diff --git a/.pre-commit-config.yaml b/.pre-commit-config.yaml index 59c6ee5..ddb207c 100644 --- a/.pre-commit-config.yaml +++ b/.pre-commit-config.yaml @@ -3,7 +3,6 @@ repos: rev: v2.4.0 hooks: - id: check-added-large-files - - id: check-byte-order-marker - id: check-json - id: check-merge-conflict - id: check-toml @@ -28,7 +27,7 @@ repos: pass_filenames: false - id: flake8 name: flake8 - entry: flake8 sensovation_data_parser tests + entry: flake8 --ignore E231 sensovation_data_parser tests language: system pass_filenames: false - id: pytest diff --git a/Makefile b/Makefile index 5cd7d95..5d74865 100644 --- a/Makefile +++ b/Makefile @@ -54,7 +54,7 @@ lint: ## reformat with black and check style with flake8 isort -rc sensovation_data_parser isort -rc tests black sensovation_data_parser tests - flake8 sensovation_data_parser tests + flake8 --ignore E231 sensovation_data_parser tests test: ## run tests quickly with the default Python pytest tests -x --disable-warnings -k "not app" @@ -82,5 +82,5 @@ repo: devenv ## complete project setup with development environment and git repo git commit -m "import of project template" git remote add origin https://git.cpi.imtek.uni-freiburg.de/holgi/sensovation-data-parser.git git push -u origin master --no-verify - + .venv/bin/pre-commit install --install-hooks diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A10_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A10_1.csv new file mode 100755 index 0000000..3cbc2f6 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A10_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 263 251 0,010645261027074 0,0467470346729722 0,0106355382619974 0,0474402990768292 0,0015766390016293 0,0102767352951674 465324 2037272 667 665 0 True 262 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 306 252 0,0105217247178654 0,0105907937616988 0,0104829480430304 0,0105287251087205 0,00137847776749265 0,00128800411185562 459924 461555 667 665 0 False 306 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 352 252 0,0106839919477204 0,0684519492826826 0,0107270923933776 0,0670481422140841 0,00128617808957342 0,0122751060788691 467017 2983189 667 665 0 True 351 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 395 251 0,0107261544325114 0,0942649826672426 0,0106813153276875 0,0933089188982986 0,00141251268205901 0,0178422398451224 468860 4108141 667 665 0 True 395 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 440 252 0,0107184906059216 0,0774541985542937 0,010757610437171 0,0740672922865644 0,00150813605034675 0,0174596779985157 468525 3375514 667 665 0 True 440 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 483 252 0,0106894366961632 0,0794580637907426 0,0106813153276875 0,0783398184176394 0,00152044838770555 0,0303115744635938 467255 3462844 667 665 0 True 484 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 528 252 0,0108748555454477 0,0881599971547087 0,0108949416342412 0,0845349813076982 0,00166390563302 0,025576995068255 475360 3842081 667 665 0 True 528 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 572 251 0,0110154352899083 0,0764666759597552 0,0110780498970016 0,0723582818341344 0,00175080106881938 0,0213419527085525 481505 3332477 667 665 0 True 573 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 617 253 0,010766829906173 0,010775531183188 0,0107881284809644 0,0108796826123445 0,00199028365062568 0,00187648736994064 470638 469606 667 665 0 False 617 253 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 659 252 0,0111179704265514 0,0477584210010033 0,0109407186999313 0,0471198596169986 0,0025791295245766 0,00835847513433339 485987 2081349 667 665 0 True 661 253 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 262 295 0,0104624044123509 0,0106445789456475 0,0105439841306172 0,0106660563057908 0,00151731892722122 0,00150069425146126 457331 463899 667 665 0 False 262 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 306 296 0,0105809992691912 0,0104844854181689 0,010605020218204 0,0104219119554437 0,00131758288955664 0,00122139133728141 462515 456922 667 665 0 False 306 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 351 296 0,0107243013878732 0,109835885203969 0,0107118333714809 0,106218051422904 0,00137624697585866 0,0259752787515287 468779 4786733 667 665 0 True 351 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 396 296 0,0109197175273659 0,0592350411391261 0,0109254596780346 0,056900892652781 0,00141461573087539 0,0113683595900624 477321 2581509 667 665 0 True 395 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 440 296 0,0108715154896802 0,0895594215568677 0,0108644235904479 0,0886701762417029 0,00174295306943016 0,0186204778349008 475214 3903069 667 665 0 True 439 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 484 297 0,0107259485386627 0,0489338704967959 0,0107881284809644 0,0486915388723583 0,00178062146700046 0,010482738331712 468851 2132576 667 665 0 True 484 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 527 296 0,0107961812181572 0,0540873355281084 0,0108186465247578 0,055039291981384 0,00165326343257516 0,014790938761362 471921 2357168 667 665 0 True 528 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 573 297 0,0109008896787587 0,0677866559279866 0,0109864957656214 0,0641489280537118 0,00179259489233568 0,0208749539989989 476498 2954195 667 665 0 True 573 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 617 296 0,0105413303876787 0,0106206234285645 0,0104676890211337 0,0107118333714809 0,00201874450892834 0,00195104162075531 460781 462855 667 665 0 False 617 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 661 296 0,0105741590179962 0,0106237440706367 0,0106507972838941 0,0106965743495842 0,00190664842803886 0,00195598967520673 462216 462991 667 665 0 False 661 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 263 342 0,0108754503498994 0,0657298774516974 0,0108186465247578 0,0598306248569467 0,00158507354408275 0,0293674652157639 475386 2864559 667 665 0 True 262 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 308 341 0,0107829353805587 0,0763600922654542 0,0107881284809644 0,074692912184329 0,00140324525179142 0,0275088565763562 471342 3327832 667 665 0 True 306 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 353 341 0,0111394748951915 0,0447591397812453 0,0110627908751049 0,0451056687266346 0,00140640785649592 0,00954008302686109 486927 1950638 667 665 0 True 351 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 396 341 0,0110146117145135 0,0434253406461909 0,0109864957656214 0,0410315098802167 0,00141807685237798 0,0108888588615972 481469 1892510 667 665 0 True 395 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 441 341 0,0110684872715851 0,0790822558800297 0,0111696040283818 0,0747539482719158 0,0017173250510591 0,0166952319940081 483824 3446466 667 665 0 True 439 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 484 341 0,0110336454569694 0,0447573729471309 0,0109712367437247 0,0413214312962539 0,00172416800259055 0,0144728595171001 482301 1950561 667 665 0 True 484 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 527 341 0,0109073410193507 0,0333013352791455 0,0108949416342412 0,0329289692530709 0,00160763484406069 0,00529620709482194 476780 1451298 667 665 0 True 528 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 572 340 0,0108253266362927 0,0586861752687968 0,0107728694590677 0,056244754711223 0,00189999236306313 0,0130354456018339 473195 2557589 667 665 0 True 573 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 617 341 0,0107366550187941 0,0636906755329615 0,0107270923933776 0,0635996032654307 0,0020967756744577 0,0145460383131588 469319 2775689 667 665 0 True 617 340 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 661 340 0,0104170391343582 0,0727823908592722 0,0104676890211337 0,069764248111696 0,00195339097488256 0,0229076615833221 455348 3171913 667 665 0 True 661 340 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 264 385 0,0107705817496379 0,0477620464528224 0,0107728694590677 0,0507209887846189 0,00148896419575456 0,0115724219913293 470802 2081507 667 665 0 True 262 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 309 385 0,0109898129442946 0,0411659269482931 0,0109864957656214 0,0366979476615549 0,00135591064142937 0,0127508847877768 480385 1794043 667 665 0 True 306 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 352 385 0,0110902205111681 0,0964771048702094 0,0110933089188983 0,0924086366063935 0,00139411737474656 0,0263637308034716 484774 4204547 667 665 0 True 351 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 396 385 0,0111620774643578 0,0786060596673648 0,0111848630502785 0,0732433051041428 0,0014407952186658 0,0263978680787221 487915 3425713 667 665 0 True 395 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 441 384 0,0111383081633823 0,0466239987700999 0,011108567940795 0,0476844434271763 0,00166909881278014 0,00987958838334445 486876 2031910 667 665 0 True 439 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 485 385 0,0113490519560545 0,0640335560806342 0,0112764171816587 0,0626230258640421 0,00180219176894044 0,0153714439539775 496088 2790632 667 665 0 True 484 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 529 385 0,0111908110947959 0,0450031923480021 0,0111390859845884 0,0454108491645685 0,00168631940676913 0,00602070103065484 489171 1961274 667 665 0 True 528 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 573 385 0,0111017048125056 0,0548702495538457 0,0110780498970016 0,0543678950179294 0,0018470478747324 0,00956655233029489 485276 2391288 667 665 0 True 572 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 617 384 0,0108621130039238 0,0491607824780537 0,0108796826123445 0,0469214923323415 0,00201117125131657 0,0129775359870195 474803 2142465 667 665 0 True 617 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 661 384 0,0105729694090927 0,0935509063342724 0,0105745021744106 0,0846723125047684 0,0019442431707232 0,023165036829058 462164 4077021 667 665 0 True 661 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 263 430 0,0108251207424441 0,0457881944504199 0,0107728694590677 0,045990691996643 0,00159534412623159 0,00741296373552478 473186 1995485 667 665 0 True 262 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 307 429 0,0110022123294041 0,062453249167781 0,0110017547875181 0,0632639047837034 0,00154436050289828 0,00817134379577288 480927 2721761 667 665 0 True 306 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 353 429 0,0114172256970622 0,0404480874881183 0,0114290074006256 0,0402075226977951 0,00151329393352878 0,00732702380156756 499068 1762759 667 665 0 True 350 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 397 429 0,0116774297676065 0,056364348729457 0,0115205615320058 0,0562752727550164 0,00177905342759509 0,0105515411404124 510442 2456402 667 665 0 True 395 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 441 429 0,0115157573422032 0,101712945673867 0,0115510795757992 0,0975661860074769 0,00171458071839079 0,0171525046751384 503375 4432729 667 665 0 True 439 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 485 429 0,0117195693753032 0,0728839723478988 0,0115815976195926 0,0665598535133898 0,00220984548368445 0,0242237781201298 512284 3176340 667 665 0 True 484 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 529 429 0,011248415618238 0,0581949724391088 0,0112458991378653 0,0552986953536278 0,00166636699557567 0,0113396657167394 491689 2536182 667 665 0 True 528 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 573 429 0,0109367380855235 0,0340787422894613 0,0109254596780346 0,0340733958953231 0,00180016192215706 0,0050742681605075 478065 1485178 667 665 0 True 572 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 617 428 0,0107110097960862 0,0452902914186359 0,0106813153276875 0,043778133821622 0,0019586723688969 0,00901739016839311 468198 1973786 667 665 0 True 617 427 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 662 428 0,0106961625618868 0,0755825934715479 0,0106813153276875 0,0754100862134737 0,00192598456824126 0,0120554522918185 467549 3293948 667 665 0 True 661 427 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 263 473 0,0106933715563825 0,0598418683467653 0,0107118333714809 0,0584420538643473 0,00162729469469802 0,0208904527225584 467427 2607955 667 665 0 True 262 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 308 474 0,0109303096220258 0,060412486928009 0,0109712367437247 0,05981536583505 0,00152600062865477 0,00900096695600929 477784 2632823 667 665 0 True 306 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 351 473 0,0114137712558232 0,0734883443444959 0,0113679713130388 0,0699626153963531 0,00161786924289685 0,0215097524056245 498917 3202679 667 665 0 True 350 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 396 472 0,0126424771134689 0,0957583705200286 0,0120241092545968 0,0900892652780957 0,00307307687597857 0,0277723394115159 552626 4173224 667 665 0 True 395 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 440 473 0,0119059948167367 0,107612473619388 0,0120088502327001 0,0993514915693904 0,00201177019419362 0,0406860470196061 520433 4689835 667 665 0 True 439 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 484 473 0,012658994375552 0,0602101729489666 0,0121919584954604 0,0572671091783017 0,00274274003819615 0,01837064138203 553348 2624006 667 665 0 True 484 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 529 473 0,0114522962826209 0,0450445408554575 0,0114137483787289 0,0464789806973373 0,00184418306737681 0,00770219591279857 500601 1963076 667 665 0 True 528 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 573 473 0,0111999161783265 0,105324561116685 0,0112306401159686 0,101457236591135 0,00189615101530538 0,0221270548297489 489569 4590126 667 665 0 True 572 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 617 472 0,0107501296273356 0,0757331873974247 0,0107423514152743 0,0710154879072251 0,00180910720436222 0,028549486435486 469908 3300511 667 665 0 True 617 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 661 473 0,01063235834589 0,0772309808625478 0,0106660563057908 0,0737010757610437 0,0018550428998373 0,0143224810599248 464760 3365786 667 665 0 True 661 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 264 518 0,010717369628301 0,0561153169029234 0,0108186465247578 0,0579842832074464 0,00149726474417888 0,0143128530203486 468476 2445549 667 665 0 True 262 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 308 518 0,0109213189239667 0,107269983151975 0,0109407186999313 0,0996414129854276 0,00148611069763589 0,0296278425600351 477391 4674909 667 665 0 True 306 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 352 517 0,0111223857057509 0,0618838467191095 0,0112306401159686 0,0626840619516289 0,00157705861014163 0,0176863678402946 486180 2696946 667 665 0 True 350 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 396 517 0,0115791955246913 0,0621820974959716 0,0116426337071794 0,0617837796597238 0,00176343934073775 0,0135380073584984 506148 2709944 667 665 0 True 395 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 441 517 0,0116417872546903 0,0608084413368051 0,0114442664225223 0,0607461661707485 0,00204202756383041 0,011591205284272 508884 2650079 667 665 0 True 439 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 484 517 0,0117205759674523 0,0628507180058179 0,0114747844663157 0,0631570916304265 0,00241389246026561 0,0150847501376661 512328 2739083 667 665 0 True 483 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 529 517 0,0112543865398498 0,0763284957644741 0,0111848630502785 0,0744792858777752 0,00204049817018885 0,0198511340309331 491950 3326455 667 665 0 True 528 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 572 516 0,0110947730529334 0,0622979742787961 0,011108567940795 0,0621194781414511 0,00180316776900248 0,0180137283522912 484973 2714994 667 665 0 True 572 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 617 517 0,0108880785059519 0,044485693519677 0,0107728694590677 0,0444037537193866 0,00187941108631494 0,00687986041109499 475938 1938721 667 665 0 True 617 514 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 661 517 0,0107493289290351 0,0702753220886962 0,0106965743495842 0,0704051270313573 0,00206251459638994 0,0169054246660048 469873 3062653 667 665 0 True 661 514 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 264 563 0,0105027138525038 0,0466870770425721 0,0104371709773404 0,0474860761425193 0,00139846014025508 0,00967306534651512 459093 2034659 667 665 0 True 261 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 308 562 0,0105708875935116 0,0550000086047116 0,0104829480430304 0,0560158693827726 0,00146744163043554 0,0122224485739509 462073 2396943 667 665 0 True 306 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 353 562 0,0111297750072091 0,0556278772004399 0,011108567940795 0,0555123216601816 0,00151914151836654 0,0130168815801307 486503 2424306 667 665 0 True 350 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 397 562 0,0113754749999685 0,0525156333268511 0,0113374532692454 0,0517891203173877 0,00162535646317299 0,00831984847020706 497243 2288672 667 665 0 True 395 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 441 561 0,0113943486027643 0,0925684777289986 0,0112916762035554 0,0854047455558099 0,00193434539756067 0,0242625291410868 498068 4034206 667 665 0 True 439 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 485 562 0,0111812713464737 0,0650576544359296 0,0112916762035554 0,0638590066376745 0,00210219874213271 0,0136682774812253 488754 2835263 667 665 0 True 483 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 529 562 0,0111283337502684 0,058189878449844 0,0111543450064851 0,0573891813534752 0,00199191775842853 0,00927477620330203 486440 2535960 667 665 0 True 528 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 573 560 0,0106492187643875 0,0403615585083101 0,0105592431525139 0,0410620279240101 0,00168836043368007 0,00959780044907428 465497 1758988 667 665 0 True 572 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 617 561 0,0107941909109533 0,0507519428004665 0,0108491645685512 0,0502327000839246 0,00166598608975226 0,00873331369641477 471834 2211809 667 665 0 True 617 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 661 561 0,0107011955226324 0,0566537423898497 0,010757610437171 0,0549172198062104 0,00176673324419782 0,00872296384201213 467769 2469014 667 665 0 True 661 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 261 600 0,0107469954654168 0,0102723964867536 0,0101625085831998 0,01025406271458 0,00315761532469483 0,00129032205659845 469771 447679 667 665 0 False 261 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 306 600 0,0107618198225218 0,0104215448210822 0,0107118333714809 0,0104371709773404 0,00178175140538078 0,00145775588861397 470419 454179 667 665 0 False 306 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 352 606 0,0107956550449884 0,0845696755048528 0,0108186465247578 0,0825513084611276 0,00144241373794533 0,0174564715432659 471898 3685612 667 665 0 True 350 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 396 606 0,0110249750382305 0,0804929926097 0,010955977721828 0,0771953917753872 0,00147783652193945 0,0236489388527502 481922 3507947 667 665 0 True 395 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 439 600 0,011286117069641 0,0110517997901598 0,0110322728313115 0,0110475318532082 0,00225253668190043 0,00200001449693691 493337 481646 667 665 0 False 439 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 483 600 0,0112293589986879 0,011110128261831 0,0108949416342412 0,0110475318532082 0,00274341249011023 0,00211325265884561 490856 484188 667 665 0 False 483 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 528 600 0,0107970963019291 0,0105786553818742 0,0107118333714809 0,010605020218204 0,00230901707246566 0,00213701684749739 471961 461026 667 665 0 False 528 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 572 601 0,010531447482942 0,0104718881203925 0,0104829480430304 0,010406652933547 0,00177009345411454 0,00184749556623214 460349 456373 667 665 0 False 572 601 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 616 601 0,0108226957704485 0,0104288645624131 0,0108186465247578 0,0103303578240635 0,00149512570925454 0,00149958844976103 473080 454498 667 665 0 False 616 601 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 661 601 0,0104953931823285 0,0105028880280353 0,0105287251087205 0,0104829480430304 0,00164308521647762 0,00161543749110005 458773 457724 667 665 0 False 661 601 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 263 651 0,0102794562892507 0,0439671391800628 0,0101930266269932 0,0438544289311055 0,00131595032968625 0,0098152896685664 449334 1916122 667 665 0 True 261 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 306 644 0,0103780336885803 0,0102647555028565 0,0103913939116503 0,0103608758678569 0,00136417607609844 0,00134133626022301 453643 447346 667 665 0 False 306 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 350 644 0,0112443206183587 0,010368516851754 0,010406652933547 0,0103608758678569 0,0047017868892037 0,00118997249815688 491510 451868 667 665 0 False 350 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 394 644 0,0112153810940719 0,0105448101829304 0,0108339055466545 0,0105439841306172 0,00290395006501216 0,0013036290833028 490245 459551 667 665 0 False 394 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 439 644 0,0106053404975242 0,0106072918620653 0,0106507972838941 0,0106355382619974 0,00164315483534638 0,00170632800640048 463579 462274 667 665 0 False 439 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 483 644 0,0105140837683699 0,0104081214709927 0,0105134660868238 0,0104219119554437 0,00179000179219256 0,0017779156954161 459590 453594 667 665 0 False 483 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 528 644 0,0105113613941484 0,0104625261941762 0,0105134660868238 0,0104982070649271 0,00177593541641403 0,00166448839826444 459471 455965 667 665 0 False 528 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 572 644 0,0103309755056095 0,01010778261745 0,0103456168459602 0,0101167315175097 0,00165573324302974 0,00139640249160353 451586 440505 667 665 0 False 572 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 616 644 0,0105130771762208 0,0104748251952839 0,010452429999237 0,0104829480430304 0,00130170218179288 0,00137653178309602 459546 456501 667 665 0 False 616 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 661 650 0,0104207909778231 0,045576312032083 0,0103913939116503 0,0455939574273289 0,00135614206110994 0,00904223807287436 455512 1986251 667 665 0 True 661 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A10_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A10_2.csv new file mode 100755 index 0000000..03f0441 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A10_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 263 251 0,00845246866152641 0,756068312231712 0,00833142595559625 0,785702296482795 0,00205100546094174 0,202406242354817 369473 32950043 667 665 15 True 262 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 306 252 0,0067936047997974 0,00664095578841817 0,00668345159075303 0,00659189745937285 0,00155251546828846 0,00121651313878848 296961 289418 667 665 0 False 306 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 352 252 0,00641993034153557 0,00636126824270564 0,00646982528419928 0,00634775310902571 0,00115392581184061 0,00109283770617603 280627 277229 667 665 0 True 351 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 395 251 0,00634956039947525 0,00641849531129265 0,0063782711528191 0,00643930724040589 0,00119480128399048 0,00117488015770301 277551 279723 667 665 0 True 395 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 440 252 0,00633693224342281 0,00636870271352448 0,00630197604333562 0,0063782711528191 0,00146753190512491 0,00159016193676685 276999 277553 667 665 0 True 440 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 483 252 0,00657595212464722 0,0065159694842508 0,00656137941557946 0,00657663843747616 0,00149439597835643 0,00148388661954043 287447 283971 667 665 0 True 484 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 528 252 0,00686511859657262 0,0071011587104635 0,00700389105058366 0,00709544518196384 0,00152242170832074 0,00155470574412442 300087 309474 667 665 0 True 528 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 572 251 0,00725995436706 0,00741363594383074 0,0072480354009308 0,00749217975127794 0,00165402547806593 0,0015632057017545 317346 323092 667 665 0 True 573 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 617 253 0,00798250451336474 0,00788723927006805 0,00793469138628214 0,00785839627679866 0,00213736326233802 0,00183094351152084 348930 343732 667 665 0 False 617 253 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 659 252 0,00979841962744881 0,768190331631321 0,0098115510795758 0,773983367666133 0,00216714598703049 0,171212164301357 428307 33478330 667 665 15 True 661 253 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 262 295 0,00685599063594776 0,0066367107973642 0,00679026474402991 0,00662241550316625 0,00150067736061663 0,00147782334474985 299688 289233 667 665 0 False 262 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 306 296 0,00648975123333275 0,00646835674675359 0,00654612039368277 0,00648508430609598 0,00121718291289563 0,00122668457199987 283679 281896 667 665 0 False 306 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 351 296 0,00647881598225836 0,00660929044974533 0,00643930724040589 0,00659189745937285 0,00125913059016816 0,00128598139321457 283201 288038 667 665 0 True 351 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 396 296 0,00649368609355199 0,00646610804878986 0,00651560234988937 0,00642404821850919 0,00134551692522815 0,00124866840701762 283851 281798 667 665 0 True 395 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 440 296 0,00649588229460459 0,00664627923665882 0,00653086137178607 0,00657663843747616 0,00162237776753102 0,0016222306298654 283947 289650 667 665 0 True 439 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 484 297 0,00663099441352796 0,0068184881980644 0,00662241550316625 0,0068207827878233 0,00172058223545508 0,00168985316649379 289853 297155 667 665 0 True 484 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 527 296 0,00680788010663929 0,00696313913646556 0,00679026474402991 0,00695811398489357 0,00153132872088151 0,00156288731295663 297585 303459 667 665 0 True 528 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 573 297 0,00718926414567951 0,00728181176218183 0,00709544518196384 0,0072327763790341 0,00160781752798685 0,00172290788743357 314256 317347 667 665 0 True 573 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 617 296 0,00755117977747222 0,00749004578280216 0,00744640268558785 0,00749217975127794 0,00189015424335679 0,00180715491278884 330076 326422 667 665 0 False 617 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 661 296 0,00783227063511046 0,00789100239727265 0,00785839627679866 0,00791943236438544 0,00202146175867349 0,00189867142637994 342363 343896 667 665 0 False 661 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 263 342 0,00639389620822457 0,0135405118426646 0,0063935301747158 0,00660715648126955 0,00137487684035885 0,0267220573038822 279489 590106 667 665 0 True 262 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 308 341 0,00644363101122819 0,00659683082735449 0,0063935301747158 0,00665293354695964 0,00128033259992652 0,00120935557502429 281663 287495 667 665 0 True 306 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 353 341 0,00668004290370265 0,00676752535951919 0,00662241550316625 0,00677500572213321 0,00126464451388472 0,00123850722408509 291997 294934 667 665 0 True 351 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 396 341 0,00657988698486646 0,00675504279123077 0,00654612039368277 0,00674448767833982 0,00134358344448048 0,00139768975751611 287619 294390 667 665 0 True 395 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 441 341 0,0069523718342248 0,00704104045878028 0,00691233691920348 0,00703440909437705 0,00158992209280901 0,00169541123920861 303901 306854 667 665 0 True 439 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 484 341 0,00698453702880764 0,00705767623453231 0,00697337300679027 0,00700389105058366 0,00155537594328191 0,00150103943126926 305307 307579 667 665 0 True 484 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 527 341 0,00705806400988107 0,00712311793445619 0,00703440909437705 0,00717174029144732 0,00153099631567897 0,00165509588229249 308521 310431 667 665 0 True 528 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 572 340 0,00717329593385958 0,00740865668405392 0,0072327763790341 0,00743114366369116 0,00178890283811756 0,00163177330178894 313558 322875 667 665 0 True 573 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 617 341 0,00732014400215777 0,00737584405050163 0,00727855344472419 0,00746166170748455 0,00193409569954952 0,00193844414774081 319977 321445 667 665 0 True 617 340 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 661 340 0,00705476970830218 0,00719530572827124 0,00709544518196384 0,00727855344472419 0,00182728475585115 0,00190633258096267 308377 313577 667 665 0 True 661 340 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 264 385 0,00636465928171186 0,00645846706489272 0,00633249408712902 0,00646982528419928 0,00136937632967023 0,00129577550709264 278211 281465 667 665 0 True 262 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 309 385 0,00668336008237584 0,00676715822515777 0,00660715648126955 0,00683604180972 0,00134157308380018 0,00127554494663359 292142 294918 667 665 0 True 306 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 352 385 0,00695944085636285 0,00732618912811899 0,00695811398489357 0,00740062561989776 0,00122455293713256 0,00139392423105584 304210 319281 667 665 0 True 351 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 396 385 0,00687571069123255 0,00714312675715381 0,00677500572213321 0,00715648126955062 0,00126878764490858 0,00132337089971631 300550 311303 667 665 0 True 395 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 441 384 0,00719557822370573 0,00714351683741283 0,00720225833524071 0,0072327763790341 0,00154192153653786 0,00155298366149608 314532 311320 667 665 0 True 439 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 485 385 0,00724725757972467 0,00742529245980596 0,00720225833524071 0,00735484855420768 0,00170879313347201 0,00174304745604673 316791 323600 667 665 0 True 484 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 529 385 0,00716236068278518 0,00721400663480629 0,00715648126955062 0,0072327763790341 0,00157366819036309 0,00165875699667121 313080 314392 667 665 0 True 528 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 573 385 0,00722101755256499 0,00737763383051357 0,00721751735713741 0,0072632944228275 0,00176353588416675 0,00162809359014731 315644 321523 667 665 0 True 572 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 617 384 0,00696136253228387 0,00687227338201305 0,00701915007248035 0,00688181887541009 0,00188929791183211 0,00175012737996506 304294 299499 667 665 0 True 617 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 661 384 0,00660720223545815 0,00670511251807706 0,00663767452506294 0,00665293354695964 0,00180483288780909 0,0018221180883782 288813 292214 667 665 0 True 661 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 263 430 0,00655058142707085 0,00661091960847415 0,00656137941557946 0,00660715648126955 0,00155301904341567 0,00152749169088846 286338 288109 667 665 0 True 262 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 307 429 0,00686935085901773 0,00697312060191679 0,00692759594110018 0,00698863202868696 0,0014892357391972 0,00141298634671426 300272 303894 667 665 0 True 306 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 353 429 0,0073306217113462 0,00710611502434273 0,00732433051041428 0,00712596322575723 0,001368200819009 0,00134054697987406 320435 309690 667 665 0 True 350 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 397 429 0,00724071473075547 0,0073665050701829 0,0072327763790341 0,00732433051041428 0,00154610915828342 0,00161614960165188 316505 321038 667 665 0 True 395 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 441 429 0,00725757514925302 0,00726437288001418 0,00730907148851759 0,0072632944228275 0,00162335888025544 0,00165641232865229 317242 316587 667 665 0 True 439 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 485 429 0,00727997182457066 0,00735673011780998 0,0072480354009308 0,00740062561989776 0,00173346414831089 0,00173462261802575 318221 320612 667 665 0 True 484 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 529 429 0,00707702912105403 0,00729112779660297 0,00706492713817044 0,0072632944228275 0,00157094440103819 0,00161587102332428 309350 317753 667 665 0 True 528 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 573 429 0,00681078549761512 0,00711292995592667 0,00689707789730678 0,00720225833524071 0,00176487909708898 0,00187707569420904 297712 309987 667 665 0 True 572 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 617 428 0,00650640575798162 0,00640998238328713 0,00650034332799268 0,0064087891966125 0,0017803645767995 0,00158879117264343 284407 279352 667 665 0 True 617 427 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 662 428 0,00642571824639294 0,00629020479787246 0,00636301213092241 0,00616464484626535 0,00177166149910642 0,00167410162718789 280880 274132 667 665 0 True 661 427 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 263 473 0,00658562913553523 0,00680405522848091 0,00654612039368277 0,00679026474402991 0,00139739743665085 0,00137565120453091 287870 296526 667 665 0 True 262 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 308 474 0,0069164547961771 0,00685917127448973 0,00704966811627375 0,00689707789730678 0,00145456490904508 0,00136997746366004 302331 298928 667 665 0 True 306 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 351 473 0,00707012023857607 0,00771663652149371 0,00709544518196384 0,00752269779507134 0,00143036553465065 0,00217235488254564 309048 336297 667 665 0 True 350 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 396 472 0,00742643098226579 0,00734647330158768 0,00729381246662089 0,00729381246662089 0,00173515753111952 0,00166316598565814 324623 320165 667 665 0 True 395 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 440 473 0,00707773831097726 0,00729076066224155 0,00701915007248035 0,00729381246662089 0,00184219404700749 0,00202621985465 309381 317737 667 665 0 True 439 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 484 473 0,00765831321006926 0,00757974129647763 0,00756847486076143 0,00750743877317464 0,00209931940039904 0,00198376590519798 334759 330331 667 665 0 True 484 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 529 473 0,00682586150275743 0,00690719703814354 0,00677500572213321 0,00689707789730678 0,00173561553474484 0,00159688663475931 298371 301021 667 665 0 True 528 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 573 473 0,00644397416764266 0,00634896924159793 0,00646982528419928 0,0063782711528191 0,00178258684737745 0,00187328529010997 281678 276693 667 665 0 True 572 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 617 472 0,0061554482543576 0,00616753602936157 0,00614938582436866 0,00611886778057527 0,00175859200394657 0,00162347277255751 269066 268786 667 665 0 True 617 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 661 473 0,00616187671785531 0,00624768604964001 0,00604257267109178 0,00634775310902571 0,0017383837681276 0,00174015657921916 269347 272279 667 665 0 True 661 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 264 518 0,00662085986075399 0,00671479568685963 0,00662241550316625 0,00674448767833982 0,00144730575237554 0,00152139055769521 289410 292636 667 665 0 True 262 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 308 518 0,00680511197822924 0,00688583440748816 0,0068055237659266 0,00688181887541009 0,00140885491637724 0,00153971539022412 297464 300090 667 665 0 True 306 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 352 517 0,00701272160898265 0,00678062746704252 0,00694285496299687 0,00677500572213321 0,00139789261663764 0,0014380160224417 306539 295505 667 665 0 True 350 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 396 517 0,00692899144385235 0,00715377365363512 0,00686655985351339 0,00720225833524071 0,0015341499030438 0,00152656392767119 302879 311767 667 665 0 True 395 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 441 517 0,00708860493076877 0,00796413097288885 0,00706492713817044 0,00796520943007553 0,00184437032774653 0,00237796033706844 309856 347083 667 665 0 True 439 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 484 517 0,00700432571537532 0,00680244901564968 0,00701915007248035 0,0068207827878233 0,0019188308970181 0,00161437506394298 306172 296456 667 665 0 True 483 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 529 517 0,00671607432722183 0,00642911926187637 0,00663767452506294 0,00651560234988937 0,00179369662689107 0,00168172628727718 293572 280186 667 665 0 True 528 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 572 516 0,00635017808102129 0,00645374020998938 0,00633249408712902 0,00645456626230259 0,00171465149422659 0,00163484888791765 277578 281259 667 665 0 True 572 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 617 517 0,00627985389314956 0,00631927725011774 0,00627145799954223 0,00631723506523232 0,00166837049802323 0,00167259298587865 274504 275399 667 665 0 True 617 514 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 661 517 0,0063500408184555 0,00641700382794937 0,00634775310902571 0,00636301213092241 0,00170888656515444 0,00195328290768962 277572 279658 667 665 0 True 661 514 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 264 563 0,00662692229074293 0,00674373046371938 0,00665293354695964 0,00672922865644312 0,00136747031220903 0,00117879839690705 289675 293897 667 665 0 True 261 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 308 562 0,00681554393322908 0,006763739286417 0,00672922865644312 0,00675974670023652 0,00133179522258939 0,00134166890745701 297920 294769 667 665 0 True 306 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 353 562 0,00693663239334784 0,00703512041720231 0,00695811398489357 0,00708018616006714 0,00129448446219642 0,00132276076815345 303213 306596 667 665 0 True 350 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 397 562 0,00674325231524773 0,0066035080835529 0,00677500572213321 0,00660715648126955 0,0013830345876297 0,00137444846756039 294760 287786 667 665 0 True 395 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 441 561 0,00686349432287747 0,00680332095975806 0,0068055237659266 0,00674448767833982 0,00183979305585988 0,00195810736000686 300016 296494 667 665 0 True 439 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 485 562 0,00651326888627099 0,00668356632024098 0,00645456626230259 0,00666819256885634 0,00194398964636072 0,00184050339894491 284707 291275 667 665 0 True 483 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 529 562 0,00643029366525252 0,00663384256016558 0,0063935301747158 0,00663767452506294 0,00177014743916556 0,00183319616500354 281080 289108 667 665 0 True 528 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 573 560 0,00635088727094452 0,00668592974769265 0,0063935301747158 0,00669871061264973 0,00162012155773471 0,00155538895288555 277609 291378 667 665 0 True 572 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 617 561 0,00633212805362025 0,00641939020129862 0,00645456626230259 0,00646982528419928 0,00156063239888572 0,00158439089630985 276789 279762 667 665 0 True 617 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 661 561 0,00647330260253256 0,00642134060259369 0,00650034332799268 0,0063782711528191 0,00160334426872084 0,00156374042681616 282960 279847 667 665 0 True 661 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 261 600 0,00702271889919083 0,00696926569112183 0,00700389105058366 0,00703440909437705 0,00144464274057975 0,00123856752801743 306976 303726 667 665 0 False 261 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 306 600 0,00679282697859127 0,00687640364357908 0,00685130083161669 0,00692759594110018 0,00129706936892859 0,00137970489163836 296927 299679 667 665 0 False 306 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 352 606 0,00655014676227919 0,00682486715759415 0,00657663843747616 0,0068207827878233 0,00130925976428032 0,0013691092905532 286319 297433 667 665 0 True 350 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 396 606 0,00656497111938423 0,00652523962687676 0,00659189745937285 0,00651560234988937 0,00130910064392528 0,00131507719357739 286967 284375 667 665 0 True 395 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 439 600 0,00646758332895809 0,00655305005475465 0,00645456626230259 0,00643930724040589 0,00183170683722586 0,00190019793103916 282710 285587 667 665 0 False 439 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 483 600 0,00657924642622612 0,00686018089398364 0,00651560234988937 0,00683604180972 0,00179769301351934 0,00201563542359972 287591 298972 667 665 0 False 483 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 528 600 0,00653905137154471 0,00652567559893095 0,00648508430609598 0,00659189745937285 0,0019103705361139 0,00199702822109931 285834 284394 667 665 0 False 528 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 572 601 0,00649585941751029 0,00647854472528311 0,00646982528419928 0,00650034332799268 0,00171340480392545 0,00171986329425817 283946 282340 667 665 0 False 572 601 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 616 601 0,00634708967329107 0,00638744951185471 0,00633249408712902 0,00642404821850919 0,00146003963183782 0,00144050672138325 277443 278370 667 665 0 False 616 601 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 661 601 0,00654200251670914 0,00656785015869956 0,00659189745937285 0,00654612039368277 0,00149209198917686 0,00162649818624292 285963 286232 667 665 0 False 661 601 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 263 651 0,00910771439640674 0,741543949138123 0,00869764248111696 0,761318379491875 0,00241514616696447 0,205798063251012 398115 32317060 667 665 15 True 261 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 306 644 0,00748414989117938 0,00684437117054481 0,0072632944228275 0,00685130083161669 0,00202223590513812 0,00125655403638141 327146 298283 667 665 0 False 306 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 350 644 0,00637554877859765 0,00641053308482926 0,00633249408712902 0,0063782711528191 0,00120254087791391 0,00119396989509579 278687 279376 667 665 0 False 350 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 394 644 0,00634420715940954 0,00627797463445751 0,0063935301747158 0,00627145799954223 0,00130148204818665 0,00123215133415714 277317 273599 667 665 0 False 394 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 439 644 0,00628840992641697 0,00636627044838005 0,00631723506523232 0,0064087891966125 0,00164199043869531 0,00162693202805067 274878 277447 667 665 0 False 439 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 483 644 0,00642132584428774 0,00643194160727982 0,00643930724040589 0,0063935301747158 0,00172635880736125 0,00161282762050151 280688 280309 667 665 0 False 483 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 528 644 0,0061630434496645 0,00622873273823148 0,00621042191195544 0,00625619897764553 0,00179529695501298 0,00166865172893759 269398 271453 667 665 0 False 528 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 572 644 0,0063913797278518 0,00631427504444333 0,00646982528419928 0,00630197604333562 0,00152863021835991 0,0013548761217524 279379 275181 667 665 0 False 572 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 616 644 0,00681719108401853 0,00662344806855775 0,0068055237659266 0,00660715648126955 0,00137298250674123 0,00128990396461366 297992 288655 667 665 0 False 616 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 661 650 0,00854056835166761 0,765970086580608 0,00840772106507973 0,790630960555428 0,00173442487629016 0,198374578691046 373324 33381570 667 665 17 True 661 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A10_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A10_3.csv new file mode 100755 index 0000000..4777188 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A10_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 263 251 0,00105202605838303 0,0775806763418044 0,000839246204318303 0,0781261921110857 0,000863542290283965 0,0240706539985726 45986 3381026 667 665 0 True 262 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 306 252 0,000881225672354942 0,000827497904752726 0,000762951094834821 0,000747692072938125 0,00064492051080008 0,0005780465859686 38520 36063 667 665 0 False 306 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 352 252 0,000904194275030029 0,000873917455575308 0,000793469138628214 0,000732433051041428 0,00063267154263475 0,000636720892540343 39524 38086 667 665 0 True 351 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 395 251 0,000874110896028296 0,000915977285855977 0,000747692072938125 0,00080872816052491 0,000656261061194863 0,000654425826752456 38209 39919 667 665 0 True 395 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 440 252 0,000942948072770664 0,000859117351630392 0,000747692072938125 0,000595101853971161 0,000801576424825859 0,00080876176617541 41218 37441 667 665 0 True 440 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 483 252 0,000930342793812524 0,00096166256795571 0,000762951094834821 0,000793469138628214 0,000741790865963243 0,000789966717953518 40667 41910 667 665 0 True 484 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 528 252 0,000990715445664671 0,000970473792629892 0,000854505226215 0,00080872816052491 0,00077371375500577 0,000834409582142456 43306 42294 667 665 0 True 528 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 572 251 0,00102075307047781 0,000924100133602489 0,000854505226215 0,000747692072938125 0,000881222768764643 0,000768102903226963 44619 40273 667 665 0 True 573 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 617 253 0,0010154227075064 0,00101354324240448 0,000625619897764553 0,000671396963454643 0,0010192806201961 0,00101989995038108 44386 44171 667 665 0 False 617 253 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 659 252 0,00108089695138698 0,0783206127013574 0,000839246204318303 0,0770580605783169 0,00096552874621831 0,0209005677497104 47248 3413273 667 665 0 True 661 253 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 262 295 0,000970697988154012 0,000921208950506273 0,000793469138628214 0,000717174029144732 0,000742093531406792 0,000748681897826309 42431 40147 667 665 0 False 262 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 306 296 0,000852720812859764 0,000835161834547458 0,000778210116731518 0,000762951094834821 0,000598940998863231 0,000581856868895134 37274 36397 667 665 0 False 306 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 351 296 0,000873516091576551 0,000917881795355865 0,000762951094834821 0,000793469138628214 0,000663279998290067 0,000657978330960683 38183 40002 667 665 0 True 351 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 396 296 0,000960837960511619 0,000926004643102377 0,000762951094834821 0,000778210116731518 0,000758925622729771 0,000702557027736815 42000 40356 667 665 0 True 395 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 440 296 0,000964978714579538 0,000987499648640943 0,000701915007248035 0,000747692072938125 0,000884260033036763 0,000887077172306203 42181 43036 667 665 0 True 439 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 484 297 0,000968799189327286 0,000915311854825895 0,000732433051041428 0,000656137941557946 0,000865191596408851 0,000847850788609466 42348 39890 667 665 0 True 484 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 527 296 0,000922038408582388 0,000902026180121854 0,000747692072938125 0,000717174029144732 0,000795791082724838 0,000762536421891241 40304 39311 667 665 0 True 528 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 573 297 0,000963194301224302 0,00089557838289934 0,000717174029144732 0,000579842832074464 0,000905697361929848 0,000914192593943432 42103 39030 667 665 0 True 573 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 617 296 0,00105040178468788 0,000895325978025861 0,000686655985351339 0,000473029678797589 0,00104185734462403 0,000953819117195445 45915 39019 667 665 0 False 617 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 661 296 0,000977744133197764 0,000923205243596517 0,000595101853971161 0,000595101853971161 0,000980630230074562 0,000960166615237981 42739 40234 667 665 0 False 661 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 263 342 0,000897376900929256 0,00145401269252325 0,000747692072938125 0,000762951094834821 0,000722299607957481 0,00257332870612084 39226 63367 667 665 0 True 262 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 308 341 0,000898543632738449 0,00082554750345766 0,000793469138628214 0,000732433051041428 0,000653919459668659 0,000622972733879637 39277 35978 667 665 0 True 306 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 353 341 0,000971109775851374 0,000906202333483055 0,000839246204318303 0,000778210116731518 0,000681158821630381 0,000664821508069495 42449 39493 667 665 0 True 351 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 396 341 0,000862992628199519 0,000939152642420884 0,000717174029144732 0,00080872816052491 0,000686278572683514 0,000664514621956357 37723 40929 667 665 0 True 395 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 441 341 0,000963606088921664 0,00090748730374804 0,000686655985351339 0,000625619897764553 0,00089489431855599 0,000850193577362898 42121 39549 667 665 0 True 439 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 484 341 0,000925081062124008 0,00094158490756532 0,000686655985351339 0,000747692072938125 0,000815230473654491 0,000806759521733947 40437 41035 667 665 0 True 484 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 527 341 0,000962370725829578 0,000963658861045954 0,000762951094834821 0,000762951094834821 0,000844143798122251 0,000842532164576566 42067 41997 667 665 0 True 528 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 572 340 0,000965779412879964 0,00093970334396302 0,000671396963454643 0,00064087891966125 0,000992175824515449 0,000917128867760116 42216 40953 667 665 0 True 573 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 617 341 0,000882483912541326 0,00088740964335765 0,000442511635004196 0,000473029678797589 0,00104186505342892 0,00103840612479884 38575 38674 667 665 0 True 617 340 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 661 340 0,000986643322879645 0,000977105157033118 0,000579842832074464 0,000625619897764553 0,00104543751980454 0,000963951948583057 43128 42583 667 665 0 True 661 340 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 264 385 0,000861620002541645 0,000869144708876793 0,000732433051041428 0,000701915007248035 0,000715782284637127 0,000761197367361326 37663 37878 667 665 0 True 262 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 309 385 0,000875643661346255 0,000825501611662482 0,000732433051041428 0,000671396963454643 0,000652426402715111 0,000676446786534473 38276 35976 667 665 0 True 306 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 352 385 0,000962416480018174 0,000925522779253008 0,000823987182421607 0,000762951094834821 0,00071134627291494 0,000729585679191985 42069 40335 667 665 0 True 351 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 396 385 0,00093505547523789 0,000921805543843587 0,000793469138628214 0,000747692072938125 0,000727109586867177 0,000732792669893097 40873 40173 667 665 0 True 395 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 441 384 0,00102686125465535 0,000926761857722815 0,000762951094834821 0,00064087891966125 0,000860132197364145 0,000849416040834928 44886 40389 667 665 0 True 439 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 485 385 0,000950108603285906 0,000958404250498069 0,00064087891966125 0,000625619897764553 0,000891531936519972 0,000939427462153528 41531 41768 667 665 0 True 484 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 529 385 0,000915221034481615 0,00103072971969865 0,000656137941557946 0,000793469138628214 0,000857703607760428 0,00093363260257832 40006 44920 667 665 0 True 528 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 573 385 0,000916273380819318 0,000937339916511352 0,000701915007248035 0,000610360875867857 0,000921698277817523 0,000957498467053722 40052 40850 667 665 0 True 572 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 617 384 0,000854459472026404 0,000888396316953978 0,0004272526131075 0,000503547722590982 0,000976668546985951 0,00097736199818959 37350 38717 667 665 0 True 617 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 661 384 0,000939333491871597 0,000985228004779631 0,000579842832074464 0,000671396963454643 0,00100832908403019 0,000980325318573958 41060 42937 667 665 0 True 661 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 263 430 0,000846109332607672 0,000861136590618226 0,00064087891966125 0,000656137941557946 0,000801384086879492 0,000800001992937936 36985 37529 667 665 0 True 262 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 307 429 0,00085841720933994 0,000863109937810881 0,000747692072938125 0,000701915007248035 0,000705413734044016 0,000702861021167797 37523 37615 667 665 0 True 306 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 353 429 0,000967952736838264 0,000907372574260095 0,000885023270008392 0,000823987182421607 0,000711708678076824 0,000620054102823484 42311 39544 667 665 0 True 350 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 397 429 0,00103413617064208 0,00102542921735559 0,000823987182421607 0,000854505226215 0,000892286791951659 0,000793105671459396 45204 44689 667 665 0 True 395 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 441 429 0,000944549469371517 0,00101377270138037 0,000686655985351339 0,000747692072938125 0,000890116805422588 0,000902541118664261 41288 44181 667 665 0 True 439 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 485 429 0,000932653380336611 0,000939083804728117 0,000625619897764553 0,000671396963454643 0,000892776037637044 0,000865481748340588 40768 40926 667 665 0 True 484 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 529 429 0,000980237736476234 0,000919258549211206 0,000762951094834821 0,000701915007248035 0,000889403573850875 0,000834126489284106 42848 40062 667 665 0 True 528 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 573 429 0,000900167906433599 0,000955788418172921 0,000610360875867857 0,000549324788281071 0,000907201799434545 0,00100111097663222 39348 41654 667 665 0 True 572 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 617 428 0,000906298967705435 0,000912351834036912 0,000564583810177768 0,000625619897764553 0,000931675685210322 0,000849221979465456 39616 39761 667 665 0 True 617 427 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 662 428 0,000909387375435651 0,000865656932443262 0,000503547722590982 0,000473029678797589 0,000964033562656816 0,000925768697192842 39751 37726 667 665 0 True 661 427 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 263 473 0,000792851457082171 0,000906248225278233 0,000671396963454643 0,000732433051041428 0,000722495094750726 0,000769921048319017 34657 39495 667 665 0 True 262 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 308 474 0,000835196958627576 0,000841311335101315 0,000732433051041428 0,00064087891966125 0,000738695106854526 0,000787131015341788 36508 36665 667 665 0 True 306 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 351 473 0,00094484687159739 0,000911365160440584 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,000805132735299798 0,000765262419435239 41301 39718 667 665 0 True 350 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 396 472 0,00101997524927168 0,00105810417552235 0,000823987182421607 0,000915541313801785 0,000865830280985422 0,000863085671184141 44585 46113 667 665 0 True 395 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 440 473 0,00104269220390949 0,000938877291649816 0,000701915007248035 0,000534065766384375 0,00105233411678793 0,00107677237309502 45578 40917 667 665 0 True 439 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 484 473 0,000986094272616496 0,000959735112558232 0,00064087891966125 0,000671396963454643 0,000990234004257205 0,000978113539793673 43104 41826 667 665 0 True 484 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 529 473 0,000961524273340556 0,000961777297443655 0,000610360875867857 0,000671396963454643 0,00094400684134952 0,000902119278365565 42030 41915 667 665 0 True 528 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 573 473 0,000891405979317505 0,000919327386903973 0,000442511635004196 0,000457770656900893 0,000959481972695427 0,00105309480657382 38965 40065 667 665 0 True 572 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 617 472 0,000854436594932106 0,000832201813758475 0,000534065766384375 0,000473029678797589 0,000881757453044255 0,000879674415004933 37349 36268 667 665 0 True 617 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 661 473 0,000910325336301865 0,000896794515471558 0,000518806744487678 0,000579842832074464 0,000938756637019849 0,00090511523213305 39792 39083 667 665 0 True 661 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 264 518 0,000783357462948544 0,000904986200910837 0,000625619897764553 0,000717174029144732 0,000671384251065865 0,000800656120503156 34242 39440 667 665 0 True 262 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 308 518 0,000866332683967012 0,000958174791522179 0,000732433051041428 0,000793469138628214 0,000718021263008626 0,000830344754968189 37869 41758 667 665 0 True 306 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 352 517 0,00089396821387887 0,000930020175180455 0,000747692072938125 0,000854505226215 0,00077488016009081 0,000753981191235224 39077 40531 667 665 0 True 350 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 396 517 0,000926613827441967 0,000931052740571961 0,000686655985351339 0,000656137941557946 0,000840901661760389 0,000842791952651803 40504 40576 667 665 0 True 395 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 441 517 0,000967838351366775 0,00103674154486697 0,000610360875867857 0,000701915007248035 0,000960289126070089 0,00108487856457278 42306 45182 667 665 0 True 439 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 484 517 0,000984241227978366 0,000904779687832536 0,000732433051041428 0,000595101853971161 0,000919861515849626 0,000854549115586717 43023 39431 667 665 0 True 483 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 529 517 0,000879372627716812 0,000936284405222257 0,000625619897764553 0,00064087891966125 0,000856909562283156 0,000882366480071679 38439 40804 667 665 0 True 528 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 572 516 0,000928238101137117 0,000894201629043999 0,000671396963454643 0,000610360875867857 0,000906518584531454 0,0008574669567845 40575 38970 667 665 0 True 572 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 617 517 0,000860521902015346 0,00089863018727868 0,000579842832074464 0,000579842832074464 0,000891710323644514 0,000925508338328711 37615 39163 667 665 0 True 617 514 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 661 517 0,000892504079843804 0,000940345829095513 0,000518806744487678 0,000534065766384375 0,000952406144963223 0,0010238169524032 39013 40981 667 665 0 True 661 514 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 264 563 0,000906550615742712 0,000896496218802901 0,000762951094834821 0,000778210116731518 0,000702121229445668 0,000657987298740217 39627 39070 667 665 0 True 261 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 308 562 0,000849655282223846 0,000854413442624644 0,000717174029144732 0,000732433051041428 0,000695331992750587 0,000690816722253832 37140 37236 667 665 0 True 306 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 353 562 0,000992728629962885 0,000901383694989362 0,000885023270008392 0,000839246204318303 0,000764582482293667 0,00066921526255275 43394 39283 667 665 0 True 350 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 397 562 0,000930068268680949 0,00099644854870066 0,000793469138628214 0,000885023270008392 0,000725306592907475 0,00074948327727616 40655 43426 667 665 0 True 395 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 441 561 0,0009066878783085 0,000861480779082061 0,000564583810177768 0,000366216525520714 0,000931917166499555 0,00100745087500853 39633 37544 667 665 0 True 439 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 485 562 0,000911537822299654 0,000864830880130057 0,000518806744487678 0,000473029678797589 0,00100029934952443 0,00101673861527605 39845 37690 667 665 0 True 483 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 529 562 0,000887196593966692 0,00090259982756158 0,000518806744487678 0,000488288700694286 0,00098386400108259 0,000971684058258615 38781 39336 667 665 0 True 528 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 573 560 0,000899916258396323 0,000900328183700267 0,000595101853971161 0,000595101853971161 0,000884632225157811 0,000873288159802872 39337 39237 667 665 0 True 572 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 617 561 0,000821653718803221 0,00085567546699204 0,000610360875867857 0,000595101853971161 0,000726239197545176 0,000806363894034663 35916 37291 667 665 0 True 617 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 661 561 0,000936725503121637 0,000910171973765955 0,000671396963454643 0,000595101853971161 0,00089447359849003 0,000889934241719409 40946 39666 667 665 0 True 661 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 261 600 0,000915655699273275 0,00087084270529838 0,000793469138628214 0,000762951094834821 0,000675161380987369 0,000644203374014595 40025 37952 667 665 0 False 261 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 306 600 0,000916433520479403 0,000839773959962851 0,000778210116731518 0,000686655985351339 0,000751890538916231 0,000725633936448198 40059 36598 667 665 0 False 306 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 352 606 0,00089298449882406 0,000949432404540764 0,000778210116731518 0,000839246204318303 0,000708913440982348 0,000781857504327005 39034 41377 667 665 0 True 350 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 396 606 0,000876535868023873 0,000987224297869875 0,000701915007248035 0,000869764248111696 0,000715709773356861 0,000705513835860992 38315 43024 667 665 0 True 395 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 439 600 0,000921672375073621 0,000914348127127156 0,000564583810177768 0,000473029678797589 0,000913902288616821 0,000995089218674869 40288 39848 667 665 0 False 439 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 483 600 0,000965138854239623 0,000911617565314063 0,000579842832074464 0,0004272526131075 0,00102509573382369 0,00104147623070839 42188 39729 667 665 0 False 483 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 528 600 0,000881934862278177 0,000929262960560018 0,000534065766384375 0,000518806744487678 0,000965798870894697 0,00101661717723551 38551 40498 667 665 0 False 528 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 572 601 0,0009023412303919 0,000850329072853798 0,000579842832074464 0,000534065766384375 0,000895747576497311 0,000891125265769926 39443 37058 667 665 0 False 572 601 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 616 601 0,000854436594932106 0,000766622438449064 0,00064087891966125 0,000595101853971161 0,000730120000467698 0,000662737319637639 37349 33410 667 665 0 False 616 601 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 661 601 0,000956308295840635 0,000919556845879863 0,000717174029144732 0,000656137941557946 0,00083813157725911 0,000852473111561266 41802 40075 667 665 0 False 661 601 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 263 651 0,000987695669217348 0,0755275003714367 0,000839246204318303 0,0760662241550317 0,000725308859363815 0,0239415895807237 43174 3291547 667 665 0 True 261 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 306 644 0,000890719666488568 0,000892159444158577 0,000701915007248035 0,000793469138628214 0,000709778980738958 0,000647535146453935 38935 38881 667 665 0 False 306 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 350 644 0,000865989527552543 0,000874835291478869 0,000793469138628214 0,000762951094834821 0,000595306886257754 0,000617969226621738 37854 38126 667 665 0 False 350 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 394 644 0,000863678941028456 0,000859438594196638 0,000747692072938125 0,000732433051041428 0,000655813038043048 0,000639715131176508 37753 37455 667 665 0 False 394 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 439 644 0,000931303631773035 0,000912030591470666 0,000732433051041428 0,00064087891966125 0,000819183239227546 0,000844199332733884 40709 39747 667 665 0 False 439 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 483 644 0,000898497878549853 0,000922608650259203 0,000564583810177768 0,000595101853971161 0,000903408288941043 0,000943875375309381 39275 40208 667 665 0 False 483 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 528 644 0,00085841720933994 0,000923893620524188 0,000488288700694286 0,000579842832074464 0,000866201400916378 0,000881256629157677 37523 40264 667 665 0 False 528 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 572 644 0,000921397849942047 0,000921553138970108 0,000747692072938125 0,000762951094834821 0,000795720163228719 0,0007497421653171 40276 40162 667 665 0 False 572 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 616 644 0,000916044609876339 0,000812628963115043 0,000762951094834821 0,000656137941557946 0,000676717494872898 0,000671088828778948 40042 35415 667 665 0 False 616 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 661 650 0,000995817037693101 0,0791225718220936 0,000885023270008392 0,0780651560234989 0,000687507910447054 0,0247816316376149 43529 3448223 667 665 0 True 661 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A11_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A11_1.csv new file mode 100755 index 0000000..70e57ba --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A11_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 252 263 0,0104663392725702 0,0460930536457876 0,0104676890211337 0,0459296559090562 0,0015627557081742 0,00942109260199352 457503 2008771 667 665 0 True 252 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 296 263 0,0104982985733043 0,0102632640195132 0,0105439841306172 0,0102388036926833 0,00138447964099901 0,00122413151040559 458900 447281 667 665 0 False 296 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 341 264 0,0105679135712528 0,0666899796986171 0,0106202792401007 0,0662394140535592 0,00135982882974532 0,0109393892729914 461943 2906401 667 665 0 True 340 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 385 263 0,0122714563981456 0,0888629676732458 0,0108949416342412 0,0874189364461738 0,00943731828587618 0,0138457559871979 536408 3872717 667 665 0 True 384 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 429 263 0,0122397029912601 0,076270213184598 0,0105745021744106 0,0728770885786221 0,0103964566443104 0,0182788136686056 535020 3323915 667 665 0 True 429 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 473 262 0,0104657215910241 0,0757689829976635 0,0104371709773404 0,0776684214541848 0,00178535384870053 0,0273602445518193 457476 3302071 667 665 0 True 473 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 517 263 0,0105390884324375 0,0849261400238981 0,0105745021744106 0,0819714656290532 0,00158205611393268 0,0285543253066723 460683 3701147 667 665 0 True 517 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 562 264 0,0103760205042821 0,075421513270473 0,0103913939116503 0,0723735408560311 0,00159556839776053 0,0226338134639026 453555 3286928 667 665 0 True 561 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 606 264 0,0101583678291319 0,0101721688060848 0,0102235446707866 0,01025406271458 0,00185456616438159 0,00186320210203702 444041 443311 667 665 0 False 606 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 647 261 0,0101555539465333 0,0467426520065327 0,0102235446707866 0,0463263904783703 0,00184076619869558 0,00907988278841281 443918 2037081 667 665 0 True 650 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 251 307 0,0102888130208185 0,0104555276954116 0,0103303578240635 0,0104676890211337 0,00156947358715307 0,00152899464049285 449743 455660 667 665 0 False 251 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 296 307 0,0103789487723522 0,010486825899723 0,0103913939116503 0,0104676890211337 0,00136021623663241 0,00128639627094323 453683 457024 667 665 0 False 296 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 341 308 0,0107977826147581 0,11327474098384 0,0108949416342412 0,111253528648814 0,00138674591150774 0,0297901170674066 471991 4936601 667 665 0 True 340 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 386 309 0,0105072663942691 0,0576724943510068 0,0105287251087205 0,056946669718471 0,00138531736297514 0,0106960357174461 459292 2513412 667 665 0 True 384 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 430 308 0,0105846824813732 0,0882536852545646 0,0106355382619974 0,0869764248111696 0,00170387316680315 0,020379704875762 462676 3846164 667 665 0 True 429 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 475 309 0,0112309375181944 0,0464637446213382 0,0105439841306172 0,0477454795147631 0,00480319027687579 0,0105816328650016 490925 2024926 667 665 0 True 473 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 518 307 0,0103830437722315 0,0553404339413423 0,0104219119554437 0,0552529182879377 0,00169542375137268 0,0180500883111565 453862 2411779 667 665 0 True 517 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 563 309 0,0103676932419576 0,0643921775140529 0,0103913939116503 0,0597390707255665 0,00182420667128418 0,0210574310186396 453191 2806261 667 665 0 True 561 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 606 307 0,0100820498425541 0,0100307073474485 0,0101319905394064 0,0101167315175097 0,00205580463713103 0,00200587143646112 440705 437146 667 665 0 False 606 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 650 307 0,00993952554507823 0,00981664506884056 0,00991836423285267 0,0098115510795758 0,0019030210993743 0,00191743483326243 434475 427817 667 665 0 False 650 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 253 354 0,0104713493562214 0,054330286691781 0,0104219119554437 0,0528725108720531 0,00155399804397811 0,0115108275145695 457722 2367756 667 665 0 True 251 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 297 354 0,0105509845214724 0,071924994449961 0,0105745021744106 0,0712901503013657 0,0014871424430139 0,0249810254719509 461203 3134547 667 665 0 True 296 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 342 353 0,0107534010518202 0,0449770569706482 0,0108186465247578 0,0450751506828412 0,00128783327443884 0,0105733306412667 470051 1960135 667 665 0 True 340 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 386 354 0,01069671161215 0,0375316868504518 0,0106507972838941 0,0383916990920882 0,00136576951723508 0,00557391559323302 467573 1635660 667 665 0 True 384 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 430 352 0,0107924980059753 0,0759552348483936 0,0107270923933776 0,0709391927977417 0,00159053451879753 0,0161180644719718 471760 3310188 667 665 0 True 429 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 474 353 0,0106235735416796 0,0375558488806131 0,0106660563057908 0,0372320134279393 0,00175099436606993 0,00841990400726732 464376 1636713 667 665 0 True 473 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 519 353 0,0105957092408248 0,0311235171930742 0,0106202792401007 0,0309758144502937 0,00174991625612891 0,00543622850992384 463158 1356387 667 665 0 True 517 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 563 353 0,0103852399732841 0,0553945633137547 0,010452429999237 0,05468833447776 0,00181435171523884 0,0103678441410553 453958 2414138 667 665 0 True 561 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 607 353 0,0102464903963674 0,0619583749944786 0,0102693217364767 0,0626993209735256 0,00210446224892612 0,0144135560251664 447893 2700194 667 665 0 True 606 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 650 352 0,0102147369894819 0,0705068920871646 0,0102235446707866 0,0675669489585718 0,00198500725627696 0,0239225353256535 446505 3072745 667 665 0 True 650 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 254 398 0,0107722975317102 0,0490350619051635 0,0107881284809644 0,0494850080109865 0,0015334505830078 0,0135756166064615 470877 2136986 667 665 0 True 251 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 298 398 0,0107321482312174 0,0352735581228191 0,010757610437171 0,0341496910048066 0,00143756765406863 0,00616194035041762 469122 1537249 667 665 0 True 296 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 341 397 0,0107189710249018 0,0942517887761289 0,0107270923933776 0,0888380254825666 0,00139131166092784 0,0296886244684416 468546 4107566 667 665 0 True 340 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 387 397 0,0109262146221465 0,0714320706779538 0,0108949416342412 0,0700541695277333 0,00151875412697661 0,0200074609706749 477605 3113065 667 665 0 True 384 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 431 397 0,0110143600664763 0,0475758863856827 0,0111238269626917 0,0480659189745937 0,00168507619243493 0,0104343609563356 481458 2073394 667 665 0 True 429 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 475 398 0,0108428047363363 0,0601172650096287 0,0108491645685512 0,0577096208133059 0,00168534675467011 0,0158767160901157 473959 2619957 667 665 0 True 473 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 519 397 0,0107556201299671 0,0456608217729033 0,0109102006561379 0,0454413672083619 0,00178674845037914 0,00777535901373639 470148 1989934 667 665 0 True 517 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 563 398 0,0107198632315794 0,0556192954347416 0,0106202792401007 0,0558327611200122 0,00181100757822715 0,00932500670341311 468585 2423932 667 665 0 True 561 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 606 397 0,0102843748645247 0,0486125132010617 0,0101930266269932 0,0465552758068208 0,00189988255573877 0,0135628608129453 449549 2118571 667 665 0 True 606 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 651 397 0,0102511115694156 0,0895126807634788 0,0103150988021668 0,0821850919356069 0,00204129894453586 0,0204308586061664 448095 3901032 667 665 0 True 650 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 255 443 0,0106621214455716 0,0444155938025425 0,0106813153276875 0,0443732356755932 0,00158909799422056 0,00812193626694899 466061 1935666 667 665 0 True 251 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 298 442 0,0108148031729157 0,0575799764919279 0,0107881284809644 0,0573891813534752 0,00150146940694875 0,00914700687814956 472735 2509380 667 665 0 True 296 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 342 442 0,0109412677501945 0,0421140055448762 0,0109102006561379 0,040360112916762 0,00149131385289267 0,009887409086833 478263 1835361 667 665 0 True 340 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 387 441 0,0109425717445695 0,0555696405123589 0,0109864957656214 0,0558327611200122 0,00150491211757664 0,0114518597991335 478320 2421768 667 665 0 True 384 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 431 441 0,0112029359547738 0,0974942047267402 0,0112458991378653 0,095201037613489 0,00176204239592986 0,0166492890731188 489701 4248873 667 665 0 True 428 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 475 442 0,0111967133851248 0,0697462126361911 0,0111848630502785 0,0644998855573358 0,00189293876573317 0,0208206744602242 489429 3039594 667 665 0 True 473 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 519 442 0,0109073410193507 0,0587982430326216 0,0108644235904479 0,0556496528572518 0,00182705789578539 0,0131179247854025 476780 2562473 667 665 0 True 517 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 564 442 0,0107683855485853 0,0330855750041159 0,0107423514152743 0,0333714808880751 0,00191499664386195 0,0051350444458124 470706 1441895 667 665 0 True 561 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 607 442 0,0104401449995991 0,0417703448366854 0,0104219119554437 0,0417029068436713 0,00190542355034339 0,006193187587435 456358 1820384 667 665 0 True 606 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 651 441 0,0103877106994683 0,0709110611272975 0,0103456168459602 0,0698558022430762 0,00185472278781124 0,0113188202915831 454066 3090359 667 665 0 True 650 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 253 487 0,0106274626477102 0,0561191718137183 0,0105897611963073 0,0558022430762188 0,00149889867403045 0,0162047539348706 464546 2445717 667 665 0 True 251 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 297 486 0,010870348757871 0,0545343675049377 0,0108949416342412 0,0553597314412146 0,00162756408558544 0,0106473984243339 475163 2376650 667 665 0 True 296 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 342 486 0,0106665367247711 0,0708911440881903 0,010605020218204 0,0682230869001297 0,00156919850205036 0,019645652266157 466254 3089491 667 665 0 True 340 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 386 486 0,0112423531882491 0,0944931337269702 0,0113374532692454 0,0874341954680705 0,0015638022315499 0,0284418409121524 491424 4118084 667 665 0 True 384 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 430 486 0,0113031833819872 0,101738759808654 0,0113374532692454 0,0968337529564355 0,00190680871499486 0,0360012262015605 494083 4433854 667 665 0 True 428 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 474 486 0,0111088195888323 0,0550656109259186 0,0110475318532082 0,0536202029449912 0,00194492627446502 0,014735664756277 485587 2399802 667 665 0 True 473 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 516 485 0,0107795495706027 0,0410222626834883 0,0108033875028611 0,0427557793545434 0,00184747108915612 0,00661139983880285 471194 1787782 667 665 0 True 517 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 562 486 0,0107097515558998 0,10886892213367 0,0107423514152743 0,108171206225681 0,00189834456394187 0,0224892417382643 468143 4744592 667 665 0 True 561 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 606 486 0,0105049329306507 0,0627878691923216 0,0105287251087205 0,0672770275425345 0,0018184686370015 0,0157388352681874 459190 2736344 667 665 0 True 606 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 650 486 0,0102463531338016 0,0762644537643032 0,0102998397802701 0,0735179674982834 0,0019808450462996 0,0154120388346799 447887 3323664 667 665 0 True 650 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 253 531 0,010473316786331 0,0542267548018593 0,0104676890211337 0,0563820859082933 0,00145436328451432 0,0134935109327246 457808 2363244 667 665 0 True 251 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 296 530 0,0108178687035516 0,104804790644499 0,0107728694590677 0,101365682459754 0,00156959464324225 0,0316769543441681 472869 4567474 667 665 0 True 296 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 341 530 0,010818738033135 0,057784034359187 0,0108491645685512 0,0602273594262608 0,00153949968531416 0,0146204212922567 472907 2518273 667 665 0 True 340 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 386 530 0,0111130289741831 0,0649931305719093 0,0110627908751049 0,0602426184481575 0,0015382581817879 0,0162121336369271 485771 2832451 667 665 0 True 384 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 429 529 0,011160407436474 0,06016464828815 0,0111696040283818 0,0599526970321202 0,00185330025677625 0,0130521508102317 487842 2622022 667 665 0 True 428 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 473 530 0,0109321397895696 0,0613682753461819 0,0108949416342412 0,061875333791104 0,00193738657865603 0,0139477153787743 477864 2674477 667 665 0 True 473 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 518 530 0,0108626849312812 0,0731901853512242 0,0108796826123445 0,0710612649729152 0,00195381556560924 0,018404928919076 474828 3189685 667 665 0 True 517 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 561 530 0,0106687100487294 0,0578106745462879 0,0107270923933776 0,0590371557183185 0,00173297851581454 0,0144969678410943 466349 2519434 667 665 0 True 561 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 606 530 0,010599644101044 0,0457596268079216 0,0104371709773404 0,0445563439383536 0,00207762333285145 0,00962405250256099 463330 1994240 667 665 0 True 606 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 650 529 0,010329396986103 0,067920407565033 0,0103608758678569 0,0676585030899519 0,00192885918699742 0,0177798751683281 451517 2960024 667 665 0 True 650 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 251 567 0,0135994259679499 0,0343454195112409 0,010955977721828 0,0384985122453651 0,00754609271466266 0,0187871287884157 594456 1496800 667 665 0 False 251 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 296 567 0,0151064316777295 0,0404219062189693 0,0113374532692454 0,044281681544213 0,0112357792926569 0,0225440239588685 660330 1761618 667 665 0 False 296 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 340 567 0,0139484617956529 0,0393992764011195 0,0112153810940719 0,0440527962157626 0,00794618123936798 0,0208081984352501 609713 1717051 667 665 0 False 340 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 384 567 0,014795371826561 0,0407009971713445 0,0114137483787289 0,0451209277485313 0,00930609528630735 0,0219692700065297 646733 1773781 667 665 0 False 384 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 428 567 0,0175628825550603 0,0643156988373887 0,0117494468604562 0,0738231479362173 0,0166202668475111 0,0426525045938035 767706 2802928 667 665 0 False 428 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 473 567 0,0152591134050736 0,0497347511603454 0,0117494468604562 0,0548714427405203 0,0108722899164932 0,029457703172266 667004 2167479 667 665 0 False 473 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 519 574 0,0105093253327559 0,0557373291319395 0,0105287251087205 0,055191882200351 0,00199311707199806 0,00895279780371584 459382 2429076 667 665 0 True 517 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 561 567 0,0122655083536282 0,0299514407442272 0,0110322728313115 0,034882124055848 0,00476942702901607 0,0140891008864689 536148 1305307 667 665 0 False 561 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 607 574 0,010410496285389 0,0499034264535222 0,0104219119554437 0,0503547722590982 0,00163763768930631 0,00843213983320199 455062 2174830 667 665 0 True 605 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 651 574 0,0100882037809203 0,055430840777843 0,0100404364080262 0,0544136720836194 0,00172032490441929 0,00990109252382306 440974 2415719 667 665 0 True 650 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 251 611 0,0112960457285663 0,0102752876698498 0,0103608758678569 0,0103303578240635 0,00466063952688938 0,00123854767274426 493771 447805 667 665 0 False 251 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 296 611 0,0113694583241682 0,0102060598968238 0,0105745021744106 0,0101777676050965 0,00448179412752631 0,00143814824135619 496980 444788 667 665 0 False 296 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 340 611 0,0174295777265865 0,0549484032810339 0,0112458991378653 0,0674143587396048 0,0164075574227677 0,0334320937082813 761879 2394694 667 665 0 False 340 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 384 611 0,0168598008160031 0,0564456001528197 0,0114747844663157 0,0624399176012818 0,0133430779692983 0,0371316831529191 736973 2459943 667 665 0 False 384 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 428 611 0,0127085232847069 0,0105471506644845 0,0108186465247578 0,0105439841306172 0,00875120257130924 0,00185129590216948 555513 459653 667 665 0 False 428 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 473 611 0,0116263452160393 0,0105642683040859 0,0105592431525139 0,0105439841306172 0,00561431809994289 0,00190135694889433 508209 460399 667 665 0 False 473 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 517 611 0,0111300037781521 0,0102964667333245 0,0103761348897536 0,0102845807583734 0,00475321844125374 0,0020512490579764 486513 448728 667 665 0 False 517 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 561 611 0,010419784385674 0,0102171198194617 0,0101167315175097 0,0102388036926833 0,00239601386996797 0,00179766719063142 455468 445270 667 665 0 False 561 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 605 611 0,0107606759678069 0,0102515845576404 0,01025406271458 0,0102845807583734 0,0032688241976425 0,00145006682617979 470369 446772 667 665 0 False 605 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 650 611 0,0110209486696341 0,0100576687771156 0,0103456168459602 0,010101472495613 0,00428081918520688 0,00160937768516399 481746 438321 667 665 0 False 650 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 251 654 0,0120282957628533 0,0341264927023441 0,0103761348897536 0,0397955291065843 0,00598608298521669 0,0169826473581369 525779 1487259 667 665 0 False 251 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 296 654 0,0101056818809638 0,0102472248370985 0,010101472495613 0,0102388036926833 0,0013318315069944 0,00120006758685277 441738 446582 667 665 0 False 296 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 340 654 0,014049921708864 0,0102349028900932 0,01025406271458 0,01025406271458 0,0135844668247603 0,00127000765675584 614148 446045 667 665 0 False 340 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 384 654 0,0129283264067211 0,0100880491455235 0,010406652933547 0,0101625085831998 0,00966318375467142 0,00122752837319389 565121 439645 667 665 0 False 384 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 428 654 0,0102292181901725 0,0101852709136081 0,0102388036926833 0,0102235446707866 0,00155944019650871 0,00146552328346669 447138 443882 667 665 0 False 428 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 473 654 0,0101003057638038 0,0100750847133857 0,0100709544518196 0,010101472495613 0,00163497093101221 0,00158016352222451 441503 439080 667 665 0 False 473 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 517 654 0,0101649106781011 0,0100387384116047 0,0101777676050965 0,0100556954299229 0,00168756739329896 0,0017155195845814 444327 437496 667 665 0 False 517 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 561 654 0,0101829149513135 0,0100019102459743 0,0101319905394064 0,00996414129854276 0,00153852107402814 0,00161925763607505 445114 435891 667 665 0 False 561 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 605 654 0,0100651207927737 0,0100670995410247 0,0100404364080262 0,0101167315175097 0,00137282759133253 0,00136460926069095 439965 438732 667 665 0 False 605 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 649 659 0,010150543862882 0,0451770075222389 0,0101472495613031 0,0450904097047379 0,00138218161681515 0,00836930919098107 443699 1968849 667 665 0 True 650 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A11_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A11_2.csv new file mode 100755 index 0000000..1d505b2 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A11_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 252 263 0,00840092656807325 0,757167030645967 0,00822461280231937 0,786007476920729 0,0021255214709726 0,192128804510667 367220 32997926 667 665 14 True 252 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 296 263 0,00700794029627439 0,00694191418119572 0,00695811398489357 0,00691233691920348 0,00141570251017565 0,00124894849061678 306330 302534 667 665 0 False 296 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 341 264 0,00647774075882636 0,0065452025577792 0,00650034332799268 0,00657663843747616 0,00123400039124738 0,00120168855244116 283154 285245 667 665 0 True 340 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 385 263 0,0202663000791011 0,00686513720786287 0,00674448767833982 0,00691233691920348 0,0951202414106516 0,00123211375397435 873924 299188 658 665 0 True 384 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 429 263 0,0277296826181157 0,00807257328489455 0,00717174029144732 0,00741588464179446 0,120917589207648 0,00447593233548017 1201212 351809 661 665 0 True 429 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 473 262 0,00701823498870844 0,00913898387534412 0,00695811398489357 0,0072327763790341 0,00163870825618732 0,00968385043127473 306780 398284 667 665 0 True 473 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 517 263 0,00718754836360716 0,00718392456306709 0,0072632944228275 0,00715648126955062 0,00148806296115438 0,00156414608606293 314181 313081 667 665 0 True 517 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 562 264 0,00729280587447178 0,00751615821425847 0,00733958953231098 0,00746166170748455 0,0016160421895234 0,00135281917295399 318782 327560 667 665 0 True 561 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 606 264 0,00834215531282196 0,00810357319253731 0,00828564888990616 0,00819409475852598 0,00212904862050576 0,00188869093089422 364651 353160 667 665 0 False 606 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 647 261 0,00959273167261643 0,766332585870719 0,00952162966353857 0,778362706950484 0,00197481120943521 0,180574255453528 419316 33397368 667 665 16 True 650 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 251 307 0,00695962387311723 0,00680807076055899 0,00695811398489357 0,0068207827878233 0,00145165523660124 0,00138349691573052 304218 296701 667 665 0 False 251 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 296 307 0,0066360273742735 0,006456218366929 0,00668345159075303 0,00642404821850919 0,00126508257122577 0,00126168807257161 290073 281367 667 665 0 False 296 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 341 308 0,00666297659135642 0,00675251874249597 0,00666819256885634 0,00675974670023652 0,00146051968601173 0,00127938590564189 291251 294280 667 665 0 True 340 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 386 309 0,00672593435486423 0,00686610093556161 0,00679026474402991 0,00689707789730678 0,00130689363789812 0,00123963204977657 294003 299230 667 665 0 True 384 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 430 308 0,00700915278227217 0,00704533134162942 0,00698863202868696 0,00695811398489357 0,00151584092403644 0,00174289981445452 306383 307041 667 665 0 True 429 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 475 309 0,00776761996662461 0,0072204544320288 0,00715648126955062 0,00733958953231098 0,00429261565646667 0,00161340686024269 339537 314673 667 665 0 True 473 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 518 307 0,00718647314017516 0,00707112253051948 0,0072632944228275 0,00700389105058366 0,00160913204837615 0,0015468582325738 314134 308165 667 665 0 True 517 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 563 309 0,00744322276948045 0,00748141812530869 0,00744640268558785 0,00753795681696803 0,00163858708777237 0,0014190662422459 325357 326046 667 665 0 True 561 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 606 307 0,00768608600254691 0,00768701336770629 0,00776684214541848 0,0076752880140383 0,0019736739362997 0,0019843057290984 335973 335006 667 665 0 False 606 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 650 307 0,00791549750416621 0,00802973329409585 0,00788891432059205 0,00802624551766232 0,00191583746978755 0,00195474775090063 346001 349942 667 665 0 False 650 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 253 354 0,00645204978192982 0,00634075461026106 0,00653086137178607 0,0064087891966125 0,00142280144496812 0,00146379862286619 282031 276335 667 665 0 True 251 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 297 354 0,0065424829356894 0,00676472596001333 0,00654612039368277 0,00675974670023652 0,00132582250156468 0,0013229135739834 285984 294812 667 665 0 True 296 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 342 353 0,00682936169818501 0,00717059299656787 0,0068055237659266 0,00704966811627375 0,00124318178003186 0,00168136551292629 298524 312500 667 665 0 True 340 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 386 354 0,00713708149358601 0,00715765151032766 0,00709544518196384 0,00717174029144732 0,00127018258214868 0,00130705961043892 311975 311936 667 665 0 True 384 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 430 352 0,00716025599010977 0,00742809185931182 0,00712596322575723 0,00743114366369116 0,00151240704607071 0,00157088412367908 312988 323722 667 665 0 True 429 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 474 353 0,00722657668647937 0,00745280459101519 0,0072480354009308 0,00750743877317464 0,00163249274578415 0,00154598626280783 315887 324799 667 665 0 True 473 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 519 353 0,00723293651869419 0,00734397219875048 0,00718699931334401 0,00735484855420768 0,00171637967109885 0,00161333858389418 316165 320056 667 665 0 True 517 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 563 353 0,00736573805109347 0,00763173670041435 0,00741588464179446 0,00772106507972839 0,00167963923095234 0,00174859194826817 321970 332597 667 665 0 True 561 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 607 353 0,00750123908061991 0,00754920030678665 0,00750743877317464 0,00752269779507134 0,00194965548447063 0,00203803215964213 327893 329000 667 665 0 True 606 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 650 352 0,00718237814029584 0,0072248370984683 0,00720225833524071 0,00727855344472419 0,00188353609747034 0,00186996877500258 313955 314864 667 665 0 True 650 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 254 398 0,00637310092950778 0,00669331832671631 0,00634775310902571 0,00669871061264973 0,00144221463322384 0,0015165053584988 278580 291700 667 665 0 True 251 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 298 398 0,00673963773434866 0,00706745118690524 0,00675974670023652 0,00708018616006714 0,00129458956650254 0,00137536712530518 294602 308005 667 665 0 True 296 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 341 397 0,0070654075571507 0,00718605853154286 0,00706492713817044 0,00720225833524071 0,00135916002381913 0,00136337158615037 308842 313174 667 665 0 True 340 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 387 397 0,00731579735424117 0,00721666835892661 0,00729381246662089 0,00721751735713741 0,00140916818296321 0,00136108640423487 319787 314508 667 665 0 True 384 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 431 397 0,00737431696145518 0,00749952243850643 0,00727855344472419 0,00755321583886473 0,00169514453035218 0,00163258742152979 322345 326835 667 665 0 True 429 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 475 398 0,00751690989021397 0,00742322732902295 0,00750743877317464 0,00740062561989776 0,00164138349463612 0,00174025416134794 328578 323510 667 665 0 True 473 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 519 397 0,00746934841116864 0,00750404278033147 0,00752269779507134 0,00744640268558785 0,00157326449826261 0,00167640543985 326499 327032 667 665 0 True 517 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 563 398 0,00733037006330893 0,00725067417915354 0,00740062561989776 0,0072327763790341 0,00169344539683662 0,00147670010682392 320424 315990 667 665 0 True 561 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 606 397 0,00684077736823966 0,00712777595166676 0,00691233691920348 0,00708018616006714 0,00186960626342277 0,00197957131757075 299023 310634 667 665 0 True 606 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 651 397 0,0065088078528829 0,00646709472238619 0,00650034332799268 0,0063782711528191 0,00186901783374323 0,00172136556142377 284512 281841 667 665 0 True 650 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 255 443 0,00659283542023907 0,00663042362142481 0,00654612039368277 0,00660715648126955 0,0015528086933581 0,00147451698264678 288185 288959 667 665 0 True 251 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 298 442 0,00685349703266929 0,00683778569793676 0,00686655985351339 0,0068207827878233 0,00147215555055203 0,00141640111934522 299579 297996 667 665 0 True 296 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 342 442 0,00708194769632808 0,00709996552378887 0,00706492713817044 0,00709544518196384 0,00139529329590423 0,00142501319897453 309565 309422 667 665 0 True 340 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 387 441 0,00712790777877255 0,00746609026571923 0,00709544518196384 0,00744640268558785 0,00138586095302629 0,00131522578279516 311574 325378 667 665 0 True 384 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 431 441 0,00729294313703757 0,00756657035126154 0,00727855344472419 0,00759899290455482 0,00159406321755484 0,00179029311692098 318788 329757 667 665 0 True 428 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 475 442 0,00740188386008415 0,00753756673670902 0,00744640268558785 0,00753795681696803 0,00169013334230905 0,0018276377477525 323550 328493 667 665 0 True 473 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 519 442 0,00742778073082937 0,007557667342997 0,00738536659800107 0,00750743877317464 0,00168728564664909 0,00167233153930612 324682 329369 667 665 0 True 517 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 564 442 0,00691368666776705 0,00663476039606914 0,00703440909437705 0,00668345159075303 0,00178523720121796 0,00175980049570452 302210 289148 667 665 0 True 561 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 607 442 0,00632949718777599 0,00625730038072981 0,00633249408712902 0,00628671702143893 0,00171776316844953 0,00172206378879705 276674 272698 667 665 0 True 606 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 651 441 0,00614833347803095 0,00626175188486207 0,00619516289005875 0,00628671702143893 0,00172241521275677 0,0019063253253794 268755 272892 667 665 0 True 650 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 253 487 0,00689408099795376 0,00674646102553247 0,00688181887541009 0,00675974670023652 0,00137833058506229 0,00142186325673091 301353 294016 667 665 0 True 251 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 297 486 0,00685523569183593 0,00689145615239747 0,00688181887541009 0,00691233691920348 0,00148251781405085 0,00148307224425715 299655 300335 667 665 0 True 296 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 342 486 0,00697927529711912 0,00715751383494213 0,00694285496299687 0,00717174029144732 0,0014388524221179 0,00140574144767494 305077 311930 667 665 0 True 340 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 386 486 0,00713445062774175 0,00728511597143465 0,00712596322575723 0,0072327763790341 0,00151002092612049 0,00153536271169601 311860 317491 667 665 0 True 384 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 430 486 0,00744024874722172 0,0073894739136695 0,00752269779507134 0,00744640268558785 0,00178711696957926 0,0019036890424342 325227 322039 667 665 0 True 428 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 474 486 0,00728745263440607 0,00743536570884754 0,00732433051041428 0,00750743877317464 0,00186810441934404 0,00177392598952652 318548 324039 667 665 0 True 473 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 516 485 0,00678349312411773 0,00661931780699173 0,00675974670023652 0,00657663843747616 0,00171177600022848 0,0016312713209962 296519 288475 667 665 0 True 517 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 562 486 0,00631458132229376 0,0062625320453801 0,00636301213092241 0,00624093995574884 0,00176902188466935 0,00177273129542431 276022 272926 667 665 0 True 561 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 606 486 0,00612538775245017 0,00599078378023337 0,00613412680247196 0,00592050049591821 0,00175175838576978 0,00158064488566667 267752 261083 667 665 0 True 606 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 650 486 0,00601395342612512 0,00601290362550918 0,00605783169298848 0,00604257267109178 0,00178834852303101 0,00170632643456632 262881 262047 667 665 0 True 650 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 253 531 0,00682611315079471 0,00692006968669098 0,00677500572213321 0,00694285496299687 0,00131793263591924 0,00142051531015694 298382 301582 667 665 0 True 251 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 296 530 0,00688154435027851 0,00703709376439497 0,00692759594110018 0,00701915007248035 0,00140571707427559 0,00146166840134468 300805 306682 667 665 0 True 296 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 341 530 0,00693153080131941 0,00703808043799129 0,00701915007248035 0,00692759594110018 0,00144830860235027 0,00148440373186485 302990 306725 667 665 0 True 340 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 386 530 0,00715153981718228 0,00731226096828246 0,00709544518196384 0,00735484855420768 0,00141094516713093 0,00152221629190866 312607 318674 667 665 0 True 384 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 429 529 0,00694868862204284 0,00706701521485104 0,00697337300679027 0,00703440909437705 0,00182330922087392 0,00191619698411208 303740 307986 667 665 0 True 428 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 473 530 0,00671403826582932 0,00670703997347454 0,00665293354695964 0,00674448767833982 0,00180860392828379 0,00166727955822572 293483 292298 667 665 0 True 473 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 518 530 0,00642429986654647 0,00631939197960569 0,00645456626230259 0,0063935301747158 0,00172785924505105 0,0017474187555943 280818 275404 667 665 0 True 517 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 561 530 0,00610564482007108 0,00638646283825838 0,00613412680247196 0,00642404821850919 0,001618876572728 0,00169206896525256 266889 278327 667 665 0 True 561 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 606 530 0,00615352657843658 0,00620723243219057 0,00619516289005875 0,00624093995574884 0,0016946344296465 0,00170103473146702 268982 270516 667 665 0 True 606 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 650 529 0,0060140906886909 0,00621760397790081 0,00614938582436866 0,00622568093385214 0,00185533240087341 0,00196963941915151 262887 270968 667 665 0 True 650 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 251 567 0,00682199527382109 0,00690517779915571 0,00683604180972 0,00691233691920348 0,00126416538009627 0,0012116426613648 298202 300933 667 665 0 False 251 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 296 567 0,00702226135730487 0,00695258402357461 0,00701915007248035 0,00697337300679027 0,00133911950069864 0,00136514567793955 306956 302999 667 665 0 False 296 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 340 567 0,00703443197147135 0,00696499775417027 0,00704966811627375 0,00698863202868696 0,00129996035986226 0,00130404352220582 307488 303540 667 665 0 False 340 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 384 567 0,00681867809514789 0,0069112584620168 0,0068055237659266 0,00689707789730678 0,00135684227646568 0,00127951040506554 298057 301198 667 665 0 False 384 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 428 567 0,00661472879948215 0,00684492187208695 0,00659189745937285 0,00683604180972 0,00174248583093032 0,00193191943822591 289142 298307 667 665 0 False 428 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 473 567 0,00655474505823307 0,00669694377853537 0,00662241550316625 0,00663767452506294 0,00200162439289909 0,00177345962492994 286520 291858 667 665 0 False 473 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 519 574 0,00630042040092337 0,00646876977291019 0,00628671702143893 0,00645456626230259 0,00186353494374763 0,00192410626621312 275403 281914 667 665 0 True 517 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 561 567 0,00627022263645014 0,00635493517497107 0,00621042191195544 0,00636301213092241 0,00165897980011146 0,00172523949598391 274083 276953 667 665 0 False 561 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 607 574 0,00633748129368596 0,00638042806719247 0,0063782711528191 0,0063782711528191 0,00143788559944878 0,00149619484266504 277023 278064 667 665 0 True 605 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 651 574 0,00629250492629629 0,00624975118042302 0,00634775310902571 0,00636301213092241 0,00167399905578465 0,00148090191810705 275057 272369 667 665 0 True 650 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 251 611 0,00720067981573416 0,00728162819500112 0,00720225833524071 0,00738536659800107 0,00137486239916181 0,00123612240664758 314755 317339 667 665 0 False 251 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 296 611 0,0068740177862545 0,00700827371702316 0,00685130083161669 0,00697337300679027 0,00133972601800975 0,00139264247691106 300476 305426 667 665 0 False 296 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 340 611 0,00670301150637773 0,00673441442929824 0,00668345159075303 0,00672922865644312 0,00142200717169104 0,00142272416662329 293001 293491 667 665 0 False 340 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 384 611 0,00645278184894735 0,00650747950214286 0,00643930724040589 0,00657663843747616 0,00129854037200576 0,00119527300980574 282063 283601 667 665 0 False 384 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 428 611 0,00633956310926707 0,00641906895873238 0,00636301213092241 0,00642404821850919 0,00168890081146243 0,0017022524503601 277114 279748 667 665 0 False 428 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 473 611 0,00654163648320038 0,006421937195931 0,00653086137178607 0,00656137941557946 0,00173832827939213 0,00185219686948172 285947 279873 667 665 0 False 473 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 517 611 0,00631140140618636 0,00629038836505317 0,00636301213092241 0,00621042191195544 0,00188871522417243 0,00192998738491449 275883 274140 667 665 0 False 517 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 561 611 0,00629257355757919 0,00624552913526664 0,00625619897764553 0,00617990386816205 0,00168893511112022 0,00178261797167268 275060 272185 667 665 0 False 561 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 605 611 0,00622604696736091 0,00632074578756344 0,00622568093385214 0,00636301213092241 0,00139006356391854 0,00139205273951408 272152 275463 667 665 0 False 605 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 650 611 0,00660196338086393 0,00638692175621016 0,00657663843747616 0,00636301213092241 0,0015662759421353 0,00155392965379887 288584 278347 667 665 0 False 650 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 251 654 0,0505158270029554 0,540852726919152 0,00874341954680705 0,632089723048753 0,121095029104907 0,377726793612604 2208140 23570781 667 665 14 False 251 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 296 654 0,00713021836529664 0,00676532255335065 0,00704966811627375 0,00669871061264973 0,00159294645367331 0,00121269010926465 311675 294838 667 665 0 False 296 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 340 654 0,00624652196675752 0,00633412324585783 0,00625619897764553 0,0064087891966125 0,00128133355432345 0,00122128428701623 273047 276046 667 665 0 False 340 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 384 654 0,00645687684882667 0,00620854034835314 0,00646982528419928 0,00610360875867857 0,00134391829510219 0,00116116230227897 282242 270573 667 665 0 False 384 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 428 654 0,0061837243429098 0,00632283386424404 0,00619516289005875 0,00628671702143893 0,00145075965010444 0,00145005885945719 270302 275554 667 665 0 False 428 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 473 654 0,00629447235640591 0,00632783606991845 0,00630197604333562 0,00642404821850919 0,00158217894157608 0,00150090683956767 275143 275772 667 665 0 False 473 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 517 654 0,00635125330445329 0,0061990178008537 0,00631723506523232 0,00625619897764553 0,0016736694251768 0,00165215578955086 277625 270158 667 665 0 False 517 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 561 654 0,00625807489937796 0,00633061252352672 0,00630197604333562 0,00631723506523232 0,00156733425516339 0,0015827413381247 273552 275893 667 665 0 False 561 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 605 654 0,00672737561180499 0,00649201396716786 0,00662241550316625 0,00656137941557946 0,00143374085484579 0,00133248749967633 294066 282927 667 665 0 False 605 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 649 659 0,0082689028568801 0,761188826954087 0,00817883573662928 0,780148012512398 0,00173289258560895 0,189824556724645 361449 33173199 667 665 15 True 650 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A11_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A11_3.csv new file mode 100755 index 0000000..63edc99 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A11_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 252 263 0,00106184033183683 0,0771919269448512 0,000854505226215 0,0774395361257343 0,000816336476573083 0,0228757474968077 46415 3364084 667 665 0 True 252 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 296 263 0,000847847991774312 0,000937225187023407 0,000747692072938125 0,000793469138628214 0,000616958443849739 0,00064332566455499 37061 40845 667 665 0 False 296 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 341 264 0,000934163268560272 0,000891516959026084 0,000854505226215 0,000778210116731518 0,000641788075780553 0,000648683960629533 40834 38853 667 665 0 True 340 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 385 263 0,00422285995935427 0,000930089012873222 0,000961318379491875 0,00080872816052491 0,0186276597776526 0,000648963761645022 184589 40534 667 665 0 True 384 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 429 263 0,0041747036758572 0,00108676360161103 0,000823987182421607 0,000854505226215 0,0171668711033005 0,000947352789559785 182484 47362 667 665 0 True 429 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 473 262 0,000968158630686945 0,00113685449604786 0,000732433051041428 0,000839246204318303 0,000864425924194484 0,00121490058690735 42320 49545 667 665 0 True 473 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 517 263 0,000936428100895764 0,00100190967232685 0,000732433051041428 0,000778210116731518 0,000855871300335227 0,000835457041297304 40933 43664 667 665 0 True 517 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 562 264 0,000970789496531203 0,000977954155243912 0,00080872816052491 0,000793469138628214 0,000813676066527674 0,000802276620573899 42435 42620 667 665 0 True 561 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 606 264 0,00104603225967698 0,00102288222272321 0,000762951094834821 0,000671396963454643 0,000994207170388111 0,000993038272757976 45724 44578 667 665 0 False 606 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 647 261 0,00110144058206649 0,0783387858522479 0,000854505226215 0,0769817654688335 0,000911330956765457 0,0221939461528459 48146 3414065 667 665 0 True 650 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 251 307 0,000955988016520465 0,000954296934829635 0,000793469138628214 0,000747692072938125 0,000770516016553435 0,000769633777071363 41788 41589 667 665 0 False 251 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 296 307 0,00091265879992025 0,0008783230679124 0,00080872816052491 0,000762951094834821 0,000678210492285091 0,00065178318944431 39894 38278 667 665 0 False 296 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 341 308 0,000899481593604663 0,00083791534225814 0,000793469138628214 0,000717174029144732 0,000641613061813696 0,000652449813370616 39318 36517 667 665 0 True 340 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 386 309 0,000967426563669413 0,00092242508307849 0,000823987182421607 0,00080872816052491 0,000695794089931113 0,000664310655465263 42288 40200 667 665 0 True 384 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 430 308 0,000920848799678897 0,000990184318658858 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000808053718165838 0,000877048895156011 40252 43153 667 665 0 True 429 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 475 309 0,0010816976496874 0,000939886911143733 0,000854505226215 0,000701915007248035 0,000961546903598861 0,000874258323589638 47283 40961 667 665 0 True 473 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 518 307 0,000889644443056567 0,00099059734481546 0,000732433051041428 0,000793469138628214 0,000783221519442989 0,000895758873027432 38888 43171 667 665 0 True 517 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 563 309 0,000902913157749347 0,00102717310557235 0,000656137941557946 0,000854505226215 0,000884793911699549 0,000793805243422421 39468 44765 667 665 0 True 561 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 606 307 0,000989159803252414 0,000893880386477753 0,00064087891966125 0,000457770656900893 0,00103607798556529 0,000980853177682974 43238 38956 667 665 0 False 606 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 650 307 0,000986460306125262 0,00105980217194394 0,000671396963454643 0,000717174029144732 0,000956953689668156 0,00102334953530545 43120 46187 667 665 0 False 650 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 253 354 0,000884771621971116 0,000931947630577933 0,000732433051041428 0,000717174029144732 0,000722750862321344 0,000817236003385188 38675 40615 667 665 0 True 251 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 297 354 0,000839337712695495 0,000867607333738328 0,000686655985351339 0,000778210116731518 0,000690404959982129 0,000625590714598231 36689 37811 667 665 0 True 296 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 342 353 0,000922038408582388 0,000959276194606452 0,000823987182421607 0,000793469138628214 0,000666481471512314 0,00074291909768066 40304 41806 667 665 0 True 340 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 386 354 0,00100750723287933 0,000996953358447618 0,000930800335698482 0,000854505226215 0,000695420068621573 0,000686401294628803 44040 43448 667 665 0 True 384 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 430 352 0,000997875976179912 0,000927496126445663 0,000732433051041428 0,00064087891966125 0,000832627867069582 0,000850776334595921 43619 40421 667 665 0 True 429 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 474 353 0,000958893407496298 0,000947367273757752 0,000701915007248035 0,000686655985351339 0,000864855128256238 0,000849550551592486 41915 41287 667 665 0 True 473 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 519 353 0,000946860055895605 0,000944499036559125 0,000701915007248035 0,00064087891966125 0,000898638713233942 0,000891163938492554 41389 41162 667 665 0 True 517 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 563 353 0,00102564876865756 0,000979147341918541 0,000747692072938125 0,000701915007248035 0,00097099676589358 0,000898932554644375 44833 42672 667 665 0 True 561 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 607 353 0,000972093490906183 0,00100459434234476 0,000518806744487678 0,000549324788281071 0,00108830593872154 0,00110809599993429 42492 43781 667 665 0 True 606 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 650 352 0,000890147739131121 0,000909690109916586 0,000442511635004196 0,000503547722590982 0,000993773765039337 0,000994914203004544 38910 39645 667 665 0 True 650 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 254 398 0,000967472317858009 0,000884679081544557 0,000823987182421607 0,000732433051041428 0,000798652023861967 0,000776551218752672 42290 38555 667 665 0 True 251 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 298 398 0,000792348161007617 0,000908726382217847 0,000656137941557946 0,000747692072938125 0,000645289209709483 0,000739510259836323 34635 39603 667 665 0 True 296 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 341 397 0,000834007349724085 0,000937477591896886 0,000762951094834821 0,000823987182421607 0,000638789443243092 0,000691619007262685 36456 40856 667 665 0 True 340 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 387 397 0,000930342793812524 0,000941952041926744 0,000793469138628214 0,000823987182421607 0,000712265524893929 0,00070344294222356 40667 41051 667 665 0 True 384 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 431 397 0,000997692959425529 0,000934907651366916 0,000793469138628214 0,000732433051041428 0,000827510716634132 0,000793787408980793 43611 40744 667 665 0 True 429 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 475 398 0,00092201553148809 0,000990803857893762 0,000656137941557946 0,000701915007248035 0,000861985350265537 0,000875065693296225 40303 43180 667 665 0 True 473 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 519 397 0,000940179944360619 0,00102400657170507 0,000671396963454643 0,000762951094834821 0,000883240211216912 0,000951334458394752 41097 44627 667 665 0 True 517 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 563 398 0,00103953516489638 0,000954503447907936 0,000823987182421607 0,000762951094834821 0,000937926168273597 0,00080526312729822 45440 41598 667 665 0 True 561 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 606 397 0,000862626594690753 0,000872334188641666 0,000457770656900893 0,000381475547417411 0,000967853730799229 0,00101687112762312 37707 38017 667 665 0 True 606 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 651 397 0,000921969777299494 0,000849686587721306 0,000534065766384375 0,000534065766384375 0,00100020189840252 0,00089075064461436 40301 37030 667 665 0 True 650 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 255 443 0,00098028349066483 0,000967559663636087 0,000823987182421607 0,000778210116731518 0,000811150724282869 0,000847791917754229 42850 42167 667 665 0 True 251 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 298 442 0,000903553716389688 0,000993672095092389 0,000778210116731518 0,000854505226215 0,000768760427394162 0,000767805317160993 39496 43305 667 665 0 True 296 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 342 442 0,000794887518474683 0,000967513771840909 0,000671396963454643 0,000839246204318303 0,000653376033829573 0,000727344420722154 34746 42165 667 665 0 True 340 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 387 441 0,00086232919246488 0,000922769271542326 0,000701915007248035 0,000793469138628214 0,000779151913051572 0,000712081681722746 37694 40215 667 665 0 True 384 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 431 441 0,000940271452737811 0,00101044554622996 0,000701915007248035 0,000762951094834821 0,000871533223480011 0,000936958606766885 41101 44036 667 665 0 True 428 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 475 442 0,000909936425698801 0,000960744732052149 0,000595101853971161 0,000625619897764553 0,000924266433163828 0,000966289712897556 39775 41870 667 665 0 True 473 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 519 442 0,000972070613811886 0,000984792032725439 0,000686655985351339 0,000732433051041428 0,000939558155846353 0,000924365328828604 42491 42918 667 665 0 True 517 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 564 442 0,000973946535544313 0,00101909614962102 0,000701915007248035 0,000686655985351339 0,000952815922447779 0,000971550367959592 42573 44413 667 665 0 True 561 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 607 442 0,000978407568932403 0,000852233582353687 0,000625619897764553 0,000457770656900893 0,000965085972149878 0,000862872753590027 42768 37141 667 665 0 True 606 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 651 441 0,00094528153638905 0,000935687811884942 0,000457770656900893 0,000534065766384375 0,00103046945398129 0,00101400708666873 41320 40778 667 665 0 True 650 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 253 487 0,000932516117770824 0,000879355633303905 0,000747692072938125 0,000686655985351339 0,000769868100365134 0,000744948577176559 40762 38323 667 665 0 True 251 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 297 486 0,00090060257122526 0,000931419874933385 0,000778210116731518 0,000762951094834821 0,000765274091625434 0,000797765138699046 39367 40592 667 665 0 True 296 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 342 486 0,000909112850304077 0,000930479093132236 0,000793469138628214 0,000823987182421607 0,000750044623353418 0,000767067887322127 39739 40551 667 665 0 True 340 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 386 486 0,000939745279568959 0,000973525597009232 0,000823987182421607 0,000793469138628214 0,000795967123279326 0,000842424118556413 41078 42427 667 665 0 True 384 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 430 486 0,000979071004667042 0,00101703101883801 0,00064087891966125 0,00064087891966125 0,00100475947820629 0,00105787249850208 42797 44323 667 665 0 True 428 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 474 486 0,000947477737441648 0,000879814551255686 0,000595101853971161 0,000534065766384375 0,000969107384139387 0,000948632370745808 41416 38343 667 665 0 True 473 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 516 485 0,000937274553384786 0,000887616156435951 0,000671396963454643 0,000595101853971161 0,000882387083003928 0,000863816381434394 40970 38683 667 665 0 True 517 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 562 486 0,000889164024076311 0,000939588614475075 0,000579842832074464 0,000610360875867857 0,000960795129278908 0,000956697225697672 38867 40948 667 665 0 True 561 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 606 486 0,000897605671872235 0,000895853733670409 0,000595101853971161 0,000534065766384375 0,000932097702295601 0,000930679953446607 39236 39042 667 665 0 True 606 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 650 486 0,000992454104831311 0,000905353335272262 0,000625619897764553 0,000579842832074464 0,0010121983047697 0,00091472245881887 43382 39456 667 665 0 True 650 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 253 531 0,000995977177353186 0,000928115665680567 0,000900282291905089 0,000732433051041428 0,000763812133584808 0,000767712293058364 43536 40448 667 665 0 True 251 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 296 530 0,000932699134525207 0,000868823466310546 0,000839246204318303 0,000686655985351339 0,000733279174859053 0,000733343263640642 40770 37864 667 665 0 True 296 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 341 530 0,000983898071563898 0,00095209412866109 0,000900282291905089 0,000839246204318303 0,000730599271692907 0,000758006057939194 43008 41493 667 665 0 True 340 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 386 530 0,00100645488654162 0,000918111254331755 0,000823987182421607 0,000747692072938125 0,000821063646562639 0,00080551544432112 43994 40012 667 665 0 True 384 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 429 529 0,00099995779176102 0,000947780299914354 0,000686655985351339 0,000549324788281071 0,00100113392534738 0,00101304425084395 43710 41305 667 665 0 True 428 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 473 530 0,000894929051839381 0,000909575380428641 0,000579842832074464 0,000518806744487678 0,000920418664748874 0,000973480953242922 39119 39640 667 665 0 True 473 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 518 530 0,000832634724066211 0,000942801040137538 0,000488288700694286 0,000579842832074464 0,000926005318560968 0,000951399502922347 36396 41088 667 665 0 True 517 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 561 530 0,000966534356991795 0,000911548727621296 0,000701915007248035 0,000564583810177768 0,000891098388292578 0,000922237008575322 42249 39726 667 665 0 True 561 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 606 530 0,000862237684087688 0,000881214251008616 0,000564583810177768 0,000625619897764553 0,00087142020141195 0,000829640643216414 37690 38404 667 665 0 True 606 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 650 529 0,000930205531246736 0,000847185484884103 0,000457770656900893 0,000350957503624018 0,000991265032876784 0,00102741077661003 40661 36921 667 665 0 True 650 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 251 567 0,000991241618833522 0,00103931148539694 0,000869764248111696 0,000946059357595178 0,000687931846837079 0,000701329584218642 43329 45294 667 665 0 False 251 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 296 567 0,000983463406772238 0,000939267371908829 0,000869764248111696 0,000854505226215 0,000709276440604015 0,000738465980829199 42989 40934 667 665 0 False 296 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 340 567 0,000882529666729922 0,000988761673008339 0,00080872816052491 0,000854505226215 0,000661210399949595 0,00073281562141462 38577 43091 667 665 0 False 340 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 384 567 0,000935192737803678 0,000955604850992209 0,000823987182421607 0,000854505226215 0,000710828896328927 0,000651080697607389 40879 41646 667 665 0 False 384 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 428 567 0,000936107821575594 0,00093550424470423 0,000625619897764553 0,000579842832074464 0,00094573594276869 0,000953591491189234 40919 40770 667 665 0 False 428 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 473 567 0,000868391622453822 0,000947849137607122 0,000442511635004196 0,000625619897764553 0,00100887700071201 0,00095018227323171 37959 41308 667 665 0 False 473 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 519 574 0,000856221008287342 0,000861618454467595 0,000457770656900893 0,000442511635004196 0,00100226103253396 0,00101553743988684 37427 37550 667 665 0 True 517 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 561 567 0,0010088569814429 0,000996976304345207 0,000732433051041428 0,000747692072938125 0,000917592256963116 0,00094498668519961 44099 43449 667 665 0 False 561 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 607 574 0,00085439084074351 0,00089583078777282 0,000625619897764553 0,000686655985351339 0,000769312536635353 0,000807754842918429 37347 39041 667 665 0 True 605 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 651 574 0,000906962403440074 0,000926784803620404 0,000656137941557946 0,000701915007248035 0,000852457349236797 0,000798037433675279 39645 40390 667 665 0 True 650 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 251 611 0,000955187318220039 0,000943764767836276 0,000823987182421607 0,00080872816052491 0,000678305737912592 0,000665879522670492 41753 41130 667 665 0 False 251 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 296 611 0,00094212449737594 0,000845097408203503 0,000793469138628214 0,000732433051041428 0,000731041384514828 0,000639705205179138 41182 36830 667 665 0 False 296 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 340 611 0,000911652207771143 0,000961295433594286 0,000747692072938125 0,000823987182421607 0,000745502861627497 0,000769855253203637 39850 41894 667 665 0 False 340 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 384 611 0,000950611899360459 0,000920176385114767 0,000839246204318303 0,00080872816052491 0,000664905828782134 0,000678195889703814 41553 40102 667 665 0 False 384 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 428 611 0,000983417652583642 0,000918822577157015 0,000717174029144732 0,000579842832074464 0,000943721338178692 0,000918378432625672 42987 40043 667 665 0 False 428 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 473 611 0,000795756848058003 0,000870154328370709 0,000335698481727321 0,000442511635004196 0,000888291226304821 0,00100653669062596 34784 37922 667 665 0 False 473 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 517 611 0,00079960019990005 0,000875821965075197 0,000366216525520714 0,000457770656900893 0,000928327697497127 0,000988283009432563 34952 38169 667 665 0 False 517 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 561 611 0,000877290812135704 0,000864349016280688 0,000579842832074464 0,000503547722590982 0,000888201958441391 0,000905255834382768 38348 37669 667 665 0 False 561 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 605 611 0,000922793352694218 0,000884541406159023 0,000747692072938125 0,000671396963454643 0,000758023088008312 0,000730258168913752 40337 38549 667 665 0 False 605 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 650 611 0,000836569584285449 0,000904343715778345 0,000610360875867857 0,000701915007248035 0,00072159986196051 0,000776644822045903 36568 39412 667 665 0 False 650 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 251 654 0,00515759515527199 0,055325542053807 0,00123598077363241 0,062027924010071 0,0119025542370789 0,0400222279650239 225448 2411130 667 665 0 False 251 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 296 654 0,000981724747605597 0,000869305330159916 0,000900282291905089 0,000762951094834821 0,000682754294694896 0,000606688638369653 42913 37885 667 665 0 False 296 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 340 654 0,000871182627958166 0,000938349536005268 0,000747692072938125 0,000823987182421607 0,000637084862657125 0,000625042410834283 38081 40894 667 665 0 False 340 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 384 654 0,000878594806510684 0,000922700433849559 0,000732433051041428 0,000823987182421607 0,000662148796098614 0,000656218145387162 38405 40212 667 665 0 False 384 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 428 654 0,000914466090369784 0,000970611468015426 0,000717174029144732 0,000778210116731518 0,000821280207190728 0,000765348008887497 39973 42300 667 665 0 False 428 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 473 654 0,000895661118856914 0,000797369941218347 0,00064087891966125 0,000549324788281071 0,00085851500193019 0,000750742697690651 39151 34750 667 665 0 False 473 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 517 654 0,000924143101257794 0,000992111774056335 0,000610360875867857 0,000747692072938125 0,000923210772204245 0,000864930726462416 40396 43237 667 665 0 False 517 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 561 654 0,000891268716751718 0,000876280883026977 0,000656137941557946 0,000625619897764553 0,000816151219652342 0,000797653830151684 38959 38189 667 665 0 False 561 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 605 654 0,000939745279568959 0,000869259438364738 0,000778210116731518 0,000732433051041428 0,000688342952629942 0,000632984790592622 41078 37883 667 665 0 False 605 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 649 659 0,000955873631048975 0,0780484973018493 0,00080872816052491 0,0776226443884947 0,000734448960291248 0,0228192096476135 41783 3401414 667 665 0 True 650 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A12_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A12_1.csv new file mode 100755 index 0000000..4fe87a7 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A12_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 226 242 0,0102448432455779 0,0446121024694949 0,0103456168459602 0,0448615243762875 0,0018649700723074 0,0091818763423525 447821 1944230 667 665 0 True 227 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 271 242 0,0102667823790096 0,0102976599199991 0,0103456168459602 0,0102845807583734 0,00149763637208122 0,00150133606019791 448780 448780 667 665 0 False 271 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 315 243 0,0104300562010137 0,0640905995820405 0,0104982070649271 0,0625162127107652 0,00133011133591937 0,00974913875257002 455917 2793118 667 665 0 True 316 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 359 242 0,0106055235142786 0,0861522081697721 0,0105287251087205 0,0853437094682231 0,00134504845332625 0,0143334397010313 463587 3754580 667 665 0 True 360 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 404 241 0,0104877751099273 0,0735630791329434 0,0104676890211337 0,0694743266956588 0,00144134431590962 0,0133171708009956 458440 3205936 667 665 0 True 404 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 448 241 0,0104010937996326 0,0704868373726718 0,010406652933547 0,0717936980239567 0,00152532174123555 0,0189903324233142 454651 3071871 667 665 0 True 449 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 492 240 0,0105904703862306 0,081295020568129 0,0106813153276875 0,0771496147096971 0,00167539985828386 0,0241734158701576 462929 3542900 667 665 0 True 493 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 536 241 0,0106082687655943 0,0722719134756094 0,0105745021744106 0,0692607003891051 0,00153101372431221 0,0189295528127151 463707 3149666 667 665 0 True 537 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 582 242 0,0102788386077046 0,0104119993276852 0,0103608758678569 0,0104371709773404 0,00173302491766459 0,00179207025431609 449307 453763 667 665 0 False 582 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 624 238 0,0102923132162461 0,0454524500768974 0,0102845807583734 0,0462043183031968 0,00190950848346698 0,0104809887276595 449896 1980853 667 665 0 True 626 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 227 285 0,0102354178827272 0,0102195520846061 0,0102845807583734 0,0101777676050965 0,00161788544277618 0,00159202966707317 447409 445376 667 665 0 False 227 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 271 285 0,0103978452522423 0,0102865082137709 0,0103456168459602 0,0102845807583734 0,00146233585179758 0,00150156575344208 454509 448294 667 665 0 False 271 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 315 287 0,0107986061901528 0,0978115005986011 0,0108033875028611 0,0943160143434806 0,0013268997837188 0,0218524032185552 472027 4262701 667 665 0 True 316 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 360 286 0,0108047372514246 0,0535000582252151 0,0108033875028611 0,052323186083772 0,00128003242338668 0,00808097749879576 472295 2331574 667 665 0 True 360 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 404 286 0,0106649353281702 0,0798308198970762 0,0106355382619974 0,0772716868848707 0,00147640781021957 0,0128972240800278 466184 3479089 667 665 0 True 404 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 448 285 0,0105216332094882 0,0464183805818047 0,0104676890211337 0,0467383840695811 0,00169653509109832 0,0102158047003144 459920 2022949 667 665 0 True 449 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 493 286 0,0104883012830961 0,0524664143765227 0,0105592431525139 0,0536354619668879 0,00168296017266291 0,0132221800259836 458463 2286527 667 665 0 True 493 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 537 285 0,0105372582648936 0,0606939413078358 0,0104982070649271 0,0583962767986572 0,00159216373447585 0,0159408268563684 460603 2645089 667 665 0 True 537 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 582 285 0,0102759332167288 0,0102759072090847 0,01025406271458 0,0102693217364767 0,00181660306490035 0,00188275351733789 449180 447832 667 665 0 False 582 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 626 285 0,01000463375545 0,0103487833798275 0,0101319905394064 0,0103608758678569 0,00195244503693916 0,00191259843528299 437321 451008 667 665 0 False 626 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 227 332 0,0103156249753356 0,0534218815521293 0,0102998397802701 0,051773861295491 0,0015265398934703 0,0114570559277286 450915 2328167 667 665 0 True 227 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 272 331 0,0104116630171982 0,0643810716996198 0,0103456168459602 0,0652475776302739 0,00142005718141985 0,0183684673690327 455113 2805777 667 665 0 True 271 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 317 331 0,0104165587153779 0,0414860910573527 0,0104371709773404 0,0421759365224689 0,00136508128060831 0,00720220874728053 455327 1807996 667 665 0 True 316 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 360 331 0,0106033959445089 0,0356513852725198 0,0106507972838941 0,0361791409170672 0,00138964384599191 0,00473043746933583 463494 1553715 667 665 0 True 360 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 405 331 0,0103121019028138 0,0755227735165334 0,0103608758678569 0,0722209506370642 0,00149653937474712 0,0130981842904343 450761 3291341 667 665 0 True 404 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 448 329 0,0105286564774376 0,0389470815973328 0,0105287251087205 0,0382238498512245 0,0016086445991514 0,00836595758830848 460227 1697344 667 665 0 True 449 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 492 328 0,0104639371776689 0,0291755711090498 0,0104829480430304 0,0298619058518349 0,00158660714914128 0,00373491483963182 457398 1271494 667 665 0 True 493 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 536 328 0,0103955804199068 0,0532382225878269 0,0105287251087205 0,0538490882734417 0,00157832375401971 0,0107992720994166 454410 2320163 667 665 0 True 537 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 581 329 0,010154227075064 0,0639084091551837 0,0101777676050965 0,0616617074845502 0,00189495515064012 0,0161138988210897 443860 2785178 667 665 0 True 582 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 625 329 0,0102529417369594 0,0671069296037071 0,0102845807583734 0,0665903715571832 0,00198431764708773 0,0190517353942586 448175 2924572 667 665 0 True 626 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 227 377 0,0101368176063033 0,0446066183999711 0,0100251773861295 0,046997787441825 0,0016849310104172 0,00979097464035873 443099 1943991 667 665 0 True 227 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 272 375 0,0104774346633046 0,0363304232198716 0,010406652933547 0,0334630350194553 0,00155692074889381 0,00831899454779455 457988 1583308 667 665 0 True 271 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 317 376 0,0106146285978091 0,0857981070781784 0,0106355382619974 0,0827038986800946 0,00137991514248522 0,0186478330270982 463985 3739148 667 665 0 True 316 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 360 376 0,0106880869475997 0,0671857028701302 0,0106355382619974 0,0654154268711376 0,00143281382039318 0,0163395795427966 467196 2928005 667 665 0 True 360 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 404 375 0,0106263416700897 0,0454451532814641 0,0105897611963073 0,0461280231937133 0,00146720790693136 0,00777010710354115 464497 1980535 667 665 0 True 404 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 449 374 0,0106271423683901 0,0577353661104007 0,0107118333714809 0,056244754711223 0,001736374725708 0,013520224864581 464532 2516152 667 665 0 True 449 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 492 372 0,0106657131493763 0,0445149954308981 0,010605020218204 0,0451972228580148 0,00173819957821948 0,00659746875348033 466218 1939998 667 665 0 True 493 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 536 373 0,0105024850815608 0,0546160090085594 0,0104676890211337 0,0545967803463798 0,00176746354450366 0,0112808368162363 459083 2380208 667 665 0 True 537 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 580 373 0,0102806001439656 0,0454729178175468 0,01025406271458 0,0450141145952544 0,00186573482937163 0,0102092496218406 449384 1981745 667 665 0 True 582 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 624 374 0,0103825175990627 0,0885757309272265 0,0102998397802701 0,0858777752346075 0,00189100555518803 0,0193895646204844 453839 3860199 667 665 0 True 626 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 228 420 0,0103167001987676 0,0412645484161307 0,0103150988021668 0,0412603952086671 0,00159248734138552 0,00590775487079342 450962 1798341 667 665 0 True 227 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 272 420 0,0105072663942691 0,0525043209993397 0,0105745021744106 0,0521400778210117 0,00161385444437282 0,00695601192576373 459292 2288179 667 665 0 True 271 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 316 418 0,0107662579788156 0,0358763927442777 0,0107423514152743 0,0355687800411994 0,00142087881292086 0,00555268481153597 470613 1563521 667 665 0 True 316 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 361 418 0,0108077799049663 0,0576100585636671 0,010757610437171 0,0537727931639582 0,00139657373553817 0,0147970582629274 472428 2510691 667 665 0 True 360 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 405 418 0,010965654732716 0,0987545769895097 0,0108644235904479 0,0982223239490349 0,00155811521426695 0,0127752645455489 479329 4303801 667 665 0 True 404 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 449 418 0,0108145286477841 0,0639696976476439 0,0108186465247578 0,0617380025940337 0,00168369900313845 0,0161620644705556 472723 2787849 667 665 0 True 449 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 494 418 0,0107105980083888 0,0562428960935183 0,0106813153276875 0,0534676127260243 0,00171913397943022 0,0108416307950839 468180 2451109 667 665 0 True 493 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 537 417 0,0104865855010238 0,0329729794846466 0,0104676890211337 0,0333409628442817 0,0016322622385035 0,00479861682979934 458388 1436988 667 665 0 True 537 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 581 417 0,010400819274501 0,0462911455796736 0,010406652933547 0,043579766536965 0,00177286050424026 0,011958201296337 454639 2017404 667 665 0 True 582 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 626 417 0,0103085559531976 0,0727583435585989 0,0103913939116503 0,0719920653086137 0,00191199810606858 0,0122344281781192 450606 3170865 667 665 0 True 626 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 228 464 0,0102544287480888 0,0525456924526927 0,01025406271458 0,0514229037918669 0,00152024467576545 0,0142048671524028 448240 2289982 667 665 0 True 227 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 273 464 0,0104091694139197 0,0540125319019682 0,010406652933547 0,051972228580148 0,0014996604669594 0,00825822078683803 455004 2353908 667 665 0 True 271 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 317 465 0,0111839708436009 0,0662451275820588 0,0110170138094148 0,0628519111924926 0,00197500696728575 0,0151913511277369 488872 2887014 667 665 0 True 316 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 362 464 0,010986152609207 0,0884227735738981 0,0109254596780346 0,0819562066071565 0,00146137325997573 0,0230462731409969 480225 3853533 667 665 0 True 360 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 406 462 0,011103809505181 0,0978069573108785 0,0111848630502785 0,0938582436865797 0,00179757189928206 0,0316057865311725 485368 4262503 667 665 0 True 404 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 451 463 0,0112183322392363 0,0469039387206859 0,0111848630502785 0,0483405813687343 0,00207739194370485 0,00835315983630317 490374 2044110 667 665 0 True 449 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 493 461 0,0109391401804248 0,0472367689652146 0,0109254596780346 0,0489662012664988 0,00198793623881187 0,00875786916617925 478170 2058615 667 665 0 True 493 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 538 461 0,0107096371704283 0,098720617061078 0,010757610437171 0,0958876935988403 0,00181165877234921 0,0153077250183087 468138 4302321 667 665 0 True 537 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 582 460 0,0104922590204097 0,0663733722036838 0,0104371709773404 0,0666666666666667 0,00186878042065062 0,0195025910011624 458636 2892603 667 665 0 True 582 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 627 462 0,0104292783798076 0,0799856817599045 0,0103303578240635 0,0780193789578088 0,00218609836561227 0,0130455247078336 455883 3485838 667 665 0 True 626 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 229 508 0,010318804891443 0,0488110640528995 0,0102998397802701 0,0501411459525444 0,00146203502513959 0,00992588182190334 451054 2127224 667 665 0 True 227 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 274 508 0,0106358585413176 0,096440276704579 0,0106813153276875 0,0894636453803311 0,00152565391938671 0,0232497313539107 464913 4202942 667 665 0 True 271 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 317 508 0,0109028113546797 0,0567890084561369 0,0108491645685512 0,0565346761272602 0,00162868866827457 0,0140009115387213 476582 2474909 667 665 0 True 316 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 363 508 0,0109737761011918 0,0561610021850231 0,0109864957656214 0,0564431219958801 0,00156243365021948 0,00811682521297438 479684 2447540 667 665 0 True 360 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 408 507 0,01102140621152 0,0563774737828779 0,0110933089188983 0,056748302433814 0,00161971620045984 0,00814461840081831 481766 2456974 667 665 0 True 404 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 451 506 0,0110276516582633 0,0615525767956169 0,0111390859845884 0,0608529793240253 0,0019204370140576 0,0125489215525325 482039 2682509 667 665 0 True 449 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 495 505 0,0108498051271915 0,070337643146548 0,0107728694590677 0,0682230869001297 0,00172719665715942 0,0166951023040852 474265 3065369 667 665 0 True 493 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 539 505 0,0105313559745648 0,0600028108724547 0,0105592431525139 0,0582589456015869 0,00175982341548804 0,0147486724376258 460345 2614969 667 665 0 True 538 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 583 505 0,0103255078800723 0,0430511389483092 0,0103456168459602 0,042221713588159 0,00184342010906483 0,0055359118240752 451347 1876202 667 665 0 True 582 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 627 506 0,0101932096437476 0,0702080906087604 0,0103150988021668 0,0673380636301213 0,00191258887485347 0,0201418688607601 445564 3059723 667 665 0 True 626 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 230 553 0,0100542084187936 0,0431578832638933 0,0100862134737163 0,0429694056610971 0,00134887258098714 0,00813658061293797 439488 1880854 667 665 0 True 227 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 272 552 0,0103920802244792 0,0494970775531183 0,0103761348897536 0,0497291523613336 0,00139984132784167 0,0110236529292841 454257 2157121 667 665 0 True 271 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 318 552 0,0105694463365708 0,0492142693653337 0,0106202792401007 0,0487525749599451 0,00142950280203372 0,00913217338967197 462010 2144796 667 665 0 True 316 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 363 552 0,010850994736095 0,0515107636337353 0,0107728694590677 0,0501564049744411 0,0014263428798255 0,0075406952427091 474317 2244879 667 665 0 True 360 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 406 553 0,0110034019383076 0,0884604277918417 0,0110170138094148 0,0829785610742351 0,00161085578546163 0,0205077495675692 480979 3855174 667 665 0 True 404 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 451 551 0,0107557573925328 0,064623150919184 0,0107728694590677 0,0636911573968109 0,00204684283090878 0,0123779578714509 470154 2816327 667 665 0 True 449 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 496 550 0,0106836487913059 0,0553591119019797 0,0107881284809644 0,0547646295872435 0,00184521081568252 0,00837821364360155 467002 2412593 667 665 0 True 493 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 538 548 0,0104853958921203 0,0358867872358856 0,0104676890211337 0,0383154039826047 0,00180082937980033 0,00872885575598805 458336 1563974 667 665 0 True 538 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 584 550 0,0102329929107316 0,0500887604683487 0,0102388036926833 0,0502021820401312 0,00168420417613333 0,00623779822144289 447303 2182907 667 665 0 True 582 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 628 551 0,0100748664349446 0,0530062395632019 0,010101472495613 0,0511940184634165 0,00175190583697188 0,00772645593568711 440391 2310053 667 665 0 True 626 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 227 590 0,0103950542467379 0,00973934033986316 0,0100556954299229 0,00978103303578241 0,00260563617643209 0,00123982141073395 454387 424448 667 665 0 False 227 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 271 590 0,0106276685415589 0,00989743757425149 0,0103303578240635 0,00994888227664607 0,00236570502299958 0,00121758866457263 464555 431338 667 665 0 False 271 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 318 597 0,0102940976296013 0,0768918175502845 0,0103303578240635 0,0769970244907301 0,00149253984263508 0,0117729108019978 449974 3351005 667 665 0 True 316 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 362 596 0,010451354775805 0,0734243711820178 0,0104982070649271 0,0721446555275807 0,00145526722400038 0,0171144044820071 456848 3199891 667 665 0 True 360 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 404 590 0,0115803851335948 0,0106315227299193 0,0108491645685512 0,0105897611963073 0,00452051446933072 0,00140776035097042 506200 463330 667 665 0 False 404 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 449 590 0,0108010311621484 0,0106124087972277 0,0107423514152743 0,0106202792401007 0,00232553521940411 0,00194473271713945 472133 462497 667 665 0 False 449 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 493 590 0,0105176297179861 0,0103343963020391 0,0104676890211337 0,0103456168459602 0,00210778940227802 0,00204814958666795 459745 450381 667 665 0 False 493 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 538 590 0,0103255993884495 0,0102517681248211 0,0103303578240635 0,0102998397802701 0,00185126218901107 0,00184504749888439 451351 446780 667 665 0 False 538 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 582 590 0,0101473639467746 0,0100130160604074 0,010101472495613 0,00996414129854276 0,0016093460170991 0,00179050793577551 443560 436375 667 665 0 False 582 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 626 590 0,0102040991406334 0,010046425287297 0,0101625085831998 0,0100862134737163 0,00170322222231969 0,00149757440920058 446040 437831 667 665 0 False 626 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 229 640 0,00992069769647106 0,0425828131785174 0,0100251773861295 0,0427710383764401 0,0013836393106498 0,00729273503921741 433652 1855792 667 665 0 True 227 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 271 633 0,010045789648092 0,00994371944968854 0,0100404364080262 0,00994888227664607 0,00134482687750372 0,00133968178655138 439120 433355 667 665 0 False 271 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 316 633 0,0113012388289719 0,010092821892222 0,0101930266269932 0,0100862134737163 0,00568566066693382 0,00129240467062122 493998 439853 667 665 0 False 316 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 360 633 0,0108041653240672 0,0100824962383069 0,0102693217364767 0,0100556954299229 0,00321248854681593 0,00137349865289145 472270 439403 667 665 0 False 360 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 404 633 0,0101335004276301 0,0101308661904246 0,0101472495613031 0,0101777676050965 0,00149670057148739 0,00127060175267199 442954 441511 667 665 0 False 404 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 449 633 0,0101820227446359 0,0100282750823041 0,01025406271458 0,00997940032043946 0,00174062766745005 0,00181042431384516 445075 437040 667 665 0 False 449 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 493 633 0,0102396730222666 0,00993323317449036 0,0102082856488899 0,00988784618905928 0,00181656406078088 0,0017687348309885 447595 432898 667 665 0 False 493 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 538 633 0,0100987958755802 0,00996524270162704 0,010101472495613 0,0100099183642329 0,00182713421431416 0,00177800713882413 441437 434293 667 665 0 False 538 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 582 633 0,00998402149348763 0,00987261011306017 0,00993362325474937 0,00988784618905928 0,00157942260333328 0,00150963483401743 436420 430256 667 665 0 False 582 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 629 636 0,00984598110649413 0,0434660696144114 0,00988784618905928 0,0441748683909361 0,00139489507512092 0,00943015210471474 430386 1894285 667 665 0 True 626 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A12_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A12_2.csv new file mode 100755 index 0000000..f212eee --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A12_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 226 242 0,00862667773460489 0,712664311270279 0,00798046845197223 0,722804608224613 0,00349135685332766 0,197032907286643 377088 31058463 667 665 8 True 227 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 271 242 0,00653319483540445 0,00623497402237569 0,0064087891966125 0,00617990386816205 0,00182423054736232 0,00142587114981815 285578 271725 667 665 0 False 271 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 315 243 0,00599167113627897 0,00606714772740962 0,00587472343022812 0,00614938582436866 0,00129129705650045 0,00117912073782098 261907 264411 667 665 0 True 316 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 359 242 0,00612406088098089 0,00620496078832926 0,00617990386816205 0,00619516289005875 0,00129865473471672 0,00111760865905677 267694 270417 667 665 0 True 360 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 404 241 0,00623034786108891 0,00633281532969526 0,00619516289005875 0,00634775310902571 0,00131948968713036 0,00137984692855907 272340 275989 667 665 0 True 404 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 448 241 0,00638277794039579 0,00653450976950272 0,00643930724040589 0,00650034332799268 0,00140691587798934 0,00151250087308589 279003 284779 667 665 0 True 449 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 492 240 0,00654037824301399 0,00648735594995729 0,00657663843747616 0,00642404821850919 0,00147647745739317 0,00145461287200099 285892 282724 667 665 0 True 493 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 536 241 0,00679589250922719 0,00670834788963712 0,00685130083161669 0,00672922865644312 0,00138170373845737 0,00143855255811221 297061 292355 667 665 0 True 537 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 582 242 0,00744658570234224 0,00734041558462418 0,00738536659800107 0,00740062561989776 0,00183495961309799 0,00166196551643308 325504 319901 667 665 0 False 582 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 624 238 0,00916827006501327 0,727672970478382 0,00907911802853437 0,759929808499275 0,00221772170033961 0,2165729849179 400762 31712552 667 665 12 True 626 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 227 285 0,00668503011025959 0,00621875127278026 0,00663767452506294 0,00633249408712902 0,00173497982662801 0,0014953413969559 292215 271018 667 665 0 False 227 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 271 285 0,00629056037328097 0,00612579744164715 0,00630197604333562 0,00619516289005875 0,00138313151417622 0,00136288154696886 274972 266967 667 665 0 False 271 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 315 287 0,00622737383883018 0,00598337225531212 0,00617990386816205 0,00601205462729839 0,00128886242935516 0,0011196618642178 272210 260760 667 665 0 True 316 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 360 286 0,0060597762460038 0,00610854212666021 0,00607309071488518 0,00614938582436866 0,00133974262904592 0,00126956522335438 264884 266215 667 665 0 True 360 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 404 286 0,00619381314149517 0,0063632415898983 0,00624093995574884 0,00636301213092241 0,00140403860093811 0,0013546752954164 270743 277315 667 665 0 True 404 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 448 285 0,00655300639906643 0,00649205985896304 0,00654612039368277 0,00654612039368277 0,00171856243531451 0,00186377728703466 286444 282929 667 665 0 True 449 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 493 286 0,00676898904633287 0,00669955961086052 0,0068055237659266 0,00665293354695964 0,00162111029488391 0,00157112510795802 295885 291972 667 665 0 True 493 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 537 285 0,00701613029603303 0,00696823312573033 0,00704966811627375 0,00708018616006714 0,00153193893809862 0,00157287461035608 306688 303681 667 665 0 True 537 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 582 285 0,00721921026211545 0,00722394220846233 0,00718699931334401 0,00715648126955062 0,00171894940720431 0,00182854459215478 315565 314825 667 665 0 False 582 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 626 285 0,00764744659027776 0,00749963716799437 0,00776684214541848 0,00758373388265812 0,00194478516467597 0,00186208512090288 334284 326840 667 665 0 False 626 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 227 332 0,00587394560902199 0,006059254338639 0,0059662775616083 0,00613412680247196 0,00141065495194533 0,00140115404493818 256761 264067 667 665 0 True 227 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 272 331 0,0058738769777391 0,00604098940415814 0,00585946440833143 0,00604257267109178 0,00136799073738189 0,00128717199495054 256758 263271 667 665 0 True 271 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 317 331 0,00608496392682578 0,00606916696639745 0,00605783169298848 0,00608834973678187 0,00126111209374193 0,00108491877703004 265985 264499 667 665 0 True 316 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 360 331 0,00624800897788689 0,00627120559466875 0,00622568093385214 0,00627145799954223 0,00123266406624034 0,00123781817004936 273112 273304 667 665 0 True 360 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 405 331 0,00653944028214778 0,00635273236880253 0,00656137941557946 0,00643930724040589 0,00137086374002879 0,00129648429765661 285851 276857 667 665 0 True 404 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 448 329 0,00661372220733305 0,00652822259356333 0,00657663843747616 0,00650034332799268 0,00162302889530223 0,00156052002503579 289098 284505 667 665 0 True 449 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 492 328 0,00679930119627758 0,00678597386118076 0,0068207827878233 0,0068207827878233 0,00149870290350149 0,00151362081426476 297210 295738 667 665 0 True 493 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 536 328 0,0069382109128544 0,00711458206055308 0,00697337300679027 0,00717174029144732 0,00151140418452118 0,00149206971351458 303282 310059 667 665 0 True 537 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 581 329 0,00702141490481585 0,00706322914174886 0,00703440909437705 0,00714122224765393 0,00174337685300427 0,00184377169968948 306919 307821 667 665 0 True 582 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 625 329 0,00705332845136141 0,00722566315078151 0,00709544518196384 0,0072632944228275 0,00187640550190148 0,00197199532829367 308314 314900 667 665 0 True 626 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 227 377 0,0059565090423431 0,00613442509914062 0,005981536583505 0,00610360875867857 0,00156640496946835 0,00146475695512148 260370 267343 667 665 0 True 227 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 272 375 0,00614311750053103 0,00610220905892564 0,00614938582436866 0,00611886778057527 0,00136555652669859 0,0013434823104993 268527 265939 667 665 0 True 271 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 317 376 0,00644671941895841 0,00637719269563242 0,00648508430609598 0,0064087891966125 0,00129476185901206 0,00126819383813019 281798 277923 667 665 0 True 316 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 360 376 0,00665252175926228 0,00682186124500998 0,00660715648126955 0,0068207827878233 0,00134649122337374 0,0012916413323268 290794 297302 667 665 0 True 360 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 404 375 0,00672048960642133 0,00672163356434116 0,00675974670023652 0,00672922865644312 0,00142740279660292 0,00132945427987633 293765 292934 667 665 0 True 404 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 449 374 0,00675320385126732 0,00747341000705013 0,00672922865644312 0,00714122224765393 0,00155760393844816 0,00242548004116311 295195 325697 667 665 0 True 449 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 492 372 0,006900166305037 0,0068962059531984 0,00691233691920348 0,00692759594110018 0,00164910572289086 0,00162550069888986 301619 300542 667 665 0 True 493 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 536 373 0,00695582627546378 0,0071118056069448 0,00698863202868696 0,00709544518196384 0,00162652100525376 0,00165382162597701 304052 309938 667 665 0 True 537 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 580 373 0,00677274088979772 0,00701680959092627 0,00675974670023652 0,00698863202868696 0,00177598740595912 0,00185285677906016 296049 305798 667 665 0 True 582 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 624 374 0,00650709207081056 0,00672741593053359 0,00653086137178607 0,00672922865644312 0,0019204413496061 0,00187376173635752 284437 293186 667 665 0 True 626 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 228 420 0,00623492327994849 0,00635009359057979 0,00628671702143893 0,0063935301747158 0,00150897919037601 0,00149146537230387 272540 276742 667 665 0 True 227 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 272 420 0,00623773716254713 0,00630186131384768 0,00622568093385214 0,00627145799954223 0,00147969577594522 0,0014341904750777 272663 274640 667 665 0 True 271 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 316 418 0,00654396994681876 0,00674616272886382 0,00651560234988937 0,00671396963454643 0,00127913938043556 0,00130435122722832 286049 294003 667 665 0 True 316 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 361 418 0,00679323876628863 0,00681474801675739 0,0068207827878233 0,00683604180972 0,00124835656306982 0,00124676335243308 296945 296992 667 665 0 True 360 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 405 418 0,00678154857110241 0,00698810427304241 0,0068055237659266 0,00697337300679027 0,00146694255773611 0,00149635250096002 296434 304547 667 665 0 True 404 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 449 418 0,00694701859415909 0,00690409934196902 0,00692759594110018 0,00694285496299687 0,00157479071848313 0,00159701430934986 303667 300886 667 665 0 True 449 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 494 418 0,00699393951456407 0,00694221247786438 0,00704966811627375 0,00697337300679027 0,00164334279684669 0,00163585182459891 305718 302547 667 665 0 True 493 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 537 417 0,0069935963581496 0,00729117368839815 0,00704966811627375 0,00732433051041428 0,00155314495928278 0,00156634453816649 305703 317755 667 665 0 True 537 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 581 417 0,00636143361141585 0,00638439770747537 0,00634775310902571 0,00646982528419928 0,00178479034840386 0,00183726679284911 278070 278237 667 665 0 True 582 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 626 417 0,0061076122501807 0,00607818470414994 0,00616464484626535 0,00607309071488518 0,00185017177246497 0,0016995864737012 266975 264892 667 665 0 True 626 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 228 464 0,00628326258019994 0,00637489810587352 0,00625619897764553 0,0063935301747158 0,00144593146725951 0,00140582744370123 274653 277823 667 665 0 True 227 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 273 464 0,00657082765552449 0,00644497487711038 0,00660715648126955 0,00646982528419928 0,00146027793038456 0,00146526129868922 287223 280877 667 665 0 True 271 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 317 465 0,00714458518051572 0,0067232168312748 0,00698863202868696 0,00674448767833982 0,00183980913844762 0,00144025845837609 312303 293003 667 665 0 True 316 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 362 464 0,0069012872826576 0,00695056478458678 0,00686655985351339 0,00703440909437705 0,00149588190144893 0,00136120566915194 301668 302911 667 665 0 True 360 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 406 462 0,00689309728289895 0,00715806453648426 0,00685130083161669 0,0072327763790341 0,00163437721386829 0,00159715775778876 301310 311954 667 665 0 True 404 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 451 463 0,00722788068085435 0,00689010234443972 0,0072632944228275 0,00689707789730678 0,00182879819634341 0,00212177185174139 315944 300276 667 665 0 True 449 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 493 461 0,00690648038306322 0,00734032380103383 0,00697337300679027 0,00733958953231098 0,00183823811295428 0,00178017708928858 301895 319897 667 665 0 True 493 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 538 461 0,00651356628849686 0,00644368990684539 0,00653086137178607 0,00646982528419928 0,00174555071386593 0,00167753363682762 284720 280821 667 665 0 True 537 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 582 460 0,00579858846040473 0,00569705334519636 0,00579842832074464 0,00564583810177768 0,00181006057575975 0,00189373649907997 253467 248282 667 665 0 True 582 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 627 462 0,00568502656430997 0,00571522649608686 0,00567635614557107 0,00570687418936446 0,0017442441820576 0,00176773231389316 248503 249074 667 665 0 True 626 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 229 508 0,00630577364098907 0,00645667728488078 0,00628671702143893 0,00646982528419928 0,00147271464037443 0,00130361581808717 275637 281387 667 665 0 True 227 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 274 508 0,00644125179342121 0,0066030950573963 0,00642404821850919 0,00663767452506294 0,00136713322393331 0,00141759243236866 281559 287768 667 665 0 True 271 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 317 508 0,00679136284455621 0,0066797573012412 0,00671396963454643 0,00666819256885634 0,00160764602364722 0,00150631375057643 296863 291109 667 665 0 True 316 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 363 508 0,00686996854056378 0,00693294233523842 0,00686655985351339 0,00695811398489357 0,0014291049403952 0,00148226586666216 300299 302143 667 665 0 True 360 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 408 507 0,00687033457407254 0,00680293087949904 0,0068055237659266 0,00686655985351339 0,00165564640691666 0,0015541507366175 300315 296477 667 665 0 True 404 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 451 506 0,00671477033284685 0,00664682993820096 0,00679026474402991 0,00663767452506294 0,0018887604736497 0,00177305302468186 293515 289674 667 665 0 True 449 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 495 505 0,00632711796996901 0,00632838677146058 0,00630197604333562 0,0063782711528191 0,00174089759342154 0,0016965160998727 276570 275796 667 665 0 True 493 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 539 505 0,00571723751308141 0,00585769757421707 0,00578316929884794 0,00590524147402152 0,00162948758754085 0,00153251030618321 249911 255283 667 665 0 True 538 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 583 505 0,00548775738017922 0,00570033460855159 0,00552376592660411 0,00566109712367437 0,00171947081941393 0,0016930066473053 239880 248425 667 665 0 True 582 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 627 506 0,00560038131540776 0,00558647706471489 0,00561532005798428 0,00558480201419089 0,00165828338325164 0,00174666763126332 244803 243463 667 665 0 True 626 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 230 553 0,00670843337772634 0,00664692172179132 0,00669871061264973 0,00663767452506294 0,00132621858255254 0,0012331909415335 293238 289678 667 665 0 True 227 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 272 552 0,00656513125904432 0,00660355397534808 0,00654612039368277 0,00666819256885634 0,00135603655514964 0,00131456712971454 286974 287788 667 665 0 True 271 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 318 552 0,00656000678992159 0,00697860467144056 0,00651560234988937 0,00700389105058366 0,00135383438981713 0,00136957254039335 286750 304133 667 665 0 True 316 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 363 552 0,00654868262824413 0,00681536755599229 0,00657663843747616 0,0068055237659266 0,00140052326349241 0,00132602188792699 286255 297019 667 665 0 True 360 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 406 553 0,00645186676517543 0,0063818277669454 0,00646982528419928 0,00634775310902571 0,0016177410860702 0,00147955087691444 282023 278125 667 665 0 True 404 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 451 551 0,00610189297660623 0,00627919076702973 0,00616464484626535 0,00625619897764553 0,0019263636172264 0,00187485386073142 266725 273652 667 665 0 True 449 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 496 550 0,00597135627654243 0,00603862597670647 0,00599679560540169 0,00611886778057527 0,00178205435829722 0,00201740626986487 261019 263168 667 665 0 True 493 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 538 548 0,00590810111080875 0,00590822444070809 0,00587472343022812 0,00588998245212482 0,00170533222595149 0,00175368273305939 258254 257485 667 665 0 True 538 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 584 550 0,00567324486074656 0,00577105386492094 0,00570687418936446 0,00575265125505455 0,00164824190661646 0,00143431422196008 247988 251507 667 665 0 True 582 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 628 551 0,00570977958034029 0,00594945821867555 0,00573739223315786 0,00601205462729839 0,00161268381070738 0,00165904881656106 249585 259282 667 665 0 True 626 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 227 590 0,0069915145425685 0,00676805311516374 0,00689707789730678 0,0068055237659266 0,00132648256202855 0,00132530727621082 305612 294957 667 665 0 False 227 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 271 590 0,0067370754997873 0,00672275791332302 0,00677500572213321 0,00669871061264973 0,00128139074756593 0,00125848795256799 294490 292983 667 665 0 False 271 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 318 597 0,00650423243402332 0,00655910777171815 0,00645456626230259 0,00653086137178607 0,00131635532106408 0,00138492401635974 284312 285851 667 665 0 True 316 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 362 596 0,00620124819714199 0,00647755805168678 0,00614938582436866 0,00642404821850919 0,00132155906882411 0,00130845439197306 271068 282297 667 665 0 True 360 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 404 590 0,00615338931587079 0,00605578950810306 0,00619516289005875 0,00607309071488518 0,00146742218473872 0,0013931297540623 268976 263916 667 665 0 False 404 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 449 590 0,00607359401095973 0,00607740454363191 0,00604257267109178 0,00602731364919509 0,00174579569197456 0,00188384406336934 265488 264858 667 665 0 False 449 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 493 590 0,0060608972236244 0,00616879805372897 0,00604257267109178 0,00619516289005875 0,00181122873154725 0,00191407634031129 264933 268841 667 665 0 False 493 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 538 590 0,00597449043846125 0,0059921834799863 0,0059510185397116 0,00607309071488518 0,0018444470567013 0,00179532824592359 261156 261144 667 665 0 False 538 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 582 590 0,00589158384872567 0,00587756872152916 0,00587472343022812 0,00584420538643473 0,00162167301397729 0,00165858718178978 257532 256149 667 665 0 False 582 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 626 590 0,00609157540707788 0,00597020131009602 0,00604257267109178 0,00601205462729839 0,00153051857507771 0,00144416278844827 266274 260186 667 665 0 False 626 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 229 640 0,00970469217211033 0,731575471064936 0,0089570458533608 0,742046234836347 0,00328431680762068 0,183690821924972 424210 31882626 667 665 9 True 227 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 271 633 0,00770010966135152 0,00680465182181822 0,00703440909437705 0,00675974670023652 0,00312860235640239 0,00142186115750562 336586 296552 667 665 0 False 271 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 316 633 0,0063619597845847 0,00627696501496359 0,00636301213092241 0,00628671702143893 0,00127136804273443 0,00119263017302643 278093 273555 667 665 0 False 316 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 360 633 0,00613726096439077 0,00607829943363788 0,00611886778057527 0,00604257267109178 0,00127745610818769 0,0011924405244745 268271 264897 667 665 0 False 360 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 404 633 0,005836930470448 0,00589943616193149 0,00578316929884794 0,00588998245212482 0,00135043037073746 0,00128230169821909 255143 257102 667 665 0 False 404 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 449 633 0,0059673756621346 0,00577206348441486 0,00608834973678187 0,00575265125505455 0,00167887405352464 0,00174080793733672 260845 251551 667 665 0 False 449 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 493 633 0,00607123767024705 0,00606278800686771 0,00605783169298848 0,00605783169298848 0,0017098368064987 0,0016996387945008 265385 264221 667 665 0 False 493 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 538 633 0,00598611200236458 0,00609720685325123 0,00601205462729839 0,00617990386816205 0,00166853525880357 0,00166714295631056 261664 265721 667 665 0 False 538 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 582 633 0,00616668090765787 0,00576224264024676 0,00613412680247196 0,00572213321126116 0,00158200114708887 0,00139506967892102 269557 251123 667 665 0 False 582 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 629 636 0,00802732074109432 0,736425247141658 0,00782787823300526 0,76932936598764 0,00191475083771766 0,218480174488221 350889 32093983 667 665 13 True 626 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A12_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A12_3.csv new file mode 100755 index 0000000..e2b0422 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A12_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 226 242 0,00098430985926126 0,0694389441215765 0,000656137941557946 0,0698405432211795 0,000948355114867169 0,0209177061093347 43026 3026203 667 665 0 True 227 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 271 242 0,000892343940183719 0,000929744824409387 0,000686655985351339 0,000732433051041428 0,000773730691218058 0,000741005952098281 39006 40519 667 665 0 False 271 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 315 243 0,000905566900687903 0,000856455627510066 0,000778210116731518 0,000717174029144732 0,00069417895842221 0,000637953781443909 39584 37325 667 665 0 True 316 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 359 242 0,00083645519881396 0,000827681471933439 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000594926051309234 0,000616062692866298 36563 36071 667 665 0 True 360 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 404 241 0,000816758020623472 0,000766783059732187 0,000671396963454643 0,00064087891966125 0,00064688226363421 0,000625051606029374 35702 33417 667 665 0 True 404 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 448 241 0,000861299723221475 0,000866047012702275 0,000671396963454643 0,000701915007248035 0,000759834991299546 0,00076968730750675 37649 37743 667 665 0 True 449 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 492 240 0,000911995364185611 0,000947459057348108 0,000717174029144732 0,000793469138628214 0,000788989074152247 0,000809931363255608 39865 41291 667 665 0 True 493 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 536 241 0,000857891036171088 0,000879608038177384 0,000686655985351339 0,000717174029144732 0,000752080504682681 0,000747205659918942 37500 38334 667 665 0 True 537 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 582 242 0,000906939526345776 0,000842252116902464 0,000595101853971161 0,000518806744487678 0,000943408920451425 0,000861032414931032 39644 36706 667 665 0 False 582 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 624 238 0,00103129941094914 0,0717158196475395 0,000717174029144732 0,0735027084763867 0,00101238174210093 0,023425228488492 45080 3125431 667 665 0 True 626 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 227 285 0,000904880587858966 0,000947596732733642 0,000656137941557946 0,000732433051041428 0,000807610603898167 0,000804731162917928 39554 41297 667 665 0 False 227 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 271 285 0,000845171371741458 0,000824033074216785 0,000671396963454643 0,000671396963454643 0,000715814578404784 0,00069302301599615 36944 35912 667 665 0 False 271 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 315 287 0,00086221480699339 0,000841219551510959 0,000732433051041428 0,000762951094834821 0,000660137154293857 0,000585501838263013 37689 36661 667 665 0 True 316 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 360 286 0,000878411789756301 0,00081340912363307 0,000747692072938125 0,00064087891966125 0,000649588683828605 0,000675938817933452 38397 35449 667 665 0 True 360 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 404 286 0,000877702599833066 0,00080524038409138 0,000701915007248035 0,000610360875867857 0,000682307125659103 0,000679851254190983 38366 35093 667 665 0 True 404 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 448 285 0,000945418798954837 0,000853036688769302 0,000732433051041428 0,000564583810177768 0,000876016486503403 0,00085177189915745 41326 37176 667 665 0 True 449 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 493 286 0,000889415672113588 0,000863385288581949 0,000656137941557946 0,000595101853971161 0,000877096501757132 0,000820136827153401 38878 37627 667 665 0 True 493 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 537 285 0,000793492015722512 0,000859071459835214 0,000579842832074464 0,000686655985351339 0,000747481947298131 0,000737814043767527 34685 37439 667 665 0 True 537 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 582 285 0,000848717321357632 0,000815566038006438 0,000518806744487678 0,000396734569314107 0,000886864348453389 0,000921040316416833 37099 35543 667 665 0 False 582 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 626 285 0,000864685533177563 0,000868226872973232 0,000442511635004196 0,000625619897764553 0,000959387340101808 0,000886929731685374 37797 37838 667 665 0 False 626 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 227 332 0,000813875506741937 0,000806502408458776 0,000610360875867857 0,00064087891966125 0,000745970129571873 0,000694820005892254 35576 35148 667 665 0 True 227 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 272 331 0,000862443577936369 0,000932636007505603 0,000671396963454643 0,000778210116731518 0,000737268102907462 0,000733319845428126 37699 40645 667 665 0 True 271 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 317 331 0,000864548270611776 0,000826671852439522 0,000732433051041428 0,000747692072938125 0,000633006620480365 0,000616921533516654 37791 36027 667 665 0 True 316 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 360 331 0,000841167880239326 0,000803244091001135 0,000778210116731518 0,000671396963454643 0,000611273396235434 0,000632452395262266 36769 35006 667 665 0 True 360 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 405 331 0,000834762293835916 0,00086173318395554 0,000656137941557946 0,000686655985351339 0,000675845444640735 0,000680400687683653 36489 37555 667 665 0 True 404 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 448 329 0,000793469138628214 0,000810081968482662 0,000549324788281071 0,000534065766384375 0,000753770646145068 0,000782643316874953 34684 35304 667 665 0 True 449 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 492 328 0,000822545925480839 0,000824469046270976 0,000595101853971161 0,000656137941557946 0,000785617555105952 0,000751787548587045 35955 35931 667 665 0 True 493 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 536 328 0,000834236120667064 0,000885000324110803 0,000549324788281071 0,000717174029144732 0,000805108087687378 0,000753177560850346 36466 38569 667 665 0 True 537 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 581 329 0,000827853411357951 0,000870062544780353 0,000503547722590982 0,000503547722590982 0,000914758235300014 0,000945048966477867 36187 37918 667 665 0 True 582 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 625 329 0,000872715393276125 0,000817309926223203 0,000442511635004196 0,000335698481727321 0,00100255486027225 0,000958606329768614 38148 35619 667 665 0 True 626 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 227 377 0,000844050394120861 0,000862880478834991 0,000610360875867857 0,000717174029144732 0,000802997840681111 0,00077495978270386 36895 37605 667 665 0 True 227 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 272 375 0,000815202378211215 0,000766897789220132 0,000686655985351339 0,000610360875867857 0,000679378067687844 0,00066151526672431 35634 33422 667 665 0 True 271 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 317 376 0,000896233046214361 0,000921163058711095 0,00080872816052491 0,00080872816052491 0,00066084095833618 0,000656128266013267 39176 40145 667 665 0 True 316 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 360 376 0,000846704137059417 0,000843904221528874 0,000747692072938125 0,000686655985351339 0,000687915019806851 0,000702526556180873 37011 36778 667 665 0 True 360 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 404 375 0,000835677377607831 0,000832729569403022 0,00064087891966125 0,00064087891966125 0,000706026688654516 0,000720693134774483 36529 36291 667 665 0 True 404 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 449 374 0,000868643270491099 0,000941952041926744 0,000610360875867857 0,000610360875867857 0,000811659404049765 0,000910217842423191 37970 41051 667 665 0 True 449 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 492 372 0,000789259753277401 0,000815382470825725 0,000473029678797589 0,000442511635004196 0,000804047307541066 0,000875928644167097 34500 35535 667 665 0 True 493 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 536 373 0,000777432295525389 0,000863568855762661 0,000503547722590982 0,000595101853971161 0,000815636300281401 0,000834969325487523 33983 37635 667 665 0 True 537 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 580 373 0,000735155425262878 0,000797851805067716 0,000381475547417411 0,000381475547417411 0,000856597913280611 0,000934509642522109 32135 34771 667 665 0 True 582 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 624 374 0,000812411372706872 0,000876051424051087 0,000442511635004196 0,000457770656900893 0,000922415266660701 0,000974420454054722 35512 38179 667 665 0 True 626 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 228 420 0,000822637433858031 0,00096937238954562 0,00064087891966125 0,000823987182421607 0,000762404543982456 0,000792788354066539 35959 42246 667 665 0 True 227 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 272 420 0,00091396279429523 0,000818434275205065 0,00080872816052491 0,000671396963454643 0,000738556119742865 0,000709350977409057 39951 35668 667 665 0 True 271 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 316 418 0,000900762710885345 0,000828255119373164 0,000778210116731518 0,000747692072938125 0,000703805872850121 0,000622360076550609 39374 36096 667 665 0 True 316 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 361 418 0,000873516091576551 0,000910814458898448 0,000732433051041428 0,000778210116731518 0,00071969354958523 0,00069063581086021 38183 39694 667 665 0 True 360 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 405 418 0,000841762684691072 0,000967077799786718 0,00064087891966125 0,000778210116731518 0,00071790155550287 0,000801259475795348 36795 42146 667 665 0 True 404 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 449 418 0,000939104720928618 0,000959964571534123 0,000701915007248035 0,000732433051041428 0,000832066284151603 0,000828407657785716 41050 41836 667 665 0 True 449 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 494 418 0,000887013577212309 0,00087341264582835 0,000595101853971161 0,000595101853971161 0,000844941298808734 0,000799490107989349 38773 38064 667 665 0 True 493 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 537 417 0,000779742882049477 0,000827429067059959 0,000564583810177768 0,000671396963454643 0,000765821863921356 0,000761060342579254 34084 36060 667 665 0 True 537 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 581 417 0,000835768885985023 0,000783074647020389 0,000488288700694286 0,000366216525520714 0,000926060276348241 0,000922214597806756 36533 34127 667 665 0 True 582 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 626 417 0,000820807266314199 0,000827520850650315 0,000411993591210803 0,000488288700694286 0,000960186392220155 0,000874973737102942 35879 36064 667 665 0 True 626 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 228 464 0,000866447069438501 0,000934907651366916 0,000717174029144732 0,000778210116731518 0,000739240588648332 0,000785981872252324 37874 40744 667 665 0 True 227 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 273 464 0,000873927879273913 0,000872104729665776 0,00064087891966125 0,000732433051041428 0,000767727144477676 0,00076933964315506 38201 38007 667 665 0 True 271 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 317 465 0,000945990726312284 0,000849709533618895 0,000839246204318303 0,000671396963454643 0,000802024579380101 0,000751626615503179 41351 37031 667 665 0 True 316 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 362 464 0,000862626594690753 0,000912650130705569 0,000747692072938125 0,000793469138628214 0,000700498693957722 0,00074373940897092 37707 39774 667 665 0 True 360 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 406 462 0,00094267354763909 0,000969280605955264 0,000747692072938125 0,000762951094834821 0,000849153438847852 0,000833816943351424 41206 42242 667 665 0 True 404 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 451 463 0,000953700307090675 0,000914210451741622 0,000625619897764553 0,000488288700694286 0,0010234266953538 0,00103108355193065 41688 39842 667 665 0 True 449 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 493 461 0,000875712292629149 0,000814166338253507 0,000518806744487678 0,000442511635004196 0,000942768307433662 0,000917097737218999 38279 35482 667 665 0 True 493 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 538 461 0,000810604082257338 0,000818480167000243 0,000473029678797589 0,000488288700694286 0,000880959947387106 0,000888665633067982 35433 35670 667 665 0 True 537 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 582 460 0,000792531177762 0,000799067937639934 0,000396734569314107 0,000366216525520714 0,000910728760977827 0,000935512904672149 34643 34824 667 665 0 True 582 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 627 462 0,000760480368650648 0,000830526763234477 0,000411993591210803 0,000442511635004196 0,000791315882883266 0,000892163645772044 33242 36195 667 665 0 True 626 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 229 508 0,000827739025886462 0,000875913748665553 0,000686655985351339 0,000747692072938125 0,0006986548294477 0,000679410965598956 36182 38173 667 665 0 True 227 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 274 508 0,000854573857497893 0,000861366049594116 0,000701915007248035 0,000717174029144732 0,000741073707774372 0,000769047456117177 37355 37539 667 665 0 True 271 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 317 508 0,00080698950135827 0,000842504521775944 0,000625619897764553 0,000701915007248035 0,000759388440517669 0,000741955290206416 35275 36717 667 665 0 True 316 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 363 508 0,000899733241641939 0,000895325978025861 0,000717174029144732 0,000747692072938125 0,000811653756189578 0,000758047826119346 39329 39019 667 665 0 True 360 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 408 507 0,000835013941873193 0,000899433293694295 0,000549324788281071 0,000610360875867857 0,000850928441441638 0,000837242082494925 36500 39198 667 665 0 True 404 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 451 506 0,000897399778023554 0,000974374595220025 0,000488288700694286 0,000656137941557946 0,00102200906668476 0,000979741702357052 39227 42464 667 665 0 True 449 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 495 505 0,000828676986752675 0,000802624551766232 0,000488288700694286 0,000503547722590982 0,000855869408366078 0,000821257112017674 36223 34979 667 665 0 True 493 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 539 505 0,000828745618035569 0,000823826561138484 0,000518806744487678 0,000549324788281071 0,000800548187124666 0,000804040958499841 36226 35903 667 665 0 True 538 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 583 505 0,000727056933881423 0,000765635764852736 0,000396734569314107 0,000442511635004196 0,000828109196449353 0,000837139926193365 31781 33367 667 665 0 True 582 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 627 506 0,000763225619966396 0,000780068734436228 0,000381475547417411 0,000411993591210803 0,000860365318492702 0,000869015594537305 33362 33996 667 665 0 True 626 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 230 553 0,000857090337870662 0,000867676171431096 0,000717174029144732 0,000762951094834821 0,000688282109833323 0,000656177841491301 37465 37814 667 665 0 True 227 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 272 552 0,000875780923912043 0,000899570969079829 0,000732433051041428 0,000778210116731518 0,000719468848122564 0,000708285893891041 38282 39204 667 665 0 True 271 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 318 552 0,000859217907640366 0,000840347607402576 0,000717174029144732 0,000732433051041428 0,000712859519227212 0,000666602019239859 37558 36623 667 665 0 True 316 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 363 552 0,000852697935765466 0,00089863018727868 0,000717174029144732 0,000793469138628214 0,000685322390165907 0,000654832249386014 37273 39163 667 665 0 True 360 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 406 553 0,000838353997640685 0,000872770160695857 0,000610360875867857 0,000671396963454643 0,000815539666288802 0,000760219128120087 36646 38036 667 665 0 True 404 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 451 551 0,000903736733144071 0,000865840499623974 0,000518806744487678 0,000411993591210803 0,000964212481118988 0,00102071886775589 39504 37734 667 665 0 True 449 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 496 550 0,000848214025283078 0,000855308332630615 0,000396734569314107 0,000244144350347143 0,000990503838205978 0,00109046551775961 37077 37275 667 665 0 True 493 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 538 548 0,000806509082378015 0,000758086564545949 0,000335698481727321 0,000320439459830625 0,000896168177353815 0,000917351946230816 35254 33038 667 665 0 True 538 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 584 550 0,000749705257236339 0,000760954801744577 0,000457770656900893 0,000518806744487678 0,000812186729064232 0,000714396742720909 32771 33163 667 665 0 True 582 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 628 551 0,000807652937092909 0,000783717132152882 0,000503547722590982 0,000503547722590982 0,000835224902830309 0,000796581334904902 35304 34155 667 665 0 True 626 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 227 590 0,000809986400711295 0,000858612541883434 0,000701915007248035 0,000747692072938125 0,000617590816449382 0,000629178095172529 35406 37419 667 665 0 False 227 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 271 590 0,000927368771553797 0,000859851620353241 0,000839246204318303 0,000717174029144732 0,000643592896560855 0,00067177373430286 40537 37473 667 665 0 False 271 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 318 597 0,000825863104154034 0,000903976581416921 0,000656137941557946 0,000778210116731518 0,000681278874903741 0,000734152458253708 36100 39396 667 665 0 True 316 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 362 596 0,000791272937575616 0,000875408938918594 0,000656137941557946 0,000701915007248035 0,000657423965490141 0,000759720125112527 34588 38151 667 665 0 True 360 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 404 590 0,000794429976588726 0,00085216474466092 0,000610360875867857 0,000671396963454643 0,000724094871926998 0,000700725890080921 34726 37138 667 665 0 False 404 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 449 590 0,000872509499427444 0,000881673168960396 0,000488288700694286 0,000473029678797589 0,000927954238835212 0,000975616417932862 38139 38424 667 665 0 False 449 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 493 590 0,000820326847333943 0,000788971742700767 0,000335698481727321 0,000244144350347143 0,000980782312910403 0,000993664273957317 35858 34384 667 665 0 False 493 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 538 590 0,000797449753036048 0,000777567631599025 0,000366216525520714 0,000411993591210803 0,000905958778012146 0,000877713062171966 34858 33887 667 665 0 False 538 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 582 590 0,00072893285561385 0,000686334742785093 0,000442511635004196 0,000366216525520714 0,000742235091900346 0,000789425144253813 31863 29911 667 665 0 False 582 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 626 590 0,000815133746928321 0,000761000693539755 0,000625619897764553 0,000579842832074464 0,000708458306105699 0,000686949409697588 35631 33165 667 665 0 False 626 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 229 640 0,000989251311629605 0,071473258564126 0,000823987182421607 0,071473258564126 0,000741096051547894 0,0193784764448705 43242 3114860 667 665 0 True 227 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 271 633 0,000913779777540847 0,000794203407351063 0,000793469138628214 0,000610360875867857 0,000689572242519808 0,000675477397694051 39943 34612 667 665 0 False 271 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 316 633 0,00081808489209275 0,00081971924547005 0,000701915007248035 0,000717174029144732 0,000638102107607138 0,00061910374037481 35760 35724 667 665 0 False 316 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 360 633 0,000787795619242336 0,0008465659456492 0,00064087891966125 0,000747692072938125 0,00064242447088368 0,000657228559749547 34436 36894 667 665 0 False 360 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 404 633 0,000839017433375324 0,000736815717480931 0,00064087891966125 0,000610360875867857 0,000726017441783382 0,000605898261043452 36675 32111 667 665 0 False 404 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 449 633 0,000799943356314518 0,000906156441687877 0,000473029678797589 0,000564583810177768 0,000842524106521547 0,000938712840620706 34967 39491 667 665 0 False 449 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 493 633 0,000768052686863252 0,00081012786027784 0,000396734569314107 0,000473029678797589 0,00086762349703993 0,000847961776785135 33573 35306 667 665 0 False 493 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 538 633 0,000725958833355124 0,000905536902452974 0,000366216525520714 0,000534065766384375 0,000846024543317931 0,000966180655078154 31733 39464 667 665 0 False 538 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 582 633 0,000773543189494747 0,000853403823130727 0,000579842832074464 0,00064087891966125 0,000743870846079841 0,000723195612642316 33813 37192 667 665 0 False 582 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 629 636 0,00090483483367037 0,0722754471438381 0,000747692072938125 0,0742198825055314 0,000786864847384529 0,0233802709857024 39552 3149820 667 665 0 True 626 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A1_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A1_1.csv new file mode 100755 index 0000000..05be4b2 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A1_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 252 275 0,00981411331413716 0,0456424650548321 0,00984206912336919 0,0453955901426719 0,00153459852247844 0,00864957462403176 428993 1989134 667 665 0 True 252 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 297 274 0,00981276356557359 0,00977304786342143 0,0098268101014725 0,0097962920576791 0,00135035545609896 0,00129346251562891 428934 425917 667 665 0 False 297 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 340 276 0,00999806802938654 0,0688238793367029 0,00996414129854276 0,0673075455863279 0,00140360118948687 0,0101742156778524 437034 2999398 667 665 0 True 341 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 385 276 0,0100409625811951 0,090045140317032 0,0100862134737163 0,0902265964751659 0,00134997169567742 0,0118815533332054 438909 3924237 667 665 0 True 385 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 429 275 0,0101195454001084 0,0781172202651284 0,0100709544518196 0,0747234302281224 0,00162375385727134 0,0133038621385266 442344 3404409 667 665 0 True 430 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 473 275 0,00994906529340045 0,0730232998380593 0,00991836423285267 0,0765239948119326 0,00171227711103769 0,0214499799533592 434892 3182412 667 665 0 True 474 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 518 274 0,00980768485063946 0,0841284947319087 0,00976577401388571 0,0803082322423133 0,00156954703867337 0,0219592492492268 428712 3666385 667 665 0 True 519 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 561 273 0,00980198845415928 0,069808189505579 0,00975051499198901 0,0684977492942702 0,00161879796427813 0,0199915876106957 428463 3042295 667 665 0 True 563 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 608 274 0,0109050304328266 0,00961607497801496 0,0097962920576791 0,00956740672922866 0,00671366019974878 0,00187115981449461 476679 419076 667 665 0 False 608 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 649 273 0,00966319312305395 0,0420191472042432 0,00973525597009232 0,0414282444495308 0,00173721192100996 0,00977013983306903 422396 1831227 667 665 0 True 652 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 252 318 0,00979212842651688 0,00994569279688119 0,0098115510795758 0,00994888227664607 0,00143735061764491 0,00147330024680495 428032 433441 667 665 0 False 252 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 297 318 0,00997999512489121 0,00990831392970869 0,0100099183642329 0,00991836423285267 0,0012817527990675 0,00125158610652348 436244 431812 667 665 0 False 297 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 340 320 0,0100047252638272 0,115621142579498 0,00999465934233616 0,11108567940795 0,00134879145645691 0,0256605628041649 437325 5038859 667 665 0 True 341 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 385 320 0,0101830979680679 0,0586707326797194 0,0101930266269932 0,0563820859082933 0,00135567687134069 0,010471340542913 445122 2556916 667 665 0 True 385 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 429 319 0,0100722813232889 0,0845365875205294 0,0100862134737163 0,0822919050888838 0,00162071033130433 0,0152066932023114 440278 3684170 667 665 0 True 430 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 474 319 0,0101610215720705 0,0449742575711423 0,0102082856488899 0,045487144274052 0,00169909723046782 0,00834414097000898 444157 1960013 667 665 0 True 474 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 518 319 0,00991683146753472 0,0459775669432221 0,00996414129854276 0,0486915388723583 0,00161340764870552 0,00857564175627166 433483 2003738 667 665 0 True 519 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 561 317 0,00980018116370974 0,0527297873890494 0,00984206912336919 0,0546730754558633 0,00166656629082893 0,0113003552539539 428384 2298005 667 665 0 True 563 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 608 318 0,00970663672512565 0,00950983547217781 0,00965896086060884 0,00947585259784848 0,00191805558004944 0,00200324085258356 424295 414446 667 665 0 False 608 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 652 318 0,00964816287210023 0,00942681721470075 0,00973525597009232 0,00944533455405508 0,00193813003096064 0,00175417432435326 421739 410828 667 665 0 False 652 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 252 364 0,00992438090865302 0,0581627563988938 0,00994888227664607 0,0554207675288014 0,00158944500162719 0,0127511651714289 433813 2534778 667 665 0 True 252 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 296 364 0,0099506666900013 0,0697937565359955 0,00991836423285267 0,0720378423743038 0,00137903240558901 0,0196996068029232 434962 3041666 667 665 0 True 297 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 342 365 0,00999033557151385 0,0427824654334394 0,0100862134737163 0,0431982909895476 0,00136795839281376 0,00886319652038456 436696 1864493 667 665 0 True 341 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 385 364 0,0100862363508106 0,0367181629973308 0,0100556954299229 0,0374761577782864 0,00133623571248132 0,00497906033405951 440888 1600206 667 665 0 True 385 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 430 364 0,0102454838042183 0,0773206534303256 0,0102693217364767 0,0722972457465477 0,00168975096073018 0,0146236057619047 447849 3369694 667 665 0 True 430 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 474 363 0,00994863062860879 0,0327060498579936 0,0100251773861295 0,0331883726253147 0,00178525998493829 0,00412249292101269 434873 1425355 667 665 0 True 474 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 519 363 0,00984650727966298 0,0284510085008814 0,00988784618905928 0,0286411841000992 0,0016707083734472 0,00284687993922166 430409 1239917 667 665 0 True 519 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 561 362 0,0100477342011073 0,0520848699914125 0,0101167315175097 0,0515297169451438 0,00174896263583661 0,00976345155881551 439205 2269899 667 665 0 True 563 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 605 362 0,00983955264299642 0,0563539312919516 0,00990310521095598 0,0577859159227894 0,0019966680995423 0,0127980155406455 430105 2455948 667 665 0 True 608 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 649 361 0,00998809361627266 0,0612232113816241 0,00991836423285267 0,0629434653238727 0,00201498688267181 0,0192718782954855 436598 2668155 667 665 0 True 652 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 253 408 0,00973525597009232 0,0494318423662727 0,0097962920576791 0,0496070801861601 0,00149368023222831 0,0130311643977489 425546 2154278 667 665 0 True 252 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 297 409 0,00995041504196403 0,0332353887694746 0,00993362325474937 0,0332494087129015 0,00135318106291571 0,00369288883993024 434951 1448424 667 665 0 True 297 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 342 409 0,0102289894192295 0,0941332502691841 0,0101777676050965 0,0889448386358434 0,00144499930290527 0,0203154513741442 447128 4102400 667 665 0 True 341 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 385 408 0,0102868684678032 0,0712073844487621 0,0102082856488899 0,069764248111696 0,00143675774323129 0,0159373314869667 449658 3103273 667 665 0 True 385 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 430 408 0,0103807331857074 0,0464081237655824 0,0104219119554437 0,0474708171206226 0,00157083340025249 0,00787204048310419 453761 2022502 667 665 0 True 430 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 474 407 0,010236859139668 0,0558202785517238 0,0102388036926833 0,0556038757915618 0,00172420683124214 0,0101883643314917 447472 2432691 667 665 0 True 474 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 517 406 0,0100630389771926 0,0413231063467779 0,0100709544518196 0,0426031891355764 0,00169702376603055 0,00601668340286396 439874 1800893 667 665 0 True 519 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 561 406 0,0100285631960856 0,0518542178288477 0,0100709544518196 0,050965133134966 0,00164993164706105 0,00826019178938042 438367 2259847 667 665 0 True 563 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 606 406 0,0100873802055255 0,0454742945714022 0,0100556954299229 0,0438849469748989 0,00188281485282111 0,0110510273869315 440938 1981805 667 665 0 True 608 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 650 406 0,00987528666428974 0,0849589067656553 0,00990310521095598 0,0805523765926604 0,00191455552020179 0,014586107273395 431667 3702575 667 665 0 True 652 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 253 453 0,00993453833852129 0,0444073562253081 0,00987258716716258 0,0441290913252461 0,00158116004635336 0,00650320743130132 434257 1935307 667 665 0 True 252 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 296 453 0,0101959091408747 0,0719336679992497 0,0102845807583734 0,0676279850461585 0,00145504106553199 0,0202445676634244 445682 3134925 667 665 0 True 297 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 342 452 0,0104014598331413 0,0368797021163575 0,0103456168459602 0,0372014953841459 0,00143605962431265 0,00373616229474945 454667 1607246 667 665 0 True 341 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 385 452 0,0103441298348308 0,0566741642387039 0,0102998397802701 0,0552681773098344 0,00153551377451865 0,0104258638757768 452161 2469904 667 665 0 True 385 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 430 453 0,0106805146293871 0,100549473936615 0,0106660563057908 0,0996871900511177 0,00179413619630205 0,0146444989781424 466865 4382024 667 665 0 True 430 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 473 451 0,0105543474543342 0,0631253574540609 0,0105592431525139 0,0639505607690547 0,00184012130129013 0,0134969457509754 461350 2751052 667 665 0 True 474 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 518 451 0,0103284819023311 0,0576504433434238 0,0102998397802701 0,0548714427405203 0,00170354756866438 0,0107544335419864 451477 2512451 667 665 0 True 519 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 563 451 0,0101832123535394 0,031799709849125 0,0101472495613031 0,031967650873579 0,0019324260271521 0,00403941711337311 445127 1385856 667 665 0 True 563 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 606 450 0,00994565660635006 0,0398303609791244 0,00997940032043946 0,0397039749752041 0,00179624447034149 0,00579218224894621 434743 1735838 667 665 0 True 608 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 650 450 0,00981951230839147 0,0658721879085445 0,00978103303578241 0,0651712825207904 0,00182800196451422 0,0127972802931363 429229 2870761 667 665 0 True 652 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 254 497 0,00984705632992613 0,0557991683259419 0,0098268101014725 0,0559395742732891 0,00142776903884619 0,0140590013982101 430433 2431771 667 665 0 True 252 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 298 497 0,010089256127258 0,0592172121766995 0,0101472495613031 0,0577248798352026 0,00160296289752739 0,00727269404727751 441020 2580732 667 665 0 True 297 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 342 497 0,0103191022936689 0,0750616986503797 0,010406652933547 0,0702983138780804 0,00154931019736253 0,0188435396735824 451067 3271247 667 665 0 True 341 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 385 496 0,0105696064762309 0,0956519703929083 0,0105439841306172 0,0884565499351492 0,00152808211678666 0,0237084640630292 462017 4168587 667 665 0 True 385 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 430 496 0,0106561734010541 0,100662436590446 0,0106965743495842 0,094697489890898 0,00190104961145057 0,0297999893827211 465801 4386947 667 665 0 True 430 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 475 495 0,0104033586319681 0,0462502789360676 0,0104371709773404 0,047348744945449 0,00183125256903218 0,0055486432203996 454750 2015623 667 665 0 True 474 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 520 495 0,0102334733297119 0,041420190439477 0,0101930266269932 0,0428473334859236 0,00185055800011862 0,00596038185853964 447324 1805124 667 665 0 True 519 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 563 495 0,0103864753363762 0,107256215613421 0,0102845807583734 0,107118333714809 0,00183092664656591 0,0173108550482053 454012 4674309 667 665 0 True 563 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 607 495 0,0100365930561842 0,060726708049593 0,0100099183642329 0,0631723506523232 0,00180894675235292 0,0144958149968132 438718 2646517 667 665 0 True 608 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 652 494 0,00973058904285555 0,07178424431415 0,0098268101014725 0,0704661631189441 0,00189166421885939 0,0109654792553383 425342 3128413 667 665 0 True 652 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 254 541 0,00985485741908172 0,0591517934226732 0,0098268101014725 0,0601052872510872 0,00139167949097575 0,0134693203626996 430774 2577881 667 665 0 True 252 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 298 541 0,0101887486103595 0,114936941805188 0,0101625085831998 0,103852903028916 0,00143906206788331 0,0317677134123964 445369 5009041 667 665 0 True 297 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 343 541 0,0103314101704012 0,0587535673700158 0,0103608758678569 0,0605935759517815 0,00143028854456262 0,0124626741104042 451605 2560526 667 665 0 True 341 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 386 541 0,0104313373182944 0,061672606785905 0,010406652933547 0,0596322575722896 0,00150229195640373 0,00970496510451905 455973 2687740 667 665 0 True 385 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 431 541 0,010579214855836 0,0582249627272576 0,0105897611963073 0,0577859159227894 0,00195126638461925 0,00753923561047191 462437 2537489 667 665 0 True 430 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 475 540 0,0103440154493593 0,0590078996988925 0,0103150988021668 0,0581673914702068 0,00195287852924777 0,0102576323392096 452156 2571610 667 665 0 True 474 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 519 539 0,0100372793690131 0,0717182060208888 0,00997940032043946 0,0691233691920348 0,0019493785270711 0,0160449474475081 438748 3125535 667 665 0 True 519 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 564 539 0,0101145124393628 0,0564531722990241 0,0100862134737163 0,0563668268863966 0,0017263407223083 0,0117142568343076 442124 2460273 667 665 0 True 563 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 608 538 0,00974143278555275 0,0412788666562263 0,0098115510795758 0,0410467689021134 0,001725738418959 0,00524320520821456 425816 1798965 667 665 0 True 608 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 652 538 0,00981797954307351 0,0609618805539828 0,0098115510795758 0,0610818646524758 0,00189694172157037 0,0119704952168363 429162 2656766 667 665 0 True 652 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 253 585 0,00956157307018269 0,0481231689890783 0,00956740672922866 0,0485236896314946 0,0012120049852792 0,00963533940846965 417954 2097245 667 665 0 True 252 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 298 586 0,00965532340261547 0,0569436408599893 0,00964370183871214 0,0562142366674296 0,0014026701512459 0,0127840430158693 422052 2481648 667 665 0 True 297 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 342 585 0,0101764178565329 0,0528226723824897 0,0101472495613031 0,0511635004196231 0,00138559992350609 0,0102238236460924 444830 2302053 667 665 0 True 341 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 386 584 0,0104265788826804 0,0515361417964687 0,010406652933547 0,0502327000839246 0,00133497260810199 0,00657493311538965 455765 2245985 667 665 0 True 386 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 431 585 0,0103215958969474 0,0901117293118353 0,0102998397802701 0,0842298008697643 0,00188691819824923 0,0186019240202259 451176 3927139 667 665 0 True 430 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 475 584 0,010341613354458 0,0624917753298329 0,0103456168459602 0,0604104676890211 0,00206046594591704 0,0102881575754275 452051 2723440 667 665 0 True 474 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 520 583 0,00999944065504442 0,0544259710847272 0,00996414129854276 0,0542000457770657 0,00199490865579548 0,00728052803879009 437094 2371926 667 665 0 True 519 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 563 579 0,0101828463200306 0,0338025425201824 0,0101625085831998 0,03759822995346 0,0019316358200949 0,0115367045830076 445111 1473141 667 665 0 False 563 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 608 583 0,00978965770033271 0,0458491846462115 0,0098115510795758 0,0455481803616388 0,00160967361985404 0,00568400327214929 427924 1998143 667 665 0 True 608 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 652 583 0,00979622342639621 0,0505130301147696 0,00988784618905928 0,0491340505073625 0,00154526207922327 0,00641263249979491 428211 2201397 667 665 0 True 652 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 252 622 0,0102828420992067 0,00946428786546361 0,00964370183871214 0,00949111161974517 0,00375570077051684 0,00137684339573518 449482 412461 667 665 0 False 252 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 297 622 0,0102971631602372 0,00958411134267346 0,00973525597009232 0,00961318379491875 0,00365892320713837 0,00139327098583231 450108 417683 667 665 0 False 297 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 342 629 0,00998582878393717 0,0824514708607178 0,00997940032043946 0,0788738841840238 0,00140034720934192 0,0125899981879861 436499 3593299 667 665 0 True 341 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 386 629 0,00988953909403733 0,0796267161380219 0,00996414129854276 0,0755321583886473 0,00132533145713791 0,0200258242274584 432290 3470194 667 665 0 True 386 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 430 622 0,0108121723070715 0,00980641119851586 0,0100556954299229 0,00984206912336919 0,0045634468348867 0,00180075558343709 472620 427371 667 665 0 False 430 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 474 622 0,0102549320441633 0,00970258101192556 0,0100556954299229 0,00967421988250553 0,00267639149343897 0,00182934984303309 448262 422846 667 665 0 False 474 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 519 622 0,0100931681103829 0,00968573872309522 0,00968947890440223 0,00961318379491875 0,00271154370514947 0,00197599060335147 441191 422112 667 665 0 False 519 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 563 622 0,00986904121754641 0,00990858928047975 0,00987258716716258 0,00994888227664607 0,00180860083951198 0,00179509604099902 431394 431824 667 665 0 False 563 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 608 622 0,00971029706021331 0,00973823893677889 0,00964370183871214 0,00973525597009232 0,00167554913054913 0,0014101134274735 424455 424400 667 665 0 False 608 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 652 622 0,00968115164207779 0,0095664888933251 0,00967421988250553 0,00964370183871214 0,00152518452148247 0,00157023640932316 423181 416915 667 665 0 False 652 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 252 666 0,012128954977764 0,0336970143371705 0,0097962920576791 0,0382696269169146 0,00718865943307954 0,0177692554483696 530179 1468542 667 665 0 False 252 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 297 666 0,00935032598143593 0,00948459498482989 0,0093690394445716 0,00950637064164187 0,00133534690591359 0,0012480884211673 408720 413346 667 665 0 False 297 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 341 666 0,0112115834964184 0,00928957780122084 0,00959792477302205 0,00929274433508812 0,00761907278375657 0,00124866656014302 490079 404847 667 665 0 False 341 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 386 666 0,0106804231210099 0,00952227214867106 0,0097962920576791 0,00959792477302205 0,00485227920640094 0,00126223750969346 466861 414988 667 665 0 False 386 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 430 666 0,00947871223463572 0,00961719932699682 0,00949111161974517 0,00958266575112535 0,00154620591341883 0,00143851193672164 414332 419125 667 665 0 False 430 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 474 666 0,00970018538453364 0,00945499477694006 0,00970473792629892 0,00946059357595178 0,00153484513450817 0,0015098592660448 424013 412056 667 665 0 False 474 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 519 666 0,00959712407472162 0,00928544753965481 0,00962844281681544 0,00929274433508812 0,00178270743047033 0,00168645991551731 419508 404667 667 665 0 False 519 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 563 666 0,00958083558358152 0,00958108248419171 0,00961318379491875 0,00964370183871214 0,00157552317108191 0,00148470235778771 418796 417551 667 665 0 False 563 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 608 666 0,00958811049956825 0,00949349799309443 0,00955214770733196 0,00955214770733196 0,00126619091445933 0,00138547245352959 419114 413734 667 665 0 False 608 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 654 671 0,00961542575015994 0,041437835834723 0,00965896086060884 0,0412756542305638 0,00145202529132882 0,00803133586986395 420308 1805893 667 665 0 True 652 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A1_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A1_2.csv new file mode 100755 index 0000000..2312f3a --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A1_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 252 275 0,00802892213769517 0,713569113904009 0,00778210116731518 0,70272373540856 0,00219932732613254 0,186329954276548 350959 31097895 667 665 9 True 252 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 297 274 0,00608462077041132 0,00598897105432384 0,00593575951781491 0,0059662775616083 0,00146485575569178 0,00117094486570916 265970 261004 667 665 0 False 297 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 340 276 0,00575665474655668 0,00594773727635638 0,00575265125505455 0,00588998245212482 0,00111218868150495 0,00123188441027951 251634 259207 667 665 0 True 341 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 385 276 0,00581771371123777 0,00593796232398345 0,00582894636453803 0,0059510185397116 0,00126335172680047 0,00123647516470484 254303 258781 667 665 0 True 385 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 429 275 0,00597366686306652 0,00599046253766713 0,0059662775616083 0,00604257267109178 0,00146613577684514 0,00148893549166104 261120 261069 667 665 0 True 430 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 473 275 0,006007570716816 0,00617609484916227 0,00607309071488518 0,00622568093385214 0,00163968582446106 0,00166623065825127 262602 269159 667 665 0 True 474 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 518 274 0,00634592294148188 0,00627884657856589 0,0064087891966125 0,00628671702143893 0,00150973097496439 0,00154624625341361 277392 273637 667 665 0 True 519 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 561 273 0,0065544019018186 0,00654226548288781 0,00651560234988937 0,00659189745937285 0,00156824822533976 0,00150408943534809 286505 285117 667 665 0 True 563 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 608 274 0,00759599600520179 0,0069262880249376 0,00741588464179446 0,00694285496299687 0,00241758314992005 0,00179270734373015 332035 301853 667 665 0 False 608 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 649 273 0,00869446256500955 0,700023186829514 0,00866712443732357 0,695536736095216 0,0018494545672703 0,215381297975494 380051 30507553 667 665 12 True 652 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 252 318 0,00622536065453197 0,00602848388997213 0,00621042191195544 0,00607309071488518 0,00153613872037675 0,00145948869528235 272122 262726 667 665 0 False 252 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 297 318 0,00581460242641325 0,0059466358732721 0,00579842832074464 0,00604257267109178 0,00124958787179351 0,00127288203021025 254167 259159 667 665 0 False 297 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 340 320 0,0058651608048116 0,00596822796290337 0,00588998245212482 0,0059662775616083 0,00117586580319671 0,00124256755260338 256377 260100 667 665 0 True 341 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 385 320 0,00605394258695784 0,00609782639248614 0,00602731364919509 0,00608834973678187 0,0012434191018207 0,00114144460986853 264629 265748 667 665 0 True 385 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 429 319 0,00619600934254777 0,00634887745800757 0,00621042191195544 0,00643930724040589 0,00152753827703539 0,00162221766421577 270839 276689 667 665 0 True 430 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 474 319 0,00642736539718239 0,00652260084865402 0,00642404821850919 0,00660715648126955 0,00160828742450622 0,00162520011177691 280952 284260 667 665 0 True 474 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 518 319 0,00638293808005587 0,00639272706830019 0,00633249408712902 0,0063935301747158 0,00143928122289619 0,0015661238991736 279010 278600 667 665 0 True 519 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 561 317 0,00652189355082129 0,00658037861878317 0,00656137941557946 0,00651560234988937 0,00155772475985947 0,00135657458903986 285084 286778 667 665 0 True 563 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 608 318 0,00700812331302877 0,00687482037664544 0,00701915007248035 0,00689707789730678 0,00195498944261432 0,00197187384552633 306338 299610 667 665 0 False 608 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 652 318 0,00716087367165582 0,00680543198233625 0,00718699931334401 0,00674448767833982 0,00189747311783863 0,00173573587088647 313015 296586 667 665 0 False 652 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 252 364 0,00562332704098855 0,00571233531299065 0,00564583810177768 0,00572213321126116 0,00138925680194153 0,00147412215793768 245806 248948 667 665 0 True 252 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 296 364 0,00576125304251056 0,0058258716142611 0,00581368734264134 0,00588998245212482 0,00133505816945915 0,00127648459610452 251835 253896 667 665 0 True 297 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 342 365 0,00618880305784393 0,00616363522677144 0,00619516289005875 0,00614938582436866 0,00122255370911976 0,00124706691001612 270524 268616 667 665 0 True 341 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 385 364 0,00620413071102352 0,00648377638993341 0,00621042191195544 0,00648508430609598 0,00135222924552456 0,00127472064336943 271194 282568 667 665 0 True 385 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 430 364 0,00657352715265164 0,00660341629996254 0,00659189745937285 0,00659189745937285 0,00164712433251193 0,00172086932152681 287341 287782 667 665 0 True 430 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 474 363 0,00656691567239955 0,0065757206015726 0,00659189745937285 0,00659189745937285 0,00165287529419081 0,00153156592298482 287052 286575 667 665 0 True 474 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 519 363 0,00646993966967077 0,00617251528913839 0,00643930724040589 0,00608834973678187 0,00158589735391417 0,00162752809409843 282813 269003 667 665 0 True 519 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 561 362 0,00670475016554437 0,00675274820147186 0,00675974670023652 0,00674448767833982 0,00176708221447762 0,00160089717203955 293077 294290 667 665 0 True 563 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 605 362 0,00676116508008298 0,00683959842384629 0,00669871061264973 0,00679026474402991 0,00199245232143577 0,00203332870943075 295543 298075 667 665 0 True 608 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 649 361 0,00665904173113718 0,00652487249251534 0,00668345159075303 0,00659189745937285 0,00193354615378837 0,00185886401316688 291079 284359 667 665 0 True 652 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 253 408 0,00580403320884763 0,0058375740220315 0,00581368734264134 0,00578316929884794 0,00142580956705419 0,00150887697048231 253705 254406 667 665 0 True 252 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 297 409 0,00604483750342727 0,00594638346839862 0,00614938582436866 0,00592050049591821 0,00130258092307329 0,00134384936767518 264231 259148 667 665 0 True 297 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 342 409 0,00620902640920327 0,00637345251432541 0,00622568093385214 0,0063935301747158 0,00124837680257217 0,0012122106586101 271408 277760 667 665 0 True 341 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 385 408 0,00662371949754123 0,00648822789406567 0,00659189745937285 0,00656137941557946 0,0012903415242036 0,00140239925414832 289535 282762 667 665 0 True 385 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 430 408 0,00664019100543571 0,00695102370253856 0,00660715648126955 0,00695811398489357 0,00155079507158429 0,00147907615072078 290255 302931 667 665 0 True 430 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 474 407 0,0067360231534496 0,00669453445928853 0,00675974670023652 0,00671396963454643 0,00160683439410711 0,00146590095380131 294444 291753 667 665 0 True 474 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 517 406 0,00643884969851993 0,00646046335798296 0,00634775310902571 0,00654612039368277 0,00163168152690828 0,00167787772966482 281454 281552 667 665 0 True 519 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 561 406 0,00668230773603814 0,00702272963250424 0,00669871061264973 0,00700389105058366 0,00167779245777242 0,00157293881509144 292096 306056 667 665 0 True 563 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 606 406 0,00640039330300517 0,00633582124227942 0,00634775310902571 0,00645456626230259 0,00181853684627758 0,00186011380256094 279773 276120 667 665 0 True 608 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 650 406 0,00583713636429668 0,00592754488647804 0,00584420538643473 0,00587472343022812 0,00183337232272068 0,00171870884682743 255152 258327 667 665 0 True 652 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 253 453 0,0059445671991196 0,00584528384362141 0,00593575951781491 0,00587472343022812 0,00146113461997837 0,00141853238781945 259848 254742 667 665 0 True 252 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 296 453 0,00602944121896479 0,00613135034886369 0,0059662775616083 0,00613412680247196 0,00148333964253223 0,00149813547180969 263558 267209 667 665 0 True 297 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 342 452 0,00626683682649406 0,00655981909454341 0,00619516289005875 0,00653086137178607 0,00127698737043139 0,00147967513225213 273935 285882 667 665 0 True 341 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 385 452 0,00652068106482351 0,00641695793615419 0,00653086137178607 0,00642404821850919 0,00141545222065283 0,00136565107473192 285031 279656 667 665 0 True 385 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 430 453 0,00684317946314094 0,00703851641004548 0,00689707789730678 0,00701915007248035 0,00183784861565721 0,00196745767507715 299128 306744 667 665 0 True 430 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 473 451 0,00673634343276977 0,0067326246492863 0,00675974670023652 0,00671396963454643 0,00186168317627848 0,0018896190201576 294458 293413 667 665 0 True 474 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 518 451 0,00640791986702918 0,00654992941268254 0,0064087891966125 0,00650034332799268 0,00168022350282707 0,00162235937261079 280102 285451 667 665 0 True 519 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 563 451 0,00621081082255851 0,0064541302902484 0,00616464484626535 0,00642404821850919 0,0017454668628198 0,00195377016295832 271486 281276 667 665 0 True 563 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 606 450 0,0059401519199201 0,00587662793972801 0,00590524147402152 0,00582894636453803 0,00175050743794842 0,00179937982018972 259655 256108 667 665 0 True 608 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 650 450 0,00561575472277594 0,0056474672605065 0,0055542839703975 0,00569161516746777 0,00182579519461865 0,00181630525330428 245475 246121 667 665 0 True 652 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 254 497 0,00606451180452347 0,00596301924415066 0,00607309071488518 0,00604257267109178 0,0014175688839903 0,00136377564845288 265091 259873 667 665 0 True 252 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 298 497 0,00628770073649374 0,00613249764374314 0,00633249408712902 0,00619516289005875 0,00156871256435669 0,00152293462746082 274847 267259 667 665 0 True 297 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 342 497 0,00608507831229727 0,00621482752429253 0,00608834973678187 0,00628671702143893 0,00150522165942033 0,00141919235892277 265990 270847 667 665 0 True 341 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 385 496 0,00643987916776334 0,00650245435057087 0,00646982528419928 0,00646982528419928 0,00142932895745581 0,00155605544904614 281499 283382 667 665 0 True 385 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 430 496 0,0067033317856979 0,00682993820096132 0,00679026474402991 0,00686655985351339 0,00181583031739059 0,00180703067813067 293015 297654 667 665 0 True 430 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 475 495 0,00633244833294042 0,00660018092840249 0,00631723506523232 0,00653086137178607 0,00171727341431199 0,00174487081599129 276803 287641 667 665 0 True 474 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 520 495 0,00586248418477875 0,00572041226894198 0,00592050049591821 0,00569161516746777 0,00160763531122123 0,001568815486849 256260 249300 667 665 0 True 519 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 563 495 0,00580739614170942 0,00581807000908084 0,00576791027695125 0,00582894636453803 0,00168583565927482 0,00163890320642165 253852 253556 667 665 0 True 563 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 607 495 0,00565270123006704 0,00558422836675116 0,00566109712367437 0,00570687418936446 0,00169147580194962 0,00169044285905948 247090 243365 667 665 0 True 608 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 652 494 0,00561767639869697 0,00564079000430809 0,00556954299229419 0,00566109712367437 0,00177722928710407 0,00177005259476071 245559 245830 667 665 0 True 652 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 254 541 0,00614558822671521 0,00608890043832401 0,00611886778057527 0,00613412680247196 0,00134710747905017 0,00139951443260221 268635 265359 667 665 0 True 252 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 298 541 0,00622494886683461 0,00619750337161283 0,00621042191195544 0,00616464484626535 0,00145564650993876 0,00134169133516797 272104 270092 667 665 0 True 297 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 343 541 0,00633439288595574 0,0064854514404574 0,00634775310902571 0,00650034332799268 0,00142605874191455 0,0013506636827267 276888 282641 667 665 0 True 341 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 386 541 0,00634175931031966 0,00646041746618779 0,0064087891966125 0,00648508430609598 0,00137409428246057 0,00140968189348015 277210 281550 667 665 0 True 385 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 431 541 0,00607878711136535 0,00594899930072377 0,00610360875867857 0,00585946440833143 0,00178995305054641 0,00179023187376772 265715 259262 667 665 0 True 430 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 475 540 0,0059130654402714 0,00598835151508894 0,005981536583505 0,0059510185397116 0,00183739864680359 0,00191176832424584 258471 260977 667 665 0 True 474 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 519 539 0,00586333063726777 0,00571433160608089 0,00576791027695125 0,00570687418936446 0,00174777462385615 0,00178791939896128 256297 249035 667 665 0 True 519 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 564 539 0,0059108463621245 0,00617717330634896 0,00588998245212482 0,00622568093385214 0,00160129067476872 0,00178120891248174 258374 269206 667 665 0 True 563 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 608 538 0,00590780370858288 0,00572881046745956 0,00599679560540169 0,00573739223315786 0,00166150350282006 0,00153923603652713 258241 249666 667 665 0 True 608 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 652 538 0,00569092885463883 0,00573640555956153 0,00570687418936446 0,00573739223315786 0,0017198586407235 0,00189536261425137 248761 249997 667 665 0 True 652 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 253 585 0,0065076868752623 0,00632595450631615 0,00650034332799268 0,00636301213092241 0,00123331504977013 0,00114489003371404 284463 275690 667 665 0 True 252 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 298 586 0,00638387604092209 0,00636216313271161 0,0063782711528191 0,0064087891966125 0,00130721948216656 0,00136045395038141 279051 277268 667 665 0 True 297 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 342 585 0,00638620950454047 0,00625697913816356 0,0063782711528191 0,00622568093385214 0,00132462335994107 0,00136204293014005 279153 272684 667 665 0 True 341 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 386 584 0,0061402578637438 0,00613628371684533 0,00622568093385214 0,00610360875867857 0,00142158920899739 0,00119549900746872 268402 267424 667 665 0 True 386 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 431 585 0,00596980063413018 0,00586949176557783 0,00590524147402152 0,00584420538643473 0,00176453052573495 0,00175118558826628 260951 255797 667 665 0 True 430 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 475 584 0,00580147097428626 0,00588149247001688 0,00581368734264134 0,00593575951781491 0,00182483476500743 0,00170823115246768 253593 256320 667 665 0 True 474 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 520 583 0,00598293208625717 0,00594762254686843 0,00599679560540169 0,0059662775616083 0,00193258249007784 0,00186667824374639 261525 259202 667 665 0 True 519 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 563 579 0,00594619147281475 0,0063600980019286 0,0059662775616083 0,00633249408712902 0,00166979114356943 0,00170325904999634 259919 277178 667 665 0 False 563 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 608 583 0,00593681186415261 0,00585487522881362 0,0059510185397116 0,005981536583505 0,00140498990476532 0,00146808024205177 259509 255160 667 665 0 True 608 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 652 583 0,0058988587647124 0,00597795702348111 0,00590524147402152 0,00605783169298848 0,00159390974953932 0,0013868641814491 257850 260524 667 665 0 True 652 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 252 622 0,00655366983480107 0,00650846617573919 0,00651560234988937 0,00648508430609598 0,0013737060015638 0,00138136272245113 286473 283644 667 665 0 False 252 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 297 622 0,00628442931200914 0,00629330249404697 0,00633249408712902 0,00630197604333562 0,00133337831869907 0,00126709749983077 274704 274267 667 665 0 False 297 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 342 629 0,00598101041033615 0,00621253293453363 0,00599679560540169 0,00614938582436866 0,00124428342678055 0,00126830614455773 261441 270747 667 665 0 True 341 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 386 629 0,00586863812314488 0,00594158777580252 0,00590524147402152 0,00590524147402152 0,00126427709034507 0,0011991853478296 256529 258939 667 665 0 True 386 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 430 622 0,00563245500161341 0,00567624141608312 0,00569161516746777 0,00567635614557107 0,00158378403385284 0,00157512715599347 246205 247375 667 665 0 False 430 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 474 622 0,00570492963634914 0,00558849630370272 0,00569161516746777 0,00560006103608759 0,00180788995034643 0,00176435075151846 249373 243551 667 665 0 False 474 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 519 622 0,00605268434677145 0,00559425572399757 0,00602731364919509 0,00566109712367437 0,00176864842422985 0,00180585834896671 264574 243802 667 665 0 False 519 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 563 622 0,00631448981391657 0,00623607542545996 0,00633249408712902 0,00619516289005875 0,00173700521007649 0,00172110505388397 276018 271773 667 665 0 False 563 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 608 622 0,0060814866084925 0,00607469692771641 0,00608834973678187 0,00601205462729839 0,00132621316944518 0,00129302401830165 265833 264740 667 665 0 False 608 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 652 622 0,00613300582485136 0,00610867980204574 0,00610360875867857 0,00613412680247196 0,00150411468116058 0,00141708992327053 268085 266221 667 665 0 False 652 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 252 666 0,0620406894286892 0,511103462478581 0,00791943236438544 0,57099259937438 0,136682578733069 0,369811806366471 2711913 22274285 667 665 11 False 252 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 297 666 0,00717707065441873 0,00645167507920637 0,00663767452506294 0,00643930724040589 0,00281035870207002 0,00128144449750661 313723 281169 667 665 0 False 297 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 341 666 0,00597137915363673 0,00606198490045209 0,00599679560540169 0,00607309071488518 0,00125741038516129 0,00127434258455639 261020 264186 667 665 0 False 341 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 386 666 0,0059435148527819 0,00582660588298395 0,00587472343022812 0,00585946440833143 0,0014381744667315 0,00114854511129458 259802 253928 667 665 0 False 386 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 430 666 0,00558109592491463 0,00573450105006164 0,00556954299229419 0,00579842832074464 0,00146365605382965 0,00140881739072964 243960 249914 667 665 0 False 430 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 474 666 0,00563556628643792 0,00564813269153658 0,00567635614557107 0,00566109712367437 0,0016564183951349 0,00139019138439669 246341 246150 667 665 0 False 474 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 519 666 0,00598327524267164 0,00588557683978773 0,00599679560540169 0,0059510185397116 0,00164440796396864 0,00159625109734877 261540 256498 667 665 0 False 519 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 563 666 0,00609624233431465 0,00608818911549875 0,0059510185397116 0,00608834973678187 0,00152191092794991 0,00155456286128969 266478 265328 667 665 0 False 563 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 608 666 0,00621890931393996 0,00623646550571898 0,00624093995574884 0,00619516289005875 0,00135914079982708 0,00134448301499542 271840 271790 667 665 0 False 608 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 654 671 0,00826304632073984 0,708091492177457 0,0081177996490425 0,698023956664378 0,00195221147710632 0,192517816337483 361193 30859176 667 665 9 True 652 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A1_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A1_3.csv new file mode 100755 index 0000000..8955ce4 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A1_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 252 275 0,000925561481104264 0,0701906517265928 0,000778210116731518 0,0684672312504769 0,000743238171355606 0,019929621662569 40458 3058963 667 665 0 True 252 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 297 274 0,000880607990808899 0,000827956822704507 0,000762951094834821 0,000686655985351339 0,000639337534138418 0,000647876366416389 38493 36083 667 665 0 False 297 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 340 276 0,000791455954329999 0,000773529153623358 0,000656137941557946 0,000625619897764553 0,000633729821809025 0,000656823404249957 34596 33711 667 665 0 True 341 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 385 276 0,000841694053408178 0,000821394295994048 0,000701915007248035 0,000717174029144732 0,000647562805509774 0,0006027329765025 36792 35797 667 665 0 True 385 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 429 275 0,000880333465677324 0,000816024955958218 0,000671396963454643 0,000549324788281071 0,000836092180253781 0,000789337815146681 38481 35563 667 665 0 True 430 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 473 275 0,000852675058671168 0,000837823558667784 0,000579842832074464 0,000518806744487678 0,000854610700430947 0,000867151984473155 37272 36513 667 665 0 True 474 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 518 274 0,000878983717113748 0,000828782875017711 0,000701915007248035 0,000579842832074464 0,000795699930831976 0,000808655924107976 38422 36119 667 665 0 True 519 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 561 273 0,000943222597902239 0,000917262256120962 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000878099720296284 0,000752457486891681 41230 39975 667 665 0 True 563 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 608 274 0,000995748406410208 0,00100486969311583 0,000671396963454643 0,000747692072938125 0,000963142125550157 0,000938938734700769 43526 43793 667 665 0 False 608 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 649 273 0,00107650454928178 0,0691372744059737 0,00080872816052491 0,0675364309147784 0,000961779472297251 0,0234701720704789 47056 3013056 667 665 0 True 652 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 252 318 0,000844965477892777 0,000922470974873668 0,000656137941557946 0,000778210116731518 0,000710482485600173 0,000727610691699199 36935 40202 667 665 0 False 252 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 297 318 0,000807058132641164 0,000826878365517823 0,000686655985351339 0,000671396963454643 0,000616490048256926 0,000642089572598871 35278 36036 667 665 0 False 297 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 340 320 0,000876970532815533 0,000861343103696527 0,000793469138628214 0,000732433051041428 0,000624466956091398 0,000662626089147599 38334 37538 667 665 0 True 341 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 385 320 0,000794590116248811 0,000876510342002867 0,000671396963454643 0,000778210116731518 0,000636099777825506 0,000678771642312833 34733 38199 667 665 0 True 385 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 429 319 0,000770980954933382 0,000859920458046008 0,000518806744487678 0,000579842832074464 0,000762934689689628 0,00082636295945639 33701 37476 667 665 0 True 430 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 474 319 0,000845377265590139 0,000885734592833652 0,000579842832074464 0,000701915007248035 0,00080890669391539 0,000795466790255816 36953 38601 667 665 0 True 474 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 518 319 0,000811542043123552 0,000859576269582172 0,000610360875867857 0,000686655985351339 0,00072748976778383 0,000773964467164703 35474 37461 667 665 0 True 519 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 561 317 0,000937205922101892 0,000960056355124479 0,000701915007248035 0,000762951094834821 0,000912639418353018 0,000753304798091687 40967 41840 667 665 0 True 563 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 608 318 0,000924097347069198 0,000989587725321544 0,000488288700694286 0,000488288700694286 0,00104864390671938 0,00111887342390149 40394 43127 667 665 0 False 608 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 652 318 0,00100807916023677 0,000895922571363176 0,00064087891966125 0,000579842832074464 0,00103353203159693 0,000923389536638671 44065 39045 667 665 0 False 652 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 252 364 0,000808362127016144 0,000874238698141554 0,000686655985351339 0,000686655985351339 0,000716950240717613 0,000764787727023192 35335 38100 667 665 0 True 252 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 296 364 0,000821036037257178 0,000859668053172529 0,000656137941557946 0,000762951094834821 0,000693178796094174 0,000646719590817428 35889 37465 667 665 0 True 297 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 342 365 0,000783540479702927 0,000865152122696304 0,000671396963454643 0,000732433051041428 0,000625424186307319 0,000712540404279724 34250 37704 667 665 0 True 341 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 385 364 0,000847481958265546 0,000778600196990531 0,000717174029144732 0,000610360875867857 0,000649337651907373 0,000654073181467194 37045 33932 667 665 0 True 385 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 430 364 0,000856747181456193 0,000860379375997788 0,000610360875867857 0,000579842832074464 0,00078554569115541 0,000848307321419901 37450 37496 667 665 0 True 430 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 474 363 0,000899115560095896 0,000889428882345484 0,000610360875867857 0,000579842832074464 0,00083841350181902 0,000843582117648438 39302 38762 667 665 0 True 474 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 519 363 0,000908678185512417 0,000888924072598525 0,000595101853971161 0,000579842832074464 0,000890319458345424 0,000889337372864962 39720 38740 667 665 0 True 519 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 561 362 0,000996091562824676 0,00100018873000767 0,000747692072938125 0,000686655985351339 0,000956408897882508 0,000925561783612612 43541 43589 667 665 0 True 563 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 605 362 0,000972939943395206 0,000973663272394766 0,000534065766384375 0,000488288700694286 0,00109533296767795 0,00113518368989474 42529 42433 667 665 0 True 608 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 649 361 0,000854139192706233 0,000931672279806864 0,000473029678797589 0,000473029678797589 0,000936469830417239 0,00103211617781717 37336 40603 667 665 0 True 652 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 253 408 0,000853475756971594 0,000812743692602988 0,000717174029144732 0,000625619897764553 0,000739505097620702 0,000730129328296652 37307 35420 667 665 0 True 252 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 297 409 0,000909959302793099 0,000851017449781469 0,000732433051041428 0,000747692072938125 0,000768182251134799 0,000668090677593289 39776 37088 667 665 0 True 297 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 342 409 0,000822362908726456 0,000846129973595008 0,000701915007248035 0,000717174029144732 0,000647301736829755 0,000655326772694895 35947 36875 667 665 0 True 341 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 385 408 0,000899161314284492 0,000797140482242457 0,000732433051041428 0,000610360875867857 0,000757572812931424 0,000737749989161362 39304 34740 667 665 0 True 385 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 430 408 0,000887905783889927 0,000860241700612254 0,000671396963454643 0,00064087891966125 0,000822291303237715 0,000787372559251092 38812 37490 667 665 0 True 430 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 474 407 0,00080568550698329 0,000891585796718851 0,000549324788281071 0,000686655985351339 0,000799688556420529 0,000750757261954415 35218 38856 667 665 0 True 474 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 517 406 0,000871983326258592 0,000878827877659358 0,000610360875867857 0,000610360875867857 0,000797598026899145 0,00084864218015389 38116 38300 667 665 0 True 519 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 561 406 0,00107156309691343 0,000998330112302959 0,000839246204318303 0,000839246204318303 0,000980183228340108 0,000798020238790985 46840 43508 667 665 0 True 563 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 606 406 0,00100734709321924 0,000869420059647861 0,000579842832074464 0,000457770656900893 0,00104819749531125 0,000965586250737276 44033 37890 667 665 0 True 608 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 650 406 0,000950039972003012 0,000918868468952193 0,000610360875867857 0,000564583810177768 0,000971548760389934 0,000930721786594073 41528 40045 667 665 0 True 652 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 253 453 0,000834556399987235 0,000883715353845818 0,000686655985351339 0,000778210116731518 0,000745179540017784 0,000705371356461678 36480 38513 667 665 0 True 252 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 296 453 0,000817307070886621 0,000936192621631901 0,000701915007248035 0,000839246204318303 0,000718008112181315 0,000759478350456811 35726 40800 667 665 0 True 297 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 342 452 0,000820441232805433 0,000775709013894315 0,000686655985351339 0,000610360875867857 0,000681374445121638 0,000692346478597264 35863 33806 667 665 0 True 341 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 385 452 0,000858554471905727 0,000888143912080499 0,000686655985351339 0,000732433051041428 0,000745297589417498 0,000747106298464913 37529 38706 667 665 0 True 385 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 430 453 0,00082199687521769 0,000889727179014141 0,000503547722590982 0,000488288700694286 0,000884761653890283 0,000969366166117637 35931 38775 667 665 0 True 430 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 473 451 0,00087102248829808 0,000980753554749772 0,000503547722590982 0,00064087891966125 0,000946982563325253 0,0010329222904863 38074 42742 667 665 0 True 474 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 518 451 0,000806692099132398 0,000863041100118114 0,000503547722590982 0,000579842832074464 0,000836723879711029 0,000865826534584812 35262 37612 667 665 0 True 519 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 563 451 0,00088243815835273 0,000889589503628607 0,000579842832074464 0,000564583810177768 0,000895757319202554 0,000915848249707024 38573 38769 667 665 0 True 563 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 606 450 0,000817810366961175 0,000916505041500524 0,0004272526131075 0,000610360875867857 0,000917112138243054 0,000939496149972359 35748 39942 667 665 0 True 608 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 650 450 0,000744191877510547 0,000797897696862894 0,000396734569314107 0,000289921416037232 0,000841489094035073 0,000959282048245909 32530 34773 667 665 0 True 652 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 254 497 0,000871502907278336 0,000905536902452974 0,000717174029144732 0,000778210116731518 0,000701571602793811 0,000740056858931345 38095 39464 667 665 0 True 252 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 298 497 0,000843112433254648 0,000858566650088256 0,000701915007248035 0,000717174029144732 0,000758548778199392 0,000746612576281388 36854 37417 667 665 0 True 297 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 342 497 0,000890490895545589 0,000892205335953755 0,000686655985351339 0,000747692072938125 0,000792538410398665 0,000787496096808559 38925 38883 667 665 0 True 341 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 385 496 0,000898909666247215 0,000864784988334879 0,000762951094834821 0,000686655985351339 0,000749591634194633 0,000781001627681493 39293 37688 667 665 0 True 385 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 430 496 0,000877290812135704 0,000876120261743854 0,000503547722590982 0,000503547722590982 0,000938205879139436 0,000921089194194203 38348 38182 667 665 0 True 430 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 475 495 0,000868986426905568 0,000846405324366077 0,000549324788281071 0,000518806744487678 0,000903827323727072 0,000865111219072428 37985 36887 667 665 0 True 474 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 520 495 0,000870221789997654 0,000868295710665999 0,000579842832074464 0,000610360875867857 0,000868263982825564 0,000864909282872628 38039 37841 667 665 0 True 519 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 563 495 0,000950794916114843 0,000904963255013248 0,000656137941557946 0,000579842832074464 0,000955126298540753 0,000929000242245455 41561 39439 667 665 0 True 563 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 607 495 0,000882712683484305 0,00087481234558128 0,000534065766384375 0,000610360875867857 0,000944311280520646 0,000864329261165453 38585 38125 667 665 0 True 608 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 652 494 0,000928993045248948 0,000828553416041821 0,000564583810177768 0,000396734569314107 0,00095519114841205 0,000932882781993281 40608 36109 667 665 0 True 652 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 254 541 0,000878686314887875 0,000884816756930091 0,000732433051041428 0,000701915007248035 0,000706541315845956 0,000736121133240152 38409 38561 667 665 0 True 252 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 298 541 0,000792165144253234 0,000841517848179616 0,000656137941557946 0,000717174029144732 0,000719688808950152 0,000709166429852597 34627 36674 667 665 0 True 297 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 343 541 0,000911514945205356 0,000803542387669793 0,000762951094834821 0,000701915007248035 0,000758189136049035 0,000706387477972504 39844 35019 667 665 0 True 341 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 386 541 0,000885961230874606 0,000768297488973062 0,000686655985351339 0,000579842832074464 0,000719163397569195 0,000712300350522091 38727 33483 667 665 0 True 385 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 431 541 0,000863656063934158 0,000894752330586136 0,000442511635004196 0,000503547722590982 0,00094663850951796 0,000955028960562311 37752 38994 667 665 0 True 430 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 475 540 0,000800561037860562 0,000929400635945552 0,000442511635004196 0,000473029678797589 0,000910984279161962 0,00105132009143451 34994 40504 667 665 0 True 474 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 519 539 0,000805868523737673 0,00080664008384431 0,000473029678797589 0,000320439459830625 0,000865674195450336 0,000970921088979502 35226 35154 667 665 0 True 519 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 564 539 0,000880104694734345 0,000935756649577709 0,000595101853971161 0,000610360875867857 0,000879148755252742 0,000936951860656785 38471 40781 667 665 0 True 563 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 608 538 0,000821379193671647 0,000860815348051979 0,000549324788281071 0,000610360875867857 0,000806241853579689 0,000828628152217341 35904 37515 667 665 0 True 608 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 652 538 0,000853315617311509 0,000790027253989861 0,000473029678797589 0,000350957503624018 0,000925316357600101 0,000921812018398852 37300 34430 667 665 0 True 652 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 253 585 0,000917279972968425 0,000863637693455428 0,00080872816052491 0,000747692072938125 0,00063828237673552 0,000581052208058595 40096 37638 667 665 0 True 252 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 298 586 0,000879189610962429 0,00084422546409512 0,000747692072938125 0,000701915007248035 0,000665947127176833 0,000717867243507519 38431 36792 667 665 0 True 297 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 342 585 0,000866607209098586 0,000818984976747201 0,000747692072938125 0,000656137941557946 0,000676268604736952 0,000714697340808831 37881 35692 667 665 0 True 341 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 386 584 0,000819251623901942 0,000823459426777059 0,000671396963454643 0,000732433051041428 0,000665609791025583 0,000614192346562836 35811 35887 667 665 0 True 386 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 431 585 0,000771461373913638 0,000786172343194907 0,0004272526131075 0,000335698481727321 0,00086224319970167 0,000945036960270955 33722 34262 667 665 0 True 430 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 475 584 0,000844919723704181 0,000856547411100422 0,000473029678797589 0,000488288700694286 0,000962703586354931 0,000885684317712622 36933 37329 667 665 0 True 474 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 520 583 0,000870679331883612 0,00075246481963664 0,000381475547417411 0,000244144350347143 0,0010076709518346 0,000998778492946193 38059 32793 667 665 0 True 519 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 563 579 0,000838376874734983 0,000865840499623974 0,000503547722590982 0,000503547722590982 0,000831283562406293 0,000899401366262621 36647 37734 667 665 0 False 563 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 608 583 0,000887562627475459 0,000873550321213884 0,000579842832074464 0,000686655985351339 0,00083559404638172 0,000763660266199058 38797 38070 667 665 0 True 608 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 652 583 0,000883078716993071 0,00091636736611499 0,000610360875867857 0,000671396963454643 0,000830140633135479 0,000796150612800014 38601 39936 667 665 0 True 652 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 252 622 0,000875529275874766 0,000895440707513806 0,000778210116731518 0,000747692072938125 0,000648236551107195 0,000684624831881096 38271 39024 667 665 0 False 252 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 297 622 0,000857387740096534 0,000857488192901572 0,000762951094834821 0,000747692072938125 0,000657530157838807 0,000670126589179838 37478 37370 667 665 0 False 297 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 342 629 0,000849975561544016 0,000905743415531275 0,000747692072938125 0,00080872816052491 0,000662362962630098 0,000698052166187561 37154 39473 667 665 0 True 341 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 386 629 0,000836226427870981 0,000792413627339119 0,000701915007248035 0,000701915007248035 0,000646245605791994 0,000596854287182195 36553 34534 667 665 0 True 386 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 430 622 0,000830575785579401 0,000836790993276278 0,000579842832074464 0,000549324788281071 0,000821343527721383 0,000838936749676172 36306 36468 667 665 0 False 430 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 474 622 0,00084210584110554 0,000847759132323829 0,000442511635004196 0,000381475547417411 0,000950580355225822 0,000980251160442288 36810 36946 667 665 0 False 474 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 519 622 0,000940225698549215 0,000840301715607398 0,000564583810177768 0,000411993591210803 0,000997317502419533 0,000943940191413753 41099 36621 667 665 0 False 519 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 563 622 0,000851325310107592 0,000881168359213438 0,000610360875867857 0,000579842832074464 0,000803697473419798 0,000901370311876172 37213 38402 667 665 0 False 563 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 608 622 0,000842860785217371 0,000906615359639658 0,000625619897764553 0,000732433051041428 0,000735696388931337 0,000693107750958473 36843 39511 667 665 0 False 608 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 652 622 0,000861414108692964 0,000915311854825895 0,000671396963454643 0,000762951094834821 0,000720400294433828 0,00075102977205056 37654 39890 667 665 0 False 652 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 252 666 0,00608667970889813 0,0511716691591648 0,00105287251087205 0,0560311284046693 0,0131542935262506 0,0381083439487118 266060 2230101 667 665 0 False 252 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 297 666 0,000904011258275646 0,000879998118436398 0,000747692072938125 0,000778210116731518 0,000709934653929176 0,000653617021948161 39516 38351 667 665 0 False 297 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 341 666 0,000832177182180253 0,000849319453359882 0,000717174029144732 0,000701915007248035 0,000625759055948945 0,000668753815301534 36376 37014 667 665 0 False 341 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 386 666 0,000861574248353049 0,000796520943007553 0,000732433051041428 0,000686655985351339 0,000640597755709893 0,000599221796164613 37661 34713 667 665 0 False 386 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 430 666 0,000753731625832769 0,000892572470315179 0,000549324788281071 0,000732433051041428 0,000713438377725208 0,000735137640968517 32947 38899 667 665 0 False 430 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 474 666 0,000783014306534076 0,000883187598201271 0,000503547722590982 0,000732433051041428 0,000787966126688448 0,000736060604455071 34227 38490 667 665 0 False 474 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 519 666 0,000841076371862135 0,000881742006653163 0,000488288700694286 0,000595101853971161 0,000898394970583653 0,000835512999639097 36765 38427 667 665 0 False 519 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 563 666 0,000871091119580974 0,00092524742848194 0,00064087891966125 0,000701915007248035 0,000802511036061059 0,000822076619555555 38077 40323 667 665 0 False 563 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 608 666 0,000901311761148494 0,000971414574431042 0,000778210116731518 0,000839246204318303 0,000693209996449759 0,000729969603361682 39398 42335 667 665 0 False 608 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 654 671 0,00104321837707834 0,0696076882524462 0,000900282291905089 0,0679636835278859 0,000771734979457902 0,0204821188691098 45601 3033557 667 665 0 True 652 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A2_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A2_1.csv new file mode 100755 index 0000000..51d24bb --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A2_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 274 258 0,0100017512415685 0,04597768167271 0,0100251773861295 0,0458686198214694 0,00145042932934315 0,00918176920926391 437195 2003743 667 665 0 True 274 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 318 258 0,0100137617160749 0,00973573783394169 0,0100404364080262 0,00987258716716258 0,00126843867172828 0,00127681471254466 437720 424291 667 665 0 False 318 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 363 258 0,00990486674721692 0,0715290629870625 0,00990310521095598 0,068863965819791 0,00125602925455326 0,0147131103886838 432960 3117292 667 665 0 True 363 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 408 258 0,0101354678577397 0,0913977091963142 0,010101472495613 0,0908216983291371 0,00141624874075478 0,0128245447193503 443040 3983183 667 665 0 True 407 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 451 256 0,0102742174346564 0,0781532912161383 0,0102388036926833 0,0744945448996719 0,0016168781761745 0,0166320650573526 449105 3405981 667 665 0 True 451 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 494 256 0,0101569723263797 0,0746009450267922 0,0101777676050965 0,077759975585565 0,0016044761106782 0,0245575807418666 443980 3251167 667 665 0 True 496 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 540 257 0,0102623213456215 0,0860489057388263 0,0102388036926833 0,0824750133516442 0,00148494206690824 0,0250107309375993 448585 3750078 667 665 0 True 540 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 584 257 0,0101816567111272 0,077162739763118 0,0102235446707866 0,0738231479362173 0,00174733261577739 0,0228362091215381 445059 3362812 667 665 0 True 584 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 629 259 0,00981495976662618 0,00981379977753952 0,00994888227664607 0,00988784618905928 0,00184400601992881 0,0018694007522953 429030 427693 667 665 0 False 629 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 670 257 0,0100276938665023 0,0462678096018256 0,00999465934233616 0,0453955901426719 0,00178726593825064 0,00895007917718457 438329 2016387 667 665 0 True 673 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 274 302 0,00981379303481699 0,00989509709269741 0,0097962920576791 0,00990310521095598 0,00142952573525065 0,00143515287230148 428979 431236 667 665 0 False 274 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 318 302 0,00989907884235955 0,0101005087679143 0,00993362325474937 0,0101319905394064 0,00127812907430058 0,00119179522850517 432707 440188 667 665 0 False 318 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 362 302 0,0101203918525974 0,126854283798303 0,0101777676050965 0,120332646677348 0,00128138734286928 0,0417742981026841 442381 5528408 667 665 0 True 363 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 408 302 0,0103076408694257 0,0578028499952101 0,0103150988021668 0,0562294956893263 0,00144690478323736 0,0102896325002811 450566 2519093 667 665 0 True 407 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 451 302 0,0103722229066286 0,0858382623989592 0,0103456168459602 0,0819562066071565 0,00182241333963796 0,017001519000468 453389 3740898 667 665 0 True 451 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 496 302 0,0102106877437912 0,0443469167310586 0,0102693217364767 0,0464179446097505 0,00160771571550378 0,00842555172667696 446328 1932673 667 665 0 True 496 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 540 302 0,0100843604290782 0,0487154714435436 0,0100099183642329 0,0519264515144579 0,0015880915196659 0,0116828032168037 440806 2123058 667 665 0 True 540 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 584 301 0,0100407566873464 0,0606527993134587 0,0101472495613031 0,0587167162584878 0,00184200718564109 0,0161750055582236 438900 2643296 667 665 0 True 584 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 629 302 0,00981317535327095 0,00969106217133587 0,0097962920576791 0,00975051499198901 0,00191735046071104 0,00190438681196304 428952 422344 667 665 0 False 629 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 673 302 0,00977364373432419 0,00965912148189196 0,0097962920576791 0,00973525597009232 0,00188853215277351 0,00195271025844941 427224 420952 667 665 0 False 673 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 275 346 0,0100580288935413 0,0601667363648306 0,0101319905394064 0,0593881132219425 0,00146649119035694 0,0147169857845338 439655 2622113 667 665 0 True 274 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 319 346 0,0100124805987942 0,071240220028212 0,0100404364080262 0,07348744945449 0,00136836608511085 0,0219058213490498 437664 3104704 667 665 0 True 318 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 364 346 0,0100906516300101 0,0443026311487118 0,0101625085831998 0,0440680552376593 0,00133256996282673 0,00993759204074938 441081 1930743 667 665 0 True 363 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 409 346 0,0103630491918152 0,0372111326611333 0,010452429999237 0,0386358434424353 0,00147327331412277 0,0063102801466681 452988 1621690 667 665 0 True 407 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 452 345 0,010225031681916 0,0789380638595803 0,0102235446707866 0,0731670099946593 0,0016856083919864 0,0165536586190423 446955 3440182 667 665 0 True 451 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 496 346 0,0102352119888785 0,0367500577949796 0,0102082856488899 0,0367284657053483 0,00166214091377091 0,00730463608634149 447400 1601596 667 665 0 True 496 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 540 346 0,0103041406739981 0,0313496719597116 0,0103456168459602 0,0315403982604715 0,00166697975274746 0,00471541814951979 450413 1366243 667 665 0 True 540 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 585 346 0,0101394942263361 0,05639477498966 0,01025406271458 0,0542610818646525 0,00187064055580715 0,0123021294212271 443216 2457728 667 665 0 True 584 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 628 345 0,0100922072724224 0,0633076855563032 0,0101777676050965 0,0617532616159304 0,00197525355019008 0,016535991199497 441149 2758998 667 665 0 True 629 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 673 345 0,0099322048749029 0,0694366036400225 0,0100709544518196 0,0683604180972 0,00186227300875429 0,0205192355561673 434155 3026101 667 665 0 True 673 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 275 390 0,00987704820055067 0,0496587314016329 0,00990310521095598 0,0508278019378958 0,00149481023982267 0,0134542906275006 431744 2164166 667 665 0 True 274 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 321 390 0,0100342367154715 0,0334498640742392 0,0100709544518196 0,0337071793698024 0,00135827731775163 0,00524852800403873 438615 1457771 667 665 0 True 318 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 364 390 0,0101741301471031 0,0963045058285448 0,0101472495613031 0,0929579613946746 0,0013552513546732 0,0221777439204741 444730 4197025 667 665 0 True 363 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 409 390 0,0103700495826703 0,0737557558349983 0,0104219119554437 0,0709086747539483 0,0015454986887402 0,020232031163962 453294 3214333 667 665 0 True 407 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 453 389 0,0105255909468017 0,0469559800164178 0,0105287251087205 0,0481879911497673 0,00166975880299581 0,00952183466663625 460093 2046378 667 665 0 True 451 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 497 390 0,0105312415890933 0,0575838314027229 0,0105897611963073 0,0571602960250248 0,00183156621021569 0,011207893010893 460340 2509548 667 665 0 True 496 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 540 390 0,0103255307571666 0,0444584796851364 0,0103608758678569 0,0453650720988785 0,00161938076409307 0,00641079646469135 451348 1937535 667 665 0 True 540 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 585 390 0,0101432003156124 0,0541550947636888 0,0101167315175097 0,0528419928282597 0,00184332726147739 0,00876530522867381 443378 2360121 667 665 0 True 584 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 629 389 0,0099387706009664 0,0462748998841806 0,0100099183642329 0,0445105668726635 0,00185255472026746 0,0109255710061781 434442 2016696 667 665 0 True 628 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 673 389 0,00998308353262142 0,0911782316858753 0,00997940032043946 0,0856641489280537 0,00185363158694553 0,0190771875992516 436379 3973618 667 665 0 True 673 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 276 435 0,0101143294226085 0,0460955088568296 0,0101319905394064 0,045838101777676 0,00150036311848447 0,0078163869784292 442116 2008878 667 665 0 True 274 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 319 434 0,0102234531624094 0,0642798343994571 0,0102082856488899 0,0632028686961166 0,00148171422615308 0,012907387570583 446886 2801365 667 665 0 True 318 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 365 434 0,0102851526857308 0,0371807522927254 0,0103456168459602 0,0381780727855345 0,00135558088041849 0,00600570472704892 449583 1620366 667 665 0 True 363 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 408 433 0,0104170848885468 0,053318051365539 0,010406652933547 0,0547188525215534 0,00155500213296669 0,00946434237419842 455350 2323642 667 665 0 True 407 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 453 434 0,0104973834895324 0,103354793484053 0,0104982070649271 0,101579308766308 0,00182616355093921 0,0152532989947355 458860 4504282 667 665 0 True 451 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 497 434 0,0106191582624801 0,0677976011211366 0,0105439841306172 0,0652475776302739 0,00173551650513753 0,0176097101425548 464183 2954672 667 665 0 True 495 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 541 434 0,0104944552214623 0,0562154298541043 0,0104676890211337 0,0543221179522393 0,00175568871148066 0,0105739522355806 458732 2449912 667 665 0 True 540 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 584 432 0,0103494601978022 0,0317238966034909 0,0104829480430304 0,0322575722896162 0,00186656678566521 0,00524849037978095 452394 1382552 667 665 0 False 584 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 629 433 0,0101499033042417 0,040863270559094 0,0101625085831998 0,0410009918364233 0,00186490702187296 0,0059371977848827 443671 1780853 667 665 0 True 628 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 673 433 0,0100940603170605 0,0689421424928767 0,0101319905394064 0,0683146410315099 0,00196484545357673 0,0108987581458149 441230 3004552 667 665 0 True 673 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 275 479 0,0101491254830355 0,0576410814172075 0,0101167315175097 0,05810635538262 0,0015523704198652 0,0162095892822788 443637 2512043 667 665 0 True 274 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 319 478 0,0100816380548568 0,0608365959531468 0,0100709544518196 0,0599069199664302 0,00155988942739716 0,012593357982961 440687 2651306 667 665 0 True 318 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 363 477 0,0104356153349281 0,0758416067635328 0,0104676890211337 0,0722362096589609 0,00151826282860189 0,023480865216173 456160 3305236 667 665 0 True 363 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 408 478 0,0107363804936625 0,0960837433478409 0,0108339055466545 0,0909742885481041 0,0017368862791776 0,0242421111378596 469307 4187404 667 665 0 True 407 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 452 477 0,0107573359120394 0,104291835103896 0,0107423514152743 0,0974288548104067 0,00194232498320283 0,0392478552882127 470223 4545119 667 665 0 True 451 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 496 478 0,0105028282379753 0,0469661221031521 0,0105287251087205 0,0486915388723583 0,00180541002676119 0,00709039156512768 459098 2046820 667 665 0 True 495 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 540 477 0,0105251105278215 0,0405189214739756 0,0105439841306172 0,0420996414129854 0,00184460591540236 0,00655669599555917 460072 1765846 667 665 0 True 540 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 584 477 0,0103539212311903 0,10320901819667 0,0102845807583734 0,101121538109407 0,00188527118811085 0,0189951321814469 452589 4497929 667 665 0 True 584 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 629 478 0,0103230371538882 0,0581454551921117 0,0102693217364767 0,0628366521705959 0,00185776034124683 0,0129290126615849 451239 2534024 667 665 0 True 628 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 672 477 0,0100643658486618 0,0745407349915186 0,0100862134737163 0,0723125047684443 0,00192653205452276 0,0131328508454891 439932 3248543 667 665 0 True 673 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 276 523 0,00990422618857657 0,0577374312411838 0,00990310521095598 0,0606851300831617 0,00146950060478705 0,0142617382807268 432932 2516242 667 665 0 True 274 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 319 522 0,0103775990237886 0,107426129985068 0,0103761348897536 0,0998702983138781 0,00156749259685521 0,0323674929074533 453624 4681714 667 665 0 True 318 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 363 522 0,0105072206400805 0,0599722469368661 0,0104676890211337 0,0629892423895628 0,00147375041594974 0,0154830218429083 459290 2613637 667 665 0 True 362 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 408 522 0,0108841893999212 0,0616980308404337 0,0109102006561379 0,0610818646524758 0,00169950522357318 0,0104017108008276 475768 2688848 667 665 0 True 407 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 452 521 0,0108614266910948 0,0581298519817511 0,0108796826123445 0,0596475165941863 0,00195404781255671 0,0112462517300526 474773 2533344 667 665 0 True 451 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 496 522 0,0105603870072288 0,0617109952725714 0,0105897611963073 0,0622415503166247 0,0018854036495318 0,0146670211692249 461614 2689413 667 665 0 True 495 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 541 522 0,0104889189646422 0,0756028317532215 0,0104219119554437 0,072129396505684 0,00176736383121059 0,0178461644278065 458490 3294830 667 665 0 True 540 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 584 522 0,0102514318487357 0,0570759698513852 0,0102693217364767 0,0584115358205539 0,00171953857802372 0,0140731138385713 448109 2487415 667 665 0 True 584 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 629 522 0,0100847035854927 0,0441388203858238 0,0100251773861295 0,0432745860990311 0,00190216786452889 0,00758298717300383 440821 1923604 667 665 0 True 628 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 673 521 0,00994515331027551 0,0643679925379941 0,00997940032043946 0,0639047837033646 0,00197437484833367 0,0146430706266615 434721 2805207 667 665 0 True 673 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 276 568 0,0097485018076908 0,0476330675624745 0,00973525597009232 0,0487220569161517 0,00132394484053688 0,00997176266733144 426125 2075886 667 665 0 True 274 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 320 567 0,00999406453788441 0,0551080837823559 0,00993362325474937 0,0558327611200122 0,00149155819158435 0,0113188692357023 436859 2401653 667 665 0 True 318 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 363 566 0,0103720627669685 0,0518734005992321 0,010406652933547 0,0524605172808423 0,00139794728932582 0,0129942192851092 453382 2260683 667 665 0 True 362 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 408 566 0,0104436451950267 0,0533596981696631 0,0105592431525139 0,0531166552224002 0,00164796387169424 0,00860370031337953 456511 2325457 667 665 0 True 407 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 452 566 0,010540049270398 0,0908044430141502 0,0105592431525139 0,0840772106507973 0,00199310584201954 0,0253354853747323 460725 3957328 667 665 0 True 451 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 497 567 0,0104379259214522 0,0637984065221419 0,0104676890211337 0,0618600747692073 0,00198313845077841 0,0123878834185003 456261 2780384 667 665 0 True 495 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 540 566 0,0103946424590406 0,056809384413196 0,0104829480430304 0,056092164492256 0,00185340272523649 0,00983631504700252 454369 2475797 667 665 0 True 540 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 585 566 0,0101255391988144 0,0366677508603278 0,0101319905394064 0,0387273975738155 0,00186435202530111 0,00684700882684088 442606 1598009 667 665 0 True 584 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 629 565 0,0100354034472807 0,0486084976689836 0,0100404364080262 0,0480659189745937 0,00173998832888528 0,00910893169868945 438666 2118396 667 665 0 True 628 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 673 565 0,00997075277879486 0,0516659696850274 0,00997940032043946 0,0509956511787594 0,00172761668536267 0,00785072121795973 435840 2251643 667 665 0 True 673 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 274 606 0,00971407178077247 0,00946316351648175 0,00962844281681544 0,00956740672922866 0,0016287137283586 0,00138602571689492 424620 412412 667 665 0 False 274 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 318 606 0,00974971429368859 0,00974392951938097 0,00962844281681544 0,00971999694819562 0,00156787729941932 0,00139319811953827 426178 424648 667 665 0 False 318 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 364 611 0,00996148755560421 0,0774063104660254 0,0100404364080262 0,0739147020675975 0,00145519335719897 0,0137060494901711 435435 3373427 667 665 0 True 362 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 408 610 0,0102665307309723 0,0796277945952086 0,0103150988021668 0,0773174639505608 0,00150705004291781 0,0256410754656988 448769 3470241 667 665 0 True 407 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 451 606 0,0103399662036686 0,010328820448925 0,0103303578240635 0,0104676890211337 0,00208329796016438 0,00198723211429055 451979 450138 667 665 0 False 451 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 495 606 0,0100975147582995 0,0101398380363819 0,0100556954299229 0,0102082856488899 0,00192517137087444 0,00197755115316482 441381 441902 667 665 0 False 495 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 540 606 0,00992003426073642 0,00987733696796351 0,0100099183642329 0,00985732814526589 0,00189535830970461 0,00207647972974089 433623 430462 667 665 0 False 540 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 584 606 0,00991182138388348 0,00994199850736936 0,00994888227664607 0,0100556954299229 0,0016127325729349 0,00176908677155089 433264 433280 667 665 0 False 584 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 628 606 0,00978169647151705 0,00989319258319752 0,00975051499198901 0,00991836423285267 0,00149664975699314 0,00147927663510011 427576 431153 667 665 0 False 628 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 673 606 0,00981598923586959 0,00980335939413652 0,0097962920576791 0,00973525597009232 0,00156311684229395 0,0017466492252845 429075 427238 667 665 0 False 673 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 274 649 0,0113677654191902 0,0344260284494711 0,0097962920576791 0,0401770046540017 0,00597448034937347 0,0180401442937033 496906 1500313 667 665 0 False 274 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 318 649 0,00949216396608288 0,00932592410300184 0,00953688868543526 0,0093842984664683 0,0013285389911301 0,00124496342893155 414920 406431 667 665 0 False 318 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 362 649 0,0104667968144561 0,00975808713819339 0,00968947890440223 0,00978103303578241 0,00425829545876663 0,00120055440385064 457523 425265 667 665 0 False 362 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 407 649 0,0103283446397653 0,00982538745582198 0,00988784618905928 0,00985732814526589 0,00265885776288257 0,0013052396060676 451471 428198 667 665 0 False 407 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 451 649 0,00997038674528609 0,00973309905571895 0,00994888227664607 0,00968947890440223 0,00166167137157932 0,00161391864472216 435824 424176 667 665 0 False 451 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 495 649 0,00974438393071718 0,00982231270554505 0,00971999694819562 0,00985732814526589 0,00171421587948177 0,00174459560461111 425945 428064 667 665 0 False 495 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 540 649 0,00976076393023447 0,00992476613828001 0,00973525597009232 0,00990310521095598 0,00177622706981159 0,00172878481228081 426661 432529 667 665 0 False 540 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 584 649 0,00956559943877912 0,00977880728371627 0,00961318379491875 0,00984206912336919 0,00139005929814652 0,00127725702813536 418130 426168 667 665 0 False 584 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 628 650 0,00983092797844612 0,00956788859307803 0,00978103303578241 0,00961318379491875 0,00137622030949184 0,00130893491469957 429728 416976 667 665 0 False 628 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 673 655 0,00982699311822688 0,0431751615247778 0,00993362325474937 0,0430151827267872 0,00141001037134734 0,00874375930536148 429556 1881607 667 665 0 True 673 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A2_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A2_2.csv new file mode 100755 index 0000000..347c0fc --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A2_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 274 258 0,00798872708301377 0,733072231964668 0,00775158312352178 0,742885481040665 0,00193745301494943 0,196017489586903 349202 31947856 667 665 12 True 274 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 318 258 0,0062413288663519 0,00596487786185537 0,00621042191195544 0,00593575951781491 0,00146203023946041 0,00124471980158978 272820 259954 667 665 0 False 318 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 363 258 0,00586891264827646 0,00605216405628399 0,00587472343022812 0,00605783169298848 0,00117089474039123 0,00118328915374284 256541 263758 667 665 0 True 363 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 408 258 0,00597288904186039 0,00610828972178673 0,00599679560540169 0,00616464484626535 0,00136694982902961 0,00130269775888099 261086 266204 667 665 0 True 407 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 451 256 0,00615931448329394 0,00617685206378271 0,00621042191195544 0,00621042191195544 0,00146168578477676 0,00157103724059344 269235 269192 667 665 0 True 451 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 494 256 0,00632817031630671 0,0062650331482173 0,0063782711528191 0,00627145799954223 0,0015380817825386 0,00143193868113093 276616 273035 667 665 0 True 496 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 540 257 0,0062587840893012 0,00638958348033049 0,00622568093385214 0,00642404821850919 0,00149064034587103 0,0014682407012385 273583 278463 667 665 0 True 540 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 584 257 0,00650311145640272 0,00666227252727837 0,00659189745937285 0,00663767452506294 0,00171098563149158 0,00179037264107588 284263 290347 667 665 0 True 584 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 629 259 0,00756323600616721 0,00717922065406134 0,00746166170748455 0,00730907148851759 0,00214257080335339 0,00170073379929564 330603 312876 667 665 0 False 629 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 670 257 0,00879221638894446 0,748229006941708 0,00880445563439384 0,749248493171588 0,00184107229242951 0,17972186774507 384324 32608400 667 665 13 True 673 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 274 302 0,00613641451190175 0,00585893665268688 0,00604257267109178 0,00592050049591821 0,00145355294611948 0,00139161733782086 268234 255337 667 665 0 False 274 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 318 302 0,00590027714455887 0,00584686711055506 0,0059662775616083 0,00581368734264134 0,00113689257418877 0,00128968568240623 257912 254811 667 665 0 False 318 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 362 302 0,00610816130044385 0,00591253826945482 0,00613412680247196 0,00592050049591821 0,00115391222934056 0,00128989093255487 266999 257673 667 665 0 True 363 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 408 302 0,00598325236557734 0,00606997007281307 0,0059510185397116 0,00604257267109178 0,00134275214523918 0,00131866731813076 261539 264534 667 665 0 True 407 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 451 302 0,0062239880288741 0,00628866742273399 0,00625619897764553 0,00631723506523232 0,00163581286994281 0,00169662582159079 272062 274065 667 665 0 True 451 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 496 302 0,0062043366048722 0,00635918016602504 0,00622568093385214 0,00636301213092241 0,00159998158233732 0,0015728869109016 271203 277138 667 665 0 True 496 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 540 302 0,00633013774641633 0,00643012888137028 0,00634775310902571 0,0063935301747158 0,00143309573228885 0,00143434969361046 276702 280230 667 665 0 True 540 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 584 301 0,00661735966532641 0,00666344276805541 0,00663767452506294 0,00668345159075303 0,00168759669453269 0,00192487873794103 289257 290398 667 665 0 True 584 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 629 302 0,00687257652931374 0,00705884647530935 0,00694285496299687 0,00706492713817044 0,00178525885862878 0,00190807685292948 300413 307630 667 665 0 False 629 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 673 302 0,00720289889388105 0,00732132459783012 0,00715648126955062 0,0072632944228275 0,00189904120840205 0,00178394929662449 314852 319069 667 665 0 False 673 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 275 346 0,00557979193053965 0,00578592280655863 0,00563057907988098 0,00581368734264134 0,00134303347739171 0,00137435743986858 243903 252155 667 665 0 True 274 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 319 346 0,00585564393358368 0,00591306602509937 0,00588998245212482 0,00590524147402152 0,00119784989390413 0,00122353828674369 255961 257696 667 665 0 True 318 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 364 346 0,00610564482007108 0,00614137770611009 0,00608834973678187 0,00607309071488518 0,00117880755453768 0,00122388273603702 266889 267646 667 665 0 True 363 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 409 346 0,00643413701709457 0,00643038128624376 0,00643930724040589 0,00643930724040589 0,00136828677345933 0,00136616605822166 281248 280241 667 665 0 True 407 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 452 345 0,00626999386550716 0,00654068221595417 0,00627145799954223 0,00663767452506294 0,00158020559316767 0,0015929662919223 274073 285048 667 665 0 True 451 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 496 346 0,00645502380418854 0,00652884213279824 0,0063935301747158 0,00656137941557946 0,00151769416316951 0,00149485914932303 282161 284532 667 665 0 True 496 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 540 346 0,0065153278247578 0,00634075461026106 0,00642404821850919 0,00633249408712902 0,0016124986145224 0,0015346414766994 284797 276335 667 665 0 True 540 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 585 346 0,00664062567022737 0,00682562437221458 0,00654612039368277 0,00679026474402991 0,0019200871821491 0,00182710082301803 290274 297466 667 665 0 True 584 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 628 345 0,0067164174836363 0,00669568175416798 0,00671396963454643 0,00675974670023652 0,00192070374720807 0,00190313176473191 293587 291803 667 665 0 True 629 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 673 345 0,00642585550895873 0,00651381256987743 0,00651560234988937 0,00656137941557946 0,00180557522210587 0,00186740116454059 280886 283877 667 665 0 True 673 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 275 390 0,00586461175454845 0,00570976537246068 0,00584420538643473 0,00573739223315786 0,00137218126243508 0,00134724666951136 256353 248836 667 665 0 True 274 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 321 390 0,00614748702554193 0,00611088260821429 0,00611886778057527 0,00605783169298848 0,00131212087787862 0,00130286257028179 268718 266317 667 665 0 True 318 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 364 390 0,00638879461619614 0,0065458450429117 0,0064087891966125 0,00653086137178607 0,00134938491070388 0,00133785536032679 279266 285273 667 665 0 True 363 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 409 390 0,00648030299338772 0,0067158970899439 0,00645456626230259 0,00672922865644312 0,00142752241541499 0,00140699913041998 283266 292684 667 665 0 True 407 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 453 389 0,00651686059007576 0,0066467381546106 0,00650034332799268 0,00666819256885634 0,00175155982078399 0,00156173980737466 284864 289670 667 665 0 True 451 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 497 390 0,0066576691054793 0,00665846350827859 0,00663767452506294 0,00669871061264973 0,00165952628907486 0,00161668568134471 291019 290181 667 665 0 True 496 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 540 390 0,00655106184605111 0,00644506666070073 0,00646982528419928 0,00646982528419928 0,00161030328799897 0,00148804502065354 286359 280881 667 665 0 True 540 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 585 390 0,00652045229388053 0,00648696586969828 0,00651560234988937 0,00648508430609598 0,0018702152128945 0,00194769212504033 285021 282707 667 665 0 True 584 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 629 389 0,00620820283380855 0,00589324076958246 0,00621042191195544 0,005981536583505 0,00187150811335251 0,00179418030274467 271372 256832 667 665 0 True 628 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 673 389 0,00588938764767307 0,00591933025514117 0,00599679560540169 0,0059510185397116 0,00174146023572874 0,00171225801060111 257436 257969 667 665 0 True 673 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 276 435 0,00607350250258254 0,00598144479991464 0,00608834973678187 0,00599679560540169 0,00140500266140832 0,00145897460455849 265484 260676 667 665 0 True 274 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 319 434 0,00637280352728191 0,00616964705193976 0,0063935301747158 0,00621042191195544 0,00142080775793994 0,00127590070159499 278567 268878 667 665 0 True 318 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 365 434 0,00638721609668958 0,00637673377768064 0,0063935301747158 0,00636301213092241 0,00129950361190303 0,0013157351203248 279197 277903 667 665 0 True 363 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 408 433 0,0066261902237254 0,00657753332748213 0,00659189745937285 0,00656137941557946 0,00145715555281235 0,00151968641749901 289643 286654 667 665 0 True 407 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 453 434 0,00666954231741991 0,00682562437221458 0,00669871061264973 0,00688181887541009 0,00163787322657606 0,00167163384878965 291538 297466 667 665 0 True 451 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 497 434 0,00677548614111347 0,00687993731180779 0,00674448767833982 0,0068055237659266 0,00174726925112666 0,00162054456283716 296169 299833 667 665 0 True 495 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 541 434 0,00632034635005683 0,00659437561631247 0,00636301213092241 0,00660715648126955 0,00160263574620124 0,00154971328090016 276274 287388 667 665 0 True 540 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 584 432 0,00620500004060684 0,00609493520938992 0,00617990386816205 0,005981536583505 0,00173222105258249 0,00199445118248661 271232 265622 667 665 0 False 584 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 629 433 0,00588808365329809 0,00567403860991458 0,00593575951781491 0,00567635614557107 0,00173917955259228 0,00165665433883089 257379 247279 667 665 0 True 628 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 673 433 0,00585530077716921 0,00590769668506354 0,00584420538643473 0,00585946440833143 0,00174079413635673 0,00188852684356387 255946 257462 667 665 0 True 673 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 275 479 0,00614750990263623 0,00599206875049836 0,00617990386816205 0,00604257267109178 0,00138518670472166 0,00147722011229677 268719 261139 667 665 0 True 274 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 319 478 0,00618660685679133 0,00608885454652883 0,00627145799954223 0,00610360875867857 0,00144384810670456 0,0014431764519705 270428 265357 667 665 0 True 318 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 363 477 0,00642596989443022 0,00638315862900556 0,00650034332799268 0,00634775310902571 0,00150701920489187 0,00151265408905453 280891 278183 667 665 0 True 363 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 408 478 0,00664300488803435 0,00704232542904526 0,00654612039368277 0,00679026474402991 0,00160335126255121 0,00235493562838827 290378 306910 667 665 0 True 407 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 452 477 0,0065903189398663 0,00681552817727542 0,00662241550316625 0,00688181887541009 0,00188096015172546 0,00193621576900879 288075 297026 667 665 0 True 451 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 496 478 0,00635301484071423 0,00646525905057907 0,00636301213092241 0,00648508430609598 0,00174580583123623 0,00183576462724053 277702 281761 667 665 0 True 495 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 540 477 0,00589103479846252 0,00575361498275329 0,0059510185397116 0,00567635614557107 0,00168323445697279 0,00158406715017168 257508 250747 667 665 0 True 540 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 584 477 0,00563501723617477 0,00590927995199718 0,00564583810177768 0,00593575951781491 0,00178209681279853 0,0018095036830994 246317 257531 667 665 0 True 584 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 629 478 0,00564130843710669 0,0056238559318874 0,00564583810177768 0,00563057907988098 0,00172920893565093 0,00165859235649204 246592 245092 667 665 0 True 628 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 672 477 0,0055336030771522 0,00579978212870239 0,0055542839703975 0,00576791027695125 0,00184546320481769 0,00174344619920964 241884 252759 667 665 0 True 673 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 276 523 0,00599096194635573 0,00606918991229504 0,00605783169298848 0,00599679560540169 0,00140991624141415 0,00162433698667941 261876 264500 667 665 0 True 274 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 319 522 0,00611028887021355 0,00622822792848452 0,00611886778057527 0,00613412680247196 0,0014481944137294 0,00133371610122671 267092 271431 667 665 0 True 318 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 363 522 0,00635134481283048 0,00635039188724845 0,0064087891966125 0,00636301213092241 0,00139333496276512 0,00146245995911218 277629 276755 667 665 0 True 362 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 408 522 0,00635534830433261 0,00659380196887274 0,00636301213092241 0,00666819256885634 0,00164174050739227 0,00165729597322797 277804 287363 667 665 0 True 407 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 452 521 0,00618745330928036 0,00611225936206963 0,00611886778057527 0,00611886778057527 0,00177911426968745 0,00168045806237515 270465 266377 667 665 0 True 451 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 496 522 0,00605076267085043 0,00588472784157693 0,00608834973678187 0,00584420538643473 0,00172996525486172 0,00164929387809754 264490 256461 667 665 0 True 495 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 541 522 0,00579314371196183 0,00590856862917192 0,00581368734264134 0,00592050049591821 0,00164561983707875 0,00159411046616006 253229 257500 667 665 0 True 540 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 584 522 0,00583498591743268 0,00593741162244132 0,00582894636453803 0,00602731364919509 0,0016240809438721 0,00158705456947982 255058 258757 667 665 0 True 584 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 629 522 0,00583418521913225 0,00571485936172544 0,00579842832074464 0,00569161516746777 0,00183094882772687 0,00185107276741316 255023 249058 667 665 0 True 628 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 673 521 0,00579941203579945 0,00581474285393043 0,00584420538643473 0,00572213321126116 0,00176658202534419 0,0018345982754339 253503 253411 667 665 0 True 673 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 276 568 0,00622639012377538 0,00640277737144417 0,00624093995574884 0,00636301213092241 0,00129385901382008 0,00131656439786885 272167 279038 667 665 0 True 274 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 320 567 0,00618930635391849 0,00625757573150087 0,00616464484626535 0,00631723506523232 0,00140969540221001 0,00143031423213842 270546 272710 667 665 0 True 318 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 363 566 0,00631650299821479 0,00636264499656098 0,00628671702143893 0,00634775310902571 0,00132457012360736 0,00128622472645561 276106 277289 667 665 0 True 362 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 408 566 0,00619589495707628 0,0062006928513777 0,00621042191195544 0,00614938582436866 0,0014403275031461 0,00151345856238822 270834 270231 667 665 0 True 407 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 452 566 0,00602356180573023 0,00609112619039014 0,005981536583505 0,00613412680247196 0,00185317009384488 0,00180237299697016 263301 265456 667 665 0 True 451 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 497 567 0,00606835515636551 0,00607120915128288 0,00602731364919509 0,00619516289005875 0,0018838707736809 0,00193867369743075 265259 264588 667 665 0 True 495 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 540 566 0,00596403560636711 0,00616804083910853 0,0059510185397116 0,00617990386816205 0,00181229851502442 0,00175294969289044 260699 268808 667 665 0 True 540 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 585 566 0,00608123496045523 0,00606611516201811 0,00611886778057527 0,00608834973678187 0,00156079370566888 0,00146613057186788 265822 264366 667 665 0 True 584 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 629 565 0,00593248809333031 0,00585159396545839 0,0059510185397116 0,00582894636453803 0,00156494109357187 0,00156755372487697 259320 255017 667 665 0 True 628 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 673 565 0,00576127591960486 0,00585540298445817 0,00569161516746777 0,00584420538643473 0,00156653291341462 0,00164905606705753 251836 255183 667 665 0 True 673 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 274 606 0,0065533495554809 0,00639942727039618 0,00656137941557946 0,00643930724040589 0,00137118202360169 0,00131248153671061 286459 278892 667 665 0 False 274 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 318 606 0,00623730249775547 0,00613649022992363 0,00622568093385214 0,00610360875867857 0,00131413600178034 0,00133071451698411 272644 267433 667 665 0 False 318 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 364 611 0,00577843374032828 0,00604454601828444 0,00575265125505455 0,00601205462729839 0,00125376666372271 0,0012732935700889 252586 263426 667 665 0 True 362 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 408 610 0,00588483510590779 0,00586689887915027 0,00588998245212482 0,00592050049591821 0,0014435737672601 0,0013400791524141 257237 255684 667 665 0 True 407 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 451 606 0,00606512948606951 0,00616654935576524 0,00614938582436866 0,00616464484626535 0,00170226826798271 0,00180612588261979 265118 268743 667 665 0 False 451 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 495 606 0,00613112990311894 0,00616753602936157 0,00608834973678187 0,00621042191195544 0,00182893409169391 0,00187933389928079 268003 268786 667 665 0 False 495 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 540 606 0,00610200736207772 0,00587258946175234 0,00616464484626535 0,00588998245212482 0,0018237268462603 0,00190038099846754 266730 255932 667 665 0 False 540 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 584 606 0,00609553314439141 0,0059324323626645 0,00622568093385214 0,00599679560540169 0,00151156319151141 0,00166529622609327 266447 258540 667 665 0 False 584 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 628 606 0,00597595457249631 0,00603548238873678 0,00593575951781491 0,00599679560540169 0,00135587424523818 0,0013285658067264 261220 263031 667 665 0 False 628 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 673 606 0,0061098313283276 0,0060997767937812 0,00607309071488518 0,00613412680247196 0,00151273140597636 0,00155845064028374 267072 265833 667 665 0 False 673 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 274 649 0,0484845011689623 0,533431748288093 0,0080872816052491 0,630289158464942 0,116185191717839 0,377192228275847 2119347 23247369 667 665 12 False 274 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 318 649 0,00661500332461373 0,00631432093623851 0,00624093995574884 0,00627145799954223 0,00217255573010238 0,00121429327467606 289154 275183 667 665 0 False 318 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 362 649 0,00590144387636807 0,00595315250818738 0,00593575951781491 0,00592050049591821 0,00114899594178594 0,00114060681127005 257963 259443 667 665 0 False 362 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 407 649 0,00583157723038229 0,00582690417965261 0,00582894636453803 0,00581368734264134 0,00128486877669733 0,00117835659810373 254909 253941 667 665 0 False 407 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 451 649 0,00602347029735304 0,00581680798471344 0,005981536583505 0,00581368734264134 0,00145954773269234 0,00151939395429638 263297 253501 667 665 0 False 451 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 495 649 0,00600043306339506 0,00595739749924135 0,00590524147402152 0,00610360875867857 0,00161915816111565 0,00158794556747676 262290 259628 667 665 0 False 495 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 540 649 0,005842306587608 0,00586967533275854 0,00581368734264134 0,00584420538643473 0,0016377303041271 0,00167898621703583 255378 255805 667 665 0 False 540 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 584 649 0,00593640007645525 0,00603662968361623 0,0059510185397116 0,00599679560540169 0,001366791366448 0,00122181866457261 259491 263081 667 665 0 False 584 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 628 650 0,00623979610103394 0,00631140680724471 0,00628671702143893 0,00628671702143893 0,00144150076346008 0,00133871130142197 272753 275056 667 665 0 False 628 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 673 655 0,00797463479292627 0,734383452336495 0,00787365529869535 0,741100175478752 0,00176825722974783 0,192986911090287 348586 32005000 667 665 12 True 673 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A2_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A2_3.csv new file mode 100755 index 0000000..403d560 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A2_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 274 258 0,00100949754008324 0,0735491509731068 0,000854505226215 0,0731212329289693 0,000790967295252047 0,021722028421836 44127 3205329 667 665 0 True 274 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 318 258 0,000925973268801626 0,000903012853718182 0,00080872816052491 0,000793469138628214 0,000650544123441571 0,000647591419021995 40476 39354 667 665 0 False 318 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 363 258 0,000936405223801466 0,000932131197758645 0,000854505226215 0,000823987182421607 0,000630658239795144 0,000626578397554792 40932 40623 667 665 0 True 363 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 408 258 0,000918835615380682 0,000921989111024299 0,000778210116731518 0,000778210116731518 0,000686622408974219 0,000690506540354136 40164 40181 667 665 0 True 407 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 451 256 0,00100592871337277 0,000831054518879024 0,000823987182421607 0,000610360875867857 0,000879444006008247 0,00079520744859402 43971 36218 667 665 0 True 451 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 494 256 0,000936542486367254 0,000948789919408271 0,000762951094834821 0,000762951094834821 0,000801355223193162 0,000822428298623852 40938 41349 667 665 0 True 496 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 540 257 0,000901014358922622 0,000849227669769526 0,000717174029144732 0,000701915007248035 0,000777412927204748 0,000723171384572788 39385 37010 667 665 0 True 540 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 584 257 0,000907580084986118 0,000967628501328854 0,000671396963454643 0,000656137941557946 0,00087664260826188 0,000931397166177103 39672 42170 667 665 0 True 584 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 629 259 0,000942399022507515 0,000956591524588537 0,000610360875867857 0,00064087891966125 0,000970620054582015 0,000919344762680361 41194 41689 667 665 0 False 629 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 670 257 0,00098083254092798 0,0762452480480212 0,000656137941557946 0,0738231479362173 0,000926894998403203 0,0218915988917951 42874 3322827 667 665 0 True 673 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 274 302 0,000883444750501838 0,000782959917532444 0,000747692072938125 0,000610360875867857 0,000694942113399232 0,000674119545040488 38617 34122 667 665 0 False 274 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 318 302 0,000894448632859125 0,000891264554152605 0,000762951094834821 0,000747692072938125 0,000647842435500785 0,000648502625504943 39098 38842 667 665 0 False 318 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 362 302 0,000883925169482093 0,000897551730091996 0,000732433051041428 0,000778210116731518 0,00066426735116234 0,000674442825044374 38638 39116 667 665 0 True 363 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 408 302 0,000891039945808739 0,000871370460942927 0,000732433051041428 0,000701915007248035 0,00073539282354911 0,000706270847551969 38949 37975 667 665 0 True 407 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 451 302 0,000839406343978388 0,000946357654263835 0,000579842832074464 0,000671396963454643 0,000830192513695371 0,000880555890874234 36692 41243 667 665 0 True 451 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 496 302 0,00089136022512891 0,00086687306501548 0,000686655985351339 0,000610360875867857 0,000825531625847778 0,000826554425265861 38963 37779 667 665 0 True 496 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 540 302 0,000877039164098427 0,000847391997962404 0,000686655985351339 0,000625619897764553 0,00075234113590649 0,000758209849653427 38337 36930 667 665 0 True 540 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 584 301 0,000804724669022779 0,000801890283043383 0,000473029678797589 0,000350957503624018 0,000889067041438425 0,000929546393055193 35176 34947 667 665 0 True 584 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 629 302 0,000956376927123529 0,000870865651195969 0,000595101853971161 0,000457770656900893 0,000991381425671018 0,000958008021690445 41805 37953 667 665 0 False 629 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 673 302 0,000916730922705276 0,000968385715949292 0,000534065766384375 0,00064087891966125 0,000969961373386737 0,000940401327683086 40072 42203 667 665 0 False 673 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 275 346 0,000855671958024192 0,000875890802767964 0,000717174029144732 0,000732433051041428 0,00068854864264885 0,000725541188972913 37403 38172 667 665 0 True 274 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 319 346 0,000855351678704022 0,000841999712028985 0,000747692072938125 0,000747692072938125 0,000654908328681019 0,000612233928221863 37389 36695 667 665 0 True 318 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 364 346 0,000934460670786145 0,000937913563951077 0,00080872816052491 0,000839246204318303 0,000677853555025916 0,000678538308967031 40847 40875 667 665 0 True 363 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 409 346 0,000852103131313721 0,000857901219058174 0,000671396963454643 0,00064087891966125 0,000723447881067868 0,000739251870319833 37247 37388 667 665 0 True 407 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 452 345 0,000843913131555074 0,000961846135136422 0,000595101853971161 0,000686655985351339 0,00079408429558986 0,00090540240278154 36889 41918 667 665 0 True 451 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 496 346 0,000812731652027042 0,000942617472956826 0,000579842832074464 0,000671396963454643 0,000769256296421043 0,000849138324247045 35526 41080 667 665 0 True 496 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 540 346 0,000919865084624088 0,000880204631514699 0,000717174029144732 0,00064087891966125 0,000839032888916787 0,000819681156861622 40209 38360 667 665 0 True 540 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 585 346 0,000846749891248013 0,000880135793821932 0,000534065766384375 0,000473029678797589 0,000936378701712889 0,00102301142923409 37013 38357 667 665 0 True 584 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 628 345 0,000973145837243887 0,000890645014917702 0,000549324788281071 0,000457770656900893 0,00104789996468167 0,00101211101680028 42538 38815 667 665 0 True 629 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 673 345 0,000805777015360482 0,000923939512319366 0,000442511635004196 0,000442511635004196 0,000883634971512587 0,00104802334497284 35222 40266 667 665 0 True 673 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 275 390 0,000819366009373432 0,000923021676415805 0,000656137941557946 0,000793469138628214 0,000707817551191693 0,000725779155696341 35816 40226 667 665 0 True 274 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 321 390 0,000893373409427124 0,000914439910717512 0,000762951094834821 0,000793469138628214 0,000703293555683439 0,000697129070800775 39051 39852 667 665 0 True 318 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 364 390 0,000912361397694378 0,000952759559691171 0,000793469138628214 0,000839246204318303 0,000723788358362439 0,00071284635790548 39881 41522 667 665 0 True 363 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 409 390 0,000925561481104264 0,00095769292767281 0,000732433051041428 0,000701915007248035 0,000748197387412512 0,000799037907231775 40458 41737 667 665 0 True 407 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 453 389 0,000909135727398375 0,000891907039285098 0,00064087891966125 0,000595101853971161 0,000855788741404179 0,000825766683005311 39740 38870 667 665 0 True 451 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 497 390 0,000861368354504368 0,000866230579882987 0,000579842832074464 0,000564583810177768 0,000863798971533875 0,000859753214584039 37652 37751 667 665 0 True 496 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 540 390 0,000865692125326671 0,000843169952806025 0,000595101853971161 0,00064087891966125 0,000848352524455993 0,000789113132523964 37841 36746 667 665 0 True 540 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 585 390 0,000948392821213564 0,00085193528568503 0,000656137941557946 0,000442511635004196 0,000984986491146624 0,000952152437813622 41456 37128 667 665 0 True 584 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 629 389 0,000854139192706233 0,000923801836933832 0,000473029678797589 0,000488288700694286 0,000929831233073018 0,00101555323460816 37336 40260 667 665 0 True 628 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 673 389 0,000945807709557901 0,000831467545035626 0,000595101853971161 0,000366216525520714 0,00095776583272979 0,000963776128116729 41343 36236 667 665 0 True 673 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 276 435 0,000824193076270288 0,000820361730602542 0,000717174029144732 0,000701915007248035 0,000699780930463249 0,000730899438738098 36027 35752 667 665 0 True 274 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 319 434 0,000851554081050571 0,000908703436320258 0,000701915007248035 0,000778210116731518 0,000721121644350741 0,00071744870732409 37223 39602 667 665 0 True 318 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 365 434 0,000918172179646043 0,000988532214032449 0,000793469138628214 0,000885023270008392 0,000720295598597464 0,000719138782098904 40135 43081 667 665 0 True 363 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 408 433 0,000877794108210257 0,000940804747047293 0,000686655985351339 0,000686655985351339 0,000782568177029475 0,000861415985532364 38370 41001 667 665 0 True 407 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 453 434 0,000922793352694218 0,000979675097563088 0,000671396963454643 0,000701915007248035 0,000881474612078758 0,000946745190227586 40337 42695 667 665 0 True 451 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 497 434 0,000948507206685053 0,000938120077029378 0,000717174029144732 0,00064087891966125 0,000869186276011704 0,000902219132142793 41461 40884 667 665 0 True 495 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 541 434 0,000868025588945056 0,000916252636627045 0,000564583810177768 0,000732433051041428 0,000867468359202801 0,00082712216253171 37943 39931 667 665 0 True 540 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 584 432 0,000906848017968585 0,00084376654614334 0,000564583810177768 0,000457770656900893 0,000949971647308943 0,000932803809090797 39640 36772 667 665 0 False 584 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 629 433 0,000834258997761362 0,000908932895296148 0,000442511635004196 0,000564583810177768 0,000907409905937535 0,000906334497340062 36467 39612 667 665 0 True 628 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 673 433 0,00077068355270751 0,000919809250753343 0,000442511635004196 0,000549324788281071 0,000874860885077403 0,00095473531132498 33688 40086 667 665 0 True 673 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 275 479 0,000903576593483986 0,000866528876551645 0,000717174029144732 0,000701915007248035 0,00079856337701358 0,000787689352575016 39497 37764 667 665 0 True 274 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 319 478 0,000945212905106156 0,000833555621716227 0,000778210116731518 0,000762951094834821 0,000836904888484896 0,000692161962824726 41317 36327 667 665 0 True 318 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 363 477 0,000993094663471652 0,000926027588999966 0,000869764248111696 0,00080872816052491 0,000808543280550319 0,00075163444774948 43410 40357 667 665 0 True 363 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 408 478 0,0009153811741417 0,000893995115965698 0,000732433051041428 0,000686655985351339 0,000833997158636711 0,0008136186232059 40013 38961 667 665 0 True 407 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 452 477 0,000888775113473247 0,000960446435383492 0,000518806744487678 0,000579842832074464 0,000962340891389079 0,0010482747604476 38850 41857 667 665 0 True 451 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 496 478 0,000938761564514149 0,00103089034098177 0,000595101853971161 0,00064087891966125 0,00094788489217653 0,00105285536844425 41035 44927 667 665 0 True 495 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 540 477 0,000873950756368211 0,000846451216161255 0,000549324788281071 0,000534065766384375 0,000904203917462015 0,000896244625515565 38202 36889 667 665 0 True 540 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 584 477 0,000856015114438661 0,000906844818615548 0,000473029678797589 0,000488288700694286 0,000944217336278762 0,00100380829545531 37418 39521 667 665 0 True 584 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 629 478 0,000858257069679855 0,000863935990124086 0,000549324788281071 0,000488288700694286 0,000880746293566117 0,000891983124093168 37516 37651 667 665 0 True 628 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 672 477 0,000857204723342151 0,000907808546314287 0,000457770656900893 0,000503547722590982 0,000947774161996895 0,000925437593914582 37470 39563 667 665 0 True 673 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 276 523 0,000889324163736397 0,000875707235587252 0,000717174029144732 0,000717174029144732 0,000733568640533642 0,000775443847275993 38874 38164 667 665 0 True 274 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 319 522 0,000876124080326511 0,000877359340213661 0,000762951094834821 0,000732433051041428 0,000693875946394966 0,000756902500247106 38297 38236 667 665 0 True 318 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 363 522 0,000886990700118011 0,000970244333654002 0,000747692072938125 0,000839246204318303 0,00074813312330943 0,000768306560577342 38772 42284 667 665 0 True 362 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 408 522 0,000864136482914414 0,000859966349841186 0,000671396963454643 0,000610360875867857 0,000790972326595041 0,000818334323724858 37773 37478 667 665 0 True 407 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 452 521 0,00090167779465726 0,000864326070383099 0,000534065766384375 0,000457770656900893 0,000953837589409314 0,000926497917318235 39414 37668 667 665 0 True 451 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 496 522 0,00095408921769374 0,00086921354656956 0,00064087891966125 0,000518806744487678 0,000954464094438025 0,000902419195126524 41705 37881 667 665 0 True 495 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 541 522 0,000909524638001439 0,000797186374037635 0,000625619897764553 0,0004272526131075 0,000886225728803101 0,000859284385829239 39757 34742 667 665 0 True 540 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 584 522 0,000817512964735302 0,000833762134794528 0,000503547722590982 0,000488288700694286 0,000841843503574112 0,000887581818190726 35735 36336 667 665 0 True 584 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 629 522 0,000836592461379747 0,000864096611407209 0,000473029678797589 0,000488288700694286 0,000934531728661962 0,00096444999328851 36569 37658 667 665 0 True 628 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 673 521 0,000829912349844762 0,000910424378639434 0,000457770656900893 0,000503547722590982 0,000918807755642534 0,000959651940636198 36277 39677 667 665 0 True 673 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 276 568 0,000831445115162721 0,000887799723616664 0,000732433051041428 0,000778210116731518 0,000630510337950831 0,000643826421447833 36344 38691 667 665 0 True 274 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 320 567 0,000908266397815054 0,000807144893591268 0,000747692072938125 0,000701915007248035 0,000735971499483906 0,000655920410567536 39702 35176 667 665 0 True 318 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 363 566 0,000916868185271063 0,00090516976809155 0,000793469138628214 0,00080872816052491 0,000633445682100091 0,00065313202091241 40078 39448 667 665 0 True 362 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 408 566 0,000908037626872076 0,000884311947183133 0,000701915007248035 0,000701915007248035 0,000819170333709062 0,000744383012572473 39692 38539 667 665 0 True 407 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 452 566 0,000876810393155448 0,000915403638416251 0,000488288700694286 0,000518806744487678 0,000956127017008164 0,000974713409784017 38327 39894 667 665 0 True 451 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 497 567 0,000991950808756757 0,000830412033746532 0,000701915007248035 0,000320439459830625 0,00103471059136662 0,000992749797550154 43360 36190 667 665 0 True 495 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 540 566 0,000922724721411325 0,000849044102588814 0,000549324788281071 0,0004272526131075 0,000980802344128692 0,000906870459006141 40334 37002 667 665 0 True 540 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 585 566 0,000900899973451132 0,00087761174508714 0,000625619897764553 0,00064087891966125 0,000866847324931576 0,000753158295285865 39380 38247 667 665 0 True 584 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 629 565 0,000915060894821529 0,000921140112813505 0,000656137941557946 0,00064087891966125 0,000858757615964469 0,000853357667263333 39999 40144 667 665 0 True 628 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 673 565 0,000855511818364107 0,00090351766346514 0,000564583810177768 0,000564583810177768 0,0008182485819258 0,000937230829804029 37396 39376 667 665 0 True 673 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 274 606 0,00089353354908721 0,000827452012957548 0,000793469138628214 0,000686655985351339 0,000688738082849681 0,000668744788771756 39058 36061 667 665 0 False 274 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 318 606 0,000868894918528376 0,000830664438620011 0,000747692072938125 0,000732433051041428 0,000692396215357412 0,000634178011869338 37981 36201 667 665 0 False 318 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 364 611 0,000879166733868131 0,000911181593259872 0,000747692072938125 0,00080872816052491 0,000677761914540902 0,000709505401588428 38430 39710 667 665 0 True 362 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 408 610 0,00082808218230093 0,000880824170749602 0,000686655985351339 0,000686655985351339 0,000715904434390493 0,000746902045217153 36197 38387 667 665 0 True 407 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 451 606 0,000922175671148175 0,000906362954766178 0,000534065766384375 0,0004272526131075 0,000991126788218583 0,00103336645350027 40310 39500 667 665 0 False 451 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 495 606 0,000913848408823741 0,000821853213945828 0,000457770656900893 0,000259403372243839 0,0010335924143012 0,00101200502443159 39946 35817 667 665 0 False 495 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 540 606 0,000841396651182305 0,000824354316783031 0,000442511635004196 0,000457770656900893 0,000952288861353846 0,00095077660126646 36779 35926 667 665 0 False 540 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 584 606 0,000906596369931308 0,000895693112387285 0,000656137941557946 0,000610360875867857 0,000827558393977501 0,00087547969929192 39629 39035 667 665 0 False 584 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 628 606 0,000852194639690912 0,00083745642430636 0,000671396963454643 0,00064087891966125 0,000747282672396782 0,000704669309210603 37251 36497 667 665 0 False 628 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 673 606 0,000864662656083265 0,000824491992168565 0,000625619897764553 0,000579842832074464 0,000790496243870321 0,000788361639364631 37796 35932 667 665 0 False 673 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 274 649 0,00478000871388522 0,0540184978353414 0,00103761348897536 0,0615548943312734 0,0111509194672374 0,0392840873361096 208943 2354168 667 665 0 False 274 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 318 649 0,000920871676773195 0,000887868561309431 0,000778210116731518 0,000793469138628214 0,000683499981959162 0,00061645780477701 40253 38694 667 665 0 False 318 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 362 649 0,000948072541893393 0,000907624979133574 0,000839246204318303 0,00080872816052491 0,000665152737477585 0,000603349067114111 41442 39555 667 665 0 False 362 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 407 649 0,000849975561544016 0,00084585462282394 0,000701915007248035 0,000686655985351339 0,000667749918080245 0,000681522993588309 37154 36863 667 665 0 False 407 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 451 649 0,000882575420918518 0,000877198718930538 0,000579842832074464 0,000656137941557946 0,000887003440795547 0,000837158271662757 38579 38229 667 665 0 False 451 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 495 649 0,000872303605578762 0,000887524372845595 0,000534065766384375 0,000564583810177768 0,000865759469001302 0,000868873759906228 38130 38679 667 665 0 False 495 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 540 649 0,000842792153934477 0,000830503817336888 0,000503547722590982 0,000488288700694286 0,000869451132865096 0,000841333294723995 36840 36194 667 665 0 False 540 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 584 649 0,000850982153693124 0,000795557215308815 0,000656137941557946 0,000656137941557946 0,000679016627870359 0,000592308710262825 37198 34671 667 665 0 False 584 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 628 650 0,000870862348637995 0,000852876067486179 0,000686655985351339 0,000701915007248035 0,00069097823830358 0,000703649623812475 38067 37169 667 665 0 False 628 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 673 655 0,000980146228099043 0,073803345626598 0,000823987182421607 0,0730449378194858 0,000750863515509348 0,0213454796861884 42844 3216407 667 665 0 True 673 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A3_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A3_1.csv new file mode 100755 index 0000000..c018911 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A3_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 268 267 0,0108940719490554 0,0464908666722884 0,0108491645685512 0,0464332036316472 0,00175696715146969 0,010147372597241 413373 2026108 579 665 0 True 269 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 313 267 0,0102900887645503 0,0101137256049256 0,0102998397802701 0,0101472495613031 0,00131017254375766 0,00137468971539453 390455 440764 579 665 0 False 313 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 357 268 0,01070437516216 0,0683145721938171 0,0106965743495842 0,0687571526665141 0,00144633877196479 0,0157592542879852 406175 2977202 579 665 0 True 357 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 401 267 0,0107001321526171 0,0927020687447619 0,0106813153276875 0,0930037384603647 0,00145283761681324 0,0170170150848018 406014 4040028 579 665 0 True 401 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 445 266 0,010647134064475 0,0766914310266396 0,0106355382619974 0,0742961776150149 0,001614581870297 0,019780977864042 404003 3342272 579 665 0 True 445 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 490 266 0,0106754383641591 0,0727820466708084 0,0107423514152743 0,0768749523155566 0,00170728092647414 0,0235877566559923 405077 3171898 579 665 0 True 489 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 534 266 0,0107527085752145 0,0877460072704077 0,0108186465247578 0,0848859388113222 0,00154441202455935 0,0295574459702978 408009 3824039 579 665 0 True 533 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 578 266 0,0185763173068411 0,0745120296736348 0,0113221942473487 0,0721599145494774 0,0645649452707231 0,0240541222535441 698787 3247292 574 665 0 True 577 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 621 270 0,0149052181506461 0,0111825914064172 0,0112458991378653 0,0111848630502785 0,0253681371168014 0,00181273767783508 565575 487346 579 665 0 False 621 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 663 265 0,0312297098163607 0,117505872715664 0,0109254596780346 0,0527046616311894 0,0947705389707577 0,148016809602539 1185004 5120997 579 665 0 True 665 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 268 310 0,0104178534245765 0,0100136585455399 0,0103456168459602 0,00999465934233616 0,00173551168310309 0,00151695494278268 395303 436403 579 665 0 False 268 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 312 310 0,010674067951139 0,0111355064245645 0,0105592431525139 0,0108949416342412 0,0017074042610184 0,00174793871014954 405025 485294 579 665 0 False 312 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 359 313 0,0109950081388039 0,116528331586577 0,0109407186999313 0,109666590371557 0,00157382370817382 0,0292321485955324 417203 5078395 579 665 0 True 356 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 403 312 0,0113089117826926 0,062367936320545 0,0112153810940719 0,0593270771343557 0,00186469807998784 0,0153676810453666 429114 2718043 579 665 0 True 400 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 448 312 0,0112237616967716 0,0852765927177752 0,0111390859845884 0,0820935378042267 0,00192775950274387 0,0225222020825428 425883 3716420 579 665 0 True 445 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 492 313 0,0110910688206924 0,0461755212017226 0,0112001220721752 0,0469520103761349 0,00172657840389953 0,012199298736739 420848 2012365 579 665 0 True 489 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 535 310 0,0110471628958566 0,0439236567041316 0,0110170138094148 0,0480811779964904 0,00167491638072727 0,0105283153559765 419182 1914227 579 665 0 True 533 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 579 311 0,0867681164474485 0,0704346813474519 0,0119172961013199 0,0615854123750668 0,206384432671228 0,0610113953801573 3246905 3069598 571 665 0 True 577 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 621 313 0,121862727247364 0,068315191733052 0,0130006866559854 0,0124971389333944 0,220510705710424 0,163212358645305 4608080 2977229 577 665 0 False 621 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 665 313 0,0356217517752449 0,0104732878201455 0,0111238269626917 0,0105439841306172 0,0979543710133677 0,00187320675872829 1351659 456434 579 665 0 False 665 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 269 358 0,0101261399299745 0,0572493719994654 0,0102082856488899 0,0552986953536278 0,00142160120341575 0,0141449101434074 384234 2494972 579 665 0 True 268 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 314 357 0,0101650649305642 0,0729280743630649 0,0101930266269932 0,0732890821698329 0,0014263954968599 0,0250038467123529 385711 3178262 579 665 0 True 312 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 358 357 0,0102221742577665 0,0440321219620349 0,0102388036926833 0,0435950255588617 0,00140153954042352 0,0102273860897547 387878 1918954 579 665 0 True 356 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 402 357 0,0104029897141279 0,0362479327180391 0,0103456168459602 0,0374303807125963 0,00156916652399435 0,00591954426682639 394739 1579713 579 665 0 True 400 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 447 355 0,0114968428451197 0,0778783993630219 0,0113679713130388 0,0749828336003662 0,00216679048508384 0,0179004244292914 436245 3394001 579 665 0 True 444 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 491 356 0,0112656647102703 0,0361245755726005 0,0111238269626917 0,0374608987563897 0,00195531551829829 0,00583520196433789 427473 1574337 579 665 0 True 488 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 532 355 0,0117431218772866 0,0319176288168349 0,0115358205539025 0,0338597695887694 0,0020772463971447 0,00959185741429315 445590 1390995 579 665 0 False 532 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 579 356 0,0117633091152363 0,0560329640764764 0,0115510795757992 0,0561989776455329 0,00228747596945638 0,0113435306259399 446356 2441960 579 665 0 True 576 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 623 356 0,0116794240259493 0,0642142320782501 0,0117341878385595 0,0639810788128481 0,00236344965936837 0,0170585012771896 443173 2798506 579 665 0 True 621 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 667 355 0,0106578338276703 0,0702140794880311 0,0105745021744106 0,0698252841992828 0,00194289338575881 0,023039339931433 404409 3059984 579 665 0 True 665 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 271 401 0,0100000882862234 0,0490323772351455 0,00997940032043946 0,0507209887846189 0,00155195568706666 0,0124861767105916 379451 2136869 579 665 0 True 267 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 315 402 0,0101012616628407 0,0344008797457136 0,0100862134737163 0,0342870222018769 0,00136792250813901 0,00475281577887695 383290 1499217 579 665 0 True 311 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 359 402 0,0103850425743841 0,0970905404963542 0,0104371709773404 0,0917982757305257 0,00142170527084155 0,0260839300700879 394058 4231281 579 665 0 True 356 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 403 401 0,0106983927822455 0,0739236739135548 0,0106507972838941 0,0721599145494774 0,0015600960070547 0,0237283759458383 405948 3221651 579 665 0 True 400 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 447 400 0,0107515226408702 0,0471567107285265 0,010757610437171 0,0481269550621805 0,00163762016246788 0,0111424360761385 407964 2055126 579 665 0 True 444 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 492 401 0,0108299524321734 0,0568191134737737 0,0108491645685512 0,0566414892805371 0,00169487836278416 0,0130198752099547 410940 2476221 579 665 0 True 488 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 535 400 0,0107193442889948 0,0437995423440726 0,0107423514152743 0,0453345540550851 0,00166437706536188 0,00837566335204812 406743 1908818 579 665 0 True 532 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 580 400 0,0107646206268506 0,0559289503227054 0,010757610437171 0,0560616464484627 0,00191329788355768 0,0127831534550358 408461 2437427 579 665 0 True 576 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 623 400 0,0135361755435829 0,0462111791265759 0,011306935225452 0,0463263904783703 0,0165721146512965 0,01078765912755 513627 2013919 579 665 0 True 620 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 667 399 0,0114413674719029 0,0895169487004304 0,0114442664225223 0,084596017395285 0,00216472944612007 0,0242985837322994 434140 3901218 579 665 0 True 664 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 271 447 0,0101305147100002 0,0451264577098503 0,010101472495613 0,0455939574273289 0,0015575293694712 0,00784075743239804 384400 1966646 579 665 0 True 267 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 315 445 0,0102972834329057 0,0598453102314036 0,0103913939116503 0,0599679560540169 0,00144696756825358 0,0106850098315252 390728 2608105 579 665 0 True 311 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 360 447 0,0105226109583232 0,0388292773591108 0,0104219119554437 0,0393224994277867 0,00150349548361003 0,00742095832835494 399278 1692210 579 665 0 True 355 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 404 445 0,01079806397536 0,0573309446653943 0,0109407186999313 0,0565499351491569 0,00163446787671548 0,0132246501745184 409730 2498527 579 665 0 True 399 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 448 445 0,0111510507444176 0,105649222621672 0,0111238269626917 0,101808194094759 0,00180824672032319 0,0203125157277873 423124 4604275 579 665 0 True 443 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 492 445 0,011006577587185 0,0657793029151042 0,0111238269626917 0,064438849469749 0,0017889926975483 0,0157724563488552 417642 2866713 579 665 0 True 488 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 537 444 0,0107264862491572 0,0576360103738403 0,0107423514152743 0,0558175020981155 0,00186658745476639 0,0136001789069576 407014 2511822 579 665 0 True 532 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 581 444 0,0105741595711556 0,0339979956758456 0,0105897611963073 0,0335393301289387 0,00185344052753987 0,0062685792676461 401234 1481659 579 665 0 True 576 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 624 445 0,0118276394648906 0,0405754831115326 0,0102693217364767 0,0412756542305638 0,0121465729447959 0,00665046891455734 448797 1768311 579 665 0 True 620 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 669 443 0,01062112257119 0,0680089098920338 0,0106355382619974 0,0696421759365225 0,00207886261881402 0,0136184206747296 403016 2963881 579 665 0 True 664 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 267 483 0,0138588287475229 0,0425268940260929 0,0105745021744106 0,0414892805371176 0,00924574187729159 0,0278345369943006 525870 1853355 579 665 0 False 267 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 311 483 0,0162978476741126 0,0434057219037523 0,0109254596780346 0,0526436255436027 0,0133519909049218 0,0258947753339073 618418 1891655 579 665 0 False 311 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 359 490 0,0107314144652102 0,0736020871588447 0,0107270923933776 0,0726787212939651 0,00151873675740142 0,0206743440341815 407201 3207636 579 665 0 True 355 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 403 490 0,0108997380798115 0,0972816109855779 0,0109254596780346 0,0902265964751659 0,00171457795653411 0,0319739021287973 413588 4239608 579 665 0 True 399 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 448 489 0,0109229296847668 0,1081148740471 0,0109864957656214 0,104280155642023 0,00190773159581045 0,0438910322334951 414468 4711730 579 665 0 True 443 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 491 490 0,0110411805159421 0,047382636036188 0,0111238269626917 0,0502021820401312 0,00187399408888782 0,0099348538946948 418955 2064972 579 665 0 True 487 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 535 487 0,0108621834922419 0,0405082057398016 0,0108949416342412 0,0433051041428244 0,00172129653903444 0,00809613976347812 412163 1765379 579 665 0 True 531 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 579 488 0,0107800641274231 0,100310607142714 0,0108491645685512 0,0971847104600595 0,00180006917922314 0,025510814665199 409047 4371614 579 665 0 True 575 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 624 489 0,010499419353368 0,0656006691023737 0,0104371709773404 0,0671244373235676 0,0018068760869871 0,0198262772803769 398398 2858928 579 665 0 True 619 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 667 488 0,0102283674704534 0,0765725253853333 0,0103456168459602 0,0752269779507134 0,00189589984880925 0,0174313374165339 388113 3337090 579 665 0 True 664 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 266 526 0,0165393829689023 0,0399824004965492 0,0108339055466545 0,0362554360265507 0,0133864549360122 0,0278389912782294 627583 1742464 579 665 0 False 266 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 310 526 0,0233840425681909 0,073440662769306 0,0113374532692454 0,0851148241397726 0,0263195028395671 0,0559465203247492 887302 3200601 579 665 0 False 310 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 354 527 0,0154957871000123 0,0447880975040026 0,0113832303349355 0,0486915388723583 0,0108844500623974 0,028295203435188 587984 1951900 579 665 0 False 354 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 404 533 0,0106582554932149 0,0628471843375892 0,0106660563057908 0,0620126649881743 0,00167966531639426 0,0129194096358985 404425 2738929 579 665 0 True 399 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 448 532 0,010970419766732 0,0601733218374386 0,0110017547875181 0,0608377203021286 0,00189369668248865 0,0128784514539731 416270 2622400 579 665 0 True 443 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 492 533 0,0109393219328147 0,0633348534990486 0,0108339055466545 0,0637216754406043 0,00188584242253382 0,0143000744909299 415090 2760182 579 665 0 True 487 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 536 532 0,0106180654959913 0,0759575064922549 0,0106507972838941 0,0748455024032959 0,00182424985777257 0,0215954638062728 402900 3310287 579 665 0 True 531 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 581 532 0,0103688084509154 0,0597476524912648 0,0104829480430304 0,0607309071488518 0,00171141927481383 0,0167478373972611 393442 2603849 579 665 0 True 575 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 624 533 0,0102023559771684 0,0442087594816751 0,0101777676050965 0,0435950255588617 0,00165997831936966 0,0069903487647905 387126 1926652 579 665 0 True 619 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 669 532 0,0101228983761001 0,0650784663650428 0,0101167315175097 0,0643167772945754 0,00184253035798257 0,0152419176677758 384111 2836170 579 665 0 True 663 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 266 569 0,0174957731323412 0,0327609364450265 0,0110322728313115 0,0270389868009461 0,013311680687823 0,0223357949534958 663873 1427747 579 665 0 False 266 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 310 569 0,0198033905335822 0,0359455287337134 0,0115663385976959 0,0328984512092775 0,0172325435531744 0,0242020270594526 751435 1566534 579 665 0 False 310 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 354 570 0,0165553799055021 0,0367930125152662 0,0113527122911421 0,0388494697489891 0,0121879255019127 0,0230133465401619 628190 1603468 579 665 0 False 354 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 398 570 0,0178031673143845 0,0375164507744527 0,0115968566414893 0,041214618142977 0,0130199694928095 0,0230849864876798 675537 1634996 579 665 0 False 398 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 442 571 0,0231330461527433 0,062308529391687 0,0118715190356298 0,0659800106813153 0,0239082950407038 0,048169239395518 877778 2715454 579 665 0 False 442 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 486 571 0,0197969864881229 0,0448689588471063 0,0119935912108034 0,0476691844052796 0,0164618087652105 0,0311104317188242 751192 1955424 579 665 0 False 486 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 537 577 0,0103794027977245 0,0557366637009094 0,0103303578240635 0,0557259479667353 0,00184953431723515 0,0105423896196154 393844 2429047 579 665 0 True 530 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 581 577 0,0100874521162537 0,0401828788037845 0,0101930266269932 0,0415503166247044 0,00169881976326875 0,0100712961217315 382766 1751201 579 665 0 True 575 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 625 578 0,0100189578193461 0,0485649693012573 0,0100099183642329 0,0487525749599451 0,0016871892275625 0,00779343687336987 380167 2116499 579 665 0 True 619 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 669 576 0,00987113769185288 0,053195726785492 0,00994888227664607 0,0529488059815366 0,00165347949307346 0,0102986241535769 374558 2318311 579 665 0 True 663 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 266 612 0,0135114817551249 0,0115117732532292 0,0116578927290761 0,0115663385976959 0,00737754553734754 0,00154418567279131 512690 501692 579 665 0 False 266 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 310 613 0,0128545795447672 0,0109890198143562 0,0114290074006256 0,0110017547875181 0,0058875016228123 0,00149143901468336 487764 478910 579 665 0 False 310 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 354 613 0,0257336156911237 0,0507318192482809 0,0133669031815061 0,0441443503471428 0,0237303170626289 0,0387744450772638 976456 2210932 579 665 0 False 354 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 398 613 0,0265148301748607 0,048934535927826 0,0141603723201343 0,0256046387426566 0,0239330355251652 0,041094568059319 1006099 2132605 579 665 0 False 398 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 442 614 0,0139140405797743 0,0121998977760262 0,0119783321889067 0,0122224765392538 0,00794105413761955 0,0021926428930486 527965 531681 579 665 0 False 442 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 486 614 0,0121711387591938 0,0105666317315376 0,0115968566414893 0,0104829480430304 0,00420186314246659 0,00204642402723891 461831 460502 579 665 0 False 486 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 530 615 0,0104629979919496 0,0100601698799528 0,0102845807583734 0,0100556954299229 0,00244051593303885 0,00206599584700899 397016 438430 579 665 0 False 530 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 574 615 0,00998316895624469 0,0101218255067745 0,00999465934233616 0,0101167315175097 0,00167188773755448 0,00181975533110694 378809 441117 579 665 0 False 574 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 618 615 0,0102025668099407 0,00996586224086194 0,0101472495613031 0,00994888227664607 0,00168404772379203 0,00141632859285167 387134 434320 579 665 0 False 618 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 662 616 0,00979481622827286 0,00997804651248171 0,0098268101014725 0,00997940032043946 0,00154610570826124 0,00156929873883833 371662 434851 579 665 0 False 662 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 265 656 0,0138804918148788 0,0314092165639551 0,0104371709773404 0,0331578545815213 0,00927971288346882 0,0188737807550837 526692 1368838 579 665 0 False 265 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 309 656 0,0101349158441224 0,00986194027068128 0,0100251773861295 0,0098268101014725 0,00160147889109855 0,00123375489353902 384567 429791 579 665 0 False 309 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 353 656 0,0141926297342993 0,0099772204601685 0,0101319905394064 0,00993362325474937 0,0142248279280847 0,00124686254451912 538536 434815 579 665 0 False 353 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 397 657 0,0132132060904844 0,0103024556125952 0,0104676890211337 0,0102845807583734 0,010486983738528 0,00134329400965662 501372 448989 579 665 0 False 397 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 442 657 0,0104453407472678 0,0102960537071679 0,0104371709773404 0,01025406271458 0,00166135478068634 0,00155367533509976 396346 448710 579 665 0 False 442 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 486 657 0,0108185147542751 0,0108865204898261 0,0107423514152743 0,0109254596780346 0,00182447724331647 0,00158094098462294 410506 474443 579 665 0 False 486 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 530 658 0,0109657814457409 0,0116793471433218 0,0107881284809644 0,011612115663386 0,00203773375299695 0,0019918614315212 416094 508995 579 665 0 False 530 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 574 658 0,010138262814383 0,0099316728534543 0,0101167315175097 0,00997940032043946 0,00163197518777127 0,0013284939523297 384694 432830 579 665 0 False 574 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 618 659 0,00991749454766685 0,00991177876024463 0,00991836423285267 0,00993362325474937 0,00128335301380929 0,00144615482134354 376317 431963 579 665 0 False 618 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 666 662 0,00983160654704279 0,0431910171400119 0,00988784618905928 0,043579766536965 0,00137075687611114 0,0100764525939769 373058 1882298 579 665 0 True 662 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A3_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A3_2.csv new file mode 100755 index 0000000..a46c634 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A3_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 268 267 0,00963695518999788 0,734558529535099 0,00920119020370794 0,757930876630808 0,00280366933193926 0,206613034533158 365672 32012630 579 665 12 True 269 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 313 267 0,00728047729377162 0,00693622359859365 0,00727855344472419 0,00698863202868696 0,00145580932785373 0,00117847014543231 276256 302286 579 665 0 False 313 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 357 268 0,00684911344160387 0,00679689610843313 0,00686655985351339 0,00679026474402991 0,00114795337776518 0,00123554988285297 259888 296214 579 665 0 True 357 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 401 267 0,00680038471710129 0,00682716174735305 0,00679026474402991 0,0068207827878233 0,00127141057544547 0,00129586403066822 258039 297533 579 665 0 True 401 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 445 266 0,00679579910430332 0,00682218248757623 0,00674448767833982 0,00677500572213321 0,00159566206407457 0,00156264809071894 257865 297316 579 665 0 True 445 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 490 266 0,00697213436425288 0,00699664014694553 0,00695811398489357 0,00704966811627375 0,00166486462888736 0,00157756453461954 264556 304919 579 665 0 True 489 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 534 266 0,00743791666650195 0,00754208707853406 0,00750743877317464 0,00762951094834821 0,00152313684239438 0,00150894865697018 282230 328690 579 665 0 True 533 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 578 266 0,018152015480198 0,00853995827288523 0,00834668497749294 0,00843823910887312 0,0766516226827121 0,00200462563005184 682826 372178 574 665 0 True 577 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 621 270 0,0141932622326163 0,00881365693932703 0,00949111161974517 0,00880445563439384 0,0296457387211761 0,00185507402433924 538560 384106 579 665 0 False 621 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 663 265 0,0379769119666441 0,773592071274547 0,0100404364080262 0,8170901045243 0,119856419174971 0,223465230701966 1441025 33713742 579 665 27 True 665 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 268 310 0,00723939125726566 0,00662039626417841 0,00691233691920348 0,00665293354695964 0,00209523177469963 0,00136564939994163 274697 288522 579 665 0 False 268 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 312 310 0,00705478081100252 0,00739284696061509 0,00695811398489357 0,00721751735713741 0,00161894352476352 0,00189714294994199 267692 322186 579 665 0 False 312 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 359 313 0,00704318500852489 0,00717823398046501 0,00685130083161669 0,00692759594110018 0,00157310562894346 0,00162821921543109 267252 312833 579 665 0 True 356 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 403 312 0,00761986534901455 0,00801580513425931 0,00746166170748455 0,00782787823300526 0,00176140386121232 0,00166814840737131 289134 349335 579 665 0 True 400 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 448 312 0,00759061230185508 0,00732937860788387 0,00753795681696803 0,00730907148851759 0,00185827507010399 0,00167093822643374 288024 319420 579 665 0 True 445 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 492 313 0,00745146267212355 0,00746742112777939 0,00737010757610437 0,00746166170748455 0,00173501474080593 0,00158842688494331 282744 325436 579 665 0 True 489 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 535 310 0,00786943864324894 0,00762987808270963 0,00782787823300526 0,00758373388265812 0,00156360295112659 0,00157661740954578 298604 332516 579 665 0 True 533 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 579 311 0,071555916291596 0,0366568745048706 0,00910963607232776 0,00993362325474937 0,189320773484656 0,123495972728401 2541664 1597535 542 665 0 True 577 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 621 313 0,110656402910612 0,060498970016022 0,0106813153276875 0,00994888227664607 0,198935772356807 0,136052561574859 4155320 2636592 573 665 0 False 621 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 665 313 0,0372058701641715 0,00804868660550438 0,00859082932784009 0,0081025406271458 0,105212970740401 0,00179663535006091 1411768 350768 579 665 0 False 665 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 269 358 0,00612972566834977 0,00606946526306611 0,00611886778057527 0,00604257267109178 0,00134040298398246 0,00142384806181993 232591 264512 579 665 0 True 268 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 314 357 0,00626745217686814 0,00638045101309006 0,00630197604333562 0,00630197604333562 0,00129194059996007 0,00128206394319066 237817 278065 579 665 0 True 312 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 358 357 0,00641384918314819 0,006495914769758 0,0063935301747158 0,00653086137178607 0,00126137087249025 0,001305303819363 243372 283097 579 665 0 True 356 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 402 357 0,00676420054255179 0,00674581854039998 0,0068207827878233 0,00668345159075303 0,00134752419235466 0,00138075190400254 256666 293988 579 665 0 True 400 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 447 355 0,00792156704620519 0,00780197231462726 0,00778210116731518 0,00756847486076143 0,00218359434670425 0,00217262961100993 300582 340016 579 665 0 True 444 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 491 356 0,00794626083466323 0,00908414318010637 0,00791943236438544 0,00914015411612116 0,00187450210797668 0,00207348766524712 301519 395894 579 665 0 True 488 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 532 355 0,00829373959754396 0,00924125374089837 0,00813305867093919 0,00917067215991455 0,00204176126924143 0,00205325739875038 314704 402741 579 665 0 False 532 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 579 356 0,00890301995545367 0,00936160497375276 0,00874341954680705 0,00927748531319142 0,00226491558433478 0,00221241362232857 337823 407986 579 665 0 True 576 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 623 356 0,00871603764050193 0,00845622869258291 0,00866712443732357 0,00839246204318303 0,00232542681978139 0,00199940025192499 330728 368529 579 665 0 True 621 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 667 355 0,00745765588481046 0,00777712190753836 0,00747692072938125 0,00779736018921187 0,00187318399310418 0,00188261952750173 282979 338933 579 665 0 True 665 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 271 401 0,00622807915663729 0,00615587951338635 0,00630197604333562 0,00614938582436866 0,00142475486539927 0,00137070163322833 236323 268278 579 665 0 True 267 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 315 402 0,00658836601043649 0,00648983410689691 0,00657663843747616 0,00651560234988937 0,0013515772005027 0,0012616212407974 249994 282832 579 665 0 True 311 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 359 402 0,0067364496788951 0,00679834169998124 0,00671396963454643 0,00675974670023652 0,00129531999456943 0,00128713606618944 255613 296277 579 665 0 True 356 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 403 401 0,00686632266664453 0,00701655718605279 0,00683604180972 0,00704966811627375 0,00136939908823266 0,00152802089658192 260541 305787 579 665 0 True 400 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 447 400 0,00703925824814042 0,00706426170714036 0,00703440909437705 0,00715648126955062 0,0015681269723182 0,0016588236902356 267103 307866 579 665 0 True 444 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 492 401 0,00720423489248122 0,00715182325234005 0,0072327763790341 0,00717174029144732 0,00165555050302472 0,001729032599483 273363 311682 579 665 0 True 488 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 535 400 0,00712873040589394 0,00735319644958127 0,00706492713817044 0,00730907148851759 0,00162911353823537 0,00149211924435563 270498 320458 579 665 0 True 532 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 580 400 0,00737102996948327 0,00728594202374786 0,00738536659800107 0,00735484855420768 0,00193018690749963 0,00175581749504931 279692 317527 579 665 0 True 576 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 623 400 0,0155835984857033 0,00939081510138358 0,00845349813076982 0,00889600976577401 0,0599428742848764 0,00354333175281105 580082 409259 568 665 0 True 620 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 667 399 0,00790567552599153 0,00765176846900956 0,00791943236438544 0,0076600289921416 0,00207494591850317 0,00211689986482467 299979 333470 579 665 0 True 664 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 271 447 0,00625050649279288 0,00636319569810312 0,00616464484626535 0,00636301213092241 0,00141795456610664 0,00151945798320783 237174 277313 579 665 0 True 267 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 315 445 0,0066708016244138 0,00645004592047755 0,00659189745937285 0,00645456626230259 0,00150141300684369 0,00145478862132099 253122 281098 579 665 0 True 311 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 360 447 0,00661129407442634 0,00688663751390378 0,00665293354695964 0,00692759594110018 0,00140074899470629 0,00132275549130139 250864 300125 579 665 0 True 355 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 404 445 0,00680750032316711 0,00679880061793302 0,00674448767833982 0,00671396963454643 0,00150010500693431 0,00150636673299646 258309 296297 579 665 0 True 399 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 448 445 0,00695890460778977 0,00700790658266174 0,00700389105058366 0,00694285496299687 0,00176384524121189 0,00181030743531602 264054 305410 579 665 0 True 443 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 492 445 0,00703991710055392 0,00716917035091735 0,00709544518196384 0,00717174029144732 0,00168397535454099 0,00180117576820741 267128 312438 579 665 0 True 488 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 537 444 0,00685773123117247 0,00702869556587738 0,00689707789730678 0,00700389105058366 0,00164602901326279 0,00166351910866227 260215 306316 579 665 0 True 532 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 581 444 0,00659993545881757 0,00655050306012227 0,00669871061264973 0,00660715648126955 0,00181140994707659 0,00191511017191372 250433 285476 579 665 0 True 576 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 624 445 0,0162670510232882 0,00687658721075979 0,00689707789730678 0,00679026474402991 0,0754080733408703 0,00210349827014587 609787 299687 572 665 0 True 620 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 669 443 0,00644165275499796 0,00621625016994305 0,0063782711528191 0,00628671702143893 0,00204563871944275 0,00186070584689734 244427 270909 579 665 0 True 664 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 267 483 0,00643095299180269 0,00639297947317366 0,00643930724040589 0,00642404821850919 0,00142238491812396 0,00143973622075745 244021 278611 579 665 0 False 267 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 311 483 0,00658188290268763 0,00638345692567422 0,00656137941557946 0,00643930724040589 0,0015012306682987 0,00148451950485366 249748 278196 579 665 0 False 311 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 359 490 0,00660544346499445 0,00662686700729852 0,00654612039368277 0,00662241550316625 0,00145301754707801 0,00144104281637858 250642 288804 579 665 0 True 355 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 403 490 0,00678027654144122 0,00654770366061641 0,0068055237659266 0,00660715648126955 0,00164500305771424 0,00158758480514396 257276 285354 579 665 0 True 399 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 448 489 0,00687059203028402 0,00709007584192801 0,00691233691920348 0,00701915007248035 0,00180173813900684 0,0019059283512381 260703 308991 579 665 0 True 443 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 491 490 0,00664853241283745 0,00664081811303264 0,00659189745937285 0,00665293354695964 0,00172461855292895 0,00185805372881027 252277 289412 579 665 0 True 487 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 535 487 0,00639582298111479 0,00618396529203531 0,00628671702143893 0,00617990386816205 0,00159297479871762 0,0015468210555232 242688 269502 579 665 0 True 531 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 579 488 0,00605972918793936 0,00601421154167176 0,0059510185397116 0,00608834973678187 0,00175547786499881 0,00173737353926284 229935 262104 579 665 0 True 575 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 624 489 0,00583666811482427 0,00590654939018409 0,00578316929884794 0,00599679560540169 0,00169714459145308 0,00168495198562449 221471 257412 579 665 0 True 619 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 667 488 0,00587849206603335 0,00614124003072456 0,00592050049591821 0,00613412680247196 0,0017909708895361 0,00175269045549487 223058 267640 579 665 0 True 664 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 266 526 0,00647962900811219 0,00644128058759855 0,00643930724040589 0,00646982528419928 0,00144612804767615 0,00150828971357824 245868 280716 579 665 0 False 266 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 310 526 0,0064691137235927 0,00641913779642514 0,00643930724040589 0,00648508430609598 0,00128394771035807 0,00148453058292311 245469 279751 579 665 0 False 310 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 354 527 0,00671805451951014 0,00667748565737989 0,00672922865644312 0,00671396963454643 0,00140703689733287 0,00136823669229103 254915 291010 579 665 0 False 354 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 404 533 0,00644990158721499 0,00655513813143525 0,00651560234988937 0,00656137941557946 0,00160133766034536 0,00151056247785994 244740 285678 579 665 0 True 399 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 448 532 0,00642855476901754 0,00613603131197185 0,00645456626230259 0,00610360875867857 0,00179229256232598 0,00187371642453993 243930 267413 579 665 0 True 443 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 492 533 0,00633781761463011 0,00629821291613102 0,0063782711528191 0,00633249408712902 0,00181571647278641 0,00190836200484997 240487 274481 579 665 0 True 487 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 536 532 0,00605422118176249 0,0063220766496236 0,00616464484626535 0,0064087891966125 0,00179458058905577 0,00172631664249733 229726 275521 579 665 0 True 531 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 581 532 0,00616978389509067 0,00615831177853079 0,00610360875867857 0,00613412680247196 0,00156783790689218 0,00150787001529196 234111 268384 579 665 0 True 575 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 624 533 0,00607490914754644 0,00629185690249887 0,00616464484626535 0,00630197604333562 0,00175970560842738 0,00180527502425506 230511 274204 579 665 0 True 619 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 669 532 0,00611778726261712 0,006093925589896 0,00616464484626535 0,00611886778057527 0,00174491489777869 0,00182963208309948 232138 265578 579 665 0 True 663 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 266 569 0,00695155181485509 0,00665729326750155 0,00685130083161669 0,00666819256885634 0,00158837872596399 0,00124817187762379 263775 290130 579 665 0 False 266 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 310 569 0,00691979512852432 0,0065230597666058 0,00675974670023652 0,00654612039368277 0,0017529077709763 0,00143386979647405 262570 284280 579 665 0 False 310 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 354 570 0,0070302978553168 0,00665676551185701 0,00695811398489357 0,00666819256885634 0,0015448868526691 0,00131709594993097 266763 290107 579 665 0 False 354 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 398 570 0,00640322848224254 0,00624991180170614 0,00648508430609598 0,00621042191195544 0,00157740316486875 0,0014432642544202 242969 272376 579 665 0 False 398 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 442 571 0,00613789543827719 0,00646528199647666 0,00611886778057527 0,00633249408712902 0,00182161125157746 0,00209075346546173 232901 281762 579 665 0 False 442 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 486 571 0,00625899251187878 0,00629435800533607 0,00624093995574884 0,00627145799954223 0,00182173166210678 0,00185307766036966 237496 274313 579 665 0 False 486 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 537 577 0,0063768216775094 0,00637065311481955 0,00631723506523232 0,00631723506523232 0,00179852721711409 0,00165852948344841 241967 277638 579 665 0 True 530 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 581 577 0,0062774930876499 0,00635952435448888 0,0063935301747158 0,00634775310902571 0,00157187669761358 0,001627722902277 238198 277153 579 665 0 True 575 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 625 578 0,00615673861730334 0,00616744424577121 0,00604257267109178 0,00617990386816205 0,00154915312159066 0,00148073727650297 233616 268782 579 665 0 True 619 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 669 576 0,00604605141183507 0,00615838061622355 0,00599679560540169 0,00616464484626535 0,00149970614453644 0,00168265036682772 229416 268387 579 665 0 True 663 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 266 612 0,00905376538766283 0,00888483511364816 0,00889600976577401 0,00880445563439384 0,00197685036944013 0,00161592063647733 343543 387208 579 665 0 False 266 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 310 613 0,00887445211480424 0,00797386003346659 0,00863660639353018 0,00793469138628214 0,00219795519399207 0,00151272682588431 336739 347507 579 665 0 False 310 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 354 613 0,00808019235327983 0,00776764525183409 0,00782787823300526 0,00775158312352178 0,00196640284038036 0,00168311352128332 306601 338520 579 665 0 False 354 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 398 613 0,00792304287561143 0,0083008161282125 0,00756847486076143 0,00813305867093919 0,00210901846194069 0,00180238144660186 300638 361756 579 665 0 False 398 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 442 614 0,0070467428115578 0,0081225953416386 0,00689707789730678 0,0081177996490425 0,00214217342850444 0,00223401381881391 267387 353989 579 665 0 False 442 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 486 614 0,00704276334298025 0,00655408262014615 0,00703440909437705 0,00654612039368277 0,00247929025408489 0,00201814447643784 267236 285632 579 665 0 False 486 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 530 615 0,0062345359102896 0,00617070256322886 0,00627145799954223 0,00619516289005875 0,00174987304704102 0,00186218054748318 236568 268924 579 665 0 False 530 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 574 615 0,00604286256615372 0,00628334397449334 0,00604257267109178 0,00628671702143893 0,00155816157401655 0,00162603853521368 229295 273833 579 665 0 False 574 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 618 615 0,00609514909368921 0,00616583803293998 0,00608834973678187 0,00614938582436866 0,00141610306975642 0,00138925906463025 231279 268712 579 665 0 False 618 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 662 616 0,00622973946471931 0,00620792080911824 0,00627145799954223 0,00619516289005875 0,00152146390359164 0,0014297026736591 236386 270546 579 665 0 False 662 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 265 656 0,0910322939145887 0,453228745932123 0,00900282291905089 0,443808651865415 0,187061988180103 0,390911925593701 3454199 19752060 579 665 11 False 265 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 309 656 0,0089090286894648 0,00712132815444425 0,00753795681696803 0,00718699931334401 0,00492415143875708 0,00129376305231349 338051 310353 579 665 0 False 309 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 353 656 0,0066106088679163 0,00637824820692152 0,00662241550316625 0,00636301213092241 0,00121892957003833 0,00121113878722653 250838 277969 579 665 0 False 353 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 397 657 0,00638944528975209 0,00610110765584137 0,0064087891966125 0,00611886778057527 0,00136435568243306 0,00125712655992187 242446 265891 579 665 0 False 397 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 442 657 0,00642515509056388 0,00636388407503079 0,00645456626230259 0,0063782711528191 0,00139367459121566 0,00149213515664418 243801 277343 579 665 0 False 442 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 486 657 0,00698446808143363 0,00674969639709253 0,00691233691920348 0,00674448767833982 0,00183374606525758 0,00163820824125294 265024 294157 579 665 0 False 486 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 530 658 0,00720041354848291 0,00831348226368163 0,00711070420386053 0,00823987182421607 0,00206428029576673 0,00209173838822452 273218 362308 579 665 0 False 530 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 574 658 0,00649064502046593 0,00602733659509268 0,0064087891966125 0,00599679560540169 0,00154443700263128 0,00126144422726266 246286 262676 579 665 0 False 574 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 618 659 0,00618188042540256 0,00620769135014235 0,00613412680247196 0,00616464484626535 0,00117201543638643 0,00131165589128921 234570 270536 579 665 0 False 618 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 666 662 0,00789513388737551 0,729014938352978 0,00775158312352178 0,754970626382849 0,00156086846939886 0,2172460813642 299579 31771036 579 665 14 True 662 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A3_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A3_3.csv new file mode 100755 index 0000000..9f841fb --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A3_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 268 267 0,00104617857035088 0,0748219828582672 0,000854505226215 0,0752574959945067 0,000762494656464786 0,0235385377979196 39697 3260800 579 665 0 True 269 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 313 267 0,000989886220141303 0,000934265166234423 0,000869764248111696 0,000854505226215 0,000701701432757468 0,000642416284554912 37561 40716 579 665 0 False 313 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 357 268 0,000958682969837868 0,0010243507601689 0,000823987182421607 0,000900282291905089 0,000684916675315555 0,000728229446385054 36377 44642 579 665 0 True 357 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 401 267 0,000994629957518514 0,000996127306134414 0,000854505226215 0,000854505226215 0,000705495929421945 0,000728744872053078 37741 43412 579 665 0 True 401 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 445 266 0,000919573490572415 0,000994314580224881 0,000717174029144732 0,000778210116731518 0,000830012580248394 0,000874111386115808 34893 43333 579 665 0 True 445 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 490 266 0,00086726060894039 0,000911824078392365 0,000625619897764553 0,000701915007248035 0,000824948890467467 0,000822971101251577 32908 39738 579 665 0 True 489 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 534 266 0,000980794056834981 0,00106494205300388 0,000823987182421607 0,000900282291905089 0,000783691785207277 0,000847318330538078 37216 46411 579 665 0 True 533 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 578 266 0,00307072662065505 0,00102657651223504 0,000823987182421607 0,000793469138628214 0,0138206463927954 0,000905493060330834 116518 44739 579 665 0 True 577 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 621 270 0,00150895650559438 0,00104213383080039 0,000839246204318303 0,000625619897764553 0,00292176015078699 0,00102075962035985 57257 45417 579 665 0 False 621 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 663 265 0,00398489752143675 0,0829874870283973 0,00103761348897536 0,0805981536583505 0,0122776065950383 0,0297489519630504 151206 3616659 579 665 0 True 665 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 268 310 0,000902179786855973 0,000916298528422223 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000694966400349363 0,000759534916792256 34233 39933 579 665 0 False 268 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 312 310 0,00088412723072603 0,000978917882942651 0,000762951094834821 0,000900282291905089 0,000682570955897973 0,000594309797807276 33548 42662 579 665 0 False 312 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 359 313 0,000977420732477853 0,000943122282703784 0,000869764248111696 0,00080872816052491 0,000649397498716605 0,000700832063865955 37088 41102 579 665 0 True 356 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 403 312 0,000932170748718565 0,00106732842635313 0,000793469138628214 0,000930800335698482 0,000709374635754693 0,000756587162171695 35371 46515 579 665 0 True 400 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 448 312 0,00104072327236708 0,00103832481180062 0,000778210116731518 0,000778210116731518 0,000946936277275956 0,000908750060455676 39490 45251 579 665 0 True 445 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 492 313 0,00111040350361901 0,000963681806943543 0,000915541313801785 0,000793469138628214 0,000921306229614658 0,000805550197418881 42134 41998 579 665 0 True 489 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 535 310 0,00103619036776219 0,0010379347315416 0,000885023270008392 0,000915541313801785 0,000813790690804311 0,000788881191834079 39318 45234 579 665 0 True 533 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 579 311 0,0184074403939516 0,00380952380952381 0,0012664988174258 0,00106813153276875 0,0474375280407934 0,0131173629789204 698466 166022 579 665 0 True 577 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 621 313 0,0124135173850728 0,00624050398369465 0,00184634164950027 0,00122072175173571 0,0226517931272304 0,01374616150092 471028 271966 579 665 0 False 621 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 665 313 0,00389571525874518 0,000983552954255632 0,000839246204318303 0,000564583810177768 0,0107514307740057 0,00099579464025463 147822 42864 579 665 0 False 665 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 269 358 0,000839483391187164 0,000851797610299496 0,000656137941557946 0,00064087891966125 0,000717088754583616 0,000743913794464137 31854 37122 579 665 0 True 268 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 314 357 0,00085880094395103 0,000913177886350117 0,000747692072938125 0,000747692072938125 0,00065533828537707 0,000706553469913619 32587 39797 579 665 0 True 312 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 358 357 0,000891980751494969 0,000881328980496561 0,000762951094834821 0,000717174029144732 0,000663465940703321 0,000675977822112547 33846 38409 579 665 0 True 356 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 402 357 0,0009803460371938 0,000913522074813952 0,00080872816052491 0,000762951094834821 0,000733009781642935 0,000699995491028936 37199 39812 579 665 0 True 400 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 447 355 0,00105310969774091 0,00109713514732127 0,000869764248111696 0,00080872816052491 0,000869103262786254 0,000992681257895815 39960 47814 579 665 0 True 444 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 491 356 0,00101434282173048 0,00101478232087428 0,00080872816052491 0,000717174029144732 0,000915565556366927 0,00091962237032974 38489 44225 579 665 0 True 488 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 532 355 0,00106133217586141 0,00113513355372868 0,000793469138628214 0,000915541313801785 0,000914631433692127 0,000956578994226742 40272 49470 579 665 0 False 532 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 579 356 0,00113438573147047 0,00113621201091536 0,000793469138628214 0,000823987182421607 0,00106408005578947 0,00112570325403204 43044 49517 579 665 0 True 576 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 623 356 0,00107456193232453 0,00102242330477143 0,000747692072938125 0,000701915007248035 0,00110846457766517 0,00105353573546741 40774 44558 579 665 0 True 621 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 667 355 0,0010725063127944 0,000986122894785602 0,000747692072938125 0,000549324788281071 0,00103858511413332 0,00102748060044142 40696 42976 579 665 0 True 665 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 271 401 0,000816476264907689 0,000841380172794082 0,00064087891966125 0,00064087891966125 0,000716313841260761 0,000753012279295509 30981 36668 579 665 0 True 267 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 315 402 0,000917043497304569 0,000927060154391472 0,000778210116731518 0,00080872816052491 0,000699005267104312 0,000660558557792557 34797 40402 579 665 0 True 311 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 359 402 0,000961502858167655 0,0009698313074974 0,000823987182421607 0,000839246204318303 0,000709530396049233 0,000700221457726679 36484 42266 579 665 0 True 356 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 403 401 0,000913011320533939 0,000996104360236825 0,000747692072938125 0,00080872816052491 0,00075627221758332 0,000810514015306213 34644 43411 579 665 0 True 400 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 447 400 0,00102064145080356 0,000984631411442316 0,000747692072938125 0,000762951094834821 0,000879187888309278 0,000832136810074977 38728 42911 579 665 0 True 444 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 492 401 0,000953965586557197 0,000900695318061691 0,000717174029144732 0,000671396963454643 0,000888052568878167 0,0008211176695237 36198 39253 579 665 0 True 488 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 535 400 0,000976709171871271 0,001014965888055 0,000823987182421607 0,000823987182421607 0,000865347729660939 0,000852035399883303 37061 44233 579 665 0 True 532 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 580 400 0,00100991533351175 0,000934012761360944 0,000671396963454643 0,000595101853971161 0,00100301130841423 0,000967512668488985 38321 40705 579 665 0 True 576 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 623 400 0,00887803627193369 0,00111964507285609 0,000823987182421607 0,000747692072938125 0,0531527071328472 0,00115122794396915 336875 48795 579 665 0 True 620 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 667 399 0,000959737133699471 0,00104938473443852 0,000610360875867857 0,000717174029144732 0,000929566661065376 0,00101339546718879 36417 45733 579 665 0 True 664 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 271 447 0,00088394275205025 0,000877519961496784 0,000732433051041428 0,000762951094834821 0,000763448523510064 0,000777118567237639 33541 38243 579 665 0 True 267 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 315 445 0,000897383341285682 0,00087458288660539 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000812517777612905 0,000759620728776839 34051 38115 579 665 0 True 311 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 360 447 0,000822985726753084 0,000977839425755967 0,000671396963454643 0,000854505226215 0,000708424507819177 0,000698655218743388 31228 42615 579 665 0 True 355 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 404 445 0,000848180243045385 0,00092687658721076 0,000656137941557946 0,000732433051041428 0,000772185169937401 0,000813711985268548 32184 40394 579 665 0 True 399 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 448 445 0,00095512516680496 0,000997045142037974 0,000686655985351339 0,000732433051041428 0,000935616855999342 0,000984980945346054 36242 43452 579 665 0 True 443 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 492 445 0,00102870580434482 0,000919694521265397 0,000747692072938125 0,000610360875867857 0,000949678818640419 0,000949730560950602 39034 40081 579 665 0 True 488 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 537 444 0,00095918369767213 0,000983162873996619 0,000625619897764553 0,000793469138628214 0,000940465457244119 0,000879634584720974 36396 42847 579 665 0 True 532 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 581 444 0,000901151977090911 0,000875156534045115 0,000457770656900893 0,000442511635004196 0,000959956648271418 0,000978066307520609 34194 38140 579 665 0 True 576 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 624 445 0,00747275678212792 0,000905582794248152 0,000610360875867857 0,000579842832074464 0,0496559909129329 0,00091550780412687 283552 39466 579 665 0 True 620 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 669 443 0,000912589654989298 0,000899639806772596 0,000564583810177768 0,000503547722590982 0,000998672096135242 0,000938672439438403 34628 39207 579 665 0 True 664 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 267 483 0,000917913182490391 0,000897872972658242 0,000793469138628214 0,000732433051041428 0,000721175141965725 0,00079707501703529 34830 39130 579 665 0 False 267 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 311 483 0,000881360050589324 0,000921713760253231 0,000732433051041428 0,000793469138628214 0,000776884728421263 0,000792653298449014 33443 40169 579 665 0 False 311 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 359 490 0,000903049472041795 0,000904527282959057 0,000732433051041428 0,000747692072938125 0,000777096494577518 0,000775569227211779 34266 39420 579 665 0 True 355 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 403 490 0,000928006801465235 0,00101322199983823 0,000747692072938125 0,000839246204318303 0,000820563454666622 0,000854602289735945 35213 44157 579 665 0 True 399 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 448 489 0,000982190823951604 0,00100039524308597 0,00064087891966125 0,000595101853971161 0,000953240510008735 0,00109145314901558 37269 43598 579 665 0 True 443 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 491 490 0,000878276621294136 0,000923044622313394 0,000579842832074464 0,000625619897764553 0,000893561886137841 0,000918785509011636 33326 40227 579 665 0 True 487 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 535 487 0,000944583528188935 0,000914921774566882 0,000671396963454643 0,00064087891966125 0,000865381566315419 0,000840819840482215 35842 39873 579 665 0 True 531 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 579 488 0,000940445935032145 0,000853725065696973 0,000686655985351339 0,000457770656900893 0,000904660639212125 0,000953346640054144 35685 37206 579 665 0 True 575 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 624 489 0,000895222305369397 0,00091473820738617 0,000534065766384375 0,000549324788281071 0,000936074644864373 0,000910024399075249 33969 39865 579 665 0 True 619 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 667 488 0,000963031395766979 0,000979698043460677 0,000717174029144732 0,000503547722590982 0,000922015956955026 0,00104673859477092 36542 42696 579 665 0 True 664 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 266 526 0,000882756817705947 0,000916550933295702 0,000732433051041428 0,000762951094834821 0,00074264902385311 0,000768686909622856 33496 39944 579 665 0 False 266 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 310 526 0,000910217786300693 0,000975521890099476 0,000732433051041428 0,000915541313801785 0,000784043135751576 0,000777525897276523 34538 42514 579 665 0 False 310 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 354 527 0,000922630565771062 0,000985434517857932 0,000747692072938125 0,000854505226215 0,000753398554270087 0,000794810768718826 35009 42946 579 665 0 False 354 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 404 533 0,000914065484395542 0,000945967574004822 0,000671396963454643 0,000671396963454643 0,000817481462681132 0,000876736607019778 34684 41226 579 665 0 True 399 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 448 532 0,00101265615955192 0,000950533807625037 0,000732433051041428 0,000488288700694286 0,000973157343918764 0,00108077395724943 38425 41425 579 665 0 True 443 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 492 533 0,000923895562404985 0,000874261644039143 0,000564583810177768 0,000473029678797589 0,000954153998503718 0,000974583057236306 35057 38101 579 665 0 True 487 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 536 532 0,000835372152126914 0,00086127426600376 0,000518806744487678 0,000457770656900893 0,000878921179984765 0,000923004667340121 31698 37535 579 665 0 True 531 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 581 532 0,000864888740251784 0,000855744304684807 0,000610360875867857 0,000595101853971161 0,000827696685321963 0,000805653326270084 32818 37294 579 665 0 True 575 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 624 533 0,000915251418739845 0,000881650223062807 0,000595101853971161 0,000503547722590982 0,00091352405524396 0,000967559347202819 34729 38423 579 665 0 True 619 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 669 532 0,000853082105001836 0,000897597621887174 0,000503547722590982 0,000473029678797589 0,000921022582047909 0,000977286031807427 32370 39118 579 665 0 True 663 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 266 569 0,000919362657800094 0,000940827692944882 0,00080872816052491 0,00080872816052491 0,000704390986843298 0,000700138399645677 34885 41002 579 665 0 False 266 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 310 569 0,000961898169615756 0,000901498424477307 0,000793469138628214 0,000793469138628214 0,000753039549146468 0,000693301536058319 36499 39288 579 665 0 False 310 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 354 570 0,000927031699893253 0,00101028492494684 0,000762951094834821 0,000869764248111696 0,000734139599621711 0,000742109178233677 35176 44029 579 665 0 False 354 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 398 570 0,000844622440012476 0,000959803950250999 0,000717174029144732 0,00080872816052491 0,00069013502649926 0,000743153849137574 32049 41829 579 665 0 False 398 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 442 571 0,000989280075920881 0,00102733372685548 0,000671396963454643 0,000701915007248035 0,000960981939768407 0,00107230872756248 37538 44772 579 665 0 False 442 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 486 571 0,000954782563549939 0,000868754628617779 0,000503547722590982 0,0004272526131075 0,00104572169335788 0,00103174180606243 36229 37861 579 665 0 False 486 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 537 577 0,000827966650999156 0,000898446620097968 0,000473029678797589 0,000503547722590982 0,000932042172079223 0,000920146137596572 31417 39155 579 665 0 True 530 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 581 577 0,000895591262720958 0,000942112663209867 0,000610360875867857 0,000656137941557946 0,000843163887259902 0,000877824888914599 33983 41058 579 665 0 True 575 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 625 578 0,000855322203207742 0,000924903240018104 0,000671396963454643 0,000671396963454643 0,000763384059457787 0,000832822358515574 32455 40308 579 665 0 True 619 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 669 576 0,000978395834049835 0,000872884890183802 0,000732433051041428 0,000595101853971161 0,000853993704152783 0,000820060491134413 37125 38041 579 665 0 True 663 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 266 612 0,00101199730713842 0,00110408775429074 0,000900282291905089 0,000991836423285267 0,000703720875634836 0,000738375958296541 38400 48117 579 665 0 False 266 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 310 613 0,0011321719873611 0,000936490918300558 0,00100709544518196 0,000839246204318303 0,000828429429607786 0,000684734641066335 42960 40813 579 665 0 False 310 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 354 613 0,00103901025609198 0,00101290075727199 0,000946059357595178 0,000885023270008392 0,000754424852183313 0,000776426333742409 39425 44143 579 665 0 False 354 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 398 613 0,00110384133358053 0,00112705659777735 0,000961318379491875 0,000991836423285267 0,000790734743860882 0,000734874458377583 41885 49118 579 665 0 False 398 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 442 614 0,0010221172802098 0,00104731960365551 0,000671396963454643 0,000747692072938125 0,000987685656508297 0,00102536842604881 38784 45643 579 665 0 False 442 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 486 614 0,000966879093861828 0,000847369052064815 0,000625619897764553 0,0004272526131075 0,000985466477147769 0,000952610592022848 36688 36929 579 665 0 False 486 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 530 615 0,000919336303703554 0,000910699729410503 0,000595101853971161 0,000488288700694286 0,00096483152593891 0,00101380148994248 34884 39689 579 665 0 False 530 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 574 615 0,000824277077483547 0,000888602830032279 0,000549324788281071 0,000564583810177768 0,000804805259438272 0,000874214512469596 31277 38726 579 665 0 False 574 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 618 615 0,00084630910219104 0,000813730366199316 0,000671396963454643 0,000625619897764553 0,000729835297690441 0,000654585799576891 32113 35463 579 665 0 False 618 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 662 616 0,000947614249291042 0,000983805359129111 0,000778210116731518 0,000793469138628214 0,000772527368169588 0,000820989369387016 35957 42875 579 665 0 False 662 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 265 656 0,00918076577888939 0,0467452448929603 0,00115968566414893 0,0441138323033494 0,018778910138948 0,04154488676984 348362 2037194 579 665 0 False 265 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 309 656 0,00101718906415681 0,000912076483265844 0,000854505226215 0,000823987182421607 0,000813992944400768 0,000673861915904043 38597 39749 579 665 0 False 309 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 353 656 0,000985168836860632 0,00104123894079442 0,000915541313801785 0,000915541313801785 0,000637082236702216 0,000672709453205809 37382 45378 579 665 0 False 353 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 397 657 0,000907687793032847 0,000943833605529044 0,000778210116731518 0,000823987182421607 0,00066064909466055 0,000700241166162855 34442 41133 579 665 0 False 397 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 442 657 0,00104096045923594 0,000983782413231522 0,000854505226215 0,000793469138628214 0,000798183449854311 0,000813227917336478 39499 42874 579 665 0 False 442 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 486 657 0,000951303822806651 0,000971070385967207 0,000671396963454643 0,000747692072938125 0,000823654420258521 0,000851058723307835 36097 42320 579 665 0 False 486 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 530 658 0,000937257089350797 0,0010933031824239 0,000564583810177768 0,000885023270008392 0,000943048782803705 0,000930873376472003 35564 47647 579 665 0 False 530 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 574 658 0,000932407935587426 0,000873665050701829 0,000717174029144732 0,000717174029144732 0,000816421663460796 0,000712707528132297 35380 38075 579 665 0 False 574 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 618 659 0,00082546301182785 0,000941607853462909 0,000671396963454643 0,000793469138628214 0,000639093321454502 0,000720370641734538 31322 41036 579 665 0 False 618 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 666 662 0,000969593565805454 0,0750033472328108 0,000778210116731518 0,0751049057755398 0,000765800374624156 0,0259326512761288 36791 3268704 579 665 0 True 662 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A4_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A4_1.csv new file mode 100755 index 0000000..8c86a7c --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A4_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 244 244 0,0101400432765993 0,0461408040586704 0,0101472495613031 0,046341649500267 0,00167394600469715 0,0109266418799778 443240 2010852 667 665 0 True 245 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 289 243 0,0100071731129171 0,0100106067411605 0,0100556954299229 0,0100251773861295 0,00150156132347481 0,00142816014619497 437432 436270 667 665 0 False 289 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 333 243 0,0100820040883655 0,0662378766784207 0,0100862134737163 0,0663767452506294 0,00129657838680207 0,00983408165701783 440703 2886698 667 665 0 True 334 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 378 242 0,01021382190571 0,0925112506604116 0,0101930266269932 0,0910353246356908 0,00143792923124018 0,0138473492242283 446465 4031712 667 665 0 True 378 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 422 242 0,0104899255567913 0,0777702094558897 0,0105134660868238 0,0737468528267338 0,00155725631609509 0,0147023444296514 458534 3389286 667 665 0 True 422 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 466 241 0,0104137448327793 0,0737791377046416 0,0103303578240635 0,075043869687953 0,00155588655864374 0,0231847430392342 455204 3215352 667 665 0 True 467 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 510 240 0,0103842791353236 0,0840374454102755 0,0103608758678569 0,0810711833371481 0,00163034070456464 0,0259606189948269 453916 3662417 667 665 0 True 511 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 554 240 0,0104444687704214 0,0743674016811312 0,0104371709773404 0,0708628976882582 0,00154616559776602 0,0225992162611 456547 3240989 667 665 0 True 555 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 599 243 0,0104023291627247 0,0106970103216384 0,0104982070649271 0,0106355382619974 0,00186785805175417 0,00202484493733845 454705 466184 667 665 0 False 599 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 640 240 0,0103553624881311 0,0458992525947508 0,0103456168459602 0,0469672693980316 0,00175361511522721 0,0110780035778356 452652 2000325 667 665 0 True 644 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 245 287 0,0100521037261182 0,0101538809257063 0,010101472495613 0,0102235446707866 0,0015833563942992 0,00148655215513659 439396 442514 667 665 0 False 245 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 289 287 0,010184104560217 0,0101729260207052 0,0101930266269932 0,0101319905394064 0,00140202230166853 0,00136759137816232 445166 443344 667 665 0 False 289 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 333 287 0,010464326088272 0,109502618987386 0,010452429999237 0,107026779583429 0,0013834869428187 0,0251491711890395 457415 4772209 667 665 0 True 334 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 378 287 0,0104499592730529 0,0596720916505042 0,0104676890211337 0,0562600137331197 0,00137698626572616 0,0117341187489197 456787 2600556 667 665 0 True 378 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 422 286 0,0104818041883155 0,0865638575725191 0,0105134660868238 0,0842298008697643 0,00158899481104123 0,0172238256735715 458179 3772520 667 665 0 True 422 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 466 285 0,0105314703600363 0,0475507147360275 0,0105745021744106 0,0481269550621805 0,00164125220226976 0,0109703057348057 460350 2072297 667 665 0 True 467 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 510 285 0,0103032713444148 0,0489684040726674 0,0102845807583734 0,0523537041275654 0,0015801179347944 0,0119208798107168 450375 2134081 667 665 0 True 511 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 555 285 0,0105722144649808 0,0622513941066904 0,0105439841306172 0,0599832150759136 0,00170018437260157 0,0176141893688695 462131 2712964 667 665 0 True 555 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 599 287 0,0105944052464498 0,0105351270141479 0,0106202792401007 0,0105439841306172 0,00196165189069143 0,00190610197247772 463101 459129 667 665 0 False 599 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 644 287 0,0104608487699387 0,0105843689103739 0,0104371709773404 0,0105439841306172 0,00188127832362812 0,00200536222488338 457263 461275 667 665 0 False 644 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 246 333 0,0101240521876851 0,0576846097849338 0,0101625085831998 0,0557259479667353 0,00149562929315419 0,0117401364553677 442541 2513940 667 665 0 True 245 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 290 333 0,0102709002559832 0,0690416129589251 0,01025406271458 0,070618753337911 0,00140310744226862 0,021413917738507 448960 3008887 667 665 0 True 289 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 334 333 0,0103258052822982 0,045038368409006 0,0103303578240635 0,044785229266804 0,00130684859153666 0,0104023156070715 451360 1962807 667 665 0 True 334 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 378 331 0,0104464819547196 0,0386240492510746 0,0104676890211337 0,0391088731212329 0,0012831458704622 0,00644259654601236 456635 1683266 667 665 0 True 378 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 422 331 0,0106293843236313 0,0777930865157859 0,0106355382619974 0,0735942626077668 0,00155271360084221 0,015903957140224 464630 3390283 667 665 0 True 422 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 466 329 0,010498504467153 0,0348231989908394 0,0104829480430304 0,0364995803768978 0,00179312859257253 0,00588367749419756 458909 1517622 667 665 0 True 467 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 510 329 0,0104445831558929 0,0302710312058471 0,0104676890211337 0,0306401159685664 0,00167833128529517 0,00355914277722711 456552 1319235 667 665 0 True 511 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 554 329 0,0106306883180063 0,0559420753761263 0,0106965743495842 0,0556954299229419 0,00167083739503769 0,0108692126704542 464687 2437999 667 665 0 True 555 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 598 329 0,010636201697732 0,0651446423336896 0,0106355382619974 0,0643472953383688 0,00191687469330929 0,0195464846137199 464928 2839054 667 665 0 True 599 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 643 328 0,0103546075440192 0,0699440062734084 0,0103303578240635 0,0700236514839399 0,00200651464107884 0,0224996527603606 452619 3048214 667 665 0 True 644 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 246 376 0,0101440467681014 0,0492510516391689 0,01025406271458 0,050064850843061 0,00161624841425302 0,012506926366785 443415 2146399 667 665 0 True 245 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 291 376 0,0102769398088779 0,0341787405111543 0,0102235446707866 0,0342565041580835 0,00143762896380779 0,00409022525477414 449224 1489536 667 665 0 True 289 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 334 376 0,0103812593588763 0,0937028081763117 0,0103761348897536 0,0893568322270542 0,00138676602012463 0,0236204093839078 453784 4083641 667 665 0 True 334 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 378 375 0,010642035356778 0,0717150624329191 0,0106202792401007 0,0687266346227207 0,00140417624602189 0,0198005874046444 465183 3125398 667 665 0 True 378 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 422 375 0,0105550337671631 0,0464302436108582 0,0106660563057908 0,047196154726482 0,00160737074380069 0,00904816092534852 461380 2023466 667 665 0 True 422 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 466 374 0,0107123137904611 0,0576157950380644 0,0106355382619974 0,0576333257038224 0,0017239968852424 0,0142129179378077 468255 2510941 667 665 0 True 467 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 510 374 0,010742946219726 0,0438572053847138 0,0107881284809644 0,0450598916609445 0,00185792273178719 0,00652447449050926 469594 1911331 667 665 0 True 511 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 555 374 0,010521770472054 0,0559461367999995 0,0105592431525139 0,0542610818646525 0,00174453653282394 0,0100223240401129 459926 2438176 667 665 0 True 555 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 598 373 0,0105335750527117 0,0449581266051372 0,0104676890211337 0,0464179446097505 0,00202589548485441 0,00968825832652395 460442 1959310 667 665 0 True 599 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 642 374 0,0114136568703517 0,0958747291667025 0,010452429999237 0,0899519340810254 0,00866759996930992 0,0238677363139367 498912 4178295 667 665 0 True 644 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 246 420 0,0102846722667506 0,0459281873716105 0,0102082856488899 0,0453498130769818 0,00164565260814677 0,00809283013787657 449562 2001586 667 665 0 True 245 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 290 420 0,0105055506121968 0,0603263480284598 0,0105287251087205 0,0587472343022812 0,00159897159710793 0,00943439654199427 459217 2629069 667 665 0 True 289 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 334 420 0,0104505998316932 0,0372058551046878 0,010406652933547 0,0376134889753567 0,00134897088591896 0,00474563788000884 456815 1621460 667 665 0 True 334 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 378 420 0,0104050515369461 0,0591502331016371 0,0103761348897536 0,0566414892805371 0,00146669115945327 0,0144254807341555 454824 2577813 667 665 0 True 378 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 423 419 0,0108572859370269 0,10286935007466 0,0108796826123445 0,101853971160449 0,00166980220319854 0,014250064752201 474592 4483126 667 665 0 True 422 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 466 417 0,0107876480619841 0,0643325181803215 0,0107118333714809 0,0644846265354391 0,00168599226967542 0,0181735962769974 471548 2803661 667 665 0 True 467 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 510 417 0,0106884072269198 0,0575031765726975 0,0106202792401007 0,0563363088426032 0,00174116323183912 0,0141818445233008 467210 2506033 667 665 0 True 511 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 554 417 0,0108491188143626 0,0335747585948162 0,0108491645685512 0,0345922026398108 0,00193914866182129 0,00557110284764172 474235 1463214 667 665 0 True 555 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 599 418 0,0103944823193805 0,0461501200930915 0,0104219119554437 0,0443121995880064 0,00183542999379749 0,00961249121288549 454362 2011258 667 665 0 True 599 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 643 417 0,0104624730436338 0,0756081322555645 0,0103761348897536 0,0759594110017548 0,00190518421536036 0,0174160307155154 457334 3295061 667 665 0 True 644 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 246 464 0,0101675186668511 0,054862470894563 0,0101625085831998 0,0543678950179294 0,00150542419405035 0,0149987392961993 444441 2390949 667 665 0 True 245 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 292 465 0,010381236481782 0,0607100952197385 0,010406652933547 0,0585488670176242 0,00169391129923 0,01214968619729 453783 2645793 667 665 0 True 289 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 335 464 0,0104759934063639 0,0742099928236705 0,0105134660868238 0,0699015793087663 0,00156694550178278 0,0201619691142373 457925 3234129 667 665 0 True 334 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 380 464 0,010740567001919 0,0981350607005038 0,0107270923933776 0,090424963759823 0,00152439783720248 0,0254065621416859 469490 4276802 667 665 0 True 378 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 424 463 0,0109026512150196 0,114818219731063 0,0110627908751049 0,107499809262226 0,00198082548479851 0,0422515322150839 476575 5003867 667 665 0 True 422 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 468 462 0,0108086949887382 0,048402512346327 0,0108186465247578 0,0505073624780652 0,00194346764752896 0,00851109547829296 472468 2109419 667 665 0 True 467 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 511 462 0,0108330362170711 0,0451241401741938 0,0108644235904479 0,0468909742885481 0,00180573512216989 0,00757279773727595 473532 1966545 667 665 0 True 511 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 556 462 0,0109797698998978 0,10937857346502 0,0110017547875181 0,110078583962768 0,00189417970548047 0,0193337954881713 479946 4766803 667 665 0 True 555 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 600 461 0,0106013370060221 0,0658892596563508 0,0106965743495842 0,0689860379949645 0,00192001137573483 0,0194820146437081 463404 2871505 667 665 0 True 599 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 645 462 0,0110101278040312 0,0782542990573252 0,0102845807583734 0,0756237125200275 0,00377398045696474 0,013436129564726 481273 3410383 667 665 0 True 644 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 247 508 0,00990523278072568 0,0536421392230863 0,00988784618905928 0,056046387426566 0,00156615227429687 0,0126310212302496 432976 2337766 667 665 0 True 245 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 291 508 0,0102313000057536 0,107918480109635 0,01025406271458 0,0999923704890517 0,00168473754115885 0,0284771737446094 447229 4703171 667 665 0 True 289 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 336 509 0,0105779794927439 0,0605785234429631 0,0106202792401007 0,0623331044480049 0,00155186116715091 0,0156854106095568 462383 2640059 667 665 0 True 334 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 380 508 0,0107052905225117 0,0619041767843734 0,0107423514152743 0,0601968413824674 0,00160944258273292 0,0105641772409517 467948 2697832 667 665 0 True 378 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 424 508 0,0108214832844507 0,0616734328382182 0,0108644235904479 0,0611276417181659 0,00189895390311247 0,00932387546365933 473027 2687776 667 665 0 True 422 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 469 506 0,0108023580336177 0,0648443493719421 0,0108949416342412 0,0640573739223316 0,00186804348488954 0,0174860645079062 472191 2825967 667 665 0 True 467 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 513 506 0,0107329489295178 0,0763847361594648 0,010757610437171 0,0739299610894942 0,00171945154302436 0,0191004750849625 469157 3328906 667 665 0 True 511 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 556 506 0,0105679822025357 0,0613641221387183 0,0106660563057908 0,0619058518348974 0,00182169968462272 0,0154550524559916 461946 2674296 667 665 0 True 555 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 600 505 0,0102690472113451 0,0441774842232613 0,01025406271458 0,0443274586099031 0,00182436194684243 0,0080359699623141 448879 1925289 667 665 0 True 599 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 645 506 0,0103579933539753 0,0662034348861396 0,0103150988021668 0,0660715648126955 0,00227280349869399 0,0145380986050797 452767 2885197 667 665 0 True 644 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 248 554 0,00993469847818137 0,0476304976219445 0,00991836423285267 0,0482948043030442 0,00150125456780678 0,010528093502607 434264 2075774 667 665 0 True 245 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 292 553 0,01004210643591 0,0538201993883771 0,0100099183642329 0,0544747081712062 0,00142930904633133 0,0108479829747509 438959 2345526 667 665 0 True 289 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 336 553 0,0102112825482429 0,0515327687495232 0,0102082856488899 0,0512703135729 0,0014067735072176 0,0101199237711205 446354 2245838 667 665 0 True 334 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 380 552 0,0104548778483269 0,0515737501226171 0,010406652933547 0,0505989166094453 0,00141417459975874 0,00723418904309002 457002 2247624 667 665 0 True 378 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 425 552 0,0107778337885303 0,0984869360400314 0,0107728694590677 0,0968184939345388 0,00187751905173304 0,022225555915165 471119 4292137 667 665 0 True 422 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 468 551 0,0108065902960628 0,0638254597353994 0,0108339055466545 0,0624551766231785 0,00206318075125387 0,0124438989497297 472376 2781563 667 665 0 True 467 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 513 550 0,0104803858084691 0,0573410408603335 0,0103761348897536 0,0568703746089876 0,00206434487916869 0,00875467013539615 458117 2498967 667 665 0 True 511 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 556 550 0,0103748080182843 0,0393730033483801 0,0103303578240635 0,0411383230334936 0,00175837058621874 0,0100602976091245 453502 1715906 667 665 0 True 555 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 601 550 0,0102374081899311 0,049446734253808 0,0103303578240635 0,0495460440985733 0,00177505657605102 0,00843992737640045 447496 2154927 667 665 0 True 599 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 645 550 0,0101215814615009 0,0539751300888981 0,0100862134737163 0,0525215533684291 0,00180562055628594 0,00780673652735776 442433 2352278 667 665 0 True 644 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 245 591 0,0100915438366877 0,00958009581059538 0,0098268101014725 0,00961318379491875 0,00188594859206874 0,00112816362227983 441120 417508 667 665 0 False 245 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 289 591 0,00986670775392802 0,00994211323685731 0,00975051499198901 0,00993362325474937 0,0015441783716804 0,00142965332595602 431292 433285 667 665 0 False 289 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 336 597 0,010237087910611 0,0897992291325705 0,0102388036926833 0,0894331273365377 0,00140808499272501 0,0181331633980411 447482 3913520 667 665 0 True 334 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 381 596 0,0104434621782723 0,079790297441934 0,010406652933547 0,0746166170748455 0,00133158908566301 0,0237293915291728 456503 3477323 667 665 0 True 378 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 422 591 0,0104344257260246 0,0104223479274978 0,0103456168459602 0,0104982070649271 0,00193255060769872 0,00184095701037215 456108 454214 667 665 0 False 422 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 467 591 0,0105578476497618 0,0103246672414614 0,0105134660868238 0,0102998397802701 0,00206524854367854 0,00188888516173481 461503 449957 667 665 0 False 467 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 511 591 0,0103087618470463 0,0101328395376172 0,0103150988021668 0,0103150988021668 0,00214042068705891 0,00211895492125392 450615 441597 667 665 0 False 511 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 555 591 0,0101786369346798 0,0099947740718241 0,0101472495613031 0,0100404364080262 0,00194818019150307 0,00182970659602302 444927 435580 667 665 0 False 555 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 599 591 0,00986743982094556 0,0100357324990205 0,00993362325474937 0,0100251773861295 0,00168058052684366 0,00167220155888105 431324 437365 667 665 0 False 599 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 644 591 0,00999022118604236 0,0100902978434872 0,0100556954299229 0,00999465934233616 0,00174765631952378 0,00152189957591275 436691 439743 667 665 0 False 644 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 247 641 0,00954892203703596 0,0440104610347108 0,00961318379491875 0,0443274586099031 0,00138082348179024 0,00847828717874047 417401 1918010 667 665 0 True 245 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 289 634 0,00957795306969999 0,00961917267418948 0,00955214770733196 0,00962844281681544 0,00136196538536873 0,00133487307779819 418670 419211 667 665 0 False 289 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 334 634 0,0105289538796635 0,00987598316000576 0,00994888227664607 0,0098268101014725 0,00352698785047626 0,0015375649674021 460240 430403 667 665 0 False 334 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 378 634 0,0103607843594797 0,00995080973204354 0,0101625085831998 0,00994888227664607 0,00206015968904088 0,00127306070990936 452889 433664 667 665 0 False 378 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 422 634 0,0101383274945269 0,0100240759830453 0,0101930266269932 0,0100404364080262 0,00163069352671948 0,00158100300350138 443165 436857 667 665 0 False 422 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 467 634 0,00996459884042872 0,00999782587620344 0,0100709544518196 0,0100099183642329 0,00184626984052547 0,00172147637795007 435571 435713 667 665 0 False 467 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 511 634 0,0100833080827405 0,00998169491019836 0,0100099183642329 0,00999465934233616 0,00183472036300654 0,00184151118920674 440760 435010 667 665 0 False 511 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 555 634 0,00988180663616464 0,00998557276689091 0,0098115510795758 0,00997940032043946 0,00182701318033261 0,00179313307393931 431952 435179 667 665 0 False 555 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 599 634 0,00991838710994697 0,00988975069855917 0,00993362325474937 0,00991836423285267 0,00145749890533402 0,00134949651910329 433551 431003 667 665 0 False 599 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 645 638 0,00995810174564812 0,0442080711047474 0,00990310521095598 0,0446173800259403 0,00134064064978166 0,00954398443099258 435287 1926622 667 665 0 True 644 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A4_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A4_2.csv new file mode 100755 index 0000000..929cd7c --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A4_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 244 244 0,00827949495154002 0,744203585181769 0,00801098649576562 0,77602807660029 0,00256539884164547 0,212019941122279 361912 32432969 667 665 15 True 245 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 289 243 0,00646053718391434 0,00621443744403352 0,00625619897764553 0,00621042191195544 0,00162746461048558 0,00128250076342942 282402 270830 667 665 0 False 289 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 333 243 0,00582379901832101 0,00592210670874944 0,00582894636453803 0,0059662775616083 0,00120223042389621 0,0011367750139506 254569 258090 667 665 0 True 334 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 378 242 0,00555243092575937 0,00586692182504786 0,00556954299229419 0,00585946440833143 0,00130025143904498 0,0011449608763306 242707 255685 667 665 0 True 378 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 422 242 0,00583642717437344 0,00606485313765072 0,00578316929884794 0,00605783169298848 0,00144239267871723 0,00143906267259687 255121 264311 667 665 0 True 422 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 466 241 0,00623304735821606 0,00619573653749847 0,00628671702143893 0,00614938582436866 0,00153632151173046 0,00133191654642478 272458 270015 667 665 0 True 467 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 510 240 0,00637596056629502 0,00619229465286012 0,00633249408712902 0,00619516289005875 0,00156635929042553 0,00151858065911866 278705 269865 667 665 0 True 511 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 554 240 0,00669754388084054 0,00674714940246015 0,00663767452506294 0,00671396963454643 0,0014064848651946 0,00131148718309586 292762 294046 667 665 0 True 555 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 599 243 0,00752008980632138 0,00727641947624841 0,00752269779507134 0,00730907148851759 0,00204010122241946 0,00191863436089327 328717 317112 667 665 0 False 599 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 640 240 0,00886672708507271 0,743385127960666 0,0089570458533608 0,771114671549554 0,00208541471204407 0,225167049641282 387581 32397300 667 665 16 True 644 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 245 287 0,00641810017399174 0,00634731713697152 0,00636301213092241 0,00628671702143893 0,00151549222130286 0,00142324103748157 280547 276621 667 665 0 False 245 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 289 287 0,00598167384607078 0,00623814055624298 0,0059662775616083 0,00622568093385214 0,00129556523012581 0,00131478733877744 261470 271863 667 665 0 False 289 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 333 287 0,00590601929522764 0,00609550885682965 0,00592050049591821 0,00611886778057527 0,00131038000647834 0,00126535108792863 258163 265647 667 665 0 True 334 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 378 287 0,0058749750782654 0,00594188607247118 0,00590524147402152 0,00593575951781491 0,00125436180704891 0,00114599641097905 256806 258952 667 665 0 True 378 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 422 286 0,00601562345400886 0,00589163455675123 0,00608834973678187 0,00588998245212482 0,00153216287606249 0,0015150542999807 262954 256762 667 665 0 True 422 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 466 285 0,00619799964975169 0,00617494755428282 0,00619516289005875 0,00622568093385214 0,00167876451455939 0,00181437501069058 270926 269109 667 665 0 True 467 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 510 285 0,00641947279964961 0,00652705235278629 0,00653086137178607 0,00643930724040589 0,0015001431826008 0,0015124862402797 280607 284454 667 665 0 True 511 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 555 285 0,00667885329479915 0,00664845909692978 0,00662241550316625 0,00666819256885634 0,00153970583890694 0,00145810846297896 291945 289745 667 665 0 True 555 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 599 287 0,00721486361419885 0,00721710433098081 0,0072480354009308 0,0072327763790341 0,00184007278198564 0,00184789567609603 315375 314527 667 665 0 False 599 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 644 287 0,0077046622031168 0,00764610083230507 0,00773632410162509 0,00761425192645151 0,00183066223674687 0,00193023005419587 336785 333223 667 665 0 False 644 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 246 333 0,00604277856494046 0,00593881132219425 0,005981536583505 0,00587472343022812 0,00143851353584448 0,00134191940343502 264141 258818 667 665 0 True 245 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 290 333 0,00607331948582816 0,00604807968651315 0,00607309071488518 0,00608834973678187 0,00119943778108037 0,00123282101990538 265476 263580 667 665 0 True 289 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 334 333 0,00597892859475504 0,00596999479701772 0,00599679560540169 0,00593575951781491 0,00124865823042368 0,00119442921565229 261350 260177 667 665 0 True 334 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 378 331 0,00623474026319411 0,00621895778585856 0,00621042191195544 0,00621042191195544 0,00125429196359759 0,00122854132178528 272532 271027 667 665 0 True 378 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 422 331 0,0063609303153413 0,00644600744250188 0,00631723506523232 0,00642404821850919 0,00155712013589353 0,00150928373984593 278048 280922 667 665 0 True 422 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 466 329 0,00642118858172196 0,00648166536735522 0,00650034332799268 0,00654612039368277 0,00170014973132522 0,0014140391849805 280682 282476 667 665 0 True 467 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 510 329 0,00658988427507464 0,00660277381483005 0,00659189745937285 0,00659189745937285 0,00157999798342676 0,00163303689067779 288056 287754 667 665 0 True 511 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 554 329 0,00675741323661813 0,00693643011167195 0,00675974670023652 0,00700389105058366 0,00156498615854769 0,00132867868796239 295379 302295 667 665 0 True 555 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 598 329 0,00697360177773324 0,00712284258368512 0,00697337300679027 0,00708018616006714 0,00187614784353323 0,00195228357739664 304829 310419 667 665 0 True 599 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 643 328 0,00697010158230567 0,00722100513357094 0,00700389105058366 0,0072632944228275 0,00181935145445992 0,00177657342030033 304676 314697 667 665 0 True 644 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 246 376 0,00586312474341909 0,00602095763556293 0,00592050049591821 0,00608834973678187 0,00143587947299621 0,00144917667419815 256288 262398 667 665 0 True 245 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 291 376 0,00587415150287068 0,00594934348918761 0,00587472343022812 0,00592050049591821 0,00132085680612308 0,00131863051660751 256770 259277 667 665 0 True 289 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 334 376 0,0061923718845544 0,00630750600465458 0,00617990386816205 0,00630197604333562 0,0012903915121155 0,00139874823440714 270680 274886 667 665 0 True 334 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 378 375 0,00635477637697517 0,00653866297696633 0,00630197604333562 0,00651560234988937 0,00132689507270727 0,00128455039504513 277779 284960 667 665 0 True 378 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 422 375 0,00665469508322058 0,00672062394484724 0,00663767452506294 0,00668345159075303 0,00149028179898042 0,00152345207131373 290889 292890 667 665 0 True 422 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 466 374 0,00662737983262889 0,00658207661520475 0,00653086137178607 0,00660715648126955 0,00162233327155603 0,00162238807303324 289695 286852 667 665 0 True 467 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 510 374 0,00664126622886771 0,00673856763676185 0,00672922865644312 0,00675974670023652 0,00167363836222374 0,00164650941528829 290302 293672 667 665 0 True 511 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 555 374 0,00684336247989532 0,00688372338490998 0,00677500572213321 0,00698863202868696 0,00171845064317738 0,00153003381498119 299136 299998 667 665 0 True 555 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 598 373 0,00679236943670531 0,00687140143790467 0,0068207827878233 0,00694285496299687 0,00193347278014544 0,0019455213146373 296907 299461 667 665 0 True 599 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 642 374 0,00677011002395346 0,00658205366930717 0,00660715648126955 0,00657663843747616 0,00231325005011023 0,00179159648526648 295934 286851 667 665 0 True 644 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 246 420 0,00602774831398675 0,00596290451466272 0,0059510185397116 0,00602731364919509 0,0015325015107503 0,00156263925148438 263484 259868 667 665 0 True 245 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 290 420 0,00606224697218797 0,00600689180034086 0,00608834973678187 0,00593575951781491 0,00132430769898483 0,00139889881915596 264992 261785 667 665 0 True 289 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 334 420 0,00621570652073826 0,0064196426061721 0,00622568093385214 0,00634775310902571 0,00120381532189363 0,00128247968956298 271700 279773 667 665 0 True 334 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 378 420 0,00636916606928854 0,00664965228360441 0,0063782711528191 0,00666819256885634 0,00123147559165866 0,00134109018870091 278408 289797 667 665 0 True 378 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 423 419 0,00652058955644631 0,00664699055948408 0,00653086137178607 0,00669871061264973 0,00156122740073113 0,00149574446150366 285027 289681 667 665 0 True 422 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 466 417 0,00678543767713305 0,0067188341648353 0,0068055237659266 0,00668345159075303 0,00161556161938793 0,00154132834576495 296604 292812 667 665 0 True 467 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 510 417 0,00664927321187198 0,00671369428377536 0,00668345159075303 0,00669871061264973 0,00167202920877327 0,00165911516073827 290652 292588 667 665 0 True 511 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 554 417 0,00649187880310245 0,00684462357541829 0,00642404821850919 0,00683604180972 0,00167073106219959 0,0014316684109992 283772 298294 667 665 0 True 555 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 599 418 0,0061837700970984 0,00625319306506137 0,00619516289005875 0,00624093995574884 0,00185827660401007 0,00173763273530407 270304 272519 667 665 0 True 599 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 643 417 0,00596449314825307 0,00605081024832624 0,0059662775616083 0,005981536583505 0,00172248898826278 0,00167356591151123 260719 263699 667 665 0 True 644 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 246 464 0,00612081233359059 0,00596194078696398 0,00617990386816205 0,00590524147402152 0,00140607665815286 0,00152798188322338 267552 259826 667 665 0 True 245 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 292 465 0,00607450909473165 0,00617191869580107 0,00607309071488518 0,00610360875867857 0,00146572829536651 0,00144884107522014 265528 268977 667 665 0 True 289 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 335 464 0,00622908962090253 0,00640227256169722 0,00625619897764553 0,0063935301747158 0,00138716003048045 0,00154049787702756 272285 279016 667 665 0 True 334 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 380 464 0,00644985358087722 0,00647296887216898 0,00648508430609598 0,0064087891966125 0,0013691910090447 0,00145401827210228 281935 282097 667 665 0 True 378 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 424 463 0,00642860076027447 0,00668161591894591 0,00634775310902571 0,00665293354695964 0,00173015167232828 0,00170318315647204 281006 291190 667 665 0 True 422 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 468 462 0,00658736779470187 0,00662629335985879 0,00659189745937285 0,00666819256885634 0,00180826730706214 0,0018321481594111 287946 288779 667 665 0 True 467 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 511 462 0,00645616765890344 0,00660607802408287 0,00645456626230259 0,00665293354695964 0,00170574905538011 0,00171607748544977 282211 287898 667 665 0 True 511 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 556 462 0,00598014108075283 0,00597323016857777 0,0059662775616083 0,00613412680247196 0,00181338184515901 0,00176445323904793 261403 260318 667 665 0 True 555 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 600 461 0,00580991262208218 0,0057443907319225 0,00582894636453803 0,00570687418936446 0,0018021325507814 0,00172208783922557 253962 250345 667 665 0 True 599 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 645 462 0,0057531545511291 0,0056973975336602 0,00564583810177768 0,00575265125505455 0,00191548938584685 0,00174583769386083 251481 248297 667 665 0 True 644 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 247 508 0,00607384565899701 0,0061933731100468 0,00608834973678187 0,00613412680247196 0,001376152575312 0,00133130847408425 265499 269912 667 665 0 True 245 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 291 508 0,00620280383955424 0,00613621487915256 0,00616464484626535 0,00619516289005875 0,0014917610614716 0,00140352701456139 271136 267421 667 665 0 True 289 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 336 509 0,00629250492629629 0,00621746630251527 0,00624093995574884 0,00616464484626535 0,00148764180369255 0,00144642210507007 275057 270962 667 665 0 True 334 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 380 508 0,00626441185449848 0,00630227434000428 0,00627145799954223 0,00628671702143893 0,00148371421858833 0,00148333663759156 273829 274658 667 665 0 True 378 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 424 508 0,00648531307703896 0,00641482396767841 0,00650034332799268 0,0063935301747158 0,00181472852483915 0,00173550841819102 283485 279563 667 665 0 True 422 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 469 506 0,00624338780483871 0,00639192396188457 0,00622568093385214 0,00646982528419928 0,00176299481224547 0,0015567383651193 272910 278565 667 665 0 True 467 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 513 506 0,006006495493384 0,00602042987991838 0,00605783169298848 0,00605783169298848 0,00162898183751972 0,00156464850783783 262555 262375 667 665 0 True 511 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 556 506 0,00588655088798013 0,00588718305261896 0,00588998245212482 0,00588998245212482 0,00153967430615116 0,00163527155409824 257312 256568 667 665 0 True 555 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 600 505 0,00571909055771954 0,00570542859781635 0,00581368734264134 0,00570687418936446 0,00170658012471173 0,00169835729678141 249992 248647 667 665 0 True 599 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 645 506 0,00581288664434091 0,00572713541693556 0,00573739223315786 0,00569161516746777 0,00176075606391995 0,00181462419342755 254092 249593 667 665 0 True 644 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 248 554 0,00614391819883146 0,00620753072885923 0,00614938582436866 0,00616464484626535 0,00137766739067678 0,00131564276006295 268562 270529 667 665 0 True 245 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 292 553 0,00621515747047511 0,00640440653017299 0,00622568093385214 0,00636301213092241 0,00139715626502037 0,00134437002932576 271676 279109 667 665 0 True 289 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 336 553 0,00640041618009947 0,00628953936684237 0,0064087891966125 0,00633249408712902 0,00135452763547919 0,00129897189667747 279774 274103 667 665 0 True 334 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 380 552 0,00613966305929205 0,00635553176830839 0,00616464484626535 0,00633249408712902 0,00146820000456995 0,0013102051412251 268376 276979 667 665 0 True 378 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 425 552 0,00604955018485264 0,00597178457702966 0,00593575951781491 0,00593575951781491 0,00173222878536167 0,00163889949361442 264437 260255 667 665 0 True 422 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 468 551 0,00580263770609545 0,00591900901257493 0,00567635614557107 0,00590524147402152 0,00180304767706285 0,00190213037794495 253644 257955 667 665 0 True 467 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 513 550 0,00591798401554544 0,00597176163113208 0,00605783169298848 0,0059510185397116 0,00187160239588774 0,00189071434028751 258686 260254 667 665 0 True 511 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 556 550 0,00595772152834089 0,00605085614012142 0,005981536583505 0,00607309071488518 0,00168169612613366 0,00176985851496245 260423 263701 667 665 0 True 555 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 601 550 0,00594626010409764 0,00604895163062153 0,0059510185397116 0,00604257267109178 0,00154731714080258 0,00149986473580361 259922 263618 667 665 0 True 599 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 645 550 0,00571227318361877 0,00595191342971758 0,00573739223315786 0,00593575951781491 0,00179692426963639 0,0017240383462104 249694 259389 667 665 0 True 644 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 245 591 0,00656675553273947 0,00662932221834054 0,00659189745937285 0,00665293354695964 0,00136785743273226 0,00113775775935052 287045 288911 667 665 0 False 245 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 289 591 0,00633501056750178 0,00646654402084405 0,00636301213092241 0,00645456626230259 0,00134002813112112 0,00141252901919543 276915 281817 667 665 0 False 289 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 336 597 0,00605407984952362 0,00618366699536665 0,00607309071488518 0,00619516289005875 0,00133576678772625 0,001459798189928 264635 269489 667 665 0 True 334 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 381 596 0,00584436552609482 0,00597249589985492 0,00582894636453803 0,0059510185397116 0,00126787647185704 0,00119006963786753 255468 260286 667 665 0 True 378 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 422 591 0,00584656172714741 0,00565609491799997 0,00590524147402152 0,00573739223315786 0,00168727845636243 0,00163575761526168 255564 246497 667 665 0 False 422 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 467 591 0,0058020886558323 0,00589663676242563 0,00579842832074464 0,00581368734264134 0,00180021612217312 0,00170608393603824 253620 256980 667 665 0 False 467 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 511 591 0,00592157571935021 0,00601175633062973 0,00584420538643473 0,00607309071488518 0,00190855551527654 0,0019377952992617 258843 261997 667 665 0 False 511 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 555 591 0,00600253775607047 0,00609420094066707 0,00601205462729839 0,00602731364919509 0,00169450348157202 0,00161222455287486 262382 265590 667 665 0 False 555 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 599 591 0,00611106669141968 0,00606565624406633 0,00610360875867857 0,00605783169298848 0,00152915877663884 0,00155472628023637 267126 264346 667 665 0 False 599 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 644 591 0,00611436099299858 0,00617657671301164 0,00613412680247196 0,00617990386816205 0,0014988777875933 0,00146508471517382 267270 269180 667 665 0 False 644 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 247 641 0,00848120229196457 0,746546613730481 0,00827038986800946 0,756176089112688 0,00213049993101478 0,193228608547249 370729 32535080 667 665 14 True 245 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 289 634 0,00697858898429018 0,00653744684439412 0,00659189745937285 0,00659189745937285 0,00220993688438038 0,00128091144858807 305047 284907 667 665 0 False 289 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 334 634 0,00597272890220031 0,00597513467807766 0,0059510185397116 0,0059510185397116 0,00126764708170524 0,00128617713266685 261079 260401 667 665 0 False 334 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 378 634 0,00570051435714965 0,00575370676634365 0,00570687418936446 0,00581368734264134 0,00118647802185398 0,00118570587640064 249180 250751 667 665 0 False 378 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 422 634 0,00578847678472506 0,00559928087556956 0,00575265125505455 0,0055542839703975 0,00146316927181682 0,00145329875361116 253025 244021 667 665 0 False 422 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 467 634 0,00579522552754293 0,00580356820180458 0,00573739223315786 0,00590524147402152 0,00177930594619733 0,001799686839733 253320 252924 667 665 0 False 467 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 511 634 0,00594923412635637 0,00577451869545688 0,00602731364919509 0,00578316929884794 0,001722873191487 0,00165011557590814 260052 251658 667 665 0 False 511 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 555 634 0,00601452535348256 0,00606001155325944 0,00604257267109178 0,00604257267109178 0,00169756385462367 0,00174977260244186 262906 264100 667 665 0 False 555 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 599 634 0,00630236495393869 0,00625870008048274 0,00633249408712902 0,00621042191195544 0,00133843873006591 0,00133692797223359 275488 272759 667 665 0 False 599 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 645 638 0,00780539004931043 0,75746993944004 0,00778210116731518 0,789852750438697 0,00161555384488935 0,209734623549119 341188 33011127 667 665 16 True 644 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A4_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A4_3.csv new file mode 100755 index 0000000..8b40058 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A4_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 244 244 0,00108753130873336 0,0759578506807187 0,000823987182421607 0,0754253452353704 0,000928010941712447 0,025656712231019 47538 3310302 667 665 0 True 245 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 289 243 0,000956628575160806 0,000895073573152382 0,000839246204318303 0,000732433051041428 0,00070606141663436 0,000682413828194709 41816 39008 667 665 0 False 289 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 333 243 0,000942170251564536 0,000884449622568667 0,00080872816052491 0,00080872816052491 0,000681324669102987 0,000580984793730096 41184 38545 667 665 0 True 334 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 378 242 0,000923090754920091 0,00081177996490425 0,000793469138628214 0,000732433051041428 0,000669311579500217 0,00055838521237146 40350 35378 667 665 0 True 378 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 422 242 0,000899595979076152 0,000838420152005099 0,000732433051041428 0,000656137941557946 0,000803249672985615 0,000717148898339763 39323 36539 667 665 0 True 422 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 466 241 0,000923708436466134 0,000953608557901965 0,000762951094834821 0,000793469138628214 0,000786300404304625 0,000740890039781342 40377 41559 667 665 0 True 467 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 510 240 0,000895546733385424 0,000902485098073635 0,000717174029144732 0,000717174029144732 0,000795058551554083 0,000799601591557492 39146 39331 667 665 0 True 511 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 554 240 0,000971796088680311 0,000935779595475298 0,000778210116731518 0,000793469138628214 0,000805762190773477 0,000675427564353017 42479 40782 667 665 0 True 555 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 599 243 0,000937549078516361 0,000951543427118953 0,000564583810177768 0,000518806744487678 0,000956078959976899 0,0010529470165183 40982 41469 667 665 0 False 599 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 640 240 0,0010686348288433 0,0761153513217698 0,000778210116731518 0,0758220798046845 0,000943328110170662 0,026597334543364 46712 3317166 667 665 0 True 644 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 245 287 0,000922473073374048 0,000952759559691171 0,000732433051041428 0,000778210116731518 0,000750494251209973 0,000777230651630819 40323 41522 667 665 0 False 245 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 289 287 0,00088678480626933 0,00085987456625083 0,000747692072938125 0,000717174029144732 0,000666789647128701 0,000688076310544601 38763 37474 667 665 0 False 289 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 333 287 0,000848099639811589 0,000840209932017042 0,000701915007248035 0,000686655985351339 0,000654089494156315 0,00064898420727933 37072 36617 667 665 0 True 334 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 378 287 0,000761029418913798 0,000816942791861779 0,000610360875867857 0,000686655985351339 0,00058893367056709 0,000589472390114974 33266 35603 667 665 0 True 378 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 422 286 0,000905315252650626 0,000938854345752227 0,000717174029144732 0,000701915007248035 0,000788549264822969 0,000804878968685311 39573 40916 667 665 0 True 422 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 466 285 0,00100871971887711 0,000831261031957325 0,000732433051041428 0,000457770656900893 0,000909805491717528 0,000881358161969046 44093 36227 667 665 0 True 467 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 510 285 0,000988244719480498 0,000920864762042437 0,000732433051041428 0,000701915007248035 0,000877303697259598 0,000830944635749733 43198 40132 667 665 0 True 511 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 555 285 0,000971452932265842 0,000917399931506496 0,000717174029144732 0,000717174029144732 0,000876702404196958 0,000758616955136473 42464 39981 667 665 0 True 555 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 599 287 0,000968524664195712 0,000951084509167173 0,000549324788281071 0,000625619897764553 0,0010357035522036 0,000950593054938811 42336 41449 667 665 0 False 599 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 644 287 0,00101135058472137 0,00100815095647106 0,000656137941557946 0,000656137941557946 0,00097996522262136 0,0010401941932481 44208 43936 667 665 0 False 644 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 246 333 0,000876490113835277 0,000893283793140439 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000699008175361931 0,000753059035459468 38313 38930 667 665 0 True 245 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 290 333 0,000894860420556488 0,00087410102275602 0,000747692072938125 0,000762951094834821 0,000691059126891597 0,000658842726490382 39116 38094 667 665 0 True 289 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 334 333 0,000843684360612095 0,000849961938492374 0,000762951094834821 0,000732433051041428 0,000612334715393611 0,000627871273708311 36879 37042 667 665 0 True 334 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 378 331 0,000807149641018356 0,000780619435978364 0,000656137941557946 0,000671396963454643 0,000659169034975539 0,000603692633034019 35282 34020 667 665 0 True 378 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 422 331 0,000900350923187983 0,000910745621205681 0,000671396963454643 0,00064087891966125 0,000808308491447876 0,000809344502342332 39356 39691 667 665 0 True 422 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 466 329 0,00103514276279118 0,000921989111024299 0,000839246204318303 0,000717174029144732 0,000868933756799834 0,000806191314297449 45248 40181 667 665 0 True 467 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 510 329 0,00100322921624562 0,000989105861472175 0,000854505226215 0,000717174029144732 0,000822883296774897 0,000900629273041099 43853 43106 667 665 0 True 511 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 554 329 0,000947500614535946 0,000929102339276894 0,000747692072938125 0,000793469138628214 0,000859735640878648 0,000689042485927331 41417 40491 667 665 0 True 555 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 598 329 0,000900305168999387 0,000930043121078044 0,000473029678797589 0,000488288700694286 0,0010011536157582 0,00113530190995631 39354 40532 667 665 0 True 599 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 643 328 0,000920825922584599 0,00094764262452882 0,000473029678797589 0,00064087891966125 0,00101223780797828 0,000928890639805898 40251 41299 667 665 0 True 644 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 246 376 0,000938326899722489 0,000928872880301004 0,00080872816052491 0,000747692072938125 0,000772876214248928 0,000779558794365739 41016 40481 667 665 0 True 245 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 291 376 0,000920414134887237 0,000937064565740283 0,000778210116731518 0,000793469138628214 0,000719583752855387 0,000741797951956583 40233 40838 667 665 0 True 289 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 334 376 0,000880470728243111 0,000860608834973678 0,000747692072938125 0,000732433051041428 0,000705946614322285 0,000698926075807938 38487 37506 667 665 0 True 334 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 378 375 0,000846429611927842 0,000901498424477307 0,000747692072938125 0,000778210116731518 0,00065199666894235 0,000675386762662477 36999 39288 667 665 0 True 378 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 422 375 0,000899138437190194 0,000901452532682129 0,000686655985351339 0,000656137941557946 0,000799178485679846 0,000793919784739775 39303 39286 667 665 0 True 422 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 466 374 0,00092679684419635 0,00102648472864468 0,000656137941557946 0,000762951094834821 0,000855247405626826 0,000908568902980426 40512 44735 667 665 0 True 467 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 510 374 0,000877885616587449 0,000948766973510682 0,000579842832074464 0,000610360875867857 0,000850678235915416 0,000910149800444522 38374 41348 667 665 0 True 511 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 555 374 0,000818862713298878 0,00094158490756532 0,000549324788281071 0,000717174029144732 0,000822657707692652 0,000836574976467906 35794 41035 667 665 0 True 555 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 598 373 0,000968135753592648 0,000912214158651378 0,000610360875867857 0,000488288700694286 0,00104917349431092 0,00102466603039224 42319 39755 667 665 0 True 599 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 642 374 0,000943085335336452 0,000914600532000636 0,000610360875867857 0,000595101853971161 0,000999418068036083 0,000909157396990255 41224 39859 667 665 0 True 644 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 246 420 0,000932744888713803 0,000888281587466033 0,000778210116731518 0,000717174029144732 0,000785680008846783 0,000799289656603133 40772 38712 667 665 0 True 245 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 290 420 0,000869215197848546 0,00092664712823487 0,000747692072938125 0,000778210116731518 0,000708164742278802 0,000761043221308231 37995 40384 667 665 0 True 289 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 334 420 0,000881202795260644 0,00086944300554545 0,000747692072938125 0,000778210116731518 0,000688859374823396 0,000650561525964776 38519 37891 667 665 0 True 334 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 378 420 0,000858577349000025 0,000926715965927637 0,000732433051041428 0,000793469138628214 0,000700176806280906 0,000742440408984853 37530 40387 667 665 0 True 378 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 423 419 0,000916845308176765 0,000975384214713942 0,000671396963454643 0,000747692072938125 0,000856314712327377 0,000820683133557813 40077 42508 667 665 0 True 422 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 466 417 0,000896416062968745 0,000904550228856646 0,000595101853971161 0,000671396963454643 0,000891022409702296 0,000797702390655449 39184 39421 667 665 0 True 467 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 510 417 0,000933293938976952 0,000972102951358713 0,000686655985351339 0,000701915007248035 0,000887151276624951 0,000962586636699712 40796 42365 667 665 0 True 511 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 554 417 0,00094962818430565 0,0010070266074892 0,000701915007248035 0,000854505226215 0,000868663949402991 0,000819258441278998 41510 43887 667 665 0 True 555 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 599 418 0,000973511870752653 0,000868846412208135 0,000534065766384375 0,000442511635004196 0,00103690188162309 0,000969975997662512 42554 37865 667 665 0 True 599 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 643 417 0,000879875923791366 0,000928436908246813 0,000534065766384375 0,000534065766384375 0,000922424531388207 0,00096288762638221 38461 40462 667 665 0 True 644 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 246 464 0,000878663437793577 0,000883577678460284 0,000717174029144732 0,000747692072938125 0,000762367078047112 0,000737853331437869 38408 38507 667 665 0 True 245 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 292 465 0,000939882542134746 0,000862995208322936 0,000793469138628214 0,000686655985351339 0,000793081608225371 0,000782159194425029 41084 37610 667 665 0 True 289 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 335 464 0,000970949636191289 0,000807397298464747 0,000823987182421607 0,000610360875867857 0,000778149618228616 0,000744883168950843 42442 35187 667 665 0 True 334 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 380 464 0,000926590950347669 0,00089137928364055 0,000747692072938125 0,000732433051041428 0,000824613361991668 0,000764011288875486 40503 38847 667 665 0 True 378 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 424 463 0,000896804973571809 0,000986421191454259 0,000625619897764553 0,000671396963454643 0,000927670354834264 0,000974581982146953 39201 42989 667 665 0 True 422 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 468 462 0,000920116732661364 0,000868915249900902 0,0004272526131075 0,000411993591210803 0,00102958724330394 0,00102298749933057 40220 37868 667 665 0 True 467 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 511 462 0,000969988798230777 0,000912673076603158 0,00064087891966125 0,000610360875867857 0,000960941495572817 0,000902702457018799 42400 39775 667 665 0 True 511 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 556 462 0,000878183018813322 0,000991193938152775 0,000518806744487678 0,00064087891966125 0,000978548376922592 0,000997027290844337 38387 43197 667 665 0 True 555 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 600 461 0,000850158578298399 0,000835253618137814 0,000473029678797589 0,000457770656900893 0,000915527182713944 0,000899162588773305 37162 36401 667 665 0 True 599 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 645 462 0,000922129916959579 0,000832201813758475 0,000534065766384375 0,000381475547417411 0,000987619948929629 0,000989551251542076 40308 36268 667 665 0 True 644 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 247 508 0,000937205922101892 0,00090982778530212 0,000793469138628214 0,000793469138628214 0,000752717357306204 0,000696760632022272 40967 39651 667 665 0 True 245 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 291 508 0,000895638241762616 0,000875133588147526 0,000778210116731518 0,000732433051041428 0,000771044456093623 0,000741671145100577 39150 38139 667 665 0 True 289 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 336 509 0,000879555644471195 0,000831719949909106 0,000778210116731518 0,000610360875867857 0,000767732378570927 0,000795917091848483 38447 36247 667 665 0 True 334 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 380 508 0,000868780533056886 0,000987499648640943 0,000656137941557946 0,00080872816052491 0,000794107291057509 0,000834480428053007 37976 43036 667 665 0 True 378 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 424 508 0,000874522683725658 0,000847896807709363 0,000610360875867857 0,000473029678797589 0,000892493289199773 0,000900954913953483 38227 36952 667 665 0 True 422 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 469 506 0,000835723131796427 0,0009997068661583 0,000473029678797589 0,00064087891966125 0,000893631011861074 0,000900443887344593 36531 43568 667 665 0 True 467 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 513 506 0,000962164831980897 0,000964347237973625 0,000625619897764553 0,000686655985351339 0,000949716488760054 0,000887124242200393 42058 42027 667 665 0 True 511 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 556 506 0,000875895309383532 0,000902576881663991 0,000564583810177768 0,000701915007248035 0,000870887173420107 0,000839247865267141 38287 39335 667 665 0 True 555 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 600 505 0,000850501734712868 0,000844569652558955 0,000549324788281071 0,000503547722590982 0,000878800733114094 0,000906825332014444 37177 36807 667 665 0 True 599 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 645 506 0,00086145986288156 0,00091962568357263 0,000473029678797589 0,000442511635004196 0,000950884349782518 0,00101120382954789 37656 40078 667 665 0 True 644 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 248 554 0,000850707628561549 0,000871347515045338 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000625686764121047 0,000655754910913949 37186 37974 667 665 0 True 245 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 292 553 0,000950085726191608 0,000877772366370263 0,000823987182421607 0,000747692072938125 0,000725908698900991 0,000712446443717661 41530 38254 667 665 0 True 289 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 336 553 0,00092462352023805 0,000852348311841632 0,000793469138628214 0,000717174029144732 0,000780572226312665 0,000701019724057528 40417 37146 667 665 0 True 334 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 380 552 0,000874385421159871 0,000841563739974794 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000729400520739312 0,000653827721103521 38221 36676 667 665 0 True 378 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 425 552 0,000895409470819637 0,000868846412208135 0,000610360875867857 0,000534065766384375 0,000911878030973374 0,000891427245342412 39140 37865 667 665 0 True 422 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 468 551 0,000883970923670689 0,00091776706586792 0,000442511635004196 0,000473029678797589 0,00103418480989311 0,00101981250624048 38640 39997 667 665 0 True 467 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 513 550 0,000968501787101414 0,000878047717141331 0,000610360875867857 0,000488288700694286 0,00101418839455558 0,000986877957475541 42335 38266 667 665 0 True 511 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 556 550 0,000838834416620941 0,000962993430015873 0,000549324788281071 0,000625619897764553 0,000863575147996351 0,000962162997768911 36667 41968 667 665 0 True 555 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 601 550 0,00084439355053533 0,000840370553300165 0,000579842832074464 0,000595101853971161 0,000812753167518716 0,000774049926293838 36910 36624 667 665 0 True 599 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 645 550 0,000879189610962429 0,00087387156378013 0,000549324788281071 0,000534065766384375 0,000923670726197167 0,000910699704261304 38431 38084 667 665 0 True 644 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 245 591 0,00101377555671695 0,000907785600416698 0,000915541313801785 0,000839246204318303 0,000682496319883133 0,000600785069355165 44314 39562 667 665 0 False 245 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 289 591 0,000941323799075514 0,000839888689450796 0,00080872816052491 0,000686655985351339 0,000733373448620644 0,000697317962354673 41147 36603 667 665 0 False 289 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 336 597 0,000846223718079161 0,000871645811713995 0,000717174029144732 0,000747692072938125 0,000688678020473944 0,000754803069377135 36990 37987 667 665 0 True 334 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 381 596 0,000864639778988967 0,000857212842130504 0,000762951094834821 0,000732433051041428 0,000653527893489868 0,000638988301395954 37795 37358 667 665 0 True 378 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 422 591 0,000847802237585716 0,000866092904497453 0,000579842832074464 0,000534065766384375 0,000832519018120575 0,000889112337552663 37059 37745 667 665 0 False 422 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 467 591 0,000814561819570874 0,000887616156435951 0,0004272526131075 0,000534065766384375 0,000926246501134636 0,000899665029817057 35606 38683 667 665 0 False 467 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 511 591 0,000897697180249427 0,000832247705553653 0,000366216525520714 0,000259403372243839 0,00108492140969804 0,00102747265156131 39240 36270 667 665 0 False 511 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 555 591 0,000930251285435332 0,000954273988932046 0,000564583810177768 0,000625619897764553 0,000988660244496919 0,000919144620827283 40663 41588 667 665 0 False 555 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 599 591 0,000893945336784572 0,00086430312448551 0,000686655985351339 0,000625619897764553 0,000789413921878599 0,000759730223288689 39076 37667 667 665 0 False 599 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 644 591 0,00094875885472233 0,000884564352056612 0,000717174029144732 0,000701915007248035 0,000825841767344116 0,000733130035323347 41472 38550 667 665 0 False 644 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 247 641 0,00110116605693491 0,0755052199048778 0,000961318379491875 0,0744945448996719 0,00074425467540336 0,0223271793451684 48134 3290576 667 665 0 True 245 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 289 634 0,00105801985708908 0,000873596213009062 0,000915541313801785 0,000732433051041428 0,000763621808177185 0,000650468237550102 46248 38072 667 665 0 False 289 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 334 634 0,000842471874614306 0,000853495606721083 0,000732433051041428 0,000717174029144732 0,000660759383510734 0,000653171237518412 36826 37196 667 665 0 False 334 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 378 634 0,000827418746566291 0,000824950910120345 0,000717174029144732 0,000671396963454643 0,000635773404739464 0,000641846655414671 36168 35952 667 665 0 False 378 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 422 634 0,00081765022730109 0,000847529673347938 0,000595101853971161 0,000595101853971161 0,000761843030596269 0,000736223425458807 35741 36936 667 665 0 False 422 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 467 634 0,000900167906433599 0,000849961938492374 0,000625619897764553 0,000488288700694286 0,000898764913726697 0,000880906189533634 39348 37042 667 665 0 False 467 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 511 634 0,000979231144327127 0,000877657636882318 0,000717174029144732 0,000595101853971161 0,000956262468861282 0,000869390804196007 42804 38249 667 665 0 False 511 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 555 634 0,000886807683363628 0,000879562146382206 0,000656137941557946 0,000595101853971161 0,000849564786608411 0,00083202174161158 38764 38332 667 665 0 False 555 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 599 634 0,000882666929295709 0,000864349016280688 0,000701915007248035 0,000701915007248035 0,000698987870527695 0,000697307775817747 38583 37669 667 665 0 False 599 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 645 638 0,000967083407254944 0,0772732701518043 0,000823987182421607 0,0771343556878004 0,000726868217091566 0,024536450343385 42273 3367629 667 665 0 True 644 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A5_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A5_1.csv new file mode 100755 index 0000000..24dcd7a --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A5_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 258 269 0,010296453970314 0,0477269392295112 0,0102693217364767 0,0476081483176928 0,00152562571328753 0,00784928640403433 450077 2079977 667 665 0 True 257 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 302 269 0,0104588355856405 0,0103078020067335 0,0103913939116503 0,0103608758678569 0,00162564807184208 0,00129260630536021 457175 449222 667 665 0 False 302 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 347 269 0,0106403882059886 0,0686822113649883 0,0106202792401007 0,0663157091630426 0,0013169197788633 0,0120422266174526 465111 2993224 667 665 0 True 346 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 391 269 0,0106926623664593 0,0921533864416133 0,0107118333714809 0,0905317769130999 0,00136646087840062 0,0166993279008503 467396 4016116 667 665 0 True 390 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 435 269 0,0105721458336979 0,0777359053389941 0,0105897611963073 0,0731517509727627 0,00156440015372528 0,0142674600271665 462128 3387791 667 665 0 True 435 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 478 269 0,0102688184404021 0,0744920896886299 0,0102388036926833 0,0760357061112383 0,00179870042239743 0,022354678029431 448869 3246423 667 665 0 True 479 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 523 269 0,0105290911422293 0,0876071386981989 0,0105134660868238 0,0843366140230411 0,00165111777402958 0,0224323723695526 460246 3817987 667 665 0 True 523 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 567 269 0,0102509514297555 0,0767870924736882 0,0102998397802701 0,072831311512932 0,001677026206468 0,0199761981359401 448088 3346441 667 665 0 True 568 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 612 269 0,010206066570743 0,0102050502773299 0,0102693217364767 0,0102388036926833 0,00194490689688287 0,00190755267811105 446126 444744 667 665 0 False 612 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 656 269 0,0101229769642531 0,0472156357935351 0,0101319905394064 0,0469825284199283 0,00167758261688076 0,00892576036552037 442494 2057694 667 665 0 True 657 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 257 313 0,0101629432479915 0,0100036770800886 0,0101930266269932 0,00999465934233616 0,00140211498250137 0,00143924484241811 444241 435968 667 665 0 False 257 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 302 313 0,0102619324350185 0,0100216207720033 0,0103303578240635 0,010101472495613 0,00132410912129492 0,00130338744692164 448568 436750 667 665 0 False 302 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 346 314 0,010398051146091 0,114757849074506 0,0104371709773404 0,109117265583276 0,00143669591145524 0,0298626592647303 454518 5001236 667 665 0 True 346 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 391 314 0,0105551252755403 0,0563440645559883 0,0105287251087205 0,0544747081712062 0,001407619938096 0,00829149995491581 461384 2455518 667 665 0 True 390 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 434 313 0,0105861923695968 0,0837237290984385 0,0105592431525139 0,0794079499504082 0,00169548533928455 0,0156295233150023 462742 3648745 667 665 0 True 435 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 480 315 0,0102541084687686 0,0466063304289563 0,0103608758678569 0,0471198596169986 0,00167325891274941 0,00919399789599354 448226 2031140 667 665 0 True 479 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 523 314 0,0102839630768273 0,0537124683991967 0,0102998397802701 0,0537422751201648 0,00159820614767699 0,0138030674422796 449531 2340831 667 665 0 True 523 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 567 314 0,0104618324849935 0,0589573269406063 0,0104829480430304 0,0583810177767605 0,0017599803696289 0,0132340104021762 457306 2569406 667 665 0 True 568 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 612 313 0,0100816151777625 0,010252892473803 0,0101777676050965 0,0103303578240635 0,00203414575926836 0,00207976724674058 440686 446829 667 665 0 False 612 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 657 313 0,0101461514607768 0,0100613401207298 0,0101472495613031 0,0100251773861295 0,00195799807565211 0,00184327706133355 443507 438481 667 665 0 False 657 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 258 358 0,0101818626049758 0,0563516137562951 0,0101472495613031 0,0539864194705119 0,00151738011915641 0,011600629148539 445068 2455847 667 665 0 True 257 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 302 358 0,0103422310360041 0,0660478846463836 0,0103761348897536 0,0699931334401465 0,00139428681829603 0,0154138544762353 452078 2878418 667 665 0 True 301 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 347 358 0,0102607657032093 0,0453249167780977 0,0102388036926833 0,0448157473105974 0,00136404193324206 0,00962322311462322 448517 1975295 667 665 0 True 346 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 390 358 0,0104482892451691 0,0395762581092236 0,010452429999237 0,0392462043183032 0,00133769329088037 0,00689677652271729 456714 1724764 667 665 0 True 390 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 435 358 0,0106928453832136 0,0762245279024983 0,0106965743495842 0,0718852521553368 0,00156820232966381 0,0112648847865276 467404 3321924 667 665 0 True 435 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 480 359 0,0106126154135109 0,0368585230528828 0,0106202792401007 0,0370794232089723 0,0016599898354402 0,00571561025447773 463897 1606323 667 665 0 True 479 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 523 358 0,0105971047435769 0,0311955902574013 0,0105745021744106 0,0313878080415045 0,00171433380285261 0,00307762982247748 463219 1359528 667 665 0 True 523 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 568 358 0,0105378073151568 0,0560851659934914 0,0106355382619974 0,0552071412222477 0,00185063544281728 0,00970168230565268 460627 2444235 667 665 0 True 568 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 612 358 0,0105017758916376 0,0536714870261027 0,0105592431525139 0,0548561837186236 0,00208728547519751 0,0120805503839139 459052 2339045 667 665 0 True 612 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 655 357 0,0103097913162897 0,0707507151949455 0,0103913939116503 0,0680247196154726 0,00201933576495962 0,019575933344543 450660 3083371 667 665 0 True 657 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 260 403 0,0102778548926498 0,0486758897702026 0,0102235446707866 0,0502784771496147 0,00151930210486228 0,0117272410163495 449264 2121333 667 665 0 True 257 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 301 403 0,0104457956418907 0,0358789856307053 0,0103913939116503 0,0347905699244678 0,00138725014399622 0,00568724010484782 456605 1563634 667 665 0 True 301 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 347 403 0,0104999686011881 0,0953630127045698 0,0105592431525139 0,0896314946211948 0,00137532394946068 0,0206716289584367 458973 4155994 667 665 0 True 346 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 392 402 0,0106407771165916 0,0713348259639715 0,0106355382619974 0,0700389105058366 0,00134948885371317 0,0177208780358685 465128 3108827 667 665 0 True 390 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 435 402 0,0107692777552629 0,0478189981706383 0,0108186465247578 0,0478980697337301 0,00162016176162354 0,00806981717662141 470745 2083989 667 665 0 True 435 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 479 402 0,0108709435623228 0,0594817324841057 0,0108644235904479 0,057801174944686 0,00164896998274257 0,0115115179190407 475189 2592260 667 665 0 True 479 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 523 402 0,0107084704386191 0,0443588944896001 0,0107270923933776 0,0448920424200809 0,00167008592505986 0,00510543899483335 468087 1933195 667 665 0 True 523 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 568 402 0,0106169391843332 0,0563179291786344 0,0105439841306172 0,0550545510032807 0,00178501449481307 0,00837906162478991 464086 2454379 667 665 0 True 568 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 611 402 0,0105236463937864 0,0442976289430374 0,0105287251087205 0,0447089341573205 0,00193594800732425 0,00707379939065707 460008 1930525 667 665 0 True 612 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 656 401 0,0104710290769012 0,0932712417344574 0,0104982070649271 0,0867627985046159 0,0018910393133996 0,0193544244579549 457708 4064833 667 665 0 True 657 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 259 447 0,0102067300064777 0,0450174417504049 0,0100404364080262 0,0445716029602502 0,00233977099517327 0,0064125531684498 446155 1961895 667 665 0 True 257 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 303 447 0,010430079078108 0,0615983768072046 0,0104371709773404 0,0608529793240253 0,00149018409600013 0,00913022579082667 455918 2684505 667 665 0 True 301 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 347 447 0,0104084144698079 0,0380582493083246 0,0104219119554437 0,0379949645227741 0,00142254359131452 0,00436064366609199 454971 1658608 667 665 0 True 346 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 391 446 0,0106207367819867 0,0595537137648424 0,0106813153276875 0,0567177843900206 0,00146990201200946 0,0138021988494847 464252 2595397 667 665 0 True 390 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 434 446 0,0108847155730901 0,100222104815713 0,0108796826123445 0,099824521248188 0,001740838964087 0,0150283403671882 475791 4367757 667 665 0 True 435 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 479 446 0,0108888105729694 0,0683131954399618 0,0107881284809644 0,0671854734111543 0,00183918286875722 0,0139975233659691 475970 2977142 667 665 0 True 479 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 523 446 0,0107818144029382 0,0582682616360081 0,0107728694590677 0,0556496528572518 0,0017580722595428 0,00964419186143487 471293 2539376 667 665 0 True 523 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 568 446 0,0107088593492222 0,0343165535720739 0,0107728694590677 0,0339665827420462 0,0019042255662217 0,00462694290075529 468104 1495542 667 665 0 True 568 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 612 446 0,0104073621234702 0,0444875291914841 0,010406652933547 0,043427176317998 0,00185954749748767 0,00689511818611573 454925 1938801 667 665 0 True 612 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 656 446 0,0103995610343146 0,0717178388865274 0,010452429999237 0,0724193179217212 0,00196150922979533 0,0124366534149025 454584 3125519 667 665 0 True 657 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 258 492 0,0101025248419507 0,0570788380885838 0,0100099183642329 0,056748302433814 0,00182090634061872 0,0136913489903226 441600 2487540 667 665 0 True 257 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 303 491 0,010409878603843 0,0628314205059456 0,0104219119554437 0,0595407034409094 0,00148564380410798 0,0108508862267256 455035 2738242 667 665 0 True 301 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 346 491 0,0106067131231821 0,0746701957457159 0,010605020218204 0,072480354009308 0,00154393079148883 0,0154037242073677 463639 3254185 667 665 0 True 346 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 390 490 0,0108768687297459 0,0957866628117559 0,0108796826123445 0,0892042420080873 0,0016518754096539 0,0256470306590231 475448 4174457 667 665 0 True 390 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 434 490 0,0109604158781218 0,10307483058757 0,0110322728313115 0,099320973525597 0,00191221245539406 0,0315167878134026 479100 4492081 667 665 0 True 435 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 480 491 0,0108100218602075 0,048641470923819 0,010757610437171 0,0496528572518502 0,00184377809970776 0,00595683302593747 472526 2119833 667 665 0 True 479 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 524 490 0,0107466751860966 0,0453397857197354 0,0107881284809644 0,0465552758068208 0,00172139006752542 0,00642451853301851 469757 1975943 667 665 0 True 523 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 567 490 0,0106472284571836 0,106840481840903 0,0107728694590677 0,104051270313573 0,00181251557461431 0,0170196900489021 465410 4656191 667 665 0 True 568 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 612 489 0,0105801756937965 0,0676828027954987 0,010605020218204 0,0682688639658198 0,0018234086101231 0,0172195629670658 462479 2949669 667 665 0 True 612 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 655 490 0,0103614020410257 0,0781319515313805 0,0102845807583734 0,0733196002136263 0,0018167479901794 0,0120275266049996 452916 3405051 667 665 0 True 656 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 259 535 0,00983893496145038 0,058002226899361 0,00985732814526589 0,0602883955138476 0,00143205350742339 0,0126740806423142 430078 2527782 667 665 0 True 257 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 302 535 0,0102968428809171 0,10607209256834 0,0102845807583734 0,0980392156862745 0,00143599320345938 0,0261955647947542 450094 4622704 667 665 0 True 301 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 347 535 0,0106748182329069 0,0611602019468447 0,0107118333714809 0,0625619897764553 0,00153628907862635 0,0126199117309853 466616 2665409 667 665 0 True 346 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 391 535 0,0107775592633987 0,061904979890789 0,010757610437171 0,0603494316014343 0,00158904113607444 0,00815430441211681 471107 2697867 667 665 0 True 390 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 435 534 0,0108067961899115 0,0595727129680461 0,0108186465247578 0,059662775616083 0,00176823731075664 0,00778776500280181 472385 2596225 667 665 0 True 435 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 478 535 0,0108005507431681 0,0636498777270482 0,0107728694590677 0,0635233081559472 0,00183235157567835 0,0124162183527512 472112 2773911 667 665 0 True 479 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 523 535 0,0107616139286731 0,0762747335264231 0,0108186465247578 0,0736095216296635 0,00191563880101762 0,0169588742811221 470410 3324112 667 665 0 True 523 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 567 535 0,0105586025938736 0,061897384798687 0,0105439841306172 0,0616617074845502 0,00172422147473992 0,014060722954237 461536 2697536 667 665 0 True 568 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 611 534 0,0104538712561778 0,045519865124014 0,0104371709773404 0,0450141145952544 0,00166418472302936 0,00541056407211921 456958 1983791 667 665 0 True 612 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 655 534 0,0104799053894888 0,0721683586397901 0,0104676890211337 0,0700389105058366 0,00179790193918851 0,01767194005316 458096 3145153 667 665 0 True 656 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 258 580 0,00992982565709592 0,0487695549241609 0,00997940032043946 0,0491645685511559 0,00131436039064412 0,00949042599482689 434051 2125415 667 665 0 True 257 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 302 579 0,0100377369108991 0,0569164499713463 0,0100862134737163 0,0572976272220951 0,00140048387265639 0,013489825557751 438768 2480463 667 665 0 True 301 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 347 579 0,010444903435213 0,0573136893504074 0,0105134660868238 0,0549782558937972 0,00137723724562849 0,01395273648282 456566 2497775 667 665 0 True 346 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 391 579 0,0106365906083351 0,0531011208497325 0,0106660563057908 0,0514381628137636 0,00141756182382841 0,00619972009419599 464945 2314188 667 665 0 True 390 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 435 579 0,0107806705482233 0,0921824588938586 0,0108339055466545 0,0860456244754711 0,00184197695442648 0,019624741803971 471243 4017383 667 665 0 True 435 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 479 579 0,0106920675620075 0,0651844534660065 0,0107270923933776 0,0631570916304265 0,00199924791547728 0,0117995801639633 467370 2840789 667 665 0 True 479 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 523 579 0,0105294114215495 0,0580350395329133 0,0104371709773404 0,0572213321126116 0,00201456318505817 0,00767550910323273 460260 2529212 667 665 0 True 523 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 568 579 0,0103426199466071 0,0394612991623026 0,0103456168459602 0,0403753719386587 0,0017204035955344 0,00721197296474834 452095 1719754 667 665 0 True 568 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 612 579 0,0104778693280963 0,0520292032438615 0,010452429999237 0,051621271076524 0,00148796548355517 0,00640000412656858 458007 2267473 667 665 0 True 612 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 655 579 0,0104019173750273 0,0559135765713207 0,0104676890211337 0,0549782558937972 0,00161625015765859 0,00793880872364274 454687 2436757 667 665 0 True 656 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 257 617 0,0107100260810314 0,00974317230476053 0,0100556954299229 0,00968947890440223 0,00371007213360162 0,00129321157546707 468155 424615 667 665 0 False 257 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 301 617 0,0104004532409922 0,0100460810988331 0,00994888227664607 0,00996414129854276 0,00321058987579278 0,00139873964075448 454623 437816 667 665 0 False 301 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 347 623 0,0103159452546558 0,0788398783637969 0,0102998397802701 0,0760204470893416 0,00136474228343538 0,011118309958819 450929 3435903 667 665 0 True 346 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 391 623 0,0104680321775482 0,0820683891004692 0,010452429999237 0,0779736018921187 0,00128781286622782 0,02173060586814 457577 3576604 667 665 0 True 390 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 435 617 0,0110891224106418 0,0103657862899409 0,0106660563057908 0,0103150988021668 0,00335971184428419 0,00182366709464511 484726 451749 667 665 0 False 435 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 479 617 0,010713457645176 0,0102639523964409 0,0105897611963073 0,0103456168459602 0,00236808579261185 0,0019081027502495 468305 447311 667 665 0 False 479 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 523 617 0,0103880081016942 0,0101368780155929 0,0103150988021668 0,0100709544518196 0,00221489972087848 0,00199089795223697 454079 441773 667 665 0 False 523 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 568 617 0,0102818355070576 0,0102612677264229 0,0103456168459602 0,0102388036926833 0,00174179229808726 0,00173108178563204 449438 447194 667 665 0 False 568 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 612 617 0,0105610275658692 0,0101168691928953 0,0104676890211337 0,0100251773861295 0,00176794068128413 0,00140247504706066 461642 440901 667 665 0 False 612 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 656 617 0,0102674000605557 0,0100388531410926 0,0103150988021668 0,0101319905394064 0,00160940680030492 0,0015646866813297 448807 437501 667 665 0 False 656 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 257 661 0,012121885955626 0,0348519731464161 0,00991836423285267 0,0406042572671092 0,00711477170422049 0,0177447789052582 529870 1518876 667 665 0 False 257 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 301 661 0,0099137659368988 0,00981120689111196 0,00991836423285267 0,0098268101014725 0,00125310545852838 0,00122377957319757 433349 427580 667 665 0 False 301 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 346 661 0,0111133034993147 0,00966951597349978 0,0100556954299229 0,00968947890440223 0,00605771119112195 0,00133855735050469 485783 421405 667 665 0 False 346 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 390 661 0,0109785345368058 0,0097827080863064 0,0103761348897536 0,00976577401388571 0,00385283116629951 0,00131916279073628 479892 426338 667 665 0 False 390 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 435 661 0,0100787555409752 0,00997077266294599 0,0101319905394064 0,0100251773861295 0,00161915725219098 0,00152660915014351 440561 434534 667 665 0 False 435 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 479 661 0,0100542084187936 0,0100534237860616 0,0100556954299229 0,0100556954299229 0,00167507407078709 0,00148095487782998 439488 438136 667 665 0 False 479 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 523 661 0,00983552627439999 0,00984902173033866 0,00985732814526589 0,00993362325474937 0,00180571071865464 0,00174726929537433 429929 429228 667 665 0 False 523 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 568 661 0,00995954300258889 0,0100248331976657 0,00996414129854276 0,0100099183642329 0,00147215676531857 0,00148780010378305 435350 436890 667 665 0 False 568 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 612 661 0,00995778146632795 0,0100645066545971 0,00996414129854276 0,0100404364080262 0,00133379833131532 0,00146896556163043 435273 438619 667 665 0 False 612 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 657 666 0,0100953414343412 0,0455763349779805 0,0100404364080262 0,0453650720988785 0,00146342131088085 0,00845574253486053 441286 1986252 667 665 0 True 656 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A5_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A5_2.csv new file mode 100755 index 0000000..421e50b --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A5_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 258 269 0,00847511698488133 0,760263808984581 0,00840772106507973 0,764583810177768 0,00181173853786912 0,162844643581901 370463 33132886 667 665 12 True 257 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 302 269 0,00688186462959868 0,00663728444480393 0,00671396963454643 0,00663767452506294 0,00148395938149013 0,00122854455104533 300819 289258 667 665 0 False 302 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 347 269 0,00618022414748222 0,00634410471130906 0,00619516289005875 0,00627145799954223 0,00124794865731783 0,00129801205918362 270149 276481 667 665 0 True 346 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 391 269 0,00631721218813802 0,00635991443474789 0,00630197604333562 0,00630197604333562 0,00127507597104087 0,00117973724875895 276137 277170 667 665 0 True 390 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 435 269 0,00624219819593522 0,00642682467211747 0,00628671702143893 0,00636301213092241 0,00146989786364261 0,00154901211012707 272858 280086 667 665 0 True 435 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 478 269 0,00645449763101969 0,00644107407452024 0,00650034332799268 0,00643930724040589 0,00152378538934152 0,00165272730629857 282138 280707 667 665 0 True 479 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 523 269 0,0067371212539759 0,00686855614660363 0,00668345159075303 0,0068055237659266 0,00157015058320772 0,00154128850129434 294492 299337 667 665 0 True 523 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 567 269 0,00701709113399354 0,00709512393939759 0,00706492713817044 0,00712596322575723 0,00165142750308844 0,00160329119430426 306730 309211 667 665 0 True 568 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 612 269 0,00757394248629862 0,00750922855318658 0,00758373388265812 0,00753795681696803 0,00184129388198216 0,00172473968446827 331071 327258 667 665 0 False 612 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 656 269 0,00921617470047306 0,760431291091083 0,00920119020370794 0,76424811169604 0,00194217131325026 0,178091934934479 402856 33140185 667 665 14 True 657 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 257 313 0,0066293930169271 0,00644288680042978 0,00653086137178607 0,0063935301747158 0,00150410750182607 0,00140272111565182 289783 280786 667 665 0 False 257 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 302 313 0,00624745992762374 0,00635619719933847 0,00621042191195544 0,00643930724040589 0,00126600289699029 0,00120781621437621 273088 277008 667 665 0 False 302 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 346 314 0,00616448470660527 0,00619493343108286 0,00613412680247196 0,00619516289005875 0,00117584159026733 0,00125227946330221 269461 269980 667 665 0 True 346 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 391 314 0,00615501358956594 0,00627850239010206 0,00614938582436866 0,00622568093385214 0,00123999191641468 0,00124194369298141 269047 273622 667 665 0 True 390 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 434 313 0,00639860888964993 0,00649219753434857 0,00646982528419928 0,00645456626230259 0,00152863813776517 0,00162834403301179 279695 282935 667 665 0 True 435 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 480 315 0,00659079935884656 0,00669262994978864 0,00656137941557946 0,00672922865644312 0,00164048740878507 0,00158339905160576 288096 291670 667 665 0 True 479 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 523 314 0,00668807276380121 0,00669795339802929 0,00663767452506294 0,00669871061264973 0,00151888162470403 0,00147623842216196 292348 291902 667 665 0 True 523 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 567 314 0,00684455208879881 0,00693266698446735 0,0068207827878233 0,00700389105058366 0,00167163884411623 0,00155552773701653 299188 302131 667 665 0 True 568 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 612 313 0,00717162590597583 0,00733256808764874 0,00727855344472419 0,00730907148851759 0,00204926178175243 0,00187174363858836 313485 319559 667 665 0 False 612 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 657 313 0,00772829424152652 0,00750011903184374 0,00770580605783169 0,00755321583886473 0,00183027167339912 0,00176519692503523 337818 326861 667 665 0 False 657 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 258 358 0,00602319577222147 0,00613993211456198 0,00611886778057527 0,00621042191195544 0,00148277795469303 0,00147096903792017 263285 267583 667 665 0 True 257 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 302 358 0,00611324001537798 0,00606450894918688 0,00611886778057527 0,00602731364919509 0,00124820284038818 0,00129053975260916 267221 264296 667 665 0 True 301 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 347 358 0,00639371319147018 0,0062094581842567 0,0063782711528191 0,00622568093385214 0,00131915925157884 0,00136607608507081 279481 270613 667 665 0 True 346 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 390 358 0,00646884156914447 0,00660834966794418 0,0063935301747158 0,00663767452506294 0,00128929414343852 0,00123137947888618 282765 287997 667 665 0 True 390 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 435 358 0,00667626818314349 0,00670924277964309 0,00660715648126955 0,00669871061264973 0,00149941304504535 0,00169629931877851 291832 292394 667 665 0 True 435 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 480 359 0,00667015999896596 0,00689379663395155 0,00668345159075303 0,00688181887541009 0,00163209368511281 0,00164790937670312 291565 300437 667 665 0 True 479 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 523 358 0,00667256209386723 0,00678023738678351 0,00672922865644312 0,0068055237659266 0,00153418777502757 0,00164683792039301 291670 295488 667 665 0 True 523 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 568 358 0,00690481035517947 0,0068761512387056 0,00697337300679027 0,00685130083161669 0,00173119317577638 0,00173185400336698 301822 299668 667 665 0 True 568 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 612 358 0,00693143929294222 0,00708647333600653 0,00691233691920348 0,00712596322575723 0,00201506710784153 0,00198374672249156 302986 308834 667 665 0 True 612 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 655 357 0,00657718748773931 0,00674616272886382 0,00659189745937285 0,00677500572213321 0,00186516806172953 0,0018271377057122 287501 294003 667 665 0 True 657 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 260 403 0,00603307867695816 0,00601226114037669 0,005981536583505 0,00599679560540169 0,00145830843098092 0,00140459810263272 263717 262019 667 665 0 True 257 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 301 403 0,00630170151820405 0,00628203605833077 0,00628671702143893 0,00627145799954223 0,00143396247681601 0,00124412585079891 275459 273776 667 665 0 True 301 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 347 403 0,00659974430271703 0,00671126201863092 0,00660715648126955 0,00672922865644312 0,00128667984821022 0,00139102228267396 288487 292482 667 665 0 True 346 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 392 402 0,00688323725525656 0,00658014915980728 0,00686655985351339 0,00662241550316625 0,00138117219075223 0,00132447466752592 300879 286768 667 665 0 True 390 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 435 402 0,00691581423753676 0,00676734179233848 0,00689707789730678 0,0068207827878233 0,00153492652480057 0,0015287391355762 302303 294926 667 665 0 True 435 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 479 402 0,00688223066310745 0,00689698611371643 0,00689707789730678 0,00689707789730678 0,00152406491242204 0,00165910019747089 300835 300576 667 665 0 True 479 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 523 402 0,00695488831459757 0,00694111107478011 0,00700389105058366 0,00701915007248035 0,00161465330356771 0,0016649048937669 304011 302499 667 665 0 True 523 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 568 402 0,00674197119796705 0,0067658273630976 0,0068055237659266 0,00679026474402991 0,00168006331525171 0,00164322637134353 294704 294860 667 665 0 True 568 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 611 402 0,00641672754833387 0,006304523037968 0,00642404821850919 0,00627145799954223 0,00185221450905339 0,00191701832075821 280487 274756 667 665 0 True 612 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 656 401 0,00601136831446945 0,00603520703796571 0,00602731364919509 0,00611886778057527 0,0017014863883515 0,00166122673122996 262768 263019 667 665 0 True 657 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 259 447 0,00694097904126444 0,00622554325846661 0,00631723506523232 0,00614938582436866 0,00577433407148307 0,00150737470253801 303403 271314 667 665 0 True 257 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 303 447 0,00618397599094708 0,00629371552020358 0,00614938582436866 0,00633249408712902 0,00142080101813507 0,00147132060706721 270313 274285 667 665 0 True 301 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 347 447 0,0065783313424542 0,00648875564971022 0,00660715648126955 0,00653086137178607 0,00135010713340034 0,00136381593320759 287551 282785 667 665 0 True 346 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 391 446 0,00670459002588429 0,00680579911669767 0,00675974670023652 0,0068055237659266 0,00141687794936 0,00136406985107327 293070 296602 667 665 0 True 390 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 434 446 0,00670699212078557 0,00688755534980734 0,00669871061264973 0,00695811398489357 0,0017280409339519 0,00174471338698482 293175 300165 667 665 0 True 435 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 479 446 0,00693580881795312 0,0067675024136216 0,00700389105058366 0,00674448767833982 0,0016162448678546 0,00174268494085169 303177 294933 667 665 0 True 479 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 523 446 0,00671344346137757 0,00680100342410157 0,00674448767833982 0,0068207827878233 0,0016649463145954 0,00165139640500277 293457 296393 667 665 0 True 523 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 568 446 0,00613060372995009 0,00623148624594216 0,00617990386816205 0,00622568093385214 0,00174724368865789 0,00180937164874632 267980 271573 667 665 0 True 568 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 612 446 0,00584061368262996 0,00585494406650639 0,00585946440833143 0,00588998245212482 0,0017578822527667 0,00178665333456896 255304 255163 667 665 0 True 612 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 656 446 0,00585019918514078 0,00575721748867477 0,00593575951781491 0,00578316929884794 0,00173429834337696 0,00180828947743131 255723 250904 667 665 0 True 657 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 258 492 0,00673698399141011 0,00632368286245483 0,00622568093385214 0,00634775310902571 0,00459221407025359 0,0014713985582891 294486 275591 667 665 0 True 257 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 303 491 0,0063816112085866 0,00648737889585488 0,0063935301747158 0,00648508430609598 0,00139087401812504 0,00149932295585877 278952 282725 667 665 0 True 301 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 346 491 0,0063522827736967 0,00651902128863014 0,00627145799954223 0,00651560234988937 0,00151240070339197 0,00150043864109339 277670 284104 667 665 0 True 346 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 390 490 0,00660967296164232 0,00672076162023277 0,00668345159075303 0,00677500572213321 0,00145356865854788 0,00143271898096035 288921 292896 667 665 0 True 390 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 434 490 0,00659116539235532 0,00667358485478976 0,00659189745937285 0,00675974670023652 0,00177443355140866 0,00189222214977588 288112 290840 667 665 0 True 435 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 480 491 0,00664277611709137 0,00651718561682301 0,00665293354695964 0,00656137941557946 0,00171801424467173 0,00176111703608476 290368 284024 667 665 0 True 479 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 524 490 0,00605510931876703 0,00599837887233534 0,00614938582436866 0,005981536583505 0,00170822568689183 0,00154646042321064 264680 261414 667 665 0 True 523 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 567 490 0,00581451091803606 0,00585161691135598 0,00576791027695125 0,00584420538643473 0,00164572028283382 0,00167831510198306 254163 255018 667 665 0 True 568 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 612 489 0,00563950114665716 0,00559517355990113 0,00564583810177768 0,00560006103608759 0,00167550365926179 0,00165658788052729 246513 243842 667 665 0 True 612 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 655 490 0,00583841748157736 0,00584035047563977 0,00578316929884794 0,00582894636453803 0,001718071399922 0,00168587575836605 255208 254527 667 665 0 True 656 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 259 535 0,00627296788776589 0,00627212343057231 0,00624093995574884 0,00624093995574884 0,00139002462028513 0,00148570073433806 274203 273344 667 665 0 True 257 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 302 535 0,00623435135259104 0,00624757132015206 0,00627145799954223 0,00628671702143893 0,00143437746310708 0,00139583070645213 272515 272274 667 665 0 True 301 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 347 535 0,00622787713490474 0,00642531024287659 0,00625619897764553 0,0063935301747158 0,00150414378228883 0,00133918401995903 272232 280020 667 665 0 True 346 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 391 535 0,00644692531280709 0,00666362633523612 0,0064087891966125 0,00666819256885634 0,00145792226350267 0,00154553567611 281807 290406 667 665 0 True 390 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 435 534 0,00639487992327938 0,00620145006599814 0,00636301213092241 0,00610360875867857 0,00169774719777715 0,00196585058459809 279532 270264 667 665 0 True 435 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 478 535 0,00603785998966642 0,00595680090590404 0,00599679560540169 0,00592050049591821 0,00178520128016533 0,00183711363377068 263926 259602 667 665 0 True 479 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 523 535 0,00584633295620443 0,00592206081695426 0,00588998245212482 0,00587472343022812 0,00174337322148308 0,00185568505913915 255554 258088 667 665 0 True 523 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 567 535 0,00593653733902104 0,00586735779710205 0,00592050049591821 0,00590524147402152 0,00157204116784338 0,00170155542436885 259497 255704 667 665 0 True 568 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 611 534 0,00592072926686119 0,00583709215818213 0,00590524147402152 0,00588998245212482 0,00163699425764244 0,0015710297844264 258806 254385 667 665 0 True 612 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 655 534 0,00584139150383609 0,00607072728743351 0,00585946440833143 0,00608834973678187 0,0017590263300845 0,00194628629860338 255338 264567 667 665 0 True 656 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 258 580 0,00669919103162999 0,00647820053681927 0,00646982528419928 0,00648508430609598 0,00182979403543787 0,00124541626698488 292834 282325 667 665 0 True 257 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 302 579 0,00636276048288513 0,0065502277093512 0,0063782711528191 0,00651560234988937 0,00140326528658526 0,00140232985043173 278128 285464 667 665 0 True 301 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 347 579 0,00632965732743608 0,00650892509369097 0,00631723506523232 0,00651560234988937 0,00131927079191474 0,00136728919008356 276681 283664 667 665 0 True 346 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 391 579 0,0059401519199201 0,00618525026230029 0,0059662775616083 0,00617990386816205 0,0012634311884681 0,00118944292042819 259655 269558 667 665 0 True 390 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 435 579 0,00581499133701632 0,00620854034835314 0,00581368734264134 0,00628671702143893 0,00171246692649114 0,00188417477636183 254184 270573 667 665 0 True 435 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 479 579 0,00591940239539191 0,00623444626673114 0,00588998245212482 0,00614938582436866 0,00188226184438246 0,00174642902879822 258748 271702 667 665 0 True 479 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 523 579 0,00602120546501755 0,00599736925284142 0,00605783169298848 0,00593575951781491 0,00185836958308587 0,00191685133921394 263198 261370 667 665 0 True 523 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 568 579 0,00608773205523583 0,00609479753400439 0,00614938582436866 0,00601205462729839 0,00162162471455485 0,00165101489363509 266106 265616 667 665 0 True 568 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 612 579 0,00611996588110156 0,00623022422157477 0,00605783169298848 0,00621042191195544 0,00146673422515817 0,00145006689698361 267515 271518 667 665 0 True 612 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 655 579 0,00598165096897649 0,00609757398761266 0,00590524147402152 0,00617990386816205 0,00160100092105666 0,00149495478363896 261469 265737 667 665 0 True 656 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 257 617 0,0075404961744351 0,00673358837698503 0,00697337300679027 0,0068055237659266 0,0029237701414784 0,00135742536424807 329609 293455 667 665 0 False 257 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 301 617 0,006334873304936 0,00644144120888167 0,00630197604333562 0,00636301213092241 0,00132207271153705 0,00141487120839143 276909 280723 667 665 0 False 301 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 347 623 0,00630467554046277 0,00611992329186436 0,00634775310902571 0,00611886778057527 0,00130134392742637 0,00137158239490238 275589 266711 667 665 0 True 346 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 391 623 0,00594548228289151 0,00596990301342737 0,00592050049591821 0,00599679560540169 0,0012571796277615 0,00118241700124847 259888 260173 667 665 0 True 390 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 435 617 0,00591899060769455 0,00588894988673331 0,00578316929884794 0,00582894636453803 0,00166953327416137 0,00175892676060758 258730 256645 667 665 0 False 435 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 479 617 0,00587255010626982 0,00605677618169938 0,00590524147402152 0,00604257267109178 0,0018796804275367 0,00187442545950709 256700 263959 667 665 0 False 479 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 523 617 0,0060097669178686 0,00595074318894054 0,00599679560540169 0,0059510185397116 0,00184626734542402 0,00183845253009187 262698 259338 667 665 0 False 523 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 568 617 0,00601731635898691 0,00600643288238908 0,00602731364919509 0,00599679560540169 0,00171976486934527 0,00171873140484997 263028 261765 667 665 0 False 568 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 612 617 0,00618612643781108 0,00596843447598167 0,00616464484626535 0,00592050049591821 0,00150748537938249 0,00129021510056548 270407 260109 667 665 0 False 612 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 656 617 0,00633112146147114 0,00634167244616462 0,0063782711528191 0,00634775310902571 0,00151759792496868 0,00147797615894488 276745 276375 667 665 0 False 656 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 257 661 0,0584884714886777 0,534410643225138 0,00801098649576562 0,635172045471885 0,135305024613372 0,370508085878031 2556639 23290030 667 665 11 False 257 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 301 661 0,00746788427713358 0,00659272351168606 0,00669871061264973 0,00659189745937285 0,00352755746393121 0,00127656071761372 326435 287316 667 665 0 False 301 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 346 661 0,00599258622005088 0,00600087997517254 0,005981536583505 0,00601205462729839 0,00114798904611651 0,00118362659085346 261947 261523 667 665 0 False 346 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 390 661 0,00583240080577702 0,00569790234340716 0,00579842832074464 0,00572213321126116 0,00131039046903239 0,00122984751473838 254945 248319 667 665 0 False 390 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 435 661 0,00575841628281762 0,00584867983646459 0,00576791027695125 0,00575265125505455 0,00147734870668236 0,00143770665452409 251711 254890 667 665 0 False 435 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 479 661 0,0057630374558658 0,00583982271999523 0,00579842832074464 0,00584420538643473 0,00156517759481712 0,00142738981968396 251913 254504 667 665 0 False 479 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 523 661 0,00582357024737803 0,00578287100217929 0,00581368734264134 0,00575265125505455 0,00160778733758359 0,00164129747194118 254559 252022 667 665 0 False 523 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 568 661 0,0060108650183949 0,00598197255555919 0,00602731364919509 0,00604257267109178 0,00145905498761733 0,00142168786500951 262746 260699 667 665 0 False 568 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 612 661 0,00628744908845646 0,00612175896367148 0,00622568093385214 0,00611886778057527 0,0013122932356453 0,00129102536329785 274836 266791 667 665 0 False 612 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 657 666 0,00794663322950564 0,747673509706975 0,00785839627679866 0,750682841229877 0,00171462465339493 0,186492571757573 347362 32584191 667 665 14 True 656 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A5_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A5_3.csv new file mode 100755 index 0000000..76afcf5 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A5_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 258 269 0,00105925522018117 0,0750611479488375 0,000854505226215 0,0744945448996719 0,000846248433514919 0,0185072821742387 46302 3271223 667 665 0 True 257 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 302 269 0,0010295607517825 0,000849273561564704 0,000915541313801785 0,000747692072938125 0,000688198009586571 0,000639666510426036 45004 37012 667 665 0 False 302 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 347 269 0,000807630059998611 0,000838488989697866 0,000686655985351339 0,000732433051041428 0,000610908121078996 0,000642760824027895 35303 36542 667 665 0 True 346 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 391 269 0,000892732850786783 0,000953516774311609 0,000762951094834821 0,000839246204318303 0,000672912091441145 0,000669610586553946 39023 41555 667 665 0 True 390 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 435 269 0,000920551397453025 0,000885918160014364 0,000656137941557946 0,000610360875867857 0,000832948447480277 0,000854278341637976 40239 38609 667 665 0 True 435 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 478 269 0,000928421117891501 0,000933714464692287 0,000701915007248035 0,00064087891966125 0,000838686731967257 0,000917876664895348 40583 40692 667 665 0 True 479 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 523 269 0,000953860446750761 0,000937431700101708 0,000762951094834821 0,000732433051041428 0,000814782960283742 0,000830969568213565 41695 40854 667 665 0 True 523 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 567 269 0,000958024077912978 0,0010419043718245 0,000701915007248035 0,000793469138628214 0,000909522951147196 0,000876177814501207 41877 45407 667 665 0 True 568 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 612 269 0,00101048125513805 0,00100530566517002 0,000656137941557946 0,000656137941557946 0,00101393520162962 0,000992889231450511 44170 43812 667 665 0 False 612 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 656 269 0,0011317756091055 0,0760822403915488 0,000823987182421607 0,0742046234836347 0,000990974729141073 0,020959419377315 49472 3315723 667 665 0 True 657 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 257 313 0,000897148129986277 0,000932039414168289 0,000717174029144732 0,000762951094834821 0,000725663716671422 0,000730683156111043 39216 40619 667 665 0 False 257 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 302 313 0,000931097737924354 0,00093458640880067 0,000793469138628214 0,000823987182421607 0,000695170852707745 0,000675283404239539 40700 40730 667 665 0 False 302 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 346 314 0,000890422264262696 0,000868249818870821 0,000793469138628214 0,000732433051041428 0,000637196155526197 0,000656886311352179 38922 37839 667 665 0 True 346 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 391 314 0,000832955003386382 0,000876510342002867 0,000701915007248035 0,000762951094834821 0,000670073888681859 0,000639407058814873 36410 38199 667 665 0 True 390 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 434 313 0,000847047293473886 0,000949432404540764 0,000595101853971161 0,000701915007248035 0,000815752361957823 0,00087767948977464 37026 41377 667 665 0 True 435 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 480 315 0,00084091623220205 0,000961134812311162 0,000656137941557946 0,000762951094834821 0,000790762608116746 0,000835949476020691 36758 41887 667 665 0 True 479 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 523 314 0,000931989944601972 0,000878988498942481 0,000732433051041428 0,000686655985351339 0,000820444195537848 0,000831575586876491 40739 38307 667 665 0 True 523 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 567 314 0,000964795697825155 0,000872632485310323 0,000747692072938125 0,000686655985351339 0,000904097467047267 0,000764433681124018 42173 38030 667 665 0 True 568 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 612 313 0,000988816646837945 0,0010057645831218 0,000625619897764553 0,000503547722590982 0,00102775369481424 0,00113642357406288 43223 43832 667 665 0 False 612 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 657 313 0,00103223737181535 0,00101228121803708 0,00064087891966125 0,00064087891966125 0,00101056854325376 0,000954801177422171 45121 44116 667 665 0 False 657 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 258 358 0,000857662265228109 0,000859966349841186 0,000701915007248035 0,000686655985351339 0,000741676984843116 0,000742017848607351 37490 37478 667 665 0 True 257 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 302 358 0,000925790252047243 0,000924559051554269 0,000793469138628214 0,000762951094834821 0,000698912954894954 0,000709204565050404 40468 40293 667 665 0 True 301 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 347 358 0,000854207823989127 0,00082600642140944 0,000717174029144732 0,000656137941557946 0,000706165420607629 0,000676848562653858 37339 35998 667 665 0 True 346 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 390 358 0,000879647152848387 0,000958954952040206 0,000747692072938125 0,00080872816052491 0,000691789531791937 0,000700367707711142 38451 41792 667 665 0 True 390 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 435 358 0,000899046928813003 0,000895761950080053 0,000610360875867857 0,000656137941557946 0,000828659846280548 0,000855716943168766 39299 39038 667 665 0 True 435 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 480 359 0,000898909666247215 0,000897528784194407 0,000610360875867857 0,000564583810177768 0,0008422803787899 0,00084276734307793 39293 39115 667 665 0 True 479 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 523 358 0,000888614973813162 0,000947436111450519 0,000625619897764553 0,00064087891966125 0,000877616393568146 0,000899840297234765 38843 41290 667 665 0 True 523 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 568 358 0,000936611117650147 0,000920612357168958 0,000595101853971161 0,000549324788281071 0,000974363906469948 0,000966463169890378 40941 40121 667 665 0 True 568 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 612 358 0,000902547124240581 0,000947000139396328 0,000442511635004196 0,000473029678797589 0,00105710147007505 0,00108521878134138 39452 41271 667 665 0 True 612 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 655 357 0,00093516986070938 0,000885505133857762 0,000595101853971161 0,0004272526131075 0,000961914688606373 0,00100364911299558 40878 38591 667 665 0 True 657 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 260 403 0,000879853046697068 0,000907831492211876 0,000732433051041428 0,000701915007248035 0,000740153752084424 0,000788972733036116 38460 39564 667 665 0 True 257 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 301 403 0,000931418017244525 0,000879332687406316 0,00080872816052491 0,000747692072938125 0,000715982677977747 0,000695749278953061 40714 38322 667 665 0 True 301 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 347 403 0,000886510281137756 0,000949271783257641 0,000747692072938125 0,000854505226215 0,000680168319198499 0,000702294142257847 38751 41370 667 665 0 True 346 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 392 402 0,000959945753834001 0,000913384399428418 0,000793469138628214 0,000762951094834821 0,000785282351226643 0,000758603934742724 41961 39806 667 665 0 True 390 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 435 402 0,000890673912299973 0,000903724176543442 0,000717174029144732 0,000671396963454643 0,000787048470247497 0,000841679773426275 38933 39385 667 665 0 True 435 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 479 402 0,000903164805786624 0,00092919412286725 0,00064087891966125 0,000686655985351339 0,000854187787992634 0,000850816215066295 39479 40495 667 665 0 True 479 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 523 402 0,000915472682518892 0,000917721174072742 0,000671396963454643 0,000671396963454643 0,000890839589092663 0,000887375151456415 40017 39995 667 665 0 True 523 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 568 402 0,000867636678341992 0,000991492234821432 0,000488288700694286 0,000747692072938125 0,000912641631902731 0,000893400937439949 37926 43210 667 665 0 True 568 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 611 402 0,000940362961115002 0,000881902627936286 0,000518806744487678 0,000442511635004196 0,00101431915831835 0,000996021255261265 41105 38434 667 665 0 True 612 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 656 401 0,000963034161564217 0,00090771676272393 0,000595101853971161 0,000579842832074464 0,00100868563250469 0,000940365359585619 42096 39559 667 665 0 True 657 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 259 447 0,000950589022266162 0,000842940493830135 0,000762951094834821 0,000671396963454643 0,000922954974623699 0,000796054728143561 41552 36736 667 665 0 True 257 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 303 447 0,00097593684274823 0,00086733198296726 0,000869764248111696 0,000717174029144732 0,000784062550096183 0,000766687885377162 42660 37799 667 665 0 True 301 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 347 447 0,000943336983373729 0,000881443709984506 0,000793469138628214 0,00080872816052491 0,000753861820715789 0,000714364832624926 41235 38414 667 665 0 True 346 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 391 446 0,000940889134283854 0,000960928299232861 0,000778210116731518 0,000823987182421607 0,000806385352024376 0,000756275974212177 41128 41878 667 665 0 True 390 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 434 446 0,000994558797506717 0,000839705122270084 0,000671396963454643 0,0004272526131075 0,000982259727158825 0,000954750241335165 43474 36595 667 665 0 True 435 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 479 446 0,000946082234689476 0,000961685513853299 0,000625619897764553 0,000549324788281071 0,000946872436220008 0,00103726411514701 41355 41911 667 665 0 True 479 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 523 446 0,000960517681191448 0,00088649180745409 0,000656137941557946 0,000625619897764553 0,000956246285641742 0,000865998775000371 41986 38634 667 665 0 True 523 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 568 446 0,000908609554229523 0,000851614043118784 0,000625619897764553 0,000442511635004196 0,000935447478076005 0,000977676416067377 39717 37114 667 665 0 True 568 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 612 446 0,000951115195435013 0,000895716058284875 0,000564583810177768 0,000595101853971161 0,000976970124833245 0,000898634210989808 41575 39036 667 665 0 True 612 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 656 446 0,000979917457156064 0,000953998638160978 0,000595101853971161 0,000625619897764553 0,0010158340253381 0,00102946471335756 42834 41576 667 665 0 True 657 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 258 492 0,00096060918956864 0,000948904648896216 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,000841983364854846 0,000774384468253472 41990 41354 667 665 0 True 257 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 303 491 0,000958275725950254 0,000956086714841579 0,000854505226215 0,00080872816052491 0,000766221111912019 0,000828773610906808 41888 41667 667 665 0 True 301 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 346 491 0,000882895700238688 0,000911663457109241 0,000732433051041428 0,00080872816052491 0,000781679484716888 0,000794628835327292 38593 39731 667 665 0 True 346 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 390 490 0,000910462598867652 0,00095021256505879 0,000732433051041428 0,000762951094834821 0,000822982967390835 0,000866128527506429 39798 41411 667 665 0 True 390 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 434 490 0,000908678185512417 0,000962327998985791 0,000564583810177768 0,000503547722590982 0,000973377420235149 0,00102847232138289 39720 41939 667 665 0 True 435 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 480 491 0,000927620419591074 0,000975338322918764 0,000534065766384375 0,00064087891966125 0,000981596398412628 0,00098474668041214 40548 42506 667 665 0 True 479 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 524 490 0,000874591315008552 0,000865106230901126 0,000595101853971161 0,000564583810177768 0,000882031223457884 0,000868943853635276 38230 37702 667 665 0 True 523 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 567 490 0,000908792570983906 0,00092850574593958 0,000595101853971161 0,000549324788281071 0,000939391266736937 0,000999605125987688 39725 40465 667 665 0 True 568 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 612 489 0,000870953857015187 0,000982933415020729 0,000534065766384375 0,000595101853971161 0,000921225014426895 0,000968867552627031 38071 42837 667 665 0 True 612 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 655 490 0,000934048883088783 0,000908175680675711 0,000610360875867857 0,000534065766384375 0,000957097689496798 0,000937123409180319 40829 39579 667 665 0 True 656 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 259 535 0,000864296622574499 0,00083768588328225 0,000701915007248035 0,000610360875867857 0,000714271614485709 0,000805271104121453 37780 36507 667 665 0 True 257 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 302 535 0,000815957322323045 0,000873779780189774 0,000671396963454643 0,000762951094834821 0,000743324566533046 0,000719328670444076 35667 38080 667 665 0 True 301 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 347 535 0,000909982179887397 0,000889084693881648 0,000793469138628214 0,000701915007248035 0,000760367205946718 0,000731479671165341 39777 38747 667 665 0 True 346 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 391 535 0,000948690223439436 0,000920314060500301 0,000762951094834821 0,000747692072938125 0,000814005515625305 0,000822123257152071 41469 40108 667 665 0 True 390 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 435 534 0,000850822014033038 0,000936536810095736 0,000457770656900893 0,000518806744487678 0,000941811310439542 0,00101311362784903 37191 40815 667 665 0 True 435 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 478 535 0,000831902657048679 0,000833096703764447 0,000442511635004196 0,0004272526131075 0,000965817094646892 0,000932120668049713 36364 36307 667 665 0 True 479 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 523 535 0,000873104303879189 0,000849503020540594 0,000503547722590982 0,0004272526131075 0,000942445260937811 0,000938894299454685 38165 37022 667 665 0 True 523 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 567 535 0,000843936008649372 0,000840668849968822 0,000564583810177768 0,000457770656900893 0,00082119143272343 0,000926288850351873 36890 36637 667 665 0 True 568 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 611 534 0,000880424974054515 0,000830366141951354 0,000610360875867857 0,000534065766384375 0,000846307034470223 0,000838867466378674 38485 36188 667 665 0 True 612 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 655 534 0,000944709609031602 0,000952598938408048 0,000610360875867857 0,000518806744487678 0,000960972034351764 0,00105199252663497 41295 41515 667 665 0 True 656 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 258 580 0,000964361033033495 0,000874881183274047 0,000869764248111696 0,000747692072938125 0,00068977125550273 0,000592702766569733 42154 38128 667 665 0 True 257 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 302 579 0,000869489722980121 0,000978045938834268 0,000747692072938125 0,000854505226215 0,000731248151523364 0,000750611936280067 38007 42624 667 665 0 True 301 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 347 579 0,000871205505052463 0,000833991593770418 0,000747692072938125 0,000701915007248035 0,000725227797938583 0,000697685241221525 38082 36346 667 665 0 True 346 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 391 579 0,000883215979558859 0,000875454830713772 0,000747692072938125 0,000762951094834821 0,000721664965170699 0,00068365537524057 38607 38153 667 665 0 True 390 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 435 579 0,000853887544668956 0,000808957619500801 0,000457770656900893 0,000381475547417411 0,000960443005983876 0,000974578318190311 37325 35255 667 665 0 True 435 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 479 579 0,000841922824351157 0,000935779595475298 0,000366216525520714 0,000549324788281071 0,00099423166240414 0,00098267242133798 36802 40782 667 665 0 True 479 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 523 579 0,000887516873286863 0,000821554917277171 0,000473029678797589 0,000381475547417411 0,000998250515359771 0,000964660504486479 38795 35804 667 665 0 True 523 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 568 579 0,000957955446630084 0,000878162446629276 0,00064087891966125 0,000549324788281071 0,000910842617440052 0,000890802308560706 41874 38271 667 665 0 True 568 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 612 579 0,00092146648122494 0,000916986905349893 0,000686655985351339 0,000717174029144732 0,000801909108150964 0,000766696089113384 40279 39963 667 665 0 True 612 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 655 579 0,0008903765100741 0,000934311058029601 0,000610360875867857 0,000717174029144732 0,000839022167532579 0,000824272214334637 38920 40718 667 665 0 True 656 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 257 617 0,00104658130994013 0,00104172080464379 0,000885023270008392 0,000900282291905089 0,000787043610651955 0,000751162853710904 45748 45399 667 665 0 False 257 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 301 617 0,000922724721411325 0,000936077892143956 0,000762951094834821 0,000823987182421607 0,00076025511132164 0,000727157156343345 40334 40795 667 665 0 False 301 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 347 623 0,000933042290939675 0,00088975012491173 0,000839246204318303 0,000778210116731518 0,000713199584370847 0,000731899887476939 40785 38776 667 665 0 True 346 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 391 623 0,000868711901773993 0,000889451828243073 0,000762951094834821 0,000732433051041428 0,000683434406638282 0,00070057563098463 37973 38763 667 665 0 True 390 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 435 617 0,000883215979558859 0,000872838998388624 0,000610360875867857 0,000457770656900893 0,000897220208955396 0,0009388996066724 38607 38039 667 665 0 False 435 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 479 617 0,000980237736476234 0,000987660269924066 0,000595101853971161 0,000549324788281071 0,000988894398008664 0,00105015126705954 42848 43043 667 665 0 False 479 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 523 617 0,000872097711730081 0,00094858340632997 0,000457770656900893 0,000473029678797589 0,000953660985862663 0,00106975712786641 38121 41340 667 665 0 False 523 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 568 617 0,000952533575281483 0,000929148231072072 0,000656137941557946 0,000518806744487678 0,000904642021898273 0,000988264056970419 41637 40493 667 665 0 False 568 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 612 617 0,000925103939218306 0,000975108863942874 0,000747692072938125 0,000762951094834821 0,000766177730666413 0,00074293954014023 40438 42496 667 665 0 False 612 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 656 617 0,000946333882726753 0,000903930689621743 0,000778210116731518 0,000686655985351339 0,000766020923624976 0,00081463743291307 41366 39394 667 665 0 False 656 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 257 661 0,00568790907819151 0,0533821392575052 0,00100709544518196 0,0621042191195544 0,0129553636704782 0,0380601110502375 248629 2326435 667 665 0 False 257 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 301 661 0,00100187946768204 0,000966917178503595 0,000854505226215 0,000900282291905089 0,000714937607033618 0,00067024358603869 43794 42139 667 665 0 False 301 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 346 661 0,000898978297530109 0,000886400023863734 0,000793469138628214 0,000762951094834821 0,00064041361827946 0,000637722254468105 39296 38630 667 665 0 False 346 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 390 661 0,000911286174262377 0,000958932006142617 0,00080872816052491 0,000869764248111696 0,00070804519335036 0,00067311875798243 39834 41791 667 665 0 False 390 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 435 661 0,000866172544306926 0,000872999619671747 0,000656137941557946 0,000671396963454643 0,000786431831323152 0,000768981105603332 37862 38046 667 665 0 False 435 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 479 661 0,000749979782367914 0,000896633894188435 0,000457770656900893 0,000732433051041428 0,000742746874415883 0,000753178022227974 32783 39076 667 665 0 False 479 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 523 661 0,000894013968067465 0,000842573359468711 0,000549324788281071 0,000534065766384375 0,000910920191887804 0,000826271675541557 39079 36720 667 665 0 False 523 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 568 661 0,000774366764889471 0,000959505653582342 0,000564583810177768 0,000747692072938125 0,00072892581324297 0,000775464953216463 33849 41816 667 665 0 False 568 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 612 661 0,000950611899360459 0,000865978175009508 0,000823987182421607 0,000686655985351339 0,0006834851760678 0,00068531030744274 41553 37740 667 665 0 False 612 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 657 666 0,00105300977343784 0,0744914013117022 0,000869764248111696 0,0724498359655146 0,000781827715660741 0,0213222773770154 46029 3246393 667 665 0 True 656 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A6_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A6_1.csv new file mode 100755 index 0000000..dffd32c --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A6_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 270 252 0,0103334919859823 0,0478164052842108 0,0103608758678569 0,0477912565804532 0,00163785948801604 0,00976599313865701 451696 2083876 667 665 0 True 269 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 314 252 0,0103604412030652 0,0102289599026176 0,0103150988021668 0,0101930266269932 0,0014208376212597 0,00128983451361385 452874 445786 667 665 0 False 314 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 359 252 0,0105255451926131 0,0703123567674049 0,0105439841306172 0,070420386053254 0,00129847385649619 0,0127579079632488 460091 3064267 667 665 0 True 358 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 404 251 0,0105957778721077 0,0912908272053446 0,0106507972838941 0,089921416037232 0,00146562243546017 0,0152499030484172 463161 3978525 667 665 0 True 402 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 448 250 0,0104994424280192 0,0833678382268328 0,0105134660868238 0,0797741664759289 0,00159576776877448 0,0206788920068527 458950 3633235 667 665 0 True 447 253 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 491 252 0,0105009523162429 0,0739363859408191 0,0105439841306172 0,0769817654688335 0,00157236624104424 0,0241020884581645 459016 3222205 667 665 0 True 491 253 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 536 251 0,0107127027010642 0,0895648826804939 0,0107118333714809 0,0870374608987564 0,00161003204955834 0,0270670698068777 468272 3903307 667 665 0 True 535 253 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 580 251 0,0107995212739247 0,0787503664173021 0,0108796826123445 0,0766613260090028 0,00171640359417561 0,0226014176575927 472067 3432002 667 665 0 True 580 253 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 624 253 0,0105856433193337 0,0103552770688451 0,0105897611963073 0,0103150988021668 0,00183760351584364 0,00176877322483864 462718 451291 667 665 0 False 624 253 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 667 251 0,010343603661662 0,0481637832278109 0,010452429999237 0,0474250400549325 0,0018124634648383 0,00876037550685315 452138 2099015 667 665 0 True 668 253 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 269 296 0,0102434477428258 0,0102684039005731 0,0101930266269932 0,0102235446707866 0,00151176675672149 0,00158964486408727 447760 447505 667 665 0 False 269 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 314 296 0,0103191938020461 0,0105246177930521 0,01025406271458 0,0105439841306172 0,00125060925588267 0,00129388241894053 451071 458671 667 665 0 False 314 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 360 296 0,0105173551928545 0,113553441855956 0,0104829480430304 0,109224078736553 0,00131843487653571 0,0291296454272373 459733 4948747 667 665 0 True 358 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 404 295 0,0105734727051672 0,0605428425722122 0,0105439841306172 0,0578622110322728 0,00141068634167128 0,0138908079700166 462186 2638504 667 665 0 True 402 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 448 295 0,010752234320011 0,0859589348743798 0,0107728694590677 0,0821698329137102 0,00169163131411836 0,0193085589617052 470000 3746157 667 665 0 True 447 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 492 296 0,0105652598283143 0,0504231280880159 0,0105134660868238 0,0499580376897841 0,00163226418476066 0,0131262788197421 461827 2197479 667 665 0 True 491 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 535 297 0,0105569554430841 0,0488841467367205 0,0105287251087205 0,0532234683756771 0,00151961163501335 0,011827089413389 461464 2130409 667 665 0 True 535 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 581 296 0,0104949127633482 0,0634729189648417 0,0104219119554437 0,0609597924773022 0,00179766936142202 0,0184573523419783 458752 2766199 667 665 0 True 580 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 624 296 0,0102528959827708 0,0103282009096901 0,0102388036926833 0,0103761348897536 0,00198767819844021 0,00194208003836647 448173 450111 667 665 0 False 624 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 668 296 0,0102699165409284 0,0101112703938835 0,010406652933547 0,0100862134737163 0,00196494444289783 0,00198250621835021 448917 440657 667 665 0 False 668 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 271 340 0,0104534137142919 0,0570380861744657 0,0103761348897536 0,056046387426566 0,00154934299632359 0,0139766008393905 456938 2485764 667 665 0 True 269 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 316 340 0,0106733540988718 0,0756267643244068 0,0106965743495842 0,0743266956588083 0,00134934451144969 0,0269699401624807 466552 3295873 667 665 0 True 314 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 360 340 0,0108042339553501 0,047316253554463 0,0107728694590677 0,0462958724345769 0,00132955811072124 0,0130213038527135 472273 2062079 667 665 0 True 358 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 404 340 0,0107294716111846 0,0392416610305806 0,0106813153276875 0,0393835355153735 0,00151717406968376 0,00667285798654243 469005 1710182 667 665 0 True 402 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 449 339 0,0108802087855134 0,0789787698819032 0,0109254596780346 0,0742656595712215 0,00172408495025093 0,0161798116810163 475594 3441956 667 665 0 True 447 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 491 340 0,0107612707722586 0,0371568885592328 0,0107881284809644 0,0379797055008774 0,00167812213521604 0,00645754599405911 470395 1619326 667 665 0 True 491 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 535 340 0,0104840003893681 0,0309277427948447 0,0104829480430304 0,0313267719539178 0,00164015225763141 0,00349594118604788 458275 1347855 667 665 0 True 535 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 580 340 0,0106140109162631 0,0570833354845112 0,0106660563057908 0,0562142366674296 0,00195398405029666 0,0109419439924196 463958 2487736 667 665 0 True 580 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 625 339 0,0103533493038329 0,0665250675326449 0,0103608758678569 0,0642404821850919 0,00205620604489697 0,0179113574178911 452564 2899214 667 665 0 True 624 340 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 669 340 0,0115320000791547 0,0724662193363932 0,010406652933547 0,0717021438925765 0,00785686309955204 0,0219897456989478 504085 3158134 667 665 0 True 668 340 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 271 385 0,0103731151133062 0,0493190173878275 0,0104219119554437 0,0508125429159991 0,00147864289857738 0,0124679109908202 453428 2149361 667 665 0 True 269 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 317 384 0,0104894680149053 0,0373457103504928 0,0105592431525139 0,0357518883039597 0,0013893780207723 0,00859145535840667 458514 1627555 667 665 0 True 314 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 360 384 0,0107835759391991 0,0999119221721046 0,0107423514152743 0,0934157320515755 0,00137177524806099 0,029244650894749 471370 4354239 667 665 0 True 358 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 404 383 0,0112199565129314 0,0736537613202152 0,0110627908751049 0,0720988784618906 0,0016786415221913 0,020795913400706 490445 3209888 667 665 0 True 402 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 449 383 0,0112517099198169 0,0479197765528493 0,0113221942473487 0,0480354009308003 0,001792083114791 0,0110788092705388 491833 2088381 667 665 0 True 447 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 493 384 0,0110305570492392 0,0596762907497629 0,0110017547875181 0,0607003891050584 0,00178878277564954 0,0121310819935831 482166 2600739 667 665 0 True 491 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 536 384 0,0107856577547802 0,0468022425025714 0,0108339055466545 0,0470130464637217 0,00177060304757743 0,00804312885905768 471461 2039678 667 665 0 True 535 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 582 384 0,0105091194389072 0,057043707919375 0,0105592431525139 0,0566109712367437 0,00179886233181924 0,0104605229845172 459373 2486009 667 665 0 True 580 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 625 383 0,010518316030815 0,0491022704392017 0,0104982070649271 0,0474402990768292 0,00190898263289727 0,0111690223480719 459775 2139915 667 665 0 True 624 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 669 383 0,0106204165026665 0,103923943527851 0,0106660563057908 0,100770580605783 0,00183164302551496 0,0257093884331917 464238 4529086 667 665 0 True 668 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 272 429 0,0103924233808937 0,0459590037120726 0,0103761348897536 0,0461585412375067 0,00151651843075388 0,00694410855538817 454272 2002929 667 665 0 True 269 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 316 428 0,0105859864757482 0,0630334820801144 0,010605020218204 0,063431754024567 0,00151809671411388 0,00837968163178053 462733 2747048 667 665 0 True 314 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 361 428 0,0108933402376404 0,0434632931608031 0,0108796826123445 0,0414129854276341 0,00143481971782429 0,0111214374286065 476168 1894164 667 665 0 True 358 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 405 428 0,0112180348370104 0,061004468139908 0,0112306401159686 0,0592965590905623 0,00172640936416683 0,0144374894077735 490361 2658622 667 665 0 True 402 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 449 427 0,0122218588577078 0,110504849902279 0,0119935912108034 0,108690012970169 0,00233938535700477 0,0259783695033272 534240 4815887 667 665 0 True 447 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 493 428 0,0117211021406212 0,0714738781033609 0,011459525444419 0,0664682993820096 0,00231399028363144 0,0209934742802735 512351 3114887 667 665 0 True 491 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 537 428 0,0108900916902501 0,0597507960792345 0,010955977721828 0,0572671091783017 0,00172629560116236 0,0122157609042365 476026 2603986 667 665 0 True 535 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 581 428 0,0108237023625976 0,0342394324102772 0,0108186465247578 0,0346074616617075 0,00184282210213154 0,00529760743632831 473124 1492181 667 665 0 True 580 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 625 427 0,0105891435147613 0,0446577189139018 0,0106813153276875 0,043778133821622 0,00185753666754524 0,00820582256291884 462871 1946218 667 665 0 True 624 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 669 427 0,0103526172368153 0,0766965709076996 0,0104219119554437 0,0768444342717632 0,0018681725753947 0,0134873437136535 452532 3342496 667 665 0 True 668 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 271 473 0,0103317533268156 0,0581081222167343 0,0103150988021668 0,0585183489738308 0,00151878470261045 0,0169235632844083 451620 2532397 667 665 0 True 269 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 316 473 0,0106074223131053 0,0604580115888256 0,0106507972838941 0,059311818112459 0,00161406701081734 0,00953515119383899 463670 2634807 667 665 0 True 314 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 360 472 0,0111730355925265 0,0732788253536106 0,0112001220721752 0,0711985961699855 0,00154825910699461 0,0194473516760111 488394 3193548 667 665 0 True 358 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 404 472 0,0113454373751554 0,102197425355561 0,0113221942473487 0,0938887617303731 0,00173872162961794 0,0323761971965378 495930 4453843 667 665 0 True 402 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 449 472 0,0126088706619453 0,104837213197792 0,0124361028458076 0,100846875715267 0,0028928048425306 0,0364203809393482 551157 4568887 667 665 0 True 447 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 492 472 0,0113445451684778 0,0540543393273754 0,0112916762035554 0,0540016784924086 0,00200016867578478 0,0121633659647605 495891 2355730 667 665 0 True 491 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 537 472 0,0110073596756211 0,0452894194745275 0,0110322728313115 0,0471656366826886 0,00169970960616442 0,0077692605960551 481152 1973748 667 665 0 True 535 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 580 472 0,0109762239502817 0,1134055096542 0,0109407186999313 0,11459525444419 0,00199425403224379 0,0243722007506044 479791 4942300 667 665 0 True 580 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 625 471 0,0104762908085898 0,0725211977070165 0,0105134660868238 0,0710765239948119 0,0018060591149803 0,0235010005477547 457938 3160530 667 665 0 True 624 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 669 472 0,0103331030753792 0,0789530934225011 0,0103150988021668 0,0755321583886473 0,00181506594771336 0,014473370171303 451679 3440837 667 665 0 True 668 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 272 517 0,0103155105898641 0,0591065900044228 0,0103456168459602 0,061219195849546 0,00147404744642107 0,0154277942971888 450910 2575911 667 665 0 True 269 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 316 517 0,0106785471992775 0,10899588178503 0,0107423514152743 0,0998855573357748 0,00144624965688015 0,0303154856402319 466779 4750125 667 665 0 True 314 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 359 516 0,0110700886681859 0,0615768076634709 0,0110322728313115 0,0649118791485466 0,00155372136084446 0,0167384593045467 483894 2683565 667 665 0 True 358 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 404 516 0,0115299182635736 0,0657977055249706 0,0113374532692454 0,0638590066376745 0,00196712086228145 0,0136464264827625 503994 2867515 667 665 0 True 402 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 449 516 0,0126057136229322 0,0652070322292341 0,0122529945830472 0,0643167772945754 0,00263689658898823 0,0134224347997809 551019 2841773 667 665 0 True 447 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 493 516 0,0125324154128017 0,0669206548070795 0,0121461814297704 0,0663767452506294 0,00287680596916689 0,016197068154259 547815 2916454 667 665 0 True 491 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 536 516 0,0110895799525277 0,0761670484290378 0,0110017547875181 0,075394827191577 0,00175904407641306 0,021394619809283 484746 3319419 667 665 0 True 535 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 581 516 0,0108403797643408 0,0608022688903536 0,0108491645685512 0,0610513466086824 0,00172147924057335 0,0146721826849683 473853 2649810 667 665 0 True 580 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 624 516 0,0106455126751113 0,0447228164253619 0,010757610437171 0,0446173800259403 0,0018469754818631 0,00768761747479543 465335 1949055 667 665 0 True 624 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 669 516 0,0105778651072724 0,0670528461230898 0,0106660563057908 0,068055237659266 0,00200761030731188 0,0157887809268363 462378 2922215 667 665 0 True 668 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 272 562 0,0102223779389774 0,049238592016778 0,0101777676050965 0,0509498741130694 0,00147093135803797 0,0106838041146585 446839 2145856 667 665 0 True 269 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 316 561 0,0104201046649941 0,0566887348836729 0,010452429999237 0,0574807354848554 0,00143443660003328 0,0134601386822018 455482 2470539 667 665 0 True 314 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 360 561 0,0108726593443951 0,0547409035291364 0,0108491645685512 0,0539253833829252 0,00142414039744148 0,0137610622557273 475264 2385651 667 665 0 True 358 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 404 561 0,0111454000626146 0,0545733984767366 0,0110627908751049 0,0529640650034333 0,00156027672711768 0,00939628410245526 487186 2378351 667 665 0 True 402 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 449 560 0,0112467455903543 0,0963484242765302 0,0112001220721752 0,087510490577554 0,00197185266614328 0,0273425263401352 491616 4198939 667 665 0 True 447 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 493 561 0,0116033079820813 0,0659496762047026 0,0113679713130388 0,0636301213092241 0,00254657660732278 0,0137949439523048 507202 2874138 667 665 0 True 491 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 537 560 0,0108470598758757 0,058238340185552 0,0109254596780346 0,0578774700541695 0,00202339861221154 0,00910139177352086 474145 2538072 667 665 0 True 535 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 581 559 0,010747247113454 0,0406588455574734 0,0107881284809644 0,0419012741283284 0,00184247291208647 0,00998336566894313 469782 1771944 667 665 0 True 580 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 625 560 0,0104178627097529 0,0514530317554013 0,0104219119554437 0,0510414282444495 0,0017345534432688 0,00967790761623482 455384 2242363 667 665 0 True 624 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 669 560 0,0105866499114828 0,0588766262187857 0,010605020218204 0,0561532005798428 0,00173059596404008 0,0117715694204302 462762 2565889 667 665 0 True 668 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 269 600 0,0103084873219147 0,00997942326633705 0,0101319905394064 0,00997940032043946 0,00178179769495013 0,001368326593789 450603 434911 667 665 0 False 269 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 314 600 0,0104144082685139 0,0102800833624459 0,0103150988021668 0,0103150988021668 0,00173380670607013 0,00152265926841027 455233 448014 667 665 0 False 314 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 360 604 0,0105584195771192 0,0822089786149971 0,0105134660868238 0,079163805600061 0,0014307062272706 0,0186714964889177 461528 3582731 667 665 0 True 358 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 405 605 0,0108265848764791 0,0815240435719649 0,0107728694590677 0,0774700541695277 0,00153940314341323 0,0241973941574891 473250 3552881 667 665 0 True 402 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 447 600 0,0107899128943196 0,0108835834149347 0,0107118333714809 0,0109712367437247 0,00201205828157176 0,00211687798485966 471647 474315 667 665 0 False 447 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 491 600 0,0106271652454844 0,010598320016108 0,0105592431525139 0,0104676890211337 0,00203535137679844 0,00207948024609569 464533 461883 667 665 0 False 491 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 535 600 0,0105450135998606 0,010531157373865 0,0106202792401007 0,0104982070649271 0,00203273389936044 0,00194836624612026 460942 458956 667 665 0 False 535 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 580 600 0,0102916726576057 0,0103167738526908 0,0102998397802701 0,010452429999237 0,00167605317774065 0,00188640275075815 449868 449613 667 665 0 False 580 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 624 600 0,0102813322109831 0,0102795556068014 0,0101930266269932 0,0103150988021668 0,00151366347997257 0,00144632183791537 449416 447991 667 665 0 False 624 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 668 600 0,0102648378259943 0,0101828157025661 0,0101930266269932 0,0101472495613031 0,00162419044165977 0,00172817319028018 448695 443775 667 665 0 False 668 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 269 643 0,0124540156106428 0,0346073010404244 0,0103761348897536 0,0395361257343404 0,00703295550001413 0,0187376822173287 544388 1508213 667 665 0 False 269 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 314 644 0,0101483476618294 0,0101374516630326 0,0101930266269932 0,0101319905394064 0,00129296445341942 0,00126110053114259 443603 441798 667 665 0 False 314 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 358 644 0,0104762450544012 0,0100930742970955 0,0102998397802701 0,010101472495613 0,00188931348049308 0,00120489992473503 457936 439864 667 665 0 False 358 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 402 644 0,0106341198821509 0,0103768462125788 0,010452429999237 0,0103456168459602 0,00185707659522624 0,00133517979682051 464837 452231 667 665 0 False 402 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 447 644 0,010223498916598 0,0102961684366558 0,0102693217364767 0,0102845807583734 0,00161232522327556 0,00170550899941119 446888 448715 667 665 0 False 447 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 491 644 0,0102092693639447 0,0102935755502283 0,0101930266269932 0,0103150988021668 0,00171016313338261 0,00181732545175881 446266 448602 667 665 0 False 491 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 535 644 0,0100412371063267 0,0101649179024467 0,0100404364080262 0,0102388036926833 0,00193605664929779 0,00174249207330711 438921 442995 667 665 0 False 535 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 579 644 0,0100497245083112 0,0101343769127557 0,0100862134737163 0,0101472495613031 0,00148583337495159 0,00136395304966142 439292 441664 667 665 0 False 579 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 624 644 0,0100867625239795 0,0100884851175776 0,0100556954299229 0,0101319905394064 0,00129042985175521 0,00139537471003452 440911 439664 667 665 0 False 624 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 668 650 0,0101929579957103 0,0456067841840812 0,0101777676050965 0,0458991378652628 0,00129726659940136 0,0101753817795344 445553 1987579 667 665 0 True 668 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A6_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A6_2.csv new file mode 100755 index 0000000..e9a4514 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A6_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 270 252 0,00833396531306331 0,756732458291529 0,0081177996490425 0,774944686045625 0,00192124243262506 0,184439526768172 364293 32978987 667 665 14 True 269 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 314 252 0,00675066449380025 0,00645826055181442 0,00666819256885634 0,00650034332799268 0,0014209123385081 0,00118834246130803 295084 281456 667 665 0 False 314 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 359 252 0,00609267350760417 0,00627893836215625 0,00607309071488518 0,00630197604333562 0,0011857795381427 0,00120155372843896 266322 273641 667 665 0 True 358 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 404 251 0,00614277434411657 0,00620115176932948 0,00616464484626535 0,00622568093385214 0,0012978615289291 0,00129349373619079 268512 270251 667 665 0 True 402 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 448 250 0,00626695121196554 0,00641592537076268 0,00628671702143893 0,00654612039368277 0,00143048402508272 0,00165625335045055 273940 279611 667 665 0 True 447 253 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 491 252 0,00663261868722311 0,00672991703337079 0,00657663843747616 0,00671396963454643 0,00149650047865087 0,00145692713664637 289924 293295 667 665 0 True 491 253 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 536 251 0,00669738374118045 0,00702575849098599 0,00675974670023652 0,00701915007248035 0,0015199148266177 0,00146491453531316 292755 306188 667 665 0 True 535 253 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 580 251 0,0071512424149564 0,00736221418733375 0,00711070420386053 0,00738536659800107 0,001703202299268 0,00164567009599506 312594 320851 667 665 0 True 580 253 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 624 253 0,00796264719551417 0,00769125835876026 0,00799572747386892 0,00770580605783169 0,00195932590790394 0,00176964766717549 348062 335191 667 665 0 False 624 253 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 667 251 0,00917314288609872 0,765440059292199 0,00918593118181125 0,769542992294194 0,00186958980954427 0,166346859129808 400975 33358471 667 665 13 True 668 253 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 269 296 0,006522945897159 0,00644229020709246 0,00653086137178607 0,0063935301747158 0,00155706161492833 0,00136868907972638 285130 280760 667 665 0 False 269 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 314 296 0,00652573690266334 0,00629080139120977 0,00650034332799268 0,00628671702143893 0,00130975095826621 0,0011355456762001 285252 274158 667 665 0 False 314 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 360 296 0,00641338749256637 0,00622189486074995 0,0063782711528191 0,00628671702143893 0,00124691082787471 0,0012221401400967 280341 271155 667 665 0 True 358 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 404 295 0,00639719050980346 0,00621214285427462 0,0063935301747158 0,00624093995574884 0,00135334452301542 0,00140920583955206 279633 270730 667 665 0 True 402 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 448 295 0,00652315179100768 0,0066818453779218 0,00659189745937285 0,00671396963454643 0,00159349931967506 0,00171272985140853 285139 291200 667 665 0 True 447 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 492 296 0,00651368067396835 0,00667477804146438 0,00648508430609598 0,00674448767833982 0,00166439828565117 0,00168758472319844 284725 290892 667 665 0 True 491 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 535 297 0,00685420622259253 0,00688682108108449 0,00683604180972 0,00689707789730678 0,00147801513242181 0,00154467310508606 299610 300133 667 665 0 True 535 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 581 296 0,00731126768957018 0,0069473982507195 0,00727855344472419 0,00689707789730678 0,0016378227564936 0,00186545075891274 319589 302773 667 665 0 True 580 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 624 296 0,00732032701891215 0,00728135284423005 0,00738536659800107 0,0072480354009308 0,00181171126925526 0,00181195905024026 319985 317327 667 665 0 False 624 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 668 296 0,00762619376967502 0,00759252216143471 0,00762951094834821 0,00762951094834821 0,00187405156612499 0,00175877232907008 333355 330888 667 665 0 False 668 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 271 340 0,00616986082376527 0,00622719536309301 0,00617990386816205 0,00625619897764553 0,00138135868077471 0,00139998823476152 269696 271386 667 665 0 True 269 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 316 340 0,00636696986823594 0,00647055955292213 0,00633249408712902 0,00645456626230259 0,00120482853867234 0,00115955257938684 278312 281992 667 665 0 True 314 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 360 340 0,00643537238018665 0,00654816257856819 0,00643930724040589 0,00651560234988937 0,00125247338521473 0,00129403560931977 281302 285374 667 665 0 True 358 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 404 340 0,00681513214553172 0,0067368008026475 0,0068207827878233 0,0068207827878233 0,0015059435728422 0,00131741241384832 297902 293595 667 665 0 True 402 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 449 339 0,00683190105565208 0,00677188508006111 0,00688181887541009 0,00677500572213321 0,00156292368926707 0,00155905298164284 298635 295124 667 665 0 True 447 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 491 340 0,00688689759034422 0,00697734264707317 0,00688181887541009 0,00695811398489357 0,00154068446876016 0,00157871402790328 301039 304078 667 665 0 True 491 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 535 340 0,00694047574518989 0,0067856755645121 0,00689707789730678 0,0068055237659266 0,00152129760791159 0,00164578687538354 303381 295725 667 665 0 True 535 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 580 340 0,00715931802924356 0,00707573465593487 0,0072632944228275 0,00718699931334401 0,00184401067992481 0,00194754466649738 312947 308366 667 665 0 True 580 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 625 339 0,00709926565671158 0,00725260163455102 0,00703440909437705 0,0072327763790341 0,00189069917440975 0,00201354895042915 310322 316074 667 665 0 True 624 340 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 669 340 0,00682894991048765 0,00683360954457556 0,0068055237659266 0,00679026474402991 0,00183658962515011 0,00187671418676153 298506 297814 667 665 0 True 668 340 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 271 385 0,0062522183632377 0,00612554503677367 0,00628671702143893 0,00613412680247196 0,00144230965541157 0,00132441543231847 273296 266956 667 665 0 True 269 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 317 384 0,00646813237922124 0,00650006797722161 0,00653086137178607 0,00648508430609598 0,00133251393015631 0,00130926114245001 282734 283278 667 665 0 True 314 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 360 384 0,00679760829129953 0,00667303415324762 0,0068207827878233 0,00666819256885634 0,00131475364915268 0,00125520623425475 297136 290816 667 665 0 True 358 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 404 383 0,00696248350990447 0,00706120990276102 0,00692759594110018 0,00708018616006714 0,00155509709530114 0,00133766727502123 304343 307733 667 665 0 True 402 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 449 383 0,00705325982007852 0,00710712464383665 0,00711070420386053 0,00704966811627375 0,00157636419216697 0,00163578210966413 308311 309734 667 665 0 True 447 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 493 384 0,00695509420844625 0,00712387514907663 0,00692759594110018 0,00714122224765393 0,00167533050692186 0,00164698150137023 304020 310464 667 665 0 True 491 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 536 384 0,00693965216979517 0,00706283906148984 0,00698863202868696 0,00703440909437705 0,00156707216522575 0,00156819782031836 303345 307804 667 665 0 True 535 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 582 384 0,00699524350893905 0,00710005730737923 0,00700389105058366 0,00711070420386053 0,00188165596742304 0,00187869085704975 305775 309426 667 665 0 True 580 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 625 383 0,00675523991265983 0,00665811931981476 0,00674448767833982 0,00669871061264973 0,00189538739155549 0,00184404413157812 295284 290166 667 665 0 True 624 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 669 383 0,00638042159968311 0,00636884038891002 0,0063935301747158 0,00633249408712902 0,00175657656495751 0,00180363428507179 278900 277559 667 665 0 True 668 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 272 429 0,00629268794305068 0,00655224694833903 0,00630197604333562 0,00653086137178607 0,00151560050356223 0,00155561149523159 275065 285552 667 665 0 True 269 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 316 428 0,00655293776778354 0,00671555290148007 0,00654612039368277 0,00669871061264973 0,00136448339224258 0,00135878996191229 286441 292669 667 665 0 True 314 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 361 428 0,00665281916148815 0,00682498188708209 0,00671396963454643 0,00674448767833982 0,00129419317134146 0,00128229949944945 290807 297438 667 665 0 True 358 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 405 428 0,00670202779132292 0,00685873530243554 0,00669871061264973 0,00692759594110018 0,00145693673000194 0,00153622529434306 292958 298909 667 665 0 True 402 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 449 427 0,00713685272264303 0,00706465178739937 0,00708018616006714 0,00703440909437705 0,00159266616496127 0,00162971641032766 311965 307883 667 665 0 True 447 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 493 428 0,00703415744633977 0,0070081819334328 0,00701915007248035 0,00704966811627375 0,00171129426836988 0,00164314955744504 307476 305422 667 665 0 True 491 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 537 428 0,00693207985158256 0,00703133434410012 0,00694285496299687 0,00697337300679027 0,00168999226262287 0,00159691781870641 303014 306431 667 665 0 True 535 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 581 428 0,00663680519547962 0,00646482307852488 0,00666819256885634 0,00648508430609598 0,0018236191915403 0,00187270333271345 290107 281742 667 665 0 True 580 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 625 427 0,00615311479073921 0,00617308893657811 0,00619516289005875 0,00617990386816205 0,00185740391644725 0,00161649104490614 268964 269028 667 665 0 True 624 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 669 427 0,00600896621956817 0,00612439774189422 0,00602731364919509 0,00621042191195544 0,00173399585042857 0,00173034720908065 262663 266906 667 665 0 True 668 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 271 473 0,00630902218837937 0,00633979088256232 0,00636301213092241 0,00633249408712902 0,00137740921824167 0,00143923233657744 275779 276293 667 665 0 True 269 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 316 473 0,0063815425773037 0,00650968230831141 0,00631723506523232 0,00653086137178607 0,00145290093167241 0,00151429074318662 278949 283697 667 665 0 True 314 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 360 472 0,00668388625554469 0,00660633042895635 0,00672922865644312 0,00662241550316625 0,00144494922048822 0,0014206732758046 292165 287909 667 665 0 True 358 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 404 472 0,00674913172848229 0,00670442414114939 0,00677500572213321 0,00659189745937285 0,00166438735802841 0,00150312564673468 295017 292184 667 665 0 True 402 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 449 472 0,00722582174236754 0,00726825073670672 0,0072632944228275 0,0072480354009308 0,00204600939458285 0,00212985086803902 315854 316756 667 665 0 True 447 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 492 472 0,00686383747929194 0,00707814397518172 0,00689707789730678 0,00711070420386053 0,00180804186581723 0,00193177202536654 300031 308471 667 665 0 True 491 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 537 472 0,00656215723678559 0,00639444801061936 0,00657663843747616 0,0063782711528191 0,00169045301733869 0,0016196193216791 286844 278675 667 665 0 True 535 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 580 472 0,00618102484578265 0,00619619545545025 0,00613412680247196 0,00625619897764553 0,00174585629014002 0,001854684678794 270184 270035 667 665 0 True 580 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 625 471 0,00585896111225687 0,00578390356757079 0,00582894636453803 0,00576791027695125 0,00181554581754306 0,00164172019979882 256106 252067 667 665 0 True 624 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 669 472 0,00598739311964526 0,00608068580698714 0,005981536583505 0,00610360875867857 0,00177410255200331 0,00168862376166301 261720 265001 667 665 0 True 668 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 272 517 0,00645502380418854 0,00631452744931682 0,00642404821850919 0,00628671702143893 0,00134635794589177 0,00145900305278328 282161 275192 667 665 0 True 269 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 316 517 0,00650045771346416 0,00651899834273255 0,00651560234988937 0,00651560234988937 0,00147622261421308 0,00140380271131283 284147 284103 667 665 0 True 314 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 359 516 0,00656501687357283 0,00650734182675733 0,00650034332799268 0,00653086137178607 0,00147091498248039 0,00145035904114201 286969 283595 667 665 0 True 358 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 404 516 0,00674453343252841 0,00679535873329467 0,00671396963454643 0,00689707789730678 0,00167418161122507 0,00166630371255 294816 296147 667 665 0 True 402 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 449 516 0,00730330646075452 0,00670435530345663 0,00721751735713741 0,00679026474402991 0,00209342754370024 0,00181007688060044 319241 292181 667 665 0 True 447 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 493 516 0,00691963471228451 0,00660302621970353 0,00689707789730678 0,00665293354695964 0,00188092754124394 0,00172413892938112 302470 287765 667 665 0 True 491 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 536 516 0,00622238663227324 0,00619240938234806 0,00621042191195544 0,00617990386816205 0,00169589556474439 0,00158996120586237 271992 269870 667 665 0 True 535 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 581 516 0,0060989418314418 0,00638981293930638 0,00611886778057527 0,00633249408712902 0,00171583702925818 0,00167681386286068 266596 278473 667 665 0 True 580 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 624 516 0,00604083401192514 0,00613568712350801 0,00616464484626535 0,00622568093385214 0,00184109196067483 0,00169494130999717 264056 267398 667 665 0 True 624 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 669 516 0,00598643228168475 0,00615578772979599 0,00601205462729839 0,00622568093385214 0,00185707068375919 0,00189149684818397 261678 268274 667 665 0 True 668 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 272 562 0,00659596958215788 0,006532261071539 0,00651560234988937 0,00651560234988937 0,00166714051812065 0,0013191636424742 288322 284681 667 665 0 True 269 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 316 561 0,00656879159413198 0,00668989938797555 0,00663767452506294 0,00669871061264973 0,00138305061342466 0,00136513549585615 287134 291551 667 665 0 True 314 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 360 561 0,0063870330799352 0,00670134939087247 0,00643930724040589 0,00666819256885634 0,00137580725669561 0,00132547187854527 279189 292050 667 665 0 True 358 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 404 561 0,00638625525872907 0,00627008124568689 0,0064087891966125 0,00628671702143893 0,00144609943698069 0,00134712665614542 279155 273255 667 665 0 True 402 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 449 560 0,00633123584694263 0,00643536054602058 0,00628671702143893 0,00631723506523232 0,00181551266829687 0,00185419052751116 276750 280458 667 665 0 True 447 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 493 561 0,00654930030979017 0,00650761717752839 0,00651560234988937 0,00654612039368277 0,00202314574054687 0,00206451666534448 286282 283607 667 665 0 True 491 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 537 560 0,00619745059948854 0,00660171830354095 0,00627145799954223 0,00666819256885634 0,00180059705808548 0,00185098960033287 270902 287708 667 665 0 True 535 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 581 559 0,00633690936632851 0,00646282678543463 0,00631723506523232 0,00646982528419928 0,00154932102019113 0,00145971298782833 276998 281655 667 665 0 True 580 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 625 560 0,00619113652146232 0,00667636130839803 0,00617990386816205 0,00642404821850919 0,00161306200273133 0,00216846014854716 270626 290961 667 665 0 True 624 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 669 560 0,00608379719501659 0,00613364493862259 0,00605783169298848 0,00616464484626535 0,00166303636217108 0,00164732243821644 265934 267309 667 665 0 True 668 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 269 600 0,00668480133931661 0,00674295030320135 0,00671396963454643 0,00675974670023652 0,00125776393116226 0,00129294787366403 292205 293863 667 665 0 False 269 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 314 600 0,00648057751851929 0,00641677436897348 0,00657663843747616 0,00646982528419928 0,0014511876055935 0,00141503674017078 283278 279648 667 665 0 False 314 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 360 604 0,00615075845002653 0,00634605511260412 0,00611886778057527 0,00633249408712902 0,00125326620940131 0,00136170427120892 268861 276566 667 665 0 True 358 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 405 605 0,00610303683132112 0,00622464836846063 0,00611886778057527 0,00621042191195544 0,00137478472806644 0,00136722392650939 266775 271275 667 665 0 True 402 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 447 600 0,00624624744162595 0,00610168130328109 0,00630197604333562 0,00617990386816205 0,00173357480895388 0,00177667985483061 273035 265916 667 665 0 False 447 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 491 600 0,0062173994257163 0,0063068176277269 0,00622568093385214 0,0064087891966125 0,00189390759005179 0,00176296861786875 271774 274856 667 665 0 False 491 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 535 600 0,00628406327850037 0,00645183570048949 0,00627145799954223 0,00645456626230259 0,00190097685948559 0,0018509218015426 274688 281176 667 665 0 False 535 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 580 600 0,00637234598539595 0,00614943171616384 0,0063782711528191 0,00613412680247196 0,00157719046059534 0,00161459551088294 278547 267997 667 665 0 False 580 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 624 600 0,00634583143310469 0,00622999476259887 0,00633249408712902 0,00628671702143893 0,00142331481288594 0,00138710544527979 277388 271508 667 665 0 False 624 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 668 600 0,00628289654669118 0,00628703826400517 0,00628671702143893 0,00627145799954223 0,00154055838273401 0,00156948145156266 274637 273994 667 665 0 False 668 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 269 643 0,0590061572555448 0,52070817923729 0,00820935378042268 0,598352025635157 0,136309758830347 0,38398576103308 2579268 22692866 667 665 14 False 269 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 314 644 0,0071002264946721 0,00666353455164577 0,00677500572213321 0,00669871061264973 0,0021863601464881 0,00127670840485365 310364 290402 667 665 0 False 314 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 358 644 0,00599597203000697 0,00609833120223309 0,0059510185397116 0,00607309071488518 0,00125209405503055 0,00116479142780633 262095 265770 667 665 0 False 358 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 402 644 0,00602001585611406 0,0058852097054263 0,00604257267109178 0,00588998245212482 0,00125997962935988 0,00125326340623677 263146 256482 667 665 0 False 402 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 447 644 0,00608192127328416 0,00591861893231591 0,00610360875867857 0,00601205462729839 0,00155781674896179 0,00160059234636384 265852 257938 667 665 0 False 447 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 491 644 0,00599928920868016 0,00612074934417756 0,00605783169298848 0,00610360875867857 0,00162160440188414 0,00166416389717818 262240 266747 667 665 0 False 491 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 535 644 0,00625409428497013 0,00630103526153447 0,00630197604333562 0,00625619897764553 0,00156086967100582 0,00162915521971002 273378 274604 667 665 0 False 535 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 579 644 0,0062543688101017 0,00625821821663337 0,00622568093385214 0,00633249408712902 0,00133580947979312 0,00133071179482134 273390 272738 667 665 0 False 579 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 624 644 0,00670513907614744 0,00631930019601533 0,00669871061264973 0,00634775310902571 0,00140930692612805 0,00128476211859179 293094 275400 667 665 0 False 624 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 668 650 0,00858549896486868 0,754490827664262 0,00834668497749294 0,7796749828336 0,00208595950062363 0,210482656839307 375288 32881295 667 665 15 True 668 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A6_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A6_3.csv new file mode 100755 index 0000000..7992ee3 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A6_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 270 252 0,0010480454439752 0,0760497260546652 0,000839246204318303 0,0757610437170977 0,000807810668276179 0,0214160192428557 45812 3314306 667 665 0 True 269 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 314 252 0,000976279999162698 0,000924949131813282 0,000885023270008392 0,000823987182421607 0,000640121552605377 0,000625459316888028 42675 40310 667 665 0 False 314 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 359 252 0,000951160949623609 0,000948560460432381 0,000839246204318303 0,000854505226215 0,000646107460729003 0,000652111692963289 41577 41339 667 665 0 True 358 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 404 251 0,000835494360853448 0,000899777482158131 0,000701915007248035 0,000778210116731518 0,000634062794406255 0,000655910116527005 36521 39213 667 665 0 True 402 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 448 250 0,00084091623220205 0,000911640511211652 0,000656137941557946 0,000717174029144732 0,000740178179098456 0,000822008174316122 36758 39730 667 665 0 True 447 253 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 491 252 0,000887699890041246 0,000960469381281081 0,00064087891966125 0,000778210116731518 0,00083006247961236 0,000808150830787949 38803 41858 667 665 0 True 491 253 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 536 251 0,000873447460293657 0,000922057948717066 0,000717174029144732 0,000732433051041428 0,000731829928834263 0,000753219796703697 38180 40184 667 665 0 True 535 253 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 580 251 0,000959854245456809 0,000957486414594509 0,000747692072938125 0,000732433051041428 0,000872611370299714 0,000869780765308474 41957 41728 667 665 0 True 580 253 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 624 253 0,00096179879847213 0,000928689313120292 0,000610360875867857 0,000564583810177768 0,000961325521990236 0,000926335919400018 42042 40473 667 665 0 False 624 253 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 667 251 0,0010839167278343 0,0766973510682176 0,000762951094834821 0,0749828336003662 0,000994146292267686 0,0199140611456763 47380 3342530 667 665 0 True 668 253 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 269 296 0,00089179488992057 0,000898974375742515 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000705445770960199 0,000715951267661598 38982 39178 667 665 0 False 269 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 314 296 0,000850341595052783 0,000884174271797599 0,000732433051041428 0,000793469138628214 0,000644033732883312 0,000617306926892699 37170 38533 667 665 0 False 314 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 360 296 0,000914740615501359 0,000878667256376235 0,000778210116731518 0,000778210116731518 0,000683691875152448 0,000633925086367871 39985 38293 667 665 0 True 358 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 404 295 0,000860430393638155 0,000872104729665776 0,000671396963454643 0,000686655985351339 0,0007161509924109 0,000723125848632663 37611 38007 667 665 0 True 402 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 448 295 0,00097495312769342 0,000928758150813059 0,00064087891966125 0,000610360875867857 0,000952891807214943 0,000898726477491311 42617 40476 667 665 0 True 447 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 492 296 0,000898383493078364 0,000833280270945159 0,000686655985351339 0,000579842832074464 0,000879013935174559 0,0008123423642199 39270 36315 667 665 0 True 491 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 535 297 0,000918034917080256 0,000951061563269584 0,000747692072938125 0,000793469138628214 0,000779389454074973 0,000802305412817268 40129 41448 667 665 0 True 535 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 581 296 0,000920825922584599 0,000909758947609353 0,000595101853971161 0,000549324788281071 0,00089553265321974 0,000952597902346181 40251 39648 667 665 0 True 580 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 624 296 0,000934346285314656 0,000955375392016319 0,000549324788281071 0,000549324788281071 0,000996378561207677 0,000986354346966141 40842 41636 667 665 0 False 624 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 668 296 0,000969874412759288 0,000937087511637872 0,000579842832074464 0,000579842832074464 0,00102229015154338 0,00094739909775543 42395 40839 667 665 0 False 668 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 271 340 0,000857273354625045 0,000930983902879194 0,000701915007248035 0,000762951094834821 0,000721711256988276 0,000719043612262906 37473 40573 667 665 0 True 269 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 316 340 0,000929976760303757 0,000849617750028539 0,000839246204318303 0,000762951094834821 0,000672399182851516 0,000617946342137248 40651 37027 667 665 0 True 314 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 360 340 0,000900373800282281 0,000838810232264112 0,000793469138628214 0,000732433051041428 0,000654590843320458 0,000631520357533666 39357 36556 667 665 0 True 358 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 404 340 0,000946059357595178 0,00086336234268436 0,000762951094834821 0,000717174029144732 0,000737011318880549 0,000690597726036803 41354 37626 667 665 0 True 402 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 449 339 0,000882140756126858 0,000923044622313394 0,000610360875867857 0,000595101853971161 0,000806807051228064 0,000914868791103099 38560 40227 667 665 0 True 447 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 491 340 0,000898497878549853 0,000835735481987184 0,000701915007248035 0,000579842832074464 0,000809302878965825 0,000779936971360473 39275 36422 667 665 0 True 491 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 535 340 0,000911423436828164 0,000869947815292408 0,000717174029144732 0,000671396963454643 0,000796911148251458 0,000810440126478776 39840 37913 667 665 0 True 535 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 580 340 0,000888134554832906 0,000894408142122301 0,000610360875867857 0,000488288700694286 0,000945743872270305 0,000994825203568324 38822 38979 667 665 0 True 580 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 625 339 0,000933362570259846 0,0009240771877049 0,000503547722590982 0,000518806744487678 0,00100725265979743 0,00099319898620625 40799 40272 667 665 0 True 624 340 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 669 340 0,000897262515457767 0,00102563573043389 0,000518806744487678 0,000656137941557946 0,000949311149430001 0,00105726550829341 39221 44698 667 665 0 True 668 340 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 271 385 0,000850936399504528 0,000860058133431542 0,000686655985351339 0,000732433051041428 0,000708980672481416 0,000702709167890979 37196 37482 667 665 0 True 269 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 317 384 0,000889758828528057 0,000858658433678612 0,000747692072938125 0,000717174029144732 0,000694043109794765 0,000665963325793156 38893 37421 667 665 0 True 314 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 360 384 0,000905841425819478 0,000877680582779907 0,000793469138628214 0,000732433051041428 0,00067694319056319 0,000726909514096329 39596 38250 667 665 0 True 358 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 404 383 0,000939608017003172 0,000949570079926298 0,000762951094834821 0,000778210116731518 0,00077996737535193 0,000739556999642197 41072 41383 667 665 0 True 402 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 449 383 0,000904423045973008 0,000891172770562249 0,00064087891966125 0,000579842832074464 0,000855023456481027 0,000848352008705563 39534 38838 667 665 0 True 447 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 493 384 0,000891085699997335 0,000915633097392141 0,000595101853971161 0,000579842832074464 0,00084443547265319 0,00091834787993102 38951 39904 667 665 0 True 491 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 536 384 0,000870107404526164 0,000939519776782308 0,00064087891966125 0,000717174029144732 0,000824852808490971 0,000834134532203116 38034 40945 667 665 0 True 535 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 582 384 0,000882621175107113 0,000887937399002198 0,000488288700694286 0,000503547722590982 0,00097748571270757 0,00096404103303725 38581 38697 667 665 0 True 580 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 625 383 0,000861871650578922 0,000821830268048239 0,000488288700694286 0,000381475547417411 0,000965991659469608 0,000936878777025388 37674 35816 667 665 0 True 624 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 669 383 0,000885320672234265 0,00093084622749366 0,000488288700694286 0,000518806744487678 0,000927885833886397 0,0010069765356471 38699 40567 667 665 0 True 668 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 272 429 0,000835768885985023 0,000906959548103493 0,000656137941557946 0,000778210116731518 0,000747992300510594 0,000782199822974092 36533 39526 667 665 0 True 269 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 316 428 0,000937732095270744 0,000959184411016096 0,000839246204318303 0,000854505226215 0,000708338289522656 0,000715812825296732 40990 41802 667 665 0 True 314 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 361 428 0,000940408715303598 0,000902439206278456 0,000854505226215 0,000793469138628214 0,00067860035949789 0,000665360271457366 41107 39329 667 665 0 True 358 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 405 428 0,000906367598988329 0,000957715873570399 0,00064087891966125 0,000717174029144732 0,000798178386187127 0,000852532045771328 39619 41738 667 665 0 True 402 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 449 427 0,000957635167309913 0,000909781893506942 0,000732433051041428 0,000656137941557946 0,000835622790260073 0,000870522191547438 41860 39649 667 665 0 True 447 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 493 428 0,00106520326469862 0,000940667071661759 0,000823987182421607 0,000671396963454643 0,000942658475263194 0,000906417297155301 46562 40995 667 665 0 True 491 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 537 428 0,000950108603285906 0,000970404954937125 0,000717174029144732 0,000778210116731518 0,00088339513803532 0,000805666488146725 41531 42291 667 665 0 True 535 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 581 428 0,000942513407979004 0,000847621456938295 0,00064087891966125 0,000381475547417411 0,000931406939931589 0,000970581708411643 41199 36940 667 665 0 True 580 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 625 427 0,000880859638846176 0,000892228281851344 0,000488288700694286 0,000610360875867857 0,000947783961849952 0,000850097204580022 38504 38884 667 665 0 True 624 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 669 427 0,000881317180732133 0,000868984087593669 0,000488288700694286 0,000442511635004196 0,000942991926637819 0,000937247857093806 38524 37871 667 665 0 True 668 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 271 473 0,000867476538681906 0,000906408846561356 0,000762951094834821 0,000732433051041428 0,000697267759228868 0,000758549259142354 37919 39502 667 665 0 True 269 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 316 473 0,000850410226335676 0,000840967146637479 0,000701915007248035 0,000701915007248035 0,000776847503990649 0,000782658253543213 37173 36650 667 665 0 True 314 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 360 472 0,00096278251352694 0,000930708552108126 0,00080872816052491 0,000793469138628214 0,000778203132249376 0,000794597093253278 42085 40561 667 665 0 True 358 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 404 472 0,000912613045731655 0,000907647925031163 0,000686655985351339 0,000701915007248035 0,000837703376716941 0,00082163741236592 39892 39556 667 665 0 True 402 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 449 472 0,000912590168637357 0,000932039414168289 0,000518806744487678 0,000457770656900893 0,000997158324614043 0,00105558504859954 39891 40619 667 665 0 True 447 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 492 472 0,000949285027891181 0,000983185819894208 0,000610360875867857 0,000579842832074464 0,000992626634130369 0,00100941505030165 41495 42848 667 665 0 True 491 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 537 472 0,000828425338715399 0,000974787621376628 0,000549324788281071 0,00064087891966125 0,000843748521539385 0,000937076107166891 36212 42482 667 665 0 True 535 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 580 472 0,000776974753639431 0,000821141891120569 0,000411993591210803 0,000396734569314107 0,000907440465844707 0,000981970014124707 33963 35786 667 665 0 True 580 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 625 471 0,000940706117529471 0,000891792309797153 0,000518806744487678 0,000518806744487678 0,00097818817660076 0,000915829265412788 41120 38865 667 665 0 True 624 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 669 472 0,000853498634065892 0,000888006236694965 0,000473029678797589 0,000473029678797589 0,000908662082130062 0,000956019954525724 37308 38700 667 665 0 True 668 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 272 517 0,000883787906916306 0,000926279993873445 0,000732433051041428 0,000747692072938125 0,000759125059532576 0,000807228715215927 38632 40368 667 665 0 True 269 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 316 517 0,000891520364788995 0,000864096611407209 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,00074847557091736 0,000779706518098497 38970 37658 667 665 0 True 314 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 359 516 0,000869123689471355 0,000910975080181571 0,000701915007248035 0,00080872816052491 0,000783635465652539 0,000773996109842338 37991 39701 667 665 0 True 358 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 404 516 0,00089385382840738 0,000952071182763501 0,000625619897764553 0,000686655985351339 0,000900593137505256 0,000861332379488168 39072 41492 667 665 0 True 402 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 449 516 0,00100327497043422 0,000884862648725269 0,000701915007248035 0,000518806744487678 0,00100948624248789 0,000962352924334313 43855 38563 667 665 0 True 447 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 493 516 0,00100929164623456 0,000919006144337727 0,000686655985351339 0,000579842832074464 0,000956975937449078 0,0008980283832135 44118 40051 667 665 0 True 491 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 536 516 0,000945350167671943 0,000963796536431488 0,000625619897764553 0,000656137941557946 0,000933052048360615 0,000889260188368238 41323 42003 667 665 0 True 535 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 581 516 0,000911194665885185 0,000867492604250383 0,000579842832074464 0,000564583810177768 0,000914200091511703 0,000863672976060693 39830 37806 667 665 0 True 580 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 624 516 0,000891977906674953 0,000893627981604274 0,000534065766384375 0,000579842832074464 0,000919217421309288 0,000927040624445141 38990 38945 667 665 0 True 624 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 669 516 0,000876238465798001 0,00085122396285977 0,000473029678797589 0,000442511635004196 0,000979429108133709 0,000979246994378097 38302 37097 667 665 0 True 668 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 272 562 0,000880356342771622 0,000899134997025638 0,000701915007248035 0,000778210116731518 0,000700838861189346 0,00067320367072195 38482 39185 667 665 0 True 269 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 316 561 0,000880859638846176 0,000904504337061468 0,000732433051041428 0,000762951094834821 0,000710939777925626 0,000739041555038482 38504 39419 667 665 0 True 314 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 360 561 0,0009153811741417 0,000913774479687431 0,000778210116731518 0,000747692072938125 0,000704603617616696 0,00069537641869972 40013 39823 667 665 0 True 358 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 404 561 0,000851279555918996 0,000821027161632624 0,00064087891966125 0,000564583810177768 0,000781691801377941 0,000740984962455507 37211 35781 667 665 0 True 402 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 449 560 0,000859561064054835 0,000929056447481716 0,000518806744487678 0,000457770656900893 0,000944789892615117 0,00104527098086298 37573 40489 667 665 0 True 447 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 493 561 0,000931280754678738 0,000937431700101708 0,000564583810177768 0,000473029678797589 0,00101229045670646 0,00110456824056552 40708 40854 667 665 0 True 491 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 537 560 0,00089918419137879 0,000887776777719075 0,000488288700694286 0,000488288700694286 0,000963439894531696 0,000962067898383863 39305 38690 667 665 0 True 535 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 581 559 0,000918675475720597 0,00092173670615082 0,00064087891966125 0,000671396963454643 0,000873747353401656 0,000817107491975826 40157 40170 667 665 0 True 580 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 625 560 0,000881934862278177 0,000921048329223149 0,000564583810177768 0,000595101853971161 0,000877315163005432 0,000879712248662899 38551 40140 667 665 0 True 624 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 669 560 0,000846246595173459 0,00089349030621874 0,000549324788281071 0,000564583810177768 0,000854156609536518 0,000898645665358224 36991 38939 667 665 0 True 668 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 269 600 0,000792371038101915 0,000927955044397444 0,000671396963454643 0,00080872816052491 0,000637221916666963 0,000659996416324694 34636 40441 667 665 0 False 269 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 314 600 0,000836638215568343 0,000867263145274493 0,000732433051041428 0,000701915007248035 0,00066983808558213 0,000720761249570273 36571 37796 667 665 0 False 314 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 360 604 0,000866835980041565 0,00087153108222605 0,000747692072938125 0,000762951094834821 0,000676856800745041 0,000736411030462495 37891 37982 667 665 0 True 358 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 405 605 0,000876856147344044 0,000848631076432211 0,000732433051041428 0,000686655985351339 0,000721936347192039 0,000707127677878314 38329 36984 667 665 0 True 402 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 447 600 0,000828493969998292 0,000918730793566659 0,000442511635004196 0,000442511635004196 0,000885165809568339 0,00103664423785148 36215 40039 667 665 0 False 447 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 491 600 0,000878915085830854 0,000917445823301674 0,000442511635004196 0,000488288700694286 0,00100342323648769 0,00106265780002155 38419 39983 667 665 0 False 491 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 535 600 0,000863267153331094 0,000841678469462739 0,0004272526131075 0,000473029678797589 0,000992644197167885 0,000988197607536328 37735 36681 667 665 0 False 535 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 580 600 0,000925904637518732 0,00086430312448551 0,000595101853971161 0,000564583810177768 0,000904822674926683 0,000854553743334259 40473 37667 667 665 0 False 580 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 624 600 0,000903507962201092 0,000783969537026361 0,000686655985351339 0,000579842832074464 0,000784881858268621 0,000686514537790687 39494 34166 667 665 0 False 624 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 668 600 0,00085352151116019 0,000909736001711764 0,00064087891966125 0,000579842832074464 0,00078622322021836 0,000884294783289877 37309 39647 667 665 0 False 668 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 269 643 0,00588078586021706 0,052961793359572 0,00122072175173571 0,0593728542000458 0,0131491479957353 0,0405513258297124 257060 2308116 667 665 0 False 269 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 314 644 0,000928146592759926 0,000942846931932716 0,000762951094834821 0,000854505226215 0,000691170510903596 0,000645362957945619 40571 41090 667 665 0 False 314 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 358 644 0,000964772820730857 0,000931878792885166 0,000854505226215 0,000823987182421607 0,000694792645983178 0,000659507320917886 42172 40612 667 665 0 False 358 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 402 644 0,000885389303517159 0,000881420764086917 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000690816320588922 0,000655382141673243 38702 38413 667 665 0 False 402 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 447 644 0,000892023660863548 0,000827773255523795 0,000717174029144732 0,000564583810177768 0,000780083025771775 0,000826092977433342 38992 36075 667 665 0 False 447 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 491 644 0,000831284975502636 0,000944338415276002 0,000518806744487678 0,000625619897764553 0,000862237917775141 0,000911566975105087 36337 41155 667 665 0 False 491 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 535 644 0,000925584358198562 0,000893444414423562 0,000579842832074464 0,000549324788281071 0,000916290244324679 0,000876684785608919 40459 38937 667 665 0 False 535 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 579 644 0,000883010085710178 0,00088975012491173 0,000671396963454643 0,000762951094834821 0,000792635532322161 0,000672590702014205 38598 38776 667 665 0 False 579 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 624 644 0,00095267083784727 0,00086267396575669 0,000823987182421607 0,000686655985351339 0,000668323300414064 0,000705186506601927 41643 37596 667 665 0 False 624 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 668 650 0,00106305281783462 0,0763738827499052 0,000946059357595178 0,0766308079652094 0,000738261183083786 0,0244518444879749 46468 3328433 667 665 0 True 668 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A7_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A7_1.csv new file mode 100755 index 0000000..d8f544e --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A7_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 264 262 0,0103792454768818 0,0477575261109973 0,0103456168459602 0,0476386663614862 0,00148798489485459 0,00897690763537915 423767 2081310 623 665 0 True 263 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 307 262 0,0107216549891062 0,0104128712717936 0,0106965743495842 0,010452429999237 0,00128575892361861 0,00125187156638977 437747 453801 623 665 0 False 307 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 353 262 0,0109184302409811 0,0675043066581537 0,0109864957656214 0,0671244373235676 0,00130685044426014 0,0114524043149419 445781 2941890 623 665 0 True 351 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 397 262 0,0108005708294772 0,0897264447454181 0,0106965743495842 0,0883039597161822 0,00138844082093819 0,0123891206247483 440969 3910348 623 665 0 True 396 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 441 261 0,0110206387455957 0,0768804593309779 0,0110627908751049 0,0725566491187915 0,00159746013233669 0,0173358878471041 449954 3350510 623 665 0 True 440 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 486 262 0,0107884468875208 0,0732339431779265 0,0108186465247578 0,0764629587243458 0,00155656198861009 0,0270320958323073 440474 3191592 623 665 0 True 484 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 529 262 0,0108234471159163 0,0874526210238345 0,0108491645685512 0,0827496757457847 0,00155903520620309 0,0253187352670797 441903 3811253 623 665 0 True 528 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 573 262 0,0108705957790802 0,0772645736566181 0,0108796826123445 0,0735332265201801 0,00177542678885578 0,0215874511326451 443828 3367250 623 665 0 True 573 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 617 263 0,0103004031149468 0,0104225314946786 0,0103456168459602 0,010452429999237 0,00194225418271599 0,00188878621082139 420548 454222 623 665 0 False 617 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 658 260 0,0106310560773953 0,0482982691335801 0,0105745021744106 0,0480354009308003 0,00175798360789924 0,00779327101372326 434048 2104876 623 665 0 True 661 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 263 305 0,0103779963434681 0,0103915545329334 0,0104219119554437 0,0104676890211337 0,00150846293765205 0,00145659789162107 423716 452872 623 665 0 False 263 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 307 306 0,0104659010458553 0,0106073377538605 0,0105134660868238 0,0105745021744106 0,00139244506755895 0,00119798132187187 427305 462276 623 665 0 False 307 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 353 307 0,0108654522885532 0,117872502267342 0,0108644235904479 0,104905775539788 0,00126811757942109 0,0428171448370137 443618 5136975 623 665 0 True 351 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 397 307 0,0108517852994387 0,0583913434306756 0,0109102006561379 0,0562600137331197 0,00139940830439378 0,0120586606792655 443060 2544740 623 665 0 True 396 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 441 306 0,0108945497492487 0,0867022442808784 0,0108796826123445 0,0804608224612802 0,00167488693385211 0,0252184320607643 444806 3778551 623 665 0 True 440 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 486 308 0,0107983419835822 0,0475534911896358 0,0107728694590677 0,0472266727702754 0,00170646325728031 0,0117174519666196 440878 2072418 623 665 0 True 484 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 530 306 0,0107507524498017 0,0500985813125168 0,0108033875028611 0,0533607995727474 0,00161689406214197 0,0112193889720398 438935 2183335 623 665 0 True 528 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 574 307 0,0106980929039303 0,0614267414932387 0,0106355382619974 0,0623941405355917 0,00179294863034866 0,0143446639003839 436785 2677025 623 665 0 True 573 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 617 306 0,0102988355749767 0,0104373774904187 0,0102235446707866 0,0104219119554437 0,0020057314836869 0,0019721142304302 420484 454869 623 665 0 False 617 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 661 306 0,0103241611426191 0,0103999297855534 0,0102998397802701 0,010406652933547 0,00194962390545173 0,00183684254020424 421518 453237 623 665 0 False 661 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 265 352 0,0106062693516177 0,0588873190070622 0,0106813153276875 0,0571755550469215 0,00151984150974162 0,0142344769404746 433036 2566355 623 665 0 True 263 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 308 352 0,0107112455439921 0,0754386768018696 0,0106965743495842 0,0743572137026017 0,00127499618206518 0,0254661498058643 437322 3287676 623 665 0 True 307 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 353 352 0,0108477439854532 0,046885283705946 0,0108949416342412 0,0447241931792172 0,00140393631464295 0,0122527691584294 442895 2043297 623 665 0 True 351 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 397 351 0,0109876959134111 0,0382892686052508 0,0110475318532082 0,0386968795300221 0,00137136601868898 0,00614452259204473 448609 1668676 623 665 0 True 396 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 443 351 0,0109262679408317 0,0788382950968632 0,0109712367437247 0,075043869687953 0,00174400034070387 0,0155637322465678 446101 3435834 623 665 0 True 440 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 486 351 0,0108910227843159 0,0398575977595626 0,0108949416342412 0,0389105058365759 0,0016805052799849 0,00897116363362786 444662 1737025 623 665 0 True 484 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 530 351 0,0108452947042499 0,0302640327070824 0,0108491645685512 0,0305180437933928 0,00172472165740136 0,00308131945350943 442795 1318930 623 665 0 True 528 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 573 351 0,010684646350124 0,0568824900429146 0,0106813153276875 0,0557869840543221 0,00182531715946695 0,0107988798776076 436236 2478983 623 665 0 True 572 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 618 352 0,0107560673900129 0,0657567929895694 0,010757610437171 0,063782711528191 0,002064887823945 0,0181335665668297 439152 2865732 623 665 0 True 617 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 662 351 0,0105966191836766 0,0706425711796084 0,0106355382619974 0,0683146410315099 0,00189373417165105 0,0212300864520452 432642 3078658 623 665 0 True 661 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 265 396 0,0105918430853301 0,0496709845109455 0,0105745021744106 0,0513466086823835 0,00152100696869417 0,0138416472769454 432447 2164700 623 665 0 True 263 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 310 396 0,0107136948251954 0,0340288808540004 0,0106660563057908 0,0342565041580835 0,00148879038047478 0,00453075970843504 437422 1483005 623 665 0 True 307 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 354 396 0,0111076617067498 0,0964310753996458 0,0110933089188983 0,0911879148546578 0,00143502780759424 0,0266763474304618 453507 4202541 623 665 0 True 351 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 398 396 0,0110447151798244 0,0747532598949881 0,010955977721828 0,0726482032501717 0,00151188471183996 0,019386758012609 450937 3257805 623 665 0 True 395 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 442 396 0,0112986811477969 0,0471122874707942 0,0113679713130388 0,0484473945220111 0,00158299364774683 0,00756972078152851 461306 2053190 623 665 0 True 440 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 486 396 0,0111641666241104 0,0598824825854979 0,0111848630502785 0,0578469520103761 0,00175316384046237 0,0133443826588984 455814 2609725 623 665 0 True 484 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 531 396 0,0110657300125489 0,0457837658921853 0,0110627908751049 0,0466620889600977 0,00165882196338737 0,00648279970121612 451795 1995292 623 665 0 True 528 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 574 396 0,0111625990841403 0,056152076230861 0,011108567940795 0,0544594491493095 0,00187894596914085 0,0101025208709775 455750 2447151 623 665 0 True 572 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 618 396 0,0108239369721569 0,0451712022101489 0,0108491645685512 0,0456855115587091 0,00198606125817091 0,00780936645115454 441923 1968596 623 665 0 True 617 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 662 395 0,0106152337208219 0,0925120078750321 0,0106965743495842 0,0851148241397726 0,00179578649263849 0,0199391464349407 433402 4031745 623 665 0 True 661 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 266 442 0,010636003625426 0,0463725576243194 0,0106355382619974 0,045990691996643 0,00154194180357124 0,00789473859924853 434250 2020952 623 665 0 True 263 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 310 441 0,0107722081531428 0,0587107273792171 0,010757610437171 0,058457312886244 0,00151560690882284 0,00827099538389781 439811 2558659 623 665 0 True 307 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 354 441 0,0112174629830947 0,0393980143767521 0,0111696040283818 0,0390630960555428 0,00151037624711827 0,00628991666595893 457990 1716996 623 665 0 True 351 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 398 440 0,0114255049285049 0,0646586482227542 0,0114900434882124 0,0599069199664302 0,00168579166945071 0,0180209233875526 466484 2817874 623 665 0 True 395 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 443 440 0,0117520430985318 0,106198524464056 0,0116731517509728 0,103791866941329 0,0019294192150591 0,0208201061958907 479816 4628214 623 665 0 True 440 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 486 440 0,0114902394307087 0,0668818532942565 0,011459525444419 0,0650644693675135 0,00187673213689274 0,015189934078519 469127 2914763 623 665 0 True 484 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 531 440 0,0113713268282874 0,0582368716481063 0,0113221942473487 0,0571755550469215 0,001816526132893 0,0103944206674277 464272 2538008 623 665 0 True 528 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 575 440 0,0111788133257063 0,0340747038114857 0,0112001220721752 0,0343633173113603 0,00195170086889259 0,00476359790411618 456412 1485002 623 665 0 True 572 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 619 440 0,0108073063527864 0,0434257995641427 0,0108033875028611 0,0435645075150683 0,00194292685349309 0,00613487245848135 441244 1892530 623 665 0 True 617 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 662 440 0,010641171608765 0,0709675080353665 0,0106355382619974 0,0712138551918822 0,00192733491079495 0,011402431823726 434461 3092819 623 665 0 True 661 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 265 486 0,010621944751319 0,0574508599261945 0,0105745021744106 0,0579385061417563 0,00147541824926081 0,0154876184864386 433676 2503753 623 665 0 True 263 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 310 485 0,0107297866027012 0,0636521264250119 0,0107881284809644 0,060364690623331 0,00155196704603389 0,0136661457195002 438079 2774009 623 665 0 True 307 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 353 484 0,0111606886448017 0,0737458661531375 0,0111848630502785 0,071976806286717 0,00162412188341338 0,0231457021835623 455672 3213902 623 665 0 True 351 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 398 484 0,0115824548680137 0,0964556504559637 0,0115815976195926 0,0893110551613642 0,00172506823549178 0,0291722034385423 472892 4203612 623 665 0 True 395 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 442 484 0,0118374250412796 0,109276716625622 0,0117799649042496 0,102952620737011 0,00224883204137961 0,0408958139847175 483302 4762364 623 665 0 True 440 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 486 484 0,0127885789037777 0,0540157213817331 0,0120851453421836 0,053681239032578 0,00364989921708548 0,0142147370561669 522136 2354047 623 665 0 True 484 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 529 483 0,0114295217496783 0,0487522766632764 0,0115053025101091 0,0493018997482261 0,00189901394338693 0,0118379421798445 466648 2124662 623 665 0 True 528 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 574 484 0,0111851814568349 0,106806085940418 0,0111696040283818 0,10281528953994 0,00187703270102384 0,0216977335469158 456672 4654692 623 665 0 True 572 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 619 485 0,0111839813090453 0,0660148425538555 0,0109712367437247 0,0684672312504769 0,00281746598152638 0,0168901927655606 456623 2876978 623 665 0 True 616 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 662 484 0,0109472582807442 0,0791778484893855 0,0108033875028611 0,0745708400091554 0,00265721956144727 0,0133863733528827 446958 3450632 623 665 0 True 661 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 263 522 0,0144793422112429 0,0433421158756355 0,0110627908751049 0,0482185091935607 0,00953735782335547 0,0251519509694909 591167 1888883 623 665 0 False 263 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 309 529 0,0109535284406247 0,107882019078367 0,0109864957656214 0,0987563897154192 0,0014668830677479 0,0293546708381637 447214 4701582 623 665 0 True 307 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 353 529 0,0112004159859196 0,0640342444575619 0,0112458991378653 0,0643625543602655 0,00157415022719978 0,0172040159938281 457294 2790662 623 665 0 True 351 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 397 528 0,0113471279299986 0,0627489988418058 0,0112764171816587 0,0631876096742199 0,00167420833202291 0,0136842425673487 463284 2734650 623 665 0 True 395 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 441 528 0,0119481815372938 0,0622598152511056 0,0118257419699397 0,0622415503166247 0,00221078939431528 0,010330038884619 487824 2713331 623 665 0 True 439 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 485 529 0,0113092130569711 0,0657545901834008 0,0114290074006256 0,065445944914931 0,00197927784069236 0,0157171225111696 461736 2865636 623 665 0 True 484 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 529 528 0,011606996665671 0,0779561859558487 0,0113374532692454 0,0747539482719158 0,00239987689660142 0,0225685602705447 473894 3397391 623 665 0 True 528 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 574 528 0,0108543325518902 0,061517676085384 0,010955977721828 0,0602731364919509 0,0017417494291997 0,0150007338308224 443164 2680988 623 665 0 True 572 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 618 529 0,0108109802745914 0,0458004475597325 0,0108186465247578 0,0453040360112917 0,00174450542169459 0,0058565103221364 441394 1996019 623 665 0 True 616 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 662 528 0,0107195975928954 0,075683532475042 0,0107270923933776 0,0698710612649729 0,00197506034791534 0,0231369157345475 437663 3298347 623 665 0 True 661 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 262 566 0,0145464280234019 0,0386110389271416 0,0110170138094148 0,0405584802014191 0,0089634533319151 0,0224574576981875 593906 1682699 623 665 0 False 262 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 307 566 0,015427556936297 0,0462806363585778 0,0113374532692454 0,047547112230106 0,0112035297709689 0,0282897367146379 629881 2016946 623 665 0 False 307 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 353 574 0,0110772661270165 0,0552401603688783 0,0110475318532082 0,0539406424048219 0,00143561465765923 0,0121476184776578 452266 2407409 623 665 0 True 351 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 397 573 0,011027447747341 0,0547824356037725 0,0109864957656214 0,0523689631494621 0,0014243132059346 0,0118741428136418 450232 2387461 623 665 0 True 395 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 443 573 0,0118203045656684 0,0913991547878623 0,0113679713130388 0,0876325627527275 0,0033097525301321 0,0227388180251807 482603 3983246 623 665 0 True 439 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 486 573 0,0116249254040794 0,0649406303582256 0,0115053025101091 0,0640421149004349 0,00248726241309863 0,0142666606418042 474626 2830163 623 665 0 True 484 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 531 573 0,0108613619889437 0,0591548222811549 0,0108186465247578 0,0576333257038224 0,00200467185831482 0,00862100735069721 443451 2578013 623 665 0 True 528 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 572 566 0,0124819044043097 0,0320675573116816 0,0112306401159686 0,0372320134279393 0,00476728333019782 0,0147480285913383 509615 1397529 623 665 0 False 572 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 619 573 0,0106453598796227 0,0561820665190098 0,0105745021744106 0,0536659800106813 0,00155726103338767 0,0122269453769551 434632 2448458 623 665 0 True 616 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 663 573 0,0104918634266105 0,0564877058748955 0,0106355382619974 0,0546120393682765 0,00174034294141511 0,00858352047592172 428365 2461778 623 665 0 True 661 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 262 609 0,0116153977001984 0,0100918581645232 0,0102388036926833 0,010101472495613 0,00575953164042264 0,00136010106583986 474237 439811 623 665 0 False 262 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 307 609 0,0119584685183478 0,0104474048476651 0,0106202792401007 0,0103913939116503 0,00593536290574648 0,00142004872361007 488244 455306 623 665 0 False 307 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 351 609 0,0209737827715356 0,0541239571806605 0,0116426337071794 0,0690928511482414 0,0197251447991287 0,0355394464740542 856324 2358764 623 665 0 False 351 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 395 609 0,019617493305196 0,0567360493245015 0,01196307316701 0,0572823682001984 0,0166817786233657 0,0407732351917524 800949 2472601 623 665 0 False 395 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 439 609 0,0139802276876299 0,0108814723923565 0,0112916762035554 0,0109102006561379 0,0115686483413563 0,0019131537304481 570789 474223 623 665 0 False 439 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 484 609 0,0126447326187066 0,0107257615313174 0,011108567940795 0,010757610437171 0,00729278280427424 0,00202180418251129 516263 467437 623 665 0 False 484 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 528 609 0,0122355801936916 0,0106186730272695 0,0108033875028611 0,0104676890211337 0,00691678243734378 0,00206479077585543 499558 462770 623 665 0 False 528 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 572 610 0,0107468825855004 0,0105431810242016 0,0104982070649271 0,0105592431525139 0,00215058760220109 0,00181294654850312 438777 459480 623 665 0 False 572 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 616 610 0,0111923088651366 0,0105306984559132 0,0105592431525139 0,0105592431525139 0,00373872900918122 0,00142947535853347 456963 458936 623 665 0 False 616 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 660 610 0,0109213693784251 0,0103919446131924 0,0105287251087205 0,0103456168459602 0,00288879050390996 0,00163016035902421 445901 452889 623 665 0 False 660 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 262 652 0,0125442631037463 0,0352747054176985 0,0104982070649271 0,0408026245517662 0,00689437904560148 0,0180555818073413 512161 1537299 623 665 0 False 262 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 307 652 0,0101262102357666 0,010208170919402 0,0101319905394064 0,0102845807583734 0,00124847182403076 0,00117305713067754 413436 444880 623 665 0 False 307 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 351 652 0,0151459630763511 0,0103521793726706 0,0106355382619974 0,0103456168459602 0,0150861002016579 0,00124174431914469 618384 451156 623 665 0 False 351 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 395 653 0,0131231507161515 0,010436184303744 0,0106355382619974 0,0104829480430304 0,00977627871940225 0,00136033932566206 535796 454817 623 665 0 False 395 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 439 653 0,0104539730463951 0,0105353335272262 0,0103913939116503 0,0105592431525139 0,0016416419906235 0,0015588307536241 426818 459138 623 665 0 False 439 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 483 653 0,0104020237920727 0,0104284285903589 0,0103913939116503 0,0103913939116503 0,0017679052553597 0,00161311487943929 424697 454479 623 665 0 False 483 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 528 653 0,0103567610754353 0,0104774410276091 0,0102998397802701 0,0104829480430304 0,00180677842926637 0,00186497549143508 422849 456615 623 665 0 False 528 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 572 653 0,0105024443214089 0,0104625032482786 0,0105287251087205 0,0104676890211337 0,00156884551713749 0,00139140811475243 428797 455964 623 665 0 False 572 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 616 653 0,0104317090802569 0,0103128959959982 0,0104371709773404 0,0103608758678569 0,00135885687017016 0,00146269899689642 425909 449444 623 665 0 False 616 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 659 658 0,010442779831296 0,0457652714987285 0,0104676890211337 0,0459449149309529 0,00138700901020148 0,00846108982875555 426361 1994486 623 665 0 True 660 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A7_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A7_2.csv new file mode 100755 index 0000000..fd82206 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A7_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 264 262 0,00855658837661764 0,773057500698416 0,00845349813076982 0,789379720759899 0,00189656120843282 0,175325704760883 349351 33690445 623 665 14 True 263 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 307 262 0,00684338965332996 0,00679506043662601 0,00675974670023652 0,00683604180972 0,00152903962088352 0,00127474195785319 279404 296134 623 665 0 False 307 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 353 262 0,00624025415701191 0,00641291945817852 0,00624093995574884 0,00642404821850919 0,00123376532451126 0,00120039705822279 254779 279480 623 665 0 True 351 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 397 262 0,00639578351342286 0,00636188778194055 0,00642404821850919 0,00633249408712902 0,00124843287939649 0,00123585334502027 261129 277256 623 665 0 True 396 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 441 261 0,00644400986031627 0,00684664281440612 0,00645456626230259 0,00674448767833982 0,00146101858991923 0,00154143472415735 263098 298382 623 665 0 True 440 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 486 262 0,00681605567510089 0,00694549374121961 0,00685130083161669 0,00694285496299687 0,00147499828367967 0,00146120154168971 278288 302690 623 665 0 True 484 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 529 262 0,00684556951360092 0,00711524749158316 0,00685130083161669 0,00712596322575723 0,00141472063133056 0,00162204106426813 279493 310088 623 665 0 True 528 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 573 262 0,00719990702528552 0,00723055062696797 0,00718699931334401 0,0072480354009308 0,00171656696857251 0,00159272079253835 293960 315113 623 665 0 True 573 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 617 263 0,00780365484190441 0,00766778470552669 0,00775158312352178 0,00762951094834821 0,00198760898535792 0,00185030733475735 318610 334168 623 665 0 False 617 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 658 260 0,00947901217060076 0,787657057498404 0,00932326237888151 0,792996108949416 0,00205133850680359 0,155800815848989 387012 34326705 623 665 15 True 661 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 263 305 0,00715628532705436 0,00668085870432547 0,00689707789730678 0,00668345159075303 0,00191236919910844 0,00144908029139956 292179 291157 623 665 0 False 263 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 307 306 0,00642632605002828 0,00615122149617578 0,0063935301747158 0,00614938582436866 0,00129757231377091 0,00114618193859011 262376 268075 623 665 0 False 307 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 353 307 0,0063058704004489 0,00654949344062835 0,00631723506523232 0,00656137941557946 0,00119727063673537 0,00132961074364003 257458 285432 623 665 0 True 351 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 397 307 0,00641768008738056 0,00645924722541075 0,00634775310902571 0,00651560234988937 0,00129632922229227 0,0012403040975117 262023 281499 623 665 0 True 396 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 441 306 0,00666657604326214 0,00689948721655363 0,00669871061264973 0,00694285496299687 0,00155592585734622 0,00167132323700922 272185 300685 623 665 0 True 440 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 486 308 0,00671494934702775 0,00691385134844435 0,00672922865644312 0,00695811398489357 0,00159845958536914 0,00162249348486458 274160 301311 623 665 0 True 484 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 530 306 0,00716671926498051 0,00705567994144207 0,00717174029144732 0,00708018616006714 0,00152436958370918 0,00147279643820437 292605 307492 623 665 0 True 528 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 574 307 0,00721100226913657 0,00730344974360828 0,0072327763790341 0,00727855344472419 0,00167841029191121 0,00162479952027538 294413 318290 623 665 0 True 573 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 617 306 0,00719128555544983 0,00755851634120779 0,00720225833524071 0,00756847486076143 0,00195263922252422 0,00189280130264419 293608 329406 623 665 0 False 617 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 661 306 0,00762831080055858 0,00786982333379799 0,00756847486076143 0,00793469138628214 0,00189725928632063 0,00182038815744472 311451 342973 623 665 0 False 661 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 265 352 0,00641270804653781 0,00640135472579365 0,0063935301747158 0,00645456626230259 0,00134611845534803 0,00148981949672323 261820 278976 623 665 0 True 263 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 308 352 0,0063867456657826 0,00636833557916306 0,0064087891966125 0,00636301213092241 0,00114043041287701 0,00121918786751434 260760 277537 623 665 0 True 307 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 353 352 0,00659393036277161 0,00655734093760379 0,00657663843747616 0,00663767452506294 0,00117520627550006 0,00133063273453367 269219 285774 623 665 0 True 351 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 397 351 0,00665579920596753 0,00681059480929378 0,00665293354695964 0,00689707789730678 0,00130307348355523 0,00124265059344974 271745 296811 623 665 0 True 396 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 443 351 0,00711917871682403 0,00715753678083972 0,00709544518196384 0,00715648126955062 0,00153539787877624 0,00166658871522108 290664 311931 623 665 0 True 440 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 486 351 0,00704790463380735 0,00694333682684624 0,00704966811627375 0,00689707789730678 0,00154232801956907 0,00161415375544865 287754 302596 623 665 0 True 484 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 530 351 0,00698481115000978 0,0070877812521691 0,00700389105058366 0,00704966811627375 0,00166213780817973 0,00153289547600916 285178 308891 623 665 0 True 528 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 573 351 0,00715217053463277 0,00732462880708294 0,00721751735713741 0,00721751735713741 0,00174915421062189 0,0017405405130347 292011 319213 623 665 0 True 572 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 618 352 0,00720693646233906 0,00737072711533928 0,00711070420386053 0,00732433051041428 0,0020464943426062 0,00185746524324098 294247 321222 623 665 0 True 617 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 662 351 0,0069876278233936 0,00693161147317825 0,00708018616006714 0,00701915007248035 0,00181860535080199 0,00178653381841814 285293 302085 623 665 0 True 661 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 265 396 0,00650813204221924 0,00664203424560486 0,00653086137178607 0,00654612039368277 0,00142382466587396 0,00142653858423537 265716 289465 623 665 0 True 263 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 310 396 0,00665276209727541 0,00672312504768444 0,00669871061264973 0,00675974670023652 0,00130397001925523 0,00124192907913182 271621 292999 623 665 0 True 307 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 354 396 0,0067987392569934 0,00697681489142862 0,0068055237659266 0,00703440909437705 0,00135008382922841 0,00136187170250548 277581 304055 623 665 0 True 351 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 398 396 0,00713940977956347 0,00706538605612222 0,00712596322575723 0,00703440909437705 0,00140595465040203 0,00133179947347002 291490 307915 623 665 0 True 395 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 442 396 0,00741556623523803 0,00739461379472944 0,00749217975127794 0,00741588464179446 0,00163833646449981 0,00159323379094795 302765 322263 623 665 0 True 440 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 486 396 0,00729729044592961 0,00733091598302233 0,0072480354009308 0,00727855344472419 0,00170278709177948 0,00169942425857576 297936 319487 623 665 0 True 484 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 531 396 0,00728967318138728 0,00719525983647606 0,00737010757610437 0,00718699931334401 0,00157583826247901 0,00159403773361709 297625 313575 623 665 0 True 528 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 574 396 0,00721448024844529 0,00733623943126298 0,00718699931334401 0,00733958953231098 0,00173825519026436 0,00173819309053516 294555 319719 623 665 0 True 572 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 618 396 0,00680265810691872 0,00665967964085081 0,00685130083161669 0,00669871061264973 0,00183297423332018 0,00191083274017586 277741 290234 623 665 0 True 617 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 662 395 0,00644981465676814 0,00643265293010508 0,0064087891966125 0,00642404821850919 0,0017440085201388 0,00177079128766821 263335 280340 623 665 0 True 661 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 266 442 0,00667140112723269 0,00668526431666256 0,00675974670023652 0,00663767452506294 0,00143421926386262 0,00151550712395394 272382 291349 623 665 0 True 263 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 310 441 0,00673060025391698 0,00669916953060151 0,00677500572213321 0,00668345159075303 0,0014050965423652 0,00143041591731112 274799 291955 623 665 0 True 307 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 354 441 0,0067922486618046 0,0068218382991124 0,00674448767833982 0,00686655985351339 0,00130104607721164 0,00135292941924076 277316 297301 623 665 0 True 351 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 398 440 0,00755436700103029 0,00748460760507357 0,00752269779507134 0,00753795681696803 0,0014977268046168 0,00142605259161623 308432 326185 623 665 0 True 395 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 443 440 0,00767511656435407 0,00774169344166092 0,00770580605783169 0,00784313725490196 0,00177665201653321 0,00187033551158915 313362 337389 623 665 0 True 440 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 486 440 0,00747557362471942 0,00733502329869076 0,00753795681696803 0,00730907148851759 0,00179016038063741 0,00171057225706291 305215 319666 623 665 0 True 484 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 531 440 0,0071393607939394 0,00740090097066883 0,00704966811627375 0,00741588464179446 0,00167478352027312 0,00168395213964997 291488 322537 623 665 0 True 528 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 575 440 0,00677559354962201 0,0067016935793363 0,00674448767833982 0,00671396963454643 0,00176863564310246 0,00181551078052237 276636 292065 623 665 0 True 572 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 619 440 0,00631645129524726 0,00633428386714096 0,00628671702143893 0,00627145799954223 0,00171188379448844 0,00165430577121452 257890 276053 623 665 0 True 617 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 662 440 0,00612668098761386 0,0061979852354622 0,00610360875867857 0,00621042191195544 0,00173142049036444 0,00187582061406277 250142 270113 623 665 0 True 661 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 265 486 0,00656823740294876 0,00676233958666407 0,00646982528419928 0,00674448767833982 0,00133486044757834 0,00150552553701526 268170 294708 623 665 0 True 263 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 310 485 0,00672207675532942 0,00666289206651327 0,00674448767833982 0,00663767452506294 0,00146050232336018 0,00145781342908254 274451 290374 623 665 0 True 307 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 353 484 0,00683770732093826 0,0069848000637896 0,00691233691920348 0,00691233691920348 0,00147099518134784 0,00177316671293258 279172 304403 623 665 0 True 351 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 398 484 0,00725947354415031 0,00713282404913634 0,00718699931334401 0,00715648126955062 0,00159450979982017 0,00157690197090761 296392 310854 623 665 0 True 395 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 442 484 0,0075093247197012 0,00751781031888487 0,00747692072938125 0,00759899290455482 0,00183032314017562 0,00208477066938585 306593 327632 623 665 0 True 440 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 486 484 0,00740167881081519 0,00714576553537655 0,00735484855420768 0,00717174029144732 0,00213912139172081 0,00183081232855809 302198 311418 623 665 0 True 484 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 529 483 0,00648866025665283 0,00657932310749407 0,00643930724040589 0,00651560234988937 0,00164166511568239 0,00159093052090646 264921 286732 623 665 0 True 528 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 574 484 0,00594462591577093 0,00620367581806427 0,00588998245212482 0,00614938582436866 0,00175578724892366 0,00186699848743439 242709 270361 623 665 0 True 572 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 619 485 0,00718846888206601 0,00616742129987363 0,00611886778057527 0,00607309071488518 0,00736804140200485 0,00191587942625263 293493 268781 623 665 0 True 616 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 662 484 0,007103674766807 0,00604539501649523 0,00602731364919509 0,00602731364919509 0,0066201240351604 0,00173906370418457 290031 263463 623 665 0 True 661 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 263 522 0,00658207584174753 0,00671796222072691 0,00657663843747616 0,0068207827878233 0,00139697297014867 0,00141021719910066 268735 292774 623 665 0 False 263 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 309 529 0,00655356620854086 0,00674038036267138 0,00657663843747616 0,0068055237659266 0,00141914258505914 0,00149044059501061 267571 293751 623 665 0 True 307 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 353 529 0,00659290166466622 0,00673287705415978 0,00657663843747616 0,0068055237659266 0,00140010006221662 0,00143651834121395 269177 293424 623 665 0 True 351 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 397 528 0,00676741295040291 0,00675446914379104 0,00677500572213321 0,00671396963454643 0,00157363612406962 0,00153668929870583 276302 294365 623 665 0 True 395 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 441 528 0,00683283325134364 0,0068588041401283 0,00686655985351339 0,00677500572213321 0,00177002030023502 0,00202463169648527 278973 298912 623 665 0 True 439 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 485 529 0,00652706498592092 0,0063615665393743 0,00665293354695964 0,00636301213092241 0,0017941231212003 0,00173051407437615 266489 277242 623 665 0 True 484 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 529 528 0,00633048567654229 0,00642081284694914 0,00631723506523232 0,0064087891966125 0,001865617696436 0,00177554157448405 258463 279824 623 665 0 True 528 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 574 528 0,00626464899779699 0,00614321337791721 0,00627145799954223 0,00613412680247196 0,0016217892052877 0,00168936465293842 255775 267726 623 665 0 True 572 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 618 529 0,00620047783026996 0,00622568093385214 0,00625619897764553 0,00627145799954223 0,00168601437672152 0,0015617473877945 253155 271320 623 665 0 True 616 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 662 528 0,00612374185016988 0,00624119236062232 0,00604257267109178 0,00625619897764553 0,00176875908379077 0,00185963106121874 250022 271996 623 665 0 True 661 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 262 566 0,0067710868722079 0,00667486982505474 0,00675974670023652 0,00671396963454643 0,0013122125005255 0,00128474520010611 276452 290896 623 665 0 False 262 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 307 566 0,0067117407886514 0,0067693839772239 0,00669871061264973 0,00679026474402991 0,00141638153954296 0,00141527362214755 274029 295015 623 665 0 False 307 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 353 574 0,00665758718124595 0,00690701347096283 0,00668345159075303 0,00689707789730678 0,00133673555283747 0,00127559448497153 271818 301013 623 665 0 True 351 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 397 573 0,00638451681988758 0,00659049775961993 0,00646982528419928 0,00656137941557946 0,00140657938594524 0,00130940763365318 260669 287219 623 665 0 True 395 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 443 573 0,00701907659404425 0,00686254432143531 0,00662241550316625 0,0068207827878233 0,00274618827399363 0,00219597163049505 286577 299075 623 665 0 True 439 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 486 573 0,00663164929330277 0,00644125764170096 0,00656137941557946 0,00643930724040589 0,00204651501726927 0,00189528612635646 270759 280715 623 665 0 True 484 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 531 573 0,00660874851405171 0,00640266264195623 0,00659189745937285 0,0064087891966125 0,00181437952170296 0,00177611697138813 269824 279033 623 665 0 True 528 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 572 566 0,00655618693942842 0,0063550957962542 0,00653086137178607 0,00634775310902571 0,0016293032547411 0,001766050235253 267678 276960 623 665 0 False 572 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 619 573 0,0062924483394547 0,00620750778296164 0,00634775310902571 0,00621042191195544 0,00153229734604464 0,00144312131414348 256910 270528 623 665 0 True 616 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 663 573 0,00618872128049401 0,00612742660037597 0,00617990386816205 0,00617990386816205 0,00160010809676162 0,00157773630405915 252675 267038 623 665 0 True 661 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 262 609 0,00711415769035722 0,00707784567851306 0,00712596322575723 0,00704966811627375 0,00128530891037795 0,00132736970469651 290459 308458 623 665 0 False 262 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 307 609 0,00718170886594484 0,00719110662901245 0,00717174029144732 0,00712596322575723 0,00134280632783474 0,00137367865048489 293217 313394 623 665 0 False 307 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 351 609 0,00677289934029835 0,00680329801386047 0,00688181887541009 0,0068055237659266 0,00133961167499585 0,00139175176746837 276526 296493 623 665 0 False 351 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 395 609 0,00620853596542889 0,00626333515179572 0,00619516289005875 0,00630197604333562 0,00132676533783443 0,00123166401770606 253484 272961 623 665 0 False 395 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 439 609 0,00633780902734022 0,00638627927107767 0,0064087891966125 0,0063935301747158 0,00169495252225969 0,00182962114030413 258762 278319 623 665 0 False 439 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 484 609 0,00644023796726315 0,00635314539495913 0,0064087891966125 0,00633249408712902 0,0019148491537944 0,00191429457718821 262944 276875 623 665 0 False 484 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 528 609 0,00644981465676814 0,00624442773218237 0,00646982528419928 0,00616464484626535 0,00183539925430535 0,00190300237489591 263335 272137 623 665 0 False 528 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 572 610 0,00639676322590419 0,00618254264638479 0,0063782711528191 0,00625619897764553 0,00150390610912487 0,00175864060430164 261169 269440 623 665 0 False 572 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 616 610 0,0062124548153542 0,00637003357558465 0,00619516289005875 0,0064087891966125 0,00138156654184407 0,00132826372433619 253644 277611 623 665 0 False 616 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 660 610 0,00639458336563323 0,00633997444974303 0,00636301213092241 0,0063782711528191 0,00156836006962389 0,00167297781390783 261080 276301 623 665 0 False 660 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 262 652 0,0593392255691242 0,540784072793566 0,00872816052491035 0,640451667048142 0,138097349902951 0,382425810094482 2422720 23567789 623 665 14 False 262 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 307 652 0,00729515957128272 0,00725136255608121 0,00715648126955062 0,0072632944228275 0,00171339714307315 0,0013258158013821 297849 316020 623 665 0 False 307 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 351 652 0,00635576225856057 0,00654657931163455 0,00631723506523232 0,00650034332799268 0,0012014653804756 0,00115512365108751 259495 285305 623 665 0 False 351 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 395 653 0,00598508804124981 0,00581513293418944 0,00592050049591821 0,00579842832074464 0,00126792512663473 0,00134184981871596 244361 253428 623 665 0 False 395 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 439 653 0,00604504644510714 0,00625007242298926 0,00593575951781491 0,00621042191195544 0,00146181492485273 0,00145352948298435 246809 272383 623 665 0 False 439 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 483 653 0,00620197189180398 0,00612430595830386 0,00617990386816205 0,00624093995574884 0,0015736183355918 0,00160221320116454 253216 266902 623 665 0 False 483 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 528 653 0,00625695825481856 0,00627171040441571 0,00625619897764553 0,00622568093385214 0,00164156376797043 0,00162204557262858 255461 273326 623 665 0 False 528 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 572 653 0,00636810663582532 0,00631592714906974 0,00643930724040589 0,0064087891966125 0,0015298813151944 0,00142369677942565 259999 275253 623 665 0 False 572 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 616 653 0,00657894076180728 0,00656211368430231 0,00665293354695964 0,00650034332799268 0,0015192707794564 0,00135277356910328 268607 285982 623 665 0 False 616 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 659 658 0,0084282705343756 0,771009510500903 0,00834668497749294 0,781933318074311 0,00169111962027107 0,185954666104192 344112 33601192 623 665 16 True 660 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A7_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A7_3.csv new file mode 100755 index 0000000..4ebd482 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A7_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 264 262 0,00104172828139694 0,0792659148443322 0,000869764248111696 0,0786602578774701 0,000801534956896597 0,0211726042302017 42532 3454470 623 665 0 True 263 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 307 262 0,000905597232116298 0,000950304348649146 0,000732433051041428 0,000885023270008392 0,000684804121864726 0,000614940200557396 36974 41415 623 665 0 False 307 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 353 262 0,000881839204444074 0,000894591709303013 0,000732433051041428 0,000762951094834821 0,000680041513342448 0,000672616554771712 36004 38987 623 665 0 True 351 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 397 262 0,000916839432839546 0,000908680490422669 0,000717174029144732 0,000778210116731518 0,000699496833231188 0,000647851119301051 37433 39601 623 665 0 True 396 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 441 261 0,000927959169502628 0,00098125836449673 0,000701915007248035 0,000747692072938125 0,000772146712236245 0,00086071156046383 37887 42764 623 665 0 True 440 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 486 262 0,000881104420083077 0,000880502928183356 0,000671396963454643 0,00064087891966125 0,00082949393091262 0,000825037910642481 35974 38373 623 665 0 True 484 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 529 262 0,000914194209139958 0,000856226168534176 0,000762951094834821 0,000671396963454643 0,0007832315460758 0,000779930853151909 37325 37315 623 665 0 True 528 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 573 262 0,000942997756091026 0,00098616878658078 0,000732433051041428 0,000717174029144732 0,000855328819940011 0,000893655758700231 38501 42978 623 665 0 True 573 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 617 263 0,00107058081397207 0,00101021608725407 0,000701915007248035 0,00064087891966125 0,00103421963698314 0,00099938114229889 43710 44026 623 665 0 False 617 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 658 260 0,00121778261429173 0,0807061370524044 0,000946059357595178 0,0783398184176394 0,000981925322854304 0,019465888557958 49720 3517236 623 665 0 True 661 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 263 305 0,000947528926317171 0,000886377077966145 0,000762951094834821 0,000686655985351339 0,000785028442593668 0,000726100276257838 38686 38629 623 665 0 False 263 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 307 306 0,000907605642703022 0,000884702027442146 0,00080872816052491 0,000778210116731518 0,000635810882824518 0,000621352716241751 37056 38556 623 665 0 False 307 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 353 307 0,000876695713917097 0,000915036504054827 0,000747692072938125 0,000762951094834821 0,000657896630943833 0,000707723539553073 35794 39878 623 665 0 True 351 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 397 307 0,000946769649144142 0,00104364826004127 0,000778210116731518 0,000900282291905089 0,000725424077027338 0,000719448410056939 38655 45483 623 665 0 True 396 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 441 306 0,000919117264358636 0,00100404364080262 0,000701915007248035 0,000778210116731518 0,000809608679524739 0,000864749477721189 37526 43757 623 665 0 True 440 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 486 308 0,00088477834188806 0,000957624089980043 0,00064087891966125 0,000717174029144732 0,000835059702136617 0,000880002872916923 36124 41734 623 665 0 True 484 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 530 306 0,000849141300379724 0,000918776685361837 0,000656137941557946 0,000762951094834821 0,000757082584520651 0,000776819095351353 34669 40041 623 665 0 True 528 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 574 307 0,000953309229957011 0,000900878885242403 0,000732433051041428 0,000625619897764553 0,00089344700258516 0,000895206660405302 38922 39261 623 665 0 True 573 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 617 306 0,00095428894243834 0,000984126601695358 0,000534065766384375 0,000656137941557946 0,00100937936823777 0,00100726756496159 38962 42889 623 665 0 False 617 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 661 306 0,000968298830921342 0,00111317432973599 0,000625619897764553 0,000854505226215 0,000980774758148684 0,001030955441852 39534 48513 623 665 0 False 661 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 265 352 0,000883651672534532 0,000872380080436844 0,000732433051041428 0,000671396963454643 0,00070519496244061 0,000740639109073676 36078 38019 623 665 0 True 263 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 308 352 0,000887546029647814 0,000948239217866135 0,000732433051041428 0,000823987182421607 0,000684692384200358 0,000680266786504402 36237 41325 623 665 0 True 307 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 353 352 0,00088842777088101 0,000989633617116722 0,000793469138628214 0,000900282291905089 0,000622286862936655 0,000727667782415347 36273 43129 623 665 0 True 351 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 397 351 0,000874540346458174 0,001008265685959 0,000717174029144732 0,000854505226215 0,000689081108044097 0,000718929947543525 35706 43941 623 665 0 True 396 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 443 351 0,000939740212090607 0,000989105861472175 0,000701915007248035 0,000717174029144732 0,000870716831096503 0,000904716015105271 38368 43106 623 665 0 True 440 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 486 351 0,000951692704362819 0,000900878885242403 0,000747692072938125 0,000595101853971161 0,000837803470566917 0,000853079543983248 38856 39261 623 665 0 True 484 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 530 351 0,000969792892455369 0,000944223685788057 0,000762951094834821 0,000671396963454643 0,0008433351907957 0,000897927330448197 39595 41150 623 665 0 True 528 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 573 351 0,000985492784968663 0,000882155032809765 0,000732433051041428 0,000488288700694286 0,00099141851157768 0,000942070111910274 40236 38445 623 665 0 True 572 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 618 352 0,000928400040119226 0,000930043121078044 0,000534065766384375 0,000534065766384375 0,00102856329220618 0,00101365043508031 37905 40532 623 665 0 True 617 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 662 351 0,000983582345630072 0,00104649355134231 0,000579842832074464 0,000671396963454643 0,00103030631762995 0,00105774816312043 40158 45607 623 665 0 True 661 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 265 396 0,00097466696204998 0,000970427900834714 0,000839246204318303 0,00080872816052491 0,000781092824516699 0,000789997151837624 39794 42292 623 665 0 True 263 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 310 396 0,000930065551337485 0,000924031295909722 0,000839246204318303 0,00080872816052491 0,000657908591467853 0,000665416423670518 37973 40270 623 665 0 True 307 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 354 396 0,00087762644077436 0,00100629233876635 0,000717174029144732 0,000885023270008392 0,000695807188811196 0,000704259345006199 35832 43855 623 665 0 True 351 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 398 396 0,000948557624422567 0,000961983810521956 0,000747692072938125 0,000793469138628214 0,000791267217688487 0,000755815914409443 38728 41924 623 665 0 True 395 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 442 396 0,00104812090533761 0,000917583498687208 0,000793469138628214 0,000701915007248035 0,000869074865146016 0,000831822305027788 42793 39989 623 665 0 True 440 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 486 396 0,000979271610712225 0,00101083562648897 0,000717174029144732 0,000717174029144732 0,000844616456468964 0,000934246382600107 39982 44053 623 665 0 True 484 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 531 396 0,000920758282764861 0,000915747826880087 0,000732433051041428 0,000686655985351339 0,000855562175783211 0,000857313712031973 37593 39909 623 665 0 True 528 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 574 396 0,000854554211839066 0,000901383694989362 0,000579842832074464 0,000595101853971161 0,000839583467941756 0,000929385555342414 34890 39283 623 665 0 True 572 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 618 396 0,000941748622677331 0,000817929465458106 0,000595101853971161 0,000473029678797589 0,000983165232265956 0,00090942746287325 38450 35646 623 665 0 True 617 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 662 395 0,000927983662314661 0,00105064675880592 0,000534065766384375 0,000747692072938125 0,000970457558702705 0,000997962039360393 37888 45788 623 665 0 True 661 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 266 442 0,000869445841555264 0,000897987702146187 0,000732433051041428 0,000686655985351339 0,000752831825825773 0,000846889092496504 35498 39135 623 665 0 True 263 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 310 441 0,000863812494787623 0,000947344327860163 0,000701915007248035 0,000839246204318303 0,000776727902979752 0,000744834832864992 35268 41286 623 665 0 True 307 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 354 441 0,000877724412022493 0,000954205151239279 0,000762951094834821 0,00080872816052491 0,000687844343628416 0,000723584991646965 35836 41585 623 665 0 True 351 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 398 440 0,000966559841266984 0,000978527802683638 0,000793469138628214 0,000839246204318303 0,000858146131230817 0,000748893457644875 39463 42645 623 665 0 True 395 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 443 440 0,00106747022684385 0,00106131660118481 0,000823987182421607 0,000747692072938125 0,000982668183637221 0,00100044601508274 43583 46253 623 665 0 True 440 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 486 440 0,00108880346612479 0,000991561072514199 0,000823987182421607 0,000686655985351339 0,000994336739272701 0,000958876234805233 44454 43213 623 665 0 True 484 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 531 440 0,000912357248237467 0,000896358543417367 0,000595101853971161 0,000671396963454643 0,000911727774911259 0,000836899527481059 37250 39064 623 665 0 True 528 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 575 440 0,000896265470731641 0,000844317247685476 0,000579842832074464 0,000442511635004196 0,000907998054259147 0,000960905365663822 36593 36796 623 665 0 True 572 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 619 440 0,000935723390917159 0,000936559755993325 0,000610360875867857 0,000564583810177768 0,00095464623348766 0,000944078062624889 38204 40816 623 665 0 True 617 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 662 440 0,000920611325892662 0,00105461639908882 0,000503547722590982 0,000656137941557946 0,000962999763842711 0,00105768684566337 37587 45961 623 665 0 True 661 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 265 486 0,000864179886968122 0,00089885964625457 0,000717174029144732 0,000762951094834821 0,000730866529689216 0,000727633156159522 35283 39173 623 665 0 True 263 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 310 485 0,000844561144529512 0,00101948622988003 0,000701915007248035 0,000915541313801785 0,000722686762133781 0,000808944711313461 34482 44430 623 665 0 True 307 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 353 484 0,00097307492926782 0,000976026699846435 0,000823987182421607 0,000869764248111696 0,000798035255883625 0,000794912784511782 39729 42536 623 665 0 True 351 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 398 484 0,000991958887345433 0,000978665478069172 0,000823987182421607 0,00080872816052491 0,000841954737629105 0,000805545742413057 40500 42651 623 665 0 True 395 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 442 484 0,000957081123010127 0,000994016283556224 0,000671396963454643 0,000686655985351339 0,00094154923007909 0,00106030773622527 39076 43320 623 665 0 True 440 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 486 484 0,000986619454322191 0,000991193938152775 0,000717174029144732 0,000595101853971161 0,000957108679220764 0,00101596406666628 40282 43197 623 665 0 True 484 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 529 483 0,000825162837399201 0,000922264461795367 0,000534065766384375 0,000625619897764553 0,000865221062277221 0,00084819885709321 33690 40193 623 665 0 True 528 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 574 484 0,000887252115903416 0,000826603014746755 0,000579842832074464 0,0004272526131075 0,000899204109486278 0,000924713587314801 36225 36024 623 665 0 True 572 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 619 485 0,000941650651429198 0,000825019747813113 0,000610360875867857 0,000503547722590982 0,00100516794487944 0,00084258153296775 38446 35955 623 665 0 True 616 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 662 484 0,00100944675513715 0,000936192621631901 0,000671396963454643 0,000564583810177768 0,00106197540517161 0,000945617722685191 41214 40800 623 665 0 True 661 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 263 522 0,000849459706936156 0,000923021676415805 0,000686655985351339 0,000732433051041428 0,000712437761029843 0,000771443419304476 34682 40226 623 665 0 False 263 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 309 529 0,000897073733528737 0,000883302327689216 0,000732433051041428 0,000747692072938125 0,000768803361958344 0,000757996716843918 36626 38495 623 665 0 True 307 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 353 529 0,000958232285175689 0,000915105341747594 0,000854505226215 0,000793469138628214 0,000762559725910872 0,000760935263611675 39123 39881 623 665 0 True 351 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 397 528 0,000916570011907181 0,000904642012447002 0,000717174029144732 0,000686655985351339 0,00082374429779394 0,000808218582501745 37422 39425 623 665 0 True 395 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 441 528 0,000910446808898875 0,000974466378810381 0,000518806744487678 0,000671396963454643 0,000945938970801725 0,00104004884725013 37172 42468 623 665 0 True 439 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 485 529 0,000928130619186861 0,000997894140248768 0,000595101853971161 0,00064087891966125 0,000972834679368786 0,000985393503870611 37894 43489 623 665 0 True 484 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 529 528 0,000872727878367716 0,000947849137607122 0,000503547722590982 0,000579842832074464 0,00091929723620726 0,000959615569857035 35632 41308 623 665 0 True 528 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 574 528 0,000889162555242007 0,000822105618819307 0,000625619897764553 0,000579842832074464 0,000820872330690199 0,000809760259715982 36303 35828 623 665 0 True 572 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 618 529 0,000851296667838648 0,000949661863516654 0,000473029678797589 0,000656137941557946 0,000921873961555019 0,000922161351920735 34757 41387 623 665 0 True 616 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 662 528 0,000905523753680198 0,000949088216076928 0,000473029678797589 0,000488288700694286 0,000989390435979207 0,00105377114074691 36971 41362 623 665 0 True 661 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 262 566 0,00086013857298264 0,000950832104293694 0,000732433051041428 0,000823987182421607 0,000656030303419013 0,000653574182768399 35118 41438 623 665 0 False 262 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 307 566 0,000964330995371961 0,000918409551000412 0,000869764248111696 0,000778210116731518 0,000747199984345358 0,000691091254074257 39372 40025 623 665 0 False 307 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 353 574 0,000857419870846953 0,000958312466907713 0,000732433051041428 0,00080872816052491 0,000660972913885084 0,000734866340031015 35007 41764 623 665 0 True 351 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 397 573 0,000955905468032533 0,000924627889247036 0,000762951094834821 0,000778210116731518 0,000802798013731133 0,000703163497186864 39028 40296 623 665 0 True 395 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 443 573 0,00100567486208404 0,00104025226719809 0,000671396963454643 0,000701915007248035 0,000969911858861449 0,00106532502281811 41060 45335 623 665 0 True 439 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 486 573 0,000909638546101779 0,000955926093558456 0,000488288700694286 0,000579842832074464 0,00103960553877039 0,00101364673781457 37139 41660 623 665 0 True 484 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 531 573 0,000867412938156507 0,000833211433252392 0,000488288700694286 0,000442511635004196 0,000956243565688637 0,000913992108485442 35415 36312 623 665 0 True 528 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 572 566 0,000894869380445747 0,000844753219739667 0,00064087891966125 0,000488288700694286 0,0008236615912805 0,000888595892790694 36536 36815 623 665 0 False 572 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 619 573 0,000882916888173535 0,000975521890099476 0,000610360875867857 0,000747692072938125 0,000803965100182163 0,000825577162688274 36048 42514 623 665 0 True 616 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 663 573 0,000896191992295541 0,000998238328712603 0,000625619897764553 0,000762951094834821 0,000834040978184848 0,000879449238399235 36590 43504 623 665 0 True 661 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 262 609 0,000908952747364849 0,000991721693797322 0,000747692072938125 0,000869764248111696 0,000671885765232136 0,000708972543100123 37111 43220 623 665 0 False 262 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 307 609 0,000869984683419995 0,000953149639950184 0,000701915007248035 0,000823987182421607 0,000736416300950513 0,0007097614026237 35520 41539 623 665 0 False 307 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 351 609 0,000903613314341607 0,000903242312694072 0,000762951094834821 0,000762951094834821 0,000703311920215572 0,000770448763720707 36893 39364 623 665 0 False 351 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 395 609 0,000962298091973203 0,000941263664999074 0,000793469138628214 0,000854505226215 0,000747525711192943 0,000662221436474214 39289 41021 623 665 0 False 395 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 439 609 0,000887790957768146 0,000840577066378466 0,000518806744487678 0,0004272526131075 0,000902760025775748 0,000962553012248713 36247 36633 623 665 0 False 439 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 484 609 0,000872629907119583 0,000957394631004153 0,000457770656900893 0,000503547722590982 0,000981576262945594 0,0010477140117652 35628 41724 623 665 0 False 484 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 528 609 0,00091086318670344 0,00081409750056074 0,000488288700694286 0,000274662394140536 0,00102000437544091 0,000989678690422228 37189 35479 623 665 0 False 528 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 572 610 0,000910079416718377 0,000904963255013248 0,000671396963454643 0,000595101853971161 0,000862616531816954 0,000905413078937771 37157 39439 623 665 0 False 572 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 616 610 0,000802555971892539 0,000854528172112589 0,000610360875867857 0,000686655985351339 0,000724330111491471 0,000682024671695688 32767 37241 623 665 0 False 616 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 660 610 0,000970282748696033 0,000960882407437683 0,000778210116731518 0,000732433051041428 0,000786332000657934 0,000846828211201288 39615 41876 623 665 0 False 660 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 262 652 0,0059446014229589 0,0562455807635362 0,00105287251087205 0,064286259250782 0,0138370210798904 0,0413003249332076 242708 2451226 623 665 0 False 262 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 307 652 0,00100768327267076 0,000978596640376405 0,000869764248111696 0,000885023270008392 0,000700273420446602 0,000686834775601638 41142 42648 623 665 0 False 307 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 351 652 0,000987868587735886 0,000931695225704453 0,000885023270008392 0,00080872816052491 0,00066590758086741 0,000634158426418689 40333 40604 623 665 0 False 351 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 395 653 0,000872703385555683 0,000933920977770588 0,000717174029144732 0,000839246204318303 0,000667818962095484 0,000635356906776695 35631 40701 623 665 0 False 395 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 439 653 0,000856660593673923 0,000896886299061914 0,000671396963454643 0,000732433051041428 0,000767474627971111 0,000778739505861551 34976 39087 623 665 0 False 439 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 483 653 0,000938515571488946 0,000903494717567551 0,000671396963454643 0,000671396963454643 0,000901512056039512 0,00081219412033325 38318 39375 623 665 0 False 483 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 528 653 0,000835425325641121 0,000818617842385777 0,000488288700694286 0,000503547722590982 0,000872648743997853 0,000777158542663659 34109 35676 623 665 0 False 528 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 572 653 0,000874760781766473 0,000907372574260095 0,000656137941557946 0,000778210116731518 0,000790701617401052 0,000701988684541163 35715 39544 623 665 0 False 572 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 616 653 0,000881667754759841 0,000895601328796929 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000686667925001972 0,000694799488190857 35997 39031 623 665 0 False 616 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 659 658 0,00107520995544635 0,0793913371205537 0,000961318379491875 0,0775310902571145 0,000733402665812162 0,0225485926975543 43899 3459936 623 665 0 True 660 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A8_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A8_1.csv new file mode 100755 index 0000000..935b460 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A8_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 236 239 0,0109330548733415 0,0471963153477652 0,0108644235904479 0,0466315709163043 0,00181395919836599 0,00777902529010258 477904 2056852 667 665 0 True 235 239 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 279 239 0,0107329260524235 0,0105603904473934 0,0107423514152743 0,0105439841306172 0,00154762126838485 0,00154588981352576 469156 460230 667 665 0 False 279 239 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 324 239 0,0107250792090794 0,0679059975413471 0,0106813153276875 0,0670634012359808 0,00138901430880625 0,00930921263906418 468813 2959396 667 665 0 True 323 239 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 369 238 0,0109235380021136 0,0866670223280793 0,0109254596780346 0,0871747920958267 0,00132939616663982 0,0133382773979646 477488 3777016 667 665 0 True 368 239 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 413 238 0,0110244259879673 0,0747440356441573 0,0110475318532082 0,0709086747539483 0,00153015171099536 0,0135433045611162 481898 3257403 667 665 0 True 412 239 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 456 239 0,010851223507038 0,0734078960275489 0,0108186465247578 0,0749980926222629 0,00166994558842314 0,0230483383558457 474327 3199173 667 665 0 True 456 239 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 501 239 0,0110968548685145 0,0859543227489644 0,0111238269626917 0,0803082322423133 0,00167258001520769 0,0268608700900373 485064 3745956 667 665 0 True 501 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 544 238 0,0112138254516596 0,0748346031019412 0,0112458991378653 0,0710612649729152 0,00154994342504519 0,0233177787055576 490177 3261350 667 665 0 True 545 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 589 240 0,0109328261023986 0,0108764013489893 0,0109102006561379 0,0108339055466545 0,00189414709850971 0,0019434635677761 477894 474002 667 665 0 False 589 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 632 238 0,0108194243459639 0,0473895427513623 0,0108186465247578 0,0470283054856184 0,0018009901121254 0,00806572825115759 472937 2065273 667 665 0 True 634 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 235 283 0,0106630136522492 0,0106085079946375 0,0107118333714809 0,0106355382619974 0,00151013741611094 0,00163259291632535 466100 462327 667 665 0 False 235 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 279 283 0,0105449220914834 0,0106141297395469 0,0105592431525139 0,0106355382619974 0,00140617401405887 0,00144290672975901 460938 462572 667 665 0 False 279 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 324 283 0,0107985146817756 0,115250405712152 0,0108339055466545 0,111146715495537 0,00126777240097545 0,0267891349929813 472023 5022702 667 665 0 True 323 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 369 284 0,0107200920025224 0,056635523347164 0,0107270923933776 0,054886701762417 0,00136459119101426 0,00835562400134945 468595 2468220 667 665 0 True 368 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 413 283 0,0108835717183752 0,0853648655858002 0,0108644235904479 0,0806134126802472 0,00151487639342019 0,0176118167042744 475741 3720267 667 665 0 True 412 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 457 284 0,0109186194268396 0,0489189097715679 0,010955977721828 0,04785229266804 0,00170604130290503 0,0123863188046133 477273 2131924 667 665 0 True 456 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 500 284 0,0108368338147246 0,0509072635812466 0,0108186465247578 0,0534981307698177 0,00181277747786923 0,0123341353705535 473698 2218578 667 665 0 True 501 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 545 283 0,0107916744305805 0,0590761866901174 0,0108186465247578 0,0597695887693599 0,00153208922241556 0,01344822332409 471724 2574586 667 665 0 True 545 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 589 283 0,0105698352471739 0,0104727830103985 0,010605020218204 0,0104982070649271 0,00186830523867871 0,00196172903201624 462027 456412 667 665 0 False 589 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 634 283 0,0105076781819665 0,0103764102405246 0,0105745021744106 0,0104829480430304 0,00191605696286151 0,00183540815359162 459310 452212 667 665 0 False 634 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 236 328 0,0108101819998675 0,0567996553526182 0,0107423514152743 0,0544899671931029 0,00154709779415263 0,0113754593304002 472533 2475373 667 665 0 True 234 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 280 328 0,0107436554096493 0,0735641805360276 0,0107423514152743 0,0730754558632792 0,00144787450509422 0,0241811026101592 469625 3205984 667 665 0 True 279 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 325 328 0,0106818872550449 0,0436326797768053 0,0106507972838941 0,0443884946974899 0,00131662331848576 0,00768714978179748 466925 1901546 667 665 0 True 323 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 369 328 0,0108403568872465 0,0394119195906911 0,0108644235904479 0,0396734569314107 0,00130157240707233 0,00636878332317703 473852 1717602 667 665 0 True 367 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 414 327 0,0109242243149426 0,0755191480647143 0,0108796826123445 0,0715495536736095 0,00156812691779274 0,0136859693558625 477518 3291183 667 665 0 True 412 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 458 327 0,0108203394297358 0,0390628895424645 0,0108796826123445 0,0385442893110552 0,00170419107125273 0,00877865327914813 472977 1702391 667 665 0 True 456 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 502 327 0,0106822532885537 0,032849232258949 0,0106507972838941 0,0330663004501411 0,00166836018397482 0,00425213240388484 466941 1431595 667 665 0 True 500 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 545 327 0,0105426801362422 0,0555293016243975 0,0106202792401007 0,0542763408865492 0,00159092204449068 0,0103403819030912 460840 2420010 667 665 0 True 545 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 589 327 0,0106661249370737 0,0636054315234183 0,0106660563057908 0,0630197604333562 0,00186173858389926 0,0145494415305561 466236 2771974 667 665 0 True 589 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 633 327 0,0105190938520211 0,0699655295253469 0,0105287251087205 0,0687418936446174 0,00199618580242504 0,0208698241326399 459809 3049152 667 665 0 True 633 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 237 372 0,0107865728385521 0,0475231108212279 0,010757610437171 0,0496528572518502 0,00165834225725057 0,0106065617355884 471501 2071094 667 665 0 True 234 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 281 371 0,0108646523613908 0,035522406382172 0,0108491645685512 0,0344853894865339 0,00142137623714394 0,00609967585496687 474914 1548094 667 665 0 True 279 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 325 372 0,0108979614106886 0,092939627622501 0,0109407186999313 0,0872510872053101 0,00147478949258838 0,0227442896814763 476370 4050381 667 665 0 True 323 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 369 372 0,010935777247563 0,0719023239031431 0,0108949416342412 0,0690470740825513 0,00144587898507204 0,0195276909579591 478023 3133559 667 665 0 True 367 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 413 372 0,0109257342031662 0,0485372965487649 0,0110322728313115 0,0483710994125277 0,0015239036859029 0,00999462699390201 477584 2115293 667 665 0 True 412 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 457 372 0,0109821033635162 0,0580573429453698 0,0110933089188983 0,0569619287403677 0,00186830739901152 0,0111425904522383 480048 2530184 667 665 0 True 456 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 502 372 0,0109339242029249 0,0456729830986255 0,0108796826123445 0,045288776989395 0,00173787722570905 0,0068275062847696 477942 1990464 667 665 0 True 500 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 546 372 0,0108974352375197 0,0561220400509169 0,0109102006561379 0,0540627145799954 0,00167547774343376 0,0107834898779972 476347 2445842 667 665 0 True 545 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 589 372 0,010806224262554 0,0519221835775064 0,0107881284809644 0,0482795452811475 0,00200684877494959 0,0148206218864258 472360 2262809 667 665 0 True 589 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 633 371 0,0105885715874038 0,0904144774846248 0,0105745021744106 0,0829175249866484 0,00203663838700212 0,0202894631580719 462846 3940333 667 665 0 True 633 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 237 416 0,0106955677574351 0,0462130606901782 0,0107423514152743 0,0453955901426719 0,00156596426118737 0,00829673654621288 467523 2014001 667 665 0 True 234 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 281 416 0,0108560734510291 0,0592868759217797 0,0109254596780346 0,0585030899519341 0,00153235490120631 0,00833376737320178 474539 2583768 667 665 0 True 279 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 325 416 0,0109723577213453 0,0383830255427996 0,0109254596780346 0,0381780727855345 0,00135390256252787 0,00560632508074252 479622 1672762 667 665 0 True 323 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 369 416 0,0110985706505868 0,0619757220930559 0,011108567940795 0,0578927290760662 0,00135317802140181 0,0163363509868848 485139 2700950 667 665 0 True 367 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 413 415 0,0113824525137294 0,10216878887537 0,0113374532692454 0,0997024490730144 0,00165833859447252 0,0182587020978607 497548 4452595 667 665 0 True 412 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 458 416 0,0113202496943334 0,0673993750684792 0,0112153810940719 0,0653543907835508 0,00170279723589448 0,016001179210151 494829 2937317 667 665 0 True 456 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 501 416 0,011261775841308 0,0573669926705067 0,011261158159762 0,05468833447776 0,0017169280032169 0,0105359630965818 492273 2500098 667 665 0 True 500 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 545 416 0,0110496136687893 0,0336492180324925 0,0110627908751049 0,0342412451361868 0,00171363115789432 0,00446010820869911 482999 1466459 667 665 0 True 545 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 590 416 0,0109624748166086 0,0437061754867829 0,0109712367437247 0,0432593270771344 0,00205778348218431 0,00705432130203869 479190 1904749 667 665 0 True 589 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 634 415 0,0106738802720407 0,0758953231097887 0,0106965743495842 0,0747844663157092 0,00180074745960627 0,0149906125018171 466575 3307577 667 665 0 True 633 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 235 460 0,0107935045981244 0,0574261701403887 0,010757610437171 0,0569924467841611 0,00156525467481096 0,019144933293913 471804 2502677 667 665 0 True 234 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 281 461 0,0108935461314891 0,0598705048269564 0,0109712367437247 0,0579232471198596 0,00164420820085083 0,00949131236984499 476177 2609203 667 665 0 True 279 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 324 460 0,0110904035279225 0,0749894649647694 0,0110322728313115 0,0726634622720684 0,00162996219208023 0,0202423366818214 484782 3268099 667 665 0 True 323 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 369 460 0,0113729813966901 0,0987908315077004 0,0113527122911421 0,0920271610589761 0,00138136159090592 0,0267369559670529 497134 4305381 667 665 0 True 367 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 413 459 0,0115251369508654 0,101571667782411 0,0115358205539025 0,0947432669565881 0,00187788321346867 0,0352808876622627 503785 4426572 667 665 0 True 412 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 457 460 0,011512668934473 0,0582487576230574 0,0115053025101091 0,0556954299229419 0,0020164628081417 0,0155243841982789 503240 2538526 667 665 0 True 456 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 501 460 0,0112900519298602 0,0487684535210767 0,0112916762035554 0,0497138933394369 0,00180135671723456 0,00965190423011628 493509 2125367 667 665 0 True 500 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 545 459 0,0112090898931399 0,105000220854264 0,0111543450064851 0,100343327992676 0,00183502103238289 0,020638084429027 489970 4575991 667 665 0 True 545 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 589 459 0,011116940957308 0,0811709291539676 0,0110475318532082 0,0800488288700694 0,00192366043310685 0,0273484038690465 485942 3537492 667 665 0 True 589 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 634 460 0,0108556616633318 0,0783223336436766 0,0108491645685512 0,0741588464179446 0,00185594340921083 0,0129376933199996 474521 3413348 667 665 0 True 633 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 236 505 0,0107613394035415 0,0539794209717473 0,0107270923933776 0,0568551155870909 0,00141612892063823 0,0129498780577597 470398 2352465 667 665 0 True 234 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 280 504 0,0109595236714442 0,105079430092742 0,0110322728313115 0,0986495765621424 0,00147898436505964 0,0304502101950444 479061 4579443 667 665 0 True 279 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 324 504 0,0113269298058684 0,0588415878331673 0,0113679713130388 0,0610818646524758 0,00155087665644144 0,0142679846629972 495121 2564362 667 665 0 True 323 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 368 503 0,011313615336987 0,0627454192817819 0,0113984893568322 0,0609140154116121 0,00160320500889388 0,0137407445479588 494539 2734494 667 665 0 True 367 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 413 504 0,0113087196388073 0,0614562269716406 0,0113374532692454 0,0607309071488518 0,00176818214766296 0,00961342376756377 494325 2678310 667 665 0 True 412 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 457 504 0,011314072878873 0,0640229321300505 0,0112916762035554 0,0645609216449226 0,00193325816563758 0,0138828970921853 494559 2790169 667 665 0 True 456 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 501 504 0,0113897045526218 0,0788120908818166 0,0113527122911421 0,072831311512932 0,00191223886642753 0,0243546451201862 497865 3434692 667 665 0 True 500 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 545 504 0,0109709393414989 0,0605148944689487 0,0109254596780346 0,060013733119707 0,00176866556061338 0,0154796792261829 479560 2637286 667 665 0 True 544 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 590 504 0,0106782497970516 0,0478575243326903 0,0107270923933776 0,0459754329747463 0,00180227655467498 0,00834606060819213 466766 2085668 667 665 0 True 589 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 633 503 0,0107377302422261 0,0692149003775174 0,010757610437171 0,0685740444037537 0,00189761919460048 0,0184029958361458 469366 3016439 667 665 0 True 633 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 235 549 0,0106765568920735 0,0475165941863127 0,0106660563057908 0,0485084306095979 0,00142844373232277 0,0122104707834495 466692 2070810 667 665 0 True 234 543 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 281 549 0,0105938333190923 0,0601509266413918 0,0107118333714809 0,056900892652781 0,00145590740640436 0,018409914936518 463076 2621424 667 665 0 True 278 543 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 325 549 0,010792246357938 0,0524183656669713 0,0108033875028611 0,0512550545510033 0,00148889039221204 0,0106360831136902 471749 2284433 667 665 0 True 323 543 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 369 549 0,011121928163865 0,0528398129679888 0,0111543450064851 0,0507820248722057 0,00149547923122302 0,00849466112711018 486160 2302800 667 665 0 True 367 543 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 413 548 0,0112443892496416 0,0921739459658531 0,0112153810940719 0,0862897688258183 0,00171607137029411 0,0244289754549559 491513 4017012 667 665 0 True 411 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 457 549 0,0113760926815146 0,0631928183929726 0,0114137483787289 0,0628213931486992 0,00203564368435398 0,012814468157178 497270 2753992 667 665 0 True 456 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 502 549 0,0108724534505464 0,0576710717053563 0,0108186465247578 0,0571297779812314 0,00196333221174837 0,00809866246437446 475255 2513350 667 665 0 True 500 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 546 548 0,0105070605004204 0,0394400283152376 0,0105745021744106 0,0404669260700389 0,0018206267737252 0,00832759468671402 459283 1718827 667 665 0 True 544 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 590 548 0,0104540771500265 0,0506625455834597 0,0104982070649271 0,0501716639963378 0,00166793430670116 0,00737404848512124 456967 2207913 667 665 0 True 589 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 634 548 0,0104756502499494 0,0551996838055312 0,010452429999237 0,0536202029449912 0,00184819220078603 0,00908393024653894 457910 2405645 667 665 0 True 633 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 234 587 0,0105187506956066 0,010165399766296 0,0102845807583734 0,0101472495613031 0,00221407748119539 0,00127657087615406 459794 443016 667 665 0 False 234 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 278 587 0,0105986146318006 0,0103976810875897 0,010406652933547 0,0103913939116503 0,00198247429304038 0,00142009017345385 463285 453139 667 665 0 False 278 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 325 593 0,0106670628979399 0,0790853535762042 0,0106507972838941 0,075745784695201 0,00145746706232343 0,0133813711838199 466277 3446601 667 665 0 True 323 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 369 592 0,0109473073030891 0,0770896341333994 0,0109254596780346 0,0735790035858701 0,00136996805305435 0,0252694530107546 478527 3359626 667 665 0 True 367 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 411 587 0,0111660352016713 0,0109949857477294 0,010955977721828 0,0109864957656214 0,00208589573211281 0,00154668277384562 488088 479170 667 665 0 False 411 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 456 587 0,0110212689489542 0,0108849142769948 0,0109102006561379 0,0108339055466545 0,00237117945533336 0,0018837848638153 481760 474373 667 665 0 False 456 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 500 587 0,0108114173629596 0,0106895070131268 0,0106660563057908 0,0107270923933776 0,00209604536372625 0,00215556948021986 472587 465857 667 665 0 False 500 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 544 587 0,0104115257546324 0,0105185141842934 0,010452429999237 0,0105897611963073 0,0019918758878698 0,00184710972389656 455107 458405 667 665 0 False 544 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 589 587 0,0103882597497315 0,0104744580609225 0,0103608758678569 0,010406652933547 0,00169678084942223 0,0016911900065484 454090 456485 667 665 0 False 589 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 633 587 0,0103910507552358 0,0103072283592937 0,0103761348897536 0,0104219119554437 0,00158406401195306 0,00148437219289678 454212 449197 667 665 0 False 633 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 235 636 0,0102920158140202 0,043375869290989 0,0103150988021668 0,0440680552376593 0,00137334204634006 0,0100616328806881 449883 1890354 667 665 0 True 234 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 278 630 0,0101474097009632 0,0103233134335037 0,0101625085831998 0,0103608758678569 0,00137122538324735 0,00135657384384857 443562 449898 667 665 0 False 278 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 323 630 0,0115408763917423 0,0102539250391945 0,0105439841306172 0,0102845807583734 0,00569363378284306 0,00126307288768272 504473 446874 667 665 0 False 323 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 367 630 0,0112381438028983 0,0103386412930931 0,0105592431525139 0,0103456168459602 0,00410881647981507 0,00125588485731502 491240 450566 667 665 0 False 367 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 411 630 0,0106634940712294 0,0104886386256325 0,0106202792401007 0,0105134660868238 0,00155360124038848 0,00140226302166685 466121 457103 667 665 0 False 411 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 456 631 0,0104440112285354 0,0102275372569671 0,0103761348897536 0,0102235446707866 0,00185799168356947 0,00173185250881548 456527 445724 667 665 0 False 456 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 500 631 0,010462175641408 0,0102674401728744 0,0104219119554437 0,0103303578240635 0,00187513390389627 0,00191575066405962 457321 447463 667 665 0 False 500 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 544 631 0,0103500321251597 0,0103708573333081 0,0103303578240635 0,0104219119554437 0,00207172695594736 0,00188142926746241 452419 451970 667 665 0 False 544 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 589 631 0,0104023977940076 0,0103582600355317 0,010452429999237 0,0103303578240635 0,00156709483288275 0,00132483555046084 454708 451421 667 665 0 False 589 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 633 636 0,0103159452546558 0,0460464275818867 0,0103761348897536 0,0460517280842298 0,00138497714543519 0,00791739022033162 450929 2006739 667 665 0 True 633 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A8_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A8_2.csv new file mode 100755 index 0000000..d1f074d --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A8_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 236 239 0,00858938807089932 0,750783344261317 0,0085297932402533 0,742519264515145 0,00192636203005003 0,167671055402309 375458 32719720 667 665 11 True 235 239 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 279 239 0,00685210152991712 0,00641971144386487 0,00668345159075303 0,00643930724040589 0,00168032481654572 0,00140557472456351 299518 279776 667 665 0 False 279 239 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 324 239 0,0062510973856171 0,00614917931129036 0,00627145799954223 0,00619516289005875 0,00128177669151342 0,00117399754436927 273247 267986 667 665 0 True 323 239 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 369 238 0,00660303860429593 0,00624571270244735 0,00659189745937285 0,00622568093385214 0,00129153393570386 0,00110485088193164 288631 272193 667 665 0 True 368 239 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 413 238 0,00679243806798821 0,00674109168549664 0,0068207827878233 0,00677500572213321 0,0014345689596918 0,00141823041028707 296910 293782 667 665 0 True 412 239 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 456 239 0,00705174993185486 0,00697458913936248 0,00698863202868696 0,00700389105058366 0,00154168068148417 0,00144790467556079 308245 303958 667 665 0 True 456 239 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 501 239 0,00726450690882529 0,00728488651245876 0,00727855344472419 0,00737010757610437 0,00163006455688569 0,00147680541731397 317545 317481 667 665 0 True 501 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 544 238 0,00744775243415143 0,00727846166113384 0,00741588464179446 0,00727855344472419 0,00155679247789721 0,00138330551309973 325555 317201 667 665 0 True 545 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 589 240 0,00799641378669786 0,00755041643935887 0,00791943236438544 0,00759899290455482 0,0018508672473006 0,00190737504030383 349538 329053 667 665 0 False 589 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 632 238 0,00936954274064616 0,759496429331511 0,00924696726939803 0,754207675288014 0,00200625173400373 0,167998161340991 409560 33099443 667 665 13 True 634 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 235 283 0,00659276678895617 0,00646863209752465 0,00659189745937285 0,00648508430609598 0,00164336791881471 0,00146035050442612 288182 281908 667 665 0 False 235 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 279 283 0,0062881125241911 0,00611173160642508 0,00616464484626535 0,00607309071488518 0,00136473594935962 0,00132339959454377 274865 266354 667 665 0 False 279 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 324 283 0,00633185352848867 0,006333779057394 0,0063935301747158 0,00630197604333562 0,00129321231429935 0,00116156951454233 276777 276031 667 665 0 True 323 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 369 284 0,00624514934109965 0,0062702648128676 0,00624093995574884 0,00621042191195544 0,00129672268782305 0,00132472342043203 272987 273263 667 665 0 True 368 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 413 283 0,00640499159895905 0,00634197074283328 0,0063782711528191 0,0063782711528191 0,0013811350938208 0,00139451757445186 279974 276388 667 665 0 True 412 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 457 284 0,00669722360152037 0,00646828790906082 0,00668345159075303 0,00648508430609598 0,00169402466257362 0,00175630201706114 292748 281893 667 665 0 True 456 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 500 284 0,00670502469067595 0,00688585735338575 0,00677500572213321 0,00689707789730678 0,0015843834221726 0,00157454314781253 293089 300091 667 665 0 True 501 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 545 283 0,00692768744947737 0,00692360335491969 0,00697337300679027 0,00691233691920348 0,00141458135939356 0,00139590809732706 302822 301736 667 665 0 True 545 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 589 283 0,00721230137963749 0,00729798861998209 0,0072327763790341 0,00735484855420768 0,00175009253339044 0,00193170814313079 315263 318052 667 665 0 False 589 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 634 283 0,00775384795585727 0,00755172435552144 0,00779736018921187 0,00753795681696803 0,00196813549413521 0,0018653745164789 338935 329110 667 665 0 False 634 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 236 328 0,00625931026247005 0,00640738949685957 0,00630197604333562 0,00633249408712902 0,00135972904582658 0,00140718451344478 273606 279239 667 665 0 True 234 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 280 328 0,00606572429052125 0,00606051636300639 0,00607309071488518 0,00608834973678187 0,00133865570685395 0,00132095599951941 265144 264122 667 665 0 True 279 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 325 328 0,00636841112517671 0,0063187265485756 0,0063935301747158 0,00633249408712902 0,00120206365701625 0,0011610894426061 278375 275375 667 665 0 True 323 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 369 328 0,00644758874854173 0,00655793753094111 0,00643930724040589 0,00657663843747616 0,00125319865233688 0,00129508569587525 281836 285800 667 665 0 True 367 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 414 327 0,00658720765504179 0,00669453445928853 0,00660715648126955 0,00668345159075303 0,00148793919400048 0,00147946323397881 287939 291753 667 665 0 True 412 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 458 327 0,00678642139218786 0,00671491041634758 0,00675974670023652 0,00677500572213321 0,00171289246194526 0,00142643141522747 296647 292641 667 665 0 True 456 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 502 327 0,00678324147608045 0,00679168738968043 0,00674448767833982 0,00679026474402991 0,00153209568376303 0,00156250029331815 296508 295987 667 665 0 True 500 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 545 327 0,00689737529953266 0,00684740002902656 0,00688181887541009 0,00692759594110018 0,00150818311874288 0,00146917866684796 301497 298415 667 665 0 True 545 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 589 327 0,00705721755739205 0,00726859492517056 0,00701915007248035 0,00730907148851759 0,00189951870463628 0,00197217458290911 308484 316771 667 665 0 True 589 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 633 327 0,00721021956405638 0,00736613793582147 0,00714122224765393 0,00735484855420768 0,00188725314629209 0,00182077384629127 315172 321022 667 665 0 True 633 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 237 372 0,00617423034877617 0,0063880919969872 0,00607309071488518 0,00642404821850919 0,00147444030904943 0,00148958497823511 269887 278398 667 665 0 True 234 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 281 371 0,006107635127275 0,00619022952207711 0,00614938582436866 0,00616464484626535 0,00134289447307236 0,00132613215488187 266976 269775 667 665 0 True 279 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 325 372 0,00667908206574213 0,00665141911771876 0,00669871061264973 0,00662241550316625 0,00140161419892738 0,00124469224083794 291955 289874 667 665 0 True 323 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 369 372 0,00663728561445988 0,0069361088691057 0,00663767452506294 0,00694285496299687 0,00139329644487882 0,0012840986447974 290128 302281 667 665 0 True 367 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 413 372 0,0069120623940719 0,0070533165139904 0,00692759594110018 0,00712596322575723 0,00148458236872083 0,00142176181161527 302139 307389 667 665 0 True 412 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 457 372 0,00695513996263484 0,00696029384516453 0,00686655985351339 0,00695811398489357 0,00168521424266501 0,00171839673842046 304022 303335 667 665 0 True 456 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 502 372 0,00698467429137343 0,00712745470910052 0,00695811398489357 0,00708018616006714 0,00163223689879301 0,00166895157388061 305313 310620 667 665 0 True 500 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 546 372 0,00701349943018877 0,00699829225157194 0,00715648126955062 0,00700389105058366 0,00153388594533814 0,00161833889900857 306573 304991 667 665 0 True 545 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 589 372 0,00717375347574553 0,00722658098668507 0,0072327763790341 0,0072327763790341 0,00184623590039373 0,00203573764543048 313578 314940 667 665 0 True 589 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 633 371 0,00703262468102181 0,00700086219210191 0,00704966811627375 0,00698863202868696 0,00193026555817047 0,00188090433455235 307409 305103 667 665 0 True 633 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 237 416 0,00619770224752581 0,00635837705960943 0,00617990386816205 0,0063935301747158 0,00142902955938521 0,001486956655678 270913 277103 667 665 0 True 234 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 281 416 0,00628996556882923 0,00613428742375509 0,00627145799954223 0,00616464484626535 0,00137186992731031 0,00153884761062124 274946 267337 667 665 0 True 279 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 325 416 0,00659322433084213 0,00686566496350742 0,00662241550316625 0,0068207827878233 0,001328304871515 0,00118915195528662 288202 299211 667 665 0 True 323 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 369 416 0,00682217829057547 0,0070589612047973 0,0068207827878233 0,00709544518196384 0,00135568611724883 0,00127264299986386 298210 307635 667 665 0 True 367 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 413 415 0,00689762694756993 0,00700235367544519 0,00689707789730678 0,00700389105058366 0,00141908191943779 0,00147467350598045 301508 305168 667 665 0 True 412 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 458 416 0,00719116294450623 0,00708599147215716 0,00717174029144732 0,00717174029144732 0,00158738611444807 0,00155583801254873 314339 308813 667 665 0 True 456 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 501 416 0,00697653004580337 0,00702605678765465 0,00697337300679027 0,00703440909437705 0,0016121105900089 0,00159705197065442 304957 306201 667 665 0 True 500 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 545 416 0,00701452889943218 0,00707763916543476 0,00714122224765393 0,00718699931334401 0,0016108831548371 0,00159667305385333 306618 308449 667 665 0 True 545 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 590 416 0,00669365477480989 0,00675692435483307 0,00663767452506294 0,0068055237659266 0,00191801291048154 0,00200634045842764 292592 294472 667 665 0 True 589 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 634 415 0,00642377369337762 0,00630500490181737 0,00650034332799268 0,00625619897764553 0,00177702624570922 0,00171831364205208 280795 274777 667 665 0 True 633 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 235 460 0,0063032571606163 0,00650809904137776 0,00633249408712902 0,00643930724040589 0,00142407539087885 0,00143093509232825 275527 283628 667 665 0 True 234 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 281 461 0,00642155461523072 0,00658003443031933 0,00648508430609598 0,00656137941557946 0,00147713678650519 0,0014451138386629 280698 286763 667 665 0 True 279 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 324 460 0,00666588198233225 0,00669719618340885 0,00668345159075303 0,00669871061264973 0,00143207749908576 0,0014508997406142 291378 291869 667 665 0 True 323 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 369 460 0,00677361021938104 0,0106303983809375 0,00679026474402991 0,00712596322575723 0,00127923089119821 0,0137027467549891 296087 463281 667 665 0 True 367 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 413 459 0,00686241909944547 0,00693723321808756 0,00685130083161669 0,00698863202868696 0,00170123209362601 0,0017316818940611 299969 302330 667 665 0 True 412 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 457 460 0,00682862963116748 0,00712548136190786 0,00683604180972 0,00701915007248035 0,00197150597649456 0,00188796282532573 298492 310534 667 665 0 True 456 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 501 460 0,00705337420555001 0,00717421844838693 0,00712596322575723 0,00729381246662089 0,00177480711855088 0,00179408865681377 308316 312658 667 665 0 True 500 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 545 459 0,00661051941413134 0,00656973172230186 0,00671396963454643 0,00660715648126955 0,00176767545713754 0,00171237228036395 288958 286314 667 665 0 True 545 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 589 459 0,00632556232755675 0,00628472072834868 0,00624093995574884 0,00621042191195544 0,00190856024033159 0,00178185353634443 276502 273893 667 665 0 True 589 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 634 460 0,00625736570945473 0,00623446921262873 0,00627145799954223 0,00617990386816205 0,00167791820978755 0,00170011136055976 273521 271703 667 665 0 True 633 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 236 505 0,00632768989732646 0,00642262557285867 0,00621042191195544 0,00645456626230259 0,00136682598053019 0,00136341546807859 276595 279903 667 665 0 True 234 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 280 504 0,00648448950164423 0,00653868592286392 0,00650034332799268 0,00657663843747616 0,001408150492177 0,00154033802248858 283449 284961 667 665 0 True 279 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 324 504 0,00665684553008458 0,00660380638022155 0,00675974670023652 0,00665293354695964 0,0015608459475964 0,00151041704636263 290983 287799 667 665 0 True 323 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 368 503 0,00669429533345023 0,0067769102316331 0,00674448767833982 0,00683604180972 0,0014301882705881 0,00144666843248797 292620 295343 667 665 0 True 367 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 413 504 0,00679538921315264 0,00690547609582436 0,00679026474402991 0,00691233691920348 0,00158757945137211 0,00155807040176835 297039 300946 667 665 0 True 412 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 457 504 0,00676706737041184 0,0070088244185653 0,00665293354695964 0,00704966811627375 0,00180496039059721 0,00167034619339567 295801 305450 667 665 0 True 456 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 501 504 0,00671650899201349 0,00651723150861819 0,00668345159075303 0,00648508430609598 0,00174611691684639 0,00170650766238 293591 284026 667 665 0 True 500 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 545 504 0,00638975545415665 0,00624470308295343 0,00634775310902571 0,00625619897764553 0,00167824824891026 0,00145701303828283 279308 272149 667 665 0 True 544 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 590 504 0,00612314579720897 0,00623717682854424 0,00611886778057527 0,00625619897764553 0,0016570035123296 0,00172226842134251 267654 271821 667 665 0 True 589 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 633 503 0,00611445250137577 0,0061440853220256 0,00613412680247196 0,00613412680247196 0,00165201581168611 0,00171346503828014 267274 267764 667 665 0 True 633 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 235 549 0,00649727779735676 0,00656906629127178 0,00646982528419928 0,00656137941557946 0,00133210038020184 0,00141981340408407 284008 286285 667 665 0 True 234 543 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 281 549 0,00645431461426531 0,00651436327141957 0,00646982528419928 0,00648508430609598 0,00139958422200854 0,00140825255611684 282130 283901 667 665 0 True 278 543 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 325 549 0,0066479005862141 0,00689971667552952 0,00663767452506294 0,00691233691920348 0,00144982240222315 0,00131782441265766 290592 300695 667 665 0 True 323 543 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 369 549 0,00652360933289364 0,00682819431274455 0,00653086137178607 0,00677500572213321 0,00135426746980976 0,00139269929226047 285159 297578 667 665 0 True 367 543 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 413 548 0,00657020997397845 0,00660860207281766 0,00657663843747616 0,00660715648126955 0,00170597149208817 0,00162610383501294 287196 288008 667 665 0 True 411 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 457 549 0,00653710681852939 0,00675745211047761 0,00648508430609598 0,00683604180972 0,001884452759138 0,00184559945298173 285749 294495 667 665 0 True 456 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 502 549 0,00647552168067946 0,00659944665967964 0,00648508430609598 0,00660715648126955 0,00187393277403125 0,00199219748429403 283057 287609 667 665 0 True 500 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 546 548 0,0063782711528191 0,00631321953315424 0,00636301213092241 0,00636301213092241 0,00173805591251208 0,00189033502885832 278806 275135 667 665 0 True 544 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 590 548 0,00624956462029914 0,00636941403634974 0,00627145799954223 0,0063782711528191 0,0015970419762459 0,0014585079955832 273180 277584 667 665 0 True 589 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 634 548 0,00630771819400439 0,00666048274726643 0,00634775310902571 0,00653086137178607 0,00169313008450616 0,00186719353583341 275722 290269 667 665 0 True 633 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 234 587 0,00666306809973361 0,00695884825361642 0,00668345159075303 0,00698863202868696 0,00132253193061398 0,00120941825022386 291255 303272 667 665 0 False 234 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 278 587 0,00667274511062162 0,00661837702519058 0,00666819256885634 0,00665293354695964 0,00127282748893725 0,00125369615203862 291678 288434 667 665 0 False 278 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 325 593 0,00666494402146603 0,00677121964903102 0,00662241550316625 0,00679026474402991 0,00136577026140724 0,00137137040277226 291337 295095 667 665 0 True 323 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 369 592 0,00648144684810261 0,00671690670943782 0,0064087891966125 0,00663767452506294 0,00132644899501243 0,0013474949993732 283316 292728 667 665 0 True 367 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 411 587 0,00629623389266685 0,00644201485632139 0,00631723506523232 0,00643930724040589 0,00165025821945147 0,00149941824331614 275220 280748 667 665 0 False 411 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 456 587 0,00637625796852089 0,00649323009974008 0,0064087891966125 0,00648508430609598 0,00182197360703234 0,00168783267433314 278718 282980 667 665 0 False 456 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 500 587 0,00653292031027288 0,00648391406531894 0,00646982528419928 0,00648508430609598 0,00184405089833142 0,00198406492574112 285566 282574 667 665 0 False 500 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 544 587 0,00639513157131665 0,00638169009155987 0,00642404821850919 0,0063782711528191 0,00188550181355958 0,00167793969855061 279543 278119 667 665 0 False 544 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 589 587 0,00652667486352955 0,00656752891613332 0,00657663843747616 0,00660715648126955 0,00162678558562089 0,00157962263322337 285293 286218 667 665 0 False 589 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 633 587 0,00662648762595127 0,00653847940978562 0,00656137941557946 0,00651560234988937 0,0014577977202362 0,00139473897511832 289656 284952 667 665 0 False 633 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 235 636 0,010148622186961 0,715072758573018 0,00868238345922026 0,743312733653773 0,00605248132257866 0,225910855508886 443615 31163425 667 665 11 True 234 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 278 630 0,00777116591624078 0,00700189475749341 0,00721751735713741 0,00700389105058366 0,00305814261345266 0,00140819537073657 339692 305148 667 665 0 False 278 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 323 630 0,00651157598129294 0,00638577446133071 0,00645456626230259 0,00642404821850919 0,0012900476130449 0,00130518139226486 284633 278297 667 665 0 False 323 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 367 630 0,00630261660197596 0,00619972912367896 0,00622568093385214 0,00616464484626535 0,00128124311363628 0,00126998462355448 275499 270189 667 665 0 False 367 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 411 630 0,0062076766606397 0,00597137155087306 0,00617990386816205 0,00593575951781491 0,00136364880279095 0,00136040877546589 271349 260237 667 665 0 False 411 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 456 631 0,00614467314294329 0,00636363167015731 0,00616464484626535 0,00636301213092241 0,00168705451171881 0,00176124865127225 268595 277332 667 665 0 False 456 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 500 631 0,00628001403280964 0,00628942463735443 0,00621042191195544 0,00628671702143893 0,0018227451811594 0,00175550169470895 274511 274098 667 665 0 False 500 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 544 631 0,00637360422558233 0,00623316129646616 0,00643930724040589 0,00636301213092241 0,00176902876962872 0,00174326066700078 278602 271646 667 665 0 False 544 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 589 631 0,00677390762160691 0,00676286734230862 0,00672922865644312 0,0068207827878233 0,0014780262007596 0,00135957801871938 296100 294731 667 665 0 False 589 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 633 636 0,00845226276767773 0,767802201773603 0,00842298008697642 0,773311970702678 0,00165317024973486 0,180812837791218 369464 33461415 667 665 13 True 633 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A8_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A8_3.csv new file mode 100755 index 0000000..e93d722 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A8_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 236 239 0,00105204893547733 0,0757276574361057 0,000793469138628214 0,0733806363012131 0,000900584113677658 0,0193230424862363 45987 3300270 667 665 0 True 235 239 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 279 239 0,000943771648165389 0,000857717651877462 0,000747692072938125 0,000656137941557946 0,000750534170972654 0,000725833749323531 41254 37380 667 665 0 False 279 239 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 324 239 0,000955919385237571 0,000872838998388624 0,000839246204318303 0,000778210116731518 0,000678914328245089 0,000631413494146601 41785 38039 667 665 0 True 323 239 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 369 238 0,00096669449665188 0,000890599123122524 0,000854505226215 0,000793469138628214 0,000665052441482224 0,000586011511699298 42256 38813 667 665 0 True 368 239 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 413 238 0,000913116341806208 0,000912604238910391 0,000717174029144732 0,000717174029144732 0,000748156976409179 0,000739107943974583 39914 39772 667 665 0 True 412 239 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 456 239 0,000948735977628032 0,000911869970187543 0,000747692072938125 0,000778210116731518 0,000828866838319408 0,000744884711277047 41471 39740 667 665 0 True 456 239 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 501 239 0,00103845994146438 0,000922631596156792 0,000854505226215 0,000732433051041428 0,000865434102762851 0,000806028685407214 45393 40209 667 665 0 True 501 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 544 238 0,000925950391707328 0,000951359859938241 0,000747692072938125 0,000823987182421607 0,000751564060818977 0,00072707874017421 40475 41461 667 665 0 True 545 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 589 240 0,00113305672638618 0,00102593402710255 0,000869764248111696 0,000701915007248035 0,00102107625062766 0,000976865509978142 49528 44711 667 665 0 False 589 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 632 238 0,00115726069215335 0,0773007363912184 0,000854505226215 0,0745555809872587 0,0010557197031962 0,0204989092644784 50586 3368826 667 665 0 True 634 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 235 283 0,000939127598022916 0,000848585184637033 0,000732433051041428 0,000656137941557946 0,00081025050519417 0,000743878221475142 41051 36982 667 665 0 False 235 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 279 283 0,000879601398659791 0,000901521370374896 0,000747692072938125 0,000778210116731518 0,000708621956428581 0,000667737449094918 38449 39289 667 665 0 False 279 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 324 283 0,00086004148303509 0,000954572285600704 0,000762951094834821 0,000854505226215 0,000648360236826965 0,00063506858137422 37594 41601 667 665 0 True 323 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 369 284 0,000861139583561389 0,000934563462903081 0,000717174029144732 0,00080872816052491 0,000657685617243822 0,00068098752909479 37642 40729 667 665 0 True 368 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 413 283 0,000827670394603568 0,000828071552192452 0,00064087891966125 0,000610360875867857 0,000730624513836827 0,000724372054117516 36179 36088 667 665 0 True 412 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 457 284 0,000934986843954997 0,000905192713989139 0,00064087891966125 0,000564583810177768 0,000910575487955353 0,000947265678512358 40870 39449 667 665 0 True 456 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 500 284 0,00089440287867053 0,000911273376850228 0,000671396963454643 0,000671396963454643 0,000842413276501829 0,000854683443155583 39096 39714 667 665 0 True 501 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 545 283 0,000994810445543994 0,000892939604676603 0,000839246204318303 0,000701915007248035 0,000827185603035875 0,000784341540209933 43485 38915 667 665 0 True 545 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 589 283 0,000909227235775566 0,00100679714851331 0,000579842832074464 0,000656137941557946 0,000908222232920435 0,00100269215694266 39744 43877 667 665 0 False 589 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 634 283 0,00101798494206776 0,00103286368817443 0,00064087891966125 0,000671396963454643 0,00101246768521577 0,00101112907267089 44498 45013 667 665 0 False 634 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 236 328 0,000831284975502636 0,000897872972658242 0,000671396963454643 0,000747692072938125 0,000724191062524371 0,000733704111982272 36337 39130 667 665 0 True 234 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 280 328 0,000903462208012496 0,000880365252797822 0,000747692072938125 0,000717174029144732 0,000710671558060937 0,000685464833026109 39492 38367 667 665 0 True 279 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 325 328 0,000941621201301386 0,000826557122951577 0,000854505226215 0,000717174029144732 0,000658772714514863 0,000630053491742052 41160 36022 667 665 0 True 323 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 369 328 0,000845217125930054 0,000847323160269637 0,000717174029144732 0,000762951094834821 0,000654150975422149 0,000595396746947346 36946 36927 667 665 0 True 367 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 414 327 0,000842700645557285 0,000842343900492821 0,00064087891966125 0,00064087891966125 0,000721179432874486 0,000728908012574594 36836 36710 667 665 0 True 412 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 458 327 0,000919613436586811 0,000949111161974517 0,000625619897764553 0,000701915007248035 0,000868094925603732 0,000796110228632722 40198 41363 667 665 0 True 456 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 502 327 0,000911560699393951 0,000933898031872999 0,000671396963454643 0,000747692072938125 0,000868192658619013 0,000810974300824992 39846 40700 667 665 0 True 500 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 545 327 0,000939859665040448 0,000971139223659974 0,000717174029144732 0,000854505226215 0,000821024545722066 0,00071109088806315 41083 42323 667 665 0 True 545 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 589 327 0,000950543268077566 0,000982887523225551 0,000625619897764553 0,000549324788281071 0,000946441992750094 0,0010941537022117 41550 42835 667 665 0 True 589 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 633 327 0,000927071369327925 0,000978780207557117 0,000503547722590982 0,000671396963454643 0,000964583200827091 0,000977779553787485 40524 42656 667 665 0 True 633 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 237 372 0,000867751063813481 0,000892136498260988 0,000701915007248035 0,000686655985351339 0,000741032113750831 0,000797640392818627 37931 38880 667 665 0 True 234 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 281 371 0,000851554081050571 0,000816369144422053 0,000701915007248035 0,00064087891966125 0,000689285641662136 0,00068342300976283 37223 35578 667 665 0 True 279 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 325 372 0,000922747598505622 0,000921163058711095 0,00080872816052491 0,00080872816052491 0,000685198244056 0,000700190134074645 40335 40145 667 665 0 True 323 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 369 372 0,000931898436224781 0,000896955136754681 0,000839246204318303 0,000778210116731518 0,000701893260175852 0,000680650116900517 40735 39090 667 665 0 True 367 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 413 372 0,000866538577815693 0,000845212137691448 0,000656137941557946 0,000656137941557946 0,000747383447056892 0,000718878140857488 37878 36835 667 665 0 True 412 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 457 372 0,000931372263055929 0,000941952041926744 0,000686655985351339 0,000671396963454643 0,000857418735746615 0,000873348062288968 40712 41051 667 665 0 True 456 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 502 372 0,000917211341685532 0,000918478388693179 0,000595101853971161 0,000610360875867857 0,000894905631444632 0,000904509650186233 40093 40028 667 665 0 True 500 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 546 372 0,000911949609997016 0,000911250430952639 0,000656137941557946 0,000686655985351339 0,000873051343882694 0,000823416399937024 39863 39713 667 665 0 True 545 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 589 372 0,00102416175752819 0,001014965888055 0,000701915007248035 0,000625619897764553 0,00102848093963999 0,00111204670912187 44768 44233 667 665 0 True 589 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 633 371 0,000903805364426965 0,000928391016451635 0,000549324788281071 0,000595101853971161 0,000941084613344045 0,00100001406320097 39507 40460 667 665 0 True 633 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 237 416 0,000920299749415748 0,000816070847753396 0,000717174029144732 0,000625619897764553 0,000827971959221331 0,000769441958120903 40228 35565 667 665 0 True 234 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 281 416 0,000855122907761043 0,000948491622739614 0,000686655985351339 0,000793469138628214 0,000776753345470378 0,000806150237254444 37379 41336 667 665 0 True 279 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 325 416 0,000937549078516361 0,000975017080352518 0,00080872816052491 0,000823987182421607 0,000694603133117364 0,000723344837849444 40982 42492 667 665 0 True 323 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 369 416 0,000882186510315453 0,000917032797145071 0,000778210116731518 0,00080872816052491 0,000674591363888252 0,000697426868434786 38562 39965 667 665 0 True 367 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 413 415 0,000906985280534372 0,000928597529529936 0,000717174029144732 0,000701915007248035 0,000773406643212365 0,000788642913998695 39646 40469 667 665 0 True 412 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 458 416 0,000925698743670051 0,000971621087509343 0,000671396963454643 0,000762951094834821 0,00085545786193254 0,000831493658597041 40464 42344 667 665 0 True 456 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 501 416 0,00093690851987602 0,000982382713478592 0,000625619897764553 0,000732433051041428 0,000913637508144537 0,000907852507149089 40954 42813 667 665 0 True 500 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 545 416 0,000945578938614922 0,00101682450575971 0,000732433051041428 0,000839246204318303 0,000857068180112414 0,000805068595195396 41333 44314 667 665 0 True 545 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 590 416 0,000908266397815054 0,00104543804005321 0,000534065766384375 0,000686655985351339 0,000933333506494194 0,00105590948343521 39702 45561 667 665 0 True 589 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 634 415 0,000902890280655049 0,000826625960644344 0,000579842832074464 0,000442511635004196 0,000900879131119837 0,000913185393595172 39467 36025 667 665 0 True 633 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 235 460 0,000860567656203942 0,000821164837018158 0,000717174029144732 0,000656137941557946 0,000729997766715904 0,000716795382812126 37617 35787 667 665 0 True 234 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 281 461 0,000828402461621101 0,000874353427629499 0,000656137941557946 0,000747692072938125 0,00075809096798993 0,000789782135383585 36211 38105 667 665 0 True 279 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 324 460 0,000865989527552543 0,000892182390056166 0,000701915007248035 0,000732433051041428 0,000737540234415162 0,000772136486261638 37854 38882 667 665 0 True 323 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 369 460 0,00092146648122494 0,00123129981052425 0,000762951094834821 0,000854505226215 0,000742261552296828 0,00150134725335582 40279 53661 667 665 0 True 367 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 413 459 0,000917943408703064 0,000852004123377797 0,00064087891966125 0,000595101853971161 0,000879656215643731 0,00086400673154302 40125 37131 667 665 0 True 412 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 457 460 0,000906619247025606 0,000924742618734981 0,000564583810177768 0,000518806744487678 0,000953870260065674 0,00101069416255137 39630 40301 667 665 0 True 456 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 501 460 0,000901494777902877 0,000880686495364068 0,000579842832074464 0,000457770656900893 0,000960032732846571 0,000969294552541178 39406 38381 667 665 0 True 500 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 545 459 0,000864891427026244 0,000890782690303236 0,000564583810177768 0,000579842832074464 0,000892827222386562 0,000930523300182218 37806 38821 667 665 0 True 545 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 589 459 0,000949673938494246 0,000910516162229791 0,000534065766384375 0,000610360875867857 0,00100143349231793 0,000917748892608237 41512 39681 667 665 0 True 589 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 634 460 0,000807767322564399 0,000886606536942035 0,000442511635004196 0,000488288700694286 0,000885758848527085 0,000923766389800489 35309 38639 667 665 0 True 633 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 236 505 0,000849769667695335 0,000901154236013472 0,000732433051041428 0,000747692072938125 0,000684771825048724 0,000720305611935957 37145 39273 667 665 0 True 234 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 280 504 0,000815957322323045 0,000888143912080499 0,000656137941557946 0,000732433051041428 0,000720685412489872 0,00079251944555205 35667 38706 667 665 0 True 279 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 324 504 0,000960975223077406 0,000948170380173368 0,000839246204318303 0,000854505226215 0,000781131480102944 0,000821173902287176 42006 41322 667 665 0 True 323 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 368 503 0,00100224550119081 0,000903678284748263 0,000900282291905089 0,000732433051041428 0,000829704544733382 0,00078304747851759 43810 39383 667 665 0 True 367 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 413 504 0,00093908184383432 0,000869534789135806 0,000656137941557946 0,000518806744487678 0,000896615756988447 0,000870142340415049 41049 37895 667 665 0 True 412 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 457 504 0,000919316034360938 0,000892457740827234 0,000503547722590982 0,000564583810177768 0,000984576322786057 0,000928328892580468 40185 38894 667 665 0 True 456 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 501 504 0,000922312933713962 0,000930662660312948 0,000595101853971161 0,000579842832074464 0,000896979536164649 0,000919726248870201 40316 40559 667 665 0 True 500 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 545 504 0,000999774775006637 0,00087013138247312 0,000671396963454643 0,000625619897764553 0,000990239985005376 0,000828306604919158 43702 37921 667 665 0 True 544 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 590 504 0,000922518827562644 0,00086384420653373 0,000579842832074464 0,000488288700694286 0,00093112553346009 0,000866984742858858 40325 37647 667 665 0 True 589 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 633 503 0,000903050420315134 0,000883784191538586 0,000549324788281071 0,000549324788281071 0,000917278524891032 0,000913271754906778 39474 38516 667 665 0 True 633 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 235 549 0,000908289274909352 0,000908726382217847 0,000793469138628214 0,000747692072938125 0,000696689611118472 0,000715245287359519 39703 39603 667 665 0 True 234 543 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 281 549 0,000837576176434557 0,000931809955192399 0,000717174029144732 0,000778210116731518 0,000699751032043454 0,000771088619239738 36612 40609 667 665 0 True 278 543 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 325 549 0,000894128353538955 0,000948422785046847 0,000747692072938125 0,000854505226215 0,000741528490050286 0,000710287476778339 39084 41333 667 665 0 True 323 543 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 369 549 0,000883376119218944 0,000896358543417367 0,000747692072938125 0,000778210116731518 0,000720805027967641 0,000663298551932434 38614 39064 667 665 0 True 367 543 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 413 548 0,000896004275271382 0,000810655615922388 0,000610360875867857 0,000534065766384375 0,000923742352607485 0,000837582101145 39166 35329 667 665 0 True 411 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 457 549 0,00093256187195942 0,000886354132068556 0,000595101853971161 0,0004272526131075 0,00101718193331351 0,00101230406953386 40764 38628 667 665 0 True 456 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 502 549 0,000898040336663895 0,000952392425329747 0,000518806744487678 0,000473029678797589 0,000955566392224387 0,00110222482502643 39255 41506 667 665 0 True 500 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 546 548 0,000855328801609724 0,00093527478572834 0,000473029678797589 0,000518806744487678 0,000923832568813238 0,00099257373973339 37388 40760 667 665 0 True 544 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 590 548 0,00091711983330834 0,000890323772351455 0,000625619897764553 0,000701915007248035 0,00087647961388293 0,000745821693462119 40089 38801 667 665 0 True 589 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 634 548 0,000843112433254648 0,000869947815292408 0,000549324788281071 0,000503547722590982 0,000843655552995801 0,000900488957004918 36854 37913 667 665 0 True 633 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 234 587 0,000924646397332348 0,000927587910036019 0,000823987182421607 0,00080872816052491 0,000645071462973618 0,000623229384407762 40418 40425 667 665 0 False 234 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 278 587 0,00090353083929539 0,00090516976809155 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,000673446992887042 0,000701232977205003 39495 39448 667 665 0 False 278 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 325 593 0,000783357462948544 0,000894155737248821 0,00064087891966125 0,000732433051041428 0,000666505570715371 0,000734571498229105 34242 38968 667 665 0 True 323 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 369 592 0,000914168688143911 0,000869328276057505 0,000823987182421607 0,000747692072938125 0,000675607858605231 0,000670647794021024 39960 37886 667 665 0 True 367 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 411 587 0,000868437376642418 0,000861434887286883 0,000656137941557946 0,000625619897764553 0,000804015551678741 0,000789395237912084 37961 37542 667 665 0 False 411 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 456 587 0,000914214442332507 0,000958656655371549 0,000488288700694286 0,000625619897764553 0,000983608770600144 0,000938525266025751 39962 41779 667 665 0 False 456 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 500 587 0,000924257486729284 0,000903815960133798 0,000518806744487678 0,000488288700694286 0,00103475552911201 0,00104663124056188 40401 39389 667 665 0 False 500 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 544 587 0,000873950756368211 0,000944407252968769 0,000442511635004196 0,000595101853971161 0,000979035167577765 0,000932123712620109 38202 41158 667 665 0 False 544 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 589 587 0,000899801872924833 0,000929262960560018 0,000625619897764553 0,000595101853971161 0,00082414695471453 0,000901307127627073 39332 40498 667 665 0 False 589 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 633 587 0,000822637433858031 0,000868548115539478 0,000595101853971161 0,000671396963454643 0,000757592253604533 0,000738996471904656 35959 37852 667 665 0 False 633 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 235 636 0,00122703582976193 0,0721829751765543 0,00106813153276875 0,073685816739147 0,00102264684116252 0,0246290375900015 53636 3145790 667 665 0 True 234 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 278 630 0,00106998457740688 0,000971666979304521 0,000915541313801785 0,00080872816052491 0,000749680707466452 0,000746039578387324 46771 42346 667 665 0 False 278 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 323 630 0,00084787086886861 0,000801752607657849 0,000717174029144732 0,000701915007248035 0,000668629869432551 0,000619085940286962 37062 34941 667 665 0 False 323 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 367 630 0,000876444359646682 0,000906546521946891 0,000778210116731518 0,00080872816052491 0,000658545506562264 0,000673448770631013 38311 39508 667 665 0 False 367 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 411 630 0,000810055031994188 0,000823757723445717 0,000595101853971161 0,000656137941557946 0,000728758962708945 0,000702585069183987 35409 35900 667 665 0 False 411 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 456 631 0,000912864693768932 0,000881558439472451 0,000579842832074464 0,000579842832074464 0,000947954869528137 0,00088310257505723 39903 38419 667 665 0 False 456 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 500 631 0,000942170251564536 0,000885711646936063 0,000564583810177768 0,000503547722590982 0,00100229796935488 0,000934043532483709 41184 38600 667 665 0 False 500 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 544 631 0,000892847236258273 0,000866551822449234 0,000534065766384375 0,000503547722590982 0,000929272249415996 0,000912213181769162 39028 37765 667 665 0 False 544 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 589 631 0,000920803045490301 0,00100122129539918 0,000686655985351339 0,000793469138628214 0,000783012428012714 0,000798231443912032 40250 43634 667 665 0 False 589 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 633 636 0,000890925560337249 0,0779440705219216 0,000717174029144732 0,0773327229724575 0,000699132462324689 0,0206965188499673 38944 3396863 667 665 0 True 633 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A9_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A9_1.csv new file mode 100755 index 0000000..0beea81 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A9_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 245 268 0,0105933071459235 0,0481851458584663 0,0105745021744106 0,0473182269016556 0,00165105723912279 0,00850888833169279 463053 2099946 667 665 0 True 244 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 289 268 0,0105733354426014 0,0106925129257109 0,0106202792401007 0,0107270923933776 0,00138088591200136 0,00131783780013825 462180 465988 667 665 0 False 289 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 334 269 0,0108411118313583 0,0677748846825234 0,0107881284809644 0,066498817425803 0,00131089697823913 0,00912236942035712 473885 2953682 667 665 0 True 333 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 378 268 0,011026164647134 0,0970753273662527 0,0109864957656214 0,0971847104600595 0,00128958569836566 0,0164807019638089 481974 4230618 667 665 0 True 378 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 422 269 0,0108506058254919 0,0770912403462306 0,0108339055466545 0,0727702754253452 0,00159175112230911 0,0127786021498451 474300 3359696 667 665 0 True 422 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 466 269 0,0108321440103935 0,075259997097344 0,0108033875028611 0,0767986572060731 0,00178555143571006 0,0223014492277606 473493 3279889 667 665 0 True 466 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 511 269 0,0105894637940814 0,0856992102595697 0,0105592431525139 0,0813458457312886 0,00174086676772126 0,0216167353215889 462885 3734838 667 665 0 True 511 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 554 269 0,0104289352233931 0,074712622710358 0,010452429999237 0,0703440909437705 0,00166239309159245 0,0189272819275303 455868 3256034 667 665 0 True 555 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 600 268 0,0105966929558796 0,0103662681537903 0,0106202792401007 0,0103456168459602 0,00186627049437391 0,0019529834140413 463201 451770 667 665 0 False 600 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 644 268 0,0104457498877021 0,0475293979971673 0,0104829480430304 0,0469214923323415 0,00182722149460011 0,00837150600394737 456603 2071368 667 665 0 True 644 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 244 312 0,0105698352471739 0,0104633063546942 0,0106660563057908 0,0105134660868238 0,00150773805761476 0,00139683806476736 462027 455999 667 665 0 False 244 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 289 312 0,0106603827864049 0,0105746169038986 0,0106507972838941 0,0105897611963073 0,00134794669740293 0,00134162408426817 465985 460850 667 665 0 False 289 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 334 313 0,0109197404044602 0,107197015197642 0,0108949416342412 0,102693217364767 0,00134714552078507 0,021183190209314 477322 4671729 667 665 0 True 333 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 379 313 0,0111273957894022 0,0573336522813098 0,011108567940795 0,05468833447776 0,0012816801521083 0,00990074571653595 486399 2498645 667 665 0 True 378 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 423 313 0,0109804562127268 0,0842766793385386 0,0109864957656214 0,0796368352788586 0,0015987924574638 0,0154624253539424 479976 3672843 667 665 0 True 422 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 467 314 0,0107150132875883 0,0514736142255387 0,0107728694590677 0,0494392309452964 0,00184425156402513 0,0136909589498165 468373 2243260 667 665 0 True 466 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 511 313 0,0107605387052411 0,0569488954705372 0,0108186465247578 0,0557564660105287 0,00170604605721217 0,0163734644207114 470363 2481877 667 665 0 True 511 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 555 313 0,0107691633697914 0,0625552436825642 0,0108491645685512 0,0595407034409094 0,00169447856548193 0,0161245855544555 470740 2726206 667 665 0 True 555 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 600 312 0,0104726304735021 0,0103772133469403 0,0104371709773404 0,0103761348897536 0,00202082075329666 0,00213364970581856 457778 452247 667 665 0 False 600 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 644 312 0,0104043423470229 0,0104330177698767 0,0104371709773404 0,0105439841306172 0,00194592689644858 0,00190537697435244 454793 454679 667 665 0 False 644 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 246 358 0,0106349434575457 0,0577901379679457 0,0106507972838941 0,0552986953536278 0,0015828162552341 0,0107115669585947 464873 2518539 667 665 0 True 244 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 289 358 0,0108099989831132 0,0713353078278209 0,0107728694590677 0,0713206683451591 0,00141318489157854 0,0209831313734432 472525 3108848 667 665 0 True 289 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 334 357 0,0110630654002365 0,0436113171461499 0,0110475318532082 0,0440527962157626 0,00141107724492894 0,00678105040539756 483587 1900615 667 665 0 True 333 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 379 358 0,0109308357951946 0,0394415197985809 0,0109102006561379 0,0393835355153735 0,00136213092773187 0,00675979148861556 477807 1718892 667 665 0 True 377 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 423 358 0,0111041526615955 0,079988664726591 0,0112001220721752 0,0749828336003662 0,00165958081057142 0,0142540808179194 485383 3485968 667 665 0 True 422 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 468 358 0,0109283650690105 0,0373882749905205 0,0108644235904479 0,037949187457084 0,00166650828427069 0,00490460538262386 477699 1629410 667 665 0 True 466 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 512 358 0,0107440900744409 0,0325440518210151 0,0106965743495842 0,0322575722896162 0,00181370348194284 0,00453778801354509 469644 1418295 667 665 0 True 511 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 556 357 0,0108750843163907 0,0560569884312521 0,0108339055466545 0,0554818036163882 0,00174282473470571 0,00928937218401407 475370 2443007 667 665 0 True 555 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 599 357 0,0107703072245063 0,0636808087969982 0,0108491645685512 0,0619668879224842 0,0020885758243362 0,0138067224568376 470790 2775259 667 665 0 True 600 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 643 357 0,0105578018955732 0,0692877536023625 0,0105287251087205 0,0681162737468528 0,00199769018647922 0,0171667282537551 461501 3019614 667 665 0 True 644 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 246 402 0,0107276414436407 0,0494284922652247 0,0106355382619974 0,0498664835584039 0,00156050752685519 0,0113700460125231 468925 2154132 667 665 0 True 244 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 291 402 0,0107257197677197 0,0354947795214748 0,0107881284809644 0,0352941176470588 0,00143104979452137 0,00426968386739428 468841 1546890 667 665 0 True 289 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 335 402 0,0110402798143158 0,0930591528030422 0,0110627908751049 0,0867627985046159 0,00134519547848871 0,0186981287961247 482591 4055590 667 665 0 True 333 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 380 402 0,0110569114618703 0,0744242845612544 0,0110170138094148 0,072327763790341 0,00150561767414002 0,018976891046188 483318 3243468 667 665 0 True 377 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 423 401 0,0111383767946652 0,0481992346395859 0,0112153810940719 0,0480964370183871 0,00159457685245817 0,00833433106683358 486879 2100560 667 665 0 True 422 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 468 402 0,0111071266838542 0,0583309268823237 0,011108567940795 0,0575265125505455 0,00178088991066656 0,0111119488392237 485513 2542107 667 665 0 True 466 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 511 402 0,010996676072584 0,0471032467871441 0,0109407186999313 0,0459296559090562 0,00166064511848975 0,00764478097981177 480685 2052796 667 665 0 True 511 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 555 401 0,0108573316912155 0,0560351898285425 0,0108339055466545 0,0539711604486152 0,00184052747222218 0,00870640882851334 474594 2442057 667 665 0 True 555 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 600 402 0,0108212545135077 0,0463220078119308 0,0107881284809644 0,0462500953688869 0,00190995959287521 0,00863722765652504 473017 2018749 667 665 0 True 600 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 644 401 0,0106943095172487 0,0891536692498011 0,0107423514152743 0,0824139772640574 0,00183679226593269 0,0187455891694318 467468 3885386 667 665 0 True 644 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 246 446 0,0106695793783127 0,0452904290940214 0,0106813153276875 0,0451514457923247 0,0014883312246849 0,0069385775185869 466387 1973792 667 665 0 True 244 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 291 446 0,01092202811389 0,0611524921252548 0,0109712367437247 0,060517280842298 0,00155918638230079 0,00899307479893092 477422 2665073 667 665 0 True 289 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 336 446 0,0110208800383512 0,0390062131754197 0,0110017547875181 0,0394598306248569 0,00148466094934685 0,00468199756330208 481743 1699921 667 665 0 True 333 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 379 446 0,0112518471823827 0,060783430308433 0,011261158159762 0,0573586633096818 0,00147975735266226 0,0132826924231904 491839 2648989 667 665 0 True 377 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 422 446 0,0115602304135183 0,10075566577235 0,0114442664225223 0,0990768291752499 0,00203608367236725 0,0170108012160427 505319 4391010 667 665 0 True 422 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 468 446 0,0113420973193879 0,0677293370758092 0,0113221942473487 0,0661173418783856 0,00180122782152944 0,0157352836752634 495784 2951697 667 665 0 True 466 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 511 445 0,0109517225822886 0,0595024526296285 0,010955977721828 0,0570229648279545 0,00173310464017849 0,0093784729376218 478720 2593163 667 665 0 True 511 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 556 446 0,0107716569730699 0,0346216192805199 0,0107881284809644 0,0345616845960174 0,00183623956370589 0,00447818331003699 470849 1508837 667 665 0 True 555 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 599 445 0,0107133890138931 0,0432872751803978 0,0106965743495842 0,0429694056610971 0,00201205916543373 0,00555383465190734 468302 1886493 667 665 0 True 600 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 644 445 0,0107868473636837 0,0706185697707303 0,0108796826123445 0,0711528191042954 0,00181393000002217 0,0122076044063617 471513 3077612 667 665 0 True 644 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 246 490 0,0106072392963509 0,0582537139369366 0,0106507972838941 0,0573281452658885 0,00142185249308577 0,016573456875889 463662 2538742 667 665 0 True 244 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 290 490 0,0108117376422798 0,0585598581025693 0,0108949416342412 0,0569619287403677 0,00160175301475229 0,00853580715231207 472601 2552084 667 665 0 True 289 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 334 490 0,0110292530548642 0,0767076308303375 0,0109864957656214 0,0744182497901884 0,00159696459297509 0,0173946526524256 482109 3342978 667 665 0 True 333 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 378 490 0,011554671279604 0,0976248357217144 0,0115815976195926 0,0927138170443275 0,0016163777213366 0,0213695721345533 505076 4254566 667 665 0 True 377 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 423 489 0,0116408264167298 0,102315252539681 0,0116426337071794 0,0977798123140307 0,00194800187839485 0,0280368603604823 508842 4458978 667 665 0 True 422 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 468 490 0,0112551643610559 0,0504639258939291 0,0112306401159686 0,0509040970473793 0,00200398673609741 0,00656996198107115 491984 2199257 667 665 0 True 466 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 512 489 0,0111740421846756 0,0483933339872914 0,0111390859845884 0,0484168764782177 0,00174312486806606 0,00872644059710262 488438 2109019 667 665 0 True 511 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 555 490 0,0112200251442143 0,112966875875888 0,0112306401159686 0,114381628137636 0,00183431794747656 0,0184481327648198 490448 4923184 667 665 0 True 555 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 600 489 0,0109689947884835 0,0731926405622663 0,0108949416342412 0,0703288319218738 0,00180948236445227 0,0227346467679065 479475 3189792 667 665 0 True 600 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 644 489 0,0107118104943866 0,0789080735714314 0,0107423514152743 0,0754406042572671 0,0018400641664685 0,0111790714604006 468233 3438875 667 665 0 True 644 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 246 535 0,010602252089794 0,0575590727792243 0,0106202792401007 0,0587319752803845 0,00142621911528576 0,0120901976143338 463444 2508469 667 665 0 True 244 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 290 534 0,0108281405188914 0,117160995874901 0,0108186465247578 0,115709163042649 0,00151946848918584 0,0289660479771571 473318 5105967 667 665 0 True 288 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 334 534 0,0111413736940182 0,0586014360690006 0,0112001220721752 0,059311818112459 0,00156025046250154 0,0121477669605464 487010 2553896 667 665 0 True 333 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 378 534 0,0114481097743644 0,0670749889142632 0,0114442664225223 0,0621499961852445 0,00151389338163808 0,0152090571519681 500418 2923180 667 665 0 True 377 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 423 534 0,0114949620634865 0,059837531572121 0,0114900434882124 0,0587319752803845 0,001989090987334 0,00728556900109257 502466 2607766 667 665 0 True 422 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 467 535 0,0112529681600033 0,066167065638461 0,0112001220721752 0,0633096818493935 0,00189183179346365 0,0151311388935773 491888 2883612 667 665 0 True 466 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 511 534 0,0111231406498628 0,0755830753353973 0,0112001220721752 0,0725871671625849 0,00194456223288429 0,0158396742754633 486213 3293969 667 665 0 True 511 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 555 534 0,0107800757437715 0,0607765694850539 0,0108491645685512 0,0604257267109178 0,00180214902085842 0,0118469734169902 471217 2648690 667 665 0 True 555 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 599 534 0,0107787031181136 0,0480095409042175 0,0108033875028611 0,0455634393835355 0,00172537334682108 0,00840735075826961 471157 2092293 667 665 0 True 600 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 644 534 0,010810753927225 0,0717874567398124 0,0107881284809644 0,0690928511482414 0,0018961484078132 0,0160320419702922 472558 3128553 667 665 0 True 644 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 246 579 0,0104025350565733 0,0487593210538362 0,0104219119554437 0,0487983520256352 0,00137166426666273 0,00972073383696885 454714 2124969 667 665 0 True 244 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 290 579 0,0106213544635327 0,0577081981676554 0,0106660563057908 0,0578164339665827 0,00134192401504377 0,0106869939803849 464279 2514968 667 665 0 True 288 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 335 578 0,0109043212429034 0,0531839555400288 0,0108644235904479 0,0529335469596399 0,00140602598700104 0,0105606476485632 476648 2317798 667 665 0 True 333 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 379 578 0,0111630840565069 0,0548035458295544 0,0111543450064851 0,0536049439230945 0,00140150223298341 0,00779783246440122 487959 2388381 667 665 0 True 377 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 423 578 0,0112987452256934 0,093505702916022 0,011306935225452 0,0876630807965209 0,00195409466883941 0,0206827408148009 493889 4075051 667 665 0 True 422 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 468 579 0,011128150733514 0,0664975554014356 0,0111390859845884 0,0642252231631952 0,00206892734616869 0,0109865491218923 486432 2898015 667 665 0 True 466 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 511 579 0,0108135906869179 0,0578226981966245 0,0109407186999313 0,0569619287403677 0,00205649557194265 0,00756641423586246 472682 2519958 667 665 0 True 511 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 556 578 0,0108493018311169 0,0410564291249984 0,0109102006561379 0,0412909132524605 0,00195617224356988 0,00842235737531913 474243 1789271 667 665 0 True 555 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 599 578 0,0106862567800558 0,0530502956865728 0,0106507972838941 0,0522621499961852 0,00177178592731102 0,00873984498378832 467116 2311973 667 665 0 True 600 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 644 578 0,0106370023960325 0,0588928030765859 0,0106660563057908 0,0561684596017395 0,00166058770404393 0,0105278325618354 464963 2566594 667 665 0 True 644 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 244 617 0,0106548922837734 0,01012453312269 0,0103913939116503 0,0100709544518196 0,00244549817293454 0,00119927573720008 465745 441235 667 665 0 False 244 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 288 617 0,0105779566156496 0,0102265276374732 0,0104371709773404 0,0102388036926833 0,00204759426217716 0,00137102779392537 462382 445680 667 665 0 False 288 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 335 623 0,0107958838159314 0,0919414810773787 0,010757610437171 0,0890516517891203 0,00150461164387555 0,0212169405935633 471908 4006881 667 665 0 True 333 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 379 623 0,0108219408263367 0,0809874078650506 0,0108186465247578 0,0762035553521019 0,00140757821081314 0,0190189916151237 473047 3529494 667 665 0 True 377 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 422 617 0,0111080875218147 0,0106614212344778 0,0108491645685512 0,0106660563057908 0,00247325760010482 0,00164442759966925 485555 464633 667 665 0 False 422 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 466 617 0,0109031545110942 0,0106168373554624 0,0108033875028611 0,0105897611963073 0,00211863739425363 0,00195527687738806 476597 462690 667 665 0 False 466 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 511 617 0,0107239582314588 0,010433339012443 0,0106965743495842 0,010452429999237 0,0022461014144709 0,00199292503613165 468764 454693 667 665 0 False 511 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 555 617 0,0104235591062331 0,0103135155352331 0,0104676890211337 0,0102388036926833 0,00191584207799347 0,00187847461736132 455633 449471 667 665 0 False 555 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 600 617 0,0105034687966157 0,0104805387237836 0,0104371709773404 0,0105287251087205 0,00165999046032486 0,00140131049143493 459126 456750 667 665 0 False 600 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 644 617 0,0105445331808804 0,0103703295776635 0,0105592431525139 0,0104676890211337 0,001463282811187 0,00150125785200415 460921 451947 667 665 0 False 644 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 247 667 0,0104267390223405 0,0449532620748484 0,0104371709773404 0,0447699702449073 0,00129246511352727 0,00853624042561151 455772 1959098 667 665 0 True 244 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 288 661 0,010274491959788 0,0100564067527482 0,0103150988021668 0,0100251773861295 0,00136486946416706 0,00122313321447748 449117 438266 667 665 0 False 288 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 333 661 0,0110987536673412 0,0101993138029326 0,0103608758678569 0,0101930266269932 0,00441526061448265 0,00125512325308214 485147 444494 667 665 0 False 333 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 377 661 0,0107094083994853 0,0103289810702081 0,0102845807583734 0,0103608758678569 0,0026605885741707 0,00129445946088508 468128 450145 667 665 0 False 377 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 422 661 0,0103546761753021 0,0105721616928565 0,0104219119554437 0,0105134660868238 0,00145262658876065 0,00136065125884074 452622 460743 667 665 0 False 422 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 466 661 0,0102800053395138 0,0103764331864222 0,0102998397802701 0,0104371709773404 0,00168269756933666 0,00143890908407542 449358 452213 667 665 0 False 466 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 511 661 0,0102821557863778 0,0101820814338432 0,0103150988021668 0,0102235446707866 0,00162669485300572 0,00177215955051338 449452 443743 667 665 0 False 511 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 555 661 0,0103225338578136 0,0103131025090765 0,0102693217364767 0,0102693217364767 0,00155835737295762 0,00176907320988414 451217 449453 667 665 0 False 555 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 600 661 0,0104606657531843 0,0104570191787549 0,010452429999237 0,0105134660868238 0,0013055740960857 0,00128130209779566 457255 455725 667 665 0 False 600 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 646 666 0,0104567995242479 0,0465005727869686 0,0104676890211337 0,0455939574273289 0,00139824139336892 0,00901766941881635 457086 2026531 667 665 0 True 644 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A9_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A9_2.csv new file mode 100755 index 0000000..50bc572 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A9_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 245 268 0,00873445172584227 0,775331645662566 0,00857557030594339 0,777523460746166 0,00194912298770619 0,170095449684406 381799 33789554 667 665 15 True 244 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 289 268 0,00703443197147135 0,00672691112078663 0,00700389105058366 0,00672922865644312 0,00140379631992402 0,00126148428771952 307488 293164 667 665 0 False 289 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 334 269 0,00662456595003025 0,0067434780588459 0,00666819256885634 0,00672922865644312 0,00117631231952198 0,00118432283806088 289572 293886 667 665 0 True 333 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 378 268 0,00664424025112644 0,00653345425821363 0,00666819256885634 0,00651560234988937 0,00119444447450542 0,00124781446111092 290432 284733 667 665 0 True 378 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 422 269 0,00644580433518649 0,00661046069052237 0,0063935301747158 0,00659189745937285 0,00143416126638989 0,00134132443129067 281758 288089 667 665 0 True 422 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 466 269 0,00667267647933872 0,00683239341200334 0,00662241550316625 0,0068207827878233 0,00159700290361925 0,00163382537372093 291675 297761 667 665 0 True 466 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 511 269 0,00694958082872045 0,00697020647292298 0,00700389105058366 0,00698863202868696 0,00162026328010275 0,00147965032350994 303779 303767 667 665 0 True 511 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 554 269 0,00713248319763213 0,00717878468200715 0,00715648126955062 0,00718699931334401 0,00161659898227761 0,00145771477512416 311774 312857 667 665 0 True 555 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 600 268 0,0076024015916052 0,00748733816688666 0,00755321583886473 0,00752269779507134 0,00189356013478676 0,0017790056083978 332315 326304 667 665 0 False 600 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 644 268 0,00909913548604503 0,764838876775367 0,00898756389715419 0,756878004119936 0,00190656662987246 0,171969370703396 397740 33332271 667 665 15 True 644 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 244 312 0,00707249945638305 0,00657496338695216 0,00701915007248035 0,00656137941557946 0,0014592242241471 0,00140059052940446 309152 286542 667 665 0 False 244 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 289 312 0,00661136586662036 0,00631741863241303 0,00660715648126955 0,00631723506523232 0,00124611672918684 0,00129724210339504 288995 275318 667 665 0 False 289 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 334 313 0,00647572757452814 0,00643226284984606 0,00646982528419928 0,00643930724040589 0,00121762372269332 0,00121697399207649 283066 280323 667 665 0 True 333 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 379 313 0,00666059737354943 0,0065759271146509 0,00665293354695964 0,00653086137178607 0,00111457085746875 0,00114260061256597 291147 286584 667 665 0 True 378 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 423 313 0,0068555788482504 0,00683796926511747 0,0068055237659266 0,00691233691920348 0,00161679453830603 0,00151895549880429 299670 298004 667 665 0 True 422 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 467 314 0,00703045135706352 0,0069895957563857 0,00709544518196384 0,00700389105058366 0,00161088979721995 0,00154543575535919 307314 304612 667 665 0 True 466 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 511 313 0,00703351688769943 0,00706444527432107 0,00711070420386053 0,00708018616006714 0,00153545899099052 0,00157911211624058 307448 307874 667 665 0 True 511 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 555 313 0,00714568328104202 0,00734206768925059 0,00720225833524071 0,00730907148851759 0,0015151210182951 0,00124280117287084 312351 319973 667 665 0 True 555 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 600 312 0,00744452676385543 0,00747905469785703 0,00738536659800107 0,00743114366369116 0,00197970955910123 0,00192616300444192 325414 325943 667 665 0 False 600 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 644 312 0,00780829544028627 0,00776305607231629 0,00782787823300526 0,00778210116731518 0,00190563081499781 0,0017542789493813 341315 338320 667 665 0 False 644 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 246 358 0,00635468486859797 0,00650878741830543 0,00631723506523232 0,00651560234988937 0,00153092497978318 0,00151529210256711 277775 283658 667 665 0 True 244 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 289 358 0,00660839184436164 0,006506355153161 0,00663767452506294 0,00650034332799268 0,00137987619613994 0,00130190158776128 288865 283552 667 665 0 True 289 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 334 357 0,00662017354792505 0,00666103344880856 0,00657663843747616 0,00666819256885634 0,00124971972170548 0,00123915578147232 289380 290293 667 665 0 True 333 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 379 358 0,00691913141620995 0,0071147426818362 0,00691233691920348 0,00711070420386053 0,0012723851894439 0,00128327184145106 302448 310066 667 665 0 True 377 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 423 358 0,00696888909630788 0,00722134932203477 0,00698863202868696 0,00718699931334401 0,00155291681327884 0,00152022226780531 304623 314712 667 665 0 True 422 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 468 358 0,0070544951831706 0,00717020291630885 0,00711070420386053 0,00721751735713741 0,00163378756867429 0,0016413900000264 308365 312483 667 665 0 True 466 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 512 358 0,00698993602306194 0,00718773358206686 0,00709544518196384 0,00720225833524071 0,0016442348145239 0,00155423619305944 305543 313247 667 665 0 True 511 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 556 357 0,00731620914193853 0,00718050562432632 0,0072480354009308 0,00715648126955062 0,00160932618002173 0,00161412926881263 319805 312932 667 665 0 True 555 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 599 357 0,0071904308774887 0,00739436138985596 0,00730907148851759 0,00749217975127794 0,00198625506917511 0,00214985321861801 314307 322252 667 665 0 True 600 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 643 357 0,00703484375916871 0,00708349036931996 0,00700389105058366 0,00712596322575723 0,0019048725562042 0,00195054087995485 307506 308704 667 665 0 True 644 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 246 402 0,00655524835430763 0,00642599861980426 0,00662241550316625 0,00643930724040589 0,00150879839226322 0,00156093965292525 286542 280050 667 665 0 True 244 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 291 402 0,00656234025353997 0,00661695437954006 0,00662241550316625 0,00660715648126955 0,00140510102700758 0,00136396833445447 286852 288372 667 665 0 True 289 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 335 402 0,00684821242388648 0,00704670809548476 0,00688181887541009 0,00706492713817044 0,00129243397503904 0,00119229142096653 299348 307101 667 665 0 True 333 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 380 402 0,00704408610526506 0,00730085685718072 0,00701915007248035 0,00729381246662089 0,00136214406654345 0,00131425964037188 307910 318177 667 665 0 True 377 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 423 401 0,0072807038915882 0,00725510273738822 0,0072632944228275 0,00733958953231098 0,00157191109123971 0,00150105196971307 318253 316183 667 665 0 True 422 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 468 402 0,00722456350218116 0,0072741478323871 0,0072327763790341 0,00732433051041428 0,00163462593503098 0,00156143422294169 315799 317013 667 665 0 True 466 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 511 402 0,00725084928352944 0,00735427490676795 0,00729381246662089 0,00733958953231098 0,00158417878319399 0,0015737998813825 316948 320505 667 665 0 True 511 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 555 401 0,00729470467329851 0,00732692339684184 0,00729381246662089 0,00735484855420768 0,00164744415792684 0,00144903848991897 318865 319313 667 665 0 True 555 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 600 402 0,00681908988284526 0,00677204570134423 0,00674448767833982 0,00674448767833982 0,00195351738805492 0,00189389489102566 298075 295131 667 665 0 True 600 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 644 401 0,0064392157320287 0,0064434604478695 0,0064087891966125 0,00648508430609598 0,00183644764189407 0,00170906615016252 281470 280811 667 665 0 True 644 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 246 446 0,00662344497240965 0,00650830555445607 0,00663767452506294 0,00648508430609598 0,00150267489992862 0,00156533482294188 289523 283637 667 665 0 True 244 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 291 446 0,0066903375961367 0,00674141292806289 0,00674448767833982 0,00671396963454643 0,00141416069383585 0,0014290797446486 292447 293796 667 665 0 True 289 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 336 446 0,00689133574663801 0,00699847581875265 0,00694285496299687 0,00703440909437705 0,00141006640141774 0,00136828709099054 301233 304999 667 665 0 True 333 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 379 446 0,00710532808670053 0,00719220803209672 0,00712596322575723 0,00715648126955062 0,00141478594846995 0,00126425566820331 310587 313442 667 665 0 True 377 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 422 446 0,00735928671050147 0,00727697017779055 0,00740062561989776 0,00737010757610437 0,00163687992450975 0,00167258301647482 321688 317136 667 665 0 True 422 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 468 446 0,00732968375047999 0,00714163527381053 0,00735484855420768 0,00708018616006714 0,00174375321103887 0,00188877152997567 320394 311238 667 665 0 True 466 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 511 445 0,0072502316019834 0,00725916416126147 0,0072632944228275 0,0072632944228275 0,00165190603719483 0,00164938740461241 316921 316360 667 665 0 True 511 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 556 446 0,00665997969200339 0,0066258573878046 0,00665293354695964 0,00659189745937285 0,00182863025520688 0,00175556263547594 291120 288760 667 665 0 True 555 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 599 445 0,00637785936512174 0,0062190725153465 0,00643930724040589 0,00628671702143893 0,00177941452421116 0,00174919660014902 278788 271032 667 665 0 True 600 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 644 445 0,00607011669262645 0,00594041753502548 0,00608834973678187 0,00590524147402152 0,00177872709616514 0,0018240727216657 265336 258888 667 665 0 True 644 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 246 490 0,00663314486039196 0,00673599769623188 0,00657663843747616 0,00669871061264973 0,00136595931781419 0,00138504585269449 289947 293560 667 665 0 True 244 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 290 490 0,00667386608824221 0,0067804668457594 0,00659189745937285 0,0068055237659266 0,00146207360138728 0,00140121983916157 291727 295498 667 665 0 True 289 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 334 490 0,00672778739950235 0,00681098488955279 0,00679026474402991 0,00689707789730678 0,00148185146160323 0,00144016535218798 294084 296828 667 665 0 True 333 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 378 490 0,00715506288970415 0,00723477267212435 0,00706492713817044 0,0072632944228275 0,00152585874966795 0,00150074360290701 312761 315297 667 665 0 True 377 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 423 489 0,00725304548458204 0,00714413637664773 0,00717174029144732 0,00712596322575723 0,00176663961252552 0,00176650366342092 317044 311347 667 665 0 True 422 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 468 490 0,0069707878951346 0,00717892235739268 0,00697337300679027 0,0072480354009308 0,00187869871109669 0,0017529227895284 304706 312863 667 665 0 True 466 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 512 489 0,00658848877232247 0,00656539494765754 0,00663767452506294 0,00660715648126955 0,00170989198541294 0,00162242329458201 287995 286125 667 665 0 True 511 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 555 490 0,00629362590391689 0,00634678938132697 0,00631723506523232 0,00631723506523232 0,00172062900962862 0,00165077280622313 275106 276598 667 665 0 True 555 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 600 489 0,00604790303406319 0,00608997889551069 0,00605783169298848 0,00608834973678187 0,00172526511052275 0,00172484591086442 264365 265406 667 665 0 True 600 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 644 489 0,00596984638831877 0,0061501430389891 0,00604257267109178 0,00610360875867857 0,00175965463523995 0,00179397066998107 260953 268028 667 665 0 True 644 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 246 535 0,00672808480172823 0,00678140762756055 0,00671396963454643 0,00677500572213321 0,00144757769578339 0,00147127787075255 294097 295539 667 665 0 True 244 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 290 534 0,00674103323710084 0,00677571704495847 0,00677500572213321 0,0068055237659266 0,00142176286875096 0,00145951897833798 294663 295291 667 665 0 True 288 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 334 534 0,00684494099940188 0,00672879268438893 0,00685130083161669 0,00668345159075303 0,00153324797358228 0,0014125283012869 299205 293246 667 665 0 True 333 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 378 534 0,00699393951456407 0,00703759857414192 0,00701915007248035 0,00709544518196384 0,00142574251818041 0,00142074621162472 305718 306704 667 665 0 True 377 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 423 534 0,00689662035542082 0,00676656163182045 0,00685130083161669 0,0068055237659266 0,00181218947036769 0,0017596016833774 301464 294892 667 665 0 True 422 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 467 535 0,00670886804251799 0,00653047129152705 0,00665293354695964 0,00662241550316625 0,00193421749408072 0,00197613160141706 293257 284603 667 665 0 True 466 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 511 534 0,00638497414144839 0,00639701795114933 0,00634775310902571 0,0064087891966125 0,0017782186894894 0,00183211865319696 279099 278787 667 665 0 True 511 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 555 534 0,00634425291359813 0,00626842914106048 0,0064087891966125 0,00630197604333562 0,00160742923499378 0,00183785270890288 277319 273183 667 665 0 True 555 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 599 534 0,00615421289126551 0,00593516292447759 0,00614938582436866 0,00593575951781491 0,00162371042270911 0,00143504297775492 269012 258659 667 665 0 True 600 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 644 534 0,00621870342009128 0,00623061430183378 0,00616464484626535 0,00622568093385214 0,00174401840520319 0,00188555456249091 271831 271535 667 665 0 True 644 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 246 579 0,006879508288886 0,00695843522745981 0,00689707789730678 0,00694285496299687 0,00129594209494131 0,00116809499344275 300716 303254 667 665 0 True 244 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 290 579 0,00686129812182487 0,00701283995064337 0,00698863202868696 0,00706492713817044 0,00146870902310853 0,00140468888585144 299920 305625 667 665 0 True 288 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 335 578 0,00671522787473281 0,00689480625344547 0,00674448767833982 0,00692759594110018 0,00140161396966033 0,00139829966778961 293535 300481 667 665 0 True 333 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 379 578 0,00675908326450188 0,00678335802885561 0,00677500572213321 0,00671396963454643 0,00130078674080559 0,00127862253952926 295452 295624 667 665 0 True 377 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 423 578 0,0067326830976821 0,00648088520683719 0,00672922865644312 0,00645456626230259 0,00177968064940314 0,00159303817605053 294298 282442 667 665 0 True 422 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 468 579 0,00647126654114005 0,00642287797773215 0,00645456626230259 0,00645456626230259 0,00193575117704164 0,00169510140216025 282871 279914 667 665 0 True 466 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 511 579 0,00640412226937573 0,00640580622992592 0,00642404821850919 0,00643930724040589 0,00195829570565575 0,00198781243162381 279936 279170 667 665 0 True 511 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 556 578 0,00638440221409094 0,00637753688409626 0,00633249408712902 0,0063782711528191 0,00169206895511874 0,00161193364942768 279074 277938 667 665 0 True 555 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 599 578 0,00634640336046214 0,00638065752616836 0,00634775310902571 0,00645456626230259 0,00155050735987664 0,00155189937000916 277413 278074 667 665 0 True 600 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 644 578 0,00628102062495875 0,00639997797193831 0,00633249408712902 0,0064087891966125 0,00160876992034154 0,0014085986850661 274555 278916 667 665 0 True 644 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 244 617 0,00704941646823647 0,00699228042640361 0,00700389105058366 0,00692759594110018 0,00134832203050364 0,00134874679339317 308143 304729 667 665 0 False 244 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 288 617 0,00685681421134249 0,00659983673993865 0,00683604180972 0,00653086137178607 0,00137512263301613 0,00132885916911533 299724 287626 667 665 0 False 288 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 335 623 0,00645355967015348 0,00660222311328791 0,0064087891966125 0,00665293354695964 0,00128535309307247 0,00136764609354314 282097 287730 667 665 0 True 333 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 379 623 0,0064076682189919 0,0063318974937917 0,0063782711528191 0,00636301213092241 0,00125845948332166 0,00124617514952547 280091 275949 667 665 0 True 377 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 422 617 0,00629719473062736 0,00627916782113214 0,00633249408712902 0,00625619897764553 0,00166826759748542 0,00160475506161447 275262 273651 667 665 0 False 422 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 466 617 0,00641020757645897 0,00644045453528534 0,00645456626230259 0,00648508430609598 0,00182434591713083 0,00177572605643989 280202 280680 667 665 0 False 466 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 511 617 0,00626766040188878 0,0062809117093489 0,00625619897764553 0,00625619897764553 0,00187437445907266 0,0018612967776317 273971 273727 667 665 0 False 511 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 555 617 0,00648842436186347 0,00624201841293552 0,00651560234988937 0,00628671702143893 0,00170843005615521 0,00178335337531332 283621 272032 667 665 0 False 555 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 600 617 0,00641844333040621 0,00635920311192263 0,0063935301747158 0,0064087891966125 0,00148189338780595 0,00148943571505442 280562 277139 667 665 0 False 600 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 644 617 0,00647392028407861 0,00646369872954301 0,00653086137178607 0,00654612039368277 0,00151870236385001 0,00140492921622952 282987 281693 667 665 0 False 644 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 247 667 0,00968552116708869 0,756238754359003 0,00891126878767071 0,765804531929503 0,00316398362812943 0,187756906988951 423372 32957471 667 665 14 True 244 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 288 661 0,00847333257152609 0,00713622004197952 0,00717174029144732 0,00712596322575723 0,00556659837152514 0,00128230576521444 370385 311002 667 665 0 False 288 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 333 661 0,00626649367007959 0,00656287089892275 0,00631723506523232 0,00662241550316625 0,00123641584224201 0,00122738122260052 273920 286015 667 665 0 False 333 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 377 661 0,0063163886127433 0,00609876717428729 0,00636301213092241 0,00604257267109178 0,00127773017392529 0,00118652787231955 276101 265789 667 665 0 False 377 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 422 661 0,00607677392706714 0,00626432182539204 0,00617990386816205 0,00630197604333562 0,00148294188500527 0,00137073981962419 265627 273004 667 665 0 False 422 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 466 661 0,00623126294486083 0,00631620249984081 0,00617990386816205 0,00631723506523232 0,00159398579277137 0,00141095235540129 272380 275265 667 665 0 False 466 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 511 661 0,00635511953338963 0,00608259031648703 0,00645456626230259 0,00602731364919509 0,00162327676148104 0,00162413087405773 277794 265084 667 665 0 False 511 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 555 661 0,0062576402345863 0,00635943257089852 0,0063782711528191 0,00633249408712902 0,0016244563536449 0,00165294923926162 273533 277149 667 665 0 False 555 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 600 661 0,00662159192777152 0,0064777186729699 0,00669871061264973 0,00643930724040589 0,00143367887579999 0,00120466561206925 289442 282304 667 665 0 False 600 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 646 666 0,00839692307657112 0,768480505452232 0,00833142595559625 0,774608987563897 0,00168680180579619 0,187204429682361 367045 33490976 667 665 17 True 644 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A9_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A9_3.csv new file mode 100755 index 0000000..6f30ac8 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A9_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 245 268 0,000952922485884547 0,0776044023999114 0,000717174029144732 0,0749675745784695 0,000802456684941833 0,0206323323329023 41654 3382060 667 665 0 True 244 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 289 268 0,000898154722135385 0,000918914360747371 0,000747692072938125 0,000793469138628214 0,000683349920398125 0,0006849644477417 39260 40047 667 665 0 False 289 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 334 269 0,000932607626148016 0,000938051239336611 0,000823987182421607 0,00080872816052491 0,000681669135421156 0,000682310775707118 40766 40881 667 665 0 True 333 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 378 268 0,00089211516924074 0,000853679173901795 0,000793469138628214 0,000732433051041428 0,000644147435042567 0,000625309505799892 38996 37204 667 665 0 True 378 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 422 269 0,000980123351004745 0,000984333114773659 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,000812317076525329 0,000809958770504291 42843 42898 667 665 0 True 422 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 466 269 0,000893556426181508 0,000948308055558902 0,000701915007248035 0,000717174029144732 0,000805751554756674 0,000872504293220101 39059 41328 667 665 0 True 466 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 511 269 0,000958184217573063 0,000915128287645183 0,000717174029144732 0,000671396963454643 0,000854728016101318 0,000822639392371666 41884 39882 667 665 0 True 511 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 554 269 0,000870816594449399 0,00109252302190587 0,000625619897764553 0,000991836423285267 0,000805346899265504 0,000793119092018246 38065 47613 667 665 0 True 555 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 600 268 0,00106696480095956 0,000977724696268022 0,00080872816052491 0,00064087891966125 0,00100525824663729 0,000969537437025969 46639 42610 667 665 0 False 600 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 644 268 0,00112660538579417 0,0761435518299066 0,000778210116731518 0,0732127870603494 0,00101725246963589 0,0197622091201774 49246 3318395 667 665 0 True 644 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 244 312 0,00091016519664178 0,000892985496471781 0,000747692072938125 0,000732433051041428 0,00072960326519923 0,000733759827345614 39785 38917 667 665 0 False 244 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 289 312 0,000862146175710497 0,000879057336635248 0,000732433051041428 0,000762951094834821 0,000677481927543609 0,000659343960943823 37686 38310 667 665 0 False 289 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 334 313 0,000811908076632318 0,000927197829777006 0,000671396963454643 0,00080872816052491 0,000633988564287976 0,000634863429673854 35490 40408 667 665 0 True 333 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 379 313 0,000878617683604982 0,000822495699078321 0,000732433051041428 0,000701915007248035 0,000632756314238103 0,00062545131969797 38406 35845 667 665 0 True 378 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 423 313 0,000931006229547163 0,000914921774566882 0,000717174029144732 0,000671396963454643 0,000837401088877016 0,000850913591108364 40696 39873 667 665 0 True 422 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 467 314 0,000865303214723606 0,000983323495279742 0,00064087891966125 0,000747692072938125 0,000826887045090672 0,00089788280773329 37824 42854 667 665 0 True 466 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 511 313 0,000918446704777618 0,000934517571107903 0,000701915007248035 0,000717174029144732 0,000825020836875527 0,000857820324020133 40147 40727 667 665 0 True 511 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 555 313 0,000858142684208365 0,000894935897766848 0,000595101853971161 0,000717174029144732 0,000813688950487898 0,000698080390100656 37511 39002 667 665 0 True 555 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 600 312 0,0010382540476157 0,00106471259402799 0,000717174029144732 0,000732433051041428 0,00106647768047814 0,00107745109976553 45384 46401 667 665 0 False 600 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 644 312 0,0011056499674173 0,000964806155925405 0,000762951094834821 0,000595101853971161 0,00108254838509649 0,000970807976209969 48330 42047 667 665 0 False 644 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 246 358 0,000889461426302184 0,000872770160695857 0,000762951094834821 0,000717174029144732 0,000715770965973092 0,000787594242789201 38880 38036 667 665 0 True 244 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 289 358 0,00087276114746472 0,000964530805154337 0,000732433051041428 0,000823987182421607 0,000654410380946942 0,000767890621809393 38150 42035 667 665 0 True 289 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 334 357 0,00087765684564447 0,000920887707940026 0,000778210116731518 0,000823987182421607 0,000658720511574175 0,000677372125648456 38364 40133 667 665 0 True 333 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 379 358 0,000907511453703224 0,00094064412576417 0,000778210116731518 0,000823987182421607 0,000690925125900253 0,000683629443174428 39669 40994 667 665 0 True 377 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 423 358 0,000942353268318919 0,000956476795100592 0,000717174029144732 0,000778210116731518 0,000825071151625573 0,000774197523953413 41192 41684 667 665 0 True 422 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 468 358 0,000912704554108846 0,000866276471678165 0,000671396963454643 0,000595101853971161 0,000844491119951134 0,000809651153630151 39896 37753 667 665 0 True 466 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 512 358 0,000950566145171864 0,000962052648214723 0,000671396963454643 0,00064087891966125 0,000921457814310117 0,00087906068357943 41551 41927 667 665 0 True 511 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 556 357 0,000948164050270585 0,000985388626062754 0,000762951094834821 0,000762951094834821 0,000855839901911657 0,000876758229147158 41446 42944 667 665 0 True 555 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 599 357 0,000917462989722809 0,0010087016580132 0,000457770656900893 0,000549324788281071 0,00106017917050551 0,00114166239712073 40104 43960 667 665 0 True 600 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 643 357 0,000941872849338663 0,00096609112619039 0,000564583810177768 0,000671396963454643 0,000985993966869179 0,000942439738883226 41171 42103 667 665 0 True 644 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 246 402 0,000921237710281961 0,000871829378894708 0,000793469138628214 0,000732433051041428 0,000788633505963996 0,000745324151236084 40269 37995 667 665 0 True 244 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 291 402 0,000872921287124806 0,000907693816826341 0,000732433051041428 0,000823987182421607 0,00072770833548893 0,000680333870404439 38157 39558 667 665 0 True 289 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 335 402 0,00081014654037138 0,000960148138714835 0,000686655985351339 0,000839246204318303 0,000637066780494307 0,000662227721494448 35413 41844 667 665 0 True 333 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 380 402 0,000949582430117054 0,000919992817934055 0,000854505226215 0,000762951094834821 0,000696445578548902 0,000736674225154623 41508 40094 667 665 0 True 377 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 423 401 0,000895317962442446 0,000929125285174483 0,000656137941557946 0,000686655985351339 0,000819940795963748 0,000832177044752376 39136 40492 667 665 0 True 422 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 468 402 0,000947363351970158 0,000948996432486572 0,000686655985351339 0,000671396963454643 0,000850809965197097 0,00086120484812171 41411 41358 667 665 0 True 466 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 511 402 0,00101276896456784 0,000953103748155006 0,000747692072938125 0,000625619897764553 0,000915900373758706 0,000919582969477612 44270 41537 667 665 0 True 511 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 555 401 0,00098463013858143 0,000873068457364514 0,000747692072938125 0,000701915007248035 0,000881513400461008 0,00076426128615619 43040 38049 667 665 0 True 555 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 600 402 0,000945761955369306 0,000865794607828796 0,000595101853971161 0,000366216525520714 0,000990678826105989 0,00105000819141738 41341 37732 667 665 0 True 600 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 644 401 0,00106145142123376 0,000918042416638988 0,000762951094834821 0,000595101853971161 0,00101767017886683 0,000909827765915785 46398 40009 667 665 0 True 644 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 246 446 0,000828654109658378 0,000943420579372441 0,00064087891966125 0,000793469138628214 0,000762655375604175 0,000788179935467158 36222 41115 667 665 0 True 244 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 291 446 0,000918950000852172 0,000885160945393927 0,000747692072938125 0,000717174029144732 0,00080593767485105 0,000769634857964512 40169 38576 667 665 0 True 289 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 336 446 0,000863999220348626 0,000916298528422223 0,000762951094834821 0,000778210116731518 0,000739491603428813 0,00071544474368387 37767 39933 667 665 0 True 333 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 379 446 0,00104969259476465 0,000990276102249214 0,000915541313801785 0,000854505226215 0,000804128662465066 0,0007585897036687 45884 43157 667 665 0 True 377 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 422 446 0,000943222597902239 0,000923274081289284 0,000671396963454643 0,000701915007248035 0,000919655465557432 0,000866281013985162 41230 40237 667 665 0 True 422 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 468 446 0,000951206703812205 0,000934081599053711 0,00064087891966125 0,000579842832074464 0,000951060851497877 0,000994266989899105 41579 40708 667 665 0 True 466 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 511 445 0,000909913548604503 0,00100925235955533 0,000610360875867857 0,000686655985351339 0,000912444096756065 0,00101904760032256 39774 43984 667 665 0 True 511 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 556 446 0,000881797599712389 0,000870911542991147 0,000579842832074464 0,000503547722590982 0,000919191929204493 0,000904863556551914 38545 37955 667 665 0 True 555 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 599 445 0,000935238491992273 0,000881260142803794 0,000564583810177768 0,000518806744487678 0,000979581400420848 0,000912412179792241 40881 38406 667 665 0 True 600 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 644 445 0,000927620419591074 0,000900075778826788 0,000518806744487678 0,000473029678797589 0,00096052916489452 0,00099293190468453 40548 39226 667 665 0 True 644 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 246 490 0,00088559519736584 0,000933186709047739 0,000747692072938125 0,000762951094834821 0,000697857031009556 0,000727190207311808 38711 40669 667 665 0 True 244 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 290 490 0,00094397754201407 0,000924903240018104 0,000778210116731518 0,000778210116731518 0,000779065874111032 0,000784329412067534 41263 40308 667 665 0 True 289 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 334 490 0,000876947655721235 0,000929308852355196 0,000732433051041428 0,00080872816052491 0,000746715465588864 0,00081291117003466 38333 40500 667 665 0 True 333 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 378 490 0,000956422681312125 0,000972722490593616 0,000823987182421607 0,000793469138628214 0,000767646432123413 0,000814268703683858 41807 42392 667 665 0 True 377 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 423 489 0,000947569245818839 0,000951589318914131 0,000656137941557946 0,000595101853971161 0,000980389625560688 0,000952898726934608 41420 41471 667 665 0 True 422 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 468 490 0,00100961192555473 0,00094555454784822 0,00064087891966125 0,000625619897764553 0,00102020942846956 0,000908669862216616 44132 41208 667 665 0 True 466 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 512 489 0,000854848382629468 0,000932039414168289 0,000518806744487678 0,000564583810177768 0,000887138975218449 0,000948633496889869 37367 40619 667 665 0 True 511 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 555 490 0,000893487794898614 0,000857212842130504 0,000610360875867857 0,000579842832074464 0,00087019474319741 0,000853304037315427 39056 37358 667 665 0 True 555 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 600 489 0,000890605281017079 0,000870154328370709 0,000457770656900893 0,000503547722590982 0,00095445539897884 0,000916378946434595 38930 37922 667 665 0 True 600 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 644 489 0,000806394696906525 0,000899112051128049 0,000396734569314107 0,000534065766384375 0,000910115643397333 0,000917302073779381 35249 39184 667 665 0 True 644 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 246 535 0,000920894553867493 0,00089723048752575 0,000778210116731518 0,000686655985351339 0,000712394043953199 0,000772071816261342 40254 39102 667 665 0 True 244 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 290 534 0,000871708801127017 0,000863890098328908 0,000778210116731518 0,000747692072938125 0,000715233950700612 0,00067454138856622 38104 37649 667 665 0 True 288 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 334 534 0,000885389303517159 0,00091870784766907 0,000747692072938125 0,00080872816052491 0,000730952076888185 0,000724470896163597 38702 40038 667 665 0 True 333 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 378 534 0,000881225672354942 0,000959918679738945 0,000717174029144732 0,000762951094834821 0,000750442928957155 0,000813732289516575 38520 41834 667 665 0 True 377 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 423 534 0,000885801091214521 0,000966458260551814 0,000549324788281071 0,000656137941557946 0,000898063439288924 0,000946237087848588 38720 42119 667 665 0 True 422 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 467 535 0,000922038408582388 0,000931144524162317 0,000564583810177768 0,000579842832074464 0,0009628441378317 0,000985366404454403 40304 40580 667 665 0 True 466 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 511 534 0,00102676974627815 0,000864463745768633 0,000701915007248035 0,000411993591210803 0,00103228308569792 0,000984666169230228 44882 37674 667 665 0 True 511 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 555 534 0,000909547515095737 0,000835597806601649 0,000610360875867857 0,000457770656900893 0,000909904409569537 0,000898369524610377 39758 36416 667 665 0 True 555 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 599 534 0,000923799944843326 0,000895761950080053 0,000671396963454643 0,000671396963454643 0,00087326634636583 0,000796849247978831 40381 39038 667 665 0 True 600 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 644 534 0,000883650644350519 0,00087550072250895 0,000518806744487678 0,000488288700694286 0,000927121781228382 0,000982533421140815 38626 38155 667 665 0 True 644 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 246 579 0,000863038382388115 0,000912420671729679 0,000778210116731518 0,000793469138628214 0,000624078932530993 0,000632644214922739 37725 39764 667 665 0 True 244 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 290 579 0,000834556399987235 0,000935550136499408 0,000701915007248035 0,00080872816052491 0,000690164247773972 0,000706173657968973 36480 40772 667 665 0 True 288 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 335 578 0,000855580449647001 0,000896106138543888 0,000762951094834821 0,000717174029144732 0,000694925493019501 0,000735228594950367 37399 39053 667 665 0 True 333 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 379 578 0,000856289639570236 0,000897941810351009 0,000732433051041428 0,00080872816052491 0,000703971152630277 0,000622565493656611 37430 39133 667 665 0 True 377 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 423 578 0,000908335029097948 0,000901062452423115 0,000564583810177768 0,000534065766384375 0,00097437160245817 0,000903827504079461 39705 39269 667 665 0 True 422 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 468 579 0,000973145837243887 0,000904068365007277 0,000656137941557946 0,000564583810177768 0,00101996071245126 0,000884618075372438 42538 39400 667 665 0 True 466 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 511 579 0,000869695616828802 0,000950373186341913 0,000457770656900893 0,000549324788281071 0,00102644537723839 0,00104182107281959 38016 41418 667 665 0 True 511 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 556 578 0,000866767348758672 0,000935894324963244 0,000473029678797589 0,000595101853971161 0,000957421424067379 0,000938248433158035 37888 40787 667 665 0 True 555 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 599 578 0,00094777513966752 0,000985572193243466 0,000701915007248035 0,000762951094834821 0,000842565463854144 0,000829569394139283 41429 42952 667 665 0 True 600 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 644 578 0,00084775648339712 0,0008187784636689 0,000610360875867857 0,000656137941557946 0,000788035820015704 0,000713816192508806 37057 35683 667 665 0 True 644 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 244 617 0,000910416844679057 0,00096329172668453 0,000778210116731518 0,000823987182421607 0,000703592175679736 0,000685076990786633 39796 41981 667 665 0 False 244 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 288 617 0,000883810784010604 0,000886216456683021 0,000747692072938125 0,000717174029144732 0,000708932239750054 0,000710570096141489 38633 38622 667 665 0 False 288 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 335 623 0,000919910838812683 0,000891677580309207 0,000823987182421607 0,000778210116731518 0,000720936762976673 0,000716338833032532 40211 38860 667 665 0 True 333 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 379 623 0,000956948854480976 0,000871967054280242 0,000823987182421607 0,000762951094834821 0,000684641703713091 0,000624851337326105 41830 38001 667 665 0 True 377 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 422 617 0,000859217907640366 0,000915541313801785 0,000595101853971161 0,000656137941557946 0,000854442389066882 0,00081283866765155 37558 39900 667 665 0 False 422 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 466 617 0,000941781340961472 0,000883967758719298 0,000625619897764553 0,000457770656900893 0,00096565914403557 0,000988980634290836 41167 38524 667 665 0 False 466 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 511 617 0,00086493718121484 0,000936812160866804 0,000366216525520714 0,000549324788281071 0,00100208890540326 0,00098965624540005 37808 40827 667 665 0 False 511 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 555 617 0,000821173299822966 0,000911571673518885 0,000442511635004196 0,000473029678797589 0,000871186145031725 0,000976241041573013 35895 39727 667 665 0 False 555 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 600 617 0,00101860262361381 0,000971575195714165 0,000839246204318303 0,000762951094834821 0,000804358197621844 0,000767978620246716 44525 42342 667 665 0 False 600 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 644 617 0,000947683631290329 0,000851430475938071 0,000762951094834821 0,000656137941557946 0,000765478360731203 0,000744397462903618 41425 37106 667 665 0 False 644 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 247 667 0,00111377133589305 0,0756628811672119 0,000976577401388571 0,0741741054398413 0,000752305304528238 0,0217378691468826 48685 3297447 667 665 0 True 244 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 288 661 0,00104198301398625 0,000910171973765955 0,000900282291905089 0,000793469138628214 0,000787940081929171 0,000649064673307025 45547 39666 667 665 0 False 288 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 333 661 0,000869649862640207 0,00090399952731451 0,000732433051041428 0,000778210116731518 0,000661533891143023 0,000658680951460811 38014 39397 667 665 0 False 333 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 377 661 0,00088461148231103 0,000883394111279572 0,000747692072938125 0,000778210116731518 0,000658166746967276 0,000632105827876051 38668 38499 667 665 0 False 377 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 422 661 0,000858462963528536 0,000840760633559178 0,000701915007248035 0,000656137941557946 0,000748983543501586 0,000728040908301827 37525 36641 667 665 0 False 422 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 466 661 0,000850638997278655 0,000913545020711541 0,000595101853971161 0,000701915007248035 0,000826851622416266 0,000781989401642872 37183 39813 667 665 0 False 466 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 511 661 0,00090613882804535 0,00090679892682037 0,000625619897764553 0,00064087891966125 0,000875744460356191 0,000851129344509465 39609 39519 667 665 0 False 511 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 555 661 0,000845720422004608 0,00098079944654495 0,000610360875867857 0,00064087891966125 0,000765299001824969 0,000944172412721791 36968 42744 667 665 0 False 555 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 600 661 0,000959991508022597 0,000962327998985791 0,000823987182421607 0,000854505226215 0,000709293614570931 0,000658555105536715 41963 41939 667 665 0 False 600 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 646 666 0,000993803853394886 0,077559313711149 0,00080872816052491 0,0752727550164034 0,000765799674336939 0,0222834941134595 43441 3380095 667 665 0 True 644 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B10_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B10_1.csv new file mode 100755 index 0000000..b9c94ff --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B10_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 265 256 0,0103373810920129 0,047149758121557 0,0103150988021668 0,0468757152666514 0,00150034627650887 0,00837635617254031 451866 2054823 667 665 0 True 265 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 309 256 0,0101930037498989 0,0101987860472881 0,0101319905394064 0,0101930266269932 0,00136042392761026 0,00129051840080702 445555 444471 667 665 0 False 309 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 354 256 0,01036142491812 0,0648281495682442 0,0103608758678569 0,065140764476997 0,00129540640889344 0,0100633643592254 452917 2825261 667 665 0 True 353 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 398 255 0,0103634381024182 0,0858319522771222 0,0103761348897536 0,0841382467383841 0,00134909053743239 0,0147800085806129 453005 3740623 667 665 0 True 398 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 442 255 0,0121509398653843 0,0720248549962684 0,0106202792401007 0,0704356450751507 0,0134925086692014 0,0142993884507896 531140 3138899 667 665 0 True 442 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 485 255 0,0138908572722108 0,0674171581391107 0,0106355382619974 0,0709697108415351 0,0209371550193572 0,0202536743986742 607195 2938092 667 665 0 True 486 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 530 255 0,0106400450495741 0,0818650655019329 0,0103761348897536 0,0783550774395361 0,00260380622740867 0,0238688154242703 465096 3567743 667 665 0 True 531 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 574 254 0,0103327599189648 0,0730239652690894 0,0102845807583734 0,0705119401846342 0,0018415537005527 0,0198625532703027 451664 3182441 667 665 0 True 575 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 619 256 0,0103131771262458 0,0102986924853906 0,0103303578240635 0,0103303578240635 0,00194199998272629 0,00193203292960072 450808 448825 667 665 0 False 619 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 661 255 0,0104178627097529 0,0473671246094178 0,0104219119554437 0,0467078660257877 0,00177240427166216 0,0085910184192425 455384 2064296 667 665 0 True 663 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 265 299 0,0102474512343279 0,0101743716122533 0,0102235446707866 0,0101625085831998 0,0014396995632691 0,00146113396138513 447935 443407 667 665 0 False 265 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 309 299 0,0102910549760597 0,0103954094437283 0,0103303578240635 0,0103608758678569 0,00129525142213254 0,00132687167508216 449841 453040 667 665 0 False 309 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 354 300 0,0105187506956066 0,111327139088279 0,0104371709773404 0,107331960021363 0,00130710090908318 0,0293972637890688 459794 4851723 667 665 0 True 353 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 399 299 0,010429850307165 0,0532157814999848 0,0104371709773404 0,0514076447699702 0,00138292363294932 0,0101541590522231 455908 2319185 667 665 0 True 398 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 442 298 0,0105580764207047 0,0776595184459203 0,0105897611963073 0,0747081712062257 0,00171555273854754 0,0170818516336578 461513 3384462 667 665 0 True 442 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 487 300 0,0104236506146103 0,0472260991228357 0,010452429999237 0,045792324711986 0,00169303697249603 0,0126364908991428 455637 2058150 667 665 0 True 486 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 529 300 0,0103385707009164 0,0443473527031128 0,0102693217364767 0,0470130464637217 0,00153691162621892 0,00907091889318333 451918 1932692 667 665 0 True 530 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 575 300 0,0102646319321456 0,0549221990659872 0,0102845807583734 0,0557564660105287 0,00174623681082488 0,0110026209242915 448686 2393552 667 665 0 True 575 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 619 300 0,00999793076682076 0,010120678211895 0,0100862134737163 0,0100862134737163 0,00192831065237168 0,00193060083953761 437028 441067 667 665 0 False 619 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 663 300 0,0101358567683428 0,0101276767106597 0,0101777676050965 0,0101472495613031 0,00196595780901722 0,00186358019325669 443057 441372 667 665 0 False 663 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 266 344 0,0103425970695129 0,0567815280935229 0,0103761348897536 0,0549782558937972 0,00146544171454889 0,0122527829826345 452094 2474583 667 665 0 True 265 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 311 345 0,0105824634032263 0,0692872717385131 0,0105592431525139 0,0712901503013657 0,00137517956049235 0,0215061166645926 462579 3019593 667 665 0 True 309 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 355 344 0,010638580915539 0,0429799837198857 0,0106660563057908 0,0427557793545434 0,00131001768401431 0,00908945974381052 465032 1873101 667 665 0 True 353 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 399 344 0,0104935630147847 0,0383030820355994 0,0104982070649271 0,0378576333257038 0,00142642545399843 0,00727433971328096 458693 1669278 667 665 0 True 398 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 443 343 0,0111370499231959 0,0730673100696351 0,0108033875028611 0,0702830548561837 0,0030644758393526 0,0137860224455151 486821 3184330 667 665 0 True 442 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 488 344 0,0105021648022407 0,0329793813900739 0,010605020218204 0,0337224383916991 0,00162287452681551 0,00460700302406621 459069 1437267 667 665 0 True 486 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 530 343 0,0103828378783829 0,0313283093290562 0,010452429999237 0,0310978866254673 0,00169664273903893 0,00461860446057849 453853 1365312 667 665 0 True 530 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 575 343 0,010252369809602 0,0557722068962748 0,0101777676050965 0,0539559014267186 0,00185233939403398 0,0105857933971941 448150 2430596 667 665 0 True 575 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 619 343 0,0104106106708605 0,0631099378108811 0,0103608758678569 0,0627908751049058 0,00208181673602435 0,0146229741414675 455067 2750380 667 665 0 True 619 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 663 342 0,0104303764803339 0,070133745900572 0,010406652933547 0,0693980315861753 0,00204192583012401 0,02056955506789 455931 3056483 667 665 0 True 663 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 267 388 0,0105151589918019 0,0537704985741993 0,0104982070649271 0,0527809567406729 0,00160928168351319 0,0176495009463716 459637 2343360 667 665 0 True 265 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 311 388 0,0106518038760432 0,0378565778144147 0,0107118333714809 0,0352941176470588 0,00135521194476222 0,00888660929656704 465610 1649819 667 665 0 True 309 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 355 388 0,0109549711296789 0,0932032300940036 0,010955977721828 0,08886854352636 0,00134515691005174 0,0225721139456973 478862 4061869 667 665 0 True 353 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 399 388 0,010864743869768 0,0700682583088529 0,0109254596780346 0,0677195391775387 0,00166378493823477 0,0182839516230076 474918 3053629 667 665 0 True 397 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 443 387 0,0108875752098773 0,0444468002232636 0,0108033875028611 0,0458686198214694 0,00164094825148711 0,0079536991021453 475916 1937026 667 665 0 True 442 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 487 388 0,0106590787920299 0,0559803491333048 0,0107118333714809 0,0558785381857023 0,00170516456383625 0,0108915626085927 465928 2439667 667 665 0 True 486 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 531 388 0,0105558573425578 0,0464516062415136 0,0105439841306172 0,0449225604638743 0,00175456849709647 0,00905930334785198 461416 2024397 667 665 0 True 530 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 576 388 0,0104042279615514 0,0544239977375345 0,0104219119554437 0,0536202029449912 0,00180080411377929 0,00964960071536661 454788 2371840 667 665 0 True 575 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 620 387 0,0105899213359674 0,0475775384903091 0,0105897611963073 0,046494239719234 0,00199778051575077 0,0102794320983857 462905 2073466 667 665 0 True 619 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 664 387 0,0105192311145869 0,0976164375231969 0,010605020218204 0,0883192187380789 0,00190056758612243 0,0253674857961792 459815 4254200 667 665 0 True 663 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 267 433 0,0106612749930825 0,047707572891946 0,0107118333714809 0,0470588235294118 0,00161336753894144 0,00909793381765733 466024 2079133 667 665 0 True 265 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 311 432 0,0109584026938236 0,0723038312191557 0,0110017547875181 0,0713817044327459 0,00146994164254703 0,019617032308256 479012 3151057 667 665 0 True 309 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 355 431 0,0109613309618937 0,0374606004597211 0,0109102006561379 0,0379034103913939 0,00138787305413652 0,00537030026157277 479140 1632562 667 665 0 True 353 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 400 432 0,0110486985850174 0,0602232062187972 0,0110627908751049 0,0563820859082933 0,00154149867976222 0,0157214390095747 482959 2624574 667 665 0 True 397 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 443 432 0,0113515684364272 0,10146194050014 0,0113527122911421 0,0995345998321508 0,00170662101104589 0,0167705443015378 496198 4421790 667 665 0 True 442 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 488 432 0,0113380709507915 0,0638029498098645 0,0113984893568322 0,0627756160830091 0,00174277540876255 0,014019450556607 495608 2780582 667 665 0 True 486 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 531 432 0,0109312933370806 0,0564956910472565 0,0109712367437247 0,0543526359960327 0,00175120175025194 0,0103319437696506 477827 2462126 667 665 0 True 530 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 576 432 0,0107571757723793 0,0336245970843795 0,0106965743495842 0,0341954680704967 0,0017994186640594 0,00451334881435035 470216 1465386 667 665 0 True 575 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 620 432 0,0111039467677468 0,0433107717795289 0,0108339055466545 0,0437476157778286 0,00333250466779649 0,00640647515647757 485374 1887517 667 665 0 True 619 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 664 431 0,0105508701360009 0,075398957453143 0,0105592431525139 0,0753185320820935 0,00181943710633594 0,0121988097587429 461198 3285945 667 665 0 True 663 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 266 477 0,0106624417248917 0,0561699740309804 0,0107118333714809 0,0574044403753719 0,00161042820517697 0,0151573888989192 466075 2447931 667 665 0 True 264 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 310 476 0,0106516894905717 0,0587867241920319 0,0106660563057908 0,0586404211490043 0,00158239956160448 0,0106053593845738 465605 2561971 667 665 0 True 309 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 354 475 0,0109710766040646 0,0726961372302351 0,0109254596780346 0,0708018616006714 0,00147741251942824 0,0201601616279496 479566 3168154 667 665 0 True 353 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 399 475 0,011169924307702 0,0941365085866417 0,0111543450064851 0,0869306477454795 0,00170938070527559 0,0262743869738798 488258 4102542 667 665 0 True 397 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 442 475 0,0113856324298368 0,0999092375020866 0,0114290074006256 0,0970016021972992 0,00182994780758832 0,0353061437100291 497687 4354122 667 665 0 True 442 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 486 475 0,0111882259831403 0,0520786287072683 0,0111848630502785 0,052124818799115 0,0018746986657402 0,0117673537450142 489058 2269627 667 665 0 True 486 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 531 474 0,0109725864922883 0,0427549303563326 0,0109102006561379 0,0446021210040436 0,001810405645685 0,00725087911850844 479632 1863293 667 665 0 True 530 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 575 475 0,0107771474757014 0,0958053637182909 0,0108033875028611 0,0906385900663767 0,00188153563546643 0,0243164527193075 471089 4175272 667 665 0 True 575 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 619 474 0,0107109411648033 0,0662046510187118 0,0106965743495842 0,0685282673380636 0,00188054762577329 0,0192046218443196 468195 2885250 667 665 0 True 619 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 664 476 0,0106526274514379 0,0783169872495384 0,0107270923933776 0,0738994430457008 0,0020536820265055 0,0142643272478402 465646 3413115 667 665 0 True 663 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 267 521 0,0103323252541731 0,0553776292413341 0,0103761348897536 0,057755397878996 0,00154873191278947 0,013371226619854 451645 2413400 667 665 0 True 264 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 310 520 0,0108090610222469 0,104722850844208 0,0108186465247578 0,0973678187228199 0,00158841358093618 0,0327659811300745 472484 4563903 667 665 0 True 309 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 355 520 0,0110360475518707 0,0611979708942762 0,0109712367437247 0,0622873273823148 0,00151660155099841 0,0159064718764787 482406 2667055 667 665 0 True 353 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 399 520 0,0112628281876457 0,0657001395684221 0,0113221942473487 0,0619974059662776 0,00171675833661761 0,0136810726586172 492319 2863263 667 665 0 True 397 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 443 520 0,0113636704193108 0,0606750109423249 0,0114290074006256 0,0606393530174716 0,00183457900932231 0,00821363528428619 496727 2644264 667 665 0 True 442 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 487 520 0,0110381064903575 0,0638665787838789 0,0110627908751049 0,0641489280537118 0,00194261177674039 0,0134277167473291 482496 2783355 667 665 0 True 486 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 531 520 0,0109436927221901 0,0760162020982876 0,0110017547875181 0,0733196002136263 0,00179808484711705 0,0197325771101791 478369 3312845 667 665 0 True 530 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 575 519 0,0108096329496044 0,0625290394675175 0,0108033875028611 0,0619058518348974 0,00172119779255495 0,0158209672851417 472509 2725064 667 665 0 True 574 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 620 520 0,0104020317604988 0,0446869519874302 0,0103761348897536 0,0442511635004196 0,00188372142171805 0,00588681321995488 454692 1947492 667 665 0 True 619 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 664 520 0,0105678678170642 0,0656311183084743 0,0105897611963073 0,0646524757763027 0,00202846861861378 0,0139509734409606 461941 2860255 667 665 0 True 663 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 267 565 0,0102504938878695 0,0465962571799148 0,01025406271458 0,0478217746242466 0,00137059116073426 0,00929495980663511 448068 2030701 667 665 0 True 264 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 310 563 0,0104651496636667 0,0531213361855084 0,0104982070649271 0,0550240329594873 0,00141854006785065 0,0138105191979483 457451 2315069 667 665 0 True 309 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 354 564 0,010696940383093 0,0538293548015151 0,0107118333714809 0,0533150225070573 0,0014491307509358 0,0134725585023414 467583 2345925 667 665 0 True 353 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 399 564 0,0110804519919029 0,0527069791668459 0,0110322728313115 0,0518043793392844 0,00159679698977427 0,00698450374570397 484347 2297011 667 665 0 True 397 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 443 563 0,0111691007323072 0,0907707584364895 0,0112764171816587 0,0849011978332189 0,00186828484145058 0,0230318118106406 488222 3955860 667 665 0 True 442 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 488 565 0,0109622231685714 0,0662345724691679 0,0110322728313115 0,0637521934843976 0,00195394276530509 0,0130045294996394 479179 2886554 667 665 0 True 486 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 531 564 0,0105769957776891 0,0596371679943737 0,0105592431525139 0,058808270389868 0,00187304689470986 0,00945798869389478 462340 2599034 667 665 0 True 530 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 575 563 0,0105274897456284 0,0415660345645528 0,0105439841306172 0,0422674906538491 0,00165558710038516 0,0106291010990873 460176 1811480 667 665 0 True 574 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 620 564 0,0106353781223373 0,0511683190581168 0,0106507972838941 0,0504615854123751 0,00155857019644526 0,0085826398663928 464892 2229955 667 665 0 True 619 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 664 564 0,0106195014188946 0,0554992654444534 0,0106507972838941 0,0534370946822309 0,00167130319938638 0,00827003932476816 464198 2418701 667 665 0 True 663 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 264 603 0,0104541457813094 0,0104198238787631 0,0102693217364767 0,0104219119554437 0,00197807753883117 0,00129558742785179 456970 454104 667 665 0 False 264 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 309 603 0,0105641159735994 0,0105977004768731 0,0104829480430304 0,0105897611963073 0,0015509304762587 0,00134188334083822 461777 461856 667 665 0 False 309 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 354 608 0,0106953389864921 0,0796366287657803 0,0106813153276875 0,0767376211184863 0,00141426516347808 0,0169656224138356 467513 3470626 667 665 0 True 353 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 398 608 0,0107600811633552 0,0807843137254902 0,0107728694590677 0,0773327229724575 0,00145552684438515 0,0264248913647651 470343 3520643 667 665 0 True 397 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 441 603 0,0108681068026298 0,0108844783049407 0,0108339055466545 0,010955977721828 0,00196296251543566 0,00201590825961805 475065 474354 667 665 0 False 441 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 486 603 0,0107149675333997 0,0106388654171478 0,0106202792401007 0,0106660563057908 0,00226519389435874 0,00185300917875611 468371 463650 667 665 0 False 486 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 530 604 0,0103752884372645 0,0104739073593804 0,0102845807583734 0,0104219119554437 0,00202061681128437 0,00202298055180716 453523 456461 667 665 0 False 530 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 574 604 0,0103622256164204 0,0103840512244218 0,0103913939116503 0,0104219119554437 0,00166171323124007 0,00186150681796251 452952 452545 667 665 0 False 574 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 619 604 0,0103658173202252 0,0103840512244218 0,010406652933547 0,0104219119554437 0,00148705892658805 0,00139464354811293 453109 452545 667 665 0 False 619 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 663 604 0,0104841147748396 0,010365946911224 0,0105287251087205 0,0103761348897536 0,00159527040356415 0,00167986125693619 458280 451756 667 665 0 False 663 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 265 653 0,0101955202302717 0,0437173271930111 0,0102235446707866 0,044785229266804 0,00135342391060996 0,0105953044835774 445665 1905235 667 665 0 True 264 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 309 647 0,0102190378832099 0,0102631951818204 0,0102235446707866 0,0102082856488899 0,00132058149235422 0,00119556916156107 446693 447278 667 665 0 False 309 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 353 647 0,0106855475901326 0,0102896747476381 0,0104371709773404 0,0103608758678569 0,00213569381478983 0,00129517838667202 467085 448432 667 665 0 False 353 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 397 647 0,0109247504881114 0,0104545410218152 0,0107728694590677 0,0104829480430304 0,00180488526051696 0,00134454101641094 477541 455617 667 665 0 False 397 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 441 647 0,0106964142099241 0,0105866635001328 0,0106965743495842 0,0107881284809644 0,00165993770119697 0,00169133590240343 467560 461375 667 665 0 False 441 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 486 647 0,0107659376994954 0,0106180993798298 0,0107881284809644 0,0106202792401007 0,00174708533895034 0,00169298044122757 470599 462745 667 665 0 False 486 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 530 647 0,0103969530455647 0,0103594991140015 0,0104219119554437 0,0103913939116503 0,00182113193260906 0,00172587428917058 454470 451475 667 665 0 False 530 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 574 647 0,0103854458671328 0,0102671648221033 0,0104982070649271 0,0102235446707866 0,001588259830631 0,00138138897620331 453967 447451 667 665 0 False 574 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 619 647 0,0105088449137757 0,0103929771785839 0,0104982070649271 0,0103608758678569 0,00131261139194709 0,0013544305087128 459361 452934 667 665 0 False 619 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 663 653 0,0105908364197393 0,0455337703379529 0,0106355382619974 0,0456855115587091 0,00136381893382631 0,00938173239008116 462945 1984397 667 665 0 True 663 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B10_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B10_2.csv new file mode 100755 index 0000000..88c70a2 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B10_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 265 256 0,00823220799762627 0,764668136351407 0,00813305867093919 0,779079880979629 0,00181366069613797 0,172527918150187 359845 33324830 667 665 13 True 265 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 309 256 0,00680872655912831 0,00666587503319985 0,00674448767833982 0,00668345159075303 0,00149454313119146 0,00109207144552704 297622 290504 667 665 0 False 309 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 354 256 0,00634827928219456 0,00646424943108515 0,0063935301747158 0,00650034332799268 0,0012326819578069 0,0012556101012474 277495 281717 667 665 0 True 353 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 398 255 0,00627015400516725 0,00642804080468968 0,00625619897764553 0,00645456626230259 0,00126180903010033 0,00119694636372688 274080 280139 667 665 0 True 398 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 442 255 0,00685187275897414 0,00670793486348051 0,00650034332799268 0,00675974670023652 0,0035151561933814 0,00156998702969284 299508 292337 667 665 0 True 442 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 485 255 0,00760903594895159 0,00684779010928557 0,00688181887541009 0,0068055237659266 0,00518480939861526 0,00140071911924682 332605 298432 667 665 0 True 486 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 530 255 0,00711736143830122 0,00691848641975734 0,00709544518196384 0,00692759594110018 0,00165004556301674 0,00155641753326676 311113 301513 667 665 0 True 531 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 574 254 0,0071654262134211 0,0073163453380533 0,00708018616006714 0,00737010757610437 0,00168576817186542 0,00151135581615467 313214 318852 667 665 0 True 575 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 619 256 0,00797827225091963 0,00792473286672851 0,00791943236438544 0,00782787823300526 0,00207523422652087 0,00181713372541836 348745 345366 667 665 0 False 619 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 661 255 0,00938281145533894 0,759290765251421 0,009399557488365 0,763912413214313 0,0018152121331365 0,169495305804644 410140 33090480 667 665 14 True 663 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 265 299 0,00682705111166092 0,00666927102604302 0,00679026474402991 0,00671396963454643 0,00150005771118886 0,00142233065840662 298423 290652 667 665 0 False 265 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 309 299 0,00645749453037272 0,00641562707409402 0,00645456626230259 0,00642404821850919 0,00127238720369162 0,00119034614933818 282269 279598 667 665 0 False 309 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 354 300 0,00646335106651298 0,00655096197807405 0,00650034332799268 0,00660715648126955 0,00122621119672795 0,00129794989065393 282525 285496 667 665 0 True 353 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 399 299 0,00646703427869494 0,00664510899588179 0,00645456626230259 0,00659189745937285 0,0013305720707464 0,00128658951684748 282686 289599 667 665 0 True 398 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 442 298 0,00657249768340824 0,00670095931061345 0,00656137941557946 0,0068055237659266 0,00162029446287707 0,00169494342855119 287296 292033 667 665 0 True 442 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 487 300 0,00665801226189377 0,0071884907966873 0,00671396963454643 0,00718699931334401 0,00157313328954027 0,00170747245147739 291034 313280 667 665 0 True 486 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 529 300 0,00682364242461054 0,00694861438329172 0,00683604180972 0,00698863202868696 0,00151927397719274 0,00149088023210456 298274 302826 667 665 0 True 530 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 575 300 0,00720939598866165 0,00730496417284915 0,0072327763790341 0,00737010757610437 0,00168290293891121 0,00180629726216147 315136 318356 667 665 0 True 575 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 619 300 0,00753781955440224 0,00748323085121823 0,00758373388265812 0,00749217975127794 0,00197058001098066 0,00197313291303025 329492 326125 667 665 0 False 619 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 663 300 0,00785018339994571 0,00778953563813402 0,00781261921110857 0,00776684214541848 0,00189679589173059 0,00187756352852777 343146 339474 667 665 0 False 663 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 266 344 0,00613158744500489 0,00615629253954295 0,00616464484626535 0,00619516289005875 0,00133127143560023 0,00137615594357238 268023 268296 667 665 0 True 265 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 311 345 0,00641007031389318 0,00634373757694763 0,0063935301747158 0,0063935301747158 0,00129390322493676 0,0013389063943359 280196 276465 667 665 0 True 309 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 355 344 0,00656892885669777 0,00650114643440829 0,00660715648126955 0,00646982528419928 0,00122930689511594 0,00132049560936681 287140 283325 667 665 0 True 353 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 399 344 0,00675704720310936 0,00695577350333949 0,00679026474402991 0,00692759594110018 0,00131371995322912 0,00132748259721116 295363 303138 667 665 0 True 398 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 443 343 0,00715474261038398 0,00694299263838241 0,00698863202868696 0,00691233691920348 0,00215679992586963 0,00165435795186449 312747 302581 667 665 0 True 442 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 488 344 0,00701997364787508 0,0070297051853713 0,00706492713817044 0,00697337300679027 0,00157632654695179 0,00154604739466589 306856 306360 667 665 0 True 486 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 530 343 0,00701793758648257 0,00701958604453454 0,00704966811627375 0,00708018616006714 0,00150457963615731 0,00165828375525369 306767 305919 667 665 0 True 530 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 575 343 0,00730499936573256 0,00733300405970293 0,00729381246662089 0,00732433051041428 0,00179522557802648 0,00177496981079588 319315 319578 667 665 0 True 575 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 619 343 0,00732620643214671 0,00752221593122197 0,00730907148851759 0,00758373388265812 0,00195198628436862 0,00188573735307154 320242 327824 667 665 0 True 619 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 663 342 0,00693837105251448 0,00714172705740088 0,00692759594110018 0,00717174029144732 0,00190979398652138 0,00179735759303338 303289 311242 667 665 0 True 663 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 267 388 0,00656089899659921 0,00644134942529131 0,00657663843747616 0,0064087891966125 0,00136961110545528 0,00146055849898193 286789 280719 667 665 0 True 265 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 311 388 0,0069056110534799 0,0065905436514151 0,00692759594110018 0,00659189745937285 0,00139118524525226 0,00132343163498664 301857 287221 667 665 0 True 309 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 355 388 0,00687504725549791 0,00694960105688804 0,00689707789730678 0,00692759594110018 0,00136382417503296 0,00133089223644555 300521 302869 667 665 0 True 353 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 399 388 0,00697394493414771 0,00714822074641858 0,00700389105058366 0,00717174029144732 0,00149857443914857 0,0013255984034488 304844 311525 667 665 0 True 397 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 443 387 0,00705655412165741 0,0069411340206777 0,00704966811627375 0,00691233691920348 0,00157483957660219 0,00155283255009411 308455 302500 667 665 0 True 442 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 487 388 0,00706382903764414 0,00722052326972157 0,00708018616006714 0,00714122224765393 0,00162373861778882 0,00182208092954286 308773 314676 667 665 0 True 486 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 531 388 0,00715801403486858 0,0071101535023184 0,00717174029144732 0,00709544518196384 0,00156426661760578 0,00177055376294422 312890 309866 667 665 0 True 530 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 576 388 0,00712980657759928 0,00721602587379412 0,00706492713817044 0,00714122224765393 0,0017775563531097 0,00167040961770082 311657 314480 667 665 0 True 575 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 620 387 0,00675345549930459 0,00680990643236611 0,00675974670023652 0,00686655985351339 0,00189778776565597 0,00192463112001296 295206 296781 667 665 0 True 619 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 664 387 0,00650320296477991 0,00656059925506143 0,00651560234988937 0,00653086137178607 0,00176792199199608 0,00183949042166371 284267 285916 667 665 0 True 663 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 267 433 0,0068685730378116 0,00672470831461809 0,0068055237659266 0,00674448767833982 0,00147147961908173 0,00159752324656143 300238 293068 667 665 0 True 265 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 311 432 0,00699416828550705 0,00700852612189664 0,00700389105058366 0,00703440909437705 0,00146507986791564 0,00138321270180596 305728 305437 667 665 0 True 309 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 355 431 0,00730445031546941 0,00717139610298348 0,00730907148851759 0,00715648126955062 0,001298974178285 0,00129477130277357 319291 312535 667 665 0 True 353 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 400 432 0,00731774190725649 0,00730450525489737 0,00738536659800107 0,00730907148851759 0,00150580426606403 0,00143488907051991 319872 318336 667 665 0 True 397 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 443 432 0,0074992030192274 0,00740636209429502 0,00752269779507134 0,00740062561989776 0,00162710130513803 0,00168525741269813 327804 322775 667 665 0 True 442 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 488 432 0,00756234379948959 0,00760768939974106 0,00759899290455482 0,00756847486076143 0,00171986997330564 0,00169293779254616 330564 331549 667 665 0 True 486 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 531 432 0,00739408277092857 0,00751081182012023 0,00744640268558785 0,00752269779507134 0,0016485960985979 0,0015242184665755 323209 327327 667 665 0 True 530 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 576 432 0,00698771694491505 0,00710834077640886 0,00701915007248035 0,00711070420386053 0,00183026397853816 0,00194813872065269 305446 309787 667 665 0 True 575 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 620 432 0,00686116085925909 0,00681217807622742 0,00668345159075303 0,00691233691920348 0,00240507808523843 0,00164299454281923 299914 296880 667 665 0 True 619 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 664 431 0,00644745148597594 0,00675967786254375 0,00645456626230259 0,00671396963454643 0,00186811505741327 0,00182685311498561 281830 294592 667 665 0 True 663 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 266 477 0,00667452952397685 0,00686848730891087 0,00660715648126955 0,00688181887541009 0,00144243566947657 0,00144172710205454 291756 299334 667 665 0 True 264 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 310 476 0,0067392259466513 0,00690625625634239 0,00668345159075303 0,00692759594110018 0,00146546229720186 0,00146639066100525 294584 300980 667 665 0 True 309 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 354 475 0,00707247657928875 0,00704365629110542 0,00709544518196384 0,00700389105058366 0,00144437416008701 0,00150065974560377 309151 306968 667 665 0 True 353 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 399 475 0,00705817839535256 0,0072286002256729 0,00706492713817044 0,0072480354009308 0,00148170793010936 0,001543950724495 308526 315028 667 665 0 True 397 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 442 475 0,00723570464710423 0,00714480180767781 0,00730907148851759 0,00715648126955062 0,0017948641498567 0,00201913205242571 316286 311376 667 665 0 True 442 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 486 475 0,00711397562834513 0,007423112599535 0,00712596322575723 0,00743114366369116 0,0017950340191394 0,00192720519446797 310965 323505 667 665 0 True 486 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 531 474 0,00702260451371934 0,00684120463667753 0,00703440909437705 0,00685130083161669 0,00161556665000211 0,00160501933062013 306971 298145 667 665 0 True 530 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 575 475 0,00654923167850728 0,00657907070262059 0,00651560234988937 0,00650034332799268 0,00186913844013194 0,00193789326078322 286279 286721 667 665 0 True 575 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 619 474 0,00643399975452878 0,00650474894032977 0,0063782711528191 0,00651560234988937 0,00175393193541829 0,00168417489147179 281242 283482 667 665 0 True 619 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 664 476 0,00650652014345311 0,00658586268830694 0,00654612039368277 0,00657663843747616 0,00184924812809576 0,00173373699088405 284412 287017 667 665 0 True 663 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 267 521 0,00675569745454579 0,00682993820096132 0,0068055237659266 0,00692759594110018 0,00140846591641282 0,00147341474926128 295304 297654 667 665 0 True 264 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 310 520 0,00668329145109295 0,0070875747390908 0,00666819256885634 0,00706492713817044 0,00133272311669483 0,00145619919154914 292139 308882 667 665 0 True 309 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 355 520 0,00702070571489261 0,00699831519746953 0,00706492713817044 0,00703440909437705 0,00146409201638925 0,00142186342003265 306888 304992 667 665 0 True 353 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 399 520 0,00693745596874257 0,00723768680111815 0,00698863202868696 0,00727855344472419 0,00161999632771282 0,00153635440307582 303249 315424 667 665 0 True 397 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 443 520 0,00712289769512131 0,00714305791946105 0,00714122224765393 0,00721751735713741 0,00174715883928442 0,00190965989025304 311355 311300 667 665 0 True 442 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 487 520 0,00704619079794047 0,00686789071557355 0,00704966811627375 0,00689707789730678 0,00171978219093412 0,00173802800671693 308002 299308 667 665 0 True 486 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 531 520 0,0065555457565335 0,00678514780886756 0,00666819256885634 0,00677500572213321 0,0017051821675569 0,00152304943823719 286555 295702 667 665 0 True 530 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 575 519 0,00650352324410008 0,00656511959688647 0,00653086137178607 0,00654612039368277 0,00158366986983551 0,0016888500455877 284281 286113 667 665 0 True 574 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 620 520 0,00656565743221317 0,00656817140126581 0,00659189745937285 0,00657663843747616 0,00178934296597201 0,00185748469093987 286997 286246 667 665 0 True 619 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 664 520 0,00671579980209026 0,00670091341881827 0,00672922865644312 0,00669871061264973 0,00183922292496694 0,00186012309720953 293560 292031 667 665 0 True 663 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 267 565 0,00689428689180244 0,00699735146977079 0,00688181887541009 0,00703440909437705 0,0013239798150419 0,00125900399963716 301362 304950 667 665 0 True 264 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 310 563 0,00691585999172536 0,00703349125847349 0,00691233691920348 0,00703440909437705 0,00141641524079921 0,00133749229260382 302305 306525 667 665 0 True 309 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 354 564 0,00703262468102181 0,0072793794970374 0,00697337300679027 0,00730907148851759 0,00136035231949058 0,00129236061622172 307409 317241 667 665 0 True 353 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 399 564 0,00690304881891853 0,00696960987958567 0,00697337300679027 0,00689707789730678 0,00154133831421973 0,00136837297906957 301745 303741 667 665 0 True 397 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 443 563 0,00682144622355794 0,00708438525932593 0,0068055237659266 0,00715648126955062 0,00191757441439391 0,0019076477123165 298178 308743 667 665 0 True 442 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 488 565 0,00696804264381885 0,00700178002800547 0,00695811398489357 0,00694285496299687 0,00201264848825788 0,00200554391342585 304586 305143 667 665 0 True 486 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 531 564 0,00685294798240614 0,00687952428565118 0,00677500572213321 0,00689707789730678 0,00190326890712409 0,00177914267484597 299555 299815 667 665 0 True 530 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 575 563 0,00671179631058813 0,00692849083110615 0,00668345159075303 0,00701915007248035 0,00158874272367281 0,00164907781130776 293385 301949 667 665 0 True 574 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 620 564 0,00675137368372348 0,00675843878407394 0,00675974670023652 0,00669871061264973 0,00145201995002551 0,00155296350003211 295115 294538 667 665 0 True 619 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 664 564 0,00666137519475556 0,00688810605134948 0,00666819256885634 0,00677500572213321 0,00164770859424899 0,00168480849295882 291181 300189 667 665 0 True 663 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 264 603 0,00732023551053496 0,00736329264452043 0,0072480354009308 0,00738536659800107 0,001357271556387 0,00126499280312337 319981 320898 667 665 0 False 264 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 309 603 0,007319777968649 0,00738589435364562 0,00733958953231098 0,00743114366369116 0,00138893806213909 0,00132520968944673 319961 321883 667 665 0 False 309 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 354 608 0,00698838038064969 0,00729268811763903 0,00701915007248035 0,0072327763790341 0,001329275029407 0,00138578978559479 305475 317821 667 665 0 True 353 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 398 608 0,00684732021720886 0,00696111989747773 0,00691233691920348 0,00698863202868696 0,00135746130678489 0,00123975798643528 299309 303371 667 665 0 True 397 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 441 603 0,00700924429064937 0,00674373046371938 0,00700389105058366 0,00674448767833982 0,0017808713731432 0,0018241598969312 306387 293897 667 665 0 False 441 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 486 603 0,00689996041118832 0,00680226544846896 0,00683604180972 0,00668345159075303 0,00187320893847638 0,00192971725235757 301610 296448 667 665 0 False 486 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 530 604 0,006899091081605 0,00660697291408884 0,00697337300679027 0,00666819256885634 0,0018542475139616 0,00194754704852949 301572 287937 667 665 0 False 530 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 574 604 0,00655707852185146 0,00669873355854732 0,00662241550316625 0,00666819256885634 0,00166307093154971 0,00180021209628551 286622 291936 667 665 0 False 574 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 619 604 0,0066740491049966 0,00663788103814124 0,00672922865644312 0,00663767452506294 0,0013848615506447 0,00133492033166843 291735 289284 667 665 0 False 619 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 663 604 0,00704399459688787 0,00703741500696121 0,00706492713817044 0,00694285496299687 0,00149086537067362 0,00160591134366752 307906 306696 667 665 0 False 663 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 265 653 0,00952025703788069 0,726972110982423 0,00907911802853437 0,759578850995651 0,00259888791230781 0,232005745929907 416148 31682008 667 665 14 True 264 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 309 647 0,00788607756089911 0,00736439404760471 0,0076752880140383 0,00740062561989776 0,00187245523657647 0,00132562067647628 344715 320946 667 665 0 False 309 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 353 647 0,00685953658556394 0,00696823312573033 0,00685130083161669 0,00694285496299687 0,00117480692475703 0,00128136750122361 299843 303681 667 665 0 False 353 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 397 647 0,00671774435510558 0,00672021091869064 0,00675974670023652 0,00672922865644312 0,00133021712253686 0,00135769321079129 293645 292872 667 665 0 False 397 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 441 647 0,00681870097224219 0,00679437205969834 0,00686655985351339 0,00685130083161669 0,00156682532359627 0,00157742436786493 298058 296104 667 665 0 False 441 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 486 647 0,00690734971264654 0,00684884562057467 0,00692759594110018 0,00685130083161669 0,00161156258184202 0,00164094854366085 301933 298478 667 665 0 False 486 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 530 647 0,00685077465844784 0,00667895419482559 0,00691233691920348 0,00668345159075303 0,00162995398825894 0,00171439611992642 299460 291074 667 665 0 False 530 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 574 647 0,0067621030409492 0,00687440735048883 0,00675974670023652 0,0068207827878233 0,00145008189411229 0,00132435733029683 295584 299592 667 665 0 False 574 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 619 647 0,00730682953327639 0,00717325472068819 0,00730907148851759 0,00717174029144732 0,00144462849431228 0,00135811307727995 319395 312616 667 665 0 False 619 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 663 653 0,00889228079940346 0,756780162812616 0,00885023270008392 0,779827573052567 0,00161076746869307 0,204457113487058 388698 32981066 667 665 16 True 663 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B10_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B10_3.csv new file mode 100755 index 0000000..bbad209 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B10_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 265 256 0,00104795393559801 0,0784820600367937 0,000885023270008392 0,077759975585565 0,000814274040733597 0,0211587161068901 45808 3420309 667 665 0 True 265 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 309 256 0,000920253995227152 0,000913063156862171 0,000793469138628214 0,000823987182421607 0,000648839829058979 0,00060664565922192 40226 39792 667 665 0 False 309 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 354 256 0,000915884470216254 0,000915678989187319 0,000854505226215 0,000823987182421607 0,000571283423848524 0,000627053478034532 40035 39906 667 665 0 True 353 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 398 255 0,000908884079361098 0,000960790623847327 0,000823987182421607 0,000823987182421607 0,000616740568013583 0,00066553008806074 39729 41872 667 665 0 True 398 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 442 255 0,000946677039141221 0,000946678896830082 0,000701915007248035 0,000732433051041428 0,000835694174370441 0,000821048245282094 41381 41257 667 665 0 True 442 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 485 255 0,00106845181208892 0,000985457463755521 0,000762951094834821 0,00080872816052491 0,00101371492962334 0,000838039798031042 46704 42947 667 665 0 True 486 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 530 255 0,000978178797989424 0,001001175403604 0,000778210116731518 0,000839246204318303 0,000822846489456525 0,000856703954646433 42758 43632 667 665 0 True 531 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 574 254 0,000863107013671008 0,000903127583206127 0,000579842832074464 0,00064087891966125 0,000863710660728256 0,000849661978927705 37728 39359 667 665 0 True 575 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 619 256 0,00100336647881141 0,00101971568885592 0,000686655985351339 0,000717174029144732 0,00100136143664759 0,000982744913246159 43859 44440 667 665 0 False 619 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 661 255 0,00110711410145236 0,0778867746156419 0,000854505226215 0,0755931944762341 0,000955291846734678 0,0207990624262534 48394 3394366 667 665 0 True 663 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 265 299 0,000912041118374207 0,000921438409482163 0,000747692072938125 0,000762951094834821 0,000732616975049489 0,000740324956975316 39867 40157 667 665 0 False 265 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 309 299 0,000937480447233467 0,00088672126642998 0,000778210116731518 0,000778210116731518 0,000680861723580691 0,000615670341934775 40979 38644 667 665 0 False 309 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 354 300 0,000832909249197786 0,00097168992520211 0,000717174029144732 0,000823987182421607 0,00061710155546442 0,000697037213714415 36408 42347 667 665 0 True 353 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 399 299 0,000914626230029869 0,000819535678289337 0,000778210116731518 0,000656137941557946 0,000686415123866192 0,000651568713231017 39980 35716 667 665 0 True 398 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 442 298 0,000861093829372794 0,000911479889928529 0,000625619897764553 0,000610360875867857 0,000782968058039663 0,000908792505632708 37640 39723 667 665 0 True 442 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 487 300 0,000927483157025287 0,000864257232690332 0,000717174029144732 0,000595101853971161 0,000834427866347697 0,000835498150839947 40542 37665 667 665 0 True 486 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 529 300 0,000870633577695016 0,000976324996515092 0,000686655985351339 0,000823987182421607 0,000753915085828555 0,000828700729410724 38057 42549 667 665 0 True 530 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 575 300 0,000894471509953423 0,000879195012020782 0,000625619897764553 0,000549324788281071 0,000880836180362267 0,000897728560804848 39099 38316 667 665 0 True 575 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 619 300 0,000933911620522996 0,000985686922731411 0,000534065766384375 0,000595101853971161 0,00104345330050756 0,0010345375528764 40823 42957 667 665 0 False 619 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 663 300 0,000990418043438798 0,000970978602376851 0,000656137941557946 0,000595101853971161 0,000957988030938485 0,000974516275188641 43293 42316 667 665 0 False 663 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 266 344 0,000904445923067306 0,000831306923752503 0,000747692072938125 0,000701915007248035 0,000714392069438366 0,000688447247136063 39535 36229 667 665 0 True 265 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 311 345 0,000936656871838743 0,000906431792458945 0,000854505226215 0,000823987182421607 0,00062970955026868 0,000613920873765018 40943 39503 667 665 0 True 309 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 355 344 0,00101167086404154 0,000898446620097968 0,000915541313801785 0,000762951094834821 0,000708313814427086 0,000698428141473097 44222 39155 667 665 0 True 353 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 399 344 0,000890445141356994 0,000922700433849559 0,000747692072938125 0,00080872816052491 0,000689547102093024 0,000664734528973303 38923 40212 667 665 0 True 398 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 443 343 0,00105902644923819 0,000891792309797153 0,000839246204318303 0,000610360875867857 0,000893656416138351 0,000852913538871332 46292 38865 667 665 0 True 442 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 488 344 0,000962439357112471 0,000904481391163879 0,000732433051041428 0,000701915007248035 0,000846348069049843 0,000811468289560757 42070 39418 667 665 0 True 486 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 530 343 0,000856426902136023 0,000903815960133798 0,00064087891966125 0,000701915007248035 0,000750224904328836 0,000847724099761648 37436 39389 667 665 0 True 530 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 575 343 0,000895020560216573 0,000902530989868813 0,000595101853971161 0,000549324788281071 0,000927520449065396 0,000954209196076258 39123 39333 667 665 0 True 575 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 619 343 0,000942582039261898 0,000985549247345877 0,000534065766384375 0,000549324788281071 0,00104970114048429 0,00106407208195486 41202 42951 667 665 0 True 619 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 663 342 0,000954157848976633 0,000894729384688547 0,000625619897764553 0,000518806744487678 0,000958437198263635 0,000916373476611966 41708 38993 667 665 0 True 663 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 267 388 0,00094832418993067 0,000892044714670632 0,00080872816052491 0,000747692072938125 0,000750148796529926 0,000725651545628018 41453 38876 667 665 0 True 265 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 311 388 0,000922404442091154 0,000876693909183579 0,000778210116731518 0,000701915007248035 0,000705165246816912 0,000714959957607151 40320 38207 667 665 0 True 309 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 355 388 0,000947843770950414 0,000937431700101708 0,000869764248111696 0,000823987182421607 0,000687582106442946 0,000689647326800689 41432 40854 667 665 0 True 353 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 399 388 0,000961112485643193 0,000977403453701776 0,000778210116731518 0,000839246204318303 0,000751933287660078 0,000728321377294878 42012 42596 667 665 0 True 397 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 443 387 0,000916982570742553 0,000925063861301227 0,000671396963454643 0,000686655985351339 0,000816546289387038 0,000869077414540387 40083 40315 667 665 0 True 442 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 487 388 0,000972276507660567 0,000923710053343475 0,00064087891966125 0,000595101853971161 0,000886357617952642 0,000898074916654355 42500 40256 667 665 0 True 486 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 531 388 0,000950886424492034 0,000892595416212768 0,000671396963454643 0,000656137941557946 0,000894194871057075 0,000846935659943703 41565 38900 667 665 0 True 530 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 576 388 0,00091929315726664 0,000838190693029208 0,000656137941557946 0,000473029678797589 0,000936817565688592 0,000911878863267345 40184 36529 667 665 0 True 575 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 620 387 0,000872806901653316 0,000905835199121631 0,000442511635004196 0,000564583810177768 0,000961041178037691 0,000939437001183229 38152 39477 667 665 0 True 619 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 664 387 0,000904125643747135 0,000978160668322213 0,000549324788281071 0,000579842832074464 0,000907230027689551 0,000992570215924522 39521 42629 667 665 0 True 663 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 267 433 0,000881408689109325 0,00100849514493489 0,000717174029144732 0,000823987182421607 0,000779534419852493 0,000881851726861665 38528 43951 667 665 0 True 265 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 311 432 0,000988473490423477 0,00101434634882009 0,000854505226215 0,000900282291905089 0,000775220393863967 0,000802697059403643 43208 44206 667 665 0 True 309 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 355 431 0,0010491435445015 0,000946403546059013 0,000930800335698482 0,000823987182421607 0,000765919608941808 0,000670628530161536 45860 41245 667 665 0 True 353 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 400 432 0,000970148937890862 0,00104277631593289 0,000778210116731518 0,000900282291905089 0,000787453552481572 0,000829320749346468 42407 45445 667 665 0 True 397 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 443 432 0,000876146957420809 0,00107407452024431 0,000579842832074464 0,000778210116731518 0,000899292856103593 0,000971157189367701 38298 46809 667 665 0 True 442 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 488 432 0,00101359253996257 0,00101622791242239 0,000747692072938125 0,000717174029144732 0,0009343197691975 0,00093933857694352 44306 44288 667 665 0 True 486 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 531 432 0,000985819747484921 0,000951726994299665 0,000762951094834821 0,000732433051041428 0,000911345438332845 0,000826187742175695 43092 41477 667 665 0 True 530 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 576 432 0,000967952736838264 0,000972011167768357 0,000671396963454643 0,000595101853971161 0,000946712957891655 0,00102133756932073 42311 42361 667 665 0 True 575 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 620 432 0,000889118269887716 0,000901750829350786 0,000473029678797589 0,000579842832074464 0,000967057192649197 0,000887361422674227 38865 39299 667 665 0 True 619 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 664 431 0,000808385004110442 0,000903861851928976 0,0004272526131075 0,000473029678797589 0,000941092443562883 0,000984362212595918 35336 39391 667 665 0 True 663 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 266 477 0,000833183774329361 0,000924559051554269 0,00064087891966125 0,000778210116731518 0,000735394821221006 0,000749969087485034 36420 40293 667 665 0 True 264 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 310 476 0,000932538994865122 0,000958128899727001 0,000793469138628214 0,000793469138628214 0,000805223899622417 0,000797809035832922 40763 41756 667 665 0 True 309 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 354 475 0,000979986088438958 0,000995851955363345 0,000854505226215 0,000946059357595178 0,000787573035709694 0,000778898177641828 42837 43400 667 665 0 True 353 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 399 475 0,000933019413845378 0,000959505653582342 0,000762951094834821 0,000778210116731518 0,0008088882613642 0,000835933918204041 40784 41816 667 665 0 True 397 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 442 475 0,000939813910851853 0,00102650767454227 0,000610360875867857 0,000671396963454643 0,0009730729309173 0,00111377323070805 41081 44736 667 665 0 True 442 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 486 475 0,000944160558768453 0,00100213913130274 0,000625619897764553 0,000579842832074464 0,00094953888779355 0,00106262241252619 41271 43674 667 665 0 True 486 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 531 474 0,000951229580906503 0,000980661771159416 0,00064087891966125 0,000686655985351339 0,000923669575977331 0,00091325272743098 41580 42738 667 665 0 True 530 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 575 475 0,000860956566807006 0,000872196513256132 0,000503547722590982 0,000488288700694286 0,000917322997169015 0,000982647642497232 37634 38011 667 665 0 True 575 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 619 474 0,000876261342892298 0,000891929985182687 0,000442511635004196 0,000503547722590982 0,000927260420282923 0,000919182996243145 38303 38871 667 665 0 True 619 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 664 476 0,000872601007804635 0,000861480779082061 0,0004272526131075 0,000473029678797589 0,000977378298082429 0,000885636075024494 38143 37544 667 665 0 True 663 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 267 521 0,000872212097201571 0,000981120689111196 0,000717174029144732 0,00080872816052491 0,000744254200741798 0,000841845921075424 38126 42758 667 665 0 True 264 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 310 520 0,000933797235051506 0,000914394018922334 0,00080872816052491 0,000793469138628214 0,000773094914357183 0,000744891465101434 40818 39850 667 665 0 True 309 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 355 520 0,000847070170568184 0,000965907559009678 0,000732433051041428 0,000854505226215 0,000697056364350797 0,000799361969773464 37027 42095 667 665 0 True 353 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 399 520 0,000848214025283078 0,000921002437427971 0,000625619897764553 0,000671396963454643 0,000818119843528647 0,000829200827571569 37077 40138 667 665 0 True 397 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 443 520 0,00100350374137719 0,000918661955873892 0,000671396963454643 0,000518806744487678 0,00100522264262248 0,000977076738958494 43865 40036 667 665 0 True 442 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 487 520 0,000943886033636878 0,000919832196650932 0,000610360875867857 0,000625619897764553 0,000939026455155522 0,000876061119764552 41259 40087 667 665 0 True 486 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 531 520 0,000835311344099065 0,00090773970862152 0,000518806744487678 0,000610360875867857 0,000863415085160742 0,000870237361547489 36513 39560 667 665 0 True 530 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 575 519 0,000817329947980919 0,000879057336635248 0,000488288700694286 0,000564583810177768 0,000845282979996378 0,000867489497936197 35727 38310 667 665 0 True 574 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 620 520 0,000896873604854702 0,000903081691410949 0,000579842832074464 0,000595101853971161 0,000936278974329091 0,000939586012128295 39204 39357 667 665 0 True 619 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 664 520 0,000892023660863548 0,000845762839233584 0,000473029678797589 0,0004272526131075 0,00100568710601916 0,000968702945950936 38992 36859 667 665 0 True 663 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 267 565 0,000963926368241835 0,000894155737248821 0,000839246204318303 0,000778210116731518 0,000720957634359335 0,000642400229520022 42135 38968 667 665 0 True 264 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 310 563 0,000886716174986437 0,000925499833355419 0,000778210116731518 0,000778210116731518 0,00070739599409252 0,000737848521208316 38760 40334 667 665 0 True 309 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 354 564 0,00101224279139899 0,00101168462469977 0,000869764248111696 0,000869764248111696 0,000763138915640441 0,000721628020920582 44247 44090 667 665 0 True 353 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 399 564 0,000929999637398055 0,00104422190748099 0,000762951094834821 0,000869764248111696 0,000799648981105893 0,00078350302886874 40652 45508 667 665 0 True 397 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 443 563 0,000941026396849641 0,000959459761787164 0,000549324788281071 0,000503547722590982 0,00100489883060624 0,00106442476908181 41134 41814 667 665 0 True 442 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 488 565 0,000916433520479403 0,000947849137607122 0,000473029678797589 0,000488288700694286 0,00104364772827271 0,00107696081959569 40059 41308 667 665 0 True 486 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 531 564 0,000890170616225419 0,000949248837360052 0,000503547722590982 0,000549324788281071 0,00100137118611115 0,000981920284706513 38911 41369 667 665 0 True 530 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 575 563 0,000804724669022779 0,00089697808265227 0,000549324788281071 0,00064087891966125 0,000823516179049678 0,000815189504537301 35176 39091 667 665 0 True 574 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 620 564 0,000929015922343246 0,000959689220763054 0,000671396963454643 0,000686655985351339 0,000810267635602641 0,000870875894354181 40609 41824 667 665 0 True 619 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 664 564 0,00085569483511849 0,00084351414126986 0,000549324788281071 0,000564583810177768 0,000861355591309767 0,000828310908267656 37404 36761 667 665 0 True 663 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 264 603 0,000949033379853905 0,000938601940878748 0,00080872816052491 0,000823987182421607 0,000677551462219367 0,000677671033985248 41484 40905 667 665 0 False 264 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 309 603 0,000987100864765603 0,00104676890211337 0,000915541313801785 0,000915541313801785 0,000747058192445898 0,000781086670088534 43148 45619 667 665 0 False 309 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 354 608 0,000907968995589182 0,00100906879237462 0,000778210116731518 0,000854505226215 0,000696688207853452 0,000824829138272931 39689 43976 667 665 0 True 353 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 398 608 0,00101578874101516 0,000948308055558902 0,000839246204318303 0,000869764248111696 0,000767963360969613 0,000668175651713618 44402 41328 667 665 0 True 397 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 441 603 0,000949536675928458 0,000950281402751557 0,000595101853971161 0,000518806744487678 0,000984312710785431 0,00101350530234023 41506 41414 667 665 0 False 441 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 486 603 0,000888546342530268 0,000920130493319589 0,000488288700694286 0,000473029678797589 0,000981881287261532 0,00103346851166842 38840 40100 667 665 0 False 486 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 530 604 0,000870976734109484 0,000870636192220079 0,000473029678797589 0,000366216525520714 0,00097174315713166 0,00101991910067909 38072 37943 667 665 0 False 530 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 574 604 0,00081405852349632 0,000834083377360774 0,000534065766384375 0,0004272526131075 0,000828187052130606 0,000896911075322676 35584 36350 667 665 0 False 574 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 619 604 0,000845445896873033 0,000914715261488581 0,00064087891966125 0,000732433051041428 0,00072409042175557 0,000727128650513797 36956 39864 667 665 0 False 619 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 663 604 0,000866447069438501 0,000952759559691171 0,000610360875867857 0,000717174029144732 0,000772079687563794 0,000839577140622131 37874 41522 667 665 0 False 663 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 265 653 0,0011415212512764 0,0743700634052515 0,00102235446707866 0,0754406042572671 0,000720166587795849 0,0262828099517341 49898 3241105 667 665 0 True 264 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 309 647 0,000951412597660886 0,000977036319340351 0,000854505226215 0,000854505226215 0,000660258020946608 0,000681428489614123 41588 42580 667 665 0 False 309 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 353 647 0,000950406005511778 0,000940299937300335 0,000823987182421607 0,000839246204318303 0,000685956830024671 0,00065432036670427 41544 40979 667 665 0 False 353 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 397 647 0,000971887597057502 0,000948468676842025 0,000839246204318303 0,00080872816052491 0,000740787020726245 0,000673617588491856 42483 41335 667 665 0 False 397 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 441 647 0,000956331172934933 0,000907074277591438 0,000793469138628214 0,000625619897764553 0,000769277094356823 0,000865832265355762 41803 39531 667 665 0 False 441 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 486 647 0,000834670785458724 0,000970680305708194 0,000579842832074464 0,000747692072938125 0,000824830244423744 0,000854605542699112 36485 42303 667 665 0 False 486 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 530 647 0,000815682797191471 0,000983300549382153 0,000442511635004196 0,000747692072938125 0,000843270090075134 0,000888885165005308 35655 42853 667 665 0 False 530 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 574 647 0,000803214780799118 0,000902370368585689 0,000579842832074464 0,000762951094834821 0,000752496913381015 0,000736086807359226 35110 39326 667 665 0 False 574 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 619 647 0,00101272321037925 0,000930157850565989 0,000869764248111696 0,000747692072938125 0,000693155433979276 0,00074078336765729 44268 40537 667 665 0 False 619 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 663 653 0,0010534215611352 0,0783584275405841 0,000915541313801785 0,0778820477607385 0,000747862496372738 0,0246975139899505 46047 3414921 667 665 0 True 663 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B11_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B11_1.csv new file mode 100755 index 0000000..238093e --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B11_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 255 266 0,0103308721731162 0,0451577100223665 0,0102845807583734 0,0456702525368124 0,00153801288743053 0,00963207311029404 421792 1968008 623 665 0 True 255 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 299 267 0,0105686238995226 0,0104851279033014 0,0105592431525139 0,0104982070649271 0,00130550717441156 0,001229897381662 431499 456950 623 665 0 False 299 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 344 267 0,0105489316786479 0,0614311700514734 0,0105592431525139 0,0613565270466163 0,00131104931705786 0,00826401747530614 430695 2677218 623 665 0 True 343 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 387 266 0,0108244268283976 0,0859882597314986 0,0108186465247578 0,0839093614099336 0,00129637233846307 0,0153866444695745 441943 3747435 623 665 0 True 387 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 433 267 0,0105208384232458 0,0719637730168865 0,010605020218204 0,0678721293965057 0,0016225750261317 0,0150563392101326 429548 3136237 623 665 0 True 431 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 475 265 0,0105219405997873 0,0682635634634767 0,0106507972838941 0,0700236514839399 0,00175184856473602 0,0210714132277986 429593 2974979 623 665 0 True 476 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 520 267 0,0106783272046194 0,0806166251059097 0,010605020218204 0,0785992217898833 0,00162281669163995 0,0236350982425686 435978 3513335 623 665 0 True 520 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 565 267 0,010621209966958 0,0725436387948585 0,0106813153276875 0,0704509040970474 0,00163366875998792 0,0198643998648311 433646 3161508 623 665 0 True 564 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 608 267 0,0103162009787083 0,0104649584593207 0,01025406271458 0,0104676890211337 0,00205483555696464 0,00182404514521999 421193 456071 623 665 0 False 608 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 651 266 0,0101594959673197 0,0466337737224728 0,0101472495613031 0,0461585412375067 0,00179063700457826 0,01005127354474 414795 2032336 623 665 0 True 652 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 255 310 0,0105247082875471 0,0102412589037253 0,0105745021744106 0,0102693217364767 0,00148699693309593 0,00147395932523642 429706 446322 623 665 0 False 255 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 299 310 0,0105529729926334 0,010298279459234 0,0105134660868238 0,0103150988021668 0,00135072244618393 0,00130415204221487 430860 448807 623 665 0 False 299 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 344 311 0,0107821522348283 0,102676099725166 0,010757610437171 0,0987563897154192 0,0012998919311333 0,0273700185100312 440217 4474704 623 665 0 True 343 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 388 312 0,0105886100341418 0,0524057913150925 0,0105592431525139 0,0504921034561685 0,00131162943465857 0,00866297834353565 432315 2283885 623 665 0 True 387 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 433 311 0,0105962762843082 0,0784401837736938 0,0105745021744106 0,0779125658045319 0,00166831355241784 0,0166327222828256 432628 3418484 623 665 0 True 431 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 477 312 0,0105048446169881 0,0429745455421571 0,0104829480430304 0,0437933928435187 0,00182069157383445 0,00817968055040232 428895 1872864 623 665 0 True 476 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 521 311 0,0103613657240975 0,0497111857235214 0,0103608758678569 0,04956130312047 0,00168909098269044 0,0146098820246158 423037 2166452 623 665 0 True 520 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 566 312 0,0106990971092236 0,0595424702750238 0,0106507972838941 0,0554970626382849 0,00170990420321033 0,0175366082419118 436826 2594907 623 665 0 True 564 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 608 311 0,0104851034104894 0,0103384118341172 0,0104371709773404 0,0103150988021668 0,00213249919073845 0,00210683979980168 428089 450556 623 665 0 False 608 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 652 311 0,0105287251087205 0,0102162249294557 0,0105287251087205 0,0102998397802701 0,00204841057829225 0,00189917289973942 429870 445231 623 665 0 False 652 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 257 357 0,0105830991514343 0,0547230975126073 0,010605020218204 0,0530861371786069 0,00154801538470531 0,0112987273156418 432090 2384875 623 665 0 True 255 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 301 356 0,0106965008711481 0,065816888295355 0,0107118333714809 0,0694743266956588 0,00138747053126275 0,0197417584709512 436720 2868351 623 665 0 True 299 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 344 356 0,0104642600274491 0,0412322405923254 0,010406652933547 0,0421606775005722 0,0013913170623936 0,00692705196668576 427238 1796933 623 665 0 True 343 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 389 356 0,0105622067827699 0,0354477404314173 0,0105134660868238 0,0359349965667201 0,00135222111372284 0,00485966971724362 431237 1544840 623 665 0 True 387 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 433 355 0,0105780536321554 0,0716908774568603 0,0105439841306172 0,0683451590753033 0,00165562436181471 0,0139607972450036 431884 3124344 623 665 0 True 431 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 478 356 0,0103904141991689 0,0375471523854268 0,0103761348897536 0,0362554360265507 0,00174674914133235 0,00900200178322978 424223 1636334 623 665 0 True 476 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 522 356 0,0104500786892819 0,030000866207634 0,0105592431525139 0,0303654535744259 0,00163130332916609 0,0038570058958932 426659 1307461 623 665 0 True 520 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 565 356 0,0104695749676603 0,0540064741850047 0,0104829480430304 0,0537575341420615 0,00178439223659103 0,00906308575319377 427455 2353644 623 665 0 True 564 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 609 356 0,0105815316114642 0,060628889688171 0,0106355382619974 0,0603799496452277 0,00200140502741959 0,014438335069357 432026 2642254 623 665 0 True 608 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 654 356 0,0106708324041373 0,0723530960612793 0,0105592431525139 0,0704814221408408 0,00218695055021445 0,0228272309699742 435672 3153204 623 665 0 True 652 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 257 401 0,0104910061781894 0,0519862714694725 0,010452429999237 0,0513313496604868 0,00156720786216483 0,0151966276182482 428330 2265602 623 665 0 True 255 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 301 401 0,0105552753169645 0,0344417922811148 0,0105287251087205 0,0343480582894636 0,00138981188387941 0,00466267213267031 430954 1501000 623 665 0 True 299 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 345 401 0,0107801683170536 0,0906359971799492 0,0108186465247578 0,0851606012054627 0,00130894111585221 0,0207069854004973 440136 3949987 623 665 0 True 343 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 390 400 0,0106666931189037 0,0668206106935914 0,0107118333714809 0,0654154268711376 0,00139673725670465 0,017334897263548 435503 2912094 623 665 0 True 387 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 433 400 0,0109212224215529 0,043298151535855 0,0109254596780346 0,0446784161135271 0,00159024430232747 0,0068034411055387 445895 1886967 623 665 0 True 431 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 478 400 0,0107609659524195 0,0553298099907585 0,0108491645685512 0,055741206988632 0,00165827235865429 0,0100739479769167 439352 2411316 623 665 0 True 475 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 522 401 0,0108006932935374 0,0431272045988168 0,0107881284809644 0,0435339894712749 0,00172589082739473 0,0058575999819938 440974 1879517 623 665 0 True 520 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 566 400 0,0105173359511251 0,0536035442233416 0,0104676890211337 0,0523537041275654 0,00178745219984962 0,00877287140763109 429405 2336084 623 665 0 True 564 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 609 400 0,0105001419970778 0,0442223663989454 0,0104676890211337 0,0443579766536965 0,00197815872579936 0,00770869441731657 428703 1927245 623 665 0 True 608 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 654 400 0,0104424614247395 0,0961903958798346 0,0104219119554437 0,0887312123292897 0,00190599957835842 0,0221404907096681 426348 4192052 623 665 0 True 652 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 257 446 0,0105072938981915 0,0466469446676889 0,0104371709773404 0,0465857938506142 0,00156980944468757 0,00787952039275627 428995 2032910 623 665 0 True 254 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 301 445 0,0106542507703908 0,0604342855307185 0,0106660563057908 0,0608224612802319 0,00150547004884841 0,0110373300331728 434995 2633773 623 665 0 True 299 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 345 445 0,010944123200804 0,0380968443080693 0,0110017547875181 0,0376897840848402 0,00140583406443548 0,00598825372058709 446830 1660290 623 665 0 True 343 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 390 444 0,0108268026311648 0,0540419944344725 0,0109102006561379 0,0537727931639582 0,00152074668424468 0,00997445872627928 442040 2355192 623 665 0 True 387 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 434 445 0,0110793480160394 0,101037716745515 0,011108567940795 0,0977187762264439 0,00183654805228483 0,0180042227688822 452351 4403302 623 665 0 True 431 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 478 445 0,0109818176385231 0,0617602830605927 0,0109864957656214 0,0605935759517815 0,00186174064085105 0,0128033539487522 448369 2691561 623 665 0 True 475 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 522 445 0,0108502912379047 0,0548011824021028 0,0108644235904479 0,0535896849011978 0,00174101725883527 0,00911126950441667 442999 2388278 623 665 0 True 520 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 566 445 0,0106247614247028 0,0327412488648951 0,0105897611963073 0,0329442282749676 0,00174890729749227 0,00469778814769174 433791 1426889 623 665 0 True 564 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 611 445 0,0102924919366601 0,0447362168295539 0,0103150988021668 0,0433356221866178 0,0018412401512224 0,00916935945569926 420225 1949639 623 665 0 True 608 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 654 444 0,0102814701712452 0,0726405393203769 0,0103150988021668 0,0725413900968948 0,00196856097642681 0,0118222724742364 419775 3165731 623 665 0 True 652 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 257 490 0,0104456209974918 0,0550889927955618 0,0103913939116503 0,0554818036163882 0,00149588290987997 0,0139522529588868 426477 2400821 623 665 0 True 254 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 300 489 0,010682441997041 0,056463337331656 0,010757610437171 0,0555123216601816 0,00151680841677914 0,00948187959271138 436146 2460716 623 665 0 True 299 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 344 489 0,010972926747755 0,0763316164065462 0,0108491645685512 0,0713969634546426 0,00159153924219246 0,0235863576405267 448006 3326591 623 665 0 True 343 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 389 488 0,0112166792131096 0,0963314213664167 0,0112306401159686 0,0904859998474098 0,00157800013536061 0,0278001646753244 457958 4198198 623 665 0 True 387 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 433 489 0,0113197694589575 0,102477480035635 0,0112306401159686 0,0968337529564355 0,00193665534058341 0,0335986379941557 462167 4466048 623 665 0 True 431 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 477 490 0,0109040039746935 0,0536422998443694 0,0108949416342412 0,0539559014267186 0,00191288764259066 0,0123752725546174 445192 2337773 623 665 0 True 475 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 520 489 0,0108682934547491 0,0457978776192025 0,0109254596780346 0,0472266727702754 0,00178765646800082 0,00804465636892866 443734 1995907 623 665 0 True 520 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 565 489 0,0107830339760615 0,102214703616446 0,0108186465247578 0,0970778973067826 0,00174510933589862 0,0211886317495199 440253 4454596 623 665 0 True 564 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 609 490 0,0104220834051279 0,0663824128873339 0,0104982070649271 0,0675364309147784 0,00181363336023954 0,0206598480687164 425516 2892997 623 665 0 True 608 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 653 489 0,0103477967062311 0,0750816386353845 0,0103913939116503 0,0713206683451591 0,00186166152959088 0,0141694167153241 422483 3272116 623 665 0 True 652 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 256 534 0,0104860586301587 0,0536267654717017 0,010406652933547 0,0567330434119173 0,00139095794712046 0,0123929263201247 428128 2337096 623 665 0 True 254 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 298 533 0,0107769842514893 0,10463623008081 0,0107728694590677 0,0988021667811093 0,00152588953866698 0,0320862285966426 440006 4560128 623 665 0 True 299 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 344 533 0,011016401489114 0,0610531822804895 0,011108567940795 0,0622873273823148 0,00142801336062154 0,0171314539245101 449781 2660745 623 665 0 True 343 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 388 533 0,0110032488490521 0,0592921534782252 0,0109864957656214 0,0600747692072938 0,00156175185852826 0,00961678789369459 449244 2583998 623 665 0 True 387 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 432 533 0,0109098332639574 0,0597237658118746 0,0108949416342412 0,060166323338674 0,00184199357346975 0,00864745270849174 445430 2602808 623 665 0 True 431 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 475 533 0,0107845770232196 0,0638858303919561 0,0108644235904479 0,0636453803311208 0,00190463219893772 0,0156382533872489 440316 2784194 623 665 0 True 475 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 520 533 0,0108191608738105 0,0752615344724824 0,0107423514152743 0,0731212329289693 0,00193710657480213 0,0198581859548658 441728 3279956 623 665 0 True 520 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 564 532 0,0107134498970751 0,0607590158733983 0,0106507972838941 0,061722743572137 0,00175666777257375 0,0157458258524587 437412 2647925 623 665 0 True 564 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 609 533 0,0103157846009037 0,0453204423280678 0,010452429999237 0,0441596093690394 0,00168521699335382 0,00764531280329093 421176 1975100 623 665 0 True 608 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 652 532 0,0103042974720601 0,0661311553087342 0,0103913939116503 0,065644312199588 0,00180419963635661 0,0160870118458673 420707 2882047 623 665 0 True 652 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 254 570 0,0138730961277966 0,0358451633776591 0,0108186465247578 0,0415503166247044 0,00806641678971484 0,019551731983264 566415 1562160 623 665 0 False 254 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 299 570 0,0149440933195733 0,0416993272836474 0,0112001220721752 0,048050659952697 0,0112106434958383 0,0225020778946518 610142 1817289 623 665 0 False 299 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 343 570 0,0138476970817182 0,0426162682972021 0,0114747844663157 0,0479438467994202 0,0075983200528286 0,0226520864427337 565378 1857250 623 665 0 False 343 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 387 570 0,0151358720377934 0,040043551313624 0,0115358205539025 0,0477759975585565 0,00972642101426849 0,019373299898115 617972 1745129 623 665 0 False 387 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 431 570 0,0181656328863028 0,068285660362855 0,0117952239261463 0,0758831158922713 0,0173085210353402 0,0445599737381832 741672 2975942 623 665 0 False 431 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 475 570 0,0160501642181815 0,0492068348945148 0,0116273746852827 0,0561074235141527 0,0126157160824638 0,0286568694494384 655301 2144472 623 665 0 False 475 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 521 578 0,0104747674438113 0,0584031835138315 0,0104676890211337 0,0584420538643473 0,00206719733570565 0,0104145390741002 427667 2545256 623 665 0 True 520 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 565 577 0,0103681012474067 0,0378537095772161 0,0104371709773404 0,0400701915007248 0,00167193124384904 0,0084690178229108 423312 1649694 623 665 0 True 564 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 610 577 0,0102623657778593 0,0508152046401194 0,0102235446707866 0,0504615854123751 0,00160949302159534 0,0075404046112998 418995 2214566 623 665 0 True 608 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 654 577 0,0103421633594635 0,0557108495661218 0,0104371709773404 0,0538643472953384 0,0016150647810514 0,008672202777924 422253 2427922 623 665 0 True 652 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 254 614 0,0110571820211493 0,0100897241960475 0,0102693217364767 0,0101472495613031 0,00429910053735214 0,00131242526287895 451446 439718 623 665 0 False 254 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 299 614 0,0108389755587453 0,0102462381635021 0,010101472495613 0,01025406271458 0,0039723776693605 0,00144002619861696 442537 446539 623 665 0 False 299 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 343 614 0,0172981954553342 0,0583737439272248 0,0110475318532082 0,0716868848706798 0,0164669848715121 0,0344110300654327 706256 2543973 623 665 0 False 343 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 387 614 0,0164900551222981 0,0646867110555056 0,0111238269626917 0,0693675135423819 0,0135104046248813 0,0436103827893116 673261 2819097 623 665 0 False 387 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 431 614 0,0125583954562895 0,0104052991255892 0,0108186465247578 0,0103761348897536 0,00908419431657102 0,00179186923796061 512738 453471 623 665 0 False 431 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 475 614 0,0119182758138012 0,0104447201776471 0,0107270923933776 0,0104982070649271 0,00642611029960443 0,00196371990373076 486603 455189 623 665 0 False 475 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 519 614 0,0115564679944465 0,010055580700435 0,0105745021744106 0,0100404364080262 0,00532181563694029 0,00196487412446582 471831 438230 623 665 0 False 519 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 564 614 0,0105334522214429 0,0100868559588488 0,0104676890211337 0,0100862134737163 0,00228538207911192 0,00188457732288718 430063 439593 623 665 0 False 564 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 608 614 0,0105734734763052 0,0100685221866752 0,010101472495613 0,00997940032043946 0,0031617826289111 0,00145132098344873 431697 438794 623 665 0 False 608 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 652 614 0,0106606923799555 0,0100967685866073 0,0103150988021668 0,0101319905394064 0,00296911763230305 0,0015786281745318 435258 440025 623 665 0 False 652 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 254 657 0,0120326572459964 0,0350902433469804 0,0104676890211337 0,0410772869459068 0,00615311624549536 0,0171547705931704 491273 1529260 623 665 0 False 254 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 298 657 0,00996847652627264 0,00989996162298628 0,0100251773861295 0,00991836423285267 0,00126861607615999 0,00116867112389002 406996 431448 623 665 0 False 298 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 343 657 0,0142399739592422 0,0100790543536686 0,0103761348897536 0,0100556954299229 0,013601634008441 0,00128554836254907 581394 439253 623 665 0 False 343 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 387 657 0,0128059932931333 0,0100962867227579 0,0105745021744106 0,0100556954299229 0,00941925737300061 0,0013460146402164 522847 440004 623 665 0 False 387 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 431 657 0,0101783309397733 0,0102149629050883 0,0101625085831998 0,0102388036926833 0,00158178927733519 0,00153650577980202 415564 445176 623 665 0 False 431 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 475 657 0,01026442317407 0,0102769856662714 0,0102845807583734 0,0102693217364767 0,00158109656321223 0,00160932605454015 419079 447879 623 665 0 False 475 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 519 657 0,0101917530007675 0,0100270360038343 0,0102388036926833 0,0101167315175097 0,00179105010633386 0,00160753503508764 416112 436986 623 665 0 False 519 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 564 657 0,0101488171012732 0,00994080532069473 0,0101777676050965 0,00994888227664607 0,00159192361546054 0,00152720354804974 414359 433228 623 665 0 False 564 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 608 657 0,00999265093174943 0,0100152647583711 0,00999465934233616 0,0100404364080262 0,00132554248306371 0,00138756382721505 407983 436473 623 665 0 False 608 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 651 662 0,0101201605111944 0,0454905402668952 0,010101472495613 0,0460517280842298 0,00138087365645595 0,00930537626518664 413189 1982513 623 665 0 True 652 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B11_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B11_2.csv new file mode 100755 index 0000000..dce1dfa --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B11_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 255 266 0,00840502685575607 0,75231454695333 0,00813305867093919 0,7879911497673 0,00215731141509596 0,20083298015854 343163 32786451 623 665 13 True 255 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 299 267 0,0068356009391034 0,00662386109471436 0,00671396963454643 0,00669871061264973 0,0016556293537563 0,00121660909026425 279086 288673 623 665 0 False 299 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 344 267 0,00618693330521558 0,00645936195489869 0,00622568093385214 0,00646982528419928 0,00119090292722595 0,00129149597850868 252602 281504 623 665 0 True 343 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 387 266 0,00633102451840702 0,00642134060259369 0,0063782711528191 0,00642404821850919 0,00128082534765514 0,00123402997468803 258485 279847 623 665 0 True 387 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 433 267 0,00642017835420795 0,00653625365771949 0,00643930724040589 0,00659189745937285 0,00143854165426904 0,00155197339476795 262125 284855 623 665 0 True 431 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 475 265 0,0065827861332965 0,00636459539785605 0,00659189745937285 0,00642404821850919 0,00146907586233782 0,00163232680772388 268764 277374 623 665 0 True 476 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 520 267 0,00662895508397912 0,00666160709624829 0,00662241550316625 0,00668345159075303 0,00147328638165124 0,00159535443938725 270649 290318 623 665 0 True 520 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 565 267 0,00707036454244182 0,00707467914464578 0,00706492713817044 0,00706492713817044 0,0015028884700245 0,00154045590496089 288671 308320 623 665 0 True 564 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 608 267 0,00766576031015738 0,00767459963711063 0,00752269779507134 0,00770580605783169 0,00200898631916341 0,00180078553600132 312980 334465 623 665 0 False 608 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 651 266 0,00909153588423521 0,762241079925724 0,00892652780956741 0,785549706263828 0,00200691082800785 0,193065643569721 371192 33219057 623 665 15 True 652 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 255 310 0,00670659729812443 0,00652696056919594 0,00663767452506294 0,00650034332799268 0,0015462249144077 0,00136251279770101 273819 284450 623 665 0 False 255 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 299 310 0,00668406391105386 0,00632900631069548 0,00645456626230259 0,00636301213092241 0,00172734902511659 0,0012290270553959 272899 275823 623 665 0 False 299 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 344 311 0,00624926751184013 0,00636124529680805 0,00624093995574884 0,00627145799954223 0,00121865931380333 0,00133945872956614 255147 277228 623 665 0 True 343 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 388 312 0,00635549283762821 0,00649586887796282 0,00636301213092241 0,00646982528419928 0,00124887425958348 0,00139593033893667 259484 283095 623 665 0 True 387 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 433 311 0,00639357916033987 0,00634793667620642 0,00631723506523232 0,0064087891966125 0,00147910908024354 0,00168777566912488 261039 276648 623 665 0 True 431 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 477 312 0,00663147784361854 0,00666582914140467 0,00671396963454643 0,00671396963454643 0,00153138342002042 0,00163139403027246 270752 290502 623 665 0 True 476 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 521 311 0,00652640367999602 0,00684457768362311 0,00654612039368277 0,0068055237659266 0,00145900145179249 0,00151991532217765 266462 298292 623 665 0 True 520 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 566 312 0,00688556627565117 0,00700136700184887 0,00698863202868696 0,00698863202868696 0,00172999372099211 0,00146777516799054 281126 305125 623 665 0 True 564 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 608 311 0,00725477092423994 0,00739851459731958 0,0072632944228275 0,00743114366369116 0,00198218874402148 0,00190861955693021 296200 322433 623 665 0 False 608 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 652 311 0,00773936121031721 0,00753733727773313 0,00756847486076143 0,00753795681696803 0,00190701269257858 0,00176212175259089 315985 328483 623 665 0 False 652 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 257 357 0,0061985184053073 0,00634520611439333 0,00624093995574884 0,00633249408712902 0,00139095657175526 0,00143346882327915 253075 276529 623 665 0 True 255 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 301 356 0,00614059290484873 0,00631338015443736 0,00608834973678187 0,00630197604333562 0,00121680582536517 0,00128756631994867 250710 275142 623 665 0 True 299 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 344 356 0,00625570912140487 0,00633517875714693 0,00625619897764553 0,00634775310902571 0,00123050559409945 0,00127767850773259 255410 276092 623 665 0 True 343 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 389 356 0,0064953467943379 0,00653081547999089 0,00650034332799268 0,00657663843747616 0,00125829759616267 0,00123966517988127 265194 284618 623 665 0 True 387 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 433 355 0,00631571651088626 0,00674802134656853 0,00628671702143893 0,00666819256885634 0,00158088806829226 0,00178844103628111 257860 294084 623 665 0 True 431 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 478 356 0,00658863991537244 0,00656470657072987 0,00656137941557946 0,00656137941557946 0,00160188324798363 0,00157578503804874 269003 286095 623 665 0 True 476 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 522 356 0,00651944772137859 0,00659384786066792 0,00656137941557946 0,00651560234988937 0,00162338673923952 0,00155968144835574 266178 287365 623 665 0 True 520 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 565 356 0,0068792471301466 0,00680701524926989 0,00691233691920348 0,00685130083161669 0,0018597309814602 0,00173560885053218 280868 296655 623 665 0 True 564 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 609 356 0,00729244086914703 0,00717731614456145 0,0072327763790341 0,00717174029144732 0,00198778065069087 0,00187998735584902 297738 312793 623 665 0 True 608 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 654 356 0,0066902116068742 0,00657475687387386 0,00665293354695964 0,00659189745937285 0,00203198680654342 0,00185041572996661 273150 286533 623 665 0 True 652 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 257 401 0,00611668792030431 0,0062949087068782 0,00613412680247196 0,00628671702143893 0,00140393467553052 0,00144859352527155 249734 274337 623 665 0 True 255 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 301 401 0,00638302275835355 0,00654935576524282 0,0063935301747158 0,00656137941557946 0,00138776526683338 0,00124739564387486 260608 285426 623 665 0 True 299 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 345 401 0,00678066356171288 0,00676651574002528 0,00671396963454643 0,00677500572213321 0,00134407825965945 0,00125486616748303 276843 294890 623 665 0 True 343 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 390 400 0,00681740277976272 0,0066749616086451 0,00686655985351339 0,00662241550316625 0,0013649575649866 0,00134807415679328 278343 290900 623 665 0 True 387 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 433 400 0,00670774846028999 0,00668907333566234 0,00666819256885634 0,00679026474402991 0,00148978661454321 0,00151164454446385 273866 291515 623 665 0 True 431 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 478 400 0,0067257506771344 0,00696176238261022 0,00679026474402991 0,00698863202868696 0,00162040174587583 0,00151722542346838 274601 303399 623 665 0 True 475 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 522 401 0,0069809902713326 0,00700313383596322 0,00695811398489357 0,00700389105058366 0,00159151392666258 0,00163289036169959 285022 305202 623 665 0 True 520 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 566 400 0,00666733532043517 0,00681204040084189 0,00671396963454643 0,00679026474402991 0,00168229328992612 0,00163459450765923 272216 296874 623 665 0 True 564 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 609 400 0,00640663382915357 0,00654609744778518 0,00636301213092241 0,00651560234988937 0,00186382914409175 0,00187063326553391 261572 285284 623 665 0 True 608 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 654 400 0,00620532740705253 0,0060444083428989 0,00627145799954223 0,0059510185397116 0,00183429679007039 0,00170261978767531 253353 263420 623 665 0 True 652 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 257 446 0,00641785153706479 0,00639984029655278 0,00642404821850919 0,00643930724040589 0,00147756419958992 0,00143809034863459 262030 278910 623 665 0 True 254 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 301 445 0,00664291598683805 0,00675130260992376 0,00663767452506294 0,00677500572213321 0,00145161532319504 0,00137395384116488 271219 294227 623 665 0 True 299 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 345 445 0,00676863759100457 0,0069139660779323 0,00675974670023652 0,00695811398489357 0,00139598657560801 0,00137140197973798 276352 301316 623 665 0 True 343 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 390 444 0,00676035902053734 0,0069089409263603 0,00674448767833982 0,00694285496299687 0,00144610876555684 0,00135369423388482 276014 301097 623 665 0 True 387 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 434 445 0,00685884461772293 0,00703144907358807 0,00683604180972 0,00708018616006714 0,00164720058796216 0,00181450296273536 280035 306436 623 665 0 True 431 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 478 445 0,00702539573954883 0,00714991874284016 0,00697337300679027 0,00720225833524071 0,00176203707130352 0,00189386965763947 286835 311599 623 665 0 True 475 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 522 445 0,0072782595309798 0,00734034674693142 0,0072480354009308 0,00738536659800107 0,00167134463416074 0,00164834075335739 297159 319898 623 665 0 True 520 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 566 445 0,00635463558920705 0,00626519376950043 0,00643930724040589 0,00630197604333562 0,00181058315001111 0,0018853487525666 259449 273042 623 665 0 True 564 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 611 445 0,00603622903277518 0,00611446216823817 0,00607309071488518 0,00605783169298848 0,00174139081427236 0,00164825060237498 246449 266473 623 665 0 True 608 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 654 444 0,00600032257033448 0,00596239970491576 0,0059662775616083 0,0059662775616083 0,00184884749842491 0,00193063244457233 244983 259846 623 665 0 True 652 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 257 490 0,00652309715037154 0,00653864003106875 0,00657663843747616 0,00654612039368277 0,00148333836316828 0,00145782536921724 266327 284959 623 665 0 True 254 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 300 489 0,0066979513354767 0,00669051892721045 0,00672922865644312 0,00669871061264973 0,00148546407582107 0,00147998653696933 273466 291578 623 665 0 True 299 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 344 489 0,00671659036543398 0,00679652897407171 0,00677500572213321 0,00677500572213321 0,00148228644090659 0,00153980202495989 274227 296198 623 665 0 True 343 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 389 488 0,00667990013300822 0,00662278263752767 0,00672922865644312 0,00662241550316625 0,00149706311682039 0,00163585833065101 272729 288626 623 665 0 True 387 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 433 489 0,00671700674323855 0,00708165469751284 0,00677500572213321 0,00715648126955062 0,00170083054064043 0,00188751707856976 274244 308624 623 665 0 True 431 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 477 490 0,00662574652560277 0,00678354159603633 0,00660715648126955 0,00679026474402991 0,00179652645393085 0,00172987812794165 270518 295632 623 665 0 True 475 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 520 489 0,00612374185016988 0,00609906547095594 0,00611886778057527 0,00599679560540169 0,00166403161985527 0,00162826829550737 250022 265802 623 665 0 True 520 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 565 489 0,00605768473611628 0,00591637023435219 0,00604257267109178 0,00588998245212482 0,00177833651856682 0,00172331993075355 247325 257840 623 665 0 True 564 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 609 490 0,00595711724990788 0,00595865952360875 0,00599679560540169 0,00592050049591821 0,00173710690795666 0,00171020222476586 243219 259683 623 665 0 True 608 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 653 489 0,00598503905562575 0,00587896842128209 0,0059662775616083 0,00587472343022812 0,00172793096602566 0,00177831008016171 244359 256210 623 665 0 True 652 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 256 534 0,0065969429786517 0,00666394757780237 0,00660715648126955 0,00668345159075303 0,00137716227041024 0,00143270398643194 269342 290420 623 665 0 True 254 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 298 533 0,00668972175063354 0,00669072544028875 0,00662241550316625 0,00672922865644312 0,00136833264539144 0,00133478039571785 273130 291587 623 665 0 True 299 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 344 533 0,00671068759773397 0,00691277289125767 0,00672922865644312 0,00692759594110018 0,00141817041375787 0,00138233961248658 273986 301264 623 665 0 True 343 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 388 533 0,00671323485018543 0,00686233780835701 0,00666819256885634 0,00683604180972 0,00148684231892197 0,00153165067735736 274090 299066 623 665 0 True 387 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 432 533 0,00654276487843421 0,00662374636522641 0,00654612039368277 0,00662241550316625 0,00170656498420726 0,00177826453959907 267130 288668 623 665 0 True 431 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 475 533 0,00628887238889785 0,00627097613569286 0,00636301213092241 0,00622568093385214 0,00185799327672391 0,00185664248841613 256764 273294 623 665 0 True 475 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 520 533 0,00602679930014239 0,00610973531333484 0,00604257267109178 0,00614938582436866 0,00172912535861182 0,00171617114511411 246064 266267 623 665 0 True 520 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 564 532 0,00602410509081873 0,00596049519541587 0,00602731364919509 0,0059510185397116 0,00160998486853324 0,00177194711198641 245954 259763 623 665 0 True 564 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 609 533 0,0059959873426046 0,00606212257583763 0,00611886778057527 0,00605783169298848 0,00168056380710703 0,00155459748852496 244806 264192 623 665 0 True 608 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 652 532 0,00595172883126057 0,00602692356893607 0,00601205462729839 0,00602731364919509 0,00177593672550299 0,002007502578723 242999 262658 623 665 0 True 652 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 254 570 0,00674507550582862 0,00686493069478457 0,00672922865644312 0,00685130083161669 0,00120830489768139 0,00116771061283989 275390 299179 623 665 0 False 254 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 299 570 0,00674074027809874 0,00669825169469795 0,00666819256885634 0,00668345159075303 0,00135958583257836 0,00140440521496787 275213 291915 623 665 0 False 299 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 343 570 0,0067840680625855 0,00672223015767847 0,00686655985351339 0,00666819256885634 0,00133464261805704 0,00138804415984298 276982 292960 623 665 0 False 343 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 387 570 0,00661634128578201 0,00649488220436649 0,00663767452506294 0,00646982528419928 0,00137209322244159 0,00128766791874908 270134 283052 623 665 0 False 387 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 431 570 0,00656120796589523 0,00662555909113594 0,00656137941557946 0,00657663843747616 0,0017093103451223 0,00198262118464562 267883 288747 623 665 0 False 431 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 475 570 0,00621029944789528 0,00639642135781202 0,0063782711528191 0,00631723506523232 0,00192971836733772 0,00176367829184383 253556 278761 623 665 0 False 475 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 521 578 0,00618715374052388 0,00617359374632507 0,00617990386816205 0,00621042191195544 0,00190774062376716 0,00191204493863763 252611 269050 623 665 0 True 520 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 565 577 0,00619832246281103 0,00626074226536816 0,00628671702143893 0,00628671702143893 0,00163819223651709 0,0017678882154616 253067 272848 623 665 0 True 564 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 610 577 0,00602626045827766 0,00603534471335124 0,00607309071488518 0,00608834973678187 0,00150124743105965 0,00153511147562219 246042 263025 623 665 0 True 608 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 654 577 0,00608883959302254 0,00600776374444924 0,00608834973678187 0,0059510185397116 0,00161125785527971 0,00154572765637436 248597 261823 623 665 0 True 652 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 254 614 0,00684096486493867 0,00687096546585048 0,00683604180972 0,00692759594110018 0,00129730456955122 0,00126896373382094 279305 299442 623 665 0 False 254 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 299 614 0,00670880165120742 0,00670036271727614 0,00675974670023652 0,00666819256885634 0,00130642951764939 0,00130451190422519 273909 292007 623 665 0 False 299 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 343 614 0,00657536481125043 0,00676043507716419 0,00650034332799268 0,00672922865644312 0,00127111903870538 0,00142818392680308 268461 294625 623 665 0 False 343 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 387 614 0,00647967139463664 0,00647748921399401 0,00648508430609598 0,00650034332799268 0,00126702362263603 0,00119337927974477 264554 282294 623 665 0 False 387 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 431 614 0,00645539901791172 0,00632588566862338 0,0064087891966125 0,00627145799954223 0,0017058558566906 0,00180822130259675 263563 275687 623 665 0 False 431 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 475 614 0,00610209020433251 0,00621351960812996 0,00613412680247196 0,00625619897764553 0,00181861105650207 0,00182472202914315 249138 270790 623 665 0 False 475 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 519 614 0,00622281527484425 0,00617106969759028 0,00634775310902571 0,00614938582436866 0,00185806080751315 0,00197956057166586 254067 268940 623 665 0 False 519 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 564 614 0,00610951152637858 0,00609190635090817 0,00610360875867857 0,00621042191195544 0,0016196427644428 0,00188661654876508 249441 265490 623 665 0 False 564 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 608 614 0,00615149220620351 0,006028323268689 0,00610360875867857 0,00605783169298848 0,00137613555598124 0,0013122368063004 251155 262719 623 665 0 False 608 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 652 614 0,00622465223574674 0,00637815642333116 0,00631723506523232 0,00636301213092241 0,00147710237271587 0,00150811026969855 254142 277965 623 665 0 False 652 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 254 657 0,0517096411423399 0,561724636608688 0,00875867856870375 0,676585030899519 0,127242253010634 0,376320015451422 2111217 24480395 623 665 14 False 254 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 298 657 0,00738766892233219 0,00683459621817189 0,00712596322575723 0,00688181887541009 0,00202564081913978 0,00125303179457815 301626 297857 623 665 0 False 298 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 343 657 0,00639771844557348 0,00629761632279371 0,00646982528419928 0,0063782711528191 0,00123051542054207 0,00122132647220304 261208 274455 623 665 0 False 343 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 387 657 0,00632847726595557 0,00615737099672964 0,00634775310902571 0,00617990386816205 0,00137974949044479 0,00114387441369828 258381 268343 623 665 0 False 387 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 431 657 0,00598063034945977 0,00585414096009077 0,0059510185397116 0,00587472343022812 0,00153910678716072 0,00139557152035034 244179 255128 623 665 0 False 431 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 475 657 0,00618441054557616 0,00596311102774102 0,00614938582436866 0,0059510185397116 0,00155699470678311 0,00143528942977779 252499 259877 623 665 0 False 475 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 519 657 0,0061696168871081 0,00594360701479035 0,00616464484626535 0,00588998245212482 0,00169416001998108 0,00160192445075919 251895 259027 623 665 0 False 519 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 564 657 0,00603451453593285 0,00615374554491057 0,00605783169298848 0,00616464484626535 0,00152932187221321 0,00151597790727588 246379 268185 623 665 0 False 564 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 608 657 0,00663397611044593 0,00651931958529879 0,00662241550316625 0,00645456626230259 0,00131212812066712 0,0012989021210405 270854 284117 623 665 0 False 608 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 651 662 0,00790623073869954 0,773194923679076 0,00787365529869535 0,803356984817273 0,00156703655970832 0,195166638130964 322798 33696434 623 665 16 True 652 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B11_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B11_3.csv new file mode 100755 index 0000000..f7a5809 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B11_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 255 266 0,00103575203526083 0,0771133372456089 0,000839246204318303 0,0788586251621271 0,000823670240887852 0,022808449208773 42288 3360659 623 665 0 True 255 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 299 267 0,000869298884683065 0,000885918160014364 0,000747692072938125 0,000778210116731518 0,000633106174645273 0,000608751023510591 35492 38609 623 665 0 False 299 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 344 267 0,00087253193587145 0,000856891599564257 0,000762951094834821 0,000732433051041428 0,000640979362647704 0,000656059690137222 35624 37344 623 665 0 True 343 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 387 266 0,0009486555956707 0,000909162354272039 0,000793469138628214 0,000839246204318303 0,000705885447597222 0,000626833952284032 38732 39622 623 665 0 True 387 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 433 267 0,000912210291365267 0,000871852324792297 0,000732433051041428 0,000686655985351339 0,00075971124093445 0,000788452074941125 37244 37996 623 665 0 True 431 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 475 265 0,000930702364450349 0,000991170992255186 0,000747692072938125 0,000793469138628214 0,000819467194829809 0,000856146276618321 37999 43196 623 665 0 True 476 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 520 267 0,000943193698587291 0,000944063064504934 0,000701915007248035 0,000762951094834821 0,000830498997532565 0,000824737175784585 38509 41143 623 665 0 True 520 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 565 267 0,000959775332333782 0,000933622681101931 0,000732433051041428 0,000717174029144732 0,000848955465233259 0,000817781648489519 39186 40688 623 665 0 True 564 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 608 267 0,00102240345270273 0,00112590930289789 0,000686655985351339 0,000839246204318303 0,00100598226133532 0,00104528377050406 41743 49068 623 665 0 False 608 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 651 266 0,00107920228380777 0,0788506170438685 0,00080872816052491 0,0782787823300526 0,000958956989415086 0,0238200309172022 44062 3436371 623 665 0 True 652 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 255 310 0,000847451296349432 0,00091776706586792 0,000656137941557946 0,000732433051041428 0,000726765752451678 0,000731015451483058 34600 39997 623 665 0 False 255 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 299 310 0,000912259276989334 0,000907120169386616 0,000747692072938125 0,000823987182421607 0,000686456252300768 0,000641547405732656 37246 39533 623 665 0 False 299 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 344 311 0,00091595769160635 0,000897941810351009 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,000683757958885136 0,000651811813412965 37397 39133 623 665 0 True 343 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 388 312 0,000817031223804172 0,000895004735459615 0,000686655985351339 0,000793469138628214 0,000620666340310535 0,000612240249105652 33358 39005 623 665 0 True 387 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 433 311 0,000901947803123348 0,000890782690303236 0,000686655985351339 0,000625619897764553 0,000817842103413198 0,000850047063001825 36825 38821 623 665 0 True 431 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 477 312 0,000867119024412108 0,000954595231498293 0,000671396963454643 0,000778210116731518 0,000801737430488622 0,000865343153102676 35403 41602 623 665 0 True 476 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 521 311 0,000884998777196359 0,000939565668577486 0,000717174029144732 0,000701915007248035 0,000782575840676194 0,000845885841005813 36133 40947 623 665 0 True 520 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 566 312 0,000854725661523299 0,000933278492638096 0,000579842832074464 0,000747692072938125 0,000845605355174459 0,000773273567638483 34897 40673 623 665 0 True 564 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 608 311 0,000979981902261189 0,000953654449697143 0,000610360875867857 0,000549324788281071 0,00110157970179507 0,00101828515807554 40011 41561 623 665 0 False 608 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 652 311 0,000996000201330915 0,000920704140759314 0,000671396963454643 0,000534065766384375 0,000969599115126962 0,000920591330100038 40665 40125 623 665 0 False 652 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 257 357 0,000883431237226233 0,000909942514790065 0,000747692072938125 0,000747692072938125 0,000730735522626203 0,000770966323427359 36069 39656 623 665 0 True 255 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 301 356 0,000825579215203766 0,000843858329733696 0,000686655985351339 0,000717174029144732 0,000668720861091103 0,000633195772926158 33707 36776 623 665 0 True 299 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 344 356 0,000808654682088811 0,000913269669940473 0,000656137941557946 0,000793469138628214 0,000693862054821055 0,00068973841615201 33016 39801 623 665 0 True 343 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 389 356 0,000894648945137448 0,000926394723361391 0,000732433051041428 0,000778210116731518 0,000685967688530181 0,000686710432638323 36527 40373 623 665 0 True 387 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 433 355 0,0010141983606716 0,000991193938152775 0,000793469138628214 0,000732433051041428 0,000838238724149801 0,000907227520268453 41408 43197 623 665 0 True 431 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 478 356 0,000878704124503822 0,000890645014917702 0,00064087891966125 0,000610360875867857 0,000819751092071749 0,000801938790872777 35876 38815 623 665 0 True 476 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 522 356 0,000946402256963643 0,000921231896403862 0,000686655985351339 0,000610360875867857 0,00091161028648491 0,000895437885135731 38640 40148 623 665 0 True 520 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 565 356 0,000917868130944941 0,000849250615667115 0,000732433051041428 0,000549324788281071 0,000844577944547739 0,00085666395000207 37475 37011 623 665 0 True 564 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 609 356 0,00096090200168731 0,000884931486418036 0,000488288700694286 0,000488288700694286 0,00112675855494822 0,00100045189834383 39232 38566 623 665 0 True 608 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 654 356 0,000828175453279287 0,000953975692263389 0,000457770656900893 0,000488288700694286 0,000901746324663778 0,0010370977555265 33813 41575 623 665 0 True 652 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 257 401 0,000811275412976365 0,000966986016196362 0,000671396963454643 0,000778210116731518 0,000716971189252669 0,00081989675121765 33123 42142 623 665 0 True 255 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 301 401 0,000902021281559448 0,000810311427458552 0,000823987182421607 0,000701915007248035 0,000645762059382577 0,000631564539236664 36828 35314 623 665 0 True 299 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 345 401 0,000934155850947033 0,000897712351375119 0,000854505226215 0,000762951094834821 0,000653109185536443 0,000677711583946744 38140 39123 623 665 0 True 343 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 390 400 0,000898200402882265 0,000905926982711987 0,000747692072938125 0,000793469138628214 0,000724467176479699 0,000711294821090751 36672 39481 623 665 0 True 387 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 433 400 0,000957595472062825 0,000916895121759537 0,000686655985351339 0,000686655985351339 0,000849574707035562 0,000793782765911061 39097 39959 623 665 0 True 431 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 478 400 0,00093831962899268 0,000928574583632347 0,000686655985351339 0,000656137941557946 0,000839488140058382 0,000884791179629234 38310 40468 623 665 0 True 475 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 522 401 0,000988652357720949 0,00093387508597541 0,000762951094834821 0,000686655985351339 0,000928501571666548 0,000878753247601757 40365 40699 623 665 0 True 520 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 566 400 0,000868760042818334 0,00102804504968074 0,000610360875867857 0,000854505226215 0,000845971547519588 0,000860722969572308 35470 44803 623 665 0 True 564 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 609 400 0,00091534537130552 0,000858406028805133 0,000595101853971161 0,000457770656900893 0,000973441860482444 0,000949339844772784 37372 37410 623 665 0 True 608 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 654 400 0,000925558873923373 0,000860539997280911 0,000595101853971161 0,000473029678797589 0,000940249062382781 0,000930191879914758 37789 37503 623 665 0 True 652 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 257 446 0,000928865403547857 0,000949386512745586 0,000793469138628214 0,00080872816052491 0,000762392694979066 0,000818382362872134 37924 41375 623 665 0 True 254 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 301 445 0,000880296157285981 0,000946655950932493 0,000717174029144732 0,000778210116731518 0,000757494474137478 0,000796788684426702 35941 41256 623 665 0 True 299 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 345 445 0,000871405266517922 0,00089160874261644 0,000778210116731518 0,000762951094834821 0,000660859683123374 0,000712908575551064 35578 38857 623 665 0 True 343 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 390 444 0,000993771355435892 0,000961043028720806 0,000854505226215 0,000823987182421607 0,000796507725774989 0,000752957361287306 40574 41883 623 665 0 True 387 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 434 445 0,000929845116029186 0,000983071090406263 0,000625619897764553 0,000671396963454643 0,00092070302487195 0,0010084671911284 37964 42843 623 665 0 True 431 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 478 445 0,000971972752726326 0,00100773793031446 0,000701915007248035 0,00064087891966125 0,00090763050729917 0,00103172988297357 39684 43918 623 665 0 True 475 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 522 445 0,000874834260202573 0,000969670686214277 0,000579842832074464 0,000732433051041428 0,00086538862716401 0,000936304198970711 35718 42259 623 665 0 True 520 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 566 445 0,000876083393616267 0,000925981697204788 0,000518806744487678 0,000549324788281071 0,00091127106643821 0,000971098701941454 35769 40355 623 665 0 True 564 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 611 445 0,00089200372143786 0,000824239587295086 0,000518806744487678 0,000442511635004196 0,000915422643088741 0,000894797424487914 36419 35921 623 665 0 True 608 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 654 444 0,000833294450994231 0,000800261124314563 0,000442511635004196 0,000335698481727321 0,000909186688590329 0,000973855999022614 34022 34876 623 665 0 True 652 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 257 490 0,000871503237766055 0,000871209839659804 0,000717174029144732 0,000732433051041428 0,000752417228305987 0,000698067266349284 35582 37968 623 665 0 True 254 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 300 489 0,000904348098702604 0,000876487396105278 0,000778210116731518 0,000701915007248035 0,000760256479138694 0,00080362214460564 36923 38198 623 665 0 True 299 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 344 489 0,000864130901344055 0,000875569560201717 0,000701915007248035 0,000732433051041428 0,000783018446274886 0,000778167765970214 35281 38158 623 665 0 True 343 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 389 488 0,000913924788207593 0,000902852232435059 0,000778210116731518 0,000717174029144732 0,000771327458446073 0,000826077099501237 37314 39347 623 665 0 True 387 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 433 489 0,000911353042944105 0,000984654357339905 0,000534065766384375 0,00064087891966125 0,00100623152937354 0,00100175360189703 37209 42912 623 665 0 True 431 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 477 490 0,000876695713917097 0,000888465154646745 0,000473029678797589 0,000625619897764553 0,00092877596082307 0,000864578953004175 35794 38720 623 665 0 True 475 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 520 489 0,000854333776530767 0,000874605832502979 0,000518806744487678 0,000564583810177768 0,000875745265041391 0,000880929441996803 34881 38116 623 665 0 True 520 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 565 489 0,00082690182705356 0,000823734777548128 0,000457770656900893 0,000518806744487678 0,00090374060818182 0,000866514314375964 33761 35899 623 665 0 True 564 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 609 490 0,000871968601194686 0,000874445211219855 0,000503547722590982 0,000534065766384375 0,000903313053402896 0,000911212551493842 35601 38109 623 665 0 True 608 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 653 489 0,00089359575422002 0,000924903240018104 0,000518806744487678 0,000564583810177768 0,000934968907003325 0,000924901225390239 36484 40308 623 665 0 True 652 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 256 534 0,000894012132024584 0,000945806952721699 0,000747692072938125 0,000778210116731518 0,000736535539126683 0,000810657604339249 36501 41219 623 665 0 True 254 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 298 533 0,000981329006923016 0,000857648814184695 0,000854505226215 0,000717174029144732 0,000739945855669889 0,000734043892488174 40066 37377 623 665 0 True 299 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 344 533 0,000881006448834944 0,000826029367307029 0,000747692072938125 0,000686655985351339 0,000751477334695919 0,000696749406600905 35970 35999 623 665 0 True 343 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 388 533 0,000875250638007138 0,000919510954084685 0,000717174029144732 0,000747692072938125 0,000764454809117311 0,000817662559820696 35735 40073 623 665 0 True 387 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 432 533 0,000951129369686055 0,000889818962604497 0,000595101853971161 0,000473029678797589 0,000978238480710147 0,00101348081289755 38833 38779 623 665 0 True 431 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 475 533 0,00087466281051834 0,000933232600842918 0,000518806744487678 0,000488288700694286 0,000935662667878238 0,00100973720837451 35711 40671 623 665 0 True 475 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 520 533 0,000950566035009291 0,000924880294120515 0,00064087891966125 0,000518806744487678 0,00096394575570277 0,00095373286009387 38810 40307 623 665 0 True 520 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 564 532 0,000875324116443237 0,000796658618393087 0,000579842832074464 0,000442511635004196 0,000855803297235884 0,000855981900853394 35738 34719 623 665 0 True 564 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 609 533 0,000762020367977559 0,000834611133005322 0,000473029678797589 0,000549324788281071 0,000787922307667962 0,000860758995572451 31112 36373 623 665 0 True 608 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 652 532 0,000851443624710847 0,000883348219484394 0,000442511635004196 0,000457770656900893 0,000928744065010493 0,00102442400791544 34763 38497 623 665 0 True 652 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 254 570 0,000981010600366584 0,00090865754452508 0,00080872816052491 0,000762951094834821 0,000703650364618117 0,000622265747601539 40053 39600 623 665 0 False 254 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 299 570 0,000876573249856931 0,000827245499879247 0,000747692072938125 0,000747692072938125 0,000675754220506984 0,000659558285278418 35789 36052 623 665 0 False 299 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 343 570 0,000891415893949063 0,000817768844174983 0,000778210116731518 0,000595101853971161 0,000677325783661205 0,000695807916945401 36395 35639 623 665 0 False 343 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 387 570 0,00092455466863001 0,000903012853718182 0,000762951094834821 0,000778210116731518 0,000702576168444605 0,000653103857085392 37748 39354 623 665 0 False 387 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 431 570 0,000885219212504658 0,000934540517005492 0,000595101853971161 0,000473029678797589 0,00088380790817247 0,00105716496056745 36142 40728 623 665 0 False 431 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 475 570 0,000938858470857411 0,000908382193754012 0,000503547722590982 0,000564583810177768 0,00103445618282781 0,000898071836387459 38332 39588 623 665 0 False 475 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 521 578 0,000856611608049857 0,000853587390311439 0,000473029678797589 0,000457770656900893 0,000982980820403787 0,00094866301981415 34974 37200 623 665 0 True 520 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 565 577 0,000858889439568946 0,00086967246452134 0,000595101853971161 0,000488288700694286 0,00083267164641858 0,000921423714265218 35067 37901 623 665 0 True 564 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 610 577 0,000868049751269371 0,00091122748505505 0,000610360875867857 0,000656137941557946 0,000769812551556762 0,000827424204246187 35441 39712 623 665 0 True 608 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 654 577 0,000840544323356064 0,000877519961496784 0,000549324788281071 0,000656137941557946 0,000825110023128513 0,000808874742197225 34318 38243 623 665 0 True 652 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 254 614 0,000954852277115104 0,000937890618053488 0,000869764248111696 0,000762951094834821 0,000681062758310539 0,000697648424226893 38985 40874 623 665 0 False 254 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 299 614 0,000915737256298051 0,000893742711092219 0,000762951094834821 0,00080872816052491 0,000752533695991703 0,000707906957890152 37388 38950 623 665 0 False 299 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 343 614 0,000910569272959042 0,000901475478579718 0,000793469138628214 0,000762951094834821 0,000692786614963019 0,000729775572808867 37177 39287 623 665 0 False 343 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 387 614 0,000902511137800112 0,000917285202018551 0,000778210116731518 0,00080872816052491 0,000666238024502993 0,000661630059683949 36848 39976 623 665 0 False 387 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 431 614 0,000920611325892662 0,000870062544780353 0,00064087891966125 0,000518806744487678 0,000905687533183124 0,000913255102716249 37587 37918 623 665 0 False 431 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 475 614 0,000889823861166904 0,000898079485736543 0,000457770656900893 0,0004272526131075 0,00100637605276176 0,00102533943616962 36330 39139 623 665 0 False 475 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 519 614 0,000906429987725427 0,000908519869139546 0,000473029678797589 0,000488288700694286 0,00101904823473986 0,000973366364271066 37008 39594 623 665 0 False 519 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 564 614 0,000857101464290521 0,000881902627936286 0,000534065766384375 0,000488288700694286 0,000880894192834801 0,000950737301967847 34994 38434 623 665 0 False 564 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 608 614 0,000858889439568946 0,000818984976747201 0,00064087891966125 0,000610360875867857 0,000733543970407279 0,000694738286887308 35067 35692 623 665 0 False 608 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 652 614 0,00081313686669089 0,00091402688456091 0,00064087891966125 0,000747692072938125 0,000692869995451358 0,000760414442369332 33199 39834 623 665 0 False 652 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 254 657 0,00540600448634838 0,0583207389037942 0,00119020370794232 0,0668650339513237 0,0128425478246579 0,0407157540526773 220718 2541663 623 665 0 False 254 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 298 657 0,000924579161442044 0,00089371976519463 0,000839246204318303 0,000823987182421607 0,000636870687209986 0,000611185510213227 37749 38949 623 665 0 False 298 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 343 657 0,000876009915180167 0,000901957342429087 0,000732433051041428 0,000762951094834821 0,000689361092998206 0,00067275747263923 35766 39308 623 665 0 False 343 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 387 657 0,000835621268137387 0,00087153108222605 0,000701915007248035 0,000762951094834821 0,000626261710670999 0,000649676764358382 34117 37982 623 665 0 False 387 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 431 657 0,000875985422368134 0,000945141521691617 0,000686655985351339 0,000778210116731518 0,000755890071528092 0,000748721259375089 35765 41190 623 665 0 False 431 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 475 657 0,000845810277943206 0,000877061043545003 0,000595101853971161 0,000671396963454643 0,000810463373732665 0,000758947068918484 34533 38223 623 665 0 False 475 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 519 657 0,000846153177311671 0,000889015856188881 0,000488288700694286 0,000579842832074464 0,000883969949131311 0,00086318112998937 34547 38744 623 665 0 False 519 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 564 657 0,00090226620967978 0,000947252544269807 0,000717174029144732 0,000701915007248035 0,000776614399359017 0,000823110934027191 36838 41282 623 665 0 False 564 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 608 657 0,000918284508749506 0,000875661343792073 0,00080872816052491 0,000701915007248035 0,000674034741369448 0,00071382800515118 37492 38162 623 665 0 False 608 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 651 662 0,00102232997426663 0,0794223829199917 0,000854505226215 0,0799877927824826 0,000754426756547764 0,023076730560033 41740 3461289 623 665 0 True 652 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B12_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B12_1.csv new file mode 100755 index 0000000..0a12869 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B12_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 230 245 0,0105421310859791 0,0456069677512619 0,0104982070649271 0,0453803311207752 0,00185300634458479 0,00854884428662385 460816 1987587 667 665 0 True 230 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 275 244 0,0103517250301377 0,0102698265462237 0,0102998397802701 0,01025406271458 0,00163843327604199 0,00160032997439359 452493 447567 667 665 0 False 275 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 317 246 0,0101791631078487 0,0656665926661469 0,0101777676050965 0,0628366521705959 0,00135408226359038 0,0172911998082338 444950 2861801 667 665 0 True 319 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 362 245 0,0101272321037925 0,077113497866892 0,0101319905394064 0,0772716868848707 0,00132365355362163 0,0103125529949105 442680 3360666 667 665 0 True 363 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 407 244 0,0100136244535091 0,0662186480162411 0,00999465934233616 0,0630960555428397 0,0014352763067773 0,0108400009671009 437714 2885860 667 665 0 True 407 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 451 243 0,0101345070197792 0,0638693322915896 0,0101777676050965 0,0664072632944228 0,00160496356885525 0,0168076596032156 442998 2783475 667 665 0 True 452 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 496 243 0,0101275523831126 0,076789616522423 0,0100862134737163 0,0734416723887999 0,00161901289509648 0,0196741408179031 442694 3346551 667 665 0 True 496 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 539 243 0,0100525841450984 0,0670912346097562 0,0101319905394064 0,064438849469749 0,00153096270694682 0,0176815835192877 439417 2923888 667 665 0 True 540 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 585 244 0,0101038288363257 0,0101731554796811 0,0100709544518196 0,0101319905394064 0,00182361931207632 0,00188264873164695 441657 443354 667 665 0 False 585 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 627 241 0,010193163889559 0,0449438313109393 0,0101777676050965 0,0455329213397421 0,00199421475168192 0,00962957553162219 445562 1958687 667 665 0 True 629 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 230 288 0,01054112449383 0,0102835023011867 0,0105134660868238 0,0103150988021668 0,00161168288572971 0,00157344027736373 460772 448163 667 665 0 False 230 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 275 288 0,0102127009280894 0,0102677155236455 0,0102235446707866 0,0102388036926833 0,00139016721740192 0,00157334513927747 446416 447475 667 665 0 False 275 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 319 289 0,0103288479358398 0,0978684064246219 0,0103303578240635 0,0930800335698482 0,00132965007027127 0,0202284487521697 451493 4265181 667 665 0 True 319 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 363 289 0,0103137490536032 0,0500745569577411 0,0102998397802701 0,0485236896314946 0,0014026702363168 0,00829549192404512 450833 2182288 667 665 0 True 363 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 407 289 0,0101312355952946 0,0754397552590563 0,010101472495613 0,0749217975127794 0,00150946330815332 0,0131054982070787 442855 3287723 667 665 0 True 407 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 451 287 0,0101479129970378 0,0416801215673654 0,0101472495613031 0,0424353398947128 0,00177414721660769 0,00861785907671122 443584 1816452 667 665 0 True 452 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 496 287 0,0102375225754026 0,0440265231630231 0,0102082856488899 0,0469062333104448 0,00173381602738482 0,00909618469823983 447501 1918710 667 665 0 True 496 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 540 288 0,0102634423232421 0,0531298261676163 0,0102235446707866 0,0534065766384375 0,00156461601470149 0,0107169982308762 448634 2315439 667 665 0 True 540 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 585 288 0,0100082254592548 0,00998073118249962 0,010101472495613 0,00990310521095598 0,00184589244660497 0,00203958377274231 437478 434968 667 665 0 False 585 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 629 288 0,00989111761354388 0,00996939590909065 0,00985732814526589 0,0100709544518196 0,00181487899180771 0,00198115533211712 432359 434474 667 665 0 False 629 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 231 334 0,0105370294939507 0,0530577301573916 0,0104982070649271 0,0503547722590982 0,00154711208734446 0,0108472113494628 460593 2312297 667 665 0 True 230 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 275 332 0,0103786513701263 0,0678739880142104 0,0103303578240635 0,0662546730754559 0,00148080855017576 0,0228182437214989 453670 2958001 667 665 0 True 275 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 319 333 0,0102949898362789 0,040249903770642 0,0103150988021668 0,0410315098802167 0,0013068265527583 0,00715308672370245 450013 1754122 667 665 0 True 319 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 364 333 0,0101254934446258 0,0356939958043426 0,0100709544518196 0,0355230029755093 0,00127396973043929 0,00556866764048445 442604 1555572 667 665 0 True 363 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 407 333 0,010193163889559 0,0704682282497271 0,0102082856488899 0,0662241550316625 0,0014692526449131 0,0129066830457427 445562 3071060 667 665 0 True 407 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 451 332 0,0102180541681551 0,0346150108620143 0,0101625085831998 0,0342107270923934 0,00160616935609269 0,00654990663495037 446650 1508549 667 665 0 True 452 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 496 331 0,0103214815114759 0,0291094869239934 0,0103761348897536 0,0292668039978637 0,0016147037957987 0,00321652292943286 451171 1268614 667 665 0 True 496 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 540 331 0,0105002431263197 0,0526117078000563 0,010452429999237 0,052124818799115 0,00159373878422991 0,00987753852276701 458985 2292859 667 665 0 True 540 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 584 332 0,0102072104254579 0,0600234621802848 0,0102388036926833 0,0592202639810788 0,00187707047511087 0,01334488946887 446176 2615869 667 665 0 True 585 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 628 331 0,0099431401259773 0,069026881692673 0,0100862134737163 0,0668192568856336 0,00198179626119416 0,0227376440506845 434633 3008245 667 665 0 True 629 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 230 378 0,0102900483839106 0,0455468494995787 0,0103608758678569 0,0471351186388952 0,00166549944177177 0,0101692289396543 449797 1984967 667 665 0 True 230 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 275 378 0,0103258510364868 0,0344052853580507 0,01025406271458 0,0334782940413519 0,00149836346580622 0,00513764775011956 451362 1499409 667 665 0 True 275 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 320 377 0,0104615350827676 0,0854240660015798 0,010452429999237 0,0809643701838712 0,0013422854018524 0,0165629509973263 457293 3722847 667 665 0 True 319 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 363 378 0,0102741259262792 0,065133284114383 0,0102998397802701 0,0630655374990463 0,00142011012921034 0,0163772096900056 449101 2838559 667 665 0 True 363 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 407 378 0,0103103861207414 0,0444779607521895 0,01025406271458 0,043930724040589 0,00155638438978091 0,00886916008605598 450686 1938384 667 665 0 True 408 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 452 376 0,0104615579598619 0,0530055970780694 0,0104676890211337 0,0523994811932555 0,0016541966598709 0,00905475645579476 457294 2310025 667 665 0 True 452 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 495 374 0,0104192124583165 0,0446684805398711 0,0104676890211337 0,0431982909895476 0,00170546645805565 0,00768072048435561 455443 1946687 667 665 0 True 496 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 540 375 0,0102762992502376 0,0526739600202153 0,0103303578240635 0,0513771267261769 0,00171358175240588 0,00892550257709139 449196 2295572 667 665 0 True 540 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 584 376 0,0103343841926599 0,0450399975677349 0,0103303578240635 0,0445105668726635 0,00188179804868432 0,00899318251530167 451735 1962878 667 665 0 True 585 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 628 376 0,0100831250659861 0,0927081952994182 0,0100556954299229 0,0875715266651408 0,00196245380233432 0,0192098411410715 440752 4040295 667 665 0 True 629 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 231 422 0,0103086703386691 0,0426533029759108 0,0102845807583734 0,0423132677195392 0,00159438211912363 0,00584538300594901 450611 1858864 667 665 0 True 230 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 275 421 0,0103922861183279 0,0544176417239023 0,0103303578240635 0,0539253833829252 0,00152972208331233 0,00858927748651497 454266 2371563 667 665 0 True 275 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 320 421 0,0105606844094547 0,0351661483762049 0,010605020218204 0,0353398947127489 0,00135740607335859 0,00364224017522585 461627 1532568 667 665 0 True 319 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 364 420 0,0104601624571097 0,0543167027204083 0,0104676890211337 0,0521095597772183 0,0015034075057775 0,0112204324440966 457233 2367164 667 665 0 True 363 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 408 421 0,0105425428736765 0,0902109703189078 0,0105897611963073 0,0900434882124056 0,00159677300531774 0,0133139877217149 460834 3931464 667 665 0 True 408 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 452 420 0,0106236650500568 0,0593535567001734 0,0106507972838941 0,0584115358205539 0,00163684362567324 0,012340517951505 464380 2586674 667 665 0 True 452 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 496 419 0,0105997813636098 0,0553094799254947 0,0106507972838941 0,0536507209887846 0,00163854366408029 0,0112399631584409 463336 2410430 667 665 0 True 496 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 540 419 0,0104929682103329 0,0330306425252878 0,0104982070649271 0,0332646677347982 0,00174424445540364 0,00515806974934596 458667 1439501 667 665 0 True 540 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 585 419 0,0102725245296784 0,0459307573121405 0,0102388036926833 0,042923628595407 0,00179094276942134 0,0112542114402249 449031 2001698 667 665 0 True 585 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 629 419 0,0101155876627948 0,0702451252874691 0,01025406271458 0,0707255664911879 0,00193814050096942 0,0140654350304877 442171 3061337 667 665 0 True 629 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 232 467 0,0101159308192093 0,0499506950025556 0,0101167315175097 0,0502327000839246 0,00150609465800587 0,0118706974971021 442186 2176890 667 665 0 True 230 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 277 466 0,0101831894764451 0,0530260648187188 0,0101625085831998 0,0522926680399786 0,00155591739316773 0,00769342418981865 445126 2310917 667 665 0 True 275 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 321 467 0,0106378030943329 0,0664829159187738 0,0105287251087205 0,0627908751049058 0,00189611303753269 0,0161620603411064 464998 2897377 667 665 0 True 319 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 366 466 0,0106344859156597 0,0922973719489844 0,0106202792401007 0,086350804913405 0,00147458555592731 0,0237975222725719 464853 4022391 667 665 0 True 363 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 409 464 0,0107305697117109 0,0955464192639989 0,0107118333714809 0,0896009765774014 0,00165506534483011 0,0290935197969901 469053 4163987 667 665 0 True 408 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 453 465 0,0106577061663721 0,0534711234483554 0,0106202792401007 0,0513618677042802 0,00201035595561716 0,0135024201669931 465868 2330313 667 665 0 True 452 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 496 463 0,0107157224775115 0,0428393483135626 0,0106507972838941 0,0446631570916304 0,00205110236293796 0,00767690972281903 468404 1866972 667 665 0 True 496 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 542 463 0,0107672416938704 0,0957169072830853 0,0107728694590677 0,0920119020370794 0,0018872678361044 0,0174589734999932 470656 4171417 667 665 0 True 540 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 584 463 0,0104613749431075 0,0648520133017368 0,0104371709773404 0,0658884565499352 0,00201194836206374 0,0179286541566162 457286 2826301 667 665 0 True 585 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 630 464 0,010486905780344 0,0766277102690349 0,0105439841306172 0,0713359273670558 0,00197776970310042 0,0133473150563433 458402 3339495 667 665 0 True 629 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 233 511 0,0100180626098029 0,0481274369260299 0,0100251773861295 0,0502327000839246 0,00146755098418667 0,0100528283741413 437908 2097431 667 665 0 True 230 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 276 510 0,0104513776528993 0,0999927605693107 0,0104371709773404 0,0940108339055467 0,00148421163210881 0,0249802286234367 456849 4357762 667 665 0 True 275 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 321 510 0,0103297172654231 0,0550608152333225 0,0103303578240635 0,0562294956893263 0,00152855052592664 0,0117155000982803 451531 2399593 667 665 0 True 319 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 365 510 0,0106295215861971 0,0615652658769836 0,0107118333714809 0,0572213321126116 0,00162126662068978 0,0135949958847634 464636 2683062 667 665 0 True 363 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 410 509 0,0105515793259241 0,0573567129083868 0,0106202792401007 0,0565346761272602 0,00182159520065664 0,00848007479916802 461229 2499650 667 665 0 True 408 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 454 508 0,0106391299658022 0,06329848425137 0,010605020218204 0,0604715037766079 0,00188479364830272 0,015635213968313 465056 2758597 667 665 0 True 452 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 499 507 0,0105021648022407 0,0731066163922051 0,0104982070649271 0,0699931334401465 0,00171971041227894 0,0181956947270489 459069 3186043 667 665 0 True 496 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 542 508 0,010360120923745 0,059145047328782 0,01025406271458 0,0580910963607233 0,00176321216221122 0,0142959156907687 452860 2577587 667 665 0 True 540 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 587 507 0,0103591600857845 0,0468590565450018 0,0104219119554437 0,0439002059967956 0,00190898847984015 0,00888541730091741 452818 2042154 667 665 0 True 585 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 630 508 0,0101219474950096 0,06476775596579 0,0100709544518196 0,0646829938200961 0,00183913937921101 0,0142971998158398 442449 2822629 667 665 0 True 629 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 233 554 0,00983989579941089 0,0422613870450904 0,0098115510795758 0,0431830319676509 0,00139708914203727 0,00768677427845589 430120 1841784 667 665 0 True 230 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 277 555 0,0101817710965986 0,0508463881149429 0,0101930266269932 0,0504005493247883 0,00140638036948548 0,0110743313007977 445064 2215925 667 665 0 True 275 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 321 554 0,0102011708725633 0,0491467395887292 0,0102082856488899 0,0484626535439078 0,00140726384314177 0,00865277175391266 445912 2141853 667 665 0 True 319 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 366 554 0,0103174093886909 0,0493151165852374 0,0102998397802701 0,0484168764782177 0,00149428023447685 0,00577163951248376 450993 2149191 667 665 0 True 363 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 409 554 0,0105734040738843 0,0900293535394908 0,0104982070649271 0,0830395971618219 0,00169877154629807 0,0214559301330746 462183 3923549 667 665 0 True 408 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 454 553 0,0105459515607268 0,0624880810403211 0,0104676890211337 0,0601052872510872 0,00231030956667195 0,0113939530106577 460983 2723279 667 665 0 True 452 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 499 552 0,0105231202206175 0,0566586528119337 0,0104829480430304 0,0557869840543221 0,00246275196609238 0,00768002329914685 459985 2469228 667 665 0 True 496 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 543 552 0,0108504914400204 0,0395994105198909 0,0104371709773404 0,0401312275883116 0,00313596367360334 0,00953059206169874 474295 1725773 667 665 0 True 540 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 587 551 0,0100768109879599 0,0506411370610091 0,010101472495613 0,0496070801861601 0,0016710591690314 0,00889964903326048 440476 2206980 667 665 0 True 585 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 631 553 0,0101632635273116 0,0528384362141334 0,0101777676050965 0,0516517891203174 0,00174768845718515 0,00759927872931839 444255 2302740 667 665 0 True 629 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 231 592 0,00989159803252414 0,00962279812600854 0,00975051499198901 0,00961318379491875 0,00156237658143184 0,00128525436812039 432380 419369 667 665 0 False 231 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 275 592 0,0101906474091862 0,00981116099931679 0,00994888227664607 0,00984206912336919 0,00231729443636956 0,00133281745495165 445452 427578 667 665 0 False 275 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 322 598 0,0101203918525974 0,0752955402927094 0,0101319905394064 0,0722667277027543 0,00139162569915464 0,0121214142487023 442381 3281438 667 665 0 True 319 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 366 598 0,010091177803179 0,0750672286116986 0,0100862134737163 0,0709849698634318 0,00132008438551076 0,019246732703133 441104 3271488 667 665 0 True 363 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 408 592 0,0105261399970649 0,0103176457967992 0,0103456168459602 0,0102845807583734 0,00193811128698425 0,00153399308601761 460117 449651 667 665 0 False 408 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 452 592 0,0103462345275062 0,0100065453172873 0,01025406271458 0,0100251773861295 0,00218363381930947 0,00200847764694797 452253 436093 667 665 0 False 452 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 496 592 0,0100309881680812 0,0100681550523138 0,0100099183642329 0,0100709544518196 0,00200516796102807 0,00209083439824463 438473 438778 667 665 0 False 496 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 540 592 0,00998356395160168 0,00998226855763809 0,00999465934233616 0,0100251773861295 0,00186265162774415 0,00191603078697276 436400 435035 667 665 0 False 540 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 585 592 0,0099746418848255 0,0100138880045158 0,0100404364080262 0,0101167315175097 0,0017370155323175 0,00190665700739813 436010 436413 667 665 0 False 585 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 629 592 0,00996569694095502 0,00996579340316917 0,00994888227664607 0,00990310521095598 0,001490598802627 0,00141248067696936 435619 434317 667 665 0 False 629 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 233 642 0,00958358083489727 0,041725646228182 0,00958266575112535 0,0420843823910887 0,00131009164388545 0,00818707554585342 418916 1818436 667 665 0 True 231 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 275 635 0,00977174493549746 0,0095493483078261 0,0098115510795758 0,00953688868543526 0,00140665608046107 0,00131896883840472 427141 416168 667 665 0 False 275 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 319 635 0,0107749512746488 0,00968876758157697 0,00999465934233616 0,00970473792629892 0,00504899762061791 0,0012608357366522 470993 422244 667 665 0 False 319 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 363 635 0,0102509514297555 0,00960859461540094 0,00971999694819562 0,00964370183871214 0,00304745831258085 0,00133321056576692 448088 418750 667 665 0 False 363 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 408 635 0,00984769688856647 0,00979514476279965 0,00984206912336919 0,00973525597009232 0,00143035254207956 0,00133225984495706 430461 426880 667 665 0 False 408 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 452 635 0,00992428940027583 0,00980980719135903 0,00993362325474937 0,00984206912336919 0,00174471851280058 0,00187151485913371 433809 427519 667 665 0 False 452 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 496 635 0,00981532580013495 0,00988828216111347 0,0097962920576791 0,00991836423285267 0,00176355174724823 0,00177756340639293 429046 430939 667 665 0 False 496 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 540 635 0,0097300628696867 0,00993394449731562 0,00975051499198901 0,00987258716716258 0,001809605263056 0,0017411695318578 425319 432929 667 665 0 False 540 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 585 635 0,00966458862580612 0,00972761498619517 0,00964370183871214 0,00978103303578241 0,00164164657835599 0,00133264480799221 422457 423937 667 665 0 False 585 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 631 638 0,00992991716547311 0,043748602451425 0,00993362325474937 0,0437933928435187 0,00143120054417553 0,00864621331837802 434055 1906598 667 665 0 True 629 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B12_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B12_2.csv new file mode 100755 index 0000000..ccee206 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B12_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 230 245 0,00821052051223187 0,732129017898374 0,00804150453955901 0,741268024719616 0,00226710449536947 0,177614383428821 358897 31906750 667 665 9 True 230 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 275 244 0,00656819678968023 0,00623222051466501 0,00643930724040589 0,00622568093385214 0,00178297662706578 0,00143521935416912 287108 271605 667 665 0 False 275 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 317 246 0,00604097127449093 0,00602485843815306 0,00599679560540169 0,00601205462729839 0,00123939458242865 0,00115279588800058 264062 262568 667 665 0 True 319 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 362 245 0,00567036234686502 0,00584181901308547 0,00570687418936446 0,00584420538643473 0,00114131632934499 0,00114982710277571 247862 254591 667 665 0 True 363 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 407 244 0,00593763543954734 0,00594480020146498 0,0059662775616083 0,0059510185397116 0,0013024270343847 0,00125595086454839 259545 259079 667 665 0 True 407 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 451 243 0,00607249591043343 0,00618841679616758 0,00605783169298848 0,00613412680247196 0,00143822765691064 0,00147568648281663 265440 269696 667 665 0 True 452 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 496 243 0,00618500546019048 0,00630399528232346 0,00621042191195544 0,0063782711528191 0,00152530159851053 0,00140108858959351 270358 274733 667 665 0 True 496 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 539 243 0,0066435539382975 0,00661358133259448 0,00669871061264973 0,00671396963454643 0,00145963434495337 0,00137260353802408 290402 288225 667 665 0 True 540 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 585 244 0,00731792492401087 0,00734876789134659 0,00729381246662089 0,00735484855420768 0,00172763170619525 0,00177063071327775 319880 320265 667 665 0 False 585 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 627 241 0,00869546915715866 0,731615236305458 0,00874341954680705 0,753246356908522 0,00194302215824491 0,200900812913941 380095 31884359 667 665 12 True 629 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 230 288 0,00669923678581858 0,00627366080571078 0,00675974670023652 0,00627145799954223 0,00165537355563011 0,00143537904987508 292836 273411 667 665 0 False 230 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 275 288 0,00597522250547878 0,0063204015990996 0,00592050049591821 0,00630197604333562 0,00136159797208364 0,00140120091605313 261188 275448 667 665 0 False 275 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 319 289 0,00587673661452634 0,00602593689533975 0,00593575951781491 0,00602731364919509 0,0011810807286705 0,00120181543481821 256883 262615 667 665 0 True 319 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 363 289 0,00591180720008501 0,00594881573354306 0,00592050049591821 0,00593575951781491 0,00126518980657692 0,00126800697733584 258416 259254 667 665 0 True 363 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 407 289 0,00578879706404523 0,00593837535014006 0,00575265125505455 0,0059662775616083 0,00142931958009697 0,00135001504376368 253039 258799 667 665 0 True 407 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 451 287 0,00610077199898563 0,00607859773030654 0,00614938582436866 0,00604257267109178 0,001545549398983 0,00176960610037841 266676 264910 667 665 0 True 452 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 496 287 0,00643216958698495 0,0066659668167902 0,00646982528419928 0,00660715648126955 0,00153383616417469 0,00157767139850047 281162 290508 667 665 0 True 496 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 540 288 0,0066880956408955 0,00691873882463081 0,00666819256885634 0,00688181887541009 0,00143026735839794 0,00147823821150122 292349 301524 667 665 0 True 540 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 585 288 0,00701786895519967 0,00694374985300284 0,00704966811627375 0,00685130083161669 0,00168494997199053 0,00182803294090927 306764 302614 667 665 0 False 585 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 629 288 0,00739721693284738 0,00738281960336869 0,00737010757610437 0,00746166170748455 0,00192852293215593 0,00183967239947771 323346 321749 667 665 0 False 629 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 231 334 0,00607000230715496 0,0060830721803364 0,00611886778057527 0,00611886778057527 0,00140133166119202 0,00148882884482145 265331 265105 667 665 0 True 230 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 275 332 0,00608233306098153 0,00603812116695951 0,00608834973678187 0,00610360875867857 0,00132920970068812 0,00127694154365846 265870 263146 667 665 0 True 275 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 319 333 0,00586859236895629 0,00595154629535615 0,00590524147402152 0,00590524147402152 0,00116662021746438 0,00116683245475011 256527 259373 667 665 0 True 319 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 364 333 0,00613520202590396 0,00620096820214877 0,00608834973678187 0,00616464484626535 0,00127133274059881 0,0012831781609202 268181 270243 667 665 0 True 363 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 407 333 0,00633780157300613 0,00638024450001176 0,00636301213092241 0,0063935301747158 0,0013520195683656 0,00133061108631599 277037 278056 667 665 0 True 407 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 451 332 0,00644701682118428 0,00650481777802253 0,00648508430609598 0,00651560234988937 0,00167190760319361 0,00146609197800107 281811 283485 667 665 0 True 452 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 496 331 0,00668514449573108 0,00666823846065151 0,00663767452506294 0,00666819256885634 0,00154458046495461 0,00153784741852576 292220 290607 667 665 0 True 496 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 540 331 0,00684343111117822 0,00695297410383363 0,00688181887541009 0,00695811398489357 0,0014782607147441 0,00142134698503151 299139 303016 667 665 0 True 540 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 584 332 0,0071099263826544 0,00689893651501149 0,00715648126955062 0,00689707789730678 0,00177830172431949 0,00200729384662649 310788 300661 667 665 0 True 585 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 628 331 0,00704463515552821 0,00704728174292449 0,00701915007248035 0,00701915007248035 0,00193875163080978 0,00189257107791516 307934 307126 667 665 0 True 629 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 230 378 0,00580577186801427 0,00594881573354306 0,00584420538643473 0,00592050049591821 0,00151458046670471 0,00144050219348465 253781 259254 667 665 0 True 230 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 275 378 0,00604220663758302 0,00595471282922344 0,00605783169298848 0,0059662775616083 0,00134255832626737 0,00135695561693718 264116 259511 667 665 0 True 275 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 320 377 0,00629168135090157 0,00623513464365882 0,00617990386816205 0,00619516289005875 0,00133327953612447 0,00136026655128209 275021 271732 667 665 0 True 319 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 363 378 0,00637872869470506 0,00646569502263326 0,00634775310902571 0,00645456626230259 0,0012589999972681 0,00133719352417224 278826 281780 667 665 0 True 363 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 407 378 0,00660502891149985 0,0065636051676456 0,00663767452506294 0,00657663843747616 0,00141408501657233 0,00134231000083408 288718 286047 667 665 0 True 408 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 452 376 0,00654628053334285 0,00688406757337381 0,00657663843747616 0,0068207827878233 0,00162841347780707 0,00159398242949495 286150 300013 667 665 0 True 452 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 495 374 0,00679136284455621 0,00691924363437777 0,00683604180972 0,00692759594110018 0,00166392727277474 0,00171846024048503 296863 301546 667 665 0 True 496 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 540 375 0,00695134236498139 0,0070006786249212 0,00697337300679027 0,00708018616006714 0,00152861764569339 0,00154469554428825 303856 305095 667 665 0 True 540 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 584 376 0,00696090499039791 0,00700790658266174 0,00706492713817044 0,00698863202868696 0,00177746012277054 0,0019503396560125 304274 305410 667 665 0 True 585 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 628 376 0,00631503886417972 0,00647368019499424 0,00625619897764553 0,00646982528419928 0,00186766262458706 0,00184189413376094 276042 282128 667 665 0 True 629 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 231 422 0,00594699217111517 0,00589269006804032 0,00602731364919509 0,00572213321126116 0,00143014414061009 0,00151491318918136 259954 256808 667 665 0 True 230 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 275 421 0,00597979792433836 0,00618584685563761 0,00602731364919509 0,00614938582436866 0,00131255614285986 0,0014325955476022 261388 269584 667 665 0 True 275 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 320 421 0,00630396635053954 0,00654910336036934 0,00628671702143893 0,00660715648126955 0,00128923260277906 0,00131983805826887 275558 285415 667 665 0 True 319 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 364 420 0,00651223941702758 0,00658076869904218 0,00643930724040589 0,00659189745937285 0,00132863644062408 0,00131107858538519 284662 286795 667 665 0 True 363 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 408 421 0,0066196473747562 0,00664327332407466 0,00663767452506294 0,00669871061264973 0,00146591224233779 0,00151454767079954 289357 289519 667 665 0 True 408 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 452 420 0,00672023795838405 0,00671640189969086 0,00671396963454643 0,00671396963454643 0,0016301408633132 0,00148615378018925 293754 292706 667 665 0 True 452 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 496 419 0,00693372700237201 0,00698172531351267 0,00697337300679027 0,00701915007248035 0,00160547270914611 0,00162527159781977 303086 304269 667 665 0 True 496 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 540 419 0,00688792705958763 0,00702339506353432 0,00692759594110018 0,00700389105058366 0,0015567140328458 0,00153387588286029 301084 306085 667 665 0 True 540 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 585 419 0,00654111031003153 0,00622065578228015 0,00659189745937285 0,00619516289005875 0,0018291886728822 0,00182791994771668 285924 271101 667 665 0 True 585 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 629 419 0,00598570021466721 0,00582750077298992 0,0059662775616083 0,00579842832074464 0,0017850123726497 0,00168469376653342 261646 253967 667 665 0 True 629 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 232 467 0,00604939004519256 0,00616276328266305 0,00604257267109178 0,00616464484626535 0,00140699900086491 0,00144553351858946 264430 268578 667 665 0 True 230 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 277 466 0,00636186827620751 0,00627395910237943 0,0064087891966125 0,00630197604333562 0,0014799575753786 0,00149041807976435 278089 273424 667 665 0 True 275 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 321 467 0,00660914678847347 0,0064411658581106 0,00646982528419928 0,0064087891966125 0,00182692663864336 0,00144144338738891 288898 280711 667 665 0 True 319 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 366 466 0,00648464964130432 0,00633777164357449 0,00651560234988937 0,00631723506523232 0,00151487682976299 0,00143904287433944 283456 276205 667 665 0 True 363 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 409 464 0,00665545002733241 0,00657721208491588 0,00665293354695964 0,00663767452506294 0,00167634723146347 0,00156989504118623 290922 286640 667 665 0 True 408 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 453 465 0,00667720614400971 0,00655734093760379 0,00671396963454643 0,00653086137178607 0,00182318378956082 0,00184523255729723 291873 285774 667 665 0 True 452 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 496 463 0,00664719139629087 0,00693369954985885 0,00668345159075303 0,00683604180972 0,00183545822452531 0,00181757750279864 290561 302176 667 665 0 True 496 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 542 463 0,0063957263757684 0,00621579125199127 0,00630197604333562 0,00610360875867857 0,00178229470303839 0,00173206752431029 279569 270889 667 665 0 True 540 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 584 463 0,00587412862577638 0,00582883163505009 0,00584420538643473 0,00590524147402152 0,0019765149746813 0,00185754055293912 256769 254025 667 665 0 True 585 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 630 464 0,00550166665351234 0,00571910435277941 0,00560006103608759 0,00570687418936446 0,00176098699847561 0,00172276279338509 240488 249243 667 665 0 True 629 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 233 511 0,00614831060093666 0,00621778754508152 0,00608834973678187 0,00631723506523232 0,0013671541003004 0,00138639712779518 268754 270976 667 665 0 True 230 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 276 510 0,00622188333619869 0,00628834618016775 0,00624093995574884 0,00633249408712902 0,00143535097614106 0,00152747196231255 271970 274051 667 665 0 True 275 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 321 510 0,0061782795944669 0,00635351252932055 0,00614938582436866 0,0064087891966125 0,00146527371546356 0,00144842830028503 270064 276891 667 665 0 True 319 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 365 510 0,0064935259538919 0,00642932577495467 0,00642404821850919 0,0064087891966125 0,00141152408814477 0,00140568671239408 283844 280195 667 665 0 True 363 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 410 509 0,00649162715506518 0,00658813433216826 0,00653086137178607 0,00656137941557946 0,00162924935133269 0,00162383068121236 283761 287116 667 665 0 True 408 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 454 508 0,00640858330276382 0,00644084461554435 0,00636301213092241 0,00645456626230259 0,00193477927713483 0,00168489963343265 280131 280697 667 665 0 True 452 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 499 507 0,00612804149538872 0,00609961617249808 0,00605783169298848 0,00617990386816205 0,00175304470307292 0,00162551261513235 267868 265826 667 665 0 True 496 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 542 508 0,00594982893080811 0,00596864098905997 0,00592050049591821 0,005981536583505 0,00159668762170089 0,00161349297825601 260078 260118 667 665 0 True 540 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 587 507 0,00552957670855577 0,00569618140108798 0,00556954299229419 0,00570687418936446 0,00166798506363368 0,00163991247481367 241708 248244 667 665 0 True 585 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 630 508 0,00552225603838044 0,00569331316388935 0,0055390249485008 0,00561532005798428 0,00172567356324661 0,00177996517992629 241388 248119 667 665 0 True 629 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 233 554 0,00617766191292086 0,00643228579574365 0,00614938582436866 0,0064087891966125 0,00127699294384339 0,00124316775037472 270037 280324 667 665 0 True 230 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 277 555 0,00632128431092305 0,00630427063309452 0,0063935301747158 0,00630197604333562 0,00132286753408078 0,00131661229165115 276315 274745 667 665 0 True 275 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 321 554 0,00629561621112081 0,00643090904188831 0,00628671702143893 0,00648508430609598 0,00131656950425317 0,00133325504193334 275193 280264 667 665 0 True 319 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 366 554 0,00636269185160224 0,00648223901479494 0,00634775310902571 0,00646982528419928 0,00137098743258824 0,00132773532074312 278125 282501 667 665 0 True 363 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 409 554 0,00613554518231843 0,00618676469154117 0,00607309071488518 0,00616464484626535 0,001668172253476 0,0015048829126872 268196 269624 667 665 0 True 408 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 454 553 0,00607384565899701 0,00604977768293473 0,00608834973678187 0,00608834973678187 0,00210508142900711 0,0018598143353048 265499 263654 667 665 0 True 452 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 499 552 0,00605959322924942 0,00597614429757158 0,00599679560540169 0,0059510185397116 0,00203963605729247 0,00200568276093788 264876 260445 667 665 0 True 496 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 543 552 0,00590739192088552 0,00593917845655567 0,0059662775616083 0,0059510185397116 0,00183868385072404 0,00178350493211104 258223 258834 667 665 0 True 540 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 587 551 0,00571865589292788 0,0057375069626458 0,00578316929884794 0,00569161516746777 0,00167947327499793 0,00140732776995778 249973 250045 667 665 0 True 585 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 631 553 0,00569930187115186 0,00583091971173069 0,00576791027695125 0,00581368734264134 0,00149620081496242 0,00159359746648526 249127 254116 667 665 0 True 629 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 231 592 0,00664879279289172 0,00659182862168009 0,00668345159075303 0,00659189745937285 0,0013320027358162 0,00122924835292901 290631 287277 667 665 0 False 231 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 275 592 0,00657496840959241 0,0065936872393848 0,00659189745937285 0,00662241550316625 0,00122247730873661 0,00128905446974204 287404 287358 667 665 0 False 275 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 322 598 0,00637259763343323 0,00646154181516965 0,0063782711528191 0,00645456626230259 0,00143817071484768 0,00135879140336528 278558 281599 667 665 0 True 319 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 366 598 0,00598521979568696 0,00611877599698491 0,005981536583505 0,00605783169298848 0,00136684925392775 0,00128121330162967 261625 266661 667 665 0 True 363 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 408 592 0,00596533960074209 0,00605388499860317 0,00593575951781491 0,00607309071488518 0,00156040879955938 0,00142679158739039 260756 263833 667 665 0 False 408 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 452 592 0,00574425536144722 0,0059478978976395 0,00575265125505455 0,0059662775616083 0,00171279314705988 0,00189779358810499 251092 259214 667 665 0 False 452 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 496 592 0,00597577155574193 0,00602754310817098 0,00588998245212482 0,005981536583505 0,0018015093530009 0,00191514524751881 261212 262685 667 665 0 False 496 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 540 592 0,0059977793204565 0,0058730942714993 0,00607309071488518 0,00593575951781491 0,00183801881079296 0,00170177058298418 262174 255954 667 665 0 False 540 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 585 592 0,0059108692392188 0,00582821209581518 0,00602731364919509 0,00592050049591821 0,00160760267411526 0,00170346231316142 258375 253998 667 665 0 False 585 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 629 592 0,00599057303575267 0,00596292746056031 0,005981536583505 0,00602731364919509 0,00145484802916581 0,00128573958968983 261859 259869 667 665 0 False 629 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 233 642 0,00854852958048328 0,722828104823744 0,00801098649576562 0,739024948500801 0,0026762573770114 0,191803195756505 373672 31501409 667 665 10 True 231 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 275 635 0,00724746347357335 0,00658806549447549 0,00694285496299687 0,00659189745937285 0,00207504967819208 0,00126858573614447 316800 287113 667 665 0 False 275 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 319 635 0,0059760460808735 0,00606751486177104 0,0059510185397116 0,00602731364919509 0,00127612117211488 0,00125340130755897 261224 264427 667 665 0 False 319 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 363 635 0,00574318013801522 0,00575551949225318 0,00570687418936446 0,00572213321126116 0,00123802249679267 0,00118714849761998 251045 250830 667 665 0 False 363 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 408 635 0,0056684177938497 0,00558113067057665 0,00566109712367437 0,00558480201419089 0,00143789382063907 0,00127318228379801 247777 243230 667 665 0 False 408 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 452 635 0,00568166363144818 0,0056769068471132 0,00570687418936446 0,00575265125505455 0,00163825378409622 0,00164659481693236 248356 247404 667 665 0 False 452 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 496 635 0,00576820767917712 0,00576869043746927 0,00578316929884794 0,00575265125505455 0,00168956322168764 0,00175283076441343 252139 251404 667 665 0 False 496 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 540 635 0,00576367801450614 0,00612510906471948 0,00573739223315786 0,00605783169298848 0,00175321970576308 0,00169871841982681 251941 266937 667 665 0 False 540 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 585 635 0,00613497325496098 0,00599688738899205 0,00613412680247196 0,00599679560540169 0,00155208312460858 0,00130446087641318 268171 261349 667 665 0 False 585 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 631 638 0,00753450237572905 0,748649398731436 0,00753795681696803 0,758205539024948 0,00159247837167899 0,191630931368378 329347 32626721 667 665 13 True 629 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B12_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B12_3.csv new file mode 100755 index 0000000..4e81c5a --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B12_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 230 245 0,000997807344897018 0,0715390444525138 0,000747692072938125 0,0715342946517128 0,000906931233909393 0,0195191530641714 43616 3117727 667 665 0 True 230 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 275 244 0,000895867012705595 0,000881627277165218 0,000732433051041428 0,000671396963454643 0,000727700110052493 0,000736747809543799 39160 38422 667 665 0 False 275 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 317 246 0,00087015315871476 0,000870337895551421 0,000762951094834821 0,000793469138628214 0,000628463465752471 0,000586248024138335 38036 37930 667 665 0 True 319 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 362 245 0,00086711050517314 0,000905032092706015 0,000717174029144732 0,000793469138628214 0,000674688351478958 0,000623820131856401 37903 39442 667 665 0 True 363 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 407 244 0,000903782487332667 0,00091636736611499 0,000701915007248035 0,000747692072938125 0,000700757243312959 0,000697352413960698 39506 39936 667 665 0 True 407 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 451 243 0,000892069415052144 0,00080407014331434 0,000701915007248035 0,000595101853971161 0,000779449600858944 0,000759364258013055 38994 35042 667 665 0 True 452 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 496 243 0,000873447460293657 0,000849847209004429 0,000686655985351339 0,000686655985351339 0,000782496768076306 0,000770303565278874 38180 37037 667 665 0 True 496 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 539 243 0,00087244086814455 0,000890759744405647 0,000717174029144732 0,000793469138628214 0,000753990240807804 0,000710815954837914 38136 38820 667 665 0 True 540 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 585 244 0,00104987561151903 0,000922838109235093 0,000793469138628214 0,00064087891966125 0,000982091170934559 0,000908017788171315 45892 40218 667 665 0 False 585 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 627 241 0,00097811016670653 0,0721437147457795 0,000656137941557946 0,0726939803158618 0,000992854682689185 0,0218097824195749 42755 3144079 667 665 0 True 629 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 230 288 0,000857044583682066 0,000888189803875677 0,000625619897764553 0,00064087891966125 0,000783237944029238 0,000772235729362993 37463 38708 667 665 0 False 230 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 275 288 0,000830827433616678 0,00087270132300309 0,000671396963454643 0,000717174029144732 0,000685256505788869 0,000719113596585165 36317 38033 667 665 0 False 275 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 319 289 0,000885778214120223 0,000768756406924842 0,000778210116731518 0,000686655985351339 0,000680030426682445 0,000574468739882895 38719 33503 667 665 0 True 319 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 363 289 0,000818176400469941 0,000857052220847381 0,000656137941557946 0,000747692072938125 0,000666407144050398 0,000643153757471585 35764 37351 667 665 0 True 363 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 407 289 0,000884840253254009 0,000937316970613763 0,000717174029144732 0,000793469138628214 0,000742088340043578 0,000705929711065615 38678 40849 667 665 0 True 407 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 451 287 0,00086091081261841 0,00087293078197898 0,000610360875867857 0,000488288700694286 0,000855754476543497 0,000928053752579422 37632 38043 667 665 0 True 452 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 496 287 0,000856221008287342 0,000927014262596294 0,000625619897764553 0,000671396963454643 0,000818543210827684 0,00085826256355456 37427 40400 667 665 0 True 496 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 540 288 0,000891977906674953 0,00092896466389136 0,000701915007248035 0,000732433051041428 0,000779745056726221 0,000788071372584754 38990 40485 667 665 0 True 540 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 585 288 0,00100270304307677 0,00101423161933215 0,000701915007248035 0,00064087891966125 0,000981674046234893 0,00107190594718927 43830 44201 667 665 0 False 585 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 629 288 0,00102093608723219 0,000968041527485457 0,000717174029144732 0,000610360875867857 0,000981365605679297 0,000987967418544868 44627 42188 667 665 0 False 629 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 231 334 0,000927323017365202 0,000902944016025415 0,000747692072938125 0,000747692072938125 0,000807974237907924 0,000708663024686941 40535 39351 667 665 0 True 230 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 275 332 0,000894929051839381 0,000863522963967483 0,000762951094834821 0,000701915007248035 0,000689778701799516 0,000722505911431045 39119 37633 667 665 0 True 275 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 319 333 0,00088863785090746 0,00078071121956872 0,000732433051041428 0,000686655985351339 0,000666869862739865 0,000548437829581831 38844 34024 667 665 0 True 319 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 364 333 0,00083254321568902 0,000795029459664267 0,000717174029144732 0,000656137941557946 0,0006344443786458 0,000634755631902466 36392 34648 667 665 0 True 363 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 407 333 0,000876604499306767 0,00084025582381222 0,000701915007248035 0,000656137941557946 0,000716889704326709 0,000668990917856484 38318 36619 667 665 0 True 407 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 451 332 0,000925012430841114 0,00078982074091156 0,000686655985351339 0,000579842832074464 0,000854971431137409 0,000738023181441065 40434 34421 667 665 0 True 452 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 496 331 0,000902318353297602 0,00093458640880067 0,000671396963454643 0,000732433051041428 0,000832173191760434 0,000819297988412967 39442 40730 667 665 0 True 496 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 540 331 0,000913116341806208 0,000955467175606675 0,000701915007248035 0,000778210116731518 0,000813721137949763 0,000800463991759297 39914 41640 667 665 0 True 540 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 584 332 0,000925149693406902 0,000937523483692064 0,000564583810177768 0,000549324788281071 0,000992845411519691 0,00103833197048424 40440 40858 667 665 0 True 585 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 628 331 0,000907282682760245 0,000953631503799554 0,000473029678797589 0,000534065766384375 0,00101616173270498 0,00105938814657252 39659 41560 667 665 0 True 629 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 230 378 0,000913139218900506 0,000872035891973009 0,000747692072938125 0,000701915007248035 0,000797816300187042 0,000756464771479126 39915 38004 667 665 0 True 230 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 275 378 0,000889667320150865 0,000929698932614209 0,000717174029144732 0,000747692072938125 0,000735655259921125 0,000746255763548286 38889 40517 667 665 0 True 275 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 320 377 0,000806897992981079 0,000900580588573746 0,000671396963454643 0,000793469138628214 0,000655767388879711 0,000653037119541621 35271 39248 667 665 0 True 319 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 363 378 0,000889186901170609 0,000774515827219686 0,000778210116731518 0,000595101853971161 0,000700259523197588 0,000664275699729967 38868 33754 667 665 0 True 363 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 407 378 0,000876398605458086 0,0010053515569652 0,000671396963454643 0,000793469138628214 0,000759367426193874 0,000787387077881608 38309 43814 667 665 0 True 408 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 452 376 0,000850547488901464 0,000909896622994887 0,000518806744487678 0,000610360875867857 0,000886375560762915 0,000865657299811104 37179 39654 667 665 0 True 452 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 495 374 0,000858348578057046 0,000886377077966145 0,000473029678797589 0,000549324788281071 0,000906282979700098 0,000904011398565792 37520 38629 667 665 0 True 496 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 540 375 0,00093549014002955 0,000931603442114097 0,000686655985351339 0,000717174029144732 0,000836287555037766 0,000869240794888014 40892 40600 667 665 0 True 540 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 584 376 0,000939745279568959 0,00094507268399885 0,000549324788281071 0,000503547722590982 0,000997799764103275 0,00103500555180767 41078 41187 667 665 0 True 585 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 628 376 0,000984584384392835 0,000922585704361613 0,000625619897764553 0,000549324788281071 0,00102354634190672 0,000988033930887421 43038 40207 667 665 0 True 629 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 231 422 0,000929450587134906 0,000946633005034904 0,000701915007248035 0,000793469138628214 0,000846256577211327 0,000791380090260873 40628 41255 667 665 0 True 230 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 275 421 0,000944046173296963 0,000875684289689663 0,00080872816052491 0,000671396963454643 0,000793062171696614 0,000792833437886981 41266 38163 667 665 0 True 275 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 320 421 0,000774115116852194 0,000862375669088032 0,000671396963454643 0,000686655985351339 0,00061773563952958 0,000731205871707766 33838 37583 667 665 0 True 319 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 364 420 0,000879990309262855 0,00090351766346514 0,000762951094834821 0,000793469138628214 0,000694668189044858 0,000694334123196944 38466 39376 667 665 0 True 363 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 408 421 0,000897720057343725 0,000943351741679674 0,000717174029144732 0,000686655985351339 0,000765939212889118 0,000829141760943567 39241 41112 667 665 0 True 408 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 452 420 0,000896919359043298 0,00083722696533047 0,000656137941557946 0,000610360875867857 0,000815005702896424 0,000766237294294156 39206 36487 667 665 0 True 452 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 496 419 0,00088429120299086 0,000911089809669516 0,00064087891966125 0,000717174029144732 0,000858595027514765 0,000855516174433153 38654 39706 667 665 0 True 496 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 540 419 0,000891817767014867 0,000931259253650262 0,000701915007248035 0,000732433051041428 0,000813749793907494 0,000820264383826307 38983 40585 667 665 0 True 540 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 585 419 0,000879189610962429 0,000952048236865912 0,000534065766384375 0,000579842832074464 0,000910175305690989 0,0010188060038814 38431 41491 667 665 0 True 585 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 629 419 0,000832749109537701 0,00085356444441385 0,000503547722590982 0,000534065766384375 0,000869734161495519 0,000886095237113396 36401 37199 667 665 0 True 629 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 232 467 0,000980374999042022 0,000877198718930538 0,000823987182421607 0,000732433051041428 0,000772251751801753 0,000723419641969682 42854 38229 667 665 0 True 230 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 277 466 0,00089396821387887 0,00092150724717493 0,000747692072938125 0,000778210116731518 0,000759806286413575 0,000801166849718735 39077 40160 667 665 0 True 275 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 321 467 0,00087026754418625 0,000866758335527535 0,000701915007248035 0,000701915007248035 0,000776500143216752 0,000801927975424929 38041 37774 667 665 0 True 319 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 366 466 0,000955164441125741 0,000862765749347046 0,000823987182421607 0,000717174029144732 0,000753755018821059 0,000752358500611543 41752 37600 667 665 0 True 363 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 409 464 0,000892687096598187 0,000913453237121185 0,00064087891966125 0,000671396963454643 0,00085738548949732 0,000866727986079228 39021 39809 667 665 0 True 408 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 453 465 0,000956010893614763 0,000848699914124978 0,000488288700694286 0,0004272526131075 0,00103249410448366 0,00100462272623031 41789 36987 667 665 0 True 452 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 496 463 0,000840710338353368 0,000860081079329131 0,000457770656900893 0,000457770656900893 0,000915157252480204 0,000945802144364043 36749 37483 667 665 0 True 496 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 542 463 0,00091897287794647 0,000968408661846881 0,000564583810177768 0,000625619897764553 0,000940386219995012 0,000944604768405368 40170 42204 667 665 0 True 540 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 584 463 0,000910668492716333 0,000862926370630169 0,000488288700694286 0,0004272526131075 0,000980348590253561 0,00100900621830332 39807 37607 667 665 0 True 585 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 630 464 0,000836203550776683 0,000893444414423562 0,000503547722590982 0,000518806744487678 0,00090075201830483 0,000919645255909264 36552 38937 667 665 0 True 629 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 233 511 0,000937297430479084 0,000916757446374003 0,000839246204318303 0,000778210116731518 0,000746505275028379 0,000761505688930873 40971 39953 667 665 0 True 230 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 276 510 0,000847962377245801 0,000960423489485903 0,000686655985351339 0,000823987182421607 0,000745242631804163 0,000807880820949921 37066 41856 667 665 0 True 275 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 321 510 0,00089831486179547 0,000870590300424901 0,000762951094834821 0,000732433051041428 0,000761507766121453 0,000766837878465664 39267 37941 667 665 0 True 319 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 365 510 0,000845056986269969 0,000884013650514476 0,000671396963454643 0,000747692072938125 0,000774616907604373 0,00071849880717841 36939 38526 667 665 0 True 363 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 410 509 0,000876101203232213 0,000958037116136645 0,000610360875867857 0,000732433051041428 0,000868306309946788 0,000846595770312725 38296 41752 667 665 0 True 408 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 454 508 0,000842998047783158 0,000855698412889629 0,000442511635004196 0,000473029678797589 0,000941746729599684 0,000931567190281585 36849 37292 667 665 0 True 452 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 499 507 0,00089309888429555 0,000886881887713103 0,000610360875867857 0,000595101853971161 0,000896906667610319 0,000866579834948545 39039 38651 667 665 0 True 496 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 542 508 0,000835974779833704 0,000984379006568837 0,000549324788281071 0,000762951094834821 0,000815932002034034 0,000844870622713351 36542 42900 667 665 0 True 540 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 587 507 0,000840573075787581 0,000866001120907097 0,000488288700694286 0,000503547722590982 0,000899724529992483 0,000913556551798086 36743 37741 667 665 0 True 585 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 630 508 0,000902249722014708 0,000908473977344368 0,000503547722590982 0,000534065766384375 0,000986493059298898 0,000957750107085466 39439 39592 667 665 0 True 629 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 233 554 0,000938921704174235 0,000904137202700044 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,000732515036283954 0,000658665807670073 41042 39403 667 665 0 True 230 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 277 555 0,000844736706949798 0,000919510954084685 0,000717174029144732 0,000778210116731518 0,00068861874023677 0,00069689735983793 36925 40073 667 665 0 True 275 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 321 554 0,000868689024679695 0,000944820279125371 0,000762951094834821 0,000839246204318303 0,000690995703454205 0,000693701104544738 37972 41176 667 665 0 True 319 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 366 554 0,000940889134283854 0,000921231896403862 0,000793469138628214 0,000839246204318303 0,000727494831674131 0,000651152149226456 41128 40148 667 665 0 True 363 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 409 554 0,00086884916433978 0,000928230395168512 0,00064087891966125 0,000671396963454643 0,000846741915162481 0,000832875215473885 37979 40453 667 665 0 True 408 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 454 553 0,00092766617377967 0,00083325732504757 0,000442511635004196 0,000442511635004196 0,00101406218300878 0,000954213049704871 40550 36314 667 665 0 True 452 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 499 552 0,000855214416138234 0,000840232877914631 0,000473029678797589 0,000289921416037232 0,000935332199108278 0,00107095967620769 37383 36618 667 665 0 True 496 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 543 552 0,000896004275271382 0,000963222888991763 0,000579842832074464 0,000564583810177768 0,000922605308002673 0,00100299449314651 39166 41978 667 665 0 True 540 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 587 551 0,000854230701083425 0,000867240199376904 0,000549324788281071 0,000656137941557946 0,000878814774656241 0,000738964970713396 37340 37795 667 665 0 True 585 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 631 553 0,000856930198210577 0,000891172770562249 0,000564583810177768 0,000549324788281071 0,000884560707288287 0,000897831717179716 37458 38838 667 665 0 True 629 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 231 592 0,00092331952586307 0,00092641766925898 0,000793469138628214 0,000885023270008392 0,000704912639027042 0,000612902618718353 40360 40374 667 665 0 False 231 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 275 592 0,000960540558285746 0,000875202425840293 0,000869764248111696 0,000762951094834821 0,00069018758298655 0,000679520349709715 41987 38142 667 665 0 False 275 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 322 598 0,000839246204318303 0,000914210451741622 0,000701915007248035 0,00080872816052491 0,000712578287653143 0,000724474660754511 36685 39842 667 665 0 True 319 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 366 598 0,00084700153928529 0,00081060972412721 0,000701915007248035 0,000686655985351339 0,000694010402473774 0,000685119667669192 37024 35327 667 665 0 True 363 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 408 592 0,000900328046093685 0,00081409750056074 0,000701915007248035 0,000625619897764553 0,000813413670724739 0,000716290961882578 39355 35479 667 665 0 False 408 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 452 592 0,000871617292749826 0,000776672741593053 0,000488288700694286 0,000320439459830625 0,000975792323460053 0,000923719087790471 38100 33848 667 665 0 False 452 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 496 592 0,000857067460776364 0,000814212230048685 0,000457770656900893 0,000244144350347143 0,00097388262100491 0,00103082139296236 37464 35484 667 665 0 False 496 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 540 592 0,00088733385653248 0,000932429494427302 0,000442511635004196 0,000579842832074464 0,00100974426728898 0,000958624548207249 38787 40636 667 665 0 False 540 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 585 592 0,000939585139908874 0,00083091684349349 0,000656137941557946 0,0004272526131075 0,000885069205733052 0,000910763145098481 41071 36212 667 665 0 False 585 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 629 592 0,000870244667091952 0,000907051331693849 0,000671396963454643 0,000656137941557946 0,00076699018404377 0,000753286597496318 38040 39530 667 665 0 False 629 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 233 642 0,00102786784680445 0,0713612596379941 0,000869764248111696 0,0710765239948119 0,000777047208538435 0,0208266747689264 44930 3109979 667 665 0 True 231 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 275 635 0,000959854245456809 0,000910630891717736 0,00080872816052491 0,000747692072938125 0,000742231318817892 0,000709072337777882 41957 39686 667 665 0 False 275 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 319 635 0,000860544779109644 0,000818617842385777 0,000732433051041428 0,000701915007248035 0,000657900968591057 0,000637075457769327 37616 35676 667 665 0 False 319 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 363 635 0,00085743349428513 0,000849525966438183 0,000732433051041428 0,000778210116731518 0,000647395564530832 0,00061140923105379 37480 37023 667 665 0 False 363 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 408 635 0,000869466845885823 0,000825570449355249 0,000717174029144732 0,000671396963454643 0,000705187443667612 0,000718372765924394 38006 35979 667 665 0 False 408 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 452 635 0,000886144247628989 0,000789178255779068 0,000595101853971161 0,000457770656900893 0,000890483400584182 0,000878690972249942 38735 34393 667 665 0 False 452 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 496 635 0,000852057377125125 0,000819673353674872 0,000473029678797589 0,000442511635004196 0,000946031652859046 0,000870433417354004 37245 35722 667 665 0 False 496 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 540 635 0,000870908102826591 0,000983392332972509 0,000488288700694286 0,000686655985351339 0,000945913274570416 0,000934038979520661 38069 42857 667 665 0 False 540 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 585 635 0,000788138775656804 0,000908795219910614 0,000610360875867857 0,000747692072938125 0,000731517301189187 0,000709271032071657 34451 39606 667 665 0 False 585 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 631 638 0,000824810757816331 0,0744745360769743 0,000686655985351339 0,0735942626077668 0,000655376452430718 0,0223848349300653 36054 3245658 667 665 0 True 629 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B1_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B1_1.csv new file mode 100755 index 0000000..7386669 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B1_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 254 279 0,00997908004111929 0,0461563154854405 0,00991836423285267 0,0452429999237049 0,00157762413093151 0,00848346732996311 436204 2011528 667 665 0 True 254 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 298 278 0,00994005171824708 0,00985349618036852 0,00997940032043946 0,00978103303578241 0,0013423626527204 0,00147489985594351 434498 429423 667 665 0 False 298 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 342 280 0,0101332030254042 0,0631514698855172 0,0101167315175097 0,0621652552071412 0,00127296367234192 0,00927513522611945 442941 2752190 667 665 0 True 343 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 386 280 0,0101781565156996 0,0828801002276807 0,0101625085831998 0,0827191577019913 0,00119258356251613 0,013699627122236 444906 3611979 667 665 0 True 387 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 431 279 0,0102103903415653 0,0722072978279987 0,0102082856488899 0,0683299000534066 0,00155084295512703 0,0124477727165162 446315 3146850 667 665 0 True 431 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 475 279 0,0102379114860057 0,0668787555980819 0,01025406271458 0,0703135728999771 0,00175399377394126 0,0184808903098811 447518 2914628 667 665 0 True 476 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 519 278 0,0105331175108257 0,0788661743624339 0,0105134660868238 0,0759136339360647 0,00159797906356405 0,0212093187858175 460422 3437049 667 665 0 True 520 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 562 277 0,0104163756986236 0,0667370417345722 0,010406652933547 0,0641641870756084 0,00173682330331719 0,0181827448240667 455319 2908452 667 665 0 True 564 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 609 278 0,0101657113764015 0,0100897930337402 0,0103303578240635 0,010101472495613 0,00213645184344726 0,00182294162545633 444362 439721 667 665 0 False 609 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 651 277 0,0100847493396813 0,0433410603643464 0,0101167315175097 0,0437323567559319 0,00185694628917565 0,00969691481368672 440823 1888837 667 665 0 True 653 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 254 322 0,00982957822988254 0,0099912174576978 0,00990310521095598 0,00991836423285267 0,00146775994250351 0,00141524015271039 429669 435425 667 665 0 False 254 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 298 322 0,00991092917720586 0,00996395773136205 0,00993362325474937 0,00988784618905928 0,00139536541384146 0,00132172755973012 433225 434237 667 665 0 False 298 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 342 324 0,0102208451736595 0,101567147440586 0,0102693217364767 0,0973678187228199 0,00131724213737755 0,0194318373825063 446772 4426375 667 665 0 True 343 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 387 324 0,0102387579384947 0,0523111624334354 0,0102388036926833 0,0512397955291066 0,00136163876113125 0,00694028772756863 447555 2279761 667 665 0 True 387 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 431 324 0,0102497160666634 0,077436599050843 0,0102693217364767 0,0739299610894942 0,00165661597032393 0,0142294725566979 448034 3374747 667 665 0 True 431 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 475 322 0,0101070545066217 0,0410760249215394 0,0101472495613031 0,042572671091783 0,00167275195734658 0,0069453324119244 441798 1790125 667 665 0 True 476 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 520 322 0,0102605598093606 0,0420956947186001 0,0102998397802701 0,0441901274128328 0,00167705439116067 0,0080917977315703 448508 1834563 667 665 0 True 520 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 564 322 0,0102010793641861 0,0525576013735414 0,0102845807583734 0,0525520714122225 0,00175830003667944 0,00970326461676778 445908 2290501 667 665 0 True 564 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 609 321 0,0100506853462717 0,0100940380247942 0,0100404364080262 0,0101472495613031 0,00214126786625233 0,00204226837507137 439334 439906 667 665 0 False 609 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 653 321 0,00997974347685393 0,00998073118249962 0,0100099183642329 0,0100251773861295 0,00189705103258969 0,00183889157350942 436233 434968 667 665 0 False 653 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 254 369 0,0101415989190115 0,0584578865336837 0,0101625085831998 0,055741206988632 0,00152121221624176 0,0129226428676402 443308 2547640 667 665 0 True 254 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 299 368 0,0101981282190216 0,0680436040891884 0,0101777676050965 0,0710154879072251 0,00141750439792778 0,017204883204868 445779 2965393 667 665 0 True 298 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 343 369 0,010264586177957 0,0417766549585224 0,0102235446707866 0,0426184481574731 0,00137771520350549 0,00721897263698416 448684 1820659 667 665 0 True 343 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 387 368 0,0103038203946779 0,0359771481805911 0,0102845807583734 0,0365148393987945 0,00140237241068065 0,00457357920653158 450399 1567912 667 665 0 True 387 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 431 368 0,0105671357500467 0,0747328609920315 0,0105745021744106 0,0702983138780804 0,00164723965058243 0,0129785408789828 461909 3256916 667 665 0 True 431 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 476 366 0,0103359855892608 0,0332930059183206 0,0103608758678569 0,0340123598077363 0,0016977792209905 0,00478123244426956 451805 1450935 667 665 0 True 476 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 519 367 0,0104488840496209 0,0291274994536008 0,0104371709773404 0,0294956893263142 0,00175487743080514 0,00343171210280882 456740 1269399 667 665 0 True 520 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 564 366 0,0102169331905345 0,0510307354561731 0,0102845807583734 0,0504921034561685 0,00186034911562901 0,0077514427694593 446601 2223959 667 665 0 True 564 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 607 366 0,0100890044792207 0,0568011927277567 0,0101472495613031 0,056748302433814 0,00199638466105794 0,0116739947871328 441009 2475440 667 665 0 True 609 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 651 365 0,0101491026059413 0,0641379599146642 0,0101777676050965 0,0634775310902571 0,00184373921573179 0,0191206203693704 443636 2795182 667 665 0 True 653 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 255 413 0,00994883652245747 0,0505910232206747 0,00997940032043946 0,0522163729304952 0,00152733933758228 0,0112398885248862 434882 2204796 667 665 0 True 254 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 299 413 0,0101767381358531 0,0357807771890243 0,0101777676050965 0,0352941176470588 0,00145226668698774 0,00528751130547659 444844 1559354 667 665 0 True 298 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 342 412 0,01069133549499 0,0953642747289372 0,010757610437171 0,0905470359349966 0,00139872016433643 0,0213077771317702 467338 4156049 667 665 0 True 343 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 388 411 0,0106142396872061 0,074245696640319 0,0106660563057908 0,072480354009308 0,00143017025164587 0,0182090904284316 463968 3235685 667 665 0 True 387 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 431 412 0,0107795266935084 0,0466199832380218 0,0107728694590677 0,0470435645075151 0,00155341527945042 0,00891829766616401 471193 2031735 667 665 0 True 431 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 476 411 0,0106546406357361 0,0553240505704637 0,0106507972838941 0,0539406424048219 0,00176426276254799 0,00965210731828889 465734 2411065 667 665 0 True 476 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 519 410 0,0105945196319213 0,0419134354540506 0,010605020218204 0,0428320744640269 0,00166219017222852 0,00636719638935589 463106 1826620 667 665 0 True 520 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 564 410 0,0103491856726706 0,0523396382923434 0,0102388036926833 0,0520637827115282 0,00184076886018672 0,00815355257305471 452382 2281002 667 665 0 True 564 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 607 410 0,0103520910636465 0,0436582415067194 0,0104219119554437 0,0428778515297169 0,00198557011569708 0,00918158395293775 452509 1902660 667 665 0 True 609 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 652 410 0,0103011208975508 0,0881245457429337 0,0102388036926833 0,0822919050888838 0,00187063594592253 0,0173042256176733 450281 3840536 667 665 0 True 653 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 255 457 0,0101408897290883 0,044540855457481 0,0101777676050965 0,044281681544213 0,00152922628621403 0,00602928478175337 443277 1941125 667 665 0 True 254 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 298 457 0,0102633279377706 0,0640198114879784 0,0102235446707866 0,0632181277180133 0,00158913945030822 0,0118087106042555 448629 2790033 667 665 0 True 298 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 344 456 0,0105013183497517 0,0379076783283455 0,0105439841306172 0,0374914168001831 0,00140951320013777 0,00480926711725101 459032 1652046 667 665 0 True 343 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 387 456 0,0105938790732809 0,0569917354613359 0,0105439841306172 0,0547798886091402 0,00160373982625304 0,0110794685256509 463078 2483744 667 665 0 True 387 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 431 455 0,0108927911873772 0,0987462246827873 0,0108491645685512 0,0981918059052415 0,00182316382793791 0,0172813959249079 476144 4303437 667 665 0 True 431 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 476 455 0,0108180974744946 0,063850493709669 0,0107881284809644 0,0618905928130007 0,00190916407169179 0,014632025144664 472879 2782654 667 665 0 True 476 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 519 454 0,0106454669209227 0,0559981322039363 0,0105897611963073 0,054886701762417 0,00180314780435093 0,0109524966542065 465333 2440442 667 665 0 True 520 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 564 454 0,0105330488795428 0,0325660110450078 0,0105134660868238 0,0329594872968643 0,00192401773497237 0,00434462618363052 460419 1419252 667 665 0 True 564 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 608 454 0,0104152089668144 0,0407668060056298 0,0103761348897536 0,0401770046540017 0,00186866288820113 0,00628363702658192 455268 1776649 667 665 0 True 609 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 653 454 0,0103374497232958 0,0664703874586902 0,0103761348897536 0,0674906538490883 0,00192797495552867 0,0121575605012276 451869 2896831 667 665 0 True 653 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 256 500 0,00995483032116352 0,055569525782871 0,00994888227664607 0,0557259479667353 0,00146724798869151 0,0136145067144844 435144 2421763 667 665 0 True 254 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 300 501 0,0102548405357861 0,0594192508049708 0,0103456168459602 0,0577401388570993 0,00157115891154537 0,00863117469498207 448258 2589537 667 665 0 True 298 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 344 500 0,0105629721188845 0,0749324444092607 0,0106202792401007 0,0696269169146258 0,00157387704773578 0,0197043447253068 461727 3265614 667 665 0 True 343 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 389 500 0,0107509989569189 0,0964852736097511 0,0106813153276875 0,0881513694972152 0,00160773062247971 0,0242067716443421 469946 4204903 667 665 0 True 387 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 433 500 0,0110760595897977 0,102698724380188 0,0110627908751049 0,0964827954528115 0,00189069644784488 0,031429852030103 484155 4475690 667 665 0 True 431 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 477 499 0,0107674475877191 0,048998348469021 0,0107881284809644 0,0498054474708171 0,00181143433709723 0,00669263771395777 470665 2135386 667 665 0 True 476 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 521 499 0,0106897112212948 0,0419235316489897 0,0107270923933776 0,043228809033341 0,00175987418501752 0,0058250463930655 467267 1827060 667 665 0 True 520 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 564 498 0,0105724432359238 0,106892936162792 0,0106660563057908 0,107209887846189 0,00174826785368792 0,0209731436766966 462141 4658477 667 665 0 True 564 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 609 498 0,0103595718734819 0,0633258128153985 0,0103456168459602 0,0641336690318151 0,00189389271519171 0,0168646922534588 452836 2759788 667 665 0 True 609 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 653 498 0,0101817939736929 0,0758124884194923 0,0102082856488899 0,0738689250019074 0,00176184181982881 0,0123304987408716 445065 3303967 667 665 0 True 653 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 256 545 0,00983886633016749 0,0569541959728802 0,00988784618905928 0,058655680170901 0,00137886149512603 0,0125969329686401 430075 2482108 667 665 0 True 254 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 299 545 0,0101213755676522 0,109712000302886 0,0100556954299229 0,102098115510796 0,00156190211586205 0,0253867408552635 442424 4781334 667 665 0 True 298 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 344 544 0,0104284319273186 0,0609684201347957 0,0104219119554437 0,0628671702143893 0,00153675051840448 0,0129979541022784 455846 2657051 667 665 0 True 343 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 389 545 0,0107572901578508 0,0618436455065336 0,0107881284809644 0,060318913557641 0,0016478027465772 0,00948855563175651 470221 2695194 667 665 0 True 387 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 433 544 0,0110016632791409 0,0607134453207865 0,0110475318532082 0,0596780346379797 0,00194891543518357 0,00757275412819136 480903 2645939 667 665 0 True 431 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 478 543 0,0108508117193406 0,0637932895869796 0,0108491645685512 0,0625467307545586 0,00191871389508575 0,0123475095489835 474309 2780161 667 665 0 True 476 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 521 543 0,0105443044099374 0,0758896784189818 0,010605020218204 0,0717021438925765 0,001819760418006 0,0177400807086978 460911 3307331 667 665 0 True 520 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 565 542 0,0105732210571299 0,0582938463118198 0,0105134660868238 0,058304722667277 0,00218963381558403 0,0133149741320599 462175 2540491 667 665 0 True 564 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 609 543 0,0105192539916812 0,0423372691284173 0,0103608758678569 0,0417639429312581 0,00239052757100971 0,00465375234066624 459816 1845091 667 665 0 True 609 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 653 542 0,0102746749765424 0,0641316727387248 0,0102845807583734 0,0626382848859388 0,00196127714698016 0,0144738053796725 449125 2794908 667 665 0 True 653 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 255 589 0,00971887597057502 0,0493502238085486 0,00970473792629892 0,0504310673685817 0,00127865661076936 0,00960010149491806 424830 2150721 667 665 0 True 254 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 300 589 0,00996322621477085 0,0565315325392905 0,0100251773861295 0,0559700923170825 0,00142587525287129 0,0121477595607277 435511 2463688 667 665 0 True 298 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 345 589 0,0102684524068934 0,0546043983843794 0,0102693217364767 0,0542610818646525 0,00148773622580188 0,0101610268153208 448853 2379702 667 665 0 True 343 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 389 589 0,0106168705530503 0,052380917962106 0,0105745021744106 0,050919356069276 0,00137422239526291 0,0062497423869845 464083 2282801 667 665 0 True 387 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 433 589 0,0105423141027335 0,0924601042546857 0,0104982070649271 0,0846265354390784 0,00189225920213095 0,0204773609079491 460824 4029483 667 665 0 True 431 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 477 587 0,0104312229328229 0,0676674290441141 0,0104829480430304 0,0650186923018235 0,00198302872105117 0,0128595944282737 455968 2948999 667 665 0 True 476 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 522 587 0,01052499614235 0,0599733942317455 0,0105287251087205 0,0592355230029755 0,00196212429481895 0,00861270700887963 460067 2613687 667 665 0 True 520 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 564 587 0,0101881309288135 0,0390376031633214 0,0101625085831998 0,0401007095445182 0,00176388575939735 0,00765419794061963 445342 1701289 667 665 0 True 564 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 610 587 0,0102760933563889 0,0503875160549577 0,0103150988021668 0,0501411459525444 0,00167032628533498 0,00558766872730077 449187 2195927 667 665 0 True 609 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 654 586 0,0104206994694459 0,0503516286711285 0,0103456168459602 0,0494392309452964 0,00186214052897912 0,00715701658309202 455508 2194363 667 665 0 True 653 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 254 626 0,0102080340008526 0,00956224390227113 0,00964370183871214 0,00955214770733196 0,00337419216765129 0,0013828182991097 446212 416730 667 665 0 False 254 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 298 626 0,0101317388913691 0,00960728669923837 0,00970473792629892 0,00958266575112535 0,0026391013586462 0,00130099210906624 442877 418693 667 665 0 False 298 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 344 632 0,0101785683033969 0,0835202219327215 0,0102082856488899 0,0784161135271229 0,00133716778483009 0,0179409020855049 444924 3639876 667 665 0 True 343 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 388 632 0,010193781571105 0,0805385172705166 0,0101930266269932 0,0741741054398413 0,00131576417575803 0,0210586885561949 445589 3509931 667 665 0 True 387 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 431 626 0,0107670358000217 0,0101651932532177 0,0101930266269932 0,01025406271458 0,00367904821650075 0,00179955258124866 470647 443007 667 665 0 False 431 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 476 626 0,0103840274872863 0,01001755934813 0,0102845807583734 0,0100099183642329 0,00245203055550942 0,00183208625943959 453905 436573 667 665 0 False 476 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 520 626 0,010088341043486 0,0101437158930744 0,0100556954299229 0,0102235446707866 0,00216603280512597 0,00190851050006112 440980 442071 667 665 0 False 520 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 564 626 0,00988947046275443 0,00986067824631389 0,00984206912336919 0,00990310521095598 0,00177341941781595 0,00178066160160435 432287 429736 667 665 0 False 564 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 609 626 0,010210596235414 0,00998910643511961 0,0102235446707866 0,00996414129854276 0,00151685029370895 0,00128406863913222 446324 435333 667 665 0 False 609 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 653 626 0,0101162053443409 0,00994851514228464 0,0101319905394064 0,00997940032043946 0,00154562384826672 0,00155856752474506 442198 433564 667 665 0 False 653 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 254 669 0,0125417035130867 0,0329760083431284 0,0100099183642329 0,0379339284351873 0,00771913228371095 0,0180219148927271 548221 1437120 667 665 0 False 254 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 298 669 0,00953370876932786 0,0093924442601124 0,00961318379491875 0,00943007553215839 0,00129909123586166 0,00124713406704485 416736 409330 667 665 0 False 298 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 343 669 0,0118344123886786 0,0109603374423699 0,00994888227664607 0,00996414129854276 0,00897500831575726 0,00447840923024122 517304 477660 667 665 0 False 343 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 387 669 0,010945454258451 0,00979539716767313 0,00987258716716258 0,00984206912336919 0,00545297090314229 0,00129014345561089 478446 426891 667 665 0 False 387 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 431 669 0,00989166666380703 0,00984794327315198 0,00994888227664607 0,00988784618905928 0,00145935345305682 0,00145971302822641 432383 429181 667 665 0 False 431 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 476 669 0,00970336530064105 0,0098015237223294 0,00962844281681544 0,0097962920576791 0,0015532971357136 0,00142267157840688 424152 427158 667 665 0 False 476 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 520 669 0,00981557744817223 0,00970680305708193 0,00976577401388571 0,00973525597009232 0,00168051763561485 0,00175834838275693 429057 423030 667 665 0 False 520 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 564 669 0,00976597990773439 0,00977134986699984 0,00984206912336919 0,00978103303578241 0,00156583560764907 0,00151839604590337 426889 425843 667 665 0 False 564 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 609 669 0,00997523668927724 0,00989619849578168 0,0100099183642329 0,00993362325474937 0,00148285410246579 0,00143212433654761 436036 431284 667 665 0 False 609 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 656 674 0,00981827694529938 0,0419417047998802 0,00984206912336919 0,041718165865568 0,00151011244274514 0,00864757315144485 429175 1827852 667 665 0 True 653 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B1_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B1_2.csv new file mode 100755 index 0000000..aeca8ac --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B1_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 254 279 0,00814415406167367 0,762728060710256 0,00796520943007553 0,767742427710384 0,00197178586986548 0,171684402144917 355996 33240280 667 665 14 True 254 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 298 278 0,00670857064029212 0,0064275818867379 0,00662241550316625 0,0063935301747158 0,00152766802285245 0,00126633864726058 293244 280119 667 665 0 False 298 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 342 280 0,00584255823564528 0,00599798879207632 0,00582894636453803 0,005981536583505 0,00122609721858762 0,00121968730443813 255389 261397 667 665 0 True 343 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 386 280 0,00611802132808624 0,00623240408184572 0,00610360875867857 0,00622568093385214 0,00118835670152932 0,00124289716005442 267430 271613 667 665 0 True 387 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 431 279 0,00631400939493632 0,00651842469529282 0,00622568093385214 0,00650034332799268 0,00153003747680655 0,00149647230446987 275997 284078 667 665 0 True 431 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 475 279 0,00650816729424256 0,00663264937349095 0,00656137941557946 0,00662241550316625 0,00154364597603463 0,00168452456748823 284484 289056 667 665 0 True 476 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 519 278 0,00694175686247057 0,0070445511811114 0,00698863202868696 0,00709544518196384 0,00145059088832528 0,00152686517976977 303437 307007 667 665 0 True 520 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 562 277 0,00691354940520127 0,00702738764971481 0,00692759594110018 0,00703440909437705 0,00160844123220963 0,00151899235716515 302204 306259 667 665 0 True 564 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 609 278 0,00778534971470548 0,00740193353606034 0,00775158312352178 0,00747692072938125 0,00207436501956531 0,00179860457073878 340312 322582 667 665 0 False 609 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 651 277 0,00919057523195372 0,717871951565799 0,00923170824750134 0,724071107042039 0,00187361207622172 0,206589213239235 401737 31285416 667 665 11 True 653 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 254 322 0,00627239596040844 0,00618938052386632 0,00616464484626535 0,00621042191195544 0,00146416395013505 0,00135666485118882 274178 269738 667 665 0 False 254 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 298 322 0,00610564482007108 0,00595358848024157 0,00608834973678187 0,0059662775616083 0,00126316596990086 0,00114883601886162 266889 259462 667 665 0 False 298 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 342 324 0,00615128462319538 0,00621705327635867 0,00613412680247196 0,00619516289005875 0,0011945939773386 0,00125755460639265 268884 270944 667 665 0 True 343 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 387 324 0,00652466167923134 0,006344219440797 0,00654612039368277 0,00634775310902571 0,00123652517003969 0,00116677996109275 285205 276486 667 665 0 True 387 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 431 324 0,00662969041915298 0,00665798164442922 0,00660715648126955 0,00665293354695964 0,00152856600567298 0,00167412734788139 289796 290160 667 665 0 True 431 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 475 322 0,00671175055639953 0,00673918717599676 0,00674448767833982 0,00677500572213321 0,00145344725916156 0,00146998089086755 293383 293699 667 665 0 True 476 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 520 322 0,0067403698013662 0,0068608922168089 0,00668345159075303 0,00688181887541009 0,00148561492961322 0,00159270610831409 294634 299003 667 665 0 True 520 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 564 322 0,00695742767206463 0,00709248516117485 0,00697337300679027 0,00714122224765393 0,00163798371753877 0,00132254825442105 304122 309096 667 665 0 True 564 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 609 321 0,00744077492039057 0,00730601968413825 0,00749217975127794 0,00749217975127794 0,00195818853966956 0,00196466236655484 325250 318402 667 665 0 False 609 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 653 321 0,00761285642369934 0,00785695068525055 0,00764476997024491 0,00784313725490196 0,00195224159853123 0,00170462307952524 332772 342412 667 665 0 False 653 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 254 369 0,00600134814716697 0,00588071230949886 0,00602731364919509 0,00592050049591821 0,00141935156098246 0,00146176854440135 262330 256286 667 665 0 True 254 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 299 368 0,00606654786591598 0,00606338460020502 0,00617990386816205 0,00607309071488518 0,00133098255113167 0,0011961254820822 265180 264247 667 665 0 True 298 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 343 369 0,00642571824639294 0,00651066898190773 0,00642404821850919 0,00650034332799268 0,00130836779150327 0,00143146392144675 280880 283740 667 665 0 True 343 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 387 368 0,00657375592359462 0,00663824817250267 0,00657663843747616 0,00666819256885634 0,00130004832817267 0,00131141647263027 287351 289300 667 665 0 True 387 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 431 368 0,00679209491157374 0,00697532340808533 0,00672922865644312 0,00695811398489357 0,00155503021110026 0,00162134100038097 296895 303990 667 665 0 True 431 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 476 366 0,00692240284069455 0,00677750682497041 0,00701915007248035 0,00672922865644312 0,00163800557194439 0,00168432878600882 302591 295369 667 665 0 True 476 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 519 367 0,00699069096717377 0,00688404462747622 0,00692759594110018 0,00686655985351339 0,00164029815268226 0,00164499985217304 305576 300012 667 665 0 True 520 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 564 366 0,00695335554927961 0,00709012173372318 0,00688181887541009 0,00701915007248035 0,00174021639247567 0,00171374948902209 303944 308993 667 665 0 True 564 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 607 366 0,00705726331158065 0,00728103160166381 0,00708018616006714 0,00733958953231098 0,00190102725878011 0,00208110095189995 308486 317313 667 665 0 True 609 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 651 365 0,00674661524810952 0,00705535869887582 0,00674448767833982 0,00708018616006714 0,00184656105171412 0,00182670730747402 294907 307478 667 665 0 True 653 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 255 413 0,00593635432226665 0,00598697476123359 0,00593575951781491 0,0059662775616083 0,00143561218917063 0,00139302261484581 259489 260917 667 665 0 True 254 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 299 413 0,00620559484505859 0,00621496519967807 0,00619516289005875 0,00622568093385214 0,00138329007458091 0,00128549490106003 271258 270853 667 665 0 True 298 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 342 412 0,00668020304336273 0,00674673637630354 0,00671396963454643 0,0068055237659266 0,0013918193566766 0,00127225793768498 292004 294028 667 665 0 True 343 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 388 411 0,00683613331809719 0,00690320445196305 0,00683604180972 0,00691233691920348 0,00132019089392157 0,00138994892850412 298820 300847 667 665 0 True 387 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 431 412 0,00701551261448699 0,00697658543245273 0,00701915007248035 0,00698863202868696 0,00155733225738614 0,00139920760103694 306661 304045 667 665 0 True 431 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 476 411 0,0070892912435977 0,00714292024407551 0,00712596322575723 0,00711070420386053 0,00160251182971493 0,00149145286093824 309886 311294 667 665 0 True 476 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 519 410 0,00709489613170069 0,00683294411354548 0,00718699931334401 0,0068207827878233 0,00153955582318832 0,00150822270717472 310131 297785 667 665 0 True 520 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 564 410 0,00680378510675996 0,00702683694817267 0,00674448767833982 0,00711070420386053 0,00176139970405169 0,00155957213000172 297406 306235 667 665 0 True 564 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 607 410 0,00667020575315455 0,00670614508346857 0,00666819256885634 0,00666819256885634 0,00189182981353085 0,00183240079090521 291567 292259 667 665 0 True 609 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 652 410 0,00642880665412316 0,00661679375825694 0,0063782711528191 0,00656137941557946 0,0018456476564657 0,00173855591576114 281015 288365 667 665 0 True 653 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 255 457 0,00598718722579658 0,00621345077043719 0,0059662775616083 0,00624093995574884 0,00138098025616795 0,00143955632845286 261711 270787 667 665 0 True 254 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 298 457 0,00642148598394783 0,00643398379216524 0,0064087891966125 0,00650034332799268 0,00144169411274762 0,00157875872405162 280695 280398 667 665 0 True 298 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 344 456 0,00660200913505252 0,00674650691732765 0,00659189745937285 0,00669871061264973 0,00140830370085723 0,00144874881316666 288586 294018 667 665 0 True 343 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 387 456 0,00662758572647757 0,00690751828070978 0,00656137941557946 0,00686655985351339 0,00146880893242011 0,00140025259098389 289704 301035 667 665 0 True 387 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 431 455 0,00684969943501584 0,00696708583085087 0,00679026474402991 0,00694285496299687 0,00179321677033753 0,0018073725857588 299413 303631 667 665 0 True 431 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 476 455 0,00703585035131782 0,00723601175059416 0,00703440909437705 0,00720225833524071 0,00169199579077438 0,001857516250605 307550 315351 667 665 0 True 476 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 519 454 0,00685402320583814 0,00679666664945724 0,00689707789730678 0,00679026474402991 0,00161489138038423 0,00161755848614937 299602 296204 667 665 0 True 520 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 564 454 0,00639309550992414 0,00639713268063728 0,00636301213092241 0,0063782711528191 0,00176531298044381 0,00175659740853616 279454 278792 667 665 0 True 564 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 608 454 0,00618674411935712 0,0061979852354622 0,00614938582436866 0,00624093995574884 0,00178884467624082 0,00168438793779854 270434 270113 667 665 0 True 609 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 653 454 0,0062325898163301 0,00627285769929516 0,00622568093385214 0,00625619897764553 0,00165994362485136 0,00188064701979689 272438 273376 667 665 0 True 653 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 256 500 0,00630048903220626 0,00638543027286688 0,00624093995574884 0,0063935301747158 0,00144992511705918 0,00136304554141212 275406 278282 667 665 0 True 254 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 300 501 0,00643946738006598 0,00642400232671402 0,0063935301747158 0,00642404821850919 0,00149506907718399 0,00150745205515174 281481 279963 667 665 0 True 298 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 344 500 0,00670811309840616 0,0064777186729699 0,00671396963454643 0,0063782711528191 0,00142709419545543 0,00143139476757259 293224 282304 667 665 0 True 343 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 389 500 0,00672817631010542 0,00676984289517568 0,00675974670023652 0,0068055237659266 0,00154668731494853 0,00147494042722056 294101 295035 667 665 0 True 387 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 433 500 0,00684738884849175 0,00710811131743297 0,00689707789730678 0,00720225833524071 0,00174331005936287 0,00175975185426369 299312 309777 667 665 0 True 431 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 477 499 0,00680389949223145 0,00669269878748141 0,00685130083161669 0,00665293354695964 0,00176371318774933 0,00163769727146935 297411 291673 667 665 0 True 476 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 521 499 0,00639510869422236 0,00645330423793519 0,00636301213092241 0,0063935301747158 0,0016936933981898 0,0015396505233103 279542 281240 667 665 0 True 520 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 564 498 0,00622321020766797 0,00621129385606383 0,00630197604333562 0,00630197604333562 0,00178752009045942 0,00184014789393593 272028 270693 667 665 0 True 564 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 609 498 0,0063858892252203 0,00620388233114257 0,00631723506523232 0,00625619897764553 0,00186383217113203 0,00168510291838652 279139 270370 667 665 0 True 609 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 653 498 0,00627084031799619 0,00653636838720743 0,00621042191195544 0,00650034332799268 0,00174661498210862 0,00179724948455359 274110 284860 667 665 0 True 653 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 256 545 0,0064293557043863 0,00627448685802398 0,00645456626230259 0,00624093995574884 0,00135470185738489 0,00143193473136437 281039 273447 667 665 0 True 254 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 299 545 0,00650748098141362 0,00644804962738731 0,00654612039368277 0,00645456626230259 0,0014658547329823 0,00140009092845596 284454 281011 667 665 0 True 298 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 344 544 0,00660720223545815 0,00665208454874885 0,00659189745937285 0,00671396963454643 0,00135835404405009 0,00135479328999027 288813 289903 667 665 0 True 343 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 389 545 0,00636479654427764 0,00670043155496891 0,0064087891966125 0,00662241550316625 0,00147303817772981 0,00143322138003683 278217 292010 667 665 0 True 387 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 433 544 0,00652477606470283 0,00648611687148748 0,00656137941557946 0,00656137941557946 0,00182671513061334 0,00181070842771697 285210 282670 667 665 0 True 431 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 478 543 0,00636019824832377 0,00664483364511072 0,0063782711528191 0,00666819256885634 0,00180954378052459 0,00190204965733647 278016 289587 667 665 0 True 476 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 521 543 0,00630634556834652 0,00640683879531743 0,00622568093385214 0,0063782711528191 0,0017592380643075 0,0017528339478312 275662 279215 667 665 0 True 520 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 565 542 0,0063316018804514 0,00635016242827256 0,00622568093385214 0,00636301213092241 0,00165576980227818 0,00167141813503296 276766 276745 667 665 0 True 564 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 609 543 0,00652740693054709 0,00640176775195026 0,00642404821850919 0,0063782711528191 0,00185475691773873 0,00154482368166209 285325 278994 667 665 0 True 609 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 653 542 0,00646163528444064 0,00647120203805462 0,00642404821850919 0,00643930724040589 0,00178829808104532 0,00191522849737668 282450 282020 667 665 0 True 653 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 255 589 0,00651827896992223 0,00654830025395372 0,00648508430609598 0,00651560234988937 0,00128749050339494 0,0011514185334208 284926 285380 667 665 0 True 254 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 300 589 0,0065565752257769 0,00666865148680812 0,00656137941557946 0,00669871061264973 0,00136982894970364 0,00130541465217085 286600 290625 667 665 0 True 298 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 345 589 0,00634372674042928 0,00647666316168081 0,0063782711528191 0,00657663843747616 0,00131453551921417 0,00149400353057835 277296 282258 667 665 0 True 343 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 389 589 0,00631627422727181 0,00633075019891225 0,00631723506523232 0,00636301213092241 0,00123643658704723 0,00124857990534187 276096 275899 667 665 0 True 387 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 433 589 0,00628445218910343 0,00641838058180471 0,00631723506523232 0,0063935301747158 0,00175245860688913 0,00174083765650945 274705 279718 667 665 0 True 431 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 477 587 0,00635280894686555 0,00647957729067462 0,00630197604333562 0,00656137941557946 0,00194545056080509 0,00180622675796784 277693 282385 667 665 0 True 476 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 522 587 0,0063087705403421 0,00638306684541521 0,00642404821850919 0,00646982528419928 0,00183613366760644 0,00200406204099741 275768 278179 667 665 0 True 520 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 564 587 0,00629888763560541 0,00711887294340222 0,00633249408712902 0,00665293354695964 0,00166999218444263 0,00353012782477885 275336 310246 667 665 0 True 564 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 610 587 0,00643887257561423 0,00665864707545931 0,0063935301747158 0,00665293354695964 0,00147414749238198 0,00142795138924861 281455 290189 667 665 0 True 609 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 654 586 0,00653868533803595 0,00655727209991103 0,00657663843747616 0,00657663843747616 0,00156776836351153 0,00147716211590086 285818 285771 667 665 0 True 653 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 254 626 0,00675890024774749 0,00661523343722089 0,00672922865644312 0,00657663843747616 0,00132262195739521 0,0013415362258144 295444 288297 667 665 0 False 254 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 298 626 0,00651493891415473 0,00652395465661177 0,00645456626230259 0,00653086137178607 0,00128474686045615 0,00126471881135346 284780 284319 667 665 0 False 298 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 344 632 0,00639387333113027 0,00646737007315726 0,0063782711528191 0,00648508430609598 0,00131162141675327 0,00123893341264882 279488 281853 667 665 0 True 343 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 388 632 0,00611259945673764 0,00618079875816802 0,00610360875867857 0,00617990386816205 0,00124670322396817 0,00118097793014818 267193 269364 667 665 0 True 387 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 431 626 0,00621373909062864 0,00622065578228015 0,00621042191195544 0,00622568093385214 0,00155717897126178 0,00166526021948629 271614 271101 667 665 0 False 431 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 476 626 0,00626040836299635 0,00626060458998262 0,00628671702143893 0,00617990386816205 0,00186022502861832 0,00176506487551733 273654 272842 667 665 0 False 476 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 520 626 0,00615487632700015 0,00614543912998335 0,00627145799954223 0,00621042191195544 0,00188625212888373 0,0018427043195329 269041 267823 667 665 0 False 520 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 564 626 0,00640037042591087 0,00628657934605339 0,00630197604333562 0,00627145799954223 0,00169305961426536 0,00166126550083242 279772 273974 667 665 0 False 564 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 609 626 0,00633837350036357 0,00644437828377306 0,00636301213092241 0,0064087891966125 0,00142297466475216 0,00132726302827356 277062 280851 667 665 0 False 609 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 653 626 0,00670911969055527 0,0066854019920481 0,00674448767833982 0,00668345159075303 0,00142592262667853 0,00145923498412584 293268 291355 667 665 0 False 653 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 254 669 0,0706502550967592 0,518081264043606 0,00825513084611276 0,620248722056916 0,159676041592716 0,385558831727564 3088253 22578383 667 665 13 False 254 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 298 669 0,00769725002456428 0,00666872032450088 0,00675974670023652 0,00663767452506294 0,00399630300012692 0,0013939238631557 336461 290628 667 665 0 False 298 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 343 669 0,00617775342129805 0,00741671069410767 0,00621042191195544 0,00645456626230259 0,00118270200701425 0,00418573642302857 270041 323226 667 665 0 False 343 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 387 669 0,0059934326725399 0,00603975032568833 0,00599679560540169 0,00602731364919509 0,00124835907138232 0,00123432263467191 261984 263217 667 665 0 False 387 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 431 669 0,00624951886611055 0,00610358581278098 0,00619516289005875 0,00617990386816205 0,0014146815698189 0,0013402827837557 273178 265999 667 665 0 False 431 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 476 669 0,00622929551475121 0,00615716448365133 0,00622568093385214 0,00604257267109178 0,00154938043613619 0,00136610746143707 272294 268334 667 665 0 False 476 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 520 669 0,00617349828175864 0,00616143242060289 0,00607309071488518 0,00621042191195544 0,0017066427139178 0,00167684852366912 269855 268520 667 665 0 False 520 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 564 669 0,00647231888747775 0,00631638606702152 0,00653086137178607 0,00636301213092241 0,00139993640249979 0,00149677862280861 282917 275273 667 665 0 False 564 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 609 669 0,00673076142176108 0,00670077574343274 0,00672922865644312 0,00666819256885634 0,00132291611928696 0,00133910837571437 294214 292025 667 665 0 False 609 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 656 674 0,00847825114680014 0,738644321951594 0,00836194399938964 0,752452887769894 0,00185367364412313 0,193763556568454 370600 32190692 667 665 13 True 653 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B1_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B1_3.csv new file mode 100755 index 0000000..e8b92c0 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B1_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 254 279 0,00100933740042316 0,077999324243316 0,00080872816052491 0,0769970244907301 0,000785302576778034 0,0212431338635506 44120 3399271 667 665 0 True 254 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 298 278 0,000859195030546068 0,000911640511211652 0,000717174029144732 0,000778210116731518 0,000602418894015984 0,000660488452986436 37557 39730 667 665 0 False 298 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 342 280 0,000882415281258432 0,000940047532426856 0,000839246204318303 0,000823987182421607 0,000617092094879525 0,000697724041672791 38572 40968 667 665 0 True 343 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 386 280 0,000947660754196031 0,000888442208749156 0,00080872816052491 0,000778210116731518 0,000698398207014532 0,000659880951400759 41424 38719 667 665 0 True 387 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 431 279 0,000835311344099065 0,000923618269753119 0,000610360875867857 0,000671396963454643 0,000776761376221498 0,000831047151298653 36513 40252 667 665 0 True 431 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 475 279 0,000878892208736557 0,000931351037240618 0,000671396963454643 0,00064087891966125 0,00083689558067089 0,000916428342280518 38418 40589 667 665 0 True 476 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 519 278 0,000907580084986118 0,00101145516572388 0,000717174029144732 0,000793469138628214 0,000769093674186214 0,000843820978181923 39672 44080 667 665 0 True 520 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 562 277 0,00100741572450213 0,000988692835315572 0,000823987182421607 0,00080872816052491 0,000855994963918902 0,000804525017484889 44036 43088 667 665 0 True 564 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 609 278 0,00100602022174996 0,000976324996515092 0,000671396963454643 0,000625619897764553 0,0010006476737032 0,000975884623025333 43975 42549 667 665 0 False 609 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 651 277 0,00103484536056531 0,0729491386970516 0,000701915007248035 0,0716716258487831 0,000958975897664032 0,0235240022467092 45235 3179180 667 665 0 True 653 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 254 322 0,000916982570742553 0,000944705549637426 0,000732433051041428 0,000823987182421607 0,000755916223471496 0,000733187908448774 40083 41171 667 665 0 False 254 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 298 322 0,000909799163133013 0,000902921070127826 0,000778210116731518 0,000778210116731518 0,000682173085652325 0,000655323687486975 39769 39350 667 665 0 False 298 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 342 324 0,000897102375797681 0,00088532156667705 0,000793469138628214 0,000747692072938125 0,000648634184027388 0,000655097011911425 39214 38583 667 665 0 True 343 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 387 324 0,000867819695096375 0,000859232081118337 0,000717174029144732 0,000762951094834821 0,000659054187311159 0,000634510988206465 37934 37446 667 665 0 True 387 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 431 324 0,000842243103671328 0,00089768940547753 0,000625619897764553 0,000671396963454643 0,000772818071716363 0,000817120651704935 36816 39122 667 665 0 True 431 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 475 322 0,00085569483511849 0,000870108436575531 0,000610360875867857 0,000671396963454643 0,000824546622585351 0,000803921574513451 37404 37920 667 665 0 True 476 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 520 322 0,000983829440281004 0,000894476979815068 0,000823987182421607 0,000686655985351339 0,000837413482823142 0,000842553024108954 43005 38982 667 665 0 True 520 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 564 322 0,000930159777058141 0,00102627821556638 0,000656137941557946 0,000823987182421607 0,000871881579793364 0,00080044907819897 40659 44726 667 665 0 True 564 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 609 321 0,000918309442211831 0,000872517755822378 0,000442511635004196 0,000411993591210803 0,00110535293474188 0,0010606925210093 40141 38025 667 665 0 False 609 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 653 321 0,000967769720083881 0,00101030787084443 0,000534065766384375 0,000686655985351339 0,00102006518022662 0,000950772349943206 42303 44030 667 665 0 False 653 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 254 369 0,000914740615501359 0,000875707235587252 0,000778210116731518 0,000671396963454643 0,000745254294308581 0,000796818816122554 39985 38164 667 665 0 True 254 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 299 368 0,000913505252409273 0,000845762839233584 0,000839246204318303 0,000686655985351339 0,00067074650329761 0,000675434957349337 39931 36859 667 665 0 True 298 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 343 369 0,000855145784855341 0,000941745528848443 0,000686655985351339 0,000823987182421607 0,000677584991827155 0,000718054672227554 37380 41042 667 665 0 True 343 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 387 368 0,00093114349211295 0,000870269057858654 0,000778210116731518 0,000732433051041428 0,000738652724204304 0,000662063318176766 40702 37927 667 665 0 True 387 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 431 368 0,000916181872442126 0,000910837404796037 0,000686655985351339 0,000671396963454643 0,000845888348502964 0,000863736934034083 40048 39695 667 665 0 True 431 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 476 366 0,000978453323120998 0,000931488712626152 0,000671396963454643 0,000625619897764553 0,000912421265615394 0,000904256702672232 42770 40595 667 665 0 True 476 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 519 367 0,000902295476203304 0,000994314580224881 0,000671396963454643 0,000717174029144732 0,000856188382730026 0,000899991621605653 39441 43333 667 665 0 True 520 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 564 366 0,000986963602199816 0,000991469288923843 0,000732433051041428 0,000656137941557946 0,000932235981418497 0,000955781691487815 43142 43209 667 665 0 True 564 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 607 366 0,000925081062124008 0,000910034298380421 0,000534065766384375 0,000457770656900893 0,000993087415606505 0,0010333901685366 40437 39660 667 665 0 True 609 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 651 365 0,000947592122913137 0,000865129176798715 0,000579842832074464 0,000457770656900893 0,000989739945082888 0,000929406672083831 41421 37703 667 665 0 True 653 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 255 413 0,000847619220831333 0,000938946129342583 0,000671396963454643 0,000732433051041428 0,000801870089512258 0,0008435088415567 37051 40920 667 665 0 True 254 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 299 413 0,000766542798639591 0,000950809158396105 0,000656137941557946 0,000839246204318303 0,000630320789318092 0,00073665026099015 33507 41437 667 665 0 True 298 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 342 412 0,000877405197607193 0,000874422265322266 0,000793469138628214 0,000793469138628214 0,00064186915486274 0,00064366272097009 38353 38108 667 665 0 True 343 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 388 411 0,000867316399021821 0,0010556948562755 0,000656137941557946 0,000900282291905089 0,000758830287352868 0,000798167137485031 37912 46008 667 665 0 True 387 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 431 412 0,000905200867179136 0,000856891599564257 0,000656137941557946 0,000625619897764553 0,000844785951828715 0,000762243513427102 39568 37344 667 665 0 True 431 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 476 411 0,000854642488780787 0,000853243201847604 0,000579842832074464 0,000610360875867857 0,000832789355747393 0,000787014159365187 37358 37185 667 665 0 True 476 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 519 410 0,000947386229064456 0,000938211860619734 0,000625619897764553 0,000701915007248035 0,000923247243659217 0,000863945331213139 41412 40888 667 665 0 True 520 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 564 410 0,000976554524294273 0,000963704752841132 0,000686655985351339 0,000732433051041428 0,000906994765771463 0,000888294873487113 42687 41999 667 665 0 True 564 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 607 410 0,000967723965895285 0,000913636804301897 0,000595101853971161 0,000503547722590982 0,000999372973600173 0,000982006696837299 42301 39817 667 665 0 True 609 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 652 410 0,000868757655962589 0,000928758150813059 0,000473029678797589 0,00064087891966125 0,000955813220810042 0,000928774017678405 37975 40476 667 665 0 True 653 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 255 457 0,000956445558406423 0,000928987609788949 0,000839246204318303 0,000778210116731518 0,000778920772082846 0,000769163328138281 41808 40486 667 665 0 True 254 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 298 457 0,000979208267232829 0,000880801224852013 0,000839246204318303 0,000747692072938125 0,000774335627178951 0,000746926057592106 42803 38386 667 665 0 True 298 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 344 456 0,000933408324448442 0,000910929188386393 0,00080872816052491 0,000747692072938125 0,00073892201838857 0,000779455677564378 40801 39699 667 665 0 True 343 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 387 456 0,000998630920291742 0,000964806155925405 0,000854505226215 0,000854505226215 0,000782425523843358 0,000761723248684771 43652 42047 667 665 0 True 387 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 431 455 0,000887288102343884 0,000967582609533676 0,000549324788281071 0,000595101853971161 0,000913468266805145 0,00105089796500494 38785 42168 667 665 0 True 431 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 476 455 0,000959076424250681 0,000948652244022737 0,000595101853971161 0,000534065766384375 0,000997184151241339 0,00102479525707077 41923 41343 667 665 0 True 476 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 519 454 0,000916456397573701 0,000879768659460508 0,000717174029144732 0,000610360875867857 0,000865677023628473 0,000857789222535648 40060 38341 667 665 0 True 520 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 564 454 0,000994352903658036 0,000925981697204788 0,000671396963454643 0,000503547722590982 0,00100413298597379 0,000967340241703376 43465 40355 667 665 0 True 564 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 608 454 0,000830347014636422 0,000868616953232245 0,000442511635004196 0,000488288700694286 0,000870426855898116 0,000949776736028399 36296 37855 667 665 0 True 609 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 653 454 0,000902684386806368 0,000916734500476414 0,000488288700694286 0,0004272526131075 0,00098642539141133 0,00105723233873552 39458 39952 667 665 0 True 653 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 256 500 0,000943954664919772 0,000857029274949791 0,000778210116731518 0,000656137941557946 0,000802849026947037 0,000738118728164081 41262 37350 667 665 0 True 254 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 300 501 0,000941872849338663 0,000972240626744247 0,00080872816052491 0,000869764248111696 0,000825796889738787 0,000784025706995873 41171 42371 667 665 0 True 298 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 344 500 0,000898429247266959 0,000985709868629 0,000778210116731518 0,000854505226215 0,000766772332334014 0,000830937627735556 39272 42958 667 665 0 True 343 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 389 500 0,000995954300258889 0,000849961938492374 0,000778210116731518 0,000625619897764553 0,000822380284175552 0,000784622953493822 43535 37042 667 665 0 True 387 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 433 500 0,000944023296202665 0,000918340713307645 0,00064087891966125 0,000534065766384375 0,000943875233228949 0,00100773071025674 41265 40022 667 665 0 True 431 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 477 499 0,000872784024559018 0,000896220868031833 0,000549324788281071 0,000579842832074464 0,000901267189255904 0,000868015157033993 38151 39058 667 665 0 True 476 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 521 499 0,000953746061279271 0,00101466759138634 0,00064087891966125 0,000747692072938125 0,000910883267656101 0,000905304179028476 41690 44220 667 665 0 True 520 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 564 498 0,000920825922584599 0,000934861759571738 0,000595101853971161 0,000610360875867857 0,000925310142736604 0,00092851175132059 40251 40742 667 665 0 True 564 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 609 498 0,000840092656807325 0,000808521647446609 0,000503547722590982 0,000457770656900893 0,000892852629604303 0,000859673907985315 36722 35236 667 665 0 True 609 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 653 498 0,000857502125568024 0,00091962568357263 0,000488288700694286 0,000488288700694286 0,000915392843026315 0,00098691438040754 37483 40078 667 665 0 True 653 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 256 545 0,000939310614777299 0,000962809862835161 0,000793469138628214 0,000762951094834821 0,000720488302230776 0,000767157105696541 41059 41960 667 665 0 True 254 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 299 545 0,000921397849942047 0,000939795127553376 0,000762951094834821 0,000839246204318303 0,000782052225506826 0,000703968386761425 40276 40957 667 665 0 True 298 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 344 544 0,000898612264021343 0,00091799652484381 0,000762951094834821 0,000793469138628214 0,000724841650041303 0,00073192705867844 39280 40007 667 665 0 True 343 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 389 545 0,000917279972968425 0,000890553231327346 0,000747692072938125 0,000701915007248035 0,000784580732358679 0,000773153840209828 40096 38811 667 665 0 True 387 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 433 544 0,00087374486251953 0,000959390924094397 0,000595101853971161 0,000595101853971161 0,00092446160068057 0,00102222130190231 38193 41811 667 665 0 True 431 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 478 543 0,000847687852114227 0,000888924072598525 0,000534065766384375 0,000473029678797589 0,000887208659500498 0,00100416567580741 37054 38740 667 665 0 True 476 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 521 543 0,00091146919101676 0,000954732906883827 0,000518806744487678 0,000579842832074464 0,00098810421803573 0,00101125901758205 39842 41608 667 665 0 True 520 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 565 542 0,00086679022585297 0,000873710942497007 0,000534065766384375 0,000549324788281071 0,000893277852274907 0,000894663726694789 37889 38077 667 665 0 True 564 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 609 543 0,000878068633341832 0,00088578048462883 0,000610360875867857 0,000656137941557946 0,000847297846051137 0,000794184851930106 38382 38603 667 665 0 True 609 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 653 542 0,000929542095512097 0,000787296692176768 0,000595101853971161 0,0004272526131075 0,000921424030767517 0,000920814808820147 40632 34311 667 665 0 True 653 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 255 589 0,000872989918407699 0,000977495237292132 0,000778210116731518 0,000900282291905089 0,000639044818594755 0,000622441538954508 38160 42600 667 665 0 True 254 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 300 589 0,000912498660260165 0,0010080591728807 0,00080872816052491 0,000869764248111696 0,000683939289057876 0,000793054536358684 39887 43932 667 665 0 True 298 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 345 589 0,00104596362839409 0,000905536902452974 0,000930800335698482 0,000778210116731518 0,000778381062153138 0,000759560910881941 45721 39464 667 665 0 True 343 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 389 589 0,000950200111663097 0,00092476556463257 0,000823987182421607 0,000793469138628214 0,00071455905418601 0,000684759050370148 41535 40302 667 665 0 True 387 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 433 589 0,000804541652268395 0,00103834775769821 0,0004272526131075 0,000747692072938125 0,0009113208263654 0,00101280365424726 35168 45252 667 665 0 True 431 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 477 587 0,000856060868627257 0,000962534512064092 0,000381475547417411 0,000549324788281071 0,00101814907756525 0,00101241125689592 37420 41948 667 665 0 True 476 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 522 587 0,000837370282585876 0,000904848525525303 0,000442511635004196 0,000473029678797589 0,000956971511997583 0,00103554011990612 36603 39434 667 665 0 True 520 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 564 587 0,000944640977748709 0,00104103242771612 0,000671396963454643 0,000686655985351339 0,000866012588666772 0,00104177650201014 41292 45369 667 665 0 True 564 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 610 587 0,00087864056069928 0,000827383175264781 0,000656137941557946 0,000579842832074464 0,00079004521052313 0,000760760531824328 38407 36058 667 665 0 True 609 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 654 586 0,000823575394724245 0,000878139500731687 0,000564583810177768 0,00064087891966125 0,000787424049218013 0,000794072267733364 36000 38270 667 665 0 True 653 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 254 626 0,000864571147706074 0,000922631596156792 0,000701915007248035 0,000762951094834821 0,000715580291235364 0,000711556751308912 37792 40209 667 665 0 False 254 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 298 626 0,000928398240797203 0,000954641123293471 0,000854505226215 0,000823987182421607 0,000678995042286748 0,000713678873438231 40582 41604 667 665 0 False 298 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 344 632 0,000903485085106794 0,000947091922986684 0,00080872816052491 0,00080872816052491 0,000643097592936103 0,000704280423670295 39493 41275 667 665 0 True 343 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 388 632 0,000868483130831014 0,000903793014236209 0,000747692072938125 0,000778210116731518 0,000679055917960403 0,00064895249724591 37963 39388 667 665 0 True 387 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 431 626 0,000829134528638633 0,000854206929546342 0,000595101853971161 0,000564583810177768 0,000784921864751965 0,000849918229156522 36243 37227 667 665 0 False 431 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 476 626 0,000906756509591393 0,000801844391248205 0,000564583810177768 0,000442511635004196 0,000959641064919433 0,000866537718491009 39636 34945 667 665 0 False 476 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 520 626 0,000908975587738289 0,000857121058540148 0,000503547722590982 0,000488288700694286 0,00095738609976866 0,000920934628540976 39733 37354 667 665 0 False 520 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 564 626 0,000906710755402798 0,000962763971039983 0,00064087891966125 0,000656137941557946 0,00084902793427529 0,000934793016221926 39634 41958 667 665 0 False 564 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 609 626 0,000824742126533437 0,000855950817763108 0,00064087891966125 0,000671396963454643 0,00070737911143077 0,000689780743566739 36051 37303 667 665 0 False 609 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 653 626 0,00087374486251953 0,000912948427374226 0,000686655985351339 0,000747692072938125 0,000711537649036057 0,000785314046225581 38193 39787 667 665 0 False 653 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 254 669 0,00709976895278614 0,0536899814195594 0,00115968566414893 0,0617074845502403 0,0156283940640164 0,0412471680316632 310344 2339851 667 665 0 False 254 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 298 669 0,00101583449520376 0,000960171084612424 0,000869764248111696 0,000854505226215 0,000745706651910693 0,00066965923311355 44404 41845 667 665 0 False 298 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 343 669 0,000920208241038556 0,0010214366311751 0,000778210116731518 0,000823987182421607 0,000675072611787577 0,0007732172233025 40224 44515 667 665 0 False 343 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 387 669 0,000910279582113269 0,000891815255694742 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,000692306683584526 0,000659342341497517 39790 38866 667 665 0 False 387 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 431 669 0,000861482739975858 0,000904986200910837 0,000671396963454643 0,000732433051041428 0,000767385863614357 0,000747286617755009 37657 39440 667 665 0 False 431 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 476 669 0,000823804165667224 0,000905651631940919 0,000549324788281071 0,000686655985351339 0,000823589258762171 0,000751425429582333 36010 39469 667 665 0 False 476 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 520 669 0,000917279972968425 0,000984057764002591 0,000564583810177768 0,000686655985351339 0,000899935645008485 0,000911021707403364 40096 42886 667 665 0 False 520 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 564 669 0,000994650305883909 0,000929698932614209 0,00080872816052491 0,000671396963454643 0,000824764280865563 0,000808415848840066 43478 40517 667 665 0 False 564 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 609 669 0,000900511062848068 0,000903701230645852 0,000762951094834821 0,000747692072938125 0,000680246116259303 0,000717055046025459 39363 39384 667 665 0 False 609 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 656 674 0,00100265728888817 0,0752250963871111 0,000854505226215 0,0746318760967422 0,000763074981219993 0,0223739672295953 43828 3278368 667 665 0 True 653 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B2_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B2_1.csv new file mode 100755 index 0000000..d47eed1 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B2_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 276 260 0,0104555641611559 0,0468176621457512 0,0105287251087205 0,0468146791790646 0,0015507659211867 0,00903098173483539 457032 2040350 667 665 0 True 275 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 320 260 0,0106162986256929 0,0106955188382951 0,0105897611963073 0,0106355382619974 0,001307635947594 0,00154036333043512 464058 466119 667 665 0 False 320 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 365 260 0,010931476353835 0,0658870568501822 0,0109712367437247 0,0656137941557946 0,00136808570531924 0,012765760500371 477835 2871409 667 665 0 True 364 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 409 260 0,0106281032063506 0,0868468493274844 0,0107270923933776 0,0868238345922026 0,00146413464381038 0,0126091133319082 464574 3784853 667 665 0 True 408 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 453 259 0,0102170018218174 0,0742425071605542 0,0102998397802701 0,0702372777904936 0,00172349475549554 0,0153146625090957 446604 3235546 667 665 0 True 453 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 495 259 0,0103090134950835 0,0683140673840701 0,0102388036926833 0,0720836194399939 0,00166074515465692 0,0217431623495886 450626 2977180 667 665 0 True 497 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 541 260 0,0102283946147778 0,0823665251478433 0,0103303578240635 0,0787670710307469 0,001635311178465 0,0243026622814838 447102 3589597 667 665 0 True 541 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 585 259 0,0101549591420815 0,0722918534606142 0,0101777676050965 0,0697947661554894 0,0017506268850466 0,0206935174776353 443892 3150535 667 665 0 True 585 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 630 260 0,0103357568183178 0,0102260228277262 0,010406652933547 0,0101625085831998 0,00202903614709797 0,00183278905125252 451795 445658 667 665 0 False 630 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 672 259 0,0103149157854124 0,0462727429698072 0,0103761348897536 0,0458838788433661 0,00182493092888039 0,00899729838143431 450884 2016602 667 665 0 True 674 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 275 304 0,0104988476235675 0,010688933365687 0,0105592431525139 0,0106965743495842 0,00150762520914071 0,00152064589724342 458924 465832 667 665 0 False 275 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 320 304 0,0107154708294743 0,0104968991487646 0,0106965743495842 0,0105439841306172 0,00131512857501706 0,00123998177251583 468393 457463 667 665 0 False 320 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 364 304 0,0109235151250193 0,112599787406259 0,0109254596780346 0,108812085145342 0,00129137563956461 0,0294508560156962 477487 4907186 667 665 0 True 364 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 409 305 0,0106710435123477 0,0533564627981031 0,0106813153276875 0,0523689631494621 0,00145658894155858 0,00885084642784378 466451 2325316 667 665 0 True 408 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 453 304 0,0107577476997368 0,080631402263957 0,0107270923933776 0,0763103685053788 0,0018578298148595 0,0175825886337316 470241 3513979 667 665 0 True 453 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 497 304 0,0106106708604956 0,0435595970929842 0,0105897611963073 0,0439459830624857 0,00167693266530778 0,00847450338070329 463812 1898361 667 665 0 True 497 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 542 304 0,0104345858656847 0,0456413407058502 0,0105592431525139 0,0475165941863127 0,0015148627036624 0,0113637472146215 456115 1989085 667 665 0 True 541 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 586 305 0,0104065843022641 0,0526571636231802 0,0104371709773404 0,0533455405508507 0,00178647445165038 0,00989456235613649 454891 2294840 667 665 0 True 585 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 630 304 0,0104130127657618 0,0104600939290318 0,0103608758678569 0,010452429999237 0,00207276657930815 0,00194188040827866 455172 455859 667 665 0 False 630 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 674 304 0,0103200173774408 0,0106122940677397 0,0103456168459602 0,010757610437171 0,0019237127432261 0,0019796695036402 451107 462492 667 665 0 False 674 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 276 349 0,0107806934253176 0,0603260956235863 0,0108033875028611 0,0570534828717479 0,00144726710940247 0,014420076228035 471244 2629058 667 665 0 True 275 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 321 349 0,0109345647615652 0,0716776376739514 0,0109102006561379 0,0744029907682918 0,00136596024924108 0,0220490537964056 477970 3123767 667 665 0 True 320 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 365 348 0,0108012828101857 0,0439382961867934 0,0107728694590677 0,0436560616464485 0,00134136117476756 0,00940125846434659 472144 1914865 667 665 0 True 364 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 410 348 0,0108100218602075 0,036899550317772 0,0108339055466545 0,0374303807125963 0,00151551977718389 0,00603972830681135 472526 1608111 667 665 0 True 408 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 454 348 0,0108990595112149 0,0768178399764575 0,0108949416342412 0,0723430228122377 0,00173144507994839 0,0155560438411733 476418 3347781 667 665 0 True 453 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 498 348 0,0106467480382034 0,0346776072706371 0,0106507972838941 0,0351720454718853 0,00175195314722541 0,00557778299217405 465389 1511277 667 665 0 True 497 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 541 349 0,0108005507431681 0,0298508918209922 0,0108186465247578 0,0301213092240787 0,00162286170873925 0,00360183592592364 472112 1300925 667 665 0 True 541 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 586 348 0,0107415735940682 0,0535449404008993 0,0108339055466545 0,0529945830472267 0,00184575367759748 0,00931557644650417 469534 2333530 667 665 0 True 585 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 630 348 0,0107078070028845 0,0618173953996917 0,0106965743495842 0,0619058518348974 0,00199939743814314 0,0138699201923641 468058 2694050 667 665 0 True 630 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 674 347 0,0107577705768311 0,0697794841876952 0,0108491645685512 0,0687724116884108 0,00184062562123056 0,0205446404181059 470242 3041044 667 665 0 True 674 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 278 393 0,0106201419775349 0,0517505941553357 0,0105592431525139 0,0526131074998093 0,00152350529797156 0,0141975518923161 464226 2255331 667 665 0 True 275 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 321 393 0,0105416735440931 0,0375133760241758 0,0104982070649271 0,0359807736324102 0,00143439134233353 0,00732726560572162 460796 1634862 667 665 0 True 320 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 365 392 0,0104931054728987 0,0959708495317029 0,010406652933547 0,0917677576867323 0,00142447895631053 0,0233728996592292 458673 4182484 667 665 0 True 364 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 409 392 0,0104220263409151 0,0714794080646799 0,0104219119554437 0,0706797894254978 0,00154098995935839 0,0182339628002343 455566 3115128 667 665 0 True 408 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 455 392 0,0107386682030923 0,0459218772497736 0,0107118333714809 0,047196154726482 0,0016888196093505 0,008868773823007 469407 2001311 667 665 0 True 453 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 498 392 0,0109002262430241 0,055941364053301 0,0108796826123445 0,0556191348134585 0,00191167214914776 0,0105238935370357 476469 2437968 667 665 0 True 497 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 542 392 0,0108106852959421 0,0437656512533336 0,0107881284809644 0,0442206454566262 0,00169463077860203 0,00574071229404703 472555 1907341 667 665 0 True 541 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 586 392 0,0107360830914367 0,0546459304590155 0,0107423514152743 0,052674143587396 0,00186913425410581 0,00978641599206544 469294 2381512 667 665 0 True 585 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 630 392 0,010711993511141 0,0460077407985517 0,0107118333714809 0,0456549935149157 0,00191966179014657 0,00990948639000985 468241 2005053 667 665 0 True 630 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 675 392 0,010654320356416 0,0933833094982822 0,0106660563057908 0,085648889906157 0,00192707056939602 0,0213305429480831 465720 4069717 667 665 0 True 674 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 278 437 0,010188405453945 0,0471953516200664 0,0103456168459602 0,0473334859235523 0,00154419406588535 0,00772009941329584 445354 2056810 667 665 0 True 275 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 321 436 0,0105197572877558 0,0620402689029738 0,0105439841306172 0,062226291294728 0,00147294299604415 0,0103573773583673 459838 2703763 667 665 0 True 320 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 366 436 0,0104758103896095 0,036396782755699 0,0104676890211337 0,0374914168001831 0,00141722308746372 0,00478591512684853 457917 1586200 667 665 0 True 364 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 410 436 0,0107508388172588 0,0573885159224452 0,0107118333714809 0,0563210498207065 0,00176851613461431 0,0120533346450688 469939 2501036 667 665 0 True 408 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 454 436 0,0107837360788592 0,103190776208087 0,0107728694590677 0,102143892576486 0,00180914387038941 0,0149481925700914 471377 4497134 667 665 0 True 452 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 498 436 0,010708767840845 0,0667650357296308 0,0106813153276875 0,0641489280537118 0,00174809744668426 0,0167095539261342 468100 2909672 667 665 0 True 497 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 542 436 0,0107934359668415 0,0575816515424519 0,0107118333714809 0,054535744258793 0,00175855206404203 0,0116643309048487 471801 2509453 667 665 0 True 541 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 587 436 0,0106398620328197 0,0327286286212212 0,0107423514152743 0,0330663004501411 0,00179882600087142 0,0049580769851646 465088 1426339 667 665 0 True 585 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 631 436 0,010542199717262 0,0434740318408748 0,0105134660868238 0,0426794842450599 0,00209985229716327 0,00756379346015563 460819 1894632 667 665 0 True 630 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 675 435 0,0106444374516793 0,0709956167599131 0,0106813153276875 0,0708323796444648 0,00190755554164959 0,0114239559388956 465288 3094044 667 665 0 True 674 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 277 480 0,0103467835777694 0,056453287028512 0,0103456168459602 0,0580758373388266 0,00149600626181403 0,0166329902322554 452277 2460278 667 665 0 True 275 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 321 481 0,0105535925102223 0,0614306422958288 0,010605020218204 0,059311818112459 0,00153061235210281 0,0103939962171381 461317 2677195 667 665 0 True 320 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 365 480 0,0105956406095419 0,073148882735564 0,010605020218204 0,0707866025787747 0,00152312443830809 0,0204462039832332 463155 3187885 667 665 0 True 364 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 409 480 0,0108885360478378 0,0972489589733088 0,0108644235904479 0,0901045242999924 0,00180865309472064 0,0312945220204512 475958 4238185 667 665 0 True 408 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 454 480 0,0109735473302488 0,103728972236038 0,0109864957656214 0,0973373006790265 0,00191861378051296 0,0361355060952344 479674 4520589 667 665 0 True 452 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 498 480 0,0109145473040545 0,0469547868297432 0,0108644235904479 0,0485999847409781 0,0018759236264825 0,00617404098767186 477095 2046326 667 665 0 True 497 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 542 480 0,0110124841447438 0,0432871375050122 0,0110780498970016 0,0449073014419776 0,00177780451872266 0,00597645451489252 481376 1886487 667 665 0 True 541 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 585 480 0,0108398535911719 0,104291376185944 0,0108644235904479 0,102113374532692 0,00186981666843632 0,0220815130683121 473830 4545099 667 665 0 True 585 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 630 480 0,0106877895453738 0,0661198659271204 0,0107423514152743 0,0681467917906462 0,00200116104845483 0,0199892116251727 467183 2881555 667 665 0 True 630 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 674 480 0,0107095914162397 0,0747560363485964 0,0107270923933776 0,0713206683451591 0,00195004458048655 0,0130772622211361 468136 3257926 667 665 0 True 674 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 277 525 0,0102131584699754 0,0558852842795935 0,0102082856488899 0,0586404211490043 0,00140114373496746 0,0142069354276939 446436 2435524 667 665 0 True 275 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 320 525 0,010482604886616 0,105153568287852 0,0105287251087205 0,0975661860074769 0,00152505557811887 0,032261761830905 458214 4582674 667 665 0 True 320 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 365 524 0,0108029757151637 0,0596950604939908 0,0108033875028611 0,0639505607690547 0,00147025583804036 0,0148823156613787 472218 2601557 667 665 0 True 364 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 410 525 0,0107234320582899 0,0627519588625948 0,010757610437171 0,0621652552071412 0,00169506404848939 0,00881120247501455 468741 2734779 667 665 0 True 408 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 454 524 0,0108571715515554 0,0619644097655446 0,0109102006561379 0,0627450980392157 0,00184470316282074 0,00892675243060767 474587 2700457 667 665 0 True 452 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 498 525 0,0108972522207653 0,0641272671263877 0,0108644235904479 0,0648050659952697 0,00191393810222131 0,013461009189986 476339 2794716 667 665 0 True 497 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 541 524 0,0110349036971558 0,0784080824629668 0,0110322728313115 0,0752422369726101 0,0017547224835439 0,0231243395949947 482356 3417085 667 665 0 True 541 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 586 524 0,0109186423039339 0,0596425602803071 0,0108033875028611 0,0601815823605707 0,00194632646308557 0,0144957878380272 477274 2599269 667 665 0 True 585 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 630 524 0,0105976537938401 0,0423538590123742 0,010605020218204 0,0421759365224689 0,00187803605836026 0,0064284951365972 463243 1845814 667 665 0 True 630 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 674 524 0,0104756731270437 0,0627214867105966 0,0105134660868238 0,063080796520943 0,00181237332537867 0,0149748275764763 457911 2733451 667 665 0 True 674 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 278 570 0,00998594316940866 0,0483976937078333 0,0100251773861295 0,0493171587701228 0,00135890483632714 0,0102806479345704 436504 2109209 667 665 0 True 275 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 321 569 0,0101464259859084 0,0551740761838219 0,0101472495613031 0,0562142366674296 0,00144330036089331 0,0129648832904369 443519 2404529 667 665 0 True 320 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 365 568 0,0103714679625168 0,0526145301454598 0,0103303578240635 0,0530403601129168 0,00140583599747219 0,0122028280989688 453356 2292982 667 665 0 True 364 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 410 569 0,010599644101044 0,0545326924544137 0,010605020218204 0,053177691309987 0,00177390503363369 0,00807861112310775 463330 2376577 667 665 0 True 408 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 454 568 0,0107258341531912 0,0970007073072932 0,0107881284809644 0,0897535667963684 0,00197741651890527 0,0276725520758997 468846 4227366 667 665 0 True 452 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 498 569 0,0109341987280564 0,065306640370668 0,0107728694590677 0,0642557412069886 0,00210450309433422 0,0131264874217467 477954 2846114 667 665 0 True 497 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 542 568 0,0108117833964684 0,0592088139781819 0,0108033875028611 0,0581979095140002 0,00204449321802513 0,00921855959936115 472603 2580366 667 665 0 True 541 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 587 567 0,0109350451805455 0,0382187558619598 0,010757610437171 0,0400396734569314 0,00200623089910644 0,00778805649598652 477991 1665603 667 665 0 True 585 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 630 568 0,0104350662846649 0,0503024326666976 0,010406652933547 0,0498512245365072 0,00153859733252692 0,0101117535248449 456136 2192219 667 665 0 True 630 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 675 568 0,0103302663156863 0,0521517572828845 0,0103761348897536 0,0506446936751354 0,00167270554834009 0,00784859093355866 451555 2272814 667 665 0 True 674 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 275 607 0,0101544787231013 0,00967311847942126 0,00987258716716258 0,00962844281681544 0,00226782508513525 0,00125788966188565 443871 421562 667 665 0 False 275 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 320 608 0,0098072501858478 0,00981932973885848 0,0098115510795758 0,00975051499198901 0,00155023640536938 0,00142226843916211 428693 427934 667 665 0 False 320 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 365 613 0,0101643158736494 0,0799427958773106 0,0101777676050965 0,0767681391622797 0,0014636256435023 0,015067954023891 444301 3483969 667 665 0 True 364 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 409 612 0,0104982985733043 0,0820166919932011 0,0105287251087205 0,0785229266803998 0,00157155808826845 0,027141620732703 458900 3574351 667 665 0 True 408 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 452 608 0,0106448263622824 0,0104180799905463 0,010605020218204 0,0104676890211337 0,00210036109925716 0,00206320368105579 465305 454028 667 665 0 False 452 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 497 608 0,0105209240195649 0,0102830204373373 0,0104371709773404 0,0104219119554437 0,00196625436059568 0,0019952843507882 459889 448142 667 665 0 False 497 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 541 608 0,0103993551404659 0,0105901053847712 0,0104219119554437 0,0105745021744106 0,00195733491078981 0,00209829910429216 454575 461525 667 665 0 False 541 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 585 608 0,0102054031350084 0,0102742780503559 0,0102388036926833 0,0103303578240635 0,00166181767831587 0,00176296581651016 446097 447761 667 665 0 False 585 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 629 608 0,0100559013237716 0,0103841430080121 0,0100862134737163 0,0103456168459602 0,00148741673455329 0,00143783280270626 439562 452549 667 665 0 False 629 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 674 608 0,0102768940546893 0,0103589254665618 0,01025406271458 0,0104219119554437 0,00164683845826751 0,00169546273672817 449222 451450 667 665 0 False 674 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 277 658 0,00954267659029263 0,0435912165398619 0,00956740672922866 0,0433661402304112 0,00134661818923852 0,00896863158095408 417128 1899739 667 665 0 True 275 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 320 651 0,00959806203558784 0,0097563891417718 0,00959792477302205 0,00975051499198901 0,0013738072907046 0,00118420137757478 419549 425191 667 665 0 False 320 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 364 651 0,0106089550784233 0,00972968011697819 0,00999465934233616 0,00967421988250553 0,00377037858992596 0,00130821808486893 463737 424027 667 665 0 False 364 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 408 651 0,01034252843823 0,0100471595560198 0,0100099183642329 0,0101167315175097 0,00246689710946997 0,00150020927118714 452091 437863 667 665 0 False 408 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 452 651 0,0101456024105137 0,0101335049686473 0,0101625085831998 0,0102082856488899 0,00155505892515077 0,00164349525658932 443483 441626 667 665 0 False 452 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 497 651 0,0100828276637602 0,0101052585687152 0,0101167315175097 0,0101777676050965 0,00162256034464464 0,00172365663483611 440739 440395 667 665 0 False 497 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 541 651 0,010136565958266 0,0100129701686122 0,0100709544518196 0,00999465934233616 0,00173562638751865 0,00167082561280807 443088 436373 667 665 0 False 541 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 585 651 0,0101682736109629 0,00986955830868083 0,0101472495613031 0,00987258716716258 0,00143337384365094 0,00120896441583913 444474 430123 667 665 0 False 585 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 629 651 0,0100386748717653 0,0101301778134969 0,0100709544518196 0,010101472495613 0,00138775762589271 0,00139845858076694 438809 441481 667 665 0 False 629 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 674 656 0,0101046295346261 0,042682100077385 0,0100862134737163 0,0422674906538491 0,00132953087046301 0,00885729184989631 441692 1860119 667 665 0 True 674 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B2_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B2_2.csv new file mode 100755 index 0000000..9139f9d --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B2_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 276 260 0,00867746488394622 0,722372146892753 0,0085145342183566 0,730571450370031 0,00189571674818055 0,190608597395259 379308 31481538 667 665 11 True 275 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 320 260 0,00741879003277029 0,00741127251637907 0,00738536659800107 0,00740062561989776 0,0014788708120063 0,00126893582165416 324289 322989 667 665 0 False 320 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 365 260 0,0069958611904851 0,00705960368992979 0,00694285496299687 0,00700389105058366 0,00123410756877723 0,00126690708653769 305802 307663 667 665 0 True 364 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 409 260 0,00689380647282218 0,00681449561188391 0,00689707789730678 0,00679026474402991 0,00133295142477671 0,00138265145843802 301341 296981 667 665 0 True 408 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 453 259 0,00684821242388648 0,00672849438772027 0,00689707789730678 0,00672922865644312 0,00151760149876657 0,00159022809559456 299348 293233 667 665 0 True 453 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 495 259 0,00710544247217202 0,00711258576746283 0,00712596322575723 0,00714122224765393 0,00147312512481283 0,00150759464836024 310592 309972 667 665 0 True 497 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 541 260 0,00739033092746371 0,00750723226009634 0,00740062561989776 0,00749217975127794 0,00153179224293523 0,00143330521266551 323045 327171 667 665 0 True 541 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 585 259 0,00765019184159351 0,00867068105144986 0,0076600289921416 0,00799572747386892 0,00166280788012584 0,00353031336589227 334404 377875 667 665 0 True 585 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 630 260 0,00827832821973083 0,00813186548426456 0,00814831769283589 0,00816357671473259 0,00231199350655747 0,00184413628733015 361861 354393 667 665 0 False 630 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 672 259 0,00937407240531714 0,725816991551894 0,00930800335698482 0,731074998092622 0,00225526541600366 0,182800164668519 409758 31631667 667 665 11 True 674 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 275 304 0,00744022587012742 0,00723846696163618 0,00741588464179446 0,00715648126955062 0,00143049426080046 0,0014434571559646 325226 315458 667 665 0 False 275 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 320 304 0,00721005942439629 0,00685088780546009 0,0072480354009308 0,0068207827878233 0,00132234793053419 0,00117883970491547 315165 298567 667 665 0 False 320 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 364 304 0,00700084839704204 0,00681614771651032 0,00700389105058366 0,0068207827878233 0,00132500411092481 0,00124417161312604 306020 297053 667 665 0 True 364 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 409 305 0,00695038152702088 0,00687943250206083 0,00689707789730678 0,00688181887541009 0,00124475893787156 0,0014078484915221 303814 299811 667 665 0 True 408 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 453 304 0,00703859560263357 0,00701605237630584 0,00703440909437705 0,00704966811627375 0,00162583813614908 0,00170184178744617 307670 305765 667 665 0 True 453 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 497 304 0,00731568296876968 0,0071759623366037 0,00729381246662089 0,00712596322575723 0,00168219978811677 0,00162533819990184 319782 312734 667 665 0 True 497 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 542 304 0,00740046548023768 0,00738424224901921 0,00743114366369116 0,00738536659800107 0,00148427444000804 0,00151456973869452 323488 321811 667 665 0 True 541 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 586 305 0,00757737405044331 0,00773067941081819 0,00758373388265812 0,00781261921110857 0,0018626216222968 0,00193844532031067 331221 336909 667 665 0 True 585 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 630 304 0,00782449242304918 0,00783919056051665 0,00778210116731518 0,00784313725490196 0,00190499833095222 0,001906703055438 342023 341638 667 665 0 False 630 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 674 304 0,00796527806135842 0,00818709625976133 0,00804150453955901 0,00827038986800946 0,00187107328293752 0,00187954525075891 348177 356800 667 665 0 False 674 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 276 349 0,00692370683506953 0,00679836464587883 0,00698863202868696 0,00683604180972 0,00144381478781501 0,00135143726182675 302648 296278 667 665 0 True 275 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 321 349 0,00695333267218531 0,00698161058402472 0,00689707789730678 0,00700389105058366 0,00133255476072289 0,00130713784244728 303943 304264 667 665 0 True 320 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 365 348 0,00694619501876436 0,00679430322200558 0,00697337300679027 0,00671396963454643 0,0013445953350816 0,0015223057044274 303631 296101 667 665 0 True 364 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 410 348 0,00703244166426743 0,00703383544693732 0,00698863202868696 0,00697337300679027 0,00154931198028509 0,00139943198630914 307401 306540 667 665 0 True 408 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 454 348 0,00708585967945302 0,00726574963386952 0,00706492713817044 0,0072480354009308 0,00163957866898329 0,00164667185988502 309736 316647 667 665 0 True 453 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 498 348 0,00735178302357176 0,00754341794059422 0,00730907148851759 0,00758373388265812 0,00163597881071793 0,00159712169323673 321360 328748 667 665 0 True 497 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 541 349 0,00747696648356984 0,00758832306217593 0,00746166170748455 0,00753795681696803 0,0016122451131479 0,00158622258441814 326832 330705 667 665 0 True 541 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 586 348 0,00775265834695378 0,00786681742121383 0,00772106507972839 0,00785839627679866 0,00180807815515521 0,00201811017038289 338883 342842 667 665 0 True 585 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 630 348 0,00762349427254786 0,007649175582582 0,007690547035935 0,00770580605783169 0,00186804585200683 0,0019403521060852 333237 333357 667 665 0 True 630 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 674 347 0,00716965847586621 0,00733002109301636 0,00720225833524071 0,00732433051041428 0,00179173764946408 0,00184433919899268 313399 319448 667 665 0 True 674 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 278 393 0,00675183122560944 0,00663501280094262 0,0068207827878233 0,00659189745937285 0,00145222829350789 0,0014165341615432 295135 289159 667 665 0 True 275 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 321 393 0,00666213013886739 0,00680332095975806 0,00657663843747616 0,00683604180972 0,00132917692704063 0,00131064599787458 291214 296494 667 665 0 True 320 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 365 392 0,00682066840235181 0,00738121339053746 0,00689707789730678 0,00709544518196384 0,00138034278249526 0,00200818067894298 298144 321679 667 665 0 True 364 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 409 392 0,00704575613314881 0,0070081819334328 0,00703440909437705 0,00709544518196384 0,00138234580168907 0,00146233226287363 307983 305422 667 665 0 True 408 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 455 392 0,00715412492883794 0,00706706110664622 0,00711070420386053 0,00712596322575723 0,00162126035460839 0,00157345700188836 312720 307988 667 665 0 True 453 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 498 392 0,00734185436464647 0,00735416017728 0,00738536659800107 0,00743114366369116 0,00171579234138154 0,00166544521067459 320926 320500 667 665 0 True 497 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 542 392 0,00752100489009329 0,00757411955156832 0,00752269779507134 0,00753795681696803 0,00159088097501596 0,00160081535997371 328757 330086 667 665 0 True 541 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 586 392 0,00748447017049955 0,00749463496231997 0,00749217975127794 0,00749217975127794 0,00188004172284475 0,00184576381394455 327160 326622 667 665 0 True 585 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 630 392 0,00691510504761352 0,00717008818682091 0,00695811398489357 0,00721751735713741 0,0017711091233651 0,0017764923137159 302272 312478 667 665 0 True 630 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 675 392 0,00673263734349351 0,00665431030081498 0,00672922865644312 0,00657663843747616 0,00167119745111532 0,00190138362337314 294296 290000 667 665 0 True 674 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 278 437 0,00689620856772346 0,00670697113578178 0,00692759594110018 0,00665293354695964 0,00152639920911956 0,00140419549416919 301446 292295 667 665 0 True 275 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 321 436 0,00679415385006055 0,00704450528931622 0,00671396963454643 0,00706492713817044 0,00140969403115159 0,00136731956207425 296985 307005 667 665 0 True 320 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 366 436 0,00722284772010882 0,00699218864281326 0,00715648126955062 0,00698863202868696 0,00137243417658362 0,00128190518615421 315724 304725 667 665 0 True 364 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 410 436 0,00728054375192811 0,00730287609616855 0,0072480354009308 0,00735484855420768 0,00160583614292537 0,00153243083004151 318246 318265 667 665 0 True 408 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 454 436 0,00743269930610341 0,00764525183409428 0,00747692072938125 0,00758373388265812 0,0017400771657129 0,00180763227707688 324897 333186 667 665 0 True 452 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 498 436 0,007280612383211 0,00732999814711877 0,00729381246662089 0,00733958953231098 0,00168664077776327 0,00175883969978827 318249 319447 667 665 0 True 497 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 542 436 0,00719889540237892 0,0076600289921416 0,0072632944228275 0,00772106507972839 0,00166946104608402 0,0016678591834801 314677 333830 667 665 0 True 541 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 587 436 0,00708332032198595 0,00680807076055899 0,00714122224765393 0,00674448767833982 0,00186110376527375 0,00197202062784019 309625 296701 667 665 0 True 585 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 631 436 0,0176279221341492 0,0455744763602758 0,00717174029144732 0,00845349813076982 0,0836090463083744 0,169081323864921 770549 1986171 667 665 2 True 630 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 675 435 0,00645918743535076 0,00655270586629081 0,00648508430609598 0,00656137941557946 0,00174013271026229 0,00176069821735302 282343 285572 667 665 0 True 674 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 277 480 0,0069609964987751 0,00663072191809347 0,00700389105058366 0,00668345159075303 0,00147533076321728 0,00150520539440811 304278 288972 667 665 0 True 275 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 321 481 0,00712543705258838 0,00699514866360224 0,00715648126955062 0,00700389105058366 0,00150457330431008 0,00146189550581553 311466 304854 667 665 0 True 320 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 365 480 0,00710336065659091 0,00692862850649168 0,00712596322575723 0,00698863202868696 0,00147581530418245 0,00135934052561491 310501 301955 667 665 0 True 364 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 409 480 0,00747044651169494 0,00735007580750916 0,00749217975127794 0,00735484855420768 0,00168560241321584 0,00170071411325996 326547 320322 667 665 0 True 408 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 454 480 0,0075959273739189 0,00773428191673966 0,00762951094834821 0,00781261921110857 0,00182426352557016 0,00189671813428038 332032 337066 667 665 0 True 452 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 498 480 0,00725441811023991 0,00748359798557965 0,0072327763790341 0,00746166170748455 0,0017844877919353 0,00184233263680056 317104 326141 667 665 0 True 497 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 542 480 0,00692759594110018 0,00679992496691488 0,00697337300679027 0,0068055237659266 0,001751306049941 0,00167818245104924 302818 296346 667 665 0 True 541 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 585 480 0,0067490173430108 0,0067971714592042 0,00674448767833982 0,0068207827878233 0,0018079352343004 0,0018769868948734 295012 296226 667 665 0 True 585 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 630 480 0,0122573412309638 0,00721682898020974 0,00721751735713741 0,0072480354009308 0,0365950825301057 0,0017707563997881 535791 314515 667 665 0 True 630 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 674 480 0,00677967264936998 0,00674249138524957 0,00688181887541009 0,0068055237659266 0,00183223675712995 0,00180509280647954 296352 293843 667 665 0 True 674 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 277 525 0,00688788130539903 0,00667436501530778 0,00686655985351339 0,00674448767833982 0,00143065763016715 0,00155276351181328 301082 290874 667 665 0 True 275 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 320 525 0,00724817266349659 0,00701171560166151 0,0072480354009308 0,00701915007248035 0,00145036868086113 0,00147336799914211 316831 305576 667 665 0 True 320 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 365 524 0,00726288263513013 0,00732081978808316 0,00730907148851759 0,00738536659800107 0,00143177566998479 0,00151740435465232 317474 319047 667 665 0 True 364 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 410 525 0,00740408006113675 0,00727931065934463 0,00738536659800107 0,0072327763790341 0,00168670545009639 0,00175455688296587 323646 317238 667 665 0 True 408 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 454 524 0,0070316638430613 0,017668409981236 0,00706492713817044 0,00782787823300526 0,00183551279483163 0,0330788201510837 307367 770003 667 665 0 True 452 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 498 525 0,00673693823722151 0,00684056215154503 0,0068055237659266 0,00683604180972 0,00185658013607948 0,00160058936607767 294484 298117 667 665 0 True 497 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 541 524 0,00669193899273755 0,00662303504240115 0,00679026474402991 0,00656137941557946 0,00172113526193074 0,00166938151327697 292517 288637 667 665 0 True 541 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 586 524 0,00677706466062002 0,00680850673261318 0,00675974670023652 0,00679026474402991 0,00174643189376404 0,001628114704992 296238 296720 667 665 0 True 585 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 630 524 0,00656577181768466 0,00654515666598403 0,00659189745937285 0,00653086137178607 0,00175430143504806 0,00177623323181504 287002 285243 667 665 0 True 630 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 674 524 0,00641999897281847 0,00656195306301919 0,0063935301747158 0,00650034332799268 0,00172917873572359 0,00188536427188501 280630 285975 667 665 0 True 674 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 278 570 0,00694294647137406 0,0069139660779323 0,00697337300679027 0,00692759594110018 0,00129843701719631 0,00126836110017569 303489 301316 667 665 0 True 275 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 321 569 0,00696589219695485 0,00694689344097254 0,00700389105058366 0,00695811398489357 0,00142088064392012 0,00130296408719729 304492 302751 667 665 0 True 320 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 365 568 0,00698892943091283 0,00701040768549894 0,00704966811627375 0,00704966811627375 0,00133057273469683 0,00127028637521291 305499 305519 667 665 0 True 364 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 410 569 0,00690984331592501 0,0068437745772075 0,00689707789730678 0,0068055237659266 0,00154952041303322 0,00146140078426761 302042 298257 667 665 0 True 408 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 454 568 0,00699210934702024 0,00694799484405681 0,00697337300679027 0,00694285496299687 0,00195251962432619 0,00185459411692268 305638 302799 667 665 0 True 452 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 498 569 0,00674313792977624 0,00673739739598481 0,00677500572213321 0,00675974670023652 0,00199715231949241 0,00197765271764707 294755 293621 667 665 0 True 497 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 542 568 0,00683405150251608 0,00675524930430907 0,00686655985351339 0,00672922865644312 0,00188794010627194 0,00177978247541641 298729 294399 667 665 0 True 541 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 587 567 0,00699892672112101 0,00677025592133228 0,00686655985351339 0,00683604180972 0,00186654422333126 0,00150878219454721 305936 295053 667 665 0 True 585 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 630 568 0,00669736086408615 0,00691309413382392 0,00668345159075303 0,00688181887541009 0,00159361575460644 0,00152629467035115 292754 301278 667 665 0 True 630 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 675 568 0,00666036860260646 0,006794670356367 0,00666819256885634 0,0068207827878233 0,00158866375051246 0,00171457933897208 291137 296117 667 665 0 True 674 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 275 607 0,00726036615475737 0,00705375248604459 0,0072480354009308 0,00700389105058366 0,00130461114448282 0,00141159199828377 317364 307408 667 665 0 False 275 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 320 608 0,00693473359452112 0,0070545785383578 0,00695811398489357 0,00698863202868696 0,0013646152937343 0,00134813635990327 303130 307444 667 665 0 False 320 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 365 613 0,00658727628632468 0,00686561907171224 0,00659189745937285 0,00689707789730678 0,00142765633146618 0,00136110949569542 287942 299209 667 665 0 True 364 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 409 612 0,00659338447050222 0,00671748035687755 0,00659189745937285 0,00675974670023652 0,00148862839077703 0,00141729698972539 288209 292753 667 665 0 True 408 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 452 608 0,00677045318036793 0,00659956138916759 0,0068207827878233 0,00656137941557946 0,00187902364451625 0,0018541146844681 295949 287614 667 665 0 False 452 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 497 608 0,0065674418455684 0,0065512602747427 0,00654612039368277 0,00651560234988937 0,00189082919903135 0,00187079717964047 287075 285509 667 665 0 False 497 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 541 608 0,0066805690768715 0,00688810605134948 0,00674448767833982 0,00685130083161669 0,00182300446441353 0,00201684210011067 292020 300189 667 665 0 False 541 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 585 608 0,00652106997542657 0,00661787221544362 0,00662241550316625 0,00662241550316625 0,00155934702376118 0,00168390860663014 285048 288412 667 665 0 False 585 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 629 608 0,00660727086674104 0,00680593679208321 0,00662241550316625 0,0068055237659266 0,00141704658076004 0,00146239440635846 288816 296608 667 665 0 False 629 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 674 608 0,00664925033477768 0,00703108193922664 0,00672922865644312 0,00706492713817044 0,00151467929630779 0,00162480066740746 290651 306420 667 665 0 False 674 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 277 658 0,00887061619110335 0,70863556235519 0,0085145342183566 0,706813153276875 0,00200735731169792 0,198180643990579 387751 30882887 667 665 10 True 275 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 320 651 0,00745690327187059 0,0071828461058804 0,00730907148851759 0,00720225833524071 0,00177204096328539 0,00123222393889719 325955 313034 667 665 0 False 320 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 364 651 0,00665963653558892 0,00650103170492035 0,00662241550316625 0,00648508430609598 0,00137361268144093 0,0012395500308753 291105 283320 667 665 0 False 364 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 408 651 0,00643093422389286 0,00642088168464191 0,0063935301747158 0,0063935301747158 0,00136647595148199 0,00128265096525286 281108 279827 667 665 0 False 408 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 452 651 0,00652566827138045 0,00641668258538312 0,00643930724040589 0,00650034332799268 0,00155136422913821 0,00157424699267128 285249 279644 667 665 0 False 452 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 497 651 0,00657517430344109 0,00652365635994312 0,00656137941557946 0,00651560234988937 0,00162774203425104 0,00168410100075412 287413 284306 667 665 0 False 497 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 541 651 0,00652466167923134 0,00652629513816585 0,00651560234988937 0,00657663843747616 0,00172773863557819 0,00167367430714101 285205 284421 667 665 0 False 541 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 585 651 0,00663568421785903 0,00669265289568623 0,00672922865644312 0,00674448767833982 0,0014566259564541 0,00122262494885341 290058 291671 667 665 0 False 585 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 629 651 0,0069773764982924 0,00693996377990066 0,00708018616006714 0,00697337300679027 0,00138192173137454 0,00131992527279659 304994 302449 667 665 0 False 629 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 674 656 0,00843588276816044 0,708174212138265 0,00834668497749294 0,709620813305867 0,00157614218078227 0,20137329019687 368748 30862781 667 665 11 True 674 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B2_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B2_3.csv new file mode 100755 index 0000000..a958b43 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B2_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 276 260 0,0010795472028234 0,0724933413873434 0,000930800335698482 0,0715648126955062 0,000759242784571891 0,0212227194572979 47189 3159316 667 665 0 True 275 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 320 260 0,00101906016549976 0,000934540517005492 0,000946059357595178 0,000793469138628214 0,000649763078331154 0,000662245686544039 44545 40728 667 665 0 False 320 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 365 260 0,00101601751195814 0,000958817276654672 0,000946059357595178 0,000885023270008392 0,000645761996738868 0,000622483034171905 44412 41786 667 665 0 True 364 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 409 260 0,000998882568329019 0,000931213361855084 0,000823987182421607 0,00080872816052491 0,000734186715039089 0,000689668677233116 43663 40583 667 665 0 True 408 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 453 259 0,000914031425578124 0,00089885964625457 0,000686655985351339 0,000701915007248035 0,000821688953460997 0,000776620100775745 39954 39173 667 665 0 True 453 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 495 259 0,00100263441179387 0,000976279104719914 0,000793469138628214 0,000762951094834821 0,000865092195821946 0,000829186032735056 43827 42547 667 665 0 True 497 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 541 260 0,00104351577930421 0,00105225297163715 0,000869764248111696 0,000885023270008392 0,000837738539828471 0,00082477459489408 45614 45858 667 665 0 True 541 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 585 259 0,00103546304211135 0,00104139956207754 0,000854505226215 0,000732433051041428 0,000914638129131455 0,000986131385201012 45262 45385 667 665 0 True 585 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 630 260 0,000992659998679992 0,00105837952629342 0,000671396963454643 0,000671396963454643 0,000960243836802253 0,00100517160771421 43391 46125 667 665 0 False 630 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 672 259 0,00110043398991738 0,0728434957845518 0,000823987182421607 0,0713817044327459 0,000955704339083553 0,0208273239580423 48102 3174576 667 665 0 True 674 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 275 304 0,000951641368603865 0,00101877490705477 0,000854505226215 0,000839246204318303 0,00066877729737755 0,000796962332420973 41598 44399 667 665 0 False 275 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 320 304 0,000964635558165069 0,000991561072514199 0,000869764248111696 0,000946059357595178 0,000638622500943578 0,000629394245177988 42166 43213 667 665 0 False 320 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 364 304 0,00096092946888881 0,000967674393124032 0,000839246204318303 0,000839246204318303 0,000689524264373589 0,000700021816414298 42004 42172 667 665 0 True 364 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 409 305 0,000966282708954518 0,000928413962349224 0,000839246204318303 0,000717174029144732 0,000787250444753086 0,000794405338328313 42238 40461 667 665 0 True 408 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 453 304 0,000959922876739703 0,000959666274865465 0,000686655985351339 0,000686655985351339 0,000885338251521521 0,000918748924480813 41960 41823 667 665 0 True 453 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 497 304 0,000956033770709061 0,000967559663636087 0,000762951094834821 0,000793469138628214 0,000835068430826889 0,000809698610959427 41790 42167 667 665 0 True 497 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 542 304 0,000939608017003172 0,000948514568637203 0,000747692072938125 0,000793469138628214 0,000805771995270407 0,000769288084291577 41072 41337 667 665 0 True 541 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 586 305 0,000951160949623609 0,000943237012191729 0,00064087891966125 0,000534065766384375 0,00093956588905262 0,00106137327781951 41577 41107 667 665 0 True 585 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 630 304 0,000965619273219879 0,00107758524257542 0,000595101853971161 0,000732433051041428 0,00101348165181289 0,00106867861067188 42209 46962 667 665 0 False 630 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 674 304 0,00105033315340499 0,00107953564387049 0,000732433051041428 0,000747692072938125 0,00100695583804392 0,00102487072013793 45912 47047 667 665 0 False 674 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 276 349 0,000995016339392675 0,00100050997257392 0,000854505226215 0,000854505226215 0,000767617030734744 0,000758341828191411 43494 43603 667 665 0 True 275 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 321 349 0,000990463797627394 0,000916459149705346 0,000885023270008392 0,000793469138628214 0,000684169981974877 0,000662296056207927 43295 39940 667 665 0 True 320 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 365 348 0,000973397485281164 0,000986788325815684 0,000839246204318303 0,000885023270008392 0,000686111557251037 0,000701357404486428 42549 43005 667 665 0 True 364 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 410 348 0,00100400703745175 0,00098665065043015 0,000869764248111696 0,000778210116731518 0,000760719987078712 0,000744579984702988 43887 42999 667 665 0 True 408 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 454 348 0,000962256340358088 0,000950281402751557 0,000717174029144732 0,000717174029144732 0,000875089841520097 0,000824001861019892 42062 41414 667 665 0 True 453 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 498 348 0,000946745670424115 0,000982933415020729 0,000686655985351339 0,000762951094834821 0,000888211770361459 0,000862102118454372 41384 42837 667 665 0 True 497 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 541 349 0,00105822575093776 0,000946839518113205 0,000869764248111696 0,000732433051041428 0,000889389500586859 0,00086766100045207 46257 41264 667 665 0 True 541 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 586 348 0,000982159412397258 0,00111946150567538 0,000656137941557946 0,000717174029144732 0,00101575373024482 0,00117917623632618 42932 48787 667 665 0 True 585 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 630 348 0,00101588024939236 0,000946219978878301 0,00064087891966125 0,000610360875867857 0,00105820955949687 0,000964092274511207 44406 41237 667 665 0 True 630 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 674 347 0,00100661502620171 0,00104791619699283 0,000717174029144732 0,000701915007248035 0,000927168419152106 0,00106453046983675 44001 45669 667 665 0 True 674 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 278 393 0,00088689919174082 0,000971162169557563 0,000717174029144732 0,000854505226215 0,000762938265032955 0,000750061870713348 38768 42324 667 665 0 True 275 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 321 393 0,000928718520117373 0,000982176200400291 0,00080872816052491 0,000869764248111696 0,000703219426954205 0,000709933806293257 40596 42804 667 665 0 True 320 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 365 392 0,00093722879919619 0,0011012424629897 0,000793469138628214 0,000976577401388571 0,00070072852778663 0,000821884908168555 40968 47993 667 665 0 True 364 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 409 392 0,000990189272495819 0,00087550072250895 0,000778210116731518 0,000671396963454643 0,000777373807387112 0,000749404268224473 43283 38155 667 665 0 True 408 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 455 392 0,000918400950589022 0,00102318051939186 0,00064087891966125 0,000778210116731518 0,000839890378682065 0,000886870870039937 40145 44591 667 665 0 True 453 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 498 392 0,00104683295797741 0,00100670536492295 0,000778210116731518 0,000747692072938125 0,000985611301379059 0,000922045660268763 45759 43873 667 665 0 True 497 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 542 392 0,000933179553505463 0,00103050026072276 0,000793469138628214 0,000869764248111696 0,00075985360474402 0,000815780869188374 40791 44910 667 665 0 True 541 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 586 392 0,00102040991406334 0,00103846248718615 0,000686655985351339 0,000701915007248035 0,00104220635827772 0,0010422424431493 44604 45257 667 665 0 True 585 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 630 392 0,000968044245215456 0,000972493031617726 0,000564583810177768 0,000656137941557946 0,00101065147911516 0,000988597059991634 42315 42382 667 665 0 True 630 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 675 392 0,000968364524535627 0,000957669981775221 0,000671396963454643 0,000625619897764553 0,000931924155542117 0,0009631890145271 42329 41736 667 665 0 True 674 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 278 437 0,000975570809239464 0,000912443617627268 0,00080872816052491 0,000778210116731518 0,000797491273704075 0,000773235788897434 42644 39765 667 665 0 True 275 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 321 436 0,00102983527691407 0,00100939003494087 0,000869764248111696 0,000839246204318303 0,000769376905058462 0,00078101793997969 45016 43990 667 665 0 True 320 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 366 436 0,000972139245094779 0,00104442842055929 0,000869764248111696 0,000946059357595178 0,000732831284038617 0,000697781642961175 42494 45517 667 665 0 True 364 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 410 436 0,000924554888955156 0,000982313875785825 0,000686655985351339 0,000762951094834821 0,000831758249056885 0,000839681857836172 40414 42810 667 665 0 True 408 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 454 436 0,000937571955610659 0,000981648444755744 0,000671396963454643 0,00064087891966125 0,000889286412257426 0,000936603461016838 40983 42781 667 665 0 True 452 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 498 436 0,000955804999766082 0,0010013819166823 0,000701915007248035 0,000656137941557946 0,00091796877213722 0,00100780925558165 41780 43641 667 665 0 True 497 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 542 436 0,00098039787613632 0,000994911173562196 0,000686655985351339 0,000747692072938125 0,00091572682584091 0,000894999737705039 42855 43359 667 665 0 True 541 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 587 436 0,00108803460480792 0,000996746845369317 0,000778210116731518 0,000671396963454643 0,0010305319449712 0,0010075440303722 47560 43439 667 665 0 True 585 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 631 436 0,00199222887983795 0,0073644169935023 0,00064087891966125 0,000839246204318303 0,00848330259915451 0,0335096076040826 87084 320947 667 665 0 True 630 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 675 435 0,000913322235654889 0,000995714279977811 0,000549324788281071 0,000686655985351339 0,000962707412465659 0,000951850286559343 39923 43394 667 665 0 True 674 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 277 480 0,000957429273461232 0,000924398430271146 0,00080872816052491 0,000778210116731518 0,000794122334534998 0,000758356789443056 41851 40286 667 665 0 True 275 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 321 481 0,00103136804223203 0,000967376096455375 0,000915541313801785 0,000823987182421607 0,000828471865496729 0,000812636015311531 45083 42159 667 665 0 True 320 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 365 480 0,00102249172964445 0,00101751288268738 0,000885023270008392 0,000869764248111696 0,000838670532747212 0,000822629291989978 44695 44344 667 665 0 True 364 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 409 480 0,000995908546070293 0,0009161379071391 0,000793469138628214 0,000671396963454643 0,0008891179676263 0,000808561457299296 43533 39926 667 665 0 True 408 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 454 480 0,00100226837828511 0,000993190231243019 0,000656137941557946 0,000671396963454643 0,00103204923454066 0,00102456562990645 43811 43284 667 665 0 True 452 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 498 480 0,00101416446732001 0,00100796738929035 0,000717174029144732 0,000625619897764553 0,000978781454647185 0,00104531628664708 44331 43928 667 665 0 True 497 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 542 480 0,00095038312841748 0,000975980808051257 0,000686655985351339 0,000686655985351339 0,00091429164711905 0,000902681410843744 41543 42534 667 665 0 True 541 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 585 480 0,000931806927847589 0,000892182390056166 0,000610360875867857 0,000473029678797589 0,000932216156893197 0,000987784482512374 40731 38882 667 665 0 True 585 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 630 480 0,00146042794578906 0,000992042936363569 0,000732433051041428 0,000656137941557946 0,00354956796411406 0,000897431295939267 63838 43234 667 665 0 True 630 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 674 480 0,00094093488847245 0,000978114776527035 0,000625619897764553 0,000671396963454643 0,00097590278981914 0,000958374109636135 41130 42627 667 665 0 True 674 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 277 525 0,000980169105193341 0,000935389515216285 0,000854505226215 0,000762951094834821 0,00075511388098993 0,000770527805605662 42845 40765 667 665 0 True 275 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 320 525 0,000914992263538636 0,00101088151828415 0,000793469138628214 0,000869764248111696 0,000735632938001225 0,000833789674973922 39996 44055 667 665 0 True 320 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 365 524 0,0010100008361578 0,00103352911920451 0,000823987182421607 0,000915541313801785 0,000795022121521147 0,00080595025989441 44149 45042 667 665 0 True 364 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 410 525 0,000947683631290329 0,000965517478750665 0,000701915007248035 0,000717174029144732 0,000883032981474091 0,000888233954721042 41425 42078 667 665 0 True 408 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 454 524 0,00100284030564256 0,00190214607243676 0,000701915007248035 0,000701915007248035 0,00100703203410803 0,00343968670671434 43836 82897 667 665 0 True 452 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 498 525 0,000944114804579857 0,000892434794929645 0,000656137941557946 0,000549324788281071 0,000914063054672191 0,000919905188520517 41269 38893 667 665 0 True 497 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 541 524 0,00100139904870179 0,000969854253394989 0,000732433051041428 0,000686655985351339 0,000931616623460504 0,000914825868717082 43773 42267 667 665 0 True 541 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 586 524 0,00093070882732129 0,000952575992510459 0,000595101853971161 0,000717174029144732 0,00088678147736051 0,000885797694033447 40683 41514 667 665 0 True 585 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 630 524 0,000975136144447804 0,000969280605955264 0,000625619897764553 0,00064087891966125 0,000993524029733145 0,000987869251234249 42625 42242 667 665 0 True 630 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 674 524 0,000867773940907779 0,000927909152602266 0,000549324788281071 0,000579842832074464 0,000934263458182461 0,000968421234055479 37932 40439 667 665 0 True 674 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 278 570 0,00101029823838367 0,00107535949050929 0,000961318379491875 0,000946059357595178 0,000690640194353707 0,000715164372417921 44162 46865 667 665 0 True 275 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 321 569 0,000949056256948203 0,0009896795089119 0,000854505226215 0,000854505226215 0,000742758686028187 0,000739221948398383 41485 43131 667 665 0 True 320 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 365 568 0,00102725016525841 0,000989266482755298 0,000900282291905089 0,000885023270008392 0,00073956206605848 0,000680961713473159 44903 43113 667 665 0 True 364 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 410 569 0,000914420336181188 0,000979743935255855 0,000732433051041428 0,000762951094834821 0,00081309289988231 0,000822853419495644 39971 42698 667 665 0 True 408 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 454 568 0,00106099387934781 0,00101340556701894 0,000701915007248035 0,000671396963454643 0,00108788240087707 0,000993925173785515 46378 44165 667 665 0 True 452 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 498 569 0,00093070882732129 0,000889360044652717 0,000564583810177768 0,000457770656900893 0,00102088295313544 0,00108015686673263 40683 38759 667 665 0 True 497 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 542 568 0,000955301703691528 0,00105700277243808 0,000595101853971161 0,000717174029144732 0,00097449287822169 0,00100911982504371 41758 46065 667 665 0 True 541 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 587 567 0,000979437038175808 0,000869557735033395 0,000717174029144732 0,00064087891966125 0,000866063646190395 0,000749172228723269 42813 37896 667 665 0 True 585 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 630 568 0,000862557963407859 0,000941378394487019 0,00064087891966125 0,000717174029144732 0,00077773521310601 0,0008299787999579 37704 41026 667 665 0 True 630 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 675 568 0,000967929859743966 0,000970680305708194 0,000747692072938125 0,000671396963454643 0,000841379544037409 0,00089121749438448 42310 42303 667 665 0 True 674 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 275 607 0,000980512261607809 0,00108612111647854 0,000823987182421607 0,000976577401388571 0,000728041698475372 0,00078804723158658 42860 47334 667 665 0 False 275 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 320 608 0,000977606870631976 0,000984103655797769 0,000854505226215 0,000900282291905089 0,000785740831072828 0,000755135668999915 42733 42888 667 665 0 False 320 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 365 613 0,000930457179284013 0,000960079301022068 0,00080872816052491 0,000823987182421607 0,000732003184082008 0,000757542763978534 40672 41841 667 665 0 True 364 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 409 612 0,00088342187340754 0,00094158490756532 0,000671396963454643 0,000762951094834821 0,000748077535178568 0,000754716304296381 38616 41035 667 665 0 True 408 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 452 608 0,00095756653602702 0,00103570897947547 0,00064087891966125 0,00064087891966125 0,000962628503329756 0,00105002863986801 41857 45137 667 665 0 False 452 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 497 608 0,00091005081117029 0,000867354928864849 0,000518806744487678 0,000442511635004196 0,00100733175225802 0,00103183365525824 39780 37800 667 665 0 False 497 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 541 608 0,000865394723100798 0,000972447139822548 0,000488288700694286 0,000503547722590982 0,000941974413304955 0,00107350852745888 37828 42380 667 665 0 False 541 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 585 608 0,000975433546673676 0,000973617380599588 0,000732433051041428 0,000686655985351339 0,000864484737440532 0,000945750643441662 42638 42431 667 665 0 False 585 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 629 608 0,000955233072408634 0,000885596917448118 0,000762951094834821 0,000701915007248035 0,0007555505902571 0,000759790879517436 41755 38595 667 665 0 False 629 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 674 608 0,000947431983253052 0,000969005255184195 0,000701915007248035 0,000717174029144732 0,000820335830841137 0,000830657041274904 41414 42230 667 665 0 False 674 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 277 658 0,00108128586199004 0,0711599552784456 0,000991836423285267 0,0700236514839399 0,000737227106305322 0,0217741712939959 47265 3101206 667 665 0 True 275 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 320 651 0,000953883323845059 0,000987201351972286 0,000823987182421607 0,000854505226215 0,000680166260123851 0,000739788198983053 41696 43023 667 665 0 False 320 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 364 651 0,000994055501432163 0,000993786824580334 0,000854505226215 0,000900282291905089 0,000713638810282135 0,000647012762001617 43452 43310 667 665 0 False 364 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 408 651 0,00094788952513901 0,000880273469207466 0,000823987182421607 0,000701915007248035 0,000699998274879315 0,000711198720058231 41434 38363 667 665 0 False 408 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 452 651 0,000907968995589182 0,000954503447907936 0,000656137941557946 0,000747692072938125 0,000827377612568764 0,000856414640822185 39689 41598 667 665 0 False 452 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 497 651 0,000979345529798616 0,0009042289862904 0,000671396963454643 0,00064087891966125 0,000916009230882615 0,000835255082158046 42809 39407 667 665 0 False 497 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 541 651 0,000922495950468346 0,00092593580540961 0,000656137941557946 0,000564583810177768 0,000873442581071573 0,000893880065461313 40324 40353 667 665 0 False 541 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 585 651 0,000948713100533734 0,000928712259017881 0,00080872816052491 0,000793469138628214 0,000745034734436891 0,000677766709760913 41470 40474 667 665 0 False 585 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 629 651 0,00096843315581852 0,000983530008358043 0,000823987182421607 0,000854505226215 0,000675892855190166 0,00071742588726774 42332 42863 667 665 0 False 629 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 674 656 0,00108613580598119 0,0709250122330316 0,000946059357595178 0,069764248111696 0,000747009980235616 0,0223147571982106 47477 3090967 667 665 0 True 674 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B3_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B3_1.csv new file mode 100755 index 0000000..b3f90e0 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B3_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 271 269 0,010716340048895 0,0471979674523916 0,0107423514152743 0,0467841611352712 0,00150578983433754 0,00939745490266463 437530 2056924 623 665 0 True 271 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 315 269 0,010585866839194 0,0106974462936926 0,0105134660868238 0,0106813153276875 0,00134547049749394 0,00126931703597893 432203 466203 623 665 0 False 315 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 360 269 0,0108405186059034 0,0662692666663225 0,0108796826123445 0,0675364309147784 0,00131656806216243 0,0128152250444547 442600 2888066 623 665 0 True 359 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 404 269 0,0109481400219774 0,0883882858898218 0,0109254596780346 0,0878461890592813 0,00140971745947734 0,0131233117061106 446994 3852030 623 665 0 True 403 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 448 269 0,0108015260491465 0,0723242071762147 0,0107881284809644 0,0693064774547952 0,00173659426721463 0,013886235589817 441008 3151945 623 665 0 True 447 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 492 268 0,010830648002654 0,068010516104865 0,0108644235904479 0,0728770885786221 0,00172731598707582 0,0232597553497071 442197 2963951 623 665 0 True 491 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 537 269 0,0107715713400299 0,0819900518061003 0,0108033875028611 0,0778362706950484 0,00145800845415999 0,0264652409691968 439785 3573190 623 665 0 True 536 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 581 270 0,0108197731941113 0,0727617854432373 0,0108186465247578 0,0703746089875639 0,0017875055871928 0,0209110998165385 441753 3171015 623 665 0 True 580 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 624 270 0,0109536753974969 0,0108738543543569 0,0109407186999313 0,0108644235904479 0,00192618414881149 0,00187965719294199 447220 473891 623 665 0 False 624 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 665 268 0,0110409187939592 0,0466541496795319 0,0111390859845884 0,0469214923323415 0,00182516304412805 0,00968031147533112 450782 2033224 623 665 0 True 668 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 270 313 0,0107792130973843 0,0105747086874889 0,0106355382619974 0,0105287251087205 0,00210281567837811 0,0014338706160599 440097 460854 623 665 0 False 270 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 315 313 0,0106215773591385 0,010690218335952 0,0106355382619974 0,0106813153276875 0,00132901765038776 0,00117972359999867 433661 465888 623 665 0 False 315 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 360 314 0,0111158178131568 0,114571184197619 0,0111696040283818 0,108308537422751 0,00140413499200271 0,0421435095322512 453840 4993101 623 665 0 True 359 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 404 313 0,0110922067423568 0,0547614630533762 0,0110780498970016 0,0537727931639582 0,00165674189246964 0,0115814827438543 452876 2386547 623 665 0 True 403 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 449 314 0,0108694936025387 0,080143320076341 0,0107270923933776 0,0757305256733043 0,00168738847274024 0,0180935007104084 443783 3492708 623 665 0 True 447 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 493 314 0,0108254065408789 0,0441341623686132 0,0108033875028611 0,0451056687266346 0,00179500836080558 0,0100991878995897 441983 1923401 623 665 0 True 491 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 537 314 0,0109080942743031 0,041357662868547 0,0110017547875181 0,0446478980697337 0,00158049939921348 0,00912025315879097 445359 1802399 623 665 0 True 536 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 581 314 0,0109405717430591 0,055343072719565 0,0110017547875181 0,0553139543755245 0,00172630864356769 0,0141599450626148 446685 2411894 623 665 0 True 580 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 624 313 0,0108680975122528 0,010948497359214 0,0108644235904479 0,0109712367437247 0,00191798370333175 0,00204629571106745 443726 477144 623 665 0 False 624 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 668 313 0,0108039508375378 0,0107525164479062 0,0106813153276875 0,0106965743495842 0,00183381176183323 0,0018947467757104 441107 468603 623 665 0 False 668 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 272 359 0,0107577084084191 0,0593621384658717 0,0107728694590677 0,0583657587548638 0,00152246663106187 0,0148385379243903 439219 2587048 623 665 0 True 270 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 316 359 0,0109416004411645 0,0743385586878618 0,0109254596780346 0,0752880140383001 0,00129801102088982 0,0280651819042834 446727 3239732 623 665 0 True 315 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 361 359 0,0112736494938989 0,0424620489195064 0,0109864957656214 0,043579766536965 0,00240622092406111 0,00976504887082869 460284 1850529 623 665 0 True 359 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 405 358 0,0108436781786557 0,0366643778133822 0,0108186465247578 0,0377508201724269 0,00141449756287742 0,00724689708391657 442729 1597862 623 665 0 True 403 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 449 358 0,0108672647566437 0,0740475817605355 0,0108644235904479 0,0706950484473945 0,00171128855895817 0,0166996260430301 443692 3227051 623 665 0 True 447 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 493 358 0,0111246842111129 0,0333593884000457 0,0110780498970016 0,0345769436179141 0,00174531047377967 0,00519032116582265 454202 1453828 623 665 0 True 491 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 537 359 0,0109575207689861 0,0311165645861048 0,0108339055466545 0,0311741817349508 0,00166291355954638 0,00571936528537438 447377 1356084 623 665 0 True 535 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 582 359 0,0111142992588108 0,0515724880982497 0,0110933089188983 0,0519874876020447 0,0019273109643459 0,00997560733733388 453778 2247569 623 665 0 True 580 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 625 358 0,0110614682632551 0,0663351443383005 0,0110170138094148 0,0641336690318151 0,0019443763424009 0,0192204243410967 451621 2890937 623 665 0 True 624 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 670 358 0,0110418005351924 0,0714296384128093 0,0110170138094148 0,0699931334401465 0,00193772134459031 0,0223178555397525 450818 3112959 623 665 0 True 668 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 274 404 0,0107003952282614 0,0497771551790899 0,0107423514152743 0,0522468909742886 0,0016329167595692 0,0146030119175323 436879 2169327 623 665 0 True 270 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 317 404 0,0108771598527051 0,0355206395480576 0,0108644235904479 0,0352025635156786 0,00140242682966501 0,00587450153761709 444096 1548017 623 665 0 True 315 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 361 403 0,011034869069387 0,0987126548346146 0,0109712367437247 0,0931105516136416 0,00135018571414952 0,0308068234741045 450535 4301974 623 665 0 True 359 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 405 403 0,0110198059899866 0,072249655954948 0,0110322728313115 0,0702830548561837 0,00145591792082252 0,0209799666321251 449920 3148696 623 665 0 True 403 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 450 402 0,0113486709771567 0,046418197014624 0,0113984893568322 0,0470435645075151 0,00170467029315631 0,0119801639764947 463347 2022941 623 665 0 True 447 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 494 403 0,0111782499910295 0,0597355141114402 0,0112458991378653 0,0592965590905623 0,00169568834278257 0,0159745740032767 456389 2603320 623 665 0 True 491 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 538 403 0,0113169527855736 0,0439308387700769 0,0112764171816587 0,0448310063324941 0,00165390100257046 0,00632278473006759 462052 1914540 623 665 0 True 535 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 582 403 0,0110308522482136 0,0559549250787761 0,0110780498970016 0,0552071412222477 0,00181184952783202 0,0109154727824397 450371 2438559 623 665 0 True 580 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 625 402 0,0111759476666984 0,0466247100929252 0,0112001220721752 0,0468299382009613 0,00190148117034842 0,0107658040074541 456295 2031941 623 665 0 True 624 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 670 402 0,010965529918521 0,102146623138299 0,010955977721828 0,0930647745479515 0,00183970439971899 0,0247502885755132 447704 4451629 623 665 0 True 668 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 274 448 0,0105965212124285 0,0459661628321204 0,0106202792401007 0,0466010528725109 0,00157385413038378 0,00929839363037893 432638 2003241 623 665 0 True 270 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 318 448 0,0105694811479438 0,0623158261871204 0,0105439841306172 0,0626382848859388 0,00144724385911221 0,0114447602742008 431534 2715772 623 665 0 True 315 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 361 447 0,0111402126539419 0,037489076318629 0,0111543450064851 0,0388189517051957 0,00145861098403127 0,00607342746700457 454836 1633803 623 665 0 True 359 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 405 446 0,011278156171313 0,0552145068553737 0,0113221942473487 0,0567177843900206 0,00161164859685539 0,0110974175418595 460468 2406291 623 665 0 True 403 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 449 447 0,0115033430851464 0,108354842244086 0,0115968566414893 0,108476386663615 0,0019056305726511 0,0210885072355869 469662 4722188 623 665 0 True 447 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 494 448 0,0115697675913805 0,0686928353155721 0,0115510795757992 0,0668192568856336 0,00215284425302027 0,0202766756028488 472374 2993687 623 665 0 True 491 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 538 447 0,0114262397128659 0,0576482175913577 0,0113527122911421 0,0560311284046693 0,00179579113571235 0,00953026946361702 466514 2512354 623 665 0 True 535 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 583 447 0,0112263538738628 0,0332469993936547 0,0112153810940719 0,0339360646982528 0,00193290737232197 0,00543461228298875 458353 1448930 623 665 0 True 580 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 626 447 0,0110828994737842 0,0453251691829712 0,0109712367437247 0,0437933928435187 0,00177235507334375 0,0115413382303247 452496 1975306 623 665 0 True 624 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 671 447 0,011113760416946 0,0712892324654621 0,0111543450064851 0,0718852521553368 0,0019205383545073 0,0137284437811569 453756 3106840 623 665 0 True 668 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 273 492 0,0107191567222788 0,0582944199592596 0,0107728694590677 0,0587930113679713 0,00148505014849463 0,0190239090077885 437645 2540516 623 665 0 True 270 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 316 492 0,0108136989767271 0,0613331910687683 0,0108033875028611 0,0604409857328145 0,00161132873235236 0,0121456737797791 441505 2672948 623 665 0 True 315 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 361 492 0,011203698022732 0,0773068629458746 0,0111848630502785 0,0725108720531014 0,00154499511938299 0,0228611912779364 457428 3369093 623 665 0 True 359 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 405 491 0,0114612644340734 0,0985657781441473 0,011459525444419 0,0950179293507286 0,00173309959719733 0,032072516973441 467944 4295573 623 665 0 True 403 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 450 491 0,012142262579845 0,106521648593904 0,0119478141451133 0,10235751888304 0,00266855439653557 0,0397977189447338 495748 4642296 623 665 0 True 447 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 494 493 0,0129914038802248 0,0494249356510984 0,0119020370794232 0,0509956511787594 0,0044115800244022 0,0115858764710654 530417 2153977 623 665 0 True 491 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 536 489 0,0123832473574399 0,0409505108617274 0,0114442664225223 0,0434576943617914 0,00427327549893144 0,00810177531300588 505587 1784655 623 665 0 True 535 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 581 491 0,0112972115790749 0,105357672046906 0,011306935225452 0,099320973525597 0,00180579450806794 0,0231603151946711 461246 4591569 623 665 0 True 580 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 625 491 0,0112956195462927 0,0675148158792495 0,0113221942473487 0,0696116578927291 0,00180702546612768 0,0219170679283978 461181 2942348 623 665 0 True 624 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 669 491 0,0110132174235497 0,0807330296443787 0,0109407186999313 0,0772259098191806 0,00190241643152781 0,0182111985673387 449651 3518408 623 665 0 True 668 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 270 529 0,0137360343516587 0,0435020717277286 0,0112001220721752 0,0478828107118334 0,00811605255886502 0,025791627295201 560819 1895854 623 665 0 False 270 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 316 536 0,0107769107730532 0,114145904931704 0,010757610437171 0,108735790035859 0,00152449336183268 0,0314223110605824 440003 4974567 623 665 0 True 314 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 360 535 0,0111169689753224 0,0610605020218204 0,0111390859845884 0,0646066987106127 0,00146239000029065 0,0173213800296951 453887 2661064 623 665 0 True 359 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 404 535 0,0113530796833226 0,0643654455433617 0,0113527122911421 0,0642404821850919 0,00169211752781183 0,0151220377451243 463527 2805096 623 665 0 True 403 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 449 535 0,0116683756526263 0,0623450133688536 0,0115968566414893 0,063782711528191 0,00209965792106578 0,0117041935739542 476400 2717044 623 665 0 True 447 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 493 535 0,0124224603495051 0,0668248097928502 0,0119172961013199 0,0674448767833982 0,00281140925267058 0,0171515585521702 507188 2912277 623 665 0 True 491 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 537 535 0,01147941360779 0,0800863454126275 0,0114747844663157 0,074692912184329 0,00185558455620371 0,0247502923767523 468685 3490225 623 665 0 True 535 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 581 535 0,011267109913086 0,0611174537396363 0,0113374532692454 0,0618600747692073 0,00178853080317723 0,0163521793063673 460017 2663546 623 665 0 True 580 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 625 535 0,0108937169936396 0,0466791607079039 0,0108644235904479 0,0451056687266346 0,00187063386692044 0,00850225699363543 444772 2034314 623 665 0 True 624 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 669 534 0,0109190180684699 0,0648747756321451 0,0108644235904479 0,0654764629587243 0,00189902827885897 0,016129537720898 445805 2827293 623 665 0 True 668 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 270 572 0,0151627406525938 0,0358961721079995 0,0108644235904479 0,0379644464789807 0,00999680610700567 0,0213433537710159 619069 1564383 623 665 0 False 270 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 314 572 0,0169877490628132 0,0414832228201541 0,0114442664225223 0,0430609597924773 0,0141604499002633 0,0258174039479623 693581 1807871 623 665 0 False 314 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 359 572 0,0150594544642497 0,0429705070641814 0,0117036697947662 0,0472877088578622 0,00939389681399145 0,0251122993499153 614852 1872688 623 665 0 False 359 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 403 572 0,0155069381400967 0,0420890863000945 0,0117341878385595 0,0480354009308003 0,0100948805931525 0,0231989508913361 633122 1834275 623 665 0 False 403 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 447 573 0,018131881791321 0,0722580541534656 0,0122529945830472 0,0797894254978256 0,0169176456186721 0,0497184917619114 740294 3149062 623 665 0 False 447 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 491 573 0,0157330067951633 0,0529835690163839 0,0122529945830472 0,0590981918059052 0,0111272055431168 0,0300445902856918 642352 2309065 623 665 0 False 491 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 538 580 0,0112136665972295 0,0599778457358778 0,0111238269626917 0,060166323338674 0,00185484245479963 0,0109544989164818 457835 2613881 623 665 0 True 535 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 582 580 0,0110301909422887 0,0400465342803105 0,0109864957656214 0,0420080872816053 0,00181596257166718 0,010085764570501 450344 1745259 623 665 0 True 579 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 627 580 0,0108914146693085 0,0521264250119462 0,0108491645685512 0,0514534218356603 0,00160185689640098 0,0110580409982649 444678 2271710 623 665 0 True 624 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 670 579 0,0109268557683205 0,0550008346570248 0,0109254596780346 0,0541084916456855 0,00159125512631758 0,0101709692718968 446125 2396979 623 665 0 True 668 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 270 616 0,0115997957789333 0,0100428227813755 0,0102082856488899 0,0100099183642329 0,00575735980537476 0,00144360586754309 473600 437674 623 665 0 False 270 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 314 616 0,0115089764319141 0,0101210682921541 0,0103913939116503 0,0101472495613031 0,00533109473209553 0,0013312001713021 469892 441084 623 665 0 False 314 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 359 616 0,0187915711906238 0,0584881062808085 0,0114290074006256 0,073182269016556 0,0180628027055647 0,0389681887849447 767228 2548957 623 665 0 False 359 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 403 616 0,0176566722522525 0,0608409786195863 0,0114900434882124 0,0592813000686656 0,0154048066610903 0,0456337148780079 720892 2651497 623 665 0 False 403 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 447 616 0,0135064877172834 0,0107184876817817 0,0112153810940719 0,0106660563057908 0,00998466298515084 0,00190300865597373 551447 467120 623 665 0 False 447 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 491 616 0,0121639387184944 0,0108564613639845 0,0109254596780346 0,0109407186999313 0,00646678975382709 0,00218743881085645 496633 473133 623 665 0 False 491 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 535 616 0,011873111068412 0,0106961842693252 0,0109864957656214 0,0107270923933776 0,00514897494217453 0,00191301808688113 484759 466148 623 665 0 False 535 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 579 616 0,0111237289914436 0,0106389572007382 0,0110017547875181 0,0106355382619974 0,00212108941208766 0,00168463646477381 454163 463654 623 665 0 False 579 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 624 616 0,011637931087269 0,0108401009390035 0,0110780498970016 0,0108644235904479 0,00356344401336674 0,00142077164794753 475157 472420 623 665 0 False 624 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 668 616 0,0114839447780161 0,0107092863768485 0,0108949416342412 0,0106507972838941 0,00401359593951096 0,00164473160377135 468870 466719 623 665 0 False 668 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 270 659 0,0118143038267202 0,0348117948797377 0,010452429999237 0,0408789196612497 0,00527059842042495 0,0183049818678736 482358 1517125 623 665 0 False 270 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 314 659 0,0101637577166135 0,0102040636037335 0,010101472495613 0,0101625085831998 0,0013105181761724 0,00128448837305731 414969 444701 623 665 0 False 314 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 359 659 0,0143050268680025 0,0103866670567469 0,0103150988021668 0,0103608758678569 0,0142917979418828 0,00131647469341624 584050 452659 623 665 0 False 359 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 403 659 0,0135689198951561 0,0108151128565291 0,0106507972838941 0,0106507972838941 0,0111489643092429 0,00178658118607931 553996 471331 623 665 0 False 403 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 447 659 0,0104294312487379 0,0104027062391616 0,010406652933547 0,0103761348897536 0,00148649655001752 0,00154517294363009 425816 453358 623 665 0 False 447 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 491 659 0,0104229406535491 0,0105143380309322 0,0104219119554437 0,0104676890211337 0,00168527425727107 0,00163796033106554 425551 458223 623 665 0 False 491 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 535 659 0,0105446209437301 0,0103600957073388 0,0105287251087205 0,0104676890211337 0,00171291466460157 0,00169616969654579 430519 451501 623 665 0 False 535 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 579 659 0,0104684482983068 0,0105088998532036 0,0104829480430304 0,0104829480430304 0,0015452451855031 0,0012649630614189 427409 457986 623 665 0 False 579 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 624 659 0,0105662480967554 0,0106287233304135 0,0105745021744106 0,0106813153276875 0,0015175233037455 0,00141518970542729 431402 463208 623 665 0 False 624 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 666 664 0,0105502053048737 0,0440754438166829 0,0104982070649271 0,0446478980697337 0,00136383435451855 0,0101697433040253 430747 1920842 623 665 0 True 668 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B3_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B3_2.csv new file mode 100755 index 0000000..6a3d535 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B3_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 271 269 0,00879985098573159 0,720840232877915 0,00877393759060044 0,719478141451133 0,00182552998176682 0,19075051423828 359283 31414776 623 665 12 True 271 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 315 269 0,0076031076969764 0,00729672659561469 0,00756847486076143 0,00730907148851759 0,00144881170885203 0,00121212906816112 310422 317997 623 665 0 False 315 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 360 269 0,00744601080059532 0,00734397219875048 0,00744640268558785 0,00732433051041428 0,00124326971860275 0,00131216063379904 304008 320056 623 665 0 True 359 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 404 269 0,00725273802084118 0,00729459262713892 0,0072480354009308 0,00729381246662089 0,00130357527837881 0,00128386552573542 296117 317904 623 665 0 True 403 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 448 269 0,00714127123327799 0,00715707786288794 0,00714122224765393 0,00720225833524071 0,00157776605939919 0,00170757009112756 291566 311911 623 665 0 True 447 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 492 268 0,0072401487154561 0,00733727199665449 0,00718699931334401 0,00733958953231098 0,00157407731401082 0,00157108440519115 295603 319764 623 665 0 True 491 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 537 269 0,00767688004682046 0,00784290779592607 0,00772106507972839 0,00791943236438544 0,00148072257982054 0,00142572988689556 313434 341800 623 665 0 True 536 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 581 270 0,00800084647158387 0,0082303951685118 0,00807202258335241 0,00827038986800946 0,00169482567184351 0,0018837687562732 326661 358687 623 665 0 True 580 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 624 270 0,0085290584558923 0,00827128475801543 0,00856031128404669 0,00833142595559625 0,0020209344736863 0,00178068369945593 348227 360469 623 665 0 False 624 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 665 268 0,0100362726299806 0,721703824679575 0,0100709544518196 0,734325169756619 0,00202521289304687 0,197838472271335 409764 31452412 623 665 12 True 668 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 270 313 0,00768579543040055 0,00723658539803388 0,00746166170748455 0,00735484855420768 0,00206846563527531 0,00149055590546841 313798 315376 623 665 0 False 270 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 315 313 0,00717294043923695 0,00716797716424272 0,00721751735713741 0,00715648126955062 0,00119171645670861 0,00108276963443557 292859 312386 623 665 0 False 315 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 360 314 0,00743062931463846 0,00716150642112262 0,0072327763790341 0,0072480354009308 0,00156279168692911 0,00133504386302555 303380 312104 623 665 0 True 359 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 404 313 0,00744561891560279 0,00706896561614611 0,00746166170748455 0,00711070420386053 0,00146562726802422 0,00132622032714669 303992 308071 623 665 0 True 403 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 449 314 0,0073124759893902 0,00746888966522509 0,00727855344472419 0,00750743877317464 0,00167233005935754 0,00165250651157462 298556 325500 623 665 0 True 447 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 493 314 0,00725048468213412 0,00762700984551101 0,0072480354009308 0,00762951094834821 0,00167553150499343 0,00149643239824175 296025 332391 623 665 0 True 491 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 537 314 0,00786846282254431 0,00768504002051363 0,00787365529869535 0,00773632410162509 0,00143578848410487 0,00150863863587265 321256 334920 623 665 0 True 536 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 581 314 0,00817668036917036 0,00816711038296129 0,00823987182421607 0,0081025406271458 0,00175478374513927 0,00192544361004004 333840 355929 623 665 0 True 580 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 624 313 0,00830068747649455 0,00829987534641135 0,00827038986800946 0,00830090791180285 0,00196956444833494 0,00189943762064054 338903 361715 623 665 0 False 624 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 668 313 0,00858218336519236 0,00843810143348759 0,00857557030594339 0,00846875715266651 0,00194287338481081 0,00192455305628585 350396 367739 623 665 0 False 668 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 272 359 0,00673219228669914 0,00679955783255346 0,00677500572213321 0,00679026474402991 0,00132970377347403 0,00151761253461269 274864 296330 623 665 0 True 270 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 316 359 0,00690650762993957 0,00708984638295212 0,00689707789730678 0,00706492713817044 0,0013060240212892 0,00124611438771727 281981 308981 623 665 0 True 315 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 361 359 0,00770943099401261 0,00714285140638275 0,00729381246662089 0,00712596322575723 0,00301398489205612 0,00151034210840482 314763 311291 623 665 0 True 359 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 405 358 0,00735893885381722 0,00733821277845564 0,00733958953231098 0,00733958953231098 0,00146921098950759 0,00129095246961327 300453 319805 623 665 0 True 403 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 449 358 0,00760609582004445 0,00752593316663139 0,00770580605783169 0,00753795681696803 0,00160887714425511 0,00169341528150938 310544 327986 623 665 0 True 447 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 493 358 0,00755419555134606 0,00756712105280367 0,00753795681696803 0,00761425192645151 0,00164678097765326 0,00172266401321605 308425 329781 623 665 0 True 491 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 537 359 0,00780965558085255 0,00772386447923425 0,00787365529869535 0,00776684214541848 0,00158847769269151 0,00165282216345137 318855 336612 623 665 0 True 535 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 582 359 0,00815282437025 0,00794933086894393 0,00816357671473259 0,00785839627679866 0,00191902375124976 0,00194035709891566 332866 346438 623 665 0 True 580 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 625 358 0,00793483834315434 0,00796195111261789 0,00791943236438544 0,00796520943007553 0,00196692859573319 0,0020214358632123 323966 346988 623 665 0 True 624 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 670 358 0,00772444508778897 0,00754208707853406 0,00770580605783169 0,00744640268558785 0,00188994367186788 0,00197744254249429 315376 328690 623 665 0 True 668 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 274 404 0,00691951331312921 0,00670495189679394 0,00700389105058366 0,00669871061264973 0,00149107234318439 0,0013845698360477 282512 292207 623 665 0 True 270 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 317 404 0,00714908444031659 0,00720698519014405 0,00711070420386053 0,0072327763790341 0,00142969699362294 0,00128011262609709 291885 314086 623 665 0 True 315 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 361 403 0,00741402318807994 0,00747315760217665 0,00743114366369116 0,00746166170748455 0,00127456692043025 0,00129587994101308 302702 325686 623 665 0 True 359 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 405 403 0,00754123885378048 0,00777556158650231 0,00752269779507134 0,00778210116731518 0,00147680909470759 0,00146251475306535 307896 338865 623 665 0 True 403 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 450 402 0,00783703854470569 0,00769254332902524 0,00788891432059205 0,00759899290455482 0,00154970377344287 0,00157074205015671 319973 335247 623 665 0 True 447 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 494 403 0,00812115516429105 0,0463366472945926 0,0081025406271458 0,00968947890440223 0,00164900352096551 0,10072114305114 331573 2019387 623 665 0 True 491 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 538 403 0,00798600382749174 0,00808927789833935 0,00804150453955901 0,0081177996490425 0,00158117128305692 0,00150751983204655 326055 352537 623 665 0 True 535 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 582 403 0,0076379854613117 0,00753648827952234 0,00764476997024491 0,00758373388265812 0,00189249277031566 0,00189054477144064 311846 328446 623 665 0 True 580 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 625 402 0,00734588418500352 0,00722508950334178 0,00735484855420768 0,0072632944228275 0,00179796158457407 0,00190233409912343 299920 314875 623 665 0 True 624 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 670 402 0,00687006232563414 0,00697757210604905 0,00694285496299687 0,00714122224765393 0,00177364187257756 0,00191360862735553 280493 304088 623 665 0 True 668 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 274 448 0,00679548171299298 0,00703913594928039 0,00683604180972 0,00708018616006714 0,0015043228213349 0,0015650697695753 277448 306771 623 665 0 True 270 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 318 448 0,00687863480984577 0,00715983137059862 0,00686655985351339 0,0072327763790341 0,00137953305233485 0,00149427553540481 280843 312031 623 665 0 True 315 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 361 447 0,00732237108545163 0,00739697722218111 0,00729381246662089 0,00750743877317464 0,00150617971411701 0,00128847472195483 298960 322366 623 665 0 True 359 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 405 446 0,00763551168729635 0,00770711397399427 0,0076752880140383 0,00775158312352178 0,00160758408612716 0,00159403762395674 311745 335882 623 665 0 True 403 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 449 447 0,00778332580791684 0,00776757641414133 0,00775158312352178 0,00784313725490196 0,001830583517225 0,00189124716807363 317780 338517 623 665 0 True 447 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 494 448 0,00802695580921128 0,00818849595951426 0,00802624551766232 0,0080872816052491 0,00192836553414049 0,00207672841860569 327727 356861 623 665 0 True 491 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 538 447 0,00748331335332192 0,00776865487132801 0,00746166170748455 0,00781261921110857 0,001712667303158 0,00173644513742338 305531 338564 623 665 0 True 535 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 583 447 0,00760612031285649 0,00727263340314623 0,00759899290455482 0,0072327763790341 0,00193125418354075 0,00193518617161439 310545 316947 623 665 0 True 580 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 626 447 0,00695294600155456 0,00760268719406665 0,00697337300679027 0,00738536659800107 0,00178081695361284 0,00242780364897392 283877 331331 623 665 0 True 624 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 671 447 0,00688448859192171 0,00717017997041126 0,00691233691920348 0,00714122224765393 0,00184730723658 0,00202613903823757 281082 312482 623 665 0 True 668 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 273 492 0,00695336237935912 0,00709227864809655 0,00700389105058366 0,00708018616006714 0,00148813841154342 0,0014130020252021 283894 309087 623 665 0 True 270 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 316 492 0,00709387764199371 0,00692885796546757 0,00717174029144732 0,00698863202868696 0,00152778152009523 0,00155398341192968 289631 301965 623 665 0 True 315 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 361 492 0,00736890742831474 0,00743612292346797 0,00743114366369116 0,00743114366369116 0,0015007702557043 0,00147486604212351 300860 324072 623 665 0 True 359 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 405 491 0,00754190015970538 0,0073472764080033 0,00749217975127794 0,00740062561989776 0,00165336749707294 0,00161030305631834 307923 320200 623 665 0 True 403 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 450 491 0,00779106553651933 0,00786649617864758 0,007690547035935 0,00798046845197223 0,00212615590096046 0,00202352853158391 318096 342828 623 665 0 True 447 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 494 493 0,00817467195858364 0,00934352360645262 0,007690547035935 0,00901808194094758 0,00276116544800007 0,0028935114801172 333758 407198 623 665 0 True 491 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 536 489 0,00779667439047494 0,00698727822072921 0,00753795681696803 0,00691233691920348 0,00261942182703382 0,00153065282892246 318325 304511 623 665 0 True 535 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 581 491 0,00725854281729305 0,00728713521042249 0,00721751735713741 0,00732433051041428 0,00171537565117523 0,00176558720910518 296354 317579 623 665 0 True 580 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 625 491 0,00708601544933105 0,00707640008696495 0,00706492713817044 0,00706492713817044 0,00178319836342709 0,00175744394533146 289310 308395 623 665 0 True 624 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 669 491 0,0072486232284196 0,00711309057720979 0,00730907148851759 0,00708018616006714 0,00186582220741975 0,00186860421509645 295949 309994 623 665 0 True 668 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 270 529 0,00703472750093348 0,00687376486535634 0,00711070420386053 0,00686655985351339 0,00145099602461598 0,0015253766077346 287216 299564 623 665 0 False 270 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 316 536 0,00701919905810442 0,00715684840391205 0,00708018616006714 0,0072327763790341 0,00145240210845398 0,00140030259127053 286582 311901 623 665 0 True 314 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 360 535 0,00710673636831115 0,00718442937281405 0,00718699931334401 0,00718699931334401 0,00141883076842368 0,0013304450710427 290156 313103 623 665 0 True 359 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 404 535 0,00740170330362723 0,0073234585663059 0,00749217975127794 0,00727855344472419 0,00164897723226279 0,00161327409276483 302199 319162 623 665 0 True 403 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 449 535 0,00730823873290846 0,00714571964358137 0,0072480354009308 0,00714122224765393 0,00186111538390175 0,00190105228339587 298383 311416 623 665 0 True 447 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 493 535 0,00775822067558278 0,0079034390737659 0,00747692072938125 0,00787365529869535 0,00209862787056672 0,00214869230411847 316755 344438 623 665 0 True 491 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 537 535 0,00739540865093469 0,0076443569440883 0,00744640268558785 0,00750743877317464 0,00172002125976514 0,00193504772034817 301942 333147 623 665 0 True 535 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 581 535 0,00736790322302138 0,00737825336974847 0,00740062561989776 0,00740062561989776 0,00176753667533003 0,00164479429776392 300819 321550 623 665 0 True 580 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 625 535 0,00728575433146196 0,00721214801710158 0,00735484855420768 0,00732433051041428 0,00175203559044088 0,00178544408113434 297465 314311 623 665 0 True 624 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 669 534 0,00726865834866277 0,00763488028838404 0,00732433051041428 0,00743114366369116 0,00180340475705392 0,00263948903919294 296767 332734 623 665 0 True 668 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 270 572 0,00703044125882767 0,00725198209531611 0,00703440909437705 0,00721751735713741 0,00143052284432011 0,0013398992996056 287041 316047 623 665 0 False 270 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 314 572 0,00731911354145121 0,00696329975774869 0,00727855344472419 0,00704966811627375 0,00135747396619728 0,00137678607176917 298827 303466 623 665 0 False 314 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 359 572 0,00718295799935853 0,00729009523121147 0,00727855344472419 0,00727855344472419 0,0013658449441826 0,00132018287567791 293268 317708 623 665 0 False 359 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 403 572 0,00728913433952254 0,0072024877942166 0,00729381246662089 0,00727855344472419 0,0014771404864495 0,00145527749657534 297603 313890 623 665 0 False 403 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 447 573 0,00710996941949954 0,00693576468064187 0,00706492713817044 0,00697337300679027 0,0018502977122841 0,00182977476251629 290288 302266 623 665 0 False 447 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 491 573 0,00748715872481113 0,00736788182403824 0,00753795681696803 0,00735484855420768 0,00191856387248352 0,00204782145801514 305688 321098 623 665 0 False 491 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 538 580 0,00737973325123343 0,00746003254875573 0,00741588464179446 0,00746166170748455 0,00189649442099689 0,00165376582697431 301302 325114 623 665 0 True 535 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 582 580 0,00743268671084925 0,00765436135543712 0,00743114366369116 0,007690547035935 0,00159858223725977 0,00171850654140087 303464 333583 623 665 0 True 579 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 627 580 0,00708307631188706 0,00736262721349035 0,00706492713817044 0,00730907148851759 0,00151644482083098 0,00152868393069986 289190 320869 623 665 0 True 624 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 670 579 0,00729133869260553 0,00723562167033514 0,00733958953231098 0,0072632944228275 0,00160700416534357 0,00167060561436388 297693 315334 623 665 0 True 668 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 270 616 0,00719927021217266 0,00717006524092332 0,0072327763790341 0,00717174029144732 0,00132681697424515 0,00134439123510489 293934 312477 623 665 0 False 270 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 314 616 0,00697846751169318 0,00686495364068216 0,00697337300679027 0,00691233691920348 0,00131786323814568 0,00135259369578279 284919 299180 623 665 0 False 314 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 359 616 0,00700607091085461 0,00693099193394335 0,00701915007248035 0,00695811398489357 0,00133142009801589 0,00147263551830037 286046 302058 623 665 0 False 359 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 403 616 0,00697410779115126 0,00705694196580947 0,00698863202868696 0,00704966811627375 0,00134170140299326 0,00135798602876266 284741 307547 623 665 0 False 403 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 447 616 0,00724467988568225 0,00686332448195334 0,00721751735713741 0,00683604180972 0,00182278985808232 0,00187744911477983 295788 299109 623 665 0 False 447 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 491 616 0,00707009512150945 0,00742334205851089 0,00704966811627375 0,00740062561989776 0,00192810308677166 0,00191113763256742 288660 323515 623 665 0 False 491 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 535 616 0,00737192004419483 0,00740328734401809 0,00746166170748455 0,00750743877317464 0,0018611825612801 0,00193990898435746 300983 322641 623 665 0 False 535 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 579 616 0,00724779047281047 0,00728128400653729 0,0072327763790341 0,00732433051041428 0,0014488232064794 0,00160605659878388 295915 317324 623 665 0 False 579 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 624 616 0,00728259475870967 0,00722974752055235 0,00729381246662089 0,00729381246662089 0,00138034615772034 0,00133931831408926 297336 315078 623 665 0 False 624 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 668 616 0,0073784596250077 0,00757935121621862 0,00737010757610437 0,00756847486076143 0,00151564568776931 0,00149976556129848 301250 330314 623 665 0 False 668 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 270 659 0,0410054250354013 0,521625739790079 0,00880445563439384 0,602777141985199 0,100319291267084 0,375953590958803 1674182 22732854 623 665 12 False 270 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 314 659 0,00750680196006178 0,00728518480912742 0,00735484855420768 0,0072327763790341 0,0017422683426623 0,00121423944845571 306490 317494 623 665 0 False 314 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 359 659 0,0067061319346958 0,00675511162892353 0,00668345159075303 0,00674448767833982 0,00127480659639088 0,00115560598998072 273800 294393 623 665 0 False 359 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 403 659 0,00669998423887546 0,0070447576941897 0,00663767452506294 0,00700389105058366 0,00133696865441385 0,00141955998248378 273549 307016 623 665 0 False 403 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 447 659 0,00678588053067596 0,00654481247752019 0,00675974670023652 0,00660715648126955 0,00149755138514343 0,00148378497792291 277056 285228 623 665 0 False 447 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 491 659 0,00694349177610974 0,00675896653971849 0,00694285496299687 0,00679026474402991 0,00162555045803314 0,00157569092201668 283491 294561 623 665 0 False 491 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 535 659 0,00708300283345096 0,00698691108636778 0,00708018616006714 0,00698863202868696 0,00177639628995945 0,00170725916639344 289187 304495 623 665 0 False 535 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 579 659 0,00701427600288574 0,00711510981619762 0,00700389105058366 0,00711070420386053 0,00142920543704886 0,00125297081269776 286381 310082 623 665 0 False 579 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 624 659 0,00750513644884352 0,00748130339582075 0,00744640268558785 0,00750743877317464 0,00139847929503586 0,00140501648211975 306422 326041 623 665 0 False 624 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 666 664 0,00879309096961042 0,707311285767635 0,00885023270008392 0,728847180895705 0,00158663284375738 0,22287841422796 359007 30825174 623 665 12 True 668 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B3_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B3_3.csv new file mode 100755 index 0000000..ea33a32 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B3_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 271 269 0,000977312185749568 0,0714228693730206 0,000793469138628214 0,0696421759365225 0,000738353364876363 0,0213347235426837 39902 3112664 623 665 0 True 271 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 315 269 0,000968641730289807 0,000904504337061468 0,000869764248111696 0,000793469138628214 0,000633845144604388 0,000656049377415749 39548 39419 623 665 0 False 315 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 360 269 0,000986937860878623 0,000934540517005492 0,000885023270008392 0,000854505226215 0,000654660670507297 0,000677495571285463 40295 40728 623 665 0 True 359 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 404 269 0,000993844833871991 0,00105128924393841 0,000854505226215 0,000900282291905089 0,000727817740888939 0,000738091697866989 40577 45816 623 665 0 True 403 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 448 269 0,000904690998071069 0,000895463653411395 0,000686655985351339 0,000625619897764553 0,000823502625096579 0,000867195078961345 36937 39025 623 665 0 True 447 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 492 268 0,000971507389297694 0,000983575900153221 0,00080872816052491 0,000762951094834821 0,000822099577620909 0,000820777665885819 39665 42865 623 665 0 True 491 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 537 269 0,000912871597290164 0,000939382101396774 0,000762951094834821 0,000747692072938125 0,000768002408443116 0,000802891539185894 37271 40939 623 665 0 True 536 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 581 270 0,00104055262641934 0,000995255362026031 0,000762951094834821 0,000686655985351339 0,000955779465585174 0,000943646149115292 42484 43374 623 665 0 True 580 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 624 270 0,0010636738409787 0,00101388743086831 0,000778210116731518 0,000671396963454643 0,00101445883011846 0,000980249771981587 43428 44186 623 665 0 False 624 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 665 268 0,00115295014083979 0,0716606806556331 0,000915541313801785 0,0718852521553368 0,000981693638532822 0,0223607769509768 47073 3123028 623 665 0 True 668 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 270 313 0,000980692193810152 0,000925316266174707 0,000793469138628214 0,000732433051041428 0,000772525680304917 0,000741824897599418 40040 40326 623 665 0 False 270 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 315 313 0,000927346849201798 0,000968684012617949 0,000854505226215 0,000869764248111696 0,000645173831035456 0,000638179838684737 37862 42216 623 665 0 False 315 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 360 314 0,000906650423033726 0,000948606352227559 0,000793469138628214 0,00080872816052491 0,000664608049230661 0,0006824571715468 37017 41341 623 665 0 True 359 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 404 313 0,00096820085967321 0,000929790716204565 0,00080872816052491 0,000762951094834821 0,000755025758382972 0,000734641392987248 39530 40521 623 665 0 True 403 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 449 314 0,00101432082473176 0,000916183798934278 0,000778210116731518 0,000656137941557946 0,000908663475154594 0,000853807308279237 41413 39928 623 665 0 True 447 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 493 314 0,001021129826477 0,00100883933339873 0,000854505226215 0,000839246204318303 0,000878071679094107 0,000832536770499544 41691 43966 623 665 0 True 491 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 537 314 0,00102468128422182 0,00102611759428326 0,00080872816052491 0,000869764248111696 0,000863103666661913 0,000815071109450743 41836 44719 623 665 0 True 536 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 581 314 0,000901090554702185 0,000965999342600034 0,00064087891966125 0,000610360875867857 0,000891574341530366 0,00100762087686784 36790 42099 623 665 0 True 580 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 624 313 0,00103080448723012 0,00102441959786167 0,000732433051041428 0,000671396963454643 0,00101573440475477 0,0010468311852519 42086 44645 623 665 0 False 624 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 668 313 0,000961930699792705 0,000993557365604444 0,000610360875867857 0,000686655985351339 0,000977893385446 0,000981107411333008 39274 43300 623 665 0 False 668 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 272 359 0,000934327300631266 0,000922356245385723 0,000778210116731518 0,00080872816052491 0,000778223495428692 0,00072543225187704 38147 40197 623 665 0 True 270 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 316 359 0,00095656677395743 0,000940965368330416 0,000885023270008392 0,000823987182421607 0,000664021858474532 0,000703138027749149 39055 41008 623 665 0 True 315 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 361 359 0,000990268883315141 0,000924352538475968 0,000885023270008392 0,000793469138628214 0,000725269958846292 0,000695667937032295 40431 40284 623 665 0 True 359 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 405 358 0,00102029707086787 0,000986558866839794 0,000854505226215 0,000854505226215 0,000789295011150182 0,000711463014580318 41657 42995 623 665 0 True 403 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 449 358 0,000977655085118033 0,000993832716375512 0,000762951094834821 0,000732433051041428 0,000882965358802957 0,000912710311655869 39916 43312 623 665 0 True 447 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 493 358 0,000937119481203053 0,0010063841223567 0,000671396963454643 0,000747692072938125 0,000876330639305718 0,00089224305458164 38261 43859 623 665 0 True 491 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 537 359 0,000909565067665679 0,0009023474226881 0,000686655985351339 0,000610360875867857 0,000835602992553725 0,000874680665339476 37136 39325 623 665 0 True 535 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 582 359 0,000950370092513025 0,000986811271713273 0,000671396963454643 0,000579842832074464 0,000953352675673986 0,0010679900583672 38802 43006 623 665 0 True 580 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 625 358 0,000988162501480284 0,000976393834207859 0,000701915007248035 0,000625619897764553 0,00101219630826283 0,00101603524457189 40345 42552 623 665 0 True 624 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 670 358 0,00102037054930397 0,000982703956044838 0,000732433051041428 0,000671396963454643 0,00100866037183667 0,00100360855063688 41660 42827 623 665 0 True 668 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 274 404 0,0008472798466652 0,000854619955702945 0,000671396963454643 0,000717174029144732 0,000759405927936666 0,00071068416517387 34593 37245 623 665 0 True 270 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 317 404 0,000969474485898937 0,00100363061464602 0,000885023270008392 0,000930800335698482 0,000671522479617597 0,000677793614974269 39582 43739 623 665 0 True 315 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 361 403 0,000874907738638672 0,000957784711263166 0,000717174029144732 0,000854505226215 0,000703431182239598 0,000695769615785135 35721 41741 623 665 0 True 359 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 405 403 0,00097976146695289 0,000959367978196808 0,000823987182421607 0,000732433051041428 0,000760048778596243 0,000789034838726794 40002 41810 623 665 0 True 403 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 450 402 0,00102338316518406 0,000982979306815907 0,000762951094834821 0,000762951094834821 0,000876201409468134 0,000845487838750592 41783 42839 623 665 0 True 447 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 494 403 0,00100888342046039 0,00464835698768551 0,000778210116731518 0,00119020370794232 0,000917994746618848 0,0097211046639954 41191 202579 623 665 0 True 491 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 538 403 0,000865575977254015 0,000971208061352741 0,000656137941557946 0,000747692072938125 0,000784673169064167 0,000857402491186817 35340 42326 623 665 0 True 535 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 582 403 0,00100180499778279 0,000877955933550975 0,000732433051041428 0,000473029678797589 0,000934691800162672 0,000970866778338136 40902 38262 623 665 0 True 580 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 625 402 0,000956811702077762 0,000984195439388125 0,000579842832074464 0,000610360875867857 0,000999403467477881 0,00105740028486722 39065 42892 623 665 0 True 624 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 670 402 0,00100418080055001 0,000907097223489027 0,000701915007248035 0,000457770656900893 0,000931057930240042 0,000967805722978083 40999 39532 623 665 0 True 668 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 274 448 0,000948925016603065 0,000839337987908659 0,000823987182421607 0,000701915007248035 0,000785108611750679 0,000750163563936081 38743 36579 623 665 0 True 270 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 318 448 0,000944687760121318 0,000975475998304298 0,000823987182421607 0,000854505226215 0,000737163503981112 0,000783499289178531 38570 42512 623 665 0 True 315 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 361 447 0,000901188525950318 0,000944499036559125 0,000747692072938125 0,000854505226215 0,000745298894801318 0,000731406709270741 36794 41162 623 665 0 True 359 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 405 446 0,000891734300505495 0,000987935620695135 0,000686655985351339 0,000839246204318303 0,00081918837736318 0,000797860512266062 36408 43055 623 665 0 True 403 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 449 447 0,00108439475995881 0,00100379123592915 0,000885023270008392 0,000656137941557946 0,00096706929348178 0,00101855891989747 44274 43746 623 665 0 True 447 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 494 448 0,00102904100476373 0,00100243742797139 0,000732433051041428 0,000686655985351339 0,000997317160491464 0,000991025931015126 42014 43687 623 665 0 True 491 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 538 447 0,000927346849201798 0,00095886316844985 0,000717174029144732 0,000717174029144732 0,000847164579303062 0,000896691444993299 37862 41788 623 665 0 True 535 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 583 447 0,000956248367400998 0,000933003141867027 0,000656137941557946 0,000488288700694286 0,000953707379347147 0,00102832201559801 39042 40661 623 665 0 True 580 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 626 447 0,000827857046722856 0,000931465766728563 0,000442511635004196 0,000564583810177768 0,000888463720021611 0,000953808819461266 33800 40594 623 665 0 True 624 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 671 447 0,000955317640543736 0,000978963774737829 0,000625619897764553 0,000625619897764553 0,000957244651023261 0,00101777914889929 39004 42664 623 665 0 True 668 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 273 492 0,000884704863451961 0,000881007737930314 0,000747692072938125 0,000686655985351339 0,000745710961140168 0,000802359615400297 36121 38395 623 665 0 True 270 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 316 492 0,000992032365781533 0,000941148935511128 0,000823987182421607 0,000793469138628214 0,000826509234022849 0,000792350870807511 40503 41016 623 665 0 True 315 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 361 492 0,000982210748156212 0,000825409828072126 0,000885023270008392 0,000610360875867857 0,000819883737072397 0,000770327016329336 40102 35972 623 665 0 True 359 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 405 491 0,000984880464667833 0,000971804654690055 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000878291820628774 0,000847979436112838 40211 42352 623 665 0 True 403 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 450 491 0,000899743450040358 0,000981120689111196 0,000579842832074464 0,000656137941557946 0,000899174082874236 0,00101428989087302 36735 42758 623 665 0 True 447 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 494 493 0,00100567486208404 0,00110649707353759 0,000701915007248035 0,00080872816052491 0,000955288543740109 0,00103699006990498 41060 48222 623 665 0 True 491 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 536 489 0,000895285758250312 0,000864624367051756 0,000579842832074464 0,000610360875867857 0,000892421943125233 0,000833748203330528 36553 37681 623 665 0 True 535 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 581 491 0,000888697191813376 0,000939427993191952 0,000534065766384375 0,000534065766384375 0,000920409357450125 0,0010221483449655 36284 40941 623 665 0 True 580 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 625 491 0,000956909673325895 0,000957256955618619 0,000686655985351339 0,000610360875867857 0,000935751777376212 0,000934972197147153 39069 41718 623 665 0 True 624 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 669 491 0,000995118460097719 0,000889887800297264 0,000656137941557946 0,000503547722590982 0,00100396685739937 0,000941689622211571 40629 38782 623 665 0 True 668 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 270 529 0,000882500510368971 0,000758935562756743 0,000762951094834821 0,000564583810177768 0,000744519513999439 0,000733103659944509 36031 33075 623 665 0 False 270 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 316 536 0,00094721051976074 0,000946219978878301 0,00080872816052491 0,000823987182421607 0,000756563438187274 0,000735953698785311 38673 41237 623 665 0 True 314 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 360 535 0,000972756522711389 0,000985572193243466 0,000823987182421607 0,000854505226215 0,000746238570642933 0,000771589264406577 39716 42952 623 665 0 True 359 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 404 535 0,000980104366321355 0,00096003340922689 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000878840191215377 0,000891674992249118 40016 41839 623 665 0 True 403 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 449 535 0,000898518809438697 0,000953631503799554 0,000503547722590982 0,000534065766384375 0,00098677396729038 0,00103982612442404 36685 41560 623 665 0 True 447 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 493 535 0,000976479430140438 0,00101693923524765 0,000625619897764553 0,000625619897764553 0,000993417958402386 0,00104316541954475 39868 44319 623 665 0 True 491 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 537 535 0,000916251605350749 0,000874422265322266 0,000564583810177768 0,000488288700694286 0,000919586275444395 0,000922102707091782 37409 38108 623 665 0 True 535 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 581 535 0,000910005938282277 0,0009002593460075 0,000625619897764553 0,00064087891966125 0,00084893595988696 0,000833418992828738 37154 39234 623 665 0 True 580 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 625 535 0,000935013099368196 0,000937523483692064 0,000579842832074464 0,000564583810177768 0,000946820405342728 0,000944837977660485 38175 40858 623 665 0 True 624 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 669 534 0,000973711742380684 0,000887363751562472 0,000671396963454643 0,000457770656900893 0,000941696892692362 0,000987472637416149 39755 38672 623 665 0 True 668 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 270 572 0,000879904272293449 0,000960584110769026 0,000762951094834821 0,000854505226215 0,000708904555308596 0,000669512876254971 35925 41863 623 665 0 False 270 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 314 572 0,000870694974968958 0,000973227300340574 0,000717174029144732 0,000885023270008392 0,000743883659111536 0,000772463435040051 35549 42414 623 665 0 False 314 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 359 572 0,000961367365115941 0,000929653040819031 0,000778210116731518 0,000823987182421607 0,000748383798262806 0,000683004825580083 39251 40515 623 665 0 False 359 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 403 572 0,000967588539372379 0,000977724696268022 0,00080872816052491 0,000823987182421607 0,000802856716979606 0,000757960616957458 39505 42610 623 665 0 False 403 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 447 573 0,000982627125960777 0,000951313968143063 0,000656137941557946 0,000595101853971161 0,000983783289608528 0,00102073998291031 40119 41459 623 665 0 False 447 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 491 573 0,000985713220276962 0,000912718968398336 0,000503547722590982 0,000473029678797589 0,00112972149851049 0,00105117601584268 40245 39777 623 665 0 False 491 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 538 580 0,000963449254138765 0,0009023474226881 0,000595101853971161 0,000473029678797589 0,000976229244943205 0,000964629782406047 39336 39325 623 665 0 True 535 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 582 580 0,000884459935331628 0,000911755240699598 0,000595101853971161 0,000671396963454643 0,000841556737433191 0,000829947717115637 36111 39735 623 665 0 True 579 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 627 580 0,000967955931552877 0,00100877049570596 0,000747692072938125 0,00080872816052491 0,00084274718941483 0,000796909518865238 39520 43963 623 665 0 True 624 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 670 579 0,000896534891664006 0,00098151076937021 0,000625619897764553 0,000732433051041428 0,000812001361097135 0,000884557006957991 36604 42775 623 665 0 True 668 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 270 616 0,000872360486187217 0,000883417057177161 0,000762951094834821 0,000732433051041428 0,000682569025502737 0,0007033936177913 35617 38500 623 665 0 False 270 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 314 616 0,000937217452451186 0,000974672891888682 0,000823987182421607 0,000869764248111696 0,000705252952863642 0,000693975377683573 38265 42477 623 665 0 False 314 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 359 616 0,000900355770341189 0,000937041619842694 0,000778210116731518 0,000839246204318303 0,000706740274140095 0,00070102023178002 36760 40837 623 665 0 False 359 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 403 616 0,000888231828384744 0,000927427288752896 0,000732433051041428 0,000762951094834821 0,000748160402343713 0,000733108330376848 36265 40418 623 665 0 False 403 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 447 616 0,000898641273498863 0,000950533807625037 0,000625619897764553 0,000549324788281071 0,000981458749852452 0,000989977266821967 36690 41425 623 665 0 False 447 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 491 616 0,000941111809564468 0,000947963867095067 0,000473029678797589 0,000534065766384375 0,00105333945756735 0,00100466208997054 38424 41313 623 665 0 False 491 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 535 616 0,000997224841932576 0,000937569375487242 0,000610360875867857 0,000518806744487678 0,000992395702416059 0,00102682720449708 40715 40860 623 665 0 False 535 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 579 616 0,000864841192893019 0,000860035187533953 0,000625619897764553 0,000534065766384375 0,000844323823840052 0,000870766177318987 35310 37481 623 665 0 False 579 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 624 616 0,00101343908349857 0,000984516681954371 0,000885023270008392 0,000854505226215 0,000780130750768355 0,000747485759903845 41377 42906 623 665 0 False 624 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 668 616 0,00095938344734125 0,000993396744321321 0,000732433051041428 0,000778210116731518 0,000804785369393706 0,000831749894503903 39170 43293 623 665 0 False 668 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 270 659 0,00404400819480505 0,0521756669081722 0,00108339055466545 0,058655680170901 0,00943049813543702 0,0389092328563374 165110 2273856 623 665 0 False 270 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 314 659 0,000972903479583588 0,000905697523736097 0,000854505226215 0,000778210116731518 0,000673155883134591 0,000685653600676658 39722 39471 623 665 0 False 314 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 359 659 0,000917206825020044 0,000904160148597633 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,000668032063644037 0,000644315972404973 37448 39404 623 665 0 False 359 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 403 659 0,000951962125295184 0,000977380507804187 0,000778210116731518 0,000793469138628214 0,000745931208636554 0,000729275284097548 38867 42595 623 665 0 False 403 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 447 659 0,0010219380892741 0,000932658953403192 0,000823987182421607 0,000762951094834821 0,000836212862335417 0,000813366411839064 41724 40646 623 665 0 False 447 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 491 659 0,000982676111584843 0,000942502743468881 0,000732433051041428 0,000717174029144732 0,000873951138579155 0,000839675364810584 40121 41075 623 665 0 False 491 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 535 659 0,000851100725342382 0,000882155032809765 0,000488288700694286 0,000579842832074464 0,000858950478052748 0,000876089313502305 34749 38445 623 665 0 False 535 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 579 659 0,000883945586278931 0,000872425972232022 0,000686655985351339 0,000701915007248035 0,000749811917977968 0,000690926137179335 36090 38021 623 665 0 False 579 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 624 659 0,000964282009747894 0,000972470085720137 0,000823987182421607 0,00080872816052491 0,000716140025597987 0,000751510032804751 39370 42381 623 665 0 False 624 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 666 664 0,0010503252584206 0,0700814751458642 0,000930800335698482 0,0700541695277333 0,000735952234770149 0,024659259407223 42883 3054205 623 665 0 True 668 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B4_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B4_1.csv new file mode 100755 index 0000000..6d73c3b --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B4_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 246 245 0,0138590372536896 0,0500784348144337 0,013015945677882 0,0498970016021973 0,00370151713940167 0,0101836913923862 565841 2182457 623 665 0 True 246 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 291 245 0,0109937946236073 0,0112185935197343 0,0110170138094148 0,011261158159762 0,00161915230516547 0,00155873498224318 448858 488915 623 665 0 False 291 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 335 245 0,010800374886981 0,0668903891681596 0,0107270923933776 0,0652475776302739 0,00138854080903766 0,0102758605289935 440961 2915135 623 665 0 True 335 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 379 244 0,0118591746583651 0,0860537702691152 0,0113374532692454 0,0865186541542687 0,00242941594067672 0,0123212222444352 484190 3750290 623 665 0 True 379 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 424 244 0,0117798424401895 0,0741528116468787 0,0113221942473487 0,0710917830167086 0,00247068963184955 0,0118606703279636 480951 3231637 623 665 0 True 423 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 467 243 0,0107071062587585 0,0705134087220799 0,0107118333714809 0,0721141374837873 0,00168942592802966 0,0227345036713367 437153 3073029 623 665 0 True 468 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 511 242 0,0117028860247811 0,0836006931955662 0,0115663385976959 0,0829480430304417 0,0025730171984475 0,0271496481577128 477809 3643383 623 665 0 True 512 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 555 242 0,0124155778693237 0,076609560064042 0,0122529945830472 0,0752269779507134 0,00255780064619827 0,0209036086103667 506907 3338704 623 665 0 True 556 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 600 245 0,0129931428698791 0,0153674642087021 0,0127718013275349 0,0150606546120394 0,00330544516164993 0,00296155240261874 530488 669726 623 665 0 False 600 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 642 242 0,012467404659586 0,0508728217889654 0,0119935912108034 0,0514839398794537 0,00317467508201779 0,0120247722411756 509023 2217077 623 665 0 True 644 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 246 289 0,01383723865098 0,0144026121609815 0,0126497291523613 0,0144197756923781 0,003815865355265 0,00282273880452596 564951 627677 623 665 0 False 246 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 291 289 0,0114179856352107 0,0114981892818565 0,0111848630502785 0,0113832303349355 0,00200113817865394 0,00166950877558186 466177 501100 623 665 0 False 291 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 335 289 0,0118116586030206 0,106089003694863 0,0116578927290761 0,104676890211337 0,00176276631409812 0,0235803181139173 482250 4623441 623 665 0 True 335 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 379 289 0,0132002785812441 0,0584960914531694 0,0129854276340887 0,0569161516746777 0,00244094134820033 0,0103973049958913 538945 2549305 623 665 0 True 379 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 423 288 0,0128600244364786 0,0836432119437986 0,0125886930647745 0,0822766460669871 0,00258515358802255 0,0152764853882987 525053 3645236 623 665 0 True 423 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 467 288 0,0116981344192466 0,0437988080753497 0,0117189288166629 0,0444190127412833 0,00189034788740486 0,0082176052997213 477615 1908786 623 665 0 True 468 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 512 288 0,0128956124923628 0,0444646062397927 0,012664988174258 0,0465400167849241 0,00262960515882394 0,00748022135133506 526506 1937802 623 665 0 True 512 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 556 286 0,0124789162812417 0,0573107981673112 0,0125581750209812 0,0567177843900206 0,00197668663998194 0,0137795197225688 509493 2497649 623 665 0 True 556 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 600 289 0,0124397032891765 0,0113423177995343 0,0125581750209812 0,0113527122911421 0,00207989753631537 0,00194135259717776 507892 494307 623 665 0 False 600 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 644 289 0,0119196229184631 0,0113809816369718 0,0119783321889067 0,0113832303349355 0,00207595735777365 0,00209006192316903 486658 495992 623 665 0 False 644 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 247 334 0,0125001515492745 0,0604065898323286 0,0124818799114977 0,060013733119707 0,00221686115449502 0,0121127261869848 510360 2632566 623 665 0 True 247 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 292 334 0,0116313915064561 0,0728310591080586 0,011459525444419 0,0725108720531014 0,00192312488427514 0,0233598642395153 474890 3174034 623 665 0 True 291 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 336 334 0,0112644891821985 0,0436693932129477 0,011108567940795 0,0440070191500725 0,00177351271260751 0,00866683226384978 459910 1903146 623 665 0 True 335 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 380 334 0,0111980401831523 0,036356306192352 0,0111696040283818 0,0368200198367285 0,00167287810662529 0,00529795303946988 457197 1584436 623 665 0 True 379 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 424 333 0,0120783853260624 0,0767556795398889 0,012115663385977 0,0724956130312047 0,00185166699880335 0,0125986344562506 493140 3345072 623 665 0 True 423 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 468 331 0,0123825370658909 0,03707754164537 0,0122682536049439 0,0382085908293278 0,00210706772242262 0,00534163532818624 505558 1615868 623 665 0 True 468 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 512 331 0,0129380340428044 0,0331699470695507 0,0129549095902953 0,0336461432822156 0,00209121314971545 0,00418858333412614 528238 1445572 623 665 0 True 512 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 556 331 0,0123979675374719 0,0546403546059013 0,0123903257801175 0,0541237506675822 0,00191077986509341 0,00994939946340678 506188 2381269 623 665 0 True 556 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 600 331 0,0118228518181198 0,0640443635983986 0,0116884107728695 0,0626382848859388 0,00208968228893391 0,0187198737015865 482707 2791103 623 665 0 True 600 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 645 330 0,0116250233753275 0,0708514706312589 0,0116426337071794 0,0699931334401465 0,00198336281937102 0,0224101177783665 474630 3087762 623 665 0 True 644 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 249 378 0,0117131974986471 0,0517789323388581 0,0117494468604562 0,0551003280689708 0,00187413753447953 0,0116348006651651 478230 2256566 623 665 0 True 247 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 291 378 0,0114635422655925 0,0351880158166072 0,011459525444419 0,0351415274280919 0,00165295801402665 0,00429653309230137 468037 1533521 623 665 0 True 291 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 335 377 0,0116363880401109 0,0962622624310834 0,0115968566414893 0,0909895475700008 0,00173732517834917 0,0242525847451679 475094 4195184 623 665 0 True 335 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 380 377 0,0118842797906991 0,0742733693928114 0,0118562600137331 0,0716716258487831 0,00160244364293303 0,0186220008182767 485215 3236891 623 665 0 True 379 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 423 376 0,0118208434075331 0,0476229025298426 0,0117036697947662 0,0477149614709697 0,00160933154318111 0,0104544714868525 482625 2075443 623 665 0 True 423 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 468 376 0,0115448828943548 0,0578539734550384 0,0114900434882124 0,0562752727550164 0,00188224211230955 0,0148086945691374 471358 2521321 623 665 0 True 468 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 512 375 0,0113676039208583 0,0447132709319648 0,0114442664225223 0,0453650720988785 0,00187662606500182 0,00816813310499809 464120 1948639 623 665 0 True 512 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 556 375 0,0112374981033379 0,0552385082642518 0,011261158159762 0,0549935149156939 0,00185139191689009 0,0105998266355529 458808 2407337 623 665 0 True 556 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 600 375 0,0112010283062204 0,0451798987053351 0,0112458991378653 0,0456092164492256 0,0020534241321298 0,00950183619518701 457319 1968975 623 665 0 True 600 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 644 375 0,0109525977137674 0,0986991626468322 0,0109407186999313 0,09057755397879 0,00195716038226072 0,0269081379406517 447176 4301386 623 665 0 True 645 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 248 422 0,0111239004411278 0,0482307393569756 0,0111543450064851 0,048355840390631 0,0016186621409018 0,00768457882770427 454170 2101933 623 665 0 True 247 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 291 421 0,011454332968268 0,0635803975491487 0,0113832303349355 0,0634470130464637 0,00162815638908063 0,0107881552973307 467661 2770883 623 665 0 True 291 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 335 421 0,0115517653745361 0,0382685484597279 0,0115205615320058 0,0390325780117494 0,00142926732040108 0,00497883086599767 471639 1667773 623 665 0 True 335 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 380 422 0,0116133892896117 0,0580358426393289 0,0116426337071794 0,0572671091783017 0,00143245012872438 0,0118266676675202 474155 2529247 623 665 0 True 379 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 424 421 0,011522912841961 0,112531018551185 0,0114747844663157 0,113130388342107 0,00165597737241668 0,0216444258955919 470461 4904189 623 665 0 True 423 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 468 419 0,0114357919095588 0,0638367720629108 0,0114290074006256 0,0635385671778439 0,00180245180787917 0,016727605627321 466904 2782056 623 665 0 True 468 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 512 419 0,0111403841036261 0,0579644120601343 0,0111390859845884 0,0566720073243305 0,00172345120845319 0,0138005135698091 454843 2526134 623 665 0 True 512 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 556 420 0,0110158136616252 0,0332984899878444 0,0110627908751049 0,0337376974135958 0,00163702315849095 0,00454797688785073 449757 1451174 623 665 0 True 556 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 601 420 0,010964084842611 0,0449962397410326 0,0109102006561379 0,0439765011062791 0,00194060373306791 0,00733660160337098 447645 1960971 623 665 0 True 600 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 645 419 0,0108172259416598 0,0754415220931707 0,010757610437171 0,0760662241550317 0,00178459676254902 0,0141362920530009 441649 3287800 623 665 0 True 645 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 248 465 0,010644821037758 0,0562286696370131 0,0105745021744106 0,0564583810177768 0,00158147007213 0,0150046932034568 434610 2450489 623 665 0 True 247 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 292 466 0,01094118406336 0,0603592753915 0,0108949416342412 0,0585183489738308 0,00151176168189448 0,00862454266070154 446710 2630504 623 665 0 True 291 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 337 465 0,0109319992588475 0,0749329262731101 0,0110017547875181 0,0705424582284276 0,0015410716733604 0,0190616643436991 446335 3265635 623 665 0 True 335 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 381 465 0,0113834752630559 0,0968280394279358 0,0114137483787289 0,089417868314641 0,00167661207086982 0,0242115530077144 464768 4219841 623 665 0 True 379 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 426 465 0,0112208919767793 0,105569164384984 0,0112001220721752 0,0998855573357748 0,00185790176808605 0,0334030159408353 458130 4600786 623 665 0 True 423 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 469 464 0,0112370572327213 0,0521166271136757 0,0112306401159686 0,0526894026092927 0,00202383336156574 0,00969644751301856 458790 2271283 623 665 0 True 468 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 514 463 0,0113745353866637 0,0432108423955288 0,011306935225452 0,0452124818799115 0,00216827213205202 0,00734593993787079 464403 1883162 623 665 0 True 512 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 558 463 0,0113244965716799 0,109898137424128 0,0113221942473487 0,110185397116045 0,0020324052046717 0,0239896864719198 462360 4789446 623 665 0 True 556 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 601 464 0,010984732283155 0,0659574778098829 0,0109864957656214 0,0687876707103075 0,00197173716956954 0,0169246229201718 448488 2874478 623 665 0 True 600 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 646 463 0,0106872670810116 0,0807080186160067 0,0106965743495842 0,0777141985198749 0,00192066954526733 0,0145426118447474 436343 3517318 623 665 0 True 645 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 249 510 0,0107628274061341 0,0541173028703597 0,0106813153276875 0,0560769054703594 0,00148466437993103 0,0122811141795595 439428 2358474 623 665 0 True 247 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 293 510 0,0108914391621205 0,107220833039339 0,0108644235904479 0,102204928664073 0,00157141756194821 0,0250161203737414 444679 4672767 623 665 0 True 291 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 337 510 0,0110709224886999 0,0607017658589137 0,0110322728313115 0,0622110322728313 0,00160175054342698 0,0135019174684859 452007 2645430 623 665 0 True 335 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 382 510 0,0110710694455721 0,061249346758978 0,0110475318532082 0,060517280842298 0,00169983761971176 0,0093217888168742 452013 2669294 623 665 0 True 379 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 426 509 0,0111397962761374 0,0627394762943064 0,0110780498970016 0,0617990386816205 0,00193377667344678 0,00880384879464117 454819 2734235 623 665 0 True 424 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 470 508 0,0112891534439159 0,0672239307355135 0,0113527122911421 0,0661020828564889 0,00191880136064304 0,0146417549720429 460917 2929671 623 665 0 True 468 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 514 508 0,0110818462828668 0,078829208521418 0,0110322728313115 0,0764629587243458 0,00187582806690268 0,0202512141491023 452453 3435438 623 665 0 True 512 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 558 507 0,0109355017309683 0,0613324568000454 0,0109254596780346 0,0615396353093767 0,00173722574093365 0,0159047576931238 446478 2672916 623 665 0 True 556 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 602 507 0,0107951579180179 0,0471208692364925 0,010757610437171 0,0458991378652628 0,00172728355098106 0,00893984113439926 440748 2053564 623 665 0 True 600 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 647 507 0,0107780129495946 0,0660421940637816 0,0107881284809644 0,0653391317616541 0,00204320602320648 0,0163331969491936 440048 2878170 623 665 0 True 645 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 250 555 0,0101901854607974 0,0482982232417849 0,0101319905394064 0,0494392309452964 0,00137967981659634 0,010260438695019 416048 2104874 623 665 0 True 247 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 294 555 0,0105201036388848 0,0544461175828103 0,0105745021744106 0,0546578164339666 0,00141528546170118 0,0127019053715699 429518 2372804 623 665 0 True 291 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 337 554 0,0106142540083405 0,0542242307531245 0,0106507972838941 0,0534065766384375 0,00147933380264325 0,0101535389020176 433362 2363134 623 665 0 True 335 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 382 554 0,0110102537932936 0,055464227058835 0,0110170138094148 0,0533150225070573 0,00152266248181775 0,00927905975992391 449530 2417174 623 665 0 True 379 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 426 553 0,0113025510120981 0,0941256092852869 0,0112916762035554 0,08720531013962 0,00182975908529815 0,0221686525740278 461464 4102067 623 665 0 True 424 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 470 552 0,0111634808253735 0,0695112466448795 0,0110933089188983 0,0675211718928817 0,00202380140108075 0,0175742274130396 455786 3029354 623 665 0 True 468 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 515 551 0,0110940926888834 0,0591439000339026 0,011108567940795 0,0593728542000458 0,00197387037612312 0,00986308788945778 452953 2577537 623 665 0 True 512 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 559 551 0,0109385143468483 0,0397053976208546 0,0108644235904479 0,0419165331502251 0,00197542943037961 0,00892113081736004 446601 1730392 623 665 0 True 556 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 602 552 0,0106953497089825 0,0512949574669106 0,010605020218204 0,0511482413977264 0,00168980381702686 0,00695163210729573 436673 2235474 623 665 0 True 600 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 647 551 0,0110617131913754 0,0553358447618245 0,0109407186999313 0,0544594491493095 0,00225182656908363 0,00902704475939636 451631 2411579 623 665 0 True 645 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 247 592 0,0104304599468433 0,0100803622698311 0,0103150988021668 0,0101319905394064 0,00176267802707219 0,00126631499058766 425858 439310 623 665 0 False 247 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 291 592 0,0102940594766302 0,0100221485276478 0,01025406271458 0,0100556954299229 0,00153913444461036 0,00153836777706504 420289 436773 623 665 0 False 291 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 337 598 0,0104822377514815 0,0847753854767383 0,010452429999237 0,0840314335851072 0,00143276031238152 0,0153604400173325 427972 3694577 623 665 0 True 335 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 382 598 0,0106420288571862 0,0832327557277263 0,0106355382619974 0,0798046845197223 0,00135344340525134 0,0229054424943108 434496 3627348 623 665 0 True 379 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 424 592 0,0110391308186808 0,0107116956960954 0,0109712367437247 0,0106660563057908 0,0019930898502746 0,0018650881852916 450709 466824 623 665 0 False 424 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 468 592 0,0107610884164797 0,0106723664276278 0,0107423514152743 0,0107118333714809 0,00215290736435327 0,0018274667304518 439357 465110 623 665 0 False 468 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 512 592 0,0106055100744447 0,0106397832530514 0,010605020218204 0,0107881284809644 0,0020262738913918 0,00206265907216109 433005 463690 623 665 0 False 512 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 556 592 0,0103733916948058 0,0103591778714353 0,0103913939116503 0,010406652933547 0,00181379686403217 0,00171822133071641 423528 451461 623 665 0 False 556 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 600 592 0,0105371016504359 0,0104717733909046 0,010605020218204 0,0105134660868238 0,00165534769804644 0,00168567562042405 430212 456368 623 665 0 False 600 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 645 592 0,0106690444288589 0,0102522499886705 0,0106965743495842 0,0102845807583734 0,00166302205080852 0,00159685430113073 435599 446801 623 665 0 False 645 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 249 642 0,0100777634535649 0,044299992370489 0,0100404364080262 0,0442053864347295 0,00133102812874807 0,00858476705504162 411458 1930628 623 665 0 True 247 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 291 636 0,0100099183642329 0,00990923176561224 0,0100251773861295 0,00993362325474937 0,00138827852839001 0,00134970473517049 408688 431852 623 665 0 False 291 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 335 635 0,0108093147633731 0,0104739532511755 0,0102388036926833 0,0104829480430304 0,00368830489017514 0,00125849303157544 441326 456463 623 665 0 False 335 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 379 635 0,0104555650791773 0,0103407064238761 0,0101472495613031 0,0103150988021668 0,00216266445036417 0,00133693163872926 426883 450656 623 665 0 False 379 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 424 635 0,0100313005891379 0,0102977975953847 0,0100099183642329 0,0102845807583734 0,00156123327462999 0,00146560055581849 409561 448786 623 665 0 False 424 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 468 635 0,0101760041226301 0,0103182194442389 0,0102082856488899 0,0103761348897536 0,00179821856186328 0,00178197266643837 415469 449676 623 665 0 False 468 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 512 635 0,0103751061916482 0,010292588876632 0,010452429999237 0,0102388036926833 0,00180197580979867 0,00187212994206227 423598 448559 623 665 0 False 512 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 556 635 0,0103184053317913 0,0103746434064103 0,0103608758678569 0,0103150988021668 0,00180757453712349 0,00165532346762281 421283 452135 623 665 0 False 556 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 600 635 0,0102171275540339 0,0101871983690056 0,0102235446707866 0,0101167315175097 0,00140892562984381 0,0013538506975063 417148 443966 623 665 0 False 600 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 647 639 0,0101989293946932 0,0449609718964383 0,0101777676050965 0,0451514457923247 0,00138861712068976 0,00978258362332309 416405 1959434 623 665 0 True 645 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B4_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B4_2.csv new file mode 100755 index 0000000..3597228 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B4_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 246 245 0,0115482873952274 0,703413030172134 0,0112764171816587 0,705989166094453 0,00335791937406676 0,205418638835729 471497 30655285 623 665 11 True 246 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 291 245 0,00741872580799031 0,00740615558121672 0,0072632944228275 0,00749217975127794 0,00180699578746037 0,00145466069903015 302894 322766 623 665 0 False 291 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 335 245 0,00699338363422141 0,00719101484542209 0,00695811398489357 0,00715648126955062 0,00141846164325189 0,0013650753093213 285528 313390 623 665 0 True 335 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 379 244 0,00791039451674518 0,00721554400994475 0,0072327763790341 0,00721751735713741 0,00257031772944672 0,00132752565780943 322968 314459 623 665 0 True 379 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 424 244 0,00777509622307367 0,00707745559825405 0,0072480354009308 0,00712596322575723 0,00258852438795613 0,00160872127072333 317444 308441 623 665 0 True 423 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 467 243 0,00694721468353878 0,00719741675084943 0,00694285496299687 0,00714122224765393 0,00162711544333955 0,00152215143851926 283643 313669 623 665 0 True 468 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 511 242 0,00808402406124869 0,0101885292310658 0,00782787823300526 0,010406652933547 0,00229512339655255 0,00276968238129762 330057 444024 623 665 0 True 512 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 555 242 0,0094701212798327 0,0113707248207495 0,00924696726939803 0,0113374532692454 0,00258154735494631 0,00184369560339645 386649 495545 623 665 0 True 556 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 600 245 0,0106052651463243 0,0132754867255114 0,0103150988021668 0,0131380178530556 0,00322042248890813 0,00304725276088396 432995 578556 623 665 0 False 600 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 642 242 0,0114542349970198 0,713118502367156 0,0112916762035554 0,725261310749981 0,00339880240368033 0,213116551315658 467657 31078257 623 665 11 True 644 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 246 289 0,0100215769427607 0,0103246213496662 0,00888075074387732 0,0105745021744106 0,00391739888312446 0,00297579513935792 409164 449955 623 665 0 False 246 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 291 289 0,00736141262783258 0,00745578755770176 0,00709544518196384 0,00737010757610437 0,00186009503068835 0,00163810371788379 300554 324929 623 665 0 False 291 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 335 289 0,00735435869796701 0,00703112783102182 0,0072632944228275 0,00704966811627375 0,00149221388449085 0,00135512706318434 300266 306422 623 665 0 True 335 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 379 289 0,00934062778261307 0,0109775468655617 0,00869764248111696 0,0110170138094148 0,00285248637474498 0,00216861982084213 381362 478410 623 665 0 True 379 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 423 288 0,00888665351157732 0,00933090336277866 0,0085145342183566 0,00923170824750134 0,00275998613337825 0,00232941349691053 362827 406648 623 665 0 True 423 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 467 288 0,00777781492520936 0,00725333590327386 0,00764476997024491 0,00729381246662089 0,00177106120626973 0,00184294782434134 317555 316106 623 665 0 True 468 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 512 288 0,00924750611126276 0,00784543184466086 0,00886549172198062 0,00778210116731518 0,00256514547962234 0,00178918371347082 377560 341910 623 665 0 True 512 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 556 286 0,00914199107702365 0,00841914812207906 0,00917067215991455 0,00839246204318303 0,00190857760262029 0,00162913980900984 373252 366913 623 665 0 True 556 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 600 289 0,00966983566915158 0,00846503991725709 0,00970473792629892 0,00840772106507973 0,0021295124649188 0,0019560943744545 394803 368913 623 665 0 False 600 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 644 289 0,0094921648106626 0,00886110905554112 0,00950637064164187 0,00888075074387732 0,00221262853010485 0,00218721648616056 387549 386174 623 665 0 False 644 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 247 334 0,00821704452340111 0,00677796574292219 0,00790417334248875 0,00674448767833982 0,0023910549122899 0,00158593804777128 335488 295389 623 665 0 True 247 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 292 334 0,00736868699300644 0,00649641957950495 0,0072327763790341 0,00653086137178607 0,00183030896077726 0,00137951896266561 300851 283119 623 665 0 True 291 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 336 334 0,00711726827748544 0,00641558118229885 0,00708018616006714 0,0063782711528191 0,00162807453720405 0,00120785823177542 290586 279596 623 665 0 True 335 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 380 334 0,00724641887533661 0,00665222222413438 0,00706492713817044 0,00659189745937285 0,00166422943002552 0,00123412821150689 295859 289909 623 665 0 True 379 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 424 333 0,00849562576746696 0,00958000402700503 0,00854505226215 0,00958266575112535 0,00192177089515302 0,0017425671564331 346862 417504 623 665 0 True 423 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 468 331 0,00886402215325863 0,0103500224582973 0,00881971465629053 0,0103761348897536 0,00200020725866051 0,00161101915451883 361903 451062 623 665 0 True 468 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 512 331 0,00949605916777588 0,00964613410385657 0,00955214770733196 0,00965896086060884 0,0020003913226666 0,00171190912431315 387708 420386 623 665 0 True 512 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 556 331 0,00933790908047738 0,00933608913563378 0,00933852140077821 0,00927748531319142 0,00179023969703589 0,00137915420292462 381251 406874 623 665 0 True 556 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 600 331 0,00896150354515085 0,00914807045078937 0,00900282291905089 0,00914015411612116 0,0019347768819789 0,00211449831491481 365883 398680 623 665 0 True 600 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 645 330 0,00882615626585527 0,00936461088633692 0,00875867856870375 0,00947585259784848 0,00198103358935482 0,0019132371949279 360357 408117 623 665 0 True 644 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 249 378 0,00734730476810144 0,00831804849730185 0,00733958953231098 0,00843823910887312 0,00181406902432949 0,00161453629716417 299978 362507 623 665 0 True 247 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 291 378 0,00723975683046357 0,00687073600687459 0,0072480354009308 0,00672922865644312 0,00171933606934777 0,00157208968711027 295587 299432 623 665 0 True 291 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 335 377 0,00741279854747828 0,00791351232280748 0,00744640268558785 0,00796520943007553 0,00188038509131495 0,00182426781680574 302652 344877 623 665 0 True 335 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 380 377 0,00841406470339633 0,00898889475921436 0,00839246204318303 0,00906385900663768 0,00169529601592252 0,00139819032452573 343532 391743 623 665 0 True 379 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 423 376 0,00866812864261693 0,00841040573509764 0,00872816052491035 0,00845349813076982 0,00167550968480564 0,00155593001558444 353905 366532 623 665 0 True 423 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 468 376 0,00828648164551529 0,00785527563472655 0,00823987182421607 0,00778210116731518 0,00173845479363244 0,00180699140105113 338323 342339 623 665 0 True 468 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 512 375 0,00803009088915153 0,00806568951561784 0,0080872816052491 0,00805676356145571 0,00163921616546087 0,00172538315319211 327855 351509 623 665 0 True 512 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 556 375 0,00799087789708635 0,00815717480930525 0,0081025406271458 0,00813305867093919 0,00180481913461997 0,00157422251541793 326254 355496 623 665 0 True 556 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 600 375 0,00778268899480397 0,00746035379132198 0,00781261921110857 0,00753795681696803 0,00195482754594725 0,00201938388545647 317754 325128 623 665 0 True 600 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 644 375 0,00763965097252996 0,00707539046747104 0,0076600289921416 0,00701915007248035 0,00187492315335162 0,00184721209077901 311914 308351 623 665 0 True 645 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 248 422 0,00720039688152619 0,00720315322524668 0,0072327763790341 0,0072632944228275 0,001560391973525 0,00151566180385488 293980 313919 623 665 0 True 247 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 291 421 0,00764954606859139 0,00757935121621862 0,0076752880140383 0,00764476997024491 0,00156784930678203 0,00147733671660226 312318 330314 623 665 0 True 291 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 335 421 0,00805850255111007 0,00776762230593651 0,0080872816052491 0,00779736018921187 0,00147152842050242 0,00137371298880634 329015 338519 623 665 0 True 335 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 380 422 0,00794657040011825 0,0080386133564628 0,00796520943007553 0,00804150453955901 0,00141330437371924 0,00135095379571774 324445 350329 623 665 0 True 379 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 424 421 0,00780982703053678 0,00808971387039354 0,00778210116731518 0,00801098649576562 0,00158237288431772 0,00157961876641444 318862 352556 623 665 0 True 423 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 468 419 0,00785633888058787 0,00778501529630898 0,00787365529869535 0,00784313725490196 0,00165485096532544 0,00148995305106397 320761 339277 623 665 0 True 468 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 512 419 0,00752176706821407 0,00765057528233493 0,00755321583886473 0,00779736018921187 0,00163122548674199 0,00162211399046737 307101 333418 623 665 0 True 512 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 556 420 0,00751449270304021 0,00726822779080914 0,00755321583886473 0,0072480354009308 0,00172350914772991 0,00153212179066006 306804 316755 623 665 0 True 556 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 601 420 0,00742004841984011 0,00716499419755615 0,00735484855420768 0,00709544518196384 0,00186165242796006 0,00186040145801126 302948 312256 623 665 0 True 600 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 645 419 0,00684549603516482 0,00678241724705446 0,00691233691920348 0,00675974670023652 0,0017164380317894 0,0018211243841547 279490 295583 623 665 0 True 645 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 248 465 0,00709402459886591 0,00691717850359476 0,00706492713817044 0,00695811398489357 0,00149804582030004 0,00146008412211232 289637 301456 623 665 0 True 247 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 292 466 0,00719985803966146 0,00722272607589011 0,00711070420386053 0,0072480354009308 0,00148186228422189 0,00157284845003702 293958 314772 623 665 0 True 291 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 337 465 0,00706632322845634 0,00740994165431891 0,00697337300679027 0,00743114366369116 0,00149015124609374 0,00155004487790786 288506 322931 623 665 0 True 335 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 381 465 0,00737319367042056 0,00736157170220126 0,00743114366369116 0,00732433051041428 0,00150442149168154 0,00143044314906239 301035 320823 623 665 0 True 379 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 426 465 0,00749257163627047 0,00743052412445625 0,00756847486076143 0,00747692072938125 0,00180013524306727 0,0018134075600448 305909 323828 623 665 0 True 423 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 469 464 0,00752049344198835 0,00764642207487132 0,00753795681696803 0,00758373388265812 0,00185340615201819 0,00199328403368767 307049 333237 623 665 0 True 468 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 514 463 0,00754212059501368 0,00744592082173848 0,00750743877317464 0,00756847486076143 0,00182319052881388 0,00182099347081914 307932 324499 623 665 0 True 512 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 558 463 0,00710450752241613 0,00705932833915872 0,00715648126955062 0,00714122224765393 0,00187127830955628 0,00175330693021548 290065 307651 623 665 0 True 556 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 601 464 0,00690168254596903 0,00662640808934674 0,00688181887541009 0,00657663843747616 0,00181919618709641 0,00180914636231375 281784 288784 623 665 0 True 600 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 646 463 0,006407687020071 0,00637652726460234 0,0064087891966125 0,0063935301747158 0,0017381543954875 0,00177954826418835 261615 277894 623 665 0 True 645 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 249 510 0,00731007569381095 0,00714640802050904 0,00732433051041428 0,00714122224765393 0,00150531751660093 0,00154423904458039 298458 311446 623 665 0 True 247 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 293 510 0,00716461288314565 0,00672044037766653 0,00720225833524071 0,00671396963454643 0,00156242584343648 0,00149438524600937 292519 292882 623 665 0 True 291 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 337 510 0,00728656259425906 0,0074818311514653 0,00732433051041428 0,00752269779507134 0,00145302435835319 0,00142270668603754 297498 326064 623 665 0 True 335 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 382 510 0,00731399454373626 0,0070702505864111 0,00733958953231098 0,00708018616006714 0,00147990633282058 0,0013492796529516 298618 308127 623 665 0 True 379 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 426 509 0,00729579638439558 0,00756262365687623 0,00737010757610437 0,00750743877317464 0,00182977306634408 0,00169774181931604 297875 329585 623 665 0 True 424 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 470 508 0,00745176661142313 0,00751673186169819 0,00752269779507134 0,00749217975127794 0,00182452641255999 0,00163120035513986 304243 327585 623 665 0 True 468 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 514 508 0,00678063906890085 0,00681405963982972 0,0068055237659266 0,00694285496299687 0,00179608253798655 0,00172349816774176 276842 296962 623 665 0 True 512 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 558 507 0,00676792729945561 0,00705294937962898 0,00679026474402991 0,00698863202868696 0,0016574204475934 0,00201683334574857 276323 307373 623 665 0 True 556 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 602 507 0,00688488047691424 0,00685123199392393 0,00694285496299687 0,0068055237659266 0,00178202353536851 0,00174573365231408 281098 298582 623 665 0 True 600 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 647 507 0,00652777527746988 0,00655777690965799 0,00653086137178607 0,00662241550316625 0,00191166225481025 0,00200026341977547 266518 285793 623 665 0 True 645 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 250 555 0,00714656168067717 0,00715329178978575 0,00715648126955062 0,00717174029144732 0,00132450513798396 0,00135352492240961 291782 311746 623 665 0 True 247 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 294 555 0,0071034543314987 0,00706368805970064 0,00706492713817044 0,00708018616006714 0,00141984236759261 0,0012905728454705 290022 307841 623 665 0 True 291 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 337 554 0,00703578069185091 0,00734491298055163 0,00709544518196384 0,00738536659800107 0,00135848521478541 0,00141144474221253 287259 320097 623 665 0 True 335 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 382 554 0,00686638840382916 0,00729769032331343 0,00683604180972 0,00729381246662089 0,00136703849283069 0,00131378118462205 280343 318039 623 665 0 True 379 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 426 553 0,00737270381417989 0,00690891798046272 0,00729381246662089 0,00691233691920348 0,00168617868595087 0,00179417249061707 301015 301096 623 665 0 True 424 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 470 552 0,00718584815117845 0,00690614152685444 0,00717174029144732 0,00691233691920348 0,00194874297513269 0,0019660617434674 293386 300975 623 665 0 True 468 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 515 551 0,00696859690844379 0,00705923655556837 0,00685130083161669 0,00708018616006714 0,00202857414805967 0,00206542258143808 284516 307647 623 665 0 True 512 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 559 551 0,0069956614657405 0,00706680870177274 0,00701915007248035 0,00701915007248035 0,00177086820841181 0,00182030072055962 285621 307977 623 665 0 True 556 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 602 552 0,00824677879720944 0,00681178799596841 0,00698863202868696 0,00679026474402991 0,0116504643975439 0,00145774307601103 336702 296863 623 665 0 True 600 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 647 551 0,0116651670942499 0,00662200247700964 0,00721751735713741 0,00651560234988937 0,0250372328792095 0,00170100031215412 476269 288592 623 665 0 True 645 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 247 592 0,00754439842653277 0,00714080922149732 0,00752269779507134 0,00718699931334401 0,00139034665928566 0,00121854849176811 308025 311202 623 665 0 False 247 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 291 592 0,00729075086511674 0,00723185854313054 0,0072632944228275 0,0072480354009308 0,0014035682790413 0,00136161373719222 297669 315170 623 665 0 False 291 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 337 598 0,00703737272463307 0,00716375511908634 0,00701915007248035 0,00720225833524071 0,00147156354410632 0,00153106384586152 287324 312202 623 665 0 True 335 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 382 598 0,00690126616816446 0,00673982966112925 0,00686655985351339 0,00677500572213321 0,00129716655613525 0,00133376867833825 281767 293727 623 665 0 True 379 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 424 592 0,00723926697422291 0,00677179329647075 0,00718699931334401 0,00685130083161669 0,00177352493165439 0,00170249209400466 295567 295120 623 665 0 False 424 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 468 592 0,00670233554883065 0,00679072366198169 0,00671396963454643 0,00668345159075303 0,00184254498754236 0,00181530950611492 273645 295945 623 665 0 False 468 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 512 592 0,00678085950420915 0,0070334683125759 0,00677500572213321 0,00703440909437705 0,00195364893183646 0,00206072515662198 276851 306524 623 665 0 False 512 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 556 592 0,00681514944105566 0,00661078193308862 0,00685130083161669 0,00662241550316625 0,00181914316423923 0,00165565719085235 278251 288103 623 665 0 False 556 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 600 592 0,00706994816463725 0,00693698081321408 0,00704966811627375 0,00692759594110018 0,00159272681068283 0,00159195037856233 288654 302319 623 665 0 False 600 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 645 592 0,0072114676325652 0,00668983055028278 0,0072480354009308 0,00669871061264973 0,00150823898879386 0,0015130395517976 294432 291548 623 665 0 False 645 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 249 642 0,00891582445070889 0,699886589901166 0,00875867856870375 0,692790112153811 0,00167764880544006 0,196729192990816 364018 30501600 623 665 10 True 247 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 291 636 0,007826947506148 0,00714473296998505 0,00759899290455482 0,00711070420386053 0,0019484015928166 0,00125621863555105 319561 311373 623 665 0 False 291 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 335 635 0,0070020785824932 0,00728768591196462 0,00700389105058366 0,00730907148851759 0,00134613404498999 0,00119304733767924 285883 317603 623 665 0 False 335 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 379 635 0,00676491468357552 0,00691704082820923 0,00679026474402991 0,00697337300679027 0,00124994990336721 0,00124212080276286 276200 301450 623 665 0 False 379 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 424 635 0,00651065480185866 0,00659281529527641 0,00653086137178607 0,00654612039368277 0,00148129495147964 0,00158338160410692 265819 287320 623 665 0 False 424 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 468 635 0,00661834969636873 0,00686509131606769 0,00646982528419928 0,00689707789730678 0,0017907508616011 0,00165203226302425 270216 299186 623 665 0 False 468 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 512 635 0,0069513539687724 0,00680905743415531 0,00703440909437705 0,00679026474402991 0,00182562563403783 0,00175803996185299 283812 296744 623 665 0 False 512 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 556 635 0,00662199912536168 0,00655408262014615 0,00659189745937285 0,00663767452506294 0,00171373742845697 0,00164372558940146 270365 285632 623 665 0 False 556 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 600 635 0,00683849109092332 0,0069003821065596 0,00675974670023652 0,00686655985351339 0,00141568954297773 0,00130040570280815 279204 300724 623 665 0 False 600 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 647 639 0,008442574336603 0,72472873646694 0,00833142595559625 0,733989471274891 0,00154201697504344 0,21149552874701 344696 31584240 623 665 13 True 645 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B4_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B4_3.csv new file mode 100755 index 0000000..6956d46 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B4_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 246 245 0,00116318813626968 0,0704230936691695 0,000930800335698482 0,0691996643015183 0,000964338144370045 0,0231088599206991 47491 3069093 623 665 0 True 246 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 291 245 0,000995069474473653 0,000910355540946667 0,000778210116731518 0,00080872816052491 0,000774770407319107 0,00065800782086815 40627 39674 623 665 0 False 291 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 335 245 0,00090880579049265 0,000857947110853352 0,000778210116731518 0,000762951094834821 0,000639269590784229 0,0006268815357807 37105 37390 623 665 0 True 335 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 379 244 0,000904446069950736 0,000804552007163709 0,000747692072938125 0,000732433051041428 0,000673094732573321 0,000566262315872173 36927 35063 623 665 0 True 379 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 424 244 0,000995216431345852 0,000932819574686315 0,000793469138628214 0,000747692072938125 0,000823966642625356 0,000767668951294209 40633 40653 623 665 0 True 423 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 467 243 0,000879659344173117 0,000964737318232638 0,000686655985351339 0,000823987182421607 0,000827625859543135 0,000739845695039586 35915 42044 623 665 0 True 468 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 511 242 0,00103082898004215 0,00122696303587993 0,000823987182421607 0,00105287251087205 0,000862011199895684 0,00093211104284895 42087 53472 623 665 0 True 512 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 555 242 0,00107334850173183 0,00131571776775424 0,000885023270008392 0,00117494468604562 0,000845327153952306 0,000827627150568148 43823 57340 623 665 0 True 556 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 600 245 0,00117945136345974 0,00136225204806477 0,000869764248111696 0,00111390859845884 0,00108176464299367 0,00122491317346731 48155 59368 623 665 0 False 600 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 642 242 0,00131122269219846 0,0717974152593661 0,00111390859845884 0,0717936980239567 0,0010367353440038 0,0237736018634685 53535 3128987 623 665 0 True 644 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 246 289 0,00103856870864465 0,00111388565256125 0,000854505226215 0,000961318379491875 0,000802483235028235 0,000838767958674012 42403 48544 623 665 0 False 246 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 291 289 0,000976748851072804 0,000916527987398113 0,000854505226215 0,00080872816052491 0,000691879192808754 0,000660008973637475 39879 39943 623 665 0 False 291 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 335 289 0,000849165793191758 0,000945003846306083 0,000747692072938125 0,000839246204318303 0,000624742534724996 0,000664697973288756 34670 41184 623 665 0 True 335 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 379 289 0,00102982477474879 0,00109722693091162 0,000915541313801785 0,000976577401388571 0,000716484428749576 0,00070371749238485 42046 47818 623 665 0 True 379 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 423 288 0,00108784824645549 0,00104770968391452 0,000930800335698482 0,000823987182421607 0,000841920972715545 0,000868715324674582 44415 45660 623 665 0 True 423 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 467 288 0,000985590756216796 0,000886078781297487 0,000747692072938125 0,000473029678797589 0,000871597477889076 0,00091741881414275 40240 38616 623 665 0 True 468 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 512 288 0,00107087472771647 0,000897437000604051 0,000900282291905089 0,000701915007248035 0,000862511392302499 0,000815417125917352 43722 39111 623 665 0 True 512 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 556 286 0,00115691797638917 0,00105817301321512 0,00100709544518196 0,000869764248111696 0,000863762461137816 0,000805818268781365 47235 46116 623 665 0 True 556 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 600 289 0,00105951006293306 0,000989863076092612 0,000732433051041428 0,000656137941557946 0,00103953279986554 0,000996098710564578 43258 43139 623 665 0 False 600 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 644 289 0,00113298849903272 0,00109876430605009 0,000839246204318303 0,000732433051041428 0,00101442274485195 0,00105831523727354 46258 47885 623 665 0 False 644 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 247 334 0,00100498906334711 0,000867790900919041 0,000823987182421607 0,000701915007248035 0,000779582695717901 0,000717242345639943 41032 37819 623 665 0 True 247 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 292 334 0,000908977240176882 0,000812835476193344 0,000793469138628214 0,000686655985351339 0,00070966959503955 0,00062998615770708 37112 35424 623 665 0 True 291 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 336 334 0,000937535859007617 0,000889933692092442 0,000839246204318303 0,000793469138628214 0,000648204608678642 0,000653265587463843 38278 38784 623 665 0 True 335 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 380 334 0,000929624680720887 0,000912099429163433 0,00080872816052491 0,000793469138628214 0,000687482066900753 0,000653346254706765 37955 39750 623 665 0 True 379 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 424 333 0,00110800583075883 0,00110523504917019 0,000930800335698482 0,000823987182421607 0,000851918143143165 0,000947138889614525 45238 48167 623 665 0 True 423 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 468 331 0,00111746005620366 0,00113219647883729 0,000930800335698482 0,000976577401388571 0,000898661869521487 0,000828000969312424 45624 49342 623 665 0 True 468 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 512 331 0,00109010158516255 0,00107962742746085 0,000930800335698482 0,000854505226215 0,000896222377861581 0,000920298556384848 44507 47051 623 665 0 True 512 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 556 331 0,00105490541427081 0,0011449085061016 0,000839246204318303 0,00105287251087205 0,000883261399928521 0,000768990947969245 43070 49896 623 665 0 True 556 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 600 331 0,00109002810672645 0,00107935207668978 0,000717174029144732 0,000717174029144732 0,00116234349133864 0,00117682510541719 44504 47039 623 665 0 True 600 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 645 330 0,00103273941938075 0,00113281601807219 0,000701915007248035 0,00080872816052491 0,00100857087924266 0,00102106662799234 42165 49369 623 665 0 True 644 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 249 378 0,000950492556573191 0,00106941650303373 0,000793469138628214 0,000885023270008392 0,000803474582910632 0,000852910490576602 38807 46606 623 665 0 True 247 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 291 378 0,000943732540452022 0,000979353854996842 0,000762951094834821 0,000839246204318303 0,000748440856553231 0,000724064724333538 38531 42681 623 665 0 True 291 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 335 377 0,000922742200539552 0,000872311242744077 0,000778210116731518 0,000717174029144732 0,00070560988893662 0,000712020875928521 37674 38016 623 665 0 True 335 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 380 377 0,000962616498529635 0,00106246389606426 0,000839246204318303 0,000946059357595178 0,000749618896792544 0,000724599898561539 39302 46303 623 665 0 True 379 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 423 376 0,000957448515190626 0,000919763358958165 0,000701915007248035 0,000686655985351339 0,000810116803557726 0,000829023941504503 39091 40084 623 665 0 True 423 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 468 376 0,000996514550383613 0,00105392802216115 0,000717174029144732 0,000778210116731518 0,00089292670108369 0,000950359125518385 40686 45931 623 665 0 True 468 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 512 375 0,00101363502599483 0,00104098653592094 0,000717174029144732 0,000778210116731518 0,000963454184942155 0,000946271491814678 41385 45367 623 665 0 True 512 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 556 375 0,00100795269360313 0,00106934766534097 0,000747692072938125 0,000885023270008392 0,000967272306603289 0,000877639250996088 41153 46603 623 665 0 True 556 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 600 375 0,00108831360988412 0,000915633097392141 0,000717174029144732 0,000473029678797589 0,00112892633224848 0,00103328556862432 44434 39904 623 665 0 True 600 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 644 375 0,00102553853264298 0,000972217680846658 0,000732433051041428 0,000701915007248035 0,00100952673840629 0,000899675132062971 41871 42370 623 665 0 True 645 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 248 422 0,000899106636927494 0,000887730885923896 0,000778210116731518 0,000717174029144732 0,000773728788873418 0,000790038162379604 36709 38688 623 665 0 True 247 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 291 421 0,000983508867193972 0,000968523391334826 0,000839246204318303 0,000854505226215 0,000786563780996452 0,000751003637615968 40155 42209 623 665 0 True 291 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 335 421 0,000872189036502985 0,000907097223489027 0,000732433051041428 0,00080872816052491 0,000668585891262845 0,000675395466554334 35610 39532 623 665 0 True 335 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 380 422 0,000963816646319263 0,000901337803194184 0,000823987182421607 0,000793469138628214 0,000741008730629556 0,000696824712831197 39351 39281 623 665 0 True 379 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 424 421 0,000927371342013831 0,000995484821001921 0,000717174029144732 0,000732433051041428 0,000818675199295348 0,000846000162661647 37863 43384 623 665 0 True 423 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 468 419 0,00103874015832888 0,00102451138145203 0,000839246204318303 0,00080872816052491 0,000923771988988757 0,000814292601388974 42410 44649 623 665 0 True 468 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 512 419 0,0010795941688003 0,000975453052406709 0,000839246204318303 0,000732433051041428 0,000935719514141398 0,000900221306152873 44078 42511 623 665 0 True 512 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 556 420 0,000920709297140795 0,000904504337061468 0,000671396963454643 0,000717174029144732 0,000868014590472862 0,000772461880981223 37591 39419 623 665 0 True 556 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 601 420 0,00100148659122636 0,000902255639097744 0,000701915007248035 0,000488288700694286 0,00101381759359852 0,000978169924632727 40889 39321 623 665 0 True 600 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 645 419 0,000937168466827119 0,000928781096710648 0,000564583810177768 0,000549324788281071 0,000976494254851001 0,00094682927792832 38263 40477 623 665 0 True 645 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 248 465 0,000971923767102259 0,000919923980241288 0,000839246204318303 0,000778210116731518 0,000804212353919952 0,000749344491992896 39682 40091 623 665 0 True 247 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 292 466 0,000887790957768146 0,00092990544569251 0,000701915007248035 0,000762951094834821 0,000817238194818242 0,000782025017779367 36247 40526 623 665 0 True 291 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 337 465 0,000977091750441269 0,000898928483947337 0,000885023270008392 0,000778210116731518 0,000798994763363257 0,000762494280887058 39893 39176 623 665 0 True 335 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 381 465 0,000953946043069875 0,000971919384178001 0,00080872816052491 0,000854505226215 0,000808460213997936 0,000807339831250244 38948 42357 623 665 0 True 379 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 426 465 0,00100053137155706 0,000954939419962128 0,000686655985351339 0,00064087891966125 0,000996581897621984 0,000975923544127015 40850 41617 623 665 0 True 423 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 469 464 0,00100043340030893 0,000989312374550476 0,00064087891966125 0,000610360875867857 0,00101100988760197 0,00101970897906924 40846 43115 623 665 0 True 468 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 514 463 0,00104545118882599 0,000966045234395212 0,000762951094834821 0,000610360875867857 0,000955830835091502 0,000964145525074716 42684 42101 623 665 0 True 512 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 558 463 0,000898322866942431 0,000936261459324668 0,000579842832074464 0,000595101853971161 0,000984323479281723 0,000976987620335998 36677 40803 623 665 0 True 556 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 601 464 0,000920439876208429 0,000883371165381983 0,000503547722590982 0,000503547722590982 0,000991890832488647 0,000889236907431735 37580 38498 623 665 0 True 600 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 646 463 0,000951766182798919 0,000952530100715281 0,000610360875867857 0,000625619897764553 0,000977483188341223 0,00094855982349326 38859 41512 623 665 0 True 645 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 249 510 0,000854554211839066 0,000970106658268468 0,000686655985351339 0,000869764248111696 0,000735194510924325 0,000727510007373916 34890 42278 623 665 0 True 247 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 293 510 0,000945814429474846 0,000844386085378243 0,000839246204318303 0,000732433051041428 0,000754968233115774 0,00069840111295242 38616 36799 623 665 0 True 291 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 337 510 0,00078279027258173 0,000924742618734981 0,000610360875867857 0,000854505226215 0,000751630508796566 0,00074232175516001 31960 40301 623 665 0 True 335 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 382 510 0,000794620300793775 0,000961524892570176 0,000610360875867857 0,000839246204318303 0,000778888045242221 0,000739978018842954 32443 41904 623 665 0 True 379 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 426 509 0,000993501934503526 0,00096446196746157 0,000656137941557946 0,000518806744487678 0,00099187967624297 0,000996593837644562 40563 42032 623 665 0 True 424 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 470 508 0,000968347816545409 0,000977403453701776 0,000625619897764553 0,000732433051041428 0,000987688802467396 0,000843089613359142 39536 42596 623 665 0 True 468 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 514 508 0,00083625808125025 0,000963544131558009 0,000518806744487678 0,000717174029144732 0,000861005672330948 0,000898914192433354 34143 41992 623 665 0 True 512 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 558 507 0,000912847104478131 0,00100620055517599 0,000610360875867857 0,000732433051041428 0,000896921245357245 0,000954739113748802 37270 43851 623 665 0 True 556 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 602 507 0,000858913932380979 0,000876808638671524 0,000503547722590982 0,000595101853971161 0,000909323517311998 0,00092738496237636 35068 38212 623 665 0 True 600 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 647 507 0,00096531070785329 0,000887363751562472 0,000610360875867857 0,000457770656900893 0,000972363266860753 0,000991554917463696 39412 38672 623 665 0 True 645 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 250 555 0,000891170965828731 0,000905559848350563 0,000762951094834821 0,000747692072938125 0,000698602759061362 0,000715398027063292 36385 39465 623 665 0 True 247 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 294 555 0,000907164772086424 0,000968729904413127 0,00080872816052491 0,000854505226215 0,00070318276489985 0,000730894086408157 37038 42218 623 665 0 True 291 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 337 554 0,000882059639752373 0,00086033348420261 0,000793469138628214 0,000701915007248035 0,000693224698688367 0,000738994152092527 36013 37494 623 665 0 True 335 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 382 554 0,00087108685996149 0,00101739815319943 0,000686655985351339 0,000915541313801785 0,000730458032932791 0,000743314583722226 35565 44339 623 665 0 True 379 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 426 553 0,000867021053163975 0,000929308852355196 0,000610360875867857 0,000610360875867857 0,00087174009172662 0,000955319093108103 35399 40500 623 665 0 True 424 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 470 552 0,000994702082293154 0,000904802633730125 0,000671396963454643 0,000442511635004196 0,00103544487447959 0,00103690067963428 40612 39432 623 665 0 True 468 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 515 551 0,000937143974015086 0,000883187598201271 0,000534065766384375 0,000457770656900893 0,00101807321179286 0,00102871966936757 38262 38490 623 665 0 True 512 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 559 551 0,000977238707313468 0,000898102431634132 0,000671396963454643 0,000518806744487678 0,000958160780187034 0,000921771235738292 39899 39140 623 665 0 True 556 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 602 552 0,00108099025908619 0,000955031203552484 0,000778210116731518 0,000732433051041428 0,00141965773300847 0,000793257104271577 44135 41621 623 665 0 True 600 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 647 551 0,00144637402899777 0,00101854544807888 0,000823987182421607 0,000732433051041428 0,00245412859746211 0,000986158458256677 59053 44389 623 665 0 True 645 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 247 592 0,000970111299011801 0,000945095629896439 0,000839246204318303 0,000854505226215 0,000699732319954403 0,000630444654160238 39608 41188 623 665 0 False 247 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 291 592 0,0009269059785852 0,000869374167852683 0,000778210116731518 0,000762951094834821 0,000736504995270593 0,000729153183848534 37844 37888 623 665 0 False 291 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 337 598 0,000917157839395978 0,000976393834207859 0,000839246204318303 0,000793469138628214 0,000700524196842688 0,000872634372627968 37446 42552 623 665 0 True 335 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 382 598 0,000885733561557356 0,000917973578946221 0,000747692072938125 0,000839246204318303 0,000695872190130069 0,000651265486506731 36163 40006 623 665 0 True 379 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 424 592 0,00085298667186894 0,0009023474226881 0,000595101853971161 0,000625619897764553 0,00085487425099077 0,000863024816015257 34826 39325 623 665 0 False 424 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 468 592 0,000969180572154538 0,000976256158822325 0,000518806744487678 0,000656137941557946 0,00106333128293214 0,000978063040979707 39570 42546 623 665 0 False 468 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 512 592 0,000958673155792287 0,000908772274013025 0,000518806744487678 0,000488288700694286 0,00107382759248883 0,00105285474184108 39141 39605 623 665 0 False 512 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 556 592 0,000926881485773166 0,000915633097392141 0,000595101853971161 0,000595101853971161 0,000941986146883161 0,000929503737207546 37843 39904 623 665 0 False 556 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 600 592 0,0009992332525193 0,00100236859027863 0,000747692072938125 0,000717174029144732 0,000869928937041881 0,000856794329588535 40797 43684 623 665 0 False 600 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 645 592 0,000999380209391499 0,00100211618540515 0,000793469138628214 0,000823987182421607 0,000837755880715325 0,000779957260408851 40803 43673 623 665 0 False 645 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 249 642 0,000963620703822997 0,0696068392542354 0,000823987182421607 0,0675669489585718 0,000681517438701445 0,0217709831717792 39343 3033520 623 665 0 True 247 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 291 636 0,00097976146695289 0,000914623477898225 0,000854505226215 0,000793469138628214 0,00067112550405862 0,000662118401341975 40002 39860 623 665 0 False 291 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 335 635 0,000974471019553714 0,000878391905605167 0,000869764248111696 0,000747692072938125 0,000701590702982368 0,000683520639614217 39786 38281 623 665 0 False 335 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 379 635 0,000982553647524677 0,000892824875188658 0,000885023270008392 0,000747692072938125 0,000673462437185348 0,000657854814109067 40116 38910 623 665 0 False 379 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 424 635 0,000939936154586873 0,000968546337232415 0,000732433051041428 0,000701915007248035 0,000852831883169591 0,0008655729215416 38376 42210 623 665 0 False 424 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 468 635 0,000870058161856095 0,000916734500476414 0,000579842832074464 0,000579842832074464 0,00089248278441561 0,000907478172976593 35523 39952 623 665 0 False 468 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 512 635 0,000923574956148682 0,000924375484373557 0,000549324788281071 0,000534065766384375 0,000960214074414948 0,000945749556732023 37708 40285 623 665 0 False 512 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 556 635 0,000940156589895172 0,00102189554912688 0,000686655985351339 0,000793469138628214 0,000927353470815259 0,000897179716046241 38385 44535 623 665 0 False 556 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 600 635 0,000958869098288553 0,000940712963456937 0,00080872816052491 0,000823987182421607 0,000727284720334643 0,000669169959170623 39149 40997 623 665 0 False 600 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 647 639 0,00119715966655976 0,0733148045210302 0,00108339055466545 0,0723125047684443 0,000796332113916053 0,023938034062843 48878 3195116 623 665 0 True 645 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B5_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B5_1.csv new file mode 100755 index 0000000..45f1eb5 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B5_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 260 272 0,0107256282593425 0,0474927075069225 0,0106965743495842 0,046997787441825 0,00166067157810447 0,0082546723481453 468837 2069769 667 665 0 True 259 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 304 272 0,0116995976719811 0,0116986216972966 0,0112458991378653 0,0113527122911421 0,00227891161341383 0,00205211059146964 511411 509835 667 665 0 False 304 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 348 273 0,0121963280204713 0,0686903112668373 0,0119783321889067 0,0671091783016709 0,00210027844889636 0,0113369692293452 533124 2993577 667 665 0 True 348 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 392 273 0,0119981208754744 0,0886814656233167 0,0115663385976959 0,088364995803769 0,00245696397983279 0,0132844597705313 524460 3864807 667 665 0 True 392 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 437 273 0,0113544509503088 0,0736422424796255 0,0112306401159686 0,0718394750896467 0,00203157381979591 0,0114626621736784 496324 3209386 667 665 0 True 437 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 480 273 0,0110619672997102 0,0694439004354558 0,0109864957656214 0,0710002288853284 0,00192344473681584 0,0203369610619913 483539 3026419 667 665 0 True 481 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 525 273 0,0109692235594265 0,0817124523370684 0,0108644235904479 0,0787823300526436 0,00179056613161043 0,0209479412705627 479485 3561092 667 665 0 True 525 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 569 273 0,0109582654312578 0,0717294954025026 0,0108339055466545 0,0697337300679026 0,00191918530285542 0,0177884450376323 479006 3126027 667 665 0 True 570 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 614 273 0,0108839835060726 0,0107677066321101 0,0109407186999313 0,0108186465247578 0,00197894158945193 0,00180651668051801 475759 469265 667 665 0 False 614 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 657 272 0,0109344961302823 0,0472246994230828 0,0108796826123445 0,0463263904783703 0,00185596503957346 0,00782877432140541 477967 2058089 667 665 0 True 658 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 259 316 0,011265001511604 0,0117054366288805 0,0112001220721752 0,0115663385976959 0,00164803025233587 0,00174344281715035 492414 510132 667 665 0 False 259 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 304 316 0,0124087418410273 0,0130398782490674 0,0123292896925307 0,0131380178530556 0,00180853950572487 0,00156834255858116 542409 568288 667 665 0 False 304 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 348 317 0,0128306183369748 0,116734431638721 0,0128023193713283 0,11108567940795 0,0015997412375422 0,0300727973612182 560850 5087377 667 665 0 True 348 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 393 318 0,0144254263346697 0,0590690964077624 0,014023041123064 0,0567330434119173 0,0026413182975351 0,00947185808376459 630562 2574277 667 665 0 True 392 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 437 317 0,0148596564615381 0,0860682491304939 0,0148165102616922 0,0840619516289006 0,00233353694078775 0,0154029339426495 649543 3750921 667 665 0 True 437 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 481 318 0,0133186325125375 0,0474746949773151 0,0131837949187457 0,0476691844052796 0,00245170613062079 0,00838630014369116 582182 2068984 667 665 0 True 481 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 525 317 0,0112304113450256 0,0449995898420806 0,0112458991378653 0,0472571908140688 0,00163782954142223 0,00784206824384226 490902 1961117 667 665 0 True 525 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 569 318 0,0112479809534464 0,0574411538115144 0,0112458991378653 0,0566567483024338 0,001825582777161 0,0135532070379025 491670 2503330 667 665 0 True 570 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 614 316 0,0109746683078694 0,011103542789223 0,0110627908751049 0,0111390859845884 0,00201093175699993 0,00205008293147774 479723 483901 667 665 0 False 614 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 658 316 0,0107174153824896 0,0108970067650243 0,0107423514152743 0,0108644235904479 0,00206979216478902 0,0018883232672737 468478 474900 667 665 0 False 658 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 260 363 0,011932280598085 0,0613224064969014 0,0118715190356298 0,0589150835431449 0,00180323377602067 0,0105931545613897 521582 2672478 667 665 0 True 259 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 304 362 0,0126844337044112 0,073611449085061 0,0122224765392538 0,0751659418631266 0,00535259423326336 0,0191506716275808 554460 3208044 667 665 0 True 304 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 349 362 0,0117551203798421 0,0439544959904912 0,0117799649042496 0,0448157473105974 0,00138289678915986 0,0068423823348903 513838 1915571 667 665 0 True 348 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 393 362 0,014669273282791 0,0392317713487197 0,0118562600137331 0,03930724040589 0,0163258069597396 0,00507330428021262 641221 1709751 667 665 0 True 392 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 438 361 0,0125593875069789 0,0750403589656219 0,0124361028458076 0,0714274814984359 0,00202039910802791 0,0133082856900929 548994 3270317 667 665 0 True 437 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 482 362 0,0141225793603542 0,038937467266243 0,013824673838407 0,039658197909514 0,00266825571473786 0,00549992900745608 617324 1696925 667 665 0 True 481 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 526 362 0,0131546952547988 0,0376606198490045 0,0128328374151217 0,0373693446250095 0,00282304834907187 0,00610331687315349 575016 1641279 667 665 0 True 525 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 570 361 0,0124906418386138 0,0552198991413071 0,0119172961013199 0,0555733577477684 0,00307792683453576 0,00812195479360584 545989 2406526 667 665 0 True 570 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 614 361 0,0107929784249555 0,0602968166582627 0,0107881284809644 0,0609140154116121 0,00216783469923 0,0112507594337922 471781 2627782 667 665 0 True 614 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 658 362 0,0106316720330611 0,0718739857196206 0,0106507972838941 0,0702220187685969 0,00187754877924105 0,0205769109740872 464730 3132324 667 665 0 True 658 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 261 406 0,0111478021575159 0,0509575380428641 0,0111848630502785 0,0531319142442969 0,00153202159440132 0,0107830514922598 487291 2220769 667 665 0 True 259 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 305 406 0,0121541884127746 0,0401096584445779 0,0114137483787289 0,0370794232089723 0,00629290318528515 0,00950468237121784 531282 1748010 667 665 0 True 303 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 350 406 0,0114413381544522 0,0963188470145379 0,0114290074006256 0,0904859998474098 0,00139934209281194 0,0199726602956289 500122 4197650 667 665 0 True 348 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 393 405 0,011320752990408 0,0734873806167972 0,0112916762035554 0,0703746089875639 0,00152781752182885 0,0163282167226026 494851 3202637 667 665 0 True 392 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 438 405 0,01146144712034 0,0483076310597964 0,0115053025101091 0,0485694666971847 0,00159210771623634 0,00818846086660785 501001 2105284 667 665 0 True 436 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 482 406 0,0119779432783036 0,0589304114027343 0,0119020370794232 0,0576180666819257 0,00180098510165338 0,01132615167647 523578 2568233 667 665 0 True 481 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 526 406 0,0123122920114674 0,0477157416314877 0,0122682536049439 0,0482337682154574 0,00187635561720707 0,00728521325305498 538193 2079489 667 665 0 True 525 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 570 406 0,0135139342665586 0,0586491176441906 0,013321126115816 0,0566872663462272 0,00233630751131046 0,00908817417197045 590719 2555974 667 665 0 True 569 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 614 405 0,0137609153765987 0,051865254805588 0,0131074998092622 0,0510566872663462 0,00347997104151865 0,0101339230100808 601515 2260328 667 665 0 True 614 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 658 405 0,0120296912656055 0,0959352145527472 0,011612115663386 0,0905317769130999 0,00278085644700916 0,018326291277897 525840 4180931 667 665 0 True 658 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 261 450 0,0108088551283983 0,045993261937173 0,0107423514152743 0,0456244754711223 0,00155887258319782 0,00652421083614202 472475 2004422 667 665 0 True 259 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 305 450 0,0109510820236483 0,0675400563665974 0,0109407186999313 0,0664530403601129 0,00159220922050039 0,0109962488044406 478692 2943448 667 665 0 True 303 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 350 450 0,0112044687200918 0,03841214388684 0,0111390859845884 0,0386358434424353 0,00154451470608154 0,00412710244744697 489768 1674031 667 665 0 True 348 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 393 449 0,0112758910084898 0,0596468282172586 0,0113221942473487 0,0570382238498512 0,00158552985382973 0,0126933598043007 492890 2599455 667 665 0 True 392 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 437 449 0,0116503890421464 0,101447691097737 0,0116273746852827 0,10106050202182 0,00201573646871972 0,016620735722167 509260 4421169 667 665 0 True 436 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 482 450 0,0115457492128278 0,065802317650386 0,0114900434882124 0,0641489280537118 0,0018334098088737 0,0135999785068959 504686 2867716 667 665 0 True 481 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 526 449 0,0114777127343858 0,0598371644377595 0,011459525444419 0,0565194171053635 0,0018271610533973 0,0108761974614394 501712 2607750 667 665 0 True 525 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 570 449 0,0116289989589778 0,0346752897349806 0,0115663385976959 0,0347142748149844 0,00192184474356767 0,00406484536908883 508325 1511176 667 665 0 True 569 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 614 449 0,0133287441882172 0,0473121921305897 0,0130922407873655 0,045990691996643 0,0028316204374668 0,00805671634375484 582624 2061902 667 665 0 True 614 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 658 448 0,0143844305816879 0,0813192284900854 0,0144197756923781 0,0813305867093919 0,00299189327440565 0,0129373970815295 628770 3543955 667 665 0 True 658 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 260 494 0,0106896654671062 0,0568361163838872 0,0106813153276875 0,0575722896162356 0,00152218370700768 0,0142899749795612 467265 2476962 667 665 0 True 259 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 304 494 0,0107866643469293 0,0601492515908678 0,0108033875028611 0,0590371557183185 0,00147024139570711 0,00898826897112207 471505 2621351 667 665 0 True 303 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 348 493 0,0119330584192912 0,0753735104527168 0,0113527122911421 0,0750896467536431 0,00479415777465714 0,0188301656701492 521616 3284836 667 665 0 True 348 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 393 493 0,0114153955295184 0,100037160881145 0,0114747844663157 0,0923933775844968 0,0017321309130348 0,0237928501761198 498988 4359697 667 665 0 True 392 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 437 493 0,0119403104581836 0,106712489624152 0,0115663385976959 0,103227283131151 0,00244003477630772 0,0311976143526732 521933 4650613 667 665 0 True 436 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 482 494 0,0114439690202964 0,0541974299447405 0,0113832303349355 0,0533455405508507 0,00187691025904686 0,0100607177161749 500237 2361966 667 665 0 True 481 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 526 494 0,0115288887943302 0,0447162309527538 0,0113527122911421 0,045990691996643 0,00199332158324049 0,00596386279285175 503949 1948768 667 665 0 True 525 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 569 493 0,0113296521800899 0,104059140756446 0,011306935225452 0,101197833218891 0,00184068988809024 0,0176659389794886 495240 4534978 667 665 0 True 569 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 613 493 0,0114489791039477 0,0697899245710982 0,0114290074006256 0,070267795834287 0,0019913102135336 0,0197262850994032 500456 3041499 667 665 0 True 614 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 657 493 0,0110519928865963 0,0801355873088535 0,011108567940795 0,0765239948119326 0,00192151908696738 0,0125974945140468 483103 3492371 667 665 0 True 658 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 261 539 0,0106629450209663 0,0568083059560093 0,0106355382619974 0,0588235294117647 0,00152574504680889 0,0116315504193898 466097 2475750 667 665 0 True 259 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 304 538 0,0107421683985199 0,105915601546783 0,010757610437171 0,0994583047226673 0,00163088189076221 0,0268100472270411 469560 4615884 667 665 0 True 303 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 349 538 0,0110657648973636 0,0611716519497416 0,0110627908751049 0,0625162127107652 0,00155978051039731 0,0118268688867477 483705 2665908 667 665 0 True 348 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 393 538 0,0113060201416801 0,0656734534895261 0,0113984893568322 0,0625162127107652 0,00166459439491331 0,0116759930309381 494207 2862100 667 665 0 True 392 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 437 537 0,0113960186306481 0,0623312458303002 0,0114442664225223 0,0619668879224842 0,00191842462182135 0,00828459098973911 498141 2716444 667 665 0 True 436 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 481 538 0,0114436029867877 0,0686274165615458 0,0113984893568322 0,0663614862287327 0,001943064401973 0,0150529967239392 500221 2990836 667 665 0 True 481 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 525 538 0,0113302698616359 0,0796834154509643 0,0113527122911421 0,076600289921416 0,0019821699719102 0,0188517774722946 495267 3472665 667 665 0 True 525 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 570 538 0,0110950933322535 0,06479354715468 0,0110475318532082 0,0628366521705959 0,00179744777842599 0,0150469672211333 484987 2823753 667 665 0 True 569 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 614 538 0,0111208071862444 0,0462177187073888 0,0110627908751049 0,0455786984054322 0,00174081253875364 0,00552669319752629 486111 2014204 667 665 0 True 614 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 658 538 0,0108366736750645 0,0691143285083847 0,0109102006561379 0,0664377813382162 0,00183904115002865 0,0154081215875931 473691 3012056 667 665 0 True 658 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 261 583 0,0102605369322663 0,0500079450170402 0,0103150988021668 0,0513313496604868 0,00129617066108964 0,00926437237770032 448507 2179385 667 665 0 True 259 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 305 582 0,0105205122318676 0,055708990948417 0,0105439841306172 0,0560769054703594 0,00148392430502405 0,0105544517738431 459871 2427841 667 665 0 True 303 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 349 582 0,0107947628383108 0,0568607602778978 0,0107728694590677 0,0547493705653468 0,00143896446896612 0,011469938486931 471859 2478036 667 665 0 True 348 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 394 582 0,0111520572970553 0,0560169019481641 0,0111238269626917 0,0541084916456855 0,00154936201005279 0,00717600505522918 487477 2441260 667 665 0 True 392 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 438 582 0,0112197048648942 0,0967434149576275 0,0111696040283818 0,0889906157015335 0,00181669238576854 0,0210667962586356 490434 4216153 667 665 0 True 436 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 482 582 0,0116136255516096 0,0713536415999945 0,0111543450064851 0,0689250019073777 0,00336391687906152 0,0122351189309931 507653 3109647 667 665 0 True 481 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 526 582 0,0109804562127268 0,0622231706526559 0,0110170138094148 0,0611581597619593 0,00195889277047081 0,00737459968814997 479976 2711734 667 665 0 True 525 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 570 581 0,0106486697141244 0,0405747947346049 0,0106355382619974 0,0416876478217746 0,00167660565514814 0,00764209976059054 465473 1768281 667 665 0 True 569 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 614 582 0,010707692617413 0,051357691550919 0,010757610437171 0,050965133134966 0,0015238145860274 0,00647630858640616 468053 2238208 667 665 0 True 614 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 658 582 0,0108119892903171 0,0566271939863392 0,0107728694590677 0,0544899671931029 0,00164245364878541 0,00999322002904271 472612 2467857 667 665 0 True 658 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 259 620 0,0106172594636534 0,00984385890338114 0,0102235446707866 0,0097962920576791 0,00291840029886966 0,0013516889659421 464100 429003 667 665 0 False 259 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 303 620 0,010711535969255 0,0102041094955287 0,0102845807583734 0,0101930266269932 0,00287577397551681 0,00135619346923221 468221 444703 667 665 0 False 303 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 349 626 0,0105184304162865 0,082598186929902 0,0104982070649271 0,0802319371328298 0,0014335501074063 0,0123236002186607 459780 3599693 667 665 0 True 348 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 393 626 0,0105611877055292 0,08428799166605 0,0105439841306172 0,0781872281986725 0,00134243956698362 0,0230775376387569 461649 3673336 667 665 0 True 392 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 436 620 0,0112158615130521 0,0105872371475725 0,0108186465247578 0,0106813153276875 0,00333905601341795 0,00185320137393978 490266 461400 667 665 0 False 436 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 481 620 0,010937470152541 0,0108629321071046 0,0107728694590677 0,0108339055466545 0,00240107715500568 0,0020557231506879 478097 473415 667 665 0 False 481 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 525 620 0,0107456457168532 0,0104678496424169 0,0105897611963073 0,0103608758678569 0,00216904933885661 0,00192722818910512 469712 456197 667 665 0 False 525 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 569 620 0,0106852501879067 0,010514406868625 0,0106813153276875 0,0104371709773404 0,0017269758208706 0,0017820951008253 467072 458226 667 665 0 False 569 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 614 620 0,0105009523162429 0,0105004098710957 0,0105134660868238 0,0105134660868238 0,0016491000852847 0,00137682967873653 459016 457616 667 665 0 False 614 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 658 620 0,0107109869189919 0,0103782459123318 0,0106813153276875 0,0103456168459602 0,0015391814050761 0,00143070079312837 468197 452292 667 665 0 False 658 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 259 664 0,0120642585550896 0,0368688487067979 0,0104371709773404 0,0427557793545434 0,00590038055208921 0,0176680290742855 527351 1606773 667 665 0 False 259 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 303 664 0,0102122433862034 0,0101274243057862 0,0102693217364767 0,0101472495613031 0,00124252032095482 0,00133026509240228 446396 441361 667 665 0 False 303 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 348 664 0,0113117394152546 0,0103560572293632 0,0104829480430304 0,0103761348897536 0,00495932947380403 0,00129889607599319 494457 451325 667 665 0 False 348 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 392 664 0,0107872362742868 0,0103415783679845 0,0104219119554437 0,0102998397802701 0,00293111169701487 0,00125937556773153 471530 450694 667 665 0 False 392 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 436 664 0,0103328514273419 0,0103431616349181 0,0102998397802701 0,0103456168459602 0,00154753032834652 0,00149169863545898 451668 450763 667 665 0 False 436 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 481 664 0,0104088491345996 0,0104721634711636 0,0104219119554437 0,010406652933547 0,00161812783834826 0,00145074484917515 454990 456385 667 665 0 False 481 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 525 664 0,0100571366868637 0,0101151253046785 0,0101167315175097 0,0101319905394064 0,00188382688391315 0,00172323513986974 439616 440825 667 665 0 False 525 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 569 664 0,0102961794451824 0,0102094329437694 0,01025406271458 0,0101777676050965 0,00162132565030706 0,00152130749689677 450065 444935 667 665 0 False 569 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 614 664 0,010318187209897 0,0103235658383771 0,0103303578240635 0,0102845807583734 0,00133169473720644 0,00141803032320443 451027 449909 667 665 0 False 614 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 659 669 0,0105378301922511 0,0454633723241498 0,0105745021744106 0,0452582589456016 0,00146651643547722 0,00886778994390162 460628 1981329 667 665 0 True 658 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B5_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B5_2.csv new file mode 100755 index 0000000..78e10ce --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B5_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 260 272 0,00897903074098108 0,7307430627381 0,00888075074387732 0,716670481422141 0,00185750457901245 0,174995163321183 392490 31846349 667 665 11 True 259 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 304 272 0,00822685475756057 0,0081852835338518 0,00779736018921187 0,00801098649576562 0,00219826943616894 0,00197884270236796 359611 356721 667 665 0 False 304 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 348 273 0,0082731808735138 0,00948968897409466 0,00793469138628214 0,00956740672922866 0,00222115923380568 0,00167996491226351 361636 413568 667 665 0 True 348 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 392 273 0,008110158699547 0,00920086896114169 0,00758373388265812 0,00854505226215 0,00242310431617642 0,00287916570992939 354510 400981 667 665 0 True 392 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 437 273 0,00710951459495704 0,00666855970321776 0,00698863202868696 0,00663767452506294 0,00191736853090132 0,00169820087490037 310770 290621 667 665 0 True 437 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 480 273 0,00716508305700663 0,00672741593053359 0,00714122224765393 0,00668345159075303 0,00178804997888932 0,00167788961753576 313199 293186 667 665 0 True 481 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 525 273 0,00733618084526059 0,00685237928880338 0,00732433051041428 0,00686655985351339 0,00156320975820646 0,00156201187640163 320678 298632 667 665 0 True 525 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 569 273 0,00761242175890768 0,0070614623076345 0,00755321583886473 0,00709544518196384 0,00174472891449414 0,00164230384679471 332753 307744 667 665 0 True 570 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 614 273 0,00855486653560379 0,00792606372878867 0,00854505226215 0,00787365529869535 0,00206519746785027 0,00181390578177869 373949 345424 667 665 0 False 614 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 657 272 0,00974600820441233 0,745995499162188 0,00968947890440223 0,735469596398871 0,00199451466141294 0,164973341700523 426016 32511062 667 665 12 True 658 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 259 316 0,00781110932288491 0,00815276919696816 0,00785839627679866 0,00816357671473259 0,00156013103528747 0,00162466102469619 341438 355304 667 665 0 False 259 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 304 316 0,00856319379792823 0,00932321648708634 0,00857557030594339 0,00929274433508812 0,00167655840851993 0,00153422628390723 374313 406313 667 665 0 False 304 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 348 317 0,00893666236234137 0,00831453777497073 0,00889600976577401 0,00834668497749294 0,00161416695944762 0,00141208812409347 390638 362354 667 665 0 True 348 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 393 318 0,01058950954827 0,00982814096353266 0,0102845807583734 0,0097962920576791 0,00211439574975386 0,00138196044759522 462887 428318 667 665 0 True 392 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 437 317 0,0111400925767375 0,0108250025383899 0,0110170138094148 0,0109102006561379 0,00213127044137364 0,00208353596058704 486954 471762 667 665 0 True 437 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 481 318 0,00974770110939037 0,0108065540367284 0,00987258716716258 0,0108339055466545 0,00258990059732427 0,00224664407220739 426090 470958 667 665 0 True 481 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 525 317 0,00758078273749369 0,00724229892653355 0,00752269779507134 0,00720225833524071 0,00157440914822232 0,00163181259208997 331370 315625 667 665 0 True 525 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 569 318 0,00777297320669031 0,00769614583494672 0,00773632410162509 0,0076752880140383 0,00171219866143726 0,00151419600637467 339771 335404 667 665 0 True 570 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 614 316 0,00807957202447071 0,00803822327620378 0,00802624551766232 0,00805676356145571 0,0020243277284675 0,00202428735528541 353173 350312 667 665 0 False 614 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 658 316 0,00822825026031274 0,00824817823914329 0,00823987182421607 0,00830090791180285 0,00203847713236571 0,00177942662981799 359672 359462 667 665 0 False 658 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 260 363 0,00802070926084223 0,00750268897237371 0,00804150453955901 0,00743114366369116 0,00175507228478969 0,00166525387889395 350600 326973 667 665 0 True 259 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 304 362 0,00855278472002268 0,00793925761990235 0,00837720302128634 0,00794995040817884 0,0017805029016296 0,00148398805763887 373858 345999 667 665 0 True 304 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 349 362 0,00767647762294179 0,0076136553331142 0,007690547035935 0,007690547035935 0,00152751508130757 0,00139268356289642 335553 331809 667 665 0 True 348 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 393 362 0,00913255892081426 0,00807337639131016 0,00834668497749294 0,00807202258335241 0,00452543336593785 0,00138820289733857 399201 351844 667 665 0 True 392 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 438 361 0,00902524247146283 0,00921651806329741 0,00898756389715419 0,00912489509422446 0,00200911845045728 0,00194776718535582 394510 401663 667 665 0 True 437 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 482 362 0,0108086949887382 0,0100976405307157 0,0104371709773404 0,00999465934233616 0,00259126326034918 0,00188561858541125 472468 440063 667 665 0 True 481 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 526 362 0,00992589079687668 0,0123664161548297 0,00962844281681544 0,0120851453421836 0,00285139833039939 0,00344193167681526 433879 538938 667 665 0 True 525 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 570 361 0,00934659701506537 0,00919797777804548 0,0089417868314641 0,00869764248111696 0,00320684174065202 0,00307344095438847 408557 400855 667 665 0 True 570 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 614 361 0,00760844114449985 0,0074743048970561 0,00747692072938125 0,00749217975127794 0,00205294902169028 0,00198430132844187 332579 325736 667 665 0 True 614 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 658 362 0,00717878643649107 0,00726643801079719 0,00715648126955062 0,0072632944228275 0,00188839917109944 0,00182159946375281 313798 316677 667 665 0 True 658 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 261 406 0,00734713897342928 0,00707073245026046 0,00729381246662089 0,00704966811627375 0,0015553965653317 0,00148357997846764 321157 308148 667 665 0 True 259 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 305 406 0,00771461373913638 0,00733187971072107 0,00756847486076143 0,00730907148851759 0,001911854908107 0,00136370896618536 337220 319529 667 665 0 True 303 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 350 406 0,00771189136491493 0,00749709017336199 0,007690547035935 0,00750743877317464 0,00143703286419425 0,00127281889899263 337101 326729 667 665 0 True 348 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 393 405 0,00769116471748104 0,00762678038653512 0,00770580605783169 0,00761425192645151 0,00143158309454612 0,00146480989613546 336195 332381 667 665 0 True 392 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 438 405 0,00784842186368478 0,00776317080180424 0,00788891432059205 0,00773632410162509 0,00160325670289942 0,00159450973663569 343069 338325 667 665 0 True 436 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 482 406 0,00846171100762276 0,00801612637682556 0,0085297932402533 0,00802624551766232 0,00180972023373502 0,00155649970380455 369877 349349 667 665 0 True 481 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 526 406 0,00877519583078683 0,00889807489655703 0,00886549172198062 0,00891126878767071 0,00175763702976148 0,00169678778139401 383580 387785 667 665 0 True 525 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 570 406 0,0103910507552358 0,00959540072428726 0,010101472495613 0,00947585259784848 0,00261315862879115 0,00173239842164911 454212 418175 667 665 0 True 569 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 614 405 0,0103422539130984 0,0104773721899163 0,0100099183642329 0,0105592431525139 0,00360329149935243 0,00303323630135952 452079 456612 667 665 0 True 614 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 658 405 0,00798142928993274 0,00688275965721124 0,00747692072938125 0,00692759594110018 0,00278703162596271 0,00175170541931545 348883 299956 667 665 0 True 658 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 261 450 0,00683702552477481 0,00703546460566615 0,0068207827878233 0,00704966811627375 0,00146579878881478 0,00152838988555235 298859 306611 667 665 0 True 259 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 305 450 0,00711706403607535 0,00719553518724713 0,00709544518196384 0,00718699931334401 0,00142738627769206 0,00141857807789799 311100 313587 667 665 0 True 303 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 350 450 0,0073709311514991 0,00726728700900799 0,00738536659800107 0,0072327763790341 0,00142069310028474 0,0013077049534918 322197 316714 667 665 0 True 348 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 393 449 0,00754342444250523 0,0075363506041368 0,00753795681696803 0,00758373388265812 0,00141854558428636 0,00145951550904891 329737 328440 667 665 0 True 392 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 437 449 0,00773849742558339 0,00779843864639855 0,00775158312352178 0,00779736018921187 0,00170161407892971 0,00184161259532429 338264 339862 667 665 0 True 436 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 482 450 0,00771406468887323 0,00769357589441675 0,0076752880140383 0,00775158312352178 0,00179083741476842 0,00181201549110108 337196 335292 667 665 0 True 481 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 526 449 0,00758249851956604 0,00764706456000381 0,00758373388265812 0,0076752880140383 0,00168770568661231 0,0016556246763186 331445 333265 667 665 0 True 525 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 570 449 0,00775874365403702 0,00736226007912893 0,00776684214541848 0,00735484855420768 0,00198590176961536 0,00198575119572684 339149 320853 667 665 0 True 569 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 614 449 0,00942815385623737 0,00882779161224187 0,00885023270008392 0,00889600976577401 0,00312265460051646 0,00218791285096726 412122 384722 667 665 0 True 614 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 658 448 0,0106259527594866 0,0102434158180987 0,0104371709773404 0,0102235446707866 0,00331157507145901 0,00234734429557892 464480 446416 667 665 0 True 658 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 260 494 0,0068914501321095 0,00709099367783157 0,00683604180972 0,00706492713817044 0,00153493947779452 0,00134608437927052 301238 309031 667 665 0 True 259 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 304 494 0,00695916633123127 0,0071103600153967 0,00701915007248035 0,00711070420386053 0,00152596633884909 0,00142364003541468 304198 309875 667 665 0 True 303 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 348 493 0,00769708988490419 0,00720996815683062 0,00733958953231098 0,0072327763790341 0,00359721997580508 0,00152740214072027 336454 314216 667 665 0 True 348 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 393 493 0,00728779579082054 0,00733575756741361 0,00729381246662089 0,0072632944228275 0,00154058332049876 0,00159693492741578 318563 319698 667 665 0 True 392 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 437 493 0,00774959281631787 0,00800061495005539 0,00779736018921187 0,00804150453955901 0,00179019423949264 0,00214972274899832 338749 348673 667 665 0 True 436 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 482 494 0,00736280978302334 0,0074709547960081 0,00743114366369116 0,00756847486076143 0,00178084437423636 0,00180118735473729 321842 325590 667 665 0 True 481 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 526 494 0,00730534252214703 0,00717268107324847 0,0072480354009308 0,00721751735713741 0,00176695594356364 0,00154354250463659 319330 312591 667 665 0 True 525 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 569 493 0,00699551803407063 0,00703665779234077 0,00701915007248035 0,00706492713817044 0,00176390236614297 0,00184170916357631 305787 306663 667 665 0 True 569 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 613 493 0,00709503339426647 0,00714824369231616 0,00704966811627375 0,00715648126955062 0,00172732506132868 0,00169777976345263 310137 311526 667 665 0 True 614 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 657 493 0,00712431607496778 0,00697796218630807 0,00717174029144732 0,00691233691920348 0,00183081267971466 0,00186378469073964 311417 304105 667 665 0 True 658 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 261 539 0,00704312526730455 0,00689111196393364 0,00708018616006714 0,00695811398489357 0,00137615232164673 0,00148110760923623 307868 300320 667 665 0 True 259 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 304 538 0,00694086465579296 0,00719039530618719 0,00694285496299687 0,0072327763790341 0,00130034707743638 0,00144092225595032 303398 313363 667 665 0 True 303 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 349 538 0,00708803300341132 0,00703232101769645 0,00709544518196384 0,00701915007248035 0,00145091236699267 0,00138764774964909 309831 306474 667 665 0 True 348 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 393 538 0,00722174961958252 0,0073387175882026 0,00718699931334401 0,00729381246662089 0,00149636610148984 0,00142571834196393 315676 319827 667 665 0 True 392 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 437 537 0,00721072286013093 0,00711907945648052 0,0072327763790341 0,00715648126955062 0,00173094957784927 0,0019939277484993 315194 310255 667 665 0 True 436 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 481 538 0,00703475225079152 0,00706768064588113 0,00711070420386053 0,00709544518196384 0,0018707571801225 0,00184225972201818 307502 308015 667 665 0 True 481 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 525 538 0,00692109884631957 0,00699278523615057 0,00686655985351339 0,00708018616006714 0,00180495445313179 0,00183069668811624 302534 304751 667 665 0 True 525 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 570 538 0,0070175944300681 0,0071289461924438 0,00706492713817044 0,00709544518196384 0,00170336653204023 0,00166588264229203 306752 310685 667 665 0 True 569 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 614 538 0,0069730069732815 0,00710356802971035 0,00703440909437705 0,00721751735713741 0,00175018743156558 0,00159452950486316 304803 309579 667 665 0 True 614 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 658 538 0,00687502437840361 0,00699411609821074 0,00694285496299687 0,00698863202868696 0,00173493524871624 0,00189255140903775 300520 304809 667 665 0 True 658 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 261 583 0,00711241998593288 0,00702165117531756 0,00701915007248035 0,00704966811627375 0,00125479166346219 0,00120874187623537 310897 306009 667 665 0 True 259 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 305 582 0,00718679341949533 0,00726861787106815 0,0072327763790341 0,00730907148851759 0,00132386949373746 0,00139198096121429 314148 316772 667 665 0 True 303 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 349 582 0,00705067470842285 0,00703392723052768 0,00712596322575723 0,00698863202868696 0,00141626300421196 0,0014322276982173 308198 306544 667 665 0 True 348 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 394 582 0,00687724345655051 0,00716136874573708 0,00695811398489357 0,00714122224765393 0,0013862429974622 0,00130628061630979 300617 312098 667 665 0 True 392 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 438 582 0,00691682082968587 0,00720849961938492 0,0068055237659266 0,00729381246662089 0,00172376442441861 0,00195664937938858 302347 314152 667 665 0 True 436 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 482 582 0,00719342777684172 0,00724629151271404 0,00697337300679027 0,0072327763790341 0,00233700295097935 0,00200710215481224 314438 315799 667 665 0 True 481 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 526 582 0,00688101817710966 0,00733008993070913 0,00688181887541009 0,00747692072938125 0,0018795697106136 0,0018769135371831 300782 319451 667 665 0 True 525 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 570 581 0,00696893485049647 0,00707718024748298 0,00694285496299687 0,00709544518196384 0,00170234651422166 0,00177417763757063 304625 308429 667 665 0 True 569 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 614 582 0,00688440398706575 0,00713525631428078 0,00683604180972 0,00711070420386053 0,00155154604405547 0,00149305734793906 300930 310960 667 665 0 True 614 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 658 582 0,00709947155056027 0,0071684360821945 0,00715648126955062 0,00717174029144732 0,00159502075701959 0,00156119272890938 310331 312406 667 665 0 True 658 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 259 620 0,00730847668406584 0,00690132288836075 0,00730907148851759 0,00692759594110018 0,00139913496827482 0,0013078836695717 319467 300765 667 665 0 False 259 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 303 620 0,00700478325726128 0,00698365276891014 0,00698863202868696 0,00703440909437705 0,00138162660954382 0,00134611569436859 306192 304353 667 665 0 False 303 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 349 626 0,00706984571344449 0,00682541785913628 0,00711070420386053 0,00686655985351339 0,00123759984882279 0,00128117157969346 309036 297457 667 665 0 True 348 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 393 626 0,00683858116718706 0,00696341448723663 0,00685130083161669 0,00700389105058366 0,0012920877797751 0,0012630208843492 298927 303471 667 665 0 True 392 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 436 620 0,00683464630696783 0,00685644071267663 0,0068055237659266 0,00677500572213321 0,00158270360071603 0,00181090686906338 298755 298809 667 665 0 False 436 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 481 620 0,00695980688987161 0,00715955601982755 0,00695811398489357 0,00704966811627375 0,00183709209110681 0,00187365086722942 304226 312019 667 665 0 False 481 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 525 620 0,00674103323710084 0,00679870883434267 0,00686655985351339 0,00677500572213321 0,00186467180846748 0,00187751170570423 294663 296293 667 665 0 False 525 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 569 620 0,0069544994039945 0,00698608503405458 0,00694285496299687 0,00695811398489357 0,00173744066894466 0,0017031751489188 303994 304459 667 665 0 False 569 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 614 620 0,00697442535312797 0,00701283995064337 0,00694285496299687 0,00697337300679027 0,00143964173895727 0,00136090842274865 304865 305625 667 665 0 False 614 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 658 620 0,0071774138108332 0,00680171474692683 0,00717174029144732 0,00679026474402991 0,00152248117920246 0,00148766429741132 313738 296424 667 665 0 False 658 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 259 664 0,0465786104430046 0,550802527031702 0,00889600976577401 0,643732356755932 0,110318265484247 0,360979772388757 2036037 24004401 667 665 11 False 259 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 303 664 0,00809833124179499 0,00748231301531467 0,00755321583886473 0,00749217975127794 0,00287416821182726 0,00138270499717486 353993 326085 667 665 0 False 303 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 348 664 0,00698639007344577 0,00697624124398889 0,00697337300679027 0,00697337300679027 0,00135775276316533 0,00133381362932376 305388 304030 667 665 0 False 348 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 392 664 0,00675528566684843 0,00644974762380889 0,00666819256885634 0,00645456626230259 0,00138630997474361 0,00127146208802034 295286 281085 667 665 0 False 392 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 436 664 0,00656783075617147 0,00660470127022753 0,00653086137178607 0,00660715648126955 0,00148342138875428 0,00143790730900371 287092 287838 667 665 0 False 436 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 481 664 0,00660916966556777 0,00700802131214968 0,00665293354695964 0,00711070420386053 0,00166887105222762 0,00144949914327823 288899 305415 667 665 0 False 481 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 525 664 0,00657000408012977 0,0068738566489467 0,00656137941557946 0,00689707789730678 0,00173361393469606 0,00168202506423297 287187 299568 667 665 0 False 525 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 569 664 0,00684645088762554 0,00673078897747918 0,0068207827878233 0,00674448767833982 0,00147788189546661 0,00151237517498053 299271 293333 667 665 0 False 569 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 614 664 0,00716981861552629 0,00721045002067999 0,00712596322575723 0,00721751735713741 0,00133640425874255 0,0013740561527747 313406 314237 667 665 0 False 614 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 659 669 0,00880692636057801 0,730441920778141 0,00874341954680705 0,725734340428778 0,00175671067783853 0,189798663630241 384967 31833225 667 665 11 True 658 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B5_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B5_3.csv new file mode 100755 index 0000000..0ad4f72 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B5_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 260 272 0,00108508345964349 0,07288814850126 0,000915541313801785 0,0708018616006714 0,000848491448520398 0,0201394827385314 47431 3176522 667 665 0 True 259 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 304 272 0,00104271508100379 0,000931098632367139 0,000900282291905089 0,000839246204318303 0,000711663191722325 0,000627607366286443 45579 40578 667 665 0 False 304 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 348 273 0,000973420362375461 0,00103189996047569 0,000869764248111696 0,000900282291905089 0,000676617458190995 0,000721449911108808 42550 44971 667 665 0 True 348 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 392 273 0,000906779386685691 0,000961479000774998 0,000762951094834821 0,000885023270008392 0,000705626966339209 0,000650016968640643 39637 41902 667 665 0 True 392 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 437 273 0,00081895422167607 0,000814900606976356 0,000564583810177768 0,000534065766384375 0,000798917057706148 0,000837220178129452 35798 35514 667 665 0 True 437 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 480 273 0,000976737541048656 0,000849640695926128 0,000717174029144732 0,000595101853971161 0,000877011763013645 0,000841802118068772 42695 37028 667 665 0 True 481 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 525 273 0,00092810083857133 0,000912764860193514 0,000778210116731518 0,000717174029144732 0,000747937640264642 0,00082250988098669 40569 39779 667 665 0 True 525 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 569 273 0,000920368380698641 0,000916941013554715 0,000701915007248035 0,000686655985351339 0,000850989269929247 0,000847652863786699 40231 39961 667 665 0 True 570 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 614 273 0,000949651061399948 0,00102501619119899 0,00064087891966125 0,000701915007248035 0,000965867248018948 0,00102710841496722 41511 44671 667 665 0 False 614 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 657 272 0,00106424242673811 0,0747494738218859 0,000747692072938125 0,0718242160677501 0,000971596198771004 0,0198391562033255 46520 3257640 667 665 0 True 658 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 259 316 0,000980969803493767 0,00102742551044583 0,000823987182421607 0,000900282291905089 0,000748392934780665 0,00077213783231661 42880 44776 667 665 0 False 259 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 304 316 0,000954432374108208 0,0011359366601443 0,000869764248111696 0,00106813153276875 0,000659560622925182 0,000699245747399532 41720 49505 667 665 0 False 304 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 348 317 0,000988725138460753 0,0009280468279878 0,000869764248111696 0,000778210116731518 0,000673194119788999 0,00071374772253899 43219 40445 667 665 0 True 348 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 393 318 0,00106696480095956 0,000984883816315795 0,000885023270008392 0,000854505226215 0,000767207879755082 0,000691256255360815 46639 42922 667 665 0 True 392 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 437 317 0,0010860900517926 0,00117554127938294 0,000839246204318303 0,000915541313801785 0,000922947013210021 0,00101205743699217 47475 51231 667 665 0 True 437 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 481 318 0,00106561505239598 0,00123965211724665 0,000839246204318303 0,00102235446707866 0,000929331453399789 0,000971578806507976 46580 54025 667 665 0 True 481 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 525 317 0,00099833351806587 0,000936812160866804 0,000823987182421607 0,000747692072938125 0,000830823030723424 0,000830408424784584 43639 40827 667 665 0 True 525 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 569 318 0,000921123324810472 0,000929469473638319 0,000701915007248035 0,000686655985351339 0,000877951383236422 0,000814652896552555 40264 40507 667 665 0 True 570 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 614 316 0,000919659190775407 0,0010032634802846 0,000518806744487678 0,000671396963454643 0,000987049263766968 0,00106529937846416 40200 43723 667 665 0 False 614 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 658 316 0,000939425000248788 0,00097705926523794 0,000549324788281071 0,000625619897764553 0,000977532752150451 0,000974136768906165 41064 42581 667 665 0 False 658 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 260 363 0,00104813695235239 0,000980868284237717 0,000854505226215 0,000823987182421607 0,000851656519688772 0,000768683567731101 45816 42747 667 665 0 True 259 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 304 362 0,0010066836574846 0,000990207264556447 0,000930800335698482 0,000869764248111696 0,000712867142827687 0,000704506456893094 44004 43154 667 665 0 True 304 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 349 362 0,00087765684564447 0,000887684994128718 0,000762951094834821 0,000762951094834821 0,000670570943627947 0,000712991726303719 38364 38686 667 665 0 True 348 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 393 362 0,000999568881157956 0,00091193880788031 0,000823987182421607 0,000778210116731518 0,000869120987222921 0,00066732316313603 43693 39743 667 665 0 True 392 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 438 361 0,000989182680346711 0,00104626409236642 0,000732433051041428 0,000762951094834821 0,000871677964174902 0,000934694547973769 43239 45597 667 665 0 True 437 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 482 362 0,00122886599730576 0,00108075177644271 0,000991836423285267 0,000747692072938125 0,00096948584657039 0,000961973045746676 53716 47100 667 665 0 True 481 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 526 362 0,00113953094407248 0,00131608490211567 0,000869764248111696 0,00111390859845884 0,000969747824475019 0,00106879291763024 49811 57356 667 665 0 True 525 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 570 361 0,00112111488316268 0,00106785618199768 0,000885023270008392 0,000717174029144732 0,00102035729856988 0,00103834139193136 49006 46538 667 665 0 True 570 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 614 361 0,000910645615622036 0,000954709960986238 0,000503547722590982 0,000503547722590982 0,00101170767561805 0,00106448399939949 39806 41607 667 665 0 True 614 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 658 362 0,000817993383715558 0,000901452532682129 0,0004272526131075 0,000457770656900893 0,000916763866453617 0,000977247458601078 35756 39286 667 665 0 True 658 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 261 406 0,000914420336181188 0,000985985219400068 0,000793469138628214 0,000793469138628214 0,000738195286869215 0,000813887135124291 39971 42970 667 665 0 True 259 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 305 406 0,000933454078637038 0,000867446712455205 0,00080872816052491 0,000778210116731518 0,000732676514866264 0,000676929593791336 40803 37804 667 665 0 True 303 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 350 406 0,000943382737562324 0,000879608038177384 0,000793469138628214 0,000732433051041428 0,000719026986437921 0,000690128162105924 41237 38334 667 665 0 True 348 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 393 405 0,000918904246663576 0,000862926370630169 0,000701915007248035 0,000686655985351339 0,000777970902792777 0,000753704882040312 40167 37607 667 665 0 True 392 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 438 405 0,000953746061279271 0,000900901831139992 0,000717174029144732 0,000671396963454643 0,000817444783541765 0,000835914711292334 41690 39262 667 665 0 True 436 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 482 406 0,000981198574436746 0,000981005959623251 0,000717174029144732 0,000717174029144732 0,00088703433203378 0,000870140154828107 42890 42753 667 665 0 True 481 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 526 406 0,000936702626027339 0,0010696918538048 0,000686655985351339 0,000915541313801785 0,000892634294097875 0,000893804196324361 40945 46618 667 665 0 True 525 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 570 406 0,00110169223010376 0,00103446990100566 0,000885023270008392 0,000778210116731518 0,0010279443261639 0,000960059496469755 48157 45083 667 665 0 True 569 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 614 405 0,00112074884965391 0,00117237474551565 0,000701915007248035 0,000900282291905089 0,0011228157312374 0,00110836107272936 48990 51093 667 665 0 True 614 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 658 405 0,000987627037934454 0,000842412738185588 0,000625619897764553 0,000442511635004196 0,00103791778395624 0,000931525362317094 43171 36713 667 665 0 True 658 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 261 450 0,00102178253972121 0,000949661863516654 0,000869764248111696 0,000747692072938125 0,000834233015258532 0,000801354222575551 44664 41387 667 665 0 True 259 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 305 450 0,000964978714579538 0,000951015671474406 0,000823987182421607 0,000854505226215 0,000820521559605292 0,000779748410191515 42181 41446 667 665 0 True 303 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 350 450 0,00093299653675108 0,000885986997707131 0,000854505226215 0,000762951094834821 0,000754488174391624 0,000722814686325319 40783 38612 667 665 0 True 348 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 393 449 0,000889964722376738 0,000920956545632793 0,000717174029144732 0,000747692072938125 0,00078227098286149 0,000768406082491904 38902 40136 667 665 0 True 392 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 437 449 0,00095038312841748 0,000971414574431042 0,000671396963454643 0,000625619897764553 0,000922121038052508 0,00101451525073956 41543 42335 667 665 0 True 436 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 482 450 0,000948026787704797 0,00100716428287473 0,000625619897764553 0,00064087891966125 0,000987051295069457 0,0010815924935658 41440 43893 667 665 0 True 481 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 526 449 0,000924326118012177 0,000971070385967207 0,000610360875867857 0,000732433051041428 0,000963476920353544 0,000899553636577751 40404 42320 667 665 0 True 525 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 570 449 0,000991012847890543 0,0009161379071391 0,00064087891966125 0,000488288700694286 0,000969313730046691 0,000982611632604445 43319 39926 667 665 0 True 569 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 614 449 0,00111333667110139 0,00107565778717795 0,000823987182421607 0,000732433051041428 0,00102741095694859 0,00102259369622845 48666 46878 667 665 0 True 614 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 658 448 0,00115046619514688 0,00114380710301733 0,00080872816052491 0,000885023270008392 0,00107109710923222 0,00109578012636068 50289 49848 667 665 0 True 658 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 260 494 0,000910119442453184 0,000941171881408717 0,000732433051041428 0,000793469138628214 0,000750622486059611 0,000735620084761965 39783 41017 667 665 0 True 259 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 304 494 0,000822111260689179 0,000963406456172475 0,000732433051041428 0,000839246204318303 0,000723249885390009 0,000776477695954144 35936 41986 667 665 0 True 303 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 348 493 0,000974175306487292 0,000865266852184249 0,000854505226215 0,000732433051041428 0,00083553220294871 0,000773715314538821 42583 37709 667 665 0 True 348 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 393 493 0,000895363716631041 0,000910240811458722 0,000671396963454643 0,000701915007248035 0,000826573255546575 0,000798204096388313 39138 39669 667 665 0 True 392 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 437 493 0,000929221816191927 0,000894018061863287 0,00064087891966125 0,000473029678797589 0,000937587500775215 0,00101743149456017 40618 38962 667 665 0 True 436 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 482 494 0,000898154722135385 0,000973892731370656 0,000518806744487678 0,00064087891966125 0,000929533551470419 0,000950384840379824 39260 42443 667 665 0 True 481 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 526 494 0,000987444021180071 0,000920359952295479 0,000656137941557946 0,00064087891966125 0,000950321267717047 0,000842178715712619 43163 40110 667 665 0 True 525 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 569 493 0,000878983717113748 0,000918042416638988 0,000518806744487678 0,000610360875867857 0,000958862401614254 0,000939358953717857 38422 40009 667 665 0 True 569 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 613 493 0,000933385447354144 0,000867836792714219 0,000579842832074464 0,000503547722590982 0,000974904127008095 0,000892038549075546 40800 37821 667 665 0 True 614 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 657 493 0,000892321063089421 0,0010045025587544 0,000473029678797589 0,000549324788281071 0,000942283825292897 0,00104577406229114 39005 43777 667 665 0 True 658 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 261 539 0,0009197278220583 0,000935894324963244 0,000778210116731518 0,000732433051041428 0,000707165257372042 0,000771121493558537 40203 40787 667 665 0 True 259 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 304 538 0,000917508743911404 0,000914118668151266 0,000793469138628214 0,000823987182421607 0,000764475225655929 0,00072971998471533 40106 39838 667 665 0 True 303 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 349 538 0,000932150084262058 0,000905972874507165 0,000793469138628214 0,000747692072938125 0,000773215129324235 0,000765067331183264 40746 39483 667 665 0 True 348 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 393 538 0,000877153549569916 0,000906064658097521 0,000656137941557946 0,000686655985351339 0,000813139090722054 0,000823804552198912 38342 39487 667 665 0 True 392 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 437 537 0,000896233046214361 0,000829769548614039 0,000564583810177768 0,000488288700694286 0,000942211507087832 0,000943893395569082 39176 36162 667 665 0 True 436 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 481 538 0,000878617683604982 0,000859255027015926 0,000549324788281071 0,000503547722590982 0,000915786534616563 0,000943788423627709 38406 37447 667 665 0 True 481 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 525 538 0,000932927905468186 0,000947459057348108 0,000564583810177768 0,000518806744487678 0,000979313820443002 0,00100025649388744 40780 41291 667 665 0 True 525 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 570 538 0,000888866621850439 0,000919855142548521 0,000625619897764553 0,000610360875867857 0,000864118295454249 0,000904532389600135 38854 40088 667 665 0 True 569 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 614 538 0,000855168661949639 0,000875707235587252 0,000549324788281071 0,000564583810177768 0,000878025136460291 0,000871921531742502 37381 38164 667 665 0 True 614 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 658 538 0,000918080671268852 0,000974764675479039 0,000595101853971161 0,000503547722590982 0,000929525006787164 0,00109119581463302 40131 42481 667 665 0 True 658 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 261 583 0,00088342187340754 0,000907579087338396 0,000762951094834821 0,000793469138628214 0,000661297364104955 0,000622642981882197 38616 39553 667 665 0 True 259 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 305 582 0,000918217933834639 0,000921713760253231 0,000732433051041428 0,00080872816052491 0,00077441931743321 0,000690849212453483 40137 40169 667 665 0 True 303 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 349 582 0,000867064750984544 0,000912558347115213 0,000717174029144732 0,000778210116731518 0,000715605506595265 0,000738649528508918 37901 39770 667 665 0 True 348 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 394 582 0,000877382320512895 0,00092267748795197 0,000671396963454643 0,000793469138628214 0,000751566878298607 0,000679704536443026 38352 40211 667 665 0 True 392 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 438 582 0,000835540115042044 0,000886193510785432 0,000488288700694286 0,000457770656900893 0,000912930489631485 0,00102450946787884 36523 38621 667 665 0 True 436 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 482 582 0,000930914721169971 0,000936720377276448 0,000595101853971161 0,000534065766384375 0,000986357176077499 0,0010066176232316 40692 40823 667 665 0 True 481 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 526 582 0,000958984915873489 0,000941837312438799 0,000488288700694286 0,000518806744487678 0,00106717163641349 0,00100726667111795 41919 41046 667 665 0 True 525 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 570 581 0,000867293521927523 0,00094461376604707 0,000579842832074464 0,000656137941557946 0,000833781064462892 0,000938096004967585 37911 41167 667 665 0 True 569 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 614 582 0,000884474219745243 0,000987545540436121 0,000656137941557946 0,000747692072938125 0,000774019082267135 0,00080594766635371 38662 43038 667 665 0 True 614 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 658 582 0,000848419919131759 0,00095161226481172 0,000549324788281071 0,000701915007248035 0,000813088288635534 0,000841842362381194 37086 41472 667 665 0 True 658 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 259 620 0,000915564190896083 0,000911617565314063 0,000793469138628214 0,000747692072938125 0,000703319796433329 0,00071458771507814 40021 39729 667 665 0 False 259 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 303 620 0,000952396312715695 0,000910011352482832 0,000823987182421607 0,000762951094834821 0,000728115131547804 0,00069444317726503 41631 39659 667 665 0 False 303 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 349 626 0,000911011649130802 0,000835207726342636 0,00080872816052491 0,000686655985351339 0,000702359284884077 0,000700936985163951 39822 36399 667 665 0 True 348 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 393 626 0,000927574665402478 0,000837341694818415 0,000778210116731518 0,000717174029144732 0,000722054627617542 0,000626258039278132 40546 36492 667 665 0 True 392 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 436 620 0,000845994947136182 0,000892733091598302 0,000595101853971161 0,000503547722590982 0,000846414292069024 0,000977703294043449 36980 38906 667 665 0 False 436 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 481 620 0,000900396677376578 0,000945256251179563 0,000503547722590982 0,000534065766384375 0,000956161187469246 0,00103671199135663 39358 41195 667 665 0 False 481 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 525 620 0,00088962156596227 0,000842320954595232 0,000473029678797589 0,000335698481727321 0,00100530917537776 0,000968342932374607 38887 36709 667 665 0 False 525 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 569 620 0,000877542460172981 0,000875546614304128 0,000564583810177768 0,000518806744487678 0,000892971817694686 0,000891047921198254 38359 38157 667 665 0 False 569 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 614 620 0,000922816229788516 0,000906133495790288 0,000762951094834821 0,000732433051041428 0,000718263851914323 0,000716594342125339 40338 39490 667 665 0 False 614 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 658 620 0,000896072906554276 0,000907670870928752 0,000686655985351339 0,000717174029144732 0,000741335153920166 0,00077128044098267 39169 39557 667 665 0 False 658 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 259 664 0,00477559343468572 0,0555123446060792 0,00123598077363241 0,062882429236286 0,0108574778562258 0,0377693323374717 208750 2419271 667 665 0 False 259 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 303 664 0,00104061038832838 0,000934655246493437 0,000915541313801785 0,000823987182421607 0,000727329710830461 0,000645920722669571 45487 40733 667 665 0 False 303 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 348 664 0,000913230727277698 0,000921828489741176 0,000823987182421607 0,000778210116731518 0,000656817174329868 0,000709305853986666 39919 40174 667 665 0 False 348 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 392 664 0,000889987599471036 0,000832752515300611 0,000762951094834821 0,000732433051041428 0,000642518635311306 0,000634772047009456 38903 36292 667 665 0 False 392 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 436 664 0,000892458325655209 0,000872196513256132 0,000717174029144732 0,000686655985351339 0,000776473926178786 0,00080741660566741 39011 38011 667 665 0 False 436 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 481 664 0,000903187682880922 0,000876716855081168 0,000625619897764553 0,000671396963454643 0,000873820854139312 0,000770896488180988 39480 38208 667 665 0 False 481 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 525 664 0,000927894944722649 0,000903907743724154 0,000656137941557946 0,00064087891966125 0,000883718870254691 0,000804128380777189 40560 39393 667 665 0 False 525 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 569 664 0,000901449023714282 0,000916069069446333 0,000686655985351339 0,000747692072938125 0,000795450614636515 0,000742113013691559 39404 39923 667 665 0 False 569 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 614 664 0,000901517654997175 0,000922769271542326 0,000778210116731518 0,000747692072938125 0,000666350661007265 0,000740100300990679 39407 40215 667 665 0 False 614 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 659 669 0,000997692959425529 0,0728201139149086 0,00080872816052491 0,0712901503013657 0,000795350692425211 0,0210975735964451 43611 3173557 667 665 0 True 658 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B6_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B6_1.csv new file mode 100755 index 0000000..113e9e4 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B6_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 272 255 0,0105370294939507 0,0469223183846547 0,0105134660868238 0,0471656366826886 0,00153138210263734 0,00965998240745023 460593 2044911 667 665 0 True 272 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 316 256 0,0103554082423197 0,010343115743123 0,0103761348897536 0,0102998397802701 0,00126298083129385 0,00140434260382631 452654 450761 667 665 0 False 316 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 361 255 0,0106292470610655 0,0645611969956936 0,010605020218204 0,0639200427252613 0,00126921890723456 0,0112402025167849 464624 2813627 667 665 0 True 360 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 404 254 0,0106311458598922 0,0834047122842584 0,0106202792401007 0,0840619516289006 0,00137403377342265 0,0158768217717155 464707 3634842 667 665 0 True 405 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 449 254 0,0105453338791808 0,0733043641376272 0,0105592431525139 0,0717021438925765 0,00166503998787783 0,0156018021488227 460956 3194661 667 665 0 True 449 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 493 254 0,0106580035685979 0,0670758838042692 0,0106507972838941 0,0708781567101549 0,00161083909998938 0,019415266239244 465881 2923219 667 665 0 True 493 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 537 255 0,0104231930727243 0,0815112168152127 0,0103150988021668 0,0787212939650568 0,00148214451297965 0,0236346009582107 455617 3552322 667 665 0 True 538 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 582 255 0,0104486095244893 0,0727605234188699 0,0105592431525139 0,0691996643015183 0,00172039587652992 0,0217078997530078 456728 3170960 667 665 0 True 582 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 626 256 0,0106993653550885 0,0106306507858109 0,0107270923933776 0,0108033875028611 0,00186395156034104 0,00174064149684159 467689 463292 667 665 0 False 626 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 669 254 0,0109254596780346 0,0482773424749789 0,0109407186999313 0,047699702449073 0,00168766146110105 0,00860410069914841 477572 2103964 667 665 0 True 671 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 272 299 0,0106186778434999 0,0108900312121572 0,0106202792401007 0,0108186465247578 0,00152438040760395 0,00156586744535947 464162 474596 667 665 0 False 272 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 316 299 0,0107525317222368 0,0108655249935321 0,0107423514152743 0,0108644235904479 0,00129889856516997 0,00118036285184864 470013 473528 667 665 0 False 316 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 361 299 0,0111979258711226 0,11064608190194 0,0111238269626917 0,106889448386358 0,00138900397879698 0,0269896531445978 489482 4822042 667 665 0 True 360 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 405 299 0,0110364364624737 0,0548390431331246 0,0110475318532082 0,0536202029449912 0,00147162384303576 0,00934250717285522 482423 2389928 667 665 0 True 405 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 450 299 0,0108909381427391 0,0887186379774109 0,0108949416342412 0,088563363088426 0,0018004489427302 0,0198860816124712 476063 3866427 667 665 0 True 449 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 494 300 0,0109524775264005 0,0448112958064651 0,010955977721828 0,0448004882887007 0,0017602411888242 0,00974787166136869 478753 1952911 667 665 0 True 493 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 537 298 0,0114686534050439 0,0441307663757701 0,0108186465247578 0,0468146791790646 0,0036023749936707 0,00874145695145986 501316 1923253 667 665 0 True 538 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 582 299 0,0107830726431245 0,0585381283375525 0,0108491645685512 0,0569314106965743 0,00183789493381358 0,015324725673676 471348 2551137 667 665 0 True 582 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 626 299 0,0116993689010382 0,0108143785878062 0,0109864957656214 0,010757610437171 0,00555968150508652 0,00193723267335688 511401 471299 667 665 0 False 626 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 671 299 0,0110071537817724 0,0111725411032732 0,0109712367437247 0,0111848630502785 0,0019098671076983 0,00184566399180019 481143 486908 667 665 0 False 671 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 273 344 0,0109025597066424 0,0587117140528134 0,0108796826123445 0,0568245975432975 0,0014461757594148 0,0128668376676792 476571 2558702 667 665 0 True 272 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 318 344 0,0109823092573649 0,074599338813961 0,0110017547875181 0,0747844663157092 0,00132674262041008 0,0247079535029537 480057 3251097 667 665 0 True 316 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 363 344 0,0109093313265546 0,0457051532470453 0,0109254596780346 0,0445258258945602 0,00137564470309997 0,0114376763623496 476867 1991866 667 665 0 True 360 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 406 343 0,0108048287598018 0,03854747879082 0,0108033875028611 0,0379644464789807 0,00153917279831808 0,00644163740278763 472299 1679929 667 665 0 True 405 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 450 343 0,0110089153180334 0,0799517218314727 0,0110322728313115 0,0783703364614328 0,00168573155286064 0,0151487194668498 481220 3484358 667 665 0 True 449 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 494 344 0,0109609878054793 0,0340709636301787 0,0109254596780346 0,0348210879682612 0,00179890261931821 0,00479221055262623 479125 1484839 667 665 0 True 493 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 538 343 0,0107670129229274 0,0307022764051351 0,0107423514152743 0,0309910734721904 0,0016618936708875 0,00321282069310364 470646 1338029 667 665 0 True 538 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 583 343 0,0106975809417333 0,0577041367437821 0,0107118333714809 0,0559853513389792 0,0019092649961833 0,0123348269172248 467611 2514791 667 665 0 True 582 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 627 343 0,0108323956584308 0,062315619674042 0,0107881284809644 0,0621347371633478 0,00192625333714449 0,0135689634509298 473504 2715763 667 665 0 True 626 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 671 342 0,0108005964973567 0,0716082951714374 0,0109102006561379 0,0710612649729152 0,0018630019927907 0,0202381580668113 472114 3120745 667 665 0 True 671 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 274 388 0,0108894282545155 0,0492827169778417 0,0108796826123445 0,0514381628137636 0,00162365728376581 0,0104762064618903 475997 2147779 667 665 0 True 272 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 319 388 0,0108085806032667 0,0380173367729234 0,0108339055466545 0,0359807736324102 0,00141110098905385 0,00762811491816136 472463 1656825 667 665 0 True 316 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 363 387 0,011014726099985 0,0956387765017947 0,0110780498970016 0,0902876325627527 0,00141443242725143 0,0243169063976016 481474 4168012 667 665 0 True 360 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 407 387 0,0110544178585919 0,0738668369252268 0,0111238269626917 0,0703288319218738 0,00154105748722813 0,0201870495752718 483209 3219174 667 665 0 True 405 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 451 387 0,010994754396663 0,0456178899985143 0,0109712367437247 0,0473334859235523 0,00175635346432775 0,00740991543582528 480601 1988063 667 665 0 True 449 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 495 387 0,0110298478593159 0,0570145666294369 0,0110170138094148 0,0566567483024338 0,00185331602588971 0,0103986936616302 482135 2484739 667 665 0 True 493 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 539 387 0,0110354756245132 0,0474041822340241 0,0110322728313115 0,0462043183031968 0,00162051212511286 0,00823740002036124 482381 2065911 667 665 0 True 538 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 584 387 0,0108055608268194 0,0563450971213798 0,0107423514152743 0,056244754711223 0,00195220405216989 0,00945755102350779 472331 2455563 667 665 0 True 582 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 627 386 0,0107592804650547 0,0492135350966108 0,0107728694590677 0,0480659189745937 0,00192136856937247 0,0108866714475184 470308 2144764 667 665 0 True 626 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 671 386 0,0109081417176511 0,0985687152190387 0,0108491645685512 0,0888075074387732 0,00178189448200377 0,0236475085580395 476815 4295701 667 665 0 True 671 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 275 431 0,0109339928342078 0,0479117454886931 0,0109712367437247 0,0478828107118334 0,00155167277055866 0,00890314718649395 477945 2088031 667 665 0 True 272 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 319 431 0,011076700148438 0,0584130731956924 0,0110627908751049 0,057953765163653 0,00134974070468945 0,00801114744868548 484183 2545687 667 665 0 True 316 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 363 431 0,0110235795354783 0,0374531430430046 0,0110170138094148 0,0382391088731212 0,00137094972297844 0,0040200802059705 481861 1632237 667 665 0 True 360 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 407 431 0,0113835963684443 0,0620146612812645 0,0113374532692454 0,0568398565651942 0,00159078264964501 0,0172121134722015 497598 2702647 667 665 0 True 405 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 451 430 0,0114082807531917 0,103606624710093 0,0113679713130388 0,10429541466392 0,00171913557679043 0,0184803274055249 498677 4515257 667 665 0 True 449 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 496 431 0,0114554761987283 0,0574686200509284 0,0114290074006256 0,0573891813534752 0,0017130596023425 0,0123274211184049 500740 2504527 667 665 0 True 493 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 539 431 0,0112978072648272 0,0598150216465861 0,0112153810940719 0,0572365911345083 0,00171089211132157 0,0126474559986615 493848 2606785 667 665 0 True 538 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 583 430 0,0108612207972461 0,0344003749359666 0,0109254596780346 0,0343480582894636 0,00193166062387104 0,00492883044026829 474764 1499195 667 665 0 True 582 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 627 430 0,01099452562572 0,0470948944804217 0,0109407186999313 0,0448767833981842 0,00188672996999736 0,0103558835257203 480591 2052432 667 665 0 True 626 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 672 430 0,010987387972299 0,0758780677948017 0,0108796826123445 0,0756237125200275 0,00179260268845866 0,0123143989114989 480279 3306825 667 665 0 True 670 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 274 476 0,0108045084804817 0,0596530465555053 0,0108033875028611 0,0604257267109178 0,00149951562109278 0,0173143184757282 472285 2599726 667 665 0 True 272 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 318 475 0,0110855764610256 0,0608970583932938 0,0110170138094148 0,0595864805065995 0,00158965949736728 0,0102523683643393 484571 2653941 667 665 0 True 316 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 362 474 0,011135219755652 0,0746427065604042 0,0111238269626917 0,0719005111772335 0,00157925830657926 0,0215441713978139 486741 3252987 667 665 0 True 360 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 407 475 0,0116252242384187 0,100182982060324 0,0116273746852827 0,0932326237888151 0,00180917165761972 0,0249397966490171 508160 4366052 667 665 0 True 405 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 451 474 0,0117370245982525 0,104896298884084 0,0117799649042496 0,0995193408102541 0,00204728209340319 0,0385211502778873 513047 4571462 667 665 0 True 449 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 495 475 0,0113240015377983 0,0531350348863691 0,011306935225452 0,0527809567406729 0,00182058489631994 0,00992046112831999 494993 2315666 667 665 0 True 493 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 539 475 0,011209936345629 0,0482965022994658 0,0111848630502785 0,0489204242008087 0,00188056139530457 0,00953835088355501 490007 2104799 667 665 0 True 538 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 583 474 0,0113191744709014 0,132306573253918 0,011306935225452 0,128160524910353 0,0019720085308959 0,0383717219009088 494782 5766023 667 665 0 True 582 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 627 474 0,0110445807080438 0,0693990182597717 0,0111238269626917 0,0705271992065309 0,00184813625592724 0,0202736182258962 482779 3024463 667 665 0 True 626 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 671 475 0,0109618342579683 0,0822968384568654 0,010955977721828 0,0790417334248875 0,0020821659550496 0,016326789030485 479162 3586560 667 665 0 True 670 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 274 519 0,0106839919477204 0,0573955832589026 0,0106813153276875 0,0602883955138476 0,0014454402871854 0,0158958834328711 467017 2501344 667 665 0 True 272 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 318 519 0,0110728110424074 0,126752036878647 0,0110170138094148 0,122316319523919 0,001459356465867 0,042224216010143 484013 5523952 667 665 0 True 316 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 362 519 0,0112825024887419 0,0640410134973506 0,0113374532692454 0,0652018005645838 0,00154361898327663 0,0172002233153636 493179 2790957 667 665 0 True 360 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 407 519 0,0114920795496049 0,0622716323883639 0,0114747844663157 0,0624704356450752 0,0018570635204202 0,00833520470944944 502340 2713846 667 665 0 True 405 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 451 518 0,011387256703532 0,0619383202799858 0,011459525444419 0,0625467307545586 0,0018943769934219 0,00949950437615114 497758 2699320 667 665 0 True 449 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 495 519 0,0113858840778741 0,0665532221489866 0,0113374532692454 0,0670786602578775 0,00191314966363834 0,0152123977471225 497698 2900441 667 665 0 True 493 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 539 519 0,0111856866256732 0,0795670109124953 0,0112306401159686 0,0758220798046845 0,00188125059131826 0,0218333453168605 488947 3467592 667 665 0 True 537 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 583 519 0,0109861297321127 0,0650461355953399 0,0109102006561379 0,0642557412069886 0,00177433628127375 0,0174183946381402 480224 2834761 667 665 0 True 582 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 627 519 0,0109445849288677 0,0481556603800644 0,0109407186999313 0,0464332036316472 0,00190855684057463 0,00941592235976156 478408 2098661 667 665 0 True 626 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 671 518 0,0108345232282005 0,0669018391710565 0,0108339055466545 0,0665903715571832 0,00185479259162153 0,0151807202388581 473597 2915634 667 665 0 True 670 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 275 565 0,0110572317411905 0,0492844149742633 0,0110933089188983 0,0503852903028916 0,00144672356116494 0,00970221767861701 483332 2147853 667 665 0 True 272 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 319 564 0,0110345147865527 0,0551897252859776 0,0110475318532082 0,0559090562294957 0,0014416980362448 0,0115737758343832 482339 2405211 667 665 0 True 316 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 362 563 0,0111259316553671 0,0536621021539888 0,0111543450064851 0,0543678950179294 0,00140945537501572 0,0131338903683805 486335 2338636 667 665 0 True 360 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 407 563 0,0113156513983795 0,0554456408817879 0,0113221942473487 0,0545967803463798 0,00163742447957707 0,00855509782826014 494628 2416364 667 665 0 True 405 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 452 562 0,0115124630406243 0,0962916331799974 0,011612115663386 0,0923323414969101 0,00197849234964912 0,0266207773066744 503231 4196464 667 665 0 True 449 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 495 563 0,0114495739083994 0,0695797860409779 0,0114137483787289 0,0655374990463111 0,00221663729021534 0,0168693308596915 500482 3032341 667 665 0 True 493 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 539 563 0,0112211461218349 0,0602532653446388 0,0112153810940719 0,0597390707255665 0,00201129475108889 0,0105292225282249 490497 2625884 667 665 0 True 537 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 583 562 0,0109052592037696 0,0423756117232885 0,0108949416342412 0,0431067368581674 0,00174454219621998 0,0102434886299034 476689 1846762 667 665 0 True 582 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 628 563 0,0109001347346469 0,0532744541601199 0,0108491645685512 0,0536049439230945 0,00178911110385833 0,00892342695687845 476465 2321742 667 665 0 True 626 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 672 563 0,0109566411575627 0,0580515376332798 0,0109712367437247 0,0568398565651942 0,00168953873735084 0,00870060655708478 478935 2529931 667 665 0 True 670 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 272 603 0,0109988951507309 0,0110791742459835 0,0109407186999313 0,0110780498970016 0,00161236133434321 0,00147001073929416 480782 482839 667 665 0 False 272 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 316 603 0,0110867660699291 0,0111124916892827 0,0110627908751049 0,0110933089188983 0,00149856340977416 0,00151472873762075 484623 484291 667 665 0 False 316 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 363 607 0,0112063217647299 0,0826550009723324 0,011261158159762 0,07861448081178 0,00152653151096914 0,0157888163017465 489849 3602169 667 665 0 True 360 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 407 607 0,0114748530975986 0,0837284788992394 0,0114442664225223 0,0779736018921187 0,00173295244597623 0,0251484280997823 501587 3648952 667 665 0 True 405 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 449 603 0,0112688448634461 0,0111471629405397 0,0112001220721752 0,0111238269626917 0,00202651606107472 0,00205132682150068 492582 485802 667 665 0 False 449 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 493 603 0,0112423989424377 0,0107910426099582 0,0111238269626917 0,0108644235904479 0,00193660152327197 0,00210351582389832 491426 470282 667 665 0 False 493 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 537 603 0,0111187482477576 0,0107066017068306 0,0110780498970016 0,0107423514152743 0,00193526322698639 0,00203935963773287 486021 466602 667 665 0 False 537 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 582 603 0,0110397765182412 0,010774636293182 0,0109712367437247 0,0106965743495842 0,00164260610112133 0,00181241680861878 482569 469567 667 665 0 False 582 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 626 603 0,0110925768518808 0,0111070076197589 0,0110780498970016 0,0110780498970016 0,00173377225269168 0,00161466783587352 484877 484052 667 665 0 False 626 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 670 603 0,0112466083277885 0,0115997478245855 0,0112458991378653 0,0116426337071794 0,00163400349501864 0,00185328491109528 491610 505526 667 665 0 False 670 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 273 652 0,0106200504691577 0,0446638684144557 0,0105897611963073 0,0453192950331884 0,00139221308269289 0,01063949078234 464222 1946486 667 665 0 True 272 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 316 646 0,0106092296035548 0,0106140609018541 0,0105134660868238 0,010605020218204 0,00135680110291208 0,00130106408293607 463749 462569 667 665 0 False 316 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 360 646 0,0112380294174268 0,0109266528647093 0,0110170138094148 0,0109407186999313 0,00244506544827598 0,00129413393815594 491235 476192 667 665 0 False 360 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 404 647 0,011115636962933 0,0112920203920192 0,0110627908751049 0,0112458991378653 0,00154485029749411 0,00141003099861297 485885 492115 667 665 0 False 404 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 449 647 0,0111086823262665 0,0110984258540606 0,0111543450064851 0,011108567940795 0,00153353809851057 0,0016975245381303 485581 483678 667 665 0 False 449 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 493 647 0,011211240340004 0,0111424360856364 0,011261158159762 0,0111543450064851 0,00174533459371998 0,0017445160988318 490064 485596 667 665 0 False 493 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 537 647 0,0111293632195118 0,0110326399656729 0,011108567940795 0,0110322728313115 0,00188232264164371 0,00185142679803115 486485 480811 667 665 0 False 537 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 582 647 0,0112169138593898 0,0112202456243607 0,0111390859845884 0,0111848630502785 0,00160428094846315 0,00137583452045265 490312 488987 667 665 0 False 582 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 626 647 0,0110083891448645 0,0112359635642092 0,0109864957656214 0,0113221942473487 0,00140033166591117 0,00148797640657921 481197 489672 667 665 0 False 626 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 671 652 0,0110657648973636 0,0466095658005164 0,0110933089188983 0,0467078660257877 0,00144643231617386 0,00901727749840541 483705 2031281 667 665 0 True 670 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B6_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B6_2.csv new file mode 100755 index 0000000..8360f8a --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B6_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 272 255 0,00834798897186792 0,732194597273683 0,00822461280231937 0,748805981536584 0,00179500502202355 0,193314371931348 364906 31909608 667 665 10 True 272 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 316 256 0,00691716398610033 0,00670933456323344 0,00688181887541009 0,00665293354695964 0,00143022965364739 0,00117400556136729 302362 292398 667 665 0 False 316 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 361 255 0,00638090201866336 0,00646619983238022 0,00633249408712902 0,00645456626230259 0,00123133054176255 0,00114548708666197 278921 281802 667 665 0 True 360 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 404 254 0,00666730036217872 0,00666371811882648 0,00659189745937285 0,00666819256885634 0,00135235690913939 0,00127779159866386 291440 290410 667 665 0 True 405 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 449 254 0,00669742949536905 0,0067027490906254 0,00668345159075303 0,00677500572213321 0,001509702406547 0,00161383150705168 292757 292111 667 665 0 True 449 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 493 254 0,00686923647354624 0,00706869026537504 0,00679026474402991 0,00701915007248035 0,0016053411743206 0,00153420044540082 300267 308059 667 665 0 True 493 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 537 255 0,0070904122212183 0,0072670575500321 0,00715648126955062 0,00727855344472419 0,0015271998485119 0,00145666214628554 309935 316704 667 665 0 True 538 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 582 255 0,00765517904815045 0,00742797712982387 0,0076752880140383 0,00735484855420768 0,00172673980937037 0,00172358973183481 334622 323717 667 665 0 True 582 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 626 256 0,00832273265976305 0,00810428451536257 0,00823987182421607 0,00817883573662928 0,00186236366379858 0,00182522504850063 363802 353191 667 665 0 False 626 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 669 254 0,00957065527661896 0,749636416516228 0,00956740672922866 0,744029907682918 0,00190566528303856 0,168543365450893 418351 32669736 667 665 12 True 671 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 272 299 0,00706732923307172 0,0072612063461469 0,00703440909437705 0,00727855344472419 0,00142866333109821 0,00146455779955655 308926 316449 667 665 0 False 272 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 316 299 0,00698735091140628 0,00705088424884596 0,00695811398489357 0,00700389105058366 0,00118919658679715 0,00120670607228776 305430 307283 667 665 0 False 316 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 361 299 0,00698442264333615 0,007108891477951 0,00701915007248035 0,00712596322575723 0,00126422066868179 0,00129738618562734 305302 309811 667 665 0 True 360 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 405 299 0,00710276585213916 0,00713773447122039 0,00708018616006714 0,00720225833524071 0,00139996249600056 0,00141216744679683 310475 311068 667 665 0 True 405 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 450 299 0,0073186569910284 0,00739459084883185 0,00735484855420768 0,00744640268558785 0,00163958803698012 0,00181293571671142 319912 322262 667 665 0 True 449 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 494 300 0,00740515528456875 0,00753979248877515 0,00735484855420768 0,00755321583886473 0,00160986285721 0,0016669546036512 323693 328590 667 665 0 True 493 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 537 298 0,00794612993343109 0,00766452638806905 0,00782787823300526 0,00775158312352178 0,00191914548472682 0,00161826228231975 347340 334026 667 665 0 True 538 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 582 299 0,00783629700370689 0,00777712190753836 0,00787365529869535 0,00788891432059205 0,00179139709346624 0,00188603383708542 342539 338933 667 665 0 True 582 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 626 299 0,00864841097418789 0,00812181518112057 0,00822461280231937 0,00801098649576562 0,0038274582358305 0,00191999297132294 378038 353955 667 665 0 False 626 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 671 299 0,008319964531353 0,0083530409911251 0,00831616693369955 0,0085297932402533 0,00198295426009589 0,00179217792959432 363681 364032 667 665 0 False 671 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 273 344 0,00669722360152037 0,00678487245809649 0,00675974670023652 0,00674448767833982 0,00142991774337421 0,00142148411577761 292748 295690 667 665 0 True 272 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 318 344 0,00678324147608045 0,00681536755599229 0,00675974670023652 0,0068207827878233 0,00123687191020689 0,00120865600342074 296508 297019 667 665 0 True 316 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 363 344 0,007067580881109 0,00687147027559744 0,00714122224765393 0,00686655985351339 0,0012344386899758 0,00125620321328658 308937 299464 667 665 0 True 360 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 406 343 0,00720136612856309 0,00739392541780177 0,00721751735713741 0,00730907148851759 0,00141294241503305 0,00132636266752335 314785 322233 667 665 0 True 405 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 450 343 0,00732153950490994 0,00758359620727259 0,00740062561989776 0,0076752880140383 0,00171195412804619 0,00158263581961626 320038 330499 667 665 0 True 449 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 494 344 0,00728331188033816 0,0073416317171964 0,00737010757610437 0,00737010757610437 0,00155311042869176 0,00155210030712428 318367 319954 667 665 0 True 493 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 538 343 0,00743324835636656 0,00731024172929463 0,00747692072938125 0,00729381246662089 0,00149480548975086 0,00160491703951006 324921 318586 667 665 0 True 538 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 583 343 0,00754063343700089 0,00765195203619027 0,00753795681696803 0,00779736018921187 0,00182189716712423 0,00191703048536139 329615 333478 667 665 0 True 582 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 627 343 0,00754527748714336 0,00775966007947312 0,00746166170748455 0,00779736018921187 0,00196083876639667 0,00196851260323465 329818 338172 667 665 0 True 626 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 671 342 0,00730932313655486 0,0074249941631373 0,00721751735713741 0,00744640268558785 0,00190943847402811 0,00192572214499004 319504 323587 667 665 0 True 671 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 274 388 0,00667645119989788 0,00684735413723138 0,00669871061264973 0,00685130083161669 0,00142932817021407 0,00136097637265164 291840 298413 667 665 0 True 272 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 319 388 0,00694875725332573 0,00689776627423445 0,00695811398489357 0,00688181887541009 0,00132498326129052 0,0013418395920929 303743 300610 667 665 0 True 316 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 363 387 0,00717912959290554 0,00720003258317458 0,00720225833524071 0,00721751735713741 0,00132101834306593 0,0013672901108069 313813 313783 667 665 0 True 360 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 407 387 0,00720498070946216 0,00746579196905057 0,00715648126955062 0,00755321583886473 0,00141305396450071 0,00138705627657745 314943 325365 667 665 0 True 405 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 451 387 0,00750306924816374 0,0074941530984706 0,00755321583886473 0,00755321583886473 0,00161370339402153 0,00158746780650314 327973 326601 667 665 0 True 449 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 495 387 0,00732719014720152 0,00766044201829821 0,00743114366369116 0,00770580605783169 0,00168159142949372 0,00172383715523745 320285 333848 667 665 0 True 493 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 539 387 0,00762450086469697 0,00747267573832728 0,00761425192645151 0,00758373388265812 0,00162913768909688 0,00163107362144856 333281 325665 667 665 0 True 538 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 584 387 0,00741178964191514 0,00755810331505119 0,00743114366369116 0,00756847486076143 0,00191491903817327 0,00192250297391314 323983 329388 667 665 0 True 582 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 627 386 0,00702994806098896 0,00711520159978798 0,00698863202868696 0,00703440909437705 0,00180229136329603 0,00188133545083902 307292 310086 667 665 0 True 626 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 671 386 0,00679591538632149 0,0069102029507277 0,00688181887541009 0,00683604180972 0,00176013366198758 0,00181817596414293 297062 301152 667 665 0 True 671 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 275 431 0,00694379292386308 0,00700795247445691 0,00701915007248035 0,00703440909437705 0,00149199969764299 0,00153945942308691 303526 305412 667 665 0 True 272 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 319 431 0,00702782049121926 0,00702977402306407 0,00701915007248035 0,00703440909437705 0,00140159518830482 0,00144519882780971 307199 306363 667 665 0 True 316 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 363 431 0,00730772173995401 0,00728142168192282 0,00735484855420768 0,00735484855420768 0,00131613109973781 0,0013003460206418 319434 317330 667 665 0 True 360 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 407 431 0,00741455777032518 0,00746085860106894 0,00741588464179446 0,00747692072938125 0,00147453940766133 0,00146068052205022 324104 325150 667 665 0 True 405 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 451 430 0,00763456678618805 0,00782806180018598 0,00764476997024491 0,00794995040817884 0,00158499801267926 0,00174929133992515 333721 341153 667 665 0 True 449 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 496 431 0,00764314569654976 0,0075187969924812 0,00781261921110857 0,00755321583886473 0,00171012467781635 0,00172323960072214 334096 327675 667 665 0 True 493 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 539 431 0,00747911693043384 0,00759165021732633 0,00750743877317464 0,00756847486076143 0,00168901059567922 0,00164818447797874 326926 330850 667 665 0 True 538 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 583 430 0,0071176130863385 0,00695634715077921 0,00715648126955062 0,00695811398489357 0,00185676820069725 0,00184054573778943 311124 303163 667 665 0 True 582 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 627 430 0,00678854896195757 0,00687048360200111 0,00688181887541009 0,0068055237659266 0,00189510611325819 0,00170459226872909 296740 299421 667 665 0 True 626 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 672 430 0,00658402773893438 0,00668283205151813 0,00663767452506294 0,00675974670023652 0,00174360052715905 0,00182066133955812 287800 291243 667 665 0 True 670 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 274 476 0,00708100973546186 0,0073027843125782 0,00712596322575723 0,00738536659800107 0,0014897872321166 0,00152380775412643 309524 318261 667 665 0 True 272 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 318 475 0,00719882677109603 0,00703548755156373 0,00718699931334401 0,00703440909437705 0,00152339007754792 0,00146653586013804 314674 306612 667 665 0 True 316 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 362 474 0,00729605442186208 0,0073539536642017 0,0072632944228275 0,00727855344472419 0,00148152074719326 0,00150624060967739 318924 320491 667 665 0 True 360 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 407 475 0,0076024015916052 0,00745163435023815 0,00759899290455482 0,00746166170748455 0,00162897597059088 0,00164186067228817 332315 324748 667 665 0 True 405 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 451 474 0,00762500416077153 0,00790002013502513 0,00744640268558785 0,00804150453955901 0,00190406443539435 0,00196032333139388 333303 344289 667 665 0 True 449 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 495 475 0,00745161866308777 0,00746939447497205 0,00735484855420768 0,00738536659800107 0,00186347359418751 0,00184781237171873 325724 325522 667 665 0 True 493 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 539 475 0,00732478805230024 0,00714083216739491 0,00738536659800107 0,00714122224765393 0,00171366709337258 0,00160206831238419 320180 311203 667 665 0 True 538 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 583 474 0,00698744241978347 0,0110226585002217 0,00695811398489357 0,00753795681696803 0,00193649517369285 0,0166006386130174 305434 480376 667 665 0 True 582 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 627 474 0,00677118524738546 0,00687647248127185 0,0068055237659266 0,00685130083161669 0,00175622482323863 0,00169150914114179 295981 299682 667 665 0 True 626 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 671 475 0,00681565831870057 0,00690717409224595 0,00685130083161669 0,00689707789730678 0,00182624524121061 0,00178747271942 297925 301020 667 665 0 True 670 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 274 519 0,0070175257987852 0,00712057093982381 0,00712596322575723 0,00714122224765393 0,00148641691924963 0,00146629808125686 306749 310320 667 665 0 True 272 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 318 519 0,00695827412455365 0,00706508775945357 0,00700389105058366 0,00717174029144732 0,00148082753487374 0,00152546465494936 304159 307902 667 665 0 True 316 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 362 519 0,00724158406033879 0,00736783593224306 0,00721751735713741 0,00752269779507134 0,00148810960092831 0,00142748647749746 316543 321096 667 665 0 True 360 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 407 519 0,00732231732611607 0,00756390862714121 0,00732433051041428 0,00762951094834821 0,0016124012588063 0,00165592986573834 320072 329641 667 665 0 True 405 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 451 518 0,00739289316202508 0,00733346297765471 0,00737010757610437 0,00740062561989776 0,00191281580581607 0,00186174358861859 323157 319598 667 665 0 True 449 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 495 519 0,00727429830518478 0,00719498448570499 0,00727855344472419 0,0072632944228275 0,00177713824812075 0,00175489854169765 317973 313563 667 665 0 True 493 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 539 519 0,00696978130298549 0,00698578673738592 0,00700389105058366 0,00698863202868696 0,00165362506805978 0,00162356149096936 304662 304446 667 665 0 True 537 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 583 519 0,00676560323637678 0,00691887650001635 0,00685130083161669 0,00688181887541009 0,00171948504090503 0,00161457218404148 295737 301530 667 665 0 True 582 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 627 519 0,00676905767761576 0,00685247107239373 0,0068055237659266 0,00672922865644312 0,0018054127168928 0,00187706545716037 295888 298636 667 665 0 True 626 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 671 518 0,00678747373852557 0,00679448678918629 0,00685130083161669 0,00688181887541009 0,00176118112717909 0,00179311012088563 296693 296109 667 665 0 True 670 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 275 565 0,00794953862048147 0,00765137838875054 0,00796520943007553 0,00762951094834821 0,00163657023434989 0,00147876054729761 347489 333453 667 665 0 True 272 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 319 564 0,00748588855034602 0,007342044743353 0,00747692072938125 0,00738536659800107 0,00137236117699609 0,00147933940680041 327222 319972 667 665 0 True 316 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 362 563 0,0072034479441442 0,00746987633882142 0,00720225833524071 0,00741588464179446 0,00131484145486129 0,00121777412995237 314876 325543 667 665 0 True 360 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 407 563 0,00732588615282654 0,00743369065832354 0,00738536659800107 0,00746166170748455 0,00159957497064337 0,00148693709180691 320228 323966 667 665 0 True 405 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 452 562 0,00723369146280602 0,00729415665508472 0,00729381246662089 0,00729381246662089 0,00194064418116854 0,00182894307442858 316198 317885 667 665 0 True 449 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 495 563 0,00730250576245409 0,00855572210452889 0,0072327763790341 0,00787365529869535 0,00192928879600138 0,00382503880802174 319206 372865 667 665 0 True 493 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 539 563 0,00703157233468411 0,00694310736787035 0,00708018616006714 0,00700389105058366 0,00186532693486396 0,00172699623712373 307363 302586 667 665 0 True 537 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 583 562 0,00710040951142648 0,00707424317259158 0,00711070420386053 0,00703440909437705 0,00159542065154714 0,0015558647228383 310372 308301 667 665 0 True 582 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 628 563 0,00710912568435398 0,00716517776473686 0,00711070420386053 0,00718699931334401 0,00151353133928048 0,00163543827285011 310753 312264 667 665 0 True 626 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 672 563 0,00690860795283292 0,00712775300576917 0,00695811398489357 0,00708018616006714 0,0016178502734436 0,0017299496704801 301988 310633 667 665 0 True 670 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 272 603 0,008506961900144 0,00836545472172076 0,0085297932402533 0,00837720302128634 0,00148745403363675 0,00141792705394625 371855 364573 667 665 0 False 272 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 316 603 0,00835320494936784 0,0084508134607519 0,00833142595559625 0,00840772106507973 0,00153450002625498 0,00148068653142313 365134 368293 667 665 0 False 316 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 363 607 0,00769418449392836 0,00816504525217828 0,00770580605783169 0,0081177996490425 0,00148364849545962 0,001515867287451 336327 355839 667 665 0 True 360 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 407 607 0,0078372807187617 0,00783978715385397 0,00781261921110857 0,00779736018921187 0,00163914086355005 0,00144362723642243 342582 341664 667 665 0 True 405 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 449 603 0,00759672807221933 0,00731198561751139 0,00756847486076143 0,0072632944228275 0,00200965145747339 0,00201870311385215 332067 318662 667 665 0 False 449 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 493 603 0,00751780209689159 0,00704051270313573 0,00743114366369116 0,00700389105058366 0,00201370411619206 0,00197097983367437 328617 306831 667 665 0 False 493 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 537 603 0,00764797276344661 0,00703814927568406 0,00759899290455482 0,00706492713817044 0,00205540218771786 0,00185749569918431 334307 306728 667 665 0 False 537 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 582 603 0,00767496773471813 0,00718773358206686 0,00772106507972839 0,00714122224765393 0,00188208390309806 0,00175271812032917 335487 313247 667 665 0 False 582 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 626 603 0,0077144535994763 0,0077550938458529 0,00770580605783169 0,00764476997024491 0,00165709001234389 0,00165483215847275 337213 337973 667 665 0 False 626 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 670 603 0,00788088446049349 0,008569283130004 0,00785839627679866 0,00854505226215 0,00172045178727006 0,00191921432832965 344488 373456 667 665 0 False 670 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 273 652 0,00950030821165293 0,70902158119033 0,00901808194094758 0,72480354009308 0,00252222896744864 0,221545113258909 415276 30899710 667 665 13 True 272 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 316 646 0,00822596255088295 0,00770179052575362 0,00796520943007553 0,00773632410162509 0,00214118852714928 0,00129070622743364 359572 335650 667 665 0 False 316 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 360 646 0,00764678315454312 0,00737467380972459 0,0076600289921416 0,00740062561989776 0,00130733048431672 0,00118919269555997 334255 321394 667 665 0 False 360 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 404 647 0,00749625187406297 0,0075244416832881 0,00749217975127794 0,00752269779507134 0,00142012986969406 0,001404545060294 327675 327921 667 665 0 False 404 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 449 647 0,00752075324205601 0,00752136693301117 0,00744640268558785 0,0076600289921416 0,00174514540373393 0,00163561488193863 328746 327787 667 665 0 False 449 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 493 647 0,00791364445952808 0,00745250629434653 0,00793469138628214 0,00749217975127794 0,00183341394315683 0,00171900261648945 345920 324786 667 665 0 False 493 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 537 647 0,00789017256077844 0,00764995574310003 0,00801098649576562 0,0076600289921416 0,00185192839228668 0,00172865268109242 344894 333391 667 665 0 False 537 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 582 647 0,00780388016108677 0,00801114711704874 0,00776684214541848 0,00798046845197223 0,00147930323350665 0,00128692240731954 341122 349132 667 665 0 False 582 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 626 647 0,00802414082498691 0,00799446544950153 0,0080872816052491 0,00804150453955901 0,00136746399344853 0,00138737924253309 350750 348405 667 665 0 False 626 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 671 652 0,00919608861167951 0,747098095433135 0,00904859998474098 0,752712291142138 0,00188532627309886 0,189674074277851 401978 32559114 667 665 14 True 670 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B6_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B6_3.csv new file mode 100755 index 0000000..86ccca4 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B6_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 272 255 0,0010404502486683 0,0720008306414927 0,000869764248111696 0,0715037766079194 0,000746031393666721 0,020876672649431 45480 3137852 667 665 0 True 272 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 316 256 0,000945258659294752 0,000923618269753119 0,000854505226215 0,000823987182421607 0,000641417166897107 0,000641563564997369 41319 40252 667 665 0 False 316 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 361 255 0,000898017459569597 0,000961616676160532 0,000793469138628214 0,000869764248111696 0,000634051406129342 0,000641722103632408 39254 41908 667 665 0 True 360 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 404 254 0,000907602962080416 0,000900305237802678 0,000793469138628214 0,000732433051041428 0,000672754821680276 0,000685263541823613 39673 39236 667 665 0 True 405 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 449 254 0,000897354023834958 0,000900626480368924 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000799125016024838 0,0007979755060767 39225 39250 667 665 0 True 449 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 493 254 0,000898566509832747 0,000925316266174707 0,000686655985351339 0,000762951094834821 0,000782658786013016 0,00077288874453899 39278 40326 667 665 0 True 493 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 537 255 0,000914855000972848 0,00100420426208575 0,000747692072938125 0,000854505226215 0,000788867320179097 0,000824772519539334 39990 43764 667 665 0 True 538 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 582 255 0,000918149302551745 0,000943466471167619 0,00064087891966125 0,000610360875867857 0,000873333280671047 0,000942843278675163 40134 41117 667 665 0 True 582 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 626 256 0,00104061038832838 0,000984195439388125 0,00064087891966125 0,000656137941557946 0,00106310000165603 0,000946125648491892 45487 42892 667 665 0 False 626 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 669 254 0,00113914203346942 0,0746392187839707 0,000900282291905089 0,0721446555275807 0,000957936060399294 0,019913749399737 49794 3252835 667 665 0 True 671 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 272 299 0,000808659529242017 0,000912030591470666 0,000686655985351339 0,000732433051041428 0,000676490926260607 0,000746902316615441 35348 39747 667 665 0 False 272 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 316 299 0,000875941063572128 0,000923549432060352 0,000762951094834821 0,000823987182421607 0,000634897159508012 0,000633862732166097 38289 40249 667 665 0 False 316 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 361 299 0,000947431983253052 0,00094041466678828 0,000839246204318303 0,000823987182421607 0,000686294839679292 0,000643432028178988 41414 40984 667 665 0 True 360 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 405 299 0,000887242348155288 0,000924031295909722 0,000701915007248035 0,000778210116731518 0,000721363848666588 0,000708255387806724 38783 40270 667 665 0 True 405 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 450 299 0,000873950756368211 0,00100413542439298 0,00064087891966125 0,000778210116731518 0,000843752083187186 0,000957546939305115 38202 43761 667 665 0 True 449 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 494 300 0,000954043463505144 0,000966825394913239 0,000747692072938125 0,000732433051041428 0,000856556471555402 0,000862019620968151 41703 42135 667 665 0 True 493 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 537 298 0,000984012457035387 0,000947780299914354 0,000747692072938125 0,000778210116731518 0,000829049634511265 0,000816363738464709 43013 41305 667 665 0 True 538 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 582 299 0,000993026032188758 0,00101315316214546 0,000732433051041428 0,000701915007248035 0,000960001308274878 0,00101830010616169 43407 44154 667 665 0 True 582 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 626 299 0,00101189963498452 0,000905491010657796 0,000656137941557946 0,000549324788281071 0,00103267709601049 0,000937588355359905 44232 39462 667 665 0 False 626 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 671 299 0,00105166002487426 0,000894041007760876 0,000717174029144732 0,000457770656900893 0,00101842602256992 0,000940503598651801 45970 38963 667 665 0 False 671 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 273 344 0,000999294356026381 0,000865588094750495 0,000839246204318303 0,000701915007248035 0,000751153829321271 0,000711232596267585 43681 37723 667 665 0 True 272 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 318 344 0,000933911620522996 0,000868387494256355 0,000839246204318303 0,000778210116731518 0,000673327372909387 0,000604561451544385 40823 37845 667 665 0 True 316 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 363 344 0,00100437307096051 0,000891103932869482 0,000885023270008392 0,000778210116731518 0,000703647988397818 0,000635221109672967 43903 38835 667 665 0 True 360 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 406 343 0,00104374455024719 0,000888396316953978 0,000854505226215 0,000732433051041428 0,000841628139277209 0,000716226153443143 45624 38717 667 665 0 True 405 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 450 343 0,000925286955972689 0,000943971280914578 0,000686655985351339 0,000701915007248035 0,000836849614160647 0,000870876925162603 40446 41139 667 665 0 True 449 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 494 344 0,000969828658570692 0,000915862556368032 0,000747692072938125 0,000686655985351339 0,000852862323141549 0,000812727462526415 42393 39914 667 665 0 True 493 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 538 343 0,000941987234810153 0,00100585636671216 0,000717174029144732 0,000778210116731518 0,000850585990944571 0,000901719466570469 41176 43836 667 665 0 True 538 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 583 343 0,000998013238745699 0,000946633005034904 0,000701915007248035 0,000579842832074464 0,00103771924046512 0,00105476585036087 43625 41255 667 665 0 True 582 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 627 343 0,000953013994261738 0,000968270986461347 0,000534065766384375 0,000473029678797589 0,00101743780328554 0,00106104246492148 41658 42198 667 665 0 True 626 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 671 342 0,00103765924316395 0,00100381418182673 0,000701915007248035 0,000656137941557946 0,000998501355377786 0,00102730142363656 45358 43747 667 665 0 True 671 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 274 388 0,000880493605337409 0,000909713055814175 0,000762951094834821 0,000793469138628214 0,000710610447759559 0,000752991120184314 38488 39646 667 665 0 True 272 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 319 388 0,000900007766773514 0,000963819482329077 0,000854505226215 0,000854505226215 0,000637953721442689 0,000726990699903925 39341 42004 667 665 0 True 316 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 363 387 0,00094962818430565 0,000986191732478369 0,00080872816052491 0,00080872816052491 0,000712438537474193 0,000780848023104059 41510 42979 667 665 0 True 360 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 407 387 0,000986460306125262 0,000970634413913015 0,000778210116731518 0,000747692072938125 0,000779857587970679 0,000833725017387622 43120 42301 667 665 0 True 405 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 451 387 0,000900556817036664 0,000961501946672587 0,00064087891966125 0,000717174029144732 0,000849636054529211 0,00086760362431253 39365 41903 667 665 0 True 449 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 495 387 0,00094603648050088 0,000910952134283982 0,000625619897764553 0,000564583810177768 0,000930939462757112 0,000923866070105287 41353 39700 667 665 0 True 493 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 539 387 0,0009240744699749 0,000909093516579271 0,000701915007248035 0,000701915007248035 0,00087254547107072 0,00081468068654598 40393 39619 667 665 0 True 538 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 584 387 0,000946082234689476 0,000830343196053765 0,000579842832074464 0,000473029678797589 0,00100024942930669 0,000906137134936098 41355 36187 667 665 0 True 582 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 627 386 0,000855877851872873 0,000864119557304798 0,000488288700694286 0,000503547722590982 0,000947022399482299 0,000924882547036364 37412 37659 667 665 0 True 626 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 671 386 0,000939608017003172 0,000812812530295755 0,000579842832074464 0,0004272526131075 0,000950432570081459 0,000906886584575335 41072 35423 667 665 0 True 671 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 275 431 0,000880036063451451 0,000969395335443209 0,000732433051041428 0,00080872816052491 0,000767437542211328 0,000859091864152193 38468 42247 667 665 0 True 272 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 319 431 0,000954134971882335 0,00100101478232087 0,000839246204318303 0,000885023270008392 0,000750616763817314 0,000779205691458138 41707 43625 667 665 0 True 316 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 363 431 0,00095354016743059 0,00100252921156175 0,000854505226215 0,000900282291905089 0,000713139644016556 0,000721940808339099 41681 43691 667 665 0 True 360 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 407 431 0,00100421293130043 0,00100236859027863 0,000839246204318303 0,000793469138628214 0,000816823941954514 0,000836315105588311 43896 43684 667 665 0 True 405 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 451 430 0,000880562236620303 0,00093458640880067 0,00064087891966125 0,000686655985351339 0,00082139077613845 0,000872458243811069 38491 40730 667 665 0 True 449 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 496 431 0,00102265186930453 0,0009896795089119 0,000793469138628214 0,000717174029144732 0,000910310919570884 0,000940289506347307 44702 43131 667 665 0 True 493 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 539 431 0,000947409106158754 0,000962419782576147 0,00064087891966125 0,000747692072938125 0,000903202485653511 0,00083335713631485 41413 41943 667 665 0 True 538 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 583 430 0,00085320123184002 0,000953402044823664 0,000518806744487678 0,000549324788281071 0,000897750838957568 0,00102696731897375 37295 41550 667 665 0 True 582 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 627 430 0,000846978662190992 0,000894683492893369 0,000473029678797589 0,000564583810177768 0,000929561845882874 0,000901450505361962 37023 38991 667 665 0 True 626 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 672 430 0,000943474245939516 0,000834381674029432 0,000610360875867857 0,000457770656900893 0,000905755162309524 0,000903035753263366 41241 36363 667 665 0 True 670 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 274 476 0,000869924387771781 0,000980225799105225 0,000671396963454643 0,000854505226215 0,000755100678214104 0,000794922882044998 38026 42719 667 665 0 True 272 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 318 475 0,00091277318539174 0,00091799652484381 0,000762951094834821 0,000793469138628214 0,000761178130254303 0,00079566444744284 39899 40007 667 665 0 True 316 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 362 474 0,00094310821243075 0,000977954155243912 0,000793469138628214 0,000839246204318303 0,000798745891581989 0,000803777820391307 41225 42620 667 665 0 True 360 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 407 475 0,000951115195435013 0,000953975692263389 0,000762951094834821 0,000732433051041428 0,00084926332024735 0,000863906404212819 41575 41575 667 665 0 True 405 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 451 474 0,00100210823862502 0,00102471789453033 0,000671396963454643 0,000549324788281071 0,00101510811805608 0,00111759365652649 43804 44658 667 665 0 True 449 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 495 475 0,000918583967343405 0,000882063249219409 0,000656137941557946 0,000442511635004196 0,000901890294305835 0,000950138629249133 40153 38441 667 665 0 True 493 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 539 475 0,000921306341564855 0,000911204539157461 0,000625619897764553 0,000610360875867857 0,000924781789502501 0,000855481361669242 40272 39711 667 665 0 True 538 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 583 474 0,000951870139546844 0,00126711835666071 0,000610360875867857 0,000671396963454643 0,000955923178004266 0,0018909697672366 41608 55222 667 665 0 True 582 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 627 474 0,000882026370655368 0,000899846319850898 0,000534065766384375 0,000579842832074464 0,000918207811304413 0,000910162763775438 38555 39216 667 665 0 True 626 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 671 475 0,00086580651079816 0,000906959548103493 0,000534065766384375 0,000518806744487678 0,00091958888142763 0,000958107266946038 37846 39526 667 665 0 True 670 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 274 519 0,000876307097080894 0,000860195808817076 0,000732433051041428 0,000701915007248035 0,000722190024813564 0,000748015706944674 38305 37488 667 665 0 True 272 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 318 519 0,00101054988642095 0,000964209562588091 0,000900282291905089 0,000839246204318303 0,000776294564739012 0,0007834831098567 44173 42021 667 665 0 True 316 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 362 519 0,000991035724984841 0,000851889393889852 0,000854505226215 0,000717174029144732 0,000770857439888392 0,000727831437808099 43320 37126 667 665 0 True 360 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 407 519 0,000965344748088304 0,000982703956044838 0,000671396963454643 0,000701915007248035 0,000921311712599224 0,000907405993859393 42197 42827 667 665 0 True 405 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 451 518 0,000897948828286704 0,000943145228601373 0,000488288700694286 0,000595101853971161 0,000975688436463156 0,00098888856860299 39251 41103 667 665 0 True 449 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 495 519 0,000961226871114683 0,000903907743724154 0,00064087891966125 0,000534065766384375 0,000939050340974708 0,000896046287018911 42017 39393 667 665 0 True 493 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 539 519 0,000918606844437703 0,000888465154646745 0,000656137941557946 0,000564583810177768 0,000869803997049829 0,000855680020040161 40154 38720 667 665 0 True 537 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 583 519 0,000924966676652518 0,000866230579882987 0,000671396963454643 0,000579842832074464 0,000904812291192052 0,000845721450131586 40432 37751 667 665 0 True 582 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 627 519 0,00087678751606115 0,000809232970271869 0,000503547722590982 0,000396734569314107 0,000963364011078911 0,000916109674043164 38326 35267 667 665 0 True 626 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 671 518 0,000994513043318121 0,00101570015677785 0,000625619897764553 0,00064087891966125 0,00102197973933578 0,00103212019866004 43472 44265 667 665 0 True 670 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 275 565 0,000946539776575434 0,000947160760679451 0,000823987182421607 0,000823987182421607 0,000693732602969025 0,000719588446811476 41375 41278 667 665 0 True 272 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 319 564 0,000973237345621078 0,000944338415276002 0,000869764248111696 0,000839246204318303 0,000707469580154193 0,000715627062250733 42542 41155 667 665 0 True 316 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 362 563 0,000942307514130323 0,000908405139651601 0,000839246204318303 0,000793469138628214 0,000703301103636343 0,000659889955558826 41190 39589 667 665 0 True 360 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 407 563 0,000954226480259527 0,000962373890780969 0,000732433051041428 0,000717174029144732 0,00086906901269444 0,00081495409912857 41711 41941 667 665 0 True 405 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 452 562 0,000914466090369784 0,0010320835276564 0,000473029678797589 0,00064087891966125 0,00104525551347843 0,00106500429028237 39973 44979 667 665 0 True 449 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 495 563 0,000949765446871437 0,000970634413913015 0,000503547722590982 0,000488288700694286 0,00103320375212371 0,00112569654409723 41516 42301 667 665 0 True 493 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 539 563 0,000884771621971116 0,000949868376594955 0,000503547722590982 0,000534065766384375 0,00096173657960014 0,000969048397727467 38675 41396 667 665 0 True 537 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 583 562 0,000939768156663257 0,00094041466678828 0,000686655985351339 0,000747692072938125 0,000876045335486275 0,00075554979121148 41079 40984 667 665 0 True 582 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 628 563 0,000928993045248948 0,000883508840767517 0,000747692072938125 0,000625619897764553 0,000807110609217767 0,000838596051578198 40608 38504 667 665 0 True 626 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 672 563 0,000949124888231096 0,000972584815208082 0,000671396963454643 0,00064087891966125 0,000877463845602397 0,000910265088876796 41488 42386 667 665 0 True 670 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 272 603 0,000953517290336292 0,000952071182763501 0,000823987182421607 0,00080872816052491 0,000726429581702365 0,00071715200463586 41680 41492 667 665 0 False 272 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 316 603 0,00103797952248412 0,00107005898816623 0,000930800335698482 0,000961318379491875 0,000782695146895517 0,000745663617617116 45372 46634 667 665 0 False 316 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 363 607 0,000976714663954358 0,00107274365818414 0,000885023270008392 0,000976577401388571 0,000729181563083758 0,000783014207222893 42694 46751 667 665 0 True 360 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 407 607 0,00098344052967794 0,00100532861106761 0,000793469138628214 0,000854505226215 0,000796009503686165 0,000753236384917833 42988 43813 667 665 0 True 405 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 449 603 0,000972551032792141 0,000969074092876962 0,000595101853971161 0,000488288700694286 0,00100549790445091 0,00112051771638818 42512 42233 667 665 0 False 449 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 493 603 0,00104285234356957 0,000885413350267406 0,000701915007248035 0,000335698481727321 0,00105765545553651 0,00104968111501815 45585 38587 667 665 0 False 493 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 537 603 0,000994650305883909 0,000961593730262943 0,000564583810177768 0,000503547722590982 0,00105381259138355 0,00106331544090022 43478 41907 667 665 0 False 537 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 582 603 0,000892709973692485 0,00088672126642998 0,000595101853971161 0,000503547722590982 0,000859377787561807 0,000926053244076456 39022 38644 667 665 0 False 582 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 626 603 0,000945739078275008 0,000874169860448787 0,000762951094834821 0,000671396963454643 0,000770414549144889 0,000717394072277826 41340 38097 667 665 0 False 626 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 670 603 0,00102031840568615 0,00100718722877232 0,00080872816052491 0,000717174029144732 0,000821382092170932 0,000914239734043683 44600 43894 667 665 0 False 670 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 273 652 0,00107396519181471 0,0704547131160472 0,000915541313801785 0,0694895857175555 0,000741931586226637 0,0245861831421303 46945 3070471 667 665 0 True 272 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 316 646 0,00110164647591517 0,000994865281767018 0,000976577401388571 0,000885023270008392 0,000751791770466709 0,000675906799720635 48155 43357 667 665 0 False 316 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 360 646 0,00102043279115764 0,000950717374805749 0,000915541313801785 0,000869764248111696 0,000715913323163884 0,000609026556611367 44605 41433 667 665 0 False 360 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 404 647 0,00100828505408545 0,00095255304661287 0,000854505226215 0,000823987182421607 0,000733749670756221 0,000698782528205276 44074 41513 667 665 0 False 404 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 449 647 0,00104289809775817 0,000981763174243689 0,000793469138628214 0,000732433051041428 0,000912897288302196 0,000882901632548132 45587 42786 667 665 0 False 449 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 493 647 0,000947180335215775 0,00088344000307475 0,000671396963454643 0,000595101853971161 0,000882706772535614 0,000867218124104299 41403 38501 667 665 0 False 493 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 537 647 0,000941095028132535 0,00109383093806845 0,000579842832074464 0,00080872816052491 0,000932652924680089 0,000969280175739958 41137 47670 667 665 0 False 537 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 582 647 0,000879212488056727 0,000976279104719914 0,000717174029144732 0,000869764248111696 0,000743684441337544 0,000700565575238384 38432 42547 667 665 0 False 582 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 626 647 0,000949170642419692 0,00108414776928588 0,000823987182421607 0,000885023270008392 0,000686066334310181 0,000812781669054937 41490 47248 667 665 0 False 626 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 671 652 0,00106140566704517 0,0744606767548305 0,000854505226215 0,0729533836881056 0,000790877244415396 0,0226443452774023 46396 3245054 667 665 0 True 670 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B7_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B7_1.csv new file mode 100755 index 0000000..b1cf3a1 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B7_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 266 263 0,0106501604707812 0,0464698941218921 0,0106965743495842 0,0471198596169986 0,00143184668733205 0,0104319592831806 434828 2025194 623 665 0 True 266 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 310 264 0,0106567490372182 0,0106535507916048 0,0106355382619974 0,0106660563057908 0,00128208410886867 0,00128717260770323 435097 464290 623 665 0 False 310 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 356 264 0,0107613333446 0,0628615025776848 0,0107423514152743 0,0633249408712901 0,00129626772887331 0,0124258848273152 439367 2739553 623 665 0 True 354 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 400 263 0,0108555816853039 0,0832979450227767 0,0108186465247578 0,0844739452201114 0,00146666009921604 0,0165276890949735 443215 3630189 623 665 0 True 399 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 444 263 0,0109538958328052 0,0708276986813566 0,0109407186999313 0,0679636835278859 0,00167794472712727 0,0193081233264459 447229 3086726 623 665 0 True 443 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 488 263 0,0109334688275695 0,0669802453031182 0,0109712367437247 0,0694438086518654 0,00167675066323005 0,0236972534522044 446395 2919051 623 665 0 True 487 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 532 264 0,0110364611021692 0,0807388579023664 0,0109864957656214 0,0783550774395361 0,00179092995125205 0,0249504839180023 450600 3518662 623 665 0 True 531 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 577 264 0,0111208388396236 0,0704604954822396 0,0111543450064851 0,0694743266956588 0,00181179398877944 0,0212659829228446 454045 3070723 623 665 0 True 575 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 620 265 0,0108142378185918 0,0108652725886586 0,0108491645685512 0,0108796826123445 0,00193223787765485 0,00182828806937101 441527 473517 623 665 0 False 620 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 661 262 0,0113062004410911 0,0475909388945011 0,0111696040283818 0,0478217746242466 0,00240906844941839 0,00920828313925202 461613 2074050 623 665 0 True 664 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 266 307 0,0108819114582396 0,0107559812784422 0,0109407186999313 0,010757610437171 0,00152788307141001 0,00143434969617999 444290 468754 623 665 0 False 266 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 310 307 0,0109141439988753 0,0108640335101888 0,0109254596780346 0,0108949416342412 0,00120909465710613 0,00119706074761088 445606 473463 623 665 0 False 310 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 357 309 0,0108954069976699 0,107273012010456 0,0109407186999313 0,102510109102007 0,00139991561351698 0,0289073529128838 444841 4675041 623 665 0 True 354 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 401 309 0,0111041102490049 0,0542627339692789 0,0110933089188983 0,0532997634851606 0,00143391348364716 0,0102347056997011 453362 2364812 623 665 0 True 398 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 445 309 0,0110458663419899 0,0825835474472402 0,0109864957656214 0,0785076676585031 0,0017773800972207 0,0216734014030239 450984 3599055 623 665 0 True 443 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 489 309 0,0110723920574219 0,0440113788706144 0,0110627908751049 0,0439459830624857 0,00166081181815624 0,0105323223729328 452067 1918050 623 665 0 True 487 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 532 308 0,0108646685185682 0,0437148031442763 0,0109254596780346 0,0466010528725109 0,0016266160950383 0,0108943311881716 443586 1905125 623 665 0 True 531 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 577 309 0,011281095308757 0,0582924466120669 0,0111543450064851 0,0562294956893263 0,00186746633684186 0,0168919146039342 460588 2540430 623 665 0 True 575 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 619 308 0,0108288845201876 0,0108047183649212 0,0108796826123445 0,0108796826123445 0,00203549749010772 0,00208082993426384 442125 470878 623 665 0 False 619 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 664 308 0,0108399552712267 0,0106279202239979 0,0109712367437247 0,0107118333714809 0,00198465900914771 0,00197098966174866 442577 463173 623 665 0 False 664 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 268 353 0,0108359874356773 0,0575727026423922 0,0108339055466545 0,0565651941710536 0,00151022059564963 0,0168384773961587 442415 2509063 623 665 0 True 266 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 313 353 0,0111160137556531 0,067859830395398 0,011108567940795 0,0721141374837873 0,00134518147610512 0,021960402354765 453848 2957384 623 665 0 True 310 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 357 353 0,011166836340622 0,0461164584613284 0,0111543450064851 0,0439154650186923 0,00136700672202919 0,0138577950622737 455923 2009791 623 665 0 True 354 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 401 353 0,0108667993932151 0,0376071100158269 0,0108949416342412 0,0377355611505302 0,00140578566755379 0,00740077736366609 443673 1638947 623 665 0 True 398 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 445 353 0,011371792191716 0,0743732987768116 0,0113527122911421 0,0704509040970474 0,00166144984106047 0,0153700001918436 464291 3241246 623 665 0 True 443 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 489 353 0,0110027100071874 0,0371311432621379 0,0110475318532082 0,0363317311360342 0,00166334905604331 0,00889713323945467 449222 1618204 623 665 0 True 487 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 533 353 0,0107763474383764 0,0305005819653276 0,0108186465247578 0,0307469291218433 0,00163536329897036 0,00415379411417155 439980 1329239 623 665 0 True 531 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 577 353 0,0110605130435858 0,0542500219420146 0,011108567940795 0,0541084916456855 0,00188866099451441 0,0108872038797136 451582 2364258 623 665 0 True 575 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 622 354 0,0108823768216682 0,0620868490750796 0,0109102006561379 0,0632639047837034 0,00191282573809181 0,0171076214318515 444309 2705793 623 665 0 True 619 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 666 353 0,0108116170877042 0,0697940548326642 0,0109102006561379 0,0700541695277333 0,00186500254446514 0,0212088943284692 441420 3041679 623 665 0 True 664 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 269 398 0,0110940437032593 0,0489721213080768 0,0110780498970016 0,0524147402151522 0,0015473572665008 0,0111995267744937 452951 2134243 623 665 0 True 266 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 313 397 0,0109570798983695 0,0375034633964173 0,010955977721828 0,0366369115739681 0,0014700656469355 0,00860357069702705 447359 1634430 623 665 0 True 310 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 357 397 0,0110739840902041 0,0954233374693314 0,0110627908751049 0,0912031738765545 0,00140769957324441 0,0316340307931745 452132 4158623 623 665 0 True 354 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 402 398 0,011348156628104 0,0753217674536536 0,0113679713130388 0,0715800717174029 0,00148754595644353 0,0253845835793259 463326 3282581 623 665 0 True 398 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 446 397 0,0111531203658834 0,0453991926485933 0,0111696040283818 0,0474708171206226 0,0017348608637157 0,0100785111763086 455363 1978532 623 665 0 True 443 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 490 398 0,0113652771037152 0,0566352021045977 0,011459525444419 0,0552986953536278 0,00174362670646103 0,0119731075123933 464025 2468206 623 665 0 True 487 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 534 398 0,0111432742554461 0,0436228359867396 0,0111543450064851 0,044785229266804 0,00180036427794545 0,00580621428417222 454961 1901117 623 665 0 True 531 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 578 398 0,0112912843185628 0,0558954493122254 0,0112458991378653 0,0549477378500038 0,00185051776759896 0,00964232731424854 461004 2435967 623 665 0 True 575 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 622 397 0,0116411396456453 0,0498586819532236 0,0115205615320058 0,0476386663614862 0,00235382234824722 0,0143706584432952 475288 2172880 623 665 0 True 619 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 666 398 0,0107984889404544 0,0934089859576843 0,0107881284809644 0,0857251850156405 0,00184187194804747 0,0242685585926107 440884 4070836 623 665 0 True 664 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 270 443 0,0110979625531846 0,046587813089602 0,0110627908751049 0,0466926070038911 0,00162447837774592 0,00909039310792368 453111 2030333 623 665 0 True 266 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 314 442 0,0112614520735064 0,0723301042718951 0,0112764171816587 0,0711375600823987 0,00157176780375709 0,0202513991781792 459786 3152202 623 665 0 True 310 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 358 442 0,0112905985198259 0,0379490497816985 0,0112916762035554 0,0386816205081254 0,00147217820558956 0,0058329621935439 460976 1653849 623 665 0 True 354 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 402 442 0,0114058372004422 0,0611830560608433 0,0114290074006256 0,057755397878996 0,00174352370670703 0,0171192163147389 465681 2666405 623 665 0 True 398 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 446 441 0,0117423929305907 0,102372617283653 0,0116273746852827 0,1006942854963 0,00200787621390074 0,0228299679929293 479422 4461478 623 665 0 True 442 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 490 442 0,0118574601615227 0,0650475352950928 0,0116426337071794 0,06494239719234 0,00212592053247988 0,0159485712398096 484120 2834822 623 665 0 True 487 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 534 442 0,0115317057614809 0,0563455560393316 0,0115815976195926 0,0553139543755245 0,00174516181995984 0,0116356314754127 470820 2455583 623 665 0 True 531 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 577 442 0,0115486792802199 0,0340610968942154 0,0114747844663157 0,0343480582894636 0,0020325718715468 0,00525682361818006 471513 1484409 623 665 0 True 575 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 622 441 0,011155030805222 0,0433709359230073 0,0111390859845884 0,0436102845807584 0,00183374680771521 0,00780746645621714 455441 1890139 623 665 0 True 619 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 667 442 0,0109707468874841 0,0738482507481797 0,0110627908751049 0,0722514686808576 0,00186747123151185 0,0127071839254479 447917 3218364 623 665 0 True 663 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 268 487 0,0109671709369272 0,0581881116157296 0,0109864957656214 0,0587777523460746 0,00154268008070051 0,0194009964005891 447771 2535883 623 665 0 True 266 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 313 487 0,0112523897330541 0,0611230754845456 0,0113527122911421 0,0599984740978103 0,00158500738446734 0,0108180888902779 459416 2663791 623 665 0 True 310 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 357 486 0,0115513000111075 0,0734486249957693 0,011612115663386 0,0713817044327459 0,00154675287329675 0,0233145951764684 471620 3200948 623 665 0 True 354 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 402 487 0,0118493775335518 0,0983320971231007 0,0117494468604562 0,0921492332341497 0,00167887693033319 0,0248630615343847 483790 4285389 623 665 0 True 398 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 446 487 0,012232200185631 0,106406391350314 0,0120241092545968 0,10074006256199 0,00224798233005201 0,0405627079648317 499420 4637273 623 665 0 True 442 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 489 486 0,0118810957251348 0,0532476762976335 0,0117036697947662 0,0530251010910201 0,00222586980514364 0,0132187764480551 485085 2320575 623 665 0 True 487 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 532 486 0,0114674856083298 0,0489197128779835 0,0114747844663157 0,0498970016021973 0,00177535873021206 0,0129303373999646 468198 2131959 623 665 0 True 531 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 577 486 0,0116934317993363 0,107796086691896 0,0116731517509728 0,10231174181735 0,00191894700594363 0,0241818171457983 477423 4697837 623 665 0 True 575 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 621 485 0,0117927256593189 0,0696748738405868 0,0116578927290761 0,0698558022430762 0,00220269432572252 0,0228823983966221 481477 3036485 623 665 0 True 619 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 665 485 0,0110661953759775 0,0812289822748678 0,0111390859845884 0,0755931944762341 0,00187220117239034 0,0186296821245588 451814 3540022 623 665 0 True 663 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 265 524 0,0155657943674125 0,0414426774191143 0,0116578927290761 0,0448004882887007 0,0104103151895139 0,0254527202191873 635525 1806104 623 665 0 False 265 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 313 531 0,0112407066617142 0,120802027958429 0,0112458991378653 0,122133211261158 0,00155275590847127 0,031766832542887 458939 5264646 623 665 0 True 310 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 354 524 0,0150151959529057 0,0466192030775038 0,0122072175173571 0,0532234683756771 0,00884832684279875 0,0259433272678017 613045 2031701 623 665 0 False 354 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 401 530 0,0117548107862915 0,061940431302564 0,0118562600137331 0,0629434653238727 0,00169421331258832 0,0128644840711353 479929 2699412 623 665 0 True 398 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 444 530 0,0122554438642505 0,063400547603846 0,0119935912108034 0,0631113145647364 0,00237076960514915 0,0141000430260394 500369 2763045 623 665 0 True 442 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 489 531 0,0119727723205751 0,0666188933078863 0,0119935912108034 0,0664377813382162 0,00213075700888971 0,0155879314684751 488828 2903303 623 665 0 True 486 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 533 531 0,0121712130836683 0,0801622274959544 0,0118410009918364 0,0787365529869535 0,002618155153714 0,0233163773071579 496930 3493532 623 665 0 True 531 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 577 531 0,0114260192775576 0,0638118757640267 0,0114747844663157 0,0643625543602655 0,00172424878635424 0,0172344367482191 466505 2780971 623 665 0 True 575 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 621 531 0,0116668326054682 0,0486841502933346 0,0115968566414893 0,0465247577630274 0,00218065851809547 0,0107003190649793 476337 2121693 623 665 0 True 619 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 665 530 0,0111364897465129 0,0667068678792426 0,0111696040283818 0,0680857557030594 0,0019279891490456 0,0153628851959266 454684 2907137 623 665 0 True 663 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 265 567 0,0166591045109514 0,0334494969398777 0,011612115663386 0,0334325169756619 0,0111787103946959 0,0204358635631221 680163 1457755 623 665 0 False 265 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 310 567 0,0182765363391892 0,0400698243663634 0,0118410009918364 0,0419165331502251 0,0162128667829249 0,0248898962311151 746200 1746274 623 665 0 False 310 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 354 567 0,0170301216276306 0,0392993929089145 0,0123750667582208 0,0418554970626383 0,0111712674421292 0,024000361395387 695311 1712698 623 665 0 False 354 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 398 567 0,0182972817509813 0,039666068352387 0,0125734340428779 0,0459449149309529 0,0129315448099355 0,0234174250113976 747047 1728678 623 665 0 False 398 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 442 568 0,0214932753147602 0,0678071466145336 0,0131990539406424 0,0746776531624323 0,0198921024273696 0,0473081237696143 877534 2955088 623 665 0 False 442 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 486 568 0,0180326369169624 0,0495969151535281 0,0132143129625391 0,0551003280689708 0,0130674611663203 0,0308321025146052 736242 2161472 623 665 0 False 486 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 531 568 0,0165182953345724 0,0457417978454949 0,0121309224078737 0,0547798886091402 0,0121377792324194 0,0253740100702136 674414 1993463 623 665 0 False 531 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 575 568 0,0127890932528304 0,0328504254456237 0,011810482948043 0,0382543678950179 0,00428884557551915 0,0152797699911118 522157 1431647 623 665 0 False 575 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 619 568 0,0147643650648735 0,0401327190716549 0,0115358205539025 0,0469520103761349 0,00925018762442018 0,0221122677204742 602804 1749015 623 665 0 False 619 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 667 575 0,0109462050898268 0,056440391434067 0,0108949416342412 0,0542915999084459 0,00168632047817775 0,0090272699985078 446915 2459716 623 665 0 True 663 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 265 611 0,012824215945286 0,0112595519469307 0,0115053025101091 0,0112153810940719 0,0058353995053968 0,00144275149804985 523591 490700 623 665 0 False 265 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 310 611 0,0128863297166022 0,0111597831842137 0,0117189288166629 0,0111543450064851 0,00597389531037531 0,00138887499691944 526127 486352 623 665 0 False 310 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 354 611 0,0228400125844068 0,0560638263087336 0,0129549095902953 0,0704661631189441 0,0207168028740747 0,0374807804535684 932519 2443305 623 665 0 False 354 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 398 611 0,0209698149359862 0,0589152900562232 0,012466620889601 0,0608072022583352 0,0181127010281479 0,0433200584409906 856162 2567574 623 665 0 False 398 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 442 611 0,0140943641917047 0,0111733442096888 0,0115053025101091 0,011306935225452 0,0109113722377944 0,00193404789469656 575449 486943 623 665 0 False 442 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 486 611 0,012903842077206 0,0109980146062111 0,011306935225452 0,0110475318532082 0,00743191366651126 0,00197167282802215 526842 479302 623 665 0 False 486 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 531 611 0,0125436507834455 0,0108547633675629 0,0111390859845884 0,0108644235904479 0,00715295175149188 0,00216927193116125 512136 473059 623 665 0 False 531 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 575 611 0,0113381390679824 0,0109724528762969 0,0112001220721752 0,0110322728313115 0,00213190105588076 0,00184961392354599 462917 478188 623 665 0 False 575 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 619 611 0,0121010901628172 0,0109121740033306 0,0111238269626917 0,0108491645685512 0,00491864314008342 0,00139122411505643 494067 475561 623 665 0 False 619 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 663 611 0,0120801733013408 0,0110573297514787 0,0112916762035554 0,0110475318532082 0,0049926885064762 0,00185419083986611 493213 481887 623 665 0 False 663 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 266 661 0,010812939699554 0,0456052009171475 0,0108339055466545 0,045990691996643 0,0014201169485702 0,00960806084995549 441474 1987510 623 665 0 True 265 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 309 654 0,0108649869251246 0,0110575133186594 0,0108796826123445 0,0110475318532082 0,00134561906078345 0,00127362921932985 443599 481895 623 665 0 False 309 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 354 654 0,0161970476119447 0,0111350704525103 0,0114442664225223 0,0111238269626917 0,015855359449896 0,00134201001059697 661298 485275 623 665 0 False 354 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 398 654 0,0152846168852711 0,0114137713246265 0,0115815976195926 0,0114137483787289 0,0127856309787949 0,00145570534914281 624045 497421 623 665 0 False 398 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 442 654 0,0111008771978166 0,0126042044915447 0,0109102006561379 0,0116731517509728 0,00156955035597536 0,00374560543669818 453230 549301 623 665 0 False 442 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 486 654 0,0109725593555745 0,0113399543720826 0,0109407186999313 0,011459525444419 0,00180401055085989 0,0016673950849787 447991 494204 623 665 0 False 486 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 530 654 0,0107511933204183 0,0119119497071817 0,0108644235904479 0,0117036697947662 0,00181277269785231 0,00239221668818183 438953 519132 623 665 0 False 530 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 575 654 0,0111984320681449 0,0112528287989371 0,0111696040283818 0,011261158159762 0,00165048810416679 0,00137760466649707 457213 490407 623 665 0 False 575 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 619 654 0,0115426295556477 0,0115008739518744 0,011306935225452 0,011459525444419 0,00210511716216157 0,00158095255933368 471266 501217 623 665 0 False 619 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 663 660 0,0113957951475086 0,046800200317686 0,0114137483787289 0,0466773479819944 0,00144336105110781 0,00934018772157727 465271 2039589 623 665 0 True 663 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B7_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B7_2.csv new file mode 100755 index 0000000..c2d8af1 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B7_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 266 263 0,00828782875017711 0,718642818995302 0,00816357671473259 0,738780804150454 0,00208223165223943 0,21053963815723 338378 31319011 623 665 11 True 266 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 310 264 0,00718430510402036 0,00686187889040523 0,00711070420386053 0,00685130083161669 0,00145862661053939 0,00122325713864408 293323 299046 623 665 0 False 310 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 356 264 0,0064513332111142 0,00670304738729405 0,00646982528419928 0,00666819256885634 0,00119748001511592 0,00124412864603259 263397 292124 623 665 0 True 354 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 400 263 0,00668477420260283 0,00655715737042308 0,00666819256885634 0,00659189745937285 0,00121745053574493 0,00131145612350549 272928 285766 623 665 0 True 399 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 444 263 0,00675065986697219 0,00689735324807785 0,00669871061264973 0,00686655985351339 0,00150560719938946 0,00158162510583366 275618 300592 623 665 0 True 443 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 488 263 0,00704442665449864 0,00712534368652233 0,00703440909437705 0,00718699931334401 0,00152400213913392 0,00154963888417996 287612 310528 623 665 0 True 487 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 532 264 0,00710208273402484 0,0071005391712286 0,00711070420386053 0,00714122224765393 0,00156354443786357 0,00147024610497138 289966 309447 623 665 0 True 531 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 577 264 0,00737471222476662 0,00736287961836383 0,00744640268558785 0,00740062561989776 0,00165448851482891 0,00174034306496127 301097 320880 623 665 0 True 575 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 620 265 0,00827318204858125 0,00795853217387713 0,00819409475852598 0,00788891432059205 0,00212725847460132 0,00179561563099406 337780 346839 623 665 0 False 620 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 661 262 0,00975044151355291 0,740391674998896 0,00970473792629892 0,753658350499733 0,00223224272775305 0,186711530162784 398094 32266843 623 665 13 True 664 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 266 307 0,00723591145897436 0,00684102106949681 0,00718699931334401 0,00685130083161669 0,00154170755923689 0,00144576122051379 295430 298137 623 665 0 False 266 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 310 307 0,00683489064755444 0,0066716115075971 0,00686655985351339 0,00668345159075303 0,00126419209871165 0,00113838827287613 279057 290754 623 665 0 False 310 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 357 309 0,0067842884978938 0,0067409769560087 0,00683604180972 0,00674448767833982 0,00126025745970254 0,00132391279324375 276991 293777 623 665 0 True 354 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 401 309 0,00687140943029597 0,00700607091085461 0,0068055237659266 0,00700389105058366 0,00142516264405583 0,00141856246957548 280548 305330 623 665 0 True 398 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 445 309 0,00701028367452433 0,00702630919252813 0,00697337300679027 0,00712596322575723 0,00166998091321528 0,00162427588430328 286218 306212 623 665 0 True 443 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 489 309 0,00702872676198534 0,00728373921757931 0,00712596322575723 0,00735484855420768 0,00162842995550648 0,00159727102061732 286971 317431 623 665 0 True 487 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 532 308 0,00744628022152769 0,00757703368056213 0,00749217975127794 0,00749217975127794 0,00146500220434131 0,0017115581892024 304019 330213 623 665 0 True 531 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 577 309 0,00777166722938902 0,00756521654330378 0,00776684214541848 0,0076752880140383 0,00176271271587223 0,00192523550843023 317304 329698 623 665 0 True 575 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 619 308 0,00802063666370671 0,00781670358087941 0,00801098649576562 0,00785839627679866 0,00188696770214224 0,00185755331311038 327469 340658 623 665 0 False 619 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 664 308 0,00832919710970122 0,00811364644157888 0,00840772106507973 0,00819409475852598 0,001865423217509 0,00186030186940874 340067 353599 623 665 0 False 664 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 268 353 0,0067263385046232 0,00663992322302667 0,00669871061264973 0,00666819256885634 0,00132018340776489 0,00144282028823539 274625 289373 623 665 0 True 266 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 313 353 0,00680292752785108 0,0068705065478987 0,00679026474402991 0,00686655985351339 0,00123399783008613 0,00124987958350494 277752 299422 623 665 0 True 310 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 357 353 0,00679540823455688 0,00695067951407473 0,0068055237659266 0,00691233691920348 0,00126506831003159 0,00132726759022017 277445 302916 623 665 0 True 354 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 401 353 0,00691270431138398 0,00734445406259985 0,00691233691920348 0,00727855344472419 0,00131392194092736 0,00157281471336532 282234 320077 623 665 0 True 398 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 445 353 0,00722631027665733 0,00722357507410091 0,00720225833524071 0,00720225833524071 0,00160737477675973 0,00175603714512276 295038 314809 623 665 0 True 443 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 489 353 0,00719816803563116 0,00712256723291405 0,00717174029144732 0,00717174029144732 0,00163148809333303 0,00162253358106208 293889 310407 623 665 0 True 487 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 533 353 0,00725041120369802 0,00720150112062027 0,00729381246662089 0,00717174029144732 0,00157793895866622 0,00167234786548743 296022 313847 623 665 0 True 531 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 577 353 0,00739325328347577 0,00739635768294621 0,00737010757610437 0,00741588464179446 0,001825597981279 0,00178747184811751 301854 322339 623 665 0 True 575 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 622 354 0,00770823084622298 0,00778444164886925 0,007690547035935 0,00778210116731518 0,00197023762477919 0,00196676310502473 314714 339252 623 665 0 True 619 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 666 353 0,00705875494953807 0,00716559079089346 0,00709544518196384 0,0072327763790341 0,00184373112392282 0,00188546547525099 288197 312282 623 665 0 True 664 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 269 398 0,00670772396747795 0,0067117209365827 0,00657663843747616 0,00669871061264973 0,00141501786726475 0,00145664123466085 273865 292502 623 665 0 True 266 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 313 397 0,00689198339240387 0,00679276584686711 0,00689707789730678 0,0068207827878233 0,00119644096928724 0,00132012221947479 281388 296034 623 665 0 True 310 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 357 397 0,00703695634682851 0,00710285670688509 0,00703440909437705 0,00714122224765393 0,00124114998803984 0,00135740839180363 287307 309548 623 665 0 True 354 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 402 398 0,00709155082485055 0,00729697900048817 0,00712596322575723 0,00735484855420768 0,00141466572262453 0,00141483994923338 289536 318008 623 665 0 True 398 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 446 397 0,00731688469555618 0,00727609823368217 0,00735484855420768 0,00721751735713741 0,00156491833014491 0,00154638434157759 298736 317098 623 665 0 True 443 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 490 398 0,00730206654427609 0,00716861964937521 0,0072480354009308 0,0072327763790341 0,00162093203390212 0,00165565821929378 298131 312414 623 665 0 True 487 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 534 398 0,00735607319480934 0,00720193709267447 0,00735484855420768 0,0072632944228275 0,0016383797220339 0,00153068987857788 300336 313866 623 665 0 True 531 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 578 398 0,00731061453567568 0,007307373492096 0,00727855344472419 0,00737010757610437 0,00180189569428082 0,00174857461914239 298480 318461 623 665 0 True 575 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 622 397 0,0071823456790577 0,00704806190344252 0,00715648126955062 0,00708018616006714 0,00184861474736751 0,00189326720033051 293243 307160 623 665 0 True 619 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 666 398 0,00657663843747616 0,00680100342410157 0,00657663843747616 0,00689707789730678 0,00180594310120095 0,0018046620492201 268513 296393 623 665 0 True 664 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 270 443 0,00700078046345544 0,00678441354014471 0,00694285496299687 0,00671396963454643 0,00139804967223757 0,00153339481458603 285830 295670 623 665 0 True 266 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 314 442 0,00706419235380945 0,00715726143006865 0,00700389105058366 0,00714122224765393 0,00141487865916646 0,00134128050415658 288419 311919 623 665 0 True 310 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 358 442 0,00724005074420797 0,00725340474096663 0,0072327763790341 0,00720225833524071 0,00135116240141435 0,0012919570939118 295599 316109 623 665 0 True 354 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 402 442 0,00728854651203375 0,00722040854023362 0,00727855344472419 0,00721751735713741 0,00154127564483723 0,0015283428430693 297579 314671 623 665 0 True 398 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 446 441 0,00752730244373358 0,00739091950521761 0,00750743877317464 0,00740062561989776 0,00185631287945751 0,0017847028787383 307327 322102 623 665 0 True 442 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 490 442 0,00762279991785111 0,00747065649933944 0,00756847486076143 0,00746166170748455 0,0019394746822838 0,00178646443668976 311226 325577 623 665 0 True 487 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 534 442 0,0073348134339645 0,00768689863821834 0,00738536659800107 0,00761425192645151 0,0016595987452552 0,00184012212638953 299468 335001 623 665 0 True 531 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 577 442 0,00713056787441947 0,0070671069984414 0,00711070420386053 0,00708018616006714 0,00181951397560691 0,00194806290896161 291129 307990 623 665 0 True 575 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 622 441 0,00672055820098336 0,00674648397143006 0,00675974670023652 0,00685130083161669 0,00173672921317754 0,00175771144407004 274389 294017 623 665 0 True 619 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 667 442 0,00652814266965038 0,00684505954747248 0,00653086137178607 0,00692759594110018 0,00179708003864528 0,00180212255322472 266533 298313 623 665 0 True 663 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 268 487 0,00712875540632902 0,00708801071114499 0,00709544518196384 0,00714122224765393 0,00142215051430236 0,00143209198888386 291055 308901 623 665 0 True 266 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 313 487 0,00713644614930745 0,00722600733924534 0,00715648126955062 0,00721751735713741 0,00150040797570569 0,00146701190021168 291369 314915 623 665 0 True 310 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 357 486 0,00721820315587434 0,00737767972230875 0,00720225833524071 0,00737010757610437 0,00143881374699544 0,0015130645967262 294707 321525 623 665 0 True 354 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 402 487 0,00736724191709648 0,00761285222669859 0,00740062561989776 0,0076752880140383 0,00156787279402216 0,00165137019508067 300792 331774 623 665 0 True 398 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 446 487 0,00765299955508807 0,00791562334538567 0,00761425192645151 0,00794995040817884 0,00200156841561858 0,00197428700012047 312459 344969 623 665 0 True 442 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 489 486 0,00765689391220135 0,00790144278067565 0,00758373388265812 0,00787365529869535 0,00195871323913729 0,00192701350635565 312618 344351 623 665 0 True 487 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 532 486 0,00721345155033989 0,00747813686195346 0,00715648126955062 0,00740062561989776 0,00161832878876493 0,00169770382626074 294513 325903 623 665 0 True 531 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 577 486 0,00707151570460738 0,00695724204078519 0,00704966811627375 0,00704966811627375 0,00181875459925696 0,00187059759284341 288718 303202 623 665 0 True 575 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 621 485 0,00680309897753532 0,00679253638789122 0,00686655985351339 0,00677500572213321 0,00178727251434448 0,00174835018706732 277759 296024 623 665 0 True 619 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 665 485 0,00687420161086775 0,00691008822123975 0,00691233691920348 0,00698863202868696 0,0017742704954868 0,0016920890586733 280662 301147 623 665 0 True 663 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 265 524 0,00714283877324812 0,00707311882360972 0,00718699931334401 0,00708018616006714 0,00142584063010037 0,0014811498059857 291630 308252 623 665 0 False 265 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 313 531 0,00713666658461575 0,00731542750214974 0,00711070420386053 0,00737010757610437 0,00143126600949809 0,00149867649111785 291378 318812 623 665 0 True 310 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 354 524 0,00723625435834282 0,00715650421544821 0,00727855344472419 0,00712596322575723 0,00145264135280701 0,00145816431304039 295444 311886 623 665 0 False 354 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 401 530 0,00721403937782869 0,00747708135066437 0,00721751735713741 0,00743114366369116 0,00156332887837351 0,00153151829495546 294537 325857 623 665 0 True 398 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 444 530 0,00734350838223629 0,00723318940519071 0,00732433051041428 0,00738536659800107 0,0018555913282137 0,00203169223992443 299823 315228 623 665 0 True 442 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 489 531 0,00738754645827203 0,00755840161171985 0,0072632944228275 0,00752269779507134 0,00190705374664448 0,00193151283129495 301621 329401 623 665 0 True 486 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 533 531 0,00747787594905054 0,00704888795575572 0,00753795681696803 0,00709544518196384 0,00192003025534563 0,00172740465438845 305309 307196 623 665 0 True 531 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 577 531 0,00709390213480574 0,00703323885360001 0,00706492713817044 0,00706492713817044 0,00163539037949221 0,00163499505491769 289632 306514 623 665 0 True 575 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 621 531 0,00730956134475825 0,00704443645162345 0,00720225833524071 0,00708018616006714 0,00180737061887971 0,00173574937118394 298437 307002 623 665 0 True 619 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 665 530 0,00696075920859316 0,00745344707614768 0,00697337300679027 0,00737010757610437 0,001772833915887 0,00209271343532991 284196 324827 623 665 0 True 663 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 265 567 0,00737356106260106 0,00720361214319846 0,00743114366369116 0,00729381246662089 0,00137624078529651 0,00125361436869949 301050 313939 623 665 0 False 265 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 310 567 0,00734960709243257 0,00733025055199225 0,00738536659800107 0,0072480354009308 0,00141072120387213 0,00138290122418022 300072 319458 623 665 0 False 310 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 354 567 0,00754890510394688 0,00728995755582593 0,00744640268558785 0,0072327763790341 0,00156818684719474 0,00129035415167652 308209 317702 623 665 0 False 354 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 398 567 0,00703538880685838 0,00719477797262669 0,00706492713817044 0,00717174029144732 0,00142111423083722 0,00135881371275513 287243 313554 623 665 0 False 398 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 442 568 0,00738460732082804 0,00719987196189145 0,00735484855420768 0,00729381246662089 0,00197445205295855 0,00193923871072438 301501 313776 623 665 0 False 442 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 486 568 0,00748397465924681 0,00728091687217586 0,00746166170748455 0,0072327763790341 0,00204992535982735 0,00198018668835151 305558 317308 623 665 0 False 486 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 531 568 0,00735391782735041 0,00717800452148912 0,00730907148851759 0,0072480354009308 0,00186999819235148 0,0017955792904365 300248 312823 623 665 0 False 531 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 575 568 0,00707242193865261 0,00713227334759421 0,00703440909437705 0,00708018616006714 0,00166978105575857 0,00176842428106176 288755 310830 623 665 0 False 575 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 619 568 0,00715055400903858 0,00708771241447634 0,00714122224765393 0,00701915007248035 0,00152294500078228 0,00153100076521827 291945 308888 623 665 0 False 619 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 667 575 0,00702948603915837 0,00710783596666191 0,00698863202868696 0,00706492713817044 0,0015235571789106 0,00164763710039848 287002 309765 623 665 0 True 663 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 265 611 0,00853540209420891 0,00836699209685922 0,00848401617456321 0,00840772106507973 0,00173113760667849 0,00135053945459783 348486 364640 623 665 0 False 265 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 310 611 0,00798159512132576 0,00784967683571483 0,00796520943007553 0,00778210116731518 0,00161503302197266 0,00144304174566628 325875 342095 623 665 0 False 310 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 354 611 0,00818089313284007 0,0075254971945772 0,00798046845197223 0,00755321583886473 0,00203736826418262 0,00135051850676016 334012 327967 623 665 0 False 354 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 398 611 0,00726601312496318 0,00717304820760989 0,00730907148851759 0,00712596322575723 0,00139865050912981 0,0013251031971352 296659 312607 623 665 0 False 398 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 442 611 0,00683045744857642 0,00692208892567881 0,0068055237659266 0,00703440909437705 0,00175929666138568 0,0017987538042805 278876 301670 623 665 0 False 442 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 486 611 0,00689818007384828 0,00704436761393068 0,00683604180972 0,00704966811627375 0,00197284021930413 0,00188809397642663 281641 306999 623 665 0 False 486 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 531 611 0,00693761350122176 0,00714700461384636 0,00692759594110018 0,0072480354009308 0,00168830698497685 0,00196359743196753 283251 311472 623 665 0 False 531 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 575 611 0,00711643552187631 0,00706302262867055 0,00712596322575723 0,00708018616006714 0,00163467966473943 0,00165174281220804 290552 307812 623 665 0 False 575 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 619 611 0,00739878865899527 0,00727343650956184 0,00740062561989776 0,0072632944228275 0,00155410802388924 0,00134848083967769 302080 316982 623 665 0 False 619 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 663 611 0,00767313264657938 0,00746023906183403 0,007690547035935 0,00744640268558785 0,00181010082318547 0,00157293445385172 313281 325123 623 665 0 False 663 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 266 661 0,00957477906565066 0,718019264228321 0,00921644922560464 0,7348744945449 0,00216091849683792 0,209071037349919 390922 31291836 623 665 12 True 265 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 309 654 0,00857681943935708 0,00799517677232679 0,00839246204318303 0,00796520943007553 0,00178811999858142 0,00133028715985095 350177 348436 623 665 0 False 309 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 354 654 0,00789246577833687 0,00786000248962989 0,00785839627679866 0,007690547035935 0,00145327510467473 0,00162213923228929 322236 342545 623 665 0 False 354 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 398 654 0,00757969256867264 0,0082101339409407 0,00761425192645151 0,00816357671473259 0,00142037423489815 0,00152248312176288 309466 357804 623 665 0 False 398 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 442 654 0,00730987975131468 0,0094262894590562 0,0072632944228275 0,00839246204318303 0,00155595975474791 0,00387551132531392 298450 410805 623 665 0 False 442 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 486 654 0,00727740228255863 0,00783203144046888 0,00720225833524071 0,00790417334248875 0,00168569913884869 0,00170300752048193 297124 341326 623 665 0 False 486 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 530 654 0,00728910984671051 0,0129255388413813 0,0072327763790341 0,00883497367818723 0,00182814530086792 0,0131617001701764 297602 563305 623 665 0 False 530 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 575 654 0,00789611520732982 0,00806977388538868 0,00785839627679866 0,00801098649576562 0,00202068301492417 0,00145498703477333 322385 351687 623 665 0 False 575 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 619 654 0,00901773904157912 0,00872627896130805 0,00862134737163348 0,00871290150301366 0,00355437418313063 0,00163052402841524 368179 380298 623 665 0 False 619 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 663 660 0,00972060926849645 0,7320126592517 0,00958266575112535 0,74009308003357 0,00193258561853724 0,198785952276101 396876 31901679 623 665 14 True 663 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B7_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B7_3.csv new file mode 100755 index 0000000..f1c77f0 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B7_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 266 263 0,000967343611252047 0,0717420468084838 0,00080872816052491 0,0725871671625849 0,000748618193305508 0,0234559788988054 39495 3126574 623 665 0 True 266 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 310 264 0,000909442603605513 0,000917881795355865 0,000839246204318303 0,000823987182421607 0,000622296319914548 0,000662072594850364 37131 40002 623 665 0 False 310 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 356 264 0,000829326615444849 0,000879149120225604 0,000747692072938125 0,000747692072938125 0,000617089836779423 0,000621487306022801 33860 38314 623 665 0 True 354 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 400 263 0,000906797379905926 0,000870383787346599 0,000717174029144732 0,000747692072938125 0,00072020977471749 0,000642005530096386 37023 37932 623 665 0 True 399 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 444 263 0,000808017868975947 0,000822105618819307 0,000625619897764553 0,000579842832074464 0,000741205493776155 0,000792245418860636 32990 35828 623 665 0 True 443 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 488 263 0,000895236772626245 0,000942204446800223 0,000656137941557946 0,000762951094834821 0,000828137759220238 0,000808417369603841 36551 41062 623 665 0 True 487 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 532 264 0,000867216995660241 0,000809921347199539 0,00064087891966125 0,000610360875867857 0,000782653595203336 0,000761813491770885 35407 35297 623 665 0 True 531 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 577 264 0,000850831304410017 0,000867309037069671 0,000610360875867857 0,000579842832074464 0,00081051759536401 0,00085849419393499 34738 37798 623 665 0 True 575 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 620 265 0,00106712732747539 0,00101257951470574 0,000747692072938125 0,000625619897764553 0,00101465581254878 0,00102857955659575 43569 44129 623 665 0 False 620 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 661 262 0,00112233412579827 0,0744263038002422 0,000869764248111696 0,0731517509727627 0,000980085446885951 0,0214151432101631 45823 3243556 623 665 0 True 664 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 266 307 0,000887423565587648 0,00092079592434967 0,000747692072938125 0,000762951094834821 0,00071210160433003 0,000726867637848187 36232 40129 623 665 0 False 266 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 310 307 0,000813920636675953 0,000837433478408771 0,000686655985351339 0,000747692072938125 0,000643642938475101 0,000550548994846533 33231 36496 623 665 0 False 310 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 357 309 0,000927959169502628 0,000940575288071403 0,000823987182421607 0,00080872816052491 0,000680293044209933 0,00068192098981355 37887 40991 623 665 0 True 354 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 401 309 0,000868294679389703 0,000906775980922781 0,000778210116731518 0,000793469138628214 0,000672965516083581 0,00066432327943672 35451 39518 623 665 0 True 398 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 445 309 0,000842969111747353 0,00094624292477589 0,000564583810177768 0,000686655985351339 0,000830117272469048 0,000886225511538765 34417 41238 623 665 0 True 443 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 489 309 0,000871233816833689 0,000883508840767517 0,000625619897764553 0,000671396963454643 0,000829696953626394 0,000821716542294527 35571 38504 623 665 0 True 487 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 532 308 0,000981549442231315 0,000835092996854691 0,000823987182421607 0,000686655985351339 0,000789875359381399 0,000737473303742384 40075 36394 623 665 0 True 531 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 577 309 0,0010201746068077 0,00096306226770864 0,000823987182421607 0,000656137941557946 0,000889132804508963 0,000982591736981276 41652 41971 623 665 0 True 575 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 619 308 0,000992595700458297 0,000992410070724993 0,00064087891966125 0,000625619897764553 0,00103914378394048 0,00102664713617991 40526 43250 623 665 0 False 619 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 664 308 0,00103815233084009 0,00103761348897536 0,000671396963454643 0,000701915007248035 0,00100962379339289 0,000950163323275242 42386 45220 623 665 0 False 664 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 268 353 0,000906772887093892 0,000835506023011293 0,000732433051041428 0,000671396963454643 0,000736184691492126 0,000696451336676991 37022 36412 623 665 0 True 266 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 313 353 0,000910079416718377 0,000902140909609799 0,000762951094834821 0,00080872816052491 0,000709594404921858 0,000646169368378381 37157 39316 623 665 0 True 310 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 357 353 0,000919656106223366 0,00091473820738617 0,000793469138628214 0,000854505226215 0,000655358748912602 0,000648408245912933 37548 39865 623 665 0 True 354 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 401 353 0,000839074754634071 0,000924604943349447 0,000701915007248035 0,000778210116731518 0,0006646017027805 0,000689970900546246 34258 40295 623 665 0 True 398 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 445 353 0,000850463912229518 0,000879332687406316 0,000579842832074464 0,000625619897764553 0,000813009148988948 0,000817575525364331 34723 38322 623 665 0 True 443 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 489 353 0,000853109135929106 0,000892365957236878 0,000564583810177768 0,000610360875867857 0,000824151309851473 0,000818970986136181 34831 38890 623 665 0 True 487 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 533 353 0,000847867674153997 0,000898699024971447 0,000564583810177768 0,000610360875867857 0,000830539518048839 0,000870851453861574 34617 39166 623 665 0 True 531 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 577 353 0,000926293658284369 0,000863913044226497 0,000656137941557946 0,000473029678797589 0,000927174088984589 0,000948786953012776 37819 37650 623 665 0 True 575 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 622 354 0,000987403224307254 0,00100821979416383 0,000610360875867857 0,000671396963454643 0,00105667329149089 0,00108425510675392 40314 43939 623 665 0 True 619 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 666 353 0,000903882735273972 0,00102611759428326 0,000457770656900893 0,000610360875867857 0,000998462639710991 0,00107035424362723 36904 44719 623 665 0 True 664 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 269 398 0,000873952518969377 0,000851109233371825 0,000732433051041428 0,000717174029144732 0,000704813567569719 0,000710044417502795 35682 37092 623 665 0 True 266 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 313 397 0,00094417341106862 0,000900006941134021 0,00080872816052491 0,000778210116731518 0,000703577347507121 0,000683574520568531 38549 39223 623 665 0 True 310 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 357 397 0,000945569501354514 0,000880021064333987 0,000747692072938125 0,000747692072938125 0,000762552580375334 0,000713303188462095 38606 38352 623 665 0 True 354 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 402 398 0,00095808532830349 0,000930203742361167 0,00080872816052491 0,000762951094834821 0,000737602192125434 0,000752351489799558 39117 40539 623 665 0 True 398 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 446 397 0,000909809995786012 0,000889887800297264 0,000671396963454643 0,000579842832074464 0,000821611608555726 0,000839192262002327 37146 38782 623 665 0 True 443 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 490 398 0,000934523243127531 0,000959849842046178 0,000610360875867857 0,000671396963454643 0,000889201869509061 0,000876295178056165 38155 41831 623 665 0 True 487 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 534 398 0,000855999287749026 0,000871393406840516 0,000656137941557946 0,000579842832074464 0,000791038514241932 0,000857466144416592 34949 37976 623 665 0 True 531 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 578 398 0,000944124425444554 0,000930295525951523 0,000625619897764553 0,000579842832074464 0,000927221919811988 0,00100851383649789 38547 40543 623 665 0 True 575 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 622 397 0,000987991051796052 0,00103332260612621 0,000656137941557946 0,000610360875867857 0,000992154107295016 0,00106448056920986 40338 45033 623 665 0 True 619 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 666 398 0,000979981902261189 0,000902140909609799 0,000610360875867857 0,000488288700694286 0,00097162417807211 0,00100560966858371 40011 39316 623 665 0 True 664 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 270 443 0,000872287007751118 0,00084702486360098 0,000732433051041428 0,000671396963454643 0,000762790397987893 0,000771399393044325 35614 36914 623 665 0 True 266 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 314 442 0,000891856764565661 0,00089557838289934 0,000762951094834821 0,000717174029144732 0,000736091217868391 0,000790547380834243 36413 39030 623 665 0 True 310 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 358 442 0,00100655660331723 0,000924949131813282 0,000900282291905089 0,00080872816052491 0,000771217997525131 0,00069632065585177 41096 40310 623 665 0 True 354 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 402 442 0,000912945075726264 0,000913866263277787 0,000762951094834821 0,000747692072938125 0,000788264767574721 0,000748703814444603 37274 39827 623 665 0 True 398 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 446 441 0,000893007926731222 0,000870957434786325 0,000595101853971161 0,000518806744487678 0,000888271772078602 0,000955548002473626 36460 37957 623 665 0 True 442 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 490 442 0,000950835455941656 0,000956591524588537 0,000686655985351339 0,00064087891966125 0,000896988201883707 0,000989979807441099 38821 41689 623 665 0 True 487 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 534 442 0,000850047534424954 0,000949937214287722 0,000564583810177768 0,000671396963454643 0,000816527290944525 0,00092416470069128 34706 41399 623 665 0 True 531 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 577 442 0,00091740276751631 0,000855262440835437 0,000610360875867857 0,000442511635004196 0,000924115031416853 0,000972316547347461 37456 37273 623 665 0 True 575 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 622 441 0,00100535645552761 0,000960377597690725 0,00064087891966125 0,000625619897764553 0,000981337861120816 0,000920457747194863 41047 41854 623 665 0 True 619 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 667 442 0,000961979685416771 0,000968179202870991 0,000671396963454643 0,000564583810177768 0,000963481582539167 0,000989075819381914 39276 42194 623 665 0 True 663 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 268 487 0,000875740494247802 0,000900075778826788 0,000732433051041428 0,000762951094834821 0,000748828734263652 0,000742674878585892 35755 39226 623 665 0 True 266 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 313 487 0,000872482950247384 0,000883118760508504 0,000701915007248035 0,000747692072938125 0,000776293528857489 0,000738215214677731 35622 38487 623 665 0 True 310 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 357 486 0,000841009686784695 0,000913063156862171 0,000701915007248035 0,000793469138628214 0,00072605338232189 0,000756154642365447 34337 39792 623 665 0 True 354 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 402 487 0,00093778078712795 0,000912971373271815 0,000732433051041428 0,000686655985351339 0,000843766010371911 0,000819754507553891 38288 39788 623 665 0 True 398 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 446 487 0,000959554897025483 0,000943007553215839 0,000610360875867857 0,000549324788281071 0,000988016606859296 0,00103940449028905 39177 41097 623 665 0 True 442 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 489 486 0,000784137377243557 0,00102664534992781 0,000442511635004196 0,000656137941557946 0,000829935156464012 0,00103877673637722 32015 44742 623 665 0 True 487 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 532 486 0,000848357530394661 0,000892457740827234 0,000564583810177768 0,00064087891966125 0,000830210228899086 0,000829299907439529 34637 38894 623 665 0 True 531 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 577 486 0,000931339177563213 0,000907647925031163 0,000671396963454643 0,000457770656900893 0,000925461698359078 0,00102163450884138 38025 39556 623 665 0 True 575 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 621 485 0,000964184038499761 0,000973778001882711 0,000610360875867857 0,000610360875867857 0,000951431541088345 0,000913095382731773 39366 42438 623 665 0 True 619 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 665 485 0,000868662071570201 0,000988807564803517 0,000457770656900893 0,00064087891966125 0,000960522373640139 0,000980970943332099 35466 43093 623 665 0 True 663 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 265 524 0,000842969111747353 0,000888878180803347 0,000686655985351339 0,000732433051041428 0,000738902452081456 0,000758621206843514 34417 38738 623 665 0 False 265 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 313 531 0,000837433736227845 0,000909483596838285 0,000717174029144732 0,000793469138628214 0,00071373161728043 0,000758504344936581 34191 39636 623 665 0 True 310 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 354 524 0,000877063106097596 0,000949248837360052 0,000762951094834821 0,000839246204318303 0,000733561264380948 0,000783700228727838 35809 41369 623 665 0 False 354 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 401 530 0,000961710264484406 0,000884174271797599 0,000732433051041428 0,000656137941557946 0,000845855634850273 0,000827126265797676 39265 38533 623 665 0 True 398 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 444 530 0,000878165282639091 0,000935251839830751 0,000457770656900893 0,000473029678797589 0,000952097351088481 0,00105477669591067 35854 40759 623 665 0 True 442 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 489 531 0,00083770315716021 0,00095021256505879 0,000473029678797589 0,000625619897764553 0,000935553383022738 0,00097529620414655 34202 41411 623 665 0 True 486 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 533 531 0,000897269676025003 0,0008783230679124 0,000549324788281071 0,000488288700694286 0,000944595513540992 0,000926462629032883 36634 38278 623 665 0 True 531 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 577 531 0,000927640762946196 0,000969647740316688 0,00064087891966125 0,000595101853971161 0,000870941531740262 0,000948608626500137 37874 42258 623 665 0 True 575 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 621 531 0,000904935926191401 0,000995553658694688 0,000595101853971161 0,000671396963454643 0,000900004744436162 0,000970679081741795 36947 43387 623 665 0 True 619 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 665 530 0,001041777267021 0,000955008257654895 0,000747692072938125 0,000549324788281071 0,0009941572490546 0,00105937542830706 42534 41620 623 665 0 True 663 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 265 567 0,000938882963669445 0,000912076483265844 0,000839246204318303 0,00080872816052491 0,000704539139362828 0,000670890062220155 38333 39749 623 665 0 False 265 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 310 567 0,000832633145069334 0,00102630116146397 0,000656137941557946 0,000885023270008392 0,000705243193704853 0,000800384880874668 33995 44727 623 665 0 False 310 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 354 567 0,00095010067158066 0,000935022380854861 0,000854505226215 0,000778210116731518 0,00069733998849481 0,000693115742353196 38791 40749 623 665 0 False 354 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 398 567 0,000830943141039041 0,000971965275973179 0,000656137941557946 0,00080872816052491 0,000733074312618116 0,000742960843072131 33926 42359 623 665 0 False 398 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 442 568 0,000916814940027513 0,000933806248282643 0,000564583810177768 0,000488288700694286 0,000936644336482165 0,00103687510970526 37432 40696 623 665 0 False 442 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 486 568 0,000856856536170189 0,000962213269497846 0,000473029678797589 0,000518806744487678 0,000963630404591176 0,0010811951731754 34984 41934 623 665 0 False 486 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 531 568 0,000907115786462357 0,000938601940878748 0,000473029678797589 0,000595101853971161 0,00104562807480914 0,000985848738734341 37036 40905 623 665 0 False 531 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 575 568 0,000944393846376919 0,000847414943859993 0,00064087891966125 0,000518806744487678 0,000867339426521068 0,000865740297226177 38558 36931 623 665 0 False 575 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 619 568 0,000889529947422505 0,000882453329478423 0,000686655985351339 0,00064087891966125 0,000766342097496445 0,00081719892074789 36318 38458 623 665 0 False 619 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 667 575 0,000927273370765698 0,000980615879364238 0,000671396963454643 0,000717174029144732 0,000847362996577646 0,000912927375465717 37859 42736 623 665 0 True 663 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 265 611 0,00106609862936999 0,00106225738298596 0,000915541313801785 0,000946059357595178 0,0007427992305062 0,000718784402258428 43527 46294 623 665 0 False 265 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 310 611 0,000949806757836261 0,000998766084357151 0,000823987182421607 0,000900282291905089 0,000763160583800168 0,000722796643083862 38779 43527 623 665 0 False 310 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 354 611 0,00106832747526502 0,00101145516572388 0,000946059357595178 0,000885023270008392 0,000773999625159936 0,000778251219011649 43618 44080 623 665 0 False 354 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 398 611 0,000860652922035338 0,000931190415957495 0,000671396963454643 0,000839246204318303 0,000665656096255787 0,00067675032348434 35139 40582 623 665 0 False 398 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 442 611 0,000875324116443237 0,000886101727195076 0,000518806744487678 0,000488288700694286 0,000943966123872908 0,000956737347810506 35738 38617 623 665 0 False 442 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 486 611 0,000860652922035338 0,000930823281596071 0,000473029678797589 0,000473029678797589 0,000924380528632855 0,00102555503314224 35139 40566 623 665 0 False 486 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 531 611 0,000908536369560284 0,000926922479005938 0,000473029678797589 0,000488288700694286 0,00102029530903253 0,00105310777167679 37094 40396 623 665 0 False 531 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 575 611 0,000951888646859085 0,000904068365007277 0,000656137941557946 0,000579842832074464 0,000920029454500751 0,000906696169606739 38864 39400 623 665 0 False 575 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 619 611 0,000928032647938728 0,000956132606636757 0,000747692072938125 0,000778210116731518 0,000713939809570364 0,000724918729969605 37890 41669 623 665 0 False 619 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 663 611 0,00099702889943631 0,00102625526966879 0,000823987182421607 0,000839246204318303 0,000787580282311255 0,000849366394010548 40707 44725 623 665 0 False 663 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 266 661 0,000989313663645846 0,0716846591186137 0,000869764248111696 0,0721141374837873 0,000703535511505986 0,0232276087779992 40392 3124073 623 665 0 True 265 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 309 654 0,00100533196271557 0,000894408142122301 0,000930800335698482 0,000762951094834821 0,000679111211210694 0,000632735322412128 41046 38979 623 665 0 False 309 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 354 654 0,000969621442771136 0,000927748531319142 0,000885023270008392 0,000823987182421607 0,000651703868099061 0,000624598082796031 39588 40432 623 665 0 False 354 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 398 654 0,000975891602651641 0,000917078688940249 0,00080872816052491 0,000762951094834821 0,00071878658999212 0,000712358077707033 39844 39967 623 665 0 False 398 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 442 654 0,000913385946342862 0,00100647590594706 0,000717174029144732 0,00080872816052491 0,000785038285085148 0,000869427422409582 37292 43863 623 665 0 False 442 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 486 654 0,000832290245700869 0,000962718079244805 0,000595101853971161 0,000701915007248035 0,000790630084820762 0,000898736668203496 33981 41956 623 665 0 False 486 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 530 654 0,000935821362165292 0,00137122389402208 0,000564583810177768 0,000823987182421607 0,000918386538390666 0,0015205337946031 38208 59759 623 665 0 False 530 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 575 654 0,000946524721023809 0,000988210971466203 0,000762951094834821 0,00080872816052491 0,000800983564875886 0,000735832736770979 38645 43067 623 665 0 False 575 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 619 654 0,00109027303484678 0,00115277894897463 0,000946059357595178 0,00100709544518196 0,000748981895770781 0,000816530606871622 44514 50239 623 665 0 False 619 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 663 660 0,00118579500177634 0,0735299452568248 0,00105287251087205 0,0724498359655146 0,000776972724676448 0,0230998145063551 48414 3204492 623 665 0 True 663 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B8_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B8_1.csv new file mode 100755 index 0000000..67088ec --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B8_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 237 242 0,0107293801028074 0,0472038645480719 0,0105897611963073 0,0470283054856184 0,00219881177810499 0,00819139963009103 469001 2057181 667 665 0 True 237 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 281 242 0,0107169578406036 0,010593294864536 0,0106355382619974 0,010605020218204 0,00160914208896961 0,00155799599182285 468458 461664 667 665 0 False 281 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 326 242 0,0106273025080502 0,0630813472224852 0,0106202792401007 0,0620126649881743 0,00134378113920785 0,0103947166629562 464539 2749134 667 665 0 True 325 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 370 241 0,0105114300254313 0,0818719951630048 0,0105592431525139 0,0809185931181811 0,00130527104482029 0,0111525217260978 459474 3568045 667 665 0 True 369 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 414 240 0,0105264145221964 0,0685460733545927 0,0105745021744106 0,0662546730754559 0,00151698951968863 0,0145364861765508 460129 2987291 667 665 0 True 414 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 458 241 0,0104970860873065 0,0668428452683551 0,010452429999237 0,0674601358052949 0,00163604136354126 0,0189982681914342 458847 2913063 667 665 0 True 458 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 502 241 0,010356506342846 0,0796428471040269 0,0102998397802701 0,0767223620965896 0,00168394414127955 0,0215815592856525 452702 3470897 667 665 0 True 502 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 547 241 0,0102891104230444 0,06892945341151 0,0102998397802701 0,0666819256885634 0,00155276448935927 0,0181071950561915 449756 3003999 667 665 0 True 547 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 591 242 0,0103164714278247 0,0105099094726975 0,0103608758678569 0,0105897611963073 0,00182322565750666 0,00195609691053548 450952 458030 667 665 0 False 591 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 633 241 0,0103848968168697 0,0470956516950421 0,0103456168459602 0,0465857938506142 0,00185061303098985 0,00821503734744197 453943 2052465 667 665 0 True 635 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 237 286 0,0105483765327224 0,010657336864707 0,010605020218204 0,0107118333714809 0,00167079165142741 0,00156415502416159 461089 464455 667 665 0 False 237 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 281 286 0,0108254410217642 0,0106078884554026 0,0107881284809644 0,0106202792401007 0,00142265335643323 0,00144496923978935 473200 462300 667 665 0 False 281 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 326 285 0,011061418249447 0,107406190000063 0,011108567940795 0,105027847714961 0,00129260938098719 0,0238051305573198 483515 4680845 667 665 0 True 325 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 370 286 0,0109545593419816 0,0527596170559151 0,0109864957656214 0,0513313496604868 0,00136839810642293 0,00750186666794496 478844 2299305 667 665 0 True 369 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 414 285 0,0108028155755036 0,0756391780550025 0,0107881284809644 0,0732127870603494 0,00149313256594674 0,013501084510188 472211 3296414 667 665 0 True 414 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 459 286 0,0106062784583904 0,0415030251297734 0,0106355382619974 0,042221713588159 0,00189773873038864 0,00679594661867016 463620 1808734 667 665 0 True 458 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 503 286 0,0107910109948459 0,0435097815493185 0,0108033875028611 0,0462348363469902 0,00187850010085432 0,00803536275751607 471695 1896190 667 665 0 True 502 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 547 285 0,0107083560531476 0,0525939935671176 0,0107728694590677 0,0533760585946441 0,00157849654342149 0,00973628404951019 468082 2292087 667 665 0 True 547 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 591 286 0,0104541000271208 0,0104731271988623 0,0105897611963073 0,0103913939116503 0,0018547032957186 0,00197772717358374 456968 456427 667 665 0 False 591 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 635 286 0,010509485472416 0,0103909579395961 0,0105439841306172 0,0104371709773404 0,00188311606522551 0,00193963865564024 459389 452846 667 665 0 False 635 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 238 330 0,0109991239216739 0,0565326109964772 0,0110322728313115 0,0540474555580987 0,00156013122582869 0,0130467054272216 480792 2463735 667 665 0 True 236 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 283 331 0,0110549440317607 0,0723013760081137 0,0110322728313115 0,0725108720531014 0,00141498436294477 0,0232602328634306 483232 3150950 667 665 0 True 281 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 327 330 0,0110330735296119 0,0418830780315403 0,0110017547875181 0,0427710383764401 0,00136455634189726 0,00691339970268207 482276 1825297 667 665 0 True 325 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 371 330 0,0109923980559503 0,0365220214647399 0,0110322728313115 0,0371404592965591 0,00133987629386467 0,00490345925687483 480498 1591658 667 665 0 True 369 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 415 329 0,011006581854415 0,0715488423507843 0,0109864957656214 0,0671854734111543 0,00159633015684342 0,0127924669843167 481118 3118154 667 665 0 True 414 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 459 330 0,0110865830531747 0,0359707692210613 0,0109712367437247 0,0359807736324102 0,00198963659933275 0,0062783657993834 484615 1567634 667 665 0 True 458 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 504 330 0,0109681940901831 0,0315513205077239 0,0110017547875181 0,0314183260852979 0,00171139112497834 0,00449309784517983 479440 1375031 667 665 0 True 502 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 548 330 0,0107957236762713 0,0530530950860787 0,0108186465247578 0,0524910353246357 0,00162350407203815 0,0105216046475086 471901 2312095 667 665 0 True 547 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 591 330 0,0109246361026399 0,0619789804105136 0,0110170138094148 0,0611123826962692 0,00199755449470035 0,0139802991164273 477536 2701092 667 665 0 True 591 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 636 329 0,0107019504667442 0,0698647970349311 0,0106660563057908 0,0687876707103075 0,00194179368462291 0,0197213173869404 467802 3044762 667 665 0 True 635 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 238 374 0,0109786260451829 0,0517684919554551 0,0109407186999313 0,0533607995727474 0,00156662925103445 0,0137832333561339 479896 2256111 667 665 0 True 236 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 283 375 0,0109292572756881 0,0360624610278271 0,0108949416342412 0,0352178225375753 0,00143470609934786 0,00560270903419876 477738 1571630 667 665 0 True 281 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 327 374 0,0110304197866734 0,093530048513364 0,010955977721828 0,0892500190737774 0,00143282094931652 0,0228618511789413 482160 4076112 667 665 0 True 325 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 371 373 0,0109072266338792 0,0716561144220129 0,0109712367437247 0,0707866025787747 0,00142011145409598 0,0202927690387562 476775 3122829 667 665 0 True 369 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 415 374 0,0110023267148756 0,0465815488595602 0,0109712367437247 0,0469672693980316 0,0015734046474721 0,00865575814961581 480932 2030060 667 665 0 True 414 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 459 374 0,0111930530500371 0,0593557824522395 0,0111390859845884 0,0578774700541695 0,00174539259197745 0,0133045238966259 489269 2586771 667 665 0 True 458 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 503 374 0,0111135093931633 0,0448547553364987 0,0110933089188983 0,0443732356755932 0,00188631323757412 0,00610983774723836 485792 1954805 667 665 0 True 502 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 547 374 0,0109585628334837 0,0545954035925245 0,0108796826123445 0,0543221179522393 0,00176364949585435 0,00814832711582682 479019 2379310 667 665 0 True 546 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 591 374 0,011099966153339 0,0490597746368668 0,0110933089188983 0,0469367513542382 0,00207148572738112 0,0116545222937348 485200 2138063 667 665 0 True 591 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 635 373 0,0110081146197329 0,097545465861954 0,0110780498970016 0,0883039597161822 0,001896154628582 0,0226566624204296 481185 4251107 667 665 0 True 635 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 239 419 0,0107878310787385 0,0481276893309034 0,0107118333714809 0,0470588235294118 0,00160963727648907 0,00794470493361015 471556 2097442 667 665 0 True 236 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 283 418 0,0108541746522024 0,059745518522789 0,0108339055466545 0,0594491493095293 0,00147014063039228 0,00931615314856238 474456 2603756 667 665 0 True 281 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 327 419 0,0110325702335374 0,0381094874976409 0,010955977721828 0,038101777676051 0,00139071949405663 0,00507750422449434 482254 1660841 667 665 0 True 325 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 371 418 0,0111694438887217 0,0559908813002981 0,0111696040283818 0,055039291981384 0,00138251546107895 0,0098389302405628 488237 2440126 667 665 0 True 369 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 415 418 0,0112962058682263 0,0963798601562271 0,011261158159762 0,0956740672922866 0,00162427305942502 0,0133670805402143 493778 4200309 667 665 0 True 414 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 459 418 0,011521957034758 0,0652604502788213 0,0115053025101091 0,0619974059662776 0,00182475833539251 0,0164464784632569 503646 2844101 667 665 0 True 458 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 503 418 0,0112526021264945 0,0571165381983225 0,0113374532692454 0,054337376974136 0,00169807188502743 0,0100307212751986 491872 2489183 667 665 0 True 502 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 547 418 0,0111898045026468 0,0333789383047915 0,0112458991378653 0,0335698481727321 0,00164967402443529 0,00378880286070891 489127 1454680 667 665 0 True 546 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 592 418 0,0108827938971691 0,0435556045068037 0,0108949416342412 0,0435187304493782 0,00193243968323024 0,00641990731911995 475707 1898187 667 665 0 True 591 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 635 417 0,0109477190907865 0,0728429680289072 0,010955977721828 0,0733653772793164 0,00185211133340839 0,0123553765414866 478545 3174553 667 665 0 True 635 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 238 464 0,010938774146916 0,0558363177341385 0,0108033875028611 0,0562294956893263 0,00177733074197705 0,0142564268327062 478154 2433390 667 665 0 True 236 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 282 463 0,0111474818781957 0,0574256194388466 0,0112306401159686 0,0566567483024338 0,00168375992020064 0,00760963906830948 487277 2502653 667 665 0 True 281 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 326 463 0,0112073512339733 0,0760937362862409 0,0112764171816587 0,0737926298924239 0,00158449143344246 0,0202130861374907 489894 3316224 667 665 0 True 325 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 371 462 0,0114591365338159 0,0912003744770487 0,0114442664225223 0,0855878538185702 0,00146966844510783 0,0224009165804958 500900 3974583 667 665 0 True 369 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 415 461 0,0118435632263978 0,0992933007731047 0,0117494468604562 0,0959487296864271 0,00212234647079165 0,0330963407200737 517704 4327279 667 665 0 True 414 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 459 462 0,011334730895024 0,0483149737470249 0,011459525444419 0,0491340505073625 0,00189634752218181 0,00612325574409807 495462 2105604 667 665 0 True 458 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 503 462 0,0110722619921442 0,0481346648837704 0,0111848630502785 0,0482185091935607 0,00195474581381465 0,00969392258226552 483989 2097746 667 665 0 True 502 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 546 462 0,0112466312048828 0,0987528101553953 0,011261158159762 0,0944838635843442 0,00200619928974265 0,0203904412310687 491611 4303724 667 665 0 True 546 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 591 462 0,0111943799215064 0,0727445760200455 0,011306935225452 0,0703135728999771 0,00194547593012403 0,0243659789182751 489327 3170265 667 665 0 True 591 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 635 462 0,0110223441723862 0,0836349973124617 0,0110933089188983 0,0785687037460899 0,00183839950808013 0,0184073398653913 481807 3644878 667 665 0 True 635 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 238 508 0,0109011184497017 0,0528884582708775 0,0109102006561379 0,0557106889448386 0,00148346350272755 0,0120470042744388 476508 2304920 667 665 0 True 236 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 282 506 0,0111816373799825 0,111638950890616 0,0112153810940719 0,10955977721828 0,00161959684745298 0,0315131558567201 488770 4865312 667 665 0 True 281 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 326 507 0,0112598312882927 0,0592508967543601 0,0112458991378653 0,0599679560540169 0,00152078733030025 0,0136956259057291 492188 2582200 667 665 0 True 325 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 370 506 0,0114278406688164 0,0601544144178253 0,0114290074006256 0,0599984740978103 0,00158137125953647 0,0121238383254772 499532 2621576 667 665 0 True 369 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 414 506 0,0116675468628698 0,0609077970733655 0,0115968566414893 0,0610360875867857 0,00180569019171506 0,0109471008473995 510010 2654409 667 665 0 True 413 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 459 506 0,0115061489625981 0,0633626180351313 0,0114900434882124 0,0623025864042115 0,002064647695453 0,0148422538079144 502955 2761392 667 665 0 True 458 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 504 507 0,0112750445560008 0,0769256398033307 0,0112916762035554 0,0750896467536431 0,00187053156230232 0,0174898861788276 492853 3352479 667 665 0 True 502 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 547 506 0,0112850876003976 0,0646849212754936 0,0112458991378653 0,0630045014114595 0,0017071359176335 0,0174311317415721 493292 2819019 667 665 0 True 546 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 591 507 0,0109678509337686 0,0494175700179724 0,0110475318532082 0,0460517280842298 0,00182434753625945 0,0106447530386954 479425 2153656 667 665 0 True 591 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 636 507 0,0109591576379354 0,0658083294755543 0,010955977721828 0,0654001678492409 0,00185209723678911 0,0142715968588096 479045 2867978 667 665 0 True 635 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 239 552 0,010938545375973 0,0468669269878748 0,0109407186999313 0,0474860761425193 0,00137967580075107 0,00903153853034728 478144 2042497 667 665 0 True 236 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 282 551 0,0109826295366851 0,0547903748843383 0,0109864957656214 0,0559700923170825 0,00153383276434664 0,0127577891036677 480071 2387807 667 665 0 True 281 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 327 551 0,0112059786083154 0,055252344640498 0,0112001220721752 0,054337376974136 0,00150539806649945 0,0129609051235358 489834 2407940 667 665 0 True 325 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 371 551 0,0114460508358776 0,0531531391995668 0,0114900434882124 0,0518959334706645 0,00146211503591018 0,0076285010863893 500328 2316455 667 665 0 True 369 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 416 551 0,0115391834867643 0,0926596647260174 0,0115663385976959 0,0861982146944381 0,00186769051298156 0,0221120926560429 504399 4038180 667 665 0 True 413 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 459 551 0,0114060845521391 0,0656668450710204 0,0113679713130388 0,0646219577325094 0,00211686597997601 0,012638235826451 498581 2861812 667 665 0 True 458 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 504 551 0,011257932489466 0,0632590402534145 0,0112458991378653 0,061371786068513 0,00219645883062813 0,0117622885979078 492105 2756878 667 665 0 True 502 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 548 551 0,0109783057658628 0,0405479939262209 0,0110475318532082 0,0416571297779812 0,00180041644369096 0,00807411624300071 479882 1767113 667 665 0 True 546 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 592 551 0,0109857636986039 0,0545823703226939 0,0110017547875181 0,0527809567406729 0,00169154074733717 0,0113233714613179 480208 2378742 667 665 0 True 591 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 636 550 0,0108585441772133 0,0554967872875138 0,0108339055466545 0,0535439078355077 0,00184807599409111 0,00790585051372798 474647 2418593 667 665 0 True 635 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 236 589 0,0109834988662684 0,01048476076894 0,0107423514152743 0,0104676890211337 0,00205193431600529 0,00116947689140079 480109 456934 667 665 0 False 236 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 280 589 0,011093286041804 0,0106849407795066 0,0108949416342412 0,0106813153276875 0,00200721750972388 0,0015386885068213 484908 465658 667 665 0 False 280 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 327 595 0,0109705504308958 0,0789424235801222 0,0110017547875181 0,0757915617608911 0,00143862585937607 0,0119630727602546 479543 3440372 667 665 0 True 325 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 371 594 0,0111020250918258 0,0790802595869394 0,0111543450064851 0,0766765850308995 0,00139475219701633 0,0243811918757483 485290 3446379 667 665 0 True 369 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 413 590 0,0111823465699057 0,0110744932828753 0,0112458991378653 0,0110322728313115 0,00168794148961687 0,00161062924044779 488801 482635 667 665 0 False 413 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 458 590 0,0112708122935557 0,0109702959619236 0,0111390859845884 0,0110322728313115 0,00193426825836603 0,00190234405931786 492668 478094 667 665 0 False 458 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 502 590 0,011221077490552 0,0107888398037896 0,0111390859845884 0,0108033875028611 0,00212329208619624 0,00209040447792259 490494 470186 667 665 0 False 502 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 546 590 0,0110931259021439 0,0109708007716705 0,0110017547875181 0,0110780498970016 0,00219226677679165 0,00185359853140129 484901 478116 667 665 0 False 546 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 591 590 0,0108941409359408 0,0106976986985661 0,0108339055466545 0,0106660563057908 0,00179253613113922 0,00161579788835099 476203 466214 667 665 0 False 591 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 635 590 0,0108968175559737 0,0107000850719153 0,0108644235904479 0,0107423514152743 0,00163125771205062 0,00144834363551354 476320 466318 667 665 0 False 635 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 237 639 0,0108150090667644 0,0450312092889583 0,0108033875028611 0,0457160296025025 0,00143979719196252 0,0103084016596902 472744 1962495 667 665 0 True 236 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 280 633 0,0104527731556515 0,0106767490940673 0,0105134660868238 0,0107118333714809 0,00140756478778527 0,00137229246931286 456910 465301 667 665 0 False 280 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 325 633 0,0110498881939209 0,0105467376383279 0,010605020218204 0,0105287251087205 0,00282031765993333 0,00130445689988459 483011 459635 667 665 0 False 325 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 369 633 0,0110567741993046 0,0106162178162275 0,0108796826123445 0,010605020218204 0,00187329606682992 0,00132448578232946 483312 462663 667 665 0 False 369 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 413 633 0,0108284607982116 0,0106473783451533 0,0107881284809644 0,0105592431525139 0,00159166383870932 0,00142706764610052 473332 464021 667 665 0 False 413 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 458 633 0,0109083018573112 0,0105962089935298 0,0108491645685512 0,0105745021744106 0,00194239209878892 0,00181578805480289 476822 461791 667 665 0 False 458 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 502 633 0,0107339326445727 0,0107185565194745 0,0107881284809644 0,0108339055466545 0,00190083170485958 0,00190114949669081 469200 467123 667 665 0 False 502 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 546 633 0,010774814012083 0,0106051120017944 0,0107118333714809 0,0107118333714809 0,00182811345845444 0,00182525848998444 470987 462179 667 665 0 False 546 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 590 633 0,0107461261358334 0,0107723187575255 0,0107270923933776 0,0107423514152743 0,00157976794704548 0,00147631500171176 469733 469466 667 665 0 False 590 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 635 639 0,010733955521667 0,0457448955416695 0,0107118333714809 0,0458228427557794 0,00142292548875068 0,00890756831170337 469201 1993598 667 665 0 True 635 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B8_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B8_2.csv new file mode 100755 index 0000000..0ab566f --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B8_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 237 242 0,00846040701324778 0,713883357971491 0,00833142595559625 0,703044174868391 0,00216254351597341 0,175979747471347 369820 31111590 667 665 9 True 237 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 281 242 0,00689307440580465 0,00654852971292961 0,00685130083161669 0,00659189745937285 0,00166332112390216 0,00130962140248811 301309 285390 667 665 0 False 281 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 326 242 0,00637278065018761 0,00643744862270118 0,0063935301747158 0,00643930724040589 0,00125562807953383 0,00118915525609104 278566 280549 667 665 0 True 325 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 370 241 0,0063207352606599 0,00640702236249814 0,00630197604333562 0,00645456626230259 0,00118934255833983 0,00111207567527947 276291 279223 667 665 0 True 369 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 414 240 0,0062380803189616 0,00630608335900406 0,00628671702143893 0,00621042191195544 0,00135242980975272 0,00133216057474669 272678 274824 667 665 0 True 414 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 458 241 0,00635921453326896 0,00645518580153749 0,0064087891966125 0,00651560234988937 0,00152688200835028 0,00144368980431615 277973 281322 667 665 0 True 458 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 502 241 0,00654996374552481 0,00654641869035142 0,00653086137178607 0,00654612039368277 0,00158038891802807 0,0015029030577064 286311 285298 667 665 0 True 502 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 547 241 0,00677955826389849 0,00703333063719037 0,00683604180972 0,00706492713817044 0,00157075241846622 0,00139937514293471 296347 306518 667 665 0 True 547 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 591 242 0,00741947634559923 0,00728998050172352 0,00732433051041428 0,00718699931334401 0,0019819140541172 0,00183139839918624 324319 317703 667 665 0 False 591 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 633 241 0,00889324163736397 0,738408552853867 0,00891126878767071 0,737514305333028 0,00183852458422616 0,169107646395008 388740 32180417 667 665 9 True 635 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 237 286 0,00700926716774366 0,00676947576081426 0,00700389105058366 0,00679026474402991 0,00148900020584243 0,00145022970539812 306388 295019 667 665 0 False 237 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 281 286 0,00666736899346161 0,00648040334298782 0,00666819256885634 0,00653086137178607 0,00132360725839123 0,00124382158983598 291443 282421 667 665 0 False 281 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 326 285 0,0064957450320388 0,00660715648126955 0,00643930724040589 0,00662241550316625 0,00129013702436878 0,00124800836626624 283941 287945 667 665 0 True 325 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 370 286 0,00650713782499915 0,00675508868302594 0,00656137941557946 0,00674448767833982 0,00123931685705699 0,00121537066092918 284439 294392 667 665 0 True 369 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 414 285 0,0065544247789129 0,00653253642231007 0,00650034332799268 0,00657663843747616 0,00137563704085346 0,0013461808227927 286506 284693 667 665 0 True 414 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 459 286 0,00676127946555447 0,00673748917957517 0,00679026474402991 0,00674448767833982 0,00166675056500132 0,00182012425388636 295548 293625 667 665 0 True 458 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 503 286 0,00711903146618497 0,00690777068558326 0,00700389105058366 0,00689707789730678 0,00175516906212947 0,00155641274786606 311186 301046 667 665 0 True 502 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 547 285 0,00714980115801564 0,00715040060668953 0,0072327763790341 0,00715648126955062 0,00150383740340034 0,00139735373553251 312531 311620 667 665 0 True 547 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 591 286 0,007357868330655 0,00729167849814511 0,00727855344472419 0,0072327763790341 0,00182672047734573 0,00183843045789063 321626 317777 667 665 0 False 591 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 635 286 0,00794359057596402 0,00767191496709271 0,00788891432059205 0,0076600289921416 0,00185423318181345 0,00200655791181311 347229 334348 667 665 0 False 635 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 238 330 0,00653614598056888 0,00668739828513834 0,00654612039368277 0,00669871061264973 0,00141504855183199 0,00139465478248673 285707 291442 667 665 0 True 236 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 283 331 0,00661150312918615 0,00664997352617066 0,00666819256885634 0,00665293354695964 0,00124475040644984 0,00136100627467167 289001 289811 667 665 0 True 281 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 327 330 0,00680385373804286 0,00687153911329021 0,00674448767833982 0,00685130083161669 0,00127153938923489 0,00118104485431893 297409 299467 667 665 0 True 325 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 371 330 0,00676983549882189 0,00662294325881079 0,00671396963454643 0,00665293354695964 0,00122080402418636 0,00121593765197829 295922 288633 667 665 0 True 369 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 415 329 0,00682796619543284 0,00693326357780466 0,0068207827878233 0,00698863202868696 0,00155509595878545 0,001523539831289 298463 302157 667 665 0 True 414 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 459 330 0,0071513110462393 0,00691570996614907 0,00714122224765393 0,00700389105058366 0,0017640518023142 0,00148682218095764 312597 301392 667 665 0 True 458 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 504 330 0,00720077132411135 0,00713817044327459 0,00727855344472419 0,00718699931334401 0,0015570219490945 0,0015840557727207 314759 311087 667 665 0 True 502 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 548 330 0,0072980676061603 0,0072645335012973 0,0072632944228275 0,0072480354009308 0,00161056557961551 0,00137333818168363 319012 316594 667 665 0 True 547 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 591 330 0,00754305840899646 0,00787957534027332 0,00753795681696803 0,00775158312352178 0,00187290107742438 0,00239804949962882 329721 343398 667 665 0 True 591 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 636 329 0,00749092151109156 0,00768132278510421 0,00755321583886473 0,007690547035935 0,00189064297897491 0,00188869213881306 327442 334758 667 665 0 True 635 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 238 374 0,00657229178955956 0,00672128937587732 0,00656137941557946 0,00674448767833982 0,00146923719318521 0,00151344055385384 287287 292919 667 665 0 True 236 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 283 375 0,00650722933337634 0,00658356809854804 0,00651560234988937 0,00662241550316625 0,00133856972993422 0,00135686747573845 284443 286917 667 665 0 True 281 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 327 374 0,00674785061120161 0,00698418052455469 0,00677500572213321 0,00700389105058366 0,00124951621468003 0,0013343017851625 294961 304376 667 665 0 True 325 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 371 373 0,00684420893238435 0,00707291231053142 0,00683604180972 0,00708018616006714 0,00131676646457674 0,00128206209432133 299173 308243 667 665 0 True 369 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 415 374 0,00703676543508973 0,00701995317889597 0,00703440909437705 0,00701915007248035 0,00148083580534863 0,00140568655133321 307590 305935 667 665 0 True 414 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 459 374 0,00704985113302813 0,00724454762449727 0,00714122224765393 0,00721751735713741 0,0016908562303731 0,00169279572857657 308162 315723 667 665 0 True 458 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 503 374 0,00692135049435685 0,00694790306046646 0,00686655985351339 0,00697337300679027 0,00171730850650168 0,001753046579118 302545 302795 667 665 0 True 502 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 547 374 0,00705643973618592 0,00731987900628201 0,00712596322575723 0,00733958953231098 0,00170597251766028 0,00154617597847072 308450 319006 667 665 0 True 546 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 591 374 0,00721815791577775 0,00726932919389341 0,0072480354009308 0,00744640268558785 0,00185550414630138 0,00196729787403957 315519 316803 667 665 0 True 591 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 635 373 0,00697529468271129 0,00700880147266771 0,00698863202868696 0,00701915007248035 0,00191081064290677 0,0018510403509433 304903 305449 667 665 0 True 635 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 239 419 0,00667247058549004 0,00680065923563773 0,00666819256885634 0,00679026474402991 0,00144033696835274 0,00146384996524318 291666 296378 667 665 0 True 236 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 283 418 0,00683119186572884 0,00682599150657601 0,00685130083161669 0,00675974670023652 0,00139742106528608 0,00147477978338437 298604 297482 667 665 0 True 281 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 327 419 0,00673826510869079 0,00708950219448828 0,00674448767833982 0,00717174029144732 0,00133153133967259 0,00126572797753941 294542 308966 667 665 0 True 325 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 371 418 0,00711203107532981 0,00716896383783905 0,00711070420386053 0,00721751735713741 0,00135352240466288 0,00128639884744609 310880 312429 667 665 0 True 369 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 415 418 0,00715602372766466 0,00707470209054336 0,00717174029144732 0,00698863202868696 0,00160041346151036 0,00147241914696406 312803 308321 667 665 0 True 414 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 459 418 0,0073447826327166 0,00726873260055609 0,0072480354009308 0,00729381246662089 0,00160945325158739 0,00156701403973589 321054 316777 667 665 0 True 458 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 503 418 0,00724270503795939 0,0071807580291998 0,0072632944228275 0,00720225833524071 0,00165915759304858 0,00165119307478707 316592 312943 667 665 0 True 502 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 547 418 0,00723451503820074 0,00720845372758975 0,0072327763790341 0,0072632944228275 0,00161599447673052 0,00147587205617585 316234 314150 667 665 0 True 546 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 592 418 0,00676988125301048 0,00692578321519064 0,00675974670023652 0,00691233691920348 0,00179227161402189 0,00172951333064503 295924 301831 667 665 0 True 591 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 635 417 0,00674327519234203 0,00661794105313639 0,00672922865644312 0,00666819256885634 0,0018057673049281 0,00176468111658647 294761 288415 667 665 0 True 635 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 238 464 0,00679854625216575 0,00705806631479133 0,00672922865644312 0,00703440909437705 0,00148005254429219 0,00142547159997114 297177 307596 667 665 0 True 236 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 282 463 0,00679019611274701 0,0069538689938396 0,00683604180972 0,00695811398489357 0,00149779818035013 0,00146109399915471 296812 303055 667 665 0 True 281 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 326 463 0,00696904923596796 0,00693129023061201 0,00697337300679027 0,00694285496299687 0,00138425313423884 0,00154204528619226 304630 302071 667 665 0 True 325 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 371 462 0,00712603185704012 0,00709973606481298 0,00709544518196384 0,00709544518196384 0,00143305918077295 0,00135862124555103 311492 309412 667 665 0 True 369 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 415 461 0,00714211445433154 0,00715875291341193 0,00712596322575723 0,00720225833524071 0,00178094750597515 0,00172737526372711 312195 311984 667 665 0 True 414 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 459 462 0,00718045646437482 0,00706848375229674 0,00717174029144732 0,00704966811627375 0,00190453339972455 0,00198761481863355 313871 308050 667 665 0 True 458 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 503 462 0,0073078132483312 0,00728619442862134 0,00738536659800107 0,00721751735713741 0,0017888422856536 0,00184250467837951 319438 317538 667 665 0 True 502 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 546 462 0,00683212982659506 0,00678732766913851 0,00683604180972 0,00677500572213321 0,00173230975781946 0,00177236131218784 298645 295797 667 665 0 True 546 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 591 462 0,00654600600821128 0,00650548320905261 0,00650034332799268 0,00657663843747616 0,00178336131527993 0,00174691653725471 286138 283514 667 665 0 True 591 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 635 462 0,00660729374383534 0,00657294414796433 0,00654612039368277 0,00665293354695964 0,00174506576763692 0,00175735269266679 288817 286454 667 665 0 True 635 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 238 508 0,00703255604973892 0,00686768420249525 0,00704966811627375 0,00689707789730678 0,00132332517736551 0,00138252132710857 307406 299299 667 665 0 True 236 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 282 506 0,00698867778287556 0,00709422904939162 0,00698863202868696 0,00715648126955062 0,00138261381398282 0,00144083522762888 305488 309172 667 665 0 True 281 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 326 507 0,00686260211619985 0,00688929923802411 0,00689707789730678 0,00689707789730678 0,0013846485834733 0,00152390552948231 299977 300241 667 665 0 True 325 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 370 506 0,00695147962754718 0,00722336856102261 0,00697337300679027 0,00717174029144732 0,00145384289640623 0,00149615652284291 303862 314800 667 665 0 True 369 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 414 506 0,00716618115753293 0,00709496331811447 0,00717174029144732 0,00717174029144732 0,00174758130409296 0,00164351132909635 313247 309204 667 665 0 True 413 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 459 506 0,00719667632423202 0,00734778121775026 0,00714122224765393 0,00741588464179446 0,00193883475184772 0,00174950023510896 314580 320222 667 665 0 True 458 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 504 507 0,00698659596729445 0,00685088780546009 0,00698863202868696 0,00697337300679027 0,0017393283226168 0,00163974487039774 305397 298567 667 665 0 True 502 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 547 506 0,00669974008189313 0,00681545933958265 0,00672922865644312 0,00679026474402991 0,00167851798545098 0,00164279757077912 292858 297023 667 665 0 True 546 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 591 507 0,00665469508322058 0,00666160709624829 0,00666819256885634 0,00668345159075303 0,00166534566974104 0,00182757458124033 290889 290318 667 665 0 True 591 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 636 507 0,00651738676324461 0,00662588033370219 0,00660715648126955 0,00653086137178607 0,00185099268660122 0,00182536943268775 284887 288761 667 665 0 True 635 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 239 552 0,00710397833813695 0,00721318058249308 0,00709544518196384 0,00729381246662089 0,00132293038695549 0,00140188291245627 310528 314356 667 665 0 True 236 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 282 551 0,00708972590838936 0,00727690134009778 0,00708018616006714 0,00718699931334401 0,00136093796290255 0,00142932267188401 309905 317133 667 665 0 True 281 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 327 551 0,00704060878693178 0,00719241454517502 0,00701915007248035 0,00717174029144732 0,00128614964772993 0,00133048969189155 307758 313451 667 665 0 True 325 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 371 551 0,00716483140896935 0,0071255960913958 0,0072480354009308 0,00712596322575723 0,00144491356212569 0,00131494072002016 313188 310539 667 665 0 True 369 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 416 551 0,00700441722375251 0,00734449995439503 0,00701915007248035 0,00732433051041428 0,00175129092166528 0,0017605568221159 306176 320079 667 665 0 True 413 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 459 551 0,00695463666656029 0,0072240110461551 0,00700389105058366 0,00720225833524071 0,00187146152527687 0,00190652042936565 304000 314828 667 665 0 True 458 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 504 551 0,00711379261159075 0,00685217277572508 0,00695811398489357 0,00689707789730678 0,00195604123162334 0,00204196967327501 310957 298623 667 665 0 True 502 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 548 551 0,00678630700671637 0,00682284791860631 0,00677500572213321 0,00683604180972 0,00169008001916982 0,00187108362628725 296642 297345 667 665 0 True 546 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 592 551 0,006688210026367 0,00675786513663422 0,00663767452506294 0,00675974670023652 0,00156140474445426 0,00143191689256506 292354 294513 667 665 0 True 591 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 636 550 0,00688019460171494 0,00675364309147784 0,00669871061264973 0,00668345159075303 0,00222228263974682 0,00160271017806827 300746 294329 667 665 0 True 635 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 236 589 0,00743844145677219 0,00747960539939916 0,00743114366369116 0,00747692072938125 0,00131553984810701 0,00126951846611987 325148 325967 667 665 0 False 236 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 280 589 0,00726489581942835 0,00716623327602595 0,00717174029144732 0,00720225833524071 0,00126347455556221 0,00136057702172694 317562 312310 667 665 0 False 280 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 327 595 0,00718315596150197 0,00721542928045681 0,0072327763790341 0,00718699931334401 0,00141744987884691 0,00135473870726847 313989 314454 667 665 0 True 325 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 371 594 0,00694198563341355 0,00693356187447332 0,00704966811627375 0,00689707789730678 0,0012954736010301 0,0011927274851933 303447 302170 667 665 0 True 369 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 413 590 0,00680728530218754 0,0070566666150384 0,00683604180972 0,00703440909437705 0,0016216695113921 0,00149288530003111 297559 307535 667 665 0 False 413 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 458 590 0,00702278753047372 0,00683955253205112 0,00704966811627375 0,0068055237659266 0,00185650044647957 0,00175229729836999 306979 298073 667 665 0 False 458 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 502 590 0,00701828074289703 0,00695524574769494 0,00695811398489357 0,00691233691920348 0,00211134526742116 0,00199046955972091 306782 303115 667 665 0 False 502 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 546 590 0,00683412013379897 0,00697800807810325 0,00686655985351339 0,00697337300679027 0,00189903721919697 0,00164171062180073 298732 304107 667 665 0 False 546 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 591 590 0,00670092969079663 0,00682259551373283 0,00668345159075303 0,00677500572213321 0,00163324141998235 0,00157793045382099 292910 297334 667 665 0 False 591 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 635 590 0,00697980147028797 0,00687417789151294 0,00704966811627375 0,00686655985351339 0,00145377959060891 0,00135143008934992 305100 299582 667 665 0 False 635 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 237 639 0,0103280014833508 0,713920094353531 0,00993362325474937 0,742900740062562 0,0024995871122143 0,22321660633748 451456 31113191 667 665 12 True 236 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 280 633 0,00806193378476704 0,00751200500679485 0,00764476997024491 0,00749217975127794 0,00232388857383222 0,00133529935719429 352402 327379 667 665 0 False 280 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 325 633 0,00707089805978219 0,00701052241498688 0,00708018616006714 0,00704966811627375 0,00132225503091457 0,00125917704351057 309082 305524 667 665 0 False 325 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 369 633 0,00688570798144073 0,00675646543688129 0,00695811398489357 0,00675974670023652 0,0013368423993031 0,00120103522635588 300987 294452 667 665 0 False 369 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 413 633 0,00692459904174715 0,00660153473636024 0,00694285496299687 0,00659189745937285 0,00153071358073101 0,00139637408998802 302687 287700 667 665 0 False 413 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 458 633 0,00696550328635179 0,00660697291408884 0,00689707789730678 0,00665293354695964 0,00182950997032337 0,00170792487975907 304475 287937 667 665 0 False 458 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 502 633 0,00674805650505029 0,00663313123734032 0,00683604180972 0,00669871061264973 0,00179917431344577 0,00176771907185248 294970 289077 667 665 0 False 502 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 546 633 0,00696689878910396 0,00660332451637219 0,00692759594110018 0,00665293354695964 0,00183994084276979 0,00174314968192706 304536 287778 667 665 0 False 546 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 590 633 0,00716723350387063 0,00706157703712245 0,00721751735713741 0,00708018616006714 0,00150605683713961 0,00133512189271534 313293 307749 667 665 0 False 590 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 635 639 0,0085972349142435 0,740326095623586 0,00859082932784009 0,753093766689555 0,00179090805897218 0,196335101913667 375801 32263985 667 665 13 True 635 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B8_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B8_3.csv new file mode 100755 index 0000000..c4a18ce --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B8_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 237 242 0,00110416295628794 0,0706185927166279 0,000915541313801785 0,0681620508125429 0,000919463183755941 0,0193255810054309 48265 3077613 667 665 0 True 237 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 281 242 0,000888912376039035 0,000827107824493713 0,000732433051041428 0,00064087891966125 0,000712470669139558 0,000708115483217896 38856 36046 667 665 0 False 281 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 326 242 0,000834968187684597 0,000868433386051533 0,000701915007248035 0,000747692072938125 0,000630668082751674 0,000608419128874763 36498 37847 667 665 0 True 325 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 370 241 0,000893670811652997 0,000863109937810881 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,000616172523333101 0,000613144044212242 39064 37615 667 665 0 True 369 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 414 240 0,000884062432047881 0,00088740964335765 0,000686655985351339 0,000701915007248035 0,000756876689627748 0,000714329623439366 38644 38674 667 665 0 True 414 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 458 241 0,000861162460655687 0,000924742618734981 0,00064087891966125 0,000762951094834821 0,000783332316581639 0,000777106625159207 37643 40301 667 665 0 True 458 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 502 241 0,000878777823265067 0,000885115053598749 0,000701915007248035 0,000747692072938125 0,000783655163367984 0,000733470134890857 38413 38574 667 665 0 True 502 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 547 241 0,000951481228943779 0,00094135544858943 0,000747692072938125 0,000854505226215 0,000811683786956714 0,000673210838652417 41591 41025 667 665 0 True 547 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 591 242 0,000994764691355398 0,000925040915403638 0,000686655985351339 0,000503547722590982 0,000993318180888365 0,00100202070079741 43483 40314 667 665 0 False 591 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 633 241 0,00103971818165076 0,0732698764535509 0,000701915007248035 0,0713664454108492 0,00102202189447887 0,0190343292889325 45448 3193158 667 665 0 True 635 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 237 286 0,00087896084001945 0,000951887615582789 0,00064087891966125 0,000732433051041428 0,000798304725304193 0,000799959446273161 38421 41484 667 665 0 False 237 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 281 286 0,00086091081261841 0,000876877476364291 0,000717174029144732 0,000717174029144732 0,000663002261419131 0,000701729791640268 37632 38215 667 665 0 False 281 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 326 285 0,00088037921986592 0,000867859738611808 0,000732433051041428 0,000717174029144732 0,00066827300808318 0,000664181507523472 38483 37822 667 665 0 True 325 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 370 286 0,00084874019845193 0,000874674670195746 0,000686655985351339 0,000778210116731518 0,000690882305786538 0,000612267894250519 37100 38119 667 665 0 True 369 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 414 285 0,000919110140512257 0,000848745805920156 0,000732433051041428 0,000625619897764553 0,000740911773495806 0,000740657972345468 40176 36989 667 665 0 True 414 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 459 286 0,000900511062848068 0,000819168543927913 0,000656137941557946 0,000488288700694286 0,000841338482982221 0,00087455373492642 39363 35700 667 665 0 True 458 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 503 286 0,000969622764722011 0,00095863370947396 0,000747692072938125 0,000732433051041428 0,000856085031682157 0,000858795259022658 42384 41778 667 665 0 True 502 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 547 285 0,000951069441246417 0,00102347881606052 0,000717174029144732 0,00080872816052491 0,000834077972922532 0,000859188391744114 41573 44604 667 665 0 True 547 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 591 286 0,000953242765204717 0,000835276564035403 0,00064087891966125 0,000442511635004196 0,000921317513622007 0,000943193440103647 41668 36402 667 665 0 False 591 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 635 286 0,000981793378888491 0,000956407957407825 0,000595101853971161 0,000610360875867857 0,00101383378802367 0,000986410255409485 42916 41681 667 665 0 False 635 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 238 330 0,000962759636432642 0,000840875363047123 0,000778210116731518 0,000671396963454643 0,000799528024358333 0,000677743171192919 42084 36646 667 665 0 True 236 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 283 331 0,000871685924032719 0,00092547688745783 0,000717174029144732 0,000762951094834821 0,000722555853242242 0,000723739714992276 38103 40333 667 665 0 True 281 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 327 330 0,000865600616949479 0,000943305849884496 0,000732433051041428 0,000823987182421607 0,000661587020726072 0,000627543094787013 37837 41110 667 665 0 True 325 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 371 330 0,000822500171292244 0,000879401525099083 0,000686655985351339 0,000762951094834821 0,00066996214542607 0,00066556074088456 35953 38325 667 665 0 True 369 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 415 329 0,000904148520841433 0,000858291299317187 0,000656137941557946 0,000656137941557946 0,000817835739484523 0,000723074935296222 39522 37405 667 665 0 True 414 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 459 330 0,000899412962321769 0,000925155644891583 0,000610360875867857 0,000701915007248035 0,000856117731785452 0,000838961209286426 39315 40319 667 665 0 True 458 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 504 330 0,000926865475479244 0,000887157238484171 0,000717174029144732 0,000686655985351339 0,000848733296447681 0,000817589760740837 40515 38663 667 665 0 True 502 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 548 330 0,000867018996795949 0,000884885594622858 0,000656137941557946 0,000762951094834821 0,000799300378613735 0,000724589434323285 37899 38564 667 665 0 True 547 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 591 330 0,00101448474664018 0,00104729665775792 0,000686655985351339 0,000717174029144732 0,00103467746467725 0,00114517370110247 44345 45642 667 665 0 True 591 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 636 329 0,00092691122966784 0,000973525597009232 0,000473029678797589 0,000595101853971161 0,00104234208663521 0,000998463896043179 40517 42427 667 665 0 True 635 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 238 374 0,000835860394362215 0,000856386789817299 0,000625619897764553 0,000747692072938125 0,000785374487630449 0,000717089780706428 36537 37322 667 665 0 True 236 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 283 375 0,000921420727036344 0,000846152919492597 0,00080872816052491 0,000732433051041428 0,000705570294699892 0,00065989876411562 40277 36876 667 665 0 True 281 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 327 374 0,000847184556039673 0,000945577493745809 0,000701915007248035 0,000823987182421607 0,000684991432606279 0,000717621904733965 37032 41209 667 665 0 True 325 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 371 373 0,000866652963287182 0,000981556661165388 0,000701915007248035 0,000854505226215 0,000717359278011916 0,000713327646153782 37883 42777 667 665 0 True 369 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 415 374 0,000953242765204717 0,000961295433594286 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000843842971451258 0,000812437322673691 41668 41894 667 665 0 True 414 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 459 374 0,000858028298736876 0,00096632058516628 0,000534065766384375 0,000671396963454643 0,000862670197305026 0,00086647950658843 37506 42113 667 665 0 True 458 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 503 374 0,000877931370776045 0,000911296322747817 0,000564583810177768 0,000564583810177768 0,000905734362941647 0,000943660975596984 38376 39715 667 665 0 True 502 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 547 374 0,000908220643626459 0,000897964756248598 0,000625619897764553 0,000656137941557946 0,000862719165601581 0,000847884611869632 39700 39134 667 665 0 True 546 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 591 374 0,00100720983065345 0,000949179999667284 0,000564583810177768 0,000350957503624018 0,00107869249112444 0,00111498766244233 44027 41366 667 665 0 True 591 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 635 373 0,000898063213758193 0,000951749940197254 0,000518806744487678 0,000625619897764553 0,000948260542474523 0,000952399587257795 39256 41478 667 665 0 True 635 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 239 419 0,00083688986360562 0,000934425787517547 0,000686655985351339 0,000793469138628214 0,000752623355051955 0,000823222061703249 36582 40723 667 665 0 True 236 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 283 418 0,000888111677738608 0,000928551637734758 0,000732433051041428 0,000793469138628214 0,000753119150683993 0,000738776310230595 38821 40467 667 665 0 True 281 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 327 419 0,000874202404405488 0,000858520758293078 0,000732433051041428 0,000717174029144732 0,000715524634674726 0,000638719171253864 38213 37415 667 665 0 True 325 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 371 418 0,000907648716269011 0,000906592413742069 0,000747692072938125 0,00080872816052491 0,000717431849448023 0,000682061191881408 39675 39510 667 665 0 True 369 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 415 418 0,000884039554953583 0,000881558439472451 0,000656137941557946 0,000625619897764553 0,000762565341638964 0,000798508889813613 38643 38419 667 665 0 True 414 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 459 418 0,000954752653428378 0,000932177089553823 0,000656137941557946 0,000732433051041428 0,000883112055308982 0,00078315512565262 41734 40625 667 665 0 True 458 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 503 418 0,000899778995830535 0,000973686218292355 0,000625619897764553 0,000686655985351339 0,000854554507439901 0,000967882014030353 39331 42434 667 665 0 True 502 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 547 418 0,000909227235775566 0,00090259982756158 0,000671396963454643 0,000717174029144732 0,000838259578581796 0,000754497262815407 39744 39336 667 665 0 True 546 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 592 418 0,000882163633221155 0,000939611560372664 0,000564583810177768 0,000518806744487678 0,000924635465301786 0,0010351506751345 38561 40949 667 665 0 True 591 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 635 417 0,000942627793450494 0,00103479114357191 0,000625619897764553 0,000686655985351339 0,000931588561680004 0,00100940966994932 41204 45097 667 665 0 True 635 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 238 464 0,000939333491871597 0,000892710145700713 0,000778210116731518 0,000732433051041428 0,000780671882752803 0,000760375485321694 41060 38905 667 665 0 True 236 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 282 463 0,000925675866575753 0,000862146210112142 0,000778210116731518 0,000701915007248035 0,000811879872662399 0,0007506148304433 40463 37573 667 665 0 True 281 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 326 463 0,000895615364668318 0,00086921354656956 0,00080872816052491 0,000762951094834821 0,000725067627829392 0,000755679567197691 39149 37881 667 665 0 True 325 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 371 462 0,000858783242848706 0,00087575312738243 0,000732433051041428 0,000717174029144732 0,000719679215595228 0,000794170126749134 37539 38166 667 665 0 True 369 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 415 461 0,000865394723100798 0,000937408754204119 0,000671396963454643 0,00064087891966125 0,00083801853381762 0,000935030873822262 37828 40853 667 665 0 True 414 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 459 462 0,00090277589518356 0,000853725065696973 0,000488288700694286 0,000396734569314107 0,00100236910611762 0,00102980855643006 39462 37206 667 665 0 True 458 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 503 462 0,000881957739372474 0,000916252636627045 0,000534065766384375 0,000610360875867857 0,00095506678164645 0,000906817318944511 38552 39931 667 665 0 True 502 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 546 462 0,000965985306728645 0,000847001917703391 0,000656137941557946 0,000503547722590982 0,000958673818737898 0,000889960315183065 42225 36913 667 665 0 True 546 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 591 462 0,000971979105434694 0,000951245130450296 0,000625619897764553 0,000549324788281071 0,0010235337377495 0,00100649783909433 42487 41456 667 665 0 True 591 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 635 462 0,000981816255982789 0,000920222276909945 0,00064087891966125 0,000518806744487678 0,000976070824360207 0,000967339107945358 42917 40104 667 665 0 True 635 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 238 508 0,000928329609514309 0,000830756222210367 0,000762951094834821 0,000701915007248035 0,000747476229720726 0,000704020909197447 40579 36205 667 665 0 True 236 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 282 506 0,000913825531729443 0,00090842808554919 0,000762951094834821 0,000747692072938125 0,000789721769173386 0,000797796208278165 39945 39590 667 665 0 True 281 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 326 507 0,0009403858382093 0,000901865558838731 0,000823987182421607 0,000732433051041428 0,000769539570134416 0,000797750202404898 41106 39304 667 665 0 True 325 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 370 506 0,000876604499306767 0,000923893620524188 0,000701915007248035 0,00080872816052491 0,000767303848742277 0,000748121777141133 38318 40264 667 665 0 True 369 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 414 506 0,000942490530884706 0,0009142563435368 0,000656137941557946 0,000579842832074464 0,000938026670146178 0,000910275245849931 41198 39844 667 665 0 True 413 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 459 506 0,000954569636673995 0,000937729996770365 0,000610360875867857 0,000610360875867857 0,000971448853988541 0,000921866082915471 41726 40867 667 665 0 True 458 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 504 507 0,000847070170568184 0,000898400728302789 0,000534065766384375 0,000595101853971161 0,000841042347368665 0,000870830556318553 37027 39153 667 665 0 True 502 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 547 506 0,000841167880239326 0,000908565760934724 0,000488288700694286 0,000686655985351339 0,000875019818352419 0,00085217653325206 36769 39596 667 665 0 True 546 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 591 507 0,000911858101619824 0,000912099429163433 0,000610360875867857 0,000595101853971161 0,000905288757138776 0,000911784277033405 39859 39750 667 665 0 True 591 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 636 507 0,000990989970796245 0,000883898921026531 0,000686655985351339 0,000473029678797589 0,000968755883513044 0,000964607925888659 43318 38521 667 665 0 True 635 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 239 552 0,000952419189809993 0,000960354651793136 0,000823987182421607 0,00080872816052491 0,000719183214288407 0,000702081930619107 41632 41853 667 665 0 True 236 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 282 551 0,000883238856653157 0,000902852232435059 0,000747692072938125 0,000762951094834821 0,000716169137155238 0,000728943447919163 38608 39347 667 665 0 True 281 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 327 551 0,000938029497496617 0,000882499221273601 0,000778210116731518 0,000762951094834821 0,000753869813464846 0,000697003816170813 41003 38460 667 665 0 True 325 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 371 551 0,000888363325775885 0,000870016652985175 0,000762951094834821 0,000747692072938125 0,000713977508075987 0,00066517346158927 38832 37916 667 665 0 True 369 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 416 551 0,000933911620522996 0,000926257047975856 0,000671396963454643 0,000656137941557946 0,00091531447262916 0,000876192326638822 40823 40367 667 665 0 True 413 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 459 551 0,000938670056136958 0,000900810047549636 0,000518806744487678 0,000518806744487678 0,00103339157564013 0,000988957159217026 41031 39258 667 665 0 True 458 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 504 551 0,000896667711006021 0,000780986570339789 0,000457770656900893 0,000274662394140536 0,00100825606151674 0,000990513147901713 39195 34036 667 665 0 True 502 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 548 551 0,000923182263297282 0,000925821075921665 0,000549324788281071 0,000457770656900893 0,000935937956639521 0,00101159464457229 40354 40348 667 665 0 True 546 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 592 551 0,00101642929965551 0,000901383694989362 0,000778210116731518 0,000686655985351339 0,000905942559856269 0,000755226615586213 44430 39283 667 665 0 True 591 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 636 550 0,000897125252891979 0,000875730181484841 0,000610360875867857 0,000534065766384375 0,000894229067604952 0,000904016158670992 39215 38165 667 665 0 True 635 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 236 589 0,0010077817580109 0,000971552249816576 0,000885023270008392 0,000869764248111696 0,000722486094265481 0,000662402648513064 44052 42341 667 665 0 False 236 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 280 589 0,00096985153566499 0,000838259530721976 0,000854505226215 0,000701915007248035 0,000709577888645972 0,000664897951889138 42394 36532 667 665 0 False 280 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 327 595 0,000825748718682545 0,00087855252688829 0,000671396963454643 0,000762951094834821 0,000714879512339534 0,000727008828076721 36095 38288 667 665 0 True 325 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 371 594 0,00087820589590762 0,00085822246162442 0,000747692072938125 0,000732433051041428 0,000687571440195638 0,000658490623576703 38388 37402 667 665 0 True 369 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 413 590 0,000908174889437863 0,000888694613622635 0,000747692072938125 0,000656137941557946 0,000806821838453978 0,000784578429998518 39698 38730 667 665 0 False 413 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 458 590 0,000987283881519986 0,000866964848605836 0,000534065766384375 0,000488288700694286 0,00106667418735955 0,00091103428093937 43156 37783 667 665 0 False 458 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 502 590 0,000883673521444817 0,000886813050020336 0,000473029678797589 0,000473029678797589 0,000984534059133727 0,0010874633666977 38627 38648 667 665 0 False 502 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 546 590 0,000903576593483986 0,000960423489485903 0,000488288700694286 0,000579842832074464 0,000962299036394686 0,000979420474648173 39497 41856 667 665 0 False 546 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 591 590 0,000952556452375781 0,00102760907762655 0,000686655985351339 0,000762951094834821 0,000864744914318146 0,000921604603258275 41638 44784 667 665 0 False 591 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 635 590 0,000893350532332826 0,000932406548529713 0,00064087891966125 0,000732433051041428 0,000812503641162863 0,000805294492757814 39050 40635 667 665 0 False 635 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 237 639 0,00108183491225319 0,0713508422004886 0,000915541313801785 0,0726634622720684 0,000785900997523655 0,0241630595927277 47289 3109525 667 665 0 True 236 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 280 633 0,00101119044506129 0,000897827080863064 0,000869764248111696 0,000762951094834821 0,000687720206960517 0,000665860282960372 44201 39128 667 665 0 False 280 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 325 633 0,000890879806148654 0,000845671055643228 0,000793469138628214 0,000732433051041428 0,000675462430573198 0,000645055695806721 38942 36855 667 665 0 False 325 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 369 633 0,000814676205042363 0,000908978787091326 0,000717174029144732 0,000778210116731518 0,000627766564281759 0,000686333646926015 35611 39614 667 665 0 False 369 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 413 633 0,000938601424854064 0,000918432496898001 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000772024793917048 0,000729131949761065 41028 40026 667 665 0 False 413 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 458 633 0,000884817376159711 0,000867423766557616 0,000595101853971161 0,000473029678797589 0,000901858632334152 0,000913995435225396 38677 37803 667 665 0 False 458 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 502 633 0,000823232238309776 0,000868984087593669 0,000442511635004196 0,000473029678797589 0,000923088126460112 0,000923849093673228 35985 37871 667 665 0 False 502 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 546 633 0,000942856564393473 0,000898194215224488 0,000625619897764553 0,000503547722590982 0,000931232202810525 0,000920112303509057 41214 39144 667 665 0 False 546 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 590 633 0,000951229580906503 0,000979147341918541 0,000717174029144732 0,000854505226215 0,000800354618593807 0,000701211596691884 41580 42672 667 665 0 False 590 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 635 639 0,00107032773382135 0,074270937127667 0,000930800335698482 0,0737773708705272 0,000770189882130959 0,0223478849399686 46786 3236785 667 665 0 True 635 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B9_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B9_1.csv new file mode 100755 index 0000000..b8af3fb --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B9_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 247 273 0,0103196513439321 0,0472391094467687 0,01025406271458 0,0467689021133745 0,00158544017943043 0,00763549831006763 451091 2058717 667 665 0 True 247 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 292 273 0,0104615350827676 0,0105201433430222 0,010452429999237 0,0105134660868238 0,00140830362801864 0,00140692475593643 457293 458476 667 665 0 False 292 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 336 274 0,0106658504119421 0,0630225139410669 0,0106202792401007 0,061875333791104 0,00136010312687625 0,00840632723292161 466224 2746570 667 665 0 True 336 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 380 273 0,0106493789040476 0,0932113758876477 0,0106202792401007 0,0919356069275959 0,00132480462669395 0,0193212085643352 465504 4062224 667 665 0 True 381 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 424 274 0,0106316262788725 0,0700028395548266 0,0106507972838941 0,0668192568856336 0,00152027929601121 0,0122243026919414 464728 3050778 667 665 0 True 425 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 468 273 0,0104010251683497 0,0674529996311447 0,0103913939116503 0,0689250019073777 0,00170019877203867 0,0196054190484574 454648 2939654 667 665 0 True 469 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 513 272 0,0106370939044097 0,0783575785423733 0,0106507972838941 0,076050965133135 0,00151182608212143 0,0203723644971348 464967 3414884 667 665 0 True 514 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 557 272 0,0102575857871019 0,069672854601599 0,0102693217364767 0,067154955367361 0,00164880328621692 0,016400609831641 448378 3036397 667 665 0 True 558 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 602 273 0,0101422852318405 0,0100496147670619 0,0101625085831998 0,010101472495613 0,00203436231869006 0,00195065096554582 443338 437970 667 665 0 False 602 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 645 271 0,0101384647570927 0,0467296187367021 0,0102693217364767 0,047196154726482 0,00188065734785669 0,00949942137968298 443171 2036513 667 665 0 True 647 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 247 316 0,0104704800266381 0,0107426726578405 0,0104982070649271 0,0106813153276875 0,00150338323731359 0,00180723877559055 457684 468174 667 665 0 False 247 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 292 316 0,0104282717876585 0,0105577975609658 0,0104371709773404 0,0105287251087205 0,00140628394114416 0,00136428329716411 455839 460117 667 665 0 False 292 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 336 318 0,0106305510554405 0,101323829142552 0,0106507972838941 0,0971389333943694 0,00131911437650181 0,0190740282966399 464681 4415771 667 665 0 True 336 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 380 318 0,0107215790136518 0,0529026388355875 0,0106965743495842 0,050965133134966 0,00134229936850413 0,0081684432592096 468660 2305538 667 665 0 True 381 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 424 318 0,0108768687297459 0,0789998112699923 0,0108949416342412 0,0777294575417716 0,00157222569169007 0,0134131243376947 475448 3442873 667 665 0 True 425 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 469 317 0,0109021479189451 0,0461271053578097 0,0108949416342412 0,0444037537193866 0,00172104192076707 0,00976096852697116 476553 2010255 667 665 0 True 469 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 513 316 0,0105949314196186 0,0507316127352026 0,0105287251087205 0,0497901884489204 0,00166662229502877 0,0138872905895102 463124 2210923 667 665 0 True 514 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 557 316 0,0105894180398928 0,0574796340817711 0,0105439841306172 0,0556801709010452 0,00168977311659393 0,0130145439595855 462883 2505007 667 665 0 True 558 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 602 316 0,0104338995528558 0,0102199651107627 0,0104829480430304 0,0102693217364767 0,00214236485112045 0,00209144870231009 456085 445394 667 665 0 False 602 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 647 316 0,0102565563178585 0,0100720788008015 0,0102693217364767 0,0100099183642329 0,00196676156351312 0,00178957099114626 448333 438949 667 665 0 False 647 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 249 363 0,010757999347774 0,0583019691595663 0,0107881284809644 0,0556496528572518 0,00155059885267734 0,0106435425015737 470252 2540845 667 665 0 True 247 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 293 362 0,0108949416342412 0,0699055718949468 0,0109102006561379 0,0705271992065309 0,00148026485633607 0,0184081031726468 476238 3046539 667 665 0 True 292 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 336 362 0,0109657919952818 0,0459173110161533 0,0108796826123445 0,0450598916609445 0,001775435464937 0,0104981625862426 479335 2001112 667 665 0 True 336 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 380 363 0,0109689947884835 0,0377090815847125 0,0108949416342412 0,0382085908293278 0,00208005797636874 0,00537364467349197 479475 1643391 667 665 0 True 381 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 425 362 0,0110127129156868 0,072316153166161 0,010955977721828 0,0687266346227207 0,00162242521324749 0,0106161253024148 481386 3151594 667 665 0 True 425 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 470 361 0,0110754419082516 0,0348343277511701 0,0110780498970016 0,0350041962310216 0,001734457693627 0,00441869318096308 484128 1518107 667 665 0 True 469 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 512 360 0,010861746970415 0,0297467403918356 0,0108796826123445 0,029907682917525 0,00170931155349869 0,00284349744648867 474787 1296386 667 665 0 True 514 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 557 360 0,0108092440390013 0,0531011896874252 0,0107881284809644 0,0529335469596399 0,00169189394045256 0,00804054872033414 472492 2314191 667 665 0 True 558 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 601 361 0,0108131560221263 0,0612134364292512 0,0107728694590677 0,0602426184481575 0,00213274834768092 0,0121605322159831 472663 2667729 667 665 0 True 602 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 645 360 0,0104422954464631 0,070072273840931 0,0104829480430304 0,0692912184328985 0,00196385687479102 0,0185667875188988 456452 3053804 667 665 0 True 647 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 249 407 0,0108619528642637 0,0493546753126809 0,0108339055466545 0,0518196383611811 0,0015471864397839 0,00996671445786462 474796 2150915 667 665 0 True 247 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 293 407 0,0108805519419279 0,0416432016181447 0,0108186465247578 0,0366063935301747 0,00152434916964747 0,0120581207980008 475609 1814843 667 665 0 True 292 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 337 407 0,0110803376064314 0,0960718573728898 0,0110475318532082 0,0896467536430915 0,00136223763752817 0,0249564132553735 484342 4186886 667 665 0 True 336 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 381 406 0,0111768103130856 0,071574931836343 0,0112306401159686 0,0696574349584192 0,0014727629410243 0,0152411025441312 488559 3119291 667 665 0 True 381 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 425 406 0,0114931776501312 0,0448811431187261 0,0115205615320058 0,04614328221561 0,00186748436866946 0,00688917088188347 502388 1955955 667 665 0 True 425 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 470 405 0,0112376405068237 0,0576714847315129 0,0113679713130388 0,0568398565651942 0,0016961588853841 0,00938162713246921 491218 2513368 667 665 0 True 469 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 513 405 0,011117627270137 0,0443621298611601 0,0111238269626917 0,044632639047837 0,00175901884602271 0,00498414256981442 485972 1933336 667 665 0 True 514 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 557 404 0,0111347164595775 0,0550213941812646 0,0111390859845884 0,0543678950179294 0,00175998201199035 0,00763074816225748 486719 2397875 667 665 0 True 558 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 602 404 0,0109759036709615 0,046183368698698 0,0110170138094148 0,0463874265659571 0,00186811726391136 0,00794515222189522 479777 2012707 667 665 0 True 602 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 645 404 0,0106371854127869 0,0913540431532023 0,0106355382619974 0,0853131914244297 0,00195530819365625 0,0202234635984566 464971 3981280 667 665 0 True 647 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 249 451 0,010979014955786 0,0457673825213067 0,0109407186999313 0,0453192950331884 0,00154102821138643 0,00596514398539677 479913 1994578 667 665 0 True 247 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 293 451 0,0107881284809644 0,0614359198522743 0,0108186465247578 0,0608072022583352 0,00156871988240001 0,0083896188066989 471569 2677425 667 665 0 True 292 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 337 451 0,0109311560745148 0,037317395112868 0,0109407186999313 0,0375066758220798 0,00146122388316905 0,00357782807097797 477821 1626321 667 665 0 True 336 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 381 450 0,0111476420178558 0,0591441753846736 0,0111696040283818 0,0549324788281071 0,00152733594316684 0,01303849602796 487284 2577549 667 665 0 True 381 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 425 451 0,0115934250773446 0,101309786253227 0,0114442664225223 0,101075761043717 0,00217434652468916 0,0154675880152427 506770 4415159 667 665 0 True 425 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 469 449 0,0114356646350663 0,0673797563260406 0,0115053025101091 0,0650186923018235 0,0020193743783033 0,0159035567912884 499874 2936462 667 665 0 True 469 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 513 448 0,0111639533860902 0,0587508368082027 0,011108567940795 0,056900892652781 0,00176722523520711 0,0116317432804499 487997 2560407 667 665 0 True 514 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 557 449 0,0109956923575292 0,0336853807670928 0,0110322728313115 0,0336308842603189 0,00187444010990914 0,00387484799367409 480642 1468035 667 665 0 True 558 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 602 448 0,0109866559052815 0,0435125121111316 0,0109712367437247 0,04272526131075 0,00185692176302904 0,00590716706091266 480247 1896309 667 665 0 True 602 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 645 448 0,0108089466367755 0,0730757082681526 0,0108644235904479 0,0730449378194858 0,00179841289694042 0,0128348702690669 472479 3184696 667 665 0 True 647 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 250 496 0,0108637601547132 0,056671364839198 0,0109102006561379 0,0569619287403677 0,00147719664032173 0,0141543735262083 474875 2469782 667 665 0 True 247 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 294 495 0,0110335081944036 0,0576328667858706 0,0109254596780346 0,0562142366674296 0,00150570550357025 0,00665136360441123 482295 2511685 667 665 0 True 292 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 338 495 0,0114004339098475 0,0804030217452535 0,0114137483787289 0,0779125658045319 0,00163676098405043 0,0214809994794717 498334 3504026 667 665 0 True 336 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 382 494 0,0117566073909715 0,0955278560328494 0,0117952239261463 0,0880292973220417 0,00170430376188289 0,0221068370270021 513903 4163178 667 665 0 True 381 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 425 493 0,0122758259231565 0,100505440759142 0,0121766994735637 0,0952925917448691 0,00239228667628673 0,0326376836433477 536599 4380105 667 665 0 True 425 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 470 493 0,0116550330922888 0,0539425010225266 0,0115815976195926 0,0531319142442969 0,00204145656870162 0,0100322858962271 509463 2350856 667 665 0 True 469 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 515 493 0,0110927369915409 0,0439733116265142 0,0111238269626917 0,0450751506828412 0,00166568541660488 0,00533964198006078 484884 1916391 667 665 0 True 514 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 558 493 0,0112014718207387 0,108006913598944 0,0112306401159686 0,106721599145495 0,00176220538156004 0,0171116349152875 489637 4707025 667 665 0 True 558 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 602 492 0,0108709435623228 0,060213110023858 0,0110170138094148 0,0630502784771496 0,00187561705788491 0,0125626774381183 475189 2624134 667 665 0 True 602 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 646 492 0,0106960939306039 0,0789960251968901 0,0106813153276875 0,0753185320820935 0,00186103806665215 0,0138531429625992 467546 3442708 667 665 0 True 647 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 248 539 0,0107882886206245 0,0561005626907736 0,0107881284809644 0,0577401388570993 0,00144576368146556 0,0117787339435556 471576 2444906 667 665 0 True 247 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 293 539 0,0111218137783935 0,109627100481806 0,0111390859845884 0,104722667277028 0,00150410203127056 0,0223939033728161 486155 4777634 667 665 0 True 292 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 338 539 0,011184291122921 0,0624442084841309 0,0112153810940719 0,0623331044480049 0,00145079536679394 0,0135068763391465 488886 2721367 667 665 0 True 336 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 382 539 0,0120000196743011 0,0622301232596254 0,0117036697947662 0,0614023041123064 0,00227665724006593 0,00768421716940476 524543 2712037 667 665 0 True 381 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 426 539 0,0119340650114403 0,0622358826799202 0,0118257419699397 0,0613107499809262 0,00211127298396516 0,00816257861991115 521660 2712288 667 665 0 True 425 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 470 537 0,0116508008298437 0,0654540907085751 0,0115968566414893 0,0646219577325094 0,00207731295321693 0,0134789599785807 509278 2852540 667 665 0 True 469 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 515 537 0,0113272500851886 0,0785278600483814 0,0113221942473487 0,0755016403448539 0,00192108519076806 0,0202123657553908 495135 3422305 667 665 0 True 514 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 559 537 0,0110887792542273 0,0626183907927291 0,0110322728313115 0,0622568093385214 0,00177259050091625 0,013247952240775 484711 2728958 667 665 0 True 558 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 603 537 0,0108059039832338 0,0451244843626576 0,0108644235904479 0,0443274586099031 0,00172246679471817 0,00484813290592971 472346 1966560 667 665 0 True 602 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 647 536 0,0110918447848632 0,0688303959716182 0,0110322728313115 0,0684519722285802 0,00185408122227818 0,0149077220960053 484845 2999682 667 665 0 True 647 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 249 583 0,0105550337671631 0,0482799124155089 0,0106507972838941 0,0486610208285649 0,00126632546904102 0,00947745983118558 461380 2104076 667 665 0 True 247 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 294 584 0,0107651827553836 0,0566350873751098 0,0108033875028611 0,0557869840543221 0,00143684177430155 0,0123060785429063 470566 2468201 667 665 0 True 292 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 338 583 0,0109396892306879 0,0541185878406247 0,0108796826123445 0,0534676127260243 0,00149084759573443 0,00881284049235836 478194 2358530 667 665 0 True 336 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 383 583 0,0112900061756716 0,0575406242775628 0,0113221942473487 0,0544899671931029 0,00139799679514218 0,0103083225170351 493507 2507665 667 665 0 True 381 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 427 582 0,0118550932819239 0,0972355585691168 0,0118257419699397 0,0909590295262074 0,00208199539057264 0,0209500544722155 518208 4237601 667 665 0 True 425 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 472 581 0,0115232381520387 0,0667242608696151 0,0115205615320058 0,0657663843747616 0,00212412894801586 0,0129786238782487 503702 2907895 667 665 0 True 469 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 515 581 0,0110905865446769 0,0615611356154176 0,011108567940795 0,0602731364919509 0,00205629933559071 0,0082228517768079 484790 2682882 667 665 0 True 514 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 559 581 0,0109654259617731 0,0403807642245922 0,0110933089188983 0,0415960936903944 0,0017666846817634 0,00693393020569101 479319 1759825 667 665 0 True 558 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 603 581 0,0108109140668851 0,0527952749807685 0,0108339055466545 0,0517586022735943 0,00164168734634543 0,00704131966898587 472565 2300859 667 665 0 True 602 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 647 581 0,0109193057396685 0,0573477181165319 0,0109102006561379 0,0558175020981155 0,00169384206187414 0,00780806919474784 477303 2499258 667 665 0 True 647 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 247 621 0,0106992280925227 0,0104036011291676 0,0104829480430304 0,0103761348897536 0,00223085040740633 0,0013697528351968 467683 453397 667 665 0 False 247 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 292 621 0,0106798740707467 0,0104833151773919 0,0104829480430304 0,010452429999237 0,00197276807497224 0,00142911191549424 466837 456871 667 665 0 False 292 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 339 627 0,010649790691745 0,0778806710068832 0,010605020218204 0,0754253452353704 0,00132937091553511 0,010080875206051 465522 3394100 667 665 0 True 336 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 383 627 0,0110106997313886 0,0844049698519588 0,0110170138094148 0,0807354848554208 0,00149350117849798 0,0207093421122759 481298 3678434 667 665 0 True 381 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 425 621 0,0111286082754 0,0108233504337635 0,0110322728313115 0,0107728694590677 0,00193525090704485 0,00170112425265308 486452 471690 667 665 0 False 425 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 469 621 0,0109843681958517 0,0107604327825744 0,0108949416342412 0,0108033875028611 0,00208217838548989 0,00196642749089939 480147 468948 667 665 0 False 469 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 514 621 0,0107339326445727 0,0109388830281242 0,0108033875028611 0,0109864957656214 0,00199532695691314 0,0020386966926736 469200 476725 667 665 0 False 514 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 558 621 0,0105386537676458 0,0104918739971926 0,0105592431525139 0,0105439841306172 0,00176292410042134 0,00189071826119313 460664 457244 667 665 0 False 558 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 602 621 0,010429621536222 0,0104181029364439 0,0104829480430304 0,0104676890211337 0,00160280851644252 0,00147841804849608 455898 454029 667 665 0 False 602 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 647 621 0,0106395417534995 0,01059753985559 0,0106355382619974 0,0105439841306172 0,00158764654862116 0,00154422600645091 465074 461849 667 665 0 False 647 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 251 671 0,0103533493038329 0,0454668830464809 0,0103608758678569 0,0448004882887007 0,00130103079078114 0,00844373204474833 452564 1981482 667 665 0 True 247 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 292 664 0,0103482019576158 0,0101963537821436 0,0103303578240635 0,0101777676050965 0,00127107298477871 0,00130171070885691 452339 444365 667 665 0 False 292 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 336 664 0,0115708453852726 0,0103955471191139 0,0105439841306172 0,0104829480430304 0,005655743072667 0,00133035066876057 505783 453046 667 665 0 False 336 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 381 664 0,0108210257425647 0,0103521105349779 0,0103456168459602 0,0103761348897536 0,00285272309223238 0,00127558371189339 473007 451153 667 665 0 False 381 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 425 664 0,0105697894929853 0,0106461851584787 0,0106355382619974 0,0106507972838941 0,00149914787120924 0,00138811316495186 462025 463969 667 665 0 False 425 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 469 664 0,0104266932681519 0,0106644042011644 0,010406652933547 0,0106965743495842 0,0016502255338184 0,00152680807772793 455770 464763 667 665 0 False 469 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 514 664 0,0103471267341838 0,0103942392029513 0,0103913939116503 0,0104829480430304 0,00167951714244102 0,00164443124460394 452292 452989 667 665 0 False 514 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 558 664 0,0103545846669249 0,0102053256281009 0,0103608758678569 0,0101625085831998 0,00160580244456341 0,00171040261696887 452618 444756 667 665 0 False 558 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 602 664 0,0103956261740954 0,0103038323664506 0,0103150988021668 0,0102998397802701 0,00128741962863582 0,00133073022826502 454412 449049 667 665 0 False 602 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 650 669 0,0105408728457927 0,0463614518098864 0,0105592431525139 0,0458991378652628 0,00144586645695483 0,00829283358885679 460761 2020468 667 665 0 True 647 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B9_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B9_2.csv new file mode 100755 index 0000000..ecb05f7 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B9_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 247 273 0,00832518050885292 0,747473903343848 0,00804150453955901 0,744090943770504 0,00225485456475947 0,167328810423347 363909 32575492 667 665 10 True 247 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 292 273 0,00677427365511568 0,00652501016790087 0,00671396963454643 0,00654612039368277 0,00149711485456556 0,00119496592983056 296116 284365 667 665 0 False 292 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 336 274 0,00632714084706331 0,00613481517939963 0,00625619897764553 0,00614938582436866 0,0011853282197802 0,00128860184490249 276571 267360 667 665 0 True 336 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 380 273 0,0063326771038834 0,00632485310323187 0,00631723506523232 0,0063782711528191 0,00121544832998095 0,00124410626748217 276813 275642 667 665 0 True 381 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 424 274 0,00638563757718303 0,00645080313509799 0,0063935301747158 0,00651560234988937 0,00148469061861184 0,00146358649522814 279128 281131 667 665 0 True 425 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 468 273 0,00651235380249907 0,00658411880009018 0,00648508430609598 0,00659189745937285 0,00156623827866056 0,00168359451644884 284667 286941 667 665 0 True 469 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 513 272 0,00669390642284717 0,00689505865831895 0,00671396963454643 0,00683604180972 0,00151593363495041 0,00155134094202004 292603 300492 667 665 0 True 514 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 557 272 0,00696088211330361 0,00700056389543325 0,00695811398489357 0,00700389105058366 0,00150476317753299 0,00145078389413176 304273 305090 667 665 0 True 558 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 602 273 0,0078764234271054 0,00736682631274914 0,00788891432059205 0,00735484855420768 0,00189385519840097 0,00188567514323715 344293 321052 667 665 0 False 602 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 645 271 0,00916275668528748 0,745346612124268 0,00915541313801785 0,766186007476921 0,00196472054310298 0,193679896537119 400521 32482783 667 665 12 True 647 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 247 316 0,00679653306786753 0,00672720941745529 0,00669871061264973 0,00668345159075303 0,00160954474576015 0,00153994952750768 297089 293177 667 665 0 False 247 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 292 316 0,00657263494597403 0,00652546908585265 0,00654612039368277 0,00659189745937285 0,0012214729024164 0,00124029880945243 287302 284385 667 665 0 False 292 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 336 318 0,0064446833575659 0,00662998764937062 0,00636301213092241 0,00665293354695964 0,00119783751072759 0,00121109907125967 281709 288940 667 665 0 True 336 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 380 318 0,006591371286204 0,00689521927960207 0,00659189745937285 0,00694285496299687 0,00121204943977663 0,00117398326692714 288121 300499 667 665 0 True 381 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 424 318 0,00677438804058717 0,00690093280810174 0,00674448767833982 0,00689707789730678 0,00161046216454502 0,001528751195416 296121 300748 667 665 0 True 425 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 469 317 0,00692803060589183 0,007029498672293 0,00701915007248035 0,00704966811627375 0,00165320750102454 0,00159516831789815 302837 306351 667 665 0 True 469 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 513 316 0,00707060065755632 0,00683234752020817 0,00704966811627375 0,0068055237659266 0,0016293721626666 0,00157632806051603 309069 297759 667 665 0 True 514 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 557 316 0,00731495090175214 0,00725881997279764 0,00735484855420768 0,00721751735713741 0,00160266860430102 0,0013742773757052 319750 316345 667 665 0 True 558 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 602 316 0,00736681327452548 0,00739537100934988 0,00737010757610437 0,00733958953231098 0,0019852719190808 0,00204538539586398 322017 322296 667 665 0 False 602 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 647 316 0,00772250633666916 0,00771971127177064 0,00770580605783169 0,00776684214541848 0,00198943663211663 0,00170502487266085 337565 336431 667 665 0 False 647 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 249 363 0,00638318972809315 0,00652797018868985 0,00633249408712902 0,00645456626230259 0,00144937644834536 0,00143859799737005 279021 284494 667 665 0 True 247 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 293 362 0,00651942282463712 0,00661103433796209 0,00648508430609598 0,00662241550316625 0,00132745446295241 0,00130153299185315 284976 288114 667 665 0 True 292 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 336 362 0,00699622722399386 0,00673514869802109 0,00695811398489357 0,00674448767833982 0,00139615974880038 0,0014089987775547 305818 293523 667 665 0 True 336 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 380 363 0,0071012330868212 0,00709207213501825 0,00708018616006714 0,00704966811627375 0,00144815498602076 0,00134903199935776 310408 309078 667 665 0 True 381 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 425 362 0,00718123428558094 0,00718883498515114 0,00715648126955062 0,0072327763790341 0,00149082474574123 0,00155892161814645 313905 313295 667 665 0 True 425 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 470 361 0,00730968917006363 0,0071354169355639 0,00733958953231098 0,0072480354009308 0,0016927254538214 0,00170261838620951 319520 310967 667 665 0 True 469 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 512 360 0,00726846464613882 0,00721813689637231 0,00727855344472419 0,0072632944228275 0,00174101060399482 0,00168809345523173 317718 314572 667 665 0 True 514 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 557 360 0,00725499003759736 0,00720849961938492 0,0072480354009308 0,00729381246662089 0,00165959745821633 0,00161733907039223 317129 314152 667 665 0 True 558 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 601 361 0,00743860159643227 0,00726944392338135 0,00750743877317464 0,0072632944228275 0,00194362133723767 0,00207813485113961 325155 316808 667 665 0 True 602 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 645 360 0,00729680936597391 0,00714968928386427 0,0072480354009308 0,00703440909437705 0,00182225646459752 0,00192379192425713 318957 311589 667 665 0 True 647 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 249 407 0,00657522005762969 0,00695350185947818 0,00657663843747616 0,00683604180972 0,00145497653239882 0,0018081263204675 287415 303039 667 665 0 True 247 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 293 407 0,00686962538414931 0,00684570203260497 0,0068207827878233 0,00677500572213321 0,00137686388598768 0,00131912689032092 300284 298341 667 665 0 True 292 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 337 407 0,00718482598938571 0,00730491828105397 0,00720225833524071 0,00732433051041428 0,00135056957442091 0,00125974143317959 314062 318354 667 665 0 True 336 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 381 406 0,00738424562038047 0,00740955157405989 0,00727855344472419 0,00738536659800107 0,00142489242886037 0,00139438084907834 322779 322914 667 665 0 True 381 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 425 406 0,00744111807680504 0,00738084625617603 0,00733958953231098 0,00733958953231098 0,00156016275504935 0,00147837826998412 325265 321663 667 665 0 True 425 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 470 405 0,00755877497277912 0,00759107656988661 0,00753795681696803 0,00761425192645151 0,00145939642329694 0,00147825598390639 330408 330825 667 665 0 True 469 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 513 405 0,00758263578213182 0,00750844839266856 0,00756847486076143 0,00750743877317464 0,00160090340881259 0,00164958691563262 331451 327224 667 665 0 True 514 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 557 404 0,00756911541940177 0,00762437106728827 0,00762951094834821 0,0076752880140383 0,00166452301055265 0,00142003783399652 330860 332276 667 665 0 True 558 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 602 404 0,00737360777153195 0,00705338535168317 0,00735484855420768 0,00698863202868696 0,0020437048188605 0,00198490488242195 322314 307392 667 665 0 True 602 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 645 404 0,00689877080228483 0,00661622011081721 0,00694285496299687 0,00663767452506294 0,00181518724088329 0,0017444145826406 301558 288340 667 665 0 True 647 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 249 451 0,00682965910041088 0,00674675932220113 0,00683604180972 0,00677500572213321 0,0014785234854363 0,00149013251976547 298537 294029 667 665 0 True 247 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 293 451 0,00693148504713082 0,00681165032058287 0,00698863202868696 0,00686655985351339 0,00137825300802824 0,00156738482218754 302988 296857 667 665 0 True 292 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 337 451 0,00701912719538606 0,0068842970323497 0,00692759594110018 0,00697337300679027 0,00137863164901264 0,00146129634962816 306819 300023 667 665 0 True 336 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 381 450 0,00720280738550386 0,00747818275374864 0,00714122224765393 0,00732433051041428 0,00139026941233492 0,00157496615438688 314848 325905 667 665 0 True 381 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 425 451 0,00726160151784945 0,00743986310477498 0,00732433051041428 0,00756847486076143 0,00179176250997131 0,00189859197303408 317418 324235 667 665 0 True 425 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 469 449 0,0074079005358845 0,00729730024305442 0,00744640268558785 0,00735484855420768 0,0019481521091626 0,00194622605095971 323813 318022 667 665 0 True 469 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 513 448 0,00738012774340685 0,00759050292244688 0,00744640268558785 0,0076752880140383 0,00173484124453288 0,0017811484102129 322599 330800 667 665 0 True 514 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 557 449 0,00693258314765712 0,00685132377751428 0,00698863202868696 0,00694285496299687 0,00181163377753865 0,00182440936887404 303036 298586 667 665 0 True 558 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 602 448 0,00667274511062162 0,00663744506608705 0,00669871061264973 0,00666819256885634 0,00188391569641712 0,00170532631284841 291678 289265 667 665 0 True 602 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 645 448 0,00661825187200403 0,00665600829723657 0,00662241550316625 0,00669871061264973 0,00178726129750706 0,0018643265102448 289296 290074 667 665 0 True 647 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 250 496 0,00683947337386468 0,00687172268047092 0,00692759594110018 0,00683604180972 0,00141166596275212 0,00138154182655566 298966 299475 667 665 0 True 247 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 294 495 0,00697172585600082 0,00711907945648052 0,00694285496299687 0,00711070420386053 0,00144247853632117 0,00142168690507636 304747 310255 667 665 0 True 292 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 338 495 0,00702150641319304 0,00730693752004181 0,00711070420386053 0,00735484855420768 0,00148025791064683 0,0014806756041666 306923 318442 667 665 0 True 336 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 382 494 0,00729243984096302 0,00744385569095547 0,00730907148851759 0,00740062561989776 0,00146883473987004 0,00142794264871459 318766 324409 667 665 0 True 381 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 425 493 0,00759089441317336 0,00780724987107274 0,0076600289921416 0,00773632410162509 0,00192800521048184 0,0019179078819282 331812 340246 667 665 0 True 425 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 470 493 0,00748627746094909 0,00744142342581104 0,00752269779507134 0,00744640268558785 0,00183533171265606 0,00170132866307844 327239 324303 667 665 0 True 469 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 515 493 0,00691281733818373 0,006889528697 0,00691233691920348 0,00692759594110018 0,00164772908918798 0,00168743005318743 302172 300251 667 665 0 True 514 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 558 493 0,00679980449235213 0,00662353985214811 0,00674448767833982 0,00669871061264973 0,00167210903061422 0,00165027684207604 297232 288659 667 665 0 True 558 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 602 492 0,00647799240686363 0,00659258583630053 0,00643930724040589 0,00663767452506294 0,00177595513266009 0,00172227402132427 283165 287310 667 665 0 True 602 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 646 492 0,00660454849251959 0,00675114198864063 0,00660715648126955 0,00672922865644312 0,00170278907132478 0,0018556135937425 288697 294220 667 665 0 True 647 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 248 539 0,00681291306738482 0,00692897269495552 0,00683604180972 0,00698863202868696 0,00132593169688124 0,00144443182521046 297805 301970 667 665 0 True 247 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 293 539 0,00713792794607503 0,00712628446832347 0,00711070420386053 0,00714122224765393 0,00144926796725184 0,00132409366435434 312012 310569 667 665 0 True 292 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 338 539 0,00719667632423202 0,00717252045196534 0,00721751735713741 0,00714122224765393 0,00138070434723953 0,00137524370983307 314580 312584 667 665 0 True 336 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 382 539 0,00718249252576733 0,0077417163875585 0,00711070420386053 0,00778210116731518 0,00160759915031515 0,00152520607663743 313960 337390 667 665 0 True 381 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 426 539 0,00738131735231034 0,00736090627117118 0,00740062561989776 0,0072632944228275 0,00189099777728549 0,00178974137622417 322651 320794 667 665 0 True 425 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 470 537 0,00725588224427498 0,0071617588259961 0,00727855344472419 0,00721751735713741 0,00190237918713625 0,0018871538938111 317168 312115 667 665 0 True 469 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 515 537 0,00711093297480351 0,00705067773576766 0,0072480354009308 0,00701915007248035 0,00179371653013385 0,00191792042632027 310832 307274 667 665 0 True 514 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 559 537 0,00689275412648448 0,00697073422856753 0,00686655985351339 0,00694285496299687 0,00160191996612473 0,0017045573581524 301295 303790 667 665 0 True 558 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 603 537 0,00684340823408392 0,00692039092925722 0,00686655985351339 0,00695811398489357 0,00157385923566183 0,00158686256891856 299138 301596 667 665 0 True 602 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 647 536 0,00692162501948843 0,00710620680793309 0,00689707789730678 0,00718699931334401 0,00173582115237884 0,00187775504427002 302557 309694 667 665 0 True 647 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 249 583 0,00698375920760151 0,00704638685291852 0,00697337300679027 0,00706492713817044 0,0013095524092604 0,00108480891879144 305273 307087 667 665 0 True 247 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 294 584 0,00717986165992307 0,00739895056937377 0,00720225833524071 0,00743114366369116 0,00135993156271697 0,00145256143190939 313845 322452 667 665 0 True 292 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 338 583 0,00719592138012019 0,00718103337997087 0,00712596322575723 0,0072480354009308 0,00137859353615019 0,00144560672145851 314547 312955 667 665 0 True 336 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 383 583 0,00709565107581252 0,00724587848655743 0,00712596322575723 0,0072632944228275 0,00138017180412532 0,00126698552427321 310164 315781 667 665 0 True 381 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 427 582 0,00722380855806933 0,00722410282974546 0,0072327763790341 0,00718699931334401 0,00186849469025876 0,00175934485454881 315766 314832 667 665 0 True 425 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 472 581 0,00718706794462691 0,00780603373850052 0,00715648126955062 0,00790417334248875 0,00202075622729068 0,00193928740491819 314160 340193 667 665 0 True 469 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 515 581 0,00701912719538606 0,00713027705450396 0,00704966811627375 0,00717174029144732 0,00196280360165017 0,00195088819428982 306819 310743 667 665 0 True 514 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 559 581 0,00713975811361886 0,0072678836023453 0,00708018616006714 0,00735484855420768 0,00167314853290113 0,00167542861400319 312092 316740 667 665 0 True 558 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 603 581 0,00703909889870812 0,00713475150453382 0,00704966811627375 0,00714122224765393 0,00154691944527185 0,00147979880858616 307692 310938 667 665 0 True 602 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 647 581 0,00709075537763277 0,00684951105160475 0,00704966811627375 0,00683604180972 0,00164073544643934 0,00142188640058602 309950 298507 667 665 0 True 647 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 247 621 0,00724972830590884 0,00740489355684932 0,00732433051041428 0,00743114366369116 0,00139723609434025 0,00129473335071297 316899 322711 667 665 0 False 247 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 292 621 0,00711694965060386 0,00714471002408746 0,00712596322575723 0,00715648126955062 0,00137442960370698 0,00138833902514027 311095 311372 667 665 0 False 292 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 339 627 0,00691613451685693 0,00712417344574529 0,00691233691920348 0,00717174029144732 0,00128969485980934 0,00130908798097856 302317 310477 667 665 0 True 336 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 383 627 0,00692997515890716 0,00671812284201004 0,00697337300679027 0,00674448767833982 0,00129810572850724 0,00124584029954654 302922 292781 667 665 0 True 381 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 425 621 0,00688133845642983 0,00682489010349173 0,00683604180972 0,00686655985351339 0,0016125960899602 0,00160090501334343 300796 297434 667 665 0 False 425 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 469 621 0,0069403384826241 0,0069158476415346 0,00697337300679027 0,00688181887541009 0,00174793376895012 0,0018166468488692 303375 301398 667 665 0 False 469 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 514 621 0,00685827834537755 0,00700496950777034 0,00683604180972 0,00695811398489357 0,00197818738869303 0,00182784972536367 299788 305282 667 665 0 False 514 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 558 621 0,00693292630407158 0,00705416551220119 0,00686655985351339 0,00712596322575723 0,00177412890480754 0,00177563416879142 303051 307426 667 665 0 False 558 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 602 621 0,00691890264526698 0,0068168131475404 0,00688181887541009 0,0068055237659266 0,00146606088441912 0,00136381856342902 302438 297082 667 665 0 False 602 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 647 621 0,00725391481416536 0,00705893825889971 0,0072632944228275 0,00698863202868696 0,00141246887614233 0,00141073031644144 317082 307634 667 665 0 False 647 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 251 671 0,00937308869026233 0,749295555207543 0,00889600976577401 0,747798886091402 0,00247824870902809 0,182602995470091 409715 32654881 667 665 14 True 247 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 292 664 0,00847399600726073 0,00739188323291635 0,00773632410162509 0,00738536659800107 0,00328578656266279 0,00135820321198798 370414 322144 667 665 0 False 292 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 336 664 0,00688257381952192 0,00695708141950206 0,00686655985351339 0,00700389105058366 0,00122862243535011 0,00127511224570771 300850 303195 667 665 0 False 336 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 381 664 0,00665734882615913 0,00673801693521972 0,00666819256885634 0,00675974670023652 0,00126481998053908 0,00118256889204415 291005 293648 667 665 0 False 381 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 425 664 0,00674219996891003 0,00689778922013204 0,00679026474402991 0,00685130083161669 0,00152671582623444 0,00135104028297971 294714 300611 667 665 0 False 425 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 469 664 0,00663662217872524 0,00669903185521597 0,00671396963454643 0,00672922865644312 0,0015206447642516 0,00145123299689541 290099 291949 667 665 0 False 469 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 514 664 0,00687038032826114 0,00685848289756206 0,00691233691920348 0,00683604180972 0,00162376856962945 0,00171066315908141 300317 298898 667 665 0 False 514 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 558 664 0,00694498253276658 0,00680295382539663 0,00692759594110018 0,0068207827878233 0,00153768166780735 0,00161711698239237 303578 296478 667 665 0 False 558 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 602 664 0,00708940562906919 0,00704223364545491 0,00708018616006714 0,00698863202868696 0,00130883762121007 0,00133212815731724 309891 306906 667 665 0 False 602 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 650 669 0,00903125914726317 0,753940103176229 0,00886549172198062 0,747875181200885 0,00193562724159231 0,182951179602369 394773 32857294 667 665 14 True 647 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B9_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B9_3.csv new file mode 100755 index 0000000..9608a96 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_B9_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 247 273 0,00104372167315289 0,0744299521979588 0,000823987182421607 0,0729533836881056 0,000847303340940952 0,0182818221283111 45623 3243715 667 665 0 True 247 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 292 273 0,000871731678221315 0,00101581488626579 0,000732433051041428 0,000885023270008392 0,000652206709613784 0,000670819118868647 38105 44270 667 665 0 False 292 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 336 274 0,000890010476565334 0,000916780392271592 0,000778210116731518 0,000793469138628214 0,000644648206897758 0,000671207532697639 38904 39954 667 665 0 True 336 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 380 273 0,000887105085589501 0,000906179387585466 0,000778210116731518 0,000778210116731518 0,000658830738527696 0,000680504085133766 38777 39492 667 665 0 True 381 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 424 274 0,000889896091093844 0,000914118668151266 0,000701915007248035 0,000701915007248035 0,000771595189442752 0,000802964048615022 38899 39838 667 665 0 True 425 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 468 273 0,000933820112145804 0,000915174179440361 0,000717174029144732 0,000625619897764553 0,000849200038521326 0,000892053116007402 40819 39884 667 665 0 True 469 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 513 272 0,000893167515578443 0,00102359354554847 0,000701915007248035 0,000793469138628214 0,000771885814425396 0,000843185035543011 39042 44609 667 665 0 True 514 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 557 272 0,00088330748793605 0,000931695225704453 0,000671396963454643 0,000732433051041428 0,000794281863801601 0,000810793622167762 38611 40604 667 665 0 True 558 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 602 273 0,000975708071805251 0,000994360472020059 0,000625619897764553 0,00064087891966125 0,00097047802184048 0,000997736586540679 42650 43335 667 665 0 False 602 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 645 271 0,00113088340242788 0,0749574095458376 0,000793469138628214 0,0749523155565728 0,0010088012153307 0,0223993365273115 49433 3266702 667 665 0 True 647 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 247 316 0,000914488967464082 0,000897528784194407 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000767488048527497 0,000738700189496574 39974 39115 667 665 0 False 247 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 292 316 0,000915152403198721 0,000960905353335272 0,000793469138628214 0,000793469138628214 0,00068714019051226 0,000708554751807024 40003 41877 667 665 0 False 292 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 336 318 0,000910325336301865 0,000940942422432827 0,000793469138628214 0,000869764248111696 0,000640272406816805 0,000636663283710205 39792 41007 667 665 0 True 336 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 380 318 0,000980191982287639 0,000817493493403915 0,000885023270008392 0,000671396963454643 0,000687083291256684 0,00063458227274357 42846 35627 667 665 0 True 381 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 424 318 0,00090440016887871 0,000900213454212322 0,000686655985351339 0,000610360875867857 0,000799523303455801 0,000845434631286722 39533 39232 667 665 0 True 425 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 469 317 0,000881362934920729 0,000961914972829189 0,000625619897764553 0,000717174029144732 0,000864942805471615 0,000849638923609623 38526 41921 667 665 0 True 469 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 513 316 0,000940889134283854 0,000986788325815684 0,000701915007248035 0,000762951094834821 0,000884115100957107 0,000883808126652407 41128 43005 667 665 0 True 514 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 557 316 0,000885526566082946 0,000856937491359435 0,000625619897764553 0,000701915007248035 0,000828083707670885 0,000674723466630668 38708 37346 667 665 0 True 558 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 602 316 0,000978041535423636 0,00086873168272019 0,000564583810177768 0,000320439459830625 0,00102255604887924 0,0010743136167088 42752 37860 667 665 0 False 602 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 647 316 0,000955530474634507 0,00105615377422728 0,000610360875867857 0,000732433051041428 0,00100103924851129 0,00102939741578278 41768 46028 667 665 0 False 647 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 249 363 0,000991470389776501 0,000909208246067217 0,00080872816052491 0,000747692072938125 0,000822469035953054 0,000765491439385535 43339 39624 667 665 0 True 247 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 293 362 0,000900122152245004 0,000843468249474682 0,000732433051041428 0,000701915007248035 0,000738010726310332 0,000661896132067355 39346 36759 667 665 0 True 292 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 336 362 0,00100688955133328 0,000892021768773043 0,000885023270008392 0,000778210116731518 0,000690751450440014 0,000698988570609073 44013 38875 667 665 0 True 336 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 380 363 0,00101050413223235 0,00085356444441385 0,000885023270008392 0,000717174029144732 0,000698621861583976 0,00063229552936201 44171 37199 667 665 0 True 381 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 425 362 0,000962736759338344 0,000922356245385723 0,000778210116731518 0,000656137941557946 0,000823851229767264 0,000806835149994937 42083 40197 667 665 0 True 425 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 470 361 0,000888111677738608 0,000895440707513806 0,000595101853971161 0,000579842832074464 0,000864064563307949 0,000860934582923326 38821 39024 667 665 0 True 469 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 512 360 0,000903119051598028 0,000937936509848666 0,000579842832074464 0,000656137941557946 0,000888306540670576 0,000864021810685477 39477 40876 667 665 0 True 514 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 557 360 0,00097159019483163 0,000963085213606229 0,000671396963454643 0,00064087891966125 0,000954005434919674 0,000910779143937509 42470 41972 667 665 0 True 558 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 601 361 0,000906481984459819 0,000901268965501417 0,000381475547417411 0,000488288700694286 0,00105171440794974 0,00106188809970668 39624 39278 667 665 0 True 602 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 645 360 0,000948438575402159 0,000967353150557786 0,000610360875867857 0,000625619897764553 0,000946384338077977 0,0010000638789817 41458 42158 667 665 0 True 647 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 249 407 0,000959877122551107 0,000869603626828573 0,000823987182421607 0,000732433051041428 0,000771476210437015 0,000753464780856166 41958 37898 667 665 0 True 247 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 293 407 0,00100112452357021 0,00101813242192228 0,000885023270008392 0,000930800335698482 0,000734699350458616 0,000724573764205409 43761 44371 667 665 0 True 292 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 337 407 0,000960243156059873 0,000999385623592054 0,00080872816052491 0,000915541313801785 0,000695852678418608 0,000680821611343164 41974 43554 667 665 0 True 336 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 381 406 0,00103248901985263 0,00094532508887233 0,000869764248111696 0,000839246204318303 0,000777217643768755 0,000728054617022591 45132 41198 667 665 0 True 381 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 425 406 0,000905978688385265 0,000900374075495445 0,000717174029144732 0,000701915007248035 0,000807222275539693 0,00077552192314774 39602 39239 667 665 0 True 425 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 470 405 0,000883078716993071 0,000936009054451189 0,000625619897764553 0,000717174029144732 0,00084305370956832 0,000778917184421566 38601 40792 667 665 0 True 469 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 513 405 0,000977103574557422 0,00101051438392273 0,000732433051041428 0,000762951094834821 0,000895356290224775 0,000913009483958286 42711 44039 667 665 0 True 514 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 557 404 0,000941644078395684 0,000959023789732973 0,000686655985351339 0,00080872816052491 0,000887288586310643 0,000788971120070157 41161 41795 667 665 0 True 558 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 602 404 0,000878800700359365 0,000871944108382653 0,000457770656900893 0,000442511635004196 0,000972317094008448 0,000987756091572635 38414 38000 667 665 0 True 602 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 645 404 0,000933293938976952 0,000921300734096629 0,000579842832074464 0,000549324788281071 0,000952133135366595 0,000925849902863301 40796 40151 667 665 0 True 647 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 249 451 0,000838834416620941 0,000942869877830305 0,000686655985351339 0,000778210116731518 0,000748681323046502 0,00078826629609539 36667 41091 667 665 0 True 247 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 293 451 0,000953013994261738 0,000919763358958165 0,000778210116731518 0,000717174029144732 0,000792448569798502 0,000810690487364062 41658 40084 667 665 0 True 292 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 337 451 0,00101780192531338 0,000969533010828743 0,000885023270008392 0,00080872816052491 0,000771333342603203 0,000831842126716439 44490 42253 667 665 0 True 336 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 381 450 0,00096941687087333 0,000984883816315795 0,000885023270008392 0,000930800335698482 0,000760013538698549 0,00073115196581249 42375 42922 667 665 0 True 381 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 425 451 0,000917577375194298 0,0010038830195195 0,00064087891966125 0,00064087891966125 0,000936508132654597 0,000994761687476794 40109 43750 667 665 0 True 425 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 469 449 0,000945464553143433 0,00094135544858943 0,000671396963454643 0,000595101853971161 0,000968104175508526 0,000975370885835271 41328 41025 667 665 0 True 469 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 513 448 0,000941758463867174 0,000935641920089764 0,000686655985351339 0,000610360875867857 0,000876545954128324 0,000942299872917664 41166 40776 667 665 0 True 514 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 557 449 0,000932172961356356 0,000897528784194407 0,00064087891966125 0,000579842832074464 0,000928292027210864 0,000913658645490252 40747 39115 667 665 0 True 558 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 602 448 0,000882849946050092 0,000946105249390356 0,000534065766384375 0,000579842832074464 0,000914305014812478 0,000967578071820513 38591 41232 667 665 0 True 602 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 645 448 0,000875780923912043 0,000944108956300112 0,000473029678797589 0,000503547722590982 0,000930155859546533 0,00101581643603271 38282 41145 667 665 0 True 647 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 250 496 0,000899710364547641 0,000951176292757529 0,000717174029144732 0,00080872816052491 0,000765536416030227 0,000762584840776777 39328 41453 667 665 0 True 247 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 294 495 0,000928855782683161 0,000981074797316018 0,000778210116731518 0,000885023270008392 0,000799470633914786 0,000788150864353834 40602 42756 667 665 0 True 292 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 338 495 0,000968135753592648 0,00100753141723616 0,000854505226215 0,000915541313801785 0,000775477980979166 0,000822073749610997 42319 43909 667 665 0 True 336 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 382 494 0,00101789343369057 0,000942617472956826 0,000915541313801785 0,000762951094834821 0,000801771006505862 0,000806993921610755 44494 41080 667 665 0 True 381 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 425 493 0,000943703016882495 0,00107652973128633 0,000610360875867857 0,000793469138628214 0,000951552930374636 0,00101524245470638 41251 46916 667 665 0 True 425 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 470 493 0,000927185754799414 0,000912489509422446 0,000549324788281071 0,000579842832074464 0,000963773184327178 0,000915399879661837 40529 39767 667 665 0 True 469 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 515 493 0,000875437767497574 0,000950419078137091 0,000595101853971161 0,000671396963454643 0,000834575595705521 0,000909447582945375 38267 41420 667 665 0 True 514 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 558 493 0,000837599053528855 0,000927220775674595 0,000473029678797589 0,000686655985351339 0,000884703766824304 0,000904127513985565 36613 40409 667 665 0 True 558 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 602 492 0,000918492458966214 0,000885849322321597 0,000534065766384375 0,000579842832074464 0,000957382187885939 0,000899294113639284 40149 38606 667 665 0 True 602 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 646 492 0,00100508226088375 0,000863522963967483 0,000625619897764553 0,000488288700694286 0,00099844548603927 0,000908407702941629 43934 37633 667 665 0 True 647 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 248 539 0,000927208631893712 0,00094929472915523 0,000793469138628214 0,000686655985351339 0,000704694057208034 0,000829425072905884 40530 41371 667 665 0 True 247 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 293 539 0,000980352121947724 0,000952897235076705 0,000885023270008392 0,000823987182421607 0,000728496233148351 0,000741243973833229 42853 41528 667 665 0 True 292 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 338 539 0,000904720448198881 0,000933324384433274 0,000732433051041428 0,000839246204318303 0,000765680386015548 0,000703985515487812 39547 40675 667 665 0 True 336 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 382 539 0,00095408921769374 0,000938900237547405 0,000762951094834821 0,000778210116731518 0,00079410422775774 0,000797088457954542 41705 40918 667 665 0 True 381 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 426 539 0,000865120197969223 0,000879355633303905 0,000518806744487678 0,000442511635004196 0,000931611597221868 0,000985096065718171 37816 38323 667 665 0 True 425 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 470 537 0,000879853046697068 0,000910355540946667 0,000534065766384375 0,000534065766384375 0,000927603759243239 0,000968091999747388 38460 39674 667 665 0 True 469 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 515 537 0,000902707263900666 0,000886445915658912 0,000564583810177768 0,000503547722590982 0,000944577302353174 0,000958952262240485 39459 38632 667 665 0 True 514 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 559 537 0,000918766984097789 0,000836768047378689 0,000625619897764553 0,000442511635004196 0,000884767087059857 0,000891294254186745 40161 36467 667 665 0 True 558 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 603 537 0,000856861566927683 0,000969074092876962 0,000595101853971161 0,000732433051041428 0,000836591193000961 0,000872325828260165 37455 42233 667 665 0 True 602 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 647 536 0,00090060257122526 0,000977747642165611 0,000549324788281071 0,000549324788281071 0,000910341397614323 0,00104008584715946 39367 42611 667 665 0 True 647 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 249 583 0,000987032233482709 0,000934724084186204 0,000869764248111696 0,000839246204318303 0,000710725551221312 0,000601355008452924 43145 40736 667 665 0 True 247 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 294 584 0,000854665365875085 0,000932177089553823 0,000717174029144732 0,000823987182421607 0,000684591382419032 0,000769483041232233 37359 40625 667 665 0 True 292 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 338 583 0,000924211732540688 0,000986306461966314 0,00080872816052491 0,000839246204318303 0,000715317765990412 0,000798112611254167 40399 42984 667 665 0 True 336 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 383 583 0,000937709218176446 0,000954503447907936 0,000839246204318303 0,000823987182421607 0,000666541750864181 0,00066446709319297 40989 41598 667 665 0 True 381 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 427 582 0,00086896354981127 0,000948537514534792 0,000610360875867857 0,000579842832074464 0,000848831491647283 0,000999165001677547 37984 41338 667 665 0 True 425 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 472 581 0,000878983717113748 0,000965219182082008 0,000488288700694286 0,000671396963454643 0,000991061556436455 0,000970125237657045 38422 42065 667 665 0 True 469 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 515 581 0,000943085335336452 0,000926784803620404 0,000503547722590982 0,000488288700694286 0,00104198903900198 0,00103494105952911 41224 40390 667 665 0 True 514 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 559 581 0,000917714637760085 0,00087061324632249 0,000625619897764553 0,000534065766384375 0,000909271629286575 0,000883570738411831 40115 37942 667 665 0 True 558 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 603 581 0,000880905393034771 0,000898010648043776 0,00064087891966125 0,000656137941557946 0,000783261319403623 0,000781942531084974 38506 39136 667 665 0 True 602 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 647 581 0,00091929315726664 0,000942961661420661 0,000686655985351339 0,000732433051041428 0,000846631436378726 0,000793608036077902 40184 41095 667 665 0 True 647 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 247 621 0,000934231899843166 0,000961869081034011 0,000778210116731518 0,000823987182421607 0,00073175840625291 0,00070349926322184 40837 41919 667 665 0 False 247 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 292 621 0,000913985671389528 0,000924168971295256 0,000793469138628214 0,000793469138628214 0,0006968977010122 0,000707738908745248 39952 40276 667 665 0 False 292 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 339 627 0,000928741397211671 0,000964553751051926 0,000823987182421607 0,000885023270008392 0,000722205610480386 0,000711899068298961 40597 42036 667 665 0 True 336 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 383 627 0,000919659190775407 0,000997917086146357 0,000778210116731518 0,000869764248111696 0,0006922564439327 0,000706670497002296 40200 43490 667 665 0 True 381 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 425 621 0,000946242374349561 0,000936146729836723 0,000747692072938125 0,000656137941557946 0,000855036525367849 0,000848338671223794 41362 40798 667 665 0 False 425 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 469 621 0,00093343120154274 0,000872357134539255 0,000518806744487678 0,0004272526131075 0,000982156908979621 0,000988842017128031 40802 38018 667 665 0 False 469 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 514 621 0,000936313715424275 0,000979216179611308 0,000549324788281071 0,000701915007248035 0,00101485381170365 0,00100629534336378 40928 42675 667 665 0 False 514 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 558 621 0,000927185754799414 0,000852899013383768 0,000610360875867857 0,000503547722590982 0,000923738195699945 0,000873048495489929 40529 37170 667 665 0 False 558 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 602 621 0,000967906982649669 0,00085519360314267 0,000778210116731518 0,00064087891966125 0,000789817480805763 0,000746078885975177 42309 37270 667 665 0 False 602 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 647 621 0,000919773576246896 0,000991469288923843 0,000762951094834821 0,00080872816052491 0,000704345144181232 0,000810335506843055 40205 43209 667 665 0 False 647 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 251 671 0,00113882175414925 0,0764773916939293 0,00100709544518196 0,0736705577172503 0,000751116729608099 0,0224332873751139 49780 3332944 667 665 0 True 247 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 292 664 0,00104077052798847 0,000974764675479039 0,000839246204318303 0,000885023270008392 0,000806594852320193 0,000638552138049625 45494 42481 667 665 0 False 292 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 336 664 0,000932516117770824 0,000905766361428864 0,00080872816052491 0,000778210116731518 0,000680890536756599 0,000644301586006596 40762 39474 667 665 0 False 336 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 381 664 0,000876101203232213 0,000938418373698035 0,000747692072938125 0,000869764248111696 0,000693933254055397 0,000632448283550165 38296 40897 667 665 0 False 381 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 425 664 0,000887379610721076 0,000978826099352295 0,000701915007248035 0,000762951094834821 0,000753434140250746 0,000785431242289605 38789 42658 667 665 0 False 425 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 469 664 0,000864227991291605 0,000835161834547458 0,000625619897764553 0,000610360875867857 0,000824698649008896 0,000741860591048801 37777 36397 667 665 0 False 469 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 514 664 0,000904377291784412 0,000918294821512467 0,000579842832074464 0,000610360875867857 0,000904449840837167 0,00092014765394432 39532 40020 667 665 0 False 514 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 558 664 0,000906596369931308 0,000910630891717736 0,000701915007248035 0,000625619897764553 0,000774669748884647 0,000872555171164982 39629 39686 667 665 0 False 558 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 602 664 0,000862123298616199 0,000877129881237771 0,000701915007248035 0,000747692072938125 0,000655443213950962 0,00064301426171238 37685 38226 667 665 0 False 602 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 650 669 0,00101686396444717 0,0769696041431113 0,000885023270008392 0,0736400396734569 0,000729323659961377 0,0223939444032346 44449 3354395 667 665 0 True 647 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C10_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C10_1.csv new file mode 100755 index 0000000..9522306 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C10_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 266 257 0,0104950042717254 0,0474492250309913 0,0104982070649271 0,0477149614709697 0,00151622314760413 0,00846487692796318 458756 2067874 667 665 0 True 266 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 310 257 0,0103893578502578 0,0105169538632574 0,0104829480430304 0,0105134660868238 0,00130796006161255 0,00132179661242904 454138 458337 667 665 0 False 310 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 356 258 0,010494432344368 0,0646089933003716 0,0105134660868238 0,0644235904478523 0,00128782960717811 0,00954572841418455 458731 2815710 667 665 0 True 355 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 399 256 0,0105628119792244 0,0996454285175057 0,0105592431525139 0,0946669718471046 0,00128161805186982 0,0245907451835548 461720 4342625 667 665 0 True 399 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 443 256 0,0106352866139601 0,0734707218951476 0,010605020218204 0,0704661631189441 0,00155944971333097 0,0165943283718483 464888 3201911 667 665 0 True 443 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 486 256 0,0107444103537611 0,0718499384189474 0,0106965743495842 0,0731670099946593 0,0015377399903575 0,0240944957896358 469658 3131276 667 665 0 True 487 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 531 256 0,0107375014712831 0,0830846399587892 0,010757610437171 0,079514763103685 0,00153625085236043 0,0237726401500497 469356 3620893 667 665 0 True 532 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 575 256 0,0109885775812025 0,0715831694135774 0,0109407186999313 0,0679789425497826 0,00169731234923674 0,0199404469884831 480331 3119650 667 665 0 True 576 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 620 258 0,0107256740135311 0,010707473650939 0,010757610437171 0,010757610437171 0,00195663422618286 0,00182752080098127 468839 466640 667 665 0 False 620 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 662 256 0,0107403382309761 0,0478942377688327 0,0106965743495842 0,0470893415732052 0,0017354606867876 0,00899989888525357 469480 2087268 667 665 0 True 664 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 266 300 0,0103282988855767 0,0102859345663311 0,0103303578240635 0,0102845807583734 0,00144456690523083 0,00148361903904993 451469 448269 667 665 0 False 266 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 310 300 0,0105556514487092 0,0104241147616122 0,0105439841306172 0,0104219119554437 0,00129849455864541 0,00131470751510142 461407 454291 667 665 0 False 310 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 355 301 0,0109590890066525 0,103874747523421 0,0109407186999313 0,10092317082475 0,00144359567210433 0,0264526793246573 479042 4526942 667 665 0 True 354 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 399 300 0,0107794580622255 0,0530892348747814 0,010757610437171 0,0520027466239414 0,00146234216253147 0,00888172793290776 471190 2313670 667 665 0 True 399 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 443 300 0,0106159097150898 0,0909374833283713 0,0106202792401007 0,0914930952925917 0,00179630423981168 0,0245332245789667 464041 3963126 667 665 0 True 443 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 488 301 0,0105195971480957 0,0454535285340841 0,0104982070649271 0,0451514457923247 0,00169449851388804 0,00984687905518662 459831 1980900 667 665 0 True 487 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 530 301 0,0105973106374256 0,0518440298503182 0,0105897611963073 0,0525215533684291 0,00153824623831075 0,0154792806104415 463228 2259403 667 665 0 True 531 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 576 301 0,0103592287170674 0,0629629463909258 0,0103303578240635 0,0589150835431449 0,00170663737217452 0,019583539316445 452821 2743974 667 665 0 True 576 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 620 301 0,0105896239337415 0,0106424908689669 0,0106202792401007 0,0106965743495842 0,00190715764180236 0,00193422565417827 462892 463808 667 665 0 False 620 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 664 301 0,0107504956608443 0,0106224132085765 0,0106355382619974 0,010605020218204 0,001921843703568 0,00184306648841474 469924 462933 667 665 0 False 664 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 267 346 0,010374556370247 0,0527094573237855 0,0103608758678569 0,0509956511787594 0,00146486155788287 0,00906276459342738 453491 2297119 667 665 0 True 266 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 311 345 0,0106354696307145 0,0646010540198057 0,0106202792401007 0,0671396963454643 0,00141757169357274 0,0176610467530582 464896 2815364 667 665 0 True 310 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 355 345 0,0107462405213049 0,040366537768087 0,0107881284809644 0,0409094377050431 0,00139675368482058 0,00734317773480103 469738 1759205 667 665 0 True 354 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 400 345 0,0106951102155491 0,03887677536712 0,010757610437171 0,0379644464789807 0,00138525347843169 0,00787572803933258 467503 1694280 667 665 0 True 399 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 444 345 0,0108634856295816 0,0727622673070867 0,0108949416342412 0,0684672312504769 0,00164792654252385 0,0126258282085701 474863 3171036 667 665 0 True 443 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 488 345 0,010832487166808 0,0410364432481983 0,010757610437171 0,0371404592965591 0,00169350050967015 0,0132271340756325 473508 1788400 667 665 0 True 487 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 531 344 0,0106509803006485 0,0317631340883681 0,0106355382619974 0,0313725490196078 0,00158736715426819 0,00516197124357682 465574 1384262 667 665 0 True 531 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 575 344 0,0106733998530604 0,052529263190019 0,0106813153276875 0,0519264515144579 0,0018400341459497 0,00858480074016549 466554 2289266 667 665 0 True 576 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 620 344 0,0106999601595403 0,05788660252141 0,0107728694590677 0,0573586633096818 0,00202851708306048 0,0123878611088242 467715 2522743 667 665 0 True 620 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 665 344 0,0104487010328665 0,0649565089193572 0,0103761348897536 0,0642252231631952 0,00189609967710741 0,0187395708011671 456732 2830855 667 665 0 True 664 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 268 389 0,0105515564488298 0,0451341675314402 0,0105592431525139 0,0473029678797589 0,00155157359207859 0,00977662677738121 461228 1966982 667 665 0 True 266 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 312 389 0,0105173551928545 0,0373282714683252 0,0105592431525139 0,034683756771191 0,00141656387321967 0,00826912880175063 459733 1626795 667 665 0 True 310 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 356 389 0,0107963642349116 0,0893029552595152 0,0107118333714809 0,0846112764171817 0,00149181265291716 0,0223364116922962 471929 3891892 667 665 0 True 354 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 400 389 0,0108766857129915 0,0674675702761137 0,0108491645685512 0,0656900892652781 0,00156270516745377 0,0169337481355315 475440 2940289 667 665 0 True 398 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 445 388 0,0108296504071151 0,0436059248602165 0,0108033875028611 0,0452582589456016 0,00170333508059333 0,00883554046557201 473384 1900380 667 665 0 True 443 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 488 389 0,0108921048745483 0,0541021815238485 0,0109254596780346 0,0533150225070573 0,00174816692514699 0,0100503440303002 476114 2357815 667 665 0 True 487 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 532 389 0,01072896831511 0,0438776501794656 0,010757610437171 0,0435645075150683 0,00179902203783072 0,0068694870224607 468983 1912222 667 665 0 True 531 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 577 389 0,010617533988785 0,0527362810780671 0,0107423514152743 0,0516060120546273 0,00188019561368786 0,00894591067062487 464112 2298288 667 665 0 True 576 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 620 388 0,0107236379521386 0,0450344446605183 0,0107270923933776 0,0441138323033494 0,00191250061724456 0,00922733893197046 468750 1962636 667 665 0 True 620 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 664 388 0,0106470683175235 0,0934102020902565 0,0106507972838941 0,0882581826504921 0,00186983669264574 0,0203399134286685 465403 4070889 667 665 0 True 664 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 268 434 0,0105184075391922 0,0487279081200369 0,0105134660868238 0,0490424963759823 0,00162055406971387 0,00732540351627087 459779 2123600 667 665 0 True 266 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 312 433 0,0107290827005815 0,0564523691926084 0,0107423514152743 0,0561989776455329 0,00144621738560254 0,00815984747145401 468988 2460238 667 665 0 True 310 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 357 433 0,0107645193196489 0,0352782849777224 0,0107728694590677 0,0359044785229267 0,00143701990968853 0,00405730408345122 470537 1537455 667 665 0 True 354 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 400 433 0,0112495823500472 0,0573940917755593 0,0110780498970016 0,0551461051346609 0,00183174233543863 0,0128050318980415 491740 2501279 667 665 0 True 398 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 445 433 0,0109983003462791 0,0986915216629351 0,0109712367437247 0,0978561074235142 0,00183258587595748 0,0159466795439932 480756 4301053 667 665 0 True 443 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 488 433 0,0112746556453977 0,0633174605086761 0,0110933089188983 0,0624246585793851 0,00310228959673379 0,0142680943865141 492836 2759424 667 665 0 True 487 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 532 433 0,0111336412361455 0,0556704418404675 0,0109102006561379 0,0529182879377432 0,00286981073713408 0,0102972356298111 486672 2426161 667 665 0 True 531 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 577 433 0,0107649768615349 0,033548416704384 0,0107728694590677 0,032974746318761 0,0018640096975853 0,00851999634897262 470557 1462066 667 665 0 True 575 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 621 433 0,0106613436243654 0,0421061121561055 0,0106813153276875 0,0425574120698863 0,00192300642253839 0,00574857260359744 466027 1835017 667 665 0 True 620 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 665 432 0,0105104691874708 0,0770520946449438 0,0104371709773404 0,0768596932936599 0,00189072355332338 0,0121733123885033 459432 3357990 667 665 0 True 664 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 267 478 0,0105159139359137 0,0607996530580285 0,0104676890211337 0,0595712214847028 0,00149005149196227 0,0189469542103265 459670 2649696 667 665 0 True 265 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 311 478 0,0107280532313381 0,0583834729878025 0,0108339055466545 0,0582131685358969 0,00167551297133217 0,00869018367334798 468943 2544397 667 665 0 True 310 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 355 476 0,0109362119123546 0,0725214042200948 0,0110017547875181 0,0720378423743038 0,0015643414353826 0,0201529399583254 478042 3160539 667 665 0 True 354 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 399 476 0,0110890766564532 0,0922644675318417 0,0110627908751049 0,0871290150301366 0,00168286950433431 0,0264608864000698 484724 4020957 667 665 0 True 398 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 443 476 0,01123597047894 0,097406780856926 0,0112153810940719 0,0948195620660716 0,00197443234853836 0,0361317518969052 491145 4245063 667 665 0 True 443 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 488 477 0,0109474903198435 0,0481607314234316 0,0109407186999313 0,0492256046387427 0,00186760715480286 0,0073437484471025 478535 2098882 667 665 0 True 487 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 531 477 0,010738416555055 0,0451525242495114 0,0106355382619974 0,0465400167849241 0,00168502831892683 0,00982189509525756 469396 1967782 667 665 0 True 531 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 576 477 0,0108425530882991 0,10338423307066 0,010757610437171 0,101136797131304 0,00187017873704467 0,0220548950855718 473948 4505565 667 665 0 True 575 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 620 477 0,0106294987091028 0,0729322505164261 0,0105897611963073 0,0698558022430762 0,00180900443398491 0,0256005581600038 464635 3178444 667 665 0 True 620 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 664 477 0,0103833182973631 0,0810579435542392 0,010452429999237 0,0770428015564202 0,00202741000299409 0,0156033135884857 453874 3532568 667 665 0 True 664 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 267 522 0,0103894722357292 0,0530605983945903 0,0103456168459602 0,0559243152513924 0,0015370185615716 0,0131788248431696 454143 2312422 667 665 0 True 265 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 311 521 0,0108742607409959 0,127618909943662 0,0108796826123445 0,124193179217212 0,00154947621182644 0,0469082482746422 475334 5561731 667 665 0 True 310 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 356 522 0,0108121494299772 0,0613634337617906 0,0108644235904479 0,0617074845502403 0,00159407517883239 0,0140251785959592 472619 2674266 667 665 0 True 354 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 400 521 0,0112337971549817 0,0582851957084288 0,0111848630502785 0,0585336079957275 0,00169512993052186 0,00630055743205801 491050 2540114 667 665 0 True 398 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 444 521 0,011926515570322 0,0709361180474647 0,0113984893568322 0,0635233081559472 0,00330685067325304 0,0273681067001939 521330 3091451 667 665 0 True 442 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 488 521 0,0114740523992982 0,0639295193809656 0,0111848630502785 0,0632639047837034 0,00271471675268536 0,0140235452434282 501552 2786098 667 665 0 True 487 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 532 521 0,0108934775002062 0,0750032095574253 0,0108339055466545 0,0711528191042954 0,00175648326995756 0,0185003952005539 476174 3268698 667 665 0 True 531 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 576 520 0,0108103650166219 0,06451193215357 0,0108644235904479 0,0619058518348974 0,00170419288837762 0,0181767358790284 472541 2811480 667 665 0 True 575 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 621 522 0,0106563564178085 0,0477610827251236 0,010605020218204 0,044785229266804 0,00189677847207575 0,010472374031098 465809 2081465 667 665 0 True 619 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 664 520 0,0104719670377675 0,063631521008977 0,0104219119554437 0,0630350194552529 0,00196433193410592 0,0144282105461132 457749 2773111 667 665 0 True 664 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 268 566 0,0104653326804211 0,0450223062806937 0,0104371709773404 0,0456092164492256 0,00131308392656246 0,0091178308431704 457459 1962107 667 665 0 True 265 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 311 565 0,0107791377829053 0,0527205631382186 0,010757610437171 0,0540169375143053 0,00157036965601333 0,0123948768342062 471176 2297603 667 665 0 True 310 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 356 566 0,0107494661916009 0,0512271752854326 0,0107118333714809 0,0513618677042802 0,00137024937876341 0,0100451085967125 469879 2232520 667 665 0 True 354 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 399 565 0,010941153364723 0,0530491713375909 0,0108644235904479 0,0523842221713588 0,0016044859295704 0,00926550911364888 478258 2311924 667 665 0 True 398 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 444 565 0,0110368940043597 0,0897492988594168 0,0109254596780346 0,0837567711909667 0,00189208595127201 0,0233398339018702 482443 3911344 667 665 0 True 442 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 489 566 0,0108165189549881 0,0646947421196617 0,0107881284809644 0,0631418326085298 0,00209895599522076 0,0118640882529132 472810 2819447 667 665 0 True 487 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 532 565 0,0107721373920501 0,058087539746597 0,0107881284809644 0,0570382238498512 0,00207867556501905 0,00869075169236171 470870 2531500 667 665 0 True 531 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 576 564 0,011023785429327 0,0388698457060481 0,0108644235904479 0,0406958113984894 0,00241868644840203 0,00762315431093057 481870 1693978 667 665 0 True 575 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 621 566 0,0108381835632882 0,0492192945169057 0,0106660563057908 0,0491950865949493 0,00256977218530492 0,0075694323583656 473757 2145015 667 665 0 True 619 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 664 565 0,0103433291365304 0,0521992782367913 0,0103761348897536 0,0508278019378958 0,00181237107353849 0,00713900405407926 452126 2274885 667 665 0 True 664 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 265 604 0,010380778939896 0,0101096182892571 0,01025406271458 0,0101167315175097 0,0016595395893505 0,00132771193119059 453763 440585 667 665 0 False 265 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 309 604 0,0105305781533587 0,0103161543134559 0,0104371709773404 0,01025406271458 0,0016535669211839 0,00139668022462291 460311 449586 667 665 0 False 309 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 356 610 0,0104478545803775 0,0791584133141276 0,0105439841306172 0,0749370565346761 0,00154112848451449 0,0131800306958508 456695 3449785 667 665 0 True 354 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 399 609 0,0107935961065016 0,0808691447088768 0,0107728694590677 0,0791485465781643 0,00153711802851496 0,0252037749035431 471808 3524340 667 665 0 True 398 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 442 604 0,010867740769121 0,0106247766360282 0,0107881284809644 0,0106355382619974 0,0021046575383829 0,00193437782108689 475049 463036 667 665 0 False 442 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 486 605 0,0104768398588529 0,0104870094669037 0,0104371709773404 0,0105745021744106 0,0019929275781508 0,00206656334234019 457962 457032 667 665 0 False 486 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 531 605 0,0101987459005677 0,0103488292716226 0,0102693217364767 0,0103456168459602 0,00203356527622927 0,00211362487469851 445806 451010 667 665 0 False 531 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 575 605 0,0103409727958177 0,010401903132746 0,0103303578240635 0,0104371709773404 0,00176212053950698 0,00182796014211639 452023 453323 667 665 0 False 575 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 619 605 0,0102968428809171 0,0103657403981457 0,0102845807583734 0,0103761348897536 0,00157676310462866 0,00142722255208432 450094 451747 667 665 0 False 619 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 664 605 0,0103044151991297 0,010438639514786 0,0104219119554437 0,010452429999237 0,00159799580765928 0,00171311691568328 450425 454924 667 665 0 False 664 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 267 655 0,0101968928559296 0,0448388308835719 0,0101625085831998 0,0447241931792172 0,00137341696999821 0,00812296075213261 445725 1954111 667 665 0 True 265 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 309 648 0,0101725745046909 0,0101652161991153 0,0101319905394064 0,0101777676050965 0,00131962462326114 0,00130683001557003 444662 443008 667 665 0 False 309 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 354 648 0,0105351764493125 0,0102187489781905 0,0102693217364767 0,0102082856488899 0,00245635989735201 0,00129956813784169 460512 445341 667 665 0 False 354 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 398 648 0,0104663392725702 0,0103525923988272 0,01025406271458 0,0103303578240635 0,00191814503988921 0,00135761355770558 457503 451174 667 665 0 False 398 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 442 648 0,0103197657294036 0,0103303807699611 0,0103303578240635 0,0103456168459602 0,00156591795031302 0,00162352441056108 451096 450206 667 665 0 False 442 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 486 648 0,0102039618780676 0,0102325624085391 0,0101777676050965 0,0101625085831998 0,00169691936153739 0,00170682825098798 446034 445943 667 665 0 False 486 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 531 648 0,0101601979966757 0,0100710003436148 0,0101319905394064 0,010101472495613 0,00182325601420173 0,00169767466574194 444121 438902 667 665 0 False 531 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 575 648 0,0102555268486151 0,0103536249642187 0,01025406271458 0,0103761348897536 0,00148721664544015 0,00138615236050024 448288 451219 667 665 0 False 575 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 619 648 0,0102666222393495 0,0101591584821518 0,0102845807583734 0,0101930266269932 0,00127778620385797 0,00137103001053806 448773 442744 667 665 0 False 619 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 664 654 0,010575142733051 0,0456697247811678 0,0105134660868238 0,0449835965514611 0,00153690606708926 0,00828818542215145 462259 1990322 667 665 0 True 663 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C10_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C10_2.csv new file mode 100755 index 0000000..3cffc57 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C10_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 266 257 0,00877215317724521 0,781711729541294 0,00859082932784009 0,806378271152819 0,0018136651357258 0,172319237719839 383447 34067603 667 665 14 True 266 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 310 257 0,00704054015564889 0,00706517954304392 0,00694285496299687 0,00712596322575723 0,00149013963337254 0,00126431372956051 307755 307906 667 665 0 False 310 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 356 258 0,00664003086577563 0,00689446206498163 0,00669871061264973 0,00686655985351339 0,00122298978097181 0,00123643868002249 290248 300466 667 665 0 True 355 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 399 256 0,00665135502745308 0,00664728885615274 0,00660715648126955 0,00663767452506294 0,00133778540322795 0,00137258477545706 290743 289694 667 665 0 True 399 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 443 256 0,00686267074748275 0,00685735854858019 0,0068207827878233 0,00691233691920348 0,00151971289868581 0,00162793067402089 299980 298849 667 665 0 True 443 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 486 256 0,00714719316926568 0,00708922684371721 0,00717174029144732 0,00709544518196384 0,00162242562840751 0,00158820405090248 312417 308954 667 665 0 True 487 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 531 256 0,0074415527415967 0,00760108098123542 0,00738536659800107 0,00758373388265812 0,00145088710467134 0,00156780816528448 325284 331261 667 665 0 True 532 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 575 256 0,00766721239975114 0,00772753582284849 0,00762951094834821 0,0076600289921416 0,00157854462242056 0,00164785606334468 335148 336772 667 665 0 True 576 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 620 258 0,00866913762162178 0,00813432069530659 0,00862134737163348 0,00823987182421607 0,00202855195018171 0,00182120478003308 378944 354500 667 665 0 False 620 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 662 256 0,00997544258312592 0,767418913500276 0,0100404364080262 0,778423743038071 0,00199907114573371 0,169774304012294 436045 33444711 667 665 15 True 664 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 266 300 0,00726169302622664 0,00682218248757623 0,0072480354009308 0,00677500572213321 0,00150882897089064 0,00141948996604138 317422 297316 667 665 0 False 266 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 310 300 0,00677992429740726 0,00635025421186291 0,00675974670023652 0,00636301213092241 0,00129782601349182 0,00108077384617602 296363 276749 667 665 0 False 310 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 355 301 0,00679291848696846 0,00648031155939746 0,00677500572213321 0,00650034332799268 0,0012326527350636 0,00136269374759801 296931 282417 667 665 0 True 354 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 399 300 0,00674071295778067 0,00679799751151741 0,00671396963454643 0,00685130083161669 0,00128338818206613 0,00145545172116087 294649 296262 667 665 0 True 399 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 443 300 0,00679044776078429 0,00718004670637454 0,00677500572213321 0,00730907148851759 0,00163883503205602 0,00167898243450232 296823 312912 667 665 0 True 443 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 488 301 0,00686813837301995 0,00718755001488615 0,00692759594110018 0,00717174029144732 0,00168644518148998 0,00161613174994292 300219 313239 667 665 0 True 487 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 530 301 0,00728399819316709 0,00725480444071956 0,00721751735713741 0,00720225833524071 0,00148274189338079 0,00153552292062813 318397 316170 667 665 0 True 531 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 576 301 0,00750268033756068 0,00761097066309629 0,00758373388265812 0,0076600289921416 0,00168503116645978 0,0018222879760469 327956 331692 667 665 0 True 576 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 620 301 0,00796440873177511 0,00797477786937015 0,00791943236438544 0,00805676356145571 0,00194727576057403 0,00188766599774169 348139 347547 667 665 0 False 620 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 664 301 0,00820008855723203 0,00820391560269408 0,00820935378042268 0,00822461280231937 0,00206789344126797 0,00183703130074269 358441 357533 667 665 0 False 664 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 267 346 0,00638403618058217 0,00669935309778222 0,00636301213092241 0,00675974670023652 0,00147120990921671 0,00133576829030003 279058 291963 667 665 0 True 266 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 311 345 0,00652427276862827 0,00659887301223992 0,00651560234988937 0,00660715648126955 0,00123652104163522 0,00130760328078221 285188 287584 667 665 0 True 310 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 355 345 0,00666656829516119 0,00667383725966323 0,00672922865644312 0,00668345159075303 0,00132387484171121 0,00122758351076702 291408 290851 667 665 0 True 354 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 400 345 0,00722810945179733 0,00693317179421431 0,00721751735713741 0,00691233691920348 0,001421299334183 0,00131296784027241 315954 302153 667 665 0 True 399 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 444 345 0,00716245219116237 0,00727302348340524 0,00715648126955062 0,0072480354009308 0,00160990054850474 0,00172402889723584 313084 316964 667 665 0 True 443 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 488 345 0,00738358218464583 0,00707582643952523 0,00738536659800107 0,00706492713817044 0,0015169410995404 0,00153902675490173 322750 308370 667 665 0 True 487 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 531 344 0,00740122042434951 0,00729238982097037 0,00743114366369116 0,00733958953231098 0,00149726903274066 0,00162562136021071 323521 317808 667 665 0 True 531 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 575 344 0,00737820606748583 0,00746466762006871 0,00744640268558785 0,00744640268558785 0,00177578531598454 0,00185207209410438 322515 325316 667 665 0 True 576 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 620 344 0,00746918827150856 0,00755060000653958 0,00740062561989776 0,00749217975127794 0,00200721261589306 0,00197569975579984 326492 329061 667 665 0 True 620 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 665 344 0,00729962324857255 0,0070773408687661 0,00720225833524071 0,00703440909437705 0,0017908020993661 0,00184852854705043 319080 308436 667 665 0 True 664 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 268 389 0,00655522547721333 0,00665522813671854 0,00653086137178607 0,00662241550316625 0,00143891917618487 0,00140081424851064 286541 290040 667 665 0 True 266 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 312 389 0,00688566222725213 0,00688877148237956 0,00689707789730678 0,00691233691920348 0,00131675980552213 0,00133449221927979 300985 300218 667 665 0 True 310 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 356 389 0,00717553788910077 0,0070274105956124 0,00718699931334401 0,00704966811627375 0,00142349056331266 0,00138645736699249 313656 306260 667 665 0 True 354 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 400 389 0,00722273333463733 0,00731223802238487 0,00721751735713741 0,00735484855420768 0,00138391449186736 0,00137453563537548 315719 318673 667 665 0 True 398 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 445 388 0,00738083693333009 0,00727180735083302 0,00744640268558785 0,00717174029144732 0,00152551497127006 0,0016448846100075 322630 316911 667 665 0 True 443 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 488 389 0,00733322970009616 0,00714980401335222 0,00738536659800107 0,00717174029144732 0,00166172335159161 0,00178948649425379 320549 311594 667 665 0 True 487 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 532 389 0,00727779850061236 0,00744013845554605 0,0072632944228275 0,00747692072938125 0,00162403536052926 0,00173587716471364 318126 324247 667 665 0 True 531 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 577 389 0,0072491563785514 0,00736751468967681 0,0072632944228275 0,00733958953231098 0,00182746498781203 0,00176431203164228 316874 321082 667 665 0 True 576 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 620 388 0,00710196515383874 0,00680926394723361 0,00712596322575723 0,00683604180972 0,00187373150090601 0,00191351479886199 310440 296753 667 665 0 True 620 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 664 388 0,00655545424815631 0,006585747958819 0,00659189745937285 0,00663767452506294 0,00179279173763768 0,00177967188781924 286551 287012 667 665 0 True 664 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 268 434 0,00672277731585112 0,00671998145971475 0,00665293354695964 0,00675974670023652 0,00144716847079745 0,00152936982341634 293865 292862 667 665 0 True 266 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 312 433 0,00665355122850568 0,00694129464196082 0,00669871061264973 0,00697337300679027 0,00138400603321049 0,00144805245261725 290839 302507 667 665 0 True 310 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 357 433 0,00704232456900412 0,00711657835364332 0,00701915007248035 0,00711070420386053 0,00131325557688905 0,00131416695004832 307833 310146 667 665 0 True 354 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 400 433 0,00723572752419853 0,00729613000227738 0,00727855344472419 0,0072327763790341 0,00157445881330038 0,00142451347394133 316287 317971 667 665 0 True 398 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 445 433 0,00715005280605291 0,00760690923922303 0,00712596322575723 0,00759899290455482 0,00160210095293498 0,00177546041720423 312542 331515 667 665 0 True 443 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 488 433 0,00738271285506251 0,00733988782897964 0,00740062561989776 0,00730907148851759 0,00181865247392618 0,00171929703019803 322712 319878 667 665 0 True 487 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 532 433 0,00725988573577711 0,00726503831104426 0,00720225833524071 0,00720225833524071 0,00182027214560776 0,00165157689706526 317343 316616 667 665 0 True 531 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 577 433 0,00669008594809942 0,00705379837783977 0,00669871061264973 0,00692759594110018 0,00177999633232855 0,00253039257714595 292436 307410 667 665 0 True 575 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 621 433 0,00643235260373933 0,00661071309539585 0,00648508430609598 0,0063782711528191 0,00188245015909136 0,00214417106297951 281170 288100 667 665 0 True 620 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 665 432 0,00617988099106775 0,00632515139990053 0,00625619897764553 0,00631723506523232 0,00179125386456848 0,00181303797882745 270134 275655 667 665 0 True 664 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 267 478 0,00686511859657262 0,00691910595899224 0,00689707789730678 0,00686655985351339 0,00148425023000428 0,00144772781706347 300087 301540 667 665 0 True 265 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 311 478 0,00695374445988267 0,00675169269018277 0,00694285496299687 0,00675974670023652 0,00158959335231007 0,00147943620058531 303961 294244 667 665 0 True 310 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 355 476 0,00702816364763372 0,00713048356758227 0,00706492713817044 0,00704966811627375 0,00148523678799851 0,00154642632569817 307214 310752 667 665 0 True 354 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 399 476 0,00699556378825922 0,00737237921996568 0,00700389105058366 0,00740062561989776 0,00161232970080752 0,00154046668740899 305789 321294 667 665 0 True 398 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 443 476 0,00713792794607503 0,00745328645486456 0,00717174029144732 0,00743114366369116 0,00185837961309695 0,00198067142897838 312012 324820 667 665 0 True 443 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 488 477 0,00708345758455174 0,00747676010809812 0,00714122224765393 0,00747692072938125 0,00178009207539872 0,00208938513817406 309631 325843 667 665 0 True 487 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 531 477 0,00652013201456036 0,00680823138184211 0,00653086137178607 0,0068207827878233 0,00174500848312169 0,00161159482782343 285007 296708 667 665 0 True 531 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 576 477 0,00630172439529835 0,00636854209224136 0,00627145799954223 0,00631723506523232 0,00170620988251767 0,00186280115036544 275460 277546 667 665 0 True 575 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 620 477 0,0062663106533252 0,00653620776592431 0,00628671702143893 0,00656137941557946 0,00170594800960078 0,00172246314926712 273912 284853 667 665 0 True 620 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 664 477 0,00646470081507655 0,00665474627286917 0,00665293354695964 0,00663767452506294 0,00186933494936851 0,00177322008133914 282584 290019 667 665 0 True 664 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 267 522 0,00678978432504965 0,00677746093317524 0,00679026474402991 0,00672922865644312 0,00143069918584656 0,00144885773718426 296794 295367 667 665 0 True 265 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 311 521 0,00669893938359271 0,00680641865593258 0,00675974670023652 0,00685130083161669 0,00143245090705832 0,00150518536288029 292823 296629 667 665 0 True 310 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 356 522 0,00691389256161574 0,00715758267263489 0,00689707789730678 0,00706492713817044 0,00155399056904259 0,00142975206900519 302219 311933 667 665 0 True 354 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 400 521 0,00700784878789719 0,00709925420096361 0,00703440909437705 0,00712596322575723 0,00158451234508452 0,00146864402444835 306326 309391 667 665 0 True 398 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 444 521 0,0072404402056239 0,0131329927014836 0,00711070420386053 0,00753795681696803 0,00203590678426755 0,0204782180147989 316493 572346 667 665 0 True 442 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 488 521 0,00716343590621718 0,00691958782284161 0,00711070420386053 0,00686655985351339 0,00189314674702972 0,00168149270270572 313127 301561 667 665 0 True 487 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 532 521 0,00661369933023875 0,00656791899639233 0,00668345159075303 0,00662241550316625 0,00171377851287518 0,0015532503430614 289097 286235 667 665 0 True 531 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 576 520 0,00644946467027416 0,00638740362005953 0,00648508430609598 0,0063782711528191 0,00169492923710742 0,00166199793321173 281918 278368 667 665 0 True 575 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 621 522 0,00638543168333435 0,00644077577785159 0,0063782711528191 0,00648508430609598 0,00174959200999122 0,00177069620910845 279119 280694 667 665 0 True 619 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 664 520 0,00655090170639103 0,00652450535815391 0,00662241550316625 0,00653086137178607 0,00187128171654407 0,00185782408539949 286352 284343 667 665 0 True 664 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 268 566 0,0069849030623164 0,00701444616347461 0,00698863202868696 0,00704966811627375 0,00131608804968514 0,00131267894921987 305323 305695 667 665 0 True 265 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 311 565 0,00710594576824657 0,00681268288597438 0,00715648126955062 0,0068055237659266 0,00148453338301237 0,0014470712266276 310614 296902 667 665 0 True 310 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 356 566 0,00695266923645067 0,00710216832995742 0,00694285496299687 0,00706492713817044 0,00132942080431106 0,001304747230083 303914 309518 667 665 0 True 354 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 399 565 0,00697794842564984 0,00697782451092253 0,00695811398489357 0,00697337300679027 0,0014493044725381 0,00134350003221818 305019 304099 667 665 0 True 398 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 444 565 0,00717917534709414 0,00707008996512797 0,00720225833524071 0,00708018616006714 0,00175556930709153 0,0020218516267301 313815 308120 667 665 0 True 442 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 489 566 0,00694232878982802 0,00675410200942962 0,00694285496299687 0,00677500572213321 0,00188566876122297 0,00201410318979867 303462 294349 667 665 0 True 487 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 532 565 0,0067675477893921 0,0070407880539068 0,00674448767833982 0,00704966811627375 0,0018302467237457 0,00180128837979406 295822 306843 667 665 0 True 531 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 576 564 0,00679207203447944 0,00680065923563773 0,00663767452506294 0,00677500572213321 0,00190540788451275 0,00159278779213888 296894 296378 667 665 0 True 575 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 621 566 0,00669047485870249 0,00667858706046416 0,00662241550316625 0,00675974670023652 0,00182486338420439 0,00156454240646863 292453 291058 667 665 0 True 619 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 664 565 0,00651779855094197 0,00659490337195701 0,00646982528419928 0,00668345159075303 0,00164311728257413 0,00167581490595632 284905 287411 667 665 0 True 664 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 265 604 0,00725617964650085 0,00713238807708215 0,0072327763790341 0,00715648126955062 0,00128434632766886 0,00131239862528922 317181 310835 667 665 0 False 265 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 309 604 0,00712900587929885 0,00686036446116435 0,00706492713817044 0,00689707789730678 0,00155350903367462 0,00137320059902996 311622 298980 667 665 0 False 309 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 356 610 0,00679127133617901 0,00694235015324991 0,0068055237659266 0,00677500572213321 0,00139896855671586 0,00191232344195929 296859 302553 667 665 0 True 354 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 399 609 0,0067229374555112 0,00698301028377765 0,00665293354695964 0,00701915007248035 0,00136152103458692 0,00129534393570501 293872 304325 667 665 0 True 398 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 442 604 0,00695024426445509 0,00675908126920643 0,00686655985351339 0,00671396963454643 0,0017706681144095 0,00190986901992378 303808 294566 667 665 0 False 442 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 486 605 0,00690849356736143 0,0068134630464924 0,00692759594110018 0,00685130083161669 0,00179284521085905 0,00186238329827789 301983 296936 667 665 0 False 486 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 531 605 0,00690938577403905 0,00666073515213991 0,00688181887541009 0,00671396963454643 0,00188340795606816 0,00190303300041873 302022 290280 667 665 0 False 531 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 575 605 0,00674130776223241 0,00670217544318567 0,00675974670023652 0,00675974670023652 0,00172559836769816 0,00175009006295579 294675 292086 667 665 0 False 575 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 619 605 0,00669530192559934 0,00646117468080822 0,00671396963454643 0,0064087891966125 0,00140018929210705 0,00143880353835362 292664 281583 667 665 0 False 619 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 664 605 0,00687367462984004 0,0069402850224669 0,00691233691920348 0,00691233691920348 0,00149606680024068 0,00158685323580918 300461 302463 667 665 0 False 664 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 267 655 0,00912722855784285 0,768350287483415 0,0089417868314641 0,782986190585183 0,00186372388025671 0,180608976338333 398968 33485301 667 665 15 True 265 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 309 648 0,00765334888060662 0,00736175526938197 0,00744640268558785 0,00732433051041428 0,00203201733159124 0,00136675120603755 334542 320831 667 665 0 False 309 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 354 648 0,00675901463321898 0,00679765332305357 0,00679026474402991 0,00683604180972 0,00128708563547494 0,00117869543212042 295449 296247 667 665 0 False 354 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 398 648 0,00647796952976933 0,00648217017710217 0,00653086137178607 0,00650034332799268 0,00135916511587499 0,00131118613363028 283164 282498 667 665 0 False 398 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 442 648 0,00659310994537064 0,00657138382692827 0,00665293354695964 0,00653086137178607 0,00159956250081267 0,00155740188923145 288197 286386 667 665 0 False 442 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 486 648 0,00660537206791431 0,00658434825906607 0,00665293354695964 0,00660715648126955 0,00164188361467916 0,00160547577986329 288733 286951 667 665 0 False 486 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 531 648 0,00657027860526134 0,00653928251620124 0,00662241550316625 0,00648508430609598 0,0017238103662831 0,00163927151095135 287199 284987 667 665 0 False 531 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 575 648 0,00644516377654615 0,00660011209070972 0,00642404821850919 0,00657663843747616 0,0014606623313696 0,00132231516917296 281730 287638 667 665 0 False 575 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 619 648 0,00695914345413697 0,00675254168839356 0,00694285496299687 0,00675974670023652 0,00132880449783566 0,00137925202127276 304197 294281 667 665 0 False 619 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 664 654 0,00883360105252935 0,771919085881332 0,00849927519645991 0,775143053330282 0,00262264672983189 0,181628782996409 386133 33640832 667 665 17 True 663 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C10_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C10_3.csv new file mode 100755 index 0000000..5eb6665 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C10_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 266 257 0,00108638745401847 0,0804581607371599 0,000961318379491875 0,0805523765926604 0,000779681443582908 0,0211615742183228 47488 3506429 667 665 0 True 266 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 310 257 0,000983120250357769 0,00106650237403993 0,000869764248111696 0,000946059357595178 0,000670308214363399 0,000694799488190857 42974 46479 667 665 0 False 310 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 356 258 0,000947958156421903 0,000896725677778791 0,000885023270008392 0,00080872816052491 0,000642408952121545 0,000619032165264698 41437 39080 667 665 0 True 355 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 399 256 0,000945944972123689 0,000949776593004599 0,00080872816052491 0,000823987182421607 0,000684774935685229 0,000617999532625904 41349 41392 667 665 0 True 399 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 443 256 0,00101176237241873 0,000941057151920772 0,00080872816052491 0,000686655985351339 0,000840679708112065 0,000884577005244737 44226 41012 667 665 0 True 443 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 486 256 0,000994101255620759 0,000976760968569283 0,000823987182421607 0,000793469138628214 0,000827083394575005 0,000820302907488692 43454 42568 667 665 0 True 487 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 531 256 0,000895112068593764 0,00116220971288372 0,000747692072938125 0,00100709544518196 0,000753279451467761 0,000917501434843802 39127 50650 667 665 0 True 532 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 575 256 0,00107202063879939 0,00098805035018308 0,000854505226215 0,000762951094834821 0,000939244498210606 0,000881588181916318 46860 43060 667 665 0 True 576 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 620 258 0,00106149717542236 0,00104787030519765 0,000839246204318303 0,000686655985351339 0,000979129850598111 0,00100105796727805 46400 45667 667 665 0 False 620 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 662 256 0,00124332432090203 0,0793798641717592 0,00105287251087205 0,0779888609140154 0,00100177956490679 0,0214220082583294 54348 3459436 667 665 0 True 664 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 266 300 0,000983623546432323 0,000928643421325114 0,000854505226215 0,000762951094834821 0,00077207613760616 0,000745414081951479 42996 40471 667 665 0 False 266 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 310 300 0,000988038825631817 0,000974374595220025 0,000869764248111696 0,000839246204318303 0,000706068509530785 0,000653367148246315 43189 42464 667 665 0 False 310 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 355 301 0,00102606055635492 0,000914692315590992 0,000854505226215 0,00080872816052491 0,000716678265376148 0,000674631568225905 44851 39863 667 665 0 True 354 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 399 300 0,00100876547306571 0,000941125989613539 0,000869764248111696 0,000793469138628214 0,000724185416893343 0,000699775155367317 44095 41015 667 665 0 True 399 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 443 300 0,000953013994261738 0,000849480074643005 0,000656137941557946 0,000579842832074464 0,000917438422643864 0,000844522170665505 41658 37021 667 665 0 True 443 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 488 301 0,000953059748450334 0,000913866263277787 0,000732433051041428 0,000671396963454643 0,000880227705748534 0,000854077134244171 41660 39827 667 665 0 True 487 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 530 301 0,000986071395522198 0,00101358913419966 0,000854505226215 0,000823987182421607 0,000785909375646656 0,000852162057605452 43103 44173 667 665 0 True 531 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 576 301 0,000925858883330136 0,000973043733159862 0,000564583810177768 0,000671396963454643 0,000956536621957201 0,000961955797663358 40471 42406 667 665 0 True 576 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 620 301 0,00105182016453435 0,000980937121930484 0,000671396963454643 0,000625619897764553 0,00105437003276468 0,000996817422410522 45977 42750 667 665 0 False 620 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 664 301 0,00106058209165044 0,00108114185670172 0,000717174029144732 0,00080872816052491 0,00102345295598929 0,000993085756814861 46360 47117 667 665 0 False 664 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 267 346 0,000896118660742872 0,000914003938663321 0,000732433051041428 0,000717174029144732 0,00072563568961428 0,00080300242659806 39171 39833 667 665 0 True 266 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 311 345 0,000964704189447963 0,000890530285429757 0,000869764248111696 0,000762951094834821 0,000693983354972397 0,000652938093480812 42169 38810 667 665 0 True 310 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 355 345 0,000988450613329179 0,000924627889247036 0,000839246204318303 0,000778210116731518 0,000674962344325005 0,00069157003252597 43207 40296 667 665 0 True 354 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 400 345 0,000928604134645884 0,000948055650685423 0,000747692072938125 0,00080872816052491 0,000740850207544146 0,000702294912955315 40591 41317 667 665 0 True 399 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 444 345 0,000957749552781403 0,000950281402751557 0,000747692072938125 0,000625619897764553 0,000831450610959831 0,000904205675876372 41865 41414 667 665 0 True 443 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 488 345 0,000931120615018652 0,000942617472956826 0,000747692072938125 0,000686655985351339 0,000800362967044039 0,000849665540811661 40701 41080 667 665 0 True 487 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 531 344 0,000952876731695951 0,000989059969676997 0,00080872816052491 0,000778210116731518 0,000789179717186206 0,000876487173842772 41652 43104 667 665 0 True 531 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 575 344 0,00101839672976512 0,000961869081034011 0,000732433051041428 0,000671396963454643 0,00102196225948933 0,000946643027369477 44516 41919 667 665 0 True 576 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 620 344 0,00097028620045665 0,000961410163082231 0,000671396963454643 0,000503547722590982 0,00101796126781975 0,00105456797425003 42413 41899 667 665 0 True 620 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 665 344 0,00100094150681583 0,00100838041544695 0,000610360875867857 0,00064087891966125 0,00102279202808957 0,00104975594974014 43753 43946 667 665 0 True 664 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 268 389 0,00100258865760528 0,000965678100033788 0,000900282291905089 0,000823987182421607 0,000762971870520619 0,0007885824372752 43825 42085 667 665 0 True 266 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 312 389 0,00104669569541162 0,000989472995833599 0,000915541313801785 0,000854505226215 0,000784641098853327 0,000738424919668643 45753 43122 667 665 0 True 310 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 356 389 0,00092983949773797 0,000967697339021621 0,000793469138628214 0,000823987182421607 0,000699921709453038 0,000754352490836324 40645 42173 667 665 0 True 354 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 400 389 0,000927162877705116 0,00101494294215741 0,000793469138628214 0,000839246204318303 0,000724291477591992 0,000775067181583135 40528 44232 667 665 0 True 398 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 445 388 0,000930297039623928 0,000981809066038867 0,000671396963454643 0,000747692072938125 0,000809128685529608 0,000893306711041568 40665 42788 667 665 0 True 443 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 488 389 0,000933705726674314 0,000940460558583458 0,000656137941557946 0,000625619897764553 0,000897953924925856 0,000927486366114003 40814 40986 667 665 0 True 487 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 532 389 0,000923296648768772 0,00100695776979643 0,000671396963454643 0,000793469138628214 0,000842520331585503 0,000918631871129345 40359 43884 667 665 0 True 531 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 577 389 0,000921374972847749 0,000935550136499408 0,000656137941557946 0,000579842832074464 0,00088206748705374 0,000957326897404357 40275 40772 667 665 0 True 576 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 620 388 0,000961432764963364 0,000939978694734089 0,000625619897764553 0,000518806744487678 0,000966641261655904 0,00103294181663036 42026 40965 667 665 0 True 620 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 664 388 0,000999889160478127 0,00100427309977851 0,000671396963454643 0,00064087891966125 0,00099276571953809 0,000995428409328253 43707 43767 667 665 0 True 664 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 268 434 0,000914626230029869 0,000932291819041768 0,000747692072938125 0,000778210116731518 0,000800003908285395 0,000800940066061808 39980 40630 667 665 0 True 266 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 312 433 0,00104761077918354 0,00103203763586123 0,000930800335698482 0,000930800335698482 0,000769575156059789 0,000761075073288609 45793 44977 667 665 0 True 310 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 357 433 0,000960860837605917 0,000889543611833429 0,000839246204318303 0,000732433051041428 0,000773313457189384 0,000702890189075176 42001 38767 667 665 0 True 354 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 400 433 0,000997075277879486 0,000925568671048186 0,000839246204318303 0,000793469138628214 0,000810501000295591 0,00073807698925446 43584 40337 667 665 0 True 398 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 445 433 0,000906710755402798 0,00104908643776987 0,000625619897764553 0,000762951094834821 0,000891007607809795 0,000948030292788608 39634 45720 667 665 0 True 443 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 488 433 0,000926476564876179 0,000975062972147696 0,000686655985351339 0,000671396963454643 0,00086734603760376 0,000923306442039443 40498 42494 667 665 0 True 487 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 532 433 0,000955736368483188 0,00086150372497965 0,000717174029144732 0,000671396963454643 0,000893950941292127 0,000821019930766869 41777 37545 667 665 0 True 531 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 577 433 0,000978476200215296 0,000964163670792913 0,000671396963454643 0,000549324788281071 0,000958625946159535 0,00103122072107137 42771 42019 667 665 0 True 575 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 621 433 0,000947363351970158 0,000906982494001082 0,000595101853971161 0,000534065766384375 0,00098115356009421 0,000909122603176771 41411 39527 667 665 0 True 620 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 665 432 0,000929679358077885 0,000998398949995726 0,000595101853971161 0,000656137941557946 0,000914917586191503 0,000977731005965617 40638 43511 667 665 0 True 664 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 267 478 0,000945693324086412 0,00091705574304266 0,000793469138628214 0,000793469138628214 0,000765345683783121 0,000756852817653262 41338 39966 667 665 0 True 265 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 311 478 0,000998242009688678 0,000911732294802008 0,000885023270008392 0,000793469138628214 0,000836521791138773 0,000748084289283874 43635 39734 667 665 0 True 310 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 355 476 0,0011153727324939 0,000961800243341244 0,000991836423285267 0,000885023270008392 0,000847398040039572 0,000756294439816079 48755 41916 667 665 0 True 354 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 399 476 0,000973946535544313 0,000986145840683191 0,000778210116731518 0,000869764248111696 0,000843140453411941 0,000802583133086721 42573 42977 667 665 0 True 398 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 443 476 0,000950634776454757 0,00096143310897982 0,000595101853971161 0,000503547722590982 0,00100011000156721 0,001108761534822 41554 41900 667 665 0 True 443 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 488 477 0,00090929586705846 0,000948055650685423 0,000595101853971161 0,000579842832074464 0,000903642108264179 0,00101588424664579 39747 41317 667 665 0 True 487 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 531 477 0,000939333491871597 0,000969464173135976 0,000656137941557946 0,000701915007248035 0,000920180551398212 0,000862434248647181 41060 42250 667 665 0 True 531 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 576 477 0,000961387010774768 0,000916895121759537 0,000625619897764553 0,000457770656900893 0,000949432693714643 0,00101808115500447 42024 39959 667 665 0 True 575 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 620 477 0,000909387375435651 0,000907624979133574 0,000549324788281071 0,000595101853971161 0,000944183145963493 0,000881837157398742 39751 39555 667 665 0 True 620 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 664 477 0,000943474245939516 0,00104142250797513 0,000518806744487678 0,000656137941557946 0,000967136042946429 0,000972961490020219 41241 45386 667 665 0 True 664 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 267 522 0,000971018267474182 0,000940712963456937 0,000854505226215 0,000793469138628214 0,000740727284266192 0,000794487671609634 42445 40997 667 665 0 True 265 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 311 521 0,000922175671148175 0,000958794330757083 0,000778210116731518 0,00080872816052491 0,000773231863250493 0,000760293416394976 40310 41785 667 665 0 True 310 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 356 522 0,0010360120923745 0,000897712351375119 0,000915541313801785 0,00080872816052491 0,000787048275412073 0,000764174767484252 45286 39123 667 665 0 True 354 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 400 521 0,000969119468647457 0,000968913471593839 0,000747692072938125 0,000701915007248035 0,000841506260213418 0,000870584930883244 42362 42226 667 665 0 True 398 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 444 521 0,000897994582475299 0,00159187164523807 0,000488288700694286 0,000885023270008392 0,000971569312188689 0,00233231560297179 39253 69375 667 665 0 True 442 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 488 521 0,000974358323241675 0,000985090329394096 0,000671396963454643 0,000671396963454643 0,00097458056548332 0,000928769292624655 42591 42931 667 665 0 True 487 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 532 521 0,000959442457759447 0,000988165079671025 0,000671396963454643 0,000686655985351339 0,000930077160909567 0,00092239436817037 41939 43065 667 665 0 True 531 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 576 520 0,000894471509953423 0,00094812448837819 0,000549324788281071 0,000656137941557946 0,000895460980207856 0,00091695862116516 39099 41320 667 665 0 True 575 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 621 522 0,00089136022512891 0,000968684012617949 0,000549324788281071 0,00064087891966125 0,000925028469110149 0,00093790022548315 38963 42216 667 665 0 True 619 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 664 520 0,000999774775006637 0,000961043028720806 0,000656137941557946 0,000518806744487678 0,00103489672186967 0,00103829148467068 43702 41883 667 665 0 True 664 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 268 566 0,000967357932386519 0,00102829745455422 0,00080872816052491 0,000930800335698482 0,000705453902742904 0,000666631850338339 42285 44814 667 665 0 True 265 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 311 565 0,00101450762373448 0,000990735020200994 0,000885023270008392 0,000869764248111696 0,000791278407476041 0,000761903247342993 44346 43177 667 665 0 True 310 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 356 566 0,000983486283866536 0,000981212472701552 0,000915541313801785 0,000854505226215 0,000691300156624753 0,000726242242782522 42990 42762 667 665 0 True 354 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 399 565 0,0010089256127258 0,00100278161643523 0,000793469138628214 0,000854505226215 0,000803978526324043 0,000739251820464029 44102 43702 667 665 0 True 398 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 444 565 0,00104619239933707 0,000985113275291685 0,000686655985351339 0,000534065766384375 0,00100735817997389 0,00106375463384681 45731 42932 667 665 0 True 442 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 489 566 0,000953128379733228 0,000960561164871437 0,000488288700694286 0,000488288700694286 0,00114126383729064 0,00111674844075007 41663 41862 667 665 0 True 487 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 532 565 0,000992065194228246 0,000987476702743354 0,000595101853971161 0,00064087891966125 0,00104324478792071 0,000988829609243308 43365 43035 667 665 0 True 531 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 576 564 0,000840984863484943 0,000930685606210537 0,000595101853971161 0,000625619897764553 0,00081521142781921 0,000875638680200954 36761 40560 667 665 0 True 575 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 621 566 0,00100000354594962 0,000966137017985568 0,000778210116731518 0,000701915007248035 0,000858603861759241 0,000812727888802479 43712 42105 667 665 0 True 619 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 664 565 0,000947157458121477 0,00103185406868051 0,000671396963454643 0,000778210116731518 0,000873853557147052 0,000926422280705694 41402 44969 667 665 0 True 664 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 265 604 0,000983371898395046 0,000959345032299219 0,000854505226215 0,000854505226215 0,000716622759818258 0,000673998077716989 42985 41809 667 665 0 False 265 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 309 604 0,000997052400785188 0,00105500647934783 0,000869764248111696 0,000900282291905089 0,000772666464359999 0,000776356263300495 43583 45978 667 665 0 False 309 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 356 610 0,00104273795809809 0,00101813242192228 0,000976577401388571 0,000946059357595178 0,00075649411243201 0,000745246463248999 45580 44371 667 665 0 True 354 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 399 609 0,00101249443943627 0,000943971280914578 0,000900282291905089 0,000793469138628214 0,000758697480479487 0,000712916288860897 44258 41139 667 665 0 True 398 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 442 604 0,00101901441131117 0,000975269485225997 0,000717174029144732 0,000549324788281071 0,000983099195795287 0,001067745662923 44543 42503 667 665 0 False 442 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 486 605 0,000930754581509886 0,000877083989442592 0,000564583810177768 0,000473029678797589 0,00101420522814592 0,00100305022944424 40685 38224 667 665 0 False 486 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 531 605 0,000954661145051187 0,000973938623165834 0,000610360875867857 0,000610360875867857 0,000994880571875019 0,00107642819838446 41730 42445 667 665 0 False 531 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 575 605 0,000871274136335357 0,000931626388011686 0,000625619897764553 0,000579842832074464 0,000831265008407918 0,000961793761251137 38085 40601 667 665 0 False 575 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 619 605 0,000906344721894031 0,000965884613112089 0,000701915007248035 0,000793469138628214 0,000731665721950026 0,0006908343279704 39618 42094 667 665 0 False 619 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 664 605 0,000991035724984841 0,000940093424222034 0,000793469138628214 0,000701915007248035 0,000834323625072682 0,000841384821033868 43320 40970 667 665 0 False 664 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 267 655 0,00114470116738381 0,0793070338928117 0,00103761348897536 0,0786449988555734 0,000748521440825113 0,0219020401225356 50037 3456262 667 665 0 True 265 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 309 648 0,000989342820006797 0,00108006339951504 0,000869764248111696 0,000946059357595178 0,000674155573842542 0,000732538542815724 43246 47070 667 665 0 False 309 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 354 648 0,000996228825390463 0,000978963774737829 0,000915541313801785 0,000869764248111696 0,000658496356656471 0,000700163380369114 43547 42664 667 665 0 False 354 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 398 648 0,000980512261607809 0,000874674670195746 0,000854505226215 0,000732433051041428 0,000724625533520227 0,000659510892702686 42860 38119 667 665 0 False 398 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 442 648 0,000962874021904131 0,000996563278188605 0,000717174029144732 0,00080872816052491 0,000871302089071197 0,000837802538961454 42089 43431 667 665 0 False 442 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 486 648 0,000929130307814735 0,000946885409908383 0,000671396963454643 0,00064087891966125 0,000873322187534642 0,000908288076384796 40614 41266 667 665 0 False 486 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 531 648 0,000955187318220039 0,00094064412576417 0,000579842832074464 0,000595101853971161 0,000950294008862162 0,000915938238945299 41753 40994 667 665 0 False 531 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 575 648 0,000869924387771781 0,00098688010940604 0,00064087891966125 0,000793469138628214 0,000786708072391436 0,000758301359335116 38026 43009 667 665 0 False 575 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 619 648 0,000933042290939675 0,000912925481476637 0,000793469138628214 0,000732433051041428 0,000694044830594694 0,000737768249754683 40785 39786 667 665 0 False 619 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 664 654 0,00114410636293206 0,0803626140195992 0,00100709544518196 0,0778820477607385 0,000776889460162244 0,0232968662746094 50011 3502265 667 665 0 True 663 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C11_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C11_1.csv new file mode 100755 index 0000000..a956d36 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C11_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 258 268 0,010347698734983 0,0451119100107788 0,0103913939116503 0,0444037537193866 0,00142518497773852 0,00813604543182765 422479 1966012 623 665 0 True 257 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 301 268 0,0103158825721518 0,0102473395665864 0,0102998397802701 0,0101930266269932 0,00129618172695277 0,00121527456185036 421180 446587 623 665 0 False 301 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 346 268 0,0108650359107487 0,0621347601092454 0,0108186465247578 0,0621042191195544 0,00135490582828769 0,00903097216660589 443601 2707881 623 665 0 True 345 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 389 267 0,010734783136356 0,0837921996568441 0,0107423514152743 0,0833752956435492 0,00134944447616877 0,0137509689027497 438283 3651729 623 665 0 True 389 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 434 268 0,0106887856353576 0,0721761602449704 0,0106813153276875 0,0687876707103075 0,00157741824887162 0,012370781912922 436405 3145493 623 665 0 True 434 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 478 266 0,0105532179207538 0,070274496036383 0,0105439841306172 0,0722514686808576 0,00160765594647091 0,0210129782177482 430870 3062617 623 665 0 True 478 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 522 268 0,0105855729254496 0,0834533575871471 0,0105439841306172 0,0809491111619745 0,0016195719556325 0,0240898077596232 432191 3636962 623 665 0 True 522 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 567 268 0,0105854504613895 0,0703123108756097 0,0106202792401007 0,0664835584039063 0,00163406295350033 0,0198460299855157 432186 3064265 623 665 0 True 566 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 610 269 0,0105278433674873 0,0103966485221981 0,0106507972838941 0,0103913939116503 0,00192584690615732 0,00191856831175337 429834 453094 623 665 0 False 610 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 651 266 0,0104899529872719 0,0469321392288228 0,0105134660868238 0,0467689021133745 0,00178267721334937 0,00746597558542026 428287 2045339 623 665 0 True 654 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 257 311 0,0103127964778357 0,0102240035887384 0,0104219119554437 0,01025406271458 0,00157766062473753 0,00145854057791354 421054 445570 623 665 0 False 257 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 301 311 0,0103969047943577 0,010401903132746 0,010406652933547 0,010452429999237 0,00134205528494943 0,00127868658902516 424488 453323 623 665 0 False 301 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 346 312 0,0107016443616751 0,101854384186605 0,0106660563057908 0,0991989013504234 0,00138298903388778 0,0236956155259962 436930 4438893 623 665 0 True 345 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 390 313 0,0106776658986945 0,0513057420387774 0,0106507972838941 0,0502174410620279 0,0014160722083155 0,00737161748321049 435951 2235944 623 665 0 True 389 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 434 312 0,0107227571656477 0,0816731230686008 0,010757610437171 0,0817730983443961 0,001722590109122 0,0170154525854499 437792 3559378 623 665 0 True 433 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 479 313 0,0108013301066503 0,0444749318937077 0,0107270923933776 0,044281681544213 0,0017976029467039 0,0097797631112525 441000 1938252 623 665 0 True 478 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 522 312 0,0106880998366207 0,0456567603490301 0,0106813153276875 0,0478675516899367 0,00164541876264772 0,00921631193069503 436377 1989757 623 665 0 True 522 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 567 313 0,0104590675512981 0,0498620779460668 0,0104829480430304 0,0514839398794537 0,00172554459252354 0,00863064473833082 427026 2173028 623 665 0 True 566 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 610 312 0,0102898956985846 0,0102361878603582 0,0104219119554437 0,0103150988021668 0,00212314251103454 0,0020500965586101 420119 446101 623 665 0 False 610 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 654 312 0,0103384404520344 0,0104202139590221 0,0104371709773404 0,0103913939116503 0,00204256296889264 0,00189722872838453 422101 454121 623 665 0 False 654 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 259 358 0,010113229045389 0,0503319410909971 0,0101319905394064 0,049210345616846 0,00159543809163784 0,00928153302702015 412906 2193505 623 665 0 True 257 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 302 358 0,0105471437033695 0,0704395458777408 0,0105134660868238 0,067856870374609 0,00136154121114435 0,0259652010001598 430622 3069810 623 665 0 True 301 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 346 357 0,0106602025237149 0,043700025986229 0,0106660563057908 0,0418860151064317 0,00132121823021806 0,0112852650922341 435238 1904481 623 665 0 True 345 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 391 357 0,0105818255252086 0,0374905678019723 0,0105745021744106 0,0365758754863813 0,0013424581523786 0,00717331486482388 432038 1633868 623 665 0 True 389 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 435 357 0,0108486502194985 0,0710404759896996 0,0108033875028611 0,0673990997177081 0,0016288173963591 0,0123017629582827 442932 3095999 623 665 0 True 433 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 480 358 0,0107077675646834 0,0368491840725641 0,0107270923933776 0,0353246356908522 0,00175434411758879 0,00913548779732068 437180 1605916 623 665 0 True 478 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 523 357 0,0105011706951832 0,0295603049739249 0,0103761348897536 0,0295414663920043 0,00167761728603517 0,00321076097288972 428745 1288261 623 665 0 True 522 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 568 357 0,01101490742758 0,0496787861161257 0,0107118333714809 0,0496375982299535 0,00344330110232932 0,00865082831301411 449720 2165040 623 665 0 True 566 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 611 357 0,0105095472368985 0,0550739861785386 0,0106202792401007 0,0567940794995041 0,00204963491227901 0,013346622196326 429087 2400167 623 665 0 True 610 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 655 356 0,0104758941131649 0,0671621374333063 0,0104829480430304 0,0640573739223316 0,0019680494236794 0,021060693533893 427713 2926978 623 665 0 True 654 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 258 401 0,0102526421314821 0,0452213389963809 0,0102693217364767 0,0470283054856184 0,00162543890988474 0,0103684081190784 418598 1970781 623 665 0 True 257 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 303 402 0,0105346523692326 0,0350789080735714 0,0105592431525139 0,0337987335011826 0,00134080073621329 0,00639616771999257 430112 1528766 623 665 0 True 301 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 347 402 0,0107422044584021 0,0894663071044515 0,0107423514152743 0,0831616693369955 0,00141716081921893 0,0227051106451176 438586 3899011 623 665 0 True 345 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 391 401 0,0108675341775761 0,0664945953806466 0,0108644235904479 0,0645761806668193 0,0015009129385384 0,0158098810519524 443703 2897886 623 665 0 True 389 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 435 401 0,0109090250011603 0,0429072452245285 0,010955977721828 0,0440375371938659 0,00170444917282423 0,00716548601288487 445397 1869931 623 665 0 True 433 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 479 401 0,010822540881871 0,0530845539116732 0,0108491645685512 0,0529945830472267 0,00175582649598785 0,00956170040729733 441866 2313466 623 665 0 True 478 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 524 402 0,0107432086636954 0,0402516017670636 0,0108339055466545 0,04101625085832 0,00160002296537125 0,00481680089500785 438627 1754196 623 665 0 True 522 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 568 402 0,0104994561983408 0,052735225566778 0,0104676890211337 0,0517128252079042 0,00179764204870115 0,0100478369407691 428675 2298242 623 665 0 True 566 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 611 402 0,0106844014220037 0,0455242018986583 0,0107881284809644 0,0441748683909361 0,00195131204692372 0,0111632036253769 436226 1983980 623 665 0 True 610 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 656 401 0,0104255613844366 0,0875681306722976 0,0104219119554437 0,0818951705195697 0,00185661647393337 0,0186969497853077 425658 3816287 623 665 0 True 654 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 259 447 0,0101628269897562 0,0465224861191661 0,0101472495613031 0,0467841611352712 0,00155355442482383 0,00687435133389218 414931 2027486 623 665 0 True 257 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 303 446 0,0106963539142759 0,0572707346301207 0,0106813153276875 0,0572213321126116 0,00152018033434378 0,00766122492992909 436714 2495903 623 665 0 True 301 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 347 445 0,0108897246652782 0,0353430841925138 0,0108949416342412 0,0361638818951705 0,00145146131201419 0,00527302966554752 444609 1540279 623 665 0 True 345 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 391 446 0,0110245820883331 0,0546167891690774 0,0110322728313115 0,0532845044632639 0,00146804897279564 0,00927070195385094 450115 2380242 623 665 0 True 389 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 435 445 0,0111992158381299 0,0952762083739906 0,0112001220721752 0,0941176470588235 0,00169006464820493 0,0145250555279234 457245 4152211 623 665 0 True 433 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 479 446 0,0108200426150437 0,0643922922435409 0,0107728694590677 0,0617074845502403 0,00186452744849785 0,0164058722285638 441764 2806266 623 665 0 True 477 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 524 446 0,0108838218975782 0,0553784094018521 0,0108491645685512 0,0540016784924086 0,00167104243553099 0,00956881592469246 444368 2413434 623 665 0 True 522 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 568 446 0,0106887611425456 0,0319477108885741 0,0106813153276875 0,032120241092546 0,00189008863959221 0,00484688213134211 436404 1392306 623 665 0 True 566 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 612 445 0,010691283902185 0,045229484790025 0,0106813153276875 0,0438239108873121 0,00182654349534873 0,00912006027373784 436507 1971136 623 665 0 True 610 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 656 445 0,0104156907811872 0,0785161346947134 0,0103761348897536 0,0778667887388418 0,00189868939826112 0,0126283189419643 425255 3421794 623 665 0 True 654 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 258 490 0,010281347707185 0,0554668199452626 0,0103303578240635 0,0560769054703594 0,00155611644877645 0,0169319994854252 419770 2417287 623 665 0 True 257 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 302 490 0,0106175850307771 0,0567085601391898 0,0105287251087205 0,0557564660105287 0,00150893631350987 0,0114728506688491 433498 2471403 623 665 0 True 301 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 346 490 0,0111043551771253 0,0701295697472108 0,0110017547875181 0,0677195391775387 0,00189036612561527 0,0189536681757366 453372 3056301 623 665 0 True 345 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 391 490 0,0113693184177007 0,0913079677908436 0,0112764171816587 0,0852826733806363 0,00173292116621698 0,0230798705123332 464190 3979272 623 665 0 True 389 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 435 490 0,0111300236441361 0,0970521979014829 0,0111390859845884 0,0944686045624475 0,00189656764655877 0,0312162448416336 454420 4229610 623 665 0 True 433 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 479 491 0,011176388537315 0,0500222632571357 0,011108567940795 0,0497138933394369 0,00183311887277273 0,0112727031373891 456313 2180009 623 665 0 True 477 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 522 489 0,0108127927426818 0,0411093882566338 0,0108033875028611 0,0424811169604028 0,00175465890623025 0,00528809076722604 441468 1791579 623 665 0 True 522 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 566 490 0,0107284394980394 0,0994892816844124 0,0106660563057908 0,094895857175555 0,00187613005839871 0,0226917052627344 438024 4335820 623 665 0 True 566 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 610 490 0,0105633334521235 0,062479155086159 0,0105592431525139 0,0649271381704433 0,00177534912835365 0,0164110750054545 431283 2722890 623 665 0 True 610 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 655 490 0,0105674482445451 0,0775901529975087 0,0106202792401007 0,073685816739147 0,00186300675691171 0,0142876944009748 431451 3381439 623 665 0 True 654 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 258 535 0,0102901161338929 0,0519415728609691 0,0102845807583734 0,0546730754558633 0,0014934014149217 0,0123169343483741 420128 2263654 623 665 0 True 257 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 300 534 0,0107073266940668 0,100452665194687 0,0107728694590677 0,0944075684748608 0,00145644823593517 0,028980932296915 437162 4377805 623 665 0 True 301 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 345 534 0,0108111517242756 0,0569355180122428 0,0109102006561379 0,0595407034409094 0,0014747099702933 0,0147338778101831 441401 2481294 623 665 0 True 345 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 390 534 0,0111986769962652 0,0585841119163209 0,0112764171816587 0,0590066376745251 0,00149216354849227 0,00798298800488482 457223 2553141 623 665 0 True 389 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 434 534 0,0111360488758963 0,0581483922670031 0,0111848630502785 0,058609903105211 0,00197881310787629 0,00755829055577868 454666 2534152 623 665 0 True 433 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 477 534 0,0108657217094856 0,064144728954453 0,0108339055466545 0,063080796520943 0,00200090410854451 0,0172704632223999 443629 2795477 623 665 0 True 477 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 522 534 0,0109108374692508 0,0761573882061528 0,010955977721828 0,0733501182574197 0,00185825669939418 0,0206154731381966 445471 3318998 623 665 0 True 522 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 567 534 0,0106608638296398 0,0612525591846405 0,0106660563057908 0,0601968413824674 0,00164235933078302 0,0158679303066555 435265 2669434 623 665 0 True 566 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 611 535 0,0104052568432611 0,0426521327351338 0,0103608758678569 0,0426947432669566 0,00183442303168924 0,00627799552293971 424829 1858813 623 665 0 True 610 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 654 534 0,0104581613172528 0,0639142603590689 0,0105134660868238 0,0638284885938811 0,00183128346878672 0,0164495310558169 426989 2785433 623 665 0 True 654 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 256 571 0,0134433452478617 0,033638249893445 0,0105592431525139 0,0368352788586252 0,0078579835725944 0,0175762417765166 548869 1465981 623 665 0 False 256 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 301 571 0,0143976831759242 0,0420185047191107 0,0110170138094148 0,0479133287556268 0,00990317285946747 0,0225944541753379 587833 1831199 623 665 0 False 301 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 346 578 0,0107614558086602 0,0502591567038448 0,0107270923933776 0,0503547722590982 0,0014547484702968 0,0105322346789401 439372 2190333 623 665 0 True 345 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 389 571 0,0147162121964162 0,0417338838054165 0,0114747844663157 0,0465857938506142 0,00921137226833995 0,0210468012052518 600838 1818795 623 665 0 False 389 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 436 579 0,010959676136445 0,0887373618298435 0,0109712367437247 0,0824597543297475 0,00181186972198427 0,0196567528164926 447465 3867243 623 665 0 True 433 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 479 578 0,0107534221663133 0,0636123841303878 0,0108033875028611 0,063080796520943 0,00189882438781803 0,0130416729390837 439044 2772277 623 665 0 True 477 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 524 579 0,0110397921246057 0,0579985785016444 0,0105897611963073 0,0565804531929503 0,0040937635688657 0,00759013355754999 450736 2527623 623 665 0 True 521 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 566 572 0,0110662198687896 0,0328494617179249 0,0108033875028611 0,0384222171358816 0,00276739008346813 0,0136376830922359 451815 1431605 623 665 0 False 566 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 612 578 0,0103486049690282 0,0492787473375588 0,0103761348897536 0,0497291523613336 0,00154325829851255 0,00625146781678441 422516 2147606 623 665 0 True 610 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 655 578 0,0104448127346947 0,0525763252259741 0,0105592431525139 0,0513313496604868 0,0017461031073258 0,00880199120881029 426444 2291317 623 665 0 True 654 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 256 614 0,0112754129763653 0,00977775177242718 0,010101472495613 0,00984206912336919 0,00531766780470249 0,00136728875340402 460356 426122 623 665 0 False 256 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 301 614 0,0114828426014746 0,0102302678187802 0,0102693217364767 0,0102845807583734 0,00548577661932211 0,00140583758012014 468825 445843 623 665 0 False 301 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 345 615 0,0175068742138573 0,0588791043757253 0,0110627908751049 0,0710612649729152 0,0167380194087012 0,0349730024521532 714776 2565997 623 665 0 False 345 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 389 615 0,0163005542355971 0,061090171067403 0,0112153810940719 0,0648661020828565 0,0132454297815043 0,0398275659945179 665524 2662357 623 665 0 False 389 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 433 615 0,0124146226496545 0,0104301036408829 0,0108796826123445 0,0104371709773404 0,00813356582275435 0,00193681687406198 506868 454552 623 665 0 False 433 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 477 615 0,011206637160176 0,0105308131854011 0,0107118333714809 0,010605020218204 0,00429374241803418 0,00193206920198319 457548 458941 623 665 0 False 477 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 521 615 0,0114193572326845 0,0102129895578957 0,0103150988021668 0,0101167315175097 0,00566542171532367 0,00202883328168047 466233 445090 623 665 0 False 521 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 566 615 0,0103996234964934 0,0102505978840441 0,0102693217364767 0,0102845807583734 0,00205812089486585 0,00187760442093877 424599 446729 623 665 0 False 566 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 610 615 0,0106455068364949 0,0102063581934924 0,0102998397802701 0,0102235446707866 0,00301532146439059 0,00144660414266028 434638 444801 623 665 0 False 610 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 654 615 0,0106497930786007 0,0102819649260482 0,010406652933547 0,0102235446707866 0,00256167866470039 0,00147940291574613 434813 448096 623 665 0 False 654 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 256 664 0,00989529200391738 0,0431493932817854 0,00993362325474937 0,0441748683909361 0,00135971120878249 0,00971025362393913 404008 1880484 623 665 0 True 256 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 301 658 0,00993874225246431 0,00988220149825238 0,00994888227664607 0,00987258716716258 0,00131939917866112 0,00126915250852749 405782 430674 623 665 0 False 301 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 345 658 0,0138354751685136 0,010121687831389 0,0102082856488899 0,010101472495613 0,0133061167501732 0,00118657446448866 564879 441111 623 665 0 False 345 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 389 658 0,012771874805971 0,0101051667851249 0,0104219119554437 0,0101167315175097 0,00961684860090698 0,00116169139694013 521454 440391 623 665 0 False 389 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 433 658 0,0100832008578362 0,0101307744068342 0,0101167315175097 0,0101167315175097 0,00149454674658009 0,00157269720849205 411680 441507 623 665 0 False 433 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 477 658 0,010226802214787 0,0101400445494602 0,0102082856488899 0,010101472495613 0,00171724606509622 0,00154997390422153 417543 441911 623 665 0 False 477 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 521 658 0,0101396078039488 0,0100865576621802 0,0101930266269932 0,0101319905394064 0,00178266453408748 0,00174371838922909 413983 439580 623 665 0 False 521 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 566 658 0,0101290024163384 0,0102294876582622 0,0102082856488899 0,01025406271458 0,00156580272924584 0,0014595974905781 413550 445809 623 665 0 False 566 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 610 658 0,010080825055069 0,0100110886050099 0,0100709544518196 0,00999465934233616 0,00129080346895275 0,00133645385609553 411583 436291 623 665 0 False 610 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 653 664 0,0101744855682841 0,0455786984054322 0,0101930266269932 0,0455024032959487 0,00138562201890102 0,00873169584395024 415407 1986355 623 665 0 True 654 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C11_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C11_2.csv new file mode 100755 index 0000000..78c1364 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C11_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 258 268 0,00818243617999817 0,744039040150158 0,00807202258335241 0,746257724879835 0,00165581115604954 0,174916859770109 334075 32425798 623 665 11 True 257 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 301 268 0,00762238354004654 0,00715808748238185 0,00755321583886473 0,00720225833524071 0,00151930119159215 0,0013096339961877 311209 311955 623 665 0 False 301 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 346 268 0,00778668132316539 0,00778721810247753 0,00787365529869535 0,00784313725490196 0,00149710675661176 0,00129851466308258 317917 339373 623 665 0 True 345 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 389 267 0,00740444649857495 0,00737949244821828 0,00738536659800107 0,00735484855420768 0,00133816193671642 0,00122476321272602 302311 321604 623 665 0 True 389 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 434 268 0,00694275699174874 0,00707518395439273 0,00701915007248035 0,00712596322575723 0,00152983189662474 0,00158103666535419 283461 308342 623 665 0 True 434 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 478 266 0,00719718832314984 0,00724945804658132 0,00720225833524071 0,0072480354009308 0,00149543265854057 0,00168528755912055 293849 315937 623 665 0 True 478 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 522 268 0,00723853218986191 0,00708534898702467 0,00733958953231098 0,00708018616006714 0,00148632842021209 0,00157727476281558 295537 308785 623 665 0 True 522 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 567 268 0,00758015793210127 0,00752138987890876 0,00749217975127794 0,00761425192645151 0,00155174418103264 0,00158423012825634 309485 327788 623 665 0 True 566 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 610 269 0,00829882602278003 0,00797211614524983 0,00828564888990616 0,00801098649576562 0,00198744185640973 0,00185536311470164 338827 347431 623 665 0 False 610 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 651 266 0,00943357800427914 0,763706496729349 0,009399557488365 0,770031280994888 0,00193478840875282 0,158377517099802 385157 33282921 623 665 12 True 654 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 257 311 0,00690606675932297 0,00654614333958035 0,00691233691920348 0,00650034332799268 0,00152357492109954 0,00142893052869804 281963 285286 623 665 0 False 257 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 301 311 0,00657982250304048 0,00671837524688352 0,00662241550316625 0,0068055237659266 0,00126615673843243 0,0012176972586223 268643 292792 623 665 0 False 301 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 346 312 0,00675362349722821 0,00682316916117256 0,00677500572213321 0,00679026474402991 0,00122867007345031 0,00133348863967247 275739 297359 623 665 0 True 345 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 390 313 0,00688052075637233 0,0069992100874755 0,00686655985351339 0,00698863202868696 0,00123112946093609 0,0012288133958531 280920 305031 623 665 0 True 389 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 434 312 0,00709936403188915 0,00720212065985518 0,00714122224765393 0,00729381246662089 0,00159430258265128 0,00166428655902068 289855 313874 623 665 0 True 433 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 479 313 0,00729836812965907 0,00725978370049638 0,00729381246662089 0,0072632944228275 0,00163900400437254 0,00163376074058749 297980 316387 623 665 0 True 478 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 522 312 0,00718192930125314 0,00718169881100095 0,00714122224765393 0,00720225833524071 0,00153795650193304 0,00160713722983154 293226 312984 623 665 0 True 522 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 567 313 0,00738416645021144 0,00748114277453763 0,00746166170748455 0,00744640268558785 0,0016134842027104 0,00151515585249035 301483 326034 623 665 0 True 566 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 610 312 0,0076021524773071 0,00772962389952909 0,00770580605783169 0,00775158312352178 0,00195502801496993 0,00218752187087527 310383 336863 623 665 0 False 610 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 654 312 0,00791433785948253 0,0079138794571689 0,00794995040817884 0,00785839627679866 0,00189739829622062 0,00202433662255418 323129 344893 623 665 0 False 654 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 259 358 0,00630520909452401 0,00608736306318554 0,00634775310902571 0,00617990386816205 0,00137333537911404 0,00140703929800398 257431 265292 623 665 0 True 257 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 302 358 0,00659995559453178 0,00699576820283715 0,00662241550316625 0,00704966811627375 0,0013578625325226 0,00132593148948524 269465 304881 623 665 0 True 301 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 346 357 0,00692115433153544 0,00696846258470622 0,00692759594110018 0,00700389105058366 0,00131807328118398 0,00130383145561284 282579 303691 623 665 0 True 345 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 391 357 0,00721553343936272 0,00741703193667391 0,00717174029144732 0,00744640268558785 0,00128458807645112 0,00131233061068883 294598 323240 623 665 0 True 389 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 435 357 0,00739144081538531 0,00753226623436596 0,00737010757610437 0,00758373388265812 0,00157583211059892 0,00163586409865943 301780 328262 623 665 0 True 433 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 480 358 0,00721215343130213 0,00730065034410242 0,00718699931334401 0,00729381246662089 0,0014951104531503 0,0016999939716577 294460 318168 623 665 0 True 478 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 523 357 0,00739021617478365 0,00728243130141674 0,00746166170748455 0,0072480354009308 0,00163563631029142 0,00164639055473089 301730 317374 623 665 0 True 522 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 568 357 0,00745304023764886 0,00755883758377404 0,00747692072938125 0,00758373388265812 0,00184417307760504 0,00177557249800883 304295 329420 623 665 0 True 566 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 611 357 0,0072619718109777 0,00746120278953277 0,0072632944228275 0,00741588464179446 0,00204678951965344 0,00205451511655749 296494 325165 623 665 0 True 610 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 655 356 0,00703536431404635 0,00714615561563556 0,00701915007248035 0,0072327763790341 0,00193725129662039 0,00191886223150908 287242 311435 623 665 0 True 654 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 258 401 0,00619241969511103 0,00621751219431045 0,00625619897764553 0,00619516289005875 0,0014916550724006 0,00142099133570687 252826 270964 623 665 0 True 257 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 303 402 0,00691902345688855 0,0072705912182608 0,00692759594110018 0,0072632944228275 0,00137033986803244 0,00127634427818803 282492 316858 623 665 0 True 301 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 347 402 0,00732719616942217 0,00736235186271928 0,00735484855420768 0,00740062561989776 0,00131876737194199 0,0013130969032485 299157 320857 623 665 0 True 345 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 391 401 0,00748941206351819 0,00747955950760398 0,00755321583886473 0,00743114366369116 0,00150614358231626 0,00140351111918747 305780 325965 623 665 0 True 389 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 435 401 0,00742818003343514 0,00751902645145709 0,00740062561989776 0,00747692072938125 0,00157584280937297 0,0015343003957368 303280 327685 623 665 0 True 433 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 479 401 0,0074144395658845 0,00735654655062926 0,00743114366369116 0,00740062561989776 0,00163246197290364 0,00160840914244321 302719 320604 623 665 0 True 478 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 524 402 0,00727047081675323 0,00727462969623647 0,0072327763790341 0,0072480354009308 0,0015551854020191 0,00167592332106121 296841 317034 623 665 0 True 522 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 568 402 0,00732614297850474 0,00721437376916771 0,00738536659800107 0,0072632944228275 0,00171698647015831 0,00169334184593136 299114 314408 623 665 0 True 566 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 611 402 0,00674696145235517 0,00682885974377464 0,00679026474402991 0,00692759594110018 0,00193302210386844 0,00191131070980555 275467 297607 623 665 0 True 610 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 656 401 0,00650046579205284 0,00633371021970123 0,00645456626230259 0,00633249408712902 0,00189061783245727 0,00173781101100997 265403 276028 623 665 0 True 654 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 259 447 0,00631539810432983 0,00643871064706858 0,00631723506523232 0,00643930724040589 0,00149288328438052 0,0014714512320786 257847 280604 623 665 0 True 257 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 303 446 0,00693562958344707 0,00721916946176382 0,00694285496299687 0,0072327763790341 0,00142863131461507 0,00146793550988055 283170 314617 623 665 0 True 301 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 347 445 0,00737870455312803 0,00712052504802863 0,00737010757610437 0,00715648126955062 0,00127925965221515 0,00138955398169152 301260 310318 623 665 0 True 345 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 391 446 0,00740927158254549 0,00759573458709718 0,00735484855420768 0,00762951094834821 0,00142464907189492 0,0013462922278628 302508 331028 623 665 0 True 389 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 435 445 0,00736028595847905 0,00765665594519602 0,00740062561989776 0,0076752880140383 0,0017568241267835 0,00182083466073884 300508 333683 623 665 0 True 433 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 479 446 0,0073575182707193 0,00736382040016498 0,00735484855420768 0,00738536659800107 0,00178242784190329 0,00184992381274794 300395 320921 623 665 0 True 477 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 524 446 0,00727705938319017 0,00719844931624093 0,00735484855420768 0,00733958953231098 0,00169273567021531 0,00174165920357508 297110 313714 623 665 0 True 522 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 568 446 0,00666373487706629 0,00667404377274154 0,00674448767833982 0,00659189745937285 0,00181089260296138 0,00187911768679843 272069 290860 623 665 0 True 566 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 612 445 0,00628666803581486 0,00647117909215704 0,00631723506523232 0,00654612039368277 0,00183409276862304 0,00168185351332349 256674 282019 623 665 0 True 610 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 656 445 0,00624747953656171 0,00643090904188831 0,00630197604333562 0,00646982528419928 0,00184961184042259 0,00202409071096642 255074 280264 623 665 0 True 654 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 258 490 0,00644060535944365 0,0065690203994766 0,00642404821850919 0,00656137941557946 0,00143714955282853 0,00135748965839746 262959 286283 623 665 0 True 257 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 302 490 0,00703379677407622 0,00700632331572809 0,00709544518196384 0,00691233691920348 0,00147208796661673 0,00149001184077915 287178 305341 623 665 0 True 301 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 346 490 0,00722133823581459 0,00712513717344402 0,00717174029144732 0,00718699931334401 0,0015791815863902 0,00147172664158521 294835 310519 623 665 0 True 345 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 391 490 0,00734578621375538 0,0073481024603165 0,00741588464179446 0,00738536659800107 0,00159208898275067 0,00149956569406978 299916 320236 623 665 0 True 389 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 435 490 0,00743099670681896 0,00748908205510343 0,00743114366369116 0,00743114366369116 0,00186763678985465 0,00197799439888842 303395 326380 623 665 0 True 433 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 479 491 0,00701792543187869 0,00697984374991037 0,00695811398489357 0,00692759594110018 0,00175498909166728 0,00179998154840397 286530 304187 623 665 0 True 477 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 522 489 0,00688517439065864 0,00656427059867568 0,00700389105058366 0,00653086137178607 0,00174085628120544 0,00157240546184046 281110 286076 623 665 0 True 522 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 566 490 0,00623697212019945 0,00649726857771575 0,00619516289005875 0,00648508430609598 0,00173392952492476 0,00183647567171046 254645 283156 623 665 0 True 566 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 610 490 0,00624324228007996 0,00619470397210697 0,00624093995574884 0,00619516289005875 0,00173407780593437 0,00156721186714072 254901 269970 623 665 0 True 610 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 655 490 0,00614686306472924 0,00612643992677964 0,00608834973678187 0,00619516289005875 0,00179310851747152 0,00174434993730177 250966 266995 623 665 0 True 654 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 258 535 0,00670128235791322 0,00662181890982893 0,00672922865644312 0,00665293354695964 0,00136706014278839 0,00149343539963928 273602 288584 623 665 0 True 257 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 300 534 0,00692463231084416 0,00690146056374629 0,00695811398489357 0,00686655985351339 0,00138393552677737 0,00146915764703606 282721 300771 623 665 0 True 301 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 345 534 0,0069222320152649 0,00714679810076806 0,00692759594110018 0,00711070420386053 0,00143912246610277 0,00140408716014876 282623 311463 623 665 0 True 345 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 390 534 0,0072764960485134 0,00729498270739793 0,00727855344472419 0,00730907148851759 0,00143847653917936 0,0015737650667561 297087 317921 623 665 0 True 389 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 434 534 0,00700053553533511 0,00705746972145401 0,00694285496299687 0,00712596322575723 0,00178156637441276 0,00204075792293146 285820 307570 623 665 0 True 433 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 477 534 0,0068561014227752 0,00690173591451735 0,00692759594110018 0,00688181887541009 0,001867062219703 0,00183962848757588 279923 300783 623 665 0 True 477 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 522 534 0,00664512033992104 0,00677794279702461 0,00660715648126955 0,0068207827878233 0,00184885911608118 0,00172536122776632 271309 295388 623 665 0 True 522 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 567 534 0,00641219369748511 0,0065623431432782 0,0063782711528191 0,00662241550316625 0,00164916818234933 0,00168512707171052 261799 285992 623 665 0 True 566 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 611 535 0,00644273623409054 0,00631042013364838 0,00646982528419928 0,00631723506523232 0,00169887102501369 0,00163708651324063 263046 275013 623 665 0 True 610 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 654 534 0,00633403713428711 0,00640993649149195 0,00646982528419928 0,00650034332799268 0,00187352806648563 0,00194007182135452 258608 279350 623 665 0 True 654 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 256 571 0,00688767265748603 0,00660222311328791 0,00686655985351339 0,00659189745937285 0,00124182020398342 0,00117592119271351 281212 287730 623 665 0 False 256 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 301 571 0,00713764629709708 0,00709861171583112 0,00715648126955062 0,00709544518196384 0,00131701321112012 0,00139343084637898 291418 309363 623 665 0 False 301 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 346 578 0,00713492759496139 0,00701878293811893 0,00717174029144732 0,00701915007248035 0,00133670660498061 0,00136685967493048 291307 305884 623 665 0 True 345 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 389 571 0,00698067186477616 0,00693158852728066 0,00701915007248035 0,00688181887541009 0,00125837218347462 0,00132077151278874 285009 302084 623 665 0 False 389 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 436 579 0,00683978920996108 0,00701768153503466 0,00677500572213321 0,00703440909437705 0,00164962288461292 0,00193162020078777 279257 305836 623 665 0 True 433 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 479 578 0,00663106146581397 0,00673393256544887 0,00668345159075303 0,0068055237659266 0,00197940528077087 0,00178896597554793 270735 293470 623 665 0 True 477 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 524 579 0,00705145609155217 0,00670871502399854 0,00660715648126955 0,00675974670023652 0,00385421555684454 0,00182802484170481 287899 292371 623 665 0 True 521 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 566 572 0,00659836356174962 0,00655757039657968 0,00653086137178607 0,00650034332799268 0,00162165994011871 0,00175581315564806 269400 285784 623 665 0 False 566 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 612 578 0,00635248022174812 0,00647097257907873 0,0063782711528191 0,00650034332799268 0,00142352979980312 0,00151267694231821 259361 282010 623 665 0 True 610 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 655 578 0,00614284624355579 0,00622632341898463 0,00617990386816205 0,00625619897764553 0,00162376024418706 0,00147731854787134 250802 271348 623 665 0 True 654 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 256 614 0,00714183456795476 0,00689393430933709 0,00717174029144732 0,00689707789730678 0,00131951376906643 0,0013700107763959 291589 300443 623 665 0 False 256 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 301 614 0,00714181007514272 0,00702617151714259 0,00715648126955062 0,00703440909437705 0,00140004250623483 0,00137115964081645 291588 306206 623 665 0 False 301 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 345 615 0,00697653257954255 0,00705368364835182 0,00689707789730678 0,00700389105058366 0,00142791498961107 0,00145528869594102 284840 307405 623 665 0 False 345 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 389 615 0,0066832066626327 0,00680387166130019 0,00672922865644312 0,00683604180972 0,00136608387619168 0,00118237254524447 272864 296518 623 665 0 False 389 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 433 615 0,00663774800349904 0,00657452741489797 0,00660715648126955 0,00663767452506294 0,00163696378046102 0,00180915805175034 271008 286523 623 665 0 False 433 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 477 615 0,00663439248825049 0,00651599243014839 0,00663767452506294 0,00653086137178607 0,00188472830914157 0,00190418885595159 270871 283972 623 665 0 False 477 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 521 615 0,0064234603910204 0,00655245346141733 0,00630197604333562 0,00651560234988937 0,00192214908368135 0,00187338142129925 262259 285561 623 665 0 False 521 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 566 615 0,00647229905821464 0,00631996562704541 0,00651560234988937 0,00630197604333562 0,00163434886314641 0,00186491769658718 264253 275429 623 665 0 False 566 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 610 615 0,00640374367733365 0,00655947490607957 0,00643930724040589 0,00663767452506294 0,00138239947334128 0,00134151051282299 261454 285867 623 665 0 False 610 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 654 615 0,00654560604463007 0,00647794813194579 0,00653086137178607 0,00648508430609598 0,00146975577557347 0,00139903655792925 267246 282314 623 665 0 False 654 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 256 664 0,00864814250799782 0,734606302893879 0,00827038986800946 0,759731441214618 0,00221085585373052 0,216335157713775 353089 32014712 623 665 13 True 256 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 301 658 0,00728288867245407 0,00696150997773674 0,00718699931334401 0,00701915007248035 0,00160317970937763 0,00119523544186626 297348 303388 623 665 0 False 301 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 345 658 0,00664200975279282 0,00666626511345886 0,00663767452506294 0,00671396963454643 0,00126493351379517 0,00124172520030645 271182 290521 623 665 0 False 345 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 389 658 0,00649409766092421 0,00658579385061418 0,00656137941557946 0,00662241550316625 0,00125108963751708 0,00115613442135855 265143 287014 623 665 0 False 389 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 433 658 0,00637903042999213 0,00626154537178377 0,0063782711528191 0,00621042191195544 0,00150774261843816 0,00142388136959664 260445 272883 623 665 0 False 433 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 477 658 0,00642172140136604 0,00629970439947431 0,00643930724040589 0,0063782711528191 0,00158567669196009 0,00148992620446511 262188 274546 623 665 0 False 477 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 521 658 0,00636685750241162 0,00630672584413655 0,00631723506523232 0,00636301213092241 0,00169081685987338 0,00159201296270729 259948 274852 623 665 0 False 521 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 566 658 0,00628034889031029 0,00640048278168527 0,00630197604333562 0,00650034332799268 0,00146644318886775 0,00151161167729625 256416 278938 623 665 0 False 566 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 610 658 0,00680224172911415 0,00657230166283183 0,00679026474402991 0,00653086137178607 0,00140221537944622 0,00137959995725135 277724 286426 623 665 0 False 610 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 653 664 0,0082333322434032 0,75900763582107 0,00817883573662928 0,76729991607538 0,00177569311085366 0,187578438367761 336153 33078141 623 665 15 True 654 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C11_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C11_3.csv new file mode 100755 index 0000000..67dab31 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C11_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 258 268 0,000969474485898937 0,0734340084590051 0,000732433051041428 0,0730601968413825 0,000829079334998228 0,0192655315528424 39582 3200311 623 665 0 True 257 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 301 268 0,00091010390953041 0,000840003418938741 0,000793469138628214 0,000701915007248035 0,000659835589751334 0,000620283868749662 37158 36608 623 665 0 False 301 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 346 268 0,000952207053415517 0,000918501334590768 0,000854505226215 0,000793469138628214 0,000686588184484965 0,000667555567508277 38877 40029 623 665 0 True 345 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 389 267 0,000937976729624215 0,000916803338169181 0,000823987182421607 0,00080872816052491 0,000669565074104898 0,000632576764626235 38296 39955 623 665 0 True 389 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 434 268 0,000862318433253597 0,000844890895125201 0,000671396963454643 0,000610360875867857 0,000769689597415008 0,000804827910402457 35207 36821 623 665 0 True 434 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 478 266 0,000874956724262739 0,000989633617116722 0,00064087891966125 0,000732433051041428 0,000836639875866137 0,000903293502326256 35723 43129 623 665 0 True 478 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 522 268 0,00101659865625085 0,000923274081289284 0,00080872816052491 0,000686655985351339 0,000882283934393775 0,000831656262428757 41506 40237 623 665 0 True 522 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 567 268 0,000913924788207593 0,000919074982030494 0,000701915007248035 0,000701915007248035 0,000807294292822456 0,000830964287021443 37314 40054 623 665 0 True 566 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 610 269 0,00108201895719159 0,000937316970613763 0,000762951094834821 0,000625619897764553 0,00100683841715369 0,000948250136607945 44177 40849 623 665 0 False 610 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 651 266 0,00106235122912891 0,075504256177179 0,000778210116731518 0,0737163347829404 0,000965563292199233 0,0179187986372021 43374 3290534 623 665 0 True 654 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 257 311 0,000832584159445267 0,000852692500305467 0,000671396963454643 0,000671396963454643 0,000690933326289964 0,000691836142903732 33993 37161 623 665 0 False 257 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 301 311 0,00101650068500272 0,000906753035025192 0,000869764248111696 0,000762951094834821 0,000740657615003095 0,000679750602438224 41502 39517 623 665 0 False 301 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 346 312 0,000866237283178912 0,000860058133431542 0,000747692072938125 0,000747692072938125 0,000627377838606153 0,000653577662917123 35367 37482 623 665 0 True 345 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 390 313 0,000911034636387673 0,000910263757356311 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,000675270587396514 0,000682319142801477 37196 39670 623 665 0 True 389 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 434 312 0,000922815678975652 0,000967077799786718 0,000717174029144732 0,000686655985351339 0,000821792018471727 0,000884827468739307 37677 42146 623 665 0 True 433 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 479 313 0,000914488122884357 0,000926325885668623 0,000656137941557946 0,000747692072938125 0,000877445359021005 0,000821125410253067 37337 40370 623 665 0 True 478 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 522 312 0,000945838922286879 0,00101230416393467 0,00080872816052491 0,000823987182421607 0,000826369264265649 0,000862702565260306 38617 44117 623 665 0 True 522 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 567 313 0,000989436127706012 0,000990872695586529 0,000778210116731518 0,000778210116731518 0,000876824667019308 0,000830463778018342 40397 43183 623 665 0 True 566 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 610 312 0,000999061802835067 0,000999660974363122 0,000625619897764553 0,000549324788281071 0,00108483920064075 0,00105582061283212 40790 43566 623 665 0 False 610 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 654 312 0,000971384925237528 0,000971988221870768 0,000595101853971161 0,00064087891966125 0,000980265380970551 0,000938486482058811 39660 42360 623 665 0 False 654 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 259 358 0,000841450557401293 0,000868226872973232 0,000747692072938125 0,000717174029144732 0,00067528092097009 0,000747267980290624 34355 37838 623 665 0 True 257 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 302 358 0,000878165282639091 0,000857052220847381 0,000717174029144732 0,000717174029144732 0,000702010884016654 0,000674034854695801 35854 37351 623 665 0 True 301 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 346 357 0,000860359008290939 0,000967766176714388 0,000747692072938125 0,000839246204318303 0,000630992509446836 0,000713868368024557 35127 42176 623 665 0 True 345 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 391 357 0,000914855515064855 0,000954319880727224 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,000660088116800225 0,000766008044376056 37352 41590 623 665 0 True 389 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 435 357 0,00092759177732213 0,00105470818267917 0,000610360875867857 0,000762951094834821 0,000878334567574337 0,00093464830377463 37872 45965 623 665 0 True 433 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 480 358 0,000946647185083975 0,000960928299232861 0,000671396963454643 0,000686655985351339 0,000864415258515409 0,000864626819600029 38650 41878 623 665 0 True 478 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 523 357 0,000876254843300499 0,000941791420643621 0,000610360875867857 0,000656137941557946 0,000855923381475085 0,000906975691826284 35776 41044 623 665 0 True 522 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 568 357 0,000942140507669863 0,000957830603058344 0,000686655985351339 0,000595101853971161 0,000942834420800925 0,000953579641127207 38466 41743 623 665 0 True 566 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 611 357 0,000943634569203889 0,00100856398262766 0,000534065766384375 0,000473029678797589 0,00106002853844411 0,00114968185914612 38527 43954 623 665 0 True 610 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 655 356 0,00100276021745208 0,000913315561735651 0,000656137941557946 0,000534065766384375 0,000991729725477963 0,000997201815271467 40941 39803 623 665 0 True 654 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 258 401 0,000807968883351881 0,000823321751391525 0,00064087891966125 0,00064087891966125 0,000727705852996874 0,000741988336260316 32988 35881 623 665 0 True 257 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 303 402 0,000917427260328343 0,000868685790925012 0,000747692072938125 0,000793469138628214 0,000716963590201062 0,000657647613236642 37457 37858 623 665 0 True 301 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 347 402 0,000977875520426332 0,000964507859256748 0,000869764248111696 0,000869764248111696 0,000736962587136341 0,000707256527143595 39925 42034 623 665 0 True 345 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 391 401 0,000995216431345852 0,0009439253891194 0,000839246204318303 0,000793469138628214 0,000784162263274675 0,000746105482243307 40633 41137 623 665 0 True 389 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 435 401 0,00101211647164877 0,000891333391845372 0,00080872816052491 0,000686655985351339 0,000818846603304716 0,000802198211549157 41323 38845 623 665 0 True 433 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 479 401 0,000942091522045797 0,000910952134283982 0,000701915007248035 0,000625619897764553 0,000834662185296269 0,000821488207145322 38464 39700 623 665 0 True 478 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 524 402 0,000970111299011801 0,000999202056411342 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000867863576326877 0,000916402154896568 39608 43546 623 665 0 True 522 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 568 402 0,00101601082876206 0,000925132698993994 0,000793469138628214 0,000625619897764553 0,00091747936386201 0,000909757747301065 41482 40318 623 665 0 True 566 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 611 402 0,000940474996451604 0,000903448825772373 0,000488288700694286 0,000534065766384375 0,00101202213972756 0,000960352411367841 38398 39373 623 665 0 True 610 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 656 401 0,000926489600780635 0,000957279901516208 0,000549324788281071 0,000564583810177768 0,000959338113620524 0,000977361445473463 37827 41719 623 665 0 True 654 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 259 447 0,000853427542485538 0,00083885612405929 0,000686655985351339 0,000686655985351339 0,000752805058191955 0,000743763050570502 34844 36558 623 665 0 True 257 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 303 446 0,000913361453530829 0,000936789214969215 0,000823987182421607 0,000762951094834821 0,000715487066167447 0,000806626000524964 37291 40826 623 665 0 True 301 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 347 445 0,000900086349408823 0,00100321758848942 0,000778210116731518 0,000869764248111696 0,000659026547271275 0,000788010874715017 36749 43721 623 665 0 True 345 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 391 446 0,000902584616236212 0,000949593025823887 0,000793469138628214 0,000823987182421607 0,000737592510442209 0,000739858643472478 36851 41384 623 665 0 True 389 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 435 445 0,000947039070076507 0,000967513771840909 0,000686655985351339 0,000579842832074464 0,000928352741391388 0,000996195632479453 38666 42165 623 665 0 True 433 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 479 446 0,000943291669835424 0,000917835903560687 0,000625619897764553 0,000579842832074464 0,000928672550747896 0,000971081625705019 38513 40000 623 665 0 True 477 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 524 446 0,00092166451681009 0,000962878700527928 0,000625619897764553 0,000701915007248035 0,000895081577163883 0,000908978410587148 37630 41963 623 665 0 True 522 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 568 446 0,000982921039705175 0,000954572285600704 0,000701915007248035 0,00064087891966125 0,000938613340771382 0,000982830934661447 40131 41601 623 665 0 True 566 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 612 445 0,000949243423159497 0,00090771676272393 0,000595101853971161 0,000549324788281071 0,000964370446082663 0,000904121460488116 38756 39559 623 665 0 True 610 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 656 445 0,000866261775990945 0,000908060951187766 0,000442511635004196 0,000488288700694286 0,000954395650752863 0,000982817782846587 35368 39574 623 665 0 True 654 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 258 490 0,000770102995948522 0,000786057613706961 0,000625619897764553 0,000610360875867857 0,000702553962752884 0,000703648801472149 31442 34257 623 665 0 True 257 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 302 490 0,000929355259788522 0,00088226976229771 0,00080872816052491 0,000732433051041428 0,000779012302121 0,000776925288442524 37944 38450 623 665 0 True 301 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 346 490 0,000924260754885612 0,000968408661846881 0,000762951094834821 0,000854505226215 0,0007736114681452 0,000818921691789805 37736 42204 623 665 0 True 345 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 391 490 0,000917353781892244 0,000965976396702445 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,00080166842041437 0,000828179659429605 37454 42098 623 665 0 True 389 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 435 490 0,000957399529566559 0,00100099183642329 0,000625619897764553 0,000534065766384375 0,00096597897084451 0,00109881299019075 39089 43624 623 665 0 True 433 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 479 491 0,000943071234527125 0,000936032000348778 0,000503547722590982 0,000610360875867857 0,0010085632223547 0,000898274587337432 38504 40793 623 665 0 True 477 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 522 489 0,000902609109048245 0,000939152642420884 0,000625619897764553 0,000610360875867857 0,000872218127508364 0,000860133991983274 36852 40929 623 665 0 True 522 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 566 490 0,00085009652004902 0,000895325978025861 0,000488288700694286 0,000549324788281071 0,000933465632671189 0,00091746442436628 34708 39019 623 665 0 True 566 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 610 490 0,000875299623631204 0,000949868376594955 0,000610360875867857 0,000595101853971161 0,000866700045462295 0,000949605727932241 35737 41396 623 665 0 True 610 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 655 490 0,000894722423573548 0,000955558959197031 0,000549324788281071 0,000610360875867857 0,000932619315649564 0,000991947486093742 36530 41644 623 665 0 True 654 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 258 535 0,000919754077471499 0,000835414239420937 0,00080872816052491 0,000656137941557946 0,000732026386460961 0,000740838249993357 37552 36408 623 665 0 True 257 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 300 534 0,000868539607510035 0,000911273376850228 0,000717174029144732 0,000747692072938125 0,00074269961225324 0,000768495325011068 35461 39714 623 665 0 True 301 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 345 534 0,000979639002892724 0,00085962216137735 0,000885023270008392 0,000717174029144732 0,00075865765113597 0,000719995029735093 39997 37463 623 665 0 True 345 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 390 534 0,00080963439457014 0,000904504337061468 0,000610360875867857 0,000717174029144732 0,000711490490618655 0,000802127459646445 33056 39419 623 665 0 True 389 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 434 534 0,00100160905528652 0,000879998118436398 0,000625619897764553 0,000457770656900893 0,00100111656663737 0,00100533069417566 40894 38351 623 665 0 True 433 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 477 534 0,000895947064175209 0,000852784283895823 0,00064087891966125 0,000473029678797589 0,000892967356146871 0,00095566902473218 36580 37165 623 665 0 True 477 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 522 534 0,000954239956814274 0,000937661159077598 0,000610360875867857 0,000579842832074464 0,0009823865307424 0,000984509309248255 38960 40864 623 665 0 True 522 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 567 534 0,000903123458100943 0,000803634171260149 0,000625619897764553 0,000457770656900893 0,00087043032673788 0,000826496339121961 36873 35023 623 665 0 True 566 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 611 535 0,000905891145860696 0,000890828582098414 0,000595101853971161 0,000625619897764553 0,000881396566934691 0,000833692809865222 36986 38823 623 665 0 True 610 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 654 534 0,000940181082707205 0,000846198811287775 0,000534065766384375 0,000350957503624018 0,000949716639099644 0,00101883837336138 38386 36878 623 665 0 True 654 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 256 571 0,000920317412148263 0,000875363047123416 0,000778210116731518 0,000762951094834821 0,000673077062355231 0,000614831137903897 37575 38149 623 665 0 False 256 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 301 571 0,000908364919876052 0,00088506916180357 0,000778210116731518 0,000793469138628214 0,000719368303086851 0,000699040383355581 37087 38572 623 665 0 False 301 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 346 578 0,00101231241414504 0,000991170992255186 0,000839246204318303 0,000854505226215 0,000770644727374268 0,000742856094231011 41331 43196 623 665 0 True 345 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 389 571 0,000841940413641958 0,000859002622142447 0,000686655985351339 0,000732433051041428 0,000673950653294187 0,000661296825025898 34375 37436 623 665 0 False 389 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 436 579 0,000924824089562376 0,000970978602376851 0,000625619897764553 0,000518806744487678 0,000919272627136978 0,00106379323692629 37759 42316 623 665 0 True 433 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 479 578 0,00100222137558735 0,000962947538220695 0,000579842832074464 0,000610360875867857 0,00109789232356175 0,000976929668445707 40919 41966 623 665 0 True 477 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 524 579 0,000973515799884418 0,000915449530211429 0,000488288700694286 0,000473029678797589 0,00111130578304544 0,00100027689613728 39747 39896 623 665 0 True 521 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 566 572 0,000858815961132846 0,000882476275376012 0,000579842832074464 0,000549324788281071 0,000835308157423771 0,000882944317911012 35064 38459 623 665 0 False 566 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 612 578 0,000952623431220081 0,000971575195714165 0,000701915007248035 0,000671396963454643 0,00083180653878413 0,00085847599407401 38894 42342 623 665 0 True 610 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 655 578 0,000866800617855676 0,00087738228611125 0,000610360875867857 0,000656137941557946 0,000844290037853926 0,000787674493931996 35390 38237 623 665 0 True 654 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 256 614 0,000878336732323323 0,000913682696097075 0,000717174029144732 0,000778210116731518 0,000712552501853338 0,000678638315803447 35861 39819 623 665 0 False 256 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 301 614 0,000910642751395141 0,000906936602205904 0,000793469138628214 0,000793469138628214 0,000716740008832686 0,000714616746948961 37180 39525 623 665 0 False 301 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 345 615 0,000902756065920444 0,000942892823727894 0,000747692072938125 0,000823987182421607 0,00072174576938589 0,000780580364247769 36858 41092 623 665 0 False 345 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 389 615 0,000863077710426627 0,000880365252797822 0,000732433051041428 0,000778210116731518 0,000674799901909672 0,000664514694058294 35238 38367 623 665 0 False 389 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 433 615 0,000846006220439472 0,00093061676851777 0,000549324788281071 0,000579842832074464 0,000846731388920716 0,000934859848068717 34541 40557 623 665 0 False 433 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 477 615 0,000963498239762831 0,000866987794503425 0,000564583810177768 0,000518806744487678 0,00102762462015813 0,000935501023718261 39338 37784 623 665 0 False 477 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 521 615 0,000894526481077282 0,00097848191088846 0,000473029678797589 0,000549324788281071 0,000982721908553744 0,00105980423541835 36522 42643 623 665 0 False 521 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 566 615 0,000899180115363594 0,000915036504054827 0,000579842832074464 0,000503547722590982 0,000911703768884911 0,000975189491983872 36712 39878 623 665 0 False 566 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 610 615 0,000930090044149518 0,000912443617627268 0,000686655985351339 0,000778210116731518 0,00074754126450293 0,000706028624079865 37974 39765 623 665 0 False 610 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 654 615 0,000842601719566854 0,000880250523309877 0,00064087891966125 0,000686655985351339 0,000707596409607466 0,000767618456544631 34402 38362 623 665 0 False 654 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 256 664 0,00103232304157618 0,0732495693341846 0,000885023270008392 0,0743724727244984 0,000706397550652183 0,024066251045211 42148 3192273 623 665 0 True 256 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 301 658 0,00104714119285628 0,000996471494598249 0,000915541313801785 0,000885023270008392 0,00074058514982487 0,000656504877425417 42753 43427 623 665 0 False 301 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 345 658 0,00088698269497105 0,000912764860193514 0,000793469138628214 0,00080872816052491 0,000599402302980639 0,000626785689797088 36214 39779 623 665 0 False 345 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 389 658 0,000943610076391856 0,000918661955873892 0,000854505226215 0,00080872816052491 0,000643585476875315 0,00062181137114583 38526 40036 623 665 0 False 389 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 433 658 0,000825775157700032 0,00091145694403094 0,00064087891966125 0,000656137941557946 0,000734085585988512 0,00079575829823648 33715 39722 623 665 0 False 433 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 477 658 0,000876891656413363 0,000932177089553823 0,000610360875867857 0,000732433051041428 0,000863295159437035 0,000820693938573405 35802 40625 623 665 0 False 477 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 521 658 0,000919386685291001 0,00100622350107358 0,000595101853971161 0,000762951094834821 0,000896111016431506 0,000891792499020346 37537 43852 623 665 0 False 521 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 566 658 0,00092394234832918 0,000931396929035796 0,000701915007248035 0,000671396963454643 0,000879328986527695 0,000820273685949996 37723 40591 623 665 0 False 566 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 610 658 0,00102073794148447 0,000880755333056835 0,000869764248111696 0,000732433051041428 0,000744072372874528 0,000711750735245921 41675 38384 623 665 0 False 610 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 653 664 0,00111361468471444 0,0762452251021236 0,000946059357595178 0,0749370565346761 0,000786719454105152 0,0220301373961004 45467 3322826 623 665 0 True 654 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C12_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C12_1.csv new file mode 100755 index 0000000..7840c6d --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C12_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 232 244 0,0103915082971218 0,0442084382391089 0,0104371709773404 0,0446478980697337 0,00175093236841044 0,00804897701964982 454232 1926638 667 665 0 True 232 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 276 245 0,0106346231782255 0,0103164985019197 0,0107270923933776 0,010406652933547 0,00149132046142613 0,0015615538309745 464859 449601 667 665 0 False 276 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 320 244 0,0106637457192667 0,0609526104113568 0,0106202792401007 0,0593881132219425 0,00140537730774213 0,00872720881354696 466132 2656362 667 665 0 True 321 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 364 244 0,0107030943214591 0,0848645073429741 0,0106813153276875 0,0831158922713054 0,00125358518109797 0,0175384959851067 467852 3698461 667 665 0 True 365 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 410 244 0,0104223466202353 0,0714654110671506 0,010406652933547 0,0682841229877165 0,00151940527124822 0,012555537709974 455580 3114518 667 665 0 True 409 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 453 244 0,0102443628265977 0,0683476831240381 0,0102082856488899 0,0704814221408408 0,0015729839820491 0,0188062855599802 447800 2978645 667 665 0 True 453 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 497 244 0,0104683753339627 0,0802274856286975 0,0105287251087205 0,0783703364614328 0,00159480331738739 0,0205291756085064 457592 3496376 667 665 0 True 498 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 541 244 0,0103623400018919 0,0684707878646031 0,0105287251087205 0,0662394140535592 0,0016416304800134 0,0168265402102218 452957 2984010 667 665 0 True 542 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 586 245 0,0105339182091262 0,0104739761970731 0,0105287251087205 0,0104982070649271 0,00185694120280511 0,00197497804464691 460457 456464 667 665 0 False 586 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 629 243 0,0105330260024485 0,0459107943812381 0,0104829480430304 0,0457770656900893 0,00249626360027384 0,00769897899027326 460418 2000828 667 665 0 True 630 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 232 288 0,0112937580191365 0,0104982070649271 0,0105287251087205 0,0105134660868238 0,00681760974873539 0,00156050329682062 493671 457520 667 665 0 False 232 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 276 288 0,0125976837628336 0,0105756494692901 0,0106507972838941 0,010605020218204 0,0136283211575002 0,00145553134880521 550668 460895 667 665 0 False 276 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 321 288 0,0104474656697744 0,0932923978520345 0,010452429999237 0,091783016708629 0,00134290342077123 0,0193480769744023 456678 4065755 667 665 0 True 321 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 365 288 0,010441288854314 0,050751300315334 0,0104676890211337 0,0497749294270237 0,00132166465691878 0,00710379622287399 456408 2211781 667 665 0 True 365 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 410 288 0,0102568079658957 0,0800302426930223 0,0103303578240635 0,0773785000381476 0,00146955892377125 0,0188381711925042 448344 3487780 667 665 0 True 409 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 453 288 0,0102698936638341 0,0445584320150342 0,0103150988021668 0,0435034714274815 0,00177530048041059 0,00939520347456611 448916 1941891 667 665 0 True 453 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 497 288 0,0102705342224745 0,0487165957925255 0,0102998397802701 0,0496223392080568 0,00166130910631421 0,0119901977567798 448944 2123107 667 665 0 True 498 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 542 289 0,0102987645568381 0,0536288306024847 0,0103150988021668 0,0522011139085985 0,00149512777066877 0,0122740974437178 450178 2337186 667 665 0 True 542 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 586 288 0,0104191667041279 0,0104368038429789 0,0104371709773404 0,0104676890211337 0,00186130891033834 0,0020256307968484 455441 454844 667 665 0 False 586 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 630 288 0,0103705757558392 0,0104010082427401 0,0103303578240635 0,0104676890211337 0,00186781871359164 0,00185280090429076 453317 453284 667 665 0 False 630 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 233 334 0,0106080857488399 0,0479139253489641 0,0107270923933776 0,0464789806973373 0,00156054935140896 0,00784572915466854 463699 2088126 667 665 0 True 232 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 277 333 0,0104327556981409 0,0644932771388301 0,0104219119554437 0,0625314717326619 0,00143418099155067 0,0212389287089723 456035 2810667 667 665 0 True 276 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 322 332 0,0104658130994013 0,0372433716472458 0,0104371709773404 0,0385290302891585 0,00135544359956923 0,00551503161052496 457480 1623095 667 665 0 True 321 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 366 332 0,0101219703721039 0,0338560294074624 0,0101319905394064 0,0341649500267033 0,00142645129188969 0,00477804063960193 442450 1475472 667 665 0 True 365 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 409 333 0,0102190150061156 0,0691619412458819 0,01025406271458 0,0652780956740673 0,00147502680583156 0,0114637385073786 446692 3014131 667 665 0 True 409 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 454 333 0,0101906931633748 0,0330799532592066 0,0102082856488899 0,0334477759975586 0,00168481748810929 0,00505937660560229 445454 1441650 667 665 0 True 453 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 499 332 0,0101930952582761 0,0281166179353167 0,0102082856488899 0,0283207446402686 0,00159810076465809 0,00278153153732976 445559 1225344 667 665 0 True 498 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 542 333 0,00995601993006701 0,050171824617621 0,0100556954299229 0,0500190737773709 0,0015695852789604 0,00862780623121914 435196 2186527 667 665 0 True 542 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 587 333 0,0102305908158304 0,0547965473307898 0,0102845807583734 0,0543068589303426 0,00196164090719108 0,0112153842222765 447198 2388076 667 665 0 True 586 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 630 332 0,0104794707246972 0,0621337734356491 0,0105287251087205 0,0598764019226368 0,00208669635246631 0,0163687735987607 458077 2707838 667 665 0 True 630 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 233 379 0,010523920918918 0,0427445129188272 0,0105439841306172 0,0438849469748989 0,00155970432859918 0,00866896008586896 460020 1862839 667 665 0 True 232 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 278 377 0,0106963227015469 0,0342143066524173 0,0104219119554437 0,0319523918516823 0,0021183187963791 0,0071035997711346 467556 1491086 667 665 0 True 276 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 322 378 0,0104370108376803 0,0824429349868147 0,010406652933547 0,0776836804760815 0,00132672422018426 0,017218857734855 456221 3592927 667 665 0 True 320 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 366 377 0,0105688057779304 0,0620087871314817 0,0105439841306172 0,0594796673533226 0,00144501947084251 0,013745358389161 461982 2702391 667 665 0 True 365 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 409 377 0,0104908635176575 0,0437972248084161 0,0105134660868238 0,0426489662012665 0,00153558991413589 0,00930268457814469 458575 1908717 667 665 0 True 409 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 454 378 0,0104629077084255 0,0533333792251285 0,0104676890211337 0,0530861371786069 0,00183623621046532 0,00995503482986149 457353 2324310 667 665 0 True 453 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 498 377 0,0101607241698446 0,0407351177210593 0,0101930266269932 0,0411078049897002 0,00178844262619155 0,00604232792191866 444144 1775268 667 665 0 True 498 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 543 377 0,0102491212622116 0,0485380767092829 0,0102693217364767 0,048706797894255 0,00164900944552067 0,00781768954646854 448008 2115327 667 665 0 True 542 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 587 377 0,0102109851460171 0,0425491744926519 0,0102388036926833 0,0420233463035019 0,00184523755861388 0,00797605855431335 446341 1854326 667 665 0 True 586 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 631 378 0,0102907575738338 0,0914209304446743 0,0102693217364767 0,0899366750591287 0,00198159739831694 0,022049133214538 449828 3984195 667 665 0 True 630 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 233 422 0,0103127882156427 0,0458781423689689 0,0102845807583734 0,0446784161135271 0,0015956336748893 0,00692362480921247 450791 1999405 667 665 0 True 232 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 278 421 0,0102712205353034 0,0511582687549728 0,0104371709773404 0,0504615854123751 0,00151512616547181 0,00570531162451335 448974 2229517 667 665 0 True 276 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 322 421 0,0105636813088077 0,0340307165258075 0,0105439841306172 0,0341649500267033 0,00137143140279198 0,00369680810857967 461758 1483085 667 665 0 True 320 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 366 420 0,0106608403282909 0,0519513019215468 0,0105745021744106 0,0498207064927138 0,00142355939470483 0,00939146086500143 466005 2264078 667 665 0 True 365 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 411 420 0,0106268678432585 0,0885943859419664 0,0106660563057908 0,0887769893949798 0,00160062221549039 0,0136264362664738 464520 3861012 667 665 0 True 409 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 455 422 0,0106407999936859 0,061617444848101 0,010605020218204 0,0599679560540169 0,00164637417081046 0,0147010439294963 465129 2685336 667 665 0 True 453 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 499 422 0,0105216332094882 0,0520434985380595 0,0104829480430304 0,0502479591058213 0,00184503671394465 0,00940219446030966 459920 2268096 667 665 0 True 498 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 543 421 0,0103477444157299 0,0311393728083083 0,0102998397802701 0,0311436636911574 0,00170020275127073 0,00419781171353269 452319 1357078 667 665 0 True 542 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 587 421 0,0101177152325645 0,0411438759407101 0,0100709544518196 0,0404211490043488 0,00179357721796969 0,00632477090097293 442264 1793082 667 665 0 True 586 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 631 421 0,0103336292485481 0,082208313183967 0,0103456168459602 0,080827038986801 0,00182556324972252 0,0186344557406068 451702 3582702 667 665 0 True 630 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 232 466 0,0102150801458964 0,0557398531806743 0,0103150988021668 0,0554512855725948 0,00148657229954112 0,0145734629574492 446520 2429186 667 665 0 True 232 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 277 466 0,0103716509792712 0,0539834365038254 0,010452429999237 0,0531013962005035 0,0015421538262976 0,0070544206506585 453364 2352640 667 665 0 True 276 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 321 466 0,0106646608030386 0,0663836060740085 0,0105897611963073 0,062928206301976 0,00153945087032456 0,016771345851404 466172 2893049 667 665 0 True 320 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 365 465 0,0108436740659197 0,0917726910547139 0,0108339055466545 0,0833447775997559 0,00154398729873639 0,0271162884024341 473997 3999525 667 665 0 True 365 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 410 465 0,0107316906893315 0,0971959539498781 0,0106660563057908 0,0945143816281376 0,0018133619216742 0,0283441921747391 469102 4235875 667 665 0 True 409 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 453 467 0,0106895968358233 0,0474762552983512 0,0107423514152743 0,0477912565804532 0,00197934995557526 0,00984475985639219 467262 2069052 667 665 0 True 453 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 497 465 0,0103343613155656 0,042235113992351 0,0104371709773404 0,0439154650186923 0,00189753330830205 0,0077838488890691 451734 1840639 667 665 0 True 497 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 543 465 0,0104640515631404 0,0960804391385881 0,0105134660868238 0,0940871290150301 0,00181832510752663 0,0164830011206178 457403 4187260 667 665 0 True 542 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 586 464 0,0101723686108422 0,0657116125172166 0,0102845807583734 0,0642252231631952 0,00195694911683658 0,0186108343185357 444653 2863763 667 665 0 True 586 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 631 465 0,0101932553979362 0,079736695825166 0,0101625085831998 0,0765087357900359 0,00179615396944792 0,0118900439079424 445566 3474987 667 665 0 True 630 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 233 510 0,0101222906514241 0,0486362851509639 0,0100862134737163 0,0505836575875486 0,00143725737050133 0,0105699808909354 442464 2119607 667 665 0 True 232 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 277 509 0,0103947339674178 0,116571997629689 0,0103456168459602 0,100938429846647 0,00153339708315262 0,0773280014446909 454373 5080298 667 665 0 True 276 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 321 509 0,0104354780723623 0,0545698648085079 0,0103761348897536 0,0562294956893263 0,00159513874205546 0,012405816275894 456154 2378197 667 665 0 True 320 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 365 509 0,0107887232854161 0,0584224580678063 0,0107270923933776 0,0551308461127642 0,00161191542808867 0,0118209099428759 471595 2546096 667 665 0 True 365 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 410 509 0,0106444832058679 0,0553626226243108 0,0107118333714809 0,0548104066529335 0,00175655480805825 0,00657740569944434 465290 2412746 667 665 0 True 409 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 453 511 0,0106933715563825 0,0615916307133134 0,0108033875028611 0,0589303425650416 0,00190253001621351 0,0142222914349863 467427 2684211 667 665 0 True 453 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 499 509 0,0103015784394367 0,0707095502546708 0,0103303578240635 0,0694438086518654 0,00169331324043146 0,0170732362031093 450301 3081577 667 665 0 True 497 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 542 510 0,0103184617350286 0,0591900671798517 0,0103456168459602 0,0583504997329671 0,00172128473043947 0,0153732601925272 451039 2579549 667 665 0 True 542 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 587 508 0,00996235688518753 0,0425670493468737 0,00993362325474937 0,0418554970626383 0,00174727270142175 0,00538899144423492 435473 1855105 667 665 0 True 586 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 630 509 0,0100665849268087 0,0632454103902466 0,0100862134737163 0,062226291294728 0,00186804669362291 0,0135231583826973 440029 2756284 667 665 0 True 630 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 234 553 0,00997706685682107 0,0398268502567933 0,00994888227664607 0,0402227817196918 0,00133904678611502 0,00723012136017771 436116 1735685 667 665 0 True 232 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 278 554 0,0100975147582995 0,0487084041070862 0,0101167315175097 0,0494850080109865 0,00138931607424897 0,00870175777274546 441381 2122750 667 665 0 True 276 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 322 554 0,0104677347753223 0,0498526012903626 0,0104829480430304 0,0487373159380484 0,00145863121620964 0,0107382384001366 457564 2172615 667 665 0 True 320 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 367 554 0,0105691718114392 0,0505353794190214 0,0105287251087205 0,0488746471351186 0,00144193458110811 0,00625362299792092 461998 2202371 667 665 0 True 365 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 410 554 0,0107025223941016 0,0962230249462062 0,0107728694590677 0,0854352635996033 0,0017701217420029 0,0317564546255122 467827 4193474 667 665 0 True 409 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 454 554 0,0106266619494098 0,0635895070704915 0,0105897611963073 0,0614480811779965 0,00203880771401003 0,0119992129645982 464511 2771280 667 665 0 True 453 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 499 553 0,010204144894822 0,0555657167638712 0,01025406271458 0,0546578164339666 0,00203514218592215 0,00722502455353442 446042 2421597 667 665 0 True 497 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 542 554 0,0102640371276939 0,0374620919430643 0,0102082856488899 0,0386816205081254 0,00183911574193184 0,00752688685991765 448660 1632627 667 665 0 True 542 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 587 554 0,0100171017718424 0,0488297190676393 0,0100404364080262 0,0479896238651102 0,00179117738965833 0,0073873172380954 437866 2128037 667 665 0 True 586 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 630 553 0,0100567248991663 0,0518772784559247 0,0101319905394064 0,0513008316166934 0,00183445084743534 0,00898840475409624 439598 2260852 667 665 0 True 630 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 232 592 0,0098267872243782 0,00970180085140753 0,00976577401388571 0,00971999694819562 0,00127347064744937 0,00124398146177265 429547 422812 667 665 0 False 232 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 276 592 0,0101384190029041 0,00988612524674011 0,0100099183642329 0,00993362325474937 0,00194129928311779 0,00136455396437802 443169 430845 667 665 0 False 276 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 322 598 0,010206524112629 0,0727015983538613 0,0101777676050965 0,0708323796444648 0,0015044310618682 0,0105144011530055 446146 3168392 667 665 0 True 320 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 365 597 0,0103150988021668 0,0722438047510628 0,0102845807583734 0,0706950484473945 0,00141237866895677 0,02042883840495 450892 3148441 667 665 0 True 365 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 409 592 0,0106511175632143 0,010220951784359 0,010452429999237 0,0102235446707866 0,00253487270450483 0,00155173308988646 465580 445437 667 665 0 False 409 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 453 592 0,0103585424042385 0,0101898600931259 0,0101930266269932 0,0102388036926833 0,00242588601078725 0,00200030117867797 452791 444082 667 665 0 False 453 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 497 592 0,010006166520768 0,00994424720533309 0,00996414129854276 0,0100251773861295 0,00198835516052437 0,00216881350530569 437388 433378 667 665 0 False 497 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 542 592 0,00992380898129557 0,00984381301158596 0,00988784618905928 0,0098268101014725 0,0018993801657002 0,00169549651944138 433788 429001 667 665 0 False 542 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 586 592 0,0099376038691572 0,00984881521726036 0,00994888227664607 0,00984206912336919 0,00180251279481664 0,0018232266938949 434391 429219 667 665 0 False 586 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 630 592 0,00992595942815958 0,00996978598934966 0,00990310521095598 0,0100099183642329 0,00156952908642737 0,00144258044057854 433882 434491 667 665 0 False 630 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 233 641 0,00989251311629605 0,0412004146323694 0,00987258716716258 0,041367208361944 0,00128227758965686 0,00811679093340942 432420 1795546 667 665 0 True 232 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 276 635 0,0096038728175395 0,00969939153216068 0,00967421988250553 0,00975051499198901 0,00134218347025374 0,00138250258260288 419803 422707 667 665 0 False 276 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 320 635 0,0114787879578178 0,00988116893286088 0,0098268101014725 0,00987258716716258 0,00787792836703537 0,00135395681477356 501759 430629 667 665 0 False 320 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 365 635 0,0102440425472775 0,010060605852007 0,0098268101014725 0,0101319905394064 0,00272866353553604 0,00128267195297738 447786 438449 667 665 0 False 365 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 409 635 0,0099441238410321 0,00972493031617726 0,00988784618905928 0,00978103303578241 0,00141731312220726 0,00145859195990086 434676 423820 667 665 0 False 409 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 453 635 0,010050936994309 0,00991572545462994 0,010101472495613 0,00988784618905928 0,00176525431616115 0,00178313910712232 439345 432135 667 665 0 False 453 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 497 635 0,00985259258674622 0,00963886025432086 0,00976577401388571 0,00956740672922866 0,00173679642695528 0,00192694249306708 430675 420069 667 665 0 False 497 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 542 635 0,00985151736331422 0,00962045764445446 0,00984206912336919 0,00956740672922866 0,00177669162389606 0,00178303786018526 430628 419267 667 665 0 False 542 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 586 635 0,00969901865272445 0,00982995368944219 0,00971999694819562 0,00984206912336919 0,00157910844605982 0,00143584885948874 423962 428397 667 665 0 False 586 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 631 640 0,0100290436150659 0,044014361837301 0,0100404364080262 0,0441443503471428 0,00136306703715231 0,00823127988533087 438388 1918180 667 665 0 True 630 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C12_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C12_2.csv new file mode 100755 index 0000000..a17fab3 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C12_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 232 244 0,00830820570488388 0,712395178837458 0,00799572747386892 0,720180056458381 0,00229591358572962 0,184786234564482 363167 31046734 667 665 8 True 232 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 276 245 0,0068316722847091 0,00655846528658566 0,00675974670023652 0,00656137941557946 0,00171836652475802 0,00141761600212935 298625 285823 667 665 0 False 276 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 320 244 0,0063707217117008 0,00637239700303632 0,00643930724040589 0,0063782711528191 0,00126157974807014 0,00123821222367713 278476 277714 667 665 0 True 321 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 364 244 0,00643736268739057 0,0065627561694348 0,00646982528419928 0,00653086137178607 0,00127303351342093 0,00117010768551521 281389 286010 667 665 0 True 365 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 410 244 0,00627166389339091 0,00634972645621837 0,00636301213092241 0,00636301213092241 0,00138228010705949 0,00130256974317249 274146 276726 667 665 0 True 409 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 453 244 0,00633947160088987 0,00625252763403129 0,00642404821850919 0,00625619897764553 0,00153383291823304 0,00144689892771274 277110 272490 667 665 0 True 453 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 497 244 0,00650786989201668 0,00653733211490617 0,00646982528419928 0,00651560234988937 0,00154045567899768 0,00137098052607262 284471 284902 667 665 0 True 498 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 541 244 0,00672847371233129 0,00687351246048286 0,00671396963454643 0,00689707789730678 0,00140811533698082 0,00139408495560048 294114 299553 667 665 0 True 542 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 586 245 0,00767370949453175 0,00762205353163178 0,00740062561989776 0,00761425192645151 0,00223350819402591 0,00181371185317826 335432 332175 667 665 0 False 586 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 629 243 0,00925909212937592 0,75155221539773 0,00914015411612116 0,765438315403983 0,0029348156157429 0,16661482104004 404732 32753228 667 665 11 True 630 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 232 288 0,00702342808911406 0,00673037595132257 0,00675974670023652 0,00675974670023652 0,00257211397914862 0,00143577880751689 307007 293315 667 665 0 False 232 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 276 288 0,00686219032850249 0,00621982972996694 0,00628671702143893 0,00622568093385214 0,00374520085086806 0,00130517401682519 299959 271065 667 665 0 False 276 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 321 288 0,00595531943343961 0,00609169983782987 0,00593575951781491 0,00611886778057527 0,0012771183303725 0,00120129053096028 260318 265481 667 665 0 True 321 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 365 288 0,00626374841876384 0,00649469863718578 0,00627145799954223 0,00645456626230259 0,00127694443889265 0,00143650250008666 273800 283044 667 665 0 True 365 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 410 288 0,00607997672026884 0,00610028160352816 0,00608834973678187 0,00611886778057527 0,00129288002888666 0,00139322830803218 265767 265855 667 665 0 True 409 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 453 288 0,00627566738489304 0,00634031863820687 0,0063935301747158 0,00630197604333562 0,00158800601893982 0,00165486668217647 274321 276316 667 665 0 True 453 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 497 288 0,00643649335780725 0,00645486455897124 0,00643930724040589 0,00654612039368277 0,00154502930424494 0,00164158053156273 281351 281308 667 665 0 True 498 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 542 289 0,00644557556424351 0,00668542493794569 0,00642404821850919 0,00671396963454643 0,00140837760777994 0,00146742626172633 281748 291356 667 665 0 True 542 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 586 288 0,00706087789247972 0,00711784037801072 0,00703440909437705 0,00712596322575723 0,00175651786722164 0,00193495308902914 308644 310201 667 665 0 False 586 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 630 288 0,00772843150409231 0,00780142161308513 0,00772106507972839 0,00779736018921187 0,001878546590709 0,00187130761145173 337824 339992 667 665 0 False 630 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 233 334 0,00632977171290757 0,00634362284745969 0,00634775310902571 0,00630197604333562 0,00142102203590552 0,0012813301654619 276686 276460 667 665 0 True 232 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 277 333 0,00600036443211217 0,00623926490522484 0,00604257267109178 0,00622568093385214 0,00143705710668828 0,00138760314360292 262287 271912 667 665 0 True 276 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 322 332 0,0059782651590204 0,00625218344556746 0,0059662775616083 0,00628671702143893 0,00116391508184859 0,00122011223502645 261321 272475 667 665 0 True 321 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 366 332 0,00607265605009352 0,00625197693248915 0,00611886778057527 0,00627145799954223 0,00123680061149424 0,00123611930366938 265447 272466 667 665 0 True 365 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 409 333 0,00624219819593522 0,00630690941131726 0,00627145799954223 0,00630197604333562 0,00141276424178437 0,00138597195313834 272858 274860 667 665 0 True 409 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 454 333 0,00642645031341047 0,00643549822140611 0,00643930724040589 0,00642404821850919 0,00164750451999273 0,00150032230394016 280912 280464 667 665 0 True 453 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 499 332 0,0066587443289113 0,00651493691885929 0,00665293354695964 0,00657663843747616 0,00146075380500002 0,00152468048956376 291066 283926 667 665 0 True 498 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 542 333 0,00655364695770677 0,00686529782914599 0,00665293354695964 0,00685130083161669 0,00154373734322443 0,0013934357573462 286472 299195 667 665 0 True 542 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 587 333 0,00698966149793037 0,00719695783289765 0,00692759594110018 0,00729381246662089 0,00175231594297112 0,00202417341174495 305531 313649 667 665 0 True 586 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 630 332 0,0073524007051178 0,00741937241822799 0,00733958953231098 0,00733958953231098 0,00193130252173339 0,00179830642486951 321387 323342 667 665 0 True 630 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 233 379 0,00615277163432475 0,00613465455811651 0,00613412680247196 0,00613412680247196 0,00158771713482406 0,00150256235327702 268949 267353 667 665 0 True 232 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 278 377 0,00610701744572896 0,00589672854601599 0,00610360875867857 0,0059510185397116 0,00134520733425483 0,00134648679171087 266949 256984 667 665 0 True 276 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 322 378 0,00628458945166922 0,00631606482445528 0,00631723506523232 0,00628671702143893 0,00136969542810054 0,00131211246195918 274711 275259 667 665 0 True 320 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 366 377 0,00655218282367171 0,00655458742989311 0,00656137941557946 0,00653086137178607 0,00119727397873587 0,0013832372052868 286408 285654 667 665 0 True 365 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 409 377 0,00666512703822042 0,00663102021476213 0,00668345159075303 0,00662241550316625 0,00143295980301838 0,0013696243987955 291345 288985 667 665 0 True 409 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 454 378 0,00663643916197086 0,00668120289278931 0,00666819256885634 0,00663767452506294 0,00165024310358025 0,00159998997398985 290091 291172 667 665 0 True 453 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 498 377 0,00665943064174024 0,00666438354985656 0,00660715648126955 0,00668345159075303 0,00158886440197091 0,0017110162794869 291096 290439 667 665 0 True 498 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 543 377 0,00656826542096313 0,00673363426878021 0,00660715648126955 0,00669871061264973 0,001536569230762 0,00156802567150438 287111 293457 667 665 0 True 542 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 587 377 0,00669175597598317 0,00686192478220041 0,00671396963454643 0,00683604180972 0,00182224786077249 0,00198392405652451 292509 299048 667 665 0 True 586 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 631 378 0,00644404279892555 0,00659719796171592 0,00633249408712902 0,00668345159075303 0,00198593030192609 0,00177841769949605 281681 287511 667 665 0 True 630 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 233 422 0,00605311901156311 0,00634770721723053 0,00605783169298848 0,0063935301747158 0,0014781496985671 0,00150132353254351 264593 276638 667 665 0 True 232 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 278 421 0,0062794192283579 0,00606035574172327 0,00625619897764553 0,00604257267109178 0,00150806572853103 0,00143018414504408 274485 264115 667 665 0 True 276 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 322 421 0,00655586603585367 0,00665428735491739 0,00660715648126955 0,00669871061264973 0,00131056029931674 0,00131239110987518 286569 289999 667 665 0 True 320 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 366 420 0,00665476371450347 0,00674003617420755 0,00665293354695964 0,00686655985351339 0,00134889765015664 0,00125323106287919 290892 293736 667 665 0 True 365 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 411 420 0,00666869586493089 0,00668976171259001 0,00666819256885634 0,00674448767833982 0,00144872186060411 0,00150995652124496 291501 291545 667 665 0 True 409 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 455 422 0,00668910223304461 0,00690265375042091 0,00668345159075303 0,00695811398489357 0,00159582244607781 0,00153863067839038 292393 300823 667 665 0 True 453 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 499 422 0,00674826239889897 0,00669854999136661 0,0068207827878233 0,00679026474402991 0,00167815048425714 0,00162827860414024 294979 291928 667 665 0 True 498 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 543 421 0,00664929608896628 0,00665066190309833 0,00663767452506294 0,00668345159075303 0,00161813203590042 0,00156906562312923 290653 289841 667 665 0 True 542 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 587 421 0,0061815281418572 0,0063598914888503 0,00616464484626535 0,00636301213092241 0,00175879245134278 0,00179688327243053 270206 277169 667 665 0 True 586 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 631 421 0,00588078586021706 0,00588094176847475 0,00588998245212482 0,00584420538643473 0,00173810910735874 0,0016376767241669 257060 256296 667 665 0 True 630 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 232 466 0,00640062207394815 0,00646948109573545 0,00642404821850919 0,00645456626230259 0,00147093264212959 0,00139094344537786 279783 281945 667 665 0 True 232 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 277 466 0,00636539134872939 0,00618447010178227 0,00634775310902571 0,00619516289005875 0,00145346657999908 0,00153626715168354 278243 269524 667 665 0 True 276 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 321 466 0,00650741235013073 0,00662204836880482 0,00643930724040589 0,00662241550316625 0,00151335857807633 0,00151820964711207 284451 288594 667 665 0 True 320 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 365 465 0,00668788974704683 0,0067117209365827 0,00671396963454643 0,00672922865644312 0,00139693972857196 0,00143818338523996 292340 292502 667 665 0 True 365 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 410 465 0,00689753543919274 0,00670098225651104 0,00691233691920348 0,00668345159075303 0,00171545021165604 0,00156126241358219 301504 292034 667 665 0 True 409 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 453 467 0,0069620717222071 0,00692720586084116 0,00697337300679027 0,00694285496299687 0,0020056721401249 0,00189298052277991 304325 301893 667 665 0 True 453 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 497 465 0,00671959739974371 0,00680607446746874 0,00677500572213321 0,00686655985351339 0,00188177186566262 0,00181413216165778 293726 296614 667 665 0 True 497 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 543 465 0,00603163742001739 0,00612960646064693 0,005981536583505 0,00613412680247196 0,00179603828828267 0,00169039258719688 263654 267133 667 665 0 True 542 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 586 464 0,00565805447013275 0,00565698980800594 0,00569161516746777 0,00564583810177768 0,00182950461772598 0,00191967836092633 247324 246536 667 665 0 True 586 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 631 465 0,00573492150697368 0,00582995598403195 0,00578316929884794 0,0059510185397116 0,00181622165358111 0,00169756484805196 250684 254074 667 665 0 True 630 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 233 510 0,00624311327970714 0,00642517256749106 0,00622568093385214 0,0064087891966125 0,00138944061165409 0,00140341136271532 272898 280014 667 665 0 True 232 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 277 509 0,00641361626350935 0,00627154978313259 0,00633249408712902 0,00628671702143893 0,00142447378653796 0,00155840243890381 280351 273319 667 665 0 True 276 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 321 509 0,00677102510772538 0,00657184274488005 0,0068207827878233 0,00663767452506294 0,0015998967837659 0,00147057273541167 295974 286406 667 665 0 True 320 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 365 509 0,00664762606108253 0,00670912805015514 0,00666819256885634 0,00668345159075303 0,00153205895534537 0,00135653187339315 290580 292389 667 665 0 True 365 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 410 509 0,00669109254024853 0,00678374810911463 0,00668345159075303 0,0068055237659266 0,00169190270975822 0,0016519085777758 292480 295641 667 665 0 True 409 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 453 511 0,00660960433035943 0,00661023123154648 0,00646982528419928 0,00662241550316625 0,00181169727571775 0,00170014313610168 288918 288079 667 665 0 True 453 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 499 509 0,00624199230208654 0,00642097346823226 0,00631723506523232 0,00624093995574884 0,00173987109990927 0,00277944186332563 272849 279831 667 665 0 True 497 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 542 510 0,0056456093308347 0,00584172722949512 0,00570687418936446 0,00582894636453803 0,00164143313400916 0,0016111430196596 246780 254587 667 665 0 True 542 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 587 508 0,00574155586432007 0,00577839655214943 0,00578316929884794 0,00581368734264134 0,00168430356501639 0,00159534234705622 250974 251827 667 665 0 True 586 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 630 509 0,00571245620037315 0,00575487700712069 0,00575265125505455 0,00575265125505455 0,00179746077704587 0,00172903258121217 249702 250802 667 665 0 True 630 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 234 553 0,00640382486714985 0,00645977498105529 0,00642404821850919 0,00653086137178607 0,00135959401652447 0,00130555413191079 279923 281522 667 665 0 True 232 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 278 554 0,0063141695345964 0,00650054984107098 0,00633249408712902 0,00646982528419928 0,00125880335347833 0,00131732319600421 276004 283299 667 665 0 True 276 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 322 554 0,00656391877304653 0,00652856678202717 0,00663767452506294 0,00653086137178607 0,00131898519958467 0,00131946188177706 286921 284520 667 665 0 True 320 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 367 554 0,00655950349384703 0,00663790398403883 0,00656137941557946 0,00663767452506294 0,00142965519119273 0,00127117651233711 286728 289285 667 665 0 True 365 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 410 554 0,00630991439505699 0,00636629339427764 0,00627145799954223 0,00633249408712902 0,00165010822929863 0,00144312270967127 275818 277448 667 665 0 True 409 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 454 554 0,00634111875167932 0,00623857652829717 0,00630197604333562 0,00634775310902571 0,00189683547213007 0,0018625046563171 277182 271882 667 665 0 True 453 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 499 553 0,0060880980887446 0,0064781546450241 0,00611886778057527 0,00654612039368277 0,00187033804556648 0,00219994692073555 266122 282323 667 665 0 True 497 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 542 554 0,00578497658929748 0,00595473577512102 0,00575265125505455 0,00590524147402152 0,00177747327698181 0,00179973742126789 252872 259512 667 665 0 True 542 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 587 554 0,00587117748061195 0,0058511579934042 0,00585946440833143 0,00581368734264134 0,00165131220332303 0,00141258586737252 256640 254998 667 665 0 True 586 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 630 553 0,0060129925881646 0,00621333604094925 0,00607309071488518 0,00611886778057527 0,00167647827375337 0,00170845604963439 262839 270782 667 665 0 True 630 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 232 592 0,00667539885356017 0,00676238547845925 0,00674448767833982 0,00674448767833982 0,00130359728134279 0,00127643633513759 291794 294710 667 665 0 False 232 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 276 592 0,00655433327053571 0,00645438269512187 0,00659189745937285 0,0063935301747158 0,00129429280728353 0,00122795294479424 286502 281287 667 665 0 False 276 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 322 598 0,00658677299025013 0,00652416116969008 0,00653086137178607 0,00651560234988937 0,00136350625468547 0,00134726741576303 287920 284328 667 665 0 True 320 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 365 597 0,0064794107867101 0,00656975466819945 0,00643930724040589 0,00659189745937285 0,0012517543950515 0,00125218003680584 283227 286315 667 665 0 True 365 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 409 592 0,00618582903558521 0,00620034866291386 0,00616464484626535 0,00624093995574884 0,00155421489238871 0,00148422890254735 270394 270216 667 665 0 False 409 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 453 592 0,00634420715940954 0,00605702858657286 0,0063935301747158 0,00613412680247196 0,00183288702539859 0,00178067981065607 277317 263970 667 665 0 False 453 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 497 592 0,00608439199946834 0,00591669147691843 0,00614938582436866 0,00588998245212482 0,00192252365284004 0,00196290742873394 265960 257854 667 665 0 False 497 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 542 592 0,00588412591598456 0,00594197785606153 0,005981536583505 0,00590524147402152 0,00176327792799651 0,0017084685321644 257206 258956 667 665 0 False 542 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 586 592 0,0059228339595366 0,00579216409070284 0,00587472343022812 0,00578316929884794 0,00163875392768498 0,0017006945536178 258898 252427 667 665 0 False 586 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 630 592 0,00620678445396208 0,00622379937024984 0,00624093995574884 0,00627145799954223 0,0014547597292457 0,00142552064145961 271310 271238 667 665 0 False 630 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 233 641 0,00867213452097481 0,722237454473905 0,00825513084611276 0,733180743114366 0,00244791964780328 0,199384162463667 379075 31475668 667 665 9 True 232 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 276 635 0,00730053833234447 0,00657640897850027 0,00698863202868696 0,00648508430609598 0,00213598822947461 0,00135581928168688 319120 286605 667 665 0 False 276 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 320 635 0,00629428933965153 0,00628660229195098 0,00627145799954223 0,00628671702143893 0,00124889307501009 0,00124822703256401 275135 273975 667 665 0 False 320 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 365 635 0,0062380803189616 0,00636693587941013 0,00617990386816205 0,00633249408712902 0,0012812380390864 0,00122099463810144 272678 277476 667 665 0 False 365 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 409 635 0,00608928769764809 0,00600849801317209 0,00605783169298848 0,00599679560540169 0,00135535687773609 0,00137168935825059 266174 261855 667 665 0 False 409 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 453 635 0,00604751412346013 0,00610962058384689 0,00610360875867857 0,00607309071488518 0,00170502642502517 0,00161852390283278 264348 266262 667 665 0 False 453 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 497 635 0,00595856798082991 0,00594759960097084 0,00593575951781491 0,00601205462729839 0,00166598619624746 0,00176456541895529 260460 259201 667 665 0 False 497 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 542 635 0,00582505725850739 0,00595402445229577 0,00585946440833143 0,00602731364919509 0,0017926657767446 0,00178378226483551 254624 259481 667 665 0 False 542 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 586 635 0,00621360182806285 0,0060995702807029 0,00625619897764553 0,00607309071488518 0,00160730393821399 0,00135267844222585 271608 265824 667 665 0 False 586 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 631 640 0,00775144586095599 0,754630201046218 0,0076752880140383 0,769344625009537 0,00161300058309346 0,191470697075158 338830 32887369 667 665 14 True 630 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C12_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C12_3.csv new file mode 100755 index 0000000..7e72640 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C12_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 232 244 0,000986826339634028 0,0710322613583627 0,000717174029144732 0,0709849698634318 0,0008720349650464 0,0197258783420315 43136 3095641 667 665 0 True 232 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 276 245 0,000954775530522676 0,000880801224852013 0,000732433051041428 0,000671396963454643 0,000823734938106918 0,000737610821412463 41735 38386 667 665 0 False 276 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 320 244 0,000894219861916147 0,000986099948888013 0,000747692072938125 0,000869764248111696 0,000684490613278022 0,000639244402694073 39088 42975 667 665 0 True 321 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 364 244 0,000874225281499786 0,000874215752243965 0,000762951094834821 0,000793469138628214 0,000634450898724995 0,000586730798362479 38214 38099 667 665 0 True 365 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 410 244 0,000882300895786943 0,000937110457535461 0,000717174029144732 0,000747692072938125 0,00069239569456287 0,000743764159858145 38567 40840 667 665 0 True 409 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 453 244 0,000870107404526164 0,000923778891036243 0,000671396963454643 0,000747692072938125 0,000783726744573256 0,000777088152043335 38034 40259 667 665 0 True 453 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 497 244 0,000872806901653316 0,000878736094069002 0,000656137941557946 0,000732433051041428 0,000783775697739806 0,000718997643544971 38152 38296 667 665 0 True 498 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 541 244 0,000938258268439596 0,000875202425840293 0,00080872816052491 0,000732433051041428 0,000741161713159877 0,000707606096567495 41013 38142 667 665 0 True 542 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 586 245 0,000871708801127017 0,00103896729693311 0,000610360875867857 0,000686655985351339 0,000894278393593397 0,000998105685818474 38104 45279 667 665 0 False 586 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 629 243 0,00100970343393192 0,0757385337915629 0,00064087891966125 0,0753490501258869 0,00102941676913094 0,0193317477471411 44136 3300744 667 665 0 True 630 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 232 288 0,000893442040710018 0,000877542907394373 0,000701915007248035 0,000686655985351339 0,000782680729660331 0,000739777679131596 39054 38244 667 665 0 False 232 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 276 288 0,000950474636794672 0,00093036436364429 0,000839246204318303 0,000762951094834821 0,000718403022566381 0,000736474352209266 41547 40546 667 665 0 False 276 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 321 288 0,000885869722497415 0,00091402688456091 0,000732433051041428 0,000823987182421607 0,000713646160813885 0,00066669417153528 38723 39834 667 665 0 True 321 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 365 288 0,000890147739131121 0,000811711127211483 0,000778210116731518 0,000717174029144732 0,000659628261376026 0,000605840599657151 38910 35375 667 665 0 True 365 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 410 288 0,000870793717355101 0,000879975172538809 0,000732433051041428 0,000656137941557946 0,000694077111015259 0,000761689224269555 38064 38350 667 665 0 True 409 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 453 288 0,000835768885985023 0,000907326682464917 0,000564583810177768 0,000595101853971161 0,000841058268801384 0,00093419995164525 36533 39542 667 665 0 True 453 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 497 288 0,000884748744876818 0,000944889116818138 0,000656137941557946 0,000717174029144732 0,000838516895118 0,000860137315845249 38674 41179 667 665 0 True 498 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 542 289 0,000956331172934933 0,000903104637308538 0,000762951094834821 0,000701915007248035 0,000797921365542448 0,000789898810501389 41803 39358 667 665 0 True 542 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 586 288 0,000810238048748571 0,000947573786836053 0,000534065766384375 0,000534065766384375 0,000843130992212627 0,00102997670323804 35417 41296 667 665 0 False 586 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 630 288 0,000956445558406423 0,000890071367477976 0,000625619897764553 0,000457770656900893 0,000978069167665042 0,000987880111701051 41808 38790 667 665 0 False 630 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 233 334 0,000890925560337249 0,000860081079329131 0,000732433051041428 0,000686655985351339 0,00073237018492368 0,00074110880696367 38944 37483 667 665 0 True 232 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 277 333 0,000818016260809856 0,000844500814866188 0,000686655985351339 0,000671396963454643 0,000662881259570534 0,000704621431332824 35757 36804 667 665 0 True 276 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 322 332 0,00085004419282691 0,000850902720293524 0,000762951094834821 0,000732433051041428 0,000609916896189526 0,000616608031374106 37157 37083 667 665 0 True 321 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 366 332 0,000895981398177085 0,000924581997451858 0,000793469138628214 0,000793469138628214 0,000628504135773733 0,000665754786774397 39165 40294 667 665 0 True 365 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 409 333 0,000933408324448442 0,000869580680930984 0,000732433051041428 0,000701915007248035 0,00080239087471245 0,000725660401935627 40801 37897 667 665 0 True 409 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 454 333 0,000909799163133013 0,000907395520157684 0,000625619897764553 0,000686655985351339 0,000898333214494288 0,000787544960734147 39769 39545 667 665 0 True 453 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 499 332 0,000934483547880443 0,000927128992084239 0,000701915007248035 0,000747692072938125 0,000832189763983879 0,000780262755547775 40848 40405 667 665 0 True 498 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 542 333 0,000985385082693261 0,000950350240444324 0,00080872816052491 0,000747692072938125 0,000831573041807689 0,000798690335561449 43073 41417 667 665 0 True 542 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 587 333 0,000907763101740501 0,000879080282532837 0,000579842832074464 0,000473029678797589 0,000942389077799813 0,00101182962103653 39680 38311 667 665 0 True 586 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 630 332 0,000889392795019291 0,00103206058175881 0,000503547722590982 0,000686655985351339 0,000948505208434064 0,00103406564557762 38877 44978 667 665 0 True 630 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 233 379 0,000887127962683799 0,000879653929972562 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000748869155767722 0,000735206086139141 38778 38336 667 665 0 True 232 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 278 377 0,000793423384439618 0,000850833882600757 0,00064087891966125 0,000701915007248035 0,000688619843019488 0,000711882444315671 34682 37080 667 665 0 True 276 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 322 378 0,000811404780557764 0,000880365252797822 0,000701915007248035 0,000747692072938125 0,000624368629973298 0,000679068956908158 35468 38367 667 665 0 True 320 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 366 377 0,000876375728363788 0,000828782875017711 0,000732433051041428 0,000686655985351339 0,000698355501883298 0,000641681882075239 38308 36119 667 665 0 True 365 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 409 377 0,000967952736838264 0,000967628501328854 0,000762951094834821 0,000793469138628214 0,000775232396606858 0,000791497595494332 42311 42170 667 665 0 True 409 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 454 378 0,000870725086072208 0,000940827692944882 0,000579842832074464 0,000671396963454643 0,000843499789286027 0,000861030510743625 38061 41002 667 665 0 True 453 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 498 377 0,000934003128900187 0,000839865743553207 0,000656137941557946 0,000488288700694286 0,000861967468057775 0,00089040707381333 40827 36602 667 665 0 True 498 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 543 377 0,000876490113835277 0,000832729569403022 0,000595101853971161 0,000579842832074464 0,000849704794229567 0,000821398454474753 38313 36291 667 665 0 True 542 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 587 377 0,000883787906916306 0,000907372574260095 0,000473029678797589 0,000442511635004196 0,00100951190770037 0,00104510618142262 38632 39544 667 665 0 True 586 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 631 378 0,000973397485281164 0,000899020267537693 0,000595101853971161 0,000549324788281071 0,0010280437460689 0,000956465538971748 42549 39180 667 665 0 True 630 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 233 422 0,000919499051115321 0,000876189099436621 0,000747692072938125 0,000717174029144732 0,000822779770206107 0,000787252950239852 40193 38185 667 665 0 True 232 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 278 421 0,000901449023714282 0,000909804839404531 0,000701915007248035 0,000762951094834821 0,000797819500767628 0,000785780760345017 39404 39650 667 665 0 True 276 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 322 421 0,000881843353900985 0,000882568058966368 0,000778210116731518 0,000747692072938125 0,000645124363945042 0,000699500483474401 38547 38463 667 665 0 True 320 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 366 420 0,000873927879273913 0,000899570969079829 0,000793469138628214 0,000762951094834821 0,000667826530204718 0,000651265070155928 38201 39204 667 665 0 True 365 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 411 420 0,000840618829976177 0,000928161557475745 0,000625619897764553 0,000732433051041428 0,000739078865965871 0,00082470352937505 36745 40450 667 665 0 True 409 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 455 422 0,000923273771674474 0,000948560460432381 0,000656137941557946 0,000732433051041428 0,000862515661832016 0,00082453794079529 40358 41339 667 665 0 True 453 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 499 422 0,000865143075063521 0,000932154143656234 0,000579842832074464 0,000701915007248035 0,000870732138026228 0,00086095079220125 37817 40624 667 665 0 True 498 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 543 421 0,000860979443901304 0,000891975876977865 0,000549324788281071 0,000717174029144732 0,00087686447739831 0,000758915468266965 37635 38873 667 665 0 True 542 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 587 421 0,000886304387289075 0,000863408234479538 0,000488288700694286 0,000396734569314107 0,000978141317423548 0,000984254825058879 38742 37628 667 665 0 True 586 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 631 421 0,000789694418069061 0,000811894694392195 0,000396734569314107 0,0004272526131075 0,000883484864925773 0,000867291505420538 34519 35383 667 665 0 True 630 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 232 466 0,000868689024679695 0,000833096703764447 0,000686655985351339 0,000671396963454643 0,000751185667727878 0,000726444546845679 37972 36307 667 665 0 True 232 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 277 466 0,000905544023593605 0,000926738911825226 0,000762951094834821 0,000778210116731518 0,000757103880496621 0,00081444118477581 39583 40388 667 665 0 True 276 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 321 466 0,000915449805424594 0,000874284589936732 0,000778210116731518 0,000686655985351339 0,00078606730530131 0,000786078048532466 40016 38102 667 665 0 True 320 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 365 465 0,000927528911213883 0,000812835476193344 0,000793469138628214 0,000686655985351339 0,000783375163400876 0,000704364651288477 40544 35424 667 665 0 True 365 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 410 465 0,000905727040347988 0,000890117259273154 0,00064087891966125 0,000610360875867857 0,000873627131862665 0,000849063630748136 39591 38792 667 665 0 True 409 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 453 467 0,000847527712454141 0,000956430903305414 0,000396734569314107 0,000579842832074464 0,000988359086153829 0,0010895811512461 37047 41682 667 665 0 True 453 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 497 465 0,000938304022628191 0,000890943311586359 0,000579842832074464 0,000457770656900893 0,000992080598229835 0,000983719352004726 41015 38828 667 665 0 True 497 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 543 465 0,000957063239952466 0,000880066956129165 0,000671396963454643 0,000579842832074464 0,000932828025167976 0,000890865838924848 41835 38354 667 665 0 True 542 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 586 464 0,000923388157145964 0,00082811744398763 0,000503547722590982 0,000457770656900893 0,000991163540658587 0,000939213975521688 40363 36090 667 665 0 True 586 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 631 465 0,000797289613375963 0,00086079240215439 0,000411993591210803 0,000549324788281071 0,000864578603674413 0,000865756814869794 34851 37514 667 665 0 True 630 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 233 510 0,000907099666005862 0,00088112246741826 0,000747692072938125 0,000717174029144732 0,000731933125673076 0,000729572263373186 39651 38400 667 665 0 True 232 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 277 509 0,000845766176193203 0,000878804931761769 0,000686655985351339 0,000732433051041428 0,000747856448592692 0,000770939548784086 36970 38299 667 665 0 True 276 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 321 509 0,000875963940666426 0,000851040395679058 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000759248119892058 0,000731442053076833 38290 37089 667 665 0 True 320 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 365 509 0,000910073688264588 0,000889061747984059 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,000774148108031823 0,000728646612669074 39781 38746 667 665 0 True 365 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 410 509 0,000871868940787102 0,000933232600842918 0,000595101853971161 0,000625619897764553 0,000878498039799669 0,000881310333061025 38111 40671 667 665 0 True 409 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 453 511 0,000880058940545749 0,000918891414849782 0,000518806744487678 0,000610360875867857 0,000937561166198917 0,00090620056575304 38469 40046 667 665 0 True 453 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 499 509 0,000847207433133971 0,000955398337913908 0,000503547722590982 0,000595101853971161 0,000884410195055297 0,000961114558934432 37033 41637 667 665 0 True 497 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 542 510 0,000858462963528536 0,000844890895125201 0,000564583810177768 0,000610360875867857 0,000859027444679369 0,00080061396175212 37525 36821 667 665 0 True 542 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 587 508 0,000855191539043936 0,000825616341150427 0,000549324788281071 0,000473029678797589 0,000864867942679673 0,000881631344137321 37382 35981 667 665 0 True 586 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 630 509 0,000815156624022619 0,000893031388266959 0,0004272526131075 0,000488288700694286 0,000891388340031405 0,000940588678727448 35632 38919 667 665 0 True 630 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 234 553 0,0008903765100741 0,000944315469378413 0,000732433051041428 0,000793469138628214 0,000673197655532292 0,000716139818351823 38920 41154 667 665 0 True 232 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 278 554 0,000845354388495841 0,000910562054024969 0,000686655985351339 0,00080872816052491 0,00070698192895058 0,000687382524333978 36952 39683 667 665 0 True 276 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 322 554 0,000890490895545589 0,000869190600671971 0,00080872816052491 0,000732433051041428 0,000704185953666865 0,000702059666263312 38925 37880 667 665 0 True 320 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 367 554 0,000937160167913297 0,000872104729665776 0,00080872816052491 0,000747692072938125 0,000725800147397866 0,000680625674726799 40965 38007 667 665 0 True 365 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 410 554 0,000929130307814735 0,000884816756930091 0,000717174029144732 0,000671396963454643 0,000833676912440081 0,000790573749150309 40614 38561 667 665 0 True 409 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 454 554 0,000891657627354782 0,000969395335443209 0,000534065766384375 0,000625619897764553 0,000950380623074157 0,0010117343784468 38976 42247 667 665 0 True 453 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 499 553 0,000889301286642099 0,000846749512829912 0,000488288700694286 0,000457770656900893 0,000974864867028228 0,00102964907571289 38873 36902 667 665 0 True 497 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 542 554 0,00079481888719179 0,000857855327262996 0,000411993591210803 0,000473029678797589 0,000880079404451174 0,000905061206568774 34743 37386 667 665 0 True 542 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 587 554 0,000833115143046467 0,000824446100373387 0,000579842832074464 0,000595101853971161 0,000818231777232571 0,000749810490031817 36417 35930 667 665 0 True 586 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 630 553 0,000862786734350838 0,000855996709558286 0,000610360875867857 0,000579842832074464 0,000855019302135647 0,000837585290087947 37714 37305 667 665 0 True 630 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 232 592 0,000838537014395068 0,000892756037495891 0,000747692072938125 0,000793469138628214 0,000625978730670029 0,000641516230907137 36654 38907 667 665 0 False 232 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 276 592 0,000889438549207886 0,000909460650940696 0,000762951094834821 0,000762951094834821 0,000670935403556356 0,000689949846399106 38879 39635 667 665 0 False 276 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 322 598 0,000943657262693899 0,000906707143230014 0,000839246204318303 0,000747692072938125 0,000743548115563319 0,000746112547511555 41249 39515 667 665 0 True 320 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 365 597 0,000845034109175671 0,000913545020711541 0,000747692072938125 0,000732433051041428 0,000669679253007639 0,000709640087109652 36938 39813 667 665 0 True 365 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 409 592 0,000899801872924833 0,000857511138799161 0,000701915007248035 0,000610360875867857 0,000792590598329586 0,000765434661836392 39332 37371 667 665 0 False 409 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 453 592 0,000956445558406423 0,000924123079500078 0,000488288700694286 0,000503547722590982 0,00103508703275399 0,000990878350613235 41808 40274 667 665 0 False 453 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 497 592 0,000927826313439755 0,000836790993276278 0,000488288700694286 0,000259403372243839 0,00103560014498017 0,00104910343275316 40557 36468 667 665 0 False 497 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 542 592 0,000832588969877616 0,000845349813076982 0,000381475547417411 0,000457770656900893 0,000928892651700282 0,00088093849381918 36394 36841 667 665 0 False 542 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 586 592 0,000829958104033358 0,000791426953742791 0,000534065766384375 0,000411993591210803 0,000808221656185513 0,000846440011231275 36279 34491 667 665 0 False 586 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 630 592 0,000890879806148654 0,000894063953658465 0,000701915007248035 0,000686655985351339 0,000760910874615794 0,000779378032920695 38942 38964 667 665 0 False 630 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 233 641 0,00101931181353704 0,0723389843342621 0,000885023270008392 0,072480354009308 0,000756246668470456 0,0213617509031797 44556 3152589 667 665 0 True 232 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 276 635 0,000909822040227311 0,000958518979986014 0,00080872816052491 0,000793469138628214 0,000679758544403973 0,000707084640500144 39770 41773 667 665 0 False 276 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 320 635 0,000894791789273594 0,00080592876101905 0,000793469138628214 0,000717174029144732 0,000646798439598226 0,000605881929190103 39113 35123 667 665 0 False 320 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 365 635 0,000883238856653157 0,000846542999751611 0,000762951094834821 0,000778210116731518 0,000671619166883028 0,00061722382544316 38608 36893 667 665 0 False 365 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 409 635 0,000886258633100479 0,000884059542309654 0,000732433051041428 0,000671396963454643 0,000701069444983116 0,00074383243272644 38740 38528 667 665 0 False 409 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 453 635 0,000943199720807941 0,00080849870154902 0,000701915007248035 0,000442511635004196 0,000878714230765377 0,000863449488910386 41229 35235 667 665 0 False 453 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 497 635 0,000859652572432026 0,000862788695244635 0,000534065766384375 0,000503547722590982 0,000901622144730213 0,000891326970574212 37577 37601 667 665 0 False 497 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 542 635 0,000880058940545749 0,000833555621716227 0,000518806744487678 0,000442511635004196 0,000920511294435758 0,000913711751852491 38469 36327 667 665 0 False 542 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 586 635 0,000867339276116119 0,000965723991828966 0,000625619897764553 0,000793469138628214 0,000773915349528549 0,00072164663182683 37913 42087 667 665 0 False 586 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 631 640 0,00100423580839473 0,0765633929180929 0,000854505226215 0,0764324406805524 0,000755381853200259 0,0221069447421679 43897 3336692 667 665 0 True 630 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C1_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C1_1.csv new file mode 100755 index 0000000..1e40880 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C1_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 255 278 0,01005562679864 0,045859877434488 0,0100556954299229 0,0449225604638743 0,00143058775524274 0,00851943169141567 439550 1998609 667 665 0 True 255 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 299 277 0,00977533663930223 0,00979179466175165 0,00975051499198901 0,0098268101014725 0,00130317141002658 0,00130609478027463 427298 426734 667 665 0 False 299 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 343 279 0,00992168141152587 0,0613027648085652 0,00993362325474937 0,0611123826962692 0,00132879445124552 0,00874070163508803 433695 2671622 667 665 0 True 344 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 387 278 0,0101200258190886 0,0871828919976756 0,0101167315175097 0,0869153887235828 0,00136677911817228 0,0140290048721866 442365 3799498 667 665 0 True 388 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 432 278 0,00999125065528577 0,0737082348810915 0,00990310521095598 0,0707103074692912 0,00159269020994865 0,0132533716028011 436736 3212262 667 665 0 True 432 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 476 277 0,0100341909612829 0,0685964395998006 0,0100709544518196 0,0710765239948119 0,00169043370881851 0,0215616285983564 438613 2989486 667 665 0 True 477 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 520 276 0,0101353534722682 0,0824866010299266 0,0102235446707866 0,0806286717021439 0,00148451051092184 0,0229094475426398 443035 3594830 667 665 0 True 521 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 564 276 0,0097746045722847 0,0688390236291117 0,0098268101014725 0,0665140764476997 0,00166330554432495 0,0185004789651367 427266 3000058 667 665 0 True 565 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 610 277 0,00973665147284449 0,00977901379679457 0,00967421988250553 0,00968947890440223 0,00192695272795991 0,00190463210665452 425607 426177 667 665 0 False 610 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 652 275 0,00971281354058608 0,0434147625874024 0,00976577401388571 0,0436713206683452 0,00180798745837856 0,00961009250147564 424565 1892049 667 665 0 True 654 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 255 321 0,0100338249277742 0,0100731343120906 0,00997940032043946 0,0101319905394064 0,00150464053747596 0,00147750939660023 438597 438995 667 665 0 False 255 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 299 321 0,0100449431956029 0,0100170086465879 0,0098268101014725 0,0100404364080262 0,00226693124262723 0,0012690584885391 439083 436549 667 665 0 False 299 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 343 322 0,010182182884296 0,107580808280716 0,0101319905394064 0,1006942854963 0,00140661938698436 0,028403667066025 445082 4688455 667 665 0 True 344 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 388 323 0,00999754185621769 0,0519756016270936 0,0100251773861295 0,0506599526970321 0,00139147876892322 0,00672732256332846 437011 2265137 667 665 0 True 388 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 431 322 0,0102719754794152 0,0790377178928094 0,01025406271458 0,0754253452353704 0,00165704598861953 0,0203792479806156 449007 3444525 667 665 0 True 432 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 477 321 0,0101149013499659 0,0413326977319701 0,0100862134737163 0,0420996414129854 0,00175951724016315 0,00648452287591429 442141 1801311 667 665 0 True 477 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 521 321 0,0100806085856134 0,0430731899558923 0,010101472495613 0,0452735179674983 0,00162417331219208 0,00785795095333552 440642 1877163 667 665 0 True 521 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 564 321 0,00998209981756661 0,0498035888531124 0,00997940032043946 0,0504005493247883 0,00178327970405736 0,00812234513912449 436336 2170479 667 665 0 True 565 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 610 321 0,00975751538284417 0,00968947890440223 0,0098115510795758 0,0098115510795758 0,00203472462318183 0,00215735991959396 426519 422275 667 665 0 False 610 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 654 321 0,00969231566409517 0,00961421636031025 0,0098268101014725 0,00958266575112535 0,00188774810408759 0,00185892950339031 423669 418995 667 665 0 False 654 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 255 368 0,0101877648953047 0,0533693354466505 0,0102388036926833 0,0522163729304952 0,00146334024994788 0,0109285267535639 445326 2325877 667 665 0 True 255 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 300 366 0,0102061809562145 0,0668569111035772 0,0101319905394064 0,0677805752651255 0,00166743016401365 0,0197321074959559 446131 2913676 667 665 0 True 299 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 343 367 0,010144938974779 0,0404059588201449 0,0100404364080262 0,0411993591210803 0,00164905005338317 0,00706283969439475 443454 1760923 667 665 0 True 344 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 388 368 0,00998704126993496 0,0355240355409008 0,0100404364080262 0,0362706950484474 0,00138741380300215 0,00498736653441201 436552 1548165 667 665 0 True 388 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 432 367 0,0101718195605791 0,0705670791765406 0,0102998397802701 0,0662088960097658 0,00162583039147716 0,0127954937683615 444629 3075368 667 665 0 True 432 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 477 365 0,010300137182496 0,032006062306143 0,0102693217364767 0,0325627527275502 0,00174203662103498 0,00444165452206586 450238 1394849 667 665 0 True 477 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 521 365 0,0101624628290112 0,0293814646481161 0,0101319905394064 0,0291599908445869 0,00173439303450946 0,00341675721862703 444220 1280467 667 665 0 True 521 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 565 365 0,0100949296466438 0,0491013296574005 0,0101777676050965 0,0485236896314946 0,00184467941610872 0,00747228127179062 441268 2139874 667 665 0 True 565 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 609 365 0,00993780976300588 0,0545346658016063 0,00991836423285267 0,05468833447776 0,00197304425238616 0,0103036718257005 434400 2376663 667 665 0 True 610 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 653 364 0,00976543085747124 0,0599617377157703 0,0098268101014725 0,0591134508278019 0,00187432640649792 0,0156984816711432 426865 2613179 667 665 0 True 654 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 255 412 0,0100049311576759 0,048411277679206 0,0100862134737163 0,0513313496604868 0,00155891528521277 0,0107663138832595 437334 2109801 667 665 0 True 255 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 300 412 0,00984840607848971 0,0338906318210266 0,0098115510795758 0,0337071793698024 0,00137887888116751 0,00417176586279142 430492 1476980 667 665 0 True 299 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 344 411 0,0100152029730157 0,0907881743727595 0,00996414129854276 0,0853131914244297 0,00135813365866003 0,0194585911807465 437783 3956619 667 665 0 True 344 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 388 411 0,0101073290317533 0,0685270970972866 0,0101319905394064 0,0652018005645838 0,00141839723479954 0,0167157391844508 441810 2986464 667 665 0 True 388 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 433 411 0,0103560030467714 0,0426855878538186 0,0103913939116503 0,0433966582742046 0,00155368008143293 0,0062804416840377 452680 1860271 667 665 0 True 432 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 477 409 0,0104277227373953 0,0525406214093256 0,0104219119554437 0,0524452582589456 0,00171611874651981 0,00920462211703291 455815 2289761 667 665 0 True 477 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 521 409 0,0103417048628352 0,0411190025877236 0,0103761348897536 0,0414587624933242 0,00167913566834155 0,00470627025538505 452055 1791998 667 665 0 True 521 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 565 409 0,010138945176073 0,0511919303867359 0,0101472495613031 0,0503395132372015 0,00182262712345063 0,0075822735507164 443192 2230984 667 665 0 True 565 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 609 409 0,0100333673858882 0,0397379578495334 0,0100404364080262 0,0403143358510719 0,00186078965645159 0,00579904808991336 438577 1731811 667 665 0 True 610 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 653 409 0,0101208265173891 0,087766199660286 0,00999465934233616 0,0831311512932021 0,00210357513552974 0,0176217575980493 442400 3824919 667 665 0 True 654 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 256 456 0,00984762825728358 0,0504212465244136 0,00988784618905928 0,0495002670328832 0,00154454664083045 0,00804142066980515 430458 2197397 667 665 0 True 255 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 299 456 0,0100129381406802 0,0662197035275302 0,010101472495613 0,0666819256885634 0,00156225259520512 0,0125850816468713 437684 2885906 667 665 0 True 299 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 345 455 0,0101964581911379 0,0368752276663276 0,0101777676050965 0,0369268329900053 0,00150015810283495 0,00373075008393999 445706 1607051 667 665 0 True 344 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 388 455 0,0104232617040072 0,0536779807151204 0,0104371709773404 0,0529488059815366 0,00145446775237481 0,00776061988746549 455620 2339328 667 665 0 True 388 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 432 454 0,0106364762228636 0,0967479582453502 0,0106813153276875 0,0953078507667658 0,00173888887150759 0,0172861030474062 464940 4216351 667 665 0 True 432 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 477 454 0,0106138965307916 0,0621943735511817 0,0106507972838941 0,0601052872510872 0,0018719539846285 0,0126404569179793 463953 2710479 667 665 0 True 477 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 520 453 0,0105155250253106 0,0537702691152234 0,0106202792401007 0,0532234683756771 0,00176432569872497 0,0102803494645553 459653 2343350 667 665 0 True 521 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 566 453 0,0101477071031891 0,0311118147853038 0,0101319905394064 0,0311741817349508 0,00190111784530688 0,00411471934162388 443575 1355877 667 665 0 True 565 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 609 453 0,0100213111571932 0,0411168686192478 0,0100556954299229 0,0403906309605554 0,0018786470851345 0,0062582613724868 438050 1791905 667 665 0 True 610 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 653 453 0,00996718395208438 0,0679834858375052 0,00996414129854276 0,0685435263599603 0,00197729841517314 0,0110017421855128 435684 2962773 667 665 0 True 654 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 257 500 0,00970986239542165 0,0563114125437191 0,00968947890440223 0,0566414892805371 0,00146531961479165 0,0135801278868487 424436 2454095 667 665 0 True 255 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 301 500 0,0100561300947146 0,0584220450416497 0,0100404364080262 0,0576333257038224 0,00150379727855764 0,00625426396329577 439572 2546078 667 665 0 True 299 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 345 500 0,0101671755104366 0,0769238041315236 0,0101625085831998 0,0749217975127794 0,00160800394353795 0,016849802040952 444426 3352399 667 665 0 True 344 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 390 499 0,0105673645209897 0,0943413695603165 0,0105592431525139 0,0853437094682231 0,00153771458785061 0,0226984253506979 461919 4111470 667 665 0 True 388 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 433 499 0,0105662206662748 0,102024137936969 0,010605020218204 0,0965743495841917 0,00182086020597997 0,0305029860189815 461869 4446291 667 665 0 True 432 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 479 498 0,0103952601405866 0,0461049625666363 0,0104371709773404 0,0473945220111391 0,00178953878683171 0,00599756839344857 454396 2009290 667 665 0 True 477 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 523 497 0,0105783455262527 0,0422172850299243 0,0105745021744106 0,0437323567559319 0,00186992952429704 0,00735373537938638 462399 1839862 667 665 0 True 521 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 565 497 0,0105825549116035 0,11205043967208 0,0106813153276875 0,113786526283665 0,00191137952300589 0,0214467982504698 462583 4883245 667 665 0 True 565 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 610 497 0,0101212383050864 0,0620078922414757 0,0101167315175097 0,0637521934843976 0,00178362866701503 0,015259426002348 442418 2702352 667 665 0 True 610 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 654 498 0,00999111339271998 0,0744269233394771 0,00997940032043946 0,0717174029144732 0,00188315669630977 0,0102298531739681 436730 3243583 667 665 0 True 654 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 258 544 0,00961503683955688 0,0530904510073536 0,00959792477302205 0,0544289311055161 0,00137310061627615 0,0111486023744304 420291 2313723 667 665 0 True 255 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 301 544 0,00997795906349869 0,10608941672102 0,0100099183642329 0,0993362325474937 0,00137446259409645 0,0244218126681455 436155 4623459 667 665 0 True 299 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 345 544 0,0101222220201412 0,0599945503493226 0,010101472495613 0,0616464484626535 0,00151979133684553 0,0127971815775137 442461 2614609 667 665 0 True 344 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 390 544 0,0105351078180296 0,0620634901513339 0,0105134660868238 0,0601510643167773 0,00160338878507594 0,0100613785607297 460509 2704775 667 665 0 True 388 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 434 544 0,0107193828125992 0,0590850667524843 0,0108186465247578 0,0588387884336614 0,00194544705791705 0,00745985225788592 468564 2574973 667 665 0 True 432 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 478 542 0,0104352950556079 0,0642307990163094 0,010452429999237 0,061875333791104 0,00192480757912257 0,0141385022110762 456146 2799228 667 665 0 True 477 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 522 542 0,0102700080493056 0,0782892456593532 0,0103150988021668 0,0747692072938125 0,00183310295698273 0,0203345836757284 448921 3411906 667 665 0 True 521 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 566 542 0,0101426283882549 0,0583380630564739 0,0102082856488899 0,057099259937438 0,0016893842952765 0,0120641731983198 443353 2542418 667 665 0 True 565 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 611 542 0,010002483308586 0,0414720252221306 0,0100556954299229 0,0408484016174563 0,00180239717681336 0,00452993526761567 437227 1807383 667 665 0 True 610 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 655 541 0,0100820269654598 0,0609710359671208 0,00996414129854276 0,0610055695429923 0,00172798813364721 0,0128837934071986 440704 2657165 667 665 0 True 654 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 256 588 0,00956141293052261 0,0467358600208464 0,00955214770733196 0,0469367513542382 0,00130405602769307 0,00890192199418149 417947 2036785 667 665 0 True 255 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 302 588 0,00968055683762605 0,0549920234323506 0,00968947890440223 0,0556343938353552 0,00135845194948777 0,0104666573522844 423155 2396595 667 665 0 True 299 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 345 587 0,00985911255862112 0,0519339318770719 0,00987258716716258 0,0503089951934081 0,00150158950759128 0,00910527560002961 430960 2263321 667 665 0 True 344 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 390 588 0,0100728532506464 0,0529718895545111 0,010101472495613 0,0512550545510033 0,00145008569494047 0,00673542985841247 440303 2308556 667 665 0 True 388 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 433 587 0,0104148200562113 0,101635090243347 0,0104676890211337 0,0983596551461051 0,001839847780062 0,0231406631093793 455251 4429336 667 665 0 True 432 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 478 586 0,0104464590776253 0,0672820526941065 0,0105287251087205 0,0644235904478523 0,00195803483092655 0,0128586285504334 456634 2932204 667 665 0 True 477 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 522 586 0,0100254519112611 0,0588491370334741 0,0101319905394064 0,0564278629739834 0,00194428011334602 0,00914245048855155 438231 2564691 667 665 0 True 521 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 567 586 0,00996636037668966 0,0373760448271055 0,00994888227664607 0,0385748073548486 0,00170782276894984 0,00669545387608264 435648 1628877 667 665 0 True 565 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 611 586 0,0101287877462047 0,0474824736365978 0,0101319905394064 0,0466773479819944 0,00153850082517002 0,00630223002468671 442748 2069323 667 665 0 True 610 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 655 585 0,010057159563958 0,0496457899153927 0,0101167315175097 0,0488441290913252 0,00162400768493705 0,00725864767799426 439617 2163602 667 665 0 True 654 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 255 625 0,00979354680636335 0,00939028734573903 0,00944533455405508 0,009399557488365 0,00264130209960753 0,00129564472152715 428094 409236 667 665 0 False 255 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 299 625 0,00987146618954199 0,0104675283998506 0,00964370183871214 0,00959792477302205 0,00234180291929046 0,00473764726993505 431500 456183 667 665 0 False 299 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 346 632 0,00983939250333634 0,0783820159233056 0,00987258716716258 0,0753795681696803 0,00151583076675566 0,0115500336926988 430098 3415949 667 665 0 True 344 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 390 632 0,00990360850703053 0,0810356860335779 0,00991836423285267 0,0761730373083085 0,00134384836459391 0,01995030028945 432905 3531598 667 665 0 True 388 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 432 625 0,0103791089120123 0,0100073025319077 0,0101777676050965 0,00999465934233616 0,00258197237490664 0,00178709204144066 453690 436126 667 665 0 False 432 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 477 625 0,0101542499521583 0,00978844456070366 0,0101167315175097 0,00973525597009232 0,00201395739322195 0,00188825227759625 443861 426588 667 665 0 False 477 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 521 625 0,00983136264323778 0,00995792296029614 0,00968947890440223 0,0100099183642329 0,0021420880988986 0,0017241449489831 429747 433974 667 665 0 False 521 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 566 625 0,00960375843206801 0,00966871286708417 0,00959792477302205 0,00961318379491875 0,00166254551614737 0,00176726526880321 419798 421370 667 665 0 False 566 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 610 625 0,009774627449379 0,00980051410283548 0,00970473792629892 0,0097962920576791 0,00152201642424816 0,00137042809658764 427267 427114 667 665 0 False 610 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 654 625 0,00970329666935816 0,00969585786393198 0,00975051499198901 0,00973525597009232 0,00152042783826355 0,00147178798810165 424149 422553 667 665 0 False 654 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 258 676 0,00938690645521826 0,0438350396476428 0,00932326237888151 0,0432745860990311 0,00130650835813794 0,00844732063718674 410319 1910365 667 665 0 True 255 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 299 668 0,00941216276732314 0,00921048329223149 0,0093690394445716 0,00924696726939803 0,00127437503136136 0,00122184878511187 411423 401400 667 665 0 False 299 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 344 668 0,0108404255185294 0,00942642713444173 0,00956740672922866 0,00943007553215839 0,00698477650503447 0,00130071263185496 473855 410811 667 665 0 False 344 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 388 668 0,0105206037402448 0,00953817365570025 0,00965896086060884 0,00955214770733196 0,0047634040807957 0,00132772825419292 459875 415681 667 665 0 False 388 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 432 668 0,00965010742511555 0,00973433813418876 0,00965896086060884 0,00971999694819562 0,00149838019838849 0,00152593702045455 421824 424230 667 665 0 False 432 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 477 668 0,00983600669338025 0,00963970925253165 0,00985732814526589 0,00967421988250553 0,00157789936873669 0,00148998967772224 429950 420106 667 665 0 False 477 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 521 668 0,00992440378574732 0,00952805451486349 0,00984206912336919 0,00955214770733196 0,00196437733284318 0,00172416663153006 433814 415240 667 665 0 False 521 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 566 668 0,00955242223246353 0,00953799008851954 0,00950637064164187 0,00961318379491875 0,00143888293991492 0,00154334923490577 417554 415673 667 665 0 False 566 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 610 668 0,00958092709195871 0,00961472117005721 0,00953688868543526 0,00958266575112535 0,00128770723806178 0,00143228929183587 418800 419017 667 665 0 False 610 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 657 673 0,00953551605977739 0,0418605681060055 0,00949111161974517 0,0418097199969482 0,00140358040851567 0,00854008744916486 416815 1824316 667 665 0 True 654 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C1_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C1_2.csv new file mode 100755 index 0000000..3ea49ed --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C1_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 255 278 0,00835620184872087 0,741745138768184 0,00827038986800946 0,742946517128252 0,00190158740723743 0,173013853290372 365265 32325828 667 665 12 True 255 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 299 277 0,00693230862252554 0,00660068573814945 0,0068055237659266 0,00663767452506294 0,00152886970924683 0,00124226999562417 303024 287663 667 665 0 False 299 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 343 279 0,00630529322200882 0,00641741685410597 0,00630197604333562 0,00646982528419928 0,00125863867429379 0,00127886713956641 275616 279676 667 665 0 True 344 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 387 278 0,00645106606687501 0,00650796136599223 0,00643930724040589 0,00646982528419928 0,00122793530572929 0,00119893616026758 281988 283622 667 665 0 True 388 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 432 278 0,00641048210159054 0,00656367400533836 0,0064087891966125 0,00653086137178607 0,00159295079906044 0,00159754300716128 280214 286050 667 665 0 True 432 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 476 277 0,00665533564186092 0,00673296883775013 0,00657663843747616 0,0068207827878233 0,00160309834564828 0,00171871289820723 290917 293428 667 665 0 True 477 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 520 276 0,0068741092946317 0,00689820224628864 0,00689707789730678 0,00695811398489357 0,00157223328664665 0,00148177824395012 300480 300629 667 665 0 True 521 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 564 276 0,00702882708336836 0,00717685722660967 0,00695811398489357 0,00706492713817044 0,00162745687483998 0,00158993454581858 307243 312773 667 665 0 True 565 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 610 277 0,00809645532006256 0,0077020199847295 0,00814831769283589 0,007690547035935 0,00207275729861225 0,00169501123548083 353911 335660 667 665 0 False 610 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 652 275 0,00907175160417045 0,721189928357171 0,00903334096284428 0,736156252384222 0,00192349142355364 0,20191792080955 396543 31430016 667 665 11 True 654 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 255 321 0,00694564596850122 0,00676080221152561 0,00686655985351339 0,00672922865644312 0,00155863008180277 0,00150604395282195 303607 294641 667 665 0 False 255 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 299 321 0,00649640846777344 0,00643655373269521 0,00643930724040589 0,00645456626230259 0,00143639235474918 0,00128340510836634 283970 280510 667 665 0 False 299 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 343 322 0,00637664687912395 0,00650837439214883 0,0063935301747158 0,00650034332799268 0,00129700211782765 0,00126002018322053 278735 283640 667 665 0 True 344 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 388 323 0,00657435072804637 0,00659820758120983 0,00665293354695964 0,00654612039368277 0,00127264912415598 0,00135507241930531 287377 287555 667 665 0 True 388 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 431 322 0,00676224030351498 0,00684659692261095 0,00674448767833982 0,00691233691920348 0,00156911583957018 0,00164803340745867 295590 298380 667 665 0 True 432 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 477 321 0,00686182429499373 0,00691768331334172 0,00691233691920348 0,00686655985351339 0,0016690643550802 0,00159409267283095 299943 301478 667 665 0 True 477 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 521 321 0,00681657340247249 0,00698932040561463 0,00679026474402991 0,00703440909437705 0,00153627614552817 0,00172401843672692 297965 304600 667 665 0 True 521 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 564 321 0,00710281160632776 0,00715583878441813 0,00709544518196384 0,00715648126955062 0,00170007365465483 0,00142390072897937 310477 311857 667 665 0 True 565 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 610 321 0,00756190913469793 0,00748915089279619 0,00761425192645151 0,00749217975127794 0,00196257901121269 0,00200130674173703 330545 326383 667 665 0 False 610 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 654 321 0,00761718019452165 0,00764763820744353 0,0076600289921416 0,00762951094834821 0,00189235516805119 0,00171401838182118 332961 333290 667 665 0 False 654 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 255 368 0,00643518936343227 0,00656695526869359 0,00642404821850919 0,00651560234988937 0,00134108374009556 0,00144576437064878 281294 286193 667 665 0 True 255 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 300 366 0,00636932620894863 0,00642553970185248 0,00625619897764553 0,0063935301747158 0,00151744531908476 0,00128459080058728 278415 280030 667 665 0 True 299 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 343 367 0,00670962298662983 0,00673342775570191 0,00660715648126955 0,00656137941557946 0,00147116068386314 0,00219471595355445 293290 293448 667 665 0 True 344 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 388 368 0,00700050524062757 0,00694081277811145 0,00692759594110018 0,00694285496299687 0,00130688939739747 0,00127663710678311 306005 302486 667 665 0 True 388 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 432 367 0,00708297716557148 0,00704774066087627 0,00709544518196384 0,00704966811627375 0,00155656978922428 0,00157975998662944 309610 307146 667 665 0 True 432 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 477 365 0,00725505866888025 0,0071011587104635 0,00729381246662089 0,00703440909437705 0,00166309955005457 0,00163124279236036 317132 309474 667 665 0 True 477 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 521 365 0,007065430434245 0,00717681133481449 0,00712596322575723 0,00715648126955062 0,00161016294083049 0,00182646329444835 308843 312771 667 665 0 True 521 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 565 365 0,00726318003735601 0,00716276844549001 0,0072327763790341 0,0072327763790341 0,0018192043424536 0,00170957223790362 317487 312159 667 665 0 True 565 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 609 365 0,00704861576993604 0,00733194854841384 0,00706492713817044 0,00746166170748455 0,00202673482346338 0,00203089302820755 308108 319532 667 665 0 True 610 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 653 364 0,00684544429547643 0,00654717590497186 0,00688181887541009 0,00663767452506294 0,00192411065409797 0,0018995038751386 299227 285331 667 665 0 True 654 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 255 412 0,00635040685196427 0,00634770721723053 0,0063935301747158 0,00631723506523232 0,00152245045882885 0,00150931253019374 277588 276638 667 665 0 True 255 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 300 412 0,00637868294051647 0,00642335984158152 0,00642404821850919 0,0064087891966125 0,00132401960475069 0,00126784218810086 278824 279935 667 665 0 True 299 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 344 411 0,00670651170180531 0,0067261309602686 0,00677500572213321 0,00672922865644312 0,00128915096566802 0,00118052258541397 293154 293130 667 665 0 True 344 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 388 411 0,00689492745044278 0,00702690578586544 0,00691233691920348 0,00704966811627375 0,00128551734442521 0,00138777613158242 301390 306238 667 665 0 True 388 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 433 411 0,00709750412045065 0,00725092658402702 0,00709544518196384 0,00730907148851759 0,00163101287589582 0,00149098049342786 310245 316001 667 665 0 True 432 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 477 409 0,00721113464782829 0,00722515834103455 0,00721751735713741 0,00721751735713741 0,00164677969420321 0,00168139612525168 315212 314878 667 665 0 True 477 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 521 409 0,00702706554710743 0,00709181973014477 0,00717174029144732 0,00708018616006714 0,00163790676613652 0,00166035122783013 307166 309067 667 665 0 True 521 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 565 409 0,00689696351183529 0,00711444438516754 0,00694285496299687 0,00708018616006714 0,0017517756966382 0,00147758968349539 301479 310053 667 665 0 True 565 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 609 409 0,00650848757356273 0,00654196718621915 0,00645456626230259 0,00660715648126955 0,00178978239198917 0,00171997575683433 284498 285104 667 665 0 True 610 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 653 409 0,00635033822068137 0,00630176953025732 0,00636301213092241 0,00625619897764553 0,00185265126653999 0,00176689310876211 277585 274636 667 665 0 True 654 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 256 456 0,00639380469984737 0,00662978113629232 0,0064087891966125 0,00657663843747616 0,00145764389430734 0,00147306258868523 279485 288931 667 665 0 True 255 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 299 456 0,00658208318591906 0,00632473837374393 0,00653086137178607 0,00633249408712902 0,00142951028685525 0,00154775022919788 287715 275637 667 665 0 True 299 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 345 455 0,0064978954789028 0,00661782632364844 0,00650034332799268 0,00659189745937285 0,00133612818535869 0,00143705651615517 284035 288410 667 665 0 True 344 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 388 455 0,00674277189626748 0,00696960987958567 0,00675974670023652 0,00698863202868696 0,00148831927721011 0,00137489936256105 294739 303741 667 665 0 True 388 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 432 454 0,00690389527140756 0,00696488302468233 0,00689707789730678 0,00697337300679027 0,00182308303593263 0,00195627296794171 301782 303535 667 665 0 True 432 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 477 454 0,00699165180513428 0,00705177913885194 0,00698863202868696 0,00704966811627375 0,00170359981683212 0,00178226551257071 305618 307322 667 665 0 True 477 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 520 453 0,00683464630696783 0,00705480799733369 0,00683604180972 0,00712596322575723 0,00170213568446746 0,00176857051795808 298755 307454 667 665 0 True 521 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 566 453 0,00644427156986853 0,00634596332901377 0,00646982528419928 0,00630197604333562 0,00178160143744533 0,00184502035122617 281691 276562 667 665 0 True 565 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 609 453 0,00611438387009288 0,00611758281031028 0,00608834973678187 0,00601205462729839 0,00180742263955442 0,00181564063517682 267271 266609 667 665 0 True 610 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 653 453 0,0061717367454977 0,00598378528146872 0,00616464484626535 0,005981536583505 0,00178367946463412 0,00190748333649836 269778 260778 667 665 0 True 654 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 257 500 0,00639385045403597 0,00660114465610123 0,0063782711528191 0,00663767452506294 0,00140023117454616 0,00139797142139089 279487 287683 667 665 0 True 255 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 301 500 0,00654509092443936 0,00653207750435829 0,00646982528419928 0,00650034332799268 0,00147845922505405 0,00144116640707528 286098 284673 667 665 0 True 299 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 345 500 0,00662124877135705 0,00662535257805764 0,00662241550316625 0,00663767452506294 0,00148470902245161 0,00144928004763918 289427 288738 667 665 0 True 344 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 390 499 0,00672053536060992 0,00684134231206306 0,00674448767833982 0,00683604180972 0,00151836795000624 0,00149766046774871 293767 298151 667 665 0 True 388 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 433 499 0,0067392945779342 0,00704962222447857 0,00679026474402991 0,00698863202868696 0,00178205177592902 0,00184373962804015 294587 307228 667 665 0 True 432 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 479 498 0,00691416708674731 0,00649205985896304 0,00692759594110018 0,00648508430609598 0,00173755718026846 0,0015930634941974 302231 282929 667 665 0 True 477 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 523 497 0,00627363132350053 0,00623270237851438 0,00624093995574884 0,00614938582436866 0,00167530629379392 0,00161242976586917 274232 271626 667 665 0 True 521 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 565 497 0,00623538082183445 0,00616618222140382 0,00619516289005875 0,00616464484626535 0,00165917009728139 0,00166694177772002 272560 268727 667 665 0 True 565 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 610 497 0,00604184060407425 0,00613669674300193 0,00607309071488518 0,00614938582436866 0,00165986993520529 0,00178026959480745 264100 267442 667 665 0 True 610 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 654 498 0,00608292786543327 0,00610636226638925 0,00614938582436866 0,00610360875867857 0,00176019665511533 0,00183748313170278 265896 266120 667 665 0 True 654 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 258 544 0,00658567488972383 0,0064484855994415 0,00659189745937285 0,0064087891966125 0,00134851803817366 0,00142515775891387 287872 281030 667 665 0 True 255 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 301 544 0,00656158530942814 0,00660628453716117 0,00662241550316625 0,00663767452506294 0,00141458764009568 0,00133513026921897 286819 287907 667 665 0 True 299 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 345 544 0,00669596536133398 0,00664609566947811 0,00672922865644312 0,00666819256885634 0,00135861491641666 0,00136688693564108 292693 289642 667 665 0 True 344 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 390 544 0,00676807396256095 0,00671605771122703 0,00674448767833982 0,00671396963454643 0,00136908481330538 0,00144456174165242 295845 292691 667 665 0 True 388 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 434 544 0,006568562823189 0,00646342337877195 0,00651560234988937 0,00643930724040589 0,00179055558348095 0,00185589796358944 287124 281681 667 665 0 True 432 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 478 542 0,00648359729496662 0,00642670994262952 0,00651560234988937 0,00648508430609598 0,00194102504441045 0,001992813533291 283410 280081 667 665 0 True 477 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 522 542 0,0062316061012753 0,00615094614540471 0,00617990386816205 0,00608834973678187 0,00185040037109881 0,00192115572712923 272395 268063 667 665 0 True 521 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 566 542 0,00614760141101342 0,00633265470841214 0,00614938582436866 0,00622568093385214 0,00158676436645659 0,0017075737761093 268723 275982 667 665 0 True 565 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 611 542 0,00648899628922092 0,00653148091102097 0,00654612039368277 0,00650034332799268 0,00163619261026126 0,00162328036084528 283646 284647 667 665 0 True 610 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 655 541 0,00624604154777727 0,00634456362926084 0,00624093995574884 0,0063782711528191 0,00175412350356587 0,00183129715400349 273026 276501 667 665 0 True 654 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 256 588 0,00663081139677357 0,00676674519900116 0,00662241550316625 0,00683604180972 0,00131201025149938 0,00125114844412583 289845 294900 667 665 0 True 255 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 302 588 0,00662781449742055 0,00680075101922809 0,00666819256885634 0,00683604180972 0,00138114214693365 0,00138091798933392 289714 296382 667 665 0 True 299 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 345 587 0,00650734371884783 0,00656486719201299 0,00646982528419928 0,00654612039368277 0,00145456949188917 0,00144229501411639 284448 286102 667 665 0 True 344 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 390 588 0,00630161000982686 0,00639366785010133 0,00627145799954223 0,0063935301747158 0,00139851939860144 0,00125178477425355 275455 278641 667 665 0 True 388 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 433 587 0,00631668601496917 0,00638251614387307 0,00642404821850919 0,0063935301747158 0,00176255056151433 0,0019071578599284 276114 278155 667 665 0 True 432 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 478 586 0,00631606833342313 0,00646718650597655 0,00633249408712902 0,00653086137178607 0,00188075276874405 0,00172717811558662 276087 281845 667 665 0 True 477 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 522 586 0,00646586754688575 0,00648581857481883 0,00646982528419928 0,00656137941557946 0,00188706166605976 0,00195226925430014 282635 282657 667 665 0 True 521 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 567 586 0,00635678956127338 0,00654476658572501 0,00633249408712902 0,00650034332799268 0,00164164974757106 0,0017086830082419 277867 285226 667 665 0 True 565 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 611 586 0,00633576551161361 0,00645899482053727 0,00634775310902571 0,00646982528419928 0,00147193502839745 0,00152707553438551 276948 281488 667 665 0 True 610 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 655 585 0,00614389532173716 0,00621494225378048 0,00614938582436866 0,00625619897764553 0,00154044558617284 0,00147262239145713 268561 270852 667 665 0 True 654 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 255 625 0,00691149046671446 0,0066647047924228 0,00689707789730678 0,00665293354695964 0,00143218197551635 0,0012931161667319 302114 290453 667 665 0 False 255 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 299 625 0,00658608667742119 0,00722871495516085 0,00654612039368277 0,00671396963454643 0,00135699148334099 0,00302566593713054 287890 315033 667 665 0 False 299 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 346 632 0,00652779584115015 0,00631344899213013 0,00630197604333562 0,0064087891966125 0,00221646419223297 0,00125946517612532 285342 275145 667 665 0 True 344 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 390 632 0,00625619897764553 0,00620145006599814 0,00633249408712902 0,00621042191195544 0,0012435936178743 0,00125853033654983 273470 270264 667 665 0 True 388 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 432 625 0,00613037495900711 0,00605383910680799 0,00617990386816205 0,00608834973678187 0,00164663208468349 0,00167214132515501 267970 263831 667 665 0 False 432 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 477 625 0,00622227224680175 0,00621267060991917 0,00622568093385214 0,00617990386816205 0,00176827718876689 0,00188539356728035 271987 270753 667 665 0 False 477 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 521 625 0,00622886084995955 0,00603734100644149 0,00631723506523232 0,005981536583505 0,00190504880270103 0,00179029381980517 272275 263112 667 665 0 False 521 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 566 625 0,00621357895096855 0,00620379054755222 0,00627145799954223 0,00621042191195544 0,00169563686015811 0,00166252911482116 271607 270366 667 665 0 False 566 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 610 625 0,00632787291408084 0,00640337396478149 0,00628671702143893 0,00631723506523232 0,00135849882788125 0,00129520681990291 276603 279064 667 665 0 False 610 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 654 625 0,00631652587530908 0,0068462756800447 0,00631723506523232 0,00677500572213321 0,00143072373392448 0,00164380088120899 276107 298366 667 665 0 False 654 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 258 676 0,00855781768076822 0,746799821710376 0,0081177996490425 0,746623941405356 0,00214506708208787 0,18635360105418 374078 32546115 667 665 14 True 255 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 299 668 0,00756696497253776 0,0066764072001932 0,00692759594110018 0,00669871061264973 0,0030371990931166 0,00126025295165562 330766 290963 667 665 0 False 299 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 344 668 0,0062097813533151 0,00604986946652509 0,00621042191195544 0,00602731364919509 0,00117647880060691 0,00128482617633741 271441 263658 667 665 0 False 344 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 388 668 0,00608793794908451 0,00593943086142915 0,00608834973678187 0,0059662775616083 0,00127361078506744 0,00123719354972739 266115 258845 667 665 0 False 388 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 432 668 0,00603069945915118 0,00597632786475229 0,00599679560540169 0,0059662775616083 0,00144814535904809 0,00141039930744146 263613 260453 667 665 0 False 432 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 477 668 0,00604142881637689 0,0058743562958667 0,00605783169298848 0,00590524147402152 0,00162290013686549 0,0013546034107845 264082 256009 667 665 0 False 477 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 521 668 0,00594086110984334 0,00600549210058793 0,005981536583505 0,00605783169298848 0,00171954845148437 0,00160677120847626 259686 261724 667 665 0 False 521 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 566 668 0,00596728415375741 0,00622646109437017 0,005981536583505 0,00619516289005875 0,00148819338193268 0,00149890480291946 260841 271354 667 665 0 False 566 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 610 668 0,00667224181454706 0,0064349016280688 0,00654612039368277 0,0063935301747158 0,00139140850212338 0,00132512439496252 291656 280438 667 665 0 False 610 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 657 673 0,00801059758516256 0,734828097939975 0,00793469138628214 0,741039139391165 0,00166716921148542 0,193361528948891 350158 32024378 667 665 12 True 654 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C1_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C1_3.csv new file mode 100755 index 0000000..ab162ea --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C1_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 255 278 0,000955050055654251 0,073349934690239 0,000793469138628214 0,07177843900206 0,000753805249790634 0,0197373351928518 41747 3196647 667 665 0 True 255 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 299 277 0,000922244302431069 0,000920245222807534 0,000823987182421607 0,00080872816052491 0,000656634476807799 0,000637863126290208 40313 40105 667 665 0 False 299 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 343 279 0,000900899973451132 0,000902783394742292 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,000640168220974577 0,000687453563590896 39380 39344 667 665 0 True 344 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 387 278 0,000907580084986118 0,000911892916085132 0,000762951094834821 0,000793469138628214 0,000679363554068128 0,000663428909820328 39672 39741 667 665 0 True 388 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 432 278 0,000910348213396163 0,00092359532385553 0,000732433051041428 0,000686655985351339 0,000780525500202369 0,000826094603960856 39793 40251 667 665 0 True 432 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 476 277 0,00102640371276939 0,000930708552108126 0,000793469138628214 0,000625619897764553 0,00091650355823826 0,000920140353708332 44866 40561 667 665 0 True 477 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 520 276 0,000966580111180391 0,000950028997878078 0,00080872816052491 0,000762951094834821 0,000809156170428497 0,000832087213037863 42251 41403 667 665 0 True 521 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 564 276 0,000903119051598028 0,000924857348222926 0,000686655985351339 0,000686655985351339 0,000890533880230383 0,000818817513462022 39477 40306 667 665 0 True 565 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 610 277 0,000921191956093366 0,000910171973765955 0,000534065766384375 0,000534065766384375 0,000953828460256233 0,000943057501946859 40267 39666 667 665 0 False 610 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 652 275 0,00110029672735159 0,071586152380264 0,000762951094834821 0,0715037766079194 0,00100243266805807 0,0219971402388786 48096 3119780 667 665 0 True 654 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 255 321 0,00085146257267338 0,000834358728131843 0,000686655985351339 0,000625619897764553 0,000728328092081282 0,0007247215403281 37219 36362 667 665 0 False 255 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 299 321 0,000878983717113748 0,000896771569573969 0,000747692072938125 0,000793469138628214 0,00064560941368259 0,000617900168433426 38422 39082 667 665 0 False 299 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 343 322 0,000863129890765306 0,000850352018751388 0,000717174029144732 0,000747692072938125 0,000640351416332359 0,000651842264833731 37729 37059 667 665 0 True 344 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 388 323 0,00087058782350642 0,000903379988079606 0,000732433051041428 0,000778210116731518 0,000656517978836825 0,000643941325280166 38055 39370 667 665 0 True 388 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 431 322 0,000910988772036504 0,000886675374634802 0,000701915007248035 0,000625619897764553 0,000836369288763833 0,000844986660668389 39821 38642 667 665 0 True 432 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 477 321 0,00100357237266009 0,000978390127298103 0,000778210116731518 0,000839246204318303 0,000876731404917892 0,000814379647274333 43868 42639 667 665 0 True 477 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 521 321 0,000979231144327127 0,000925109753096405 0,000778210116731518 0,000762951094834821 0,000874133799466277 0,000833355240915655 42804 40317 667 665 0 True 521 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 564 321 0,000930937598264269 0,000925408049765063 0,000656137941557946 0,000747692072938125 0,000896555488902972 0,000802383835645229 40693 40330 667 665 0 True 565 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 610 321 0,000936656871838743 0,0009558343099681 0,000503547722590982 0,000488288700694286 0,0010512680259361 0,0011148125677942 40943 41656 667 665 0 False 610 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 654 321 0,000933454078637038 0,000958197737419768 0,000518806744487678 0,000625619897764553 0,000971217284267437 0,000936519463196309 40803 41759 667 665 0 False 654 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 255 368 0,000879990309262855 0,000885665755140885 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000746778867730499 0,000759289048794202 38466 38598 667 665 0 True 255 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 300 366 0,000890902683242952 0,000895968463158354 0,000793469138628214 0,000793469138628214 0,000691266503362022 0,000674991114122244 38943 39047 667 665 0 True 299 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 343 367 0,000855168661949639 0,00088672126642998 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000674874566394426 0,000772506906524006 37381 38644 667 665 0 True 344 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 388 368 0,000913917040106635 0,000960377597690725 0,000747692072938125 0,00080872816052491 0,000705223751394027 0,00069925985197559 39949 41854 667 665 0 True 388 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 432 367 0,000949147765325394 0,000879562146382206 0,000671396963454643 0,000610360875867857 0,000864252806802355 0,000848648048061892 41489 38332 667 665 0 True 432 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 477 365 0,00094615086597237 0,000976049645744024 0,000686655985351339 0,000671396963454643 0,000826547552241241 0,000868771211675028 41358 42537 667 665 0 True 477 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 521 365 0,000971887597057502 0,000938120077029378 0,000717174029144732 0,00064087891966125 0,000891550332280888 0,000905391917241877 42483 40884 667 665 0 True 521 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 565 365 0,000964269524656303 0,000991033316869652 0,000686655985351339 0,000686655985351339 0,000948447010389578 0,000974528614085231 42150 43190 667 665 0 True 565 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 609 365 0,000888340448681587 0,000921920273331532 0,000442511635004196 0,000473029678797589 0,00100216366406562 0,00106350410345979 38831 40178 667 665 0 True 610 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 653 364 0,000927437402836691 0,000826671852439522 0,000518806744487678 0,000442511635004196 0,00099419165746569 0,000883777462519478 40540 36027 667 665 0 True 654 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 255 412 0,000964864329108048 0,000898194215224488 0,000839246204318303 0,000732433051041428 0,000796448780586492 0,000738580783672639 42176 39144 667 665 0 True 255 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 300 412 0,000873676231236636 0,000870429679141777 0,000747692072938125 0,000732433051041428 0,0007425353856638 0,000708656100187852 38190 37934 667 665 0 True 299 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 344 411 0,000833046511763574 0,000907418466055273 0,000717174029144732 0,000762951094834821 0,000668295907147245 0,000660218309959798 36414 39546 667 665 0 True 344 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 388 411 0,000921169078999068 0,000968248040563758 0,000762951094834821 0,000823987182421607 0,000729816401758989 0,000769509947291814 40266 42197 667 665 0 True 388 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 433 411 0,000937571955610659 0,0010218496573317 0,000717174029144732 0,000762951094834821 0,000855945808429494 0,000882247859286343 40983 44533 667 665 0 True 432 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 477 409 0,000903141928692326 0,000921254842301451 0,000610360875867857 0,000701915007248035 0,000847969569434041 0,00080814147772966 39478 40149 667 665 0 True 477 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 521 409 0,000893464917804316 0,000922608650259203 0,00064087891966125 0,000625619897764553 0,000810266770080339 0,000909670781503983 39055 40208 667 665 0 True 521 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 565 409 0,000847184556039673 0,000874858237376458 0,000503547722590982 0,000610360875867857 0,000889902064854234 0,000817649262639799 37032 38127 667 665 0 True 565 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 609 409 0,00087896084001945 0,00088578048462883 0,000473029678797589 0,000518806744487678 0,000970560008673478 0,000943749246172953 38421 38603 667 665 0 True 610 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 653 409 0,000801224473595201 0,000890071367477976 0,0004272526131075 0,000534065766384375 0,000893410718446623 0,000924531967162414 35023 38790 667 665 0 True 654 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 256 456 0,000838331120546387 0,000906294117073411 0,000686655985351339 0,000732433051041428 0,000762719452241576 0,000763986806623075 36645 39497 667 665 0 True 255 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 299 456 0,0009132078501834 0,000842091495619341 0,000747692072938125 0,000686655985351339 0,000814855734572252 0,000766197201228455 39918 36699 667 665 0 True 299 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 345 455 0,000857685142322407 0,000896152030339066 0,000701915007248035 0,000732433051041428 0,000749521643818499 0,000770760296237886 37491 39055 667 665 0 True 344 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 388 455 0,000848900338112015 0,000963727698738721 0,000686655985351339 0,000839246204318303 0,000720912237912488 0,00077058064464412 37107 42000 667 665 0 True 388 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 432 454 0,000990669691476075 0,000910745621205681 0,000686655985351339 0,000473029678797589 0,000965077055149506 0,000983061986825744 43304 39691 667 665 0 True 432 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 477 454 0,000935879050632615 0,000984906762213384 0,000610360875867857 0,000579842832074464 0,000945774109352811 0,00106458457546089 40909 42923 667 665 0 True 477 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 520 453 0,000900396677376578 0,000954319880727224 0,000579842832074464 0,00064087891966125 0,000912525140856761 0,000929096663562803 39358 41590 667 665 0 True 521 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 566 453 0,00083503681896749 0,000876372666617333 0,000518806744487678 0,000457770656900893 0,000918098307913431 0,000966329427466646 36501 38193 667 665 0 True 565 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 609 453 0,000895729750139808 0,000807695595133405 0,000488288700694286 0,000457770656900893 0,000961455383222632 0,000882733225279111 39154 35200 667 665 0 True 610 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 653 453 0,000844599444384011 0,000930869173391249 0,000442511635004196 0,000518806744487678 0,00090878862125723 0,0010010125760934 36919 40568 667 665 0 True 654 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 257 500 0,000856655673079002 0,000848401617456321 0,000717174029144732 0,000701915007248035 0,000721520103664895 0,00073489359427889 37446 36974 667 665 0 True 255 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 301 500 0,00083373282459251 0,00087807066303892 0,000671396963454643 0,000717174029144732 0,000765902917517364 0,000747820357914326 36444 38267 667 665 0 True 299 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 345 500 0,000847207433133971 0,000893375576730795 0,000686655985351339 0,000732433051041428 0,00075433183263968 0,000756445909116078 37033 38934 667 665 0 True 344 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 390 499 0,000832703355349105 0,000916069069446333 0,000564583810177768 0,000732433051041428 0,000809961367720183 0,000775189614918189 36399 39923 667 665 0 True 388 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 433 499 0,000867842572190673 0,000850558531829689 0,000534065766384375 0,000457770656900893 0,000915912118597389 0,000957438248883806 37935 37068 667 665 0 True 432 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 479 498 0,000915243911575913 0,000857694705979873 0,000610360875867857 0,000549324788281071 0,000936227713320081 0,000847730214385221 40007 37379 667 665 0 True 477 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 523 497 0,000844096148309457 0,000888992910291292 0,000564583810177768 0,000671396963454643 0,000854291669978719 0,000804925569869958 36897 38743 667 665 0 True 521 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 565 497 0,000891657627354782 0,000852279474148865 0,000625619897764553 0,000518806744487678 0,000900208406142356 0,000903294027503477 38976 37143 667 665 0 True 565 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 610 497 0,0008816832142409 0,000858589595985845 0,000518806744487678 0,000534065766384375 0,000902339856651588 0,000903918941087396 38540 37418 667 665 0 True 610 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 654 498 0,000882323772881241 0,000853816849287329 0,000503547722590982 0,000411993591210803 0,000929542018376784 0,000983360288665326 38568 37210 667 665 0 True 654 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 258 544 0,000916181872442126 0,000941332502691841 0,000747692072938125 0,000747692072938125 0,000733485314610025 0,000787933588658017 40048 41024 667 665 0 True 255 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 301 544 0,000906436230271223 0,000867997413997342 0,000839246204318303 0,000732433051041428 0,000707056086607158 0,000693735039046485 39622 37828 667 665 0 True 299 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 345 544 0,000811610674406445 0,000891792309797153 0,000686655985351339 0,000793469138628214 0,000676125798915927 0,000678109536748908 35477 38865 667 665 0 True 344 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 390 544 0,000847802237585716 0,000926670074132459 0,000671396963454643 0,000732433051041428 0,000771085444535437 0,000811313942765562 37059 40385 667 665 0 True 388 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 434 544 0,000924394749295071 0,000896817461369147 0,000518806744487678 0,0004272526131075 0,00101477857118711 0,00102601305066239 40407 39084 667 665 0 True 432 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 478 542 0,00088255254382422 0,000825524557560071 0,000503547722590982 0,0004272526131075 0,000979658181699284 0,000974293091834732 38578 35977 667 665 0 True 477 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 522 542 0,000815087992739725 0,000941997933721922 0,000396734569314107 0,000473029678797589 0,000957392047374145 0,00103856023144058 35629 41053 667 665 0 True 521 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 566 542 0,000958138463384467 0,000897069866242626 0,000686655985351339 0,000610360875867857 0,000920067422726765 0,000881403575552617 41882 39095 667 665 0 True 565 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 611 542 0,000821264808200157 0,000797691183784593 0,000564583810177768 0,000549324788281071 0,000827651184488538 0,000764929927244727 35899 34764 667 665 0 True 610 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 655 541 0,000862626594690753 0,000883095814610915 0,000473029678797589 0,000457770656900893 0,0009372952207159 0,000997780027625554 37707 38486 667 665 0 True 654 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 256 588 0,000891909275392059 0,000784818535237154 0,000793469138628214 0,000686655985351339 0,000656784610104749 0,000528649381729658 38987 34203 667 665 0 True 255 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 302 588 0,0009610438543603 0,000859461540094227 0,000854505226215 0,000717174029144732 0,000732896114372848 0,000718706554581563 42009 37456 667 665 0 True 299 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 345 587 0,000849037600677803 0,000939657452167842 0,000701915007248035 0,000793469138628214 0,00070540388645445 0,000761883351025734 37113 40951 667 665 0 True 344 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 390 588 0,000844324919252436 0,000967903852099923 0,000686655985351339 0,000854505226215 0,000666282680703671 0,000691405204356396 36907 42182 667 665 0 True 388 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 433 587 0,000909387375435651 0,000851430475938071 0,000579842832074464 0,000442511635004196 0,000927862840655107 0,000970189199852837 39751 37106 667 665 0 True 432 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 478 586 0,00088852346543597 0,000918891414849782 0,000503547722590982 0,000579842832074464 0,000955328598334576 0,000929741767235425 38839 40046 667 665 0 True 477 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 522 586 0,00085482550553517 0,000945164467589206 0,000488288700694286 0,000488288700694286 0,000941045156502875 0,0010637896560267 37366 41191 667 665 0 True 521 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 567 586 0,000944618100654411 0,000901475478579718 0,000656137941557946 0,000534065766384375 0,000905468606030501 0,000923354313739562 41291 39287 667 665 0 True 565 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 611 586 0,000861436985787262 0,000922562758464024 0,000656137941557946 0,000701915007248035 0,000763634209113049 0,00080450900577025 37655 40206 667 665 0 True 610 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 655 585 0,000894608772519211 0,000876602125593223 0,00064087891966125 0,000610360875867857 0,000838689646782719 0,000769753248306149 39105 38203 667 665 0 True 654 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 255 625 0,000992728629962885 0,000859507431889405 0,000869764248111696 0,000717174029144732 0,000724252828432209 0,000691130018667726 43394 37458 667 665 0 False 255 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 299 625 0,00092679684419635 0,000934081599053711 0,000793469138628214 0,000793469138628214 0,000701185815349151 0,000735922137461897 40512 40708 667 665 0 False 299 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 346 632 0,000905521146499307 0,000874376373527088 0,000778210116731518 0,000747692072938125 0,000713943853495447 0,000679960682848499 39582 38106 667 665 0 True 344 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 390 632 0,000835242712816171 0,00091145694403094 0,000701915007248035 0,000823987182421607 0,000654203861393523 0,000657952255929212 36510 39722 667 665 0 True 388 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 432 625 0,000911560699393951 0,000891126878767071 0,000686655985351339 0,000579842832074464 0,000864653179190781 0,000894624607313303 39846 38836 667 665 0 False 432 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 477 625 0,000865188829252117 0,000901016560627937 0,000549324788281071 0,000473029678797589 0,000917759236317383 0,000964189878366239 37819 39267 667 665 0 False 477 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 521 625 0,000967495194952306 0,000937110457535461 0,000534065766384375 0,000564583810177768 0,0010427582918121 0,000970155686938614 42291 40840 667 665 0 False 521 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 566 625 0,000856037991532959 0,000860815348051979 0,000595101853971161 0,000549324788281071 0,000853919263408589 0,000883561690911812 37419 37515 667 665 0 False 566 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 610 625 0,000850822014033038 0,000857740597775051 0,000686655985351339 0,000701915007248035 0,000711503190554105 0,000678004446200645 37191 37381 667 665 0 False 610 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 654 625 0,000868894918528376 0,000892457740827234 0,000701915007248035 0,000762951094834821 0,000749784694577227 0,000747405695755264 37981 38894 667 665 0 False 654 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 258 676 0,00104998999699052 0,074622674791809 0,000900282291905089 0,0736247806515602 0,000730960812031927 0,0216730776129189 45897 3252114 667 665 0 True 255 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 299 668 0,000892870113352571 0,000844477868968599 0,000762951094834821 0,000732433051041428 0,000726305097640847 0,000627011007232029 39029 36803 667 665 0 False 299 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 344 668 0,000882827068955795 0,000803221145103546 0,000747692072938125 0,00064087891966125 0,000676456660811517 0,000619221195367406 38590 35005 667 665 0 False 344 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 388 668 0,00092691122966784 0,000888212749773266 0,00080872816052491 0,00080872816052491 0,000695994379059321 0,000619267153242495 40517 38709 667 665 0 False 388 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 432 668 0,000902890280655049 0,000963016375913462 0,000732433051041428 0,000778210116731518 0,000769046486801377 0,000787152799200987 39467 41969 667 665 0 False 432 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 477 668 0,000908975587738289 0,000943948335016989 0,00064087891966125 0,000732433051041428 0,00083152617873513 0,000764057036366829 39733 41138 667 665 0 False 477 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 521 668 0,000948690223439436 0,000799480963796536 0,000595101853971161 0,000457770656900893 0,000956540476018297 0,000840696337060091 41469 34842 667 665 0 False 521 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 566 668 0,000841373774088007 0,000955145933040429 0,000610360875867857 0,000732433051041428 0,000743459745025297 0,000817269837399604 36778 41626 667 665 0 False 566 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 610 668 0,000839429221072686 0,000780183463924173 0,000686655985351339 0,000610360875867857 0,000658516281554697 0,000660199568795688 36693 34001 667 665 0 False 610 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 657 673 0,00105573214765929 0,0733075306714945 0,000885023270008392 0,0727550164034485 0,000798131075747126 0,0218055790203474 46148 3194799 667 665 0 True 654 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C2_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C2_1.csv new file mode 100755 index 0000000..9eed919 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C2_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 278 259 0,0103112554503247 0,0461239158780448 0,0103456168459602 0,0463874265659571 0,00146697019932008 0,0100851321088627 450724 2010116 667 665 0 True 278 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 322 260 0,0101930952582761 0,010370191902278 0,0101472495613031 0,0102845807583734 0,00138528688391422 0,00128613142230503 445559 451941 667 665 0 False 322 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 367 260 0,0103150759250725 0,0657294644255408 0,0103761348897536 0,0651712825207904 0,00132415082958186 0,0111282280680743 450891 2864541 667 665 0 True 366 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 410 259 0,0102348688324641 0,0874844240378929 0,0102082856488899 0,087357900358587 0,00147015802950272 0,0126111691082354 447385 3812639 667 665 0 True 410 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 455 259 0,0102345256760496 0,0761356125493409 0,0102693217364767 0,0717021438925765 0,00160284922609812 0,0153683899869663 447370 3318049 667 665 0 True 455 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 497 259 0,0100735395634753 0,0696151686150602 0,0100709544518196 0,0732585641260395 0,00154095585400029 0,0200341306782268 440333 3033883 667 665 0 True 499 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 542 258 0,0102597819881545 0,0833743319158505 0,0102693217364767 0,0809033340962844 0,00162285045337413 0,024727050647841 448474 3633518 667 665 0 True 543 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 587 258 0,0103973419561677 0,073304318245832 0,0102235446707866 0,069916838330663 0,00339175629122712 0,0211590650646446 454487 3194659 667 665 0 True 587 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 632 260 0,0100769024963371 0,010217716412799 0,0100862134737163 0,0101777676050965 0,0018781474040603 0,00182415333454115 440480 445296 667 665 0 False 632 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 673 259 0,0100032153756036 0,0461378899296766 0,0100404364080262 0,0453192950331884 0,00174779640531107 0,00865608713787149 437259 2010725 667 665 0 True 676 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 278 303 0,0100332072462281 0,0100570492378807 0,00997940032043946 0,0101167315175097 0,0012938947255143 0,00142098300070036 438570 438294 667 665 0 False 278 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 322 303 0,0100118400401539 0,0100574393181397 0,00997940032043946 0,0100251773861295 0,00134089318766735 0,00122454848073327 437636 438311 667 665 0 False 322 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 366 303 0,0101517105946912 0,103405916943882 0,0101319905394064 0,0996871900511177 0,00139237707399309 0,0235686674084323 443750 4506510 667 665 0 True 366 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 411 304 0,0101410269916541 0,0524115736812849 0,0101777676050965 0,0523689631494621 0,00151507552403673 0,00819148697947797 443283 2284137 667 665 0 True 410 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 454 303 0,0102578145580449 0,0813401780945841 0,0103303578240635 0,0784313725490196 0,00171352676316899 0,0192300769030894 448388 3544868 667 665 0 True 455 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 499 305 0,0100846578313041 0,0450210901481215 0,0100862134737163 0,0456092164492256 0,00168291963791349 0,0111834566573894 440819 1962054 667 665 0 True 499 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 543 302 0,0100699249825762 0,0472149474166074 0,0100556954299229 0,0487525749599451 0,00152807830446307 0,0125388807010099 440175 2057664 667 665 0 True 543 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 588 304 0,0100310796764584 0,0553226967625059 0,0101167315175097 0,0549477378500038 0,00179926168880012 0,0125790232832858 438477 2411006 667 665 0 True 587 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 632 303 0,00983852317375302 0,00967777649663183 0,0098268101014725 0,00975051499198901 0,0019739249852004 0,00194168644613953 430060 421765 667 665 0 False 632 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 676 304 0,00962196859912914 0,00963762117585105 0,00967421988250553 0,00968947890440223 0,00195684569150272 0,00193057670826842 420594 420015 667 665 0 False 676 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 278 348 0,0100000125824019 0,0547428080386363 0,00991836423285267 0,0529640650034333 0,00142683050088475 0,0134621624482415 437119 2385734 667 665 0 True 277 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 322 348 0,0100647090050763 0,0671762491603236 0,0100251773861295 0,0692301823453117 0,00140601373284833 0,0205728988646575 439947 2927593 667 665 0 True 322 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 367 348 0,0100971487247907 0,0396137975976793 0,00997940032043946 0,0407873655298695 0,00126275279611145 0,00613871867514951 441365 1726400 667 665 0 True 366 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 411 347 0,00983701328552936 0,0353974200780046 0,00984206912336919 0,0360418097199969 0,00149292537842805 0,00503834547361083 429994 1542647 667 665 0 True 410 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 455 347 0,0101981053419273 0,0721517687558333 0,0102693217364767 0,0691233691920348 0,00165881760936172 0,0132417346068873 445778 3144430 667 665 0 True 455 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 499 349 0,0100854585296045 0,034020138467019 0,0100099183642329 0,0345464255741207 0,00167108064599704 0,00592672166243564 440854 1482624 667 665 0 True 499 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 543 348 0,00997885127017631 0,0289448042169971 0,00993362325474937 0,0291905088883803 0,00156940323954609 0,00331007792523715 436194 1261437 667 665 0 True 543 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 587 348 0,0098561385363624 0,049251717070199 0,00988784618905928 0,0491493095292592 0,00194596548668147 0,00801742352422397 430830 2146428 667 665 0 True 587 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 632 347 0,00969002795466538 0,0565366494744529 0,0098115510795758 0,0567788204776074 0,00201290270048457 0,0113231107299897 423569 2463911 667 665 0 True 632 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 676 347 0,00971267627802029 0,0628122147896636 0,00973525597009232 0,0621805142290379 0,00187146386765616 0,0175747437453089 424559 2737405 667 665 0 True 676 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 279 392 0,00997649492946363 0,0466031180032939 0,00994888227664607 0,0495918211642634 0,00135613683806759 0,0104927821238725 436091 2031000 667 665 0 True 277 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 323 392 0,0101444128016102 0,0322894211954698 0,0101472495613031 0,0325627527275502 0,00139299630852896 0,00315212370512666 443431 1407198 667 665 0 True 322 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 367 391 0,0102473368488564 0,0903389625356594 0,01025406271458 0,0857709620813306 0,00143160705241624 0,0227999742307587 447930 3937042 667 665 0 True 366 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 411 391 0,0102134101180126 0,0697974278796098 0,0102998397802701 0,0692301823453117 0,00153342266332799 0,0182499702799092 446447 3041826 667 665 0 True 410 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 456 391 0,0101736726052172 0,0423416288489592 0,0101625085831998 0,0433813992523079 0,00170735790299089 0,00730064356204636 444710 1845281 667 665 0 True 455 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 500 392 0,0103690887447098 0,0545251662000045 0,0102082856488899 0,0539711604486152 0,00252009833835715 0,0106723752970515 453252 2376249 667 665 0 True 499 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 544 392 0,0102457812064442 0,0416111003074177 0,0102388036926833 0,0424353398947128 0,00166518859975308 0,00622110139724046 447862 1813444 667 665 0 True 543 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 588 392 0,010169051432169 0,052441885212 0,0102082856488899 0,0507057297627222 0,00192309872703889 0,00976189367440003 444508 2285458 667 665 0 True 587 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 632 391 0,0102279828270804 0,0441239284982885 0,0102693217364767 0,0434424353398947 0,00189388363237248 0,00905947278482967 447084 1922955 667 665 0 True 632 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 676 391 0,0102054260121027 0,0868394836943583 0,0101930266269932 0,0817120622568093 0,00187979111928495 0,0174644077316497 446098 3784532 667 665 0 True 676 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 279 436 0,0101607470469389 0,0479862049263695 0,0102388036926833 0,0486152437628748 0,00155267016468262 0,00862056044606405 444145 2091276 667 665 0 True 277 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 323 436 0,0100552150109427 0,0605417641150255 0,0101625085831998 0,0600442511635004 0,00149089095674973 0,00766449676812557 439532 2638457 667 665 0 True 322 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 368 436 0,0100174678053512 0,0364553865781414 0,0100099183642329 0,0368963149462119 0,00138423488711637 0,00518457936784374 437882 1588754 667 665 0 True 366 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 412 436 0,0110733829697648 0,0561481524823732 0,0103456168459602 0,0536964980544747 0,0065190289574582 0,0126407126328541 484038 2446980 667 665 0 True 410 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 456 435 0,0111153853148958 0,0979606718788273 0,0106202792401007 0,0980697337300679 0,00592965330522816 0,0164733745014459 485874 4269202 667 665 0 True 455 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 500 436 0,0107118791256695 0,0608876964670775 0,0106813153276875 0,0599679560540169 0,00198127722357427 0,0129560017533156 468236 2653533 667 665 0 True 499 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 544 435 0,0107308213597481 0,0557216341379886 0,010757610437171 0,0542458228427558 0,00170905591662033 0,00973104320693736 469064 2428392 667 665 0 True 543 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 589 436 0,0105566809179526 0,0320865335689877 0,0105439841306172 0,0325780117494469 0,00184469170003446 0,00487677763822434 461452 1398356 667 665 0 True 587 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 633 436 0,010356506342846 0,042469942308277 0,0103913939116503 0,0414129854276341 0,0019041129718834 0,00771185429828776 452702 1850873 667 665 0 True 632 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 676 435 0,010144550064176 0,0746393335134586 0,0102388036926833 0,0738689250019074 0,00196129202819516 0,0120858459853647 443437 3252840 667 665 0 True 676 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 278 481 0,00967909270359098 0,0600043482475931 0,00971999694819562 0,0615701533531701 0,00156161129134742 0,0167776131770636 423091 2615036 667 665 0 True 277 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 322 480 0,0101397229972791 0,0584116505500418 0,0101777676050965 0,0582284275577935 0,00161856361636348 0,00948805506164492 443226 2545625 667 665 0 True 322 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 366 480 0,0102985586629894 0,0725342539227446 0,0102998397802701 0,069214923323415 0,00158596408475322 0,0208503983481858 450169 3161099 667 665 0 True 366 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 411 480 0,0107625518895393 0,0958859956024187 0,0108186465247578 0,0905165178912032 0,00184018586760993 0,0237395845050121 470451 4178786 667 665 0 True 410 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 455 479 0,010709843064277 0,102191069341929 0,0107881284809644 0,101991302357519 0,0020569433029554 0,0368516158392922 468147 4453566 667 665 0 True 454 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 499 480 0,0111553515986342 0,0491167263546828 0,0110933089188983 0,0504005493247883 0,00231391120506477 0,00877043240978511 487621 2140545 667 665 0 True 499 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 543 480 0,0107332920859323 0,0437207002399567 0,0107118333714809 0,0457618066681926 0,00184110917238463 0,00784344121371548 469172 1905382 667 665 0 True 543 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 587 479 0,0106737887636635 0,104646280383954 0,0106355382619974 0,102662699320974 0,00187485322209707 0,0205919796536506 466571 4560566 667 665 0 True 587 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 631 479 0,0104689472613201 0,0639166467324181 0,0103761348897536 0,0670786602578775 0,00183962848572216 0,0178703637632722 457617 2785537 667 665 0 True 632 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 676 480 0,010110989366841 0,0798872897510428 0,0101319905394064 0,0745250629434653 0,00193631116855405 0,0156394281094588 441970 3481550 667 665 0 True 676 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 278 524 0,00981644677775555 0,055057327456889 0,00971999694819562 0,0578927290760662 0,00157505481496593 0,0155381934404814 429095 2399441 667 665 0 True 277 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 322 524 0,010182411655239 0,105248954384129 0,0101472495613031 0,0961013199053941 0,00161910643046606 0,0335374052082582 445092 4586831 667 665 0 True 322 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 367 523 0,0106385122842561 0,0603112955196414 0,0106507972838941 0,062729839017319 0,00143851350964936 0,0155575681868974 465029 2628413 667 665 0 True 366 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 411 524 0,0107492602977522 0,0600924604943349 0,010757610437171 0,0605783169298848 0,00176307098588916 0,00864909212117521 469870 2618876 667 665 0 True 410 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 455 523 0,0107884716373788 0,0590578988097389 0,0107423514152743 0,0598458838788434 0,00193488299911431 0,00924056248521338 471584 2573789 667 665 0 True 454 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 499 524 0,0107597151298464 0,0636249584822666 0,0107881284809644 0,0642252231631952 0,00179021019582835 0,0142708456215178 470327 2772825 667 665 0 True 499 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 543 524 0,010754613537818 0,0753210331849307 0,0107423514152743 0,0740215152208743 0,00199170328174305 0,0189144993053383 470104 3282549 667 665 0 True 543 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 588 524 0,010667451808543 0,0593370127080117 0,0106202792401007 0,059510185397116 0,00163503202788375 0,0128621957005771 466294 2585953 667 665 0 True 587 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 632 524 0,0104336021506299 0,0446265583849759 0,010406652933547 0,043579766536965 0,00187151954919793 0,00670518320464432 456072 1944860 667 665 0 True 632 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 676 523 0,0103459828794689 0,0613684130215674 0,0103913939116503 0,0612954909590295 0,00181152864972857 0,0123901064428803 452242 2674483 667 665 0 True 676 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 278 568 0,00989608194300652 0,0456186931049299 0,00991836423285267 0,0470435645075151 0,00139251441915892 0,0105355778575368 432576 1988098 667 665 0 True 277 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 323 568 0,0101616163765222 0,0549758465745504 0,0100862134737163 0,0561379415579461 0,00143230040118247 0,0133789976948979 444183 2395890 667 665 0 True 322 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 366 568 0,010556177621878 0,0528742088684747 0,0105287251087205 0,0525673304341192 0,00151245308047669 0,0127766138336663 461430 2304299 667 665 0 True 366 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 412 568 0,0106258383740151 0,0549671730252617 0,010605020218204 0,053330281528954 0,00159157099765445 0,00804870439482222 464475 2395512 667 665 0 True 410 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 455 567 0,0107473157447369 0,0912737554575383 0,0107270923933776 0,0873426413366903 0,00198076606512832 0,0264961233614982 469785 3977781 667 665 0 True 454 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 499 568 0,0106700140431043 0,0661644268602383 0,0107423514152743 0,0641489280537118 0,00208278353055098 0,0143142520761003 466406 2883497 667 665 0 True 499 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 543 567 0,0106072164192566 0,0582719100337247 0,0105897611963073 0,0582742046234836 0,00191196714260739 0,00972287430461485 463661 2539535 667 665 0 True 543 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 588 567 0,0104268991620006 0,0381512031394577 0,0104219119554437 0,0394598306248569 0,00166666537151057 0,00751057552592527 455779 1662659 667 665 0 True 587 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 632 568 0,0103307238575722 0,0482536623086671 0,0103303578240635 0,0482185091935607 0,00158050133619419 0,00666875268883764 451575 2102932 667 665 0 True 632 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 676 567 0,0101205519922575 0,0504681020472904 0,0101472495613031 0,0496528572518502 0,00169363396880181 0,00738759463837059 442388 2199439 667 665 0 True 676 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 277 607 0,00973797834431377 0,00967208591402975 0,00967421988250553 0,00965896086060884 0,00165692610972913 0,00138150648726501 425665 421517 667 665 0 False 277 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 322 607 0,00998150501311487 0,00976191910309076 0,00987258716716258 0,00973525597009232 0,00151618293666737 0,00144036648735181 436310 425432 667 665 0 False 322 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 367 612 0,0102934341938667 0,0806506997638294 0,0103303578240635 0,0774242771038376 0,00142963938580458 0,0150476587806338 449945 3514820 667 665 0 True 366 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 411 612 0,0104461159212108 0,0835798353746577 0,0105134660868238 0,0782330052643626 0,00151482836074107 0,025515287570641 456619 3642474 667 665 0 True 410 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 454 607 0,0104467564798512 0,0104135596487213 0,0103303578240635 0,0105897611963073 0,0019540264213006 0,00203019661709437 456647 453831 667 665 0 False 454 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 499 607 0,0104488611725266 0,0103534643429356 0,0104219119554437 0,0103303578240635 0,00193492890082012 0,00205180864758584 456739 451212 667 665 0 False 499 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 543 607 0,0103545846669249 0,0102023197155168 0,0104371709773404 0,0101777676050965 0,00190387199734683 0,00194951110423616 452618 444625 667 665 0 False 543 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 587 607 0,0101117443109528 0,0102275372569671 0,0102082856488899 0,0102388036926833 0,00162438282682388 0,00172394774203248 442003 445724 667 665 0 False 587 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 631 607 0,0101926377163901 0,0101277455483525 0,01025406271458 0,0102082856488899 0,001473727594202 0,00139924050760973 445539 441375 667 665 0 False 631 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 676 607 0,0102536509268826 0,0100017266787936 0,0102235446707866 0,0100709544518196 0,00150980948523533 0,00160706234823668 448206 435883 667 665 0 False 676 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 277 650 0,0114667317291228 0,0341752986265159 0,00985732814526589 0,0401312275883116 0,00619332383505292 0,0179851733536012 501232 1489386 667 665 0 False 277 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 322 650 0,00964932960390942 0,00961655684186433 0,00962844281681544 0,00962844281681544 0,00128558421438888 0,00120241018368718 421790 419097 667 665 0 False 322 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 366 650 0,0107527604931798 0,0100272654628102 0,0100099183642329 0,00985732814526589 0,00443211029162444 0,00159049163545534 470023 436996 667 665 0 False 366 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 410 651 0,0102993593612898 0,00996978598934966 0,0101319905394064 0,0100404364080262 0,00179386486731456 0,00139145967510852 450204 434491 667 665 0 False 410 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 454 651 0,0099637066337511 0,00988548276160761 0,00999465934233616 0,00985732814526589 0,0016236210064991 0,00173830982802118 435532 430817 667 665 0 False 454 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 499 651 0,00996407266725987 0,00993364620064696 0,0100099183642329 0,00993362325474937 0,00167432557977944 0,00164307205452379 435548 432916 667 665 0 False 499 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 543 651 0,0100492212122366 0,00993142044858083 0,0100709544518196 0,00993362325474937 0,00162145389339116 0,00170952441870575 439270 432819 667 665 0 False 543 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 587 651 0,0100261611011844 0,00990572104328113 0,0100099183642329 0,00990310521095598 0,00137204351445862 0,00126789822192509 438262 431699 667 665 0 False 587 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 631 651 0,0100237132520945 0,009962397410326 0,00999465934233616 0,00993362325474937 0,00140589512510172 0,00133826743087359 438155 434169 667 665 0 False 631 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 676 657 0,0101039660988915 0,043368664279146 0,0101625085831998 0,0431372549019608 0,00141266944473404 0,00860616015310109 441663 1890040 667 665 0 True 676 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C2_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C2_2.csv new file mode 100755 index 0000000..103b323 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C2_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 278 259 0,0083090750344672 0,720046809631082 0,00819409475852598 0,740856031128405 0,00187840288350304 0,206282649382111 363205 31380198 667 665 11 True 278 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 322 260 0,00704966811627375 0,00697339595268785 0,00698863202868696 0,00694285496299687 0,00149587685599174 0,00125397282894997 308154 303906 667 665 0 False 322 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 367 260 0,00654037824301399 0,00667654487557874 0,00646982528419928 0,00671396963454643 0,00121943145165163 0,00111257438468452 285892 290969 667 665 0 True 366 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 410 259 0,00645845536833323 0,0066615841503507 0,0063935301747158 0,00668345159075303 0,00143479028121662 0,00137378040425112 282311 290317 667 665 0 True 410 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 455 259 0,00665249888216798 0,00679540462508985 0,00665293354695964 0,00685130083161669 0,00152345975899204 0,00157378903424148 290793 296149 667 665 0 True 455 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 497 259 0,00672783315369095 0,00677374369776582 0,00672922865644312 0,0068207827878233 0,00152822261299413 0,00146921821637868 294086 295205 667 665 0 True 499 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 542 258 0,00690435281329351 0,00685517868830924 0,00694285496299687 0,00685130083161669 0,00150463503998834 0,00141242413917932 301802 298754 667 665 0 True 543 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 587 258 0,00726789271878137 0,00705423434989396 0,00720225833524071 0,00700389105058366 0,0021288908185176 0,00181236729125598 317693 307429 667 665 0 True 587 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 632 260 0,00790984686187462 0,00764222297561253 0,00788891432059205 0,00773632410162509 0,00204975766736775 0,00175390133051842 345754 333054 667 665 0 False 632 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 673 259 0,00879551069052336 0,720105252832241 0,00877393759060044 0,712214847028306 0,00179576561111767 0,178234424541593 384468 31382745 667 665 11 True 676 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 278 303 0,0068501569769018 0,00666500308909146 0,00671396963454643 0,00657663843747616 0,00155642923309236 0,00132612086211021 299433 290466 667 665 0 False 278 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 322 303 0,00662543527961357 0,0063473630287667 0,00659189745937285 0,00633249408712902 0,00129390276342194 0,00120112709928907 289610 276623 667 665 0 False 322 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 366 303 0,00640142277224857 0,00638529259748134 0,0064087891966125 0,00633249408712902 0,00129640543464675 0,00128419368947656 279818 278276 667 665 0 True 366 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 411 304 0,00645040263114037 0,00649474452898096 0,00651560234988937 0,00646982528419928 0,00139005511632183 0,00145450313191865 281959 283046 667 665 0 True 410 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 454 303 0,00668201033381227 0,00678900271966251 0,00660715648126955 0,00679026474402991 0,00171171771690345 0,00170557540555046 292083 295870 667 665 0 True 455 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 499 305 0,00655787922015188 0,00669072544028875 0,00656137941557946 0,00666819256885634 0,00157279704848558 0,00147761798142313 286657 291587 667 665 0 True 499 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 543 302 0,00675942642091634 0,00668108816330136 0,00677500572213321 0,00669871061264973 0,00135232244678208 0,0014381896528021 295467 291167 667 665 0 True 543 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 588 304 0,00693583169504742 0,00707582643952523 0,00688181887541009 0,00712596322575723 0,00182405901463125 0,00189982429296508 303178 308370 667 665 0 True 587 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 632 303 0,0070968864389046 0,0072104270747824 0,00711070420386053 0,00727855344472419 0,00188200297276393 0,0018642112332529 310218 314236 667 665 0 False 632 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 676 304 0,00722129207769656 0,00707029647820627 0,00720225833524071 0,00704966811627375 0,0018519641797176 0,00182413439711063 315656 308129 667 665 0 False 676 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 278 348 0,00619873171676922 0,006154112679272 0,00621042191195544 0,00614938582436866 0,00133993873050749 0,00131522115065762 270958 268201 667 665 0 True 277 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 322 348 0,00636321802477109 0,00628017744062606 0,00634775310902571 0,00624093995574884 0,00123988178205193 0,00122274230965551 278148 273695 667 665 0 True 322 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 367 348 0,0064446833575659 0,00653040245383429 0,0064087891966125 0,00656137941557946 0,0013157337760219 0,00127748077203567 281709 284600 667 665 0 True 366 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 411 347 0,00648089779783946 0,00665082252438145 0,00645456626230259 0,00659189745937285 0,00147657607405733 0,00140406011208701 283292 289848 667 665 0 True 410 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 455 347 0,00666263343494195 0,00671470390326927 0,00674448767833982 0,00675974670023652 0,00160594426779733 0,00156176941007923 291236 292632 667 665 0 True 455 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 499 349 0,00660091103452622 0,00676350982744111 0,00665293354695964 0,00679026474402991 0,00150320461761005 0,00154353241975483 288538 294759 667 665 0 True 499 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 543 348 0,00669475287533619 0,00661578413876302 0,0068055237659266 0,00654612039368277 0,0015543094139084 0,00152099689393542 292640 288321 667 665 0 True 543 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 587 348 0,00687614535602421 0,00668501191178909 0,00700389105058366 0,00666819256885634 0,00194612171302674 0,00206933358140026 300569 291338 667 665 0 True 587 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 632 347 0,00669370052899849 0,00674742475323121 0,00671396963454643 0,00669871061264973 0,00187180524200318 0,00185421619439377 292594 294058 667 665 0 True 632 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 676 347 0,00656698430368245 0,00628685469682446 0,00659189745937285 0,00628671702143893 0,00183466843804464 0,00169184884429016 287055 273986 667 665 0 True 676 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 279 392 0,00628868445154854 0,00631138386134712 0,00631723506523232 0,00630197604333562 0,00140599134411155 0,00137890514415113 274890 275055 667 665 0 True 277 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 323 392 0,00648556472507624 0,00665513635312819 0,00642404821850919 0,00668345159075303 0,00136103723059127 0,00124335403715859 283496 290036 667 665 0 True 322 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 367 391 0,00648654844013104 0,00661052952821514 0,00650034332799268 0,00656137941557946 0,0013445561083436 0,00136158171087516 283539 288092 667 665 0 True 366 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 411 391 0,0066739804737137 0,00681396785623936 0,00669871061264973 0,00685130083161669 0,00136738686241374 0,00139228217868453 291732 296958 667 665 0 True 410 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 456 391 0,00685267345727457 0,00680084280281844 0,00685130083161669 0,00688181887541009 0,00161269266219092 0,00158054305810846 299543 296386 667 665 0 True 455 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 500 392 0,00698460566009053 0,00668781131129495 0,0068207827878233 0,00663767452506294 0,00249883233023721 0,00164897833661739 305310 291460 667 665 0 True 499 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 544 392 0,00691700384644025 0,00672312504768444 0,00686655985351339 0,00672922865644312 0,00154012602728646 0,0014969667626543 302355 292999 667 665 0 True 543 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 588 392 0,00666826120013923 0,00676334920615799 0,00660715648126955 0,00683604180972 0,00180246925644448 0,00193347889571164 291482 294752 667 665 0 True 587 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 632 391 0,006505513551304 0,00647324422294005 0,00651560234988937 0,00648508430609598 0,0018464409470594 0,00181677191208683 284368 282109 667 665 0 True 632 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 676 391 0,00628534439578105 0,00637214459816284 0,00627145799954223 0,0064087891966125 0,00173827709072974 0,00178747026368908 274744 277703 667 665 0 True 676 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 279 436 0,00633517070716187 0,00647065133651249 0,00636301213092241 0,00653086137178607 0,00141433931505136 0,00143350980611428 276922 281996 667 665 0 True 277 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 323 436 0,00647995983697325 0,00671731973559442 0,00648508430609598 0,00674448767833982 0,0013350219198279 0,00152676241214448 283251 292746 667 665 0 True 322 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 368 436 0,00662083698365969 0,00657103963846444 0,00665293354695964 0,00659189745937285 0,00127514288824368 0,00130583287654481 289409 286371 667 665 0 True 366 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 412 436 0,00721564143540498 0,00673980671523166 0,0068055237659266 0,00685130083161669 0,00348719722936025 0,00160037615397926 315409 293726 667 665 0 True 410 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 456 435 0,0074948334942165 0,00686750063531454 0,00720225833524071 0,00677500572213321 0,00342449928934429 0,00164579630233316 327613 299291 667 665 0 True 455 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 500 436 0,00702024817300665 0,00710808837153538 0,00701915007248035 0,00709544518196384 0,00171400410451263 0,00173922337528845 306868 309776 667 665 0 True 499 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 544 435 0,00681977619567419 0,0071841081302478 0,0068207827878233 0,00714122224765393 0,00164765438251676 0,00163755651868046 298105 313089 667 665 0 True 543 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 589 436 0,00668907935595031 0,00663159386220185 0,00663767452506294 0,00660715648126955 0,00174098853292643 0,00183302601241261 292392 289010 667 665 0 True 587 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 633 436 0,00631149291456355 0,00630190720564286 0,00630197604333562 0,00625619897764553 0,00173095399373997 0,00172890035628081 275887 274642 667 665 0 True 632 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 676 435 0,00601395342612512 0,0062495905591399 0,00605783169298848 0,00624093995574884 0,00169688245854576 0,00179004321968963 262881 272362 667 665 0 True 676 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 278 481 0,00612760683059706 0,00619858182879951 0,00619516289005875 0,00622568093385214 0,00146670622158569 0,00149443177693145 267849 270139 667 665 0 True 277 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 322 480 0,00628019704956403 0,00628173776166211 0,00625619897764553 0,00625619897764553 0,00147217867467167 0,00147156415957381 274519 273763 667 665 0 True 322 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 366 480 0,00678191460461118 0,00669201041055374 0,00672922865644312 0,00668345159075303 0,00155900132793376 0,00150472157732772 296450 291643 667 665 0 True 366 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 411 480 0,00697039898453154 0,00704909446883402 0,00701915007248035 0,00704966811627375 0,00165058670800373 0,00161891295262898 304689 307205 667 665 0 True 410 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 455 479 0,0072327763790341 0,00768738050206771 0,00730907148851759 0,00772106507972839 0,00179033661538086 0,00198074290647361 316158 335022 667 665 0 True 454 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 499 480 0,00708075808742459 0,00714370040459354 0,00706492713817044 0,00715648126955062 0,00193301059335606 0,00182154100023816 309513 311328 667 665 0 True 499 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 543 480 0,00674876569497352 0,00661943253647967 0,00674448767833982 0,00660715648126955 0,00177047430702192 0,00167219054336654 295001 288480 667 665 0 True 543 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 587 479 0,00659979005690563 0,00640952346533535 0,00662241550316625 0,00645456626230259 0,00186908094319315 0,00192716256044771 288489 279332 667 665 0 True 587 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 631 479 0,00610299107713253 0,00629738686381782 0,00608834973678187 0,00634775310902571 0,0018758802708627 0,00166467843996961 266773 274445 667 665 0 True 632 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 676 480 0,00626429746902699 0,00645484161307365 0,00631723506523232 0,0063782711528191 0,0017783772841082 0,00182885645766139 273824 281307 667 665 0 True 676 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 278 524 0,00639021299604261 0,00658544966215034 0,0064087891966125 0,00666819256885634 0,00147662958363955 0,00145770888913526 279328 286999 667 665 0 True 277 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 322 524 0,00664124335177342 0,00679921364408962 0,00666819256885634 0,00679026474402991 0,00145691493054686 0,00136396608281865 290301 296315 667 665 0 True 322 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 367 523 0,00694518842661526 0,00693170325676861 0,00701915007248035 0,00694285496299687 0,00140088602758175 0,00142651294808824 303587 302089 667 665 0 True 366 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 411 524 0,00679751678292234 0,00712066272341417 0,0068207827878233 0,00715648126955062 0,00165774488300765 0,00166384752428809 297132 310324 667 665 0 True 410 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 455 523 0,00693237725380844 0,00687973079872949 0,00706492713817044 0,00695811398489357 0,0017307804442339 0,00179408847016577 303027 299824 667 665 0 True 454 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 499 524 0,00679262108474259 0,00678829139683725 0,00674448767833982 0,00669871061264973 0,00177211817925899 0,00172196704007694 296918 295839 667 665 0 True 499 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 543 524 0,00653106726563475 0,00654476658572501 0,00648508430609598 0,00654612039368277 0,00166309337707645 0,00165237916464832 285485 285226 667 665 0 True 543 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 588 524 0,00648076053527368 0,00654554674624304 0,00651560234988937 0,00656137941557946 0,00166523575788233 0,00165560343275067 283286 285260 667 665 0 True 587 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 632 524 0,0063174638361753 0,00651711677913025 0,00643930724040589 0,00646982528419928 0,00173477337948947 0,00182881354072206 276148 284021 667 665 0 True 632 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 676 523 0,00650080086987863 0,00665788986083887 0,00662241550316625 0,00669871061264973 0,00174006175182978 0,00183334349089054 284162 290156 667 665 0 True 676 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 278 568 0,00666075751320952 0,00669650780648118 0,00669871061264973 0,00668345159075303 0,00136715983938884 0,00130628776825139 291154 291839 667 665 0 True 277 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 323 568 0,00682043963140883 0,00688071747232581 0,00677500572213321 0,00686655985351339 0,00132419006517571 0,00135631588215229 298134 299867 667 665 0 True 322 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 366 568 0,00679209491157374 0,00680579911669767 0,00685130083161669 0,00675974670023652 0,00128482520177031 0,00130768826097094 296895 296602 667 665 0 True 366 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 412 568 0,00657258919178543 0,0066845529938373 0,00657663843747616 0,00662241550316625 0,00156383650196265 0,00155131974678401 287300 291318 667 665 0 True 410 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 455 567 0,00681279868191333 0,00669471802646924 0,00672922865644312 0,00669871061264973 0,00195577982871997 0,00177682224102254 297800 291761 667 665 0 True 454 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 499 568 0,00690073823239445 0,00663987733123149 0,00691233691920348 0,00665293354695964 0,00191727109490788 0,00198672848771819 301644 289371 667 665 0 True 499 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 543 567 0,00670561949512769 0,00687181446406127 0,00675974670023652 0,00694285496299687 0,0017682420040924 0,00173393642282504 293115 299479 667 665 0 True 543 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 588 567 0,00671579980209026 0,00677383548135617 0,00674448767833982 0,0068207827878233 0,00160996814908044 0,00143431474835885 293560 295209 667 665 0 True 587 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 632 568 0,00662774586613766 0,0066695234309165 0,00666819256885634 0,00668345159075303 0,00160451520811816 0,00149545379457757 289711 290663 667 665 0 True 632 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 676 567 0,00650068648440714 0,00640016153911903 0,00651560234988937 0,00634775310902571 0,00153728327032199 0,00164301690501462 284157 278924 667 665 0 True 676 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 277 607 0,00695653546538701 0,00700026559876459 0,00695811398489357 0,00695811398489357 0,00140184151443845 0,00130573098185205 304083 305077 667 665 0 False 277 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 322 607 0,00672472186886644 0,0067328311623646 0,00669871061264973 0,00671396963454643 0,00137440160852867 0,00132211320881751 293950 293422 667 665 0 False 322 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 367 612 0,00664641357508474 0,00686036446116435 0,00663767452506294 0,00688181887541009 0,00130418881337713 0,001357901004424 290527 298980 667 665 0 True 366 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 411 612 0,0064587756476534 0,00661101139206451 0,00642404821850919 0,00662241550316625 0,00155239440461463 0,00142312603541335 282325 288113 667 665 0 True 410 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 454 607 0,00672806192463393 0,00656117290250116 0,00674448767833982 0,00662241550316625 0,00188896006366973 0,00180108165547425 294096 285941 667 665 0 False 454 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 499 607 0,00690185921001504 0,00669056481900563 0,00694285496299687 0,00666819256885634 0,0019394150270342 0,00197875186284235 301693 291580 667 665 0 False 499 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 543 607 0,00675057298542306 0,00661720678441354 0,00675974670023652 0,00657663843747616 0,00184798267495944 0,00186517787715435 295080 288383 667 665 0 False 543 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 587 607 0,00664927321187198 0,00661030006923925 0,00665293354695964 0,00668345159075303 0,00164449205602165 0,00161966679252005 290652 288082 667 665 0 False 587 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 631 607 0,00666080326739812 0,00648990294458967 0,00674448767833982 0,00653086137178607 0,00148782031240847 0,00142794868210391 291156 282835 667 665 0 False 631 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 676 607 0,00696335283948779 0,00670341452165548 0,00685130083161669 0,00671396963454643 0,00172397380583871 0,00164627143101329 304381 292140 667 665 0 False 676 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 277 650 0,0471656595597829 0,516369385353978 0,0085297932402533 0,61007095445182 0,116815761058694 0,374607198396654 2061698 22503778 667 665 11 False 277 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 322 650 0,00704424624492514 0,00690054272784272 0,00691233691920348 0,00689707789730678 0,00159154186111877 0,00126230129274546 307917 300731 667 665 0 False 322 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 366 650 0,00635434171218351 0,00650848912163678 0,00631723506523232 0,00650034332799268 0,00127731301745681 0,00121274312986985 277760 283645 667 665 0 False 366 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 410 651 0,00625960766469592 0,00632540380477401 0,00624093995574884 0,00627145799954223 0,00141912823626193 0,00132830092131849 273619 275666 667 665 0 False 410 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 454 651 0,00635171084633925 0,00638692175621016 0,00625619897764553 0,0063935301747158 0,00156643622306414 0,00145494945965529 277645 278347 667 665 0 False 454 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 499 651 0,00647604785384831 0,00655422029553169 0,00656137941557946 0,00656137941557946 0,00167619700271891 0,00166781169876614 283080 285638 667 665 0 False 499 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 543 651 0,00644543830167773 0,0064474300881524 0,00651560234988937 0,00648508430609598 0,00173566302127302 0,00160061484109539 281742 280984 667 665 0 False 543 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 587 651 0,00648496992062449 0,00655848823248324 0,00653086137178607 0,00654612039368277 0,00138980153199065 0,00123976291921291 283470 285824 667 665 0 False 587 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 631 651 0,00690357499208738 0,00679877767203543 0,00691233691920348 0,00683604180972 0,00142613712146887 0,00130808905130346 301768 296296 667 665 0 False 631 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 676 657 0,00843677497483806 0,719227044493816 0,00834668497749294 0,723201342793927 0,00173788095243429 0,19461652312688 368787 31344472 667 665 11 True 676 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C2_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C2_3.csv new file mode 100755 index 0000000..8105f0b --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C2_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 278 259 0,00108487756579481 0,0734777662857074 0,000915541313801785 0,0740062561989776 0,000760723885173139 0,0235207797129124 47422 3202218 667 665 0 True 278 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 322 260 0,000870885225732293 0,000854344604931876 0,000793469138628214 0,000747692072938125 0,000607975108062825 0,000618443664469943 38068 37233 667 665 0 False 322 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 367 260 0,000902890280655049 0,000901131290115882 0,000823987182421607 0,00080872816052491 0,000606367919993929 0,000606939501652566 39467 39272 667 665 0 True 366 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 410 259 0,0008795098902826 0,000961479000774998 0,000778210116731518 0,000839246204318303 0,000674572986790597 0,000696501075637987 38445 41902 667 665 0 True 410 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 455 259 0,0008610251980899 0,000924559051554269 0,000625619897764553 0,000732433051041428 0,000801620616174019 0,000837398432620336 37637 40293 667 665 0 True 455 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 497 259 0,000873378829010764 0,000876028478153498 0,000701915007248035 0,000671396963454643 0,000755471731139634 0,000787651529294035 38177 38178 667 665 0 True 499 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 542 258 0,000887905783889927 0,000881787898448341 0,000701915007248035 0,000701915007248035 0,00075595712593298 0,00078016169366551 38812 38429 667 665 0 True 543 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 587 258 0,000922061285676686 0,000962419782576147 0,000579842832074464 0,000595101853971161 0,000960108804366617 0,00102139980341515 40305 41943 667 665 0 True 587 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 632 260 0,00095081779320914 0,000947482003245697 0,000625619897764553 0,000610360875867857 0,000918153418641037 0,000906525500547516 41562 41292 667 665 0 False 632 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 673 259 0,00105639558339393 0,0735520880479982 0,000762951094834821 0,0708323796444648 0,000945826581049541 0,0212156428365292 46177 3205457 667 665 0 True 676 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 278 303 0,000928192346948522 0,000872816052491035 0,000793469138628214 0,000717174029144732 0,000702498259074464 0,00070553223601783 40573 38038 667 665 0 False 278 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 322 303 0,000918012039985958 0,000793859218887227 0,000823987182421607 0,000686655985351339 0,000655852051992274 0,000609136219449168 40128 34597 667 665 0 False 322 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 366 303 0,000860704918769729 0,000821531971379582 0,000762951094834821 0,000686655985351339 0,00063646557326534 0,00060546170661317 37623 35803 667 665 0 True 366 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 411 304 0,000836134919493789 0,000831536382728393 0,000625619897764553 0,00064087891966125 0,000729024599818834 0,000725927255073346 36549 36239 667 665 0 True 410 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 454 303 0,000809780506862614 0,000871554028123639 0,000518806744487678 0,000564583810177768 0,000826585741565989 0,000887611353758743 35397 37983 667 665 0 True 455 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 499 305 0,000887196593966692 0,000863981881919264 0,000656137941557946 0,000610360875867857 0,000808971671956171 0,000847806322696335 38781 37653 667 665 0 True 499 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 543 302 0,00082492514328782 0,000935848433168066 0,000625619897764553 0,000778210116731518 0,000748265059937657 0,000769109520947387 36059 40785 667 665 0 True 543 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 588 304 0,000854230701083425 0,000961364271287053 0,000518806744487678 0,000488288700694286 0,000900558477680299 0,00109022288484996 37340 41897 667 665 0 True 587 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 632 303 0,000914580475841274 0,000768504002051363 0,000564583810177768 0,000350957503624018 0,000916586458845456 0,000913970071047726 39978 33492 667 665 0 False 632 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 676 304 0,000926979860950733 0,000908359247856423 0,000610360875867857 0,000503547722590982 0,000907418453541007 0,000924646039765871 40520 39587 667 665 0 False 676 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 278 348 0,000895295085348148 0,000915151233542772 0,000747692072938125 0,000778210116731518 0,000720133124342617 0,000708650376280442 39135 39883 667 665 0 True 277 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 322 348 0,000873470337387955 0,000858337191112365 0,000747692072938125 0,000732433051041428 0,000648626278297471 0,000643328646072673 38181 37407 667 665 0 True 322 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 367 348 0,000810718467728827 0,000855354224425793 0,000656137941557946 0,000732433051041428 0,000629749991056186 0,000644528111812438 35438 37277 667 665 0 True 366 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 411 347 0,00086667584038148 0,00090608760399511 0,000701915007248035 0,000717174029144732 0,000714791016783233 0,000717950290044944 37884 39488 667 665 0 True 410 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 455 347 0,00084265489136869 0,000838305422517154 0,000579842832074464 0,000549324788281071 0,000822997304995365 0,000832293053307191 36834 36534 667 665 0 True 455 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 499 349 0,000831742517388593 0,000881879682038697 0,000610360875867857 0,000595101853971161 0,000800186086434277 0,000827835819609614 36357 38433 667 665 0 True 499 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 543 348 0,000814699082136661 0,000898400728302789 0,000595101853971161 0,000656137941557946 0,000764946769109248 0,000860154982292758 35612 39153 667 665 0 True 543 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 587 348 0,000908449414569438 0,000800880663549466 0,000488288700694286 0,000320439459830625 0,00102078890570773 0,00100039452520406 39710 34903 667 665 0 True 587 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 632 347 0,000911858101619824 0,000934448733415136 0,000457770656900893 0,000457770656900893 0,00102098042944651 0,00105704968657966 39859 40724 667 665 0 True 632 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 676 347 0,000969599887627713 0,000946311762468657 0,000656137941557946 0,000488288700694286 0,000922203577829815 0,00101872596980824 42383 41241 667 665 0 True 676 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 279 392 0,000876398605458086 0,000870865651195969 0,000762951094834821 0,000747692072938125 0,000696325139005198 0,000695497868608971 38309 37953 667 665 0 True 277 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 323 392 0,000931532402716014 0,000942020879619511 0,000823987182421607 0,000839246204318303 0,000688245239153358 0,000713104579551984 40719 41054 667 665 0 True 322 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 367 391 0,000877473828890087 0,000862123264214553 0,000717174029144732 0,000747692072938125 0,000728969642342729 0,000690611491859625 38356 37572 667 665 0 True 366 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 411 391 0,000890925560337249 0,000932727791095959 0,000701915007248035 0,000717174029144732 0,000726508275864848 0,00076698427943327 38944 40649 667 665 0 True 410 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 456 391 0,000871754555315613 0,000820155217524241 0,000610360875867857 0,000564583810177768 0,000835350270842668 0,00076069333390739 38106 35743 667 665 0 True 455 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 500 392 0,000872555253616039 0,000893237901345261 0,000564583810177768 0,000595101853971161 0,000893387465920447 0,000843169184736932 38141 38928 667 665 0 True 499 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 544 392 0,000926773967102052 0,000892847821086247 0,000701915007248035 0,000701915007248035 0,000832855920385539 0,000787660245306923 40511 38911 667 665 0 True 543 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 588 392 0,000898658018209938 0,000823780669343306 0,000579842832074464 0,000274662394140536 0,00095329249858298 0,000993702442505927 39282 35901 667 665 0 True 587 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 632 391 0,000848351287848866 0,000881099521520671 0,000488288700694286 0,000503547722590982 0,000897871057310977 0,000936383523846471 37083 38399 667 665 0 True 632 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 676 391 0,000883879415293498 0,00090188850473632 0,000534065766384375 0,000534065766384375 0,000902675632034229 0,000969801820924704 38636 39305 667 665 0 True 676 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 279 436 0,000883193102464561 0,000872035891973009 0,000717174029144732 0,000732433051041428 0,000783089933244269 0,000735251946639274 38606 38004 667 665 0 True 277 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 323 436 0,00082330086959267 0,000864876771925235 0,000701915007248035 0,000747692072938125 0,000673563840257477 0,000677841154617344 35988 37692 667 665 0 True 322 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 368 436 0,000845628913627416 0,000840232877914631 0,000732433051041428 0,000747692072938125 0,000688802390398603 0,000646116016398709 36964 36618 667 665 0 True 366 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 412 436 0,000931051983735759 0,000844156626402353 0,000732433051041428 0,000595101853971161 0,00084776849599354 0,000769712007922868 40698 36789 667 665 0 True 410 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 456 435 0,000942216005753132 0,000877359340213661 0,000610360875867857 0,000579842832074464 0,0009756192542161 0,000861868685461797 41186 38236 667 665 0 True 455 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 500 436 0,000815271009494109 0,000916665662783647 0,000534065766384375 0,000595101853971161 0,000870542196469562 0,000944054535673202 35637 39949 667 665 0 True 499 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 544 435 0,000933842989240102 0,000971506358021398 0,000701915007248035 0,000762951094834821 0,000899985127521879 0,000857562124994567 40820 42339 667 665 0 True 543 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 589 436 0,000868597516302503 0,000898538403688324 0,000473029678797589 0,000473029678797589 0,000937119236482787 0,00100730112272796 37968 39159 667 665 0 True 587 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 633 436 0,000961753044283535 0,000840783579456767 0,000625619897764553 0,000518806744487678 0,000993548872028216 0,000869218860375196 42040 36642 667 665 0 True 632 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 676 435 0,000937068659536105 0,000881306034598972 0,000564583810177768 0,000457770656900893 0,00099825825315854 0,000930152647719021 40961 38408 667 665 0 True 676 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 278 481 0,00084091623220205 0,000885895214116775 0,000686655985351339 0,000701915007248035 0,000713875552053204 0,000806207723630231 36758 38608 667 665 0 True 277 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 322 480 0,00084222022657703 0,000796796293778621 0,000701915007248035 0,000656137941557946 0,000745185318058742 0,000731595856022231 36815 34725 667 665 0 True 322 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 366 480 0,000792073635876042 0,000912191212753789 0,000595101853971161 0,000747692072938125 0,000758702754102286 0,000793904538012972 34623 39754 667 665 0 True 366 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 411 480 0,00083329815980085 0,000910493216332201 0,000564583810177768 0,000686655985351339 0,000858823529271872 0,000822999325607611 36425 39680 667 665 0 True 410 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 455 479 0,000836409444625364 0,000921805543843587 0,000442511635004196 0,000518806744487678 0,000943230720539674 0,00100950655884387 36561 40173 667 665 0 True 454 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 499 480 0,000772673859911427 0,000906821872717959 0,000457770656900893 0,000518806744487678 0,000815177782106882 0,000963637462503585 33775 39520 667 665 0 True 499 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 543 480 0,000865715002420968 0,000837112235842525 0,000579842832074464 0,000564583810177768 0,000877144916470278 0,000833076317519325 37842 36482 667 665 0 True 543 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 587 479 0,000794750255908896 0,000867033686298603 0,0004272526131075 0,000457770656900893 0,000882766070551259 0,000958402871589709 34740 37786 667 665 0 True 587 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 631 479 0,000820166707673858 0,000871095110171859 0,000442511635004196 0,000518806744487678 0,00089299967057969 0,000890013177405993 35851 37963 667 665 0 True 632 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 676 480 0,000938349776816787 0,000923342918982051 0,000625619897764553 0,000534065766384375 0,000953969205647405 0,000940713806080381 41017 40240 667 665 0 True 676 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 278 524 0,000833206651423659 0,000903632392953085 0,00064087891966125 0,000747692072938125 0,000724499273063004 0,000777132025399971 36421 39381 667 665 0 True 277 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 322 524 0,000855466064175511 0,000904963255013248 0,000732433051041428 0,000778210116731518 0,000693659891774938 0,000724573844137313 37394 39439 667 665 0 True 322 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 367 523 0,000877885616587449 0,000898217161122077 0,000717174029144732 0,000762951094834821 0,000771231604743693 0,000803317519629958 38374 39145 667 665 0 True 366 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 411 524 0,000905887180008073 0,000923664161548297 0,000549324788281071 0,000656137941557946 0,000904848459066122 0,000872527567439055 39598 40254 667 665 0 True 410 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 455 523 0,000900465308659472 0,000888373371056389 0,000534065766384375 0,000488288700694286 0,000989844274512673 0,000951928246831397 39361 38716 667 665 0 True 454 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 499 524 0,000887791398418438 0,000912030591470666 0,000564583810177768 0,000518806744487678 0,000936520792049894 0,000947742126627033 38807 39747 667 665 0 True 499 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 543 524 0,000900373800282281 0,000967376096455375 0,000595101853971161 0,000686655985351339 0,000900128532295481 0,000915217565281903 39357 42159 667 665 0 True 543 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 588 524 0,000870084527431867 0,00083791534225814 0,000610360875867857 0,000549324788281071 0,000838627193505811 0,000872291858387783 38033 36517 667 665 0 True 587 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 632 524 0,000897079498703384 0,000850489694136922 0,000595101853971161 0,000473029678797589 0,000932522328385673 0,000951729423208092 39213 37065 667 665 0 True 632 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 676 523 0,000902592878429176 0,000911273376850228 0,000549324788281071 0,000595101853971161 0,000958206543836366 0,000927267292915757 39454 39714 667 665 0 True 676 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 278 568 0,000877862739493151 0,000919763358958165 0,000762951094834821 0,000823987182421607 0,000678328330695927 0,000691896231925663 38373 40084 667 665 0 True 277 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 323 568 0,000943039581147856 0,000872793106593446 0,00080872816052491 0,000793469138628214 0,000751632163432692 0,00067788687267604 41222 38037 667 665 0 True 322 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 366 568 0,000830278383353528 0,000892985496471781 0,000686655985351339 0,000778210116731518 0,000696751558546324 0,000665568420680267 36293 38917 667 665 0 True 366 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 412 568 0,000973832150072824 0,00088461024385179 0,000762951094834821 0,00064087891966125 0,000894459545315159 0,000776351644837752 42568 38552 667 665 0 True 410 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 455 567 0,000908563800040927 0,000946701842727671 0,000488288700694286 0,000595101853971161 0,000995926252236298 0,000983560759170233 39715 41258 667 665 0 True 454 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 499 568 0,000932424609393632 0,000913728587892253 0,000473029678797589 0,000488288700694286 0,001051512010059 0,0010835108709451 40758 39821 667 665 0 True 499 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 543 567 0,000917142710402638 0,00076928416256939 0,000503547722590982 0,000396734569314107 0,0009898489913115 0,000863376008515158 40090 33526 667 665 0 True 543 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 588 567 0,000832794863726297 0,000937775888565543 0,000564583810177768 0,000717174029144732 0,000822585143285364 0,000840680563336728 36403 40869 667 665 0 True 587 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 632 568 0,000836295059153875 0,000854619955702945 0,000595101853971161 0,000595101853971161 0,000779861582340142 0,000791367459222654 36556 37245 667 665 0 True 632 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 676 567 0,000921626620885026 0,000846611837444378 0,00064087891966125 0,000473029678797589 0,000824340413571803 0,000864021100762063 40286 36896 667 665 0 True 676 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 277 607 0,000820349724428241 0,00090562868604333 0,000701915007248035 0,000747692072938125 0,000686348371395383 0,000734999299530526 35859 39468 667 665 0 False 277 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 322 607 0,000939722402474661 0,000904481391163879 0,000778210116731518 0,000762951094834821 0,000783026086541542 0,000773971498529125 41077 39418 667 665 0 False 322 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 367 612 0,000892892990446869 0,000877726474575085 0,000732433051041428 0,000762951094834821 0,000736189698111686 0,000681828262260286 39030 38252 667 665 0 True 366 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 411 612 0,000817238439603728 0,000841839090745862 0,000564583810177768 0,000656137941557946 0,000780903948347664 0,000718504827818434 35723 36688 667 665 0 True 410 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 454 607 0,000814561819570874 0,000844110734607175 0,0004272526131075 0,000366216525520714 0,000935941082472343 0,000990250372916119 35606 36787 667 665 0 False 454 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 499 607 0,000841396651182305 0,000853289093642782 0,000320439459830625 0,000366216525520714 0,00103709572392336 0,0010224749731903 36779 37187 667 665 0 False 499 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 543 607 0,000918469581871916 0,000841701415360328 0,000503547722590982 0,000366216525520714 0,000980937805983729 0,000999429768998285 40148 36682 667 665 0 False 543 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 587 607 0,000852880952519849 0,000824193695499908 0,000579842832074464 0,000518806744487678 0,000815060277332382 0,000843283706104706 37281 35919 667 665 0 False 587 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 631 607 0,000844736706949798 0,000922608650259203 0,000686655985351339 0,000717174029144732 0,0006829737394719 0,000759429802148011 36925 40208 667 665 0 False 631 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 676 607 0,000884634359405328 0,000891103932869482 0,000656137941557946 0,000625619897764553 0,000761337598299662 0,000825873258432759 38669 38835 667 665 0 False 676 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 277 650 0,00471526653702217 0,0527034225527196 0,000915541313801785 0,0607309071488518 0,0116900894286105 0,0392000102255205 206113 2296856 667 665 0 False 277 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 322 650 0,000955965139426167 0,000892021768773043 0,00080872816052491 0,00080872816052491 0,000710273051956822 0,00061775886262085 41787 38875 667 665 0 False 322 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 366 650 0,00085960681824343 0,000875546614304128 0,000717174029144732 0,000778210116731518 0,000667479908490696 0,000617269934588263 37575 38157 667 665 0 False 366 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 410 651 0,000784821596983609 0,000858956730347269 0,000625619897764553 0,000701915007248035 0,00068653212804188 0,000644101654954789 34306 37434 667 665 0 False 410 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 454 651 0,000812571512366957 0,00085028318105862 0,000549324788281071 0,00064087891966125 0,0008234073586692 0,000784491310365547 35519 37056 667 665 0 False 454 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 499 651 0,0008175358418296 0,000884954432315625 0,000503547722590982 0,000595101853971161 0,000823537731175597 0,000875214331853882 35736 38567 667 665 0 False 499 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 543 651 0,000817467210546706 0,000865611040648084 0,000473029678797589 0,000549324788281071 0,000838803982427033 0,000848950601062336 35733 37724 667 665 0 False 543 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 587 651 0,000824559109779054 0,000819558624186927 0,000671396963454643 0,000686655985351339 0,000672988690607063 0,000625296329112659 36043 35717 667 665 0 False 587 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 631 651 0,000924669274426646 0,000811091587976579 0,000778210116731518 0,000656137941557946 0,000698759908111563 0,000623787151056628 40419 35348 667 665 0 False 631 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 676 657 0,00110331650379891 0,0730397979384258 0,000961318379491875 0,0713359273670558 0,00074841972570887 0,0218538955867928 48228 3183131 667 665 0 True 676 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C3_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C3_1.csv new file mode 100755 index 0000000..30a3703 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C3_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 273 269 0,0101275328476164 0,0450936221304004 0,0101930266269932 0,0454261081864652 0,00148232579975694 0,00982824437419045 413490 1965215 623 665 0 True 272 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 317 269 0,0100991456784699 0,0103217760583652 0,010101472495613 0,0103303578240635 0,00132249382228428 0,00122289962051899 412331 449831 623 665 0 False 317 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 361 269 0,0103782657644005 0,0649110301503358 0,0103456168459602 0,0639810788128481 0,00135267284142189 0,0144764329964339 423727 2828873 623 665 0 True 361 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 406 269 0,010447947814635 0,0879978155505495 0,0104219119554437 0,0886701762417029 0,00144094195430015 0,0162384632428632 426572 3835013 623 665 0 True 405 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 450 269 0,0105105269493798 0,0744959216535273 0,0105745021744106 0,0725413900968948 0,00180932548812698 0,0171754788069534 429127 3246590 623 665 0 True 449 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 494 269 0,0102950391891116 0,0692218300385893 0,0103150988021668 0,0735027084763867 0,00172013404488443 0,0241109416621611 420329 3016741 623 665 0 True 493 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 539 270 0,010374248943227 0,0836561534300388 0,0104371709773404 0,0803540093080034 0,0015544780243056 0,0289078104227658 423563 3645800 623 665 0 True 537 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 583 270 0,0103486539546523 0,0719358478595206 0,0103150988021668 0,0698710612649729 0,00175175101095223 0,0229873512801723 422518 3135020 623 665 0 True 582 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 626 270 0,0100391627818005 0,0101133355246666 0,0100709544518196 0,0101472495613031 0,00186681652287255 0,00183560151044446 409882 440747 623 665 0 False 626 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 667 268 0,00995632809150417 0,0444611414092567 0,0100099183642329 0,0444647898069734 0,00177131925047121 0,00983168388033455 406500 1937651 623 665 0 True 670 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 272 313 0,0101362033030761 0,0100117769819376 0,0100862134737163 0,0100099183642329 0,0014191029305497 0,00148016275167853 413844 436321 623 665 0 False 272 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 317 313 0,0100514336806292 0,0102096624027452 0,0100404364080262 0,0102082856488899 0,00128318978191103 0,0012002493581153 410383 444945 623 665 0 False 317 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 361 314 0,0103981784205835 0,10779842717345 0,0103913939116503 0,103044174868391 0,00135849221269493 0,0350033332935866 424540 4697939 623 665 0 True 361 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 406 314 0,0103694973376926 0,0559190376949469 0,0102998397802701 0,0537727931639582 0,00151651573272405 0,013674829148871 423369 2436995 623 665 0 True 405 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 450 314 0,0107784048345872 0,0816804887017269 0,0108339055466545 0,0790112153810941 0,00180204351000446 0,0191694672076918 440064 3559699 623 665 0 True 449 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 494 314 0,0106547896122555 0,0434727698165074 0,0106507972838941 0,044083314259556 0,00178253754467964 0,0100445914043745 435017 1894577 623 665 0 True 493 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 539 314 0,0105807233486671 0,0451251956854829 0,0105745021744106 0,0471198596169986 0,00162389717312187 0,0129416901028104 431993 1966591 623 665 0 True 537 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 582 314 0,0107391183640859 0,056836460572351 0,0106965743495842 0,0553597314412146 0,00173494143648803 0,0177561243461368 438460 2476977 623 665 0 True 582 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 626 313 0,0102023094027538 0,0105822119960005 0,0101777676050965 0,0105745021744106 0,00186081979287293 0,00201928350290565 416543 461181 623 665 0 False 626 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 670 313 0,0101931735838654 0,0100846531526803 0,0101472495613031 0,0102082856488899 0,00189740197831704 0,00189372027600135 416170 439497 623 665 0 False 670 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 273 359 0,0102822784340423 0,0529257453544596 0,0102998397802701 0,05297932402533 0,00151441219188719 0,0144978265900715 419808 2306545 623 665 0 True 272 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 318 359 0,0103207321489344 0,0611222494322324 0,0103150988021668 0,0667277027542535 0,0013783302358225 0,0180052933229992 421378 2663755 623 665 0 True 317 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 362 359 0,0103549241145328 0,0402285411399866 0,0103608758678569 0,0408789196612497 0,00143068198680922 0,00926766743091457 422774 1753191 623 665 0 True 361 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 406 358 0,0104965905393329 0,0354592133802118 0,0105287251087205 0,0361333638513771 0,00151389473933539 0,00659159385334755 428558 1545340 623 665 0 True 405 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 451 358 0,0109126989229653 0,0717129973021361 0,0108491645685512 0,0687418936446174 0,00175437623562549 0,0167244868902762 445547 3125308 623 665 0 True 449 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 495 358 0,0105457721058957 0,0320571857659714 0,0106355382619974 0,0331578545815213 0,00175610829605686 0,00541476669846585 430566 1397077 623 665 0 True 493 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 539 358 0,0106915533231174 0,0293336453975405 0,0106660563057908 0,0296330205233845 0,00161324449074391 0,00413888511076743 436518 1278383 623 665 0 True 537 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 583 359 0,0108090698352528 0,0517572484656365 0,0108644235904479 0,0513008316166934 0,00190833453954323 0,0115943883628358 441316 2255621 623 665 0 True 582 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 628 359 0,010512829273711 0,056980170728951 0,0105592431525139 0,0582284275577935 0,00208215273233141 0,0148543896797862 429221 2483240 623 665 0 True 626 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 671 358 0,0101195726837056 0,0654665962227611 0,010101472495613 0,0643472953383688 0,00178236351899379 0,0219974309841908 413165 2853085 623 665 0 True 670 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 275 403 0,0102424286288642 0,0479005937824649 0,0101777676050965 0,0500495918211643 0,00145999219581748 0,0142117386414825 418181 2087545 623 665 0 True 272 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 318 404 0,0113281704934849 0,035013328698262 0,010605020218204 0,0342259861142901 0,00492898077941164 0,00687375471692657 462510 1525908 623 665 0 True 316 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 363 403 0,0105234346613214 0,0918133741311393 0,0105134660868238 0,0877851529716945 0,00135730586538847 0,028298648770219 429654 4001298 623 665 0 True 361 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 406 403 0,0105700444826206 0,0672285199150313 0,0105897611963073 0,0667277027542535 0,00150065466230216 0,0205466044949606 431557 2929871 623 665 0 True 405 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 451 403 0,0107094575687137 0,0437775831200799 0,0107118333714809 0,0449988555733577 0,00160465459774618 0,0102655565575169 437249 1907861 623 665 0 True 449 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 495 403 0,0106440372677729 0,0542125283453541 0,0105745021744106 0,0544899671931029 0,00178744256059194 0,0109098775150831 434578 2362624 623 665 0 True 493 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 539 402 0,0109600190358135 0,0426959135077336 0,0110322728313115 0,0432898451209277 0,00157355318188785 0,00671458432410268 447479 1860721 623 665 0 True 537 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 583 403 0,0117510388932384 0,0546270000935045 0,0110780498970016 0,0535133897917143 0,00579194493636572 0,011968177872981 479775 2380687 623 665 0 True 581 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 628 403 0,0110151523557003 0,0424972249805103 0,0110933089188983 0,0433051041428244 0,00192777287688263 0,00869261279449592 449730 1852062 623 665 0 True 626 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 672 402 0,0104941412581296 0,0890625510904751 0,0104219119554437 0,085145342183566 0,00188518657683409 0,0201326897023552 428458 3881415 623 665 0 True 670 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 275 448 0,00997048493685937 0,0487383026116447 0,00991836423285267 0,0492256046387427 0,00154693389596411 0,0097268253528297 407078 2124053 623 665 0 True 272 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 319 448 0,0104104738122241 0,0616216668932574 0,0105287251087205 0,0611123826962692 0,00141951534973456 0,0101367263784355 425042 2685520 623 665 0 True 316 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 363 448 0,0104871608067002 0,0366291788064806 0,0104982070649271 0,0374303807125963 0,0014607688623271 0,0060109059478341 428173 1596328 623 665 0 True 361 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 407 447 0,0109459601617064 0,0559244529267779 0,0109712367437247 0,0548561837186236 0,00170196940760714 0,0127122024994365 446905 2437231 623 665 0 True 405 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 451 447 0,0107588595705847 0,0997837234422747 0,0107423514152743 0,0975051499198901 0,00192847766686904 0,0188918270452154 439266 4348652 623 665 0 True 449 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 495 447 0,0110760904720389 0,0637641024052463 0,010955977721828 0,0623483634699016 0,00230939513454357 0,0162085493861986 452218 2778889 623 665 0 True 493 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 539 447 0,0106510911976385 0,0542713616267724 0,0105897611963073 0,0529488059815366 0,001708819722477 0,0104671709225483 434866 2365188 623 665 0 True 537 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 584 447 0,0108742697008852 0,0323078467512338 0,0108796826123445 0,0323033493553063 0,00189292943170388 0,00699452569313706 443978 1408001 623 665 0 True 581 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 628 447 0,0110183854068887 0,0438838685177122 0,0109864957656214 0,0433051041428244 0,00231724277752731 0,010003213707469 449862 1912493 623 665 0 True 626 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 672 447 0,0107482051973502 0,0774103948357963 0,0108339055466545 0,0774853131914244 0,00186034984423626 0,013745470883143 438831 3373605 623 665 0 True 670 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 274 492 0,010125010087977 0,0570043786509074 0,0101319905394064 0,0583199816891737 0,00143024362936768 0,0185097126677753 413387 2484295 623 665 0 True 272 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 318 492 0,0104140987484051 0,0576350695920392 0,0103608758678569 0,0586709391927977 0,00151979144695832 0,0109012438483777 425190 2511781 623 665 0 True 316 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 362 492 0,0107631703055025 0,0740239015942236 0,0107423514152743 0,0710765239948119 0,0015543360231385 0,0249907869729795 439442 3226019 623 665 0 True 361 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 406 491 0,0108037059094175 0,0942673231487967 0,0108186465247578 0,0897535667963684 0,00172231650022761 0,0321867638160785 441097 4108243 623 665 0 True 405 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 451 492 0,010892541338662 0,101057037191284 0,0110170138094148 0,0965285725185016 0,001941081623348 0,0388541860916015 444724 4404144 623 665 0 True 449 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 495 493 0,010913923563567 0,0468195666552511 0,0108033875028611 0,049210345616846 0,00186645965810881 0,00944014757522804 445597 2040433 623 665 0 True 493 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 538 490 0,0104813560102483 0,0422606068845724 0,0105592431525139 0,0448920424200809 0,00173954312936001 0,00847995899421123 427936 1841750 623 665 0 True 537 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 582 492 0,0108472541292126 0,10275267018542 0,0108186465247578 0,0985427634088655 0,00185981427165341 0,025972215389338 442875 4478041 623 665 0 True 581 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 627 491 0,010828394663947 0,0657062890689759 0,0108339055466545 0,0682230869001297 0,00191558054675377 0,0195130721122787 442105 2863531 623 665 0 True 626 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 671 491 0,0107138907676917 0,0804519882907085 0,0107270923933776 0,0756847486076142 0,00192934780564937 0,0185103116438638 437430 3506160 623 665 0 True 670 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 274 536 0,0101490865222056 0,0538052386631491 0,0101472495613031 0,0571450370031281 0,00156766241026939 0,0144736067454405 414370 2344874 623 665 0 True 272 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 318 536 0,0104226957254287 0,106770336231974 0,010452429999237 0,0976729991607538 0,00148076878596478 0,0343531188223404 425541 4653134 623 665 0 True 316 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 362 536 0,0105841768351637 0,0599082737743879 0,0104982070649271 0,0620584420538643 0,00142040255458177 0,0155882864063932 432134 2610849 623 665 0 True 361 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 406 535 0,0107523934682079 0,0583497425183467 0,0106660563057908 0,0601205462729839 0,00170159580857807 0,00930260272137616 439002 2542927 623 665 0 True 405 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 450 535 0,0107859731135054 0,0581118394521438 0,0108186465247578 0,0596780346379797 0,0018850229945818 0,0110627072900649 440373 2532559 623 665 0 True 449 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 494 536 0,0107216304962942 0,0635848719991785 0,0107423514152743 0,0650339513237202 0,00200424443991113 0,0167781774105162 437746 2771078 623 665 0 True 493 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 539 536 0,0105417797775342 0,0750197764954845 0,0106965743495842 0,0734416723887999 0,00186734771145736 0,0197185018939224 430403 3269420 623 665 0 True 537 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 583 535 0,0105897856891194 0,060648095404453 0,0105592431525139 0,0599374380102235 0,0017092447580508 0,014949376278044 432363 2643091 623 665 0 True 581 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 627 535 0,0106801641655219 0,0434465426555632 0,0107728694590677 0,0436713206683452 0,00178156182020205 0,00735446010175249 436053 1893434 623 665 0 True 626 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 671 535 0,010708257420924 0,0678389266826944 0,0106507972838941 0,0655680170901045 0,0020490253292497 0,0183494038362966 437200 2956473 623 665 0 True 670 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 272 572 0,0136333849764275 0,0331633386510451 0,0102998397802701 0,0352178225375753 0,00869836054070718 0,0195061999457576 556628 1445284 623 665 0 False 272 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 316 572 0,0159206217353378 0,0403398057973958 0,0110170138094148 0,0447089341573205 0,0133490351007965 0,0238192526437259 650012 1758040 623 665 0 False 316 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 361 573 0,0129349234556762 0,0408888093431106 0,0107728694590677 0,0469214923323415 0,00687200128509704 0,021634950804068 528111 1781966 623 665 0 False 361 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 405 573 0,0137671402229409 0,0412647319833114 0,0111390859845884 0,048203250171664 0,00805693195187396 0,0205398826954592 562089 1798349 623 665 0 False 405 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 449 573 0,0162141191019319 0,0707814856436123 0,0113527122911421 0,0797131303883421 0,0151061248272168 0,0481266961024775 661995 3084712 623 665 0 False 449 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 493 573 0,0137883509981617 0,0520772290075154 0,011261158159762 0,0594949263752193 0,00951590672974206 0,0308263800486134 562955 2269566 623 665 0 False 493 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 537 573 0,0138063777078181 0,0443183720344579 0,011108567940795 0,0543526359960327 0,00943125149664983 0,0230186723771403 563691 1931429 623 665 0 False 537 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 581 573 0,0112319627278184 0,0324925612268254 0,0106355382619974 0,0375066758220798 0,00333036902757157 0,0158628217754608 458582 1416051 623 665 0 False 581 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 628 580 0,0103773105447312 0,0497344987554719 0,0104371709773404 0,0495307850766766 0,00161962274997989 0,00936925139952921 423688 2167468 623 665 0 True 626 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 672 580 0,0104828010861582 0,052110913585176 0,0104982070649271 0,0515449759670405 0,00172171067159149 0,00824762987184691 427995 2271034 623 665 0 True 670 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 272 616 0,0107640520467357 0,00977669626113808 0,00978103303578241 0,00984206912336919 0,00473862223115498 0,00140333325818903 439478 426076 623 665 0 False 272 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 316 616 0,0109157360316574 0,00986558866839793 0,0101625085831998 0,00985732814526589 0,00426400051258656 0,00135027393936495 445671 429950 623 665 0 False 316 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 360 616 0,0184456102206545 0,0551847919179959 0,0108949416342412 0,0705119401846342 0,0182104512907218 0,0367646031043682 753103 2404996 623 665 0 False 360 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 405 616 0,0167763516021544 0,058786999542803 0,011306935225452 0,0606088349736782 0,014283531759073 0,0434991000738288 684950 2561983 623 665 0 False 405 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 449 616 0,0123259341772822 0,0105199368299439 0,0105287251087205 0,0104676890211337 0,00908073638317332 0,00192628228466859 503247 458467 623 665 0 False 449 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 493 616 0,011686622797591 0,0102997250507821 0,0105592431525139 0,010406652933547 0,00602953314024464 0,00203913721632007 477145 448870 623 665 0 False 493 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 537 616 0,0113521979420894 0,0100297895115449 0,0103456168459602 0,00991836423285267 0,00535507197620658 0,00201747731649384 463491 437106 623 665 0 False 537 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 581 616 0,0103199728717614 0,0101014954415106 0,0102082856488899 0,0100862134737163 0,00204085256313924 0,00170198758753075 421347 440231 623 665 0 False 581 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 625 616 0,0109256311277189 0,0102879308594214 0,0103303578240635 0,0103150988021668 0,00335629989059839 0,00137991597652865 446075 448356 623 665 0 False 625 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 670 616 0,010950050461316 0,0101511733097908 0,0105287251087205 0,0101777676050965 0,00328377805068819 0,00165509843677041 447072 442396 623 665 0 False 670 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 272 667 0,00987574673991487 0,0435815333710793 0,00976577401388571 0,0438239108873121 0,00181250223344769 0,00948050347089872 403210 1899317 623 665 0 True 272 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 316 659 0,00980253772474757 0,00974491619297729 0,0098115510795758 0,00973525597009232 0,00126625705708401 0,00130594843512652 400221 424691 623 665 0 False 316 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 360 659 0,0139473093482573 0,00972339294103879 0,0100556954299229 0,00970473792629892 0,0140554762455463 0,00118574105184535 569445 423753 623 665 0 False 360 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 405 659 0,0132475252156561 0,00986836512200621 0,0103761348897536 0,00993362325474937 0,0108018694053581 0,00133328636178641 540874 430071 623 665 0 False 405 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 449 659 0,0101227567492699 0,0100975258012277 0,0100556954299229 0,0101930266269932 0,00165233453848502 0,00162508338257906 413295 440058 623 665 0 False 449 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 493 659 0,0101147720925471 0,00997173639064473 0,0100862134737163 0,00996414129854276 0,0018288419734971 0,00170602880262449 412969 434576 623 665 0 False 493 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 537 659 0,00987155846905719 0,00988213266055962 0,00971999694819562 0,00996414129854276 0,00176117068021946 0,00179958890154815 403039 430671 623 665 0 False 537 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 581 659 0,0100455309129292 0,0100178576447987 0,0100556954299229 0,0100709544518196 0,0015029292108674 0,00130078005986536 410142 436586 623 665 0 False 581 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 625 659 0,0100167763516022 0,00994477496097763 0,00996414129854276 0,00996414129854276 0,00142701091274589 0,00136722736619397 408968 433401 623 665 0 False 625 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 669 665 0,00987893080547919 0,0434799289365552 0,00988784618905928 0,0435950255588617 0,00146494561556391 0,00916382546571295 403340 1894889 623 665 0 True 670 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C3_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C3_2.csv new file mode 100755 index 0000000..fd9c90a --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C3_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 273 269 0,00830984778819498 0,700466662192217 0,00827038986800946 0,709529259174487 0,00168997777805344 0,206943299826025 339277 30526880 623 665 11 True 272 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 317 269 0,00710350331712277 0,00704126991775617 0,00703440909437705 0,00701915007248035 0,00133186199096779 0,00118834548744539 290024 306864 623 665 0 False 317 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 361 269 0,00691882751439228 0,00697585116372988 0,00697337300679027 0,00698863202868696 0,00129778243607957 0,00136979680828302 282484 304013 623 665 0 True 361 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 406 269 0,00697910432480604 0,00705944306864667 0,00700389105058366 0,00706492713817044 0,00139911843764148 0,00132957843194564 284945 307656 623 665 0 True 405 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 450 269 0,00736226987625374 0,00742260778978804 0,00749217975127794 0,00741588464179446 0,00165207856227041 0,00155514868046719 300589 323483 623 665 0 True 449 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 494 269 0,00758635461354568 0,00769779793957313 0,00758373388265812 0,007690547035935 0,00160580017902484 0,00152873588261305 309738 335476 623 665 0 True 493 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 539 270 0,00769324124525865 0,00789421482293511 0,00770580605783169 0,00791943236438544 0,001444715679994 0,001495678990078 314102 344036 623 665 0 True 537 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 583 270 0,00792254295151366 0,00792737164495124 0,00790417334248875 0,00785839627679866 0,00174060983046918 0,00186477296375294 323464 345481 623 665 0 True 582 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 626 270 0,008421926896059 0,0082521249335286 0,00840772106507973 0,00830090791180285 0,00219701287746506 0,00192817959976462 343853 359634 623 665 0 False 626 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 667 268 0,00952848765090787 0,697595763269469 0,00944533455405508 0,707255664911879 0,00201892858875871 0,208240021304127 389032 30401764 623 665 11 True 670 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 272 313 0,00698885246399526 0,00673925601368952 0,00695811398489357 0,00677500572213321 0,00146899788533484 0,00139360351899825 285343 293702 623 665 0 False 272 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 317 313 0,00673214330107507 0,00686628450274232 0,00677500572213321 0,00677500572213321 0,00126533491383255 0,00119097093966069 274862 299238 623 665 0 False 317 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 361 314 0,00678279443635977 0,00697931599426582 0,00672922865644312 0,00695811398489357 0,00130862817433513 0,00122526863616385 276930 304164 623 665 0 True 361 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 406 314 0,00712045234304975 0,00702121520326337 0,00709544518196384 0,00700389105058366 0,00143513001787695 0,00139204620257312 290716 305990 623 665 0 True 405 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 450 314 0,00762877616398721 0,00773464905110109 0,00761425192645151 0,00779736018921187 0,00170894621831784 0,00160038551416132 311470 337082 623 665 0 True 449 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 494 314 0,00760685509721748 0,00778164224936339 0,007690547035935 0,00779736018921187 0,0016381593060988 0,00165765749169922 310575 339130 623 665 0 True 493 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 539 314 0,00792472281178462 0,00797151955191251 0,00787365529869535 0,00793469138628214 0,00145186460514703 0,00146687288530923 323553 347405 623 665 0 True 537 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 582 314 0,00820883943136998 0,00833470721895148 0,00823987182421607 0,00830090791180285 0,00172713484330821 0,00191158332860149 335153 363233 623 665 0 True 582 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 626 313 0,00804446816981503 0,00817798673841849 0,0081025406271458 0,0081177996490425 0,00199280811953854 0,00193944517867421 328442 356403 623 665 0 False 626 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 670 313 0,00797640264517471 0,007702662469862 0,00781261921110857 0,00770580605783169 0,00194182711010996 0,00182628569748942 325663 335688 623 665 0 False 670 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 273 359 0,00634613658343152 0,00643737978500841 0,00628671702143893 0,00643930724040589 0,00134916822168952 0,00135316420026789 259102 280546 623 665 0 True 272 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 318 359 0,00675497060189004 0,00678707526426503 0,00671396963454643 0,00685130083161669 0,00119566500220046 0,00119618753924578 275794 295786 623 665 0 True 317 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 362 359 0,00697724287109151 0,00707993375519366 0,00694285496299687 0,00703440909437705 0,00124447161928825 0,00130759950386412 284869 308549 623 665 0 True 361 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 406 358 0,00737422236852595 0,00735253101855118 0,00738536659800107 0,00737010757610437 0,0013509741988648 0,00133810891847686 301077 320429 623 665 0 True 405 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 451 358 0,00775684907810893 0,00758928678987466 0,00782787823300526 0,00752269779507134 0,00173860104592879 0,00168664717255602 316699 330747 623 665 0 True 449 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 495 358 0,00765344042570467 0,00773478672648662 0,007690547035935 0,00770580605783169 0,00169015509627001 0,00167691092588755 312477 337088 623 665 0 True 493 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 539 358 0,0080221797108648 0,00803498790464373 0,00807202258335241 0,00799572747386892 0,00163675015712068 0,00164384729725079 327532 350171 623 665 0 True 537 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 583 359 0,00800047907940337 0,00820570538270602 0,00807202258335241 0,00830090791180285 0,0018730980282636 0,00193653679733747 326646 357611 623 665 0 True 582 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 628 359 0,00783529955505133 0,00786438515606939 0,00773632410162509 0,00790417334248875 0,00191707659071529 0,00192511700954598 319902 342736 623 665 0 True 626 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 671 358 0,0068650902847914 0,00704728174292449 0,00683604180972 0,00697337300679027 0,00183318027858065 0,00192192272992741 280290 307126 623 665 0 True 670 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 275 403 0,00651420625960348 0,00643079431240036 0,0064087891966125 0,00648508430609598 0,0014909222698782 0,00139650212439002 265964 280259 623 665 0 True 272 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 318 404 0,0073923960350546 0,00687876707103075 0,0068207827878233 0,00689707789730678 0,00357881604094176 0,00137825967783788 301819 299782 623 665 0 True 316 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 363 403 0,00694261003487654 0,00727107308211017 0,00698863202868696 0,00721751735713741 0,00135732992109412 0,00134515634353239 283455 316879 623 665 0 True 361 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 406 403 0,00717438551514691 0,00736230597092411 0,00704966811627375 0,00740062561989776 0,00149757455805233 0,00137118427866833 292918 320855 623 665 0 True 405 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 451 403 0,00753016810274147 0,00763084181040837 0,00752269779507134 0,00762951094834821 0,00153110461775637 0,00156431015210624 307444 332558 623 665 0 True 449 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 495 403 0,00755118293546597 0,0078441009826007 0,00752269779507134 0,00794995040817884 0,00162576553122843 0,00162933475894379 308302 341852 623 665 0 True 493 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 539 402 0,00796048231735312 0,00782964506711962 0,00796520943007553 0,00781261921110857 0,00167130745133968 0,00156654961439954 325013 341222 623 665 0 True 537 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 583 403 0,00832224115108379 0,00795720131181697 0,00802624551766232 0,00794995040817884 0,00343922361121267 0,00195370666692114 339783 346781 623 665 0 True 581 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 628 403 0,00748174581335179 0,00715533397467117 0,00741588464179446 0,00709544518196384 0,00173701086573781 0,001884387198197 305467 311835 623 665 0 True 626 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 672 402 0,00678311284291621 0,00697401549192276 0,00674448767833982 0,00700389105058366 0,00168395822492875 0,00185100362509296 276943 303933 623 665 0 True 670 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 275 448 0,00651491655115244 0,00664825258385148 0,00650034332799268 0,00663767452506294 0,00149799120023646 0,00144096117755772 265993 289736 623 665 0 True 272 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 319 448 0,00676741295040291 0,00669506221493308 0,00672922865644312 0,00669871061264973 0,00143080365294942 0,00145639115999859 276302 291776 623 665 0 True 316 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 363 448 0,00680571970842287 0,00690228661605949 0,00675974670023652 0,00689707789730678 0,00137722685943374 0,00133747736029442 277866 300807 623 665 0 True 361 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 407 447 0,00711513740283855 0,00727417077828469 0,00709544518196384 0,00727855344472419 0,00151806843482425 0,00153964684952272 290499 317014 623 665 0 True 405 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 451 447 0,00731842774271428 0,00745943595541842 0,0072327763790341 0,00749217975127794 0,00177077777095496 0,00189346804972304 298799 325088 623 665 0 True 449 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 495 447 0,00765868188747978 0,00761627116543935 0,007690547035935 0,00756847486076143 0,00190880260272163 0,00190793123618377 312691 331923 623 665 0 True 493 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 539 447 0,00724534119160715 0,00739486619960292 0,0072632944228275 0,00740062561989776 0,00170638689623066 0,00168286315374826 295815 322274 623 665 0 True 537 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 584 447 0,00700695265208781 0,00729883761819288 0,00708018616006714 0,0072327763790341 0,00187220236340528 0,00195167556579539 286082 318089 623 665 0 True 581 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 628 447 0,00707276483802107 0,00700164235261993 0,00704966811627375 0,00706492713817044 0,00185607975847432 0,00176582614522534 288769 305137 623 665 0 True 626 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 672 447 0,00700678120240358 0,00700490067007757 0,00708018616006714 0,00706492713817044 0,00182231234785263 0,00184211287370455 286075 305279 623 665 0 True 670 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 274 492 0,00673596417975226 0,00664547613024321 0,00679026474402991 0,00669871061264973 0,00143498910709573 0,00158275132353861 275018 289615 623 665 0 True 272 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 318 492 0,00672805300146553 0,00683806104870783 0,00671396963454643 0,00689707789730678 0,0014522312756384 0,00147812503767659 274695 298008 623 665 0 True 316 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 362 492 0,00675972220742448 0,0069371643803948 0,00679026474402991 0,00700389105058366 0,00136801088357476 0,00142430623932074 275988 302327 623 665 0 True 361 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 406 491 0,00711464754659788 0,00704280729289463 0,00708018616006714 0,00701915007248035 0,00156337905232258 0,00173021597166531 290479 306931 623 665 0 True 405 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 451 492 0,00738142325526372 0,0074858007917482 0,00737010757610437 0,00758373388265812 0,00176812802912634 0,00182022569300896 301371 326237 623 665 0 True 449 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 495 493 0,00726518036935405 0,00697112430882654 0,0072327763790341 0,00698863202868696 0,00168670496195171 0,00175558949928364 296625 303807 623 665 0 True 493 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 538 490 0,00685188865910549 0,00688370043901239 0,0068055237659266 0,00686655985351339 0,00162587462251029 0,00154186384206662 279751 299997 623 665 0 True 537 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 582 492 0,00666829054010447 0,00683806104870783 0,00677500572213321 0,00689707789730678 0,00168817941524987 0,00183695771177737 272255 298008 623 665 0 True 581 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 627 491 0,00704342244920528 0,00707958956672983 0,00704966811627375 0,00711070420386053 0,00173599220313879 0,00172318681740438 287571 308534 623 665 0 True 626 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 671 491 0,00704577375916046 0,00725122488069567 0,00695811398489357 0,00730907148851759 0,0017646565045603 0,00174877626574857 287667 316014 623 665 0 True 670 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 274 536 0,00682693048364364 0,00652000796222646 0,00686655985351339 0,00654612039368277 0,00147995503748361 0,00142841630854986 278732 284147 623 665 0 True 272 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 318 536 0,00682746932550837 0,00687537107818757 0,0068207827878233 0,00683604180972 0,00135838237443335 0,00136637681475007 278754 299634 623 665 0 True 316 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 362 536 0,00703955258490403 0,00704450528931622 0,00706492713817044 0,00706492713817044 0,00137226562199154 0,00140156213458938 287413 307005 623 665 0 True 361 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 406 535 0,00708971386394806 0,00709856582403594 0,00711070420386053 0,00709544518196384 0,00155426170144219 0,00162315506824221 289461 309361 623 665 0 True 405 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 450 535 0,00704729231350652 0,0068738566489467 0,00704966811627375 0,00695811398489357 0,00174059166397392 0,00205465541363951 287729 299568 623 665 0 True 449 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 494 536 0,0069593876111193 0,00677911303780165 0,00694285496299687 0,0068055237659266 0,00174857522497708 0,00190109617125362 284140 295439 623 665 0 True 493 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 539 536 0,00679300793897763 0,006780879871916 0,00688181887541009 0,0068055237659266 0,00176219182025533 0,00174728858345003 277347 295516 623 665 0 True 537 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 583 535 0,0067201418231788 0,00678826845093966 0,00669871061264973 0,00683604180972 0,00161181244213017 0,0015426699743741 274372 295838 623 665 0 True 581 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 627 535 0,00688047177074826 0,00693386017114198 0,00688181887541009 0,00697337300679027 0,00178026497909955 0,00169748665869785 280918 302183 623 665 0 True 626 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 671 535 0,00716980535929669 0,00721253809736059 0,00715648126955062 0,0072480354009308 0,00191814845906579 0,00172904223427149 292731 314328 623 665 0 True 670 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 272 572 0,00693193116883006 0,00688175003771732 0,00689707789730678 0,00688181887541009 0,00124310033324526 0,00132955761243288 283019 299912 623 665 0 False 272 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 316 572 0,0068357478959756 0,00693828872937666 0,00683604180972 0,00692759594110018 0,00142264062823155 0,00136804540684516 279092 302376 623 665 0 False 316 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 361 573 0,00686974391907771 0,00696479124109197 0,00689707789730678 0,00698863202868696 0,00138438716772464 0,00130485614389495 280480 303531 623 665 0 False 361 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 405 573 0,00678830531906725 0,00689618300730081 0,00683604180972 0,00688181887541009 0,00146836945278406 0,00138036637862456 277155 300541 623 665 0 False 405 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 449 573 0,0069155209847678 0,00673650250597884 0,00689707789730678 0,00668345159075303 0,00185720432788067 0,00185514071492895 282349 293582 623 665 0 False 449 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 493 573 0,00691850910783585 0,00689306236522871 0,00689707789730678 0,00695811398489357 0,00191060776603707 0,00196579785026095 282471 300405 623 665 0 False 493 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 537 573 0,00694858628101265 0,00706309146636332 0,00704966811627375 0,00698863202868696 0,00178009030257334 0,00172368835540306 283699 307815 623 665 0 False 537 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 581 573 0,00695483194808112 0,00717224510119428 0,00695811398489357 0,00721751735713741 0,00161214875218288 0,00159604541467453 283954 312572 623 665 0 False 581 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 628 580 0,0067623919239361 0,00694808662764717 0,00675974670023652 0,00694285496299687 0,00150514159877797 0,00147145204647597 276097 302803 623 665 0 True 626 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 672 580 0,00702625298796999 0,00703018704922067 0,00697337300679027 0,00709544518196384 0,00163036394302674 0,00174357184475239 286870 306381 623 665 0 True 670 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 272 616 0,00716640085842408 0,0069400785093886 0,00712596322575723 0,00688181887541009 0,0013984752730598 0,00141542232937854 292592 302454 623 665 0 False 272 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 316 616 0,00694883120913298 0,00685042888750831 0,00697337300679027 0,0068055237659266 0,00143168191368546 0,00132143135303195 283709 298547 623 665 0 False 316 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 360 616 0,00668210448609121 0,00682502777887727 0,00668345159075303 0,00686655985351339 0,00152596441783477 0,00139203887244834 272819 297440 623 665 0 False 360 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 405 616 0,00678181472387845 0,00663136440322596 0,00685130083161669 0,00665293354695964 0,00133651128895824 0,0013639427227945 276890 289000 623 665 0 False 405 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 449 616 0,00678041863359255 0,00660844145153454 0,0068055237659266 0,00662241550316625 0,00179663819443431 0,00186922334859595 276833 288001 623 665 0 False 449 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 493 616 0,00718401119027596 0,006844807142599 0,00700389105058366 0,00689707789730678 0,00239204618495615 0,00186705442377154 293311 298302 623 665 0 False 493 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 537 616 0,00691135720672215 0,00689462268626476 0,00685130083161669 0,00692759594110018 0,00179424404140967 0,00184503562133367 282179 300473 623 665 0 False 537 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 581 616 0,00706108176668123 0,00690458120581839 0,00717174029144732 0,00697337300679027 0,00142446390978817 0,0017285124132553 288292 300907 623 665 0 False 581 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 625 616 0,00703440909437705 0,00675022415273707 0,00701915007248035 0,00677500572213321 0,001389716971724 0,00136422901424684 287203 294180 623 665 0 False 625 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 670 616 0,00758052532428177 0,00695988081900792 0,00738536659800107 0,00689707789730678 0,00185875205116078 0,00147796581654923 309500 303317 623 665 0 False 670 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 272 667 0,00841947761485567 0,700925488360407 0,00825513084611276 0,705714503700313 0,00182388147806455 0,208800391948878 343753 30546876 623 665 12 True 272 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 316 659 0,00726199630378974 0,00688067158053064 0,0072327763790341 0,00688181887541009 0,00153299309819499 0,00129512301439116 296495 299865 623 665 0 False 316 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 360 659 0,00657448307001724 0,00652179774223841 0,00662241550316625 0,00653086137178607 0,0012705214332776 0,00119814420883762 268425 284225 623 665 0 False 360 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 405 659 0,00640298440016062 0,00618614515230626 0,00636301213092241 0,00619516289005875 0,00138784003173643 0,00134856996473231 261423 269597 623 665 0 False 405 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 449 659 0,00650421319229392 0,00637462275510245 0,00656137941557946 0,00636301213092241 0,00158739273393728 0,00148688181507064 265556 277811 623 665 0 False 449 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 493 659 0,00690655661556364 0,00650555204674538 0,0068207827878233 0,00643930724040589 0,00208602780925161 0,00162465543307321 281983 283517 623 665 0 False 493 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 537 659 0,00660083733576498 0,00644040864349016 0,00660715648126955 0,0063935301747158 0,00167624236638868 0,00170336694702988 269501 280678 623 665 0 False 537 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 581 659 0,00681710886601832 0,00670091341881827 0,00679026474402991 0,00671396963454643 0,00136301796175599 0,00125648399575598 278331 292031 623 665 0 False 581 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 625 659 0,00716556810281495 0,00691476918434791 0,00717174029144732 0,00688181887541009 0,00131653301516567 0,00129388841090994 292558 301351 623 665 0 False 625 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 669 665 0,00844306419284367 0,713607181148109 0,00840772106507973 0,730861371786068 0,00175632325956827 0,203845365394766 344716 31099554 623 665 11 True 670 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C3_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C3_3.csv new file mode 100755 index 0000000..478d89a --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C3_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 273 269 0,00109191405325301 0,0707546618893308 0,000946059357595178 0,0700541695277333 0,000772413171515644 0,0234444285922185 44581 3083543 623 665 0 True 272 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 317 269 0,000896314456355707 0,000875408938918594 0,000747692072938125 0,000762951094834821 0,000638660777716393 0,000639905984904235 36595 38151 623 665 0 False 317 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 361 269 0,000896069528235375 0,000829815440409217 0,000793469138628214 0,000732433051041428 0,00068050729779354 0,000638906082578669 36585 36164 623 665 0 True 361 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 406 269 0,00093261280378894 0,000881466655882095 0,000778210116731518 0,000732433051041428 0,000722205083257684 0,000693463148298548 38077 38415 623 665 0 True 405 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 450 269 0,000924481190193911 0,000869626572726162 0,000671396963454643 0,000625619897764553 0,000875071622720518 0,000812971316811698 37745 37899 623 665 0 True 449 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 494 269 0,000934866142495996 0,000949822484799777 0,000701915007248035 0,000762951094834821 0,000841400758629449 0,00078990042957171 38169 41394 623 665 0 True 493 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 539 270 0,000933641501894335 0,000944361361173591 0,000762951094834821 0,000762951094834821 0,000789246647397052 0,000818849078596216 38119 41156 623 665 0 True 537 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 583 270 0,00103104941535045 0,00108976951419519 0,000762951094834821 0,000762951094834821 0,000979388634053979 0,00104345798214156 42096 47493 623 665 0 True 582 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 626 270 0,00103210260626788 0,00104569044492669 0,000656137941557946 0,00080872816052491 0,00101322075418625 0,000955976570997268 42139 45572 623 665 0 False 626 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 667 268 0,00107200139707 0,0710386862096876 0,000747692072938125 0,0700541695277333 0,000955436285540943 0,0243719141218835 43768 3095921 623 665 0 True 670 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 272 313 0,000955783003972367 0,000886790104122747 0,000778210116731518 0,000717174029144732 0,000768792803636371 0,000719324079625113 39023 38647 623 665 0 False 272 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 317 313 0,000925093510494741 0,000873687996599418 0,000778210116731518 0,000778210116731518 0,000639537952008877 0,000575805706491508 37770 38076 623 665 0 False 317 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 361 314 0,000885194719692625 0,000858819054961735 0,000747692072938125 0,000732433051041428 0,000709273510454329 0,000636925178950088 36141 37428 623 665 0 True 361 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 406 314 0,000782618822897497 0,000849938992594785 0,000595101853971161 0,000656137941557946 0,000699634534375895 0,000733431341790306 31953 37041 623 665 0 True 405 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 450 314 0,000913802324147427 0,000813225556452358 0,000610360875867857 0,000564583810177768 0,000917724064323292 0,000796103154711456 37309 35441 623 665 0 True 449 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 494 314 0,000954754305866971 0,000866941902708247 0,000701915007248035 0,000701915007248035 0,00090758097902626 0,000755917478524069 38981 37782 623 665 0 True 493 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 539 314 0,000969156079342505 0,00101400216035626 0,000839246204318303 0,000854505226215 0,000767379678774992 0,000812831938822652 39569 44191 623 665 0 True 537 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 582 314 0,000999453687827599 0,00101673272216935 0,000717174029144732 0,000686655985351339 0,000996405817941676 0,00104201932009983 40806 44310 623 665 0 True 582 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 626 313 0,000915443342553652 0,000959712166660643 0,000457770656900893 0,000595101853971161 0,00106040937227001 0,00100073930028156 37376 41825 623 665 0 False 626 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 670 313 0,000950957920001822 0,000942823986035127 0,000534065766384375 0,000534065766384375 0,000981187585068339 0,0009630036268021 38826 41089 623 665 0 False 670 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 273 359 0,000894061117648651 0,000853610336209028 0,000747692072938125 0,000686655985351339 0,000695271692833737 0,00071038301920868 36503 37201 623 665 0 True 272 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 318 359 0,000972119709598525 0,000911847024289954 0,000854505226215 0,000747692072938125 0,000751346027450716 0,000689525625264475 39690 39739 623 665 0 True 317 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 362 359 0,00100699747393383 0,000922287407692956 0,000839246204318303 0,000762951094834821 0,000774924740686715 0,000698168323429331 41114 40194 623 665 0 True 361 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 406 358 0,000913949281019626 0,00084165552356515 0,000717174029144732 0,000656137941557946 0,000741578671600915 0,000678825389851634 37315 36680 623 665 0 True 405 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 451 358 0,000993330484819294 0,000849709533618895 0,000701915007248035 0,000549324788281071 0,000945363629819375 0,000841888814353376 40556 37031 623 665 0 True 449 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 495 358 0,000909809995786012 0,000989954859682968 0,000625619897764553 0,000686655985351339 0,000869898541962401 0,000946940123500482 37146 43143 623 665 0 True 493 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 539 358 0,000940866881444135 0,000908864057603381 0,000671396963454643 0,000610360875867857 0,000865944620226203 0,000895847997471509 38414 39609 623 665 0 True 537 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 583 359 0,0010433937926152 0,000925729292331309 0,000701915007248035 0,000518806744487678 0,00104039305000444 0,000997971635638264 42600 40344 623 665 0 True 582 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 628 359 0,00101534952283716 0,000958289521010124 0,000625619897764553 0,000473029678797589 0,0010766422427317 0,0010744146192694 41455 41763 623 665 0 True 626 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 671 358 0,000898273881318365 0,000936123783939134 0,000473029678797589 0,000473029678797589 0,0009583513771491 0,00104062297744214 36675 40797 623 665 0 True 670 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 275 403 0,00093915238460181 0,000933691518794698 0,00080872816052491 0,00080872816052491 0,000784567493138186 0,000749536971166092 38344 40691 623 665 0 True 272 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 318 404 0,000960534609506811 0,000966343531063869 0,000839246204318303 0,000869764248111696 0,000748276512023778 0,000678971460853375 39217 42114 623 665 0 True 316 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 363 403 0,00082249312088758 0,000952208858149035 0,000686655985351339 0,000839246204318303 0,000639518424060784 0,000733126834419181 33581 41498 623 665 0 True 361 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 406 403 0,000881716740383908 0,000862352723190443 0,000671396963454643 0,00064087891966125 0,000776732601108296 0,000766077290198143 35999 37582 623 665 0 True 405 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 451 403 0,000853623484981804 0,000901980288326676 0,000579842832074464 0,000656137941557946 0,000808776895071839 0,000810370105207869 34852 39309 623 665 0 True 449 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 495 403 0,0009558074967844 0,000978504856786048 0,000701915007248035 0,000656137941557946 0,000853776634947763 0,000921098273782415 39024 42644 623 665 0 True 493 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 539 402 0,000931069756630847 0,000888465154646745 0,000732433051041428 0,000686655985351339 0,00086232568534112 0,000796707206182932 38014 38720 623 665 0 True 537 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 583 403 0,00098980351988651 0,000984631411442316 0,000747692072938125 0,000564583810177768 0,000928744069531959 0,00109022958757877 40412 42911 623 665 0 True 581 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 628 403 0,000964208531311795 0,000906477684254124 0,000656137941557946 0,000488288700694286 0,000937750951071595 0,000974874402180307 39367 39505 623 665 0 True 626 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 672 402 0,00100596877582844 0,00085822246162442 0,00064087891966125 0,000488288700694286 0,000946329254285258 0,000934463256200582 41072 37402 623 665 0 True 670 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 275 448 0,000880663549466479 0,000896909244959503 0,000732433051041428 0,000762951094834821 0,000732115377441719 0,000780621886369755 35956 39088 623 665 0 True 272 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 319 448 0,000965090272544991 0,000984677303237494 0,000839246204318303 0,000823987182421607 0,000781787672951344 0,000847487254431536 39403 42913 623 665 0 True 316 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 363 448 0,000862293940441564 0,000855629575196862 0,000701915007248035 0,000686655985351339 0,000702919474120041 0,000708905974563891 35206 37289 623 665 0 True 361 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 407 447 0,000790995364612859 0,000810311427458552 0,000610360875867857 0,000625619897764553 0,000738498640816349 0,000743652714551444 32295 35314 623 665 0 True 405 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 451 447 0,000938442093052847 0,000953608557901965 0,000610360875867857 0,000564583810177768 0,000953365116508459 0,000983325676674316 38315 41559 623 665 0 True 449 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 495 447 0,000952035603731284 0,000948629298125148 0,000656137941557946 0,000625619897764553 0,000965291889369819 0,000953311909850385 38870 41342 623 665 0 True 493 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 539 447 0,000857052478666455 0,000902576881663991 0,000534065766384375 0,000625619897764553 0,000922825206725908 0,000844617538847672 34992 39335 623 665 0 True 537 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 584 447 0,000887986900264412 0,000910217865561133 0,000503547722590982 0,000473029678797589 0,000917960762040037 0,00100421946171414 36255 39668 623 665 0 True 581 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 628 447 0,000972193188034625 0,000880571765876123 0,000686655985351339 0,000503547722590982 0,000925564337459049 0,000929973239668779 39693 38376 623 665 0 True 626 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 672 447 0,000922938143035818 0,000860585889076089 0,000518806744487678 0,000411993591210803 0,000973590758979199 0,000980154247071671 37682 37505 623 665 0 True 670 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 274 492 0,000890509659903834 0,000910584999922558 0,000717174029144732 0,000747692072938125 0,000770300636195865 0,000797283076855063 36358 39684 623 665 0 True 272 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 318 492 0,000917549724388509 0,000948904648896216 0,000778210116731518 0,00080872816052491 0,000796100392470977 0,000827659452904551 37462 41354 623 665 0 True 316 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 362 492 0,000914684065380623 0,000908038005290177 0,000793469138628214 0,000762951094834821 0,000790241541823883 0,000789204790926186 37345 39573 623 665 0 True 361 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 406 491 0,000780120556070109 0,000848608130534622 0,000518806744487678 0,000549324788281071 0,000805960180244738 0,00085518752833785 31851 36983 623 665 0 True 405 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 451 492 0,000866286268802979 0,000855216549040259 0,000473029678797589 0,0004272526131075 0,000963021771063869 0,000954917849185343 35369 37271 623 665 0 True 449 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 495 493 0,000825750664887999 0,000890507339532168 0,000503547722590982 0,000549324788281071 0,000879694330042592 0,000908259752897589 33714 38809 623 665 0 True 493 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 538 490 0,000880369635722081 0,000885505133857762 0,000595101853971161 0,000610360875867857 0,000867243217798105 0,000846118800502549 35944 38591 623 665 0 True 537 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 582 492 0,000863249160110859 0,000934425787517547 0,000534065766384375 0,000534065766384375 0,000851518537517403 0,00101131706603126 35245 40723 623 665 0 True 581 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 627 491 0,000961465336364074 0,000843215844601203 0,000701915007248035 0,000442511635004196 0,000938516700952197 0,000916999128668591 39255 36748 623 665 0 True 626 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 671 491 0,000917549724388509 0,000969257660057675 0,000518806744487678 0,000625619897764553 0,000946882117727458 0,00098033723042366 37462 42241 623 665 0 True 670 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 274 536 0,000862857275118328 0,000940712963456937 0,000732433051041428 0,00080872816052491 0,000725755969118837 0,000758395898089514 35229 40997 623 665 0 True 272 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 318 536 0,000978046970110564 0,000935664865987353 0,000854505226215 0,000823987182421607 0,000790365723066656 0,00075591844320837 39932 40777 623 665 0 True 316 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 362 536 0,00096447795224416 0,000843582978962627 0,000793469138628214 0,000686655985351339 0,000787510149710453 0,000746892820436441 39378 36764 623 665 0 True 361 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 406 535 0,000816908759744006 0,000887478481050417 0,000579842832074464 0,000610360875867857 0,000809375790946186 0,000877981283298355 33353 38677 623 665 0 True 405 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 450 535 0,000911989856056968 0,000931121578264728 0,000518806744487678 0,000473029678797589 0,000997022922575387 0,0010691154103334 37235 40579 623 665 0 True 449 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 494 536 0,000890779080836199 0,000921208950506273 0,000503547722590982 0,000488288700694286 0,000985742990050797 0,00101950112833641 36369 40147 623 665 0 True 493 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 539 536 0,000937682815879817 0,000882866355635025 0,000610360875867857 0,000488288700694286 0,000964737261420701 0,000940046692286703 38284 38476 623 665 0 True 537 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 583 535 0,000913851309771493 0,000923664161548297 0,000701915007248035 0,000656137941557946 0,00081746975932252 0,000874427988531116 37311 40254 623 665 0 True 581 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 627 535 0,000831286040407507 0,000828530470144232 0,000534065766384375 0,000457770656900893 0,000846775025611338 0,000901476639978857 33940 36108 623 665 0 True 626 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 671 535 0,00091382681695946 0,000879653929972562 0,000534065766384375 0,000488288700694286 0,000968391605997223 0,000950353017471719 37310 38336 623 665 0 True 670 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 272 572 0,000908903761740783 0,000899616860875007 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,000676074692587932 0,000674215929399878 37109 39206 623 665 0 False 272 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 316 572 0,000902927515604677 0,000961180704106341 0,000732433051041428 0,000854505226215 0,000738618735937865 0,00077646448344741 36865 41889 623 665 0 False 316 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 361 573 0,00091010390953041 0,000838374260209921 0,000747692072938125 0,000717174029144732 0,000750285784810862 0,000676086535892246 37158 36537 623 665 0 False 361 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 405 573 0,000848259559146528 0,000827245499879247 0,00064087891966125 0,000610360875867857 0,000771225121890703 0,000729906000073937 34633 36052 623 665 0 False 405 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 449 573 0,00085732189959882 0,000823941290626429 0,0004272526131075 0,0004272526131075 0,000938901269045435 0,000928211936677158 35003 35908 623 665 0 False 449 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 493 573 0,000871037874337424 0,000897666459579941 0,000457770656900893 0,0004272526131075 0,00102997380161449 0,00108628457152131 35563 39121 623 665 0 False 493 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 537 573 0,000967319118440014 0,000878254230219632 0,000595101853971161 0,000518806744487678 0,00103619709916156 0,00091282932464682 39494 38275 623 665 0 False 537 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 581 573 0,000863543073855258 0,000897964756248598 0,000595101853971161 0,00064087891966125 0,00083089073606005 0,000832783255104157 35257 39134 623 665 0 False 581 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 628 580 0,000882010654128306 0,000915082395850005 0,000701915007248035 0,000686655985351339 0,000750397312620178 0,000753190670156414 36011 39880 623 665 0 True 626 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 672 580 0,000931045263818814 0,000924604943349447 0,000671396963454643 0,000595101853971161 0,000830342560602391 0,000896111133065663 38013 40295 623 665 0 True 670 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 272 616 0,000938760499609278 0,000852646608510289 0,000793469138628214 0,000717174029144732 0,000696893444922744 0,000688424146413695 38328 37159 623 665 0 False 272 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 316 616 0,000896118513859441 0,00096095124513045 0,000778210116731518 0,000778210116731518 0,000716903153034937 0,000756252605429045 36587 41879 623 665 0 False 316 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 360 616 0,000904348098702604 0,000899570969079829 0,000762951094834821 0,000793469138628214 0,000721610383034783 0,000701264627427 36923 39204 623 665 0 False 360 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 405 616 0,000850145505673086 0,000894362250327122 0,000656137941557946 0,000717174029144732 0,000712518873054253 0,000727648478195153 34710 38977 623 665 0 False 405 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 449 616 0,000829571543565181 0,000803450604079436 0,000457770656900893 0,000396734569314107 0,000882070032796608 0,000937954055920015 33870 35015 623 665 0 False 449 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 493 616 0,000869764248111696 0,000842045603824163 0,000442511635004196 0,000396734569314107 0,00102662539083688 0,000979808077736319 35511 36697 623 665 0 False 493 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 537 616 0,000901262004386418 0,00084422546409512 0,000518806744487678 0,000442511635004196 0,000981098761783867 0,000994753884700396 36797 36792 623 665 0 False 537 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 581 616 0,00080089046067428 0,000930249634156345 0,000549324788281071 0,000701915007248035 0,000816677133500368 0,00085747221106084 32699 40541 623 665 0 False 581 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 625 616 0,000903049979664843 0,00094087358474006 0,000701915007248035 0,000793469138628214 0,000755013444508304 0,000710459529720202 36870 41004 623 665 0 False 625 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 670 616 0,000936433682466123 0,000924146025397667 0,000732433051041428 0,000686655985351339 0,000813379989691406 0,0008422501896349 38233 40275 623 665 0 False 670 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 272 667 0,00103112289378655 0,070585871866666 0,000885023270008392 0,0701915007248035 0,000717944690304715 0,0237031555068135 42099 3076187 623 665 0 True 272 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 316 659 0,000948337189114268 0,000891975876977865 0,000839246204318303 0,000778210116731518 0,000692669071927085 0,000631115630344037 38719 38873 623 665 0 False 316 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 360 659 0,000879904272293449 0,00098408070990018 0,000762951094834821 0,000885023270008392 0,000657849035624127 0,00063828411412987 35925 42887 623 665 0 False 360 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 405 659 0,000878581660443655 0,000858360137009954 0,000701915007248035 0,000686655985351339 0,000686043657180629 0,000728933942418727 35871 37408 623 665 0 False 405 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 449 659 0,000852839714996741 0,000788512824748986 0,000656137941557946 0,000579842832074464 0,000751231050999654 0,00075781546166517 34820 34364 623 665 0 False 449 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 493 659 0,000846545062304203 0,000938188914722145 0,000549324788281071 0,000656137941557946 0,000821193317273272 0,00084185611862118 34563 40887 623 665 0 False 493 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 537 659 0,000907532164266922 0,00079144989964038 0,000564583810177768 0,000411993591210803 0,000893921238410764 0,000831264242299262 37053 34492 623 665 0 False 537 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 581 659 0,000914610586944523 0,000925063861301227 0,000762951094834821 0,00080872816052491 0,000755648561965523 0,000649604524740952 37342 40315 623 665 0 False 581 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 625 659 0,000968225352485243 0,000889245315164772 0,00080872816052491 0,000717174029144732 0,000723268562363098 0,000726130973819731 39531 38754 623 665 0 False 625 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 669 665 0,000945324573234182 0,0721634482177061 0,000778210116731518 0,0717021438925765 0,000749197005140511 0,0232626917991908 38596 3144939 623 665 0 True 670 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C4_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C4_1.csv new file mode 100755 index 0000000..7c31b9d --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C4_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 249 246 0,0104270554459706 0,0458830986828481 0,010452429999237 0,0456244754711223 0,00157729925042856 0,00841825311661621 425719 1999621 623 665 0 True 249 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 293 246 0,0103995500180573 0,0103395361830991 0,0103303578240635 0,0104219119554437 0,00148173471531883 0,00142512336337783 424596 450605 623 665 0 False 293 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 337 245 0,0102947452753672 0,0639791972492458 0,0102998397802701 0,0626535439078355 0,00138685914885771 0,00913850620865551 420317 2788263 623 665 0 True 337 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 382 244 0,0104521605783047 0,0863135178298229 0,0104371709773404 0,0864271000228885 0,001360538182118 0,0132945108192624 426744 3761610 623 665 0 True 382 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 426 244 0,0107136703323834 0,0741559322889508 0,0106202792401007 0,0714122224765393 0,00158246013321068 0,0128608257685509 437421 3231773 623 665 0 True 426 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 470 245 0,0107709835125411 0,0697685160486476 0,0105439841306172 0,0718699931334401 0,00226172804816731 0,020144761241586 439761 3040566 623 665 0 True 470 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 514 244 0,0107593249340133 0,0890567457783851 0,0108033875028611 0,0900434882124056 0,00157012130329999 0,0220193213498995 439285 3881162 623 665 0 True 514 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 558 244 0,0104967864818292 0,0730456032505159 0,0104829480430304 0,0685435263599603 0,00160242396996343 0,0194977655556911 428566 3183384 623 665 0 True 559 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 603 246 0,0105266187268857 0,0101751288268738 0,0106660563057908 0,0101777676050965 0,00191721777836513 0,00205430648665255 429784 443440 623 665 0 False 603 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 644 244 0,0103168622846332 0,0455155512952672 0,0103303578240635 0,0453955901426719 0,00191321462113632 0,00840396110064071 421220 1983603 623 665 0 True 647 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 249 289 0,0106296599871094 0,0106399668202321 0,0106355382619974 0,0106660563057908 0,00153683866074468 0,00164586826266324 433991 463698 623 665 0 False 249 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 293 289 0,0102644476668821 0,0101950688118786 0,0102693217364767 0,0101930266269932 0,00134882862085846 0,00135412533698475 419080 444309 623 665 0 False 293 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 337 289 0,0104873322563844 0,107832341210086 0,0104982070649271 0,106309605554284 0,00129164969264598 0,0247779160813796 428180 4699417 623 665 0 True 337 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 382 288 0,0102802210378315 0,0533233289219845 0,0103456168459602 0,0523537041275654 0,00130915805250865 0,00842392291400801 419724 2323872 623 665 0 True 382 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 426 288 0,0104880670407454 0,0816633251703303 0,0105439841306172 0,0809796292057679 0,00168394798755088 0,0175364907418584 428210 3558951 623 665 0 True 426 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 470 288 0,010366876606805 0,0449053739865801 0,0103913939116503 0,0448004882887007 0,0017143595178752 0,0101426626988003 423262 1957011 623 665 0 True 470 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 514 288 0,0103989866833806 0,0468205992206426 0,010406652933547 0,0497291523613336 0,00161792274324894 0,010528883100079 424573 2040478 623 665 0 True 514 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 559 288 0,0107897450065586 0,0550439499985946 0,0107423514152743 0,0547798886091402 0,00183215438555862 0,011950931743444 440527 2398858 623 665 0 True 559 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 603 289 0,0103595532560071 0,0103869194616204 0,01025406271458 0,0104371709773404 0,00197722067961596 0,00202919307616763 422963 452670 623 665 0 False 603 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 647 289 0,00995473605872201 0,0099369045181046 0,00999465934233616 0,0100099183642329 0,00184429144589828 0,00204310810937858 406435 433058 623 665 0 False 647 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 250 333 0,0104818458664889 0,0535104297709254 0,010452429999237 0,0516823071641108 0,00157155021688737 0,0111586331656109 427956 2332026 623 665 0 True 249 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 294 334 0,0103267083950705 0,0649823230541449 0,0103913939116503 0,0671854734111543 0,00134969033843064 0,0188262997987129 421622 2831980 623 665 0 True 293 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 338 333 0,0105121924605981 0,0404432688496246 0,0105287251087205 0,041214618142977 0,00142376376449317 0,00737539529209466 429195 1762549 623 665 0 True 337 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 383 334 0,0104678114851939 0,0376502024114991 0,0104219119554437 0,0369878690775921 0,00146784239433529 0,00727830313713934 427383 1640825 623 665 0 True 382 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 426 332 0,0102464454500377 0,0734851319188335 0,0102235446707866 0,0693522545204852 0,00164827003795206 0,0145840665369215 418345 3202539 623 665 0 True 426 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 470 333 0,0104035668392308 0,0336857020096591 0,0103761348897536 0,0345922026398108 0,00166947940559472 0,00484280967244829 424760 1468049 623 665 0 True 470 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 515 333 0,0104550752229366 0,0313986614510641 0,0103913939116503 0,0309300373846036 0,00166166446387464 0,00517457040726927 426863 1368378 623 665 0 True 514 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 559 333 0,0107162420776469 0,0525057665908878 0,010605020218204 0,052323186083772 0,00189955092025017 0,00789549516663541 437526 2288242 623 665 0 True 559 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 604 333 0,0102768410297709 0,0574758939004641 0,0103608758678569 0,0572823682001984 0,00214654452480229 0,0122731697781083 419586 2504844 623 665 0 True 603 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 647 332 0,0100568220992765 0,064714544429281 0,0100556954299229 0,0637521934843976 0,00181463270022102 0,0173695810581155 410603 2820310 623 665 0 True 647 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 250 378 0,0105715875297787 0,0465013070556914 0,0105439841306172 0,0497444113832303 0,0016264447321592 0,0107667489879776 431620 2026563 623 665 0 True 249 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 294 378 0,0105225039344641 0,0353594216715972 0,0105287251087205 0,0340733958953231 0,0014841127679226 0,00631166129739188 429616 1540991 623 665 0 True 293 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 338 377 0,010762019143337 0,0924374337078678 0,0108033875028611 0,0890974288548104 0,00136394198387203 0,0228253144963037 439395 4028495 623 665 0 True 337 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 382 376 0,0106929739062153 0,0697982309860254 0,0106355382619974 0,0677500572213321 0,00143303217956101 0,0194800755016067 436576 3041861 623 665 0 True 382 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 426 376 0,0105678401295376 0,0453446961418194 0,0105439841306172 0,0459143968871595 0,00162024785405333 0,0102232442843604 431467 1976157 623 665 0 True 426 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 471 377 0,0109273946101853 0,0557915961797375 0,0108949416342412 0,0547035934996567 0,00170603822180138 0,0112721534880828 446147 2431441 623 665 0 True 470 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 515 378 0,0107491604170195 0,0422850442655047 0,0108186465247578 0,0428015564202335 0,00171806498404796 0,00509385910662928 438870 1842815 623 665 0 True 514 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 559 377 0,0107789436764519 0,0529235196023935 0,010757610437171 0,0513771267261769 0,00187829210340556 0,00920630075044945 440086 2306448 623 665 0 True 559 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 603 377 0,0105941454096613 0,0439130556994455 0,0106660563057908 0,0438849469748989 0,00211540741507047 0,00855530592620096 432541 1913765 623 665 0 True 603 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 647 377 0,0102366483252244 0,0889679681006132 0,0103761348897536 0,0827038986800946 0,00198017119984408 0,0180480397551675 417945 3877293 623 665 0 True 647 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 251 422 0,0106634110820912 0,0503129877795886 0,0106355382619974 0,0507362478065156 0,00163925011872871 0,00841124236622365 435369 2192679 623 665 0 True 249 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 294 421 0,0105323010592774 0,0597155970723329 0,0105287251087205 0,0594491493095293 0,00153266653555149 0,00973087075640186 430016 2602452 623 665 0 True 293 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 339 422 0,0104787352793607 0,0381305518316276 0,0104676890211337 0,0376745250629435 0,00140083637181973 0,00617283612505907 427829 1661759 623 665 0 True 337 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 383 422 0,0104876261701288 0,0571372583438454 0,0105592431525139 0,053681239032578 0,00144771157236484 0,0135925786822594 428192 2490086 623 665 0 True 382 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 426 421 0,0110116008979555 0,114539794209717 0,0110170138094148 0,109315632867933 0,00168446255773457 0,0374643591800256 449585 4991733 623 665 0 True 426 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 471 422 0,0111426129495212 0,0630276308762293 0,0111696040283818 0,0607614251926452 0,00181374605613889 0,0144152859391581 454934 2746793 623 665 0 True 470 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 515 421 0,0109577656971065 0,0579516311951772 0,0108949416342412 0,0561684596017395 0,00204109729948098 0,0105403370446484 447387 2525577 623 665 0 True 514 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 559 422 0,0108863201644056 0,0319883021814091 0,0109254596780346 0,0323033493553063 0,00182218123657012 0,0042189649346304 444470 1394075 623 665 0 True 559 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 604 421 0,0104205648507818 0,0416404022186388 0,010406652933547 0,0412909132524605 0,00194310951095093 0,00621154280079358 425454 1814721 623 665 0 True 603 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 648 421 0,0111053593824186 0,081082243259786 0,0105897611963073 0,0804455634393835 0,00390636535760168 0,0187050381485195 453413 3533627 623 665 0 True 647 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 249 466 0,0107299090667614 0,0633222332553746 0,0108186465247578 0,0650492103456169 0,00158197327965993 0,0193819025831712 438084 2759632 623 665 0 True 249 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 293 466 0,0109376815912392 0,0593878837629666 0,0109102006561379 0,0588387884336614 0,00154504344258954 0,0116055769681437 446567 2588170 623 665 0 True 293 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 338 466 0,0106857240338535 0,0767964773458021 0,0107118333714809 0,0739604791332876 0,00150093720184046 0,0204452632240306 436280 3346850 623 665 0 True 337 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 382 465 0,0108035099669212 0,091436074737083 0,0108644235904479 0,08720531013962 0,00155402325001503 0,0260360909699983 441089 3984855 623 665 0 True 382 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 427 465 0,0109383673899761 0,0991078749746878 0,0109102006561379 0,0950026703288319 0,00193232309859387 0,0324066951385879 446595 4319198 623 665 0 True 426 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 470 465 0,0108856098728566 0,0487055358698876 0,0108949416342412 0,049912260624094 0,00195616395220993 0,00944141209388442 444441 2122625 623 665 0 True 470 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 515 465 0,011160149802937 0,0423126252344067 0,0110017547875181 0,0434119172961013 0,00212090358911147 0,00574393890563054 455650 1844017 623 665 0 True 514 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 558 465 0,0114876676854452 0,106285695928996 0,0110780498970016 0,104402227817197 0,00334808066468288 0,0244153566053964 469022 4632013 623 665 0 True 559 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 602 465 0,0108881816181201 0,0667819698020515 0,0108949416342412 0,0684214541847868 0,00193697396916573 0,0207143392240838 444546 2910410 623 665 0 True 603 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 647 466 0,0107554550697121 0,0839364834608838 0,0107118333714809 0,0801556420233463 0,00210128469772881 0,0150269895299541 439127 3658017 623 665 0 True 647 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 249 510 0,0101772287632318 0,0517491944555828 0,0101319905394064 0,0547798886091402 0,00151889649856584 0,0143784869573085 415519 2255270 623 665 0 True 249 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 294 510 0,0107235164428207 0,108002439148914 0,0107118333714809 0,103028915846494 0,00152006268010208 0,0313517994770713 437823 4706830 623 665 0 True 293 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 338 510 0,0107719877178345 0,0582529796682138 0,0108949416342412 0,0614328221560998 0,00161698371631153 0,0133875599070509 439802 2538710 623 665 0 True 337 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 382 509 0,0106297334655455 0,0591032628492724 0,0106355382619974 0,0593881132219425 0,00165400882753511 0,00996654548828268 433994 2575766 623 665 0 True 382 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 427 509 0,0109659218035135 0,0599183240775319 0,0110017547875181 0,0601968413824674 0,00188087743287159 0,0100347875050173 447720 2611287 623 665 0 True 426 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 471 510 0,0110810380200697 0,0640107249125331 0,0110322728313115 0,0623483634699016 0,00204563818036022 0,0141042294879596 452420 2789637 623 665 0 True 470 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 515 509 0,0112620399009952 0,0743877776381902 0,0112153810940719 0,073685816739147 0,00204886792677061 0,0184847250149509 459810 3241877 623 665 0 True 514 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 559 509 0,0108820339222997 0,0596472412434152 0,0109864957656214 0,0602426184481575 0,00179290103868865 0,014073909810523 444295 2599473 623 665 0 True 558 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 603 509 0,0105101105715753 0,0439382273491006 0,0105439841306172 0,0435950255588617 0,00178051926628556 0,00551668626318619 429110 1914862 623 665 0 True 603 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 647 509 0,01042367543791 0,0654202684555288 0,0103913939116503 0,0653238727397574 0,00196076200598119 0,014936035424925 425581 2851066 623 665 0 True 647 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 250 555 0,0101062241011475 0,0417658015489628 0,0101319905394064 0,0419470511940185 0,00153561106360324 0,0089250099983399 412620 1820186 623 665 0 True 249 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 294 554 0,0102245243832679 0,0533666966684278 0,0101930266269932 0,0537117570763714 0,00140599455286268 0,0131114367324214 417450 2325762 623 665 0 True 293 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 338 554 0,0105016605514238 0,0548624938404606 0,0104982070649271 0,0552681773098344 0,00131601299064677 0,0128414237606381 428765 2390950 623 665 0 True 337 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 382 554 0,0108292029267441 0,0505513956555385 0,0108033875028611 0,0503852903028916 0,00151531257263705 0,00904148988940197 442138 2203069 623 665 0 True 382 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 427 553 0,0107917534171453 0,0944290687809017 0,0106813153276875 0,0886243991760128 0,00202259783772316 0,0261493690397 440609 4115292 623 665 0 True 426 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 470 554 0,0109121845739126 0,0644323787266289 0,0108491645685512 0,0635690852216373 0,0020427169604133 0,0138555195954631 445526 2808013 623 665 0 True 470 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 515 553 0,0109782661807783 0,0589578088044556 0,010955977721828 0,0585793850614176 0,00209658455553295 0,0095361465935778 448224 2569427 623 665 0 True 514 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 558 549 0,0105425145618952 0,0357887164695901 0,0105897611963073 0,0404058899824521 0,00196286695240417 0,0124239779294201 430433 1559700 623 665 0 False 558 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 603 554 0,01028502162899 0,0487211161343505 0,0103608758678569 0,0494392309452964 0,00168034587858795 0,00824154900867064 419920 2123304 623 665 0 True 603 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 647 553 0,0100325007369275 0,0526124191228816 0,0100251773861295 0,0522621499961852 0,0018893426207183 0,00909297251918902 409610 2292890 623 665 0 True 647 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 249 592 0,0105675952014173 0,0102936902797162 0,0102388036926833 0,0103150988021668 0,00246213251039556 0,00118010586132568 431457 448607 623 665 0 False 249 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 293 592 0,0105989215080077 0,010274943481386 0,0104676890211337 0,0102235446707866 0,00190689942850142 0,00138992234474464 432736 447790 623 665 0 False 293 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 338 598 0,0104433676587848 0,0776541032140892 0,0104676890211337 0,076401922636759 0,00140020949548024 0,0153899615901549 426385 3384226 623 665 0 True 337 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 383 598 0,0106270637490339 0,0814596344374326 0,0106202792401007 0,0777294575417716 0,00136042184740838 0,0238936176778028 433885 3550074 623 665 0 True 382 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 426 592 0,0108817645013674 0,0107636222623393 0,0107728694590677 0,0107118333714809 0,00224142146079615 0,00181620494730103 444284 469087 623 665 0 False 426 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 470 592 0,0109342036119305 0,0107269317720945 0,010757610437171 0,0107118333714809 0,00242669780793031 0,00192308569280214 446425 467488 623 665 0 False 470 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 514 592 0,0107224877447153 0,0105860210150003 0,0107118333714809 0,0105592431525139 0,00212305941034448 0,00224823452309768 437781 461347 623 665 0 False 514 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 558 592 0,0107737512003009 0,0105530707060625 0,0107423514152743 0,0105287251087205 0,00205709511582323 0,001830493988543 439874 459911 623 665 0 False 558 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 603 592 0,010505481430101 0,0106166537882816 0,0105287251087205 0,0106355382619974 0,00165528957750445 0,0015585750330991 428921 462682 623 665 0 False 603 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 647 592 0,010217225525282 0,0104505713815323 0,0101930266269932 0,0104829480430304 0,0015516634186739 0,00153788306542912 417152 455444 623 665 0 False 647 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 250 643 0,0102279533769526 0,043507073933403 0,0101930266269932 0,0430914778362707 0,0013782072502764 0,00821642080326902 417590 1896072 623 665 0 True 249 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 293 636 0,0102295699025468 0,00980895819314824 0,0101472495613031 0,0097962920576791 0,00137540843342756 0,00139798131723844 417656 427482 623 665 0 False 293 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 337 636 0,0107497237516963 0,00978279986989676 0,0102388036926833 0,00976577401388571 0,00309090717682214 0,00122832900556185 438893 426342 623 665 0 False 337 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 382 636 0,0105117515899815 0,0100568886165976 0,0103303578240635 0,0100556954299229 0,00193003433761065 0,00122780980313629 429177 438287 623 665 0 False 382 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 426 636 0,0103513236711639 0,009883004604668 0,0102998397802701 0,00985732814526589 0,00162644123813432 0,00149866626206553 422627 430709 623 665 0 False 426 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 470 636 0,0103803966390473 0,0101346752094243 0,0102235446707866 0,0100709544518196 0,00213938321834829 0,00188176179348782 423814 441677 623 665 0 False 470 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 514 636 0,0100688235771727 0,0100517946273328 0,0100404364080262 0,0100862134737163 0,0018216082641571 0,00176408267947357 411093 438065 623 665 0 False 514 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 558 636 0,0100720811211732 0,0100677649720548 0,0101167315175097 0,0100862134737163 0,00173374034639557 0,00158483534259813 411226 438761 623 665 0 False 558 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 603 636 0,0101171234025023 0,0102887110199394 0,0100862134737163 0,0102845807583734 0,00142347340188383 0,00134378327092225 413065 448390 623 665 0 False 603 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 647 642 0,0102189400221244 0,0435820611267239 0,0101625085831998 0,0444800488288701 0,00145026595056086 0,00977567572338892 417222 1899340 623 665 0 True 647 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C4_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C4_2.csv new file mode 100755 index 0000000..ecd1281 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C4_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 249 246 0,00830908851102195 0,670349322608421 0,00823987182421607 0,658121614404517 0,00197651149831949 0,188715595714307 339246 29214343 623 665 7 True 249 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 293 246 0,00712755525853939 0,00677165562108522 0,00700389105058366 0,00677500572213321 0,0016749492593015 0,00131987139866436 291006 295114 623 665 0 False 293 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 337 245 0,00636555938337386 0,00635599068626017 0,00633249408712902 0,0063935301747158 0,00120043706186241 0,00118555384569711 259895 276999 623 665 0 True 337 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 382 244 0,0064229460419677 0,0062364196139238 0,00631723506523232 0,00624093995574884 0,00143657488242886 0,00107297306686268 262238 271788 623 665 0 True 382 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 426 244 0,00673052677548088 0,00715154790156898 0,00669871061264973 0,00714122224765393 0,00150231610144198 0,00154157673628028 274796 311670 623 665 0 True 426 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 470 245 0,00711192884446219 0,00703516630899749 0,00691233691920348 0,00697337300679027 0,00189219100584121 0,00138054780988746 290368 306598 623 665 0 True 470 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 514 244 0,00729613928376405 0,00729585465150631 0,00729381246662089 0,00733958953231098 0,00152601344588322 0,00157226728310051 297889 317959 623 665 0 True 514 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 558 244 0,00767266728315075 0,00787321932664116 0,00773632410162509 0,00791943236438544 0,00153252715080543 0,00133495830749292 313262 343121 623 665 0 True 559 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 603 246 0,00831692621087258 0,00787296692176768 0,00836194399938964 0,00788891432059205 0,00203713773796763 0,00195435269948141 339566 343110 623 665 0 False 603 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 644 244 0,00909768358005555 0,69418116130335 0,00917067215991455 0,676417181658656 0,00190339582520215 0,181303895774786 371443 30252953 623 665 9 True 647 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 249 289 0,00706722946250157 0,0068573356026826 0,00703440909437705 0,00685130083161669 0,00159933267352567 0,00148876399868245 288543 298848 623 665 0 False 249 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 293 289 0,00625262302708868 0,0062347445633998 0,00622568093385214 0,00625619897764553 0,00133090792318966 0,00122245958086983 255284 271715 623 665 0 False 293 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 337 289 0,00619354636446455 0,00621987562176212 0,00619516289005875 0,00624093995574884 0,00117998733773466 0,00136554843065893 252872 271067 623 665 0 True 337 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 382 288 0,00628999905825138 0,00639511344164944 0,0063782711528191 0,00646982528419928 0,00134129696830313 0,00121030169493407 256810 278704 623 665 0 True 382 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 426 288 0,0065456305374421 0,00655525286092319 0,00654612039368277 0,00665293354695964 0,0015493315944106 0,0015395258233629 267247 285683 623 665 0 True 426 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 470 288 0,00680361332658801 0,00665066190309833 0,00683604180972 0,00666819256885634 0,00167445249349768 0,00171615160640124 277780 289841 623 665 0 True 470 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 514 288 0,00684206704148017 0,00702750237920276 0,00686655985351339 0,00703440909437705 0,00158705400905809 0,00152835482817973 279350 306264 623 665 0 True 514 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 559 288 0,00755446497227842 0,00764814301719049 0,00749217975127794 0,00764476997024491 0,00169026521033204 0,00149902933065802 308436 333312 623 665 0 True 559 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 603 289 0,00783049896389282 0,00780332612258502 0,00785839627679866 0,00773632410162509 0,00192905624322837 0,00195248319227393 319706 340075 623 665 0 False 603 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 647 289 0,00785477134061774 0,00782932382455337 0,00782787823300526 0,00788891432059205 0,00184582964241158 0,0019908985023151 320697 341208 623 665 0 False 647 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 250 333 0,00630954432225389 0,00659293002476436 0,00630197604333562 0,00656137941557946 0,00140730366158244 0,00144046887088579 257608 287325 623 665 0 True 249 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 294 334 0,00636979663985561 0,00658820316986102 0,0063782711528191 0,00650034332799268 0,00125950330128366 0,0013866395489743 260068 287119 623 665 0 True 293 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 338 333 0,00643617216046564 0,00642753599494272 0,00642404821850919 0,00643930724040589 0,00130996607225356 0,00124583433047923 262778 280117 623 665 0 True 337 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 383 334 0,00680976102240835 0,00669526872801138 0,00683604180972 0,00662241550316625 0,00127390907829061 0,00128885390603735 278031 291785 623 665 0 True 382 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 426 332 0,00659770225582473 0,00673530931930421 0,00659189745937285 0,0068055237659266 0,0015090673641941 0,00171984482336812 269373 293530 623 665 0 True 426 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 470 333 0,00689695543324662 0,00682126465167267 0,00700389105058366 0,00691233691920348 0,00162292456689751 0,00158056841351268 281591 297276 623 665 0 True 470 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 515 333 0,00711788059778627 0,00695361658896612 0,00709544518196384 0,00700389105058366 0,00157604933203315 0,00158430727210567 290611 303044 623 665 0 True 514 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 559 333 0,00761623584422621 0,00745475499231026 0,00759899290455482 0,00752269779507134 0,00170954445102887 0,00146533770274435 310958 324884 623 665 0 True 559 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 604 333 0,0071113410169734 0,00723573639982309 0,00720225833524071 0,00720225833524071 0,00205260221892091 0,00205151646984837 290344 315339 623 665 0 True 603 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 647 332 0,00717186275550748 0,00740913854790329 0,00718699931334401 0,00738536659800107 0,00187141957822858 0,0017381610697368 292815 322896 623 665 0 True 647 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 250 378 0,00652143163915328 0,00611648140722601 0,00651560234988937 0,00602731364919509 0,00156087480177074 0,00146168820184382 266259 266561 623 665 0 True 249 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 294 378 0,00652106424697278 0,00667604006583178 0,00659189745937285 0,00663767452506294 0,00138622094781201 0,00133049941137191 266244 290947 623 665 0 True 293 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 338 377 0,00684270385459303 0,0068698870086638 0,00685130083161669 0,00683604180972 0,00131877618819075 0,00143156565736023 279376 299395 623 665 0 True 337 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 382 376 0,00696707835409773 0,00714057976252143 0,00689707789730678 0,00721751735713741 0,00135261400755157 0,00131009699159992 284454 311192 623 665 0 True 382 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 426 376 0,00704075273269365 0,00739794094987985 0,00709544518196384 0,00735484855420768 0,00156276837399 0,00158027111060376 287462 322408 623 665 0 True 426 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 471 377 0,00743234381148079 0,00776613082259322 0,00749217975127794 0,00785839627679866 0,00160805462080845 0,00179174435218885 303450 338454 623 665 0 True 470 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 515 378 0,00748539524234474 0,00749837514362698 0,00750743877317464 0,00749217975127794 0,00171554060140545 0,001674083548369 305616 326785 623 665 0 True 514 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 559 377 0,00765762869656235 0,00777540096521918 0,00761425192645151 0,00782787823300526 0,0017681120905023 0,00156148122441696 312648 338858 623 665 0 True 559 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 603 377 0,00716461288314565 0,00713319118349777 0,00720225833524071 0,00717174029144732 0,00204917099468236 0,00198352279144654 292519 310870 623 665 0 True 603 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 647 377 0,00686971942626568 0,00662663754832263 0,00683604180972 0,00672922865644312 0,00197329184547317 0,00183883427510099 280479 288794 623 665 0 True 647 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 251 422 0,00658616614135708 0,006359684975772 0,00659189745937285 0,00634775310902571 0,00157042904318929 0,00161478626518718 268902 277160 623 665 0 True 249 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 294 421 0,0064879744579159 0,00643111555496661 0,00648508430609598 0,00643930724040589 0,00133870235486669 0,00152449327461 264893 280273 623 665 0 True 293 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 339 422 0,00654283835687031 0,00658421058368053 0,00657663843747616 0,00660715648126955 0,00136562819521655 0,00128801964551687 267133 286945 623 665 0 True 337 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 383 422 0,00689396731017856 0,00702084806890194 0,00688181887541009 0,00697337300679027 0,00135395538197174 0,00133591886262037 281469 305974 623 665 0 True 382 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 426 421 0,00725604455046566 0,00732908031121521 0,00729381246662089 0,00727855344472419 0,00162752886291409 0,00150838113703087 296252 319407 623 665 0 True 426 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 471 422 0,00768574644477649 0,00768533831718229 0,00770580605783169 0,0076600289921416 0,00166867395232788 0,00145590599411147 313796 334933 623 665 0 True 470 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 515 421 0,00755500381414315 0,0072956710843256 0,00741588464179446 0,00720225833524071 0,00226323993293898 0,00169905624928781 308458 317951 623 665 0 True 514 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 559 422 0,00705566885522189 0,00704324326494882 0,00704966811627375 0,00701915007248035 0,00175515973229497 0,00156304269472215 288071 306950 623 665 0 True 559 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 604 421 0,00654200560126118 0,0065038540503238 0,00657663843747616 0,00650034332799268 0,00185921397284733 0,00170381430113981 267099 283443 623 665 0 True 603 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 648 421 0,00695057019878734 0,00684421054926169 0,00653086137178607 0,00674448767833982 0,00329364694703338 0,00183273183066561 283780 298276 623 665 0 True 647 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 249 466 0,00669361610774682 0,00696442410673055 0,00672922865644312 0,00703440909437705 0,00150599544107582 0,00148226514807413 273289 303515 623 665 0 True 249 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 293 466 0,00699046898958945 0,00686722528454347 0,00704966811627375 0,00691233691920348 0,00147976336526483 0,00154451320338023 285409 299279 623 665 0 True 293 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 338 466 0,0067046623659738 0,00700916860702913 0,00665293354695964 0,00703440909437705 0,00143383338477736 0,00148873030418378 273740 305465 623 665 0 True 337 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 382 465 0,00696918473593258 0,00690386988299313 0,00688181887541009 0,00689707789730678 0,00152745669926994 0,00146001939741783 284540 300876 623 665 0 True 382 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 427 465 0,00708016166725511 0,00697344184448303 0,00708018616006714 0,00692759594110018 0,00177254736848519 0,00193399430190552 289071 303908 623 665 0 True 426 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 470 465 0,00737216497231516 0,00777434545393009 0,00741588464179446 0,00772106507972839 0,00189331914133258 0,0023291507384631 300993 338812 623 665 0 True 470 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 515 465 0,00734877433682344 0,00682617507375672 0,00732433051041428 0,00683604180972 0,0018662594455794 0,00160085767716088 300038 297490 623 665 0 True 514 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 558 465 0,00714766385721866 0,00666231841907355 0,00685130083161669 0,00659189745937285 0,00247809015352062 0,00187441262964554 291827 290349 623 665 0 True 559 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 602 465 0,00670233554883065 0,00673464388827413 0,00671396963454643 0,00666819256885634 0,00183630570416012 0,00179566755548184 273645 293501 623 665 0 True 603 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 647 466 0,0068491699569698 0,00675609830251986 0,00668345159075303 0,00672922865644312 0,00227169682727286 0,00182293851190183 279640 294436 623 665 0 True 647 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 249 510 0,00649407316811217 0,00652092579813002 0,00646982528419928 0,00659189745937285 0,00140236537974776 0,00140876432075699 265142 284187 623 665 0 True 249 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 294 510 0,00677931645705106 0,00678836023453002 0,00677500572213321 0,00675974670023652 0,00148123537823459 0,0014740463660125 276788 295842 623 665 0 True 293 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 338 510 0,00673219228669914 0,00702305087507049 0,00668345159075303 0,00704966811627375 0,00141962283968738 0,00155156619164477 274864 306070 623 665 0 True 337 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 382 509 0,00676993571004234 0,00676371634051942 0,00675974670023652 0,00674448767833982 0,00150595246637586 0,00151670206068764 276405 294768 623 665 0 True 382 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 427 509 0,00704234476547581 0,00742880318213708 0,00700389105058366 0,00738536659800107 0,00181427748181728 0,00179572937587428 287527 323753 623 665 0 True 426 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 471 510 0,00722241591954405 0,00682661104581091 0,00729381246662089 0,0068207827878233 0,00172653723065792 0,00160808031429005 294879 297509 623 665 0 True 470 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 515 509 0,00696115109358569 0,00710866201897511 0,00691233691920348 0,00700389105058366 0,00186060617018427 0,00166262195445726 284212 309801 623 665 0 True 514 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 559 509 0,00690731589273667 0,00655412851194133 0,0068207827878233 0,00656137941557946 0,00183496404780195 0,00165832591786083 282014 285634 623 665 0 True 558 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 603 509 0,00664512033992104 0,00655401378245339 0,00669871061264973 0,00656137941557946 0,00174410688740291 0,00175647263899497 271309 285629 623 665 0 True 603 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 647 509 0,00674434072146762 0,00676155942614605 0,00675974670023652 0,00663767452506294 0,00188158493419067 0,00193872351874183 275360 294674 623 665 0 True 647 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 250 555 0,00663424553137829 0,00655385316117026 0,00665293354695964 0,00660715648126955 0,00132691392883261 0,00132520044409587 270865 285622 623 665 0 True 249 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 294 554 0,00675159059382945 0,00668095048791583 0,00669871061264973 0,00663767452506294 0,00136219664631459 0,00134219813146478 275656 291161 623 665 0 True 293 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 338 554 0,00661195707242806 0,00677305532083814 0,00656137941557946 0,00677500572213321 0,00133261593315121 0,00132788341738529 269955 295175 623 665 0 True 337 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 382 554 0,00640295990734859 0,00664196540791209 0,00648508430609598 0,00665293354695964 0,00138734178123529 0,00124423518017078 261422 289462 623 665 0 True 382 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 427 553 0,00672616705493897 0,00646709472238619 0,00671396963454643 0,00651560234988937 0,00182280513792389 0,00176231446043105 274618 281841 623 665 0 True 426 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 470 554 0,00699166913737908 0,00684723940774344 0,00706492713817044 0,00685130083161669 0,00197248191353844 0,00191897940921559 285458 298408 623 665 0 True 470 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 515 553 0,00712892685601325 0,00668854558001779 0,00717174029144732 0,00663767452506294 0,00187590766705709 0,00192970057871136 291062 291492 623 665 0 True 514 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 558 549 0,00668068390299328 0,00659134675783072 0,00659189745937285 0,00665293354695964 0,00186414743695275 0,00178520829747143 272761 287256 623 665 0 False 558 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 603 554 0,00652544846032673 0,00661344365720894 0,00653086137178607 0,00663767452506294 0,00156922515751094 0,00149662892316685 266423 288219 623 665 0 True 603 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 647 553 0,00644530797935403 0,00653088431768366 0,00648508430609598 0,00657663843747616 0,00174006238463358 0,00168575648457899 263151 284621 623 665 0 True 647 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 249 592 0,00723240898685361 0,00734505065593717 0,0072480354009308 0,00741588464179446 0,00128258546399389 0,00121797416118184 295287 320103 623 665 0 False 249 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 293 592 0,007052803196214 0,00720693929834887 0,00709544518196384 0,00718699931334401 0,00146785496488024 0,00137876880781407 287954 314084 623 665 0 False 293 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 338 598 0,00706169408698206 0,00727098129851982 0,00706492713817044 0,0072327763790341 0,00140727847108427 0,00143830202570277 288317 316875 623 665 0 True 337 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 383 598 0,00666811909042024 0,00689230515060827 0,00666819256885634 0,00689707789730678 0,0012925271921134 0,00122591839706531 272248 300372 623 665 0 True 382 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 426 592 0,00680346636971581 0,00674191773780985 0,00691233691920348 0,00674448767833982 0,00178858873255578 0,00179063909962245 277774 293818 623 665 0 False 426 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 470 592 0,00717587957668093 0,0071279136270523 0,00717174029144732 0,00714122224765393 0,00207936979601205 0,00184082232019221 292979 310640 623 665 0 False 470 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 514 592 0,00736310263186287 0,00719966544881315 0,00735484855420768 0,00718699931334401 0,00190634069464093 0,00194933970926597 300623 313767 623 665 0 False 514 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 558 592 0,00750905529876883 0,0070808974828924 0,00744640268558785 0,00709544518196384 0,00187843951252393 0,00184611165990666 306582 308591 623 665 0 False 558 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 603 592 0,00721844808399467 0,00715042355258712 0,00721751735713741 0,00715648126955062 0,00158416978574265 0,00142035619373706 294717 311621 623 665 0 False 603 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 647 592 0,00692448535397196 0,00716891794604387 0,00697337300679027 0,00706492713817044 0,00152065969588703 0,00177568839616424 282715 312427 623 665 0 False 647 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 250 643 0,00903936619460445 0,682340343878694 0,00883497367818723 0,669413290608072 0,00206524075711439 0,191883902946126 369062 29736921 623 665 8 True 249 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 293 636 0,00745225646766379 0,00661823934980505 0,00735484855420768 0,00660715648126955 0,00171087562431289 0,00129657530556731 304263 288428 623 665 0 False 293 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 337 636 0,00687525480178518 0,0063603045150069 0,00665293354695964 0,00636301213092241 0,00187737573495388 0,0012348922142063 280705 277187 623 665 0 False 337 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 382 636 0,00645047596269304 0,0065099117672873 0,00645456626230259 0,0064087891966125 0,0012803980927615 0,00131478119977568 263362 283707 623 665 0 False 382 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 426 636 0,00640866673255233 0,00615826588673561 0,0064087891966125 0,00614938582436866 0,00152612591019286 0,0015935512061008 261655 268382 623 665 0 False 426 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 470 636 0,00683403339913327 0,00633437565073131 0,00672922865644312 0,00633249408712902 0,0019608919511584 0,00185053039251881 279022 276057 623 665 0 False 470 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 514 636 0,00668957479376134 0,006316638471895 0,00662241550316625 0,0063782711528191 0,00180149918611664 0,00179607919783923 273124 275284 623 665 0 False 514 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 558 636 0,00664546323928951 0,00655511518553766 0,00663767452506294 0,00659189745937285 0,00157901789414527 0,00162460127558518 271323 285677 623 665 0 False 558 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 603 636 0,00714070789860123 0,00688636216313271 0,00711070420386053 0,00683604180972 0,00144800685397176 0,00129340582545945 291543 300113 623 665 0 False 603 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 647 642 0,00843216489148888 0,706104377446248 0,00825513084611276 0,722545204852369 0,00184146460788894 0,222890086696134 344271 30772576 623 665 11 True 647 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C4_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C4_3.csv new file mode 100755 index 0000000..0fa81d9 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C4_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 249 246 0,000998988324398968 0,0662261742706503 0,000778210116731518 0,0639963378347448 0,000845180570178945 0,0200308282620334 40787 2886188 623 665 0 True 249 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 293 246 0,00097968798851679 0,00100523682747725 0,000839246204318303 0,000869764248111696 0,000730167306437298 0,00069021818107517 39999 43809 623 665 0 False 293 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 337 245 0,000881104420083077 0,000847185484884103 0,000747692072938125 0,000732433051041428 0,000674947635050573 0,000645644322945775 35974 36921 623 665 0 True 337 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 382 244 0,0009486555956707 0,000878116554834098 0,000839246204318303 0,000778210116731518 0,000667758260705341 0,000618366615578493 38732 38269 623 665 0 True 382 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 426 244 0,000946892113204308 0,000972538923412904 0,00080872816052491 0,000762951094834821 0,000760261487368366 0,000826354733854937 38660 42384 623 665 0 True 426 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 470 245 0,000972340144906824 0,000978390127298103 0,000762951094834821 0,000854505226215 0,000868457404096136 0,000769290776785253 39699 42639 623 665 0 True 470 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 514 244 0,00100812414328736 0,00100670536492295 0,000854505226215 0,000823987182421607 0,000790587689531979 0,000830345975592652 41160 43873 623 665 0 True 514 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 558 244 0,000984243651554969 0,00100613171748323 0,000747692072938125 0,000900282291905089 0,000832326007494237 0,000700497251714413 40185 43848 623 665 0 True 559 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 603 246 0,0011146923684439 0,00102772380711449 0,000762951094834821 0,000503547722590982 0,00108690033939155 0,00111947098157091 45511 44789 623 665 0 False 603 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 644 244 0,00109139970420031 0,0684039694108239 0,000778210116731518 0,0650797283894102 0,000992869550533375 0,0200463743191113 44560 2981098 623 665 0 True 647 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 249 289 0,000926097715788103 0,000856501519305244 0,000747692072938125 0,00064087891966125 0,000777148957311257 0,000732342604690405 37811 37327 623 665 0 False 249 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 293 289 0,000902903022792643 0,00087878198586418 0,000778210116731518 0,000762951094834821 0,000641594242058027 0,00063557855607545 36864 38298 623 665 0 False 293 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 337 289 0,000798171758538592 0,000859461540094227 0,000671396963454643 0,000747692072938125 0,000628936105971926 0,000649105178772996 32588 37456 623 665 0 True 337 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 382 288 0,000898347359754464 0,000897299325218517 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,000619476683690382 0,000641620022388012 36678 39105 623 665 0 True 382 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 426 288 0,000830330820738211 0,000914416964819923 0,000656137941557946 0,000656137941557946 0,000750937655627542 0,000819436296790802 33901 39851 623 665 0 True 426 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 470 288 0,000961048958559509 0,000979262071406486 0,000656137941557946 0,000610360875867857 0,000915699035105298 0,00100999920215143 39238 42677 623 665 0 True 470 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 514 288 0,000898665766310896 0,00097682980626205 0,000701915007248035 0,000778210116731518 0,000814847622497715 0,000836848440991148 36691 42571 623 665 0 True 514 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 559 288 0,000957301558318426 0,00100319464259183 0,000717174029144732 0,000793469138628214 0,000874005307821114 0,000792293292105167 39085 43720 623 665 0 True 559 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 603 289 0,000995069474473653 0,00100243742797139 0,000595101853971161 0,000656137941557946 0,00107520195545793 0,000998650896710353 40627 43687 623 665 0 False 603 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 647 289 0,00102137475459733 0,000908451031446779 0,000625619897764553 0,000473029678797589 0,000990977376947206 0,000991958632587455 41701 39591 623 665 0 False 647 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 250 333 0,000926416122344535 0,000885941105911953 0,000732433051041428 0,000717174029144732 0,000764989985943193 0,000745435425764522 37824 38610 623 665 0 True 249 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 294 334 0,000989509606142112 0,000944453144763947 0,000854505226215 0,000823987182421607 0,000696826152456678 0,000680608255168178 40400 41160 623 665 0 True 293 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 338 333 0,000974495512365747 0,000955513067401853 0,000854505226215 0,000869764248111696 0,000689536937406807 0,000646638341991675 39787 41642 623 665 0 True 337 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 383 334 0,000996979913812244 0,000838879069956879 0,000869764248111696 0,000732433051041428 0,000678201876860462 0,00060324448545456 40705 36559 623 665 0 True 382 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 426 332 0,000900698669709654 0,000936628593686092 0,000701915007248035 0,000671396963454643 0,000764151409447808 0,00086098276036937 36774 40819 623 665 0 True 426 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 470 333 0,000897539096957368 0,0009320164682707 0,000656137941557946 0,000762951094834821 0,000827950896699495 0,000791781874956786 36645 40618 623 665 0 True 470 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 515 333 0,000942213986105963 0,000965815775419322 0,000747692072938125 0,000747692072938125 0,000817607835676989 0,000870107811493234 38469 42091 623 665 0 True 514 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 559 333 0,00104140987484051 0,000993603257399622 0,000793469138628214 0,00080872816052491 0,000940354379573673 0,000795445778834318 42519 43302 623 665 0 True 559 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 604 333 0,000905401289620032 0,000885206837189105 0,000457770656900893 0,000473029678797589 0,00107160890524313 0,0010456666015048 36966 38578 623 665 0 True 603 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 647 332 0,000967147668755781 0,000978803153454706 0,000625619897764553 0,000610360875867857 0,00102831735948476 0,000978621185528955 39487 42657 623 665 0 True 647 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 250 378 0,000926465107968602 0,000888992910291292 0,000762951094834821 0,000762951094834821 0,000819946555071561 0,000731296824395871 37826 38743 623 665 0 True 249 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 294 378 0,000931510627247445 0,000941034206023183 0,000778210116731518 0,000823987182421607 0,000740798470251377 0,000727901289703743 38032 41011 623 665 0 True 293 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 338 377 0,000924285247697645 0,000938578994981159 0,000793469138628214 0,000823987182421607 0,000685186866211289 0,000744164409136485 37737 40904 623 665 0 True 337 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 382 376 0,000937952236812182 0,000975934916256079 0,000823987182421607 0,000823987182421607 0,000697933520707466 0,000726215287366407 38295 42532 623 665 0 True 382 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 426 376 0,000925730323607605 0,000963567077455598 0,000701915007248035 0,000732433051041428 0,000783862132320691 0,000870443213450499 37796 41993 623 665 0 True 426 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 471 377 0,00094782284006157 0,000895899625465587 0,000671396963454643 0,000564583810177768 0,000871237441756821 0,000890406727300595 38698 39044 623 665 0 True 470 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 515 378 0,000960020260454114 0,000916619770988469 0,000701915007248035 0,000610360875867857 0,000874436591232079 0,000901423938927806 39196 39947 623 665 0 True 514 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 559 377 0,000894477495453216 0,0010034699933629 0,000656137941557946 0,000793469138628214 0,0008829564591317 0,000827220133746347 36520 43732 623 665 0 True 559 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 603 377 0,000954190971190207 0,000964140724895324 0,000457770656900893 0,000518806744487678 0,00111602807485415 0,00106777191815001 38958 42018 623 665 0 True 603 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 647 377 0,000914316673200124 0,000789476552447725 0,000503547722590982 0,000442511635004196 0,000985877506219674 0,000890068552918725 37330 34406 623 665 0 True 647 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 251 422 0,00087480976739054 0,000866322363473343 0,000732433051041428 0,000656137941557946 0,00077014158272867 0,000792217194773125 35717 37755 623 665 0 True 249 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 294 421 0,000868147722517504 0,000860953023437513 0,000717174029144732 0,000778210116731518 0,00075352014373042 0,000729823148149915 35445 37521 623 665 0 True 293 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 339 422 0,000932563818164874 0,000884266055387955 0,000854505226215 0,000747692072938125 0,000685120113852601 0,000672106701897922 38075 38537 623 665 0 True 337 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 383 422 0,000993232513571161 0,000883875975128942 0,000869764248111696 0,000732433051041428 0,000738022563200807 0,000704997018261444 40552 38520 623 665 0 True 382 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 426 421 0,000956272860213031 0,00103189996047569 0,000717174029144732 0,000823987182421607 0,000876187486163174 0,000847937076331472 39043 44971 623 665 0 True 426 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 471 422 0,000908977240176882 0,00104871930340844 0,000656137941557946 0,000839246204318303 0,000851426425035329 0,000859444750757095 37112 45704 623 665 0 True 470 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 515 421 0,00100320108806868 0,000983782413231522 0,000762951094834821 0,000732433051041428 0,000903505302306028 0,000919933281664785 40959 42874 623 665 0 True 514 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 559 422 0,000950149657204726 0,000875248317635471 0,000717174029144732 0,00064087891966125 0,000878983390075992 0,000804054931903946 38793 38144 623 665 0 True 559 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 604 421 0,000915908705982284 0,000908451031446779 0,000625619897764553 0,000549324788281071 0,000969429312804386 0,000951208802995619 37395 39591 623 665 0 True 603 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 648 421 0,000903539835905507 0,000921851435638765 0,000442511635004196 0,000534065766384375 0,000949188592081644 0,000967550802105022 36890 40175 623 665 0 True 647 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 249 466 0,000914855515064855 0,000954939419962128 0,000747692072938125 0,000839246204318303 0,000780799583316876 0,000741382674063459 37352 41617 623 665 0 True 249 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 293 466 0,000971899274290226 0,000901544316272485 0,000839246204318303 0,00080872816052491 0,000821175791920253 0,000767042495650054 39681 39290 623 665 0 True 293 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 338 466 0,00101003458262595 0,000952920180974294 0,000946059357595178 0,000854505226215 0,000744929750964483 0,000785700227321025 41238 41529 623 665 0 True 337 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 382 465 0,000903294907785175 0,000971506358021398 0,000732433051041428 0,000839246204318303 0,000780135395338732 0,000782743921800883 36880 42339 623 665 0 True 382 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 427 465 0,000921321617441625 0,0009579223866487 0,000579842832074464 0,000579842832074464 0,000974434339975501 0,00100170316213945 37616 41747 623 665 0 True 426 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 470 465 0,000976405951704338 0,000951428697631008 0,000595101853971161 0,000579842832074464 0,00105271629927655 0,00102490831679172 39865 41464 623 665 0 True 470 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 515 465 0,000950737484693523 0,000892044714670632 0,000610360875867857 0,000564583810177768 0,000938945585879855 0,000892426616363763 38817 38876 623 665 0 True 514 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 558 465 0,000931608598495578 0,000887983290797376 0,000579842832074464 0,000503547722590982 0,000948427702685164 0,00094371374321597 38036 38699 623 665 0 True 559 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 602 465 0,000952745895280247 0,000803496495874614 0,000610360875867857 0,000396734569314107 0,000965731800150821 0,000890633922016074 38899 35017 623 665 0 True 603 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 647 466 0,00105593411237621 0,000868387494256355 0,000732433051041428 0,000503547722590982 0,00104676476755844 0,000910641603710485 43112 37845 623 665 0 True 647 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 249 510 0,000939397312722142 0,000989427104038421 0,000747692072938125 0,000839246204318303 0,000811083952249221 0,000771205156085565 38354 43120 623 665 0 True 249 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 294 510 0,000896118513859441 0,000964025995407379 0,000778210116731518 0,000839246204318303 0,000742343660617418 0,000792011410596955 36587 42013 623 665 0 True 293 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 338 510 0,000891489372385163 0,000985159167086863 0,000778210116731518 0,000854505226215 0,000755247948078549 0,000825933937035275 36398 42934 623 665 0 True 337 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 382 509 0,00086013857298264 0,00098268101014725 0,000656137941557946 0,000854505226215 0,000783679230878576 0,000796263529324181 35118 42826 623 665 0 True 382 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 427 509 0,000895285758250312 0,00099456698509836 0,000518806744487678 0,00064087891966125 0,000925579203142434 0,00102719873684278 36553 43344 623 665 0 True 426 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 471 510 0,000932735267849106 0,000914371073024745 0,000625619897764553 0,000610360875867857 0,000918554478603354 0,00082431921250396 38082 39849 623 665 0 True 470 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 515 509 0,00100175601215872 0,000987224297869875 0,000671396963454643 0,000701915007248035 0,000959926864411369 0,00087236356537827 40900 43024 623 665 0 True 514 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 559 509 0,000935968319037491 0,000973915677268245 0,000610360875867857 0,000717174029144732 0,000915424462919901 0,00089296485247235 38214 42444 623 665 0 True 558 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 603 509 0,000878361225135356 0,000880571765876123 0,000518806744487678 0,000564583810177768 0,000913744072673646 0,000903275916581988 35862 38376 623 665 0 True 603 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 647 509 0,000941601665805132 0,000928184503373334 0,000549324788281071 0,000503547722590982 0,000989038380154942 0,000995332767959489 38444 40451 623 665 0 True 647 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 250 555 0,000914831022252822 0,000954778798679005 0,000762951094834821 0,000823987182421607 0,000697136393184129 0,000673437314557787 37351 41610 623 665 0 True 249 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 294 554 0,000884802834700093 0,000928551637734758 0,000747692072938125 0,00080872816052491 0,000701359138412793 0,000718153822897799 36125 40467 623 665 0 True 293 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 338 554 0,000919141757170669 0,000913063156862171 0,00080872816052491 0,000747692072938125 0,000697302207172005 0,000738713961984389 37527 39792 623 665 0 True 337 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 382 554 0,000943879497324222 0,000923434702572407 0,00080872816052491 0,00080872816052491 0,000725868719562607 0,000702435100601483 38537 40244 623 665 0 True 382 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 427 553 0,000962224613537104 0,00105844836398618 0,000671396963454643 0,000671396963454643 0,000978188923906206 0,00105061194248499 39286 46128 623 665 0 True 426 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 470 554 0,000902756065920444 0,000903655338850674 0,0004272526131075 0,000396734569314107 0,00103684503527422 0,00105319162751991 36858 39382 623 665 0 True 470 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 515 553 0,000988995257089414 0,000962259161293024 0,000488288700694286 0,000549324788281071 0,0010916814538976 0,00104609754811582 40379 41936 623 665 0 True 514 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 558 549 0,000926122208600137 0,000876028478153498 0,000579842832074464 0,000518806744487678 0,000935034674928813 0,000916460395240453 37812 38178 623 665 0 False 558 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 603 554 0,000900723162521687 0,000817539385199093 0,000656137941557946 0,000564583810177768 0,000808296528190047 0,000743490360553265 36775 35629 623 665 0 True 603 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 647 553 0,000892126185498026 0,000946564167342137 0,000579842832074464 0,000686655985351339 0,000915373728446381 0,000894164953128324 36424 41252 623 665 0 True 647 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 249 592 0,000908095498943686 0,000969968982882934 0,000762951094834821 0,000854505226215 0,000646237257658002 0,000675204902453958 37076 42272 623 665 0 False 249 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 293 592 0,000982088284096046 0,000991905260978035 0,000854505226215 0,000854505226215 0,00076618994388098 0,000800829533450602 40097 43228 623 665 0 False 293 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 338 598 0,000938172672120481 0,00100037229718838 0,000823987182421607 0,000839246204318303 0,000684862012539894 0,000846112089917913 38304 43597 623 665 0 True 337 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 383 598 0,000973736235192717 0,00098782089120719 0,000885023270008392 0,000900282291905089 0,000702141369865305 0,00066182097479494 39756 43050 623 665 0 True 382 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 426 592 0,000996245129451247 0,00105321669933589 0,000717174029144732 0,000747692072938125 0,000940093533385726 0,00101796712341824 40675 45900 623 665 0 False 426 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 470 592 0,000957301558318426 0,000942135609107456 0,000503547722590982 0,000518806744487678 0,00103927242038479 0,000994562185633395 39085 41059 623 665 0 False 470 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 514 592 0,00103727058960689 0,000994681714586306 0,000610360875867857 0,000488288700694286 0,00112000383247866 0,00112157161119657 42350 43349 623 665 0 False 514 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 558 592 0,00091375333852336 0,000860448213690555 0,000488288700694286 0,000488288700694286 0,000992473680969075 0,000882507142524641 37307 37499 623 665 0 False 558 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 603 592 0,000914341166012157 0,000924444322066324 0,000747692072938125 0,000686655985351339 0,00079178468177196 0,000809434978849009 37331 40288 623 665 0 False 603 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 647 592 0,000897686053829568 0,000915449530211429 0,000701915007248035 0,000701915007248035 0,000780466179889248 0,000812452185965606 36651 39896 623 665 0 False 647 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 250 643 0,00112838385037047 0,0675820244132877 0,00102235446707866 0,0647745479514763 0,000728329817988839 0,0208500986014319 46070 2945277 623 665 0 True 249 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 293 636 0,000979663495704757 0,000957578198184865 0,000885023270008392 0,00080872816052491 0,000711335964563963 0,00072782869321835 39998 41732 623 665 0 False 293 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 337 636 0,00101914590870231 0,000898699024971447 0,000976577401388571 0,000778210116731518 0,000690240122582713 0,000660826921220438 41610 39166 623 665 0 False 337 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 382 636 0,000917182332208011 0,000982635118352072 0,000823987182421607 0,000869764248111696 0,000670444908167232 0,000673702507914891 37447 42824 623 665 0 False 382 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 426 636 0,000843777374544449 0,000922356245385723 0,000625619897764553 0,000671396963454643 0,000770962287315098 0,000840630859705255 34450 40197 623 665 0 False 426 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 470 636 0,000875887451120001 0,000841770253053095 0,000564583810177768 0,000549324788281071 0,000873508461754104 0,000856205588310224 35761 36685 623 665 0 False 470 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 514 636 0,000883847615030798 0,000886583591044446 0,000503547722590982 0,000549324788281071 0,000942087589968271 0,000900516785282786 36086 38638 623 665 0 False 514 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 558 636 0,000871454252141988 0,000860012241636364 0,000579842832074464 0,000595101853971161 0,000875898979671925 0,000805475942143898 35580 37480 623 665 0 False 558 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 603 636 0,00097466696204998 0,000922654542054381 0,000823987182421607 0,000747692072938125 0,000762279753818564 0,000721661896380756 39794 40210 623 665 0 False 603 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 647 642 0,000893644739844086 0,070193428180201 0,000747692072938125 0,0704966811627375 0,000703466753176521 0,0239515214702916 36486 3059084 623 665 0 True 647 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C5_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C5_1.csv new file mode 100755 index 0000000..abbae80 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C5_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 260 273 0,0110331192838005 0,0467280584156661 0,0110170138094148 0,0464332036316472 0,00157547227024621 0,00844887648911029 482278 2036445 667 665 0 True 261 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 305 273 0,0113207301133137 0,0105712668028506 0,0108491645685512 0,0105287251087205 0,00332911871733963 0,00121611198004872 494850 460704 667 665 0 False 305 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 348 274 0,0119283686149601 0,0639751817171677 0,0110780498970016 0,0638742656595712 0,00508592730688868 0,01033318453931 521411 2788088 667 665 0 True 349 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 393 273 0,0112976242480728 0,106827632138254 0,0112764171816587 0,10443274586099 0,00148955273216458 0,02621046065433 493840 4655631 667 665 0 True 394 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 437 273 0,0110604574114865 0,0756897967050838 0,0109864957656214 0,0725719081406882 0,00167496567282601 0,0122757072051353 483473 3298620 667 665 0 True 438 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 481 272 0,0146026094300069 0,0713786755742641 0,0111238269626917 0,0749828336003662 0,0170386042829553 0,0220046888527621 638307 3110738 667 665 0 True 482 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 525 272 0,011860011857198 0,0854128454576588 0,0110170138094148 0,0833142595559625 0,00656209563373667 0,021564286768597 518423 3722358 667 665 0 True 526 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 569 271 0,010808374709418 0,0692533118100814 0,0107423514152743 0,0675669489585718 0,00168460037208032 0,0167935558458196 472454 3018113 667 665 0 True 571 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 615 273 0,0105969217268226 0,0105547228106889 0,0106202792401007 0,0106507972838941 0,00196926870324003 0,0019876112750964 463211 459983 667 665 0 False 615 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 657 271 0,0106748182329069 0,0456696559434751 0,0105134660868238 0,046341649500267 0,00241625854477066 0,00907150524421247 466616 1990319 667 665 0 True 659 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 261 316 0,0114446782102197 0,0114227431705838 0,0115510795757992 0,0114290074006256 0,00152465779908177 0,00139966150535782 500268 497812 667 665 0 False 261 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 305 316 0,011591000105349 0,011395988253995 0,011459525444419 0,0113679713130388 0,00188456728067734 0,00135098580428861 506664 496646 667 665 0 False 305 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 349 317 0,0114101109207356 0,10547088710561 0,0115053025101091 0,103593499656672 0,00136820840661505 0,0219540056390118 498757 4596503 667 665 0 True 349 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 393 318 0,0114212978198472 0,0573354650072194 0,0114290074006256 0,0547798886091402 0,00147532159843523 0,0108418438576082 499246 2498724 667 665 0 True 394 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 437 318 0,011385723938214 0,0878726227333038 0,0113679713130388 0,0882887006942855 0,00196003327042985 0,01628472456525 497691 3829557 667 665 0 True 438 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 482 317 0,0108094956870386 0,0429919385325295 0,0107881284809644 0,0439612420843824 0,00177857729489523 0,00704247259107529 472503 1873622 667 665 0 True 482 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 526 316 0,0108541288980138 0,0464156500199916 0,0108949416342412 0,0484931715877012 0,00158253254456435 0,00899225302501758 474454 2022830 667 665 0 True 527 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 569 316 0,010781494123618 0,0566067950833825 0,0108491645685512 0,0553749904631113 0,00186901812888376 0,0122168462383515 471279 2466968 667 665 0 True 571 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 615 316 0,0109892867711258 0,0106102518828543 0,0108186465247578 0,0105745021744106 0,00241912119795808 0,0020398083787131 480362 462403 667 665 0 False 615 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 659 316 0,0104488840496209 0,0106807875720429 0,0103608758678569 0,0106813153276875 0,00192770054255422 0,00188335289615281 456740 465477 667 665 0 False 659 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 260 362 0,0506893115283093 0,0724996515091804 0,0143434805828946 0,0604409857328145 0,146106823097884 0,0751449282193975 2142641 3159591 645 665 0 True 261 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 305 362 0,0135036853283132 0,0723272130887989 0,0131380178530556 0,0728007934691386 0,0023190437365107 0,0193731450043466 590271 3152076 667 665 0 True 305 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 349 363 0,0122035571822695 0,0428529093390377 0,0121461814297704 0,0434576943617914 0,00151355437517659 0,00693621823797518 533440 1867563 667 665 0 True 349 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 393 362 0,0119872542556829 0,0376751446021784 0,0120088502327001 0,0384985122453651 0,00151613857544187 0,00461581398356878 523985 1641912 667 665 0 True 394 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 438 362 0,0115049593536946 0,0743242633936638 0,0115205615320058 0,0704814221408408 0,00177406860152622 0,0111413804496819 502903 3239109 667 665 0 True 438 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 482 361 0,0113533757268768 0,0343715548885948 0,0112153810940719 0,0348210879682612 0,00188539064153469 0,00410058622532694 496277 1497939 667 665 0 True 482 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 526 361 0,0113251225154189 0,0317044843741306 0,0113832303349355 0,0317845426108186 0,00194978712895665 0,00380664261123271 495042 1381706 667 665 0 True 527 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 569 360 0,0111281964877026 0,0541411207120571 0,0112001220721752 0,054886701762417 0,00179219852794766 0,00864944447213782 486434 2359512 667 665 0 True 571 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 614 360 0,0108631195960729 0,0583449927175458 0,0109864957656214 0,058655680170901 0,00220126983536723 0,0110853893846469 474847 2542720 667 665 0 True 615 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 658 360 0,0107138694328734 0,0672097960625987 0,0107728694590677 0,0663614862287327 0,00195606152713263 0,0176030224182372 468323 2929055 667 665 0 True 659 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 261 403 0,0777593702689938 0,0985790408729537 0,017792019531548 0,0610360875867857 0,180099590075618 0,16578276999428 3083056 4296151 605 665 0 False 261 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 305 403 0,0517297905102047 0,406414204428444 0,0190280003051804 0,108445868619821 0,13290060607826 0,43323097465242 2122210 17711846 626 665 29 False 305 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 349 406 0,0143721227049556 0,0914260932716318 0,0139925230792706 0,0865339131761654 0,00260353131734236 0,0226238276325653 628232 3984420 667 665 0 True 349 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 394 406 0,0131959655329122 0,0721355460062378 0,0130464637216754 0,0698252841992828 0,00182824821871119 0,0145962078222218 576820 3143723 667 665 0 True 394 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 438 405 0,0129225842560523 0,0469417535599126 0,0127260242618448 0,0476081483176928 0,00266058296442046 0,0079751492754161 564870 2045758 667 665 0 True 438 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 482 405 0,0120549475777103 0,0564882336305401 0,0120851453421836 0,0561074235141527 0,00177446337930571 0,0100643992435993 526944 2461801 667 665 0 True 482 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 526 404 0,0113936394128411 0,0427955445950651 0,0113374532692454 0,0437323567559319 0,00179734753801098 0,00544578662920405 498037 1865063 667 665 0 True 527 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 570 405 0,0114323245792988 0,054191372227777 0,0114900434882124 0,0527351796749828 0,00190700658676358 0,00730175575386281 499728 2361702 667 665 0 True 571 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 613 404 0,0109961041452265 0,0441524502489917 0,0110017547875181 0,0442053864347295 0,00194786800139778 0,00805977646410493 480660 1924198 667 665 0 True 615 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 658 404 0,0108911211594935 0,0971189475175694 0,0109254596780346 0,0930800335698482 0,00201347144948114 0,0199657650861884 476071 4232519 667 665 0 True 659 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 261 451 0,0145185361084621 0,0550584518058708 0,0139925230792706 0,0554360265506981 0,00281857432971294 0,0085128756305799 634632 2399490 667 665 0 True 261 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 305 446 0,094072016152347 0,439743143622389 0,0196078431372549 0,0999160753795682 0,186667990221364 0,435756898365003 3218135 19164347 522 665 34 False 305 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 349 446 0,0960429252955474 0,0405467548477511 0,0159761959258412 0,0377508201724269 0,21772932721921 0,0150184770363393 3745033 1767059 595 665 0 False 349 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 393 450 0,0151577221231453 0,0597023113976289 0,0150606546120394 0,0591134508278019 0,00186755419011028 0,00884266263238929 662572 2601873 667 665 0 True 394 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 438 450 0,0141761803922941 0,104733061768635 0,0140840772106508 0,104570077058061 0,00202918380982017 0,0166873947556323 619667 4564348 667 665 0 True 438 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 482 448 0,0144677718362151 0,0699626612881483 0,0132448310063325 0,0675669489585718 0,00848263757142387 0,0160725173135193 632413 3049027 667 665 0 True 482 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 526 448 0,0123463788819712 0,0549004004632777 0,0122377355611505 0,0538643472953384 0,00205991537236449 0,00905789959419855 539683 2392602 667 665 0 True 527 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 570 448 0,0119538536980079 0,0335783611007377 0,0120546272983902 0,0336614023041123 0,00208888018824756 0,00437159018764296 522525 1463371 667 665 0 True 571 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 614 448 0,011473274578092 0,0433259160719377 0,0114900434882124 0,0430609597924773 0,0021003166067574 0,00575284781142378 501518 1888177 667 665 0 True 615 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 658 447 0,0107068004107354 0,0760633100260379 0,0106813153276875 0,0762951094834821 0,00193031859594476 0,0155539553813059 468014 3314898 667 665 0 True 659 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 262 495 0,0150539287463158 0,0614664149501701 0,013519493400473 0,0612649729152361 0,00574720506366284 0,0148779090076944 658035 2678754 667 665 0 True 261 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 307 495 0,0755281310074582 0,0652634332455079 0,0161898222323949 0,064591439688716 0,170481840008793 0,0114089065186642 3019339 2844231 610 665 0 True 305 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 349 490 0,100855037517677 0,508079422635325 0,024933241779202 0,314030670634012 0,201330592391156 0,421226104854321 3410520 22142495 516 665 37 False 349 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 395 494 0,0165458126967645 0,102495308998062 0,0162813763637751 0,0970626382848859 0,00306738482670551 0,0218779266951118 723248 4466825 667 665 0 True 394 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 438 490 0,0261221872469579 0,199063073109645 0,0149385824368658 0,115526054779889 0,0680976093345147 0,172897580406685 1141849 8675323 667 665 0 False 438 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 482 490 0,0631028729169405 0,184316754348678 0,0143434805828946 0,0631723506523232 0,133566253131627 0,201435664380227 2758343 8032667 667 665 0 False 482 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 527 490 0,0132900590217594 0,043134340772967 0,012817578393225 0,0429083695735103 0,00326330793892141 0,0161121248714047 580933 1879828 667 665 0 False 527 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 570 492 0,0122942877382549 0,104338552951387 0,0122682536049439 0,100984206912337 0,00200821477779275 0,0204932388698959 537406 4547155 667 665 0 True 571 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 615 492 0,0112984935776561 0,0677062535028347 0,0113221942473487 0,0699778744182498 0,00180285131232833 0,0172047388811306 493878 2950691 667 665 0 True 615 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 660 492 0,0110677323274733 0,0795765564058923 0,0109712367437247 0,0757763027389944 0,00190504220768019 0,013392240322575 483791 3468008 667 665 0 True 659 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 262 538 0,0125153262233612 0,0573201600935275 0,0124971389333944 0,059662775616083 0,0016085287637226 0,0121545518363976 547068 2498057 667 665 0 True 261 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 306 538 0,0185348159063064 0,11712513143697 0,014373998626688 0,116731517509728 0,0158262786634088 0,0236824559753371 810191 5104404 667 665 0 True 305 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 349 533 0,101953024507524 0,495977756246877 0,0267643244068055 0,187075608453498 0,192763337133625 0,440728586422751 3521146 21615095 527 665 39 False 349 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 395 538 0,0459932401051539 0,0721320582298043 0,0186160067139696 0,0647440299076829 0,116957931825679 0,0349199200533817 1552296 3143571 515 665 0 True 394 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 438 533 0,0459642003214461 0,0994874001208102 0,0177004654001678 0,102861066605631 0,0484761118759066 0,0429538626031794 2009180 4335738 667 665 0 False 438 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 482 533 0,216556015880821 0,0873252254004203 0,173281452658885 0,0857251850156405 0,207866089123364 0,0423748146775289 9466063 3805701 667 665 0 False 482 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 527 537 0,19685648134962 0,0756491824663513 0,016586556801709 0,0721751735713741 0,289634298133357 0,0184858153160194 8604960 3296850 667 665 0 True 527 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 572 537 0,0144420122280357 0,0651236468373956 0,012161440451667 0,0639505607690547 0,0144787302551134 0,0145631797089084 631287 2838139 667 665 0 True 571 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 616 537 0,0121011364310978 0,04626767192644 0,0117036697947662 0,0457618066681926 0,00347997699479952 0,00572167655928016 528963 2016381 667 665 0 True 615 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 660 536 0,011356235363664 0,0652428048835754 0,0110933089188983 0,0657511253528649 0,00236665436704548 0,0127074968327891 496402 2843332 667 665 0 True 659 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 262 582 0,0118894089233708 0,052944147964326 0,011810482948043 0,0504615854123751 0,00147658013809044 0,0174574086297401 519708 2307347 667 665 0 True 261 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 307 583 0,0126945225029966 0,0584985237183139 0,0126955062180514 0,0580453192950332 0,00163529512688878 0,0118578078667144 554901 2549411 667 665 0 True 305 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 351 583 0,0176090714084478 0,0548979681981332 0,0144502937361715 0,0535896849011978 0,0115026115719149 0,00927585522762764 769725 2392496 667 665 0 True 349 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 394 577 0,0526544716776338 0,480760059911739 0,0197451743343252 0,21727321278706 0,139343850885515 0,431935733489754 1980708 20951896 574 665 33 False 394 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 439 582 0,0389522336565752 0,100900293764854 0,0153505760280766 0,0947585259784848 0,0519860158562727 0,0220888847882694 1702674 4397313 667 665 0 True 438 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 484 581 0,120479929410438 0,0903323082253586 0,0171206225680934 0,0753032730601968 0,157018190998594 0,0463904413948944 5266400 3936752 667 665 0 True 482 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 528 580 0,0554910917166731 0,0634398309805184 0,0132600900282292 0,0612649729152361 0,111533917962961 0,0101538557030979 2425618 2764757 667 665 0 True 527 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 571 577 0,011909083224467 0,0396548707543636 0,0118867780575265 0,0429388876173037 0,00183169370390424 0,0127186736655257 520568 1728190 667 665 0 False 571 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 616 580 0,0113935250273696 0,0530486435819464 0,0113527122911421 0,0523384451056687 0,00161963555823358 0,010624186132488 498032 2311901 667 665 0 True 615 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 659 580 0,0112605862324045 0,0572154120710336 0,011261158159762 0,056092164492256 0,0017600317715742 0,00822107869202406 492221 2493492 667 665 0 True 659 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 261 620 0,011600059434691 0,0110473941778227 0,0113679713130388 0,0110017547875181 0,00242286774183204 0,00144557445950512 507060 481454 667 665 0 False 261 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 305 620 0,0144010622292424 0,011940402620192 0,0119783321889067 0,011810482948043 0,0129584434417477 0,00180623148112824 629497 520372 667 665 0 False 305 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 351 627 0,0135675581755929 0,0857896170960705 0,0124971389333944 0,0831464103150988 0,00835332735678318 0,0136494929928137 593063 3738778 667 665 0 True 349 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 395 627 0,0125757217523076 0,0993021808354716 0,0124818799114977 0,0847028305485618 0,00196112826403764 0,0544519672033567 549708 4327666 667 665 0 True 394 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 438 620 0,0121867882721491 0,012130234030946 0,0120241092545968 0,0120851453421836 0,00237654416905295 0,00227399767780659 532707 528645 667 665 0 False 438 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 482 620 0,0124358740748646 0,0119129593266756 0,0122835126268406 0,0117647058823529 0,00237566991839028 0,00226039642962256 543595 519176 667 665 0 False 482 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 527 620 0,0147326657110904 0,0137922053933185 0,0118562600137331 0,0119935912108034 0,0150623106387188 0,00891059913000944 643992 601075 667 665 0 False 527 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 571 620 0,0111965303683704 0,0113473658970039 0,0112306401159686 0,0113527122911421 0,00178646068141366 0,001884870338158 489421 494527 667 665 0 False 571 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 615 620 0,0111033290862008 0,0110369767403173 0,0110933089188983 0,0110475318532082 0,00158586207053908 0,00133253360812683 485347 481000 667 665 0 False 615 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 659 620 0,0112076028820106 0,011212191614307 0,0111543450064851 0,0111696040283818 0,00155971337102026 0,00166110236288784 489905 488636 667 665 0 False 659 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 261 664 0,0125675546296433 0,0359411001754788 0,0109864957656214 0,0419775692378119 0,00586150744065437 0,0170978098184892 549351 1566341 667 665 0 False 261 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 305 664 0,0110034476924962 0,0108119004308666 0,0109864957656214 0,0107881284809644 0,0014145611008314 0,00122335110430777 480981 471191 667 665 0 False 305 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 349 664 0,0119895877193013 0,0114880242492246 0,0113679713130388 0,0114290074006256 0,00400437748925503 0,0015940255695305 524087 500657 667 665 0 False 349 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 394 664 0,0121604796137065 0,0111574656485572 0,0112306401159686 0,0110933089188983 0,00478705430938932 0,00136006981182888 531557 486251 667 665 0 False 394 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 438 664 0,0113192888563729 0,0120228472302294 0,0112764171816587 0,0118410009918364 0,00168574011547664 0,00211895372408536 494787 523965 667 665 0 False 438 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 482 664 0,0115247480402623 0,0110724281520923 0,0114442664225223 0,0110627908751049 0,00183417460079003 0,00163440857309983 503768 482545 667 665 0 False 482 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 527 664 0,0112083807032167 0,0113045259062052 0,0111390859845884 0,0112916762035554 0,0018205014841729 0,00185972422027676 489939 492660 667 665 0 False 527 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 571 664 0,01084154649615 0,0108204592506673 0,0108033875028611 0,0108644235904479 0,00149405116524209 0,00147775419300579 473904 471564 667 665 0 False 571 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 615 664 0,0109623604311371 0,0112658850146653 0,0109102006561379 0,0112916762035554 0,00145203306806407 0,00157205783784398 479185 490976 667 665 0 False 615 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 662 669 0,0110998060136789 0,0464870576532886 0,0110627908751049 0,045792324711986 0,00144290836976158 0,00816818107991155 485193 2025942 667 665 0 True 659 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C5_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C5_2.csv new file mode 100755 index 0000000..e56017a --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C5_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 260 273 0,00897733783600303 0,709247529443889 0,00871290150301366 0,693888761730373 0,00202557262068345 0,18361215542465 392416 30909557 667 665 9 True 261 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 305 273 0,0111844512625811 0,00699703022720454 0,00753795681696803 0,00703440909437705 0,01935685415777 0,00129108671320348 488893 304936 667 665 0 False 305 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 348 274 0,0130793609832758 0,00801208789884989 0,00711070420386053 0,00717174029144732 0,0267521488305934 0,00373349745686912 571723 349173 667 665 0 True 349 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 393 273 0,0070425762170414 0,00732022319474585 0,00704966811627375 0,00729381246662089 0,00132342920723082 0,00130453694758961 307844 319021 667 665 0 True 394 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 437 273 0,0074393336634498 0,00744158404709416 0,00737010757610437 0,00738536659800107 0,00155293585806834 0,00167540895243423 325187 324310 667 665 0 True 438 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 481 272 0,0114106370939044 0,00760929561257229 0,00787365529869535 0,0076600289921416 0,015166620532769 0,00170699143860756 498780 331619 667 665 0 True 482 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 525 272 0,00904111917490557 0,00793356703730028 0,00791943236438544 0,00799572747386892 0,00741757967575678 0,00153570638178945 395204 345751 667 665 0 True 526 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 569 271 0,00785915122091049 0,00809682709864613 0,00790417334248875 0,0081177996490425 0,00166594288857993 0,00170108658244666 343538 352866 667 665 0 True 571 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 615 273 0,00861073239987926 0,00858424385523204 0,00868238345922026 0,00854505226215 0,00204728978934636 0,00183461319204645 376391 374108 667 665 0 False 615 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 657 271 0,0111957754242586 0,710538580371735 0,00993362325474937 0,699092088197147 0,0080520647585636 0,193957613784185 489388 30965822 667 665 10 True 659 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 261 316 0,00781470102668968 0,0076915796013265 0,00781261921110857 0,00772106507972839 0,00145417477105529 0,00145807774258336 341595 335205 667 665 0 False 261 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 305 316 0,00755630424659494 0,00758481233984481 0,00740062561989776 0,00752269779507134 0,00160427566160267 0,00134703504660699 330300 330552 667 665 0 False 305 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 349 317 0,00750187963926025 0,00781339937162659 0,00747692072938125 0,00781261921110857 0,00122640868629103 0,0014348589116323 327921 340514 667 665 0 True 349 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 393 318 0,00729248559515161 0,00879497897868957 0,00735484855420768 0,00775158312352178 0,0013934137433711 0,00447223705658206 318768 383292 667 665 0 True 394 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 437 318 0,00776052806739226 0,00784614316748612 0,00775158312352178 0,00784313725490196 0,00163963977322682 0,00177834765235003 339227 341941 667 665 0 True 438 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 482 317 0,00774012169927854 0,00789258566420629 0,00778210116731518 0,00790417334248875 0,00157394131451013 0,00157043773766479 338335 343965 667 665 0 True 482 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 526 316 0,0076763632374703 0,00776727811747267 0,0076600289921416 0,00790417334248875 0,00159986111791041 0,00169621925801616 335548 338504 667 665 0 True 527 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 569 316 0,00786262853924377 0,00820306660448328 0,00782787823300526 0,00816357671473259 0,00171204037949553 0,00161078838599268 343690 357496 667 665 0 True 571 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 615 316 0,00861151022108538 0,00830441863413397 0,00848401617456321 0,00836194399938964 0,00232155286659261 0,00203981489879998 376425 361913 667 665 0 False 615 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 659 316 0,00842595410923515 0,00818796820386971 0,00846875715266651 0,00816357671473259 0,002011326674848 0,00178548978624561 368314 356838 667 665 0 False 659 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 260 362 0,0499230994670745 0,0244198502665453 0,00915541313801785 0,00958266575112535 0,154144918999329 0,0748358952100807 2123340 1064236 649 665 0 True 261 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 305 362 0,00858069477506612 0,00865585800160736 0,00843823910887312 0,00860608834973678 0,00182301045562871 0,0014508950375771 375078 377229 667 665 0 True 305 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 349 363 0,00819478107135492 0,00816300306729286 0,00817883573662928 0,00823987182421607 0,0013859358226132 0,00130193537736976 358209 355750 667 665 0 True 349 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 393 362 0,00823852207565249 0,00840455453121244 0,00827038986800946 0,00840772106507973 0,00143957298904319 0,00134754644654256 360121 366277 667 665 0 True 394 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 438 362 0,00847070170568184 0,00819620578110417 0,00849927519645991 0,00823987182421607 0,00177754049340813 0,00169548846130047 370270 357197 667 665 0 True 438 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 482 361 0,0083852100042906 0,00830643787312181 0,00840772106507973 0,00828564888990616 0,00163152522993658 0,00172955706285693 366533 362001 667 665 0 True 482 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 526 361 0,00821747514889843 0,00813002981245744 0,00833142595559625 0,00816357671473259 0,00168116067454166 0,00167080857564033 359201 354313 667 665 0 True 527 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 569 360 0,00813971590537988 0,00830467103900745 0,00814831769283589 0,00828564888990616 0,00177574736817137 0,00180700567842658 355802 361924 667 665 0 True 571 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 614 360 0,00810384462152078 0,00791968476925892 0,00807202258335241 0,00794995040817884 0,00195117279527172 0,00192932630843607 354234 345146 667 665 0 True 615 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 658 360 0,00761214723377611 0,0076518831984975 0,00761425192645151 0,00773632410162509 0,00180816519026916 0,00193138433087343 332741 333475 667 665 0 True 659 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 261 403 0,078560493179672 0,0672176435595741 0,0119172961013199 0,0133821622034028 0,189267769031611 0,177297913169359 3109671 2929397 604 665 0 False 261 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 305 403 0,0469716256419224 0,379471613343269 0,0125429159990845 0,0536354619668879 0,139299489642498 0,444474398056891 1930085 16537667 627 665 28 False 305 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 349 406 0,0100033526381694 0,00980712252134112 0,00984206912336919 0,00976577401388571 0,00188279579387915 0,00128876164935799 437265 427402 667 665 0 True 349 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 394 406 0,00952158390934997 0,00943870318965186 0,00950637064164187 0,00943007553215839 0,00162970487039809 0,00153220564833336 416206 411346 667 665 0 True 394 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 438 405 0,00985339328504665 0,00973594434701999 0,0097962920576791 0,00967421988250553 0,00186052397832479 0,00202420695904623 430710 424300 667 665 0 True 438 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 482 405 0,00926961559275295 0,00951777475274361 0,00926222629129473 0,00953688868543526 0,00173006581528865 0,0017828139538848 405192 414792 667 665 0 True 482 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 526 404 0,00885897175010572 0,00880321655592403 0,00885023270008392 0,00881971465629053 0,00173953062573724 0,00171489206108701 387242 383651 667 665 0 True 527 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 570 405 0,00833254693321684 0,00858261469650322 0,00827038986800946 0,00863660639353018 0,00173470290358866 0,00169214075904491 364231 374037 667 665 0 True 571 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 613 404 0,00773087935318219 0,00749167494153099 0,00775158312352178 0,00756847486076143 0,00188841389495414 0,0018334738713211 337931 326493 667 665 0 True 615 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 658 404 0,0072513297025097 0,00801018338935001 0,0072480354009308 0,00756847486076143 0,00176204701131416 0,00286226767271223 316969 349090 667 665 0 True 659 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 261 451 0,00941124768355122 0,00894499925712657 0,00923170824750134 0,0089417868314641 0,0019134517727078 0,0016174650368216 411383 389830 667 665 0 True 261 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 305 446 0,0974992766359903 0,40745780679669 0,0128328374151217 0,0360723277637903 0,205622389554461 0,457459763983158 3386496 17757327 530 665 32 False 305 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 349 446 0,104231822878085 0,0153260698094515 0,0116578927290761 0,0119478141451133 0,232752060853623 0,00987034484254752 4159977 667922 609 665 0 False 349 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 393 450 0,0110067419940751 0,0109541649959185 0,0109407186999313 0,0108796826123445 0,00178426520640872 0,00161222741923188 481125 477391 667 665 0 True 394 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 438 450 0,0175207429473636 0,0143715663615436 0,0127565423056382 0,0139314869916838 0,0105265538678313 0,00356108356776217 765864 626324 667 665 0 True 438 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 482 448 0,0211397620027249 0,0155533259791732 0,0132448310063325 0,0144502937361715 0,0138688004877898 0,00508075307959988 924058 677826 667 665 0 True 482 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 526 448 0,0143950913076307 0,0113568196068106 0,011261158159762 0,0110933089188983 0,00758727703704595 0,00244093138466711 629236 494939 667 665 0 True 527 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 570 448 0,00919261129334623 0,00878993088121999 0,00920119020370794 0,00883497367818723 0,00193057001567951 0,00200159352485282 401826 383072 667 665 0 True 571 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 614 448 0,00802121255691678 0,00879793899947855 0,00798046845197223 0,00842298008697642 0,00200173840528278 0,00371571178800801 350622 383421 667 665 0 True 615 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 658 447 0,00729632894699366 0,00745826571464138 0,00735484855420768 0,00741588464179446 0,00178996200345572 0,00182348007660428 318936 325037 667 665 0 True 659 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 262 495 0,00956111552829673 0,00908563466344965 0,00880445563439384 0,00883497367818723 0,00310037066616948 0,00211696549391179 417934 395959 667 665 0 True 261 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 307 495 0,125839670415182 0,0308440591063376 0,0116731517509728 0,0126802471961547 0,241896471571983 0,0560920536209042 5005870 1344208 607 665 0 True 305 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 349 490 0,143872839913124 0,471200018815636 0,0199282825970855 0,243244068055238 0,246084022768609 0,44650694554212 4884070 20535262 518 665 35 False 349 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 395 494 0,0154861456888859 0,0128519513478133 0,0137483787289235 0,012817578393225 0,00634781508890177 0,00201397667883613 676928 560098 667 665 0 True 394 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 438 490 0,0362479708435305 0,387869444726488 0,028397039749752 0,0579385061417563 0,0690959798519781 0,439561500772678 1544082 16903651 650 665 27 False 438 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 482 490 0,0681632126670021 0,404722059210741 0,0349126420996414 0,0749828336003662 0,138972461609806 0,441155440689099 2640042 17638101 591 665 30 False 482 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 527 490 0,0438755902433311 0,0525732275297995 0,0325780117494469 0,029556725413901 0,0375661851912923 0,0775721011042171 1917883 2291182 667 665 0 False 527 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 570 492 0,0212676907140387 0,0161934247383164 0,0123750667582208 0,0138551918822004 0,0174154234613776 0,00776871241512157 929650 705722 667 665 0 True 571 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 615 492 0,00850243223547302 0,0082435661137279 0,00845349813076982 0,00833142595559625 0,00188354078859374 0,0018650848132162 371657 359261 667 665 0 True 615 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 660 492 0,00773664438094526 0,00764548129307017 0,00770580605783169 0,00755321583886473 0,00182222144935789 0,00216049398676199 338183 333196 667 665 0 True 659 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 262 538 0,00832623285519062 0,00854613071933668 0,00828564888990616 0,00856031128404669 0,00149709914820238 0,00142969857703632 363955 372447 667 665 0 True 261 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 306 538 0,0132812055862661 0,0233486898752948 0,0100099183642329 0,0112458991378653 0,0138941510412242 0,0373361737965083 580546 1017554 667 665 0 True 305 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 349 533 0,118669470980672 0,474458405110969 0,02221713588159 0,19140917067216 0,217041860030324 0,463980510766546 4114035 20677265 529 665 39 False 349 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 395 538 0,0529296880178089 0,0264867937754664 0,0161745632104982 0,0173495078965438 0,141548612442222 0,0319312021103408 1796811 1154315 518 665 0 True 394 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 438 533 0,115798925394943 0,496658010326801 0,0209506370641642 0,576195925841154 0,209405344249148 0,359134987887073 4006930 21644741 528 665 7 False 438 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 482 533 0,261661341268025 0,315320597212877 0,0874494544899672 0,170138094148165 0,299467937352838 0,312096973082976 4286994 13741916 250 665 8 False 482 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 527 537 0,103172599367658 0,0765904920231455 0,0621805142290379 0,0624399176012818 0,129537681450766 0,04717679023187 3069683 3337873 454 665 0 True 527 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 572 537 0,0609606160526969 0,0381671505382821 0,0370183871213855 0,0296635385671778 0,108910052407468 0,0377935786356263 2664701 1663354 667 665 0 True 571 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 616 537 0,049460163486579 0,0201929405798773 0,0212405584802014 0,018142977035172 0,11972180085886 0,00882456332684273 2161995 880024 667 665 0 True 615 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 660 536 0,0239024685414217 0,0114591812559552 0,0112306401159686 0,0111543450064851 0,0564611047761027 0,00312011586228088 1044821 499400 667 665 0 True 659 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 262 582 0,00824126732696824 0,0109955364492715 0,00825513084611276 0,00875867856870375 0,00129732989261641 0,00760633021937213 360241 479194 667 665 0 True 261 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 307 583 0,00868172002348562 0,0093042861215754 0,00865186541542687 0,00930800335698482 0,00152286861569584 0,0015277654676442 379494 405488 667 665 0 True 305 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 351 583 0,0129856792821259 0,0104713833106456 0,0103913939116503 0,0103913939116503 0,0129691566356483 0,00205498956611915 567628 456351 667 665 0 True 349 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 394 577 0,0516827317629809 0,45427728166835 0,0144502937361715 0,205615320057984 0,147090772984919 0,449280839840063 1947541 19797756 575 665 31 False 394 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 439 582 0,0698165420513212 0,0134252775449725 0,0122835126268406 0,012664988174258 0,184452020867744 0,00386420226470944 2635446 585084 576 665 0 True 438 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 484 581 0,0799292868898532 0,227854346325874 0,0377660791943236 0,0614023041123064 0,161567194933668 0,343948910857765 2053361 9930069 392 665 14 True 482 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 528 580 0,0864790182415037 0,0506679608152907 0,0590218966964218 0,0451056687266346 0,128703341421569 0,0200905846886108 3224752 2208149 569 665 0 True 527 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 571 577 0,0441771561003659 0,0726547657768821 0,0395513847562371 0,0482185091935607 0,0160549347515379 0,0769346071519229 1931065 3166351 667 665 0 False 571 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 616 580 0,030312012682146 0,0272081898497675 0,0286564431219959 0,0270542458228428 0,00891141319319572 0,00422550809686332 1324994 1185754 667 665 0 True 615 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 659 580 0,0275751572600058 0,0274912504424256 0,0287327382314794 0,0289921416037232 0,00855442365400785 0,00553631611342655 1205361 1198090 667 665 0 True 659 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 261 620 0,00800961387010775 0,00791856042027706 0,00805676356145571 0,00790417334248875 0,00137812331451559 0,00142848239883951 350115 345097 667 665 0 False 261 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 305 620 0,0100798765185958 0,00866462333448637 0,00857557030594339 0,00849927519645991 0,00853875682140488 0,00166406282504163 440610 377611 667 665 0 False 305 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 351 627 0,00946464282164251 0,00848392439097285 0,00866712443732357 0,00846875715266651 0,00569026068937027 0,00133584497857909 413717 369736 667 665 0 True 349 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 395 627 0,00859453541711635 0,0178011519987885 0,00848401617456321 0,00907911802853437 0,00159455880193347 0,0236921507060407 375683 775788 667 665 0 True 394 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 438 620 0,00921816500767698 0,00941901560952048 0,00920119020370794 0,00915541313801785 0,00191620284707491 0,00252133810367814 402943 410488 667 665 0 False 438 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 482 620 0,0226329270704542 0,0154665904862867 0,0127565423056382 0,0139620050354772 0,0222254158993334 0,0060446073629235 989327 674046 667 665 0 False 482 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 527 620 0,061974094207188 0,0502204928664073 0,0355077439536126 0,0415655756466011 0,085275409516564 0,0415820935051709 2709002 2188648 667 665 0 False 527 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 571 620 0,0354123235932961 0,0391849387717405 0,0321355001144427 0,0368505378805219 0,00922137463151771 0,0093430429697314 1547938 1707710 667 665 0 False 571 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 615 620 0,0290196627481636 0,0281811188534394 0,0288700694285496 0,0278934920271611 0,00476544421265135 0,00341280846582229 1268503 1228155 667 665 0 False 615 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 659 620 0,0326370575298297 0,0312037360510454 0,0328374151216907 0,0309758144502937 0,00437367847310814 0,00669247741396298 1426626 1359883 667 665 0 False 659 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 261 664 0,04742577212195 0,533725914695184 0,00900282291905089 0,621347371633478 0,113498446441039 0,362836670779119 2073068 23260189 667 665 10 False 261 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 305 664 0,00850183743102127 0,00789540800960974 0,0080872816052491 0,00784313725490196 0,00235252746180748 0,0013813364895451 371631 344088 667 665 0 False 305 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 349 664 0,00778736289900369 0,00771406658096374 0,00781261921110857 0,00773632410162509 0,00124592194220472 0,00134204968856335 340400 336185 667 665 0 False 349 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 394 664 0,00894787213854734 0,00761312757746965 0,00773632410162509 0,00759899290455482 0,00725501506670937 0,00127340417807364 391128 331786 667 665 0 False 394 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 438 664 0,00793663593929746 0,00832364729631357 0,00788891432059205 0,00828564888990616 0,00165186165764944 0,00183192590420446 346925 362751 667 665 0 False 438 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 482 664 0,00840616542266747 0,00804742458113698 0,00836194399938964 0,00798046845197223 0,00178586665350633 0,00160988484301048 367449 350713 667 665 0 False 482 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 527 664 0,0182847921427247 0,0150259145230896 0,0176089112687877 0,0135652704661631 0,00887977189629871 0,00589812585869701 799262 654841 667 665 0 False 527 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 571 664 0,0262999193925582 0,0268137498702123 0,025986114290074 0,0268558785381857 0,00338108521414666 0,00305632429867119 1149618 1168564 667 665 0 False 571 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 615 664 0,0278190499623157 0,0305212791649529 0,0276188296330205 0,028702220187686 0,00341204809222573 0,00681606790927153 1216022 1330141 667 665 0 False 615 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 662 669 0,0280509779443078 0,751138225513429 0,0287174792095827 0,745845731288624 0,00500436801635018 0,176344751954354 1226160 32735186 667 665 13 True 659 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C5_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C5_3.csv new file mode 100755 index 0000000..cba3d54 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C5_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 260 273 0,0010653634043587 0,0693796519222065 0,000885023270008392 0,0668802929732204 0,000814860157265702 0,0197339755482149 46569 3023619 667 665 0 True 261 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 305 273 0,00138141046208413 0,000942778094239949 0,00100709544518196 0,000854505226215 0,00189164175251931 0,000673039822225796 60384 41087 667 665 0 False 305 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 348 274 0,00153672305527255 0,00112717132726529 0,000930800335698482 0,00102235446707866 0,00264457791660444 0,00079677300426079 67173 49123 667 665 0 True 349 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 393 273 0,000955187318220039 0,0009896795089119 0,000823987182421607 0,000869764248111696 0,000698269654315278 0,000708730943601115 41753 43131 667 665 0 True 394 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 437 273 0,000928901536871756 0,000951956453275556 0,000747692072938125 0,000717174029144732 0,000798495565375179 0,000889670604260276 40604 41487 667 665 0 True 438 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 481 272 0,00133293389926689 0,000985916381707301 0,000869764248111696 0,000762951094834821 0,00166282191520185 0,000872092536384002 58265 42967 667 665 0 True 482 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 525 272 0,00111802647543246 0,00100849514493489 0,000869764248111696 0,000839246204318303 0,00104337085773924 0,000846708080859777 48871 43951 667 665 0 True 526 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 569 271 0,00103468522090523 0,00103942621488489 0,000778210116731518 0,000762951094834821 0,000911060054999631 0,000922551146760041 45228 45299 667 665 0 True 571 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 615 273 0,000999179970554892 0,00107985688643674 0,000656137941557946 0,000793469138628214 0,00101867239494889 0,00103235200677358 43676 47061 667 665 0 False 615 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 657 271 0,00125094239330323 0,069697085469453 0,000930800335698482 0,0678416113527123 0,00118804966158243 0,0207446860721022 54681 3037453 667 665 0 True 659 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 261 316 0,00103585195271442 0,00103210647355399 0,000885023270008392 0,000869764248111696 0,000763400751383722 0,00079436911868462 45279 44980 667 665 0 False 261 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 305 316 0,00105728779007155 0,000976416780105448 0,000961318379491875 0,000915541313801785 0,000700635995708616 0,000627174349448773 46216 42553 667 665 0 False 305 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 349 317 0,000987512652462965 0,000962282107190613 0,000900282291905089 0,000854505226215 0,00069245661428509 0,000709805781276368 43166 41937 667 665 0 True 349 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 393 318 0,000921649497979324 0,00100849514493489 0,000778210116731518 0,000839246204318303 0,000695501535493986 0,0007130530193489 40287 43951 667 665 0 True 394 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 437 318 0,000945647569897816 0,000956086714841579 0,000671396963454643 0,000717174029144732 0,000882597243697161 0,000886988861885894 41336 41667 667 665 0 True 438 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 482 317 0,000994375780752334 0,00103508944024056 0,000747692072938125 0,000839246204318303 0,000919871720601776 0,000870705889793999 43466 45110 667 665 0 True 482 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 526 316 0,000982639831377513 0,000950006051980489 0,000762951094834821 0,000732433051041428 0,000837142350942317 0,000837087036613373 42953 41402 667 665 0 True 527 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 569 316 0,000993941115960674 0,0010103537626396 0,000747692072938125 0,00080872816052491 0,000933979007814727 0,000850922185689066 43447 44032 667 665 0 True 571 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 615 316 0,00104845723167256 0,000985044437598918 0,000686655985351339 0,000595101853971161 0,00109061434640602 0,00103125999876086 45830 42929 667 665 0 False 615 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 659 316 0,00113692295532252 0,000982176200400291 0,000869764248111696 0,00064087891966125 0,0010663797869444 0,000950045484054588 49697 42804 667 665 0 False 659 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 260 362 0,0093342891383331 0,00262315206647885 0,00122072175173571 0,00125123979552911 0,0290352365199281 0,00735521557002634 408019 114319 667 665 0 True 261 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 305 362 0,00107323312479718 0,00117226001602771 0,000976577401388571 0,00105287251087205 0,000769449441821416 0,000779440442422691 46913 51088 667 665 0 True 305 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 349 363 0,00107051075057573 0,00100307991310389 0,000930800335698482 0,000915541313801785 0,000776962715505049 0,00073171395302053 46794 43715 667 665 0 True 349 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 393 362 0,00104726762276907 0,000977793533960789 0,000900282291905089 0,000839246204318303 0,000775532480388145 0,000737537167500154 45778 42613 667 665 0 True 394 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 438 362 0,00108926996790001 0,00104564455313151 0,000930800335698482 0,000762951094834821 0,000853253008442151 0,000942060130069644 47614 45570 667 665 0 True 438 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 482 361 0,00101361541705686 0,000998674300766794 0,000778210116731518 0,000793469138628214 0,000888922958457331 0,000845861397385868 44307 43523 667 665 0 True 482 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 526 361 0,00101077865736392 0,000951497535323775 0,000793469138628214 0,000656137941557946 0,000916872200940656 0,000904429744829447 44183 41467 667 665 0 True 527 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 569 360 0,000953036871356036 0,000988142133773436 0,000656137941557946 0,000656137941557946 0,000963815372788112 0,000971786092781311 41659 43064 667 665 0 True 571 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 614 360 0,00101814508172785 0,00102134484758474 0,000625619897764553 0,000701915007248035 0,00112107183198233 0,00106976093832553 44505 44511 667 665 0 True 615 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 658 360 0,00103674415939204 0,00104071118514987 0,000656137941557946 0,000656137941557946 0,00103583290294618 0,00107774092453625 45318 45355 667 665 0 True 659 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 261 403 0,0261765432230097 0,00762996986629999 0,00186160067139696 0,00175478751812009 0,0605411515908994 0,0234321844354941 1144225 332520 667 665 0 False 261 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 305 403 0,0164827176706909 0,074676941839607 0,00167849240863661 0,00518806744487678 0,0489112096391434 0,10432718464367 720490 3254479 667 665 0 False 305 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 349 406 0,00119821069094658 0,00118476553021372 0,00108339055466545 0,00111390859845884 0,000766449296716637 0,00072630392545129 52376 51633 667 665 0 True 349 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 394 406 0,00117917694849074 0,00115690921054066 0,00100709544518196 0,000991836423285267 0,000830821898736082 0,000815457939544721 51544 50419 667 665 0 True 394 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 438 405 0,00117483030057414 0,00118767965920753 0,000976577401388571 0,00100709544518196 0,000882113680527851 0,000899470030498028 51354 51760 667 665 0 True 438 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 482 405 0,00111592178275705 0,00112510619648228 0,000885023270008392 0,000885023270008392 0,000920956775256875 0,000930591333171408 48779 49033 667 665 0 True 482 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 526 404 0,00110969921310803 0,00104745727904105 0,000930800335698482 0,000793469138628214 0,000912944367399477 0,000931399227805903 48507 45649 667 665 0 True 527 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 570 405 0,00102402449496241 0,00108547863134605 0,000747692072938125 0,000778210116731518 0,000980753730403246 0,00096065154208869 44762 47306 667 665 0 True 571 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 613 404 0,000986986479294114 0,000958450142293247 0,000564583810177768 0,000503547722590982 0,00106732671040502 0,00103923286432909 43143 41770 667 665 0 True 615 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 658 404 0,000978682094063977 0,000977196940623475 0,000595101853971161 0,000610360875867857 0,00100435779191756 0,000971334874614758 42780 42587 667 665 0 True 659 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 261 451 0,00111567013471978 0,00104188142592691 0,000976577401388571 0,000900282291905089 0,000848133096408407 0,000857556086615077 48768 45406 667 665 0 True 261 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 305 446 0,0368285529929016 0,076053925153924 0,00234988937209125 0,00444037537193866 0,0575064451481876 0,0950368966011847 1609844 3314489 667 665 0 False 305 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 349 446 0,0202811388995363 0,00163583598501862 0,0016937514305333 0,00135805294880598 0,0388171280714042 0,00129979939863973 886526 71291 667 665 0 False 349 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 393 450 0,00125268105246987 0,00128809090705707 0,00111390859845884 0,00117494468604562 0,000941381056787997 0,000876217581992472 54757 56136 667 665 0 True 394 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 438 450 0,00177141916567466 0,00145729395587848 0,00148012512397955 0,00120546272983902 0,00148118294162334 0,00125953886918569 77432 63510 667 665 0 True 438 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 482 448 0,00202350186774317 0,00156346462402286 0,00158693827725643 0,0012817578393225 0,00167460656727665 0,00129655573842082 88451 68137 667 665 0 True 482 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 526 448 0,0014274391758115 0,00118224148147893 0,00115968566414893 0,000915541313801785 0,00118200205926288 0,00101142671876156 62396 51523 667 665 0 True 527 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 570 448 0,00106234362791138 0,00102591108120496 0,000747692072938125 0,000656137941557946 0,000981586618890788 0,00109682272304883 46437 44710 667 665 0 True 571 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 614 448 0,0010501501366506 0,00110174727273666 0,000671396963454643 0,000686655985351339 0,000980852453733312 0,00109326282301054 45904 48015 667 665 0 True 615 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 658 447 0,000983394775489344 0,000873779780189774 0,000549324788281071 0,000381475547417411 0,00104589506266304 0,00100685151941443 42986 38080 667 665 0 True 659 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 262 495 0,00121166242239375 0,00108566219852676 0,00103761348897536 0,000946059357595178 0,00091245473663878 0,000808950502043221 52964 47314 667 665 0 True 261 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 307 495 0,0258190657475108 0,00306915147791658 0,00205996795605402 0,00144960708018616 0,047729703975174 0,00538328572119363 1128599 133756 667 665 0 True 305 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 349 490 0,0441176070239085 0,0789986180833177 0,00462348363469902 0,0223086900129702 0,0598374124260767 0,0883765984126951 1928462 3442821 667 665 0 False 349 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 395 494 0,00156129305454849 0,00144019926217466 0,00137331197070268 0,0012817578393225 0,0011088468980826 0,00101030955934422 68247 62765 667 665 0 True 394 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 438 490 0,0132877026810468 0,104548416130737 0,00267032883192187 0,00650034332799268 0,0639430122957289 0,152811237083268 580830 4556301 667 665 0 False 438 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 482 490 0,0499112769090392 0,130774613347284 0,00370794232089723 0,00764476997024491 0,126240385019561 0,184915043651545 2181714 5699259 667 665 0 False 482 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 527 490 0,00408447641594629 0,00494956778533654 0,00314335851071946 0,0030060273136492 0,00388226874569932 0,00758206460416069 178540 215706 667 665 0 False 527 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 570 492 0,00206353678276449 0,00156768666917924 0,00164797436484321 0,00134279392690929 0,00192195609162477 0,0013401996389454 90201 68321 667 665 0 True 571 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 615 492 0,00101519393656342 0,00108742903264111 0,000686655985351339 0,000778210116731518 0,000979703008331873 0,00101492526776923 44376 47391 667 665 0 True 615 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 660 492 0,00101919742806555 0,000993511473809266 0,000625619897764553 0,000595101853971161 0,00102993156243619 0,00103600721160085 44551 43298 667 665 0 True 659 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 262 538 0,0010524149689861 0,00110002633041748 0,000930800335698482 0,000915541313801785 0,000753233566284316 0,000852755158809367 46003 47940 667 665 0 True 261 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 306 538 0,00149728294470297 0,00238625861976984 0,0012664988174258 0,00135805294880598 0,00147611663754453 0,00349875789257427 65449 103995 667 665 0 True 305 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 349 533 0,0589845841556219 0,10369154747707 0,00393682764934768 0,0196993972686351 0,100557175041689 0,122998605411724 2578325 4518958 667 665 0 False 349 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 395 538 0,0762380311332089 0,00249933600308852 0,00253299763485161 0,00177004654001678 0,139541294270049 0,00313714811555751 3332505 108923 667 665 0 True 394 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 438 533 0,0366731946455246 0,0501881391508068 0,00413519493400473 0,0571297779812314 0,0533232610252382 0,0380689572649716 1603053 2187238 667 665 0 False 438 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 482 533 0,230453919298076 0,0328769967950318 0,181002517738613 0,0164797436484321 0,231866463838409 0,0360265034231833 10073566 1432805 667 665 0 False 482 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 527 537 0,176101373106421 0,0072536800917377 0,00764476997024491 0,00622568093385214 0,294149132443005 0,00511400554503544 7282247 316121 631 665 0 True 527 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 572 537 0,00558548832701983 0,00358538828187429 0,00352483405813687 0,00294499122606241 0,010659412542423 0,00399076866231279 244152 156254 667 665 0 True 571 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 616 537 0,00489411966024312 0,00194913927069906 0,00210574502174411 0,00170901045243 0,0120319698670827 0,0014216524607499 213931 84945 667 665 0 True 615 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 660 536 0,00247665135159589 0,00118724368715334 0,00143434805828946 0,000839246204318303 0,00577010999226013 0,00115101988895646 108259 51741 667 665 0 True 659 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 262 582 0,00104058751123408 0,00121808297351298 0,000976577401388571 0,000976577401388571 0,000692446334519278 0,00100261155444228 45486 53085 667 665 0 True 261 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 307 583 0,00103660689682625 0,00115704688592619 0,000930800335698482 0,00108339055466545 0,00077576157748305 0,000810015161734263 45312 50425 667 665 0 True 305 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 351 583 0,0014415772200876 0,00125709099941431 0,00122072175173571 0,00111390859845884 0,00158446675833417 0,000863878682594772 63014 54785 667 665 0 True 349 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 394 577 0,0444160844732132 0,104689762859885 0,00193789578088045 0,0224307621881437 0,104588552187211 0,135814556784273 1941509 4562461 667 665 0 False 394 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 439 582 0,0269244183127022 0,00142698242516339 0,00158693827725643 0,00119020370794232 0,0538126684904167 0,0012610912621075 1176916 62189 667 665 0 True 438 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 484 581 0,135790470523493 0,0336872623306951 0,00941481651026169 0,00601205462729839 0,208326601871948 0,0628360196536364 5935652 1468117 667 665 0 True 482 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 528 580 0,0573550608037604 0,00456380135506998 0,00608834973678187 0,00422674906538491 0,137830693463931 0,00268854948565117 2499578 198894 665 665 0 True 527 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 571 577 0,0040952744044549 0,00693278171395529 0,00386053253986419 0,00471503776607919 0,00211174517070047 0,00788769157329563 179012 302136 667 665 0 False 571 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 616 580 0,00267410355248103 0,00244146644936902 0,00259403372243839 0,00244144350347143 0,00142251930604085 0,0011723235458051 116890 106401 667 665 0 True 615 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 659 580 0,00250824461882128 0,00245312296534424 0,00248722056916152 0,00239566643778134 0,00141107514306562 0,00120516823185025 109640 106909 667 665 0 True 659 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 261 620 0,00114435801096934 0,00102359354554847 0,00105287251087205 0,000869764248111696 0,000765429915958536 0,00074601997957211 50022 44609 667 665 0 False 261 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 305 620 0,00120667521583681 0,00103412571254183 0,00100709544518196 0,000915541313801785 0,00105684229083018 0,000705128868801033 52746 45068 667 665 0 False 305 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 351 627 0,00115634560838144 0,00109119215984571 0,000976577401388571 0,000976577401388571 0,00091822544579196 0,000792990697168783 50546 47555 667 665 0 True 349 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 395 627 0,00103594346109161 0,00184351930409682 0,000900282291905089 0,00114442664225223 0,00078263123120668 0,0022510684790311 45283 80342 667 665 0 True 394 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 438 620 0,00107565809679276 0,00112283455262097 0,00080872816052491 0,000869764248111696 0,000961433796516937 0,00100880649433397 47019 48934 667 665 0 False 438 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 482 620 0,00213418124995639 0,00155047724598748 0,00135805294880598 0,00131227588311589 0,00251233490022647 0,00135031892968095 93289 67571 667 665 0 False 482 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 527 620 0,00590295376459173 0,00462924305499386 0,00355535210193027 0,00390630960555428 0,00838086988800503 0,00427521701211037 258029 201746 667 665 0 False 527 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 571 620 0,00322349697204499 0,00368582247562142 0,00302128633554589 0,00369268329900053 0,0016490735482259 0,0016736302818484 140905 160631 667 665 0 False 571 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 615 620 0,0026917417921847 0,00252765124071337 0,00263981078812848 0,00250247959105821 0,00123816396282808 0,00112934518320855 117661 110157 667 665 0 False 615 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 659 620 0,00294739332096369 0,00284675983848383 0,00289921416037232 0,00282291905088884 0,00124937314867884 0,00129114570929616 128836 124064 667 665 0 False 659 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 261 664 0,00469463139796547 0,052440324890964 0,00120546272983902 0,059159227893492 0,0108810518807089 0,0364556578404602 205211 2285390 667 665 0 False 261 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 305 664 0,00105326142147512 0,00101251067701297 0,000900282291905089 0,000915541313801785 0,000722298097213547 0,000680078591527931 46040 44126 667 665 0 False 305 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 349 664 0,0010110303054012 0,00109692863424297 0,000900282291905089 0,000976577401388571 0,000700732271148637 0,000680051380312034 44194 47805 667 665 0 False 349 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 394 664 0,00109702530286699 0,00101586077806097 0,000885023270008392 0,000900282291905089 0,00105927330252644 0,000679758882537824 47953 44272 667 665 0 False 394 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 438 664 0,0010914661689526 0,00111813064361522 0,000915541313801785 0,000961318379491875 0,000820221689409332 0,00084965625311218 47710 48729 667 665 0 False 438 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 482 664 0,00112937351420422 0,0010229051686208 0,000885023270008392 0,000839246204318303 0,000922512283243801 0,000825578077863155 49367 44579 667 665 0 False 482 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 527 664 0,00185414273865585 0,00161851183233892 0,00164797436484321 0,00140383001449607 0,00133468664572573 0,00120721606334074 81048 70536 667 665 0 False 527 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 571 664 0,00246637953625613 0,00257117960843973 0,00238040741588464 0,0025482566567483 0,00115628565006608 0,0011132617208362 107810 112054 667 665 0 False 571 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 615 664 0,00254187394743919 0,00285020172312218 0,00250247959105821 0,00268558785381857 0,00105583759970985 0,00128691889455358 111110 124214 667 665 0 False 615 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 662 669 0,00255429620964295 0,0745232272716582 0,002563515678645 0,0717479209582666 0,00121341373765159 0,0200840980979202 111653 3247780 667 665 0 True 659 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C6_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C6_1.csv new file mode 100755 index 0000000..9d76099 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C6_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 273 256 0,0110256613510594 0,0466666551937179 0,0110322728313115 0,0463874265659571 0,00153286698619888 0,00998999565574193 481952 2033769 667 665 0 True 273 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 317 257 0,0108322126416764 0,0109220636851915 0,0107728694590677 0,0109864957656214 0,00124199170001671 0,00127105988764936 473496 475992 667 665 0 False 317 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 362 256 0,0120069743109677 0,0659311818112459 0,0112458991378653 0,066498817425803 0,00524524565911438 0,0112073903809151 524847 2873332 667 665 0 True 362 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 406 255 0,0124273180415972 0,0945343904508353 0,0115358205539025 0,0921644922560464 0,00520804452059959 0,0241186015431308 543221 4119882 667 665 0 True 406 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 451 255 0,0115114564484752 0,0761173017230648 0,0114900434882124 0,0748760204470893 0,00160356884892304 0,0145395250631056 503187 3317251 667 665 0 True 450 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 494 255 0,0112564912325252 0,0738490768004929 0,0112458991378653 0,076050965133135 0,00163259417614189 0,0235095583261016 492042 3218400 667 665 0 True 494 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 538 256 0,0110182949266955 0,0847342205364636 0,0110475318532082 0,0805828946364538 0,00152942272207706 0,0252689767154258 481630 3692783 667 665 0 True 539 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 583 256 0,0110683500090193 0,073805020677122 0,0110322728313115 0,0717479209582666 0,0018305507027736 0,0203565579583549 483818 3216480 667 665 0 True 583 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 627 257 0,0109141355163572 0,0108640564560864 0,0109407186999313 0,0108339055466545 0,00189446231780151 0,00180365802956633 477077 473464 667 665 0 False 627 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 671 256 0,0111111072982621 0,0479019475904226 0,0109254596780346 0,047699702449073 0,00228862438984589 0,00974294182682256 485687 2087604 667 665 0 True 672 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 273 300 0,010840631412378 0,010734664539582 0,0108033875028611 0,0106660563057908 0,00141500999476127 0,00148104400417083 473864 467825 667 665 0 False 273 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 317 300 0,0111334810964854 0,0108446442267261 0,0112001220721752 0,0108339055466545 0,00131504972630982 0,00119136788420055 486665 472618 667 665 0 False 317 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 362 301 0,0112063217647299 0,118689238546125 0,0112153810940719 0,109269855802243 0,00134370439872025 0,0382934852877386 489849 5172569 667 665 0 True 362 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 406 300 0,0113985808652094 0,0547064617368553 0,0114442664225223 0,0547646295872435 0,00148793004215924 0,00817824484779976 498253 2384150 667 665 0 True 406 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 451 300 0,0120023302608252 0,0840606666586356 0,0112001220721752 0,0822461280231937 0,00468699129515141 0,0186335680226073 524644 3663429 667 665 0 True 450 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 496 301 0,0111779999219891 0,0435925703478197 0,0111848630502785 0,0452277409018082 0,00168038775267688 0,00768269292838519 488611 1899798 667 665 0 True 494 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 538 300 0,0109150277230348 0,0503779476156631 0,0109407186999313 0,0493324177920195 0,00161719690981081 0,0149423124610196 477116 2195510 667 665 0 True 539 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 583 300 0,0110152751502482 0,0554522493002935 0,0111543450064851 0,0557106889448386 0,00180765409446107 0,0121166807849834 481498 2416652 667 665 0 True 583 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 627 300 0,0109837962684943 0,0107977428120542 0,0109254596780346 0,0107881284809644 0,00192650718308633 0,00196416959410467 480122 470574 667 665 0 False 627 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 672 300 0,0108011913018085 0,010757610437171 0,0108186465247578 0,0108339055466545 0,00194259189058691 0,00199401039587803 472140 468825 667 665 0 False 672 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 275 345 0,0109330548733415 0,0539854786887108 0,0109102006561379 0,0525825894560159 0,00155131416239461 0,0108191074956276 477904 2352729 667 665 0 True 273 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 318 345 0,0110480122721885 0,0706313506356874 0,0110627908751049 0,0695201037613489 0,00125771987863787 0,0243417212700961 482929 3078169 667 665 0 True 317 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 363 344 0,0111264578285359 0,04180503903384 0,011108567940795 0,0416113527122911 0,00139582747237216 0,00881869063456619 486358 1821896 667 665 0 True 362 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 408 344 0,011111564840148 0,0379834227362868 0,0110170138094148 0,0377203021286336 0,0015164444593608 0,00662501043314159 485707 1655347 667 665 0 True 406 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 452 344 0,0112100964852891 0,0747522732213918 0,0111848630502785 0,0710612649729152 0,00183436816679847 0,0140459142597949 490014 3257762 667 665 0 True 450 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 495 345 0,0110401654288443 0,0349634213710059 0,010955977721828 0,035233081559472 0,0017106242160911 0,00583996573340317 482586 1523733 667 665 0 True 494 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 539 344 0,0108178915806459 0,0295757246171047 0,0108339055466545 0,0298008697642481 0,00168016320295252 0,00290107236654958 472870 1288933 667 665 0 True 539 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 584 345 0,0111706334976252 0,0526609955880775 0,0108949416342412 0,0522774090180819 0,00284490629288632 0,00940166718038658 488289 2295007 667 665 0 True 583 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 629 344 0,0109557947050736 0,0596194308155374 0,0110170138094148 0,0592813000686656 0,00198375748157122 0,0141786978580488 478898 2598261 667 665 0 True 627 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 673 344 0,0110019149271782 0,0672629617073125 0,0110170138094148 0,0677805752651255 0,00192144595760556 0,019294674304336 480914 2931372 667 665 0 True 672 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 276 389 0,0109509218839882 0,0503865752731566 0,0110170138094148 0,0513923857480735 0,00151389270025216 0,0128762509083016 478685 2195886 667 665 0 True 273 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 320 389 0,0109749885871896 0,0344001684228883 0,0109712367437247 0,0339360646982528 0,0013769942720346 0,00434437996602741 479737 1499186 667 665 0 True 317 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 364 388 0,0112602201988957 0,0926716195386613 0,0112458991378653 0,0880750743877318 0,00150095606561513 0,0233919595243786 492205 4038701 667 665 0 True 361 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 408 388 0,0112041941949602 0,0698661278969913 0,0112153810940719 0,0675364309147784 0,00156584113860636 0,0178346534830371 489756 3044820 667 665 0 True 406 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 452 387 0,0111057540581964 0,045991472157161 0,0111238269626917 0,04614328221561 0,00166400822741373 0,00920616243608218 485453 2004344 667 665 0 True 450 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 497 388 0,0110488587246775 0,0556815935466958 0,0109712367437247 0,0551461051346609 0,00180345127425402 0,0112595193399541 482966 2426647 667 665 0 True 494 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 540 388 0,011130072409435 0,0442989368592 0,0111543450064851 0,0444190127412833 0,00168890839830789 0,00650004679177262 486516 1930582 667 665 0 True 539 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 585 389 0,0110612809868812 0,0541494271269843 0,0110780498970016 0,0530403601129168 0,00184655570517843 0,00930185223871284 483509 2359874 667 665 0 True 583 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 629 388 0,0109413135043831 0,0463137013970036 0,010955977721828 0,0455634393835355 0,00194454449075883 0,0107531114191922 478265 2018387 667 665 0 True 627 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 673 387 0,0109479936159181 0,0921331481599398 0,0109712367437247 0,086854352635996 0,00178303100869431 0,019687610260066 478557 4015234 667 665 0 True 672 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 276 433 0,0109516997051943 0,0491394427932959 0,0108796826123445 0,0486152437628748 0,00158655290240428 0,00763773280507015 478719 2141535 667 665 0 True 273 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 319 432 0,0110967633601373 0,0664409937638787 0,0111390859845884 0,0640421149004349 0,00144164999808065 0,0145212483937099 485060 2895550 667 665 0 True 317 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 365 432 0,0111153853148958 0,0367533390583348 0,0111390859845884 0,0375677119096666 0,00146575028045695 0,00478757422973775 485874 1601739 667 665 0 True 361 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 408 432 0,0112641779362093 0,0605118885563646 0,0112153810940719 0,0565804531929503 0,00169469395983279 0,0149480895481382 492378 2637155 667 665 0 True 406 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 452 431 0,0115050508620718 0,105987376314441 0,0115358205539025 0,107209887846189 0,00170683255620497 0,0205141313456732 502907 4619012 667 665 0 True 450 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 497 432 0,0115193948001966 0,0649850765618556 0,0114747844663157 0,0635538261997406 0,00177576575435166 0,0152890930568096 503534 2832100 667 665 0 True 494 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 541 432 0,0112775610363736 0,0571452894080016 0,0111543450064851 0,0549172198062104 0,00162596432220268 0,0105366973664546 492963 2490436 667 665 0 True 539 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 585 432 0,0110562480261357 0,0345023465048522 0,0110475318532082 0,0346990157930877 0,00185525490401696 0,00558203922671649 483289 1503639 667 665 0 True 583 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 629 432 0,0110720332212013 0,04896200216724 0,0110933089188983 0,0455939574273289 0,00188875937719419 0,0139518019140796 483979 2133802 667 665 0 True 627 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 673 431 0,0109272898455785 0,0793035461163782 0,0108644235904479 0,0786297398336767 0,00195798166078187 0,0127767672500342 477652 3456110 667 665 0 True 672 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 275 477 0,0108951017739013 0,0631664765025404 0,010955977721828 0,0641336690318151 0,00158343189030957 0,0186697448938573 476245 2752844 667 665 0 True 273 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 320 477 0,011252716511966 0,0609393017907552 0,0112153810940719 0,0602731364919509 0,00187774944419387 0,00750437659294465 491877 2655782 667 665 0 True 317 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 363 476 0,0112011972956072 0,0739781474744311 0,0112001220721752 0,0733958953231098 0,00165973693425931 0,0196335162481922 489625 3224025 667 665 0 True 361 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 408 476 0,011382955809804 0,0976153590660102 0,0114290074006256 0,0894026092927443 0,00171076269370848 0,0284594749125152 497570 4254153 667 665 0 True 406 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 452 476 0,0114713986563596 0,102331567072866 0,0115053025101091 0,0979324025329976 0,00201832991863342 0,0352027566229774 501436 4459689 667 665 0 True 450 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 495 476 0,0114828372035086 0,0504784735930006 0,0114442664225223 0,0516060120546273 0,00195059090657774 0,0101399064326865 501936 2199891 667 665 0 True 494 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 539 476 0,0113426234925568 0,0457702966503005 0,0113832303349355 0,0473029678797589 0,00176712546848467 0,00944686448660757 495807 1994705 667 665 0 True 539 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 584 476 0,0113979631836634 0,12390273004553 0,0113527122911421 0,122392614633402 0,00193141226720137 0,0304476550589906 498226 5399777 667 665 0 True 583 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 628 475 0,0115328236545495 0,0729827544370195 0,0113984893568322 0,0715190356298161 0,00232539547767845 0,0243518869167894 504121 3180645 667 665 0 True 627 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 672 476 0,0112864831031497 0,0914002791368442 0,0110322728313115 0,0909437705043107 0,0024645413206253 0,0186574740072726 493353 3983295 667 665 0 True 672 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 275 520 0,0106686642945408 0,0559043293745924 0,010605020218204 0,0590981918059052 0,00158922878984242 0,0161887642339251 466347 2436354 667 665 0 True 273 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 320 521 0,0113770763965694 0,129205481086557 0,0113984893568322 0,11949340047303 0,0016081557807923 0,0415124551051945 497313 5630875 667 665 0 True 317 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 363 520 0,0113657522348919 0,0619620922298881 0,0113984893568322 0,0641489280537118 0,00157214893117026 0,015922852514222 496818 2700356 667 665 0 True 361 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 409 521 0,0117286287046452 0,0637223638175319 0,0117189288166629 0,0618142977035172 0,00175971503691148 0,00947117609062766 512680 2777070 667 665 0 True 406 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 452 520 0,0116541637627055 0,0625975559177183 0,011459525444419 0,0619516289005875 0,00206182661575899 0,0110252898988219 509425 2728050 667 665 0 True 450 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 496 521 0,0113840996645188 0,0673205559102609 0,0113832303349355 0,0668345159075303 0,00180528869446951 0,0163746732914964 497620 2933882 667 665 0 True 494 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 540 520 0,0114781245220832 0,0777638304963599 0,0114442664225223 0,0755779354543374 0,00191043980707615 0,0214955885331857 501730 3389008 667 665 0 True 539 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 584 520 0,0113333353922718 0,0627200181731509 0,0113221942473487 0,0616159304188602 0,00181517470539189 0,0165059305051604 495401 2733387 667 665 0 True 583 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 629 520 0,0108114631171482 0,0460978952301789 0,0108949416342412 0,0451819638361181 0,00190752718087579 0,00687854292661393 472589 2008982 667 665 0 True 627 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 673 520 0,0109798842853693 0,0716924377778963 0,0110475318532082 0,0686655985351339 0,00183256539530619 0,0202241865256769 479951 3124412 667 665 0 True 672 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 276 566 0,0105709333477001 0,0484641679731487 0,0105745021744106 0,0487220569161517 0,00136913786728955 0,0109256761468731 462075 2112106 667 665 0 True 273 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 320 564 0,0109207012424207 0,0549356224160768 0,0108796826123445 0,0559548332951858 0,00145906111131239 0,012866502224671 477364 2394137 667 665 0 True 317 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 364 564 0,0111796699498729 0,0536174723831781 0,0111696040283818 0,0538033112077516 0,00151784738054465 0,0121786916888655 488684 2336691 667 665 0 True 361 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 408 564 0,0111525834702241 0,0545065111852646 0,0110170138094148 0,0533150225070573 0,0016395691221772 0,00934087844343839 487500 2375436 667 665 0 True 406 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 453 564 0,0115254801072798 0,0978466307678099 0,0113832303349355 0,0908827344167239 0,00193496824647516 0,0249890616450543 503800 4264232 667 665 0 True 450 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 496 564 0,0111913372679648 0,0675891605874379 0,0111848630502785 0,0660715648126955 0,00206360423194718 0,0156983316832433 489194 2945588 667 665 0 True 494 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 541 564 0,0112282837752559 0,0598414553206087 0,0112458991378653 0,0583962767986572 0,00194519460847251 0,00839778511718652 490809 2607937 667 665 0 True 539 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 584 563 0,0110303282782962 0,0391595147172119 0,0110322728313115 0,0414435034714275 0,0017149671293942 0,00791673506386514 482156 1706602 667 665 0 True 583 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 628 564 0,0109287539796135 0,0503776952107896 0,0109254596780346 0,0503089951934081 0,00165314061152052 0,0080403314537584 477716 2195499 667 665 0 True 627 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 673 564 0,0108786988972897 0,054496552665711 0,0108186465247578 0,054032196536202 0,00174089539012225 0,00710837917626146 475528 2375002 667 665 0 True 672 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 273 604 0,0104315203350488 0,0102798539034701 0,0104219119554437 0,0102998397802701 0,00138054060441613 0,00140882659374652 455981 448004 667 665 0 False 273 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 317 604 0,0106183346870854 0,0104664728885615 0,0106507972838941 0,0105287251087205 0,00153143233368458 0,00147575063311282 464147 456137 667 665 0 False 317 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 364 609 0,0107661207162498 0,0837187727845592 0,0107423514152743 0,0810406652933547 0,00138550956969579 0,0145184270468826 470607 3648529 667 665 0 True 361 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 408 608 0,0112441833557929 0,0820692839904752 0,0112306401159686 0,0790569924467842 0,00153996565372323 0,0227457056180746 491504 3576643 667 665 0 True 406 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 450 604 0,0115592924526521 0,0108098353000836 0,0115510795757992 0,0108186465247578 0,00198309712034766 0,00208648802144594 505278 471101 667 665 0 False 450 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 494 604 0,0108962913828048 0,0108656167771225 0,0108033875028611 0,0108796826123445 0,00207352528259499 0,00199164534574913 476297 473532 667 665 0 False 494 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 539 604 0,0107480935659431 0,0107667429044114 0,0107423514152743 0,0107270923933776 0,00198636247333518 0,00198822712709763 469819 469223 667 665 0 False 539 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 583 604 0,0108273169434967 0,0107650449079898 0,0109407186999313 0,0108033875028611 0,00172107289385155 0,00181563377549486 473282 469149 667 665 0 False 583 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 627 604 0,0107986748214357 0,0107067393822161 0,0107423514152743 0,0107881284809644 0,00161312593086834 0,00142790408021584 472030 466608 667 665 0 False 627 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 672 604 0,0107548880629495 0,0105390048708404 0,0107270923933776 0,0105439841306172 0,00164170638243093 0,00162512352956715 470116 459298 667 665 0 False 672 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 275 654 0,0129477261826857 0,0445314246935719 0,0105439841306172 0,0446173800259403 0,0129886341871659 0,00922405702849708 565969 1940714 667 665 0 True 273 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 317 647 0,0102980782440091 0,0103778328861752 0,0103150988021668 0,010406652933547 0,00134325998124794 0,00129048658969966 450148 452274 667 665 0 False 317 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 361 647 0,0107078298799788 0,0104054368009747 0,0105287251087205 0,010452429999237 0,00223239676863815 0,0012986635710328 468059 453477 667 665 0 False 361 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 406 647 0,0109013472206447 0,0105526117881107 0,0107728694590677 0,0104982070649271 0,00164201857232368 0,00139473660970018 476518 459891 667 665 0 False 406 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 450 648 0,0104807518419778 0,0108153193696074 0,010406652933547 0,0107118333714809 0,00164195795280214 0,00179910725852285 458133 471340 667 665 0 False 450 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 494 648 0,0106685041548807 0,0105580270199417 0,0106813153276875 0,0105439841306172 0,00170589569959056 0,00168936015437365 466340 460127 667 665 0 False 494 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 539 648 0,0105546219794658 0,0104621361139172 0,0105439841306172 0,0105745021744106 0,00172581570025634 0,00175436775091598 461362 455948 667 665 0 False 539 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 583 648 0,0106686871716351 0,0106151393590408 0,0107118333714809 0,010605020218204 0,00158131806669164 0,00135674898902761 466348 462616 667 665 0 False 583 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 627 648 0,0105595405547398 0,01079150152791 0,0105592431525139 0,0107728694590677 0,00130573812893572 0,00139384804117153 461577 470302 667 665 0 False 627 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 672 653 0,0107224254661408 0,0455434305608379 0,0106355382619974 0,0458228427557794 0,00151065456089226 0,00990604329191251 468697 1984818 667 665 0 True 672 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C6_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C6_2.csv new file mode 100755 index 0000000..83619eb --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C6_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 273 256 0,00885997834225483 0,71737257999657 0,00878919661249714 0,731151293202106 0,00179445027589662 0,201437808835963 387286 31263653 667 665 11 True 273 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 317 257 0,00753775092311935 0,00755927355582823 0,00744640268558785 0,00756847486076143 0,00136927189122251 0,00125987781887881 329489 329439 667 665 0 False 317 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 362 256 0,00782703178051624 0,00714507715844888 0,00714122224765393 0,00711070420386053 0,00404066430134937 0,00133104343828872 342134 311388 667 665 0 True 362 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 406 255 0,00883302912517191 0,00750220710852434 0,00747692072938125 0,00746166170748455 0,00671656631089357 0,00129458323462857 386108 326952 667 665 0 True 406 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 451 255 0,00741503818930544 0,00765128660516019 0,00747692072938125 0,00764476997024491 0,00152419883397222 0,00157809853977154 324125 333449 667 665 0 True 450 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 494 255 0,00755609835274626 0,00784979156520278 0,00755321583886473 0,00788891432059205 0,00144030420377115 0,0014953630183895 330291 342100 667 665 0 True 494 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 538 256 0,00778123183773185 0,00781232091443991 0,00779736018921187 0,00788891432059205 0,00144829103000786 0,00145603840628621 340132 340467 667 665 0 True 539 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 583 256 0,00797591591020695 0,00806052668866031 0,00790417334248875 0,00807202258335241 0,00167804974381351 0,00178702279098859 348642 351284 667 665 0 True 583 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 627 257 0,00863946603031741 0,00847754543144311 0,00865186541542687 0,00846875715266651 0,00189741137971967 0,00185606741594071 377647 369458 667 665 0 False 627 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 671 256 0,0103854458671328 0,737248913081514 0,0102235446707866 0,751140611886778 0,00296163072679502 0,189226543101693 453967 32129879 667 665 13 True 672 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 273 300 0,00753576061591543 0,00707621651978424 0,00746166170748455 0,00711070420386053 0,00150853459829223 0,00138267360218425 329402 308387 667 665 0 False 273 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 317 300 0,00736649299520531 0,00726304201795402 0,00743114366369116 0,0072632944228275 0,00134360615251873 0,00117518720482285 322003 316529 667 665 0 False 317 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 362 301 0,007155589062873 0,00774720045708228 0,00718699931334401 0,00750743877317464 0,00125633890955383 0,00209183728930236 312784 337629 667 665 0 True 362 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 406 300 0,00732064729823232 0,00728507007963947 0,00730907148851759 0,00732433051041428 0,00137038925251838 0,00139011554138973 319999 317489 667 665 0 True 406 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 451 300 0,0373029391973869 0,00767898230355013 0,00778210116731518 0,007690547035935 0,138132380014986 0,00183624029606375 1625691 334656 665 665 0 True 450 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 496 301 0,00794233233577764 0,00773875636676952 0,00788891432059205 0,00764476997024491 0,00183589296214061 0,00183976628641859 347174 337261 667 665 0 True 494 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 538 300 0,00781161261895946 0,00774245065628135 0,00785839627679866 0,00775158312352178 0,0015309529966326 0,00144146824407792 341460 337422 667 665 0 True 539 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 583 300 0,00774627563764467 0,00802603900458402 0,0076752880140383 0,00802624551766232 0,00178567002372957 0,0019041226887043 338604 349781 667 665 0 True 583 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 627 300 0,00823383227132142 0,00826621371464826 0,00827038986800946 0,00827038986800946 0,00191225644438715 0,00194323006259895 359916 360248 667 665 0 False 627 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 672 300 0,00843128447220656 0,0082337452695598 0,00834668497749294 0,00822461280231937 0,00208897159259541 0,00193287377007943 368547 358833 667 665 0 False 672 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 275 345 0,00705527300437673 0,00711731262236617 0,00704966811627375 0,00712596322575723 0,00137669070211526 0,00135889579072025 308399 310178 667 665 0 True 273 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 318 345 0,00705460956864209 0,00711166793155927 0,00703440909437705 0,00711070420386053 0,00126437236361143 0,00122890712561239 308370 309932 667 665 0 True 317 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 363 344 0,00725288534492195 0,00730092569487348 0,00729381246662089 0,00729381246662089 0,00132902602459301 0,00132322257655992 317037 318180 667 665 0 True 362 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 408 344 0,00738680785494183 0,00746843074727331 0,00737010757610437 0,00743114366369116 0,00143504090257085 0,00142094854968603 322891 325480 667 665 0 True 406 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 452 344 0,0127410316357042 0,00775952240408758 0,00813305867093919 0,00779736018921187 0,0331997059476654 0,00162332091860891 556934 338166 667 665 0 True 450 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 495 345 0,00816966202181583 0,00790997865457877 0,00807202258335241 0,00790417334248875 0,00200252775283748 0,00169845436553161 357111 344723 667 665 0 True 494 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 539 344 0,00768002357255796 0,00776541949976796 0,00772106507972839 0,00775158312352178 0,00160817469244153 0,00152919667226037 335708 338423 667 665 0 True 539 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 584 345 0,00823165894736312 0,00787455018870133 0,0081177996490425 0,00781261921110857 0,0024375531405422 0,00194339010334136 359821 343179 667 665 0 True 583 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 629 344 0,0078350845177091 0,00782895669019195 0,00785839627679866 0,00794995040817884 0,00199641338565629 0,00197631808506889 342486 341192 667 665 0 True 627 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 673 344 0,00742681989286886 0,0075006238415907 0,00743114366369116 0,00755321583886473 0,00190189678689459 0,00191895080572153 324640 326883 667 665 0 True 672 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 276 389 0,00688806432215341 0,00708954808628346 0,00686655985351339 0,00712596322575723 0,00138843375623118 0,00138278421850148 301090 308968 667 665 0 True 273 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 320 389 0,00722117769222507 0,00740232361631935 0,00721751735713741 0,00738536659800107 0,00134933664477987 0,00138996655741783 315651 322599 667 665 0 True 317 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 364 388 0,0075296066775493 0,00763467377530574 0,00756847486076143 0,00770580605783169 0,00134148972322715 0,00128305893144554 329133 332725 667 665 0 True 361 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 408 388 0,00765659742799692 0,00761893288955967 0,00770580605783169 0,0076752880140383 0,00138650388704096 0,00146661819488183 334684 332039 667 665 0 True 406 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 452 387 0,00769338379562794 0,00785325639573872 0,00770580605783169 0,00788891432059205 0,00166397346897747 0,00154673963982839 336292 342251 667 665 0 True 450 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 497 388 0,00766609142213055 0,00777161489211699 0,0076600289921416 0,00778210116731518 0,00162222065836911 0,00171887218721566 335099 338693 667 665 0 True 494 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 540 388 0,00774147144784211 0,00781619877113245 0,00770580605783169 0,00781261921110857 0,00155788962870355 0,00166726344610373 338394 340636 667 665 0 True 539 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 585 389 0,00782062619411283 0,00782962212122203 0,00781261921110857 0,00784313725490196 0,00183833216788413 0,00197051947996689 341854 341221 667 665 0 True 583 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 629 388 0,00731671243801308 0,00738896910392254 0,00732433051041428 0,00744640268558785 0,00192979076563114 0,0018122135519529 319827 322017 667 665 0 True 627 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 673 387 0,00699178906770007 0,00703489095822642 0,00701915007248035 0,00694285496299687 0,00173690824418188 0,00186852163672212 305624 306586 667 665 0 True 672 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 276 433 0,00704623655212906 0,00710712464383665 0,00701915007248035 0,00708018616006714 0,00149718011763566 0,00152187024837539 308004 309734 667 665 0 True 273 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 319 432 0,00739396838545708 0,00761865753878861 0,00747692072938125 0,00758373388265812 0,0014776141837359 0,00134380610687205 323204 332027 667 665 0 True 317 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 365 432 0,00765332600351232 0,00772620496078833 0,00761425192645151 0,00776684214541848 0,00131312874746498 0,00125510364796845 334541 336714 667 665 0 True 361 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 408 432 0,0078264140989702 0,00784699216569692 0,00784313725490196 0,00784313725490196 0,00153748617276847 0,00155428204703796 342107 341978 667 665 0 True 406 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 452 431 0,00778347379297305 0,00786849247173783 0,00775158312352178 0,00779736018921187 0,00174370283204401 0,0016385464702533 340230 342915 667 665 0 True 450 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 497 432 0,00774671030243633 0,00780194936872968 0,00781261921110857 0,00787365529869535 0,00177564818313993 0,00166317347893514 338623 340015 667 665 0 True 494 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 541 432 0,00746124991978719 0,00767531095993589 0,00749217975127794 0,0076600289921416 0,00168250498765069 0,00156280353737139 326145 334496 667 665 0 True 539 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 585 432 0,00715373601823487 0,00722068389100469 0,00718699931334401 0,00721751735713741 0,00186540641854154 0,00190804051628765 312703 314683 667 665 0 True 583 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 629 432 0,00694569172268981 0,00678099460140394 0,00697337300679027 0,0068055237659266 0,001808416693286 0,00173252076938764 303609 295521 667 665 0 True 627 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 673 431 0,00681574982707776 0,00692915626213623 0,00675974670023652 0,00695811398489357 0,00182731923729301 0,00189463766813382 297929 301978 667 665 0 True 672 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 275 477 0,00707785269644875 0,00731687309369785 0,00714122224765393 0,00730907148851759 0,00149934788196178 0,00166658381461156 309386 318875 667 665 0 True 273 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 320 477 0,00738605291083 0,00726898500542957 0,00738536659800107 0,00727855344472419 0,00164087146398999 0,00145316759579822 322858 316788 667 665 0 True 317 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 363 476 0,00751890019741789 0,00784511060209462 0,00752269779507134 0,00776684214541848 0,00148934485020921 0,00161735467166352 328665 341896 667 665 0 True 361 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 408 476 0,00759293047456588 0,00784667092313067 0,00758373388265812 0,00782787823300526 0,00165040958142744 0,00159781358944833 331901 341964 667 665 0 True 406 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 452 476 0,00777825781547313 0,00769098300798919 0,00778210116731518 0,00762951094834821 0,00183253185993735 0,00191911192055404 340002 335179 667 665 0 True 450 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 495 476 0,00759835234591448 0,00760576194434358 0,0076600289921416 0,00764476997024491 0,00178148939923661 0,00187436001660387 332138 331465 667 665 0 True 494 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 539 476 0,00718409392236818 0,00698837962381348 0,00717174029144732 0,00706492713817044 0,00165809361117679 0,00158597854163025 314030 304559 667 665 0 True 539 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 584 476 0,00713570886792813 0,00678590502348799 0,00718699931334401 0,00668345159075303 0,00181901618340983 0,00193760999433499 311915 295735 667 665 0 True 583 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 628 475 0,00704337691534183 0,00693500746602143 0,00703440909437705 0,00695811398489357 0,00177957578556045 0,00166367005029768 307879 302233 667 665 0 True 627 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 672 476 0,00708309155104297 0,00696566318520036 0,00692759594110018 0,00694285496299687 0,00235034886103895 0,00189881246485083 309615 303569 667 665 0 True 672 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 275 520 0,00706520166330202 0,00722013318946256 0,00698863202868696 0,00715648126955062 0,00149991509146019 0,00157779674001674 308833 314659 667 665 0 True 273 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 320 521 0,00718327034697346 0,00727800274318206 0,00721751735713741 0,0072327763790341 0,00149885104521033 0,00153367472153163 313994 317181 667 665 0 True 317 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 363 520 0,00741455777032518 0,00729037058198254 0,00743114366369116 0,00718699931334401 0,00148119877365206 0,00142703827123949 324104 317720 667 665 0 True 361 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 409 521 0,00744198740638836 0,00757827275903194 0,00741588464179446 0,00753795681696803 0,00168281904208667 0,00166654837796118 325303 330267 667 665 0 True 406 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 452 520 0,00745324293678292 0,0073031973387348 0,00753795681696803 0,00730907148851759 0,0019242762174253 0,00187298758501387 325795 318279 667 665 0 True 450 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 496 521 0,00708364060130612 0,00718312145665147 0,00709544518196384 0,00721751735713741 0,00170069819155397 0,00174533539283246 309639 313046 667 665 0 True 494 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 540 520 0,00699542652569344 0,00708713876703661 0,00711070420386053 0,00706492713817044 0,00175777091554099 0,001634235705905 305783 308863 667 665 0 True 539 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 584 520 0,00680074245321834 0,00681940603396796 0,0068207827878233 0,00674448767833982 0,00166499949589877 0,00162264811201645 297273 297195 667 665 0 True 583 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 629 520 0,00678184597332828 0,00696245075953789 0,00674448767833982 0,00688181887541009 0,00185936102227218 0,00187517383832676 296447 303429 667 665 0 True 627 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 673 520 0,00686907633388616 0,00707004407333279 0,00697337300679027 0,00709544518196384 0,00183462646894289 0,00176379701427963 300260 308118 667 665 0 True 672 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 276 566 0,00737818319039153 0,00766989572810488 0,00732433051041428 0,00750743877317464 0,00132544344546407 0,00178273975481815 322514 334260 667 665 0 True 273 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 320 564 0,00728514204788199 0,00747623235245358 0,0072480354009308 0,00756847486076143 0,00145938532161026 0,00138091693776767 318447 325820 667 665 0 True 317 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 364 564 0,00737342475477757 0,00763662417660081 0,00738536659800107 0,00758373388265812 0,0014062677249598 0,00132848991378063 322306 332810 667 665 0 True 361 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 408 564 0,00716853749824561 0,0072398896072867 0,00711070420386053 0,00727855344472419 0,00153848176565695 0,00152675616781181 313350 315520 667 665 0 True 406 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 453 564 0,00717864917392528 0,00738848724007317 0,00717174029144732 0,00738536659800107 0,00190031138888963 0,00184713275189445 313792 321996 667 665 0 True 450 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 496 564 0,0071338787003843 0,00723098659902216 0,00720225833524071 0,0072480354009308 0,00194029004839782 0,00200084228324164 311835 315132 667 665 0 True 494 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 541 564 0,00717242660427625 0,00719535162006642 0,00720225833524071 0,00715648126955062 0,00185412911870707 0,0018089087141789 313520 313579 667 665 0 True 539 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 584 563 0,00704321677568174 0,00737976779898935 0,00700389105058366 0,00746166170748455 0,00168602999708138 0,00148249534376787 307872 321616 667 665 0 True 583 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 628 564 0,00696625823046362 0,00708250369572363 0,00694285496299687 0,00709544518196384 0,00156450758096901 0,00158017996134388 304508 308661 667 665 0 True 627 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 673 564 0,00684240164193481 0,00701313824731203 0,00686655985351339 0,00703440909437705 0,00168406393855089 0,00177106543785321 299094 305638 667 665 0 True 672 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 273 604 0,00771850284516703 0,00753917294954025 0,00778210116731518 0,00752269779507134 0,00140324120287693 0,0014511151426077 337390 328563 667 665 0 False 273 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 317 604 0,00739165779893299 0,00731205445520416 0,00744640268558785 0,00730907148851759 0,00146956215533716 0,00143559886822509 323103 318665 667 665 0 False 317 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 364 609 0,00702779761412496 0,00723858169112413 0,00701915007248035 0,00720225833524071 0,0013536677044971 0,00137820027532202 307198 315463 667 665 0 True 361 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 408 608 0,00709441571272043 0,00714916152821973 0,00714122224765393 0,00712596322575723 0,00148453747779047 0,00143934448797149 310110 311566 667 665 0 True 406 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 450 604 0,00736262676626896 0,00696662691289909 0,00744640268558785 0,00694285496299687 0,00194211118118411 0,00185469808854629 321834 303611 667 665 0 False 450 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 494 604 0,00704500118903698 0,00711974488751061 0,00711070420386053 0,00720225833524071 0,0019660797404209 0,0020492761085157 307950 310284 667 665 0 False 494 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 539 604 0,0070849903498697 0,00737371008202585 0,00714122224765393 0,00746166170748455 0,00174544759497078 0,00187041547107202 309698 321352 667 665 0 False 539 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 583 604 0,00711495934339994 0,00716616443833319 0,00715648126955062 0,00714122224765393 0,00167138693934321 0,00174149129648259 311008 312307 667 665 0 False 583 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 627 604 0,00718150881071252 0,00710125049405386 0,00714122224765393 0,00708018616006714 0,00149593608734791 0,00157804595949114 313917 309478 667 665 0 False 627 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 672 604 0,00724300244018526 0,00709574347863249 0,00732433051041428 0,00706492713817044 0,00162761202225696 0,00169157179530145 316605 309238 667 665 0 False 672 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 275 654 0,0150458531320286 0,706578944500184 0,00943007553215839 0,700328068970779 0,0275434514577033 0,201409066216307 657682 30793258 667 665 10 True 273 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 317 647 0,00794484881615041 0,00767163961632165 0,00762951094834821 0,007690547035935 0,00230206893363884 0,00129656434093579 347284 334336 667 665 0 False 317 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 361 647 0,00698826599517819 0,00681587236573925 0,00691233691920348 0,0068207827878233 0,0012908429286546 0,00110241122511079 305470 297041 667 665 0 False 361 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 406 647 0,00691997786869898 0,00671208807094413 0,00694285496299687 0,00671396963454643 0,0014069411776814 0,00133389899105119 302485 292518 667 665 0 False 406 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 450 648 0,00685498404379865 0,00727986136088677 0,00675974670023652 0,0072327763790341 0,00165123727810384 0,00185770143840079 299644 317262 667 665 0 False 450 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 494 648 0,00691583711463106 0,00713348948016643 0,00701915007248035 0,00712596322575723 0,00173651613569287 0,00171458747198502 302304 310883 667 665 0 False 494 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 539 648 0,00706222764104329 0,00705276581244826 0,00704966811627375 0,00706492713817044 0,00169133918058773 0,00169775443830415 308703 307365 667 665 0 False 539 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 583 648 0,00692073281281081 0,0072001932044577 0,00689707789730678 0,00720225833524071 0,00138234073936771 0,00128868188586478 302518 313790 667 665 0 False 583 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 627 648 0,00733320682300187 0,00740234656221694 0,00733958953231098 0,00740062561989776 0,00147902629681137 0,00134670630991455 320548 322600 667 665 0 False 627 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 672 653 0,0089352668595892 0,734911598061301 0,00886549172198062 0,744335088120851 0,0017857992305683 0,202373158434402 390577 32028017 667 665 13 True 672 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C6_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C6_3.csv new file mode 100755 index 0000000..8ba846b --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C6_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 273 256 0,00107321024770288 0,0709110381813999 0,000915541313801785 0,0705271992065309 0,000821674220413862 0,0224868954067397 46912 3090358 667 665 0 True 273 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 317 257 0,00101967784704581 0,000936697431378859 0,000900282291905089 0,000823987182421607 0,000673625983682599 0,000652074790563149 44572 40822 667 665 0 False 317 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 362 256 0,00101805357335066 0,00104261569464976 0,000915541313801785 0,000961318379491875 0,000699138655357167 0,000662792534263637 44501 45438 667 665 0 True 362 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 406 255 0,00103438781867935 0,00098408070990018 0,000793469138628214 0,000839246204318303 0,000891840263254523 0,000719578634808785 45215 42887 667 665 0 True 406 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 451 255 0,00096854754129001 0,00103352911920451 0,000839246204318303 0,000854505226215 0,000798446954260352 0,00086018519884477 42337 45042 667 665 0 True 450 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 494 255 0,0010142788527915 0,000985618085038644 0,00080872816052491 0,00080872816052491 0,000866977845842951 0,000820017020451164 44336 42954 667 665 0 True 494 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 538 256 0,0009632171783186 0,000979032612430596 0,00080872816052491 0,000854505226215 0,000752710450203049 0,000786156247014057 42104 42667 667 665 0 True 539 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 583 256 0,000951938770829737 0,000988830510701106 0,000656137941557946 0,000717174029144732 0,000946664295804633 0,000924630422653789 41611 43094 667 665 0 True 583 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 627 257 0,000980443630324915 0,000995920793056113 0,000671396963454643 0,000701915007248035 0,000971707123844883 0,000914379582182413 42857 43403 667 665 0 False 627 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 671 256 0,00112548440817357 0,0730599673824066 0,000823987182421607 0,0722514686808576 0,000980758914089496 0,0215052106342289 49197 3184010 667 665 0 True 672 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 273 300 0,0010263122043922 0,000959367978196808 0,000900282291905089 0,000854505226215 0,000738124522885358 0,00070423622092246 44862 41810 667 665 0 False 273 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 317 300 0,000884359834273754 0,000965517478750665 0,000778210116731518 0,000885023270008392 0,000661137157312679 0,000644028057477905 38657 42078 667 665 0 False 317 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 362 301 0,000997738713614124 0,000970313171346769 0,000869764248111696 0,000823987182421607 0,00071367924056987 0,000691802565813764 43613 42287 667 665 0 True 362 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 406 300 0,000968387401629924 0,000960997136925628 0,000778210116731518 0,000823987182421607 0,000774716624836439 0,000724495626551747 42330 41881 667 665 0 True 406 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 451 300 0,0041442542633467 0,000980317582695581 0,000839246204318303 0,000656137941557946 0,0144744605096322 0,00096898091690448 181153 42723 667 665 0 True 450 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 496 301 0,000921443604130642 0,000974305757527258 0,000717174029144732 0,000747692072938125 0,000837055713922679 0,000858854342413155 40278 42461 667 665 0 True 494 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 538 300 0,000954615390862591 0,000955214770733196 0,000823987182421607 0,000793469138628214 0,000762635849886196 0,000809188376238099 41728 41629 667 665 0 True 539 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 583 300 0,000959533966136639 0,000899456239591884 0,000686655985351339 0,000473029678797589 0,000927473061977082 0,00102286446675373 41943 39199 667 665 0 True 583 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 627 300 0,000880882515940473 0,000967674393124032 0,000473029678797589 0,000595101853971161 0,000957910348070638 0,0010124190109552 38505 42172 667 665 0 False 627 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 672 300 0,000969554133439117 0,000875202425840293 0,000625619897764553 0,000488288700694286 0,000969688131505464 0,000920078052724308 42381 38142 667 665 0 False 672 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 275 345 0,000952945362978845 0,00089371976519463 0,000823987182421607 0,000732433051041428 0,000714843145939613 0,000696554378072345 41655 38949 667 665 0 True 273 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 318 345 0,000877382320512895 0,00096049232717867 0,000747692072938125 0,000839246204318303 0,000650398822117222 0,000680156792454289 38352 41859 667 665 0 True 317 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 363 344 0,000896621956817426 0,000908290410163656 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,000671455614432575 0,000656369184944946 39193 39584 667 665 0 True 362 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 408 344 0,000968021368121158 0,000972240626744247 0,000778210116731518 0,000793469138628214 0,000781560743114293 0,000761090043072112 42314 42371 667 665 0 True 406 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 452 344 0,00150890450860631 0,000986054057092835 0,000839246204318303 0,000762951094834821 0,00333564667633859 0,000873559252408324 65957 42973 667 665 0 True 450 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 495 345 0,00101224279139899 0,00097168992520211 0,000762951094834821 0,000747692072938125 0,000884806917059708 0,000863906153116303 44247 42347 667 665 0 True 494 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 539 344 0,000935787542255423 0,000954136313546512 0,000671396963454643 0,000701915007248035 0,000891694165626939 0,000855351690506021 40905 41582 667 665 0 True 539 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 584 345 0,000934506424974741 0,000924375484373557 0,000579842832074464 0,000488288700694286 0,00101669183949105 0,00102167290174875 40849 40285 667 665 0 True 583 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 629 344 0,0009295192184178 0,000966228801575924 0,000503547722590982 0,000656137941557946 0,00103780309893538 0,00100756939830659 40631 42109 667 665 0 True 627 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 673 344 0,000906756509591393 0,000883279381791627 0,000534065766384375 0,000442511635004196 0,000971693965758131 0,000991204029420003 39636 38494 667 665 0 True 672 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 276 389 0,000901883688505942 0,000946036411697589 0,000747692072938125 0,000793469138628214 0,000733548093007697 0,000741033872233468 39423 41229 667 665 0 True 273 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 320 389 0,000950794916114843 0,000933439113921219 0,000823987182421607 0,000823987182421607 0,000710392188395568 0,000692432945622185 41561 40680 667 665 0 True 317 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 364 388 0,000950520390983268 0,000999110272820986 0,000839246204318303 0,000885023270008392 0,000735540126445777 0,000757147085563303 41549 43542 667 665 0 True 361 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 408 388 0,000983783686092408 0,00100023462180285 0,000839246204318303 0,00080872816052491 0,000766232446232394 0,000796176232114038 43003 43591 667 665 0 True 406 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 452 387 0,00101796206497346 0,000947688516323998 0,000762951094834821 0,000656137941557946 0,00090580774451313 0,000867169185002667 44497 41301 667 665 0 True 450 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 497 388 0,000945830586652199 0,00106019225220295 0,000671396963454643 0,000823987182421607 0,000909266327574572 0,000983453095667745 41344 46204 667 665 0 True 494 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 540 388 0,000927048492233627 0,000915472476109018 0,000701915007248035 0,000701915007248035 0,000834910542913694 0,000837174341307024 40523 39897 667 665 0 True 539 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 585 389 0,00101045837804375 0,0010017949428389 0,000671396963454643 0,000686655985351339 0,00105716392990288 0,00102506973750499 44169 43659 667 665 0 True 583 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 629 388 0,000986574691596751 0,00087667096328599 0,000625619897764553 0,000579842832074464 0,00103360100958832 0,000916032369241554 43125 38206 667 665 0 True 627 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 673 387 0,000865188829252117 0,000860930077539924 0,000488288700694286 0,000350957503624018 0,000914650967627818 0,00101201888272558 37819 37520 667 665 0 True 672 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 276 433 0,000926499441970477 0,000970267279551591 0,000747692072938125 0,00080872816052491 0,00082662378793814 0,000839334703688701 40499 42285 667 665 0 True 273 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 319 432 0,000865234583440713 0,000989771292502256 0,000701915007248035 0,000900282291905089 0,000763111497509091 0,000760292959335268 37821 43135 667 665 0 True 317 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 365 432 0,000943725893976793 0,00101528713062124 0,00080872816052491 0,000930800335698482 0,000719348777645275 0,00070941351645348 41252 44247 667 665 0 True 361 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 408 432 0,000901998073977431 0,000964806155925405 0,000686655985351339 0,000732433051041428 0,000822236191605405 0,000861486120721822 39428 42047 667 665 0 True 406 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 452 431 0,00102711290269262 0,00103687922025251 0,00080872816052491 0,000793469138628214 0,000924064373652533 0,000916808285981651 44897 45188 667 665 0 True 450 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 497 432 0,00101036686966656 0,000981418985779854 0,000823987182421607 0,000717174029144732 0,000889450420751284 0,000920343162907676 44165 42771 667 665 0 True 494 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 541 432 0,000911629330676845 0,0008645325834614 0,000671396963454643 0,000671396963454643 0,000878061200132239 0,000805412571723532 39849 37677 667 665 0 True 539 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 585 432 0,00090526949846203 0,000868594007334656 0,000518806744487678 0,000442511635004196 0,000957413307575041 0,000988422568467881 39571 37854 667 665 0 True 583 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 629 432 0,00086276385725654 0,000789545390140492 0,000503547722590982 0,000442511635004196 0,000926423636711257 0,00084960843732792 37713 34409 667 665 0 True 627 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 673 431 0,000841831315973965 0,000944544928354303 0,000457770656900893 0,00064087891966125 0,000919313193862286 0,000916418851020273 36798 41164 667 665 0 True 672 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 275 477 0,000943588631411005 0,000992088828158747 0,000778210116731518 0,000793469138628214 0,000769170848899128 0,000881780537088971 41246 43236 667 665 0 True 273 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 320 477 0,00092853550336299 0,000959413869991986 0,000762951094834821 0,000839246204318303 0,000810548360319744 0,000781346404189764 40588 41812 667 665 0 True 317 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 363 476 0,000966145446388731 0,00102391478811471 0,000823987182421607 0,000885023270008392 0,000820275753480429 0,000825278162517217 42232 44623 667 665 0 True 361 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 408 476 0,000980855418022277 0,00110023284349578 0,000717174029144732 0,000839246204318303 0,000907649124798757 0,000916871943290506 42875 47949 667 665 0 True 406 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 452 476 0,000913665392069358 0,000969624794419099 0,000625619897764553 0,000503547722590982 0,000947642441408773 0,00107063248438402 39938 42257 667 665 0 True 450 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 495 476 0,000996960892407996 0,000909162354272039 0,000686655985351339 0,000503547722590982 0,000974786837882153 0,000968643499347106 43579 39622 667 665 0 True 494 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 539 476 0,000957841061158594 0,00093270484519837 0,000656137941557946 0,00064087891966125 0,000934311976325074 0,000886621835955632 41869 40648 667 665 0 True 539 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 584 476 0,000903668101861177 0,000992295341237048 0,000503547722590982 0,000518806744487678 0,000979952581844304 0,00106683124933604 39501 43245 667 665 0 True 583 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 628 475 0,000857845281982492 0,000833509729921049 0,0004272526131075 0,000534065766384375 0,0009646249767863 0,000834679019454596 37498 36325 667 665 0 True 627 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 672 476 0,000831582377728508 0,000890897419791181 0,0004272526131075 0,000488288700694286 0,000947253147860489 0,000918998745944647 36350 38826 667 665 0 True 672 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 275 520 0,000888500588341673 0,00096049232717867 0,000717174029144732 0,000793469138628214 0,000754101089544533 0,000838911346674006 38838 41859 667 665 0 True 273 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 320 521 0,000947271843592967 0,000948675189920326 0,00080872816052491 0,000839246204318303 0,000800234963381255 0,000769345127689654 41407 41344 667 665 0 True 317 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 363 520 0,000950726284831949 0,00101446107830804 0,000747692072938125 0,000854505226215 0,000870835321732514 0,000802263847388811 41558 44211 667 665 0 True 361 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 409 521 0,000994535920412419 0,0010216431442534 0,000732433051041428 0,000778210116731518 0,000920473508053027 0,0009191900045069 43473 44524 667 665 0 True 406 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 452 520 0,0009675638262352 0,000974076298551368 0,000579842832074464 0,000610360875867857 0,00100924796994112 0,000993216476817224 42294 42451 667 665 0 True 450 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 496 521 0,000970126060796564 0,000854115145955986 0,000610360875867857 0,000549324788281071 0,000976905270482895 0,000856356627376537 42406 37223 667 665 0 True 494 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 540 520 0,000998379272254466 0,000916527987398113 0,000701915007248035 0,000625619897764553 0,000929268629191768 0,000885716166553013 43641 39943 667 665 0 True 539 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 584 520 0,000921100447716174 0,000900167562417144 0,000625619897764553 0,000595101853971161 0,000862863605218101 0,000892533672506552 40263 39230 667 665 0 True 583 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 629 520 0,000837095757454301 0,000929767770306976 0,000473029678797589 0,000503547722590982 0,000902807203830052 0,00100125056605697 36591 40520 667 665 0 True 627 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 673 520 0,000872417991050252 0,000793193787857146 0,000473029678797589 0,0004272526131075 0,00095293656990699 0,000877180143354811 38135 34568 667 665 0 True 672 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 276 566 0,000972802680829418 0,00100838041544695 0,000854505226215 0,000869764248111696 0,000728042786112625 0,000728060105211572 42523 43946 667 665 0 True 273 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 320 564 0,000995679775127314 0,000956568578690948 0,000869764248111696 0,000839246204318303 0,000766433661593411 0,000743276599105266 43523 41688 667 665 0 True 317 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 364 564 0,00100391552907456 0,00102100065912091 0,000869764248111696 0,000915541313801785 0,000747472848585612 0,000678400075830806 43883 44496 667 665 0 True 361 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 408 564 0,000899024051718705 0,000931557550318919 0,000747692072938125 0,000701915007248035 0,000791980393162223 0,000791174178194488 39298 40598 667 665 0 True 406 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 453 564 0,000943314106279431 0,000996287927417537 0,000549324788281071 0,000610360875867857 0,00101209526870872 0,00103104729522471 41234 43419 667 665 0 True 450 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 496 564 0,000866698717475778 0,000947826191709533 0,000503547722590982 0,000595101853971161 0,000975353975801816 0,00104900802782427 37885 41307 667 665 0 True 494 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 541 564 0,00100398416035745 0,000940231099607568 0,000686655985351339 0,000549324788281071 0,00101076992107527 0,000948090661456754 43886 40976 667 665 0 True 539 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 584 563 0,000926590950347669 0,000880319361002644 0,000671396963454643 0,000610360875867857 0,000855208660892341 0,000808206471950437 40503 38365 667 665 0 True 583 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 628 564 0,000956903100292381 0,000856799815973901 0,000686655985351339 0,000595101853971161 0,000877660366887584 0,000827315892011127 41828 37340 667 665 0 True 627 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 673 564 0,000832291567651743 0,000914302235331978 0,000549324788281071 0,000610360875867857 0,000822068662965652 0,000853813212222233 36381 39846 667 665 0 True 672 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 273 604 0,000958527373987531 0,00104282220772806 0,000854505226215 0,000930800335698482 0,000703567098085928 0,000731343149613069 41899 45447 667 665 0 False 273 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 317 604 0,000965413379371198 0,000941561961667731 0,00080872816052491 0,000839246204318303 0,000777012400612304 0,000739065513618297 42200 41034 667 665 0 False 317 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 364 609 0,000798570730656645 0,000966940124401184 0,000671396963454643 0,000823987182421607 0,000652237627171322 0,000765668267813811 34907 42140 667 665 0 True 361 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 408 608 0,000970652233965416 0,000941378394487019 0,000717174029144732 0,000747692072938125 0,000860154846006518 0,000750097153955511 42429 41026 667 665 0 True 406 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 450 604 0,000961547150434853 0,00099153812661661 0,000610360875867857 0,000656137941557946 0,00098456527265364 0,00101743284004246 42031 43212 667 665 0 False 450 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 494 604 0,000835700254702129 0,00096166256795571 0,000488288700694286 0,000488288700694286 0,000916694923344567 0,00105124436485949 36530 41910 667 665 0 False 494 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 539 604 0,000914557598746976 0,000948308055558902 0,000579842832074464 0,000488288700694286 0,000967359147790564 0,00106122272512935 39977 41328 667 665 0 False 539 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 583 604 0,000914671984218465 0,000914371073024745 0,000701915007248035 0,000610360875867857 0,000830958051828442 0,000888250993001775 39982 39849 667 665 0 False 583 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 627 604 0,00091940754273813 0,000880709441261657 0,000778210116731518 0,000717174029144732 0,000705773164159678 0,000724005695070305 40189 38382 667 665 0 False 627 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 672 604 0,000913802654635145 0,000870819759400791 0,00064087891966125 0,000564583810177768 0,000825681171924827 0,000852632431385785 39944 37951 667 665 0 False 672 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 275 654 0,00167773746452478 0,0695442198997149 0,00108339055466545 0,0682993820096132 0,00280228768452472 0,0217738431952745 73337 3030791 667 665 0 True 273 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 317 647 0,000995451004184335 0,000949271783257641 0,000885023270008392 0,000869764248111696 0,000697190046428915 0,00064757055459254 43513 41370 667 665 0 False 317 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 361 647 0,000935284246180869 0,000998972597435452 0,00080872816052491 0,000885023270008392 0,000708006803832711 0,000685565075152117 40883 43536 667 665 0 False 361 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 406 647 0,0009545238824854 0,00088857988413469 0,000778210116731518 0,000732433051041428 0,000728797712571107 0,000735673890133161 41724 38725 667 665 0 False 406 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 450 648 0,000999706143723744 0,000931029794674372 0,00080872816052491 0,000686655985351339 0,000869210924978466 0,000897780600846682 43699 40575 667 665 0 False 450 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 494 648 0,000856815812739087 0,000862398614985621 0,000610360875867857 0,000579842832074464 0,00083772926876545 0,000843919797118818 37453 37584 667 665 0 False 494 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 539 648 0,000860842181335517 0,000910493216332201 0,000488288700694286 0,000625619897764553 0,000916493261733557 0,000890755662958304 37629 39680 667 665 0 False 539 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 583 648 0,000851737097804954 0,000910424378639434 0,000671396963454643 0,00080872816052491 0,000734639998806884 0,000634797324116958 37231 39677 667 665 0 False 583 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 627 648 0,000908220643626459 0,000942869877830305 0,000732433051041428 0,000747692072938125 0,000720225638865568 0,000731121557562684 39700 41091 667 665 0 False 627 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 672 653 0,0010056541882412 0,072852582359997 0,000854505226215 0,0715495536736095 0,000751689558639424 0,0228488311415023 43959 3174972 667 665 0 True 672 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C7_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C7_1.csv new file mode 100755 index 0000000..a7077f1 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C7_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 267 266 0,0111291419029029 0,0466466234251227 0,0111696040283818 0,046646829938201 0,0014944600584285 0,00985227407909288 454384 2032896 623 665 0 True 267 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 311 266 0,0109715061646571 0,0109552205072076 0,0108949416342412 0,0109712367437247 0,0013416103476054 0,0013699937281242 447948 477437 623 665 0 False 311 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 357 265 0,0111060451811556 0,0633978170420329 0,0111543450064851 0,0656900892652781 0,00122433429641565 0,0136827388306821 453441 2762926 623 665 0 True 355 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 401 265 0,0112747516704404 0,0903372645392378 0,0112306401159686 0,0911726558327611 0,00154878334181733 0,0212273968386646 460329 3936968 623 665 0 True 399 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 445 265 0,011114446215683 0,0795283241291602 0,0110322728313115 0,0759899290455482 0,00189531958304931 0,0215075156435517 453784 3465906 623 665 0 True 444 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 490 265 0,0110140746719708 0,0691162789096798 0,0109407186999313 0,0725871671625849 0,00159119771170898 0,023892032352227 449686 3012141 623 665 0 True 488 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 534 266 0,0109967337610513 0,0832654536317906 0,0110475318532082 0,0812237735561151 0,00164528403103378 0,0286158994989506 448978 3628773 623 665 0 True 532 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 578 265 0,0108634928635906 0,0722051409136253 0,0108339055466545 0,0711375600823987 0,00171058750823794 0,0231396893368298 443538 3146756 623 665 0 True 576 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 620 266 0,0109267822898844 0,0107686933057065 0,0108949416342412 0,0108491645685512 0,0019770097208553 0,00194614247812334 446122 469308 623 665 0 False 620 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 662 264 0,011007535091158 0,0478163593924156 0,0110627908751049 0,04785229266804 0,00187570873581587 0,00898653285520048 449419 2083874 623 665 0 True 665 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 267 309 0,0107372324175593 0,0108526064531895 0,0107270923933776 0,0109712367437247 0,00155690339757153 0,00147274501446065 438383 472965 623 665 0 False 267 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 311 309 0,0109580596108509 0,010849118676756 0,0109407186999313 0,0108491645685512 0,00130677731883051 0,00130592933539318 447399 472813 623 665 0 False 311 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 357 310 0,0112227534304939 0,107847760853266 0,0112458991378653 0,108415350576028 0,0014306171161388 0,029962734722694 458206 4700089 623 665 0 True 355 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 401 310 0,011180821736293 0,0527039732542618 0,0111848630502785 0,0529488059815366 0,0017010610276088 0,00995469983568547 456494 2296880 623 665 0 True 399 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 445 310 0,0109902921514866 0,0848554896052216 0,0110627908751049 0,0832074464026856 0,00175748130367077 0,0199497318721542 448715 3698068 623 665 0 True 444 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 490 310 0,0110029059496837 0,0438446998705278 0,0109864957656214 0,0449530785076677 0,00171456647817466 0,0098671489574178 449230 1910786 623 665 0 True 488 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 533 310 0,0109088780442881 0,0444731191677982 0,0108949416342412 0,0484931715877012 0,00147638920944843 0,0120656097621856 445391 1938173 623 665 0 True 532 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 578 310 0,0108934475727072 0,0597780099137751 0,0108796826123445 0,0561226825360494 0,00180821737593461 0,0206693305150157 444761 2605172 623 665 0 True 576 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 620 309 0,0109103231201981 0,010783401626061 0,010955977721828 0,010757610437171 0,00202745045747746 0,00198685520092833 445450 469949 623 665 0 False 620 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 665 309 0,0105783230530878 0,0108366820002627 0,0107118333714809 0,0108339055466545 0,00196003863622222 0,00187390798337088 431895 472271 623 665 0 False 665 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 269 355 0,0108621212661167 0,0536872508577463 0,0108339055466545 0,0532539864194705 0,00161434503103189 0,0110266111965189 443482 2339732 623 665 0 True 267 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 313 355 0,0110106701710982 0,0676515045911873 0,0110322728313115 0,0685740444037537 0,00136592758150131 0,0261337539826525 449547 2948305 623 665 0 True 311 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 357 354 0,0109046652806184 0,0418827108971789 0,0109712367437247 0,0425574120698863 0,00146826258527303 0,0104932086189909 445219 1825281 623 665 0 True 355 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 402 355 0,0111205694186913 0,0377550881093785 0,0111390859845884 0,036942092011902 0,00142330417912259 0,00859035802687867 454034 1645396 623 665 0 True 399 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 447 355 0,0110402574880343 0,0754851422444874 0,0110475318532082 0,0710917830167086 0,00175994498454359 0,0195472533934655 450755 3289701 623 665 0 True 444 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 490 355 0,0111908637892266 0,0328462722381601 0,0112306401159686 0,034027618829633 0,00165776335443609 0,00575052124240357 456904 1431466 623 665 0 True 488 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 534 355 0,0109896308455617 0,0331271300246496 0,0110322728313115 0,0317387655451286 0,00165400847282108 0,0076055422159852 448688 1443706 623 665 0 True 532 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 578 355 0,0109889205540127 0,0519733529291299 0,0110475318532082 0,051773861295491 0,00193640676598679 0,0113043942994033 448659 2265039 623 665 0 True 576 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 623 355 0,0110295051435518 0,0581337986761364 0,0111390859845884 0,058655680170901 0,00221011155318688 0,0157556296785692 450316 2533516 623 665 0 True 620 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 668 355 0,0107486950535909 0,0652925056977532 0,0108339055466545 0,0657206073090715 0,00196021847441169 0,0234236649804896 438851 2845498 623 665 0 True 665 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 271 400 0,0111649993797195 0,0512476659719796 0,0111696040283818 0,0504615854123751 0,00157263778152466 0,017310829168325 455848 2233413 623 665 0 True 267 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 314 400 0,0110744494536327 0,0359766204249466 0,0111390859845884 0,0347447928587778 0,00145303811276954 0,00616989301236712 452151 1567889 623 665 0 True 311 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 358 399 0,0114146056271501 0,0963294021274289 0,0113832303349355 0,0902265964751659 0,00148561019242148 0,0314246704264965 466039 4198110 623 665 0 True 355 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 402 399 0,0112727187670416 0,069755987588564 0,0112916762035554 0,0676890211337453 0,00157541382463854 0,0214888159380585 460246 3040020 623 665 0 True 399 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 446 400 0,0111103069304494 0,0458823414682277 0,0110475318532082 0,0459601739528496 0,00165215403659734 0,0118361595154289 453615 1999588 623 665 0 True 444 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 491 400 0,0114487730999364 0,0569715660173551 0,0114137483787289 0,0562905317769131 0,00172568304662669 0,0124398101213373 467434 2482865 623 665 0 True 488 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 534 399 0,0114483812149439 0,0420949375039797 0,0114442664225223 0,0434119172961013 0,00166883949973853 0,00634992906081895 467418 1834530 623 665 0 True 532 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 579 400 0,0110109885776546 0,0521884936649245 0,0110475318532082 0,0529488059815366 0,00175844143464735 0,00991518390011783 449560 2274415 623 665 0 True 576 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 623 399 0,0109812543038463 0,0432734388041516 0,0110322728313115 0,0439917601281758 0,00194297259387676 0,00785430739560096 448346 1885890 623 665 0 True 620 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 667 399 0,0110031018921799 0,0924352767934944 0,0110017547875181 0,0865491721980621 0,0018867432172902 0,0233132310557744 449238 4028401 623 665 0 True 665 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 271 444 0,0109299663554487 0,0497029022544918 0,0109864957656214 0,049408712901503 0,00165835763721565 0,0123339070586473 446252 2166091 623 665 0 True 267 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 314 444 0,0110583821689389 0,0590876825848095 0,0110627908751049 0,0590524147402152 0,00151854838165319 0,00920511538986758 451495 2575087 623 665 0 True 311 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 358 444 0,0111370775740017 0,0368737591288819 0,0111238269626917 0,037445639734493 0,0015582840778639 0,00575406480837899 454708 1606987 623 665 0 True 355 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 402 443 0,0114238884029107 0,0572172706887383 0,011459525444419 0,0559243152513924 0,0017084357463411 0,0173699019056497 466418 2493573 623 665 0 True 399 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 447 443 0,0113916313694629 0,098344923879853 0,0112916762035554 0,0942549782558938 0,00189495500580091 0,0197751451233225 465101 4285948 623 665 0 True 443 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 491 444 0,0115353551904739 0,0638023532165272 0,0115663385976959 0,0624093995574884 0,00186252017154299 0,0169480880934858 470969 2780556 623 665 0 True 488 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 535 444 0,0112122949997557 0,0557179169025792 0,0112001220721752 0,0552681773098344 0,00178727536333856 0,0116447678828739 457779 2428230 623 665 0 True 532 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 579 444 0,0111954439450768 0,0330899576705554 0,0111238269626917 0,0333562218661784 0,00179495825633724 0,00473483266643672 457091 1442086 623 665 0 True 576 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 624 444 0,0110713143736925 0,0436471356922863 0,0110475318532082 0,043930724040589 0,00186860604743771 0,00736208013210616 452023 1902176 623 665 0 True 620 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 668 444 0,0110685466859327 0,0789473110563087 0,0110933089188983 0,0787670710307469 0,00197343749308682 0,0134319480687067 451910 3440585 623 665 0 True 665 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 267 483 0,0128092753299457 0,0457491864245186 0,0113527122911421 0,0488441290913252 0,00580874809580086 0,0274348964229305 522981 1993785 623 665 0 False 267 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 314 489 0,0112311299722092 0,0586754365887252 0,0112001220721752 0,0587472343022812 0,00166713108171787 0,010947114979023 458548 2557121 623 665 0 True 311 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 359 489 0,0114340529199045 0,074838687471712 0,0114442664225223 0,071473258564126 0,00154370041689153 0,0222958874124006 466833 3261528 623 665 0 True 355 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 403 488 0,0116557128688051 0,0970909305766132 0,0117189288166629 0,090424963759823 0,0017391864533167 0,0332300325798142 475883 4231298 623 665 0 True 399 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 447 489 0,0118217986272024 0,103156472091192 0,0117494468604562 0,0986495765621424 0,00202207748030959 0,0395791655052855 482664 4495639 623 665 0 True 443 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 490 488 0,0118100910630505 0,052846834412651 0,0118867780575265 0,0526436255436027 0,00198148910791148 0,0142763226108894 482186 2303106 623 665 0 True 488 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 533 487 0,011466897780841 0,041916762609201 0,0115205615320058 0,0444800488288701 0,00175340308264881 0,00775043461093429 468174 1826765 623 665 0 True 532 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 578 488 0,0115392495475871 0,113258357612961 0,0115053025101091 0,113664454108492 0,00187169670959956 0,0267863478661808 471128 4935887 623 665 0 True 576 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 622 487 0,0110769477204601 0,0681199680363647 0,011108567940795 0,0701152056153201 0,0017825743821305 0,0212249847047435 452253 2968721 623 665 0 True 620 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 666 488 0,0109563451140085 0,0801489418212503 0,0109254596780346 0,0758220798046845 0,00191616839090939 0,0167046530252647 447329 3492953 623 665 0 True 665 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 270 533 0,0108412533902644 0,0540981200999753 0,0107423514152743 0,0561226825360494 0,00148868303578121 0,0140086156620316 442630 2357638 623 665 0 True 267 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 314 533 0,0111775396994805 0,110125531269235 0,0111848630502785 0,0980849927519646 0,00154809049802687 0,0357483090940512 456360 4799356 623 665 0 True 311 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 357 532 0,0116272767140345 0,0635724353226853 0,0115968566414893 0,0639200427252613 0,00160518787665791 0,0196221048075489 474722 2770536 623 665 0 True 355 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 402 532 0,0115601909018755 0,0615111594504687 0,0115205615320058 0,062577248798352 0,00178481237967417 0,0125855528689809 471983 2680704 623 665 0 True 399 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 445 532 0,0115311914124282 0,0626609095409616 0,0114747844663157 0,0632944228274968 0,00186947548554714 0,0136616972196726 470799 2730811 623 665 0 True 443 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 490 533 0,0115066251219589 0,0645821007083972 0,0115205615320058 0,0658731975280385 0,00186953742386285 0,0160962962741138 469796 2814538 623 665 0 True 488 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 534 533 0,0113812464171608 0,0769657492323163 0,0113832303349355 0,0755626764324407 0,00180090583895365 0,0219897596946145 464677 3354227 623 665 0 True 532 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 579 533 0,0111605906735536 0,0632227398434287 0,0111238269626917 0,0620431830319677 0,00178491841062323 0,0189770421109487 455668 2755296 623 665 0 True 576 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 622 532 0,0111310033566174 0,0450957560988762 0,0111238269626917 0,0446173800259403 0,00183512633464229 0,00887010936593472 454460 1965308 623 665 0 True 620 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 666 532 0,0112419802879399 0,0678929642715165 0,0112153810940719 0,0668039978637369 0,00192144391056838 0,0195427257037933 458991 2958828 623 665 0 True 665 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 267 569 0,0147013695523241 0,0336769825685753 0,0112764171816587 0,0364843213550011 0,00884376365165841 0,0192429052317172 600232 1467669 623 665 0 False 267 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 311 569 0,0165196914248583 0,0396458300707135 0,0115663385976959 0,0433051041428244 0,012694321015 0,0239876753017676 674471 1727796 623 665 0 False 311 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 355 569 0,0151934056532594 0,0388645681496027 0,0119172961013199 0,0438696879530022 0,0094102894890216 0,0221651938025825 620321 1693748 623 665 0 False 355 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 399 569 0,0167498013939104 0,0403419627117691 0,0122224765392538 0,0465552758068208 0,011502726046673 0,0227045067904878 683866 1758134 623 665 0 False 399 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 443 569 0,0218630677908378 0,0650272281757266 0,0125276569771878 0,0696879530022126 0,0214596968872641 0,0493838721019437 892632 2833937 623 665 0 False 443 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 488 569 0,0163364117124137 0,0488768728871848 0,0119478141451133 0,052323186083772 0,0124553478948595 0,0313402936464525 666988 2130092 623 665 0 False 488 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 535 576 0,0112649300528151 0,0599781210866489 0,0112916762035554 0,0601052872510872 0,00183840561570332 0,0121885523040739 459928 2613893 623 665 0 True 532 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 576 569 0,0128213257934661 0,0315041666881784 0,0117036697947662 0,0364690623331045 0,00455366289874041 0,0146998514010844 523473 1372976 623 665 0 False 576 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 623 577 0,0109814502463426 0,0499214848749248 0,010955977721828 0,050415808346685 0,00154191774275943 0,00888479139729396 448354 2175617 623 665 0 True 620 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 668 577 0,01088372392633 0,0547896635615131 0,0108644235904479 0,0535896849011978 0,00163134755609451 0,00826428347794484 444364 2387776 623 665 0 True 665 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 267 613 0,011659288819362 0,0105948092937769 0,0106355382619974 0,0106355382619974 0,00481253409886647 0,00141480058292328 476029 461730 623 665 0 False 267 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 311 613 0,0119568274999415 0,0107944844945965 0,0108644235904479 0,0108186465247578 0,00516824321792651 0,00144237953602657 488177 470432 623 665 0 False 311 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 355 613 0,0203646220434574 0,0549546445651781 0,0116884107728695 0,0689707789730678 0,0195966293997131 0,0374354161413711 831453 2394966 623 665 0 False 355 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 399 613 0,0198422638412249 0,0582510981046115 0,01196307316701 0,0579995422293431 0,0173110652410149 0,0434315826908738 810126 2538628 623 665 0 False 399 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 443 613 0,0133717527582886 0,0110620566063821 0,0112764171816587 0,0110933089188983 0,00934957586530984 0,0019980626658116 545946 482093 623 665 0 False 443 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 488 613 0,0123319349162303 0,0110820654290797 0,011261158159762 0,011108567940795 0,00590508876467037 0,0019672613851266 503492 482965 623 665 0 False 488 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 532 613 0,0118389925812497 0,0109860597935672 0,0111238269626917 0,0108949416342412 0,00457781022170426 0,00213774407511748 483366 478781 623 665 0 False 532 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 576 613 0,0109557572865197 0,0107272759605583 0,0108796826123445 0,0108033875028611 0,0018114194245638 0,00180048251182999 447305 467503 623 665 0 False 576 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 620 613 0,0115307995274357 0,0107357429967686 0,0109864957656214 0,0107728694590677 0,00346661945852909 0,00134548649317762 470783 467872 623 665 0 False 620 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 664 613 0,0112712981839437 0,0107793172562902 0,0106660563057908 0,0108491645685512 0,00368390367034127 0,0016081832200681 460188 469771 623 665 0 False 664 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 267 662 0,0102981742690518 0,0436605360964783 0,0103150988021668 0,0449835965514611 0,00123464497852624 0,0115586820903684 420457 1902760 623 665 0 True 267 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 311 656 0,0104681788773744 0,0105358612828707 0,0104371709773404 0,0105745021744106 0,00130609359711899 0,00125751954555723 427398 459161 623 665 0 False 311 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 355 656 0,0143274622838249 0,0105140856260587 0,0108033875028611 0,0105287251087205 0,0130236047424159 0,00127907991952091 584966 458212 623 665 0 False 355 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 399 656 0,0140712429771454 0,0107686244680137 0,0111543450064851 0,0107423514152743 0,0112560049154674 0,00131666209634553 574505 469305 623 665 0 False 399 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 443 656 0,0108239124793449 0,0106743856666156 0,0108339055466545 0,0106660563057908 0,00157801225112054 0,00167937651602065 441922 465198 623 665 0 False 443 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 488 656 0,0108474745645209 0,0107624979133574 0,0108644235904479 0,0107423514152743 0,00169983748066332 0,00168026547956013 442884 469038 623 665 0 False 488 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 532 656 0,0108887449527968 0,0106346892637866 0,0108796826123445 0,0106355382619974 0,00196851893749993 0,00172683019723233 444569 463468 623 665 0 False 532 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 576 656 0,0108452212258138 0,0108614406237613 0,0108339055466545 0,0109407186999313 0,00153068834240099 0,00136302331751099 442792 473350 623 665 0 False 576 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 620 656 0,010790087905927 0,0105976316391803 0,0108339055466545 0,0105439841306172 0,00139955453009466 0,00149691676507181 440541 461853 623 665 0 False 620 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 663 661 0,0107341708160552 0,0446682051891 0,0107423514152743 0,0453345540550851 0,0013657143667288 0,0106234972644556 438258 1946675 623 665 0 True 664 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C7_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C7_2.csv new file mode 100755 index 0000000..54df674 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C7_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 267 266 0,00887724827175657 0,729034075231567 0,00886549172198062 0,746761272602426 0,00166227330336297 0,196752535098731 362443 31771870 623 665 12 True 267 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 311 266 0,00778379117134547 0,00739266339343438 0,007690547035935 0,00733958953231098 0,00142786644584283 0,00124426268968936 317799 322178 623 665 0 False 311 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 357 265 0,00712380785829831 0,00698576379148833 0,00712596322575723 0,00697337300679027 0,00119420369175859 0,00128711564049891 290853 304445 623 665 0 True 355 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 401 265 0,00713578484338255 0,00718229540433827 0,00709544518196384 0,00720225833524071 0,00138996045189916 0,00120777960810469 291342 313010 623 665 0 True 399 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 445 265 0,00722506114324364 0,00729385835841607 0,00729381246662089 0,00729381246662089 0,00157900819556036 0,00150973421289433 294987 317872 623 665 0 True 444 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 490 265 0,00726295152345903 0,00736675747505638 0,0072480354009308 0,00749217975127794 0,00164223551339834 0,00156265957854933 296534 321049 623 665 0 True 488 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 534 266 0,00754998278767634 0,00763354942632388 0,00750743877317464 0,00772106507972839 0,00141027281745693 0,00152047885971311 308253 332676 623 665 0 True 532 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 578 265 0,00788401575818541 0,00812961678630084 0,00782787823300526 0,00822461280231937 0,00167774452039122 0,00166732568601534 321891 354295 623 665 0 True 576 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 620 266 0,00848141993648769 0,00864417853973455 0,00857557030594339 0,00868238345922026 0,00192655782751601 0,00179532102943748 346282 376720 623 665 0 False 620 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 662 264 0,010131696625662 0,752080016934072 0,0100556954299229 0,766720073243305 0,00192223509019861 0,175944413835413 413660 32776230 623 665 14 True 665 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 267 309 0,00772023232411926 0,00740565077146976 0,00770580605783169 0,00735484855420768 0,00154475832333444 0,00135764809681235 315204 322744 623 665 0 False 267 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 311 309 0,00734345939661223 0,00704085689159956 0,00743114366369116 0,00703440909437705 0,00122964644424691 0,00115329881810977 299821 306846 623 665 0 False 311 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 357 310 0,00698765231620563 0,00732947039147422 0,00698863202868696 0,00735484855420768 0,00118973973491801 0,00128409598987436 285294 319424 623 665 0 True 355 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 401 310 0,00723164970968058 0,00728619442862134 0,00729381246662089 0,00729381246662089 0,00140527043836488 0,00135873048940651 295256 317538 623 665 0 True 399 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 445 310 0,00705113768499574 0,00731877760319774 0,00711070420386053 0,00741588464179446 0,00162452970073427 0,00176021480225668 287886 318958 623 665 0 True 444 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 490 310 0,0074936248271879 0,00749183556281411 0,00755321583886473 0,00744640268558785 0,00163362915124539 0,00168643860673819 305952 326500 623 665 0 True 488 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 533 310 0,00768599137289682 0,00769568691699494 0,0076600289921416 0,00778210116731518 0,00140438744391478 0,00147759483748937 313806 335384 623 665 0 True 532 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 578 310 0,00793545066345517 0,00810029192918208 0,00788891432059205 0,00805676356145571 0,00184534693871499 0,00178807384430659 323991 353017 623 665 0 True 576 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 620 309 0,00804285164422084 0,00828957263839388 0,00813305867093919 0,00843823910887312 0,00197733397796173 0,00202454806492989 328376 361266 623 665 0 False 620 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 665 309 0,00837592939506061 0,00843195193293373 0,00836194399938964 0,00843823910887312 0,00206710266290825 0,00194908565376342 341975 367471 623 665 0 False 665 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 269 355 0,00695642398086328 0,00694078983221386 0,00695811398489357 0,00695811398489357 0,00143681259616819 0,00142108920232969 284019 302485 623 665 0 True 267 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 313 355 0,00692313824931013 0,00712096102008282 0,00689707789730678 0,00712596322575723 0,00131892518757163 0,00123267235392983 282660 310337 623 665 0 True 311 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 357 354 0,00717418957265064 0,00749945360081366 0,00718699931334401 0,00744640268558785 0,00124971732033007 0,0015544307548928 292910 326832 623 665 0 True 355 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 402 355 0,00740834085568823 0,00747281341371281 0,00740062561989776 0,00746166170748455 0,00136947562765834 0,00134895910636614 302470 325671 623 665 0 True 399 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 447 355 0,00775256283600311 0,00768616436949549 0,00772106507972839 0,00776684214541848 0,00164125023222934 0,0017268801971049 316524 334969 623 665 0 True 444 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 490 355 0,00773948367437737 0,00781282572418687 0,00776684214541848 0,00778210116731518 0,00157266832164978 0,0016701975047629 315990 340489 623 665 0 True 488 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 534 355 0,00781156602019114 0,00764628439948578 0,00785839627679866 0,00759899290455482 0,00155888749337809 0,00167931090301452 318933 333231 623 665 0 True 532 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 578 355 0,00785653482308413 0,00798088147812883 0,00794995040817884 0,00799572747386892 0,00187809047457654 0,00197508001655528 320769 347813 623 665 0 True 576 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 623 355 0,00783965927559325 0,00775204204147356 0,00779736018921187 0,00776684214541848 0,00199435550778706 0,00201392137958827 320080 337840 623 665 0 True 620 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 668 355 0,00732477138103088 0,00751363416552367 0,00737010757610437 0,00746166170748455 0,00184385450853358 0,00191831902677911 299058 327450 623 665 0 True 665 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 271 400 0,00684892502884947 0,00705168735526158 0,0068207827878233 0,00700389105058366 0,00152396577132212 0,00143752332613408 279630 307318 623 665 0 True 267 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 314 400 0,00713480513090122 0,00732632680350453 0,00714122224765393 0,00732433051041428 0,00141250479176048 0,00125690323634907 291302 319287 623 665 0 True 311 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 358 399 0,00750349543043729 0,00767191496709271 0,00752269779507134 0,00775158312352178 0,00131047833109237 0,00126674919396776 306355 334348 623 665 0 True 355 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 402 399 0,00757224675381454 0,00772235004999338 0,00758373388265812 0,00778210116731518 0,00135356954629934 0,00139017077234576 309162 336546 623 665 0 True 399 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 446 400 0,00787510037460531 0,00772551658386066 0,00790417334248875 0,00770580605783169 0,0015721032344424 0,00159003949652218 321527 336684 623 665 0 True 444 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 491 400 0,00785996381676878 0,00804932909063687 0,00784313725490196 0,0081177996490425 0,00161482344512778 0,00165349848197078 320909 350796 623 665 0 True 488 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 534 399 0,00771763608604374 0,00795688006925072 0,00779736018921187 0,00798046845197223 0,00158107868641258 0,00164963401020486 315098 346767 623 665 0 True 532 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 579 400 0,00758189692175563 0,00773990366164897 0,00762951094834821 0,00772106507972839 0,00180133095970516 0,0018989475454931 309556 337311 623 665 0 True 576 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 623 399 0,00720539341518096 0,00705951190633944 0,00721751735713741 0,00697337300679027 0,00182377405200233 0,00189265011998105 294184 307659 623 665 0 True 620 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 667 399 0,00701028367452433 0,00679276584686711 0,00706492713817044 0,00683604180972 0,00162574802716247 0,00195088014335279 286218 296034 623 665 0 True 665 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 271 444 0,00720265022023324 0,00728672218426588 0,0072327763790341 0,00727855344472419 0,00145277281143432 0,00149710520055981 294072 317561 623 665 0 True 267 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 314 444 0,00720764675388802 0,00714799128744269 0,00717174029144732 0,00714122224765393 0,00138755959750655 0,00146885780718994 294276 311515 623 665 0 True 311 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 358 444 0,00736050639378735 0,00753600641567297 0,00738536659800107 0,00746166170748455 0,00143496198623458 0,00141454181082302 300517 328425 623 665 0 True 355 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 402 443 0,00751963619356718 0,00764786766641942 0,00749217975127794 0,00762951094834821 0,00152364962778077 0,00152408994723339 307014 333300 623 665 0 True 399 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 447 443 0,00764053271376316 0,00783434897612537 0,00762951094834821 0,00779736018921187 0,00173475820664082 0,00191235393968441 311950 341427 623 665 0 True 443 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 491 444 0,00763658937102581 0,00779986129204907 0,0076600289921416 0,00785839627679866 0,00184829234569524 0,00178522183035344 311789 339924 623 665 0 True 488 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 535 444 0,00757839444963488 0,00759371534810934 0,007690547035935 0,0076600289921416 0,00169662928710867 0,00169181681866834 309413 330940 623 665 0 True 532 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 579 444 0,00713225787844977 0,00707080128795323 0,00712596322575723 0,00709544518196384 0,00184340442476808 0,00197199017580448 291198 308151 623 665 0 True 576 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 624 444 0,00687655292082294 0,00664481069921313 0,00689707789730678 0,00662241550316625 0,0018487733182686 0,00175598833047289 280758 289586 623 665 0 True 620 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 668 444 0,00680689536340046 0,00682470653631102 0,00674448767833982 0,00686655985351339 0,00179738694749739 0,00194482552113959 277914 297426 623 665 0 True 665 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 267 483 0,0071765163897938 0,00730012258845787 0,0072327763790341 0,00733958953231098 0,00149061167421945 0,00150222432362372 293005 318145 623 665 0 False 267 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 314 489 0,0071757081269967 0,00724702578143688 0,00717174029144732 0,0072480354009308 0,00149368841613564 0,00156248537697565 292972 315831 623 665 0 True 311 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 359 489 0,00730931641663792 0,00746950920445999 0,00732433051041428 0,00747692072938125 0,00146764669346467 0,00146368009758461 298427 325527 623 665 0 True 355 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 403 488 0,0074735652141327 0,00752129809531841 0,00753795681696803 0,00752269779507134 0,00172854714528055 0,00166205076886782 305133 327784 623 665 0 True 399 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 447 489 0,00745384850044595 0,00780295898822359 0,00746166170748455 0,00784313725490196 0,00198025595051072 0,00188027901258055 304328 340059 623 665 0 True 443 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 490 488 0,00770830432465908 0,00748926562228414 0,00772106507972839 0,00747692072938125 0,00183791209126605 0,00182248437883793 314717 326388 623 665 0 True 488 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 533 487 0,00723556855960589 0,00705547342836377 0,00718699931334401 0,00704966811627375 0,00167901237057879 0,00157652159452812 295416 307483 623 665 0 True 532 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 578 488 0,0071399486214282 0,00706846080639915 0,00717174029144732 0,00704966811627375 0,00179358114038802 0,0018612167899118 291512 308049 623 665 0 True 576 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 622 487 0,00685465634686524 0,00663494396324985 0,00692759594110018 0,00659189745937285 0,00178590855613761 0,00164559835768552 279864 289156 623 665 0 True 620 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 666 488 0,00696928270718072 0,00678432175655435 0,00695811398489357 0,00675974670023652 0,0017955469687065 0,00176035505041799 284544 295666 623 665 0 True 665 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 270 533 0,00739075501664838 0,0078854724359537 0,00737010757610437 0,00761425192645151 0,00140732392056447 0,00242556494733241 301752 343655 623 665 0 True 267 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 314 533 0,00721185951755773 0,00754796122831684 0,00715648126955062 0,00756847486076143 0,0014013016966259 0,00143054255198341 294448 328946 623 665 0 True 311 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 357 532 0,00751194545058875 0,00749307464128391 0,00746166170748455 0,00744640268558785 0,00140694163326151 0,00150834749573244 306700 326554 623 665 0 True 355 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 402 532 0,00736871148581848 0,00765725253853333 0,00732433051041428 0,00773632410162509 0,00164236501138831 0,00166614895830488 300852 333709 623 665 0 True 399 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 445 532 0,00724247553259926 0,00724411165244308 0,00714122224765393 0,00730907148851759 0,0018895052940334 0,00192707285877921 295698 315704 623 665 0 True 443 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 490 533 0,00717982291941828 0,00736719344711057 0,00711070420386053 0,00737010757610437 0,00185354631273665 0,00190355458342937 293140 321068 623 665 0 True 488 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 534 533 0,0070744793348634 0,00725333590327386 0,00709544518196384 0,00729381246662089 0,00178344469365157 0,00174370092953827 288839 316106 623 665 0 True 532 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 579 533 0,0070604694463804 0,00719955071932521 0,00714122224765393 0,00727855344472419 0,0016345068941114 0,00159728174718867 288267 313762 623 665 0 True 576 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 622 532 0,00697741432077575 0,0070894563026931 0,00700389105058366 0,00711070420386053 0,00176952549489792 0,00177189040630143 284876 308964 623 665 0 True 620 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 666 532 0,0071170968278012 0,00722290964307083 0,0072327763790341 0,00721751735713741 0,00190610629866808 0,00186435439515208 290579 314780 623 665 0 True 665 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 267 569 0,00732163630109063 0,00731487680060761 0,0072632944228275 0,00727855344472419 0,00124569130814757 0,0012792158012891 298930 318788 623 665 0 False 267 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 311 569 0,00731617440400722 0,00755977836557519 0,00729381246662089 0,00753795681696803 0,00134703686668942 0,00142713037884994 298707 329461 623 665 0 False 311 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 355 569 0,00738392152209111 0,00752370741456525 0,00735484855420768 0,00759899290455482 0,00130547967271354 0,00134645078535897 301473 327889 623 665 0 False 355 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 399 569 0,00725680382763869 0,00731717139036651 0,00715648126955062 0,0072632944228275 0,00147786087227367 0,00143499694087276 296283 318888 623 665 0 False 399 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 443 569 0,00711065521823647 0,00755156373423832 0,00711070420386053 0,00752269779507134 0,00184999444798665 0,00209640396277411 290316 329103 623 665 0 False 443 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 488 569 0,0073492641930641 0,00726269782949018 0,00737010757610437 0,0072480354009308 0,00184518704534624 0,00213358039748238 300058 316514 623 665 0 False 488 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 535 576 0,00720020093902992 0,0073802955546339 0,00720225833524071 0,00729381246662089 0,00183561438200337 0,0018403868362926 293972 321639 623 665 0 True 532 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 576 569 0,0072186195336789 0,00739438433575355 0,0072327763790341 0,00738536659800107 0,0015988979567721 0,00175601636401922 294724 322253 623 665 0 False 576 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 623 577 0,00698238636161849 0,0070656384609957 0,00697337300679027 0,00712596322575723 0,00167013990984765 0,00143319169927422 285079 307926 623 665 0 True 620 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 668 577 0,00699159565894298 0,00706212773866458 0,00695811398489357 0,00709544518196384 0,00163786404896065 0,00171975954213371 285455 307773 623 665 0 True 665 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 267 613 0,00766291914396152 0,00770316727960896 0,007690547035935 0,00776684214541848 0,00130763106681776 0,00138584205002197 312864 335710 623 665 0 False 267 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 311 613 0,00745945735440156 0,00736519715402032 0,00749217975127794 0,00740062561989776 0,00136052090252519 0,0013726768769355 304557 320981 623 665 0 False 311 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 355 613 0,0073424796841309 0,00719402075800625 0,00729381246662089 0,00718699931334401 0,0013278482986064 0,00144906934526546 299781 313521 623 665 0 False 355 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 399 613 0,00705277870340197 0,00694769654738815 0,00706492713817044 0,00697337300679027 0,00130735429465686 0,00133531543091044 287953 302786 623 665 0 False 399 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 443 613 0,00719875586311996 0,00722396515435992 0,00718699931334401 0,00717174029144732 0,00179704935816341 0,00188474298658539 293913 314826 623 665 0 False 443 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 488 613 0,00721359850721209 0,00716375511908634 0,00727855344472419 0,00714122224765393 0,00203438757789346 0,00199851905267721 294519 312202 623 665 0 False 488 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 532 613 0,00726954008989597 0,00714168116560571 0,0072327763790341 0,00720225833524071 0,00186264760793943 0,00201419483622842 296803 311240 623 665 0 False 532 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 576 613 0,00715929794293444 0,0072081324850235 0,00708018616006714 0,00718699931334401 0,00164399057579218 0,00177782467110454 292302 314136 623 665 0 False 576 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 620 613 0,00711425566160535 0,00703337652898554 0,00701915007248035 0,00708018616006714 0,00149111546069118 0,00134698517549225 290463 306520 623 665 0 False 620 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 664 613 0,00713443773872072 0,00732653331658283 0,00714122224765393 0,00740062561989776 0,00146618988125023 0,00165476829588337 291287 319296 623 665 0 False 664 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 267 662 0,00901357526353347 0,696563083148475 0,00888075074387732 0,732326237888151 0,00192391284415527 0,240937138749586 368009 30356759 623 665 13 True 267 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 311 656 0,00797483510520459 0,00742880318213708 0,00779736018921187 0,00741588464179446 0,00165791692536119 0,00120343268373859 325599 323753 623 665 0 False 311 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 355 656 0,00697322604991807 0,00719730202136148 0,00694285496299687 0,00727855344472419 0,00131382512754673 0,00124930242311184 284705 313664 623 665 0 False 355 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 399 656 0,00701050410983263 0,00663537993530404 0,00698863202868696 0,00657663843747616 0,00123946352008841 0,00130173163237035 286227 289175 623 665 0 False 399 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 443 656 0,00691975824124954 0,00682034681576911 0,00694285496299687 0,0068207827878233 0,00154453832391751 0,00160893833108997 282522 297236 623 665 0 False 443 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 488 656 0,00690922633207526 0,00701726850887805 0,00698863202868696 0,00694285496299687 0,00169017259384213 0,00163715810996494 282092 305818 623 665 0 False 488 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 532 656 0,00711954610900453 0,00707637714106736 0,00708018616006714 0,00708018616006714 0,00187283964383251 0,00166710080667047 290679 308394 623 665 0 False 532 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 576 656 0,00709889866846052 0,00717249750606776 0,00715648126955062 0,00712596322575723 0,00142195681324937 0,00134097205947785 289836 312583 623 665 0 False 576 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 620 656 0,0074873546673074 0,00749243215615142 0,00737010757610437 0,00752269779507134 0,00151091425985997 0,00144091542257283 305696 326526 623 665 0 False 620 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 663 661 0,00858904135256166 0,7273244681858 0,00848401617456321 0,754161898222324 0,0016824940442979 0,223564744513362 350676 31697364 623 665 14 True 664 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C7_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C7_3.csv new file mode 100755 index 0000000..e2127e9 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C7_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 267 266 0,00112620399009952 0,0724220943753295 0,000930800335698482 0,0723125047684443 0,00086344026663017 0,022267976164546 45981 3156211 623 665 0 True 267 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 311 266 0,000992791642954563 0,000934196328541656 0,000869764248111696 0,000823987182421607 0,000704293318916296 0,000645813792230015 40534 40713 623 665 0 False 311 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 357 265 0,000930653378826282 0,000937362862408941 0,00080872816052491 0,00080872816052491 0,000676576127315734 0,000698665378852206 37997 40851 623 665 0 True 355 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 401 265 0,000986545975886092 0,000924880294120515 0,000839246204318303 0,000762951094834821 0,000703708441407583 0,000696255457104895 40279 40307 623 665 0 True 399 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 445 265 0,000894550973889315 0,000823275859596347 0,000671396963454643 0,000579842832074464 0,000771560267628991 0,000813142195336171 36523 35879 623 665 0 True 444 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 490 265 0,000873340198668546 0,000971414574431042 0,000656137941557946 0,000778210116731518 0,000770220170362485 0,000835596938316739 35657 42335 623 665 0 True 488 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 534 266 0,000872654399931616 0,000903150529103716 0,000717174029144732 0,000686655985351339 0,000755255252479554 0,00082610981298537 35629 39360 623 665 0 True 532 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 578 265 0,000906283030853228 0,000990528507122693 0,000686655985351339 0,000671396963454643 0,00081134596049167 0,000976878898771052 37002 43168 623 665 0 True 576 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 620 266 0,000962126642288971 0,000986765379918095 0,000579842832074464 0,00064087891966125 0,000979689011422891 0,000963594713716228 39282 43004 623 665 0 False 620 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 662 264 0,00104809641252558 0,0750678252050359 0,000717174029144732 0,0738841840238041 0,000977993124555822 0,0211098483508551 42792 3271514 623 665 0 True 665 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 267 309 0,00102921245444796 0,00103917381001141 0,000869764248111696 0,000915541313801785 0,000776914558933467 0,000763849825920213 42021 45288 623 665 0 False 267 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 311 309 0,000904225634642437 0,000924811456427748 0,000778210116731518 0,000823987182421607 0,000638765376831815 0,000618638286473406 36918 40304 623 665 0 False 311 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 357 310 0,000949463858467796 0,000901796721145964 0,00080872816052491 0,000762951094834821 0,000715299961583692 0,000688959573435196 38765 39301 623 665 0 True 355 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 401 310 0,000986496990262025 0,000941561961667731 0,000869764248111696 0,000762951094834821 0,000700948397759486 0,00072820940004642 40277 41034 623 665 0 True 399 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 445 310 0,000994677589481121 0,000957761765365577 0,000732433051041428 0,000717174029144732 0,000900069179483236 0,000882121965208823 40611 41740 623 665 0 True 444 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 490 310 0,000914537108508423 0,000869236492467149 0,000717174029144732 0,000701915007248035 0,000841435078414838 0,000779132625934412 37339 37882 623 665 0 True 488 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 533 310 0,00091740276751631 0,000937913563951077 0,000762951094834821 0,000778210116731518 0,000760810046649633 0,000793098716126923 37456 40875 623 665 0 True 532 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 578 310 0,000923599448960715 0,000889474774140662 0,000671396963454643 0,000473029678797589 0,000905341876401477 0,000998183145531577 37709 38764 623 665 0 True 576 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 620 309 0,000965090272544991 0,0010552818301189 0,000625619897764553 0,000656137941557946 0,00103065689009885 0,00108408992366412 39403 45990 623 665 0 False 620 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 665 309 0,000956444309897264 0,000950969779679228 0,000595101853971161 0,000595101853971161 0,000971874062989187 0,000941116618476854 39050 41444 623 665 0 False 665 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 269 355 0,000858105669583883 0,000919120873825672 0,000686655985351339 0,000747692072938125 0,0007246788905092 0,00076364819501484 35035 40056 623 665 0 True 267 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 313 355 0,000951521254678586 0,000884793811032502 0,000839246204318303 0,000717174029144732 0,000695640007773866 0,000704775383481209 38849 38560 623 665 0 True 311 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 357 354 0,000916153634102616 0,000899180888820816 0,000778210116731518 0,000793469138628214 0,000698113116214343 0,000666558422158429 37405 39187 623 665 0 True 355 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 402 355 0,000934939620932096 0,000867836792714219 0,000778210116731518 0,000717174029144732 0,000727180705598845 0,000690278609257975 38172 37821 623 665 0 True 399 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 447 355 0,000991175117360371 0,00097263070700326 0,000717174029144732 0,000747692072938125 0,000898969688866462 0,000880871701792106 40468 42388 623 665 0 True 444 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 490 355 0,000852447830004209 0,000993350852526143 0,000534065766384375 0,000732433051041428 0,000850179754698495 0,000867637027689153 34804 43291 623 665 0 True 488 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 534 355 0,000981402485359115 0,000925981697204788 0,000747692072938125 0,000701915007248035 0,000830360759429887 0,000847141398291897 40069 40355 623 665 0 True 532 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 578 355 0,000955660539912201 0,00109564366397798 0,000656137941557946 0,000747692072938125 0,000971809439397099 0,00107187387662606 39018 47749 623 665 0 True 576 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 623 355 0,00096660882689105 0,00093341616802363 0,000518806744487678 0,000564583810177768 0,00104110308942641 0,000989162526730238 39465 40679 623 665 0 True 620 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 668 355 0,000873462662728712 0,000874605832502979 0,000473029678797589 0,000442511635004196 0,000927999403958644 0,000993503903404261 35662 38116 623 665 0 True 665 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 271 400 0,000978193926982764 0,000975131809840463 0,000839246204318303 0,000793469138628214 0,0007561121786122 0,000817548441723205 39938 42497 623 665 0 True 267 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 314 400 0,000883382251602167 0,000836423858914854 0,000762951094834821 0,000671396963454643 0,000646489397962893 0,000676648311738377 36067 36452 623 665 0 True 311 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 358 399 0,000982480169088577 0,000938028293439022 0,000854505226215 0,000823987182421607 0,000701120077398172 0,000707722678053068 40113 40880 623 665 0 True 355 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 402 399 0,000941087316752434 0,000876395612514922 0,000778210116731518 0,000686655985351339 0,000770354342386157 0,000734507054041222 38423 38194 623 665 0 True 399 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 446 400 0,000964257516935861 0,000962695133347216 0,000671396963454643 0,000732433051041428 0,000860801804112191 0,000801905575238195 39369 41955 623 665 0 True 444 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 491 400 0,000936286725593923 0,000921667868458053 0,000671396963454643 0,000701915007248035 0,000882329492422797 0,000858485632228736 38227 40167 623 665 0 True 488 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 534 399 0,000885733561557356 0,000965609262341021 0,00064087891966125 0,000717174029144732 0,000847513149060873 0,000889002640168061 36163 42082 623 665 0 True 532 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 579 400 0,00101297372006994 0,00093176406339722 0,000732433051041428 0,000564583810177768 0,000985119329700886 0,000973269624414328 41358 40607 623 665 0 True 576 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 623 399 0,00101718648373965 0,00103756759718018 0,000656137941557946 0,000595101853971161 0,00101720799153928 0,00111856615014267 41530 45218 623 665 0 True 620 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 667 399 0,000935527448420893 0,0010174669908922 0,000579842832074464 0,000625619897764553 0,00095053003285997 0,00102489962515399 38196 44342 623 665 0 True 665 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 271 444 0,00105319091742849 0,000971506358021398 0,000900282291905089 0,000762951094834821 0,000871200774562945 0,000862690398075629 43000 42339 623 665 0 True 267 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 314 444 0,00100131514154212 0,000899043213435282 0,000885023270008392 0,000778210116731518 0,00080291392462437 0,000754402578179174 40882 39181 623 665 0 True 311 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 358 444 0,000949292408783563 0,000880778278954424 0,000839246204318303 0,000778210116731518 0,000742235012328769 0,000705351853325493 38758 38385 623 665 0 True 355 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 402 443 0,000929575695096821 0,000931190415957495 0,000732433051041428 0,000793469138628214 0,000821197988933041 0,000792578285949981 37953 40582 623 665 0 True 399 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 447 443 0,000935453969984794 0,00095863370947396 0,000671396963454643 0,000625619897764553 0,000954308297233843 0,000974105512228389 38193 41778 623 665 0 True 443 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 491 444 0,000951251833746221 0,000952140020456268 0,00064087891966125 0,000610360875867857 0,000937999253582266 0,000965528002243191 38838 41495 623 665 0 True 488 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 535 444 0,00094706356288854 0,000886744212327569 0,000656137941557946 0,000625619897764553 0,000889975186641183 0,000862383307205812 38667 38645 623 665 0 True 532 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 579 444 0,000912504205109666 0,000915495422006607 0,000579842832074464 0,000549324788281071 0,000931812085679632 0,000977237588774814 37256 39898 623 665 0 True 576 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 624 444 0,000948116753805969 0,000953608557901965 0,000579842832074464 0,000610360875867857 0,000966540926384772 0,000941028273283381 38710 41559 623 665 0 True 620 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 668 444 0,000847010425732834 0,000888281587466033 0,000457770656900893 0,0004272526131075 0,000921429170264467 0,00102492403439804 34582 38712 623 665 0 True 665 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 267 483 0,000922962635847851 0,000971299844943097 0,000747692072938125 0,00080872816052491 0,000754203955064616 0,000785918085617723 37683 42330 623 665 0 False 267 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 314 489 0,000926808007337067 0,000959735112558232 0,000793469138628214 0,000762951094834821 0,00078720542580251 0,000871271502160007 37840 41826 623 665 0 True 311 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 359 489 0,000948557624422567 0,000936513864198147 0,000793469138628214 0,000762951094834821 0,000795438671826918 0,000805962295904532 38728 40814 623 665 0 True 355 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 403 488 0,000996588028819712 0,000927977990295033 0,000732433051041428 0,000671396963454643 0,000886474670256162 0,000861309508188522 40689 40442 623 665 0 True 399 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 447 489 0,000867902794397171 0,000965035614901295 0,000503547722590982 0,000518806744487678 0,000908661709783332 0,00104469354166056 35435 42057 623 665 0 True 443 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 490 488 0,000923452492088516 0,000916619770988469 0,000610360875867857 0,000518806744487678 0,000945832087906954 0,00094526399939173 37703 39947 623 665 0 True 488 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 533 487 0,000882353553496771 0,000839521555089371 0,000625619897764553 0,000595101853971161 0,000863354652048839 0,00080391833455677 36025 36587 623 665 0 True 532 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 578 488 0,000951815168422985 0,000943466471167619 0,00064087891966125 0,000595101853971161 0,000920718002925711 0,000993022334656915 38861 41117 623 665 0 True 576 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 622 487 0,000889358497738273 0,000887226076176938 0,000518806744487678 0,000518806744487678 0,000915870420221662 0,000902121363130465 36311 38666 623 665 0 True 620 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 666 488 0,000992669178894397 0,000935205948035573 0,000625619897764553 0,000579842832074464 0,000988993659678072 0,00097053623618802 40529 40757 623 665 0 True 665 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 270 533 0,000965114765357024 0,00101604434524168 0,000839246204318303 0,000854505226215 0,000757996382852249 0,000793750458016599 39404 44280 623 665 0 True 267 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 314 533 0,000902633601860278 0,000910217865561133 0,000762951094834821 0,000732433051041428 0,000762687312364643 0,00079466342581998 36853 39668 623 665 0 True 311 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 357 532 0,000881055434459011 0,000894063953658465 0,000701915007248035 0,000732433051041428 0,000749817147180818 0,000787317982934575 35972 38964 623 665 0 True 355 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 402 532 0,000962420556033369 0,000875730181484841 0,000701915007248035 0,000686655985351339 0,000857441451074729 0,000808539667420565 39294 38165 623 665 0 True 399 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 445 532 0,000947161534136673 0,000997251655116275 0,000534065766384375 0,000549324788281071 0,000959582633826153 0,00111942822358763 38671 43461 623 665 0 True 443 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 490 533 0,00100408282930188 0,000940850638842471 0,000625619897764553 0,000595101853971161 0,00105028440038498 0,00100021345672431 40995 41003 623 665 0 True 488 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 534 533 0,000861020314215836 0,000793698597604104 0,000457770656900893 0,000381475547417411 0,000944718893484066 0,000904075705917552 35154 34590 623 665 0 True 532 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 579 533 0,000935282520300561 0,000909575380428641 0,000610360875867857 0,000610360875867857 0,000894754071910784 0,000880457989900307 38186 39640 623 665 0 True 576 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 622 532 0,000846398105432004 0,000963842428226666 0,000564583810177768 0,000564583810177768 0,000846563074034291 0,000998706075660991 34557 42005 623 665 0 True 620 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 666 532 0,000869886712171862 0,000930502039029825 0,000457770656900893 0,000503547722590982 0,000951606707106883 0,00100369209306904 35516 40552 623 665 0 True 665 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 267 569 0,00098554177059273 0,000921438409482163 0,000823987182421607 0,00080872816052491 0,000742741124982328 0,000651268866618638 40238 40157 623 665 0 False 267 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 311 569 0,000911402028568171 0,000956935713052372 0,00080872816052491 0,000839246204318303 0,000718942147231965 0,000747443640299332 37211 41704 623 665 0 False 311 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 355 569 0,000975377253598943 0,000905536902452974 0,000869764248111696 0,000747692072938125 0,000731104423863538 0,000728197357951419 39823 39464 623 665 0 False 355 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 399 569 0,00096386563194333 0,000968293932358936 0,000778210116731518 0,000793469138628214 0,000817748431368621 0,000755863463990272 39353 42199 623 665 0 False 399 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 443 569 0,00098181886316368 0,000921208950506273 0,000625619897764553 0,000488288700694286 0,000953496970817755 0,00103741425510746 40086 40147 623 665 0 False 443 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 488 569 0,00100687500987366 0,000920153439217178 0,000610360875867857 0,000473029678797589 0,00110862539584994 0,00103714978486381 41109 40101 623 665 0 False 488 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 535 576 0,00093337208096197 0,00087013138247312 0,000564583810177768 0,000457770656900893 0,00100577777971807 0,000929491991863432 38108 37921 623 665 0 True 532 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 576 569 0,000910765215455307 0,000967743230816799 0,000656137941557946 0,000701915007248035 0,00082739099486183 0,000873258913351986 37185 42175 623 665 0 False 576 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 623 577 0,000888574727753209 0,000876234991231799 0,000671396963454643 0,000656137941557946 0,000776157277210729 0,000787768317458929 36279 38187 623 665 0 True 620 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 668 577 0,000906038102732896 0,000900465859085801 0,000610360875867857 0,000656137941557946 0,000850597199380624 0,000847229887366606 36992 39243 623 665 0 True 665 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 267 613 0,000998718903466602 0,000984654357339905 0,000885023270008392 0,000869764248111696 0,000717578113622583 0,000734087035547825 40776 42912 623 665 0 False 267 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 311 613 0,000927224385141632 0,000963154051298996 0,000839246204318303 0,000869764248111696 0,000705373758586799 0,000715986052948768 37857 41975 623 665 0 False 311 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 355 613 0,000908144484567753 0,000885826376424008 0,000823987182421607 0,000717174029144732 0,00067323408430399 0,000744356578279455 37078 38605 623 665 0 False 355 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 399 613 0,000928008155126695 0,000958014170239056 0,000762951094834821 0,000839246204318303 0,000721581733932192 0,000723227633976788 37889 41751 623 665 0 False 399 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 443 613 0,000870939903089291 0,000953769179185088 0,000534065766384375 0,000656137941557946 0,000913155933738404 0,000954430922149423 35559 41566 623 665 0 False 443 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 488 613 0,000900233306281022 0,000882109141014587 0,000488288700694286 0,000442511635004196 0,00100192457679187 0,000991584647626395 36755 38443 623 665 0 False 488 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 532 613 0,000995706287586516 0,000841540794077205 0,000579842832074464 0,000305180437933928 0,00105549369360398 0,00101313210817962 40653 36675 623 665 0 False 532 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 576 613 0,0009412097808126 0,00084842456335391 0,000686655985351339 0,000564583810177768 0,000861897432496665 0,000876431328902478 38428 36975 623 665 0 False 576 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 620 613 0,00103122086503469 0,000944476090661536 0,000854505226215 0,000778210116731518 0,000787718787086954 0,000716527552148279 42103 41161 623 665 0 False 620 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 664 613 0,000865086121013351 0,000906408846561356 0,000656137941557946 0,000671396963454643 0,000773713848828181 0,000805452993478469 35320 39502 623 665 0 False 664 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 267 662 0,00116813568430039 0,0698231961226022 0,00108339055466545 0,0710154879072251 0,000780306219420756 0,0269473783876991 47693 3042949 623 665 0 True 267 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 311 656 0,00103278840500481 0,000892526578520001 0,000900282291905089 0,000762951094834821 0,000708000833753786 0,000651567316073607 42167 38897 623 665 0 False 311 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 355 656 0,000895212279814212 0,000884105434104832 0,000747692072938125 0,000778210116731518 0,00066725722375123 0,000601479759124916 36550 38530 623 665 0 False 355 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 399 656 0,00091451261569639 0,000884472568466256 0,000793469138628214 0,000762951094834821 0,000660198635784862 0,000692375303913101 37338 38546 623 665 0 False 399 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 443 656 0,000882892395361502 0,000942319176288168 0,000656137941557946 0,000747692072938125 0,000758814027556849 0,000837837822985225 36047 41067 623 665 0 False 443 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 488 656 0,000922668722103453 0,00088135192639415 0,000656137941557946 0,000625619897764553 0,000838281094721496 0,00078931997648683 37671 38410 623 665 0 False 488 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 532 656 0,000881569783511708 0,000919579791777452 0,000534065766384375 0,000595101853971161 0,000890182358190223 0,000837133862521351 35993 40076 623 665 0 False 532 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 576 656 0,000915786241922117 0,000961479000774998 0,000747692072938125 0,000823987182421607 0,000756411862582273 0,000696020327339154 37390 41902 623 665 0 False 576 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 620 656 0,000929330766976489 0,000903012853718182 0,000793469138628214 0,000762951094834821 0,000698418795518673 0,000696516352296529 37943 39354 623 665 0 False 620 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 663 661 0,00101858257402554 0,0731139131876384 0,000854505226215 0,0737926298924239 0,00074782575489802 0,0256785209631757 41587 3186361 623 665 0 True 664 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C8_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C8_1.csv new file mode 100755 index 0000000..01f7511 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C8_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 239 244 0,0111295919904548 0,046620419210076 0,0111238269626917 0,0463569085221637 0,00178529811135666 0,00818651568494399 486495 2031754 667 665 0 True 238 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 282 244 0,0112238913731507 0,0109803921568627 0,0110933089188983 0,0109864957656214 0,00211191317860458 0,00150351411438426 490617 478534 667 665 0 False 282 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 327 243 0,0113373160066797 0,0644259997670991 0,0111238269626917 0,0638895246814679 0,0023825101493412 0,0105224827459272 495575 2807735 667 665 0 True 327 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 371 242 0,0111384911801366 0,0969797577027944 0,0110933089188983 0,0931258106355383 0,00125474971306886 0,0245624375922003 486884 4226453 667 665 0 True 371 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 415 241 0,0110399366579013 0,0767523064929433 0,0110933089188983 0,0748149843595026 0,00141516248818347 0,0192820310663268 482576 3344925 667 665 0 True 415 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 459 242 0,0109229660747562 0,0708935534074371 0,0109712367437247 0,0725566491187915 0,0017213320422294 0,0210541229652485 477463 3089596 667 665 0 True 459 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 504 243 0,0109459804316199 0,0823796960930594 0,0108949416342412 0,0795757991912718 0,00161975110988472 0,023114508515355 478469 3590171 667 665 0 True 504 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 547 242 0,0110699285285258 0,100333621877996 0,0110627908751049 0,0744792858777752 0,00151337613253866 0,128226057087509 483887 4372617 667 665 0 True 548 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 592 244 0,010713686416119 0,0193561266407034 0,0107270923933776 0,011108567940795 0,00189893406936109 0,0394294026695409 468315 843555 667 665 0 False 592 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 635 243 0,0107550482026096 0,0472488385073464 0,0107270923933776 0,0473182269016556 0,00175471273761189 0,00877588054896456 470123 2059141 667 665 0 True 636 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 238 287 0,0110317466581427 0,0111047359758976 0,0110017547875181 0,0111238269626917 0,00155223237569642 0,00160085648590245 482218 483953 667 665 0 False 238 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 282 287 0,0109644422467183 0,0109331694996245 0,0109712367437247 0,0110627908751049 0,00147417120725223 0,00141914544166417 479276 476476 667 665 0 False 282 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 327 286 0,0114331024005049 0,0962145808558935 0,0113679713130388 0,0927748531319142 0,0015043977471212 0,0225083404832377 499762 4193106 667 665 0 True 327 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 372 287 0,0110786447014533 0,0518584628199017 0,0110780498970016 0,0510566872663462 0,00137873748483664 0,00689456651267669 484268 2260032 667 665 0 True 371 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 415 286 0,0111648913469564 0,0847638895820462 0,0112916762035554 0,0789806973373007 0,00156340186793419 0,0240170992505648 488038 3694076 667 665 0 True 415 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 460 288 0,0109025139524538 0,0423496140213202 0,010955977721828 0,0433356221866178 0,00180071160585187 0,00734521632336629 476569 1845629 667 665 0 True 459 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 503 287 0,0109745081682093 0,0470394113000515 0,0110170138094148 0,0495155260547799 0,00167447707879408 0,010159013620655 479716 2050014 667 665 0 True 504 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 548 287 0,0108953534219386 0,0608732864433916 0,0109712367437247 0,0568856336308843 0,00156732106934578 0,0195005827063712 476256 2652905 667 665 0 True 548 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 592 287 0,0109395977223107 0,0107843424078622 0,0109864957656214 0,0108339055466545 0,00203600148551804 0,00197097827575273 478190 469990 667 665 0 False 592 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 636 287 0,0105255680697074 0,0107331960021363 0,0105287251087205 0,0107423514152743 0,00189987470729486 0,00199343503888537 460092 467761 667 665 0 False 636 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 240 332 0,0121393869327639 0,0542158784464021 0,0112306401159686 0,0531929503318837 0,00646733267786223 0,00982620479677693 530635 2362770 667 665 0 True 238 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 284 332 0,0110327990044804 0,0674488005318859 0,0110780498970016 0,0677958342870222 0,00141869382345237 0,0216419783196957 482264 2939471 667 665 0 True 282 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 328 331 0,0109892181398429 0,0407737356667017 0,0110322728313115 0,0410467689021134 0,00133382654932939 0,00705150363404297 480359 1776951 667 665 0 True 327 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 372 331 0,0110514209592389 0,0374205369225306 0,0110627908751049 0,037247272449836 0,00127748231540104 0,00575917329953974 483078 1630816 667 665 0 True 371 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 416 331 0,0110354527474189 0,0721269871864371 0,0110780498970016 0,0691233691920348 0,00158654096160559 0,0128482879659934 482380 3143350 667 665 0 True 415 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 461 331 0,0109656318556217 0,0343824771358472 0,0108949416342412 0,0351415274280919 0,00186620069165056 0,00493847506459641 479328 1498415 667 665 0 True 459 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 505 332 0,0111286769066828 0,0318191450243829 0,0110933089188983 0,0314793621728847 0,00189016213797723 0,00537273001368679 486455 1386703 667 665 0 True 504 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 548 330 0,011041835456728 0,0516701917301838 0,010955977721828 0,0524452582589456 0,00176612153203372 0,00760718254465304 482659 2251827 667 665 0 True 548 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 593 331 0,0108719959086605 0,0578127167311733 0,010757610437171 0,057953765163653 0,00195837940794032 0,0127371792578626 475235 2519523 667 665 0 True 592 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 637 330 0,0107677678670392 0,0648634862505313 0,010757610437171 0,0635538261997406 0,00189980295524087 0,0180108647917468 470679 2826801 667 665 0 True 636 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 240 376 0,0111539332187877 0,0458562749285666 0,0111696040283818 0,0483863584344244 0,00167124025027459 0,00938933461170244 487559 1998452 667 665 0 True 238 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 284 376 0,0111914974076249 0,0351192010697377 0,0111696040283818 0,0339360646982528 0,00143673282761142 0,00601768652774166 489201 1530522 667 665 0 True 282 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 328 375 0,0111989324632717 0,0864619318954287 0,0112916762035554 0,0845197222858015 0,00142572570251739 0,0185566187031513 489526 3768078 667 665 0 True 327 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 372 375 0,0113142101414388 0,067365942895692 0,0112458991378653 0,0659800106813153 0,00151129114263785 0,0168556570038701 494565 2935860 667 665 0 True 371 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 416 375 0,0112254241384686 0,0438307717106912 0,011261158159762 0,0450293736171511 0,0016515940855862 0,0070079979510811 490684 1910179 667 665 0 True 415 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 460 375 0,0111736990282611 0,0550336702364747 0,0112001220721752 0,0549935149156939 0,00176200521430458 0,00838082517677936 488423 2398410 667 665 0 True 459 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 504 376 0,0116580299916419 0,0421232986333997 0,0115205615320058 0,0426031891355764 0,00211234598559263 0,00479913603939613 509594 1835766 667 665 0 True 504 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 548 375 0,0112792996955402 0,0540069331029565 0,0111848630502785 0,0527199206530861 0,00185228986820879 0,00915251404120274 493039 2353664 667 665 0 True 548 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 592 375 0,0108920133661711 0,0433034061464029 0,0108491645685512 0,0435339894712749 0,00196807351499668 0,0071032413386912 476110 1887196 667 665 0 True 592 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 636 375 0,0108015573353172 0,0867055943819264 0,0105897611963073 0,0801098649576562 0,00192047387530966 0,0180063481930942 472156 3778697 667 665 0 True 636 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 240 420 0,0108345689823891 0,0490524090037408 0,0108949416342412 0,0486915388723583 0,00164628946755988 0,00743096712335923 473599 2137742 667 665 0 True 238 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 284 420 0,0111294318507947 0,0584127290072285 0,0110322728313115 0,0574959945067521 0,00176886314300868 0,00760929503221132 486488 2545672 667 665 0 True 282 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 328 420 0,0114821737677739 0,0364767033170016 0,0113527122911421 0,0367895017929351 0,00180181217315145 0,00348512080981937 501907 1589683 667 665 0 True 326 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 372 420 0,0114334455569194 0,0553715256325754 0,0113832303349355 0,0541084916456855 0,00148367702090872 0,0109010296060016 499777 2413134 667 665 0 True 371 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 415 419 0,0115382455258981 0,100411614983901 0,0114747844663157 0,0981765468833448 0,00169454783551249 0,0236989808574242 504358 4376016 667 665 0 True 415 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 460 420 0,0115792412788799 0,0625055658142839 0,0115358205539025 0,0608377203021286 0,0018444411251864 0,0139540272292656 506150 2724041 667 665 0 True 459 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 504 419 0,0114376778193645 0,0548017560495425 0,0114442664225223 0,0536202029449912 0,00187633536690438 0,00908842663530284 499962 2388303 667 665 0 True 503 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 549 420 0,0118504034775929 0,0325479526236052 0,0115815976195926 0,0330205233844511 0,00280309879308109 0,00473808987886368 518003 1418465 667 665 0 True 548 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 593 420 0,0111837649497522 0,0451247597134287 0,0112153810940719 0,0435034714274815 0,00186570002224752 0,010339298145309 488863 1966572 667 665 0 True 592 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 636 418 0,0109937478045139 0,0737454301810833 0,0109102006561379 0,0728770885786221 0,00193779880675922 0,0146528279077499 480557 3213883 667 665 0 True 636 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 239 465 0,0111562895595004 0,0652942036941748 0,0111543450064851 0,063431754024567 0,00147563737794443 0,0198720241357218 487662 2845572 667 665 0 True 238 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 283 464 0,0113303384929188 0,0624433824318177 0,0112001220721752 0,0600289921416037 0,00188190808970854 0,0122914598505111 495270 2721331 667 665 0 True 282 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 327 464 0,0112853621255291 0,070602507642418 0,011261158159762 0,0691081101701381 0,00162114738537999 0,0184775041136738 493304 3076912 667 665 0 True 326 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 371 463 0,0116985224485491 0,0899288046162557 0,011612115663386 0,085297932402533 0,00193082178242586 0,0264178430357829 511364 3919167 667 665 0 True 371 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 416 463 0,0116856197673651 0,0985801881678332 0,0116578927290761 0,0916914625772488 0,00191593531686388 0,0353090819941981 510800 4296201 667 665 0 True 415 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 459 464 0,011669102505282 0,0505674348379532 0,0114442664225223 0,051117723353933 0,00270933676900899 0,00962899703606371 510078 2203768 667 665 0 True 459 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 504 464 0,0119847148982158 0,0500134061406664 0,0116426337071794 0,0506752117189288 0,00257840223027318 0,0107362871506539 523874 2179623 667 665 0 True 503 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 548 464 0,0118998866325592 0,10699612386425 0,011612115663386 0,105531395437552 0,00279634356958169 0,020529188524007 520166 4662974 667 665 0 True 548 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 592 463 0,0113082163427327 0,068090023640011 0,0112001220721752 0,068711375600824 0,00194651373925736 0,0198561975778979 494303 2967416 667 665 0 True 592 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 636 464 0,0112091585244228 0,0810780441605272 0,0112916762035554 0,0782024872205692 0,00193409843285284 0,0138987330362079 489973 3533444 667 665 0 True 636 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 239 509 0,0110105853459171 0,0524222435236638 0,0110017547875181 0,0548256656748302 0,00142530189472753 0,0117815852755559 481293 2284602 667 665 0 True 238 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 284 508 0,0113245505880614 0,115543401878466 0,0112916762035554 0,108537422751202 0,00161452616443675 0,0335153795613165 495017 5035471 667 665 0 True 282 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 327 508 0,0112821822094217 0,0606558970096333 0,0113679713130388 0,0612039368276493 0,00154756569836595 0,0164803491252012 493165 2643431 667 665 0 True 326 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 372 508 0,0117722782005655 0,0594979093419059 0,0116578927290761 0,0585183489738308 0,00179363079003319 0,00864050584121784 514588 2592965 667 665 0 True 371 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 416 508 0,0114963346891443 0,0608590370409888 0,0114747844663157 0,0598764019226368 0,00179239050258183 0,00932365339345005 502526 2652284 667 665 0 True 415 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 461 509 0,0115490435144067 0,0658620458218102 0,0116884107728695 0,0650034332799268 0,00199820491916006 0,0155452126348049 504830 2870319 667 665 0 True 459 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 504 508 0,0114103396916785 0,0754264695843523 0,0113374532692454 0,0713817044327459 0,00198602864324295 0,0213762767572235 498767 3287144 667 665 0 True 503 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 548 508 0,0111674078273292 0,0612905346451503 0,0112001220721752 0,060318913557641 0,00177311632929487 0,0150739255919925 488148 2671089 667 665 0 True 548 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 592 508 0,0110589475232629 0,0472539783884064 0,0110475318532082 0,0454566262302586 0,00186665917040214 0,00798235149409631 483407 2059365 667 665 0 True 592 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 637 508 0,0108794309643073 0,065596240544139 0,0108949416342412 0,0653391317616541 0,00192327347365886 0,0149733522120141 475560 2858735 667 665 0 True 636 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 240 553 0,0111739506762984 0,0449245338110669 0,0108949416342412 0,0462195773250935 0,00238412335414081 0,00849611091354195 488434 1957846 667 665 0 True 238 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 283 553 0,0112839208685884 0,0525238938499832 0,0110627908751049 0,0530708781567102 0,00195777593385537 0,011583620027974 493241 2289032 667 665 0 True 282 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 328 553 0,011212933244982 0,0522967983015447 0,0112153810940719 0,0525673304341192 0,00149931382350209 0,00882184708228939 490138 2279135 667 665 0 True 326 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 372 553 0,0115591780671806 0,0510934465942838 0,0115663385976959 0,0503700312809949 0,00153467255529778 0,00729315302417878 505273 2226692 667 665 0 True 371 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 416 551 0,0120543985274472 0,089742529819628 0,0119020370794232 0,0849927519645991 0,00238839892028291 0,022703951703105 526920 3911049 667 665 0 True 415 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 460 553 0,0116067624233203 0,0657824923948691 0,0115205615320058 0,0644541084916457 0,00206963625082863 0,0136148579331848 507353 2866852 667 665 0 True 459 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 504 552 0,0114398282662285 0,0578485582232074 0,0113984893568322 0,0581216144045167 0,00220379709143999 0,0104626181649444 500056 2521085 667 665 0 True 503 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 548 552 0,0110516268530875 0,039350172180279 0,0110322728313115 0,0406347753109026 0,00193474716883554 0,00798863340685134 483087 1714911 667 665 0 True 548 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 592 552 0,0108932487292632 0,0525558345394271 0,0109102006561379 0,0524147402151522 0,00172833405209638 0,0122142931511529 476164 2290424 667 665 0 True 592 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 636 551 0,0110378319652259 0,0552277925300778 0,0110475318532082 0,0535591668574044 0,00192286174665062 0,0108844626595243 482484 2406870 667 665 0 True 636 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 238 591 0,0109781456262027 0,0106010505779211 0,0107423514152743 0,010605020218204 0,00178108985614994 0,00127634401211429 479875 462002 667 665 0 False 238 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 282 591 0,0108031587319181 0,0107118333714809 0,0107423514152743 0,0107270923933776 0,00158293588128745 0,00140392678298982 472226 466830 667 665 0 False 282 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 328 596 0,0109180246223878 0,0771346769303667 0,0109254596780346 0,0732433051041428 0,00151695441932358 0,0145868325066513 477247 3361589 667 665 0 True 326 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 372 596 0,0111409161521322 0,0773095476158926 0,0110933089188983 0,0743572137026017 0,0013684807786257 0,0220871904505535 486990 3369210 667 665 0 True 371 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 415 591 0,0113206614820308 0,0110731853667127 0,0111543450064851 0,011108567940795 0,00214197374778438 0,00168477059826301 494847 482578 667 665 0 False 415 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 459 591 0,0111551914589741 0,0111739637489237 0,0111238269626917 0,0113374532692454 0,00203084200890717 0,00193223856092269 487614 486970 667 665 0 False 459 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 503 591 0,0109924438101389 0,0109448489614974 0,0110170138094148 0,0109864957656214 0,00200802184185147 0,00221099336646035 480500 476985 667 665 0 False 503 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 548 591 0,0109422972194379 0,0107430627380995 0,010955977721828 0,0107270923933776 0,00197761876381217 0,00187058483918272 478308 468191 667 665 0 False 548 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 592 591 0,010643339351153 0,0107083685409449 0,0106660563057908 0,0107118333714809 0,00168428764009564 0,0017117018857484 465240 466679 667 665 0 False 592 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 636 591 0,0106960939306039 0,0107562336833156 0,0107881284809644 0,0107423514152743 0,00166263756665781 0,0014834978277233 467546 468765 667 665 0 False 636 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 240 641 0,0105366405833476 0,0445458347172578 0,0104371709773404 0,0440527962157626 0,00145832371786176 0,00839472675982008 460576 1941342 667 665 0 True 238 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 282 634 0,010488598685322 0,0104543804005321 0,0104219119554437 0,0104676890211337 0,00137169532847117 0,00138283086585311 458476 455610 667 665 0 False 282 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 326 634 0,011242421819532 0,0105155082717093 0,0106355382619974 0,0104829480430304 0,00388939295830084 0,00133455232020011 491427 458274 667 665 0 False 326 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 371 634 0,0111661038329542 0,0106173651111069 0,0107118333714809 0,0105745021744106 0,00269861155032586 0,00131771516105001 488091 462713 667 665 0 False 371 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 415 634 0,0106933715563825 0,0106980199411323 0,0107118333714809 0,0106507972838941 0,00159426191342812 0,00148030892003947 467427 466228 667 665 0 False 415 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 459 634 0,0109928098436476 0,0109318386375644 0,0110475318532082 0,010757610437171 0,00194699847138274 0,0020497084339361 480516 476418 667 665 0 False 459 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 503 634 0,0107062284833779 0,0106977445903612 0,010757610437171 0,0107423514152743 0,00194373451513223 0,00182977683574019 467989 466216 667 665 0 False 503 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 548 634 0,0107764154086838 0,0107221360794984 0,0106965743495842 0,0107881284809644 0,00194820090013637 0,00179967898890057 471057 467279 667 665 0 False 548 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 592 634 0,010679668176898 0,0111142585233971 0,0106660563057908 0,0107270923933776 0,00148606869108238 0,00258662305213347 466828 484368 667 665 0 False 592 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 637 640 0,0107379590131691 0,0452579147571378 0,0107881284809644 0,0456855115587091 0,001401613255721 0,0080752283358424 469376 1972375 667 665 0 True 636 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C8_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C8_2.csv new file mode 100755 index 0000000..de91106 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C8_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 239 244 0,0095637235170467 0,711340057628622 0,00892652780956741 0,691340505073625 0,00333664379791003 0,174266600940807 418048 31000751 667 665 9 True 238 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 282 244 0,00756012472134269 0,00730436757951184 0,00733958953231098 0,00733958953231098 0,00177202876199725 0,00137706662593802 330467 318330 667 665 0 False 282 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 327 243 0,00708871931624025 0,0068182816849861 0,00694285496299687 0,00692759594110018 0,00192392583336807 0,00117926103628007 309861 297146 667 665 0 True 327 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 371 242 0,00695111359403841 0,00702229366045005 0,00697337300679027 0,00701915007248035 0,00125687934899545 0,0011464028381019 303846 306037 667 665 0 True 371 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 415 241 0,00696275803503604 0,00713904238738297 0,00689707789730678 0,00714122224765393 0,00139260535460767 0,00144797270422338 304355 311125 667 665 0 True 415 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 459 242 0,00690815041094696 0,00718458999409717 0,00694285496299687 0,00721751735713741 0,00160365159962023 0,00145646369460615 301968 313110 667 665 0 True 459 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 504 243 0,00719436573770794 0,00720799480963796 0,0072327763790341 0,0072480354009308 0,00155349398641608 0,00149368002910263 314479 314130 667 665 0 True 504 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 547 242 0,00742794087048945 0,0177238243239135 0,00743114366369116 0,00782787823300526 0,0015223897862809 0,0404483329636496 324689 772418 667 665 0 True 548 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 592 244 0,00842149307584706 0,010808642113409 0,00825513084611276 0,00836194399938964 0,00214319881735838 0,0108752394233985 368119 471049 667 665 0 False 592 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 635 243 0,00965365337473172 0,742599988182863 0,00959792477302205 0,762798504615854 0,00186509246387128 0,183063423647176 421979 32363083 667 665 10 True 636 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 238 287 0,00803857627148888 0,00707837343415761 0,00735484855420768 0,00709544518196384 0,0034754679242978 0,00143989142723279 351381 308481 667 665 0 False 238 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 282 287 0,00693198834320537 0,00690680695788453 0,00692759594110018 0,00683604180972 0,00127154923417875 0,0012945669841987 303010 301004 667 665 0 False 282 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 327 286 0,00699673052006842 0,00704090278339474 0,00704966811627375 0,00706492713817044 0,00131893565334709 0,00122935823404856 305840 306848 667 665 0 True 327 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 372 287 0,00712575733190855 0,00713656423044336 0,00709544518196384 0,00718699931334401 0,00127889048507852 0,00126532997685373 311480 311017 667 665 0 True 371 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 415 286 0,00702470920639474 0,00696552550981482 0,00700389105058366 0,00698863202868696 0,00146545941265508 0,00141289209400697 307063 303563 667 665 0 True 415 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 460 288 0,00724595358534969 0,00720521835602969 0,0072632944228275 0,00714122224765393 0,00167387242527946 0,00180238979979433 316734 314009 667 665 0 True 459 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 503 287 0,00733689003518383 0,00736014905655074 0,00730907148851759 0,00735484855420768 0,00159873586422014 0,00160364199437686 320709 320761 667 665 0 True 504 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 548 287 0,00750258882918349 0,0075156763504091 0,00749217975127794 0,00750743877317464 0,00159663937740435 0,001482008114883 327952 327539 667 665 0 True 548 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 592 287 0,00790799381723649 0,00778083914294778 0,00793469138628214 0,00782787823300526 0,00196692857526461 0,00193035063290995 345673 339095 667 665 0 False 592 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 636 287 0,00855065715025298 0,00838872186187602 0,00868238345922026 0,00840772106507973 0,00188563477225064 0,00201707800925536 373765 365587 667 665 0 False 636 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 240 332 0,00768672656118725 0,00672170240203392 0,00689707789730678 0,00674448767833982 0,00509176880630036 0,0014514120666321 336001 292937 667 665 0 True 238 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 284 332 0,00675260904681557 0,00699859054824059 0,00674448767833982 0,00700389105058366 0,00125830145307876 0,00147012451127515 295169 305004 667 665 0 True 282 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 328 331 0,00705483833958507 0,00690116226707763 0,00706492713817044 0,00688181887541009 0,00118562379231661 0,00120307273173183 308380 300758 667 665 0 True 327 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 372 331 0,00707892791988076 0,00743720138065466 0,00706492713817044 0,00737010757610437 0,00122863907038146 0,00132080713091832 309433 324119 667 665 0 True 371 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 416 331 0,0072686476628932 0,00753538687643806 0,00729381246662089 0,00749217975127794 0,00149628050841073 0,00135188093271662 317726 328398 667 665 0 True 415 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 461 331 0,0074371603394915 0,00780975097390994 0,00744640268558785 0,00749217975127794 0,0016302316417022 0,0024372808318517 325092 340355 667 665 0 True 459 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 505 332 0,00759428022312945 0,00740622441890948 0,00758373388265812 0,00744640268558785 0,0015222535495662 0,00168454925951055 331960 322769 667 665 0 True 504 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 548 330 0,00750190251635455 0,00741625177615588 0,00744640268558785 0,00746166170748455 0,00170181518645469 0,0014385735965294 327922 323206 667 665 0 True 548 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 593 331 0,00758991069811855 0,00758104921264021 0,0076752880140383 0,00755321583886473 0,00192021213776516 0,00212424811135503 331769 330388 667 665 0 True 592 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 637 330 0,00768885413095695 0,00778244535577901 0,00772106507972839 0,00799572747386892 0,00190760382168085 0,00182515707700562 336094 339165 667 665 0 True 636 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 240 376 0,00677054468874512 0,00687644953537426 0,00677500572213321 0,00685130083161669 0,00151870271190702 0,00147623822029276 295953 299681 667 665 0 True 238 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 284 376 0,00681659627956679 0,00674230781806886 0,00685130083161669 0,00671396963454643 0,00132351372589568 0,00129745308771376 297966 293835 667 665 0 True 282 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 328 375 0,00714739906311436 0,00911381222568896 0,00711070420386053 0,00813305867093919 0,00127666556433131 0,00379695087136188 312426 397187 667 665 0 True 327 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 372 375 0,00737333324640038 0,00752033436761967 0,00727855344472419 0,00753795681696803 0,00140461398177935 0,00133788797742994 322302 327742 667 665 0 True 371 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 416 375 0,00765147295887419 0,00925825665101183 0,00764476997024491 0,00799572747386892 0,0016026762620267 0,00560925407618878 334460 403482 667 665 0 True 415 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 460 375 0,00754417938661706 0,00760961685513853 0,00762951094834821 0,00759899290455482 0,00166149487672309 0,00168423934558039 329770 331633 667 665 0 True 459 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 504 376 0,00780962231175554 0,00754096272955219 0,00778210116731518 0,00753795681696803 0,00188125738408332 0,00179173395995336 341373 328641 667 665 0 True 504 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 548 375 0,00757247835226356 0,00783402773355912 0,00756847486076143 0,00781261921110857 0,00178152391158538 0,0016650700437041 331007 341413 667 665 0 True 548 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 592 375 0,00751743606338282 0,00765142428054572 0,00750743877317464 0,0076752880140383 0,00195161148061795 0,00199594005353699 328601 333455 667 665 0 True 592 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 636 375 0,00717450841985736 0,00717146494067625 0,00717174029144732 0,00717174029144732 0,0019277673688533 0,00177196541712685 313611 312538 667 665 0 True 636 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 240 420 0,00692006937707617 0,00676261493743514 0,00683604180972 0,00675974670023652 0,00153419806116396 0,00150841954596198 302489 294720 667 665 0 True 238 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 284 420 0,00701603878765584 0,00706483535458009 0,00698863202868696 0,00701915007248035 0,00142129941556127 0,00147918250156488 306684 307891 667 665 0 True 282 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 328 420 0,00736898659848377 0,00726058680691199 0,00730907148851759 0,0072327763790341 0,00140629874406881 0,00128996573029965 322112 316422 667 665 0 True 326 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 372 420 0,0074013805640096 0,00734718462441294 0,00741588464179446 0,00740062561989776 0,00134095253581977 0,00139862840032152 323528 320196 667 665 0 True 371 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 415 419 0,00758808053057472 0,00787796912744209 0,00761425192645151 0,00785839627679866 0,0015993546271908 0,00170456986120146 331689 343328 667 665 0 True 415 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 460 420 0,00761148379804147 0,00764350794587751 0,00758373388265812 0,00764476997024491 0,00163278889536794 0,00151219474797852 332712 333110 667 665 0 True 459 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 504 419 0,0076165625129756 0,00747196441550202 0,00762951094834821 0,00747692072938125 0,00170840488917269 0,00171711244011503 332934 325634 667 665 0 True 503 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 549 420 0,00767723256705362 0,00752258306558339 0,00744640268558785 0,00758373388265812 0,0024529503150308 0,00164677191831803 335586 327840 667 665 0 True 548 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 593 420 0,00699858356470655 0,00712387514907663 0,00704966811627375 0,00714122224765393 0,00178268884168112 0,00193192711931596 305921 310464 667 665 0 True 592 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 636 418 0,00664460628463521 0,00678048979165699 0,00666819256885634 0,00669871061264973 0,00188446906907962 0,00182940098271598 290448 295499 667 665 0 True 636 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 239 465 0,00705101786483732 0,00685763389935126 0,00706492713817044 0,00683604180972 0,00151241600135211 0,00150570409547652 308213 298861 667 665 0 True 238 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 283 464 0,0069805564143998 0,00700896209395083 0,00698863202868696 0,00704966811627375 0,0015642545568702 0,00151826014546893 305133 305456 667 665 0 True 282 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 327 464 0,00735940109597296 0,00750645209957831 0,00733958953231098 0,00740062561989776 0,00146931628032494 0,00156609808398723 321693 327137 667 665 0 True 326 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 371 463 0,00757945586602442 0,0075866939034471 0,00762951094834821 0,00755321583886473 0,00154538537157309 0,00170666508108327 331312 330634 667 665 0 True 371 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 416 463 0,00748767296370126 0,00733527570356424 0,00752269779507134 0,00729381246662089 0,00186497768178069 0,00166954268326863 327300 319677 667 665 0 True 415 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 459 464 0,00753219178920496 0,00742453524518552 0,00744640268558785 0,00737010757610437 0,00209420029405752 0,00186620271417191 329246 323567 667 665 0 True 459 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 504 464 0,00751718441534554 0,00765247979183482 0,00749217975127794 0,00761425192645151 0,00194050156034961 0,00180511497830677 328590 333501 667 665 0 True 503 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 548 464 0,00710903417597679 0,00695363953486371 0,00701915007248035 0,00700389105058366 0,00194178800438065 0,00179771663375168 310749 303045 667 665 0 True 548 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 592 463 0,00666345701033667 0,00677842466087397 0,00666819256885634 0,00669871061264973 0,00194519655238317 0,00189220953574506 291272 295409 667 665 0 True 592 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 636 464 0,0065369924330579 0,00679182506506596 0,00651560234988937 0,00683604180972 0,00182622034831533 0,00180779426879043 285744 295993 667 665 0 True 636 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 239 509 0,00725611101521796 0,00754812184959997 0,00727855344472419 0,00753795681696803 0,00142856946525289 0,00142762844103955 317178 328953 667 665 0 True 238 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 284 508 0,00706666579733708 0,00703108193922664 0,00708018616006714 0,00703440909437705 0,00156405739877043 0,00142085950126222 308897 306420 667 665 0 True 282 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 327 508 0,0072055983910082 0,00729782799869897 0,00715648126955062 0,00729381246662089 0,00152690251069061 0,00155183136948098 314970 318045 667 665 0 True 326 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 372 508 0,00746033483601527 0,00768733461027253 0,00741588464179446 0,0076752880140383 0,00157905502088066 0,00158207097407514 326105 335020 667 665 0 True 371 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 416 508 0,0074861630754776 0,00725271636403896 0,00752269779507134 0,00720225833524071 0,0018391013447924 0,00173835196203968 327234 316079 667 665 0 True 415 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 461 509 0,0071892870227738 0,00738024966283872 0,00720225833524071 0,00741588464179446 0,00188385597264595 0,00166383147449811 314257 321637 667 665 0 True 459 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 504 508 0,00708592831073591 0,00760264130227147 0,00703440909437705 0,00741588464179446 0,0017508816863383 0,00232424214031559 309739 331329 667 665 0 True 503 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 548 508 0,00686296814970862 0,0068134630464924 0,00688181887541009 0,00683604180972 0,0016695868604326 0,00160587174751792 299993 296936 667 665 0 True 548 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 592 508 0,00673453614232023 0,00675623597790539 0,00671396963454643 0,0068207827878233 0,00174524332949839 0,00175597579294992 294379 294442 667 665 0 True 592 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 637 508 0,00663833796079758 0,00682941044531677 0,00668345159075303 0,00683604180972 0,00177398743989192 0,00185014792131364 290174 297631 667 665 0 True 636 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 240 553 0,00735548911284802 0,00724234481832872 0,00729381246662089 0,00727855344472419 0,00166342686791267 0,00128468494942291 321522 315627 667 665 0 True 238 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 283 553 0,00724757785904484 0,00709188856783754 0,00721751735713741 0,00711070420386053 0,00162392380257245 0,0013478321647164 316805 309070 667 665 0 True 282 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 328 553 0,00724842431153386 0,00744307553043745 0,00733958953231098 0,00749217975127794 0,00139386982214521 0,00137004637762223 316842 324375 667 665 0 True 326 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 372 553 0,00725691171351838 0,00760064500918123 0,00735484855420768 0,00756847486076143 0,00138778431268038 0,00150031549439996 317213 331242 667 665 0 True 371 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 416 551 0,00769173664483849 0,00721673719661938 0,00758373388265812 0,00729381246662089 0,00192428809794629 0,00162551991597005 336220 314511 667 665 0 True 415 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 460 553 0,00719180350314657 0,00720804070143314 0,00714122224765393 0,00720225833524071 0,00203523463694122 0,00179595165438377 314367 314132 667 665 0 True 459 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 504 552 0,00718706794462691 0,00804138981007107 0,0072327763790341 0,00773632410162509 0,00195930522229603 0,0028805696611502 314160 350450 667 665 0 True 503 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 548 552 0,00695397323082565 0,0070046482652041 0,00697337300679027 0,00697337300679027 0,00181985692219837 0,00194648690233356 303971 305268 667 665 0 True 548 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 592 552 0,00689353194769061 0,00747648475732706 0,00692759594110018 0,00711070420386053 0,00153197096520787 0,0023237500469321 301329 325831 667 665 0 True 592 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 636 551 0,00698975300630756 0,00704315148135847 0,00698863202868696 0,00701915007248035 0,00167043273730556 0,00167441881496317 305535 306946 667 665 0 True 636 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 238 591 0,00763600804312881 0,0075403202444197 0,00759899290455482 0,00756847486076143 0,00153520256265901 0,00126917596462516 333784 328613 667 665 0 False 238 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 282 591 0,00735917232502998 0,00723770974701574 0,00732433051041428 0,00720225833524071 0,00148250436879296 0,0013412177514723 321683 315425 667 665 0 False 282 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 328 596 0,00726013738381439 0,00715606824339402 0,00730907148851759 0,00711070420386053 0,00144226546486198 0,00135493472279496 317354 311867 667 665 0 True 326 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 372 596 0,007050148535254 0,00763942357610667 0,00711070420386053 0,00753795681696803 0,00129758104091416 0,00155165045450621 308175 332932 667 665 0 True 371 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 415 591 0,00737701645858234 0,00693551227576839 0,00735484855420768 0,00691233691920348 0,00174168996812198 0,00152060350325391 322463 302255 667 665 0 False 415 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 459 591 0,00713399308585579 0,00717350712556167 0,00717174029144732 0,00715648126955062 0,0020496541625169 0,00183673428420831 311840 312627 667 665 0 False 459 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 503 591 0,00705525012728243 0,00704404637136444 0,00697337300679027 0,00695811398489357 0,00199749006890479 0,00208382339512439 308398 306985 667 665 0 False 503 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 548 591 0,0071034750420624 0,0069780998616936 0,00718699931334401 0,00704966811627375 0,00186529655607408 0,00175636460790076 310506 304111 667 665 0 False 548 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 592 591 0,00717142001212715 0,00690077218681861 0,00720225833524071 0,00692759594110018 0,00160035591016798 0,00156060089759009 313476 300741 667 665 0 False 592 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 636 591 0,00719951308392496 0,00710414167715007 0,00718699931334401 0,00717174029144732 0,00151514318477848 0,0014425129649932 314704 309604 667 665 0 False 636 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 240 641 0,00945123684438394 0,719612466735619 0,00903334096284428 0,708888380254826 0,00249238551421195 0,185674097156876 413131 31361269 667 665 10 True 238 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 282 634 0,00796674219539349 0,00747838926682694 0,0076752880140383 0,00737010757610437 0,00206972601102986 0,00143296011693345 348241 325914 667 665 0 False 282 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 326 634 0,00711839090754463 0,00708885970935579 0,00714122224765393 0,00708018616006714 0,00131622352500554 0,00124921487969257 311158 308938 667 665 0 False 326 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 371 634 0,0068664225909476 0,00692759594110018 0,00689707789730678 0,00692759594110018 0,00127776036249998 0,00124600248672117 300144 301910 667 665 0 False 371 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 415 634 0,00696991856555128 0,00684315503797259 0,00694285496299687 0,00685130083161669 0,00141104422228034 0,00148990966358701 304668 298230 667 665 0 False 415 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 459 634 0,00718837193900189 0,00716421403703812 0,00714122224765393 0,00717174029144732 0,00181663830914404 0,00182759020309875 314217 312222 667 665 0 False 459 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 503 634 0,00702020241881806 0,00694260255812339 0,00698863202868696 0,00697337300679027 0,00179365746166896 0,00177360697311173 306866 302564 667 665 0 False 503 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 548 634 0,00711875694105339 0,00690203421118601 0,00704966811627375 0,00694285496299687 0,0018318052331388 0,00169360349958226 311174 300796 667 665 0 False 548 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 592 634 0,00728745263440607 0,00735308172009332 0,00744640268558785 0,00718699931334401 0,00155200926000451 0,00165787320664959 318548 320453 667 665 0 False 592 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 637 640 0,00872909848577657 0,735919657234182 0,00881971465629053 0,725734340428778 0,00161870636038642 0,184557362344918 381565 32071949 667 665 13 True 636 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C8_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C8_3.csv new file mode 100755 index 0000000..f429502 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C8_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 239 244 0,00124817426489319 0,0705807090397085 0,00106813153276875 0,0673838406958114 0,000991429141368062 0,0197915284642926 54560 3075962 667 665 0 True 238 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 282 244 0,00108625019145268 0,00108194496311734 0,000976577401388571 0,000930800335698482 0,000768654898299468 0,000763062381567864 47482 47152 667 665 0 False 282 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 327 243 0,000900671202508153 0,000866666551937179 0,00080872816052491 0,000762951094834821 0,00063244401331063 0,000612872755682165 39370 37770 667 665 0 True 327 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 371 242 0,000916090364064935 0,00103492881895744 0,000793469138628214 0,000961318379491875 0,000641721859143484 0,000665211779933345 40044 45103 667 665 0 True 371 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 415 241 0,000904102766652838 0,000950946833781639 0,000762951094834821 0,000793469138628214 0,000684999257868074 0,000756786967538718 39520 41443 667 665 0 True 415 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 459 242 0,00100199385315353 0,00094181436654121 0,000793469138628214 0,000793469138628214 0,000819453186930234 0,000773430460772973 43799 41045 667 665 0 True 459 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 504 243 0,000982296674963045 0,000983988926309823 0,00080872816052491 0,00080872816052491 0,000841643066511048 0,000802472883873584 42938 42883 667 665 0 True 504 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 547 242 0,00092864988883448 0,0019482214347955 0,000778210116731518 0,000961318379491875 0,000758841538953433 0,00391629504679113 40593 84905 667 665 0 True 548 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 592 244 0,00104104505312004 0,00133132097811478 0,000717174029144732 0,00080872816052491 0,000996030126519062 0,00155999748897269 45506 58020 667 665 0 False 592 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 635 243 0,00116812731194485 0,0734160188752954 0,000885023270008392 0,0741741054398413 0,0010260079090215 0,0196468733109832 51061 3199527 667 665 0 True 636 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 238 287 0,00108055379497251 0,000945164467589206 0,000885023270008392 0,000747692072938125 0,00086935757239231 0,000744860552512032 47233 41191 667 665 0 False 238 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 282 287 0,00098245681462313 0,00102914645276501 0,000823987182421607 0,000900282291905089 0,000728365834477703 0,00075145958030275 42945 44851 667 665 0 False 282 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 327 286 0,000921855391828005 0,000875661343792073 0,000823987182421607 0,000778210116731518 0,000640368282802231 0,000651445180493635 40296 38162 667 665 0 True 327 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 372 287 0,000867911203473566 0,000900764155754458 0,000778210116731518 0,000823987182421607 0,000645951493983334 0,000635636834761235 37938 39256 667 665 0 True 371 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 415 286 0,000831582377728508 0,000868364548358766 0,00064087891966125 0,000686655985351339 0,000705782701826658 0,000715336101018124 36350 37844 667 665 0 True 415 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 460 288 0,00093592480482121 0,000907831492211876 0,000717174029144732 0,000579842832074464 0,000881128903822182 0,000940555620873203 40911 39564 667 665 0 True 459 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 503 287 0,00086363318683986 0,000912879589681459 0,000671396963454643 0,000686655985351339 0,000803186148409615 0,000802916418810213 37751 39784 667 665 0 True 504 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 548 287 0,000976417261728486 0,00104706719878203 0,000793469138628214 0,000839246204318303 0,000801634486473074 0,000851282779754132 42681 45632 667 665 0 True 548 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 592 287 0,000964544049787878 0,000924788510530159 0,000625619897764553 0,000473029678797589 0,000983218345898011 0,00100922416978423 42162 40303 667 665 0 False 592 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 636 287 0,00112166393342583 0,0010508991636794 0,000778210116731518 0,00064087891966125 0,00106343708337097 0,00111385671409214 49030 45799 667 665 0 False 636 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 240 332 0,00105326142147512 0,00095021256505879 0,000778210116731518 0,000778210116731518 0,000912550695319076 0,000770030045009727 46040 41411 667 665 0 True 238 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 284 332 0,00092375419065473 0,000896083192646299 0,00080872816052491 0,000717174029144732 0,000687078516050632 0,000702415807523006 40379 39052 667 665 0 True 282 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 328 331 0,000999294356026381 0,000860654726768856 0,000900282291905089 0,000747692072938125 0,000684820738363006 0,000596969600220776 43681 37508 667 665 0 True 327 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 372 331 0,000911126034602291 0,0010339650912587 0,00080872816052491 0,000946059357595178 0,000609083327107844 0,000667028502576002 39827 45061 667 665 0 True 371 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 416 331 0,000849906930261123 0,00089814832342931 0,000656137941557946 0,000656137941557946 0,000775588162929278 0,000790450422157475 37151 39142 667 665 0 True 415 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 461 331 0,000888409079964481 0,000982130308605113 0,00064087891966125 0,00080872816052491 0,000845224153241911 0,00082702572164462 38834 42802 667 665 0 True 459 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 505 332 0,000990669691476075 0,000952966072769472 0,000762951094834821 0,000717174029144732 0,000858647196578161 0,000866761153493487 43304 41531 667 665 0 True 504 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 548 330 0,00103441069577365 0,000930983902879194 0,000854505226215 0,00080872816052491 0,000846843535176429 0,000749468714950957 45216 40573 667 665 0 True 548 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 593 331 0,00108991052654035 0,0010410783195113 0,000747692072938125 0,000671396963454643 0,00107336918424138 0,00118066836833111 47642 45371 667 665 0 True 592 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 637 330 0,00102354407598215 0,000967789122611977 0,000717174029144732 0,00064087891966125 0,00102661591048082 0,000958394233315462 44741 42177 667 665 0 True 636 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 240 376 0,000951709999886758 0,0010063841223567 0,00080872816052491 0,00080872816052491 0,000803719950303126 0,000879153302868177 41601 43859 667 665 0 True 238 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 284 376 0,000916593660139488 0,000950051943775667 0,000732433051041428 0,000839246204318303 0,000743540687582822 0,000703202904333063 40066 41404 667 665 0 True 282 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 328 375 0,000880287711488728 0,00118352645174392 0,000793469138628214 0,00103761348897536 0,00068459745853743 0,000852791920866342 38479 51579 667 665 0 True 327 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 372 375 0,000931326508867333 0,000923549432060352 0,000793469138628214 0,000793469138628214 0,00071159691089755 0,000698889565254276 40710 40249 667 665 0 True 371 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 416 375 0,00100505938378945 0,00101735226140425 0,000823987182421607 0,000717174029144732 0,000814840038505332 0,000956962912225759 43933 44337 667 665 0 True 415 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 460 375 0,000966580111180391 0,000944476090661536 0,000656137941557946 0,000610360875867857 0,000934369760899942 0,000876828028257019 42251 41161 667 665 0 True 459 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 504 376 0,00100535678601532 0,00104995838187825 0,000717174029144732 0,000686655985351339 0,000971262124357485 0,000999830636677655 43946 45758 667 665 0 True 504 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 548 375 0,00104639829318575 0,00102570456812666 0,000793469138628214 0,000854505226215 0,000952879257114663 0,000889715520764829 45740 44701 667 665 0 True 548 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 592 375 0,000993346311508928 0,000952048236865912 0,000686655985351339 0,000534065766384375 0,000987762704342513 0,00103485641319689 43421 41491 667 665 0 True 592 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 636 375 0,000933362570259846 0,00095069442890816 0,000579842832074464 0,000595101853971161 0,000986259532824663 0,000961784767490884 40799 41432 667 665 0 True 636 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 240 420 0,000846658382870821 0,000953218477642951 0,000671396963454643 0,000762951094834821 0,000762753094129495 0,000823794588177411 37009 41542 667 665 0 True 238 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 284 420 0,000973260222715376 0,000970749143400961 0,000839246204318303 0,000854505226215 0,000748744723683923 0,000774570300227288 42543 42306 667 665 0 True 282 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 328 420 0,000915632822178977 0,000934884705469327 0,00080872816052491 0,000839246204318303 0,000684167781186573 0,000663271980353399 40024 40743 667 665 0 True 326 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 372 420 0,000979620054930191 0,000963773590533899 0,000854505226215 0,000869764248111696 0,00072524354491644 0,000681153639096872 42821 42002 667 665 0 True 371 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 415 419 0,000954615390862591 0,000889084693881648 0,000701915007248035 0,00064087891966125 0,000821205523740184 0,000788630870699633 41728 38747 667 665 0 True 415 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 460 420 0,000889575811773674 0,000929882499794921 0,000625619897764553 0,000732433051041428 0,000833935355558659 0,000791149446404466 38885 40525 667 665 0 True 459 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 504 419 0,00100414430001754 0,000958450142293247 0,000762951094834821 0,000671396963454643 0,000914200506559747 0,000904136440127002 43893 41770 667 665 0 True 503 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 549 420 0,00100199385315353 0,000960928299232861 0,000793469138628214 0,000762951094834821 0,000923932770136017 0,000813998838346595 43799 41878 667 665 0 True 548 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 593 420 0,00097669178686006 0,000936697431378859 0,000656137941557946 0,000442511635004196 0,000978518410220882 0,00108219390807496 42693 40822 667 665 0 True 592 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 636 418 0,000950566145171864 0,000857442301106394 0,00064087891966125 0,000473029678797589 0,000945358914495243 0,000925460888681727 41551 37368 667 665 0 True 636 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 239 465 0,000999179970554892 0,000972011167768357 0,000869764248111696 0,000854505226215 0,000810762422216247 0,000740848739149803 43676 42361 667 665 0 True 238 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 283 464 0,00104763365627784 0,000997136925628331 0,000976577401388571 0,000839246204318303 0,00079038626358758 0,000846552035198668 45794 43456 667 665 0 True 282 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 327 464 0,000966099692200135 0,000915472476109018 0,000823987182421607 0,000793469138628214 0,000788005028829978 0,000779343535519133 42230 39897 667 665 0 True 326 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 371 463 0,000940088435983427 0,00101386448497072 0,000823987182421607 0,000915541313801785 0,000733090203311927 0,000806036659879924 41093 44185 667 665 0 True 371 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 416 463 0,000993277680226035 0,000869167654774382 0,000762951094834821 0,000549324788281071 0,000961286432637658 0,000893503674774977 43418 37879 667 665 0 True 415 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 459 464 0,000945990726312284 0,000887822669514253 0,000503547722590982 0,000442511635004196 0,00103238923568078 0,0010179521538911 41351 38692 667 665 0 True 459 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 504 464 0,000956948854480976 0,000893559143911507 0,00064087891966125 0,000564583810177768 0,00097248137279559 0,000917665151842812 41830 38942 667 665 0 True 503 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 548 464 0,000889301286642099 0,000986421191454259 0,000549324788281071 0,000732433051041428 0,00092378807735587 0,000952509269977039 38873 42989 667 665 0 True 548 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 592 463 0,000895134945688062 0,000949799538902188 0,000473029678797589 0,000595101853971161 0,000996606634522886 0,000947754917984172 39128 41393 667 665 0 True 592 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 636 464 0,000977652624820572 0,00093084622749366 0,000625619897764553 0,000503547722590982 0,000967857992396126 0,000968359744811818 42735 40567 667 665 0 True 636 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 239 509 0,00100071273587285 0,000946931301703561 0,000854505226215 0,00080872816052491 0,000730606873510976 0,000757748923934571 43743 41268 667 665 0 True 238 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 284 508 0,000941232290698322 0,00101794885474157 0,00080872816052491 0,000869764248111696 0,000804008017727794 0,000833478556080742 41143 44363 667 665 0 True 282 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 327 508 0,000927460279930989 0,000951061563269584 0,000778210116731518 0,000762951094834821 0,000788424993490389 0,000830558885285033 40541 41448 667 665 0 True 326 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 372 508 0,000984813155335814 0,00101895847423549 0,000839246204318303 0,000900282291905089 0,000847552060429225 0,000800613100903431 43048 44407 667 665 0 True 371 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 416 508 0,000865211706346415 0,000860884185744746 0,000518806744487678 0,000564583810177768 0,000926042232680868 0,000835325560114057 37820 37518 667 665 0 True 415 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 461 509 0,000930640196038397 0,000837869450462962 0,000579842832074464 0,000503547722590982 0,000956807531638045 0,000835893073227198 40680 36515 667 665 0 True 459 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 504 508 0,000908975587738289 0,000854344604931876 0,000564583810177768 0,000549324788281071 0,000940512282616202 0,000829434744573752 39733 37233 667 665 0 True 503 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 548 508 0,000898589386927045 0,000970037820575701 0,000579842832074464 0,000747692072938125 0,000890212161895868 0,000878333560091894 39279 42275 667 665 0 True 548 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 592 508 0,000954455251202506 0,000968729904413127 0,000625619897764553 0,000625619897764553 0,000951332786875687 0,000985015887772084 41721 42218 667 665 0 True 592 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 637 508 0,000894311370293338 0,000931396929035796 0,000518806744487678 0,000473029678797589 0,000959233553273885 0,000975698425952337 39092 40591 667 665 0 True 636 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 240 553 0,00097811016670653 0,000961869081034011 0,000854505226215 0,000793469138628214 0,000717212790136873 0,000743487269404471 42755 41919 667 665 0 True 238 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 283 553 0,000989114049063818 0,000958450142293247 0,000854505226215 0,000854505226215 0,000741445927387825 0,000724596092476673 43236 41770 667 665 0 True 282 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 328 553 0,000873035672596295 0,0008983777824052 0,000732433051041428 0,000762951094834821 0,000698791886089459 0,00074205036397794 38162 39152 667 665 0 True 326 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 372 553 0,000914694861312763 0,000950097835570845 0,000778210116731518 0,000869764248111696 0,000713282138221023 0,000677746787484815 39983 41406 667 665 0 True 371 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 416 551 0,0009360391902927 0,000844087788709586 0,000671396963454643 0,000534065766384375 0,00091245502055848 0,000828186216516664 40916 36786 667 665 0 True 415 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 460 553 0,000933522709919931 0,00096235094488338 0,000534065766384375 0,00064087891966125 0,00103226729575262 0,00100318007037148 40806 41940 667 665 0 True 459 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 504 552 0,000953883323845059 0,00106546980864842 0,000610360875867857 0,000701915007248035 0,00102603100739069 0,00113861741119851 41696 46434 667 665 0 True 503 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 548 552 0,000957360642178339 0,000908473977344368 0,00064087891966125 0,000534065766384375 0,000941182106046737 0,000946751801488158 41848 39592 667 665 0 True 548 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 592 552 0,000918835615380682 0,00100145075437507 0,00064087891966125 0,00080872816052491 0,000897277258203912 0,000796311764672568 40164 43644 667 665 0 True 592 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 636 551 0,000978819356629765 0,000938165968824556 0,000717174029144732 0,00064087891966125 0,000926427025135378 0,000915308775618164 42786 40886 667 665 0 True 636 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 238 591 0,00106099387934781 0,00102084003783779 0,000946059357595178 0,000915541313801785 0,000702384839261414 0,000693106740632998 46378 44489 667 665 0 False 238 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 282 591 0,00100105589228732 0,000994521093303182 0,000915541313801785 0,000885023270008392 0,000718699454909254 0,000739896520340699 43758 43342 667 665 0 False 282 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 328 596 0,000841579667936689 0,000967743230816799 0,000671396963454643 0,000823987182421607 0,00071140855814104 0,000783555498233879 36787 42175 667 665 0 True 326 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 372 596 0,00100293181401975 0,000923618269753119 0,000869764248111696 0,000839246204318303 0,000737923549417511 0,000670874657213003 43840 40252 667 665 0 True 371 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 415 591 0,000908174889437863 0,000911479889928529 0,000686655985351339 0,000625619897764553 0,000838226004492584 0,000837472675266141 39698 39723 667 665 0 False 415 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 459 591 0,000976989189085933 0,000920038709729233 0,000625619897764553 0,000518806744487678 0,00102507058949521 0,00100112541593405 42706 40096 667 665 0 False 459 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 503 591 0,000992843015434375 0,000931695225704453 0,000534065766384375 0,000488288700694286 0,00109057656738413 0,00105592118385823 43399 40604 667 665 0 False 503 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 548 591 0,000988061702726115 0,000890874473893592 0,000610360875867857 0,000549324788281071 0,00103776826501387 0,000871269367750142 43190 38825 667 665 0 False 548 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 592 591 0,000860201622695176 0,000928987609788949 0,000625619897764553 0,000656137941557946 0,000811375207110955 0,000858813442308671 37601 40486 667 665 0 False 592 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 636 591 0,000934552179163337 0,000948652244022737 0,000762951094834821 0,000717174029144732 0,000798888271285007 0,000783751125673914 40851 41343 667 665 0 False 636 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 240 641 0,00109462320796571 0,07157286670556 0,000961318379491875 0,0695506218051423 0,000755997151832788 0,0207553280713508 47848 3119201 667 665 0 True 238 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 282 634 0,0010295607517825 0,00100133602488712 0,000900282291905089 0,000885023270008392 0,00071609245020526 0,000743136607926895 45004 43639 667 665 0 False 282 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 326 634 0,000872578130710337 0,000980478203978704 0,000762951094834821 0,000869764248111696 0,000669992795908896 0,000728788142413504 38142 42730 667 665 0 False 326 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 371 634 0,000886967823023714 0,000950855050191283 0,000762951094834821 0,000823987182421607 0,000670826397112457 0,000684057753429301 38771 41439 667 665 0 False 371 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 415 634 0,000854436594932106 0,00080966894232606 0,00064087891966125 0,000625619897764553 0,000764030356015003 0,000687212445754091 37349 35286 667 665 0 False 415 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 459 634 0,000961318379491875 0,000937982401643844 0,000671396963454643 0,00064087891966125 0,000932827252043297 0,000923595781336792 42021 40878 667 665 0 False 459 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 503 634 0,000879441258999706 0,000902875178332648 0,000518806744487678 0,000534065766384375 0,000923111454064365 0,000955677315208646 38442 39348 667 665 0 False 503 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 548 634 0,000902798772277857 0,000858061840341297 0,000518806744487678 0,000488288700694286 0,000930307196008225 0,000923910604116346 39463 37395 667 665 0 False 548 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 592 634 0,000908266397815054 0,00100057881026668 0,000747692072938125 0,000869764248111696 0,000771171025352726 0,000737715155257004 39702 43606 667 665 0 False 592 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 637 640 0,000997121032068081 0,0735080319246273 0,000823987182421607 0,0711833371480888 0,000732824478027702 0,0210568267038379 43586 3203537 667 665 0 True 636 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C9_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C9_1.csv new file mode 100755 index 0000000..5a67e5a --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C9_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 249 272 0,0109378133089555 0,0479961175541279 0,010955977721828 0,0477149614709697 0,0016232137799508 0,00739068430506324 478112 2091708 667 665 0 True 248 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 293 272 0,0108482266076849 0,0108441853087743 0,0108339055466545 0,0108644235904479 0,00144173688330029 0,00129082195242463 474196 472598 667 665 0 False 293 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 337 273 0,0111007210974508 0,0637118316505386 0,0111238269626917 0,0627908751049058 0,00133165422887547 0,00816851029136017 485233 2776611 667 665 0 True 337 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 381 272 0,0113143931581932 0,107185198060383 0,0113527122911421 0,109864957656214 0,00131467162347456 0,0200561075084252 494573 4671214 667 665 0 True 381 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 426 272 0,0109189397061597 0,0719110892360221 0,0109712367437247 0,0699931334401465 0,00154555688359009 0,0115030989363066 477287 3133941 667 665 0 True 426 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 470 272 0,0109563208782425 0,0701847087391172 0,0109864957656214 0,0720073243305104 0,0017653974357632 0,0199463328987154 478921 3058704 667 665 0 True 470 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 515 272 0,0108692506573447 0,084104080296874 0,0108644235904479 0,0812542915999084 0,00164446261689277 0,0213719913910706 475115 3665321 667 665 0 True 514 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 559 272 0,010764679459309 0,0693287808672517 0,0107270923933776 0,0665140764476997 0,00168165601747228 0,0170489194734709 470544 3021402 667 665 0 True 559 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 603 272 0,010491206674072 0,0104803781025005 0,0105134660868238 0,0105439841306172 0,00197107097173192 0,0019102332025426 458590 456743 667 665 0 False 603 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 647 271 0,0106800799645954 0,0473174467411376 0,0106965743495842 0,0470893415732052 0,00181911479277949 0,00780874290835515 466846 2062131 667 665 0 True 648 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 248 315 0,011101659058317 0,0109498741130694 0,0110780498970016 0,0110017547875181 0,0015269847229442 0,0014767684490433 485274 477204 667 665 0 False 248 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 293 315 0,0111841081061666 0,0110722675308092 0,0111238269626917 0,0110933089188983 0,00137521902421848 0,00140679021961123 488878 482538 667 665 0 False 293 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 337 316 0,011385723938214 0,0995686744900705 0,0113527122911421 0,0973067826352331 0,00136366656547041 0,0213450676842178 497691 4339280 667 665 0 True 337 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 382 317 0,0110847528856309 0,0526115701246708 0,0110322728313115 0,0513313496604868 0,0014206208877024 0,00716598779737176 484535 2292853 667 665 0 True 381 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 426 316 0,0111132348680318 0,0821400950304349 0,0111696040283818 0,0804455634393835 0,00161887727167394 0,0159617749146235 485780 3579729 667 665 0 True 426 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 470 317 0,0107931385646156 0,0426267086806051 0,0107270923933776 0,0433661402304112 0,00176707190112308 0,00633974040554744 471788 1857705 667 665 0 True 470 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 514 316 0,0108319152394505 0,051860229654016 0,0108339055466545 0,0514076447699702 0,00160101909345151 0,0147388992340599 473483 2260109 667 665 0 True 514 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 559 316 0,0109413363814774 0,056481258077673 0,0109407186999313 0,0544594491493095 0,00173209399971511 0,0136807179011216 478266 2461497 667 665 0 True 559 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 603 316 0,0106443001891135 0,0106402192251056 0,0106355382619974 0,0106813153276875 0,00210723722976819 0,00226355277114861 465282 463709 667 665 0 False 603 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 648 316 0,0111581426041385 0,0104902677843613 0,0109102006561379 0,0104219119554437 0,00390234640327771 0,00177894754012939 487743 457174 667 665 0 False 648 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 250 361 0,0112351697806395 0,0535276850859123 0,0112916762035554 0,0533455405508507 0,00164659281666212 0,00922788414453094 491110 2332778 667 665 0 True 248 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 293 360 0,0114320500541672 0,0651014811003246 0,0113832303349355 0,0662851911192493 0,00159221438800715 0,0177386715612546 499716 2837173 667 665 0 True 293 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 338 361 0,0109996958490313 0,0405216979275839 0,0109407186999313 0,0409857328145266 0,00142641745619897 0,00561750357554791 480817 1765967 667 665 0 True 337 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 381 360 0,0109683999840318 0,0366775717044958 0,0109712367437247 0,0368352788586252 0,00143815216525921 0,00481690442057552 479449 1598437 667 665 0 True 381 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 426 360 0,0109131060471138 0,0738870063692075 0,0108949416342412 0,0711070420386053 0,00159497427752916 0,0112522186184876 477032 3220053 667 665 0 True 426 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 471 362 0,0109018276396249 0,0336334083090537 0,0108491645685512 0,0341954680704967 0,00181474557908893 0,00421117127485123 476539 1465770 667 665 0 True 470 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 515 361 0,0108396019431346 0,0322049573464446 0,0107881284809644 0,031464103150988 0,00173474663579103 0,00474558345775966 473819 1403517 667 665 0 True 514 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 559 360 0,0109275872478043 0,0526131074998093 0,0109254596780346 0,0519569695582513 0,00180650032727742 0,00839921272300533 477665 2292920 667 665 0 True 559 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 603 361 0,0107282133709982 0,0576302509535455 0,010757610437171 0,0575875486381323 0,00210009537117766 0,0116729282287725 468950 2511571 667 665 0 True 603 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 647 360 0,0106685956632579 0,0653882818742898 0,0107270923933776 0,0641794460975051 0,00211838435863249 0,0167457011682397 466344 2849672 667 665 0 True 648 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 251 406 0,0109608276658192 0,0484408549411983 0,010955977721828 0,0507057297627222 0,00157082164315098 0,00941785774244185 479118 2111090 667 665 0 True 248 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 294 405 0,0110786218243591 0,0402502479591058 0,0111696040283818 0,0366216525520714 0,00145966711952181 0,0101871403076555 484267 1754137 667 665 0 True 293 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 338 405 0,0111724407880747 0,0873645087770926 0,0112306401159686 0,0832074464026856 0,00138210029504413 0,01605585432116 488368 3807413 667 665 0 True 337 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 382 405 0,0110899917402251 0,0690993677831567 0,0111238269626917 0,0670939192797742 0,00142606716340466 0,0150748544939078 484764 3011404 667 665 0 True 381 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 426 404 0,0109608505429135 0,0435673986981645 0,0109864957656214 0,0435645075150683 0,00158438157003928 0,00669119512055164 479119 1898701 667 665 0 True 426 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 471 405 0,0110288183900725 0,054590516116338 0,011108567940795 0,0543068589303426 0,00172925693980164 0,00871598828307151 482090 2379097 667 665 0 True 470 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 515 405 0,0108863398467852 0,0437611309115086 0,0108644235904479 0,043778133821622 0,00176451010908993 0,00605698565028868 475862 1907144 667 665 0 True 514 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 559 405 0,0112088153680084 0,0530903592237632 0,0111543450064851 0,051773861295491 0,00186526803649073 0,00820931004424655 489958 2313719 667 665 0 True 559 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 603 405 0,0108177314409858 0,0448584955178057 0,0108644235904479 0,0441138323033494 0,00212997843827399 0,00823302697768949 472863 1954968 667 665 0 True 603 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 647 404 0,0108175713013258 0,0931102762628705 0,0107423514152743 0,0905928130006867 0,00195697312588462 0,0178046377978482 472856 4057818 667 665 0 True 648 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 250 449 0,0110757850646661 0,0509930582923319 0,0110170138094148 0,050263218127718 0,00178748862853488 0,00787664854233252 484143 2222317 667 665 0 True 248 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 294 449 0,0110603887802036 0,0602455555230489 0,0109102006561379 0,0593728542000458 0,00150297901803867 0,00920653539464309 483470 2625548 667 665 0 True 293 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 338 449 0,0113148049458905 0,0381272017305796 0,011261158159762 0,0376134889753567 0,00169522312639425 0,00449128765820746 494591 1661613 667 665 0 True 337 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 381 448 0,0114985308901969 0,0712979519065459 0,0114747844663157 0,069916838330663 0,00166288616872982 0,0213286264720142 502622 3107220 667 665 0 True 381 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 426 448 0,0114337887133339 0,0968157633727257 0,0113679713130388 0,0960708018616007 0,00179325948561127 0,0160087399347063 499792 4219306 667 665 0 True 426 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 470 449 0,0115854638485289 0,0627645561603712 0,0114290074006256 0,0623178454261082 0,00234683642980006 0,0110967760110193 506422 2735328 667 665 0 True 470 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 515 449 0,0112876040807703 0,0584725489622431 0,0112916762035554 0,0568551155870909 0,00183642868283294 0,00977688095163826 493402 2548279 667 665 0 True 514 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 559 449 0,0109741421347006 0,033348259639715 0,0109712367437247 0,0337529564354925 0,0019351931218594 0,00428195877229257 479700 1453343 667 665 0 True 559 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 604 449 0,0109677823024857 0,0431180721315764 0,0109254596780346 0,0435339894712749 0,0018770901068777 0,00636866608615218 479422 1879119 667 665 0 True 603 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 647 448 0,0107264518347372 0,0777469882075296 0,0106813153276875 0,0785992217898833 0,0018180267199072 0,0132018927625913 468873 3388274 667 665 0 True 647 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 249 494 0,0107563750740789 0,0578100320611554 0,0108186465247578 0,0582284275577935 0,00157338108146451 0,0141356669658954 470181 2519406 667 665 0 True 248 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 294 493 0,011201952239719 0,0593131719204167 0,0112306401159686 0,0575722896162356 0,00168991769339852 0,007204090851365 489658 2584914 667 665 0 True 293 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 338 493 0,0115975429543182 0,0726185571504867 0,0114747844663157 0,0694285496299687 0,00197126002290118 0,0174488432156988 506950 3164773 667 665 0 True 337 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 381 489 0,0122991834364347 0,0404515293727567 0,0115663385976959 0,0339360646982528 0,00476170268505619 0,0229582140016324 537620 1762909 667 665 0 False 381 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 425 492 0,0115155514483546 0,100494082539836 0,0113984893568322 0,0969558251316091 0,00188242286664398 0,0322427811378875 503366 4379610 667 665 0 True 426 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 469 494 0,0116571606620585 0,0481020587632964 0,0115815976195926 0,0496833752956435 0,00193249172537418 0,00655930122169181 509556 2096325 667 665 0 True 470 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 515 493 0,0112296335238195 0,0452880427206721 0,0112001220721752 0,0468146791790646 0,00174522150658325 0,00694737961636543 490868 1973688 667 665 0 True 514 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 558 493 0,0111408017666607 0,104513676041787 0,0112306401159686 0,104997329671168 0,00177275270186755 0,0173278037234713 486985 4554787 667 665 0 True 559 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 602 493 0,0109518140906658 0,0652376191107203 0,0109407186999313 0,0676432440680552 0,00180922371380973 0,0156667357701949 478724 2843106 667 665 0 True 603 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 646 493 0,0109011870809846 0,0787073199134251 0,0108644235904479 0,0750286106660563 0,00207244127389494 0,0130962177033843 476511 3430126 667 665 0 True 647 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 249 538 0,0110302596470133 0,0542421973909367 0,0108949416342412 0,0565499351491569 0,00164126623768455 0,0111777575112671 482153 2363917 667 665 0 True 248 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 293 537 0,0111452856771431 0,123187919443837 0,011108567940795 0,120180056458381 0,0014677087889267 0,0386299450735442 487181 5368625 667 665 0 True 292 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 337 538 0,011356235363664 0,0610886107463669 0,011261158159762 0,0618448157473106 0,00161007157572821 0,0136274350831458 496402 2662289 667 665 0 True 337 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 381 537 0,0113135695827984 0,0604979603965281 0,011306935225452 0,0588387884336614 0,00167528258578235 0,00836291026499888 494537 2636548 667 665 0 True 381 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 426 537 0,0116129163616864 0,0601902100180642 0,0115968566414893 0,0590371557183185 0,00212041130939885 0,00741488145589156 507622 2623136 667 665 0 True 426 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 470 538 0,011485788348673 0,06485217392302 0,0115205615320058 0,0635538261997406 0,00196866076936164 0,0126086059242295 502065 2826308 667 665 0 True 470 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 515 538 0,0112639034110777 0,0742289461350791 0,0113221942473487 0,0721751735713741 0,00184804241252444 0,0153158017561037 492366 3234955 667 665 0 True 514 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 558 537 0,0111093686390954 0,0603466780937237 0,0110780498970016 0,0602426184481575 0,00173900436759113 0,0129537035278568 485611 2629955 667 665 0 True 559 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 603 537 0,0109139753766971 0,0461653102772954 0,0108339055466545 0,0442969405661097 0,0017522083870796 0,0073965304451594 477070 2011920 667 665 0 True 603 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 647 537 0,0109781227491084 0,0659242980419692 0,0109864957656214 0,065293354695964 0,00175861914389819 0,0127267342038188 479874 2873032 667 665 0 True 647 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 249 582 0,0106583467250124 0,0464038099368357 0,010605020218204 0,0456702525368124 0,00136982345141887 0,0101093661864061 465896 2022314 667 665 0 True 248 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 293 582 0,010675596054113 0,0574285794596356 0,0106355382619974 0,0568551155870909 0,00146406927358347 0,0118101555017425 466650 2502782 667 665 0 True 292 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 338 581 0,0109645566321897 0,054122144454751 0,0109102006561379 0,0537270160982681 0,00150779785530814 0,0106594262230199 479281 2358685 667 665 0 True 337 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 382 581 0,0111332752026367 0,0591176269811631 0,0110475318532082 0,0555886167696651 0,00135852920680224 0,0121095964655809 486656 2576392 667 665 0 True 381 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 426 581 0,0113448883248923 0,0897518917458443 0,0114442664225223 0,0833295185778592 0,00198062756000909 0,0202505718923537 495906 3911457 667 665 0 True 426 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 470 582 0,0112983105609017 0,0658544966215034 0,0112916762035554 0,0647287708857862 0,00199615752865528 0,0128370800564204 493870 2869990 667 665 0 True 470 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 515 581 0,0109216849574755 0,0591810953338944 0,0110170138094148 0,0576638437476158 0,00203428885683237 0,00657265268981702 477407 2579158 667 665 0 True 514 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 558 581 0,0107869159949666 0,040629222403686 0,0108491645685512 0,0421301594567788 0,00183100587225737 0,00796652598355261 471516 1770653 667 665 0 True 559 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 603 581 0,0107839877268965 0,052073397042618 0,010757610437171 0,0518806744487678 0,00157016206968101 0,00604131465873636 471388 2269399 667 665 0 True 603 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 647 581 0,0107390799907897 0,0558925351832316 0,0106507972838941 0,0542915999084459 0,0016594433650941 0,00713325809180339 469425 2435840 667 665 0 True 647 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 248 620 0,0108579951269501 0,0103909349936985 0,010605020218204 0,0103913939116503 0,00230543982701003 0,00135807697713726 474623 452845 667 665 0 False 248 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 292 620 0,0109073410193507 0,0105792060834164 0,0106660563057908 0,0106202792401007 0,00209617970010045 0,00143421816453185 476780 461050 667 665 0 False 292 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 338 626 0,0106910609698584 0,0842545824391604 0,0106813153276875 0,0821850919356069 0,00148506575046042 0,0126507886744612 467326 3671880 667 665 0 True 337 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 382 625 0,0108593219984194 0,0823673741460541 0,0108644235904479 0,0780498970016022 0,00138873432089403 0,0202608121550672 474681 3589634 667 665 0 True 381 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 426 620 0,0110031045360817 0,0108765390243749 0,0109254596780346 0,0108186465247578 0,00202097083784239 0,00174556033499098 480966 474008 667 665 0 False 426 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 470 620 0,0109172925553703 0,0106502695282496 0,0109102006561379 0,010605020218204 0,00198238109513759 0,00190363325656552 477215 464147 667 665 0 False 470 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 514 620 0,0106598794903304 0,0107719057313689 0,0107423514152743 0,0108186465247578 0,0019087792864829 0,00205426730552288 465963 469448 667 665 0 False 514 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 559 620 0,0104906576238088 0,0105906790322109 0,0104829480430304 0,0106660563057908 0,00178614436094967 0,00198318682769049 458566 461550 667 665 0 False 559 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 603 620 0,010655395579848 0,0107695652498149 0,010605020218204 0,0107728694590677 0,00155773134938449 0,00133210064812631 465767 469346 667 665 0 False 603 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 647 620 0,0107627120291994 0,0107324158416182 0,0107423514152743 0,010757610437171 0,00151985826733875 0,00153153522803059 470458 467727 667 665 0 False 647 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 251 670 0,0104874548306071 0,0462763225298311 0,0105134660868238 0,0467078660257877 0,00130577209048142 0,0084568413665242 458426 2016758 667 665 0 True 248 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 292 663 0,0104934028751246 0,0104225773864737 0,010452429999237 0,0104676890211337 0,00127774751350927 0,00119400631930637 458686 454224 667 665 0 False 292 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 337 663 0,011861933533119 0,0104430680730207 0,0104371709773404 0,0104371709773404 0,00747267539806636 0,00126530488527872 518507 455117 667 665 0 False 337 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 381 663 0,010992992860402 0,0105287480546181 0,0104371709773404 0,0105592431525139 0,00363615423381662 0,00137149817429641 480524 458851 667 665 0 False 381 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 426 663 0,0105940163358467 0,0106064199179569 0,0106507972838941 0,0106507972838941 0,00146973608636315 0,00152112441883166 463084 462236 667 665 0 False 426 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 470 663 0,0105223881536 0,0104731501447599 0,0106202792401007 0,0104219119554437 0,00156842656076276 0,00145869317647135 459953 456428 667 665 0 False 470 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 514 663 0,0103317990810042 0,0104380199755511 0,0103150988021668 0,0105592431525139 0,00174686710414404 0,00170174543263147 451622 454897 667 665 0 False 514 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 559 663 0,0104918929869009 0,0104781523504343 0,0105439841306172 0,010452429999237 0,00161896483602657 0,00164638643571334 458620 456646 667 665 0 False 559 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 603 663 0,0106855247130383 0,010445064366111 0,0107118333714809 0,0104219119554437 0,00136356878151107 0,00129512136669943 467084 455204 667 665 0 False 603 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 649 669 0,0106355611390917 0,0454082333322434 0,0106813153276875 0,0455786984054322 0,00151928172317905 0,00807651156227242 464900 1978926 667 665 0 True 647 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C9_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C9_2.csv new file mode 100755 index 0000000..abcf14f --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C9_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 249 272 0,00957509343291275 0,760637437035023 0,00910963607232776 0,760753795681697 0,00290078952712529 0,154630797002202 418545 33149169 667 665 11 True 248 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 293 272 0,00765945706478416 0,0072718532426282 0,0076600289921416 0,00727855344472419 0,00146126067500138 0,00123259697344684 334809 316913 667 665 0 False 293 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 337 273 0,00738989626267205 0,00743811921655822 0,00738536659800107 0,00737010757610437 0,00133875618734792 0,00133696881311951 323026 324159 667 665 0 True 337 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 381 272 0,00735798271612649 0,00732373391707697 0,00743114366369116 0,00729381246662089 0,00125266139369012 0,00131190829484509 321631 319174 667 665 0 True 381 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 426 272 0,00710988062846581 0,00726278961308054 0,00712596322575723 0,00727855344472419 0,00151486019198867 0,00151040931848141 310786 316518 667 665 0 True 426 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 470 272 0,00734524017460256 0,00725950834972531 0,00737010757610437 0,00729381246662089 0,00164494646157314 0,00164528687246755 321074 316375 667 665 0 True 470 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 515 272 0,00729838788548047 0,00760369681356057 0,00730907148851759 0,007690547035935 0,00153898556255732 0,00154779610592046 319026 331375 667 665 0 True 514 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 559 272 0,00769461915872002 0,00766202528523185 0,00776684214541848 0,00770580605783169 0,00163853153329716 0,00151833902067005 336346 333917 667 665 0 True 559 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 603 272 0,00834668497749294 0,00832364729631357 0,00827038986800946 0,00825513084611276 0,00189451044281376 0,00184974031584756 364849 362751 667 665 0 False 603 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 647 271 0,00986128588257943 0,757349909449752 0,00990310521095598 0,758861676966506 0,00188650292226966 0,160392438629401 431055 33005896 667 665 12 True 648 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 248 315 0,008216674450598 0,00746533305109879 0,007690547035935 0,00744640268558785 0,00283942524469963 0,00142054578542686 359166 325345 667 665 0 False 248 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 293 315 0,00735157712972308 0,00709333415938565 0,00737010757610437 0,00701915007248035 0,00129023171126358 0,00124993585518042 321351 309133 667 665 0 False 293 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 337 316 0,00722419746867239 0,00735204915470182 0,00718699931334401 0,00733958953231098 0,00128047855761955 0,00129715137362999 315783 320408 667 665 0 True 337 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 382 317 0,00706462973594457 0,00722690222925132 0,00708018616006714 0,00715648126955062 0,001253761371935 0,00134344635099461 308808 314954 667 665 0 True 381 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 426 316 0,00721580157506507 0,00714895501514142 0,00717174029144732 0,0072480354009308 0,00153820264743876 0,00163247634709944 315416 311557 667 665 0 True 426 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 470 317 0,00737296721289161 0,00732582199375757 0,00744640268558785 0,00737010757610437 0,00158661527857001 0,00161590420058866 322286 319265 667 665 0 True 470 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 514 316 0,00743050310505082 0,00747623235245358 0,00741588464179446 0,00747692072938125 0,00152183985260401 0,00157643563177548 324801 325820 667 665 0 True 514 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 559 316 0,00756241243077248 0,00782434456477656 0,00753795681696803 0,00779736018921187 0,00167761949487152 0,00132744619595714 330567 340991 667 665 0 True 559 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 603 316 0,00802338588087508 0,00798999099947167 0,0081177996490425 0,00804150453955901 0,00206099264367698 0,00198498985823404 350717 348210 667 665 0 False 603 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 648 316 0,00850028178860902 0,0081411815186857 0,00840772106507973 0,00814831769283589 0,00236002029141808 0,0018389238098796 371563 354799 667 665 0 False 648 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 250 361 0,00703573596584633 0,00748903616330825 0,00701915007248035 0,00732433051041428 0,0014899904762535 0,00201561258021814 307545 326378 667 665 0 True 248 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 293 360 0,00724810403221369 0,00722389631666715 0,0072327763790341 0,0072632944228275 0,00147009478938067 0,00128796820508061 316828 314823 667 665 0 True 293 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 338 361 0,00723295939578849 0,00734571608696725 0,00727855344472419 0,00732433051041428 0,00131328978518683 0,00131134862109206 316166 320132 667 665 0 True 337 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 381 360 0,00728820757851791 0,007664641117557 0,0072327763790341 0,00772106507972839 0,00131141917650044 0,00118039662445255 318581 334031 667 665 0 True 381 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 426 360 0,00745219059044522 0,00758885081782047 0,00750743877317464 0,00762951094834821 0,00152362639895326 0,00153720480642512 325749 330728 667 665 0 True 426 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 471 362 0,00767020929910417 0,00752999459050464 0,007690547035935 0,00750743877317464 0,00170601707070308 0,0016548920492853 335279 328163 667 665 0 True 470 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 515 361 0,00751718441534554 0,0075737524172069 0,00761425192645151 0,0076752880140383 0,00179554516983507 0,00172349030039858 328590 330070 667 665 0 True 514 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 559 360 0,00767608871233873 0,007794170709447 0,00764476997024491 0,00784313725490196 0,00169505967680547 0,00171285243443791 335536 339676 667 665 0 True 559 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 603 361 0,00770091035965194 0,00792528356827064 0,0076752880140383 0,00794995040817884 0,00197226514358567 0,00201531086185766 336621 345390 667 665 0 True 603 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 647 360 0,00732666397403267 0,00739286990651268 0,00727855344472419 0,00740062561989776 0,00194771018680631 0,00196511175552047 320262 322187 667 665 0 True 648 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 251 406 0,00701873828478299 0,00666649457243475 0,00706492713817044 0,00675974670023652 0,0014918928908814 0,00144524499510554 306802 290531 667 665 0 True 248 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 294 405 0,00702901010012275 0,00724603910784056 0,00709544518196384 0,0072480354009308 0,00137814153888346 0,00138445108697812 307251 315788 667 665 0 True 293 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 338 405 0,00737479738043544 0,00748802654381433 0,00737010757610437 0,00752269779507134 0,00131779945032352 0,00118885822006325 322366 326334 667 665 0 True 337 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 382 405 0,00749233989093803 0,00762136515470411 0,00755321583886473 0,00762951094834821 0,00138206190066901 0,00132493214667011 327504 332145 667 665 0 True 381 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 426 404 0,00762788667465306 0,0078620676204129 0,0076600289921416 0,00776684214541848 0,00153409483950904 0,00182076399190983 333429 342635 667 665 0 True 426 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 471 405 0,00767375524872034 0,00767303931607458 0,0076600289921416 0,00770580605783169 0,00159358557890401 0,00150911760291516 335434 334397 667 665 0 True 470 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 515 405 0,00764476997024491 0,00771257509762045 0,00770580605783169 0,00775158312352178 0,00166936103091256 0,00163043901728351 334167 336120 667 665 0 True 514 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 559 405 0,00758814916185762 0,00781528093522889 0,00761425192645151 0,00782787823300526 0,00173748332135023 0,00141740444485726 331692 340596 667 665 0 True 559 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 603 405 0,00712211987391518 0,00733346297765471 0,00712596322575723 0,0072327763790341 0,00184494700826285 0,0018486131096554 311321 319598 667 665 0 True 603 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 647 404 0,00677557764949066 0,00672640631103967 0,00677500572213321 0,00669871061264973 0,0018151626510327 0,00165334983670294 296173 293142 667 665 0 True 648 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 250 449 0,00714515710787316 0,00698014204657903 0,00709544518196384 0,00698863202868696 0,00175437017499139 0,0014030296897682 312328 304200 667 665 0 True 248 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 294 449 0,00711203107532981 0,0071958105380182 0,00714122224765393 0,00708018616006714 0,00142118970900873 0,0014622587364475 310880 313599 667 665 0 True 293 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 338 449 0,0074600145566951 0,00734867610775623 0,00750743877317464 0,00735484855420768 0,00145700294791026 0,00141094692475999 326091 320261 667 665 0 True 337 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 381 448 0,00757330192765828 0,00789852865168185 0,00758373388265812 0,00798046845197223 0,00147521837426111 0,00138171746230474 331043 344224 667 665 0 True 381 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 426 448 0,00794649596693985 0,00842981796445795 0,00798046845197223 0,00807202258335241 0,00179779479183564 0,00257306309245268 347356 367378 667 665 0 True 426 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 470 449 0,00788548275644737 0,00789795500424212 0,00790417334248875 0,00787365529869535 0,0017795246505171 0,00198574929568887 344689 344199 667 665 0 True 470 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 515 449 0,00767133027672476 0,00748733816688666 0,00784313725490196 0,00756847486076143 0,00169475763404259 0,0018069288007125 335328 326304 667 665 0 True 514 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 559 449 0,00692018376254766 0,00706159998302004 0,00692759594110018 0,00701915007248035 0,0018427886525941 0,0018272021298444 302494 307750 667 665 0 True 559 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 604 449 0,00677358734228674 0,00668691642128897 0,00674448767833982 0,00665293354695964 0,00183347498462094 0,00176577232613422 296086 291421 667 665 0 True 603 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 647 448 0,00662543527961357 0,00683530754099715 0,00660715648126955 0,00686655985351339 0,00184979238181583 0,00190069533402438 289610 297888 667 665 0 True 647 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 249 494 0,00723568177000994 0,0073706812235441 0,00717174029144732 0,00744640268558785 0,00145705045654857 0,00139903687142091 316285 321220 667 665 0 True 248 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 294 493 0,00707140135585675 0,00735347180035233 0,00711070420386053 0,00735484855420768 0,00156958937892489 0,00146009257936623 309104 320470 667 665 0 True 293 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 338 493 0,00763140974717494 0,00747731080964026 0,00752269779507134 0,00750743877317464 0,00161910701844118 0,00149259626231066 333583 325867 667 665 0 True 337 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 381 489 0,00760656522276742 0,00776608493079804 0,00761425192645151 0,00770580605783169 0,00149339680646413 0,00158304387815191 332497 338452 667 665 0 False 381 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 425 492 0,00769644932626385 0,00783049406533041 0,00773632410162509 0,00785839627679866 0,00185866823765576 0,00188728803096867 336426 341259 667 665 0 True 426 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 469 494 0,00767668351679047 0,00774830186016655 0,00773632410162509 0,00776684214541848 0,00179082667477015 0,00183742309838112 335562 337677 667 665 0 True 470 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 515 493 0,00698696200080321 0,00686008911039329 0,00703440909437705 0,00691233691920348 0,00171953409538083 0,00159905822080589 305413 298968 667 665 0 True 514 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 558 493 0,00674933762233097 0,00683950664025594 0,0068055237659266 0,0068055237659266 0,00172174057323456 0,00169307715337106 295026 298071 667 665 0 True 559 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 602 493 0,00669447835020462 0,00654444534315877 0,00672922865644312 0,00656137941557946 0,00178208174092026 0,00179194126315486 292628 285212 667 665 0 True 603 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 646 493 0,00673771605842764 0,00661507281593776 0,00665293354695964 0,00659189745937285 0,00172718471420019 0,00186985643160899 294518 288290 667 665 0 True 647 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 249 538 0,00730202534347383 0,00710882264025823 0,00721751735713741 0,00709544518196384 0,00156780611908261 0,00149917500078559 319185 309808 667 665 0 True 248 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 293 537 0,00723339406058015 0,00744309847633504 0,00727855344472419 0,00746166170748455 0,00141888619149217 0,00145444732480516 316185 324376 667 665 0 True 292 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 337 538 0,00739833791046797 0,00753382655540201 0,00740062561989776 0,00744640268558785 0,00136107040216593 0,00144508333644144 323395 328330 667 665 0 True 337 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 381 537 0,00756554659269129 0,00757402776797797 0,00752269779507134 0,00750743877317464 0,00137596384417369 0,00153299708032769 330704 330082 667 665 0 True 381 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 426 537 0,00762427209375399 0,00740778473994554 0,007690547035935 0,00746166170748455 0,0018180934957984 0,00177697605027306 333271 322837 667 665 0 True 426 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 470 538 0,00727670040008606 0,00710485299997533 0,0072480354009308 0,00694285496299687 0,00181787544106126 0,00185457133629762 318078 309635 667 665 0 True 470 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 515 538 0,00700187786628544 0,00692986758496149 0,00698863202868696 0,00691233691920348 0,00176446464083084 0,00180767313928401 306065 302009 667 665 0 True 514 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 558 537 0,00669331161839543 0,00679501454483083 0,00666819256885634 0,00688181887541009 0,0016387190027808 0,00180173391649391 292577 296132 667 665 0 True 559 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 603 537 0,00674350396328501 0,00700510718315588 0,00672922865644312 0,00704966811627375 0,00163889087322846 0,00159457070045809 294771 305288 667 665 0 True 603 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 647 537 0,0066892623727047 0,0068842970323497 0,00671396963454643 0,00697337300679027 0,00185181423617174 0,00198273612037543 292400 300023 667 665 0 True 647 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 249 582 0,0073143103431118 0,00733438081355827 0,0072632944228275 0,00732433051041428 0,00140581225525904 0,00115248995607929 319722 319638 667 665 0 True 248 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 293 582 0,00730188808090805 0,00717313999120025 0,00727855344472419 0,00714122224765393 0,00140314803433608 0,00150311954835487 319179 312611 667 665 0 True 292 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 338 581 0,00752688430332785 0,0072524180673703 0,00756847486076143 0,0072632944228275 0,00144976237020604 0,00133289909663936 329014 316066 667 665 0 True 337 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 382 581 0,00726009162962579 0,00734436227900949 0,00721751735713741 0,00730907148851759 0,00134307058317681 0,00132381164943835 317352 320073 667 665 0 True 381 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 426 581 0,00728294584682939 0,00710801953384262 0,00727855344472419 0,00701915007248035 0,0018569441153437 0,00184584069867517 318351 309773 667 665 0 True 426 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 470 582 0,00724819554059089 0,00731333942546914 0,0072480354009308 0,00730907148851759 0,00201132652418809 0,00172441617724487 316832 318721 667 665 0 True 470 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 515 581 0,00709336336638273 0,00700457942751133 0,00717174029144732 0,00706492713817044 0,00193742895849884 0,00196398701649469 310064 305265 667 665 0 True 514 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 558 581 0,00708153590863072 0,00683760213075605 0,00712596322575723 0,00689707789730678 0,00178090625158655 0,00177871105247416 309547 297988 667 665 0 True 559 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 603 581 0,00677470831990734 0,00693209333702762 0,0068055237659266 0,00697337300679027 0,00158926132380996 0,0014787360361855 296135 302106 667 665 0 True 603 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 647 581 0,00683933611129889 0,0069515744040807 0,00689707789730678 0,00697337300679027 0,00157447332014851 0,00132108937631297 298960 302955 667 665 0 True 647 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 248 620 0,00769031826499202 0,00779504265355538 0,0076752880140383 0,00778210116731518 0,00133783419660355 0,00133112815137861 336158 339714 667 665 0 False 248 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 292 620 0,00760919608861168 0,00750002724825339 0,00753795681696803 0,00752269779507134 0,00151211083787713 0,00133432575723401 332612 326857 667 665 0 False 292 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 338 626 0,00731460774533768 0,00751416192116822 0,00729381246662089 0,00747692072938125 0,00137258303985444 0,001358229659878 319735 327473 667 665 0 True 337 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 382 625 0,00718365925757652 0,00723105543671493 0,00717174029144732 0,00720225833524071 0,00136717125279922 0,00132878520278983 314011 315135 667 665 0 True 381 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 426 620 0,00706133543436567 0,00700834255471593 0,00701915007248035 0,00698863202868696 0,00168091958190812 0,00158018015459922 308664 305429 667 665 0 False 426 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 470 620 0,00688515893117758 0,00692282319440166 0,00683604180972 0,00692759594110018 0,0018279750009231 0,00189619064846495 300963 301702 667 665 0 False 470 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 514 620 0,00689776421013572 0,00684175533821966 0,00692759594110018 0,00683604180972 0,00184386488052776 0,0018854671253322 301514 298169 667 665 0 False 514 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 559 620 0,00675210575074102 0,00673423086211753 0,00669871061264973 0,00672922865644312 0,001725814074508 0,00180705634500782 295147 293483 667 665 0 False 559 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 603 620 0,00693253739346852 0,0070010916510778 0,00691233691920348 0,00704966811627375 0,00145918562601225 0,00139785230416294 303034 305113 667 665 0 False 603 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 647 620 0,00708409814319208 0,00712828076141372 0,00712596322575723 0,00704966811627375 0,00147050317675245 0,00142155624775672 309659 310656 667 665 0 False 647 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 251 670 0,00951076304374707 0,755983137059862 0,00918593118181125 0,76221866178378 0,00222702644391634 0,184467071306254 415733 32946331 667 665 13 True 248 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 292 663 0,00837997114969638 0,00770268541575959 0,00761425192645151 0,00770580605783169 0,00347061740206115 0,0012694831318332 366304 335689 667 665 0 False 292 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 337 663 0,00715648126955062 0,00696625977853767 0,00718699931334401 0,00692759594110018 0,00123777983513341 0,00128006657907085 312823 303595 667 665 0 False 337 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 381 663 0,00701228694419099 0,00703427141899152 0,00700389105058366 0,00703440909437705 0,00120775146172408 0,00120495795177141 306520 306559 667 665 0 False 381 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 426 663 0,00688618840042098 0,00679873178024025 0,0068055237659266 0,00683604180972 0,00145642902822529 0,00136554426418547 301008 296294 667 665 0 False 426 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 470 663 0,00673279748315359 0,00664095578841817 0,00672922865644312 0,00666819256885634 0,00161658368214496 0,00142754485114688 294303 289418 667 665 0 False 470 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 514 663 0,00676624379501712 0,00683560583766581 0,00677500572213321 0,00685130083161669 0,00164200269341082 0,00158923897188456 295765 297901 667 665 0 False 514 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 559 663 0,00673645781824126 0,00671406141813678 0,00675974670023652 0,00677500572213321 0,00154231338901199 0,00165229061219948 294463 292604 667 665 0 False 559 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 603 663 0,00722385431225792 0,0071464998040994 0,00720225833524071 0,00711070420386053 0,00138811651427333 0,00126997759344867 315768 311450 667 665 0 False 603 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 649 669 0,00888168870474353 0,746948579964445 0,00888075074387732 0,747127489127947 0,00169178713588601 0,183665825717638 388235 32552598 667 665 14 True 647 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C9_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C9_3.csv new file mode 100755 index 0000000..bd3da63 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_C9_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 249 272 0,00110981359857952 0,0766190596656439 0,000885023270008392 0,0744792858777752 0,00087232391273842 0,0184297883149764 48512 3339118 667 665 0 True 248 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 293 272 0,00105760806939172 0,000935527190601819 0,000930800335698482 0,00080872816052491 0,000724308264469281 0,000641398320803825 46230 40771 667 665 0 False 293 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 337 273 0,000960243156059873 0,000913912155072965 0,000885023270008392 0,000762951094834821 0,000673941297577994 0,000675142711008089 41974 39829 667 665 0 True 337 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 381 272 0,000928077961477032 0,000920474681783424 0,000778210116731518 0,000793469138628214 0,000680787787627886 0,000638454494701868 40568 40115 667 665 0 True 381 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 426 272 0,00100965767974333 0,00100188672642926 0,000823987182421607 0,00080872816052491 0,000868528045318666 0,000815220148361638 44134 43663 667 665 0 True 426 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 470 272 0,000940248575643513 0,000982084416809935 0,000686655985351339 0,000717174029144732 0,000868533688503158 0,000925645878779536 41100 42800 667 665 0 True 470 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 515 272 0,000925515726915668 0,000943833605529044 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,00079399535694879 0,000827291744893775 40456 41133 667 665 0 True 514 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 559 272 0,000977378099688997 0,000994704660483894 0,000747692072938125 0,000778210116731518 0,00084913863994279 0,000855652877989538 42723 43350 667 665 0 True 559 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 603 272 0,000988176088197604 0,000990574398917871 0,000625619897764553 0,000671396963454643 0,00100127261672226 0,00100367285505667 43195 43170 667 665 0 False 603 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 647 271 0,00115829016139676 0,07613666806063 0,000885023270008392 0,0746776531624323 0,00101154585173995 0,0187081449573503 50631 3318095 667 665 0 True 648 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 248 315 0,00104989848861333 0,0009399557488365 0,000885023270008392 0,000732433051041428 0,00081982035806125 0,000747645851915758 45893 40964 667 665 0 False 248 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 293 315 0,00093038854800112 0,000985985219400068 0,000778210116731518 0,000869764248111696 0,000692136945019391 0,0006756367079861 40669 42970 667 665 0 False 293 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 337 316 0,000962119077792301 0,00097240124802737 0,000839246204318303 0,000823987182421607 0,000691795324539024 0,000675329063898055 42056 42378 667 665 0 True 337 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 382 317 0,000933522709919931 0,00100842630724213 0,000823987182421607 0,000930800335698482 0,000662888868970511 0,000636475372104153 40806 43948 667 665 0 True 381 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 426 316 0,000942170251564536 0,000903265258591661 0,000717174029144732 0,00064087891966125 0,000861719189321048 0,000825810762755163 41184 39365 667 665 0 True 426 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 470 317 0,000848397042037461 0,000998490733586082 0,000579842832074464 0,00080872816052491 0,000848709126966 0,00084694171498469 37085 43515 667 665 0 True 470 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 514 316 0,000939813910851853 0,000948445730944436 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000824061161583445 0,000796160658261713 41081 41334 667 665 0 True 514 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 559 316 0,000935993436104104 0,000934494625210314 0,000671396963454643 0,00080872816052491 0,000886294352300137 0,000715657268819342 40914 40726 667 665 0 True 559 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 603 316 0,00103349561200174 0,00096609112619039 0,000549324788281071 0,000488288700694286 0,00112530768935787 0,00111966883227095 45176 42103 667 665 0 False 603 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 648 316 0,000998196255500082 0,00109341791191185 0,000610360875867857 0,000823987182421607 0,00104420874112462 0,000975471397455307 43633 47652 667 665 0 False 648 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 250 361 0,000931875559130483 0,000945875790414466 0,000762951094834821 0,000762951094834821 0,000760518513160073 0,000808196096079863 40734 41222 667 665 0 True 248 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 293 360 0,000900282291905089 0,00103598433024654 0,000747692072938125 0,000946059357595178 0,000711568407009086 0,000730084362630154 39353 45149 667 665 0 True 293 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 338 361 0,000969188099930351 0,000893765656989808 0,000839246204318303 0,000793469138628214 0,000715123740780468 0,000665968840243143 42365 38951 667 665 0 True 337 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 381 360 0,000928375363702905 0,00100328642618219 0,000823987182421607 0,000854505226215 0,000679757737524644 0,000703993164269667 40581 43724 667 665 0 True 381 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 426 360 0,0008718918178814 0,000932498332120069 0,000610360875867857 0,00064087891966125 0,000841175859403957 0,000849401272676986 38112 40639 667 665 0 True 426 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 471 362 0,000978453323120998 0,0009439253891194 0,000717174029144732 0,000701915007248035 0,000883629019646683 0,000863030936926615 42770 41137 667 665 0 True 470 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 515 361 0,000949811201060033 0,000898561349585913 0,000625619897764553 0,000610360875867857 0,000940568357514452 0,000872115548709824 41518 39160 667 665 0 True 514 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 559 360 0,000931051983735759 0,000943053445011017 0,000656137941557946 0,000595101853971161 0,000899828090000068 0,000917344461317383 40698 41099 667 665 0 True 559 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 603 361 0,000892572711126698 0,000985641030936233 0,000488288700694286 0,000488288700694286 0,000990693975110503 0,0011313810287021 39016 42955 667 665 0 True 603 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 647 360 0,000945190028011858 0,000911548727621296 0,000503547722590982 0,000503547722590982 0,00100674110592506 0,000977137348816344 41316 39726 667 665 0 True 648 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 251 406 0,000889735951433759 0,000899570969079829 0,000747692072938125 0,000717174029144732 0,000736720058830528 0,000745966459550794 38892 39204 667 665 0 True 248 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 294 405 0,000922312933713962 0,000985618085038644 0,000839246204318303 0,000885023270008392 0,000692309192636547 0,000758149600983039 40316 42954 667 665 0 True 293 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 338 405 0,00106778837635428 0,000978344235502925 0,000991836423285267 0,000900282291905089 0,000718006773906037 0,000672080842062583 46675 42637 667 665 0 True 337 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 382 405 0,00101219703721039 0,000935940216758422 0,000900282291905089 0,000793469138628214 0,00075596087689341 0,000719889575112329 44245 40789 667 665 0 True 381 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 426 404 0,00105220907513741 0,00105711750192602 0,000823987182421607 0,000793469138628214 0,000852327030183706 0,000864068001985067 45994 46070 667 665 0 True 426 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 471 405 0,000979276898515723 0,00100831157775418 0,000686655985351339 0,000762951094834821 0,000916632877421163 0,00085643639485117 42806 43943 667 665 0 True 470 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 515 405 0,00093722879919619 0,000873068457364514 0,00064087891966125 0,000656137941557946 0,000873669394439076 0,000837440676634671 40968 38049 667 665 0 True 514 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 559 405 0,000907282682760245 0,000910516162229791 0,000625619897764553 0,000701915007248035 0,00090945246298908 0,000780159399075835 39659 39681 667 665 0 True 559 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 603 405 0,000900671202508153 0,000817654114687038 0,000518806744487678 0,000366216525520714 0,00098300589762945 0,000965605974379469 39370 35634 667 665 0 True 603 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 647 404 0,000945373044766241 0,000982290929888236 0,000625619897764553 0,000595101853971161 0,000948158152415235 0,000955912123778018 41324 42809 667 665 0 True 648 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 250 449 0,00101173949532444 0,000905536902452974 0,000854505226215 0,000732433051041428 0,000847785048570638 0,000786163007262631 44225 39464 667 665 0 True 248 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 294 449 0,00088863785090746 0,00100468612593512 0,000762951094834821 0,000869764248111696 0,000742276635435937 0,000811912975743224 38844 43785 667 665 0 True 293 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 338 449 0,00100487636703507 0,000988142133773436 0,000869764248111696 0,000854505226215 0,000748522632250156 0,000784428138839373 43925 43064 667 665 0 True 337 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 381 448 0,00105737929844874 0,000969211768262496 0,000900282291905089 0,000869764248111696 0,000818750927217042 0,000729518393381688 46220 42239 667 665 0 True 381 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 426 448 0,00105477130969878 0,00106390948761237 0,000839246204318303 0,000732433051041428 0,000953828302780594 0,00103554546872374 46106 46366 667 665 0 True 426 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 470 449 0,000989868993175648 0,000991836423285267 0,000732433051041428 0,000595101853971161 0,00094887769707176 0,00106873713278616 43269 43225 667 665 0 True 470 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 515 449 0,00101187675789022 0,000895280086230683 0,000732433051041428 0,000625619897764553 0,000928530957580563 0,00088743376428614 44231 39017 667 665 0 True 514 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 559 449 0,000882529666729922 0,000902714557049525 0,000549324788281071 0,000564583810177768 0,000906168478143491 0,000938455749737651 38577 39341 667 665 0 True 559 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 604 449 0,000882049247749666 0,000929698932614209 0,000488288700694286 0,000534065766384375 0,000923367416877039 0,000984547357295383 38556 40517 667 665 0 True 603 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 647 448 0,000896004275271382 0,000992846042779184 0,000503547722590982 0,000534065766384375 0,000946567050931631 0,00108972643996184 39166 43269 667 665 0 True 647 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 249 494 0,000909158604492672 0,000918019470741399 0,000778210116731518 0,000778210116731518 0,000710363573542811 0,000728710769511231 39741 40008 667 665 0 True 248 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 294 493 0,000936633994744445 0,000996081414339236 0,000823987182421607 0,000839246204318303 0,000809456987966648 0,00087223337193994 40942 43410 667 665 0 True 293 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 338 493 0,000912750308297442 0,00087433048173191 0,000732433051041428 0,000778210116731518 0,000810236358656817 0,00074360082970382 39898 38104 667 665 0 True 337 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 381 489 0,0010175274001818 0,000968844633901072 0,000854505226215 0,000793469138628214 0,000850967528660133 0,000793470510868676 44478 42223 667 665 0 False 381 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 425 492 0,000982342429151641 0,00102490146171104 0,000686655985351339 0,000686655985351339 0,00100828933632957 0,00100348725300824 42940 44666 667 665 0 True 426 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 469 494 0,0010295836288768 0,000953103748155006 0,000656137941557946 0,000625619897764553 0,00104433479229978 0,000957362868414306 45005 41537 667 665 0 True 470 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 515 493 0,000924143101257794 0,00101315316214546 0,000579842832074464 0,000701915007248035 0,00090117425873093 0,000955455524596332 40396 44154 667 665 0 True 514 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 558 493 0,000873447460293657 0,00086733198296726 0,000549324788281071 0,000595101853971161 0,000919717940350089 0,000875859802535344 38180 37799 667 665 0 True 559 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 602 493 0,000836226427870981 0,000887088400791404 0,000488288700694286 0,000579842832074464 0,000874693913027891 0,000896775789796163 36553 38660 667 665 0 True 603 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 646 493 0,000996183071201868 0,000939336209601596 0,00064087891966125 0,000518806744487678 0,000984866248235099 0,000980211491050074 43545 40937 667 665 0 True 647 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 249 538 0,000978636339875382 0,000967766176714388 0,000839246204318303 0,00080872816052491 0,000749003520848556 0,000775099288028992 42778 42176 667 665 0 True 248 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 293 537 0,00101407295894282 0,000945256251179563 0,000885023270008392 0,00080872816052491 0,000791195225849927 0,000781160979058388 44327 41195 667 665 0 True 292 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 337 538 0,00103402178517059 0,000971758762894877 0,000961318379491875 0,000854505226215 0,000765032825929183 0,000754187212653435 45199 42350 667 665 0 True 337 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 381 537 0,000969325362496138 0,001011615787007 0,00080872816052491 0,000823987182421607 0,000808302306073045 0,000818146005359199 42371 44087 667 665 0 True 381 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 426 537 0,00101890002583968 0,000935205948035573 0,000701915007248035 0,000534065766384375 0,00101421982552874 0,000994033189856571 44538 40757 667 665 0 True 426 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 470 538 0,0010361036007517 0,000928689313120292 0,000701915007248035 0,000488288700694286 0,00101757160728515 0,00103437293435473 45290 40473 667 665 0 True 470 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 515 538 0,000951160949623609 0,000902095017814621 0,000610360875867857 0,000473029678797589 0,00099136107184244 0,000969307255031083 41577 39314 667 665 0 True 514 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 558 537 0,000891428856411803 0,000867951522202164 0,000625619897764553 0,000488288700694286 0,000870631832320712 0,000923300026720281 38966 37826 667 665 0 True 559 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 603 537 0,000944663854843007 0,000918799631259426 0,000686655985351339 0,000686655985351339 0,000900475063381976 0,000845960574221979 41293 40042 667 665 0 True 603 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 647 537 0,000954889915994166 0,000905536902452974 0,00064087891966125 0,000457770656900893 0,000976263258668564 0,00103159061901229 41740 39464 667 665 0 True 647 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 249 582 0,000963262932507196 0,000997320492809043 0,000869764248111696 0,000915541313801785 0,00068113647871044 0,000670868766346483 42106 43464 667 665 0 True 248 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 293 582 0,00101256307071916 0,000987316081460231 0,000869764248111696 0,000854505226215 0,000784590970309595 0,000756925257709446 44261 43028 667 665 0 True 292 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 338 581 0,000959716982891022 0,00100840336134454 0,000854505226215 0,000869764248111696 0,000735163835314462 0,000766361062713841 41951 43947 667 665 0 True 337 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 382 581 0,000901380392431388 0,000972217680846658 0,000762951094834821 0,000854505226215 0,000652884933603992 0,000679196475593728 39401 42370 667 665 0 True 381 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 426 581 0,000961112485643193 0,00100124424129676 0,000747692072938125 0,000671396963454643 0,000898154121946516 0,00100358542349871 42012 43635 667 665 0 True 426 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 470 582 0,000956514189689316 0,000888556938237101 0,000564583810177768 0,000518806744487678 0,000971916129328934 0,000915686690687341 41811 38724 667 665 0 True 470 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 515 581 0,00089657620262883 0,00101604434524168 0,000503547722590982 0,000701915007248035 0,000980332864437413 0,00109383205239037 39191 44280 667 665 0 True 514 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 558 581 0,000881500197486517 0,000974902350864573 0,000518806744487678 0,000625619897764553 0,000916075422762209 0,000962296903971751 38532 42487 667 665 0 True 559 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 603 581 0,000838353997640685 0,000855400116220971 0,000564583810177768 0,000610360875867857 0,000788747848552661 0,000770156663165494 36646 37279 667 665 0 True 603 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 647 581 0,000874339666971275 0,000828828766812889 0,000610360875867857 0,000610360875867857 0,000792166280938841 0,000739565581219469 38219 36121 667 665 0 True 647 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 248 620 0,001045803488734 0,000918088308434166 0,000869764248111696 0,000747692072938125 0,000752362818115524 0,000695149394376514 45714 40011 667 665 0 False 248 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 292 620 0,00102786784680445 0,000979514476279965 0,000900282291905089 0,000793469138628214 0,000742545907296072 0,000767316080426619 44930 42688 667 665 0 False 292 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 338 626 0,000944778240314496 0,000915105341747594 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,000738469012903897 0,00073430373028316 41298 39881 667 665 0 True 337 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 382 625 0,000991104356267735 0,000926991316698705 0,000869764248111696 0,000839246204318303 0,00070612234250701 0,000661983269358439 43323 40399 667 665 0 True 381 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 426 620 0,000876101203232213 0,000972057059563535 0,000579842832074464 0,000671396963454643 0,00084866508364612 0,000923242957500535 38296 42363 667 665 0 False 426 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 470 620 0,000956742960632295 0,000855239494937848 0,000564583810177768 0,000411993591210803 0,000989168715321437 0,000985478291798127 41821 37272 667 665 0 False 470 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 514 620 0,000911812347431228 0,000877955933550975 0,000473029678797589 0,000457770656900893 0,00101957131096379 0,000972469935476229 39857 38262 667 665 0 False 514 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 559 620 0,000953997709316548 0,000860310538305021 0,000625619897764553 0,000442511635004196 0,000955954071999052 0,000937987706723957 41701 37493 667 665 0 False 559 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 603 620 0,000907397068231735 0,000875454830713772 0,000701915007248035 0,000686655985351339 0,000740867125021689 0,000709002309875298 39664 38153 667 665 0 False 603 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 647 620 0,000885503688988648 0,000872058837870598 0,000686655985351339 0,000656137941557946 0,000714046515859659 0,00079713882767904 38707 38005 667 665 0 False 647 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 251 670 0,00110713697854666 0,0767838571021282 0,000961318379491875 0,0759136339360647 0,000750904688317658 0,0218275430522217 48395 3346300 667 665 0 True 248 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 292 663 0,00111576164309697 0,00106980658329275 0,000991836423285267 0,000961318379491875 0,000783799455040074 0,000699980643074926 48772 46623 667 665 0 False 292 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 337 663 0,000891543241883293 0,000886583591044446 0,00080872816052491 0,000762951094834821 0,000619069039097558 0,000658033854491337 38971 38638 667 665 0 False 337 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 381 663 0,00099529086452425 0,00103570897947547 0,000869764248111696 0,000946059357595178 0,000683729568526822 0,000692411588416483 43506 45137 667 665 0 False 381 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 426 663 0,000839108941752516 0,000968936417491428 0,000656137941557946 0,00080872816052491 0,000742616426858965 0,000741717547137257 36679 42227 667 665 0 False 426 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 470 663 0,000915243911575913 0,000970886818786495 0,000656137941557946 0,000778210116731518 0,000869719244617864 0,000796294289862423 40007 42312 667 665 0 False 470 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 514 663 0,000936016313198402 0,000944338415276002 0,000579842832074464 0,000610360875867857 0,000917520723704896 0,000887935484025425 40915 41155 667 665 0 False 514 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 559 663 0,000877748354021662 0,000949248837360052 0,000656137941557946 0,000656137941557946 0,000804780946033671 0,000866628078279325 38368 41369 667 665 0 False 559 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 603 663 0,000948278435742074 0,000957417576901742 0,00080872816052491 0,000854505226215 0,000694924288781519 0,0006518258296923 41451 41725 667 665 0 False 603 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 649 669 0,00107641304090459 0,0757034036223541 0,000915541313801785 0,0738994430457008 0,00080220791790354 0,0216219315729042 47052 3299213 667 665 0 True 647 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D10_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D10_1.csv new file mode 100755 index 0000000..59440dc --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D10_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 268 258 0,010893276123023 0,0464060127430042 0,0109407186999313 0,0470893415732052 0,00151739250736574 0,00947645305898645 444754 2022410 623 665 0 True 268 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 312 259 0,0104884344329259 0,010517642240185 0,0105134660868238 0,0104982070649271 0,00141259549649169 0,00135397472643118 428225 458367 623 665 0 False 312 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 357 258 0,0106650765933095 0,0648914572996924 0,0107728694590677 0,0654154268711376 0,00129540112034503 0,0111162116983834 435437 2828020 623 665 0 True 356 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 400 256 0,010673600091897 0,0905602298261103 0,0107423514152743 0,0895399404898146 0,00144150525755481 0,0203078128117453 435785 3946685 623 665 0 True 400 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 445 257 0,0108420126674375 0,0789343007323757 0,0108796826123445 0,0756542305638209 0,00167349903955081 0,0161215873078769 442661 3440018 623 665 0 True 444 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 488 257 0,0107721591675187 0,0712979977983411 0,0107270923933776 0,0726176852063783 0,00157761962198718 0,0224172345002398 439809 3107222 623 665 0 True 489 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 533 257 0,0107538875297419 0,0851208130190434 0,0107118333714809 0,0829633020523384 0,00155247632598243 0,0249305707881596 439063 3709631 623 665 0 True 533 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 577 258 0,010710412788383 0,0759755190218623 0,0106507972838941 0,0737010757610437 0,00161908872887865 0,020641396040565 437288 3311072 623 665 0 True 577 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 621 259 0,0103843644745967 0,0103476131390504 0,010406652933547 0,0103761348897536 0,00194386974129717 0,00192905541406027 423976 450957 623 665 0 False 621 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 664 258 0,01026731332589 0,0463091122174858 0,0102388036926833 0,0462348363469902 0,00177842659795333 0,00875888952360786 419197 2018187 623 665 0 True 665 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 268 302 0,0106273086771542 0,0106353546948167 0,010605020218204 0,0106813153276875 0,0014325314155102 0,0014894417496257 433895 463497 623 665 0 False 268 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 312 302 0,0104084654016374 0,0107738790785616 0,0104676890211337 0,0107728694590677 0,00136546097481488 0,00129257910332994 424960 469534 623 665 0 False 312 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 356 302 0,010526153363457 0,109985148267786 0,0104829480430304 0,103028915846494 0,00136933965609986 0,0302124273564363 429765 4793238 623 665 0 True 356 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 401 302 0,0106462171280439 0,0547320923044622 0,0106813153276875 0,0536507209887846 0,00131241982317813 0,00878091331060939 434667 2385267 623 665 0 True 400 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 445 302 0,0106334563729746 0,0846195598862113 0,0105134660868238 0,081177996490425 0,00173910125934726 0,0175102748878483 434146 3687786 623 665 0 True 444 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 490 303 0,010537909913233 0,0438610373496112 0,0104982070649271 0,0455786984054322 0,00159658775496794 0,00747033791449298 430245 1911498 623 665 0 True 489 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 532 302 0,0107079635071796 0,0547047407945361 0,0107118333714809 0,0547341115434501 0,00162424552041531 0,0174527409245089 437188 2384075 623 665 0 True 533 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 578 302 0,0105243898809907 0,0570920090337999 0,0105745021744106 0,0569771877622644 0,00177190582558932 0,0138019996887322 429693 2488114 623 665 0 True 577 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 621 303 0,0104878955910612 0,0105877649032171 0,0104982070649271 0,0105745021744106 0,00194373570144442 0,00206262699671432 428203 461423 623 665 0 False 621 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 665 303 0,0104380037329495 0,0105594267196946 0,010452429999237 0,0106507972838941 0,00183774928788649 0,00184084303029904 426166 460188 623 665 0 False 665 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 269 347 0,0106767106790252 0,0529257453544596 0,0106660563057908 0,0518654154268711 0,00148753274089244 0,00935546900532453 435912 2306545 623 665 0 True 268 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 313 347 0,0105787884165164 0,0709710646494928 0,0105592431525139 0,068711375600824 0,00142690427363675 0,0253856719322455 431914 3092974 623 665 0 True 312 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 357 346 0,0107231735434523 0,0405060488254282 0,0107728694590677 0,0415655756466011 0,0014020212942176 0,00713866713585468 437809 1765285 623 665 0 True 356 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 401 346 0,0105639212796123 0,0384726063269871 0,0105592431525139 0,0380865186541543 0,00134701903134401 0,00702508477085335 431307 1676666 623 665 0 True 400 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 446 346 0,0107711059766013 0,0742146049490859 0,0107881284809644 0,0700236514839399 0,00169196943307887 0,0139470802621532 439766 3234330 623 665 0 True 444 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 489 346 0,0105280148171716 0,0400427252613107 0,0105745021744106 0,0375066758220798 0,00158851253143626 0,0118254322910119 429841 1745093 623 665 0 True 488 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 533 347 0,0107158501926543 0,0293723780726708 0,0106813153276875 0,0298924238956283 0,00169669196828826 0,00397175290023177 437510 1280071 623 665 0 True 533 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 578 346 0,0106372772516518 0,0531026123330758 0,0107423514152743 0,0525368123903258 0,00193268549165078 0,00960221017157025 434302 2314253 623 665 0 True 577 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 622 346 0,0107202833916323 0,0588866535760321 0,010757610437171 0,0585793850614176 0,00199943764168697 0,0130149267049341 437691 2566326 623 665 0 True 621 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 666 345 0,0109533324981284 0,0644691839463617 0,0109712367437247 0,064438849469749 0,00188627341237948 0,0171599807915246 447206 2809617 623 665 0 True 665 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 269 390 0,0107811235367229 0,0427472664265378 0,0108491645685512 0,045487144274052 0,00152666895345699 0,00937305183822602 440175 1862959 623 665 0 True 267 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 314 391 0,0105670563595525 0,0347680829448306 0,0105287251087205 0,0337834744792859 0,00138686387887786 0,00543770127004785 431435 1515220 623 665 0 True 312 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 358 390 0,0107999340163644 0,0916459149705346 0,0109102006561379 0,0862134737163348 0,00152515780481984 0,0220893770180322 440943 3994000 623 665 0 True 356 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 402 390 0,0108159278226221 0,0691864015727118 0,0106965743495842 0,0665293354695964 0,00147325094934234 0,0185498848809078 441596 3015197 623 665 0 True 400 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 445 389 0,0111201530408867 0,0458667841496623 0,0110780498970016 0,0460517280842298 0,00167601701910209 0,0107380860273708 454017 1998910 623 665 0 True 444 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 490 390 0,0107629008845702 0,0564378444394346 0,0108339055466545 0,0556343938353552 0,00183325682008462 0,011891437863208 439431 2459605 623 665 0 True 488 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 534 390 0,010798905318259 0,043671160047062 0,0107270923933776 0,0443274586099031 0,00160974549372098 0,00636280539235376 440901 1903223 623 665 0 True 533 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 579 390 0,0105524096579567 0,0528759986484866 0,0105745021744106 0,0526436255436027 0,0018431494658103 0,00923893558081755 430837 2304377 623 665 0 True 577 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 623 390 0,0105214262507346 0,0424109025137804 0,0104829480430304 0,0430457007705806 0,00191966864669133 0,00820326820479983 429572 1848300 623 665 0 True 621 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 667 390 0,0108627090936055 0,0896335597519778 0,0108339055466545 0,0897383077744717 0,00190035724064019 0,0204710293525307 443506 3906300 623 665 0 True 665 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 270 435 0,0106079103700239 0,0449348135731868 0,0105134660868238 0,0446021210040436 0,00175183574418868 0,00686921976712378 433103 1958294 623 665 0 True 267 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 313 434 0,010622728521304 0,0537296548764908 0,010605020218204 0,054032196536202 0,00137806324234709 0,00721663827956372 433708 2341580 623 665 0 True 312 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 357 435 0,0107875406534756 0,0388354498055622 0,010757610437171 0,0378881513694972 0,00139632354110591 0,00699781671742272 440437 1692479 623 665 0 True 356 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 402 434 0,0108934475727072 0,0520320485351626 0,0108491645685512 0,0526894026092927 0,00161267118355333 0,00760531543483384 444761 2267597 623 665 0 True 400 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 446 434 0,0111304400219407 0,0962855295712387 0,0110627908751049 0,0945754177157244 0,00179368942155765 0,0155160509826305 454437 4196198 623 665 0 True 444 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 491 435 0,0108672892494557 0,0600604050754031 0,0108186465247578 0,0604562447547112 0,00176893060688062 0,013340559072032 443693 2617479 623 665 0 True 488 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 534 434 0,0108973909154446 0,0535551513253264 0,010955977721828 0,0516670481422141 0,00170641814719175 0,00931820923068001 444922 2333975 623 665 0 True 533 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 577 433 0,0104335460411594 0,0316243343538521 0,0104371709773404 0,0319981689173724 0,00195064658650755 0,00442977011017217 425984 1378213 623 665 0 True 577 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 623 434 0,0104182380336387 0,0420903253785643 0,0104829480430304 0,0418860151064317 0,00186846826406179 0,00784748737922209 425359 1834329 623 665 0 True 621 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 667 433 0,0107204058556925 0,0684701912712658 0,0107423514152743 0,0677195391775387 0,00188575166058463 0,0114904562780427 437696 2983984 623 665 0 True 665 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 269 480 0,0105111882553047 0,0610197959994975 0,0105439841306172 0,0606851300831617 0,00158234335797785 0,0182148711314525 429154 2659290 623 665 0 True 267 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 313 479 0,0107632437839386 0,0578879563293677 0,0107270923933776 0,0567177843900206 0,00170075646207403 0,00798593822949752 439445 2522802 623 665 0 True 312 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 356 478 0,0109937946236073 0,0671912098855516 0,0109254596780346 0,0677195391775387 0,00161648595951246 0,0169285210951183 448858 2928245 623 665 0 True 356 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 401 478 0,0111027631443431 0,089954022157706 0,0110933089188983 0,0836804760814832 0,00176002880282599 0,0249898174513346 453307 3920266 623 665 0 True 400 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 445 478 0,011021569472453 0,0956259267991448 0,0110933089188983 0,0917219806210422 0,00191652234573464 0,0311135593124828 449992 4167452 623 665 0 True 444 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 489 479 0,0109820870594554 0,0493144511542073 0,0109407186999313 0,0495155260547799 0,00182620102974114 0,0114093013315526 448380 2149162 623 665 0 True 488 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 534 477 0,0107006156635697 0,0397049616488004 0,0106660563057908 0,0411078049897002 0,00183824717876798 0,00555361661505013 436888 1730373 623 665 0 True 532 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 577 478 0,0107214345537979 0,0983756254908271 0,0107728694590677 0,0935225452048524 0,00193730731906249 0,021018086880631 437738 4287286 623 665 0 True 577 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 621 478 0,010534946282977 0,0661306963907824 0,0105745021744106 0,0693064774547952 0,00191811664697406 0,0204285512749256 430124 2882027 623 665 0 True 621 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 666 478 0,0106441352390211 0,0840795281864538 0,0107118333714809 0,0784924086366064 0,0019410270048115 0,0177824247490556 434582 3664251 623 665 0 True 665 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 268 522 0,0104828990574064 0,0532657117731385 0,010452429999237 0,0569771877622644 0,00155451703412849 0,0152496382045721 427999 2321361 623 665 0 True 267 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 313 522 0,0108957988826624 0,103737255705067 0,0109254596780346 0,0957961394674601 0,00151356439337724 0,0285810932325226 444857 4520950 623 665 0 True 311 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 357 522 0,0107129845336464 0,053697484728071 0,0108033875028611 0,0573281452658885 0,0015765413402952 0,0114270285089682 437393 2340178 623 665 0 True 356 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 401 522 0,0109289131645313 0,0604217800165325 0,0109864957656214 0,0581979095140002 0,00168864216824256 0,0127022146798422 446209 2633228 623 665 0 True 400 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 445 522 0,0112216512539524 0,0579748983353325 0,0112153810940719 0,0577706569008927 0,00185679435813237 0,0104646330486441 458161 2526591 623 665 0 True 444 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 490 522 0,0108821808791719 0,0602146932907916 0,0110170138094148 0,0602273594262608 0,00173944119006576 0,0126234996645109 444301 2624203 623 665 0 True 488 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 534 522 0,0108780171011263 0,0708745083124382 0,0108644235904479 0,0688487067978943 0,00179645429282961 0,016658844985171 444131 3088766 623 665 0 True 532 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 577 522 0,0106302968002223 0,0562086837602131 0,0106660563057908 0,0573586633096818 0,00167169038667511 0,0133705062748999 434017 2449618 623 665 0 True 577 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 622 522 0,0104703342448333 0,04550400950878 0,0104829480430304 0,0441748683909361 0,00192337113849968 0,00892409708899157 427486 1983100 623 665 0 True 621 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 667 522 0,0103965129093652 0,0737934559447371 0,0103456168459602 0,0685282673380636 0,00199563869474246 0,0220413069244761 424472 3215976 623 665 0 True 665 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 269 566 0,0102054444826941 0,0431764694409404 0,0101319905394064 0,0444800488288701 0,00142150720844303 0,00819206497022343 416671 1881664 623 665 0 True 267 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 313 566 0,0102434083413455 0,0512352751872815 0,0102388036926833 0,0526131074998093 0,00134709266920233 0,0111581800732273 418221 2232873 623 665 0 True 311 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 357 566 0,0106723999441074 0,0515845805862792 0,0106813153276875 0,0522468909742886 0,00136878658762251 0,0112652510540622 435736 2248096 623 665 0 True 356 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 401 566 0,0107570960881183 0,048670841672733 0,0108491645685512 0,048706797894255 0,00147629085698908 0,00701759747450014 439194 2121113 623 665 0 True 400 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 446 566 0,0110108416207824 0,0894594921728675 0,0109712367437247 0,0825055313954376 0,00191886311300431 0,0228760663531442 449554 3898714 623 665 0 True 444 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 490 567 0,0107457069305228 0,061455033784966 0,0107728694590677 0,0602731364919509 0,0021221994382151 0,0120469128145358 438729 2678258 623 665 0 True 488 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 533 566 0,010585132054833 0,0541839607028558 0,0105897611963073 0,0543984130617227 0,00202038192241096 0,00889972160321022 432173 2361379 623 665 0 True 532 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 578 565 0,0104001378455461 0,0377822789980215 0,0104219119554437 0,0390783550774395 0,00171836216086815 0,00800281646319836 424620 1646581 623 665 0 True 576 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 622 566 0,0103386608873427 0,0472778421218989 0,0103608758678569 0,0476539253833829 0,00160673016744711 0,00654670142207151 422110 2060405 623 665 0 True 621 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 666 566 0,0104577694322603 0,050472920685784 0,0104676890211337 0,0496070801861601 0,00180876426031124 0,0064952753999262 426973 2199649 623 665 0 True 665 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 267 605 0,0101313537262936 0,010106497647185 0,0100404364080262 0,0101625085831998 0,00151469462468421 0,00136568971886786 413646 440449 623 665 0 False 267 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 311 605 0,010179604565999 0,00994284750558016 0,0101625085831998 0,00988784618905928 0,00150362202729249 0,00141055662398527 415616 433317 623 665 0 False 311 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 357 610 0,0105149601483579 0,0759483740250145 0,0104676890211337 0,0749980926222629 0,00146113602530734 0,0138855104350543 429308 3309889 623 665 0 True 355 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 402 610 0,0106290721596206 0,0767851420723932 0,010605020218204 0,0733501182574197 0,00146132927086166 0,0213089045184803 433967 3346356 623 665 0 True 400 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 444 605 0,0104316356018208 0,010444169476105 0,0103303578240635 0,0104676890211337 0,00187680045321234 0,00197416308016271 425906 455165 623 665 0 False 444 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 488 605 0,0103792699696938 0,0103101654341851 0,010452429999237 0,0102845807583734 0,00205429311067025 0,00198924295228392 423768 449325 623 665 0 False 488 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 532 606 0,010365382545271 0,0103691134450913 0,0102845807583734 0,0104219119554437 0,00191887281144693 0,00196064921791055 423201 451894 623 665 0 False 532 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 576 606 0,0101813925412774 0,0101232940442202 0,0102998397802701 0,0101777676050965 0,00179533908172104 0,00188981467290158 415689 441181 623 665 0 False 576 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 621 606 0,0103239652001228 0,010249542372755 0,0102693217364767 0,0101625085831998 0,00149884557975806 0,00145130838249802 421510 446683 623 665 0 False 621 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 665 606 0,0103815233084009 0,010165399766296 0,0102998397802701 0,0101930266269932 0,00166502773201081 0,00157637449433276 423860 443016 623 665 0 False 665 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 268 655 0,00984500826081318 0,0432259866879375 0,0098115510795758 0,0440680552376593 0,00130733968296836 0,00917367634436476 401955 1883822 623 665 0 True 267 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 311 649 0,0102562180820389 0,00991090681613624 0,0101472495613031 0,00996414129854276 0,0013145764144763 0,00128356357938723 418744 431925 623 665 0 False 311 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 355 649 0,010375694019137 0,0104718881203925 0,0102388036926833 0,0101472495613031 0,00169262355597861 0,00257929368999255 423622 456373 623 665 0 False 355 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 400 649 0,0102506827065194 0,0100229057422682 0,0101472495613031 0,00994888227664607 0,00157726942068472 0,00131650262910538 418518 436806 623 665 0 False 400 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 444 649 0,0102948432466153 0,0101049143802514 0,0103456168459602 0,0101472495613031 0,00152458086726674 0,00162472037106624 420321 440380 623 665 0 False 444 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 488 649 0,0100192011399934 0,0100158154599132 0,00994888227664607 0,0100251773861295 0,00174406818458346 0,00172933699813802 409067 436497 623 665 0 False 488 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 532 649 0,0100813149113097 0,0101146204949315 0,0101319905394064 0,0101930266269932 0,0018635317706769 0,00163719033743886 411603 440803 623 665 0 False 532 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 576 649 0,010060153121713 0,00988919999701703 0,0101319905394064 0,00988784618905928 0,00161666783365159 0,00137302738218081 410739 430979 623 665 0 False 576 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 621 649 0,0100444532291997 0,0102431404673276 0,0100556954299229 0,0102082856488899 0,00135409832052629 0,00139678932837843 410098 446404 623 665 0 False 621 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 665 654 0,010269566664597 0,0442999464786939 0,0102693217364767 0,0445410849164569 0,00137357535740454 0,00843678746291644 419289 1930626 623 665 0 True 665 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D10_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D10_2.csv new file mode 100755 index 0000000..ccc911c --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D10_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 268 258 0,00858406931171892 0,756361950883159 0,0085145342183566 0,790371557183185 0,00177598871267382 0,192862769018532 350473 32962840 623 665 12 True 268 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 312 259 0,00729410638036529 0,00692052860464276 0,0072632944228275 0,00689707789730678 0,00145375908137324 0,00127910557442248 297806 301602 623 665 0 False 312 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 357 258 0,00654484676745704 0,00662943694782849 0,00654612039368277 0,00672922865644312 0,00121096827327806 0,00120547176206347 267215 288916 623 665 0 True 356 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 400 256 0,00663353523982933 0,00654407820879734 0,00665293354695964 0,00653086137178607 0,00129071180445426 0,00121802968024604 270836 285196 623 665 0 True 400 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 445 257 0,00674561434769335 0,0068496257810927 0,00671396963454643 0,00677500572213321 0,00146259832831182 0,00153137838150225 275412 298512 623 665 0 True 444 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 488 257 0,00687625900707855 0,00705572583323725 0,00695811398489357 0,00704966811627375 0,00152713102448774 0,00154131366860834 280746 307494 623 665 0 True 489 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 533 257 0,00708743603242897 0,00734892851262971 0,00715648126955062 0,00737010757610437 0,00149156806576832 0,00148214805513046 289368 320272 623 665 0 True 533 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 577 258 0,00744098977412851 0,00743148785215499 0,00737010757610437 0,00743114366369116 0,00163042762272997 0,00156054241114242 303803 323870 623 665 0 True 577 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 621 259 0,00821437480688949 0,00810336667945901 0,00817883573662928 0,0081025406271458 0,00191595333405155 0,00178232000581704 335379 353151 623 665 0 False 621 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 664 258 0,00948983799351945 0,763728157656673 0,00944533455405508 0,776943617914092 0,00183672785231781 0,176988277364491 387454 33283865 623 665 14 True 665 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 268 302 0,00711014086918377 0,00694604444276175 0,00708018616006714 0,00695811398489357 0,00158881841763667 0,00133696526683873 290295 302714 623 665 0 False 268 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 312 302 0,00657313596535541 0,00694728352123155 0,00660715648126955 0,00695811398489357 0,00125076361491864 0,00123200729392715 268370 302768 623 665 0 False 312 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 356 302 0,00637033548172034 0,00657737270619901 0,00633249408712902 0,00657663843747616 0,0012806174685175 0,00128997243433319 260090 286647 623 665 0 True 356 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 401 302 0,00647168673791381 0,00686141997245345 0,00648508430609598 0,00685130083161669 0,00127327783282605 0,00131987147844701 264228 299026 623 665 0 True 400 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 445 302 0,00668220245733934 0,00669593415904146 0,00671396963454643 0,00668345159075303 0,00165898461678131 0,00159689589142378 272823 291814 623 665 0 True 444 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 490 303 0,00697557735987325 0,00707222393360375 0,00706492713817044 0,00709544518196384 0,00164906472783225 0,00158645368451591 284801 308213 623 665 0 True 489 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 532 302 0,00730358509862214 0,007343719793877 0,00733958953231098 0,00737010757610437 0,00151104668375937 0,00153957466053693 298193 320045 623 665 0 True 533 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 578 302 0,00748191726303602 0,00768386977973659 0,00747692072938125 0,00764476997024491 0,00169992298906807 0,00178467636671854 305474 334869 623 665 0 True 577 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 621 303 0,00794889721726141 0,00789703716833856 0,00796520943007553 0,00793469138628214 0,00196372946224846 0,00176113490071088 324540 344159 623 665 0 False 621 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 665 303 0,00804035337739345 0,00790210821170574 0,00801098649576562 0,00790417334248875 0,00186792387954886 0,00183934609482703 328274 344380 623 665 0 False 665 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 269 347 0,00663662133414552 0,0066229203129132 0,00660715648126955 0,00657663843747616 0,0013666484597191 0,00142414420098903 270962 288632 623 665 0 True 268 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 313 347 0,00664867179766586 0,00673753507137035 0,00666819256885634 0,00675974670023652 0,00124793149135103 0,00124643220033334 271454 293627 623 665 0 True 312 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 357 346 0,00669689814455927 0,00660082341353498 0,00668345159075303 0,00656137941557946 0,00123425936460979 0,00129597746119856 273423 287669 623 665 0 True 356 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 401 346 0,00681201436111541 0,00680967697339022 0,0068207827878233 0,00679026474402991 0,00142829288472295 0,00130456847259056 278123 296771 623 665 0 True 400 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 446 346 0,00675795872495809 0,0071425301638165 0,00671396963454643 0,00721751735713741 0,00166632216837619 0,0016765471500223 275916 311277 623 665 0 True 444 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 489 346 0,00688221076040262 0,00711354949516157 0,00700389105058366 0,00708018616006714 0,00158059250080352 0,00149608838143209 280989 310014 623 665 0 True 488 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 533 347 0,00701775398219446 0,00705609296759867 0,00698863202868696 0,00706492713817044 0,00163375249984992 0,0015661215458462 286523 307510 623 665 0 True 533 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 578 346 0,00740464244107121 0,00765227327875652 0,00733958953231098 0,00776684214541848 0,00184843852403375 0,00195001318814338 302319 333492 623 665 0 True 577 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 622 346 0,00756791152608466 0,00754798417421443 0,00752269779507134 0,00756847486076143 0,00202020715102753 0,00196444256446543 308985 328947 623 665 0 True 621 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 666 345 0,00720823458137682 0,00745489266769579 0,00720225833524071 0,00744640268558785 0,00194876857634173 0,00177796515417049 294300 324890 623 665 0 True 665 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 269 390 0,00664798599892893 0,00655557410348944 0,00659189745937285 0,00654612039368277 0,00135470314115442 0,00141565184004412 271426 285697 623 665 0 True 267 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 314 391 0,00676202453175561 0,00701047652319171 0,00679026474402991 0,00700389105058366 0,00130794620307575 0,00133722126051377 276082 305522 623 665 0 True 312 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 358 390 0,00696480052257864 0,00702272963250424 0,00700389105058366 0,00695811398489357 0,00139076424314724 0,00135092493357093 284361 306056 623 665 0 True 356 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 402 390 0,00711844393246303 0,00703466149925053 0,00718699931334401 0,00700389105058366 0,00143369021256897 0,00133961800744449 290634 306576 623 665 0 True 400 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 445 389 0,00714325515105268 0,00685572938985137 0,00720225833524071 0,00688181887541009 0,0017134252590305 0,00155428423536629 291647 298778 623 665 0 True 444 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 490 390 0,00691108778578978 0,0070911313532171 0,00695811398489357 0,00717174029144732 0,00166357106396479 0,00169817275568528 282168 309037 623 665 0 True 488 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 534 390 0,00714097731953359 0,00720216655165036 0,00720225833524071 0,00727855344472419 0,00167689291602097 0,00167064156784981 291554 313876 623 665 0 True 533 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 579 390 0,00721827663431044 0,00753001753640223 0,00720225833524071 0,00741588464179446 0,00173606850252091 0,00243863560379091 294710 328164 623 665 0 True 577 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 623 390 0,00687214421465696 0,00681708849831147 0,00675974670023652 0,00672922865644312 0,00196601145158771 0,00182853137184028 280578 297094 623 665 0 True 621 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 667 390 0,00650303753731633 0,00660708764357678 0,0063935301747158 0,00660715648126955 0,00182891521870231 0,00183593813747006 265508 287942 623 665 0 True 665 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 270 435 0,00677578949211827 0,00658721649626469 0,00669871061264973 0,00666819256885634 0,00157899596168768 0,00153094647210387 276644 287076 623 665 0 True 267 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 313 434 0,00682212989248513 0,00716850491988727 0,00688181887541009 0,00720225833524071 0,00142869839254465 0,00140279421167808 278536 312409 623 665 0 True 312 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 357 435 0,00691699055348979 0,00722779711925729 0,00695811398489357 0,00729381246662089 0,00127765368745369 0,00123843371907746 282409 314993 623 665 0 True 356 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 402 434 0,00708449689498499 0,00702947572639541 0,00709544518196384 0,00704966811627375 0,00150537933362056 0,00155720846039125 289248 306350 623 665 0 True 400 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 446 434 0,00706960526526879 0,00710125049405386 0,00704966811627375 0,00704966811627375 0,00172893170097504 0,00194055980648072 288640 309478 623 665 0 True 444 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 491 435 0,00718528481650169 0,0070478783362618 0,00727855344472419 0,00697337300679027 0,00177585406984478 0,00171178065058533 293363 307152 623 665 0 True 488 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 534 434 0,00698125969226496 0,00690329623555341 0,00697337300679027 0,00695811398489357 0,00169484030159037 0,00158641468931847 285033 300851 623 665 0 True 533 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 577 433 0,00666361241300612 0,00661571530107025 0,00666819256885634 0,00659189745937285 0,00186906953458408 0,00184486254320112 272064 288318 623 665 0 True 577 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 623 434 0,00625000229620113 0,00608403590803514 0,00628671702143893 0,00601205462729839 0,00175928175881304 0,00174615357000978 255177 265147 623 665 0 True 621 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 667 433 0,00621713294245255 0,00635615130754329 0,00633249408712902 0,0064087891966125 0,00168096830803043 0,00173871579641267 253835 277006 623 665 0 True 665 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 269 480 0,00694841483132841 0,00683005293044926 0,00698863202868696 0,00688181887541009 0,0014491861666839 0,00150306144787418 283692 297659 623 665 0 True 267 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 313 479 0,00711815001871863 0,00667434206941019 0,00720225833524071 0,00663767452506294 0,00145260636553567 0,00148597623503237 290622 290873 623 665 0 True 312 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 356 478 0,0070523623255974 0,00698824194842795 0,00700389105058366 0,00704966811627375 0,00151876304998103 0,0014637901855857 287936 304553 623 665 0 True 356 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 401 478 0,00706544148722314 0,00703227512590127 0,00698863202868696 0,00704966811627375 0,00158850601926883 0,00150626353892483 288470 306472 623 665 0 True 400 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 445 478 0,00711055724698833 0,0070376444659371 0,00712596322575723 0,00708018616006714 0,00189794396972619 0,00202082238543024 290312 306706 623 665 0 True 444 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 489 479 0,00698632970435584 0,00708034678135026 0,00697337300679027 0,00718699931334401 0,0018798866763716 0,00196173287271541 285240 308567 623 665 0 True 488 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 534 477 0,00642801605405858 0,00638722005287882 0,00648508430609598 0,0064087891966125 0,00168092721821231 0,00165498443513982 262445 278360 623 665 0 True 532 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 577 478 0,00604511992354324 0,00633478867688792 0,00602731364919509 0,00643930724040589 0,00179639563062199 0,00193022660961814 246812 276075 623 665 0 True 577 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 621 478 0,00632607697037631 0,00622453363897269 0,00628671702143893 0,00617990386816205 0,00165174713463693 0,00164412156219244 258283 271270 623 665 0 True 621 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 666 478 0,00629629371094391 0,00615509935286832 0,00634775310902571 0,00624093995574884 0,00185079383222263 0,00171256232718504 257067 268244 623 665 0 True 665 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 268 522 0,00672609357650287 0,00706456000380902 0,00671396963454643 0,00708018616006714 0,00143659803003476 0,00151292984015854 274615 307879 623 665 0 True 267 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 313 522 0,00660309067447204 0,00665137322592359 0,00657663843747616 0,00665293354695964 0,00145021988571016 0,00148680623128471 269593 289872 623 665 0 True 311 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 357 522 0,00701302686947205 0,00663753684967741 0,00700389105058366 0,00657663843747616 0,00134586866310955 0,00140184952706755 286330 289269 623 665 0 True 356 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 401 522 0,00708454588060905 0,00691385134844435 0,00711070420386053 0,00691233691920348 0,00161744905901378 0,00167641132840026 289250 301311 623 665 0 True 400 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 445 522 0,00683373948538887 0,00673886593343051 0,0068207827878233 0,00672922865644312 0,00179613817141875 0,00194741533948991 279010 293685 623 665 0 True 444 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 490 522 0,00646223251246898 0,00652101758172038 0,00645456626230259 0,00656137941557946 0,00173269638222744 0,00170446729753546 263842 284191 623 665 0 True 488 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 534 522 0,00614696103597737 0,00622361580306913 0,00608834973678187 0,00628671702143893 0,00161355810610676 0,00160908079438789 250970 271230 623 665 0 True 532 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 577 522 0,00631037707786302 0,0060322929089719 0,00636301213092241 0,00613412680247196 0,00165306442857626 0,00162620774037733 257642 262892 623 665 0 True 577 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 622 522 0,00625541520766047 0,00625927372792246 0,00621042191195544 0,00608834973678187 0,00168986512123181 0,001806625614103 255398 272784 623 665 0 True 621 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 667 522 0,00641099354969549 0,00643988088784562 0,00642404821850919 0,0064087891966125 0,00187947978996487 0,00182622715392743 261750 280655 623 665 0 True 665 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 269 566 0,00713056787441947 0,00686970344148309 0,00712596322575723 0,00688181887541009 0,00132789749945564 0,001289233987327 291129 299387 623 665 0 True 267 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 313 566 0,00681245523173201 0,00733268281713668 0,00677500572213321 0,00730907148851759 0,00141721442021219 0,00144535606832595 278141 319564 623 665 0 True 311 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 357 566 0,00675171305788962 0,00686488480298939 0,00677500572213321 0,0068207827878233 0,00144411341462652 0,00129803768508867 275661 299177 623 665 0 True 356 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 401 566 0,00672041124411116 0,00696795777495926 0,00668345159075303 0,00694285496299687 0,00142976840488272 0,001366178205833 274383 303669 623 665 0 True 400 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 446 566 0,00676077539834191 0,00677812636420532 0,00672922865644312 0,0068207827878233 0,00174700370832098 0,00188624861535247 276031 295396 623 665 0 True 444 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 490 567 0,00668741942630242 0,00659983673993865 0,00672922865644312 0,00654612039368277 0,00197394341515486 0,00198152058721486 273036 287626 623 665 0 True 488 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 533 566 0,00634826745807841 0,00634511433080298 0,0063935301747158 0,00636301213092241 0,00182569611311204 0,00180306328325289 259189 276525 623 665 0 True 532 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 578 565 0,00628358194149867 0,00644527317377903 0,00630197604333562 0,00642404821850919 0,00157616155224083 0,00159015432194306 256548 280890 623 665 0 True 576 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 622 566 0,00630087386679413 0,00637241994893391 0,00633249408712902 0,0064087891966125 0,00153513788035529 0,00156512223375096 257254 277715 623 665 0 True 621 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 666 566 0,00656191825744419 0,00651473040578099 0,00663767452506294 0,00657663843747616 0,0016699629608809 0,00168065271269871 267912 283917 623 665 0 True 665 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 267 605 0,00732820037471553 0,00715372776183994 0,00735484855420768 0,00717174029144732 0,00142515121778652 0,00131557998110908 299198 311765 623 665 0 False 267 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 311 605 0,00678526821037513 0,00682670282940127 0,00683604180972 0,00674448767833982 0,0014733874207613 0,00131319445194081 277031 297513 623 665 0 False 311 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 357 610 0,00651224683464082 0,00664458124023724 0,00651560234988937 0,00657663843747616 0,00135239458713044 0,00142112184008223 265884 289576 623 665 0 True 355 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 402 610 0,00656855580950519 0,0067158970899439 0,00654612039368277 0,00671396963454643 0,00136985347628409 0,00137737063370314 268183 292684 623 665 0 True 400 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 444 605 0,0065451161883894 0,00660160357405301 0,00651560234988937 0,00668345159075303 0,00176360337033355 0,00185525093777217 267226 287703 623 665 0 False 444 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 488 605 0,00649150142284868 0,00648884743330058 0,00645456626230259 0,00650034332799268 0,00198151100849622 0,00191677201701237 265037 282789 623 665 0 False 488 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 532 606 0,00631659825211946 0,00642395643491884 0,00628671702143893 0,00628671702143893 0,00194310881568894 0,00183395740175164 257896 279961 623 665 0 False 532 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 576 606 0,006170278193033 0,00633104849558091 0,00605783169298848 0,0063782711528191 0,00164311047661085 0,00171088331028207 251922 275912 623 665 0 False 576 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 621 606 0,00630809924634393 0,00629327954814939 0,00625619897764553 0,00634775310902571 0,00143219728997964 0,00142681262837002 257549 274266 623 665 0 False 621 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 665 606 0,0066119815652401 0,00662705057447923 0,00662241550316625 0,00662241550316625 0,00154875053885191 0,00164973819847003 269956 288812 623 665 0 False 665 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 268 655 0,00865647006408912 0,74384620282682 0,00848401617456321 0,765194171053635 0,00208412950342685 0,209240982626652 353429 32417394 623 665 13 True 267 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 311 649 0,00747807189154681 0,0070533165139904 0,0072632944228275 0,00692759594110018 0,00179444149881293 0,00154624771386559 305317 307389 623 665 0 False 311 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 355 649 0,00670439294504144 0,00692075806361865 0,00669871061264973 0,00646982528419928 0,00128400535943173 0,0033986234177042 273729 301612 623 665 0 False 355 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 400 649 0,00646705759643953 0,00627294948288552 0,0064087891966125 0,00627145799954223 0,00133915578248116 0,00136863024857852 264039 273380 623 665 0 False 400 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 444 649 0,00648246357520842 0,00618860036334829 0,00657663843747616 0,00630197604333562 0,00157224696074892 0,00150158692689833 264668 269704 623 665 0 False 444 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 488 649 0,00628314107088208 0,00625144917684461 0,00621042191195544 0,00621042191195544 0,00172130077249884 0,00160712544434645 256530 272443 623 665 0 False 488 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 532 649 0,00637832013844317 0,00614128592251973 0,00648508430609598 0,00614938582436866 0,00172469262715477 0,00168324836481494 260416 267642 623 665 0 False 532 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 576 649 0,00636112618439585 0,00623357432262276 0,00634775310902571 0,00625619897764553 0,0014418997775986 0,00134158455736892 259714 271664 623 665 0 False 576 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 621 649 0,00671171629583937 0,00659178272988491 0,00674448767833982 0,00662241550316625 0,00139516588969277 0,00141361042417254 274028 287275 623 665 0 False 621 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 665 654 0,00822297178391315 0,75903989775308 0,00822461280231937 0,779476615548943 0,00153866052727026 0,189353975631734 335730 33079547 623 665 14 True 665 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D10_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D10_3.csv new file mode 100755 index 0000000..1d73360 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D10_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 268 258 0,00104442249072059 0,0752175242409067 0,000839246204318303 0,0768291752498665 0,000798917499186604 0,0212483520845465 42642 3278038 623 665 0 True 268 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 312 259 0,000920513354644529 0,000890346718249044 0,000839246204318303 0,000778210116731518 0,000644257850387314 0,000624044177889773 37583 38802 623 665 0 False 312 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 357 258 0,000864498293524554 0,00090165904576043 0,000732433051041428 0,000823987182421607 0,000662131188747245 0,000612726198503545 35296 39295 623 665 0 True 356 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 400 256 0,000906332016477294 0,000926302939771034 0,000823987182421607 0,000778210116731518 0,000651941970758067 0,000719045152899253 37004 40369 623 665 0 True 400 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 445 257 0,000966780276575283 0,000932268873144179 0,000778210116731518 0,000717174029144732 0,000828904450403481 0,000832419115962437 39472 40629 623 665 0 True 444 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 488 257 0,00100692399549773 0,000994957065357374 0,000793469138628214 0,000839246204318303 0,000895584836135008 0,000855268693943658 41111 43361 623 665 0 True 489 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 533 257 0,000998596439406436 0,00102841218404216 0,000854505226215 0,000839246204318303 0,000815155488746161 0,000815418481884622 40771 44819 623 665 0 True 533 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 577 258 0,00107347096579199 0,000970542630322659 0,000900282291905089 0,000686655985351339 0,000900635649165988 0,000932637577219333 43828 42297 623 665 0 True 577 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 621 259 0,000967564046560346 0,000984195439388125 0,00064087891966125 0,000686655985351339 0,000981613880200404 0,000924905876276423 39504 42892 623 665 0 False 621 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 664 258 0,00111736208495552 0,0767145145996142 0,000747692072938125 0,0754100862134737 0,000996177241252562 0,021274898089193 45620 3343278 623 665 0 True 665 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 268 302 0,000920733789952828 0,000923411756674818 0,000778210116731518 0,000762951094834821 0,000731180258834027 0,00074535756642012 37592 40243 623 665 0 False 268 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 312 302 0,000897514604145335 0,000846474162058844 0,000793469138628214 0,000747692072938125 0,000642000672119064 0,000585741860808915 36644 36890 623 665 0 False 312 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 356 302 0,000847059411356901 0,000865978175009508 0,000747692072938125 0,000747692072938125 0,000666580111952022 0,000649514518919163 34584 37740 623 665 0 True 356 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 401 302 0,0008326086522573 0,000864371962178277 0,000656137941557946 0,000671396963454643 0,000689575341662513 0,000681813888974601 33994 37670 623 665 0 True 400 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 445 302 0,000890877052084332 0,00090305874551336 0,000625619897764553 0,000610360875867857 0,000871358324942473 0,000868761696114578 36373 39356 623 665 0 True 444 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 490 303 0,000914488122884357 0,000954319880727224 0,000701915007248035 0,000701915007248035 0,000849614543724025 0,000863422170334905 37337 41590 623 665 0 True 489 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 532 302 0,00095291734496448 0,00101067500520585 0,000778210116731518 0,000839246204318303 0,00082581670507994 0,000837868403867965 38906 44046 623 665 0 True 533 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 578 302 0,000944810224181484 0,00101494294215741 0,000686655985351339 0,000686655985351339 0,000869337415221016 0,000996865261489916 38575 44232 623 665 0 True 577 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 621 303 0,000986692932758291 0,00100594815030251 0,00064087891966125 0,000656137941557946 0,0010029884611222 0,0010321701849686 40285 43840 623 665 0 False 621 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 665 303 0,000938760499609278 0,00103598433024654 0,000610360875867857 0,000686655985351339 0,000917724990587346 0,000987163234742067 38328 45149 623 665 0 False 665 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 269 347 0,000817178180676371 0,00088672126642998 0,000671396963454643 0,000701915007248035 0,000695164581245344 0,000717576876577773 33364 38644 623 665 0 True 268 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 313 347 0,000900110842220856 0,000814028662867973 0,000823987182421607 0,000701915007248035 0,000655264140093204 0,00060365329053441 36750 35476 623 665 0 True 312 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 357 346 0,000895310251062345 0,000898033593941365 0,000778210116731518 0,000778210116731518 0,000655334841674429 0,000645171151907629 36554 39137 623 665 0 True 356 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 401 346 0,000880173693225815 0,000865037393208359 0,000732433051041428 0,000686655985351339 0,000685041936706397 0,000683239558047397 35936 37699 623 665 0 True 400 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 446 346 0,000769319225963459 0,000921576084867697 0,000549324788281071 0,00064087891966125 0,000739580563941253 0,000877094161480579 31410 40163 623 665 0 True 444 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 489 346 0,000952500967159915 0,000936467972402969 0,000747692072938125 0,000686655985351339 0,000824150445836453 0,000872663532614915 38889 40812 623 665 0 True 488 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 533 347 0,00107606720386751 0,00101925677090414 0,000885023270008392 0,00080872816052491 0,000866599023206835 0,000865438574620939 43934 44420 623 665 0 True 533 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 578 346 0,00100983864012968 0,000972515977515315 0,000717174029144732 0,00064087891966125 0,0010424302500985 0,000990533102882754 41230 42383 623 665 0 True 577 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 622 346 0,000962689976965735 0,0010091146841698 0,000595101853971161 0,000701915007248035 0,00101648014664402 0,00105150873357404 39305 43978 623 665 0 True 621 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 666 345 0,0010204685205521 0,00101354324240448 0,000732433051041428 0,000656137941557946 0,000952300532844815 0,00102513386570412 41664 44171 623 665 0 True 665 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 269 390 0,000926734528900967 0,000888098020285321 0,000793469138628214 0,000732433051041428 0,000754779583398917 0,000738043584727594 37837 38704 623 665 0 True 267 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 314 391 0,000880761520714612 0,000886032889502309 0,000778210116731518 0,000747692072938125 0,000653963135776606 0,00066736806250594 35960 38614 623 665 0 True 312 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 358 390 0,000833882278483028 0,00097871136986435 0,000701915007248035 0,000885023270008392 0,000652951554781294 0,000702681778035896 34046 42653 623 665 0 True 356 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 402 390 0,000962812441025901 0,000871990000177831 0,000762951094834821 0,000671396963454643 0,00077255188423554 0,000736358910640225 39310 38002 623 665 0 True 400 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 445 389 0,000855558417132428 0,000969303551852853 0,000625619897764553 0,000717174029144732 0,000788118739404527 0,000862464371914321 34931 42243 623 665 0 True 444 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 490 390 0,000964355488183994 0,00105388213036597 0,000717174029144732 0,000778210116731518 0,000882601781870371 0,000936366334642568 39373 45929 623 665 0 True 488 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 534 390 0,00100486659928694 0,000998031815634302 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,000898888175056952 0,000883624913616412 41027 43495 623 665 0 True 533 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 579 390 0,000938662528361146 0,000998192436917425 0,000625619897764553 0,000579842832074464 0,00097441880733 0,00104992943007274 38324 43502 623 665 0 True 577 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 623 390 0,000904715490883102 0,000880617657671301 0,000503547722590982 0,000488288700694286 0,001004909950456 0,000950833854665708 36938 38378 623 665 0 True 621 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 667 390 0,000963008383522167 0,000848470455149088 0,000656137941557946 0,000457770656900893 0,000922428780524334 0,000917105458954761 39318 36977 623 665 0 True 665 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 270 435 0,000872801356803815 0,000893513252116329 0,000686655985351339 0,000778210116731518 0,000763338306170192 0,000762653689090843 35635 38940 623 665 0 True 267 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 313 434 0,000916202619726682 0,00092641766925898 0,00080872816052491 0,000823987182421607 0,000692526266137794 0,000760848680898623 37407 40374 623 665 0 True 312 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 357 435 0,000884312978459429 0,00094275514834236 0,000793469138628214 0,000839246204318303 0,000663056470523224 0,000696003699308654 36105 41086 623 665 0 True 356 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 402 434 0,000900331277529155 0,000908382193754012 0,000686655985351339 0,000701915007248035 0,000811449445749914 0,000800636400706066 36759 39588 623 665 0 True 400 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 446 434 0,000865110613825384 0,000843973059221641 0,000625619897764553 0,000518806744487678 0,000806286528313348 0,000855697619147764 35321 36781 623 665 0 True 444 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 491 435 0,000924162783637479 0,000927473180548074 0,000686655985351339 0,000625619897764553 0,00088623970929777 0,000915857029996858 37732 40420 623 665 0 True 488 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 534 434 0,000903417371845341 0,000973043733159862 0,000625619897764553 0,000747692072938125 0,00086008486399092 0,000872952180215298 36885 42406 623 665 0 True 533 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 577 433 0,000951374297806387 0,000999362677694465 0,000595101853971161 0,000518806744487678 0,000993693578930916 0,00107231852807558 38843 43553 623 665 0 True 577 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 623 434 0,000909956952658211 0,000901521370374896 0,000518806744487678 0,000549324788281071 0,000978695370624642 0,000869980519526699 37152 39289 623 665 0 True 621 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 667 433 0,000896191992295541 0,000916023177651155 0,000503547722590982 0,000564583810177768 0,000976516212284414 0,000901296655781928 36590 39921 623 665 0 True 665 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 269 480 0,000872287007751118 0,000844018951016819 0,000732433051041428 0,000686655985351339 0,000727824099062799 0,000748899723958898 35614 36783 623 665 0 True 267 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 313 479 0,000884606892203828 0,000915770772777676 0,000686655985351339 0,00080872816052491 0,000797806766910232 0,000778763961758598 36117 39910 623 665 0 True 312 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 356 478 0,000927934676690595 0,000909942514790065 0,000762951094834821 0,000762951094834821 0,000786013502008699 0,00081087734257636 37886 39656 623 665 0 True 356 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 401 478 0,000907679121139122 0,000859323864708693 0,000717174029144732 0,000610360875867857 0,000823445351437597 0,00082548022047157 37059 37450 623 665 0 True 400 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 445 478 0,000907581149890989 0,000905261551681906 0,000579842832074464 0,000518806744487678 0,000954073172970086 0,00102066006489416 37055 39452 623 665 0 True 444 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 489 479 0,00101307169131807 0,00102106949681368 0,000671396963454643 0,00064087891966125 0,000997601373925124 0,00103168855833063 41362 44499 623 665 0 True 488 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 534 477 0,000979149146652059 0,000945738115028932 0,000717174029144732 0,000625619897764553 0,000908645375645188 0,000888898912308593 39977 41216 623 665 0 True 532 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 577 478 0,000845295928890509 0,000975613673689832 0,000488288700694286 0,000549324788281071 0,000920509482565431 0,00106868001972943 34512 42518 623 665 0 True 577 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 621 478 0,000839785046183034 0,000840186986119453 0,000473029678797589 0,000518806744487678 0,000931407684385747 0,000871348381543489 34287 36616 623 665 0 True 621 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 666 478 0,000827514147354391 0,000854872360576424 0,000457770656900893 0,000488288700694286 0,000912367814605525 0,000913443110586072 33786 37256 623 665 0 True 665 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 268 522 0,000854505226215 0,000825639287048016 0,000717174029144732 0,000656137941557946 0,000730170605111959 0,000763388823918284 34888 35982 623 665 0 True 267 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 313 522 0,000910005938282277 0,000916482095602935 0,000823987182421607 0,00080872816052491 0,000730799911057845 0,000765308235925433 37154 39941 623 665 0 True 311 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 357 522 0,000837874606844443 0,000870200220165887 0,000717174029144732 0,000732433051041428 0,000742912687289181 0,000742911879433935 34209 37924 623 665 0 True 356 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 401 522 0,000911989856056968 0,000917514660994441 0,000701915007248035 0,000686655985351339 0,000805127616567994 0,000866938495616552 37235 39986 623 665 0 True 400 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 445 522 0,000805642066208725 0,00094064412576417 0,0004272526131075 0,000488288700694286 0,000910053276592514 0,00103923838007561 32893 40994 623 665 0 True 444 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 490 522 0,000915614792237885 0,00091239772583209 0,000549324788281071 0,000579842832074464 0,000936419528828372 0,000882996324714376 37383 39763 623 665 0 True 488 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 534 522 0,000909761010161945 0,000961777297443655 0,000625619897764553 0,000656137941557946 0,00090724363395271 0,000898524319558394 37144 41915 623 665 0 True 532 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 577 522 0,000889578933046572 0,000872586593515145 0,000610360875867857 0,000579842832074464 0,000854463340008647 0,000854583125958226 36320 38028 623 665 0 True 577 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 622 522 0,000863983944471856 0,0008962897057246 0,000518806744487678 0,000564583810177768 0,000915563071390134 0,000952795252763865 35275 39061 623 665 0 True 621 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 667 522 0,000917157839395978 0,000844248409992709 0,000534065766384375 0,000442511635004196 0,000973295016334102 0,000958336531118419 37446 36793 623 665 0 True 665 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 269 566 0,000910887679515473 0,00104172080464379 0,000778210116731518 0,000900282291905089 0,0006838288805116 0,000732171234111447 37190 45399 623 665 0 True 267 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 313 566 0,000862685825434095 0,000927725585421553 0,000717174029144732 0,000854505226215 0,000705723142985671 0,000742124995999705 35222 40431 623 665 0 True 311 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 357 566 0,000947969796933769 0,000873045511466925 0,000839246204318303 0,000701915007248035 0,000700851488872949 0,000664762611111988 38704 38048 623 665 0 True 356 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 401 566 0,000916765954403446 0,000847667348733473 0,000732433051041428 0,000686655985351339 0,000769033881301205 0,000714077817226122 37430 36942 623 665 0 True 400 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 446 566 0,000850072027236987 0,000879562146382206 0,000442511635004196 0,000473029678797589 0,000942606763683985 0,000995350772265547 34707 38332 623 665 0 True 444 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 490 567 0,000964208531311795 0,000868984087593669 0,000579842832074464 0,000473029678797589 0,0010423717704746 0,00100976133497056 39367 37871 623 665 0 True 488 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 533 566 0,000964086067251628 0,000937248132920996 0,000579842832074464 0,000549324788281071 0,00102454979230943 0,000962550706103943 39362 40846 623 665 0 True 532 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 578 565 0,000876646728293031 0,000963268780786941 0,000610360875867857 0,000717174029144732 0,00084247554885746 0,000845942457609483 35792 41980 623 665 0 True 576 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 622 566 0,000938540064300979 0,000923067568210983 0,000656137941557946 0,000656137941557946 0,000854829632615608 0,000851069591820704 38319 40228 623 665 0 True 621 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 666 566 0,000912577683545766 0,000924673781042214 0,000610360875867857 0,000656137941557946 0,000846856683298788 0,000874988435290649 37259 40298 623 665 0 True 665 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 267 605 0,00092759177732213 0,000911732294802008 0,000823987182421607 0,000793469138628214 0,000656385230850937 0,000675230127226723 37872 39734 623 665 0 False 267 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 311 605 0,000888599220565243 0,00093270484519837 0,000747692072938125 0,000823987182421607 0,000746147626832655 0,000728453709986327 36280 40648 623 665 0 False 311 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 357 610 0,000939813690526707 0,000900649426266513 0,00080872816052491 0,000793469138628214 0,000725272844722617 0,000708867010729671 38371 39251 623 665 0 True 355 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 402 610 0,000795942912643569 0,000824927964222756 0,000595101853971161 0,000671396963454643 0,000693163000049903 0,000665632739050319 32497 35951 623 665 0 True 400 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 444 605 0,000819480505007494 0,000935068272650039 0,0004272526131075 0,000457770656900893 0,000911337197091126 0,00103692758079788 33458 40751 623 665 0 False 444 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 488 605 0,000891489372385163 0,000882132086912176 0,000473029678797589 0,000473029678797589 0,000962371213227589 0,000999909668299333 36398 38444 623 665 0 False 488 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 532 606 0,00100268673901598 0,00104952240982406 0,000686655985351339 0,000747692072938125 0,00102114391396194 0,00107714466964949 40938 45739 623 665 0 False 532 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 576 606 0,000870743960593025 0,000886652428737213 0,000564583810177768 0,000564583810177768 0,000860673832225975 0,000894194349565257 35551 38641 623 665 0 False 576 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 621 606 0,00087823876107519 0,000883853029231353 0,000671396963454643 0,000686655985351339 0,000756345157345044 0,000724448114883906 35857 38519 623 665 0 False 621 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 665 606 0,000838805333701705 0,000928689313120292 0,000610360875867857 0,000671396963454643 0,000774542555689045 0,00081912215783612 34247 40473 623 665 0 False 665 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 268 655 0,0010065321105052 0,0742709141817694 0,000885023270008392 0,0749828336003662 0,00074557899398962 0,0229387407366167 41095 3236784 623 665 0 True 267 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 311 649 0,000995975708518882 0,000868479277846711 0,000869764248111696 0,000762951094834821 0,000704355561161568 0,000628139511953237 40664 37849 623 665 0 False 311 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 355 649 0,000928816417923791 0,000863660639353018 0,000839246204318303 0,000717174029144732 0,000614356191733805 0,000634101800390712 37922 37639 623 665 0 False 355 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 400 649 0,000853011164680973 0,000892939604676603 0,000686655985351339 0,000732433051041428 0,000688540442024671 0,000689689111678968 34827 38915 623 665 0 False 400 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 444 649 0,000855901316500893 0,000881260142803794 0,000579842832074464 0,000610360875867857 0,000854110141249405 0,000841198622296223 34945 38406 623 665 0 False 444 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 488 649 0,000850218984109186 0,000972607761105671 0,000595101853971161 0,000701915007248035 0,000814175143838121 0,000910645334694511 34713 42387 623 665 0 False 488 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 532 649 0,000945838922286879 0,000936858052661982 0,000610360875867857 0,000625619897764553 0,000929150199589055 0,000879019803628792 38617 40829 623 665 0 False 532 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 576 649 0,000961024465747476 0,000984493736056782 0,000732433051041428 0,000823987182421607 0,000823889606547567 0,0007019609012934 39237 42905 623 665 0 False 576 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 621 649 0,000833245465370164 0,000889268261062361 0,000686655985351339 0,000747692072938125 0,000649724698567317 0,000675959566956969 34020 38755 623 665 0 False 621 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 665 654 0,000986448004637959 0,0764066035998671 0,000823987182421607 0,0757610437170977 0,000772584122897328 0,022129138216333 40275 3329859 623 665 0 True 665 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D11_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D11_1.csv new file mode 100755 index 0000000..cf15066 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D11_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 258 270 0,010256065625917 0,0458552653090726 0,0103608758678569 0,0458533607995727 0,00146380002369563 0,00887891927212615 389164 1998408 579 665 0 True 258 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 302 271 0,0101769506281038 0,0102388036926833 0,0101472495613031 0,0102388036926833 0,0013378971129525 0,00133085513879192 386162 446215 579 665 0 False 302 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 347 270 0,0104809187775969 0,0633962337750992 0,0104829480430304 0,0631113145647364 0,00132129548958767 0,00930483795006438 397696 2762857 579 665 0 True 347 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 391 270 0,0102752777622947 0,0868688314973747 0,0102998397802701 0,0865949492637522 0,00133878988884212 0,0159578084557569 389893 3785811 579 665 0 True 391 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 436 270 0,0104066792876435 0,074564552833216 0,0104371709773404 0,0716411078049897 0,0016839380341026 0,0131900894769731 394879 3249581 579 665 0 True 435 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 479 268 0,010654644981989 0,0695551650928649 0,0106965743495842 0,0731517509727627 0,00165894546200764 0,02013315553227 404288 3031268 579 665 0 True 479 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 524 270 0,0105027926777251 0,0842913188212004 0,0105287251087205 0,08203250171664 0,00159549293444942 0,0232971701078338 398526 3673481 579 665 0 True 523 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 568 270 0,0102718780838411 0,0705618245659927 0,0103150988021668 0,0684977492942702 0,00164609125867671 0,019140048202273 389764 3075139 579 665 0 True 567 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 611 271 0,0102943317740932 0,0102452055981106 0,0102998397802701 0,0102388036926833 0,0019779105221642 0,00203433917167212 390616 446494 579 665 0 False 611 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 653 269 0,0104258914240212 0,047481234558128 0,0104371709773404 0,0464026855878538 0,0018076543523644 0,00917499823665497 395608 2069269 579 665 0 True 655 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 258 314 0,010185990083217 0,0102682891710852 0,010101472495613 0,0103303578240635 0,00151189844231453 0,00160632627829846 386505 447500 579 665 0 False 258 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 302 314 0,0102458402364595 0,010165399766296 0,0102235446707866 0,010101472495613 0,00133849670515877 0,00125741520929586 388776 443016 579 665 0 False 302 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 348 315 0,0103867028824661 0,108628999828479 0,0104371709773404 0,103196765087358 0,0013725192563786 0,0273930523961197 394121 4734136 579 665 0 True 347 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 392 315 0,0103607704514707 0,0544647955434478 0,0103303578240635 0,0529182879377432 0,00131979741742691 0,00853607330914747 393137 2373618 579 665 0 True 391 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 436 315 0,0104980752944444 0,0802117217970539 0,0105592431525139 0,077409018081941 0,00165806163038048 0,0168747774576426 398347 3495689 579 665 0 True 435 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 480 316 0,0103459858033117 0,0465735407413016 0,0102693217364767 0,0456702525368124 0,00175056356305974 0,0119410297015801 392576 2029711 579 665 0 True 479 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 524 314 0,0103060857011501 0,0462162042781479 0,0103150988021668 0,0485389486533913 0,00163014971265581 0,00929244071154196 391062 2014138 579 665 0 True 523 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 569 315 0,0103030286259514 0,0578062689339508 0,0103913939116503 0,0555275806820783 0,0016805632475803 0,0158543495518057 390946 2519242 579 665 0 True 567 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 611 314 0,010307983196101 0,0103789342892594 0,0102845807583734 0,0104676890211337 0,00203024662976983 0,002134296157021 391134 452322 579 665 0 False 611 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 655 314 0,0104226498701468 0,0103113127290646 0,0104676890211337 0,0103150988021668 0,00189963094106712 0,00181031779363958 395485 449375 579 665 0 False 655 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 260 359 0,0102661328907953 0,0484400288888851 0,0102388036926833 0,0478370336461433 0,00148016543070353 0,00862023450603727 389546 2111054 579 665 0 True 258 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 304 360 0,010322477949198 0,0629907338729061 0,0103303578240635 0,0654306858930343 0,00141313832920583 0,0165735234948842 391684 2745185 579 665 0 True 302 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 348 360 0,0106507972838941 0,0394637543733447 0,0106813153276875 0,0402532997634852 0,00136841778594648 0,00560650606330338 404142 1719861 579 665 0 True 346 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 393 360 0,010519474820835 0,0354871385375776 0,010452429999237 0,0359960326543069 0,00134399373277908 0,00502213345016618 399159 1546557 579 665 0 True 391 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 437 358 0,010350097042372 0,0722011712733424 0,0104371709773404 0,0690470740825513 0,00167870371761793 0,0131422240560907 392732 3146583 579 665 0 True 435 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 481 359 0,0105576619067215 0,0334625990474011 0,0104829480430304 0,0341344319829099 0,00172303771294385 0,00447898519062235 400608 1458326 579 665 0 True 479 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 525 360 0,0104347464004587 0,0299456813239324 0,0103608758678569 0,0301670862897688 0,00173249894575572 0,00366491630440745 395944 1305056 579 665 0 True 523 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 569 360 0,0101437181123668 0,0513034933408137 0,01025406271458 0,0518806744487678 0,00180874758372829 0,00909011400027079 384901 2235846 579 665 0 True 567 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 613 359 0,0102936729216797 0,0563492962206386 0,0102845807583734 0,0575112535286488 0,0020275938173281 0,0113566728249553 390591 2455746 579 665 0 True 611 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 657 359 0,0103703106344182 0,0645633309641694 0,0102998397802701 0,0650034332799268 0,00189272313125146 0,0169274461303004 393499 2813720 579 665 0 True 655 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 260 405 0,0104085504284978 0,0448236177534704 0,0104676890211337 0,0450598916609445 0,00144501447618908 0,0177140505680685 394950 1953448 579 665 0 True 258 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 304 405 0,0109149180394186 0,0315871161079627 0,010605020218204 0,0315861753261616 0,00313846202456213 0,00301317917643676 414164 1376591 579 665 0 True 302 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 349 404 0,0106882464550775 0,0909210540656975 0,0107270923933776 0,0848401617456321 0,00133182256828741 0,0232477470484278 405563 3962410 579 665 0 True 346 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 393 403 0,0105068775626888 0,0659521084698471 0,0104982070649271 0,064789806973373 0,00141626194750133 0,0160078369389694 398681 2874244 579 665 0 True 391 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 437 403 0,0105328363477808 0,0453975864357621 0,0105134660868238 0,0455329213397421 0,00160310876223829 0,00911883021269167 399666 1978462 579 665 0 True 435 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 481 404 0,0107053766178286 0,0556135130685491 0,0107270923933776 0,0544289311055161 0,00160998200200533 0,0117224354400662 406213 2423680 579 665 0 True 479 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 525 404 0,0103553942157765 0,0410556260185827 0,0103303578240635 0,041870756084535 0,00178629753811496 0,00494390496248752 392933 1789236 579 665 0 True 523 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 570 404 0,0102625487336659 0,0511510637431299 0,0103761348897536 0,0511329823758297 0,00177574631075699 0,00815533869622589 389410 2229203 579 665 0 True 567 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 614 403 0,0102303176735974 0,0417487986388494 0,010406652933547 0,0421911955443656 0,00188112826589288 0,00817640176001154 388187 1819445 579 665 0 True 611 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 657 403 0,0104544065564776 0,0802368705008114 0,0105287251087205 0,0760814831769284 0,00183582694835733 0,0162656081490367 396690 3496785 579 665 0 True 655 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 261 449 0,0102924869873354 0,0425352004410201 0,0103150988021668 0,0428015564202335 0,00157741953840354 0,00606975563746382 390546 1853717 579 665 0 True 258 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 305 448 0,0103882050659689 0,0553590201183894 0,0103456168459602 0,053482871747921 0,00150948963091412 0,0114173819574228 394178 2412589 579 665 0 True 302 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 347 448 0,0106188034106945 0,0370105625703077 0,0106813153276875 0,0363164721141375 0,0014259722400182 0,00635866653027068 402928 1612949 579 665 0 True 346 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 393 448 0,0107516017031598 0,0534601094175126 0,0107270923933776 0,0525062943465324 0,00153991465673598 0,00911585938007793 407967 2329833 579 665 0 True 390 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 437 448 0,0106928320678755 0,0935853940183487 0,0107270923933776 0,0923323414969101 0,00182726644019784 0,0130524296679367 405737 4078524 579 665 0 True 435 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 481 449 0,0107939000281066 0,0626113693480669 0,0108949416342412 0,0602578774700542 0,00188224333085787 0,0162045804980785 409572 2728652 579 665 0 True 479 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 526 448 0,0104864004296772 0,0529775801371132 0,0103761348897536 0,0517891203173877 0,0018459395817079 0,00946393149148669 397904 2308804 579 665 0 True 523 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 569 447 0,0103646972118552 0,0315259423449904 0,010452429999237 0,0317845426108186 0,00185364055921808 0,00437752131040826 393286 1373925 579 665 0 True 567 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 614 449 0,010255037816152 0,0412996785853395 0,01025406271458 0,0407873655298695 0,00192218143131245 0,00701074615877717 389125 1799872 579 665 0 True 611 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 658 448 0,0103365773908469 0,0711612631946082 0,0102998397802701 0,069718471046006 0,00194070686612038 0,0129701333612374 392219 3101263 579 665 0 True 655 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 260 493 0,0103659885625856 0,0575746759895849 0,0103761348897536 0,0585030899519341 0,00157601708928792 0,0152201729000136 393335 2509149 579 665 0 True 258 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 304 493 0,0104919347899506 0,0571034590366968 0,0104219119554437 0,0546578164339666 0,00161007951721676 0,0101658589354409 398114 2488613 579 665 0 True 302 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 348 492 0,0108371471005289 0,0685532324746405 0,0108644235904479 0,0653086137178607 0,00149415802584012 0,0166261342033086 411213 2987603 579 665 0 True 346 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 392 492 0,0109071699350358 0,0865947198047763 0,0109712367437247 0,0816357671473259 0,00159250697956629 0,0218607883808177 413870 3773865 579 665 0 True 390 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 437 492 0,0109855997263391 0,0909249089764925 0,0110322728313115 0,0891279468986038 0,00184162160931141 0,0269271690980173 416846 3962578 579 665 0 True 435 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 481 493 0,0108063655157701 0,0453991238109006 0,010757610437171 0,0464179446097505 0,00186007485097843 0,00703127728606237 410045 1978529 579 665 0 True 479 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 524 491 0,0106399657502161 0,0420612070345238 0,0106813153276875 0,0431525139238575 0,00179664508776795 0,00738524252827821 403731 1833060 579 665 0 True 523 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 568 492 0,0105341276985112 0,0941334108904672 0,0105439841306172 0,0898298619058518 0,00181282511412243 0,0190204413255583 399715 4102407 579 665 0 True 567 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 613 493 0,0103520735996125 0,0628112740078624 0,0104219119554437 0,0666208896009766 0,0018114264856204 0,0169891455196006 392807 2737364 579 665 0 True 611 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 656 492 0,0103714438605694 0,0828470810810501 0,0103761348897536 0,0777752346074617 0,00194033047788779 0,0175809277196063 393542 3610540 579 665 0 True 655 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 260 537 0,0101223976482658 0,0521612109926912 0,0101319905394064 0,0546272983901732 0,00146045188834358 0,0118923141885346 384092 2273226 579 665 0 True 258 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 302 536 0,0106103173916086 0,101126861557648 0,0105745021744106 0,0976577401388571 0,00153221611577362 0,0280989097603564 402606 4407187 579 665 0 True 302 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 347 536 0,0107677831184354 0,0535337657487734 0,0108339055466545 0,0562294956893263 0,00146074641635524 0,0118457626420507 408581 2333043 579 665 0 True 346 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 392 536 0,0107512590999048 0,0592622549736667 0,0107118333714809 0,0565499351491569 0,00159179528966982 0,0114922524974424 407954 2582695 579 665 0 True 390 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 436 536 0,010927330818889 0,0545403334383108 0,0109102006561379 0,0550087739375906 0,00189998778391338 0,00655363615181747 414635 2376910 579 665 0 True 434 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 480 537 0,0107299649899005 0,0605666833598072 0,0108033875028611 0,059464408331426 0,00205061144974512 0,0151970045461158 407146 2639543 579 665 0 True 479 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 524 537 0,0107032682901054 0,0670660629601011 0,0107423514152743 0,0675669489585718 0,00184528539463099 0,0147822569492033 406133 2922791 579 665 0 True 523 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 568 536 0,0103841992432948 0,0583522895129791 0,0103150988021668 0,0578927290760662 0,00175019627484373 0,0150625710868967 394026 2543038 579 665 0 True 567 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 613 537 0,0103891274593478 0,0429652524536335 0,0104371709773404 0,0426184481574731 0,00176791480325496 0,007315776728314 394213 1872459 579 665 0 True 611 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 657 535 0,0100766205825758 0,0653817193475793 0,0100709544518196 0,0654764629587243 0,0018687697802553 0,0137755118109444 382355 2849386 579 665 0 True 655 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 258 573 0,012856714226587 0,0336804244532136 0,0104829480430304 0,0393835355153735 0,00681885847044419 0,0167770067558969 487845 1467819 579 665 0 False 258 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 304 580 0,0101253756611749 0,0511924122505853 0,0101167315175097 0,0511329823758297 0,00142986508832197 0,012832098372665 384205 2231005 579 665 0 True 302 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 346 573 0,0131243664310479 0,0384869245670826 0,0108339055466545 0,0437323567559319 0,00746638728377688 0,0196747819545684 498001 1677290 579 665 0 False 346 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 392 580 0,0104838967905059 0,0475173055091379 0,0104829480430304 0,047196154726482 0,00134499325612432 0,00617455409769503 397809 2070841 579 665 0 True 390 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 434 573 0,0176853908569469 0,0660055265194343 0,0113221942473487 0,0747539482719158 0,0170339675502758 0,0411630030353693 671068 2876572 579 665 0 False 434 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 481 581 0,0103397662365283 0,0607784510486562 0,010452429999237 0,0599069199664302 0,00196265652253576 0,0105885435072714 392340 2648772 579 665 0 True 478 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 526 580 0,010302765084986 0,0532907228015105 0,0103150988021668 0,0532387273975738 0,00193741000779287 0,00675643529758814 390936 2322451 579 665 0 True 523 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 569 580 0,0101844878997142 0,0361299219667388 0,0102082856488899 0,0378271152819104 0,00171973102769939 0,00706693521763807 386448 1574570 579 665 0 True 567 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 613 580 0,0101674631533493 0,0472788746872904 0,0101319905394064 0,0471503776607919 0,00157837479210466 0,0070734246749319 385802 2060450 579 665 0 True 611 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 657 580 0,0101049775904529 0,0498504902677844 0,0101167315175097 0,0489204242008087 0,00168606154246725 0,0073888429949674 383431 2172523 579 665 0 True 655 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 258 616 0,010465896942569 0,00972316348206291 0,00984206912336919 0,00971999694819562 0,0036045780051571 0,00135164421872342 397126 423743 579 665 0 False 258 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 302 617 0,0102193280153402 0,010113312578769 0,00999465934233616 0,0101625085831998 0,00207732724603366 0,00142235354405057 387770 440746 579 665 0 False 302 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 346 617 0,0173781811535794 0,0518526345619141 0,0109407186999313 0,0648355840390631 0,016309168176805 0,0299996384037003 659411 2259778 579 665 0 False 346 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 390 617 0,0162697542072009 0,0556872152916051 0,0109712367437247 0,0602883955138476 0,0138490990472106 0,0360113269082129 617352 2426892 579 665 0 False 390 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 434 617 0,0107691798855521 0,010239101989352 0,0102388036926833 0,0102082856488899 0,00363962441399728 0,00181975541356667 408634 446228 579 665 0 False 434 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 478 617 0,0105975093006901 0,0103904760757467 0,01025406271458 0,0103456168459602 0,00345433388843796 0,0019586565427317 402120 452825 579 665 0 False 478 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 523 617 0,0103514411012955 0,0100343557451652 0,0100709544518196 0,0101167315175097 0,00273972988966887 0,00203447973432051 392783 437305 579 665 0 False 523 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 567 617 0,010067212170111 0,0101268736042441 0,00996414129854276 0,0100709544518196 0,0016594939340481 0,00180754994285119 381998 441337 579 665 0 False 567 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 611 617 0,0101539698559208 0,0101055109735887 0,0100709544518196 0,0101319905394064 0,00158832084622538 0,00134067045894755 385290 440406 579 665 0 False 611 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 655 617 0,0100596221903074 0,0101940591923847 0,010101472495613 0,0102845807583734 0,00155185358499 0,00152591021553692 381710 444265 579 665 0 False 655 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 258 667 0,0096257810530649 0,0435912165398619 0,00962844281681544 0,0439154650186923 0,00134080442306635 0,00803407010586585 365248 1899739 579 665 0 True 258 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 302 660 0,00996013547586867 0,009537852413134 0,00996414129854276 0,00956740672922866 0,001306293364697 0,00130186535734815 377935 415667 579 665 0 False 302 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 346 660 0,0118580257382013 0,00992901112933398 0,0100404364080262 0,00991836423285267 0,00930487302776232 0,00123624834009916 449950 432714 579 665 0 False 346 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 390 660 0,0112222331591723 0,0101077367256548 0,0100862134737163 0,010101472495613 0,00623724252920393 0,00134001497926481 425825 440503 579 665 0 False 390 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 434 660 0,0100345594444978 0,00993527535937578 0,00999465934233616 0,00994888227664607 0,00152308353415821 0,00156270441919574 380759 432987 579 665 0 False 434 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 478 660 0,0099729172126906 0,0100115016311665 0,0100404364080262 0,00997940032043946 0,00165251072341817 0,00151870565918032 378420 436309 579 665 0 False 478 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 522 660 0,00986958280015702 0,00990145310632957 0,00988784618905928 0,00991836423285267 0,0017494996284121 0,00173459418894551 374499 431513 579 665 0 False 522 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 567 660 0,00987543340958891 0,00993380682193008 0,00994888227664607 0,00993362325474937 0,00161004700848875 0,00150752381358895 374721 432923 579 665 0 False 567 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 611 660 0,00993855147080236 0,00994711544253171 0,00993362325474937 0,00997940032043946 0,00138392426018301 0,00146198356589896 377116 433503 579 665 0 False 611 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 654 665 0,00989809793261336 0,0439708793613698 0,00988784618905928 0,0442511635004196 0,0014508389091884 0,00898280932744003 375581 1916285 579 665 0 True 655 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D11_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D11_2.csv new file mode 100755 index 0000000..e114d37 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D11_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 258 270 0,00833132053921009 0,743118840819146 0,0081025406271458 0,759548332951858 0,00202851967413003 0,187623449993221 316130 32385695 579 665 12 True 258 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 302 271 0,00727478480891896 0,00680729060004096 0,00715648126955062 0,00683604180972 0,00151173456280983 0,00126225460555605 276040 296667 579 665 0 False 302 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 347 270 0,00638203978862433 0,00640130883399848 0,0063782711528191 0,00634775310902571 0,00121143011979383 0,00125461447391239 242165 278974 579 665 0 True 347 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 391 270 0,00627414611738932 0,0065113573588354 0,00628671702143893 0,00650034332799268 0,00123192584505968 0,00116246174386325 238071 283770 579 665 0 True 391 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 436 270 0,0065445655019869 0,00667833465559068 0,00653086137178607 0,00660715648126955 0,00159458017557948 0,00158286082829538 248332 291047 579 665 0 True 435 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 479 268 0,00679543014695176 0,00679421143841522 0,00683604180972 0,00685130083161669 0,00159070012946196 0,00177725876706104 257851 296097 579 665 0 True 479 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 524 270 0,00698304496022047 0,00702738764971481 0,00695811398489357 0,00706492713817044 0,00145154563640817 0,00161666982089119 264970 306259 579 665 0 True 523 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 568 270 0,00721451299013184 0,00740273664247595 0,00721751735713741 0,00746166170748455 0,00167984617030994 0,00157115857260665 273753 322617 579 665 0 True 567 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 611 271 0,00799833652942639 0,00772721458028225 0,00807202258335241 0,00773632410162509 0,00196879143576671 0,00180355750770431 303495 336758 579 665 0 False 611 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 653 269 0,00941900681161156 0,760529407749174 0,00943007553215839 0,752758068207828 0,00193107990740984 0,171701051521615 357402 33144461 579 665 15 True 655 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 258 314 0,00685741498201399 0,00666860559501294 0,00683604180972 0,00662241550316625 0,00151589952343697 0,00147082154438238 260203 290623 579 665 0 False 258 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 302 314 0,00664602877366614 0,0065746650902835 0,00659189745937285 0,00660715648126955 0,00129854240012932 0,00120244576285456 252182 286529 579 665 0 False 302 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 348 315 0,00654925653117103 0,00657023653204882 0,00656137941557946 0,00653086137178607 0,00118369818233566 0,00125484939977604 248510 286336 579 665 0 True 347 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 392 315 0,00642391644802649 0,00655334835142331 0,00636301213092241 0,00651560234988937 0,00128299979513227 0,00124486836998957 243754 285600 579 665 0 True 391 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 436 315 0,00652896387683518 0,00672831082053956 0,00645456626230259 0,00674448767833982 0,00176181138506192 0,00163865466814811 247740 293225 579 665 0 True 435 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 480 316 0,00692735875423132 0,00694212069427402 0,00691233691920348 0,00691233691920348 0,00178913382283944 0,00152130176835094 262857 302543 579 665 0 True 479 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 524 314 0,00696725885639297 0,00700708053034853 0,00694285496299687 0,00700389105058366 0,00146459828699973 0,0014983223083588 264371 305374 579 665 0 True 523 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 569 315 0,00717964652040934 0,00738359976388671 0,00718699931334401 0,00746166170748455 0,0016699641870292 0,00147248394198935 272430 321783 579 665 0 True 567 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 611 314 0,00736423061257594 0,00742634797109505 0,00743114366369116 0,00741588464179446 0,00200386948810952 0,00203139699128351 279434 323646 579 665 0 False 611 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 655 314 0,00795898986329208 0,00778951269223643 0,00799572747386892 0,007690547035935 0,00204816447870176 0,00179671782576188 302002 339473 579 665 0 False 655 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 260 359 0,00643769964051695 0,0064296699634185 0,00645456626230259 0,00643930724040589 0,00149488852247559 0,00151821300516708 244277 280210 579 665 0 True 258 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 304 360 0,00664565981631458 0,00661966199545557 0,00665293354695964 0,00656137941557946 0,00122069349244344 0,00132458364979301 252168 288490 579 665 0 True 302 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 348 360 0,00669863155036011 0,0067092198337455 0,00671396963454643 0,00672922865644312 0,00126781615219866 0,00133604057201252 254178 292393 579 665 0 True 346 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 393 360 0,00688637813411152 0,0068588041401283 0,0068207827878233 0,00688181887541009 0,00137180388000754 0,00130609826162283 261302 298912 579 665 0 True 391 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 437 358 0,00689939705780231 0,00692229543875711 0,00686655985351339 0,00692759594110018 0,00160677582102406 0,00164889860840656 261796 301679 579 665 0 True 435 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 481 359 0,0068119014572893 0,00691568702025148 0,00671396963454643 0,0068207827878233 0,00161579178180391 0,00163546170996842 258476 301391 579 665 0 True 479 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 525 360 0,00691950523346238 0,00691692609872128 0,00691233691920348 0,00704966811627375 0,00160739283307484 0,00163399797047979 262559 301445 579 665 0 True 523 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 569 360 0,00730150786281059 0,00723335002647383 0,00727855344472419 0,00727855344472419 0,00182187294929307 0,0017441204771852 277054 315235 579 665 0 True 567 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 613 359 0,0072045511416397 0,00713727555326861 0,0072632944228275 0,00721751735713741 0,00196069296209091 0,00202617070203494 273375 311048 579 665 0 True 611 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 657 359 0,00666861423440098 0,006744533570135 0,00668345159075303 0,00683604180972 0,0019833303716594 0,00200161884827754 253039 293932 579 665 0 True 655 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 260 405 0,00665151042574648 0,00713947835943716 0,00660715648126955 0,00653086137178607 0,00147225911910445 0,00485290467389984 252390 311144 579 665 0 True 258 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 304 405 0,00698019871779414 0,00670242784805915 0,00689707789730678 0,00672922865644312 0,00172114007586811 0,00123386958186059 264862 292097 579 665 0 True 302 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 349 404 0,00685522759200116 0,00696878382727246 0,00689707789730678 0,00708018616006714 0,00128280885158199 0,0013565690144557 260120 303705 579 665 0 True 346 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 393 403 0,00670450851388854 0,00726008199716503 0,00677500572213321 0,00712596322575723 0,00130241741712479 0,00204144668947283 254401 316400 579 665 0 True 391 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 437 403 0,00678931599655447 0,00709262283656039 0,00683604180972 0,00706492713817044 0,00154423176599784 0,00156918879397947 257619 309102 579 665 0 True 435 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 481 404 0,00700718531265117 0,00692071217182347 0,00697337300679027 0,00698863202868696 0,00160301795807227 0,00155310221376002 265886 301610 579 665 0 True 479 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 525 404 0,00710256078802965 0,00698463944250647 0,00709544518196384 0,00686655985351339 0,00170957698257711 0,00167995806084021 269505 304396 579 665 0 True 523 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 570 404 0,00692796489845174 0,00706809367203773 0,00694285496299687 0,00715648126955062 0,00180179919183689 0,00165692164207013 262880 308033 579 665 0 True 567 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 614 403 0,00646352665512621 0,00642583799852114 0,00648508430609598 0,0064087891966125 0,00177476970202922 0,00197417423042908 245257 280043 579 665 0 True 611 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 657 403 0,00618580718578702 0,00620693413552191 0,00622568093385214 0,00619516289005875 0,00176481061344897 0,00163446346963047 234719 270503 579 665 0 True 655 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 261 449 0,0067967742058753 0,00667888535713282 0,00675974670023652 0,00668345159075303 0,00146646646304319 0,0015078971827992 257902 291071 579 665 0 True 258 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 305 448 0,0066967867636023 0,00697252400857947 0,00663767452506294 0,00701915007248035 0,00144498842069107 0,00151209732370387 254108 303868 579 665 0 True 302 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 347 448 0,00688073835745194 0,00686931336122407 0,00686655985351339 0,0068207827878233 0,00133177917192081 0,00138250296039749 261088 299370 579 665 0 True 346 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 393 448 0,00705960361066935 0,00702087101479953 0,00714122224765393 0,00701915007248035 0,00144313902108266 0,00147259575020211 267875 305975 579 665 0 True 390 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 437 448 0,00694994421496615 0,00708332974803683 0,00701915007248035 0,00709544518196384 0,00176207305448265 0,00187016487933588 263714 308697 579 665 0 True 435 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 481 449 0,00705259342098969 0,00703406490591321 0,00706492713817044 0,00704966811627375 0,00173200335018174 0,00186607338408369 267609 306550 579 665 0 True 479 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 526 448 0,0068364371211681 0,0069783063747719 0,00689707789730678 0,00708018616006714 0,00164097819357333 0,00165205914191501 259407 304120 579 665 0 True 523 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 569 447 0,00648374024717244 0,00663632071710519 0,00646982528419928 0,00663767452506294 0,00171952685356598 0,00186204785254876 246024 289216 579 665 0 True 567 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 614 449 0,00605398399489363 0,00596448778159636 0,005981536583505 0,00602731364919509 0,00161627482631768 0,00177930698274884 229717 259937 579 665 0 True 611 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 658 448 0,00593164827875466 0,0060809841036558 0,0059662775616083 0,00607309071488518 0,00176368444712915 0,00181045085334493 225075 265014 579 665 0 True 655 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 260 493 0,00678865714414096 0,00678271554372312 0,0068055237659266 0,00672922865644312 0,00143838976067833 0,00146679971858663 257594 295596 579 665 0 True 258 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 304 493 0,00674195768507197 0,00686917568583854 0,00674448767833982 0,00694285496299687 0,00147378125907661 0,00153134951227573 255822 299364 579 665 0 True 302 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 348 492 0,00678639069183852 0,0068715620591878 0,00675974670023652 0,00688181887541009 0,00133326450434963 0,00141479802366398 257508 299468 579 665 0 True 346 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 392 492 0,00695684898825965 0,00692415405646182 0,00695811398489357 0,00695811398489357 0,00146990835421177 0,00149595442595464 263976 301760 579 665 0 True 390 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 437 492 0,00682146799433334 0,00704849787549671 0,00672922865644312 0,00709544518196384 0,00186597623157875 0,00193292460709267 258839 307179 579 665 0 True 435 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 481 493 0,00665841519903997 0,00689258050137934 0,00668345159075303 0,00688181887541009 0,00169417307660498 0,00167787799607907 252652 300384 579 665 0 True 479 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 524 491 0,00649304324325108 0,00628896571940265 0,00648508430609598 0,00630197604333562 0,00167361153885795 0,0016157632353609 246377 274078 579 665 0 True 523 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 568 492 0,00616345891192105 0,00628458305296315 0,00619516289005875 0,00633249408712902 0,00167771735967239 0,00177951212808489 233871 273887 579 665 0 True 567 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 613 493 0,00596633026980138 0,00606331576251225 0,00602731364919509 0,00613412680247196 0,00165209582255844 0,00161659552383063 226391 264244 579 665 0 True 611 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 656 492 0,00604739547075861 0,00614823852948921 0,00614938582436866 0,00622568093385214 0,00176226442090451 0,00180679317367812 229467 267945 579 665 0 True 655 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 260 537 0,00685098458245821 0,00678179770781956 0,0068055237659266 0,00675974670023652 0,00134856918914436 0,00143367273416876 259959 295556 579 665 0 True 258 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 302 536 0,00675571452346589 0,00691183210945652 0,00674448767833982 0,00697337300679027 0,00141093801970454 0,00133472155515919 256344 301223 579 665 0 True 302 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 347 536 0,00686076195227458 0,00676376223231459 0,00689707789730678 0,0068207827878233 0,00142165573062389 0,00141238904883324 260330 294770 579 665 0 True 346 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 392 536 0,00668342523665649 0,00693301117293118 0,00671396963454643 0,00694285496299687 0,00150442437681585 0,00153995042466235 253601 302146 579 665 0 True 390 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 436 536 0,0067119140150163 0,0066085102892273 0,00660715648126955 0,00669871061264973 0,00181879171756865 0,00194869154520657 254682 288004 579 665 0 True 434 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 480 537 0,00653405021746742 0,00660132822328194 0,00653086137178607 0,00660715648126955 0,00187918712885749 0,00194262679653749 247933 287691 579 665 0 True 479 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 524 537 0,00628758670662475 0,006257736352784 0,00630197604333562 0,00622568093385214 0,0017753155511083 0,00191773613972802 238581 272717 579 665 0 True 523 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 568 536 0,00617492294391598 0,0063131048036663 0,00619516289005875 0,00633249408712902 0,00169033980517569 0,00172757338932317 234306 275130 579 665 0 True 567 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 613 537 0,00612751192424041 0,00621250998863604 0,00622568093385214 0,00613412680247196 0,00163614186727735 0,00163809186559278 232507 270746 579 665 0 True 611 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 657 535 0,00624744941759423 0,00652436768276838 0,00619516289005875 0,00651560234988937 0,00181027907856528 0,00193817468584872 237058 284337 579 665 0 True 655 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 258 573 0,00686798297472655 0,00810341257125418 0,00677500572213321 0,00709544518196384 0,00128193994632786 0,00530854324989418 260604 353153 579 665 0 False 258 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 304 580 0,00674069268843805 0,00710776712896914 0,0068207827878233 0,00717174029144732 0,00143517127353887 0,00141054326656302 255774 309762 579 665 0 True 302 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 346 573 0,00677276562392731 0,00671291412325733 0,00677500572213321 0,00677500572213321 0,00139753079079207 0,00131939207118643 256991 292554 579 665 0 False 346 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 392 580 0,00657468823433219 0,0065402003521048 0,00653086137178607 0,00650034332799268 0,00131096496123005 0,00129258544390915 249475 285027 579 665 0 True 390 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 434 573 0,00648869481732197 0,00658563322933105 0,00642404821850919 0,00660715648126955 0,00176952558187817 0,00190013491973461 246212 287007 579 665 0 False 434 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 481 581 0,00638731060793235 0,00648815905637291 0,00628671702143893 0,00643930724040589 0,00186901579362739 0,00178116854574228 242365 282759 579 665 0 True 478 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 526 580 0,00622462676999054 0,00637928077231302 0,00622568093385214 0,00631723506523232 0,00183611037177211 0,00184641011506499 236192 278014 579 665 0 True 523 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 569 580 0,00632653806131096 0,00656794194228992 0,00630197604333562 0,00651560234988937 0,00166179160206406 0,00179083363248665 240059 286236 579 665 0 True 567 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 613 580 0,00616896691809792 0,00606964883024682 0,00621042191195544 0,00605783169298848 0,00159800459257072 0,0015357630117304 234080 264520 579 665 0 True 611 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 657 580 0,00603142488825534 0,00638733478236677 0,00602731364919509 0,0064087891966125 0,00156790159798805 0,00153641721525299 228861 278365 579 665 0 True 655 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 258 616 0,00697371561004529 0,00698773713868099 0,00701915007248035 0,00704966811627375 0,00135281224581984 0,00127269394686815 264616 304531 579 665 0 False 258 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 302 617 0,00674129883265847 0,00695453442486968 0,00674448767833982 0,00692759594110018 0,00141986113078591 0,00132491125851748 255797 303084 579 665 0 False 302 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 346 617 0,0066611296709836 0,00668152413535556 0,00671396963454643 0,00662241550316625 0,00125733523443387 0,00143638871702758 252755 291186 579 665 0 False 346 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 390 617 0,00646571404513903 0,00641633839691928 0,00646982528419928 0,0064087891966125 0,00129306407465368 0,00120725455200926 245340 279629 579 665 0 False 390 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 434 617 0,00646542415007709 0,00638689881031258 0,00648508430609598 0,00643930724040589 0,0016026429768611 0,00181457314478153 245329 278346 579 665 0 False 434 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 478 617 0,00631731412752194 0,00647244111652443 0,00631723506523232 0,00653086137178607 0,00180613176527226 0,00186083262070279 239709 282074 579 665 0 False 478 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 523 617 0,00644647555466479 0,00628442243168002 0,00648508430609598 0,00622568093385214 0,00181648136688319 0,0018705108470389 244610 273880 579 665 0 False 523 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 567 617 0,00630192333514254 0,00618093643355356 0,00633249408712902 0,00617990386816205 0,00166860276802397 0,00171269134912274 239125 269370 579 665 0 False 567 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 611 617 0,00627388257642392 0,00615108382079024 0,00625619897764553 0,00611886778057527 0,00140404818965206 0,00134685855535469 238061 268069 579 665 0 False 611 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 655 617 0,00636248504899161 0,00658248964136136 0,00630197604333562 0,00660715648126955 0,00143988229893816 0,001532882110577 241423 286870 579 665 0 False 655 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 258 667 0,0086466209502154 0,746681925688563 0,00827038986800946 0,761470969710841 0,00210393044829248 0,184562198770402 328094 32540977 579 665 12 True 258 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 302 660 0,00718937118203262 0,00683455032637671 0,00706492713817044 0,00683604180972 0,00156870623574799 0,00133492685845189 272799 297855 579 665 0 False 302 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 346 660 0,0062662398884273 0,00639965672937207 0,00634775310902571 0,00645456626230259 0,00122532147676673 0,00122243142908551 237771 278902 579 665 0 False 346 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 390 660 0,00631947516343822 0,00624422121910407 0,00633249408712902 0,00630197604333562 0,00117464782639104 0,00128028603246468 239791 272128 579 665 0 False 390 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 434 660 0,00620617890241249 0,00618963292873979 0,00619516289005875 0,00621042191195544 0,00140183058222047 0,00136559726374145 235492 269749 579 665 0 False 434 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 478 660 0,006176583251998 0,0061986047746971 0,00616464484626535 0,00628671702143893 0,00155818967781029 0,00143035824279692 234369 270140 579 665 0 False 478 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 522 660 0,0063008428171844 0,00623820939393574 0,00633249408712902 0,00619516289005875 0,00168909421896923 0,00160307498030041 239084 271866 579 665 0 False 522 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 567 660 0,00625669970547979 0,0063738884863796 0,00617990386816205 0,0063782711528191 0,00148698214129526 0,00141369453333493 237409 277779 579 665 0 False 567 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 611 660 0,00653080866359299 0,00661075898719103 0,00650034332799268 0,00660715648126955 0,00132309012995789 0,00147149060638773 247810 288102 579 665 0 False 611 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 654 665 0,00804442984427496 0,743701666617907 0,00802624551766232 0,763103685053788 0,00159969254546799 0,195263100359784 305244 32411095 579 665 14 True 655 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D11_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D11_3.csv new file mode 100755 index 0000000..c89bfd5 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D11_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 258 270 0,000958076825617447 0,0750965993606126 0,000793469138628214 0,0750896467536431 0,000752375926230056 0,0216049996312222 36354 3272768 579 665 0 True 258 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 302 271 0,000935491364882613 0,000974558162400737 0,00080872816052491 0,000854505226215 0,000682944751099444 0,000681720522809961 35497 42472 579 665 0 False 302 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 347 270 0,00095923640586521 0,000885023270008392 0,000869764248111696 0,000762951094834821 0,000662992574808084 0,000665124817834539 36398 38570 579 665 0 True 347 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 391 270 0,000908162166770568 0,000798884370459222 0,000793469138628214 0,000686655985351339 0,000631240721921109 0,000606464342085191 34460 34816 579 665 0 True 391 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 436 270 0,000832525909700587 0,00086079240215439 0,00064087891966125 0,000656137941557946 0,000781046460636248 0,000796603250296286 31590 37514 579 665 0 True 435 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 479 268 0,000928428467009876 0,000876005532255909 0,000686655985351339 0,000671396963454643 0,000863402360937484 0,000830809721093145 35229 38177 579 665 0 True 479 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 524 270 0,000929719817740339 0,000905835199121631 0,000778210116731518 0,000686655985351339 0,000799603188987226 0,00081917615588877 35278 39477 579 665 0 True 523 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 568 270 0,000947324354229101 0,000968729904413127 0,000717174029144732 0,000747692072938125 0,000879854592750116 0,000853734165436654 35946 42218 579 665 0 True 567 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 611 271 0,00115159495651113 0,000981051851418429 0,000869764248111696 0,000656137941557946 0,00105135036309611 0,000954984261193094 43697 42755 579 665 0 False 611 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 653 269 0,00115562713328176 0,0775299200163375 0,000839246204318303 0,074540321965362 0,00103593341932266 0,0208787143767015 43850 3378814 579 665 0 True 655 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 258 314 0,00091743880875267 0,000958954952040206 0,000762951094834821 0,00080872816052491 0,000736047012570977 0,000716568892305713 34812 41792 579 665 0 False 258 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 302 314 0,000869474353049755 0,000894821168278903 0,000762951094834821 0,000762951094834821 0,000646994882101423 0,000642833121781694 32992 38997 579 665 0 False 302 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 348 315 0,000886472745318096 0,000895555437001751 0,000793469138628214 0,000732433051041428 0,00063765995780211 0,000704510126381207 33637 39029 579 665 0 True 347 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 392 315 0,000841354532041508 0,000821784376253061 0,000717174029144732 0,000717174029144732 0,000615636875719625 0,000640363014258184 31925 35814 579 665 0 True 391 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 436 315 0,000894247203797414 0,000938946129342583 0,000610360875867857 0,000686655985351339 0,000841109390022669 0,000885168744680626 33932 40920 579 665 0 True 435 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 480 316 0,000845887436646399 0,000873458537623528 0,000595101853971161 0,000671396963454643 0,000841254695479626 0,000815711021074773 32097 38066 579 665 0 True 479 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 524 314 0,000875957460798611 0,000947344327860163 0,000686655985351339 0,000701915007248035 0,000760799046536241 0,000920278721034169 33238 41286 579 665 0 True 523 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 569 315 0,000889529820516743 0,00096515034438924 0,000625619897764553 0,000732433051041428 0,000891721059733493 0,000850077295714242 33753 42062 579 665 0 True 567 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 611 314 0,000909690704369891 0,00102441959786167 0,000518806744487678 0,000625619897764553 0,000997711370122518 0,0010991004059355 34518 44645 579 665 0 False 611 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 655 314 0,00106246540201264 0,000978321289605336 0,000717174029144732 0,00064087891966125 0,0010227819756797 0,000969932268860529 40315 42636 579 665 0 False 655 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 260 359 0,000883626502891769 0,000796016133260595 0,000717174029144732 0,00064087891966125 0,000794420394390002 0,00067688273375275 33529 34691 579 665 0 True 258 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 304 360 0,000866628110623429 0,000895784895977642 0,000793469138628214 0,000762951094834821 0,00064436216914892 0,000694046409709141 32884 39039 579 665 0 True 302 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 348 360 0,000910639451845334 0,00090888700350097 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,000683965891934227 0,000724075495742239 34554 39610 579 665 0 True 346 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 393 360 0,000906976232426265 0,000873527375316295 0,000717174029144732 0,000717174029144732 0,00076086695279537 0,00067216144923687 34415 38069 579 665 0 True 391 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 437 358 0,000920733070820178 0,000881007737930314 0,00064087891966125 0,000564583810177768 0,000827311821538113 0,000886311051328501 34937 38395 579 665 0 True 435 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 481 359 0,000878961827804178 0,000882774572044669 0,00064087891966125 0,000595101853971161 0,000797791256601346 0,00082344513206276 33352 38472 579 665 0 True 479 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 525 360 0,000932539706070126 0,000842343900492821 0,000717174029144732 0,000549324788281071 0,00080771300919156 0,000853281578360818 35385 36710 579 665 0 True 523 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 569 360 0,000979818955262999 0,000866437092961288 0,000701915007248035 0,000564583810177768 0,000956621286138233 0,000891089744823846 37179 37760 579 665 0 True 567 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 613 359 0,000987092685908056 0,000989863076092612 0,000518806744487678 0,000579842832074464 0,00109357090459898 0,00107713019357795 37455 43139 579 665 0 True 611 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 657 359 0,000878487454066457 0,000927840314909499 0,000488288700694286 0,000564583810177768 0,000963067197641431 0,000962304360957655 33334 40436 579 665 0 True 655 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 260 405 0,000926794513024392 0,000991997044568391 0,000747692072938125 0,00080872816052491 0,000784942909625154 0,000816410140045875 35167 43232 579 665 0 True 258 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 304 405 0,000911746323900016 0,000893582089809096 0,000778210116731518 0,000762951094834821 0,000727782211365132 0,000708987561430976 34596 38943 579 665 0 True 302 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 349 404 0,000897673236347623 0,000946541221444548 0,000778210116731518 0,00080872816052491 0,000690206096447001 0,000687005015121933 34062 41251 579 665 0 True 346 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 393 403 0,000933145850290547 0,0008783230679124 0,000747692072938125 0,000701915007248035 0,000759287332527207 0,000745255552980957 35408 38278 579 665 0 True 391 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 437 403 0,000909374455211411 0,000871049218376681 0,000671396963454643 0,000671396963454643 0,00080568885179658 0,00080194851565648 34506 37961 579 665 0 True 435 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 481 404 0,000865758425437606 0,000842435684083177 0,000564583810177768 0,000579842832074464 0,000855817710360222 0,000824208101799835 32851 36714 579 665 0 True 479 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 525 404 0,000926425555672831 0,000948789919408271 0,000671396963454643 0,000732433051041428 0,000881615305097091 0,000872231800665803 35153 41349 579 665 0 True 523 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 570 404 0,000897304278996062 0,000962855754630339 0,000671396963454643 0,000717174029144732 0,000884167471890347 0,000894207433507029 34048 41962 579 665 0 True 567 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 614 403 0,000904709780123819 0,000925017969506049 0,000488288700694286 0,000534065766384375 0,000954377306133036 0,00100347504667359 34329 40313 579 665 0 True 611 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 657 403 0,000947508832904882 0,00099059734481546 0,000549324788281071 0,000625619897764553 0,00097860122927411 0,000946880171360931 35953 43171 579 665 0 True 655 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 261 449 0,000974679906437686 0,000954273988932046 0,000793469138628214 0,000823987182421607 0,000825823346191074 0,000796244988849278 36984 41588 579 665 0 True 258 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 305 448 0,000933224912580168 0,000933324384433274 0,000778210116731518 0,000823987182421607 0,000770166821920425 0,000767900032476917 35411 40675 579 665 0 True 302 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 347 448 0,000955731311025381 0,00103160166380703 0,000839246204318303 0,000915541313801785 0,000748208589856511 0,000813008102681966 36265 44958 579 665 0 True 346 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 393 448 0,000902891347462555 0,000875959640460731 0,000747692072938125 0,000762951094834821 0,000781381409409694 0,000696275690678706 34260 38175 579 665 0 True 390 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 437 448 0,000910639451845334 0,000927702639523964 0,000579842832074464 0,000564583810177768 0,000923641484487176 0,000984260868222386 34554 40430 579 665 0 True 435 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 481 449 0,000970858562439377 0,00094227328449299 0,000610360875867857 0,000610360875867857 0,000982947836127036 0,000983788427185506 36839 41065 579 665 0 True 479 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 526 448 0,000947192583746401 0,000922402137180901 0,000717174029144732 0,00064087891966125 0,000894786726836922 0,000877622851402439 35941 40199 579 665 0 True 523 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 569 447 0,000892718666198091 0,00102689775480129 0,000579842832074464 0,000717174029144732 0,000923296703633498 0,00102506398012653 33874 44753 579 665 0 True 567 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 614 449 0,000961660982746895 0,000893605035706685 0,000518806744487678 0,000518806744487678 0,00101000550635339 0,000956194831227609 36490 38944 579 665 0 True 611 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 658 448 0,000901968954083653 0,000946564167342137 0,000518806744487678 0,000656137941557946 0,000963726538342869 0,000976635709508359 34225 41252 579 665 0 True 655 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 260 493 0,00088399546024333 0,00103059204431312 0,000732433051041428 0,000854505226215 0,000758733951485043 0,000803688648149086 33543 44914 579 665 0 True 258 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 304 493 0,000891242836791847 0,000906248225278233 0,000747692072938125 0,000747692072938125 0,000774396690401834 0,00078945012347458 33818 39495 579 665 0 True 302 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 348 492 0,000907292481584746 0,000902209747302566 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,000755572583905003 0,000776185181439487 34427 39319 579 665 0 True 346 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 392 492 0,000889371695937503 0,000880204631514699 0,000686655985351339 0,000686655985351339 0,000813653555419644 0,000789766138773891 33747 38360 579 665 0 True 390 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 437 492 0,000920864841302878 0,00096026286820278 0,000549324788281071 0,000625619897764553 0,000968905718147553 0,00101877064929734 34942 41849 579 665 0 True 435 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 481 493 0,00093865385646742 0,000951428697631008 0,000656137941557946 0,000625619897764553 0,000926515411864648 0,000937256710488127 35617 41464 579 665 0 True 479 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 524 491 0,000901125622994371 0,00100184083463408 0,000610360875867857 0,000747692072938125 0,000872377522448085 0,000891525934356773 34193 43661 579 665 0 True 523 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 568 492 0,000891769918722649 0,000899226780615994 0,000595101853971161 0,000579842832074464 0,000885771503601437 0,000945628249929589 33838 39189 579 665 0 True 567 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 613 493 0,000999742652247286 0,000941974987824333 0,000686655985351339 0,000595101853971161 0,000936264128288773 0,000921429486097827 37935 41052 579 665 0 True 611 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 656 492 0,000937415213930038 0,000940827692944882 0,000564583810177768 0,000610360875867857 0,000952248940597002 0,000949305043965411 35570 41002 579 665 0 True 655 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 260 537 0,000948562996766484 0,00095209412866109 0,000823987182421607 0,000686655985351339 0,000736250325930328 0,000837477085544363 35993 41493 579 665 0 True 258 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 302 536 0,000955520478253061 0,000972125897256302 0,00080872816052491 0,000869764248111696 0,000759137192252711 0,000768870068141775 36257 42366 579 665 0 True 302 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 347 536 0,000919178179124314 0,00095115334685994 0,000793469138628214 0,000839246204318303 0,000780280579493203 0,000753577917065814 34878 41452 579 665 0 True 346 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 392 536 0,000845623895680998 0,000919235603313617 0,000686655985351339 0,000732433051041428 0,000739712568335398 0,000799658487986035 32087 40061 579 665 0 True 390 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 436 536 0,000922920460833003 0,000908680490422669 0,000534065766384375 0,000488288700694286 0,000944178396888732 0,00102008056196828 35020 39601 579 665 0 True 434 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 480 537 0,000933778348607509 0,000924627889247036 0,000534065766384375 0,000503547722590982 0,00101474163961436 0,000991875110455418 35432 40296 579 665 0 True 479 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 524 537 0,000925318683618149 0,000859530377786994 0,000534065766384375 0,000503547722590982 0,000976727541913919 0,00091614514214296 35111 37459 579 665 0 True 523 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 568 536 0,000879093598286878 0,000928322178758868 0,000564583810177768 0,000610360875867857 0,000891537286491284 0,000906743743564264 33357 40457 579 665 0 True 567 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 613 537 0,000850051383899729 0,000978780207557117 0,000579842832074464 0,000747692072938125 0,000859905732568452 0,000886313262384614 32255 42656 579 665 0 True 611 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 657 535 0,000963005041670439 0,000980914176032895 0,000595101853971161 0,000610360875867857 0,000989742899850161 0,00104496343028687 36541 42749 579 665 0 True 655 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 258 573 0,000983086863233967 0,00111152222510958 0,000869764248111696 0,000946059357595178 0,000692773522863843 0,000824130313157709 37303 48441 579 665 0 False 258 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 304 580 0,000906739045557404 0,000896725677778791 0,000732433051041428 0,000747692072938125 0,00072153786808015 0,000756710647730439 34406 39080 579 665 0 True 302 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 346 573 0,00093443720102101 0,000938120077029378 0,000869764248111696 0,00080872816052491 0,000696925835899815 0,000725636293892942 35457 40884 579 665 0 False 346 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 392 580 0,000854188977056519 0,000942640418854415 0,000686655985351339 0,000839246204318303 0,000714288549101784 0,000650546431921162 32412 41081 579 665 0 True 390 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 434 573 0,000828151129674937 0,00088975012491173 0,000518806744487678 0,000411993591210803 0,000866370404993633 0,00101889735111817 31424 38776 579 665 0 False 434 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 481 581 0,000834291634168771 0,000890254934658688 0,000411993591210803 0,000488288700694286 0,00092512075602723 0,000951398058520554 31657 38798 579 665 0 True 478 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 526 580 0,000881834424327045 0,000801247797910891 0,000503547722590982 0,000366216525520714 0,000962376293628577 0,00093517445228045 33461 34919 579 665 0 True 523 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 569 580 0,000915435897415625 0,00096632058516628 0,000625619897764553 0,000671396963454643 0,000856150296614951 0,000953690389458515 34736 42113 579 665 0 True 567 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 613 580 0,000956785474886984 0,000895807841875231 0,000762951094834821 0,00064087891966125 0,000761370558750882 0,000777113524431829 36305 39040 579 665 0 True 611 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 657 580 0,000898094901892264 0,000924788510530159 0,00064087891966125 0,000686655985351339 0,00081851053673879 0,000805953826815847 34078 40303 579 665 0 True 655 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 258 616 0,000920917549495958 0,00095326436943813 0,000793469138628214 0,00080872816052491 0,000694682540265404 0,00071466530047265 34944 41544 579 665 0 False 258 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 302 617 0,000856850740807065 0,000927427288752896 0,000701915007248035 0,00080872816052491 0,000701086460926425 0,000696103219494106 32513 40418 579 665 0 False 302 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 346 617 0,000879409847445359 0,000909713055814175 0,000717174029144732 0,000823987182421607 0,000742508606366727 0,000756192269052172 33369 39646 579 665 0 False 346 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 390 617 0,000911535491127696 0,000851201016962181 0,000793469138628214 0,000747692072938125 0,000691605919441943 0,000617903857173703 34588 37096 579 665 0 False 390 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 434 617 0,000845202230136357 0,000881535493574862 0,000564583810177768 0,000488288700694286 0,000828462008401759 0,000930501663312743 32071 38418 579 665 0 False 434 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 478 617 0,000880226824438101 0,000845097408203503 0,000457770656900893 0,000411993591210803 0,000998375777054738 0,00097409882717211 33400 36830 579 665 0 False 478 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 523 617 0,000920021510213596 0,000857006329052202 0,000488288700694286 0,000289921416037232 0,00100365596976578 0,00101990284648923 34910 37349 579 665 0 False 523 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 567 617 0,000932987725711307 0,000904412553471112 0,000656137941557946 0,000610360875867857 0,000896992763124897 0,000913360630637133 35402 39415 579 665 0 False 567 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 611 617 0,000923948270598065 0,000950327294546735 0,000778210116731518 0,000778210116731518 0,00069981075757963 0,000709618959157205 35059 41416 579 665 0 False 611 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 655 617 0,000943371239748092 0,000992777205086417 0,000793469138628214 0,00080872816052491 0,000757849285893727 0,000797956596945944 35796 43266 579 665 0 False 655 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 258 667 0,0010386940069335 0,0757590933158027 0,000885023270008392 0,075547417410544 0,000753526132648869 0,0215978908168972 39413 3301640 579 665 0 True 258 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 302 660 0,00090094114431859 0,000956430903305414 0,000778210116731518 0,000869764248111696 0,000665810588681352 0,000651063760448573 34186 41682 579 665 0 False 302 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 346 660 0,000888396594365521 0,000937821780360721 0,000762951094834821 0,000839246204318303 0,000636674735325068 0,000668160359848712 33710 40871 579 665 0 False 346 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 390 660 0,000894273557893955 0,000917950633048632 0,000717174029144732 0,00080872816052491 0,000717538188886707 0,000663496311405898 33933 40005 579 665 0 False 390 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 434 660 0,000889872423771764 0,000866987794503425 0,000686655985351339 0,000717174029144732 0,000796283409411833 0,00073181874769441 33766 37784 579 665 0 False 434 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 478 660 0,00086322843216976 0,000889887800297264 0,000564583810177768 0,000701915007248035 0,000856980285801019 0,000762675330543193 32755 38782 579 665 0 False 478 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 522 660 0,000785483847376575 0,000843009331522902 0,000457770656900893 0,000579842832074464 0,000816626016806986 0,000810856418154575 29805 36739 579 665 0 False 522 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 567 660 0,000918677451290053 0,000902714557049525 0,000701915007248035 0,000701915007248035 0,000823001863288878 0,00076882628144879 34859 39341 579 665 0 False 567 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 611 660 0,000919178179124314 0,00101994514783181 0,000778210116731518 0,000869764248111696 0,000665623082660698 0,000728748236702543 34878 44450 579 665 0 False 611 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 654 665 0,00110418393683556 0,0758632447449592 0,000900282291905089 0,074692912184329 0,000802838911761825 0,0228436019204547 41898 3306179 579 665 0 True 655 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D12_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D12_1.csv new file mode 100755 index 0000000..ecc309d --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D12_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 233 248 0,0103839970824162 0,0431866344735724 0,010406652933547 0,0433051041428244 0,00177316405274939 0,00851667926485747 423961 1882107 623 665 0 True 234 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 278 248 0,0101896711117447 0,010129443544774 0,0101625085831998 0,0101625085831998 0,00154836199350151 0,00141649420596328 416027 441449 623 665 0 False 278 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 321 248 0,0101365462024446 0,060354364969416 0,0100709544518196 0,060669871061265 0,00136218916450759 0,0111130668131139 413858 2630290 623 665 0 True 322 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 365 248 0,0100317659525665 0,0854038965575991 0,0100556954299229 0,0839551384756237 0,00129270816887561 0,0129948398865235 409580 3721968 623 665 0 True 366 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 409 248 0,0100645128422549 0,070875747390908 0,0101625085831998 0,0687571526665141 0,00143282504415127 0,0137066294103967 410917 3088820 623 665 0 True 411 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 454 246 0,00994275907363776 0,0659594741029731 0,00988784618905928 0,0683909361409934 0,00166628978452143 0,0175232148018533 405946 2874565 623 665 0 True 455 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 498 246 0,0100484700503731 0,0785234314901467 0,0101167315175097 0,0795757991912718 0,001529289131552 0,0226323421057553 410262 3422112 623 665 0 True 499 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 542 247 0,0100356848024918 0,0703925297335809 0,0100404364080262 0,0698405432211795 0,0016168764293848 0,0179640664138259 409740 3067761 623 665 0 True 543 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 587 248 0,01030128485618 0,0101702872424825 0,0103303578240635 0,0102845807583734 0,00181999662699929 0,00195702096210907 420584 443229 623 665 0 False 587 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 630 244 0,0105671298379886 0,0439950643374286 0,0105745021744106 0,0446631570916304 0,00183520681531932 0,0096507788287018 431438 1917339 623 665 0 True 632 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 234 291 0,0102919530947954 0,00999803238928174 0,0103303578240635 0,0100709544518196 0,00161786127668359 0,00153113046236177 420203 435722 623 665 0 False 234 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 278 291 0,0102028482446185 0,010150943850815 0,0103150988021668 0,0101167315175097 0,00136377577166352 0,00139912420678422 416565 442386 623 665 0 False 278 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 321 292 0,0102256510526215 0,0934731197414456 0,01025406271458 0,0909895475700008 0,00133970875950274 0,0219417751661614 417496 4073631 623 665 0 True 322 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 366 292 0,0101180786221716 0,0497409006608992 0,010101472495613 0,0494544899671931 0,00133602466151809 0,00684660524820314 413104 2167747 623 665 0 True 366 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 410 292 0,010039505681169 0,078097922765256 0,0100556954299229 0,0781719691767758 0,00147678486354607 0,0155188914286947 409896 3403568 623 665 0 True 411 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 454 291 0,00995843447333902 0,0423963318688114 0,00991836423285267 0,0431830319676509 0,00181190865084864 0,0081587605399709 406586 1847665 623 665 0 True 455 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 499 291 0,0100592713804798 0,0474977326584945 0,0100404364080262 0,0491950865949493 0,00169909707775196 0,0102880957472579 410703 2069988 623 665 0 True 499 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 543 291 0,0101822252968866 0,0541973611070478 0,0102693217364767 0,0536659800106813 0,00148525339654091 0,0125130107414723 415723 2361963 623 665 0 True 543 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 587 291 0,0100172417150308 0,010162439745507 0,0100709544518196 0,0101167315175097 0,00185134663153088 0,00198328405081732 408987 442887 623 665 0 False 587 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 632 291 0,010185507333699 0,0100247184681778 0,0101625085831998 0,00999465934233616 0,00184199956692281 0,00199247806667949 415857 436885 623 665 0 False 632 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 234 338 0,0102913162816825 0,0459782782660474 0,0102845807583734 0,0450293736171511 0,00152543940270129 0,00769842698348245 420177 2003769 623 665 0 True 234 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 278 336 0,0102711831901912 0,0611665809063744 0,0101777676050965 0,061722743572137 0,00147845383738365 0,0184885626054265 419355 2665687 623 665 0 True 278 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 322 336 0,0102485273390605 0,0380301176378805 0,0102235446707866 0,0385748073548486 0,00135752735464865 0,00528092583772673 418430 1657382 623 665 0 True 322 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 367 336 0,0101550382755297 0,0352488224452181 0,0101777676050965 0,0355077439536126 0,00141377450565386 0,00516971052128039 414613 1536171 623 665 0 True 366 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 410 337 0,0101788207960139 0,0675523553677051 0,0102693217364767 0,0660868238345922 0,00141312197667634 0,0110182621247963 415584 2943984 623 665 0 True 411 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 455 335 0,0101058077233429 0,0336495163291612 0,0100556954299229 0,0342412451361868 0,00158142449392698 0,00525012867725054 412603 1466472 623 665 0 True 455 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 499 334 0,0100133963435416 0,0282385983268999 0,0100709544518196 0,0286869611657893 0,00173632855717688 0,00298511857007263 408830 1230660 623 665 0 True 499 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 543 334 0,0101379422927305 0,0535970964261191 0,0102082856488899 0,0523689631494621 0,00165430518738217 0,0111619495461252 413915 2335803 623 665 0 True 543 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 588 334 0,0102480864684439 0,0559505424123366 0,0102388036926833 0,0560311284046693 0,00188546218898714 0,011941118593392 418412 2438368 623 665 0 True 587 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 632 334 0,00994873531977387 0,063239582132259 0,00991836423285267 0,0611429007400626 0,00193787350022128 0,018113151079935 406190 2756030 623 665 0 True 632 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 233 381 0,0100632147232171 0,0382210963435139 0,010101472495613 0,040360112916762 0,00158952084076762 0,00834640461640693 410864 1665705 623 665 0 True 234 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 279 381 0,0101826906603152 0,0311705792290293 0,0101472495613031 0,0304570077058061 0,00151970248426964 0,00486691563665263 415742 1358438 623 665 0 True 278 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 323 382 0,0100707095236993 0,0806570328315639 0,0100862134737163 0,0776379034103914 0,00149323270908946 0,0165560532203044 411170 3515096 623 665 0 True 322 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 366 381 0,0103502704802465 0,061250631729243 0,010406652933547 0,0603799496452277 0,0013770436946794 0,0144096107992525 422584 2669350 623 665 0 True 366 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 411 380 0,0101088938176591 0,0427218882638044 0,0101167315175097 0,043228809033341 0,00148531212646592 0,00798605813117134 412729 1861853 623 665 0 True 411 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 454 380 0,00992507526334978 0,051788317210972 0,00996414129854276 0,051773861295491 0,00170807547801134 0,0112463884657323 405224 2256975 623 665 0 True 455 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 498 379 0,0101891077770679 0,0407130208216811 0,0101319905394064 0,0413366903181506 0,00180744335911592 0,00536308268537087 416004 1774305 623 665 0 True 499 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 543 378 0,0100786451947981 0,0496470519397601 0,0101472495613031 0,0491950865949493 0,00170247474749478 0,00811503719050634 411494 2163657 623 665 0 True 543 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 588 379 0,0100594918157881 0,0395428259364364 0,0100556954299229 0,0398413061722744 0,00185333571875113 0,00575845858973844 410712 1723307 623 665 0 True 587 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 632 379 0,0102790943684779 0,0815278066991695 0,0104676890211337 0,0779888609140154 0,002039471316257 0,0148198458940963 419678 3553045 623 665 0 True 632 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 234 425 0,0100514581734412 0,0388590381882837 0,0100556954299229 0,0393224994277867 0,00149409208669023 0,00532854276507265 410384 1693507 623 665 0 True 234 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 278 425 0,010192879670121 0,0472755934239352 0,01025406271458 0,0474097810330358 0,00155464300271769 0,00708893048538138 416158 2060307 623 665 0 True 278 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 323 425 0,00994743720073611 0,033312693498452 0,00999465934233616 0,0336614023041123 0,00132624184483365 0,00393685662323471 406137 1451793 623 665 0 True 322 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 367 424 0,0104114780175175 0,0487864431047865 0,0103913939116503 0,048706797894255 0,00154240132282133 0,0076508934986588 425083 2126151 623 665 0 True 366 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 412 424 0,0104592145081703 0,0871362888796723 0,0104371709773404 0,0867780575265125 0,00160696639756486 0,011200196753769 427032 3797467 623 665 0 True 411 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 455 424 0,0103611942744133 0,0569245498731952 0,0103303578240635 0,0563057907988098 0,00175876211154692 0,0107222770080463 423030 2480816 623 665 0 True 455 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 499 423 0,0103029503673983 0,0505440070765148 0,0101930266269932 0,0496528572518502 0,00169036672885343 0,00871581733016634 420652 2202747 623 665 0 True 499 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 544 423 0,0101599123451243 0,0301283995064337 0,0102235446707866 0,0303959716182193 0,00162445720124613 0,00298008366140158 414812 1313019 623 665 0 True 543 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 588 424 0,0103030973242705 0,0399721436803269 0,0102388036926833 0,0398565651941711 0,00224225694348173 0,00546599136710032 420658 1742017 623 665 0 True 587 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 632 422 0,0129840070509907 0,0643105589563288 0,0103456168459602 0,0645151445792325 0,0165895496524735 0,0120859604526763 530115 2802704 623 665 0 True 632 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 235 469 0,00999412050047143 0,0562114372679238 0,0100099183642329 0,0554055085069047 0,00141548589165807 0,0147886190958652 408043 2449738 623 665 0 True 234 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 279 470 0,0102137720387853 0,0527167770651164 0,0101777676050965 0,0516060120546273 0,00148345397624466 0,00707984069659973 417011 2297438 623 665 0 True 278 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 324 470 0,0103802986677992 0,0630939215743639 0,0103913939116503 0,0604562447547112 0,00170755749978468 0,0144186660272792 423810 2749682 623 665 0 True 322 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 368 469 0,0106043834050911 0,0807302761366681 0,0106507972838941 0,0765697718776227 0,00148594523219539 0,0165749850617566 432959 3518288 623 665 0 True 366 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 413 469 0,0104833154352109 0,0893080721946776 0,0105592431525139 0,0857557030594339 0,00170172038994888 0,0268281714191855 428016 3892115 623 665 0 True 411 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 456 468 0,0100435714879665 0,0468027473123183 0,0100709544518196 0,0460517280842298 0,00194495793170064 0,00861677688839625 410062 2039700 623 665 0 True 455 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 500 466 0,0104727345404126 0,038498236894594 0,0104219119554437 0,0391851682307164 0,00186819641322663 0,00470217611995831 427584 1677783 623 665 0 True 499 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 545 466 0,0103785841709569 0,0926217351573027 0,0103913939116503 0,0910658426794842 0,00175442828346658 0,0151859586231858 423740 4036527 623 665 0 True 543 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 589 466 0,0102463964644136 0,0622723437111892 0,010406652933547 0,0629434653238727 0,00199115070242325 0,0165496076325093 418343 2713877 623 665 0 True 587 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 633 467 0,0101273858907442 0,0759542940665924 0,010101472495613 0,0728160524910353 0,00182123445188718 0,0107178376012327 413484 3310147 623 665 0 True 632 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 236 514 0,0100361991515445 0,0515438745639562 0,0101167315175097 0,0530708781567102 0,001406863706812 0,0104477302515052 409761 2246322 623 665 0 True 234 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 280 513 0,0101093346882757 0,0926480999936325 0,010101472495613 0,0853284504463264 0,00165041091434411 0,0213790929388858 412747 4037676 623 665 0 True 278 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 324 513 0,010399280597125 0,0516534412249438 0,0103303578240635 0,0533150225070573 0,00178188402587739 0,00986573870781023 424585 2251097 623 665 0 True 322 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 368 513 0,0103820621502656 0,0529087653902438 0,0103761348897536 0,051773861295491 0,00158525750961147 0,00672878281003846 423882 2305805 623 665 0 True 366 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 412 513 0,0103426042300801 0,0515794177593216 0,0103150988021668 0,0512855725947967 0,00176063557188617 0,00638638403846158 422271 2247871 623 665 0 True 411 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 456 512 0,0102360849905476 0,0573419357503395 0,0102235446707866 0,0560616464484627 0,00195443520628935 0,0113916870606495 417922 2499006 623 665 0 True 455 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 502 511 0,0103260715819577 0,0674067177557077 0,0102235446707866 0,0644998855573358 0,00173614518105645 0,0146532681223893 421596 2937637 623 665 0 True 499 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 545 512 0,0100809230263172 0,0539625327911218 0,0100709544518196 0,0543984130617227 0,00172931758650103 0,0103654465071429 411587 2351729 623 665 0 True 543 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 589 510 0,0101429633191973 0,0428964606526616 0,0102082856488899 0,0417486839093614 0,00172316898868451 0,00632940307174755 414120 1869461 623 665 0 True 587 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 633 511 0,010171497445216 0,0640047360332624 0,0101777676050965 0,0630045014114595 0,00196862929321535 0,0134454178637071 415285 2789376 623 665 0 True 632 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 236 558 0,0097104692443147 0,0391793170268312 0,00976577401388571 0,0395513847562371 0,00134504678259281 0,00663661413464799 396462 1707465 623 665 0 True 234 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 280 558 0,00999492876326852 0,0457882862340103 0,00997940032043946 0,0465094987411307 0,00137185643597097 0,00849561386609369 408076 1995489 623 665 0 True 278 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 325 557 0,0100737711252035 0,0448761409130517 0,0101167315175097 0,0450141145952544 0,0015034604315745 0,00799604377989909 411295 1955737 623 665 0 True 322 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 368 557 0,0102839929308846 0,0482968923797248 0,0101930266269932 0,0456855115587091 0,00134061467453963 0,00882377218028462 419878 2104816 623 665 0 True 366 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 412 557 0,0103073345807522 0,0830120161929199 0,01025406271458 0,0772259098191806 0,00167803296096008 0,017010778540862 420831 3617728 623 665 0 True 411 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 457 556 0,0101800209438036 0,0589953941847064 0,0101930266269932 0,0563057907988098 0,00202346367849352 0,0117201247948218 415633 2571065 623 665 0 True 455 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 502 556 0,0100850378187387 0,0531571776775424 0,0101777676050965 0,0525825894560159 0,00200448172357111 0,00675021393845874 411755 2316631 623 665 0 True 499 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 544 555 0,00995397678154898 0,0360189326601007 0,00993362325474937 0,0369115739681086 0,00182739075317841 0,00741284954968097 406404 1569733 623 665 0 True 543 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 589 556 0,0099934347017345 0,0460029451059556 0,00997940032043946 0,0458075837338827 0,00161293338257893 0,00564334777363388 408015 2004844 623 665 0 True 587 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 633 555 0,00995054778786433 0,0484736905206481 0,00990310521095598 0,0474402990768292 0,00170497427636451 0,00604647016228261 406264 2112521 623 665 0 True 632 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 234 594 0,0101580263985977 0,00967853371125227 0,00976577401388571 0,00971999694819562 0,00280391074074634 0,001243789418766 414735 421798 623 665 0 False 234 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 278 594 0,0101925122779405 0,00974330998014606 0,00971999694819562 0,00975051499198901 0,00306681671409961 0,00149759769227266 416143 424621 623 665 0 False 278 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 325 601 0,00981331456204219 0,0661351708408123 0,00978103303578241 0,0638895246814679 0,00154612171405782 0,00887111614827325 400661 2882222 623 665 0 True 322 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 369 601 0,0100371543712138 0,0688350769347264 0,0100251773861295 0,0650644693675135 0,00138151071100202 0,017480335900191 409800 2999886 623 665 0 True 366 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 411 594 0,0106242715684621 0,0100411018390563 0,0101625085831998 0,0100251773861295 0,00367337012599993 0,00164039495900169 433771 437599 623 665 0 False 411 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 455 594 0,00996595376663322 0,00991639088566002 0,00985732814526589 0,00997940032043946 0,00214269283042365 0,00185177561205057 406893 432164 623 665 0 False 455 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 499 594 0,0100374482849582 0,0097607718082113 0,0100099183642329 0,00967421988250553 0,00218139064183833 0,0023109318507639 409812 425382 623 665 0 False 499 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 543 594 0,00995912027207595 0,00979725578537784 0,0100709544518196 0,00968947890440223 0,00203135398378886 0,00185916637713219 406614 426972 623 665 0 False 543 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 587 594 0,00993310890569667 0,00970877640427459 0,00984206912336919 0,00964370183871214 0,00180449494938292 0,00175490946829032 405552 423116 623 665 0 False 587 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 632 594 0,00990192955597838 0,00974911529223608 0,00985732814526589 0,0098115510795758 0,00170539024363526 0,00146555997998007 404279 424874 623 665 0 False 632 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 236 644 0,00944731847182978 0,0401802400255617 0,00950637064164187 0,0398260471503777 0,00132785685758711 0,00705067515826112 385718 1751086 623 665 0 True 234 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 278 638 0,00953343519893858 0,00940648714943688 0,00953688868543526 0,00935378042267491 0,00134831615054769 0,00133577746841984 389234 409942 623 665 0 False 278 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 322 638 0,0105735959403654 0,00960148138714835 0,00988784618905928 0,00961318379491875 0,00448140835416887 0,00121709390245257 431702 418440 623 665 0 False 322 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 366 638 0,00974960875794378 0,0097089599714553 0,00961318379491875 0,00968947890440223 0,00164185667977843 0,00132567605258245 398060 423124 623 665 0 False 366 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 411 638 0,0096304022417781 0,00988610230084251 0,00949111161974517 0,00984206912336919 0,00202811845940484 0,00150430146069535 393193 430844 623 665 0 False 411 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 455 638 0,00966273275366195 0,009725894043876 0,00962844281681544 0,0098115510795758 0,00169568381865886 0,00174551248518263 394513 423862 623 665 0 False 455 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 499 638 0,00954227710408257 0,00964801566745887 0,00958266575112535 0,00959792477302205 0,00185105922446843 0,00178435431391493 389595 420468 623 665 0 False 499 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 543 638 0,00967657119246072 0,00971559133585853 0,00964370183871214 0,0098268101014725 0,00185287071925698 0,00176033082830403 395078 423413 623 665 0 False 543 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 587 638 0,00958518851076477 0,00969337970699236 0,00959792477302205 0,00970473792629892 0,00153349200238686 0,00138295827068656 391347 422445 623 665 0 False 587 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 633 641 0,00963936661098226 0,0426998831480165 0,00955214770733196 0,0431067368581674 0,00147270841388106 0,00769329096108576 393559 1860894 623 665 0 True 632 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D12_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D12_2.csv new file mode 100755 index 0000000..255b850 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D12_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 233 248 0,00842765821407477 0,704390800760198 0,00840772106507973 0,711436636911574 0,00217274504635146 0,193197122096751 344087 30697897 623 665 9 True 234 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 278 248 0,00694868425226078 0,00667218515503683 0,00692759594110018 0,00666819256885634 0,00157988575991132 0,00143236167623559 283703 290779 623 665 0 False 278 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 321 248 0,0062058907417293 0,00626250909948251 0,00616464484626535 0,00627145799954223 0,00131101219518872 0,00112588923791867 253376 272925 623 665 0 True 322 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 365 248 0,00616462035345332 0,00625904426894657 0,00621042191195544 0,00619516289005875 0,0011409561367416 0,00111163051972433 251691 272774 623 665 0 True 366 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 409 248 0,00608768843085698 0,00619013773848675 0,00605783169298848 0,00616464484626535 0,00130458221372505 0,0012232650755613 248550 269771 623 665 0 True 411 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 454 246 0,00593360415035598 0,00608910695140231 0,00601205462729839 0,00608834973678187 0,00149060836526541 0,00149178425649704 242259 265368 623 665 0 True 455 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 498 246 0,00633839685482902 0,00648613981738507 0,00633249408712902 0,00651560234988937 0,00146985131738 0,00140358517264419 258786 282671 623 665 0 True 499 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 542 247 0,00679952302697847 0,00699351950487342 0,0068055237659266 0,00701915007248035 0,00155985320338832 0,0013937395533751 277613 304783 623 665 0 True 543 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 587 248 0,00751228834995722 0,00740551309608423 0,00735484855420768 0,00747692072938125 0,0017684632026483 0,00175615174755109 306714 322738 623 665 0 False 587 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 630 244 0,00904034590708578 0,715102680023474 0,0089570458533608 0,732616159304189 0,00208060956027231 0,2113199146706 369102 31164729 623 665 10 True 632 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 234 291 0,00671455746203522 0,00666504898088664 0,00671396963454643 0,00662241550316625 0,00164522537047219 0,00152624092254382 274144 290468 623 665 0 False 234 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 278 291 0,00632551363569955 0,00634041042179723 0,00631723506523232 0,00625619897764553 0,00134435202144191 0,00136324927883417 258260 276320 623 665 0 False 278 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 321 292 0,0060463445641449 0,00618550266717377 0,00604257267109178 0,00616464484626535 0,00122048138203229 0,0012022147733119 246862 269569 623 665 0 True 322 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 366 292 0,00626440406967666 0,00635915722012745 0,00621042191195544 0,00636301213092241 0,00131260861046932 0,00132461367933861 255765 277137 623 665 0 True 366 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 410 292 0,00626222420940571 0,0063709743573858 0,00628671702143893 0,00633249408712902 0,00130229740408017 0,00138920891018584 255676 277652 623 665 0 True 411 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 454 291 0,00623616385740236 0,00616703121961461 0,00630197604333562 0,00616464484626535 0,00158900021744441 0,00168092476117191 254612 268764 623 665 0 True 455 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 499 291 0,0063004085033655 0,00661284706387163 0,00631723506523232 0,00663767452506294 0,00161995951642785 0,00155964186784032 257235 288193 623 665 0 True 499 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 543 291 0,00666603720139741 0,00667023475374176 0,00668345159075303 0,00672922865644312 0,0014385704453244 0,00147062937342113 272163 290694 623 665 0 True 543 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 587 291 0,00715662822642282 0,00699613533719857 0,00712596322575723 0,00697337300679027 0,00177677728363719 0,00187156040345595 292193 304897 623 665 0 False 587 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 632 291 0,00753842218039666 0,00737114014149588 0,00762951094834821 0,00737010757610437 0,00187528745453009 0,00190803084494322 307781 321240 623 665 0 False 632 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 234 338 0,00599270530579215 0,00612460425497252 0,0059662775616083 0,00611886778057527 0,00143511966541874 0,00149397793315914 244672 266915 623 665 0 True 234 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 278 336 0,00609442395416611 0,00625227522915781 0,00611886778057527 0,00624093995574884 0,00130842504347496 0,00132330480543212 248825 272479 623 665 0 True 278 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 322 336 0,00612256619519228 0,00621370317531067 0,00616464484626535 0,00616464484626535 0,00117515228425288 0,00116308907925647 249974 270798 623 665 0 True 322 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 367 336 0,00645699105069387 0,00638515492209581 0,00646982528419928 0,0063935301747158 0,00123059183556754 0,00120274619481475 263628 278270 623 665 0 True 366 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 410 337 0,0065808756939579 0,0064054390955645 0,00660715648126955 0,0063935301747158 0,00137380431857926 0,00138982802848862 268686 279154 623 665 0 True 411 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 455 335 0,00653725399572674 0,0065449960447009 0,00654612039368277 0,00657663843747616 0,00158948768060226 0,00152043441205796 266905 285236 623 665 0 True 455 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 499 334 0,0065384051578923 0,00653005826537045 0,00654612039368277 0,00650034332799268 0,00159146719240229 0,00154629053013615 266952 284585 623 665 0 True 499 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 543 334 0,00676119177614647 0,00678774069529512 0,00675974670023652 0,00675974670023652 0,00157932671133461 0,00137957058304697 276048 295815 623 665 0 True 543 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 588 334 0,0070816312359771 0,00711208095771587 0,00701915007248035 0,00711070420386053 0,00175940848939468 0,00195653340555155 289131 309950 623 665 0 True 587 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 632 334 0,00704217331579158 0,00717919770816375 0,00700389105058366 0,00720225833524071 0,00184844730647185 0,00170596989164848 287520 312875 623 665 0 True 632 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 233 381 0,0060903581473686 0,00616122590752459 0,00604257267109178 0,00611886778057527 0,00158839507304569 0,00141809937955187 248659 268511 623 665 0 True 234 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 279 381 0,00601763898844197 0,00612678411524348 0,00601205462729839 0,00613412680247196 0,00139328010221793 0,00133379532099611 245690 267010 623 665 0 True 278 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 323 382 0,00638919494698592 0,00656048452557349 0,00631723506523232 0,00662241550316625 0,00136108305994308 0,00134074975750915 260860 285911 623 665 0 True 322 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 366 381 0,00657264610911474 0,00678957636710224 0,00662241550316625 0,00677500572213321 0,0013236352923719 0,00131351393021442 268350 295895 623 665 0 True 366 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 411 380 0,00687351581213082 0,00681736384908254 0,00697337300679027 0,0068055237659266 0,00148444137458905 0,00146937777695699 280634 297106 623 665 0 True 411 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 454 380 0,00658072873708571 0,00651739212990132 0,00654612039368277 0,00646982528419928 0,00159446729236029 0,00163263447822069 268680 284033 623 665 0 True 455 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 498 379 0,00678823184063115 0,00686798249916391 0,00679026474402991 0,00689707789730678 0,00166319304526519 0,00170977346056181 277152 299312 623 665 0 True 499 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 543 378 0,00690939778175949 0,00686550434222429 0,00692759594110018 0,00686655985351339 0,00160784656551683 0,0015324039195055 282099 299204 623 665 0 True 543 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 588 379 0,00687241363558933 0,00707263695976035 0,00691233691920348 0,00706492713817044 0,00181172686451273 0,0018197463209837 280589 308231 623 665 0 True 587 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 632 379 0,00652282772943917 0,00632095230064174 0,00646982528419928 0,00625619897764553 0,00178171221142582 0,00181054508102889 266316 275472 623 665 0 True 632 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 234 425 0,00618791301769691 0,00622292742614146 0,00613412680247196 0,00628671702143893 0,00137892857481324 0,00138683577166255 252642 271200 623 665 0 True 234 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 278 425 0,00609616294382047 0,0061739608806865 0,00610360875867857 0,00610360875867857 0,00150341418025547 0,00148528759715972 248896 269066 623 665 0 True 278 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 323 425 0,0063277669744066 0,00662184185572652 0,00633249408712902 0,00663767452506294 0,00125658234075498 0,00135154327913949 258352 288585 623 665 0 True 322 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 367 424 0,00669613886738624 0,00684382046900267 0,00674448767833982 0,00686655985351339 0,00136059346352393 0,00125455586672331 273392 298259 623 665 0 True 366 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 412 424 0,00669618785301031 0,0065529353252667 0,00672922865644312 0,00659189745937285 0,00149040155112228 0,0015475208421961 273394 285582 623 665 0 True 411 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 455 424 0,00671034469836551 0,00677725442009694 0,00665293354695964 0,00686655985351339 0,00159656289072309 0,0015659055047409 273972 295358 623 665 0 True 455 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 499 423 0,00674862696357343 0,00690251607503538 0,00679026474402991 0,00691233691920348 0,0016196006958562 0,00165418530520082 275535 300817 623 665 0 True 499 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 544 423 0,00668776232567088 0,00677493688444044 0,0068055237659266 0,00675974670023652 0,00171046325144084 0,00148180111645832 273050 295257 623 665 0 True 543 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 588 424 0,00631953738956344 0,0062807051962706 0,00631723506523232 0,0064087891966125 0,00182418960379836 0,00190547390898421 258016 273718 623 665 0 True 587 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 632 422 0,00727424270980635 0,00569744342545538 0,005981536583505 0,00567635614557107 0,00879782087323104 0,00172945941540803 296995 248299 623 665 0 True 632 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 235 469 0,00618541475086953 0,00627122854056634 0,00611886778057527 0,00628671702143893 0,00132402875157965 0,00142868411076814 252540 273305 623 665 0 True 234 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 279 470 0,00621137713162474 0,00622843444156282 0,00628671702143893 0,00627145799954223 0,00150878893314054 0,00149870063956904 253600 271440 623 665 0 True 278 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 324 470 0,00661046301089404 0,00663322302093067 0,00654612039368277 0,00656137941557946 0,00194118146851067 0,00138601817221001 269894 289081 623 665 0 True 322 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 368 469 0,00662491376999364 0,00690347980273412 0,00662241550316625 0,00688181887541009 0,00144889716913776 0,00141285589208784 270484 300859 623 665 0 True 366 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 413 469 0,00661582693672931 0,00657679905875928 0,00656137941557946 0,00665293354695964 0,00164178202081793 0,00162674427323799 270113 286622 623 665 0 True 411 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 456 468 0,00657085813383632 0,00656801077998269 0,00656137941557946 0,00654612039368277 0,00197556125547003 0,00193332582143504 268277 286239 623 665 0 True 455 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 500 466 0,00649583665057856 0,00666888094578401 0,00650034332799268 0,00665293354695964 0,00174922593469413 0,00181609061140224 265214 290635 623 665 0 True 499 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 545 466 0,00602990988727061 0,00611840886262348 0,005981536583505 0,00614938582436866 0,00176139696500339 0,00165315363476606 246191 266645 623 665 0 True 543 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 589 466 0,00578806786125459 0,00570829683501498 0,00585946440833143 0,00563057907988098 0,00187099603423034 0,00178251881593986 236317 248772 623 665 0 True 587 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 633 467 0,00570133881384495 0,00552174668761627 0,00570687418936446 0,00549324788281071 0,00171624871590348 0,00160441554477366 232776 240642 623 665 0 True 632 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 236 514 0,00632108043672153 0,00631315069546147 0,00631723506523232 0,00628671702143893 0,00138313187620257 0,00132574858552677 258079 275132 623 665 0 True 234 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 280 513 0,00636217937531328 0,00633414619175542 0,0064087891966125 0,00625619897764553 0,00148492564989338 0,00147245970220548 259757 276047 623 665 0 True 278 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 324 513 0,00648346778050179 0,00641799050154569 0,0064087891966125 0,00642404821850919 0,00169964372926574 0,00143439824472567 264709 279701 623 665 0 True 322 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 368 513 0,00667071532849576 0,00676713527926018 0,00669871061264973 0,00683604180972 0,00144120450637616 0,00141847961598867 272354 294917 623 665 0 True 366 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 412 513 0,00668619478570075 0,00658400407060223 0,00671396963454643 0,00651560234988937 0,00160157842881896 0,00167491446407304 272986 286936 623 665 0 True 411 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 456 512 0,0062995267621323 0,00636861092993413 0,00630197604333562 0,00633249408712902 0,00189062939556109 0,00166342657073491 257199 277549 623 665 0 True 455 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 502 511 0,00611649197780804 0,00591671442281602 0,00610360875867857 0,0059662775616083 0,00169437013584873 0,00165996249154091 249726 257855 623 665 0 True 499 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 545 512 0,00583698000688493 0,00576146247972873 0,00584420538643473 0,00578316929884794 0,00160366576490328 0,0015299101933755 238314 251089 623 665 0 True 543 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 589 510 0,00572174132626863 0,00580246679872031 0,00575265125505455 0,00581368734264134 0,00168458180851878 0,00160664595106247 233609 252876 623 665 0 True 587 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 633 511 0,00580986646396415 0,00564315343175976 0,00575265125505455 0,00561532005798428 0,00171776117070231 0,0018669205072106 237207 245933 623 665 0 True 632 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 236 558 0,00631196911064518 0,00628026922421641 0,00634775310902571 0,00634775310902571 0,00127864533963757 0,00124510270410151 257707 273699 623 665 0 True 234 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 280 558 0,00654068298941139 0,00644320804299602 0,00657663843747616 0,00646982528419928 0,00128780044857317 0,00127261386350107 267045 280800 623 665 0 True 278 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 325 557 0,00638951335354235 0,0065750781164401 0,00633249408712902 0,00660715648126955 0,00138552055154248 0,0013345706796879 260873 286547 623 665 0 True 322 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 368 557 0,00653651921136574 0,00654446828905636 0,00651560234988937 0,00653086137178607 0,00140946713141348 0,00127439595035623 266875 285213 623 665 0 True 366 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 412 557 0,00616342020566369 0,00608359993598095 0,00614938582436866 0,00610360875867857 0,00154123699036177 0,0015537242937774 251642 265128 623 665 0 True 411 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 457 556 0,00610649891049849 0,00607003891050584 0,00607309071488518 0,00607309071488518 0,00176171199340809 0,00184550966377906 249318 264537 623 665 0 True 455 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 502 556 0,00594374417453774 0,00599220642588389 0,00593575951781491 0,00601205462729839 0,00177774665430064 0,00201547474306234 242673 261145 623 665 0 True 499 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 544 555 0,00597316004178964 0,00583711510407972 0,0059510185397116 0,00581368734264134 0,0018055945936768 0,00177380305212738 243874 254386 623 665 0 True 543 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 589 556 0,00587687879768705 0,00595808587616902 0,00590524147402152 0,0059662775616083 0,00144317551138407 0,00134827766547694 239943 259658 623 665 0 True 587 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 633 555 0,00561282179115689 0,00596634639930107 0,00570687418936446 0,00587472343022812 0,00163143300692871 0,001719046549016 229162 260018 623 665 0 True 632 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 234 594 0,00663172277173887 0,00681380723495624 0,00663767452506294 0,00675974670023652 0,00135271253991042 0,001234492080473 270762 296951 623 665 0 False 234 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 278 594 0,00669479176272441 0,0065324675846173 0,00668345159075303 0,00650034332799268 0,00127301424825528 0,00131686512660553 273337 284690 623 665 0 False 278 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 325 601 0,00643977260383452 0,00643297417267132 0,00648508430609598 0,00645456626230259 0,00138840752986656 0,00140225027950126 262925 280354 623 665 0 True 322 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 369 601 0,00623589443646999 0,00631700560625643 0,00621042191195544 0,00628671702143893 0,00129951946853475 0,00131493302934029 254601 275300 623 665 0 True 366 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 411 594 0,00590617220087878 0,00596166543619291 0,00599679560540169 0,00601205462729839 0,00145963413630703 0,0014987099728937 241139 259814 623 665 0 False 411 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 455 594 0,00583822914029862 0,00595852184822321 0,00585946440833143 0,00585946440833143 0,00172319833285146 0,00183912187754375 238365 259677 623 665 0 False 455 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 499 594 0,00584129074180278 0,00612953762295416 0,00592050049591821 0,00616464484626535 0,00190608479060743 0,00197165443079488 238490 267130 623 665 0 False 499 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 543 594 0,00590707843492401 0,0058524200177716 0,00592050049591821 0,00576791027695125 0,00188474405317361 0,00175411120932129 241176 255053 623 665 0 False 543 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 587 594 0,00591763483691032 0,00600686885444327 0,00588998245212482 0,00610360875867857 0,00150015052708427 0,00170473031235834 241607 261784 623 665 0 False 587 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 632 594 0,00594580157074853 0,00587509056458955 0,00592050049591821 0,00579842832074464 0,0014247843245983 0,0014177939285495 242757 256041 623 665 0 False 632 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 236 644 0,00845903350628932 0,706866433651077 0,00827038986800946 0,696971084153506 0,00210710287153965 0,175202320548628 345368 30805787 623 665 7 True 234 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 278 638 0,00709980490250575 0,00677076073107924 0,0068055237659266 0,00675974670023652 0,00207551593185139 0,00131731132251079 289873 295075 623 665 0 False 278 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 322 638 0,00607169462459928 0,00611990034596677 0,00607309071488518 0,00610360875867857 0,00125899280875082 0,00117055006936268 247897 266710 623 665 0 False 322 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 366 638 0,00593718010091283 0,00596352405389762 0,00592050049591821 0,00593575951781491 0,00127935070567546 0,00125905454215403 242405 259895 623 665 0 False 366 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 411 638 0,00589390130205013 0,00572972830336312 0,00575265125505455 0,00570687418936446 0,00211479332723297 0,00140145912867801 240638 249706 623 665 0 False 411 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 455 638 0,00551693243204684 0,00570283571138879 0,00552376592660411 0,00567635614557107 0,00163547532491948 0,00164160683781006 225247 248534 623 665 0 False 455 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 499 638 0,005698424169213 0,00572653882359825 0,00570687418936446 0,00567635614557107 0,00167227127814552 0,0016809623407025 232657 249567 623 665 0 False 499 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 543 638 0,0057558598134309 0,00591731101615334 0,00576791027695125 0,00590524147402152 0,00175952022403751 0,00158957706193813 235002 257881 623 665 0 False 543 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 587 638 0,00608754147398478 0,00593298306420664 0,00613412680247196 0,00592050049591821 0,00142092984046702 0,00123566458736849 248544 258564 623 665 0 False 587 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 633 641 0,00767384293812834 0,739393046589924 0,00764476997024491 0,745937285420005 0,0016093642430333 0,185484351496899 313310 32223322 623 665 12 True 632 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D12_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D12_3.csv new file mode 100755 index 0000000..6896a62 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D12_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 233 248 0,00105928962762476 0,0700578179254499 0,00080872816052491 0,0691081101701381 0,000882564622977027 0,0211701618446016 43249 3053174 623 665 0 True 234 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 278 248 0,000910299852026676 0,000940850638842471 0,000732433051041428 0,000793469138628214 0,000758389261898987 0,000741546469349581 37166 41003 623 665 0 False 278 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 321 248 0,000865600470066048 0,000909896622994887 0,000747692072938125 0,000778210116731518 0,00064234087601026 0,000693044994037125 35341 39654 623 665 0 True 322 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 365 248 0,000959285476093117 0,000900442913188212 0,000900282291905089 0,000793469138628214 0,000655899504060138 0,000624248335707972 39166 39242 623 665 0 True 366 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 409 248 0,000975401746410976 0,000934035707258533 0,000854505226215 0,000793469138628214 0,00072102866254822 0,000674364793017862 39824 40706 623 665 0 True 411 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 454 246 0,00095352966526531 0,00088903880208647 0,000762951094834821 0,000686655985351339 0,000822534858115585 0,000778558264755882 38931 38745 623 665 0 True 455 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 498 246 0,000931975990676076 0,000910401432741845 0,000747692072938125 0,000747692072938125 0,000821589817738253 0,000770257545558049 38051 39676 623 665 0 True 499 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 542 247 0,000996808464128011 0,000950579699420215 0,000869764248111696 0,000793469138628214 0,000785393661554225 0,000776523709796876 40698 41427 623 665 0 True 543 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 587 248 0,000911255071695972 0,000984906762213384 0,000625619897764553 0,000671396963454643 0,000869669460640481 0,00100904862007 37205 42923 623 665 0 False 587 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 630 244 0,00108748085427499 0,0711442832303923 0,000854505226215 0,0719615472648203 0,000992668685460411 0,0223780114466072 44400 3100523 623 665 0 True 632 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 234 291 0,000953113287460746 0,000948285109661313 0,000701915007248035 0,000793469138628214 0,000806638456729646 0,000777136734753218 38914 41327 623 665 0 False 234 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 278 291 0,000914096237891825 0,000879493308689439 0,000732433051041428 0,000717174029144732 0,000730963388760236 0,000712240943551339 37321 38329 623 665 0 False 278 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 321 292 0,00084074026585233 0,000863867152431319 0,000701915007248035 0,000732433051041428 0,000628311312936498 0,000657747696925243 34326 37648 623 665 0 True 322 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 366 292 0,000896167499483508 0,000881787898448341 0,000793469138628214 0,00080872816052491 0,000651436045924214 0,000623783799282604 36589 38429 623 665 0 True 366 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 410 292 0,00091664349034328 0,000914164559946444 0,000732433051041428 0,000717174029144732 0,00073400292684796 0,000774880695526021 37425 39840 623 665 0 True 411 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 454 291 0,000878410210759423 0,000951107455064762 0,000579842832074464 0,000656137941557946 0,000899760316152035 0,000955039878033778 35864 41450 623 665 0 True 455 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 499 291 0,000935355998736661 0,000908244518368478 0,000701915007248035 0,000656137941557946 0,000867207537649151 0,000865117353826393 38189 39582 623 665 0 True 499 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 543 291 0,000957154601446227 0,000965035614901295 0,000747692072938125 0,000778210116731518 0,000841857664484367 0,000822399525211111 39079 42057 623 665 0 True 543 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 587 291 0,00096812738123711 0,0010306379361083 0,00064087891966125 0,000579842832074464 0,000955930989091535 0,00110213072698476 39527 44916 623 665 0 False 587 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 632 291 0,000945642979790613 0,00100941298083845 0,000579842832074464 0,000671396963454643 0,000982251389918837 0,00101449605967583 38609 43991 623 665 0 False 632 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 234 338 0,000888917627121675 0,000980822392442539 0,000732433051041428 0,000823987182421607 0,000772227544418502 0,000757415631110097 36293 42745 623 665 0 True 234 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 278 336 0,000856783057734089 0,000851178071064592 0,000701915007248035 0,000686655985351339 0,000687023311169848 0,000695578625619591 34981 37095 623 665 0 True 278 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 322 336 0,00084865144413906 0,000920038709729233 0,000732433051041428 0,000839246204318303 0,000671705088309832 0,000617492736829073 34649 40096 623 665 0 True 322 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 367 336 0,000914904500688922 0,000927473180548074 0,00080872816052491 0,000823987182421607 0,000682181514727875 0,000646889164204304 37354 40420 623 665 0 True 366 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 410 337 0,000883725150970632 0,000933943923668177 0,000686655985351339 0,000717174029144732 0,000753796229852616 0,000703434470107425 36081 40702 623 665 0 True 411 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 455 335 0,000903074472476876 0,00104057350976434 0,000625619897764553 0,000823987182421607 0,000897588231956364 0,000877208521405953 36871 45349 623 665 0 True 455 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 499 334 0,000928938881983957 0,000963635915148365 0,00064087891966125 0,000793469138628214 0,00085241393953771 0,000821513739369278 37927 41996 623 665 0 True 499 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 543 334 0,000990244390503108 0,000896312651622189 0,000839246204318303 0,000717174029144732 0,000824590713359392 0,000758887106342276 40430 39062 623 665 0 True 543 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 588 334 0,000926122208600137 0,000950510861727447 0,000656137941557946 0,000518806744487678 0,000956289143343501 0,0010829539136231 37812 41424 623 665 0 True 587 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 632 334 0,000948116753805969 0,00108875989470128 0,000488288700694286 0,000732433051041428 0,000999126889507262 0,00111006980830038 38710 47449 623 665 0 True 632 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 233 381 0,000853329571237405 0,000986535920942204 0,000671396963454643 0,000823987182421607 0,000746422192355189 0,000809025051464886 34840 42994 623 665 0 True 234 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 279 381 0,000908266948627919 0,000963544131558009 0,000778210116731518 0,00080872816052491 0,000732775210336585 0,000752433362044828 37083 41992 623 665 0 True 278 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 323 382 0,000896363441979774 0,000969441227238387 0,000778210116731518 0,000869764248111696 0,000683168033839921 0,000712968102651168 36597 42249 623 665 0 True 322 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 366 381 0,000905621724928331 0,00087761174508714 0,000747692072938125 0,000732433051041428 0,000713559452709991 0,000661900106191088 36975 38247 623 665 0 True 366 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 411 380 0,00094774936162547 0,000998054761531891 0,000762951094834821 0,000823987182421607 0,000760313892287662 0,000772858269159447 38695 43496 623 665 0 True 411 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 454 380 0,000979369581960358 0,000965815775419322 0,000717174029144732 0,000717174029144732 0,000909839006771188 0,000865017846763956 39986 42091 623 665 0 True 455 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 498 379 0,000990366854563274 0,00103196879816846 0,000717174029144732 0,000717174029144732 0,000876859540564421 0,000963595702711112 40435 44974 623 665 0 True 499 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 543 378 0,000925975251727937 0,000971139223659974 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000840906445352894 0,000893160248081038 37806 42323 623 665 0 True 543 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 588 379 0,00100031093624876 0,00096469142643746 0,000717174029144732 0,000549324788281071 0,000979255661033687 0,00104613169279771 40841 42042 623 665 0 True 587 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 632 379 0,000929159317292256 0,000924604943349447 0,000534065766384375 0,000595101853971161 0,00103771069829142 0,000965611581355927 37936 40295 623 665 0 True 632 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 234 425 0,000929575695096821 0,000916229690729456 0,000732433051041428 0,000823987182421607 0,000836253857067023 0,000766078782981936 37953 39930 623 665 0 True 234 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 278 425 0,000908315934251985 0,0008983777824052 0,000762951094834821 0,000717174029144732 0,000809332932966283 0,0007773497640182 37085 39152 623 665 0 True 278 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 323 425 0,000997567741301041 0,000910516162229791 0,000915541313801785 0,000732433051041428 0,000717713998983522 0,000734363907735184 40729 39681 623 665 0 True 322 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 367 424 0,000986521483074059 0,000958060062034234 0,000869764248111696 0,000839246204318303 0,000718867873570932 0,000680914547121684 40278 41753 623 665 0 True 366 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 412 424 0,000998522960970337 0,000977288724213831 0,000854505226215 0,000747692072938125 0,000806469442634785 0,000835442029536453 40768 42591 623 665 0 True 411 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 455 424 0,000978193926982764 0,000954549339703114 0,000762951094834821 0,000732433051041428 0,000870888044685151 0,000839645187729009 39938 41600 623 665 0 True 455 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 499 423 0,0010212033049131 0,00105367561728767 0,000762951094834821 0,000793469138628214 0,000940306887560327 0,000910983844731333 41694 45920 623 665 0 True 499 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 544 423 0,000941332244872767 0,000983484116562865 0,000671396963454643 0,000762951094834821 0,00089461454276015 0,000843239668710122 38433 42861 623 665 0 True 543 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 588 424 0,000973687249568651 0,000948514568637203 0,000625619897764553 0,000610360875867857 0,00100678026430673 0,00101823556360396 39754 41337 623 665 0 True 587 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 632 422 0,00100378891555748 0,000842389792287999 0,000488288700694286 0,000473029678797589 0,00129748455306725 0,000883907074255282 40983 36712 623 665 0 True 632 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 235 469 0,000955709525536267 0,000869810139906874 0,000839246204318303 0,000717174029144732 0,000756333047379802 0,000714558062346487 39020 37907 623 665 0 True 234 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 279 470 0,000959260983281084 0,000955880201763278 0,000823987182421607 0,00080872816052491 0,000774374424242842 0,00082370212282853 39165 41658 623 665 0 True 278 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 324 470 0,000945912400722979 0,000946311762468657 0,000823987182421607 0,000823987182421607 0,000817016237807463 0,000758260489750031 38620 41241 623 665 0 True 322 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 368 469 0,00100334804494088 0,00101400216035626 0,000869764248111696 0,000885023270008392 0,000786957339960183 0,000786275369297387 40965 44191 623 665 0 True 366 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 413 469 0,000928375547307193 0,000988440430442093 0,000686655985351339 0,000732433051041428 0,000873207966832401 0,000908751891883076 37904 43077 623 665 0 True 411 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 456 468 0,0010066055889413 0,00104009164591497 0,000610360875867857 0,000686655985351339 0,0010485012950831 0,00107558986511789 41098 45328 623 665 0 True 455 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 500 466 0,000941479201744966 0,000959276194606452 0,000549324788281071 0,00064087891966125 0,000990306867920646 0,000953430892157456 38439 41806 623 665 0 True 499 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 545 466 0,000874858753014606 0,000863913044226497 0,000534065766384375 0,000564583810177768 0,000916490439866451 0,000877606225923581 35719 37650 623 665 0 True 543 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 589 466 0,000908291441439952 0,000873274970442816 0,000503547722590982 0,000473029678797589 0,000982812609194855 0,00094454960793678 37084 38058 623 665 0 True 587 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 633 467 0,000864008437283889 0,000901636099862841 0,000549324788281071 0,000518806744487678 0,000898774379971601 0,000932997307605599 35276 39294 623 665 0 True 632 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 236 514 0,000894746916385581 0,00101625085831998 0,000732433051041428 0,000885023270008392 0,000719623560853099 0,000790682850764859 36531 44289 623 665 0 True 234 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 280 513 0,00096014272451428 0,000940208153709979 0,000793469138628214 0,000732433051041428 0,000797015568108782 0,00085942020144315 39201 40975 623 665 0 True 278 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 324 513 0,000874246432713775 0,000952461263022514 0,000762951094834821 0,00080872816052491 0,000732683356851105 0,000811542350777322 35694 41509 623 665 0 True 322 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 368 513 0,00086302872480256 0,0010036765064412 0,000686655985351339 0,000839246204318303 0,000753780641660413 0,000800537560292733 35236 43741 623 665 0 True 366 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 412 513 0,000922815678975652 0,000971116277762385 0,000656137941557946 0,000701915007248035 0,000870563638214249 0,000889307899949693 37677 42322 623 665 0 True 411 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 456 512 0,00094424688950472 0,000940024586529267 0,000595101853971161 0,000625619897764553 0,00096558702095623 0,000923797686600956 38552 40967 623 665 0 True 455 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 502 511 0,000958060835491456 0,00102685186300611 0,000595101853971161 0,000778210116731518 0,000915301376643592 0,000922891256172803 39116 44751 623 665 0 True 499 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 545 512 0,000941185288000567 0,000893696819297041 0,000595101853971161 0,000625619897764553 0,000930636587848843 0,000825582743644895 38427 38948 623 665 0 True 543 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 589 510 0,000902339688115879 0,000897115758037804 0,000579842832074464 0,000518806744487678 0,000910745033773743 0,000943843104769333 36841 39097 623 665 0 True 587 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 633 511 0,000900282291905089 0,000854275767239109 0,000518806744487678 0,000457770656900893 0,000955961884933892 0,0009567812939157 36757 37230 623 665 0 True 632 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 236 558 0,000945496022918414 0,000985342734267576 0,000762951094834821 0,00080872816052491 0,00073481827541077 0,000732047306704866 38603 42942 623 665 0 True 234 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 280 558 0,000884263992835363 0,00095161226481172 0,000732433051041428 0,000854505226215 0,00071427082453476 0,000714011490906788 36103 41472 623 665 0 True 278 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 325 557 0,000922227851486855 0,000976187321129558 0,000793469138628214 0,000854505226215 0,000696962063306691 0,000746168966345045 37653 42543 623 665 0 True 322 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 368 557 0,000987011339314723 0,000933232600842918 0,000854505226215 0,000854505226215 0,000750214503127962 0,000662348790906791 40298 40671 623 665 0 True 366 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 412 557 0,000887423565587648 0,000922815163337504 0,000671396963454643 0,000701915007248035 0,000827311179224179 0,000833939120093049 36232 40217 623 665 0 True 411 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 457 556 0,000908560862372317 0,000816873954169011 0,000473029678797589 0,000411993591210803 0,000986127794364521 0,000951303778613408 37095 35600 623 665 0 True 455 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 502 556 0,000929404245412588 0,000924673781042214 0,000503547722590982 0,000473029678797589 0,00103722545476302 0,00109392527981006 37946 40298 623 665 0 True 499 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 544 555 0,000976307980456206 0,000934517571107903 0,000564583810177768 0,000488288700694286 0,00102611538580836 0,000996825294073081 39861 40727 623 665 0 True 543 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 589 556 0,000838633884017473 0,00090865754452508 0,000549324788281071 0,000701915007248035 0,000812149684602496 0,000740770568301459 34240 39600 623 665 0 True 587 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 633 555 0,000924285247697645 0,000950120781468434 0,00064087891966125 0,000625619897764553 0,000914416081187321 0,000932445886630074 37737 41407 623 665 0 True 632 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 234 594 0,000986741918382358 0,000953815070980266 0,000854505226215 0,000839246204318303 0,000716167960083323 0,000681670663128345 40287 41568 623 665 0 False 234 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 278 594 0,000927567284510097 0,000941929096029155 0,000762951094834821 0,000793469138628214 0,000711512349958622 0,000751971709608733 37871 41050 623 665 0 False 278 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 325 601 0,000928816417923791 0,000901268965501417 0,000778210116731518 0,000762951094834821 0,000750399741315833 0,000723052214892182 37922 39278 623 665 0 True 322 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 369 601 0,000959677361085649 0,000943741821938687 0,000823987182421607 0,000839246204318303 0,000734424923525415 0,000694937108722293 39182 41129 623 665 0 True 366 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 411 594 0,00093481715687193 0,000878644310478646 0,000656137941557946 0,000671396963454643 0,000855774155051377 0,00075499320850404 38167 38292 623 665 0 False 411 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 455 594 0,000911451014192237 0,000869190600671971 0,000534065766384375 0,000457770656900893 0,000971817685871084 0,000963601709330613 37213 37880 623 665 0 False 455 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 499 594 0,00095938344734125 0,000966710665425294 0,00064087891966125 0,000534065766384375 0,00102897532958867 0,00111519109453379 39170 42130 623 665 0 False 499 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 543 594 0,000961832728544572 0,000828255119373164 0,000564583810177768 0,000473029678797589 0,0010125718239124 0,000900769658404247 39270 36096 623 665 0 False 543 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 587 594 0,000915639285049918 0,000873596213009062 0,000686655985351339 0,000534065766384375 0,000841611320904012 0,000884986291062229 37384 38072 623 665 0 False 587 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 632 594 0,000946157328843311 0,000940483504481047 0,000747692072938125 0,000747692072938125 0,000799175223319825 0,000731073249297683 38630 40987 623 665 0 False 632 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 236 644 0,00102607737450771 0,0699084171862478 0,000885023270008392 0,0679331654840925 0,000737871419544898 0,0187166817915344 41893 3046663 623 665 0 True 234 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 278 638 0,0010282817275907 0,000870705029912846 0,000885023270008392 0,000747692072938125 0,000738743887685113 0,000665501222627543 41983 37946 623 665 0 False 278 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 322 638 0,000971654346169894 0,000938349536005268 0,000839246204318303 0,000793469138628214 0,000712790791227172 0,000699572169987436 39671 40894 623 665 0 False 322 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 366 638 0,000973393335824252 0,000921254842301451 0,000885023270008392 0,000839246204318303 0,000715756702611999 0,000619955938439661 39742 40149 623 665 0 False 366 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 411 638 0,000951496761866553 0,00087293078197898 0,000793469138628214 0,000701915007248035 0,00075265809217543 0,000706782950136839 38848 38043 623 665 0 False 411 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 455 638 0,000876916149225396 0,000918409551000412 0,00064087891966125 0,000610360875867857 0,000840294763377202 0,000911876691105098 35803 40025 623 665 0 False 455 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 499 638 0,00081032019330707 0,000875661343792073 0,000457770656900893 0,000579842832074464 0,000887014284684778 0,000913251447541697 33084 38162 623 665 0 False 499 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 543 638 0,000911328550132071 0,00079193176348975 0,000549324788281071 0,0004272526131075 0,000961694545353858 0,000821342513373837 37208 34513 623 665 0 False 543 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 587 638 0,000900943597829986 0,00083697456045699 0,000701915007248035 0,000686655985351339 0,000766892055247271 0,00065709597021683 36784 36476 623 665 0 False 587 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 633 641 0,00096744158250018 0,0747583079924577 0,000839246204318303 0,0737773708705272 0,000746093001514776 0,0214849443128793 39499 3258025 623 665 0 True 632 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D1_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D1_1.csv new file mode 100755 index 0000000..24e14e1 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D1_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 258 279 0,0100718924126859 0,0466498358507851 0,0100099183642329 0,0462348363469902 0,0015559617807177 0,00837638708967243 440261 2033036 667 665 0 True 257 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 301 279 0,0100956388365671 0,00988972775266158 0,0100862134737163 0,00993362325474937 0,00129563091418527 0,00130584727722225 441299 431002 667 665 0 False 301 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 346 279 0,0100616434744404 0,0644482113959653 0,0100251773861295 0,0644083314259556 0,00132152350551524 0,00867235625351047 439813 2808703 667 665 0 True 345 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 390 279 0,0101300459863911 0,0891813190563959 0,0100709544518196 0,0886243991760128 0,00185005149570368 0,0132243085359125 442803 3886591 667 665 0 True 390 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 434 278 0,00992886481913541 0,0751857900645411 0,00996414129854276 0,0713054093232624 0,00160135761356082 0,0149801402030157 434009 3276655 667 665 0 True 434 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 477 279 0,00993247940003448 0,0708316453757419 0,00991836423285267 0,07348744945449 0,00168155953062167 0,0214706129857633 434167 3086898 667 665 0 True 478 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 522 279 0,00980553440377545 0,0840327185553722 0,0097962920576791 0,0805828946364538 0,00151174044209806 0,0216426091072551 428618 3662211 667 665 0 True 523 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 567 279 0,0099637981421283 0,0729066887865119 0,0100099183642329 0,0699015793087663 0,00166500276148337 0,0191497352055448 435536 3177330 667 665 0 True 567 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 611 279 0,00989043130071494 0,00980510328235329 0,00991836423285267 0,0098115510795758 0,00187225508460406 0,00187987486784616 432329 427314 667 665 0 False 611 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 655 278 0,00989969652390559 0,0449941287184544 0,00988784618905928 0,0443579766536965 0,00176527454394153 0,00860420735736785 432734 1960879 667 665 0 True 655 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 257 322 0,0101896408170371 0,0100249708730512 0,0101930266269932 0,0101472495613031 0,00145627500597063 0,00148010996993391 445408 436896 667 665 0 False 257 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 301 322 0,0101799866832434 0,0100937167822279 0,0101777676050965 0,0101167315175097 0,00129666583785346 0,00133037994401519 444986 439892 667 665 0 False 301 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 345 323 0,0103508328234601 0,101936163365612 0,0102998397802701 0,0983443961242084 0,00133940462763301 0,0208525086161654 452454 4442457 667 665 0 True 345 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 389 323 0,0102813322109831 0,0532623157802953 0,0101930266269932 0,0518959334706645 0,00161131660346033 0,00721379852940515 449416 2321213 667 665 0 True 390 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 434 323 0,0101676788065111 0,0821016606519733 0,0102082856488899 0,0798809796292058 0,00168870109129467 0,0139400687349657 444448 3578054 667 665 0 True 434 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 478 324 0,010284626512562 0,0433124468300529 0,0102235446707866 0,0447394522011139 0,00165288562127369 0,00735513527748544 449560 1887590 667 665 0 True 478 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 522 323 0,0101282844501302 0,0449289853151992 0,0101319905394064 0,0472419317921721 0,00146782981674143 0,00853974265494139 442726 1958040 667 665 0 True 523 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 567 324 0,00997125607486941 0,0528585827122166 0,00993362325474937 0,053833829251545 0,00177860711509342 0,00926680477415054 435862 2303618 667 665 0 True 567 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 611 323 0,00981299233651657 0,00982107362707524 0,00984206912336919 0,00971999694819562 0,00207201438494771 0,00218513779607829 428944 428010 667 665 0 False 611 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 655 323 0,00978791904116607 0,00959987517431712 0,0097962920576791 0,00959792477302205 0,00205569891731979 0,00181796124596278 427848 418370 667 665 0 False 655 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 258 369 0,010104698165909 0,0523593029265771 0,010101472495613 0,0505683985656519 0,00155158534223143 0,0090072757424389 441695 2281859 667 665 0 True 257 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 301 368 0,0101498346729588 0,0655629919385325 0,01025406271458 0,0679942015716793 0,00147760116812745 0,0175473773566878 443668 2857286 667 665 0 True 301 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 346 368 0,0102012623809405 0,0408966338941884 0,0101930266269932 0,0417944609750515 0,00132789966529388 0,00594917192578025 445916 1782307 667 665 0 True 345 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 390 367 0,0101014267414244 0,0361293483192991 0,0100556954299229 0,0368352788586252 0,00137253291100005 0,00499019518980332 441552 1574545 667 665 0 True 390 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 435 367 0,0104243826816278 0,0730581317105995 0,0103608758678569 0,0694743266956588 0,00165201320820756 0,0116159379658659 455669 3183930 667 665 0 True 434 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 478 367 0,0104064012855097 0,0347161334326891 0,0103456168459602 0,035233081559472 0,0017603866383318 0,00491348347711585 454883 1512956 667 665 0 True 478 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 523 368 0,0100994821884091 0,0301110982996516 0,0100709544518196 0,0303807125963226 0,00168137449172051 0,00316144372481678 441467 1312265 667 665 0 True 522 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 566 367 0,0101547532482328 0,0515631950097262 0,0101625085831998 0,0511787594415198 0,00191580622608307 0,00757384118749395 443883 2247164 667 665 0 True 567 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 611 368 0,0101255163217201 0,0570359980977851 0,0101167315175097 0,0570077058060578 0,00196675568315697 0,0117549325526431 442605 2485673 667 665 0 True 611 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 656 367 0,00993629987478223 0,0607329722796348 0,00999465934233616 0,0605935759517815 0,00195146979247522 0,0162809622013949 434334 2646790 667 665 0 True 655 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 258 413 0,00986883532369773 0,0429467580601768 0,00991836423285267 0,0450446326390478 0,00153355661780089 0,00793815405107489 431385 1871653 667 665 0 True 257 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 301 413 0,0102278226874203 0,0351141529722682 0,0102998397802701 0,0338597695887694 0,00135442137623026 0,00568050946124775 447077 1530302 667 665 0 True 301 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 346 412 0,0103897010066722 0,0910791054082907 0,0103608758678569 0,0872205691615167 0,00144832187614273 0,0181563378463822 454153 3969298 667 665 0 True 345 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 390 412 0,0101929808728046 0,0683450443458153 0,0101625085831998 0,0657816433966583 0,00147733868825426 0,0147516674636365 445554 2978530 667 665 0 True 390 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 434 412 0,0104493415915068 0,0447957384878998 0,0105134660868238 0,045639734493019 0,00165534397646723 0,00669147277475814 456760 1952233 667 665 0 True 434 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 478 412 0,0104195327376367 0,0542380212375755 0,0104829480430304 0,0543526359960327 0,00163654189385151 0,00842232456878506 455457 2363735 667 665 0 True 478 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 523 412 0,010772434794276 0,0420832580421069 0,0103303578240635 0,0429083695735103 0,00413414395077759 0,00570040638851085 470883 1834021 667 665 0 True 522 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 567 412 0,01015745274536 0,0520125215763143 0,0101472495613031 0,0506752117189288 0,00171462183333729 0,00814915287863799 444001 2266746 667 665 0 True 567 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 611 412 0,00998129911926619 0,0416200950992726 0,0100099183642329 0,0420233463035019 0,00189681621827588 0,00750701008103065 436301 1813836 667 665 0 True 611 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 655 412 0,00996869384030804 0,0810787325374549 0,00997940032043946 0,0767223620965896 0,00189385009067013 0,0145724750328745 435750 3533474 667 665 0 True 655 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 258 457 0,0101397001201848 0,0478923103134352 0,0100709544518196 0,0474860761425193 0,00153451202719781 0,00700889235199043 443225 2087184 667 665 0 True 257 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 302 456 0,0102764365128033 0,0617450928763887 0,0101930266269932 0,0609292744335088 0,00159532520584546 0,00822749561343938 449202 2690899 667 665 0 True 301 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 346 456 0,0102345256760496 0,0364471948927021 0,0101930266269932 0,0366826886396582 0,00142610915524275 0,00378728168498738 447370 1588397 667 665 0 True 345 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 390 456 0,0103537610915302 0,0532841373289025 0,010406652933547 0,0531319142442969 0,00147040641721998 0,00775703238587366 452582 2322164 667 665 0 True 390 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 435 456 0,0106636770879838 0,100133074733068 0,0106202792401007 0,100175478751812 0,00184070004543002 0,0164599838030646 466129 4363877 667 665 0 True 434 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 479 457 0,0105915684867569 0,0604480071774768 0,0106507972838941 0,0601205462729839 0,00186476623653701 0,0124022285485022 462977 2634371 667 665 0 True 478 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 523 456 0,0104589042169234 0,0532403106645075 0,0104982070649271 0,0518501564049744 0,00176998450714988 0,00788019576143108 457178 2320254 667 665 0 True 522 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 567 456 0,0102271592516857 0,0311221174933213 0,0102998397802701 0,0312352178225376 0,00186469556103882 0,00379852882790604 447048 1356326 667 665 0 True 567 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 611 456 0,0101779506218509 0,0403138769331202 0,0101625085831998 0,0398870832379644 0,00195524300004187 0,00566011940789368 444897 1756910 667 665 0 True 611 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 654 455 0,0100759874125652 0,0683116351189257 0,0101472495613031 0,0684061951628901 0,00190014588638355 0,0113174547913712 440440 2977074 667 665 0 True 655 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 257 501 0,00996011492994633 0,0656450694142084 0,00999465934233616 0,0649881742580301 0,00155762323370504 0,0182837730730731 435375 2860863 667 665 0 True 257 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 301 501 0,0103438324326049 0,0611481094588153 0,0102998397802701 0,0592660410467689 0,00152561469800608 0,00888920668751123 452148 2664882 667 665 0 True 301 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 345 500 0,0102042364031992 0,0708163863538452 0,01025406271458 0,0673838406958114 0,00149932222797216 0,0155848875485346 446046 3086233 667 665 0 True 345 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 389 500 0,0106480291554841 0,0908220884093961 0,0106660563057908 0,0835736629282063 0,00167412542286589 0,0226624743487523 465445 3958097 667 665 0 True 390 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 434 500 0,0107149675333997 0,0949099000648795 0,0107118333714809 0,091279468986038 0,00194255295637196 0,0261904342137536 468371 4136247 667 665 0 True 434 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 479 500 0,0105470039070645 0,0467463004042494 0,0105439841306172 0,0471808957045853 0,00166904272046994 0,00688746092308202 461029 2037240 667 665 0 True 478 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 523 500 0,0103233116790197 0,0407369763387641 0,0103303578240635 0,0417334248874647 0,00167101572066952 0,00611467139798367 451251 1775349 667 665 0 True 522 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 566 500 0,0102031840568615 0,0938879356780599 0,01025406271458 0,0917067215991455 0,0017840937834727 0,0137739644919399 446000 4091709 667 665 0 True 567 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 611 500 0,0101087245345055 0,0594413935961442 0,010101472495613 0,0627450980392157 0,00188171872365768 0,0129572637120437 441871 2590502 667 665 0 True 611 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 654 500 0,00998864266653581 0,0748554609228496 0,00999465934233616 0,0717021438925765 0,00186535372888663 0,011133608941564 436622 3262259 667 665 0 True 655 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 257 545 0,00999365275018705 0,0556700517602085 0,00996414129854276 0,0581368734264134 0,00136995320406123 0,0129808259849136 436841 2426144 667 665 0 True 257 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 301 544 0,0101527858181232 0,111236273333827 0,0100862134737163 0,102693217364767 0,00143180525410311 0,0315261669648998 443797 4847763 667 665 0 True 301 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 345 544 0,0102649064572772 0,056030417081844 0,01025406271458 0,0579690241855497 0,00145241320830547 0,0108412234879618 448698 2441849 667 665 0 True 345 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 389 544 0,0103961523472642 0,0584856969615616 0,0103608758678569 0,0570687418936446 0,00151279694775537 0,00819219261327162 454435 2548852 667 665 0 True 390 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 435 544 0,010517858488929 0,0560326887257053 0,010605020218204 0,0555275806820783 0,00193399750588654 0,00549705867280294 459755 2441948 667 665 0 True 434 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 478 545 0,0104514920383708 0,0575438137573276 0,0105439841306172 0,0573586633096818 0,00191425933360261 0,011227105253703 456854 2507804 667 665 0 True 478 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 522 544 0,0101604038905244 0,0704259848522657 0,0100556954299229 0,0682841229877165 0,00196871726065231 0,0163078852888209 444130 3069219 667 665 0 True 522 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 567 544 0,0100492440893309 0,0553600756296785 0,0101319905394064 0,0554207675288014 0,00176813396512319 0,0101351297820929 439271 2412635 667 665 0 True 567 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 611 544 0,0100889587250321 0,0411673037021485 0,0101472495613031 0,0405737392233158 0,00174855261973511 0,00494774374789649 441007 1794103 667 665 0 True 611 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 655 544 0,0101075120485077 0,0592783400478766 0,0100709544518196 0,0595407034409094 0,00182243789110176 0,00955910983609537 441818 2583396 667 665 0 True 655 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 257 589 0,00981143669410431 0,0446182978618439 0,00990310521095598 0,0449683375295644 0,00128631792423691 0,00840800729245609 428876 1944500 667 665 0 True 257 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 301 589 0,00980143940389613 0,0521561170034264 0,00978103303578241 0,052826733806363 0,00145785214846457 0,0108049353368421 428439 2273004 667 665 0 True 301 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 345 588 0,0100484891452191 0,0497713498669998 0,0100556954299229 0,0494239719233997 0,00138770104318202 0,00901382045947509 439238 2169074 667 665 0 True 345 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 390 588 0,0102410227708302 0,0496261941188517 0,0102693217364767 0,0485999847409781 0,00138082723599063 0,00503685725194045 447654 2162748 667 665 0 True 389 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 434 588 0,0102447746142951 0,0881429483528001 0,0102082856488899 0,0815594720378424 0,00188684010699962 0,0194599698561912 447818 3841338 667 665 0 True 434 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 478 589 0,0101896865712257 0,0612098339233297 0,0103303578240635 0,0596017395284962 0,0019733123870965 0,0115441144216491 445410 2667572 667 665 0 True 478 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 523 588 0,0100185659058775 0,0542561026048757 0,0100556954299229 0,0537117570763714 0,00201966457767548 0,00567261992183297 437930 2364523 667 665 0 True 522 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 567 588 0,00991827272447548 0,036037449999455 0,0101167315175097 0,0370489051651789 0,00171338397905681 0,00626016874959549 433546 1570540 667 665 0 True 567 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 611 588 0,0100218144532678 0,0457602234012589 0,0100862134737163 0,0454566262302586 0,00156351286107747 0,0056788069366285 438072 1994266 667 665 0 True 611 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 655 587 0,00990013118869725 0,0487273803643923 0,00984206912336919 0,047196154726482 0,00160711243813739 0,00715314497202861 432753 2123577 667 665 0 True 655 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 257 626 0,0100182456265573 0,00941298083845457 0,00955214770733196 0,0093842984664683 0,00326713850375118 0,00141339930703943 437916 410225 667 665 0 False 257 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 301 626 0,0100519893406467 0,00948877113819109 0,00964370183871214 0,00947585259784848 0,00302938348871551 0,00126802136538017 439391 413528 667 665 0 False 301 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 346 632 0,00977904272857849 0,0767370015792514 0,00990310521095598 0,0739452201113909 0,00133861464794831 0,0130418659613076 427460 3344258 667 665 0 True 345 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 390 632 0,00997869113051623 0,0766734643888274 0,00993362325474937 0,0727702754253452 0,00139389499029481 0,0190163770518497 436187 3341489 667 665 0 True 389 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 434 626 0,010240084809964 0,00974133663295341 0,0098268101014725 0,00973525597009232 0,00339546757164655 0,00169761520557429 447613 424535 667 665 0 False 434 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 478 626 0,0099181354619097 0,0096979000488174 0,00990310521095598 0,00970473792629892 0,00211457859025889 0,00189378049531405 433540 422642 667 665 0 False 478 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 522 627 0,00961094183967755 0,00982295519067754 0,00962844281681544 0,00985732814526589 0,00191764867417587 0,00194309576666753 420112 428092 667 665 0 False 522 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 567 627 0,0097114637920225 0,00950577404830456 0,00971999694819562 0,00952162966353857 0,00174203678777407 0,00167693939848505 424506 414269 667 665 0 False 567 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 611 627 0,00968401127886503 0,00960086184791344 0,00968947890440223 0,00956740672922866 0,00143402571804395 0,00140806280825601 423306 418413 667 665 0 False 611 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 655 627 0,00972313111011443 0,00964207267998332 0,00970473792629892 0,00968947890440223 0,00150153254803461 0,0015219153425474 425016 420209 667 665 0 False 655 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 259 676 0,00945839737489918 0,0432376202580151 0,00943007553215839 0,0437018387121385 0,00132499432386254 0,00911674482156245 413444 1884329 667 665 0 True 257 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 301 670 0,00949090572589649 0,00936555166813807 0,00953688868543526 0,0093690394445716 0,00126402400277163 0,00130548061246855 414865 408158 667 665 0 False 301 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 345 670 0,0106374370608241 0,0092882010473655 0,00965896086060884 0,00927748531319142 0,005802613098312 0,0013231301675266 464982 404787 667 665 0 False 345 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 389 670 0,0103798638561241 0,00954317586137465 0,00976577401388571 0,00955214770733196 0,00375604028341656 0,00135393502033639 453723 415899 667 665 0 False 389 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 434 670 0,00965699343049922 0,00955905442250625 0,00970473792629892 0,00959792477302205 0,00156461567284416 0,00150412658763994 422125 416591 667 665 0 False 434 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 478 670 0,00963516868253902 0,00962924592323106 0,00964370183871214 0,00967421988250553 0,00169134282202814 0,00151216542407213 421171 419650 667 665 0 False 478 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 522 670 0,00932918754630467 0,00948707314176951 0,00943007553215839 0,00949111161974517 0,0017979296990203 0,00175758453082799 407796 413454 667 665 0 False 522 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 567 670 0,00969826370861262 0,00940520217917189 0,00971999694819562 0,00930800335698482 0,00154025423331242 0,00152017205075139 423929 409886 667 665 0 False 567 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 611 670 0,00970990814961025 0,00948275931302277 0,00971999694819562 0,00955214770733196 0,0013144391011306 0,00142372809152988 424438 413266 667 665 0 False 611 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 657 675 0,00956203061206865 0,0419556788515119 0,00953688868543526 0,042221713588159 0,00151592446085109 0,00809714642474072 417974 1828461 667 665 0 True 655 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D1_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D1_2.csv new file mode 100755 index 0000000..c45f68e --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D1_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 258 279 0,00813742819595009 0,775410854901043 0,00816357671473259 0,78304722667277 0,00163244007899078 0,167749906837098 355702 33793006 667 665 13 True 257 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 301 279 0,00695630669444404 0,00676100872460391 0,00688181887541009 0,00674448767833982 0,00155165086182686 0,00126192979546456 304073 294650 667 665 0 False 301 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 346 279 0,00620154559936786 0,00635477455368795 0,00617990386816205 0,00642404821850919 0,00119122222626036 0,00133843249397999 271081 276946 667 665 0 True 345 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 390 279 0,00631423816587929 0,00613733922813442 0,00625619897764553 0,00613412680247196 0,00135765090422169 0,00126485276551832 276007 267470 667 665 0 True 390 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 434 278 0,00639005285638252 0,00655887831274226 0,00634775310902571 0,00657663843747616 0,00156637150936754 0,00151642306792258 279321 285841 667 665 0 True 434 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 477 279 0,00662909561470123 0,00658393523290947 0,00668345159075303 0,00657663843747616 0,00161952259071228 0,00170225592075222 289770 286933 667 665 0 True 478 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 522 279 0,00679980449235213 0,006763739286417 0,00689707789730678 0,00675974670023652 0,00149007333348454 0,00159539145639987 297232 294769 667 665 0 True 523 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 567 279 0,00707021174695326 0,0069753922457781 0,00703440909437705 0,00697337300679027 0,00165754931506139 0,00162787767375252 309052 303993 667 665 0 True 567 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 611 279 0,00769516820898317 0,00773919233882371 0,0076600289921416 0,0076752880140383 0,00193812254127687 0,0017213134688204 336370 337280 667 665 0 False 611 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 655 278 0,00898623702568492 0,752062784564983 0,00901808194094758 0,750118257419699 0,00191958396137108 0,1731975501314 392805 32775479 667 665 14 True 655 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 257 322 0,00674480795765999 0,00652971407690662 0,00666819256885634 0,00656137941557946 0,00162231964076613 0,00135516478435134 294828 284570 667 665 0 False 257 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 301 322 0,0064424414023247 0,00645371726409179 0,00634775310902571 0,00643930724040589 0,00132418086455286 0,00123662534864379 281611 281258 667 665 0 False 301 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 345 323 0,00616661227637497 0,00617393793478891 0,00613412680247196 0,00619516289005875 0,00125481174161197 0,00125818492883354 269554 269065 667 665 0 True 345 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 389 323 0,00650146430561327 0,00659985968583624 0,0064087891966125 0,00654612039368277 0,00131090778480089 0,00124365472335082 284191 287627 667 665 0 True 390 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 434 323 0,00681307320704491 0,00684960283519511 0,00688181887541009 0,00679026474402991 0,00156515303353419 0,00159514116956383 297812 298511 667 665 0 True 434 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 478 324 0,00680966451999452 0,00690882619687236 0,00686655985351339 0,00686655985351339 0,00152317324395166 0,00155008301498619 297663 301092 667 665 0 True 478 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 522 323 0,00686363158544326 0,00693546638397321 0,00689707789730678 0,00698863202868696 0,0014936366963994 0,00156353453357896 300022 302253 667 665 0 True 523 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 567 324 0,00705360297649299 0,00722889852234156 0,00701915007248035 0,0072327763790341 0,00169339882340663 0,00141648352505617 308326 315041 667 665 0 True 567 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 611 323 0,0073622378556659 0,00753699308926929 0,00730907148851759 0,00758373388265812 0,00189423666686378 0,00203248567403232 321817 328468 667 665 0 False 611 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 655 323 0,00736349609585228 0,00739709195166906 0,0072632944228275 0,00747692072938125 0,00190671865136053 0,00171575168518657 321872 322371 667 665 0 False 655 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 258 369 0,00635617187972734 0,0063709743573858 0,00631723506523232 0,00633249408712902 0,00140125957878688 0,00136736911895951 277840 277652 667 665 0 True 257 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 301 368 0,00644058835768657 0,00647207398216301 0,00642404821850919 0,00650034332799268 0,00117982879169671 0,00130703342101503 281530 282058 667 665 0 True 301 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 346 368 0,00653939452795918 0,00668668696231308 0,00656137941557946 0,00666819256885634 0,00133573290979075 0,00125866943236498 285849 291411 667 665 0 True 345 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 390 367 0,00681838069292202 0,00678166003243403 0,0068055237659266 0,0068207827878233 0,00129751810522278 0,00130398564262847 298044 295550 667 665 0 True 390 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 435 367 0,00695623806316114 0,00710005730737923 0,00691233691920348 0,00709544518196384 0,00157122597021771 0,00162064744194147 304070 309426 667 665 0 True 434 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 478 367 0,00713637230366277 0,00698906800074115 0,00712596322575723 0,00695811398489357 0,00157659742265954 0,00154618651433117 311944 304589 667 665 0 True 478 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 523 368 0,00708837615982579 0,00695618652949609 0,00704966811627375 0,00694285496299687 0,00161235595160603 0,0017291527150262 309846 303156 667 665 0 True 522 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 566 367 0,0071480396217547 0,00687337478509733 0,00712596322575723 0,00692759594110018 0,00180662020998649 0,00167486160668527 312454 299547 667 665 0 True 567 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 611 368 0,00699519775475046 0,00707247633847723 0,00697337300679027 0,00714122224765393 0,00189919585770538 0,00188298141616885 305773 308224 667 665 0 True 611 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 656 367 0,00658583502938391 0,00659538523580639 0,00660715648126955 0,00669871061264973 0,00193443146240819 0,0018317228264232 287879 287432 667 665 0 True 655 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 258 413 0,00628571042928982 0,00655832761120012 0,00630197604333562 0,00648508430609598 0,00144953388337009 0,0015096792948161 274760 285817 667 665 0 True 257 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 301 413 0,00643782022927653 0,00673248697390076 0,00642404821850919 0,00675974670023652 0,00133246191128855 0,0013752662944447 281409 293407 667 665 0 True 301 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 346 412 0,00667272223352732 0,00690866557558924 0,00669871061264973 0,00694285496299687 0,00130746730217836 0,00122350070752483 291677 301085 667 665 0 True 345 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 390 412 0,00694374716967449 0,00694886678816519 0,00692759594110018 0,00698863202868696 0,00138793326903556 0,00129502089175722 303524 302837 667 665 0 True 390 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 434 412 0,00706737498726032 0,00710150289892734 0,00704966811627375 0,00717174029144732 0,00152129348341365 0,00150394924889006 308928 309489 667 665 0 True 434 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 478 412 0,00711656074000079 0,00710294849047544 0,00712596322575723 0,00714122224765393 0,00154120274597133 0,00159525732851684 311078 309552 667 665 0 True 478 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 523 412 0,00736566941981058 0,00696561729340518 0,00701915007248035 0,00689707789730678 0,0035636076566378 0,00161857316304718 321967 303567 667 665 0 True 522 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 567 412 0,00672060399189281 0,00711302173951702 0,00672922865644312 0,00708018616006714 0,00176728235840528 0,00176216564033641 293770 309991 667 665 0 True 567 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 611 412 0,00655060430416515 0,0065349686874545 0,00651560234988937 0,00660715648126955 0,00185909247770276 0,0017323934713584 286339 284799 667 665 0 True 611 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 655 412 0,00618422763898435 0,0060642565443134 0,00624093995574884 0,00616464484626535 0,001786982862175 0,00183456748040736 270324 264285 667 665 0 True 655 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 258 457 0,00650414092564613 0,00647592889295796 0,00657663843747616 0,00642404821850919 0,00145000841970226 0,0014046894244766 284308 282226 667 665 0 True 257 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 302 456 0,0065816485211274 0,00650903982317891 0,00657663843747616 0,00643930724040589 0,00148536368154641 0,00147242983512499 287696 283669 667 665 0 True 301 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 346 456 0,00649283964106297 0,0066640852531879 0,00656137941557946 0,00665293354695964 0,00142754628122244 0,00148148325498871 283814 290426 667 665 0 True 345 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 390 456 0,00682256720117854 0,00696754474880265 0,00679026474402991 0,00694285496299687 0,00140052521826308 0,00133530034492608 298227 303651 667 665 0 True 390 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 435 456 0,00701850951384001 0,00699462090795769 0,00698863202868696 0,00703440909437705 0,00184593244681153 0,00188924705554258 306792 304831 667 665 0 True 434 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 479 457 0,00702139202772155 0,00692403932697388 0,00701915007248035 0,00695811398489357 0,00188491010051607 0,00193240283089027 306918 301755 667 665 0 True 478 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 523 456 0,00677479982828453 0,00675586884354397 0,00683604180972 0,0068055237659266 0,00169709867741457 0,00166417611713467 296139 294426 667 665 0 True 522 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 567 456 0,00625150917331446 0,00634256733617059 0,00631723506523232 0,00627145799954223 0,00185517668736731 0,00189656529000418 273265 276414 667 665 0 True 567 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 611 456 0,00621881780556277 0,00625631370713348 0,00621042191195544 0,00622568093385214 0,00171367907800951 0,00165075516085028 271836 272655 667 665 0 True 611 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 654 455 0,00602253233648683 0,00595803998437384 0,00605783169298848 0,00593575951781491 0,00168835109327483 0,0018559671292489 263256 259656 667 665 0 True 655 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 257 501 0,00673787619808773 0,00673221162312969 0,00674448767833982 0,00662241550316625 0,00139432495111394 0,00153170273936048 294525 293395 667 665 0 True 257 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 301 501 0,00645150073166667 0,00657617951952438 0,00653086137178607 0,00660715648126955 0,00142608155692886 0,00143611202558443 282007 286595 667 665 0 True 301 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 345 500 0,0064598051168968 0,00651980144914816 0,00650034332799268 0,00653086137178607 0,00148887221616709 0,00151732299699386 282370 284138 667 665 0 True 345 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 389 500 0,00678429382241816 0,00658235196597582 0,00685130083161669 0,00666819256885634 0,00150157253577174 0,00149567372379654 296554 286864 667 665 0 True 390 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 434 500 0,00686841289815152 0,0069829185001873 0,00688181887541009 0,00698863202868696 0,00173816689295536 0,00183672834436235 300231 304321 667 665 0 True 434 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 479 500 0,00672813055591682 0,00666598976268779 0,00669871061264973 0,00669871061264973 0,00159582868184362 0,00163889722454758 294099 290509 667 665 0 True 478 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 523 500 0,00631009741181138 0,00630798786850395 0,00642404821850919 0,00631723506523232 0,00168262164231516 0,00154926206193241 275826 274907 667 665 0 True 522 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 566 500 0,00616393565634212 0,00620714064860021 0,00616464484626535 0,00616464484626535 0,00171999309472625 0,00160470204398384 269437 270512 667 665 0 True 567 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 611 500 0,00609754632868963 0,00610900104461199 0,00605783169298848 0,00607309071488518 0,00176790857903232 0,001663421675053 266535 266235 667 665 0 True 611 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 654 500 0,0061206979481191 0,00617694384737307 0,00619516289005875 0,00630197604333562 0,00176554155370466 0,00184679358816265 267547 269196 667 665 0 True 655 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 257 545 0,00651015760144647 0,00655226989423662 0,00657663843747616 0,00656137941557946 0,00136548362242896 0,00137259587122975 284571 285553 667 665 0 True 257 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 301 544 0,00646236735145817 0,00662888624628635 0,00645456626230259 0,00662241550316625 0,00139654673177708 0,0012898931694071 282482 288892 667 665 0 True 301 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 345 544 0,0067196889081209 0,00644584682121876 0,00668345159075303 0,00646982528419928 0,0014136060581805 0,00144180159225608 293730 280915 667 665 0 True 345 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 389 544 0,00666938217775983 0,00681059480929378 0,00672922865644312 0,00683604180972 0,00140745036429917 0,0014529914601621 291531 296811 667 665 0 True 390 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 435 544 0,00651972022686299 0,00639775221987218 0,00654612039368277 0,0063782711528191 0,00174142499940503 0,00194738246869737 284989 278819 667 665 0 True 434 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 478 545 0,0063761435830494 0,0066367107973642 0,00642404821850919 0,00665293354695964 0,00189430719640972 0,00195887566976262 278713 289233 667 665 0 True 478 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 522 544 0,00632558520465105 0,00625991621305495 0,00636301213092241 0,00631723506523232 0,0018646454537278 0,00180871957485693 276503 272812 667 665 0 True 522 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 567 544 0,00629575347368659 0,00641654490999758 0,00633249408712902 0,00648508430609598 0,0015591795327431 0,00166870689261093 275199 279638 667 665 0 True 567 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 611 544 0,0063130943111644 0,00650064162466133 0,00633249408712902 0,0064087891966125 0,00161757004243931 0,00153564794082512 275957 283303 667 665 0 True 611 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 655 544 0,00629442660221732 0,00634382936053799 0,00619516289005875 0,00631723506523232 0,00167482085495431 0,00171976599710874 275141 276469 667 665 0 True 655 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 257 589 0,00663438022348405 0,00660807431717311 0,00666819256885634 0,00659189745937285 0,00125809542927437 0,00120765752468838 290001 287985 667 665 0 True 257 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 301 589 0,00650590246190706 0,00653001237357527 0,00651560234988937 0,00645456626230259 0,00133894642397514 0,00145443458079762 284385 284583 667 665 0 True 301 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 345 588 0,00658203743173046 0,00648494663071045 0,00654612039368277 0,00642404821850919 0,00134597015121981 0,00140493521578309 287713 282619 667 665 0 True 345 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 390 588 0,00647780939010925 0,0064060586347994 0,00650034332799268 0,00643930724040589 0,00135524018766336 0,00121725338581614 283157 279181 667 665 0 True 389 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 434 588 0,00620120244295339 0,00632453186066563 0,00617990386816205 0,00625619897764553 0,00164618617551365 0,00177419251167785 271066 275628 667 665 0 True 434 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 478 589 0,00639707612433198 0,00654329804827932 0,00636301213092241 0,00650034332799268 0,00190347255240958 0,00176485733932513 279628 285162 667 665 0 True 478 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 523 588 0,00637328394626216 0,00655327951373054 0,0064087891966125 0,00657663843747616 0,00180122758240006 0,00199600900060938 278588 285597 667 665 0 True 522 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 567 588 0,00640107961583411 0,00638217195540924 0,00636301213092241 0,00642404821850919 0,00169215502474846 0,00175569270397056 279803 278140 667 665 0 True 567 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 611 588 0,00631437542844508 0,00655004414217049 0,00633249408712902 0,00656137941557946 0,00146964433707604 0,00146916680894866 276013 285456 667 665 0 True 611 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 655 587 0,00639165425298337 0,00625076079991694 0,00642404821850919 0,00625619897764553 0,00153288294302575 0,00151802916578414 279391 272413 667 665 0 True 655 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 257 626 0,00682220116766977 0,00670387343960726 0,00672922865644312 0,00674448767833982 0,0013110538151617 0,00130972786518589 298211 292160 667 665 0 False 257 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 301 626 0,00663424296091826 0,00638699059390293 0,00668345159075303 0,0064087891966125 0,00127197407631875 0,00120398804144619 289995 278350 667 665 0 False 301 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 346 632 0,00632000319364236 0,00636828968736788 0,00628671702143893 0,0063782711528191 0,00127979940511134 0,00133616215052722 276259 277535 667 665 0 True 345 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 390 632 0,00621659872741588 0,00628123295191515 0,00617990386816205 0,00627145799954223 0,00124459570810489 0,00125723127401442 271739 273741 667 665 0 True 389 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 434 626 0,00617260607508102 0,00619917842213683 0,00622568093385214 0,00619516289005875 0,00162273151118176 0,00165510054365502 269816 270165 667 665 0 False 434 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 478 626 0,00632224514888356 0,00624523083859798 0,00633249408712902 0,00624093995574884 0,00178310096981423 0,00175686233805998 276357 272172 667 665 0 False 478 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 522 627 0,00614778442776781 0,00625557943841063 0,00614938582436866 0,00631723506523232 0,00186645503596229 0,00176061954340084 268731 272623 667 665 0 False 522 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 567 627 0,00630172439529835 0,00607770284030057 0,00628671702143893 0,00605783169298848 0,00164277781816725 0,00165216497524852 275460 264871 667 665 0 False 567 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 611 627 0,00630353168574788 0,00635454509471206 0,00636301213092241 0,00633249408712902 0,00142880438221825 0,00127809714552644 275539 276936 667 665 0 False 611 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 655 627 0,00653326346668735 0,00648685114021033 0,00654612039368277 0,00657663843747616 0,00145717595009365 0,00135569948155078 285581 282702 667 665 0 False 655 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 259 676 0,00866383013574467 0,739024214232078 0,0085145342183566 0,745067521171893 0,00185931295436718 0,196562347705792 378712 32207248 667 665 13 True 257 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 301 670 0,00726551350097439 0,00665841761648342 0,00691233691920348 0,00665293354695964 0,00229670259835838 0,0013122560192569 317589 290179 667 665 0 False 301 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 345 670 0,00620152272227356 0,00622988003311093 0,00617990386816205 0,00624093995574884 0,00120391958445013 0,00128628257470001 271080 271503 667 665 0 False 345 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 389 670 0,00610418068603602 0,00617967440918616 0,00608834973678187 0,00614938582436866 0,00135337321131801 0,0012585462980002 266825 269315 667 665 0 False 389 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 434 670 0,00605623029638763 0,00599670382181134 0,00605783169298848 0,005981536583505 0,00143663596953952 0,00140847808912213 264729 261341 667 665 0 False 434 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 478 670 0,00609578479242869 0,00608857919575776 0,00616464484626535 0,00614938582436866 0,00155413765077846 0,00147672129630933 266458 265345 667 665 0 False 478 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 522 670 0,00615238272372168 0,00590829327840085 0,00621042191195544 0,00587472343022812 0,00165859086131563 0,00165963661220697 268932 257488 667 665 0 False 522 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 567 670 0,00620907216339187 0,00618430948049914 0,00621042191195544 0,00622568093385214 0,00143891205201408 0,00147984283477376 271410 269517 667 665 0 False 567 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 611 670 0,00677205457696878 0,0065385253015808 0,00671396963454643 0,00660715648126955 0,00141287661284069 0,00129033715023096 296019 284954 667 665 0 False 611 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 657 675 0,0080514789526729 0,742428192247614 0,00807202258335241 0,73519493400473 0,00171349796918165 0,17954015559096 351945 32355596 667 665 13 True 655 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D1_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D1_3.csv new file mode 100755 index 0000000..c19e358 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D1_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 258 279 0,000972413770226354 0,0784015199362563 0,000793469138628214 0,0786449988555734 0,000772922196836683 0,0195681951360046 42506 3416799 667 665 0 True 257 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 301 279 0,000896827850666107 0,000855514845708916 0,000778210116731518 0,000701915007248035 0,000630347031539096 0,000662862936309268 39202 37284 667 665 0 False 301 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 346 279 0,000791707602367276 0,00087364210480424 0,000686655985351339 0,000747692072938125 0,000621789120663826 0,000680097075209441 34607 38074 667 665 0 True 345 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 390 279 0,000788390423694081 0,000909162354272039 0,000625619897764553 0,000762951094834821 0,000652469776587182 0,000663169411725588 34462 39622 667 665 0 True 390 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 434 278 0,00085395617595185 0,00076694368101531 0,000625619897764553 0,000534065766384375 0,000780350473692842 0,000735286282851905 37328 33424 667 665 0 True 434 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 477 279 0,000826869696303142 0,000846749512829912 0,000564583810177768 0,000503547722590982 0,000799606861012974 0,000899336191328207 36144 36902 667 665 0 True 478 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 522 279 0,000849357879997973 0,000929698932614209 0,000671396963454643 0,000732433051041428 0,000787608357708349 0,00085169311419878 37127 40517 667 665 0 True 523 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 567 279 0,000954729776334081 0,000906202333483055 0,000732433051041428 0,000610360875867857 0,000884629863428708 0,00084706001769724 41733 39493 667 665 0 True 567 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 611 279 0,000972207876377673 0,000873137295057282 0,000579842832074464 0,000488288700694286 0,00101898552345345 0,000935751288805157 42497 38052 667 665 0 False 611 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 655 278 0,00110953907344794 0,0763724371583571 0,000839246204318303 0,0734416723887999 0,00100464327722706 0,0211424856493613 48500 3328370 667 665 0 True 655 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 257 322 0,000893144638484145 0,000870246111961065 0,000732433051041428 0,000686655985351339 0,000741214790138497 0,00069712650970691 39041 37926 667 665 0 False 257 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 301 322 0,000857364863002237 0,000866138796292631 0,000717174029144732 0,000762951094834821 0,000649194064542117 0,000602020555362707 37477 37747 667 665 0 False 301 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 345 323 0,000835608746324938 0,000837548207896716 0,000717174029144732 0,000717174029144732 0,000624090870928299 0,000669048140175111 36526 36501 667 665 0 True 345 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 389 323 0,000864548270611776 0,000799090883537523 0,000686655985351339 0,000656137941557946 0,000701814058035006 0,000615741132937208 37791 34825 667 665 0 True 390 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 434 323 0,000871754555315613 0,000906271171175822 0,00064087891966125 0,000579842832074464 0,000813297287531807 0,000873318343370459 38106 39496 667 665 0 True 434 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 478 324 0,000880241957300132 0,000895486599308984 0,000671396963454643 0,000747692072938125 0,000808629850217323 0,000784565445851925 38477 39026 667 665 0 True 478 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 522 323 0,000826229137662801 0,000810472048741676 0,000610360875867857 0,000625619897764553 0,000787113682212361 0,000784434230025708 36116 35321 667 665 0 True 523 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 567 324 0,000856701427267598 0,000918822577157015 0,000579842832074464 0,000717174029144732 0,000875402471901908 0,000822072853591886 37448 40043 667 665 0 True 567 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 611 323 0,000972322261849162 0,00092781736901191 0,000656137941557946 0,000381475547417411 0,00105433184257777 0,00109599653422347 42502 40435 667 665 0 False 611 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 655 323 0,000830918941993869 0,000953860962775444 0,0004272526131075 0,000656137941557946 0,000965181269310173 0,000922820675140514 36321 41570 667 665 0 False 655 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 258 369 0,000894334247387636 0,000970909764684084 0,000778210116731518 0,000793469138628214 0,000744094902693277 0,000797937023563975 39093 42313 667 665 0 True 257 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 301 368 0,000804610283551289 0,000867079578093781 0,000656137941557946 0,000762951094834821 0,000657750238724218 0,00063904346454246 35171 37788 667 665 0 True 301 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 346 368 0,000808956931467889 0,000821761430355472 0,000701915007248035 0,000671396963454643 0,00063508163884258 0,000718170714466835 35361 35813 667 665 0 True 345 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 390 367 0,000832085673803062 0,00086173318395554 0,00064087891966125 0,000701915007248035 0,000682777562752 0,000658395240678379 36372 37555 667 665 0 True 390 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 435 367 0,000777661066468368 0,000879906334846042 0,000503547722590982 0,000625619897764553 0,000775209706749923 0,000844075400603508 33993 38347 667 665 0 True 434 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 478 367 0,000782465256270926 0,000882820463839847 0,000457770656900893 0,000564583810177768 0,000824715989526083 0,000893732329117844 34203 38474 667 665 0 True 478 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 523 368 0,00087287553293621 0,00083557486070406 0,000610360875867857 0,000457770656900893 0,000834468610791611 0,00086264898893573 38155 36415 667 665 0 True 522 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 566 367 0,000859698326620622 0,00090305874551336 0,000549324788281071 0,000610360875867857 0,000925693122753631 0,000920158810181471 37579 39356 667 665 0 True 567 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 611 368 0,00102281200896462 0,000967628501328854 0,000717174029144732 0,000534065766384375 0,00106279066042476 0,00108750883244712 44709 42170 667 665 0 True 611 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 656 367 0,000975181898636399 0,000910562054024969 0,000549324788281071 0,000534065766384375 0,00104635431462389 0,000968629836912822 42627 39683 667 665 0 True 655 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 258 413 0,000900396677376578 0,000855514845708916 0,000762951094834821 0,00064087891966125 0,000784566410476574 0,000782819857158142 39358 37284 667 665 0 True 257 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 301 413 0,000872486622333146 0,000846038190004652 0,000747692072938125 0,000701915007248035 0,000715513461150507 0,000689053787235387 38138 36871 667 665 0 True 301 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 346 412 0,000815454026248492 0,000927932098499855 0,000671396963454643 0,000823987182421607 0,00065838387657003 0,000675314369064905 35645 40440 667 665 0 True 345 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 390 412 0,000810764221917423 0,000821210728813336 0,00064087891966125 0,000656137941557946 0,000717146314332889 0,000744307615912849 35440 35789 667 665 0 True 390 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 434 412 0,000930502933472609 0,000906110549892699 0,000701915007248035 0,000656137941557946 0,000819466883127335 0,000794271174146168 40674 39489 667 665 0 True 434 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 478 412 0,000975593686333761 0,000901085398320704 0,000686655985351339 0,000701915007248035 0,000905908611937164 0,000779618026744871 42645 39270 667 665 0 True 478 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 523 412 0,000861070952278496 0,000870154328370709 0,000579842832074464 0,000656137941557946 0,000891243996357629 0,000873068534254888 37639 37922 667 665 0 True 522 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 567 412 0,000854367963649212 0,000937707050872776 0,000564583810177768 0,000671396963454643 0,000904778809314529 0,000904742921916237 37346 40866 667 665 0 True 567 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 611 412 0,00083645519881396 0,000966114072087979 0,000411993591210803 0,000671396963454643 0,000958362815300571 0,000961094050664832 36563 42104 667 665 0 True 611 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 655 412 0,000938395531005383 0,000944453144763947 0,000534065766384375 0,000488288700694286 0,00100237982527578 0,000975717022975787 41019 41160 667 665 0 True 655 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 258 457 0,000913482375314975 0,00100546628645314 0,000762951094834821 0,000869764248111696 0,000794897639480116 0,000804861499332428 39930 43819 667 665 0 True 257 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 302 456 0,000976096982408315 0,000898308944712433 0,000869764248111696 0,000762951094834821 0,000804847731304544 0,000783299136957232 42667 39149 667 665 0 True 301 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 346 456 0,000830827433616678 0,000842229171004875 0,000701915007248035 0,000656137941557946 0,000711764849205465 0,000758261821552747 36317 36705 667 665 0 True 345 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 390 456 0,000873790616708126 0,000834014539668007 0,000686655985351339 0,000686655985351339 0,000792643717111631 0,000744702856640928 38195 36347 667 665 0 True 390 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 435 456 0,000863839080688541 0,000819604515982105 0,000549324788281071 0,000411993591210803 0,000904358646517304 0,00097639169071183 37760 35719 667 665 0 True 434 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 479 457 0,000814195786062107 0,000900580588573746 0,000442511635004196 0,000473029678797589 0,00089934158312973 0,000986511343751289 35590 39248 667 665 0 True 478 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 523 456 0,000824147322081692 0,000890736798508058 0,000518806744487678 0,000610360875867857 0,000870986696813155 0,000882695505596159 36025 38819 667 665 0 True 522 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 567 456 0,000806600590755206 0,0007730243438764 0,000442511635004196 0,000305180437933928 0,000905291436121942 0,000938250915758302 35258 33689 667 665 0 True 567 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 611 456 0,000906115950951052 0,000825134477301058 0,000518806744487678 0,000457770656900893 0,000963652732982816 0,000908944357745873 39608 35960 667 665 0 True 611 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 654 455 0,000841854193068263 0,000856478573407655 0,000442511635004196 0,000457770656900893 0,000914320486472965 0,000974911484733169 36799 37326 667 665 0 True 655 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 257 501 0,000902455615863389 0,000896725677778791 0,000747692072938125 0,000762951094834821 0,00075299347966248 0,000719088158313587 39448 39080 667 665 0 True 257 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 301 501 0,000900625448319557 0,000835322455830581 0,000778210116731518 0,00064087891966125 0,000807076660812695 0,00077793607389514 39368 36404 667 665 0 True 301 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 345 500 0,00087461419210285 0,000893077280062137 0,00080872816052491 0,000747692072938125 0,0007430235541853 0,000789559528391881 38231 38921 667 665 0 True 345 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 389 500 0,000849243494526484 0,00083488648377639 0,00064087891966125 0,00064087891966125 0,000787564830120527 0,000783598754157939 37122 36385 667 665 0 True 390 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 434 500 0,000815293886588406 0,000817998303150873 0,000473029678797589 0,000350957503624018 0,000873141196273119 0,000968117563923079 35638 35649 667 665 0 True 434 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 479 500 0,000834396260327149 0,000801591986374726 0,000457770656900893 0,000488288700694286 0,000894515002524163 0,00082444290531221 36473 34934 667 665 0 True 478 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 523 500 0,000837164388737195 0,000911709348904419 0,000534065766384375 0,000686655985351339 0,000868946626715889 0,000817658078083159 36594 39733 667 665 0 True 522 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 566 500 0,000907259805665947 0,00084913588617917 0,000610360875867857 0,000549324788281071 0,000913790596888203 0,000848865208433906 39658 37006 667 665 0 True 567 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 611 500 0,000810695590634529 0,000872494809924789 0,000442511635004196 0,000503547722590982 0,000862845084315037 0,000913655456981879 35437 38024 667 665 0 True 611 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 654 500 0,000862489332124965 0,000883898921026531 0,000473029678797589 0,000488288700694286 0,000907976709925418 0,000985461758054308 37701 38521 667 665 0 True 655 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 257 545 0,000890948437431547 0,000895876679567998 0,000747692072938125 0,000717174029144732 0,000706282983924112 0,000752535196569652 38945 39043 667 665 0 True 257 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 301 544 0,000867385030304715 0,000877887095858208 0,000717174029144732 0,000778210116731518 0,000765701405478102 0,000723219098053483 37915 38259 667 665 0 True 301 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 345 544 0,00085276656704836 0,000827681471933439 0,000732433051041428 0,000671396963454643 0,000719704138999679 0,000733133049489342 37276 36071 667 665 0 True 345 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 389 544 0,000876101203232213 0,000853656228004206 0,000686655985351339 0,000671396963454643 0,000777427632644865 0,000735859021486677 38296 37203 667 665 0 True 390 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 435 544 0,000829020143167144 0,000819742191367639 0,000442511635004196 0,000320439459830625 0,000912004438941182 0,000966869560741041 36238 35725 667 665 0 True 434 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 478 545 0,000838559891489366 0,000831054518879024 0,000473029678797589 0,000305180437933928 0,000950324926146565 0,0010448820166033 36655 36218 667 665 0 True 478 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 522 544 0,000828105059395228 0,000883004031020559 0,0004272526131075 0,000442511635004196 0,000922843808587545 0,00101013438225311 36198 38482 667 665 0 True 522 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 567 544 0,00080493056287146 0,000891884093387509 0,000518806744487678 0,000595101853971161 0,000807587318301857 0,000868701155533808 35185 38869 667 665 0 True 567 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 611 544 0,000882575420918518 0,000889497720038251 0,00064087891966125 0,000610360875867857 0,000853778126920747 0,000818411548363664 38579 38765 667 665 0 True 611 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 655 544 0,000872669639087529 0,00088158138537004 0,000518806744487678 0,000503547722590982 0,000895456213336502 0,000964642549051082 38146 38420 667 665 0 True 655 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 257 589 0,000943016704053558 0,000976577401388571 0,000823987182421607 0,000885023270008392 0,000676240996214066 0,000656736663045446 41221 42560 667 665 0 True 257 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 301 589 0,000833481176555234 0,000865909337316741 0,000701915007248035 0,000762951094834821 0,000702887801151099 0,000689950901792636 36433 37737 667 665 0 True 301 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 345 588 0,000842426120425711 0,000845762839233584 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000677712541958347 0,000709065814538406 36824 36859 667 665 0 True 345 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 390 588 0,00086264947178505 0,00072889938281272 0,000717174029144732 0,000625619897764553 0,00070221681830357 0,000562060739886298 37708 31766 667 665 0 True 389 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 434 588 0,000822957713178201 0,000856891599564257 0,000473029678797589 0,000396734569314107 0,000889960802882387 0,000990605182723782 35973 37344 667 665 0 True 434 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 478 589 0,000800378021106178 0,000861756129853129 0,000335698481727321 0,000457770656900893 0,000960917449679347 0,000939821535665573 34986 37556 667 665 0 True 478 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 523 588 0,000919201648889449 0,000802693389458999 0,000473029678797589 0,000289921416037232 0,00105718357971193 0,00098853766940042 40180 34982 667 665 0 True 522 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 567 588 0,000860270253978069 0,000777131659544834 0,000564583810177768 0,000457770656900893 0,000867535851851404 0,000848778588907103 37604 33868 667 665 0 True 567 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 611 588 0,000843158187443243 0,000902301530892922 0,00064087891966125 0,000656137941557946 0,000730425016364146 0,000758626467656004 36856 39323 667 665 0 True 611 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 655 587 0,000811038747048998 0,000848562238739444 0,000564583810177768 0,000595101853971161 0,000772903084875043 0,000771894870248258 35452 36981 667 665 0 True 655 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 257 626 0,00094820980445918 0,000894109845453643 0,000778210116731518 0,000701915007248035 0,000694121566996721 0,00071191261378112 41448 38966 667 665 0 False 257 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 301 626 0,000894883297650786 0,000912214158651378 0,000732433051041428 0,000793469138628214 0,000729886525669767 0,000685196192126381 39117 39755 667 665 0 False 301 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 346 632 0,000849701036412442 0,000748334558070617 0,000747692072938125 0,00064087891966125 0,000631500930394307 0,000591035308716711 37142 32613 667 665 0 True 345 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 390 632 0,000808453635393336 0,000781238975213268 0,00064087891966125 0,00064087891966125 0,000664766727562496 0,000650298318203831 35339 34047 667 665 0 True 389 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 434 626 0,000796100004472472 0,000817952411355695 0,000549324788281071 0,000518806744487678 0,000800060974611457 0,000842075875269924 34799 35647 667 665 0 False 434 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 478 626 0,000764689754001461 0,000784359617285374 0,000411993591210803 0,000366216525520714 0,00085979416686146 0,000906791533925003 33426 34183 667 665 0 False 478 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 522 627 0,000882941454427284 0,000889704233116552 0,000457770656900893 0,000534065766384375 0,000986257301426855 0,000950251282944073 38595 38774 667 665 0 False 522 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 567 627 0,000883536258879029 0,000859530377786994 0,000625619897764553 0,000610360875867857 0,000833320428321259 0,000818334763808595 38621 37459 667 665 0 False 567 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 611 627 0,000954546759579697 0,00081457936441011 0,000762951094834821 0,00064087891966125 0,000750808916515591 0,000686138288318956 41725 35500 667 665 0 False 611 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 655 627 0,000895615364668318 0,00085333498543796 0,000732433051041428 0,000671396963454643 0,000745197718888299 0,000725209409120611 39149 37189 667 665 0 False 655 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 259 676 0,00102676974627815 0,0753021716571126 0,000915541313801785 0,0735179674982834 0,000706408692178799 0,0237103437922411 44882 3281727 667 665 0 True 257 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 301 670 0,000959694105796724 0,000915770772777676 0,000823987182421607 0,00080872816052491 0,00072626636467427 0,000661298312296685 41950 39910 667 665 0 False 301 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 345 670 0,000847253187322567 0,000885137999496338 0,000747692072938125 0,000762951094834821 0,000642580009289554 0,000672022719998523 37035 38575 667 665 0 False 345 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 389 670 0,000859103522168877 0,000802119742019273 0,000762951094834821 0,000656137941557946 0,000642296393419003 0,000637559907630448 37553 34957 667 665 0 False 389 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 434 670 0,000815637043002875 0,000819696299572461 0,000579842832074464 0,000625619897764553 0,000760217707433902 0,000729284227795843 35653 35723 667 665 0 False 434 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 478 670 0,000789511401314678 0,000845074462305914 0,000488288700694286 0,000595101853971161 0,000788161084342888 0,000731000635060666 34511 36829 667 665 0 False 478 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 522 670 0,000822385785820754 0,000864922663720413 0,000473029678797589 0,000564583810177768 0,000879776089211779 0,000843428842147631 35948 37694 667 665 0 False 522 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 567 670 0,000778027099977134 0,000811366938747647 0,000625619897764553 0,000595101853971161 0,000715802746250905 0,000769136811100843 34009 35360 667 665 0 False 567 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 611 670 0,000875758046817745 0,00083160522042116 0,000717174029144732 0,000671396963454643 0,000673850490435988 0,000671148749769754 38281 36242 667 665 0 False 611 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 657 675 0,000916525028856595 0,0753233736664848 0,000778210116731518 0,0723582818341344 0,000693809056330782 0,0213715067434808 40063 3282651 667 665 0 True 655 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D2_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D2_1.csv new file mode 100755 index 0000000..c39ef2c --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D2_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 278 261 0,00988816459561571 0,0452173464102004 0,00991836423285267 0,0457770656900893 0,00143726244267927 0,00926856220858382 403717 1970607 623 665 0 True 278 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 322 262 0,00995321750437595 0,00988116893286088 0,00991836423285267 0,00987258716716258 0,00122227218970989 0,00139585055483413 406373 430629 623 665 0 False 322 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 367 262 0,0103692769023843 0,0696823771490984 0,0104371709773404 0,0680399786373693 0,00131321939399301 0,012955263898278 423360 3036812 623 665 0 True 366 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 411 260 0,010419193253308 0,0898602652201573 0,0104219119554437 0,0896162355992981 0,00140999892836828 0,0151396228787329 425398 3916180 623 665 0 True 411 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 456 261 0,0102575406938887 0,0770101724900487 0,0102693217364767 0,0731517509727627 0,00180439484234225 0,0161714121208788 418798 3356163 623 665 0 True 455 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 498 260 0,0103373382754929 0,0722902243018854 0,0103456168459602 0,0749980926222629 0,00168218993723846 0,0230061449827478 422056 3150464 623 665 0 True 499 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 542 261 0,0102354726702468 0,0865389153818398 0,0102235446707866 0,0825513084611276 0,00152571582612434 0,0268942932943665 417897 3771433 623 665 0 True 543 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 588 261 0,0102143598662741 0,0738534594669324 0,0101625085831998 0,0711070420386053 0,00171134762020962 0,0216811210140275 417035 3218591 623 665 0 True 588 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 632 262 0,0101457310069571 0,0102114292368596 0,0101930266269932 0,0102235446707866 0,00181995518867217 0,00180265774190128 414233 445022 623 665 0 False 632 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 674 260 0,0099266428033199 0,0453933414447081 0,00991836423285267 0,0449530785076677 0,00186694073904048 0,00869456194313275 405288 1978277 623 665 0 True 676 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 278 305 0,00997325262461912 0,0100579441278867 0,00994888227664607 0,0100709544518196 0,00146621716012953 0,00151885247748118 407191 438333 623 665 0 False 278 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 322 305 0,0101140862938101 0,010151609281845 0,0101472495613031 0,0100862134737163 0,00134926327095172 0,00124571944318245 412941 442415 623 665 0 False 322 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 367 305 0,0105586308322131 0,106359099855383 0,0105745021744106 0,101991302357519 0,00139027327577547 0,0245498912959327 431091 4635212 623 665 0 True 366 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 411 305 0,0104332766202271 0,0561440910585 0,0103608758678569 0,0546120393682765 0,00145990638443592 0,0089770897310836 425973 2446803 623 665 0 True 411 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 455 304 0,0103400569776286 0,0816907684638467 0,0103150988021668 0,0786297398336767 0,00172171808967732 0,0193687313488998 422167 3560147 623 665 0 True 455 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 500 306 0,0102583244638738 0,0442343671033845 0,0102845807583734 0,0451514457923247 0,00154650597577505 0,00858720550105152 418830 1927768 623 665 0 True 499 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 542 305 0,0101253529873454 0,0484286247777833 0,010101472495613 0,0498512245365072 0,00157818517207106 0,0122214267522781 413401 2110557 623 665 0 True 543 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 589 306 0,0100125390951204 0,0532121789940633 0,00990310521095598 0,0547188525215534 0,00175445775241771 0,010782108988336 408795 2319028 623 665 0 True 587 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 632 305 0,00994736372230001 0,00996102065647066 0,0100862134737163 0,00987258716716258 0,00197186986212317 0,0019662266291462 406134 434109 623 665 0 False 632 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 676 305 0,0100163599737976 0,00971740406176806 0,0101472495613031 0,00973525597009232 0,00182271882231661 0,00194099197915574 408951 423492 623 665 0 False 676 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 279 351 0,0101329457590757 0,0537758679142351 0,0101625085831998 0,0519264515144579 0,00150223650021568 0,0107374540387439 413711 2343594 623 665 0 True 278 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 322 349 0,0103173031552498 0,0686442359044785 0,0103608758678569 0,0702067597467002 0,00134716837057798 0,0228380288384933 421238 2991569 623 665 0 True 322 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 368 350 0,0102596470757236 0,0411309574003675 0,0102235446707866 0,0421149004348821 0,00141254960507132 0,00679264258105715 418884 1792519 623 665 0 True 366 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 412 349 0,0102737059498306 0,0371222402538734 0,0102998397802701 0,0377508201724269 0,00146535760692449 0,00583112695749753 419458 1617816 623 665 0 True 411 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 456 349 0,0105260798850209 0,0755770864561266 0,0105287251087205 0,0713664454108492 0,00174209247337727 0,0146785146792839 429762 3293708 623 665 0 True 455 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 500 350 0,0101467597050625 0,0358657229018988 0,0101167315175097 0,036087586785687 0,00165388302259609 0,00635856331390339 414275 1563056 623 665 0 True 499 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 544 350 0,0100890546399122 0,028651578591707 0,0101167315175097 0,0291294728007935 0,00180535345154301 0,00321671375758356 411919 1248658 623 665 0 True 543 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 588 349 0,0101928306844969 0,0532646562618494 0,0101319905394064 0,0529640650034333 0,00187927286409872 0,00871947382454172 416156 2321315 623 665 0 True 587 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 633 349 0,0100274552176486 0,0583766810021162 0,0100099183642329 0,0587014572365911 0,00196338258209723 0,0132331563822824 409404 2544101 623 665 0 True 632 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 676 348 0,00999037310023034 0,0631657881256127 0,00994888227664607 0,0625925078202487 0,00190640863781339 0,0174852451720794 407890 2752814 623 665 0 True 676 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 279 394 0,010145682021333 0,0433439974392378 0,0102082856488899 0,045838101777676 0,00144334873191167 0,0095825252733678 414231 1888965 623 665 0 True 278 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 323 394 0,0101817599334579 0,033707592395959 0,0102082856488899 0,0335545891508354 0,00149128777987153 0,00433868846387821 415704 1469003 623 665 0 True 322 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 368 394 0,010734758643544 0,0935928055432699 0,0104676890211337 0,0888532845044633 0,00269360145103062 0,0205772927917498 438282 4078847 623 665 0 True 366 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 411 393 0,0105774658046666 0,0700198195190425 0,0105439841306172 0,0686198214694438 0,00154663503113343 0,0177656267073217 431860 3051518 623 665 0 True 410 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 455 393 0,0105169440661326 0,0437975001591872 0,0105745021744106 0,0451972228580148 0,00164132312225451 0,00771718513302883 429389 1908729 623 665 0 True 455 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 500 393 0,0105311009114878 0,0554364166309571 0,0105439841306172 0,0561684596017395 0,0017374311517348 0,00896427065428516 429967 2415962 623 665 0 True 499 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 544 394 0,0104194871670524 0,0425076194721182 0,0104219119554437 0,0433203631647211 0,00171334993163732 0,00554153906964974 425410 1852515 623 665 0 True 543 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 589 393 0,0102524461889858 0,0525569588884089 0,0102388036926833 0,0521858548867018 0,00186793944117272 0,00877862444058807 418590 2290473 623 665 0 True 587 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 633 393 0,0101063710580197 0,041822569699598 0,0100404364080262 0,0415960936903944 0,0018255785554526 0,0077587182366317 412626 1822660 623 665 0 True 632 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 677 393 0,0100242466592723 0,0817100430178215 0,0100556954299229 0,0781261921110857 0,00177666072129267 0,0171804804509872 409273 3560987 623 665 0 True 676 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 280 438 0,010025495792686 0,0451928401915753 0,0100862134737163 0,0458686198214694 0,00162271358484842 0,00711681311962731 409324 1969539 623 665 0 True 278 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 323 437 0,0104115514959536 0,0582015349658192 0,0103761348897536 0,0582894636453803 0,00152067034809595 0,0090966634691686 425086 2536468 623 665 0 True 322 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 368 438 0,0105000685186417 0,0383824060035646 0,0104676890211337 0,0377813382162203 0,00155934206818931 0,00648382775733187 428700 1672735 623 665 0 True 366 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 412 437 0,010638918270058 0,0541968562973008 0,0106813153276875 0,0540474555580987 0,00159339236585156 0,00868548920858152 434369 2361941 623 665 0 True 410 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 457 437 0,0104778780309396 0,0988071460408861 0,0104829480430304 0,0975661860074769 0,00182666309964176 0,0166708073235762 427794 4306092 623 665 0 True 455 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 501 438 0,0106705874760169 0,0615421364122139 0,0107118333714809 0,060669871061265 0,00179468106198287 0,0136413774530733 435662 2682054 623 665 0 True 499 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 544 437 0,0102514419836924 0,0560804620844856 0,01025406271458 0,0542305638208591 0,00165210514185921 0,0100369396685786 418549 2444030 623 665 0 True 543 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 589 438 0,0104652642327425 0,0316743793564938 0,0105592431525139 0,0322270542458228 0,00192028510601295 0,00511645892247068 427279 1380394 623 665 0 True 587 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 633 437 0,0101930266269932 0,0410727207122865 0,0101625085831998 0,0406195162890059 0,00179101258105269 0,00634573667861804 416164 1789981 623 665 0 True 631 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 677 436 0,0101328477878276 0,0678686875118673 0,0100862134737163 0,068055237659266 0,00186870899098906 0,0107915245099362 413707 2957770 623 665 0 True 676 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 278 482 0,00995877737270749 0,0624995539891156 0,00996414129854276 0,064087891966125 0,00154138223922913 0,0198560332643092 406600 2723779 623 665 0 True 278 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 322 481 0,0103605574613004 0,0580040396252705 0,0103761348897536 0,0583199816891737 0,00163126936678701 0,0114795849558004 423004 2527861 623 665 0 True 322 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 366 481 0,0105467273255649 0,0712732621207402 0,0105439841306172 0,0700846875715267 0,00162037686276064 0,0213641794097846 430605 3106144 623 665 0 True 366 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 411 481 0,010728880368656 0,0932834260060772 0,0108033875028611 0,0874494544899672 0,00168426373055746 0,0263070825974718 438042 4065364 623 665 0 True 410 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 456 481 0,0107897694993706 0,0977290789344614 0,0108186465247578 0,0942092011902037 0,00191812340337767 0,0316768873221832 440528 4259109 623 665 0 True 455 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 500 482 0,0106122945833779 0,0462782040934334 0,0106507972838941 0,0478217746242466 0,00185387597495826 0,00769176453860197 433282 2016840 623 665 0 True 499 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 544 480 0,0102684399952435 0,0380237845701459 0,0103150988021668 0,0392767223620966 0,00180955796124887 0,00585433476368201 419243 1657106 623 665 0 True 543 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 588 482 0,0103247244772958 0,10223969169892 0,0103913939116503 0,0992599374380102 0,00185033816309125 0,021786783660905 421541 4455685 623 665 0 True 587 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 633 482 0,0102577121435729 0,0642252690549904 0,0102998397802701 0,066300450141146 0,00181582631888745 0,018701024876607 418805 2798987 623 665 0 True 631 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 677 481 0,0101467597050625 0,0812443560262524 0,0102082856488899 0,0775768673228046 0,00194418873618809 0,0133558119534568 414275 3540692 623 665 0 True 676 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 279 526 0,00992465888554521 0,0560285355182417 0,00997940032043946 0,0604409857328145 0,00146452430868769 0,0149691879461245 405207 2441767 623 665 0 True 278 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 323 526 0,010287274967697 0,106061422725961 0,0102082856488899 0,0972152285038529 0,00149286959127215 0,0309412760954822 420012 4622239 623 665 0 True 322 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 367 525 0,0105162092817716 0,057182392924403 0,0104829480430304 0,0600289921416037 0,00145037863887075 0,0135560866684261 429359 2492053 623 665 0 True 366 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 412 526 0,0104217649985715 0,0603772190834146 0,0104219119554437 0,0584115358205539 0,00188959743037645 0,00954085175122658 425503 2631286 623 665 0 True 410 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 456 526 0,0105456006562114 0,055803459208791 0,0105439841306172 0,0564888990615702 0,00192773820100433 0,00666490986149774 430559 2431958 623 665 0 True 454 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 500 526 0,0105351912110973 0,0590775634439727 0,010452429999237 0,0602273594262608 0,00188491479350309 0,0128546602256352 430134 2574646 623 665 0 True 499 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 544 525 0,0102881567089302 0,0719733414561811 0,0102845807583734 0,0705882352941176 0,00179373075999537 0,0161437817932875 420048 3136654 623 665 0 True 543 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 588 525 0,0102144578375223 0,0577195563869619 0,0101167315175097 0,0579079880979629 0,0016755750134794 0,01376195388525 417039 2515463 623 665 0 True 587 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 633 525 0,0100679173431275 0,044212843851446 0,0100404364080262 0,0427405203326467 0,00191629269601316 0,00721433064644526 411056 1926830 623 665 0 True 631 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 676 525 0,0100236098461594 0,067410044910858 0,0100556954299229 0,06665140764477 0,00181954459677489 0,0171131796984585 409247 2937782 623 665 0 True 676 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 279 570 0,0096366724016586 0,0445358073600114 0,00968947890440223 0,0458075837338827 0,00134386989737286 0,0107055166550109 393449 1940905 623 665 0 True 278 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 323 569 0,0100156251894366 0,0511350933984079 0,00997940032043946 0,0528572518501564 0,00143264321290243 0,0119889192820302 408921 2228507 623 665 0 True 322 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 367 569 0,0103202912783178 0,0495182795624906 0,0102388036926833 0,0504768444342718 0,00141828171048582 0,0106361356508135 421360 2158045 623 665 0 True 366 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 411 569 0,0104092736644345 0,0491732879922397 0,0104676890211337 0,0494697489890898 0,00156445171810651 0,00748687021407543 424993 2143010 623 665 0 True 410 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 456 569 0,0106494011936082 0,0871085931812823 0,0106202792401007 0,0818036163881895 0,0020315028434295 0,0215924790890091 434797 3796260 623 665 0 True 454 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 500 570 0,0104929900959641 0,0628779318403585 0,0105745021744106 0,0621652552071412 0,00217674335578141 0,0116668849273707 428411 2740269 623 665 0 True 499 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 544 569 0,0101752938310812 0,0543719105500074 0,0102693217364767 0,0541390096894789 0,00192429947381829 0,0075369683354932 415440 2369570 623 665 0 True 543 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 589 569 0,00998424989722204 0,0365648155637434 0,0100862134737163 0,0379339284351873 0,00176647554629118 0,00728531399654948 407640 1593523 623 665 0 True 587 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 632 569 0,00984574304517418 0,0456492340946209 0,00988784618905928 0,0464026855878538 0,00162218713093231 0,00721814034439794 401985 1989429 623 665 0 True 631 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 677 569 0,00987550181179454 0,0502763890729341 0,00997940032043946 0,0497749294270237 0,00174885569146247 0,0064673501321448 403200 2191084 623 665 0 True 676 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 277 608 0,00977816737677452 0,00954748969012139 0,00962844281681544 0,00959792477302205 0,00197727641243432 0,00140853017443957 399226 416087 623 665 0 False 277 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 322 608 0,00966202246211299 0,00978112481937276 0,00962844281681544 0,00971999694819562 0,00160408457406227 0,00136270852607123 394484 426269 623 665 0 False 322 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 367 614 0,00993749311905062 0,0760903173475001 0,0100099183642329 0,0739604791332876 0,00138071739881086 0,0152435806973557 405731 3316075 623 665 0 True 366 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 412 613 0,0101413957792272 0,0766002669755184 0,0100709544518196 0,0738536659800107 0,00148765987148121 0,0212226603180434 414056 3338299 623 665 0 True 410 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 454 609 0,0102141149381538 0,0100850661788369 0,0102235446707866 0,0102388036926833 0,00182866022498075 0,00198477026068618 417025 439515 623 665 0 False 454 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 499 609 0,00997577538425854 0,00990943827869055 0,0100251773861295 0,0100404364080262 0,00204718640203224 0,00201102895394423 407294 431861 623 665 0 False 499 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 543 609 0,00998834019683159 0,00984078415310421 0,010101472495613 0,00987258716716258 0,00188865783217457 0,00202487025470238 407807 428869 623 665 0 False 543 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 587 609 0,00970946503902134 0,00983309727741189 0,00976577401388571 0,00987258716716258 0,00160698679065546 0,00170887821172024 396421 428534 623 665 0 False 587 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 631 609 0,00990971827020495 0,00974399835707373 0,00988784618905928 0,00973525597009232 0,00148747391272276 0,00154704703539336 404597 424651 623 665 0 False 631 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 675 609 0,00983393750977416 0,00985225710189871 0,00987258716716258 0,00978103303578241 0,00149600297061877 0,00168710294041309 401503 429369 623 665 0 False 675 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 278 658 0,00948266159959371 0,0425207445255391 0,00956740672922866 0,0434424353398947 0,00130008390576415 0,00996275863311196 387161 1853087 623 665 0 True 277 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 322 652 0,00964926170704368 0,00939221480113651 0,00959792477302205 0,009399557488365 0,00131780562979242 0,00127998705240992 393963 409320 623 665 0 False 322 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 366 652 0,0100571649986449 0,00981382272343711 0,0097962920576791 0,00973525597009232 0,00256824442352806 0,00125204379955309 410617 427694 623 665 0 False 366 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 410 652 0,00977980839518075 0,00969152108928765 0,00964370183871214 0,00971999694819562 0,00155132218019579 0,00151601178594134 399293 422364 623 665 0 False 410 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 454 652 0,00966373695895531 0,00973599023881517 0,00961318379491875 0,00970473792629892 0,00164388624767873 0,00156218634647957 394554 424302 623 665 0 False 454 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 499 652 0,00997621625487514 0,00966226506986165 0,00978103303578241 0,00967421988250553 0,00251025033171674 0,00168725290468372 407312 421089 623 665 0 False 499 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 543 652 0,0101111471563662 0,00979151931098059 0,0098268101014725 0,00978103303578241 0,00309485596713216 0,00167604260036259 412821 426722 623 665 0 False 543 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 587 652 0,00954364870155643 0,00962718079244805 0,00955214770733196 0,00959792477302205 0,00143998099178875 0,0012443173523149 389651 419560 623 665 0 False 587 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 631 652 0,009760826465855 0,00973934033986316 0,00970473792629892 0,0097962920576791 0,00130908630427433 0,00141161953050831 398518 424448 623 665 0 False 631 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 676 658 0,0098187029806895 0,0423973644342029 0,0097962920576791 0,0427405203326467 0,00142066046523491 0,00849266600365101 400881 1847710 623 665 0 True 675 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D2_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D2_2.csv new file mode 100755 index 0000000..2551aba --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D2_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 278 261 0,00804047584145362 0,702801843243953 0,00794995040817884 0,711635004196231 0,00158551530972656 0,197730629431742 328279 30628649 623 665 9 True 278 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 322 262 0,00693455189971761 0,00662096991161814 0,00686655985351339 0,00665293354695964 0,00134184206273092 0,00118905983944457 283126 288547 623 665 0 False 322 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 367 262 0,00675117421602489 0,00689496687472859 0,00669871061264973 0,0068207827878233 0,00123834228125402 0,00117637663162492 275639 300488 623 665 0 True 366 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 411 260 0,00687706726987564 0,00670903626656479 0,00691233691920348 0,00672922865644312 0,00132457763571661 0,00125406028961588 280779 292385 623 665 0 True 411 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 456 261 0,00677985529891579 0,0069112584620168 0,00669871061264973 0,00689707789730678 0,0015857234247455 0,00156766960013416 276810 301198 623 665 0 True 455 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 498 260 0,00692090940341511 0,00710496772946328 0,00692759594110018 0,00712596322575723 0,00165814845277935 0,00156725862815752 282569 309640 623 665 0 True 499 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 542 261 0,00740598954573304 0,00756009960814143 0,00743114366369116 0,00756847486076143 0,00146225605981268 0,0017379137506117 302374 329475 623 665 0 True 543 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 588 261 0,00767785975930179 0,00776140396768988 0,007690547035935 0,00776684214541848 0,0016846860464147 0,00169487535858352 313474 338248 623 665 0 True 588 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 632 262 0,00839826683963491 0,00829540089638149 0,00845349813076982 0,00833142595559625 0,00184297697977764 0,00181155821608559 342887 361520 623 665 0 False 632 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 674 260 0,00937464829852721 0,698111242858806 0,00935378042267491 0,690028229190509 0,00184409623903544 0,182479052563682 382751 30424229 623 665 9 True 676 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 278 305 0,00679746563076767 0,00679138909301177 0,00679026474402991 0,0068207827878233 0,00140556277775456 0,00144160372597104 277529 295974 623 665 0 False 278 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 322 305 0,0066548929719223 0,00681229280571536 0,00665293354695964 0,00686655985351339 0,00132778216467164 0,00117920417726388 271708 296885 623 665 0 False 322 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 367 305 0,00665932617090031 0,00694831608662306 0,00663767452506294 0,00697337300679027 0,00125413014203252 0,00129260777988526 271889 302813 623 665 0 True 366 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 411 305 0,0066316737861148 0,00656952520922356 0,00666819256885634 0,00653086137178607 0,00140630648298691 0,00147134516262896 270760 286305 623 665 0 True 411 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 455 304 0,00711087565354477 0,00707642303286254 0,00700389105058366 0,00698863202868696 0,00170035118173261 0,00174429406646584 290325 308396 623 665 0 True 455 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 500 306 0,00715175415682821 0,00741473734691501 0,00711070420386053 0,00743114366369116 0,00156904802413125 0,00158039006693016 291994 323140 623 665 0 True 499 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 542 305 0,00733478894115247 0,00735588111959918 0,00732433051041428 0,00737010757610437 0,00154066513252762 0,00141546944890167 299467 320575 623 665 0 True 543 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 589 306 0,00734821100214667 0,00763595874557072 0,00737010757610437 0,00764476997024491 0,00189780033097973 0,00193687986607629 300015 332781 623 665 0 True 587 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 632 305 0,00779461699426415 0,0075580803691536 0,007690547035935 0,00753795681696803 0,0020520825853614 0,00187383225616281 318241 329387 623 665 0 False 632 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 676 305 0,00762909457054365 0,00745748555412335 0,00762951094834821 0,00750743877317464 0,0018789785727586 0,00177716682919244 311483 325003 623 665 0 False 676 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 279 351 0,00649069316005159 0,00639922075731788 0,00654612039368277 0,0063782711528191 0,00137322689977456 0,00130212192914011 265004 278883 623 665 0 True 278 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 322 349 0,00652777527746988 0,00715411784209895 0,00659189745937285 0,00656137941557946 0,00127478151284541 0,00429217855412693 266518 311782 623 665 0 True 322 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 368 350 0,00683408238475734 0,00701719967118529 0,00686655985351339 0,00708018616006714 0,00128155746766585 0,00129028774863321 279024 305815 623 665 0 True 366 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 412 349 0,00717002579460499 0,00728289021936852 0,00715648126955062 0,00730907148851759 0,00144492100952981 0,00144832906848902 292740 317394 623 665 0 True 411 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 456 349 0,00735350144954585 0,00725076596274389 0,00740062561989776 0,00720225833524071 0,00168092146735633 0,00164107292629608 300231 315994 623 665 0 True 455 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 500 350 0,00734198982789023 0,00721834340945061 0,00735484855420768 0,00715648126955062 0,00161516538139401 0,00158800490867622 299761 314581 623 665 0 True 499 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 544 350 0,00741157390687661 0,00723640183085317 0,00744640268558785 0,00721751735713741 0,00153021421399182 0,00152466909060323 302602 315368 623 665 0 True 543 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 588 349 0,00731524367714996 0,00747928415683292 0,00740062561989776 0,00756847486076143 0,0019022220928325 0,00200688545720958 298669 325953 623 665 0 True 587 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 633 349 0,00729048144418437 0,00729310114379563 0,00729381246662089 0,00740062561989776 0,0019933733688388 0,00189945657013639 297658 317839 623 665 0 True 632 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 676 348 0,00682043988845484 0,00685084191366491 0,00685130083161669 0,00683604180972 0,00173339724716992 0,00184508074945583 278467 298565 623 665 0 True 676 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 279 394 0,00650504594790305 0,0065130324093594 0,00653086137178607 0,00650034332799268 0,00137668522718768 0,00135808235750225 265590 283843 623 665 0 True 278 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 323 394 0,00684458980111959 0,00694769654738815 0,00685130083161669 0,00695811398489357 0,00130495310396542 0,00136943860141157 279453 302786 623 665 0 True 322 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 368 394 0,00706656815657667 0,00701449205526978 0,00700389105058366 0,00695811398489357 0,00147872544216207 0,00129266116918614 288516 305697 623 665 0 True 366 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 411 393 0,00717717769571869 0,00720620502962602 0,00714122224765393 0,0072327763790341 0,00144948537061036 0,00147131065983676 293032 314052 623 665 0 True 410 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 455 393 0,0071258652545091 0,007031173722817 0,0072632944228275 0,00711070420386053 0,00166044166915891 0,00163918037423473 290937 306424 623 665 0 True 455 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 500 393 0,00724485133536648 0,00722889852234156 0,0072480354009308 0,00721751735713741 0,00161693759948055 0,00170428156750831 295795 315041 623 665 0 True 499 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 544 394 0,0072111737188208 0,00719425021698214 0,00729381246662089 0,0072632944228275 0,00160951192198237 0,00148312643715301 294420 313531 623 665 0 True 543 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 589 393 0,00724705568844947 0,00714661453358734 0,0072327763790341 0,00709544518196384 0,00169828958743822 0,00198687791331446 295885 311455 623 665 0 True 587 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 633 393 0,00654807981864542 0,00659563764067986 0,00654612039368277 0,00663767452506294 0,00175964217104368 0,00173143220045002 267347 287443 623 665 0 True 632 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 677 393 0,0062554397004725 0,00642441535287062 0,00616464484626535 0,0063782711528191 0,0017515124839616 0,0018211754769817 255399 279981 623 665 0 True 676 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 280 438 0,00675945278649212 0,00662895508397912 0,00675974670023652 0,00669871061264973 0,00142435795223421 0,0015019862854278 275977 288895 623 665 0 True 278 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 323 437 0,00677052353753113 0,00667271291068137 0,00669871061264973 0,00669871061264973 0,00128866997444474 0,00137233497446531 276429 290802 623 665 0 True 322 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 368 438 0,00679636345422618 0,00687337478509733 0,00679026474402991 0,00686655985351339 0,0013773651939317 0,00122721029386491 277484 299547 623 665 0 True 366 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 412 437 0,00692548955926532 0,0069663974539232 0,00686655985351339 0,00695811398489357 0,00155199299968024 0,0015644057322859 282756 303601 623 665 0 True 410 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 457 437 0,00716360867785229 0,00731060886365605 0,00720225833524071 0,00727855344472419 0,00169384278796199 0,00167438656381808 292478 318602 623 665 0 True 455 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 501 438 0,00726466602030136 0,00724124341524445 0,0072632944228275 0,0072480354009308 0,00166269962364872 0,00178992203906074 296604 315579 623 665 0 True 499 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 544 437 0,00694638192792966 0,00691665074795021 0,00692759594110018 0,00700389105058366 0,00163866423784593 0,00158442137247231 283609 301433 623 665 0 True 543 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 589 438 0,00660301719603594 0,00646124351850099 0,00653086137178607 0,0064087891966125 0,00172710853684523 0,00184393746480489 269590 281586 623 665 0 True 587 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 633 437 0,00621387539845213 0,00605994271556667 0,00627145799954223 0,00605783169298848 0,0016511068179044 0,00176280786285815 253702 264097 623 665 0 True 631 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 677 436 0,00603076713569177 0,00611379673720809 0,00601205462729839 0,00611886778057527 0,00181472110355098 0,00169469448778453 246226 266444 623 665 0 True 676 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 278 482 0,00653696008198234 0,00643937607809866 0,00648508430609598 0,00654612039368277 0,0014214195337414 0,00151461569540956 266893 280633 623 665 0 True 278 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 322 481 0,00657815699182222 0,00662381520291918 0,00665293354695964 0,00663767452506294 0,00137125246276941 0,00142707424472604 268575 288671 623 665 0 True 322 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 366 481 0,0066756873693385 0,00668606742307818 0,00662241550316625 0,00669871061264973 0,00148822456539443 0,00139187523646453 272557 291384 623 665 0 True 366 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 411 481 0,00677375658871952 0,00682362807912434 0,00686655985351339 0,00675974670023652 0,00168827226687074 0,00172391345920187 276561 297379 623 665 0 True 410 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 456 481 0,00682768976081667 0,00713174559194966 0,00685130083161669 0,00720225833524071 0,00173090135528907 0,00196910790511208 278763 310807 623 665 0 True 455 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 500 482 0,00686251853952791 0,00677987025242208 0,00675974670023652 0,00679026474402991 0,00174965230630514 0,00181071775381647 280185 295472 623 665 0 True 499 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 544 480 0,00646874760046982 0,0063866464054391 0,00643930724040589 0,0063935301747158 0,00162327156262226 0,00169111614867642 264108 278335 623 665 0 True 543 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 588 482 0,00622193353361106 0,00624651580886297 0,00621042191195544 0,00627145799954223 0,00180010532916077 0,00179088751575421 254031 272228 623 665 0 True 587 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 633 482 0,00608827625834577 0,00623114205747833 0,00610360875867857 0,00624093995574884 0,00186252363947539 0,001619647990036 248574 271558 623 665 0 True 631 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 677 481 0,00620821755887245 0,00624284446524873 0,00614938582436866 0,00624093995574884 0,00186758986864473 0,00182220769788339 253471 272068 623 665 0 True 676 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 279 526 0,00653918892787736 0,00643529170832781 0,00648508430609598 0,00642404821850919 0,00148649840157216 0,00145890944375994 266984 280455 623 665 0 True 278 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 323 526 0,00646162019216815 0,00650305094390818 0,00648508430609598 0,00653086137178607 0,00140359689592521 0,00139053967400603 263817 283408 623 665 0 True 322 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 367 525 0,00678504777506683 0,00664120819329165 0,00685130083161669 0,00666819256885634 0,00144192941563855 0,00144568591895497 277022 289429 623 665 0 True 366 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 412 526 0,00679415910114319 0,00665105198335734 0,00679026474402991 0,00672922865644312 0,00159457536695959 0,00171972699441141 277394 289858 623 665 0 True 410 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 456 526 0,00662319927315131 0,00656289384482034 0,00665293354695964 0,00663767452506294 0,00183080709910413 0,0018963097910173 270414 286016 623 665 0 True 454 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 500 526 0,006516802497679 0,00678273848962071 0,00663767452506294 0,00677500572213321 0,00170470228538449 0,00160899749590985 266070 295597 623 665 0 True 499 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 544 525 0,00629573037626715 0,00647092668728355 0,00631723506523232 0,00643930724040589 0,00167535156516633 0,00161894111964467 257044 282008 623 665 0 True 543 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 588 525 0,00618423909589193 0,00639272706830019 0,00625619897764553 0,0063935301747158 0,00163506538656299 0,0016056370384019 252492 278600 623 665 0 True 587 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 633 525 0,00621870048242267 0,00626429887949446 0,00619516289005875 0,00621042191195544 0,00182098606408793 0,00188437376222195 253899 273003 623 665 0 True 631 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 676 525 0,00623307776308617 0,00641053308482926 0,00622568093385214 0,00648508430609598 0,0016872851878959 0,00174176321039775 254486 279376 623 665 0 True 676 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 279 570 0,00657117654039275 0,00665059306540556 0,00665293354695964 0,00663767452506294 0,00130373329122235 0,00130004695230779 268290 289838 623 665 0 True 278 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 323 569 0,00663784597474718 0,00661725267620872 0,00668345159075303 0,00669871061264973 0,00135552148937536 0,00131654898584369 271012 288385 623 665 0 True 322 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 367 569 0,00666491053204388 0,00661078193308862 0,00657663843747616 0,00665293354695964 0,00142456226138829 0,0012557442585182 272117 288103 623 665 0 True 366 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 411 569 0,00650303753731633 0,00627244467313856 0,00650034332799268 0,00627145799954223 0,00161226969070245 0,00147004346889177 265508 273358 623 665 0 True 410 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 456 569 0,00648765605135947 0,00643522287063504 0,00653086137178607 0,00650034332799268 0,00183689160971311 0,00171809300722072 264880 280452 623 665 0 True 454 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 500 570 0,00663980539970983 0,00653237580102694 0,00660715648126955 0,00651560234988937 0,0019357372683365 0,00199654638818051 271092 284686 623 665 0 True 499 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 544 569 0,00637565042193155 0,00649148621152331 0,0064087891966125 0,00646982528419928 0,00184894471848447 0,00167543761019788 260307 282904 623 665 0 True 543 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 589 569 0,00645143118236233 0,00641069370611239 0,00645456626230259 0,00645456626230259 0,00156947867658629 0,00145559466089127 263401 279383 623 665 0 True 587 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 632 569 0,00630851562414849 0,0064031445058056 0,00634775310902571 0,00645456626230259 0,00159691231443922 0,00147242817058044 257566 279054 623 665 0 True 631 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 677 569 0,00627902627846049 0,00641048719303408 0,00630197604333562 0,00645456626230259 0,00156344985296658 0,00169583871364196 256362 279374 623 665 0 True 676 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 277 608 0,00677912051455479 0,00684645924722541 0,0068055237659266 0,00686655985351339 0,00135036600260124 0,00143713791590162 276780 298374 623 665 0 False 277 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 322 608 0,00649990245737608 0,00657223282513907 0,00651560234988937 0,00654612039368277 0,00137603524978359 0,00138615447278126 265380 286423 623 665 0 False 322 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 367 614 0,00618938258641891 0,00655070957320057 0,00622568093385214 0,00656137941557946 0,00125404594457996 0,00130169463275291 252702 285485 623 665 0 True 366 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 412 613 0,00618235314936537 0,00610069462968476 0,00622568093385214 0,00613412680247196 0,0014880641163491 0,00148407526980672 252415 265873 623 665 0 True 410 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 454 609 0,00634767963058961 0,00638650873005356 0,00636301213092241 0,00631723506523232 0,00176245766287007 0,00191693199410444 259165 278329 623 665 0 False 454 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 499 609 0,00645013306332457 0,00648820494816808 0,00648508430609598 0,00654612039368277 0,00186228779022107 0,0019564401318442 263348 282761 623 665 0 False 499 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 543 609 0,00677828775894566 0,00638364049285493 0,00659189745937285 0,00642404821850919 0,00246959558700349 0,00179474653316238 276746 278204 623 665 0 False 543 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 587 609 0,00649350983343541 0,00649935665439635 0,00648508430609598 0,00650034332799268 0,00151974304989318 0,00155770537273117 265119 283247 623 665 0 False 587 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 631 609 0,00628103468904722 0,0064177610425698 0,00633249408712902 0,00643930724040589 0,00140313946751115 0,00141321582230633 256444 279691 623 665 0 False 631 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 675 609 0,00640881368942453 0,00658684936190327 0,00646982528419928 0,00666819256885634 0,00155362638559368 0,0016103431696323 261661 287060 623 665 0 False 675 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 278 658 0,00848166486460802 0,685647398422814 0,0081177996490425 0,700617990386816 0,00209075917581297 0,220554221375481 346292 29881045 623 665 10 True 277 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 322 652 0,0070390137430393 0,00652868151151511 0,00686655985351339 0,00651560234988937 0,00150852197012194 0,00125950706571517 287391 284525 623 665 0 False 322 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 366 652 0,00627158046360239 0,00620789786322065 0,00627145799954223 0,00616464484626535 0,00114358311895612 0,0012334937128909 256058 270545 623 665 0 False 366 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 410 652 0,00604034382519676 0,00599284891101638 0,00605783169298848 0,0059510185397116 0,00140518441370299 0,00124276835853345 246617 261173 623 665 0 False 410 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 454 652 0,00597654004985022 0,0060435822905857 0,00604257267109178 0,00608834973678187 0,00156199571289335 0,00140615598489109 244012 263384 623 665 0 False 454 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 499 652 0,00654761445521679 0,00619793934366702 0,0064087891966125 0,00616464484626535 0,00248592587176937 0,001582513808834 267328 270111 623 665 0 False 499 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 543 652 0,0067348130175867 0,00616817851449406 0,00646982528419928 0,00617990386816205 0,00289999889143562 0,0016346974948842 274971 268814 623 665 0 False 543 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 587 652 0,00631373259311157 0,00637372786509648 0,00625619897764553 0,0064087891966125 0,00134627632165439 0,00115063700939607 257779 277772 623 665 0 False 587 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 631 652 0,00645544800353578 0,00652707529868388 0,00650034332799268 0,00656137941557946 0,0013447038317975 0,00125137915053841 263565 284455 623 665 0 False 631 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 676 658 0,00804209236704781 0,708038234749153 0,00801098649576562 0,715449759670405 0,00169329484012422 0,196142992999132 328345 30856855 623 665 10 True 675 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D2_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D2_3.csv new file mode 100755 index 0000000..c1194e4 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D2_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 278 261 0,00101223893570894 0,0707045939407916 0,000854505226215 0,0704509040970474 0,000728328498480578 0,021867606747588 41328 3081361 623 665 0 True 278 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 322 262 0,000966045492214286 0,000930800335698482 0,000869764248111696 0,000823987182421607 0,000662914289789957 0,000656201706709793 39442 40565 623 665 0 False 322 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 367 262 0,000918064073441207 0,000928643421325114 0,00080872816052491 0,000793469138628214 0,000640420381716377 0,000671496226531675 37483 40471 623 665 0 True 366 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 411 260 0,000845393900138642 0,00109426691012264 0,000671396963454643 0,000946059357595178 0,00070121018547388 0,00075839884794006 34516 47689 623 665 0 True 411 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 456 261 0,00094721051976074 0,00100330937207978 0,000793469138628214 0,000793469138628214 0,000764809661269154 0,000862212264443987 38673 43725 623 665 0 True 455 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 498 260 0,00101850909558944 0,00101592961575374 0,000839246204318303 0,00080872816052491 0,000840357094287771 0,000787954455604755 41584 44275 623 665 0 True 499 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 542 261 0,00103660928368199 0,00104539214825803 0,000839246204318303 0,000900282291905089 0,000848948789668497 0,0008205253174125 42323 45559 623 665 0 True 543 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 588 261 0,000947014577264474 0,00105677331346219 0,000625619897764553 0,000671396963454643 0,000957332865805352 0,00103006866893302 38665 46055 623 665 0 True 588 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 632 262 0,00106328195598617 0,00109158224010473 0,000732433051041428 0,00080872816052491 0,00102664014764237 0,000984906975244608 43412 47572 623 665 0 False 632 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 674 260 0,00117183409891741 0,0705757297799316 0,000839246204318303 0,0681010147249561 0,00103728298341625 0,0209598652935316 47844 3075745 623 665 0 True 676 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 278 305 0,000956027932092699 0,000959413869991986 0,000823987182421607 0,000793469138628214 0,000702460854466159 0,000737315877407353 39033 41812 623 665 0 False 278 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 322 305 0,000969621442771136 0,000930433201337058 0,000839246204318303 0,000854505226215 0,000661395798338672 0,00059689910306288 39588 40549 623 665 0 False 322 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 367 305 0,000904495055574803 0,000905376281169851 0,000778210116731518 0,00080872816052491 0,000643909014930276 0,000606543905525128 36929 39457 623 665 0 True 366 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 411 305 0,000913092032598463 0,000917101634837838 0,000747692072938125 0,000701915007248035 0,000721639432517333 0,00075676898636018 37280 39968 623 665 0 True 411 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 455 304 0,000897049240716704 0,000938120077029378 0,000610360875867857 0,000625619897764553 0,000895835835933759 0,000913328179499746 36625 40884 623 665 0 True 455 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 500 306 0,000966706798139183 0,00102763202352413 0,00080872816052491 0,000793469138628214 0,000877485455654104 0,000872354776452479 39469 44785 623 665 0 True 499 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 542 305 0,00105289700368409 0,00104828333135425 0,000854505226215 0,000900282291905089 0,000865550731408454 0,000781148135597008 42988 45685 623 665 0 True 543 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 589 306 0,00100822211453549 0,00102469494863274 0,000686655985351339 0,000671396963454643 0,00102534436027639 0,00110445712374518 41164 44657 623 665 0 True 587 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 632 305 0,00106120006696335 0,00101179935418771 0,000686655985351339 0,000625619897764553 0,00106849089492609 0,00107240041336109 43327 44095 623 665 0 False 632 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 676 305 0,000997200349120543 0,0010565438544863 0,00064087891966125 0,000701915007248035 0,00101476441384527 0,00100582279581591 40714 46045 623 665 0 False 676 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 279 351 0,00088774197214408 0,000901521370374896 0,000732433051041428 0,000747692072938125 0,000714634323783924 0,000717178573159552 36245 39289 623 665 0 True 278 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 322 349 0,000904739983695135 0,00102338703247017 0,000778210116731518 0,000854505226215 0,000674837413156625 0,000787553066877078 36939 44600 623 665 0 True 322 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 368 350 0,000943144712963225 0,000852072961070564 0,000823987182421607 0,000747692072938125 0,000694524063657748 0,000639122545933581 38507 37134 623 665 0 True 366 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 412 349 0,000936997017142887 0,000917675282277564 0,000717174029144732 0,000732433051041428 0,000775911422746361 0,000730534684662304 38256 39993 623 665 0 True 411 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 456 349 0,000993624398563692 0,00100383712772432 0,000747692072938125 0,000732433051041428 0,000928904316491956 0,000910608746916962 40568 43748 623 665 0 True 455 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 500 350 0,000968911151222173 0,000988715781213161 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000872299372359041 0,000875469768303719 39559 43089 623 665 0 True 499 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 544 350 0,00101277777757367 0,000950579699420215 0,000793469138628214 0,000701915007248035 0,000838453733769863 0,000851686969297405 41350 41427 623 665 0 True 543 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 588 349 0,000997763683797307 0,000923205243596517 0,000564583810177768 0,000473029678797589 0,00105557195581469 0,00109557150977956 40737 40234 623 665 0 True 587 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 633 349 0,000987011339314723 0,00098219914629788 0,000625619897764553 0,000656137941557946 0,00102515482232429 0,00101556627096563 40298 42805 623 665 0 True 632 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 676 348 0,000974495512365747 0,000973594434701999 0,000625619897764553 0,000534065766384375 0,000966871617071066 0,000983251318589347 39787 42430 623 665 0 True 676 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 279 394 0,000942385435790195 0,000921759652048409 0,000717174029144732 0,000793469138628214 0,00078448115564264 0,000715893667681452 38476 40171 623 665 0 True 278 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 323 394 0,000946769649144142 0,000959505653582342 0,000823987182421607 0,000869764248111696 0,000681477359386909 0,000703100113912952 38655 41816 623 665 0 True 322 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 368 394 0,000944540803249118 0,00093270484519837 0,000778210116731518 0,000793469138628214 0,00071546135138043 0,000716022304270483 38564 40648 623 665 0 True 366 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 411 393 0,000893105897979355 0,00102412130119301 0,000732433051041428 0,000778210116731518 0,000708565565889679 0,000827711317092727 36464 44632 623 665 0 True 410 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 455 393 0,000942018043609697 0,000983736521436344 0,000686655985351339 0,000762951094834821 0,00084361333283133 0,00084656131217479 38461 42872 623 665 0 True 455 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 500 393 0,000962983890710134 0,00103800356923437 0,000686655985351339 0,000732433051041428 0,00093004990626338 0,000923293001752106 39317 45237 623 665 0 True 499 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 544 394 0,000984635536547501 0,00106565337582914 0,000778210116731518 0,000915541313801785 0,00082105354016952 0,000853951571345275 40201 46442 623 665 0 True 543 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 589 393 0,000983019010953308 0,00103398803715629 0,000595101853971161 0,00064087891966125 0,00104425427849451 0,00110980022245658 40135 45062 623 665 0 True 587 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 633 393 0,000826509942061028 0,000934563462903081 0,000442511635004196 0,000625619897764553 0,000919802123271308 0,00096033713368261 33745 40729 623 665 0 True 632 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 677 393 0,000901629396566916 0,000941516069872553 0,000518806744487678 0,000518806744487678 0,00093094108734772 0,00102603119397161 36812 41032 623 665 0 True 676 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 280 438 0,000890019803663169 0,000930433201337058 0,000732433051041428 0,00080872816052491 0,000787912706774836 0,000790733777012307 36338 40549 623 665 0 True 278 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 323 437 0,000978757261659528 0,000935228893933162 0,000869764248111696 0,00080872816052491 0,000775688864400093 0,000740820745229865 39961 40758 623 665 0 True 322 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 368 438 0,000923697420208848 0,000978367181400514 0,000793469138628214 0,000869764248111696 0,00072088784397709 0,000724594001955346 37713 42638 623 665 0 True 366 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 412 437 0,000983435388757873 0,000899983995236432 0,000839246204318303 0,00064087891966125 0,000825081863926452 0,0008067653646953 40152 39222 623 665 0 True 410 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 457 437 0,000919092771546602 0,000971919384178001 0,000610360875867857 0,000701915007248035 0,000934379093528386 0,000937726801116202 37525 42357 623 665 0 True 455 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 501 438 0,000958599677356187 0,000998857867947507 0,000717174029144732 0,000671396963454643 0,000874133666831009 0,000946863823303327 39138 43531 623 665 0 True 499 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 544 437 0,000960289681386479 0,00104208793900521 0,000717174029144732 0,000869764248111696 0,000885009581068215 0,00087112802095328 39207 45415 623 665 0 True 543 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 589 438 0,000916447547847014 0,000932888412379082 0,000534065766384375 0,000595101853971161 0,000959736280923859 0,000965576802090954 37417 40656 623 665 0 True 587 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 633 437 0,000938515571488946 0,00100129013309194 0,000671396963454643 0,000656137941557946 0,000903731812201084 0,000985516357997755 38318 43637 623 665 0 True 631 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 677 436 0,000899474029107993 0,000947321381962574 0,000549324788281071 0,000579842832074464 0,000934800581225501 0,000979677786090907 36724 41285 623 665 0 True 676 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 278 482 0,000917255810644111 0,000957004550745139 0,000762951094834821 0,000823987182421607 0,000777684336535929 0,000789765954105991 37450 41707 623 665 0 True 278 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 322 481 0,000909712024537879 0,000973732110087533 0,000793469138628214 0,000854505226215 0,000768059622170298 0,00080707824297431 37142 42436 623 665 0 True 322 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 366 481 0,00093907890616571 0,000939175588318473 0,000839246204318303 0,000839246204318303 0,000801511159263367 0,000721899392172985 38341 40930 623 665 0 True 366 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 411 481 0,000918529436869838 0,000961800243341244 0,000656137941557946 0,000717174029144732 0,000899027948432263 0,000875175395923165 37502 41916 623 665 0 True 410 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 456 481 0,000873021792112114 0,00096072178615456 0,000503547722590982 0,000671396963454643 0,000957004888635064 0,000981081081174528 35644 41869 623 665 0 True 455 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 500 482 0,000971654346169894 0,00101221238034431 0,00064087891966125 0,00064087891966125 0,000962564984471245 0,00100277796257975 39671 44113 623 665 0 True 499 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 544 480 0,000967221147191881 0,000949822484799777 0,000686655985351339 0,000625619897764553 0,000926626955149284 0,000908100229837076 39490 41394 623 665 0 True 543 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 588 482 0,000940009633022973 0,000947160760679451 0,000610360875867857 0,000564583810177768 0,000984452440612772 0,00102350309200137 38379 41278 623 665 0 True 587 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 633 482 0,000850414926605452 0,000850191397468264 0,0004272526131075 0,000564583810177768 0,000899098642650014 0,000837374203390787 34721 37052 623 665 0 True 631 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 677 481 0,000870352075600493 0,00093738580830653 0,000518806744487678 0,000549324788281071 0,000950032887573686 0,000951565732832977 35535 40852 623 665 0 True 676 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 279 526 0,000892567056114624 0,000871485190430872 0,000686655985351339 0,000732433051041428 0,000790667237350252 0,000758271969701524 36442 37980 623 665 0 True 278 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 323 526 0,000903588821529574 0,000914371073024745 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,000764639169266241 0,000786941781370387 36892 39849 623 665 0 True 322 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 367 525 0,000915933198794317 0,000858337191112365 0,000793469138628214 0,000732433051041428 0,000739046255588102 0,000711588154702557 37396 37407 623 665 0 True 366 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 412 526 0,00100055586436909 0,000966389422859047 0,000732433051041428 0,000625619897764553 0,000919738856737824 0,000929656956876657 40851 42116 623 665 0 True 410 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 456 526 0,00095945692577735 0,000884495514363845 0,000625619897764553 0,000488288700694286 0,000958267824855883 0,000966694033455144 39173 38547 623 665 0 True 454 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 500 526 0,00102867361258323 0,000950419078137091 0,000732433051041428 0,00064087891966125 0,000987883726428248 0,000934515931872319 41999 41420 623 665 0 True 499 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 544 525 0,000908781297680616 0,000888396316953978 0,000595101853971161 0,000579842832074464 0,000926213440673414 0,000899678788554098 37104 38717 623 665 0 True 543 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 588 525 0,000896216485107574 0,000929859553897332 0,000625619897764553 0,000595101853971161 0,000837416772468086 0,000906819812694246 36591 40524 623 665 0 True 587 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 633 525 0,000936678610586455 0,000890667960815291 0,000579842832074464 0,000549324788281071 0,000982168631489775 0,000955551128885661 38243 38816 623 665 0 True 631 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 676 525 0,000980055380697288 0,000965356857467542 0,000701915007248035 0,000579842832074464 0,000952780023352109 0,000982632020779611 40014 42071 623 665 0 True 676 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 279 570 0,000918431465621705 0,000869695410418929 0,000778210116731518 0,000747692072938125 0,000692387508275287 0,00065355223001425 37498 37902 623 665 0 True 278 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 323 569 0,000953358215581078 0,000996494440495838 0,000869764248111696 0,000869764248111696 0,000731556259524092 0,000754976802553134 38924 43428 623 665 0 True 322 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 367 569 0,00101579039345376 0,000940667071661759 0,000915541313801785 0,000854505226215 0,000718497429590001 0,000657567821968458 41473 40995 623 665 0 True 366 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 411 569 0,000948802552542899 0,000892113552363399 0,000778210116731518 0,000656137941557946 0,000810725063085814 0,000832678088917155 38738 38879 623 665 0 True 410 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 456 569 0,000879340937616685 0,000955949039456045 0,000488288700694286 0,000686655985351339 0,000968908518917721 0,000912625536253393 35902 41661 623 665 0 True 454 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 500 570 0,000936727596210521 0,000970014874678112 0,000518806744487678 0,000564583810177768 0,00104473268234811 0,00108050522461139 38245 42274 623 665 0 True 499 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 544 569 0,000918872336238303 0,000927197829777006 0,000534065766384375 0,000595101853971161 0,000958473647927579 0,000903725939213124 37516 40408 623 665 0 True 543 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 589 569 0,00102943288975626 0,000947734408119176 0,000793469138628214 0,000732433051041428 0,000853512020370429 0,000816736884760208 42030 41303 623 665 0 True 587 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 632 569 0,00094630428571551 0,00098291046912314 0,000686655985351339 0,00080872816052491 0,000902447269309782 0,000804525164079676 38636 42836 623 665 0 True 631 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 677 569 0,000924309740509678 0,000966963070298773 0,00064087891966125 0,00064087891966125 0,000849476901589054 0,000926171055843043 37738 42141 623 665 0 True 676 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 277 608 0,000937437887759484 0,000939749235758198 0,000778210116731518 0,000823987182421607 0,000720982740357192 0,000709772713783714 38274 40955 623 665 0 False 277 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 322 608 0,0009701847774479 0,00086756144194315 0,000854505226215 0,000717174029144732 0,000748076525368168 0,000702616537102706 39611 37809 623 665 0 False 322 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 367 614 0,000948067768181902 0,000910011352482832 0,000823987182421607 0,000778210116731518 0,000685827140131268 0,000708679302937088 38708 39659 623 665 0 True 366 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 412 613 0,000906625930221693 0,000891838201592331 0,000732433051041428 0,000717174029144732 0,000780669517205221 0,000730832823570842 37016 38867 623 665 0 True 410 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 454 609 0,00088264746724117 0,00087924090381596 0,000518806744487678 0,000457770656900893 0,000942241817625528 0,000963002427250118 36037 38318 623 665 0 False 454 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 499 609 0,000970772604936698 0,000938762562161871 0,000579842832074464 0,000534065766384375 0,00104359247077471 0,00102940994691953 39635 40912 623 665 0 False 499 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 543 609 0,0009774101569977 0,00103203763586123 0,000656137941557946 0,000717174029144732 0,000994915316733276 0,00105513527254182 39906 44977 623 665 0 False 543 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 587 609 0,000963204326018433 0,00091122748505505 0,000701915007248035 0,000625619897764553 0,000882362959298355 0,000889253178099508 39326 39712 623 665 0 False 587 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 631 609 0,000884312978459429 0,000887524372845595 0,000701915007248035 0,000717174029144732 0,000730708781309641 0,000743486798472313 36105 38679 623 665 0 False 631 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 675 609 0,000891293429888897 0,000957669981775221 0,000671396963454643 0,000717174029144732 0,0007847771712103 0,000835922895730459 36390 41736 623 665 0 False 675 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 278 658 0,00102154620428156 0,0696299687190051 0,000869764248111696 0,0702372777904936 0,000734313840587937 0,023972148281597 41708 3034528 623 665 0 True 277 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 322 652 0,000959799825145815 0,000983071090406263 0,000823987182421607 0,000839246204318303 0,00069347166413043 0,000713370440483626 39187 42843 623 665 0 False 322 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 366 652 0,00091306753978643 0,000925155644891583 0,000793469138628214 0,000839246204318303 0,00066812438142208 0,000639924040980808 37279 40319 623 665 0 False 366 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 410 652 0,000847794195717897 0,000942915769625483 0,000686655985351339 0,000762951094834821 0,000693705970568397 0,000721622423254449 34614 41093 623 665 0 False 410 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 454 652 0,000941160795188534 0,000966917178503595 0,000701915007248035 0,000747692072938125 0,000836533090747545 0,000849404303811982 38426 42139 623 665 0 False 454 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 499 652 0,000948631102858666 0,000961754351546066 0,000701915007248035 0,000701915007248035 0,000856530765489792 0,000880385633066656 38731 41914 623 665 0 False 499 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 543 652 0,00105475845739861 0,00087947036279185 0,000793469138628214 0,000579842832074464 0,000926265039287635 0,00084925454784994 43064 38328 623 665 0 False 543 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 587 652 0,000922913650223785 0,000998146545122247 0,000717174029144732 0,000915541313801785 0,000709801467909446 0,0006525083950973 37681 43500 623 665 0 False 587 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 631 652 0,000905572739304265 0,000986260570171136 0,000762951094834821 0,000900282291905089 0,000710221398085561 0,000707920150615606 36973 42982 623 665 0 False 631 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 676 658 0,00101275328476164 0,0718665741946994 0,000869764248111696 0,0712443732356756 0,000722760176056038 0,0219035114969697 41349 3132001 623 665 0 True 675 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D3_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D3_1.csv new file mode 100755 index 0000000..611323a --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D3_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 274 270 0,0097520171754918 0,0452008253639363 0,00975051499198901 0,045288776989395 0,001474060820577 0,00925923329473921 370038 1969887 579 665 0 True 273 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 318 270 0,00992492640289115 0,00993630792476729 0,00991836423285267 0,00993362325474937 0,00130719747695487 0,0013151759237087 376599 433032 579 665 0 False 318 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 362 270 0,0101692552319141 0,0629350441794576 0,0101625085831998 0,0649881742580301 0,0013426697591949 0,0134829433700436 385870 2742758 579 665 0 True 362 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 407 270 0,0101893106993811 0,09404972720196 0,0101625085831998 0,0926070038910506 0,0014734085627127 0,0214105157913372 386631 4098760 579 665 0 True 406 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 451 270 0,010219855097271 0,0862246024766655 0,0102388036926833 0,0821393148699168 0,00175981636801198 0,0257552996075262 387790 3757735 579 665 0 True 450 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 495 270 0,0101970588037638 0,0685450637350988 0,0101167315175097 0,0739604791332876 0,00160094405698358 0,0233032429343046 386925 2987247 579 665 0 True 494 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 540 271 0,0103758713487882 0,090231116816991 0,0103150988021668 0,0884412909132525 0,00158692837255635 0,0311448512206896 393710 3932342 579 665 0 True 538 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 584 271 0,0104539058286433 0,0730604721921535 0,0105439841306172 0,070618753337911 0,00187730354490299 0,0217077467537113 396671 3184032 579 665 0 True 582 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 626 271 0,0103684394935639 0,0102733143226572 0,010406652933547 0,0101472495613031 0,00192194230134252 0,00198965979315171 393428 447719 579 665 0 False 626 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 668 269 0,0103946091114282 0,045508529850605 0,0104219119554437 0,0453803311207752 0,00190080564596191 0,00931149269495292 394421 1983297 579 665 0 True 671 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 273 314 0,0099623228658815 0,00994936414049544 0,00997940032043946 0,00991836423285267 0,00143655208746567 0,00146144272536077 378018 433601 579 665 0 False 273 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 318 314 0,00994611509650936 0,00988566632878833 0,0100099183642329 0,00990310521095598 0,00124565278114689 0,00124619403658694 377403 430825 579 665 0 False 318 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 363 316 0,0102758048442255 0,113373775477834 0,0102388036926833 0,109864957656214 0,00135647174218298 0,030840511226732 389913 4940917 579 665 0 True 362 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 407 316 0,010359663579416 0,055042642082432 0,0103150988021668 0,0539559014267186 0,00141413564669842 0,00932565109281151 393095 2398801 579 665 0 True 406 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 451 314 0,0103319127157593 0,0808591861893232 0,0104219119554437 0,0769359884031434 0,00174859414536232 0,0214868621087991 392042 3523906 579 665 0 True 450 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 496 316 0,0102574623930337 0,0430993482791437 0,0103456168459602 0,0445868619821469 0,00164897213379822 0,00882852672066547 389217 1878303 579 665 0 True 494 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 539 314 0,00996224380359188 0,0476729704783818 0,00996414129854276 0,0493324177920195 0,00153632639844233 0,0142764871261681 378015 2077625 579 665 0 True 538 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 584 315 0,0104085240744013 0,0563917690770758 0,0105592431525139 0,056595712214847 0,00192940686669708 0,01536523139472 394949 2457597 579 665 0 True 582 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 626 314 0,010176423546173 0,010207161299908 0,0102082856488899 0,0102693217364767 0,00201574323802493 0,00200726473892694 386142 444836 579 665 0 False 626 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 670 314 0,0101530474625419 0,010224026534636 0,0101625085831998 0,01025406271458 0,00190175110383078 0,00194304123765083 385255 445571 579 665 0 False 670 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 275 360 0,00991256633161386 0,0498418626102909 0,00999465934233616 0,0501564049744411 0,00138582678991298 0,0105207700476586 376130 2172147 579 665 0 True 273 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 319 360 0,0100686352913241 0,0670047056299481 0,0100862134737163 0,0687418936446174 0,00141041350348183 0,0217562321950513 382052 2920117 579 665 0 True 317 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 363 360 0,0101741570938705 0,0395910123213734 0,0101625085831998 0,0412603952086671 0,00143226437264202 0,00744019972537011 386056 1725407 579 665 0 True 362 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 408 360 0,0103361820793988 0,0356553549128027 0,0103150988021668 0,0360112916762036 0,00141165295068142 0,00452248198463808 392204 1553888 579 665 0 True 406 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 452 359 0,0104481606355976 0,0768905325800195 0,0103608758678569 0,0736247806515602 0,00178659753464281 0,0168415036294293 396453 3350949 579 665 0 True 450 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 497 360 0,0105843586065166 0,0331262351346437 0,0106202792401007 0,0347600518806745 0,00171609940470472 0,00586667062188256 401621 1443667 579 665 0 True 494 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 540 359 0,0105137032736927 0,0307445656943916 0,0104829480430304 0,0308995193408103 0,00177068697184513 0,00513367661639902 398940 1339872 579 665 0 True 538 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 584 359 0,0105391086227573 0,0531772323920352 0,0106813153276875 0,0531624322880903 0,00202595715760304 0,0113996702322158 399904 2317505 579 665 0 True 582 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 628 360 0,0106985772609212 0,0585347323447093 0,0102082856488899 0,0592507820248722 0,00462862778126978 0,0128734689689187 405955 2550989 579 665 0 True 626 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 673 360 0,0100997067711448 0,0645632621264766 0,0100099183642329 0,0639810788128481 0,00194823039001674 0,0210371253941378 383231 2813717 579 665 0 True 670 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 276 404 0,0100510571089319 0,0446400735186559 0,0101777676050965 0,0470130464637217 0,00151936985106384 0,0126568394570027 381385 1945449 579 665 0 True 273 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 319 404 0,0100730100713498 0,031817125785395 0,0100862134737163 0,0325169756618601 0,00140542889678518 0,00450018523562345 382218 1386615 579 665 0 True 317 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 364 404 0,0105558961822533 0,0945423067855035 0,0105287251087205 0,0890058747234302 0,0014597674764438 0,0259825292602971 400541 4120227 579 665 0 True 361 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 407 404 0,0105470412058159 0,0701318413910721 0,0105592431525139 0,0688944838635843 0,00162040613036825 0,0197710274066091 400205 3056400 579 665 0 True 406 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 452 403 0,010776058304749 0,0460748116572043 0,0107881284809644 0,0476691844052796 0,00166209719915581 0,010847755920771 408895 2007976 579 665 0 True 450 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 497 404 0,0105694421878749 0,0557267969649461 0,0106202792401007 0,0554970626382849 0,0018158044857763 0,0123743027853743 401055 2428617 579 665 0 True 494 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 540 404 0,0105295684398098 0,0429446470375986 0,0104219119554437 0,0443579766536965 0,00179143882343587 0,00670417414083039 399542 1871561 579 665 0 True 538 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 585 404 0,0103920791181603 0,0538414013977494 0,0102845807583734 0,0525978484779126 0,00186159773706795 0,0113620046953412 394325 2346450 579 665 0 True 582 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 628 404 0,010182379571991 0,0425394913238693 0,0101472495613031 0,0427557793545434 0,00206374261195159 0,00889890179266905 386368 1853904 579 665 0 True 626 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 673 404 0,0100967814664289 0,0827974720504626 0,0100556954299229 0,0780956740672923 0,00182986370489006 0,0182445352852013 383120 3608378 579 665 0 True 670 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 276 449 0,0101195514058395 0,0454343228178021 0,0100251773861295 0,0466163118944076 0,00156996763880806 0,00813637499590864 383984 1980063 579 665 0 True 273 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 320 449 0,0104229397652087 0,0604359376353449 0,0104219119554437 0,0599679560540169 0,00152160204321383 0,00921557688345015 395496 2633845 579 665 0 True 317 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 364 448 0,0106881937468845 0,0354101779970641 0,0106507972838941 0,0363622491798276 0,0015112814339242 0,00472220183143878 405561 1543203 579 665 0 True 361 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 408 448 0,010831981697607 0,0562550115274453 0,0108491645685512 0,0552681773098344 0,00167281160899526 0,012575460561147 411017 2451637 579 665 0 True 406 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 452 448 0,0106825012620318 0,0995599550489866 0,0105592431525139 0,0971389333943694 0,00196099070082503 0,0190063584427867 405345 4338900 579 665 0 True 450 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 496 448 0,0105310179151195 0,061094025978198 0,0105592431525139 0,0606393530174716 0,00178589076654858 0,0135662081259144 399597 2662525 579 665 0 True 494 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 541 448 0,0102380394238836 0,0546336085120102 0,0102845807583734 0,0531624322880903 0,00187954209625552 0,010760979478521 388480 2380975 579 665 0 True 538 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 585 448 0,0103324134435936 0,0313582537254099 0,0104219119554437 0,0316624704356451 0,00174897040646014 0,00462582020691117 392061 1366617 579 665 0 True 582 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 629 448 0,0101245323300856 0,0419846824660645 0,0102082856488899 0,0415960936903944 0,00184930961866652 0,00741623551424499 384173 1829725 579 665 0 True 626 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 672 448 0,0102329267291549 0,0728579746459305 0,0101930266269932 0,0725566491187915 0,0019737438352094 0,0150257390548432 388286 3175207 579 665 0 True 670 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 274 493 0,010168859920466 0,0630047997081282 0,0102388036926833 0,0639200427252613 0,00155608750163705 0,0228096344919437 385855 2745798 579 665 0 True 273 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 319 493 0,010344483619809 0,0593748734390336 0,0103456168459602 0,0597695887693599 0,00151754611930404 0,0101144298713624 392519 2587603 579 665 0 True 317 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 363 493 0,0105721039516255 0,0725744780812182 0,010605020218204 0,0692607003891051 0,00156327769350667 0,0213963519745472 401156 3162852 579 665 0 True 361 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 407 492 0,0106808936621429 0,0918594265476004 0,0106202792401007 0,0882276646066987 0,00168209970936432 0,0280166713635233 405284 4003305 579 665 0 True 405 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 452 492 0,0105971666974351 0,0971599747824586 0,0106813153276875 0,0949874113069352 0,00195820400348323 0,0350348610368347 402107 4234307 579 665 0 True 450 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 496 493 0,010444523770275 0,0457907643909499 0,0105287251087205 0,0475318532082094 0,00182853269203381 0,00774662569974298 396315 1995597 579 665 0 True 494 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 540 493 0,0102521915737257 0,0388166800613344 0,0102235446707866 0,0414129854276341 0,00165961934720662 0,00815534960142139 389017 1691661 579 665 0 True 538 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 583 492 0,0103242963818593 0,0984368680914922 0,0103456168459602 0,0935683222705425 0,00189026330975133 0,0230939818081927 391753 4289955 579 665 0 True 582 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 628 492 0,0102552222948278 0,0634561914054993 0,0102082856488899 0,0656748302433814 0,0019751821022515 0,0193628853784245 389132 2765470 579 665 0 True 626 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 672 492 0,0102073369014145 0,081040871806433 0,0101930266269932 0,0764934767681392 0,00180616235477531 0,0158143793844459 387315 3531824 579 665 0 True 670 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 275 537 0,00992010360322432 0,055041861921914 0,00987258716716258 0,058304722667277 0,00151419194114331 0,0145380612067683 376416 2398767 579 665 0 True 273 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 319 537 0,0100726938221913 0,104314138516353 0,010101472495613 0,09570458533608 0,00147403532468694 0,0307995925906469 382206 4546091 579 665 0 True 317 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 362 536 0,0102682675726151 0,0556918733088156 0,0103150988021668 0,060318913557641 0,00144978963830564 0,014398105449082 389627 2427095 579 665 0 True 361 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 407 536 0,0105729736368113 0,0603884625732333 0,0105439841306172 0,0591744869153887 0,00175535199967853 0,0124271103917239 401189 2631776 579 665 0 True 405 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 451 536 0,0104605997691645 0,0555890297958217 0,0105439841306172 0,0572823682001984 0,00194172196195364 0,00959441454903043 396925 2422613 579 665 0 True 449 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 496 537 0,0103734204178099 0,060959471234736 0,0104829480430304 0,0607766842145418 0,00198209834259378 0,0119194067123175 393617 2656661 579 665 0 True 494 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 539 536 0,0105120166115141 0,0724025215246861 0,0104676890211337 0,0703898680094606 0,00182933471170234 0,0197781128827502 398876 3155358 579 665 0 True 538 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 583 536 0,0102198287431745 0,0570988469112814 0,0102235446707866 0,057450217441062 0,00186788380054412 0,0150596873487736 387789 2488412 579 665 0 True 582 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 628 537 0,010204727845857 0,0413016289866346 0,0103608758678569 0,0415960936903944 0,00176791415464728 0,00589687321909702 387216 1799957 579 665 0 True 626 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 672 536 0,0101740780315809 0,0675509327220546 0,0101930266269932 0,0660257877470054 0,00187915293582288 0,0182359271680452 386053 2943922 579 665 0 True 670 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 273 573 0,0130107275667671 0,0326555918291953 0,0100404364080262 0,0359044785229267 0,00804760945378368 0,0182752419770378 493689 1423156 579 665 0 False 273 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 317 573 0,0140412518037732 0,0393529256879897 0,0105745021744106 0,0440070191500725 0,00997269748666381 0,0223706540125959 532792 1715031 579 665 0 False 317 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 361 573 0,0134847587012332 0,0373409834955895 0,0106660563057908 0,0427557793545434 0,00857298373926811 0,0207905256761821 511676 1627349 579 665 0 False 361 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 405 573 0,014808445908151 0,0376826708565876 0,010955977721828 0,045990691996643 0,0101881478661058 0,0195386138843603 561903 1642240 579 665 0 False 405 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 449 573 0,0191270126458815 0,0634848049397928 0,0111696040283818 0,0745098039215686 0,0201478580880278 0,0434276314437376 725770 2766717 579 665 0 False 449 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 494 574 0,0134998332444541 0,049539022653911 0,0107423514152743 0,0562600137331197 0,00951964083720884 0,0274433492541612 512248 2158949 579 665 0 False 494 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 541 581 0,0104510068780239 0,0572899632923003 0,0101777676050965 0,0556343938353552 0,00250479470488066 0,0104044004295853 396561 2496741 579 665 0 True 538 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 582 574 0,01117274016587 0,0294375444218236 0,0102845807583734 0,0344548714427405 0,00389741415970091 0,0135536712615906 423947 1282911 579 665 0 False 582 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 629 581 0,0101495687217986 0,0461731118824757 0,0101319905394064 0,0468909742885481 0,0015740403473229 0,00694008838839109 385123 2012260 579 665 0 True 626 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 673 580 0,00994840790290835 0,0505429286193281 0,00997940032043946 0,0498512245365072 0,00161782292967904 0,00688864701127492 377490 2202700 579 665 0 True 670 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 273 616 0,0103906559969471 0,00940072772914204 0,00959792477302205 0,00943007553215839 0,0041022772628674 0,00142550040248378 394271 409691 579 665 0 False 273 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 317 616 0,010201117334631 0,00955070211578385 0,00959792477302205 0,00949111161974517 0,00390442896415336 0,00140323816386823 387079 416227 579 665 0 False 317 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 361 617 0,0173600231810633 0,0549571686139129 0,01025406271458 0,0680857557030594 0,0173768975622058 0,0350479062568364 658722 2395076 579 665 0 False 361 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 405 617 0,0167911436531495 0,0585747958818998 0,0109407186999313 0,0624704356450752 0,0149185127988044 0,0412333656677814 637136 2552735 579 665 0 False 405 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 449 617 0,0110282406545409 0,0101561755154652 0,01025406271458 0,0102235446707866 0,00528348197578066 0,00198088944942989 418464 442614 579 665 0 False 449 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 493 617 0,0104498209436796 0,00981054146008188 0,0100862134737163 0,0098268101014725 0,00315196911697564 0,00202776709815029 396516 427551 579 665 0 False 493 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 538 617 0,00994108146407021 0,00991795120669607 0,0098268101014725 0,00999465934233616 0,00209733738658215 0,00202198502170886 377212 432232 579 665 0 False 538 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 582 617 0,0100780700578855 0,00975397982252496 0,0100251773861295 0,00968947890440223 0,00180796115660758 0,0016671281254183 382410 425086 579 665 0 False 582 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 626 617 0,0101101957015678 0,00980856811288923 0,0100404364080262 0,0097962920576791 0,00184048991004609 0,00144703311375769 383629 427465 579 665 0 False 626 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 670 617 0,0100547993906406 0,00971469644585256 0,00993362325474937 0,00964370183871214 0,00176461950032396 0,0015599268658411 381527 423374 579 665 0 False 670 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 273 667 0,00937249183121835 0,0431094903658781 0,00944533455405508 0,0438239108873121 0,00133280470997958 0,00958848899419583 355637 1878745 579 665 0 True 273 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 317 660 0,00929559057751445 0,0092361597516336 0,00932326237888151 0,00929274433508812 0,00129270076257762 0,00129156647630345 352719 402519 579 665 0 False 317 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 361 660 0,0113565336351404 0,00956896705026471 0,00955214770733196 0,00962844281681544 0,00878088292020057 0,00125957706447701 430921 417023 579 665 0 False 361 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 405 660 0,0109528152302432 0,00960448729973251 0,00987258716716258 0,00964370183871214 0,00634439927017908 0,00141112891057179 415602 418571 579 665 0 False 405 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 449 660 0,00967806758060038 0,00978624175453511 0,00970473792629892 0,0097962920576791 0,0015675300682185 0,00157186687842183 367232 426492 579 665 0 False 449 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 493 660 0,00971045676524812 0,00962431255524942 0,00968947890440223 0,00964370183871214 0,00160756387847582 0,00163321217236824 368461 419435 579 665 0 False 493 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 537 660 0,00967406175792629 0,00976295166848226 0,00975051499198901 0,00976577401388571 0,00190698627932073 0,00178575473995751 367080 425477 579 665 0 False 537 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 582 660 0,00971385644370179 0,00958204621189045 0,00973525597009232 0,00959792477302205 0,00141671691890484 0,00119059518055619 368590 417593 579 665 0 False 582 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 626 660 0,00983998714974253 0,00966719843784329 0,00984206912336919 0,00968947890440223 0,0012756350608205 0,00138287556225055 373376 421304 579 665 0 False 626 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 670 665 0,00979407831356974 0,0423585399754823 0,0098115510795758 0,0423285267414359 0,00132463503079616 0,00891726404417826 371634 1846018 579 665 0 True 670 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D3_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D3_2.csv new file mode 100755 index 0000000..14a4240 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D3_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 274 270 0,00800658536164343 0,698010923394547 0,00790417334248875 0,704264896620127 0,00164252381989261 0,194473327361734 303808 30419857 579 665 10 True 273 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 318 270 0,0067936117142905 0,00674467124552053 0,00672922865644312 0,00679026474402991 0,00145017401839848 0,00114648363780969 257782 293938 579 665 0 False 318 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 362 270 0,00645627927857769 0,00652897980818377 0,00645456626230259 0,00653086137178607 0,00126989373981645 0,00123059358687186 244982 284538 579 665 0 True 362 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 407 270 0,00656654481850131 0,00667874768174728 0,00659189745937285 0,00663767452506294 0,00129824603086287 0,00131887462189676 249166 291065 579 665 0 True 406 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 451 270 0,00673281281357257 0,00683120022532871 0,00671396963454643 0,00675974670023652 0,00152179386058374 0,00171243579767897 255475 297709 579 665 0 True 450 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 495 270 0,00698304496022047 0,00712327855573931 0,00698863202868696 0,00711070420386053 0,0015491011798519 0,00154844685363405 264970 310438 579 665 0 True 494 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 540 271 0,00739298293190115 0,00748084447786897 0,00744640268558785 0,00747692072938125 0,00151087897189004 0,0014531306725696 280525 326021 579 665 0 True 538 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 584 271 0,00765359859258583 0,00776645206515946 0,007690547035935 0,00762951094834821 0,00173561619737756 0,00180104235565452 290414 338468 579 665 0 True 582 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 626 271 0,00833706573225582 0,00829613516510434 0,00834668497749294 0,00833142595559625 0,00184918242913464 0,00185945747025873 316348 361552 579 665 0 False 626 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 668 269 0,00972244787917385 0,707237170518423 0,00967421988250553 0,710154879072252 0,00190845279322948 0,195276451321367 368916 30821944 579 665 12 True 671 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 273 314 0,00683295838042481 0,00662574265831666 0,0068207827878233 0,00665293354695964 0,00141351828860195 0,00133049826257665 259275 288755 579 665 0 False 273 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 318 314 0,00647926005076063 0,0064975668743844 0,00651560234988937 0,00643930724040589 0,00122746077643332 0,0012166231851303 245854 283169 579 665 0 False 318 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 363 316 0,00663717379722868 0,00667087723887425 0,00665293354695964 0,00659189745937285 0,00129974449090714 0,00125587891712271 251846 290722 579 665 0 True 362 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 407 316 0,00679084453415379 0,00669593415904146 0,00679026474402991 0,00679026474402991 0,00152416488263908 0,0013870166076016 257677 291814 579 665 0 True 406 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 451 314 0,0068886709405105 0,00695285937434568 0,00688181887541009 0,00697337300679027 0,00159615738326842 0,00175735788483904 261389 303011 579 665 0 True 450 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 496 316 0,00725196216131527 0,00715558637954465 0,0072480354009308 0,00718699931334401 0,00154124779360111 0,001490729739178 275174 311846 579 665 0 True 494 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 539 314 0,00733226309347284 0,00739046058726583 0,0072632944228275 0,00740062561989776 0,00152747083855209 0,00143886493610568 278221 322082 579 665 0 True 538 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 584 315 0,00774523178625563 0,00763260864452273 0,00770580605783169 0,007690547035935 0,00186556454520432 0,00195286164639583 293891 332635 579 665 0 True 582 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 626 314 0,00814821227644973 0,00810632670024799 0,0081025406271458 0,00805676356145571 0,0019398965152259 0,00189995977831388 309182 353280 579 665 0 False 626 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 670 314 0,00790180147380014 0,00814450867383611 0,00788891432059205 0,00820935378042268 0,0020349786252198 0,00204795000458384 299832 354944 579 665 0 False 670 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 275 360 0,00625319461063997 0,00639093728828824 0,00631723506523232 0,00645456626230259 0,00139603067554388 0,00137468597189017 237276 278522 579 665 0 True 273 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 319 360 0,00639023591264829 0,0064814818001745 0,00636301213092241 0,00651560234988937 0,00127783385935823 0,0012184252792018 242476 282468 579 665 0 True 317 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 363 360 0,00670458757617816 0,00682846966351562 0,00672922865644312 0,00675974670023652 0,00122749426935763 0,00127085398585972 254404 297590 579 665 0 True 362 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 408 360 0,00700971530591901 0,00706033795865264 0,00706492713817044 0,00706492713817044 0,00138847594748815 0,00130989025619342 265982 307695 579 665 0 True 406 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 452 359 0,00711020347602627 0,00715696313339999 0,00714122224765393 0,00718699931334401 0,00158014673495805 0,00173416137681564 269795 311906 579 665 0 True 450 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 497 360 0,00734246212883385 0,00724750764528625 0,00732433051041428 0,00721751735713741 0,00166905054960738 0,0017050801568036 278608 315852 579 665 0 True 494 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 540 359 0,00772810162350459 0,00775892581075027 0,0076752880140383 0,00778210116731518 0,00172291238947406 0,00164310391381764 293241 338140 579 665 0 True 538 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 584 359 0,00770757178229988 0,00800313899879018 0,00773632410162509 0,00799572747386892 0,00181731125499609 0,00199265560581005 292462 348783 579 665 0 True 582 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 628 360 0,00764722090122313 0,00713169970015448 0,00737010757610437 0,00715648126955062 0,00283397673166143 0,00190097011830377 290172 310805 579 665 0 True 626 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 673 360 0,00657342323769827 0,00669616361801735 0,00657663843747616 0,00668345159075303 0,00179372972998729 0,00179205570928444 249427 291824 579 665 0 True 670 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 276 404 0,00642847570672792 0,00649990735593848 0,00646982528419928 0,00648508430609598 0,00150655037646733 0,00142209736811284 243927 283271 579 665 0 True 273 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 319 404 0,00669504739323066 0,00671449739019097 0,00672922865644312 0,00671396963454643 0,00132498407838904 0,00122886678937106 254042 292623 579 665 0 True 317 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 364 404 0,00711455190195538 0,00713408607350374 0,00706492713817044 0,00718699931334401 0,00133474365316471 0,00127519017171977 269960 310909 579 665 0 True 361 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 407 404 0,00715930115788041 0,00722974752055235 0,00714122224765393 0,00729381246662089 0,00142951588916961 0,00153856372787623 271658 315078 579 665 0 True 406 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 452 403 0,00752604476533192 0,00783760729358301 0,00743114366369116 0,00787365529869535 0,00158764273103842 0,00165980656651379 285574 341569 579 665 0 True 450 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 497 404 0,00751070668114561 0,00761165904002396 0,00746166170748455 0,00756847486076143 0,0017492603164186 0,00180888810387545 284992 331722 579 665 0 True 494 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 540 404 0,00734354264679199 0,00745984898157502 0,00740062561989776 0,00744640268558785 0,00172449686718707 0,00151724188101047 278649 325106 579 665 0 True 538 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 585 404 0,00709989902427911 0,00703160969487119 0,00711070420386053 0,00706492713817044 0,00177014805397719 0,00191137958228763 269404 306443 579 665 0 True 582 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 628 404 0,00667085433260688 0,00654637279855624 0,00666819256885634 0,00651560234988937 0,00185261897676207 0,00176020713252204 253124 285296 579 665 0 True 626 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 673 404 0,00639729881052103 0,00639573298088435 0,00642404821850919 0,0063782711528191 0,00167452138165238 0,00180292123243643 242744 278731 579 665 0 True 670 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 276 449 0,0064858222207991 0,0066007775217398 0,00653086137178607 0,00663767452506294 0,00137163286848217 0,00140196789006315 246103 287667 579 665 0 True 273 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 320 449 0,00682839912172338 0,00683489451484055 0,00685130083161669 0,0068055237659266 0,00142026509647434 0,00144049272608078 259102 297870 579 665 0 True 317 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 364 448 0,0071874473329852 0,0072601508348578 0,00709544518196384 0,00721751735713741 0,00134491921540485 0,00136461993670773 272726 316403 579 665 0 True 361 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 408 448 0,00754686450159857 0,00758940151936261 0,00753795681696803 0,00762951094834821 0,00164054880199138 0,00162924900485238 286364 330752 579 665 0 True 406 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 452 448 0,00716333333465104 0,00713211272631109 0,00727855344472419 0,00711070420386053 0,00179711774751132 0,00183354574220913 271811 310823 579 665 0 True 450 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 496 448 0,0072060006169494 0,00738596319133838 0,00727855344472419 0,00743114366369116 0,00172230090935311 0,00180701550498322 273430 321886 579 665 0 True 494 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 541 448 0,00692082293828938 0,00705515218579752 0,00686655985351339 0,00711070420386053 0,0016453325582973 0,00172190138534306 262609 307469 579 665 0 True 538 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 585 448 0,00640741878359241 0,00659212691834874 0,00642404821850919 0,00659189745937285 0,00179833889230076 0,00192502073008798 243128 287290 579 665 0 True 582 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 629 448 0,00647894380160214 0,00649040775433663 0,00651560234988937 0,00645456626230259 0,0017497303548242 0,0018031164848184 245842 282857 579 665 0 True 626 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 672 448 0,00647970807040181 0,00632267324296092 0,00657663843747616 0,00634775310902571 0,00179540632316465 0,00180412046118697 245871 275547 579 665 0 True 670 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 274 493 0,00680995125414533 0,00676988878697086 0,00683604180972 0,0068207827878233 0,00154046309441195 0,00158291878215394 258402 295037 579 665 0 True 273 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 319 493 0,00684523938941248 0,00734032380103383 0,00691233691920348 0,00729381246662089 0,00155601771761678 0,00152250223233237 259741 319897 579 665 0 True 317 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 363 493 0,00697735247536781 0,00687410905382018 0,00685130083161669 0,00688181887541009 0,00152404647341912 0,00145322815806485 264754 299579 579 665 0 True 361 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 407 492 0,00699313857919531 0,00696492891647751 0,00703440909437705 0,00694285496299687 0,00157297717009485 0,00161038460380388 265353 303537 579 665 0 True 405 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 452 492 0,00700818676831969 0,00740695868763233 0,00695811398489357 0,00735484855420768 0,00175905194216098 0,00185317904611882 265924 322801 579 665 0 True 450 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 496 493 0,00690796213917783 0,00693693492141891 0,00695811398489357 0,00694285496299687 0,00172313277253 0,00164034182863657 262121 302317 579 665 0 True 494 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 540 493 0,00644141556812909 0,00660867091051043 0,00645456626230259 0,00663767452506294 0,00155384482495377 0,00150738742021313 244418 288011 579 665 0 True 538 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 583 492 0,00626017844622308 0,00657526168362082 0,00625619897764553 0,00651560234988937 0,00167381277924509 0,00175665009431438 237541 286555 579 665 0 True 582 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 628 492 0,0065252215951265 0,00653400495975576 0,00653086137178607 0,00651560234988937 0,00172612584470455 0,00175856033470692 247598 284757 579 665 0 True 626 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 672 492 0,00638064302150771 0,00652071928505172 0,0063782711528191 0,00656137941557946 0,00177486822618776 0,00177066124680047 242112 284178 579 665 0 True 670 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 275 537 0,00695094567063467 0,00672053216125688 0,00683604180972 0,00668345159075303 0,00145674688438005 0,00147509093800827 263752 292886 579 665 0 True 273 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 319 537 0,00685211780860944 0,00684437117054481 0,0068055237659266 0,0068055237659266 0,00136999046227899 0,00141875071075509 260002 298283 579 665 0 True 317 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 362 536 0,0068458455336329 0,00694095045349698 0,00677500572213321 0,00700389105058366 0,00142000744794099 0,00133790886053772 259764 302492 579 665 0 True 361 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 407 536 0,00669011917717767 0,00692215776337158 0,00669871061264973 0,00700389105058366 0,00151335938368267 0,00166193691560746 253855 301673 579 665 0 True 405 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 451 536 0,00674111435398269 0,00669864177495696 0,00674448767833982 0,00668345159075303 0,0018526502686452 0,00191247464417621 255790 291932 579 665 0 True 449 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 496 537 0,00672195492579806 0,00660389816381191 0,00666819256885634 0,00662241550316625 0,00182223509382769 0,00185505368569585 255063 287803 579 665 0 True 494 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 539 536 0,00654920382297795 0,00652062750146137 0,00651560234988937 0,00651560234988937 0,00178549435059719 0,00175668978721801 248508 284174 579 665 0 True 538 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 583 536 0,0065621963925722 0,00645004592047755 0,00651560234988937 0,00648508430609598 0,00162774783933352 0,00157308675032578 249001 281098 579 665 0 True 582 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 628 537 0,00640620649515157 0,00665846350827859 0,00643930724040589 0,00672922865644312 0,00169607569316802 0,00172970342096078 243082 290181 579 665 0 True 626 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 672 536 0,00639318757146078 0,00656314624969382 0,00643930724040589 0,00656137941557946 0,00167785340477847 0,00171037212638676 242588 286027 579 665 0 True 670 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 273 573 0,006604494717519 0,00684246666104492 0,00654612039368277 0,0068207827878233 0,00129166405449205 0,00129330066007036 250606 298200 579 665 0 False 273 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 317 573 0,00676251388037322 0,00670646632603482 0,00675974670023652 0,00671396963454643 0,00131057094623391 0,00137448606988323 256602 292273 579 665 0 False 317 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 361 573 0,0065106214256433 0,00683631716049107 0,00650034332799268 0,00679026474402991 0,00132441574806668 0,00133066856787121 247044 297932 579 665 0 False 361 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 405 573 0,00646676820900064 0,00672016502689546 0,00645456626230259 0,00675974670023652 0,00152885846403092 0,00145107093856831 245380 292870 579 665 0 False 405 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 449 573 0,00652756710971856 0,00674189479191226 0,00646982528419928 0,00671396963454643 0,00190497030106481 0,00198567058702013 247687 293817 579 665 0 False 449 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 494 574 0,00660734095994533 0,00662445768805167 0,00656137941557946 0,00665293354695964 0,00184326937644495 0,00203072017302181 250714 288699 579 665 0 False 494 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 541 581 0,00705767976162193 0,00667957373406049 0,00691233691920348 0,00671396963454643 0,00211027976449328 0,00168156289561271 267802 291101 579 665 0 True 538 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 582 574 0,00657669114566924 0,00675352836198989 0,00653086137178607 0,00669871061264973 0,00166828678359358 0,0016356869805297 249551 294324 579 665 0 False 582 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 629 581 0,00646342123874005 0,00660502251279377 0,00646982528419928 0,00666819256885634 0,00150907815036678 0,00144565899399745 245253 287852 579 665 0 True 626 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 673 580 0,00646647831393869 0,00656124174019393 0,00653086137178607 0,00665293354695964 0,0015722241717169 0,00166711145313977 245369 285944 579 665 0 True 670 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 273 616 0,00682866266268878 0,00666594387089261 0,00683604180972 0,00668345159075303 0,00136520120571172 0,00129742261051542 259112 290507 579 665 0 False 273 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 317 616 0,00657036616249962 0,00648058691016853 0,00657663843747616 0,00643930724040589 0,0012949976771081 0,00121917310181903 249311 282429 579 665 0 False 317 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 361 617 0,00652100493968009 0,00665862412956172 0,00650034332799268 0,00662241550316625 0,00129590166830064 0,00128084124813668 247438 290188 579 665 0 False 361 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 405 617 0,00650574591778339 0,00646592448160915 0,00650034332799268 0,00643930724040589 0,0013753649456299 0,00128055487445442 246859 281790 579 665 0 False 405 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 449 617 0,00641983156306278 0,00638820672647515 0,00643930724040589 0,0063782711528191 0,00172726247289653 0,00182394353718679 243599 278403 579 665 0 False 449 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 493 617 0,00657250084431937 0,00644731535866446 0,00656137941557946 0,0063782711528191 0,00183407252164897 0,00196924386787032 249392 280979 579 665 0 False 493 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 538 617 0,00635455246593305 0,00643143679753286 0,00636301213092241 0,00643930724040589 0,00179487730313528 0,00190617454136976 241122 280287 579 665 0 False 538 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 582 617 0,00652696096549814 0,00641789871795534 0,00651560234988937 0,00651560234988937 0,00152854166375606 0,00154674138813522 247664 279697 579 665 0 False 582 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 626 617 0,00645327491157212 0,00636716533838602 0,00642404821850919 0,0063782711528191 0,00130627008460093 0,00134936355478785 244868 277486 579 665 0 False 626 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 670 617 0,00665011365862985 0,00653437209411719 0,00671396963454643 0,00651560234988937 0,00152228386043246 0,00154540952542801 252337 284773 579 665 0 False 670 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 273 667 0,00816642295715891 0,69835885203969 0,00801098649576562 0,719783321889067 0,00165753996475468 0,206715671548628 309873 30435020 579 665 10 True 273 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 317 660 0,00705934006970395 0,00662890919218394 0,00704966811627375 0,00665293354695964 0,0013440449206603 0,00120723574875798 267865 288893 579 665 0 False 317 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 361 660 0,00646307863548503 0,00621611249455752 0,00648508430609598 0,00622568093385214 0,00122048006267905 0,00115304001526405 245240 270903 579 665 0 False 361 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 405 660 0,00609335701512448 0,00621950848740069 0,00616464484626535 0,00613412680247196 0,00129742089202708 0,00136099472501983 231211 271051 579 665 0 False 405 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 449 660 0,00602525802966496 0,00612281447496058 0,005981536583505 0,00614938582436866 0,0014764465325119 0,00153250270139188 228627 266837 579 665 0 False 449 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 493 660 0,00618085261563749 0,00637173157200623 0,00619516289005875 0,00634775310902571 0,00157371983093843 0,00161535268209375 234531 277685 579 665 0 False 493 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 537 660 0,00647485891663844 0,00632799669120157 0,00650034332799268 0,00631723506523232 0,00165321586216509 0,00163410236209046 245687 275779 579 665 0 False 537 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 582 660 0,00633130815278471 0,00632590861452097 0,00628671702143893 0,00631723506523232 0,0013679233332037 0,00120109278475099 240240 275688 579 665 0 False 582 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 626 660 0,00687325379403457 0,00659671609786655 0,00685130083161669 0,00663767452506294 0,0013389804307102 0,00131626263800784 260804 287490 579 665 0 False 626 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 670 665 0,00786540646647831 0,699256839741836 0,00779736018921187 0,702159151598382 0,00173414297557351 0,202667478150861 298451 30474155 579 665 11 True 670 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D3_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D3_3.csv new file mode 100755 index 0000000..a6f5567 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D3_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 274 270 0,00104952554061147 0,0693323145354804 0,000930800335698482 0,0689707789730678 0,000745588893333109 0,0214532223709721 39824 3021556 579 665 0 True 273 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 318 270 0,000937652400798898 0,000873435591725939 0,000823987182421607 0,000793469138628214 0,000663919651767953 0,000638065560863257 35579 38065 579 665 0 False 318 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 362 270 0,00084225057132387 0,000866574768346823 0,000732433051041428 0,000778210116731518 0,000662157841744968 0,000622533320905239 31959 37766 579 665 0 True 362 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 407 270 0,000905974776757742 0,000924857348222926 0,000778210116731518 0,000778210116731518 0,000684713112443286 0,000676807118478989 34377 40306 579 665 0 True 406 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 451 270 0,000958155887907067 0,000849617750028539 0,000717174029144732 0,000564583810177768 0,000877163733162294 0,000899016611882156 36357 37027 579 665 0 True 450 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 495 270 0,000915673084284486 0,00102265276374732 0,000762951094834821 0,000869764248111696 0,000796478683653653 0,000868919619354042 34745 44568 579 665 0 True 494 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 540 271 0,000900967498415131 0,000896037300851121 0,000701915007248035 0,000701915007248035 0,000779397169435441 0,000792470702323521 34187 39050 579 665 0 True 538 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 584 271 0,000927189824472493 0,00091402688456091 0,000610360875867857 0,000579842832074464 0,000909861647129871 0,000952187061010958 35182 39834 579 665 0 True 582 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 626 271 0,0010146854249855 0,00109798414553206 0,00064087891966125 0,00080872816052491 0,000980987262704324 0,00101326908753803 38502 47851 579 665 0 False 626 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 668 269 0,00116956845035145 0,0710490348095003 0,000900282291905089 0,0687418936446174 0,00102575774905361 0,0227237945004756 44379 3096372 579 665 0 True 671 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 273 314 0,000919336303703554 0,000839682176372495 0,000732433051041428 0,000656137941557946 0,000756195139376871 0,000707315067945776 34884 36594 579 665 0 False 273 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 318 314 0,000856139180200484 0,000919763358958165 0,000747692072938125 0,000823987182421607 0,000637908253302209 0,000634451086607436 32486 40084 579 665 0 False 318 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 363 316 0,000892639603908471 0,000825708124740783 0,000778210116731518 0,000686655985351339 0,00063564089297241 0,000630562713740592 33871 35985 579 665 0 True 362 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 407 316 0,000865942904113387 0,000898331890610022 0,000701915007248035 0,000701915007248035 0,000691764810136523 0,000761768495629819 32858 39150 579 665 0 True 406 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 451 314 0,000932539706070126 0,000889222369267183 0,000656137941557946 0,00064087891966125 0,000852566112085846 0,000830594739457245 35385 38753 579 665 0 True 450 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 496 316 0,000954729855356859 0,000900603534471335 0,00080872816052491 0,000732433051041428 0,0008162890260836 0,000794359492665542 36227 39249 579 665 0 True 494 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 539 314 0,000954387252101838 0,000981396039882264 0,000762951094834821 0,000854505226215 0,000825807882953423 0,000775532241243962 36214 42770 579 665 0 True 538 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 584 315 0,00092155004781292 0,000893605035706685 0,000595101853971161 0,000488288700694286 0,000943955537973038 0,0010158442728648 34968 38944 579 665 0 True 582 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 626 314 0,000962767854801578 0,000971185115455152 0,000549324788281071 0,000656137941557946 0,00102972880469355 0,000979933916155557 36532 42325 579 665 0 False 626 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 670 314 0,000960923068043774 0,000928413962349224 0,000579842832074464 0,000625619897764553 0,00100756543896851 0,000918271197025213 36462 40461 579 665 0 False 670 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 275 360 0,000825094054476289 0,000788902905007999 0,000671396963454643 0,000625619897764553 0,000703663930174551 0,000703231527975974 31308 34381 579 665 0 True 273 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 319 360 0,000916938080918409 0,000933278492638096 0,000839246204318303 0,000793469138628214 0,000643989358777422 0,000691525040924615 34793 40673 579 665 0 True 317 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 363 360 0,000902522390110994 0,000918386605102823 0,000778210116731518 0,000793469138628214 0,000728171749059229 0,00067112595895891 34246 40024 579 665 0 True 362 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 408 360 0,000940445935032145 0,000932613061608014 0,000793469138628214 0,000717174029144732 0,000749481376528757 0,000752440985067816 35685 40644 579 665 0 True 406 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 452 359 0,000835477568513074 0,000929079393379305 0,000564583810177768 0,000610360875867857 0,000834917926385295 0,000903605170181782 31702 40490 579 665 0 True 450 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 497 360 0,000855190432725041 0,00100904584647703 0,000549324788281071 0,000732433051041428 0,000836736856871718 0,000910884481832729 32450 43975 579 665 0 True 494 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 540 359 0,000958524845258628 0,000947068977089095 0,000732433051041428 0,000610360875867857 0,00082690940253418 0,000936407091716992 36371 41274 579 665 0 True 538 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 584 359 0,00097599761126469 0,000911709348904419 0,000701915007248035 0,000457770656900893 0,00097577639509676 0,00107197086688056 37034 39733 579 665 0 True 582 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 628 360 0,00101031064495985 0,000896702731881202 0,000717174029144732 0,000457770656900893 0,00104176646918669 0,00102748633198038 38336 39079 579 665 0 True 626 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 673 360 0,000934990637048352 0,000862972262425347 0,000595101853971161 0,0004272526131075 0,000952411333312973 0,000977261638994698 35478 37609 579 665 0 True 670 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 276 404 0,000857694071896347 0,000865817553726385 0,000701915007248035 0,000701915007248035 0,000744787133151117 0,000729124119147112 32545 37733 579 665 0 True 273 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 319 404 0,000926530972058992 0,000931190415957495 0,00080872816052491 0,000839246204318303 0,000708525873783648 0,000663024939293538 35157 40582 579 665 0 True 317 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 364 404 0,00088410087662949 0,000880250523309877 0,000793469138628214 0,000747692072938125 0,000675158918377448 0,000687969768450771 33547 38362 579 665 0 True 361 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 407 404 0,000940946662866406 0,000993511473809266 0,000762951094834821 0,000778210116731518 0,000762708861778576 0,00080022332874699 35704 43298 579 665 0 True 406 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 452 403 0,000948958308214585 0,000937890618053488 0,000717174029144732 0,000701915007248035 0,000803146719578758 0,000826406848123299 36008 40874 579 665 0 True 450 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 497 404 0,00094250155456227 0,000900351129597856 0,000671396963454643 0,000579842832074464 0,000888383744793783 0,000899302861178632 35763 39238 579 665 0 True 494 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 540 404 0,000947877790256442 0,00103738402999947 0,000732433051041428 0,000839246204318303 0,000856815329063156 0,000875280910742513 35967 45210 579 665 0 True 538 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 585 404 0,000914645274519423 0,000968248040563758 0,000579842832074464 0,000564583810177768 0,000941998061106891 0,00101065807409024 34706 42197 579 665 0 True 582 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 628 404 0,00100482899287952 0,000865633986545673 0,000671396963454643 0,000457770656900893 0,000978246418516803 0,000979591083061333 38128 37725 579 665 0 True 626 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 673 404 0,000882493276740546 0,000885734592833652 0,000564583810177768 0,000503547722590982 0,000893171452985643 0,000931749765541473 33486 38601 579 665 0 True 670 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 276 449 0,000915699438381026 0,000863798314738552 0,000778210116731518 0,000671396963454643 0,000763011163424309 0,000796701972131756 34746 37645 579 665 0 True 273 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 320 449 0,000935886676330714 0,00100422720798334 0,000762951094834821 0,000915541313801785 0,000782436396703317 0,000760652929937471 35512 43765 579 665 0 True 317 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 364 448 0,000929693463643799 0,000849548912335772 0,000839246204318303 0,000717174029144732 0,000759403744195441 0,000678908793156894 35277 37024 579 665 0 True 361 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 408 448 0,000888660135330921 0,00103850837898133 0,000610360875867857 0,000823987182421607 0,000836163849021633 0,000873876277786498 33720 45259 579 665 0 True 406 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 452 448 0,00101046876953909 0,000937523483692064 0,000717174029144732 0,00064087891966125 0,000989671545444727 0,000942141542698154 38342 40858 579 665 0 True 450 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 496 448 0,00100308962250787 0,000909667164018997 0,000671396963454643 0,000564583810177768 0,000994366250665688 0,000954406199521882 38062 39644 579 665 0 True 494 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 541 448 0,000880174116245021 0,00101023903315166 0,000625619897764553 0,000701915007248035 0,000865196817434335 0,000929192315582116 33398 44027 579 665 0 True 538 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 585 448 0,000865494884472206 0,000821486079584404 0,000518806744487678 0,0004272526131075 0,000906539449866841 0,000904702359163386 32841 35801 579 665 0 True 582 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 629 448 0,000915225064643305 0,00100425015388093 0,000534065766384375 0,000656137941557946 0,00094471982334312 0,00100156924859386 34728 43766 579 665 0 True 626 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 672 448 0,000934041889572909 0,000912191212753789 0,000610360875867857 0,000518806744487678 0,000946504906926411 0,00095652474776388 35442 39754 579 665 0 True 670 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 274 493 0,000854373455732299 0,000861320157798938 0,000686655985351339 0,000732433051041428 0,000759423337987192 0,000760805011102701 32419 37537 579 665 0 True 273 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 319 493 0,00082517311676591 0,000942388013980935 0,000717174029144732 0,000823987182421607 0,000726919529525419 0,00075152184006479 31311 41070 579 665 0 True 317 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 363 493 0,000893403872708133 0,000911411052235762 0,000762951094834821 0,000793469138628214 0,000730487772040835 0,000747458428041184 33900 39720 579 665 0 True 361 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 407 492 0,000969804398577775 0,00100379123592915 0,000717174029144732 0,000747692072938125 0,000888654712873043 0,000865891015124352 36799 43746 579 665 0 True 405 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 452 492 0,00092168181829562 0,000927610855933608 0,000595101853971161 0,00064087891966125 0,000956138653173616 0,000965621293567581 34973 40426 579 665 0 True 450 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 496 493 0,000921075674075199 0,000948376893251669 0,000549324788281071 0,000595101853971161 0,000927164325473515 0,000938735632090602 34950 41331 579 665 0 True 494 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 540 493 0,000848391075817705 0,000899341510103939 0,000534065766384375 0,000610360875867857 0,000875316956398366 0,000864308855306014 32192 39194 579 665 0 True 538 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 583 492 0,000809228888359172 0,000853472660823494 0,000457770656900893 0,000473029678797589 0,000845044530066315 0,000900094223802807 30706 37195 579 665 0 True 582 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 628 492 0,000928428467009876 0,000900557642676157 0,000518806744487678 0,000625619897764553 0,000946207696227673 0,000878090944263059 35229 39247 579 665 0 True 626 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 672 492 0,000873875487171946 0,000828759929120122 0,000503547722590982 0,0004272526131075 0,000922141181652338 0,000926698642002214 33159 36118 579 665 0 True 670 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 275 537 0,000890663046667966 0,000862995208322936 0,000732433051041428 0,000686655985351339 0,000753010642369979 0,000787414829841276 33796 37610 579 665 0 True 273 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 319 537 0,000870660287394058 0,000904619066549413 0,000717174029144732 0,000747692072938125 0,000713051785018971 0,0007098846858786 33037 39424 579 665 0 True 317 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 362 536 0,000883099420960968 0,000916436203807757 0,000701915007248035 0,000762951094834821 0,000755526278552102 0,000745677075790697 33509 39939 579 665 0 True 361 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 407 536 0,000908847373280609 0,000894798222381314 0,000671396963454643 0,000656137941557946 0,000836560394931801 0,000802261022074297 34486 38996 579 665 0 True 405 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 451 536 0,000951962675220152 0,000899226780615994 0,000579842832074464 0,000473029678797589 0,000996361910697363 0,0010391886121582 36122 39189 579 665 0 True 449 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 496 537 0,000875324962481649 0,000919212657416028 0,000503547722590982 0,000503547722590982 0,000913221874189473 0,00104131761770591 33214 40060 579 665 0 True 494 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 539 536 0,000865099573024105 0,000872150621460954 0,000564583810177768 0,000518806744487678 0,000887193207746456 0,000932065400307616 32826 38009 579 665 0 True 538 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 583 536 0,000866601756526888 0,000950809158396105 0,000579842832074464 0,000701915007248035 0,000852179401373542 0,000869229799837444 32883 41437 579 665 0 True 582 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 628 537 0,000882545984933627 0,000871944108382653 0,000534065766384375 0,000488288700694286 0,00090824880459826 0,000967090053382437 33488 38000 579 665 0 True 626 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 672 536 0,000893772830059693 0,000904389607573523 0,000564583810177768 0,000549324788281071 0,000943427860777996 0,000941116187694918 33914 39414 579 665 0 True 670 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 273 573 0,000871767159448741 0,000853518552618672 0,000732433051041428 0,000747692072938125 0,000691799495785313 0,000652866457475536 33079 37197 579 665 0 False 273 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 317 573 0,00086707613026461 0,00091776706586792 0,000717174029144732 0,000793469138628214 0,000674799410086294 0,000739800080876088 32901 39997 579 665 0 False 317 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 361 573 0,000817240533707351 0,000824629667554099 0,000656137941557946 0,000717174029144732 0,000684335190345737 0,000638942754223169 31010 35938 579 665 0 False 361 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 405 573 0,000866364569658028 0,000823964236524018 0,000671396963454643 0,000656137941557946 0,00074290267793635 0,000714243170414208 32874 35909 579 665 0 False 405 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 449 573 0,000956680058500823 0,00104289104542083 0,000549324788281071 0,000732433051041428 0,0010132718150012 0,00102781154918017 36301 45450 579 665 0 False 449 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 494 574 0,000809808678483053 0,00089674862367638 0,000381475547417411 0,000473029678797589 0,000984934618375423 0,00104292374319095 30728 39081 579 665 0 False 494 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 541 581 0,000879278076962659 0,000950671483010571 0,000457770656900893 0,000518806744487678 0,00099555570026751 0,000982161356001362 33364 41431 579 665 0 True 538 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 582 574 0,000939418125267082 0,000867607333738328 0,000656137941557946 0,000579842832074464 0,000895043426203827 0,000863017288814871 35646 37811 579 665 0 False 582 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 629 581 0,000890478567992185 0,000798976154049578 0,000656137941557946 0,00064087891966125 0,000769007211108759 0,000699773127633326 33789 34820 579 665 0 True 626 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 673 580 0,000897831360926863 0,000905192713989139 0,000656137941557946 0,000610360875867857 0,000784187385408486 0,000868737544631778 34068 39449 579 665 0 True 670 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 273 616 0,000864388012417523 0,000897827080863064 0,000732433051041428 0,000762951094834821 0,000694765315154794 0,000727977503918435 32799 39128 579 665 0 False 273 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 317 616 0,000902390619628294 0,000855446008016149 0,000778210116731518 0,000701915007248035 0,000710416839984592 0,000679620287185478 34241 37281 579 665 0 False 317 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 361 617 0,000898358442857664 0,000912787806091103 0,000762951094834821 0,00080872816052491 0,000699295275394233 0,000694537627412032 34088 39780 579 665 0 False 361 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 405 617 0,000872847677406883 0,000922539812566435 0,000686655985351339 0,000778210116731518 0,000702569360203399 0,000717883563880495 33120 40205 579 665 0 False 405 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 449 617 0,000889608882806363 0,000952185912251446 0,000579842832074464 0,000549324788281071 0,000877591039653631 0,00100658560404218 33756 41497 579 665 0 False 449 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 493 617 0,000858273862020229 0,000887386697460061 0,000442511635004196 0,0004272526131075 0,000968145508060446 0,00103016256603736 32567 38673 579 665 0 False 493 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 538 617 0,000868446543284693 0,000958610763576371 0,000503547722590982 0,000503547722590982 0,00092949482373631 0,0010700040896058 32953 41777 579 665 0 False 538 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 582 617 0,000848628262686566 0,00081620852313893 0,000610360875867857 0,000579842832074464 0,000807155358204597 0,000790791021843077 32201 35571 579 665 0 False 582 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 626 617 0,000908372999542888 0,000893077280062137 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000746649881392363 0,00068855906493677 34468 38921 579 665 0 False 626 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 670 617 0,000970384188701656 0,00093107568646955 0,000778210116731518 0,000732433051041428 0,000810887462425612 0,000782498806724379 36821 40577 579 665 0 False 670 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 273 667 0,00101381573979968 0,06971177084391 0,000839246204318303 0,0699626153963531 0,000723904708744784 0,0225260948606379 38469 3038093 579 665 0 True 273 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 317 660 0,000955863081508082 0,000945715169131343 0,000823987182421607 0,000869764248111696 0,000725507336804174 0,00065684772295189 36270 41215 579 665 0 False 317 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 361 660 0,000863729160004022 0,00081854900469301 0,000732433051041428 0,000701915007248035 0,000656233369643279 0,000607851325579777 32774 35673 579 665 0 False 361 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 405 660 0,000933514807642108 0,000922631596156792 0,00080872816052491 0,000762951094834821 0,00069666138757916 0,000709776201750656 35422 40209 579 665 0 False 405 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 449 660 0,000830127686915441 0,00090608760399511 0,000625619897764553 0,000701915007248035 0,000735002252164055 0,000815515851228404 31499 39488 579 665 0 False 449 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 493 660 0,000878909119611098 0,000904871471422892 0,000610360875867857 0,000656137941557946 0,000849763164369504 0,000829760762221523 33350 39435 579 665 0 False 493 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 537 660 0,000889635236902903 0,000922333299488134 0,000549324788281071 0,000595101853971161 0,000894742300386794 0,000896658735262373 33757 40196 579 665 0 False 537 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 582 660 0,000869079041601654 0,000825639287048016 0,000701915007248035 0,000701915007248035 0,000711020536006626 0,000627012229024676 32977 35982 579 665 0 False 582 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 626 660 0,000938838335143201 0,000924742618734981 0,000793469138628214 0,000793469138628214 0,000661164375112898 0,000703441044819723 35624 40301 579 665 0 False 626 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 670 665 0,00105975093006901 0,0700739259455574 0,000900282291905089 0,0688944838635843 0,000778297015068704 0,0229779396842646 40212 3053876 579 665 0 True 670 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D4_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D4_1.csv new file mode 100755 index 0000000..9f7398f --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D4_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 250 246 0,0104069958329154 0,0454577046874453 0,0102845807583734 0,0456244754711223 0,00187356447732002 0,00936228736135924 424900 1981082 623 665 0 True 250 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 294 246 0,010363153699376 0,0101697594868379 0,0104371709773404 0,0101777676050965 0,00147541375800442 0,00133966074321678 423110 443206 623 665 0 False 294 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 338 245 0,0106716896525584 0,0670920147702743 0,0105745021744106 0,0664072632944228 0,00175946602026841 0,0110358751242585 435707 2923922 623 665 0 True 338 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 382 245 0,0107904797909196 0,106298591523441 0,0108033875028611 0,0993514915693904 0,0013593249070622 0,0355035102892825 440557 4632575 623 665 0 True 382 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 427 244 0,0109641583210471 0,084559166283757 0,0108949416342412 0,0815747310597391 0,00160496515473842 0,0259287304786698 447648 3685154 623 665 0 True 426 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 471 245 0,0110920842782966 0,0738122027430673 0,0111696040283818 0,0766613260090028 0,00164951374336698 0,0226272578104847 452871 3216793 623 665 0 True 471 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 515 245 0,0107758085965117 0,0847804565201055 0,0108491645685512 0,0811627374685283 0,00164789962447038 0,0235356693067094 439958 3694798 623 665 0 True 515 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 559 244 0,010744384318673 0,0765506808908286 0,0107423514152743 0,0746776531624323 0,00162975761097889 0,0202430684676401 438675 3336138 623 665 0 True 559 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 603 247 0,010317499097746 0,0104086951184324 0,0104371709773404 0,0104676890211337 0,0020674834804833 0,00186396927722544 421246 453619 623 665 0 False 603 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 646 245 0,0102522502464895 0,0461800415435476 0,01025406271458 0,0460517280842298 0,00187006729520239 0,00878392278693957 418582 2012562 623 665 0 True 647 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 250 290 0,0103327336268307 0,0102447007883637 0,0103761348897536 0,0102082856488899 0,0015028525361211 0,001569605703455 421868 446472 623 665 0 False 250 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 294 290 0,0104326887927383 0,0101369009614905 0,0103761348897536 0,0101777676050965 0,00140606230965505 0,00133104233031066 425949 441774 623 665 0 False 294 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 339 289 0,0106058529738131 0,10945147258166 0,0106202792401007 0,10785076676585 0,00132456473486976 0,0270762964223992 433019 4769980 623 665 0 True 338 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 383 289 0,0106318643401924 0,0561375973694823 0,0105287251087205 0,0560769054703594 0,00140149005029146 0,00980795158298183 434081 2446520 623 665 0 True 382 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 427 289 0,0108218550831341 0,0866721392632416 0,0108186465247578 0,0850843060959793 0,00169480478533551 0,0161657795031207 441838 3777239 623 665 0 True 426 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 471 290 0,0107412982243569 0,0462922469827579 0,0108491645685512 0,047547112230106 0,00173381422254399 0,00916976904471476 438549 2017452 623 665 0 True 471 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 516 289 0,0109093679005288 0,0482565075999681 0,0108796826123445 0,0505989166094453 0,00154385102983426 0,0104478431494337 445411 2103056 623 665 0 True 515 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 561 290 0,0109244799655533 0,0569644298432049 0,0108949416342412 0,0574349584191653 0,00174398214451393 0,0136146179177071 446028 2482554 623 665 0 True 559 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 603 290 0,0106184912648223 0,0104786801060789 0,0104829480430304 0,0104676890211337 0,00203038111111642 0,00192933403559975 433535 456669 623 665 0 False 603 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 647 290 0,0103922511600714 0,0104860916310001 0,0103761348897536 0,0104371709773404 0,00191429997615172 0,00203279120502897 424298 456992 623 665 0 False 647 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 251 334 0,0104084898944495 0,0532597228938678 0,0103761348897536 0,0521095597772183 0,00154008933541798 0,0103229654988102 424961 2321100 623 665 0 True 250 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 295 334 0,0103818662077693 0,0650540978218033 0,010406652933547 0,0663767452506294 0,00137795016737826 0,0181436575233947 423874 2835108 623 665 0 True 294 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 339 334 0,0105304885911869 0,042071303229463 0,0105897611963073 0,0425116350041962 0,00135949625039134 0,00781152583044336 429942 1833500 623 665 0 True 338 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 383 334 0,0104925247325354 0,0376284726464823 0,0105134660868238 0,0382391088731212 0,001354917359475 0,00560855666541347 428392 1639878 623 665 0 True 382 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 428 334 0,0107071797371946 0,0763197763233903 0,0107118333714809 0,0723735408560311 0,00158837893753502 0,012849044122387 437156 3326075 623 665 0 True 426 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 472 334 0,0107334605245062 0,0352249816576231 0,010757610437171 0,0363164721141375 0,0017634015287175 0,00571157455579686 438229 1535132 623 665 0 True 471 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 516 333 0,0108483807985661 0,0301025165339533 0,0108186465247578 0,0303959716182193 0,00161347855204253 0,00283456613414581 442921 1311891 623 665 0 True 515 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 560 334 0,0109778253101617 0,054180266413344 0,010955977721828 0,0544136720836194 0,00178206033463301 0,00914493629256121 448206 2361218 623 665 0 True 559 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 605 333 0,0108668728716512 0,061731233554245 0,0109407186999313 0,0623941405355917 0,00214255997985978 0,0141577207096931 443676 2690295 623 665 0 True 603 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 648 332 0,0107361057482058 0,0675571969520964 0,0106813153276875 0,0682536049439231 0,0020098789379685 0,0177523584408561 438337 2944195 623 665 0 True 647 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 251 379 0,0102390241279916 0,0422095522624368 0,01025406271458 0,0444953078507668 0,00159374057442374 0,00860652938775774 418042 1839525 623 665 0 True 250 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 295 378 0,0103273941938075 0,0339677759287209 0,0103456168459602 0,0335545891508354 0,0014097291065886 0,00515603922906124 421650 1480342 623 665 0 True 294 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 340 378 0,0107411512674847 0,0918952450937369 0,0107270923933776 0,0855420767528801 0,0014059030710847 0,0233335125060511 438543 4004866 623 665 0 True 338 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 383 377 0,0106383794281933 0,0689581587293939 0,0106660563057908 0,0670786602578775 0,00149213536938505 0,018275561752355 434347 3005250 623 665 0 True 382 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 428 378 0,0106313744839518 0,0470130923555169 0,0106660563057908 0,046845197222858 0,0015918271438084 0,00964007476071969 434061 2048867 623 665 0 True 426 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 472 378 0,0106930963702755 0,0569278311365505 0,0106660563057908 0,0555733577477684 0,00155141223715153 0,0119319423083025 436581 2480959 623 665 0 True 470 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 516 379 0,0106265249071692 0,0434976890612891 0,0106965743495842 0,0443427176317998 0,00176870300329808 0,00700833868061458 433863 1895663 623 665 0 True 515 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 560 378 0,0110957337072896 0,0566622782637528 0,011108567940795 0,0543678950179294 0,00171726898879614 0,0117950655102293 453020 2469386 623 665 0 True 559 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 605 378 0,0110514751959456 0,0446926655159299 0,0110170138094148 0,0451819638361181 0,00208651585974881 0,00927241294147429 451213 1947741 623 665 0 True 603 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 648 378 0,010988381712148 0,112829911813179 0,010955977721828 0,112031738765545 0,00198215517021024 0,0344704961486157 448637 4917215 623 665 0 True 647 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 252 423 0,0101940553250986 0,0426100958507507 0,0101930266269932 0,0426184481574731 0,00152359336314965 0,00529186250977516 416206 1856981 623 665 0 True 250 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 295 422 0,0104506910095827 0,0563390394044163 0,0104219119554437 0,0552224002441443 0,00145387182572939 0,00756678717080288 426684 2455299 623 665 0 True 294 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 339 422 0,0104201484729773 0,0365274137506733 0,010406652933547 0,0369573510337987 0,00139179850019024 0,00421399573896339 425437 1591893 623 665 0 True 338 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 383 422 0,0108047101147109 0,0558433621246983 0,0108186465247578 0,0542610818646525 0,00154483660958746 0,0107261770322123 441138 2433697 623 665 0 True 382 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 428 421 0,0107433556205676 0,1024568746196 0,0107270923933776 0,103120469977874 0,00173096655637921 0,0169669576151438 438633 4465150 623 665 0 True 426 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 472 422 0,0109012852725578 0,0637650661329451 0,0108796826123445 0,0616769665064469 0,00177013683657176 0,0147649065827891 445081 2778931 623 665 0 True 470 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 516 422 0,0106980194254942 0,0551872930208332 0,0108186465247578 0,053177691309987 0,00174808075346665 0,00914174296897535 436782 2405105 623 665 0 True 515 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 561 422 0,0107990767679432 0,0326339309018713 0,0107881284809644 0,0330510414282445 0,00176406528506222 0,00457497091493946 440908 1422212 623 665 0 True 559 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 605 422 0,0106575817928273 0,0429234909200215 0,0105897611963073 0,0426031891355764 0,00210656305051726 0,00794045784425692 435131 1870639 623 665 0 True 603 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 648 421 0,0107920473308897 0,0750367564597004 0,0107728694590677 0,075043869687953 0,00184253039005549 0,0139404085873885 440621 3270160 623 665 0 True 647 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 250 467 0,0102112492791459 0,0642100100330937 0,0102845807583734 0,0648050659952697 0,0015032672354015 0,0192775516164457 416908 2798322 623 665 0 True 250 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 295 467 0,0104949250281147 0,0602439493102176 0,0104829480430304 0,0587014572365911 0,00162836403661779 0,0093317374667804 428490 2625478 623 665 0 True 294 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 338 466 0,0104425593959877 0,0698317549424029 0,0104371709773404 0,068207827878233 0,00152244187867114 0,0190563107799828 426352 3043322 623 665 0 True 338 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 383 466 0,0107499441870046 0,0907543980115085 0,010757610437171 0,0865339131761654 0,00156847060174758 0,0213875885958414 438902 3955147 623 665 0 True 382 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 428 465 0,0108462254311072 0,0976530132839538 0,0108186465247578 0,0937972075989929 0,00179518461735863 0,0334079450441721 442833 4255794 623 665 0 True 426 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 471 466 0,0108537447244014 0,0478991711368143 0,0108339055466545 0,0492713817044327 0,00196993690383097 0,00878343061079999 443140 2087483 623 665 0 True 470 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 516 465 0,0107286844261597 0,0424181763633162 0,0107270923933776 0,0436102845807584 0,00184285970057501 0,00672537872267107 438034 1848617 623 665 0 True 515 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 559 466 0,0106539568566464 0,1044983252363 0,0107728694590677 0,107820248722057 0,00199904846664366 0,0192284860081831 434983 4554118 623 665 0 True 559 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 604 466 0,0105613005487247 0,0651498051606471 0,0104676890211337 0,0665598535133898 0,00187730028062612 0,0185196546673769 431200 2839279 623 665 0 True 603 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 648 466 0,0105073183910035 0,0781939972384612 0,0104829480430304 0,0742351415274281 0,00197484709305606 0,0137221421851758 428996 3407755 623 665 0 True 647 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 251 511 0,00996862348314484 0,0597253490788083 0,0100099183642329 0,0623941405355917 0,00146472746181594 0,0160426141965665 407002 2602877 623 665 0 True 250 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 295 511 0,0102908264254419 0,105635363299528 0,0102845807583734 0,0989394979781796 0,00151918133334768 0,0300717898925107 420157 4603671 623 665 0 True 294 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 339 510 0,0105605412715517 0,0555066769693747 0,0106507972838941 0,0580605783169299 0,00145450837728065 0,0127542880699891 431169 2419024 623 665 0 True 338 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 383 510 0,0106512626473227 0,0593524782429867 0,0106813153276875 0,0585336079957275 0,00155958576237117 0,0110456638266276 434873 2586627 623 665 0 True 382 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 428 510 0,0108477684782653 0,0567294409059958 0,0108796826123445 0,0564431219958801 0,00194964341317979 0,00749158572652655 442896 2472313 623 665 0 True 426 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 472 511 0,0107661829213826 0,0595854938330032 0,0108339055466545 0,0602121004043641 0,00193645772857256 0,0125606195000511 439565 2596782 623 665 0 True 470 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 516 510 0,0108137479623511 0,0706947272048283 0,0108796826123445 0,0695506218051423 0,00188639432191949 0,016139800416875 441507 3080931 623 665 0 True 515 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 560 510 0,0106400204465995 0,055777277939642 0,0106202792401007 0,0572060730907149 0,00188347128725406 0,0118538649367467 434414 2430817 623 665 0 True 559 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 605 510 0,0104467231740333 0,0432425536259968 0,0104371709773404 0,0428473334859236 0,00188569621503777 0,00570543459597919 426522 1884544 623 665 0 True 603 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 648 510 0,0103726079248208 0,0687472629846532 0,010406652933547 0,0666971847104601 0,00189179422830949 0,0174150699182014 423496 2996059 623 665 0 True 647 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 251 555 0,00993670934906556 0,0432338571308106 0,00994888227664607 0,0448615243762875 0,00134214728856622 0,00899805231561231 405699 1884165 623 665 0 True 250 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 295 554 0,0101835479087364 0,0526629689352702 0,0102235446707866 0,054032196536202 0,00138402154973408 0,0133958936726058 415777 2295093 623 665 0 True 294 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 339 554 0,0103177195330543 0,0493237671886285 0,0102998397802701 0,0487525749599451 0,00145254885606177 0,0113820777723144 421255 2149568 623 665 0 True 338 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 384 555 0,0106048732613318 0,04919013028107 0,0106202792401007 0,0480048828870069 0,00151305254420104 0,00609609583103368 432979 2143744 623 665 0 True 382 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 428 554 0,010813625498291 0,0868844117618377 0,0108186465247578 0,0831311512932021 0,00183672682316227 0,0194705024399198 441502 3786490 623 665 0 True 426 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 471 555 0,0106471723477132 0,0608095197939917 0,0105592431525139 0,0600747692072938 0,00208222918924273 0,013426217507937 434706 2650126 623 665 0 True 470 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 516 554 0,0105484418224073 0,0548462940367628 0,010605020218204 0,0547951476310369 0,0021015496280827 0,00792744996753688 430675 2390244 623 665 0 True 515 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 559 550 0,0103982029133955 0,0341843163642684 0,010452429999237 0,0378728923476005 0,00186448777625246 0,010339463430973 424541 1489779 623 665 0 False 559 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 604 554 0,0104364606857914 0,0467330835672381 0,0104371709773404 0,0473182269016556 0,00168425565384369 0,00674801717215289 426103 2036664 623 665 0 True 603 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 649 554 0,010372730388881 0,0511010646322834 0,0103913939116503 0,0508278019378958 0,00186336151295955 0,00715001490477504 423501 2227024 623 665 0 True 647 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 250 593 0,0101016929309213 0,00971956097614143 0,00988784618905928 0,00973525597009232 0,00212432470207929 0,00116160495809564 412435 423586 623 665 0 False 250 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 294 593 0,00979798206170939 0,00990246272582349 0,00973525597009232 0,00991836423285267 0,00158396849547543 0,00146819673954747 400035 431557 623 665 0 False 294 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 339 598 0,0099047462293622 0,0717542769718987 0,00991836423285267 0,0712901503013657 0,00135822917478775 0,0147122072280243 404394 3127107 623 665 0 True 338 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 384 598 0,0104100819272316 0,0762781295192662 0,0103608758678569 0,0723125047684443 0,00140488926700738 0,0216848842148184 425026 3324260 623 665 0 True 382 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 426 593 0,0104765799119018 0,0105723452600373 0,0104371709773404 0,0104829480430304 0,00182153939215542 0,00185934277177479 427741 460751 623 665 0 False 426 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 470 593 0,0103490703324569 0,0101895159046621 0,0103456168459602 0,0101472495613031 0,00202790610188369 0,00195974420017835 422535 444067 623 665 0 False 470 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 515 593 0,0105118495612296 0,0102201257320458 0,0105439841306172 0,0103456168459602 0,00215998291807949 0,0021441299729522 429181 445401 623 665 0 False 515 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 559 593 0,0103097593691435 0,0101011512530468 0,0102693217364767 0,0100862134737163 0,00193937623184636 0,00182690052290527 420930 440216 623 665 0 False 559 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 603 593 0,0102944758544348 0,0101088840205343 0,0102388036926833 0,0100404364080262 0,00160880455092718 0,00160431294703763 420306 440553 623 665 0 False 603 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 647 593 0,0100667416881499 0,0101335508604425 0,010101472495613 0,0101625085831998 0,00156639985789358 0,00150923400865974 411008 441628 623 665 0 False 647 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 250 642 0,00970366024256946 0,0417261280920314 0,00968947890440223 0,0422827496757458 0,00131040125589941 0,00983892099296823 396184 1818457 623 665 0 True 249 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 294 636 0,00960059448953367 0,00964276105691099 0,00964370183871214 0,00968947890440223 0,00138116747083624 0,00131530184943944 391976 420239 623 665 0 False 294 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 338 636 0,0102522992321136 0,00975609084510315 0,00976577401388571 0,00978103303578241 0,00307347921054049 0,00125537556309189 418584 425178 623 665 0 False 338 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 382 636 0,0103424817660199 0,010049270578598 0,0101930266269932 0,0101472495613031 0,00197834733830418 0,00133342987162533 422266 437955 623 665 0 False 382 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 426 636 0,0100184173700084 0,0100628316040731 0,0100251773861295 0,0100556954299229 0,00152863237682717 0,00168462378033989 409035 438546 623 665 0 False 426 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 470 636 0,0100571160130209 0,0100825421301021 0,0100251773861295 0,0100709544518196 0,0016369680743824 0,00178078012224116 410615 439405 623 665 0 False 470 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 515 636 0,00997496712146145 0,00992992896523754 0,010101472495613 0,00996414129854276 0,00180225549737925 0,00175515052667882 407261 432754 623 665 0 False 515 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 559 636 0,0101292228516467 0,0100306844015509 0,0101472495613031 0,0100556954299229 0,00189702676358891 0,0016959931032746 413559 437145 623 665 0 False 559 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 603 636 0,0107346361794838 0,00999814711876969 0,0100099183642329 0,0100251773861295 0,00442352799033249 0,00141374123299465 438277 435727 623 665 0 False 603 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 648 642 0,00996455767634733 0,0430456089869903 0,00994888227664607 0,0429388876173037 0,00148882324133241 0,00871833655849755 406836 1875961 623 665 0 True 647 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D4_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D4_2.csv new file mode 100755 index 0000000..a4933b4 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D4_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 250 246 0,00805316311808683 0,671806937806866 0,00801098649576562 0,673655298695354 0,00190171396861243 0,19547066735887 328797 29277867 623 665 8 True 250 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 294 246 0,00675788524652199 0,00652324333378651 0,00671396963454643 0,00651560234988937 0,00147402922926153 0,00122600083618891 275913 284288 623 665 0 False 294 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 338 245 0,00884401152582749 0,0067098393729804 0,00657663843747616 0,00679026474402991 0,0103115281111968 0,00110487090009217 361086 292420 623 665 0 True 338 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 382 245 0,00676780483539545 0,00693053301599157 0,00685130083161669 0,00692759594110018 0,0012406898831177 0,00119152668066702 276318 302038 623 665 0 True 382 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 427 244 0,00721430879876106 0,00725641065355079 0,00721751735713741 0,0072632944228275 0,00151314165126491 0,00150166010267296 294548 316240 623 665 0 True 426 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 471 245 0,00749242467939828 0,00747088595831534 0,00746166170748455 0,00741588464179446 0,00158398577649419 0,00138512836881897 305903 325587 623 665 0 True 471 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 515 245 0,00745125226237043 0,00755523507785256 0,00752269779507134 0,0076600289921416 0,00156405420355816 0,00161928126056629 304222 329263 623 665 0 True 515 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 559 244 0,00764548026179387 0,00776163342666577 0,00762951094834821 0,00776684214541848 0,00155937525349106 0,00128270476077127 312152 338258 623 665 0 True 559 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 603 247 0,00797843554857347 0,00824673264759519 0,00807202258335241 0,00822461280231937 0,00192929465714494 0,00205086206741904 325746 359399 623 665 0 False 603 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 646 245 0,00924811843156359 0,698964554898347 0,00923170824750134 0,686228732738231 0,0018926676946952 0,188347941729303 377585 30461417 623 665 10 True 647 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 250 290 0,00677262991936599 0,00642342867927429 0,00674448767833982 0,0064087891966125 0,00158288990329034 0,00142907814050846 276515 279938 623 665 0 False 250 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 294 290 0,00654087893190766 0,00638322746669833 0,00653086137178607 0,0064087891966125 0,00128395338567173 0,00124300363157747 267053 278186 623 665 0 False 294 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 339 289 0,00645219045953536 0,0066862280443613 0,00646982528419928 0,00672922865644312 0,00127334874139608 0,00129293551610725 263432 291391 623 665 0 True 338 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 383 289 0,00657294002285914 0,00673092665286471 0,00660715648126955 0,00671396963454643 0,00128334573963422 0,0012466056238396 268362 293339 623 665 0 True 382 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 427 289 0,00703073517257207 0,00700409756366196 0,00709544518196384 0,00697337300679027 0,00142632217165617 0,00151348947192983 287053 305244 623 665 0 True 426 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 471 290 0,00738499920582057 0,00732568431837203 0,00730907148851759 0,00733958953231098 0,0017253931374018 0,00181570142581887 301517 319259 623 665 0 True 471 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 516 289 0,007661792474608 0,00753368888001647 0,007690547035935 0,00755321583886473 0,00157689170405302 0,00160896373969186 312818 328324 623 665 0 True 515 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 561 290 0,00771158636147153 0,00800609901957916 0,007690547035935 0,00805676356145571 0,00162604213295935 0,00155792030455393 314851 348912 623 665 0 True 559 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 603 290 0,00812975214131471 0,00823764607214993 0,00814831769283589 0,00827038986800946 0,00196967306883132 0,00192139863412653 331924 359003 623 665 0 False 603 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 647 290 0,0081449376847753 0,00826692503747352 0,00822461280231937 0,00823987182421607 0,00181137512266747 0,0019583537977222 332544 360279 623 665 0 False 647 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 251 334 0,00642174589417807 0,00642212076311172 0,00634775310902571 0,00642404821850919 0,00144357274571823 0,00139799954914195 262189 279881 623 665 0 True 250 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 295 334 0,00653054296522964 0,00631269177750969 0,00646982528419928 0,00634775310902571 0,00126108965970504 0,00131021915227263 266631 275112 623 665 0 True 294 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 339 334 0,00662048057101562 0,0065387318146591 0,00659189745937285 0,00651560234988937 0,00123912726721601 0,00116747231155678 270303 284963 623 665 0 True 338 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 383 334 0,0067845089332021 0,00692759594110018 0,00679026474402991 0,00691233691920348 0,00130213374108092 0,00128244439338637 277000 301910 623 665 0 True 382 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 428 334 0,00694890468756908 0,00701573113373959 0,00697337300679027 0,00704966811627375 0,00157998085304871 0,00158587022923869 283712 305751 623 665 0 True 426 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 472 334 0,0075221589532066 0,00735989665167726 0,00741588464179446 0,00733958953231098 0,00166109937049506 0,00143892349801189 307117 320750 623 665 0 True 471 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 516 333 0,00772295102625495 0,00795853217387713 0,00772106507972839 0,00798046845197223 0,00157812293209334 0,00168260632887672 315315 346839 623 665 0 True 515 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 560 334 0,00779513134331685 0,00777969184806833 0,00785839627679866 0,00787365529869535 0,00170269952308525 0,00141844510008936 318262 339045 623 665 0 True 559 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 605 333 0,00788355039475678 0,00814666558820948 0,00788891432059205 0,00822461280231937 0,00211880674744427 0,00204659820434781 321872 355038 623 665 0 True 603 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 648 332 0,00781813009381604 0,00785357763830496 0,00778210116731518 0,00778210116731518 0,00197282657860985 0,00175695533302713 319201 342265 623 665 0 True 647 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 251 379 0,00647886313183954 0,0061791695994392 0,00645456626230259 0,00621042191195544 0,00144114414422271 0,00150606901934247 264521 269293 623 665 0 True 250 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 295 378 0,00638204304587222 0,00651381256987743 0,0063935301747158 0,00657663843747616 0,00130014484587009 0,00135517209752127 260568 283877 623 665 0 True 294 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 340 378 0,00660784228000648 0,00711689959620957 0,00659189745937285 0,00709544518196384 0,00129162584605718 0,00123633332190409 269787 310160 623 665 0 True 338 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 383 377 0,00708807284554184 0,00720168468780099 0,00698863202868696 0,0072327763790341 0,00135041732474701 0,00130266801065923 289394 313855 623 665 0 True 382 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 428 378 0,00706171857979409 0,00723137667928117 0,00708018616006714 0,00714122224765393 0,00155498812032184 0,00153388842268762 288318 315149 623 665 0 True 426 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 472 378 0,00740170330362723 0,00733504624458835 0,00741588464179446 0,00735484855420768 0,00154858911333481 0,00174389271023049 302199 319667 623 665 0 True 470 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 516 379 0,00735915928912552 0,00735845106012915 0,00727855344472419 0,00735484855420768 0,00168485563443071 0,00167488790292865 300462 320687 623 665 0 True 515 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 560 378 0,00783679361658536 0,00789965300066371 0,00787365529869535 0,00791943236438544 0,00180037146691839 0,00161134296032051 319963 344273 623 665 0 True 559 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 605 378 0,00773698540754998 0,0081317966465718 0,00782787823300526 0,0080872816052491 0,00206825533144843 0,00195888184560025 315888 354390 623 665 0 True 603 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 648 378 0,00713514803026969 0,00736363683298427 0,0072480354009308 0,00741588464179446 0,00184205795574199 0,00180125170324376 291316 320913 623 665 0 True 647 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 252 423 0,00635176993019916 0,00645692968975426 0,0063782711528191 0,00648508430609598 0,00153829893637363 0,00152942228046537 259332 281398 623 665 0 True 250 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 295 422 0,00650796059253501 0,00668019327329539 0,00650034332799268 0,00669871061264973 0,00144124570929941 0,0014227458828109 265709 291128 623 665 0 True 294 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 339 422 0,00680001288321913 0,00705212332731577 0,0068207827878233 0,00708018616006714 0,001312701553258 0,00125551996945026 277633 307337 623 665 0 True 338 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 383 422 0,0071113410169734 0,0069705736072844 0,00711070420386053 0,00694285496299687 0,00142096951196369 0,00133143954166786 290344 303783 623 665 0 True 382 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 428 421 0,00711523537408668 0,00737701429127867 0,00712596322575723 0,00744640268558785 0,0016180569840233 0,00151125815001303 290503 321496 623 665 0 True 426 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 472 422 0,00741453753713263 0,00740755528096965 0,00743114366369116 0,00749217975127794 0,00163282420007712 0,00148002362051903 302723 322827 623 665 0 True 470 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 516 422 0,0073360625673782 0,00747093185011051 0,00738536659800107 0,00744640268558785 0,00163579712285919 0,00170999648943558 299519 325589 623 665 0 True 515 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 561 422 0,00704660651476959 0,00710795069614985 0,00704966811627375 0,00711070420386053 0,00163121245441452 0,00154702390877819 287701 309770 623 665 0 True 559 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 605 422 0,00677762645302077 0,00667395198915118 0,00675974670023652 0,00675974670023652 0,00190021293003001 0,0016791998548828 276719 290856 623 665 0 True 603 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 648 421 0,00699066493208572 0,0070756658182421 0,00703440909437705 0,00703440909437705 0,0018463690713493 0,00188648735413505 285417 308363 623 665 0 True 647 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 250 467 0,00630956881506592 0,00637152505892793 0,00633249408712902 0,0064087891966125 0,00146173401971827 0,00143864179304109 257609 277676 623 665 0 True 250 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 295 467 0,00655684824535332 0,00654676287881526 0,00657663843747616 0,00654612039368277 0,00150210855694209 0,001440314133498 267705 285313 623 665 0 True 294 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 338 466 0,00667448722154887 0,00644348339376709 0,00665293354695964 0,00651560234988937 0,00141388781629734 0,00152772096661327 272508 280812 623 665 0 True 338 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 383 466 0,006908295605218 0,00684308620027982 0,00695811398489357 0,00692759594110018 0,00152377930480094 0,00145373174805639 282054 298227 623 665 0 True 382 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 428 465 0,00712003596524519 0,00704751120190038 0,00712596322575723 0,00709544518196384 0,00175944678692046 0,00191310448666482 290699 307136 623 665 0 True 426 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 471 466 0,00720796516044445 0,00728309673244682 0,00718699931334401 0,00720225833524071 0,00193467807682491 0,0019143967346822 294289 317403 623 665 0 True 470 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 516 465 0,00703362532439199 0,00675192214915866 0,00703440909437705 0,00671396963454643 0,00167818069266503 0,0018056717616984 287171 294254 623 665 0 True 515 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 559 466 0,00642297053477973 0,0063801527164214 0,00645456626230259 0,0063782711528191 0,00182164478803778 0,0018489884758552 262239 278052 623 665 0 True 559 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 604 466 0,00625494984423184 0,0060916310001371 0,00625619897764553 0,00602731364919509 0,00183358579907222 0,0016416508626823 255379 265478 623 665 0 True 603 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 648 466 0,00605180646122831 0,00601467045962354 0,00604257267109178 0,005981536583505 0,00173633816026399 0,00181173322678441 247085 262124 623 665 0 True 647 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 251 511 0,00630092285241819 0,00643246936292436 0,00631723506523232 0,0063782711528191 0,0013887692130579 0,00157477428950028 257256 280332 623 665 0 True 250 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 295 511 0,00648772952979557 0,00647927899400596 0,00650034332799268 0,00656137941557946 0,00144955658256481 0,00143110202570833 264883 282372 623 665 0 True 294 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 339 510 0,00660267429666747 0,00678601975297594 0,00665293354695964 0,00677500572213321 0,00153845787097801 0,00161298494836889 269576 295740 623 665 0 True 338 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 383 510 0,00674796565764854 0,00673101843645507 0,00683604180972 0,00671396963454643 0,00151176949566434 0,00147343723524547 275508 293343 623 665 0 True 382 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 428 510 0,00671671282949415 0,0069503123797133 0,00685130083161669 0,00700389105058366 0,0018243102778939 0,00176754368401336 274232 302900 623 665 0 True 426 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 472 511 0,00679989041915896 0,0066946032969813 0,00686655985351339 0,00677500572213321 0,00177939742365485 0,00156573145379814 277628 291756 623 665 0 True 470 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 516 510 0,00651934975013046 0,00645146856612807 0,00651560234988937 0,00643930724040589 0,00175542426100548 0,00152935091502766 266174 281160 623 665 0 True 515 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 560 510 0,00625708071887873 0,00617469514940934 0,00628671702143893 0,00614938582436866 0,00173128668294911 0,00157839745844259 255466 269098 623 665 0 True 559 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 605 510 0,00608812930147357 0,00627577182828896 0,00604257267109178 0,00628671702143893 0,00178191142817111 0,00169792037066788 248568 273503 623 665 0 True 603 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 648 510 0,00616861268181474 0,00600700652982881 0,00614938582436866 0,00607309071488518 0,00182892781644156 0,00184033125067171 251854 261790 623 665 0 True 647 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 251 555 0,00649275055626238 0,00676807606106133 0,00657663843747616 0,00666819256885634 0,00143840886542173 0,00133916472468373 265088 294958 623 665 0 True 250 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 295 554 0,00656272652024129 0,0064998844100409 0,00663767452506294 0,00653086137178607 0,00142739533074595 0,00134039464093122 267945 283270 623 665 0 True 294 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 339 554 0,00673985853686554 0,00678278438141589 0,00675974670023652 0,00674448767833982 0,00139665734862881 0,00123412347805507 275177 295599 623 665 0 True 338 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 384 555 0,00662692218058036 0,00661376489977519 0,00660715648126955 0,00657663843747616 0,00126607006996105 0,00121466496672138 270566 288233 623 665 0 True 382 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 428 554 0,00642764866187808 0,0065009169754324 0,00653086137178607 0,00646982528419928 0,00170754510098026 0,00179922233772548 262430 283315 623 665 0 True 426 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 471 555 0,00639744902464112 0,00653707971003269 0,0063782711528191 0,00645456626230259 0,00189423940508303 0,00190948516889374 261197 284891 623 665 0 True 470 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 516 554 0,00649226070002171 0,00649240404742688 0,00646982528419928 0,00660715648126955 0,00188985386838181 0,00203648839259894 265068 282944 623 665 0 True 515 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 559 550 0,00629195848321403 0,00639286474368572 0,00625619897764553 0,0063782711528191 0,00174495940908304 0,00179551872433396 256890 278606 623 665 0 False 559 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 604 554 0,00633981743792695 0,00662989586578027 0,00633249408712902 0,00672922865644312 0,00153312657123338 0,00152597219444463 258844 288936 623 665 0 True 603 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 649 554 0,0062917135550937 0,00631925430422015 0,00630197604333562 0,00633249408712902 0,00180550568434148 0,00167832222018287 256880 275398 623 665 0 True 647 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 250 593 0,00688865236996735 0,00654669404112249 0,00679026474402991 0,00656137941557946 0,00153086396573924 0,00121174270575331 281252 285310 623 665 0 False 250 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 294 593 0,00664636947333474 0,00655116849115235 0,00662241550316625 0,00653086137178607 0,00140902150545057 0,00142554683986187 271360 285505 623 665 0 False 294 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 339 598 0,00670096395135678 0,00663909717071346 0,00669871061264973 0,00666819256885634 0,00131487842824419 0,00147778696131213 273589 289337 623 665 0 True 338 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 384 598 0,00640935253128926 0,00667365369248252 0,00636301213092241 0,00662241550316625 0,0013197627335466 0,00120126821563097 261683 290843 623 665 0 True 382 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 426 593 0,00618218169968114 0,00636172716065742 0,00614938582436866 0,0063935301747158 0,00172156426883164 0,00170940307762824 252408 277249 623 665 0 False 426 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 470 593 0,0062555131789086 0,00631833646831659 0,00628671702143893 0,0063782711528191 0,00195320366738989 0,00176235328454376 255402 275358 623 665 0 False 470 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 515 593 0,00659691848583966 0,006285317321686 0,00651560234988937 0,00621042191195544 0,00192534417994811 0,00210828063005498 269341 273919 623 665 0 False 515 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 559 593 0,00642725677688555 0,00628281621884879 0,00645456626230259 0,0064087891966125 0,00170075012960596 0,00170920656113285 262414 273810 623 665 0 False 559 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 603 593 0,00626922915364721 0,00627847944420447 0,00633249408712902 0,00621042191195544 0,00148466381747533 0,00145748656512656 255962 273621 623 665 0 False 603 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 647 593 0,00646149772810799 0,0064035575319622 0,00643930724040589 0,00643930724040589 0,0014533601213002 0,00146749676122771 263812 279072 623 665 0 False 647 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 250 642 0,00849496446154206 0,661439476466401 0,00813305867093919 0,6683604180972 0,00195562684777007 0,218873808864572 346835 28826045 623 665 7 True 249 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 294 636 0,00707386701456257 0,00672776011899742 0,00698863202868696 0,00668345159075303 0,00159378492830387 0,00123112694472514 288814 293201 623 665 0 False 294 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 338 636 0,00647202963728227 0,00637838588230705 0,0064087891966125 0,00634775310902571 0,00123321270741366 0,00122417352220961 264242 277975 623 665 0 False 338 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 382 636 0,00619437912007368 0,00620890748271457 0,00621042191195544 0,00628671702143893 0,00126523508913642 0,00125458171885346 252906 270589 623 665 0 False 382 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 426 636 0,00595672536491534 0,00610321867841956 0,00602731364919509 0,00610360875867857 0,00148374674783134 0,00150022405181635 243203 265983 623 665 0 False 426 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 470 636 0,00607485419735157 0,00615236879105523 0,00605783169298848 0,00622568093385214 0,00175391606887251 0,00166370293104044 248026 268125 623 665 0 False 470 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 515 636 0,0063353597461369 0,00614392470074247 0,00633249408712902 0,00607309071488518 0,00174063129295158 0,00168445846328761 258662 267757 623 665 0 False 515 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 559 636 0,00620728683201519 0,00623547883212265 0,00616464484626535 0,00614938582436866 0,00191506754735928 0,00152549998927746 253433 271747 623 665 0 False 559 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 603 636 0,00709106096860989 0,00647225754934372 0,00672922865644312 0,00643930724040589 0,00270208151348011 0,00133472651725034 289516 282066 623 665 0 False 603 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 648 642 0,00800283038935856 0,698229712528059 0,00790417334248875 0,683863584344244 0,00161311793321192 0,203145245855963 326742 30429392 623 665 11 True 647 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D4_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D4_3.csv new file mode 100755 index 0000000..9ad13bc --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D4_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 250 246 0,000964110560063662 0,0663191051558858 0,000732433051041428 0,0654154268711376 0,000802762290978993 0,0209783848467646 39363 2890238 623 665 0 True 250 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 294 246 0,000951888646859085 0,000900236400109911 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,000730316743217172 0,000653705166978785 38864 39233 623 665 0 False 294 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 338 245 0,00118209658715932 0,000966572990039759 0,000930800335698482 0,000854505226215 0,00110382427696662 0,000652084579947026 48263 42124 623 665 0 True 338 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 382 245 0,000909148689861115 0,000894362250327122 0,000823987182421607 0,000793469138628214 0,000650001610642675 0,000607618388673755 37119 38977 623 665 0 True 382 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 427 244 0,00091808856625324 0,0010231116816991 0,000778210116731518 0,00080872816052491 0,000718495849893378 0,000841068292207117 37484 44588 623 665 0 True 426 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 471 245 0,00099337947044336 0,000910171973765955 0,00080872816052491 0,000762951094834821 0,000847241236665529 0,000740459256510487 40558 39666 623 665 0 True 471 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 515 245 0,00101125922322761 0,000928941717993771 0,00080872816052491 0,000747692072938125 0,000851016980531273 0,00084032066403967 41288 40484 623 665 0 True 515 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 559 244 0,000996710492879878 0,000988578105827627 0,00080872816052491 0,000900282291905089 0,000798513562558783 0,000725541642525774 40694 43083 623 665 0 True 559 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 603 247 0,00113085762438583 0,0010776311343706 0,000854505226215 0,000747692072938125 0,00102054484963082 0,00108328701227764 46171 46964 623 665 0 False 603 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 646 245 0,00110656075484887 0,0693852048294231 0,00080872816052491 0,0672922865644312 0,000973369225433066 0,0206164771069362 45179 3023861 623 665 0 True 647 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 250 290 0,0008615836488926 0,000877772366370263 0,000671396963454643 0,000686655985351339 0,00072819551157954 0,000777588268548699 35177 38254 623 665 0 False 250 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 294 290 0,000925191481742874 0,000900580588573746 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,000676327748416222 0,000650463308049257 37774 39248 623 665 0 False 294 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 339 289 0,000919215235606768 0,000903127583206127 0,000793469138628214 0,000762951094834821 0,000658224170626405 0,000706073077769585 37530 39359 623 665 0 True 338 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 383 289 0,000850610869101718 0,000923870674626599 0,000732433051041428 0,00080872816052491 0,000627783894649519 0,000670601952240023 34729 40263 623 665 0 True 382 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 427 289 0,000907066800838291 0,000898538403688324 0,000717174029144732 0,000671396963454643 0,000767322257206139 0,000787292356245531 37034 39159 623 665 0 True 426 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 471 290 0,000918578422493905 0,000912076483265844 0,000625619897764553 0,000503547722590982 0,000872196875405662 0,000979509485341015 37504 39749 623 665 0 True 471 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 516 289 0,00100506254178321 0,000908772274013025 0,000869764248111696 0,000701915007248035 0,000838835279593764 0,000797899917675331 41035 39605 623 665 0 True 515 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 561 290 0,000986203076517627 0,00100172610514613 0,000732433051041428 0,000778210116731518 0,000908301821302816 0,00084428307945756 40265 43656 623 665 0 True 559 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 603 290 0,00101147965853591 0,00106597461839538 0,000671396963454643 0,000732433051041428 0,00102654813239506 0,00105013701752947 41297 46456 623 665 0 False 603 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 647 290 0,00115682000514104 0,00113260950499389 0,000869764248111696 0,000732433051041428 0,00104818038369965 0,00109706742762313 47231 49360 623 665 0 False 647 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 251 334 0,000917451753140376 0,00086196264293143 0,000686655985351339 0,000732433051041428 0,000755734752288794 0,000694468009551335 37458 37565 623 665 0 True 250 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 295 334 0,00093344555939807 0,000937316970613763 0,000793469138628214 0,000793469138628214 0,000681666436217665 0,00071519397277249 38111 40849 623 665 0 True 294 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 339 334 0,000952500967159915 0,000877015151749825 0,000854505226215 0,000762951094834821 0,000671335164777558 0,000647070582884338 38889 38221 623 665 0 True 338 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 383 334 0,000976577401388571 0,000935779595475298 0,000839246204318303 0,000823987182421607 0,000702276449391742 0,000653844463460202 39872 40782 623 665 0 True 382 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 428 334 0,000849582170996322 0,000918340713307645 0,00064087891966125 0,000625619897764553 0,000753136435353542 0,000860697362944255 34687 40022 623 665 0 True 426 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 472 334 0,000891440386761096 0,000942571581161648 0,00064087891966125 0,000732433051041428 0,000853437770021978 0,000806498958863289 36396 41078 623 665 0 True 471 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 516 333 0,000992448743586098 0,000924559051554269 0,00080872816052491 0,000732433051041428 0,000842406727756337 0,000832059177989416 40520 40293 623 665 0 True 515 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 560 334 0,000992742657330497 0,000985824598116945 0,000732433051041428 0,00080872816052491 0,000942598514316227 0,000807832726298325 40532 42963 623 665 0 True 559 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 605 333 0,00110114784338953 0,00110934236483862 0,000778210116731518 0,000747692072938125 0,00110939955557568 0,00118706531497847 44958 48346 623 665 0 True 603 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 648 332 0,000986692932758291 0,00108082061413548 0,000656137941557946 0,000778210116731518 0,00101230067197479 0,000940465325670336 40285 47103 623 665 0 True 647 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 251 379 0,000886517331542419 0,000894545817507835 0,000732433051041428 0,000701915007248035 0,000742153183252338 0,000818282378669976 36195 38985 623 665 0 True 250 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 295 378 0,000974936382982345 0,000864371962178277 0,000839246204318303 0,000747692072938125 0,000749538449291601 0,000668836208148175 39805 37670 623 665 0 True 294 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 340 378 0,000992987585450829 0,000955214770733196 0,000839246204318303 0,000854505226215 0,000776441371549295 0,000716818181807837 40542 41629 623 665 0 True 338 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 383 377 0,000950345599700992 0,00086781384681663 0,000793469138628214 0,000747692072938125 0,000732328909053149 0,000642611760881071 38801 37820 623 665 0 True 382 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 428 378 0,000910397823274809 0,000967926797997512 0,000686655985351339 0,000747692072938125 0,000783111544530705 0,000865871697431446 37170 42183 623 665 0 True 426 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 472 378 0,00090150693250675 0,000911043917874338 0,000610360875867857 0,000579842832074464 0,000843244369871166 0,000913057920901489 36807 39704 623 665 0 True 470 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 516 379 0,000994506139796888 0,000965494532853076 0,000762951094834821 0,000610360875867857 0,000903774034251944 0,000975990704612997 40604 42077 623 665 0 True 515 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 560 378 0,000986472497449992 0,00101033081674202 0,000717174029144732 0,000778210116731518 0,000979119816656999 0,000881937027007127 40276 44031 623 665 0 True 559 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 605 378 0,000992791642954563 0,00108550157724364 0,00064087891966125 0,000717174029144732 0,00105790415393745 0,00111493413366606 40534 47307 623 665 0 True 603 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 648 378 0,000981843355975713 0,00093784472625831 0,000686655985351339 0,00064087891966125 0,000984707094132151 0,000906231731329944 40087 40872 623 665 0 True 647 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 252 423 0,000979149146652059 0,000916711554578825 0,00080872816052491 0,000747692072938125 0,000795411420851104 0,000783442209815335 39977 39951 623 665 0 True 250 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 295 422 0,000918480451245772 0,000907234898874561 0,00080872816052491 0,00080872816052491 0,000740628239855903 0,000698140971116802 37500 39538 623 665 0 True 294 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 339 422 0,000863665537915424 0,000957325793311386 0,000778210116731518 0,000885023270008392 0,000658577129612272 0,000655778572336472 35262 41721 623 665 0 True 338 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 383 422 0,000886492838730386 0,000943558254757975 0,000762951094834821 0,000823987182421607 0,000718856645237063 0,000735064504948737 36194 41121 623 665 0 True 382 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 428 421 0,00088781545058018 0,000923641215650708 0,000656137941557946 0,00064087891966125 0,000876888718803424 0,00084468648639477 36248 40253 623 665 0 True 426 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 472 422 0,000868980478126633 0,000912673076603158 0,000595101853971161 0,000717174029144732 0,00085118488830599 0,000753623824217662 35479 39775 623 665 0 True 470 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 516 422 0,000941111809564468 0,00084842456335391 0,000747692072938125 0,000595101853971161 0,000878644929726997 0,000839736769079553 38424 36975 623 665 0 True 515 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 561 422 0,00104216915201354 0,000957761765365577 0,000747692072938125 0,000732433051041428 0,00100396784212426 0,000876959200241097 42550 41740 623 665 0 True 559 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 605 422 0,000970356227132133 0,000992868988676773 0,000595101853971161 0,000656137941557946 0,00104077049993071 0,000976608943401241 39618 43270 623 665 0 True 603 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 648 421 0,00100298065276038 0,000937775888565543 0,00064087891966125 0,000503547722590982 0,0010113165627109 0,00101351565588718 40950 40869 623 665 0 True 647 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 250 467 0,000920047991215898 0,000899456239591884 0,000747692072938125 0,000701915007248035 0,000757873409061097 0,000801407551314866 37564 39199 623 665 0 True 250 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 295 467 0,000950933427189789 0,000925408049765063 0,000793469138628214 0,000839246204318303 0,000809084021709251 0,000754449531519673 38825 40330 623 665 0 True 294 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 338 466 0,000942238478917996 0,000908083897085355 0,000823987182421607 0,000747692072938125 0,000770512989899683 0,000806151770782745 38470 39575 623 665 0 True 338 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 383 466 0,000921835966494323 0,000877474069701606 0,000762951094834821 0,000747692072938125 0,000785489333865293 0,000745967557092103 37637 38241 623 665 0 True 382 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 428 465 0,000936360204030023 0,000938211860619734 0,000595101853971161 0,000610360875867857 0,000992823047325873 0,00100083751936323 38230 40888 623 665 0 True 426 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 471 466 0,000903147950912976 0,000932154143656234 0,000518806744487678 0,000549324788281071 0,000974968165895168 0,00100327950365956 36874 40624 623 665 0 True 470 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 516 465 0,000999429195015566 0,00090491736321807 0,00064087891966125 0,000564583810177768 0,00100039174439167 0,000938850313555581 40805 39437 623 665 0 True 515 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 559 466 0,000920341904960297 0,000911961753777899 0,000549324788281071 0,000534065766384375 0,000970753774610967 0,000956694112937259 37576 39744 623 665 0 True 559 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 604 466 0,000931633091307611 0,000978206560117391 0,000610360875867857 0,000656137941557946 0,000962746677043829 0,000957586327525798 38037 42631 623 665 0 True 603 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 648 466 0,000872066572442819 0,000931832901089988 0,000442511635004196 0,000686655985351339 0,000955737806720563 0,000913898817733883 35605 40610 623 665 0 True 647 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 251 511 0,000932514832540807 0,000902370368585689 0,000762951094834821 0,000747692072938125 0,000781317175044116 0,000753638469035686 38073 39326 623 665 0 True 250 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 295 511 0,000893130390791389 0,000930639714415359 0,000717174029144732 0,00080872816052491 0,000799164272067438 0,000786059849885557 36465 40558 623 665 0 True 294 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 339 510 0,000879242966368552 0,000890897419791181 0,000732433051041428 0,000747692072938125 0,000775103799541736 0,000740934749037335 35898 38826 623 665 0 True 338 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 383 510 0,000923917855517147 0,000923411756674818 0,000747692072938125 0,000732433051041428 0,000801112763568552 0,000815026976002511 37722 40243 623 665 0 True 382 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 428 510 0,000916325083786848 0,000879309741508727 0,000564583810177768 0,000457770656900893 0,000974825427398915 0,000959890077295899 37412 38321 623 665 0 True 426 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 472 511 0,000817570065668903 0,000878804931761769 0,000473029678797589 0,000595101853971161 0,000854101396749139 0,000815961772125353 33380 38299 623 665 0 True 470 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 516 510 0,000849753620680555 0,00085987456625083 0,000518806744487678 0,000549324788281071 0,000865069278920586 0,000870715913817063 34694 37474 623 665 0 True 515 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 560 510 0,00088409254315113 0,000925408049765063 0,000579842832074464 0,00064087891966125 0,000889687350966574 0,000884682963383195 36096 40330 623 665 0 True 559 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 605 510 0,000902168238431647 0,00090399952731451 0,000595101853971161 0,000564583810177768 0,000915348102919783 0,000893305281747487 36834 39397 623 665 0 True 603 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 648 510 0,000894795902009647 0,000878208338424454 0,000488288700694286 0,0004272526131075 0,000965299443903016 0,000981856171354357 36533 38273 623 665 0 True 647 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 251 555 0,000940866881444135 0,00092196616512671 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,000685675806985858 0,000689777462867033 38414 40180 623 665 0 True 250 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 295 554 0,000802727421576771 0,000945577493745809 0,000656137941557946 0,000778210116731518 0,000683602194122422 0,000751483829595041 32774 41209 623 665 0 True 294 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 339 554 0,000933959908450767 0,000960469381281081 0,000823987182421607 0,000839246204318303 0,000695919622768508 0,0006926705192203 38132 41858 623 665 0 True 338 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 384 555 0,000933494545022136 0,000906385900663767 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,000763135889789388 0,000713826514475087 38113 39501 623 665 0 True 382 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 428 554 0,000876034407992201 0,000904940309115659 0,000503547722590982 0,000518806744487678 0,000943859321379505 0,000962671604969093 35767 39438 623 665 0 True 426 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 471 555 0,000909883474222111 0,000873573267111473 0,000473029678797589 0,000473029678797589 0,00100870907271758 0,000971062804357128 37149 38071 623 665 0 True 470 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 516 554 0,000829424586692982 0,000867790900919041 0,000488288700694286 0,000442511635004196 0,000921809385322133 0,00101757222702502 33864 37819 623 665 0 True 515 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 559 550 0,000920807268388928 0,000898102431634132 0,000534065766384375 0,000610360875867857 0,000950790207106126 0,000894083532600672 37595 39140 623 665 0 False 559 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 604 554 0,000932710775037073 0,00089583078777282 0,000717174029144732 0,000671396963454643 0,000813172998669488 0,00075830264385144 38081 39041 623 665 0 True 603 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 649 554 0,000917280303456144 0,000930524984927414 0,000610360875867857 0,00064087891966125 0,000938921397870084 0,000897293349172686 37451 40553 623 665 0 True 647 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 250 593 0,000980741179434218 0,000961593730262943 0,000839246204318303 0,000869764248111696 0,000672633160939698 0,000632297553659117 40042 41907 623 665 0 False 250 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 294 593 0,000922154373050755 0,000930915065186427 0,00080872816052491 0,000778210116731518 0,000701820486730659 0,000782767943850941 37650 40570 623 665 0 False 294 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 339 598 0,000872189036502985 0,000863522963967483 0,000717174029144732 0,000701915007248035 0,000696381049677583 0,000763515984856137 35610 37633 623 665 0 True 338 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 384 598 0,000842675198002954 0,000868594007334656 0,000747692072938125 0,000747692072938125 0,000638654535058823 0,000620267986128617 34405 37854 623 665 0 True 382 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 426 593 0,000903466357469408 0,000862352723190443 0,000656137941557946 0,000488288700694286 0,000887663894113295 0,000917872729840233 36887 37582 623 665 0 False 426 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 470 593 0,000921909444930423 0,000875638397894484 0,000488288700694286 0,000488288700694286 0,00103771280487615 0,000943197793690854 37640 38161 623 665 0 False 470 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 515 593 0,000838511419957307 0,000863477072172305 0,000274662394140536 0,000366216525520714 0,00100970917635902 0,00106131634693592 34235 37631 623 665 0 False 515 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 559 593 0,000966780276575283 0,00094110304371595 0,000610360875867857 0,000625619897764553 0,000962404426196545 0,000908741639086672 39472 41014 623 665 0 False 559 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 603 593 0,0009486555956707 0,000909965460687654 0,000717174029144732 0,000717174029144732 0,000855906720041838 0,000773084219595508 38732 39657 623 665 0 False 603 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 647 593 0,000963694182259097 0,00104800798058318 0,000762951094834821 0,000869764248111696 0,000820533237155219 0,000835536501453591 39346 45673 623 665 0 False 647 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 250 642 0,00105311743899239 0,0653119179271135 0,000930800335698482 0,0648661020828565 0,000724825219642361 0,0227015313167366 42997 2846344 623 665 0 True 249 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 294 636 0,000930971785382714 0,000886032889502309 0,000839246204318303 0,000747692072938125 0,000684907672879588 0,000648268895644468 38010 38614 623 665 0 False 294 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 338 636 0,000919092771546602 0,000860517051383322 0,000823987182421607 0,000762951094834821 0,000664647344241461 0,000635176840796852 37525 37502 623 665 0 False 338 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 382 636 0,000825603708015799 0,000901452532682129 0,000701915007248035 0,000762951094834821 0,00063592123727619 0,000637347840440929 33708 39286 623 665 0 False 382 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 426 636 0,000848920865071425 0,000859713944967707 0,000579842832074464 0,000610360875867857 0,000770724835205561 0,000811670384977556 34660 37467 623 665 0 False 426 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 470 636 0,000846153177311671 0,00081946684059657 0,000473029678797589 0,000488288700694286 0,000895178165468386 0,000867710710345154 34547 35713 623 665 0 False 470 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 515 636 0,000845736799507107 0,000864326070383099 0,000473029678797589 0,000473029678797589 0,000916264031723379 0,000931614283705038 34530 37668 623 665 0 False 515 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 559 636 0,000961832728544572 0,000832729569403022 0,000701915007248035 0,000549324788281071 0,000920705406338845 0,000803136813109859 39270 36291 623 665 0 False 559 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 603 636 0,00101792126810065 0,00087013138247312 0,000854505226215 0,000701915007248035 0,000763560334181164 0,000690015869869797 41560 37921 623 665 0 False 603 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 648 642 0,00105897122106833 0,0697792547287193 0,000900282291905089 0,0667429617761501 0,000779740248817344 0,0226583161504626 43236 3041034 623 665 0 True 647 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D5_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D5_1.csv new file mode 100755 index 0000000..c9563d4 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D5_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 262 274 0,0107568554930591 0,0454595862510476 0,0107270923933776 0,045792324711986 0,00143608218496063 0,00952004722074494 470202 1981164 667 665 0 True 262 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 306 275 0,0104288665921102 0,0104097965215167 0,0104219119554437 0,0104219119554437 0,00133782187998944 0,00131287324444435 455865 453667 667 665 0 False 306 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 351 275 0,0108096100725101 0,0657532134295455 0,0108339055466545 0,0650034332799268 0,0013612919887418 0,00984053734856095 472508 2865576 667 665 0 True 351 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 395 275 0,0109181618849536 0,0942006194245054 0,0109407186999313 0,0944838635843442 0,00148990536733183 0,0155821030645515 477253 4105336 667 665 0 True 395 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 439 275 0,010957281716203 0,0771753141149968 0,0109254596780346 0,0735179674982834 0,00181608034246688 0,0131518685774058 478963 3363360 667 665 0 True 439 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 483 276 0,0110612352326926 0,0715323442504178 0,0110627908751049 0,0749217975127794 0,00174182703541685 0,0189371128978784 483507 3117435 667 665 0 True 484 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 527 276 0,0107554828674013 0,0860520034350009 0,0107881284809644 0,0821850919356069 0,00159082614399276 0,0230656940286967 470142 3750213 667 665 0 True 528 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 572 276 0,0110559048697212 0,0740792470992083 0,0110780498970016 0,0718242160677501 0,00173344772880572 0,0181815938103062 483274 3228431 667 665 0 True 572 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 616 276 0,0111510278278119 0,0112824978445197 0,0112153810940719 0,0113527122911421 0,00191581795806902 0,00208021335646892 487432 491700 667 665 0 False 616 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 660 275 0,0108055150726308 0,046816836093438 0,0108339055466545 0,0463569085221637 0,00190064557568441 0,00834774922412043 472329 2040314 667 665 0 True 661 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 262 319 0,0107519140406908 0,0104861375227953 0,0107270923933776 0,0105134660868238 0,00148974294418985 0,00148186289970869 469986 456994 667 665 0 False 262 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 306 319 0,0109405585602712 0,0108687603650922 0,0109407186999313 0,0108644235904479 0,00135886624643494 0,00118016835710207 478232 473669 667 665 0 False 306 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 351 320 0,0110939952317272 0,1116552883697 0,0111390859845884 0,108903639276722 0,00131198891055212 0,026936697703888 484939 4866024 667 665 0 True 351 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 395 320 0,0111410762917923 0,0566420629279768 0,0111848630502785 0,0542305638208591 0,00139907566941551 0,00878024446918876 486997 2468505 667 665 0 True 395 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 440 320 0,0114783532930262 0,0839307928782818 0,0115053025101091 0,0818646524757763 0,00171921864052051 0,013829394090047 501740 3657769 667 665 0 True 439 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 484 320 0,0114016692729396 0,0448861912161957 0,0113832303349355 0,0464026855878538 0,00172821228077703 0,00643882283586591 498388 1956175 667 665 0 True 483 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 528 319 0,0110526105681423 0,0466519468733633 0,0110017547875181 0,0493171587701228 0,0016219906488984 0,00867706937818445 483130 2033128 667 665 0 True 528 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 572 320 0,0111848172960899 0,0569373766299475 0,0112001220721752 0,0572060730907149 0,00184162094739097 0,01225669659078 488909 2481375 667 665 0 True 572 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 616 319 0,0111560379114631 0,0111545285736658 0,0111390859845884 0,0111238269626917 0,00209340128005679 0,00208598970629906 487651 486123 667 665 0 False 616 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 661 319 0,0108282091501743 0,0106892546082533 0,0108644235904479 0,0107728694590677 0,00194654967328985 0,00193370868793708 473321 465846 667 665 0 False 661 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 263 365 0,0109166748738242 0,0537921136097281 0,0109102006561379 0,0527046616311894 0,00155441954858839 0,00895987492284676 477188 2344302 667 665 0 True 262 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 307 364 0,0110320898145571 0,0661602277609795 0,0110322728313115 0,0681925688563363 0,00144853421751749 0,0182721762794804 482233 2883314 667 665 0 True 306 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 351 364 0,0111066691419683 0,0430193129883532 0,0110627908751049 0,0433203631647211 0,00137993603028411 0,00751350992204369 485493 1874815 667 665 0 True 351 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 395 364 0,0112439317077556 0,0385234544360443 0,0112153810940719 0,0381933318074311 0,00143409966352042 0,00574934168733629 491493 1678882 667 665 0 True 395 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 440 363 0,0112424446966263 0,0762520859255027 0,011306935225452 0,0736247806515602 0,00175270962616498 0,0123015912560007 491428 3323125 667 665 0 True 439 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 484 365 0,0114010515913936 0,0351513253263624 0,0114137483787289 0,0357061112382696 0,00180413425294243 0,00430978550974083 498361 1531922 667 665 0 True 483 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 528 364 0,01119849779848 0,0338737436404011 0,0112153810940719 0,0329137102311742 0,0017811006533918 0,00564305039503111 489507 1476244 667 665 0 True 528 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 572 364 0,0112915846951782 0,0568644545674096 0,0112764171816587 0,054886701762417 0,00196281898350327 0,0106924918341741 493576 2478197 667 665 0 True 572 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 617 364 0,0112658022099044 0,0597888633233347 0,0113527122911421 0,0604409857328145 0,00199583689249694 0,0121486120816904 492449 2605645 667 665 0 True 616 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 660 363 0,0113540391626114 0,0675567380341446 0,011261158159762 0,066849774929427 0,00196925512794955 0,0166961718378122 496306 2944175 667 665 0 True 660 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 264 409 0,0108265162451962 0,0451220291516156 0,0108339055466545 0,0469520103761349 0,00156556133884276 0,00881676669827147 473247 1966453 667 665 0 True 262 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 307 408 0,0110300537531646 0,0349154873909425 0,0109712367437247 0,0341954680704967 0,00148298458042932 0,00501446273368204 482144 1521644 667 665 0 True 306 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 352 408 0,011359918575846 0,090153399061857 0,0114442664225223 0,0855420767528801 0,00139648143686504 0,0175195840830394 496563 3928955 667 665 0 True 351 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 396 408 0,0114473319531582 0,0725717934112002 0,0113984893568322 0,07006942854963 0,00152854964153128 0,0161193745601309 500384 3162735 667 665 0 True 395 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 440 408 0,0116424735675193 0,0476805655704838 0,0116426337071794 0,048355840390631 0,00166519943725856 0,00904021320424332 508914 2077956 667 665 0 True 439 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 484 408 0,0117096178392836 0,060388531410926 0,0117189288166629 0,0602578774700542 0,00179059481538052 0,0111124966311276 511849 2631779 667 665 0 True 483 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 528 408 0,0114809155275875 0,045795170003287 0,0113679713130388 0,0456702525368124 0,00179595343476197 0,00586382725150792 501852 1995789 667 665 0 True 528 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 572 408 0,0116084782053926 0,054996635557766 0,0116273746852827 0,0538948653391318 0,00187884616842438 0,00789498033919926 507428 2396796 667 665 0 True 572 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 617 408 0,0114034994404835 0,0446730238275937 0,0114137483787289 0,0440070191500725 0,00189210700858087 0,00873647994275632 498468 1946885 667 665 0 True 616 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 661 408 0,0113895444129617 0,0908317715781787 0,0114900434882124 0,0894026092927443 0,00192164532538952 0,0176019381051347 497858 3958519 667 665 0 True 660 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 264 453 0,0111800817375702 0,048720198298447 0,0111390859845884 0,0492408636606394 0,00167272198651621 0,00600838015547004 488702 2123264 667 665 0 True 262 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 308 452 0,0114766832651424 0,0603403909177843 0,0114900434882124 0,0601968413824674 0,00157909566579616 0,00776397490184578 501667 2629681 667 665 0 True 306 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 352 452 0,0115142932081682 0,0376487109281558 0,0115510795757992 0,03759822995346 0,00147293041422129 0,0039404720391564 503311 1640760 667 665 0 True 350 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 396 452 0,0116918194599198 0,0575609543428266 0,0117189288166629 0,0558785381857023 0,00159794181522414 0,0104631947583685 511071 2508551 667 665 0 True 395 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 441 452 0,011683766722727 0,0982872149474166 0,0117036697947662 0,0975661860074769 0,00194134357195293 0,0152435840675328 510719 4283433 667 665 0 True 439 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 484 452 0,0117899164402692 0,0642011299707268 0,0117189288166629 0,0635080491340505 0,00206775891341565 0,0126604285580047 515359 2797935 667 665 0 True 483 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 529 452 0,0114601431259651 0,0559964342075147 0,0114900434882124 0,0544899671931029 0,00179800245607495 0,00831279499649578 500944 2440368 667 665 0 True 528 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 573 452 0,011314530420759 0,0329093964024274 0,0113832303349355 0,0332188906691081 0,00210191814753038 0,0043119571898224 494579 1434217 667 665 0 True 572 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 617 452 0,0114471031822153 0,040828989388096 0,0113221942473487 0,0409552147707332 0,00224310391607576 0,00458571929041783 500374 1779359 667 665 0 True 616 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 660 451 0,011126229057593 0,0737377203594934 0,0112153810940719 0,0735942626077668 0,00192147062408547 0,01229123835847 486348 3213547 667 665 0 True 660 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 263 497 0,0110457016856644 0,0643569785071514 0,0110017547875181 0,0642252231631952 0,00177374958457797 0,0160487723244473 482828 2804727 667 665 0 True 262 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 307 497 0,0112114233567583 0,0619803571643689 0,0112306401159686 0,0605630579079881 0,00175097275680807 0,0100599239999032 490072 2701152 667 665 0 True 306 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 351 496 0,0113042357283249 0,0715597645980366 0,0113374532692454 0,0680857557030594 0,00175580894414621 0,0166299642211944 494129 3118630 667 665 0 True 350 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 395 496 0,0114476522324784 0,0936989532655167 0,011459525444419 0,0846570534828718 0,0017449610652614 0,0306901206460913 500398 4083473 667 665 0 True 395 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 439 495 0,0112997746949368 0,0966193235434661 0,0113221942473487 0,0947280079346914 0,0018057140778602 0,0293210084868308 493934 4210745 667 665 0 True 439 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 485 497 0,0113882861727754 0,0486713694283775 0,0113679713130388 0,0496070801861601 0,00183929081188469 0,0088236852911325 497803 2121136 667 665 0 True 483 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 529 496 0,011224143021188 0,0408888781808033 0,0112153810940719 0,0419928282597086 0,00204725038928892 0,00492683899446348 490628 1781969 667 665 0 True 527 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 572 496 0,0112412550877228 0,0976176995475643 0,0111390859845884 0,0963607232776379 0,00240222509608768 0,0153804335210414 491376 4254255 667 665 0 True 572 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 617 495 0,0108389156303057 0,0616158386352698 0,0109102006561379 0,065491721980621 0,00184405120484699 0,012942816092384 473789 2685266 667 665 0 True 616 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 660 496 0,0107652056324779 0,0831361534988765 0,0107423514152743 0,0801251239795529 0,00188371122213453 0,0133002972395102 470567 3623138 667 665 0 True 660 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 263 541 0,0101860033590438 0,0546095153195417 0,0101472495613031 0,0580300602731365 0,00146637708137412 0,0125409880019743 445249 2379925 667 665 0 True 262 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 307 540 0,0104999228469995 0,103976007769481 0,0105134660868238 0,0970168612191959 0,00156890463174955 0,0275940103399721 458971 4531355 667 665 0 True 306 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 351 540 0,0107789776432452 0,0579734986355796 0,0107423514152743 0,0598764019226368 0,0014872690180825 0,0127775558987703 471169 2526530 667 665 0 True 350 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 395 540 0,0109958524971893 0,056235989378344 0,0110017547875181 0,0563668268863966 0,00170392521393936 0,0069624576704369 480649 2450808 667 665 0 True 395 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 440 540 0,0110726051485587 0,058700906535049 0,0110475318532082 0,057450217441062 0,00202725838278714 0,00837819691119115 484004 2558231 667 665 0 True 439 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 483 541 0,0111009041142052 0,0602662986144693 0,011108567940795 0,0602731364919509 0,00207910109205757 0,0119254541080014 485241 2626452 667 665 0 True 483 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 528 540 0,0110238311835156 0,0748229695318635 0,010955977721828 0,0701609826810101 0,00180990010561523 0,0196391095996428 481872 3260843 667 665 0 True 527 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 573 541 0,0108006422515453 0,0558529076180954 0,0107881284809644 0,0573739223315785 0,00187450777594227 0,0120497443922046 472116 2434113 667 665 0 True 572 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 617 540 0,0103936587439858 0,0426400402471044 0,0104371709773404 0,0423590447852293 0,00186744356642789 0,00461420814290336 454326 1858286 667 665 0 True 616 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 660 540 0,0105182702766264 0,066636722270313 0,010605020218204 0,0658121614404517 0,00184909023230915 0,013363304880767 459773 2904080 667 665 0 True 660 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 264 585 0,0101146497019286 0,0448272890970847 0,010101472495613 0,0461127641718166 0,00124300660869454 0,00754595192876763 442130 1953608 667 665 0 True 262 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 308 585 0,010220730788188 0,05183097363459 0,0103150988021668 0,0525215533684291 0,00147133133306133 0,0090381227352579 446767 2258834 667 665 0 True 306 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 352 584 0,0105606844094547 0,0489404100776088 0,0105745021744106 0,0478675516899367 0,00141613087825919 0,00784057685573857 461627 2132861 667 665 0 True 350 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 396 584 0,0109405128060827 0,0519278512142109 0,0106507972838941 0,0501411459525444 0,00244141468377889 0,00692988412346437 478230 2263056 667 665 0 True 395 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 440 584 0,0108089466367755 0,0903416930974725 0,0107118333714809 0,0845807583733883 0,00213611831977173 0,0201066897878208 472479 3937161 667 665 0 True 439 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 484 585 0,0107212358572373 0,0634263617386336 0,0107881284809644 0,0616159304188602 0,00207017118397354 0,0117123371872047 468645 2764170 667 665 0 True 483 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 528 584 0,0105937189336209 0,0563576714732586 0,0105745021744106 0,0553139543755245 0,00203854143710957 0,00826972076058355 463071 2456111 667 665 0 True 527 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 573 584 0,0105865584031056 0,0373437599491978 0,0105897611963073 0,0383306630045014 0,00177126320445884 0,00652557581908695 462758 1627470 667 665 0 True 572 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 617 584 0,010548422286911 0,0485146030560494 0,0105439841306172 0,0484779125658045 0,00163007106556165 0,00575370226333611 461091 2114304 667 665 0 True 616 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 660 584 0,0105591058899481 0,0565649188202826 0,0105592431525139 0,0546578164339666 0,0017096431265791 0,0134651702507232 461558 2465143 667 665 0 True 660 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 262 622 0,0105942908609783 0,0100651720856272 0,0101319905394064 0,0101167315175097 0,00308481870894579 0,00137799317834697 463096 438648 667 665 0 False 262 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 306 622 0,010622910105945 0,0101753812317473 0,0102998397802701 0,0101472495613031 0,00286090715835853 0,00141001002498156 464347 443451 667 665 0 False 306 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 351 628 0,0103536009518701 0,0750674121788793 0,0103150988021668 0,0726787212939651 0,00141105901309832 0,012151731008505 452575 3271496 667 665 0 True 350 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 396 628 0,0106256096030721 0,078950867670435 0,0106507972838941 0,077409018081941 0,00140186962132088 0,0192107630609141 464465 3440740 667 665 0 True 395 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 439 623 0,0106582323395409 0,010486321089976 0,0106813153276875 0,010406652933547 0,00186037452804361 0,00183339702797951 465891 457002 667 665 0 False 439 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 483 623 0,0104376513963206 0,0104375151658042 0,0105134660868238 0,010452429999237 0,00194989534449022 0,00190860739334044 456249 454875 667 665 0 False 483 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 527 623 0,0102710832727376 0,0101829074861565 0,0102998397802701 0,010101472495613 0,00186534781643527 0,00196673552817217 448968 443779 667 665 0 False 527 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 572 623 0,0103618595829117 0,0104599791995438 0,0102998397802701 0,010452429999237 0,00167408884649377 0,00173914725380446 452936 455854 667 665 0 False 572 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 616 623 0,0103348417345459 0,0102375187224183 0,0103150988021668 0,0102845807583734 0,00147980025773916 0,001401921124962 451755 446159 667 665 0 False 616 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 660 623 0,0102888130208185 0,0103306331748345 0,0103456168459602 0,0103913939116503 0,0015668539641172 0,00152026150419006 449743 450217 667 665 0 False 660 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 263 672 0,00995492182954071 0,0436449328861178 0,00997940032043946 0,0440680552376593 0,00129018208548982 0,0102759178469554 435148 1902080 667 665 0 True 262 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 306 666 0,00994144722099925 0,00996046995492852 0,00994888227664607 0,00999465934233616 0,00122020986117262 0,00118386782366819 434559 434085 667 665 0 False 306 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 350 666 0,0107880369725872 0,0100713904238738 0,0101472495613031 0,0101472495613031 0,00412953733923021 0,00125847543862617 471565 438919 667 665 0 False 350 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 394 666 0,0105098972601134 0,00997233298398204 0,0101625085831998 0,00993362325474937 0,00274190068607477 0,00139483651209222 459407 434602 667 665 0 False 394 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 439 666 0,0102428986925626 0,0100372469282614 0,01025406271458 0,0100556954299229 0,00142835573181286 0,00154815847308171 447736 437431 667 665 0 False 439 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 483 666 0,0101507497567307 0,0101391267135566 0,0101777676050965 0,010101472495613 0,00175881810067813 0,00153891935198974 443708 441871 667 665 0 False 483 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 527 666 0,0101013809872358 0,0101130831197931 0,0102082856488899 0,0101472495613031 0,0017771297863254 0,00162605301362322 441550 440736 667 665 0 False 527 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 572 666 0,0101018156520275 0,0099964491223481 0,0101167315175097 0,00999465934233616 0,00149437589052973 0,00146999471681577 441569 435653 667 665 0 False 572 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 616 666 0,0102868684678032 0,0102116357499379 0,0103150988021668 0,0102082856488899 0,00134381248215982 0,00144262448579351 449658 445031 667 665 0 False 616 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 661 671 0,010495050025914 0,0439734493018998 0,0102845807583734 0,0443732356755932 0,00254258466396304 0,00894344298033039 458758 1916397 667 665 0 True 660 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D5_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D5_2.csv new file mode 100755 index 0000000..edd63dc --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D5_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 262 274 0,00840252796467411 0,703216337938001 0,00813305867093919 0,711696040283818 0,00220298388628703 0,201129983194563 367290 30646713 667 665 10 True 262 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 306 275 0,0069980116373491 0,00666878916219365 0,00688181887541009 0,00663767452506294 0,00144780143161166 0,00125597545549572 305896 290631 667 665 0 False 306 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 351 275 0,0067012270930225 0,00697904064349475 0,00666819256885634 0,00689707789730678 0,00120588325607646 0,00135489618576695 292923 304152 667 665 0 True 351 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 395 275 0,00685271921146316 0,00678198127500027 0,00686655985351339 0,0068207827878233 0,00139656392538377 0,00119785291691531 299545 295564 667 665 0 True 395 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 439 275 0,00710503068447465 0,00723401545750391 0,00714122224765393 0,0072632944228275 0,00163893278686791 0,00163851898409311 310574 315264 667 665 0 True 439 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 483 276 0,00739115450285844 0,00741845458232443 0,00741588464179446 0,00733958953231098 0,00168492321867256 0,00173154706729142 323081 323302 667 665 0 True 484 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 527 276 0,00726775545621559 0,00728415224373591 0,0072480354009308 0,00732433051041428 0,00157613630012723 0,00163239079481429 317687 317449 667 665 0 True 528 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 572 276 0,0078111779541678 0,00784568424953434 0,00788891432059205 0,00796520943007553 0,00169750468529795 0,00179535537603878 341441 341921 667 665 0 True 572 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 616 276 0,00838832128911511 0,00873935812293379 0,00839246204318303 0,00880445563439384 0,00202596727356674 0,00187989513456203 366669 380868 667 665 0 False 616 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 660 275 0,00971340834503783 0,726933584820371 0,00975051499198901 0,706157015335317 0,00201814385150753 0,172412732172368 424591 31680329 667 665 11 True 661 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 262 319 0,00727507612639091 0,00688438881594006 0,00730907148851759 0,00683604180972 0,00155495713439989 0,00129283398143407 318007 300027 667 665 0 False 262 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 306 319 0,00708919973522051 0,0068652748832484 0,00708018616006714 0,0068055237659266 0,00122933508284029 0,00120923625752229 309882 299194 667 665 0 False 306 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 351 320 0,00688895652883103 0,00717017997041126 0,00694285496299687 0,00718699931334401 0,00122755830930987 0,00126058460179598 301129 312482 667 665 0 True 351 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 395 320 0,0071719690623903 0,00729557930073524 0,00718699931334401 0,00733958953231098 0,00133779688298567 0,001299897163894 313500 317947 667 665 0 True 395 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 440 320 0,00745575941715569 0,00748442403789286 0,00753795681696803 0,00749217975127794 0,00164826667894068 0,00171612875000344 325905 326177 667 665 0 True 439 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 484 320 0,00767499061181243 0,00760573899844599 0,00761425192645151 0,0076752880140383 0,00164479654769204 0,00148421390232327 335488 331464 667 665 0 True 483 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 528 319 0,00765723798663726 0,00765486616518407 0,00761425192645151 0,00764476997024491 0,00163661269892795 0,00164340912423885 334712 333605 667 665 0 True 528 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 572 320 0,00807142777890066 0,00806192638841324 0,00802624551766232 0,00807202258335241 0,00164919349460694 0,00169614374980208 352817 351345 667 665 0 True 572 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 616 319 0,00831154576065138 0,0081054547561396 0,00834668497749294 0,00807202258335241 0,00185834729579347 0,00197392484258654 363313 353242 667 665 0 False 616 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 661 319 0,00813090822407519 0,00782021430321053 0,00804150453955901 0,00775158312352178 0,00203281467872875 0,00174495541549911 355417 340811 667 665 0 False 661 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 263 365 0,00686806974173705 0,00672842555002751 0,0068207827878233 0,00674448767833982 0,0014310611211455 0,00144668882516121 300216 293230 667 665 0 True 262 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 307 364 0,00699892672112101 0,0070518479765447 0,00703440909437705 0,00709544518196384 0,0013597503711145 0,00122393159630461 305936 307325 667 665 0 True 306 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 351 364 0,00720802336300378 0,00711462795234826 0,0072327763790341 0,00703440909437705 0,00136588872675837 0,0013129407493108 315076 310061 667 665 0 True 351 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 395 364 0,00759313636841456 0,00750927444498176 0,00759899290455482 0,00747692072938125 0,00122321620152927 0,00133420849197753 331910 327260 667 665 0 True 395 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 440 363 0,00774437683881795 0,00772843071285446 0,00775158312352178 0,007690547035935 0,00160605509661132 0,00168341938512666 338521 336811 667 665 0 True 439 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 484 365 0,0077894447145848 0,00795573277437127 0,00776684214541848 0,00778210116731518 0,00159130997637749 0,00225267667817423 340491 346717 667 665 0 True 483 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 528 364 0,00808339249921846 0,00803319812463179 0,0080872816052491 0,00796520943007553 0,00167148244096098 0,00165385660087349 353340 350093 667 665 0 True 528 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 572 364 0,00820631112688106 0,00831708476960311 0,00823987182421607 0,00840772106507973 0,00185821802124073 0,00189817300014081 358713 362465 667 665 0 True 572 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 617 364 0,00803164451191662 0,00833656583665619 0,0080872816052491 0,00842298008697642 0,00206445338012381 0,00199928912232934 351078 363314 667 665 0 True 616 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 660 363 0,00770669826450931 0,00789359528370021 0,00770580605783169 0,00796520943007553 0,00196627655733451 0,00195446384162543 336874 344009 667 665 0 True 660 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 264 409 0,00703374565864241 0,00671789338303415 0,00697337300679027 0,00666819256885634 0,00140743347287846 0,00146584826698638 307458 292771 667 665 0 True 262 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 307 408 0,00740192961427274 0,00723656245213629 0,00741588464179446 0,00721751735713741 0,00136236820945477 0,00128785351760525 323552 315375 667 665 0 True 306 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 352 408 0,00769281186827049 0,0077849694045138 0,00770580605783169 0,00778210116731518 0,0013636249819692 0,00124604091398355 336267 339275 667 665 0 True 351 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 396 408 0,00797541261413239 0,008091251245532 0,00793469138628214 0,00807202258335241 0,00150014687612875 0,00145222139973962 348620 352623 667 665 0 True 395 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 440 408 0,0083319063745765 0,00850193692058023 0,00831616693369955 0,00845349813076982 0,00167028132015727 0,00212558619075635 364203 370521 667 665 0 True 439 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 484 408 0,00813065657603791 0,00862134737163348 0,00813305867093919 0,00871290150301366 0,00168910011482025 0,00161511219262346 355406 375725 667 665 0 True 483 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 528 408 0,00845994947136182 0,00887361456972713 0,00846875715266651 0,00885023270008392 0,00167367389588557 0,00158398450440987 369800 386719 667 665 0 True 528 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 572 408 0,00820448095933722 0,00860888774924264 0,00823987182421607 0,00863660639353018 0,00176226908733754 0,00173774218875502 358633 375182 667 665 0 True 572 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 617 408 0,00783137842843284 0,00817957000535213 0,00776684214541848 0,00817883573662928 0,00183917447814475 0,00192816373502084 342324 356472 667 665 0 True 616 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 661 408 0,00733057595715761 0,00766916145938203 0,00730907148851759 0,0076752880140383 0,00181067571609085 0,00188250008738606 320433 334228 667 665 0 True 660 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 264 453 0,00745900796454599 0,00793719248911934 0,00738536659800107 0,00796520943007553 0,0016055731064 0,00151490256580698 326047 345909 667 665 0 True 262 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 308 452 0,00792652426361779 0,00821956470484979 0,00801098649576562 0,00819409475852598 0,00149550458683105 0,00155474103972198 346483 358215 667 665 0 True 306 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 352 452 0,00810951814090666 0,0080005920041578 0,0081025406271458 0,00801098649576562 0,00142195445537996 0,00141003494102936 354482 348672 667 665 0 True 350 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 396 452 0,0083492929662429 0,00821561801046448 0,00831616693369955 0,00816357671473259 0,00150436683350425 0,0015180139879616 364963 358043 667 665 0 True 395 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 441 452 0,00841774123238221 0,00847972529171406 0,0085297932402533 0,0085145342183566 0,00183840888552062 0,00198639575147533 367955 369553 667 665 0 True 439 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 484 452 0,00830420221338175 0,00840395793787513 0,00834668497749294 0,00839246204318303 0,00172447089350947 0,00184616988434513 362992 366251 667 665 0 True 483 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 529 452 0,00793741376050359 0,00796117095209986 0,00793469138628214 0,00796520943007553 0,00173971408870216 0,00167807843649329 346959 346954 667 665 0 True 528 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 573 452 0,00743027433410784 0,00734842370288275 0,00744640268558785 0,00733958953231098 0,00181204214429456 0,00194154662114289 324791 320250 667 665 0 True 572 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 617 452 0,00739579855300091 0,00711758797313724 0,00727855344472419 0,00709544518196384 0,00193669186026228 0,00175139159757752 323284 310190 667 665 0 True 616 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 660 451 0,00711701828188675 0,00709067243526532 0,00712596322575723 0,00714122224765393 0,00174593150858459 0,00189830851126164 311098 309017 667 665 0 True 660 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 263 497 0,00725789542857319 0,00789637173730848 0,00720225833524071 0,00785839627679866 0,00166712418564265 0,00179448085410938 317256 344130 667 665 0 True 262 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 307 497 0,00745431816021493 0,00724941215478614 0,00740062561989776 0,0072632944228275 0,0017634108394026 0,00162695300101468 325842 315935 667 665 0 True 306 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 351 496 0,00766883667344629 0,00734381157746736 0,007690547035935 0,00737010757610437 0,00169286638889279 0,00150927693166643 335219 320049 667 665 0 True 350 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 395 496 0,00783847032766519 0,00739587581909684 0,00791943236438544 0,00741588464179446 0,00163038027446067 0,00156372716070898 342634 322318 667 665 0 True 395 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 439 495 0,00762587349035485 0,00771851808509601 0,007690547035935 0,0076752880140383 0,00178006489091057 0,00192504061204206 333341 336379 667 665 0 True 439 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 485 497 0,00713680696845443 0,00715914299367095 0,00711070420386053 0,00721751735713741 0,00173650198858204 0,00174718701649872 311963 312001 667 665 0 True 483 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 529 496 0,0068490131221869 0,00661945548237726 0,0068207827878233 0,00668345159075303 0,00172806492001098 0,00157975584052782 299383 288481 667 665 0 True 527 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 572 496 0,00670083818241943 0,00670676462270347 0,00665293354695964 0,00683604180972 0,00178435160918335 0,00170389751966997 292906 292286 667 665 0 True 572 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 617 495 0,00658885480583123 0,00652087990633485 0,00651560234988937 0,00650034332799268 0,00172776546563932 0,00167044481105992 288011 284185 667 665 0 True 616 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 660 496 0,00687431518848038 0,00668751301462629 0,00692759594110018 0,00669871061264973 0,00171409556369323 0,00180792004369537 300489 291447 667 665 0 True 660 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 263 541 0,00675517128137694 0,00660777602050445 0,00674448767833982 0,00668345159075303 0,00134809511194286 0,00147253123863379 295281 287972 667 665 0 True 262 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 307 540 0,00676962960497321 0,00677213748493458 0,00675974670023652 0,00677500572213321 0,00140085909050846 0,00135369454970909 295913 295135 667 665 0 True 306 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 351 540 0,00697687320221784 0,00676378517821218 0,00700389105058366 0,0068207827878233 0,00140989078797439 0,00142607115062173 304972 294771 667 665 0 True 350 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 395 540 0,00711418152219381 0,00695531458538771 0,00714122224765393 0,00695811398489357 0,00155097778501068 0,00146684070199191 310974 303118 667 665 0 True 395 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 440 540 0,00680634734132133 0,00678221073397616 0,0068207827878233 0,00677500572213321 0,00186577219771507 0,00201228737055395 297518 295574 667 665 0 True 439 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 483 541 0,00664044265347299 0,00668583796410229 0,00663767452506294 0,00668345159075303 0,00192738090321713 0,00189087476217985 290266 291374 667 665 0 True 483 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 528 540 0,00638431070571375 0,00651860826247353 0,00630197604333562 0,00643930724040589 0,00178877389056857 0,00186544364039711 279070 284086 667 665 0 True 527 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 573 541 0,00664067142441597 0,00659288413296918 0,00660715648126955 0,00654612039368277 0,00161117074152538 0,0016156551713532 290276 287323 667 665 0 True 572 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 617 540 0,00668823290346129 0,0065301729948584 0,0068207827878233 0,00651560234988937 0,00159065557702615 0,00164988463466188 292355 284590 667 665 0 True 616 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 660 540 0,00660251243112708 0,00645555293589891 0,00665293354695964 0,00646982528419928 0,00184156722991834 0,00183180816886257 288608 281338 667 665 0 True 660 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 264 585 0,00687070060758131 0,00691922068848018 0,00688181887541009 0,00685130083161669 0,00131406517935161 0,00131957753361577 300331 301545 667 665 0 True 262 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 308 585 0,00687577932251544 0,00694638863122558 0,00688181887541009 0,00698863202868696 0,00141540726036062 0,00137228135612354 300553 302729 667 665 0 True 306 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 352 584 0,0066054864533858 0,00680919510954085 0,00653086137178607 0,00683604180972 0,00131468919398362 0,00133942859258233 288738 296750 667 665 0 True 350 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 396 584 0,00685075178135354 0,0066943738380054 0,00683604180972 0,00674448767833982 0,00150315304809492 0,00129781625028048 299459 291746 667 665 0 True 395 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 440 584 0,00663977921773835 0,0065842794213733 0,00657663843747616 0,00653086137178607 0,00184388444291711 0,00192788078059035 290237 286948 667 665 0 True 439 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 484 585 0,00635191674018793 0,00662884035449117 0,00636301213092241 0,00656137941557946 0,00183089238885139 0,00189213204830713 277654 288890 667 665 0 True 483 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 528 584 0,00653088424888037 0,00642533318877418 0,00660715648126955 0,00648508430609598 0,00186978440270035 0,00190762758174247 285477 280021 667 665 0 True 527 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 573 584 0,00658437089534885 0,00655584945426051 0,00660715648126955 0,00660715648126955 0,00163561492216502 0,00181652637198718 287815 285709 667 665 0 True 572 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 617 584 0,00656240888482287 0,00646796666649457 0,00659189745937285 0,00650034332799268 0,00143801975217462 0,00140943348456516 286855 281879 667 665 0 True 616 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 660 584 0,00644745148597594 0,00640261675016105 0,00650034332799268 0,0063935301747158 0,00148805227029293 0,00154348984523889 281830 279031 667 665 0 True 660 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 262 622 0,00712095314210599 0,00706910329153164 0,00712596322575723 0,00711070420386053 0,00137901066308801 0,00140537678701723 311270 308077 667 665 0 False 262 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 306 622 0,00672458460630065 0,00688613270415682 0,00674448767833982 0,00689707789730678 0,00137535023288976 0,00129588281801033 293944 300103 667 665 0 False 306 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 351 628 0,00656282067252023 0,00664627923665882 0,00656137941557946 0,00659189745937285 0,00128599169485693 0,00136294072167663 286873 289650 667 665 0 True 350 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 396 628 0,00651827896992223 0,00665692613314013 0,00645456626230259 0,00669871061264973 0,00127995997441046 0,00125400989093568 284926 290114 667 665 0 True 395 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 439 623 0,00646792648537256 0,00626042102280191 0,00650034332799268 0,00625619897764553 0,00166766162589352 0,00175671671531171 282725 272834 667 665 0 False 439 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 483 623 0,00633469028818161 0,00636923046916903 0,00627145799954223 0,0064087891966125 0,00190871339998354 0,0017640108309915 276901 277576 667 665 0 False 483 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 527 623 0,00650032045089838 0,00634098406923695 0,00653086137178607 0,0063935301747158 0,00179990926831059 0,00186157905466906 284141 276345 667 665 0 False 527 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 572 623 0,00655646084030541 0,00645165213330878 0,00643930724040589 0,00648508430609598 0,001584172324493 0,00162787621020404 286595 281168 667 665 0 False 572 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 616 623 0,00660804868794717 0,00660394405560709 0,00666819256885634 0,00656137941557946 0,00135796397194135 0,00133128213127448 288850 287805 667 665 0 False 616 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 660 623 0,00675281494066425 0,00672461653102773 0,00671396963454643 0,00675974670023652 0,00141000832282772 0,00140849850690375 295178 293064 667 665 0 False 660 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 263 672 0,00859892781922154 0,692685983670552 0,00814831769283589 0,700343327992676 0,00230208695398647 0,224166538166534 375875 30187792 667 665 11 True 262 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 306 666 0,00723371433990032 0,0069848000637896 0,00697337300679027 0,00694285496299687 0,00204047078385222 0,0013157594442714 316199 304403 667 665 0 False 306 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 350 666 0,00644587296646939 0,00641939020129862 0,00643930724040589 0,00633249408712902 0,00128152652942711 0,00117479031729903 281761 279762 667 665 0 False 350 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 394 666 0,00634658637721652 0,00639348428292062 0,00630197604333562 0,0063935301747158 0,0013434201843678 0,00121410832486302 277421 278633 667 665 0 False 394 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 439 666 0,00626329087687788 0,00629848826690209 0,00627145799954223 0,00625619897764553 0,00158226997436359 0,00149013075698199 273780 274493 667 665 0 False 439 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 483 666 0,00635365539935457 0,0063086991913292 0,00630197604333562 0,00634775310902571 0,00165594430402389 0,0015255926070647 277730 274938 667 665 0 False 483 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 527 666 0,00621227495659357 0,00626881922131949 0,00614938582436866 0,00627145799954223 0,00169170260521591 0,00161147338155007 271550 273200 667 665 0 False 527 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 572 666 0,00643109436355295 0,00646922869086197 0,00646982528419928 0,00643930724040589 0,00142813317050954 0,00141900020874269 281115 281934 667 665 0 False 572 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 616 666 0,00689895381903921 0,00682468359041343 0,00694285496299687 0,00683604180972 0,00131469382851109 0,0013367325082525 301566 297425 667 665 0 False 616 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 661 671 0,00826039257780128 0,712531959332986 0,00828564888990616 0,707042038605325 0,00165224395811205 0,200507555203973 361077 31052695 667 665 12 True 660 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D5_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D5_3.csv new file mode 100755 index 0000000..7215eaf --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D5_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 262 274 0,00114094932391895 0,0703579273200167 0,000976577401388571 0,0694285496299687 0,000836413473965204 0,0221699855191936 49873 3066253 667 665 0 True 262 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 306 275 0,000964178016279112 0,000963658861045954 0,000885023270008392 0,000839246204318303 0,000654091392879523 0,000666356110022443 42146 41997 667 665 0 False 306 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 351 275 0,00106401365579513 0,00109036610753251 0,000946059357595178 0,000976577401388571 0,000723186052366553 0,000772397047359522 46510 47519 667 665 0 True 351 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 395 275 0,0009990884621777 0,000917170472530606 0,000869764248111696 0,000762951094834821 0,000723959146380576 0,000681165882125823 43672 39971 667 665 0 True 395 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 439 275 0,000930114022869545 0,0010101472495613 0,000671396963454643 0,000747692072938125 0,000844703914159313 0,000896179902517443 40657 44023 667 665 0 True 439 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 483 276 0,000972825557923716 0,000904986200910837 0,000762951094834821 0,000625619897764553 0,000886092655872782 0,000853159743132194 42524 39440 667 665 0 True 484 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 527 276 0,000921763883450813 0,000985457463755521 0,000747692072938125 0,000793469138628214 0,00078300983998373 0,000850728792810804 40292 42947 667 665 0 True 528 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 572 276 0,000951298212189396 0,000947023085293917 0,000625619897764553 0,000686655985351339 0,000889333071717106 0,000883983238904548 41583 41272 667 665 0 True 572 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 616 276 0,00107089966117879 0,00106852161302776 0,000762951094834821 0,000762951094834821 0,00102046485679554 0,001008755666596 46811 46567 667 665 0 False 616 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 660 275 0,00099702952369089 0,0730641205898702 0,000671396963454643 0,0693369954985885 0,000906481337245204 0,0203625120187812 43582 3184191 667 665 0 True 661 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 262 319 0,00101279184166214 0,000962259161293024 0,000869764248111696 0,000793469138628214 0,000789145476239153 0,000738009301890051 44271 41936 667 665 0 False 262 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 306 319 0,00103569181305433 0,000943902443221811 0,000961318379491875 0,000854505226215 0,000700978266726395 0,000615071478567687 45272 41136 667 665 0 False 306 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 351 320 0,000895729750139808 0,000993144339447841 0,000793469138628214 0,000900282291905089 0,000630815038305227 0,000675191119624894 39154 43282 667 665 0 True 351 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 395 320 0,00100368675813158 0,0010302019640541 0,000869764248111696 0,000946059357595178 0,000726880445130189 0,000678272673674378 43873 44897 667 665 0 True 395 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 440 320 0,000983646423526621 0,000959528599479931 0,000717174029144732 0,000625619897764553 0,000878276390857428 0,000933353205558791 42997 41817 667 665 0 True 439 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 484 320 0,000991996562945353 0,00104988954418548 0,000778210116731518 0,000854505226215 0,000860912309914176 0,000844807301205535 43362 45755 667 665 0 True 483 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 528 319 0,000922267179525367 0,00096306226770864 0,000762951094834821 0,000823987182421607 0,000782536531998596 0,000846055273700459 40314 41971 667 665 0 True 528 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 572 320 0,00107105980083888 0,00106450608094968 0,000839246204318303 0,000839246204318303 0,000984041737610393 0,000904884880723381 46818 46392 667 665 0 True 572 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 616 319 0,00103093337744037 0,00106152311426311 0,000656137941557946 0,000701915007248035 0,00108025591262792 0,00110733014682244 45064 46262 667 665 0 False 616 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 661 319 0,00101443899245159 0,000900695318061691 0,000656137941557946 0,000534065766384375 0,00104233737189219 0,000922366659374814 44343 39253 667 665 0 False 661 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 263 365 0,00100366388103728 0,00104458904184242 0,000869764248111696 0,000900282291905089 0,000801765406486071 0,000845591586134971 43872 45524 667 665 0 True 262 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 307 364 0,00104932656125588 0,00103371268638522 0,000915541313801785 0,000946059357595178 0,000728460005534302 0,000706545911444957 45868 45050 667 665 0 True 306 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 351 364 0,00103088762325178 0,000986535920942204 0,000930800335698482 0,000885023270008392 0,000743990221620786 0,00075343778888134 45062 42994 667 665 0 True 351 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 395 364 0,00101578874101516 0,000971093331864796 0,000839246204318303 0,000839246204318303 0,000749970825963071 0,000736659419625642 44402 42321 667 665 0 True 395 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 440 363 0,00096799849102686 0,000957279901516208 0,000717174029144732 0,000625619897764553 0,000875491788283284 0,000910699819889799 42313 41719 667 665 0 True 439 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 484 365 0,000993575082451908 0,000978550748581226 0,000732433051041428 0,000717174029144732 0,000911817995657366 0,000904200988391501 43431 42646 667 665 0 True 483 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 528 364 0,00104507142171647 0,00106521740377494 0,000778210116731518 0,000823987182421607 0,000890296246179802 0,000916309821448524 45682 46423 667 665 0 True 528 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 572 364 0,00102384147820802 0,000968569283130004 0,000717174029144732 0,000686655985351339 0,000976996367279569 0,000938255514499806 44754 42211 667 665 0 True 572 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 617 364 0,000965367625182602 0,00104029815899327 0,000549324788281071 0,000701915007248035 0,00104789859272358 0,00107099599709965 42198 45337 667 665 0 True 616 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 660 363 0,000972070613811886 0,000970496738527481 0,000579842832074464 0,000549324788281071 0,00100066775495809 0,00103820205278959 42491 42295 667 665 0 True 660 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 264 409 0,00102903457861365 0,00104302872080636 0,000900282291905089 0,000900282291905089 0,000809802490794536 0,000837869415586956 44981 45456 667 665 0 True 262 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 307 408 0,00100428156258332 0,000915334800723484 0,000915541313801785 0,000732433051041428 0,000712504878834148 0,000721352625845377 43899 39891 667 665 0 True 306 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 352 408 0,00104468251111341 0,00108013223720781 0,000961318379491875 0,000991836423285267 0,000746807478370905 0,00071587486602587 45665 47073 667 665 0 True 351 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 396 408 0,00104051887995119 0,00107272071228655 0,000885023270008392 0,000946059357595178 0,000787350743544356 0,000821040557692468 45483 46750 667 665 0 True 395 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 440 408 0,000950703407737651 0,00108084356003307 0,00064087891966125 0,000885023270008392 0,00086072015026916 0,000883301537591779 41557 47104 667 665 0 True 439 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 484 408 0,000995451004184335 0,00112049407106689 0,000778210116731518 0,000900282291905089 0,000860663643483864 0,000900237203417746 43513 48832 667 665 0 True 483 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 528 408 0,000936679748933041 0,000981005959623251 0,000701915007248035 0,000732433051041428 0,000849491458673906 0,000909808880535603 40944 42753 667 665 0 True 528 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 572 408 0,00104351577930421 0,00103807240692714 0,00080872816052491 0,000717174029144732 0,000995122676905566 0,000994241132689013 45614 45240 667 665 0 True 572 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 617 408 0,000964223770467707 0,000974076298551368 0,000625619897764553 0,000579842832074464 0,000963333051025533 0,00103298854799865 42148 42451 667 665 0 True 616 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 661 408 0,000954386619919612 0,000962442728473736 0,000579842832074464 0,000564583810177768 0,000981397818019196 0,000999140984923279 41718 41944 667 665 0 True 660 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 264 453 0,00106399077870083 0,00101278602778404 0,000930800335698482 0,000854505226215 0,000815822799345805 0,000814137964828864 46509 44138 667 665 0 True 262 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 308 452 0,00108158326421591 0,0010187290152596 0,000946059357595178 0,000869764248111696 0,000829833073335221 0,000820367475400321 47278 44397 667 665 0 True 306 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 352 452 0,0011338803017809 0,0011210906644042 0,00103761348897536 0,00106813153276875 0,000800620403399261 0,000777100876960715 49564 48858 667 665 0 True 350 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 396 452 0,0010382540476157 0,000954021584058567 0,000839246204318303 0,000778210116731518 0,000868033061968399 0,000798457414957008 45384 41577 667 665 0 True 395 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 441 452 0,00102484807035713 0,00102279043913285 0,000762951094834821 0,00064087891966125 0,000976827085001609 0,00107979686711414 44798 44574 667 665 0 True 439 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 484 452 0,000999248601837786 0,00105489174985989 0,000717174029144732 0,000686655985351339 0,000964002439519281 0,0010698842029497 43679 45973 667 665 0 True 483 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 529 452 0,000965115977145325 0,00106108714220892 0,00064087891966125 0,000778210116731518 0,000940070343959826 0,000980115643852005 42187 46243 667 665 0 True 528 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 573 452 0,00095582787686038 0,000952162966353857 0,000625619897764553 0,000473029678797589 0,00096050910537583 0,00105922409805724 41781 41496 667 665 0 True 572 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 617 452 0,000948690223439436 0,000834221052746309 0,000625619897764553 0,000473029678797589 0,00092711209885166 0,000915530008708058 41469 36356 667 665 0 True 616 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 660 451 0,000897354023834958 0,000962603349756859 0,000549324788281071 0,000549324788281071 0,000926842516507599 0,00104585633536079 39225 41951 667 665 0 True 660 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 263 497 0,00108476318032332 0,00102361649144606 0,000976577401388571 0,000885023270008392 0,00080861454461298 0,00077924097604367 47417 44610 667 665 0 True 262 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 307 497 0,000999751897912339 0,000983736521436344 0,000854505226215 0,000823987182421607 0,000816743661279104 0,000789038717667831 43701 42872 667 665 0 True 306 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 351 496 0,00100242851794519 0,00108155488285832 0,000885023270008392 0,000915541313801785 0,000789568157152717 0,000889788405912206 43818 47135 667 665 0 True 350 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 395 496 0,000997235417539571 0,000888511046441923 0,000854505226215 0,000671396963454643 0,000830404740483891 0,000837955288481801 43591 38722 667 665 0 True 395 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 439 495 0,000959099301344979 0,00100886227929632 0,000610360875867857 0,000671396963454643 0,000974655423690039 0,00105351032740138 41924 43967 667 665 0 True 439 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 485 497 0,000988908155215137 0,000972194734949069 0,000686655985351339 0,000656137941557946 0,000917697122059198 0,000946630268264759 43227 42369 667 665 0 True 483 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 529 496 0,000872509499427444 0,000961960864624367 0,000534065766384375 0,000686655985351339 0,00088714443453433 0,000834621717650565 38139 41923 667 665 0 True 527 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 572 496 0,000915701453461871 0,000951038617371995 0,000534065766384375 0,00064087891966125 0,000962866951225953 0,00093955369793461 40027 41447 667 665 0 True 572 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 617 495 0,000836935617794216 0,000848608130534622 0,000503547722590982 0,000564583810177768 0,000885220406430133 0,000871708587054171 36584 36983 667 665 0 True 616 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 660 496 0,00092864988883448 0,000926004643102377 0,000564583810177768 0,000518806744487678 0,000942891619305777 0,000985955839455861 40593 40356 667 665 0 True 660 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 263 541 0,000931715419470398 0,000936146729836723 0,000747692072938125 0,000778210116731518 0,000755898340454561 0,000771670131994326 40727 40798 667 665 0 True 262 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 307 540 0,00113511566487299 0,00103843954128856 0,00106813153276875 0,000930800335698482 0,000789567945705078 0,000777168992818596 49618 45256 667 665 0 True 306 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 351 540 0,00106378488485215 0,0010187290152596 0,000961318379491875 0,000885023270008392 0,000786467747589958 0,000772987803191431 46500 44397 667 665 0 True 350 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 395 540 0,000972230753471971 0,000867171361684137 0,000823987182421607 0,000701915007248035 0,000822711830514906 0,000735159922694589 42498 37792 667 665 0 True 395 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 440 540 0,000933499832825633 0,000969785415702222 0,000534065766384375 0,000518806744487678 0,000944019829289497 0,00106642139039568 40805 42264 667 665 0 True 439 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 483 541 0,00085754787975662 0,000908542815037135 0,000488288700694286 0,000518806744487678 0,000917796977063391 0,0010156125332602 37485 39595 667 665 0 True 483 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 528 540 0,0009066878783085 0,000908359247856423 0,000579842832074464 0,000473029678797589 0,000961880239917541 0,00097845137282997 39633 39587 667 665 0 True 527 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 573 541 0,000872601007804635 0,00091799652484381 0,000595101853971161 0,000671396963454643 0,000838327278971212 0,000858084212529896 38143 40007 667 665 0 True 572 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 617 540 0,000867682432530587 0,000937752942667954 0,000564583810177768 0,000595101853971161 0,000884880983694142 0,000888100373920416 37928 40868 667 665 0 True 616 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 660 540 0,000910576984339142 0,000926279993873445 0,000595101853971161 0,000518806744487678 0,000924960621829919 0,00101460321318059 39803 40368 667 665 0 True 660 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 264 585 0,00102919471827373 0,000973732110087533 0,000976577401388571 0,000885023270008392 0,000697620112223367 0,00065779272961704 44988 42436 667 665 0 True 262 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 308 585 0,000963125669941408 0,00103401098305388 0,000839246204318303 0,000946059357595178 0,000726978391619108 0,000773097292369048 42100 45063 667 665 0 True 306 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 352 584 0,00104978410314184 0,00104291399131842 0,000946059357595178 0,000915541313801785 0,000734687188444485 0,000759410763142574 45888 45451 667 665 0 True 350 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 396 584 0,000928947291060352 0,000908978787091326 0,000747692072938125 0,000747692072938125 0,000744733712676782 0,000673467505851452 40606 39614 667 665 0 True 395 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 440 584 0,000934094637277379 0,000921186004608684 0,000610360875867857 0,000488288700694286 0,000901245311883059 0,00101027694422071 40831 40146 667 665 0 True 439 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 484 585 0,000949879832342927 0,00098034052859317 0,000549324788281071 0,000549324788281071 0,0010365503684851 0,00106178412139592 41521 42724 667 665 0 True 483 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 528 584 0,000969393993779032 0,000892733091598302 0,000595101853971161 0,000411993591210803 0,00105108644665022 0,00105019428321298 42374 38906 667 665 0 True 527 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 573 584 0,000948507206685053 0,000929469473638319 0,000747692072938125 0,000534065766384375 0,000829840685641663 0,000970938108931521 41461 40507 667 665 0 True 572 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 617 584 0,000824673495250544 0,000916206744831867 0,000625619897764553 0,000656137941557946 0,000734870802534255 0,000799870755413365 36048 39929 667 665 0 True 616 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 660 584 0,000838056595414813 0,000924237808988023 0,000579842832074464 0,000656137941557946 0,000807957082193867 0,00082865851574507 36633 40279 667 665 0 True 660 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 262 622 0,000990784076947564 0,000973938623165834 0,000854505226215 0,000839246204318303 0,00070302387622974 0,000683758206596418 43309 42445 667 665 0 False 262 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 306 622 0,00100572281952409 0,000972997841364684 0,000869764248111696 0,000869764248111696 0,000720613312515247 0,000703814304472194 43962 42404 667 665 0 False 306 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 351 628 0,00100224550119081 0,00102005987731976 0,000900282291905089 0,000900282291905089 0,000722573534394264 0,000714426478056632 43810 44455 667 665 0 True 350 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 396 628 0,000892595588220996 0,000929171176969661 0,000732433051041428 0,000793469138628214 0,000707730725328221 0,0006967746153723 39017 40494 667 665 0 True 395 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 439 623 0,000905361006839222 0,000927174883879417 0,000625619897764553 0,000595101853971161 0,000857586874291638 0,000932666760824228 39575 40407 667 665 0 False 439 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 483 623 0,000943588631411005 0,00093690394445716 0,000564583810177768 0,000534065766384375 0,000983359165960275 0,00101412220576487 41246 40831 667 665 0 False 483 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 527 623 0,000826915450491737 0,000898331890610022 0,000457770656900893 0,000457770656900893 0,00090750928559869 0,00100049392221002 36146 39150 667 665 0 False 527 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 572 623 0,000921352095753451 0,000849503020540594 0,000717174029144732 0,000564583810177768 0,000792191232114916 0,000849787172542621 40274 37022 667 665 0 False 572 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 616 623 0,000916227626630722 0,000829172955276725 0,000747692072938125 0,00064087891966125 0,000715560510777397 0,00068861943609404 40050 36136 667 665 0 False 616 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 660 623 0,000867911203473566 0,000911020971976749 0,000671396963454643 0,000671396963454643 0,000750661171930733 0,000773545235868306 37938 39703 667 665 0 False 660 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 263 672 0,00107600125320723 0,0700338853542646 0,000946059357595178 0,0691081101701381 0,000749178909422494 0,0248133836212162 47034 3052131 667 665 0 True 262 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 306 666 0,000953402904864803 0,00105119746034805 0,000839246204318303 0,000900282291905089 0,00069154483262891 0,000725952517518639 41675 45812 667 665 0 False 306 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 350 666 0,000930365670906822 0,000960239922305191 0,00080872816052491 0,000854505226215 0,00068118421401966 0,000657505446922342 40668 41848 667 665 0 False 350 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 394 666 0,00089527220825385 0,000933530897511575 0,000732433051041428 0,000839246204318303 0,000735795674849351 0,000644021822940759 39134 40684 667 665 0 False 394 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 439 666 0,000846246595173459 0,000964117778997735 0,000625619897764553 0,000793469138628214 0,000770717599357414 0,000813615721485256 36991 42017 667 665 0 False 439 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 483 666 0,000925515726915668 0,000934448733415136 0,000656137941557946 0,000717174029144732 0,00082414285873422 0,000828540618691375 40456 40724 667 665 0 False 483 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 527 666 0,00084949514256376 0,000882568058966368 0,000488288700694286 0,000534065766384375 0,000895676887733076 0,000864422541570318 37133 38463 667 665 0 False 527 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 572 666 0,000997967484557103 0,000954916474064539 0,00080872816052491 0,000762951094834821 0,000810367028876533 0,000788466151663037 43623 41616 667 665 0 False 572 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 616 666 0,000946242374349561 0,000880388198695411 0,000823987182421607 0,000732433051041428 0,000686016375376989 0,00071596117717679 41362 38368 667 665 0 False 616 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 661 671 0,00101908304259406 0,0715254145893459 0,000885023270008392 0,0695811398489357 0,000750997589275944 0,0222679692210189 44546 3117133 667 665 0 True 660 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D6_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D6_1.csv new file mode 100755 index 0000000..636f318 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D6_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 274 259 0,0109937211451712 0,0471388588202023 0,0108491645685512 0,0475318532082094 0,00251734686915845 0,00953572160488536 448855 2054348 623 665 0 True 274 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 319 259 0,0109664361525662 0,0112159776874092 0,0109254596780346 0,0112153810940719 0,00139547845974777 0,00132454514079759 447741 488801 623 665 0 False 319 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 363 259 0,0111535612365 0,068943748705708 0,0112153810940719 0,0679942015716793 0,00132985032196054 0,0118121701700721 455381 3004622 623 665 0 True 363 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 407 257 0,0113704205942422 0,11734488429818 0,0113832303349355 0,116334782940414 0,0014570670805825 0,0384511341655154 464235 5113981 623 665 0 True 407 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 451 258 0,0113045349298728 0,0788800107386801 0,0113527122911421 0,0752422369726101 0,00162016196769283 0,014899116410421 461545 3437652 623 665 0 True 451 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 495 258 0,0125414954159865 0,0730930783126275 0,011261158159762 0,0756237125200275 0,00632080682909506 0,0215715512662839 512048 3185453 623 665 0 True 496 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 539 258 0,0113397800863886 0,0891721177514627 0,0113984893568322 0,0837720302128633 0,0017516523544446 0,0289689154033274 462984 3886190 623 665 0 True 540 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 583 258 0,011220671541471 0,0765570139585632 0,0111848630502785 0,0740062561989776 0,00178467932691444 0,0200790779789913 458121 3336414 623 665 0 True 584 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 628 260 0,01084095947652 0,010834433302299 0,0108339055466545 0,0109102006561379 0,00198463488533724 0,0018344239631175 442618 472173 623 665 0 False 628 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 672 258 0,0105669828811164 0,0472066868934754 0,0105287251087205 0,0469825284199283 0,00175718454909189 0,0087902187646432 431432 2057304 623 665 0 True 672 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 274 303 0,0118815121029394 0,0110459944780697 0,011108567940795 0,010955977721828 0,00582834224567621 0,00209734922817131 485102 481393 623 665 0 False 274 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 319 303 0,0108736573805844 0,0110889033065612 0,0108491645685512 0,011108567940795 0,00133503972262951 0,00130046113275504 443953 483263 623 665 0 False 319 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 363 303 0,0114220024563841 0,138771648737316 0,0114290074006256 0,135820553902495 0,00133392505817301 0,0516844103347028 466341 6047776 623 665 0 True 363 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 407 302 0,0112951541828641 0,0561428978718254 0,0113679713130388 0,0556343938353552 0,00149364710072892 0,00977941299356879 461162 2446751 623 665 0 True 407 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 451 302 0,0110602191298414 0,0889442190966085 0,0110933089188983 0,0889906157015335 0,00176208316925817 0,0212831072566219 451570 3876258 623 665 0 True 451 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 496 303 0,0111122418626 0,047011853277047 0,0111238269626917 0,048050659952697 0,00171975698807913 0,00963672132569533 453694 2048813 623 665 0 True 495 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 539 302 0,0111654402503361 0,0491859541277088 0,0111390859845884 0,0510566872663462 0,00159682232942428 0,0120145153785393 455866 2143562 623 665 0 True 540 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 585 303 0,0111351916274751 0,059150187209842 0,011108567940795 0,0581521324483101 0,0020325707532525 0,0146928532992615 454631 2577811 623 665 0 True 584 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 628 303 0,0110426087979895 0,0110780498970016 0,0111238269626917 0,0110170138094148 0,00199171244329011 0,00196544507271248 450851 482790 623 665 0 False 628 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 672 303 0,0108588147364922 0,010890880210368 0,0108796826123445 0,0108796826123445 0,00197643679617532 0,00185948410926685 443347 474633 623 665 0 False 672 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 275 347 0,0109091719580325 0,0541100749126192 0,0108949416342412 0,0540474555580987 0,00156146492135683 0,0116364342109018 445403 2358159 623 665 0 True 274 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 320 347 0,0110979380603726 0,0711990321420397 0,0111390859845884 0,0706950484473945 0,00133219509241928 0,0244420095703966 453110 3102909 623 665 0 True 318 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 364 347 0,0112735515226508 0,0421878683892152 0,0112306401159686 0,0429694056610971 0,00160400525138786 0,00764236554868417 460280 1838580 623 665 0 True 363 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 408 347 0,0110966154485228 0,0386355221998691 0,0111238269626917 0,0388342107270924 0,0015122917905784 0,00595168798407627 453056 1683766 623 665 0 True 407 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 453 346 0,0112049226633337 0,0782424589741692 0,0111696040283818 0,0740520332646677 0,00173887720249792 0,0151019773004613 457478 3409867 623 665 0 True 451 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 496 347 0,0112467808790985 0,0347024347318284 0,0112153810940719 0,0355840390630961 0,00178088582904676 0,00499178319239916 459187 1512359 623 665 0 True 495 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 539 346 0,0114611909556373 0,0342558846188486 0,0113527122911421 0,0332341496910048 0,00211782937088067 0,00645346256529715 467941 1492898 623 665 0 True 540 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 585 346 0,0111648524228473 0,0556681931425038 0,0112001220721752 0,0542763408865492 0,00198836065675534 0,0112654904360964 455842 2426063 623 665 0 True 584 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 630 346 0,0110742780039485 0,0588462229044802 0,0110780498970016 0,0591744869153887 0,00209413393835912 0,0126976493293594 452144 2564564 623 665 0 True 628 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 673 345 0,0109233532961998 0,0676529042909402 0,011108567940795 0,0669871061264973 0,00196005019042132 0,0199252473446744 445982 2948366 623 665 0 True 672 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 276 391 0,0107344892226116 0,0446857129089604 0,0108339055466545 0,0476691844052796 0,00155357690295523 0,0101469942363942 438271 1947438 623 665 0 True 274 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 321 391 0,0106502584420294 0,0329651090417736 0,0106355382619974 0,0330205233844511 0,00143312018529602 0,00317485804242132 434832 1436645 623 665 0 True 318 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 365 391 0,0111704367839909 0,0927089525140386 0,0111848630502785 0,08715953307393 0,00138764064639551 0,0217548037619895 456070 4040328 623 665 0 True 363 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 408 390 0,0114135279434206 0,0697956610454954 0,011459525444419 0,0687876707103075 0,00155192204822271 0,0176068338735539 465995 3041749 623 665 0 True 407 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 453 390 0,0111977217765959 0,0466206945608471 0,0112001220721752 0,0480201419089036 0,00166970908181675 0,00898643314922013 457184 2031766 623 665 0 True 451 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 497 391 0,0112142054390943 0,0573900532975836 0,0112153810940719 0,0588540474555581 0,00175396791455207 0,0110190852896186 457857 2501103 623 665 0 True 495 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 541 391 0,0108867855278342 0,0438695043858215 0,0109407186999313 0,0448462653543908 0,00170545584562654 0,00661225456881956 444489 1911867 623 665 0 True 540 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 586 391 0,0110857651327921 0,0542693653336821 0,011108567940795 0,0544899671931029 0,00194832640375908 0,0100916707956165 452613 2365101 623 665 0 True 584 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 630 391 0,0110292357226194 0,0455437747493017 0,0109712367437247 0,0449835965514611 0,00248508339085797 0,0107680558970984 450305 1984833 623 665 0 True 628 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 674 389 0,010956712506189 0,0884402812937585 0,0109102006561379 0,0829480430304417 0,00181377797826516 0,0189042553768242 447344 3854296 623 665 0 True 672 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 277 435 0,0106508707623302 0,0470089162021557 0,0106355382619974 0,0469214923323415 0,00154967766764635 0,0074836093532676 434857 2048685 623 665 0 True 274 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 320 434 0,0109181608200487 0,0594318251568496 0,0108491645685512 0,0590066376745251 0,00150985702320103 0,00836018849204253 445770 2590085 623 665 0 True 318 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 365 435 0,0111401636683178 0,0380949168526718 0,0110780498970016 0,0376897840848402 0,00158775067633907 0,00508513065462523 454834 1660206 623 665 0 True 363 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 409 434 0,0114967300258975 0,0553177404486267 0,0114290074006256 0,0555275806820783 0,0018756303061422 0,00946911539824012 469392 2410790 623 665 0 True 407 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 453 434 0,0111735228783071 0,109349569850467 0,0110933089188983 0,111665522240024 0,00173833297674187 0,0171409987890085 456196 4765539 623 665 0 True 451 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 498 435 0,0113465890881338 0,0645964877861855 0,0113679713130388 0,0639505607690547 0,00187221571412784 0,0156529110863119 463262 2815165 623 665 0 True 495 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 541 434 0,0110810870056937 0,0558194754453082 0,0111390859845884 0,0541237506675822 0,00171670827730749 0,0102974324892222 452422 2432656 623 665 0 True 539 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 586 435 0,0109374611559309 0,032594532795711 0,0108033875028611 0,0331578545815213 0,00186271201287362 0,00506234003977882 446558 1420495 623 665 0 True 584 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 630 434 0,0112606193178972 0,0438651446652796 0,0108186465247578 0,0430304417486839 0,00338951526482109 0,00784714049430721 459752 1911677 623 665 0 True 628 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 674 434 0,0108450987617536 0,0733168925977108 0,0109864957656214 0,0738689250019074 0,00195153739402995 0,012433704079247 442787 3195207 623 665 0 True 672 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 276 479 0,0105628680886948 0,0613172666158415 0,0105897611963073 0,0623025864042115 0,00161163838554155 0,0174730208314426 431264 2672254 623 665 0 True 274 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 320 479 0,010778306863339 0,0592821031750812 0,0107423514152743 0,0587014572365911 0,00160191244487369 0,00991986977822119 440060 2583560 623 665 0 True 318 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 364 478 0,0113502385171268 0,0723008023606739 0,0111238269626917 0,0699473563744564 0,00186106984712017 0,0204361396143805 463411 3150925 623 665 0 True 362 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 408 478 0,0114034369048629 0,0925052847270385 0,0113221942473487 0,0881666285191119 0,00182048807532896 0,0259534861691402 465583 4031452 623 665 0 True 407 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 452 478 0,0113420334250957 0,0977844244394461 0,0113984893568322 0,0951247425040055 0,00190104512738317 0,0345499446116952 463076 4261521 623 665 0 True 451 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 496 478 0,0113030408683388 0,0507337237577808 0,0114747844663157 0,0503089951934081 0,00197038227332349 0,0111430424717838 461484 2211015 623 665 0 True 495 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 541 479 0,0112386982511275 0,0413318028419641 0,011306935225452 0,0431219958800641 0,00184677986281003 0,00677787223601031 458857 1801272 623 665 0 True 539 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 584 478 0,010961880489528 0,106078173231201 0,010955977721828 0,104783703364614 0,00181807788860237 0,0251673315135311 447555 4622969 623 665 0 True 584 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 628 478 0,0108577370527628 0,0635846884319978 0,0109102006561379 0,0667734798199435 0,00188525354434804 0,017277672985548 443303 2771070 623 665 0 True 628 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 673 478 0,0109568104774372 0,0895452639380553 0,0108491645685512 0,0834821087968261 0,00204441208755283 0,0189764635269645 447348 3902452 623 665 0 True 672 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 277 523 0,0105868955372994 0,0572252099693041 0,0105439841306172 0,0601205462729839 0,00166219605414246 0,0143295718726209 432245 2493919 623 665 0 True 274 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 320 522 0,0108135275270428 0,103684204789841 0,0108186465247578 0,0959945067521172 0,0013578079829106 0,0347757366824965 441498 4518638 623 665 0 True 318 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 364 522 0,0109857609812604 0,0577712993860251 0,010955977721828 0,061020828564889 0,00159769731330798 0,0145130941597672 448530 2517718 623 665 0 True 362 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 408 522 0,0113124950937836 0,0587747005416953 0,011306935225452 0,0587930113679713 0,0016703692262537 0,0112810728001905 461870 2561447 623 665 0 True 407 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 453 522 0,0113097518988359 0,0599125417113395 0,011261158159762 0,0592813000686656 0,00186304195432233 0,0106981394290459 461758 2611035 623 665 0 True 451 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 496 523 0,0111661750346971 0,0629754748510094 0,0112001220721752 0,0631570916304265 0,00198699134691706 0,0163586530513974 455896 2744520 623 665 0 True 495 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 541 522 0,0109410860921118 0,0736600714420521 0,0108796826123445 0,074540321965362 0,00214192168918613 0,0177967828336279 446706 3210163 623 665 0 True 539 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 585 522 0,0108529119687922 0,0575320425118645 0,0108796826123445 0,0576180666819257 0,00186610385217679 0,0137734673676366 443106 2507291 623 665 0 True 584 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 629 522 0,0105912797506534 0,0437527556588886 0,0105897611963073 0,0433813992523079 0,00191379374528869 0,00620881519663545 432424 1906779 623 665 0 True 628 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 673 522 0,0105943168593455 0,0703415439491381 0,0105592431525139 0,0691081101701381 0,00201738860406936 0,0194860927183383 432548 3065539 623 665 0 True 672 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 276 567 0,0103001581868265 0,0439543124233105 0,0101777676050965 0,0456092164492256 0,0015959812968293 0,0101655029753334 420538 1915563 623 665 0 True 274 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 320 566 0,0106375466725841 0,0509913373500127 0,0106660563057908 0,0528114747844663 0,00142562596661349 0,0130773814229618 434313 2222242 623 665 0 True 318 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 365 567 0,0107616517511565 0,0528363251915552 0,0106507972838941 0,0513160906385901 0,00152765380423633 0,0125263525741461 439380 2302648 623 665 0 True 362 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 409 566 0,0110734942339634 0,0511623990165388 0,0110627908751049 0,0502937361715114 0,00165306333334231 0,00744683268623669 452112 2229697 623 665 0 True 407 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 453 566 0,0111104293945095 0,0868418241759124 0,0111696040283818 0,0823071641107805 0,00199285549499793 0,0230656738693585 453620 3784634 623 665 0 True 451 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 497 566 0,0111542225424249 0,0641061798465034 0,0110780498970016 0,0628976882581826 0,00220729863443211 0,0143869886094834 455408 2793797 623 665 0 True 495 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 542 567 0,0110244596242729 0,0568835685001013 0,0110780498970016 0,0556649118791486 0,00188152511801079 0,00953802113260859 450110 2479030 623 665 0 True 539 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 585 565 0,0106488133661194 0,0372447484011012 0,0106507972838941 0,0394293125810636 0,00164307401268298 0,00743153054888741 434773 1623155 623 665 0 True 583 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 629 566 0,0104985989499197 0,0520128887106757 0,0105439841306172 0,0511329823758297 0,00168118307963014 0,0107062282065846 428640 2266762 623 665 0 True 628 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 674 566 0,0118865086365941 0,0510864480955192 0,0108033875028611 0,0502327000839246 0,00760653498415631 0,0070212776668345 485306 2226387 623 665 0 True 672 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 274 606 0,0099772204601685 0,0101314857296595 0,00999465934233616 0,0101319905394064 0,00129770467987306 0,00140108320640026 407353 441538 623 665 0 False 274 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 318 606 0,0102831111896514 0,0103310232550936 0,0102082856488899 0,0102998397802701 0,00139797657120936 0,0016059327691806 419842 450234 623 665 0 False 318 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 364 610 0,01039560667532 0,0756248368690093 0,010406652933547 0,0729381246662089 0,00144882226159716 0,0185904349759623 424435 3295789 623 665 0 True 362 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 409 610 0,0107526139035162 0,0795450746344002 0,0106965743495842 0,0780346379797055 0,00153398925199466 0,0215656459066545 439011 3466636 623 665 0 True 406 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 451 606 0,0104865239935873 0,0106565796500865 0,010452429999237 0,0106507972838941 0,00191592487776327 0,00195125802226012 428147 464422 623 665 0 False 451 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 495 606 0,010680188658334 0,0107272759605583 0,0105592431525139 0,0107728694590677 0,00213676341289638 0,00202715634726844 436054 467503 623 665 0 False 495 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 539 606 0,0106312520198916 0,0103634228624893 0,0106202792401007 0,0103761348897536 0,00215942005863046 0,00194419723590287 434056 451646 623 665 0 False 539 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 583 607 0,0102600634535281 0,0104272583495819 0,0103150988021668 0,0103150988021668 0,00170765807285262 0,00219310843579906 418901 454428 623 665 0 False 583 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 628 607 0,0104129230934275 0,0109216047672397 0,0104676890211337 0,0106355382619974 0,00148171779037786 0,00228612994113402 425142 475972 623 665 0 False 628 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 672 607 0,0115939175040453 0,010625006095004 0,0107270923933776 0,0105745021744106 0,00728493392386567 0,00156989483224335 473360 463046 623 665 0 False 672 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 275 655 0,00995892432957969 0,0429583227925616 0,00994888227664607 0,0441596093690394 0,00123518422488116 0,0100280859450324 406606 1872157 623 665 0 True 274 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 318 649 0,0100033053049839 0,00999222707719172 0,00999465934233616 0,00999465934233616 0,00124507646993474 0,00121707322272289 408418 435469 623 665 0 False 318 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 362 650 0,010164100615982 0,010183045161542 0,010101472495613 0,0102082856488899 0,00120453462487867 0,00128033200374493 414983 443785 623 665 0 False 362 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 406 650 0,0102162458128007 0,010394812850391 0,0101930266269932 0,0103608758678569 0,00139388873112554 0,00141899091030185 417112 453014 623 665 0 False 406 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 451 650 0,0102740243563871 0,0101434405423033 0,01025406271458 0,0101472495613031 0,00157572271923198 0,00167420905222497 419471 442059 623 665 0 False 451 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 495 650 0,0102979048481195 0,0101607417490855 0,0102693217364767 0,0101319905394064 0,00168018812267187 0,00166046864322243 420446 442813 623 665 0 False 495 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 539 650 0,010113988322562 0,0102310938710934 0,0100556954299229 0,0102998397802701 0,00173148116682577 0,00175668733101484 412937 445879 623 665 0 False 539 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 583 650 0,0100769306979557 0,0101296959496475 0,0101319905394064 0,0100556954299229 0,00147977958811565 0,001297286240004 411424 441460 623 665 0 False 583 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 628 650 0,0102556547473622 0,0101727883453197 0,01025406271458 0,0101625085831998 0,0012917420851957 0,00132047957176452 418721 443338 623 665 0 False 628 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 673 655 0,0105760697143807 0,0444468002232636 0,0105592431525139 0,0440527962157626 0,00155263333910827 0,00870251172113925 431803 1937026 623 665 0 True 672 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D6_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D6_2.csv new file mode 100755 index 0000000..1753df8 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D6_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 274 259 0,00921995169772539 0,763465840155436 0,00901808194094758 0,791668574044404 0,00231979219397732 0,192534240587585 376435 33272433 623 665 15 True 274 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 319 259 0,00777237752093799 0,00801628699810868 0,00773632410162509 0,00796520943007553 0,00147822950674981 0,00131073904323297 317333 349356 623 665 0 False 319 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 363 259 0,00743594425484967 0,00765018520207592 0,00746166170748455 0,007690547035935 0,00129816079594718 0,00120662939210495 303597 333401 623 665 0 True 363 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 407 257 0,00743119264931522 0,00791335170152435 0,00738536659800107 0,00794995040817884 0,00137766614847629 0,00136938329094702 303403 344870 623 665 0 True 407 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 451 258 0,00798387295284485 0,00843534792577691 0,00781261921110857 0,00787365529869535 0,00226838010803932 0,00391671042366896 325968 367619 623 665 0 True 451 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 495 258 0,0409832884081062 0,00803429952771606 0,00837720302128634 0,00798046845197223 0,12935980204678 0,00156129330242711 1659849 350141 618 665 0 True 496 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 539 258 0,00821390944346086 0,00833888337231268 0,00823987182421607 0,00836194399938964 0,0014532958344421 0,00152085793497528 335360 363415 623 665 0 True 540 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 583 258 0,00832187375890329 0,00885291737010184 0,00827038986800946 0,00878919661249714 0,00162608456835971 0,00198784112703015 339768 385817 623 665 0 True 584 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 628 260 0,00879299299836229 0,00855748893864324 0,00874341954680705 0,0085297932402533 0,00193731224691364 0,0018366488968968 359003 372942 623 665 0 False 628 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 672 258 0,00976915402194629 0,775702634934785 0,0097962920576791 0,785992217898833 0,00192009652062299 0,171082195404926 398858 33805722 623 665 15 True 672 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 274 303 0,0083693653214357 0,00764853309744951 0,00802624551766232 0,007690547035935 0,00304355369947027 0,00156074375425586 341707 333329 623 665 0 False 274 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 319 303 0,00746844621641775 0,00751978366607753 0,00744640268558785 0,00747692072938125 0,00126181984359985 0,00127513239915135 304924 327718 623 665 0 False 319 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 363 303 0,0074072141863347 0,00757012696538783 0,00735484855420768 0,00747692072938125 0,00126819032570686 0,00137800000050561 302424 329912 623 665 0 True 363 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 407 302 0,00753643826262197 0,00746563134776745 0,00755321583886473 0,00750743877317464 0,00142207018695886 0,00145577473809679 307700 325358 623 665 0 True 407 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 451 302 0,00793057659386056 0,00782221059630078 0,00790417334248875 0,00784313725490196 0,00180598207909173 0,0018097157267177 323792 340898 623 665 0 True 451 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 496 303 0,00859761383677329 0,00803482728336061 0,00846875715266651 0,00801098649576562 0,00207987700889067 0,0016059720048325 351026 350164 623 665 0 True 495 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 539 302 0,00796491551633113 0,00807824092159903 0,00793469138628214 0,00802624551766232 0,00153272017902704 0,00152764675134642 325194 352056 623 665 0 True 540 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 585 303 0,00845340015952168 0,00834964499828193 0,00849927519645991 0,00840772106507973 0,00186926799329808 0,00190818278242451 345138 363884 623 665 0 True 584 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 628 303 0,00854211312470601 0,00845324572589634 0,00859082932784009 0,00845349813076982 0,00199632344765441 0,00197328015000737 348760 368399 623 665 0 False 628 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 672 303 0,0087048923534788 0,00859420237478567 0,00875867856870375 0,00857557030594339 0,00191379233283728 0,00191967395501426 355406 374542 623 665 0 False 672 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 275 347 0,00719295106666809 0,00723562167033514 0,00727855344472419 0,0072327763790341 0,00148998400458173 0,00140362334630948 293676 315334 623 665 0 True 274 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 320 347 0,00722496317199551 0,00731955776371577 0,0072480354009308 0,00729381246662089 0,00133177393221527 0,00134037681844737 294983 318992 623 665 0 True 318 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 364 347 0,00757408371471703 0,00711545400466146 0,00752269779507134 0,00712596322575723 0,00144614970596265 0,00123415473940594 309237 310097 623 665 0 True 363 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 408 347 0,00763810792537187 0,0074164353433366 0,007690547035935 0,00733958953231098 0,00136044017200883 0,00142510392158963 311851 323214 623 665 0 True 407 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 453 346 0,00769164921247649 0,00806300484559992 0,00779736018921187 0,00804150453955901 0,00180768680532294 0,00172153407718784 314037 351392 623 665 0 True 451 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 496 347 0,00783809173562312 0,00780034315589844 0,00787365529869535 0,00775158312352178 0,00163593410626268 0,00172393231804993 320016 339945 623 665 0 True 495 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 539 346 0,00814447232134667 0,00816295717549768 0,00816357671473259 0,0080872816052491 0,00169995115602012 0,00166613056218991 332525 355748 623 665 0 True 540 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 585 346 0,00820977015822724 0,00813285215786089 0,00823987182421607 0,00814831769283589 0,00205138735605097 0,00197787750309119 335191 354436 623 665 0 True 584 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 630 346 0,00791769337473108 0,00803960003005913 0,00794995040817884 0,00801098649576562 0,00194890746592781 0,00200947038019799 323266 350372 623 665 0 True 628 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 673 345 0,0074950209174738 0,00754128397211844 0,00747692072938125 0,00750743877317464 0,00190160667087342 0,00192092191596309 306009 328655 623 665 0 True 672 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 276 391 0,00674877392044563 0,00682073689602812 0,00671396963454643 0,00688181887541009 0,00145739098932201 0,00139171819957868 275541 297253 623 665 0 True 274 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 321 391 0,00698517854219028 0,0071542325715869 0,00701915007248035 0,00714122224765393 0,00126329566447585 0,00135135356822376 285193 311787 623 665 0 True 318 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 365 391 0,00728100272592752 0,00732201297475779 0,00727855344472419 0,00729381246662089 0,00139483736838711 0,00142690571102766 297271 319099 623 665 0 True 363 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 408 390 0,00752784128559831 0,00751677775349337 0,00750743877317464 0,00758373388265812 0,00143742111736915 0,00148045377017928 307349 327587 623 665 0 True 407 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 453 390 0,00761030858371417 0,00767303931607458 0,00775158312352178 0,00773632410162509 0,0016712072874176 0,00165117768131634 310716 334397 623 665 0 True 451 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 497 391 0,00770031966793625 0,00774045436319111 0,00764476997024491 0,00770580605783169 0,00169861701775065 0,00172144504696303 314391 337335 623 665 0 True 495 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 541 391 0,00775263631443921 0,00748889848792271 0,007690547035935 0,00750743877317464 0,00160138311824157 0,00151288385903002 316527 326372 623 665 0 True 540 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 586 391 0,00760450378726229 0,00743327763216694 0,00750743877317464 0,00749217975127794 0,00188747595106381 0,00192667772786909 310479 323948 623 665 0 True 584 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 630 391 0,00731134932003668 0,00709744147505408 0,00733958953231098 0,00714122224765393 0,00239805603441394 0,00176542200574777 298510 309312 623 665 0 True 628 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 674 389 0,00687630799270261 0,00698275787890417 0,00691233691920348 0,00697337300679027 0,00172879781301156 0,00189121467600724 280748 304314 623 665 0 True 672 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 277 435 0,00694576960762882 0,00708218245315738 0,00698863202868696 0,00711070420386053 0,00141366830917649 0,00148988030322632 283584 308647 623 665 0 True 274 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 320 434 0,00708506022966175 0,00750330851160862 0,00720225833524071 0,00743114366369116 0,00141536472285258 0,00166049027702537 289271 327000 623 665 0 True 318 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 365 435 0,00739604546404755 0,00744470468916627 0,00735484855420768 0,00740062561989776 0,00139686782272064 0,00130290850753048 301968 324446 623 665 0 True 363 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 409 434 0,00724325930258432 0,00736418753452641 0,0072327763790341 0,00737010757610437 0,00168369796167945 0,00157013565348342 295730 320937 623 665 0 True 407 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 453 434 0,00755003177330041 0,0077467415391305 0,00759899290455482 0,00778210116731518 0,00174095760974576 0,00177314884154797 308255 337609 623 665 0 True 451 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 498 435 0,00756849935357346 0,00758166875187511 0,0076600289921416 0,00759899290455482 0,00173662636256029 0,0018394568791221 309009 330415 623 665 0 True 495 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 541 434 0,0075234080866203 0,0074511065945936 0,00764476997024491 0,00750743877317464 0,00163696065996743 0,00160551738720075 307168 324725 623 665 0 True 539 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 586 435 0,00664940658202686 0,00694354333992454 0,00668345159075303 0,00701915007248035 0,00183729029083155 0,00189101001530103 271484 302605 623 665 0 True 584 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 630 434 0,0071317680222091 0,00658526609496963 0,00677500572213321 0,00659189745937285 0,00312314693544786 0,0017565020763424 291178 286991 623 665 0 True 628 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 674 434 0,00647572805189929 0,00668551672153604 0,00650034332799268 0,00665293354695964 0,00181559850199546 0,00175439009202531 264393 291360 623 665 0 True 672 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 276 479 0,00695701180835207 0,00689625184499358 0,00697337300679027 0,00689707789730678 0,00139865004504706 0,00144612563613366 284043 300544 623 665 0 True 274 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 320 479 0,00705135812030404 0,007029498672293 0,00706492713817044 0,00701915007248035 0,00152470639326181 0,00147903658356403 287895 306351 623 665 0 True 318 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 364 478 0,00712422423610287 0,00691240575689625 0,00706492713817044 0,00683604180972 0,00150718943290919 0,00151947492940472 290870 301248 623 665 0 True 362 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 408 478 0,00750589572601655 0,00721503920019779 0,00752269779507134 0,0072632944228275 0,00159768258479778 0,0015568890308014 306453 314437 623 665 0 True 407 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 452 478 0,00742311002134426 0,00745645298873184 0,00747692072938125 0,00750743877317464 0,00179716302557753 0,00185809732740251 303073 324958 623 665 0 True 451 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 496 478 0,00724142234168183 0,00744534717429876 0,00727855344472419 0,00746166170748455 0,00181621915092654 0,00179462315171204 295655 324474 623 665 0 True 495 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 541 479 0,0068934039755018 0,00682376575450987 0,00686655985351339 0,0068055237659266 0,00168556792910976 0,00166004354127931 281446 297385 623 665 0 True 539 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 584 478 0,00656417159615125 0,00660598624049251 0,00653086137178607 0,00665293354695964 0,00183616753504187 0,00191627980499076 268004 287894 623 665 0 True 584 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 628 478 0,00633190625964022 0,00641560412819644 0,00633249408712902 0,0063935301747158 0,00176154072404736 0,00169427531752207 258521 279597 623 665 0 True 628 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 673 478 0,00670390308880077 0,00670229017267362 0,00666819256885634 0,00675974670023652 0,00198590852078314 0,0017036741046447 273709 292091 623 665 0 True 672 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 277 523 0,00685730157056483 0,006874063162025 0,00689707789730678 0,00695811398489357 0,00149419485329521 0,00152279492838132 279972 299577 623 665 0 True 274 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 320 522 0,00685152126692499 0,00703998494749118 0,00674448767833982 0,00704966811627375 0,00145587501642371 0,00141815278220754 279736 306808 623 665 0 True 318 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 364 522 0,00680123752382079 0,00705824988197204 0,00679026474402991 0,00703440909437705 0,00150319890713587 0,0015983888521619 277683 307604 623 665 0 True 362 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 408 522 0,00718824844675771 0,0073251336168299 0,00720225833524071 0,00730907148851759 0,00157799804332022 0,0017065675454576 293484 319235 623 665 0 True 407 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 453 522 0,0071171703062373 0,00724229892653355 0,00715648126955062 0,00718699931334401 0,00181992523729412 0,00196004827877307 290582 315625 623 665 0 True 451 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 496 523 0,00685394605531628 0,00699131669870488 0,00688181887541009 0,00698863202868696 0,00181954273299851 0,00164163296467081 279835 304687 623 665 0 True 495 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 541 522 0,00660331110978033 0,00680100342410157 0,00663767452506294 0,00685130083161669 0,00171738957204001 0,00163760810194089 269602 296393 623 665 0 True 539 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 585 522 0,00674323854492612 0,00665139617182118 0,0068055237659266 0,00665293354695964 0,00169663888117977 0,00178642713159071 275315 289873 623 665 0 True 584 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 629 522 0,00649395070405201 0,00652712119047906 0,00642404821850919 0,00654612039368277 0,00168950141203394 0,00187540738798378 265137 284457 623 665 0 True 628 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 673 522 0,00655464389227033 0,00678627215784942 0,00659189745937285 0,00683604180972 0,00182447864273969 0,00184169499199203 267615 295751 623 665 0 True 672 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 276 567 0,0071748263857635 0,00725420784738225 0,00712596322575723 0,00721751735713741 0,00129973150029075 0,00151864806138477 292936 316144 623 665 0 True 274 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 320 566 0,00697780620576828 0,0071026272479092 0,00709544518196384 0,00717174029144732 0,00132009263953296 0,00139420986676525 284892 309538 623 665 0 True 318 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 365 567 0,00698209244787409 0,00687252578688653 0,00706492713817044 0,00685130083161669 0,00135600302809599 0,00122660928841245 285067 299510 623 665 0 True 362 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 409 566 0,00671178977427547 0,00685639482088145 0,00671396963454643 0,00686655985351339 0,00154985965620846 0,0015404270961397 274031 298807 623 665 0 True 407 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 453 566 0,00670649932687629 0,00704618033984022 0,00677500572213321 0,00711070420386053 0,00196827699074586 0,00176862542631491 273815 307078 623 665 0 True 451 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 497 566 0,00695177034657696 0,00692452119082325 0,00688181887541009 0,00686655985351339 0,00196855340272709 0,0020300281353878 283829 301776 623 665 0 True 495 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 542 567 0,00692556303770142 0,00671853586816664 0,00694285496299687 0,0068207827878233 0,00189174318160661 0,00170859588549367 282759 292799 623 665 0 True 539 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 585 565 0,00683202498854655 0,00663363604708728 0,00677500572213321 0,00666819256885634 0,00161987985159953 0,00143177794124692 278940 289099 623 665 0 True 583 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 629 566 0,00665102310762105 0,00671174388248029 0,00671396963454643 0,00668345159075303 0,00157771278971076 0,00156347258789972 271550 292503 623 665 0 True 628 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 674 566 0,00710504636428086 0,00669978906983641 0,00672922865644312 0,00665293354695964 0,00283897880554009 0,0016504298370002 290087 291982 623 665 0 True 672 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 274 606 0,00717198521956765 0,00732247189270957 0,00718699931334401 0,00732433051041428 0,00133314273074668 0,00144639376613661 292820 319119 623 665 0 False 274 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 318 606 0,00711327594912402 0,00709702844889748 0,00720225833524071 0,00701915007248035 0,00134004197017468 0,00153689222853583 290423 309294 623 665 0 False 318 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 364 610 0,00652728542122922 0,00671390079685366 0,00654612039368277 0,00669871061264973 0,0014074720282829 0,00134966571721958 266498 292597 623 665 0 True 362 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 409 610 0,0066191334663538 0,00663957903456283 0,00660715648126955 0,00659189745937285 0,00139086955439092 0,00140382660261173 270248 289358 623 665 0 True 406 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 451 606 0,00649740419054869 0,006663465713953 0,00642404821850919 0,00663767452506294 0,00182143427671297 0,00189121307799041 265278 290399 623 665 0 False 451 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 495 606 0,00675585234312323 0,00664155238175549 0,00669871061264973 0,00668345159075303 0,00188028132865561 0,00199344912985578 275830 289444 623 665 0 False 495 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 539 606 0,00682915932953866 0,00684416465746651 0,0068055237659266 0,00691233691920348 0,00177460901873288 0,00185363206885294 278823 298274 623 665 0 False 539 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 583 607 0,00657918568992761 0,00686428820965208 0,00645456626230259 0,00688181887541009 0,00172255516989828 0,00174104269532787 268617 299151 623 665 0 False 583 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 628 607 0,0065967225433434 0,00683881826332827 0,00662241550316625 0,00657663843747616 0,00149450173269418 0,00185263648783997 269333 298041 623 665 0 False 628 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 672 607 0,00725332584832998 0,00675389549635132 0,00697337300679027 0,00671396963454643 0,00259991750687649 0,00155014709787939 296141 294340 623 665 0 False 672 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 275 655 0,0088412193452557 0,729393270312426 0,00849927519645991 0,753734645609216 0,00211428515751426 0,221084034003383 360972 31787524 623 665 14 True 274 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 318 649 0,00759406984933614 0,00717759149533252 0,00738536659800107 0,00715648126955062 0,00198568703141268 0,00118304471161849 310053 312805 623 665 0 False 318 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 362 650 0,00633724569266346 0,00646525905057907 0,00631723506523232 0,00645456626230259 0,00130189222609281 0,00118995443197031 258739 281761 623 665 0 False 362 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 406 650 0,00641865979986189 0,00634947405134489 0,0064087891966125 0,00628671702143893 0,00127583794732167 0,00137516710982008 262063 276715 623 665 0 False 406 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 451 650 0,00646482875054451 0,00630073696486582 0,00646982528419928 0,00631723506523232 0,00155589561474567 0,00161669282338314 263948 274591 623 665 0 False 451 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 495 650 0,00639644481934775 0,00655158151730895 0,00646982528419928 0,00651560234988937 0,00161160794030754 0,00163447413380045 261156 285523 623 665 0 False 495 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 539 650 0,00667179301222522 0,00639226815034841 0,00669871061264973 0,0063935301747158 0,00165609214357849 0,00164453978464871 272398 278580 623 665 0 False 539 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 583 650 0,00658364338171766 0,006609978826673 0,00663767452506294 0,00663767452506294 0,00140013081344384 0,00115853602559521 268799 288068 623 665 0 False 583 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 628 650 0,00685235402253412 0,00683918539768969 0,0068055237659266 0,00691233691920348 0,00136660142219538 0,00128121887656111 279770 298057 623 665 0 False 628 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 673 655 0,00846858570298228 0,761499881541804 0,00834668497749294 0,766033417257954 0,00172438802427771 0,186075825111609 345758 33186755 623 665 15 True 672 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D6_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D6_3.csv new file mode 100755 index 0000000..0b4b66b --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D6_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 274 259 0,0011213299205049 0,0771478937673779 0,00100709544518196 0,0766765850308995 0,000795512982989431 0,0232867622520687 45782 3362165 623 665 0 True 274 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 319 259 0,000948753566918832 0,00103798062333678 0,000854505226215 0,000915541313801785 0,000653047868284459 0,000703060274138574 38736 45236 623 665 0 False 319 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 363 259 0,000930359465081884 0,00100801328108552 0,000839246204318303 0,000869764248111696 0,000636829911885119 0,000714481520574196 37985 43930 623 665 0 True 363 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 407 257 0,000882329060684738 0,00102230857528348 0,000686655985351339 0,000869764248111696 0,000734699868183597 0,000725429751513159 36024 44553 623 665 0 True 407 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 451 258 0,000978071462922597 0,00103121158354802 0,000762951094834821 0,000762951094834821 0,000846037089215141 0,000927704062361489 39933 44941 623 665 0 True 451 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 495 258 0,00520425719363074 0,000990276102249214 0,000961318379491875 0,000823987182421607 0,0169383511188993 0,000833458912920928 212481 43157 623 665 0 True 496 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 539 258 0,00108209243562769 0,00105298724036 0,000885023270008392 0,000900282291905089 0,000866581986226056 0,000792112618382422 44180 45890 623 665 0 True 540 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 583 258 0,00107234429643846 0,00115716161541414 0,000778210116731518 0,000915541313801785 0,00096517651940492 0,000997356109945748 43782 50430 623 665 0 True 584 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 628 260 0,00111243902973685 0,00104848984443255 0,000778210116731518 0,00080872816052491 0,00100031300255215 0,000957399599192749 45419 45694 623 665 0 False 628 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 672 258 0,00107231980362643 0,0778048118694539 0,000762951094834821 0,0761120012207217 0,000944079701985901 0,0215139798761762 43781 3390794 623 665 0 True 672 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 274 303 0,00103019216692929 0,000949134107872106 0,000885023270008392 0,00080872816052491 0,00077283740171935 0,000769978040037677 42061 41364 623 665 0 False 274 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 319 303 0,000897196197588903 0,000995301253821209 0,000793469138628214 0,000946059357595178 0,00062507171063357 0,000628912006914442 36631 43376 623 665 0 False 319 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 363 303 0,00097900218977986 0,000915541313801785 0,000869764248111696 0,000793469138628214 0,000648137047256978 0,000671029206876517 39971 39900 623 665 0 True 363 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 407 302 0,000995755273210583 0,00103593843845136 0,000854505226215 0,000854505226215 0,000769687472761411 0,000808566221274406 40655 45147 623 665 0 True 407 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 451 302 0,000974177105809315 0,00098873872711075 0,000732433051041428 0,000717174029144732 0,000900887265397779 0,000904591755606694 39774 43090 623 665 0 True 451 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 496 303 0,000985394813720531 0,00109821360450795 0,000732433051041428 0,000869764248111696 0,0009339271471664 0,000928917894967677 40232 47861 623 665 0 True 495 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 539 302 0,00107736532290527 0,000986971892996396 0,000900282291905089 0,000839246204318303 0,000881086132326404 0,000797624354457682 43987 43013 623 665 0 True 540 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 585 303 0,00101958677931891 0,00105124335214323 0,000732433051041428 0,000701915007248035 0,000972928523318798 0,00111918629109779 41628 45814 623 665 0 True 584 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 628 303 0,00102294229456746 0,00105147281111912 0,000671396963454643 0,000671396963454643 0,00103350046345244 0,00107488209346902 41765 45824 623 665 0 False 628 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 672 303 0,000966265927522585 0,000934356949824779 0,000595101853971161 0,000610360875867857 0,000967048849815165 0,000925824302149736 39451 40720 623 665 0 False 672 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 275 347 0,00100861399952802 0,000976393834207859 0,000885023270008392 0,000793469138628214 0,000733963230512854 0,000799712316274187 41180 42552 623 665 0 True 274 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 320 347 0,000978904218531727 0,000999752757953478 0,000854505226215 0,000900282291905089 0,000733516697652107 0,000656976002870484 39967 43570 623 665 0 True 318 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 364 347 0,000930530914766116 0,000966687719527705 0,000839246204318303 0,000839246204318303 0,00067798626208301 0,000692154412267348 37992 42129 623 665 0 True 363 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 408 347 0,000947430955069039 0,000931167470059906 0,000778210116731518 0,000778210116731518 0,000728673185300513 0,000721447933347831 38682 40581 623 665 0 True 407 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 453 346 0,000944491817625052 0,000992180611749103 0,000671396963454643 0,000762951094834821 0,000863305625158432 0,000850966825992744 38562 43240 623 665 0 True 451 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 496 347 0,000957717936122991 0,000952644830203226 0,000747692072938125 0,000701915007248035 0,000823057363001976 0,000840886721333732 39102 41517 623 665 0 True 495 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 539 346 0,00103908305769735 0,00100888522519391 0,000839246204318303 0,000778210116731518 0,000884612333338833 0,000886420057787837 42424 43968 623 665 0 True 540 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 585 346 0,00101199400758861 0,00110970949920005 0,000793469138628214 0,000732433051041428 0,00101037433281189 0,00114225016439886 41318 48362 623 665 0 True 584 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 630 346 0,000958379242047888 0,000955696634582565 0,000579842832074464 0,000564583810177768 0,00100247777688689 0,00101557075290392 39129 41650 623 665 0 True 628 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 673 345 0,000926465107968602 0,000955421283811497 0,000518806744487678 0,000503547722590982 0,000968422205896381 0,00101552885313762 37826 41638 623 665 0 True 672 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 276 391 0,000879977750729549 0,000956385011510236 0,000732433051041428 0,000823987182421607 0,000730723673748636 0,00073686291008792 35928 41680 623 665 0 True 274 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 321 391 0,000923574956148682 0,000966412368756636 0,00080872816052491 0,000869764248111696 0,000692530444027793 0,000700400912528258 37708 42117 623 665 0 True 318 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 365 391 0,000911353042944105 0,000957004550745139 0,000793469138628214 0,000839246204318303 0,000692157635957833 0,00070091036813651 37209 41707 623 665 0 True 363 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 408 390 0,000981010600366584 0,00104176669643897 0,000778210116731518 0,000839246204318303 0,0008010026936177 0,00079948764496175 40053 45401 623 665 0 True 407 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 453 390 0,000918627408117971 0,000961364271287053 0,000671396963454643 0,000717174029144732 0,000828835764725936 0,000845609590716902 37506 41897 623 665 0 True 451 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 497 391 0,00098828496554045 0,000931649333909275 0,000701915007248035 0,000656137941557946 0,000957276002044999 0,000883045525496953 40350 40602 623 665 0 True 495 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 541 391 0,00100273572464005 0,000965242127979597 0,000839246204318303 0,000762951094834821 0,000817120802172228 0,00081105879586816 40940 42066 623 665 0 True 540 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 586 391 0,000928179604810927 0,000947849137607122 0,000610360875867857 0,000473029678797589 0,000957275488800687 0,00104956707885065 37896 41308 623 665 0 True 584 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 630 391 0,000949022987851198 0,000937156349330639 0,000579842832074464 0,000579842832074464 0,00100905509724917 0,00100732307371124 38747 40842 623 665 0 True 628 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 674 389 0,000918970307486436 0,00090562868604333 0,000595101853971161 0,000457770656900893 0,000934142130633137 0,000993433647718055 37520 39468 623 665 0 True 672 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 277 435 0,000877234555781828 0,000954296934829635 0,000747692072938125 0,000823987182421607 0,000729120480259451 0,000802032755632166 35816 41589 623 665 0 True 274 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 320 434 0,000989068735525513 0,000976898643954817 0,000869764248111696 0,000839246204318303 0,000731899756553835 0,000759735957379622 40382 42574 623 665 0 True 318 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 365 435 0,00096675578376325 0,000981327202189498 0,000854505226215 0,000854505226215 0,000715525355331405 0,000718419243668297 39471 42767 623 665 0 True 363 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 409 434 0,000967931438740844 0,0009499831060829 0,000778210116731518 0,000778210116731518 0,000840790499375967 0,000821297917505778 39519 41401 623 665 0 True 407 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 453 434 0,000907630135515055 0,000971873492382823 0,000595101853971161 0,000701915007248035 0,000907818311182839 0,000900452776326705 37057 42355 623 665 0 True 451 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 498 435 0,000932318890044541 0,000970427900834714 0,000686655985351339 0,000671396963454643 0,000892318628053869 0,000957502331638962 38065 42292 623 665 0 True 495 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 541 434 0,000998865860338802 0,00100865576621802 0,000793469138628214 0,00080872816052491 0,000901320725116887 0,000881209008043031 40782 43958 623 665 0 True 539 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 586 435 0,000978904218531727 0,000955329500221141 0,000610360875867857 0,000534065766384375 0,000997122864747067 0,00103285557401275 39967 41634 623 665 0 True 584 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 630 434 0,000937290930887285 0,000947321381962574 0,000534065766384375 0,000595101853971161 0,000977183463868541 0,000960481664915876 38268 41285 623 665 0 True 628 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 674 434 0,000880688042278512 0,00085636384391971 0,000503547722590982 0,000457770656900893 0,000941379673368286 0,00094693295864635 35957 37321 623 665 0 True 672 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 276 479 0,00093694803151882 0,00101875196115718 0,00080872816052491 0,000885023270008392 0,000748396752665517 0,000836338497355957 38254 44398 623 665 0 True 274 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 320 479 0,000950590527821324 0,000887662048231129 0,000839246204318303 0,000793469138628214 0,000810597404611 0,000778202043508955 38811 38685 623 665 0 True 318 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 364 478 0,000912822611666098 0,00091870784766907 0,000793469138628214 0,000762951094834821 0,000766907989422093 0,000770711252830462 37269 40038 623 665 0 True 362 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 408 478 0,00101975822900314 0,00106143133067276 0,000839246204318303 0,000793469138628214 0,000925679894750885 0,000920632958832611 41635 46258 623 665 0 True 407 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 452 478 0,000912602176357799 0,000948078596583012 0,000488288700694286 0,000625619897764553 0,0010279043685242 0,00104296067493431 37260 41318 623 665 0 True 451 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 496 478 0,00104407959135213 0,00101145516572388 0,000762951094834821 0,000717174029144732 0,00100108943858451 0,000987482451864314 42628 44080 623 665 0 True 495 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 541 479 0,000975769138591475 0,000876992205852236 0,000671396963454643 0,000579842832074464 0,000908666753031929 0,000875159283457471 39839 38220 623 665 0 True 539 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 584 478 0,000920562340268596 0,000955398337913908 0,000549324788281071 0,000595101853971161 0,00091371263892349 0,000999664134514798 37585 41637 623 665 0 True 584 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 628 478 0,000947308491008872 0,000893696819297041 0,000564583810177768 0,000579842832074464 0,000987868909282556 0,000881697608056901 38677 38948 623 665 0 True 628 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 673 478 0,00089200372143786 0,000872999619671747 0,000549324788281071 0,000442511635004196 0,000943481457793975 0,000949736343144819 36419 38046 623 665 0 True 672 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 277 523 0,000982063791284012 0,00093573370368012 0,000869764248111696 0,00080872816052491 0,000799753847640808 0,000764809168339282 40096 40780 623 665 0 True 274 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 320 522 0,000914022759455726 0,000902301530892922 0,000732433051041428 0,000778210116731518 0,000785143076279182 0,000751424193569011 37318 39323 623 665 0 True 318 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 364 522 0,00108265577030445 0,000917698228175153 0,000900282291905089 0,000778210116731518 0,00086807594756096 0,000772282280926557 44203 39994 623 665 0 True 362 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 408 522 0,000994359182924689 0,00100684304030848 0,000747692072938125 0,000778210116731518 0,000899116461954953 0,000887009583532883 40598 43879 623 665 0 True 407 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 453 522 0,000886615302790552 0,000957394631004153 0,000473029678797589 0,000686655985351339 0,000980913377987009 0,000973368852504056 36199 41724 623 665 0 True 451 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 496 523 0,000972707537087322 0,000870475570936955 0,00064087891966125 0,000457770656900893 0,000937724702361535 0,00089845771323261 39714 37936 623 665 0 True 495 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 541 522 0,000916325083786848 0,000909713055814175 0,00064087891966125 0,000610360875867857 0,000890818458446183 0,000895870924415374 37412 39646 623 665 0 True 539 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 585 522 0,000916667983155313 0,00105128924393841 0,000610360875867857 0,000778210116731518 0,000894471112008068 0,000956471284304063 37426 45816 623 665 0 True 584 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 629 522 0,000903098965288909 0,000902186801404977 0,000534065766384375 0,000534065766384375 0,000960179133147255 0,000957752171359578 36872 39318 623 665 0 True 628 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 673 522 0,000802751914388805 0,000903311150386839 0,0004272526131075 0,000518806744487678 0,000893981246901275 0,000995152879463221 32775 39367 623 665 0 True 672 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 276 567 0,000927395834825864 0,0009698313074974 0,00080872816052491 0,000839246204318303 0,000687422179400714 0,000722468904670632 37864 42266 623 665 0 True 274 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 320 566 0,0009630328763342 0,000944866170920549 0,000823987182421607 0,000885023270008392 0,00080093030441512 0,000721394138359286 39319 41178 623 665 0 True 318 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 365 567 0,000992228308277799 0,000945623385540987 0,000839246204318303 0,000869764248111696 0,000705769387427572 0,000672195021283868 40511 41211 623 665 0 True 362 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 409 566 0,00093033497226985 0,000915059449952416 0,000671396963454643 0,000701915007248035 0,000839131173858005 0,000813166045859289 37984 39879 623 665 0 True 407 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 453 566 0,000946622692271942 0,000946770680420438 0,000595101853971161 0,000564583810177768 0,00101050681383782 0,000995629110431887 38649 41261 623 665 0 True 451 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 497 566 0,000851908988139478 0,000928345124656457 0,000442511635004196 0,000488288700694286 0,00099130214101997 0,00108028627541567 34782 40458 623 665 0 True 495 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 542 567 0,00103851972302059 0,00094835394735408 0,00064087891966125 0,000610360875867857 0,0010614962551307 0,00094999655700242 42401 41330 623 665 0 True 539 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 585 565 0,000903466357469408 0,000920176385114767 0,00064087891966125 0,000717174029144732 0,000820075118795708 0,000780743010292618 36887 40102 623 665 0 True 583 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 629 566 0,000930653378826282 0,000966756557220472 0,000686655985351339 0,000747692072938125 0,00084325898579364 0,000839367503282602 37997 42132 623 665 0 True 628 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 674 566 0,000860456979539072 0,000855032981859547 0,000595101853971161 0,000518806744487678 0,000841517670590703 0,000892081098841086 35131 37263 623 665 0 True 672 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 274 606 0,000950443570949125 0,000988899348393873 0,000823987182421607 0,000854505226215 0,000704628880871804 0,000736267732298417 38805 43097 623 665 0 False 274 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 318 606 0,000945789936662813 0,000925958751307199 0,000823987182421607 0,000778210116731518 0,000777196560240535 0,000702829267537891 38615 40354 623 665 0 False 318 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 364 610 0,00089930257942376 0,000871714649406763 0,000762951094834821 0,000732433051041428 0,000717275232500048 0,000710712535665931 36717 37990 623 665 0 True 362 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 409 610 0,000985345828096464 0,000934769975981382 0,000778210116731518 0,000762951094834821 0,000827462432166347 0,000745722921431885 40230 40738 623 665 0 True 406 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 451 606 0,000892126185498026 0,000920314060500301 0,000473029678797589 0,000473029678797589 0,000953110517428819 0,000993862408067559 36424 40108 623 665 0 False 451 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 495 606 0,000915516820989752 0,000942181500902634 0,000473029678797589 0,000488288700694286 0,00101427427087887 0,00104286393508367 37379 41061 623 665 0 False 495 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 539 606 0,00100278471026412 0,000891746418001974 0,000671396963454643 0,000457770656900893 0,00100005256671446 0,000998803200542776 40942 38863 623 665 0 False 539 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 583 607 0,000930873814134581 0,000973709164189944 0,000671396963454643 0,000671396963454643 0,00086457389970126 0,000957882465605366 38006 42435 623 665 0 False 583 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 628 607 0,000894746916385581 0,000902049126019443 0,000686655985351339 0,000717174029144732 0,000726494476284775 0,000730603719596462 36531 39312 623 665 0 False 628 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 672 607 0,000905572739304265 0,000891975876977865 0,000671396963454643 0,000610360875867857 0,000786714547203934 0,000832074788638527 36973 38873 623 665 0 False 672 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 275 655 0,00106854791057331 0,0724379040987683 0,000915541313801785 0,0722667277027543 0,000749302250133149 0,0238483087668625 43627 3156900 623 665 0 True 274 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 318 649 0,000999404702203532 0,000902898124230237 0,000900282291905089 0,000778210116731518 0,000682522968758119 0,000629178551243943 40804 39349 623 665 0 False 318 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 362 650 0,000929869608841219 0,000890186096965921 0,000823987182421607 0,000778210116731518 0,000652407471629363 0,000646309623453871 37965 38795 623 665 0 False 362 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 406 650 0,000867902794397171 0,000935458352909052 0,000732433051041428 0,000778210116731518 0,000682548427706151 0,000712692910293668 35435 40768 623 665 0 False 406 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 451 650 0,000938197164932514 0,00092267748795197 0,000701915007248035 0,000732433051041428 0,00082771156185329 0,000818131222340949 38305 40211 623 665 0 False 451 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 495 650 0,000873805562097177 0,000886767158225158 0,000595101853971161 0,000656137941557946 0,0008436788970289 0,000838400182826583 35676 38646 623 665 0 False 495 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 539 650 0,000855509431508362 0,000952392425329747 0,000488288700694286 0,000610360875867857 0,000863388497295436 0,000915203076524257 34929 41506 623 665 0 False 539 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 583 650 0,000900502727213388 0,000959918679738945 0,000671396963454643 0,000839246204318303 0,000751186347468808 0,000662456700438347 36766 41834 623 665 0 False 583 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 628 650 0,000924750611126276 0,000876349720719744 0,00080872816052491 0,000717174029144732 0,000691286947469466 0,000692714038647849 37756 38192 623 665 0 False 628 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 673 655 0,00102230548145459 0,0762077085595655 0,000869764248111696 0,0738536659800107 0,000751110998920971 0,0224598339682345 41739 3321191 623 665 0 True 672 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D7_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D7_1.csv new file mode 100755 index 0000000..8757552 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D7_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 270 268 0,011112521055276 0,0472766259893267 0,0110780498970016 0,0473945220111391 0,00155715967001792 0,00966497772068781 421662 2060352 579 665 0 True 269 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 314 268 0,0109531051253052 0,0109661886462551 0,0110017547875181 0,010955977721828 0,00139324741097823 0,00131397480997118 415613 477915 579 665 0 False 314 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 359 267 0,0112100839206673 0,065989074310863 0,0111848630502785 0,067353322652018 0,00139836166307527 0,0160448148919374 425364 2875855 579 665 0 True 358 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 403 267 0,0112247104442471 0,0932233536461892 0,0112306401159686 0,0921187151903563 0,00136140829441738 0,0228046437704781 425919 4062746 579 665 0 True 402 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 447 267 0,0108241281768381 0,0766204593653968 0,0109102006561379 0,0734569314106966 0,00174384259211 0,0212122568376379 410719 3339179 579 665 0 True 446 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 492 267 0,0109374771460569 0,0723073189955892 0,0110017547875181 0,0749065384908827 0,00166837414654493 0,0272078266108778 415020 3151209 579 665 0 True 490 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 537 268 0,0111248284183602 0,0864867823025176 0,0112458991378653 0,0833600366216525 0,00149940627544684 0,0300329109541615 422129 3769161 579 665 0 True 534 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 580 268 0,0112479811114919 0,074663266084644 0,0113374532692454 0,071976806286717 0,00181275366183978 0,0231703090818401 426802 3253883 579 665 0 True 578 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 622 269 0,0108993164142669 0,0109815165058446 0,0109102006561379 0,0110780498970016 0,00193356694513283 0,00189073166294308 413572 478583 579 665 0 False 622 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 665 267 0,0111221403005131 0,0468959535483249 0,011108567940795 0,0470130464637217 0,00214720895592117 0,00930069353843838 422027 2043762 579 665 0 True 667 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 269 311 0,0107941372149755 0,0108310373094558 0,0108186465247578 0,0107728694590677 0,00158453699826978 0,00150544805673498 409581 472025 579 665 0 False 269 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 313 311 0,0109382941230496 0,010826952939685 0,010955977721828 0,0107728694590677 0,00128701370714309 0,00123694609903406 415051 471847 579 665 0 False 313 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 360 312 0,0112667452282285 0,124662124526239 0,011261158159762 0,131090257114519 0,00136962717205219 0,0377504437351928 427514 5432872 579 665 0 True 358 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 404 312 0,0111631209206329 0,0575027864924385 0,0111696040283818 0,0554970626382849 0,00149628710369639 0,0126574531574082 423582 2506016 579 665 0 True 402 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 448 312 0,0111063278425891 0,094382488608796 0,0111543450064851 0,0935378042267491 0,00179170820876686 0,0300722958882161 421427 4113262 579 665 0 True 446 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 493 313 0,010906590144912 0,0466127093884861 0,0108339055466545 0,0460669871061265 0,00174335817557969 0,0178945155081136 413848 2031418 579 665 0 True 490 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 536 312 0,0111598003044689 0,0520935664865987 0,0111848630502785 0,0513771267261769 0,00157104509324972 0,0178651626965797 423456 2270278 579 665 0 True 534 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 581 313 0,0112381510334825 0,0575305739744188 0,0113374532692454 0,0571297779812314 0,00187700192664397 0,0163340193915423 426429 2507227 579 665 0 True 578 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 622 312 0,0107955076279956 0,010798867161036 0,0106813153276875 0,0107881284809644 0,00202942569746973 0,00195128530895271 409633 470623 579 665 0 False 622 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 666 312 0,0110233915007775 0,0108325517386967 0,0110017547875181 0,0107270923933776 0,00188179618567517 0,00189249818798108 418280 472091 579 665 0 False 666 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 271 357 0,0108433666673123 0,0520360411213431 0,0108186465247578 0,0514381628137636 0,00145082626387555 0,0123900087013883 411449 2267771 579 665 0 True 269 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 316 357 0,0110178571405041 0,0689231891814682 0,0110627908751049 0,0696116578927291 0,00150712295478198 0,0241941450629434 418070 3003726 579 665 0 True 313 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 360 357 0,0113265953814709 0,0435562699378338 0,0114137483787289 0,043930724040589 0,00147575936904073 0,00976662167015302 429785 1898216 579 665 0 True 357 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 404 356 0,0110778127101327 0,0392303487030692 0,0111238269626917 0,0388647287708858 0,00151362195202343 0,00869890117346981 420345 1709689 579 665 0 True 402 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 449 356 0,0114110602608818 0,0753907428218062 0,0113527122911421 0,0719310292210269 0,00179462220637139 0,0168156299893276 432990 3285587 579 665 0 True 446 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 493 357 0,0112566252551571 0,0395654505914592 0,011261158159762 0,0384679942015717 0,00181765970244317 0,0090358686489276 427130 1724293 579 665 0 True 490 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 536 357 0,0110640822258354 0,0298063308878743 0,0110627908751049 0,0304875257495995 0,00156870147312209 0,00406891727090886 419824 1298983 579 665 0 True 534 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 581 357 0,0114578124281439 0,0547303943080406 0,0113984893568322 0,0545662623025864 0,00189619238229573 0,0112154383733692 434764 2385193 579 665 0 True 578 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 625 357 0,010923035101153 0,0572431995530139 0,0108186465247578 0,0583504997329671 0,00201640874230782 0,0133516626772267 414472 2494703 579 665 0 True 622 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 669 357 0,0111077773178988 0,0681568191478926 0,0110933089188983 0,0665293354695964 0,00198578415036327 0,0225810490938519 421482 2970327 579 665 0 True 666 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 273 402 0,0114830860067258 0,0437249681769083 0,011306935225452 0,0464332036316472 0,00223611588275699 0,011095305964653 435723 1905568 579 665 0 True 269 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 316 402 0,0111949039610602 0,0355630435668021 0,0112001220721752 0,0348973830777447 0,00135522260315248 0,00604839696368255 424788 1549865 579 665 0 True 313 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 360 401 0,0117150547644715 0,091768721414431 0,0115663385976959 0,0898146028839551 0,00177132648633824 0,0245572037528177 444525 3999352 579 665 0 True 357 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 404 401 0,0113773270173106 0,0705071674379357 0,0113221942473487 0,0706340123598077 0,00154314540757822 0,0200515078397958 431710 3072757 579 665 0 True 402 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 449 401 0,0115220110073155 0,0451631940918903 0,0115815976195926 0,0473640039673457 0,00168158494125733 0,0092480384664661 437200 1968247 579 665 0 True 446 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 493 402 0,0115116802014718 0,0557644282369921 0,0114900434882124 0,0563363088426032 0,0018261474152059 0,0117576842311409 436808 2430257 579 665 0 True 490 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 537 401 0,0113874733444785 0,0435712306630619 0,0113679713130388 0,044785229266804 0,00173528635140838 0,00669008128847196 432095 1898868 579 665 0 True 534 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 581 401 0,0114039183007195 0,0530008243313709 0,0113984893568322 0,0532692454413672 0,00195794585684254 0,00955066030049899 432719 2309817 579 665 0 True 578 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 626 401 0,0112719106311503 0,043261690504586 0,0113527122911421 0,0440070191500725 0,00189883712407974 0,00841933291669176 427710 1885378 579 665 0 True 622 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 670 401 0,0112261862736533 0,084144166779962 0,0112916762035554 0,0792553597314412 0,0018357001564507 0,01973430677945 425975 3667068 579 665 0 True 666 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 273 447 0,0109200834423405 0,0482556586017573 0,0109712367437247 0,0480659189745937 0,0015989116057277 0,00954325631153763 414360 2103019 579 665 0 True 269 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 317 446 0,0111605909273651 0,0566203102170625 0,0111696040283818 0,055893797207599 0,0015805148955421 0,00896175225712155 423486 2467557 579 665 0 True 313 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 361 446 0,0112305346995824 0,0403871661300195 0,0112764171816587 0,0388647287708858 0,00143118206873832 0,0089740395171932 426140 1760104 579 665 0 True 357 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 405 446 0,0114278214662813 0,0581639266396708 0,0115358205539025 0,0563057907988098 0,00156700924163047 0,013573268969767 433626 2534829 579 665 0 True 401 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 449 445 0,0115500517660341 0,103441597814633 0,0115815976195926 0,102037079423209 0,00186291708700235 0,022179544597233 438264 4508065 579 665 0 True 446 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 494 447 0,0112410236300054 0,0633287269443923 0,0112306401159686 0,063782711528191 0,00182053983494633 0,0162984219530872 426538 2759915 579 665 0 True 490 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 538 447 0,0114052360055465 0,0556168631695971 0,011459525444419 0,0548561837186236 0,00169187043816567 0,010936873918651 432769 2423826 579 665 0 True 534 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 581 446 0,0112164352579335 0,0336463956870891 0,0112306401159686 0,0337376974135958 0,00184771310355029 0,0045148375702123 425605 1466336 579 665 0 True 578 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 626 445 0,0113521325010183 0,0404056146316811 0,0113221942473487 0,0409552147707332 0,00193486207969337 0,00519130314986285 430754 1760908 579 665 0 True 622 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 670 446 0,0114357540493399 0,0716144446719913 0,0114442664225223 0,0712596322575723 0,00194166674604359 0,0117162494507055 433927 3121013 579 665 0 True 666 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 272 491 0,0108828451039294 0,0614819493228379 0,0108644235904479 0,0623178454261082 0,00156813076804841 0,0191652304372338 412947 2679431 579 665 0 True 269 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 316 490 0,0109433014013923 0,0575190321879315 0,0109407186999313 0,0584725719081407 0,00155676711455164 0,0137800556720537 415241 2506724 579 665 0 True 313 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 360 490 0,0110609987965402 0,0713114440943283 0,0110933089188983 0,0690470740825513 0,0015439343787642 0,0221071437248223 419707 3107808 579 665 0 True 357 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 405 491 0,0115136831128088 0,0927068185455628 0,0114442664225223 0,0863660639353017 0,00163316629866191 0,0270112100377499 436884 4040235 579 665 0 True 401 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 449 490 0,0111613815502613 0,0990444754596494 0,0111390859845884 0,0952620737010758 0,00195919679818347 0,035875228646397 423516 4316435 579 665 0 True 445 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 493 491 0,0113721089061956 0,0460187318834968 0,0114137483787289 0,0483100633249409 0,0018264373632851 0,0092315997651106 431512 2005532 579 665 0 True 490 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 534 485 0,0111260934149941 0,0402086011549818 0,0111696040283818 0,0457007705806058 0,001725728620398 0,0149675548236527 422177 1752322 579 665 0 False 534 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 580 490 0,0111798821260324 0,0963081312803639 0,0112306401159686 0,0918745708400092 0,00190167866780762 0,0187299169520111 424218 4197183 579 665 0 True 578 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 624 489 0,0111462279447507 0,0696224424645959 0,0112764171816587 0,0705119401846342 0,00178621839200135 0,0234138629427949 422941 3034200 579 665 0 True 622 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 668 490 0,0110613413997952 0,0853549070662465 0,0110322728313115 0,0807660028992142 0,00197753600366204 0,0215049862124704 419720 3719833 579 665 0 True 666 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 272 535 0,0106585453882769 0,054676219043833 0,0106660563057908 0,0564888990615702 0,00148565400964249 0,0138745505935076 404436 2382832 579 665 0 True 269 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 316 535 0,0107688109282005 0,103969766485337 0,0108339055466545 0,094193942168307 0,00152822420062973 0,0311901868011891 408620 4531083 579 665 0 True 313 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 359 534 0,0111166850025293 0,058344533799594 0,0111848630502785 0,0606546120393683 0,00144507557588078 0,015921437013132 421820 2542700 579 665 0 True 357 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 404 534 0,0110484806006837 0,0600618506669512 0,0110933089188983 0,0605630579079881 0,00163304175157442 0,00971093062766488 419232 2617542 579 665 0 True 401 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 448 534 0,0113784865975583 0,0573152496714434 0,0114290074006256 0,0583504997329671 0,00195585135800778 0,00929282790537849 431754 2497843 579 665 0 True 445 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 492 535 0,0113722670307749 0,0602828196607334 0,0114137483787289 0,0612497138933394 0,00191421460920006 0,0122084282865786 431518 2627172 579 665 0 True 489 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 536 535 0,0110825828016065 0,0725428815802381 0,0110933089188983 0,0719615472648203 0,00177371242742245 0,0195375867471176 420526 3161475 579 665 0 True 534 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 580 535 0,0110090548722597 0,0572974666008119 0,0110933089188983 0,0589303425650416 0,00172290265694896 0,014971805348569 417736 2497068 579 665 0 True 578 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 624 534 0,0111292295524824 0,0453844384364436 0,011108567940795 0,0447394522011139 0,00183705750149833 0,00800292444772914 422296 1977889 579 665 0 True 622 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 669 534 0,0110160650619394 0,0702272504332472 0,0109254596780346 0,0686045624475471 0,00176149371063742 0,0201298957149851 418002 3060558 579 665 0 True 666 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 269 571 0,0142367728460039 0,0331820854493753 0,0110780498970016 0,0373235675593194 0,00826344040645029 0,0180588410713536 540211 1446101 579 665 0 False 269 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 313 571 0,0152559911755943 0,0379215147045916 0,0112153810940719 0,0420996414129854 0,0104194589832033 0,0217880954628903 578885 1652649 579 665 0 False 313 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 357 571 0,0146790736482358 0,0380801855864197 0,0114137483787289 0,0429846646829938 0,00905043913983479 0,0220018746704097 556994 1659564 579 665 0 False 357 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 401 571 0,0159466002754267 0,0375674365588955 0,0117799649042496 0,0448157473105974 0,0106004632013879 0,0182968342753009 605090 1637218 579 665 0 False 401 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 445 571 0,021360337848976 0,0617313482837329 0,0120546272983902 0,0705577172503243 0,0210705092055742 0,0440197427344886 810513 2690300 579 665 0 False 445 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 489 571 0,0174615128068391 0,0456778017371192 0,0122072175173571 0,0531319142442969 0,0134344582288207 0,0273768308333532 662573 1990674 579 665 0 False 489 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 538 579 0,0109237730158561 0,0572716983578195 0,0109864957656214 0,05639734493019 0,00193806986840268 0,00856274964086972 414500 2495945 579 665 0 True 534 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 581 577 0,0110661905535586 0,0385322656607185 0,011108567940795 0,0406042572671092 0,00172028742023899 0,010434178173478 419904 1679266 579 665 0 True 578 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 626 579 0,0107755839310113 0,0512116409127649 0,0106660563057908 0,0503700312809949 0,0016334237544949 0,0107805324355183 408877 2231843 579 665 0 True 622 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 670 579 0,0108040463552746 0,0526246722321941 0,0108033875028611 0,0509956511787594 0,00168202229261195 0,00938982965236162 409957 2293424 579 665 0 True 666 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 269 614 0,0108333784647237 0,0104091540363842 0,0101319905394064 0,0104676890211337 0,00387701378976355 0,00138708352032225 411070 453639 579 665 0 False 269 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 313 614 0,0110281088840582 0,0102502995873754 0,0102082856488899 0,0101777676050965 0,00445810381420839 0,00142097829313229 418459 446716 579 665 0 False 313 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 357 614 0,0218924270581199 0,0502925659307344 0,0114442664225223 0,059510185397116 0,0215444017298214 0,035791901431584 830703 2191789 579 665 0 False 357 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 401 614 0,0206721533260253 0,0506936602205904 0,0117952239261463 0,0472266727702754 0,018749809643585 0,0385695788482943 784400 2209269 579 665 0 False 401 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 445 614 0,0128525766334302 0,0106660563057908 0,0110322728313115 0,0107118333714809 0,0092824007423895 0,00183890881055631 487688 464835 579 665 0 False 445 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 489 615 0,0109527888761467 0,0105995132027826 0,0105897611963073 0,010605020218204 0,00323482647507102 0,00188562827090749 415601 461935 579 665 0 False 489 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 533 615 0,0109137057509778 0,0105175963483899 0,0107270923933776 0,0105287251087205 0,00263960950287401 0,00202000010452735 414118 458365 579 665 0 False 533 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 578 615 0,0106223612137274 0,0104248949221302 0,0106355382619974 0,0104371709773404 0,00161805790565357 0,00182276617876514 403063 454325 579 665 0 False 578 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 622 615 0,010791185556163 0,0107749116439531 0,010605020218204 0,0106965743495842 0,00191941726985764 0,00168051596497421 409469 469579 579 665 0 False 622 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 666 615 0,0108290563928911 0,0105241359292027 0,0108033875028611 0,0105592431525139 0,00185766170001789 0,00169235475698297 410906 458650 579 665 0 False 666 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 269 664 0,00996743556061027 0,0429353310031774 0,00999465934233616 0,0437476157778286 0,00138704697836732 0,0101584711442615 378212 1871155 579 665 0 True 269 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 313 657 0,0100358244411317 0,0100739603644038 0,0100862134737163 0,0100556954299229 0,00130399357617017 0,00133758307566212 380807 439031 579 665 0 False 313 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 357 658 0,0122670413165031 0,0102855903778673 0,0103761348897536 0,0102998397802701 0,00915685684095525 0,00123337580631331 465470 448254 579 665 0 False 357 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 401 658 0,0118230011438996 0,0101858445610478 0,0103150988021668 0,0101777676050965 0,00749809780858448 0,00131339997453315 448621 443907 579 665 0 False 401 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 445 658 0,0103442200788436 0,0103420831777315 0,0103150988021668 0,0102845807583734 0,00155539417166139 0,00163695176448619 392509 450716 579 665 0 False 445 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 489 658 0,0102817872241401 0,0104171621546427 0,01025406271458 0,0104219119554437 0,00164680150669623 0,00163626355159986 390140 453988 579 665 0 False 489 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 533 658 0,0103870191316246 0,0101356159912255 0,0104982070649271 0,0100556954299229 0,00175973550279195 0,00169815250946289 394133 441718 579 665 0 False 533 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 577 658 0,0106926475891997 0,0103891681595841 0,0106813153276875 0,0103608758678569 0,00141853714461496 0,00137283140604252 405730 452768 579 665 0 False 577 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 622 658 0,0112787890503473 0,0105020390298245 0,01025406271458 0,0104982070649271 0,00852046026950393 0,00141614892339837 427971 457687 579 665 0 False 622 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 665 663 0,0107331801896783 0,044134736016053 0,0108186465247578 0,0441596093690394 0,0014146292970673 0,00970419815953024 407268 1923426 579 665 0 True 666 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D7_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D7_2.csv new file mode 100755 index 0000000..a75ec3f --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D7_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 270 268 0,00890502286679072 0,732457901448517 0,00881971465629053 0,75210193026627 0,00157979951787488 0,197950000129129 337899 31921083 579 665 13 True 269 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 314 268 0,00746593107112404 0,00726065564460476 0,00741588464179446 0,00729381246662089 0,00131344944463505 0,00122795796444044 283293 316425 579 665 0 False 314 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 359 267 0,00695033952641425 0,00688716526954833 0,00698863202868696 0,00686655985351339 0,00121912079376288 0,0013034455360469 263729 300148 579 665 0 True 358 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 403 267 0,00699909460501337 0,00710281081508991 0,00698863202868696 0,00704966811627375 0,00134379692330181 0,00130131103551708 265579 309546 579 665 0 True 402 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 447 267 0,00705662559776032 0,00748311612173028 0,00698863202868696 0,00750743877317464 0,00164011964904764 0,00165859388404354 267762 326120 579 665 0 True 446 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 492 267 0,00690482600168956 0,00739624295345826 0,00689707789730678 0,00737010757610437 0,00169529940799284 0,00167280534808226 262002 322334 579 665 0 True 490 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 537 268 0,00738360087353288 0,00762203058573419 0,00733958953231098 0,00762951094834821 0,0015042632174794 0,00157635162329379 280169 332174 579 665 0 True 534 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 580 268 0,00772681027277412 0,0077981403497299 0,00772106507972839 0,00776684214541848 0,00178208733995292 0,00179152280805778 293192 339849 579 665 0 True 578 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 622 269 0,00854908443892063 0,00833415651740934 0,0085297932402533 0,00823987182421607 0,00197518718333594 0,00187392524054388 324393 363209 579 665 0 False 622 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 665 267 0,00966694615186047 0,735178917768213 0,00967421988250553 0,744151979858091 0,00212283111571681 0,188182667963288 366810 32039667 579 665 13 True 667 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 269 311 0,00716783988515939 0,00695838933566464 0,00715648126955062 0,00688181887541009 0,00156278930750127 0,00142457616430677 271982 303252 579 665 0 False 269 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 313 311 0,00700412823745252 0,00701557051245647 0,00697337300679027 0,00697337300679027 0,00124434767510703 0,00116799782658066 265770 305744 579 665 0 False 313 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 360 312 0,00679564097972408 0,00705434907938191 0,00679026474402991 0,00711070420386053 0,00127413738252893 0,00129679607853665 257859 307434 579 665 0 True 358 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 404 312 0,0068528820774091 0,00698567200789798 0,00677500572213321 0,00695811398489357 0,00142878549891281 0,00138118989947678 260031 304441 579 665 0 True 402 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 448 312 0,00728740842116165 0,00703376660924456 0,00730907148851759 0,00717174029144732 0,00156701071890026 0,00163536717423244 276519 306537 579 665 0 True 446 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 493 313 0,00704914103434295 0,00798620492636948 0,00704966811627375 0,00712596322575723 0,00153585677650074 0,00462970570051809 267478 348045 579 665 0 True 490 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 536 312 0,00744909080343494 0,007241771170889 0,00738536659800107 0,00729381246662089 0,0014502110223235 0,00159590277682115 282654 315602 579 665 0 True 534 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 581 313 0,007834941130878 0,0079951538264292 0,00788891432059205 0,00801098649576562 0,00174610320285919 0,00196029138907837 297295 348435 579 665 0 True 578 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 622 312 0,00758415554820276 0,00765433840953953 0,00762951094834821 0,00770580605783169 0,00191660743941584 0,00190497649891381 287779 333582 579 665 0 False 622 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 666 312 0,00777801628235147 0,00794191934402268 0,00781261921110857 0,00796520943007553 0,00187524416745528 0,00182137235327553 295135 346115 579 665 0 False 666 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 271 357 0,00680064825806669 0,00693601708551534 0,00683604180972 0,00692759594110018 0,00143687804769038 0,00143086930114974 258049 302277 579 665 0 True 269 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 316 357 0,00691481420427824 0,00698243663633793 0,00688181887541009 0,00698863202868696 0,00134503496103978 0,00126828780058098 262381 304300 579 665 0 True 313 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 360 357 0,00712359135706862 0,00714686693846082 0,00709544518196384 0,00714122224765393 0,00121095671693188 0,00130824468724489 270303 311466 579 665 0 True 357 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 404 356 0,00723891688352794 0,00776108272512363 0,0072327763790341 0,00735484855420768 0,0014109027724762 0,00249018088786403 274679 338234 579 665 0 True 402 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 449 356 0,00755545593707063 0,00750241362160264 0,00758373388265812 0,00758373388265812 0,00167127100801145 0,00167120177404195 286690 326961 579 665 0 True 446 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 493 357 0,00749102017103018 0,00750273486416889 0,00750743877317464 0,00741588464179446 0,00169509040833681 0,00165861936683618 284245 326975 579 665 0 True 490 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 536 357 0,00760834860882654 0,00770023020471756 0,0076752880140383 0,00764476997024491 0,00162851426006825 0,00168852878946167 288697 335582 579 665 0 True 534 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 581 357 0,00774765636313731 0,00774157871217297 0,00775158312352178 0,00764476997024491 0,00192230883756474 0,00196621789953116 293983 337384 579 665 0 True 578 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 625 357 0,00720365510235733 0,00734844664878034 0,0072480354009308 0,00729381246662089 0,00186154041767004 0,00187319250388432 273341 320251 579 665 0 True 622 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 669 357 0,00692496053144617 0,00688558200261468 0,00698863202868696 0,00703440909437705 0,00179423279242798 0,00188084883810424 262766 300079 579 665 0 True 666 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 273 402 0,00741330194033353 0,00719945893573485 0,00718699931334401 0,00720225833524071 0,00275138751647954 0,00144928491031632 281296 313758 579 665 0 True 269 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 316 402 0,00725515100699662 0,00739247982625366 0,00717174029144732 0,00740062561989776 0,00130867208259573 0,00132167717188797 275295 322170 579 665 0 True 313 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 360 401 0,00771307978847675 0,00764008900713675 0,00749217975127794 0,0076600289921416 0,00178967830199763 0,00128739932335994 292671 332961 579 665 0 True 357 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 404 401 0,00757024058522961 0,00795768317566633 0,00762951094834821 0,00770580605783169 0,00142917940520353 0,00181594943930524 287251 346802 579 665 0 True 402 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 449 401 0,00789191868759762 0,00800208348750108 0,00779736018921187 0,00805676356145571 0,00154590580683634 0,00149317920111213 299457 348737 579 665 0 True 446 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 493 402 0,00782756198384678 0,00785961240937087 0,00781261921110857 0,00784313725490196 0,00166972326612639 0,00170645979001063 297015 342528 579 665 0 True 490 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 537 401 0,00783607435702922 0,00764380624254617 0,00776684214541848 0,00770580605783169 0,00166377137683726 0,00165486956025934 297338 333123 579 665 0 True 534 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 581 401 0,00759430187537069 0,00759821274403679 0,00762951094834821 0,00761425192645151 0,00177188801496851 0,00189575272955542 288164 331136 579 665 0 True 578 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 626 401 0,00714164391319857 0,00709287524143387 0,00709544518196384 0,00706492713817044 0,00176982178413009 0,00195483335700968 270988 309113 579 665 0 True 622 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 670 401 0,00699047681544477 0,00689175444906613 0,00703440909437705 0,00686655985351339 0,00170679639620906 0,00179199148567926 265252 300348 579 665 0 True 666 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 273 447 0,0068813708557689 0,00694643452302076 0,00679026474402991 0,00695811398489357 0,00149492052438912 0,00154270717193874 261112 302731 579 665 0 True 269 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 317 446 0,00714641400467232 0,00716621033012836 0,00720225833524071 0,00721751735713741 0,00144776264195386 0,0014420578667353 271169 312309 579 665 0 True 313 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 361 446 0,00727146419275492 0,00725092658402702 0,00732433051041428 0,0072480354009308 0,00139048613950309 0,00138658123262686 275914 316001 579 665 0 True 357 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 405 446 0,00723657136893587 0,00757533568414054 0,0072480354009308 0,00758373388265812 0,00159280416979329 0,00156755869223871 274590 330139 579 665 0 True 401 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 449 445 0,00730148150871405 0,00765479732749131 0,00733958953231098 0,00770580605783169 0,00177319790498651 0,00196426396511472 277053 333602 579 665 0 True 446 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 494 447 0,00738412795546368 0,00760945623385541 0,00735484855420768 0,00756847486076143 0,00179830309712927 0,00182756118738906 280189 331626 579 665 0 True 490 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 538 447 0,00729238934540773 0,0075726969059178 0,00727855344472419 0,00756847486076143 0,00169004973525693 0,00159990938977107 276708 330024 579 665 0 True 534 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 581 446 0,00698299225202739 0,00695545226077324 0,00692759594110018 0,00685130083161669 0,00188528778342525 0,0019004218789242 264968 303124 579 665 0 True 578 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 626 445 0,00687810294779794 0,00704982873755687 0,00689707789730678 0,00703440909437705 0,0017658155884653 0,00179116401258409 260988 307237 579 665 0 True 622 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 670 446 0,0068438689763924 0,00688397578978345 0,00674448767833982 0,00685130083161669 0,00180423686166932 0,0019348768309095 259689 300009 579 665 0 True 666 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 272 491 0,00685804748033095 0,00709877233711424 0,00688181887541009 0,00709544518196384 0,00154178494835898 0,00150639781846235 260227 309370 579 665 0 True 269 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 316 490 0,00695265868690978 0,0067873506150361 0,00692759594110018 0,00683604180972 0,0015285167789912 0,00154291452418773 263817 295798 579 665 0 True 313 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 360 490 0,00704170917911865 0,00696339154133904 0,00703440909437705 0,00691233691920348 0,00149353936144359 0,00153113960316294 267196 303470 579 665 0 True 357 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 405 491 0,00710524890587674 0,00694567730840032 0,00709544518196384 0,00695811398489357 0,00159521380491495 0,00156454552104335 269607 302698 579 665 0 True 401 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 449 490 0,00715194836494573 0,00756794710511688 0,00720225833524071 0,00772106507972839 0,00177261475845901 0,00191498036682016 271379 329817 579 665 0 True 445 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 493 491 0,0072973702696538 0,0070599937701888 0,00729381246662089 0,00712596322575723 0,00181271165656751 0,00182018065272072 276897 307680 579 665 0 True 490 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 534 485 0,00673052000717358 0,00663141029502114 0,00675974670023652 0,00660715648126955 0,0016861333797853 0,00163552197240456 255388 289002 579 665 0 False 534 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 580 490 0,00638456978189218 0,00624486370423656 0,00643930724040589 0,00628671702143893 0,00169270303753158 0,00181779858113327 242261 272156 579 665 0 True 578 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 624 489 0,00663395859745079 0,00636161243116948 0,00665293354695964 0,00627145799954223 0,00179312569965103 0,00170753712142613 251724 277244 579 665 0 True 622 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 668 490 0,00682194236807106 0,00698346920172943 0,00686655985351339 0,00698863202868696 0,00177701650006251 0,00186923230106344 258857 304345 579 665 0 True 666 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 272 535 0,00673044094488396 0,0068771838040971 0,00677500572213321 0,00685130083161669 0,00139174048752231 0,00156255411982468 255385 299713 579 665 0 True 269 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 316 535 0,00694306579576919 0,0069778933486153 0,00697337300679027 0,00694285496299687 0,00139493596243 0,00143867229020259 263453 304102 579 665 0 True 313 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 359 534 0,0068961027957348 0,00694673281968942 0,00695811398489357 0,00692759594110018 0,0013959377854557 0,00137860482954789 261671 302744 579 665 0 True 357 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 404 534 0,0069876042189219 0,00687537107818757 0,00698863202868696 0,00692759594110018 0,00154777096660331 0,00156588232914869 265143 299634 579 665 0 True 401 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 448 534 0,00686687610267187 0,00690029032296925 0,00698863202868696 0,00686655985351339 0,0019169412502445 0,00207438223892644 260562 300720 579 665 0 True 445 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 492 535 0,00672308815194929 0,00688874853648197 0,00672922865644312 0,0068055237659266 0,00180385107115796 0,00196081222369598 255106 300217 579 665 0 True 489 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 536 535 0,00667451755202595 0,0066691104047599 0,00671396963454643 0,00665293354695964 0,00165024151705388 0,00179606249222558 253263 290645 579 665 0 True 534 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 580 535 0,00666845610982174 0,0067292745482383 0,00668345159075303 0,00669871061264973 0,00160328533223053 0,00169693925344185 253033 293267 579 665 0 True 578 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 624 534 0,00651786880219182 0,00667539758069929 0,00663767452506294 0,00659189745937285 0,00164899834580272 0,0018559675576166 247319 290919 579 665 0 True 622 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 669 534 0,00656072056316596 0,0069971220107949 0,00650034332799268 0,00698863202868696 0,00171341085346915 0,00180142641752577 248945 304940 579 665 0 True 666 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 269 571 0,00702729348831123 0,00678936985402394 0,00708018616006714 0,0068055237659266 0,00142052405554987 0,00119738597725807 266649 295886 579 665 0 False 269 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 313 571 0,00695582117849458 0,00716290612087555 0,00695811398489357 0,00706492713817044 0,00137857474521158 0,00144190227744347 263937 312165 579 665 0 False 313 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 357 571 0,00692098106286862 0,00692470475800396 0,00688181887541009 0,00689707789730678 0,00134104386124585 0,00126200937821223 262615 301784 579 665 0 False 357 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 401 571 0,00684147075360725 0,00659003884166814 0,0068207827878233 0,00653086137178607 0,00146981734323539 0,00141477235973488 259598 287199 579 665 0 False 401 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 445 571 0,0067300719875324 0,00700269786390903 0,00672922865644312 0,00701915007248035 0,00178789778257724 0,00208839913709505 255371 305183 579 665 0 False 445 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 489 571 0,00663872868892455 0,00687456797177196 0,00663767452506294 0,00683604180972 0,00185329065375743 0,00191809428240469 251905 299599 579 665 0 False 489 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 538 579 0,0066263949717438 0,00686876265968194 0,00665293354695964 0,00689707789730678 0,0019066692727601 0,00181946730074409 251437 299346 579 665 0 True 534 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 581 577 0,00668326711207725 0,00688934512981928 0,00663767452506294 0,00685130083161669 0,00161886005154157 0,00162120409007743 253595 300243 579 665 0 True 578 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 626 579 0,00665680759915103 0,00690898681815548 0,00666819256885634 0,00695811398489357 0,00149879548740069 0,00147897631236677 252591 301099 579 665 0 True 622 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 670 579 0,00639447892219124 0,00702153644582961 0,00642404821850919 0,00708018616006714 0,00158200235479886 0,0016900995854456 242637 306004 579 665 0 True 666 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 269 614 0,00677682415479447 0,0070856931754885 0,00677500572213321 0,00709544518196384 0,00131560404280169 0,00132077561001878 257145 308800 579 665 0 False 269 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 313 614 0,00689657716947252 0,00676208718179059 0,00688181887541009 0,00669871061264973 0,00135554215851298 0,00127660519146028 261689 294697 579 665 0 False 313 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 357 614 0,00649892020677951 0,00669118435824053 0,00646982528419928 0,00674448767833982 0,00131541760076721 0,00139775594194943 246600 291607 579 665 0 False 357 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 401 614 0,00656261805811684 0,00654001678492409 0,00653086137178607 0,00657663843747616 0,00143828276496138 0,001298359527084 249017 285019 579 665 0 False 401 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 445 614 0,00644254879428032 0,00673402434903923 0,00651560234988937 0,00669871061264973 0,00183444110822306 0,00185551715097278 244461 293474 579 665 0 False 445 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 489 615 0,00643387829651864 0,00653370666308711 0,00651560234988937 0,00650034332799268 0,00183020292607284 0,00183466984829722 244132 284744 579 665 0 False 489 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 533 615 0,00661912124109874 0,00663606831223171 0,00665293354695964 0,00669871061264973 0,00186428900979288 0,00192189530249805 251161 289205 579 665 0 False 533 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 578 615 0,00641403366182397 0,00633327424764704 0,00648508430609598 0,00628671702143893 0,0015119144980774 0,00167806371009395 243379 276009 579 665 0 False 578 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 622 615 0,00743970874506668 0,0067403574167738 0,00685130083161669 0,00662241550316625 0,00536699825306736 0,0018711120188618 282298 293750 579 665 0 False 622 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 666 615 0,00692308939059182 0,00687096546585048 0,00691233691920348 0,00695811398489357 0,00154388026449673 0,00146976791235509 262695 299442 579 665 0 False 666 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 269 664 0,0085637373165969 0,706010184536645 0,00837720302128634 0,727138170443275 0,00176779783552475 0,222426193018509 324949 30768471 579 665 12 True 269 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 313 657 0,00724142052269924 0,00679937426537275 0,00720225833524071 0,00675974670023652 0,00146904196730416 0,00128556557230945 274774 296322 579 665 0 False 313 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 357 658 0,00634669894516411 0,00625087552940488 0,0063782711528191 0,00625619897764553 0,00123727831431549 0,00114140604473423 240824 272418 579 665 0 False 357 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 401 658 0,00623066185809821 0,00613302539938769 0,00621042191195544 0,00616464484626535 0,00125476776615387 0,00134750060837053 236421 267282 579 665 0 False 401 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 445 658 0,00622668238952066 0,00637010241327741 0,00616464484626535 0,00636301213092241 0,00140668559952129 0,00159337823863441 236270 277614 579 665 0 False 445 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 489 658 0,00634812206637727 0,00635716092703721 0,00628671702143893 0,0063935301747158 0,0016089886204863 0,00151888540288505 240878 277050 579 665 0 False 489 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 533 658 0,00653165199468227 0,00622233083280414 0,00654612039368277 0,00613412680247196 0,00169223877135553 0,00169000285774628 247842 271174 579 665 0 False 533 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 577 658 0,00649472990542964 0,00641007416687748 0,00648508430609598 0,00634775310902571 0,0014068352671791 0,00130659183867997 246441 279356 579 665 0 False 577 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 622 658 0,0131593383171565 0,00686977227917585 0,00695811398489357 0,00688181887541009 0,0505304123419941 0,00143825994574082 499328 299390 579 665 0 False 622 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 665 663 0,00850773486144927 0,728078217975701 0,00849927519645991 0,747661554894331 0,00159406159398783 0,211220138038029 322824 31730213 579 665 14 True 666 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D7_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D7_3.csv new file mode 100755 index 0000000..ae958b3 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D7_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 270 268 0,00105463823534024 0,0740540066118604 0,000915541313801785 0,0737621118486305 0,000803169287203888 0,0230349421212329 40018 3227331 579 665 0 True 269 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 314 268 0,000857298760448246 0,000832752515300611 0,000732433051041428 0,000686655985351339 0,000633863778433804 0,000632056291074636 32530 36292 579 665 0 False 314 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 359 267 0,000836083712733496 0,000905605740145741 0,000717174029144732 0,00080872816052491 0,000618907992769148 0,000619079162851904 31725 39467 579 665 0 True 358 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 403 267 0,000890610338474886 0,00085707516674497 0,000717174029144732 0,000701915007248035 0,00070945599309254 0,000673579829627568 33794 37352 579 665 0 True 402 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 447 267 0,000885075978201473 0,000882843409737436 0,000671396963454643 0,000579842832074464 0,000789641602100978 0,000876786416081942 33584 38475 579 665 0 True 446 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 492 267 0,00100561961577572 0,00090094772293517 0,000823987182421607 0,000717174029144732 0,00085189797773543 0,000771446040120345 38158 39264 579 665 0 True 490 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 537 268 0,000934885220662192 0,000983300549382153 0,000793469138628214 0,000793469138628214 0,000751140408724994 0,000818067099652754 35474 42853 579 665 0 True 534 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 580 268 0,00104886668819796 0,000946908355805972 0,00080872816052491 0,000610360875867857 0,000905190228089428 0,000932385251545884 39799 41267 579 665 0 True 578 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 622 269 0,00104169837393907 0,00101549364369954 0,000732433051041428 0,000625619897764553 0,0010212734771514 0,0010225376004483 39527 44256 579 665 0 False 622 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 665 267 0,00114590247165848 0,0743606785331376 0,000915541313801785 0,0728160524910353 0,00102698967208819 0,0225261145924178 43481 3240696 579 665 0 True 667 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 269 311 0,00100272066515631 0,000887226076176938 0,000885023270008392 0,000671396963454643 0,0007562180648222 0,000732449816019469 38048 38666 579 665 0 False 269 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 313 311 0,000908004042191327 0,000774607610810042 0,000778210116731518 0,000686655985351339 0,00067748492839617 0,00058015008495253 34454 33758 579 665 0 False 313 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 360 312 0,000857904904668668 0,000907762654519109 0,000762951094834821 0,00080872816052491 0,000631712499794044 0,000693811775856921 32553 39561 579 665 0 True 358 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 404 312 0,00085903813081989 0,000845716947438406 0,000686655985351339 0,00064087891966125 0,000702474781379812 0,000714673305718501 32596 36857 579 665 0 True 402 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 448 312 0,000906659983267784 0,00104043583437881 0,000686655985351339 0,000762951094834821 0,00082230535657126 0,00094067362349171 34403 45343 579 665 0 True 446 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 493 313 0,000877644122977175 0,00100163432155578 0,000625619897764553 0,000778210116731518 0,000829730561549489 0,000909231403617161 33302 43652 579 665 0 True 490 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 536 312 0,000918229431648872 0,000897505838296818 0,000732433051041428 0,000747692072938125 0,000769984219525392 0,00077318991510004 34842 39114 579 665 0 True 534 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 581 313 0,000932671476552826 0,000968729904413127 0,00064087891966125 0,000625619897764553 0,000908748003902107 0,00101863545282177 35390 42218 579 665 0 True 578 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 622 312 0,000884259001208731 0,000964186616690502 0,000442511635004196 0,000488288700694286 0,00100418421034117 0,00106006170821032 33553 42020 579 665 0 False 622 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 666 312 0,00101937645416963 0,000968592229027593 0,000610360875867857 0,00064087891966125 0,00105597237352999 0,00094479795208415 38680 42212 579 665 0 False 666 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 271 357 0,000829837791853501 0,000874422265322266 0,000625619897764553 0,000732433051041428 0,00071784431015469 0,000743900138063187 31488 38108 579 665 0 True 269 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 316 357 0,000863307494459381 0,000823780669343306 0,000747692072938125 0,000732433051041428 0,000654130220933641 0,000627949292798037 32758 35901 579 665 0 True 313 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 360 357 0,000888976384489402 0,000951245130450296 0,000747692072938125 0,000793469138628214 0,00070749795953155 0,00067927675615657 33732 41456 579 665 0 True 357 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 404 356 0,000953464858722936 0,000933943923668177 0,000747692072938125 0,000762951094834821 0,000785449048676126 0,000733573429103314 36179 40702 579 665 0 True 402 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 449 356 0,000951936321123612 0,000981441931677442 0,00064087891966125 0,000686655985351339 0,000873425336426278 0,000886655357762158 36121 42772 579 665 0 True 446 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 493 357 0,00103123579761266 0,00102118422630162 0,000793469138628214 0,00080872816052491 0,000928982255920372 0,000874183208863956 39130 44504 579 665 0 True 490 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 536 357 0,000930431378346921 0,000943994226812167 0,000686655985351339 0,000762951094834821 0,000819298347148648 0,000821543607032838 35305 41140 579 665 0 True 534 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 581 357 0,000985274253246792 0,00104422190748099 0,000686655985351339 0,000534065766384375 0,000983472639478239 0,00113911046860933 37386 45508 579 665 0 True 578 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 625 357 0,000989411846403582 0,000926371777463802 0,000549324788281071 0,000564583810177768 0,00107585909736381 0,000979784379669055 37543 40372 579 665 0 True 622 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 669 357 0,000941315620217967 0,000878759039966591 0,000534065766384375 0,000442511635004196 0,000950364840131183 0,000965115878012243 35718 38297 579 665 0 True 666 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 273 402 0,00087975245070038 0,000919189711518439 0,000701915007248035 0,000793469138628214 0,000763309140689884 0,000741921148380594 33382 40059 579 665 0 True 269 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 316 402 0,000928797424361437 0,000835643698396827 0,000793469138628214 0,000701915007248035 0,000675492126859369 0,000661144772949212 35243 36418 579 665 0 True 313 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 360 401 0,000899544377201967 0,000885642809243296 0,000778210116731518 0,000701915007248035 0,000721512597007277 0,000718791332468613 34133 38597 579 665 0 True 357 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 404 401 0,000976682817774731 0,000982772793737606 0,00080872816052491 0,00080872816052491 0,00075406545145666 0,000787385535222958 37060 42830 579 665 0 True 402 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 449 401 0,000959658071409851 0,000947482003245697 0,000717174029144732 0,000732433051041428 0,000849010175290821 0,000818111677919729 36414 41292 579 665 0 True 446 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 493 402 0,000912958612340859 0,00102067941655466 0,000610360875867857 0,000778210116731518 0,000849132669616712 0,000918197080089009 34642 44482 579 665 0 True 490 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 537 401 0,000871108307035239 0,000945485710155453 0,00064087891966125 0,000732433051041428 0,000843134609781432 0,000808110779835557 33054 41205 579 665 0 True 534 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 581 401 0,000896882613451421 0,000943099336806195 0,000625619897764553 0,000534065766384375 0,000912999944019413 0,00102353481035892 34032 41101 579 665 0 True 578 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 626 401 0,00103740265620304 0,000927312559264951 0,000595101853971161 0,000534065766384375 0,00107645782587218 0,0010012791186114 39364 40413 579 665 0 True 622 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 670 401 0,000962846917091198 0,000844271355890298 0,00064087891966125 0,000442511635004196 0,000926297841618664 0,000942826767918848 36535 36794 579 665 0 True 666 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 273 447 0,000941552807086827 0,000952025290968323 0,000732433051041428 0,000778210116731518 0,000835235469288705 0,000813247423098306 35727 41490 579 665 0 True 269 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 317 446 0,000943503010230792 0,000878506635093111 0,000823987182421607 0,000701915007248035 0,000771231616069393 0,000812091984842596 35801 38286 579 665 0 True 313 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 361 446 0,000888633781234381 0,000924444322066324 0,000778210116731518 0,000869764248111696 0,000683948939673961 0,000684117714475946 33719 40288 579 665 0 True 357 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 405 446 0,000943634780713492 0,000906890710410726 0,000778210116731518 0,000732433051041428 0,00081050049105742 0,000796335567855996 35806 39523 579 665 0 True 401 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 449 445 0,000945242380602436 0,000933622681101931 0,000671396963454643 0,000534065766384375 0,000915475281284742 0,000996389953725343 35867 40688 579 665 0 True 446 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 494 447 0,000967195343020309 0,000904619066549413 0,000656137941557946 0,000595101853971161 0,000941128303625829 0,000887215307574431 36700 39424 579 665 0 True 490 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 538 447 0,000913907359816301 0,000866322363473343 0,00064087891966125 0,000579842832074464 0,000880436074764146 0,00087227885798249 34678 37755 579 665 0 True 534 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 581 446 0,00091735974646305 0,000879745713562919 0,000579842832074464 0,000473029678797589 0,000934136526635701 0,00100045338138961 34809 38340 579 665 0 True 578 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 626 445 0,000961133900816094 0,000948308055558902 0,000595101853971161 0,000625619897764553 0,000978258686947481 0,000953926247884928 36470 41328 579 665 0 True 622 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 670 446 0,000853345645967237 0,000968821688003483 0,000442511635004196 0,000488288700694286 0,000968465906930366 0,00104269909908087 32380 42222 579 665 0 True 666 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 272 491 0,000982190823951604 0,00093878550805946 0,000854505226215 0,000823987182421607 0,000772998751125313 0,000773133965784349 37269 40913 579 665 0 True 269 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 316 490 0,000875272254288569 0,000799090883537523 0,000747692072938125 0,000625619897764553 0,000754403905952414 0,000761361752376403 33212 34825 579 665 0 True 313 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 360 490 0,00083803391587746 0,000940299937300335 0,000686655985351339 0,000793469138628214 0,000747327153216184 0,00081104654271099 31799 40979 579 665 0 True 357 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 405 491 0,000879093598286878 0,000869695410418929 0,000625619897764553 0,000579842832074464 0,000845984148607587 0,000867480344016381 33357 37902 579 665 0 True 401 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 449 490 0,00096785419543381 0,0009420438255171 0,000564583810177768 0,000518806744487678 0,00102256425080784 0,00102656270506031 36725 41055 579 665 0 True 445 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 493 491 0,000995684121380117 0,00092173670615082 0,000686655985351339 0,000518806744487678 0,000981627456975751 0,00096926910251895 37781 40170 579 665 0 True 490 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 534 485 0,000788198319320201 0,000970083712370879 0,000564583810177768 0,000701915007248035 0,000774506541046384 0,000883787792838521 29908 42277 579 665 0 False 534 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 580 490 0,000898068547795724 0,000879814551255686 0,000549324788281071 0,000534065766384375 0,000903239994230802 0,000944480234025637 34077 38343 579 665 0 True 578 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 624 489 0,000838771830580582 0,000889796016706908 0,000473029678797589 0,000518806744487678 0,000874983446299692 0,000877953199493425 31827 38778 579 665 0 True 622 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 668 490 0,000947666957484122 0,00090656946784448 0,000595101853971161 0,000518806744487678 0,000938374956401001 0,00095527812712297 35959 39509 579 665 0 True 666 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 272 535 0,00076685150112275 0,00082226624010243 0,000579842832074464 0,00064087891966125 0,000706966603963408 0,00073271994796612 29098 35835 579 665 0 True 269 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 316 535 0,000857087927675926 0,000843078169215669 0,000732433051041428 0,000671396963454643 0,000719259255021011 0,000730610663087483 32522 36742 579 665 0 True 313 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 359 534 0,000873796424882326 0,000912581293012802 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000753787714061282 0,000771666187580338 33156 39771 579 665 0 True 357 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 404 534 0,000877327873818694 0,000852004123377797 0,000671396963454643 0,00064087891966125 0,000819640159314576 0,000781835701553675 33290 37131 579 665 0 True 401 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 448 534 0,000950223304848508 0,000809462429247759 0,00064087891966125 0,000366216525520714 0,000976478338785701 0,000971575735464476 36056 35277 579 665 0 True 445 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 492 535 0,000925265975425069 0,000949891322492544 0,000534065766384375 0,00064087891966125 0,000956787521582913 0,000998204131334128 35109 41397 579 665 0 True 489 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 536 535 0,000876458188632872 0,000826075259102207 0,000534065766384375 0,0004272526131075 0,000911847048330906 0,000924673467869208 33257 36001 579 665 0 True 534 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 580 535 0,000927664198210214 0,000871324569147749 0,000656137941557946 0,000579842832074464 0,000856941986389928 0,000847554888859319 35200 37973 579 665 0 True 578 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 624 534 0,000929403568581858 0,000827796201421384 0,000579842832074464 0,000442511635004196 0,000958071163174349 0,000902079914975523 35266 36076 579 665 0 True 622 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 669 534 0,000935754905848014 0,000834794700186034 0,000579842832074464 0,000457770656900893 0,000943274254102233 0,000944734489471324 35507 36381 579 665 0 True 666 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 269 571 0,000930405024250381 0,000914439910717512 0,000793469138628214 0,000839246204318303 0,000713685573783844 0,000653995013477807 35304 39852 579 665 0 False 269 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 313 571 0,000911087471486515 0,000833303216842748 0,000793469138628214 0,000671396963454643 0,000735300493568677 0,000740359587016328 34571 36316 579 665 0 False 313 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 357 571 0,000918888284062373 0,000876372666617333 0,000839246204318303 0,000747692072938125 0,000720926161177647 0,000689682831092388 34867 38193 579 665 0 False 357 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 401 571 0,000844517023626316 0,000859920458046008 0,000671396963454643 0,000656137941557946 0,000739181257622414 0,000755339661471914 32045 37476 579 665 0 False 401 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 445 571 0,000966009408676006 0,000925798130024076 0,000625619897764553 0,000503547722590982 0,000990999688232316 0,00102953112792845 36655 40347 579 665 0 False 445 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 489 571 0,000844121712178215 0,000901039506525526 0,000442511635004196 0,000473029678797589 0,000950975626407036 0,00103268077385923 32030 39268 579 665 0 False 489 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 538 579 0,000914961523677904 0,000827842093216562 0,000534065766384375 0,000473029678797589 0,000988288932732225 0,000869987752269387 34718 36078 579 665 0 True 534 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 581 577 0,000876985270563673 0,000956201444329524 0,000610360875867857 0,000717174029144732 0,000854948033267914 0,000856091163882375 33277 41672 579 665 0 True 578 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 626 579 0,000933646578124809 0,000886881887713103 0,000717174029144732 0,000717174029144732 0,0007941297065531 0,000746831371861277 35427 38651 579 665 0 True 622 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 670 579 0,000911482782934616 0,000862788695244635 0,000686655985351339 0,000595101853971161 0,000831096772384314 0,000824187090997758 34586 37601 579 665 0 True 666 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 269 614 0,000902416973724834 0,00092196616512671 0,000778210116731518 0,000747692072938125 0,000689407307513859 0,000728060302638076 34242 40180 579 665 0 False 269 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 313 614 0,00086307030759052 0,000806502408458776 0,000717174029144732 0,000686655985351339 0,000692657111296207 0,000659916828470118 32749 35148 579 665 0 False 313 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 357 614 0,00085872188166141 0,00094812448837819 0,000701915007248035 0,00080872816052491 0,000729783456365522 0,000792339091194168 32584 41320 579 665 0 False 357 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 401 614 0,000958498491162088 0,000846129973595008 0,00080872816052491 0,000701915007248035 0,000737546897454432 0,000656559280166784 36370 36875 579 665 0 False 401 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 445 614 0,000872610490538023 0,00089466054699578 0,000595101853971161 0,000473029678797589 0,000864732440506268 0,000993546666293433 33111 38990 579 665 0 False 445 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 489 615 0,000841328177944968 0,000904091310904866 0,000442511635004196 0,000503547722590982 0,00095431598916936 0,000974270148070728 31924 39401 579 665 0 False 489 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 533 615 0,000901204685283991 0,00098151076937021 0,000518806744487678 0,000503547722590982 0,000947533800907162 0,00109285215147867 34196 42775 579 665 0 False 533 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 578 615 0,000830681122942783 0,000837387586613593 0,000579842832074464 0,000518806744487678 0,0007940549395276 0,000869430891812373 31520 36494 579 665 0 False 578 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 622 615 0,000922577857577982 0,000951222184552707 0,000656137941557946 0,000762951094834821 0,000867926043651256 0,000741524598223166 35007 41455 579 665 0 False 622 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 666 615 0,000895933865975979 0,000847231376679281 0,000686655985351339 0,000579842832074464 0,000778512091404114 0,000807401598159888 33996 36923 579 665 0 False 666 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 269 664 0,000999057445737245 0,0713477445043141 0,000823987182421607 0,0715495536736095 0,000735058357214472 0,0249847471294725 37909 3109390 579 665 0 True 269 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 313 657 0,000920522238047857 0,000846313540775721 0,00080872816052491 0,000732433051041428 0,000646569764228729 0,000646511789672141 34929 36883 579 665 0 False 313 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 357 658 0,000864809677962164 0,000854344604931876 0,000717174029144732 0,000747692072938125 0,000644029574548218 0,000621719790029503 32815 37233 579 665 0 False 357 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 401 658 0,000848022118466144 0,000881489601779684 0,000717174029144732 0,000717174029144732 0,000653311500284805 0,000708466002949156 32178 38416 579 665 0 False 401 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 445 658 0,000830180395108522 0,000835919049167896 0,000595101853971161 0,000610360875867857 0,000785697576504115 0,000774554569291415 31501 36430 579 665 0 False 445 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 489 658 0,000860593022515754 0,00090142958678454 0,000564583810177768 0,000686655985351339 0,000853895767900114 0,000818788032495341 32655 39285 579 665 0 False 489 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 533 658 0,000943503010230792 0,000774102801063083 0,000625619897764553 0,000473029678797589 0,000967955056580907 0,00080036110602164 35801 33736 579 665 0 False 533 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 577 658 0,000944557174092395 0,000881558439472451 0,000778210116731518 0,000732433051041428 0,000796177818686089 0,00067641760935241 35841 38419 579 665 0 False 577 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 622 658 0,00132869448526035 0,000937018673945105 0,000762951094834821 0,000778210116731518 0,0037605170160683 0,000694613296226977 50417 40836 579 665 0 False 622 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 665 663 0,00103350224991511 0,0738882225017797 0,000885023270008392 0,07348744945449 0,000739149989725552 0,0243148652989948 39216 3220106 579 665 0 True 666 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D8_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D8_1.csv new file mode 100755 index 0000000..46e9d6e --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D8_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 240 245 0,011111336069205 0,046457893417453 0,0112153810940719 0,0462043183031968 0,00166806561237998 0,00841400397750233 485697 2024671 667 665 0 True 240 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 284 244 0,0110896485838106 0,011369806984846 0,0111238269626917 0,011306935225452 0,00146496852344644 0,00147400072788921 484749 495505 667 665 0 False 284 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 328 244 0,011183902212318 0,0646187911986421 0,0112458991378653 0,0640421149004349 0,00141263808240208 0,00919099532839121 488869 2816137 667 665 0 True 329 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 372 242 0,0112433597803982 0,0890070679101048 0,0112458991378653 0,0892042420080873 0,00136014055348709 0,0177454797986034 491468 3878997 667 665 0 True 373 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 416 243 0,0112561251990164 0,0756642808669649 0,0112458991378653 0,0718242160677501 0,00161165731240647 0,0147739427782134 492026 3297508 667 665 0 True 417 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 460 243 0,0113128832699695 0,0694415828997993 0,0113221942473487 0,0728465705348287 0,00163907919853248 0,0202974127219967 494507 3026318 667 665 0 True 461 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 504 243 0,0111947459550152 0,0832561375973695 0,0111848630502785 0,0797436484321355 0,00169285333901762 0,0249951527986234 489343 3628367 667 665 0 True 506 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 549 242 0,0109808680004241 0,0721366474093221 0,0108949416342412 0,0698252841992828 0,00157007329256675 0,0193139239712581 479994 3143771 667 665 0 True 550 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 594 245 0,0108227872788257 0,0108566678770628 0,0107881284809644 0,0108491645685512 0,00186708832525145 0,00201802790991683 473084 473142 667 665 0 False 594 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 636 243 0,0109771161569593 0,0461302489457794 0,0108949416342412 0,0466620889600977 0,00184636253900633 0,00907799430130137 479830 2010392 667 665 0 True 638 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 240 287 0,0108573316912155 0,0108523999401112 0,0108339055466545 0,0109254596780346 0,00151132873832461 0,00163518092697479 474594 472956 667 665 0 False 240 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 284 287 0,01099452562572 0,0108242453237695 0,0110017547875181 0,0108033875028611 0,00141233026090917 0,00147797415402484 480591 471729 667 665 0 False 284 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 329 288 0,0112948789967571 0,123397438434723 0,011261158159762 0,11958495460441 0,00136898935499328 0,0354962770973679 493720 5377756 667 665 0 True 328 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 373 288 0,0112331565963413 0,0543358166530999 0,011261158159762 0,053177691309987 0,00149897013292785 0,00773824403327465 491022 2367997 667 665 0 True 373 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 417 287 0,011320752990408 0,0827504788522003 0,011306935225452 0,0796368352788586 0,00159169936502758 0,0160990410673029 494851 3606330 667 665 0 True 417 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 460 288 0,0111293403424175 0,0439404760470643 0,0111238269626917 0,0458075837338827 0,00176231672075602 0,00780522864636511 486484 1914960 667 665 0 True 461 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 506 287 0,0110728110424074 0,0499794462122346 0,0110170138094148 0,0505226214999619 0,00171339889282488 0,0126201994497529 484013 2178143 667 665 0 True 506 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 550 288 0,0109422057110607 0,0591948628724478 0,0110475318532082 0,0572365911345083 0,0016564124854143 0,0165730763951921 478304 2579758 667 665 0 True 550 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 594 288 0,0108535340935621 0,0110165089996679 0,0108339055466545 0,0110627908751049 0,00185429814751703 0,0019294452146382 474428 480108 667 665 0 False 594 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 638 288 0,0108032044861067 0,0110389730334075 0,0108186465247578 0,0110627908751049 0,00204167016045134 0,00204102706506891 472228 481087 667 665 0 False 638 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 241 333 0,0109777795926939 0,0522814016042624 0,0110627908751049 0,050766765850309 0,00154978759703079 0,00931921238337329 479859 2278464 667 665 0 True 240 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 285 332 0,0110333251776492 0,0676616466779216 0,0110933089188983 0,067856870374609 0,00149549372169436 0,0217033345798809 482287 2948747 667 665 0 True 284 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 329 332 0,0112140999767912 0,0414116775114715 0,0112153810940719 0,0428778515297169 0,0013722362367761 0,00657126698678214 490189 1804753 667 665 0 True 328 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 373 332 0,0111888894188749 0,0381541861061443 0,0111848630502785 0,0378881513694972 0,00131588915510406 0,00590870767094252 489087 1662789 667 665 0 True 373 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 417 332 0,0114102481833013 0,0799521578035269 0,0113832303349355 0,0761425192645151 0,00159453573302871 0,0189697177397511 498763 3484377 667 665 0 True 417 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 462 332 0,0114002737701875 0,0344474140260241 0,0113984893568322 0,0352788586251621 0,0017060251293266 0,00442804051762421 498327 1501245 667 665 0 True 461 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 506 332 0,0112032333569997 0,0315758267263489 0,0112306401159686 0,0319371328297856 0,00173914779876698 0,00329612905899698 489714 1376099 667 665 0 True 505 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 550 332 0,0111668130228774 0,0542149606104985 0,0111543450064851 0,0546120393682765 0,0017385213802678 0,00903971636759333 488122 2362730 667 665 0 True 550 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 595 332 0,0109573503474859 0,0582614696503217 0,0109254596780346 0,0597543297474632 0,00196992540272894 0,0129980312024665 478966 2539080 667 665 0 True 594 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 638 330 0,0110950247009706 0,0643496358199229 0,0109407186999313 0,0635233081559472 0,00236288658081742 0,0182937176845103 484984 2804407 667 665 0 True 638 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 241 378 0,0113806223461856 0,0431116472802514 0,0113374532692454 0,0455024032959487 0,0016933436658482 0,0097496585613001 497468 1878839 667 665 0 True 240 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 285 376 0,0114719934608114 0,0371465170135226 0,0114290074006256 0,0349126420996414 0,00144287795995639 0,0086462842452802 501462 1618874 667 665 0 True 284 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 330 376 0,011829836969819 0,0874252006762156 0,0116884107728695 0,084443427176318 0,00175997096980849 0,018466374372327 517104 3810058 667 665 0 True 328 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 373 375 0,011217462909653 0,0669885517180454 0,0112306401159686 0,0662241550316625 0,00141931232690393 0,0169427627799928 490336 2919413 667 665 0 True 373 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 418 376 0,0113142101414388 0,0458800239325712 0,011261158159762 0,0472266727702754 0,00169973049110957 0,00717558225002797 494565 1999487 667 665 0 True 417 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 462 376 0,0111318110686017 0,0574468443941164 0,0112001220721752 0,0578927290760662 0,00173161936226221 0,0101510229165121 486592 2503578 667 665 0 True 461 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 506 376 0,0112085637199711 0,0458370233204894 0,0112458991378653 0,0456549935149157 0,0018757696329217 0,006831457179611 489947 1997613 667 665 0 True 505 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 550 377 0,0112248064569226 0,05201656005429 0,0112306401159686 0,0521095597772183 0,0017888987835237 0,00863440251627169 490657 2266922 667 665 0 True 550 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 595 375 0,0109176814659734 0,0437791434411159 0,0110017547875181 0,0447394522011139 0,00200636234201219 0,00781171497139913 477232 1907929 667 665 0 True 594 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 638 375 0,0109637101797007 0,087221280484342 0,0110170138094148 0,0833905546654459 0,00196049285120214 0,0165476324884686 479244 3801171 667 665 0 True 638 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 241 421 0,0112671748355623 0,0441916877338689 0,0113984893568322 0,0442053864347295 0,00167562609204935 0,00609986252435303 492509 1925908 667 665 0 True 240 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 285 420 0,0113910771782797 0,0571453582456943 0,0114442664225223 0,0566262302586404 0,00154668683953056 0,0101251762140183 497925 2490439 667 665 0 True 284 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 330 420 0,0110987536673412 0,0374243000497352 0,0111543450064851 0,0377508201724269 0,0013970428673835 0,00514443759876361 485147 1630980 667 665 0 True 328 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 373 420 0,0112092500328 0,0585781918747429 0,0112458991378653 0,05468833447776 0,00141449749588107 0,0145237884282334 489977 2552883 667 665 0 True 372 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 418 420 0,0113278906438289 0,0961892256390576 0,0113984893568322 0,0953383688105592 0,00155323257241473 0,0136986016577892 495163 4192001 667 665 0 True 417 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 462 420 0,0110688990592824 0,0624789715189783 0,0110933089188983 0,0606851300831617 0,00175147428556193 0,014043510165367 483842 2722882 667 665 0 True 461 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 506 420 0,0111028486672205 0,0553271253207406 0,0110933089188983 0,0542458228427558 0,00171200965263603 0,0095879085241409 485326 2411199 667 665 0 True 505 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 550 421 0,0111342360405972 0,0324043342505956 0,0111238269626917 0,0327000839246204 0,00175707449496443 0,00423148320884052 486698 1412206 667 665 0 True 549 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 595 421 0,0108792250704586 0,0414507543750656 0,0109407186999313 0,0421454184786755 0,00194642784404429 0,00628530696712746 475551 1806456 667 665 0 True 594 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 638 418 0,0113878515079837 0,0689851660508561 0,0110933089188983 0,0693064774547952 0,00282051097164211 0,0126366463923022 497784 3006427 667 665 0 True 638 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 240 466 0,0109888978605227 0,0623175012376443 0,0109254596780346 0,0628061341268025 0,00156192549954784 0,0185630648440518 480345 2715845 667 665 0 True 240 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 285 465 0,0113252140237961 0,05872564221265 0,0112306401159686 0,0580910963607233 0,00162720129808406 0,0109339646399978 495046 2559309 667 665 0 True 284 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 329 465 0,0110349036971558 0,0685174598202992 0,0110475318532082 0,0665598535133898 0,00159099829631318 0,0160855855773522 482356 2986044 667 665 0 True 328 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 373 464 0,0114497798022481 0,0873395436405158 0,0114442664225223 0,0824750133516442 0,00149090097608217 0,0222822377337691 500491 3806325 667 665 0 True 372 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 418 464 0,0113800275417338 0,0965676493820957 0,0113679713130388 0,0917067215991455 0,00192805758051939 0,0296733390826146 497442 4208493 667 665 0 True 417 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 461 465 0,0111971251728221 0,0467997184538366 0,0112916762035554 0,0477759975585565 0,0020477535269005 0,007358250395255 489447 2039568 667 665 0 True 461 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 505 464 0,0112666715394878 0,0425618635740186 0,0113374532692454 0,0440985732814527 0,00196616783236467 0,00735854575632696 492487 1854879 667 665 0 True 505 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 550 465 0,0110879328017383 0,0972081382214979 0,0110627908751049 0,0953688868543526 0,00190706046981508 0,0174819863782849 484674 4236406 667 665 0 True 549 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 595 464 0,0111179475494571 0,0619173018377943 0,0110475318532082 0,065644312199588 0,00226798129257958 0,0140307587778296 485986 2698404 667 665 0 True 594 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 638 463 0,0108259671949331 0,0812810465164972 0,0108796826123445 0,0778362706950484 0,00201057205999442 0,0156782799293373 473223 3542291 667 665 0 True 638 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 241 510 0,0109886233353911 0,0579458717748824 0,0110017547875181 0,0602426184481575 0,0015833588181417 0,0140489088641498 480333 2525326 667 665 0 True 239 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 285 509 0,0111461092525378 0,101179935418771 0,0112916762035554 0,0946364538033112 0,001520753213405 0,0303019017166309 487217 4409500 667 665 0 True 284 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 329 509 0,0111237583314088 0,0556157158747177 0,0110933089188983 0,0581521324483101 0,0015276671646681 0,0118427872605055 486240 2423776 667 665 0 True 328 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 373 508 0,0115348139617534 0,058943215213589 0,011459525444419 0,0574959945067521 0,0019895827956396 0,011424340507282 504208 2568791 667 665 0 True 372 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 418 508 0,0115274475373895 0,0557141078835794 0,0114442664225223 0,0559090562294957 0,00216153713077962 0,00681779415151874 503886 2428064 667 665 0 True 416 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 462 509 0,0112014718207387 0,0596607334311976 0,0112001220721752 0,0597848477912566 0,00198424713522463 0,012334206703575 489637 2600061 667 665 0 True 461 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 506 509 0,0110996229969245 0,07079635458525 0,0110322728313115 0,0688181887541009 0,00183235832407654 0,0168129835680158 485185 3085360 667 665 0 True 505 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 550 509 0,0109332150130016 0,0555268234674578 0,0108949416342412 0,0567330434119173 0,00175863577180717 0,0122146358713711 477911 2419902 667 665 0 True 549 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 594 509 0,0107314161641999 0,0450445867472527 0,0106813153276875 0,0435339894712749 0,00192905337531541 0,00870596431816151 469090 1963078 667 665 0 True 593 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 639 507 0,0111173069908168 0,0640633169098071 0,0109407186999313 0,0655069810025177 0,00249963851405956 0,0137290383527488 485958 2791929 667 665 0 True 638 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 241 554 0,0105592431525139 0,0439525914809913 0,0105897611963073 0,0447089341573205 0,00129822595765506 0,00945686474844137 461564 1915488 667 665 0 True 239 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 285 552 0,0106301621448374 0,0517649123954312 0,0106355382619974 0,0521858548867018 0,00140606524230256 0,0140146768123535 464664 2255955 667 665 0 True 284 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 329 553 0,010864743869768 0,0491288188427122 0,0109254596780346 0,0489356832227054 0,00145839567020642 0,0102045229400012 474918 2141072 667 665 0 True 328 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 374 552 0,0110643693946115 0,0507234439956609 0,0110780498970016 0,0495155260547799 0,001546470522053 0,00773781735942733 483644 2210567 667 665 0 True 372 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 418 552 0,0113971167311744 0,0859984477100281 0,0112153810940719 0,0812695506218051 0,00224536972798297 0,0220449223628056 498189 3747879 667 665 0 True 416 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 462 553 0,011146429531858 0,0608500193032364 0,0112306401159686 0,059510185397116 0,00210585032964872 0,0113651482933447 487231 2651891 667 665 0 True 461 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 507 553 0,0109860153466412 0,054550039552991 0,0110170138094148 0,0546120393682765 0,00206036084020909 0,00724693619332222 480219 2377333 667 665 0 True 505 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 549 548 0,0109457516606769 0,0340984298695927 0,0108949416342412 0,0381322957198444 0,00186680239053824 0,0113604912014583 478459 1486036 667 665 0 False 549 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 594 553 0,0107608132303727 0,0469937489638493 0,0108186465247578 0,0475165941863127 0,00167147888462952 0,00674298552606124 470375 2048024 667 665 0 True 593 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 638 551 0,0110424760153684 0,0522127474786761 0,0109254596780346 0,0520180056458381 0,00221706075788421 0,00770397788125708 482687 2275472 667 665 0 True 638 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 239 591 0,0105948170341472 0,0104589925259475 0,0104829480430304 0,0104371709773404 0,00169653281260126 0,00122644095627203 463119 455811 667 665 0 False 239 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 283 591 0,0104234447207616 0,0105236540653534 0,010452429999237 0,0105287251087205 0,00154250304510863 0,00145933952551348 455628 458629 667 665 0 False 283 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 330 597 0,0106329989045303 0,0720618208372843 0,0106660563057908 0,0684672312504769 0,00145775773370524 0,0113992662326374 464788 3140510 667 665 0 True 328 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 374 596 0,0109912770783297 0,0738440745948185 0,0110322728313115 0,0711833371480888 0,00139867413410413 0,0218031245818914 480449 3218182 667 665 0 True 372 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 416 591 0,011023327887441 0,011914611431302 0,0110933089188983 0,0113374532692454 0,00185506301242429 0,00345726301150422 481850 519248 667 665 0 False 416 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 460 592 0,0107599667778837 0,0110062980752407 0,0108339055466545 0,0110017547875181 0,00198903442319149 0,00185444010363732 470338 479663 667 665 0 False 460 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 505 592 0,0108479063283648 0,0107456785704247 0,0108644235904479 0,0108033875028611 0,00207269216718784 0,00228023459347449 474182 468305 667 665 0 False 505 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 549 592 0,0104573256974168 0,0105263387353713 0,0104676890211337 0,0105134660868238 0,00205741416546926 0,00179781867941964 457109 458746 667 665 0 False 549 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 593 592 0,0106207367819867 0,0104224856028834 0,0105897611963073 0,0103761348897536 0,00167326782163028 0,00168211271086102 464252 454220 667 665 0 False 593 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 637 592 0,0106253122008462 0,0105088310155109 0,0106660563057908 0,0105287251087205 0,00166600324230308 0,00146914984189438 464452 457983 667 665 0 False 637 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 242 641 0,0103671441916945 0,0438301521714563 0,0103913939116503 0,0438239108873121 0,00141821678724889 0,00814578621983943 453167 1910152 667 665 0 True 239 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 283 634 0,0101641786110836 0,0103036717451675 0,01025406271458 0,0102998397802701 0,00140334963896301 0,00138328692005174 444295 449042 667 665 0 False 283 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 328 635 0,0105384478737971 0,0104371250855452 0,0103761348897536 0,0103303578240635 0,00202474081483696 0,00144607187818863 460655 454858 667 665 0 False 328 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 372 635 0,0105847053584675 0,0103867588403373 0,0104982070649271 0,0103456168459602 0,00161766908292986 0,0013276427253324 462677 452663 667 665 0 False 372 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 416 635 0,0106329989045303 0,0105715650995192 0,0105592431525139 0,0105745021744106 0,0017351895338087 0,00155293883988036 464788 460717 667 665 0 False 416 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 460 635 0,0102972775457087 0,0104665646721519 0,0103913939116503 0,0105592431525139 0,00176790556569739 0,00187751739678103 450113 456141 667 665 0 False 460 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 505 635 0,0104672543563421 0,0104766838129886 0,0104982070649271 0,0104829480430304 0,00182651662030591 0,00190142656016851 457543 456582 667 665 0 False 505 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 549 635 0,0104245885754765 0,0103396738584846 0,0103608758678569 0,0103456168459602 0,001802561778402 0,00174441696617945 455678 450611 667 665 0 False 549 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 593 635 0,0105042008636332 0,0103111750536791 0,0104371709773404 0,0102845807583734 0,00172389753824123 0,00136288696476963 459158 449369 667 665 0 False 593 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 638 639 0,0105002202492254 0,0408895206659358 0,0104219119554437 0,0419470511940185 0,00147749633281397 0,00892039569760116 458984 1781997 667 665 0 True 637 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D8_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D8_2.csv new file mode 100755 index 0000000..f8f790d --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D8_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 240 245 0,00874595890427412 0,705110498838077 0,00859082932784009 0,694926375219348 0,0018507206841276 0,180719490446736 382302 30729262 667 665 10 True 240 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 284 244 0,00752786801838266 0,00740764706456 0,00746166170748455 0,00746166170748455 0,00148018224772319 0,00140717727153103 329057 322831 667 665 0 False 284 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 328 244 0,00714701015251129 0,00724165644140105 0,00717174029144732 0,00733958953231098 0,00121464635310757 0,001253364095252 312409 315597 667 665 0 True 329 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 372 242 0,00702420591032019 0,00690515485325812 0,00703440909437705 0,00688181887541009 0,00127705009911372 0,00120350328270777 307041 300932 667 665 0 True 373 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 416 243 0,007274161042619 0,00748123455812798 0,00727855344472419 0,00747692072938125 0,00148145396160514 0,00137439801054577 317967 326038 667 665 0 True 417 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 460 243 0,00750860550498383 0,00783329346483627 0,00752269779507134 0,00772106507972839 0,00163422454439284 0,00177281432633834 328215 341381 667 665 0 True 461 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 504 243 0,00770658387903782 0,00785541331011209 0,007690547035935 0,00785839627679866 0,0015746710047657 0,0015576134786162 336869 342345 667 665 0 True 506 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 549 242 0,0078753482036734 0,00813147540400555 0,00791943236438544 0,00814831769283589 0,0014344852887491 0,0013261786689069 344246 354376 667 665 0 True 550 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 594 245 0,00871560100014081 0,00869358105724371 0,00849927519645991 0,00863660639353018 0,00200648173200849 0,00208047830929951 380975 378873 667 665 0 False 594 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 636 243 0,0101752282476294 0,713857314377727 0,0101625085831998 0,721507591363394 0,00189569435913236 0,19602507845136 444778 31110455 667 665 10 True 638 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 240 287 0,00716021023592118 0,00690370926171001 0,00712596322575723 0,00689707789730678 0,00156511806531714 0,00140441169775697 312986 300869 667 665 0 False 240 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 284 287 0,00689209069074984 0,00671509398352829 0,00689707789730678 0,00669871061264973 0,00129424708740745 0,00136740464149026 301266 292649 667 665 0 False 284 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 329 288 0,00709965456731465 0,00728247719321192 0,00714122224765393 0,0072632944228275 0,00131016140562265 0,00136910017013248 310339 317376 667 665 0 True 328 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 373 288 0,00705538738984822 0,00718424580563333 0,00700389105058366 0,0072632944228275 0,00129749575145556 0,00124202700869191 308404 313095 667 665 0 True 373 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 417 287 0,00742755195988639 0,008015208540922 0,00741588464179446 0,00772106507972839 0,00140005594568294 0,00236548989967886 324672 349309 667 665 0 True 417 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 460 288 0,00763118097623196 0,00764594021102195 0,0076600289921416 0,00758373388265812 0,00172148229078772 0,00178643760155944 333573 333216 667 665 0 True 461 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 506 287 0,00770841404658165 0,00770153812088014 0,00772106507972839 0,00773632410162509 0,00152313664708136 0,00152109525149647 336949 335639 667 665 0 True 506 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 550 288 0,00783611398695251 0,00806892488717789 0,00779736018921187 0,0081025406271458 0,00151622212105506 0,00147483677105259 342531 351650 667 665 0 True 550 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 594 288 0,00800165264129208 0,00813581217864988 0,00807202258335241 0,0080872816052491 0,00196963953372379 0,00193272744831623 349767 354565 667 665 0 False 594 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 638 288 0,00881738119267215 0,00865672994571574 0,00885023270008392 0,00863660639353018 0,00207589252753576 0,00194052928400862 385424 377267 667 665 0 False 638 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 241 333 0,00664632206670755 0,00666043685547125 0,00662241550316625 0,00663767452506294 0,00136327722834977 0,00143731285129998 290523 290267 667 665 0 True 240 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 285 332 0,00689595691968619 0,00665809637391717 0,00689707789730678 0,00662241550316625 0,00130787095397087 0,00136767596754135 301435 290165 667 665 0 True 284 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 329 332 0,0071751947326863 0,00703183915384708 0,00712596322575723 0,00700389105058366 0,00128453695560907 0,00125239734749388 313641 306453 667 665 0 True 328 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 373 332 0,00729225682420863 0,00723426786237739 0,00738536659800107 0,0072327763790341 0,00129115813683857 0,0012221327753213 318758 315275 667 665 0 True 373 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 417 332 0,0075578598890072 0,00776610787669563 0,00747692072938125 0,00779736018921187 0,00167073570742121 0,00144501975546814 330368 338453 667 665 0 True 417 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 462 332 0,00793883214035006 0,00784944737673894 0,00784313725490196 0,00784313725490196 0,00164707321457235 0,00149587146522241 347021 342085 667 665 0 True 461 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 506 332 0,00778194102765509 0,00777721369112871 0,00779736018921187 0,00779736018921187 0,00163363016257574 0,00151890217972303 340163 338937 667 665 0 True 505 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 550 332 0,00799737462465837 0,00803175253308368 0,00804150453955901 0,0081177996490425 0,00165447666105454 0,00133931355417118 349580 350030 667 665 0 True 550 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 595 332 0,00800840138410996 0,00831371172265752 0,00804150453955901 0,00842298008697642 0,00205854254664309 0,00204063487107597 350062 362318 667 665 0 True 594 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 638 330 0,0082938846438534 0,00813351758889097 0,00816357671473259 0,00819409475852598 0,00224132307802875 0,0018788821704517 362541 354465 667 665 0 True 638 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 241 378 0,0071197864102968 0,00707961251262741 0,00704966811627375 0,00709544518196384 0,00153757163617061 0,00155769299218753 311219 308535 667 665 0 True 240 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 285 376 0,00717649872706128 0,00713007054142566 0,00720225833524071 0,00717174029144732 0,00144637879485615 0,00135408315493347 313698 310734 667 665 0 True 284 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 330 376 0,00775412248098885 0,00764616966999784 0,00779736018921187 0,0076600289921416 0,00147204983073821 0,00148114508489238 338947 333226 667 665 0 True 328 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 373 375 0,00757803748617795 0,00773446548392038 0,00756847486076143 0,00773632410162509 0,0013080458534832 0,00128096966954072 331250 337074 667 665 0 True 373 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 418 376 0,0076078920942367 0,00826894427646135 0,00759899290455482 0,00802624551766232 0,00156738795430162 0,00203260950364996 332555 360367 667 665 0 True 417 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 462 376 0,00773188594533129 0,00779811740383231 0,00776684214541848 0,00776684214541848 0,00166097631799057 0,00166770691110397 337975 339848 667 665 0 True 461 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 506 376 0,00777944742437662 0,00743311701088381 0,00787365529869535 0,00746166170748455 0,00163130884626787 0,00171278609371654 340054 323941 667 665 0 True 505 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 550 377 0,00772410773327001 0,00803824622210137 0,00776684214541848 0,00787365529869535 0,00165588235513969 0,00216716531225728 337635 350313 667 665 0 True 550 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 595 375 0,00777299608378461 0,00792581132391519 0,00779736018921187 0,00794995040817884 0,00198469541021831 0,0020677183344531 339772 345413 667 665 0 True 594 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 638 375 0,0074502460374299 0,00727538691085691 0,00746166170748455 0,00738536659800107 0,00193900965497724 0,00168777623532757 325664 317067 667 665 0 True 638 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 241 421 0,00729982914242124 0,00722474531487795 0,00730907148851759 0,0072327763790341 0,00149204120538926 0,00150465805262689 319089 314860 667 665 0 True 240 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 285 420 0,00710473328224878 0,0072835556503986 0,00714122224765393 0,00729381246662089 0,00143033589733647 0,00148248425084496 310561 317423 667 665 0 True 284 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 330 420 0,00724641112723565 0,00752634619278799 0,00718699931334401 0,00758373388265812 0,00134295632395753 0,00125568549818172 316754 328004 667 665 0 True 328 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 373 420 0,0074513441379562 0,00744000078016052 0,00744640268558785 0,00743114366369116 0,00134100468858517 0,00134154748340859 325712 324241 667 665 0 True 372 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 418 420 0,00747602852270363 0,0073531276118885 0,00753795681696803 0,00732433051041428 0,00151241010856906 0,00146349977062147 326791 320455 667 665 0 True 417 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 462 420 0,0075546113416169 0,00755642826452719 0,00749217975127794 0,00759899290455482 0,00163954839627459 0,00140804952514633 330226 329315 667 665 0 True 461 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 506 420 0,00748540813136577 0,00763728960763089 0,00752269779507134 0,007690547035935 0,00166493482852348 0,00165421934587894 327201 332839 667 665 0 True 505 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 550 421 0,00737758838593978 0,00747398365448985 0,00746166170748455 0,00741588464179446 0,00173998765181933 0,0014770552759557 322488 325722 667 665 0 True 549 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 595 421 0,00665888159147709 0,00711208095771587 0,00671396963454643 0,00708018616006714 0,00181848824033613 0,00192167229645064 291072 309950 667 665 0 True 594 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 638 418 0,00664494944104967 0,00667535168890411 0,00656137941557946 0,0068055237659266 0,00196061087095757 0,00181461773756622 290463 290917 667 665 0 True 638 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 240 466 0,00701079993306162 0,00718277726818764 0,00697337300679027 0,00712596322575723 0,00139649181387456 0,00163795747309524 306455 313031 667 665 0 True 240 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 285 465 0,0069805792914941 0,00715957896572514 0,00700389105058366 0,00714122224765393 0,00154646356676454 0,00154640220718423 305134 312020 667 665 0 True 284 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 329 465 0,0070273629493333 0,00678489540399408 0,00700389105058366 0,00677500572213321 0,00152591383121946 0,00149529021227283 307179 295691 667 665 0 True 328 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 373 464 0,00735404785590725 0,00724766826656938 0,00740062561989776 0,00732433051041428 0,00146465651901534 0,00143824766269909 321459 315859 667 665 0 True 372 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 418 464 0,00734180861045788 0,00765638059442495 0,00737010757610437 0,0076752880140383 0,00174311238360753 0,00166168265617227 320924 333671 667 665 0 True 417 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 461 465 0,00756122282186899 0,00763478850479369 0,00753795681696803 0,00756847486076143 0,0019246035772463 0,00193384706163832 330515 332730 667 665 0 True 461 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 505 464 0,0075557094421432 0,00736618382761665 0,00759899290455482 0,00733958953231098 0,00197301810223449 0,00176283981647463 330274 321024 667 665 0 True 505 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 550 465 0,00698032764345683 0,00696444705262814 0,00689707789730678 0,00698863202868696 0,00175078487707291 0,00169890769570764 305123 303516 667 665 0 True 549 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 595 464 0,00635049836034146 0,00657767100286766 0,00628671702143893 0,00657663843747616 0,00190677949059689 0,00182561198896989 277592 286660 667 665 0 True 594 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 638 463 0,00631103537267759 0,00651691026605195 0,00631723506523232 0,00660715648126955 0,00172664299869069 0,00181197648915458 275867 284012 667 665 0 True 638 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 241 510 0,00717784847562486 0,00723417607878703 0,00717174029144732 0,0072632944228275 0,0014271852334622 0,00144339286171884 313757 315271 667 665 0 True 239 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 285 509 0,00716208615765361 0,00713979960200341 0,00717174029144732 0,00711070420386053 0,00150179548133828 0,00142653030120225 313068 311158 667 665 0 True 284 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 329 509 0,00703054286544071 0,00718908739002462 0,00703440909437705 0,0072480354009308 0,0015534042836735 0,00162971907049264 307318 313306 667 665 0 True 328 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 373 508 0,00720376822346437 0,00714145170662982 0,00721751735713741 0,00704966811627375 0,00159259768735142 0,00148600920504641 314890 311230 667 665 0 True 372 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 418 508 0,00724531302670935 0,00754917736088906 0,00714122224765393 0,00756847486076143 0,00175908164284165 0,00177360920401853 316706 328999 667 665 0 True 416 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 462 509 0,00709205937200775 0,00707874056851903 0,00711070420386053 0,00706492713817044 0,00183282095353376 0,00163234473874779 310007 308497 667 665 0 True 461 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 506 509 0,00699162892803999 0,00690900976405307 0,00700389105058366 0,00689707789730678 0,00172690463003752 0,00167887424579524 305617 301100 667 665 0 True 505 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 550 509 0,00674110186838373 0,00679685021663796 0,00671396963454643 0,00685130083161669 0,00166963130202845 0,0016822014925237 294666 296212 667 665 0 True 549 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 594 509 0,00646598193235724 0,0066569949708329 0,0064087891966125 0,00666819256885634 0,001730391760413 0,00167482706414251 282640 290117 667 665 0 True 593 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 639 507 0,00674080446615786 0,00657163623180175 0,00671396963454643 0,00657663843747616 0,00187476658680661 0,00196768542761207 294653 286397 667 665 0 True 638 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 241 554 0,00708787286375123 0,00692204303388363 0,00714122224765393 0,00689707789730678 0,00131739127859862 0,00128176903001994 309824 301668 667 665 0 True 239 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 285 552 0,00681131167078397 0,00695586528692984 0,00686655985351339 0,00694285496299687 0,00131957215101676 0,00149400248741976 297735 303142 667 665 0 True 284 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 329 553 0,00703868711101076 0,00720999110272821 0,00711070420386053 0,00721751735713741 0,00138515881360257 0,00139682704546764 307674 314217 667 665 0 True 328 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 374 552 0,0069457603539727 0,00699211980512049 0,00697337300679027 0,00698863202868696 0,00139682542948817 0,00128092267216462 303612 304722 667 665 0 True 372 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 418 552 0,00701446026814929 0,00684742297492415 0,00700389105058366 0,0068055237659266 0,00175461254876196 0,00168800573268035 306615 298416 667 665 0 True 416 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 462 553 0,00673034963406372 0,00711818456647455 0,00679026474402991 0,00717174029144732 0,00197249770728666 0,00187098747440523 294196 310216 667 665 0 True 461 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 507 553 0,00680053655936966 0,00666091871932062 0,00688181887541009 0,00659189745937285 0,0018465395682626 0,0020561932874999 297264 290288 667 665 0 True 505 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 549 548 0,00667427787593958 0,00685485744574299 0,00672922865644312 0,00683604180972 0,00176537363379884 0,0018018000174775 291745 298740 667 665 0 False 549 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 594 553 0,00692533110876468 0,00666227252727837 0,00698863202868696 0,00671396963454643 0,00156021906084368 0,00145095336758598 302719 290347 667 665 0 True 593 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 638 551 0,00688355753457673 0,00674065571344245 0,00694285496299687 0,00665293354695964 0,00176324146044879 0,00171752420430007 300893 293763 667 665 0 True 638 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 239 591 0,00747696648356984 0,00740475588146379 0,00746166170748455 0,00738536659800107 0,00127411616975738 0,00116656552259684 326832 322705 667 665 0 False 239 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 283 591 0,00704298800473876 0,00726946686927894 0,00704966811627375 0,0072327763790341 0,00131992726834116 0,00139808955836042 307862 316809 667 665 0 False 283 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 330 597 0,0067957323695671 0,0069791553729827 0,00679026474402991 0,00695811398489357 0,001419908975487 0,00149302219020991 297054 304157 667 665 0 True 328 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 374 596 0,00708682051741353 0,0071676100298813 0,00706492713817044 0,00720225833524071 0,0013857614214958 0,00127850759478582 309778 312370 667 665 0 True 372 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 416 591 0,00679319301210004 0,00705680429042393 0,0068207827878233 0,00686655985351339 0,00157680452256675 0,00207565780613906 296943 307541 667 665 0 False 416 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 460 592 0,00679010460436982 0,00659309064604748 0,00675974670023652 0,00660715648126955 0,00186920816198864 0,00173511466081306 296808 287332 667 665 0 False 460 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 505 592 0,00690046370726287 0,00687874412513316 0,00688181887541009 0,0068207827878233 0,00194770702870195 0,00207941855394041 301632 299781 667 665 0 False 505 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 549 592 0,00680106273253852 0,00675352836198989 0,00668345159075303 0,00675974670023652 0,00186712105411012 0,001681311402482 297287 294324 667 665 0 False 549 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 593 592 0,00691167348346884 0,00675761273176074 0,00686655985351339 0,00669871061264973 0,00159180997110678 0,00161992458461697 302122 294502 667 665 0 False 593 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 637 592 0,00698815160970671 0,00667544347249447 0,00695811398489357 0,00663767452506294 0,00150588455543277 0,0014654694836766 305465 290921 667 665 0 False 637 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 242 641 0,00885789652667372 0,724984307874286 0,00878919661249714 0,717952239261463 0,00177531824447726 0,179988667590008 387195 31595378 667 665 11 True 239 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 283 634 0,00780692281462839 0,00728571256477197 0,00744640268558785 0,0072480354009308 0,00224473482094512 0,00139833063626489 341255 317517 667 665 0 False 283 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 328 635 0,00676745628101491 0,00698211539377168 0,00668345159075303 0,00675974670023652 0,00128766513621604 0,00186210811215026 295818 304286 667 665 0 False 328 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 372 635 0,00679461139194651 0,00638526965158375 0,00677500572213321 0,0063935301747158 0,00131639287191312 0,00124105557880422 297005 278275 667 665 0 False 372 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 416 635 0,00668306268014997 0,00643815994552644 0,00669871061264973 0,0064087891966125 0,00149748183085678 0,00140247133905331 292129 280580 667 665 0 False 416 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 460 635 0,00662280441376931 0,00663634366300278 0,00656137941557946 0,00660715648126955 0,00163498048194029 0,00173657370928386 289495 289217 667 665 0 False 460 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 505 635 0,00664515533489836 0,00646649812904888 0,00662241550316625 0,00657663843747616 0,00175277314647708 0,00186060031728435 290472 281815 667 665 0 False 505 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 549 635 0,00672012357291256 0,00658733122575264 0,00668345159075303 0,00657663843747616 0,00172686190061197 0,00166459026726388 293749 287081 667 665 0 False 549 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 593 635 0,00704989688721673 0,00679795161972223 0,00697337300679027 0,00677500572213321 0,00165291981940004 0,00130812307392207 308164 296260 667 665 0 False 593 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 638 639 0,00826620335975295 0,654105531624897 0,00819409475852598 0,664408331425956 0,00169110693716234 0,209717718112993 361331 28506426 667 665 5 True 637 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D8_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D8_3.csv new file mode 100755 index 0000000..aec2ef8 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D8_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 240 245 0,00100906287529158 0,0708365099060308 0,000778210116731518 0,0685740444037537 0,000853133319530182 0,020060686349651 44108 3087110 667 665 0 True 240 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 284 244 0,000963857736958941 0,000911984699675488 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,000724516864168506 0,000724487209491862 42132 39745 667 665 0 False 284 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 328 244 0,000869375337508632 0,000847460835655171 0,000747692072938125 0,000747692072938125 0,000645392301266575 0,000582092982697662 38002 36933 667 665 0 True 329 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 372 242 0,000937892234930829 0,000850260235161031 0,000823987182421607 0,000762951094834821 0,000651511878421138 0,000597069164618872 40997 37055 667 665 0 True 373 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 416 243 0,000961341256586172 0,000956614470486126 0,000823987182421607 0,000793469138628214 0,000716198411568004 0,000747175566068406 42022 41690 667 665 0 True 417 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 460 243 0,00101674957897568 0,000919717467162986 0,000854505226215 0,000778210116731518 0,000839151780558133 0,000746286178811288 44444 40082 667 665 0 True 461 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 504 243 0,000988725138460753 0,00102568162222907 0,000778210116731518 0,000854505226215 0,000875309172665392 0,000828293874631636 43219 44700 667 665 0 True 506 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 549 242 0,00102278913187032 0,00107850307847899 0,000869764248111696 0,000976577401388571 0,000790792062932909 0,000753133809782211 44708 47002 667 665 0 True 550 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 594 245 0,00101686396444717 0,001025406271458 0,000656137941557946 0,000610360875867857 0,00100429076700316 0,00106252958219729 44449 44688 667 665 0 False 594 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 636 243 0,00121630647253622 0,0720663411791094 0,000915541313801785 0,070923933775845 0,00105586187652926 0,0217848121359926 53167 3140707 667 665 0 True 638 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 240 287 0,000944274944239942 0,000920199331012356 0,000747692072938125 0,000671396963454643 0,000781084603186153 0,000815444209967755 41276 40103 667 665 0 False 240 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 284 287 0,000871045365392378 0,000879263849713549 0,000747692072938125 0,000732433051041428 0,000660839708617729 0,000708107590466382 38075 38319 667 665 0 False 284 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 329 288 0,00092363980518324 0,000839911635348385 0,000793469138628214 0,000686655985351339 0,000674740682618862 0,000636319890156518 40374 36604 667 665 0 True 328 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 373 288 0,000876284219986596 0,000824124857807141 0,000793469138628214 0,000701915007248035 0,000658817661327308 0,000602792849778785 38304 35916 667 665 0 True 373 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 417 287 0,000913688269163656 0,000918570172283536 0,000717174029144732 0,000701915007248035 0,000754357453145596 0,000790167724644013 39939 40032 667 665 0 True 417 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 460 288 0,0009990884621777 0,0010377282184633 0,000732433051041428 0,000762951094834821 0,000935122200280873 0,0009826041459389 43672 45225 667 665 0 True 461 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 506 287 0,000962141954886599 0,000977013373442762 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000839883413298697 0,000870050311683126 42057 42579 667 665 0 True 506 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 550 288 0,000983257512923557 0,000993809770477923 0,000762951094834821 0,000793469138628214 0,000850359761745796 0,000796335481242552 42980 43311 667 665 0 True 550 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 594 288 0,00105715052750576 0,000996700953574139 0,000686655985351339 0,000579842832074464 0,00103025267642856 0,00106020255456492 46210 43437 667 665 0 False 594 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 638 288 0,0011197422575048 0,00102620937787362 0,000839246204318303 0,000686655985351339 0,00104743002665195 0,00100838958937829 48946 44723 667 665 0 False 638 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 241 333 0,000897834442815214 0,000906248225278233 0,000732433051041428 0,000778210116731518 0,00073824504100477 0,000749472555599389 39246 39495 667 665 0 True 240 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 285 332 0,000857250477530747 0,000870016652985175 0,000717174029144732 0,000747692072938125 0,000686856616320468 0,0006663126185405 37472 37916 667 665 0 True 284 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 329 332 0,000822202769066371 0,000869856031702052 0,000671396963454643 0,000793469138628214 0,000619152954653955 0,000615746034294798 35940 37909 667 665 0 True 328 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 373 332 0,00080872816052491 0,000844982678715557 0,000671396963454643 0,000732433051041428 0,000615519026219709 0,000623791351932561 35351 36825 667 665 0 True 373 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 417 332 0,000902638632617772 0,000903976581416921 0,000686655985351339 0,000686655985351339 0,000782093144954329 0,000797098649465693 39456 39396 667 665 0 True 417 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 462 332 0,00091940754273813 0,000989312374550476 0,000625619897764553 0,000793469138628214 0,000864184644720791 0,000812424567309231 40189 43115 667 665 0 True 461 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 506 332 0,000934140391465975 0,00105817301321512 0,000732433051041428 0,000885023270008392 0,000850177038845612 0,00088084650994473 40833 46116 667 665 0 True 505 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 550 332 0,000952579329470078 0,000956935713052372 0,000732433051041428 0,000793469138628214 0,000846301836132473 0,000768312642518345 41639 41704 667 665 0 True 550 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 595 332 0,00102773058423867 0,000987178406074697 0,000656137941557946 0,000518806744487678 0,0010760195487931 0,00112834608031276 44924 43022 667 665 0 True 594 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 638 330 0,000983028741980578 0,00099667800767655 0,000595101853971161 0,000701915007248035 0,00101432169277526 0,00097473569978279 42970 43436 667 665 0 True 638 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 241 378 0,000881317180732133 0,0009280468279878 0,000701915007248035 0,000762951094834821 0,000804060204543989 0,000809611602863643 38524 40445 667 665 0 True 240 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 285 376 0,000904034135369944 0,000902530989868813 0,000762951094834821 0,000747692072938125 0,000748228016337724 0,000735823957101835 39517 39333 667 665 0 True 284 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 330 376 0,000826320646039992 0,000874009239165664 0,000717174029144732 0,000747692072938125 0,000663905135141611 0,000673676610079088 36120 38090 667 665 0 True 328 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 373 375 0,000907351314043139 0,00085590492596793 0,000747692072938125 0,000717174029144732 0,000716720931735224 0,000688549319264226 39662 37301 667 665 0 True 373 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 418 376 0,000911126034602291 0,000979514476279965 0,000671396963454643 0,000762951094834821 0,00081549866664843 0,000829225009893708 39827 42688 667 665 0 True 417 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 462 376 0,000984927540807303 0,000989014077881818 0,000686655985351339 0,00064087891966125 0,000896699407142951 0,000898989636175233 43053 43102 667 665 0 True 461 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 506 376 0,00100000354594962 0,000984333114773659 0,000701915007248035 0,000671396963454643 0,000951121195735383 0,000964398612495528 43712 42898 667 665 0 True 505 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 550 377 0,000978247429272317 0,000996884520754851 0,000732433051041428 0,000823987182421607 0,000895573584027059 0,000824399089639224 42761 43445 667 665 0 True 550 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 595 375 0,00106124552738508 0,000933599735204342 0,000625619897764553 0,000457770656900893 0,00112389188935157 0,00106463995377214 46389 40687 667 665 0 True 594 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 638 375 0,000990143518307223 0,000967582609533676 0,000656137941557946 0,000625619897764553 0,000994594520684002 0,000992821888280956 43281 42168 667 665 0 True 638 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 241 421 0,000907374191137437 0,000956086714841579 0,000747692072938125 0,000747692072938125 0,000800662160338067 0,000827314805654192 39663 41667 667 665 0 True 240 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 285 420 0,00086438813095169 0,000916986905349893 0,000762951094834821 0,000762951094834821 0,000688095530957371 0,000748443765974942 37784 39963 667 665 0 True 284 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 330 420 0,000923022123637197 0,000897941810351009 0,000823987182421607 0,000778210116731518 0,00067871844714352 0,000691588301201107 40347 39133 667 665 0 True 328 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 373 420 0,000840664584164773 0,000857465247003983 0,000717174029144732 0,000747692072938125 0,000700182225420397 0,000663763687770073 36747 37369 667 665 0 True 372 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 418 420 0,000984012457035387 0,000858681379576201 0,000747692072938125 0,000595101853971161 0,000852383323356376 0,000766642007114606 43013 37422 667 665 0 True 417 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 462 420 0,000915449805424594 0,00102659945813263 0,00064087891966125 0,000854505226215 0,000834319611045232 0,000829745082654836 40016 44740 667 665 0 True 461 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 506 420 0,000922061285676686 0,000968592229027593 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000842573471711048 0,000862418090450397 40305 42212 667 665 0 True 505 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 550 421 0,000950451759700374 0,000955283608425963 0,000671396963454643 0,000747692072938125 0,000899947939563946 0,000841022836646975 41546 41632 667 665 0 True 549 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 595 421 0,000915221034481615 0,000969785415702222 0,000595101853971161 0,000610360875867857 0,000950746720301519 0,000993879547959282 40006 42264 667 665 0 True 594 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 638 418 0,00101071002608103 0,000951336914040652 0,000656137941557946 0,00064087891966125 0,00102322676607147 0,000938424287590777 44180 41460 667 665 0 True 638 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 240 466 0,000849586650940952 0,000927977990295033 0,000656137941557946 0,000747692072938125 0,000745468918661215 0,000774477461876209 37137 40442 667 665 0 True 240 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 285 465 0,00092462352023805 0,000918180092024522 0,000762951094834821 0,000778210116731518 0,000810752559937795 0,000798429608291735 40417 40015 667 665 0 True 284 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 329 465 0,000927483157025287 0,00095441166431758 0,00080872816052491 0,000854505226215 0,000791796793684244 0,000795625936531654 40542 41594 667 665 0 True 328 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 373 464 0,000937205922101892 0,000846267648980542 0,000823987182421607 0,00064087891966125 0,000782218415539962 0,000724482937698453 40967 36881 667 665 0 True 372 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 418 464 0,00102203418775849 0,000898721970869036 0,000732433051041428 0,000579842832074464 0,000971441519511218 0,000910109788178152 44675 39167 667 665 0 True 417 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 461 465 0,000949696815588544 0,00100135897078471 0,000518806744487678 0,000610360875867857 0,00106105263216454 0,00105791468957251 41513 43640 667 665 0 True 461 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 505 464 0,00100025519398689 0,00098873872711075 0,000671396963454643 0,000686655985351339 0,000996555470058902 0,000943603845521766 43723 43090 667 665 0 True 505 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 550 465 0,000839841008770049 0,000879998118436398 0,000503547722590982 0,000549324788281071 0,000902481233345149 0,000922245817672636 36711 38351 667 665 0 True 549 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 595 464 0,00091364251497506 0,000904504337061468 0,000534065766384375 0,000518806744487678 0,000986067229359029 0,000917870626930685 39937 39419 667 665 0 True 594 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 638 463 0,000866561454909991 0,000915931394060799 0,000473029678797589 0,000579842832074464 0,000932150907356482 0,000961554650481315 37879 39917 667 665 0 True 638 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 241 510 0,000874568437914254 0,000889956637990031 0,000717174029144732 0,000732433051041428 0,000698286542863595 0,00072389267711582 38229 38785 667 665 0 True 239 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 285 509 0,000831033327465359 0,000929469473638319 0,00064087891966125 0,00080872816052491 0,00076418540803439 0,000787826656596443 36326 40507 667 665 0 True 284 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 329 509 0,000937594832704957 0,000937546429589653 0,000793469138628214 0,000854505226215 0,000781234278797085 0,000782177522196041 40984 40859 667 665 0 True 328 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 373 508 0,000801110088123711 0,000872793106593446 0,000610360875867857 0,000686655985351339 0,000742046201276968 0,000782463012977367 35018 38037 667 665 0 True 372 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 418 508 0,00096310279284711 0,000883692407948229 0,000671396963454643 0,000503547722590982 0,000988609000174751 0,000912122673783068 42099 38512 667 665 0 True 416 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 462 509 0,000879441258999706 0,000960239922305191 0,000488288700694286 0,000701915007248035 0,000989960794171097 0,000890220227114405 38442 41848 667 665 0 True 461 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 506 509 0,000868048466039354 0,000964714372335049 0,000534065766384375 0,000686655985351339 0,000903842444339936 0,000877119325437083 37944 42043 667 665 0 True 505 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 550 509 0,000912063995468505 0,000949409458643175 0,000595101853971161 0,000732433051041428 0,000909986559232631 0,000856972026248556 39868 41376 667 665 0 True 549 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 594 509 0,000890010476565334 0,000868456331949122 0,000595101853971161 0,000549324788281071 0,000889017108997388 0,000885250348745672 38904 37848 667 665 0 True 593 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 639 507 0,000944366452617134 0,00101092741007933 0,000595101853971161 0,000686655985351339 0,000976694959361801 0,00102169568387493 41280 44057 667 665 0 True 638 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 241 554 0,000863495924274073 0,000934058653156122 0,000717174029144732 0,000793469138628214 0,000690451846053478 0,000662695099426223 37745 40707 667 665 0 True 239 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 285 552 0,000884314080085158 0,000959482707684753 0,000732433051041428 0,000854505226215 0,000730937735990179 0,000708036412685467 38655 41815 667 665 0 True 284 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 329 553 0,000824765003627735 0,000897046920345037 0,000686655985351339 0,000778210116731518 0,000703552357432142 0,000687655725152358 36052 39094 667 665 0 True 328 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 374 552 0,000851576958144869 0,000803175253308368 0,000732433051041428 0,000656137941557946 0,000689547266035498 0,000648814398351071 37224 35003 667 665 0 True 372 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 418 552 0,000919476174021023 0,000892457740827234 0,00064087891966125 0,000625619897764553 0,000913151283242617 0,000848033359330024 40192 38894 667 665 0 True 416 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 462 553 0,000929633603889289 0,000903104637308538 0,000518806744487678 0,000564583810177768 0,00100844413476921 0,000938494018275052 40636 39358 667 665 0 True 461 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 507 553 0,00095626254165204 0,000919074982030494 0,000579842832074464 0,000473029678797589 0,000993422609728737 0,00106661772500788 41800 40054 667 665 0 True 505 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 549 548 0,000849426511280867 0,000876556233798045 0,000473029678797589 0,000442511635004196 0,000913571404296201 0,00096054614868067 37130 38201 667 665 0 False 549 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 594 553 0,000982662708471811 0,000883302327689216 0,000747692072938125 0,000671396963454643 0,000875337018968803 0,000735379625564711 42954 38495 667 665 0 True 593 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 638 551 0,000987878685971731 0,00093947388498713 0,000717174029144732 0,000579842832074464 0,000981833945499151 0,000980083110721518 43182 40943 667 665 0 True 638 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 239 591 0,000917508743911404 0,000946678896830082 0,000793469138628214 0,000854505226215 0,000685721433067537 0,000671143442626209 40106 41257 667 665 0 False 239 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 283 591 0,000924920922463923 0,000978504856786048 0,00080872816052491 0,00080872816052491 0,000693094671578734 0,000765671160765258 40430 42644 667 665 0 False 283 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 330 597 0,00087852617522779 0,000818686680078544 0,000747692072938125 0,000717174029144732 0,000719061601134657 0,000722858138313232 38402 35679 667 665 0 True 328 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 374 596 0,000911080280413696 0,000924283700783201 0,000823987182421607 0,00080872816052491 0,000690165764400979 0,000676315111459402 39825 40281 667 665 0 True 372 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 416 591 0,000935718910972529 0,000916527987398113 0,000778210116731518 0,000610360875867857 0,000851744423101263 0,00084874033602089 40902 39943 667 665 0 False 416 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 460 592 0,00101599463486385 0,00082134840419887 0,000564583810177768 0,000457770656900893 0,00107223664056747 0,000879572085038819 44411 35795 667 665 0 False 460 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 505 592 0,000977538239349083 0,000950717374805749 0,000518806744487678 0,000488288700694286 0,00108361259363533 0,00112065907465598 42730 41433 667 665 0 False 505 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 549 592 0,000941849972244365 0,000860241700612254 0,000595101853971161 0,000457770656900893 0,000980111459040611 0,000941337375550226 41170 37490 667 665 0 False 549 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 593 592 0,000931921313319079 0,000904114256802455 0,000656137941557946 0,000610360875867857 0,000857923702209663 0,000842400980776367 40736 39402 667 665 0 False 593 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 637 592 0,00100487636703507 0,000901681991658019 0,000793469138628214 0,000717174029144732 0,000812395695767775 0,000751207270469919 43925 39296 667 665 0 False 637 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 242 641 0,000986780585445433 0,0734880231019297 0,00080872816052491 0,070923933775845 0,000767551938555411 0,0205094453567853 43134 3202665 667 665 0 True 239 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 283 634 0,00099485619973259 0,00101547069780196 0,000854505226215 0,000900282291905089 0,000740727144369123 0,000709124067132554 43487 44255 667 665 0 False 283 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 328 635 0,000890788297771462 0,000882132086912176 0,000762951094834821 0,000778210116731518 0,000672728439734426 0,000641513476517743 38938 38444 667 665 0 False 328 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 372 635 0,000824330338836075 0,000812881367988522 0,000717174029144732 0,000717174029144732 0,00063205699931847 0,000626412633893434 36033 35426 667 665 0 False 372 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 416 635 0,000836043411116598 0,000848676968227389 0,000625619897764553 0,000656137941557946 0,000760919790633255 0,000719726242658701 36545 36986 667 665 0 False 416 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 460 635 0,000908998464832587 0,000851132179269414 0,000625619897764553 0,000503547722590982 0,000903604269785838 0,000892926178734345 39734 37093 667 665 0 False 460 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 505 635 0,000918629721532001 0,000889864854399675 0,000579842832074464 0,000518806744487678 0,000954084272268055 0,000933780609712934 40155 38781 667 665 0 False 505 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 549 635 0,000882186510315453 0,000965471586955487 0,000549324788281071 0,00064087891966125 0,000892389596431509 0,00093528256399499 38562 42076 667 665 0 False 549 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 593 635 0,000877359443418597 0,000888006236694965 0,000671396963454643 0,000747692072938125 0,000731980313215108 0,000689432837606853 38351 38700 667 665 0 False 593 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 638 639 0,00101235717687048 0,065460125479641 0,000854505226215 0,0657816433966583 0,000741035481897778 0,021937203130289 44252 2852803 667 665 0 True 637 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D9_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D9_1.csv new file mode 100755 index 0000000..4391d05 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D9_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 251 272 0,0106005134306273 0,046959261279773 0,0106202792401007 0,046646829938201 0,00156121600473769 0,00817374525413396 463368 2046521 667 665 0 True 251 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 295 272 0,0105131915616923 0,0106049284346137 0,0104676890211337 0,0106507972838941 0,00138275466404925 0,00128723294359898 459551 462171 667 665 0 False 295 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 340 273 0,0106089779555175 0,0655165264959148 0,0105592431525139 0,0644846265354391 0,00138449428429489 0,00951103666199605 463738 2855261 667 665 0 True 339 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 384 273 0,0108916473326623 0,0930603000979216 0,0108796826123445 0,0935835812924392 0,00134468111939132 0,0151368142177527 476094 4055640 667 665 0 True 384 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 428 272 0,0108662308808974 0,073181098775779 0,0108949416342412 0,0704509040970474 0,00164661893728236 0,0121480285650724 474983 3189289 667 665 0 True 428 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 473 273 0,0108189210498893 0,07131123758125 0,0107728694590677 0,0732738231479362 0,00169522448541072 0,0195400952162892 472915 3107799 667 665 0 True 472 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 516 273 0,0109674620231656 0,0833956027629155 0,0110017547875181 0,0787212939650568 0,00157880444289793 0,0223871026628829 479408 3634445 667 665 0 True 517 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 561 272 0,0110534798977257 0,0715152495567139 0,0110780498970016 0,0679179064621958 0,00169995497790545 0,0182386965430834 483168 3116690 667 665 0 True 561 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 605 273 0,0107435639012721 0,0108322763879256 0,010757610437171 0,0108644235904479 0,00196382274718921 0,00183159839973165 469621 472079 667 665 0 False 605 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 650 272 0,0108493933394941 0,0470731876613025 0,0108491645685512 0,0468146791790646 0,00172193634032882 0,00817769741059765 474247 2051486 667 665 0 True 650 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 251 316 0,0104759018979867 0,0104912544579577 0,010406652933547 0,0105439841306172 0,0014873727173564 0,00145443771033714 457921 457217 667 665 0 False 251 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 295 316 0,0107546821691008 0,0106553635175143 0,0106965743495842 0,0106660563057908 0,00135181508102259 0,00132289441989268 470107 464369 667 665 0 False 295 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 340 316 0,0108578349872901 0,122617828618238 0,0108796826123445 0,123476005188067 0,00135001480614423 0,0392545020654272 474616 5343780 667 665 0 True 339 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 384 317 0,010819584485624 0,0543916899137292 0,0108644235904479 0,0529640650034333 0,0013267799407833 0,00802209795447312 472944 2370432 667 665 0 True 384 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 429 317 0,0108562564677835 0,0798730174027424 0,0109254596780346 0,0773785000381476 0,00165613335601146 0,0131204700975786 474547 3480928 667 665 0 True 428 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 472 317 0,0108103192624333 0,0464421066399118 0,0107881284809644 0,0462043183031968 0,00168632920906383 0,00977883862159786 472539 2023983 667 665 0 True 472 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 516 317 0,0108691591489675 0,0482760116129188 0,0109102006561379 0,0496681162737469 0,00171850450244758 0,00996590125398899 475111 2103906 667 665 0 True 517 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 562 317 0,0107500381189584 0,0574387674381651 0,0107423514152743 0,0558327611200122 0,00183701921274077 0,0139393962251674 469904 2503226 667 665 0 True 561 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 605 316 0,0107151047959655 0,0106018536843367 0,0106660563057908 0,0105897611963073 0,00207767542995757 0,00201903736624585 468377 462037 667 665 0 False 605 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 650 316 0,0104838860038967 0,0105162884322273 0,010452429999237 0,0105439841306172 0,00195168014619425 0,00195266949497737 458270 458308 667 665 0 False 650 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 253 362 0,0108120350445057 0,0511260297688602 0,0108796826123445 0,0495307850766766 0,00151632435005657 0,00821778196348733 472614 2228112 667 665 0 True 251 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 296 361 0,0108772347632547 0,0665825011143102 0,010955977721828 0,0670786602578775 0,00140804176456957 0,0187692905399449 475464 2901717 667 665 0 True 295 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 341 361 0,0107953805198568 0,0410972498768092 0,0107728694590677 0,0416418707560845 0,00132564492954691 0,00612876430266301 471886 1791050 667 665 0 True 339 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 385 361 0,0108509261048121 0,0375861833572258 0,0108339055466545 0,0374151216906996 0,0014077442630222 0,00564326504858823 474314 1638035 667 665 0 True 384 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 429 361 0,0108437655742969 0,0724422408734126 0,0108186465247578 0,0698558022430762 0,00166071305517137 0,0108857741409952 474001 3157089 667 665 0 True 428 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 473 361 0,0108898400422128 0,0359901126127289 0,0108796826123445 0,0362096589608606 0,00174500920532683 0,00554428442316963 476015 1568477 667 665 0 True 472 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 518 361 0,0108325557980909 0,0311952690148351 0,0108491645685512 0,0311894407568475 0,00178417472150705 0,00345076616357035 473511 1359514 667 665 0 True 517 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 562 361 0,0108419125296587 0,0532996487556727 0,0108033875028611 0,0528877698939498 0,0018277863448654 0,0098145373738126 473920 2322840 667 665 0 True 561 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 605 361 0,0108170908823455 0,0628863988765689 0,0108339055466545 0,0585488670176242 0,0021075289337223 0,0437512782483499 472835 2740638 667 665 0 True 605 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 650 361 0,0105866270343885 0,0631393544515902 0,0106660563057908 0,0632944228274968 0,00191518643844427 0,0169678103632436 462761 2751662 667 665 0 True 650 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 252 406 0,0106505227587625 0,0435458295544308 0,0107270923933776 0,0450751506828412 0,00157455167981439 0,00829481914473457 465554 1897761 667 665 0 True 251 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 297 406 0,0105279472875144 0,0326148399150772 0,0105592431525139 0,0327916380560006 0,0014494644244741 0,00278349597968879 460196 1421380 667 665 0 True 295 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 340 405 0,010862364651961 0,0864071829837813 0,0109254596780346 0,0823682001983673 0,001401669681571 0,0159345476968668 474814 3765692 667 665 0 True 339 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 385 405 0,0109980944524305 0,0668572094002459 0,0110017547875181 0,0645304036011292 0,00160582483536495 0,0145421729967081 480747 2913689 667 665 0 True 384 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 429 405 0,0110516726072761 0,0473019812061626 0,0110170138094148 0,0468299382009613 0,00159080045350363 0,0094819946248366 483089 2061457 667 665 0 True 428 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 473 405 0,0109485197890869 0,0558158041016939 0,0110017547875181 0,0554665445944915 0,00172890543631038 0,00958966486835996 478580 2432496 667 665 0 True 472 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 517 406 0,0108764569420485 0,0439444227414496 0,0109712367437247 0,0440222781719692 0,00168290658305647 0,00614631326857479 475430 1915132 667 665 0 True 517 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 561 405 0,0106619613059115 0,0540760461464946 0,0107423514152743 0,0524605172808423 0,00174178994838732 0,00862782076889113 466054 2356676 667 665 0 True 561 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 605 405 0,0106636770879838 0,0448822904136055 0,010605020218204 0,0437933928435187 0,00201355107795297 0,00862951789242426 466129 1956005 667 665 0 True 605 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 649 405 0,0106717298251767 0,0850443113964816 0,0107118333714809 0,0815747310597391 0,00187943511375123 0,0143100723179649 466481 3706297 667 665 0 True 650 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 252 450 0,010588891866724 0,0478599336519371 0,0105134660868238 0,047699702449073 0,00152860864735036 0,00660721915161395 462860 2085773 667 665 0 True 251 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 297 450 0,010713457645176 0,0595758336101182 0,0107118333714809 0,0592050049591821 0,00150297239530269 0,00944359056500793 468305 2596361 667 665 0 True 295 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 340 450 0,0109163545945041 0,0357169417019316 0,0109254596780346 0,0357976653696498 0,00146121963888986 0,00307157437455465 477174 1556572 667 665 0 True 339 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 384 449 0,0112991798904851 0,0568422888303386 0,0112153810940719 0,0543526359960327 0,0016317370759706 0,0119490076839649 493908 2477231 667 665 0 True 384 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 430 449 0,0113632128774249 0,0960941148935511 0,0113832303349355 0,0972457465476463 0,00189484163339421 0,013447560126369 496707 4187856 667 665 0 True 428 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 474 450 0,0111655319055968 0,0601571220337408 0,0111238269626917 0,060669871061265 0,00195257872421614 0,012193114526109 488066 2621694 667 665 0 True 472 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 518 450 0,0108770059923117 0,0547575163589909 0,0108033875028611 0,0537727931639582 0,00179547503833887 0,00929145325586384 475454 2386375 667 665 0 True 517 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 562 449 0,0107401323371274 0,0318589332108022 0,0108339055466545 0,0320744640268559 0,00195250438568932 0,00394697607257138 469471 1388437 667 665 0 True 561 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 605 450 0,0109234693708307 0,0423742808612284 0,0108796826123445 0,0418402380407416 0,00184858098493647 0,00699071576161948 477485 1846704 667 665 0 True 605 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 648 448 0,010752234320011 0,0706493172734996 0,0106813153276875 0,0717479209582666 0,00191880776930124 0,0119404670742089 470000 3078952 667 665 0 True 649 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 252 494 0,01514502533581 0,0591201510298979 0,0108033875028611 0,0583352407110704 0,0218036278924551 0,0160542370946345 662017 2576502 667 665 0 True 251 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 296 494 0,0107615224202959 0,0597111685140982 0,0107270923933776 0,0583352407110704 0,00166669808831814 0,00762405361989417 470406 2602259 667 665 0 True 295 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 340 494 0,0109793352351062 0,0747025035695212 0,0109864957656214 0,0741435873960479 0,00157619101892402 0,0180648598176858 479927 3255593 667 665 0 True 339 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 384 494 0,0110017090333295 0,0902212730269253 0,0110322728313115 0,0852216372930495 0,00163877092550542 0,0187159113544437 480905 3931913 667 665 0 True 384 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 428 493 0,0118000281159489 0,0971387957189839 0,0115205615320058 0,092835889219501 0,00262014541595711 0,0305960279429471 515801 4233384 667 665 0 True 428 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 472 494 0,0112695998075579 0,0451997927985448 0,0111390859845884 0,0463569085221637 0,00197333934835775 0,00567002704803329 492615 1969842 667 665 0 True 472 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 518 492 0,0111208986946216 0,0404187626309996 0,0111390859845884 0,0414435034714275 0,0017275871495245 0,00504694836386113 486115 1761481 667 665 0 True 517 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 560 493 0,0109960126368493 0,0970380632285681 0,0109712367437247 0,0943770504310674 0,00186814482026428 0,0176012539469948 480656 4228994 667 665 0 True 561 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 605 493 0,010939002917859 0,0640814212230049 0,0108644235904479 0,0652018005645838 0,00186780750894955 0,015852839097334 478164 2792718 667 665 0 True 605 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 650 493 0,0105995754697611 0,0806525124897389 0,0106813153276875 0,0757610437170977 0,0018147419156183 0,0123612910806147 463327 3514899 667 665 0 True 649 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 252 538 0,0107420311359541 0,0532270708815986 0,0107118333714809 0,055237659266041 0,00197143825657449 0,010580973899479 469554 2319677 667 665 0 True 251 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 296 537 0,0107645193196489 0,102317340616361 0,0107881284809644 0,0981918059052415 0,00154153243971458 0,0274480393043941 470537 4459069 667 665 0 True 295 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 340 538 0,0106554870882252 0,0556724610794553 0,010605020218204 0,0570840009155413 0,00147871656836434 0,0101303596292356 465771 2426249 667 665 0 True 339 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 384 537 0,0111008354829223 0,0589123759272294 0,0110780498970016 0,0573281452658885 0,00157152862797826 0,00933280951974951 485238 2567447 667 665 0 True 384 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 428 537 0,0117075817778911 0,0558604338725046 0,0114900434882124 0,0565499351491569 0,00229251900840738 0,00713823048784969 511760 2434441 667 665 0 True 428 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 472 538 0,0111471615988755 0,0597368449735004 0,0111390859845884 0,0597238117036698 0,00216320757814716 0,0112983229273403 487263 2603378 667 665 0 True 472 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 517 538 0,0111010184996767 0,0705673774732092 0,0111696040283818 0,0681162737468528 0,00195398184299917 0,0154692623904542 485246 3075381 667 665 0 True 517 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 561 538 0,0108744666348446 0,0574295661332319 0,0109102006561379 0,0580605783169299 0,00180191538277669 0,0119685684417893 475343 2502825 667 665 0 True 561 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 605 538 0,0107996814135848 0,0427240222322802 0,0107881284809644 0,0428320744640269 0,00176146979192051 0,0055262236846014 472074 1861946 667 665 0 True 605 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 650 537 0,010640731362403 0,067802098517064 0,0106355382619974 0,0658579385061418 0,00194989797673519 0,015361836747462 465126 2954868 667 665 0 True 649 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 252 582 0,0102989704506868 0,0435051235321079 0,0102998397802701 0,0449835965514611 0,00126798397035226 0,00769450091355191 450187 1895987 667 665 0 True 251 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 296 582 0,0104510573735792 0,0537186637915457 0,0104371709773404 0,0525062943465324 0,00155316565947718 0,0115303608814558 456835 2341101 667 665 0 True 295 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 341 582 0,0105165773716483 0,0500055356977934 0,0104829480430304 0,0490424963759823 0,00146309065367087 0,00844745727775832 459699 2179280 667 665 0 True 339 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 384 582 0,0109419083088348 0,0502312086005813 0,0109407186999313 0,0485847257190814 0,00148759380566182 0,00678866225184484 478291 2189115 667 665 0 True 384 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 429 581 0,0110580781936795 0,0879320526080594 0,0109712367437247 0,0828564888990616 0,00190326873746125 0,0171172347426469 483369 3832147 667 665 0 True 428 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 473 582 0,0108695480595706 0,0640891080986972 0,0109407186999313 0,0616922255283436 0,00209818539072082 0,013215157731097 475128 2793053 667 665 0 True 472 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 517 582 0,0109481766326724 0,0562311019021575 0,0109254596780346 0,0551613641565576 0,00219619081721916 0,00810389841857495 478565 2450595 667 665 0 True 516 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 561 581 0,0107351680076647 0,0374947669012311 0,0107423514152743 0,0386663614862287 0,00188592125062358 0,00673831624857266 469254 1634051 667 665 0 True 561 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 605 582 0,0105894637940814 0,0475656754612556 0,0106202792401007 0,0482642862592508 0,00164442934153252 0,00639175870912951 462885 2072949 667 665 0 True 605 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 649 581 0,0105919345202656 0,0512489968340398 0,0105745021744106 0,0500343327992676 0,00164531821331894 0,00594095747224906 462993 2233471 667 665 0 True 649 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 251 620 0,0104798825123945 0,0101366256107194 0,0101930266269932 0,0101625085831998 0,00237656015429455 0,00138391672893567 458095 441762 667 665 0 False 251 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 295 620 0,0104350434075706 0,0101217107772865 0,0102845807583734 0,0101167315175097 0,00181784518395411 0,00146974833319166 456135 441112 667 665 0 False 295 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 341 626 0,0102733023508845 0,076005738768987 0,0102998397802701 0,0726024261844816 0,00149574157044604 0,0116165063363843 449065 3312389 667 665 0 True 339 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 384 625 0,0105351078180296 0,0744514983957949 0,0105439841306172 0,0703593499656672 0,00141675036133545 0,0198188333581396 460509 3244654 667 665 0 True 384 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 428 620 0,0106178313910108 0,0105412994605993 0,0105439841306172 0,010406652933547 0,0017828666872727 0,00177816584049348 464125 459398 667 665 0 False 428 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 472 620 0,0105587169793451 0,0106792043051093 0,0105439841306172 0,0106965743495842 0,00196133768835335 0,00193878236223443 461541 465408 667 665 0 False 472 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 516 620 0,0106600396299905 0,0105436399421534 0,0106660563057908 0,0105287251087205 0,00202117927038522 0,00190382052836406 465970 459500 667 665 0 False 516 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 561 620 0,0105417879295646 0,0105808811339404 0,0105897611963073 0,0105134660868238 0,00176468638532406 0,00191212811916267 460801 461123 667 665 0 False 561 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 605 620 0,010414797179117 0,0105795732177778 0,0105134660868238 0,0105287251087205 0,00149316902860299 0,00148002796205114 455250 461066 667 665 0 False 605 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 649 620 0,0105564292699153 0,0105808122962476 0,0105897611963073 0,0106355382619974 0,00150026700694416 0,00145817635248675 461441 461120 667 665 0 False 649 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 254 669 0,0101839672976512 0,0443431765497516 0,0101625085831998 0,0451209277485313 0,00130804650045994 0,00978227558636609 445160 1932510 667 665 0 True 251 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 295 663 0,0101102572998234 0,010144128919231 0,0100709544518196 0,0101777676050965 0,0013659222234424 0,001260718630221 441938 442089 667 665 0 False 295 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 339 663 0,0112885649187308 0,00986694247635569 0,0101777676050965 0,0097962920576791 0,0066085968750746 0,00129907495987514 493444 430009 667 665 0 False 339 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 384 663 0,0106052032349584 0,0102373810470328 0,0101319905394064 0,0101930266269932 0,00332754916163577 0,00131900581650406 463573 446153 667 665 0 False 384 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 428 663 0,0102647691947114 0,0101711132947957 0,01025406271458 0,0101625085831998 0,00154569853808954 0,00150612075397088 448692 443265 667 665 0 False 428 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 472 663 0,010423856508459 0,0103318951992019 0,010452429999237 0,0102845807583734 0,0017583919486056 0,00148273761574272 455646 450272 667 665 0 False 472 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 516 663 0,010240084809964 0,0102437141147673 0,0101777676050965 0,01025406271458 0,00169964617320563 0,00174904665457125 447613 446429 667 665 0 False 516 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 561 663 0,0101956574928375 0,0102295335500573 0,0101625085831998 0,0103150988021668 0,00165984876848593 0,00166097131574026 445671 445811 667 665 0 False 561 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 605 664 0,0102588897814769 0,0103866441108493 0,0102388036926833 0,0103913939116503 0,00143543677146879 0,00148655982888522 448435 452658 667 665 0 False 605 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 651 669 0,0104000872074835 0,0450857287416298 0,0103913939116503 0,045487144274052 0,00137756427719659 0,00865627832838547 454607 1964871 667 665 0 True 649 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D9_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D9_2.csv new file mode 100755 index 0000000..4e52722 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D9_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 251 272 0,00876652541204792 0,739034333372915 0,00868238345922026 0,737224383916991 0,00189162279053582 0,171666315099408 383201 32207689 667 665 11 True 251 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 295 272 0,00721335372597519 0,00730253190770472 0,00700389105058366 0,00729381246662089 0,00156753073167446 0,00128463907202649 315309 318250 667 665 0 False 295 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 340 273 0,0066598424294376 0,00695802220130321 0,00668345159075303 0,00694285496299687 0,00123335110145997 0,0012938084275304 291114 303236 667 665 0 True 339 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 384 273 0,00683533261979676 0,00715521924518323 0,00688181887541009 0,00712596322575723 0,0012317376351506 0,0012547554359676 298785 311830 667 665 0 True 384 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 428 272 0,00690103563462032 0,00705219216500854 0,00683604180972 0,00712596322575723 0,00162112825703169 0,00161476289317012 301657 307340 667 665 0 True 428 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 473 273 0,00715577207962739 0,00721591114430618 0,00717174029144732 0,0072327763790341 0,00158816585799159 0,00167266620361558 312792 314475 667 665 0 True 472 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 516 273 0,007279537159779 0,00730468882207808 0,00735484855420768 0,00732433051041428 0,00154904127719023 0,00152594763808744 318202 318344 667 665 0 True 517 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 561 272 0,0076708956119331 0,00759821274403679 0,0076600289921416 0,00762951094834821 0,00164338691919167 0,00163851349728131 335309 331136 667 665 0 True 561 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 605 273 0,0082438753157182 0,00819202962774297 0,00820935378042268 0,0081177996490425 0,00194791437682116 0,00192630113408439 360355 357015 667 665 0 False 605 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 650 272 0,00950815505499711 0,74280939244426 0,009399557488365 0,738551918822004 0,00184559391610834 0,170177061809869 415619 32372209 667 665 12 True 650 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 251 316 0,00708553940013285 0,00669946782727017 0,00701915007248035 0,00666819256885634 0,00149217743670403 0,00156777185377416 309722 291968 667 665 0 False 251 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 295 316 0,00672394404766031 0,00670451592473975 0,00675974670023652 0,00675974670023652 0,00129039547709324 0,00131336279450185 293916 292188 667 665 0 False 295 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 340 316 0,00689268549520159 0,0070290856461364 0,00689707789730678 0,00706492713817044 0,00126782440693669 0,00117516132029381 301292 306333 667 665 0 True 339 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 384 317 0,0068099619222204 0,00695148262049034 0,00683604180972 0,00698863202868696 0,00127346990399986 0,00117204671134116 297676 302951 667 665 0 True 384 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 429 317 0,00701450602233788 0,00713140140348583 0,00708018616006714 0,00709544518196384 0,00164729100481715 0,00165994208155049 306617 310792 667 665 0 True 428 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 472 317 0,0072469830545931 0,00733050295686573 0,0072632944228275 0,00735484855420768 0,00157735494552817 0,00155696636096876 316779 319469 667 665 0 True 472 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 516 317 0,00731161084598465 0,00728947569197656 0,00729381246662089 0,0072632944228275 0,00151380539250772 0,00160633884745202 319604 317681 667 665 0 True 517 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 562 317 0,00754241785035612 0,0075079435829216 0,00759899290455482 0,00756847486076143 0,00166838858878356 0,00135655577671564 329693 327202 667 665 0 True 561 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 605 316 0,00775043926880689 0,00777624996342998 0,00773632410162509 0,00781261921110857 0,00205660051281309 0,00200387054003675 338786 338895 667 665 0 False 605 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 650 316 0,0080318504057653 0,00790130510529012 0,00805676356145571 0,00785839627679866 0,00193699598046248 0,0018226596547779 351087 344345 667 665 0 False 650 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 253 362 0,00686173278661653 0,00678326624526526 0,00685130083161669 0,00671396963454643 0,00152839721349896 0,00146412867347693 299939 295620 667 665 0 True 251 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 296 361 0,0068077199669792 0,00706414697765242 0,0068207827878233 0,00711070420386053 0,00129758290311619 0,00141222534002001 297578 307861 667 665 0 True 295 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 341 361 0,0068012457492929 0,00725205093300888 0,00674448767833982 0,0072480354009308 0,00137562855602602 0,00144429151186379 297295 316050 667 665 0 True 339 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 385 361 0,00690428418201062 0,00717495271710978 0,00689707789730678 0,00708018616006714 0,00134284413038876 0,00133861368215668 301799 312690 667 665 0 True 384 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 429 361 0,00703589610550641 0,00731097599801747 0,00701915007248035 0,00727855344472419 0,00155732772590871 0,00163055889597696 307552 318618 667 665 0 True 428 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 473 361 0,0070773722774685 0,00732735936889603 0,00706492713817044 0,00730907148851759 0,00162764192854293 0,00161582870276718 309365 319332 667 665 0 True 472 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 518 361 0,0071491148451867 0,00729989312948198 0,00715648126955062 0,00730907148851759 0,00168979520960398 0,00159402897893247 312501 318135 667 665 0 True 517 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 562 361 0,00731602612518415 0,00750011903184374 0,00729381246662089 0,00764476997024491 0,00165536461842003 0,00175420489249343 319797 326861 667 665 0 True 561 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 605 361 0,00744875902630054 0,0133476056816337 0,00750743877317464 0,00793469138628214 0,00196071936168177 0,042404774441562 325599 581699 667 665 0 True 605 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 650 361 0,00693450482357814 0,00703041650819656 0,00698863202868696 0,00697337300679027 0,00189240126885963 0,00185413887719273 303120 306391 667 665 0 True 650 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 252 406 0,00667370594858213 0,00687195213944681 0,00672922865644312 0,00691233691920348 0,00145824800323905 0,00149786024753299 291720 299485 667 665 0 True 251 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 297 406 0,00700158046405957 0,00720170763369858 0,00701915007248035 0,0072327763790341 0,00134947635027451 0,0012572296072344 306052 313856 667 665 0 True 295 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 340 405 0,00727400090295891 0,00749748025362101 0,00727855344472419 0,00744640268558785 0,00129702367429414 0,00126660687387997 317960 326746 667 665 0 True 339 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 385 405 0,00733018704655454 0,00734149404181087 0,00738536659800107 0,00733958953231098 0,00143241799497721 0,00135279300420988 320416 319948 667 665 0 True 384 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 429 405 0,00730486210316677 0,00726021967255057 0,00727855344472419 0,00729381246662089 0,0015963241420431 0,00159687330935451 319309 316406 667 665 0 True 428 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 473 405 0,0072686476628932 0,0074444293383952 0,00727855344472419 0,00741588464179446 0,00164247488800363 0,00154283533897139 317726 324434 667 665 0 True 472 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 517 406 0,0075208905046218 0,0072595312956229 0,00753795681696803 0,00732433051041428 0,0015284862164152 0,00160040657905886 328752 316376 667 665 0 True 517 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 561 405 0,00705268789272107 0,00743004226060688 0,00708018616006714 0,00741588464179446 0,00180170283223975 0,00139277225080771 308286 323807 667 665 0 True 561 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 605 405 0,00681762574881019 0,00680614330516151 0,00677500572213321 0,00686655985351339 0,00180790764489046 0,0019378815890401 298011 296617 667 665 0 True 605 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 649 405 0,00634251425443149 0,00643923840271312 0,0064087891966125 0,00651560234988937 0,00191951607638534 0,00168008274322027 277243 280627 667 665 0 True 650 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 252 450 0,00675956368348213 0,00696157881542951 0,00672922865644312 0,00700389105058366 0,00149051622952528 0,00154299122050868 295473 303391 667 665 0 True 251 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 297 450 0,00706691744537436 0,0071676100298813 0,00704966811627375 0,00715648126955062 0,00142537843376872 0,00150151770505149 308908 312370 667 665 0 True 295 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 340 450 0,00713445062774175 0,00755190792270215 0,00709544518196384 0,00740062561989776 0,0013808524845708 0,00204200759179199 311860 329118 667 665 0 True 339 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 384 449 0,00716510593410093 0,00723977487779875 0,00712596322575723 0,00717174029144732 0,00142154422153795 0,00136934950346922 313200 315515 667 665 0 True 384 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 430 449 0,00724224749607343 0,00738825778109728 0,00727855344472419 0,00732433051041428 0,00180305578849708 0,00181569663971888 316572 321986 667 665 0 True 428 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 474 450 0,00734462249305652 0,00733497740689559 0,00730907148851759 0,00735484855420768 0,00171029593091898 0,00186010484866561 321047 319664 667 665 0 True 472 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 518 450 0,00712685543243485 0,00727722258266403 0,00720225833524071 0,00738536659800107 0,00170885936701822 0,00176204495746181 311528 317147 667 665 0 True 517 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 562 449 0,00664591027901019 0,00665580178415827 0,00659189745937285 0,00668345159075303 0,00183782426892595 0,00172407051417504 290505 290065 667 665 0 True 561 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 605 450 0,00625308769282102 0,00630126472051036 0,00624093995574884 0,00630197604333562 0,00171324057116763 0,00170800540879249 273334 274614 667 665 0 True 605 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 648 448 0,00617487090741651 0,00629715740484193 0,00617990386816205 0,00622568093385214 0,00184394257480892 0,00187293227257039 269915 274435 667 665 0 True 649 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 252 494 0,00879331448947076 0,00698831078612072 0,00672922865644312 0,00701915007248035 0,00934242325016417 0,00135847528169499 384372 304556 667 665 0 True 251 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 296 494 0,00692565138808485 0,00693824283758148 0,00697337300679027 0,00692759594110018 0,00151557416537432 0,00155614331107753 302733 302374 667 665 0 True 295 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 340 494 0,00708860493076877 0,00727931065934463 0,00704966811627375 0,00729381246662089 0,00147270045137104 0,00149947361972066 309856 317238 667 665 0 True 339 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 384 494 0,00710406984651414 0,00723667718162424 0,00704966811627375 0,0072632944228275 0,00155208683177396 0,00147463935027577 310532 315380 667 665 0 True 384 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 428 493 0,00748696377377802 0,00714567375178619 0,00744640268558785 0,00717174029144732 0,00200047775031965 0,00189373694920934 327269 311414 667 665 0 True 428 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 472 494 0,0072849819082219 0,00703970959672011 0,0072480354009308 0,00703440909437705 0,00179348577795756 0,0016538229198003 318440 306796 667 665 0 True 472 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 518 492 0,00674933762233097 0,00666000088341706 0,00675974670023652 0,00668345159075303 0,00167063158983457 0,00166679863651218 295026 290248 667 665 0 True 517 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 560 493 0,00647671128958295 0,00631087905160016 0,00645456626230259 0,00631723506523232 0,00181118768750507 0,00172420090108185 283109 275033 667 665 0 True 561 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 605 493 0,00634601444985907 0,0063868529185174 0,00633249408712902 0,0064087891966125 0,00177586052751724 0,00178277645249285 277396 278344 667 665 0 True 605 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 650 493 0,00629833858534226 0,00627350018442765 0,00633249408712902 0,00619516289005875 0,00174306093550183 0,00176616096566216 275312 273404 667 665 0 True 649 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 252 538 0,00717988453701737 0,00700519896674623 0,00709544518196384 0,00703440909437705 0,00190462564955952 0,00148879023638401 313846 305292 667 665 0 True 251 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 296 537 0,00713685272264303 0,00696359805441734 0,00711070420386053 0,00698863202868696 0,00136249685441869 0,00145055143148996 311965 303479 667 665 0 True 295 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 340 538 0,00686962538414931 0,00702222482275728 0,00686655985351339 0,00704966811627375 0,00140080637002412 0,00138048308960024 300284 306034 667 665 0 True 339 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 384 537 0,00710077554493525 0,00708050740263339 0,00708018616006714 0,00706492713817044 0,00144013398055602 0,00151494677608499 310388 308574 667 665 0 True 384 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 428 537 0,00710848512571364 0,00687484332254302 0,00708018616006714 0,00688181887541009 0,0020511539494756 0,00198725103523439 310725 299611 667 665 0 True 428 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 472 538 0,00686690300992786 0,00682534902144352 0,00691233691920348 0,00686655985351339 0,00190107793176042 0,0018576095857295 300165 297454 667 665 0 True 472 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 517 538 0,00667317977541328 0,00661677081235935 0,00666819256885634 0,00668345159075303 0,00177625965962463 0,00177278359022132 291697 288364 667 665 0 True 517 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 561 538 0,0064348919612064 0,00659111729885483 0,00646982528419928 0,00654612039368277 0,00164473525413973 0,00175862817580326 281281 287246 667 665 0 True 561 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 605 538 0,00642633592793898 0,00652523962687676 0,00642404821850919 0,00648508430609598 0,00172699799101734 0,00151224108813146 280907 284375 667 665 0 True 605 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 650 537 0,00659766248713592 0,00653875476055669 0,00674448767833982 0,00654612039368277 0,00172822346682324 0,0019332869423571 288396 284964 667 665 0 True 649 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 252 582 0,00711985504157969 0,00692470475800396 0,00709544518196384 0,00688181887541009 0,00129243700603009 0,00115567286994851 311222 301784 667 665 0 True 251 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 296 582 0,00725807844532758 0,00713328296708813 0,0072632944228275 0,00714122224765393 0,0014171422948622 0,00142842457032582 317264 310874 667 665 0 True 295 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 341 582 0,00704916482019919 0,00690444353043286 0,00704966811627375 0,00688181887541009 0,00134126643768374 0,00144613411021238 308132 300901 667 665 0 True 339 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 384 582 0,00682302474306449 0,00666654046422993 0,00689707789730678 0,00666819256885634 0,00124085564580963 0,00122527607705658 298247 290533 667 665 0 True 384 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 429 581 0,00659812002902188 0,00681862587344993 0,00668345159075303 0,0068055237659266 0,00178953965484105 0,00192191261696963 288416 297161 667 665 0 True 428 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 473 582 0,00664126622886771 0,006894943928831 0,00668345159075303 0,00698863202868696 0,00182168194218672 0,00176443766693471 290302 300487 667 665 0 True 472 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 517 582 0,00667393471952511 0,0066839334546024 0,00668345159075303 0,0068055237659266 0,0020176675086055 0,00197598345272989 291730 291291 667 665 0 True 516 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 561 581 0,00641386791154663 0,00645130794484495 0,00653086137178607 0,00650034332799268 0,0016266910929076 0,00170596861021447 280362 281153 667 665 0 True 561 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 605 582 0,00640313855432092 0,00647374903268701 0,00643930724040589 0,00653086137178607 0,00152436173013987 0,00152474884044525 279893 282131 667 665 0 True 605 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 649 581 0,00646460930669936 0,00647721386322295 0,00653086137178607 0,00643930724040589 0,00161033060338928 0,00141721821641407 282580 282282 667 665 0 True 649 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 251 620 0,00724577056859531 0,00731350004675227 0,00730907148851759 0,00738536659800107 0,00134230878063771 0,00132090465270726 316726 318728 667 665 0 False 251 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 295 620 0,00711129900831228 0,0070067363418847 0,00711070420386053 0,00694285496299687 0,00138053573109099 0,00132973587059031 310848 305359 667 665 0 False 295 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 341 626 0,00680872655912831 0,00691848641975734 0,00688181887541009 0,00691233691920348 0,00135175532200017 0,00133540430937025 297622 301513 667 665 0 True 339 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 384 625 0,00647810679233512 0,00660456359484199 0,00646982528419928 0,00662241550316625 0,00136353092929614 0,00128263601104846 283170 287832 667 665 0 True 384 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 428 620 0,00635887137685449 0,00646172538235036 0,00643930724040589 0,00650034332799268 0,00159403409702391 0,00157706638755534 277958 281607 667 665 0 False 428 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 472 620 0,00658123673343004 0,00648269793274672 0,00662241550316625 0,00645456626230259 0,00185416355142212 0,00179301547791101 287678 282521 667 665 0 False 472 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 516 620 0,00658510296236638 0,00647546997500618 0,00656137941557946 0,00654612039368277 0,00192956988515983 0,0018479342800824 287847 282206 667 665 0 False 516 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 561 620 0,00647863296550397 0,00639894540654681 0,00643930724040589 0,00634775310902571 0,00165639900899868 0,00171331499283856 283193 278871 667 665 0 False 561 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 605 620 0,00648565623345343 0,00642012447002147 0,00651560234988937 0,00642404821850919 0,0014053780972283 0,00135440403561706 283500 279794 667 665 0 False 605 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 649 620 0,0066664539096897 0,00653930546209883 0,00672922865644312 0,00646982528419928 0,00137422895220195 0,00136042788089379 291403 284988 667 665 0 False 649 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 254 669 0,00880777281306703 0,728576924113901 0,00862134737163348 0,740794995040818 0,00189537253438364 0,206817959081133 385004 31751947 667 665 13 True 251 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 295 663 0,00787042962839935 0,00756269249456899 0,00721751735713741 0,00753795681696803 0,00298057242580724 0,00119229913390264 344031 329588 667 665 0 False 295 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 339 663 0,0067121165899083 0,00663411791093665 0,00663767452506294 0,00657663843747616 0,00125304566610523 0,00123753754660722 293399 289120 667 665 0 False 339 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 384 663 0,00625882984348979 0,00645837528130236 0,00621042191195544 0,00646982528419928 0,00127154133320472 0,00120487464313368 273585 281461 667 665 0 False 384 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 428 663 0,00625210397776621 0,00627299537468069 0,00621042191195544 0,00627145799954223 0,00148477201657236 0,00132268012479348 273291 273382 667 665 0 False 428 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 472 663 0,00631302567988151 0,0064994484379867 0,00634775310902571 0,00648508430609598 0,00161146060812353 0,00140250110645105 275954 283251 667 665 0 False 472 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 516 663 0,00636994389049467 0,00650461126494423 0,00642404821850919 0,00657663843747616 0,00162659937657434 0,00158976009689427 278442 283476 667 665 0 False 516 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 561 663 0,00642802883291703 0,00658221429059029 0,0063935301747158 0,00660715648126955 0,00141797126027732 0,00160859399703422 280981 286858 667 665 0 False 561 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 605 664 0,00686500421110113 0,00683184271046121 0,00685130083161669 0,00677500572213321 0,00134877713408208 0,00138168219343101 300082 297737 667 665 0 False 605 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 651 669 0,00843732402510121 0,740323410953568 0,00840772106507973 0,742778667887388 0,00166897241537886 0,184626624568381 368811 32263868 667 665 13 True 649 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D9_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D9_3.csv new file mode 100755 index 0000000..a878298 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_D9_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 251 272 0,000973992289732909 0,0734243941279153 0,000778210116731518 0,0713664454108492 0,000792108953746271 0,0194183936820593 42575 3199892 667 665 0 True 251 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 295 272 0,000930937598264269 0,000932200035451412 0,00080872816052491 0,000823987182421607 0,000659306733366111 0,000627642137840106 40693 40626 667 665 0 False 295 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 340 273 0,000845308634307246 0,000967926797997512 0,000686655985351339 0,000823987182421607 0,000669971797624269 0,000716255182856469 36950 42183 667 665 0 True 339 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 384 273 0,000886693297892139 0,000911640511211652 0,000762951094834821 0,000778210116731518 0,000642403610204622 0,0006481045356893 38759 39730 667 665 0 True 384 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 428 272 0,000902043828166027 0,000904504337061468 0,000671396963454643 0,000671396963454643 0,000798769941399071 0,000786745988961556 39430 39419 667 665 0 True 428 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 473 273 0,000948392821213564 0,00101999103962699 0,000701915007248035 0,000778210116731518 0,000862723601354477 0,000941884177455256 41456 44452 667 665 0 True 472 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 516 273 0,000915449805424594 0,000855078873654725 0,000732433051041428 0,000671396963454643 0,000810447074582036 0,000795722592766427 40016 37265 667 665 0 True 517 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 561 272 0,000846040701324778 0,00096095124513045 0,00064087891966125 0,000732433051041428 0,000802347854898685 0,000799687296802424 36982 41879 667 665 0 True 561 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 605 273 0,000911171788790887 0,000970198441858824 0,000473029678797589 0,000610360875867857 0,00100246437051094 0,00101016998436745 39829 42282 667 665 0 False 605 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 650 272 0,00106625561103632 0,0744144407711887 0,000747692072938125 0,0720378423743038 0,000962171882525617 0,0199651722553825 46608 3243039 667 665 0 True 650 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 251 316 0,00092114620190477 0,000827933876806918 0,000747692072938125 0,000656137941557946 0,000760612906195548 0,000683096907060886 40265 36082 667 665 0 False 251 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 295 316 0,000895615364668318 0,000933966869565766 0,000778210116731518 0,000823987182421607 0,000673516406410237 0,000630390784851219 39149 40703 667 665 0 False 295 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 340 316 0,00083428187485566 0,000875638397894484 0,000671396963454643 0,000732433051041428 0,000658074688829952 0,000664920918954294 36468 38161 667 665 0 True 339 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 384 317 0,000843981762837968 0,000966228801575924 0,000717174029144732 0,000885023270008392 0,000633365164118894 0,000642657799296282 36892 42109 667 665 0 True 384 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 429 317 0,000874522683725658 0,000991905260978035 0,000671396963454643 0,000762951094834821 0,000774752510684005 0,000903601381577286 38227 43228 667 665 0 True 428 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 472 317 0,000893259023955635 0,000992547746110527 0,000610360875867857 0,000762951094834821 0,000851406234912244 0,000856338839529156 39046 43256 667 665 0 True 472 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 516 317 0,000982090781114364 0,000890048421580387 0,000762951094834821 0,000701915007248035 0,000868899891651478 0,000854572602178352 42929 38789 667 665 0 True 517 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 562 317 0,000959145055533574 0,000932222981349001 0,000732433051041428 0,000762951094834821 0,000883911744970011 0,000740909412583814 41926 40627 667 665 0 True 561 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 605 316 0,000963125669941408 0,000965769883624144 0,000503547722590982 0,000503547722590982 0,00105883923112508 0,00108591979597293 42100 42089 667 665 0 False 605 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 650 316 0,00101775617112478 0,000919327386903973 0,000671396963454643 0,000518806744487678 0,000992537873585137 0,000937436829131021 44488 40065 667 665 0 False 650 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 253 362 0,000880996901411963 0,000826763636029878 0,000686655985351339 0,000595101853971161 0,000781514573675961 0,00077491422159346 38510 36031 667 665 0 True 251 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 296 361 0,000888294694492992 0,000914761153283759 0,000747692072938125 0,000762951094834821 0,000700446936321318 0,000732348973798427 38829 39866 667 665 0 True 295 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 341 361 0,000846406734833545 0,000892113552363399 0,000762951094834821 0,000778210116731518 0,000642641333429299 0,000738385651715175 36998 38879 667 665 0 True 339 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 385 361 0,000787841373430932 0,000922264461795367 0,00064087891966125 0,000793469138628214 0,00064795228449906 0,000661750332208425 34438 40193 667 665 0 True 384 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 429 361 0,00094658553076403 0,00100652179774224 0,000686655985351339 0,000732433051041428 0,000820675679158796 0,0009261122800346 41377 43865 667 665 0 True 428 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 473 361 0,00091984220752979 0,000966894232606006 0,000610360875867857 0,000701915007248035 0,000911152310398872 0,000866914530811993 40208 42138 667 665 0 True 472 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 518 361 0,000890330755885504 0,000893283793140439 0,000610360875867857 0,000579842832074464 0,000856518755747073 0,000871814104142797 38918 38930 667 665 0 True 517 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 562 361 0,000907488576608926 0,000941974987824333 0,000595101853971161 0,000625619897764553 0,000916925901339347 0,000894118566571694 39668 41052 667 665 0 True 561 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 605 361 0,000900465308659472 0,00145233764199925 0,000503547722590982 0,000503547722590982 0,00100510071954148 0,00433404735606114 39361 63294 667 665 0 True 605 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 650 361 0,000950520390983268 0,000932291819041768 0,000564583810177768 0,000473029678797589 0,00100862012235691 0,00102602020570015 41549 40630 667 665 0 True 650 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 252 406 0,000893579303275805 0,000897941810351009 0,000717174029144732 0,000747692072938125 0,000774397638450008 0,000782593788979231 39060 39133 667 665 0 True 251 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 297 406 0,000926339302310392 0,000898951429844926 0,000778210116731518 0,000823987182421607 0,000738087127760943 0,000674427571449519 40492 39177 667 665 0 True 295 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 340 405 0,000896370308780149 0,000867997413997342 0,000762951094834821 0,000778210116731518 0,000685958174368687 0,000632975611657222 39182 37828 667 665 0 True 339 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 385 405 0,000927483157025287 0,00090725784477215 0,000778210116731518 0,000793469138628214 0,000741445388106033 0,000698474925714682 40542 39539 667 665 0 True 384 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 429 405 0,000872989918407699 0,000971529303918987 0,000656137941557946 0,000762951094834821 0,000798481689708855 0,00078534601734907 38160 42340 667 665 0 True 428 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 473 405 0,000938441285193979 0,00097334202982852 0,000717174029144732 0,000762951094834821 0,000852902888929503 0,000809609604398974 41021 42419 667 665 0 True 472 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 517 406 0,00092059715164162 0,000943007553215839 0,000671396963454643 0,000671396963454643 0,000844664472650084 0,000899034453706454 40241 41097 667 665 0 True 517 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 561 405 0,000918355196400426 0,0010078526598024 0,00064087891966125 0,000823987182421607 0,000911768411985601 0,000876615870019867 40143 43923 667 665 0 True 561 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 605 405 0,000863427292991179 0,000900695318061691 0,000457770656900893 0,000442511635004196 0,000975221343075614 0,00106843691749495 37742 39253 667 665 0 True 605 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 649 405 0,000924440503483667 0,00093481586777656 0,000579842832074464 0,000564583810177768 0,000961599605319691 0,000956818820707946 40409 40740 667 665 0 True 650 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 252 450 0,000898818157870024 0,000875684289689663 0,000778210116731518 0,000717174029144732 0,000737599318638383 0,000767397422332081 39289 38163 667 665 0 True 251 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 297 450 0,000914832123878551 0,000898607241381091 0,000747692072938125 0,000686655985351339 0,000802605553815223 0,000829559699288311 39989 39162 667 665 0 True 295 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 340 450 0,0008947231579907 0,000911204539157461 0,000823987182421607 0,00080872816052491 0,000688565213250883 0,00075351597881587 39110 39711 667 665 0 True 339 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 384 449 0,000944984134163177 0,000856088493148642 0,000823987182421607 0,000671396963454643 0,000748774610294525 0,000739495934010525 41307 37309 667 665 0 True 384 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 430 449 0,000955965139426167 0,000938441319595625 0,000686655985351339 0,000473029678797589 0,000929944659164315 0,00102760880350952 41787 40898 667 665 0 True 428 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 474 450 0,00094994846362582 0,000862719857551868 0,00064087891966125 0,0004272526131075 0,000936514384974337 0,00101038372964584 41524 37598 667 665 0 True 472 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 518 450 0,000928832905588863 0,000898790808561803 0,000625619897764553 0,000595101853971161 0,000891922793412579 0,000915510077518865 40601 39170 667 665 0 True 517 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 562 449 0,000868460253736716 0,000892251227748933 0,000503547722590982 0,000488288700694286 0,000944863851321509 0,000997410169099317 37962 38885 667 665 0 True 561 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 605 450 0,000859675449526324 0,000920291114602712 0,000442511635004196 0,000595101853971161 0,000950205311389059 0,000955202155063852 37578 40107 667 665 0 True 605 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 648 448 0,000840435813221794 0,000839154420727947 0,000488288700694286 0,000396734569314107 0,000876153380641167 0,000973841928532235 36737 36571 667 665 0 True 649 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 252 494 0,00109922150391959 0,000945233305281974 0,000885023270008392 0,000778210116731518 0,00109748923222815 0,000757317280377583 48049 41194 667 665 0 True 251 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 296 494 0,000922495950468346 0,000852531879022344 0,000778210116731518 0,000732433051041428 0,000790301696051248 0,000735518244798837 40324 37154 667 665 0 True 295 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 340 494 0,000934803827200613 0,00096843160774447 0,000793469138628214 0,000854505226215 0,000758926714378998 0,000797127523055059 40862 42205 667 665 0 True 339 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 384 494 0,000864250868385903 0,000837181073535292 0,000656137941557946 0,000671396963454643 0,00076809344691312 0,000752736923141763 37778 36485 667 665 0 True 384 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 428 493 0,000879143856773833 0,000898699024971447 0,000579842832074464 0,000549324788281071 0,000920263924922162 0,000919301659820101 38429 39166 667 665 0 True 428 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 472 494 0,000993803853394886 0,000968844633901072 0,000595101853971161 0,000625619897764553 0,00104222389982114 0,00091849736925091 43441 42223 667 665 0 True 472 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 518 492 0,000884062432047881 0,000980432312183526 0,000656137941557946 0,000671396963454643 0,000829721949677029 0,000911251770564969 38644 42728 667 665 0 True 517 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 560 493 0,000886121370534691 0,00084025582381222 0,000534065766384375 0,000549324788281071 0,000917761236217259 0,00086187332522279 38734 36619 667 665 0 True 561 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 605 493 0,000892206677617932 0,000906362954766178 0,000534065766384375 0,000610360875867857 0,000904259391138428 0,00087659710460586 39000 39500 667 665 0 True 605 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 650 493 0,00086635556106131 0,000924972077710871 0,000457770656900893 0,000488288700694286 0,000914600527556558 0,00100361329267575 37870 40311 667 665 0 True 649 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 252 538 0,000863381538802583 0,000934655246493437 0,000717174029144732 0,000747692072938125 0,000698855314934828 0,000780221034134636 37740 40733 667 665 0 True 251 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 296 537 0,000983143127452067 0,000935550136499408 0,000869764248111696 0,000823987182421607 0,000763465543514214 0,000747963526409043 42975 40772 667 665 0 True 295 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 340 538 0,00086797983475646 0,000895693112387285 0,000762951094834821 0,000793469138628214 0,000714313525600546 0,000721943330267433 37941 39035 667 665 0 True 339 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 384 537 0,000888043046455715 0,000815290687235369 0,000732433051041428 0,000671396963454643 0,000710787924710619 0,000697493222085253 38818 35531 667 665 0 True 384 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 428 537 0,000929267570380523 0,000923939512319366 0,000610360875867857 0,000473029678797589 0,000958337424068477 0,00101082395502123 40620 40266 667 665 0 True 428 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 472 538 0,000969050837364563 0,000929377690047963 0,000534065766384375 0,000488288700694286 0,00104524366279819 0,00102332000252994 42359 40503 667 665 0 True 472 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 517 538 0,000856152377004448 0,000931442820830974 0,000488288700694286 0,000534065766384375 0,000932528994115232 0,000974866580650221 37424 40593 667 665 0 True 517 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 561 538 0,000829180282827229 0,000853197310052426 0,000518806744487678 0,000473029678797589 0,000851216390576635 0,000903710089336255 36245 37183 667 665 0 True 561 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 605 538 0,000847504835359844 0,000866941902708247 0,000534065766384375 0,000610360875867857 0,000892207028986567 0,000785281153233862 37046 37782 667 665 0 True 605 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 650 537 0,000957772429875701 0,000820430568295309 0,000610360875867857 0,000350957503624018 0,000971468698929572 0,000961595852264708 41866 35755 667 665 0 True 649 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 252 582 0,000879647152848387 0,00100459434234476 0,000778210116731518 0,000915541313801785 0,000680215929329351 0,000645815980417661 38451 43781 667 665 0 True 251 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 296 582 0,0008773365663243 0,000958840222552261 0,000717174029144732 0,000839246204318303 0,00073591988057472 0,000767011457115497 38350 41787 667 665 0 True 295 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 341 582 0,000952945362978845 0,000905376281169851 0,000839246204318303 0,000732433051041428 0,00076362365181309 0,000757184541940411 41655 39457 667 665 0 True 339 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 384 582 0,000887928660984225 0,000756090271455705 0,000747692072938125 0,00064087891966125 0,000655570508812425 0,000609728550160175 38813 32951 667 665 0 True 384 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 429 581 0,000884153940425072 0,000904435499368701 0,000549324788281071 0,000457770656900893 0,000920339760713562 0,00100192870561676 38648 39416 667 665 0 True 428 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 473 582 0,000991218741739224 0,00087341264582835 0,000595101853971161 0,000488288700694286 0,00107888776669209 0,000880245337409295 43328 38064 667 665 0 True 472 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 517 582 0,000941712709678578 0,000887340805664883 0,000549324788281071 0,000473029678797589 0,00103323335251426 0,00102241622395127 41164 38671 667 665 0 True 516 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 561 581 0,00093299653675108 0,000817860627765339 0,00064087891966125 0,000442511635004196 0,000907729427739673 0,000871642334515929 40783 35643 667 665 0 True 561 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 605 582 0,000868803410151184 0,000924329592578379 0,000579842832074464 0,000701915007248035 0,00083167936277116 0,000772955179221893 37977 40283 667 665 0 True 605 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 649 581 0,000815431149154194 0,000853977470570452 0,000564583810177768 0,000656137941557946 0,000800674884397493 0,000731587916479787 35644 37217 667 665 0 True 649 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 251 620 0,000908701062606714 0,000882384491785656 0,000778210116731518 0,000732433051041428 0,000695536880792055 0,000673593338237895 39721 38455 667 665 0 False 251 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 295 620 0,000881385812015027 0,000877290502520894 0,000762951094834821 0,000778210116731518 0,000665478753340326 0,000670759447873994 38527 38233 667 665 0 False 295 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 341 626 0,000838971679186728 0,000931626388011686 0,000747692072938125 0,000793469138628214 0,000683811499783289 0,000721296603958343 36673 40601 667 665 0 True 339 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 384 625 0,000914397459086891 0,000867538496045561 0,000793469138628214 0,000747692072938125 0,000692690186334643 0,000625135566156682 39970 37808 667 665 0 True 384 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 428 620 0,00089788019700381 0,000907280790669739 0,000610360875867857 0,000610360875867857 0,000865694135178728 0,000871084067505759 39248 39540 667 665 0 False 428 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 472 620 0,000925767374952945 0,000834404619927021 0,000518806744487678 0,000411993591210803 0,000971816913404118 0,000939754513215785 40467 36364 667 665 0 False 472 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 516 620 0,000839520729449878 0,000909024678886504 0,000411993591210803 0,000457770656900893 0,000978342308624871 0,00101472952162594 36697 39616 667 665 0 False 516 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 561 620 0,000986780585445433 0,000819673353674872 0,000732433051041428 0,000411993591210803 0,000905974415311542 0,000946583424634864 43134 35722 667 665 0 False 561 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 605 620 0,000898520755644151 0,000898790808561803 0,000686655985351339 0,000717174029144732 0,000775649300811851 0,000714250437338071 39276 39170 667 665 0 False 605 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 649 620 0,00086939821460293 0,000751317524757189 0,000686655985351339 0,000564583810177768 0,000740306119615676 0,000694285549289674 38003 32743 667 665 0 False 649 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 254 669 0,00100373251232017 0,072688496246338 0,000900282291905089 0,0717631799801633 0,000708903633887288 0,0230388683832827 43875 3167821 667 665 0 True 251 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 295 663 0,000944069050391261 0,000907923275802232 0,000839246204318303 0,000778210116731518 0,000686245257349879 0,000650344203514672 41267 39568 667 665 0 False 295 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 339 663 0,000875277627837489 0,00085939270240146 0,000732433051041428 0,000686655985351339 0,000658579365671803 0,000653066079566613 38260 37453 667 665 0 False 339 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 384 663 0,000859949974657899 0,000874720561990924 0,000717174029144732 0,000747692072938125 0,00065121689340563 0,000646022699735284 37590 38121 667 665 0 False 384 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 428 663 0,00087907522549094 0,00086616174219022 0,000686655985351339 0,000701915007248035 0,000767120411819456 0,000707161466925952 38426 37748 667 665 0 False 428 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 472 663 0,000929610726794991 0,000872127675563365 0,000686655985351339 0,000671396963454643 0,000860065053531129 0,000709253513574673 40635 38008 667 665 0 False 472 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 516 663 0,000933728603768612 0,000870498516834545 0,000610360875867857 0,000564583810177768 0,000913321343159542 0,000863443530119813 40815 37937 667 665 0 False 516 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 561 663 0,000903873995709859 0,000886698320532391 0,000701915007248035 0,000610360875867857 0,000810130873547985 0,000832033980125961 39510 38643 667 665 0 False 561 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 605 664 0,000914397459086891 0,000931580496216508 0,000762951094834821 0,000778210116731518 0,000710079468811713 0,000669089611689017 39970 40599 667 665 0 False 605 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 651 669 0,000975868211465336 0,0738810863276296 0,000793469138628214 0,0725413900968948 0,000757764513989705 0,0212059135998305 42657 3219795 667 665 0 True 649 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E10_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E10_1.csv new file mode 100755 index 0000000..cd8cfb4 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E10_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 270 261 0,0111606151663656 0,0471935388941569 0,0112001220721752 0,0473640039673457 0,00153287806089533 0,00865046725094312 455669 2056731 623 665 0 True 270 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 314 261 0,0109742248667928 0,0109193101774808 0,0109254596780346 0,0109407186999313 0,00132438441873988 0,00130256612991713 448059 475872 623 665 0 False 314 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 359 261 0,0110856426687319 0,0696285460733546 0,0110933089188983 0,0702067597467002 0,00140167615568879 0,0124478957592145 452608 3034466 623 665 0 True 358 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 403 260 0,0111800379663079 0,0987833511450863 0,0111543450064851 0,0977187762264439 0,0014191672145395 0,0241563526452444 456462 4305055 623 665 0 True 402 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 447 260 0,0109805440122974 0,0768251367718908 0,010955977721828 0,0747997253376059 0,00166604131035314 0,0161010601943105 448317 3348099 623 665 0 True 447 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 490 260 0,0109330034641409 0,0743064573771348 0,0109864957656214 0,075745784695201 0,00172392640322841 0,025915607347467 446376 3238333 623 665 0 True 491 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 536 261 0,0110978890747485 0,0858421632015493 0,0110170138094148 0,0840009155413138 0,0016046973325559 0,024719796517162 453108 3741068 623 665 0 True 535 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 579 260 0,0111775152066685 0,0778555223031256 0,0111238269626917 0,0766308079652094 0,00172525524906304 0,0221597515291948 456359 3393004 623 665 0 True 579 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 623 262 0,0111020283599821 0,0112058585465724 0,0110322728313115 0,0112458991378653 0,00188461283647355 0,00187307138406843 453277 488360 623 665 0 False 623 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 666 261 0,0111210102893079 0,0475955510199165 0,0111696040283818 0,046997787441825 0,00183956969738687 0,00857693506517367 454052 2074251 623 665 0 True 668 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 270 305 0,0108265821958565 0,0110530847604248 0,0108644235904479 0,0110780498970016 0,00145421144193765 0,00144139053057142 442031 481702 623 665 0 False 270 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 314 305 0,0110120907541961 0,0109379881381182 0,0110322728313115 0,0109407186999313 0,00130496064453974 0,00117050277051626 449605 476686 623 665 0 False 314 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 359 305 0,0111290194388427 0,108837142065509 0,0111543450064851 0,1076218814374 0,00133656999861126 0,0278769862366 454379 4743207 623 665 0 True 358 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 403 305 0,0110648972569398 0,0568678505602528 0,0110017547875181 0,0553139543755245 0,0014729339283188 0,00968844756339326 451761 2478345 623 665 0 True 402 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 447 304 0,0112074944085972 0,0933112823257503 0,011108567940795 0,093339436942092 0,00187008571772842 0,0278333291848855 457583 4066578 623 665 0 True 446 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 492 306 0,0109890920036969 0,0485918160014364 0,0110017547875181 0,0480811779964904 0,00180114567174964 0,0117854826564627 448666 2117669 623 665 0 True 491 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 534 305 0,0110155687335049 0,0471938371908255 0,0110170138094148 0,0498664835584039 0,00157943012086936 0,0103003266749323 449747 2056744 623 665 0 True 535 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 579 305 0,0111145931725552 0,0621244803471255 0,011108567940795 0,0592507820248722 0,00184199156728864 0,0177349406813163 453790 2707433 623 665 0 True 579 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 623 305 0,0112701715145902 0,0110985864753438 0,0113984893568322 0,0111238269626917 0,0019608187059068 0,00198649780944204 460142 483685 623 665 0 False 623 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 668 305 0,0109473317591803 0,0112079007314579 0,0108491645685512 0,0112306401159686 0,0020604378002963 0,00188560346357354 446961 488449 623 665 0 False 668 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 270 349 0,0110580882551945 0,0720774240476449 0,0111390859845884 0,0737010757610437 0,00150908197450186 0,0251402522277051 451483 3141190 623 665 0 True 269 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 315 350 0,0109708203659202 0,0686787235885548 0,0109254596780346 0,0704661631189441 0,00143191998180047 0,021908571077806 447920 2993072 623 665 0 True 314 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 359 349 0,0109584025102193 0,0437044774903613 0,0109864957656214 0,0437018387121385 0,00134470763227934 0,00902067053666264 447413 1904675 623 665 0 True 358 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 403 350 0,0108812991379387 0,0373475689681976 0,0110017547875181 0,0379949645227741 0,00148218537987466 0,00479363468452542 444265 1627636 623 665 0 True 402 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 448 350 0,0110825565744157 0,0768056557048377 0,0110017547875181 0,0730144197756924 0,00170512761094896 0,0144624199057914 452482 3347250 623 665 0 True 446 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 492 350 0,0111812626069096 0,0385774231871737 0,0111238269626917 0,0376287479972534 0,00179022553424943 0,00903119523667764 456512 1681234 623 665 0 True 491 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 535 349 0,0109586719311517 0,031121130819725 0,0109712367437247 0,0315709163042649 0,00165573015318873 0,00389003340253082 447424 1356283 623 665 0 True 535 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 580 349 0,0109796867638762 0,0549859198235919 0,0109407186999313 0,054535744258793 0,00184093529056198 0,00970917384538137 448282 2396329 623 665 0 True 579 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 624 349 0,0110605130435858 0,0613923455927528 0,0111696040283818 0,0608529793240253 0,0019820734916574 0,0143560233407058 451582 2675526 623 665 0 True 623 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 668 349 0,0111709021474195 0,0669505074198428 0,0111238269626917 0,0659647516594186 0,00196301624858993 0,0183924479887178 456089 2917755 623 665 0 True 668 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 271 394 0,0107262351449564 0,0449533079666435 0,0107118333714809 0,0469825284199283 0,00158683406559891 0,0102431722418188 437934 1959100 623 665 0 True 269 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 315 394 0,0107417146021614 0,0358508539602612 0,0107118333714809 0,0339208056763561 0,00138724369766274 0,00634799933453397 438566 1562408 623 665 0 True 314 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 359 394 0,0109946028864044 0,0921610733173056 0,010955977721828 0,087357900358587 0,00145633910710717 0,0221334330416391 448891 4016451 623 665 0 True 358 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 403 393 0,0111657586568926 0,0726997626820542 0,0111696040283818 0,0708323796444648 0,00151416731282653 0,0202185145640248 455879 3168312 623 665 0 True 402 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 448 393 0,0111453071588448 0,0485680669974318 0,0111696040283818 0,0483253223468376 0,0017699718399053 0,0110791394796903 455044 2116634 623 665 0 True 446 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 491 393 0,0109442456648641 0,0584522418428768 0,0110627908751049 0,0574044403753719 0,00182122064607898 0,0127486252647247 446835 2547394 623 665 0 True 491 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 536 394 0,0108921984392935 0,0446767640089007 0,0108949416342412 0,045136186770428 0,00164195126457522 0,00741346530112417 444710 1947048 623 665 0 True 535 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 580 393 0,0107015463904269 0,054876376108502 0,0107728694590677 0,0542915999084459 0,00177938773739164 0,00917363896424837 436926 2391555 623 665 0 True 579 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 625 393 0,0107296641386411 0,0448811890105213 0,0106965743495842 0,044785229266804 0,00196864965386275 0,00929112776272364 438074 1955957 623 665 0 True 623 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 668 393 0,0109778987885978 0,0877061043545004 0,0110017547875181 0,0823224231326772 0,00182819031860885 0,018130727754754 448209 3822300 623 665 0 True 667 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 271 438 0,0105984316517671 0,043382064683338 0,010605020218204 0,0440680552376593 0,00155972671481805 0,00698619512362582 432716 1890624 623 665 0 True 269 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 315 438 0,0109948478145248 0,0582490100279309 0,0110170138094148 0,0576180666819257 0,00156122976453767 0,00894516579995342 448901 2538537 623 665 0 True 314 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 360 438 0,0111436416476266 0,0373357977227344 0,0111238269626917 0,0374608987563897 0,00147147782209077 0,00464883089328826 454976 1627123 623 665 0 True 358 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 404 437 0,01133196687935 0,0602358953001639 0,0113527122911421 0,0570229648279545 0,00158535386830581 0,0159015108663518 462665 2625127 623 665 0 True 402 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 448 437 0,0113922926753878 0,101148109458815 0,0114442664225223 0,100846875715267 0,00191294801347123 0,0142805490471297 465128 4408113 623 665 0 True 446 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 493 438 0,0111039143065087 0,065282524232302 0,0111390859845884 0,0641336690318151 0,00175472224404915 0,016947059434611 453354 2845063 623 665 0 True 490 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 536 438 0,0107365221260104 0,0551919969298389 0,0108339055466545 0,0541237506675822 0,0017572467983502 0,0108638054671419 438354 2405310 623 665 0 True 535 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 580 437 0,0108566838618454 0,0320022073953481 0,0107881284809644 0,0321355001144427 0,00193628637044205 0,00402540377219898 443260 1394681 623 665 0 True 579 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 625 437 0,0105960558489999 0,0405261953235113 0,0106355382619974 0,0408789196612497 0,00187740562263007 0,00525617258193953 432619 1766163 623 665 0 True 623 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 669 437 0,010826900602413 0,0721633334882181 0,0108796826123445 0,0725261310749981 0,00192557799185835 0,0127042221654865 442044 3144934 623 665 0 True 667 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 270 481 0,0106517280107514 0,0566378179369229 0,0105745021744106 0,0579079880979629 0,00146277783649961 0,0195705704167125 434892 2468320 623 665 0 True 269 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 315 482 0,0109685915200251 0,0593235893579222 0,010955977721828 0,0574807354848554 0,00148041626661312 0,0110932129727083 447829 2585368 623 665 0 True 313 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 359 481 0,0113031633323989 0,0693690050257252 0,0112306401159686 0,0682230869001297 0,00181237599845531 0,0193467012152804 461489 3023155 623 665 0 True 358 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 403 481 0,0114471320815302 0,0906283103042569 0,0113984893568322 0,0859082932784009 0,00174491834334818 0,0274719067349769 467367 3949652 623 665 0 True 402 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 448 481 0,011564232215861 0,0994205357752358 0,0113832303349355 0,0974746318760967 0,00203252953826234 0,0308984657313117 472148 4332824 623 665 0 True 446 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 491 482 0,011259737576664 0,0475497739542264 0,0113374532692454 0,0493629358358129 0,0020173400782145 0,00943658019146055 459716 2072256 623 665 0 True 490 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 534 481 0,0109406942071193 0,0407983336689171 0,0111238269626917 0,043228809033341 0,0017849841955012 0,00805503475058114 446690 1778023 623 665 0 True 535 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 580 481 0,0107654971226457 0,117791709761931 0,0107881284809644 0,120241092545968 0,00195073536361851 0,0256220324570828 439537 5133454 623 665 0 True 579 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 624 481 0,0106095758812422 0,0670568157633727 0,0105897611963073 0,0674601358052949 0,00192321249380651 0,0202729543862381 433171 2922388 623 665 0 True 623 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 669 482 0,0106872425881995 0,0778428332217589 0,0106965743495842 0,0756694895857176 0,00181983753376535 0,0125938268648142 436342 3392451 623 665 0 True 667 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 270 526 0,010588781483826 0,0557660115039258 0,0105439841306172 0,0596017395284962 0,00147434114875296 0,0158569895288505 432322 2430326 623 665 0 True 269 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 315 526 0,0109070655761977 0,105966105467376 0,0108949416342412 0,0975661860074769 0,0015360792681851 0,0303807268361757 445317 4618085 623 665 0 True 313 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 359 525 0,0110723920574219 0,0550674236518281 0,0110170138094148 0,058960860608835 0,00150037327505316 0,0133046027166697 452067 2399881 623 665 0 True 358 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 404 526 0,0124124672821955 0,0618101674419512 0,0116273746852827 0,0600595101853971 0,004309401280974 0,0118829506941875 506780 2693735 623 665 0 True 402 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 448 526 0,0117074416878193 0,0603166878055748 0,011459525444419 0,0590676737621118 0,00250378244369131 0,010847415082787 477995 2628648 623 665 0 True 446 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 492 526 0,0111459194791457 0,0617344230340098 0,0111696040283818 0,0626840619516289 0,00189921917703826 0,0132054913929374 455069 2690434 623 665 0 True 490 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 536 526 0,0108966071454595 0,0738702329180699 0,0108186465247578 0,0727550164034485 0,0018938543980287 0,0178686592485873 444890 3219322 623 665 0 True 534 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 580 525 0,0107289293542801 0,0604467451531094 0,0108339055466545 0,0605477988860914 0,00172713783804526 0,0138890744493066 438044 2634316 623 665 0 True 579 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 623 522 0,010670611968829 0,0462802233324212 0,0107728694590677 0,0466010528725109 0,00182210958742157 0,0170378912396482 435663 2016928 623 665 0 False 623 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 668 525 0,0106636560102115 0,0731044135860365 0,0107118333714809 0,0714579995422293 0,0019310633158399 0,018040203198957 435379 3185947 623 665 0 True 667 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 271 571 0,0106291211452447 0,0463748522140783 0,0106202792401007 0,0469672693980316 0,00132681946820886 0,0106515933323944 433969 2021052 623 665 0 True 269 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 315 569 0,0105230672691409 0,0521085042659292 0,0105287251087205 0,0534065766384375 0,00146448811753084 0,0128199785937224 429639 2270929 623 665 0 True 313 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 359 569 0,0109530875700081 0,0504663122672784 0,0110322728313115 0,0505378805218586 0,00136277551732063 0,0113942397214245 447196 2199361 623 665 0 True 357 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 403 569 0,0110104742286019 0,0510918862732478 0,010955977721828 0,0505836575875486 0,00149637085210668 0,0100004062228433 449539 2226624 623 665 0 True 402 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 448 569 0,0110402819808464 0,086685631451024 0,0110933089188983 0,0817730983443961 0,00200602354710063 0,0217288586041192 450756 3777827 623 665 0 True 446 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 492 570 0,0108110537530275 0,060112446371135 0,0108033875028611 0,0594186312657359 0,00213820723784866 0,0111583642814679 441397 2619747 623 665 0 True 490 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 536 570 0,0108187200031939 0,0543992620599335 0,0109102006561379 0,0545510032806897 0,00193594385719685 0,0078034650888758 441710 2370762 623 665 0 True 534 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 580 568 0,0104616148037495 0,0396481934981652 0,0104829480430304 0,0404974441138323 0,00167337934778579 0,00985241063830422 427130 1727899 623 665 0 True 579 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 624 569 0,0105263493059533 0,0507449443017018 0,010605020218204 0,050415808346685 0,00160012700677681 0,0089521031472162 429773 2211504 623 665 0 True 623 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 668 569 0,0106814622845597 0,058135221321787 0,0106813153276875 0,0563363088426032 0,00179217054570912 0,010666297336829 436106 2533578 623 665 0 True 667 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 269 608 0,0107430861996353 0,010434233902449 0,0106355382619974 0,0104371709773404 0,00193103350778464 0,00136761740388128 438622 454732 623 665 0 False 269 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 313 608 0,0105267411909458 0,010201860797565 0,0105592431525139 0,0102235446707866 0,00144509589305054 0,0013618233598415 429789 444605 623 665 0 False 313 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 359 614 0,0109283253370425 0,0729804598472606 0,010955977721828 0,0708323796444648 0,00149980817987079 0,0141843791950901 446185 3180545 623 665 0 True 357 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 403 614 0,0105616434480932 0,0726170886130409 0,0106202792401007 0,0709849698634318 0,00149552741999732 0,0219158901439061 431214 3164709 623 665 0 True 402 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 446 608 0,0109192385037782 0,010612225230047 0,010955977721828 0,0105897611963073 0,00197039365604658 0,00198164654807059 445814 462489 623 665 0 False 446 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 490 609 0,0109040039746935 0,0107461604342741 0,0110170138094148 0,0106660563057908 0,00209833642493767 0,00217390722662942 445192 468326 623 665 0 False 490 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 534 609 0,0105580919903484 0,0103526153447248 0,0106507972838941 0,0103608758678569 0,00188430135427349 0,00201041772011378 431069 451175 623 665 0 False 534 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 579 609 0,0103623209437668 0,0104335914173165 0,0103608758678569 0,0104219119554437 0,00173640580463929 0,00187006458565738 423076 454704 623 665 0 False 579 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 623 609 0,0102987620965406 0,0104964172849152 0,0102082856488899 0,0104676890211337 0,00147444881133337 0,00141926739266791 420481 457442 623 665 0 False 623 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 667 609 0,0106098453021746 0,0105663793266641 0,0106202792401007 0,0105745021744106 0,00160856951937344 0,00167877186170086 433182 460491 623 665 0 False 667 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 271 659 0,0104149559968262 0,0431763776573501 0,010452429999237 0,0432135500114443 0,00142312402608947 0,00804210408292923 425225 1881660 623 665 0 True 269 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 313 652 0,0105149111627338 0,0103678514207239 0,0103150988021668 0,010406652933547 0,00182231888633082 0,00119858753290111 429306 451839 623 665 0 False 313 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 357 652 0,0106820011264244 0,0101838482679576 0,010406652933547 0,0101777676050965 0,00245203210951047 0,00123499432940124 436128 443820 623 665 0 False 357 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 402 652 0,0109141684916873 0,0105021537593124 0,0104371709773404 0,0105134660868238 0,00315366568147246 0,00136106306828627 445607 457692 623 665 0 False 402 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 446 652 0,010446502738725 0,0103040618254265 0,0105134660868238 0,01025406271458 0,00155773148692239 0,00152443031374347 426513 449059 623 665 0 False 446 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 490 652 0,0104895366094674 0,0104269141611181 0,0105287251087205 0,0103456168459602 0,00159739579410027 0,00166240602717292 428270 454413 623 665 0 False 490 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 534 652 0,0103163479355805 0,0103571127406523 0,0102998397802701 0,0103913939116503 0,00179708769207652 0,00175671855556038 421199 451371 623 665 0 False 534 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 578 652 0,0102084570985741 0,0102058074919503 0,0102845807583734 0,0102082856488899 0,00152859120333732 0,00131099568604194 416794 444777 623 665 0 False 578 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 623 652 0,0105498134198811 0,0104875831143434 0,0105897611963073 0,0105439841306172 0,00137987249504336 0,00143978139373693 430731 457057 623 665 0 False 623 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 667 658 0,0109576187402343 0,0445048303982662 0,0109102006561379 0,0452277409018082 0,00143970559954563 0,00868696725523735 447381 1939555 623 665 0 True 667 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E10_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E10_2.csv new file mode 100755 index 0000000..9306a61 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E10_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 270 261 0,00862871970805548 0,735848593789349 0,0085297932402533 0,749324788281071 0,00171373470644761 0,183831852395331 352296 32068852 623 665 11 True 270 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 314 261 0,00760842263718761 0,00719624651007239 0,00764476997024491 0,00721751735713741 0,00144960683250602 0,00120061280887126 310639 313618 623 665 0 False 314 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 359 261 0,00668835015315968 0,00692807780494954 0,00674448767833982 0,00695811398489357 0,00126068611093951 0,00120661257501146 273074 301931 623 665 0 True 358 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 403 260 0,00677405050246392 0,0066369402563401 0,00677500572213321 0,00654612039368277 0,00130840780235964 0,00127353409855326 276573 289243 623 665 0 True 402 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 447 260 0,00681821104255981 0,00674010501190032 0,0068055237659266 0,00677500572213321 0,00153392250655174 0,00165827717652664 278376 293739 623 665 0 True 447 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 490 260 0,00687760611174037 0,00701534105348058 0,00694285496299687 0,00703440909437705 0,00161970192152091 0,00153170319379049 280801 305734 623 665 0 True 491 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 536 261 0,0071167294356207 0,00720508068064416 0,00712596322575723 0,00720225833524071 0,00144664659695283 0,0014733646850357 290564 314003 623 665 0 True 535 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 579 260 0,00749173888066135 0,00746755880316493 0,00746166170748455 0,00750743877317464 0,0016743629040539 0,00169356854373639 305875 325442 623 665 0 True 579 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 623 262 0,00811441964098191 0,00834012245078248 0,00816357671473259 0,00837720302128634 0,00187012347485482 0,00175076498106348 331298 363469 623 665 0 False 623 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 666 261 0,00955278452044482 0,720091485293687 0,00955214770733196 0,708735790035859 0,00181210779616399 0,177628957021187 390024 31382145 623 665 11 True 668 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 270 305 0,0072842357771159 0,00700217010826448 0,00717174029144732 0,00698863202868696 0,0014947844022237 0,00144296842982358 297403 305160 623 665 0 False 270 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 314 305 0,00689134657929101 0,00695609474590574 0,00686655985351339 0,00701915007248035 0,00120742290329367 0,0011436822424953 281362 303152 623 665 0 False 314 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 359 305 0,00667652012494763 0,00667163445349469 0,00663767452506294 0,00671396963454643 0,00122688213836682 0,00120544895719889 272591 290755 623 665 0 True 358 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 403 305 0,00662180318286542 0,00661413203413661 0,00663767452506294 0,00656137941557946 0,00143231449460365 0,00133059137073911 270357 288249 623 665 0 True 402 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 447 304 0,00685806084773786 0,00676387696180254 0,00685130083161669 0,00685130083161669 0,00160941490405207 0,00173167689398643 280003 294775 623 665 0 True 446 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 492 306 0,00696129805045789 0,00699345066718065 0,00704966811627375 0,00697337300679027 0,00162121562796349 0,00154654145766553 284218 304780 623 665 0 True 491 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 534 305 0,00703720127494884 0,00704207302417178 0,00708018616006714 0,00692759594110018 0,0015097030117556 0,00149811902578832 287317 306899 623 665 0 True 535 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 579 305 0,00746126982249202 0,00759490853478397 0,00747692072938125 0,00755321583886473 0,00175065557084576 0,0019214525275401 304631 330992 623 665 0 True 579 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 623 305 0,00784384754645093 0,00798413979558647 0,00787365529869535 0,00791943236438544 0,00191236292114955 0,00184911417286556 320251 347955 623 665 0 False 623 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 668 305 0,00814917494125705 0,00819687121213425 0,00819409475852598 0,00822461280231937 0,00192673251587614 0,0018491110939843 332717 357226 623 665 0 False 668 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 270 349 0,00690677705087194 0,00679921364408962 0,00688181887541009 0,00672922865644312 0,00139014266130483 0,00138339122728683 281992 296315 623 665 0 True 269 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 315 350 0,00687963901513913 0,00692227249285952 0,00688181887541009 0,00694285496299687 0,00125395976567201 0,00124164930125413 280884 301678 623 665 0 True 314 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 359 349 0,00682619569928264 0,00699980668081281 0,00688181887541009 0,00704966811627375 0,00132795453900463 0,00126539297199098 278702 305057 623 665 0 True 358 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 403 350 0,00703497242905381 0,00718713698872955 0,00712596322575723 0,00715648126955062 0,00144659948502939 0,0013783000117927 287226 313221 623 665 0 True 402 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 448 350 0,00713448672434479 0,00731494563830038 0,00712596322575723 0,00732433051041428 0,00162725698164542 0,00168137646739167 291289 318791 623 665 0 True 446 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 492 350 0,00712865743508088 0,00724856315657535 0,00708018616006714 0,00720225833524071 0,00166746767767481 0,00154329089196654 291051 315898 623 665 0 True 491 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 535 349 0,00728208040965698 0,00718532426282002 0,0072480354009308 0,0072480354009308 0,00150755140039813 0,00160113378478032 297315 313142 623 665 0 True 535 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 580 349 0,00761437439051168 0,00760583078203635 0,00753795681696803 0,00756847486076143 0,00191856342597547 0,00189711399944934 310882 331468 623 665 0 True 579 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 624 349 0,00771690130168274 0,00753602936157056 0,0076600289921416 0,00746166170748455 0,00197129110924266 0,00188309755024307 315068 328426 623 665 0 True 623 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 668 349 0,00726135949067687 0,00732455996939017 0,00718699931334401 0,00721751735713741 0,00186855638184367 0,00188603139215872 296469 319210 623 665 0 True 668 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 271 394 0,0064724215222748 0,00648852619073433 0,00646982528419928 0,00656137941557946 0,00147240553443008 0,00137888875951486 264258 282775 623 665 0 True 269 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 315 394 0,00655251301762344 0,00647666316168081 0,00654612039368277 0,00653086137178607 0,00123830127837883 0,00130958371031918 267528 282258 623 665 0 True 314 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 359 394 0,00691782330909892 0,00686789071557355 0,00688181887541009 0,00686655985351339 0,00123363244291028 0,00136165428156371 282443 299308 623 665 0 True 358 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 403 393 0,0070521418902891 0,00693023471932291 0,00708018616006714 0,00704966811627375 0,00145964526715885 0,00143765786062598 287927 302025 623 665 0 True 402 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 448 393 0,0070744793348634 0,00693555816756357 0,00704966811627375 0,00692759594110018 0,00154659689422228 0,00161029997891219 288839 302257 623 665 0 True 446 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 491 393 0,00691292474669228 0,00684024090897879 0,00692759594110018 0,00686655985351339 0,00160524690982264 0,00171940209880296 282243 298103 623 665 0 True 491 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 536 394 0,00704258969359615 0,00701862231683581 0,00711070420386053 0,00698863202868696 0,00155574016171018 0,00154984880612124 287537 305877 623 665 0 True 535 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 580 393 0,00712667351730619 0,00707926832416358 0,00715648126955062 0,00708018616006714 0,0016932993178434 0,00181439640717342 290970 308520 623 665 0 True 579 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 625 393 0,00666437169017915 0,00656739124074778 0,00659189745937285 0,00657663843747616 0,00183016564606526 0,00190038954566257 272095 286212 623 665 0 True 623 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 668 393 0,00633051016935432 0,00639924370321547 0,00630197604333562 0,0064087891966125 0,001703822399232 0,00177273527680331 258464 278884 623 665 0 True 667 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 271 438 0,00644040941694738 0,00664584326460463 0,00645456626230259 0,00671396963454643 0,0014026652907426 0,00151126981073613 262951 289631 623 665 0 True 269 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 315 438 0,00661923143760193 0,00664795428718282 0,00662241550316625 0,00672922865644312 0,00136799939215379 0,00131852313353138 270252 289723 623 665 0 True 314 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 360 438 0,00686129389892625 0,00683131495481666 0,00689707789730678 0,00688181887541009 0,00135702851555092 0,00135075059589891 280135 297714 623 665 0 True 358 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 404 437 0,00677985529891579 0,00693955075374405 0,00677500572213321 0,00711070420386053 0,00151844834260497 0,00162829859034984 276810 302431 623 665 0 True 402 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 448 437 0,00693695219529687 0,00728006787396507 0,00689707789730678 0,00727855344472419 0,00162466629785512 0,00174019233623754 283224 317271 623 665 0 True 446 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 493 438 0,00670885063683148 0,00693496157422625 0,00683604180972 0,00697337300679027 0,00177258130268749 0,00179361841804292 273911 302231 623 665 0 True 490 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 536 438 0,00682528946523741 0,00680139350436058 0,0068055237659266 0,00672922865644312 0,00169037032674597 0,00152381443760872 278665 296410 623 665 0 True 535 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 580 437 0,00646869861484576 0,00630642754746789 0,00643930724040589 0,00636301213092241 0,00180721255055597 0,00188230046960868 264106 274839 623 665 0 True 579 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 625 437 0,00618742316145625 0,00598793848893233 0,00622568093385214 0,0059662775616083 0,00166216083071023 0,00170264503736424 252622 260959 623 665 0 True 623 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 669 437 0,00608056102255531 0,00609027719217935 0,00608834973678187 0,00604257267109178 0,00174734045649395 0,0017534236415759 248259 265419 623 665 0 True 667 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 270 481 0,00652706498592092 0,00669827464059554 0,00653086137178607 0,00666819256885634 0,001468370815696 0,00143311851694297 266489 291916 623 665 0 True 269 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 315 482 0,00668996667875387 0,00660534375536002 0,00672922865644312 0,00662241550316625 0,00137259638011064 0,00138301790169534 273140 287866 623 665 0 True 313 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 359 481 0,00677892457205853 0,0068974679775658 0,0068207827878233 0,00689707789730678 0,00150642921599928 0,0014194072289122 276772 300597 623 665 0 True 358 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 403 481 0,00675570538625103 0,00720629681321638 0,0068055237659266 0,00714122224765393 0,00152824255679892 0,00168267226678055 275824 314056 623 665 0 True 402 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 448 481 0,00702184428180401 0,00710079157610208 0,00694285496299687 0,00714122224765393 0,00185351338345519 0,00188267226853156 286690 309458 623 665 0 True 446 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 491 482 0,00675565640062697 0,00674028857908103 0,00669871061264973 0,00679026474402991 0,0018675837886777 0,00186151571703128 275822 293747 623 665 0 True 490 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 534 481 0,00627794859473103 0,00612398471573762 0,00622568093385214 0,00613412680247196 0,00174253403380585 0,00168230088462887 256318 266888 623 665 0 True 535 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 580 481 0,00618208372843301 0,00593100971701398 0,00622568093385214 0,00593575951781491 0,00188454875313261 0,00187416465295317 252404 258478 623 665 0 True 579 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 624 481 0,00589813855853188 0,00599271123563085 0,00588998245212482 0,005981536583505 0,00178329497331568 0,00150537954406238 240811 261167 623 665 0 True 623 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 669 482 0,00612746475759893 0,00606492197534349 0,00611886778057527 0,00599679560540169 0,00182002186773752 0,0017399118335946 250174 264314 623 665 0 True 667 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 270 526 0,00648621097544951 0,00671424498531749 0,00657663843747616 0,00663767452506294 0,00141127003812273 0,00144059475379874 264821 292612 623 665 0 True 269 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 315 526 0,00651893337232589 0,00662746360063583 0,00653086137178607 0,00662241550316625 0,00137768925038182 0,00138892802244249 266157 288830 623 665 0 True 313 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 359 525 0,00651837003764913 0,00676261493743514 0,00650034332799268 0,00677500572213321 0,00146429812918897 0,00142760828284126 266134 294720 623 665 0 True 358 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 404 526 0,00746090243031152 0,00679051714890339 0,00689707789730678 0,0068207827878233 0,00354829476579866 0,00157301420850079 304616 295936 623 665 0 True 402 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 448 526 0,00685531765279014 0,0066983434782883 0,00691233691920348 0,00668345159075303 0,00188797180705684 0,00187098554956119 279891 291919 623 665 0 True 446 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 492 526 0,00637403389633736 0,00644077577785159 0,00645456626230259 0,00648508430609598 0,00172699165880805 0,00174691987370879 260241 280694 623 665 0 True 490 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 536 526 0,0060233458136457 0,00615216227797693 0,00604257267109178 0,00611886778057527 0,00164270769101762 0,00169018154349575 245923 268116 623 665 0 True 534 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 580 525 0,00604039281082083 0,00597155511805378 0,00605783169298848 0,005981536583505 0,00162739256025395 0,00168083172428859 246619 260245 623 665 0 True 579 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 623 522 0,00587864228015344 0,00602134771582194 0,00593575951781491 0,00601205462729839 0,00174366382305821 0,00178976672533678 240015 262415 623 665 0 False 623 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 668 525 0,00607830768384825 0,0060256156527735 0,00611886778057527 0,0059662775616083 0,0017788311925569 0,00184386664716556 248167 262601 623 665 0 True 667 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 271 571 0,00660887097811188 0,0066891651192527 0,00663767452506294 0,00671396963454643 0,00136546794400356 0,00126438669237968 269829 291519 623 665 0 True 269 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 315 569 0,00668945232970117 0,00695712731129724 0,00663767452506294 0,00697337300679027 0,00138344544888264 0,00132709110722418 273119 303197 623 665 0 True 313 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 359 569 0,00670164975009372 0,00658168653494574 0,00669871061264973 0,00657663843747616 0,00132231949940026 0,00128757579136558 273617 286835 623 665 0 True 357 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 403 569 0,0065233665713039 0,00660568794382385 0,00654612039368277 0,00663767452506294 0,00145975345224956 0,0013643265160958 266338 287881 623 665 0 True 402 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 448 569 0,00636497155588507 0,00642397938081643 0,00650034332799268 0,00633249408712902 0,00187271790175754 0,00190838011639701 259871 279962 623 665 0 True 446 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 492 570 0,00614872451844376 0,00643389200857488 0,00613412680247196 0,00656137941557946 0,00204179219363673 0,00195052521166472 251042 280394 623 665 0 True 490 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 536 570 0,0061845085168243 0,00606579391945187 0,00614938582436866 0,00614938582436866 0,00182222186214941 0,00174133202805707 252503 264352 623 665 0 True 534 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 580 568 0,00620300058990938 0,00624259206037525 0,00614938582436866 0,00621042191195544 0,00152576399913398 0,00149963155791268 253258 272057 623 665 0 True 579 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 624 569 0,00617184573300312 0,00614672410024833 0,00616464484626535 0,00616464484626535 0,00153652902010262 0,00149123381472362 251986 267879 623 665 0 True 623 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 668 569 0,00608815379428561 0,00617822881763805 0,00605783169298848 0,00616464484626535 0,00165330606850879 0,00161020985623705 248569 269252 623 665 0 True 667 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 269 608 0,00708334573281943 0,00694145526324394 0,00698863202868696 0,00689707789730678 0,00127905499074487 0,00141285062080892 289201 302514 623 665 0 False 269 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 313 608 0,00681772118631915 0,00665233695362233 0,0068055237659266 0,00662241550316625 0,00138576317769077 0,00128555481275494 278356 289914 623 665 0 False 313 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 359 614 0,00647908356714784 0,0066062156994684 0,00642404821850919 0,00665293354695964 0,0013231145676455 0,00135279013537453 264530 287904 623 665 0 True 357 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 403 614 0,00630349459768168 0,00631845119780454 0,00633249408712902 0,00634775310902571 0,00134221430046492 0,00124398081631738 257361 275363 623 665 0 True 402 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 446 608 0,0061905582413965 0,00613369083041777 0,00633249408712902 0,005981536583505 0,00177535260538396 0,00186906142470957 252750 267311 623 665 0 False 446 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 490 609 0,0061409358042172 0,00613995506045957 0,00610360875867857 0,00611886778057527 0,00188479144298579 0,00192602021243179 250724 267584 623 665 0 False 490 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 534 609 0,00602623596546562 0,00603220112538155 0,00602731364919509 0,00604257267109178 0,00185270608758333 0,00204849362587874 246041 262888 623 665 0 False 534 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 579 609 0,00605606821052209 0,00599264239793808 0,00607309071488518 0,005981536583505 0,00152227142504582 0,00164073280557308 247259 261164 623 665 0 False 579 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 623 609 0,00627319698919659 0,00630821732747984 0,00624093995574884 0,00634775310902571 0,00134478567874764 0,00132013542930479 256124 274917 623 665 0 False 623 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 667 609 0,00650925871157277 0,00644206074811657 0,00645456626230259 0,00651560234988937 0,00151424307314292 0,00154827317732646 265762 280750 623 665 0 False 667 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 271 659 0,00841697934802828 0,71840044147907 0,00834668497749294 0,717860685130083 0,00173097091238855 0,187658881008696 343651 31308448 623 665 10 True 269 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 313 652 0,00725229715022458 0,00686543550453153 0,00703440909437705 0,00686655985351339 0,00193988142022055 0,00126527440604386 296099 299201 623 665 0 False 313 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 357 652 0,00628475759647627 0,00625179336530844 0,00627145799954223 0,00624093995574884 0,00114928269024898 0,001204018242905 256596 272458 623 665 0 False 357 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 402 652 0,00595601507336638 0,00615425035465753 0,00593575951781491 0,00614938582436866 0,00133018820343684 0,00124596685698979 243174 268207 623 665 0 False 402 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 446 652 0,00605817459235694 0,00609638080093803 0,00613412680247196 0,00611886778057527 0,00146929231870043 0,00145432875604337 247345 265685 623 665 0 False 446 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 490 652 0,0060830592893827 0,00603288950230922 0,00611886778057527 0,00602731364919509 0,00160614814666238 0,00161574163552044 248361 262918 623 665 0 False 490 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 534 652 0,00586656732382106 0,00582557331759245 0,00584420538643473 0,00587472343022812 0,0017537936812967 0,00154061126445229 239522 253883 623 665 0 False 534 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 578 652 0,00601572854910337 0,00621042191195544 0,00610360875867857 0,00619516289005875 0,00141800104423816 0,00128771675029961 245612 270655 623 665 0 False 578 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 623 652 0,00674453666396389 0,0065788412436447 0,00675974670023652 0,00660715648126955 0,00136260963522094 0,00128592505250641 275368 286711 623 665 0 False 623 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 667 658 0,00821236639630276 0,723032598663057 0,00816357671473259 0,730327306019684 0,00155227671936152 0,195493667470673 335297 31510321 623 665 12 True 667 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E10_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E10_3.csv new file mode 100755 index 0000000..a4d335d --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E10_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 270 261 0,00106159195195588 0,0733039052196754 0,000885023270008392 0,0729076066224155 0,00080706685159952 0,0205050766459033 43343 3194641 623 665 0 True 270 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 314 261 0,000973491307072385 0,000901154236013472 0,000854505226215 0,000823987182421607 0,00068276024263023 0,000634026211708614 39746 39273 623 665 0 False 314 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 359 261 0,000944516310437085 0,000908359247856423 0,000839246204318303 0,00080872816052491 0,000652850983651921 0,000654860446616735 38563 39587 623 665 0 True 358 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 403 260 0,000947186026948706 0,000909965460687654 0,000778210116731518 0,000747692072938125 0,000725197600573645 0,000673681981673896 38672 39657 623 665 0 True 402 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 447 260 0,00099421222605249 0,000979789827051034 0,00080872816052491 0,000762951094834821 0,000864164200055347 0,000867284877309756 40592 42700 623 665 0 True 447 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 490 260 0,000985443799344597 0,000994750552279073 0,00080872816052491 0,000793469138628214 0,000862802916661085 0,000817887500540924 40234 43352 623 665 0 True 491 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 536 261 0,0009050828830636 0,000988830510701106 0,000701915007248035 0,000793469138628214 0,000798576956560099 0,000811312629908646 36953 43094 623 665 0 True 535 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 579 260 0,000831090097911241 0,000984401952466426 0,000518806744487678 0,000717174029144732 0,000854565364454877 0,000920960801384911 33932 42901 623 665 0 True 579 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 623 262 0,000982994518141275 0,00103295547176479 0,000656137941557946 0,000625619897764553 0,000967361707980972 0,0010175399088536 40134 45017 623 665 0 False 623 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 666 261 0,00102779187135004 0,0718367215819361 0,000747692072938125 0,0685282673380636 0,000941272113426856 0,0205530513440923 41963 3130700 623 665 0 True 668 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 270 305 0,000921223646193492 0,00101060616751308 0,000762951094834821 0,000839246204318303 0,000734119482019933 0,000787248434494077 37612 44043 623 665 0 False 270 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 314 305 0,000926465107968602 0,000835987886860663 0,00080872816052491 0,000747692072938125 0,000673032847344259 0,000593061666616599 37826 36433 623 665 0 False 314 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 359 305 0,00085085579722205 0,000840967146637479 0,000732433051041428 0,000747692072938125 0,000626437890192465 0,0006473023231399 34739 36650 623 665 0 True 358 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 403 305 0,000932857731909272 0,000941332502691841 0,000778210116731518 0,000778210116731518 0,000738474867051783 0,000744638055420422 38087 41024 623 665 0 True 402 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 447 304 0,00101992967868737 0,000927977990295033 0,000778210116731518 0,00064087891966125 0,000902857053084375 0,000925764051210063 41642 40442 623 665 0 True 446 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 492 306 0,000947235012572773 0,000956775091769249 0,000747692072938125 0,000701915007248035 0,000860640149976618 0,000866036618804275 38674 41697 623 665 0 True 491 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 534 305 0,000874515853646141 0,000878460743297934 0,000671396963454643 0,000732433051041428 0,000765104791436473 0,000756270055850339 35705 38284 623 665 0 True 535 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 579 305 0,000924750611126276 0,000900236400109911 0,000610360875867857 0,000534065766384375 0,000933330912488286 0,000928966052773169 37756 39233 623 665 0 True 579 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 623 305 0,000964208531311795 0,000909713055814175 0,000625619897764553 0,000473029678797589 0,000997951448864843 0,000968884784178209 39367 39646 623 665 0 False 623 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 668 305 0,000962200120725071 0,000960079301022068 0,000610360875867857 0,000595101853971161 0,000986093172091942 0,000940564068075758 39285 41841 623 665 0 False 668 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 270 349 0,00095786489299519 0,000956040823046401 0,000823987182421607 0,000793469138628214 0,000751893553904816 0,000771387651828872 39108 41665 623 665 0 True 269 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 315 350 0,000936776581834588 0,000883462948972339 0,000823987182421607 0,000778210116731518 0,000682211515049347 0,000645767703231768 38247 38502 623 665 0 True 314 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 359 349 0,00089717170477687 0,000897046920345037 0,000793469138628214 0,000793469138628214 0,000643157107953179 0,000634034847288573 36630 39094 623 665 0 True 358 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 403 350 0,000948263710678168 0,00091705574304266 0,000747692072938125 0,000732433051041428 0,00076020319590797 0,000734045961117687 38716 39966 623 665 0 True 402 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 448 350 0,000996661507255812 0,000940001640631678 0,000762951094834821 0,000671396963454643 0,00085567061877181 0,000886713558584229 40692 40966 623 665 0 True 446 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 492 350 0,00102296678737949 0,000854000416468041 0,000762951094834821 0,00064087891966125 0,000955329503822679 0,000784058750698836 41766 37218 623 665 0 True 491 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 535 349 0,000973564785508485 0,000880273469207466 0,000732433051041428 0,000610360875867857 0,00085899675680875 0,000842747862071484 39749 38363 623 665 0 True 535 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 580 349 0,000897024747904671 0,000938487211390803 0,000579842832074464 0,000534065766384375 0,00095203580852066 0,0010582264492968 36624 40900 623 665 0 True 579 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 624 349 0,000939446298346209 0,000883853029231353 0,000534065766384375 0,000457770656900893 0,00103288876361837 0,0010015203425262 38356 38519 623 665 0 True 623 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 668 349 0,000993085556698962 0,000905353335272262 0,000625619897764553 0,000442511635004196 0,00101680436007173 0,00106484349667596 40546 39456 623 665 0 True 668 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 271 394 0,000938564557113013 0,00096235094488338 0,000793469138628214 0,000823987182421607 0,000756238876820929 0,000767393783915498 38320 41940 623 665 0 True 269 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 315 394 0,000894746916385581 0,000867469658352794 0,000793469138628214 0,000762951094834821 0,000671318475004932 0,000653654541282094 36531 37805 623 665 0 True 314 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 359 394 0,000869078449374766 0,000866184688087809 0,000747692072938125 0,000717174029144732 0,000647286959515097 0,000678654895284884 35483 37749 623 665 0 True 358 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 403 393 0,00096371867507113 0,000914348127127156 0,000823987182421607 0,000732433051041428 0,000754355809697234 0,000728195384778587 39347 39848 623 665 0 True 402 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 448 393 0,00095793837143129 0,000936513864198147 0,000686655985351339 0,00064087891966125 0,000841985470304012 0,000873109278566538 39111 40814 623 665 0 True 446 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 491 393 0,000953039809024646 0,000847690294631062 0,000610360875867857 0,000534065766384375 0,000927882648532414 0,000830348039553572 38911 36943 623 665 0 True 491 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 536 394 0,000986668439946258 0,000875454830713772 0,000762951094834821 0,000701915007248035 0,000900273685696045 0,000812854931133118 40284 38153 623 665 0 True 535 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 580 393 0,000798171758538592 0,00084422546409512 0,000442511635004196 0,000457770656900893 0,00090014608252208 0,000935456709975038 32588 36792 623 665 0 True 579 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 625 393 0,000815218755713714 0,000865266852184249 0,000473029678797589 0,000473029678797589 0,00089622212484244 0,000961093489140984 33284 37709 623 665 0 True 623 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 668 393 0,000863004231990527 0,000848975264896046 0,000534065766384375 0,0004272526131075 0,00090432588455108 0,000963744788910245 35235 36999 623 665 0 True 667 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 271 438 0,000868392650637836 0,000880915954339958 0,000671396963454643 0,000747692072938125 0,000787249723109472 0,000726747847722601 35455 38391 623 665 0 True 269 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 315 438 0,000892714012986824 0,000888235695670855 0,000762951094834821 0,000762951094834821 0,000729230692554009 0,000742858637293912 36448 38710 623 665 0 True 314 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 360 438 0,00100770776548279 0,000891287500050194 0,000839246204318303 0,000732433051041428 0,0007621919290321 0,000679306582510207 41143 38843 623 665 0 True 358 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 404 437 0,001007119937994 0,000955375392016319 0,000747692072938125 0,000762951094834821 0,00086291842155235 0,000831355590444386 41119 41636 623 665 0 True 402 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 448 437 0,000918039580629174 0,000923503540265174 0,000671396963454643 0,000595101853971161 0,000925135355488526 0,000953949807339176 37482 40247 623 665 0 True 446 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 493 438 0,000937609337443717 0,000956499740998181 0,000671396963454643 0,000656137941557946 0,000954913545503545 0,000929966891854361 38281 41685 623 665 0 True 490 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 536 438 0,000910373330462776 0,000846290594878131 0,000656137941557946 0,000579842832074464 0,000875787218409125 0,000823674649355075 37169 36882 623 665 0 True 535 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 580 437 0,000868294679389703 0,000885665755140885 0,000457770656900893 0,000457770656900893 0,000933216611799179 0,00102401991100677 35451 38598 623 665 0 True 579 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 625 437 0,000909712024537879 0,000857373463413627 0,000564583810177768 0,000518806744487678 0,000929247577225242 0,000908768929601018 37142 37365 623 665 0 True 623 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 669 437 0,00081389614386392 0,000858153623931653 0,000411993591210803 0,000473029678797589 0,000917464742255301 0,000936359584265376 33230 37399 623 665 0 True 667 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 270 481 0,000873119763360247 0,000876762746876346 0,000762951094834821 0,000701915007248035 0,000731455971221 0,000784818844174492 35648 38210 623 665 0 True 269 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 315 482 0,000832951551625765 0,000877198718930538 0,000701915007248035 0,000762951094834821 0,000735828401803038 0,000763679999706033 34008 38229 623 665 0 True 313 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 359 481 0,000929232795728356 0,000987361973255409 0,000793469138628214 0,000854505226215 0,000782910171654485 0,000834556900560864 37939 43030 623 665 0 True 358 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 403 481 0,000957473008002659 0,00097425986573208 0,000656137941557946 0,000762951094834821 0,000903680469738602 0,000886181213098768 39092 42459 623 665 0 True 402 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 448 481 0,000932980195969438 0,000859277972913515 0,000625619897764553 0,000457770656900893 0,000950288796659328 0,00103266747938634 38092 37448 623 665 0 True 446 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 491 482 0,000943144712963225 0,000963154051298996 0,000579842832074464 0,00064087891966125 0,000967618295154997 0,000984640498908399 38507 41975 623 665 0 True 490 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 534 481 0,000963669689447064 0,000926715965927637 0,000732433051041428 0,000610360875867857 0,000886590943275485 0,000887381647307162 39345 40387 623 665 0 True 535 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 580 481 0,000890632123964 0,000854092200058397 0,000473029678797589 0,000396734569314107 0,000954618177615601 0,00099837992667343 36363 37222 623 665 0 True 579 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 624 481 0,000893007926731222 0,00078165200136987 0,000473029678797589 0,0004272526131075 0,000947079883371406 0,000847179521390827 36460 34065 623 665 0 True 623 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 669 482 0,000800914953486313 0,000884518460261434 0,000411993591210803 0,000503547722590982 0,000931957736590447 0,000929546169319033 32700 38548 623 665 0 True 667 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 270 526 0,000851811016891345 0,000942342122185757 0,000656137941557946 0,000762951094834821 0,000755802585306803 0,000806688932310485 34778 41068 623 665 0 True 269 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 315 526 0,00090356432871754 0,000922884001030271 0,000762951094834821 0,000869764248111696 0,000773483581040308 0,000739227940571852 36891 40220 623 665 0 True 313 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 359 525 0,000909442603605513 0,000878506635093111 0,000732433051041428 0,000686655985351339 0,00079986880318073 0,000776268927654358 37131 38286 623 665 0 True 358 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 404 526 0,000937952236812182 0,000932383602632124 0,000671396963454643 0,000701915007248035 0,000891445618285495 0,000862886058627095 38295 40634 623 665 0 True 402 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 448 526 0,000989974969570743 0,000953906854570622 0,000701915007248035 0,000518806744487678 0,000977469590123798 0,00106838622059915 40419 41572 623 665 0 True 446 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 492 526 0,000869837726547796 0,000860838293949568 0,000503547722590982 0,000488288700694286 0,000940480071944584 0,000911234074927525 35514 37516 623 665 0 True 490 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 536 526 0,000835866196257719 0,000905605740145741 0,000503547722590982 0,000549324788281071 0,000884140969005228 0,000895153873133128 34127 39467 623 665 0 True 534 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 580 525 0,000835792717821619 0,000831742895806695 0,000534065766384375 0,000549324788281071 0,000861469346278962 0,00085019655674962 34124 36248 623 665 0 True 579 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 623 522 0,000801355824102911 0,000840416445095343 0,000457770656900893 0,000473029678797589 0,000870143282676639 0,000925878043666637 32718 36626 623 665 0 False 623 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 668 525 0,000821317465909986 0,000853266147745193 0,0004272526131075 0,000381475547417411 0,000942180738543745 0,000991465091805524 33533 37186 623 665 0 True 667 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 271 571 0,000922472779607187 0,000888143912080499 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,000670737127454612 0,000662503945068119 37663 38706 623 665 0 True 269 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 315 569 0,000854799139959398 0,000857373463413627 0,000762951094834821 0,000732433051041428 0,000695778764505842 0,000702844574452849 34900 37365 623 665 0 True 313 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 359 569 0,000871503237766055 0,00084165552356515 0,000747692072938125 0,000717174029144732 0,000674180287724776 0,000608892988682401 35582 36680 623 665 0 True 357 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 403 569 0,000837433736227845 0,000866804227322713 0,000610360875867857 0,000686655985351339 0,000758999776024952 0,000724425130109849 34191 37776 623 665 0 True 402 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 448 569 0,000927420327637897 0,000898194215224488 0,000518806744487678 0,000503547722590982 0,000976429176438389 0,000962834444599253 37865 39144 623 665 0 True 446 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 492 570 0,000874270925525809 0,000948721081715504 0,000488288700694286 0,000518806744487678 0,000965860330246649 0,00107557152245489 35695 41346 623 665 0 True 490 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 536 570 0,000802898871261004 0,000876143207641443 0,000442511635004196 0,000488288700694286 0,000916230747037484 0,00090517993337888 32781 38183 623 665 0 True 534 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 580 568 0,00097900218977986 0,000816713332885888 0,000732433051041428 0,000534065766384375 0,000865839609089181 0,000800183271194764 39971 35593 623 665 0 True 579 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 624 569 0,00081595354007471 0,000830503817336888 0,000595101853971161 0,000595101853971161 0,000771193788658492 0,000753999870853471 33314 36194 623 665 0 True 623 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 668 569 0,00081610049694691 0,000837708829179839 0,000534065766384375 0,000534065766384375 0,000854975178130596 0,000844128915793272 33320 36508 623 665 0 True 667 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 269 608 0,000934866142495996 0,000972309464437014 0,000793469138628214 0,000839246204318303 0,000713754803184845 0,000757073112380586 38169 42374 623 665 0 False 269 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 313 608 0,000916496533471081 0,000878575472785879 0,00080872816052491 0,000747692072938125 0,00072857305839802 0,00068946119442822 37419 38289 623 665 0 False 313 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 359 614 0,000980079873509322 0,000832913136583734 0,000839246204318303 0,000686655985351339 0,000792023729830443 0,000686326619884676 40015 36299 623 665 0 True 357 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 403 614 0,000906381002101361 0,000931098632367139 0,000701915007248035 0,000793469138628214 0,000746941036021696 0,00070702896255764 37006 40578 623 665 0 True 402 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 446 608 0,000877454991090127 0,000939450939089541 0,000518806744487678 0,000473029678797589 0,000959460328054438 0,00104534432915074 35825 40942 623 665 0 False 446 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 490 609 0,000929061346044123 0,000858428974702722 0,000503547722590982 0,000442511635004196 0,00101834769022375 0,000986775063739412 37932 37411 623 665 0 False 490 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 534 609 0,000889064583993874 0,000818434275205065 0,0004272526131075 0,000381475547417411 0,00104301043785491 0,000966268311316222 36299 35668 623 665 0 False 534 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 579 609 0,000874491360834108 0,000866528876551645 0,000579842832074464 0,000518806744487678 0,000837201951546212 0,000895767763241352 35704 37764 623 665 0 False 579 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 623 609 0,000812426575141927 0,000860884185744746 0,00064087891966125 0,000701915007248035 0,000710686242317682 0,000701987777751477 33170 37518 623 665 0 False 623 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 667 609 0,00088774197214408 0,000847667348733473 0,000701915007248035 0,000610360875867857 0,000766041028771049 0,000776052339028534 36245 36942 623 665 0 False 667 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 271 659 0,000921958430554489 0,0713938198666729 0,000762951094834821 0,0701457236591135 0,000707268056399786 0,0207857591785531 37642 3111398 623 665 0 True 269 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 313 652 0,000955905468032533 0,000915862556368032 0,000793469138628214 0,00080872816052491 0,00068693993536466 0,000649718158732286 39028 39914 623 665 0 False 313 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 357 652 0,000840250409611665 0,000835987886860663 0,000701915007248035 0,000732433051041428 0,000670474036064052 0,000616910540929827 34306 36433 623 665 0 False 357 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 402 652 0,000914096237891825 0,000890117259273154 0,000762951094834821 0,000671396963454643 0,000703158622953578 0,00072587990311769 37321 38792 623 665 0 False 402 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 446 652 0,000830183863866012 0,00087318318685246 0,000610360875867857 0,000732433051041428 0,000760083047156419 0,000756347510949336 33895 38054 623 665 0 False 446 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 490 652 0,000880883984774778 0,000869374167852683 0,000671396963454643 0,000579842832074464 0,000820640099075429 0,000848749483000189 35965 37888 623 665 0 False 490 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 534 652 0,000859820166426209 0,000893995115965698 0,000503547722590982 0,000564583810177768 0,000889631843230178 0,000889275670564078 35105 38961 623 665 0 False 534 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 578 652 0,000880369635722081 0,000927220775674595 0,000717174029144732 0,000793469138628214 0,000723638371137355 0,000703014901224884 35944 40409 623 665 0 False 578 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 623 652 0,000847598253221631 0,000850466748239333 0,000717174029144732 0,000671396963454643 0,000642682537982284 0,000688249747462978 34606 37064 623 665 0 False 623 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 667 658 0,000992326279525932 0,0721155142376426 0,000823987182421607 0,0713817044327459 0,000722540896602257 0,0217059020803829 40515 3142850 623 665 0 True 667 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E11_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E11_1.csv new file mode 100755 index 0000000..0d8114b --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E11_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 261 274 0,0104438575150254 0,0461252237942074 0,0104829480430304 0,0464789806973373 0,00146919968695395 0,00821063399383048 426405 2010173 623 665 0 True 261 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 305 274 0,0102603573672725 0,0103208582224616 0,0102235446707866 0,0103150988021668 0,00138372128813942 0,00127573353165359 418913 449791 623 665 0 False 305 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 351 275 0,010391932753515 0,0650420512255691 0,0103303578240635 0,064438849469749 0,00137193658522004 0,0107753336124423 424285 2834583 623 665 0 True 349 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 394 274 0,0106495971361045 0,0916434827053902 0,0106813153276875 0,0896467536430915 0,00139122688445785 0,0171661365508446 434805 3993894 623 665 0 True 393 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 439 274 0,0104303374827831 0,0751677316431385 0,0104371709773404 0,0727855344472419 0,00168365446428494 0,0168103400671947 425853 3275868 623 665 0 True 438 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 482 273 0,0105704853532372 0,0699972637017125 0,0105439841306172 0,0725108720531014 0,00170204607998286 0,0214087499137736 431575 3050535 623 665 0 True 482 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 527 274 0,0105778087040351 0,0863244630229729 0,0105745021744106 0,0847180895704585 0,00160135321153716 0,0264609469877981 431874 3762087 623 665 0 True 526 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 571 274 0,0106378405863285 0,0735218453549759 0,010605020218204 0,0714122224765393 0,00177065767977134 0,0213666167074834 434325 3204139 623 665 0 True 570 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 614 275 0,0106640723880161 0,0106458409700149 0,0107270923933776 0,0105897611963073 0,00190501982313981 0,00196717959240182 435396 463954 623 665 0 False 614 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 656 273 0,0109450539276612 0,0470122433573061 0,0110322728313115 0,046646829938201 0,00183450808176281 0,00855791177537131 446868 2048830 623 665 0 True 658 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 261 318 0,0102873729389452 0,0103082150328901 0,0102845807583734 0,0102998397802701 0,00152131429651913 0,00152685032496134 420016 449240 623 665 0 False 261 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 305 318 0,0103416490104108 0,0102385053960146 0,0103303578240635 0,0103303578240635 0,00133561166724514 0,00129876170110598 422232 446202 623 665 0 False 305 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 351 320 0,0107927331296266 0,127547754715239 0,0107728694590677 0,127260242618448 0,0012724428587343 0,0346663036118236 440649 5558630 623 665 0 True 349 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 396 320 0,0108661380872902 0,0544784483525132 0,0108644235904479 0,053681239032578 0,00142285240164826 0,00854496037658363 443646 2374213 623 665 0 True 393 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 439 319 0,0107441883761768 0,0841994663931516 0,0107270923933776 0,0810711833371481 0,00176881471109357 0,0171940397209277 438667 3669478 623 665 0 True 437 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 484 320 0,0106756085024838 0,045611258634111 0,0106355382619974 0,0460059510185397 0,00166437391792278 0,0100822216960114 435867 1987774 623 665 0 True 482 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 527 318 0,0103795883762503 0,0442839990798695 0,0103303578240635 0,0471503776607919 0,0016014278171087 0,00946445069194878 423781 1929931 623 665 0 True 526 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 572 319 0,0105436412312488 0,0585931984917662 0,010452429999237 0,056595712214847 0,0018049326726769 0,0163820517184382 430479 2553537 623 665 0 True 570 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 614 318 0,0104366076426636 0,010228156796202 0,0105439841306172 0,0102235446707866 0,00205518950416617 0,00211191692383529 426109 445751 623 665 0 False 614 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 658 318 0,0106511891688866 0,0105276466515338 0,0105745021744106 0,0105287251087205 0,00188758305570645 0,00188817324383482 434870 458803 623 665 0 False 658 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 263 364 0,0102939370125701 0,0517996754302786 0,0103456168459602 0,0515602349889372 0,00147542650637114 0,0107995167278358 420284 2257470 623 665 0 True 261 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 307 364 0,010446527231537 0,0674771846072035 0,0104829480430304 0,0681162737468528 0,0013636621586543 0,0222151579143069 426514 2940708 623 665 0 True 305 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 350 364 0,0105207894376218 0,040699069715947 0,0105287251087205 0,0410009918364233 0,00141306742316892 0,0073875587360685 429546 1773697 623 665 0 True 349 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 395 364 0,0107626804492619 0,0367506314424193 0,0108186465247578 0,0373388265812161 0,00139813108572723 0,00506386295208784 439422 1601621 623 665 0 True 393 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 440 364 0,0109121355882886 0,0758439701909844 0,010955977721828 0,0713359273670558 0,00167451038454975 0,0146735933878952 445524 3305339 623 665 0 True 437 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 482 361 0,010751021870734 0,0327970762337292 0,0106660563057908 0,0353704127565423 0,00196527147569162 0,00815672252545441 438946 1429322 623 665 0 False 482 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 528 363 0,0106287782458762 0,0295743019714542 0,0106965743495842 0,030060273136492 0,00172454047001988 0,00346598344188978 433955 1288871 623 665 0 True 526 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 572 364 0,010565170413026 0,0526217122114051 0,0105745021744106 0,0535439078355077 0,00196464582464053 0,00950283606832836 431358 2293295 623 665 0 True 570 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 616 363 0,0106903041897037 0,0582003417791446 0,0107270923933776 0,0587014572365911 0,0021038712694073 0,0132004250274539 436467 2536416 623 665 0 True 614 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 660 364 0,0107368895181909 0,0661261531030598 0,0106660563057908 0,0645304036011292 0,00221123754891633 0,0207690796843769 438369 2881829 623 665 0 True 658 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 263 409 0,0103295250684543 0,0419790607211551 0,0103456168459602 0,0442053864347295 0,00148064079021111 0,00843485392337306 421737 1829480 623 665 0 True 261 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 307 409 0,0103939901497258 0,03491227496528 0,0103913939116503 0,0331425955596246 0,00141094603816692 0,00646636617501078 424369 1521504 623 665 0 True 305 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 351 408 0,010522405963216 0,0865249183843105 0,0105287251087205 0,0840772106507973 0,00136740973976582 0,020234804001153 429612 3770823 623 665 0 True 349 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 396 408 0,0105880956850891 0,0682858898218308 0,0105897611963073 0,0669413290608072 0,00154211632659209 0,0179191878646064 432294 2975952 623 665 0 True 393 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 441 409 0,0109389552174649 0,0440320990161373 0,010955977721828 0,0453192950331884 0,0016276841243775 0,0075192987428749 446619 1918953 623 665 0 True 437 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 485 409 0,0106470743764651 0,0537880062940597 0,0106813153276875 0,0551308461127642 0,00163083608793488 0,0107091476128783 434702 2344123 623 665 0 True 482 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 529 409 0,0105126088384027 0,0429276211815875 0,0105897611963073 0,0438086518654154 0,00163112986917588 0,00638965205837746 429212 1870819 623 665 0 True 526 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 573 409 0,010377188080671 0,0511722657525021 0,0103456168459602 0,0510719462882429 0,00184595306679503 0,00812268803780011 423683 2230127 623 665 0 True 570 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 616 408 0,0101755387592015 0,0436808891076398 0,0101472495613031 0,0430151827267872 0,00184901355275294 0,00966542430304599 415450 1903647 623 665 0 True 614 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 661 408 0,0103553894779614 0,0874391747278473 0,0103913939116503 0,0839703974975204 0,00177354444325871 0,0222160327505814 422793 3810667 623 665 0 True 658 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 263 453 0,010106640478952 0,0431984286649331 0,0100709544518196 0,0443121995880064 0,00153328355832989 0,00827402370719166 412637 1882621 623 665 0 True 261 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 307 452 0,0104067998904192 0,0566360281569109 0,0104371709773404 0,0541390096894789 0,00141440065500227 0,0149520220523983 424892 2468242 623 665 0 True 305 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 352 453 0,0106210875028978 0,0347606025822166 0,0106202792401007 0,0352788586251621 0,00143175589452223 0,00374025936476032 433641 1514894 623 665 0 True 349 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 396 452 0,0109990850710065 0,052702229366045 0,0109254596780346 0,0527351796749828 0,00182607597629609 0,00906073873727936 449074 2296804 623 665 0 True 393 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 440 452 0,010969228333138 0,0976834395441568 0,0109254596780346 0,0955672541390097 0,00184565270688534 0,0164727165379483 447855 4257120 623 665 0 True 437 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 484 453 0,011096003128222 0,0638716268813485 0,0111238269626917 0,0623331044480049 0,00186551926953181 0,0155941731822784 453031 2783575 623 665 0 True 482 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 528 452 0,0105613250415367 0,0536048291936066 0,0105897611963073 0,0518196383611811 0,00176078231970622 0,0100075863375096 431201 2336140 623 665 0 True 526 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 573 452 0,010422132390752 0,0312719083127824 0,0104982070649271 0,0316777294575418 0,00187030886644798 0,00419343574694122 425518 1362854 623 665 0 True 570 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 616 452 0,0103048363139249 0,0431412704340389 0,0103456168459602 0,0410620279240101 0,00186816813728963 0,0104882750133476 420729 1880130 623 665 0 True 614 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 661 452 0,0101971414194148 0,0656180850386437 0,01025406271458 0,0650644693675135 0,00196420127128282 0,00993192397476735 416332 2859687 623 665 0 True 658 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 262 497 0,0102671173833937 0,0514706542047497 0,0102845807583734 0,0538033112077516 0,00143626854616166 0,0151701498998828 419189 2243131 623 665 0 True 261 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 307 497 0,0105136620293201 0,0544150029456796 0,0104982070649271 0,0545662623025864 0,00160569931435461 0,00803630158178201 429255 2371448 623 665 0 True 305 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 350 497 0,0108008402504096 0,0659737923430687 0,0107728694590677 0,0658731975280385 0,00154430734413447 0,0174628809856706 440980 2875189 623 665 0 True 349 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 395 497 0,0110840261431377 0,0872274988225886 0,0110475318532082 0,0841382467383841 0,00164598067276634 0,0250233730345548 452542 3801442 623 665 0 True 393 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 440 497 0,0114687592345555 0,0967608538397952 0,0113527122911421 0,0929579613946746 0,00232348721130821 0,0310177380704972 468250 4216913 623 665 0 True 437 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 484 498 0,0109644032491675 0,0453118376164719 0,010955977721828 0,0465552758068208 0,00180855207856572 0,00629900946742029 447658 1974725 623 665 0 True 482 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 526 496 0,0106754125599875 0,0441363422288842 0,0106965743495842 0,0453192950331884 0,0017364299495533 0,00910506951742357 435859 1923496 623 665 0 True 526 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 571 497 0,0105582144544085 0,0996635098848059 0,0105745021744106 0,0985732814526589 0,00171450039867806 0,0217929153744389 431074 4343413 623 665 0 True 570 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 614 491 0,0110575004277057 0,0560174526497062 0,0106965743495842 0,0653696498054475 0,00255041317311976 0,0269658555518883 451459 2441284 623 665 0 False 614 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 660 497 0,011034820083763 0,0769015007190671 0,010605020218204 0,073685816739147 0,00374568244916858 0,0141779804589638 450533 3351427 623 665 0 True 658 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 264 541 0,0101688522215164 0,0573421652093153 0,0100862134737163 0,0601358052948806 0,00145568484107633 0,0146973347815178 415177 2499016 623 665 0 True 261 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 307 541 0,0105159398608392 0,108085227947415 0,0105134660868238 0,100724803540093 0,0014368946949344 0,0299819370058059 429348 4710438 623 665 0 True 305 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 351 541 0,0105964477339924 0,0567715695739693 0,0106202792401007 0,0576333257038224 0,00139204655623858 0,0133677789977326 432635 2474149 623 665 0 True 349 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 394 540 0,010968469055965 0,0585227545861679 0,0108491645685512 0,0578316929884794 0,00161052693799813 0,0133531977236965 447824 2550467 623 665 0 True 393 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 439 540 0,0109365304290737 0,0579433706720452 0,0109254596780346 0,0574196993972686 0,00205870946334252 0,010388467028446 446520 2525217 623 665 0 True 437 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 482 541 0,0105634804089957 0,058418786724192 0,0105592431525139 0,0597390707255665 0,00194103429402694 0,0139744170963787 431289 2545936 623 665 0 True 481 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 527 541 0,0105611290990405 0,0686867087609158 0,010605020218204 0,0679484245059892 0,00201972769989249 0,0166692634594759 431193 2993420 623 665 0 True 526 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 571 540 0,0104908837141292 0,0564982150959913 0,0104676890211337 0,0568703746089876 0,00171238925256019 0,013536451542556 428325 2462236 623 665 0 True 570 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 616 541 0,0104105472906602 0,0459507890807357 0,0103761348897536 0,0440222781719692 0,0018035274804625 0,00884906201493535 425045 2002571 623 665 0 True 614 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 659 540 0,0103789760559494 0,0748205143208215 0,0105439841306172 0,0717174029144732 0,0018148388306699 0,0226390366258233 423756 3260736 623 665 0 True 658 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 261 577 0,013734736232621 0,0337080513139108 0,0106660563057908 0,0376440070191501 0,00806304345089904 0,0186505479660109 560766 1469023 623 665 0 False 261 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 305 577 0,0151616139832403 0,0374635145887149 0,0106813153276875 0,043076218814374 0,0130187282335571 0,020300439864314 619023 1632689 623 665 0 False 305 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 349 577 0,0138970500979651 0,0358868101817831 0,0110170138094148 0,0409857328145266 0,00812166120350778 0,0188152364637957 567393 1563975 623 665 0 False 349 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 393 577 0,0151153470613095 0,0367542110024432 0,0114442664225223 0,0437933928435187 0,00958211623300505 0,0182684139339571 617134 1601777 623 665 0 False 393 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 440 585 0,0107872957253552 0,0839815950955439 0,0108339055466545 0,0792858777752346 0,00178234042647811 0,0201708150629394 440427 3659983 623 665 0 True 437 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 481 577 0,0151695741471511 0,0443687841714609 0,011261158159762 0,0528725108720531 0,0110561060867435 0,0253313684862779 619348 1933626 623 665 0 False 481 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 526 577 0,0148174164957375 0,041395684220852 0,011108567940795 0,0504921034561685 0,0108021034704951 0,0216728118742755 604970 1804056 623 665 0 False 526 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 570 578 0,0113933948519293 0,0317170587260093 0,0107118333714809 0,036591134508278 0,00344664080530414 0,0141061405607054 465173 1382254 623 665 0 False 570 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 617 584 0,0103070161741958 0,0480705540459067 0,0103303578240635 0,0486762798504616 0,00149339455589568 0,00724663681354675 420818 2094952 623 665 0 True 614 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 661 585 0,0103133353197004 0,056320407335574 0,0102998397802701 0,0530708781567102 0,0016854435127485 0,0116903744415675 421076 2454487 623 665 0 True 658 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 261 621 0,010871183606569 0,00988704308264367 0,0100404364080262 0,0098115510795758 0,00435537791046734 0,00132881479544054 443852 430885 623 665 0 False 261 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 305 621 0,0109136051570106 0,00999507236849276 0,0101930266269932 0,0100251773861295 0,00402677068446982 0,00134439026188499 445584 435593 623 665 0 False 305 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 349 621 0,0176297546518279 0,0575662089533745 0,0110017547875181 0,0676432440680552 0,015768621733313 0,0368717565957465 719793 2508780 623 665 0 False 349 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 393 621 0,0169615172611256 0,0520331269923493 0,0112458991378653 0,0577248798352026 0,0139877360314283 0,0342496486327834 692510 2267644 623 665 0 False 393 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 437 621 0,01217689541606 0,010248532753261 0,0105439841306172 0,0102388036926833 0,00857850000649638 0,00187184768572338 497162 446639 623 665 0 False 437 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 481 621 0,0115639138093046 0,010234352188551 0,0106355382619974 0,0102235446707866 0,00571053911723522 0,00199020391792532 472135 446021 623 665 0 False 481 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 526 621 0,011352614319894 0,0101142074687749 0,01025406271458 0,0101319905394064 0,0060065518556066 0,00189107862899207 463508 440785 623 665 0 False 526 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 570 621 0,0103972476937262 0,0100988107714927 0,0103150988021668 0,0101167315175097 0,00213740214236472 0,00170830223681714 424502 440114 623 665 0 False 570 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 614 621 0,0108536222603412 0,0100144845978531 0,0103761348897536 0,0100099183642329 0,00360074955217092 0,001362545035917 443135 436439 623 665 0 False 614 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 658 621 0,0105673012876729 0,010084721990373 0,0101167315175097 0,0101625085831998 0,00316651848950797 0,00157566452175215 431445 439500 623 665 0 False 658 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 262 671 0,0113400250145089 0,0471294510021908 0,0102388036926833 0,0467383840695811 0,00412269411786478 0,0113794254669565 462994 2053938 623 665 0 True 261 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 305 664 0,0103798577971826 0,00982676420967732 0,00996414129854276 0,00987258716716258 0,00254612444382478 0,00126846193395527 423792 428258 623 665 0 False 305 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 349 664 0,0137740227031223 0,00990445901891373 0,0103303578240635 0,00990310521095598 0,0123862228177202 0,00127016220404688 562370 431644 623 665 0 False 349 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 393 664 0,0129141290582599 0,00999410864079402 0,0104219119554437 0,00993362325474937 0,00953522154326902 0,00128414514913825 527262 435551 623 665 0 False 393 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 437 664 0,0100989252431616 0,0099964491223481 0,010101472495613 0,0101167315175097 0,00144587674830384 0,00155216615001327 412322 435653 623 665 0 False 437 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 481 664 0,0100482251222528 0,0100407117587973 0,0100556954299229 0,0100556954299229 0,00164967162309806 0,0015353203842261 410252 437582 623 665 0 False 481 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 526 664 0,00998780135496686 0,0099801575350599 0,0100556954299229 0,00987258716716258 0,00181451360719982 0,00177872131951154 407785 434943 623 665 0 False 526 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 570 664 0,00997455074365688 0,00991824950336473 0,00994888227664607 0,0100251773861295 0,00165298223429636 0,00152558607287271 407244 432245 623 665 0 False 570 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 614 664 0,010135395040279 0,00986496912916303 0,0101472495613031 0,00987258716716258 0,00137621565174006 0,00135677372480187 413811 429923 623 665 0 False 614 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 657 670 0,0101687052646442 0,0443679810650453 0,0101777676050965 0,0445716029602502 0,00149915207376802 0,00792132305620468 415171 1933591 623 665 0 True 658 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E11_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E11_2.csv new file mode 100755 index 0000000..34a4c46 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E11_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 261 274 0,00837823171939173 0,745634881435679 0,00840772106507973 0,761089494163424 0,00166281405384915 0,181738002819812 342069 32495346 623 665 12 True 261 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 305 274 0,0069659516847442 0,00689817930039105 0,00688181887541009 0,00691233691920348 0,00138047940820771 0,00118142134912741 284408 300628 623 665 0 False 305 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 351 275 0,00643879289135319 0,00649655725489049 0,00646982528419928 0,00636301213092241 0,00128647776225952 0,0013696922092176 262885 283125 623 665 0 True 349 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 394 274 0,00640543368136395 0,0065481396326706 0,00642404821850919 0,00653086137178607 0,00131587919336017 0,00133121293699409 261523 285373 623 665 0 True 393 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 439 274 0,0065309593430342 0,00665346130260419 0,00645456626230259 0,00660715648126955 0,00150561885458329 0,00152246862674379 266648 289963 623 665 0 True 438 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 482 273 0,00682546091492165 0,00682711585555787 0,0068055237659266 0,0068207827878233 0,00165855761285383 0,00158346649949385 278672 297531 623 665 0 True 482 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 527 274 0,0070387198292949 0,00715113487541238 0,00708018616006714 0,00714122224765393 0,00140862829955002 0,0016376537193441 287379 311652 623 665 0 True 526 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 571 274 0,00754035711254729 0,00740957451995748 0,00744640268558785 0,00741588464179446 0,00170167272517165 0,00164244461012997 307860 322915 623 665 0 True 570 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 614 275 0,00805017499501877 0,00784880489160645 0,0080872816052491 0,00788891432059205 0,00197167605607567 0,00181266147775911 328675 342057 623 665 0 False 614 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 656 273 0,009319931356445 0,745014217851794 0,00930800335698482 0,743099107347219 0,00191170778646235 0,175326799310318 380517 32468297 623 665 14 True 658 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 261 318 0,00693717263060516 0,0066419424620145 0,00688181887541009 0,00666819256885634 0,00156001982871813 0,00139190410436495 283233 289461 623 665 0 False 261 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 305 318 0,00664276902996585 0,00642264851875626 0,00663767452506294 0,00645456626230259 0,00120170661850387 0,00118110313904527 271213 279904 623 665 0 False 305 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 351 320 0,00667972868332398 0,00645153740382084 0,00669871061264973 0,00643930724040589 0,00130415200566801 0,00125167622293408 272722 281163 623 665 0 True 349 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 396 320 0,00645696655788184 0,00671713616841371 0,00646982528419928 0,00665293354695964 0,00140361230234202 0,00122659573196541 263627 292738 623 665 0 True 393 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 439 319 0,00703862185804676 0,00697548402936845 0,00711070420386053 0,00695811398489357 0,0015628921517683 0,00166232143434475 287375 303997 623 665 0 True 437 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 484 320 0,00704273665046835 0,00702968223947371 0,00701915007248035 0,00700389105058366 0,00163465043840701 0,00152127757061354 287543 306359 623 665 0 True 482 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 527 318 0,00716000823448341 0,00729635946125327 0,00720225833524071 0,00733958953231098 0,00153673155483308 0,00157514621816531 292331 317981 623 665 0 True 526 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 572 319 0,00730899801008149 0,00771994073074653 0,00730907148851759 0,00775158312352178 0,00167279785418018 0,00162050367338672 298414 336441 623 665 0 True 570 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 614 318 0,0077686301206969 0,00776298723462352 0,00772106507972839 0,00770580605783169 0,00192550285214199 0,00190628745476367 317180 338317 623 665 0 False 614 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 658 318 0,00812015095899769 0,00787473375588204 0,0081177996490425 0,00791943236438544 0,00193736865155394 0,00181245038330017 331532 343187 623 665 0 False 658 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 263 364 0,00628997456543934 0,00605826766504267 0,00631723506523232 0,00610360875867857 0,00140540792993822 0,0014229391508273 256809 264024 623 665 0 True 261 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 307 364 0,00649919216582711 0,00623575418289372 0,00653086137178607 0,00625619897764553 0,00131522132049488 0,00124391529303492 265351 271759 623 665 0 True 305 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 350 364 0,00650497246946695 0,00633476573099033 0,00654612039368277 0,00633249408712902 0,00128417767014156 0,00133127841441582 265587 276074 623 665 0 True 349 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 395 364 0,00669880858389786 0,00662135999187715 0,00674448767833982 0,00663767452506294 0,00136126939070901 0,00136965140496747 273501 288564 623 665 0 True 393 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 440 364 0,00711499044596635 0,00683505513612367 0,00714122224765393 0,00685130083161669 0,00158242067645323 0,00160476378764024 290493 297877 623 665 0 True 437 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 482 361 0,00712826555008835 0,00654811668677301 0,00711070420386053 0,00651560234988937 0,00168991902460782 0,001624473111444 291035 285372 623 665 0 False 482 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 528 363 0,00722425288044654 0,00677337656340439 0,0072632944228275 0,00677500572213321 0,00172065946593239 0,00168479169250612 294954 295189 623 665 0 True 526 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 572 364 0,00744052441069988 0,00713273226554599 0,00733958953231098 0,00717174029144732 0,00184207644572967 0,00185543401085775 303784 310850 623 665 0 True 570 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 616 363 0,00744708848432478 0,00699530928488537 0,00744640268558785 0,00708018616006714 0,00222789056858934 0,00198993616047488 304052 304861 623 665 0 True 614 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 660 364 0,00678232907293114 0,0062961707312456 0,00666819256885634 0,00636301213092241 0,00215222796385046 0,00197149965207915 276911 274392 623 665 0 True 658 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 263 409 0,00607835666947232 0,00627781401317439 0,00616464484626535 0,00624093995574884 0,00143562564964251 0,0014760036271318 248169 273592 623 665 0 True 261 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 307 409 0,00639619989122742 0,00651943431478674 0,00633249408712902 0,00654612039368277 0,00140487641659373 0,00129228624677506 261146 284122 623 665 0 True 305 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 351 408 0,00650274362357193 0,00650247729646845 0,00648508430609598 0,00656137941557946 0,0013552070923996 0,00119559993987662 265496 283383 623 665 0 True 349 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 396 408 0,00663493133011522 0,00657608773593402 0,00660715648126955 0,00659189745937285 0,00132823528016494 0,00143644791796509 270893 286591 623 665 0 True 393 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 441 409 0,00681958264003367 0,00678934690812635 0,00685130083161669 0,00671396963454643 0,00151648714849924 0,00159490692807622 278432 295885 623 665 0 True 437 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 485 409 0,00659140760313219 0,00671706733072094 0,00656137941557946 0,00669871061264973 0,00163460275747038 0,00158889867520379 269116 292735 623 665 0 True 482 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 529 409 0,00675095378071659 0,00671243225940796 0,00672922865644312 0,00672922865644312 0,00155877649877705 0,00153834757190257 275630 292533 623 665 0 True 526 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 573 409 0,0066106589533903 0,00674320270807483 0,00662241550316625 0,00683604180972 0,00176070428993156 0,00163095230527328 269902 293874 623 665 0 True 570 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 616 408 0,00606111372980093 0,0062360065877672 0,00604257267109178 0,00622568093385214 0,00179531517705717 0,00180010964226545 247465 271770 623 665 0 True 614 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 661 408 0,00574745877890351 0,00595973798079543 0,00578316929884794 0,00602731364919509 0,0016992169607933 0,00177622411593265 234659 259730 623 665 0 True 658 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 263 453 0,00610204121870844 0,00604998419601304 0,00622568093385214 0,00611886778057527 0,00149193260250233 0,00149051967775798 249136 263663 623 665 0 True 261 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 307 452 0,00635546834481618 0,00627703385265636 0,0063935301747158 0,00631723506523232 0,00140958915104982 0,00152724648004387 259483 273558 623 665 0 True 305 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 352 453 0,00641043021501872 0,00641707266564213 0,0064087891966125 0,00634775310902571 0,00143866399841041 0,00145136898244053 261727 279661 623 665 0 True 349 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 396 452 0,00663529872229572 0,0066609646111158 0,00660715648126955 0,00665293354695964 0,00145489752861616 0,00146800510656855 270908 290290 623 665 0 True 393 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 440 452 0,00690648313712754 0,00691674253154057 0,00686655985351339 0,00689707789730678 0,00165298768786374 0,00193968072472079 281980 301437 623 665 0 True 437 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 484 453 0,0067407892637228 0,00672278085922061 0,00675974670023652 0,00674448767833982 0,00175451950382966 0,00187209332450714 275215 292984 623 665 0 True 482 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 528 452 0,00654117284565205 0,00654641869035142 0,00654612039368277 0,00656137941557946 0,00165276148344834 0,00173167684016979 267065 285298 623 665 0 True 526 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 573 452 0,00602640741514986 0,00589893135218454 0,00601205462729839 0,0059510185397116 0,00173929996784868 0,00188299397178348 246048 257080 623 665 0 True 570 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 616 452 0,0058154998107318 0,00574452840730804 0,00579842832074464 0,00570687418936446 0,00157066261875398 0,00172114402535321 237437 250351 623 665 0 True 614 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 661 452 0,00580482094468531 0,00575701097559646 0,00585946440833143 0,00575265125505455 0,00182618278109773 0,0019615171477001 237001 250895 623 665 0 True 658 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 262 497 0,00641096905688345 0,0063776516135842 0,0063782711528191 0,0063935301747158 0,00136347694639875 0,00144350547297775 261749 277943 623 665 0 True 261 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 307 497 0,00642037429670421 0,0064593390090011 0,00651560234988937 0,00646982528419928 0,00155726307238892 0,00152149007711145 262133 281503 623 665 0 True 305 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 350 497 0,00635742776977883 0,0064388712683517 0,0063935301747158 0,00642404821850919 0,00142442207739976 0,00147755643866195 259563 280611 623 665 0 True 349 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 395 497 0,00661229997179653 0,00678117816858466 0,00663767452506294 0,0068207827878233 0,00152407456985815 0,00152476596610242 269969 295529 623 665 0 True 393 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 440 497 0,00677169919250873 0,00705528986118306 0,00660715648126955 0,00709544518196384 0,00176118602051659 0,00192766759710612 276477 307475 623 665 0 True 437 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 484 498 0,00651513698646074 0,00624116941472473 0,00659189745937285 0,00624093995574884 0,00163892099513239 0,00171709388536017 266002 271995 623 665 0 True 482 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 526 496 0,00603593511903078 0,0057859686983538 0,00607309071488518 0,00573739223315786 0,00159933118965868 0,00152324177384928 246437 252157 623 665 0 True 526 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 571 497 0,00584922641290154 0,00582488494066478 0,00582894636453803 0,0059510185397116 0,00167271256799814 0,00179668584431239 238814 253853 623 665 0 True 570 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 614 491 0,00566009291838101 0,00646245965107321 0,00570687418936446 0,00588998245212482 0,00171407954039234 0,0048151963758239 231092 281639 623 665 0 False 614 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 660 497 0,00642728126969758 0,00602575332815903 0,00613412680247196 0,00607309071488518 0,00258038688392559 0,00183066735983313 262415 262607 623 665 0 True 658 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 264 541 0,00639811033056601 0,00696128051876085 0,0063935301747158 0,00651560234988937 0,0013211019018247 0,00347777789399758 261224 303378 623 665 0 True 261 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 307 541 0,00644449971655693 0,00639160271931832 0,00643930724040589 0,00634775310902571 0,00135326854091105 0,00137289752941027 263118 278551 623 665 0 True 305 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 351 541 0,00648758257292337 0,00655724915401344 0,00650034332799268 0,00657663843747616 0,00138951812424646 0,00128725760079306 264877 285770 623 665 0 True 349 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 394 540 0,00644207492816564 0,00659549996529433 0,00651560234988937 0,00665293354695964 0,00146447550497779 0,00148047151136433 263019 287437 623 665 0 True 393 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 439 540 0,00642821199655484 0,0064292569372619 0,00642404821850919 0,00651560234988937 0,00173684205383104 0,00194985672855037 262453 280192 623 665 0 True 437 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 482 541 0,00620939321385005 0,00616439244139188 0,00625619897764553 0,00621042191195544 0,00179560763546225 0,00189940064859375 253519 268649 623 665 0 True 481 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 527 541 0,00586279543076794 0,00596685120904803 0,00592050049591821 0,0059662775616083 0,00166836685548876 0,00182683443524607 239368 260040 623 665 0 True 526 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 571 540 0,0059810957128884 0,00598334930941453 0,0059662775616083 0,00602731364919509 0,0015826079133977 0,00158143535759923 244198 260759 623 665 0 True 570 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 616 541 0,00595295347186223 0,00590739838839488 0,00582894636453803 0,00590524147402152 0,00167900901417353 0,00166350952640757 243049 257449 623 665 0 True 614 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 659 540 0,00621928830991147 0,0062460339450136 0,00633249408712902 0,00627145799954223 0,00173783784857188 0,00183608506440588 253923 272207 623 665 0 True 658 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 261 577 0,00638843566981289 0,00659501810144496 0,00643930724040589 0,00660715648126955 0,00123845593300896 0,0012586787627386 260829 287416 623 665 0 False 261 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 305 577 0,00635671747822987 0,00653343131231604 0,00630197604333562 0,00659189745937285 0,00133371746885388 0,00140618587048882 259534 284732 623 665 0 False 305 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 349 577 0,00638270435179712 0,00658216839879511 0,00634775310902571 0,00660715648126955 0,00126351476493339 0,00134308041501117 260595 286856 623 665 0 False 349 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 393 577 0,0062188719321069 0,00641314891715441 0,00616464484626535 0,0063935301747158 0,00132440273872314 0,00124894193651302 253906 279490 623 665 0 False 393 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 440 585 0,00644942277177561 0,00645582828666998 0,00646982528419928 0,00651560234988937 0,00171496094524077 0,00191989080116333 263319 281350 623 665 0 True 437 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 481 577 0,00621544293842225 0,00630716181619074 0,00614938582436866 0,00634775310902571 0,00185591764922155 0,00189119151019914 253766 274871 623 665 0 False 481 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 526 577 0,00597744628389545 0,00611700916287056 0,00614938582436866 0,00611886778057527 0,00189271318820802 0,00179684614701378 244049 266584 623 665 0 False 526 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 570 578 0,0061553130848807 0,00617639314583093 0,00619516289005875 0,00610360875867857 0,00153357145483553 0,00192523642869162 251311 269172 623 665 0 False 570 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 617 584 0,00585280236345839 0,00614537029229058 0,00585946440833143 0,00616464484626535 0,00143226403587691 0,00145029818444385 238960 267820 623 665 0 True 614 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 661 585 0,00596843292906722 0,00590875219635264 0,00604257267109178 0,0059662775616083 0,00152258342580389 0,00155598890313188 243681 257508 623 665 0 True 658 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 261 621 0,00682967367859136 0,00662273674573249 0,0068055237659266 0,00660715648126955 0,00137254125040555 0,00138438610038836 278844 288624 623 665 0 False 261 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 305 621 0,00659282818623012 0,0063517456952062 0,00660715648126955 0,0064087891966125 0,00135965926148616 0,00129753769225479 269174 276814 623 665 0 False 305 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 349 621 0,00634709180310081 0,00634355400976692 0,00634775310902571 0,0063935301747158 0,00133835699212565 0,00134804513261428 259141 276457 623 665 0 False 349 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 393 621 0,00616023614009937 0,00613079964732155 0,00617990386816205 0,00617990386816205 0,00134400855413864 0,00119463715632328 251512 267185 623 665 0 False 393 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 437 621 0,00624280140946336 0,00594695711583835 0,00624093995574884 0,00601205462729839 0,00153866549866251 0,00169566569957244 254883 259173 623 665 0 False 437 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 481 621 0,00620447015863137 0,00598139890811946 0,00627145799954223 0,0059510185397116 0,00175339483858189 0,00182394534973255 253318 260674 623 665 0 False 481 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 526 621 0,00600103286188344 0,00596636934519866 0,00605783169298848 0,00599679560540169 0,00174603709716269 0,00180881088817258 245012 260019 623 665 0 False 526 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 570 621 0,00589635058325346 0,00601251354525017 0,0059510185397116 0,00605783169298848 0,00160986694331138 0,00160669193076293 240738 262030 623 665 0 False 570 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 614 621 0,00583822914029862 0,00591455750844266 0,00587472343022812 0,00584420538643473 0,00141304294973632 0,00135853564552227 238365 257761 623 665 0 False 614 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 658 621 0,00603907019897103 0,00612244734059915 0,00611886778057527 0,00622568093385214 0,00144518688802664 0,00145675706966304 246565 266821 623 665 0 False 658 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 262 671 0,0242731849877187 0,740675033888222 0,00827038986800946 0,748210879682612 0,0669604171880118 0,185951536214978 991033 32279192 623 665 11 True 261 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 305 664 0,0194904980748037 0,00663675668915938 0,0072632944228275 0,00660715648126955 0,0340199520409244 0,00148794705548751 795764 289235 623 665 0 False 305 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 349 664 0,00608340218875116 0,00603300423179716 0,00610360875867857 0,00599679560540169 0,00119587168145842 0,00117350723155426 248375 262923 623 665 0 False 349 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 393 664 0,00589774667353935 0,00593479579011617 0,00593575951781491 0,00601205462729839 0,00121996096714913 0,00134814365964747 240795 258643 623 665 0 False 393 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 437 664 0,00591271178169165 0,00594229909862778 0,00587472343022812 0,00593575951781491 0,00143270214570899 0,00139870833276177 241406 258970 623 665 0 False 437 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 481 664 0,00604622210008473 0,00601487697270184 0,00604257267109178 0,00602731364919509 0,00155347968265966 0,00140924456261269 246857 262133 623 665 0 False 481 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 526 664 0,00594800592383152 0,0060193514227317 0,00601205462729839 0,00608834973678187 0,00163689183022418 0,00159603473785453 242847 262328 623 665 0 False 526 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 570 664 0,00587009428875384 0,00615301127618772 0,0059510185397116 0,00611886778057527 0,00148985424889603 0,00143754452904789 239666 268153 623 665 0 False 570 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 614 664 0,00645101480455777 0,00627526701854201 0,00648508430609598 0,00622568093385214 0,00141391587089338 0,00133592185005726 263384 273481 623 665 0 False 614 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 657 670 0,00775383646222884 0,742999040287833 0,00770580605783169 0,750835431448844 0,00173851544646308 0,182280435209433 316576 32380474 623 665 12 True 658 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E11_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E11_3.csv new file mode 100755 index 0000000..8e0a5c0 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E11_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 261 274 0,00100685051706163 0,0751083476601781 0,00080872816052491 0,0757305256733043 0,00080992253691405 0,0204231741397121 41108 3273280 623 665 0 True 261 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 305 274 0,000967735496244578 0,000915220071235539 0,000854505226215 0,000823987182421607 0,000677110046722348 0,000640260640669096 39511 39886 623 665 0 False 305 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 351 275 0,000870866424653191 0,00091962568357263 0,000747692072938125 0,000793469138628214 0,000648312458387361 0,000673234385529387 35556 40078 623 665 0 True 349 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 394 274 0,000904250127454471 0,000896152030339066 0,000732433051041428 0,000762951094834821 0,000694337743369216 0,00065371515182703 36919 39055 623 665 0 True 393 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 439 274 0,000879414416052785 0,000916803338169181 0,000671396963454643 0,000686655985351339 0,000780394074245128 0,000851991093041329 35905 39955 623 665 0 True 438 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 482 273 0,000888991105557774 0,000964622588744693 0,000671396963454643 0,000717174029144732 0,00083150526041721 0,000903186257188324 36296 42039 623 665 0 True 482 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 527 274 0,000958918083912619 0,000958977897937795 0,000793469138628214 0,000747692072938125 0,000801896213038088 0,000827112172273457 39151 41793 623 665 0 True 526 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 571 274 0,0009992332525193 0,00102244625066902 0,000762951094834821 0,000732433051041428 0,00089134970302353 0,000950525481980519 40797 44559 623 665 0 True 570 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 614 275 0,00111016119821776 0,00100025756770044 0,000793469138628214 0,000671396963454643 0,00106648389459464 0,000974777799562593 45326 43592 623 665 0 False 614 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 656 273 0,00118040658312903 0,0758490412343516 0,000915541313801785 0,0737926298924239 0,00101667797656194 0,0208210396779607 48194 3305560 623 665 0 True 658 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 261 318 0,000942630363910527 0,000892136498260988 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000772574019244507 0,000739197501992564 38486 38880 623 665 0 False 261 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 305 318 0,000900380263153222 0,000941929096029155 0,000793469138628214 0,000854505226215 0,000664518766409653 0,000620130854600317 36761 41050 623 665 0 False 305 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 351 320 0,000934474257503465 0,000862788695244635 0,000854505226215 0,000732433051041428 0,000628401380240911 0,000672156103090018 38153 37601 623 665 0 True 349 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 396 320 0,000949071973475264 0,000918776685361837 0,00080872816052491 0,000793469138628214 0,000695581320277959 0,000666124546301301 38749 40041 623 665 0 True 393 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 439 319 0,000905180854311733 0,000947619678631231 0,000671396963454643 0,000625619897764553 0,000827887682460947 0,000919640798839455 36957 41298 623 665 0 True 437 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 484 320 0,000988603372096882 0,000948078596583012 0,000732433051041428 0,000762951094834821 0,000902685820290498 0,000841773821747144 40363 41318 623 665 0 True 482 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 527 318 0,000921493067125858 0,00105502942524542 0,000717174029144732 0,000854505226215 0,00081826781453517 0,000895255104864521 37623 45979 623 665 0 True 526 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 572 319 0,00109632275941899 0,00100945887263363 0,000930800335698482 0,00080872816052491 0,000962064054577871 0,000846177706249372 44761 43993 623 665 0 True 570 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 614 318 0,0010711196558368 0,00109839717168866 0,000701915007248035 0,000686655985351339 0,00111226521177876 0,00115643256889953 43732 47869 623 665 0 False 614 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 658 318 0,00101500662346869 0,00115149397870965 0,000625619897764553 0,000930800335698482 0,00101952960252091 0,000991306822491829 41441 50183 623 665 0 False 658 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 263 364 0,000875324116443237 0,000809737780018827 0,000701915007248035 0,00064087891966125 0,000746685512841074 0,000739842730994357 35738 35289 623 665 0 True 261 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 307 364 0,00093344555939807 0,000849755425414073 0,000762951094834821 0,000732433051041428 0,000722583806560078 0,0006793910140406 38111 37033 623 665 0 True 305 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 350 364 0,000866310761615012 0,00090002988703161 0,000701915007248035 0,000762951094834821 0,000672856897959191 0,000719134887074348 35370 39224 623 665 0 True 349 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 395 364 0,000914659572568589 0,000872311242744077 0,000778210116731518 0,000732433051041428 0,000683319830194531 0,000698655224018665 37344 38016 623 665 0 True 393 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 440 364 0,000926661050464867 0,00091308610275976 0,000610360875867857 0,000610360875867857 0,000853007918728435 0,000878110083682194 37834 39793 623 665 0 True 437 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 482 361 0,000970968547432964 0,000959230302811274 0,000671396963454643 0,000671396963454643 0,000894300667637607 0,00085930027943347 39643 41804 623 665 0 False 482 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 528 363 0,0010860847639891 0,000958496034088425 0,000854505226215 0,000701915007248035 0,000958842891203377 0,000926012500941589 44343 41772 623 665 0 True 526 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 572 364 0,00106467804627207 0,000970152550063646 0,00080872816052491 0,000579842832074464 0,000952531191738769 0,00100209439962188 43469 42280 623 665 0 True 570 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 616 363 0,00102049301336414 0,00108219736799082 0,000564583810177768 0,000717174029144732 0,00112533672296163 0,00109617339902382 41665 47163 623 665 0 True 614 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 660 364 0,00106271862130941 0,000950235510956379 0,000732433051041428 0,000595101853971161 0,00103477900540904 0,000978801014428017 43389 41412 623 665 0 True 658 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 263 409 0,00083846243433324 0,000907602033235985 0,00064087891966125 0,000732433051041428 0,000772396416575449 0,000760940214357346 34233 39554 623 665 0 True 261 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 307 409 0,000950541542197258 0,000847827970016596 0,000854505226215 0,000717174029144732 0,000684432314270787 0,00066740441198568 38809 36949 623 665 0 True 305 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 351 408 0,000937119481203053 0,000836423858914854 0,000854505226215 0,000701915007248035 0,000698895672657323 0,000646793589428269 38261 36452 623 665 0 True 349 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 396 408 0,000855631895568528 0,00096095124513045 0,000671396963454643 0,000747692072938125 0,000736951965805522 0,000796201969634523 34934 41879 623 665 0 True 393 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 441 409 0,00100807515766329 0,000939611560372664 0,000747692072938125 0,000671396963454643 0,000879317356607285 0,000833290693050099 41158 40949 623 665 0 True 437 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 485 409 0,000950272121264892 0,000918340713307645 0,000656137941557946 0,000717174029144732 0,000882944114672402 0,000821977734872036 38798 40022 623 665 0 True 482 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 529 409 0,00096021620295038 0,00101774234166327 0,000762951094834821 0,00080872816052491 0,000841572635820762 0,000896049762061531 39204 44354 623 665 0 True 526 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 573 409 0,000932220918796409 0,000989495941731188 0,000610360875867857 0,00064087891966125 0,000952299574696579 0,00100717859540277 38061 43123 623 665 0 True 570 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 616 408 0,000931486134435412 0,000984195439388125 0,000534065766384375 0,000610360875867857 0,000975252118688019 0,00100122124281198 38031 42892 623 665 0 True 614 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 661 408 0,000900943597829986 0,000991423397128665 0,000503547722590982 0,00064087891966125 0,000945289462368356 0,000989058641492769 36784 43207 623 665 0 True 658 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 263 453 0,000909883474222111 0,000907670870928752 0,000747692072938125 0,000717174029144732 0,000798696524986522 0,000792245904007348 37149 39557 623 665 0 True 261 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 307 452 0,000878067311390958 0,000926302939771034 0,000778210116731518 0,000839246204318303 0,000746130784586753 0,000785287391342073 35850 40369 623 665 0 True 305 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 352 453 0,000961832728544572 0,000894339304429533 0,000823987182421607 0,000732433051041428 0,000750106288702986 0,000735238104288158 39270 38976 623 665 0 True 349 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 396 452 0,000915222907245353 0,000921208950506273 0,000778210116731518 0,000793469138628214 0,000780580802659173 0,00076655729845264 37367 40147 623 665 0 True 393 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 440 452 0,000919337699666934 0,00095324142354054 0,000579842832074464 0,000625619897764553 0,00094047161766473 0,000999881576360244 37535 41543 623 665 0 True 437 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 484 453 0,000934866142495996 0,00094858340632997 0,000625619897764553 0,00064087891966125 0,000925637057518327 0,000994107022176593 38169 41340 623 665 0 True 482 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 528 452 0,000976503922952471 0,000898997321640104 0,000732433051041428 0,000610360875867857 0,00089409506628401 0,000876345409942091 39869 39179 623 665 0 True 526 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 573 452 0,000951374297806387 0,000942594527059237 0,000610360875867857 0,000473029678797589 0,000950813519035038 0,00107485201231812 38843 41079 623 665 0 True 570 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 616 452 0,000906772887093892 0,000887455535152828 0,000534065766384375 0,000518806744487678 0,000913609298708177 0,00092879701618706 37022 38676 623 665 0 True 614 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 661 452 0,000925607859547439 0,000949248837360052 0,00064087891966125 0,000457770656900893 0,000934217207471935 0,00106274367821076 37791 41369 623 665 0 True 658 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 262 497 0,000981720891915547 0,000905077984501193 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,000817298720555941 0,000729868015930826 40082 39444 623 665 0 True 261 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 307 497 0,000938442093052847 0,00095558190509462 0,000747692072938125 0,000793469138628214 0,000847800200376904 0,000829632087100794 38315 41645 623 665 0 True 305 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 350 497 0,000968372309357442 0,000973938623165834 0,000823987182421607 0,00080872816052491 0,000842824294105433 0,000819405899955678 39537 42445 623 665 0 True 349 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 395 497 0,00091390029539556 0,000916803338169181 0,000732433051041428 0,000701915007248035 0,000783096411186743 0,000814430987893734 37313 39955 623 665 0 True 393 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 440 497 0,000956664745205563 0,000958656655371549 0,00064087891966125 0,000579842832074464 0,000964338120730911 0,00103238853844667 39059 41779 623 665 0 True 437 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 484 498 0,000940156589895172 0,000824950910120345 0,000579842832074464 0,000488288700694286 0,000923792453964301 0,000841190670704246 38385 35952 623 665 0 True 482 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 526 496 0,000978218419794797 0,000948721081715504 0,000701915007248035 0,000732433051041428 0,000909455399395332 0,000846423604933309 39939 41346 623 665 0 True 526 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 571 497 0,000970233763071967 0,000946174087083123 0,000671396963454643 0,000610360875867857 0,000933979839318492 0,000942621025430868 39613 41235 623 665 0 True 570 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 614 491 0,000894771409197614 0,000906041712199932 0,000518806744487678 0,000534065766384375 0,000936063204486149 0,000982734785745749 36532 39486 623 665 0 False 614 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 660 497 0,000932906717533339 0,000935389515216285 0,000610360875867857 0,000579842832074464 0,000933703452151448 0,000984662451895506 38089 40765 623 665 0 True 658 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 264 541 0,000911083622011739 0,000893306739038028 0,000747692072938125 0,000686655985351339 0,000736538590184696 0,000840456880425064 37198 38931 623 665 0 True 261 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 307 541 0,000965335200665323 0,000808957619500801 0,000869764248111696 0,000686655985351339 0,000771572067070211 0,00069753158560662 39413 35255 623 665 0 True 305 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 351 541 0,000914684065380623 0,000915678989187319 0,000839246204318303 0,00080872816052491 0,000730182130227384 0,00073889298096534 37345 39906 623 665 0 True 349 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 394 540 0,000892567056114624 0,000966779503118061 0,000717174029144732 0,000717174029144732 0,000781498348687857 0,000863412378732376 36442 42133 623 665 0 True 393 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 439 540 0,000895628657618777 0,000937064565740283 0,000579842832074464 0,000549324788281071 0,000944563729574156 0,00102673765657742 36567 40838 623 665 0 True 437 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 482 541 0,000888623713377276 0,000881558439472451 0,000534065766384375 0,000366216525520714 0,000945268998884906 0,00101775385955507 36281 38419 623 665 0 True 481 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 527 541 0,000900208813468989 0,000872265350948899 0,000534065766384375 0,000457770656900893 0,000954149072586161 0,000971709546897317 36754 38014 623 665 0 True 526 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 571 540 0,000944981673865716 0,00100652179774224 0,000656137941557946 0,000671396963454643 0,000920107001847316 0,000964614581199609 38582 43865 623 665 0 True 570 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 616 541 0,00095717909425826 0,000928528691837169 0,000656137941557946 0,000595101853971161 0,000916000674674085 0,000883250360065561 39080 40466 623 665 0 True 614 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 659 540 0,000854333776530767 0,00085636384391971 0,000503547722590982 0,000442511635004196 0,000915440259321774 0,000958738810620963 34881 37321 623 665 0 True 658 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 261 577 0,000917574217200543 0,000913705641994664 0,000793469138628214 0,000793469138628214 0,000668483216673493 0,000602215333583793 37463 39820 623 665 0 False 261 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 305 577 0,00091086318670344 0,000870223166063476 0,000793469138628214 0,000732433051041428 0,000719205473683263 0,000701663903909023 37189 37925 623 665 0 False 305 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 349 577 0,000958060835491456 0,000839865743553207 0,000823987182421607 0,000671396963454643 0,000692946751837828 0,000728718803982591 39116 36602 623 665 0 False 349 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 393 577 0,000895187787002179 0,00100195556412202 0,000717174029144732 0,000900282291905089 0,000723076364598993 0,000696968838170813 36549 43666 623 665 0 False 393 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 440 585 0,000936752089022554 0,000940575288071403 0,000564583810177768 0,000534065766384375 0,000940684552557074 0,00103975589255229 38246 40991 623 665 0 True 437 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 481 577 0,000927395834825864 0,000988027404285491 0,000518806744487678 0,00064087891966125 0,000990625548402196 0,00104058083462525 37864 43059 623 665 0 False 481 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 526 577 0,000902315195303846 0,00100204734771238 0,000457770656900893 0,000595101853971161 0,00104658766500277 0,00104215984486987 36840 43670 623 665 0 False 526 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 570 578 0,000881471812263576 0,000950396132239502 0,000656137941557946 0,000625619897764553 0,00083332034507066 0,000926327606183052 35989 41419 623 665 0 False 570 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 617 584 0,000963522732574864 0,000947963867095067 0,000762951094834821 0,000717174029144732 0,00078992743929226 0,000786452109201133 39339 41313 623 665 0 True 614 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 661 585 0,000883994571902997 0,000985342734267576 0,000625619897764553 0,000732433051041428 0,000846788202680445 0,000844121929912902 36092 42942 623 665 0 True 658 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 261 621 0,000925730323607605 0,000917812957663098 0,000778210116731518 0,000747692072938125 0,000690811873635793 0,000712142766230963 37796 39999 623 665 0 False 261 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 305 621 0,000998596439406436 0,000946885409908383 0,000915541313801785 0,000823987182421607 0,000733920939281917 0,000669503355860896 40771 41266 623 665 0 False 305 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 349 621 0,000933151645653671 0,000915770772777676 0,00080872816052491 0,000778210116731518 0,000702576854943309 0,000740571360126039 38099 39910 623 665 0 False 349 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 393 621 0,000955660539912201 0,000969028201081784 0,000823987182421607 0,000869764248111696 0,000730678015229425 0,000668039047168225 39018 42231 623 665 0 False 393 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 437 621 0,000977630592305999 0,000932177089553823 0,000717174029144732 0,00064087891966125 0,000936026929077178 0,000912305307115874 39915 40625 623 665 0 False 437 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 481 621 0,000934376286255332 0,000910883296591215 0,000579842832074464 0,000595101853971161 0,00101273079826363 0,000953611176366555 38149 39697 623 665 0 False 481 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 526 621 0,000954509377746639 0,00084748378155276 0,000503547722590982 0,000442511635004196 0,00103419397936707 0,000942641497698061 38971 36934 623 665 0 False 526 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 570 621 0,000944418339188952 0,000924811456427748 0,000701915007248035 0,000625619897764553 0,000875923820420319 0,000901131582256515 38559 40304 623 665 0 False 570 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 614 621 0,00102448534172555 0,000904848525525303 0,000854505226215 0,000747692072938125 0,000781911220458876 0,000703524226389563 41828 39434 623 665 0 False 614 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 658 621 0,000900012870972723 0,000921323679994218 0,000717174029144732 0,000732433051041428 0,000745805196568928 0,000786941651572009 36746 40152 623 665 0 False 658 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 262 671 0,00132138720919225 0,0743221294251881 0,000915541313801785 0,0740520332646677 0,00179682137476274 0,0210327270080766 53950 3239016 623 665 0 True 261 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 305 664 0,00369131170152667 0,00118813857715931 0,00112916762035554 0,000915541313801785 0,00754407835158762 0,00113710317445256 150710 51780 623 665 0 False 305 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 349 664 0,00091375333852336 0,000891585796718851 0,00080872816052491 0,000778210116731518 0,00063549601673427 0,000622570173836849 37307 38856 623 665 0 False 349 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 393 664 0,000904813462131235 0,000894339304429533 0,000778210116731518 0,000747692072938125 0,000675454977766394 0,000641078333918408 36942 38976 623 665 0 False 393 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 437 664 0,000874760781766473 0,000836332075324498 0,000701915007248035 0,000656137941557946 0,000745837867455288 0,00074899458053586 35715 36448 623 665 0 False 437 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 481 664 0,000951986618107217 0,000901314857296595 0,000701915007248035 0,000686655985351339 0,000869097744592782 0,000772184627747696 38868 39280 623 665 0 False 481 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 526 664 0,000987525688367421 0,000964255454383269 0,000656137941557946 0,000656137941557946 0,000948052292683481 0,000916085230519652 40319 42023 623 665 0 False 526 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 570 664 0,000932980195969438 0,000980868284237717 0,000732433051041428 0,00080872816052491 0,000775308139331199 0,00077754246803273 38092 42747 623 665 0 False 570 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 614 664 0,00106056325385048 0,00092781736901191 0,000930800335698482 0,000717174029144732 0,000688150798337261 0,000721581134017994 43301 40435 623 665 0 False 614 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 657 670 0,0010852030227559 0,075470869896187 0,000915541313801785 0,0747539482719158 0,000760548783162865 0,0209813804756631 44307 3289079 623 665 0 True 658 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E12_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E12_1.csv new file mode 100755 index 0000000..c0e6877 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E12_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 236 252 0,0103798088115586 0,0439127574027768 0,0103761348897536 0,043427176317998 0,00170681604954486 0,00775424874952197 423790 1913752 623 665 0 True 236 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 280 252 0,0103570304963677 0,0102894223427647 0,0103761348897536 0,0102998397802701 0,00148655710571614 0,00141577145638057 422860 448421 623 665 0 False 280 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 324 252 0,0104200505017291 0,0605462844568505 0,0103456168459602 0,0594796673533226 0,00130695624523906 0,00909103764463204 425433 2638654 623 665 0 True 324 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 368 252 0,0102714771039356 0,0839172318528067 0,0102998397802701 0,0831769283588922 0,00132346010947891 0,0115872284420277 419367 3657178 623 665 0 True 368 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 412 252 0,0102996928233979 0,0709336169446275 0,0103913939116503 0,0691081101701381 0,00139199159350684 0,011837068964601 420519 3091342 623 665 0 True 412 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 456 252 0,0102091428973111 0,0671846473588411 0,0102235446707866 0,070420386053254 0,00163266315567936 0,0185437442336706 416822 2927959 623 665 0 True 457 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 500 252 0,0102538177864597 0,0806342016634628 0,01025406271458 0,0791790646219577 0,00167241809260963 0,0205669440341934 418646 3514101 623 665 0 True 501 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 545 252 0,010161136985726 0,0689350063187265 0,0101319905394064 0,0674601358052949 0,00148948962559324 0,0172617038975555 414862 3004241 623 665 0 True 545 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 589 252 0,00994452255610415 0,0101004169843239 0,0100404364080262 0,0101319905394064 0,00184732212820381 0,00191543088374197 406018 440184 623 665 0 False 589 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 632 250 0,0100957656704093 0,045066454187655 0,0101319905394064 0,0450446326390478 0,00184673782971993 0,00806410818110409 412193 1964031 623 665 0 True 633 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 236 296 0,0101187154352844 0,0102627821556638 0,010101472495613 0,0103303578240635 0,00164080305823823 0,00151201603636869 413130 447260 623 665 0 False 236 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 280 296 0,0103747877850917 0,0101596174001036 0,0103608758678569 0,0101319905394064 0,00144416554004937 0,00145799323405294 423585 442764 623 665 0 False 280 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 324 296 0,0104749388934956 0,100920990964479 0,0103913939116503 0,100175478751812 0,00137346862927292 0,0236439847676273 427674 4398215 623 665 0 True 324 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 369 297 0,0102934961419535 0,0503969009270716 0,0102845807583734 0,0494697489890898 0,00131820559927807 0,00684635126390601 420266 2196336 623 665 0 True 368 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 412 296 0,0102990805030971 0,0811401816511983 0,0102693217364767 0,0801403830014496 0,00145846990521538 0,0166176694995415 420494 3536152 623 665 0 True 412 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 457 297 0,0101245692173604 0,0437375195828895 0,010101472495613 0,0441901274128328 0,00173996132425628 0,0090957482892232 413369 1906115 623 665 0 True 457 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 501 295 0,0102352522349385 0,047016098268101 0,0103303578240635 0,048355840390631 0,00170080438426263 0,0110907634533783 417888 2048998 623 665 0 True 501 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 545 296 0,010546776311189 0,0504568126656766 0,0104829480430304 0,0522163729304952 0,00160015424536881 0,00846652535850232 430607 2198947 623 665 0 True 545 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 589 296 0,0100758530142263 0,0101008759022757 0,0100251773861295 0,0100862134737163 0,00180251670224941 0,00204613835636564 411380 440204 623 665 0 False 589 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 633 296 0,0104149559968262 0,0101750370432834 0,0104676890211337 0,0101319905394064 0,00195419035760539 0,00195245964292357 425225 443436 623 665 0 False 633 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 236 342 0,0102340765799609 0,0494645402703371 0,01025406271458 0,0485084306095979 0,00161786262082156 0,0100321625985594 417840 2155703 623 665 0 True 236 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 280 341 0,0103118657509784 0,0615710023513809 0,0102845807583734 0,0628061341268025 0,00136775009686525 0,0169253864150375 421016 2683312 623 665 0 True 280 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 324 340 0,0103417224888469 0,0384365812677723 0,010406652933547 0,039154650186923 0,00153583554433625 0,00618107738877325 422235 1675096 623 665 0 True 324 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 369 340 0,0103877934682814 0,0359302697118167 0,0103761348897536 0,0363469901579309 0,00126237040801837 0,00543461375723665 424116 1565869 623 665 0 True 368 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 413 341 0,0103674889271058 0,0715961567916128 0,0103456168459602 0,0672770275425345 0,00147795250494515 0,0132431053260799 423287 3120216 623 665 0 True 412 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 457 342 0,0103220792535962 0,032913779068867 0,0103608758678569 0,0336308842603189 0,00197368313333449 0,00441638294945646 421433 1434408 623 665 0 True 457 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 501 340 0,0101188134065326 0,0280610888631512 0,0101625085831998 0,0284122987716487 0,0016352451161348 0,00288500486296016 413134 1222924 623 665 0 True 501 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 545 341 0,0101976312756555 0,0514331606080892 0,0102082856488899 0,0511329823758297 0,00165123087615395 0,00912412626942383 416352 2241497 623 665 0 True 545 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 590 341 0,0102746121838759 0,0555500906076131 0,01025406271458 0,0561684596017395 0,00189109972853454 0,0114289985905096 419495 2420916 623 665 0 True 589 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 634 340 0,0102942309263145 0,0634544016254874 0,0102693217364767 0,0624246585793851 0,00190844452445611 0,0170937671788967 420296 2765392 623 665 0 True 633 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 236 386 0,0101112941132384 0,0391234667120995 0,0100862134737163 0,0414740215152209 0,00150573687208477 0,00712825314179893 412827 1705031 623 665 0 True 236 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 281 385 0,0101537401564919 0,029904332816477 0,0102235446707866 0,0298313878080415 0,00150633485919511 0,00329946734423325 414560 1303254 623 665 0 True 280 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 325 386 0,0104445678065744 0,0804647921015631 0,010406652933547 0,0777752346074617 0,00145100283434805 0,0155100474276505 426434 3506718 623 665 0 True 324 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 370 385 0,0103490458396448 0,0638491169558137 0,0102998397802701 0,0619363698786908 0,0015883408764478 0,0149452933505629 422534 2782594 623 665 0 True 368 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 413 384 0,0101939573538505 0,0419818371747634 0,0102235446707866 0,0428473334859236 0,00155480955981876 0,00671158127127004 416202 1829601 623 665 0 True 412 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 457 386 0,0110105721998501 0,0550369744457275 0,0105134660868238 0,0534523537041276 0,00420678994678335 0,0118495959554597 449543 2398554 623 665 0 True 457 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 501 386 0,0102189155293123 0,0415179170173087 0,0101930266269932 0,0420233463035019 0,0017412826788792 0,00564616162621368 417221 1809383 623 665 0 True 501 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 546 385 0,0100428122107935 0,0497921847420107 0,00991836423285267 0,0498970016021973 0,0017697906030113 0,00831870816394344 410031 2169982 623 665 0 True 545 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 591 385 0,00995961012831662 0,0424694604444276 0,00999465934233616 0,042572671091783 0,00205822887313146 0,00827729721116795 406634 1850852 623 665 0 True 589 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 635 385 0,0100766122913993 0,0798284564696245 0,0100862134737163 0,0765239948119326 0,00190759016104903 0,0160906433094901 411411 3478986 623 665 0 True 633 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 237 429 0,0100311291394536 0,0386259537605745 0,010101472495613 0,0390020599679561 0,00148892762544028 0,00535901082945065 409554 1683349 623 665 0 True 236 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 281 429 0,0102892343926597 0,0464819866099215 0,0103456168459602 0,0465400167849241 0,00156444520011389 0,00587078298927436 420092 2025721 623 665 0 True 280 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 325 429 0,0104369995276561 0,0329360365895283 0,0104676890211337 0,0330968184939345 0,00140542525693804 0,00329247172607577 426125 1435378 623 665 0 True 324 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 370 429 0,0105424655762712 0,0525448205085843 0,010605020218204 0,0506294346532387 0,00135779627701255 0,0105475457027175 430431 2289944 623 665 0 True 368 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 414 428 0,0103930594228685 0,091282314277339 0,0103608758678569 0,0908522163729305 0,00156165488287183 0,0123697227168496 424331 3978154 623 665 0 True 412 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 458 430 0,0106775434346344 0,0588434923426671 0,0107118333714809 0,0581216144045167 0,00186408562881084 0,0127451701217121 435946 2564445 623 665 0 True 457 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 502 430 0,0103909040554096 0,0535436554306343 0,0103150988021668 0,0513923857480735 0,00169085509066148 0,0108094603143534 424243 2333474 623 665 0 True 501 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 545 428 0,00992894512765103 0,0309374489095249 0,0100099183642329 0,0312199588006409 0,00174700983467238 0,00417628942412286 405382 1348278 623 665 0 True 545 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 591 429 0,010125034580789 0,0397590221835201 0,0102235446707866 0,0399481193255512 0,00183942308395828 0,00646270626036354 413388 1732729 623 665 0 True 589 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 635 428 0,0100773960613844 0,0720230652162565 0,0100709544518196 0,0703746089875639 0,00186435688045863 0,0136812913803575 411443 3138821 623 665 0 True 633 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 235 473 0,0100636311010217 0,0477241398300053 0,0101319905394064 0,0494392309452964 0,0015307396285537 0,0127627125653957 410881 2079855 623 665 0 True 236 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 280 473 0,010304909792361 0,0516266174706622 0,01025406271458 0,050614175631342 0,00146480999990479 0,00724377820265485 420732 2249928 623 665 0 True 280 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 324 473 0,0103633986274963 0,0628021185947244 0,0104371709773404 0,0603952086671244 0,00156406530277844 0,0161489959387028 423120 2736965 623 665 0 True 324 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 369 473 0,0105393304963309 0,0820874341954681 0,0105897611963073 0,0776836804760815 0,00148792171734012 0,0180316643289772 430303 3577434 623 665 0 True 368 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 413 473 0,010492230818791 0,0892312034377544 0,0104829480430304 0,0854962996871901 0,00175225264452444 0,0266942188151534 428380 3888765 623 665 0 True 412 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 457 474 0,0108808337745101 0,0450410301331264 0,0107270923933776 0,0456092164492256 0,00231919112624959 0,00794533070710942 444246 1962923 623 665 0 True 457 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 501 471 0,0104220589123159 0,0412429792723971 0,0104676890211337 0,0426337071793698 0,00186165226039554 0,00730690270069306 425515 1797401 623 665 0 True 501 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 546 473 0,0100803841844524 0,0917744578888283 0,0100709544518196 0,0872968642710002 0,00180597032279927 0,0183975646756656 411565 3999602 623 665 0 True 545 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 590 471 0,00991990728001077 0,0608795965652286 0,00990310521095598 0,0623483634699016 0,00193614072505212 0,0151305343422504 405013 2653180 623 665 0 True 589 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 634 473 0,0101747794820285 0,0732129935734277 0,0102998397802701 0,0707408255130846 0,00181298321362812 0,0107688924687094 415419 3190679 623 665 0 True 633 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 236 518 0,00993396615411784 0,0510733000962007 0,00993362325474937 0,0540474555580987 0,00145144399686437 0,0122190533221036 405587 2225814 623 665 0 True 236 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 280 517 0,0102963373081493 0,095773423028847 0,0103150988021668 0,0915236133363851 0,00158197663489389 0,0273492672583482 420382 4173880 623 665 0 True 280 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 324 517 0,0103893855010635 0,0522765600198711 0,0103913939116503 0,053681239032578 0,00175299566831078 0,0116123577527664 424181 2278253 623 665 0 True 324 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 369 518 0,0103981784205835 0,0521110053687664 0,0103150988021668 0,0524452582589456 0,00157021171703855 0,00596864885204592 424540 2271038 623 665 0 True 368 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 413 517 0,0106218957656949 0,0512615252941234 0,0105134660868238 0,0515449759670405 0,00182496051889867 0,00546965371538505 433674 2234017 623 665 0 True 412 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 457 519 0,0106772005352659 0,0553327470656499 0,0104982070649271 0,056595712214847 0,0023548573302007 0,0106710536532857 435932 2411444 623 665 0 True 457 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 502 517 0,0104677624995698 0,0658388016275525 0,0105592431525139 0,0646982528419928 0,00172211731394581 0,015028045027051 427381 2869306 623 665 0 True 501 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 545 517 0,0101205768889989 0,054521953774342 0,0101930266269932 0,054886701762417 0,00185467856386443 0,0121502620849883 413206 2376109 623 665 0 True 545 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 590 517 0,00990413390906137 0,0432506305819481 0,00988784618905928 0,0418860151064317 0,00188943634900686 0,00727662520472445 404369 1884896 623 665 0 True 589 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 633 517 0,0100044319743374 0,0632474984669272 0,0100709544518196 0,0639200427252613 0,00199549229290855 0,0131168417544657 408464 2756375 623 665 0 True 633 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 236 561 0,00992306685276305 0,0435749937902665 0,00993362325474937 0,0442053864347295 0,00132598388945532 0,00987494768696117 405142 1899032 623 665 0 True 236 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 281 562 0,00979149146652059 0,0477499310188954 0,00975051499198901 0,0481422140840772 0,00148052469894224 0,00878461355615866 399770 2080979 623 665 0 True 280 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 325 560 0,0100717382218047 0,0434302969600701 0,010101472495613 0,0443427176317998 0,00143019107036404 0,0087257820147193 411212 1892726 623 665 0 True 324 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 369 561 0,0103080693651132 0,0438779255302367 0,0103913939116503 0,0440375371938659 0,00139191840705196 0,00588691853226296 420861 1912234 623 665 0 True 368 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 413 561 0,0104201974586013 0,0774007116670137 0,0103913939116503 0,0742961776150149 0,00175122062915059 0,0166693964994576 425439 3373183 623 665 0 True 412 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 458 562 0,0104899284944599 0,0544449243961357 0,0104982070649271 0,0548409246967269 0,00203430249236454 0,00948234925976891 428286 2372752 623 665 0 True 457 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 502 561 0,0102374565880215 0,0509973032833859 0,0102235446707866 0,0508735790035859 0,00203560752424186 0,0063343312950489 417978 2222502 623 665 0 True 501 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 545 562 0,00990325216782818 0,0347270556799414 0,00994888227664607 0,0360112916762036 0,00180407297237666 0,00663748914758284 404333 1513432 623 665 0 True 545 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 590 561 0,00998772787653075 0,0466059632945949 0,0100251773861295 0,0470588235294118 0,00168480596431019 0,00659742322261616 407782 2031124 623 665 0 True 589 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 634 562 0,0101044361258691 0,0519207150400607 0,0101319905394064 0,0513008316166934 0,00168396625462028 0,00731302054155506 412547 2262745 623 665 0 True 633 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 236 599 0,0100281410163856 0,00975216709661542 0,0097962920576791 0,00968947890440223 0,00225354906440268 0,00134223270479506 409432 425007 623 665 0 False 236 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 280 599 0,0103670725493013 0,00995994219928397 0,00996414129854276 0,00988784618905928 0,00310439364946509 0,00155199670919126 423270 434062 623 665 0 False 280 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 324 599 0,0141473666369446 0,0561895239357262 0,0105592431525139 0,065491721980621 0,011430425531713 0,0284027292922826 577613 2448783 623 665 0 False 324 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 369 605 0,0100154047541283 0,0661760604303159 0,0101167315175097 0,0632791638056001 0,00135308343731234 0,0165627530437597 408912 2884004 623 665 0 True 368 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 412 599 0,0106813643133116 0,0100300878082136 0,0102388036926833 0,0100404364080262 0,00326717630464594 0,00156876399699293 436102 437119 623 665 0 False 412 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 457 599 0,0102944023759987 0,0100332772879785 0,0102693217364767 0,0100556954299229 0,00201606269023563 0,00195373567946153 420303 437258 623 665 0 False 457 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 501 599 0,00996808464128011 0,00973013903492997 0,0100404364080262 0,00976577401388571 0,00213878725494992 0,00196594810612987 406980 424047 623 665 0 False 501 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 545 599 0,00985642191122066 0,00970710135375059 0,00985732814526589 0,00985732814526589 0,00195040228244084 0,00186963181384177 402421 423043 623 665 0 False 545 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 589 599 0,0099132207423257 0,00969927680267274 0,00987258716716258 0,00970473792629892 0,00175581785330409 0,00173740297322476 404740 422702 623 665 0 False 589 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 633 599 0,0101158007906525 0,00971455877046702 0,0100251773861295 0,00967421988250553 0,00189425348976385 0,00146221016087614 413011 423368 623 665 0 False 633 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 237 648 0,00969685124082423 0,0400070443905598 0,00975051499198901 0,0400701915007248 0,00137380249766807 0,00838094036840562 395906 1743538 623 665 0 True 236 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 280 642 0,00963963603191462 0,00964562929410962 0,00962844281681544 0,00962844281681544 0,00125734745999075 0,00128752469060547 393570 420364 623 665 0 False 280 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 324 642 0,0117152304020458 0,00963525774839938 0,00978103303578241 0,00961318379491875 0,0088832430722655 0,00129253620441708 478313 419912 623 665 0 False 324 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 368 642 0,0104326642999262 0,00956056885174713 0,00978103303578241 0,00958266575112535 0,00410548956396249 0,00119220309620963 425948 416657 623 665 0 False 368 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 412 642 0,0099622553520162 0,00972059354153293 0,00987258716716258 0,0097962920576791 0,00199981607685873 0,00139242785736567 406742 423631 623 665 0 False 412 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 457 642 0,00982617328835963 0,00975379625534424 0,00985732814526589 0,00976577401388571 0,00169588558503481 0,00160236001550652 401186 425078 623 665 0 False 457 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 501 642 0,00960443986102289 0,00959351916068496 0,00962844281681544 0,00953688868543526 0,00176277077972096 0,00179955337414198 392133 418093 623 665 0 False 501 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 545 642 0,00948795204699289 0,00948074007403494 0,00961318379491875 0,00952162966353857 0,00177210150698527 0,00176806642553728 387377 413178 623 665 0 False 545 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 589 642 0,00961729858734033 0,00961173820337064 0,00962844281681544 0,00965896086060884 0,00144150330867292 0,00121846250635686 392658 418887 623 665 0 False 589 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 634 648 0,00982727546490113 0,0418971668126599 0,00985732814526589 0,0428015564202335 0,00136428752762356 0,00848997602832559 401231 1825911 623 665 0 True 633 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E12_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E12_2.csv new file mode 100755 index 0000000..ad097c9 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E12_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 236 252 0,00790380595030825 0,708628862153094 0,00788891432059205 0,701121538109407 0,0018243437497445 0,174462478267046 322699 30882595 623 665 7 True 236 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 280 252 0,00675565640062697 0,00660020387430008 0,00665293354695964 0,00660715648126955 0,00140189857694335 0,00140604515745683 275822 287642 623 665 0 False 280 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 324 252 0,00641302645309424 0,0061881643912941 0,00643930724040589 0,00622568093385214 0,00118379460661411 0,00122282653018239 261833 269685 623 665 0 True 324 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 368 252 0,00613789869552508 0,00645089491868834 0,00613412680247196 0,00646982528419928 0,00119592409473422 0,00114076450765285 250600 281135 623 665 0 True 368 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 412 252 0,00626073014787168 0,00622815909079175 0,00622568093385214 0,00633249408712902 0,00133336505518468 0,00137095575897502 255615 271428 623 665 0 True 412 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 456 252 0,00633768656328006 0,0063987618393661 0,0063935301747158 0,0063782711528191 0,00143394776105854 0,00156989233901278 258757 278863 623 665 0 True 457 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 500 252 0,00659691848583966 0,00665534286620649 0,00666819256885634 0,00668345159075303 0,00160987159233824 0,00146860109408653 269341 290045 623 665 0 True 501 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 545 252 0,00698027997978363 0,00706472062509214 0,00691233691920348 0,00704966811627375 0,00143508556523261 0,00150296061571209 284993 307886 623 665 0 True 545 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 589 252 0,00763044167520547 0,00750076151697624 0,00761425192645151 0,00755321583886473 0,00185815762074921 0,00185387894115639 311538 326889 623 665 0 False 589 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 632 250 0,0091025821424622 0,729580784187523 0,00904859998474098 0,733974212252995 0,00194725065659926 0,177631614734378 371643 31795696 623 665 10 True 633 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 236 296 0,00644381391782 0,00622561209615937 0,00636301213092241 0,00628671702143893 0,00165926358384658 0,00144036277161421 263090 271317 623 665 0 False 236 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 280 296 0,00619592216723178 0,00604998419601304 0,00622568093385214 0,00613412680247196 0,00129337130748925 0,00135155908877118 252969 263663 623 665 0 False 280 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 324 296 0,00596571422693154 0,00611026306897938 0,0059662775616083 0,00613412680247196 0,00125151697430807 0,00121570717179226 243570 266290 623 665 0 True 324 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 369 297 0,00618708026208778 0,00597290892601153 0,00616464484626535 0,0059510185397116 0,00119109221426943 0,00125225703321949 252608 260304 623 665 0 True 368 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 412 296 0,00618881925174214 0,006266501685663 0,00624093995574884 0,00616464484626535 0,00130981993573608 0,00139722599546709 252679 273099 623 665 0 True 412 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 457 297 0,00632019869548834 0,00647631897321697 0,00631723506523232 0,00651560234988937 0,00169874683113426 0,00172969258170172 258043 282243 623 665 0 True 457 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 501 295 0,00687537726584535 0,00686281967220638 0,00692759594110018 0,00689707789730678 0,00154538189408602 0,00157517584568473 280710 299087 623 665 0 True 501 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 545 296 0,00696022036672843 0,00701343654398069 0,00691233691920348 0,00701915007248035 0,00149275662396164 0,00160213903358791 284174 305651 623 665 0 True 545 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 589 296 0,00744294919909117 0,00717752265763975 0,00758373388265812 0,00712596322575723 0,00175388787825478 0,00191799576808782 303883 312802 623 665 0 False 589 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 633 296 0,007682439915152 0,0075591358804427 0,0076752880140383 0,00750743877317464 0,00193080788100984 0,00184378937342597 313661 329433 623 665 0 False 633 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 236 342 0,00597115163120291 0,00606967177614441 0,0059662775616083 0,00613412680247196 0,00137789365972013 0,00144500172258135 243792 264521 623 665 0 True 236 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 280 341 0,00602946901665401 0,00593078025803809 0,00607309071488518 0,005981536583505 0,00129041503300419 0,00135049809934275 246173 258468 623 665 0 True 280 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 324 340 0,00611725125498107 0,00623251881133367 0,00610360875867857 0,00627145799954223 0,00130421621005455 0,00119985808474546 249757 271618 623 665 0 True 324 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 369 340 0,00622286426046832 0,00628621221169197 0,00622568093385214 0,00628671702143893 0,00122486316182631 0,00121568668545651 254069 273958 623 665 0 True 368 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 413 341 0,00632037014517257 0,00657328833642816 0,00634775310902571 0,00654612039368277 0,00144688384798846 0,00136841678295379 258050 286469 623 665 0 True 412 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 457 342 0,00656328985491805 0,00669708145392091 0,00665293354695964 0,00672922865644312 0,00154809179385392 0,00155821004388569 267968 291864 623 665 0 True 457 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 501 340 0,00673775215503068 0,0067744091287959 0,00677500572213321 0,00675974670023652 0,00152832084984101 0,00159347487422421 275091 295234 623 665 0 True 501 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 545 341 0,00701866021623969 0,00702848905279908 0,00712596322575723 0,00697337300679027 0,00147933285453972 0,0014188312915431 286560 306307 623 665 0 True 545 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 590 341 0,00705532595585342 0,00721861876022168 0,00701915007248035 0,00709544518196384 0,00184640747005855 0,00202013974142928 288057 314593 623 665 0 True 589 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 634 340 0,00709052212674516 0,00712229188214299 0,00704966811627375 0,00717174029144732 0,00180485320659222 0,00193918307923859 289494 310395 623 665 0 True 633 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 236 386 0,00600504968305689 0,00591178105483439 0,00599679560540169 0,00587472343022812 0,00150410946067671 0,00144765196168113 245176 257640 623 665 0 True 236 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 281 385 0,00608930495645117 0,00609828531043792 0,00611886778057527 0,00610360875867857 0,0014742505380037 0,00127296027432461 248616 265768 623 665 0 True 280 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 325 386 0,00644045840257145 0,00630266442026329 0,00646982528419928 0,00633249408712902 0,00130477036353616 0,00122983065251981 262953 274675 623 665 0 True 324 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 370 385 0,00651513698646074 0,00660899215307667 0,00653086137178607 0,00653086137178607 0,00129776229760997 0,001286562606666 266002 288025 623 665 0 True 368 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 413 384 0,00657127451164088 0,00653822700491214 0,00660715648126955 0,00654612039368277 0,00149857605357139 0,00148500397389033 268294 284941 623 665 0 True 412 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 457 386 0,00667794070804556 0,00672984819567803 0,00665293354695964 0,0068055237659266 0,00169823504402345 0,00157985224157477 272649 293292 623 665 0 True 457 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 501 386 0,00675379494691244 0,00667886241123523 0,00683604180972 0,00666819256885634 0,00171194337940565 0,00160971366432207 275746 291070 623 665 0 True 501 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 546 385 0,00688492946253831 0,0070401455687743 0,00689707789730678 0,00709544518196384 0,00153831087540623 0,00142364684224137 281100 306815 623 665 0 True 545 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 591 385 0,00677696514709587 0,00691807339360073 0,00677500572213321 0,00675974670023652 0,00189255338572687 0,00239979745024206 276692 301495 623 665 0 True 589 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 635 385 0,0063215702929622 0,00629348606122769 0,00631723506523232 0,00630197604333562 0,00186771791050394 0,0017317259105139 258099 274275 623 665 0 True 633 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 237 429 0,00608083044348767 0,00604271034647732 0,00602731364919509 0,00604257267109178 0,00139547034217074 0,00152377660124192 248270 263346 623 665 0 True 236 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 281 429 0,0062642081271804 0,00624610278270637 0,00619516289005875 0,00633249408712902 0,00142141794095639 0,00136299509723496 255757 272210 623 665 0 True 280 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 325 429 0,00645466423355072 0,00656525727227201 0,00650034332799268 0,00660715648126955 0,00132881199547713 0,00131659328903114 263533 286119 623 665 0 True 324 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 370 429 0,00664323439339448 0,00666899567527195 0,00671396963454643 0,00663767452506294 0,0013451337753213 0,00133762573789469 271232 290640 623 665 0 True 368 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 414 428 0,00668203100765511 0,00682319210707015 0,00662241550316625 0,00695811398489357 0,00152930395192184 0,00149539215596942 272816 297360 623 665 0 True 412 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 458 430 0,00672489342871324 0,00689255755548175 0,00669871061264973 0,00692759594110018 0,00157058403467895 0,00163435757633247 274566 300383 623 665 0 True 457 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 502 430 0,00678374965602907 0,00670655810962517 0,00677500572213321 0,00663767452506294 0,0016620599498981 0,00161818221336933 276969 292277 623 665 0 True 501 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 545 428 0,00668124723767004 0,00662461830933479 0,00671396963454643 0,00663767452506294 0,00162251000408582 0,00156727740809648 272784 288706 623 665 0 True 545 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 591 429 0,00623251442840941 0,00618472250665574 0,00630197604333562 0,00614938582436866 0,0018950046962315 0,00185941762061422 254463 269535 623 665 0 True 589 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 635 428 0,00595821942644937 0,00591306602509937 0,005981536583505 0,0059662775616083 0,00178850061199447 0,00172979496248953 243264 257696 623 665 0 True 633 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 235 473 0,006148161183767 0,00611450806003335 0,00616464484626535 0,00607309071488518 0,00148841218281086 0,00130983330224571 251019 266475 623 665 0 True 236 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 280 473 0,00620980959165461 0,00635032304955568 0,00619516289005875 0,00631723506523232 0,00143662694522684 0,00155021168622536 253536 276752 623 665 0 True 280 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 324 473 0,0066026253110434 0,00659754215017975 0,00653086137178607 0,00665293354695964 0,00151258242966718 0,00147278029874312 269574 287526 623 665 0 True 324 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 369 473 0,00654920648799895 0,00665201571105608 0,00653086137178607 0,00666819256885634 0,00150547717721811 0,0015035762902194 267393 289900 623 665 0 True 368 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 413 473 0,00681865191317641 0,0068807404182234 0,00683604180972 0,00694285496299687 0,00168509391670831 0,00159795945248148 278394 299868 623 665 0 True 412 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 457 474 0,0068793940870188 0,00695097781074338 0,00697337300679027 0,00692759594110018 0,00204983660637321 0,00190739944882035 280874 302929 623 665 0 True 457 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 501 471 0,00649502838778147 0,00673152324620202 0,00642404821850919 0,00679026474402991 0,00184606921424548 0,00178704330551231 265181 293365 623 665 0 True 501 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 546 473 0,0059011021887879 0,00611932669852705 0,00593575951781491 0,00611886778057527 0,00168108232401763 0,00161939359119085 240932 266685 623 665 0 True 545 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 590 471 0,00582970564171106 0,00563544361016985 0,00587472343022812 0,00567635614557107 0,00181937924472027 0,0017280381704934 238017 245597 623 665 0 True 589 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 634 473 0,00575870097962676 0,00555274659525903 0,00572213321126116 0,00552376592660411 0,00172065571486599 0,00163605786759243 235118 241993 623 665 0 True 633 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 236 518 0,00621436525469279 0,00629571181329382 0,00622568093385214 0,00633249408712902 0,00140263087114789 0,00133749456125155 253722 274372 623 665 0 True 236 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 280 517 0,00623053051063472 0,00624442773218237 0,00617990386816205 0,00622568093385214 0,00146326031414201 0,00150928646262074 254382 272137 623 665 0 True 280 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 324 517 0,00640832383318387 0,00644894451739328 0,00634775310902571 0,00648508430609598 0,0014445557791569 0,00146938648887737 261641 281050 623 665 0 True 324 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 369 518 0,00649341186218727 0,00643540643781576 0,00653086137178607 0,00643930724040589 0,0014411135430102 0,00152864778236844 265115 280460 623 665 0 True 368 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 413 517 0,00659370992746331 0,00681403669393213 0,00646982528419928 0,00677500572213321 0,00171330586211505 0,00179754213562832 269210 296961 623 665 0 True 412 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 457 519 0,00654384256216368 0,00644043158938775 0,00643930724040589 0,00651560234988937 0,00197145201740789 0,00173800166123677 267174 280679 623 665 0 True 457 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 502 517 0,00606459170910965 0,00615174925182033 0,00610360875867857 0,00614938582436866 0,00168503745659569 0,00165103173037165 247607 268098 623 665 0 True 501 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 545 517 0,00579071308495418 0,00575480816942792 0,00573739223315786 0,00575265125505455 0,00169430681111741 0,00164094906954977 236425 250799 623 665 0 True 545 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 590 517 0,00574449514864749 0,00564533329203072 0,00570687418936446 0,00563057907988098 0,00165330348140466 0,0015965816956728 234538 246028 623 665 0 True 589 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 633 517 0,0057062373762516 0,00591790760949065 0,00576791027695125 0,0059662775616083 0,00183024344575838 0,00182603481933647 232976 257907 623 665 0 True 633 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 236 561 0,00640954847378553 0,00628389467603548 0,00642404821850919 0,00630197604333562 0,00123003261716665 0,00129603106146956 261691 273857 623 665 0 True 236 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 281 562 0,0065084749415877 0,00637751393819867 0,00651560234988937 0,00636301213092241 0,00127416020169516 0,00134659721587388 265730 277937 623 665 0 True 280 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 325 560 0,00648640691794577 0,00646223019209732 0,00648508430609598 0,00650034332799268 0,00138259241580638 0,00137819386063691 264829 281629 623 665 0 True 324 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 369 561 0,00651087523716696 0,0065556658870798 0,00651560234988937 0,00657663843747616 0,00132537753265664 0,00124903949918414 265828 285701 623 665 0 True 368 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 413 561 0,00627388278793352 0,00633299889687597 0,00631723506523232 0,00634775310902571 0,00164740971650988 0,00159804858406321 256152 275997 623 665 0 True 412 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 458 562 0,00604472803855071 0,00603844240952576 0,005981536583505 0,00608834973678187 0,0018841787863084 0,00180721606665911 246796 263160 623 665 0 True 457 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 502 561 0,0059528555006141 0,00610679823844344 0,005981536583505 0,00605783169298848 0,0019094188528083 0,0020570588220255 243045 266139 623 665 0 True 501 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 545 562 0,00605308008745403 0,0060252026266169 0,00605783169298848 0,00604257267109178 0,00175605074229149 0,00167349478571719 247137 262583 623 665 0 True 545 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 590 561 0,00601244651229092 0,00589574187241966 0,0059510185397116 0,00584420538643473 0,0014979059773781 0,00137151186591929 245478 256941 623 665 0 True 589 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 634 562 0,00586975138938538 0,005914259211774 0,00584420538643473 0,00590524147402152 0,00165635373953128 0,00159318082416478 239652 257748 623 665 0 True 633 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 236 599 0,00669244045276922 0,00667039537502488 0,00677500572213321 0,00660715648126955 0,00134739331565286 0,00120022333018494 273241 290701 623 665 0 False 236 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 280 599 0,00641434906494404 0,00656330687097694 0,00643930724040589 0,00654612039368277 0,00121350724423669 0,00144879171470754 261887 286034 623 665 0 False 280 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 324 599 0,00627672395412937 0,00635346663752538 0,00627145799954223 0,00634775310902571 0,00132672946688013 0,00134643605094429 256268 276889 623 665 0 False 324 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 369 605 0,00605712140143952 0,00607724392234879 0,00607309071488518 0,00601205462729839 0,00126715355795722 0,00135012205916918 247302 264851 623 665 0 True 368 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 412 599 0,0061914399826297 0,00602256384839416 0,00614938582436866 0,00605783169298848 0,00168470485990558 0,00152216621915748 252786 262468 623 665 0 False 412 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 457 599 0,00614409537696948 0,00618391940024013 0,00610360875867857 0,00625619897764553 0,00184233831236517 0,0018544112065156 250853 269500 623 665 0 False 457 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 501 599 0,00604384629731751 0,00615929845212711 0,00601205462729839 0,00619516289005875 0,00191171925714844 0,0019055474616821 246760 268427 623 665 0 False 501 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 545 599 0,00578657379972056 0,00599959500490755 0,00579842832074464 0,00601205462729839 0,00187943971995272 0,0017822119139851 236256 261467 623 665 0 False 545 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 589 599 0,00606258329852292 0,00599413388128137 0,00604257267109178 0,00593575951781491 0,00158956502858874 0,00164901273957721 247525 261229 623 665 0 False 589 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 633 599 0,00607081288336609 0,00591875660770145 0,00605783169298848 0,00593575951781491 0,00142967627834465 0,00137962863930833 247861 257944 623 665 0 False 633 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 237 648 0,00815493075208486 0,697352605592718 0,00784313725490196 0,701075761043717 0,00227642084883628 0,204307237201134 332952 30391167 623 665 8 True 236 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 280 642 0,00692477926771636 0,00659017651705368 0,00671396963454643 0,00656137941557946 0,00190285224663749 0,00134261146090532 282727 287205 623 665 0 False 280 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 324 642 0,0061775035725828 0,00607866656799931 0,00614938582436866 0,00613412680247196 0,00122317966964102 0,00123598377706422 252217 264913 623 665 0 False 324 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 368 642 0,005800167310399 0,00588534738081184 0,00588998245212482 0,00585946440833143 0,00127749174726422 0,00110480963595287 236811 256488 623 665 0 False 368 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 412 642 0,00630983823599829 0,00598176604248089 0,0059662775616083 0,00585946440833143 0,00238486717913632 0,00131076803829153 257620 260690 623 665 0 False 412 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 457 642 0,00599672212696559 0,00598956764766115 0,005981536583505 0,00599679560540169 0,00165042873368398 0,00159405559956452 244836 261030 623 665 0 False 457 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 501 642 0,0059305180560398 0,00609605955837178 0,00588998245212482 0,00608834973678187 0,00170530479372964 0,00174266585651906 242133 265671 623 665 0 False 501 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 545 642 0,00601310781821582 0,00575285776813285 0,00605783169298848 0,00569161516746777 0,00167816284020279 0,00164838658288802 245505 250714 623 665 0 False 545 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 589 642 0,00631792086396925 0,00622687412052677 0,00630197604333562 0,00625619897764553 0,00141074587491885 0,00117759343174167 257950 271372 623 665 0 False 589 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 634 648 0,0079499993938029 0,732073121691847 0,00776684214541848 0,750225070572976 0,00165074991988753 0,207675549439557 324585 31904314 623 665 13 True 633 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E12_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E12_3.csv new file mode 100755 index 0000000..6d5cfc2 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E12_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 236 252 0,00101184705071641 0,0692368137097149 0,000747692072938125 0,0680094605935759 0,000873463088547224 0,0183539697954355 41312 3017394 623 665 0 True 236 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 280 252 0,00089648590603994 0,00100668241902536 0,000701915007248035 0,000869764248111696 0,000718837984367984 0,000727184857366477 36602 43872 623 665 0 False 280 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 324 252 0,00087390353334531 0,000856501519305244 0,000732433051041428 0,000717174029144732 0,000654806047842289 0,000626740617597825 35680 37327 623 665 0 True 324 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 368 252 0,000891587343633296 0,000969647740316688 0,000778210116731518 0,000885023270008392 0,000645081610120722 0,000593854953488498 36402 42258 623 665 0 True 368 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 412 252 0,000857444363658986 0,000973181408545396 0,000671396963454643 0,000793469138628214 0,000714223058435739 0,000737911228699605 35008 42412 623 665 0 True 412 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 456 252 0,000873609619600912 0,000945646331438576 0,000671396963454643 0,000778210116731518 0,000800257914845129 0,000779444282646757 35668 41212 623 665 0 True 457 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 500 252 0,00089215067831006 0,000900397021393034 0,000686655985351339 0,000717174029144732 0,000800720513881728 0,000788658634970718 36425 39240 623 665 0 True 501 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 545 252 0,000882402539120838 0,000943810659631455 0,000717174029144732 0,000823987182421607 0,000744516163676459 0,000716199034247528 36027 41132 623 665 0 True 545 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 589 252 0,000997273827556642 0,000980478203978704 0,000732433051041428 0,000656137941557946 0,000909112009949091 0,000946092395660322 40717 42730 623 665 0 False 589 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 632 250 0,00111552512405303 0,0718246061480091 0,000823987182421607 0,0710765239948119 0,00101128446851901 0,0192913243277021 45545 3130172 623 665 0 True 633 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 236 296 0,000947406462257005 0,000858520758293078 0,000717174029144732 0,000686655985351339 0,000805647090521918 0,00073702099468015 38681 37415 623 665 0 False 236 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 280 296 0,000835082426272656 0,000822243294204841 0,000686655985351339 0,00064087891966125 0,000669210093611284 0,000674337848597292 34095 35834 623 665 0 False 280 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 324 296 0,00086523307788555 0,00082437726268062 0,000717174029144732 0,000717174029144732 0,000664531727141167 0,000630883584286881 35326 35927 623 665 0 True 324 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 369 297 0,000860187558606707 0,000804712628446832 0,000732433051041428 0,000717174029144732 0,000662131979693982 0,000602000340891154 35120 35070 623 665 0 True 368 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 412 296 0,000987427717119288 0,000810311427458552 0,000793469138628214 0,000610360875867857 0,000766955933881476 0,000691190632982669 40315 35314 623 665 0 True 412 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 457 297 0,000925950758915904 0,000917032797145071 0,000701915007248035 0,000625619897764553 0,000861878352985554 0,000926938853289219 37805 39965 623 665 0 True 457 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 501 295 0,00091375333852336 0,000920841816144848 0,000656137941557946 0,000686655985351339 0,000877485910284956 0,000841990585208891 37307 40131 623 665 0 True 501 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 545 296 0,000969376514650804 0,000926371777463802 0,000778210116731518 0,000732433051041428 0,000791386697377982 0,000781914035434425 39578 40372 623 665 0 True 545 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 589 296 0,000974740440486079 0,000934425787517547 0,000656137941557946 0,000488288700694286 0,000963717813243966 0,00100130765299937 39797 40723 623 665 0 False 589 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 633 296 0,00103364565342597 0,000967674393124032 0,000747692072938125 0,00064087891966125 0,000961615138904921 0,00100718646293296 42202 42172 623 665 0 False 633 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 236 342 0,000823423847744843 0,000811206317464524 0,000656137941557946 0,000610360875867857 0,00073617958221376 0,000752189397118078 33619 35353 623 665 0 True 236 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 280 341 0,000850904782846116 0,000911915861982721 0,000701915007248035 0,000778210116731518 0,000677794817753939 0,000685765479359837 34741 39742 623 665 0 True 280 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 324 340 0,000866139311930779 0,000855560737504094 0,000762951094834821 0,000762951094834821 0,000636454603919569 0,000603454907990004 35363 37286 623 665 0 True 324 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 369 340 0,000897318661649069 0,000763364120991423 0,000747692072938125 0,000656137941557946 0,000667241898362951 0,000584936043633722 36636 33268 623 665 0 True 368 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 413 341 0,000905474768056132 0,000929790716204565 0,000701915007248035 0,000717174029144732 0,000782967079834774 0,00075885736889149 36969 40521 623 665 0 True 412 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 457 342 0,000925926266103871 0,000930066066975633 0,000595101853971161 0,000701915007248035 0,000909808259014125 0,000826404526481721 37804 40533 623 665 0 True 457 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 501 340 0,000933592516270269 0,00090377006833862 0,000671396963454643 0,000656137941557946 0,000879525534636397 0,000829933203947167 38117 39387 623 665 0 True 501 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 545 341 0,000919925527155732 0,00100750847133857 0,000656137941557946 0,000869764248111696 0,000871431720941842 0,000794802743883652 37559 43908 623 665 0 True 545 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 590 341 0,000990366854563274 0,000973663272394766 0,000579842832074464 0,000534065766384375 0,00104968098519485 0,00107142488672013 40435 42433 623 665 0 True 589 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 634 340 0,000960338667010546 0,00103912791821623 0,000534065766384375 0,000610360875867857 0,00100258188792911 0,00108786134670362 39209 45286 623 665 0 True 633 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 236 386 0,000848235066334495 0,000853151418257248 0,000701915007248035 0,000671396963454643 0,00077119657347137 0,000732280484469677 34632 37181 623 665 0 True 236 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 281 385 0,000838609391205439 0,000875936694563142 0,000747692072938125 0,000747692072938125 0,000670799104640929 0,000701664100508427 34239 38174 623 665 0 True 280 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 325 386 0,000948729074106799 0,0008962897057246 0,000869764248111696 0,000793469138628214 0,000678671422767031 0,000643896432653231 38735 39061 623 665 0 True 324 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 370 385 0,000846422598244037 0,000870452625039366 0,000671396963454643 0,000732433051041428 0,000695886033280947 0,000692539512698078 34558 37935 623 665 0 True 368 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 413 384 0,000874270925525809 0,000948629298125148 0,000671396963454643 0,000732433051041428 0,000761130001089396 0,000779686732368978 35695 41342 623 665 0 True 412 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 457 386 0,000856979000230355 0,000864211340895154 0,000610360875867857 0,000595101853971161 0,000796413323612283 0,000812637898133004 34989 37663 623 665 0 True 457 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 501 386 0,000864424815088454 0,00088392186692412 0,000579842832074464 0,000564583810177768 0,000875342477292897 0,000872518534564459 35293 38522 623 665 0 True 501 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 546 385 0,00087534860925527 0,000979445638587198 0,000579842832074464 0,000793469138628214 0,000846025058372553 0,000852378753868538 35739 42685 623 665 0 True 545 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 591 385 0,00091025086640261 0,00102648472864468 0,000442511635004196 0,000625619897764553 0,00105713877016811 0,00107935462278921 37164 44735 623 665 0 True 589 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 635 385 0,000946549213835843 0,000908703436320258 0,000534065766384375 0,000625619897764553 0,00100782835930657 0,000889147573319058 38646 39602 623 665 0 True 633 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 237 429 0,000860505965163139 0,000850214343365853 0,000701915007248035 0,000732433051041428 0,000747152449438744 0,000734998597510567 35133 37053 623 665 0 True 236 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 281 429 0,000852790729372674 0,000906362954766178 0,000686655985351339 0,000762951094834821 0,000747827804488949 0,000776493670005149 34818 39500 623 665 0 True 280 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 325 429 0,000889529947422505 0,000818847301361667 0,000778210116731518 0,000686655985351339 0,000717550352752132 0,000676229124086751 36318 35686 623 665 0 True 324 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 370 429 0,000871111352773523 0,000932888412379082 0,000747692072938125 0,000793469138628214 0,000674086937560702 0,000707698128581951 35566 40656 623 665 0 True 368 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 414 428 0,000898861708807162 0,000930157850565989 0,000671396963454643 0,000762951094834821 0,000839168625388564 0,00080836523540806 36699 40537 623 665 0 True 412 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 458 430 0,000813479766059355 0,000915931394060799 0,000534065766384375 0,00064087891966125 0,000834038144988792 0,0009023566158794 33213 39917 623 665 0 True 457 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 502 430 0,000879953257917516 0,000867607333738328 0,000549324788281071 0,000564583810177768 0,000902010742964717 0,000923065469150648 35927 37811 623 665 0 True 501 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 545 428 0,000894159088896784 0,000905445118862618 0,00064087891966125 0,000656137941557946 0,000840261080259489 0,00084421697471894 36507 39460 623 665 0 True 545 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 591 429 0,000876279336112533 0,000910126081970777 0,000518806744487678 0,000457770656900893 0,000978027223302219 0,00102324507292212 35777 39664 623 665 0 True 589 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 635 428 0,000889309512114206 0,000994957065357374 0,000473029678797589 0,00064087891966125 0,000936628811225007 0,000986775623988439 36309 43361 623 665 0 True 633 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 235 473 0,000854407254966867 0,000848745805920156 0,000686655985351339 0,000717174029144732 0,00073758241627375 0,000691610046964598 34884 36989 623 665 0 True 236 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 280 473 0,00087245845743535 0,000867194307581726 0,000656137941557946 0,000732433051041428 0,000792032790085412 0,000755949643290604 35621 37793 623 665 0 True 280 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 324 473 0,000869200913434932 0,000877955933550975 0,000717174029144732 0,000762951094834821 0,000785771710905241 0,000747785805121222 35488 38262 623 665 0 True 324 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 369 473 0,0009050094046275 0,000921713760253231 0,000778210116731518 0,000793469138628214 0,000754098293178545 0,000782799080679595 36950 40169 623 665 0 True 368 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 413 473 0,000943438626707624 0,0008883504251588 0,00064087891966125 0,000595101853971161 0,000929810786491026 0,000877958073294397 38519 38715 623 665 0 True 412 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 457 474 0,000889995310851136 0,000938441319595625 0,000457770656900893 0,000518806744487678 0,0010069078079251 0,00103173419773509 36337 40898 623 665 0 True 457 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 501 471 0,000861314227960235 0,000925178590789172 0,000503547722590982 0,000518806744487678 0,000929351914161459 0,000955674556131959 35166 40320 623 665 0 True 501 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 546 473 0,000862097997945298 0,000882912247430203 0,000518806744487678 0,000579842832074464 0,000894602957321259 0,000903849780655385 35198 38478 623 665 0 True 545 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 590 471 0,000838560405581373 0,000907808546314287 0,0004272526131075 0,000534065766384375 0,000976001409643821 0,000948808910390432 34237 39563 623 665 0 True 589 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 634 473 0,000971580867733794 0,000958656655371549 0,000564583810177768 0,000625619897764553 0,000985887971605227 0,000917423574699242 39668 41779 623 665 0 True 633 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 236 518 0,000834935469400456 0,000889084693881648 0,000671396963454643 0,000701915007248035 0,000699561957359458 0,000744831684382708 34089 38747 623 665 0 True 236 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 280 517 0,000793297688943981 0,000857809435467818 0,000625619897764553 0,000671396963454643 0,000734324953477462 0,000748083881070076 32389 37384 623 665 0 True 280 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 324 517 0,000878900067000087 0,000882200924604943 0,000747692072938125 0,000701915007248035 0,000734028876362565 0,000785680995283284 35884 38447 623 665 0 True 324 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 369 518 0,000907336221770656 0,000844845003330023 0,000747692072938125 0,000717174029144732 0,000785864147114105 0,000687105443275444 37045 36819 623 665 0 True 368 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 413 517 0,000856513636801724 0,000921782597945998 0,000579842832074464 0,000610360875867857 0,000852872534170658 0,000884413558764191 34970 40172 623 665 0 True 412 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 457 519 0,000866874096291776 0,00090142958678454 0,000473029678797589 0,000564583810177768 0,000970216038963308 0,00090587601076837 35393 39285 623 665 0 True 457 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 502 517 0,000894232567332883 0,000838213638926797 0,000564583810177768 0,000503547722590982 0,000907453799815679 0,00084807791018916 36510 36530 623 665 0 True 501 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 545 517 0,000836943879987181 0,000817814735970161 0,000579842832074464 0,000534065766384375 0,000837265028581939 0,000823981273080982 34171 35641 623 665 0 True 545 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 590 517 0,000836111124378051 0,000875959640460731 0,000549324788281071 0,000549324788281071 0,000899473811684572 0,000883877285641332 34137 38175 623 665 0 True 589 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 633 517 0,000902584616236212 0,000959941625636534 0,000549324788281071 0,000595101853971161 0,00097552054198474 0,00103523697830733 36851 41835 623 665 0 True 633 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 236 561 0,00085739537803492 0,000858979676244858 0,000717174029144732 0,000717174029144732 0,000657428710521056 0,00064353182567637 35006 37435 623 665 0 True 236 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 281 562 0,000909320139545347 0,000897987702146187 0,00080872816052491 0,000778210116731518 0,000697240065748081 0,000674005372341866 37126 39135 623 665 0 True 280 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 325 560 0,000972487101779023 0,000837479370203949 0,000839246204318303 0,000671396963454643 0,000728499103756349 0,000705114674039709 39705 36498 623 665 0 True 324 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 369 561 0,000900306784717122 0,000836148508143786 0,00080872816052491 0,000732433051041428 0,000703728061829085 0,000646444698182973 36758 36440 623 665 0 True 368 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 413 561 0,000914806529440789 0,000913499128916363 0,000701915007248035 0,000656137941557946 0,000818802560344322 0,00084461963775171 37350 39811 623 665 0 True 412 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 458 562 0,000861779591388866 0,000886675374634802 0,000350957503624018 0,000534065766384375 0,00101599588273459 0,000926542447005524 35185 38642 623 665 0 True 457 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 502 561 0,000851321160650681 0,000846657729239556 0,000366216525520714 0,000350957503624018 0,00106244400796499 0,00102119266134868 34758 36898 623 665 0 True 501 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 545 562 0,000887595015271881 0,000959872787943767 0,000457770656900893 0,000595101853971161 0,000935299412914743 0,000958701175552351 36239 41832 623 665 0 True 545 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 590 561 0,000863959451659823 0,000915816664572854 0,000579842832074464 0,000732433051041428 0,000796272579334739 0,000762472702658915 35274 39912 623 665 0 True 589 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 634 562 0,000992179322653732 0,000912053537368255 0,000762951094834821 0,000717174029144732 0,000898990445525074 0,000794722948209191 40509 39748 623 665 0 True 633 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 236 599 0,000838976783385938 0,000859025568040036 0,000701915007248035 0,000732433051041428 0,00066163994064273 0,000638412033509804 34254 37437 623 665 0 False 236 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 280 599 0,000813994115112053 0,000872311242744077 0,000671396963454643 0,000717174029144732 0,000681040443977839 0,000714302845017489 33234 38016 623 665 0 False 280 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 324 599 0,000808630189276777 0,000871668757611585 0,000671396963454643 0,000778210116731518 0,000693647912502363 0,000723645269570083 33015 37988 623 665 0 False 324 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 369 605 0,000863249160110859 0,000906179387585466 0,000701915007248035 0,000823987182421607 0,000707197405412051 0,000671451634574196 35245 39492 623 665 0 True 368 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 412 599 0,000887399072775615 0,000935137110342806 0,000671396963454643 0,00064087891966125 0,000808885476251357 0,000826914232190976 36231 40754 623 665 0 False 412 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 457 599 0,000875593537375602 0,000877015151749825 0,000457770656900893 0,0004272526131075 0,00101259190005529 0,000976583109271744 35749 38221 623 665 0 False 457 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 501 599 0,000835841703445686 0,000787044287303289 0,000289921416037232 0,000244144350347143 0,00102556401693611 0,00100181274350254 34126 34300 623 665 0 False 501 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 545 599 0,000882549495993037 0,000879791605358097 0,000457770656900893 0,000534065766384375 0,000952924558185528 0,000931134087622021 36033 38342 623 665 0 False 545 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 589 599 0,000850121012861053 0,00083745642430636 0,000579842832074464 0,000518806744487678 0,000817718479519517 0,000833573549920602 34709 36497 623 665 0 False 589 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 633 599 0,000970405212756199 0,000920061655626822 0,00080872816052491 0,000762951094834821 0,000769849917021047 0,000744755233818849 39620 40097 623 665 0 False 633 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 237 648 0,00101872953089774 0,0683837770209456 0,000839246204318303 0,0679026474402991 0,00077900976626014 0,0214687432429703 41593 2980218 623 665 0 True 236 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 280 642 0,000895971556987242 0,000852256528251276 0,000701915007248035 0,000732433051041428 0,000750219378487261 0,000634579787781048 36581 37142 623 665 0 False 280 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 324 642 0,000889529947422505 0,000907693816826341 0,000762951094834821 0,00080872816052491 0,00067666773954552 0,000617827155986182 36318 39558 623 665 0 False 324 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 368 642 0,000852374351568109 0,00083417516095113 0,000717174029144732 0,000732433051041428 0,000653897252806766 0,000627283936041172 34801 36354 623 665 0 False 368 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 412 642 0,000896020542611309 0,000820224055217008 0,000747692072938125 0,000671396963454643 0,000751225286223122 0,000679375807994548 36583 35746 623 665 0 False 412 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 457 642 0,000845393900138642 0,000891356337742961 0,000579842832074464 0,00064087891966125 0,000868958808217405 0,000840788930476662 34516 38846 623 665 0 False 457 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 501 642 0,000921909444930423 0,00085987456625083 0,000610360875867857 0,000564583810177768 0,000947173814031368 0,000875347274045048 37640 37474 623 665 0 False 501 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 545 642 0,000882843409737436 0,000847919753606952 0,000534065766384375 0,000488288700694286 0,000944460895277122 0,000874474351464291 36045 36953 623 665 0 False 545 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 589 642 0,00092325654959225 0,000869603626828573 0,000732433051041428 0,000762951094834821 0,00071923438842501 0,000610574501020575 37695 37898 623 665 0 False 589 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 634 648 0,00104381017041976 0,0730998702983139 0,000900282291905089 0,0732585641260395 0,000750269188178661 0,0231624781884374 42617 3185749 623 665 0 True 633 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E1_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E1_1.csv new file mode 100755 index 0000000..cc4285f --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E1_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 257 282 0,0101495372707329 0,0456264258724174 0,0101167315175097 0,0454261081864652 0,00147479365026245 0,00857846610650008 443655 1988435 667 665 0 True 258 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 302 282 0,0102701453118714 0,0101863723166924 0,0103150988021668 0,0101625085831998 0,00126552314104822 0,00125708678697018 448927 443930 667 665 0 False 302 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 346 283 0,0104625874291053 0,0659571336214191 0,0104676890211337 0,0653086137178607 0,00127581076538288 0,00915358237428008 457339 2874463 667 665 0 True 346 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 390 283 0,0106105564750241 0,0875680847805024 0,0106355382619974 0,0877546349279011 0,0013719028064397 0,0123693989718121 463807 3816285 667 665 0 True 391 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 434 282 0,0105298232092468 0,0758941528690116 0,0105592431525139 0,0732433051041428 0,00176882500881666 0,0136933212883342 460278 3307526 667 665 0 True 435 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 478 282 0,0103239751147544 0,0723071583743061 0,0102998397802701 0,0737773708705272 0,0016928337586059 0,0214768511394985 451280 3151202 667 665 0 True 479 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 521 280 0,0100680261837495 0,0820561818829518 0,0100251773861295 0,0803540093080034 0,00164703416964965 0,0248231139244586 440092 3576072 667 665 0 True 523 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 566 281 0,0102233845311265 0,0722240253873411 0,01025406271458 0,0683909361409934 0,00170123220068358 0,0189155634146922 446883 3147579 667 665 0 True 568 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 612 282 0,0103266974889758 0,0104142250797513 0,0104219119554437 0,0103150988021668 0,0020220255828278 0,00185121333442319 451399 453860 667 665 0 False 612 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 654 279 0,0104715094958815 0,0443357420789327 0,0104829480430304 0,0448615243762875 0,00191470010865924 0,0100440718904929 457729 1932186 667 665 0 True 656 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 258 325 0,0101139633890997 0,0101203340234312 0,010101472495613 0,0102082856488899 0,0014564494903012 0,00146364921714171 442100 441052 667 665 0 False 258 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 302 325 0,010187559001456 0,0102446319506709 0,0102082856488899 0,01025406271458 0,001325854131293 0,00125167722786006 445317 446469 667 665 0 False 302 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 345 327 0,0104058064810579 0,107208947064388 0,0103913939116503 0,10263218127718 0,00144468809953646 0,0292823227500998 454857 4672249 667 665 0 True 346 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 389 327 0,0103895637441064 0,054392928992199 0,0103761348897536 0,0534523537041276 0,00146255898964812 0,0095913985887614 454147 2370486 667 665 0 True 391 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 434 327 0,0104241767877791 0,0779959053045752 0,0104371709773404 0,0753337911039902 0,00164735638799712 0,0149791052708362 455660 3399122 667 665 0 True 435 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 479 325 0,0111650972408051 0,0437417416280459 0,010452429999237 0,0447089341573205 0,00590460247143394 0,00715162855940074 488047 1906299 667 665 0 True 479 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 523 325 0,0102601937758518 0,0481962746187969 0,0103303578240635 0,0502937361715114 0,00164132769649626 0,0105424239270707 448492 2100431 667 665 0 True 523 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 567 325 0,0102284403689664 0,0541615655068089 0,0102693217364767 0,0544899671931029 0,00175063631769951 0,00943755033202411 447104 2360403 667 665 0 True 568 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 612 325 0,0103349103658288 0,0102205158123049 0,0104982070649271 0,0101930266269932 0,00208593691021725 0,00211177181659421 451758 445418 667 665 0 False 612 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 656 325 0,0101981739732102 0,010137153366364 0,0102388036926833 0,0101930266269932 0,00193691597026992 0,00175978061204183 445781 441785 667 665 0 False 656 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 258 372 0,00997409283456235 0,0536956031644687 0,0100404364080262 0,0516823071641108 0,00155061964727697 0,00971087132272395 435986 2340096 667 665 0 True 258 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 301 371 0,0102716323230008 0,0670302903057598 0,01025406271458 0,0684977492942702 0,00136134873991138 0,020308050791059 448992 2921232 667 665 0 True 302 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 346 372 0,0101448017122132 0,041677574572733 0,0101167315175097 0,0419317921721218 0,0014192930503655 0,0073845188594784 443448 1816341 667 665 0 True 346 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 389 371 0,0102924047246233 0,037091836939568 0,0102845807583734 0,0375066758220798 0,00142793722815525 0,00595061705763115 449900 1616491 667 665 0 True 391 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 435 371 0,0104333276254983 0,0757151060301245 0,010452429999237 0,0714885175860227 0,00172996079893371 0,0141673521973947 456060 3299723 667 665 0 True 435 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 479 370 0,0103223965952478 0,0340800502056239 0,0102998397802701 0,0346227206836042 0,0017669639712867 0,0044452459257777 451211 1485235 667 665 0 True 479 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 523 370 0,0103119417631537 0,0287299388319735 0,0103913939116503 0,0288242923628595 0,00178919341145711 0,00298941989394643 450754 1252073 667 665 0 True 523 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 567 369 0,0104309941618799 0,0517217511620663 0,0105439841306172 0,0518654154268711 0,00178702107747588 0,00862550689500641 455958 2254074 667 665 0 True 568 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 611 369 0,0106369795189382 0,0569550908628862 0,0107118333714809 0,0571145189593347 0,00203135074929491 0,0113058585046758 464962 2482147 667 665 0 True 612 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 656 369 0,010483222568162 0,0624984755319289 0,0105439841306172 0,0624856946669718 0,00196504062271419 0,0153761384673198 458241 2723732 667 665 0 True 656 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 258 417 0,0102036187216531 0,0448701520337809 0,0101777676050965 0,0469825284199283 0,00156396792677357 0,0115806780603199 446019 1955476 667 665 0 True 258 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 302 416 0,0101406838352396 0,0318459458327669 0,0102235446707866 0,0320592050049592 0,00153221185936745 0,0030271885373351 443268 1387871 667 665 0 True 302 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 346 416 0,0102898653671562 0,0901148499539074 0,0102998397802701 0,086854352635996 0,00151025143322393 0,0201605944112034 449789 3927275 667 665 0 True 346 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 390 415 0,0104082772072421 0,0689280537117571 0,0104676890211337 0,066147859922179 0,00144305961201599 0,0164516246850947 454965 3003938 667 665 0 True 391 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 435 414 0,0106248775360546 0,045026367704567 0,0106355382619974 0,0461127641718166 0,001605713618438 0,00663584952656687 464433 1962284 667 665 0 True 435 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 479 414 0,010551259046604 0,0539855704723011 0,0105287251087205 0,0535896849011978 0,00172066746798174 0,00868070457546311 461215 2352733 667 665 0 True 479 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 523 414 0,0103676932419576 0,0427550909776157 0,0104371709773404 0,0433813992523079 0,00159727091707614 0,00483863034382709 453191 1863300 667 665 0 True 523 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 566 414 0,0104394815638644 0,0535044638375522 0,0104676890211337 0,0521858548867018 0,00180295807993284 0,00894834627582078 456329 2331766 667 665 0 True 568 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 611 413 0,0106721644899683 0,0428793430130602 0,0106660563057908 0,0428473334859236 0,00200067545329356 0,00807629285318751 466500 1868715 667 665 0 True 612 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 655 413 0,010601565776965 0,0860943386160526 0,0105897611963073 0,0809948882276646 0,00198508709850664 0,0195809229976027 463414 3752058 667 665 0 True 656 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 258 461 0,00985590976541942 0,0419113473773699 0,00994888227664607 0,0424963759822995 0,00152582145848695 0,00704532049470523 430820 1826529 667 665 0 True 258 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 302 460 0,0101505667399763 0,0591088387023865 0,010101472495613 0,059464408331426 0,00148491877746632 0,00829138809355951 443700 2576009 667 665 0 True 302 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 346 460 0,0102387121843061 0,0352360645261586 0,0102998397802701 0,0357671473258564 0,00145678223942287 0,00389353539725884 447553 1535615 667 665 0 True 346 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 390 460 0,0105860322299368 0,0544510968425871 0,010605020218204 0,0538796063172351 0,00143424159875155 0,0101856526718347 462735 2373021 667 665 0 True 391 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 435 459 0,0107113987066892 0,0996772544774617 0,0107423514152743 0,0990615701533532 0,00185602704873122 0,0153509900643551 468215 4344012 667 665 0 True 435 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 479 458 0,0107717256043528 0,0626866777839541 0,0106813153276875 0,0613412680247196 0,00230786709394555 0,012975088878263 470852 2731934 667 665 0 True 479 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 523 458 0,0105052074557823 0,0550396361698478 0,010406652933547 0,0534218356603342 0,00178094876989605 0,00895651498725249 459202 2398670 667 665 0 True 523 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 567 458 0,0106939434837399 0,0317100602272447 0,0106813153276875 0,0318760967421988 0,00189347749314603 0,00375701438980593 467452 1381949 667 665 0 True 568 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 612 458 0,0107376158567546 0,0402329008605285 0,0106965743495842 0,0402990768291753 0,00191012135909926 0,00467690182641542 469361 1753381 667 665 0 True 612 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 655 457 0,0105721000795093 0,0710265707757606 0,0105287251087205 0,0703288319218738 0,00191562106886043 0,0151788919995011 462126 3095393 667 665 0 True 656 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 259 505 0,0100828734179488 0,0611922114739814 0,0101167315175097 0,0611886778057526 0,00149023189716581 0,016861385561475 440741 2666804 667 665 0 True 258 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 303 504 0,0102653182449746 0,060035898856778 0,0102388036926833 0,0584420538643473 0,00153540060327044 0,0071965850795389 448716 2616411 667 665 0 True 302 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 347 504 0,0104845723167256 0,0726635999474539 0,0104829480430304 0,0683299000534066 0,00149593186353669 0,0171834524986587 458300 3166736 667 665 0 True 346 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 391 504 0,0107255596280596 0,0905151411373478 0,0106202792401007 0,0850385290302892 0,0016114332079583 0,019510421936072 468834 3944720 667 665 0 True 391 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 435 503 0,0107958838159314 0,0977324978732021 0,0108491645685512 0,0930037384603647 0,0019894153701453 0,026355602942246 471908 4259258 667 665 0 True 435 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 481 502 0,010607628206954 0,0464027085337514 0,0106355382619974 0,0472571908140688 0,00195552654991929 0,00605684794497992 463679 2022266 667 665 0 True 479 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 524 502 0,0105620341580183 0,0413872860223344 0,0106202792401007 0,0423285267414359 0,00165010603005461 0,00509362342993453 461686 1803690 667 665 0 True 523 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 568 502 0,0107405898790133 0,102550264422787 0,0106202792401007 0,10106050202182 0,00180172804237672 0,0159586253074092 469491 4469220 667 665 0 True 568 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 612 501 0,0107992696258874 0,0614660248699111 0,0108339055466545 0,064637216754406 0,00191935085421647 0,014763932158897 472056 2678737 667 665 0 True 612 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 657 501 0,0120660429684448 0,0751108717089129 0,0107423514152743 0,0725413900968948 0,0105171062795363 0,0128769800303361 527429 3273390 667 665 0 True 656 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 260 549 0,00981962669386296 0,0605560364633259 0,00978103303578241 0,0624093995574884 0,00132853496468793 0,013812605426066 429234 2639079 667 665 0 True 258 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 303 548 0,0101534263767636 0,108254086807772 0,0101777676050965 0,0990005340657664 0,00144627399348586 0,0254697103869611 443825 4717797 667 665 0 True 302 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 347 548 0,010418480391299 0,0568823753134266 0,0104676890211337 0,0587777523460746 0,00148161342301345 0,0102098088595092 455411 2478978 667 665 0 True 346 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 392 548 0,0105947941570529 0,0585826892706704 0,0105287251087205 0,0570382238498512 0,00155146769839186 0,00815904035461896 463118 2553079 667 665 0 True 391 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 436 548 0,0106865999364703 0,0560602926405049 0,0107728694590677 0,0560311284046693 0,00194337457562566 0,00667991823969786 467131 2443151 667 665 0 True 435 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 480 547 0,010757381666228 0,0601995719442805 0,0107270923933776 0,0587472343022812 0,00188962640852662 0,0105788444264973 470225 2623544 667 665 0 True 479 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 524 546 0,0105505956108693 0,0706591610635653 0,0104982070649271 0,0678416113527123 0,00192424164186871 0,0153294293132355 461186 3079381 667 665 0 True 523 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 569 546 0,0106288352733681 0,0571912500408724 0,0106507972838941 0,0571450370031281 0,00175710068705 0,0120615663257055 464606 2492439 667 665 0 True 568 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 613 546 0,0104878666183045 0,0442679828433524 0,0104676890211337 0,0427862973983368 0,0017090298260685 0,00688885615845647 458444 1929233 667 665 0 True 612 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 656 546 0,0105537755269767 0,0653512242496835 0,0104982070649271 0,0641184100099184 0,0018888767405962 0,0114968386199997 461325 2848057 667 665 0 True 656 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 259 592 0,00975680619292094 0,0471724057224774 0,00973525597009232 0,0470588235294118 0,00129737673785398 0,00823529714234986 426488 2055810 667 665 0 True 258 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 303 592 0,0100037415487724 0,0547871395127783 0,0100404364080262 0,0548104066529335 0,00141829324443016 0,0103913279182407 437282 2387666 667 665 0 True 302 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 347 592 0,0101324252041981 0,0494850768486793 0,0101472495613031 0,0484931715877012 0,00136516292420834 0,00858867189775244 442907 2156598 667 665 0 True 346 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 392 592 0,010514632818633 0,0493730090848545 0,0105287251087205 0,0486610208285649 0,00144610169531285 0,00543666138656823 459614 2151714 667 665 0 True 391 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 436 592 0,0105355424828213 0,0896175894072558 0,0105592431525139 0,0849011978332189 0,0018246876895157 0,0183462131077283 460528 3905604 667 665 0 True 435 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 480 591 0,0104024664252904 0,0604540190026451 0,0103913939116503 0,0588845654993515 0,00193924918117193 0,00922709257598305 454711 2634633 667 665 0 True 479 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 525 590 0,010267811848253 0,0541787749300007 0,0103150988021668 0,0537422751201648 0,00197011685240206 0,00654663571408151 448825 2361153 667 665 0 True 523 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 569 590 0,0104846180709142 0,0359812096044644 0,0104371709773404 0,0372014953841459 0,00179717276903634 0,00583753665083513 458302 1568089 667 665 0 True 568 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 613 590 0,0106071020337851 0,0476216405054752 0,0105897611963073 0,047348744945449 0,00148601658359877 0,00578866568292562 463656 2075388 667 665 0 True 612 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 657 589 0,0104287979608273 0,0527228118361824 0,010406652933547 0,0519417105363546 0,00166441126242446 0,00708132916235754 455862 2297701 667 665 0 True 656 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 258 629 0,00992991716547311 0,00936502391249352 0,00953688868543526 0,00933852140077821 0,00285019353349044 0,00137792793227431 434055 408135 667 665 0 False 258 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 302 629 0,00998612618616304 0,00964372478460973 0,00978103303578241 0,00967421988250553 0,00238764891008117 0,00128857961191772 436512 420281 667 665 0 False 302 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 348 636 0,0099170144842891 0,0750040815015336 0,0097962920576791 0,0730907148851759 0,00128177959703966 0,00995635618176144 433491 3268736 667 665 0 True 346 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 392 636 0,0100383317153508 0,0761939869128073 0,0101319905394064 0,0723125047684443 0,00137514413290238 0,0175905171610548 438794 3320593 667 665 0 True 391 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 435 629 0,0104985273442473 0,0100365126595385 0,0102388036926833 0,00999465934233616 0,00271967339074542 0,00178916317199007 458910 437399 667 665 0 False 435 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 479 629 0,0101971902581554 0,0101486033692609 0,010101472495613 0,0102235446707866 0,00198787569766655 0,0018571845326867 445738 442284 667 665 0 False 479 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 523 629 0,0100875632222799 0,0099047343696848 0,0101319905394064 0,00999465934233616 0,00189708701769043 0,00186619897564618 440946 431656 667 665 0 False 523 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 568 629 0,0104168103634152 0,0101196915382987 0,0104219119554437 0,0101930266269932 0,00176847959811155 0,00153433490787819 455338 441024 667 665 0 False 568 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 612 629 0,0103594803651047 0,0102948375745957 0,0103303578240635 0,0102845807583734 0,00158099311107656 0,00140010040920089 452832 448657 667 665 0 False 612 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 656 629 0,010257906066422 0,0101586077806097 0,0103303578240635 0,0101472495613031 0,00146784991629858 0,00140138371363865 448392 442720 667 665 0 False 656 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 260 679 0,00965973868181496 0,0434169424476733 0,00968947890440223 0,0440985732814527 0,00131070790089405 0,00858203544528883 422245 1892144 667 665 0 True 258 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 302 672 0,00951343966377992 0,00948526041585998 0,00958266575112535 0,00952162966353857 0,00131706148445277 0,00124288748541773 415850 413375 667 665 0 False 302 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 346 672 0,0112200708984029 0,00947743586478212 0,00955214770733196 0,00950637064164187 0,00856314967317268 0,00136530188819118 490450 413034 667 665 0 False 346 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 391 672 0,010813133145032 0,00967254483198153 0,0098115510795758 0,00968947890440223 0,00547639280521083 0,00127187388988691 472662 421537 667 665 0 False 391 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 435 672 0,00969254443503815 0,0095591691519942 0,00975051499198901 0,00956740672922866 0,00144825430186618 0,00155607006599364 423679 416596 667 665 0 False 435 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 479 672 0,00970144362472003 0,00976875698057228 0,00967421988250553 0,00978103303578241 0,00165637078311677 0,00146526384706443 424068 425730 667 665 0 False 479 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 523 672 0,0098745545972722 0,00965228360441043 0,00985732814526589 0,00973525597009232 0,00177488975066809 0,00175863846877254 431635 420654 667 665 0 False 523 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 568 672 0,0100653266866224 0,0103323770630513 0,010101472495613 0,0102845807583734 0,00150908791152974 0,00153844909130503 439974 450293 667 665 0 False 568 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 612 672 0,0100060978894851 0,0102301760351898 0,00997940032043946 0,0102082856488899 0,00130891438909319 0,00142662542991269 437385 445839 667 665 0 False 612 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 659 677 0,00964253510690295 0,041626772355471 0,00967421988250553 0,0417029068436713 0,00137555046211124 0,00817927154566196 421493 1814127 667 665 0 True 656 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E1_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E1_2.csv new file mode 100755 index 0000000..630d9e7 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E1_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 257 282 0,00829534877788846 0,710783252477727 0,00813305867093919 0,707331960021363 0,00194021142107513 0,184276173899004 362605 30976485 667 665 8 True 258 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 302 282 0,00688513605408328 0,0066841399676807 0,00686655985351339 0,00668345159075303 0,0014199682380443 0,00126078534613845 300962 291300 667 665 0 False 302 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 346 283 0,00658345581157693 0,00654848382113443 0,00660715648126955 0,00648508430609598 0,00120668731531544 0,00140565066913309 287775 285388 667 665 0 True 346 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 390 283 0,00667155550171813 0,00674623156655658 0,00665293354695964 0,0068207827878233 0,00130574907078069 0,00126865973733338 291626 294006 667 665 0 True 391 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 434 282 0,00686413488151781 0,00669988085342677 0,0068055237659266 0,00679026474402991 0,00167324776805832 0,00162310447274679 300044 291986 667 665 0 True 435 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 478 282 0,00713662395170005 0,00723949952702769 0,00720225833524071 0,00718699931334401 0,00156333109110447 0,0017736570249015 311955 315503 667 665 0 True 479 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 521 280 0,00713163674514311 0,0070589612047973 0,00715648126955062 0,00714122224765393 0,00154259645354647 0,0015452024953783 311737 307635 667 665 0 True 523 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 566 281 0,00747040075750635 0,0075206785560835 0,00750743877317464 0,00750743877317464 0,00161140016676532 0,00164470412942028 326545 327757 667 665 0 True 568 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 612 282 0,00843071254484911 0,00854746158139684 0,00848401617456321 0,00857557030594339 0,00204194052957767 0,00185236086505372 368522 372505 667 665 0 False 612 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 654 279 0,00972491552346967 0,699587857260455 0,00975051499198901 0,705790798809796 0,00190987672175291 0,210360278638013 425094 30488581 667 665 9 True 656 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 258 325 0,00672396692475461 0,00659568353247504 0,00671396963454643 0,00665293354695964 0,00146901512245646 0,00143070700772356 293917 287445 667 665 0 False 258 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 302 325 0,00655918321452686 0,00653533582181593 0,00663767452506294 0,00654612039368277 0,00132863901284536 0,00122617525704947 286714 284815 667 665 0 False 302 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 345 327 0,00668628835044597 0,00868775279925609 0,00672922865644312 0,00665293354695964 0,0012463253718367 0,0110428776359016 292270 378619 667 665 0 True 346 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 389 327 0,00680602706200116 0,00676821373644686 0,00672922865644312 0,0068055237659266 0,00134377900608303 0,00124282959699984 297504 294964 667 665 0 True 391 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 434 327 0,00712680967824625 0,00726708049592968 0,00715648126955062 0,0072632944228275 0,00158745193310312 0,00173739584312766 311526 316705 667 665 0 True 435 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 479 325 0,0245255719588135 0,00723796215188922 0,00749217975127794 0,00729381246662089 0,0871430479466109 0,00148690232653651 1072058 315436 667 665 0 True 479 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 523 325 0,0078568177572921 0,00731294934521013 0,00733958953231098 0,00730907148851759 0,0050644720554187 0,00158649430592776 343436 318704 667 665 0 True 523 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 567 325 0,00752656402400768 0,00765156195593126 0,00755321583886473 0,00772106507972839 0,00178086512731296 0,00151707348338032 329000 333461 667 665 0 True 568 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 612 325 0,00808346113050135 0,00806061847225066 0,00817883573662928 0,00807202258335241 0,00201182147373167 0,00212422941526116 353343 351288 667 665 0 False 612 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 656 325 0,0081319376933186 0,0080193846942832 0,00820935378042268 0,00794995040817884 0,00194276737839845 0,00171408446965984 355462 349491 667 665 0 False 656 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 258 372 0,00618317529264665 0,00629874067177557 0,00616464484626535 0,00633249408712902 0,0014224007938142 0,0014799649794166 270278 274504 667 665 0 True 258 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 301 371 0,00631002878052848 0,00638474189593921 0,0063782711528191 0,00631723506523232 0,00124893912343478 0,00125303925296792 275823 278252 667 665 0 True 302 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 346 372 0,00659038757114919 0,00647342779012076 0,00650034332799268 0,00645456626230259 0,00132927957922126 0,00145992774838644 288078 282117 667 665 0 True 346 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 389 371 0,00690201934967513 0,0068234904037388 0,00689707789730678 0,0068055237659266 0,00133047714287867 0,0013486063537197 301700 297373 667 665 0 True 391 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 435 371 0,00737461436368106 0,00754736463497953 0,00740062561989776 0,00752269779507134 0,00167803884177753 0,0016813491634528 322358 328920 667 665 0 True 435 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 479 370 0,00727269690858393 0,00723943068933492 0,00727855344472419 0,00721751735713741 0,00157967663522961 0,00167759785743183 317903 315500 667 665 0 True 479 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 523 370 0,00736747671026011 0,00745505328897891 0,0072480354009308 0,00750743877317464 0,00167451093754082 0,00168154928028085 322046 324897 667 665 0 True 523 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 567 369 0,00749890561700152 0,00765479732749131 0,00743114366369116 0,0076752880140383 0,00180323073928996 0,00177870286189037 327791 333602 667 665 0 True 568 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 611 369 0,00768583435450963 0,00783411951714948 0,00770580605783169 0,00782787823300526 0,00188645649920807 0,00196799717431576 335962 341417 667 665 0 True 612 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 656 369 0,00734414207407626 0,00712722525012463 0,00743114366369116 0,00715648126955062 0,00197466058759971 0,0018148040059052 321026 310610 667 665 0 True 656 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 258 417 0,0063044010153312 0,00620443303268471 0,00627145799954223 0,00622568093385214 0,00153027267964894 0,00149630738202601 275577 270394 667 665 0 True 258 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 302 416 0,00641656740867378 0,00663079075578624 0,00648508430609598 0,00663767452506294 0,00142334930402933 0,00126132898604349 280480 288975 667 665 0 True 302 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 346 416 0,00667782382555575 0,00679496865303566 0,00669871061264973 0,00677500572213321 0,00133351238949669 0,00128001875425258 291900 296130 667 665 0 True 346 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 390 415 0,00741531271443701 0,00731914473755916 0,00749217975127794 0,0072632944228275 0,00151913547631506 0,00142831661868222 324137 318974 667 665 0 True 391 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 435 414 0,00756959583838202 0,00740466409787343 0,00750743877317464 0,00741588464179446 0,00180246077506613 0,00152021332665818 330881 322701 667 665 0 True 435 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 479 414 0,0077177021468666 0,00757480792849599 0,00775158312352178 0,00762951094834821 0,00167784846156772 0,00153422439607848 337355 330116 667 665 0 True 479 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 523 414 0,00751890019741789 0,00767606817455633 0,00752269779507134 0,0076600289921416 0,00162619901066379 0,00161152608590953 328665 334529 667 665 0 True 523 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 566 414 0,00736013316299049 0,00743905999835937 0,00735484855420768 0,00746166170748455 0,00163506934511865 0,00160490623241581 321725 324200 667 665 0 True 568 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 611 413 0,00719406833548206 0,00713970781841305 0,00720225833524071 0,00721751735713741 0,00201330228753056 0,00176296399024894 314466 311154 667 665 0 True 612 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 655 413 0,00673586301378951 0,00675010942324913 0,00668345159075303 0,00679026474402991 0,00180859861335905 0,00187927396453325 294437 294175 667 665 0 True 656 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 258 461 0,00648522156866177 0,00728780064145257 0,00653086137178607 0,00663767452506294 0,00146883109694556 0,00312848304101743 283481 317608 667 665 0 True 258 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 302 460 0,00646557014465987 0,00647269352139791 0,00650034332799268 0,0064087891966125 0,00146009108241692 0,00153326446079789 282622 282085 667 665 0 True 302 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 346 460 0,00688472426638592 0,00671417614762473 0,00686655985351339 0,00671396963454643 0,00141937113687063 0,00144931453614673 300944 292609 667 665 0 True 346 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 390 460 0,00721362825110677 0,00767760554969479 0,0072632944228275 0,00776684214541848 0,00156017547202481 0,00153634671450085 315321 334596 667 665 0 True 391 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 435 459 0,00731501953303504 0,00734098923206391 0,00730907148851759 0,00743114366369116 0,00183982090673011 0,00190333298839159 319753 319926 667 665 0 True 435 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 479 458 0,00772280373889503 0,00778035727909841 0,00775158312352178 0,00784313725490196 0,00178969494774651 0,00193607988378087 337578 339074 667 665 0 True 479 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 523 458 0,00734125956019473 0,00720397927755989 0,00729381246662089 0,0072632944228275 0,00174110058712443 0,00172896612802844 320900 313955 667 665 0 True 523 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 567 458 0,0068979701039844 0,00666791721808527 0,00692759594110018 0,00668345159075303 0,00178525958419264 0,00184851310100348 301523 290593 667 665 0 True 568 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 612 458 0,00674435041577403 0,00668088165022306 0,00672922865644312 0,00677500572213321 0,00178092528098006 0,00188114476450911 294808 291158 667 665 0 True 612 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 655 457 0,00664709988791368 0,00685097958905045 0,00675974670023652 0,0068055237659266 0,00181763504012718 0,00184098261436896 290557 298571 667 665 0 True 656 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 259 505 0,00631078372464031 0,00627629958393351 0,00631723506523232 0,00627145799954223 0,0014688383250633 0,00146960132404997 275856 273526 667 665 0 True 258 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 303 504 0,00654159072901178 0,00648180304274075 0,00665293354695964 0,00648508430609598 0,00151270880766315 0,00138376487070232 285945 282482 667 665 0 True 302 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 347 504 0,00701832649708563 0,00693431908909376 0,00704966811627375 0,00689707789730678 0,001451203390515 0,00147230390764162 306784 302203 667 665 0 True 346 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 391 504 0,00743331698764946 0,00715941834444202 0,00747692072938125 0,00714122224765393 0,00162682106429398 0,00156736109437505 324924 312013 667 665 0 True 391 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 435 503 0,00703669680380684 0,00717779800841082 0,00709544518196384 0,00706492713817044 0,00178577340636051 0,001920590680329 307587 312814 667 665 0 True 435 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 481 502 0,00716476277768646 0,00683491746073814 0,00714122224765393 0,00694285496299687 0,00176895791941769 0,001599958880854 313185 297871 667 665 0 True 479 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 524 502 0,00665496960835215 0,00659437561631247 0,00666819256885634 0,00653086137178607 0,00165717062388065 0,00158598644972203 290901 287388 667 665 0 True 523 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 568 502 0,00670269122705756 0,00674198657550262 0,00666819256885634 0,0068055237659266 0,00177721725778173 0,00166350830785099 292987 293821 667 665 0 True 568 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 612 501 0,00685823259118896 0,00672737003873841 0,00686655985351339 0,00675974670023652 0,00181190107595716 0,0018515553460376 299786 293184 667 665 0 True 612 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 657 501 0,00791076194564654 0,00676656163182045 0,00688181887541009 0,00683604180972 0,00674790899732894 0,00196178279575262 345794 294892 667 665 0 True 656 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 260 549 0,0065175011487161 0,00646057808747091 0,00659189745937285 0,00651560234988937 0,00135257732686414 0,00142956988871469 284892 281557 667 665 0 True 258 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 303 548 0,0066783271216303 0,00653402790565335 0,00662241550316625 0,00654612039368277 0,00140551603525335 0,00139562901021389 291922 284758 667 665 0 True 302 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 347 548 0,00685374868070657 0,00744601260532884 0,00685130083161669 0,00738536659800107 0,00148044971141871 0,00141497595316786 299590 324503 667 665 0 True 346 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 392 548 0,00675368427024757 0,00695981198131515 0,00683604180972 0,00694285496299687 0,00148670954312998 0,00140942238405442 295216 303314 667 665 0 True 391 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 436 548 0,00677248924176044 0,00662730297935271 0,00663767452506294 0,00665293354695964 0,00193835244566107 0,00201900297887416 296038 288823 667 665 0 True 435 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 480 547 0,00679367343108029 0,00681291234495027 0,0068055237659266 0,00689707789730678 0,0018050968532625 0,00201001388987096 296964 296912 667 665 0 True 479 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 524 546 0,00677777385054326 0,00684287968720152 0,0068055237659266 0,00689707789730678 0,00188235795631578 0,00194764094196181 296269 298218 667 665 0 True 523 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 569 546 0,00685084328973074 0,00686830374173015 0,00683604180972 0,00692759594110018 0,00169699464699929 0,00167521120421211 299463 299326 667 665 0 True 568 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 613 546 0,00703257892683322 0,00718224951254309 0,00711070420386053 0,00715648126955062 0,00173668202321584 0,00171562681365713 307407 313008 667 665 0 True 612 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 656 546 0,00692972351086988 0,00698184004300061 0,00691233691920348 0,00703440909437705 0,00179594504908572 0,0018357067209803 302911 304274 667 665 0 True 656 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 259 592 0,00660814019632436 0,00666098755701339 0,00659189745937285 0,00668345159075303 0,00123407503031745 0,00124536778035474 288854 290291 667 665 0 True 258 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 303 592 0,00676461952132197 0,0066273259252503 0,00679026474402991 0,00660715648126955 0,00142341948097214 0,00139904201109349 295694 288824 667 665 0 True 302 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 347 592 0,00678612398996199 0,00685371015086354 0,00683604180972 0,00688181887541009 0,00140180740133567 0,00141924933047088 296634 298690 667 665 0 True 346 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 392 592 0,00656604634281623 0,00649545585180621 0,00656137941557946 0,00650034332799268 0,00139880541936976 0,00129525230592054 287014 283077 667 665 0 True 391 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 436 592 0,00655174815888005 0,00669565880827039 0,00663767452506294 0,00666819256885634 0,00174161580937233 0,00189907153799759 286389 291802 667 665 0 True 435 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 480 591 0,00672316622645418 0,00690721998404113 0,00671396963454643 0,00695811398489357 0,00181314527139211 0,00184259816812092 293882 301022 667 665 0 True 479 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 525 590 0,00683997666993924 0,00701655718605279 0,00683604180972 0,00703440909437705 0,00183111138066129 0,00193276906497454 298988 305787 667 665 0 True 523 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 569 590 0,00696230049315008 0,00702325738814879 0,00708018616006714 0,00695811398489357 0,00169322432947168 0,00175938183879827 304335 306079 667 665 0 True 568 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 613 590 0,00729740417042566 0,00740356269478916 0,0072480354009308 0,00743114366369116 0,00148112466231462 0,00156586098642677 318983 322653 667 665 0 True 612 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 657 589 0,00690858507573862 0,00683172798097326 0,00686655985351339 0,00686655985351339 0,00161127066420741 0,0015305776935543 301987 297732 667 665 0 True 656 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 258 629 0,00677816276114632 0,00684847848621324 0,00683604180972 0,00683604180972 0,00132553078509187 0,0013453822652803 296286 298462 667 665 0 False 258 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 302 629 0,00684455208879881 0,00673661723546679 0,00686655985351339 0,00677500572213321 0,0013777972661325 0,00127158633224335 299188 293587 667 665 0 False 302 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 348 636 0,00649627120520765 0,00654639574445383 0,00651560234988937 0,00651560234988937 0,00129220826548773 0,00121698097057398 283964 285297 667 665 0 True 346 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 392 636 0,0061815510189515 0,00637317716355434 0,00616464484626535 0,0063935301747158 0,00125832561237771 0,00121931548954809 270207 277748 667 665 0 True 391 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 435 629 0,00640069070523104 0,00630218255641392 0,0064087891966125 0,00625619897764553 0,00169932603197867 0,00166135769960065 279786 274654 667 665 0 False 435 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 479 629 0,00654625765624855 0,0067062827588541 0,00653086137178607 0,00668345159075303 0,00183110187724531 0,00179726632209511 286149 292265 667 665 0 False 479 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 523 629 0,00671570829371307 0,00673455210468377 0,00677500572213321 0,00674448767833982 0,00181652423441834 0,00180661127864227 293556 293497 667 665 0 False 523 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 568 629 0,0070969550701875 0,00692112519798007 0,00718699931334401 0,00692759594110018 0,00167308673429747 0,00156432688000166 310221 301628 667 665 0 False 568 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 612 629 0,00727937702011892 0,00720978458964991 0,0072632944228275 0,00718699931334401 0,00130057153911172 0,00130279569663145 318195 314208 667 665 0 False 612 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 656 629 0,00688197901507017 0,00698057801863322 0,00692759594110018 0,00697337300679027 0,0014796715133097 0,00134943179612656 300824 304219 667 665 0 False 656 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 260 679 0,00833872374867728 0,694052847844032 0,00817883573662928 0,694666971847105 0,00184549154466974 0,189334528609862 364501 30247361 667 665 6 True 258 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 302 672 0,00732895168346246 0,00725228039198477 0,00701915007248035 0,0072632944228275 0,00214063798262758 0,00133977151462629 320362 316060 667 665 0 False 302 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 346 672 0,00634935450562656 0,00633109438737609 0,00636301213092241 0,0064087891966125 0,00136799478274241 0,00120958484050201 277542 275914 667 665 0 False 346 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 391 672 0,00608176113362408 0,00614608161511584 0,00605783169298848 0,00614938582436866 0,00125653407846368 0,00118660382105302 265845 267851 667 665 0 False 391 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 435 672 0,00632423545608747 0,00630853857004608 0,00630197604333562 0,00634775310902571 0,00142822798772801 0,00143364107699524 276444 274931 667 665 0 False 435 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 479 672 0,00643900983818002 0,00637108908687374 0,00643930724040589 0,00633249408712902 0,001655606616468 0,00145295412369851 281461 277657 667 665 0 False 479 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 523 672 0,00678459122464403 0,00664664637102025 0,00675974670023652 0,00663767452506294 0,00167768525523037 0,00159377412965169 296567 289666 667 665 0 False 523 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 568 672 0,00714456230342142 0,00721953659612524 0,00714122224765393 0,0072327763790341 0,0015608485063165 0,00145843626445712 312302 314633 667 665 0 False 568 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 612 672 0,00733325257719046 0,00730037499333135 0,00729381246662089 0,00732433051041428 0,00127507199659788 0,00138681969598789 320550 318156 667 665 0 False 612 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 659 677 0,00831394785555265 0,692075829307762 0,00828564888990616 0,691096360723278 0,00175014726876129 0,192401500704696 363418 30161201 667 665 8 True 656 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E1_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E1_3.csv new file mode 100755 index 0000000..3a2d480 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E1_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 257 282 0,00101013809872358 0,0700392088025052 0,000793469138628214 0,0687266346227207 0,000829553880486779 0,0195833762035834 44155 3052363 667 665 0 True 258 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 302 282 0,000944595223560113 0,000921599030765286 0,000869764248111696 0,000793469138628214 0,000653482244873373 0,000634055856526522 41290 40164 667 665 0 False 302 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 346 283 0,00093288215127959 0,000907074277591438 0,00080872816052491 0,000793469138628214 0,000656632960046172 0,000684069252540649 40778 39531 667 665 0 True 346 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 390 283 0,000872486622333146 0,000930502039029825 0,000747692072938125 0,000793469138628214 0,000652419391650606 0,000672855246218872 38138 40552 667 665 0 True 391 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 434 282 0,000895752627234106 0,0008584748664979 0,000610360875867857 0,000610360875867857 0,00086238381318121 0,000813199125930463 39155 37413 667 665 0 True 435 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 478 282 0,000895844135611297 0,000862283885497676 0,000671396963454643 0,000534065766384375 0,000850598523799356 0,000891626477279844 39159 37579 667 665 0 True 479 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 521 280 0,000885252040951371 0,000902806340639881 0,000656137941557946 0,000686655985351339 0,000792708077274888 0,00084479387659816 38696 39345 667 665 0 True 523 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 566 281 0,000893442040710018 0,000922035002819477 0,000671396963454643 0,000595101853971161 0,000873268215027368 0,000894484673738865 39054 40183 667 665 0 True 568 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 612 282 0,000989914747364244 0,0010757495707683 0,000564583810177768 0,000778210116731518 0,00102763914716141 0,00102475672578787 43271 46882 667 665 0 False 612 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 654 279 0,00105934672855836 0,0695681295250027 0,000717174029144732 0,0700236514839399 0,00100576473553214 0,0221327905373478 46306 3031833 667 665 0 True 656 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 258 325 0,000908655308418119 0,000871714649406763 0,000762951094834821 0,000701915007248035 0,000750430015724862 0,000707435266860946 39719 37990 667 665 0 False 258 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 302 325 0,000848923215206313 0,00092641766925898 0,000762951094834821 0,000839246204318303 0,000644295586392215 0,000625747246106783 37108 40374 667 665 0 False 302 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 345 327 0,000890651035205675 0,00111794707643451 0,000762951094834821 0,000869764248111696 0,000619353184101145 0,00121780434015072 38932 48721 667 665 0 True 346 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 389 327 0,000911926732902718 0,000934402841619958 0,000762951094834821 0,000839246204318303 0,000705619421014718 0,000671821311205736 39862 40722 667 665 0 True 391 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 434 327 0,00086711050517314 0,00100181788873649 0,000595101853971161 0,000686655985351339 0,000794919590268169 0,000932663005028181 37903 43660 667 665 0 True 435 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 479 325 0,00260021053789882 0,00094367298424592 0,00080872816052491 0,000778210116731518 0,00857753548989473 0,000806765579408477 113660 41126 667 665 0 True 479 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 523 325 0,000882369527069837 0,000962993430015873 0,000717174029144732 0,000762951094834821 0,000819924069357894 0,000892440307344012 38570 41968 667 665 0 True 523 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 567 325 0,000880630867903197 0,000969854253394989 0,000610360875867857 0,000762951094834821 0,000898151372726744 0,000815790400567221 38494 42267 667 665 0 True 568 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 612 325 0,000976440138822784 0,00103453873869843 0,000671396963454643 0,000595101853971161 0,00100278497083558 0,00113572367253635 42682 45086 667 665 0 False 612 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 656 325 0,000962507988395365 0,000970427900834714 0,000518806744487678 0,000656137941557946 0,00100739383371741 0,0009181232920749 42073 42292 667 665 0 False 656 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 258 372 0,000847161678945375 0,000926761857722815 0,000701915007248035 0,000747692072938125 0,000709470167616863 0,000817669716383413 37031 40389 667 665 0 True 258 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 301 371 0,000832680478254807 0,000823390589084292 0,000701915007248035 0,000717174029144732 0,00066268549868861 0,000655987437485145 36398 35884 667 665 0 True 302 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 346 372 0,000920734414207408 0,00096772028491921 0,000793469138628214 0,000793469138628214 0,000706098434705915 0,000777825553270019 40247 42174 667 665 0 True 346 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 389 371 0,000935444385840954 0,000938418373698035 0,000762951094834821 0,00080872816052491 0,000710394266684852 0,000715518854928575 40890 40897 667 665 0 True 391 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 435 371 0,00100364100394298 0,000948835811203449 0,000717174029144732 0,00064087891966125 0,000891934907379961 0,000898432270812765 43871 41351 667 665 0 True 435 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 479 370 0,000919659190775407 0,000866528876551645 0,000610360875867857 0,000518806744487678 0,000843399232100638 0,000871816512006206 40200 37764 667 665 0 True 479 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 523 370 0,00084874019845193 0,000888465154646745 0,000579842832074464 0,000579842832074464 0,000844995241127914 0,000885779403104437 37100 38720 667 665 0 True 523 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 567 369 0,000923731313560432 0,000839246204318303 0,000579842832074464 0,000503547722590982 0,000948639079461185 0,000856518814769208 40378 36575 667 665 0 True 568 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 611 369 0,00089483754346219 0,000965884613112089 0,000457770656900893 0,000534065766384375 0,000998191046232705 0,00106848376791193 39115 42094 667 665 0 True 612 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 656 369 0,000898154722135385 0,000907234898874561 0,000488288700694286 0,000518806744487678 0,00101825415266839 0,000968616236796794 39260 39538 667 665 0 True 656 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 258 417 0,000897788688626618 0,000889245315164772 0,000732433051041428 0,000701915007248035 0,000775904230263753 0,000784972738886674 39244 38754 667 665 0 True 258 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 302 416 0,000915312542858806 0,000955467175606675 0,000793469138628214 0,00080872816052491 0,000719425313177756 0,000733231710800756 40010 41640 667 665 0 True 302 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 346 416 0,000886647543703543 0,000923939512319366 0,000778210116731518 0,00080872816052491 0,00068692701075932 0,000683536815669578 38757 40266 667 665 0 True 346 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 390 415 0,00087907522549094 0,0009102867032539 0,000717174029144732 0,000732433051041428 0,000748267432411393 0,000780227896420173 38426 39671 667 665 0 True 391 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 435 414 0,000871640169844123 0,000970267279551591 0,000610360875867857 0,000732433051041428 0,000821574760498217 0,00084502624675798 38101 42285 667 665 0 True 435 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 479 414 0,000867751063813481 0,00099947740718241 0,000610360875867857 0,000778210116731518 0,000834119676875714 0,000826742086754851 37931 43558 667 665 0 True 479 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 523 414 0,00086221480699339 0,000922241515897778 0,000595101853971161 0,000671396963454643 0,00082844605052808 0,000869966467220878 37689 40192 667 665 0 True 523 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 566 414 0,000882575420918518 0,000815543092108849 0,000595101853971161 0,000549324788281071 0,000893571124062185 0,000779998596319592 38579 35542 667 665 0 True 568 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 611 413 0,000894608772519211 0,000927610855933608 0,000503547722590982 0,000534065766384375 0,000976053194741665 0,000968529660134412 39105 40426 667 665 0 True 612 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 655 413 0,000885091901291286 0,000919809250753343 0,000473029678797589 0,000549324788281071 0,000980285919317643 0,000946745260856203 38689 40086 667 665 0 True 656 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 258 461 0,00084601782423048 0,00089371976519463 0,000656137941557946 0,000701915007248035 0,000768206312859672 0,000791811993708038 36981 38949 667 665 0 True 258 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 302 460 0,000862352069559178 0,000836332075324498 0,000701915007248035 0,000717174029144732 0,000746824951872375 0,000744979946914243 37695 36448 667 665 0 True 302 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 346 460 0,000910119442453184 0,00092967598671662 0,000747692072938125 0,00080872816052491 0,000775031286471618 0,000771441422973914 39783 40516 667 665 0 True 346 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 390 460 0,000862397823747774 0,000920474681783424 0,000671396963454643 0,000793469138628214 0,000771237148246112 0,0007331945280153 37697 40115 667 665 0 True 391 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 435 459 0,000902478492957687 0,000969923091087756 0,000579842832074464 0,000549324788281071 0,000904892664852905 0,00107924696137009 39449 42270 667 665 0 True 435 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 479 458 0,000951778631169652 0,00103843954128856 0,000595101853971161 0,000732433051041428 0,000972079970865068 0,0010542588358376 41604 45256 667 665 0 True 479 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 523 458 0,000880081817640047 0,000910584999922558 0,000549324788281071 0,000610360875867857 0,00094764909632731 0,000906515771436799 38470 39684 667 665 0 True 523 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 567 458 0,000831788271577189 0,000925086807198816 0,000457770656900893 0,000595101853971161 0,000926448326503475 0,000987035955972171 36359 40316 667 665 0 True 568 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 612 458 0,00084427916506384 0,000852990796974124 0,000503547722590982 0,000488288700694286 0,000873926036875683 0,000922797394744735 36905 37174 667 665 0 True 612 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 655 457 0,000879418381905408 0,000924375484373557 0,000473029678797589 0,000518806744487678 0,000934756417976516 0,00101510545117571 38441 40285 667 665 0 True 656 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 259 505 0,000944320698428538 0,000900190508314733 0,000747692072938125 0,000747692072938125 0,000773326083054476 0,000771543669405529 41278 39231 667 665 0 True 258 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 303 504 0,000905475392310711 0,000916390312012579 0,000747692072938125 0,000823987182421607 0,000783939418790362 0,000753404836201431 39580 39937 667 665 0 True 302 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 347 504 0,000882895700238688 0,000968798742105894 0,000747692072938125 0,000823987182421607 0,000780694155762681 0,000822618680087272 38593 42221 667 665 0 True 346 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 391 504 0,000927300140270904 0,000964852047720583 0,000717174029144732 0,000747692072938125 0,000834788912508531 0,000808224349118989 40534 42049 667 665 0 True 391 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 435 503 0,00104395044409587 0,000928368070554046 0,000778210116731518 0,000518806744487678 0,000986014708557979 0,000983410216710873 45633 40459 667 665 0 True 435 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 481 502 0,000960975223077406 0,00088461024385179 0,000595101853971161 0,000595101853971161 0,000973188690113542 0,000841549838184642 42006 38552 667 665 0 True 479 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 524 502 0,00091842382768332 0,000884082488207243 0,000610360875867857 0,000671396963454643 0,000871700865193548 0,000808236508260115 40146 38529 667 665 0 True 523 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 568 502 0,000823964305327309 0,000920268168705123 0,000473029678797589 0,000625619897764553 0,000889287659915623 0,000917768599054411 36017 40106 667 665 0 True 568 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 612 501 0,000830003858221953 0,000883233489996449 0,000503547722590982 0,000488288700694286 0,00083774376818797 0,000944748840767642 36281 38492 667 665 0 True 612 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 657 501 0,000925630112387157 0,00091916676562085 0,000473029678797589 0,000656137941557946 0,00108706374176363 0,000956230861892092 40461 40058 667 665 0 True 656 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 260 549 0,000883810784010604 0,000884013650514476 0,000686655985351339 0,000747692072938125 0,000775470312179234 0,000698909415962113 38633 38526 667 665 0 True 258 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 303 548 0,000828608355469782 0,00082951714374056 0,000686655985351339 0,000701915007248035 0,000733312534432923 0,000668839795452241 36220 36151 667 665 0 True 302 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 347 548 0,00089918419137879 0,000995140632538086 0,000778210116731518 0,000915541313801785 0,000748870375992015 0,000712855944237776 39305 43369 667 665 0 True 346 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 392 548 0,000894585895424913 0,000897414054706462 0,000717174029144732 0,000747692072938125 0,000781074137690974 0,00074145013939483 39104 39110 667 665 0 True 391 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 436 548 0,000957863938252892 0,000820201109319419 0,000534065766384375 0,000335698481727321 0,00100879537575263 0,000990573428885821 41870 35745 667 665 0 True 435 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 480 547 0,00080177352385835 0,000851040395679058 0,000396734569314107 0,000366216525520714 0,000924731329837397 0,00105077897955352 35047 37089 667 665 0 True 479 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 524 546 0,000877267935041406 0,000837181073535292 0,000503547722590982 0,0004272526131075 0,000920826814058228 0,000951492264896523 38347 36485 667 665 0 True 523 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 569 546 0,000833366791083744 0,000898492511893146 0,000503547722590982 0,000610360875867857 0,000823357816890887 0,000856584800559643 36428 39157 667 665 0 True 568 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 613 546 0,000903439330918198 0,000904137202700044 0,000625619897764553 0,00064087891966125 0,000888677529801007 0,000829334826289128 39491 39403 667 665 0 True 612 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 656 546 0,000878777823265067 0,000930754443903304 0,000610360875867857 0,000579842832074464 0,000885561361537769 0,0009491165837546 38413 40563 667 665 0 True 656 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 259 592 0,00075709455869456 0,000908083897085355 0,000625619897764553 0,000823987182421607 0,00061647666631184 0,000628019902769068 33094 39575 667 665 0 True 258 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 303 592 0,000903896872804156 0,000903379988079606 0,000762951094834821 0,000762951094834821 0,000760118358211413 0,000730936595649899 39511 39370 667 665 0 True 302 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 347 592 0,000913345112749187 0,00091333850763324 0,000762951094834821 0,000762951094834821 0,00071987020633379 0,000764975024440347 39924 39804 667 665 0 True 346 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 392 592 0,000902753018089262 0,000809255916169458 0,000762951094834821 0,000686655985351339 0,000717873511182452 0,000630129361459109 39461 35268 667 665 0 True 391 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 436 592 0,00094647114529254 0,000928184503373334 0,000579842832074464 0,000534065766384375 0,00097160102085658 0,00100918699209688 41372 40451 667 665 0 True 435 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 480 591 0,000795436568737833 0,00085636384391971 0,000457770656900893 0,000488288700694286 0,000903116125385935 0,000938585209941987 34770 37321 667 665 0 True 479 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 525 590 0,000826435031511482 0,000809829563609183 0,000442511635004196 0,000335698481727321 0,000937846594304581 0,000973201123790712 36125 35293 667 665 0 True 523 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 569 590 0,000892092292146442 0,00090142958678454 0,000564583810177768 0,000488288700694286 0,000912399444604789 0,000992393894398531 38995 39285 667 665 0 True 568 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 613 590 0,000942513407979004 0,000951084509167173 0,000747692072938125 0,000778210116731518 0,000785039239297322 0,000757760255994403 41199 41449 667 665 0 True 612 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 657 589 0,000871388521806847 0,000875408938918594 0,000625619897764553 0,000595101853971161 0,000792033058603466 0,000832941184925346 38090 38151 667 665 0 True 656 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 258 629 0,000811313272180573 0,000869856031702052 0,000656137941557946 0,000686655985351339 0,000660556130105132 0,00071108681123467 35464 37909 667 665 0 False 258 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 302 629 0,000885526566082946 0,000867745009123863 0,000762951094834821 0,000762951094834821 0,000684653677657884 0,00063047492335124 38708 37817 667 665 0 False 302 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 348 636 0,000898154722135385 0,000933760356487465 0,000793469138628214 0,000854505226215 0,000664416971199432 0,000657753631661018 39260 40694 667 665 0 True 346 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 392 636 0,000905589777782201 0,000851751718504318 0,000793469138628214 0,000717174029144732 0,000680212619341579 0,000645617850080942 39585 37120 667 665 0 True 391 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 435 629 0,00101784767950197 0,000903884797826565 0,000762951094834821 0,000625619897764553 0,000933602091284254 0,000891527857271601 44492 39392 667 665 0 False 435 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 479 629 0,000868345868265227 0,000810334373356142 0,000534065766384375 0,000442511635004196 0,000949068120592702 0,000848672350621258 37957 35315 667 665 0 False 479 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 523 629 0,000862397823747774 0,000864739096539701 0,000473029678797589 0,000442511635004196 0,000940039868850589 0,000946086536656637 37697 37686 667 665 0 False 523 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 568 629 0,000875689415534851 0,00089674862367638 0,000625619897764553 0,000732433051041428 0,000852503674997027 0,000812870615225994 38278 39081 667 665 0 False 568 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 612 629 0,00089179488992057 0,000930089012873222 0,000717174029144732 0,000793469138628214 0,000690760487107403 0,000700554282267879 38982 40534 667 665 0 False 612 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 656 629 0,00092940483294631 0,000899525077284651 0,000778210116731518 0,000732433051041428 0,000712957706491448 0,000733332972269458 40626 39202 667 665 0 False 656 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 260 679 0,000978316060555211 0,0685103465920466 0,000885023270008392 0,0683756771190967 0,000699014899584454 0,0199450745704416 42764 2985734 667 665 0 True 258 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 302 672 0,000959419580665149 0,000937500537794475 0,00080872816052491 0,000823987182421607 0,00069569638935945 0,000670722271499665 41938 40857 667 665 0 False 302 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 346 672 0,000907763101740501 0,000939221480113651 0,000793469138628214 0,00080872816052491 0,000660833208142954 0,000693920336121831 39680 40932 667 665 0 False 346 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 391 672 0,000873493214482253 0,000850925666191113 0,000717174029144732 0,000732433051041428 0,00067577745836879 0,000634752972598589 38182 37084 667 665 0 False 391 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 435 672 0,000895729750139808 0,000948904648896216 0,000671396963454643 0,000793469138628214 0,00078433382240086 0,00077441883030385 39154 41354 667 665 0 False 435 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 479 672 0,000879738661225579 0,000941125989613539 0,000610360875867857 0,000747692072938125 0,000835070520964853 0,000777884866863522 38455 41015 667 665 0 False 479 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 523 672 0,000829592070524591 0,000947229598372218 0,000518806744487678 0,000656137941557946 0,000851658620121478 0,000868669016825827 36263 41281 667 665 0 False 523 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 568 672 0,0009132078501834 0,000892182390056166 0,000747692072938125 0,000701915007248035 0,000807764461059799 0,000734747317253159 39918 38882 667 665 0 False 568 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 612 672 0,000927071369327925 0,00090351766346514 0,000793469138628214 0,000717174029144732 0,000671957521486208 0,000716781425699313 40524 39376 667 665 0 False 612 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 659 677 0,00104658130994013 0,0682042024264139 0,000946059357595178 0,0669871061264973 0,000788643592423234 0,0201057928351894 45748 2972392 667 665 0 True 656 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E2_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E2_1.csv new file mode 100755 index 0000000..34cd857 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E2_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 280 263 0,0106366159457269 0,0460566385063138 0,0105592431525139 0,0470588235294118 0,0014906509033986 0,00989357521653422 434275 2007184 623 665 0 True 280 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 325 264 0,0104122862803146 0,0102446778424661 0,010406652933547 0,0102998397802701 0,0012767367590558 0,00135671916936509 425116 446471 623 665 0 False 325 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 370 264 0,0104454495478076 0,0653794247578204 0,0103913939116503 0,0660257877470054 0,00123488712762155 0,0113484019789391 426470 2849286 623 665 0 True 369 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 414 264 0,0107002972570132 0,0894853521994503 0,0107423514152743 0,0896620126649882 0,00150209423185342 0,0123775030171098 436875 3899841 623 665 0 True 413 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 457 262 0,0106439637893368 0,0787743448802826 0,0106355382619974 0,0779125658045319 0,00163059786582086 0,0176313469706792 434575 3433047 623 665 0 True 457 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 500 263 0,0105886835125779 0,0746008073514067 0,0105287251087205 0,076600289921416 0,00170326322644484 0,024563046662536 432318 3251161 623 665 0 True 502 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 546 263 0,0103259246250855 0,0870437480746958 0,0103913939116503 0,081879911497673 0,0016156451974569 0,0270880799864037 421590 3793434 623 665 0 True 546 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 590 264 0,010439865186664 0,0736572720425463 0,0105134660868238 0,0698710612649729 0,00188779935425531 0,0201825965232748 426242 3210041 623 665 0 True 590 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 634 264 0,0103006725358792 0,0100333002338761 0,0104371709773404 0,00996414129854276 0,00197889534207332 0,00177140453044862 420559 437259 623 665 0 False 634 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 677 264 0,0105118495612296 0,0454888881622688 0,0106202792401007 0,0457618066681926 0,00174019450961979 0,00904767734844415 429181 1982441 623 665 0 True 679 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 280 307 0,0106748247324987 0,0106246848524378 0,0105592431525139 0,0105439841306172 0,00161092809099225 0,0015429592080666 435835 463032 623 665 0 False 280 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 325 307 0,0103917123182067 0,0104352205760453 0,0104371709773404 0,0105439841306172 0,00133525412364212 0,00129193168320938 424276 454775 623 665 0 False 325 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 369 309 0,0108268516167889 0,127643760350751 0,0107728694590677 0,129808499275196 0,00137744569638468 0,0337509110511486 442042 5562814 623 665 0 True 369 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 414 309 0,010708943219661 0,0569727592040298 0,0106813153276875 0,0560616464484627 0,0015423146884312 0,00892705394126735 437228 2482917 623 665 0 True 413 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 457 307 0,0108730450602835 0,086325403804774 0,0108033875028611 0,0859540703440909 0,00216760828389275 0,0184482446181505 443928 3762128 623 665 0 True 457 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 503 309 0,0105568673497467 0,0450712269343535 0,0106355382619974 0,0462653543907836 0,0016490843202142 0,00880522597895302 431019 1964239 623 665 0 True 502 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 545 308 0,0107666972704353 0,048399552325538 0,0105287251087205 0,0510719462882429 0,0023981508632145 0,0117768593653722 439586 2109290 623 665 0 True 546 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 591 309 0,0102745631982518 0,054056932213803 0,0103303578240635 0,0556801709010452 0,0020595863309636 0,0108963694006693 419493 2355843 623 665 0 True 590 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 634 308 0,0101318680753463 0,0100619596599647 0,0100251773861295 0,0100709544518196 0,0019947491269951 0,00194965554931023 413667 438508 623 665 0 False 634 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 678 308 0,0100104082204735 0,010143234029225 0,0100251773861295 0,0101167315175097 0,00185140071836869 0,00194236633430536 408708 442050 623 665 0 False 678 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 281 353 0,0107066653881419 0,0565075999681052 0,0105897611963073 0,0557106889448386 0,0015026229379445 0,0130790489975306 437135 2462645 623 665 0 True 280 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 325 353 0,0106022035448202 0,0668530103009871 0,0105897611963073 0,0712596322575723 0,00148152090612115 0,0183949938573118 432870 2913506 623 665 0 True 324 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 369 352 0,0106336768082829 0,0425740707915359 0,0106813153276875 0,0434882124055848 0,0014168908459807 0,00829926149435513 434155 1855411 623 665 0 True 369 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 414 353 0,0105048201241761 0,0382976438578708 0,0105287251087205 0,0386816205081254 0,00157141409063846 0,00579731899586563 428894 1669041 623 665 0 True 413 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 459 353 0,0107649582807809 0,0797057188634209 0,0107118333714809 0,0757610437170977 0,00167508662763078 0,0150971710748208 439515 3473637 623 665 0 True 457 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 503 353 0,010530513083999 0,0358144158748898 0,0105287251087205 0,0364385442893111 0,00166170755384847 0,00575544071610485 429943 1560820 623 665 0 True 501 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 547 352 0,0104679339492541 0,0318970463466976 0,0104829480430304 0,0317235065232319 0,00161109321597034 0,00513512008146953 427388 1390098 623 665 0 True 546 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 591 352 0,0104540220320192 0,0538212319537686 0,0104676890211337 0,0537117570763714 0,00195573500620022 0,00983554838532566 426820 2345571 623 665 0 True 590 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 635 352 0,0102499724149704 0,0581027987684937 0,0103303578240635 0,0592355230029755 0,00193170669247856 0,0121290139653885 418489 2532165 623 665 0 True 634 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 679 352 0,0101668927965538 0,0661759227549304 0,0100862134737163 0,0660105287251087 0,00195038223573407 0,0182695263204798 415097 2883998 623 665 0 True 678 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 281 397 0,0102623167922352 0,0479196388774637 0,0103150988021668 0,0495002670328832 0,00144102202730012 0,0128601019871317 418993 2088375 623 665 0 True 280 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 327 397 0,0105037179476346 0,0346558775056203 0,0105439841306172 0,0345464255741207 0,001405715458944 0,00541510961695877 428849 1510330 623 665 0 True 324 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 370 397 0,0107859486206934 0,094674543993309 0,0107881284809644 0,0893110551613642 0,00148426081369634 0,022185626314889 440372 4125990 623 665 0 True 369 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 414 396 0,0107549652134714 0,0726596073612734 0,0107270923933776 0,0704661631189441 0,00159333183173016 0,0199713996946563 439107 3166562 623 665 0 True 413 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 459 396 0,0106936352121402 0,0483660742609557 0,0107270923933776 0,0479896238651102 0,00172452369162944 0,0105122615060291 436603 2107831 623 665 0 True 457 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 503 397 0,0108267291527287 0,0574045551048599 0,010757610437171 0,0563668268863966 0,00181416723913433 0,0117450225495409 442037 2501735 623 665 0 True 501 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 547 396 0,0107461722939515 0,0434959451730723 0,0108033875028611 0,0445410849164569 0,00173686780289237 0,00523242746707808 438748 1895587 623 665 0 True 546 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 591 397 0,0105182911707944 0,0519395536219813 0,0105897611963073 0,0517586022735943 0,00186273369195654 0,00921441978537428 429444 2263566 623 665 0 True 590 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 635 396 0,0103841440392884 0,0434023259109091 0,0105439841306172 0,0431372549019608 0,00184111854412775 0,00862292119994173 423967 1891507 623 665 0 True 634 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 679 396 0,010189205748316 0,0834600118974479 0,0102082856488899 0,0790722514686809 0,00179028572255368 0,016667637108579 416008 3637252 623 665 0 True 678 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 282 441 0,0101511194256044 0,0446434695114991 0,0102082856488899 0,0454413672083619 0,00147860792939797 0,0065290011216781 414453 1945597 623 665 0 True 280 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 326 440 0,0106709548681974 0,0707107434413454 0,0106660563057908 0,0685435263599603 0,00145908123841141 0,0159956213674683 435677 3081629 623 665 0 True 324 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 371 441 0,0105302926486907 0,0368493446938472 0,0105745021744106 0,0375371938658732 0,00163485836524622 0,00436909290492863 429934 1605923 623 665 0 True 369 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 415 441 0,0107581982646598 0,0584083004489939 0,0108033875028611 0,0562142366674296 0,00162608149044327 0,0124804355983262 439239 2545479 623 665 0 True 413 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 458 440 0,0108794621770362 0,100462807281422 0,0109254596780346 0,0991989013504234 0,00187684335173621 0,0158772685295466 444190 4378247 623 665 0 True 457 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 503 441 0,0110598027520369 0,0676320005782366 0,0110627908751049 0,0654306858930343 0,0018273011259733 0,0179707739057526 451553 2947455 623 665 0 True 501 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 547 440 0,0106530261297891 0,0559405609468854 0,0106813153276875 0,0553139543755245 0,00178080395960815 0,00937660204006907 434945 2437933 623 665 0 True 546 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 591 441 0,0106310560773953 0,0324210847558356 0,0105592431525139 0,0327153429465171 0,00204536165897178 0,00475444725259467 434048 1412936 623 665 0 True 590 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 636 440 0,0104020972705088 0,0393992075634268 0,0103761348897536 0,0397650110627909 0,00192824680433741 0,0056911491717395 424700 1717048 623 665 0 True 634 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 679 439 0,0103910510122818 0,0674468271846932 0,010452429999237 0,0669871061264973 0,00185988153473241 0,0103779667577909 424249 2939385 623 665 0 True 678 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 281 485 0,0104580633460047 0,0580471320209427 0,0104982070649271 0,059311818112459 0,00152866872740917 0,0164550621248868 426985 2529739 623 665 0 True 280 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 326 485 0,0104377832976412 0,0602607686531504 0,0104676890211337 0,0589913786526284 0,00156740992359046 0,00805910018681078 426157 2626211 623 665 0 True 324 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 369 484 0,0106925330355987 0,0722070913149204 0,0107728694590677 0,0697947661554894 0,00166066711064493 0,0210941652784166 436558 3146841 623 665 0 True 369 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 413 484 0,0109144134198077 0,0948451696877809 0,0109254596780346 0,0895857175555047 0,00183178875328363 0,0291273734708066 445617 4133426 623 665 0 True 413 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 458 484 0,0109418453692849 0,10061443377269 0,0108644235904479 0,0977035172045472 0,00207156121875932 0,0316494172567373 446737 4384855 623 665 0 True 457 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 502 484 0,0106439882821489 0,0476614286918945 0,0105897611963073 0,0492408636606394 0,00186343531777702 0,00779077438721035 434576 2077122 623 665 0 True 501 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 547 484 0,0106060244234974 0,0427282672233341 0,010605020218204 0,0440680552376593 0,00180543914367298 0,00625525983773476 433026 1862131 623 665 0 True 546 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 590 484 0,0105310029402396 0,10283823543753 0,0105745021744106 0,0996108949416342 0,00194241090251327 0,0198680775868926 429963 4481770 623 665 0 True 590 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 635 485 0,0102355951343069 0,0633450644234757 0,0102388036926833 0,0663767452506294 0,00184543989688068 0,0192022992001724 417902 2760627 623 665 0 True 634 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 678 484 0,0101918264792036 0,0753820922184151 0,0101472495613031 0,0729228656443122 0,00192086148822623 0,0144782898425362 416115 3285210 623 665 0 True 678 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 281 529 0,0102293984528625 0,0601429185231332 0,0101625085831998 0,0633249408712901 0,00155989616990806 0,0168568754917636 417649 2621075 623 665 0 True 280 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 325 528 0,0103877199898453 0,112848199693558 0,0103608758678569 0,111863889524681 0,00156468238341572 0,0328570031685056 424113 4918012 623 665 0 True 324 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 369 528 0,0106684810941821 0,0578876121409039 0,0106813153276875 0,0608987563897154 0,00151179441922116 0,0144556358865484 435576 2522787 623 665 0 True 368 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 414 529 0,0109137766066948 0,0581310451684258 0,0108949416342412 0,0584115358205539 0,00176668971932882 0,00673198373302467 445591 2533396 623 665 0 True 413 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 458 528 0,0108922474249176 0,0571326232725324 0,0109712367437247 0,05810635538262 0,0019919269508788 0,00770118140973707 444712 2489884 623 665 0 True 457 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 503 529 0,010534235991428 0,0599124728736467 0,0104829480430304 0,0601968413824674 0,00187852394293863 0,0111003732948093 430095 2611032 623 665 0 True 501 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 546 528 0,0105244388666147 0,0727715374497126 0,0104829480430304 0,070923933775845 0,00179720820720566 0,0170923262644523 429695 3171440 623 665 0 True 545 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 591 529 0,0103408652404257 0,0599271353022061 0,0103913939116503 0,0596932936598764 0,00170586302581433 0,0153513989088683 422200 2611671 623 665 0 True 590 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 635 528 0,0102212423464555 0,0448397716653731 0,0102235446707866 0,0443884946974899 0,00193358031973918 0,00599575353655478 417316 1954152 623 665 0 True 634 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 679 528 0,0103417469816589 0,0753244750695691 0,0103608758678569 0,0721141374837873 0,00187882793605027 0,0214265212098038 422236 3282699 623 665 0 True 678 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 281 573 0,00994346936518673 0,047754979116365 0,00994888227664607 0,0490424963759823 0,00138245985802947 0,0118091698043782 405975 2081199 623 665 0 True 280 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 326 573 0,010310126761324 0,0547357636480765 0,0102693217364767 0,0550698100251774 0,00149225339315667 0,0127795996911528 420945 2385427 623 665 0 True 324 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 369 572 0,0104530668123499 0,049593794511456 0,0104371709773404 0,0501869230182345 0,00147622916373055 0,0108213726956499 426781 2161336 623 665 0 True 368 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 415 573 0,0106228999709883 0,0496296818952852 0,0106202792401007 0,0488899061570153 0,00159415415441579 0,00533325838703046 433715 2162900 623 665 0 True 413 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 458 571 0,0107519281047793 0,0860008570292749 0,0107423514152743 0,082383459220264 0,00194417530362239 0,0233151545206911 438983 3747984 623 665 0 True 457 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 502 573 0,0105496664630089 0,0608821206139634 0,0105897611963073 0,0604257267109178 0,00191043674894559 0,0126657162375329 430725 2653290 623 665 0 True 501 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 546 572 0,0102712566686273 0,0539307986147562 0,0102998397802701 0,0539101243610285 0,00186135321554813 0,00910655975038181 419358 2350346 623 665 0 True 545 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 590 572 0,0101913121301509 0,0363074773222826 0,0101625085831998 0,0382391088731212 0,00173909360150599 0,0079391387962239 416094 1582308 623 665 0 True 590 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 635 572 0,0100384524902516 0,0491200535098332 0,0100251773861295 0,0490119783321889 0,00164945284848244 0,00743648181391738 409853 2140690 623 665 0 True 634 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 679 572 0,0100916508779877 0,0551691198699426 0,0100709544518196 0,054337376974136 0,00166890289826943 0,00872997779933045 412025 2404313 623 665 0 True 678 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 280 611 0,0100928020401533 0,00993360030885178 0,0100099183642329 0,00996414129854276 0,0018697770519057 0,00144545977510318 412072 432914 623 665 0 False 280 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 324 611 0,0100079099536461 0,00994642706560404 0,00987258716716258 0,00999465934233616 0,00171634117482326 0,00141293418046934 408606 433473 623 665 0 False 324 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 370 617 0,0101573405998608 0,073931200167964 0,0101777676050965 0,0710154879072251 0,00142174790519031 0,0123316336092101 414707 3221979 623 665 0 True 368 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 414 616 0,0104116984528258 0,0731769455683154 0,010406652933547 0,070923933775845 0,00165962035497217 0,0210735575563687 425092 3189108 623 665 0 True 413 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 457 611 0,0104306313965275 0,0103480491111046 0,0104676890211337 0,0102388036926833 0,00196803268450117 0,00196966265510593 425865 450976 623 665 0 False 457 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 501 611 0,0100669621234582 0,0101437847307672 0,0100251773861295 0,010101472495613 0,00184586320373591 0,00202494749716375 411017 442074 623 665 0 False 501 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 545 611 0,00984936798135509 0,00976944535749995 0,0098268101014725 0,00976577401388571 0,00191525544927672 0,00203253822852016 402133 425760 623 665 0 False 545 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 590 611 0,00995698939742906 0,00997412276399399 0,00993362325474937 0,00987258716716258 0,00154435048174248 0,00185695797241736 406527 434680 623 665 0 False 590 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 634 611 0,00983702360409035 0,0100185919135215 0,00987258716716258 0,0100556954299229 0,00145238742692989 0,00147240821234804 401629 436618 623 665 0 False 634 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 678 611 0,00992813686485393 0,0100710691813076 0,00997940032043946 0,0101472495613031 0,00154496968031846 0,00162845750479043 405349 438905 623 665 0 False 678 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 280 654 0,0118334572057302 0,0337163118370428 0,010101472495613 0,0400244144350347 0,00656839854014795 0,017454917420498 483140 1469383 623 665 0 False 280 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 324 654 0,00973194944046783 0,00955471764786193 0,00965896086060884 0,00959792477302205 0,00121805029790821 0,00127412542741062 397339 416402 623 665 0 False 324 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 368 654 0,0105454047137152 0,00985696101090446 0,00965896086060884 0,0097962920576791 0,00522607114618051 0,00139463521306874 430551 429574 623 665 0 False 368 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 413 654 0,0104123842515627 0,00978243273553534 0,00984206912336919 0,0098268101014725 0,00355399365339053 0,00135750218772808 425120 426326 623 665 0 False 413 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 457 654 0,0098334476535335 0,0101286404383584 0,00984206912336919 0,0102082856488899 0,00164077739314826 0,00157525685389604 401483 441414 623 665 0 False 457 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 501 654 0,00969239354903418 0,00994394890866443 0,00965896086060884 0,00990310521095598 0,0016891530365562 0,00167016759067532 395724 433365 623 665 0 False 501 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 545 654 0,00983895853624097 0,0097565956548501 0,00990310521095598 0,0098115510795758 0,00172467389542636 0,0017245294133249 401708 425200 623 665 0 False 545 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 590 654 0,0097609734227272 0,00985512533909734 0,00975051499198901 0,00985732814526589 0,00138228652220607 0,00128607425341033 398524 429494 623 665 0 False 590 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 634 655 0,00986808048974847 0,0100460122611404 0,00991836423285267 0,0100709544518196 0,00136083658765854 0,00130561563791978 402897 437813 623 665 0 False 634 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 679 661 0,0101845276212177 0,043905988362988 0,0101472495613031 0,0444953078507668 0,00138242162087639 0,00824612124482398 415817 1913457 623 665 0 True 678 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E2_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E2_2.csv new file mode 100755 index 0000000..f9fb0ae --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E2_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 280 263 0,00851142363122838 0,715471718894398 0,00831616693369955 0,736705577172503 0,00206949974312913 0,208835793330819 347507 31180812 623 665 11 True 280 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 325 264 0,0069360214684396 0,00683705142921391 0,0068055237659266 0,0068207827878233 0,00137427556829463 0,00133567448302785 283186 297964 623 665 0 False 325 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 370 264 0,00641510834211707 0,00670173947113148 0,00646982528419928 0,00672922865644312 0,00118947202023049 0,00115984171571806 261918 292067 623 665 0 True 369 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 414 264 0,0065962816727268 0,00670951813041416 0,00656137941557946 0,00666819256885634 0,001416932896058 0,00132912597544581 269315 292406 623 665 0 True 413 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 457 262 0,00676572294637262 0,00667335539581387 0,00683604180972 0,00663767452506294 0,00158433996346617 0,00149722814851558 276233 290830 623 665 0 True 457 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 500 263 0,00722988622721418 0,00714845020539447 0,0072480354009308 0,00720225833524071 0,00160951195962712 0,00147692399653938 295184 311535 623 665 0 True 502 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 546 263 0,00747613695939618 0,00727970073960364 0,00753795681696803 0,00721751735713741 0,00152883390077453 0,00142857387155746 305238 317255 623 665 0 True 546 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 590 264 0,00746957288577128 0,00727609823368217 0,00747692072938125 0,00732433051041428 0,00185172450256292 0,00185761338689148 304970 317098 623 665 0 True 590 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 634 264 0,00821682408809281 0,00762198469393901 0,00827038986800946 0,00756847486076143 0,00192433706036733 0,00183048538420812 335479 332172 623 665 0 False 634 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 677 264 0,00935199244739648 0,71530600362201 0,00929274433508812 0,728419928282597 0,00195080920702402 0,191135907705294 381826 31173590 623 665 10 True 679 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 280 307 0,00725312990583371 0,00722313910204672 0,0072480354009308 0,0072327763790341 0,00144307411995833 0,00144994878123849 296133 314790 623 665 0 False 280 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 325 307 0,00664827991267333 0,00647636486501215 0,00672922865644312 0,00648508430609598 0,00123665082640484 0,0011516194308331 271438 282245 623 665 0 False 325 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 369 309 0,00660945880560067 0,00669343305620426 0,00666819256885634 0,00662241550316625 0,00129437482732359 0,00123258627393547 269853 291705 623 665 0 True 369 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 414 309 0,00681179392580711 0,00689588471063215 0,00679026474402991 0,00685130083161669 0,00148222418531221 0,0014866645624209 278114 300528 623 665 0 True 413 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 457 307 0,0071463657381809 0,00733103071251028 0,00714122224765393 0,00729381246662089 0,00184695510401595 0,00188452316139885 291774 319492 623 665 0 True 457 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 503 309 0,00722572244916854 0,00740220888683141 0,00721751735713741 0,00747692072938125 0,00158619187917094 0,00150369204893166 295014 322594 623 665 0 True 502 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 545 308 0,00740892868317703 0,00734404103644325 0,00711070420386053 0,00746166170748455 0,00232726171612347 0,00137827631787652 302494 320059 623 665 0 True 546 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 591 309 0,00745409342856629 0,00766879432502061 0,00756847486076143 0,00770580605783169 0,00178818948442506 0,00200331092636371 304338 334212 623 665 0 True 590 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 634 308 0,0075878486750797 0,00761613349005381 0,00756847486076143 0,00762951094834821 0,00199357400850111 0,00202484419652159 309799 331917 623 665 0 False 634 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 678 308 0,00768856311816031 0,00775816859612983 0,0076752880140383 0,00773632410162509 0,00194714467030967 0,00185997580056441 313911 338107 623 665 0 False 678 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 281 353 0,00649862883115035 0,00643981205015285 0,00656137941557946 0,00648508430609598 0,0013420623019269 0,00136745199598519 265328 280652 623 665 0 True 280 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 325 353 0,00654014414754666 0,00664655458742989 0,00660715648126955 0,00671396963454643 0,0013380004269364 0,00132089389043027 267023 289662 623 665 0 True 324 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 369 352 0,00683702152220133 0,00686690404197723 0,00679026474402991 0,00683604180972 0,00124828483756788 0,00125287860708048 279144 299265 623 665 0 True 369 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 414 353 0,0071830804634187 0,00733603291818468 0,00721751735713741 0,00733958953231098 0,00147638738544222 0,0015273866261776 293273 319710 623 665 0 True 413 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 459 353 0,00741828493737372 0,00751409308347546 0,00741588464179446 0,00746166170748455 0,00171264994678732 0,00166022818358387 302876 327470 623 665 0 True 457 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 503 353 0,00741304347559861 0,00744745819687695 0,00741588464179446 0,00744640268558785 0,00162625906854048 0,00169026065826244 302662 324566 623 665 0 True 501 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 547 352 0,00741492942212517 0,00735218683008735 0,00741588464179446 0,00732433051041428 0,00160233276883621 0,00161151734128458 302739 320414 623 665 0 True 546 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 591 352 0,00749688237118832 0,00751365711142126 0,00752269779507134 0,00764476997024491 0,00191851666056061 0,00201728452131422 306085 327451 623 665 0 True 590 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 635 352 0,00727654503413747 0,00733256808764874 0,0072632944228275 0,00737010757610437 0,00195124411840588 0,00201297188520402 297089 319559 623 665 0 True 634 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 679 352 0,00669719205830367 0,00675593768123674 0,00669871061264973 0,0068207827878233 0,00172610403196113 0,00183538361901835 273435 294429 623 665 0 True 678 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 281 397 0,0064440343531283 0,00632806552889434 0,00645456626230259 0,00630197604333562 0,00146362910230967 0,00136499451672054 263099 275782 623 665 0 True 280 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 327 397 0,00663760104662684 0,00663689436454492 0,00659189745937285 0,00668345159075303 0,00133052079422502 0,00134757358533453 271002 289241 623 665 0 True 324 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 370 397 0,00694057713147778 0,00716221774394788 0,00689707789730678 0,00718699931334401 0,00131772349921139 0,00136293487490015 283372 312135 623 665 0 True 369 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 414 396 0,00739026516040771 0,00726359271949615 0,00743114366369116 0,00735484855420768 0,0015297747076376 0,00148396084128145 301732 316553 623 665 0 True 413 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 459 396 0,00759122868314029 0,00737325116407407 0,00749217975127794 0,00733958953231098 0,00158524780870918 0,00161849491462823 309937 321332 623 665 0 True 457 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 503 397 0,00762914355616771 0,00753889759876918 0,00772106507972839 0,00750743877317464 0,00167348268072947 0,00175097670290506 311485 328551 623 665 0 True 501 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 547 396 0,00749678439994019 0,00749995841056062 0,00753795681696803 0,00750743877317464 0,00154481216864097 0,0014734103039096 306081 326854 623 665 0 True 546 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 591 397 0,00716069403322034 0,00699207391332531 0,0072480354009308 0,00697337300679027 0,00190101520964931 0,00193358629953324 292359 304720 623 665 0 True 590 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 635 396 0,00651236929870099 0,00645082608099558 0,00653086137178607 0,00654612039368277 0,00178292534973479 0,00179734977889706 265889 281132 623 665 0 True 634 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 679 396 0,00626097507599201 0,00650263791775158 0,00617990386816205 0,00653086137178607 0,00170271513544128 0,00178813272539537 255625 283390 623 665 0 True 678 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 282 441 0,00644376493219594 0,00665419557132704 0,00654612039368277 0,00666819256885634 0,00143418009439809 0,00163941823973082 263088 289995 623 665 0 True 280 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 326 440 0,00656282449148942 0,00959335853940184 0,00654612039368277 0,00697337300679027 0,0014127775054609 0,0111080381151008 267949 418086 623 665 0 True 324 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 371 441 0,00703705431807664 0,00706552373150776 0,00708018616006714 0,00708018616006714 0,00133884495528955 0,00134782438592308 287311 307921 623 665 0 True 369 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 415 441 0,00735318304298942 0,0075054424800844 0,00743114366369116 0,00747692072938125 0,00159815526933924 0,00156452844212685 300218 327093 623 665 0 True 413 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 458 440 0,00742029334796044 0,00776468523104511 0,00743114366369116 0,00778210116731518 0,00175555929725794 0,00264810164438833 302958 338391 623 665 0 True 457 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 503 441 0,00757731676590542 0,00771695776405996 0,00747692072938125 0,00778210116731518 0,00173251109673833 0,00179353064632492 309369 336311 623 665 0 True 501 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 547 440 0,00717992089066641 0,00704691460856307 0,00712596322575723 0,00697337300679027 0,00176435896945496 0,00171584065794097 293144 307110 623 665 0 True 546 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 591 441 0,00664681034395133 0,00673306062134049 0,00660715648126955 0,00668345159075303 0,00186405352421051 0,00190634342838101 271378 293432 623 665 0 True 590 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 636 440 0,00630187807208749 0,00626907162619297 0,00631723506523232 0,00631723506523232 0,00181566686288402 0,00183964796785362 257295 273211 623 665 0 True 634 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 679 439 0,0062271260097621 0,00633761102229137 0,00622568093385214 0,00627145799954223 0,00175507868288539 0,00168219119821257 254243 276198 623 665 0 True 678 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 281 485 0,0066102915612098 0,00688750945801216 0,00665293354695964 0,0068055237659266 0,00153400198206658 0,00160553523788816 269887 300163 623 665 0 True 280 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 326 485 0,00657894076180728 0,00679031063582509 0,00656137941557946 0,00677500572213321 0,00148717725456888 0,00147380327478811 268607 295927 623 665 0 True 324 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 369 484 0,00695461151277282 0,00704744236420761 0,00694285496299687 0,00704966811627375 0,00151544813808459 0,00148931985156447 283945 307133 623 665 0 True 369 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 413 484 0,00704092418237789 0,00714677515487047 0,00704966811627375 0,00715648126955062 0,00166235157206906 0,00170913172680797 287469 311462 623 665 0 True 413 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 458 484 0,00718254162155397 0,00772014724382483 0,00711070420386053 0,00782787823300526 0,00185225961114106 0,00188913595056591 293251 336450 623 665 0 True 457 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 502 484 0,00687696929862751 0,0072273611472031 0,00685130083161669 0,00712596322575723 0,00177114933080063 0,00178634657526596 280775 314974 623 665 0 True 501 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 547 484 0,00663902162972477 0,00672319388537721 0,00669871061264973 0,00671396963454643 0,00176405891494273 0,00169284016984907 271060 293002 623 665 0 True 546 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 590 484 0,00642392575444903 0,00656482130021781 0,00636301213092241 0,00657663843747616 0,00182622752858063 0,00181032573357512 262278 286100 623 665 0 True 590 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 635 485 0,00614377697041305 0,00625507462866367 0,00608834973678187 0,00621042191195544 0,00181540860322672 0,0016728207581342 250840 272601 623 665 0 True 634 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 678 484 0,00630253937801239 0,0067658273630976 0,00627145799954223 0,00685130083161669 0,00179576092161026 0,00177415950156184 257322 294860 623 665 0 True 678 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 281 529 0,00664406714900361 0,00636360872425972 0,00669871061264973 0,00631723506523232 0,0013981149714348 0,00150314838321009 271266 277331 623 665 0 True 280 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 325 528 0,00659081977564339 0,00671837524688352 0,00657663843747616 0,00672922865644312 0,00131450751536254 0,00133444599187904 269092 292792 623 665 0 True 324 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 369 528 0,00672553024182611 0,00689804162500552 0,00672922865644312 0,00692759594110018 0,00135069167687523 0,00150225323279097 274592 300622 623 665 0 True 368 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 414 529 0,0070386463508588 0,00699549285206608 0,00704966811627375 0,00706492713817044 0,00166460576174316 0,00176280938134305 287376 304869 623 665 0 True 413 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 458 528 0,00686758855161879 0,00684935043032163 0,0068055237659266 0,00675974670023652 0,00183277564213051 0,00179992802747459 280392 298500 623 665 0 True 457 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 503 529 0,00658646005510148 0,00704198124058143 0,00654612039368277 0,00717174029144732 0,00177941441587155 0,00193398807899095 268914 306895 623 665 0 True 501 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 546 528 0,00655753404409025 0,00658115877930119 0,00654612039368277 0,00663767452506294 0,00158806142102822 0,00174178565695505 267733 286812 623 665 0 True 545 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 591 529 0,00664808397017706 0,00657643192439786 0,00669871061264973 0,00665293354695964 0,00165923288480791 0,00159657222250129 271430 286606 623 665 0 True 590 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 635 528 0,00640624194416104 0,0065600485535193 0,00646982528419928 0,00659189745937285 0,00175171872218009 0,00189137698628017 261556 285892 623 665 0 True 634 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 679 528 0,00632803639533897 0,00660834966794418 0,00634775310902571 0,00656137941557946 0,00175956731186343 0,00171730044196244 258363 287997 623 665 0 True 678 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 281 573 0,00667267475345842 0,00677693317753069 0,00672922865644312 0,00677500572213321 0,00138324911687517 0,00136065370789258 272434 295344 623 665 0 True 280 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 326 573 0,00670723411123729 0,00684964872699028 0,00666819256885634 0,00685130083161669 0,0013489430753983 0,00135205924856724 273845 298513 623 665 0 True 324 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 369 572 0,00683231890229095 0,006953455967683 0,00692759594110018 0,00692759594110018 0,0012788645554172 0,00124110409178336 278952 303037 623 665 0 True 368 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 415 573 0,00671727616417091 0,00689937248706568 0,00668345159075303 0,00694285496299687 0,00164492419934441 0,00160764652959917 274255 300680 623 665 0 True 413 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 458 571 0,00705348899495093 0,0070150886486071 0,00701915007248035 0,00703440909437705 0,00190571462975586 0,00178810520684653 287982 305723 623 665 0 True 457 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 502 573 0,00671862326883274 0,00706364216790546 0,00674448767833982 0,00704966811627375 0,00188119837461975 0,00224314866769344 274310 307839 623 665 0 True 501 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 546 572 0,00678250052261538 0,00675591473533915 0,00675974670023652 0,00675974670023652 0,00182923000333561 0,00165421287702952 276918 294428 623 665 0 True 545 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 590 572 0,00686932754127314 0,00656736829485019 0,00683604180972 0,00646982528419928 0,00165899201485025 0,00155567752728218 280463 286211 623 665 0 True 590 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 635 572 0,00657916119711558 0,00657767100286766 0,00659189745937285 0,00662241550316625 0,00156617120174875 0,00153982829125707 268616 286660 623 665 0 True 634 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 679 572 0,0064287753312316 0,00639366785010133 0,00625619897764553 0,0064087891966125 0,0015645736188915 0,00163465675685893 262476 278641 623 665 0 True 678 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 280 611 0,00690518501808978 0,00708433936753075 0,00689707789730678 0,00715648126955062 0,00139559131466914 0,00145990446105551 281927 308741 623 665 0 False 280 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 324 611 0,00670549512158293 0,00665105198335734 0,00665293354695964 0,00663767452506294 0,00135500593258177 0,00143560902659138 273774 289858 623 665 0 False 324 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 370 617 0,00676263685205643 0,00663147913271391 0,00677500572213321 0,00662241550316625 0,00140180092262098 0,00129417025156886 276107 289005 623 665 0 True 368 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 414 616 0,00662689768776833 0,00661899656442548 0,00660715648126955 0,00665293354695964 0,00153623200091624 0,0014577909552879 270565 288461 623 665 0 True 413 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 457 611 0,00661492070268408 0,00694673281968942 0,00654612039368277 0,00694285496299687 0,00181786654644481 0,00201430336133232 270076 302744 623 665 0 False 457 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 501 611 0,00648875822790096 0,00669797634392688 0,00660715648126955 0,00669871061264973 0,00185897265338416 0,00194645030542121 264925 291903 623 665 0 False 501 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 545 611 0,00668575391508416 0,0064279949128945 0,00663767452506294 0,00631723506523232 0,00183771630894681 0,00196632931462659 272968 280137 623 665 0 False 545 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 590 611 0,00662714261588866 0,00675593768123674 0,00660715648126955 0,00677500572213321 0,00157274899062466 0,0016612312112135 270575 294429 623 665 0 False 590 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 634 611 0,00648633343950967 0,00664304386509877 0,00653086137178607 0,00660715648126955 0,00146710176660487 0,00136688529626199 264826 289509 623 665 0 False 634 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 678 611 0,00644964320708391 0,00659944665967964 0,00645456626230259 0,00672922865644312 0,00160962138249881 0,00157941295959109 263328 287609 623 665 0 False 678 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 280 654 0,0506950264038637 0,509017221469788 0,00837720302128634 0,61353475242237 0,126252092687986 0,377243273156575 2069792 22183365 623 665 10 False 280 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 324 654 0,00719998050372162 0,00673234929851523 0,00701915007248035 0,00671396963454643 0,0017823906433142 0,00131347708291189 293963 293401 623 665 0 False 324 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 368 654 0,00658570077792845 0,00667796752122926 0,00651560234988937 0,00671396963454643 0,0012634582443148 0,00134607367554419 268883 291031 623 665 0 False 368 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 413 654 0,00649123200191632 0,00643728800141806 0,00645456626230259 0,0063935301747158 0,00146303282557401 0,00140449981940652 265026 280542 623 665 0 False 413 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 457 654 0,00639833076587431 0,00669311181363801 0,0063935301747158 0,00663767452506294 0,00154523464990443 0,00155270649412174 261233 291691 623 665 0 False 457 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 501 654 0,00648474140672751 0,00678565261861452 0,00645456626230259 0,00677500572213321 0,00165252574825882 0,001705080366473 264761 295724 623 665 0 False 501 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 545 654 0,00656850682388113 0,0065431144810986 0,00668345159075303 0,00650034332799268 0,00164580203938891 0,00165551028602794 268181 285154 623 665 0 False 545 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 590 654 0,00660894445654798 0,00669490159364995 0,00659189745937285 0,00674448767833982 0,00129530114980885 0,00124878785731836 269832 291769 623 665 0 False 590 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 634 655 0,00690552791745824 0,00697729675527799 0,00683604180972 0,00697337300679027 0,00141667390577568 0,00127908801183014 281941 304076 623 665 0 False 634 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 679 661 0,00845638828258974 0,730142499760502 0,00833142595559625 0,745235370412757 0,00178120119211734 0,18728087050923 345260 31820176 623 665 10 True 678 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E2_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E2_3.csv new file mode 100755 index 0000000..df51ae4 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E2_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 280 263 0,00104741061378865 0,0710931827164615 0,000854505226215 0,0719005111772335 0,000798443761433977 0,0225854796350781 42764 3098296 623 665 0 True 280 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 325 264 0,000911083622011739 0,000931695225704453 0,00080872816052491 0,000839246204318303 0,000632790395034432 0,000684125671584362 37198 40604 623 665 0 False 325 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 370 264 0,000915614792237885 0,000835735481987184 0,000839246204318303 0,000747692072938125 0,000656096924941491 0,000591639541925444 37383 36422 623 665 0 True 369 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 414 264 0,000882206596624572 0,0008267177442347 0,000732433051041428 0,000671396963454643 0,0007230839151732 0,000681552901638823 36019 36029 623 665 0 True 413 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 457 262 0,00094934139440763 0,000934219274439245 0,000686655985351339 0,000732433051041428 0,000924322973984222 0,000841933375793048 38760 40714 623 665 0 True 457 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 500 263 0,000880149200413782 0,0010055580700435 0,000671396963454643 0,000839246204318303 0,000815283328995353 0,000812400959441141 35935 43823 623 665 0 True 502 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 546 263 0,000884386456895529 0,000900993614730348 0,000701915007248035 0,000747692072938125 0,00077712204689655 0,000765116307645043 36108 39266 623 665 0 True 546 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 590 264 0,000951766182798919 0,00090328820448925 0,000671396963454643 0,000549324788281071 0,000911887422199801 0,000966124311689563 38859 39366 623 665 0 True 590 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 634 264 0,00107552836200278 0,00101200586726601 0,000732433051041428 0,000610360875867857 0,00100966162112719 0,00098782551342225 43912 44104 623 665 0 False 634 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 677 264 0,00114496548411696 0,0710742982427458 0,000839246204318303 0,07006942854963 0,00100886465154104 0,0211649134215798 46747 3097473 623 665 0 True 679 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 280 307 0,000830379806362277 0,000999202056411342 0,000671396963454643 0,000885023270008392 0,000682350983920071 0,000747519034086873 33903 43546 623 665 0 False 280 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 325 307 0,000953750100573609 0,000938051239336611 0,000823987182421607 0,00080872816052491 0,000712580396816808 0,000664405830238705 38940 40881 623 665 0 False 325 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 369 309 0,000896461413227906 0,000844477868968599 0,000793469138628214 0,000717174029144732 0,000653100620224278 0,000655815239832984 36601 36803 623 665 0 True 369 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 414 309 0,000819039634390896 0,000858658433678612 0,000625619897764553 0,00064087891966125 0,000715693944806205 0,000735352770243816 33440 37421 623 665 0 True 413 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 457 307 0,000834715034092157 0,000942479797571292 0,000549324788281071 0,000701915007248035 0,000855505361284031 0,000948294941305886 34080 41074 623 665 0 True 457 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 503 309 0,000842258820198389 0,000903425879874784 0,000656137941557946 0,000671396963454643 0,000819165844681992 0,000847714690794594 34388 39372 623 665 0 True 502 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 545 308 0,00096516375098109 0,000972493031617726 0,000793469138628214 0,000823987182421607 0,000798535560139748 0,000765823643099991 39406 42382 623 665 0 True 546 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 591 309 0,000964649401928393 0,000983897142719467 0,000579842832074464 0,000473029678797589 0,000987690982942529 0,00111663816961452 39385 42879 623 665 0 True 590 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 634 308 0,00108919535111732 0,000979353854996842 0,000701915007248035 0,000503547722590982 0,00110455667748869 0,00104014810552551 44470 42681 623 665 0 False 634 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 678 308 0,00110342567490862 0,00107655267718392 0,000747692072938125 0,000762951094834821 0,00103069134420236 0,00102812627027897 45051 46917 623 665 0 False 678 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 281 353 0,000918113059065273 0,00090351766346514 0,000762951094834821 0,000747692072938125 0,000765130610517497 0,000741134058454821 37485 39376 623 665 0 True 280 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 325 353 0,000939691226466541 0,00088649180745409 0,000839246204318303 0,000778210116731518 0,000675230138179129 0,00065003337418831 38366 38634 623 665 0 True 324 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 369 352 0,000837507214663945 0,000884793811032502 0,000701915007248035 0,000762951094834821 0,000662127267521982 0,000661205120517623 34194 38560 623 665 0 True 369 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 414 353 0,00086097132859177 0,000934747030083793 0,00064087891966125 0,000732433051041428 0,000784315404821119 0,000769460500533581 35152 40737 623 665 0 True 413 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 459 353 0,000859158860501312 0,000956820983564427 0,000579842832074464 0,000686655985351339 0,000856676217362915 0,000903295845511941 35078 41699 623 665 0 True 457 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 503 353 0,00096379215350723 0,000937431700101708 0,000671396963454643 0,000595101853971161 0,000926250340698187 0,000901806399287242 39350 40854 623 665 0 True 501 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 547 352 0,000930359465081884 0,000966137017985568 0,000732433051041428 0,000701915007248035 0,000833472420625273 0,000915581025445751 37985 42105 623 665 0 True 546 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 591 352 0,000978414362291063 0,000951245130450296 0,000564583810177768 0,000457770656900893 0,00105122398481006 0,0011355658473579 39947 41456 623 665 0 True 590 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 635 352 0,000988382936788583 0,000948560460432381 0,000625619897764553 0,000534065766384375 0,00101298674989209 0,000989242286094733 40354 41339 623 665 0 True 634 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 679 352 0,0010206154774243 0,000942778094239949 0,00064087891966125 0,000625619897764553 0,00103014129305263 0,000962221449965027 41670 41087 623 665 0 True 678 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 281 397 0,000884753849076027 0,000866345309370932 0,000701915007248035 0,000671396963454643 0,000764613522673448 0,000760408494593287 36123 37756 623 665 0 True 280 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 327 397 0,000923917855517147 0,000912420671729679 0,000793469138628214 0,000732433051041428 0,000720468628665997 0,000719784423968717 37722 39764 623 665 0 True 324 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 370 397 0,000914880007876888 0,000963429402070064 0,000778210116731518 0,000793469138628214 0,000726641542770073 0,000765227893919936 37353 41987 623 665 0 True 369 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 414 396 0,000919558134975233 0,000934792921878971 0,000686655985351339 0,000732433051041428 0,000804858239950043 0,000766344239875066 37544 40739 623 665 0 True 413 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 459 396 0,000907434193018789 0,000951956453275556 0,000610360875867857 0,00064087891966125 0,000849546161838244 0,000859944058149703 37049 41487 623 665 0 True 457 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 503 397 0,000944981673865716 0,000924788510530159 0,00064087891966125 0,000595101853971161 0,000916617322745995 0,00090127654010445 38582 40303 623 665 0 True 501 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 547 396 0,000858399583328282 0,000961020082823217 0,000610360875867857 0,000793469138628214 0,00080611601681081 0,000813395169489645 35047 41882 623 665 0 True 546 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 591 397 0,000891979228625827 0,000927610855933608 0,000473029678797589 0,000488288700694286 0,000943232641475326 0,00102412643459984 36418 40426 623 665 0 True 590 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 635 396 0,000932563818164874 0,000966687719527705 0,000549324788281071 0,00064087891966125 0,0009542780676483 0,000971724414961141 38075 42129 623 665 0 True 634 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 679 396 0,000937217452451186 0,000927840314909499 0,000579842832074464 0,000564583810177768 0,000957156246980215 0,000961404873610846 38265 40436 623 665 0 True 678 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 282 441 0,000856317694305458 0,000890599123122524 0,000686655985351339 0,000701915007248035 0,000773195073011251 0,000809223987248265 34962 38813 623 665 0 True 280 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 326 440 0,000931559612871512 0,00113628084860813 0,000823987182421607 0,000839246204318303 0,000745697611740199 0,00133211887223832 38034 49520 623 665 0 True 324 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 371 441 0,00100925081264089 0,00091285664378387 0,000915541313801785 0,000823987182421607 0,000753560456938451 0,000676350237439331 41206 39783 623 665 0 True 369 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 415 441 0,000924652639878143 0,00100663652723018 0,000732433051041428 0,000717174029144732 0,000826630858174025 0,000911323588467887 37752 43870 623 665 0 True 413 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 458 440 0,000881447319451542 0,000903357042182017 0,000564583810177768 0,00064087891966125 0,0009512030442614 0,00094281267831789 35988 39369 623 665 0 True 457 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 503 441 0,000980643208186086 0,000859140297527981 0,000701915007248035 0,000518806744487678 0,000945108750271604 0,000913362041805692 40038 37442 623 665 0 True 501 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 547 440 0,000852104930635744 0,00100464023413994 0,000549324788281071 0,000671396963454643 0,000850642504503984 0,00093776465248131 34790 43783 623 665 0 True 546 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 591 441 0,000969156079342505 0,000944567874251892 0,000656137941557946 0,000625619897764553 0,000988854487858825 0,000976374209854201 39569 41165 623 665 0 True 590 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 636 440 0,000859281324561478 0,000973158462647807 0,000442511635004196 0,000564583810177768 0,000948548417438264 0,0010225833208058 35083 42411 623 665 0 True 634 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 679 439 0,000878140789827058 0,000877955933550975 0,000534065766384375 0,000534065766384375 0,000932709070295663 0,000881822333938195 35853 38262 623 665 0 True 678 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 281 485 0,000887864436204246 0,00103348322740933 0,000747692072938125 0,000900282291905089 0,000750614353252906 0,00086664167985544 36250 45040 623 665 0 True 280 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 326 485 0,000807895404915781 0,000935205948035573 0,00064087891966125 0,00080872816052491 0,000745903243539345 0,000815251726842678 32985 40757 623 665 0 True 324 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 369 484 0,00094052398207567 0,000909942514790065 0,000823987182421607 0,000747692072938125 0,000779599447803036 0,000773042159111473 38400 39656 623 665 0 True 369 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 413 484 0,000840764758664363 0,000943994226812167 0,000473029678797589 0,000686655985351339 0,000902138268583839 0,000897613270573707 34327 41140 623 665 0 True 413 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 458 484 0,000916202619726682 0,000880801224852013 0,000503547722590982 0,000457770656900893 0,00100705199359814 0,000990422316589205 37407 38386 623 665 0 True 457 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 502 484 0,000966510855642917 0,000966871286708417 0,000610360875867857 0,000625619897764553 0,000935842808515009 0,000999352719389775 39461 42137 623 665 0 True 501 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 547 484 0,000938540064300979 0,000935871379065655 0,000625619897764553 0,000671396963454643 0,000903321063179527 0,000930152086761906 38319 40786 623 665 0 True 546 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 590 484 0,000914169716327925 0,000892205335953755 0,000579842832074464 0,000488288700694286 0,000938211420273839 0,000935972991819123 37324 38883 623 665 0 True 590 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 635 485 0,000922448286795153 0,00107577251666589 0,000534065766384375 0,000762951094834821 0,000991793720679973 0,000991133897570203 37662 46883 623 665 0 True 634 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 678 484 0,000878826588563988 0,00103708573333081 0,000564583810177768 0,000625619897764553 0,000925790572564889 0,00107173161106093 35881 45197 623 665 0 True 678 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 281 529 0,000957693443310958 0,000873114349159693 0,000823987182421607 0,000686655985351339 0,00078857262261177 0,000795087368661659 39101 38051 623 665 0 True 280 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 325 528 0,000858301612080149 0,000922746325644737 0,000732433051041428 0,000778210116731518 0,000731763896832118 0,000787220845212773 35043 40214 623 665 0 True 324 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 369 528 0,000829742993249414 0,000831697004011517 0,000610360875867857 0,000717174029144732 0,000760395731453021 0,000729928678094523 33877 36246 623 665 0 True 368 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 414 529 0,000947430955069039 0,000992800150984006 0,00064087891966125 0,000732433051041428 0,000923662415665311 0,000929961180935777 38682 43267 623 665 0 True 413 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 458 528 0,000940964852692268 0,000866253525780576 0,000564583810177768 0,000457770656900893 0,00100631481563239 0,000951430438051178 38418 37752 623 665 0 True 457 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 503 529 0,00088774197214408 0,000907303736567328 0,000503547722590982 0,000503547722590982 0,000938045344850521 0,000973507361320916 36245 39541 623 665 0 True 501 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 546 528 0,000884459935331628 0,00100131307898953 0,000534065766384375 0,000671396963454643 0,000920103601728617 0,000979416862659622 36111 43638 623 665 0 True 545 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 591 529 0,000905474768056132 0,000828553416041821 0,000595101853971161 0,000579842832074464 0,000866675863020647 0,000808732587257884 36969 36109 623 665 0 True 590 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 635 528 0,00102304026581559 0,000947229598372218 0,000717174029144732 0,000595101853971161 0,0010179754508172 0,00100618573162241 41769 41281 623 665 0 True 634 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 679 528 0,000961538814800174 0,000883325273586805 0,000625619897764553 0,000564583810177768 0,000997097068976592 0,000889054498671162 39258 38496 623 665 0 True 678 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 281 573 0,000952794880904314 0,000937546429589653 0,000854505226215 0,000793469138628214 0,000728821563723378 0,000681983349836908 38901 40859 623 665 0 True 280 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 326 573 0,000875813972683902 0,000935435407011463 0,000747692072938125 0,000793469138628214 0,000719620199660003 0,000774949838138734 35758 40767 623 665 0 True 324 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 369 572 0,000872482950247384 0,000890943311586359 0,000747692072938125 0,000793469138628214 0,000691618860627835 0,000692681377480351 35622 38828 623 665 0 True 368 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 415 573 0,000871258309645722 0,000854528172112589 0,000656137941557946 0,000595101853971161 0,000825726836468562 0,000807017531071406 35572 37241 623 665 0 True 413 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 458 571 0,000912871597290164 0,000802257417404808 0,0004272526131075 0,000396734569314107 0,00106386228888266 0,000930911939177334 37271 34963 623 665 0 True 457 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 502 573 0,000891440386761096 0,000809187078476691 0,000411993591210803 0,000244144350347143 0,00106257924519604 0,00102958908815947 36396 35265 623 665 0 True 501 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 546 572 0,000915786241922117 0,000924329592578379 0,000579842832074464 0,00064087891966125 0,000952429319730762 0,000868001145093692 37390 40283 623 665 0 True 545 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 590 572 0,00087480976739054 0,000898102431634132 0,000610360875867857 0,000671396963454643 0,000847382219556923 0,000806773324707585 35717 39140 623 665 0 True 590 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 635 572 0,000984733507795633 0,000931167470059906 0,000747692072938125 0,000732433051041428 0,000877590799290641 0,000762063401685723 40205 40581 623 665 0 True 634 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 679 572 0,000944467324813019 0,000929630094921442 0,000701915007248035 0,000610360875867857 0,000838862964244824 0,000891895998385203 38561 40514 623 665 0 True 678 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 280 611 0,00101432082473176 0,000916275582524634 0,000869764248111696 0,000762951094834821 0,000765222438000737 0,000766808292800489 41413 39932 623 665 0 False 280 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 324 611 0,000873021792112114 0,000929997229282866 0,000701915007248035 0,000793469138628214 0,000723989110772699 0,000728824321895487 35644 40530 623 665 0 False 324 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 370 617 0,000927224385141632 0,000829907223999573 0,000839246204318303 0,000686655985351339 0,000700337650897094 0,000681733246852249 37857 36168 623 665 0 True 368 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 414 616 0,000821439929970152 0,000820109325729063 0,000595101853971161 0,000625619897764553 0,000797815223112472 0,000725227987652606 33538 35741 623 665 0 True 413 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 457 611 0,000837801128408343 0,000926325885668623 0,0004272526131075 0,000457770656900893 0,000967267356811086 0,00104468403738982 34206 40370 623 665 0 False 457 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 501 611 0,000886076460925821 0,000868846412208135 0,000457770656900893 0,000350957503624018 0,00101614901168169 0,00105240760315595 36177 37865 623 665 0 False 501 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 545 611 0,00094280181359476 0,00090679892682037 0,000564583810177768 0,000442511635004196 0,00100294773136863 0,00101725627893319 38493 39519 623 665 0 False 545 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 590 611 0,000910373330462776 0,000877428177906428 0,000701915007248035 0,000595101853971161 0,000799032474446097 0,000836835769549012 37169 38239 623 665 0 False 590 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 634 611 0,000939789197714674 0,000944499036559125 0,000747692072938125 0,000778210116731518 0,000743582432952464 0,000776332146619508 38370 41162 623 665 0 False 634 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 678 611 0,000972805508335455 0,000967123691581896 0,000732433051041428 0,000778210116731518 0,000835450348376624 0,000785616930887021 39718 42148 623 665 0 False 678 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 280 654 0,00505854945484511 0,050947602469208 0,00111390859845884 0,0598306248569467 0,0121035467368659 0,0388350840014479 206532 2220336 623 665 0 False 280 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 324 654 0,000920317412148263 0,000901498424477307 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,000688258385226462 0,000646968018207774 37575 39288 623 665 0 False 324 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 368 654 0,000870719467780992 0,000943076390908606 0,000762951094834821 0,000854505226215 0,000631342237932637 0,000628736578451655 35550 41100 623 665 0 False 368 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 413 654 0,000804956267471794 0,000872861944286213 0,000610360875867857 0,000686655985351339 0,000711098290290657 0,00073006090478895 32865 38040 623 665 0 False 413 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 457 654 0,000896436920415873 0,000859025568040036 0,000595101853971161 0,00064087891966125 0,000891778500567015 0,000785000293156808 36600 37437 623 665 0 False 457 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 501 654 0,000851664060019146 0,000861021861130281 0,000534065766384375 0,000595101853971161 0,000877560007180742 0,000828835053549532 34772 37524 623 665 0 False 501 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 545 654 0,000852276380319977 0,000913958046868143 0,000518806744487678 0,000610360875867857 0,000862536923239528 0,000886827794809955 34797 39831 623 665 0 False 545 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 590 654 0,000925044524870675 0,000914439910717512 0,000762951094834821 0,000823987182421607 0,000706902964717521 0,000589482268776866 37768 39852 623 665 0 False 590 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 634 655 0,000986472497449992 0,000999798649748656 0,000854505226215 0,000869764248111696 0,000732184512979441 0,000702597548759425 40276 43572 623 665 0 False 634 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 679 661 0,000951766182798919 0,0726018525370419 0,000747692072938125 0,0728770885786221 0,000741514573533157 0,0205401915642636 38859 3164045 623 665 0 True 678 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E3_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E3_1.csv new file mode 100755 index 0000000..1bca7ad --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E3_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 275 275 0,0101545760001413 0,0458676560937707 0,0101777676050965 0,0460975051499199 0,00149635846233462 0,00926647624880689 385313 1998948 579 665 0 True 275 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 320 275 0,01030471528813 0,0102107867517271 0,0102998397802701 0,0101625085831998 0,00132104089507573 0,00125706138509885 391010 444994 579 665 0 False 320 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 364 275 0,0105765050857477 0,0655626477500687 0,010605020218204 0,069214923323415 0,00134479116385052 0,0129236907519357 401323 2857271 579 665 0 True 364 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 409 275 0,0107284891604942 0,0885537028655411 0,010757610437171 0,0876020447089342 0,00145220398212313 0,0137877332361216 407090 3859239 579 665 0 True 408 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 453 274 0,0104242574700357 0,0749476345934647 0,0105134660868238 0,0724040588998245 0,00166520156466962 0,0174518403024862 395546 3266276 579 665 0 True 452 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 496 275 0,0103626679464216 0,0713602270726025 0,0103761348897536 0,0736552986953536 0,00172438270154655 0,0253951150391124 393209 3109934 579 665 0 False 496 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 541 275 0,010181404470419 0,0856640800903609 0,0101472495613031 0,0814373998626688 0,00157647147922006 0,02574760785152 386331 3733307 579 665 0 True 540 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 586 276 0,0101478029973305 0,0732870629308451 0,0101777676050965 0,0711833371480888 0,00182432286879846 0,0202640254531141 385056 3193907 579 665 0 True 584 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 628 276 0,00994287354263493 0,00966942418990943 0,0100404364080262 0,00965896086060884 0,00202162820295048 0,00181382856081172 377280 421401 579 665 0 False 628 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 670 273 0,00978548687809768 0,0453066747895144 0,0098115510795758 0,0457160296025025 0,00179248923192551 0,00945511378751439 371308 1974500 579 665 0 True 672 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 275 318 0,0103379214497705 0,0102140680150823 0,0103303578240635 0,0102388036926833 0,00147570485623377 0,00149740208246987 392270 445137 579 665 0 False 275 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 320 319 0,010416562073846 0,0104905890269276 0,0103913939116503 0,0105287251087205 0,00136652098068204 0,00122381298832293 395254 457188 579 665 0 False 320 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 365 320 0,0108107402957957 0,113119672607933 0,0107728694590677 0,108232242313268 0,00144952379324275 0,0288282443378397 410211 4929843 579 665 0 True 364 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 409 319 0,0108377532447493 0,0557653001811005 0,0108339055466545 0,0556343938353552 0,00147842854873957 0,0105192780367538 411236 2430295 579 665 0 True 408 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 453 320 0,0106001447103441 0,0847706127300398 0,0106660563057908 0,0812085145342184 0,00174055876223082 0,0231168182177358 402220 3694369 579 665 0 True 452 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 498 319 0,010308325799356 0,0439567446884549 0,0103303578240635 0,0461585412375067 0,00163618079112786 0,00867090019920235 391147 1915669 579 665 0 True 496 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 541 319 0,0102364581780912 0,0467013952826676 0,01025406271458 0,049210345616846 0,00166398906017512 0,0115350173044131 388420 2035283 579 665 0 True 540 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 585 320 0,010703347352395 0,0531128920951956 0,0104676890211337 0,0547493705653468 0,00330039426201111 0,0103262048758237 406136 2314701 579 665 0 True 584 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 628 319 0,0100171920948779 0,009917675855925 0,00990310521095598 0,00990310521095598 0,00202673217757962 0,00200464124109819 380100 432220 579 665 0 False 628 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 672 319 0,00970057397904559 0,00975588433202484 0,00970473792629892 0,0098268101014725 0,00195766015998379 0,00191320907359655 368086 425169 579 665 0 False 672 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 277 365 0,0105893658848592 0,0527442203586329 0,0105745021744106 0,0523384451056687 0,00150224930890832 0,00981539199137475 401811 2298634 579 665 0 True 275 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 321 365 0,0105741595711556 0,0691090050601441 0,0106813153276875 0,0703898680094606 0,00139716561675689 0,0219851696770849 401234 3011824 579 665 0 True 319 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 365 365 0,0107028729786573 0,0412846490224187 0,0107423514152743 0,0427557793545434 0,00141932639404258 0,0070539848680247 406118 1799217 579 665 0 True 364 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 409 363 0,0104832379380924 0,0363745481809353 0,0105134660868238 0,0370794232089723 0,00148928104354534 0,00785273856595801 397784 1585231 579 665 0 True 408 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 454 364 0,0103729196899757 0,0744179285476222 0,0103150988021668 0,0708323796444648 0,00172912639821512 0,0142654083036406 393598 3243191 579 665 0 True 452 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 498 364 0,0103493854817654 0,0341581350951193 0,0103761348897536 0,0350652323186084 0,00170612125806614 0,00466417587861484 392705 1488638 579 665 0 True 496 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 542 364 0,010188282889616 0,0309428641413559 0,0102693217364767 0,0312046997787442 0,00166278011206002 0,00475644137588113 386592 1348514 579 665 0 True 540 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 586 364 0,0103961903572206 0,0523634790799383 0,010406652933547 0,0527962157625696 0,00192159222460456 0,00944248201318453 394481 2282041 579 665 0 True 584 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 630 365 0,0100051219186626 0,0581578689227073 0,0100099183642329 0,0586709391927977 0,00200598652134125 0,0128216744011826 379642 2534565 579 665 0 True 628 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 674 364 0,00996187484624032 0,0660973560015856 0,00997940032043946 0,0646982528419928 0,0019496792727567 0,0209272716221012 378001 2880574 579 665 0 True 672 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 278 409 0,0104975218584171 0,043470727631622 0,0105287251087205 0,0467231250476844 0,00158077704870159 0,0106181009837292 398326 1894488 579 665 0 True 275 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 322 409 0,0106608118405793 0,0321233617346181 0,0106507972838941 0,0324406805523766 0,00144029241200967 0,00350250617699091 404522 1399961 579 665 0 True 319 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 365 409 0,0106887208288153 0,093933322663491 0,0107728694590677 0,0896620126649882 0,00141984285029268 0,0235524765835693 405581 4093687 579 665 0 True 364 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 409 409 0,0106754383641591 0,0713056158363407 0,010757610437171 0,0692301823453117 0,00156219696476498 0,020681078730705 405077 3107554 579 665 0 True 408 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 454 409 0,0103794818600142 0,0460621914135304 0,0103913939116503 0,0466620889600977 0,00159231290518415 0,00875073519274396 393847 2007426 579 665 0 True 452 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 498 408 0,0104637886148458 0,0556937778183155 0,0104676890211337 0,0558632791638056 0,00175395053805048 0,0115131543911847 397046 2427178 579 665 0 True 496 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 543 409 0,0102311082964936 0,0422080837249911 0,0101319905394064 0,0431525139238575 0,00163364212087457 0,00625111353871774 388217 1839461 579 665 0 True 540 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 587 409 0,0102473687740588 0,053310295652154 0,01025406271458 0,0525520714122225 0,00187044162895019 0,0100983260985376 388834 2323304 579 665 0 True 584 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 631 409 0,0100260207172188 0,0396102868753481 0,00996414129854276 0,0410925459678035 0,00184203276145574 0,00701130707264647 380435 1726247 579 665 0 True 628 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 675 409 0,0101515979872322 0,084511874788826 0,0101625085831998 0,0830090791180285 0,0018631493002706 0,0162469265885166 385200 3683093 579 665 0 True 672 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 278 454 0,0102277876803296 0,0444616462190037 0,0101930266269932 0,0452277409018082 0,0016054455036183 0,00682765431206674 388091 1937673 579 665 0 True 275 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 322 454 0,010438910347712 0,0593666129159016 0,0104219119554437 0,0587319752803845 0,00154798843190212 0,00776561008619436 396102 2587243 579 665 0 True 319 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 366 453 0,0104533787467125 0,0364650926928215 0,0105134660868238 0,0368352788586252 0,00139262631841013 0,00497125148036155 396651 1589177 579 665 0 True 364 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 410 453 0,0106250229774779 0,0560088708840079 0,0105897611963073 0,0550698100251774 0,00171700598761231 0,0110356144937903 403164 2440910 579 665 0 True 408 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 454 453 0,0106070231295411 0,101836807629052 0,0105439841306172 0,101686121919585 0,00204153178287082 0,015473222910832 402481 4438127 579 665 0 True 452 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 498 454 0,010599749398896 0,0641620301612351 0,0105134660868238 0,0618142977035172 0,00190858668181781 0,016250015501909 402205 2796231 579 665 0 True 496 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 542 453 0,0103821436237647 0,0549825467766464 0,010406652933547 0,0539253833829252 0,00177325839608076 0,00962680016161637 393948 2396182 579 665 0 True 540 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 587 454 0,0104448927276266 0,032562706835755 0,0104371709773404 0,0325474937056535 0,00200485795916843 0,00563035984571869 396329 1419108 579 665 0 True 584 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 632 453 0,0102207247824568 0,0398734533747966 0,01025406271458 0,0402838178072786 0,00181696247926494 0,00638260638333638 387823 1737716 579 665 0 True 628 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 675 452 0,010185304876707 0,0668068890468332 0,0101777676050965 0,0661326009002823 0,00195972288733635 0,0101688283529339 386479 2911496 579 665 0 True 672 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 277 498 0,0101679902352801 0,0603951627753293 0,0102388036926833 0,0608224612802319 0,0015746825794659 0,0185452033118618 385822 2632068 579 665 0 True 275 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 320 497 0,0104495310486176 0,0574046698343478 0,0103608758678569 0,0588540474555581 0,00164983409795425 0,0125917817995601 396505 2501740 579 665 0 True 319 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 365 497 0,0105154426440643 0,0697040839682176 0,0105287251087205 0,0683451590753033 0,00145767978791063 0,0214047435611918 399006 3037758 579 665 0 True 363 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 409 497 0,0106183553910533 0,0902419243347554 0,0106355382619974 0,0873884184023804 0,00165340215396881 0,0269734850758976 402911 3932813 579 665 0 True 408 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 454 497 0,0106741997216217 0,0962318132249828 0,0106507972838941 0,0932326237888151 0,00203370284076627 0,0315525146833237 405030 4193857 579 665 0 True 452 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 498 498 0,0104624445559223 0,0451902931969429 0,0105745021744106 0,0470130464637217 0,00178185994190945 0,00687178139601175 396995 1969428 579 665 0 True 496 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 541 497 0,0103996163897708 0,0420951669629556 0,0104219119554437 0,0438239108873121 0,00170694933991121 0,00784972219128495 394611 1834540 579 665 0 True 540 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 585 497 0,0103895227707959 0,0976257076658228 0,010406652933547 0,0945754177157244 0,00177132405884097 0,0182791206520049 394228 4254604 579 665 0 True 584 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 630 497 0,0102448914889841 0,0646563995247905 0,0101625085831998 0,0658579385061418 0,00190145762513935 0,0186105958588854 388740 2817776 579 665 0 True 628 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 674 497 0,0101861482077963 0,0783109295325749 0,0102693217364767 0,0744335088120851 0,00195240226349489 0,0140958720618972 386511 3412851 579 665 0 True 672 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 275 535 0,0134665743746206 0,0457410865226697 0,0107270923933776 0,0508583199816892 0,00849948879819699 0,0262682324280385 510986 1993432 579 665 0 False 275 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 321 541 0,0106062852148379 0,116626976000312 0,0105287251087205 0,115526054779889 0,0015124606429798 0,033406144792091 402453 5082694 579 665 0 True 319 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 365 541 0,0105009478909673 0,0580726249131641 0,0105134660868238 0,0602121004043641 0,0014526886654297 0,0123168376195887 398456 2530850 579 665 0 True 363 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 409 541 0,0105786924757605 0,057061628665392 0,0105134660868238 0,0577248798352026 0,00176287657852759 0,00735814882126788 401406 2486790 579 665 0 True 408 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 453 540 0,0105485170352221 0,0566199660285986 0,0104829480430304 0,0571297779812314 0,00201126554818032 0,0107660901108957 400261 2467542 579 665 0 True 452 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 497 541 0,0105513105694554 0,0597830809571422 0,0106355382619974 0,0609903105210956 0,00192976534914205 0,0124663137012523 400367 2605393 579 665 0 True 496 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 541 541 0,0105121747360934 0,0715115552672021 0,0105592431525139 0,0696879530022126 0,0018585128291933 0,0180736179897514 398882 3116529 579 665 0 True 540 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 586 541 0,0104526408320094 0,058760198734419 0,010406652933547 0,0583504997329671 0,00167551125592401 0,0132280521212906 396623 2560815 579 665 0 True 584 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 629 541 0,010232346939031 0,0447642108246125 0,0102082856488899 0,04443427176318 0,00179393452067503 0,00810761417131514 388264 1950859 579 665 0 True 628 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 674 541 0,0101441924861045 0,072341278924021 0,0101472495613031 0,0712443732356756 0,00184270204194905 0,019055480929086 384919 3152689 579 665 0 True 672 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 275 578 0,0134388235109639 0,0350369170809835 0,0104676890211337 0,0400244144350347 0,00831525327662556 0,0188746336302381 509933 1526936 579 665 0 False 275 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 319 578 0,013901970403559 0,0410054892323507 0,0107118333714809 0,0465247577630274 0,00879855574112963 0,0234007181649533 527507 1787051 579 665 0 False 319 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 363 578 0,0134366361209511 0,0378474682930719 0,0106507972838941 0,0440527962157626 0,00827443082892868 0,0199313994629451 509850 1649422 579 665 0 False 363 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 408 578 0,01341882075169 0,0390100910321122 0,0108033875028611 0,0459754329747463 0,00789317866361639 0,0186780470680291 509174 1700090 579 665 0 False 408 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 452 578 0,0170465939109123 0,0629978241552611 0,0111390859845884 0,0716563668268864 0,0161793645775694 0,0416864643428436 646829 2745494 579 665 0 False 452 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 499 585 0,01044349596051 0,0598916150527383 0,0104829480430304 0,0599221789883269 0,00191163197477337 0,0116891149449889 396276 2610123 579 665 0 True 496 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 543 585 0,0103468027803045 0,0526044339505206 0,0104219119554437 0,0524910353246357 0,00200990173669298 0,00683246672191145 392607 2292542 579 665 0 True 540 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 587 585 0,0101125675702564 0,0360952277695842 0,0100556954299229 0,0374151216906996 0,00167768228997101 0,00714711432016727 383719 1573058 579 665 0 True 584 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 631 585 0,0099129879971585 0,0492499043442894 0,00990310521095598 0,0487678339818418 0,00165080087313342 0,00861539647330575 376146 2146349 579 665 0 True 628 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 674 585 0,0102452340922391 0,053962854033688 0,0101777676050965 0,0536659800106813 0,00174446325669421 0,00872944822713096 388753 2351743 579 665 0 True 672 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 275 621 0,0105291204201686 0,00963080624426711 0,00973525597009232 0,00965896086060884 0,00423747838633973 0,00135013260249944 399525 419718 579 665 0 False 275 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 319 621 0,0103663838740337 0,00969689042932348 0,0097962920576791 0,00965896086060884 0,00402297873990779 0,00139428651494824 393350 422598 579 665 0 False 319 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 363 621 0,0198176217457138 0,0480943948335017 0,0106507972838941 0,0622873273823148 0,0197236490964786 0,0320790476559322 751975 2095991 579 665 0 False 363 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 407 621 0,0178858401152307 0,0506627291506404 0,0108949416342412 0,053681239032578 0,0158699869442635 0,0357846862068247 678674 2207921 579 665 0 False 407 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 452 621 0,0114904387996605 0,00989920440836584 0,01025406271458 0,00984206912336919 0,00783224125577657 0,00198725451609191 436002 431415 579 665 0 False 452 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 496 621 0,0108804995893373 0,00994449961020656 0,0101930266269932 0,00996414129854276 0,0049681363853071 0,0019314492891426 412858 433389 579 665 0 False 496 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 540 621 0,0106181182041844 0,00984507503595335 0,00996414129854276 0,00988784618905928 0,00433703884041784 0,00197457593165874 402902 429056 579 665 0 False 540 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 584 621 0,00988874222834164 0,00985808535988632 0,00970473792629892 0,0098268101014725 0,00200092202063212 0,00159209640176137 375226 429623 579 665 0 False 584 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 628 621 0,0102943844822863 0,00966485795628921 0,00997940032043946 0,00971999694819562 0,00278869313020286 0,00144454515442576 390618 421202 579 665 0 False 628 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 672 621 0,0101507283020464 0,00977616850549353 0,00991836423285267 0,00973525597009232 0,00277283046084599 0,00152238148737765 385167 426053 579 665 0 False 672 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 275 664 0,011665113751528 0,0344462208393495 0,00994888227664607 0,0411230640115969 0,00634790668107456 0,0180066219580523 442630 1501193 579 665 0 False 275 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 319 664 0,00956102903786596 0,00961341325389464 0,00961318379491875 0,00962844281681544 0,00125709740010331 0,00132409051026045 362791 418960 579 665 0 False 319 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 363 664 0,0127395175592733 0,00967935976356547 0,00988784618905928 0,00968947890440223 0,0119368781517148 0,00120813246915517 483398 421834 579 665 0 False 363 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 407 664 0,0115855770881701 0,00960914531694308 0,00978103303578241 0,00959792477302205 0,00826443606604281 0,0014300758851546 439612 418774 579 665 0 False 407 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 452 665 0,00982051147239942 0,00982974717636389 0,00985732814526589 0,00978103303578241 0,00150154615372496 0,00149921183973376 372637 428388 579 665 0 False 452 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 496 665 0,00976008152903306 0,00975177701635641 0,00973525597009232 0,0097962920576791 0,00163044366748354 0,00162247352352607 370344 424990 579 665 0 False 496 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 540 665 0,0096187445092887 0,00958032526957127 0,00959792477302205 0,00962844281681544 0,00178248808003574 0,00175273009568178 364981 417518 579 665 0 False 540 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 584 665 0,00964944703175787 0,00977534245318033 0,00964370183871214 0,00978103303578241 0,00145033023938385 0,00119141238902941 366146 426017 579 665 0 False 584 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 628 665 0,00964335923545712 0,00959767236814857 0,00961318379491875 0,00964370183871214 0,00137189437079731 0,00136800744698114 365915 418274 579 665 0 False 628 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 672 671 0,00986072782371956 0,0428227354837081 0,00988784618905928 0,0437476157778286 0,00148420184878135 0,00950782262125554 374163 1866248 579 665 0 True 672 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E3_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E3_2.csv new file mode 100755 index 0000000..a262c4d --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E3_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 275 275 0,00866960172239833 0,719973612217773 0,00849927519645991 0,732219424734874 0,00183728036658162 0,192870196610871 328966 31377008 579 665 11 True 275 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 320 275 0,00711434106918306 0,00698030266786215 0,00708018616006714 0,00698863202868696 0,00144170401270059 0,00128411757188194 269952 304207 579 665 0 False 320 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 364 275 0,0067868387114797 0,00670038566317373 0,00674448767833982 0,00672922865644312 0,00128835367784951 0,00120271305504804 257525 292008 579 665 0 True 364 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 409 275 0,0067218495094119 0,00696839374701345 0,00677500572213321 0,00698863202868696 0,00137275616660424 0,00139551746900374 255059 303688 579 665 0 True 408 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 453 274 0,00683008578390194 0,00676474890591092 0,00688181887541009 0,00674448767833982 0,00168996512276855 0,00169270960775165 259166 294813 579 665 0 True 452 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 496 275 0,00708843499228418 0,0070656384609957 0,00712596322575723 0,00709544518196384 0,00160994659140897 0,00156993312232098 268969 307926 579 665 0 False 496 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 541 275 0,00712456645864061 0,00726327147692991 0,00709544518196384 0,00729381246662089 0,00155526722140644 0,00147751929853489 270340 316539 579 665 0 True 540 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 586 276 0,00751292042525497 0,00767921176252602 0,00747692072938125 0,00781261921110857 0,0017092825930546 0,00192891977204412 285076 334666 579 665 0 True 584 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 628 276 0,00811561225902967 0,00790057083656727 0,0081177996490425 0,00794995040817884 0,00205334987496887 0,00182396780823457 307945 344313 579 665 0 False 628 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 670 273 0,00919792229573697 0,722301014610227 0,00912489509422446 0,739574273289082 0,00184968520505742 0,192943477918553 349013 31478438 579 665 11 True 672 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 275 318 0,00702183819032744 0,00686945103660961 0,00700389105058366 0,00688181887541009 0,00139225611505965 0,00126584166529309 266442 299376 579 665 0 False 275 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 320 319 0,00678807735401708 0,00692954634239524 0,00672922865644312 0,00689707789730678 0,00114960424522967 0,00115585463784968 257572 301995 579 665 0 False 320 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 365 320 0,006795588271531 0,00686024973167641 0,00683604180972 0,00688181887541009 0,0012897891138537 0,00125346961595211 257857 298975 579 665 0 True 364 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 409 319 0,00677337176814773 0,00693450265627447 0,00674448767833982 0,00689707789730678 0,00142566633647474 0,00142543109522221 257014 302211 579 665 0 True 408 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 453 320 0,00689209697306071 0,00713516453069042 0,00695811398489357 0,00718699931334401 0,00163579049532761 0,00156131858263462 261519 310956 579 665 0 True 452 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 498 319 0,00708819780541532 0,00714094689688286 0,00708018616006714 0,00711070420386053 0,00159901852571392 0,00153832635166135 268960 311208 579 665 0 True 496 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 541 319 0,00727251835661652 0,0072553551422617 0,0072632944228275 0,00721751735713741 0,00150171568263705 0,00144034782047124 275954 316194 579 665 0 True 540 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 585 320 0,00774599605505529 0,00766890905450855 0,00764476997024491 0,00756847486076143 0,00215787333747563 0,00197642598418105 293920 334217 579 665 0 True 584 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 628 319 0,00753176360428112 0,00764527477999187 0,00755321583886473 0,0076752880140383 0,00200405475869088 0,00186939154799445 285791 333187 579 665 0 False 628 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 672 319 0,0076000997766095 0,00746560840186986 0,00759899290455482 0,00744640268558785 0,0018929591979892 0,0019361632698567 288384 325357 579 665 0 False 672 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 277 365 0,00665733468108183 0,00665311711414035 0,00657663843747616 0,00662241550316625 0,00144565716081454 0,0014291303257196 252611 289948 579 665 0 True 275 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 321 365 0,00649530969555352 0,0066588765344352 0,00642404821850919 0,00671396963454643 0,00126065329175968 0,00126533234201069 246463 290199 579 665 0 True 319 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 365 365 0,00686637537483761 0,00690084102451138 0,00691233691920348 0,00695811398489357 0,00129692786121432 0,00134869494696995 260543 300744 579 665 0 True 364 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 409 363 0,00715258086326269 0,00720163879600581 0,00711070420386053 0,0072480354009308 0,00137628152699049 0,00140863045687637 271403 313853 579 665 0 True 408 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 454 364 0,00720273270897843 0,00723635593905799 0,0072327763790341 0,00732433051041428 0,00174416012414828 0,00170155823864264 273306 315366 579 665 0 True 452 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 498 364 0,00746129275013299 0,00745645298873184 0,00737010757610437 0,00746166170748455 0,00157931753971336 0,00164933287265066 283117 324958 579 665 0 True 496 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 542 364 0,00740310290497253 0,00750105981364489 0,00740062561989776 0,00759899290455482 0,00162734032596187 0,00180741527043359 280909 326902 579 665 0 True 540 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 586 364 0,00746727513004758 0,0074408727242689 0,00752269779507134 0,00750743877317464 0,00185391692145902 0,00201349141099061 283344 324279 579 665 0 True 584 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 630 365 0,00699195264485101 0,00703461560745535 0,00698863202868696 0,00697337300679027 0,00182070225762312 0,00193104034632788 265308 306574 579 665 0 True 628 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 674 364 0,00643788411919273 0,00651181627678718 0,00648508430609598 0,00648508430609598 0,0016900297478158 0,00188615077753945 244284 283790 579 665 0 True 672 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 278 409 0,00658006447002637 0,0065600485535193 0,00656137941557946 0,00653086137178607 0,00142212046027712 0,00132097568352921 249679 285892 579 665 0 True 275 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 322 409 0,0068374912850297 0,00686724823044106 0,0068207827878233 0,00686655985351339 0,00132380081764968 0,00128726866678395 259447 299280 579 665 0 True 319 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 365 409 0,00696789135470993 0,00704540017932219 0,00700389105058366 0,00700389105058366 0,00125317777592577 0,00138154500764581 264395 307044 579 665 0 True 364 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 409 409 0,0072636897342756 0,00748954097305521 0,00721751735713741 0,00744640268558785 0,00148346853697125 0,00149588221283957 275619 326400 579 665 0 True 408 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 454 409 0,00747979332590411 0,00743070769163697 0,00752269779507134 0,00750743877317464 0,00153976739939308 0,00154462980153535 283819 323836 579 665 0 True 452 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 498 408 0,00765033068461486 0,00767157077862888 0,00756847486076143 0,00770580605783169 0,00164362778446467 0,00162783532087673 290290 334333 579 665 0 True 496 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 543 409 0,00753487338767285 0,00771193261248796 0,00755321583886473 0,00770580605783169 0,00161493821069278 0,00142485215006479 285909 336092 579 665 0 True 540 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 587 409 0,00693252415715317 0,00698367571480773 0,00706492713817044 0,00698863202868696 0,00185556406980617 0,00202711730654988 263053 304354 579 665 0 True 584 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 631 409 0,00640325483633908 0,00636175010655501 0,00642404821850919 0,0063935301747158 0,00178906312939872 0,00180454251348852 242970 277250 579 665 0 True 628 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 675 409 0,00617866522562467 0,00627522112674683 0,00621042191195544 0,00624093995574884 0,0017300683741762 0,00176066942402442 234448 273479 579 665 0 True 672 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 278 454 0,00649828770846255 0,00672815019925644 0,00648508430609598 0,00663767452506294 0,00149106652942487 0,00146887968260236 246576 293218 579 665 0 True 275 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 322 454 0,00669636509805766 0,00667509928403063 0,00672922865644312 0,00669871061264973 0,00144082569583684 0,00131493714436213 254092 290906 579 665 0 True 319 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 366 453 0,00691652722055335 0,0068053172528483 0,00698863202868696 0,00685130083161669 0,00138475778341829 0,00143808056110459 262446 296581 579 665 0 True 364 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 410 453 0,00733310642456212 0,00721710433098081 0,00737010757610437 0,0072480354009308 0,00161632138919281 0,00155631781859125 278253 314527 579 665 0 True 408 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 454 453 0,00757047777209847 0,00773678301957687 0,00753795681696803 0,007690547035935 0,00197871918903169 0,00201962810885226 287260 337175 579 665 0 True 452 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 498 454 0,00769992909430326 0,00770972980631942 0,007690547035935 0,00775158312352178 0,00179447667004208 0,00191968640531018 292172 335996 579 665 0 True 496 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 542 453 0,00709004259217312 0,0070543720252795 0,00714122224765393 0,00701915007248035 0,00181593449083234 0,00169272856198751 269030 307435 579 665 0 True 540 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 587 454 0,00642966164107223 0,00633600480946013 0,0063935301747158 0,00633249408712902 0,00192675954103882 0,00178056602224426 243972 276128 579 665 0 True 584 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 632 453 0,00617974574358281 0,0061424102715016 0,00613412680247196 0,00610360875867857 0,00176213854213211 0,00181069847639335 234489 267691 579 665 0 True 628 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 675 452 0,00613660408754673 0,00627226110595784 0,00624093995574884 0,00630197604333562 0,0017031076164246 0,00193647479663368 232852 273350 579 665 0 True 672 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 277 498 0,00662908308959088 0,00670871502399854 0,00657663843747616 0,00665293354695964 0,00146225285556019 0,00162044347173444 251539 292371 579 665 0 True 275 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 320 497 0,00663651494481518 0,00672330861486516 0,00659189745937285 0,00679026474402991 0,00138348687893069 0,00141675068746804 251821 293007 579 665 0 True 319 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 365 497 0,00683783388828472 0,00688216306387392 0,00689707789730678 0,00686655985351339 0,00151932240921813 0,00151874194915942 259460 299930 579 665 0 True 363 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 409 497 0,00725955214111881 0,00715680251211687 0,00720225833524071 0,00715648126955062 0,00169114870577898 0,00159287322311976 275462 311899 579 665 0 True 408 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 454 497 0,00728458853283187 0,00756299079123765 0,0072632944228275 0,00750743877317464 0,00183467889305576 0,00181182199251729 276412 329601 579 665 0 True 452 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 498 498 0,00698357204215127 0,00684781305518316 0,00698863202868696 0,00689707789730678 0,00177574828163372 0,00167640587798221 264990 298433 579 665 0 True 496 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 541 497 0,00663314162045805 0,0063974998149987 0,00665293354695964 0,00643930724040589 0,00161949609811034 0,00157315656579896 251693 278808 579 665 0 True 540 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 585 497 0,00625548741703895 0,00630484428053425 0,00634775310902571 0,00630197604333562 0,00176813412389892 0,00184832990330496 237363 274770 579 665 0 True 584 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 630 497 0,00643775234871003 0,00635452214881447 0,0063782711528191 0,00643930724040589 0,00177456311648202 0,00171903505633188 244279 276935 579 665 0 True 628 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 674 497 0,00629839188620617 0,00645963730566976 0,00633249408712902 0,00645456626230259 0,00183042542025715 0,00174997310519867 238991 281516 579 665 0 True 672 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 275 535 0,00676970854872866 0,00667190980426576 0,00672922865644312 0,00671396963454643 0,00151073902746456 0,00143416869502364 256875 290767 579 665 0 False 275 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 321 541 0,006712045785499 0,00682174651552204 0,00679026474402991 0,00688181887541009 0,00131377993145608 0,00139368536108894 254687 297297 579 665 0 True 319 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 365 541 0,00666416039208571 0,00697328122319991 0,00665293354695964 0,00698863202868696 0,00136381251509418 0,00133886076451043 252870 303901 579 665 0 True 363 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 409 541 0,00697677268524393 0,00682346745784122 0,00704966811627375 0,0068207827878233 0,00169364853473119 0,00162381783663633 264732 297372 579 665 0 True 408 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 453 540 0,00671454942467031 0,00658801960268031 0,00668345159075303 0,00657663843747616 0,00175814115669082 0,00202265526921742 254782 287111 579 665 0 True 452 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 497 541 0,00627612267462982 0,00661693143364247 0,00622568093385214 0,00669871061264973 0,0017983155870146 0,00201724377987907 238146 288371 579 665 0 True 496 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 541 541 0,00634614550913677 0,0064371962178277 0,00634775310902571 0,0064087891966125 0,00170308516530382 0,0017385829560394 240803 280538 579 665 0 True 540 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 586 541 0,00639007778806905 0,0063016089089742 0,00651560234988937 0,00634775310902571 0,00160978142183294 0,00145863830357247 242470 274629 579 665 0 True 584 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 629 541 0,00647195996601903 0,00654648752804419 0,00656137941557946 0,00650034332799268 0,001703673375626 0,00166536226827397 245577 285301 579 665 0 True 628 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 674 541 0,00638778498167007 0,00659820758120983 0,0063782711528191 0,00660715648126955 0,00176223872152851 0,00178179337332791 242383 287555 579 665 0 True 672 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 275 578 0,0067619077361528 0,00677635953009096 0,0068207827878233 0,00677500572213321 0,00126769076144537 0,0012853446411948 256579 295319 579 665 0 False 275 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 319 578 0,00685277666102294 0,00684391225259303 0,00686655985351339 0,00675974670023652 0,00139575022718763 0,00130818755741352 260027 298263 579 665 0 False 319 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 363 578 0,00659513901324728 0,00673402434903923 0,00656137941557946 0,00671396963454643 0,00136347696412138 0,00123273268019699 250251 293474 579 665 0 False 363 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 408 578 0,00667812806325194 0,0065713379351331 0,00672922865644312 0,00662241550316625 0,00147119929161501 0,0014326855625934 253400 286384 579 665 0 False 408 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 452 578 0,00665404041901432 0,00649008651177038 0,00669871061264973 0,00645456626230259 0,00173974404936434 0,00175723877590269 252486 282843 579 665 0 False 452 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 499 585 0,00654930923936411 0,00659214986424633 0,00651560234988937 0,00669871061264973 0,00194738954144036 0,00202419123332214 248512 287291 579 665 0 True 496 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 543 585 0,00646268332403693 0,00647824642861445 0,00650034332799268 0,00651560234988937 0,00189743733483035 0,00168968569125032 245225 282327 579 665 0 True 540 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 587 585 0,00649277970228568 0,00652758010843084 0,0064087891966125 0,00656137941557946 0,00161212534336818 0,0015668059723507 246367 284477 579 665 0 True 584 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 631 585 0,00658757538754028 0,0064994484379867 0,00660715648126955 0,00648508430609598 0,00150536639973828 0,0013745806386584 249964 283251 579 665 0 True 628 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 674 585 0,00638254051645859 0,00655956668966993 0,0064087891966125 0,00650034332799268 0,00153713050553849 0,00156901288745588 242184 285871 579 665 0 True 672 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 275 621 0,00695070848376581 0,00682959401249748 0,00698863202868696 0,00688181887541009 0,00133132956442517 0,00133638248570795 263743 297639 579 665 0 False 275 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 319 621 0,00665965384157736 0,0066989859634208 0,00666819256885634 0,00671396963454643 0,00138478208376225 0,00130651043910102 252699 291947 579 665 0 False 319 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 363 621 0,00665446208455896 0,00657099374666926 0,00663767452506294 0,00660715648126955 0,00135404880214655 0,00132197112978441 252502 286369 579 665 0 False 363 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 407 621 0,006492990535058 0,00642230433029243 0,00651560234988937 0,00636301213092241 0,00142689439155427 0,0013328593220551 246375 279889 579 665 0 False 407 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 452 621 0,00635481600689845 0,00635610541574811 0,0063935301747158 0,00643930724040589 0,00174615778448629 0,00183299061346842 241132 277004 579 665 0 False 452 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 496 621 0,00619827267345047 0,00640706825429332 0,00617990386816205 0,00642404821850919 0,00183467577219385 0,00186247152231823 235192 279225 579 665 0 False 496 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 540 621 0,00639308215507462 0,00646298740671776 0,00631723506523232 0,00650034332799268 0,00178406192503112 0,00185579990680337 242584 281662 579 665 0 False 540 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 584 621 0,0064085256556471 0,00626620338899434 0,00651560234988937 0,00627145799954223 0,00144261816298121 0,0014577593144149 243170 273086 579 665 0 False 584 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 628 621 0,00659672025903969 0,00647595183885555 0,00653086137178607 0,00643930724040589 0,0014778572277161 0,00137651273709172 250311 282227 579 665 0 False 628 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 672 621 0,00668287180062915 0,00656135646968187 0,00677500572213321 0,00659189745937285 0,00148991955761909 0,00144179772392038 253580 285949 579 665 0 False 672 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 275 664 0,0489641192928722 0,52120325992367 0,00813305867093919 0,628610666056306 0,122482769890446 0,376889081493443 1857932 22714442 579 665 11 False 275 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 319 664 0,00716454562309188 0,00681800633421503 0,00706492713817044 0,0068055237659266 0,00163736247865902 0,00126283904760506 271857 297134 579 665 0 False 319 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 363 664 0,00623930600176335 0,00617939905841509 0,00628671702143893 0,00617990386816205 0,00121535006325192 0,00124094274643457 236749 269303 579 665 0 False 363 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 407 664 0,00613278274354842 0,00623715388264665 0,00622568093385214 0,00625619897764553 0,00133727495457249 0,00126288050759462 232707 271820 579 665 0 False 407 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 452 665 0,00624207318190006 0,00626962232773511 0,00622568093385214 0,00622568093385214 0,00146973431764329 0,00153757604749268 236854 273235 579 665 0 False 452 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 496 665 0,00627796746138762 0,00621868243508749 0,00633249408712902 0,00619516289005875 0,00161759276367914 0,00159168837262566 238216 271015 579 665 0 False 496 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 540 665 0,00638591384081572 0,00622336339819565 0,0064087891966125 0,00622568093385214 0,00167293119627923 0,00171168827760687 242312 271219 579 665 0 False 540 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 584 665 0,00643943901088859 0,00630835500286537 0,00646982528419928 0,00630197604333562 0,00132370196270544 0,00120338372096285 244343 274923 579 665 0 False 584 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 628 665 0,00663843879386261 0,00660008914481213 0,00657663843747616 0,00666819256885634 0,00134285195670149 0,00133759880152333 251894 287637 579 665 0 False 628 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 672 671 0,00834681674797564 0,711837983606303 0,00825513084611276 0,727336537727932 0,00192590930248318 0,209853342746578 316718 31022451 579 665 12 True 672 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E3_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E3_3.csv new file mode 100755 index 0000000..e0fd4ad --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E3_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 275 275 0,001015344277399 0,0728947569197657 0,000854505226215 0,0727855344472419 0,000733389353925063 0,0219235113637937 38527 3176810 579 665 0 True 275 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 320 275 0,000971622831239039 0,000924168971295256 0,000839246204318303 0,000839246204318303 0,000686103485696536 0,000611097970603399 36868 40276 579 665 0 False 320 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 364 275 0,00097628750632663 0,00090328820448925 0,000869764248111696 0,00080872816052491 0,000678285798977843 0,000651098290145558 37045 39366 579 665 0 True 364 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 409 275 0,00096374295637356 0,000900832993447225 0,00080872816052491 0,000717174029144732 0,000714337986521982 0,000683725950826043 36569 39259 579 665 0 True 408 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 453 274 0,000917886828393851 0,000978137722424624 0,000701915007248035 0,000717174029144732 0,000853431403162357 0,000921509411491613 34829 42628 579 665 0 True 452 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 496 275 0,00086702342207153 0,000902668665254347 0,000686655985351339 0,000717174029144732 0,000782849675800759 0,000796367765585824 32899 39339 579 665 0 False 496 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 541 275 0,00089651365609986 0,00103726930051152 0,000701915007248035 0,000854505226215 0,000795296030632636 0,000833640713384155 34018 45205 579 665 0 True 540 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 586 276 0,000938153128633159 0,000937271078818585 0,000625619897764553 0,000564583810177768 0,000919604567307303 0,000995345424328745 35598 40847 579 665 0 True 584 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 628 276 0,00095942088454099 0,000957188117925851 0,000625619897764553 0,00064087891966125 0,000974140528607704 0,000921142726117983 36405 41715 579 665 0 False 628 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 670 273 0,00101790062476339 0,0729139167442525 0,000717174029144732 0,0731059739070726 0,000946584948586441 0,0220178358437577 38624 3177645 579 665 0 True 672 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 275 318 0,00101624031668137 0,000894981789562026 0,000900282291905089 0,000732433051041428 0,000733007959567643 0,000732703752544414 38561 39004 579 665 0 False 275 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 320 319 0,000931353771725823 0,000930823281596071 0,000839246204318303 0,000869764248111696 0,000661924192309595 0,000600565548517786 35340 40566 579 665 0 False 320 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 365 320 0,00098437821396443 0,000946931301703561 0,000839246204318303 0,000869764248111696 0,000689903819159527 0,000648248571210618 37352 41268 579 665 0 True 364 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 409 319 0,000938891043336281 0,000961479000774998 0,000717174029144732 0,000793469138628214 0,000780290658185113 0,000753719391160888 35626 41902 579 665 0 True 408 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 453 320 0,00092157640190946 0,000902691611151936 0,000686655985351339 0,000671396963454643 0,000858297080452601 0,000830401182085762 34969 39340 579 665 0 True 452 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 498 319 0,000869764248111696 0,000892801929291069 0,000656137941557946 0,000701915007248035 0,000796862574334392 0,000785376549170467 33003 38909 579 665 0 True 496 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 541 319 0,000881834424327045 0,000875225371737882 0,000671396963454643 0,000762951094834821 0,000766732946526269 0,000722223348085925 33461 38143 579 665 0 True 540 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 585 320 0,000987567059645777 0,000919832196650932 0,000732433051041428 0,000534065766384375 0,000931034398384216 0,00103352653943074 37473 40087 579 665 0 True 584 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 628 319 0,000968091382302671 0,00105574074807068 0,000610360875867857 0,000701915007248035 0,00102998088887991 0,00105398338815711 36734 46010 579 665 0 False 628 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 672 319 0,000915883917056806 0,00094110304371595 0,000534065766384375 0,000518806744487678 0,000935714651654825 0,00100822087594542 34753 41014 579 665 0 False 672 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 277 365 0,00084225057132387 0,000880893008442369 0,000656137941557946 0,000732433051041428 0,000709699453281282 0,000711186095279294 31959 38390 579 665 0 True 275 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 321 365 0,000969593565805454 0,000883049922815737 0,000839246204318303 0,000778210116731518 0,000697356331680918 0,000664686400454216 36791 38484 579 665 0 True 319 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 365 365 0,000956917245369684 0,000971781708792466 0,000839246204318303 0,000869764248111696 0,000694011499355661 0,000679818307301673 36310 42351 579 665 0 True 364 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 409 363 0,000887843158338179 0,00086921354656956 0,000686655985351339 0,000717174029144732 0,000776952430216335 0,000676507779397927 33689 37881 579 665 0 True 408 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 454 364 0,000956653704404284 0,000902209747302566 0,000671396963454643 0,000610360875867857 0,000879119547883732 0,000871398792850075 36300 39319 579 665 0 True 452 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 498 364 0,000853292937774157 0,000903334096284428 0,000518806744487678 0,000549324788281071 0,000896344091606346 0,000903782980156438 32378 39368 579 665 0 True 496 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 542 364 0,00096342670721508 0,000935756649577709 0,000701915007248035 0,000732433051041428 0,0009120063229033 0,000889802859975905 36557 40781 579 665 0 True 540 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 586 364 0,000935754905848014 0,000954296934829635 0,000549324788281071 0,000534065766384375 0,000963769940316227 0,00106966865318247 35507 41589 579 665 0 True 584 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 630 365 0,000922656919867602 0,000926807749517993 0,000564583810177768 0,000595101853971161 0,000973562635224404 0,00097470272779732 35010 40391 579 665 0 True 628 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 674 364 0,000903734678551837 0,000925499833355419 0,000579842832074464 0,000473029678797589 0,000915944302445461 0,00100794942804198 34292 40334 579 665 0 True 672 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 278 409 0,00091733339236651 0,00085962216137735 0,000762951094834821 0,000747692072938125 0,000763659168019864 0,000699898913515669 34808 37463 579 665 0 True 275 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 322 409 0,000964638995655922 0,000957256955618619 0,000854505226215 0,000869764248111696 0,000740196719434869 0,000691775984729528 36603 41718 579 665 0 True 319 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 365 409 0,000997502554041381 0,000926440615156569 0,000869764248111696 0,000854505226215 0,000711910858073865 0,00068651184813319 37850 40375 579 665 0 True 364 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 409 409 0,000925002434459668 0,00096072178615456 0,000717174029144732 0,000762951094834821 0,000801271729002785 0,000785028022852548 35099 41869 579 665 0 True 408 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 454 409 0,00101162834978685 0,00090865754452508 0,000732433051041428 0,000671396963454643 0,000880224927572342 0,0008068083107616 38386 39600 579 665 0 True 452 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 498 408 0,000904156344096478 0,000833922756077651 0,000610360875867857 0,000595101853971161 0,000868997023722335 0,000827329878967907 34308 36343 579 665 0 True 496 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 543 409 0,000969593565805454 0,000969418281340798 0,000747692072938125 0,000778210116731518 0,000850081278176779 0,000830411553778322 36791 42248 579 665 0 True 540 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 587 409 0,000960870359850693 0,00102464905683756 0,000701915007248035 0,000686655985351339 0,000916252708022866 0,00107197966949762 36460 44655 579 665 0 True 584 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 631 409 0,000942238013596869 0,000865083285003537 0,000625619897764553 0,000488288700694286 0,000964550252147554 0,000919758887577022 35753 37701 579 665 0 True 628 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 675 409 0,000872004346317601 0,000903402933977195 0,000457770656900893 0,000534065766384375 0,000954152118309882 0,000955708893618302 33088 39371 579 665 0 True 672 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 278 454 0,000948352163994164 0,00086336234268436 0,00080872816052491 0,000701915007248035 0,00078684687985569 0,000781383889172881 35985 37626 579 665 0 True 275 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 322 454 0,00100050692104695 0,000903334096284428 0,000900282291905089 0,00080872816052491 0,000770185794710595 0,000716571177440637 37964 39368 579 665 0 True 319 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 366 453 0,000957470681397025 0,000957968278443878 0,000793469138628214 0,000854505226215 0,00078418664763742 0,000779684668681721 36331 41749 579 665 0 True 364 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 410 453 0,000937204381157717 0,000940024586529267 0,000793469138628214 0,000747692072938125 0,00082207649510939 0,000842656542364911 35562 40967 579 665 0 True 408 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 454 453 0,000898911878885006 0,00096423250848568 0,000534065766384375 0,000564583810177768 0,000957075697959983 0,00101857987616503 34109 42022 579 665 0 True 452 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 498 454 0,000921022965882118 0,000913682696097075 0,000610360875867857 0,000473029678797589 0,000941500437863801 0,000997894724066015 34948 39819 579 665 0 True 496 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 542 453 0,000911693615706936 0,00088812096618291 0,000564583810177768 0,000579842832074464 0,00093124396919503 0,000911432348575942 34594 38705 579 665 0 True 540 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 587 454 0,000928507529299496 0,000940483504481047 0,000564583810177768 0,000595101853971161 0,000983375319604426 0,000949724380117491 35232 40987 579 665 0 True 584 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 632 453 0,000923342126377644 0,000855836088275163 0,000579842832074464 0,0004272526131075 0,000946341703226743 0,000952496164370801 35036 37298 579 665 0 True 628 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 675 452 0,000851527213305973 0,000903311150386839 0,0004272526131075 0,000534065766384375 0,000930204357939347 0,000971847301309901 32311 39367 579 665 0 True 672 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 277 498 0,000869158103891275 0,000932613061608014 0,000701915007248035 0,000793469138628214 0,000753814792537311 0,000787454732560368 32980 40644 579 665 0 True 275 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 320 497 0,000958893802610189 0,000911617565314063 0,000793469138628214 0,000762951094834821 0,000828189554572565 0,000760887999840121 36385 39729 579 665 0 True 319 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 365 497 0,00096790690362689 0,00102219384579554 0,000823987182421607 0,000900282291905089 0,000778914396846697 0,000789766414108985 36727 44548 579 665 0 True 363 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 409 497 0,000984325505771349 0,00101859133987406 0,000732433051041428 0,000747692072938125 0,000921955986945154 0,000940437108531024 37350 44391 579 665 0 True 408 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 454 497 0,000941315620217967 0,000948950540691394 0,000595101853971161 0,00064087891966125 0,000964759804160153 0,000958459572752573 35718 41356 579 665 0 True 452 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 498 498 0,000887395138696998 0,000861664346262773 0,000595101853971161 0,000549324788281071 0,000866947429721085 0,000882186411937943 33672 37552 579 665 0 True 496 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 541 497 0,000963110458056599 0,00083488648377639 0,000625619897764553 0,000595101853971161 0,000914640002318085 0,000817006646092005 36545 36385 579 665 0 True 540 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 585 497 0,00093412095186253 0,000874743507888513 0,000595101853971161 0,000488288700694286 0,000936484447052972 0,000948714430345441 35445 38122 579 665 0 True 584 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 630 497 0,000901889891794033 0,00087715282713536 0,000564583810177768 0,000473029678797589 0,000901372328325182 0,000950425303756419 34222 38227 579 665 0 True 628 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 674 497 0,00080422161001656 0,000893605035706685 0,000442511635004196 0,000518806744487678 0,000869202191945999 0,000973802681467595 30516 38944 579 665 0 True 672 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 275 535 0,00081695063864541 0,000873894509677719 0,000656137941557946 0,000747692072938125 0,000687514263264586 0,000726137770106946 30999 38085 579 665 0 False 275 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 321 541 0,000818479176244734 0,000952943126871883 0,000686655985351339 0,000854505226215 0,000705221407223075 0,000759263649395508 31057 41530 579 665 0 True 319 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 365 541 0,000977051775126292 0,000941217773203895 0,000839246204318303 0,000778210116731518 0,000743108124268123 0,000788081963309862 37074 41019 579 665 0 True 363 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 409 541 0,000845808374356779 0,000970382009039536 0,000625619897764553 0,000732433051041428 0,000790165952788036 0,000862991254859577 32094 42290 579 665 0 True 408 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 453 540 0,000935807614041094 0,000784795589339565 0,000534065766384375 0,000320439459830625 0,00102060034621388 0,000921487011025076 35509 34202 579 665 0 True 452 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 497 541 0,000863491973135161 0,000809875455404361 0,000457770656900893 0,000335698481727321 0,000982359455822893 0,000969766007265842 32765 35295 579 665 0 True 496 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 541 541 0,000830470290170462 0,000807948000006884 0,0004272526131075 0,0004272526131075 0,00092739409678155 0,000912160929022668 31512 35211 579 665 0 True 540 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 586 541 0,000964770766138623 0,000878575472785879 0,000671396963454643 0,000717174029144732 0,00090064143129004 0,000759258023384484 36608 38289 579 665 0 True 584 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 629 541 0,000894194495604334 0,000935596028294586 0,000549324788281071 0,000579842832074464 0,000895132947651467 0,000944268495860188 33930 40774 579 665 0 True 628 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 674 541 0,000813603668384822 0,000908978787091326 0,000549324788281071 0,000625619897764553 0,000804483181717471 0,00090517784751497 30872 39614 579 665 0 True 672 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 275 578 0,000939918853101343 0,000957853548955933 0,000839246204318303 0,000839246204318303 0,000676009627446549 0,00067680623551838 35665 41744 579 665 0 False 275 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 319 578 0,000993259544498431 0,000931121578264728 0,000885023270008392 0,000839246204318303 0,000749523849326957 0,000749926825819441 37689 40579 579 665 0 False 319 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 363 578 0,000920364113468617 0,000995415983309154 0,00080872816052491 0,000900282291905089 0,000715231332882898 0,000735173640470677 34923 43381 579 665 0 False 363 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 408 578 0,000985590502405273 0,000911250430952639 0,00080872816052491 0,000686655985351339 0,000821300048920239 0,000794960635548954 37398 39713 579 665 0 False 408 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 452 578 0,000852291482105634 0,000872517755822378 0,000442511635004196 0,000488288700694286 0,000946963001924009 0,000966971460780129 32340 38025 579 665 0 False 452 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 499 585 0,000823486454587346 0,000831697004011517 0,000274662394140536 0,000457770656900893 0,00100899202807116 0,00101361811549341 31247 36246 579 665 0 True 496 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 543 585 0,000858300216116769 0,000858245407522009 0,000457770656900893 0,000518806744487678 0,000958217228424991 0,000851087863452775 32568 37403 579 665 0 True 540 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 587 585 0,000867893107257352 0,000886606536942035 0,000595101853971161 0,000610360875867857 0,000816635338206638 0,000850767902542215 32932 38639 579 665 0 True 584 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 631 585 0,000950276013041588 0,0009221956241026 0,000717174029144732 0,000686655985351339 0,000856437194251466 0,00079333090708288 36058 40190 579 665 0 True 628 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 674 585 0,000838903601063282 0,000914233397639211 0,000549324788281071 0,000625619897764553 0,000810897154707191 0,000885434245255582 31832 39843 579 665 0 True 672 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 275 621 0,000957391619107405 0,000891035095176715 0,000839246204318303 0,000732433051041428 0,000684238178402917 0,000725109869741933 36328 38832 579 665 0 False 275 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 319 621 0,000909479871597571 0,000839567446884549 0,00080872816052491 0,000732433051041428 0,000669904091792332 0,000642539718464015 34510 36589 579 665 0 False 319 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 363 621 0,000903945511324158 0,00104548393184839 0,000762951094834821 0,000961318379491875 0,000701046397486064 0,000742735977040993 34300 45563 579 665 0 False 363 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 407 621 0,000932355227394345 0,000815405416723314 0,00080872816052491 0,000610360875867857 0,000743518626174043 0,000711466264847876 35378 35536 579 665 0 False 407 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 452 621 0,000833975385010291 0,000820086379831474 0,000442511635004196 0,0004272526131075 0,000874672124663885 0,000878006159174101 31645 35740 579 665 0 False 452 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 496 621 0,000802930259286096 0,000835414239420937 0,000396734569314107 0,0004272526131075 0,000941939233515594 0,000954245430826708 30467 36408 579 665 0 False 496 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 540 621 0,000827492277261435 0,000836171454041375 0,000457770656900893 0,000366216525520714 0,000911205118911631 0,00100196491984165 31399 36441 579 665 0 False 540 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 584 621 0,00089659271838948 0,000903219366796483 0,000656137941557946 0,000671396963454643 0,000808210646259583 0,000817896622412616 34021 39363 579 665 0 False 584 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 628 621 0,000917860474297311 0,000926142318487911 0,000747692072938125 0,00080872816052491 0,000770744420886115 0,00073036716548722 34828 40362 579 665 0 False 628 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 672 621 0,00089643459381024 0,000874697616093335 0,000732433051041428 0,000701915007248035 0,000735603828748642 0,000708519166207059 34015 38120 579 665 0 False 672 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 275 664 0,00497786717087324 0,0528637225932765 0,00109864957656214 0,0616769665064469 0,0120431876086515 0,0391792724357371 188884 2303842 579 665 0 False 275 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 319 664 0,000934621679696791 0,000866918956810658 0,00080872816052491 0,000732433051041428 0,000668437791334197 0,000645631552301201 35464 37781 579 665 0 False 319 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 363 664 0,000941289266121427 0,000867538496045561 0,00080872816052491 0,000762951094834821 0,000687108370709816 0,000607710276299274 35717 37808 579 665 0 False 363 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 407 664 0,000899860626360448 0,000948101542480601 0,000732433051041428 0,000778210116731518 0,000715525440046206 0,000739580029568488 34145 41319 579 665 0 False 407 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 452 665 0,000998082344165262 0,00081783768186775 0,000778210116731518 0,00064087891966125 0,000850978261299224 0,000714352233581737 37872 35642 579 665 0 False 452 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 496 665 0,000932750538842446 0,000856708032383545 0,00064087891966125 0,000579842832074464 0,000862882540884397 0,000847657559619886 35393 37336 579 665 0 False 496 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 540 665 0,000807384101601367 0,00084002636483633 0,000503547722590982 0,000473029678797589 0,000797048897005962 0,0008546355697985 30636 36609 579 665 0 False 540 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 584 665 0,000926267431093591 0,000920199331012356 0,000747692072938125 0,00080872816052491 0,000728011682892879 0,000632558105952827 35147 40103 579 665 0 False 584 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 628 665 0,000979845309359539 0,000920956545632793 0,000823987182421607 0,000747692072938125 0,000705818721812603 0,000722147576484504 37180 40136 579 665 0 False 628 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 672 671 0,00100453909781758 0,0723814801365969 0,00080872816052491 0,0720378423743038 0,000779424493447677 0,0240183525630375 38117 3154441 579 665 0 True 672 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E4_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E4_1.csv new file mode 100755 index 0000000..d23ee28 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E4_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 250 251 0,0102016480968289 0,0456573569423674 0,0101777676050965 0,0458686198214694 0,00164066463814969 0,00957568924895143 416516 1989783 623 665 0 True 251 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 295 251 0,0102706443483265 0,0101905943618488 0,0103150988021668 0,0102082856488899 0,00146557689976276 0,00136268888657389 419333 444114 623 665 0 False 295 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 339 251 0,0104516952148761 0,0664814703272257 0,0104829480430304 0,0663614862287327 0,00134149637154907 0,0106937063096738 426725 2897314 623 665 0 True 339 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 382 250 0,010500337939574 0,0934707333680964 0,010406652933547 0,0944686045624475 0,00129977841791536 0,0166456477584109 428711 4073527 623 665 0 True 383 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 427 251 0,0104841726836321 0,0745466779789942 0,0105287251087205 0,0719157701991302 0,00164068683327208 0,0140623346979864 428051 3248802 623 665 0 True 427 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 471 249 0,0104672481505171 0,0704746072092568 0,0103913939116503 0,0738536659800107 0,0016085245345043 0,0217892710186217 427360 3071338 623 665 0 True 472 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 515 249 0,0100246385442648 0,0855796162413358 0,0100099183642329 0,0851300831616693 0,00161284176513556 0,0252891903482275 409289 3729626 623 665 0 True 516 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 559 248 0,0101763960076227 0,0719375229100446 0,0102082856488899 0,072480354009308 0,00153566453038956 0,0226406392557779 415485 3135093 623 665 0 True 560 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 604 251 0,0100249324580092 0,0100037000259862 0,010101472495613 0,0100709544518196 0,00193556223971633 0,00196932109581132 409301 435969 623 665 0 False 604 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 645 248 0,0099999987753594 0,0447735956967264 0,0100099183642329 0,0457160296025025 0,00182518584825629 0,0100340935683383 408283 1951268 623 665 0 True 649 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 251 294 0,0100787921516703 0,0102232004823228 0,0101167315175097 0,0101777676050965 0,00139037860133884 0,00152835023533392 411500 445535 623 665 0 False 251 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 295 294 0,0103542873014199 0,0101525271177486 0,010452429999237 0,0101625085831998 0,00135148480502435 0,00139929742342956 422748 442455 623 665 0 False 295 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 340 294 0,0104526749273574 0,114871500105264 0,0105287251087205 0,11436636911574 0,00142169931287964 0,0286905415144501 426765 5006189 623 665 0 True 339 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 383 295 0,0105082491178608 0,0546284686309502 0,0105287251087205 0,0533607995727474 0,00138461868447251 0,00828561504334334 429034 2380751 623 665 0 True 383 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 427 295 0,0103641089190453 0,0809043666616759 0,0103150988021668 0,0784771496147097 0,00166382931279871 0,016040048969398 423149 3525875 623 665 0 True 428 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 472 294 0,0106471233620891 0,0428442816815442 0,010452429999237 0,0441748683909361 0,00292237294159838 0,00744107000210734 434704 1867187 623 665 0 True 472 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 516 293 0,0101744855682841 0,0508637352135202 0,0101777676050965 0,0523842221713588 0,00158054823483046 0,0137762240310612 415407 2216681 623 665 0 True 516 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 559 292 0,0101136209303815 0,0538637048102059 0,0102082856488899 0,0560311284046693 0,00165081502301301 0,014086560441658 412922 2347422 623 665 0 True 560 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 604 294 0,0100260591273627 0,00997455873604818 0,00994888227664607 0,00994888227664607 0,00194488108854686 0,00188428702806707 409347 434699 623 665 0 False 604 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 649 294 0,00990359506719664 0,00986657534199426 0,00999465934233616 0,0098115510795758 0,00179422945284295 0,00198997391186801 404347 429993 623 665 0 False 649 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 251 340 0,0102748816048082 0,0563031520205871 0,01025406271458 0,0562600137331197 0,00161070373186273 0,0115436141103644 419506 2453735 623 665 0 True 251 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 295 340 0,0104350890883175 0,0650033185504388 0,0104982070649271 0,0685740444037537 0,00131356957703568 0,0176527014288502 426047 2832895 623 665 0 True 295 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 338 339 0,0105347013548566 0,0403435689246004 0,0105745021744106 0,0425574120698863 0,00130790810147851 0,00826755732754001 430114 1758204 623 665 0 True 339 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 383 340 0,0103916388397706 0,0371997514959291 0,0104371709773404 0,0378271152819104 0,00131015266637104 0,00676047596528658 424273 1621194 623 665 0 True 383 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 428 339 0,0104969579315134 0,0798900203128558 0,0105287251087205 0,0754253452353704 0,00163690280204348 0,01589408473545 428573 3481669 623 665 0 True 428 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 472 338 0,0102679256461908 0,0343108859353694 0,0102693217364767 0,0354161898222324 0,00169787761215731 0,00518999951889191 419222 1495295 623 665 0 True 472 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 516 338 0,0101138658585018 0,0294966989458081 0,0101319905394064 0,0296940566109712 0,00161915294798489 0,00319973894031951 412932 1285489 623 665 0 True 516 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 560 338 0,0104347461889491 0,0544757177907001 0,0104371709773404 0,0545662623025864 0,00176406729654884 0,00996422412285171 426033 2374094 623 665 0 True 560 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 604 337 0,0102410570313904 0,057776278645802 0,0102388036926833 0,0591897459372854 0,00208286462302009 0,013277957409282 418125 2517935 623 665 0 True 604 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 648 337 0,00998831570401955 0,065346336773497 0,0100709544518196 0,0653696498054475 0,00187846322035951 0,0175948940948963 407806 2847844 623 665 0 True 649 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 250 384 0,0103528177326979 0,0435710470958812 0,0102998397802701 0,0469367513542382 0,00166243889491287 0,0111620025074276 422688 1898860 623 665 0 True 251 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 295 384 0,0103700361795573 0,0324625250468813 0,0102388036926833 0,03247119859617 0,00142673946823208 0,00369516494274944 423391 1414742 623 665 0 True 295 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 339 384 0,010568183028906 0,0908788106682362 0,0105897611963073 0,0888990615701534 0,00144663630078476 0,0220630967944853 431481 3960569 623 665 0 True 339 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 383 383 0,0106080818197082 0,0703962240230928 0,0104829480430304 0,069413290608072 0,001395162073157 0,0188281308003303 433110 3067922 623 665 0 True 383 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 427 383 0,0105416573134741 0,0455066712329003 0,0105439841306172 0,0469520103761349 0,00163255069643955 0,00895343462506781 430398 1983216 623 665 0 True 428 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 472 382 0,0107286354405357 0,0558842746600995 0,0107270923933776 0,0565194171053635 0,00176458494023315 0,0109539911239127 438032 2435480 623 665 0 True 472 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 516 382 0,0104247531216395 0,0436282512185706 0,010406652933547 0,0443884946974899 0,00176922419299142 0,00559505565757405 425625 1901353 623 665 0 True 516 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 560 382 0,010372779374505 0,055043032162691 0,0104829480430304 0,0539864194705119 0,00167276499857827 0,0092982894849021 423503 2398818 623 665 0 True 560 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 604 382 0,0102234956851625 0,0447339910774877 0,0102082856488899 0,0448310063324941 0,00199179874370213 0,00906306862934052 417408 1949542 623 665 0 True 604 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 648 382 0,0100266714476636 0,0942173699297454 0,0100404364080262 0,0900892652780957 0,00181020234888387 0,021326922115561 409372 4106066 623 665 0 True 649 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 251 428 0,0105088859309736 0,0432113701511733 0,0103761348897536 0,0439002059967956 0,00190877996125177 0,00823347298858157 429060 1883185 623 665 0 True 251 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 295 427 0,0105745021744106 0,0572538464494952 0,0105592431525139 0,0570077058060578 0,00152215606930327 0,00888113765410328 431739 2495167 623 665 0 True 295 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 339 428 0,0106174625667169 0,0355877792444031 0,010605020218204 0,0366216525520714 0,00137771115054698 0,0049882716980579 433493 1550943 623 665 0 True 339 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 383 428 0,0108449762976935 0,0564183633723815 0,010955977721828 0,0547798886091402 0,00150930946052683 0,0125978893872139 442782 2458756 623 665 0 True 383 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 428 427 0,0110104252429779 0,098929034648879 0,0110017547875181 0,0982833600366217 0,00177603996670736 0,0170724589654942 449537 4311404 623 665 0 True 428 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 472 426 0,0108812501523147 0,0628379141949633 0,0109102006561379 0,0621347371633478 0,00176830621185215 0,0167470340693926 444263 2738525 623 665 0 True 472 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 516 426 0,0106756329952958 0,0559646541393539 0,0107118333714809 0,0549629968719005 0,00170250985638839 0,0113400047255509 435868 2438983 623 665 0 True 516 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 561 426 0,0104225242757445 0,0319094830231908 0,0104371709773404 0,0322117952239261 0,00178014004908466 0,00410586250597794 425534 1390640 623 665 0 True 560 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 605 426 0,0103060119689025 0,0395997088165596 0,0103303578240635 0,0399633783474479 0,00195745468782728 0,00488047187281512 420777 1725786 623 665 0 True 604 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 649 425 0,0102160253774924 0,0694017947133799 0,0101777676050965 0,0699778744182498 0,00190306238676949 0,0131068102729783 417103 3024584 623 665 0 True 649 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 252 473 0,0102033870864833 0,0546947593290849 0,0102082856488899 0,0557717250324254 0,00155301317947524 0,0138303050242954 416587 2383640 623 665 0 True 251 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 296 472 0,0103679297977224 0,0566046611149067 0,0102998397802701 0,0562142366674296 0,00154190210637636 0,00680659887838764 423305 2466875 623 665 0 True 295 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 340 472 0,0106882467934929 0,0715230511618942 0,0107118333714809 0,0693827725642786 0,00144191001106633 0,0176459102085348 436383 3117030 623 665 0 True 339 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 385 471 0,0110050613171426 0,0953634027848289 0,010955977721828 0,0901350423437858 0,0015268800881731 0,0219256640704822 449318 4156011 623 665 0 True 383 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 429 470 0,011018630335009 0,100802314782149 0,0110780498970016 0,0969558251316091 0,00185637868788473 0,0325786273373318 449872 4393043 623 665 0 True 428 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 473 470 0,0109702080456193 0,048602784140484 0,0109712367437247 0,049256122682536 0,00195908331907132 0,00855849821516616 447895 2118147 623 665 0 True 472 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 517 470 0,0106798947445896 0,0406677715116356 0,0107270923933776 0,0419317921721218 0,0017098131252263 0,00584199771370496 436042 1772333 623 665 0 True 516 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 561 470 0,0108570267612138 0,105962847149919 0,010955977721828 0,104875257495995 0,0017920591476013 0,0192571954429443 443274 4617943 623 665 0 True 560 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 606 470 0,0104108656972167 0,0625731414826836 0,0104982070649271 0,0651865415426871 0,00195085691636016 0,0169735935359436 425058 2726986 623 665 0 True 604 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 650 470 0,0102613615725659 0,0765244996216795 0,0103608758678569 0,0736095216296635 0,00194377732457048 0,0128591119219351 418954 3334997 623 665 0 True 649 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 252 516 0,0103567365826233 0,0592490151907578 0,0103303578240635 0,0616464484626535 0,00146168766536452 0,015112454587379 422848 2582118 623 665 0 True 251 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 296 516 0,0103826254849424 0,109521572298795 0,0103303578240635 0,107011520561532 0,00151239564848462 0,0262941930042872 423905 4773035 623 665 0 True 295 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 341 516 0,0105815805970882 0,0594090169346461 0,010605020218204 0,0608529793240253 0,00151752948920728 0,0139722808406244 432028 2589091 623 665 0 True 339 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 385 516 0,0109501484325641 0,0598939325883948 0,0107881284809644 0,0588235294117647 0,00168465207911723 0,00874472654959398 447076 2610224 623 665 0 True 383 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 430 516 0,0110363876237331 0,0578913064304157 0,0110627908751049 0,0583657587548638 0,00194249167194289 0,00869695979816269 450597 2522948 623 665 0 True 428 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 474 514 0,010910274134574 0,0605305435711045 0,0108949416342412 0,0611581597619593 0,00192245801005884 0,0118629499211124 445448 2637968 623 665 0 True 472 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 518 514 0,0106142540083405 0,0736005268378087 0,0105134660868238 0,0704509040970474 0,00181346478077201 0,0182744844567391 433362 3207568 623 665 0 True 516 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 562 514 0,0104737142528939 0,0575176324881786 0,0105439841306172 0,0578622110322728 0,00184268717309421 0,0118469516178461 427624 2506663 623 665 0 True 560 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 606 515 0,0104437350509653 0,0431432208353339 0,0102693217364767 0,0428473334859236 0,0021382833544121 0,00481474982946034 426400 1880215 623 665 0 True 604 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 650 514 0,0101924143066924 0,0648043317265469 0,0101930266269932 0,065445944914931 0,00207933680002422 0,0129907207678729 416139 2824223 623 665 0 True 649 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 253 561 0,0101299821288197 0,0479372842727097 0,010101472495613 0,0489509422446021 0,00134700415471815 0,0092998076307493 413590 2089144 623 665 0 True 251 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 297 560 0,0103122331431589 0,0533393222126041 0,0103608758678569 0,0543221179522393 0,00143572694367051 0,0106618153227743 421031 2324569 623 665 0 True 295 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 341 560 0,0105972070111654 0,0510564807532679 0,0106355382619974 0,0507972838941024 0,00145404568633659 0,00891824936401031 432666 2225081 623 665 0 True 339 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 385 561 0,0108210713131491 0,051779666607581 0,0107423514152743 0,0497901884489204 0,00141948379877537 0,00930501311547488 441806 2256598 623 665 0 True 383 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 430 559 0,0107303009517539 0,0869468246032798 0,0108033875028611 0,0816052491035325 0,00178531754181568 0,019191619552732 438100 3789210 623 665 0 True 428 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 474 558 0,0106434984259082 0,0601725416769206 0,0106660563057908 0,0598001068131533 0,00204060496171266 0,0119274409735945 434556 2622366 623 665 0 True 472 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 519 558 0,0104477763649507 0,0535965916163721 0,010406652933547 0,0535591668574044 0,00185392522875866 0,00659201895353813 426565 2335781 623 665 0 True 516 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 562 558 0,0102571977945202 0,0368839241615139 0,0102693217364767 0,0380560006103609 0,00176228978393945 0,00739691191186326 418784 1607430 623 665 0 True 560 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 606 558 0,0102023338955658 0,0472457178652743 0,0101777676050965 0,0478828107118334 0,00162233207848329 0,00586258284801151 416544 2059005 623 665 0 True 604 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 651 557 0,0101194747124574 0,054675828963574 0,0100862134737163 0,0548104066529335 0,00176191057166957 0,00820622431771885 413161 2382815 623 665 0 True 649 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 251 598 0,0100684071993682 0,0100517487355376 0,0100099183642329 0,0100404364080262 0,00177026301777808 0,001331731132374 411076 438063 623 665 0 False 251 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 295 598 0,0102073059364086 0,0100096200675642 0,0101777676050965 0,0100251773861295 0,00140495775259694 0,00145865332171484 416747 436227 623 665 0 False 295 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 342 604 0,0103434124928772 0,0735361406491739 0,0103761348897536 0,0709544518196384 0,0014036954304781 0,0107677189660395 422304 3204762 623 665 0 True 339 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 386 604 0,0105167236308243 0,0735134012646631 0,0105134660868238 0,0706492713817044 0,00148643782814593 0,0183256483505757 429380 3203771 623 665 0 True 383 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 428 598 0,0105146172489894 0,0103992643545233 0,0105439841306172 0,0103456168459602 0,00188035358212729 0,0018906514671212 429294 453208 623 665 0 False 428 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 472 598 0,0104945821287462 0,0103660386948144 0,0104219119554437 0,0103761348897536 0,00198372944687041 0,00189530817814841 428476 451760 623 665 0 False 472 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 516 598 0,0101875157442857 0,0101117981495281 0,0102235446707866 0,0101930266269932 0,00201471219879103 0,00203091985729999 415939 440680 623 665 0 False 516 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 560 598 0,010018172441888 0,0099467253622727 0,0100404364080262 0,00984206912336919 0,00191167067995006 0,00189676904817586 409025 433486 623 665 0 False 560 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 604 598 0,0101402936026857 0,00995078678614596 0,0101625085831998 0,00994888227664607 0,00152964066720344 0,00157847344670731 414011 433663 623 665 0 False 604 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 649 598 0,0100163844666096 0,00993249890576751 0,0100404364080262 0,0100251773861295 0,00151129482404529 0,00152456286818139 408952 432866 623 665 0 False 649 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 253 648 0,0100007090669084 0,0427838880790899 0,00994888227664607 0,0431830319676509 0,00135613538641042 0,00811249755365692 408312 1864555 623 665 0 True 251 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 295 641 0,00993411311099003 0,00970427900834714 0,00993362325474937 0,00970473792629892 0,00131761887240905 0,00126036270598084 405593 422920 623 665 0 False 295 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 339 641 0,0105176543576815 0,00978002341628849 0,0102082856488899 0,00976577401388571 0,00282855386115915 0,00126123160756936 429418 426221 623 665 0 False 339 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 383 641 0,0102895038135921 0,00996005692877192 0,0101167315175097 0,00997940032043946 0,00190178961355337 0,00134397178058165 420103 434067 623 665 0 False 383 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 428 641 0,0101060281586512 0,0100542498383748 0,0101319905394064 0,0101167315175097 0,00159488425534375 0,00163395674068749 412612 438172 623 665 0 False 428 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 472 641 0,00999605543262205 0,0103671630437963 0,00999465934233616 0,0100709544518196 0,00180875538236889 0,0031926601663853 408122 451809 623 665 0 False 472 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 516 641 0,00981324108360609 0,00986237624273547 0,0097962920576791 0,00996414129854276 0,00169955031149662 0,0017839567571496 400658 429810 623 665 0 False 516 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 560 641 0,00981561688637331 0,00991691864130457 0,00994888227664607 0,00985732814526589 0,00160050766019485 0,00160032469716821 400755 432187 623 665 0 False 560 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 604 641 0,00985137639194182 0,00992405481545475 0,00984206912336919 0,00991836423285267 0,00142660858325226 0,00135062970997309 402215 432498 623 665 0 False 604 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 650 646 0,0107131804761427 0,0433915642849399 0,00996414129854276 0,0433966582742046 0,00522876786420353 0,00745581405165727 437401 1891038 623 665 0 True 649 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E4_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E4_2.csv new file mode 100755 index 0000000..badcdf1 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E4_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 250 251 0,00808243202846653 0,689523786577912 0,00799572747386892 0,695201037613489 0,00204152083611398 0,20377253378941 329992 30049981 623 665 9 True 251 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 295 251 0,00694476540233546 0,00679682727074037 0,00688181887541009 0,00679026474402991 0,00136399490013215 0,00121223222220436 283543 296211 623 665 0 False 295 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 339 251 0,00631956188237547 0,00640034510629974 0,00636301213092241 0,0064087891966125 0,00120176787837027 0,00120327963727262 258017 278932 623 665 0 True 339 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 382 250 0,00629751835154558 0,00657578943926536 0,00627145799954223 0,00656137941557946 0,00118791816031146 0,00119123919731339 257117 286578 623 665 0 True 383 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 427 251 0,00651241828432505 0,00651984734094334 0,00646982528419928 0,00651560234988937 0,00144965089242019 0,00150013710916234 265891 284140 623 665 0 True 427 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 471 249 0,00681272465266437 0,00682908920275052 0,0068207827878233 0,00689707789730678 0,0014278894661593 0,00145684305686156 278152 297617 623 665 0 True 472 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 515 249 0,00677052353753113 0,00691662780205263 0,00674448767833982 0,00689707789730678 0,00147205613568804 0,00146992940050415 276429 301432 623 665 0 True 516 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 559 248 0,00729645769032048 0,00722309321025154 0,00730907148851759 0,00720225833524071 0,0014218522269897 0,00133854249301253 297902 314788 623 665 0 True 560 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 604 251 0,00801938753029302 0,0078087872462112 0,00802624551766232 0,00784313725490196 0,00202335209211889 0,0018389631753992 327418 340313 623 665 0 False 604 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 645 248 0,00921485719282248 0,685027560891242 0,00915541313801785 0,689433127336538 0,00181502723132431 0,213362315566918 376227 29854032 623 665 9 True 649 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 251 294 0,00679543272736892 0,00642677878032229 0,00671396963454643 0,0064087891966125 0,00165597334731759 0,00140413597283801 277446 280084 623 665 0 False 251 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 295 294 0,00649946158675948 0,00640218077810686 0,00651560234988937 0,00643930724040589 0,00125944307492603 0,00127245355420265 265362 279012 623 665 0 False 295 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 340 294 0,00638456580551164 0,00633173687250858 0,0063935301747158 0,0064087891966125 0,00118425387980814 0,00133834435440744 260671 275942 623 665 0 True 339 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 383 295 0,00659733486364423 0,00664561380562874 0,00663767452506294 0,00669871061264973 0,0012140194003778 0,00112647353108978 269358 289621 623 665 0 True 383 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 427 295 0,00655807288595498 0,00670389638550485 0,00662241550316625 0,00677500572213321 0,00154563988909618 0,00156077108260051 267755 292161 623 665 0 True 428 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 472 294 0,00688563975408727 0,00687124081662155 0,00691233691920348 0,00686655985351339 0,00179947255170951 0,00185450319943079 281129 299454 623 665 0 True 472 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 516 293 0,0069441285892226 0,0068556834980562 0,00695811398489357 0,00689707789730678 0,00154035136096123 0,00148207815664345 283517 298776 623 665 0 True 516 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 559 292 0,00713238034250993 0,0074314649062574 0,00715648126955062 0,00741588464179446 0,00156379285548807 0,00149334123345328 291203 323869 623 665 0 True 560 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 604 294 0,00751118617341572 0,0076153303836382 0,00752269779507134 0,0076600289921416 0,00193124492841568 0,00188647390157961 306669 331882 623 665 0 False 604 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 649 294 0,00814212101139148 0,00798255652865283 0,00816357671473259 0,00799572747386892 0,00180840826570362 0,00197282210918656 332429 347886 623 665 0 False 649 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 251 340 0,00616104440289647 0,00629791461946237 0,00619516289005875 0,00627145799954223 0,00145497772705717 0,00146344370863643 251545 274468 623 665 0 True 251 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 295 340 0,00624071952044054 0,00639403498446276 0,00617990386816205 0,00646982528419928 0,00130964637603929 0,00126143732611739 254798 278657 623 665 0 True 295 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 338 339 0,00647462587535779 0,00645908660412762 0,00645456626230259 0,00646982528419928 0,00130979782375598 0,00127872794570563 264348 281492 623 665 0 True 339 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 383 340 0,00677867964393819 0,0069139660779323 0,0068207827878233 0,00691233691920348 0,00126890286372286 0,00126713567130016 276762 301316 623 665 0 True 383 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 428 339 0,00688439062067357 0,00701472151424567 0,00685130083161669 0,00708018616006714 0,00153213309030669 0,00165704859763986 281078 305707 623 665 0 True 428 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 472 338 0,00709938852470118 0,00689634362858393 0,00704966811627375 0,00692759594110018 0,00153631278611145 0,00156655949060858 289856 300548 623 665 0 True 472 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 516 338 0,00706975222214099 0,00700217010826448 0,00704966811627375 0,00701915007248035 0,00163671715443809 0,0015561100439075 288646 305160 623 665 0 True 516 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 560 338 0,00724215712604283 0,00708739117191009 0,00727855344472419 0,00706492713817044 0,00165100727027741 0,00143848112065047 295685 308874 623 665 0 True 560 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 604 337 0,00754341871405144 0,00739904235296412 0,00753795681696803 0,00735484855420768 0,00196917657844733 0,00210420574055618 307985 322456 623 665 0 True 604 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 648 337 0,00722315070390505 0,00742157522439654 0,00715648126955062 0,00743114366369116 0,00192163142468621 0,00177665543001747 294909 323438 623 665 0 True 649 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 250 384 0,00632335826824062 0,00636383818323561 0,00634775310902571 0,00633249408712902 0,00146910636539405 0,00141641801980209 258172 277341 623 665 0 True 251 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 295 384 0,00649230968564578 0,00654816257856819 0,00646982528419928 0,00651560234988937 0,0013266903822478 0,00135419437258001 265070 285374 623 665 0 True 295 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 339 384 0,00672151342065266 0,00684219131027385 0,00671396963454643 0,00683604180972 0,00127137070659771 0,00139073013591339 274428 298188 623 665 0 True 339 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 383 383 0,00683704601501336 0,00717933538354928 0,00685130083161669 0,00715648126955062 0,00129323300884044 0,00134701952471946 279145 312881 623 665 0 True 383 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 427 383 0,00709965794563355 0,00722768238976934 0,00714122224765393 0,00718699931334401 0,0014803184674125 0,00167234205833942 289867 314988 623 665 0 True 428 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 472 382 0,00730493220328397 0,00729266517174144 0,00730907148851759 0,0072327763790341 0,00163443673293126 0,00168560145439601 298248 317820 623 665 0 True 472 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 516 382 0,00717284246798881 0,00711963015802266 0,00721751735713741 0,00711070420386053 0,00165761061867489 0,00174028770385589 292855 310279 623 665 0 True 516 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 560 382 0,00726701733025655 0,0073094615687766 0,00730907148851759 0,00737010757610437 0,00167769029057516 0,00149694605882311 296700 318552 623 665 0 True 560 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 604 382 0,00708376211062399 0,00718133167663953 0,00708018616006714 0,00715648126955062 0,00188845841619623 0,00192836554141151 289218 312968 623 665 0 True 604 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 648 382 0,00673006141205225 0,00669540640339691 0,00663767452506294 0,00672922865644312 0,00187143826921004 0,00175047495642486 274777 291791 623 665 0 True 649 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 251 428 0,00638147971119546 0,00634178717565257 0,00630197604333562 0,0063782711528191 0,00154268949087166 0,00143189249627294 260545 276380 623 665 0 True 251 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 295 427 0,00659206890905709 0,00669095489926464 0,00663767452506294 0,00663767452506294 0,00141902028647859 0,0014134037448186 269143 291597 623 665 0 True 295 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 339 428 0,00698848507181476 0,006889528697 0,00698863202868696 0,00691233691920348 0,00141211448235995 0,00129898698870255 285328 300251 623 665 0 True 339 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 383 428 0,00692781637640847 0,00702190358019104 0,00692759594110018 0,00704966811627375 0,00134802171504147 0,00125917884277229 282851 306020 623 665 0 True 383 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 428 427 0,00702483240487206 0,0072317438136426 0,00704966811627375 0,00733958953231098 0,00162181382334397 0,00156638486796678 286812 315165 623 665 0 True 428 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 472 426 0,00717051565084566 0,00724530483911771 0,00720225833524071 0,00727855344472419 0,00170853780560717 0,00149764888914787 292760 315756 623 665 0 True 472 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 516 426 0,00735026839835746 0,00714803717923786 0,00732433051041428 0,00714122224765393 0,00165855405554503 0,00168606607030629 300099 311517 623 665 0 True 516 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 561 426 0,00703996896270859 0,00715671072852651 0,00701915007248035 0,00720225833524071 0,00166873621000866 0,00166451942283218 287430 311895 623 665 0 True 560 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 605 426 0,00633413510553524 0,00644596155070671 0,00642404821850919 0,0063935301747158 0,00190321831907531 0,00174711805518526 258612 280920 623 665 0 True 604 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 649 425 0,00630398445392235 0,00638031333770453 0,00636301213092241 0,0063935301747158 0,00185489918127386 0,00180765385007224 257381 278059 623 665 0 True 649 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 252 473 0,00653514761389188 0,00658026388929522 0,00657663843747616 0,00657663843747616 0,00151967834530512 0,00132457758521129 266819 286773 623 665 0 True 251 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 296 472 0,0066262118890314 0,00666605860038056 0,00663767452506294 0,00671396963454643 0,00147317601166277 0,00150376354947989 270537 290512 623 665 0 True 295 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 340 472 0,00673069822516512 0,00678909450325287 0,0068055237659266 0,00683604180972 0,00145028179314602 0,00153055347218615 274803 295874 623 665 0 True 339 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 385 471 0,00677299731154649 0,00699526339309019 0,0068055237659266 0,00700389105058366 0,00146404092204065 0,00147785059753838 276530 304859 623 665 0 True 383 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 429 470 0,00694513279451596 0,00714865671847277 0,00695811398489357 0,00706492713817044 0,00190684451450119 0,00193336935249249 283558 311544 623 665 0 True 428 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 473 470 0,00711910523838793 0,00719080833234379 0,00715648126955062 0,00717174029144732 0,00189627931703236 0,00190572965302369 290661 313381 623 665 0 True 472 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 517 470 0,00690856502615036 0,00670137233677006 0,00691233691920348 0,00662241550316625 0,00179159634654032 0,00165589902840774 282065 292051 623 665 0 True 516 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 561 470 0,00624970838245673 0,00626719006259067 0,00625619897764553 0,00622568093385214 0,00177649711735697 0,00175979445026667 255165 273129 623 665 0 True 560 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 606 470 0,0061402010198562 0,00618570918025207 0,00617990386816205 0,00624093995574884 0,00177243395859701 0,00155008560665391 250694 269578 623 665 0 True 604 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 650 470 0,00630841765290036 0,00633616543074326 0,00619516289005875 0,00627145799954223 0,00179541559655905 0,00169406463413759 257562 276135 623 665 0 True 649 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 252 516 0,00654523865244957 0,00658349926085527 0,00648508430609598 0,00663767452506294 0,00138497273966045 0,00138229352638084 267231 286914 623 665 0 True 251 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 296 516 0,00665094962918495 0,00673269348697906 0,00672922865644312 0,00674448767833982 0,0014589286543577 0,00146842660099701 271547 293416 623 665 0 True 295 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 341 516 0,00676229395268797 0,0067248918817988 0,00679026474402991 0,00677500572213321 0,00149437518135132 0,00146771833087474 276093 293076 623 665 0 True 339 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 385 516 0,00689876790133708 0,00700295026878251 0,00685130083161669 0,00695811398489357 0,00153682501967516 0,0019468558988271 281665 305194 623 665 0 True 383 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 430 516 0,00682597526397434 0,00701501981091433 0,00691233691920348 0,00697337300679027 0,00183931898337783 0,0019592870828144 278693 305720 623 665 0 True 428 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 474 514 0,00665665645438869 0,00672856322541304 0,00665293354695964 0,0068055237659266 0,00174452268568347 0,00158552998061381 271780 293236 623 665 0 True 472 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 518 514 0,0063144183918485 0,00661798694493157 0,00642404821850919 0,00660715648126955 0,00167759793462583 0,00163366378238642 257807 288417 623 665 0 True 516 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 562 514 0,00615330467429397 0,00633554589150835 0,00613412680247196 0,00630197604333562 0,00174648460941078 0,00169213321979747 251229 276108 623 665 0 True 560 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 606 515 0,00635938719474149 0,00627540469392754 0,00621042191195544 0,00636301213092241 0,0018984707365832 0,001759102278764 259643 273487 623 665 0 True 604 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 650 514 0,00644572435715859 0,00631888716985873 0,00636301213092241 0,00631723506523232 0,00177792664491293 0,00184509581731486 263168 275382 623 665 0 True 649 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 253 561 0,00683386194944904 0,00681403669393213 0,00686655985351339 0,00679026474402991 0,00123780539404692 0,00125798116370496 279015 296961 623 665 0 True 251 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 297 560 0,00680324593440751 0,00674281262781582 0,0068207827878233 0,00671396963454643 0,00143923011977713 0,00123543278151959 277765 293857 623 665 0 True 295 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 341 560 0,00678272095792368 0,00681066364698654 0,0068207827878233 0,0068207827878233 0,00133722917027959 0,00130089426015934 276927 296814 623 665 0 True 339 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 385 561 0,00671715370011074 0,00672351512794346 0,00669871061264973 0,00675974670023652 0,00133625356920576 0,00121332218529275 274250 293016 623 665 0 True 383 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 430 559 0,00664791252049283 0,00650773190701634 0,00671396963454643 0,0063935301747158 0,00172344915408742 0,00195947192579413 271423 283612 623 665 0 True 428 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 474 558 0,00652579135969519 0,0066914597090116 0,00654612039368277 0,00671396963454643 0,00187627707433695 0,00195300563445932 266437 291619 623 665 0 True 472 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 519 558 0,00635999951504232 0,00636555912555479 0,0064087891966125 0,00633249408712902 0,00201367579965987 0,00189122199095379 259668 277416 623 665 0 True 516 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 562 558 0,00657705481528072 0,00651633661861222 0,00659189745937285 0,00656137941557946 0,00170881346377214 0,00175807104288075 268530 283987 623 665 0 True 560 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 606 558 0,00663576408572435 0,00653054012921982 0,00671396963454643 0,00648508430609598 0,00157940821160808 0,00152352080803678 270927 284606 623 665 0 True 604 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 651 557 0,00652326860005577 0,00654568442162857 0,00656137941557946 0,00651560234988937 0,00163361386132278 0,0016326177081434 266334 285266 623 665 0 True 649 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 251 598 0,00690200095252546 0,0068669499337724 0,00689707789730678 0,00688181887541009 0,00127003253105436 0,00115952481514592 281797 299267 623 665 0 False 251 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 295 598 0,00696918473593258 0,00698787481406652 0,00698863202868696 0,00694285496299687 0,00131031300567765 0,00146829982277836 284540 304537 623 665 0 False 295 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 342 604 0,00663745408975464 0,00664742653153828 0,00663767452506294 0,00659189745937285 0,00138705347560013 0,00146824640909722 270996 289700 623 665 0 True 339 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 386 604 0,0064599546809499 0,00669171211388508 0,00642404821850919 0,00666819256885634 0,00128455168571826 0,00118132422297768 263749 291630 623 665 0 True 383 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 428 598 0,0064796469018246 0,00641213929766049 0,00653086137178607 0,00648508430609598 0,00172609851746486 0,00173872439339078 264553 279446 623 665 0 False 428 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 472 598 0,00649466099560097 0,0066020395461072 0,00651560234988937 0,00659189745937285 0,00177161798592447 0,00186062260132505 265166 287722 623 665 0 False 472 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 516 598 0,00645865656191213 0,00651771337246756 0,00642404821850919 0,00650034332799268 0,00197005332815122 0,00204032012537985 263696 284047 623 665 0 False 516 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 560 598 0,00636629416773486 0,00654403231700216 0,0063782711528191 0,00656137941557946 0,00178185315209019 0,00171441800469572 259925 285194 623 665 0 False 560 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 604 598 0,00651748829641593 0,00644577798352599 0,00654612039368277 0,00650034332799268 0,00145349525382528 0,00140003787368288 266098 280912 623 665 0 False 604 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 649 598 0,00673616012224852 0,00666110228650133 0,00672922865644312 0,00671396963454643 0,00149706726022291 0,00141614797867211 275026 290296 623 665 0 False 649 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 253 648 0,00842332298634489 0,685685511558709 0,00831616693369955 0,681055924315251 0,00172639607733793 0,19360154955829 343910 29882706 623 665 8 True 251 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 295 641 0,00737294874230022 0,00687959312334395 0,0072480354009308 0,00688181887541009 0,00167644672489156 0,00113404129980943 301025 299818 623 665 0 False 295 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 339 641 0,00641214471186105 0,00647799402374097 0,00643930724040589 0,00648508430609598 0,00130938437883023 0,00120582783665834 261797 282316 623 665 0 False 339 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 383 641 0,00626371827093973 0,00619757220930559 0,00628671702143893 0,00619516289005875 0,00119172501380014 0,00116023750563384 255737 270095 623 665 0 False 383 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 428 641 0,00631875361957838 0,00626705238720514 0,0063935301747158 0,00619516289005875 0,00155181354946603 0,00149409751758829 257984 273123 623 665 0 False 428 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 472 641 0,00606608577064368 0,0064643641605731 0,00605783169298848 0,0064087891966125 0,00165830254007845 0,00192728431674541 247668 281722 623 665 0 False 472 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 516 641 0,00649177084378105 0,00629516111175168 0,00645456626230259 0,00631723506523232 0,00171932593410768 0,00164442437544499 265048 274348 623 665 0 False 516 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 560 641 0,00633310640742985 0,00642407116440678 0,00628671702143893 0,00648508430609598 0,00169633653825683 0,0015149083282826 258570 279966 623 665 0 False 560 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 604 641 0,00663419654575423 0,00671713616841371 0,00668345159075303 0,00669871061264973 0,00131920183585568 0,0013182279662006 270863 292738 623 665 0 False 604 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 650 646 0,00879238067806146 0,704729826397075 0,00817883573662928 0,695307850766766 0,00391203456965206 0,18579204719056 358978 30712672 623 665 9 True 649 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E4_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E4_3.csv new file mode 100755 index 0000000..fd6d306 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E4_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 250 251 0,00098546829215663 0,0687148404313599 0,000747692072938125 0,0683909361409934 0,000830016997175533 0,0221841615653202 40235 2994646 623 665 0 True 251 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 295 251 0,000930996278194747 0,000947963867095067 0,000762951094834821 0,000839246204318303 0,000699345987644148 0,000655812253264169 38011 41313 623 665 0 False 295 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 339 251 0,000902143745619614 0,000965288019774775 0,000762951094834821 0,000839246204318303 0,00063535964555389 0,000696911929731723 36833 42068 623 665 0 True 339 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 382 250 0,000944271382316753 0,000973273192135753 0,000793469138628214 0,000869764248111696 0,000683636580211161 0,000646369739165058 38553 42416 623 665 0 True 383 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 427 251 0,000966290420334618 0,00100631528466394 0,000793469138628214 0,000869764248111696 0,000794068245422579 0,000753290345289274 39452 43856 623 665 0 True 427 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 471 249 0,000965114765357024 0,000978734315761939 0,000762951094834821 0,000854505226215 0,000844452687155643 0,000799006412143471 39404 42654 623 665 0 True 472 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 515 249 0,000936286725593923 0,000874651724298157 0,000762951094834821 0,000671396963454643 0,000795518579913944 0,000780987413046232 38227 38118 623 665 0 True 516 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 559 248 0,000949904729084394 0,00104213383080039 0,000793469138628214 0,000885023270008392 0,000748715680408881 0,000765258862374609 38783 45417 623 665 0 True 560 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 604 251 0,000930628886014249 0,0010360531679393 0,000534065766384375 0,000671396963454643 0,00100383986102292 0,00104314172282682 37996 45152 623 665 0 False 604 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 645 248 0,00109899247593061 0,0683330665872739 0,000793469138628214 0,0668039978637369 0,00100088064284839 0,0231654505490988 44870 2978008 623 665 0 True 649 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 251 294 0,000933617009082302 0,000932658953403192 0,000778210116731518 0,000762951094834821 0,000723172810390688 0,000786436636689067 38118 40646 623 665 0 False 251 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 295 294 0,000988725836157048 0,000918616064078714 0,000900282291905089 0,000762951094834821 0,000706222405549633 0,000690231843097621 40368 40034 623 665 0 False 295 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 340 294 0,00089435503139305 0,000920520573578602 0,000793469138628214 0,000762951094834821 0,000642033705795963 0,000700769818369052 36515 40117 623 665 0 True 339 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 383 295 0,000944540803249118 0,00091962568357263 0,000839246204318303 0,00080872816052491 0,000659138805115599 0,000655198449528085 38564 40078 623 665 0 True 383 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 427 295 0,000848382023206694 0,000863155829606059 0,000595101853971161 0,000610360875867857 0,000828746289370591 0,000804857987099582 34638 37617 623 665 0 True 428 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 472 294 0,000890215746159435 0,000889818962604497 0,000671396963454643 0,000549324788281071 0,000830100826587411 0,000911069963962285 36346 38779 623 665 0 True 472 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 516 293 0,000910838693891407 0,000940093424222034 0,000732433051041428 0,000762951094834821 0,000818064222073408 0,000776128557326006 37188 40970 623 665 0 True 516 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 559 292 0,000867241488472274 0,000908129788880533 0,00064087891966125 0,000701915007248035 0,000823448157698563 0,000821696230934642 35408 39577 623 665 0 True 560 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 604 294 0,00101654967062679 0,000994039229453813 0,000686655985351339 0,000625619897764553 0,00105731547561021 0,00102562384878648 41504 43321 623 665 0 False 604 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 649 294 0,000919043785922536 0,00105677331346219 0,000518806744487678 0,000671396963454643 0,000961884109062739 0,00109858464752979 37523 46055 623 665 0 False 649 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 251 340 0,000893056912355289 0,000977977101141501 0,000717174029144732 0,000854505226215 0,000751295905879693 0,000776272240960309 36462 42621 623 665 0 True 251 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 295 340 0,000877601947962327 0,000893605035706685 0,000747692072938125 0,000747692072938125 0,000632527162395403 0,000704022780358944 35831 38944 623 665 0 True 295 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 338 339 0,000959677361085649 0,000901268965501417 0,000839246204318303 0,000793469138628214 0,000692151083622193 0,000682114305854275 39182 39278 623 665 0 True 339 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 383 340 0,000903294907785175 0,000944453144763947 0,000793469138628214 0,000793469138628214 0,000635960526690974 0,000677261828621178 36880 41160 623 665 0 True 383 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 428 339 0,000959481418589383 0,000887776777719075 0,000732433051041428 0,000595101853971161 0,000837082921108014 0,000858892680009577 39174 38690 623 665 0 True 428 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 472 338 0,000948900523791032 0,000927679693626375 0,000701915007248035 0,000747692072938125 0,000849712274729253 0,000770929017602129 38742 40429 623 665 0 True 472 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 516 338 0,000997322813180709 0,000901475478579718 0,00080872816052491 0,000625619897764553 0,000856267211507906 0,000898755860641805 40719 39287 623 665 0 True 516 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 560 338 0,000889040091181841 0,000936536810095736 0,000595101853971161 0,000717174029144732 0,000902748915011709 0,000814132912038656 36298 40815 623 665 0 True 560 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 604 337 0,000951717197174852 0,000876120261743854 0,000473029678797589 0,000274662394140536 0,0010794694987565 0,00110505347240458 38857 38182 623 665 0 True 604 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 648 337 0,000982896546893142 0,000947321381962574 0,000656137941557946 0,000625619897764553 0,000982662350497427 0,000936697455549002 40130 41285 623 665 0 True 649 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 250 384 0,000933861937202634 0,000886170564887843 0,000793469138628214 0,000717174029144732 0,00081398509810492 0,000745152763877 38128 38620 623 665 0 True 251 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 295 384 0,000909712024537879 0,00089534892392345 0,000778210116731518 0,000778210116731518 0,000705603485325907 0,000680801363160715 37142 39020 623 665 0 True 295 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 339 384 0,000978708276035461 0,00091356796660913 0,000839246204318303 0,00080872816052491 0,000759801394229975 0,000692835270549334 39959 39814 623 665 0 True 339 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 383 383 0,00090576868180053 0,000929561257228675 0,000747692072938125 0,000778210116731518 0,000693287224250107 0,000681672566289633 36981 40511 623 665 0 True 383 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 427 383 0,000978291898230896 0,000997366384604221 0,000793469138628214 0,000747692072938125 0,000833324130956363 0,000858082963254232 39942 43466 623 665 0 True 428 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 472 382 0,000945814429474846 0,00104676890211337 0,000610360875867857 0,000762951094834821 0,000916493964009887 0,000969603406447658 38616 45619 623 665 0 True 472 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 516 382 0,000898102431634132 0,000952805451486349 0,000595101853971161 0,000686655985351339 0,000886139582998515 0,000893141722393857 36668 41524 623 665 0 True 516 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 560 382 0,00092036639777233 0,000989427104038421 0,000671396963454643 0,000778210116731518 0,000872437099450084 0,000868859109168556 37577 43120 623 665 0 True 560 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 604 382 0,000895138801378112 0,00094110304371595 0,000488288700694286 0,000457770656900893 0,00102308245111571 0,00105297108060387 36547 41014 623 665 0 True 604 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 648 382 0,000901090554702185 0,000915174179440361 0,000473029678797589 0,000610360875867857 0,000992488895390488 0,000888087890690393 36790 39884 623 665 0 True 649 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 251 428 0,000939348327098076 0,000921920273331532 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,000777057739420136 0,000789617629169174 38352 40178 623 665 0 True 251 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 295 427 0,000835327354392988 0,000910952134283982 0,000686655985351339 0,000778210116731518 0,000728448998767444 0,000760007388728829 34105 39700 623 665 0 True 295 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 339 428 0,000977018272005169 0,000940116370119623 0,000839246204318303 0,00080872816052491 0,000733946846740557 0,000702516362727338 39890 40971 623 665 0 True 339 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 383 428 0,00100621370394877 0,000953149639950184 0,000885023270008392 0,000839246204318303 0,000745566905480815 0,000707724565465788 41082 41539 623 665 0 True 383 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 428 427 0,000985198871224265 0,000920727086656903 0,000717174029144732 0,000671396963454643 0,000925558996747146 0,000813167952705445 40224 40126 623 665 0 True 428 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 472 426 0,000887129651843249 0,00109155929420714 0,000610360875867857 0,000915541313801785 0,000845461537218629 0,000875575591612172 36220 47571 623 665 0 True 472 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 516 426 0,00106497196001646 0,00101875196115718 0,000793469138628214 0,000839246204318303 0,000949638471138349 0,000876091397706622 43481 44398 623 665 0 True 516 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 561 426 0,000857738277403385 0,000845051516408325 0,000610360875867857 0,000564583810177768 0,000871903456247031 0,000852662393355893 35020 36828 623 665 0 True 560 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 605 426 0,000963473746950798 0,000920750032554492 0,000579842832074464 0,000579842832074464 0,00106193394097115 0,000914618713129307 39337 40127 623 665 0 True 604 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 649 425 0,000780610412310773 0,000828278065270753 0,0004272526131075 0,000442511635004196 0,000859316455945285 0,000897147912647635 31871 36097 623 665 0 True 649 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 252 473 0,00094721051976074 0,000918868468952193 0,000778210116731518 0,000793469138628214 0,000771100285451491 0,00074010635505882 38673 40045 623 665 0 True 251 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 296 472 0,000894159088896784 0,000918042416638988 0,000747692072938125 0,00080872816052491 0,000808474569089754 0,000761646913342443 36507 40009 623 665 0 True 295 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 340 472 0,000949978207520494 0,000821050107530213 0,000823987182421607 0,000610360875867857 0,000762867057452127 0,000789756757323242 38786 35782 623 665 0 True 339 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 385 471 0,000876328321736599 0,000985434517857932 0,000701915007248035 0,000854505226215 0,000763093804209533 0,000805237819322719 35779 42946 623 665 0 True 383 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 429 470 0,000892346620806325 0,000889704233116552 0,000625619897764553 0,000518806744487678 0,00090177563364898 0,000962031335444556 36433 38774 623 665 0 True 428 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 473 470 0,00103043709504962 0,00098336938707492 0,000656137941557946 0,00064087891966125 0,00107093598712448 0,000999855062351564 42071 42856 623 665 0 True 472 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 517 470 0,000979173639464092 0,00097240124802737 0,000595101853971161 0,00064087891966125 0,00101899837194772 0,00092928150554199 39978 42378 623 665 0 True 516 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 561 470 0,000893473290159854 0,000880319361002644 0,000564583810177768 0,000534065766384375 0,000931687867066219 0,00096476152889614 36479 38365 623 665 0 True 560 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 606 470 0,00081899064876683 0,000939863965246143 0,0004272526131075 0,000610360875867857 0,000899264268439639 0,000943428834892446 33438 40960 623 665 0 True 604 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 650 470 0,000912087827305101 0,00085496414416678 0,000549324788281071 0,000503547722590982 0,00094767314157554 0,00089690610316 37239 37260 623 665 0 True 649 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 252 516 0,000996147158203114 0,000954618177395882 0,00080872816052491 0,000823987182421607 0,00080866283123421 0,000754853141470021 40671 41603 623 665 0 True 251 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 296 516 0,000886100953737854 0,000834565241210144 0,000732433051041428 0,000671396963454643 0,000775235492799021 0,00077758907431136 36178 36371 623 665 0 True 295 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 341 516 0,00088196166850424 0,000893146117754905 0,000762951094834821 0,000732433051041428 0,000751065699581685 0,000784177590684334 36009 38924 623 665 0 True 339 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 385 516 0,000931192220691013 0,000962901646425517 0,000732433051041428 0,000778210116731518 0,000815150413753171 0,000791541955287511 38019 41964 623 665 0 True 383 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 430 516 0,000901972295935381 0,000954365772522402 0,000503547722590982 0,000564583810177768 0,000949084392360293 0,000988759714742763 36826 41592 623 665 0 True 428 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 474 514 0,000998890353150835 0,000929997229282866 0,000610360875867857 0,000671396963454643 0,00102638160989963 0,000861389365290987 40783 40530 623 665 0 True 472 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 518 514 0,000936531653714255 0,000989014077881818 0,000656137941557946 0,000686655985351339 0,000911871079397658 0,00090101805862268 38237 43102 623 665 0 True 516 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 562 514 0,00087101338152539 0,000907074277591438 0,000549324788281071 0,000610360875867857 0,000902877244643589 0,000887824614682805 35562 39531 623 665 0 True 560 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 606 515 0,000904813462131235 0,000921300734096629 0,000595101853971161 0,000595101853971161 0,00094148554013638 0,000918718066038588 36942 40151 623 665 0 True 604 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 650 514 0,000916472040659048 0,000907326682464917 0,0004272526131075 0,000381475547417411 0,00105196813930536 0,00108164854173229 37418 39542 623 665 0 True 649 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 253 561 0,000937192959639152 0,00101085857238656 0,00080872816052491 0,000915541313801785 0,000707664219913962 0,000695731172512367 38264 44054 623 665 0 True 251 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 297 560 0,00098554177059273 0,000966114072087979 0,000885023270008392 0,000869764248111696 0,000725359502512155 0,000754247012756119 40238 42104 623 665 0 True 295 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 341 560 0,00101231241414504 0,000941057151920772 0,000900282291905089 0,00080872816052491 0,000724734035587144 0,000701149527565244 41331 41012 623 665 0 True 339 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 385 561 0,000931045263818814 0,00089511946494756 0,00080872816052491 0,000778210116731518 0,000691897806511487 0,000654860765808547 38013 39010 623 665 0 True 383 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 430 559 0,000830404299174311 0,000993350852526143 0,000503547722590982 0,000579842832074464 0,000864085899724009 0,00106328443286045 33904 43291 623 665 0 True 428 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 474 558 0,000855166532139897 0,000894155737248821 0,000473029678797589 0,000549324788281071 0,000952620791378195 0,000941302743141835 34915 38968 623 665 0 True 472 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 519 558 0,000960853016063243 0,000935068272650039 0,000488288700694286 0,000503547722590982 0,00105533513777962 0,0010316537192316 39230 40751 623 665 0 True 516 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 562 558 0,000918015087817141 0,000965930504907267 0,00064087891966125 0,000610360875867857 0,000894698804762032 0,000978026622724056 37481 42096 623 665 0 True 560 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 606 558 0,000854823632771432 0,000940667071661759 0,00064087891966125 0,000717174029144732 0,000785883613335386 0,000809671196855227 34901 40995 623 665 0 True 604 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 651 557 0,000899474029107993 0,000869236492467149 0,000579842832074464 0,000549324788281071 0,000937016064566675 0,000900724612142132 36724 37882 623 665 0 True 649 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 251 598 0,000962469541657436 0,000987683215821655 0,000854505226215 0,000854505226215 0,000701737532858425 0,000701003497022955 39296 43044 623 665 0 False 251 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 295 598 0,000986962353690656 0,00087527126353306 0,000854505226215 0,000747692072938125 0,000732395146156265 0,000718622157939889 40296 38145 623 665 0 False 295 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 342 604 0,000874785274578506 0,000887134292586582 0,000717174029144732 0,000762951094834821 0,000724355258840131 0,000766262178756009 35716 38662 623 665 0 True 339 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 386 604 0,000878557167631622 0,000878644310478646 0,000747692072938125 0,000762951094834821 0,000655565564994285 0,000635040948808848 35870 38292 623 665 0 True 383 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 428 598 0,000863004231990527 0,000969165876467318 0,000579842832074464 0,000656137941557946 0,000871969399596286 0,000966327406034069 35235 42237 623 665 0 False 428 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 472 598 0,000912014348869002 0,000945577493745809 0,000534065766384375 0,000579842832074464 0,000976111681196836 0,000961096787061716 37236 41209 623 665 0 False 472 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 516 598 0,000900845626581853 0,000979009666533007 0,000549324788281071 0,000701915007248035 0,0009697865318501 0,00107520317604176 36780 42666 623 665 0 False 516 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 560 598 0,000873805562097177 0,00096843160774447 0,000488288700694286 0,000610360875867857 0,000943691118651467 0,000950918715325817 35676 42205 623 665 0 False 560 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 604 598 0,000935111070616329 0,000907074277591438 0,000717174029144732 0,000656137941557946 0,000831238773132346 0,000780985052791732 38179 39531 623 665 0 False 604 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 649 598 0,000926636557652834 0,000949615971721476 0,000717174029144732 0,000717174029144732 0,0007882020968155 0,000837997826742734 37833 41385 623 665 0 False 649 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 253 648 0,00108174953625922 0,0682134037313471 0,000961318379491875 0,0669871061264973 0,000726783990207723 0,0209313567404287 44166 2972793 623 665 0 True 251 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 295 641 0,000859942630486375 0,000945898736312055 0,000686655985351339 0,000823987182421607 0,000697468494363976 0,000658805429899733 35110 41223 623 665 0 False 295 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 339 641 0,000831114590723274 0,000905445118862618 0,000656137941557946 0,000762951094834821 0,000663216367853659 0,000671800187492425 33933 39460 623 665 0 False 339 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 383 641 0,000909589560477713 0,000873045511466925 0,000793469138628214 0,000732433051041428 0,000645686038610803 0,000654195671478686 37137 38048 623 665 0 False 383 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 428 641 0,000974887397358279 0,000950373186341913 0,000762951094834821 0,000762951094834821 0,000858852436235285 0,000808883972215915 39803 41418 623 665 0 False 428 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 472 641 0,000967711003432545 0,000940299937300335 0,000686655985351339 0,000671396963454643 0,000941882736913042 0,000868892120700312 39510 40979 623 665 0 False 472 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 516 641 0,000947039070076507 0,000928781096710648 0,00064087891966125 0,000579842832074464 0,000902995335192273 0,000929136089381236 38666 40477 623 665 0 False 516 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 560 641 0,000856734072110023 0,000911365160440584 0,000579842832074464 0,000686655985351339 0,000852018585402474 0,000791994418609782 34979 39718 623 665 0 False 560 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 604 641 0,000866163804742813 0,000929997229282866 0,000717174029144732 0,000793469138628214 0,000691734786942706 0,00068066446216103 35364 40530 623 665 0 False 604 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 650 646 0,00109012607797458 0,0708339629113984 0,000915541313801785 0,0683146410315099 0,000813410894854916 0,0211355407202672 44508 3086999 623 665 0 True 649 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E5_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E5_1.csv new file mode 100755 index 0000000..b5f1cf7 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E5_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 265 278 0,0107866643469293 0,0469880583812472 0,0107881284809644 0,0469672693980316 0,00156880531465211 0,00833398965300407 471505 2047776 667 665 0 True 265 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 309 278 0,0110282464627151 0,0109376210037568 0,0110017547875181 0,0109407186999313 0,00131905732151759 0,00122455938591245 482065 476670 667 665 0 False 309 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 354 278 0,0111157971025931 0,0664659130086604 0,0112001220721752 0,0667734798199435 0,00144745036814997 0,00920315878795551 485892 2896636 667 665 0 True 354 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 397 278 0,0108680152942526 0,107537119291706 0,0109254596780346 0,0997482261387045 0,00145322714004589 0,0340585685570773 475061 4686551 667 665 0 True 398 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 442 277 0,010739331638827 0,0746894932455882 0,0106965743495842 0,0717631799801633 0,00175307496624391 0,0130685917810376 469436 3255026 667 665 0 True 442 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 486 278 0,0107591889566775 0,0726407917252504 0,0107881284809644 0,0745860990310521 0,00159121228303429 0,0209948827364607 470304 3165742 667 665 0 True 487 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 530 277 0,0106933029250996 0,0881542377344139 0,010757610437171 0,0860456244754711 0,00162313222036113 0,0237717017808011 467424 3841830 667 665 0 True 531 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 575 278 0,0106855704672269 0,0762604152863275 0,0106660563057908 0,0733196002136263 0,00183439225241215 0,0209421556699811 467086 3323488 667 665 0 True 575 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 619 278 0,0102194496709073 0,0102846725419637 0,0103608758678569 0,0102998397802701 0,00192623100062577 0,00182603234366948 446711 448214 667 665 0 False 619 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 663 277 0,0102389867094377 0,046511265575245 0,0101930266269932 0,0467231250476844 0,00181420215536987 0,00847060372574926 447565 2026997 667 665 0 True 664 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 265 321 0,0108308628931128 0,0109654084857371 0,0108949416342412 0,0109712367437247 0,00150367540584311 0,00152979355402233 473437 477881 667 665 0 False 265 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 309 321 0,0110221154014432 0,0110047148083071 0,0110170138094148 0,0108949416342412 0,00125953488084141 0,00122969474796312 481797 479594 667 665 0 False 309 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 354 323 0,0110588560148857 0,105694999687362 0,0110780498970016 0,101762417029068 0,00140227421197102 0,0210922884841767 483403 4606270 667 665 0 True 354 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 398 322 0,0109718086710822 0,0566630813701684 0,0109864957656214 0,0551461051346609 0,0014488330332929 0,00903374718620743 479598 2469421 667 665 0 True 398 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 442 322 0,0108438113284854 0,0893271402355741 0,0108491645685512 0,0901197833218891 0,00168173863912512 0,0145163790822238 474003 3892946 667 665 0 True 442 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 486 323 0,0106738345178521 0,0475025971887834 0,0106507972838941 0,0468909742885481 0,00167121112981673 0,0102427283210483 466573 2070200 667 665 0 True 487 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 530 322 0,0105632466440161 0,0499667571308679 0,0105592431525139 0,0508278019378958 0,00149175127245157 0,0119254726106477 461739 2177590 667 665 0 True 531 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 574 322 0,0106682067526548 0,0568207655784001 0,0106202792401007 0,0569161516746777 0,00182018767050119 0,0117435451097831 466327 2476293 667 665 0 True 575 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 619 322 0,0102226982182976 0,0102971780561498 0,0101930266269932 0,0102998397802701 0,00210194722763845 0,00206951044901154 446853 448759 667 665 0 False 619 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 664 322 0,0101130940595164 0,0101906173077464 0,0101319905394064 0,0102082856488899 0,00194904861431063 0,00196499488914844 442062 444115 667 665 0 False 664 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 266 368 0,011215541233732 0,0543847143608621 0,0112001220721752 0,0541237506675822 0,00149084887917119 0,00827383042411727 490252 2370128 667 665 0 True 265 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 309 366 0,0111108098960362 0,0666921595588881 0,0111848630502785 0,0703288319218738 0,00130273705899662 0,0181829253986526 485674 2906496 667 665 0 True 309 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 354 367 0,0107418481191997 0,0424510807804588 0,0107881284809644 0,043228809033341 0,00142662832363432 0,00636935297123912 469546 1850051 667 665 0 True 354 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 398 367 0,0107332463317437 0,038947907649646 0,0107728694590677 0,0389105058365759 0,00147460374693824 0,00574315195594055 469170 1697380 667 665 0 True 398 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 443 367 0,0105611648284349 0,0774428862267823 0,0104982070649271 0,0748302433813993 0,00169864772073645 0,0121253791868084 461648 3375021 667 665 0 True 442 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 487 367 0,0106370710273154 0,036503871259747 0,0106813153276875 0,0370336461432822 0,00172385938602381 0,00666169144222815 464966 1590867 667 665 0 True 487 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 531 367 0,0106487383454073 0,0306537228858367 0,0106507972838941 0,0308079652094301 0,00162637407575896 0,00301425626022059 465476 1335913 667 665 0 True 531 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 575 367 0,0107743335931027 0,0569643380596146 0,0106813153276875 0,0561532005798428 0,00189908872849145 0,0114292963409837 470966 2482550 667 665 0 True 575 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 619 367 0,010643339351153 0,0599977857208827 0,0106355382619974 0,0601052872510872 0,0020410414401251 0,0117363145671228 465240 2614750 667 665 0 True 619 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 663 367 0,0103081899196888 0,0675269542590741 0,0103303578240635 0,0697489890897993 0,00201405043937758 0,0164843722748839 450590 2942877 667 665 0 True 664 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 267 412 0,0107442730911953 0,0477177838163732 0,0107423514152743 0,0496833752956435 0,00150004467679361 0,00966736970379472 469652 2079578 667 665 0 True 265 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 310 411 0,0108591847358536 0,0337785640572018 0,0108339055466545 0,033676661326009 0,00142171051665595 0,00383190848741556 474675 1472096 667 665 0 True 309 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 354 411 0,0109543305710386 0,0933722495756443 0,0109407186999313 0,088014038300145 0,00143476200434618 0,0196230329195373 478834 4069235 667 665 0 True 354 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 399 411 0,0108285523065888 0,0707475257151806 0,0108339055466545 0,067200732433051 0,00152460609874162 0,0163294118549469 473336 3083232 667 665 0 True 398 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 443 411 0,0106709748810648 0,0454589667118127 0,0105897611963073 0,0463721675440604 0,0017497888849426 0,00668989032356424 466448 1981137 667 665 0 True 442 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 487 412 0,0108926768019058 0,057742272825575 0,0108796826123445 0,0585336079957275 0,00173397920445706 0,0118449386928091 476139 2516453 667 665 0 True 486 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 531 411 0,0108216205470165 0,0430230990614554 0,0108949416342412 0,0438849469748989 0,00162954599818709 0,00504629856564735 473033 1874980 667 665 0 True 531 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 575 412 0,0106055692684672 0,0560817011629555 0,0107118333714809 0,0558022430762188 0,00181008470291062 0,00980103597973927 463589 2444084 667 665 0 True 575 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 618 410 0,0105111097461112 0,0447047580039593 0,0105592431525139 0,0445563439383536 0,00177572722343783 0,00823820472512204 459460 1948268 667 665 0 True 619 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 664 411 0,0105986603859892 0,0951997985350192 0,0105439841306172 0,0956740672922866 0,00184998431824483 0,0227234722966592 463287 4148881 667 665 0 True 664 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 267 456 0,0107570385098135 0,0443752090227858 0,0107881284809644 0,0445410849164569 0,00157394679004967 0,00550242135096148 470210 1933906 667 665 0 True 265 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 310 455 0,0108711723332657 0,0589063182102659 0,010955977721828 0,058304722667277 0,00155893250259698 0,00721217707821348 475199 2567183 667 665 0 True 309 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 354 455 0,0108892681148554 0,0381531305948552 0,0109864957656214 0,0381933318074311 0,00144902212611781 0,00475192876387412 475990 1662743 667 665 0 True 354 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 398 455 0,0110588331377914 0,0559432915086985 0,0110170138094148 0,0546272983901732 0,00161037569945228 0,00865575088873263 483402 2438052 667 665 0 True 398 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 443 455 0,0110515353447103 0,104783221500765 0,0110475318532082 0,104982070649271 0,00188857526699696 0,0155079978678477 483083 4566534 667 665 0 True 442 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 487 455 0,011029779228033 0,0631232464314827 0,0110170138094148 0,0632028686961166 0,00197032607595958 0,0118381786262187 482132 2750960 667 665 0 True 486 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 531 455 0,0109666155706766 0,0551348386989447 0,0110170138094148 0,0531929503318837 0,00175908948693107 0,0096827880181949 479371 2402819 667 665 0 True 531 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 575 455 0,0107552998506469 0,0318931914359026 0,0107881284809644 0,0320897230487526 0,00180693985562262 0,00396357046066051 470134 1389930 667 665 0 True 575 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 620 455 0,0105610961971521 0,0413741150771183 0,0105897611963073 0,0414282444495308 0,00186079840917104 0,00623603124309682 461645 1803116 667 665 0 True 619 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 664 454 0,0104908177634689 0,0731288050751736 0,0105439841306172 0,0733196002136263 0,00183376953312429 0,0139858275965304 458573 3187010 667 665 0 True 664 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 265 500 0,0106194785418003 0,0602981704662205 0,0105592431525139 0,0617074845502403 0,00157747448475865 0,0162693675328399 464197 2627841 667 665 0 True 265 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 310 500 0,0109445391746791 0,0609214269365334 0,0110170138094148 0,0592660410467689 0,00154092179747504 0,00904833072657433 478406 2655003 667 665 0 True 309 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 354 499 0,0108155352399332 0,0726541462376472 0,0107728694590677 0,0718242160677501 0,0015571691962184 0,0172217419126665 472767 3166324 667 665 0 True 354 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 398 499 0,0110779583886244 0,0984053174823073 0,0111238269626917 0,0950637064164187 0,00171864234359753 0,0228391419205192 484238 4288580 667 665 0 True 398 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 443 499 0,0113330837442345 0,0996926282288463 0,0112764171816587 0,0943007553215839 0,00214327745716966 0,0291077585827307 495390 4344682 667 665 0 True 442 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 487 500 0,0110092355973535 0,0448155637434167 0,0110322728313115 0,046494239719234 0,00180472889442962 0,00617651110553596 481234 1953097 667 665 0 True 486 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 531 500 0,0108936605169606 0,0446115517679527 0,0109254596780346 0,0458991378652628 0,00176367061922077 0,00848200736560706 476182 1944206 667 665 0 True 531 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 574 499 0,0107747453808001 0,113380728084803 0,0107423514152743 0,112581063553826 0,00186557609589415 0,0262351512357779 470984 4941220 667 665 0 True 575 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 619 499 0,0105375327900252 0,066019110490807 0,0105439841306172 0,0659800106813153 0,00179014247894376 0,0176916643273964 460615 2877164 667 665 0 True 619 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 663 499 0,0104505540775046 0,0819637099156681 0,0104676890211337 0,0810711833371481 0,00187247769861772 0,0121124812362381 456813 3572042 667 665 0 True 664 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 266 544 0,0105488569517027 0,0633970139356173 0,0106202792401007 0,0657053482871748 0,00146696154884964 0,0147479779320281 461110 2762891 667 665 0 True 265 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 310 543 0,0107267949911517 0,104635059840033 0,0108033875028611 0,0977492942702373 0,00140441658331878 0,0254635187469815 468888 4560077 667 665 0 True 309 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 354 543 0,010954056045907 0,0583497425183467 0,0109102006561379 0,0602731364919509 0,00147447932955678 0,0116627796219236 478822 2542927 667 665 0 True 354 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 398 543 0,0109104065499866 0,0594144780582723 0,0108339055466545 0,0582589456015869 0,00165919307314161 0,00971183019431209 476914 2589329 667 665 0 True 398 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 443 543 0,0109096058516862 0,0567840980340529 0,0108796826123445 0,0568245975432975 0,00190553441547758 0,00655284077268963 476879 2474695 667 665 0 True 442 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 487 544 0,0108994484218179 0,0604664327332407 0,0109864957656214 0,0600595101853971 0,00190241351931661 0,011865323111101 476435 2635174 667 665 0 True 486 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 530 543 0,0106678178420517 0,0722580541534656 0,0107270923933776 0,0728007934691386 0,00193520207732257 0,0163048574514367 466310 3149062 667 665 0 True 531 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 575 543 0,0106141253017346 0,058781469581484 0,0106507972838941 0,0592050049591821 0,00177235941312672 0,0122630041291219 463963 2561742 667 665 0 True 575 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 619 543 0,0105305095220758 0,0451306338632115 0,0105287251087205 0,0443274586099031 0,00173598142646343 0,00664914781597719 460308 1966828 667 665 0 True 619 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 663 543 0,0104265102513975 0,068696690226367 0,0103913939116503 0,0686198214694438 0,00166843696672274 0,0135712385332375 455762 2993855 667 665 0 True 664 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 266 588 0,0102921759536803 0,0484490925184327 0,0103150988021668 0,0495460440985733 0,00120867423967022 0,0100711702411668 449890 2111449 667 665 0 True 265 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 310 588 0,0104782582386994 0,0552864192984177 0,0105134660868238 0,0553749904631113 0,001329303545414 0,0114725777953371 458024 2409425 667 665 0 True 309 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 355 587 0,0105305323991701 0,0485514082757822 0,0105134660868238 0,0488746471351186 0,00142458349477848 0,00746001117100022 460309 2115908 667 665 0 True 354 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 398 587 0,0106797596852752 0,0487053981945021 0,0106202792401007 0,048554207675288 0,00150568550023779 0,00553991402766049 466832 2122619 667 665 0 True 398 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 443 587 0,010909056801423 0,0916189994326627 0,0109254596780346 0,0884107728694591 0,00199540124677584 0,0194478199796078 476855 3992827 667 665 0 True 442 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 487 588 0,0108043254637273 0,0603585181768796 0,0107728694590677 0,0595407034409094 0,00186066795985354 0,010887794795492 472277 2630471 667 665 0 True 486 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 531 588 0,0105418336837532 0,0529703521793727 0,0105897611963073 0,0531624322880903 0,00201709736913724 0,0070375986500038 460803 2308489 667 665 0 True 531 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 575 588 0,010426853407812 0,0366514822189371 0,0104676890211337 0,0384679942015717 0,00164674447931586 0,00767627922299724 455777 1597300 667 665 0 True 575 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 619 587 0,0103745106160584 0,0486857106143707 0,0104676890211337 0,0494392309452964 0,0015557370724381 0,00555518858865218 453489 2121761 667 665 0 True 619 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 663 587 0,0102439967930889 0,0540188190779076 0,0101625085831998 0,0527962157625696 0,00161554233387195 0,0077529819266773 447784 2354182 667 665 0 True 664 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 265 625 0,0108565309929151 0,0101095953433595 0,0104676890211337 0,0101625085831998 0,00303762760474434 0,00134069476445025 474559 440584 667 665 0 False 265 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 309 625 0,0107641304090459 0,010259087866152 0,0103761348897536 0,0102998397802701 0,0027467838999609 0,00131058705602224 470520 447099 667 665 0 False 309 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 354 631 0,010318644751783 0,0714639195838073 0,0102845807583734 0,0697337300679026 0,00140531064744177 0,0104768157352135 451047 3114453 667 665 0 True 354 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 398 631 0,0104882326518133 0,0730912426408204 0,0105592431525139 0,0692759594110018 0,00136665550771604 0,01793656443629 458460 3185373 667 665 0 True 398 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 442 625 0,0110084577761474 0,0103828580377471 0,0106202792401007 0,0103761348897536 0,00323384157348011 0,00190612805241828 481200 452493 667 665 0 False 442 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 486 625 0,0107303409407679 0,0103827203623616 0,0106660563057908 0,0103303578240635 0,00198881579328076 0,00182782841089453 469043 452487 667 665 0 False 486 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 531 625 0,0100587152063703 0,0101908697126198 0,00999465934233616 0,0102235446707866 0,00204734082725042 0,00193933394712861 439685 444126 667 665 0 False 531 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 575 625 0,0101611130804476 0,0101574145939351 0,0101319905394064 0,010101472495613 0,0016447320988252 0,00159434969270392 444161 442668 667 665 0 False 575 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 619 626 0,0100486721619735 0,0101160890323772 0,0100251773861295 0,0100709544518196 0,00154547856110314 0,00131507667229876 439246 440867 667 665 0 False 619 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 664 626 0,010134415511402 0,0101770792281688 0,0101777676050965 0,010101472495613 0,00140456004591427 0,00144170369749316 442994 443525 667 665 0 False 664 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 267 676 0,0102062724645917 0,0438333875430164 0,0101930266269932 0,0444800488288701 0,0014112203022498 0,00816879902117186 446135 1910293 667 665 0 True 265 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 309 669 0,0100260009615243 0,0101686121919585 0,0100556954299229 0,0101777676050965 0,00136664236057835 0,00128704954900124 438255 443156 667 665 0 False 309 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 353 669 0,0109295318008197 0,0101308891363222 0,0102388036926833 0,0100862134737163 0,00464782088998395 0,00125202286402121 477750 441512 667 665 0 False 353 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 398 669 0,0106005363077216 0,00996889109934369 0,0101777676050965 0,00994888227664607 0,0034377668738713 0,00135174824617853 463369 434452 667 665 0 False 398 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 442 669 0,00995947437130599 0,0102533054999596 0,00996414129854276 0,0102845807583734 0,00160175871869314 0,00151996294417796 435347 446847 667 665 0 False 442 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 486 669 0,0100229583079827 0,0100323135602797 0,0100862134737163 0,0100099183642329 0,00158322420051342 0,00154539975561027 438122 437216 667 665 0 False 486 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 531 669 0,00999429330882739 0,0102389413680688 0,0100404364080262 0,0102998397802701 0,0016504467967247 0,00168876596489585 436869 446221 667 665 0 False 531 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 575 669 0,0102180541681551 0,00998302577225852 0,0101625085831998 0,0100251773861295 0,00151252861695556 0,00145434159655395 446650 435068 667 665 0 False 575 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 619 669 0,0102139820453701 0,0100027821900827 0,0102082856488899 0,0100404364080262 0,00136122005257299 0,00139938263366622 446472 435929 667 665 0 False 619 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 664 675 0,0100962793952074 0,0432020311708546 0,0102235446707866 0,0433356221866178 0,00149863589776055 0,00917705729698527 441327 1882778 667 665 0 True 663 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E5_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E5_2.csv new file mode 100755 index 0000000..463998b --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E5_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 265 278 0,00852027636902537 0,714805851892262 0,00840772106507973 0,697810330357824 0,00178164808400014 0,180605815909073 372437 31151793 667 665 10 True 265 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 309 278 0,00738342204498575 0,00692135465695596 0,00735484855420768 0,00691233691920348 0,00148665159911123 0,00120701417333668 322743 301638 667 665 0 False 309 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 354 278 0,00675748186790102 0,00695423612820102 0,0068055237659266 0,00691233691920348 0,00122560543696943 0,00145564077336815 295382 303071 667 665 0 True 354 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 397 278 0,00669692619929449 0,00674446473244223 0,00666819256885634 0,0068055237659266 0,0012575992128333 0,00124258458095873 292735 293929 667 665 0 True 398 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 442 277 0,00682524382121139 0,00688941396751205 0,00688181887541009 0,00685130083161669 0,00161215308952102 0,00163341056784917 298344 300246 667 665 0 True 442 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 486 278 0,0069566727279528 0,00708573906728368 0,00689707789730678 0,00714122224765393 0,00177679907240994 0,00166997580680531 304089 308802 667 665 0 True 487 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 530 277 0,00710665495816981 0,00730562960387923 0,00715648126955062 0,00737010757610437 0,00150417045353721 0,00157527688244613 310645 318385 667 665 0 True 531 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 575 278 0,00748165628790091 0,00752398276533632 0,00746166170748455 0,00758373388265812 0,00174023581237659 0,00175737533228297 327037 327901 667 665 0 True 575 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 619 278 0,00813374498376813 0,00805768139735927 0,00814831769283589 0,0081025406271458 0,00192231723843981 0,0017556363702799 355541 351160 667 665 0 False 619 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 663 277 0,0093343120154274 0,71136738619265 0,00930800335698482 0,698634317540246 0,00200581321039163 0,17822196612276 408020 31001942 667 665 9 True 664 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 265 321 0,00705072046261145 0,00695834344386946 0,00700389105058366 0,00700389105058366 0,00148965305286785 0,00137673351174036 308200 303250 667 665 0 False 265 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 309 321 0,00688216203182456 0,00685371015086354 0,00685130083161669 0,00688181887541009 0,00128447904925509 0,00121184850864285 300832 298690 667 665 0 False 309 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 354 323 0,00676853150444691 0,00680318328437252 0,00683604180972 0,0068207827878233 0,00124051256991095 0,00130234574240735 295865 296488 667 665 0 True 354 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 398 322 0,00682229267604696 0,00689007939854213 0,0068207827878233 0,00692759594110018 0,00129105923431137 0,00127862176661353 298215 300275 667 665 0 True 398 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 442 322 0,00705929937297316 0,00709744147505408 0,00706492713817044 0,00706492713817044 0,00158825308536723 0,00169692683472469 308575 309312 667 665 0 True 442 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 486 323 0,00704786082582421 0,00732238010911922 0,00712596322575723 0,00735484855420768 0,00163515096767957 0,00149567493757749 308075 319115 667 665 0 True 487 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 530 322 0,00722826959145742 0,00727233510647757 0,00730907148851759 0,00732433051041428 0,00155287931886205 0,00162038323210299 315961 316934 667 665 0 True 531 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 574 322 0,00743885324446955 0,00769426427134442 0,00741588464179446 0,007690547035935 0,00172464272854833 0,00168148090606448 325166 335322 667 665 0 True 575 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 619 322 0,00774478862651531 0,00768999633439286 0,00779736018921187 0,00772106507972839 0,00199630519281131 0,00191767761276367 338539 335136 667 665 0 False 619 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 664 322 0,00779026828997952 0,00778698864350164 0,00787365529869535 0,00773632410162509 0,00190642406575756 0,00221485298122369 340527 339363 667 665 0 False 664 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 266 368 0,00651452712645737 0,00654125586339389 0,00657663843747616 0,00645456626230259 0,00142287600796645 0,00140531228704226 284762 285073 667 665 0 True 265 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 309 366 0,00668734069678368 0,00680182947641477 0,00674448767833982 0,00685130083161669 0,00136658905307877 0,00125616431519442 292316 296429 667 665 0 True 309 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 354 367 0,00678896074965493 0,00684184712181002 0,00677500572213321 0,00686655985351339 0,00131505173331358 0,0013807016693356 296758 298173 667 665 0 True 354 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 398 367 0,00702713417839032 0,0071563206482675 0,00703440909437705 0,00721751735713741 0,00125806705476552 0,00133793611453964 307169 311878 667 665 0 True 398 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 443 367 0,00732179115294722 0,00752205530993884 0,00735484855420768 0,0076600289921416 0,00163464673006965 0,00170300619291708 320049 327817 667 665 0 True 442 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 487 367 0,00741501531221114 0,00735264574803913 0,00758373388265812 0,00737010757610437 0,0017227776508775 0,00176520904092653 324124 320434 667 665 0 True 487 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 531 367 0,00735372757658708 0,00751480440630071 0,00738536659800107 0,00755321583886473 0,00161975140197818 0,0016814571174539 321445 327501 667 665 0 True 531 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 575 367 0,00737662754797927 0,00754635501548561 0,00737010757610437 0,00762951094834821 0,00187912968341254 0,00183344324866554 322446 328876 667 665 0 True 575 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 619 367 0,0072142916868414 0,00738623854210945 0,00715648126955062 0,00737010757610437 0,00184447671540843 0,00200416533754177 315350 321898 667 665 0 True 619 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 663 367 0,00672913714806593 0,00683069541558176 0,00672922865644312 0,00686655985351339 0,00186451989774114 0,00181244533007077 294143 297687 667 665 0 True 664 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 267 412 0,0063902816273255 0,00645674612257354 0,00636301213092241 0,00650034332799268 0,00146246701948847 0,00148443745256827 279331 281390 667 665 0 True 265 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 310 411 0,00667780094846145 0,0066870770425721 0,00668345159075303 0,00671396963454643 0,00135489230024804 0,00126153352511156 291899 291428 667 665 0 True 309 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 354 411 0,00698918107895011 0,00694101929118975 0,00703440909437705 0,00688181887541009 0,00125490134841461 0,00120788317980006 305510 302495 667 665 0 True 354 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 399 411 0,00716336727493429 0,00733534454125701 0,00720225833524071 0,00737010757610437 0,00145133245120562 0,00148585270860879 313124 319680 667 665 0 True 398 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 443 411 0,00743667992051125 0,00752602495022174 0,00746166170748455 0,00753795681696803 0,00156950255815515 0,00160580387343985 325071 327990 667 665 0 True 442 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 487 412 0,00762392893733952 0,00780621730568123 0,00756847486076143 0,00778210116731518 0,00157371330540241 0,00161796147899436 333256 340201 667 665 0 True 486 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 531 411 0,00754424801789995 0,00761351765772867 0,00753795681696803 0,0076752880140383 0,00153787979516594 0,00155771866139184 329773 331803 667 665 0 True 531 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 575 412 0,007234995457181 0,00716579730397176 0,00720225833524071 0,00720225833524071 0,00174401373760636 0,00169108338031504 316255 312291 667 665 0 True 575 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 618 410 0,00675517128137694 0,00664421410587581 0,00677500572213321 0,00666819256885634 0,0017255038924588 0,00181724144194629 295281 289560 667 665 0 True 619 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 664 411 0,00622458283332584 0,00624341811268845 0,00622568093385214 0,00624093995574884 0,00169835455409635 0,00188770670617282 272088 272093 667 665 0 True 664 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 267 456 0,00660143720769508 0,00675047655761055 0,00663767452506294 0,00679026474402991 0,00139386653261634 0,00150941999954001 288561 294191 667 665 0 True 265 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 310 455 0,00680099410125562 0,00683002998455167 0,0068207827878233 0,00683604180972 0,00139463278913561 0,00154584117756697 297284 297658 667 665 0 True 309 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 354 455 0,00695109071694411 0,00694459885121364 0,00704966811627375 0,00694285496299687 0,00143731483813156 0,00145026346374302 303845 302651 667 665 0 True 354 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 398 455 0,00718944716243389 0,00731898411627604 0,00718699931334401 0,00738536659800107 0,00165680939554984 0,00149672089179501 314264 318967 667 665 0 True 398 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 443 455 0,00756133720734048 0,00763985954816086 0,00759899290455482 0,0076752880140383 0,00176802036867799 0,00185441896532542 330520 332951 667 665 0 True 442 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 487 455 0,00752615223631032 0,00802486876380698 0,00752269779507134 0,00802624551766232 0,00182307537245115 0,00188575148739902 328982 349730 667 665 0 True 486 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 531 455 0,00716007297335539 0,00706979166845932 0,00714122224765393 0,00709544518196384 0,00173343956065988 0,00170127270800615 312980 308107 667 665 0 True 531 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 575 455 0,00651452712645737 0,00653161858640651 0,00648508430609598 0,00665293354695964 0,00173961114159179 0,00197763695559158 284762 284653 667 665 0 True 575 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 620 455 0,00631167593131793 0,00617522290505389 0,00636301213092241 0,00622568093385214 0,0016657156375217 0,00179334426083803 275895 269121 667 665 0 True 619 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 664 454 0,00618733892380887 0,00620709475680504 0,00619516289005875 0,00617990386816205 0,00181612729216337 0,00187106412408147 270460 270510 667 665 0 True 664 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 265 500 0,00687863895930268 0,00676961343619979 0,00695811398489357 0,0068207827878233 0,00152837800299229 0,0015279271930332 300678 295025 667 665 0 True 265 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 310 500 0,00684212711680324 0,00670910510425755 0,00683604180972 0,00672922865644312 0,00152132079901669 0,00152255787920435 299082 292388 667 665 0 True 309 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 354 499 0,00682991074844816 0,00698881559586767 0,00675974670023652 0,00694285496299687 0,00152900829054867 0,00151775436508069 298548 304578 667 665 0 True 354 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 398 499 0,00717105397861838 0,00720377276448159 0,0072327763790341 0,00712596322575723 0,0015451068369115 0,00152876400871934 313460 313946 667 665 0 True 398 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 443 499 0,00738788307837384 0,00757827275903194 0,00738536659800107 0,00756847486076143 0,0017686408015618 0,00196084954068943 322938 330267 667 665 0 True 442 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 487 500 0,00708672900903634 0,0070046482652041 0,00717174029144732 0,00695811398489357 0,00183930102190862 0,00172700541560052 309774 305268 667 665 0 True 486 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 531 500 0,00666485251308884 0,00637586183357226 0,00665293354695964 0,00643930724040589 0,00162665717892005 0,00156006284128608 291333 277865 667 665 0 True 531 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 574 499 0,0064511118210636 0,00639396614676999 0,00646982528419928 0,00631723506523232 0,00161576931478056 0,00183185119758131 281990 278654 667 665 0 True 575 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 619 499 0,006341324645528 0,006333779057394 0,0064087891966125 0,00636301213092241 0,00164629104499707 0,00168256987378345 277191 276031 667 665 0 True 619 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 663 499 0,00640389349843275 0,00627320188775899 0,0063935301747158 0,00633249408712902 0,00165628989787556 0,00175980492939138 279926 273391 667 665 0 True 664 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 266 544 0,00677230622500606 0,00675850762176671 0,00674448767833982 0,00674448767833982 0,00148543465776936 0,00131292536011562 296030 294541 667 665 0 True 265 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 310 543 0,0066653100549748 0,00698034855965733 0,00677500572213321 0,00695811398489357 0,00141279410657402 0,00130967923079306 291353 304209 667 665 0 True 309 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 354 543 0,00714504272240167 0,00702424406174512 0,00717174029144732 0,00706492713817044 0,00131637077028156 0,00139150457639386 312323 306122 667 665 0 True 354 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 398 543 0,00693976655526666 0,00693900005220192 0,00694285496299687 0,00697337300679027 0,00150703869183053 0,00146981805646434 303350 302407 667 665 0 True 398 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 443 543 0,00679570949247281 0,00687839993666932 0,00683604180972 0,00692759594110018 0,00177368332628252 0,00197766689843772 297053 299766 667 665 0 True 442 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 487 544 0,00660525768244283 0,00663737622839429 0,00665293354695964 0,00663767452506294 0,00177264696554533 0,00198850296804153 288728 289262 667 665 0 True 486 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 530 543 0,0063348504278417 0,00667509928403063 0,00630197604333562 0,00668345159075303 0,00184197661602727 0,00196458861612541 276908 290906 667 665 0 True 531 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 575 543 0,00653783888554693 0,00663861530686409 0,00651560234988937 0,00663767452506294 0,0016508426826408 0,00147188132215731 285781 289316 667 665 0 True 575 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 619 543 0,00652937436065671 0,00650956757882346 0,00650034332799268 0,00650034332799268 0,00158856882559319 0,00172866116699403 285411 283692 667 665 0 True 619 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 663 543 0,00629115517773272 0,00645279942818823 0,00633249408712902 0,00645456626230259 0,0017636763864615 0,00192056596793018 274998 281218 667 665 0 True 664 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 266 588 0,00681723683820713 0,0069047647729991 0,00679026474402991 0,00691233691920348 0,00132674422393359 0,00130216478033378 297994 300915 667 665 0 True 265 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 310 588 0,00690799027128688 0,00699459796206011 0,00692759594110018 0,00695811398489357 0,00134672250434592 0,00135714529584582 301961 304830 667 665 0 True 309 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 355 587 0,00688406083065128 0,00682918098634088 0,00692759594110018 0,00685130083161669 0,00128368291753 0,00131999827690449 300915 297621 667 665 0 True 354 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 398 587 0,0066446977930124 0,00657333422822334 0,00660715648126955 0,00657663843747616 0,00145886043285379 0,00134979332459112 290452 286471 667 665 0 True 398 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 443 587 0,00672170209241911 0,00663661901377385 0,00668345159075303 0,00656137941557946 0,00177596720117915 0,00197599696204317 293818 289229 667 665 0 True 442 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 487 588 0,00674052994102628 0,00669400670364398 0,00674448767833982 0,00669871061264973 0,00188196987088712 0,00195256527354061 294641 291730 667 665 0 True 486 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 531 588 0,00672257142200243 0,00668051451586164 0,00672922865644312 0,00677500572213321 0,00179069768835008 0,00183327965679383 293856 291142 667 665 0 True 531 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 575 588 0,00668006578079694 0,00653081547999089 0,00677500572213321 0,00657663843747616 0,00163808926134293 0,0017676858896191 291998 284618 667 665 0 True 575 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 619 587 0,00644456897209441 0,0067012805531797 0,00643930724040589 0,00659189745937285 0,00146791709906406 0,00143724231861496 281704 292047 667 665 0 True 619 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 663 587 0,00654650930428583 0,00651222930294379 0,00646982528419928 0,00642404821850919 0,00156454468364818 0,00174102683247592 286160 283808 667 665 0 True 664 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 265 625 0,00694210001888504 0,00704698344625583 0,00694285496299687 0,00698863202868696 0,00140797179133273 0,00149506479093253 303452 307113 667 665 0 False 265 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 309 625 0,00679273547021408 0,00669859588316178 0,0068207827878233 0,00666819256885634 0,00129068429798401 0,00128417266389195 296923 291930 667 665 0 False 309 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 354 631 0,00664460628463521 0,00657505517054251 0,00659189745937285 0,00656137941557946 0,00135355907830063 0,00124672275096096 290448 286546 667 665 0 True 354 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 398 631 0,00651150735001005 0,00645103259407388 0,00646982528419928 0,00646982528419928 0,00133832714911002 0,00120406851751629 284630 281141 667 665 0 True 398 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 442 625 0,0064359214304498 0,00641746274590115 0,00651560234988937 0,00643930724040589 0,0016661452704882 0,00178593696615926 281326 279678 667 665 0 False 442 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 486 625 0,00653948603633638 0,0066757876609583 0,00654612039368277 0,00672922865644312 0,00183215924202248 0,00175445060474514 285853 290936 667 665 0 False 486 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 531 625 0,00652319754519627 0,00641668258538312 0,00648508430609598 0,00642404821850919 0,00179328899979162 0,00190988536496838 285141 279644 667 665 0 False 531 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 575 625 0,00676686147656316 0,00642232727619002 0,00679026474402991 0,0064087891966125 0,00167428023280686 0,00158190387603863 295792 279890 667 665 0 False 575 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 619 626 0,00653953179052497 0,00666532433165771 0,00656137941557946 0,00665293354695964 0,00131691063753071 0,00122175868155886 285855 290480 667 665 0 False 619 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 664 626 0,00659528326932894 0,0066281519775635 0,00660715648126955 0,00659189745937285 0,00141396715138329 0,0013600347779135 288292 288860 667 665 0 False 664 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 267 676 0,0083264845032279 0,679452510883526 0,00817883573662928 0,667643244068055 0,00191575824428279 0,194394420590634 363966 29611067 667 665 7 True 265 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 309 669 0,00712571157771995 0,00687791807281995 0,00688181887541009 0,00688181887541009 0,00186365292989731 0,00127936356723639 311478 299745 667 665 0 False 309 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 353 669 0,00634308618178894 0,00623903544624895 0,0063935301747158 0,00625619897764553 0,00130863438444146 0,00124754601985098 277268 271902 667 665 0 False 353 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 398 669 0,00625050258116536 0,00625300949788066 0,00624093995574884 0,00628671702143893 0,00125525248240619 0,00131231402956451 273221 272511 667 665 0 False 398 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 442 669 0,00631979729979368 0,00633488046047827 0,00636301213092241 0,00633249408712902 0,00150211228955184 0,0014710638878041 276250 276079 667 665 0 False 442 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 486 669 0,00633738978530876 0,00634683527312215 0,00642404821850919 0,00630197604333562 0,00162229722308895 0,00154125260554542 277019 276600 667 665 0 False 486 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 531 669 0,00627255610006853 0,00649749803669164 0,00627145799954223 0,00651560234988937 0,00168100623142865 0,00176012518353444 274185 283166 667 665 0 False 531 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 575 669 0,00648796681997751 0,00648063280196371 0,00653086137178607 0,00650034332799268 0,00143735788646154 0,00129977451068919 283601 282431 667 665 0 False 575 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 619 669 0,00688360328876532 0,0066417359489362 0,0068207827878233 0,00671396963454643 0,00134455883694672 0,00133718993832524 300895 289452 667 665 0 False 619 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 664 675 0,00816142626786858 0,679803697846126 0,00814831769283589 0,667750057221332 0,00187929180811902 0,208056925989418 356751 29626372 667 665 9 True 663 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E5_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E5_3.csv new file mode 100755 index 0000000..ea52510 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E5_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 265 278 0,000962164831980897 0,0725169527159625 0,000732433051041428 0,0701915007248035 0,000775976607401297 0,020024578372149 42058 3160345 667 665 0 True 265 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 309 278 0,000925218324689795 0,00093153460442133 0,00080872816052491 0,00080872816052491 0,000673537950004158 0,000648934331327218 40443 40597 667 665 0 False 309 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 354 278 0,000948438575402159 0,000875936694563142 0,000869764248111696 0,000732433051041428 0,000676791904095931 0,00065820972329796 41458 38174 667 665 0 True 354 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 397 278 0,000976760418142954 0,00098756848633371 0,000839246204318303 0,000854505226215 0,000715854438375496 0,000688504714516009 42696 43039 667 665 0 True 398 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 442 277 0,000916410643385105 0,000932590115710425 0,000671396963454643 0,000671396963454643 0,00081607434937894 0,000906376523532356 40058 40643 667 665 0 True 442 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 486 278 0,000927254386082308 0,00104709014467962 0,000717174029144732 0,000823987182421607 0,000862701058975981 0,000966830263722562 40532 45633 667 665 0 True 487 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 530 277 0,000932744888713803 0,000900993614730348 0,000686655985351339 0,000686655985351339 0,000867044679498749 0,000803623811372523 40772 39266 667 665 0 True 531 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 575 278 0,000928947291060352 0,000894522871610246 0,000671396963454643 0,000503547722590982 0,000877784455299307 0,000940012341113358 40606 38984 667 665 0 True 575 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 619 278 0,00101160223275865 0,000997894140248768 0,00064087891966125 0,000625619897764553 0,0010255079768166 0,00100907088680652 44219 43489 667 665 0 False 619 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 663 277 0,00110363678311908 0,0716013884562631 0,000793469138628214 0,0690775921263447 0,000984027780734507 0,0200592884558127 48242 3120444 667 665 0 True 664 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 265 321 0,000920368380698641 0,000960216976407602 0,000747692072938125 0,000747692072938125 0,000729922336166959 0,000776093411422203 40231 41847 667 665 0 False 265 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 309 321 0,00092778055925116 0,000990803857893762 0,000823987182421607 0,000900282291905089 0,000685766475747789 0,000643237992919099 40555 43180 667 665 0 False 309 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 354 323 0,00088429120299086 0,000887134292586582 0,000732433051041428 0,000762951094834821 0,000666044344937782 0,000648060972201262 38654 38662 667 665 0 True 354 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 398 322 0,00084395888574367 0,00106434545966656 0,000671396963454643 0,000961318379491875 0,000721789931182662 0,000700526919395484 36891 46385 667 665 0 True 398 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 442 322 0,000950177234568799 0,000891516959026084 0,000671396963454643 0,00064087891966125 0,000861484757218407 0,000812619937937707 41534 38853 667 665 0 True 442 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 486 323 0,000955690614294592 0,0009320164682707 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000860693798774924 0,00080624658066423 41775 40618 667 665 0 True 487 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 530 322 0,000954638267956889 0,000873458537623528 0,000793469138628214 0,000717174029144732 0,000813008053647247 0,000774463847449853 41729 38066 667 665 0 True 531 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 574 322 0,000994490166223823 0,00093481586777656 0,000778210116731518 0,00064087891966125 0,000955069842132936 0,000898502019942572 43471 40740 667 665 0 True 575 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 619 322 0,000943954664919772 0,000964048941304968 0,000442511635004196 0,000503547722590982 0,00109428908197112 0,00108412501158087 41262 42014 667 665 0 False 619 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 664 322 0,000931006229547163 0,000950969779679228 0,000595101853971161 0,000564583810177768 0,000935729091005983 0,000988755499466435 40696 41444 667 665 0 False 664 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 266 368 0,000860407516543857 0,000894201629043999 0,000701915007248035 0,000747692072938125 0,000722387413342374 0,000763423954688742 37610 38970 667 665 0 True 265 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 309 366 0,000860773550052623 0,000928345124656457 0,000732433051041428 0,000823987182421607 0,000677693331270942 0,00067528955443544 37626 40458 667 665 0 True 309 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 354 367 0,000933476955731335 0,000880755333056835 0,000823987182421607 0,000793469138628214 0,000673719773797929 0,000663466113948781 40804 38384 667 665 0 True 354 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 398 367 0,000917348604251319 0,00100218502309791 0,000732433051041428 0,000854505226215 0,000707175340199783 0,000731618768085607 40099 43676 667 665 0 True 398 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 443 367 0,000952830977507355 0,000948973486588983 0,000717174029144732 0,00064087891966125 0,000860311527758266 0,000896307327208859 41650 41357 667 665 0 True 442 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 487 367 0,000921283464470557 0,0010776311343706 0,00064087891966125 0,000793469138628214 0,000876390133027476 0,000971756230986516 40271 46964 667 665 0 True 487 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 531 367 0,000941666955489982 0,000901796721145964 0,000625619897764553 0,000579842832074464 0,000893276302597822 0,000886128226259388 41162 39301 667 665 0 True 531 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 575 367 0,000990578183098883 0,00095489352816695 0,000656137941557946 0,00064087891966125 0,00102521955843595 0,000967856325584961 43300 41615 667 665 0 True 575 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 619 367 0,000916730922705276 0,000920497627681013 0,000488288700694286 0,000503547722590982 0,00101253106135363 0,00101441567258646 40072 40116 667 665 0 True 619 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 663 367 0,000935810419349721 0,000986191732478369 0,000503547722590982 0,000579842832074464 0,00101395756851387 0,00101663555969752 40906 42979 667 665 0 True 664 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 267 412 0,000869695616828802 0,000864463745768633 0,000656137941557946 0,000671396963454643 0,000807102682020436 0,000765642663995014 38016 37674 667 665 0 True 265 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 310 411 0,00082014383057956 0,000862742803449457 0,00064087891966125 0,000717174029144732 0,000665856481912091 0,000677539019450569 35850 37599 667 665 0 True 309 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 354 411 0,000918309442211831 0,00089745994650164 0,000778210116731518 0,00080872816052491 0,000702385085896304 0,000648432839616444 40141 39112 667 665 0 True 354 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 399 411 0,000999751897912339 0,000964645534642282 0,000793469138628214 0,000793469138628214 0,000813463563348041 0,00078281366126504 43701 42040 667 665 0 True 398 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 443 411 0,00102400161786811 0,00098011106961728 0,000793469138628214 0,000793469138628214 0,000864378525715602 0,000813994917935166 44761 42714 667 665 0 True 442 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 487 412 0,0010686805830319 0,000991997044568391 0,000823987182421607 0,000762951094834821 0,000957988559223139 0,000856074948694833 46714 43232 667 665 0 True 486 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 531 411 0,000939173352211512 0,00093667448548127 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000821675294302753 0,000819317943448338 41053 40821 667 665 0 True 531 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 575 412 0,00101533119912921 0,000914692315590992 0,000778210116731518 0,000564583810177768 0,000940341196595744 0,000942509581405352 44382 39863 667 665 0 True 575 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 618 410 0,000914260196521103 0,000881604331267629 0,000549324788281071 0,000518806744487678 0,000953744238353393 0,000930672923650451 39964 38421 667 665 0 True 619 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 664 411 0,00087070220897791 0,000858566650088256 0,000503547722590982 0,000442511635004196 0,000926112505321398 0,000952311420754562 38060 37417 667 665 0 True 664 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 267 456 0,000931463771433121 0,000856524465202833 0,000778210116731518 0,000732433051041428 0,000767881134470319 0,000721490819623306 40716 37328 667 665 0 True 265 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 310 455 0,000930228408341034 0,000906110549892699 0,000793469138628214 0,000747692072938125 0,00076387387072547 0,000763649473984736 40662 39489 667 665 0 True 309 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 354 455 0,000909089973209779 0,000870039598882764 0,000762951094834821 0,000701915007248035 0,000754262492364811 0,000753962504869219 39738 37917 667 665 0 True 354 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 398 455 0,000949262150796884 0,000960928299232861 0,000747692072938125 0,000793469138628214 0,000823226509956981 0,000837692698764988 41494 41878 667 665 0 True 398 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 443 455 0,00102132499783526 0,000967674393124032 0,000732433051041428 0,000488288700694286 0,00100413022305008 0,00108940678201347 44644 42172 667 665 0 True 442 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 487 455 0,00103912337719902 0,00101416278163938 0,000717174029144732 0,00064087891966125 0,000988818473118883 0,00103909671586698 45422 44198 667 665 0 True 486 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 531 455 0,000873721985425232 0,000863155829606059 0,000549324788281071 0,000579842832074464 0,000896002074357396 0,00087372692891073 38192 37617 667 665 0 True 531 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 575 455 0,000892641342409592 0,000854895306474013 0,000564583810177768 0,000473029678797589 0,000919390823220729 0,00094438811688421 39019 37257 667 665 0 True 575 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 620 455 0,000849769667695335 0,000824652613451688 0,000534065766384375 0,000473029678797589 0,000872125762889799 0,00090860637083525 37145 35939 667 665 0 True 619 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 664 454 0,000865097320874925 0,000905215659886728 0,000473029678797589 0,000457770656900893 0,000900732084202299 0,00101256111762661 37815 39450 667 665 0 True 664 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 265 500 0,000888248940304396 0,000956385011510236 0,000762951094834821 0,000762951094834821 0,000737317512883537 0,000824906945905967 38827 41680 667 665 0 True 265 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 310 500 0,000931418017244525 0,00088064060356889 0,00080872816052491 0,000778210116731518 0,000799557900505241 0,000739050332104643 40714 38379 667 665 0 True 309 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 354 499 0,000908701062606714 0,000932062360065878 0,000778210116731518 0,000762951094834821 0,000767031287471044 0,000772411422127669 39721 40620 667 665 0 True 354 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 398 499 0,000939013212551426 0,000973227300340574 0,000747692072938125 0,000747692072938125 0,000829020819290495 0,000816938552695613 41046 42414 667 665 0 True 398 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 443 499 0,00102068443919491 0,000884977378213214 0,000701915007248035 0,000518806744487678 0,000967801603261663 0,000964622917603632 44616 38568 667 665 0 True 442 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 487 500 0,0009425591621676 0,000928643421325114 0,000595101853971161 0,000595101853971161 0,000952087436693231 0,000906598977487848 41201 40471 667 665 0 True 486 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 531 500 0,000955942262331869 0,000940276991402746 0,000610360875867857 0,000686655985351339 0,000935629726213405 0,000845485055746748 41786 40978 667 665 0 True 531 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 574 499 0,000844485058912521 0,000866482984756467 0,000457770656900893 0,000503547722590982 0,000914570119345281 0,00094343771846005 36914 37762 667 665 0 True 575 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 619 499 0,000869215197848546 0,000900832993447225 0,000488288700694286 0,000625619897764553 0,000921532502895671 0,000902923444602339 37995 39259 667 665 0 True 619 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 663 499 0,000873241566444976 0,000849067048486403 0,000534065766384375 0,000473029678797589 0,000901245011656352 0,00092072475352176 38171 37003 667 665 0 True 664 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 266 544 0,000894768912179296 0,000937087511637872 0,000732433051041428 0,000778210116731518 0,000745435723277585 0,000759795267406893 39112 40839 667 665 0 True 265 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 310 543 0,000913711146257954 0,000976554455490982 0,000793469138628214 0,000854505226215 0,000765172978322413 0,000730324969869348 39940 42559 667 665 0 True 309 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 354 543 0,000956628575160806 0,0009579223866487 0,00080872816052491 0,000869764248111696 0,000761857699960194 0,000711884794787199 41816 41747 667 665 0 True 354 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 398 543 0,000892641342409592 0,000909988406585243 0,00064087891966125 0,000701915007248035 0,000823704294521503 0,000801863079017798 39019 39658 667 665 0 True 398 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 443 543 0,000902409861674793 0,000974627000093504 0,000488288700694286 0,000534065766384375 0,000956044182768504 0,00108020206046825 39446 42475 667 665 0 True 442 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 487 544 0,000855946483155767 0,000904940309115659 0,000411993591210803 0,000488288700694286 0,000960029144120161 0,00105074071261334 37415 39438 667 665 0 True 486 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 530 543 0,000920414134887237 0,000910309649151489 0,000518806744487678 0,000564583810177768 0,000976249378221145 0,000942728899201517 40233 39672 667 665 0 True 531 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 575 543 0,000868048466039354 0,000882591004863957 0,000625619897764553 0,000656137941557946 0,000852444736269064 0,000808936401019879 37944 38464 667 665 0 True 575 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 619 543 0,000947317597781562 0,00093713340343305 0,000656137941557946 0,000610360875867857 0,000922817904536847 0,000937358650512056 41409 40841 667 665 0 True 619 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 663 543 0,000905749917442286 0,000893926278272931 0,000610360875867857 0,000488288700694286 0,000888166711942591 0,000982360502393996 39592 38958 667 665 0 True 664 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 266 588 0,000917485866817106 0,000964140724895324 0,00080872816052491 0,000854505226215 0,000675482694897686 0,000683841447914436 40105 42018 667 665 0 True 265 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 310 588 0,00087015315871476 0,000887684994128718 0,000747692072938125 0,000762951094834821 0,000699430076828541 0,000716842155999718 38036 38686 667 665 0 True 309 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 355 587 0,000961547150434853 0,000953195531745362 0,000854505226215 0,00080872816052491 0,000692595839782827 0,000717486063279509 42031 41541 667 665 0 True 354 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 398 587 0,000972711172452227 0,000970382009039536 0,000778210116731518 0,000839246204318303 0,000804714532434269 0,000715754708813647 42519 42290 667 665 0 True 398 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 443 587 0,000911331928450973 0,000927610855933608 0,000549324788281071 0,000411993591210803 0,000912236709555136 0,00108525354069826 39836 40426 667 665 0 True 442 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 487 588 0,000876284219986596 0,000955237716630785 0,000411993591210803 0,000488288700694286 0,00102669807203493 0,00104546525814367 38304 41630 667 665 0 True 486 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 531 588 0,000889095392793418 0,000900098724724377 0,000518806744487678 0,000457770656900893 0,000951106987433821 0,00101891379704002 38864 39227 667 665 0 True 531 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 575 588 0,000861116706467092 0,000865427473467372 0,000534065766384375 0,000534065766384375 0,000858464775099861 0,000904974417789912 37641 37716 667 665 0 True 575 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 619 587 0,000940271452737811 0,000837984179950907 0,000732433051041428 0,000625619897764553 0,000799694788786323 0,000720477331859002 41101 36520 667 665 0 True 619 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 663 587 0,000863610309745562 0,000870269057858654 0,000625619897764553 0,000625619897764553 0,000816632954682806 0,000784637283444739 37750 37927 667 665 0 True 664 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 265 625 0,000945876340840795 0,000897184595730572 0,000823987182421607 0,000701915007248035 0,000721592466974864 0,000727926474237838 41346 39100 667 665 0 False 265 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 309 625 0,000907602962080416 0,000866941902708247 0,000823987182421607 0,000747692072938125 0,000667600192863063 0,000666310892761181 39673 37782 667 665 0 False 309 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 354 631 0,000954981424371357 0,000928987609788949 0,000869764248111696 0,000823987182421607 0,000681704551482976 0,000680038270197978 41744 40486 667 665 0 True 354 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 398 631 0,000954363742825314 0,000856409735714888 0,000839246204318303 0,000686655985351339 0,00073157500181466 0,000668160214855635 41717 37323 667 665 0 True 398 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 442 625 0,000955644860105996 0,000940070478324445 0,00064087891966125 0,00064087891966125 0,000940193081745144 0,000924969531293909 41773 40969 667 665 0 False 442 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 486 625 0,000933842989240102 0,000892113552363399 0,000564583810177768 0,000534065766384375 0,000986892411896971 0,000942417164932518 40820 38879 667 665 0 False 486 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 531 625 0,000871434275995442 0,000874972966864403 0,000488288700694286 0,000473029678797589 0,000897047321834187 0,000943468384486443 38092 38132 667 665 0 False 531 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 575 625 0,000887905783889927 0,00085496414416678 0,00064087891966125 0,000595101853971161 0,000799088050936961 0,000797225448209234 38812 37260 667 665 0 False 575 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 619 626 0,00090538388393352 0,000868318656563588 0,000686655985351339 0,000701915007248035 0,000752316556322736 0,000665658134350117 39576 37842 667 665 0 False 619 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 664 626 0,000889141146982014 0,000844179572299942 0,000701915007248035 0,00064087891966125 0,00075234647982315 0,000721483330070702 38866 36790 667 665 0 False 664 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 267 676 0,00098463013858143 0,0683322175890631 0,000823987182421607 0,0667582207980468 0,000692409424813413 0,0207979800836403 43040 2977971 667 665 0 True 265 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 309 669 0,00088461148231103 0,000895417761616217 0,000732433051041428 0,000778210116731518 0,000695858153044315 0,000676003821831002 38668 39023 667 665 0 False 309 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 353 669 0,000903439330918198 0,000920176385114767 0,000762951094834821 0,000778210116731518 0,000659961758091305 0,000658937144101568 39491 40102 667 665 0 False 353 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 398 669 0,000885938353780308 0,000933485005716397 0,000717174029144732 0,000793469138628214 0,000703098545887019 0,000680646266950888 38726 40682 667 665 0 False 398 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 442 669 0,000883627767256221 0,000921208950506273 0,000656137941557946 0,000747692072938125 0,000763726102312151 0,000793519718851863 38625 40147 667 665 0 False 442 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 486 669 0,000872074834635784 0,000963108159503818 0,000579842832074464 0,000717174029144732 0,000871493303289716 0,0008143609955526 38120 41973 667 665 0 False 486 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 531 669 0,000872120588824379 0,000902255639097744 0,000503547722590982 0,000549324788281071 0,000906228168718098 0,000899498655341142 38122 39321 667 665 0 False 531 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 575 669 0,000885823968308819 0,000902163855507388 0,000717174029144732 0,000717174029144732 0,000722988538034233 0,000732069624233995 38721 39317 667 665 0 False 575 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 619 669 0,000868322991170929 0,000853380877233138 0,000686655985351339 0,000686655985351339 0,000680468077351598 0,000686514315378576 37956 37191 667 665 0 False 619 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 664 675 0,000969622764722011 0,0685223014046905 0,000747692072938125 0,0675516899366751 0,00079201631089845 0,022411644403688 42384 2986255 667 665 0 True 663 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E6_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E6_1.csv new file mode 100755 index 0000000..7613b32 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E6_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 277 263 0,0104967886850807 0,0464446536345441 0,0104676890211337 0,0466926070038911 0,00142024315151059 0,00930708860885713 458834 2024094 667 665 0 True 277 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 321 263 0,0104859449423835 0,0105027274067522 0,0104371709773404 0,0105134660868238 0,00132364935178886 0,00133320410403709 458360 457717 667 665 0 False 321 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 365 263 0,0105168518967799 0,0668395181132047 0,0104982070649271 0,0671091783016709 0,00130503701838759 0,0106758066382995 459711 2912918 667 665 0 True 365 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 410 262 0,0107022936231587 0,0910975539099523 0,0106355382619974 0,0907606622415503 0,00145642039851381 0,0135342108797362 467817 3970102 667 665 0 True 409 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 453 262 0,010674520830681 0,0813096829966883 0,0106813153276875 0,0807660028992142 0,00169956129097734 0,016064823327968 466603 3543539 667 665 0 True 454 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 497 262 0,0107120621424239 0,072985966862682 0,0106813153276875 0,0750896467536431 0,00168106907978359 0,0229456952941093 468244 3180785 667 665 0 True 498 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 541 262 0,010750083873147 0,0887109740476162 0,0107881284809644 0,0889295796139467 0,00152928570329049 0,0261339856617065 469906 3866093 667 665 0 True 542 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 585 262 0,0105797639060991 0,0731830491770741 0,0106813153276875 0,0717021438925765 0,00184066371883529 0,0200489379288146 462461 3189374 667 665 0 True 586 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 631 264 0,0107760036209865 0,0105924917581204 0,0107728694590677 0,0106355382619974 0,00188061854736915 0,00171096503254134 471039 461629 667 665 0 False 631 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 674 262 0,0110876353995124 0,0467355846700753 0,0111848630502785 0,0472419317921721 0,00193067087541044 0,00846605544420265 484661 2036773 667 665 0 True 675 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 277 307 0,0106010853579848 0,0104868947374158 0,0105745021744106 0,0105134660868238 0,00139654535455554 0,00143528993600983 463393 457027 667 665 0 False 277 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 321 307 0,0105666095768778 0,0105540344337612 0,0105439841306172 0,0105287251087205 0,00129842553407476 0,00126670704300744 461886 459953 667 665 0 False 321 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 365 307 0,0108212545135077 0,142242789395095 0,0108186465247578 0,143862058442054 0,00134399917990342 0,0481101407614742 473017 6199051 667 665 0 True 365 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 410 307 0,010673445607249 0,0559851677717985 0,0106355382619974 0,0554360265506981 0,00153960337574027 0,00993215850242636 466556 2439877 667 665 0 True 409 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 454 306 0,010519162483304 0,0836818757812361 0,0104982070649271 0,0824597543297475 0,00177865127994197 0,0203724931580428 459812 3646921 667 665 0 True 454 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 499 307 0,0107179644327527 0,0474237780305651 0,010757610437171 0,0470588235294118 0,00170092801401602 0,010927771624397 468502 2066765 667 665 0 True 498 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 541 306 0,0105619426496411 0,0477249888282161 0,0105287251087205 0,0498664835584039 0,00152364221794895 0,0115110811400947 461682 2079892 667 665 0 True 542 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 587 307 0,0105303036282271 0,0547560248756476 0,010605020218204 0,0554665445944915 0,00187373137409697 0,0118484726032815 460299 2386310 667 665 0 True 586 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 631 307 0,0106570198535431 0,0104127794882032 0,0106355382619974 0,010452429999237 0,0018794012431755 0,0018926143740416 465838 453797 667 665 0 False 631 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 675 307 0,010544121393183 0,0105007081677643 0,0104982070649271 0,0104829480430304 0,00185590060625913 0,00194809649232934 460903 457629 667 665 0 False 675 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 278 352 0,0111041297845012 0,0551171015201083 0,0106355382619974 0,0544747081712062 0,00432110778470149 0,0121087785484339 485382 2402046 667 665 0 True 277 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 322 351 0,0107182847120729 0,066222227576265 0,0107270923933776 0,0699778744182498 0,00135524693414397 0,01935756851695 468516 2886016 667 665 0 True 321 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 367 352 0,0106428589321727 0,0420263292701885 0,0106660563057908 0,0428625925078202 0,00135291406280891 0,00710203321136442 465219 1831540 667 665 0 True 365 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 410 351 0,0107060225895292 0,0374771444518827 0,0107270923933776 0,0381170366979477 0,00149155541680414 0,005666537116618 467980 1633283 667 665 0 True 409 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 455 350 0,0106909008301983 0,0769224273776683 0,0106660563057908 0,0741435873960479 0,00175576010101937 0,0167115285289796 467319 3352339 667 665 0 True 454 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 498 352 0,0107699640680918 0,0367039824326208 0,0107270923933776 0,036942092011902 0,00178609863615997 0,00716505853089004 470775 1599588 667 665 0 True 498 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 542 351 0,0106961168076982 0,0304421158182708 0,0107118333714809 0,0306248569466697 0,00158048607239044 0,00377320591476258 467547 1326691 667 665 0 True 542 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 587 351 0,0107654572805152 0,0539137957046427 0,0107423514152743 0,0541695277332723 0,00202612309334098 0,00964867610331292 470578 2349605 667 665 0 True 586 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 631 351 0,0109634585316634 0,0588615278181721 0,0109102006561379 0,0588235294117647 0,00215079360339272 0,0134626192709317 479233 2565231 667 665 0 True 631 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 676 351 0,0109055108518069 0,0661268414799874 0,0108644235904479 0,0670939192797742 0,00202927006917414 0,0185739484463838 476700 2881859 667 665 0 True 675 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 279 396 0,0107608132303727 0,0451691370793658 0,0107423514152743 0,0477912565804532 0,00162732923153952 0,00967076194574321 470375 1968506 667 665 0 True 277 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 323 395 0,0107213959968974 0,0352482946895736 0,0107881284809644 0,0343175402456703 0,00148490074242757 0,00612901041611537 468652 1536148 667 665 0 True 321 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 367 395 0,0107254223654938 0,0913957358491215 0,0107423514152743 0,0871900511177233 0,00146081399366249 0,0203112916840832 468828 3983097 667 665 0 True 365 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 410 394 0,0109192828625742 0,0714077250806118 0,0108949416342412 0,0701762417029068 0,00155671499537541 0,0200360545551436 477302 3112004 667 665 0 True 409 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 455 394 0,0107304553262394 0,0450991291458218 0,0108033875028611 0,0468604562447547 0,00170246329444099 0,00791492373424728 469048 1965455 667 665 0 True 454 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 499 395 0,0109221196222671 0,059260786436221 0,0108796826123445 0,0594491493095293 0,00178995929098038 0,0131246391413221 477426 2582631 667 665 0 True 498 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 544 395 0,0108239082564463 0,0429014169665409 0,0108796826123445 0,044281681544213 0,00171310694515647 0,0061172083537645 473133 1869677 667 665 0 True 542 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 588 395 0,0106871489867335 0,054280930066067 0,0106202792401007 0,053177691309987 0,00196640302815675 0,010131617970136 467155 2365605 667 665 0 True 586 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 632 394 0,0105518538510557 0,0425977509578478 0,0106202792401007 0,043579766536965 0,00191552121504165 0,00812952999598097 461241 1856443 667 665 0 True 631 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 676 394 0,0104740717304429 0,0950781623318998 0,0104982070649271 0,0939803158617533 0,00179801880243657 0,0206678153291194 457841 4143580 667 665 0 True 675 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 279 439 0,0105152505001791 0,0433234838067933 0,0105134660868238 0,0442206454566262 0,0015668536511399 0,00641955249749779 459641 1888071 667 665 0 True 277 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 322 439 0,0107390799907897 0,0598138972976043 0,0107728694590677 0,0598001068131533 0,0013952595493422 0,00860828131247197 469425 2606736 667 665 0 True 321 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 367 438 0,0106361788206377 0,0351347813342007 0,0106507972838941 0,0358587014572366 0,00141646704224873 0,00412843124387661 464927 1531201 667 665 0 True 365 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 411 439 0,0112986537173162 0,0607293009360205 0,0110170138094148 0,0574349584191653 0,00287744746543624 0,015598821369353 493885 2646630 667 665 0 True 409 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 455 438 0,0110411491438991 0,106982746405955 0,0110170138094148 0,107286182955673 0,00179171034518375 0,0231800331110041 482629 4662391 667 665 0 True 454 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 499 439 0,0108233820832774 0,0668748089036966 0,0108339055466545 0,0636453803311208 0,00176264123099264 0,0189035713718691 473110 2914456 667 665 0 True 498 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 543 438 0,010664226138247 0,0574083182320645 0,0106355382619974 0,0563363088426032 0,00178787839836997 0,0103792636994147 466153 2501899 667 665 0 True 542 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 588 438 0,010571230749926 0,0319073949465102 0,0105745021744106 0,031967650873579 0,00191578687850283 0,00460044349705325 462088 1390549 667 665 0 True 586 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 632 439 0,0104934943835018 0,040243203568546 0,0104829480430304 0,0407873655298695 0,00198549429212064 0,00658432587452131 458690 1753830 667 665 0 True 631 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 676 438 0,0104938604170105 0,0680418602009716 0,0104371709773404 0,06665140764477 0,00191126479281743 0,0099018953135136 458706 2965317 667 665 0 True 675 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 278 483 0,010716523175812 0,0571565328978202 0,0106660563057908 0,0583657587548638 0,00153704519899288 0,0171139551138898 468439 2490926 667 665 0 True 277 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 322 483 0,0107781083136619 0,0571893684772701 0,0107270923933776 0,0575722896162356 0,00162459917813641 0,00976620934937599 471131 2492357 667 665 0 True 321 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 366 482 0,0108589330878164 0,0749069056252442 0,0108491645685512 0,076096742198825 0,00160526671392496 0,0205347014600878 474664 3264501 667 665 0 True 365 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 410 482 0,0112404086352338 0,0914054878555969 0,011108567940795 0,0871900511177233 0,00251694837255478 0,0297296331440335 491339 3983522 667 665 0 True 409 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 455 482 0,0110182949266955 0,0987477850038234 0,0110322728313115 0,0960860608834974 0,00190463639964504 0,0350734412338113 481630 4303505 667 665 0 True 454 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 498 482 0,0106322210833242 0,0503856803831506 0,0105745021744106 0,0507820248722057 0,00182402071797817 0,0120252645099798 464754 2195847 667 665 0 True 498 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 543 482 0,0106381004965588 0,0434028536665537 0,0107270923933776 0,0449073014419776 0,00177056821801343 0,00726627770181652 465011 1891530 667 665 0 True 542 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 587 483 0,0107631009398025 0,118402827852419 0,0107881284809644 0,116716258487831 0,00199291632609562 0,0238331988793606 470475 5160087 667 665 0 True 586 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 630 482 0,010571688291812 0,0629915369793217 0,0106202792401007 0,0675822079804684 0,00188168829715948 0,0186700894341625 462108 2745220 667 665 0 True 631 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 675 482 0,0104433020386122 0,0766574252064127 0,0104982070649271 0,0729228656443122 0,00185998360089286 0,0142968916396619 456496 3340790 667 665 0 True 675 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 278 527 0,0103369693043156 0,0591604899178594 0,010406652933547 0,0628061341268025 0,00147862966655783 0,0168989112678796 451848 2578260 667 665 0 True 277 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 323 527 0,0106166417821073 0,105977280119502 0,0105287251087205 0,0974288548104067 0,00155674822699237 0,0285167530990161 464073 4618572 667 665 0 True 321 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 366 526 0,0107371354377744 0,0574472803661706 0,0106660563057908 0,0601510643167773 0,00154077191916881 0,0145309759999379 469340 2503597 667 665 0 True 365 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 411 527 0,0109864728885271 0,0598800503203534 0,0110170138094148 0,0590829327840085 0,00176473136950708 0,0107870704833801 480239 2609619 667 665 0 True 409 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 455 526 0,0110307629430879 0,0562787146396548 0,0110780498970016 0,0570840009155413 0,001953716414507 0,00831537551867244 482175 2452670 667 665 0 True 454 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 499 527 0,010913815237037 0,0614288295699193 0,0108644235904479 0,0624093995574884 0,00206620544830707 0,0142294894255262 477063 2677116 667 665 0 True 498 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 543 527 0,010606324212579 0,0743440657032832 0,0105897611963073 0,0712596322575723 0,00179544778506503 0,0206555618148882 463622 3239972 667 665 0 True 542 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 587 527 0,0105265289076679 0,0592797626935271 0,0104371709773404 0,0601052872510872 0,00168735780619898 0,015728276569712 460134 2583458 667 665 0 True 586 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 631 526 0,0104677805295109 0,0458111862398041 0,0104219119554437 0,0446936751354238 0,00196295236445641 0,00860167745590211 457566 1996487 667 665 0 True 631 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 675 526 0,0104616952224277 0,0738836562681595 0,0104219119554437 0,0713511863889525 0,00189076212319414 0,0220650050058665 457300 3219907 667 665 0 True 675 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 279 571 0,0104396188264302 0,047782560085267 0,0104219119554437 0,0488593881132219 0,0013221017625143 0,0115707258960559 456335 2082401 667 665 0 True 277 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 323 571 0,0104792419537542 0,0536799081705178 0,0105439841306172 0,0545204852368963 0,00149506787788353 0,0119842583927972 458067 2339412 667 665 0 True 321 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 367 571 0,0106577290434664 0,0499248120300752 0,0105897611963073 0,0504615854123751 0,00155853306403081 0,0101335439519598 465869 2175762 667 665 0 True 365 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 411 571 0,010752463090954 0,0517890514796949 0,0108186465247578 0,0505073624780652 0,00171369985897951 0,0096061559750237 470010 2257007 667 665 0 True 409 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 455 570 0,0108174111616657 0,0848222180537175 0,0108186465247578 0,0812390325780118 0,00205108746734695 0,0231871332808354 472849 3696618 667 665 0 True 454 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 499 571 0,0105982028441032 0,0611973972468365 0,0105745021744106 0,0610971236743725 0,00203160676936367 0,014146203840517 463267 2667030 667 665 0 True 498 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 544 571 0,0104875920931729 0,0555877677714543 0,0104982070649271 0,0553749904631113 0,00204106902316791 0,00796983935214911 458432 2422558 667 665 0 True 542 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 588 570 0,0103261941929013 0,0368449161356125 0,0104219119554437 0,0385290302891585 0,00175815610386433 0,00695817277688671 451377 1605730 667 665 0 True 586 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 632 570 0,010503880584313 0,049342330419778 0,0105287251087205 0,049759670405127 0,0016460239752985 0,00812720554089146 459144 2150377 667 665 0 True 631 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 676 570 0,0103178898076711 0,0544918258108076 0,0103456168459602 0,0539559014267186 0,00164997211264485 0,00748396028726362 451014 2374796 667 665 0 True 675 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 277 610 0,0100914752054049 0,010103652355884 0,00999465934233616 0,0100404364080262 0,00149990681836919 0,00173629106095959 441117 440325 667 665 0 False 277 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 321 610 0,0102072561796465 0,0101757024743135 0,0102388036926833 0,0101625085831998 0,00140207384055128 0,00136601129891347 446178 443465 667 665 0 False 321 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 367 615 0,010237087910611 0,0728076772384153 0,0101930266269932 0,0701304646372168 0,00139672018150607 0,0145694722504167 447482 3173015 667 665 0 True 365 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 411 614 0,0105188650810781 0,0745899539418471 0,0104982070649271 0,0731212329289693 0,00154915014957757 0,0219782848274094 459799 3250688 667 665 0 True 409 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 454 611 0,0102191751457757 0,0132275756913456 0,0102235446707866 0,0106355382619974 0,00193049462551258 0,0145044461664858 446699 576468 667 665 0 False 454 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 498 611 0,0101484620473009 0,0102294876582622 0,0101777676050965 0,01025406271458 0,00209958545551599 0,00205246604048782 443608 445809 667 665 0 False 498 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 542 611 0,0101866210405898 0,0101112703938835 0,0102998397802701 0,0101777676050965 0,00184879405792425 0,00196319247300501 445276 440657 667 665 0 False 542 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 586 611 0,0102328556481658 0,0100718493418256 0,01025406271458 0,0102082856488899 0,00158513311127924 0,00177539659002027 447297 438939 667 665 0 False 586 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 631 611 0,0102469250611591 0,0101744863417413 0,01025406271458 0,0102082856488899 0,00149762909144954 0,00151346904108925 447912 443412 667 665 0 False 631 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 675 611 0,0102002786658856 0,0101915121977523 0,0101472495613031 0,0101472495613031 0,00148344134020852 0,00163357702884344 445873 444154 667 665 0 False 675 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 278 660 0,0100079509341232 0,0427867104244934 0,0100404364080262 0,0430304417486839 0,00132359998647074 0,00911753676831535 437466 1864678 667 665 0 True 276 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 321 654 0,00988503230646064 0,00983513946229731 0,00990310521095598 0,0098268101014725 0,00136105954168468 0,00126444665566173 432093 428623 667 665 0 False 321 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 365 654 0,00987659065866472 0,0100079679629378 0,00987258716716258 0,0100709544518196 0,00137554411578716 0,00125384286527804 431724 436155 667 665 0 False 365 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 409 654 0,0100801052895388 0,0101054650817935 0,010101472495613 0,0100862134737163 0,00142094690638354 0,00139724587113137 440620 440404 667 665 0 False 409 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 453 654 0,0101480731366978 0,00995686744900704 0,0100556954299229 0,00994888227664607 0,00197521758325177 0,00158038005826806 443591 433928 667 665 0 False 453 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 498 654 0,00994343752820317 0,0100805228911143 0,00994888227664607 0,0100404364080262 0,00169834597588207 0,00171497637137369 434646 439317 667 665 0 False 498 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 542 654 0,00987267867553978 0,0100538597581158 0,00988784618905928 0,00997940032043946 0,00174464923868742 0,00169543033901206 431553 438155 667 665 0 False 542 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 586 654 0,00993890786353219 0,0100127407096363 0,00988784618905928 0,0100251773861295 0,00146319333165647 0,00119408967232832 434448 436363 667 665 0 False 586 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 630 654 0,0101403178017309 0,0101313251083763 0,0101777676050965 0,0101777676050965 0,00135918070112856 0,00140002903560079 443252 441531 667 665 0 False 630 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 676 660 0,0100950897863039 0,0441929497582363 0,0101167315175097 0,0444037537193866 0,00144662508990417 0,00854617596871275 441275 1925963 667 665 0 True 675 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E6_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E6_2.csv new file mode 100755 index 0000000..03af627 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E6_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 277 263 0,00821154998147527 0,718154645024096 0,00813305867093919 0,729915312428473 0,00167348339689437 0,195378776902539 358942 31297736 667 665 11 True 277 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 321 263 0,00719200939699525 0,00690359453222206 0,00715648126955062 0,00697337300679027 0,0014293188258046 0,00129738282537625 314376 300864 667 665 0 False 321 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 365 263 0,00653074698631458 0,00670258846934227 0,00654612039368277 0,00674448767833982 0,00116514000583926 0,0012462028338047 285471 292104 667 665 0 True 365 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 410 262 0,00654660081266302 0,00678462005322301 0,00660715648126955 0,00671396963454643 0,00139162804701494 0,00132048498211461 286164 295679 667 665 0 True 409 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 453 262 0,00677088784515959 0,0068964124662767 0,00685130083161669 0,00694285496299687 0,00153404568604333 0,00153123418947296 295968 300551 667 665 0 True 454 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 497 262 0,00710656344979261 0,00713550871915426 0,0072632944228275 0,00708018616006714 0,00158014020531696 0,00151386545674822 310641 310971 667 665 0 True 498 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 541 262 0,00752580907989585 0,00745682012309327 0,00756847486076143 0,00744640268558785 0,00152942945201948 0,0015140252981814 328967 324974 667 665 0 True 542 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 585 262 0,00787944320355272 0,00775477260328666 0,00794995040817884 0,00779736018921187 0,00172137278856733 0,00189967042006257 344425 337959 667 665 0 True 586 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 631 264 0,00867634390632562 0,00827300570033461 0,00866712443732357 0,00822461280231937 0,00202663067501827 0,00173866101125439 379259 360544 667 665 0 False 631 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 674 262 0,0102313228828479 0,721404197148857 0,0102388036926833 0,716853589684901 0,00202551361581132 0,179688309249108 447230 31439354 667 665 10 True 675 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 277 307 0,00698892943091283 0,00678666223810843 0,00683604180972 0,00685130083161669 0,00150167550555828 0,00136586828117281 305499 295768 667 665 0 False 277 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 321 307 0,00669095527768274 0,00669575059186075 0,00668345159075303 0,00671396963454643 0,00117888862963186 0,00115644576317938 292474 291806 667 665 0 False 321 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 365 307 0,00668040893721141 0,00667918365380147 0,00665293354695964 0,00663767452506294 0,00126852409208841 0,00118220637270555 292013 291084 667 665 0 True 365 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 410 307 0,00696740208517851 0,00687213570662752 0,00689707789730678 0,00688181887541009 0,00145080147917741 0,00139448364082363 304558 299493 667 665 0 True 409 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 454 306 0,00692427876242698 0,00700496950777034 0,00703440909437705 0,00701915007248035 0,00170065597587007 0,00176858171643496 302673 305282 667 665 0 True 454 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 499 307 0,00705936800425605 0,00727026997569456 0,00708018616006714 0,0072327763790341 0,00156870769576217 0,00169247383673038 308578 316844 667 665 0 True 498 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 541 306 0,00733741620835268 0,00732244894681198 0,00729381246662089 0,00735484855420768 0,00148395673216244 0,00136746666951609 320732 319118 667 665 0 True 542 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 587 307 0,0076230596077562 0,00765938650700911 0,00755321583886473 0,00770580605783169 0,00185540913176681 0,00193210456459776 333218 333802 667 665 0 True 586 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 631 307 0,00792842306244452 0,00797025752754511 0,00804150453955901 0,00798046845197223 0,00183475676249056 0,00197426152026579 346566 347350 667 665 0 False 631 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 675 307 0,00790209152690764 0,00789396241806163 0,00787365529869535 0,00794995040817884 0,00189399744799305 0,0018595992792271 345415 344025 667 665 0 False 675 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 278 352 0,00664705413372508 0,00642414000209955 0,00645456626230259 0,00645456626230259 0,00260939033646268 0,00146466769936528 290555 279969 667 665 0 True 277 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 322 351 0,00674160516445828 0,00670584678679991 0,00679026474402991 0,00669871061264973 0,00123829613902891 0,00129691057077621 294688 292246 667 665 0 True 321 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 367 352 0,00692016088545336 0,0070848671231753 0,00692759594110018 0,00701915007248035 0,00129526189456038 0,00139688234048822 302493 308764 667 665 0 True 365 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 410 351 0,00729852514804626 0,00728211005885049 0,0072480354009308 0,00727855344472419 0,00147732786416615 0,00144832273319995 319032 317360 667 665 0 True 409 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 455 350 0,00732048715857224 0,00735002991571398 0,00730907148851759 0,00738536659800107 0,00161242131674313 0,00159190707579029 319992 320320 667 665 0 True 454 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 498 352 0,00716748515190791 0,00721203328761363 0,0072327763790341 0,00721751735713741 0,00163175819392011 0,00163215769497403 313304 314306 667 665 0 True 498 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 542 351 0,00728921417066701 0,0075056489931627 0,00729381246662089 0,00747692072938125 0,00154422024400385 0,00161100962276839 318625 327102 667 665 0 True 542 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 587 351 0,00751242597973158 0,00750213827083158 0,00761425192645151 0,00750743877317464 0,00179824171468487 0,0020828343420309 328382 326949 667 665 0 True 586 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 631 351 0,00756776567083819 0,00781548744830719 0,00752269779507134 0,00791943236438544 0,00199944038771804 0,00190946013408705 330801 340605 667 665 0 True 631 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 676 351 0,00705113225030881 0,00687429262100089 0,00689707789730678 0,00688181887541009 0,00187789509458617 0,0018619457889227 308218 299587 667 665 0 True 675 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 279 396 0,00639753366621793 0,00649683260566156 0,00643930724040589 0,00663767452506294 0,00148853299578921 0,00137863857580516 279648 283137 667 665 0 True 277 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 323 395 0,00690908837181318 0,00691098311124573 0,00689707789730678 0,00689707789730678 0,00133086719827523 0,00133584311625116 302009 301186 667 665 0 True 321 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 367 395 0,00707702912105403 0,00733463321843175 0,00706492713817044 0,00733958953231098 0,00136553786608738 0,00132551371073429 309350 319649 667 665 0 True 365 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 410 394 0,00715753361588833 0,00742084095567369 0,00715648126955062 0,00740062561989776 0,00138804746442943 0,00144254292188554 312869 323406 667 665 0 True 409 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 455 394 0,00726345456248758 0,00746111100594241 0,0072632944228275 0,00752269779507134 0,00154972785628261 0,00153009977572965 317499 325161 667 665 0 True 454 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 499 395 0,00715522302936424 0,00738371449337466 0,00718699931334401 0,00738536659800107 0,00168006233928142 0,00166515859162358 312768 321788 667 665 0 True 498 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 544 395 0,00734546894554554 0,0074195559854087 0,00741588464179446 0,00746166170748455 0,00153767712096517 0,00147810882923202 321084 323350 667 665 0 True 542 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 588 395 0,00703488951335731 0,00714000611508171 0,00704966811627375 0,00708018616006714 0,00185869660987529 0,00192720437568466 307508 311167 667 665 0 True 586 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 632 394 0,00665364273688287 0,00657269174309085 0,00666819256885634 0,00663767452506294 0,00187967096447591 0,00169325673081323 290843 286443 667 665 0 True 631 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 676 394 0,00642862363736877 0,00631191161699167 0,0063935301747158 0,00633249408712902 0,00172397073331761 0,0019175583769186 281007 275078 667 665 0 True 675 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 279 439 0,00660244379984418 0,00664565969742392 0,00671396963454643 0,00662241550316625 0,00153582630104413 0,00154007815821905 288605 289623 667 665 0 True 277 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 322 439 0,00700919853646077 0,0068477442174904 0,00695811398489357 0,00689707789730678 0,00148277676345224 0,00140573508600423 306385 298430 667 665 0 True 321 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 367 438 0,00694791080083671 0,00717956484252517 0,00694285496299687 0,00712596322575723 0,00140272772328696 0,00120701611622391 303706 312891 667 665 0 True 365 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 411 439 0,00722701135127103 0,00732274724348064 0,00720225833524071 0,00735484855420768 0,00160315673775711 0,00161625942721976 315906 319131 667 665 0 True 409 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 455 438 0,00730685241037069 0,00737063533174892 0,00732433051041428 0,00729381246662089 0,00163974697641737 0,00180188525857364 319396 321218 667 665 0 True 454 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 499 439 0,00727681478555755 0,00746147814030384 0,0072480354009308 0,00747692072938125 0,0016394621553967 0,00181799223134436 318083 325177 667 665 0 True 498 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 543 438 0,00688360328876532 0,00705271992065309 0,00700389105058366 0,00708018616006714 0,00170535937968012 0,00161112823536538 300895 307363 667 665 0 True 542 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 588 438 0,00638902338713912 0,00651966377376263 0,00636301213092241 0,00653086137178607 0,00180276320518469 0,00187989960457568 279276 284132 667 665 0 True 586 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 632 439 0,00626150646352264 0,00621159215273248 0,00643930724040589 0,00613412680247196 0,00180199357384795 0,001741980478479 273702 270706 667 665 0 True 631 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 676 438 0,00609420627292213 0,00637918898872266 0,00617990386816205 0,00648508430609598 0,00177746228898949 0,00178562408864747 266389 278010 667 665 0 True 675 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 278 483 0,00667594790382332 0,00663641250069555 0,00668345159075303 0,00666819256885634 0,00147097023111114 0,00152755643233161 291818 289220 667 665 0 True 277 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 322 483 0,00679628141983025 0,00684489892618936 0,0068207827878233 0,00677500572213321 0,00146523986830627 0,00141874887152701 297078 298306 667 665 0 True 321 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 366 482 0,00684244739612341 0,00683879531743068 0,00691233691920348 0,00685130083161669 0,00150619887357828 0,00138967036509355 299096 298040 667 665 0 True 365 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 410 482 0,00710223967897031 0,00721341004146897 0,00700389105058366 0,00720225833524071 0,00166737274182792 0,00155467410802473 310452 314366 667 665 0 True 409 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 455 482 0,0071403757951649 0,00739463674062703 0,00717174029144732 0,00753795681696803 0,00195811238894718 0,00194057151773588 312119 322264 667 665 0 True 454 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 498 482 0,0069426033149596 0,00696465356570644 0,00692759594110018 0,00691233691920348 0,00168853275321237 0,00178390215865389 303474 303525 667 665 0 True 498 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 543 482 0,00657000408012977 0,00666000088341706 0,00662241550316625 0,00663767452506294 0,00167711733892563 0,00163860378746214 287187 290248 667 665 0 True 542 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 587 483 0,00618569177301942 0,00628061341268025 0,00613412680247196 0,00642404821850919 0,00182324350490715 0,00185998337396007 270388 273714 667 665 0 True 586 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 630 482 0,0062783440049259 0,00631482574598547 0,00631723506523232 0,00630197604333562 0,00177051222153243 0,00160472104521268 274438 275205 667 665 0 True 631 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 675 482 0,00629147545705289 0,00631188867109408 0,00628671702143893 0,00624093995574884 0,00179395854399633 0,00170683016044851 275012 275077 667 665 0 True 675 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 278 527 0,00666807818338485 0,00675814048740528 0,00660715648126955 0,00672922865644312 0,00148798270941061 0,00154350577474699 291474 294525 667 665 0 True 277 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 323 527 0,00679474865451229 0,00687658721075979 0,00679026474402991 0,00688181887541009 0,00145375987504543 0,00140414720925826 297011 299687 667 665 0 True 321 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 366 526 0,00688257381952192 0,00688255314413293 0,00691233691920348 0,0068055237659266 0,00141642200886297 0,00146087027220389 300850 299947 667 665 0 True 365 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 411 527 0,00685386306617806 0,00720170763369858 0,00689707789730678 0,00717174029144732 0,00160671886172339 0,00166799239213732 299595 313856 667 665 0 True 409 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 455 526 0,00690515351159394 0,00673042184311775 0,00698863202868696 0,00677500572213321 0,00188712863491985 0,00185353765740215 301837 293317 667 665 0 True 454 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 499 527 0,00675729885114664 0,00685806987140545 0,00672922865644312 0,00691233691920348 0,00184997711982822 0,00181798705363546 295374 298880 667 665 0 True 498 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 543 527 0,00659375050401098 0,0065303795079367 0,00659189745937285 0,00642404821850919 0,00164634856510704 0,00179119796770281 288225 284599 667 665 0 True 542 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 587 527 0,00647469810528474 0,00640321334349837 0,00650034332799268 0,00645456626230259 0,00161643613203106 0,00162864274997109 283021 279057 667 665 0 True 586 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 631 526 0,00633711526017719 0,00641537466922055 0,00636301213092241 0,00650034332799268 0,00180240958978293 0,00186766591819914 277007 279587 667 665 0 True 631 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 675 526 0,00648876751827794 0,00663712382352081 0,00651560234988937 0,00660715648126955 0,00172129036179218 0,0017992668108628 283636 289251 667 665 0 True 675 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 279 571 0,0069426033149596 0,0068080478146614 0,00685130083161669 0,00685130083161669 0,00140892024185202 0,00129420832062746 303474 296700 667 665 0 True 277 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 323 571 0,00704589339571459 0,00706754297049559 0,00698863202868696 0,00706492713817044 0,00140306767487617 0,00141089261159965 307989 308009 667 665 0 True 321 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 367 571 0,00691821633243804 0,00678326624526526 0,00685130083161669 0,0068055237659266 0,00141779170276778 0,00125974023490434 302408 295620 667 665 0 True 365 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 411 571 0,00677242061047755 0,00676107756229668 0,00677500572213321 0,00671396963454643 0,00153674718291998 0,0015415912101071 296035 294653 667 665 0 True 409 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 455 570 0,00670253108739748 0,00673636483059331 0,00668345159075303 0,00671396963454643 0,00181195327007269 0,00174383112190867 292980 293576 667 665 0 True 454 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 499 571 0,00666389167512833 0,00655626248041711 0,00662241550316625 0,00659189745937285 0,00197063927142806 0,00194770761472899 291291 285727 667 665 0 True 498 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 544 571 0,00665567879827539 0,00673372605237057 0,00660715648126955 0,0068055237659266 0,00178861589886405 0,00165287518729962 290932 293461 667 665 0 True 542 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 588 570 0,00662596145278242 0,00674031152497862 0,00662241550316625 0,00675974670023652 0,00165727403437562 0,00150685456771978 289633 293748 667 665 0 True 586 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 632 570 0,00635797917017687 0,00644853149123668 0,0063935301747158 0,00646982528419928 0,00147867542560899 0,00151990692343842 277919 281032 667 665 0 True 631 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 676 570 0,0065196973497687 0,00654538612495992 0,00659189745937285 0,00659189745937285 0,00163342565717922 0,00164710925379172 284988 285253 667 665 0 True 675 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 277 610 0,00700151183277668 0,00696570907699553 0,00692759594110018 0,00694285496299687 0,00129209470369829 0,00138878470667643 306049 303571 667 665 0 False 277 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 321 610 0,00678145706272522 0,0068400114500029 0,0068207827878233 0,00683604180972 0,0013762014565356 0,00134158820368172 296430 298093 667 665 0 False 321 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 367 615 0,00659825729158767 0,00649749803669164 0,00657663843747616 0,00650034332799268 0,00130644230999874 0,00129248209665526 288422 283166 667 665 0 True 365 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 411 614 0,00642365930790613 0,00665791280673646 0,00642404821850919 0,00660715648126955 0,00143919232463354 0,0014425495176107 280790 290157 667 665 0 True 409 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 454 611 0,00641583534165625 0,0082780308519066 0,00648508430609598 0,00674448767833982 0,00184057677030822 0,00863792828112895 280448 360763 667 665 0 False 454 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 498 611 0,00661655896702599 0,00632845560915335 0,00660715648126955 0,00636301213092241 0,00192890157077884 0,00187579141813193 289222 275799 667 665 0 False 498 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 542 611 0,00651157598129294 0,00645940784669387 0,00653086137178607 0,00651560234988937 0,00176830027062463 0,00194457355125361 284633 281506 667 665 0 False 542 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 586 611 0,00652662910934096 0,0067012805531797 0,00651560234988937 0,00665293354695964 0,00155495559961201 0,00169859932126857 285291 292047 667 665 0 False 586 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 631 611 0,00663936743004099 0,00636716533838602 0,00663767452506294 0,00634775310902571 0,00135777875458683 0,00132531662768321 290219 277486 667 665 0 False 631 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 675 611 0,00676919494018155 0,00660532080946243 0,00679026474402991 0,00659189745937285 0,00150533818390754 0,00156873177276913 295894 287865 667 665 0 False 675 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 278 660 0,00856033416114099 0,691741048661939 0,00833142595559625 0,692225528343633 0,00191667065179271 0,212365204769365 374188 30146611 667 665 10 True 276 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 321 654 0,0074045833572113 0,00704113224237063 0,0072632944228275 0,00712596322575723 0,00174470807864816 0,00125014265504594 323668 306858 667 665 0 False 321 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 365 654 0,00647989120569036 0,00651769042656997 0,00645456626230259 0,00648508430609598 0,00120141955321053 0,00122045448126921 283248 284046 667 665 0 False 365 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 409 654 0,00639401059369606 0,00630254969077535 0,0064087891966125 0,0063935301747158 0,00129193482954166 0,00133265660610813 279494 274670 667 665 0 False 409 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 453 654 0,00639051039826848 0,00637065311481955 0,00636301213092241 0,00631723506523232 0,00158406084019052 0,00158381834659209 279341 277638 667 665 0 False 453 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 498 654 0,00645342240758769 0,00637129559995204 0,0063935301747158 0,00633249408712902 0,00167979051992376 0,00171204655337604 282091 277666 667 665 0 False 498 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 542 654 0,00630636844544082 0,0063404563135924 0,0063782711528191 0,00630197604333562 0,0016541561856294 0,00173162115426216 275663 276322 667 665 0 False 542 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 586 654 0,00658075631444978 0,00656117290250116 0,00665293354695964 0,00660715648126955 0,00133753455899466 0,00111912613854108 287657 285941 667 665 0 False 586 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 630 654 0,00683910734035592 0,00663434736991254 0,0068055237659266 0,00659189745937285 0,00137978656864339 0,00130237706656542 298950 289130 667 665 0 False 630 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 676 660 0,00825188229872246 0,707306031157087 0,0080872816052491 0,700541695277333 0,00182367507979425 0,199626696134584 360705 30824945 667 665 10 True 675 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E6_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E6_3.csv new file mode 100755 index 0000000..5fa72f3 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E6_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 277 263 0,00100933740042316 0,0717313310743097 0,000885023270008392 0,0715953307392996 0,000705967870311187 0,0215594910413324 44120 3126107 667 665 0 True 277 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 321 263 0,000952533575281483 0,000945967574004822 0,000854505226215 0,000885023270008392 0,000676443435384835 0,000637013437565045 41637 41226 667 665 0 False 321 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 365 263 0,000930182654152438 0,000905972874507165 0,000839246204318303 0,00080872816052491 0,00064665763177363 0,000646877291485179 40660 39483 667 665 0 True 365 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 410 262 0,000892412571466613 0,000921690814355642 0,000732433051041428 0,000762951094834821 0,000726232512080559 0,000696329399015726 39009 40168 667 665 0 True 409 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 453 262 0,000916593660139488 0,000946701842727671 0,000701915007248035 0,000747692072938125 0,000804619232113305 0,000868785441488798 40066 41258 667 665 0 True 454 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 497 262 0,000913871285918039 0,000905353335272262 0,000701915007248035 0,000686655985351339 0,000841163197356204 0,000811317886515258 39947 39456 667 665 0 True 498 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 541 262 0,000910943017847908 0,000922952838723038 0,000717174029144732 0,000762951094834821 0,000806425395008666 0,000792673601433254 39819 40223 667 665 0 True 542 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 585 262 0,000928260978231415 0,000964760264130227 0,000686655985351339 0,000671396963454643 0,000860056648089104 0,000949236501273818 40576 42045 667 665 0 True 586 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 631 264 0,000963994999524728 0,00106574515941949 0,000701915007248035 0,000793469138628214 0,00096008176289316 0,000951768563710555 42138 46446 667 665 0 False 631 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 674 262 0,00121131926597928 0,0717688476168678 0,000946059357595178 0,070420386053254 0,00102100224421824 0,0199190192203165 52949 3127742 667 665 0 True 675 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 277 307 0,000925973268801626 0,000895532491104162 0,000778210116731518 0,000747692072938125 0,000703164241153639 0,000707275492392859 40476 39028 667 665 0 False 277 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 321 307 0,000952464943998589 0,00093690394445716 0,000839246204318303 0,000839246204318303 0,000682942768834074 0,000636523411092081 41634 40831 667 665 0 False 321 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 365 307 0,000906024442573861 0,00085356444441385 0,000793469138628214 0,000732433051041428 0,000665721959021365 0,000618971528700163 39604 37199 667 665 0 True 365 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 410 307 0,000915884470216254 0,000879585092279795 0,000717174029144732 0,000717174029144732 0,000771804105497697 0,000749994248459379 40035 38333 667 665 0 True 409 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 454 306 0,000888752236378949 0,000928253341066101 0,000610360875867857 0,00064087891966125 0,000879424172128248 0,000893963896313977 38849 40454 667 665 0 True 454 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 499 307 0,000895683995951212 0,000918134200229344 0,00064087891966125 0,000701915007248035 0,000855030508477414 0,000813006169556332 39152 40013 667 665 0 True 498 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 541 306 0,000912292766411484 0,000858245407522009 0,000717174029144732 0,000701915007248035 0,000768842936288896 0,000741873025260665 39878 37403 667 665 0 True 542 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 587 307 0,000923273771674474 0,000874674670195746 0,000564583810177768 0,000473029678797589 0,000933926943617727 0,00100264298742076 40358 38119 667 665 0 True 586 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 631 307 0,00104868600261554 0,00103977040334872 0,000701915007248035 0,000671396963454643 0,00106678629549328 0,00102942572519389 45840 45314 667 665 0 False 631 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 675 307 0,000996183071201868 0,000970909764684084 0,000671396963454643 0,000534065766384375 0,000980932902281353 0,00102599539814002 43545 42313 667 665 0 False 675 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 278 352 0,000889186901170609 0,000915724880982497 0,000762951094834821 0,000747692072938125 0,000713283457478796 0,000715926274482908 38868 39908 667 665 0 True 277 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 322 351 0,00091798916289166 0,000891126878767071 0,00080872816052491 0,000747692072938125 0,000688075651781206 0,000673523288596293 40127 38836 667 665 0 True 321 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 367 352 0,000861825896390326 0,000856340898022121 0,000778210116731518 0,000717174029144732 0,000650644520262451 0,00067390183564638 37672 37320 667 665 0 True 365 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 410 351 0,000940500223680789 0,000966274693371102 0,000778210116731518 0,00080872816052491 0,000799372012963729 0,000746640702110142 41111 42111 667 665 0 True 409 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 455 350 0,00097854483149819 0,000944659657842248 0,000686655985351339 0,000701915007248035 0,000885644069057563 0,000861080033534127 42774 41169 667 665 0 True 454 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 498 352 0,000953242765204717 0,000914852936874115 0,000701915007248035 0,000595101853971161 0,000906484501721898 0,000908547585882088 41668 39870 667 665 0 True 498 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 542 351 0,00087559790715766 0,00089394922417052 0,000701915007248035 0,000686655985351339 0,000789970360637123 0,00080775918731555 38274 38959 667 665 0 True 542 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 587 351 0,000835951902739406 0,000904206040392811 0,000473029678797589 0,000381475547417411 0,00098674250024091 0,00107987477868627 36541 39406 667 665 0 True 586 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 631 351 0,000946997318461392 0,00103536479101163 0,000503547722590982 0,000671396963454643 0,0010107744470233 0,00107075619645472 41395 45122 667 665 0 True 631 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 676 351 0,0009447324861259 0,000954549339703114 0,000579842832074464 0,000656137941557946 0,000980429412708515 0,000962972545676514 41296 41600 667 665 0 True 675 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 279 396 0,000936428100895764 0,000900993614730348 0,00080872816052491 0,00080872816052491 0,000756332703538805 0,000692128080518319 40933 39266 667 665 0 True 277 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 323 395 0,000892252431806527 0,000833532675818638 0,000793469138628214 0,000717174029144732 0,000684034678852196 0,00066918419174972 39002 36326 667 665 0 True 321 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 367 395 0,000967403686575115 0,000888419262851567 0,000823987182421607 0,000762951094834821 0,000724671363224043 0,000690079662189291 42287 38718 667 665 0 True 365 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 410 394 0,000939974050511938 0,00083185762529464 0,000747692072938125 0,000671396963454643 0,000801670409725723 0,000706200312217246 41088 36253 667 665 0 True 409 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 455 394 0,00105442815328431 0,000946518275546959 0,000839246204318303 0,000686655985351339 0,00092037830262025 0,000829152811332977 46091 41250 667 665 0 True 454 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 499 395 0,000962164831980897 0,000939519776782308 0,000671396963454643 0,00064087891966125 0,000910587785415563 0,000885981900651041 42058 40945 667 665 0 True 498 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 544 395 0,000960266033154171 0,000908038005290177 0,000747692072938125 0,000671396963454643 0,000869750166059737 0,000844536541603719 41975 39573 667 665 0 True 542 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 588 395 0,000810649836445934 0,000919671575367808 0,000411993591210803 0,000473029678797589 0,000924344311249476 0,00100942788531233 35435 40080 667 665 0 True 586 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 632 394 0,000903599470578284 0,000933576789306753 0,000534065766384375 0,000610360875867857 0,000951776022548268 0,000956148568519899 39498 40686 667 665 0 True 631 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 676 394 0,000902501370051985 0,000866987794503425 0,000579842832074464 0,000488288700694286 0,000886025132558147 0,000897086358436577 39450 37784 667 665 0 True 675 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 279 439 0,000914969386444338 0,000931970576475522 0,000747692072938125 0,00080872816052491 0,000776701246996424 0,000785080673982528 39995 40616 667 665 0 True 277 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 322 439 0,000860087237223686 0,000959069681528151 0,000717174029144732 0,000839246204318303 0,000716418136811926 0,000733518724590193 37596 41797 667 665 0 True 321 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 367 438 0,000929336201663416 0,000907510249645629 0,000793469138628214 0,000839246204318303 0,0007579004695626 0,00063359973146113 40623 39550 667 665 0 True 365 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 411 439 0,000959099301344979 0,000896932190857092 0,000732433051041428 0,000701915007248035 0,000849144339872292 0,000797790164334353 41924 39089 667 665 0 True 409 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 455 438 0,000965436256465496 0,000993580311502033 0,000701915007248035 0,000732433051041428 0,000926517420529314 0,000940883354770936 42201 43301 667 665 0 True 454 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 499 439 0,000919887961718386 0,00102409835529543 0,000579842832074464 0,000610360875867857 0,000955123944544705 0,00103453913007029 40210 44631 667 665 0 True 498 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 543 438 0,000890239247508313 0,000868754628617779 0,00064087891966125 0,000625619897764553 0,000867339722337913 0,000820475155798351 38914 37861 667 665 0 True 542 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 588 438 0,000850341595052783 0,000805309221784147 0,000457770656900893 0,000396734569314107 0,000931720091549233 0,000939496199849907 37170 35096 667 665 0 True 586 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 632 439 0,000892526956938102 0,000933370276228452 0,000534065766384375 0,000534065766384375 0,000948322719444456 0,000972305343545649 39014 40677 667 665 0 True 631 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 676 438 0,000935970559009806 0,000886606536942035 0,000579842832074464 0,000518806744487678 0,00095447710238562 0,000911168827022986 40913 38639 667 665 0 True 675 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 278 483 0,000882849946050092 0,000972011167768357 0,000747692072938125 0,00080872816052491 0,000732746940746304 0,000821218282414977 38591 42361 667 665 0 True 277 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 322 483 0,000862626594690753 0,000900511750880979 0,000701915007248035 0,000778210116731518 0,00074778802381309 0,000748678762709383 37707 39245 667 665 0 True 321 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 366 482 0,000889141146982014 0,000826121150897385 0,000778210116731518 0,000701915007248035 0,000769472347785126 0,000710325665939908 38866 36003 667 665 0 True 365 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 410 482 0,000918172179646043 0,000915449530211429 0,000686655985351339 0,000671396963454643 0,000894730891479746 0,000869111650599031 40135 39896 667 665 0 True 409 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 455 482 0,000919796453341194 0,000907097223489027 0,000488288700694286 0,000488288700694286 0,00101514033667765 0,00101543587548963 40206 39532 667 665 0 True 454 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 498 482 0,000935146983615082 0,000901131290115882 0,000579842832074464 0,000518806744487678 0,000942530789001954 0,000950181552876512 40877 39272 667 665 0 True 498 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 543 482 0,000834144612289872 0,00085799300264853 0,000518806744487678 0,000579842832074464 0,000868475642999161 0,000858061662701558 36462 37392 667 665 0 True 542 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 587 483 0,000881889108089581 0,000893077280062137 0,000503547722590982 0,000442511635004196 0,000947074419613757 0,00099744245485527 38549 38921 667 665 0 True 586 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 630 482 0,000955438966257315 0,000932154143656234 0,00064087891966125 0,00064087891966125 0,000977779134969812 0,000871566003005304 41764 40624 667 665 0 True 631 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 675 482 0,000885892599591713 0,000910745621205681 0,000549324788281071 0,000534065766384375 0,000938038266273828 0,000938161371888988 38724 39691 667 665 0 True 675 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 278 527 0,000883925169482093 0,000940804747047293 0,000717174029144732 0,000762951094834821 0,000751544535938094 0,000821003517994755 38638 41001 667 665 0 True 277 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 323 527 0,000826068998002715 0,000904596120651824 0,000732433051041428 0,000793469138628214 0,000696603484622687 0,000752767396878789 36109 39423 667 665 0 True 321 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 366 526 0,00088429120299086 0,000976072591641613 0,000747692072938125 0,000823987182421607 0,000782013551258072 0,000811078274598852 38654 42538 667 665 0 True 365 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 411 527 0,00083993251714724 0,000943695930143509 0,000579842832074464 0,00064087891966125 0,000831237119968265 0,000925921145177609 36715 41127 667 665 0 True 409 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 455 526 0,000854779751346574 0,000872563647617556 0,000457770656900893 0,000457770656900893 0,000973182434636122 0,000945032085317416 37364 38027 667 665 0 True 454 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 499 527 0,00089341916361572 0,000913131994554939 0,000564583810177768 0,000534065766384375 0,000947167337844987 0,000931030033605746 39053 39795 667 665 0 True 498 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 543 527 0,000888500588341673 0,000895647220592107 0,000595101853971161 0,000595101853971161 0,000885368205409092 0,000888332890621621 38838 39033 667 665 0 True 542 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 587 527 0,000857685142322407 0,000854069254160808 0,000610360875867857 0,000549324788281071 0,000861928471026331 0,000832464671317963 37491 37221 667 665 0 True 586 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 631 526 0,000843364081291924 0,000942342122185757 0,000473029678797589 0,000610360875867857 0,000932669584617251 0,000981178782510099 36865 41068 667 665 0 True 631 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 675 526 0,000997166786256677 0,000987660269924066 0,000717174029144732 0,000717174029144732 0,000975111739851127 0,00095764350643086 43588 43043 667 665 0 True 675 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 279 571 0,000947981033516201 0,000975682511382599 0,000854505226215 0,000839246204318303 0,000708784166020727 0,000705784371915591 41438 42521 667 665 0 True 277 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 323 571 0,000959167932627872 0,000883784191538586 0,000823987182421607 0,000762951094834821 0,000776665895261906 0,000709391372354207 41927 38516 667 665 0 True 321 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 367 571 0,000894517264142019 0,000868662845027423 0,000778210116731518 0,000762951094834821 0,000678937027196641 0,000651318018141223 39101 37857 667 665 0 True 365 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 411 571 0,000883604890161923 0,000893398522628384 0,00064087891966125 0,000686655985351339 0,000791846337174134 0,000792345021889555 38624 38935 667 665 0 True 409 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 455 570 0,000857593633945216 0,000863224667298826 0,000396734569314107 0,000488288700694286 0,000998733760773514 0,000909885820640549 37487 37620 667 665 0 True 454 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 499 571 0,000912841816674634 0,000964530805154337 0,000457770656900893 0,000488288700694286 0,00103221916545057 0,00114358062426941 39902 42035 667 665 0 True 498 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 544 571 0,00087319581225638 0,000882063249219409 0,000503547722590982 0,000457770656900893 0,000921092439306286 0,000897734994642988 38169 38441 667 665 0 True 542 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 588 570 0,000960860837605917 0,000858520758293078 0,000732433051041428 0,000625619897764553 0,000854221952725037 0,000774449137536249 42001 37415 667 665 0 True 586 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 632 570 0,000941095028132535 0,000901727883453197 0,000701915007248035 0,000686655985351339 0,000840189334098762 0,000789281722365127 41137 39298 667 665 0 True 631 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 676 570 0,000960083016399788 0,000843215844601203 0,000686655985351339 0,000488288700694286 0,000866164821093071 0,000880942546638659 41967 36748 667 665 0 True 675 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 277 610 0,000890651035205675 0,00106744315584108 0,000762951094834821 0,000961318379491875 0,000677840590800873 0,000775292689274895 38932 46520 667 665 0 False 277 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 321 610 0,00090364522476688 0,000928023882090211 0,000762951094834821 0,00080872816052491 0,000735766617515604 0,000719372485233386 39500 40444 667 665 0 False 321 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 367 615 0,000832451707311828 0,000884105434104832 0,000701915007248035 0,000778210116731518 0,000696124290958584 0,000680141745967756 36388 38530 667 665 0 True 365 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 411 614 0,000814607573759469 0,000872999619671747 0,000610360875867857 0,000671396963454643 0,000757966818683546 0,000734774833162845 35608 38046 667 665 0 True 409 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 454 611 0,000874202404405488 0,00112808916316885 0,000457770656900893 0,00064087891966125 0,000967733531005535 0,00134300142499581 38213 49163 667 665 0 False 454 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 498 611 0,000869581231357313 0,000902255639097744 0,000457770656900893 0,000518806744487678 0,000966771790377908 0,000990488385008446 38011 39321 667 665 0 False 498 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 542 611 0,000838170980886302 0,00084633648667331 0,000473029678797589 0,000320439459830625 0,00090101187023287 0,00100632183994063 36638 36884 667 665 0 False 542 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 586 611 0,000858966259603089 0,00090002988703161 0,000656137941557946 0,000671396963454643 0,000783542617789903 0,000850615405645018 37547 39224 667 665 0 False 586 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 631 611 0,000962485111301067 0,000936330297017435 0,000762951094834821 0,000778210116731518 0,000797591507148116 0,000761584971790104 42072 40806 667 665 0 False 631 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 675 611 0,00090396550408705 0,000926257047975856 0,000671396963454643 0,000686655985351339 0,000784956783993069 0,000810794126087494 39514 40367 667 665 0 False 675 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 278 660 0,00102370421564224 0,0689077236464932 0,000885023270008392 0,0681620508125429 0,000707281990012267 0,0225091607964216 44748 3003052 667 665 0 True 276 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 321 654 0,000946105111783774 0,000902232693200155 0,000823987182421607 0,000778210116731518 0,000665133215177512 0,00065816981254797 41356 39320 667 665 0 False 321 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 365 654 0,000847550589548439 0,00086639120116611 0,000762951094834821 0,000762951094834821 0,000635160124821352 0,000618664304468066 37048 37758 667 665 0 False 365 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 409 654 0,000802185311555712 0,000862972262425347 0,00064087891966125 0,000686655985351339 0,000678225204975566 0,000703950312219824 35065 37609 667 665 0 False 409 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 453 654 0,000940774748812364 0,000913912155072965 0,000732433051041428 0,000701915007248035 0,00084882611146703 0,000794773648042766 41123 39829 667 665 0 False 453 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 498 654 0,00090929586705846 0,00096632058516628 0,00064087891966125 0,000671396963454643 0,000859768166221335 0,00094017999129389 39747 42113 667 665 0 False 498 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 542 654 0,000957520781838424 0,000879309741508727 0,000625619897764553 0,000579842832074464 0,000934838886241659 0,000854049006652125 41855 38321 667 665 0 False 542 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 586 654 0,000859583941149133 0,000885918160014364 0,000732433051041428 0,000762951094834821 0,000662711995343192 0,000669055714623555 37574 38609 667 665 0 False 586 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 630 654 0,000880058940545749 0,00093433400392719 0,000778210116731518 0,000778210116731518 0,00066059696499741 0,000723793721190568 38469 40719 667 665 0 False 630 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 676 660 0,000966076815105837 0,0705784373958471 0,00080872816052491 0,0689707789730678 0,000735373322655714 0,022228444974792 42229 3075863 667 665 0 True 675 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E7_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E7_1.csv new file mode 100755 index 0000000..12db40d --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E7_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 271 272 0,0104226467398047 0,0461115250933468 0,0104219119554437 0,046341649500267 0,00145931107981021 0,00909000568444046 425539 2009576 623 665 0 True 271 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 315 272 0,0104092981572465 0,0103899712659997 0,010406652933547 0,010452429999237 0,00130258986566737 0,00131983986658716 424994 452803 623 665 0 False 315 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 360 271 0,0106481520601945 0,0674318435135676 0,0106660563057908 0,0676737621118486 0,0012770283103877 0,0175385871454152 434746 2938732 623 665 0 True 359 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 405 272 0,0107744369990378 0,0893040796084971 0,0108186465247578 0,0875257495994507 0,00142526338741668 0,016283152950585 439902 3891941 623 665 0 True 403 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 448 271 0,0106047997828957 0,0752775507089996 0,0106355382619974 0,0743724727244984 0,00173055806412248 0,0192337780628269 432976 3280654 623 665 0 True 448 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 493 271 0,0104569366766512 0,0713870508268841 0,0104676890211337 0,0737926298924239 0,00167425198417788 0,0269448042055004 426939 3111103 623 665 0 True 492 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 538 272 0,0107254513749714 0,0839371488919139 0,010757610437171 0,0816510261692226 0,00163790789363119 0,0288328462371478 437902 3658046 623 665 0 True 536 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 581 272 0,0105174339223732 0,072828466221631 0,0104982070649271 0,0704814221408408 0,00173743781767117 0,020964484121644 429409 3173921 623 665 0 True 580 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 624 273 0,0102575406938887 0,0103237264596603 0,0102388036926833 0,0103150988021668 0,00188657201315015 0,00187912646155869 418798 449916 623 665 0 False 624 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 667 271 0,0103998929174258 0,0450157666998809 0,0104676890211337 0,046341649500267 0,00170075719150737 0,0109125595154744 424610 1961822 623 665 0 True 668 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 271 316 0,0106589044046771 0,0105787471654646 0,0106660563057908 0,0106202792401007 0,0014464257293378 0,00145931888929688 435185 461030 623 665 0 False 271 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 315 316 0,0104415062050702 0,0103965337927102 0,010452429999237 0,0103608758678569 0,0012689819186252 0,0012535290098125 426309 453089 623 665 0 False 315 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 361 317 0,0104724406266682 0,109145098957052 0,0105134660868238 0,106752117189288 0,00139795349516264 0,0272864906346281 427572 4756628 623 665 0 True 359 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 405 317 0,0106989991379755 0,0578833212580547 0,0107270923933776 0,0558632791638056 0,00143086314450466 0,0136194708958905 436822 2522600 623 665 0 True 403 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 449 316 0,010654397727263 0,0809737091641899 0,0107423514152743 0,0781872281986725 0,00178593528399771 0,0222166414353633 435001 3528897 623 665 0 True 448 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 493 317 0,0104562018922902 0,0470661662166402 0,0104982070649271 0,0476691844052796 0,0017475828023488 0,0126208213391469 426909 2051180 623 665 0 True 492 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 537 316 0,0106554264253684 0,0508770438341218 0,0106355382619974 0,0519417105363546 0,00168223870785441 0,0144763460435106 435043 2217261 623 665 0 True 536 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 581 316 0,0104360443079868 0,0534191509903163 0,0104219119554437 0,0549324788281071 0,00183197360257351 0,0113823716832889 426086 2328048 623 665 0 True 580 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 624 316 0,0103955821825079 0,010416588507203 0,0103608758678569 0,0104371709773404 0,00205859708754491 0,00195953544594038 424434 453963 623 665 0 False 624 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 668 316 0,0101896956045567 0,0103425879874784 0,0102235446707866 0,0103608758678569 0,00200910000049745 0,00193668024260368 416028 450738 623 665 0 False 668 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 273 362 0,0106416124793816 0,054918917802632 0,0107270923933776 0,0533607995727474 0,0015072660991733 0,0132972691796931 434479 2393409 623 665 0 True 271 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 317 361 0,0106347055063883 0,0710511458320785 0,0105897611963073 0,0700541695277333 0,00140173486729746 0,0278731073068952 434197 3096464 623 665 0 True 315 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 361 361 0,010804832578771 0,043805714790524 0,0106660563057908 0,0431830319676509 0,00184997055074901 0,0122290057300634 441143 1909087 623 665 0 True 359 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 406 362 0,0107614558086602 0,0363082574828006 0,0108186465247578 0,0371404592965591 0,00153767254633833 0,0051521931406504 439372 1582342 623 665 0 True 403 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 450 361 0,0108175198554042 0,0763213825362215 0,0108186465247578 0,072983901731899 0,00170359822182527 0,0162251235480808 441661 3326145 623 665 0 True 448 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 494 361 0,0106078613843999 0,0373809552491896 0,0105897611963073 0,0372167544060426 0,00175901153367329 0,00836304899292427 433101 1629091 623 665 0 True 492 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 536 359 0,0106524872879244 0,0308248074982604 0,0107270923933776 0,031815060654612 0,0016638537209432 0,0078506113296175 434923 1343369 623 665 0 False 536 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 582 361 0,0105999991917372 0,0537267866392922 0,0106507972838941 0,054383154039826 0,00184891893814901 0,0107532634244238 432780 2341455 623 665 0 True 580 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 626 361 0,0102918551235473 0,0582372617283653 0,0102693217364767 0,0591439688715953 0,00191039779958644 0,0125269985035286 420199 2538025 623 665 0 True 624 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 670 361 0,0103404733554332 0,0664272032794277 0,0104676890211337 0,0644541084916457 0,00197913169414568 0,0226160313915136 422184 2894949 623 665 0 True 668 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 274 406 0,0104793720924736 0,0443451498969442 0,0104982070649271 0,0475928892957961 0,00151646061052372 0,00971666572996346 427855 1932596 623 665 0 True 271 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 317 406 0,0107870018116108 0,0331378228129261 0,010757610437171 0,0331883726253147 0,00144886070853192 0,00507547249269321 440415 1444172 623 665 0 True 315 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 361 406 0,0108093882418092 0,0927819893060644 0,0108949416342412 0,0893263141832609 0,00138133532696828 0,025442601958245 441329 4043511 623 665 0 True 359 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 405 406 0,0107162665704589 0,0697122985995545 0,0107728694590677 0,0683756771190967 0,00155977626235173 0,0185798981313356 437527 3038116 623 665 0 True 403 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 450 406 0,0108006198151013 0,0473257302101672 0,0108186465247578 0,047547112230106 0,00170663414612572 0,0114341516873971 440971 2062492 623 665 0 True 447 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 494 406 0,0107997380738681 0,0559508866008005 0,0108339055466545 0,0566567483024338 0,00171469289047862 0,0113139762240047 440935 2438383 623 665 0 True 492 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 538 406 0,0107873692037913 0,0434628801346465 0,0108186465247578 0,0447089341573205 0,00160580656016417 0,00619253257339301 440430 1894146 623 665 0 True 536 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 583 406 0,0105502542904977 0,0533495560829288 0,0105897611963073 0,0535591668574044 0,00191758195179736 0,010170158452757 430749 2325015 623 665 0 True 580 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 627 406 0,0109088290586641 0,0436602148539121 0,0105745021744106 0,0437323567559319 0,00266775710554744 0,00957568834742599 445389 1902746 623 665 0 True 624 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 671 406 0,0105981132452106 0,0843048110089828 0,010605020218204 0,0801861600671397 0,00184932385753097 0,0180035820210613 432703 3674069 623 665 0 True 668 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 274 451 0,0108766455036524 0,0433086607569507 0,0108491645685512 0,0439459830624857 0,00160936818006202 0,00613753528687551 444075 1887425 623 665 0 True 271 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 318 450 0,0108880346612479 0,0565475946676029 0,0108491645685512 0,0564583810177768 0,00165575811724079 0,00837792633659556 444540 2464388 623 665 0 True 315 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 362 451 0,011222875894554 0,0352033895679919 0,0111543450064851 0,0357824063477531 0,00155888505628368 0,00359836419747766 458211 1534191 623 665 0 True 359 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 406 451 0,011062888846353 0,0568636973527892 0,0110780498970016 0,0564126039520867 0,00173969907538827 0,0120861428921652 451679 2478164 623 665 0 True 403 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 450 449 0,0112445520332034 0,0940193468335522 0,0112001220721752 0,0913710231174182 0,00184400456257649 0,018611798675657 459096 4097436 623 665 0 True 447 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 494 451 0,0108948681558051 0,063882985100655 0,0109712367437247 0,0631113145647364 0,00185554581654684 0,0160035431390635 444819 2784070 623 665 0 True 492 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 539 451 0,0107978276345295 0,0570415739508992 0,0107270923933776 0,0551461051346609 0,00185594551382271 0,0117672696946402 440857 2485916 623 665 0 True 536 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 582 450 0,0106055590600687 0,0321305438005634 0,010605020218204 0,0326390478370336 0,00183235675179168 0,00458501015227417 433007 1400274 623 665 0 True 580 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 627 450 0,0106946639102456 0,040303000577663 0,0104676890211337 0,0405737392233158 0,00236439004087073 0,00677020887478017 436645 1756436 623 665 0 True 624 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 671 450 0,0107813194792191 0,067039101530434 0,0107881284809644 0,0665751125352865 0,00203573290080591 0,00995281384531264 440183 2921616 623 665 0 True 668 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 273 496 0,0105886345269538 0,0582710610355139 0,0106202792401007 0,0590676737621118 0,00157961529351073 0,0194338553208344 432316 2539498 623 665 0 True 271 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 317 495 0,0109368733284421 0,0578695307736037 0,0108949416342412 0,0581979095140002 0,00147678331382036 0,0111955653525596 446534 2521999 623 665 0 True 315 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 362 496 0,0110995300931547 0,0717029240530945 0,011108567940795 0,0700846875715267 0,0015325593192973 0,0203588257734889 453175 3124869 623 665 0 True 359 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 406 495 0,0113685836333397 0,0915902711688812 0,011261158159762 0,0864423590447852 0,00171047895251087 0,0288720582111054 464160 3991575 623 665 0 True 403 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 450 495 0,0115304076424432 0,0996959553839967 0,0115358205539025 0,0970778973067826 0,00198129869440978 0,0351281492544169 470767 4344827 623 665 0 True 447 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 493 495 0,0112960604169093 0,045514335162695 0,011306935225452 0,0485084306095979 0,00191441657960548 0,0101029257707686 461199 1983550 623 665 0 True 492 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 537 493 0,0109826748869442 0,0460423202662183 0,0110017547875181 0,046646829938201 0,00174552544424085 0,0104157424235453 448404 2006560 623 665 0 True 536 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 581 494 0,0109257780845911 0,109515950553885 0,0109102006561379 0,108155947203784 0,00184468731245341 0,0244323836603168 446081 4772790 623 665 0 True 580 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 626 494 0,0108752739061786 0,0616202442476069 0,010955977721828 0,064438849469749 0,00182967048001762 0,0150980818014755 444019 2685458 623 665 0 True 624 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 670 494 0,0105103799925076 0,078105517857358 0,0104829480430304 0,073685816739147 0,00179607249046538 0,0149898828408272 429121 3403899 623 665 0 True 668 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 271 532 0,014035581442825 0,0461897706041253 0,0111238269626917 0,0514991989013504 0,00852597286919714 0,026745090492003 573049 2012986 623 665 0 False 271 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 318 539 0,0109066247055811 0,110494317735286 0,0109102006561379 0,105897611963073 0,00165638633611554 0,0303505003465856 445299 4815428 623 665 0 True 315 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 361 538 0,0110241167249045 0,0565708618077581 0,0110475318532082 0,0598306248569467 0,00155980676354231 0,013110055640343 450096 2465402 623 665 0 True 359 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 405 538 0,0110972522616356 0,0600001032565392 0,0110780498970016 0,0593575951781491 0,00177460871719665 0,0141310649726827 453082 2614851 623 665 0 True 403 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 449 538 0,0110909821017551 0,0562754792680947 0,0109712367437247 0,0574959945067521 0,00202539769415511 0,0100555488724355 452826 2452529 623 665 0 True 447 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 493 539 0,0112297338819233 0,0615159780889624 0,0112916762035554 0,0623331044480049 0,00187141796486128 0,0154873074276909 458491 2680914 623 665 0 True 492 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 537 539 0,0108966806238956 0,0718640730918622 0,0110627908751049 0,0704814221408408 0,00184907006678325 0,0192683754087538 444893 3131892 623 665 0 True 536 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 582 539 0,0111642156097345 0,05846658302887 0,0109407186999313 0,0584420538643473 0,002652549817781 0,0144374696187975 455816 2548019 623 665 0 True 580 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 626 539 0,0109054000649794 0,0469626802185138 0,0109864957656214 0,0451056687266346 0,00183243335061115 0,008704756540747 445249 2046670 623 665 0 True 624 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 670 539 0,0108094127346212 0,0745776549407394 0,0107881284809644 0,0724498359655146 0,00207076853671166 0,0214675504468823 441330 3250152 623 665 0 True 668 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 271 575 0,0152972551762803 0,0347907534916485 0,0110780498970016 0,0385595483329519 0,0104957678551594 0,0195666256158628 624561 1516208 623 665 0 False 271 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 315 575 0,0169999954688298 0,0393333987291415 0,0113832303349355 0,0447089341573205 0,0138010809081955 0,0219008475624823 694081 1714180 623 665 0 False 315 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 359 575 0,0150452731260825 0,0372729030174429 0,0115815976195926 0,0418402380407416 0,00913702962326301 0,0208117308069403 614273 1624382 623 665 0 False 359 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 403 575 0,0159139596904647 0,036988993426574 0,0118410009918364 0,0438086518654154 0,0100851568582302 0,018453513702771 649740 1612009 623 665 0 False 403 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 447 576 0,0183835944205864 0,0665797246607019 0,0118867780575265 0,0725566491187915 0,0170603580163884 0,0448682156278148 750571 2901596 623 665 0 False 447 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 491 576 0,0155427711241013 0,0466445353484421 0,0117952239261463 0,0536354619668879 0,010471260935902 0,0257370828834902 634585 2032805 623 665 0 False 491 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 536 576 0,0141842773046787 0,0421863080681791 0,0113527122911421 0,0518043793392844 0,00902958287174349 0,0204275952725641 579120 1838512 623 665 0 False 536 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 582 582 0,011375441620709 0,0371612712256723 0,0109712367437247 0,0389868009460594 0,00330208932658224 0,00902212504395099 464440 1619517 623 665 0 True 580 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 624 576 0,0135934861856254 0,0414200298181939 0,0110322728313115 0,0484168764782177 0,00795794239667011 0,0205798121690897 554999 1805117 623 665 0 False 624 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 671 583 0,0107532752094411 0,0568521785121995 0,0106813153276875 0,0556038757915618 0,0016153037627413 0,00909518430522668 439038 2477662 623 665 0 True 668 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 271 619 0,0117602481905629 0,0103937573391019 0,0104371709773404 0,0103913939116503 0,0053353165688594 0,00139967152655827 480151 452968 623 665 0 False 271 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 315 619 0,0118172429641642 0,0102737044029162 0,0105134660868238 0,0101777676050965 0,00566086462623356 0,00146353656571951 482478 447736 623 665 0 False 315 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 359 619 0,0186486311395979 0,0491405671422778 0,0115053025101091 0,0622720683604181 0,0165152445272772 0,0303213393173056 761392 2141584 623 665 0 False 359 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 403 619 0,0185150718355807 0,0508167879070531 0,0117341878385595 0,0531013962005035 0,01524480323884 0,0352181162474876 755939 2214635 623 665 0 False 403 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 447 619 0,0133729773988903 0,0106138314428782 0,0110017547875181 0,010605020218204 0,0105143606278903 0,00195942476773987 545996 462559 623 665 0 False 447 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 491 619 0,0117976242217256 0,0105753052808262 0,0107423514152743 0,0105745021744106 0,00588206266827813 0,00200967392834208 481677 460880 623 665 0 False 491 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 536 619 0,0117890272447019 0,0104318016373045 0,0107423514152743 0,0103761348897536 0,00555817750977409 0,00199594164341435 481326 454626 623 665 0 False 536 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 580 619 0,0107327257401452 0,0103743910015368 0,0105134660868238 0,0103761348897536 0,00193306178347205 0,00168592370773817 438199 452124 623 665 0 False 580 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 624 619 0,0113055146423541 0,0105024750018787 0,010452429999237 0,0104829480430304 0,00452075986481531 0,00139961085431424 461585 457706 623 665 0 False 624 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 668 619 0,0113596192641355 0,0104053220714868 0,0105439841306172 0,0105134660868238 0,00473448874597594 0,00155431193811711 463794 453472 623 665 0 False 668 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 271 669 0,0106552059900601 0,0440026594295306 0,0102998397802701 0,0444953078507668 0,00287321421795003 0,00961190605536901 435034 1917670 623 665 0 True 271 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 315 662 0,0101706157039828 0,0100606517438022 0,0100862134737163 0,0100404364080262 0,00135906780212757 0,00123281739270261 415249 438451 623 665 0 False 315 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 359 662 0,013831311390468 0,0100692335095005 0,0103761348897536 0,010101472495613 0,0121989105732042 0,0012488576664006 564709 438825 623 665 0 False 359 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 403 662 0,0139293316242249 0,0103998150560654 0,0107423514152743 0,0103303578240635 0,0108138766393153 0,00141004934879093 568711 453232 623 665 0 False 403 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 447 662 0,0101833274734281 0,0103798291792654 0,0101930266269932 0,0103608758678569 0,0015908370639307 0,00159732854229506 415768 452361 623 665 0 False 447 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 491 662 0,0101844541427816 0,0102006217190952 0,0102693217364767 0,0102082856488899 0,00164821262761784 0,0015114853541663 415814 444551 623 665 0 False 491 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 536 662 0,0103098573403917 0,0101132666869738 0,0102998397802701 0,0101472495613031 0,00180948222047031 0,00173605301944859 420934 440744 623 665 0 False 536 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 580 662 0,01030863269979 0,0102467429732491 0,0103150988021668 0,0102235446707866 0,00156770367229923 0,00133539460587569 420884 446561 623 665 0 False 580 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 624 662 0,0104872342851363 0,0103618625414532 0,0105134660868238 0,0102998397802701 0,00146662034981381 0,00134371825277159 428176 451578 623 665 0 False 624 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 668 668 0,0103900957926125 0,0438470632979794 0,0103913939116503 0,0444647898069734 0,00139455580497737 0,00918551708004414 424210 1910889 623 665 0 True 668 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E7_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E7_2.csv new file mode 100755 index 0000000..716e747 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E7_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 271 272 0,00796873639500832 0,712170859742627 0,00787365529869535 0,722270542458228 0,00167993471794817 0,194641463214426 325350 31036958 623 665 10 True 271 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 315 272 0,00682810613862123 0,00672213837408812 0,00672922865644312 0,00668345159075303 0,00140242143692261 0,00124294357252391 278780 292956 623 665 0 False 315 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 360 271 0,00628115715310739 0,00650688290880555 0,00627145799954223 0,00642404821850919 0,00119972072645327 0,00125338603462094 256449 283575 623 665 0 True 359 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 405 272 0,00652657512968026 0,00657381609207271 0,00645456626230259 0,00659189745937285 0,00135176089849995 0,00136444358845494 266469 286492 623 665 0 True 403 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 448 271 0,00656284898430145 0,00673280821646701 0,00660715648126955 0,00666819256885634 0,00165078345313833 0,00164393853042858 267950 293421 623 665 0 True 448 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 493 271 0,00700180916156083 0,00692089573900418 0,00706492713817044 0,00688181887541009 0,00149309924565244 0,00159846553239575 285872 301618 623 665 0 True 492 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 538 272 0,00726229021753413 0,00732164584039637 0,00733958953231098 0,0072327763790341 0,0014159989590711 0,00154620032287396 296507 319083 623 665 0 True 536 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 581 272 0,00744405137563266 0,00744146931760621 0,00740062561989776 0,00740062561989776 0,00173424799625488 0,00182503303383209 303928 324305 623 665 0 True 580 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 624 273 0,00809409060699434 0,0080634637635517 0,0081025406271458 0,0080872816052491 0,00199716432779119 0,0017679926581972 330468 351412 623 665 0 False 624 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 667 271 0,00923643536022375 0,694871855766677 0,00910963607232776 0,721828030823224 0,00197227346949198 0,22457145128748 377108 30283054 623 665 11 True 668 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 271 316 0,00675443176002531 0,00655474805117624 0,00669871061264973 0,00659189745937285 0,00144856723431522 0,00141966582400867 275772 285661 623 665 0 False 271 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 315 316 0,00649098707379599 0,00630672584413655 0,00660715648126955 0,00628671702143893 0,00120475762236173 0,00118282795367755 265016 274852 623 665 0 False 315 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 361 317 0,00642742822656978 0,00667046421271765 0,0064087891966125 0,00665293354695964 0,00124713191493126 0,00122565808358572 262421 290704 623 665 0 True 359 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 405 317 0,00674703493079127 0,00668012443560263 0,00669871061264973 0,00675974670023652 0,00137870566863084 0,00131852886856973 275470 291125 623 665 0 True 403 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 449 316 0,0068865459881325 0,00705721731658053 0,00695811398489357 0,00701915007248035 0,00160935678829782 0,00170693548100872 281166 307559 623 665 0 True 448 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 493 317 0,00705498305648496 0,00723433670007016 0,00711070420386053 0,00727855344472419 0,00162945894833481 0,00146563949096972 288043 315278 623 665 0 True 492 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 537 316 0,00721864402649094 0,00732430756451669 0,00715648126955062 0,00732433051041428 0,00150046933011218 0,00146343833858662 294725 319199 623 665 0 True 536 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 581 316 0,0073717485945106 0,00759169610912151 0,00735484855420768 0,00761425192645151 0,00177113843427571 0,00184005485770454 300976 330852 623 665 0 True 580 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 624 316 0,0076969641526877 0,00777058232672549 0,00762951094834821 0,00778210116731518 0,00206090036029112 0,00191298701625353 314254 338648 623 665 0 False 624 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 668 316 0,0075009236851738 0,00741932652643281 0,00756847486076143 0,00743114366369116 0,0019023180048351 0,00187808001509671 306250 323340 623 665 0 False 668 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 273 362 0,00642407271132123 0,00651755275118444 0,00642404821850919 0,00657663843747616 0,00151573206981354 0,00139584283844139 262284 284040 623 665 0 True 271 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 317 361 0,00666444516861525 0,00657333422822334 0,00654612039368277 0,00657663843747616 0,00131008699547096 0,00130096938646467 272098 286471 623 665 0 True 315 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 361 361 0,00681115711269424 0,00674435000295428 0,00677500572213321 0,00669871061264973 0,0014787620000816 0,00135584847535128 278088 293924 623 665 0 True 359 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 406 362 0,00704418172637831 0,00709161321706647 0,00711070420386053 0,00706492713817044 0,00144671100097499 0,00143020682182013 287602 309058 623 665 0 True 403 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 450 361 0,00724997033308143 0,00710223716765019 0,00718699931334401 0,00717174029144732 0,00161867622489006 0,00171743442112547 296004 309521 623 665 0 True 448 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 494 361 0,00736721742428445 0,00721024350760169 0,00743114366369116 0,00720225833524071 0,00168468053878015 0,00169739269854812 300791 314228 623 665 0 True 492 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 536 359 0,00723659725771129 0,00720296965806597 0,0072327763790341 0,00712596322575723 0,00165625649611279 0,00174082199836351 295458 313911 623 665 0 False 536 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 582 361 0,00744767631181358 0,00739007050700682 0,00750743877317464 0,00743114366369116 0,00180057513433941 0,00205411206660708 304076 322065 623 665 0 True 580 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 626 361 0,00693790741496616 0,00722690222925132 0,00694285496299687 0,00727855344472419 0,00194158061583067 0,0019026224168984 283263 314954 623 665 0 True 624 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 670 361 0,00660059240764465 0,00651305535525699 0,00665293354695964 0,00656137941557946 0,00177953201177744 0,00186903126568642 269491 283844 623 665 0 True 668 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 274 406 0,0063785650665635 0,00624598805321842 0,00633249408712902 0,00627145799954223 0,00141890529797075 0,00146138676820781 260426 272205 623 665 0 True 271 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 317 406 0,00672974300549582 0,00671821462560039 0,00669871061264973 0,00675974670023652 0,00136234497041408 0,00136799474137193 274764 292785 623 665 0 True 315 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 361 406 0,00686033867925695 0,00684799662236388 0,00686655985351339 0,00689707789730678 0,0012696193474552 0,00129121338815968 280096 298441 623 665 0 True 359 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 405 406 0,00686026520082085 0,00710650510460174 0,00683604180972 0,00708018616006714 0,0014286480139535 0,00148707532723614 280093 309707 623 665 0 True 403 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 450 406 0,00723836074017768 0,00717057005067028 0,00730907148851759 0,00704966811627375 0,00148484188790336 0,00160632073462379 295530 312499 623 665 0 True 447 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 494 406 0,00722993521283825 0,00730998932442115 0,00720225833524071 0,00729381246662089 0,00165159468954626 0,00161050518540645 295186 318575 623 665 0 True 492 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 538 406 0,00726687037338435 0,00753827805953428 0,00727855344472419 0,00746166170748455 0,00158579986987619 0,00165004008179792 296694 328524 623 665 0 True 536 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 583 406 0,00697785519139234 0,00692830726392544 0,00700389105058366 0,00695811398489357 0,00177242952713585 0,00186842636971499 284894 301941 623 665 0 True 580 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 627 406 0,00663008175333264 0,00658441709675883 0,00648508430609598 0,00653086137178607 0,00207424520945806 0,00177075516791388 270695 286954 623 665 0 True 624 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 671 406 0,00615381902334667 0,00610549032228087 0,00614938582436866 0,00616464484626535 0,00171900908735739 0,00177385560353943 251250 266082 623 665 0 True 668 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 274 451 0,00678147182450998 0,00709110840731951 0,00675974670023652 0,00701915007248035 0,00151755081575247 0,00148855917522931 276876 309036 623 665 0 True 271 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 318 450 0,00701782746063056 0,00733890115538331 0,00706492713817044 0,00738536659800107 0,00151296057744565 0,00155397532268012 286526 319835 623 665 0 True 315 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 362 451 0,00685472982530134 0,007304023391048 0,00679026474402991 0,00741588464179446 0,00144130571216511 0,00131967259443872 279867 318315 623 665 0 True 359 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 406 451 0,00732969443624956 0,00723252397416062 0,00735484855420768 0,00720225833524071 0,00164626374448834 0,00163988678641076 299259 315199 623 665 0 True 403 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 450 449 0,00756462948927221 0,00717447085326041 0,00764476997024491 0,00727855344472419 0,00184574769790451 0,00181983689179942 308851 312669 623 665 0 True 447 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 494 451 0,00709642489444516 0,00718805482463311 0,00700389105058366 0,0072327763790341 0,0017936015372138 0,00188591080906373 289735 313261 623 665 0 True 492 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 539 451 0,00678617444442036 0,00692679283468456 0,00683604180972 0,00691233691920348 0,00167423999443342 0,00175031516624885 277068 301875 623 665 0 True 536 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 582 450 0,00643178794711169 0,00631296712828076 0,00648508430609598 0,00627145799954223 0,00178643236945191 0,00186880771710791 262599 275124 623 665 0 True 580 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 627 450 0,00622685658882974 0,00624222492601382 0,00625619897764553 0,00628671702143893 0,00183582119295833 0,00176729973164941 254232 272041 623 665 0 True 624 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 671 450 0,00608634132619515 0,00625594657277205 0,00610360875867857 0,00627145799954223 0,00170708309420882 0,00182026137808685 248495 272639 623 665 0 True 668 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 273 496 0,00671629645168958 0,00671876532714253 0,00671396963454643 0,00675974670023652 0,001363245338927 0,00146184288569931 274215 292809 623 665 0 True 271 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 317 495 0,00686232259703164 0,00719505332339776 0,00695811398489357 0,00717174029144732 0,00141753565266831 0,00154043548861402 280177 313566 623 665 0 True 315 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 362 496 0,00690780574897733 0,0071958105380182 0,00689707789730678 0,0072327763790341 0,00144605630943469 0,00144731493671434 282034 313599 623 665 0 True 359 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 406 495 0,00706975222214099 0,00701685548272145 0,00714122224765393 0,00698863202868696 0,00164734681052478 0,00174430444492483 288646 305800 623 665 0 True 403 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 450 495 0,00741590913460649 0,00742800007572146 0,00746166170748455 0,00743114366369116 0,00190655028823074 0,00189911600532005 302779 323718 623 665 0 True 447 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 493 495 0,00724928453434449 0,00722761355207657 0,00708018616006714 0,00720225833524071 0,00180594980889545 0,00180786300666921 295976 314985 623 665 0 True 492 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 537 493 0,00647695269250095 0,0067812928980726 0,00648508430609598 0,00677500572213321 0,00167731802118176 0,00165865011295901 264443 295534 623 665 0 True 536 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 581 494 0,00623045703219862 0,00661174566078735 0,0063782711528191 0,00662241550316625 0,00177084765001483 0,00201557028780227 254379 288145 623 665 0 True 580 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 626 494 0,00633227365182072 0,00600445953519643 0,00634775310902571 0,00604257267109178 0,00169826201710692 0,0018039106275253 258536 261679 623 665 0 True 624 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 670 494 0,00619513839724671 0,00590414007093724 0,00621042191195544 0,00592050049591821 0,00186267152224736 0,0018151882918965 252937 257307 623 665 0 True 668 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 271 532 0,00670963440681655 0,00679416554662004 0,00672922865644312 0,0068207827878233 0,00135028657044065 0,00148176514764486 273943 296095 623 665 0 False 271 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 318 539 0,00674017694342197 0,00689414082241539 0,00679026474402991 0,00694285496299687 0,00142352390165643 0,00142231634173583 275190 300452 623 665 0 True 315 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 361 538 0,00693237203944665 0,00693083131266023 0,00688181887541009 0,00685130083161669 0,0014915501001128 0,00143089751997486 283037 302051 623 665 0 True 359 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 405 538 0,00686749058037065 0,00687073600687459 0,00691233691920348 0,00691233691920348 0,00164663348219421 0,00163050387541245 280388 299432 623 665 0 True 403 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 449 538 0,00659929428860689 0,00672138115946768 0,00669871061264973 0,00674448767833982 0,00184027066962383 0,0019771187417354 269438 292923 623 665 0 True 447 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 493 539 0,00656382869678278 0,006768764437989 0,00653086137178607 0,0068055237659266 0,00176005652527381 0,0020778515054945 267990 294988 623 665 0 True 492 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 537 539 0,00671563514576469 0,00653180215358722 0,00671396963454643 0,00650034332799268 0,00183724857580216 0,00184645423951798 274188 284661 623 665 0 True 536 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 582 539 0,00670236004164268 0,00673205100184657 0,00668345159075303 0,00668345159075303 0,00174293989651693 0,00166768306998118 273646 293388 623 665 0 True 580 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 626 539 0,00669785336422857 0,0065203521506903 0,00666819256885634 0,00650034332799268 0,00173121880216867 0,00184940244340666 273462 284162 623 665 0 True 624 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 670 539 0,00663074305925754 0,00679671254125242 0,00662241550316625 0,00688181887541009 0,00184923575206776 0,00180684859777973 270722 296206 623 665 0 True 668 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 271 575 0,00686680478163372 0,00670118876958934 0,00683604180972 0,00668345159075303 0,00147110916074996 0,00121365871491507 280360 292043 623 665 0 False 271 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 315 575 0,0069428059773728 0,00683292116764789 0,00700389105058366 0,00683604180972 0,00150238867964148 0,00136017535680159 283463 297784 623 665 0 False 315 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 359 575 0,00675842408838672 0,00670972464349246 0,00677500572213321 0,00666819256885634 0,00134386107209946 0,00127655488683077 275935 292415 623 665 0 False 359 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 403 575 0,00652953875993627 0,00652737359535254 0,00656137941557946 0,00657663843747616 0,00149419543705528 0,00146195832008493 266590 284468 623 665 0 False 403 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 447 576 0,00653100832865827 0,00658990116628261 0,00662241550316625 0,00660715648126955 0,0018840211243896 0,00195234199196353 266650 287193 623 665 0 False 447 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 491 576 0,00659912283892265 0,00668420880537347 0,00666819256885634 0,00666819256885634 0,00185115038206469 0,00191494335612033 269431 291303 623 665 0 False 491 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 536 576 0,00654790836896119 0,00674421232756875 0,00651560234988937 0,00677500572213321 0,00194030185793455 0,00176586939258552 267340 293918 623 665 0 False 536 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 582 582 0,006813190016093 0,00661557762568472 0,00675974670023652 0,00660715648126955 0,00187195679258837 0,00177111581831528 278171 288312 623 665 0 True 580 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 624 576 0,0064593668534611 0,00660449475714922 0,00643930724040589 0,00659189745937285 0,00146405153260356 0,00141647879324175 263725 287829 623 665 0 False 624 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 671 583 0,00645853409785197 0,00646709472238619 0,00643930724040589 0,00646982528419928 0,00157527212915348 0,00164505038684396 263691 281841 623 665 0 True 668 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 271 619 0,00725202772929222 0,00716219479805029 0,00694285496299687 0,00715648126955062 0,00210722758869195 0,0012954811097444 296088 312134 623 665 0 False 271 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 315 619 0,00686146534861048 0,0067359518044367 0,00663767452506294 0,00671396963454643 0,00168742837708842 0,00139670242114054 280142 293558 623 665 0 False 315 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 359 619 0,00660306618166 0,00648478600942732 0,00659189745937285 0,00645456626230259 0,00135408913040852 0,00139977955084476 269592 282612 623 665 0 False 359 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 403 619 0,00623594342209406 0,00629135209275191 0,00628671702143893 0,00628671702143893 0,00141155742056621 0,00132153426269985 254603 274182 623 665 0 False 403 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 447 619 0,00631336520093107 0,00637691734486135 0,00630197604333562 0,00631723506523232 0,00172530576476639 0,00180623997654779 257764 277911 623 665 0 False 447 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 491 619 0,00651511249364871 0,00651668080707606 0,00660715648126955 0,00643930724040589 0,00190213793058896 0,0018550767124328 266001 284002 623 665 0 False 491 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 536 619 0,00659919631735875 0,00654180656493603 0,00646982528419928 0,00642404821850919 0,00198589116908638 0,00187432720623063 269434 285097 623 665 0 False 536 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 580 619 0,00657352785034794 0,0064768926206567 0,00650034332799268 0,00650034332799268 0,00152444945533423 0,00165135513517105 268386 282268 623 665 0 False 580 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 624 619 0,00660345806665253 0,00658528904086722 0,00657663843747616 0,00662241550316625 0,00133242017146718 0,0013469767687356 269608 286992 623 665 0 False 624 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 668 619 0,00663765003225091 0,00662005207571458 0,00663767452506294 0,00665293354695964 0,00144088978803492 0,00147779345638437 271004 288507 623 665 0 False 668 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 271 669 0,00890127572036116 0,693157361244723 0,00819409475852598 0,710612649729152 0,00337960945064119 0,209996852047961 363424 30208335 623 665 9 True 271 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 315 662 0,0071106062326124 0,0066812258386869 0,00694285496299687 0,00668345159075303 0,00177610237182224 0,00131995003848267 290314 291173 623 665 0 False 315 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 359 662 0,00614105826827736 0,00631741863241303 0,00614938582436866 0,00627145799954223 0,00128714840048319 0,00125777321883934 250729 275318 623 665 0 False 359 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 403 662 0,00639541612124236 0,00607981386287876 0,00627145799954223 0,00617990386816205 0,00193502283174092 0,00130342519345328 261114 264963 623 665 0 False 403 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 447 662 0,00612930171850142 0,00602380292686397 0,00614938582436866 0,0059662775616083 0,00149409755810192 0,00141804829251026 250249 262522 623 665 0 False 447 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 491 662 0,0064433730472034 0,00627414266956014 0,00646982528419928 0,00631723506523232 0,00157077404102053 0,00154948303258899 263072 273432 623 665 0 False 491 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 536 662 0,00626795552742148 0,00626209607332591 0,00633249408712902 0,00631723506523232 0,00169897965719812 0,00165829993081011 255910 272907 623 665 0 False 536 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 580 662 0,00643641708858597 0,00631693676856366 0,0064087891966125 0,00630197604333562 0,00159880865159061 0,00120839127280705 262788 275297 623 665 0 False 580 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 624 662 0,00658959513504173 0,0066001579825049 0,00662241550316625 0,00663767452506294 0,00136893900367998 0,00136458200579558 269042 287640 623 665 0 False 624 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 668 668 0,00810055670937111 0,707676309106481 0,0080872816052491 0,719020370794232 0,00165894717971061 0,203709943962727 330732 30841082 623 665 11 True 668 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E7_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E7_3.csv new file mode 100755 index 0000000..36de70a --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E7_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 271 272 0,000976161023584006 0,0720124642115703 0,00080872816052491 0,0717326619363699 0,00075667731501364 0,0215771904093091 39855 3138359 623 665 0 True 271 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 315 272 0,000883357758790133 0,000869465951443039 0,000793469138628214 0,00080872816052491 0,000618297779173889 0,00061101584375824 36066 37892 623 665 0 False 315 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 360 271 0,000902045774371481 0,000870016652985175 0,000793469138628214 0,000732433051041428 0,000651886535483286 0,000648437312796448 36829 37916 623 665 0 True 359 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 405 272 0,000854211312470601 0,000901337803194184 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,00064018334546461 0,000700462130206136 34876 39281 623 665 0 True 403 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 448 271 0,000933494545022136 0,000988417484544504 0,000701915007248035 0,000686655985351339 0,00083231317230342 0,000916844404691895 38113 43076 623 665 0 True 448 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 493 271 0,000973197393327987 0,000987247243767464 0,000762951094834821 0,000778210116731518 0,00086791682399599 0,000847624867136571 39734 43025 623 665 0 True 492 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 538 272 0,000889676904294704 0,00101221238034431 0,000701915007248035 0,000793469138628214 0,000727252372457286 0,000844224304700335 36324 44113 623 665 0 True 536 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 581 272 0,00101312067694214 0,00096703190799154 0,000717174029144732 0,000656137941557946 0,000949897509035977 0,000967194378238309 41364 42144 623 665 0 True 580 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 624 273 0,000956101410528799 0,00102994955918063 0,000625619897764553 0,000732433051041428 0,000953931106286832 0,000963977381681228 39036 44886 623 665 0 False 624 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 667 271 0,00107359342985216 0,0706507169732526 0,000778210116731518 0,0721599145494774 0,000928342223199279 0,0252517482749581 43833 3079013 623 665 0 True 668 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 271 316 0,000925877280479804 0,000948927594793805 0,000762951094834821 0,00080872816052491 0,000731271822036879 0,000702973089048181 37802 41355 623 665 0 False 271 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 315 316 0,000821660365278451 0,000878621364581057 0,000671396963454643 0,000778210116731518 0,000650034629945207 0,000595411527090885 33547 38291 623 665 0 False 315 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 361 317 0,000840152438363532 0,000866597714244412 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000635054303549739 0,000651769646440005 34302 37767 623 665 0 True 359 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 405 317 0,000861877562636999 0,000852784283895823 0,000686655985351339 0,000717174029144732 0,000700128371639891 0,00071149059550031 35189 37165 623 665 0 True 403 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 449 316 0,00094409993263252 0,000887593210538362 0,000671396963454643 0,000656137941557946 0,000923369979853548 0,00084335890776667 38546 38682 623 665 0 True 448 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 493 317 0,000960877508875277 0,000940965368330416 0,000686655985351339 0,000732433051041428 0,000895751443811735 0,000844989910147329 39231 41008 623 665 0 True 492 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 537 316 0,000921027703697227 0,00101469053728393 0,000778210116731518 0,000854505226215 0,000777325582169008 0,000846523804354291 37604 44221 623 665 0 True 536 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 581 316 0,000937535859007617 0,0010274943481386 0,000671396963454643 0,000717174029144732 0,000915089638934395 0,00103749850802897 38278 44779 623 665 0 True 580 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 624 316 0,0010282082491546 0,000995186524333264 0,000701915007248035 0,000579842832074464 0,00105805548020417 0,00107150939152661 41980 43371 623 665 0 False 624 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 668 316 0,00107734083009324 0,000913751533789842 0,000686655985351339 0,000503547722590982 0,00104756300923068 0,000959367063324062 43986 39822 623 665 0 False 668 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 273 362 0,000904005199334138 0,000945944628107233 0,000762951094834821 0,000793469138628214 0,000681973846184172 0,000766915246632705 36909 41225 623 665 0 True 271 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 317 361 0,000865478006005882 0,000876326774822155 0,000747692072938125 0,000747692072938125 0,00066096770425076 0,000662778393217892 35336 38191 623 665 0 True 315 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 361 361 0,000827440668918291 0,000850420856444155 0,00064087891966125 0,000732433051041428 0,000669094891959441 0,000670361606299905 33783 37062 623 665 0 True 359 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 406 362 0,000940328039579404 0,000886468861556501 0,000793469138628214 0,000717174029144732 0,000751271230718577 0,000714494123969745 38392 38633 623 665 0 True 403 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 450 361 0,000973393335824252 0,000992226503544281 0,000717174029144732 0,000701915007248035 0,00085589643860102 0,000922010344343849 39742 43242 623 665 0 True 448 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 494 361 0,00100133963435416 0,000976852752159639 0,000671396963454643 0,000701915007248035 0,000934509699926216 0,000876444589108947 40883 42572 623 665 0 True 492 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 536 359 0,00101667213468695 0,000937729996770365 0,000762951094834821 0,000610360875867857 0,00091336163579343 0,000936923274705505 41509 40867 623 665 0 False 536 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 582 361 0,000938882963669445 0,000946082303492767 0,000625619897764553 0,000503547722590982 0,000990461649959734 0,00105963810330489 38333 41231 623 665 0 True 580 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 626 361 0,0009268325001491 0,00095092388788405 0,000488288700694286 0,000579842832074464 0,00105143370649086 0,00101021272557493 37841 41442 623 665 0 True 624 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 670 361 0,000926881485773166 0,000928368070554046 0,000503547722590982 0,000564583810177768 0,00096111773297355 0,000982637665630601 37843 40459 623 665 0 True 668 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 274 406 0,000840544323356064 0,00090702838579626 0,000701915007248035 0,000762951094834821 0,000709254954381517 0,000738017734524253 34318 39529 623 665 0 True 271 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 317 406 0,000855901316500893 0,000923228189494106 0,000717174029144732 0,000854505226215 0,000680216507395198 0,000667252932629877 34945 40235 623 665 0 True 315 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 361 406 0,000889554440234538 0,000902485098073635 0,000778210116731518 0,000793469138628214 0,000672614950597653 0,000694744235303379 36319 39331 623 665 0 True 359 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 405 406 0,000967808974680678 0,000971621087509343 0,000823987182421607 0,000778210116731518 0,000779518009437435 0,000805776790468001 39514 42344 623 665 0 True 403 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 450 406 0,000928081633562794 0,000954549339703114 0,000686655985351339 0,000762951094834821 0,00084558245020596 0,000821063220099864 37892 41600 623 665 0 True 447 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 494 406 0,000963253311642499 0,00101528713062124 0,000732433051041428 0,000747692072938125 0,000899899454761558 0,000980702776335965 39328 44247 623 665 0 True 492 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 538 406 0,00100165804091059 0,00110016400580302 0,000762951094834821 0,000900282291905089 0,000895202492687668 0,000921646641530276 40896 47946 623 665 0 True 536 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 583 406 0,000915541313801785 0,000950235510956379 0,000564583810177768 0,000686655985351339 0,000933813495063669 0,000987681075502943 37380 41412 623 665 0 True 580 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 627 406 0,000959530404213449 0,000903930689621743 0,000595101853971161 0,000473029678797589 0,00099339472171856 0,000989858276426211 39176 39394 623 665 0 True 624 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 671 406 0,000934547735939564 0,000843674762552983 0,000595101853971161 0,0004272526131075 0,000933445099567277 0,000955494330070506 38156 36768 623 665 0 True 668 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 274 451 0,000943781526076089 0,00101806358422951 0,000823987182421607 0,000900282291905089 0,000773287851252797 0,000849801568446192 38533 44368 623 665 0 True 271 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 318 450 0,000864939164141152 0,000796337375826841 0,000686655985351339 0,000656137941557946 0,000745454306539558 0,000720925514602815 35314 34705 623 665 0 True 315 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 362 451 0,000891268937076864 0,000912581293012802 0,000762951094834821 0,000823987182421607 0,000686640643427648 0,000696502344862967 36389 39771 623 665 0 True 359 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 406 451 0,000915663777861951 0,000954090421751334 0,00064087891966125 0,000732433051041428 0,000879357633257557 0,00084989784589564 37385 41580 623 665 0 True 403 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 450 449 0,000933421066586036 0,000978091830629446 0,000579842832074464 0,000671396963454643 0,000966215281993598 0,000998123170100041 38110 42626 623 665 0 True 447 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 494 451 0,000989779027074477 0,000961479000774998 0,00064087891966125 0,000610360875867857 0,00100376981889511 0,000998812143519415 40411 41902 623 665 0 True 492 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 539 451 0,000893644739844086 0,000940001640631678 0,000625619897764553 0,000701915007248035 0,000870771762325869 0,000837403125596754 36486 40966 623 665 0 True 536 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 582 450 0,000959750839521748 0,000929790716204565 0,000610360875867857 0,000534065766384375 0,00100142263526467 0,000975723205356663 39185 40521 623 665 0 True 580 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 627 450 0,000890681109588066 0,00094158490756532 0,000488288700694286 0,000518806744487678 0,000927755909007117 0,0009706414382582 36365 41035 623 665 0 True 624 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 671 450 0,000854015369974335 0,000898905538049748 0,000488288700694286 0,0004272526131075 0,000925109916058875 0,001004447725751 34868 39175 623 665 0 True 668 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 273 496 0,000894575466701348 0,000963337618479708 0,000732433051041428 0,000823987182421607 0,000775810650466449 0,00081177883375853 36524 41983 623 665 0 True 271 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 317 495 0,000855901316500893 0,000844546706661366 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000741764505507674 0,000773852991504047 34945 36806 623 665 0 True 315 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 362 496 0,000919068278734569 0,000953769179185088 0,000762951094834821 0,000869764248111696 0,00079404185552495 0,000777151012367659 37524 41566 623 665 0 True 359 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 406 495 0,000936899045894754 0,000973686218292355 0,000762951094834821 0,000732433051041428 0,000813720946489934 0,000870635579914002 38252 42434 623 665 0 True 403 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 450 495 0,00102681215886871 0,000986742434020506 0,000656137941557946 0,000610360875867857 0,00101984504728166 0,00100227673209309 41923 43003 623 665 0 True 447 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 493 495 0,00103913204332142 0,000957784711263166 0,000747692072938125 0,000549324788281071 0,000976408200690547 0,000993669577955232 42426 41741 623 665 0 True 492 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 537 493 0,000982749590020943 0,00096329172668453 0,000701915007248035 0,000732433051041428 0,000927873675390809 0,000849381303487624 40124 41981 623 665 0 True 536 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 581 494 0,000863322638546959 0,000928459854144402 0,000534065766384375 0,000503547722590982 0,000893566758325711 0,000976742016242647 35248 40463 623 665 0 True 580 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 626 494 0,000906160566793062 0,000927266667469773 0,000564583810177768 0,000595101853971161 0,000924359841743667 0,000951461817086993 36997 40411 623 665 0 True 624 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 670 494 0,000948312696302234 0,00091870784766907 0,000610360875867857 0,000473029678797589 0,000959039677250295 0,00100904662681987 38718 40038 623 665 0 True 668 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 271 532 0,000874099475841576 0,000834611133005322 0,000762951094834821 0,000701915007248035 0,000729355982934392 0,000717940998345533 35688 36373 623 665 0 False 271 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 318 539 0,000888648206189309 0,000831444599138037 0,000747692072938125 0,000656137941557946 0,000752917236670259 0,00072018416155088 36282 36235 623 665 0 True 315 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 361 538 0,000883700658158599 0,000890943311586359 0,000762951094834821 0,000717174029144732 0,000694749243199117 0,000772446201170665 36080 38828 623 665 0 True 359 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 405 538 0,00089504083012998 0,00102462611093997 0,000671396963454643 0,000793469138628214 0,000817690809691381 0,000880899276553125 36543 44654 623 665 0 True 403 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 449 538 0,000885390662188891 0,000937707050872776 0,000488288700694286 0,000534065766384375 0,000956319665036531 0,00103965143831364 36149 40866 623 665 0 True 447 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 493 539 0,000938589049925046 0,000879080282532837 0,000518806744487678 0,000442511635004196 0,00102941848009645 0,00101379079654245 38321 38311 623 665 0 True 492 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 537 539 0,000927371342013831 0,000907762654519109 0,000549324788281071 0,000442511635004196 0,000961590393814009 0,00104621497445207 37863 39561 623 665 0 True 536 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 582 539 0,000966584334079017 0,00095932208640163 0,000671396963454643 0,000717174029144732 0,000904399253687419 0,000826510261592917 39464 41808 623 665 0 True 580 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 626 539 0,00094645124258771 0,000931351037240618 0,000595101853971161 0,000549324788281071 0,000957095287944182 0,000990992738086439 38642 40589 623 665 0 True 624 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 670 539 0,000987158296186922 0,000957555252287276 0,000701915007248035 0,000610360875867857 0,000953108446036357 0,000957510661779685 40304 41731 623 665 0 True 668 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 271 575 0,000940181082707205 0,000977564074984899 0,000854505226215 0,000854505226215 0,000674183235685787 0,000678891871654378 38386 42603 623 665 0 False 271 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 315 575 0,000903882735273972 0,00090002988703161 0,000793469138628214 0,000747692072938125 0,000731654049727046 0,000757432569535874 36904 39224 623 665 0 False 315 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 359 575 0,000875079188322905 0,000925798130024076 0,000747692072938125 0,00080872816052491 0,000710914704666679 0,000683962856059809 35728 40347 623 665 0 False 359 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 403 575 0,000836625473430749 0,000853357931335549 0,000656137941557946 0,000671396963454643 0,000708028788577845 0,000705405140815894 34158 37190 623 665 0 False 403 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 447 576 0,000958648662980253 0,000916550933295702 0,000625619897764553 0,000488288700694286 0,000985869913436553 0,000994348481147626 39140 39944 623 665 0 False 447 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 491 576 0,000903245922161109 0,000958450142293247 0,000473029678797589 0,000488288700694286 0,0010298837792636 0,00109628959048543 36878 41770 623 665 0 False 491 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 536 576 0,000891832271753628 0,000867263145274493 0,000473029678797589 0,000473029678797589 0,00100121184966312 0,000920811186512939 36412 37796 623 665 0 False 536 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 582 582 0,000904788969319202 0,0008783230679124 0,000625619897764553 0,000579842832074464 0,000892143919478688 0,000854820220137292 36941 38278 623 665 0 True 580 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 624 576 0,00102480374828198 0,000930272580053934 0,000747692072938125 0,000701915007248035 0,00085619704318931 0,000800374970660267 41841 40542 623 665 0 False 624 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 671 583 0,000973932177688983 0,000897872972658242 0,000747692072938125 0,000579842832074464 0,000844461282222192 0,000891501246738438 39764 39130 623 665 0 True 668 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 271 619 0,00102242794551476 0,000888878180803347 0,000915541313801785 0,000717174029144732 0,000723202064213667 0,000697344256689355 41744 38738 623 665 0 False 271 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 315 619 0,000870450046848626 0,000890048421580387 0,000732433051041428 0,000793469138628214 0,000713750345256055 0,000664425074820828 35539 38789 623 665 0 False 315 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 359 619 0,000915786241922117 0,000992754259188828 0,000732433051041428 0,000885023270008392 0,00074538840899795 0,000728736987427134 37390 43265 623 665 0 False 359 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 403 619 0,000784063898807457 0,000793744489399282 0,000595101853971161 0,00064087891966125 0,000708027915032778 0,000643640622400047 32012 34592 623 665 0 False 403 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 447 619 0,000932318890044541 0,000852508933124755 0,000625619897764553 0,000442511635004196 0,000937044897139075 0,000946994425282932 38065 37153 623 665 0 False 447 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 491 619 0,000938540064300979 0,000917721174072742 0,000534065766384375 0,000457770656900893 0,000988949364226248 0,00103002293068325 38319 39995 623 665 0 False 491 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 536 619 0,000999527166263699 0,000906110549892699 0,000656137941557946 0,000518806744487678 0,00100121927636923 0,000999886357137542 40809 39489 623 665 0 False 536 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 580 619 0,000891440386761096 0,000958128899727001 0,00064087891966125 0,000732433051041428 0,000849386603177352 0,000865443500647581 36396 41756 623 665 0 False 580 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 624 619 0,000865771919750281 0,000849089994383992 0,000701915007248035 0,000671396963454643 0,000701302513727666 0,000673719931751847 35348 37004 623 665 0 False 624 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 668 619 0,000998498468158304 0,000938487211390803 0,00080872816052491 0,000732433051041428 0,000825813783374226 0,000794025875679716 40767 40900 623 665 0 False 668 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 271 669 0,00111297787160158 0,0698584869130941 0,000976577401388571 0,0698558022430762 0,000776202642468162 0,022729272602849 45441 3044487 623 665 0 True 271 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 315 662 0,00101133270166371 0,00095746346869692 0,000900282291905089 0,000839246204318303 0,000722802476254418 0,000673736382972778 41291 41727 623 665 0 False 315 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 359 662 0,00089131792270093 0,000950992725576817 0,000778210116731518 0,000869764248111696 0,000674712834638941 0,000644742260556292 36391 41445 623 665 0 False 359 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 403 662 0,000848700429763126 0,000830113737077874 0,000717174029144732 0,000686655985351339 0,000667812233838695 0,000644878094670644 34651 36177 623 665 0 False 403 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 447 662 0,00087321773460838 0,000876166153539032 0,000671396963454643 0,000701915007248035 0,000745212710618732 0,000776736347283604 35652 38184 623 665 0 False 447 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 491 662 0,000902707080296378 0,000892893712881425 0,00064087891966125 0,000671396963454643 0,000843010605180554 0,000842781414079603 36856 38913 623 665 0 False 491 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 536 662 0,000925485395487273 0,00097006076647329 0,000595101853971161 0,000625619897764553 0,000886507096201432 0,000931063181982584 37786 42276 623 665 0 False 536 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 580 662 0,000979296103524259 0,000936789214969215 0,000793469138628214 0,00080872816052491 0,000780430565660747 0,000673064353699065 39983 40826 623 665 0 False 580 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 624 662 0,000980006395073222 0,00098196968732199 0,000823987182421607 0,000823987182421607 0,000750529738611169 0,000739760585566352 40012 42795 623 665 0 False 624 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 668 668 0,00102926144007203 0,0714908121757816 0,000900282291905089 0,0706950484473945 0,000746390660215086 0,0227226038740055 42023 3115625 623 665 0 True 668 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E8_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E8_1.csv new file mode 100755 index 0000000..3d7dccc --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E8_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 242 248 0,0109632275941899 0,0455293647256158 0,0109254596780346 0,0466010528725109 0,00170770323519975 0,00937328080116927 447610 1984205 623 665 0 True 242 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 286 249 0,0111724941802017 0,011002764407012 0,0111848630502785 0,0110170138094148 0,00146714084710613 0,00142809792764443 456154 479509 623 665 0 False 286 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 331 248 0,0111465562922585 0,066049261400239 0,0112153810940719 0,0646829938200961 0,00131402903564685 0,0124945875075959 455095 2878478 623 665 0 True 330 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 374 248 0,0111275008844967 0,0966205855678335 0,0110933089188983 0,0941023880369268 0,00133888970296261 0,0192509438695093 454317 4210800 623 665 0 True 374 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 418 247 0,0113672120358658 0,0740939324736653 0,0113679713130388 0,0711070420386053 0,00166302287651364 0,0158677241393215 464104 3229071 623 665 0 True 419 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 463 247 0,0112561861189192 0,0714767004487644 0,0113221942473487 0,0729991607537957 0,00173219860290277 0,0213241391960387 459571 3115010 623 665 0 True 463 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 507 248 0,0111320075619108 0,0876845811025619 0,0112001220721752 0,0905012588693065 0,00171912610890013 0,0216464075991988 454501 3821362 623 665 0 True 507 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 551 247 0,0111362938040166 0,0746035149673222 0,0111238269626917 0,0724040588998245 0,00158186051114359 0,0195806305412871 454676 3251279 623 665 0 True 551 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 596 249 0,0109359181087728 0,0110906930865732 0,0110322728313115 0,0111848630502785 0,00189279119369532 0,00192952915839817 446495 483341 623 665 0 False 596 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 638 248 0,0109339341909981 0,0469470999540508 0,0110170138094148 0,0469062333104448 0,00188805722448109 0,00820526257228485 446414 2045991 623 665 0 True 640 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 242 292 0,0110053062452629 0,0109983587946749 0,0109712367437247 0,0109864957656214 0,00162299299395156 0,00155167185730028 449328 479317 623 665 0 False 242 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 286 292 0,0109614151260994 0,0110297487825767 0,0109864957656214 0,0109864957656214 0,00134226874458262 0,00139053196184111 447536 480685 623 665 0 False 286 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 331 292 0,0109506627816168 0,111500564182257 0,0109407186999313 0,108278019378958 0,00140981472415839 0,0294444245061711 447097 4859281 623 665 0 True 330 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 375 292 0,0107132294617668 0,0539366957104365 0,0106965743495842 0,0530708781567102 0,00138514568519648 0,00964644133342285 437403 2350603 623 665 0 True 374 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 419 291 0,0108671912782076 0,0805728213874122 0,0108033875028611 0,0792553597314412 0,00172158482581148 0,016411606969851 443689 3511426 623 665 0 True 419 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 462 292 0,0108265821958565 0,0442197046748251 0,0109102006561379 0,0450904097047379 0,00174906908578456 0,00986515297341989 442031 1927129 623 665 0 True 463 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 507 292 0,010719989477888 0,0490341670151575 0,0107270923933776 0,0511024643320363 0,00168699980358034 0,0115932027899078 437679 2136947 623 665 0 True 507 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 552 292 0,0109281293945463 0,056002836112942 0,0109712367437247 0,0559090562294957 0,00161329665971602 0,0130638571119959 446177 2440647 623 665 0 True 551 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 596 293 0,0111521896390262 0,0109822048827723 0,011108567940795 0,0109864957656214 0,00225228847329566 0,00201271193756326 455325 478613 623 665 0 False 596 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 640 293 0,0108877162546914 0,0109029038607046 0,0109102006561379 0,0109254596780346 0,00198877861449124 0,0019108790901464 444527 475157 623 665 0 False 640 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 243 337 0,0109781437167181 0,0530377672264892 0,010955977721828 0,0531624322880903 0,00148758438169521 0,00988608280599203 448219 2311427 623 665 0 True 242 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 287 337 0,0111348242352946 0,0638622649551322 0,011108567940795 0,0662699320973526 0,00156263612755167 0,016752195605779 454616 2783167 623 665 0 True 286 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 331 336 0,0110432211182904 0,0425751033569274 0,0109102006561379 0,0424811169604028 0,0017594113429338 0,0101849225606884 450876 1855456 623 665 0 True 330 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 375 337 0,010782691076693 0,0381154075392188 0,0107881284809644 0,0373693446250095 0,00139731751015179 0,00710403296256512 440239 1661099 623 665 0 True 374 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 420 337 0,0110516956312539 0,0773431633558605 0,0110627908751049 0,0742656595712215 0,00161523561049757 0,0135702723005496 451222 3370675 623 665 0 True 419 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 464 337 0,010902118028167 0,0346182691794719 0,0109864957656214 0,0354467078660258 0,00172979299008251 0,00503459405836573 445115 1508691 623 665 0 True 463 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 508 337 0,0106365669601028 0,0309909357968049 0,0107728694590677 0,030960555428397 0,00160405303253242 0,00398952655632137 434273 1350609 623 665 0 True 507 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 551 336 0,0108545774800105 0,0559601567434264 0,0107881284809644 0,0574654764629587 0,00182051025722497 0,00958723394793631 443174 2438787 623 665 0 True 551 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 597 336 0,0110176751153397 0,0602441328773983 0,011108567940795 0,0599374380102235 0,00199626475046866 0,0140074588483503 449833 2625486 623 665 0 True 595 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 641 335 0,0107412982243569 0,0655165953336075 0,010757610437171 0,0646829938200961 0,00197618369450816 0,0184598591683797 438549 2855264 623 665 0 True 640 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 243 381 0,0109091474652205 0,0436496138492259 0,0109254596780346 0,0461127641718166 0,00167382092145371 0,00960276038341598 445402 1902284 623 665 0 True 242 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 287 382 0,0108848505956836 0,0331484467635098 0,0109102006561379 0,0330510414282445 0,00142543619640424 0,00381216424173414 444410 1444635 623 665 0 True 286 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 332 382 0,0107304724014382 0,0904910020530842 0,010757610437171 0,0869764248111696 0,00141486503919207 0,0198334612527211 438107 3943668 623 665 0 True 330 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 375 380 0,010822540881871 0,0681729271680001 0,0108186465247578 0,0674753948271916 0,00140381542795847 0,0183742023925696 441866 2971029 623 665 0 True 374 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 419 380 0,0109763557414397 0,0445429435341616 0,0108796826123445 0,0462653543907836 0,00172050581613163 0,00839054711751414 448146 1941216 623 665 0 True 418 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 464 381 0,0109101516705139 0,0579345135555758 0,0109102006561379 0,0578927290760662 0,00179323190571436 0,0124439598471732 445443 2524831 623 665 0 True 463 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 507 380 0,0108875203121952 0,0419990236520576 0,0107270923933776 0,0431372549019608 0,00229037930124648 0,00620443909744081 444519 1830350 623 665 0 True 507 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 552 380 0,0109409146424276 0,0539645520301096 0,0107423514152743 0,053177691309987 0,00230595152568404 0,00847455630909704 446699 2351817 623 665 0 True 551 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 596 380 0,010898444106362 0,0448058805746341 0,0109864957656214 0,0441596093690394 0,00211994540597046 0,00878609968442184 444965 1952675 623 665 0 True 595 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 640 380 0,0106976275405016 0,104124169430213 0,0106813153276875 0,103654535744259 0,00204260000541616 0,0292939775522842 436766 4537812 623 665 0 True 640 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 243 425 0,0107934434211756 0,0445646044614856 0,0108033875028611 0,0445563439383536 0,00167569850573409 0,00921931517683681 440678 1942160 623 665 0 True 241 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 287 425 0,0107371099534992 0,0577017503704328 0,010757610437171 0,0566720073243305 0,00161978636899806 0,0113074373158192 438378 2514687 623 665 0 True 286 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 332 425 0,0108323624994964 0,0344584510027644 0,0108949416342412 0,0347905699244678 0,0014413645846278 0,00325923947142645 442267 1501726 623 665 0 True 330 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 375 424 0,0110312931188302 0,0569966229375223 0,0110475318532082 0,0546425574120699 0,0014834580035853 0,0139099876539228 450389 2483957 623 665 0 True 374 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 419 424 0,0113181284405512 0,105101159857758 0,0112916762035554 0,106660563057908 0,00190596297478828 0,0186700175290806 462100 4580390 623 665 0 True 418 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 464 425 0,0109489972703986 0,064240757535863 0,0109864957656214 0,0617837796597238 0,00179288013232815 0,0166253459607908 447029 2799662 623 665 0 True 463 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 508 425 0,0110857896256041 0,0560430602714155 0,0111543450064851 0,0549935149156939 0,00178981394887981 0,0104394385402204 452614 2442400 623 665 0 True 507 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 551 423 0,0108218305903221 0,0320989702454809 0,0108339055466545 0,0329900053406577 0,0019048428957122 0,00566969955990299 441837 1398898 623 665 0 False 551 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 597 425 0,0106394081262987 0,0400228082222035 0,0105897611963073 0,0403906309605554 0,00197453386752748 0,00506357495788557 434389 1744225 623 665 0 True 595 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 640 424 0,0105501073336255 0,0705708423037452 0,0105134660868238 0,0701915007248035 0,00190052278168525 0,0103106360476213 430743 3075532 623 665 0 True 640 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 242 470 0,0106542752632028 0,0531694078409574 0,0106660563057908 0,0557869840543221 0,00145484586069295 0,0147357873188527 434996 2317164 623 665 0 True 241 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 286 469 0,0108132581061105 0,0533254628904603 0,0107728694590677 0,0542610818646525 0,00162715003106236 0,0102205554053354 441487 2323965 623 665 0 True 286 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 331 470 0,0108215611693897 0,0678032917037386 0,010757610437171 0,0660563057907988 0,00172991711865229 0,0155323022931291 441826 2954920 623 665 0 True 330 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 375 468 0,0109608762842347 0,0887775400965219 0,0109407186999313 0,084443427176318 0,00154574072239893 0,0240324999686051 447514 3868994 623 665 0 True 374 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 419 468 0,0112307625800287 0,093962578682917 0,0111238269626917 0,0913405050736248 0,00208221250739804 0,0339435441564707 458533 4094962 623 665 0 True 418 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 463 470 0,0109977624591567 0,0468665139617182 0,0110017547875181 0,0484931715877012 0,00201108424894633 0,00758009592820514 449020 2042479 623 665 0 True 463 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 508 468 0,0111098660598328 0,042149020984597 0,0111696040283818 0,0439002059967956 0,00181086759540391 0,00662178768458883 453597 1836887 623 665 0 True 507 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 551 469 0,0108152420238851 0,0958345509000241 0,0107728694590677 0,0902418554970626 0,00179620997450234 0,0240276040250591 441568 4176544 623 665 0 True 551 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 595 469 0,0110515731671937 0,0649027466813061 0,0110322728313115 0,0665445944914931 0,00220066563707664 0,019719325385842 451217 2828512 623 665 0 True 595 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 640 469 0,0106056325385048 0,0761910039461207 0,0105592431525139 0,073685816739147 0,00193731355489465 0,0130288775396634 433010 3320463 623 665 0 True 640 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 243 514 0,0106252022953194 0,0584141745987766 0,0105897611963073 0,0604409857328145 0,00155035366130909 0,0154040134363194 433809 2545735 623 665 0 True 241 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 287 514 0,0108087514286963 0,104796300662391 0,0107881284809644 0,0994888227664607 0,0015078195279142 0,0313283752240408 441303 4567104 623 665 0 True 286 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 331 514 0,0109361140512691 0,057574836610868 0,0108796826123445 0,0591287098496986 0,00157740824875672 0,0139788437088938 446503 2509156 623 665 0 True 330 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 375 513 0,0111334771306328 0,0584787673004897 0,010955977721828 0,0572976272220951 0,00201433494980246 0,0115817669974112 454561 2548550 623 665 0 True 374 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 419 514 0,0112523897330541 0,0559446912084514 0,0111390859845884 0,0568093385214008 0,00189754087217132 0,00816766819148016 459416 2438113 623 665 0 True 418 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 464 514 0,0111217940592929 0,0608308365328519 0,0110627908751049 0,0610360875867857 0,00199785809771657 0,014595774099086 454084 2651055 623 665 0 True 463 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 508 513 0,0110040571118492 0,0703683447575221 0,0110322728313115 0,0696421759365225 0,00192940118619395 0,0173037290393569 449277 3066707 623 665 0 True 507 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 552 513 0,0108362568566096 0,0588775440546893 0,0108186465247578 0,0588387884336614 0,00178224470765435 0,0152839256973268 442426 2565929 623 665 0 True 551 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 597 513 0,0107663298782548 0,0451316205368078 0,0108033875028611 0,043579766536965 0,00181251401588495 0,00768710605348866 439571 1966871 623 665 0 True 595 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 640 513 0,0104625700234188 0,0673899443045701 0,0104676890211337 0,0672159914549477 0,00189328106415549 0,0167257893602823 427169 2936906 623 665 0 True 640 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 244 558 0,010288720043607 0,0481764264173824 0,0102082856488899 0,0497444113832303 0,00140314020672712 0,00993737969767467 420071 2099566 623 665 0 True 241 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 287 557 0,0105102575284475 0,0513395184000285 0,0104676890211337 0,0529182879377432 0,00147122774872644 0,0120314857202624 429116 2237416 623 665 0 True 286 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 331 557 0,010709702496834 0,0492148889045686 0,010757610437171 0,0491187914854658 0,0016161390476918 0,0127991334340515 437259 2144823 623 665 0 True 330 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 375 557 0,0109619784607762 0,0467518762573635 0,0110017547875181 0,0470130464637217 0,00148610490204156 0,00735132851773865 447559 2037483 623 665 0 True 374 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 420 557 0,0112696571655375 0,08191458274893 0,0112001220721752 0,0793316548409247 0,00176132670622777 0,0205406437918675 460121 3569901 623 665 0 True 418 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 464 558 0,0108169810135395 0,0584672025681049 0,0107728694590677 0,0582742046234836 0,00213211367784962 0,0106681263346834 441639 2548046 623 665 0 True 463 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 509 558 0,0108570022684018 0,0524662996470347 0,0107728694590677 0,0527504386968795 0,00212341782300776 0,0080254970474633 443273 2286522 623 665 0 True 507 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 552 558 0,0104937983587612 0,0360011266435716 0,0105439841306172 0,0378271152819104 0,00178222193269707 0,00757962062430789 428444 1568957 623 665 0 True 551 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 597 558 0,0105573082203633 0,0480084395011332 0,0105897611963073 0,0483405813687343 0,00168546627495168 0,0067715526440614 431037 2092245 623 665 0 True 595 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 640 557 0,0104204423867217 0,0617506228377077 0,0105287251087205 0,0582894636453803 0,00180588331515299 0,0171939023600763 425449 2691140 623 665 0 True 640 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 241 596 0,0103969537799818 0,0102245542902805 0,0102998397802701 0,0102388036926833 0,00175027410869141 0,00124518436782546 424490 445594 623 665 0 False 241 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 286 596 0,0104748899078715 0,0102743927798439 0,010452429999237 0,01025406271458 0,00151026809153007 0,00151952430602082 427672 447766 623 665 0 False 286 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 332 602 0,0104599982781553 0,0721328383903223 0,0104676890211337 0,070923933775845 0,00144286836461733 0,011481717466814 427064 3143605 623 665 0 True 330 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 376 602 0,0108115681020802 0,0705875928089851 0,0108033875028611 0,0683299000534066 0,00144719574731703 0,0197849185208158 441418 3076262 623 665 0 True 374 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 418 596 0,0108861732075334 0,0106578646203515 0,0108186465247578 0,0107270923933776 0,00181430125170581 0,00171121504778441 444464 464478 623 665 0 False 418 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 463 596 0,0107266025371369 0,0105668382446159 0,0106355382619974 0,0105897611963073 0,00196113838948773 0,00199166277740133 437949 460511 623 665 0 False 463 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 507 596 0,0106851362063647 0,0104750087624646 0,0107118333714809 0,0104982070649271 0,00212745996281355 0,00215790110857235 436256 456509 623 665 0 False 507 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 551 596 0,0103406448051174 0,0102545216325318 0,0103913939116503 0,0102845807583734 0,00202527353647184 0,00175297649131627 422191 446900 623 665 0 False 551 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 595 596 0,010331460000605 0,0103186095244979 0,0102693217364767 0,0103150988021668 0,00174451913310662 0,00157486537183562 421816 449693 623 665 0 False 595 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 639 596 0,0104900754513321 0,0102891469919936 0,0104676890211337 0,0102998397802701 0,00151899416221094 0,00148097629618652 428292 448409 623 665 0 False 639 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 243 645 0,0102942554191265 0,0432522138488818 0,0103608758678569 0,0447699702449073 0,00138194529620318 0,00972349494657478 420297 1884965 623 665 0 True 241 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 286 639 0,0102583489566858 0,0100765073590362 0,0102693217364767 0,0101472495613031 0,00130874385771285 0,00131054017663645 418831 439142 623 665 0 False 286 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 330 639 0,0110572554995854 0,0100165956204313 0,0102235446707866 0,0100404364080262 0,0049707701450633 0,0012994908580864 451449 436531 623 665 0 False 330 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 374 639 0,0110497851919153 0,01031335491395 0,0104219119554437 0,0103150988021668 0,00371914358439097 0,00128413917525751 451144 449464 623 665 0 False 374 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 418 639 0,0102809313293804 0,0103472689505866 0,0102235446707866 0,0103303578240635 0,00147891088896326 0,00150676185517952 419753 450942 623 665 0 False 418 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 462 639 0,010294622811307 0,0102002775306313 0,0102845807583734 0,0102082856488899 0,00177390609191667 0,00174661218937139 420312 444536 623 665 0 False 462 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 507 639 0,0101680439587193 0,0101099165859258 0,0101625085831998 0,0100862134737163 0,00188121088691704 0,00181426853409559 415144 440598 623 665 0 False 507 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 551 639 0,0102934716491414 0,0102211353515398 0,0102845807583734 0,0101930266269932 0,00176548092345393 0,0016527464084595 420265 445445 623 665 0 False 551 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 595 639 0,0102740978348232 0,0103952947142404 0,0102998397802701 0,0103303578240635 0,00141350910708695 0,00136058566293205 419474 453035 623 665 0 False 595 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 641 646 0,0102312843993891 0,0437424070590759 0,0101930266269932 0,0443884946974899 0,00139573894085051 0,0081079856721076 417726 1906328 623 665 0 True 639 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E8_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E8_2.csv new file mode 100755 index 0000000..9362e94 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E8_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 242 248 0,00837088387578176 0,691234495026763 0,00834668497749294 0,708506904707408 0,00198408156648265 0,203748169488463 341769 30124535 623 665 8 True 242 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 286 249 0,00747427550568166 0,00721382306762558 0,00740062561989776 0,00727855344472419 0,00152109565434676 0,00134285937601688 305162 314384 623 665 0 False 286 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 331 248 0,00686484535667106 0,00704528544983424 0,00683604180972 0,00703440909437705 0,00132247653006353 0,00132551427875193 280280 307039 623 665 0 True 330 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 374 248 0,00686680478163372 0,0072695586528693 0,00683604180972 0,00729381246662089 0,00135164338847632 0,00128194998674847 280360 316813 623 665 0 True 374 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 418 247 0,0069286491320176 0,00739229625907295 0,00692759594110018 0,00743114366369116 0,00154621022557431 0,00149358049998025 282885 322162 623 665 0 True 419 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 463 247 0,00718709728459215 0,00779026990685687 0,00717174029144732 0,007690547035935 0,00146294802537921 0,00199246787634416 293437 339506 623 665 0 True 463 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 507 248 0,00746117185124389 0,00721588819840859 0,00752269779507134 0,00721751735713741 0,00160258124888315 0,00148590830603613 304627 314474 623 665 0 True 507 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 551 247 0,00776089039209441 0,00792012074131311 0,00779736018921187 0,00793469138628214 0,00136241628503255 0,00146338661693922 316864 345165 623 665 0 True 551 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 596 249 0,00840941106911002 0,00832704328915674 0,00833142595559625 0,00833142595559625 0,00192535891448786 0,00207407532616393 343342 362899 623 665 0 False 596 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 638 248 0,00968448237074745 0,715958263706875 0,00964370183871214 0,704142824444953 0,00191737363106584 0,173797015455592 395401 31202016 623 665 9 True 640 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 242 292 0,00722878405067269 0,00687796396461513 0,0072327763790341 0,00688181887541009 0,00162841741839867 0,00146882627316016 295139 299747 623 665 0 False 242 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 286 292 0,00654019313317073 0,00655089314038128 0,00653086137178607 0,00656137941557946 0,00133507459384958 0,00129305736641013 267025 285493 623 665 0 False 286 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 331 292 0,00620307406834548 0,00637875301666847 0,00619516289005875 0,0064087891966125 0,00128153848417283 0,00123968471655696 253261 277991 623 665 0 True 330 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 375 292 0,00632291739762403 0,00641145092073282 0,0063935301747158 0,0063782711528191 0,00124420125566378 0,00118252823256828 258154 279416 623 665 0 True 374 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 419 291 0,00639507322187389 0,00639974851296242 0,0063782711528191 0,00642404821850919 0,00151214361294438 0,00143498095232906 261100 278906 623 665 0 True 419 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 462 292 0,00671267151550867 0,0064211111436178 0,00669871061264973 0,0063935301747158 0,00166288612456216 0,00181554074776082 274067 279837 623 665 0 True 463 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 507 292 0,00697011546278985 0,00666718294936242 0,00691233691920348 0,00666819256885634 0,00161617301325634 0,00152622077037974 284578 290561 623 665 0 True 507 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 552 292 0,0075745735709577 0,00738761529596479 0,00752269779507134 0,00738536659800107 0,00157237874757042 0,00151087082003493 309257 321958 623 665 0 True 551 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 596 293 0,00803631206340797 0,00782673093812581 0,0081177996490425 0,00773632410162509 0,00195367098360821 0,00194985427994282 328109 341095 623 665 0 False 596 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 640 293 0,00832309839950495 0,00836205872887758 0,00837720302128634 0,00833142595559625 0,00198836750393269 0,00204855089977345 339818 364425 623 665 0 False 640 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 243 337 0,00680003737603116 0,00664485659100831 0,0068207827878233 0,00660715648126955 0,00145310127530807 0,00146978591148583 277634 289588 623 665 0 True 242 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 287 337 0,00633117147527922 0,00625987032125978 0,00633249408712902 0,00622568093385214 0,00130273533090985 0,00126977563489675 258491 272810 623 665 0 True 286 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 331 336 0,00642647300690048 0,00616012450444032 0,00642404821850919 0,00616464484626535 0,00125567220311391 0,00126006281609608 262382 268463 623 665 0 True 330 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 375 337 0,00635955864442572 0,00638132295719844 0,00633249408712902 0,00634775310902571 0,00125826461010595 0,00116894217265958 259650 278103 623 665 0 True 374 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 420 337 0,00666449415423932 0,00652312860429857 0,00672922865644312 0,00651560234988937 0,00150608848120464 0,00153092415053454 272100 284283 623 665 0 True 419 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 464 337 0,00682254627028969 0,00667560409377759 0,00679026474402991 0,00669871061264973 0,00156422368495714 0,00141404840837491 278553 290928 623 665 0 True 463 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 508 337 0,00674044636435434 0,00698399695737398 0,00668345159075303 0,00683604180972 0,00159753247699176 0,0025200964612471 275201 304368 623 665 0 True 507 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 551 336 0,00718631351460708 0,00700795247445691 0,00721751735713741 0,00700389105058366 0,00160959707104767 0,00150197987849789 293405 305412 623 665 0 True 551 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 597 336 0,00745820822098787 0,00769841747880803 0,00743114366369116 0,00761425192645151 0,00197596440272308 0,00248135661662678 304506 335503 623 665 0 True 595 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 641 335 0,00746660925551526 0,00742095568516163 0,00744640268558785 0,00740062561989776 0,00186934941894981 0,00184548871418145 304849 323411 623 665 0 True 640 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 243 381 0,00650901378345244 0,00665187803567054 0,00648508430609598 0,00663767452506294 0,00134801256315553 0,00151241149536121 265752 289894 623 665 0 True 242 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 287 382 0,00617485834888321 0,00631796933395517 0,00616464484626535 0,0063782711528191 0,00132815002256612 0,00133684852810566 252109 275342 623 665 0 True 286 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 332 382 0,00629903690589164 0,00655784574735075 0,00631723506523232 0,00654612039368277 0,00133416769537323 0,0013910347768158 257179 285796 623 665 0 True 330 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 375 380 0,00655567259037572 0,00664439767305653 0,00654612039368277 0,00660715648126955 0,00127049000028312 0,00127118478294435 267657 289568 623 665 0 True 374 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 419 380 0,00672237066907382 0,00679210041583703 0,00671396963454643 0,00672922865644312 0,00151407607347965 0,00151738734612165 274463 296005 623 665 0 True 418 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 464 381 0,00676885802631287 0,00682128759757026 0,00672922865644312 0,00688181887541009 0,00156085669951671 0,00165938246704837 276361 297277 623 665 0 True 463 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 507 380 0,00695282353749439 0,00686929041532648 0,00686655985351339 0,00689707789730678 0,00183643313459284 0,00166441864686398 283872 299369 623 665 0 True 507 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 552 380 0,00720664254859466 0,00703835578876236 0,0072480354009308 0,00703440909437705 0,00178479978381189 0,0014609681818723 294235 306737 623 665 0 True 551 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 596 380 0,00705530146304139 0,00703523514669026 0,00709544518196384 0,00704966811627375 0,00198120687421308 0,00192676296176954 288056 306601 623 665 0 True 595 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 640 380 0,00657578118905499 0,00663590769094859 0,00659189745937285 0,00662241550316625 0,00191247933467585 0,00181060749963258 268478 289198 623 665 0 True 640 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 243 425 0,00634510788532612 0,00639015712777022 0,0063782711528191 0,00633249408712902 0,00153425236664549 0,00154528113918139 259060 278488 623 665 0 True 241 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 287 425 0,00631231201001364 0,0065700759107657 0,00630197604333562 0,00659189745937285 0,00141179740648953 0,0014626837794769 257721 286329 623 665 0 True 286 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 332 425 0,00655520722694709 0,00668347453665062 0,00656137941557946 0,00665293354695964 0,00126597861715151 0,00125853032190736 267638 291271 623 665 0 True 330 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 375 424 0,00675609727124356 0,00696582380648348 0,0068055237659266 0,00697337300679027 0,00133549658315921 0,00138678198046249 275840 303576 623 665 0 True 374 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 419 424 0,00703100459350443 0,0071268581157632 0,00704966811627375 0,00718699931334401 0,00155404020817082 0,00157568319482162 287064 310594 623 665 0 True 418 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 464 425 0,00692034606873834 0,00716143758342985 0,00698863202868696 0,00718699931334401 0,00163719052053156 0,0015681387969558 282546 312101 623 665 0 True 463 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 508 425 0,00706294322039575 0,00684682638158684 0,00708018616006714 0,00694285496299687 0,00154284223178806 0,00164881887825647 288368 298390 623 665 0 True 507 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 551 423 0,00685453388280508 0,00700781479907138 0,00685130083161669 0,00704966811627375 0,00160015715234084 0,00150963808454339 279859 305406 623 665 0 False 551 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 597 425 0,00633626598018213 0,00646574091442844 0,0063782711528191 0,00648508430609598 0,00180579491336061 0,00179196836081003 258699 281782 623 665 0 True 595 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 640 424 0,00610801746484455 0,00615007420129633 0,00602731364919509 0,00621042191195544 0,00178136089603171 0,00168197497088214 249380 268025 623 665 0 True 640 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 242 470 0,00644258927721834 0,00667386020556082 0,00648508430609598 0,00671396963454643 0,00145447300597221 0,00143675014927638 263040 290852 623 665 0 True 241 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 286 469 0,00654754097678069 0,00664430588946617 0,00650034332799268 0,00651560234988937 0,0014600410573511 0,00175547560096954 267325 289564 623 665 0 True 286 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 331 470 0,00672621604056304 0,00658896038448146 0,00674448767833982 0,00656137941557946 0,00150594681973825 0,00160563727876438 274620 287152 623 665 0 True 330 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 375 468 0,00680620956466353 0,0068750957274165 0,00686655985351339 0,00689707789730678 0,00148927605281485 0,00151318048763018 277886 299622 623 665 0 True 374 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 419 468 0,00705116217780777 0,00717967957201312 0,00698863202868696 0,00708018616006714 0,00173543047196714 0,00175263756476857 287887 312896 623 665 0 True 418 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 463 470 0,00711332493474809 0,00724445584090691 0,00714122224765393 0,00729381246662089 0,00189093129281456 0,00189031877157406 290425 315719 623 665 0 True 463 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 508 468 0,00677238499124566 0,00688152057874143 0,00672922865644312 0,00691233691920348 0,00177815542238265 0,00174206224767287 276505 299902 623 665 0 True 507 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 551 469 0,00645838714097977 0,00645589712436275 0,00648508430609598 0,00650034332799268 0,0017492153885927 0,00168818793295324 263685 281353 623 665 0 True 551 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 595 469 0,00621475713968532 0,00645254702331475 0,00617990386816205 0,00653086137178607 0,00186589007376442 0,00176605859571915 253738 281207 623 665 0 True 595 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 640 469 0,00601256897635109 0,00604371996597123 0,0059662775616083 0,00610360875867857 0,00170827313541779 0,00176208323801548 245483 263390 623 665 0 True 640 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 243 514 0,00658121859332637 0,00667748565737989 0,00654612039368277 0,00668345159075303 0,0013317056264467 0,00138561379207136 268700 291010 623 665 0 True 241 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 287 514 0,00648866025665283 0,00650231667518533 0,00646982528419928 0,00646982528419928 0,00146417603123278 0,00147329750576978 264921 283376 623 665 0 True 286 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 331 514 0,00653651921136574 0,00649267939819794 0,00654612039368277 0,00642404821850919 0,00140412460926079 0,00147948170022051 266875 282956 623 665 0 True 330 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 375 513 0,00696690690441349 0,00691607710051049 0,00694285496299687 0,00692759594110018 0,00147087265721096 0,0014857063092021 284447 301408 623 665 0 True 374 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 419 514 0,00667355649469161 0,00692516367595574 0,00672922865644312 0,00689707789730678 0,00170625410217852 0,00181262669398419 272470 301804 623 665 0 True 418 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 464 514 0,00673684592098545 0,00671305179864287 0,0068055237659266 0,00665293354695964 0,00186696967845961 0,00167371260532517 275054 292560 623 665 0 True 463 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 508 513 0,00633883772544562 0,00643958259117696 0,00625619897764553 0,00645456626230259 0,00163664620831125 0,00158173313305064 258804 280642 623 665 0 True 507 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 552 513 0,00622585238353637 0,00643074842060519 0,00622568093385214 0,00643930724040589 0,00164475505578945 0,00163152802754928 254191 280257 623 665 0 True 551 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 597 513 0,00621505105342972 0,00621996740535247 0,00617990386816205 0,00627145799954223 0,0016670237305396 0,00179947877598032 253750 271071 623 665 0 True 595 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 640 513 0,00633156336027175 0,00613605425786944 0,0063782711528191 0,00608834973678187 0,0017174013503146 0,0019003358026992 258507 267414 623 665 0 True 640 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 244 558 0,00664436106274801 0,00662207131470241 0,00666819256885634 0,00662241550316625 0,00123523644741622 0,00134937327566801 271278 288595 623 665 0 True 241 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 287 557 0,00646740049580799 0,00653634544130984 0,00646982528419928 0,00657663843747616 0,00136792076245938 0,00126698474924516 264053 284859 623 665 0 True 286 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 331 557 0,00659486108962887 0,00671764097816067 0,00653086137178607 0,00672922865644312 0,00132699855880931 0,00139024106786761 269257 292760 623 665 0 True 330 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 375 557 0,00667705896681236 0,00675283998506222 0,00668345159075303 0,0068055237659266 0,0013182674518465 0,00121511333296629 272613 294294 623 665 0 True 374 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 420 557 0,00647751602717771 0,00664637102024918 0,00646982528419928 0,00668345159075303 0,00166597664956418 0,00167502786147064 264466 289654 623 665 0 True 418 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 464 558 0,00649061968161549 0,00641711855743731 0,00650034332799268 0,00646982528419928 0,00201745080769975 0,0018403002039647 265001 279663 623 665 0 True 463 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 509 558 0,00632313783293232 0,00642028509130459 0,00642404821850919 0,00636301213092241 0,00197711070907899 0,0019673011281889 258163 279801 623 665 0 True 507 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 552 558 0,00629039094324391 0,00638595802851142 0,00624093995574884 0,00642404821850919 0,00174687734774652 0,00179252414682368 256826 278305 623 665 0 True 551 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 597 558 0,0063574032769668 0,0064900635658728 0,00633249408712902 0,00650034332799268 0,00156522962292784 0,00141305317209686 259562 282842 623 665 0 True 595 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 640 557 0,0063349188755203 0,00644768249302588 0,00625619897764553 0,00645456626230259 0,0016376038707828 0,0015888602291283 258644 280995 623 665 0 True 640 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 241 596 0,00699904147380108 0,00703378955514215 0,00698863202868696 0,00700389105058366 0,00122398397956761 0,00128617930474875 285759 306538 623 665 0 False 241 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 286 596 0,00670689121186883 0,00665598535133898 0,00666819256885634 0,00669871061264973 0,00129516646903369 0,00140418717682806 273831 290073 623 665 0 False 286 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 332 602 0,00652299917912341 0,0067911137422407 0,00648508430609598 0,00679026474402991 0,00145382847100934 0,00148527708518356 266323 295962 623 665 0 True 330 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 376 602 0,00642282357790753 0,00646381345903096 0,00643930724040589 0,00645456626230259 0,00134768719003742 0,00126859425274303 262233 281698 623 665 0 True 374 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 418 596 0,00637420534602159 0,00652838321484645 0,00634775310902571 0,00645456626230259 0,00167104339871745 0,0015648382364704 260248 284512 623 665 0 False 418 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 463 596 0,00652339106411594 0,00647558470449413 0,00654612039368277 0,00653086137178607 0,00186257046285551 0,00178668484846486 266339 282211 623 665 0 False 463 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 507 596 0,00624277691665133 0,00636250732117545 0,00621042191195544 0,00631723506523232 0,00193525791976573 0,00201738819913308 254882 277283 623 665 0 False 507 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 551 596 0,00628617817957419 0,00644272617914665 0,00624093995574884 0,00648508430609598 0,00183777705518032 0,00173616141068837 256654 280779 623 665 0 False 551 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 595 596 0,00641856182861375 0,0064298764764968 0,0064087891966125 0,0064087891966125 0,00162217947921614 0,00143908259790398 262059 280219 623 665 0 False 595 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 639 596 0,00654594894399853 0,00639224520445082 0,00654612039368277 0,00634775310902571 0,00147643421768242 0,00147712993469793 267260 278579 623 665 0 False 639 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 243 645 0,00848004833901383 0,686608625018715 0,00828564888990616 0,704753185320821 0,00199379438461712 0,221685277222094 346226 29922936 623 665 8 True 241 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 286 639 0,0073928369056712 0,00687089662815771 0,0072632944228275 0,00685130083161669 0,00173526966367647 0,00126104117908112 301837 299439 623 665 0 False 286 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 330 639 0,00622254585391189 0,0061689357291145 0,00619516289005875 0,00614938582436866 0,00126059804701053 0,00119484772500202 254056 268847 623 665 0 False 330 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 374 639 0,00633753960640786 0,00618547972127618 0,00633249408712902 0,00624093995574884 0,00120837183110778 0,00123920163768849 258751 269568 623 665 0 False 374 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 418 639 0,00612817504914789 0,0060065935036722 0,00610360875867857 0,00602731364919509 0,00137666016841713 0,00139040996286353 250203 261772 623 665 0 False 418 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 462 639 0,00615504366394833 0,00613164864553235 0,00617990386816205 0,00613412680247196 0,00170119790534344 0,00164743190892307 251300 267222 623 665 0 False 462 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 507 639 0,00629083181386051 0,00621932492021998 0,00633249408712902 0,00622568093385214 0,00178183023914148 0,00178589211744268 256844 271043 623 665 0 False 507 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 551 639 0,00638520261862451 0,00627508345136129 0,0063935301747158 0,00634775310902571 0,00168029482951732 0,00163409595859685 260697 273473 623 665 0 False 551 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 595 639 0,00669562451833354 0,00662840438243698 0,00665293354695964 0,00660715648126955 0,00142162710807159 0,0012371223802229 273371 288871 623 665 0 False 595 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 641 646 0,00809247408140015 0,715989355398108 0,00799572747386892 0,721034561684596 0,00178626542825913 0,192220142995274 330402 31203371 623 665 9 True 639 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E8_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E8_3.csv new file mode 100755 index 0000000..d8b2739 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E8_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 242 248 0,000965604621597688 0,0673102990940386 0,000717174029144732 0,0676279850461585 0,000873279563510801 0,0212168225254475 39424 2933435 623 665 0 True 242 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 286 249 0,00097459348361388 0,000977357561906598 0,00080872816052491 0,000854505226215 0,00074485990574862 0,000692702192026752 39791 42594 623 665 0 False 286 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 331 248 0,000938858470857411 0,000988004458387902 0,000778210116731518 0,000900282291905089 0,000702560377935409 0,000654730344907519 38332 43058 623 665 0 True 330 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 374 248 0,00099710237787241 0,000972791328286383 0,000869764248111696 0,000869764248111696 0,000712612668211347 0,000613219567584654 40710 42395 623 665 0 True 374 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 418 247 0,00108642766335757 0,000981763174243689 0,000946059357595178 0,000823987182421607 0,000776260813641643 0,000755492371054817 44357 42786 623 665 0 True 419 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 463 247 0,000973540292696452 0,000940529396276225 0,000823987182421607 0,000762951094834821 0,00083403225918922 0,000767453028336807 39748 40989 623 665 0 True 463 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 507 248 0,000869176420622899 0,000861618454467595 0,000701915007248035 0,000671396963454643 0,000798857413845074 0,000776622641072525 35487 37550 623 665 0 True 507 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 551 247 0,000929624680720887 0,000999615082567944 0,000762951094834821 0,000839246204318303 0,000778918957286806 0,000721340808691495 37955 43564 623 665 0 True 551 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 596 249 0,000929134824480223 0,0010015884297606 0,000610360875867857 0,00064087891966125 0,000977881266481432 0,00107097653991307 37935 43650 623 665 0 False 596 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 638 248 0,00114467157037256 0,0704609085083962 0,000930800335698482 0,0688181887541009 0,000963163452311786 0,0192207373003458 46735 3070741 623 665 0 True 640 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 242 292 0,000853770441854003 0,000895647220592107 0,00064087891966125 0,000686655985351339 0,000768410252056658 0,000743155071983679 34858 39033 623 665 0 False 242 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 286 292 0,000852374351568109 0,000906982494001082 0,000732433051041428 0,000778210116731518 0,000674866216353754 0,000669926759843602 34801 39527 623 665 0 False 286 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 331 292 0,000925166988930841 0,00096469142643746 0,000823987182421607 0,000839246204318303 0,000674351612004218 0,000669080256034452 37773 42042 623 665 0 True 330 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 375 292 0,000813479766059355 0,000914669369693403 0,000686655985351339 0,00080872816052491 0,000635045707265495 0,000627767202699207 33213 39862 623 665 0 True 374 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 419 291 0,00088994632522707 0,000953654449697143 0,000701915007248035 0,000747692072938125 0,000756960181874678 0,000805464393046805 36335 41561 623 665 0 True 419 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 462 292 0,000889848353978937 0,000983897142719467 0,000595101853971161 0,000610360875867857 0,00087088883822228 0,00103088505611335 36331 42879 623 665 0 True 463 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 507 292 0,000877332527029961 0,000933806248282643 0,000671396963454643 0,000717174029144732 0,000801300629157103 0,000862468290553961 35820 40696 623 665 0 True 507 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 552 292 0,000981843355975713 0,00097705926523794 0,000762951094834821 0,000762951094834821 0,000864778303525384 0,000822014519941834 40087 42581 623 665 0 True 551 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 596 293 0,000941038331128368 0,00100842630724213 0,000534065766384375 0,000656137941557946 0,000992853398160254 0,0010255656069589 38421 43948 623 665 0 False 596 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 640 293 0,00101902344464214 0,0010316705014998 0,00064087891966125 0,000686655985351339 0,00102214741081975 0,00106869980496757 41605 44961 623 665 0 False 640 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 243 337 0,000853501020921638 0,000812330666446386 0,000717174029144732 0,000625619897764553 0,000714536279689092 0,000750493467324991 34847 35402 623 665 0 True 242 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 287 337 0,000836503009370582 0,000850971557986291 0,000701915007248035 0,000717174029144732 0,000676740147067843 0,000663107782738611 34153 37086 623 665 0 True 286 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 331 336 0,000878630646067722 0,000908496923241957 0,000747692072938125 0,000762951094834821 0,000675570496996272 0,000684482954200817 35873 39593 623 665 0 True 330 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 375 337 0,000995387881030085 0,000916734500476414 0,000946059357595178 0,000839246204318303 0,000692692848523066 0,000634355839842551 40640 39952 623 665 0 True 374 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 420 337 0,000939715719278574 0,000939795127553376 0,000701915007248035 0,000686655985351339 0,000803757556439267 0,000806641271803087 38367 40957 623 665 0 True 419 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 464 337 0,000884680370639927 0,000853610336209028 0,000656137941557946 0,000656137941557946 0,000837795127984445 0,000766797391771913 36120 37201 623 665 0 True 463 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 508 337 0,000886419360294286 0,000927519072343252 0,000656137941557946 0,000717174029144732 0,000797035141317176 0,000879455668865342 36191 40422 623 665 0 True 507 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 551 336 0,000930506421954083 0,000777751198779737 0,000701915007248035 0,000610360875867857 0,000877119400686652 0,000680654750425645 37991 33895 623 665 0 True 551 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 597 336 0,000923036114283951 0,000975705457280188 0,000534065766384375 0,000518806744487678 0,000975360364710742 0,00111341009393331 37686 42522 623 665 0 True 595 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 641 335 0,00097976146695289 0,000952644830203226 0,000701915007248035 0,000625619897764553 0,000984130416450389 0,00092221435516413 40002 41517 623 665 0 True 640 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 243 381 0,000879585865737018 0,000921599030765286 0,000686655985351339 0,000793469138628214 0,000799188532166062 0,000762161162076061 35912 40164 623 665 0 True 242 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 287 382 0,000774511702114501 0,000954549339703114 0,000610360875867857 0,000823987182421607 0,000681138557104358 0,000723615632199874 31622 41600 623 665 0 True 286 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 332 382 0,0009123082626134 0,000864027773714442 0,000762951094834821 0,000717174029144732 0,000722258595739843 0,000686254318497745 37248 37655 623 665 0 True 330 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 375 380 0,000901849831875215 0,00088181084434593 0,000762951094834821 0,000747692072938125 0,000725014321748623 0,00067755693365391 36821 38430 623 665 0 True 374 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 419 380 0,000916300590974815 0,000971024494172029 0,000717174029144732 0,000747692072938125 0,00079143538514734 0,000825205374909235 37411 42318 623 665 0 True 418 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 464 381 0,000847990138214163 0,00087972276766533 0,000518806744487678 0,000534065766384375 0,000867161414142813 0,000862801029163792 34622 38339 623 665 0 True 463 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 507 380 0,000958942576724652 0,00085356444441385 0,00064087891966125 0,000595101853971161 0,000942298536282331 0,000873756021703691 39152 37199 623 665 0 True 507 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 552 380 0,000986937860878623 0,000954457556112758 0,000671396963454643 0,000823987182421607 0,000960194317607475 0,00077847677490391 40295 41596 623 665 0 True 551 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 596 380 0,000876989627661496 0,000934402841619958 0,000488288700694286 0,000518806744487678 0,00101557679430115 0,00102933647648028 35806 40722 623 665 0 True 595 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 640 380 0,000907140279274391 0,000916665662783647 0,000473029678797589 0,000610360875867857 0,00096625348485059 0,000921920875848184 37037 39949 623 665 0 True 640 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 243 425 0,000814753392285083 0,000886790104122747 0,000686655985351339 0,000717174029144732 0,000715779674574422 0,000808790736374642 33265 38647 623 665 0 True 241 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 287 425 0,00085291319343284 0,000894270466736766 0,000671396963454643 0,000762951094834821 0,00077700596811984 0,000753899575776926 34823 38973 623 665 0 True 286 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 332 425 0,00089124444426483 0,000981533715267799 0,000823987182421607 0,000869764248111696 0,000644429419047633 0,000721094104205839 36388 42776 623 665 0 True 330 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 375 424 0,000982945532517208 0,000906638305537247 0,000839246204318303 0,000839246204318303 0,000762968605225342 0,000672860156434955 40132 39512 623 665 0 True 374 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 419 424 0,000900086349408823 0,000918616064078714 0,000671396963454643 0,00064087891966125 0,000830578391992129 0,000828823707976946 36749 40034 623 665 0 True 418 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 464 425 0,00100832008578362 0,000932658953403192 0,000747692072938125 0,000717174029144732 0,000932803977297102 0,000823291529028593 41168 40646 623 665 0 True 463 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 508 425 0,00100040890749689 0,000957302847413797 0,000701915007248035 0,000701915007248035 0,000954713415045577 0,000930910534817018 40845 41720 623 665 0 True 507 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 551 423 0,000810393671743169 0,000979193233713719 0,000534065766384375 0,000747692072938125 0,000801905066742149 0,000868108445314151 33087 42674 623 665 0 False 551 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 597 425 0,000971286953989395 0,000868639899129834 0,000656137941557946 0,0004272526131075 0,000976823659103757 0,00096853281313799 39656 37856 623 665 0 True 595 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 640 424 0,000901262004386418 0,000964852047720583 0,000595101853971161 0,00064087891966125 0,000905775261475428 0,000968506955487468 36797 42049 623 665 0 True 640 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 242 470 0,000884900805948226 0,000871049218376681 0,000747692072938125 0,000732433051041428 0,000751180399468254 0,00070530363956903 36129 37961 623 665 0 True 241 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 286 469 0,000900992583454052 0,000874169860448787 0,000747692072938125 0,000732433051041428 0,000792966794556078 0,000759791456763343 36786 38097 623 665 0 True 286 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 331 470 0,000945030659489783 0,000898194215224488 0,000839246204318303 0,000747692072938125 0,000753175889773684 0,000783559618652525 38584 39144 623 665 0 True 330 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 375 468 0,000859648716741976 0,000858268353419598 0,000686655985351339 0,000701915007248035 0,000720726644691295 0,00073255148887891 35098 37404 623 665 0 True 374 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 419 468 0,00092599974453997 0,000924719672837392 0,000671396963454643 0,000656137941557946 0,000929825199115841 0,000922477474723456 37807 40300 623 665 0 True 418 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 463 470 0,000966584334079017 0,00102568162222907 0,000579842832074464 0,00064087891966125 0,00104820601544839 0,00108403969410239 39464 44700 623 665 0 True 463 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 508 468 0,000853035657493006 0,000977472291394543 0,000488288700694286 0,000671396963454643 0,000921105546046913 0,000948428462797437 34828 42599 623 665 0 True 507 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 551 469 0,000835204890332822 0,000918776685361837 0,000564583810177768 0,000595101853971161 0,000891718959402164 0,000942262910588041 34100 40041 623 665 0 True 551 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 595 469 0,000851566088771013 0,000924214863090434 0,000457770656900893 0,000579842832074464 0,000969295960659542 0,000944457550522102 34768 40278 623 665 0 True 595 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 640 469 0,000958942576724652 0,000867377874762438 0,000610360875867857 0,000518806744487678 0,000987892568028984 0,000887303791868342 39152 37801 623 665 0 True 640 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 243 514 0,000953456186829211 0,000931488712626152 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,000775136346891094 0,000742290495099302 38928 40595 623 665 0 True 241 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 287 514 0,000904715490883102 0,00088952066593584 0,000762951094834821 0,000717174029144732 0,000776114218881014 0,000770208379218971 36938 38766 623 665 0 True 286 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 331 514 0,000888256321196778 0,00094135544858943 0,000778210116731518 0,000839246204318303 0,00077236730562383 0,000801420167333887 36266 41025 623 665 0 True 330 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 375 513 0,00100447471429441 0,00103525006152369 0,000839246204318303 0,000854505226215 0,000842480066189396 0,000826916298986954 41011 45117 623 665 0 True 374 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 419 514 0,000940964852692268 0,00103024785584928 0,00064087891966125 0,00080872816052491 0,000940421965894339 0,000919336358182121 38418 44899 623 665 0 True 418 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 464 514 0,000846789990424535 0,000862559236268745 0,000473029678797589 0,000534065766384375 0,00095228959251107 0,000889768211132228 34573 37591 623 665 0 True 463 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 508 513 0,000798367701034858 0,000971391628533453 0,000457770656900893 0,000625619897764553 0,000860171352190768 0,000926191506859824 32596 42334 623 665 0 True 507 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 552 513 0,000911793913560703 0,000909185300169628 0,000610360875867857 0,000671396963454643 0,00092370903917042 0,000824106071421991 37227 39623 623 665 0 True 551 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 597 513 0,000763808343255984 0,000930272580053934 0,0004272526131075 0,00064087891966125 0,000816401456055177 0,000938048821597778 31185 40542 623 665 0 True 595 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 640 513 0,000899523014732059 0,000910722675308092 0,000488288700694286 0,000473029678797589 0,00098500435386075 0,000985399276099061 36726 39690 623 665 0 True 640 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 244 558 0,000808483232404578 0,000846772458727501 0,000671396963454643 0,000732433051041428 0,000648469266713336 0,000624765060238812 33009 36903 623 665 0 True 241 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 287 557 0,000879977750729549 0,000934242220336834 0,000717174029144732 0,000869764248111696 0,000727733695513054 0,000688134955071176 35928 40715 623 665 0 True 286 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 331 557 0,000988260472728417 0,000910906242488804 0,000930800335698482 0,000732433051041428 0,000758742345293771 0,000752377471045747 40349 39698 623 665 0 True 330 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 375 557 0,000957056630198094 0,000915724880982497 0,000778210116731518 0,000793469138628214 0,000739950859491357 0,000673730756264347 39075 39908 623 665 0 True 374 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 420 557 0,000913116525410496 0,000898721970869036 0,000671396963454643 0,000610360875867857 0,000923848585180596 0,00085996510146296 37281 39167 623 665 0 True 418 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 464 558 0,000878753110127888 0,000997366384604221 0,000442511635004196 0,000686655985351339 0,00100999826266899 0,00100571560098116 35878 43466 623 665 0 True 463 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 509 558 0,00087405049021751 0,000825983475511851 0,000457770656900893 0,000350957503624018 0,00101066910814177 0,000996324831531329 35686 35997 623 665 0 True 507 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 552 558 0,000930359465081884 0,000909736001711764 0,000564583810177768 0,000503547722590982 0,000928240021808459 0,000974033321679218 37985 39647 623 665 0 True 551 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 597 558 0,000881594276323742 0,000909208246067217 0,000595101853971161 0,000701915007248035 0,000807604300861139 0,00077095519162637 35994 39624 623 665 0 True 595 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 640 557 0,000972242173658691 0,000887363751562472 0,000671396963454643 0,000549324788281071 0,00094707264210437 0,00087825054058349 39695 38672 623 665 0 True 640 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 241 596 0,000887301101527482 0,000908496923241957 0,000793469138628214 0,00080872816052491 0,000633576691869032 0,000641049699661686 36227 39593 623 665 0 False 241 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 286 596 0,000834568077219958 0,000941791420643621 0,000686655985351339 0,000762951094834821 0,00068662753037825 0,000807711185807725 34074 41044 623 665 0 False 286 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 332 602 0,00101094081667118 0,000934999434957272 0,000854505226215 0,000823987182421607 0,000781381102795961 0,000768823443513886 41275 40748 623 665 0 True 330 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 376 602 0,000901849831875215 0,000930547930825003 0,000823987182421607 0,00080872816052491 0,000654157992802609 0,000696341673890894 36821 40554 623 665 0 True 374 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 418 596 0,000928889896359891 0,000852577770817522 0,000717174029144732 0,000564583810177768 0,000858612821537249 0,000821800040487815 37925 37156 623 665 0 False 418 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 463 596 0,000865208585073517 0,000867309037069671 0,000457770656900893 0,000442511635004196 0,000967877854466815 0,000928582244518565 35325 37798 623 665 0 False 463 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 507 596 0,000856464651177657 0,000822610428566266 0,000473029678797589 0,000244144350347143 0,000995364034605324 0,00100231248566321 34968 35850 623 665 0 False 507 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 551 596 0,00084355693923615 0,000913682696097075 0,0004272526131075 0,000534065766384375 0,000965572519600729 0,000964619494736056 34441 39819 623 665 0 False 551 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 595 596 0,0010273265079214 0,000844317247685476 0,00080872816052491 0,000595101853971161 0,000880149898698907 0,000776325045077214 41944 36796 623 665 0 False 595 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 639 596 0,000916839432839546 0,000954732906883827 0,000717174029144732 0,000778210116731518 0,000776289019720236 0,000785820666307375 37433 41608 623 665 0 False 639 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 243 645 0,00106073470353472 0,0672176435595741 0,000930800335698482 0,0679636835278859 0,00073283289042443 0,0232683273017734 43308 2929397 623 665 0 True 241 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 286 639 0,000917378274704277 0,000908634598627491 0,000778210116731518 0,000747692072938125 0,000711271719419679 0,00066876050737318 37455 39599 623 665 0 False 286 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 330 639 0,000943585583579823 0,000979491530382376 0,000839246204318303 0,000885023270008392 0,000729942445471525 0,000664886505277692 38525 42687 623 665 0 False 330 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 374 639 0,000914047252267759 0,000919717467162986 0,000854505226215 0,00080872816052491 0,000629373370661016 0,000666318759086254 37319 40082 623 665 0 False 374 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 418 639 0,000857468856471019 0,000875523668406539 0,000671396963454643 0,000656137941557946 0,00077589052801923 0,000768709951088185 35009 38156 623 665 0 False 418 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 462 639 0,000886149939361921 0,000907303736567328 0,000671396963454643 0,000625619897764553 0,000827358164055896 0,000884374453328642 36180 39541 623 665 0 False 462 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 507 639 0,000858154655207949 0,00083302786607168 0,000503547722590982 0,000457770656900893 0,000886634394312142 0,000928536765904664 35037 36304 623 665 0 False 507 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 551 639 0,000899572000356125 0,000794800000688377 0,000610360875867857 0,000488288700694286 0,000894916625870518 0,000817915796036378 36728 34638 623 665 0 False 551 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 595 639 0,000888966612745741 0,000908152734778122 0,000701915007248035 0,000778210116731518 0,000756096456475258 0,000684855452656847 36295 39578 623 665 0 False 595 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 641 646 0,000992130337029666 0,0701189687425247 0,000839246204318303 0,0697032120241093 0,000727328352550657 0,0201513235394195 40507 3055839 623 665 0 True 639 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E9_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E9_1.csv new file mode 100755 index 0000000..7193b7a --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E9_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 254 277 0,0109849172461149 0,0470997819566082 0,0108491645685512 0,046845197222858 0,00221784458289707 0,00741160913825662 480171 2052645 667 665 0 True 253 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 298 277 0,0104930597187101 0,0103731978148622 0,010452429999237 0,0103761348897536 0,00136610751781251 0,00129309045795265 458671 452072 667 665 0 False 298 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 343 277 0,0116118640153487 0,0636154129888695 0,0106965743495842 0,0626230258640421 0,00644963839161487 0,00897362368226141 507576 2772409 667 665 0 True 342 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 387 277 0,0107671959396818 0,115701476166957 0,0107118333714809 0,113176165407797 0,00132699426310504 0,0281902890517296 470654 5042360 667 665 0 True 386 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 431 277 0,0106844037354177 0,0741015505116648 0,0106355382619974 0,0718852521553368 0,00163825297138219 0,0114183506961742 467035 3229403 667 665 0 True 430 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 475 278 0,0105632923982047 0,0718238489333886 0,0105592431525139 0,0737621118486305 0,00177860397864215 0,0206757764589813 461741 3130139 667 665 0 True 475 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 519 277 0,0104650810323838 0,0817258068494651 0,0105134660868238 0,0792706187533379 0,0016638215300557 0,0208387853457271 457448 3561674 667 665 0 True 519 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 563 277 0,0105990492965923 0,0706294461261875 0,0106507972838941 0,0681620508125429 0,00186375089557799 0,017045335430065 463304 3078086 667 665 0 True 563 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 608 277 0,0105477817282707 0,0105292528643651 0,0106202792401007 0,010605020218204 0,0019192192869487 0,00193488854717334 461063 458873 667 665 0 False 608 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 652 277 0,0106952246010206 0,0470594660145443 0,0106813153276875 0,047348744945449 0,00183428602939637 0,00847165325292581 467508 2050888 667 665 0 True 652 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 253 321 0,0108330362170711 0,010695243487524 0,0108033875028611 0,0107423514152743 0,00156155438320845 0,0014112499817647 473532 466107 667 665 0 False 253 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 298 321 0,0106835115287401 0,010716514334589 0,0107118333714809 0,0107270923933776 0,00134481860691382 0,00128210818343208 466996 467034 667 665 0 False 298 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 343 321 0,0105707960851344 0,133794064011023 0,0105134660868238 0,133562218661784 0,00134799031601696 0,0411065269752237 462069 5830849 667 665 0 True 342 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 387 322 0,0106846782605493 0,0552173062548796 0,0107118333714809 0,0538643472953384 0,00147705305653564 0,00793486541772632 467047 2406413 667 665 0 True 386 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 431 321 0,0108445662725973 0,0812569533240288 0,0108796826123445 0,0791485465781643 0,0017205023229706 0,0138602398152606 474036 3541241 667 665 0 True 430 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 476 322 0,0104357525974939 0,0430855807405903 0,0104219119554437 0,0443884946974899 0,0016312192263848 0,00660940110642541 456166 1877703 667 665 0 True 475 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 519 321 0,0105029883776354 0,0480016016236517 0,010605020218204 0,0505073624780652 0,00161222254272593 0,00901213076317871 459105 2091947 667 665 0 True 519 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 563 322 0,0106104192124583 0,0570492608265915 0,010605020218204 0,0559395742732891 0,00167143584953836 0,0131474700027388 463801 2486251 667 665 0 True 563 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 608 321 0,0103866812302249 0,0102941950894632 0,0103608758678569 0,0103608758678569 0,00210976145752744 0,00215115736308945 454021 448629 667 665 0 False 608 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 652 321 0,010394985615455 0,0104164049400223 0,0104371709773404 0,0103913939116503 0,00196303826312471 0,00176814114179753 454384 453955 667 665 0 False 652 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 255 367 0,010772892336162 0,052910371603075 0,0107881284809644 0,0517128252079042 0,0015483006749332 0,00904129925764527 470903 2305875 667 665 0 True 253 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 299 367 0,0106655072555277 0,0649138066039441 0,0107423514152743 0,0667277027542535 0,00141462049234545 0,0159444718526454 466209 2828994 667 665 0 True 298 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 343 366 0,0105995983468554 0,0438297850370949 0,0106355382619974 0,0434119172961013 0,00143796523204001 0,00855923145909204 463328 1910136 667 665 0 True 342 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 387 366 0,0105979283189717 0,0376998114420866 0,0105439841306172 0,0376440070191501 0,00134963390491316 0,00612611744594905 463255 1642987 667 665 0 True 386 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 431 366 0,0109487714371242 0,072924999612788 0,0109407186999313 0,0703288319218738 0,00163346319245877 0,0111432469644995 478591 3178128 667 665 0 True 430 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 475 365 0,0107906220842428 0,0392857171539515 0,0108491645685512 0,0379797055008774 0,00185952549872586 0,00910366033674899 471678 1712102 667 665 0 True 475 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 519 365 0,0105536611415052 0,0292690068040323 0,0105592431525139 0,0293888761730373 0,00172005410018537 0,00271379963834418 461320 1275566 667 665 0 True 519 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 564 366 0,0105572985994986 0,0537617102954227 0,0105592431525139 0,0542763408865492 0,00179142994777775 0,00886343490675373 461479 2342977 667 665 0 True 563 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 608 366 0,0103565978512232 0,0566790746607879 0,0104676890211337 0,0556954299229419 0,00200757605017022 0,0121456110745809 452706 2470118 667 665 0 True 608 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 652 366 0,0104639371776689 0,0648022436498663 0,010452429999237 0,0657358663309682 0,00186101868429458 0,0177327817448931 457398 2824132 667 665 0 True 652 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 256 411 0,0105593575379854 0,0469248424333895 0,010452429999237 0,0470283054856184 0,00161051386673599 0,0117035238756863 461569 2045021 667 665 0 True 253 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 299 410 0,0104279743854326 0,0353917294954025 0,0103150988021668 0,0336461432822156 0,00152363426673694 0,00624847933388856 455826 1542399 667 665 0 True 298 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 343 410 0,0106491958872932 0,0857017572542021 0,0106813153276875 0,0824292362859541 0,00139502563969086 0,015143093365543 465496 3734949 667 665 0 True 342 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 387 410 0,0108087864971154 0,0674273690635378 0,0107881284809644 0,066300450141146 0,00154011252866533 0,0136102289349508 472472 2938537 667 665 0 True 386 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 431 410 0,0109330091191529 0,0442732145080027 0,0108644235904479 0,0453650720988785 0,00189824766619685 0,00629811565118597 477902 1929461 667 665 0 True 430 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 475 411 0,0108148946812929 0,0558685796661487 0,0108796826123445 0,055390249485008 0,00179281522463375 0,0105914270359422 472739 2434796 667 665 0 True 475 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 519 410 0,0107014929248582 0,0428038969017875 0,0107270923933776 0,0433966582742046 0,00181117251239931 0,0047059914992571 467782 1865427 667 665 0 True 519 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 564 410 0,0106434079824359 0,0535198375889369 0,0106355382619974 0,0525215533684291 0,00177078896145758 0,00892365305452784 465243 2332436 667 665 0 True 563 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 608 410 0,0104206537152573 0,0450703779361427 0,010452429999237 0,0441138323033494 0,00188879016499072 0,00983223083849455 455506 1964202 667 665 0 True 608 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 653 410 0,010566929856198 0,0833249752901365 0,0104371709773404 0,0790264744029908 0,00201786025239605 0,0165621839673887 461900 3631367 667 665 0 True 652 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 255 455 0,0104896510316597 0,0426789335435178 0,0104829480430304 0,0426337071793698 0,00170428677892121 0,00560823950104216 458522 1859981 667 665 0 True 253 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 299 455 0,0103462802816948 0,0554820789671593 0,0102998397802701 0,0543678950179294 0,00150049820569313 0,00696385880045114 452255 2417952 667 665 0 True 298 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 343 455 0,0106335479547935 0,0378516215005355 0,0105745021744106 0,0373540856031128 0,001654003698638 0,00531832074303234 464812 1649603 667 665 0 True 342 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 387 454 0,0108900001818729 0,0546313139222513 0,010955977721828 0,0535439078355077 0,00169570588750339 0,00933349457658422 476022 2380875 667 665 0 True 386 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 431 454 0,0111317653144131 0,0936369763961288 0,0112153810940719 0,0929427023727779 0,00187058063145708 0,0123233177726549 486590 4080772 667 665 0 True 430 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 476 455 0,0108458931440666 0,0614340612345696 0,0108339055466545 0,061173418783856 0,00203712805503221 0,0125102723356324 474094 2677344 667 665 0 True 475 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 520 455 0,0106054548829957 0,0562499634299757 0,010605020218204 0,0546578164339666 0,0018150530665237 0,0108708470506631 463584 2451417 667 665 0 True 519 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 563 451 0,0104372853628118 0,0301946213668756 0,0104371709773404 0,0312962539101244 0,00177613586453931 0,00539225573360398 456233 1315905 667 665 0 False 563 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 608 454 0,0104269220390949 0,0414820066875819 0,010452429999237 0,0415960936903944 0,00176936158309486 0,00584274190462508 455780 1807818 667 665 0 True 608 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 652 454 0,0112324245293238 0,0668069349386283 0,0106507972838941 0,0666361486228733 0,0046504155641419 0,0106677400269375 490990 2911498 667 665 0 True 652 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 254 499 0,0102030239172014 0,0575568240812606 0,0101472495613031 0,0585946440833143 0,00157710726659018 0,0138671808655246 445993 2508371 667 665 0 True 253 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 299 498 0,0105796495206276 0,0588720829310631 0,0106202792401007 0,0572365911345083 0,00155737619126484 0,00904540305226825 462456 2565691 667 665 0 True 298 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 342 498 0,0105584882084021 0,0710354967299228 0,0105592431525139 0,0684519722285802 0,00160324171939586 0,0178029512175196 461531 3095782 667 665 0 True 342 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 387 498 0,0113383912301117 0,0861807299204753 0,0110322728313115 0,0819256885633631 0,00235223299265478 0,0168086416154147 495622 3755823 667 665 0 True 386 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 431 498 0,0109276101248986 0,0967080323835453 0,0108949416342412 0,092637521934844 0,001843174875863 0,0292249490034517 477666 4214611 667 665 0 True 430 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 475 499 0,0109155310191094 0,0447061806496098 0,0107881284809644 0,0457312886243992 0,00195757237893512 0,00496702127640406 477138 1948330 667 665 0 True 475 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 520 497 0,0103926292747423 0,0420564572337229 0,0103456168459602 0,0433813992523079 0,00175045747279884 0,00612276376072842 454281 1832853 667 665 0 True 519 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 563 498 0,0105197344106615 0,097935729688148 0,0106202792401007 0,0947737850003815 0,00189728349851539 0,0181020998744896 459837 4268115 667 665 0 True 563 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 607 499 0,0103999956991063 0,0654340589399798 0,0103608758678569 0,0659342336156252 0,00184351378861016 0,0189522702300506 454603 2851667 667 665 0 True 608 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 651 498 0,0104832683223506 0,0772799474080027 0,0103608758678569 0,073685816739147 0,00180552940705948 0,0121150104956506 458243 3367920 667 665 0 True 652 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 254 543 0,0104446975413644 0,0589797909743459 0,0103303578240635 0,0612649729152361 0,00163857927847259 0,0136041016609002 456557 2570385 667 665 0 True 253 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 298 542 0,0106025723691141 0,118257557374783 0,0104982070649271 0,114824139772641 0,00167455874512169 0,0345354617051404 463458 5153756 667 665 0 True 298 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 343 543 0,0105215645782053 0,0576508334236828 0,0104982070649271 0,0580453192950332 0,00145331170108836 0,0116232335015005 459917 2512468 667 665 0 True 342 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 386 543 0,0107634669733112 0,0582727360860379 0,0107881284809644 0,0567940794995041 0,00153263604497408 0,00988835084146458 470491 2539571 667 665 0 True 386 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 431 542 0,0109563666324311 0,0590673984113408 0,0109102006561379 0,0574807354848554 0,00188205245166072 0,0100996287143059 478923 2574203 667 665 0 True 430 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 475 543 0,0107132746284217 0,060149687562922 0,010757610437171 0,0607461661707485 0,00195183115111988 0,0117899233249752 468297 2621370 667 665 0 True 475 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 519 543 0,0106204165026665 0,0700196130059642 0,0106507972838941 0,0687418936446174 0,00186999899304044 0,0151936576958287 464238 3051509 667 665 0 True 519 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 563 542 0,0104766797191928 0,0588712568787499 0,0105287251087205 0,0585641260395209 0,00181617119298965 0,0130947091125281 457955 2565655 667 665 0 True 563 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 608 542 0,0102280743354576 0,0459881679479082 0,0102845807583734 0,0440680552376593 0,00179951127248113 0,00757130735810945 447088 2004200 667 665 0 True 608 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 651 543 0,010364261677813 0,0673967821820516 0,0103761348897536 0,0684977492942702 0,00188905579380584 0,0141121265146666 453041 2937204 667 665 0 True 652 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 255 587 0,01021121391696 0,0466704642127177 0,0102082856488899 0,0484168764782177 0,00134127738975755 0,00932565437266669 446351 2033935 667 665 0 True 253 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 298 587 0,0101980595877387 0,0511312614335105 0,0102693217364767 0,0523537041275654 0,00145206614071018 0,0101573114303832 445776 2228340 667 665 0 True 298 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 343 586 0,0104966971767035 0,0508069900087825 0,0104982070649271 0,0498970016021973 0,00146690282904842 0,0113742151472387 458830 2214208 667 665 0 True 342 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 387 586 0,0106638372276439 0,0491574553229033 0,010605020218204 0,0485084306095979 0,0015787129812043 0,00565651593958827 466136 2142320 667 665 0 True 386 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 432 586 0,0108815814111713 0,0841874656887125 0,0108644235904479 0,0791790646219577 0,00197433307784686 0,0175960819677324 475654 3668955 667 665 0 True 430 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 476 587 0,0105812737943228 0,0591967444360501 0,0106202792401007 0,0586251621271077 0,00202484998459107 0,0102087062826483 462527 2579840 667 665 0 True 475 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 520 587 0,010522159382657 0,0528161328016769 0,0104829480430304 0,0525062943465324 0,00209654969720762 0,00699378706839898 459943 2301768 667 665 0 True 519 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 564 585 0,0103409041645348 0,0365010718602411 0,0104219119554437 0,0379034103913939 0,00175681180667984 0,00637802408567402 452020 1590745 667 665 0 True 563 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 608 587 0,0103844163978894 0,0478026606915549 0,0103913939116503 0,048050659952697 0,00158855969143576 0,00676456441332098 453922 2083277 667 665 0 True 608 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 652 586 0,0103677389961462 0,053828689370485 0,0103456168459602 0,0527962157625696 0,00162301336202071 0,00677134730682094 453193 2345896 667 665 0 True 652 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 253 624 0,0106766026462621 0,00983208765791797 0,0101625085831998 0,00988784618905928 0,0033705423984953 0,00137747778399939 466694 428490 667 665 0 False 253 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 298 624 0,0105170577906286 0,00994055291582125 0,01025406271458 0,00993362325474937 0,00278423601379106 0,00129028431807215 459720 433217 667 665 0 False 298 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 343 631 0,0101872158450415 0,0727208958537337 0,0101777676050965 0,071473258564126 0,00131060123200559 0,0110502103659162 445302 3169233 667 665 0 True 342 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 387 630 0,0103353221535261 0,072050783860544 0,0103150988021668 0,0699626153963531 0,00138907588146796 0,0174792463943183 451776 3140029 667 665 0 True 386 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 430 624 0,0106483265577099 0,0104315951242262 0,010406652933547 0,0104676890211337 0,00257336105660356 0,00173062041212002 465458 454617 667 665 0 False 430 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 475 624 0,0104544889377239 0,0101157218980158 0,0102388036926833 0,0101930266269932 0,00232484978116355 0,00191827163599281 456985 440851 667 665 0 False 475 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 519 624 0,0104372396086232 0,0100676731884644 0,0102388036926833 0,0100862134737163 0,00288906152924441 0,00190666823266822 456231 438757 667 665 0 False 519 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 563 624 0,0101538610415552 0,0100633823056153 0,0101167315175097 0,0100709544518196 0,00178236458470903 0,00181636277744891 443844 438570 667 665 0 False 563 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 608 624 0,0102245283858414 0,010258697785893 0,0101167315175097 0,0102082856488899 0,00172461555463442 0,00147768702338457 446933 447082 667 665 0 False 608 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 652 624 0,0102697106470798 0,0103570897947547 0,01025406271458 0,0102998397802701 0,00144994725477876 0,00145099706320649 448908 451370 667 665 0 False 652 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 257 674 0,00992115523835702 0,0444843856035144 0,00990310521095598 0,045136186770428 0,00133400737097895 0,00835654082469343 433672 1938664 667 665 0 True 253 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 298 668 0,0098147996269661 0,0101081038600163 0,0098115510795758 0,010101472495613 0,00133007718841509 0,00126166687057517 429023 440519 667 665 0 False 298 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 342 668 0,0108943468297895 0,00994023167325501 0,0100556954299229 0,00994888227664607 0,00519419001479075 0,00125852590865794 476212 433203 667 665 0 False 342 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 386 668 0,0105992780675352 0,0100489952278269 0,0100862134737163 0,0100862134737163 0,00353463468401966 0,00130861166828135 463314 437943 667 665 0 False 386 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 430 668 0,0100454236145832 0,0102055091952816 0,0100556954299229 0,0102082856488899 0,00155837082537608 0,00149528638653771 439104 444764 667 665 0 False 430 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 475 668 0,00995652322614156 0,0100986730961072 0,00993362325474937 0,0100556954299229 0,00166295356475523 0,00134046728556667 435218 440108 667 665 0 False 475 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 519 668 0,0101304120198999 0,00961322968671392 0,00991836423285267 0,00959792477302205 0,00257283476377834 0,00169250351957618 442819 418952 667 665 0 False 519 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 563 668 0,0100373251232017 0,00975402571432013 0,0100862134737163 0,0097962920576791 0,00160553836722871 0,0016524855363448 438750 425088 667 665 0 False 563 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 608 668 0,0100278082519738 0,00995136043358568 0,0100099183642329 0,00997940032043946 0,00136669920741648 0,00146710024426947 438334 433688 667 665 0 False 608 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 654 674 0,0101029823838367 0,045058078935035 0,0101625085831998 0,0453803311207752 0,00149102501301467 0,00785520322138842 441620 1963666 667 665 0 True 652 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E9_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E9_2.csv new file mode 100755 index 0000000..12bfdde --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E9_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 254 277 0,00874321365295837 0,73043707919375 0,0085297932402533 0,719279774166476 0,00194504491479048 0,16090631331042 382182 31833014 667 665 8 True 253 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 298 277 0,00707288836698611 0,00700896209395083 0,00701915007248035 0,00701915007248035 0,00141292656789168 0,00121630579361526 309169 305456 667 665 0 False 298 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 343 277 0,00699204071573735 0,00667129026503085 0,00668345159075303 0,00662241550316625 0,00245131187705116 0,00132706516870146 305635 290740 667 665 0 True 342 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 387 277 0,0067556059461686 0,00669343305620426 0,00675974670023652 0,00657663843747616 0,00126524476374158 0,00124949279203647 295300 291705 667 665 0 True 386 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 431 277 0,00690684641657198 0,00716939980989324 0,00689707789730678 0,00694285496299687 0,00149021217359353 0,00279222817743975 301911 312448 667 665 0 True 430 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 475 278 0,00699018767109922 0,0069244064613353 0,00704966811627375 0,00695811398489357 0,00159554762478958 0,00171027016311912 305554 301771 667 665 0 True 475 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 519 277 0,00718301869893618 0,00721832046355302 0,00715648126955062 0,00721751735713741 0,00152653879603381 0,00159044701346664 313983 314580 667 665 0 True 519 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 563 277 0,00755360474946779 0,00749855871080769 0,00756847486076143 0,00746166170748455 0,00169260136992328 0,00147227131269353 330182 326793 667 665 0 True 563 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 608 277 0,00836963070307373 0,00818145156895443 0,00840772106507973 0,00820935378042268 0,00203190090322017 0,00178170407698486 365852 356554 667 665 0 False 608 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 652 277 0,00950874985944885 0,739080844707328 0,009399557488365 0,736736095216297 0,00200535305579453 0,177703728282275 415645 32209716 667 665 11 True 652 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 253 321 0,00723890744030594 0,00727274813263417 0,0072327763790341 0,00727855344472419 0,00158879554935354 0,00135308441948573 316426 316952 667 665 0 False 253 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 298 321 0,00686354007706607 0,00675024709863466 0,00689707789730678 0,00679026474402991 0,00133675220461975 0,00122106650268976 300018 294181 667 665 0 False 298 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 343 321 0,00680108560963281 0,00690189653580048 0,00679026474402991 0,00692759594110018 0,00120980482616436 0,00135655092591145 297288 300790 667 665 0 True 342 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 387 322 0,00701073130177873 0,00692284614029925 0,00700389105058366 0,00685130083161669 0,00129338319030684 0,00120655805355206 306452 301703 667 665 0 True 386 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 431 321 0,0071414510185969 0,00716510892704409 0,00706492713817044 0,00718699931334401 0,00151614178573963 0,00171027174549007 312166 312261 667 665 0 True 430 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 476 322 0,00727686053974615 0,00735964424680378 0,00737010757610437 0,00737010757610437 0,0017130771026309 0,00158653593549839 318085 320739 667 665 0 True 475 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 519 321 0,00742455506053336 0,00754171994417263 0,00750743877317464 0,00764476997024491 0,00150588864776017 0,0015777340594907 324541 328674 667 665 0 True 519 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 563 322 0,00755815729123307 0,00771328642044571 0,00755321583886473 0,007690547035935 0,00179892366970487 0,00144484767726335 330381 336151 667 665 0 True 563 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 608 321 0,00798758322829887 0,00788310900850203 0,00799572747386892 0,00784313725490196 0,00192044021019362 0,0020014355848895 349152 343552 667 665 0 False 608 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 652 321 0,0080590283937912 0,00772677860822805 0,0081177996490425 0,00776684214541848 0,00194665281086406 0,00181189027189698 352275 336739 667 665 0 False 652 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 255 367 0,00685054588750486 0,0066801703273978 0,00685130083161669 0,00674448767833982 0,00149123148258107 0,00157940010381658 299450 291127 667 665 0 True 253 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 299 367 0,00676562611347107 0,00656544083945272 0,00677500572213321 0,00650034332799268 0,00134009222869283 0,00132250032399508 295738 286127 667 665 0 True 298 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 343 366 0,00678793128041152 0,0069267010510942 0,0068055237659266 0,00697337300679027 0,00127591363506274 0,00136342580357309 296713 301871 667 665 0 True 342 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 387 366 0,0071240644269305 0,00714932214950285 0,00708018616006714 0,00717174029144732 0,00139049958402437 0,00133932587182004 311406 311573 667 665 0 True 386 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 431 366 0,00738273573215681 0,00735338001676198 0,00740062561989776 0,00738536659800107 0,00163978596409942 0,00164123529624544 322713 320466 667 665 0 True 430 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 475 365 0,00727917112627024 0,00749440550334408 0,00735484855420768 0,00750743877317464 0,00160548005717715 0,0016524864953894 318186 326612 667 665 0 True 475 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 519 365 0,00729717539948268 0,00725299171481003 0,0072632944228275 0,00730907148851759 0,00171099864339968 0,00173384451235356 318973 316091 667 665 0 True 519 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 564 366 0,00741892729533608 0,00753222034257078 0,00740062561989776 0,00749217975127794 0,00174886942754113 0,00169889724322711 324295 328260 667 665 0 True 563 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 608 366 0,00740693969792398 0,00746485118724942 0,00743114366369116 0,00756847486076143 0,00198542584703439 0,00197440221700486 323771 325324 667 665 0 True 608 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 652 366 0,00684505538487337 0,00706579908227883 0,00685130083161669 0,00708018616006714 0,00186363630073549 0,0018664543442294 299210 307933 667 665 0 True 652 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 256 411 0,00630648283091231 0,00641824290641917 0,0063782711528191 0,00646982528419928 0,00144959501735626 0,0014918226755692 275668 279712 667 665 0 True 253 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 299 410 0,00656684704111666 0,00667707263122329 0,00663767452506294 0,00671396963454643 0,00129979444467667 0,00136783531004585 287049 290992 667 665 0 True 298 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 343 410 0,00684864708867814 0,00685756506165849 0,00685130083161669 0,00679026474402991 0,00135827281151262 0,00121848059449776 299367 298858 667 665 0 True 342 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 387 410 0,00699789725187761 0,00694166177632224 0,00701915007248035 0,00697337300679027 0,00140626519387392 0,0014971812673758 305891 302523 667 665 0 True 386 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 431 410 0,00707487867419003 0,00707256812206759 0,00711070420386053 0,00714122224765393 0,00164335915325551 0,00146358179374629 309256 308228 667 665 0 True 430 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 475 411 0,00717800861528494 0,00718667807077777 0,00720225833524071 0,0072327763790341 0,0015553468201897 0,00144776766964214 313764 313201 667 665 0 True 475 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 519 410 0,00708098685836757 0,00695363953486371 0,00711070420386053 0,00695811398489357 0,00162961267301951 0,00174481330396783 309523 303045 667 665 0 True 519 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 564 410 0,0069142814722188 0,00690733471352907 0,00692759594110018 0,00691233691920348 0,0017711898448327 0,00156162032552297 302236 301027 667 665 0 True 563 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 608 410 0,00656128790720227 0,006508030203685 0,00645456626230259 0,00651560234988937 0,00195309671339742 0,00186687998065324 286806 283625 667 665 0 True 608 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 653 410 0,00626274182661473 0,00619906369264888 0,00636301213092241 0,00614938582436866 0,00178902794615611 0,00176099542833938 273756 270160 667 665 0 True 652 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 255 455 0,00650151005980187 0,00639768338217941 0,00653086137178607 0,00648508430609598 0,00150981198069979 0,00149492934233133 284193 278816 667 665 0 True 253 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 299 455 0,00660596687236606 0,00681610182471514 0,00662241550316625 0,00685130083161669 0,0013961308949437 0,00140840468434117 288759 297051 667 665 0 True 298 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 343 455 0,00678317284479756 0,00678386283860257 0,00677500572213321 0,00679026474402991 0,00139225847472967 0,00145059618745825 296505 295646 667 665 0 True 342 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 387 454 0,00691629465651701 0,00717247456017017 0,00685130083161669 0,00717174029144732 0,00146704615979765 0,00155095609392443 302324 312582 667 665 0 True 386 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 431 454 0,00702571579854385 0,00721212507120399 0,00689707789730678 0,00715648126955062 0,00179135583431462 0,00194914518983754 307107 314310 667 665 0 True 430 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 476 455 0,00717270112940783 0,00719626945596998 0,00717174029144732 0,00715648126955062 0,00182985956763678 0,00192098399518138 313532 313619 667 665 0 True 475 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 520 455 0,00649158140087658 0,00695779274232732 0,00656137941557946 0,00691233691920348 0,00172015702598032 0,00168114887090793 283759 303226 667 665 0 True 519 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 563 451 0,00624158051438918 0,00619135387105897 0,00622568093385214 0,00619516289005875 0,00182258320382701 0,00182449568684188 272831 269824 667 665 0 False 563 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 608 454 0,00601482275570844 0,00601132035857554 0,00588998245212482 0,00593575951781491 0,00175007308410608 0,00179893239656218 262919 261978 667 665 0 True 608 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 652 454 0,00621518034756941 0,00608217729033043 0,00604257267109178 0,00621042191195544 0,00232889117354614 0,00201452689687827 271677 265066 667 665 0 True 652 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 254 499 0,00638826844302728 0,0064712479298498 0,0063935301747158 0,00650034332799268 0,00143575220585906 0,00141751046998769 279243 282022 667 665 0 True 253 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 299 498 0,00650587958481277 0,00652881918690065 0,00650034332799268 0,00651560234988937 0,00145705038219574 0,00158921767083481 284384 284531 667 665 0 True 298 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 342 498 0,00665538139604951 0,00688225484746428 0,00668345159075303 0,00679026474402991 0,00139210074521977 0,00145127699718775 290919 299934 667 665 0 True 342 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 387 498 0,00694516554952096 0,00691603120871531 0,00686655985351339 0,00688181887541009 0,00153817350099556 0,00146139093740789 303586 301406 667 665 0 True 386 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 431 498 0,00695731328659314 0,00732327499912519 0,00700389105058366 0,00727855344472419 0,00188436031134237 0,00177896533668648 304117 319154 667 665 0 True 430 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 475 499 0,00679673896171621 0,0068322786825154 0,00674448767833982 0,00683604180972 0,00187943299043596 0,00163446714322825 297098 297756 667 665 0 True 475 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 520 497 0,00629209313859893 0,00618841679616758 0,00628671702143893 0,00624093995574884 0,00168264095152359 0,00157454721735469 275039 269696 667 665 0 True 519 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 563 498 0,00587984789935085 0,00615732510493446 0,00588998245212482 0,00616464484626535 0,00174729706476219 0,0016618551119756 257019 268341 667 665 0 True 563 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 607 499 0,0058434504423229 0,00591265299894277 0,0059510185397116 0,00585946440833143 0,00166911879642136 0,00176140511893645 255428 257678 667 665 0 True 608 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 651 498 0,00593228219948163 0,00608988711192034 0,00588998245212482 0,00608834973678187 0,00178445190155024 0,00175891245756487 259311 265402 667 665 0 True 652 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 254 543 0,00666954231741991 0,00665708675442325 0,00671396963454643 0,00665293354695964 0,0014152686810893 0,00144269362946976 291538 290121 667 665 0 True 253 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 298 542 0,00669443259601602 0,00677259640288636 0,00660715648126955 0,00677500572213321 0,00139072825749137 0,00134572186730864 292626 295155 667 665 0 True 298 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 343 543 0,00669196186983185 0,00672149588895562 0,00675974670023652 0,00672922865644312 0,0014537082623113 0,00130647163838427 292518 292928 667 665 0 True 342 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 386 543 0,00658528597912076 0,00677913598369923 0,00660715648126955 0,00686655985351339 0,00146976668361643 0,00138498557795492 287855 295440 667 665 0 True 386 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 431 542 0,00664979938504083 0,00664731180205033 0,00665293354695964 0,00668345159075303 0,00176178547944641 0,00183706448345756 290675 289695 667 665 0 True 430 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 475 543 0,00654273458372668 0,00642893569469565 0,00659189745937285 0,00634775310902571 0,00187285976611689 0,00192874076493332 285995 280178 667 665 0 True 475 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 519 543 0,00614755565682483 0,00609766577120301 0,00616464484626535 0,00607309071488518 0,00181793508779832 0,00188084256196541 268721 265741 667 665 0 True 519 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 563 542 0,0060880980887446 0,00609105735269738 0,00604257267109178 0,00608834973678187 0,00164847703547875 0,00176790564534904 266122 265453 667 665 0 True 563 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 608 542 0,00603301004567526 0,00590537914940705 0,00605783169298848 0,00584420538643473 0,00161489767895634 0,00152533026450884 263714 257361 667 665 0 True 608 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 651 543 0,00613874797552014 0,00624793845451349 0,00611886778057527 0,00625619897764553 0,00176222291708663 0,0018438677245415 268336 272290 667 665 0 True 652 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 255 587 0,00665597620050126 0,00701125668370973 0,00669871061264973 0,00701915007248035 0,00126931638491189 0,00114534488246138 290945 305556 667 665 0 True 253 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 298 587 0,00668731781968938 0,00682509661657004 0,00671396963454643 0,00688181887541009 0,00138825761393889 0,00136557203310941 292315 297443 667 665 0 True 298 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 343 586 0,00669729223280326 0,00690478771889669 0,00672922865644312 0,00695811398489357 0,00140347416056374 0,00137486277718888 292751 300916 667 665 0 True 342 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 387 586 0,00660329025233321 0,00642051455028048 0,00656137941557946 0,00643930724040589 0,00131197394786747 0,0011861666699103 288642 279811 667 665 0 True 386 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 432 586 0,00655579740457077 0,00663570117787029 0,00654612039368277 0,00665293354695964 0,0016545450752861 0,0019004144276168 286566 289189 667 665 0 True 430 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 476 587 0,00647170120593171 0,00649267939819794 0,00648508430609598 0,00643930724040589 0,0018527096826769 0,00179158730002631 282890 282956 667 665 0 True 475 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 520 587 0,00628509274774378 0,00635979970525995 0,00624093995574884 0,00634775310902571 0,00182914805673382 0,00197644270239523 274733 277165 667 665 0 True 519 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 564 585 0,00614760141101342 0,00625390438788663 0,00614938582436866 0,00622568093385214 0,00168656430337093 0,00177482243365983 268723 272550 667 665 0 True 563 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 608 587 0,00610141255762597 0,00612696768242419 0,00607309071488518 0,00621042191195544 0,00151615333619667 0,00153185783344358 266704 267018 667 665 0 True 608 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 652 586 0,00631593107085734 0,00621457511941906 0,00631723506523232 0,00622568093385214 0,00149394828406365 0,00152540897225462 276081 270836 667 665 0 True 652 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 253 624 0,00688856761822797 0,00688133701156072 0,00688181887541009 0,00689707789730678 0,00137382133994434 0,00138661989339647 301112 299894 667 665 0 False 253 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 298 624 0,00668695178618061 0,00671660841276916 0,00669871061264973 0,00671396963454643 0,00140857792256485 0,00137447090128645 292299 292715 667 665 0 False 298 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 343 631 0,00647023707189665 0,00634392114412835 0,00654612039368277 0,0064087891966125 0,00136929874068251 0,00134241175314249 282826 276473 667 665 0 True 342 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 387 630 0,00629300822237085 0,00629545940842034 0,00631723506523232 0,00627145799954223 0,00125724951851682 0,00117131896115205 275079 274361 667 665 0 True 386 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 430 624 0,00644397416764266 0,00640149240117919 0,00634775310902571 0,00634775310902571 0,00161424944308754 0,00159008954016449 281678 278982 667 665 0 False 430 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 475 624 0,00641983883315838 0,00615408973337441 0,00650034332799268 0,00625619897764553 0,00175762002644819 0,00177855167476006 280623 268200 667 665 0 False 475 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 519 624 0,00623439710677964 0,00625514346635644 0,00610360875867857 0,00630197604333562 0,0019870613380475 0,00184515090613851 272517 272604 667 665 0 False 519 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 563 624 0,00616254015358995 0,00604142537621233 0,00617990386816205 0,00608834973678187 0,00156979312993467 0,001709191985875 269376 263290 667 665 0 False 563 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 608 624 0,00638499701854269 0,00618029394842106 0,00646982528419928 0,00622568093385214 0,00146402064607604 0,00128903215797117 279100 269342 667 665 0 False 608 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 652 624 0,00642654182178766 0,0064012629422033 0,00653086137178607 0,0063935301747158 0,00138900963401182 0,00140251053148568 280916 278972 667 665 0 False 652 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 257 674 0,00869947264866079 0,731095557616862 0,00839246204318303 0,739772640573739 0,00200551447096191 0,18717584523643 380270 31861711 667 665 10 True 253 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 298 668 0,00778756879285237 0,00698021088427179 0,00703440909437705 0,00695811398489357 0,00336666541067718 0,00134432110663924 340409 304203 667 665 0 False 298 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 342 668 0,00636994389049467 0,0063749439976687 0,0063935301747158 0,0064087891966125 0,00125183994590154 0,00122243738450694 278442 277825 667 665 0 False 342 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 386 668 0,00625196671520042 0,00624169717036927 0,00619516289005875 0,00630197604333562 0,00127149994860218 0,00127977467588543 273285 272018 667 665 0 False 386 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 430 668 0,0060989647085361 0,00627159567492776 0,00610360875867857 0,00624093995574884 0,00140116145336126 0,00131425520113194 266597 273321 667 665 0 False 430 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 475 668 0,00612746956803127 0,00627368375160836 0,00616464484626535 0,00627145799954223 0,00151177724283853 0,00143206395904327 267843 273412 667 665 0 False 475 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 519 668 0,00637680701878404 0,00620606219141353 0,00636301213092241 0,00616464484626535 0,00180736657595029 0,00164440578304221 278742 270465 667 665 0 False 519 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 563 668 0,00617864562797567 0,00612722008729767 0,00621042191195544 0,00616464484626535 0,00149883349591692 0,00151187198377894 270080 267029 667 665 0 False 563 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 608 668 0,00659880634185082 0,00647700735014465 0,00660715648126955 0,00650034332799268 0,0013478262011399 0,00133305873843256 288446 282273 667 665 0 False 608 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 654 674 0,00825929447727498 0,750672286116986 0,00825513084611276 0,755001144426642 0,00168378575984034 0,174845330802656 361029 32714880 667 665 12 True 652 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E9_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E9_3.csv new file mode 100755 index 0000000..055cff7 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_E9_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 254 277 0,000959854245456809 0,0726241559494984 0,000778210116731518 0,0712138551918822 0,000799997419263081 0,0176113111230118 41957 3165017 667 665 0 True 253 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 298 277 0,000921603743790728 0,000844638490251722 0,000793469138628214 0,000701915007248035 0,000673375442626718 0,000631521327154924 40285 36810 667 665 0 False 298 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 343 277 0,000904217152124327 0,000947321381962574 0,000793469138628214 0,000854505226215 0,000668597951780402 0,000679574943739844 39525 41285 667 665 0 True 342 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 387 277 0,000865600616949479 0,00105500647934783 0,000778210116731518 0,000915541313801785 0,000634053617437209 0,000698080548489252 37837 45978 667 665 0 True 386 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 431 277 0,000905589777782201 0,0010312574753432 0,000701915007248035 0,00080872816052491 0,000806333809631501 0,000874566933296745 39585 44943 667 665 0 True 430 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 475 278 0,000945121396728965 0,00102639294505433 0,000717174029144732 0,000701915007248035 0,000865063240502069 0,000959866669127945 41313 44731 667 665 0 True 475 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 519 277 0,0010599186559158 0,00097497118855734 0,000900282291905089 0,000793469138628214 0,000857382441687012 0,000835908580784534 46331 42490 667 665 0 True 519 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 563 277 0,000966671619557582 0,000935848433168066 0,000717174029144732 0,000701915007248035 0,00086096116482686 0,000820743987382348 42255 40785 667 665 0 True 563 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 608 277 0,00106627848813062 0,00107540538230447 0,000701915007248035 0,000778210116731518 0,00101923811906764 0,00100930623538119 46609 46867 667 665 0 False 608 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 652 277 0,001166525915344 0,0743618028821195 0,000839246204318303 0,073136491950866 0,00104123872073238 0,0201819033026112 50991 3240745 667 665 0 True 652 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 253 321 0,000972276507660567 0,000942250338595401 0,000793469138628214 0,000747692072938125 0,000746242877701599 0,000764370255059472 42500 41064 667 665 0 False 253 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 298 321 0,000908723939701012 0,000831742895806695 0,00080872816052491 0,000717174029144732 0,000681062852300131 0,000628110224973654 39722 36248 667 665 0 False 298 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 343 321 0,00093777784945934 0,000851040395679058 0,000854505226215 0,000671396963454643 0,000663211538309941 0,000663982756339128 40992 37089 667 665 0 True 342 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 387 322 0,000930571564755503 0,000922470974873668 0,000823987182421607 0,00080872816052491 0,000646644660461501 0,000626244679928461 40677 40202 667 665 0 True 386 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 431 321 0,00091929315726664 0,000857511138799161 0,000686655985351339 0,000595101853971161 0,000814468644342288 0,000812942298702457 40184 37371 667 665 0 True 430 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 476 322 0,000926499441970477 0,000967353150557786 0,000686655985351339 0,000793469138628214 0,000880158181124459 0,000826618992769129 40499 42158 667 665 0 True 475 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 519 321 0,00093647385508436 0,000939037912932939 0,000732433051041428 0,000686655985351339 0,000814624236064926 0,000879944616568977 40935 40924 667 665 0 True 519 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 563 322 0,00101787055659627 0,000976738022671694 0,000762951094834821 0,000823987182421607 0,000937584995569787 0,00072595346762647 44493 42567 667 665 0 True 563 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 608 321 0,00099648047342774 0,00105693393474531 0,000656137941557946 0,000701915007248035 0,00106793300934642 0,00113387256277364 43558 46062 667 665 0 False 608 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 652 321 0,00103139091932633 0,00101207470495878 0,00064087891966125 0,000717174029144732 0,00103576132783987 0,000923558726045625 45084 44107 667 665 0 False 652 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 255 367 0,000847573466642737 0,00095932208640163 0,000686655985351339 0,000793469138628214 0,000742783144339701 0,000823648367160532 37049 41808 667 665 0 True 253 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 299 367 0,000855168661949639 0,000858520758293078 0,000701915007248035 0,000701915007248035 0,0007181650273456 0,000698891345437541 37381 37415 667 665 0 True 298 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 343 366 0,00089733114674066 0,000959712166660643 0,000762951094834821 0,000823987182421607 0,000683059706572107 0,000755171002434425 39224 41825 667 665 0 True 342 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 387 366 0,0010403587402911 0,000901314857296595 0,000930800335698482 0,000778210116731518 0,0007379935759902 0,000647284314264466 45476 39280 667 665 0 True 386 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 431 366 0,000967357932386519 0,000913545020711541 0,000701915007248035 0,00064087891966125 0,000868046872527449 0,000858406061313354 42285 39813 667 665 0 True 430 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 475 365 0,00100048396492987 0,00100975716930229 0,000686655985351339 0,000701915007248035 0,00092785028762765 0,000947202957110658 43733 44006 667 665 0 True 475 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 519 365 0,00100151343417328 0,00100883933339873 0,000732433051041428 0,000762951094834821 0,000895310777079314 0,000918735797476826 43778 43966 667 665 0 True 519 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 564 366 0,000925126816312604 0,000969097038774551 0,000656137941557946 0,000701915007248035 0,000917199505353315 0,000911341412935449 40439 42234 667 665 0 True 563 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 608 366 0,00105280387958916 0,00110280278402575 0,000686655985351339 0,000701915007248035 0,00109962348455455 0,0011770027599207 46020 48061 667 665 0 True 608 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 652 366 0,000983920948658196 0,00100649885184465 0,000579842832074464 0,000656137941557946 0,00105349490146244 0,00103649477676178 43009 43864 667 665 0 True 652 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 256 411 0,000841922824351157 0,000872173567358543 0,000671396963454643 0,000747692072938125 0,000738865316517269 0,000780329371436823 36802 38010 667 665 0 True 253 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 299 410 0,000798776624505326 0,000857970056750941 0,00064087891966125 0,000732433051041428 0,00065930391614366 0,000690502598195577 34916 37391 667 665 0 True 298 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 343 410 0,000927506034119585 0,000948996432486572 0,000823987182421607 0,000854505226215 0,000696954763210199 0,000651880300657624 40543 41358 667 665 0 True 342 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 387 410 0,000855008522289553 0,000910332595049078 0,000671396963454643 0,000747692072938125 0,00069020048211505 0,000742410027650189 37374 39673 667 665 0 True 386 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 431 410 0,000915152403198721 0,000961914972829189 0,000686655985351339 0,000732433051041428 0,000810199926358863 0,00082341992252974 40003 41921 667 665 0 True 430 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 475 411 0,000979231144327127 0,00100925235955533 0,000747692072938125 0,000839246204318303 0,000900558485816428 0,000852479634959833 42804 43984 667 665 0 True 475 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 519 410 0,000972802680829418 0,000969165876467318 0,000686655985351339 0,000732433051041428 0,000929246242961807 0,000903796871361824 42523 42237 667 665 0 True 519 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 564 410 0,00104326413126694 0,00105626850371523 0,000823987182421607 0,00080872816052491 0,000934681076604919 0,000922030565010646 45603 46033 667 665 0 True 563 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 608 410 0,000998996953800509 0,000929584203126264 0,000625619897764553 0,000503547722590982 0,00107626671469989 0,00097595170580598 43668 40512 667 665 0 True 608 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 653 410 0,000973626256224142 0,000976669184978927 0,00064087891966125 0,000625619897764553 0,000964504825533363 0,000995531063971979 42559 42564 667 665 0 True 652 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 255 455 0,000885663828648733 0,000863086991913292 0,000747692072938125 0,000717174029144732 0,000750698759864536 0,000743262253783083 38714 37614 667 665 0 True 253 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 299 455 0,00094875885472233 0,00088298108512297 0,000839246204318303 0,000747692072938125 0,000756235738826267 0,000780552043490644 41472 38481 667 665 0 True 298 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 343 455 0,00091059986143344 0,000906454738356534 0,00080872816052491 0,000717174029144732 0,000714570819776222 0,000781058112204501 39804 39504 667 665 0 True 342 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 387 454 0,000974998881882016 0,000897505838296818 0,000823987182421607 0,000747692072938125 0,000792801432117058 0,000733377283585586 42619 39114 667 665 0 True 386 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 431 454 0,000910073688264588 0,000944820279125371 0,00064087891966125 0,000534065766384375 0,000881662111738693 0,00101210355794594 39781 41176 667 665 0 True 430 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 476 455 0,000952396312715695 0,0010208170919402 0,00064087891966125 0,000610360875867857 0,000951080096124755 0,00110274991781873 41631 44488 667 665 0 True 475 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 520 455 0,000908106258154969 0,000982061470912346 0,000579842832074464 0,000732433051041428 0,000938099073297414 0,000916386690889177 39695 42799 667 665 0 True 519 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 563 451 0,000927277263176606 0,000961456054877409 0,000579842832074464 0,000595101853971161 0,000979918968621884 0,00104337915224534 40533 41901 667 665 0 False 563 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 608 454 0,000908975587738289 0,000941011260125594 0,000534065766384375 0,000625619897764553 0,000933454889087874 0,000953879569911921 39733 41010 667 665 0 True 608 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 652 454 0,000846223718079161 0,000943282903986907 0,000473029678797589 0,000595101853971161 0,000867716652196136 0,00101731655741238 36990 41109 667 665 0 True 652 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 254 499 0,000891634750260484 0,000854206929546342 0,000747692072938125 0,000656137941557946 0,000736622301432205 0,000752831092014006 38975 37227 667 665 0 True 253 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 299 498 0,000870015896148973 0,000909529488633463 0,000671396963454643 0,000732433051041428 0,000826550686524594 0,000784509985665072 38030 39638 667 665 0 True 298 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 342 498 0,000978956619195552 0,000953860962775444 0,000823987182421607 0,00080872816052491 0,000812045610531638 0,000762734492770503 42792 41570 667 665 0 True 342 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 387 498 0,000952579329470078 0,000858612541883434 0,000793469138628214 0,000686655985351339 0,000819957574567243 0,000787823073766251 41639 37419 667 665 0 True 386 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 431 498 0,000933339693165548 0,000955421283811497 0,000579842832074464 0,000595101853971161 0,000963281540544882 0,00100727407326937 40798 41638 667 665 0 True 430 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 475 499 0,000943268352090835 0,000944957954510905 0,000610360875867857 0,000610360875867857 0,000947522670842739 0,000904711144616341 41232 41182 667 665 0 True 475 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 520 497 0,00094093488847245 0,000899249726513583 0,000625619897764553 0,00064087891966125 0,000921668415524346 0,000840063713689567 41130 39190 667 665 0 True 519 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 563 498 0,000893785197124486 0,000902576881663991 0,000579842832074464 0,000595101853971161 0,000928807910388764 0,000919972336143162 39069 39335 667 665 0 True 563 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 607 499 0,00100400703745175 0,000987407865050587 0,000732433051041428 0,000671396963454643 0,000930892716351979 0,000960971940815247 43887 43032 667 665 0 True 608 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 651 498 0,000988496367517775 0,000902921070127826 0,000656137941557946 0,000473029678797589 0,000948564411490122 0,000986707659725155 43209 39350 667 665 0 True 652 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 254 543 0,00081090148448321 0,0008962897057246 0,000701915007248035 0,000717174029144732 0,000639673325554513 0,000760623692772933 35446 39061 667 665 0 True 253 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 298 542 0,000925241201784093 0,000890782690303236 0,000823987182421607 0,000762951094834821 0,000749989668169104 0,000711556466429297 40444 38821 667 665 0 True 298 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 343 543 0,000858828997037302 0,00090679892682037 0,000732433051041428 0,000778210116731518 0,000694717938636559 0,000699847508143456 37541 39519 667 665 0 True 342 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 386 543 0,000887105085589501 0,000899249726513583 0,000732433051041428 0,000762951094834821 0,00074305596282355 0,000750846090342593 38777 39190 667 665 0 True 386 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 431 542 0,00089396821387887 0,000933966869565766 0,000564583810177768 0,000549324788281071 0,000941218020138627 0,001006292603255 39077 40703 667 665 0 True 430 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 475 543 0,000838559891489366 0,000897758243170297 0,000473029678797589 0,000518806744487678 0,000952020107737545 0,0010019402497492 36655 39125 667 665 0 True 475 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 519 543 0,000805205088003034 0,000880044010231576 0,0004272526131075 0,000411993591210803 0,000917421109605814 0,00100948249917827 35197 38353 667 665 0 True 519 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 563 542 0,000954935670182762 0,000906041712199932 0,000717174029144732 0,000579842832074464 0,000881443316991778 0,000904615108163888 41742 39486 667 665 0 True 563 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 608 542 0,000980146228099043 0,000926784803620404 0,000701915007248035 0,000686655985351339 0,000923049958518135 0,000822274434567651 42844 40390 667 665 0 True 608 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 651 543 0,000917074079119744 0,000951933507377967 0,000579842832074464 0,00064087891966125 0,00094646446660841 0,000989797517291686 40087 41486 667 665 0 True 652 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 255 587 0,00087157153856123 0,000909736001711764 0,000747692072938125 0,000793469138628214 0,000682273656288631 0,000617835268906405 38098 39647 667 665 0 True 253 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 298 587 0,00092462352023805 0,000969877199292578 0,000762951094834821 0,000854505226215 0,000733678960918924 0,000742910306789434 40417 42268 667 665 0 True 298 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 343 586 0,000953791815467867 0,00101866017756683 0,000793469138628214 0,000854505226215 0,000735579214923257 0,000813698859706668 41692 44394 667 665 0 True 342 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 387 586 0,000927734805062564 0,000953333207130897 0,000793469138628214 0,000823987182421607 0,00070641015614881 0,000657242387612237 40553 41547 667 665 0 True 386 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 432 586 0,000942261759941727 0,000950671483010571 0,00064087891966125 0,000503547722590982 0,000943503020626229 0,00104023381541496 41188 41431 667 665 0 True 430 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 476 587 0,000976142736596911 0,000939060858830528 0,000564583810177768 0,000595101853971161 0,00103580469913703 0,000951327632695267 42669 40925 667 665 0 True 475 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 520 587 0,000962119077792301 0,000899134997025638 0,000549324788281071 0,000473029678797589 0,0010249050117923 0,00104558428379568 42056 39185 667 665 0 True 519 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 564 585 0,000935558771312444 0,000842756926649423 0,00064087891966125 0,000473029678797589 0,000921729460991292 0,000892790357192237 40895 36728 667 665 0 True 563 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 608 587 0,000903324945446709 0,00088461024385179 0,000701915007248035 0,000671396963454643 0,000770999013853011 0,000778553894698344 39486 38552 667 665 0 True 608 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 652 586 0,000975639440522357 0,000954732906883827 0,000717174029144732 0,000732433051041428 0,000858563723823654 0,000812807466998826 42647 41608 667 665 0 True 652 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 253 624 0,000876238465798001 0,000891516959026084 0,000747692072938125 0,000732433051041428 0,000684909494255823 0,000693097929468925 38302 38853 667 665 0 False 253 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 298 624 0,00091625050372502 0,000876395612514922 0,00080872816052491 0,000778210116731518 0,00071449253218393 0,000646249631691488 40051 38194 667 665 0 False 298 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 343 631 0,000870770840260803 0,000903701230645852 0,000762951094834821 0,00080872816052491 0,000619808938912879 0,000698554270540278 38063 39384 667 665 0 True 342 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 387 630 0,000856312516664533 0,000893192009550083 0,000717174029144732 0,000732433051041428 0,000649066631867701 0,000639972303207762 37431 38926 667 665 0 True 386 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 430 624 0,000861482739975858 0,000849250615667115 0,000625619897764553 0,000564583810177768 0,000835107836097786 0,000812030205122576 37657 37011 667 665 0 False 430 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 475 624 0,000950222988757395 0,0009161379071391 0,000625619897764553 0,000473029678797589 0,000981518211764782 0,000970202549991765 41536 39926 667 665 0 False 475 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 519 624 0,00101887714874538 0,000883830083333764 0,000656137941557946 0,000473029678797589 0,00104843867225964 0,000948547184534412 44537 38518 667 665 0 False 519 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 563 624 0,000921283464470557 0,000967835014407155 0,000656137941557946 0,000625619897764553 0,000901259572246048 0,00093683916168486 40271 42179 667 665 0 False 563 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 608 624 0,000874431175348467 0,000964989723106117 0,000686655985351339 0,000793469138628214 0,000728156755452604 0,000720661747495703 38223 42055 667 665 0 False 608 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 652 624 0,000953814692562165 0,000943971280914578 0,000793469138628214 0,00080872816052491 0,000749531114965633 0,000770082972898784 41693 41139 667 665 0 False 652 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 257 674 0,00105536611415052 0,0734500476414199 0,000915541313801785 0,072983901731899 0,000755878386775993 0,0209883179087705 46132 3201010 667 665 0 True 253 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 298 668 0,000955233072408634 0,000979560368075143 0,000823987182421607 0,000885023270008392 0,000700168684967816 0,000690048590818383 41755 42690 667 665 0 False 298 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 342 668 0,000847893745962908 0,000903563555260318 0,000717174029144732 0,000762951094834821 0,000647966967802305 0,000698483252200219 37063 39378 667 665 0 False 342 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 386 668 0,000906070196762457 0,00090328820448925 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,00066022448098017 0,000638132967302612 39606 39366 667 665 0 False 386 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 430 668 0,000932401732299334 0,000900878885242403 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000806383020735722 0,000754362516388088 40757 39261 667 665 0 False 430 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 475 668 0,000908357906192246 0,000891539904923673 0,000671396963454643 0,000656137941557946 0,000800725868811276 0,000737565161122117 39706 38854 667 665 0 False 475 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 519 668 0,000890651035205675 0,000855446008016149 0,000579842832074464 0,000549324788281071 0,000889815524776223 0,000844371161589741 38932 37281 667 665 0 False 519 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 563 668 0,000918812738286384 0,00088135192639415 0,000701915007248035 0,000610360875867857 0,000785653833011483 0,000799936362386711 40163 38410 667 665 0 False 563 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 608 668 0,00100483061284647 0,00100014283821249 0,000915541313801785 0,000869764248111696 0,000693102309455707 0,00069758506516582 43923 43587 667 665 0 False 608 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 654 674 0,00106241225919428 0,0758296978426841 0,000915541313801785 0,074189364461738 0,000812977595416139 0,0203056589595283 46440 3304717 667 665 0 True 652 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F10_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F10_1.csv new file mode 100755 index 0000000..09a12ff --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F10_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 272 263 0,0104077551100885 0,046467163560079 0,0104676890211337 0,0465705348287175 0,00144636353574348 0,00854535526893922 424931 2025075 623 665 0 True 272 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 316 263 0,0102871280108248 0,0103254015101842 0,0102693217364767 0,0102693217364767 0,00129927883704551 0,00131720663672958 420006 449989 623 665 0 False 316 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 360 262 0,0105008767814388 0,062660381785317 0,0105439841306172 0,0637979705500877 0,00128941346302146 0,0103607066524796 428733 2730788 623 665 0 True 360 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 404 262 0,010448682598996 0,0816719298819261 0,0105287251087205 0,0802624551766232 0,00135235265733928 0,0118338485676475 426602 3559326 623 665 0 True 404 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 449 262 0,0107077430718713 0,0715652486675604 0,0106202792401007 0,0686198214694438 0,00245380330237763 0,0142575385476439 437179 3118869 623 665 0 True 448 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 491 262 0,0105903490237961 0,0714906056627033 0,0105745021744106 0,0706797894254978 0,00162878352689087 0,0257227694371557 432386 3115616 623 665 0 True 493 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 537 262 0,0106590758543613 0,0800172553149869 0,0107118333714809 0,0791485465781643 0,00161576666175074 0,0235987418617976 435192 3487214 623 665 0 True 537 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 581 262 0,0105794252296293 0,0714735109689995 0,0106202792401007 0,0701915007248035 0,00171630839674995 0,0195564058745207 431940 3114871 623 665 0 True 581 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 625 264 0,010472269176984 0,0103491275682913 0,0104982070649271 0,0103456168459602 0,00189462173308665 0,00180285225590943 427565 451023 623 665 0 False 625 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 668 262 0,0102891364214116 0,0462120281247867 0,0103761348897536 0,0462806134126802 0,001834910574645 0,00887451456853672 420088 2013956 623 665 0 True 669 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 272 306 0,0103022155830373 0,0102476378632551 0,0103150988021668 0,0102693217364767 0,00146034119707854 0,00152503988072251 420622 446600 623 665 0 False 272 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 316 306 0,0102748571119962 0,0104994002516018 0,0102693217364767 0,010452429999237 0,00130112931445825 0,00128428975859494 419505 457572 623 665 0 False 316 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 361 307 0,0105788863877646 0,106613523967851 0,0105287251087205 0,107881284809644 0,00132284491374424 0,0248832759500317 431918 4646300 623 665 0 True 360 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 404 306 0,010472293669796 0,0515980498281639 0,0104676890211337 0,0513771267261769 0,00137894644988175 0,00942587950809858 427566 2248683 623 665 0 True 404 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 449 306 0,0220378974831309 0,0783543202249157 0,0109407186999313 0,0763866636148623 0,0474824714064593 0,0163333852398033 899770 3414742 623 665 0 True 448 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 493 307 0,0104719507704275 0,0449623945420888 0,0104982070649271 0,0452124818799115 0,00166706315903019 0,0108989325273921 427552 1959496 623 665 0 True 492 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 536 307 0,0104613943684412 0,0486723561019739 0,0104829480430304 0,0487983520256352 0,00163352454771808 0,014256415856487 427121 2121179 623 665 0 True 537 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 581 306 0,01059172062127 0,0534983143369984 0,0106202792401007 0,0541695277332723 0,00181039730990151 0,0116926198368945 432442 2331498 623 665 0 True 581 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 625 307 0,0101764449932467 0,010021804339184 0,0101930266269932 0,0100404364080262 0,00199034846428882 0,00202167113968866 415487 436758 623 665 0 False 625 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 669 307 0,0101274838619923 0,0100388990328878 0,0101777676050965 0,0100709544518196 0,0019062139398137 0,00191792290554034 413488 437503 623 665 0 False 669 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 273 351 0,0104261737047374 0,0513295598804748 0,010406652933547 0,0506294346532387 0,00148219828936525 0,0111923479182557 425683 2236982 623 665 0 True 271 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 316 351 0,0105634804089957 0,0686270264812868 0,0105592431525139 0,0679484245059892 0,0014428045424715 0,0251843820552509 431289 2990819 623 665 0 True 316 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 360 351 0,0105462619621363 0,0404236959989812 0,0104982070649271 0,0409552147707332 0,00139170524254854 0,00815500957111447 430586 1761696 623 665 0 True 360 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 405 351 0,0104261492119254 0,0354462948398692 0,0103608758678569 0,0360418097199969 0,00143232401376503 0,00505834455236734 425682 1544777 623 665 0 True 404 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 449 350 0,0107094820615257 0,0706071886055262 0,0107728694590677 0,0679942015716793 0,00181826139237214 0,0135329663146027 437250 3077116 623 665 0 True 448 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 492 350 0,0106032077501136 0,032896913834139 0,0105745021744106 0,0339665827420462 0,00172520040616872 0,00525381220827908 432911 1433673 623 665 0 False 492 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 537 350 0,0102652314368671 0,0306158621548148 0,0103150988021668 0,0303196765087358 0,00162019791276355 0,00504006073586034 419112 1334263 623 665 0 True 537 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 581 351 0,0101891077770679 0,0536910828226437 0,0101472495613031 0,0523689631494621 0,00192528083603327 0,0118384806999786 416004 2339899 623 665 0 True 581 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 625 350 0,0101390934548961 0,0577112958638299 0,01025406271458 0,0587624933241779 0,00214196883222288 0,0139018046721349 413962 2515103 623 665 0 True 625 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 670 350 0,0101096530948321 0,0636797762316067 0,0101167315175097 0,0643625543602655 0,00202007050487844 0,0183042765945407 412760 2775214 623 665 0 True 669 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 273 395 0,010302019640541 0,0425660167814822 0,0103608758678569 0,0454566262302586 0,00155446177175692 0,00946341612084099 420614 1855060 623 665 0 True 271 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 317 395 0,0106791599602286 0,0334862792137129 0,0108033875028611 0,033173113603418 0,00139815906604108 0,0048107997496369 436012 1459358 623 665 0 True 316 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 361 395 0,0108228837812395 0,0884946401251469 0,0108033875028611 0,0864271000228885 0,00140090286176077 0,01961635265844 441880 3856665 623 665 0 True 360 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 405 394 0,0106702935622725 0,0685424708486712 0,0106965743495842 0,0664835584039063 0,00149508507371413 0,0183845513398127 435650 2987134 623 665 0 True 404 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 449 394 0,0108616803955001 0,0435737317658991 0,010955977721828 0,0447547112230106 0,00169162549550765 0,00804306353358428 443464 1898977 623 665 0 True 448 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 494 395 0,0108660891016661 0,0539964468277583 0,0109254596780346 0,0548714427405203 0,00168916523972241 0,0110290862051277 443644 2353207 623 665 0 True 492 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 537 394 0,0106393836334866 0,0425419006431161 0,0106202792401007 0,0430151827267872 0,00168921754993001 0,00630536206534827 434388 1854009 623 665 0 True 536 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 582 394 0,0104861076157827 0,0522240368602899 0,0103913939116503 0,0526436255436027 0,00192620398549039 0,00874594385678391 428130 2275964 623 665 0 True 581 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 626 394 0,0101579774129737 0,0435309606127931 0,0102082856488899 0,0434576943617914 0,00196074831889248 0,00905159968875676 414733 1897113 623 665 0 True 625 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 669 394 0,010232655996863 0,0828762223709881 0,0101930266269932 0,0790264744029908 0,00181491352883122 0,0161273603841354 417782 3611810 623 665 0 True 669 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 273 440 0,0105131721730794 0,0424948156612635 0,0104982070649271 0,0425879301136797 0,00163821909743409 0,0066505415083061 429235 1851957 623 665 0 True 271 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 317 438 0,0107552101415917 0,0583832435288266 0,0107423514152743 0,0592202639810788 0,00150466593068891 0,0120203936414289 439117 2544387 623 665 0 True 315 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 362 439 0,0107883244234606 0,0368721070242555 0,0108033875028611 0,0366369115739681 0,00148102059529287 0,00598195542741702 440469 1606915 623 665 0 True 360 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 405 438 0,0112062452751835 0,053882566338024 0,0110780498970016 0,0527809567406729 0,00184381723282116 0,0122517193330878 457532 2348244 623 665 0 True 404 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 449 438 0,0112869490908329 0,091063846386394 0,0110933089188983 0,0882887006942855 0,00224738267068254 0,0145901145381174 460827 3968633 623 665 0 True 448 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 494 439 0,0109967582538633 0,061232320902967 0,010955977721828 0,0603799496452277 0,0017940796631645 0,0145533611030017 448979 2668552 623 665 0 True 492 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 538 439 0,0105321051167811 0,0542729219478084 0,0104371709773404 0,0539864194705119 0,00173824552701909 0,010313705145531 430008 2365256 623 665 0 True 536 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 581 437 0,0105011462023711 0,0310615632695839 0,0105134660868238 0,0313420309758145 0,0019076230301545 0,00450261645356885 428744 1353687 623 665 0 False 581 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 626 438 0,0101744855682841 0,0437166158701859 0,01025406271458 0,0412756542305638 0,00184565331144643 0,01083612005734 415407 1905204 623 665 0 True 625 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 670 437 0,0104968599602653 0,0655511977471718 0,0104982070649271 0,0645761806668193 0,00187012214714674 0,00929668164333437 428569 2856772 623 665 0 True 669 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 272 483 0,0102866626473962 0,0527170753617851 0,0103303578240635 0,0539406424048219 0,00162390119608558 0,0155400676288188 419987 2297451 623 665 0 True 271 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 316 483 0,0105246837947351 0,0540094800975889 0,0105134660868238 0,0542305638208591 0,00162727417124062 0,00920891719932832 429705 2353775 623 665 0 True 315 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 360 483 0,0108179117403968 0,0668850886658165 0,0107270923933776 0,0659647516594186 0,00163923476083399 0,0171996264067727 441677 2914904 623 665 0 True 359 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 405 482 0,0110905167383265 0,0858472112990189 0,0111390859845884 0,0835126268406195 0,00177368917400604 0,0214154315052449 452807 3741288 623 665 0 True 404 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 448 482 0,0112222635742532 0,0931875809918479 0,0112458991378653 0,0926527809567407 0,00219103693033958 0,0341131421540831 458186 4061187 623 665 0 True 448 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 493 483 0,0107880060169042 0,0438020663928074 0,0109254596780346 0,0457618066681926 0,00188678469745096 0,00716053675301175 440456 1908928 623 665 0 True 492 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 537 481 0,0106222141722513 0,0392588016160796 0,0106507972838941 0,0409552147707332 0,00170265334859794 0,00611010953418754 433687 1710929 623 665 0 True 536 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 581 482 0,0104754777353603 0,0945576346450929 0,0105592431525139 0,0914930952925917 0,00189811997925304 0,0196130624718434 427696 4120895 623 665 0 True 580 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 625 482 0,0103531116464423 0,0603579445294399 0,0102998397802701 0,0624551766231785 0,00185991288370729 0,0165390993084073 422700 2630446 623 665 0 True 625 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 669 482 0,0101455105716488 0,0704295185204944 0,0100556954299229 0,0686655985351339 0,00200334205795207 0,0136423471998462 414224 3069373 623 665 0 True 669 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 272 528 0,0104660724955396 0,0517125728030307 0,010452429999237 0,0550240329594873 0,00147971020405079 0,0142420394675234 427312 2253674 623 665 0 True 271 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 317 527 0,0104925247325354 0,104797677416246 0,0105134660868238 0,0999008163576715 0,00147896424034547 0,0294426688794134 428392 4567164 623 665 0 True 315 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 360 527 0,0107508749138618 0,057285236437397 0,0107728694590677 0,058655680170901 0,00160838583246865 0,0162452756099196 438940 2496535 623 665 0 True 359 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 405 527 0,0109778253101617 0,0551807304941227 0,0110322728313115 0,0555275806820783 0,00164089762626265 0,00812771973331381 448206 2404819 623 665 0 True 404 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 449 526 0,0110692079918576 0,055017516324572 0,0110780498970016 0,0561837186236362 0,00199184526072101 0,00820931596466002 451937 2397706 623 665 0 True 448 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 493 527 0,0107172952685643 0,0585863606142846 0,0107270923933776 0,060517280842298 0,00193668389278609 0,0122883964531524 437569 2553239 623 665 0 True 492 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 537 527 0,0105179237786139 0,0718137068466543 0,0105745021744106 0,0701915007248035 0,00193117694389918 0,0210939387502148 429429 3129697 623 665 0 True 536 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 581 526 0,0104548058020043 0,0576406224992557 0,0104982070649271 0,0583199816891737 0,00177761278346265 0,0148747882901384 426852 2512023 623 665 0 True 580 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 626 527 0,0104419470756868 0,044726327147693 0,010452429999237 0,043228809033341 0,00183120712489524 0,00910559252658641 426327 1949208 623 665 0 True 624 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 670 526 0,0101836948656086 0,0636584824386441 0,0100709544518196 0,0638437476157778 0,00195008600636736 0,014075467352929 415783 2774286 623 665 0 True 669 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 273 572 0,0101307414059927 0,0446229099872593 0,0101472495613031 0,0459143968871595 0,00138605562060255 0,00974646113998135 413621 1944701 623 665 0 True 271 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 317 571 0,0104525279704852 0,0511380993109921 0,0104371709773404 0,0518196383611811 0,00142079000066928 0,0114180180052454 426759 2228638 623 665 0 True 315 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 361 571 0,0107240307918734 0,0504279926183047 0,0107270923933776 0,0499275196459907 0,00139902277913196 0,0115747424462589 437844 2197691 623 665 0 True 359 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 405 570 0,0108126947714337 0,0481875551777131 0,0108186465247578 0,0484473945220111 0,00156938038830515 0,00760496079009099 441464 2100051 623 665 0 True 403 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 449 570 0,0107256228246556 0,0826135147894915 0,010757610437171 0,080872816052491 0,00192620009839818 0,0217700495253694 437909 3600361 623 665 0 True 448 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 493 571 0,0107058326325327 0,0595569032446073 0,0107728694590677 0,0602121004043641 0,00206903805547248 0,0130482904290422 437101 2595536 623 665 0 True 492 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 537 571 0,0103696687873768 0,0540903873324878 0,0102388036926833 0,0543984130617227 0,00195068426230973 0,00904293347350318 423376 2357301 623 665 0 True 536 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 582 570 0,0101409059229865 0,0383775414732758 0,0101319905394064 0,0391393911650263 0,00171519586673815 0,00884920328992755 414036 1672523 623 665 0 True 580 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 626 570 0,0101492334790778 0,0473740542704897 0,010101472495613 0,0476691844052796 0,00168914509331696 0,00706166193354026 414376 2064598 623 665 0 True 624 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 669 570 0,0107843076022872 0,0541246455575882 0,0101930266269932 0,0530708781567102 0,00468658974275166 0,00997683672937474 440305 2358794 623 665 0 True 669 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 271 609 0,0104048649582685 0,00986198616247646 0,0101625085831998 0,00985732814526589 0,00224567856559252 0,00144901133438864 424813 429793 623 665 0 False 271 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 315 610 0,0103268308591307 0,0101430734079419 0,0102693217364767 0,0101319905394064 0,00150457751939961 0,00144125330945695 421627 442043 623 665 0 False 315 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 360 615 0,0104344767680167 0,0743082242112491 0,0104829480430304 0,0724956130312047 0,00139591898554789 0,0154252517159287 426022 3238410 623 665 0 True 359 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 405 615 0,0105985786086393 0,0747156056770445 0,0105592431525139 0,0720378423743038 0,00146544080175531 0,0203278915754236 432722 3256164 623 665 0 True 403 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 448 610 0,010427324866903 0,0103822614444098 0,0104982070649271 0,0103913939116503 0,00175558490847785 0,00196181969037156 425730 452467 623 665 0 False 448 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 492 610 0,0101439920173027 0,0101572310267543 0,0100709544518196 0,0102388036926833 0,00194213973091179 0,00187424123702529 414162 442660 623 665 0 False 492 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 536 610 0,0102154620428156 0,0101402051707433 0,0101930266269932 0,0103150988021668 0,00188993573899742 0,00202921735797978 417080 441918 623 665 0 False 536 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 580 610 0,0100503804897117 0,0102002775306313 0,0101167315175097 0,0101625085831998 0,00160471789130544 0,00188453635799198 410340 444536 623 665 0 False 580 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 624 610 0,0099202256865672 0,0100849055575538 0,0097962920576791 0,0100404364080262 0,00153811669775797 0,0014665275560054 405026 439508 623 665 0 False 624 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 668 610 0,00992904309889916 0,0102040406578359 0,00990310521095598 0,0103150988021668 0,00161107245744446 0,00164985077389186 405386 444700 623 665 0 False 668 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 273 660 0,00995929172176019 0,0445383543546438 0,00997940032043946 0,0445410849164569 0,00137699850742436 0,00861477894564484 406621 1941016 623 665 0 True 271 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 315 653 0,00989009952776634 0,0100028510277754 0,00990310521095598 0,0100251773861295 0,00130772777680769 0,00129421610435597 403796 435932 623 665 0 False 315 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 359 653 0,0103629332640677 0,00988222444414997 0,00996414129854276 0,00991836423285267 0,0029596986458469 0,00123402141666352 423101 430675 623 665 0 False 359 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 403 653 0,0102786045122373 0,010168864596832 0,0100709544518196 0,0102693217364767 0,00188445813545843 0,00135959313970507 419658 443167 623 665 0 False 403 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 447 653 0,00989178953179663 0,00997602727349388 0,00984206912336919 0,00994888227664607 0,00169367269791156 0,00159152067587653 403865 434763 623 665 0 False 447 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 492 653 0,00998883005307225 0,00998775262716186 0,0100709544518196 0,0100404364080262 0,0016293820715142 0,00168754007613184 407827 435274 623 665 0 False 492 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 536 653 0,0100532461487196 0,00994748257689314 0,0100709544518196 0,00994888227664607 0,00162507642565432 0,00170226594494939 410457 433519 623 665 0 False 536 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 580 654 0,009928185850478 0,00991134278819043 0,00999465934233616 0,00991836423285267 0,00144208371931063 0,00132067590515253 405351 431944 623 665 0 False 580 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 624 654 0,0098697215081547 0,0100110886050099 0,00987258716716258 0,0100099183642329 0,00131866619488832 0,00140954948648952 402964 436291 623 665 0 False 624 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 669 659 0,00995456460903777 0,0452974505386836 0,0100099183642329 0,0456092164492256 0,00138813821052942 0,00877251223801984 406428 1974098 623 665 0 True 668 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F10_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F10_2.csv new file mode 100755 index 0000000..a8de81a --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F10_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 272 263 0,00821057842102433 0,772557348968668 0,00813305867093919 0,796704051270314 0,0016406494748568 0,178498233386948 335224 33668648 623 665 15 True 272 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 316 263 0,00693802987902633 0,00654595977239964 0,00689707789730678 0,00656137941557946 0,00140627406746228 0,0012355600167888 283268 285278 623 665 0 False 316 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 360 262 0,00645319466482873 0,00658423352957812 0,00645456626230259 0,00657663843747616 0,00112570235687987 0,00118877288406727 263473 286946 623 665 0 True 360 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 404 262 0,00638113681182699 0,00651819523631693 0,00630197604333562 0,00654612039368277 0,0013087445979912 0,00131158302739507 260531 284068 623 665 0 True 404 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 449 262 0,00673368634823317 0,00669203335645133 0,00663767452506294 0,00663767452506294 0,00167594978012502 0,00157811550685937 274925 291644 623 665 0 True 448 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 491 262 0,00686910710596484 0,0069139660779323 0,00685130083161669 0,00694285496299687 0,00156391053407689 0,0014844235352007 280454 301316 623 665 0 True 493 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 537 262 0,00709441648385844 0,00723240924467268 0,00717174029144732 0,0072480354009308 0,00139090690286552 0,00145290109966207 289653 315194 623 665 0 True 537 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 581 262 0,00738426442145957 0,00734975456494291 0,00740062561989776 0,00732433051041428 0,00161616898293358 0,00177042588690912 301487 320308 623 665 0 True 581 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 625 264 0,00806800576217896 0,00785633114601565 0,00814831769283589 0,00788891432059205 0,00189699763758178 0,00179971692418028 329403 342385 623 665 0 False 625 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 668 262 0,0095947896930818 0,769180561841775 0,00961318379491875 0,790371557183185 0,00200701467353679 0,181106352232242 391739 33521485 623 665 15 True 669 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 272 306 0,00688835845622296 0,00660954285461881 0,00675974670023652 0,00657663843747616 0,00150705944972135 0,00132809613473099 281240 288049 623 665 0 False 272 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 316 306 0,00646392251649928 0,00644882978790533 0,00648508430609598 0,00643930724040589 0,00124185157235238 0,00126798763080389 263911 281045 623 665 0 False 316 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 361 307 0,0065827861332965 0,00674880150708655 0,00662241550316625 0,00677500572213321 0,00125419871370687 0,00118408153697911 268764 294118 623 665 0 True 360 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 404 306 0,00680630753591167 0,00679776805254152 0,00683604180972 0,00685130083161669 0,00135004237644773 0,00133041389405024 277890 296252 623 665 0 True 404 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 449 306 0,0108543815375142 0,00722001845997461 0,00720225833524071 0,00714122224765393 0,0170725516607921 0,00163037663191325 443166 314654 623 665 0 True 448 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 493 307 0,00712686945980246 0,00729507449098829 0,00709544518196384 0,00721751735713741 0,00164221675145538 0,00160980181966396 290978 317925 623 665 0 True 492 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 536 307 0,00705356247338703 0,00727105013621258 0,00715648126955062 0,00732433051041428 0,00147639947446959 0,00149173929093195 287985 316878 623 665 0 True 537 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 581 306 0,00741549275680193 0,00742187352106519 0,00735484855420768 0,00744640268558785 0,00166054088422085 0,00195514242653921 302762 323451 623 665 0 True 581 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 625 307 0,00757503893438633 0,0076769630645623 0,00762951094834821 0,00770580605783169 0,0018866178813233 0,00195918876721731 309276 334568 623 665 0 False 625 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 669 307 0,00777014867504296 0,00772664093284252 0,00772106507972839 0,00775158312352178 0,00188039534999145 0,00184701389923556 317242 336733 623 665 0 False 669 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 273 351 0,00622974674064965 0,00645927017130834 0,00622568093385214 0,0063935301747158 0,00138274438558972 0,00130700505814797 254350 281500 623 665 0 True 271 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 316 351 0,00671399412735846 0,00663703203993045 0,00672922865644312 0,00665293354695964 0,00140195332928481 0,0013179298483698 274121 289247 623 665 0 True 316 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 360 351 0,00686957246939348 0,00680715292465542 0,00685130083161669 0,00683604180972 0,00127046924032123 0,00130067823445156 280473 296661 623 665 0 True 360 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 405 351 0,00705006000126628 0,00716143758342985 0,00706492713817044 0,00718699931334401 0,00136980878451644 0,00134124651317294 287842 312101 623 665 0 True 404 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 449 350 0,00714227543857135 0,00727761266292304 0,00706492713817044 0,00737010757610437 0,00158154091938264 0,00160248961110995 291607 317164 623 665 0 True 448 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 492 350 0,00728972216701134 0,00706683164767033 0,00732433051041428 0,00703440909437705 0,00159067306748665 0,00156763173841615 297627 307978 623 665 0 False 492 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 537 350 0,00720833255262495 0,00723954541882286 0,0072632944228275 0,00729381246662089 0,00154303877297535 0,00170757841107797 294304 315505 623 665 0 True 537 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 581 351 0,00723581348772622 0,00744059737349783 0,0072480354009308 0,00746166170748455 0,00185972575803838 0,00189413509830852 295426 324267 623 665 0 True 581 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 625 350 0,00720867545199341 0,00741916590514969 0,00718699931334401 0,00750743877317464 0,00214583265091032 0,00193312268923218 294318 323333 623 665 0 True 625 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 670 350 0,00680246216442245 0,00702291319968495 0,0068055237659266 0,00706492713817044 0,00179383119930258 0,00196478080053587 277733 306064 623 665 0 True 669 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 273 395 0,0065164351054985 0,00660766129101651 0,00656137941557946 0,00656137941557946 0,00140389951704822 0,0013230103172863 266055 287967 623 665 0 True 271 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 317 395 0,00669481625553645 0,00688877148237956 0,00672922865644312 0,00692759594110018 0,00134901716009366 0,00136780755666075 273338 300218 623 665 0 True 316 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 361 395 0,00713130265878047 0,00705251340757479 0,00717174029144732 0,00712596322575723 0,00134244370604243 0,00125040267276293 291159 307354 623 665 0 True 360 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 405 394 0,00721384343533242 0,00719071654875343 0,00727855344472419 0,0072327763790341 0,00146448844113827 0,00138576289560104 294529 313377 623 665 0 True 404 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 449 394 0,00731526816996199 0,00733550516254013 0,00729381246662089 0,00741588464179446 0,00162396711511932 0,00159705938049849 298670 319687 623 665 0 True 448 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 494 395 0,00731308830969103 0,00734516538542511 0,00732433051041428 0,00729381246662089 0,0017210518261052 0,00171278909119279 298581 320108 623 665 0 True 492 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 537 394 0,00733226618151305 0,00730865846236098 0,00741588464179446 0,00730907148851759 0,0016479337129864 0,00148284567639929 299364 318517 623 665 0 True 536 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 582 394 0,00707509165516423 0,00713996022328653 0,00715648126955062 0,00717174029144732 0,00169487128160573 0,00192869299142731 288864 311165 623 665 0 True 581 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 626 394 0,00684890053603744 0,00672842555002751 0,00688181887541009 0,00677500572213321 0,00176689033821021 0,0018996511789065 279629 293230 623 665 0 True 625 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 669 394 0,00648305140269722 0,00638166714566228 0,00650034332799268 0,00631723506523232 0,00169420977490771 0,00188742666629334 264692 278118 623 665 0 True 669 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 273 440 0,00661896201666956 0,00657459625259074 0,00665293354695964 0,00659189745937285 0,00149998784229324 0,00160434666261863 270241 286526 623 665 0 True 271 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 317 438 0,00672016631599083 0,00685453620317674 0,00675974670023652 0,00686655985351339 0,0014658552084655 0,00141321136270079 274373 298726 623 665 0 True 315 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 362 439 0,00695838340582593 0,00706318324995368 0,00695811398489357 0,00708018616006714 0,00133657348649446 0,00132381222773173 284099 307819 623 665 0 True 360 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 405 438 0,00742134653887787 0,00713936362994922 0,00733958953231098 0,00706492713817044 0,00164041268370292 0,00155521771138422 303001 311139 623 665 0 True 404 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 449 438 0,00733123748340765 0,00726047207742405 0,00735484855420768 0,00712596322575723 0,00190513791152624 0,00197876166215974 299322 316417 623 665 0 True 448 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 494 439 0,0073488968008836 0,00719778388521085 0,00737010757610437 0,00717174029144732 0,00165061726726282 0,00178111378137059 300043 313685 623 665 0 True 492 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 538 439 0,00694153235114708 0,00721597998199894 0,00700389105058366 0,00711070420386053 0,00167934468900866 0,00198019952553707 283411 314478 623 665 0 True 536 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 581 437 0,00645632974476898 0,00646301035261534 0,00650034332799268 0,00645456626230259 0,0019156855035792 0,00197554307874325 263601 281663 623 665 0 False 581 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 626 438 0,00609719164192587 0,00622435007179198 0,00611886778057527 0,00616464484626535 0,00172789415723663 0,00179780828012432 248938 271262 623 665 0 True 625 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 670 437 0,00619565274629941 0,00616542500678338 0,00628671702143893 0,00621042191195544 0,00185540465616288 0,00179924434720379 252958 268694 623 665 0 True 669 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 272 483 0,00677250745530582 0,00662131410008197 0,00663767452506294 0,00659189745937285 0,00149500887142669 0,00146989582875001 276510 288562 623 665 0 True 271 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 316 483 0,00671551268170452 0,00657014474845847 0,00674448767833982 0,00659189745937285 0,00149618027889451 0,00143240446465938 274183 286332 623 665 0 True 315 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 360 483 0,00699277131392058 0,00689154793598783 0,00703440909437705 0,00692759594110018 0,00140506092494646 0,00145528108269723 285503 300339 623 665 0 True 359 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 405 482 0,00715165618558008 0,00689157088188542 0,00715648126955062 0,00691233691920348 0,00161344546858002 0,00164648852003169 291990 300340 623 665 0 True 404 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 448 482 0,00722920042847725 0,00728463410758528 0,00718699931334401 0,0072327763790341 0,00195864550941568 0,00202170083220235 295156 317470 623 665 0 True 448 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 493 483 0,00708743603242897 0,00697417611320588 0,00701915007248035 0,00700389105058366 0,00179672043951537 0,00185482278719046 289368 303940 623 665 0 True 492 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 537 481 0,00657578118905499 0,00638682997261981 0,00657663843747616 0,0063782711528191 0,00163566258271926 0,00178021065535086 268478 278343 623 665 0 True 536 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 581 482 0,00622813021505546 0,00634240671488747 0,00622568093385214 0,00627145799954223 0,00170820505584052 0,001803544439369 254284 276407 623 665 0 True 580 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 625 482 0,00604818152504739 0,00653304123205703 0,00607309071488518 0,00622568093385214 0,00182915492921576 0,00320874543353584 246937 284715 623 665 0 True 625 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 669 482 0,00623239196434924 0,00622710357950266 0,00625619897764553 0,00617990386816205 0,00173365464465232 0,00176004355710217 254458 271382 623 665 0 True 669 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 272 528 0,00675171305788962 0,00659834525659537 0,0068055237659266 0,00659189745937285 0,00145181057235327 0,00140692781713895 275661 287561 623 665 0 True 271 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 317 527 0,00673246170763151 0,0070092374447219 0,00672922865644312 0,00700389105058366 0,00136467039233028 0,00138723045164597 274875 305468 623 665 0 True 315 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 360 527 0,00696335544666868 0,00687521045690445 0,00694285496299687 0,00692759594110018 0,00128552397944984 0,00143113047025061 284302 299627 623 665 0 True 359 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 405 527 0,00693460088534168 0,00697699845860933 0,00697337300679027 0,00704966811627375 0,00156598514655355 0,00154494507732136 283128 304063 623 665 0 True 404 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 449 526 0,00690658110837567 0,00686114462168238 0,00686655985351339 0,0068207827878233 0,00178988041686754 0,00195469607351838 281984 299014 623 665 0 True 448 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 493 527 0,00660767083032225 0,00676766303490473 0,00657663843747616 0,00675974670023652 0,00172232079277883 0,00176701548342585 269780 294940 623 665 0 True 492 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 537 527 0,00638037753465396 0,00640266264195623 0,00645456626230259 0,00643930724040589 0,00173192686352579 0,00174094169124259 260500 279033 623 665 0 True 536 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 581 526 0,00628867644640158 0,00631891011575632 0,00624093995574884 0,00630197604333562 0,00159912911244898 0,00165083745774506 256756 275383 623 665 0 True 580 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 626 527 0,00626300797939077 0,00614716007230252 0,00611886778057527 0,00611886778057527 0,00185347420208153 0,00178096427885103 255708 267898 623 665 0 True 624 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 670 526 0,00633450249771574 0,00636725712197638 0,00636301213092241 0,0063935301747158 0,00174192791120456 0,00185376182952754 258627 277490 623 665 0 True 669 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 273 572 0,00673934418781284 0,00690451236812562 0,00683604180972 0,00694285496299687 0,00133220877585212 0,00127985986570688 275156 300904 623 665 0 True 271 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 317 571 0,00681539436917599 0,00699845287285506 0,00677500572213321 0,00700389105058366 0,00142723798349324 0,00134412315786604 278261 304998 623 665 0 True 315 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 361 571 0,00680797304712993 0,00681683609343799 0,00686655985351339 0,00688181887541009 0,00134206617470344 0,00131715529005892 277958 297083 623 665 0 True 359 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 405 570 0,00648158183397523 0,00670609919167339 0,00646982528419928 0,00671396963454643 0,00150647328532743 0,00149335792459503 264632 292257 623 665 0 True 403 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 449 570 0,00663649887008535 0,00679343127789719 0,00665293354695964 0,00686655985351339 0,00186252979135964 0,0019042468488391 270957 296063 623 665 0 True 448 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 493 571 0,00664487541180071 0,00654534023316474 0,00668345159075303 0,00660715648126955 0,00196181631490615 0,00195909416113763 271299 285251 623 665 0 True 492 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 537 571 0,006473303263508 0,00665222222413438 0,00650034332799268 0,00656137941557946 0,00187313773848894 0,00169057453272004 264294 289909 623 665 0 True 536 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 582 570 0,0064513332111142 0,00658746890113817 0,00645456626230259 0,00654612039368277 0,00162684563430675 0,00153078311996874 263397 287087 623 665 0 True 580 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 626 570 0,00622190904079902 0,00645406145255563 0,00613412680247196 0,00648508430609598 0,0015491104452966 0,00148113324956677 254030 281273 623 665 0 True 624 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 669 570 0,00648650488919391 0,00642879801931012 0,00630197604333562 0,0063935301747158 0,00216446414419531 0,00170860091798326 264833 280172 623 665 0 True 669 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 271 609 0,00706818468217086 0,00698280377069935 0,00706492713817044 0,00701915007248035 0,00141830209943074 0,00142844577375939 288582 304316 623 665 0 False 271 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 315 610 0,00685210909441379 0,00668308445639161 0,00677500572213321 0,00672922865644312 0,00143078164679912 0,00132925086323422 279760 291254 623 665 0 False 315 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 360 615 0,00654024211879479 0,006596188342222 0,00656137941557946 0,00668345159075303 0,00133387670389345 0,00130196231800119 267027 287467 623 665 0 True 359 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 405 615 0,00645003509207644 0,00631689087676848 0,00654612039368277 0,00634775310902571 0,00142379636706731 0,00134498980889192 263344 275295 623 665 0 True 403 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 448 610 0,00641405515119964 0,00652936988844278 0,00653086137178607 0,00651560234988937 0,00185461240367078 0,00191906796814279 261875 284555 623 665 0 False 448 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 492 610 0,00646436338711587 0,00634745481235705 0,00642404821850919 0,00636301213092241 0,00194725452539221 0,00183800082056068 263929 276627 623 665 0 False 492 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 536 610 0,00637065388827677 0,00640071224066116 0,00633249408712902 0,0063782711528191 0,00182135557143826 0,00184235886497662 260103 278948 623 665 0 False 536 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 580 610 0,00633362075648254 0,0064453420114718 0,00627145799954223 0,00645456626230259 0,00158586548315445 0,00168267097323656 258591 280893 623 665 0 False 580 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 624 610 0,00640389063420585 0,0061559942428743 0,0063935301747158 0,00613412680247196 0,00145336903784692 0,00143622318117444 261460 268283 623 665 0 False 624 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 668 610 0,00663194320704717 0,00678186654551233 0,00656137941557946 0,00689707789730678 0,0016135765015869 0,00150702747658451 270771 295559 623 665 0 False 668 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 273 660 0,0084939602562487 0,770579022516236 0,00836194399938964 0,789257648584726 0,00171864107522632 0,178788499394879 346794 33582431 623 665 16 True 271 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 315 653 0,00715202357776058 0,00677174740467557 0,00704966811627375 0,0068055237659266 0,00169815351494038 0,00129532189811075 292005 295118 623 665 0 False 315 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 359 653 0,00618641895616289 0,00631530760983484 0,00617990386816205 0,00630197604333562 0,00120112767941231 0,00126874005700679 252581 275226 623 665 0 False 359 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 403 653 0,00600965433171913 0,00610698180562415 0,00607309071488518 0,00608834973678187 0,00137563526927543 0,00136347328467148 245364 266147 623 665 0 False 403 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 447 653 0,00607965478851008 0,00616067520598245 0,00608834973678187 0,00621042191195544 0,00155507743763372 0,0014873671805303 248222 268487 623 665 0 False 447 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 492 653 0,00617948749035749 0,00620211549702822 0,00616464484626535 0,00624093995574884 0,00160213122972686 0,00167988453689386 252298 270293 623 665 0 False 492 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 536 653 0,00609197467296279 0,00627935138831285 0,00608834973678187 0,00636301213092241 0,00170490547392427 0,00166947758575518 248725 273659 623 665 0 False 536 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 580 654 0,00629227688977047 0,00622749365976167 0,00631723506523232 0,00627145799954223 0,00135620472519726 0,00130381728748431 256903 271399 623 665 0 False 580 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 624 654 0,00685232952972209 0,00664478775331554 0,00683604180972 0,00668345159075303 0,00136966766245465 0,00138879973789227 279769 289585 623 665 0 False 624 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 669 659 0,00857096565728114 0,779787027651528 0,00836194399938964 0,809506370641642 0,00184559034339546 0,184003510963654 349938 33983723 623 665 17 True 668 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F10_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F10_3.csv new file mode 100755 index 0000000..4702286 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F10_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 272 263 0,00104765554190898 0,077781636512889 0,000869764248111696 0,0767681391622797 0,000803320082942491 0,0218495260850266 42774 3389784 623 665 0 True 272 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 316 263 0,000946647185083975 0,000837525261999127 0,00080872816052491 0,000717174029144732 0,000647462558331342 0,000598375156864839 38650 36500 623 665 0 False 316 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 360 262 0,000864694236020819 0,000889061747984059 0,000762951094834821 0,000854505226215 0,000630037862341602 0,000613888200793308 35304 38746 623 665 0 True 360 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 404 262 0,000961171422619675 0,000950166673263612 0,000793469138628214 0,00080872816052491 0,000747318324736704 0,000707262188631943 39243 41409 623 665 0 True 404 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 449 262 0,000924113798013412 0,000918891414849782 0,000747692072938125 0,000701915007248035 0,000780296501753843 0,000808544777304676 37730 40046 623 665 0 True 448 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 491 262 0,000940450503639571 0,000917193418428195 0,000717174029144732 0,000701915007248035 0,000865185754282038 0,000819074054085079 38397 39972 623 665 0 True 493 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 537 262 0,000919386685291001 0,000904664958344591 0,000701915007248035 0,000747692072938125 0,000801530932544618 0,00075545736767141 37537 39426 623 665 0 True 537 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 581 262 0,000900478234401355 0,000942961661420661 0,00064087891966125 0,000625619897764553 0,000857854156525658 0,000943433143304821 36765 41095 623 665 0 True 581 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 625 264 0,00105892223544426 0,000988004458387902 0,000701915007248035 0,000701915007248035 0,00101639265523206 0,000934396283291799 43234 43058 623 665 0 False 625 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 668 262 0,00111278192910531 0,077459040138685 0,000885023270008392 0,076752880140383 0,000979865117828046 0,0220386163803826 45433 3375725 623 665 0 True 669 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 272 306 0,000883161816293868 0,000871554028123639 0,000747692072938125 0,000732433051041428 0,000681832939072723 0,000727447062641974 36058 37983 623 665 0 False 272 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 316 306 0,000931461641623379 0,000924008350012133 0,000839246204318303 0,000854505226215 0,000629312442239126 0,000620476572816303 38030 40269 623 665 0 False 316 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 361 307 0,000915467835365686 0,000864830880130057 0,000823987182421607 0,000747692072938125 0,0006112202702894 0,000666460437392682 37377 37690 623 665 0 True 360 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 404 306 0,000940915867068202 0,000999798649748656 0,000778210116731518 0,000839246204318303 0,000732652232354015 0,00073776670182885 38416 43572 623 665 0 True 404 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 449 306 0,00124756587372412 0,000858176569829242 0,000717174029144732 0,000579842832074464 0,00182753568287906 0,000870444811543586 50936 37400 623 665 0 True 448 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 493 307 0,000869323377495098 0,000973961569063423 0,000656137941557946 0,000717174029144732 0,000847515316442988 0,00090321913799619 35493 42446 623 665 0 True 492 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 536 307 0,000866972067539909 0,000881328980496561 0,000656137941557946 0,000686655985351339 0,000772045239543058 0,000804265865509635 35397 38409 623 665 0 True 537 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 581 306 0,000948141246618002 0,000868456331949122 0,000656137941557946 0,000534065766384375 0,000926824894536969 0,000950071215717884 38711 37848 623 665 0 True 581 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 625 307 0,000937560351819651 0,000979950448334157 0,000534065766384375 0,000595101853971161 0,00101202863351807 0,00104813925753043 38279 42707 623 665 0 False 625 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 669 307 0,0010055034123998 0,000889428882345484 0,000625619897764553 0,000457770656900893 0,000976726302181552 0,000920844919447764 41053 38762 623 665 0 False 669 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 273 351 0,00099862093221847 0,000939634506270253 0,000854505226215 0,00080872816052491 0,000776405843903994 0,000759870608754742 40772 40950 623 665 0 True 271 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 316 351 0,000988774821781115 0,000865886391419152 0,000869764248111696 0,000717174029144732 0,000700569253401638 0,000677488595570587 40370 37736 623 665 0 True 316 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 360 351 0,000883651672534532 0,000947298436064985 0,000747692072938125 0,000823987182421607 0,000667512232909602 0,000711686200644508 36078 41284 623 665 0 True 360 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 405 351 0,000915859720358217 0,000911273376850228 0,000762951094834821 0,000747692072938125 0,000712084847299449 0,000708045709435462 37393 39714 623 665 0 True 404 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 449 350 0,000910912172327507 0,000925063861301227 0,000671396963454643 0,000595101853971161 0,000838913629109653 0,000903106627101266 37191 40315 623 665 0 True 448 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 492 350 0,000899767942852391 0,000884770865134913 0,00064087891966125 0,000625619897764553 0,00087924103071241 0,000821817386826648 36736 38559 623 665 0 False 492 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 537 350 0,000941944565173597 0,000842183279209697 0,000701915007248035 0,000579842832074464 0,000872899199193041 0,000823821309890164 38458 36703 623 665 0 True 537 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 581 351 0,000968249845297276 0,00101895847423549 0,000610360875867857 0,000701915007248035 0,00102094414249405 0,00104298563578328 39532 44407 623 665 0 True 581 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 625 350 0,000936825567458654 0,00100165726745337 0,000564583810177768 0,000534065766384375 0,00100454140334832 0,00106654520882957 38249 43653 623 665 0 True 625 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 670 350 0,000963302297266565 0,000934792921878971 0,000595101853971161 0,000534065766384375 0,000980212881907039 0,000991939404807478 39330 40739 623 665 0 True 669 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 273 395 0,00088257398880507 0,000932521278017658 0,000732433051041428 0,000778210116731518 0,000754502287595378 0,000771327755334348 36034 40640 623 665 0 True 271 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 317 395 0,000918627408117971 0,000894683492893369 0,000778210116731518 0,000793469138628214 0,000710542166721766 0,000657096026306039 37506 38991 623 665 0 True 316 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 361 395 0,000959873303581914 0,000810701507717566 0,000823987182421607 0,000671396963454643 0,000734189175658956 0,000662769380636226 39190 35331 623 665 0 True 360 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 405 394 0,000905817667424597 0,000995783117670578 0,000732433051041428 0,00080872816052491 0,000738208954250862 0,00079581839041303 36983 43397 623 665 0 True 404 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 449 394 0,000929820623217153 0,000954044529956156 0,00064087891966125 0,000686655985351339 0,000861254645250093 0,00091954272638627 37963 41578 623 665 0 True 448 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 494 395 0,000972340144906824 0,000898928483947337 0,000732433051041428 0,000579842832074464 0,000906579818432232 0,000902451132477094 39699 39176 623 665 0 True 492 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 537 394 0,000844512158905446 0,00100291929182076 0,000595101853971161 0,000793469138628214 0,000839422044859315 0,000879338998972478 34480 43708 623 665 0 True 536 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 582 394 0,000898665766310896 0,000964025995407379 0,000518806744487678 0,000595101853971161 0,000950305456610711 0,00100668843163593 36691 42013 623 665 0 True 581 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 626 394 0,00101072038136288 0,000895211248537916 0,000595101853971161 0,000473029678797589 0,00103222383069253 0,00101489251720146 41266 39014 623 665 0 True 625 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 669 394 0,00090074765533372 0,000911066863771927 0,000534065766384375 0,000549324788281071 0,000929042304062974 0,000972536626330079 36776 39705 623 665 0 True 669 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 273 440 0,000877724412022493 0,000891425175435728 0,000762951094834821 0,000717174029144732 0,000723989330351836 0,000772122503243776 35836 38849 623 665 0 True 271 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 317 438 0,000939593255218408 0,000869764248111696 0,000839246204318303 0,000732433051041428 0,000763471176351647 0,000724693331021862 38362 37905 623 665 0 True 315 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 362 439 0,000903074472476876 0,000982543334761715 0,000747692072938125 0,000854505226215 0,000772082997334158 0,00070126881916856 36871 42820 623 665 0 True 360 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 405 438 0,0010220115677102 0,000899157942923227 0,000793469138628214 0,000686655985351339 0,00085787676461294 0,000793080593604476 41727 39186 623 665 0 True 404 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 449 438 0,000939960647398906 0,00100945887263363 0,000686655985351339 0,000701915007248035 0,000888633974294758 0,00093795416706598 38377 43993 623 665 0 True 448 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 494 439 0,000968004917176944 0,000975751349075366 0,000656137941557946 0,00064087891966125 0,000963361624341518 0,00099173881918899 39522 42524 623 665 0 True 492 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 538 439 0,000876916149225396 0,000987752053514422 0,000610360875867857 0,000732433051041428 0,000876822654186479 0,000920501848947737 35803 43047 623 665 0 True 536 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 581 437 0,000860187558606707 0,000913017265066993 0,000457770656900893 0,000518806744487678 0,00095330981204026 0,000998797223753714 35120 39790 623 665 0 False 581 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 626 438 0,000918309001561539 0,000888419262851567 0,000488288700694286 0,000579842832074464 0,00102062415831709 0,000885116445555977 37493 38718 623 665 0 True 625 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 670 437 0,000960681566379011 0,000947803245811943 0,000534065766384375 0,000534065766384375 0,00103469056997804 0,000993494258142459 39223 41306 623 665 0 True 669 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 272 483 0,000975009861418445 0,000876372666617333 0,000839246204318303 0,000747692072938125 0,000781246207608686 0,000731813075450866 39808 38193 623 665 0 True 271 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 316 483 0,000956934166137928 0,000913223778145295 0,000869764248111696 0,000793469138628214 0,000776930773230358 0,000780599270037521 39070 39799 623 665 0 True 315 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 360 483 0,000859109874877245 0,000863201721401237 0,000701915007248035 0,000701915007248035 0,000758928880417641 0,000785618769891836 35076 37619 623 665 0 True 359 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 405 482 0,00102262388801103 0,000890553231327346 0,000778210116731518 0,000671396963454643 0,000913034472675941 0,000844973288136572 41752 38811 623 665 0 True 404 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 448 482 0,000964967808484824 0,000987476702743354 0,000625619897764553 0,000595101853971161 0,0010018293352056 0,00107985349020842 39398 43035 623 665 0 True 448 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 493 483 0,00100491558491101 0,000959597437172698 0,000610360875867857 0,000579842832074464 0,00101607292153394 0,00100839253786315 41029 41820 623 665 0 True 492 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 537 481 0,000909197675485181 0,000871967054280242 0,000625619897764553 0,000579842832074464 0,000877047719382352 0,000837710582740354 37121 38001 623 665 0 True 536 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 581 482 0,000885782547181422 0,000884449622568667 0,000503547722590982 0,000473029678797589 0,000937156094236303 0,000967488337286536 36165 38545 623 665 0 True 580 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 625 482 0,00088416602158723 0,000851958231582619 0,000549324788281071 0,000473029678797589 0,000900507687583733 0,000920655528198762 36099 37129 623 665 0 True 625 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 669 482 0,000892787491422923 0,000940437612685869 0,000549324788281071 0,000518806744487678 0,000933099159075248 0,000990338467114917 36451 40985 623 665 0 True 669 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 272 528 0,000891611836445329 0,000804643790754065 0,000717174029144732 0,000656137941557946 0,000775287547140224 0,000707498669574617 36403 35067 623 665 0 True 271 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 317 527 0,000908707819244517 0,000956430903305414 0,000778210116731518 0,000839246204318303 0,000735378017986515 0,000780788333776649 37101 41682 623 665 0 True 315 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 360 527 0,000926710036088934 0,000880388198695411 0,00080872816052491 0,000701915007248035 0,000763946380785119 0,00080493180029509 37836 38368 623 665 0 True 359 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 405 527 0,000949096466287297 0,000892411849032056 0,000717174029144732 0,000610360875867857 0,00084408369167272 0,000885596748304227 38750 38892 623 665 0 True 404 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 449 526 0,000945863415098912 0,000856524465202833 0,000549324788281071 0,000457770656900893 0,000996250548565258 0,000982175991333358 38618 37328 623 665 0 True 448 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 493 527 0,000962469541657436 0,000863775368840963 0,000579842832074464 0,000503547722590982 0,00101695773655596 0,000894676455382263 39296 37644 623 665 0 True 492 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 537 527 0,00093778078712795 0,000862375669088032 0,00064087891966125 0,000503547722590982 0,000926883205763325 0,000932969221264693 38288 37583 623 665 0 True 536 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 581 526 0,000858448568952348 0,000897643513682352 0,000534065766384375 0,000656137941557946 0,000868023170622288 0,000869763063132798 35049 39120 623 665 0 True 580 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 626 527 0,000875618030187636 0,000903907743724154 0,000473029678797589 0,000518806744487678 0,000925041629930938 0,000993109185193134 35750 39393 623 665 0 True 624 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 670 526 0,000942140507669863 0,000920589411271369 0,000579842832074464 0,000564583810177768 0,000950077307116889 0,000966676469278574 38466 40120 623 665 0 True 669 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 273 572 0,000926514093592668 0,000876464450207689 0,000793469138628214 0,000793469138628214 0,000698812964780505 0,000659079836404319 37828 38197 623 665 0 True 271 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 317 571 0,000877675426398426 0,000974902350864573 0,000762951094834821 0,000854505226215 0,000697325581472275 0,000739545444897277 35834 42487 623 665 0 True 315 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 361 571 0,000907777092387254 0,000932819574686315 0,000778210116731518 0,000823987182421607 0,000735224937059717 0,000668768255133896 37063 40653 623 665 0 True 359 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 405 570 0,000878655138879755 0,000937431700101708 0,000671396963454643 0,000732433051041428 0,000791199717630545 0,000765039847001716 35874 40854 623 665 0 True 403 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 449 570 0,000935723390917159 0,00093433400392719 0,000503547722590982 0,000518806744487678 0,00101235363851695 0,000982588355810546 38204 40719 623 665 0 True 448 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 493 571 0,000940034125835006 0,000904940309115659 0,000488288700694286 0,000473029678797589 0,00104310746110195 0,00107472208254331 38380 39438 623 665 0 True 492 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 537 571 0,000832633145069334 0,000861343103696527 0,000442511635004196 0,000488288700694286 0,000931276014240126 0,000921292320295731 33995 37538 623 665 0 True 536 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 582 570 0,000885929504053622 0,00089697808265227 0,000610360875867857 0,000656137941557946 0,000842504060904991 0,000838120227649906 36171 39091 623 665 0 True 580 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 626 570 0,000900257799093056 0,000940965368330416 0,000625619897764553 0,000701915007248035 0,000831039282362422 0,000804246246006081 36756 41008 623 665 0 True 624 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 669 570 0,000941038331128368 0,000933966869565766 0,000656137941557946 0,000625619897764553 0,000867627427936004 0,00089411093191762 38421 40703 623 665 0 True 669 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 271 609 0,000880859491962745 0,000891172770562249 0,000762951094834821 0,000762951094834821 0,000688861317710686 0,00071023397736674 35964 38838 623 665 0 False 271 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 315 610 0,000941748622677331 0,000952736613793582 0,000793469138628214 0,000885023270008392 0,000762757155521085 0,000711307289977029 38450 41521 623 665 0 False 315 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 360 615 0,000876132379240333 0,000979675097563088 0,000747692072938125 0,000869764248111696 0,000705301089152821 0,000747440233012239 35771 42695 623 665 0 True 359 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 405 615 0,000948631102858666 0,000856799815973901 0,000793469138628214 0,000686655985351339 0,000747840090686128 0,000684508450879113 38731 37340 623 665 0 True 403 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 448 610 0,000871723673074354 0,000847575565143116 0,000488288700694286 0,000396734569314107 0,000894632196569566 0,000968311447893449 35591 36938 623 665 0 False 448 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 492 610 0,00084652056949217 0,000883049922815737 0,000442511635004196 0,000350957503624018 0,000952290315067074 0,00105836749461514 34562 38484 623 665 0 False 492 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 536 610 0,000775662864280063 0,000899708644465363 0,000350957503624018 0,000442511635004196 0,000944635458867817 0,00103301683748787 31669 39210 623 665 0 False 536 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 580 610 0,000882549495993037 0,000880502928183356 0,000579842832074464 0,000564583810177768 0,000857367540325977 0,000882099294511655 36033 38373 623 665 0 False 580 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 624 610 0,00089352227578392 0,0008346570248005 0,000686655985351339 0,000686655985351339 0,000743625385605708 0,000690785265589871 36481 36375 623 665 0 False 624 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 668 610 0,000881104420083077 0,000913958046868143 0,000656137941557946 0,000610360875867857 0,000788319513840193 0,000870024431897746 35974 39831 623 665 0 False 668 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 273 660 0,00101218995008487 0,0778833327310035 0,000885023270008392 0,0767071030746929 0,000749707154223634 0,0220525827137579 41326 3394216 623 665 0 True 271 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 315 653 0,000960950987311376 0,000798310723019497 0,000793469138628214 0,000671396963454643 0,000714084835311272 0,000618960661838209 39234 34791 623 665 0 False 315 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 359 653 0,000794326387049377 0,000809278862067047 0,00064087891966125 0,000701915007248035 0,000633563099787766 0,000588798990540366 32431 35269 623 665 0 False 359 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 403 653 0,000908315934251985 0,000892733091598302 0,000762951094834821 0,000747692072938125 0,000691507557870564 0,000665766795769936 37085 38906 623 665 0 False 403 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 447 653 0,000834470105971825 0,000818365437512297 0,000610360875867857 0,000625619897764553 0,000760743048106948 0,000749127795323762 34070 35665 623 665 0 False 447 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 492 653 0,000912014348869002 0,000881145413315849 0,000610360875867857 0,000610360875867857 0,000875930417106143 0,000855820744937297 37236 38401 623 665 0 False 492 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 536 653 0,000856881028982222 0,000862215047804909 0,000564583810177768 0,000518806744487678 0,000864130033220226 0,000881858243695799 34985 37576 623 665 0 False 536 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 580 654 0,000816296439443176 0,000853633282106617 0,000610360875867857 0,000732433051041428 0,000717607665739103 0,000634382855709248 33328 37202 623 665 0 False 580 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 624 654 0,000887962407452379 0,000912902535579048 0,000747692072938125 0,000747692072938125 0,000693655701251568 0,000726706002731687 36254 39785 623 665 0 False 624 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 669 659 0,000908536369560284 0,0790153685885577 0,000762951094834821 0,0782940413519493 0,000673813147567889 0,0230222832208578 37094 3443551 623 665 0 True 668 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F11_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F11_1.csv new file mode 100755 index 0000000..274463d --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F11_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 264 273 0,0105240077254399 0,0465029591603178 0,0105287251087205 0,0470588235294118 0,00145654002958785 0,00838128259130923 399331 2026635 579 665 0 True 264 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 308 273 0,0103661466871649 0,0101059469456429 0,0103456168459602 0,0100404364080262 0,00127560711313551 0,00130233491651387 393341 440425 579 665 0 False 308 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 353 273 0,0105211614830135 0,0611678658766394 0,0104982070649271 0,062073701075761 0,00140806902151941 0,0106915869702359 399223 2665743 579 665 0 True 352 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 397 273 0,0104417565901383 0,0856741533394025 0,0104982070649271 0,0856031128404669 0,00132353771229174 0,0127581141694037 396210 3733746 579 665 0 True 396 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 441 272 0,0105679663584687 0,0688072665068485 0,0106355382619974 0,067002365148394 0,00163846675730385 0,0176520362904377 400999 2998674 579 665 0 True 440 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 485 272 0,0102639982089756 0,0666397740746923 0,01025406271458 0,0688029297322042 0,00177524628196301 0,0202698272446784 389465 2904213 579 665 0 True 484 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 530 274 0,0103858595513768 0,0801027517294036 0,0104219119554437 0,0793621728847181 0,00161431163625856 0,0257983062529407 394089 3490940 579 665 0 True 528 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 574 273 0,0102184846842509 0,0693123974963731 0,0102388036926833 0,0688181887541009 0,00173903467191303 0,0203929822862769 387738 3020688 579 665 0 True 573 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 617 274 0,0100658681111874 0,0101231334229371 0,0101625085831998 0,0101930266269932 0,0019499376397089 0,00186465185104171 381947 441174 579 665 0 False 617 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 659 271 0,0101021840562196 0,0459632487031265 0,0101167315175097 0,0461738002594034 0,00179086176822793 0,00892693207964239 383325 2003114 579 665 0 True 661 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 264 316 0,0102763319261563 0,0102886651281442 0,0102845807583734 0,0102845807583734 0,00139490567883669 0,00151541271403601 389933 448388 579 665 0 False 264 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 308 316 0,0102211991561945 0,0103246442955638 0,0102388036926833 0,010406652933547 0,00139715304043382 0,00127358376430274 387841 449956 579 665 0 False 308 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 354 318 0,0106198575745561 0,112779889756435 0,0106202792401007 0,112077515831235 0,00133238859881221 0,0292961867677836 402968 4915035 579 665 0 True 352 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 397 317 0,0105407689308393 0,0510891327655371 0,0105592431525139 0,0510109102006561 0,00144490861610614 0,0103669140226699 399967 2226504 579 665 0 True 396 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 441 317 0,010578376226602 0,0755092354369559 0,0105745021744106 0,0744335088120851 0,00161135923076864 0,0175596492631064 401394 3290751 579 665 0 True 440 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 485 318 0,0104793375318045 0,042861101024477 0,0105439841306172 0,0435034714274815 0,00180349248665545 0,00961155971913226 397636 1867920 579 665 0 True 484 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 529 317 0,0103213974312399 0,0422056055680515 0,0102998397802701 0,0443732356755932 0,00158309585392061 0,00897757200666454 391643 1839353 579 665 0 True 528 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 574 318 0,0103288819946572 0,0536273850109366 0,0104982070649271 0,0528877698939498 0,00179276548282023 0,0138399608491879 391927 2337123 579 665 0 True 572 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 617 317 0,0100901929422939 0,0101982353457459 0,0102082856488899 0,0102845807583734 0,00206028677886235 0,00212054875087207 382870 444447 579 665 0 False 617 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 661 317 0,0101621132717517 0,0102112686155765 0,010101472495613 0,0102235446707866 0,00187975872021125 0,00182960628486406 385599 445015 579 665 0 False 661 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 265 362 0,0103646181495656 0,0496895936338902 0,0103303578240635 0,0500801098649577 0,00143069605462155 0,0114346233781855 393283 2165511 579 665 0 True 264 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 309 362 0,0105299637512579 0,0659580055655275 0,0105439841306172 0,0656595712214847 0,00142328054160015 0,0230117665434397 399557 2874501 579 665 0 True 308 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 354 362 0,0104800754465076 0,0411895153310146 0,0104371709773404 0,0411535820553902 0,0014911853250535 0,00930932547805359 397664 1795071 579 665 0 True 352 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 397 362 0,0103685712640466 0,0357591621534954 0,0103608758678569 0,0355992980849928 0,00147150529304791 0,0066241058261517 393433 1558412 579 665 0 True 396 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 442 362 0,0106704047317199 0,0699295044661321 0,0105592431525139 0,0678721293965057 0,00171434916922256 0,0136982945140181 404886 3047582 579 665 0 True 440 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 484 360 0,0104504797960931 0,0322542680803634 0,0103913939116503 0,0335851071946288 0,00188117675115493 0,00788248555869473 396541 1405666 579 665 0 False 484 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 528 360 0,0102604404059427 0,0296166600984035 0,0102082856488899 0,0301213092240787 0,0017348599668414 0,00633761700978224 389330 1290717 579 665 0 False 528 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 573 362 0,0103952943179382 0,0507829197622117 0,010452429999237 0,0515754940108339 0,00186912254903631 0,00948881621220605 394447 2213159 579 665 0 True 572 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 618 363 0,0103237692999285 0,0562125616169056 0,0104371709773404 0,0568551155870909 0,00204179788645609 0,0132327264176811 391733 2449787 579 665 0 True 616 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 662 362 0,0103150197398772 0,064300944625239 0,0102693217364767 0,0635385671778439 0,00182449994871634 0,0201496136364181 391401 2802285 579 665 0 True 661 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 265 406 0,0103771363454221 0,0409294006359456 0,0104219119554437 0,0437018387121385 0,00159440294124652 0,0109971218723905 393758 1783735 579 665 0 True 263 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 309 406 0,0104444447079854 0,0333452766730284 0,0105592431525139 0,0328068970778973 0,00145822359520128 0,00611046535367925 396312 1453213 579 665 0 True 308 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 353 406 0,0106176174763502 0,0839943530146033 0,010605020218204 0,0823224231326772 0,00145526803604229 0,0216954980627953 402883 3660539 579 665 0 True 352 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 398 406 0,010847398844083 0,0668938081069003 0,0108644235904479 0,0650644693675135 0,00149216052970632 0,0189932526341319 411602 2915284 579 665 0 True 396 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 442 407 0,0107450395331214 0,0433952126826565 0,0107728694590677 0,0444953078507668 0,00160511230078881 0,0085487588808209 407718 1891197 579 665 0 True 440 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 486 407 0,010819489855847 0,0529904527856606 0,0108186465247578 0,0534065766384375 0,00173227689678369 0,0114004310575813 410543 2309365 579 665 0 True 484 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 530 406 0,0104452880390747 0,0417405151698197 0,010452429999237 0,0422980086976425 0,0016768579174463 0,00636362835029382 396344 1819084 579 665 0 True 528 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 575 407 0,0103624307595527 0,0503746663523079 0,0104219119554437 0,0509346150911727 0,001761981874679 0,00943427638093477 393200 2195367 579 665 0 True 572 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 618 406 0,0102016707706584 0,0417098594506408 0,0103608758678569 0,041519798580911 0,00187660204717305 0,00854691151636631 387100 1817748 579 665 0 True 616 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 662 406 0,0104881134459523 0,0827577297558384 0,0105439841306172 0,0778210116731518 0,00198230537314877 0,0189516187487274 397969 3606646 579 665 0 True 660 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 266 452 0,0102098668946823 0,0415098859531525 0,01025406271458 0,0415503166247044 0,00158811259972319 0,00711653148636037 387411 1809033 579 665 0 True 263 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 310 451 0,0106669786991697 0,0514627149241839 0,0106660563057908 0,0514534218356603 0,00153068020241627 0,00708317167080504 404756 2242785 579 665 0 True 307 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 354 452 0,0106068913590584 0,0352958844811732 0,0106355382619974 0,0354161898222324 0,00154663097760573 0,00473908201910106 402476 1538222 579 665 0 True 352 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 398 450 0,0110179625568903 0,0507971232728193 0,0110933089188983 0,0513923857480735 0,00156535083999089 0,00914789172813908 418074 2213778 579 665 0 True 396 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 442 450 0,0106651339124119 0,0910581328578943 0,0107118333714809 0,0882734416723888 0,00189789641234376 0,0149882255304785 404686 3968384 579 665 0 True 440 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 487 451 0,0104827635643547 0,0613849340678315 0,0105439841306172 0,0598306248569467 0,00181738335471305 0,0165551594337281 397766 2675203 579 665 0 True 484 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 530 451 0,0105274864661831 0,0513129929424156 0,0105592431525139 0,0511482413977264 0,00168477009640146 0,00935092467474342 399463 2236260 579 665 0 True 528 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 575 451 0,0106418895992636 0,0308349725308923 0,0105439841306172 0,0311436636911574 0,00237410743451267 0,00468894360550543 403804 1343812 579 665 0 True 572 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 619 451 0,0103164165069938 0,0383219435634176 0,0103456168459602 0,0392462043183032 0,00171955973172983 0,00553444879212854 391454 1670100 579 665 0 True 616 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 663 450 0,0102585165568953 0,0636254632920135 0,0103303578240635 0,0626230258640421 0,00200411155044483 0,00895914967144481 389257 2772847 579 665 0 True 660 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 265 496 0,0101579756785949 0,0520298916207892 0,0101167315175097 0,0529640650034333 0,0015251528779794 0,0153118879862148 385442 2267503 579 665 0 True 263 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 309 495 0,0104971792551621 0,0543700978240979 0,0105287251087205 0,0537575341420615 0,00159258730551587 0,0102106665164526 398313 2369491 579 665 0 True 307 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 352 495 0,010658940699725 0,0645546115230856 0,0106202792401007 0,064087891966125 0,00152791511785793 0,0178150711419411 404451 2813340 579 665 0 True 351 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 397 495 0,0109999890630499 0,0868586894106404 0,010955977721828 0,082383459220264 0,00167900446812742 0,0260705307621885 417392 3785369 579 665 0 True 396 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 441 494 0,0110373591719437 0,0917734023775392 0,0110933089188983 0,0907606622415503 0,00188151384834459 0,0322029703446079 418810 3999556 579 665 0 True 440 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 485 495 0,0105684670863029 0,0431486819589601 0,0105897611963073 0,0454261081864652 0,00178754711676661 0,00764471954547603 401018 1880453 579 665 0 True 484 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 528 495 0,0104659496507621 0,0401210396097821 0,0104982070649271 0,0425421530479896 0,00175901986374914 0,00825412058277424 397128 1748506 579 665 0 True 528 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 573 495 0,0105341540526078 0,090503851755734 0,0105439841306172 0,0874799725337606 0,00178993110042945 0,0184045666619753 399716 3944228 579 665 0 True 572 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 617 494 0,0103965856686687 0,0587741957319483 0,0103913939116503 0,0616922255283436 0,00184543133454094 0,0168266867417399 394496 2561425 579 665 0 True 616 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 661 495 0,0102972570788092 0,0713899190640827 0,0103913939116503 0,069214923323415 0,00196261662217889 0,0161385453178743 390727 3111228 579 665 0 True 660 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 265 539 0,0102592017634053 0,051262833210286 0,0102388036926833 0,0545815213244831 0,00148833925346284 0,0140932355775693 389283 2234074 579 665 0 True 263 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 309 539 0,0102962556231406 0,100049459882253 0,0103456168459602 0,0927595941100176 0,00142679539568679 0,0308702300662821 390689 4360233 579 665 0 True 307 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 354 539 0,0106008826250472 0,0537948212256436 0,0106202792401007 0,0559395742732891 0,00162630801421879 0,011681646487831 402248 2344420 579 665 0 True 351 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 397 539 0,0107650950005884 0,0542648908836523 0,0107728694590677 0,0549935149156939 0,0015558099257496 0,00882209901145765 408479 2364906 579 665 0 True 395 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 440 538 0,0108898289395125 0,05576130759492 0,0109864957656214 0,0568856336308843 0,00190145235470451 0,0118982084120415 413212 2430121 579 665 0 True 440 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 485 539 0,0106575439326084 0,0568768682980053 0,0108033875028611 0,0588387884336614 0,00191109213649825 0,011863254995585 404398 2478738 579 665 0 True 484 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 529 539 0,0104567257169731 0,0700898962902794 0,010406652933547 0,0695353627832456 0,00189068113887888 0,0207542855252176 396778 3054572 579 665 0 True 528 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 573 539 0,0104147963493778 0,0554417171333002 0,0104371709773404 0,0558785381857023 0,00175719567208225 0,0143840641071743 395187 2416193 579 665 0 True 572 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 617 538 0,0100029345286497 0,041826814690652 0,00994888227664607 0,0422522316319524 0,00181647156980745 0,00796261555811369 379559 1822845 579 665 0 True 616 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 661 538 0,0101564207868991 0,063583174002757 0,0100862134737163 0,0638132295719844 0,00177173907685823 0,0157401677236875 385383 2771004 579 665 0 True 660 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 263 576 0,0127883517001621 0,0332570726426962 0,0103150988021668 0,0369115739681086 0,00686137307314405 0,0177961161251839 485251 1449369 579 665 0 False 263 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 309 583 0,0100993905219864 0,0508250484301851 0,010101472495613 0,0508278019378958 0,00161012547935992 0,0135608442746879 383219 2214995 579 665 0 True 307 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 353 583 0,0104379088920435 0,0474088861430298 0,010406652933547 0,0481574731059739 0,00135050769328722 0,0108524653019748 396064 2066116 579 665 0 True 351 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 397 583 0,0104752262927442 0,0457132760947918 0,010406652933547 0,0465400167849241 0,00142007480887853 0,00625602767426507 397480 1992220 579 665 0 True 395 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 442 583 0,0105109097394594 0,0835926850773076 0,0104829480430304 0,0780956740672923 0,00192778468129642 0,0239643910583768 398834 3643034 579 665 0 True 440 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 486 583 0,0103638802348624 0,0577458523855989 0,0104219119554437 0,0584115358205539 0,00193796369382414 0,0126079571174362 393255 2516609 579 665 0 True 484 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 531 583 0,0102120542846951 0,0537478280273813 0,01025406271458 0,0539406424048219 0,00205814233890578 0,00794096972264165 387494 2342372 579 665 0 True 528 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 574 583 0,0101657237829777 0,0359709068964469 0,0101472495613031 0,0374914168001831 0,00172952729724591 0,00800241922586549 385736 1567640 579 665 0 True 572 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 619 583 0,0102685838217736 0,0500403216785383 0,0103456168459602 0,0491035324635691 0,00159918528769972 0,0100786850616496 389639 2180796 579 665 0 True 616 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 662 583 0,0101379202111279 0,0528790963446611 0,0101472495613031 0,052124818799115 0,00159974481302977 0,00942948261708553 384681 2304512 579 665 0 True 660 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 263 619 0,0104654225688313 0,00997749581093957 0,0100404364080262 0,00997940032043946 0,00330677524573804 0,00129923796347254 397108 434827 579 665 0 False 263 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 307 619 0,0104121082315308 0,00982295519067754 0,0101319905394064 0,00976577401388571 0,00290945067554478 0,00140555159194316 395085 428092 579 665 0 False 307 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 351 619 0,0173237599442242 0,0522824341696539 0,0108033875028611 0,0656137941557946 0,0152922098667962 0,0321713800461168 657346 2278509 579 665 0 False 351 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 395 619 0,0168588473271609 0,0525245592810132 0,0111238269626917 0,0538185702296483 0,0144336734862234 0,035897023824393 639705 2289061 579 665 0 False 395 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 439 619 0,01110822533754 0,0101877490705477 0,0103456168459602 0,0103150988021668 0,00511107078478946 0,00193417057919147 421499 443990 579 665 0 False 439 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 484 619 0,0110360414671167 0,0102554165225377 0,0103456168459602 0,0103150988021668 0,0045811290242048 0,00185134038483299 418760 446939 579 665 0 False 484 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 528 619 0,0102448651348875 0,00998548098330055 0,00996414129854276 0,0100099183642329 0,00318004923425494 0,00199127344622499 388739 435175 579 665 0 False 528 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 572 619 0,0100806264052498 0,0100661817051211 0,0100556954299229 0,0100404364080262 0,0018342095480075 0,00176150538336041 382507 438692 579 665 0 False 572 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 616 620 0,010209313458655 0,010199680937294 0,0101930266269932 0,0102235446707866 0,00167047387352358 0,00138115029683663 387390 444510 579 665 0 False 616 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 660 620 0,0100681872716829 0,0103228545155519 0,0100099183642329 0,0103303578240635 0,00151044309745607 0,00161254712991234 382035 449878 579 665 0 False 660 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 263 669 0,00987298247861068 0,0432233708556124 0,00987258716716258 0,0440985732814527 0,00123745468492142 0,00872087317385128 374628 1883708 579 665 0 True 263 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 307 662 0,010022173019124 0,00975985397230774 0,0100251773861295 0,0097962920576791 0,0012341783609839 0,00119063341053055 380289 425342 579 665 0 False 307 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 351 662 0,011970636792717 0,00971598141611754 0,0101167315175097 0,00978103303578241 0,00883034752196316 0,00126621043308663 454223 423430 579 665 0 False 351 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 395 662 0,0115079906279562 0,00971738111587047 0,0101777676050965 0,00971999694819562 0,00664436669844543 0,00139596202228363 436668 423491 579 665 0 False 395 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 439 662 0,00996055714141332 0,00980983013725662 0,00996414129854276 0,0097962920576791 0,00161200651753271 0,00158530171537046 377951 427520 579 665 0 False 439 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 483 663 0,00986813332484732 0,00984046291053796 0,0098268101014725 0,00987258716716258 0,00162053702433027 0,00151765755581199 374444 428855 579 665 0 False 483 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 528 663 0,00965450701829356 0,00982635118352071 0,00967421988250553 0,0097962920576791 0,00175760293321842 0,00166684695556583 366338 428240 579 665 0 False 528 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 572 663 0,0100270221728874 0,00983527713768284 0,0100556954299229 0,00987258716716258 0,0014598292370492 0,00143076576369958 380473 428629 579 665 0 False 572 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 616 663 0,00995286174522362 0,0098211654106656 0,00996414129854276 0,0098115510795758 0,00133768553383422 0,00139575665538914 377659 428014 579 665 0 False 616 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 659 668 0,0100127382525626 0,0443003365589529 0,0100709544518196 0,0442511635004196 0,00143102263771217 0,00905184580330184 379931 1930643 579 665 0 True 660 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F11_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F11_2.csv new file mode 100755 index 0000000..16eab91 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F11_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 264 273 0,00825839875408373 0,752324276013908 0,00814831769283589 0,773205157549401 0,00169372441664107 0,179446795692097 313363 32786875 579 665 10 True 264 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 308 273 0,00691072931931453 0,00697387781653722 0,00688181887541009 0,00697337300679027 0,00156144428104856 0,00126535353044083 262226 303927 579 665 0 False 308 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 353 273 0,00639814214161031 0,0063176939831841 0,00633249408712902 0,00633249408712902 0,00129369899406222 0,00132448016610562 242776 275330 579 665 0 True 352 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 397 273 0,00626020480031962 0,00630702414080521 0,00625619897764553 0,00630197604333562 0,00120493137698185 0,00122098061396641 237542 274865 579 665 0 True 396 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 441 272 0,00664233920015053 0,00658453182624678 0,00671396963454643 0,00654612039368277 0,00150464994965442 0,00156667141629048 252042 286959 579 665 0 True 440 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 485 272 0,00681443145055715 0,00673934779727988 0,00689707789730678 0,00679026474402991 0,00159300998403557 0,0015936150069787 258572 293706 579 665 0 True 484 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 530 274 0,00692612011169393 0,00704939276550268 0,0068207827878233 0,00703440909437705 0,00143432122504946 0,00141548080626023 262810 307218 579 665 0 True 528 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 574 273 0,00720921581672729 0,00729936537383743 0,00718699931334401 0,0072632944228275 0,00168955315140837 0,0016345507266213 273552 318112 579 665 0 True 573 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 617 274 0,00800529401091297 0,00768437458948355 0,00785839627679866 0,0076600289921416 0,00214931959116758 0,00184344470314439 303759 334891 579 665 0 False 617 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 659 271 0,00954363533414952 0,741185281812909 0,00952162966353857 0,755901426718547 0,00210633454641381 0,185534511413874 362131 32301429 579 665 12 True 661 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 264 316 0,00684929792027965 0,00655298121706188 0,0068055237659266 0,00659189745937285 0,00150434057833167 0,00138347490922921 259895 285584 579 665 0 False 264 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 308 316 0,00646600394020097 0,0062840552973186 0,00645456626230259 0,00634775310902571 0,00122700694897055 0,00117120343031519 245351 273864 579 665 0 False 308 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 354 318 0,00633902990307095 0,00648460244224661 0,00634775310902571 0,00648508430609598 0,00125612021197712 0,00131104507720722 240533 282604 579 665 0 True 352 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 397 317 0,00647000976287506 0,00657833643389774 0,00645456626230259 0,00660715648126955 0,00130367941420838 0,00127752823727944 245503 286689 579 665 0 True 396 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 441 317 0,00675189317946758 0,00702438173713065 0,0068207827878233 0,00697337300679027 0,00158346163575125 0,00162501985620173 256199 306128 579 665 0 True 440 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 485 318 0,00703857304163038 0,00694980756996634 0,00703440909437705 0,00686655985351339 0,00177944961518455 0,00154338852810919 267077 302878 579 665 0 True 484 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 529 317 0,00688998864533751 0,00708587674266922 0,00685130083161669 0,00709544518196384 0,00143066047664621 0,00151645820704801 261439 308808 579 665 0 True 528 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 574 318 0,00721240466240864 0,00734794183903338 0,00709544518196384 0,00733958953231098 0,00164713216044388 0,00169241257237343 273673 320229 579 665 0 True 572 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 617 317 0,00754620564918507 0,00734408692823843 0,007690547035935 0,00735484855420768 0,00192106342367019 0,00189593796464593 286339 320061 579 665 0 False 617 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 661 317 0,007648775792919 0,00754601082702178 0,00755321583886473 0,00762951094834821 0,00189341006060195 0,00180360310352761 290231 328861 579 665 0 False 661 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 265 362 0,00622844811398885 0,00627925960472249 0,00619516289005875 0,00628671702143893 0,0014452848005137 0,00142173511388084 236337 273655 579 665 0 True 264 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 309 362 0,00629715324366879 0,00643246936292436 0,00625619897764553 0,00646982528419928 0,00121542083684256 0,00137448763086247 238944 280332 579 665 0 True 308 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 354 362 0,00669025094766037 0,00656190717122401 0,00665293354695964 0,00666819256885634 0,00128489844897236 0,00129224982419317 253860 285973 579 665 0 True 352 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 397 362 0,00684342095675121 0,00685405433932738 0,00683604180972 0,00683604180972 0,00133109635111294 0,00131448727784585 259672 298705 579 665 0 True 396 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 442 362 0,00707370305231828 0,00712027264315515 0,00711070420386053 0,00715648126955062 0,00164442145338386 0,00173663364767352 268410 310307 579 665 0 True 440 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 484 360 0,00700884562073319 0,00693677430013578 0,00700389105058366 0,00698863202868696 0,00159275579175978 0,00163612090811063 265949 302310 579 665 0 False 484 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 528 360 0,0070390474153681 0,00697913242708511 0,00711070420386053 0,00698863202868696 0,0016215963853162 0,00161410147026188 267095 304156 579 665 0 False 528 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 573 362 0,00723860063436946 0,00718603558564528 0,00717174029144732 0,0072480354009308 0,00172491044143978 0,00187958550983737 274667 313173 579 665 0 True 572 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 618 363 0,00710321964044315 0,00713702314839514 0,00712596322575723 0,00717174029144732 0,00192527022889389 0,0019489090189434 269530 311037 579 665 0 True 616 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 662 362 0,00668563898076586 0,00656741418664537 0,00672922865644312 0,00666819256885634 0,00185123290544538 0,00186322582806148 253685 286213 579 665 0 True 661 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 265 406 0,0063928713223023 0,00626042102280191 0,0063935301747158 0,00619516289005875 0,00153140920828755 0,00140457718957101 242576 272834 579 665 0 True 263 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 309 406 0,00639218611579226 0,006561517090965 0,00642404821850919 0,00651560234988937 0,00137558656964641 0,00134527630097483 242550 285956 579 665 0 True 308 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 353 406 0,00648207993909041 0,00669774688495099 0,00648508430609598 0,00671396963454643 0,00123269883776509 0,00138873416961683 245961 291893 579 665 0 True 352 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 398 406 0,00697276686256984 0,00695928422567061 0,00698863202868696 0,00700389105058366 0,00147496718293943 0,00152260095913417 264580 303291 579 665 0 True 396 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 442 407 0,0071536350271243 0,00707658365414566 0,00712596322575723 0,00708018616006714 0,00153909675383756 0,00159648702738721 271443 308403 579 665 0 True 440 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 486 407 0,00688624636362882 0,00702032031325739 0,00689707789730678 0,00709544518196384 0,00161168258064018 0,00153651801992056 261297 305951 579 665 0 True 484 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 530 406 0,00702057319369352 0,00708943335679551 0,00703440909437705 0,00704966811627375 0,0015629836746139 0,0015906070101603 266394 308963 579 665 0 True 528 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 575 407 0,00674562090449104 0,00671608065712461 0,00685130083161669 0,00675974670023652 0,00176459600514467 0,0018987566882191 255961 292692 579 665 0 True 572 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 618 406 0,00641058127517722 0,006219715000479 0,00643930724040589 0,00628671702143893 0,00177079293215887 0,00176429998031812 243248 271060 579 665 0 True 616 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 662 406 0,00629069649001647 0,00616489725113883 0,00631723506523232 0,00622568093385214 0,00175738807192757 0,00172632097949007 238699 268671 579 665 0 True 660 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 266 452 0,00654422289873188 0,00653818111311697 0,00657663843747616 0,00663767452506294 0,00153267741905264 0,00155130162759733 248319 284939 579 665 0 True 263 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 310 451 0,00648012973594645 0,00652668521842487 0,00645456626230259 0,00646982528419928 0,00146693740889716 0,00144004419691925 245887 284438 579 665 0 True 307 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 354 452 0,00640718159672355 0,00656406408559738 0,00656137941557946 0,00662241550316625 0,00140304441014589 0,00142491095458241 243119 286067 579 665 0 True 352 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 398 450 0,00689615550392788 0,00692780245417848 0,00677500572213321 0,00692759594110018 0,00168819726579654 0,00148407434171254 261673 301919 579 665 0 True 396 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 442 450 0,00693402634065595 0,00707851110954314 0,00697337300679027 0,00697337300679027 0,0017510968334445 0,0019376648615129 263110 308487 579 665 0 True 440 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 487 451 0,00704112938899477 0,00708349036931996 0,00704966811627375 0,00709544518196384 0,00170814133384801 0,00193133713527755 267174 308704 579 665 0 True 484 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 530 451 0,0068126920801855 0,00676440471744709 0,00677500572213321 0,00675974670023652 0,00172690068655273 0,00166211371651489 258506 294798 579 665 0 True 528 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 575 451 0,00639595475159749 0,00621620427814788 0,00633249408712902 0,00628671702143893 0,00210614481952083 0,00193280699014177 242693 270907 579 665 0 True 572 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 619 451 0,00602631219352656 0,00584576570747078 0,00601205462729839 0,00593575951781491 0,00169224507589408 0,00177531517194777 228667 254763 579 665 0 True 616 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 663 450 0,00594506251389355 0,00614619634460378 0,0059510185397116 0,00610360875867857 0,00175762353804506 0,001801711119476 225584 267856 579 665 0 True 660 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 265 496 0,0064687184121446 0,00643095493368349 0,0063782711528191 0,00650034332799268 0,00143042025907437 0,00143532106857007 245454 280266 579 665 0 True 263 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 309 495 0,00656383034655769 0,00651902128863014 0,00656137941557946 0,00653086137178607 0,00149862837408776 0,00147007626509371 249063 284104 579 665 0 True 307 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 352 495 0,00649217355806526 0,00651886066734701 0,00657663843747616 0,00662241550316625 0,00145153395183162 0,00156861808489634 246344 284097 579 665 0 True 351 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 397 495 0,00687628451513667 0,00652914042946689 0,00675974670023652 0,00650034332799268 0,00155097346960463 0,00159098665421031 260919 284545 579 665 0 True 396 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 441 494 0,00699954262465455 0,00702539135662457 0,00701915007248035 0,00708018616006714 0,00175529653431476 0,00200134146473802 265596 306172 579 665 0 True 440 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 485 495 0,00687438702018579 0,00673670901905714 0,00689707789730678 0,00669871061264973 0,00178332606618178 0,00173547948756751 260847 293591 579 665 0 True 484 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 528 495 0,00641851385823578 0,00624002211984528 0,00643930724040589 0,00622568093385214 0,00165483846870901 0,001500204567256 243549 271945 579 665 0 True 528 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 573 495 0,00592980349199685 0,00616526438550026 0,00590524147402152 0,00614938582436866 0,00159942279552234 0,00172314545992664 225005 268687 579 665 0 True 572 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 617 494 0,00588734704247081 0,00595234940177177 0,00587472343022812 0,00602731364919509 0,00179965946483016 0,0017773103257911 223394 259408 579 665 0 True 616 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 661 495 0,00603553612731559 0,00607240233795751 0,00604257267109178 0,00607309071488518 0,00175672460663322 0,0018021485780742 229017 264640 579 665 0 True 660 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 265 539 0,00662281081461435 0,00645837528130236 0,00666819256885634 0,00645456626230259 0,00137109916878765 0,00143861265341324 251301 281461 579 665 0 True 263 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 309 539 0,00643725162087576 0,00665671962006183 0,00643930724040589 0,00654612039368277 0,00138146827996588 0,00129890070919431 244260 290105 579 665 0 True 307 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 354 539 0,00660931751718584 0,00671768686995585 0,00662241550316625 0,00677500572213321 0,0013583140049952 0,00149313522434939 250789 292762 579 665 0 True 351 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 397 539 0,00668740470523404 0,00660045627917356 0,00675974670023652 0,00648508430609598 0,00146380457249275 0,00151729913000398 253752 287653 579 665 0 True 395 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 440 538 0,00681303468344052 0,00675024709863466 0,00679026474402991 0,00672922865644312 0,00175276438709221 0,00199762626381429 258519 294181 579 665 0 True 440 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 485 539 0,00643930724040589 0,00647854472528311 0,00648508430609598 0,00650034332799268 0,00185706634896762 0,00197813629350857 244338 282340 579 665 0 True 484 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 529 539 0,00633979417187061 0,00610005214455227 0,00627145799954223 0,00621042191195544 0,00178652300791849 0,0018061177630122 240562 265845 579 665 0 True 528 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 573 539 0,00619413508029368 0,00623157802953252 0,00617990386816205 0,00627145799954223 0,00166204937297655 0,00156370444644789 235035 271577 579 665 0 True 572 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 617 538 0,00598119398024998 0,00593782464859792 0,00599679560540169 0,00593575951781491 0,0015970010952716 0,00170083031233857 226955 258775 579 665 0 True 616 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 661 538 0,00619782465380929 0,00636503136991024 0,00622568093385214 0,00633249408712902 0,00176652628770257 0,00179584265588834 235175 277393 579 665 0 True 660 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 263 576 0,00677945956444848 0,00666704527397689 0,00685130083161669 0,00662241550316625 0,00133764826397186 0,00131483775199256 257245 290555 579 665 0 False 263 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 309 583 0,00663345786961653 0,0067405639298521 0,00662241550316625 0,00677500572213321 0,00140860770045948 0,00139493762950151 251705 293759 579 665 0 True 307 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 353 583 0,00651106944528448 0,006325013724515 0,00648508430609598 0,00624093995574884 0,00136382789727756 0,00131465665314303 247061 275649 579 665 0 True 351 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 397 583 0,00653273251264041 0,00647831526630722 0,00653086137178607 0,00648508430609598 0,00141022070160426 0,00119850589804403 247883 282330 579 665 0 True 395 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 442 583 0,00640198983970516 0,00671431382301026 0,00642404821850919 0,00679026474402991 0,00176529745816045 0,00194066751160431 242922 292615 579 665 0 True 440 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 486 583 0,00641398095363089 0,00650373932083585 0,00643930724040589 0,00654612039368277 0,00177612842828979 0,00178622865654507 243377 283438 579 665 0 True 484 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 531 583 0,00634087468982876 0,00645149151202566 0,00650034332799268 0,0063782711528191 0,00193849522800446 0,00183693375682252 240603 281161 579 665 0 True 528 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 574 583 0,0060849500583282 0,00633304478867115 0,00616464484626535 0,0064087891966125 0,00152429615059453 0,00176869509761544 230892 275999 579 665 0 True 572 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 619 583 0,00606621229568822 0,00616386468574733 0,00608834973678187 0,00616464484626535 0,00135067662147658 0,00141406922567258 230181 268626 579 665 0 True 616 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 662 583 0,00616034912852932 0,00614078111277278 0,00611886778057527 0,00622568093385214 0,00153317743471413 0,00150799842786464 233753 267620 579 665 0 True 660 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 263 619 0,00672893876138118 0,00684762948800245 0,00675974670023652 0,00686655985351339 0,00131207251041722 0,00136594307640981 255328 298425 579 665 0 False 263 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 307 619 0,00664903314067171 0,00676130702127257 0,00662241550316625 0,00679026474402991 0,00132120439558244 0,00132720307728437 252296 294663 579 665 0 False 307 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 351 619 0,00632637993673172 0,00645637898821212 0,00631723506523232 0,00650034332799268 0,00128686022768546 0,00137266494985277 240053 281374 579 665 0 False 351 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 395 619 0,00635223330543752 0,00617735687352967 0,00636301213092241 0,00616464484626535 0,00127136799541389 0,00123810377899134 241034 269214 579 665 0 False 395 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 439 619 0,00625588272848705 0,00630362814796203 0,00628671702143893 0,00628671702143893 0,0016181572566727 0,00181132383565838 237378 274717 579 665 0 False 439 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 484 619 0,00619655965717537 0,0061549387315852 0,00614938582436866 0,00617990386816205 0,00175206602575011 0,001752683308282 235127 268237 579 665 0 False 484 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 528 619 0,00632063474368599 0,00612836738217712 0,00642404821850919 0,00614938582436866 0,00189976045154962 0,00185922164232896 239835 267079 579 665 0 False 528 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 572 619 0,00622328271106699 0,00675781924483904 0,00625619897764553 0,00642404821850919 0,00152157697876771 0,00332064707587578 236141 294511 579 665 0 False 572 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 616 620 0,00616432859710687 0,00615156568463962 0,00617990386816205 0,00617990386816205 0,00137594978861726 0,00135737270697078 233904 268090 579 665 0 False 616 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 660 620 0,0066014639964169 0,00673482745545484 0,00657663843747616 0,00675974670023652 0,00154307974630591 0,00152360937337878 250491 293509 579 665 0 False 660 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 263 669 0,00856365825430728 0,723483301983501 0,00830090791180285 0,747829404135195 0,0020234209425861 0,19898773678595 324946 31529963 579 665 10 True 263 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 307 662 0,00696768052193761 0,00661702321723283 0,00689707789730678 0,00659189745937285 0,00153494272237605 0,00123166833868668 264387 288375 579 665 0 False 307 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 351 662 0,00607609508189074 0,0061649660888316 0,00610360875867857 0,00611886778057527 0,00123862710556149 0,00124781304504886 230556 268674 579 665 0 False 351 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 395 662 0,00618332990071226 0,00598139890811946 0,00621042191195544 0,005981536583505 0,00135298763358765 0,00120546635265165 234625 260674 579 665 0 False 395 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 439 662 0,00614632874917001 0,0060719893118009 0,00607309071488518 0,00602731364919509 0,0015911878566499 0,00148107453544081 233221 264622 579 665 0 False 439 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 483 663 0,00600393756556405 0,00594323988042893 0,00601205462729839 0,005981536583505 0,00152316657507065 0,00150971405836255 227818 259011 579 665 0 False 483 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 528 663 0,00611789267900328 0,00617393793478891 0,00605783169298848 0,00614938582436866 0,00164344287218506 0,00169413871154713 232142 269065 579 665 0 False 528 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 572 663 0,00613370513692732 0,00624176600806204 0,00614938582436866 0,00625619897764553 0,00153023596974955 0,00141819251248469 232742 272021 579 665 0 False 572 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 616 663 0,00641759146485688 0,00641468629229288 0,00631723506523232 0,0063935301747158 0,00139433814090983 0,00126976986832694 243514 279557 579 665 0 False 616 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 659 668 0,00842740757519516 0,733208507650449 0,00823987182421607 0,744548714427405 0,00194387891147218 0,195924510467806 319776 31953795 579 665 13 True 660 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F11_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F11_3.csv new file mode 100755 index 0000000..012fb55 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F11_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 264 273 0,00101732083463951 0,0752083229359735 0,000778210116731518 0,0759288929579614 0,000794985076552665 0,0199305045098563 38602 3277637 579 665 0 True 264 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 308 273 0,000893430226804673 0,000895234194435505 0,000793469138628214 0,000762951094834821 0,000649807625448222 0,000659440833011196 33901 39015 579 665 0 False 308 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 353 273 0,000871925284027981 0,00097123100725033 0,000762951094834821 0,000869764248111696 0,000645369233392546 0,000677527693929677 33085 42327 579 665 0 True 352 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 397 273 0,000949907055690027 0,000906294117073411 0,000762951094834821 0,000747692072938125 0,000735641548498488 0,000649353510808417 36044 39497 579 665 0 True 396 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 441 272 0,000923421188667264 0,000972883111876739 0,000671396963454643 0,000732433051041428 0,000825371706434317 0,000877560903215821 35039 42399 579 665 0 True 440 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 485 272 0,000925608578680089 0,000898584295483502 0,000762951094834821 0,000625619897764553 0,000808559817988751 0,00088261656628576 35122 39161 579 665 0 True 484 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 530 274 0,000961713690939975 0,000890828582098414 0,000747692072938125 0,000656137941557946 0,000812184501388212 0,000833970368576622 36492 38823 579 665 0 True 528 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 574 273 0,000878750995031858 0,000975361268816353 0,000610360875867857 0,000671396963454643 0,000856481890091508 0,000926828196427179 33344 42507 579 665 0 True 573 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 617 274 0,00106934382120959 0,000994176904839347 0,000732433051041428 0,00064087891966125 0,00103067824191744 0,00100509479292224 40576 43327 579 665 0 False 617 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 659 271 0,00104667929818514 0,0747776743300228 0,000778210116731518 0,0740825513084611 0,000940739067502044 0,0214699051780692 39716 3258869 579 665 0 True 661 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 264 316 0,000908320291349808 0,000931603442114097 0,000778210116731518 0,000793469138628214 0,000693034311589211 0,000736134042046632 34466 40600 579 665 0 False 264 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 308 316 0,000802534947837996 0,000918432496898001 0,000671396963454643 0,00080872816052491 0,000637422110867405 0,00065513853395767 30452 40026 579 665 0 False 308 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 354 318 0,000991256633161386 0,000911594619416474 0,000900282291905089 0,000793469138628214 0,000645888319619133 0,000672701399411276 37613 39728 579 665 0 True 352 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 397 317 0,000865784779534147 0,000949363566847997 0,000717174029144732 0,000839246204318303 0,000694636082352906 0,000684148728897881 32852 41374 579 665 0 True 396 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 441 317 0,0010290220535033 0,000975889024460901 0,000823987182421607 0,000732433051041428 0,00090848204580258 0,000944017679972297 39046 42530 579 665 0 True 440 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 485 318 0,000996184849214378 0,00102141368527751 0,000778210116731518 0,000793469138628214 0,000864363146452722 0,000892536322376715 37800 44514 579 665 0 True 484 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 529 317 0,000854347101635759 0,000993580311502033 0,000656137941557946 0,00080872816052491 0,00078685148216491 0,000881875928164731 32418 43301 579 665 0 True 528 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 574 318 0,000937336151640417 0,000890966257483948 0,000732433051041428 0,00064087891966125 0,000910292735736651 0,000863470225449323 35567 38829 579 665 0 True 572 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 617 317 0,000955546832349601 0,000931557550318919 0,000534065766384375 0,000488288700694286 0,00106057471412826 0,00102902134932133 36258 40598 579 665 0 False 617 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 661 317 0,00100467086830028 0,00086944300554545 0,000656137941557946 0,000503547722590982 0,00105776080632733 0,000897306600925042 38122 37891 579 665 0 False 661 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 265 362 0,000961002130333394 0,000947527895040875 0,000823987182421607 0,000793469138628214 0,000741819680260299 0,000763887593954936 36465 41294 579 665 0 True 264 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 309 362 0,000858379278406389 0,000800192286621796 0,000778210116731518 0,00064087891966125 0,000623645585696589 0,000649664320165113 32571 34873 579 665 0 True 308 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 354 362 0,000874376215006207 0,000875385993021005 0,000747692072938125 0,000793469138628214 0,000666790187466771 0,000666522754868527 33178 38150 579 665 0 True 352 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 397 362 0,000879515263831519 0,000945348034769919 0,000717174029144732 0,000854505226215 0,000700745158837786 0,00066997582667712 33373 41199 579 665 0 True 396 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 442 362 0,000931670020884304 0,000987316081460231 0,000656137941557946 0,000762951094834821 0,00087261002372392 0,000874766889254265 35352 43028 579 665 0 True 440 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 484 360 0,000897330633092602 0,000911479889928529 0,000579842832074464 0,000595101853971161 0,000856895947998949 0,000891721837158972 34049 39723 579 665 0 False 484 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 528 360 0,000909532579790651 0,00101469053728393 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000823624542877994 0,000937449562841564 34512 44221 579 665 0 False 528 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 573 362 0,000914039130299002 0,000981992633219579 0,000625619897764553 0,000610360875867857 0,000929190130892776 0,00100876428855616 34683 42796 579 665 0 True 572 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 618 363 0,000901995308180193 0,000954273988932046 0,000457770656900893 0,000488288700694286 0,00106659845065392 0,00104542705707895 34226 41588 579 665 0 True 616 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 662 362 0,000892982207163491 0,00094110304371595 0,000473029678797589 0,000518806744487678 0,00100150573797358 0,00102295958717913 33884 41014 579 665 0 True 661 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 265 406 0,00084196067626193 0,000831742895806695 0,000686655985351339 0,000671396963454643 0,000720861322578883 0,00071110262380833 31948 36248 579 665 0 True 263 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 309 406 0,000894985118500536 0,000833601513511405 0,000793469138628214 0,000717174029144732 0,000690672963701731 0,000659179494165993 33960 36329 579 665 0 True 308 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 353 406 0,000882414214450926 0,000995255362026031 0,000732433051041428 0,000869764248111696 0,000675427247651132 0,000705167687512546 33483 43374 579 665 0 True 352 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 398 406 0,000949643514724627 0,000881833790243519 0,000823987182421607 0,000701915007248035 0,000745110577185694 0,000740949987870807 36034 38431 579 665 0 True 396 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 442 407 0,000950249658945048 0,000954228097136868 0,000686655985351339 0,000747692072938125 0,000834916398249204 0,000825072450217665 36057 41586 579 665 0 True 440 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 486 407 0,000869368936663595 0,000899593914977418 0,000579842832074464 0,00064087891966125 0,000841240902096582 0,000848325728887114 32988 39205 579 665 0 True 484 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 530 406 0,000920416821661697 0,000965127398491651 0,000701915007248035 0,000717174029144732 0,00083796990867368 0,000864232306195925 34925 42061 579 665 0 True 528 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 575 407 0,000889134509068642 0,000992157665851514 0,000656137941557946 0,000732433051041428 0,000897697436110432 0,000950077773908076 33738 43239 579 665 0 True 572 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 618 406 0,000836241837312736 0,000892365957236878 0,000442511635004196 0,000488288700694286 0,000920478957505962 0,000966386446469277 31731 38890 579 665 0 True 616 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 662 406 0,000954650793067239 0,000849984884389963 0,000595101853971161 0,000442511635004196 0,000950823499857178 0,00093079838728909 36224 37043 579 665 0 True 660 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 266 452 0,000914671628615963 0,00100865576621802 0,000762951094834821 0,000885023270008392 0,000764479450731858 0,000818857476684573 34707 43958 579 665 0 True 263 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 310 451 0,000839746932152564 0,000863522963967483 0,000701915007248035 0,000732433051041428 0,00075624198604547 0,000770092565988378 31864 37633 579 665 0 True 307 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 354 452 0,000889556174613283 0,000907854438109465 0,000762951094834821 0,000732433051041428 0,000753154285405394 0,000770201562332606 33754 39565 579 665 0 True 352 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 398 450 0,000843752754826654 0,000954457556112758 0,000625619897764553 0,000793469138628214 0,000771945569078231 0,000796076838590479 32016 41596 579 665 0 True 396 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 442 450 0,000953412150529856 0,000980248745002814 0,000625619897764553 0,000610360875867857 0,000955735084453649 0,00103871119074208 36177 42720 579 665 0 True 440 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 487 451 0,000901942599987113 0,000910975080181571 0,000488288700694286 0,000579842832074464 0,000964245324314599 0,000945339146597193 34224 39701 579 665 0 True 484 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 530 451 0,000972255329556001 0,000946105249390356 0,000671396963454643 0,00064087891966125 0,000951413122473896 0,000905302971069005 36892 41232 579 665 0 True 528 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 575 451 0,00103337047943241 0,000903425879874784 0,000732433051041428 0,000457770656900893 0,00100455670796875 0,00103787510265603 39211 39372 579 665 0 True 572 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 619 451 0,000893482934997753 0,000829356522457437 0,000534065766384375 0,000457770656900893 0,000910883465682892 0,000884048652351141 33903 36144 579 665 0 True 616 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 663 450 0,000815132205984146 0,00078959128193567 0,000411993591210803 0,000320439459830625 0,000907136853371489 0,000920523472054385 30930 34411 579 665 0 True 660 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 265 496 0,000994234646070413 0,000938877291649816 0,000854505226215 0,000762951094834821 0,000773494906426112 0,000785469159749679 37726 40917 579 665 0 True 263 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 309 495 0,000971570123045959 0,000873825671984952 0,000839246204318303 0,000701915007248035 0,00080918715123756 0,000796238968177086 36866 38082 579 665 0 True 307 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 352 495 0,000890926587633367 0,000851292800552537 0,000732433051041428 0,000686655985351339 0,000782850708492212 0,00078342957042392 33806 37100 579 665 0 True 351 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 397 495 0,00087545673296435 0,000953677395594732 0,000686655985351339 0,000747692072938125 0,00080046104577973 0,000809708449325933 33219 41562 579 665 0 True 396 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 441 494 0,00100427555685218 0,0010366956530718 0,00064087891966125 0,000686655985351339 0,00100904958752881 0,00105188414193482 38107 45180 579 665 0 True 440 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 485 495 0,000907002586522805 0,000897138703935394 0,000534065766384375 0,000518806744487678 0,000926165530655047 0,000948160418685077 34416 39098 579 665 0 True 484 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 528 495 0,000878039434425276 0,000932383602632124 0,000610360875867857 0,000656137941557946 0,000835062897761832 0,000858623074708803 33317 40634 579 665 0 True 528 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 573 495 0,000851738046078293 0,000880594711773712 0,000534065766384375 0,000473029678797589 0,000885299026882522 0,000945017148303201 32319 38377 579 665 0 True 572 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 617 494 0,000918940992255453 0,00097146046622622 0,000534065766384375 0,000671396963454643 0,000933990036549049 0,00090683289155902 34869 42337 579 665 0 True 616 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 661 495 0,000848812741362346 0,000870452625039366 0,000549324788281071 0,000457770656900893 0,000889085975524639 0,000960204611797257 32208 37935 579 665 0 True 660 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 265 539 0,000969514503515834 0,000861297211901349 0,00080872816052491 0,000701915007248035 0,000756569896683701 0,000715196306471326 36788 37536 579 665 0 True 263 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 309 539 0,00082098281541604 0,000904481391163879 0,000701915007248035 0,000762951094834821 0,000714625645501536 0,000767319566195015 31152 39418 579 665 0 True 307 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 354 539 0,000905184153861541 0,000898194215224488 0,000793469138628214 0,000732433051041428 0,000758523474763188 0,000709029232049916 34347 39144 579 665 0 True 351 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 397 539 0,000903734678551837 0,000931832901089988 0,000625619897764553 0,000762951094834821 0,000840350998176301 0,000816568597416847 34292 40610 579 665 0 True 395 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 440 538 0,00090932174701833 0,000910171973765955 0,000473029678797589 0,000473029678797589 0,000976999759339366 0,00103275982030614 34504 39666 579 665 0 True 440 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 485 539 0,000880595781789662 0,000876326774822155 0,000473029678797589 0,000473029678797589 0,000974400196065667 0,0010119799414618 33414 38191 579 665 0 True 484 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 529 539 0,000905526757116561 0,000892044714670632 0,000503547722590982 0,000473029678797589 0,000971548238734027 0,000972498710957135 34360 38876 579 665 0 True 528 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 573 539 0,000893061269453112 0,000865886391419152 0,000579842832074464 0,000579842832074464 0,000904223059563882 0,000829370393106066 33887 37736 579 665 0 True 572 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 617 538 0,000849471593775848 0,000927037208493883 0,000564583810177768 0,000579842832074464 0,000839746541770426 0,000936136054911007 32233 40401 579 665 0 True 616 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 661 538 0,000787381342327459 0,000798746695073688 0,0004272526131075 0,000335698481727321 0,000872056770182667 0,000939890196365803 29877 34810 579 665 0 True 660 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 263 576 0,000853398354160317 0,0009102867032539 0,000747692072938125 0,000778210116731518 0,00062627325176936 0,000654561623672787 32382 39671 579 665 0 False 263 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 309 583 0,00090499967518576 0,000901773775248375 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,00073908788129667 0,000718578613933402 34340 39300 579 665 0 True 307 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 353 583 0,000877380582011774 0,00103637441050555 0,000747692072938125 0,000930800335698482 0,00068583727565355 0,000777842584020166 33292 45166 579 665 0 True 351 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 397 583 0,000856244596586644 0,000922241515897778 0,000686655985351339 0,000778210116731518 0,000746865354909338 0,000682336418369916 32490 40192 579 665 0 True 395 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 442 583 0,000932803247035526 0,000950556753522626 0,000518806744487678 0,000549324788281071 0,000971945395212991 0,00101999057247046 35395 41426 579 665 0 True 440 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 486 583 0,000849787842934328 0,000939129696523295 0,000442511635004196 0,000564583810177768 0,000959110604918374 0,000998156389655003 32245 40928 579 665 0 True 484 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 531 583 0,000965324202165964 0,000964507859256748 0,000701915007248035 0,000579842832074464 0,000965261961279186 0,00102080717865362 36629 42034 579 665 0 True 528 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 574 583 0,00096780148724073 0,000945026792203672 0,000701915007248035 0,000549324788281071 0,000867299301541719 0,000987721800468024 36723 41185 579 665 0 True 572 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 619 583 0,000866575402430348 0,000825432773969715 0,000656137941557946 0,000595101853971161 0,000741331622701026 0,000745548013481504 32882 35973 579 665 0 True 616 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 662 583 0,000865732071341066 0,000812996097476468 0,000595101853971161 0,000549324788281071 0,000803554555560637 0,000797697562459881 32850 35431 579 665 0 True 660 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 263 619 0,000868973625215494 0,0010036765064412 0,000732433051041428 0,000885023270008392 0,000671579753823839 0,000747177864707185 32973 43741 579 665 0 False 263 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 307 619 0,000865310405796425 0,000799320342513413 0,000747692072938125 0,000625619897764553 0,000669404173466739 0,000690320157620303 32834 34835 579 665 0 False 307 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 351 619 0,000920311405275537 0,000908841111705792 0,000839246204318303 0,000793469138628214 0,000672896997484442 0,000729520728891377 34921 39608 579 665 0 False 351 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 395 619 0,000874903296937008 0,000948973486588983 0,000717174029144732 0,000854505226215 0,000676419989793572 0,000682710639430462 33198 41357 579 665 0 False 395 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 439 619 0,000925081496749288 0,000895463653411395 0,000610360875867857 0,000549324788281071 0,000916413147223281 0,000899468450023322 35102 39025 579 665 0 False 439 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 484 619 0,000847495036535343 0,000864027773714442 0,000457770656900893 0,0004272526131075 0,000976094630706334 0,000997796630061466 32158 37655 579 665 0 False 484 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 528 619 0,000943740197099653 0,000843674762552983 0,000534065766384375 0,000411993591210803 0,000997725828670919 0,000971536188205816 35810 36768 579 665 0 False 528 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 572 619 0,000884917853622232 0,000911388106338173 0,000610360875867857 0,000610360875867857 0,000863603071046622 0,000887085550058781 33578 39719 579 665 0 False 572 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 616 620 0,000890267735219865 0,000766737167937009 0,000747692072938125 0,000610360875867857 0,000699459381052458 0,000648803639367649 33781 33415 579 665 0 False 616 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 660 620 0,000926451909769371 0,00092944652774073 0,000732433051041428 0,000762951094834821 0,000750224494978246 0,000780144338976384 35154 40506 579 665 0 False 660 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 263 669 0,000923921916501525 0,0725489392972016 0,000762951094834821 0,0736095216296635 0,000728369658028417 0,0218086381462702 35058 3161739 579 665 0 True 263 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 307 662 0,000928902840747597 0,000906018766302343 0,000778210116731518 0,000793469138628214 0,000700515999915606 0,000641581120604681 35247 39485 579 665 0 False 307 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 351 662 0,000953174963660995 0,000904114256802455 0,000823987182421607 0,000823987182421607 0,000671482636732875 0,00060635776136588 36168 39402 579 665 0 False 351 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 395 662 0,000831814349094005 0,00091239772583209 0,000656137941557946 0,000793469138628214 0,000666740293301599 0,000673124750398192 31563 39763 579 665 0 False 395 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 439 662 0,000956680058500823 0,000868594007334656 0,000732433051041428 0,000686655985351339 0,000823148427046876 0,000760418503309604 36301 37854 579 665 0 False 439 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 483 663 0,00087137184800064 0,000931511658523741 0,000610360875867857 0,000717174029144732 0,000824074676647328 0,000771418766819427 33064 40596 579 665 0 False 483 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 528 663 0,000862727704335499 0,00089885964625457 0,000534065766384375 0,000579842832074464 0,000878914361966571 0,00085291560871774 32736 39173 579 665 0 False 528 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 572 663 0,000945268734698976 0,000890415555941812 0,000732433051041428 0,000717174029144732 0,000764908392231867 0,000737407834366131 35868 38805 579 665 0 False 572 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 616 663 0,000914618920422883 0,000950625591215393 0,00080872816052491 0,000778210116731518 0,000689493403233838 0,000761930570329727 34705 41429 579 665 0 False 616 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 659 668 0,000972228975459461 0,0733307978116498 0,000839246204318303 0,0731670099946593 0,000733038938969045 0,0216757534741889 36891 3195813 579 665 0 True 660 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F12_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F12_1.csv new file mode 100755 index 0000000..738a377 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F12_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 238 250 0,0101757591945098 0,0434618016774598 0,0102235446707866 0,0432135500114443 0,00178974686536874 0,00819465735847843 415459 1894099 623 665 0 True 237 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 282 250 0,0104860831229707 0,0105111714970649 0,0105287251087205 0,0104676890211337 0,00153252703846113 0,00150264749265247 428129 458085 623 665 0 False 282 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 326 249 0,0105730815913127 0,0596387053695121 0,0105745021744106 0,0602883955138476 0,00131951413777579 0,00942291135645513 431681 2599101 623 665 0 True 326 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 370 250 0,0105765840634334 0,0800558503147317 0,010605020218204 0,0794995040817884 0,00138316267548638 0,00888648511446589 431824 3488896 623 665 0 True 370 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 413 249 0,0104134374424802 0,0691376185944376 0,010452429999237 0,0686961165789273 0,00152619360664826 0,0145009294829537 425163 3013071 623 665 0 True 414 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 457 250 0,010399329582749 0,0646937095542702 0,0103608758678569 0,0661020828564889 0,00172150743148075 0,0186794843090021 424587 2819402 623 665 0 True 458 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 502 250 0,0104763594765935 0,0776823725599189 0,0104676890211337 0,0766613260090028 0,00170203071173638 0,0200390943958691 427732 3385458 623 665 0 True 502 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 547 249 0,0103705995142341 0,067229323021447 0,0103456168459602 0,0659800106813153 0,00154323988193923 0,0174716673098931 423414 2929906 623 665 0 True 547 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 591 251 0,010088883190228 0,00981994927809338 0,0101167315175097 0,00976577401388571 0,00175682700261803 0,00200245538653721 411912 427961 623 665 0 False 591 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 634 248 0,00980006395073222 0,0438312076827454 0,00976577401388571 0,0437323567559319 0,0018626208520083 0,00796422489206107 400120 1910198 623 665 0 True 635 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 237 294 0,0103831398339951 0,0103068153331371 0,0103761348897536 0,0103761348897536 0,0014672579016499 0,00154853374993491 423926 449179 623 665 0 False 237 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 282 294 0,0106151357495737 0,0103188160375762 0,0106507972838941 0,0102845807583734 0,00140046396964185 0,00141707151341387 433398 449702 623 665 0 False 282 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 325 294 0,0106830788101539 0,10255928216054 0,0107270923933776 0,0973983367666133 0,00137949143992837 0,0381225658773172 436172 4469613 623 665 0 True 326 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 369 295 0,0104207852860901 0,0485001241946707 0,0104219119554437 0,0481879911497673 0,00128049563443575 0,00701385318183561 425463 2113673 623 665 0 True 370 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 414 294 0,0104226467398047 0,0780977162521777 0,0103761348897536 0,0789196612497139 0,00146237752839749 0,0162968197154779 425539 3403559 623 665 0 True 414 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 458 295 0,0102935451275775 0,0415215883609229 0,0102845807583734 0,0419623102159152 0,00185902443148196 0,00828115310238934 420268 1809543 623 665 0 True 458 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 502 294 0,0103921531888233 0,0465911861365476 0,010452429999237 0,0475776302738994 0,00168835800569177 0,0114682654907438 424294 2030480 623 665 0 True 502 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 546 294 0,0102048076695812 0,0512951639799889 0,0102082856488899 0,0513618677042802 0,00146311504842753 0,0109935839408104 416645 2235483 623 665 0 True 547 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 591 294 0,0102074039076567 0,00994573868867637 0,01025406271458 0,00993362325474937 0,00181723344504619 0,00200432124853112 416751 433443 623 665 0 False 591 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 635 294 0,00981524949419282 0,00956412546587343 0,0098268101014725 0,00952162966353857 0,00190409340177808 0,00194900186343303 400740 416812 623 665 0 False 635 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 238 340 0,0104115025103295 0,0479405425901673 0,0104371709773404 0,0464484626535439 0,00161226858896486 0,00864659377650303 425084 2089286 623 665 0 True 237 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 282 338 0,0105056528797852 0,0570403807642246 0,0105287251087205 0,0593881132219425 0,00141163743924735 0,0150849643361822 428928 2485864 623 665 0 True 282 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 326 337 0,0105517728448438 0,0373958471367249 0,0105439841306172 0,0382543678950179 0,00137957921671558 0,00604683947670877 430811 1629740 623 665 0 True 326 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 370 338 0,0103969782727938 0,0336120227325007 0,0104371709773404 0,0339665827420462 0,00135605677041369 0,00461562957784529 424491 1464838 623 665 0 True 370 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 415 338 0,010339567121388 0,0660572924643951 0,0103150988021668 0,064637216754406 0,00157701463464562 0,0100454133222253 422147 2878828 623 665 0 True 414 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 458 339 0,0102637373753331 0,0323657621967485 0,0101777676050965 0,0330357824063478 0,00175349505255012 0,00476530961264418 419051 1410525 623 665 0 True 458 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 503 338 0,0102264838082306 0,0296930699373749 0,0102693217364767 0,029556725413901 0,00167524986689534 0,0043304844452193 417530 1294047 623 665 0 True 502 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 546 338 0,010352131933961 0,0501446796207731 0,010406652933547 0,0504921034561685 0,0016577482241444 0,00800598013258604 422660 2185344 623 665 0 True 547 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 591 338 0,0102536463367754 0,0580429788134791 0,01025406271458 0,057099259937438 0,00209711799637908 0,0140215957985356 418639 2529558 623 665 0 True 591 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 636 337 0,010218670601192 0,061802251107283 0,0102845807583734 0,0604867627985046 0,00193989105625815 0,016915322293716 417211 2693390 623 665 0 True 635 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 238 383 0,0103144374962419 0,0408084069179587 0,0103456168459602 0,041718165865568 0,00166405996316675 0,00862348951127446 421121 1778462 623 665 0 True 237 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 282 383 0,010367611391166 0,0306226770863988 0,0103608758678569 0,0310368505378805 0,00141729948655741 0,00387332406650247 423292 1334560 623 665 0 True 282 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 327 384 0,0106173890882808 0,0800152590218967 0,0105745021744106 0,0782330052643626 0,00147680561143404 0,0147299929919207 433490 3487127 623 665 0 True 326 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 371 383 0,0103315334790411 0,0621250769404629 0,01025406271458 0,0604257267109178 0,00144526474301491 0,014514984824367 421819 2707459 623 665 0 True 370 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 416 381 0,0103588919500822 0,0400330650384258 0,0103608758678569 0,0412451361867704 0,00159587447974132 0,00674805402491063 422936 1744672 623 665 0 True 414 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 458 383 0,010532741929894 0,0504706949337179 0,0105439841306172 0,0508888380254826 0,00168215107942448 0,00879991179044526 430034 2199552 623 665 0 True 458 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 503 383 0,0105428819540757 0,0395329821463707 0,0106202792401007 0,0402380407415885 0,00178935742887163 0,00481654222204261 430448 1722878 623 665 0 True 502 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 548 382 0,010436877063596 0,0500163432155578 0,0104371709773404 0,0501258869306477 0,00170814683732682 0,00896657429173616 426120 2179751 623 665 0 True 547 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 592 383 0,0104602432062756 0,0416326694511513 0,0105439841306172 0,0419165331502251 0,00204939682712392 0,00835180387073929 427074 1814384 623 665 0 True 591 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 635 382 0,0102362564402318 0,0805689205848221 0,01025406271458 0,075745784695201 0,00194646797800551 0,0147998773706575 417929 3511256 623 665 0 True 635 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 239 427 0,010039505681169 0,0396334392860154 0,0100251773861295 0,0397802700846876 0,00158900018422162 0,00574918432265078 409896 1727256 623 665 0 True 237 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 283 427 0,0103289127481535 0,0478872622159656 0,0103303578240635 0,0473640039673457 0,00148148529093096 0,0056359802918381 421712 2086964 623 665 0 True 282 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 327 427 0,0102751020401165 0,0330000785896992 0,0102235446707866 0,0327611200122072 0,00147153752455842 0,00398931413173745 419515 1438169 623 665 0 True 326 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 371 426 0,0102286881613136 0,0530688359718247 0,0102082856488899 0,0501258869306477 0,0014404425773689 0,013527556777851 417620 2312781 623 665 0 True 370 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 415 426 0,0104436860653412 0,0934754143312045 0,0104829480430304 0,0917372396429389 0,00158728425078994 0,0132878447768336 426398 4073731 623 665 0 True 414 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 458 427 0,0105296803283898 0,0596061910326285 0,0105745021744106 0,0588998245212482 0,00166808885951687 0,0137096507743965 429909 2597684 623 665 0 True 458 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 503 426 0,0104382486610698 0,0512869722945496 0,0103913939116503 0,0511329823758297 0,00175006874504113 0,00875553888334523 426176 2235126 623 665 0 True 502 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 547 424 0,0106515075754431 0,0298916896269054 0,0105592431525139 0,0305485618371862 0,00171871046917005 0,0045235225592002 434883 1302703 623 665 0 False 547 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 591 426 0,0103494867102614 0,0398140005541434 0,0102693217364767 0,0395208667124437 0,00192853591259159 0,006049376197082 422552 1735125 623 665 0 True 591 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 636 426 0,010377947357844 0,065398538690512 0,0104676890211337 0,0643472953383688 0,00201172035228375 0,00897742537200873 423714 2850119 623 665 0 True 635 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 237 471 0,00998275583568801 0,0456825285920225 0,00996414129854276 0,0464026855878538 0,00150749563922173 0,0110051163982999 407579 1990880 623 665 0 True 237 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 282 471 0,0101922183641961 0,0507095158358244 0,0101167315175097 0,0501106279087511 0,00153369394192812 0,00779171644338783 416131 2209960 623 665 0 True 282 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 326 469 0,0104854952954819 0,0597638522949626 0,0105439841306172 0,059510185397116 0,00151481696892037 0,0161803539567414 428105 2604555 623 665 0 True 326 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 370 470 0,0106972111626971 0,0799772376695917 0,0106660563057908 0,0765392538338293 0,00162639425230511 0,0195616636354407 436749 3485470 623 665 0 True 370 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 414 470 0,0106289496955605 0,0855270012981642 0,0105745021744106 0,0841840238040742 0,00174493181807913 0,0266395780060626 433962 3727333 623 665 0 True 414 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 459 472 0,0104529198554777 0,0437616816130507 0,0103913939116503 0,0441290913252461 0,00200941668194655 0,00724744798470442 426775 1907168 623 665 0 True 458 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 502 470 0,0104730774397811 0,038243032621609 0,0105287251087205 0,039658197909514 0,00189004698151453 0,00544471449195257 427598 1666661 623 665 0 True 502 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 547 471 0,0103391507435834 0,0899598963074888 0,0103608758678569 0,0878461890592813 0,00187407551644295 0,0141387142887159 422130 3920522 623 665 0 True 546 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 590 469 0,0104073632250959 0,059990901951606 0,0104371709773404 0,0608072022583352 0,00194051326390489 0,0168713117394145 424915 2614450 623 665 0 True 591 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 636 471 0,0102985661540444 0,069161321706647 0,0102693217364767 0,0679484245059892 0,00207573781169855 0,0113918555573626 420473 3014104 623 665 0 True 635 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 237 515 0,00996730087129505 0,0446831429684305 0,00988784618905928 0,0477759975585565 0,00148917134547922 0,0110380954140578 406948 1947326 623 665 0 True 237 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 282 515 0,0102803679947037 0,0934410413766162 0,0102388036926833 0,086305027847715 0,0016785766299167 0,0248600975552832 419730 4072233 623 665 0 True 281 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 326 514 0,0134928452209809 0,0506807187343502 0,0105287251087205 0,0522163729304952 0,0183347929315982 0,0109735525411515 550890 2208705 623 665 0 True 326 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 371 515 0,0105086165100413 0,0535395710608634 0,0105134660868238 0,0521553368429084 0,00160719235302616 0,00844413738551249 429049 2333296 623 665 0 True 370 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 414 514 0,0107373548816195 0,052414809052845 0,0107270923933776 0,0525673304341192 0,0018176900896274 0,00716107240081312 438388 2284278 623 665 0 True 414 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 458 515 0,0104371709773404 0,0553014947531337 0,0103608758678569 0,0559395742732891 0,00191597893191947 0,0101471302871026 426132 2410082 623 665 0 True 458 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 503 514 0,0106911369453128 0,0658553456197142 0,0107270923933776 0,0660715648126955 0,00183795576918505 0,0161519720020316 436501 2870027 623 665 0 True 502 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 547 515 0,0102781391488087 0,0526640932842521 0,0103456168459602 0,0536964980544747 0,00182665980074157 0,0110684184445137 419639 2295142 623 665 0 True 546 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 591 514 0,0102613615725659 0,0400202153357759 0,0102082856488899 0,039810788128481 0,00178717424979921 0,00553345279210397 418954 1744112 623 665 0 True 591 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 635 514 0,0101706646896069 0,0604368784171461 0,0101777676050965 0,0620889600976577 0,00196140094558444 0,0121137656465596 415251 2633886 623 665 0 True 635 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 238 559 0,00987273412403479 0,0407367468797882 0,00984206912336919 0,0419623102159152 0,0013747704157245 0,00876016357108698 403087 1775339 623 665 0 True 237 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 282 559 0,0100184418628204 0,0450318058822956 0,0100099183642329 0,0462348363469902 0,00139314718903104 0,0104628579136574 409036 1962521 623 665 0 True 281 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 326 558 0,0102413019595107 0,0442854446714176 0,0101625085831998 0,045288776989395 0,00153433811246083 0,00838736077864537 418135 1929994 623 665 0 True 326 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 371 559 0,0105726652135081 0,0448035630389776 0,0106355382619974 0,0444800488288701 0,00142829048940173 0,00548926612318206 431664 1952574 623 665 0 True 370 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 415 559 0,0105484908080313 0,0780751374889501 0,0104982070649271 0,0739757381551843 0,00174247605681673 0,0167525023909428 430677 3402575 623 665 0 True 414 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 459 559 0,0105376894779247 0,055734231435765 0,0104829480430304 0,0554055085069047 0,00198005884126374 0,00955372983575808 430236 2428941 623 665 0 True 458 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 504 559 0,0101576834992293 0,0519559599387574 0,01025406271458 0,0512550545510033 0,00211963409235067 0,00762175103832515 414721 2264281 623 665 0 True 502 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 546 554 0,0100716157577445 0,0318697636744643 0,0100862134737163 0,0354619668879225 0,0019567121894174 0,00998986835965472 411207 1388909 623 665 0 False 546 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 592 559 0,00997624074768718 0,0469991412497827 0,0100099183642329 0,0467078660257877 0,00173355211270495 0,00844258237493878 407313 2048259 623 665 0 True 591 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 635 559 0,0100228260761744 0,0503871948123915 0,0100099183642329 0,0495002670328832 0,00182797544645411 0,00701201267984853 409215 2195913 623 665 0 True 635 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 237 597 0,00980537889094343 0,00967022729632504 0,00975051499198901 0,00967421988250553 0,00155005735377079 0,00127619758022216 400337 421436 623 665 0 False 237 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 281 597 0,010342530751644 0,00964299051588688 0,00993362325474937 0,00968947890440223 0,00280313523058798 0,00146445750712177 422268 420249 623 665 0 False 281 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 327 602 0,0100699012609022 0,0670197122469713 0,010101472495613 0,0658731975280385 0,00147453792290709 0,0116306878259192 411137 2920771 623 665 0 True 326 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 370 602 0,0101129351316446 0,0680292399572977 0,0101167315175097 0,0668039978637369 0,00144711484856112 0,0180465465002648 412894 2964767 623 665 0 True 370 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 414 597 0,0102319946909381 0,0100596880161034 0,0100862134737163 0,0100862134737163 0,00227422679178916 0,00159451818720567 417755 438409 623 665 0 False 414 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 458 597 0,0102212668392675 0,00999532477336624 0,01025406271458 0,00996414129854276 0,00208357566095753 0,00194340713094351 417317 435604 623 665 0 False 458 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 502 597 0,00996632115881372 0,00984314758055588 0,0100709544518196 0,00985732814526589 0,00210330304667283 0,00207260744053273 406908 428972 623 665 0 False 502 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 546 597 0,00974478367397324 0,00978059706372821 0,00970473792629892 0,00976577401388571 0,00184056111330793 0,00185163697211874 397863 426246 623 665 0 False 546 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 591 597 0,00962170729350631 0,0097035447396243 0,00952162966353857 0,00973525597009232 0,00170749315023344 0,00177875562640859 392838 422888 623 665 0 False 591 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 635 597 0,00973905235595747 0,00971910205818965 0,00971999694819562 0,00971999694819562 0,00177858874540721 0,00143422535507535 397629 423566 623 665 0 False 635 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 238 646 0,00946963142359204 0,0404104332701748 0,00952162966353857 0,0415350576028077 0,00126560900898647 0,00776542207581869 386629 1761118 623 665 0 True 237 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 281 640 0,00958335154986228 0,00934831929904872 0,00965896086060884 0,0093842984664683 0,00135126326516254 0,00134356953774117 391272 407407 623 665 0 False 281 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 326 640 0,0107425718505826 0,00965455524827174 0,00964370183871214 0,00965896086060884 0,00602282253250201 0,00130109260889973 438601 420753 623 665 0 False 326 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 370 640 0,0103421878522755 0,00957190412515611 0,0098268101014725 0,00956740672922866 0,00359988181804523 0,00125823778566343 422254 417151 623 665 0 False 370 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 414 640 0,0096455877852387 0,00965721697239207 0,00962844281681544 0,00968947890440223 0,00138482128602932 0,00141081057347406 393813 420869 623 665 0 False 414 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 458 640 0,00950272121264892 0,00972013462358115 0,00958266575112535 0,00976577401388571 0,00170613662180665 0,00172023998917643 387980 423611 623 665 0 False 458 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 502 640 0,00971958057039106 0,00975012491173 0,00978103303578241 0,00990310521095598 0,00188393905565079 0,00182718576353146 396834 424918 623 665 0 False 502 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 546 640 0,0096383624056889 0,00971191999224429 0,00959792477302205 0,00970473792629892 0,00182917769997568 0,00163749895388685 393518 423253 623 665 0 False 546 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 591 640 0,00956236120994981 0,00954774209499487 0,00962844281681544 0,00959792477302205 0,00144264379275152 0,00134016307512414 390415 416098 623 665 0 False 591 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 635 645 0,00968051453519807 0,042054552724223 0,00964370183871214 0,0430457007705806 0,00139728863543592 0,00838179711948577 395239 1832770 623 665 0 True 635 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F12_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F12_2.csv new file mode 100755 index 0000000..507f604 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F12_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 238 250 0,00819262518980399 0,692565127627951 0,00801098649576562 0,690699626153964 0,00193518185330273 0,185269275404364 334491 30182525 623 665 7 True 237 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 282 250 0,00697949620979857 0,00698915978433151 0,00689707789730678 0,00703440909437705 0,00152663259612578 0,00133655957835814 284961 304593 623 665 0 False 282 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 326 249 0,00650707885130181 0,00650523080417914 0,00651560234988937 0,00653086137178607 0,00124721165331695 0,0011979922988033 265673 283503 623 665 0 True 326 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 370 250 0,00629350153037213 0,00644990824509202 0,00630197604333562 0,00648508430609598 0,00128007808288478 0,00112048347301189 256953 281092 623 665 0 True 370 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 413 249 0,00627750772411444 0,00646427237698274 0,00625619897764553 0,00650034332799268 0,00136133186281547 0,00140163995765996 256300 281718 623 665 0 True 414 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 457 250 0,0065454835805699 0,00644704000789339 0,00657663843747616 0,00646982528419928 0,00160377618102178 0,00149914701318607 267241 280967 623 665 0 True 458 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 502 250 0,00675599929999543 0,00682734531453376 0,0068055237659266 0,00672922865644312 0,00152401353437887 0,00165259880458438 275836 297541 623 665 0 True 502 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 547 249 0,0069298247869952 0,00708562433779574 0,00691233691920348 0,00704966811627375 0,00146782441170527 0,0014457668324836 282933 308797 623 665 0 True 547 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 591 251 0,00745098284143807 0,00738662862236846 0,00740062561989776 0,00730907148851759 0,00175728697277011 0,00183604755076247 304211 321915 623 665 0 False 591 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 634 248 0,00899579348199735 0,717853916090294 0,00904859998474098 0,716197451743343 0,00189569038476921 0,177691246123862 367283 31284630 623 665 8 True 635 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 237 294 0,00684860662229304 0,00652482660072016 0,0068207827878233 0,00654612039368277 0,00165270880303342 0,0014396513264186 279617 284357 623 665 0 False 237 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 282 294 0,0064800877724412 0,00636828968736788 0,00653086137178607 0,00636301213092241 0,00129111047121334 0,00134474844029242 264571 277535 623 665 0 False 282 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 325 294 0,00619582419598364 0,00608722538780001 0,00617990386816205 0,00611886778057527 0,00135503544356316 0,00117658735644567 252965 265286 623 665 0 True 326 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 369 295 0,00607061694086982 0,00610152068199797 0,00608834973678187 0,00605783169298848 0,00128399648478118 0,00120494321969276 247853 265909 623 665 0 True 370 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 414 294 0,0063076338829153 0,00608362288187853 0,00627145799954223 0,00607309071488518 0,00134329501038942 0,00147280207371109 257530 265129 623 665 0 True 414 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 458 295 0,00648050415024577 0,00669249227440311 0,00648508430609598 0,00662241550316625 0,00170094057622001 0,00184516871903998 264588 291664 623 665 0 True 458 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 502 294 0,00669119131935553 0,00690510896146294 0,00669871061264973 0,00695811398489357 0,00160074511740377 0,00155385400260238 273190 300930 623 665 0 True 502 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 546 294 0,00694770453977945 0,00722580082616704 0,00695811398489357 0,00715648126955062 0,0014724107515242 0,00145740414404776 283663 314906 623 665 0 True 547 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 591 294 0,00750222180421156 0,00711478857363138 0,00755321583886473 0,00703440909437705 0,00169181883547062 0,00193997437341808 306303 310068 623 665 0 False 591 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 635 294 0,00778942451811311 0,00748006431735094 0,00781261921110857 0,00752269779507134 0,00192135702094151 0,00198103220272199 318029 325987 623 665 0 False 635 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 238 340 0,00616302832067116 0,00619757220930559 0,00617990386816205 0,00624093995574884 0,00146115239297809 0,00141939043712333 251626 270095 623 665 0 True 237 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 282 338 0,00611284254881509 0,00620702591911227 0,00610360875867857 0,00624093995574884 0,00131620037971204 0,00138853897660787 249577 270507 623 665 0 True 282 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 326 337 0,00613427375934416 0,00599108207690203 0,00610360875867857 0,00602731364919509 0,00126975614787829 0,0012085684450706 250452 261096 623 665 0 True 326 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 370 338 0,00621096075382017 0,0061670541655122 0,00627145799954223 0,00619516289005875 0,00126082238804634 0,00115578137206424 253583 268765 623 665 0 True 370 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 415 338 0,00639362814596393 0,0063335725443157 0,00633249408712902 0,0064087891966125 0,00146620442783961 0,00141230559448483 261041 276022 623 665 0 True 414 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 458 339 0,00659941675266705 0,00679283468455988 0,00662241550316625 0,00677500572213321 0,00157172071632782 0,00146829073434567 269443 296037 623 665 0 True 458 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 503 338 0,00679077909308261 0,00670614508346857 0,0068055237659266 0,00675974670023652 0,00154886390267004 0,00157987686788934 277256 292259 623 665 0 True 502 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 546 338 0,00694665134886202 0,00692346567953415 0,00694285496299687 0,00694285496299687 0,001557278018306 0,0013799521753472 283620 301730 623 665 0 True 547 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 591 338 0,00711954610900453 0,0073675376355744 0,00703440909437705 0,00737010757610437 0,00184650912588017 0,00210011451350182 290679 321083 623 665 0 True 591 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 636 337 0,0070017846687488 0,00718006965227213 0,00700389105058366 0,0072327763790341 0,00186420894763528 0,00179550713289393 285871 312913 623 665 0 True 635 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 238 383 0,00608416146592419 0,00631927725011774 0,00608834973678187 0,0063782711528191 0,00157128221527333 0,00149555752822347 248406 275399 623 665 0 True 237 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 282 383 0,00614953278124086 0,0061014518443052 0,00610360875867857 0,00605783169298848 0,00137099353009753 0,00143327465677347 251075 265906 623 665 0 True 282 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 327 384 0,00634716528153691 0,00639187807008939 0,0064087891966125 0,00642404821850919 0,00130490951093307 0,00132767325952291 259144 278563 623 665 0 True 326 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 371 383 0,00638850914824899 0,00659605066683647 0,00643930724040589 0,00659189745937285 0,00131430060921011 0,00130094878660578 260832 287461 623 665 0 True 370 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 416 381 0,00657274408036288 0,00648813611047532 0,00656137941557946 0,00650034332799268 0,00146453240315796 0,00146817284139269 268354 282758 623 665 0 True 414 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 458 383 0,00666540038828455 0,00674251433114716 0,00660715648126955 0,0068055237659266 0,00162267286578525 0,0016845973141493 272137 293844 623 665 0 True 458 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 503 383 0,00683342107883244 0,00687537107818757 0,0068207827878233 0,0068207827878233 0,00168542765177589 0,0017616653172691 278997 299634 623 665 0 True 502 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 548 382 0,00706889497371983 0,00706316030405609 0,00715648126955062 0,00708018616006714 0,00160848926319861 0,00157267932086918 288611 307818 623 665 0 True 547 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 592 383 0,00698130867788903 0,00700471710289686 0,00703440909437705 0,00704966811627375 0,00194530184204135 0,00192122416145495 285035 305271 623 665 0 True 591 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 635 382 0,00651263871963335 0,00655458742989311 0,00657663843747616 0,00654612039368277 0,00182244789121863 0,00174384444299131 265900 285654 623 665 0 True 635 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 239 427 0,00611044225323584 0,00618559445076413 0,00607309071488518 0,00614938582436866 0,00144913378304513 0,00153839573905252 249479 269573 623 665 0 True 237 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 283 427 0,00637035997453237 0,00634135120359838 0,00636301213092241 0,00628671702143893 0,00140539768252202 0,00148097044434328 260091 276361 623 665 0 True 282 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 327 427 0,00637327461916433 0,00652087990633485 0,0063935301747158 0,00662241550316625 0,00134064953901898 0,00138247967366046 260210 284185 623 665 0 True 326 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 371 426 0,00649404867530014 0,00649116496895707 0,00654612039368277 0,00650034332799268 0,00129164960765288 0,00129151605159133 265141 282890 623 665 0 True 370 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 415 426 0,00659091774689153 0,00672753066002154 0,00657663843747616 0,00669871061264973 0,00144068388271119 0,00153107069230892 269096 293191 623 665 0 True 414 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 458 427 0,00680209477224195 0,00697562170475399 0,0068055237659266 0,00703440909437705 0,00159079081133749 0,00161332180970607 277718 304003 623 665 0 True 458 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 503 426 0,00684995372695487 0,0070560241299059 0,00683604180972 0,00709544518196384 0,00173476716726292 0,001656621997695 279672 307507 623 665 0 True 502 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 547 424 0,00691828867252755 0,00687704612871157 0,00688181887541009 0,00685130083161669 0,00164487313085205 0,00154251714262573 282462 299707 623 665 0 False 547 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 591 426 0,00633800496983649 0,00635943257089852 0,00642404821850919 0,0063935301747158 0,00183722001131083 0,0018241552943707 258770 277149 623 665 0 True 591 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 636 426 0,00585282685627042 0,00598523087301683 0,00601205462729839 0,00607309071488518 0,001854136390584 0,00178045061222746 238961 260841 623 665 0 True 635 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 237 471 0,00610765007266405 0,00625094436709765 0,00617990386816205 0,00627145799954223 0,00142700556246155 0,00132024726904319 249365 272421 623 665 0 True 237 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 282 471 0,00651633713425037 0,0063995878916793 0,00653086137178607 0,00645456626230259 0,00147819114472368 0,00149141945771489 266051 278899 623 665 0 True 282 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 326 469 0,00650166593984247 0,00678962225889742 0,00648508430609598 0,00677500572213321 0,00144720664304792 0,00152260207814002 265452 295897 623 665 0 True 326 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 370 470 0,006712916443629 0,00677716263650658 0,00674448767833982 0,00677500572213321 0,00143410988918546 0,00139807284495287 274077 295354 623 665 0 True 370 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 414 470 0,00663446596668659 0,00693057890778675 0,00665293354695964 0,0068207827878233 0,00170939283148139 0,00158143834335202 270874 302040 623 665 0 True 414 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 459 472 0,00683890746872788 0,00691027178842047 0,00683604180972 0,00698863202868696 0,00191445361848174 0,0018762666271878 279221 301155 623 665 0 True 458 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 502 470 0,00668318216982067 0,00670346041345066 0,00659189745937285 0,00666819256885634 0,00175300543264605 0,00178560908537267 272863 292142 623 665 0 True 502 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 547 471 0,00624071952044054 0,00616792610962058 0,00610360875867857 0,00622568093385214 0,00172104965907735 0,00166535749937056 254798 268803 623 665 0 True 546 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 590 469 0,00592997921417507 0,00599938849182925 0,00590524147402152 0,00602731364919509 0,00180025306229297 0,00178337282403018 242111 261458 623 665 0 True 591 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 636 471 0,00579867324886497 0,00591758636692441 0,00572213321126116 0,00602731364919509 0,00172453354725344 0,00170526583535908 236750 257893 623 665 0 True 635 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 237 515 0,00622411339388201 0,00629897013075146 0,00616464484626535 0,00631723506523232 0,00136545963571435 0,00144488899508651 254120 274514 623 665 0 True 237 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 282 515 0,00638030405621786 0,00656450005765157 0,00642404821850919 0,00663767452506294 0,00141306192754109 0,00147938252985817 260497 286086 623 665 0 True 281 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 326 514 0,00735455464046328 0,00641682026076865 0,00653086137178607 0,00650034332799268 0,0074268897689635 0,00147768218362202 300274 279650 623 665 0 True 326 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 371 515 0,00667213591159368 0,00683425202970805 0,00662241550316625 0,00675974670023652 0,00157928458606858 0,00143900618288799 272412 297842 623 665 0 True 370 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 414 514 0,00667803867929369 0,00681371545136588 0,00674448767833982 0,00677500572213321 0,00173796590534201 0,00162990240626427 272653 296947 623 665 0 True 414 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 458 515 0,00662018665727122 0,00657358663309682 0,00662241550316625 0,00662241550316625 0,00188201985702162 0,00173027565133274 270291 286482 623 665 0 True 458 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 503 514 0,00606973519963662 0,00621930197432239 0,00607309071488518 0,00627145799954223 0,00162676394474568 0,00168987956532473 247817 271042 623 665 0 True 502 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 547 515 0,00586676326631733 0,00578824034221512 0,00582894636453803 0,00575265125505455 0,00166520338107738 0,00152999501641092 239530 252256 623 665 0 True 546 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 591 514 0,00585054902475133 0,00581256299365947 0,00585946440833143 0,00585946440833143 0,00172603685483375 0,00162517579676069 238868 253316 623 665 0 True 591 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 635 514 0,0058225047549733 0,00582940528248981 0,00579842832074464 0,00582894636453803 0,00174926164919058 0,00178899822891305 237723 254050 623 665 0 True 635 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 238 559 0,00639017465946725 0,00647904953503007 0,00636301213092241 0,00648508430609598 0,00136540180667027 0,00126771298384606 260900 282362 623 665 0 True 237 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 282 559 0,00636962519017138 0,00648256025736119 0,00645456626230259 0,00645456626230259 0,00137760225893933 0,00123243419909645 260061 282515 623 665 0 True 281 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 326 558 0,00629029297199578 0,0064961212828363 0,00619516289005875 0,00653086137178607 0,00151228586414849 0,00136154784155441 256822 283106 623 665 0 True 326 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 371 559 0,00653164514177113 0,00647994442503604 0,00657663843747616 0,00651560234988937 0,00132107042717892 0,00126322237648444 266676 282401 623 665 0 True 370 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 415 559 0,00632255000544353 0,00628921812427613 0,0063782711528191 0,0063782711528191 0,00155009392369377 0,00174423721672201 258139 274089 623 665 0 True 414 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 459 559 0,00603059568600754 0,00623121089517109 0,00599679560540169 0,00628671702143893 0,00201399152182588 0,00183958857817804 246219 271561 623 665 0 True 458 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 504 559 0,00599201950705522 0,00600842917547933 0,00605783169298848 0,00593575951781491 0,00195180722985993 0,0019398532751971 244644 261852 623 665 0 True 502 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 546 554 0,0059664245184805 0,00607423800976463 0,00593575951781491 0,00617990386816205 0,00181673773367575 0,00183477646500417 243599 264720 623 665 0 False 546 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 592 559 0,00581851242661188 0,00587529707766785 0,00584420538643473 0,00588998245212482 0,0015215240282413 0,00143024170693667 237560 256050 623 665 0 True 591 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 635 559 0,00572487640620888 0,00589569598062448 0,00566109712367437 0,00582894636453803 0,00166169759239002 0,00159531236962712 233737 256939 623 665 0 True 635 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 237 597 0,00679560417705315 0,00649410204384846 0,00677500572213321 0,00648508430609598 0,00132779792577504 0,00123991606805341 277453 283018 623 665 0 False 237 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 281 597 0,00647668327156858 0,00664783955769488 0,00650034332799268 0,00675974670023652 0,00127252610812679 0,00144608857205968 264432 289718 623 665 0 False 281 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 327 602 0,00638490870488011 0,00639378257958928 0,00645456626230259 0,0064087891966125 0,00136666228147961 0,00140507238641817 260685 278646 623 665 0 True 326 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 370 602 0,00636945374048715 0,00631982795165988 0,0063935301747158 0,00633249408712902 0,00128978848076155 0,00130435428898466 260054 275423 623 665 0 True 370 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 414 597 0,00605824807079304 0,00610303511123884 0,00604257267109178 0,00616464484626535 0,00145529161361917 0,00152580329654744 247348 265975 623 665 0 False 414 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 458 597 0,00604222977172332 0,00590120299604585 0,00599679560540169 0,00592050049591821 0,00191675314441871 0,00180662565490392 246694 257179 623 665 0 False 458 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 502 597 0,00595809696238921 0,00602240322711104 0,00602731364919509 0,0059510185397116 0,00194496323866796 0,00196520270498068 243259 262461 623 665 0 False 502 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 546 597 0,00586269745951981 0,00582520618323102 0,00582894636453803 0,00582894636453803 0,00178300521306852 0,00176016597932774 239364 253867 623 665 0 False 546 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 591 597 0,00590156755221653 0,00592605340313475 0,0059662775616083 0,00585946440833143 0,00158504530040863 0,00158423474953539 240951 258262 623 665 0 False 591 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 635 597 0,00596747770939793 0,00597300070960188 0,00599679560540169 0,005981536583505 0,0013642900924794 0,00137777787231304 243642 260308 623 665 0 False 635 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 238 646 0,00874175403558879 0,710253615269577 0,0081025406271458 0,711299305714504 0,00319776363182751 0,19538111393834 356911 30953403 623 665 6 True 237 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 281 640 0,00725658339233039 0,00646149592337447 0,00686655985351339 0,0063935301747158 0,00228214298976946 0,00130222374678941 296274 281597 623 665 0 False 281 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 326 640 0,00595302695029833 0,00608444893419174 0,005981536583505 0,00610360875867857 0,0012384795696478 0,00127204064237579 243052 265165 623 665 0 False 326 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 370 640 0,00589355840268167 0,0058806205259085 0,00585946440833143 0,00590524147402152 0,00130618579467882 0,00117960043401686 240624 256282 623 665 0 False 370 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 414 640 0,0055761805443552 0,0058125171018643 0,0055542839703975 0,00590524147402152 0,001397568936586 0,00131250440018642 227666 253314 623 665 0 False 414 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 458 640 0,00586012571425632 0,00567750344045052 0,00584420538643473 0,00567635614557107 0,00169793968973178 0,00164185709091413 239259 247430 623 665 0 False 458 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 502 640 0,00570733955279309 0,00580776730106337 0,00576791027695125 0,00582894636453803 0,00165565903116695 0,00170924132007211 233021 253107 623 665 0 False 502 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 546 640 0,00576580389511639 0,00578668002117906 0,00569161516746777 0,00578316929884794 0,00167451854731728 0,00162934361798759 235408 252188 623 665 0 False 546 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 591 640 0,00616692267778444 0,00610303511123884 0,00622568093385214 0,00611886778057527 0,00150984212915408 0,00125064810761294 251785 265975 623 665 0 False 591 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 635 645 0,00793461790784604 0,728454783101035 0,00775158312352178 0,745754177157244 0,00215534027173059 0,201297254781514 323957 31746624 623 665 11 True 635 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F12_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F12_3.csv new file mode 100755 index 0000000..9bb514c --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F12_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 238 250 0,00104846380470607 0,0690777527476278 0,000732433051041428 0,0678416113527123 0,000932692188009916 0,0198795071581111 42807 3010462 623 665 0 True 237 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 282 250 0,000894869380445747 0,000912328888139323 0,000717174029144732 0,000732433051041428 0,000724437048769697 0,000721248175643849 36536 39760 623 665 0 False 282 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 326 249 0,000955513583040001 0,000998513679483671 0,000823987182421607 0,000885023270008392 0,000657874587703777 0,000664317243293456 39012 43516 623 665 0 True 326 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 370 250 0,000877871368894692 0,000885229783086694 0,000732433051041428 0,000793469138628214 0,000634734172139182 0,000626268169157647 35842 38579 623 665 0 True 370 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 413 249 0,000824305588978039 0,000853885686980096 0,000625619897764553 0,000701915007248035 0,000714258075966173 0,000674764149249539 33655 37213 623 665 0 True 414 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 457 250 0,000845565349822874 0,000924650835144625 0,000610360875867857 0,000732433051041428 0,00082028843907385 0,000808925772857882 34523 40297 623 665 0 True 458 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 502 250 0,00088477834188806 0,000927496126445663 0,000701915007248035 0,000732433051041428 0,00081241466979065 0,000785999690881344 36124 40421 623 665 0 True 502 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 547 249 0,000898567795062763 0,000853220255950015 0,000747692072938125 0,000671396963454643 0,000729198505042984 0,000734490817738604 36687 37184 623 665 0 True 547 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 591 251 0,000981867848787747 0,000873389699930761 0,000701915007248035 0,0004272526131075 0,000982019373234388 0,00099925680869387 40088 38063 623 665 0 False 591 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 634 248 0,00107667952416834 0,0716437465832124 0,000793469138628214 0,0714274814984359 0,000991805240200413 0,0191781027145608 43959 3122290 623 665 0 True 635 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 237 294 0,000903172443725009 0,000886078781297487 0,000686655985351339 0,000686655985351339 0,000756466657915652 0,000782065335531815 36875 38616 623 665 0 False 237 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 282 294 0,000920880746825027 0,000862719857551868 0,00080872816052491 0,000717174029144732 0,00065231810989177 0,000660573458927563 37598 37598 623 665 0 False 282 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 325 294 0,000834641555656058 0,000826970149108179 0,000732433051041428 0,000717174029144732 0,000642205776170467 0,000614963844174379 34077 36040 623 665 0 True 326 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 369 295 0,000867755837524972 0,000957073388437906 0,000732433051041428 0,000854505226215 0,00065910517427718 0,000655637352291044 35429 41710 623 665 0 True 370 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 414 294 0,000891709807693462 0,000819352111108625 0,000717174029144732 0,000595101853971161 0,000747367690445578 0,000716744675786363 36407 35708 623 665 0 True 414 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 458 295 0,000850145505673086 0,000823849507036073 0,000579842832074464 0,0004272526131075 0,000859307878916869 0,000933155694699426 34710 35904 623 665 0 True 458 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 502 294 0,000895481700746578 0,000871990000177831 0,000686655985351339 0,000625619897764553 0,000819141120925642 0,000801832276681441 36561 38002 623 665 0 True 502 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 546 294 0,000839785046183034 0,000945302142974741 0,00064087891966125 0,000701915007248035 0,000751303842769803 0,000822394166576759 34287 41197 623 665 0 True 547 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 591 294 0,000986252062141693 0,000905605740145741 0,000656137941557946 0,000503547722590982 0,00100414280547527 0,000974174278946625 40267 39467 623 665 0 False 591 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 635 294 0,000986496990262025 0,000977862371653556 0,000625619897764553 0,000595101853971161 0,000962661963274375 0,00101630113894702 40277 42616 623 665 0 False 635 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 238 340 0,0008617306057648 0,000877588799189551 0,000701915007248035 0,000717174029144732 0,00073792318216215 0,000731457234142155 35183 38246 623 665 0 True 237 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 282 338 0,000838976783385938 0,000856776870076312 0,000717174029144732 0,000717174029144732 0,000656855190570326 0,000704180565997601 34254 37339 623 665 0 True 282 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 326 337 0,000779998092009943 0,000850397910546566 0,000656137941557946 0,000732433051041428 0,000614977592301519 0,000636479188951459 31846 37061 623 665 0 True 326 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 370 338 0,000881251376955276 0,000930456147234647 0,000762951094834821 0,00080872816052491 0,000639844702117547 0,000648187759791818 35980 40550 623 665 0 True 370 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 415 338 0,000939936154586873 0,000926968370801116 0,000762951094834821 0,000747692072938125 0,00076520054895729 0,000748709443814153 38376 40398 623 665 0 True 414 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 458 339 0,000929183810104289 0,000937890618053488 0,000671396963454643 0,000686655985351339 0,000828632035823219 0,000838940012546809 37937 40874 623 665 0 True 458 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 503 338 0,000938613542737079 0,000889773070809319 0,000717174029144732 0,000686655985351339 0,000848194191661206 0,000809457676726487 38322 38777 623 665 0 True 502 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 546 338 0,000831800389460204 0,000798448398405031 0,000579842832074464 0,000549324788281071 0,000810950869508503 0,000729947375264006 33961 34797 623 665 0 True 547 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 591 338 0,000924726118314243 0,000910493216332201 0,000564583810177768 0,000518806744487678 0,00098139657959617 0,00106042822393286 37755 39680 623 665 0 True 591 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 636 337 0,000972952465207654 0,000918248929717289 0,000671396963454643 0,000518806744487678 0,00102183008426025 0,000947903051822935 39724 40018 623 665 0 True 635 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 238 383 0,000903907228086006 0,00086896114169608 0,000747692072938125 0,000717174029144732 0,000764419945487813 0,000759130941957787 36905 37870 623 665 0 True 237 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 282 383 0,000880932970398845 0,000836148508143786 0,000732433051041428 0,000701915007248035 0,000725434016210485 0,000687613078562515 35967 36440 623 665 0 True 282 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 327 384 0,000867388445344474 0,000896037300851121 0,000732433051041428 0,000747692072938125 0,000706623108093638 0,000736920888735948 35414 39050 623 665 0 True 326 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 371 383 0,000947357476632939 0,000856478573407655 0,000823987182421607 0,000701915007248035 0,000749316703381192 0,0006851132767964 38679 37326 623 665 0 True 370 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 416 381 0,000758811809601207 0,000854321659034287 0,000549324788281071 0,000610360875867857 0,000712035097041453 0,00076544397269392 30981 37232 623 665 0 True 414 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 458 383 0,000895506193558611 0,000913912155072965 0,000610360875867857 0,000610360875867857 0,000853178953162189 0,000863595370716657 36562 39829 623 665 0 True 458 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 503 383 0,000850733333161884 0,000886835995917925 0,000564583810177768 0,000610360875867857 0,000861990842365678 0,000897253904335493 34734 38649 623 665 0 True 502 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 548 382 0,000882696452865237 0,000922493920771257 0,000579842832074464 0,000762951094834821 0,000860224949084418 0,000777825327183626 36039 40203 623 665 0 True 547 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 592 383 0,000889970818039103 0,000881902627936286 0,000503547722590982 0,000457770656900893 0,00101325372308043 0,00101015411016488 36336 38434 623 665 0 True 591 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 635 382 0,000868049751269371 0,000991285721743131 0,000549324788281071 0,000656137941557946 0,000938222010053243 0,000977047165500928 35441 43201 623 665 0 True 635 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 239 427 0,000829375601068915 0,000921300734096629 0,000625619897764553 0,000762951094834821 0,000769617402670687 0,000802202354352149 33862 40151 623 665 0 True 237 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 283 427 0,000874687303330373 0,000809255916169458 0,000717174029144732 0,000656137941557946 0,000768719912847294 0,000742938683332885 35712 35268 623 665 0 True 282 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 327 427 0,00082903270170045 0,000992960772267129 0,000671396963454643 0,000915541313801785 0,000671071766117963 0,000689213613273265 33848 43274 623 665 0 True 326 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 371 426 0,000880932970398845 0,000940391720890691 0,000747692072938125 0,000793469138628214 0,00072701341502275 0,000728012006036081 35967 40983 623 665 0 True 370 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 415 426 0,000895065322942013 0,000939909857041322 0,000701915007248035 0,000717174029144732 0,000804397785552084 0,000817036275755103 36544 40962 623 665 0 True 414 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 458 427 0,000886002982489721 0,000947000139396328 0,000610360875867857 0,000701915007248035 0,00084962672849992 0,000871670989500156 36174 41271 623 665 0 True 458 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 503 426 0,000894306045768983 0,000908932895296148 0,000595101853971161 0,000656137941557946 0,000882674425098578 0,000872658720952352 36513 39612 623 665 0 True 502 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 547 424 0,00086971526248763 0,00091379742558502 0,000610360875867857 0,000747692072938125 0,000865496538997632 0,000769873516890614 35509 39824 623 665 0 False 547 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 591 426 0,000875911943932034 0,000907349628362506 0,0004272526131075 0,000457770656900893 0,000977183004053567 0,000996930102798584 35762 39543 623 665 0 True 591 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 636 426 0,000873438169916679 0,000868869358105724 0,000549324788281071 0,000503547722590982 0,00091552986016261 0,000922198708290993 35661 37866 623 665 0 True 635 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 237 471 0,00081754557285687 0,000872816052491035 0,00064087891966125 0,000671396963454643 0,000717816020019552 0,000721434534786675 33379 38038 623 665 0 True 237 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 282 471 0,000838119534964775 0,000790440280146464 0,000717174029144732 0,000625619897764553 0,000734840260448072 0,000744265939694143 34219 34448 623 665 0 True 282 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 326 469 0,00086447380071252 0,000844638490251722 0,000701915007248035 0,000717174029144732 0,000757349380522843 0,000730185195287274 35295 36810 623 665 0 True 326 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 370 470 0,000892518070490558 0,000928322178758868 0,000732433051041428 0,000778210116731518 0,00074640301507667 0,000777562291396506 36440 40457 623 665 0 True 370 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 414 470 0,000901702875003016 0,00090259982756158 0,00064087891966125 0,000625619897764553 0,000893765118814522 0,000895379259391582 36815 39336 623 665 0 True 414 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 459 472 0,000904642012447002 0,000869810139906874 0,000488288700694286 0,000457770656900893 0,00102855067609409 0,00097089682746732 36935 37907 623 665 0 True 458 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 502 470 0,000919362192478968 0,000880984792032725 0,000595101853971161 0,000549324788281071 0,000952619831662872 0,000890075033253551 37536 38394 623 665 0 True 502 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 547 471 0,00081450846416475 0,000837020452252169 0,000473029678797589 0,000503547722590982 0,000855664917529544 0,000888750627574521 33255 36478 623 665 0 True 546 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 590 469 0,000781296211047703 0,000871163947864626 0,000381475547417411 0,000473029678797589 0,000905840263538406 0,000939328066650914 31899 37966 623 665 0 True 591 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 636 471 0,000865747426938248 0,000928872880301004 0,000488288700694286 0,000579842832074464 0,000909455200848741 0,000921832761458467 35347 40481 623 665 0 True 635 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 237 515 0,000850659854725784 0,000863109937810881 0,000717174029144732 0,000717174029144732 0,000687642727211982 0,000709493513266802 34731 37615 623 665 0 True 237 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 282 515 0,000874466868022074 0,000894981789562026 0,000732433051041428 0,000747692072938125 0,000763637277720256 0,000749313329568557 35703 39004 623 665 0 True 281 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 326 514 0,00100511152740727 0,000896496218802901 0,000839246204318303 0,000793469138628214 0,00100756004620552 0,000758728853292733 41037 39070 623 665 0 True 326 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 371 515 0,000847426803537399 0,000981763174243689 0,000686655985351339 0,000900282291905089 0,000749682822070096 0,000779682254511849 34599 42786 623 665 0 True 370 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 414 514 0,00086302872480256 0,000904206040392811 0,000625619897764553 0,000610360875867857 0,000830693962268265 0,000877059838408801 35236 39406 623 665 0 True 414 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 458 515 0,000948606610046633 0,000962144431805079 0,000564583810177768 0,000625619897764553 0,00102954135928542 0,000975928973675634 38730 41931 623 665 0 True 458 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 503 514 0,000869176420622899 0,000879378579201494 0,000549324788281071 0,000564583810177768 0,000890290668261309 0,000875119916704209 35487 38324 623 665 0 True 502 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 547 515 0,000804956267471794 0,000724562608168395 0,000488288700694286 0,000457770656900893 0,000850946342624365 0,000764937021006074 32865 31577 623 665 0 True 546 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 591 514 0,000775540400219896 0,000788398095261041 0,000442511635004196 0,000442511635004196 0,000821761210234848 0,000843467345283859 31664 34359 623 665 0 True 591 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 635 514 0,000857027985854421 0,000838282476619565 0,000442511635004196 0,000411993591210803 0,000960232495742594 0,000955872488103323 34991 36533 623 665 0 True 635 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 238 559 0,000818010936285501 0,000827819147318973 0,000671396963454643 0,000686655985351339 0,000647563958909566 0,000638679184314829 33398 36077 623 665 0 True 237 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 282 559 0,000921835966494323 0,000850742099010401 0,000778210116731518 0,000762951094834821 0,000693521016044295 0,000638523059849902 37637 37076 623 665 0 True 281 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 326 558 0,000902658094672311 0,000911135701464694 0,000793469138628214 0,000762951094834821 0,000728272226064763 0,00071582861732382 36854 39708 623 665 0 True 326 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 371 559 0,000885978489677688 0,00100216207720033 0,000747692072938125 0,000930800335698482 0,000724224971641475 0,000676576702926554 36173 43675 623 665 0 True 370 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 415 559 0,000875201652383071 0,000872448918129611 0,000625619897764553 0,000595101853971161 0,000856210344300602 0,000807878589448543 35733 38022 623 665 0 True 414 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 459 559 0,000871919615570619 0,000878483689195523 0,000457770656900893 0,000473029678797589 0,00102681860148105 0,000936440699716945 35599 38285 623 665 0 True 458 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 504 559 0,000818133400345667 0,000818021249048462 0,000289921416037232 0,000274662394140536 0,00101090675788546 0,00105575332559926 33403 35650 623 665 0 True 502 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 546 554 0,000805691051832791 0,000855308332630615 0,0004272526131075 0,0004272526131075 0,000881444585546393 0,000950585371488267 32895 37275 623 665 0 False 546 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 592 559 0,000909369125169414 0,000810908020795867 0,000656137941557946 0,000610360875867857 0,000856490351854501 0,000746043402107668 37128 35340 623 665 0 True 591 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 635 559 0,000907115786462357 0,000969395335443209 0,000595101853971161 0,000701915007248035 0,000924466274732988 0,000872678462175216 37036 42247 623 665 0 True 635 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 237 597 0,000972756522711389 0,000884220163592777 0,000885023270008392 0,000793469138628214 0,000709371516594297 0,000639335631992423 39716 38535 623 665 0 False 237 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 281 597 0,000924089305201379 0,000776259715436451 0,000823987182421607 0,000595101853971161 0,00066040135910053 0,000707414479435149 37729 33830 623 665 0 False 281 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 327 602 0,000875813972683902 0,000875431884816183 0,000762951094834821 0,000732433051041428 0,000686610827892533 0,000740208977140365 35758 38152 623 665 0 True 326 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 370 602 0,000856219723057325 0,000887249022074527 0,000762951094834821 0,000793469138628214 0,000650649999481129 0,00066152567729547 34958 38667 623 665 0 True 370 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 414 597 0,000868980478126633 0,000946151141185534 0,000701915007248035 0,000701915007248035 0,000802554906353224 0,0008129665857745 35479 41234 623 665 0 False 414 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 458 597 0,00092462814706611 0,00087784120406303 0,000518806744487678 0,000457770656900893 0,0010097971761496 0,000961324330509384 37751 38257 623 665 0 False 458 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 502 597 0,000874025997405476 0,000918363659205234 0,0004272526131075 0,000488288700694286 0,000995252450794008 0,00107723995610777 35685 40023 623 665 0 False 502 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 546 597 0,00079427740142531 0,000773850396189604 0,000320439459830625 0,000350957503624018 0,000955828414360951 0,000903592997878633 32429 33725 623 665 0 False 546 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 591 597 0,000822370656827414 0,000825065639608291 0,000534065766384375 0,000549324788281071 0,000833109921692872 0,000806153836600116 33576 35957 623 665 0 False 591 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 635 597 0,000869127434998832 0,000868479277846711 0,000671396963454643 0,000656137941557946 0,00076804547086107 0,000715920254221257 35485 37849 623 665 0 False 635 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 238 646 0,00103783392428366 0,0708068179145506 0,000915541313801785 0,0709086747539483 0,000773895554438969 0,0203753143031033 42373 3085816 623 665 0 True 237 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 281 640 0,000829326615444849 0,000868089197587698 0,000671396963454643 0,000717174029144732 0,000683256326656084 0,000665144554557377 33860 37832 623 665 0 False 281 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 326 640 0,000940646446135836 0,000925201536686762 0,000823987182421607 0,00080872816052491 0,000700811058350219 0,0006418775098712 38405 40321 623 665 0 False 326 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 370 640 0,000802996842509137 0,000829999007589929 0,000686655985351339 0,000701915007248035 0,000595460693956264 0,000622954110409397 32785 36172 623 665 0 False 370 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 414 640 0,000832290245700869 0,000850742099010401 0,000671396963454643 0,000671396963454643 0,000727662987865671 0,000683592389057324 33981 37076 623 665 0 False 414 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 458 640 0,000856023780561059 0,000847805024119007 0,000610360875867857 0,000534065766384375 0,000861458661174956 0,000871308059462436 34950 36948 623 665 0 False 458 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 502 640 0,000793689573936513 0,000849434182847827 0,000457770656900893 0,000488288700694286 0,000857792066184384 0,000888039778576178 32405 37019 623 665 0 False 502 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 546 640 0,000864008437283889 0,000792230060158407 0,000503547722590982 0,0004272526131075 0,000938564170417962 0,000849379394256044 35276 34526 623 665 0 False 546 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 591 640 0,000896608370100106 0,000894706438790958 0,000701915007248035 0,000762951094834821 0,000713611870845898 0,000677629192564412 36607 38992 623 665 0 False 591 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 635 645 0,000990832217991905 0,0737861820952014 0,000793469138628214 0,0737621118486305 0,000742170625801515 0,0227708778976797 40454 3215659 623 665 0 True 635 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F1_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F1_1.csv new file mode 100755 index 0000000..4187b04 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F1_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 258 283 0,0100544462965092 0,0452614254794689 0,0100709544518196 0,0453955901426719 0,00149589676068045 0,00837365205689298 410506 1972528 623 665 0 True 258 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 302 282 0,00981919283693017 0,00996574751137399 0,0098268101014725 0,00996414129854276 0,00129522083481043 0,00138626839558593 400901 434315 623 665 0 False 302 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 346 283 0,0103452249609676 0,0649705747545793 0,0102998397802701 0,0646066987106127 0,00132012451420987 0,0113520353416117 422378 2831468 623 665 0 True 347 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 391 283 0,010595394543075 0,0995523829027822 0,0105134660868238 0,094544899671931 0,00139968608909116 0,0252696783834021 432592 4338570 623 665 0 True 391 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 435 282 0,0103466700368776 0,0726507502448041 0,0103761348897536 0,0690775921263447 0,00168695029154028 0,0131466585456552 422437 3166176 623 665 0 True 435 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 479 282 0,0102589122913626 0,0682406864035805 0,0103303578240635 0,0705119401846342 0,0017226849578482 0,0188059660620588 418854 2973982 623 665 0 True 479 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 523 281 0,010594684251526 0,0773408917119992 0,0102845807583734 0,0751659418631266 0,00259627774502443 0,0208607971275246 432563 3370576 623 665 0 True 524 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 567 281 0,010440624463837 0,0696610374643406 0,0104829480430304 0,0674296177615015 0,00174922630130814 0,0188193231754231 426273 3035882 623 665 0 True 568 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 612 282 0,0102197972705455 0,0100249479271537 0,01025406271458 0,0100251773861295 0,00184407035838645 0,00194825237658124 417257 436895 623 665 0 False 612 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 655 280 0,0101343908349857 0,0443456317607936 0,0100709544518196 0,0439765011062791 0,00170326472859854 0,00867560543733599 413770 1932617 623 665 0 True 656 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 258 325 0,00984427347645218 0,00992600521674982 0,0098268101014725 0,00994888227664607 0,00158789968198058 0,0014918181580134 401925 432583 623 665 0 False 258 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 302 325 0,0100077140111499 0,00986845690559656 0,00999465934233616 0,00990310521095598 0,00128379451862275 0,00137684940447943 408598 430075 623 665 0 False 302 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 345 327 0,0103250183910402 0,103805037886545 0,0102845807583734 0,10235751888304 0,00135476703546126 0,0229133900123375 421553 4523904 623 665 0 True 347 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 390 327 0,0102753469682369 0,0523337870884582 0,0102998397802701 0,0512855725947967 0,00146027733833191 0,0087623142797969 419525 2280747 623 665 0 True 391 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 435 327 0,0107641500179838 0,0774321704926083 0,0107270923933776 0,0731670099946593 0,00192624922075068 0,0128505968884628 439482 3374554 623 665 0 True 435 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 479 326 0,010313016913144 0,0417382894177536 0,0102845807583734 0,0428778515297169 0,00158562753570076 0,00684603063645855 421063 1818987 623 665 0 True 479 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 524 326 0,0104112085965851 0,0423716650289032 0,0104371709773404 0,0446478980697337 0,00159401651307946 0,00746410291383558 425072 1846590 623 665 0 True 524 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 567 325 0,0105258104640886 0,0511675847893939 0,0105287251087205 0,0530708781567102 0,00181177337724564 0,0098581809135288 429751 2229923 623 665 0 True 568 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 612 325 0,0102543321355124 0,0101552347336641 0,0103150988021668 0,0102693217364767 0,00207667324330156 0,00203340370101923 418667 442573 623 665 0 False 612 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 656 325 0,0102797801672149 0,0101452532682129 0,0102998397802701 0,0101472495613031 0,00196270739895224 0,00174788344473131 419706 442138 623 665 0 False 656 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 259 372 0,009970215515927 0,0550324541039025 0,00997940032043946 0,0535439078355077 0,00158481036555378 0,0105894987445597 407067 2398357 623 665 0 True 258 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 302 372 0,0101890587914438 0,0653816505098865 0,0101930266269932 0,0670176241702907 0,00139634265162893 0,0199932954934418 416002 2849383 623 665 0 True 302 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 346 372 0,0102594021476032 0,0396024393783727 0,0102388036926833 0,0411841000991836 0,00134992850483326 0,00738722911611747 418874 1725905 623 665 0 True 347 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 391 372 0,0105698485401243 0,0358274261988228 0,0105439841306172 0,0365758754863813 0,00139019290337399 0,00538470682658626 431549 1561387 623 665 0 True 391 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 435 371 0,0106444046599534 0,0726693593677487 0,0106202792401007 0,0696574349584192 0,00164077517677011 0,012593807635353 434593 3166987 623 665 0 True 435 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 479 371 0,01056076170686 0,0330053790920423 0,0105592431525139 0,0340123598077363 0,00164274659006334 0,005380524379628 431178 1438400 623 665 0 True 479 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 524 370 0,0105645580927251 0,0296403632106129 0,0105745021744106 0,029556725413901 0,00188091697439173 0,00334937296077028 431333 1291750 623 665 0 True 524 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 567 370 0,0107037017578859 0,0511089350751564 0,0107270923933776 0,0510872053101396 0,00188824776276415 0,00823566834718979 437014 2227367 623 665 0 True 568 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 612 369 0,0104245571791432 0,056014056656863 0,0103761348897536 0,0563057907988098 0,00205924631474309 0,0116376751136129 425617 2441136 623 665 0 True 612 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 656 369 0,0103548751289087 0,0624596051814131 0,010452429999237 0,062027924010071 0,00191445455791076 0,016353861164845 422772 2722038 623 665 0 True 656 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 259 417 0,0100108735839021 0,0439533257497142 0,0100556954299229 0,0467383840695811 0,00158599296864766 0,0100263306046255 408727 1915520 623 665 0 True 258 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 302 416 0,0102224914798692 0,0321402499152436 0,0102235446707866 0,0323796444647898 0,00140344047576764 0,00404568115510692 417367 1400697 623 665 0 True 302 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 346 416 0,0104790291931051 0,0880248458179094 0,0105592431525139 0,0846570534828718 0,001280928446799 0,0202158869543164 427841 3836191 623 665 0 True 347 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 391 416 0,0105223569775919 0,0685782205571149 0,0104219119554437 0,0667887388418402 0,00159088466061701 0,0168417034235189 429610 2988692 623 665 0 True 391 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 435 415 0,0108164176788627 0,0435778390815675 0,0106965743495842 0,0447547112230106 0,00212246559424942 0,00752498934535269 441616 1899156 623 665 0 True 435 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 479 414 0,0106393101550505 0,0538992021137761 0,0106660563057908 0,0538490882734417 0,00163952148172435 0,0103449251171312 434385 2348969 623 665 0 True 479 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 523 414 0,0104232345672935 0,0409724700857201 0,010452429999237 0,0419775692378119 0,00166581507358064 0,00512288164758456 425563 1785612 623 665 0 True 524 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 568 414 0,0108122294080051 0,0519736282799009 0,0108949416342412 0,0509956511787594 0,00180953461207833 0,00762022578007459 441445 2265051 623 665 0 True 568 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 612 414 0,010471583378247 0,0424841917106798 0,0103608758678569 0,0422369726100557 0,0019184414247009 0,00792741819676398 427537 1851494 623 665 0 True 612 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 656 413 0,010456789719779 0,0815544468862704 0,010605020218204 0,0782330052643626 0,00187313689139152 0,0146296077519385 426933 3554206 623 665 0 True 656 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 259 461 0,00989671258701531 0,041459886842306 0,00985732814526589 0,0418097199969482 0,00159535604002163 0,00690827659206399 404066 1806854 623 665 0 True 258 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 303 460 0,0103003786221348 0,0674042625446656 0,0102388036926833 0,0643778133821622 0,00150873773939478 0,0172582470468707 420547 2937530 623 665 0 True 303 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 347 460 0,0106795518452211 0,0345580361983007 0,0107118333714809 0,035385671778439 0,0014557719195553 0,00427652811037034 436028 1506066 623 665 0 True 347 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 390 459 0,0109498790116318 0,0561526498783007 0,0109712367437247 0,0540779736018921 0,00160573278231955 0,0126496999805055 447065 2447176 623 665 0 True 391 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 435 460 0,0110942151529435 0,0966542471995966 0,0110627908751049 0,0957351033798734 0,00197426212787095 0,0149613360982869 452958 4212267 623 665 0 True 435 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 479 458 0,0107069103162622 0,0603512902191391 0,0107728694590677 0,0607003891050584 0,00185718554016086 0,0126186332878641 437145 2630156 623 665 0 True 479 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 524 458 0,010498133586491 0,0543813183680189 0,0103913939116503 0,0531624322880903 0,00180335615562098 0,00855461343426921 428621 2369980 623 665 0 True 524 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 568 455 0,0107460743227033 0,0306522084565958 0,0108491645685512 0,0315861753261616 0,00192419772820227 0,00644727153857945 438744 1335847 623 665 0 False 568 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 613 458 0,0104953169131072 0,0403015090943197 0,0103761348897536 0,0402990768291753 0,00173435299097265 0,00571451757364175 428506 1756371 623 665 0 True 612 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 656 457 0,0103208791058066 0,0643066581537386 0,0103761348897536 0,0633554589150835 0,0019053937280082 0,0098772889200661 421384 2802534 623 665 0 True 656 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 260 505 0,00992299337432695 0,0548079055500963 0,00999465934233616 0,055191882200351 0,00150273213878881 0,014821702050455 405139 2388571 623 665 0 True 258 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 303 504 0,0102956025237883 0,0569647969775664 0,0102082856488899 0,0570077058060578 0,00162513932547427 0,00658300660764315 420352 2482570 623 665 0 True 303 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 348 504 0,0106911859309369 0,0712089906615933 0,0106507972838941 0,0668802929732204 0,00159695370799967 0,0175248173869804 436503 3103343 623 665 0 True 347 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 392 504 0,0110147114850837 0,0938073496857273 0,0109864957656214 0,0879530022125582 0,0016754210742504 0,0227867981549695 449712 4088197 623 665 0 True 391 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 436 503 0,0110836587509572 0,0978511740555325 0,0110933089188983 0,0936751354238193 0,00204834351016857 0,0286458370358107 452527 4264430 623 665 0 True 435 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 481 502 0,0107873447109793 0,0464430474217129 0,0108033875028611 0,0468909742885481 0,00179144410245789 0,00627172924786818 440429 2024024 623 665 0 True 479 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 525 502 0,010692043179358 0,0424325175493093 0,0107118333714809 0,0434576943617914 0,00178063903197226 0,00589122063508037 436538 1849242 623 665 0 True 524 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 569 502 0,0108294723476764 0,102220164740072 0,0107881284809644 0,100236514839399 0,00192883302102319 0,0174636301648183 442149 4454834 623 665 0 True 568 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 613 501 0,0107296641386411 0,0613956956938008 0,0106813153276875 0,0632791638056001 0,00188555186820996 0,0156864975083283 438074 2675672 623 665 0 True 612 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 658 502 0,0105398448453836 0,0707468143923553 0,0105897611963073 0,0679484245059892 0,00190617252116121 0,0102551762568115 430324 3083201 623 665 0 True 656 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 260 548 0,00975820573496745 0,0564000066543103 0,00975051499198901 0,0584420538643473 0,00145279315402341 0,0115876316164018 398411 2457956 623 665 0 True 258 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 304 548 0,010281372199997 0,116554742314702 0,0103456168459602 0,0998855573357748 0,00146710464893779 0,0505056636886144 419771 5079546 623 665 0 True 303 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 348 548 0,0107778170070984 0,0587120811871748 0,0107728694590677 0,0602578774700542 0,0014891046131289 0,0119993766867068 440040 2558718 623 665 0 True 347 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 393 548 0,0108994238188433 0,0582658752626588 0,0109254596780346 0,0576943617914092 0,00145561781940424 0,00761171912997949 445005 2539272 623 665 0 True 391 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 437 548 0,0109589903377081 0,0565333452652001 0,0108796826123445 0,0563668268863966 0,0018602280374528 0,00748536854527662 447437 2463767 623 665 0 True 435 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 481 546 0,0106597371602862 0,0584828975620557 0,0107270923933776 0,0587624933241779 0,00191996471485838 0,0100031045324853 435219 2548730 623 665 0 True 480 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 525 546 0,0105230917619529 0,0717866306874993 0,0105745021744106 0,0693522545204852 0,00195042779512668 0,0170959051166 429640 3128517 623 665 0 True 524 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 569 546 0,0106383304425692 0,0571409526333573 0,0106813153276875 0,0577248798352026 0,00174154574264956 0,0114218251819141 434345 2490247 623 665 0 True 568 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 613 546 0,0104187768755034 0,0424449542258025 0,0104829480430304 0,0420386053253986 0,00171817176269667 0,00509392158859147 425381 1849784 623 665 0 True 612 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 658 546 0,0104134374424802 0,0635181453289897 0,0105287251087205 0,0648355840390631 0,00185203795082383 0,0120903579615775 425163 2768170 623 665 0 True 656 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 260 592 0,00968531512635658 0,0470986346617287 0,00961318379491875 0,0479591058213169 0,0013402425265185 0,00866978252901274 395435 2052595 623 665 0 True 258 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 304 592 0,0099629166579411 0,0544887281146331 0,00996414129854276 0,0543984130617227 0,00142730340450937 0,0103715586308494 406769 2374661 623 665 0 True 303 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 348 592 0,0103680522617826 0,0506495123136291 0,0103913939116503 0,0496986343175402 0,00142865118172068 0,00870346934451917 423310 2207345 623 665 0 True 347 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 392 592 0,0105805763917949 0,0514874735476824 0,0106507972838941 0,0495307850766766 0,00138013955274705 0,00717142354164612 431987 2243864 623 665 0 True 391 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 437 592 0,0107500666510647 0,086627509492431 0,0107423514152743 0,0818341344319829 0,00191361074421705 0,0187953889823747 438907 3775294 623 665 0 True 435 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 481 591 0,0105927493193754 0,0621535757452684 0,0106202792401007 0,0602731364919509 0,00207967109639214 0,0112736048935754 432484 2708701 623 665 0 True 480 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 525 591 0,0104623006024864 0,0546726394838091 0,010452429999237 0,054383154039826 0,00202708832534842 0,00593167986469448 427158 2382676 623 665 0 True 524 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 568 585 0,0106321582539368 0,0343503758251201 0,0106507972838941 0,0376592660410468 0,00183394965800823 0,0116790900884436 434093 1497016 623 665 0 False 568 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 613 590 0,0105307335193073 0,0505259257092147 0,0105287251087205 0,0507209887846189 0,00171308531049914 0,00786236072484125 429952 2201959 623 665 0 True 612 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 657 589 0,0103872546264166 0,0532422381199049 0,0104219119554437 0,0517280842298009 0,00166451036023036 0,00922574529606999 424094 2320338 623 665 0 True 656 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 258 629 0,00994760865042034 0,00959060503169115 0,00953688868543526 0,00959792477302205 0,00290213916723392 0,00139195240091687 406144 417966 623 665 0 False 258 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 303 629 0,0102200421986659 0,00965891496881366 0,00990310521095598 0,00970473792629892 0,00272508200379216 0,00132951192233197 417267 420943 623 665 0 False 303 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 347 635 0,0102290555534941 0,0774360254034032 0,0102082856488899 0,0749217975127794 0,00145993701702687 0,0118843241955629 417635 3374722 623 665 0 True 347 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 392 635 0,010229716859419 0,0780592130360233 0,0102082856488899 0,0741588464179446 0,00136396802487138 0,0196631117416408 417662 3401881 623 665 0 True 391 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 435 629 0,0105507441467384 0,0101746928548196 0,0102998397802701 0,0102388036926833 0,00239937872541781 0,00177336178781408 430769 443421 623 665 0 False 435 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 480 629 0,0102285901900654 0,00994186083198383 0,0102388036926833 0,00991836423285267 0,00201659604796904 0,00180602784144906 417616 433274 623 665 0 False 480 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 524 629 0,0100794289647831 0,00998316344764406 0,00996414129854276 0,0100251773861295 0,0020902956658971 0,00180951607990276 411526 435074 623 665 0 False 524 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 568 628 0,0102205565477185 0,0101558772187966 0,0102693217364767 0,0102082856488899 0,00181586879429525 0,00168601405531041 417288 442601 623 665 0 False 568 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 612 628 0,010519466825772 0,0109011370265903 0,0105134660868238 0,0103303578240635 0,00173823125258196 0,00343001513006209 429492 475080 623 665 0 False 612 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 656 628 0,0101978027253397 0,0102979811625654 0,0100862134737163 0,0102998397802701 0,00167778218555925 0,00144165761254662 416359 448794 623 665 0 False 656 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 262 679 0,00918260015937473 0,0451241401741938 0,00920119020370794 0,0443884946974899 0,00129871257317445 0,0105468192700888 374910 1966545 623 665 0 True 258 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 303 672 0,00978945856312183 0,00940761149841874 0,00962844281681544 0,0093690394445716 0,00175126138233427 0,00131319256310382 399687 409991 623 665 0 False 303 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 347 672 0,0114595989228551 0,00976253864232566 0,00997940032043946 0,00975051499198901 0,00766509598627209 0,0013063412352712 467876 425459 623 665 0 False 347 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 391 672 0,0108892837946616 0,00998644471099929 0,00999465934233616 0,00996414129854276 0,00531004767789428 0,00127019521474514 444591 435217 623 665 0 False 391 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 435 672 0,0100027664631192 0,00981939857655124 0,00997940032043946 0,0098268101014725 0,00152635929664133 0,00147867564271178 408396 427937 623 665 0 False 435 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 480 672 0,00983178214231524 0,00980923354391931 0,00994888227664607 0,00984206912336919 0,00164194204477384 0,00148292975071833 401415 427494 623 665 0 False 480 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 524 672 0,0096814942476794 0,00972284223949666 0,00962844281681544 0,00978103303578241 0,00172245544646221 0,00165274052511176 395279 423729 623 665 0 False 524 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 568 672 0,0100791840366628 0,00993174169114707 0,0100251773861295 0,00990310521095598 0,00147403658944487 0,00148483041165333 411516 432833 623 665 0 False 568 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 612 672 0,010121336166172 0,00993532125117096 0,0101625085831998 0,00991836423285267 0,00135415275288575 0,00142545602760856 413237 432989 623 665 0 False 612 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 659 676 0,00995735678960956 0,0429302140680151 0,0100251773861295 0,0428473334859236 0,00150495393715795 0,00854045560042915 406542 1870932 623 665 0 True 657 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F1_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F1_2.csv new file mode 100755 index 0000000..3218aec --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F1_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 258 283 0,0082322300668617 0,700880284942156 0,00814831769283589 0,695475700007629 0,00191964998499491 0,173532773057278 336108 30544906 623 665 5 True 258 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 302 282 0,00700068249220731 0,00680063628974014 0,00686655985351339 0,00677500572213321 0,00145519927626293 0,0013073708052371 285826 296377 623 665 0 False 302 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 346 283 0,00655265997449564 0,00687651837306702 0,00659189745937285 0,0068207827878233 0,00126257293427269 0,00152881568928442 267534 299684 623 665 0 True 347 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 391 283 0,00680797304712993 0,00688507719286773 0,0068207827878233 0,00692759594110018 0,00122039410854199 0,00124124156454957 277958 300057 623 665 0 True 391 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 435 282 0,00677231151280956 0,00674272084422546 0,00686655985351339 0,00666819256885634 0,00157824288977349 0,00164826244710112 276502 293853 623 665 0 True 435 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 479 282 0,00678291690041994 0,006991477319988 0,00679026474402991 0,00709544518196384 0,00156484905577034 0,00175986934808443 276935 304694 623 665 0 True 479 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 523 281 0,00750849196409207 0,00733796037358216 0,00738536659800107 0,00733958953231098 0,00199844691105313 0,0016277338900815 306559 319794 623 665 0 True 524 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 567 281 0,00771019027118564 0,00777595166676132 0,00764476997024491 0,00781261921110857 0,00163939150114115 0,00155332914038488 314794 338882 623 665 0 True 568 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 612 282 0,00821679959528077 0,00822759576900594 0,00823987182421607 0,00823987182421607 0,00190129270225266 0,00182405233206246 335478 358565 623 665 0 False 612 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 655 280 0,0094131999846675 0,696885312388318 0,0093842984664683 0,688014038300145 0,00185437038638763 0,183055672177396 384325 30370802 623 665 8 True 656 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 258 325 0,00678979938060128 0,00651454683860028 0,00671396963454643 0,00646982528419928 0,00143530067135544 0,00132498993062221 277216 283909 623 665 0 False 258 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 302 325 0,0066186191173011 0,00651844764119041 0,00662241550316625 0,00648508430609598 0,00126928313279499 0,00112543940503167 270227 284079 623 665 0 False 302 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 345 327 0,00681465958481499 0,00688647689262066 0,00688181887541009 0,00683604180972 0,00123848748685461 0,0012644214820147 278231 300118 623 665 0 True 347 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 390 327 0,00686749058037065 0,006989802269464 0,00689707789730678 0,00697337300679027 0,00125199730247388 0,00123478050122483 280388 304621 623 665 0 True 391 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 435 327 0,0071758550838689 0,00685320534111658 0,00709544518196384 0,00683604180972 0,00167763902874864 0,00162014186152775 292978 298668 623 665 0 True 435 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 479 326 0,0069285756535815 0,00707238455488687 0,00698863202868696 0,00712596322575723 0,00158426978286685 0,00147833037223532 282882 308220 623 665 0 True 479 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 524 326 0,00715141125745975 0,00726164231820109 0,00721751735713741 0,00721751735713741 0,00163655519439804 0,00155389866431986 291980 316468 623 665 0 True 524 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 567 325 0,00762248151129468 0,00784756581313664 0,00761425192645151 0,00791943236438544 0,00181109360362265 0,00155254914664504 311213 342003 623 665 0 True 568 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 612 325 0,00785898410428745 0,00781445488291569 0,00782787823300526 0,00785839627679866 0,00199894720683947 0,00215928814452902 320869 340560 623 665 0 False 612 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 656 325 0,00788068473574889 0,00785837333090107 0,00779736018921187 0,00790417334248875 0,00199730119608924 0,0017759242827637 321755 342474 623 665 0 False 656 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 259 372 0,00643191041117186 0,00660555026843832 0,00643930724040589 0,00659189745937285 0,00143628423782249 0,0014076473902872 262604 287875 623 665 0 True 258 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 302 372 0,00665217426978661 0,00671947664996779 0,00660715648126955 0,00669871061264973 0,00134234511261823 0,0012906213757807 271597 292840 623 665 0 True 302 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 346 372 0,00701900311560815 0,00701699315810699 0,00697337300679027 0,00700389105058366 0,00132808784068289 0,00130867814576271 286574 305806 623 665 0 True 347 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 391 372 0,00715119082215145 0,00716375511908634 0,00709544518196384 0,00712596322575723 0,0013267309187744 0,00121967868592302 291971 312202 623 665 0 True 391 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 435 371 0,00725332584832998 0,00722912798131745 0,00720225833524071 0,0072480354009308 0,0015079071575387 0,00159586504682599 296141 315051 623 665 0 True 435 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 479 371 0,00728881593296611 0,00722327677743225 0,00737010757610437 0,0072327763790341 0,00160947521867319 0,00171027858907364 297590 314796 623 665 0 True 479 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 524 370 0,00755973092686557 0,00718709109693437 0,00747692072938125 0,00714122224765393 0,00179507547560823 0,00171169812844799 308651 313219 623 665 0 True 524 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 567 370 0,00759749884302079 0,00777106419057486 0,00755321583886473 0,00781261921110857 0,00175091124563066 0,00169275248177659 310193 338669 623 665 0 True 568 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 612 369 0,00747219361665884 0,00745464026282231 0,00747692072938125 0,00740062561989776 0,00206968268434093 0,00194537797754693 305077 324879 623 665 0 True 612 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 656 369 0,00694395713953837 0,00702633213842572 0,00695811398489357 0,00695811398489357 0,0019404799539819 0,00179221642230377 283510 306213 623 665 0 True 656 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 259 417 0,00644672856245196 0,00647301476396416 0,0063782711528191 0,00650034332799268 0,00157669331033515 0,00146572249212509 263209 282099 623 665 0 True 258 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 302 416 0,00678766850595439 0,00696931158291701 0,0068055237659266 0,00698863202868696 0,00148194568433052 0,00133671199198895 277129 303728 623 665 0 True 302 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 346 416 0,00713835658864604 0,00724358389679853 0,00711070420386053 0,0072480354009308 0,00129438106555174 0,00121154553170784 291447 315681 623 665 0 True 347 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 391 416 0,00721448024844529 0,00725005463991863 0,0072327763790341 0,00732433051041428 0,00152939616951585 0,00142552585665391 294555 315963 623 665 0 True 391 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 435 415 0,00746800534580115 0,00778109154782126 0,00730907148851759 0,00737010757610437 0,00226828284358268 0,00345238963271437 304906 339106 623 665 0 True 435 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 479 414 0,00721445575563325 0,00729305525200045 0,00727855344472419 0,00737010757610437 0,00164561818642954 0,00146139588984872 294554 317837 623 665 0 True 479 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 523 414 0,0073274410975425 0,00734436227900949 0,00735484855420768 0,00741588464179446 0,00172668607874046 0,00164286852922497 299167 320073 623 665 0 True 524 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 568 414 0,00736442524371266 0,00753912705774507 0,00750743877317464 0,00759899290455482 0,0016328822752606 0,00169052374215947 300677 328561 623 665 0 True 568 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 612 414 0,00684098935775071 0,00704907152293643 0,00691233691920348 0,00704966811627375 0,00187212676273428 0,00183765182123612 279306 307204 623 665 0 True 612 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 656 413 0,00660360502352473 0,00661957021186521 0,00671396963454643 0,00663767452506294 0,0018718463334741 0,00178672135843604 269614 288486 623 665 0 True 656 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 259 461 0,00665435413005757 0,00664143765226754 0,00666819256885634 0,00666819256885634 0,00146658451511927 0,00137371952560017 271686 289439 623 665 0 True 258 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 303 460 0,00683080034794489 0,0069582516602791 0,00683604180972 0,00697337300679027 0,00140808670673296 0,00143170488523749 278890 303246 623 665 0 True 303 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 347 460 0,0070309801006924 0,00717394309761586 0,00708018616006714 0,00717174029144732 0,00146049149888825 0,00147148920341362 287063 312646 623 665 0 True 347 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 390 459 0,00700962236859943 0,00729124252609092 0,00703440909437705 0,00730907148851759 0,00140599118727366 0,00145387430823783 286191 317758 623 665 0 True 391 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 435 460 0,00725151338023952 0,00718665512488018 0,0072632944228275 0,00720225833524071 0,001671995209722 0,00189448017510734 296067 313200 623 665 0 True 435 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 479 458 0,00725234613584865 0,00731226096828246 0,0072632944228275 0,00730907148851759 0,00178151785236072 0,00186470142255131 296101 318674 623 665 0 True 479 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 524 458 0,00706872352403559 0,00698679635687984 0,00709544518196384 0,00704966811627375 0,00167479352962357 0,00173706755665401 288604 304490 623 665 0 True 524 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 568 455 0,00685169271660923 0,00668813255386119 0,00692759594110018 0,00671396963454643 0,00173833928480419 0,0019086938653376 279743 291474 623 665 0 False 568 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 613 458 0,00655408055759356 0,00651904423452773 0,00663767452506294 0,00646982528419928 0,0017486153855797 0,00174451873001845 267592 284105 623 665 0 True 612 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 656 457 0,00658594570604878 0,0063832963043911 0,00656137941557946 0,0063782711528191 0,00184360322695311 0,00195305233932443 268893 278189 623 665 0 True 656 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 260 505 0,00661683114202267 0,00656323803328417 0,00663767452506294 0,00659189745937285 0,00143994865650523 0,00141647129962114 270154 286031 623 665 0 True 258 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 303 504 0,00677111136501993 0,006924199948257 0,0068055237659266 0,00688181887541009 0,00155028137255927 0,00144993626350224 276453 301762 623 665 0 True 303 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 348 504 0,00715361561054273 0,00716173588009851 0,00708018616006714 0,00718699931334401 0,00141936080516738 0,00144139784313601 292070 312114 623 665 0 True 347 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 392 504 0,00722861260098846 0,00700992582164957 0,00727855344472419 0,00700389105058366 0,00148043347549824 0,0015122665853163 295132 305498 623 665 0 True 391 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 436 503 0,00690618922338314 0,00718647155769947 0,00688181887541009 0,00729381246662089 0,00182435883111328 0,00180887091607256 281968 313192 623 665 0 True 435 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 481 502 0,00689494702265989 0,00679432616790316 0,00689707789730678 0,00679026474402991 0,00180414992214551 0,00164284774405873 281509 296102 623 665 0 True 479 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 525 502 0,00679124445651124 0,00655871769145914 0,00669871061264973 0,00654612039368277 0,00168307692807753 0,00161005924455263 277275 285834 623 665 0 True 524 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 569 502 0,0068053033306183 0,00673586002084635 0,00672922865644312 0,00669871061264973 0,00177156474625538 0,00173765310783451 277849 293554 623 665 0 True 568 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 613 501 0,00646296729682998 0,0064823307983853 0,00650034332799268 0,00651560234988937 0,00178853831944838 0,00175664767851881 263872 282505 623 665 0 True 612 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 658 502 0,00653046948679354 0,00661511870773294 0,00654612039368277 0,00659189745937285 0,00186700849757133 0,00188619030524435 266628 288292 623 665 0 True 656 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 260 548 0,00657984699585251 0,00668480539871079 0,00660715648126955 0,00669871061264973 0,00135309614206607 0,0013162679688898 268644 291329 623 665 0 True 258 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 304 548 0,00689697992605865 0,007121006911878 0,00688181887541009 0,00715648126955062 0,00137095782307195 0,00129672080383628 281592 310339 623 665 0 True 303 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 348 548 0,00717864726444069 0,00733419724637756 0,0072480354009308 0,00730907148851759 0,00141999358015582 0,00134975067090584 293092 319630 623 665 0 True 347 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 393 548 0,00687694480581548 0,00707103074692912 0,00694285496299687 0,00711070420386053 0,00142791985082911 0,00146696577226242 280774 308161 623 665 0 True 391 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 437 548 0,00662305231627911 0,00680414701207126 0,00668345159075303 0,00677500572213321 0,00181687031153156 0,00189093039095256 270408 296530 623 665 0 True 435 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 481 546 0,00668215347171527 0,00672415761307595 0,00675974670023652 0,00672922865644312 0,00183317276274485 0,00193707845948076 272821 293044 623 665 0 True 480 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 525 546 0,00662214608223388 0,00663331480452103 0,00663767452506294 0,00659189745937285 0,00189602708986299 0,00186871438708077 270371 289085 623 665 0 True 524 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 569 546 0,00679251808273696 0,00688801426775912 0,00691233691920348 0,00683604180972 0,00171043988650317 0,00157747936499593 277327 300185 623 665 0 True 568 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 613 546 0,00682891440141833 0,00702188063429345 0,00697337300679027 0,00700389105058366 0,00163821696511406 0,00157399983469982 278813 306019 623 665 0 True 612 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 658 546 0,00668827667472358 0,00663496690914744 0,00665293354695964 0,00656137941557946 0,00183372968397752 0,00180111277718687 273071 289157 623 665 0 True 656 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 260 592 0,00691040198705285 0,00688030444616921 0,00691233691920348 0,00686655985351339 0,00121068327336987 0,00118581492816074 282140 299849 623 665 0 True 258 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 304 592 0,00713340904061533 0,00710393516407177 0,00712596322575723 0,00714122224765393 0,00140429365870638 0,00131768638279155 291245 309595 623 665 0 True 303 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 348 592 0,00700724656583221 0,00705992493249604 0,00701915007248035 0,00708018616006714 0,00136057362688547 0,00141050344736844 286094 307677 623 665 0 True 347 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 392 592 0,00685051706163163 0,00698296439198247 0,00685130083161669 0,00703440909437705 0,00137457146074734 0,00128100084603519 279695 304323 623 665 0 True 391 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 437 592 0,00664874527610196 0,00661695437954006 0,00653086137178607 0,00662241550316625 0,00172215627738554 0,0018115191194248 271457 288372 623 665 0 True 435 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 481 591 0,00672746517397673 0,00675660311226682 0,00666819256885634 0,00671396963454643 0,00191799868739734 0,00184204897906656 274671 294458 623 665 0 True 480 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 525 591 0,00681877437723658 0,00700295026878251 0,00685130083161669 0,00701915007248035 0,00183845575482661 0,00197699887849396 278399 305194 623 665 0 True 524 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 568 585 0,00691794577315909 0,00688707348595797 0,00698863202868696 0,00686655985351339 0,00164290413056176 0,00176644909596803 282448 300144 623 665 0 False 568 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 613 590 0,00712209336145598 0,00701731440067323 0,00709544518196384 0,00706492713817044 0,00148635024246748 0,00143732018021453 290783 305820 623 665 0 True 612 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 657 589 0,00662153376193305 0,00675786513663422 0,00659189745937285 0,00674448767833982 0,001516083753586 0,00160188136732194 270346 294513 623 665 0 True 656 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 258 629 0,00704273665046835 0,0068962059531984 0,00701915007248035 0,00688181887541009 0,00133055723430141 0,00137338384411444 287543 300542 623 665 0 False 258 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 303 629 0,00704895782472478 0,00690783952327603 0,00698863202868696 0,00689707789730678 0,00123808727296725 0,00135312653111381 287797 301049 623 665 0 False 303 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 347 635 0,00688862787715532 0,00700900798574601 0,00689707789730678 0,00709544518196384 0,00136075011430748 0,00129450322910314 281251 305458 623 665 0 True 347 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 392 635 0,00681169595455898 0,00671107845145021 0,00686655985351339 0,00674448767833982 0,00128687363564052 0,00125103720131493 278110 292474 623 665 0 True 391 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 435 629 0,00641229166873325 0,00631416031495539 0,00634775310902571 0,00630197604333562 0,00163914283332733 0,00165029716837117 261803 275176 623 665 0 False 435 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 480 629 0,006472568479147 0,0064137914022869 0,00646982528419928 0,00636301213092241 0,0018536584843612 0,00178837546990142 264264 279518 623 665 0 False 480 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 524 629 0,00652821614808648 0,00650825966266089 0,00653086137178607 0,00645456626230259 0,00175937215060634 0,00180149598670591 266536 283635 623 665 0 False 524 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 568 628 0,00687716524112377 0,00685552287677307 0,00685130083161669 0,00689707789730678 0,00167243621766687 0,00162153350519437 280783 298769 623 665 0 False 568 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 612 628 0,00700440539963636 0,00821958765074738 0,00703440909437705 0,00738536659800107 0,00137511621763999 0,00406606576868945 285978 358216 623 665 0 False 612 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 656 628 0,0068496843060225 0,0068471017323579 0,00686655985351339 0,00686655985351339 0,00147125131667337 0,00139387393133183 279661 298402 623 665 0 False 656 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 262 679 0,00826071520725634 0,697329063101792 0,00817883573662928 0,69390402075227 0,0017670646211091 0,177127845854436 337271 30390141 623 665 7 True 258 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 303 672 0,00768858761097234 0,00691385134844435 0,00733958953231098 0,00686655985351339 0,00208900971756682 0,00128741374169496 313912 301311 623 665 0 False 303 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 347 672 0,00691647620443709 0,00659428383272211 0,00695811398489357 0,00656137941557946 0,00125443429306742 0,00121247174702003 282388 287384 623 665 0 False 347 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 391 672 0,00667519751309784 0,00657500927874734 0,00666819256885634 0,00657663843747616 0,00133635283201627 0,00126825812908942 272537 286544 623 665 0 False 391 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 435 672 0,00620167797805958 0,00635036894135086 0,00624093995574884 0,00636301213092241 0,00144343819207208 0,00133892803505425 253204 276754 623 665 0 False 435 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 480 672 0,0063712662085776 0,00636890922660279 0,00643930724040589 0,0063782711528191 0,00158942455277389 0,00151748740634095 260128 277562 623 665 0 False 480 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 524 672 0,00646267338308558 0,0064449289853152 0,0064087891966125 0,00643930724040589 0,00174335324196507 0,00161202164809236 263860 280875 623 665 0 False 524 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 568 672 0,0068197540897179 0,00690320445196305 0,00683604180972 0,00698863202868696 0,00153146186978174 0,00156152315667189 278439 300847 623 665 0 False 568 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 612 672 0,00724105494950133 0,00728392278476002 0,00721751735713741 0,00730907148851759 0,00128019526931985 0,00139558815392776 295640 317439 623 665 0 False 612 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 659 676 0,00854583603213506 0,698890783837598 0,00846875715266651 0,699671931029221 0,00178632448157282 0,188521185132709 348912 30458202 623 665 8 True 657 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F1_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F1_3.csv new file mode 100755 index 0000000..a520fb9 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F1_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 258 283 0,000974544497989814 0,0682369691681711 0,000839246204318303 0,0676432440680552 0,000741565498590976 0,0179443083546577 39789 2973820 623 665 0 True 258 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 302 282 0,000982259733780278 0,000963475293865242 0,000869764248111696 0,000823987182421607 0,000705491855749374 0,000677661358599977 40104 41989 623 665 0 False 302 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 346 283 0,00091519841443332 0,00085193528568503 0,00080872816052491 0,000686655985351339 0,000631234231502141 0,000705915928459461 37366 37128 623 665 0 True 347 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 391 283 0,000975818124215541 0,000955513067401853 0,000823987182421607 0,000839246204318303 0,000710774336688529 0,000700872375863319 39841 41642 623 665 0 True 391 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 435 282 0,000836478516558549 0,000904596120651824 0,000564583810177768 0,000656137941557946 0,000842690286878108 0,000879120106487759 34152 39423 623 665 0 True 435 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 479 282 0,000927150906705532 0,000829838386306806 0,000671396963454643 0,000503547722590982 0,000848859211046853 0,0009000730745224 37854 36165 623 665 0 True 479 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 523 281 0,000929012360420057 0,00087293078197898 0,000747692072938125 0,000686655985351339 0,00083498643544036 0,000811270803628387 37930 38043 623 665 0 True 524 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 567 281 0,000934841649683963 0,000973892731370656 0,000717174029144732 0,000747692072938125 0,000838376994189291 0,000845547566817067 38168 42443 623 665 0 True 568 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 612 282 0,00100670356018943 0,00104217972259557 0,000686655985351339 0,000671396963454643 0,00098344636141789 0,000985863528145473 41102 45419 623 665 0 False 612 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 655 280 0,00107173197613763 0,0685494464015383 0,000778210116731518 0,0670328831921874 0,00095836446230676 0,0193493518601673 43757 2987438 623 665 0 True 656 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 258 325 0,000870792946217091 0,000885757538731241 0,000717174029144732 0,000701915007248035 0,000725740215094705 0,000719761627491986 35553 38602 623 665 0 False 258 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 302 325 0,000890387195843668 0,000873274970442816 0,000778210116731518 0,000762951094834821 0,000687236224207719 0,000612708830132169 36353 38058 623 665 0 False 302 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 345 327 0,000852741743748608 0,000879791605358097 0,000747692072938125 0,000747692072938125 0,000658646983731826 0,000686591435143127 34816 38342 623 665 0 True 347 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 390 327 0,000875789479871868 0,000886422969761323 0,000717174029144732 0,000762951094834821 0,000684147110852357 0,000647946459265968 35757 38631 623 665 0 True 391 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 435 327 0,000897686053829568 0,000953356153028486 0,000656137941557946 0,000686655985351339 0,000862838069088744 0,000890275732277364 36651 41548 623 665 0 True 435 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 479 326 0,000927199892329598 0,000918684901771481 0,000686655985351339 0,000778210116731518 0,000851936687339969 0,000788319336056642 37856 40037 623 665 0 True 479 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 524 326 0,000913238989470663 0,00092524742848194 0,000717174029144732 0,000747692072938125 0,000807905804548071 0,000842546206385708 37286 40323 623 665 0 True 524 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 567 325 0,000959432432965317 0,000942869877830305 0,000732433051041428 0,000747692072938125 0,000917874441539567 0,000788098822525968 39172 41091 623 665 0 True 568 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 612 325 0,00102796332103427 0,00102664534992781 0,000656137941557946 0,000549324788281071 0,00109947161944652 0,0011237157252792 41970 44742 623 665 0 False 612 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 656 325 0,000983606838442105 0,00101152400341664 0,000656137941557946 0,000686655985351339 0,000987541217449925 0,000978085823098749 40159 44083 623 665 0 False 656 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 259 372 0,000870841931841158 0,000875569560201717 0,000717174029144732 0,000732433051041428 0,000751370913329497 0,000734331931056409 35555 38158 623 665 0 True 258 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 302 372 0,000964061574439595 0,00094952418813112 0,000854505226215 0,000869764248111696 0,000744844199800359 0,000671638037955801 39361 41381 623 665 0 True 302 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 346 372 0,00091664349034328 0,000962786916937572 0,000778210116731518 0,000823987182421607 0,000682081478620641 0,000736698568042296 37425 41959 623 665 0 True 347 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 391 372 0,000939299341474009 0,000956775091769249 0,000823987182421607 0,000793469138628214 0,000701920259106744 0,000712430030569661 38350 41697 623 665 0 True 391 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 435 371 0,000922546258043286 0,000826625960644344 0,000671396963454643 0,000549324788281071 0,000822620508144294 0,000815987636002286 37666 36025 623 665 0 True 435 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 479 371 0,000936507160902222 0,000867309037069671 0,000610360875867857 0,000534065766384375 0,000895701036322253 0,000849994651965678 38236 37798 623 665 0 True 479 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 524 370 0,000912626669169832 0,000911709348904419 0,000610360875867857 0,000595101853971161 0,000886816242666856 0,000893983202995396 37261 39733 623 665 0 True 524 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 567 370 0,000953627636513443 0,000952208858149035 0,00064087891966125 0,00064087891966125 0,000938920369204579 0,000924967531041043 38935 41498 623 665 0 True 568 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 612 369 0,000944491817625052 0,00100184083463408 0,000595101853971161 0,000701915007248035 0,00101801963180883 0,00104163912008061 38562 43661 623 665 0 True 612 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 656 369 0,000858864946756913 0,000900878885242403 0,000457770656900893 0,000488288700694286 0,000915675431282354 0,000984527166012107 35066 39261 623 665 0 True 656 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 259 417 0,000868074244081404 0,000893650927501863 0,000656137941557946 0,000717174029144732 0,000789931309359001 0,000770437272492496 35442 38946 623 665 0 True 258 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 302 416 0,000880541085406313 0,000906294117073411 0,000762951094834821 0,000793469138628214 0,000678286745095604 0,000730217039181757 35951 39497 623 665 0 True 302 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 346 416 0,000954215464002241 0,000958128899727001 0,00080872816052491 0,000900282291905089 0,000723366387388396 0,000668704795803172 38959 41756 623 665 0 True 347 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 391 416 0,000866849603479743 0,000947206652474629 0,000717174029144732 0,00080872816052491 0,00071726086124142 0,000772427692940879 35392 41280 623 665 0 True 391 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 435 415 0,000847622746033665 0,00100927530545292 0,000610360875867857 0,000732433051041428 0,000794619997681674 0,000913142126846641 34607 43985 623 665 0 True 435 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 479 414 0,000888623713377276 0,000783694186255293 0,000579842832074464 0,000549324788281071 0,000882073370732287 0,000736570058384522 36281 34154 623 665 0 True 479 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 523 414 0,000885292690940758 0,000832385380939187 0,00064087891966125 0,000549324788281071 0,000859887368155173 0,00082251404823008 36145 36276 623 665 0 True 524 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 568 414 0,000889897339603003 0,000979124396020952 0,000610360875867857 0,000671396963454643 0,000896356216982699 0,000922843118545204 36333 42671 623 665 0 True 568 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 612 414 0,000947161534136673 0,000987843837104778 0,000579842832074464 0,000686655985351339 0,00102266090110025 0,000949378188131548 38671 43051 623 665 0 True 612 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 656 413 0,000904788969319202 0,000914761153283759 0,000518806744487678 0,000518806744487678 0,000966066937624635 0,000944889922841274 36941 39866 623 665 0 True 656 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 259 461 0,00089131792270093 0,000859530377786994 0,000762951094834821 0,000701915007248035 0,000756121069377191 0,000751374456359599 36391 37459 623 665 0 True 258 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 303 460 0,000886468345918353 0,000862283885497676 0,00064087891966125 0,000747692072938125 0,000807333736182464 0,000768838368578341 36193 37579 623 665 0 True 303 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 347 460 0,000940156589895172 0,000887134292586582 0,000823987182421607 0,000793469138628214 0,000740542672946615 0,00073845626707522 38385 38662 623 665 0 True 347 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 390 459 0,000934278315007199 0,000959758058455821 0,000793469138628214 0,000839246204318303 0,000786957864422636 0,000761951156422123 38145 41827 623 665 0 True 391 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 435 460 0,00101733344061185 0,000764190173304628 0,000701915007248035 0,000289921416037232 0,0009700827269417 0,000941480863545988 41536 33304 623 665 0 True 435 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 479 458 0,000886688781226651 0,000925316266174707 0,000503547722590982 0,000503547722590982 0,000930821129833335 0,00103433770157993 36202 40326 623 665 0 True 479 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 524 458 0,00088112891289511 0,000930089012873222 0,000579842832074464 0,000656137941557946 0,000862437846488374 0,000913336532637507 35975 40534 623 665 0 True 524 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 568 455 0,000982186255344178 0,000961983810521956 0,000671396963454643 0,000579842832074464 0,000948324763607096 0,00105863226140952 40101 41924 623 665 0 False 568 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 613 458 0,000981524949419282 0,000887937399002198 0,000671396963454643 0,000442511635004196 0,000954721466109393 0,000987768022550967 40074 38697 623 665 0 True 612 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 656 457 0,000816761802871807 0,000919579791777452 0,000457770656900893 0,000503547722590982 0,000900731418110001 0,000994952949100055 33347 40076 623 665 0 True 656 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 260 505 0,000952672416844148 0,000851912339787441 0,000823987182421607 0,000686655985351339 0,000765661305805086 0,000722438318242953 38896 37127 623 665 0 True 258 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 303 504 0,000971923767102259 0,000907372574260095 0,000869764248111696 0,000747692072938125 0,000807472750840887 0,000798565606958576 39682 39544 623 665 0 True 303 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 348 504 0,00092249727241922 0,000956912767154783 0,000762951094834821 0,00080872816052491 0,00078252988202323 0,000809429127838594 37664 41703 623 665 0 True 347 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 392 504 0,000915835227546184 0,000982612172454482 0,000717174029144732 0,000762951094834821 0,000804069604756706 0,000822357471477509 37392 42823 623 665 0 True 391 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 436 503 0,000870792946217091 0,000931649333909275 0,000518806744487678 0,000488288700694286 0,000894076294099 0,000994282254064502 35553 40602 623 665 0 True 435 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 481 502 0,000808213811472213 0,000965792829521733 0,0004272526131075 0,000671396963454643 0,000876614017680101 0,000892326295176864 32998 42090 623 665 0 True 479 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 525 502 0,000862563361373929 0,00082343648087947 0,000564583810177768 0,000579842832074464 0,000852459652679441 0,000750670076939841 35217 35886 623 665 0 True 524 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 569 502 0,000961685771672373 0,000793629759911337 0,000656137941557946 0,000473029678797589 0,00096320046954191 0,000831141783213722 39264 34587 623 665 0 True 568 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 613 501 0,000870278597164394 0,000891631688514029 0,000503547722590982 0,000595101853971161 0,00092856022014726 0,000914349889758275 35532 38858 623 665 0 True 612 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 658 502 0,000916765954403446 0,000857281679823271 0,000457770656900893 0,000396734569314107 0,000959121816929105 0,000945562001003645 37430 37361 623 665 0 True 656 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 260 548 0,000837727649972243 0,000886881887713103 0,00064087891966125 0,000717174029144732 0,000713267686247611 0,000755114551956753 34203 38651 623 665 0 True 258 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 304 548 0,00090591563867273 0,000908565760934724 0,000717174029144732 0,000762951094834821 0,00077906067826597 0,000732907836261646 36987 39596 623 665 0 True 303 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 348 548 0,000925240467366941 0,000930180796463578 0,000747692072938125 0,000747692072938125 0,00078980756111618 0,000743961998599765 37776 40538 623 665 0 True 347 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 393 548 0,000878851081376021 0,000967215475172252 0,000686655985351339 0,000839246204318303 0,000777975494832602 0,000742165729718122 35882 42152 623 665 0 True 391 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 437 548 0,000862073505133265 0,000875684289689663 0,000442511635004196 0,000457770656900893 0,000945750725467997 0,000988356823288306 35197 38163 623 665 0 True 435 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 481 546 0,000849484199748189 0,000795993187363006 0,000457770656900893 0,000305180437933928 0,00095784004475642 0,000985657581170279 34683 34690 623 665 0 True 480 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 525 546 0,000872482950247384 0,000840439390992932 0,000442511635004196 0,000411993591210803 0,000966126815831707 0,000971373809444727 35622 36627 623 665 0 True 524 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 569 546 0,00091534537130552 0,000913017265066993 0,000656137941557946 0,000656137941557946 0,00089455285529314 0,000866886985560683 37372 39790 623 665 0 True 568 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 613 546 0,000995412373842118 0,000999775703851067 0,000762951094834821 0,000778210116731518 0,000850333404262339 0,000862585359256592 40641 43571 623 665 0 True 612 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 658 546 0,000952207053415517 0,000877726474575085 0,000625619897764553 0,000549324788281071 0,000961626021178201 0,000917401852701857 38877 38252 623 665 0 True 656 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 260 592 0,000938246150556581 0,000857602922389517 0,000823987182421607 0,000793469138628214 0,000694323152226373 0,000611584270623315 38307 37375 623 665 0 True 258 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 304 592 0,000936115275909691 0,000895647220592107 0,000823987182421607 0,000747692072938125 0,000738541855833307 0,000731543510452359 38220 39033 623 665 0 True 303 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 348 592 0,000894183581708817 0,000934196328541656 0,000732433051041428 0,00080872816052491 0,000720722046767421 0,000774711791556045 36508 40713 623 665 0 True 347 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 392 592 0,000882451524744904 0,000936582701890914 0,000732433051041428 0,000823987182421607 0,00070172897123353 0,000679794921871315 36029 40817 623 665 0 True 391 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 437 592 0,00082682834861746 0,000926234102078267 0,000411993591210803 0,000549324788281071 0,00092073546637196 0,00101063080866742 33758 40366 623 665 0 True 435 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 481 591 0,000882378046308805 0,000822954617030101 0,000518806744487678 0,000411993591210803 0,000953420688956391 0,00096258775253525 36026 35865 623 665 0 True 480 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 525 591 0,000878973545436187 0,000896725677778791 0,000457770656900893 0,000442511635004196 0,00102730066471324 0,00104862124356911 35887 39080 623 665 0 True 524 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 568 585 0,000912161305741201 0,000894224574941588 0,00064087891966125 0,000457770656900893 0,000893052046291613 0,000957454281110385 37242 38971 623 665 0 False 568 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 613 590 0,000985835684337128 0,000917216364325784 0,000747692072938125 0,000686655985351339 0,000883059692928935 0,000790478990409229 40250 39973 623 665 0 True 612 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 657 589 0,000980520744125919 0,000860815348051979 0,000747692072938125 0,000625619897764553 0,00085556200469677 0,000796301713182705 40033 37515 623 665 0 True 656 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 258 629 0,00093915238460181 0,000873366754033172 0,000778210116731518 0,000717174029144732 0,000709753230290227 0,000692720305433035 38344 38062 623 665 0 False 258 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 303 629 0,000999429195015566 0,000916780392271592 0,000869764248111696 0,000793469138628214 0,000750267068497553 0,000651182825547425 40805 39954 623 665 0 False 303 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 347 635 0,000903049979664843 0,000896404435212545 0,000839246204318303 0,000778210116731518 0,000643183080484301 0,000686765365120039 36870 39066 623 665 0 True 347 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 392 635 0,000880737027902579 0,000928436908246813 0,000747692072938125 0,00080872816052491 0,000670675106973293 0,000681482862020501 35959 40462 623 665 0 True 391 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 435 629 0,000796065376703735 0,000902989907820593 0,000518806744487678 0,000595101853971161 0,000793618428217741 0,000913539210302825 32502 39353 623 665 0 False 435 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 480 629 0,000901310990010484 0,000939221480113651 0,000549324788281071 0,000610360875867857 0,000973400254948186 0,00095004253349476 36799 40932 623 665 0 False 480 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 524 629 0,000867706851900905 0,000857625868287106 0,000442511635004196 0,000411993591210803 0,00102146679745778 0,000932472227048444 35427 37376 623 665 0 False 524 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 568 628 0,000909858981410078 0,000894339304429533 0,00064087891966125 0,00064087891966125 0,000883053123006594 0,000864495516427633 37148 38976 623 665 0 False 568 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 612 628 0,000949512844091862 0,0010734549810094 0,00080872816052491 0,000869764248111696 0,000745990156933267 0,000815148752395451 38767 46782 623 665 0 False 612 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 656 628 0,00090302548685281 0,000929951337487688 0,000732433051041428 0,000762951094834821 0,000752374747275382 0,00076841854349412 36869 40528 623 665 0 False 656 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 262 679 0,000983606838442105 0,0685580511131342 0,000854505226215 0,0672922865644312 0,000709728068480976 0,0189171461371216 40159 2987813 623 665 0 True 258 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 303 672 0,000985296842472397 0,000893857440580164 0,000900282291905089 0,000778210116731518 0,000694376684702083 0,000679950862719666 40228 38955 623 665 0 False 303 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 347 672 0,000945569501354514 0,000941974987824333 0,000869764248111696 0,000762951094834821 0,000618935995450048 0,000726384383791942 38606 41052 623 665 0 False 347 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 391 672 0,000853574499357737 0,000916527987398113 0,000717174029144732 0,000793469138628214 0,000664712127421734 0,000673113682260516 34850 39943 623 665 0 False 391 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 435 672 0,000871037874337424 0,000763387066889012 0,000625619897764553 0,000595101853971161 0,000741505451002177 0,000677100466025916 35563 33269 623 665 0 False 435 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 480 672 0,000896020542611309 0,000861366049594116 0,000686655985351339 0,000625619897764553 0,000803007200993042 0,000757239722833445 36583 37539 623 665 0 False 480 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 524 672 0,000879806301045316 0,000859484485991816 0,000579842832074464 0,000518806744487678 0,000911403326894938 0,000838497665163934 35921 37457 623 665 0 False 524 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 568 672 0,000843409982363951 0,000906454738356534 0,000595101853971161 0,000686655985351339 0,00080372181811641 0,000787142217378887 34435 39504 623 665 0 False 568 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 612 672 0,000970429705568233 0,000995645442285044 0,000839246204318303 0,000869764248111696 0,000686689423974527 0,000712472667461611 39621 43391 623 665 0 False 612 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 659 676 0,00108236185656005 0,0688650901687728 0,000915541313801785 0,0673380636301213 0,000802675232718181 0,02044834640754 44191 3001194 623 665 0 True 657 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F2_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F2_1.csv new file mode 100755 index 0000000..31af007 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F2_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 282 264 0,0109601904854977 0,0463716856802111 0,0109102006561379 0,0462806134126802 0,00143841572056393 0,00933073305121192 447486 2020914 623 665 0 True 282 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 326 264 0,0108620232948686 0,010849508757015 0,0108796826123445 0,0108339055466545 0,00135354036811624 0,00134869898474617 443478 472830 623 665 0 False 326 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 370 264 0,0109015057078661 0,066407813995965 0,0109407186999313 0,0663614862287327 0,00141102268648828 0,012036970033324 445090 2894104 623 665 0 True 370 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 414 263 0,0107985379260785 0,0933709875512769 0,0108491645685512 0,0921187151903563 0,00156220289030345 0,0191242096250137 440886 4069180 623 665 0 True 414 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 459 263 0,0106621864414895 0,0744581756519933 0,0107270923933776 0,0712596322575723 0,00177750534777616 0,0171567134285405 435319 3244945 623 665 0 True 458 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 501 263 0,0105716855010268 0,0698998354205495 0,0104676890211337 0,0726482032501717 0,00183182030171457 0,0229522083166772 431624 3046289 623 665 0 True 503 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 546 264 0,0104865974720234 0,0824743708665117 0,0104829480430304 0,0788281071183337 0,00157178749135756 0,0256919180194436 428150 3594297 623 665 0 True 547 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 591 264 0,010376428803498 0,0737524975175407 0,010452429999237 0,0712291142137789 0,00184188452589022 0,0214785402969057 423652 3214191 623 665 0 True 591 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 635 265 0,0101578794417255 0,010074786416717 0,0101930266269932 0,0101319905394064 0,00188974534106856 0,00174771250966583 414729 439067 623 665 0 False 635 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 678 264 0,0100880994202429 0,0456586419126324 0,0101319905394064 0,0456244754711223 0,00189972892030903 0,00963248182917742 411880 1989839 623 665 0 True 679 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 282 308 0,0107492583882677 0,0106064428638545 0,0106813153276875 0,0106660563057908 0,00139436603190339 0,00144508393506621 438874 462237 623 665 0 False 282 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 326 308 0,0106879528797485 0,0106851702384824 0,0106660563057908 0,010605020218204 0,00135505906498973 0,00125205320915828 436371 465668 623 665 0 False 326 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 370 308 0,0108395144006101 0,11174941244161 0,0108033875028611 0,110978866254673 0,00135214473558592 0,0292159219481398 442559 4870126 623 665 0 True 370 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 414 308 0,0106710283466335 0,0541264582834977 0,0106660563057908 0,0539253833829252 0,00148935687116732 0,00989110632494382 435680 2358873 623 665 0 True 414 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 458 308 0,010755381591276 0,0943233570307091 0,0107881284809644 0,0958724345769436 0,00182167974926826 0,0245235066557895 439124 4110685 623 665 0 True 458 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 503 308 0,0105021749004765 0,0426512148992302 0,0105745021744106 0,0443884946974899 0,00171501353690932 0,00836716924877861 428786 1858773 623 665 0 True 503 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 546 308 0,0104370240204682 0,0480384756810773 0,0105897611963073 0,0489509422446021 0,00160704966834454 0,0138739331190704 426126 2093554 623 665 0 True 547 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 591 308 0,0105794987080654 0,0551956453275556 0,010605020218204 0,0549629968719005 0,00213481165334191 0,0124965200590161 431943 2405469 623 665 0 True 591 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 635 308 0,00982078486971232 0,0101230645852443 0,0098115510795758 0,01025406271458 0,00191092138298388 0,00195844128941761 400966 441171 623 665 0 False 635 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 679 308 0,0099624023088884 0,010103652355884 0,00991836423285267 0,0100556954299229 0,00187969432896587 0,00198086028279299 406748 440325 623 665 0 False 679 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 282 353 0,0107116129361726 0,0564553751051926 0,0106202792401007 0,0556038757915618 0,00142405474233601 0,0139203822327656 437337 2460369 623 665 0 True 282 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 327 353 0,0105624272180782 0,0679254097707074 0,0105439841306172 0,0698558022430762 0,00140233100925964 0,0203879556498196 431246 2960242 623 665 0 True 326 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 371 353 0,0105539771979268 0,0405220650619453 0,0105439841306172 0,0409704737926299 0,00129399522229886 0,00746905494526972 430901 1765983 623 665 0 True 370 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 415 352 0,010598407158955 0,0361741616572904 0,010605020218204 0,0366674296177615 0,00160124972859893 0,00547404090974284 432715 1576498 623 665 0 True 414 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 460 352 0,0105393060035189 0,07415765323127 0,0105439841306172 0,070267795834287 0,0017526420677969 0,0157961238221919 430302 3231848 623 665 0 True 458 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 503 353 0,0105804294349227 0,0334907536637428 0,0106507972838941 0,034378576333257 0,00172239258484359 0,00545058808044808 431981 1459553 623 665 0 True 502 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 547 352 0,0103769676453627 0,0311625940566683 0,0104371709773404 0,0305027847714961 0,00166910367782256 0,00491858294683805 423674 1358090 623 665 0 True 547 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 592 352 0,0104163275943001 0,0530253534958935 0,0103608758678569 0,0530861371786069 0,00205608513952597 0,0106847742356897 425281 2310886 623 665 0 True 591 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 636 352 0,0101466127481903 0,0585643554984968 0,010101472495613 0,0587472343022812 0,00199953081635242 0,0145148403006219 414269 2552280 623 665 0 True 635 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 680 352 0,0100987293006653 0,06517890055879 0,0101625085831998 0,0646219577325094 0,00183211326707157 0,0193143725406983 412314 2840547 623 665 0 True 679 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 282 396 0,0106656889136103 0,0458919328534199 0,010605020218204 0,0481422140840772 0,00150057992179304 0,0117317795960572 435462 2000006 623 665 0 True 281 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 327 396 0,0106122700905658 0,0341900757845633 0,0105897611963073 0,0341344319829099 0,00132730858964468 0,00590927812630246 433281 1490030 623 665 0 True 326 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 370 396 0,0106785966255518 0,0914498193297389 0,0106660563057908 0,0871290150301366 0,00140640993474127 0,025156298690421 435989 3985454 623 665 0 True 370 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 414 396 0,0107120048211651 0,0717446855867065 0,0107270923933776 0,0705424582284276 0,00157185282625684 0,0193637211370287 437353 3126689 623 665 0 True 414 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 459 395 0,0106864343254024 0,0427737689382532 0,0108033875028611 0,0447699702449073 0,00167904840202772 0,00798297356445734 436309 1864114 623 665 0 True 458 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 503 396 0,0106814867773717 0,0534717659334879 0,010605020218204 0,0538185702296483 0,00183452664195874 0,00990595406533397 436107 2330341 623 665 0 True 502 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 547 396 0,0105938759887289 0,0419569867676745 0,0105745021744106 0,0428931105516136 0,00161838524419485 0,00582994776067899 432530 1828518 623 665 0 True 547 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 592 396 0,0104855197882939 0,0520145178694046 0,0104982070649271 0,0512245365072099 0,00193143088129335 0,00978322232084107 428106 2266833 623 665 0 True 591 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 636 396 0,0101851399415185 0,0426889379548666 0,0101930266269932 0,0428168154421302 0,00182297486232474 0,00885140010928758 415842 1860417 623 665 0 True 635 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 680 395 0,0100885402908595 0,0845986332276101 0,0100862134737163 0,0806897077897307 0,00179746840839143 0,0181631220704438 411898 3686874 623 665 0 True 679 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 283 441 0,0106539078710223 0,0445862194970145 0,0106355382619974 0,044937819485771 0,00156655691725975 0,00684882196614384 434981 1943102 623 665 0 True 281 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 326 440 0,010492181833167 0,0588092570634643 0,0104982070649271 0,0592507820248722 0,00137863413272159 0,00878630268666 428378 2562953 623 665 0 True 326 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 371 441 0,0107102658315108 0,0360497490005628 0,0106660563057908 0,0366521705958648 0,00163194288415419 0,00411111379616731 437282 1571076 623 665 0 True 370 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 415 440 0,0108930311949027 0,0565463785350306 0,0110475318532082 0,0550698100251774 0,00167381469208733 0,0129980927684467 444744 2464335 623 665 0 True 414 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 460 440 0,0108445599198889 0,0983722294979839 0,0108644235904479 0,0969710841535058 0,00186317349629474 0,0151164723445324 442765 4287138 623 665 0 True 458 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 503 440 0,010737011982251 0,0625700896783042 0,0107270923933776 0,0624093995574884 0,00180626960643478 0,0147725902701716 438374 2726853 623 665 0 True 502 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 548 440 0,0105433473175044 0,0548649719974002 0,010605020218204 0,053482871747921 0,0017486275103249 0,0100262187233145 430467 2391058 623 665 0 True 547 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 592 440 0,0106483235098787 0,0316624933815427 0,0107118333714809 0,0318760967421988 0,0018178212053872 0,0046105744865061 434753 1379876 623 665 0 True 591 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 636 440 0,010223814091719 0,0382130652793577 0,0102845807583734 0,0389410238803693 0,00187974621221333 0,00539628565897763 417421 1665355 623 665 0 True 635 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 680 439 0,010167039753426 0,063978853060782 0,0101472495613031 0,0634012359807736 0,00184712657486757 0,00985691405992892 415103 2788248 623 665 0 True 679 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 281 485 0,0103756695263249 0,0561621724258001 0,0103303578240635 0,058304722667277 0,00158534502318205 0,0185366412090071 423621 2447591 623 665 0 True 281 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 326 484 0,0105287251087205 0,0574228429852383 0,010605020218204 0,0579690241855497 0,00145993525834531 0,00939594215817146 429870 2502532 623 665 0 True 326 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 370 484 0,0108145317323362 0,0697043593189887 0,0108186465247578 0,0670634012359808 0,00151519391802722 0,0191774040768343 441539 3037770 623 665 0 True 370 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 414 484 0,0110030039209318 0,0874396336457991 0,0110475318532082 0,0854657816433967 0,00180992420354468 0,0225331681449379 449234 3810687 623 665 0 True 414 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 459 484 0,0108271210377213 0,0977642091036701 0,0107423514152743 0,0928206301976043 0,00190856858202359 0,0341878583992777 442053 4260640 623 665 0 True 458 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 503 483 0,0106975050764415 0,0467121110168417 0,010605020218204 0,0477759975585565 0,00199648788782796 0,00814278919765432 436761 2035750 623 665 0 True 502 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 547 484 0,0107086003202925 0,0391835390719876 0,010452429999237 0,0407110704203861 0,00218155990212107 0,00610607320754415 437214 1707649 623 665 0 True 547 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 591 484 0,010650723805458 0,102340424189336 0,0105897611963073 0,103242542153048 0,00190412545256593 0,0176346903717366 434851 4460075 623 665 0 True 591 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 635 484 0,0103072366095041 0,0599798649748656 0,0103456168459602 0,0625925078202487 0,00180965747570792 0,0161681300222898 420827 2613969 623 665 0 True 635 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 680 484 0,0100520949865541 0,0724074778385653 0,0100709544518196 0,069565880827039 0,00191101324928787 0,0130819973955146 410410 3155574 623 665 0 True 679 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 282 529 0,0101468576763106 0,0576533574724176 0,0101930266269932 0,0607003891050584 0,00158783408324367 0,0167724220196285 414279 2512578 623 665 0 True 281 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 326 528 0,0105745021744106 0,102388495844785 0,0106202792401007 0,0958266575112535 0,00144903860657199 0,0334131396311799 431739 4462170 623 665 0 True 325 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 370 528 0,0105381303485413 0,0574743106335305 0,0105134660868238 0,0608529793240253 0,00159471492145779 0,0142356033089589 430254 2504775 623 665 0 True 370 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 415 528 0,0107684117672776 0,058084579725808 0,0108339055466545 0,058304722667277 0,00170937264868438 0,00816758250838413 439656 2531371 623 665 0 True 414 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 459 528 0,0109129683438977 0,0570742259631684 0,0109254596780346 0,057602807660029 0,00199002726770621 0,00940106917186688 445558 2487339 623 665 0 True 458 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 503 528 0,010722953108144 0,0609015098974261 0,0107118333714809 0,0615701533531701 0,00180660264370152 0,0134823206293014 437800 2654135 623 665 0 True 502 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 547 528 0,0104824581867898 0,0705110911864234 0,010452429999237 0,0702983138780804 0,00182068400347951 0,0162759651782616 427981 3072928 623 665 0 True 546 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 591 528 0,0104229651463611 0,0580877692055729 0,010452429999237 0,0584115358205539 0,00171813895285797 0,014934763957544 425552 2531510 623 665 0 True 591 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 636 529 0,0101489885509575 0,0413493793995173 0,0101930266269932 0,0414129854276341 0,00183232836837448 0,00633924858071197 414366 1802038 623 665 0 True 635 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 680 527 0,0100465106254105 0,0641148533957921 0,0100862134737163 0,0647745479514763 0,00176966784038753 0,013428676710073 410182 2794175 623 665 0 True 679 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 282 573 0,0101007866968761 0,0464467876030199 0,0100556954299229 0,0479591058213169 0,00135128290240799 0,0109945489432506 412398 2024187 623 665 0 True 281 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 327 572 0,0101484986947168 0,05336534286047 0,0100709544518196 0,053833829251545 0,00152523961629144 0,0125083827170425 414346 2325703 623 665 0 True 325 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 370 572 0,0103478946774793 0,0513803162059417 0,0103608758678569 0,0519874876020447 0,0014278902328946 0,0118918556004497 422487 2239194 623 665 0 True 370 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 415 572 0,0105235571253815 0,0503404310731051 0,0105287251087205 0,0501258869306477 0,00166523189357537 0,00785396416508039 429659 2193875 623 665 0 True 414 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 459 572 0,0106420288571862 0,0890532809478491 0,0106660563057908 0,0841382467383841 0,00200390643953776 0,0262364056748593 434496 3881011 623 665 0 True 458 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 503 573 0,0105529729926334 0,062528511711873 0,0105287251087205 0,0627145799954223 0,00199129682605627 0,0137260372608575 430860 2725041 623 665 0 True 502 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 547 572 0,0104664888733441 0,053827014319961 0,0104829480430304 0,0539864194705119 0,00199523434802918 0,00831287763830722 427329 2345823 623 665 0 True 546 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 592 573 0,0104707261298259 0,0373836628651051 0,0104676890211337 0,0390783550774395 0,00171354362745891 0,00870495553447603 427502 1629209 623 665 0 True 591 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 635 572 0,00996975015249837 0,0483639861842751 0,0100404364080262 0,0488288700694286 0,00171093061888028 0,00891618236352042 407048 2107740 623 665 0 True 635 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 680 572 0,0101461718775737 0,0530804465960048 0,0101319905394064 0,0518043793392844 0,00168520813912421 0,00814598387067486 414251 2313287 623 665 0 True 679 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 281 611 0,0100654680619242 0,00981632382627431 0,0100251773861295 0,0098115510795758 0,00159011580102853 0,00137149969875108 410956 427803 623 665 0 False 281 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 325 611 0,01005060092502 0,00989009488702301 0,0100709544518196 0,00984206912336919 0,00138312365103136 0,00146026054702021 410349 431018 623 665 0 False 325 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 370 616 0,0100577773189458 0,0774779016665032 0,0100862134737163 0,0760051880674449 0,00142753897165733 0,0155864567465981 410642 3376547 623 665 0 True 370 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 415 616 0,0104137803418486 0,0789951073609866 0,0104219119554437 0,0761425192645151 0,00158686115545885 0,0240663323286045 425177 3442668 623 665 0 True 414 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 458 611 0,0104207363004661 0,0100332313961833 0,0103456168459602 0,0101167315175097 0,00208625243922415 0,00203895681176504 425461 437256 623 665 0 False 458 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 502 611 0,0102634434615887 0,00997761054042752 0,0102693217364767 0,0100404364080262 0,00193880744580107 0,0020003970533439 419039 434832 623 665 0 False 502 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 546 611 0,0101094326595238 0,010225976935931 0,0102082856488899 0,0102082856488899 0,00195642219100688 0,00202189078370653 412751 445656 623 665 0 False 546 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 591 611 0,0101627780041322 0,00985049026778436 0,0100251773861295 0,00985732814526589 0,00181373040494657 0,00165794188279477 414929 429292 623 665 0 False 591 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 635 611 0,00984637985828704 0,00978819215583018 0,00987258716716258 0,00978103303578241 0,00143277395861192 0,00150899301481838 402011 426577 623 665 0 False 635 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 679 611 0,00968568251853708 0,00984014166797171 0,00962844281681544 0,0098115510795758 0,00157200635927889 0,00166431363924312 395450 428841 623 665 0 False 679 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 282 661 0,00991794785504811 0,0441961162921036 0,00988784618905928 0,0448310063324941 0,00123577325312505 0,0096184366527708 404933 1926101 623 665 0 True 281 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 325 654 0,00983185562075134 0,00961242658029831 0,00987258716716258 0,00962844281681544 0,00132151755627825 0,00133057799444912 401418 418917 623 665 0 False 325 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 370 654 0,0104160581733677 0,0100324282897677 0,0100099183642329 0,0100556954299229 0,00368678479323448 0,00117167688358918 425270 437221 623 665 0 False 370 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 414 654 0,0101221689217811 0,0100862593655115 0,00999465934233616 0,010101472495613 0,00188609762047998 0,00147772130354293 413271 439567 623 665 0 False 414 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 458 654 0,0098337415672779 0,00974805978094699 0,0097962920576791 0,00975051499198901 0,00160629442537912 0,00158457880835508 401495 424828 623 665 0 False 458 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 502 654 0,0100278471026412 0,00974583402888085 0,00993362325474937 0,0098115510795758 0,00167817106885273 0,00175585790905049 409420 424731 623 665 0 False 502 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 546 654 0,00995265416969918 0,0102628509933566 0,00996414129854276 0,0102235446707866 0,00171536544847026 0,00180280259733234 406350 447263 623 665 0 False 546 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 591 654 0,00958440474077971 0,00958748438961905 0,00962844281681544 0,00956740672922866 0,00134758997607248 0,0013121939269102 391315 417830 623 665 0 False 591 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 635 655 0,00969396108900431 0,00978277692399917 0,00975051499198901 0,00985732814526589 0,00133701835374611 0,00131669796639527 395788 426341 623 665 0 False 635 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 679 660 0,00987775515050159 0,0432148808735044 0,00988784618905928 0,0439459830624857 0,00138452925182675 0,00900168801617591 403292 1883338 623 665 0 True 679 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F2_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F2_2.csv new file mode 100755 index 0000000..9779a46 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F2_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 282 264 0,00889427077611965 0,737127368661984 0,00891126878767071 0,754207675288014 0,00161424792042907 0,191685533266132 363138 32124582 623 665 13 True 282 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 326 264 0,00783250737447954 0,00748444698379044 0,00775158312352178 0,00743114366369116 0,00139055707820238 0,00122105330641576 319788 326178 623 665 0 False 326 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 370 264 0,00731242700376614 0,00735886408628575 0,00727855344472419 0,00738536659800107 0,00122819016596764 0,00126752681149113 298554 320705 623 665 0 True 370 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 414 263 0,00719233874636726 0,00717155672426661 0,0072327763790341 0,00717174029144732 0,00135599877616802 0,00135716484602948 293651 312542 623 665 0 True 414 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 459 263 0,0071894975801714 0,00729544162534971 0,0072480354009308 0,00733958953231098 0,00161070848983494 0,00157047830498484 293535 317941 623 665 0 True 458 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 501 263 0,0071835948124714 0,00710079157610208 0,00718699931334401 0,00703440909437705 0,00157746946086421 0,00142911433454161 293294 309458 623 665 0 True 503 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 546 264 0,00735306057892925 0,00745824276874379 0,00733958953231098 0,00746166170748455 0,0015143490908911 0,00141864789031241 300213 325036 623 665 0 True 547 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 591 264 0,00783434433538203 0,00797971123735179 0,00787365529869535 0,00798046845197223 0,00173229712340957 0,00183377252710345 319863 347762 623 665 0 True 591 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 635 265 0,00797797018514484 0,0079289319659873 0,00796520943007553 0,00785839627679866 0,00198901519370786 0,00177174967722251 325727 345549 623 665 0 False 635 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 678 264 0,00945143326425136 0,731566407435389 0,00949111161974517 0,74018463416495 0,00202146709443425 0,194449700001262 385886 31882231 623 665 12 True 679 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 282 308 0,00723378058432747 0,00708592263446439 0,0072480354009308 0,00706492713817044 0,00140457529024597 0,00139208898544934 295343 308810 623 665 0 False 282 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 326 308 0,00710984695543937 0,00708993816654247 0,00708018616006714 0,00709544518196384 0,00122885246952578 0,00120297596405382 290283 308985 623 665 0 False 326 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 370 308 0,00694907613725331 0,00711120901360749 0,00689707789730678 0,00709544518196384 0,0012791610764612 0,00123441837050082 283719 309912 623 665 0 True 370 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 414 308 0,00703563373497871 0,00706341270892957 0,00701915007248035 0,00711070420386053 0,00145602712365536 0,00144470048532888 287253 307829 623 665 0 True 414 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 458 308 0,00707893702665345 0,00731753852472793 0,00703440909437705 0,00729381246662089 0,00167220678614859 0,0016372377043386 289021 318904 623 665 0 True 458 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 503 308 0,00736440075090063 0,00735367831343064 0,00746166170748455 0,00737010757610437 0,00159661497653973 0,00158263660973546 300676 320479 623 665 0 True 503 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 546 308 0,00733892822638608 0,00756730461998439 0,00730907148851759 0,00752269779507134 0,00149293133222936 0,001360147929058 299636 329789 623 665 0 True 547 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 591 308 0,00783375650789324 0,00813542209839086 0,00785839627679866 0,0080872816052491 0,00196416272592037 0,00198285360122235 319839 354548 623 665 0 True 591 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 635 308 0,00759948276079548 0,00750658977496385 0,00762951094834821 0,00752269779507134 0,0018720370114322 0,00189156172714768 310274 327143 623 665 0 False 635 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 679 308 0,0076398959006503 0,00763107126938426 0,00761425192645151 0,00770580605783169 0,00179647913871102 0,00182306124661936 311924 332568 623 665 0 False 679 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 282 353 0,00686518825603953 0,00704604266445468 0,00689707789730678 0,00706492713817044 0,00146050869855995 0,00139656435677596 280294 307072 623 665 0 True 282 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 327 353 0,00710232766214517 0,00704897973934608 0,00715648126955062 0,00701915007248035 0,00131920872337564 0,00129858994813632 289976 307200 623 665 0 True 326 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 371 353 0,00713081280253981 0,00733529864946183 0,00720225833524071 0,00730907148851759 0,00129909996934069 0,00130816083675285 291139 319678 623 665 0 True 370 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 415 352 0,00726091862006027 0,00722518128693214 0,00732433051041428 0,00721751735713741 0,00150425794198648 0,00145405794032392 296451 314879 623 665 0 True 414 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 460 352 0,0075096921118817 0,00752196352634849 0,00756847486076143 0,00746166170748455 0,00159267693112107 0,00165720003617003 306608 327813 623 665 0 True 458 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 503 353 0,0074299190230895 0,00736177821527956 0,00733958953231098 0,00730907148851759 0,00167978891221152 0,0016517998554256 303351 320832 623 665 0 True 502 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 547 352 0,00749198380878168 0,00759449550862737 0,00756847486076143 0,00764476997024491 0,00158881674120355 0,00157507950440159 305885 330974 623 665 0 True 547 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 592 352 0,00783848362061565 0,00793079058369201 0,00781261921110857 0,0081025406271458 0,00195993081598784 0,00214084099219031 320032 345630 623 665 0 True 591 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 636 352 0,00710556071333356 0,00726907678901993 0,00703440909437705 0,00732433051041428 0,00189433177003879 0,00190440433925395 290108 316792 623 665 0 True 635 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 680 352 0,00669310175869412 0,00661241109181744 0,00679026474402991 0,00665293354695964 0,00192031970592029 0,00185239089244473 273268 288174 623 665 0 True 679 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 282 396 0,00685411750500051 0,0072446852998828 0,00679026474402991 0,0072480354009308 0,00146458004046817 0,00153486856645217 279842 315729 623 665 0 True 281 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 327 396 0,00707827572072855 0,00722866906336567 0,00714122224765393 0,0072327763790341 0,00128103979970847 0,00122341561329041 288994 315031 623 665 0 True 326 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 370 396 0,00741319043247081 0,00735177380393075 0,00746166170748455 0,00732433051041428 0,00135013514299438 0,00140833079532816 302668 320396 623 665 0 True 370 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 414 396 0,00737483468882678 0,00748201471864601 0,00733958953231098 0,00749217975127794 0,00143206544142933 0,00142607931042315 301102 326072 623 665 0 True 414 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 459 395 0,00744059788913598 0,00759662947710315 0,00752269779507134 0,00758373388265812 0,00162837662129211 0,00161427421499954 303787 331067 623 665 0 True 458 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 503 396 0,00758334199766559 0,00763556866531171 0,00753795681696803 0,00759899290455482 0,00165752198971201 0,001615478863706 309615 332764 623 665 0 True 502 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 547 396 0,007582166342688 0,00753660300901028 0,0076752880140383 0,00749217975127794 0,00161976363415597 0,00144744091063593 309567 328451 623 665 0 True 547 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 592 396 0,00739266545598697 0,00743864697220277 0,00752269779507134 0,00750743877317464 0,00186208338396762 0,00186480828397685 301830 324182 623 665 0 True 591 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 636 396 0,00650164144703044 0,00649660314668567 0,00653086137178607 0,00653086137178607 0,0018177498483932 0,00175069078876225 265451 283127 623 665 0 True 635 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 680 395 0,00615585192674543 0,00638084109334907 0,00607309071488518 0,0063782711528191 0,00173751528201438 0,00176315580035746 251333 278082 623 665 0 True 679 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 283 441 0,00712351394455391 0,00731120545699336 0,00712596322575723 0,00732433051041428 0,00141795413723928 0,0016857295867204 290841 318628 623 665 0 True 281 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 326 440 0,00721291270847516 0,00724250543961185 0,0072480354009308 0,0072632944228275 0,00139739699582754 0,00141614405253027 294491 315634 623 665 0 True 326 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 371 441 0,00708339471844349 0,00733846518332912 0,00708018616006714 0,00738536659800107 0,00133774244831842 0,00128920120887474 289203 319816 623 665 0 True 370 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 415 440 0,00724323480977229 0,00747742553912821 0,00730907148851759 0,00752269779507134 0,0017044366782003 0,00157570214467669 295729 325872 623 665 0 True 414 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 460 440 0,0074940656978045 0,00755268808322018 0,00752269779507134 0,00755321583886473 0,00175514938693378 0,00173469127721997 305970 329152 623 665 0 True 458 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 503 440 0,00747821884841901 0,00763554571941412 0,00749217975127794 0,00755321583886473 0,0017648138648895 0,00175130206519653 305323 332763 623 665 0 True 502 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 548 440 0,00716512723219835 0,00728571256477197 0,00727855344472419 0,00732433051041428 0,00179085325045791 0,00164757229708829 292540 317517 623 665 0 True 547 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 592 440 0,00712851047820868 0,00702853494459426 0,00714122224765393 0,00711070420386053 0,0017797886293033 0,00187492400612756 291045 306309 623 665 0 True 591 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 636 440 0,00633144089621159 0,0061781370340477 0,00634775310902571 0,00613412680247196 0,00170630382508662 0,00174351531451368 258502 269248 623 665 0 True 635 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 680 439 0,00610889920607774 0,00642845383084628 0,00610360875867857 0,00643930724040589 0,00166165319922025 0,00178631681357801 249416 280157 623 665 0 True 679 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 281 485 0,00713046990317134 0,00722093629587817 0,00718699931334401 0,0072632944228275 0,00142976235121392 0,00149183099207129 291125 314694 623 665 0 True 281 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 326 484 0,00726833994210634 0,0070217659048055 0,00730907148851759 0,00701915007248035 0,00147047415663679 0,00150930005688571 296754 306014 623 665 0 True 326 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 370 484 0,00711048376855223 0,00721421314788459 0,00703440909437705 0,00729381246662089 0,00143536009730754 0,00145964578913647 290309 314401 623 665 0 True 370 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 414 484 0,00719336744447265 0,00742878023623949 0,0072632944228275 0,00750743877317464 0,00166579534954296 0,00158784074828714 293693 323752 623 665 0 True 414 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 459 484 0,00734309200443173 0,00749509388027175 0,00735484855420768 0,00752269779507134 0,00182451413854653 0,00187850321943035 299806 326642 623 665 0 True 458 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 503 483 0,00707271585239701 0,00690327328965582 0,00718699931334401 0,00688181887541009 0,00185262366005068 0,00178670210470936 288767 300850 623 665 0 True 502 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 547 484 0,0066830597057605 0,00673650250597884 0,00666819256885634 0,00660715648126955 0,00168928305517576 0,00171447062742403 272858 293582 623 665 0 True 547 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 591 484 0,00683562543191543 0,00691387429434194 0,00683604180972 0,00694285496299687 0,00181984703604767 0,0018183568059937 279087 301312 623 665 0 True 591 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 635 484 0,00630662967762193 0,00622267502126798 0,00636301213092241 0,00627145799954223 0,00178034810118901 0,00172536202240729 257489 271189 623 665 0 True 635 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 680 484 0,00630266184207255 0,00639419560574588 0,00630197604333562 0,00642404821850919 0,00171723955064474 0,00181566671217133 257327 278664 623 665 0 True 679 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 282 529 0,00712799612915599 0,00711292995592667 0,00712596322575723 0,00708018616006714 0,00139902171356911 0,00157195211532982 291024 309987 623 665 0 True 281 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 326 528 0,00713705846960828 0,00704422993854515 0,00718699931334401 0,00701915007248035 0,0015077887421549 0,00147277239840056 291394 306993 623 665 0 True 325 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 370 528 0,00699779234038739 0,00710781302076432 0,00697337300679027 0,00706492713817044 0,00134877736591058 0,00147496787534909 285708 309764 623 665 0 True 370 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 415 528 0,00699039551115335 0,0073098745949332 0,00691233691920348 0,00732433051041428 0,00171013059638811 0,00164008388042303 285406 318570 623 665 0 True 414 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 459 528 0,00699943335879361 0,00694108812888252 0,00704966811627375 0,00695811398489357 0,00194910324292769 0,00175823609875539 285775 302498 623 665 0 True 458 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 503 528 0,00677938993548716 0,00692991347675667 0,00677500572213321 0,00691233691920348 0,00174008954571878 0,00172704376309399 276791 302011 623 665 0 True 502 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 547 528 0,00658090018676994 0,00679978729152935 0,00656137941557946 0,00677500572213321 0,00159270450202459 0,00175662213262621 268687 296340 623 665 0 True 546 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 591 528 0,00702125645431521 0,00734548662799136 0,00695811398489357 0,00730907148851759 0,00170826655408904 0,00164165421422803 286666 320122 623 665 0 True 591 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 636 529 0,00633369423491864 0,00635755100729622 0,00642404821850919 0,0063782711528191 0,00189560919245685 0,00187043839173218 258594 277067 623 665 0 True 635 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 680 527 0,00642647300690048 0,00654068221595417 0,00650034332799268 0,00653086137178607 0,00171868302851269 0,00185920886217344 262382 285048 623 665 0 True 679 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 282 573 0,00732587355757238 0,00726269782949018 0,00735484855420768 0,00727855344472419 0,00128443272915435 0,00132778543784275 299103 316514 623 665 0 True 281 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 327 572 0,00715339517523444 0,00725209682480406 0,00711070420386053 0,0072632944228275 0,00137661568542669 0,00132725067365001 292061 316052 623 665 0 True 325 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 370 572 0,00694001379680102 0,00699195918383737 0,00698863202868696 0,00701915007248035 0,00135102063308911 0,00127783181824574 283349 304715 623 665 0 True 370 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 415 572 0,00682320757621459 0,00703773624952746 0,00683604180972 0,00712596322575723 0,00155759871616121 0,00157558260517135 278580 306710 623 665 0 True 414 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 459 572 0,00687297697026609 0,0068769772910188 0,00689707789730678 0,00689707789730678 0,00191114364119581 0,00162459212946438 280612 299704 623 665 0 True 458 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 503 573 0,00668555797258789 0,00671029829093218 0,00656137941557946 0,00675974670023652 0,0019438921728017 0,00208008847154835 272960 292440 623 665 0 True 502 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 547 572 0,00692389752648316 0,00701047652319171 0,00694285496299687 0,00698863202868696 0,00187883037002423 0,00167932400569237 282691 305522 623 665 0 True 546 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 592 573 0,00714222645294729 0,00737488032280289 0,00706492713817044 0,00730907148851759 0,00171510924779585 0,0016309432519088 291605 321403 623 665 0 True 591 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 635 572 0,00640859325411623 0,00646980233830169 0,00634775310902571 0,00642404821850919 0,00157503652303209 0,00150802111950267 261652 281959 623 665 0 True 635 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 680 572 0,00619579970317161 0,0062687962754219 0,00624093995574884 0,00628671702143893 0,00157944260319731 0,0016498586505999 252964 273199 623 665 0 True 679 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 281 611 0,00726251065284243 0,0075361440910585 0,00730907148851759 0,00756847486076143 0,00141809994009478 0,00141291458288188 296516 328431 623 665 0 False 281 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 325 611 0,00710027026593438 0,0070564601019601 0,00701915007248035 0,00706492713817044 0,00139762236440261 0,00137686376830438 289892 307526 623 665 0 False 325 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 370 616 0,00677412398090002 0,00694441528403292 0,00672922865644312 0,00692759594110018 0,00128266519841181 0,00138037935712706 276576 302643 623 665 0 True 370 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 415 616 0,0066180312898123 0,00655424324142928 0,00659189745937285 0,00659189745937285 0,00161076815230986 0,00143821381634154 270203 285639 623 665 0 True 414 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 458 611 0,00659733486364423 0,00681077837647449 0,00656137941557946 0,00675974670023652 0,00184900316181658 0,00195548906198797 269358 296819 623 665 0 False 458 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 502 611 0,00675950177211618 0,00658753773883094 0,0068207827878233 0,00660715648126955 0,00189404376369225 0,00204110373917907 275979 287090 623 665 0 False 502 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 546 611 0,0069357275546952 0,00731987900628201 0,00689707789730678 0,00738536659800107 0,00188524578362078 0,00193819174269912 283174 319006 623 665 0 False 546 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 591 611 0,0070304657516397 0,00652721297406941 0,00694285496299687 0,00662241550316625 0,00169850039365905 0,00162269907768275 287042 284461 623 665 0 False 591 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 635 611 0,00639877163649091 0,00643632427371932 0,00634775310902571 0,00642404821850919 0,00138617421221781 0,00139223291673479 261251 280500 623 665 0 False 635 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 679 611 0,00656524927988071 0,00651046246882943 0,00650034332799268 0,00659189745937285 0,00149239352335909 0,0015516429160376 268048 283731 623 665 0 False 679 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 282 661 0,00894198277396037 0,727798255079218 0,00875867856870375 0,742504005493248 0,00191746530963042 0,206085226087283 365086 31718012 623 665 13 True 281 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 325 654 0,00764721925144823 0,00724904502042472 0,00747692072938125 0,00718699931334401 0,00178298256625861 0,0011655977443342 312223 315919 623 665 0 False 325 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 370 654 0,00646671469707106 0,00678060452114493 0,00646982528419928 0,00679026474402991 0,00121362778511054 0,00123397285990801 264025 295504 623 665 0 False 370 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 414 654 0,00643700491607477 0,00641569591178679 0,0064087891966125 0,0063935301747158 0,00138303978306812 0,00132961946690259 262812 279601 623 665 0 False 414 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 458 654 0,00654276487843421 0,00659990557763142 0,00653086137178607 0,00663767452506294 0,001602535715959 0,00155449697088703 267130 287629 623 665 0 False 458 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 502 654 0,00657051523446785 0,00658182421033128 0,00654612039368277 0,00656137941557946 0,001669621683257 0,00167552509172071 268263 286841 623 665 0 False 502 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 546 654 0,00665425615880943 0,00720597557065013 0,00666819256885634 0,00721751735713741 0,00173325382167968 0,00179406641592448 271682 314042 623 665 0 False 546 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 591 654 0,00641106702813159 0,00636620161068728 0,0064087891966125 0,00634775310902571 0,0013169742385279 0,00130677654800031 261753 277444 623 665 0 False 591 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 635 655 0,00688799106404246 0,00675855351356189 0,00683604180972 0,00674448767833982 0,00140782279688569 0,00123506953287164 281225 294543 623 665 0 False 635 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 679 660 0,00853018512524583 0,724748125750403 0,0085145342183566 0,741084916456855 0,00180952777279724 0,201144799569956 348273 31585085 623 665 12 True 679 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F2_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F2_3.csv new file mode 100755 index 0000000..3cf320a --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F2_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 282 264 0,00114165895449248 0,0749756056426257 0,00100709544518196 0,074891279468986 0,000789565770172225 0,0226970953729503 46612 3267495 623 665 0 True 282 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 326 264 0,00097253608740309 0,00107710337872606 0,000854505226215 0,000991836423285267 0,000675050728730473 0,000703985341225949 39707 46941 623 665 0 False 326 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 370 264 0,000943340655459491 0,00101010135776613 0,000823987182421607 0,000915541313801785 0,000673851561265134 0,000671091085974698 38515 44021 623 665 0 True 370 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 414 263 0,000900306784717122 0,000963635915148365 0,000732433051041428 0,000793469138628214 0,000731830432630062 0,00073152987431019 36758 41996 623 665 0 True 414 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 459 263 0,000932563818164874 0,000993672095092389 0,000717174029144732 0,000793469138628214 0,000850314921048249 0,000858037815690076 38075 43305 623 665 0 True 458 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 501 263 0,00100724240205416 0,000984470790159193 0,000823987182421607 0,000793469138628214 0,000862079288902459 0,000834224605452395 41124 42904 623 665 0 True 503 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 546 264 0,00108118620158246 0,0011484651202279 0,000915541313801785 0,00100709544518196 0,000814678357918454 0,000830884875007828 44143 50051 623 665 0 True 547 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 591 264 0,00106046528260235 0,00102262981784973 0,00080872816052491 0,000671396963454643 0,000973858309632233 0,00100222815474126 43297 44567 623 665 0 True 591 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 635 265 0,00101850909558944 0,00114181080992708 0,000701915007248035 0,000839246204318303 0,00097756874899098 0,00101345164454459 41584 49761 623 665 0 False 635 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 678 264 0,00119757604436432 0,0745773566440707 0,000991836423285267 0,0740215152208743 0,000983593417894801 0,0228609304806466 48895 3250139 623 665 0 True 679 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 282 308 0,00101152864415998 0,000898079485736543 0,000885023270008392 0,000732433051041428 0,000758744963123577 0,000712084226737931 41299 39139 623 665 0 False 282 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 326 308 0,000953505172453277 0,000972929003671917 0,000839246204318303 0,000900282291905089 0,000702694526620343 0,000649116275053151 38930 42401 623 665 0 False 326 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 370 308 0,000937756294315916 0,00101026197904925 0,000793469138628214 0,000900282291905089 0,00069395349520688 0,000711148206271047 38287 44028 623 665 0 True 370 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 414 308 0,000936090783097657 0,000958518979986014 0,000717174029144732 0,000732433051041428 0,000792315043664637 0,000793055920602935 38219 41773 623 665 0 True 414 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 458 308 0,000894820394821681 0,000890186096965921 0,000549324788281071 0,000656137941557946 0,000927941564985574 0,000824812157210179 36534 38795 623 665 0 True 458 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 503 308 0,00106766616934012 0,00091285664378387 0,000854505226215 0,000701915007248035 0,000908774336768261 0,000837470276794322 43591 39783 623 665 0 True 503 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 546 308 0,00103242101282431 0,00108095828952101 0,000869764248111696 0,000930800335698482 0,000819663256145474 0,000796285845561373 42152 47109 623 665 0 True 547 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 591 308 0,00110580147767584 0,00108935648803859 0,000732433051041428 0,000778210116731518 0,00110923141185206 0,00114466974288198 45148 47475 623 665 0 True 591 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 635 308 0,00103754001053926 0,00100126718719435 0,000656137941557946 0,000625619897764553 0,00103525535464243 0,00100917008297217 42361 43636 623 665 0 False 635 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 679 308 0,00106041629697829 0,00105532772191408 0,000717174029144732 0,000656137941557946 0,00101880465686805 0,00105394556327988 43295 45992 623 665 0 False 679 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 282 353 0,000910642751395141 0,000871576974021228 0,000747692072938125 0,000717174029144732 0,00071841812152389 0,000719728828675856 37180 37984 623 665 0 True 282 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 327 353 0,000878924559812121 0,000839521555089371 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000664423572169169 0,000628896159684535 35885 36587 623 665 0 True 326 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 371 353 0,000962983890710134 0,00101744404499461 0,000823987182421607 0,000900282291905089 0,000700526216126358 0,000678023044666476 39317 44341 623 665 0 True 370 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 415 352 0,000963351282890632 0,000893834494682575 0,000747692072938125 0,000656137941557946 0,000818544946265541 0,000754502042966553 39332 38954 623 665 0 True 414 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 460 352 0,000988603372096882 0,00105379034677561 0,000701915007248035 0,000854505226215 0,000940260895667912 0,000890102209921185 40363 45925 623 665 0 True 458 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 503 353 0,00099056279705954 0,000986696542225328 0,000762951094834821 0,000762951094834821 0,000888525076757825 0,000868817626795117 40443 43001 623 665 0 True 502 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 547 352 0,00102896752632763 0,000981441931677442 0,00080872816052491 0,000701915007248035 0,000896941747779668 0,0008732677962782 42011 42772 623 665 0 True 547 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 592 352 0,00102583244638738 0,00101156989521182 0,000579842832074464 0,000717174029144732 0,00111051211093123 0,00106225956981786 41883 44085 623 665 0 True 591 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 636 352 0,000953431694017178 0,00104988954418548 0,000549324788281071 0,000671396963454643 0,00101773252983256 0,00104465467178178 38927 45755 623 665 0 True 635 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 680 352 0,000971801303042093 0,0010983283339959 0,000595101853971161 0,000823987182421607 0,000997775850163907 0,00102302219815138 39677 47866 623 665 0 True 679 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 282 396 0,000854627690275166 0,000949661863516654 0,000701915007248035 0,000854505226215 0,000752013800942289 0,000735821667358348 34893 41387 623 665 0 True 281 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 327 396 0,000872238022127051 0,000914325181229567 0,000747692072938125 0,000778210116731518 0,000681909645474033 0,000688096948374659 35612 39847 623 665 0 True 326 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 370 396 0,000953137780272779 0,000959230302811274 0,000823987182421607 0,00080872816052491 0,000706282686465067 0,000731932981810346 38915 41804 623 665 0 True 370 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 414 396 0,00100001702250436 0,000999752757953478 0,000823987182421607 0,000793469138628214 0,000798944394803626 0,000803779002754687 40829 43570 623 665 0 True 414 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 459 395 0,000936899045894754 0,00107531359871411 0,000671396963454643 0,000885023270008392 0,000881636248712512 0,000866796078745229 38252 46863 623 665 0 True 458 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 503 396 0,000975377253598943 0,00107834245719586 0,000701915007248035 0,000823987182421607 0,000903586938026913 0,000930150141240008 39823 46995 623 665 0 True 502 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 547 396 0,00102803679947037 0,000997251655116275 0,000778210116731518 0,000823987182421607 0,000889775966418899 0,000820292309778628 41973 43461 623 665 0 True 547 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 592 396 0,000913190003846596 0,00103811829872232 0,000564583810177768 0,000701915007248035 0,000947048667363912 0,00109467742005309 37284 45242 623 665 0 True 591 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 636 396 0,000976283487644172 0,00100922941365774 0,000656137941557946 0,000717174029144732 0,000973493281482141 0,000968990121532047 39860 43983 623 665 0 True 635 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 680 395 0,001020395042116 0,000937225187023407 0,000686655985351339 0,000610360875867857 0,000987279850933782 0,000994004929721418 41661 40845 623 665 0 True 679 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 283 441 0,000832094303204603 0,000901980288326676 0,000656137941557946 0,000778210116731518 0,000724943107233103 0,00078273412792739 33973 39309 623 665 0 True 281 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 326 440 0,000899425043483926 0,000946174087083123 0,000823987182421607 0,00080872816052491 0,000756915468775031 0,000774302645216811 36722 41235 623 665 0 True 326 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 371 441 0,00099778817660934 0,000935366569318696 0,000900282291905089 0,000839246204318303 0,000746341553807161 0,000708982540503369 40738 40764 623 665 0 True 370 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 415 440 0,000998302525662038 0,000926096426692733 0,000778210116731518 0,000656137941557946 0,000898998436427266 0,000846941770934558 40759 40360 623 665 0 True 414 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 460 440 0,00101713749811558 0,000971345736738275 0,000717174029144732 0,000732433051041428 0,000957475664540542 0,000940190287099961 41528 42332 623 665 0 True 458 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 503 440 0,00102247693113883 0,00102132190168715 0,000762951094834821 0,000762951094834821 0,000947462103396141 0,000947306487993229 41746 44510 623 665 0 True 502 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 548 440 0,000980030887885255 0,000931878792885166 0,000778210116731518 0,000656137941557946 0,000881168042314676 0,000876001020538806 40013 40612 623 665 0 True 547 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 592 440 0,000957840400183157 0,000982887523225551 0,000610360875867857 0,000656137941557946 0,000984359531359693 0,000973727463688994 39107 42835 623 665 0 True 591 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 636 440 0,000960387652634612 0,000972974895467095 0,000549324788281071 0,000549324788281071 0,000999543323322612 0,00104315630463201 39211 42403 623 665 0 True 635 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 680 439 0,000883504715662333 0,00108054526336441 0,000534065766384375 0,000762951094834821 0,000944241949887796 0,00100748560252481 36072 47091 623 665 0 True 679 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 281 485 0,00091162246387647 0,000875156534045115 0,000762951094834821 0,000701915007248035 0,000786038673985691 0,000781730637548783 37220 38140 623 665 0 True 281 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 326 484 0,000936580639338322 0,000991675802002144 0,000823987182421607 0,000839246204318303 0,0008116232050533 0,00078625180530555 38239 43218 623 665 0 True 326 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 370 484 0,000877038613285563 0,000932360656734535 0,000701915007248035 0,00080872816052491 0,000796641073659637 0,000757646619218386 35808 40633 623 665 0 True 370 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 414 484 0,000926220179848269 0,00090842808554919 0,000701915007248035 0,000625619897764553 0,000898020688798241 0,000859819420605567 37816 39590 623 665 0 True 414 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 459 484 0,000961538814800174 0,00104578222851705 0,000579842832074464 0,000747692072938125 0,00103278814739665 0,00100829650639085 39258 45576 623 665 0 True 458 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 503 483 0,00103029013817742 0,00102866458891564 0,000778210116731518 0,000717174029144732 0,000966514791702602 0,000981804627326526 42065 44830 623 665 0 True 502 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 547 484 0,0009703317343201 0,000963934211817023 0,000686655985351339 0,000656137941557946 0,000919631585035235 0,000909616337702162 39617 42009 623 665 0 True 547 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 591 484 0,0010417037885849 0,000987293135562642 0,000686655985351339 0,000625619897764553 0,00105800089095489 0,000998968146440026 42531 43027 623 665 0 True 591 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 635 484 0,00100178050497075 0,000965242127979597 0,000701915007248035 0,000625619897764553 0,000933666883951796 0,000905334111132873 40901 42066 623 665 0 True 635 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 680 484 0,000908193470191819 0,00101613612883204 0,000518806744487678 0,000732433051041428 0,00101709224957604 0,000968516034148337 37080 44284 623 665 0 True 679 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 282 529 0,000925754816419638 0,000857166950335326 0,000793469138628214 0,000717174029144732 0,000736197790476821 0,000749772283957475 37797 37356 623 665 0 True 281 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 326 528 0,000979075668215959 0,000896679785983613 0,000839246204318303 0,000778210116731518 0,000809041492325612 0,000716726916827983 39974 39078 623 665 0 True 325 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 370 528 0,000919166249982702 0,000943420579372441 0,000778210116731518 0,00080872816052491 0,0006903904656609 0,000788233241079005 37528 41115 623 665 0 True 370 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 415 528 0,000864277858216255 0,000925683400536131 0,000564583810177768 0,000656137941557946 0,000866141750265293 0,00088988359710915 35287 40342 623 665 0 True 414 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 459 528 0,00101312067694214 0,000969028201081784 0,000686655985351339 0,000671396963454643 0,0010457543837079 0,000965387078919428 41364 42231 623 665 0 True 458 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 503 528 0,000997494262864941 0,000957738819467988 0,000671396963454643 0,000625619897764553 0,00100727380911119 0,000994896991500357 40726 41739 623 665 0 True 502 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 547 528 0,000903858242461939 0,000949547134028709 0,000610360875867857 0,000625619897764553 0,00087066545721618 0,000941858194729456 36903 41382 623 665 0 True 546 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 591 528 0,00105833440795546 0,000952713667895993 0,000823987182421607 0,000671396963454643 0,000927413398277562 0,000867707258942766 43210 41520 623 665 0 True 591 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 636 529 0,00093048192914205 0,000942801040137538 0,000579842832074464 0,000488288700694286 0,000953124578986806 0,00103171611440045 37990 41088 623 665 0 True 635 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 680 527 0,00105458700771438 0,000994245742532114 0,000747692072938125 0,000717174029144732 0,000993454480547067 0,000937980927038424 43057 43330 623 665 0 True 679 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 282 573 0,000958648662980253 0,000876992205852236 0,000854505226215 0,000778210116731518 0,00071711277609643 0,000699007273594553 39140 38220 623 665 0 True 281 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 327 572 0,000927224385141632 0,000956568578690948 0,000793469138628214 0,000839246204318303 0,000734112909520422 0,000738502563830297 37857 41688 623 665 0 True 325 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 370 572 0,000961808235732539 0,000913407345326007 0,000823987182421607 0,000823987182421607 0,000722874964730151 0,000646890953191832 39269 39807 623 665 0 True 370 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 415 572 0,00103744203929112 0,00101214354265155 0,000839246204318303 0,000717174029144732 0,000896334845160001 0,000907294361377936 42357 44110 623 665 0 True 414 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 459 572 0,00100084977811349 0,000906730089127603 0,000701915007248035 0,000549324788281071 0,00100338139174044 0,000914569088862298 40863 39516 623 665 0 True 458 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 503 573 0,000898347359754464 0,000976210267027147 0,000518806744487678 0,000595101853971161 0,000991531531790009 0,00108486239307531 36678 42544 623 665 0 True 502 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 547 572 0,00100156006966246 0,00102233152118107 0,000579842832074464 0,000762951094834821 0,00105899795401549 0,000947007620926972 40892 44554 623 665 0 True 546 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 592 573 0,000990048448006842 0,00106904936867231 0,000701915007248035 0,000915541313801785 0,000905301252231672 0,000832087970455139 40422 46590 623 665 0 True 591 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 635 572 0,00102860013414713 0,000996930412550029 0,000793469138628214 0,00080872816052491 0,000897926160672451 0,000824372899518814 41996 43447 623 665 0 True 635 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 680 572 0,000965825056905987 0,000910171973765955 0,000717174029144732 0,000625619897764553 0,000867783802737476 0,000861257353363221 39433 39666 623 665 0 True 679 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 281 611 0,000903000994040776 0,000975934916256079 0,000762951094834821 0,000839246204318303 0,000709583356179266 0,000781272950537231 36868 42532 623 665 0 False 281 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 325 611 0,000959530404213449 0,000967674393124032 0,000854505226215 0,000823987182421607 0,000698013118505003 0,000775992141045256 39176 42172 623 665 0 False 325 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 370 616 0,000962592005717602 0,000999225002308931 0,000823987182421607 0,000915541313801785 0,00073605862211827 0,000712689238610736 39301 43547 623 665 0 True 370 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 415 616 0,000915614792237885 0,000857809435467818 0,000671396963454643 0,000656137941557946 0,00081735354049647 0,000736898862460017 37383 37384 623 665 0 True 414 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 458 611 0,000914880007876888 0,000895624274694518 0,000503547722590982 0,000457770656900893 0,000970672439400573 0,000986212507108666 37353 39032 623 665 0 False 458 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 502 611 0,000911646956688503 0,000918065362536577 0,000503547722590982 0,000488288700694286 0,00101740433379383 0,00102924562960905 37221 40010 623 665 0 False 502 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 546 611 0,00100768327267076 0,00100225386079068 0,00064087891966125 0,00064087891966125 0,00102239761655175 0,001033043950898 41142 43679 623 665 0 False 546 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 591 611 0,000971997245538359 0,000944017172709756 0,000747692072938125 0,000732433051041428 0,000880474258186636 0,000843988051185979 39685 41141 623 665 0 False 591 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 635 611 0,000968421294981509 0,000994291634327292 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,000766582332227059 0,000840823146766702 39539 43332 623 665 0 False 635 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 679 611 0,00090789955644742 0,000938487211390803 0,000701915007248035 0,000671396963454643 0,000780205104403654 0,000864553049507909 37068 40900 623 665 0 False 679 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 282 661 0,00102095837679277 0,0740081607084775 0,000885023270008392 0,0728160524910353 0,000783801473767385 0,0238562329243921 41684 3225333 623 665 0 True 281 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 325 654 0,0010075608086106 0,000983346441177331 0,000930800335698482 0,000885023270008392 0,000645741661521249 0,000709872071848449 41137 42855 623 665 0 False 325 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 370 654 0,000905474768056132 0,000906202333483055 0,000793469138628214 0,000793469138628214 0,000648522869321166 0,00067660009764759 36969 39493 623 665 0 False 370 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 414 654 0,000871821644322487 0,000990413777634748 0,000701915007248035 0,000823987182421607 0,000703237617391727 0,000720989308379801 35595 43163 623 665 0 False 414 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 458 654 0,000943316162647457 0,000888786397212991 0,000686655985351339 0,000701915007248035 0,000866250567589924 0,000765312143622975 38514 38734 623 665 0 False 458 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 502 654 0,000963302297266565 0,000934747030083793 0,000686655985351339 0,000610360875867857 0,000895947727717247 0,00093572416234689 39330 40737 623 665 0 False 502 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 546 654 0,000939789197714674 0,000977862371653556 0,000595101853971161 0,000671396963454643 0,000906341887945497 0,00090749849639649 38370 42616 623 665 0 False 546 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 591 654 0,000990366854563274 0,00103100507046972 0,00080872816052491 0,000915541313801785 0,000729214928041201 0,000701190658549689 40435 44932 623 665 0 False 591 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 635 655 0,00101414937504753 0,00111510178513347 0,000869764248111696 0,000976577401388571 0,000729136672999378 0,000750447278874836 41406 48597 623 665 0 False 635 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 679 660 0,00106798457589655 0,0735077106820611 0,000946059357595178 0,0736400396734569 0,00072041718990705 0,022809116891797 43604 3203523 623 665 0 True 679 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F3_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F3_1.csv new file mode 100755 index 0000000..813e0f6 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F3_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 276 273 0,0104236513258153 0,0463521816672604 0,01025406271458 0,0465247577630274 0,00227864805540572 0,00924551600141124 395523 2020064 579 665 0 True 276 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 320 273 0,0100524011678554 0,0100550988365856 0,0100556954299229 0,0100251773861295 0,00130300418178461 0,00136824803343015 381436 438209 579 665 0 False 320 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 365 273 0,0103832241417228 0,0643206780971655 0,010406652933547 0,0650339513237202 0,00132132763844984 0,0122160316770305 393989 2803145 579 665 0 True 364 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 410 273 0,0104314521383912 0,0847755002062262 0,0104676890211337 0,0838178072785534 0,00144497921951629 0,0133153745147217 395819 3694582 579 665 0 True 408 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 454 273 0,0102245724805517 0,0740910183446715 0,0102845807583734 0,0711680781261921 0,00163662036154495 0,0153024892508712 387969 3228944 579 665 0 True 452 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 498 273 0,0102186691629267 0,068481457706982 0,0101777676050965 0,0713817044327459 0,00166139034595419 0,0206584873012849 387745 2984475 579 665 0 True 497 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 542 274 0,0102656848711542 0,0819031786378283 0,0101777676050965 0,0789959563591974 0,00156852435754619 0,0244026869334328 389529 3569404 579 665 0 True 541 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 587 274 0,0102689791332217 0,0732145080026686 0,0103150988021668 0,0719005111772335 0,00177721518567541 0,0204341741758634 389654 3190745 579 665 0 True 585 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 629 274 0,0100896395062665 0,0101958948641918 0,0102693217364767 0,0102845807583734 0,0017935764349976 0,00188465857393472 382849 444345 579 665 0 False 629 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 671 272 0,00986784342978537 0,0458765591020352 0,00985732814526589 0,0460975051499199 0,00188147830185766 0,00934170827418288 374433 1999336 579 665 0 True 673 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 276 317 0,0103314646961182 0,0101843530777046 0,0103913939116503 0,0102082856488899 0,0014395786342823 0,00142016562170727 392025 443842 579 665 0 False 276 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 320 317 0,0102593071797915 0,0101982582916435 0,0102235446707866 0,0102388036926833 0,00138692326107228 0,00119860225568239 389287 444448 579 665 0 False 320 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 366 319 0,0105297002102925 0,12884855764956 0,0104982070649271 0,127122911421378 0,00147619826714438 0,0362392874638271 399547 5615320 579 665 0 True 364 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 410 318 0,0104850300166571 0,0528564028519456 0,0105134660868238 0,0525978484779126 0,00161857601008042 0,00888612837020437 397852 2303523 579 665 0 True 408 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 454 318 0,0105159433718986 0,0878587863570577 0,0104676890211337 0,0839856565194171 0,00172750260250855 0,0275608304681674 399025 3828954 579 665 0 True 452 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 498 318 0,0103318336534697 0,0426940778359265 0,0103456168459602 0,0440527962157626 0,0016760973386519 0,00872165517977795 392039 1860641 579 665 0 True 497 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 542 318 0,0102300277785355 0,0463493593218569 0,01025406271458 0,0481727321278706 0,00154516632876442 0,011684121862513 388176 2019941 579 665 0 True 541 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 587 319 0,0102725896444477 0,0548670600740808 0,0103456168459602 0,0551155870908675 0,00192342235255385 0,0126802057104197 389791 2391149 579 665 0 True 585 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 629 317 0,01022839382455 0,00991237535358194 0,0102388036926833 0,00994888227664607 0,00201578822632789 0,0020411521857683 388114 431989 579 665 0 False 629 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 673 317 0,00998388051685127 0,00991216884050364 0,0101167315175097 0,00994888227664607 0,00188019225119481 0,00190087326727268 378836 431980 579 665 0 False 673 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 278 363 0,0102214890512565 0,0546621532086109 0,010101472495613 0,0539101243610285 0,00150830336033867 0,011883897604913 387852 2382219 579 665 0 True 276 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 322 363 0,0102930404233627 0,0678592796938558 0,0103913939116503 0,0700236514839399 0,00138766133876049 0,0207286568308439 390567 2957360 579 665 0 True 320 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 366 363 0,010284027322346 0,0415382700284701 0,0103456168459602 0,0426031891355764 0,00145686420409458 0,00818829815392788 390225 1810270 579 665 0 True 364 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 410 363 0,0104159295755291 0,0368799774671286 0,0104371709773404 0,0369726100556954 0,0015554577534164 0,00631874071527149 395230 1607258 579 665 0 True 408 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 455 362 0,0106698776497891 0,0745362834873864 0,0107270923933776 0,0722972457465477 0,00180108318090659 0,0155172772820244 404866 3248349 579 665 0 True 452 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 499 362 0,0105841214196477 0,0341951238820328 0,0105287251087205 0,0346074616617075 0,00182576994025528 0,00615868644596423 401612 1490250 579 665 0 True 496 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 543 363 0,0103563956714451 0,0299575672988835 0,0103456168459602 0,0300907911802853 0,00174329491390702 0,00344744797370185 392971 1305574 579 665 0 True 541 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 586 363 0,0104546437433464 0,0511233221529447 0,0105134660868238 0,0512855725947967 0,00201330881462669 0,00891233618874864 396699 2227994 579 665 0 True 585 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 631 362 0,0102000895248659 0,057466577866043 0,0101625085831998 0,0593270771343557 0,0019446887261292 0,0115962852222589 387040 2504438 579 665 0 True 629 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 675 362 0,010154707770624 0,0663485676883901 0,0102235446707866 0,0663157091630426 0,00185437672266566 0,0193489326463391 385318 2891522 579 665 0 True 673 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 279 407 0,0102275241393642 0,0444407654521977 0,0102235446707866 0,047501335164416 0,00159526455303943 0,0103628618927466 388081 1936763 579 665 0 True 276 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 323 408 0,0102134246977152 0,0349590157586688 0,0102082856488899 0,0334019989318685 0,00137733931489716 0,0066739506053254 387546 1523541 579 665 0 True 320 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 367 408 0,0104474754290875 0,0912653802049183 0,0104829480430304 0,0875867856870375 0,0013578551242241 0,0202788268984539 396427 3977416 579 665 0 True 364 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 410 407 0,0106910399893108 0,06859111615156 0,0106507972838941 0,0675516899366751 0,00162041519779805 0,0176172543773819 405669 2989254 579 665 0 True 408 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 455 407 0,0107032946442019 0,043983040687092 0,0106813153276875 0,045288776989395 0,00157440156513509 0,00784528465357823 406134 1916815 579 665 0 True 452 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 499 407 0,0106540651918651 0,0551201992162829 0,010757610437171 0,0551155870908675 0,00183277371863228 0,0112511535366123 404266 2402181 579 665 0 True 496 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 544 407 0,0105752400891137 0,0429541007474053 0,0105745021744106 0,0438544289311055 0,00161040972911492 0,00608988815381523 401275 1871973 579 665 0 True 541 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 588 408 0,0106576493489945 0,0517033026604047 0,010757610437171 0,051468680857557 0,00175498645128076 0,00869223809014881 404402 2253270 579 665 0 True 585 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 632 408 0,0102296588211839 0,042866126176049 0,0101777676050965 0,0435034714274815 0,00185329692497343 0,00893518024702966 388162 1868139 579 665 0 True 629 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 676 407 0,0100500292991668 0,086195874212884 0,0100251773861295 0,0818188754100862 0,00179990819848602 0,0181695351349953 381346 3756483 579 665 0 True 673 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 278 452 0,0100743804843698 0,0433637079652668 0,0101472495613031 0,0440070191500725 0,00156566924088384 0,00790002208155632 382270 1889824 579 665 0 True 276 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 323 452 0,0103747117685404 0,0593526388642699 0,0104219119554437 0,058304722667277 0,00151143570756761 0,00989874030063837 393666 2586634 579 665 0 True 320 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 367 452 0,0106461589629031 0,0357537239757668 0,0106507972838941 0,0359044785229267 0,00149689961262179 0,00420360383573179 403966 1558175 579 665 0 True 364 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 411 452 0,0105927392092163 0,0560953080802257 0,010605020218204 0,0546730754558633 0,00173918550620091 0,0103175923528422 401939 2444677 579 665 0 True 408 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 455 452 0,0106917251958208 0,0974797488112591 0,0107118333714809 0,0952162966353857 0,00196413864646247 0,0126877665438196 405695 4248243 579 665 0 True 452 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 499 452 0,0105052963168964 0,0610291579257138 0,010605020218204 0,0608834973678187 0,00176657666926513 0,0126690055690421 398621 2659698 579 665 0 True 496 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 543 452 0,010381379354965 0,0549227956593246 0,0104982070649271 0,0528877698939498 0,00180176626512767 0,0112558204221201 393919 2393578 579 665 0 True 540 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 589 451 0,0105999075234752 0,0314410884157062 0,0106355382619974 0,0319218738078889 0,00186059862182796 0,00464003462525432 402211 1370227 579 665 0 True 585 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 632 451 0,0102916700103427 0,0396857559325184 0,0102235446707866 0,0400396734569314 0,00180616461047493 0,00558732649470432 390515 1729536 579 665 0 True 629 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 676 451 0,010224493418262 0,0672299425606819 0,0102693217364767 0,0657358663309682 0,00198554692974472 0,0117752865805794 387966 2929933 579 665 0 True 673 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 276 490 0,012384053505141 0,045965176158524 0,0104829480430304 0,0491340505073625 0,00658334758009133 0,0262160417698613 469910 2003198 579 665 0 False 276 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 322 496 0,010244838780791 0,0574443891830744 0,0102082856488899 0,057251850156405 0,00150864578114123 0,00918168763063525 388738 2503471 579 665 0 True 320 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 367 496 0,0103756341619193 0,0718978265072156 0,0103608758678569 0,0695963988708324 0,00150743939509427 0,0191240961906022 393701 3133363 579 665 0 True 364 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 411 496 0,0108718554456721 0,088392071962924 0,0108644235904479 0,0847791256580453 0,00175156932756624 0,0212834392078351 412530 3852195 579 665 0 True 408 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 455 495 0,0109125725248265 0,09718032779362 0,0108796826123445 0,0942854962996872 0,00182113990558179 0,0329418836667709 414075 4235194 579 665 0 True 452 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 499 496 0,0106466860448339 0,044096990014519 0,0106507972838941 0,0457770656900893 0,00178604343325762 0,00686834001638428 403986 1921781 579 665 0 True 496 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 543 495 0,0105965869073112 0,040489252428393 0,0104982070649271 0,042069123369192 0,0016543498680764 0,00548908613054291 402085 1764553 579 665 0 True 540 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 586 496 0,0106287916132832 0,0999037075407677 0,010605020218204 0,098970016021973 0,00195256944943748 0,0188948525654342 403307 4353881 579 665 0 True 585 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 631 495 0,0104075489728293 0,0591157454175608 0,0103913939116503 0,0630655374990463 0,00184638510095407 0,013991801853386 394912 2576310 579 665 0 True 629 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 675 495 0,0103570545238586 0,0738440287030233 0,010452429999237 0,0702372777904936 0,00186887818081889 0,0128107852457439 392996 3218180 579 665 0 True 673 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 279 540 0,00998506645119557 0,0577798123140307 0,00996414129854276 0,0604867627985046 0,00140455215502476 0,0145464362100326 378881 2518089 579 665 0 True 276 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 322 540 0,0102140308419356 0,107925753959171 0,0101777676050965 0,103440909437705 0,00142301446530807 0,0286985365621004 387569 4703488 579 665 0 True 320 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 365 539 0,010488930422945 0,0553405716167278 0,0105745021744106 0,0590981918059052 0,00145062080410564 0,0145591972758856 398000 2411785 579 665 0 True 364 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 409 539 0,0105982472153932 0,0551662286868464 0,0106660563057908 0,0573891813534752 0,00167079408388808 0,0103368546798008 402148 2404187 579 665 0 True 408 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 454 539 0,0106809727244325 0,0559544891067219 0,0106965743495842 0,0568703746089876 0,00204313068900263 0,00962234912837996 405287 2438540 579 665 0 True 452 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 498 540 0,0106476875005024 0,0606829502228907 0,0106202792401007 0,061371786068513 0,00192972840492984 0,01406928657378 404024 2644610 579 665 0 True 496 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 542 540 0,010619462263108 0,0722804722954101 0,0106660563057908 0,0701762417029068 0,00179990151551576 0,0184631373062648 402953 3150039 579 665 0 True 540 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 587 540 0,0103134648481813 0,0591512197752335 0,0103608758678569 0,0592050049591821 0,00165180387044669 0,0147579410296609 391342 2577856 579 665 0 True 585 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 631 540 0,0103119099564854 0,0431585257490258 0,01025406271458 0,0432135500114443 0,00179655023401731 0,00635523256156159 391283 1880882 579 665 0 True 629 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 675 539 0,0102068098194837 0,0664649722268592 0,0102082856488899 0,0658884565499352 0,0018019827449301 0,0151124253870023 387295 2896595 579 665 0 True 673 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 276 576 0,0137922582996627 0,0352258306558339 0,0104371709773404 0,0392462043183032 0,00872213383894413 0,0199333363422653 523344 1535169 579 665 0 False 276 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 320 576 0,0148419683189499 0,0420163248588397 0,010605020218204 0,0496681162737469 0,0109884153901105 0,0234807757717538 563175 1831104 579 665 0 False 320 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 364 576 0,0143791903837064 0,0387688378648613 0,0109712367437247 0,0434424353398947 0,00926982971322046 0,0216248287956503 545615 1689576 579 665 0 False 364 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 408 576 0,0149013177443581 0,0382718067771856 0,011108567940795 0,0457160296025025 0,0100709764696798 0,0191057218322519 565427 1667915 579 665 0 False 408 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 452 576 0,0203047772202569 0,0616986733255662 0,0115663385976959 0,0706034943160143 0,020886166617898 0,0430257969483282 770460 2688876 579 665 0 False 452 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 496 576 0,0163159002302426 0,0461643924413919 0,0117189288166629 0,053833829251545 0,0123038261840529 0,0273681876710962 619103 2011880 579 665 0 False 496 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 540 576 0,0153201106924763 0,0439304716357155 0,0110475318532082 0,0524299992370489 0,0114912229746159 0,023323654819436 581318 1914524 579 665 0 False 540 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 584 576 0,0125227287611348 0,0303123108756097 0,0108644235904479 0,0334935530632486 0,00539601237171293 0,0147829507454596 475172 1321034 579 665 0 False 584 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 632 584 0,0101711000186719 0,0488849498431361 0,0101625085831998 0,0488593881132219 0,00157759363456956 0,00694643906560679 385940 2130444 579 665 0 True 629 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 675 583 0,0102142680288045 0,0552959189000196 0,0101930266269932 0,0548104066529335 0,00166167958303001 0,00908909975275039 387578 2409839 579 665 0 True 673 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 276 619 0,0105877846390668 0,00969528421649225 0,00978103303578241 0,00973525597009232 0,00444083497287845 0,00134546274382751 401751 422528 579 665 0 False 276 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 320 619 0,0109080132661251 0,00962300463908685 0,010101472495613 0,00953688868543526 0,00465067209908344 0,00127432318670814 413902 419378 579 665 0 False 320 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 364 619 0,0219958141788465 0,0590093682363382 0,0109102006561379 0,0697032120241093 0,0262830949219108 0,0389855107667216 834626 2571674 579 665 0 False 364 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 408 619 0,0185334129754131 0,0522392499903914 0,0111543450064851 0,0534370946822309 0,0168486862696905 0,0374202398491133 703246 2276627 579 665 0 False 408 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 452 619 0,0122219758114196 0,0102660175272239 0,010452429999237 0,0102235446707866 0,00906572375262013 0,00189500832264131 463760 447401 579 665 0 False 452 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 496 619 0,0114733613451025 0,00996021755005504 0,0102082856488899 0,00996414129854276 0,00674110721532499 0,00196069295465507 435354 434074 579 665 0 False 496 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 540 619 0,0108177504854754 0,0100169168629975 0,0101472495613031 0,0100251773861295 0,00487909210729094 0,00199477961305728 410477 436545 579 665 0 False 540 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 584 620 0,0101957674530334 0,0100180182660818 0,010101472495613 0,00997940032043946 0,0016331493051662 0,00156482091344376 386876 436593 579 665 0 False 584 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 629 620 0,0102677141365877 0,00988986542804711 0,0100709544518196 0,00991836423285267 0,00223100904255273 0,00143325531416773 389606 431008 579 665 0 False 629 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 673 620 0,0100776220382443 0,00993263658115304 0,00990310521095598 0,00994888227664607 0,00193471817618732 0,00158028992181629 382393 432872 579 665 0 False 673 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 276 669 0,00949970305521724 0,044512379598573 0,00950637064164187 0,045288776989395 0,00131796377114421 0,00987765745143391 360464 1939884 579 665 0 True 276 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 320 663 0,00962870635778084 0,00938120077029378 0,00962844281681544 0,0093842984664683 0,00122046013084485 0,00129946390511347 365359 408840 579 665 0 False 320 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 364 663 0,0118941835586543 0,00954542455933838 0,00968947890440223 0,00956740672922866 0,0110629671303568 0,00118211306534615 451322 415997 579 665 0 False 364 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 408 663 0,0114101378675029 0,00976563633850018 0,00996414129854276 0,00975051499198901 0,00744410927175661 0,00138281109217075 432955 425594 579 665 0 False 408 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 452 663 0,00984462547073358 0,0097804134965475 0,00973525597009232 0,00978103303578241 0,00160306345589812 0,00152836503939212 373552 426238 579 665 0 False 452 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 496 663 0,00967403540382975 0,00992256333211146 0,00973525597009232 0,00993362325474937 0,00167080948651197 0,00175587577800723 367079 432433 579 665 0 False 496 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 540 663 0,00979244435958425 0,00987059087407234 0,00975051499198901 0,00999465934233616 0,00167731482812052 0,00168940687385026 371572 430168 579 665 0 False 540 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 584 663 0,00992018266551394 0,010036374984153 0,0100099183642329 0,0100404364080262 0,00142836423981265 0,00132291194617905 376419 437393 579 665 0 False 584 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 628 663 0,00984581140507788 0,00995014430101346 0,00984206912336919 0,0100099183642329 0,00141492666064558 0,00135954740639907 373597 433635 579 665 0 False 628 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 673 668 0,0109449090012812 0,0441121572528254 0,0101319905394064 0,0439917601281758 0,00534303334642659 0,00834945237257585 415302 1922442 579 665 0 True 673 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F3_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F3_2.csv new file mode 100755 index 0000000..688f92d --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F3_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 276 273 0,00853379906292739 0,723352716880322 0,00814831769283589 0,736278324559396 0,00269444724141883 0,191100713144613 323813 31524272 579 665 11 True 276 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 320 273 0,0071870520215371 0,00691463150896238 0,00712596322575723 0,00686655985351339 0,00153271348830126 0,00129813370553159 272711 301345 579 665 0 False 320 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 365 273 0,00657381854914637 0,00660795958768517 0,00654612039368277 0,00660715648126955 0,00128521141297576 0,00130366280430785 249442 287980 579 665 0 True 364 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 410 273 0,00676572908015111 0,00664458124023724 0,0068055237659266 0,00663767452506294 0,00136501818283724 0,00134222234261779 256724 289576 579 665 0 True 408 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 454 273 0,00678349174121911 0,00680143939615576 0,00677500572213321 0,00679026474402991 0,00168639452241729 0,00174830994283532 257398 296412 579 665 0 True 452 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 498 273 0,00694541131036126 0,00707350890386874 0,00692759594110018 0,00717174029144732 0,00172459709104052 0,00150914197574041 263542 308269 579 665 0 True 497 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 542 274 0,00724808810912388 0,00714048797893108 0,0072327763790341 0,00718699931334401 0,00148752259848808 0,00147701700390718 275027 311188 579 665 0 True 541 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 587 274 0,0074327512635801 0,00748648916867587 0,00746166170748455 0,00752269779507134 0,00165639744468624 0,00191795387287301 282034 326267 579 665 0 True 585 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 629 274 0,00810528145318597 0,00810405505638668 0,00807202258335241 0,00814831769283589 0,00201410057759373 0,00181430878077698 307553 353181 579 665 0 False 629 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 671 272 0,00936938204782662 0,723608127666385 0,00930800335698482 0,730052643625544 0,00192348206989707 0,189014028355328 355519 31535403 579 665 11 True 673 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 276 317 0,00690371912963488 0,00652948461793073 0,00695811398489357 0,00654612039368277 0,00135092266953486 0,00133849650462266 261960 284560 579 665 0 False 276 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 320 317 0,00664384138365332 0,00640950051943776 0,00660715648126955 0,0064087891966125 0,00128242395898169 0,00113674219917447 252099 279331 579 665 0 False 320 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 366 319 0,00665174761261534 0,00687693139922363 0,00657663843747616 0,00686655985351339 0,00119734409989772 0,00129184639769765 252399 299702 579 665 0 True 364 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 410 318 0,00697258238389406 0,00690960635739039 0,00695811398489357 0,00691233691920348 0,00140652734958045 0,00136654816293843 264573 301126 579 665 0 True 408 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 454 318 0,00703509430088709 0,00725510273738822 0,00706492713817044 0,00729381246662089 0,00165706498257999 0,00158244857885305 266945 316183 579 665 0 True 452 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 498 318 0,00697948715718756 0,00699491920462635 0,00698863202868696 0,00701915007248035 0,00159077917833575 0,00158006201619547 264835 304844 579 665 0 True 497 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 542 318 0,00721588340315192 0,00719906885547584 0,0072327763790341 0,00718699931334401 0,00149070156559659 0,00145855264638165 273805 313741 579 665 0 True 541 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 587 319 0,00732749300199909 0,00737042881867062 0,00735484855420768 0,00741588464179446 0,00186044517488359 0,00204009088353576 278040 321209 579 665 0 True 585 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 629 317 0,00762827230581083 0,00760631264588571 0,0076600289921416 0,00762951094834821 0,00194428061185932 0,00183738743799129 289453 331489 579 665 0 False 629 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 673 317 0,00764524434398263 0,00757588638568268 0,00755321583886473 0,00752269779507134 0,00188861520553794 0,00182736200554041 290097 330163 579 665 0 False 673 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 278 363 0,0065339711551778 0,00647468981448815 0,00660715648126955 0,00651560234988937 0,00132610782876739 0,0013960269772708 247930 282172 579 665 0 True 276 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 322 363 0,00660114774725842 0,0066477936658997 0,00656137941557946 0,00668345159075303 0,0013174430974523 0,00124765798370436 250479 289716 579 665 0 True 320 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 366 363 0,0069881313008527 0,00697130787600725 0,00698863202868696 0,00695811398489357 0,00132681608818932 0,00125439756242782 265163 303815 579 665 0 True 364 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 410 363 0,00712609499623993 0,00721455733634842 0,00717174029144732 0,00721751735713741 0,00135088287491552 0,00144323573345599 270398 314416 579 665 0 True 408 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 455 362 0,00723741470002515 0,00732678572145631 0,00732433051041428 0,00738536659800107 0,00168245193370636 0,00179954006753189 274622 319307 579 665 0 True 452 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 499 362 0,00719954386329708 0,00723837517804582 0,00721751735713741 0,00730907148851759 0,00173531305309862 0,00169617735598516 273185 315454 579 665 0 True 496 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 543 363 0,0074657729465448 0,00731260515674629 0,00741588464179446 0,00732433051041428 0,00156339849795001 0,00165409998128521 283287 318689 579 665 0 True 541 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 586 363 0,00744764132812524 0,00743671951680529 0,00755321583886473 0,00752269779507134 0,00187803842094625 0,00189574976919074 282599 324098 579 665 0 True 585 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 631 362 0,00710187558151961 0,00733396778740167 0,00711070420386053 0,0072480354009308 0,00195468430364919 0,00184405377161477 269479 319620 579 665 0 True 629 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 675 362 0,00661814613952676 0,00663746801198464 0,00660715648126955 0,00659189745937285 0,00185126718046933 0,00190483472662387 251124 289266 579 665 0 True 673 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 279 407 0,00642389009392995 0,00647673199937358 0,0064087891966125 0,00648508430609598 0,00147828203400682 0,00139350841171812 243753 282261 579 665 0 True 276 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 323 408 0,00664784720632741 0,00670724648655284 0,00660715648126955 0,00669871061264973 0,00126173654804561 0,00120642126996528 252251 292307 579 665 0 True 320 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 367 408 0,00693294582269781 0,00698252841992828 0,00692759594110018 0,00703440909437705 0,00128880697375626 0,00133681541458789 263069 304304 579 665 0 True 364 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 410 407 0,00703820408427882 0,00722910503541986 0,00703440909437705 0,00732433051041428 0,001397363838339 0,00142976590135539 267063 315050 579 665 0 True 408 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 455 407 0,00754259513795908 0,00740021259374116 0,00759899290455482 0,00746166170748455 0,00162396666584125 0,00152503430256953 286202 322507 579 665 0 True 452 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 499 407 0,00729091351600148 0,00751696132067408 0,0072480354009308 0,00758373388265812 0,00168774845304769 0,00179403455361296 276652 327595 579 665 0 True 496 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 544 407 0,0072292185760012 0,00742453524518552 0,00729381246662089 0,00737010757610437 0,00154124868946092 0,00146709151087743 274311 323567 579 665 0 True 541 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 588 408 0,00678412423953607 0,00706634978382096 0,00688181887541009 0,00711070420386053 0,00172466640023529 0,00190180744616199 257422 307957 579 665 0 True 585 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 632 408 0,00633547210003804 0,00632212254141878 0,00628671702143893 0,0063782711528191 0,00161168553645456 0,00185464001431111 240398 275523 579 665 0 True 629 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 676 407 0,0062184862654967 0,00625076079991694 0,00616464484626535 0,00621042191195544 0,00170888082768956 0,00170325697269771 235959 272413 579 665 0 True 673 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 278 452 0,00655539703566487 0,0064998844100409 0,00660715648126955 0,00654612039368277 0,00143375440802561 0,0015229973881116 248743 283270 579 665 0 True 276 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 323 452 0,00679877711721235 0,00678287616500624 0,0068207827878233 0,00675974670023652 0,00140752972488735 0,00147149800051509 257978 295603 579 665 0 True 320 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 367 452 0,00688640448820806 0,00693913772758745 0,00692759594110018 0,00700389105058366 0,00131485447446807 0,00150427437035354 261303 302413 579 665 0 True 364 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 411 452 0,00687306931535879 0,00722396515435992 0,00694285496299687 0,00732433051041428 0,0016968973048639 0,00157932450818553 260797 314826 579 665 0 True 408 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 455 452 0,00712788707480465 0,00727951717242293 0,00712596322575723 0,0072480354009308 0,00185811237593283 0,00194068958437038 270466 317247 579 665 0 True 452 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 499 452 0,00704510885757232 0,00709163616296406 0,00708018616006714 0,00715648126955062 0,00182320968990815 0,00182562566418195 267325 309059 579 665 0 True 496 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 543 452 0,00662547257836489 0,00678932396222876 0,00668345159075303 0,0068207827878233 0,00164665842350679 0,00161575488319614 251402 295884 579 665 0 True 540 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 589 451 0,00649003887624551 0,00631062664672668 0,00642404821850919 0,00625619897764553 0,00176674339763543 0,00187112418138856 246263 275022 579 665 0 True 585 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 632 451 0,00627533205173362 0,00623646550571898 0,00630197604333562 0,00625619897764553 0,00164865695060187 0,00184429765237451 238116 271790 579 665 0 True 629 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 676 451 0,00614097886757238 0,0061277707888398 0,00622568093385214 0,00608834973678187 0,00178972692737641 0,00188354468979612 233018 267053 579 665 0 True 673 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 276 490 0,00650537696043183 0,0066279454644852 0,00654612039368277 0,00668345159075303 0,00145754332096343 0,00153280130033182 246845 288851 579 665 0 False 276 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 322 496 0,0067694713618598 0,00672078456613036 0,0068207827878233 0,00675974670023652 0,00155918493667886 0,00149583437435082 256866 292897 579 665 0 True 320 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 367 496 0,00679015932764375 0,00686357688682682 0,0068207827878233 0,00683604180972 0,0014033486793003 0,00144561280568691 257651 299120 579 665 0 True 364 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 411 496 0,00699240066449219 0,0070884237373016 0,00698863202868696 0,00709544518196384 0,00162358616507619 0,00161975222469568 265325 308919 579 665 0 True 408 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 455 495 0,00705101217519729 0,00731012699980668 0,00709544518196384 0,00732433051041428 0,00186449332515427 0,00188228441789557 267549 318581 579 665 0 True 452 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 499 496 0,00665393500262816 0,00674028857908103 0,00666819256885634 0,00677500572213321 0,00168390251197812 0,00179045269690186 252482 293747 579 665 0 True 496 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 543 495 0,00644934815118765 0,00631971322217193 0,00651560234988937 0,00634775310902571 0,00160101962761016 0,00160190153858722 244719 275418 579 665 0 True 540 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 586 496 0,00629425429304938 0,00644176245144791 0,00628671702143893 0,00643930724040589 0,00184566521945211 0,00185006847240355 238834 280737 579 665 0 True 585 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 631 495 0,00622491666505248 0,00618538793768583 0,00630197604333562 0,00619516289005875 0,00171056670005774 0,00183156759221233 236203 269564 579 665 0 True 629 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 675 495 0,0061852010415666 0,00637496694356629 0,00621042191195544 0,00642404821850919 0,00173804223264156 0,00180392388146503 234696 277826 579 665 0 True 673 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 279 540 0,006536079482901 0,00660174124943854 0,00648508430609598 0,00660715648126955 0,00148171574294707 0,00142732335603201 248010 287709 579 665 0 True 276 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 322 540 0,00663090152225215 0,0067551804666163 0,00665293354695964 0,00677500572213321 0,00135432211379067 0,0014527784115803 251608 294396 579 665 0 True 320 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 365 539 0,00687243681704182 0,00691591647922737 0,00691233691920348 0,00698863202868696 0,00138022760523083 0,00139153647099303 260773 301401 579 665 0 True 364 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 409 539 0,0066522483404496 0,00690173591451735 0,00669871061264973 0,00691233691920348 0,00155935063826668 0,00158315641635627 252418 300783 579 665 0 True 408 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 454 539 0,00674851985511045 0,00664306681099636 0,00672922865644312 0,00660715648126955 0,00184156533324764 0,00193616638407545 256071 289510 579 665 0 True 452 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 498 540 0,00663996733146193 0,00673271643287665 0,00654612039368277 0,00679026474402991 0,00191153430145123 0,00192313087519869 251952 293417 579 665 0 True 496 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 542 540 0,00654809695092327 0,00659077311039099 0,00662241550316625 0,00659189745937285 0,00178214345556774 0,0017455473584975 248466 287231 579 665 0 True 540 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 587 540 0,00656319784824073 0,00651289473397387 0,00654612039368277 0,00659189745937285 0,00150263207962451 0,00142496926894448 249039 283837 579 665 0 True 585 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 631 540 0,00642304676284067 0,00627471631699987 0,00654612039368277 0,00633249408712902 0,00169202192131757 0,00186058171488074 243721 273457 579 665 0 True 629 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 675 539 0,00640256962982904 0,00620647521757013 0,00648508430609598 0,00622568093385214 0,00179150005706414 0,00164812706619947 242944 270483 579 665 0 True 673 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 276 576 0,00674179956049273 0,00689650424986706 0,00674448767833982 0,0068207827878233 0,00131252684068599 0,00127788506676096 255816 300555 579 665 0 False 276 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 320 576 0,0067937434847732 0,0068782393153862 0,0068055237659266 0,00694285496299687 0,00135723171216579 0,0013209850218222 257787 299759 579 665 0 False 320 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 364 576 0,00681883258467934 0,00673244108210558 0,00679026474402991 0,00668345159075303 0,00137466949358785 0,00130721757333271 258739 293405 579 665 0 False 364 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 408 576 0,00658206738136341 0,00670589267859509 0,00659189745937285 0,00671396963454643 0,00147755128435962 0,00140490103945887 249755 292248 579 665 0 False 408 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 452 576 0,00673521103635772 0,00661849175467853 0,00669871061264973 0,00660715648126955 0,00191493976077246 0,00184988727648795 255566 288439 579 665 0 False 452 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 496 576 0,0067430909112232 0,00660068573814945 0,00671396963454643 0,00657663843747616 0,00183416238514922 0,00199951116100058 255865 287663 579 665 0 False 496 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 540 576 0,0067292813646362 0,00667610890352455 0,00679026474402991 0,00669871061264973 0,00184721863983831 0,00188005140424287 255341 290950 579 665 0 False 540 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 584 576 0,00660096326858264 0,00667574176916312 0,00669871061264973 0,00662241550316625 0,00155897056666442 0,00159538989374512 250472 290934 579 665 0 False 584 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 632 584 0,00655123308841154 0,00636037335269967 0,00651560234988937 0,0063782711528191 0,00146834195416533 0,0013586215931705 248585 277190 579 665 0 True 629 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 675 583 0,0064270789396113 0,00644965584021854 0,00642404821850919 0,0063782711528191 0,00155989176432507 0,00162087544868112 243874 281081 579 665 0 True 673 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 276 619 0,00687667982658477 0,00688535254363879 0,00683604180972 0,00688181887541009 0,00143049003069152 0,00140707340368261 260934 300069 579 665 0 False 276 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 320 619 0,00683079734450852 0,00670258846934227 0,0068207827878233 0,00668345159075303 0,00135979706292716 0,00125305009969848 259193 292104 579 665 0 False 320 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 364 619 0,00658583601716864 0,00662535257805764 0,00657663843747616 0,00663767452506294 0,00136540091091075 0,00136555645819828 249898 288738 579 665 0 False 364 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 408 619 0,0063349186640107 0,00638380111413806 0,00636301213092241 0,00634775310902571 0,00143148372963274 0,0013776477216689 240377 278211 579 665 0 False 408 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 452 619 0,00636351285875667 0,00620961880553983 0,00636301213092241 0,00625619897764553 0,00181330331043718 0,00178602087541489 241462 270620 579 665 0 False 452 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 496 619 0,00643559131279374 0,00642939461264744 0,00636301213092241 0,0063782711528191 0,00186986041372721 0,00190551714376396 244197 280198 579 665 0 False 496 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 540 619 0,00630661436432667 0,00650054984107098 0,00625619897764553 0,00642404821850919 0,00183494694710709 0,00184981060548859 239303 283299 579 665 0 False 540 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 584 620 0,00651172829769798 0,00629522994944445 0,00659189745937285 0,00633249408712902 0,00148230258209223 0,00149725728039264 247086 274351 579 665 0 False 584 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 629 620 0,00665319708792504 0,00659575237016781 0,00662241550316625 0,00659189745937285 0,00138531531605384 0,00138684375115383 252454 287448 579 665 0 False 629 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 673 620 0,0066112677203298 0,00660557321433591 0,00657663843747616 0,00665293354695964 0,00145400141081609 0,00140259511182355 250863 287876 579 665 0 False 673 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 276 669 0,00829930031191391 0,716835645992987 0,0080872816052491 0,722560463874266 0,0020062352659028 0,209615565701035 314915 31240253 579 665 12 True 276 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 320 663 0,0071037730764705 0,00688119933617518 0,00701915007248035 0,00683604180972 0,00151810696824754 0,00130425014688616 269551 299888 579 665 0 False 320 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 364 663 0,00618973394617149 0,00617815997994529 0,00622568093385214 0,00624093995574884 0,001214690990024 0,00118291923286783 234868 269249 579 665 0 False 364 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 408 663 0,00636514681274215 0,00641147386663041 0,0064087891966125 0,00643930724040589 0,00137835299346555 0,00143912169987698 241524 279417 579 665 0 False 408 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 452 663 0,00623137341870479 0,00624991180170614 0,00631723506523232 0,00631723506523232 0,0014536079946362 0,001530991032417 236448 272376 579 665 0 False 452 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 496 663 0,0063354457459415 0,00634690411081492 0,0063935301747158 0,00631723506523232 0,00153952186309532 0,00156506627454753 240397 276603 579 665 0 False 496 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 540 663 0,00628814014265209 0,00634343928027898 0,00622568093385214 0,00634775310902571 0,00161891992276119 0,00168851392657587 238602 276452 579 665 0 False 540 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 584 663 0,0062088143120665 0,00641849531129265 0,00617990386816205 0,0063935301747158 0,00131236177219797 0,00123515372703494 235592 279723 579 665 0 False 584 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 628 663 0,00676211856892512 0,00655167330089931 0,00685130083161669 0,00653086137178607 0,00139675962557562 0,00133506235970035 256587 285527 579 665 0 False 628 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 673 668 0,00826003270806922 0,721833927918905 0,00802624551766232 0,717479209582666 0,00195262479205789 0,186883314589634 313425 31458082 579 665 12 True 673 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F3_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F3_3.csv new file mode 100755 index 0000000..a763d92 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F3_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 276 273 0,000985300607343332 0,0734844664878034 0,00080872816052491 0,0732433051041428 0,000734255194985003 0,0219454990144882 37387 3202510 579 665 0 True 276 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 320 273 0,000926610034348612 0,000896197922134244 0,000823987182421607 0,000793469138628214 0,000664799786895624 0,000643623914019507 35160 39057 579 665 0 False 320 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 365 273 0,000924817955783887 0,000857671760082284 0,000839246204318303 0,000732433051041428 0,000637186869653636 0,000655283681308961 35092 37378 579 665 0 True 364 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 410 273 0,00087985786708654 0,00100172610514613 0,000717174029144732 0,00080872816052491 0,000703811558795446 0,000761763330472558 33386 43656 579 665 0 True 408 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 454 273 0,000840036827214505 0,000943145228601373 0,000610360875867857 0,000671396963454643 0,000790820298001773 0,00087499942898372 31875 41103 579 665 0 True 452 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 498 273 0,000901837183600953 0,000855331278528204 0,000717174029144732 0,000625619897764553 0,000800538300519669 0,000794105202357659 34220 37276 579 665 0 True 497 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 542 274 0,000955625894639221 0,000928643421325114 0,000762951094834821 0,000747692072938125 0,000818949723010983 0,000781003089916942 36261 40471 579 665 0 True 541 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 587 274 0,00102332956865064 0,000952828397383938 0,000717174029144732 0,000610360875867857 0,000965479935918173 0,000993234279349571 38830 41525 579 665 0 True 585 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 629 274 0,00101067960231141 0,000981579607062977 0,00064087891966125 0,000625619897764553 0,000982990870587792 0,000990627591363653 38350 42778 579 665 0 False 629 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 671 272 0,00107796161077819 0,0732951398867964 0,00080872816052491 0,0721599145494774 0,000950030641519652 0,0220660934661778 40903 3194259 579 665 0 True 673 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 276 317 0,000874587047778527 0,000872632485310323 0,000686655985351339 0,000732433051041428 0,000722657750933158 0,00069874618496603 33186 38030 579 665 0 False 276 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 320 317 0,000898569275629985 0,000841471956384438 0,000823987182421607 0,000732433051041428 0,000633878087304196 0,000619833113199052 34096 36672 579 665 0 False 320 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 366 319 0,000981057597800382 0,000914095722253677 0,000823987182421607 0,000823987182421607 0,000707328258294635 0,000641802381674068 37226 39837 579 665 0 True 364 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 410 318 0,00102398842106414 0,00098639824555667 0,000823987182421607 0,000762951094834821 0,000781721850266417 0,000799360367891082 38855 42988 579 665 0 True 408 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 454 318 0,00098464175492983 0,00102653062043986 0,000778210116731518 0,000793469138628214 0,000877347816890314 0,000881921362250135 37362 44737 579 665 0 True 452 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 498 318 0,000950697678586229 0,00087178348709953 0,000793469138628214 0,000686655985351339 0,000818518249925202 0,000756016618646963 36074 37993 579 665 0 True 497 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 542 318 0,000888818259910162 0,000981143635008785 0,000701915007248035 0,000854505226215 0,000791594817675498 0,000782703191666323 33726 42759 579 665 0 True 541 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 587 319 0,000957734222362426 0,000977219886521063 0,000671396963454643 0,000518806744487678 0,000960291078177467 0,00109671353490253 36341 42588 579 665 0 True 585 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 629 317 0,001006462946865 0,00103837070359579 0,000671396963454643 0,00064087891966125 0,00103254714192143 0,00107941789066293 38190 45253 579 665 0 False 629 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 673 317 0,000912747779568539 0,000937523483692064 0,000473029678797589 0,000534065766384375 0,000954254964493819 0,000972880399160118 34634 40858 579 665 0 False 673 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 278 363 0,000880490365403502 0,000888786397212991 0,000732433051041428 0,000762951094834821 0,000720667783711984 0,000716907552108317 33410 38734 579 665 0 True 276 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 322 363 0,000816186369845748 0,000870452625039366 0,000701915007248035 0,000732433051041428 0,000657843738447545 0,000695250166745167 30970 37935 579 665 0 True 320 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 366 363 0,00100772794349893 0,000914531694307868 0,000885023270008392 0,000839246204318303 0,000722935333163357 0,00066213677569188 38238 39856 579 665 0 True 364 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 410 363 0,000919230887317394 0,000918271875614878 0,000656137941557946 0,000747692072938125 0,00084165896315686 0,000748190793802734 34880 40019 579 665 0 True 408 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 455 362 0,000914302671264402 0,00102880226430117 0,000625619897764553 0,000762951094834821 0,000847818343188282 0,00092863776094937 34693 44836 579 665 0 True 452 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 499 362 0,000978580312725616 0,000864716150642112 0,000717174029144732 0,000564583810177768 0,000929133572126091 0,000900755517683832 37132 37685 579 665 0 True 496 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 543 363 0,000977974168505194 0,000958289521010124 0,000717174029144732 0,000686655985351339 0,000858418824013689 0,000897731839898034 37109 41763 579 665 0 True 541 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 586 363 0,000969409087129674 0,000973984514961012 0,000610360875867857 0,000534065766384375 0,000993461185068681 0,00106951424239959 36784 42447 579 665 0 True 585 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 631 362 0,0010475753374675 0,000984493736056782 0,000701915007248035 0,00064087891966125 0,00104816872532112 0,00101364122149811 39750 42905 579 665 0 True 629 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 675 362 0,000998872967061464 0,000928918772096182 0,000701915007248035 0,000610360875867857 0,000967522709621265 0,000953728084795081 37902 40483 579 665 0 True 673 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 279 407 0,000776497100456413 0,000910126081970777 0,000595101853971161 0,000762951094834821 0,000704004099394604 0,000739545269759274 29464 39664 579 665 0 True 276 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 323 408 0,000929403568581858 0,000987591432231299 0,000839246204318303 0,000915541313801785 0,00072329935149933 0,000708266114929644 35266 43040 579 665 0 True 320 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 367 408 0,000907898625805167 0,000890002529785209 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,000718243586291118 0,00068421918972569 34450 38787 579 665 0 True 364 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 410 407 0,00101890208043191 0,000905445118862618 0,00080872816052491 0,000701915007248035 0,000816468156863455 0,000745504299150791 38662 39460 579 665 0 True 408 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 455 407 0,00100846585820205 0,00106078884554026 0,000793469138628214 0,000869764248111696 0,000842896294377544 0,00087679731517145 38266 46230 579 665 0 True 452 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 499 407 0,00102069415899664 0,00102641589095192 0,000686655985351339 0,000793469138628214 0,000970032448677189 0,00092329552798677 38730 44732 579 665 0 True 496 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 544 407 0,000989385492307041 0,00100064764795945 0,000747692072938125 0,000823987182421607 0,000863732998845094 0,000834371115366485 37542 43609 579 665 0 True 541 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 588 408 0,00098024062080764 0,000888281587466033 0,000732433051041428 0,000473029678797589 0,000984538811838451 0,000988902896197997 37195 38712 579 665 0 True 585 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 632 408 0,00093406824366945 0,000932544223915247 0,000610360875867857 0,000625619897764553 0,000939442902788931 0,000958690635886684 35443 40641 579 665 0 True 629 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 676 407 0,0009217345264887 0,00088204030332182 0,000610360875867857 0,000488288700694286 0,000908605352737916 0,000923151545531997 34975 38440 579 665 0 True 673 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 278 452 0,000858484694792549 0,000842206225107286 0,000701915007248035 0,000717174029144732 0,000788528995276759 0,000743098376143349 32575 36704 579 665 0 True 276 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 323 452 0,000864098117355582 0,000895968463158354 0,000747692072938125 0,000732433051041428 0,000742078056055253 0,000779908924957732 32788 39047 579 665 0 True 320 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 367 452 0,000959737133699471 0,00095441166431758 0,000793469138628214 0,000839246204318303 0,000782625796234511 0,000739242799357057 36417 41594 579 665 0 True 364 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 411 452 0,000932302519201265 0,000924329592578379 0,000701915007248035 0,000717174029144732 0,000874747170826833 0,000823090618056179 35376 40283 579 665 0 True 408 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 455 452 0,000992205380636828 0,000909529488633463 0,000701915007248035 0,000503547722590982 0,00101359583986472 0,000983234259564281 37649 39638 579 665 0 True 452 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 499 452 0,000920733070820178 0,000966458260551814 0,000610360875867857 0,000671396963454643 0,000934992638971069 0,000949788589189562 34937 42119 579 665 0 True 496 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 543 452 0,000910639451845334 0,000929974283385277 0,000610360875867857 0,00064087891966125 0,000859673412389936 0,00090917772688579 34554 40529 579 665 0 True 540 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 589 451 0,00089643459381024 0,000906844818615548 0,000518806744487678 0,000595101853971161 0,000980860265585497 0,00094951288812009 34015 39521 579 665 0 True 585 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 632 451 0,000910823930521114 0,000976210267027147 0,000534065766384375 0,00064087891966125 0,000925257390731022 0,000963871928590023 34561 42544 579 665 0 True 629 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 676 451 0,000873875487171946 0,000931993522373111 0,000503547722590982 0,000564583810177768 0,000942231538382019 0,00097936778312914 33159 40617 579 665 0 True 673 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 276 490 0,000874824234647388 0,000859300918811104 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000757709797039795 0,000736557749099806 33195 37449 579 665 0 False 276 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 322 496 0,00093006242099536 0,000880227577412288 0,000793469138628214 0,000732433051041428 0,000787094384807328 0,000775783587531255 35291 38361 579 665 0 True 320 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 367 496 0,000915594021994866 0,000893146117754905 0,000762951094834821 0,000747692072938125 0,000752445706766876 0,000743481717343209 34742 38924 579 665 0 True 364 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 411 496 0,000930853043891562 0,000936009054451189 0,00064087891966125 0,000656137941557946 0,00088132962224501 0,000850302246696195 35321 40792 579 665 0 True 408 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 455 495 0,000990492364361724 0,000978826099352295 0,000671396963454643 0,000625619897764553 0,000979459849181314 0,000983864853701207 37584 42658 579 665 0 True 452 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 499 496 0,000956363809342343 0,000883049922815737 0,000610360875867857 0,000503547722590982 0,000977078609389733 0,000940242990229115 36289 38484 579 665 0 True 496 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 543 495 0,000864256241934823 0,00096095124513045 0,000579842832074464 0,000778210116731518 0,000858320302707398 0,000861102033509461 32794 41879 579 665 0 True 540 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 586 496 0,000940208748163284 0,000931052740571961 0,000595101853971161 0,000488288700694286 0,000944083474600852 0,00103995484134112 35676 40576 579 665 0 True 585 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 631 495 0,000834133509589531 0,000919648629470219 0,000518806744487678 0,000534065766384375 0,000846663015335315 0,000985389883854493 31651 40079 579 665 0 True 629 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 675 495 0,000926241076997051 0,000888625775929868 0,000564583810177768 0,000488288700694286 0,000957347087135205 0,000958656052601484 35146 38727 579 665 0 True 673 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 279 540 0,000908004042191327 0,000852004123377797 0,000717174029144732 0,000686655985351339 0,000719738053027608 0,000715722118472156 34454 37131 579 665 0 True 276 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 322 540 0,000936756361516536 0,000818457221102654 0,00080872816052491 0,000701915007248035 0,000779097068910076 0,000690406995865686 35545 35669 579 665 0 True 320 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 365 539 0,000873058510179204 0,00104612641698088 0,000762951094834821 0,000930800335698482 0,000711672682703947 0,000818240018100439 33128 45591 579 665 0 True 364 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 409 539 0,00101281428413116 0,0010001198923149 0,000747692072938125 0,000732433051041428 0,000922606744850171 0,000915457754141544 38431 43586 579 665 0 True 408 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 454 539 0,000918993700448533 0,000969074092876962 0,000534065766384375 0,000625619897764553 0,000990724541254602 0,00105200273562848 34871 42233 579 665 0 True 452 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 498 540 0,00084623003990142 0,00085239420363681 0,0004272526131075 0,000488288700694286 0,000954680313651424 0,000965751335207751 32110 37148 579 665 0 True 496 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 542 540 0,000877090686949833 0,000913866263277787 0,000473029678797589 0,000488288700694286 0,000948197684622109 0,000985295748614027 33281 39827 579 665 0 True 540 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 587 540 0,000922182546129881 0,000880594711773712 0,000686655985351339 0,000625619897764553 0,00081851673190119 0,000784779555493345 34992 38377 579 665 0 True 585 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 631 540 0,000886762640380037 0,000902163855507388 0,000579842832074464 0,000534065766384375 0,000917725763257905 0,000937233965073198 33648 39317 579 665 0 True 629 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 675 539 0,00088399546024333 0,000970014874678112 0,000564583810177768 0,000610360875867857 0,000916965605246977 0,000961737869818907 33543 42274 579 665 0 True 673 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 276 576 0,00090900549785985 0,000914462856615101 0,000747692072938125 0,000823987182421607 0,000690853013427442 0,000664115355174547 34492 39853 579 665 0 False 276 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 320 576 0,000908847373280609 0,000901980288326676 0,000732433051041428 0,000747692072938125 0,000748491297217877 0,000726481603299451 34486 39309 579 665 0 False 320 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 364 576 0,000927058053989793 0,000961800243341244 0,000747692072938125 0,000869764248111696 0,000741182829429509 0,000654736568346198 35177 41916 579 665 0 False 364 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 408 576 0,000918361202131572 0,00092710604618665 0,000656137941557946 0,000701915007248035 0,000823128574015937 0,000799767505667165 34847 40404 579 665 0 False 408 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 452 576 0,000911930802575797 0,000893237901345261 0,000488288700694286 0,000503547722590982 0,00096786403412691 0,000960498583161933 34603 38928 579 665 0 False 452 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 496 576 0,000969619919901994 0,000948789919408271 0,000534065766384375 0,000488288700694286 0,00108411757743617 0,00108498310687372 36792 41349 579 665 0 False 496 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 540 576 0,000949907055690027 0,000917078688940249 0,000579842832074464 0,000579842832074464 0,000976557467770358 0,000909963047016959 36044 39967 579 665 0 False 540 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 584 576 0,000923921916501525 0,000892021768773043 0,000625619897764553 0,000656137941557946 0,000859940262294899 0,000810571281188976 35058 38875 579 665 0 False 584 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 632 584 0,00100543513709994 0,000947826191709533 0,00080872816052491 0,000717174029144732 0,000824675065436279 0,000797267759725687 38151 41307 579 665 0 True 629 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 675 583 0,000957655160072806 0,000855537791606505 0,000717174029144732 0,000518806744487678 0,000850715865523096 0,000866457972504232 36338 37285 579 665 0 True 673 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 276 619 0,000916015687539506 0,000880434090490589 0,000793469138628214 0,000701915007248035 0,000709930002370276 0,000713499337170476 34758 38370 579 665 0 False 276 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 320 619 0,000887816804241639 0,000917721174072742 0,000747692072938125 0,000778210116731518 0,000663570477640539 0,000699922727778928 33688 39995 579 665 0 False 320 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 364 619 0,00100446003552796 0,000951084509167173 0,000823987182421607 0,00080872816052491 0,000793985594174684 0,000756166315131438 38114 41449 579 665 0 False 364 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 408 619 0,00091730703826997 0,000859966349841186 0,000747692072938125 0,00064087891966125 0,000744947890978187 0,000741625153349616 34807 37478 579 665 0 False 408 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 452 619 0,000877459644301394 0,000921805543843587 0,000579842832074464 0,000534065766384375 0,000901109104613511 0,000963233715231547 33295 40173 579 665 0 False 452 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 496 619 0,000957523389590105 0,000890277880556277 0,000579842832074464 0,000457770656900893 0,000998792458038749 0,00097789664183011 36333 38799 579 665 0 False 496 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 540 619 0,000956996307659304 0,000981235418599141 0,000579842832074464 0,000610360875867857 0,000970231293766131 0,00105116681962516 36313 42763 579 665 0 False 540 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 584 620 0,000872557782344943 0,000891975876977865 0,000671396963454643 0,00064087891966125 0,000745166309828639 0,000832116446186885 33109 38873 579 665 0 False 584 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 629 620 0,000989569970982822 0,000930938011084016 0,00080872816052491 0,000717174029144732 0,000769954239524212 0,000745737465118645 37549 40571 579 665 0 False 629 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 673 620 0,00103107767303342 0,000888671667725046 0,000854505226215 0,000717174029144732 0,000824128158793651 0,000742366512945634 39124 38729 579 665 0 False 673 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 276 669 0,00106088415622023 0,0725028409889452 0,000915541313801785 0,0717631799801633 0,00076487998667564 0,023289145743428 40255 3159730 579 665 0 True 276 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 320 663 0,000960527756595673 0,000845992298209474 0,000793469138628214 0,000747692072938125 0,000693508251249612 0,000629305296995993 36447 36869 579 665 0 False 320 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 364 663 0,000927216178569033 0,000962901646425517 0,00080872816052491 0,000854505226215 0,000665517029304768 0,000652452201221272 35183 41964 579 665 0 False 364 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 408 663 0,00100145566852239 0,000932590115710425 0,000900282291905089 0,000762951094834821 0,000691122214704546 0,000716278543733046 38000 40643 579 665 0 False 408 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 452 663 0,000876273709957092 0,000875064750454759 0,000686655985351339 0,000686655985351339 0,000767643933553797 0,00079673985676604 33250 38136 579 665 0 False 452 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 496 663 0,000927110762182873 0,000892801929291069 0,000671396963454643 0,000610360875867857 0,000847992155283191 0,000838561967939218 35179 38909 579 665 0 False 496 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 540 663 0,00090507873747538 0,000985709868629 0,000610360875867857 0,000625619897764553 0,000882449273447421 0,000960267538355172 34343 42958 579 665 0 False 540 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 584 663 0,000940103331777124 0,000953287315335719 0,000762951094834821 0,00080872816052491 0,000769877605530461 0,000676709766495237 35672 41545 579 665 0 False 584 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 628 663 0,000944952485540495 0,000922402137180901 0,000854505226215 0,000778210116731518 0,000640453647254132 0,000699584264537044 35856 40199 579 665 0 False 628 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 673 668 0,00111859962764297 0,0732972968011698 0,000930800335698482 0,071976806286717 0,000833457635919068 0,0215548798083328 42445 3194353 579 665 0 True 673 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F4_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F4_1.csv new file mode 100755 index 0000000..b284d44 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F4_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 254 249 0,0102042198420924 0,0454232628951642 0,0102235446707866 0,0460822461280232 0,00155890088751631 0,00931573308192358 416621 1979581 623 665 0 True 253 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 298 250 0,00999020165054611 0,0100455074513934 0,00999465934233616 0,0100251773861295 0,00136670162102322 0,00135130770684786 407883 437791 623 665 0 False 298 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 342 248 0,0101981456247082 0,0657720061196709 0,0102845807583734 0,066498817425803 0,00127108834635782 0,0128597323513001 416373 2866395 623 665 0 True 342 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 386 248 0,0101859237115036 0,085334278704314 0,0102082856488899 0,0857557030594339 0,00129428000069981 0,0130498754510989 415874 3718934 623 665 0 True 386 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 430 248 0,0101717423733363 0,0699234696950662 0,0102235446707866 0,0685282673380636 0,0015429168873787 0,0144301497273293 415295 3047319 623 665 0 True 430 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 474 248 0,0105264962628255 0,0681662269659041 0,0102998397802701 0,070267795834287 0,00203819605891438 0,0218763011418478 429779 2970737 623 665 0 True 474 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 519 248 0,0102705953627024 0,080030540989691 0,01025406271458 0,0791180285343709 0,00162520402675787 0,0227360910485792 419331 3487793 623 665 0 True 518 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 562 248 0,0101924387995044 0,0722703990463685 0,0101930266269932 0,0744945448996719 0,00159603238640627 0,0176552716157444 416140 3149600 623 665 0 True 563 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 607 250 0,010223079307358 0,0101360978550749 0,0102998397802701 0,0101625085831998 0,00198001839530406 0,00203585377519005 417391 441739 623 665 0 False 607 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 649 249 0,0102071834723484 0,0454617661113186 0,0102998397802701 0,0459754329747463 0,00178937413809267 0,00995009391074017 416742 1981259 623 665 0 True 651 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 253 293 0,0101204054393147 0,0102697806544285 0,0101472495613031 0,0102388036926833 0,00154314008607759 0,00151341388176486 413199 447565 623 665 0 False 253 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 298 293 0,0102882546801784 0,0101544086813509 0,01025406271458 0,0102388036926833 0,00136191414335977 0,00136718700596439 420052 442537 623 665 0 False 298 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 342 293 0,0104124822228109 0,102733418577343 0,0103913939116503 0,1006942854963 0,00135491756270001 0,0244206681389458 425124 4477202 623 665 0 True 342 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 386 293 0,0104175277420897 0,053758061897706 0,010452429999237 0,0534981307698177 0,00136540162829161 0,00953733847324566 425330 2342818 623 665 0 True 386 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 430 293 0,0103302843456274 0,0953486485726791 0,0103608758678569 0,0980086976424811 0,00156017043773042 0,0244424242739087 421768 4155368 623 665 0 True 430 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 474 293 0,0102573202585804 0,0422468852378142 0,0103303578240635 0,0431525139238575 0,00166149456750549 0,00802198808509222 418789 1841152 623 665 0 True 474 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 518 293 0,0103109105313091 0,0463115674285278 0,0103913939116503 0,0489356832227054 0,00169726009476891 0,010385547186171 420977 2018294 623 665 0 True 518 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 563 292 0,0102283207691331 0,0526594123211439 0,0102845807583734 0,0541237506675822 0,00171098928437202 0,0103163515212679 417605 2294938 623 665 0 True 563 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 607 293 0,0101302760425641 0,0100063846960041 0,010101472495613 0,0100404364080262 0,00206106305018768 0,0020893232521195 413602 436086 623 665 0 False 607 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 651 293 0,0100798208497757 0,00993644560015282 0,0100404364080262 0,00997940032043946 0,00175885783236552 0,00200342415083084 411542 433038 623 665 0 False 651 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 254 338 0,0102452942878721 0,0559906288954246 0,0102845807583734 0,0558022430762188 0,00152895489349881 0,0115916502631204 418298 2440115 623 665 0 True 253 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 298 337 0,0103619290587743 0,0645517432858869 0,0103761348897536 0,0673075455863279 0,00135751441738236 0,0187276709253515 423060 2813215 623 665 0 True 298 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 342 337 0,0103850992589577 0,0412645025243356 0,0104982070649271 0,0420233463035019 0,00134411797097949 0,00889583064069878 424006 1798339 623 665 0 True 342 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 387 338 0,0102997173162099 0,0361927478343375 0,0103608758678569 0,036392767223621 0,0014034989178077 0,00590814745294826 420520 1577308 623 665 0 True 386 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 431 337 0,0104937493731371 0,0884932174794964 0,0105134660868238 0,089768825818265 0,00154091284795476 0,0195638303202767 428442 3856603 623 665 0 True 430 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 475 337 0,0104104248266001 0,0328479702345817 0,010406652933547 0,0338139925230793 0,0016367140976163 0,00457766158735254 425040 1431540 623 665 0 True 474 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 519 337 0,0103386608873427 0,0294405273885102 0,0103303578240635 0,0298313878080415 0,00166069245534587 0,00315305687353305 422110 1283041 623 665 0 True 518 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 563 337 0,0102734365288983 0,0529349237134952 0,01025406271458 0,0537727931639582 0,00178652263834001 0,00920284511976663 419447 2306945 623 665 0 True 563 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 607 337 0,010253352423031 0,0585929919786879 0,0103150988021668 0,0599832150759136 0,00213334815109401 0,0131952392401218 418627 2553528 623 665 0 True 607 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 651 336 0,0101409549086106 0,0663773877357619 0,010101472495613 0,0655069810025177 0,00187823894649239 0,0190132372546107 414038 2892778 623 665 0 True 651 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 254 382 0,0100886137692956 0,0454130519707371 0,0101625085831998 0,048554207675288 0,00156320371717698 0,0104836695471304 411901 1979136 623 665 0 True 253 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 299 382 0,0102967047003298 0,0331097829260723 0,0102998397802701 0,0333867399099718 0,00142265375462017 0,00466800529213021 420397 1442950 623 665 0 True 298 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 343 381 0,0102802700234555 0,0900457139644717 0,0103608758678569 0,0854657816433967 0,00138568582093954 0,0232672947791654 419726 3924262 623 665 0 True 342 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 387 382 0,0105271575687504 0,0696569072027746 0,0105287251087205 0,0671854734111543 0,00126847977326458 0,0191277741976325 429806 3035702 623 665 0 True 386 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 430 381 0,0104554671079292 0,0441734916370808 0,0104982070649271 0,0452582589456016 0,00158915207492872 0,0095309390617744 426879 1925115 623 665 0 True 430 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 475 382 0,0106664726835954 0,053995964963909 0,0106965743495842 0,0541695277332723 0,00167176126122968 0,0104061774810873 435494 2353186 623 665 0 True 474 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 519 381 0,0105412654284815 0,0422780228208424 0,0105897611963073 0,0429541466392004 0,00172574797037558 0,00549820941940343 430382 1842509 623 665 0 True 518 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 563 381 0,010434697203325 0,0537051027660706 0,0104219119554437 0,0541084916456855 0,00189346954745636 0,00838469041436781 426031 2340510 623 665 0 True 563 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 607 381 0,0104631578509076 0,0422829791347217 0,0105134660868238 0,0433051041428244 0,00215617581868125 0,00757495674958163 427193 1842725 623 665 0 True 607 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 651 381 0,0103707954567303 0,104740840427918 0,0103150988021668 0,101640344853895 0,00210561471928004 0,0265786783458941 423422 4564687 623 665 0 True 651 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 255 426 0,0102735834857705 0,0452933891148104 0,0102693217364767 0,0457007705806058 0,00162671300202253 0,00813565797080984 419453 1973921 623 665 0 True 253 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 298 425 0,0103242591138672 0,0577791468830006 0,0103608758678569 0,0571602960250248 0,0015861302185062 0,0109917761345592 421522 2518060 623 665 0 True 298 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 342 425 0,0106070041359787 0,0355273856419488 0,0105897611963073 0,0364843213550011 0,00145246881468873 0,00577073879259745 433066 1548311 623 665 0 True 342 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 386 425 0,0106201077904165 0,0525523467629936 0,010605020218204 0,0527199206530861 0,00147068192280825 0,0101731274989425 433601 2290272 623 665 0 True 386 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 431 425 0,0108265087174204 0,104442796164134 0,0108033875028611 0,102937361715114 0,00157706067313795 0,0192168799931782 442028 4551698 623 665 0 True 430 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 474 426 0,0107480827332901 0,0613508135181166 0,0108033875028611 0,0621347371633478 0,0017275578160309 0,0139380112567259 438826 2673716 623 665 0 True 474 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 519 426 0,0106547161338194 0,0554420154299688 0,010605020218204 0,0544899671931029 0,00172683669752971 0,010213838787433 435014 2416206 623 665 0 True 518 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 564 426 0,0103996234964934 0,0314209648635207 0,010452429999237 0,031967650873579 0,00174975328420424 0,00450767281712419 424599 1369350 623 665 0 True 563 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 608 426 0,0103265614381983 0,0418695170060652 0,0103608758678569 0,0421454184786755 0,00198289819836562 0,00741748727297507 421616 1824706 623 665 0 True 607 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 652 425 0,010428035158452 0,07248537916088 0,0103303578240635 0,0709697108415351 0,00202013717653241 0,0135341133870362 425759 3158969 623 665 0 True 651 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 253 470 0,0102961903512771 0,0516275353065658 0,0102845807583734 0,0534065766384375 0,00157836872152222 0,0164817909000677 420376 2249968 623 665 0 True 253 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 298 470 0,0105913287362774 0,0540509203886347 0,0105745021744106 0,0547188525215534 0,00172368896473515 0,00892813183301552 432426 2355581 623 665 0 True 298 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 341 470 0,0106495971361045 0,068256404343429 0,0105897611963073 0,0687876707103075 0,00161631343689239 0,020386679117936 434805 2974667 623 665 0 True 342 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 386 469 0,0110641379797667 0,0907744297801037 0,0110627908751049 0,0889295796139467 0,00155664883359867 0,0253004789243495 451730 3956020 623 665 0 True 386 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 431 469 0,0108884510390524 0,096277865641444 0,0109102006561379 0,0930800335698482 0,00191241887528406 0,0316312432084412 444557 4195864 623 665 0 True 430 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 474 470 0,0108909737986919 0,047166508626797 0,0109102006561379 0,0487983520256352 0,0020003563260687 0,00919162605632132 444660 2055553 623 665 0 True 474 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 519 469 0,0107761759886922 0,0418044194946051 0,0107881284809644 0,043228809033341 0,00185279210638662 0,0062949648594096 439973 1821869 623 665 0 True 518 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 562 469 0,0106615741211887 0,0989635452788529 0,0106202792401007 0,0978713664454108 0,00182518129507878 0,0199754562760003 435294 4312908 623 665 0 True 563 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 607 468 0,010522405963216 0,0626232782689156 0,0105592431525139 0,0648050659952697 0,00186921152829648 0,0175882163122388 429612 2729171 623 665 0 True 607 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 651 469 0,0103767961956785 0,0771397479737338 0,0104829480430304 0,0762645914396887 0,0019747129072357 0,0124329603664306 423667 3361810 623 665 0 True 651 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 254 514 0,0102309170072086 0,0537829123047949 0,0101625085831998 0,0564126039520867 0,00155988134637518 0,0147066641829334 417711 2343901 623 665 0 True 253 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 298 514 0,0104573530544557 0,100078073416547 0,0104371709773404 0,0961013199053941 0,00164597814266736 0,0289669997587562 426956 4361480 623 665 0 True 298 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 342 514 0,0105881201779011 0,0588248373279273 0,0105745021744106 0,0608224612802319 0,00156128978237999 0,0158102318583967 432295 2563632 623 665 0 True 342 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 386 513 0,0106727428434759 0,0580816885427118 0,0106965743495842 0,0597695887693599 0,00162388001870855 0,0110919714777926 435750 2531245 623 665 0 True 386 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 431 514 0,0108636643132748 0,0593500459778423 0,0108644235904479 0,0589303425650416 0,00193477153373835 0,0106331094598633 443545 2586521 623 665 0 True 430 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 475 514 0,0107888142797013 0,0605171431669125 0,0107881284809644 0,0611581597619593 0,00191524698853782 0,0132216767816317 440489 2637384 623 665 0 True 474 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 519 513 0,0107800213601814 0,0707569335331921 0,0108491645685512 0,0706797894254978 0,0017323962571198 0,0166783031268762 440130 3083642 623 665 0 True 518 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 563 514 0,0103949453693951 0,0579935074582772 0,010452429999237 0,0587319752803845 0,00189221759759523 0,0152065596386084 424408 2527402 623 665 0 True 563 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 607 513 0,0103489723612087 0,0424681066364699 0,0103303578240635 0,0426947432669566 0,00192679243739747 0,00607178079981308 422531 1850793 623 665 0 True 607 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 651 514 0,0104387875029345 0,0642530106451755 0,0103608758678569 0,0654154268711376 0,00187448298387101 0,0147499344727332 426198 2800196 623 665 0 True 651 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 254 558 0,0100877565208744 0,046723538073841 0,010101472495613 0,0499732967116808 0,00139853686001657 0,0116135215574406 411866 2036248 623 665 0 True 253 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 298 558 0,0102671908618298 0,0551024620374466 0,0102693217364767 0,0585793850614176 0,00148577368152081 0,0141112088150411 419192 2401408 623 665 0 True 298 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 342 558 0,0104316111090088 0,0528906381311484 0,0104371709773404 0,054383154039826 0,00140636676042181 0,0112124318072936 425905 2305015 623 665 0 True 342 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 386 558 0,0108824258072923 0,0492834053547694 0,0108644235904479 0,0496223392080568 0,00141947466219123 0,00884076932387011 444311 2147809 623 665 0 True 386 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 431 557 0,0110474583747721 0,0861808217040656 0,0110780498970016 0,0835736629282063 0,00184844925599155 0,0237512304078469 451049 3755827 623 665 0 True 430 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 475 558 0,0108028486609963 0,062347055553739 0,0106813153276875 0,0630350194552529 0,00192448441981729 0,0107565482519124 441062 2717133 623 665 0 True 474 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 520 558 0,0106789885105443 0,054714240396138 0,0107118333714809 0,0551308461127642 0,00197194137993955 0,00759132963185129 436005 2384489 623 665 0 True 518 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 562 553 0,0103275901363037 0,0336750551131778 0,0102845807583734 0,0377050431067369 0,00187095915049183 0,0109445324567763 421658 1467585 623 665 0 False 562 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 607 558 0,0103308966659282 0,054924723114722 0,0103303578240635 0,0518806744487678 0,00158392671598075 0,0197835829374545 421793 2393662 623 665 0 True 607 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 651 557 0,0103339582674324 0,0555614717728173 0,0103303578240635 0,0542763408865492 0,00187383082531577 0,0103626576799594 421918 2421412 623 665 0 True 651 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 253 596 0,0101702972974264 0,00997334260347596 0,00991836423285267 0,0100251773861295 0,00187443838919607 0,00120985542913763 415236 434646 623 665 0 False 253 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 298 596 0,0102642517243858 0,00988484027647512 0,0100556954299229 0,00985732814526589 0,00201643372332659 0,00146103069293636 419072 430789 623 665 0 False 298 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 343 601 0,0103382200167261 0,0846934227305503 0,0103608758678569 0,085801480125124 0,00142093567338806 0,0166659933877182 422092 3691005 623 665 0 True 342 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 387 602 0,0103530871536303 0,0777334042361569 0,01025406271458 0,0742351415274281 0,00141491499569913 0,0204815960737693 422699 3387682 623 665 0 True 386 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 430 596 0,0109754740002065 0,0103830645508255 0,0106813153276875 0,010406652933547 0,00294318137194381 0,00186220909446105 448110 452502 623 665 0 False 430 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 474 596 0,0103886262238905 0,0103724176543441 0,0102845807583734 0,0103456168459602 0,00201236279530863 0,00184919152419518 424150 452038 623 665 0 False 474 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 518 596 0,0101917040151434 0,0101017937381793 0,0101777676050965 0,0101167315175097 0,00205263448352673 0,00207372986812606 416110 440244 623 665 0 False 518 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 562 596 0,0101064935220798 0,0100901142763065 0,0101167315175097 0,0101167315175097 0,00185091417422109 0,00190724827573489 412631 439735 623 665 0 False 562 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 607 596 0,0100643658853827 0,0100553741873567 0,0101472495613031 0,0100709544518196 0,00151681263596806 0,00156929293116276 410911 438221 623 665 0 False 607 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 651 596 0,0102305741078401 0,0101861658036141 0,0102845807583734 0,0100862134737163 0,00158687266183692 0,00148703976464845 417697 443921 623 665 0 False 651 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 254 645 0,00963319442234989 0,0423317621129959 0,00970473792629892 0,0433203631647211 0,00130628619373953 0,0098447017526093 393307 1844851 623 665 0 True 253 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 297 639 0,00998934440212495 0,00984883816315795 0,00996414129854276 0,00990310521095598 0,00129778202375394 0,00130849665956249 407848 429220 623 665 0 False 297 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 342 639 0,01065363845009 0,0100860987442284 0,0100404364080262 0,0100404364080262 0,00407216661675314 0,00132064061359159 434970 439560 623 665 0 False 342 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 386 639 0,0105846666914044 0,0100591143686637 0,0100404364080262 0,010101472495613 0,0034666335283154 0,00129971742944415 432154 438384 623 665 0 False 386 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 430 639 0,0101844786355936 0,0101879785295236 0,010101472495613 0,0101625085831998 0,00160168409170462 0,00186010719887978 415815 444000 623 665 0 False 430 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 474 639 0,00994763314323237 0,0101626233126878 0,00993362325474937 0,0101472495613031 0,00180622357936253 0,00171006573649539 406145 442895 623 665 0 False 474 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 518 639 0,0101473965181753 0,00996937296319306 0,0101472495613031 0,0100099183642329 0,00178713101183531 0,00182297009228256 414301 434473 623 665 0 False 518 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 562 639 0,00999367962985483 0,00995831304055515 0,0100251773861295 0,00996414129854276 0,00172105037154426 0,00162813109167164 408025 433991 623 665 0 False 562 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 607 639 0,0100356848024918 0,0100337591518278 0,010101472495613 0,010101472495613 0,00150431554353393 0,00144113298694236 409740 437279 623 665 0 False 607 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 651 645 0,0100538829618325 0,043923633758234 0,0101319905394064 0,0443121995880064 0,00146814717008418 0,00888365094362163 410483 1914226 623 665 0 True 651 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F4_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F4_2.csv new file mode 100755 index 0000000..47b5177 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F4_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 254 249 0,00782589431523057 0,660367788319505 0,0076752880140383 0,664728770885786 0,00171487543455672 0,198206491252675 319518 28779340 623 665 6 True 253 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 298 250 0,00664298946527415 0,00665850940007377 0,00660715648126955 0,00659189745937285 0,00144259191840668 0,00124668966228128 271222 290183 623 665 0 False 298 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 342 248 0,00633117147527922 0,00630752895055216 0,00633249408712902 0,00634775310902571 0,00119550391378796 0,00116719394305066 258491 274887 623 665 0 True 342 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 386 248 0,00634314846036347 0,00653159564050892 0,00634775310902571 0,00653086137178607 0,00114618457290691 0,00117616397950522 258980 284652 623 665 0 True 386 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 430 248 0,00642985301496107 0,00649212869665581 0,00651560234988937 0,00654612039368277 0,00139256455473352 0,0014903534910729 262520 282932 623 665 0 True 430 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 474 248 0,00689600021357732 0,006779204821392 0,00686655985351339 0,0068207827878233 0,00163330762879316 0,00144148340604229 281552 295443 623 665 0 True 474 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 519 248 0,00694554917232053 0,00704209597006937 0,00698863202868696 0,00698863202868696 0,00147574852690626 0,00155220330080405 283575 306900 623 665 0 True 518 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 562 248 0,00727443865230261 0,00727511156008584 0,00732433051041428 0,0072632944228275 0,00140909152634551 0,00141933761558465 297003 317055 623 665 0 True 563 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 607 250 0,00788092966386922 0,0078056666041391 0,00778210116731518 0,00788891432059205 0,00205556183224742 0,0019365505345218 321765 340177 623 665 0 False 607 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 649 249 0,00927106819643872 0,680101214354265 0,00926222629129473 0,682475013351644 0,00183440429123477 0,207033661287503 378522 29639338 623 665 10 True 651 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 253 293 0,00675693002685269 0,00668629688205407 0,0068055237659266 0,00666819256885634 0,001520212651241 0,00139994139450356 275874 291394 623 665 0 False 253 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 298 293 0,00642385227601293 0,00635137856084478 0,00634775310902571 0,00631723506523232 0,00128490827690179 0,00122789029289243 262275 276798 623 665 0 False 298 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 342 293 0,00617689125228196 0,00627710269034913 0,00616464484626535 0,00630197604333562 0,00120143914969297 0,00136305342493269 252192 273561 623 665 0 True 342 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 386 293 0,00639637134091165 0,00641702677384695 0,0063935301747158 0,0064087891966125 0,00130465677817426 0,00118941669674651 261153 279659 623 665 0 True 386 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 430 293 0,00668012056831651 0,00682911214864811 0,00660715648126955 0,00688181887541009 0,00154016120590307 0,00153787802446847 272738 297618 623 665 0 True 430 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 474 293 0,00678196168075065 0,00685549993087548 0,00679026474402991 0,00686655985351339 0,00167174337645807 0,0017574567536946 276896 298768 623 665 0 True 474 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 518 293 0,00716662129373238 0,00703853935594307 0,00712596322575723 0,00703440909437705 0,00164756415965848 0,00158230142671865 292601 306745 623 665 0 True 518 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 563 292 0,00711508841721448 0,00715510451569528 0,00718699931334401 0,00709544518196384 0,0016716791052487 0,00151338949563244 290497 311825 623 665 0 True 563 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 607 293 0,00745563647572438 0,00748093626145932 0,00733958953231098 0,00752269779507134 0,00199404395735028 0,00185923620761746 304401 326025 623 665 0 False 607 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 651 293 0,00781325602422143 0,00776665857823777 0,00775158312352178 0,00773632410162509 0,00193534645768069 0,00192578304502953 319002 338477 623 665 0 False 651 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 254 338 0,00615901149949771 0,006173318395554 0,00621042191195544 0,00617990386816205 0,00143505779490313 0,00135216139645184 251462 269038 623 665 0 True 253 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 298 337 0,00610804195765658 0,00637223638175319 0,00607309071488518 0,0063782711528191 0,00124139955844297 0,0013124817112149 249381 277707 623 665 0 True 298 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 342 337 0,00635027586866513 0,00639502165805909 0,0064087891966125 0,0064087891966125 0,00135063932005001 0,00124968923768955 259271 278700 623 665 0 True 342 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 387 338 0,00688186786103415 0,00676846614132034 0,00689707789730678 0,00674448767833982 0,00125067155177578 0,00125879902152907 280975 294975 623 665 0 True 386 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 431 337 0,00693344972317612 0,00696050035824283 0,00697337300679027 0,00703440909437705 0,00155623404249695 0,00171885413880739 283081 303344 623 665 0 True 430 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 475 337 0,0072255509994843 0,00702357863071503 0,00729381246662089 0,00700389105058366 0,00159710921408329 0,00150282783440533 295007 306093 623 665 0 True 474 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 519 337 0,00721617025247558 0,00721260693505336 0,00717174029144732 0,00721751735713741 0,00164150578906333 0,00161120806992286 294624 314331 623 665 0 True 518 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 563 337 0,00738147224088779 0,00720505773474657 0,00740062561989776 0,0072327763790341 0,00168036244191788 0,0015879058598825 301373 314002 623 665 0 True 563 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 607 337 0,0072418387194864 0,00748715459970595 0,00732433051041428 0,00756847486076143 0,00204290812572564 0,00213087109451868 295672 326296 623 665 0 True 607 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 651 336 0,00716017968416764 0,00735085596802719 0,00720225833524071 0,00732433051041428 0,00175401288456319 0,00180864039278649 292338 320356 623 665 0 True 651 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 254 382 0,00624796939280237 0,0063632415898983 0,00617990386816205 0,0064087891966125 0,00137881763918756 0,00139087713854039 255094 277315 623 665 0 True 253 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 299 382 0,00619638753066041 0,00637124970815686 0,00622568093385214 0,00633249408712902 0,00124112610113101 0,00129563129491447 252988 277664 623 665 0 True 298 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 343 381 0,00657320944379151 0,00674708056476738 0,00659189745937285 0,00669871061264973 0,00134664692696058 0,001413963684259 268373 294043 623 665 0 True 342 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 387 382 0,00697408329833923 0,007174493799158 0,00697337300679027 0,00714122224765393 0,00130010197339544 0,00137022512685917 284740 312670 623 665 0 True 386 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 430 381 0,00710024577312235 0,00718029911124802 0,00711070420386053 0,0072327763790341 0,00146638901047287 0,00164869697918558 289891 312923 623 665 0 True 430 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 475 382 0,00720999806384321 0,00735946067962307 0,00714122224765393 0,00733958953231098 0,00164520522565827 0,00172949699642362 294372 320731 623 665 0 True 474 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 519 381 0,00719748223689423 0,00719200151901842 0,00721751735713741 0,00729381246662089 0,00155367340980333 0,00168822978534304 293861 313433 623 665 0 True 518 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 563 381 0,00721516604718222 0,00740131399682544 0,00720225833524071 0,00735484855420768 0,00178515129313977 0,00161170167015853 294583 322555 623 665 0 True 563 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 607 381 0,00713326208374313 0,00707552814285657 0,00704966811627375 0,00701915007248035 0,00216768555546071 0,00196303304196394 291239 308357 623 665 0 True 607 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 651 381 0,00637817318157097 0,00661901951032307 0,0064087891966125 0,00662241550316625 0,0018603561384213 0,0017665108301248 260410 288462 623 665 0 True 651 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 255 426 0,00650391927854953 0,00668212072869287 0,00650034332799268 0,00671396963454643 0,00153023149441399 0,00149344406922989 265544 291212 623 665 0 True 253 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 298 425 0,00662927349053555 0,00685153029059258 0,00659189745937285 0,00683604180972 0,00142623075670269 0,00142341906307626 270662 298595 623 665 0 True 298 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 342 425 0,00694821888883215 0,00691086838175778 0,00692759594110018 0,00695811398489357 0,00142208571721794 0,00126604767610282 283684 301181 623 665 0 True 342 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 386 425 0,00698890144961933 0,00706091160609237 0,00692759594110018 0,00701915007248035 0,00141489242782965 0,00143234706761052 285345 307720 623 665 0 True 386 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 431 425 0,00709833533378376 0,00800779701600075 0,00708018616006714 0,00750743877317464 0,00164812943901153 0,00446605802470343 289813 348986 623 665 0 True 430 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 474 426 0,00729871102902753 0,00713027705450396 0,00732433051041428 0,00714122224765393 0,00167373448204081 0,00153009631093753 297994 310743 623 665 0 True 474 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 519 426 0,00721800721337807 0,00734078271898561 0,0072327763790341 0,00740062561989776 0,00168235819507654 0,00155300699296057 294699 319917 623 665 0 True 518 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 564 426 0,00680371129783615 0,00684930453852645 0,00686655985351339 0,00675974670023652 0,00183286924246064 0,00170443662509424 277784 298498 623 665 0 True 563 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 608 426 0,00628767224110822 0,00634667465183903 0,00624093995574884 0,0063935301747158 0,0017731047140532 0,00174761139817752 256715 276593 623 665 0 True 607 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 652 425 0,00606263228414699 0,00616292390394618 0,00605783169298848 0,00625619897764553 0,00185641405329532 0,00180856877032441 247527 268585 623 665 0 True 651 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 253 470 0,00675208045007012 0,00672229899537124 0,00679026474402991 0,00671396963454643 0,00153659402159455 0,00130752881590328 275676 292963 623 665 0 True 253 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 298 470 0,00662907754803928 0,00668501191178909 0,00660715648126955 0,00665293354695964 0,00152479388489663 0,00160385619870142 270654 291338 623 665 0 True 298 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 341 470 0,00681590871822869 0,00686851025480846 0,00686655985351339 0,00688181887541009 0,00146202695999338 0,00139821726848433 278282 299335 623 665 0 True 342 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 386 469 0,00694207119301181 0,0069923033723012 0,00698863202868696 0,00708018616006714 0,0014765683013379 0,00156112776554542 283433 304730 623 665 0 True 386 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 431 469 0,00720813661012868 0,00716744940859817 0,00729381246662089 0,00711070420386053 0,00178071831363096 0,00202457464496504 294296 312363 623 665 0 True 430 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 474 470 0,00728247229464951 0,00729018701480182 0,00732433051041428 0,00721751735713741 0,00186539068055286 0,00181015690879267 297331 317712 623 665 0 True 474 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 519 469 0,00684877807197727 0,00699074305126515 0,0068055237659266 0,00697337300679027 0,0018000746579176 0,00159859470628044 279624 304662 623 665 0 True 518 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 562 469 0,00654247096468981 0,00647487338166887 0,00653086137178607 0,00646982528419928 0,00171081883265297 0,00189779294528817 267118 282180 623 665 0 True 563 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 607 468 0,00626641248026339 0,00616423182010875 0,00621042191195544 0,00616464484626535 0,0017057302848807 0,00172825993176732 255847 268642 623 665 0 True 607 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 651 469 0,00604972457220548 0,00607758811081262 0,00621042191195544 0,00605783169298848 0,00168032915943749 0,00166382642526463 247000 264866 623 665 0 True 651 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 254 514 0,00665129252855341 0,00678865853119868 0,00669871061264973 0,00679026474402991 0,001485428894412 0,00151559456928157 271561 295855 623 665 0 True 253 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 298 514 0,00659525297462141 0,006803435689246 0,00665293354695964 0,00689707789730678 0,00144937526595682 0,00145375020613863 269273 296499 623 665 0 True 298 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 342 514 0,00672212574095349 0,00678363337962668 0,0068207827878233 0,00677500572213321 0,00151728098157347 0,00146658620235215 274453 295636 623 665 0 True 342 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 386 513 0,00692845318952134 0,00700269786390903 0,00695811398489357 0,00709544518196384 0,00150964878285883 0,00142671482738104 282877 305183 623 665 0 True 386 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 431 514 0,00715547706425726 0,0071013652235418 0,00720225833524071 0,00708018616006714 0,00178112593256507 0,00180338490550187 292146 309483 623 665 0 True 430 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 475 514 0,00688997498181715 0,00677622185470543 0,00689707789730678 0,00677500572213321 0,00181516506269863 0,00152974752564725 281306 295313 623 665 0 True 474 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 519 513 0,00656764957545997 0,00674462535372535 0,00663767452506294 0,00665293354695964 0,00171860164812366 0,00157021638018992 268146 293936 623 665 0 True 518 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 563 514 0,00641361428058304 0,00665084547027904 0,00646982528419928 0,00656137941557946 0,00179833650832957 0,00166642754073276 261857 289849 623 665 0 True 563 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 607 513 0,00639127683600874 0,00640378699093809 0,00630197604333562 0,00636301213092241 0,00170964019685259 0,00174284308719965 260945 279082 623 665 0 True 607 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 651 514 0,00637667912003694 0,00645000002868237 0,00636301213092241 0,00650034332799268 0,00194081952313036 0,0019348108466866 260349 281096 623 665 0 True 651 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 254 558 0,00674558985488131 0,00689340655369254 0,00671396963454643 0,00685130083161669 0,00138486504194525 0,00132064333657948 275411 300420 623 665 0 True 253 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 298 558 0,00681958264003367 0,00713929479225645 0,00677500572213321 0,00685130083161669 0,0013586373682436 0,00253999444514007 278432 311136 623 665 0 True 298 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 342 558 0,00672810198708959 0,00693654484115989 0,0068207827878233 0,00683604180972 0,00132774091067343 0,00143350702498959 274697 302300 623 665 0 True 342 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 386 558 0,00688456207035781 0,0068351928115092 0,00692759594110018 0,00685130083161669 0,00135926505872362 0,00127471389010134 281085 297883 623 665 0 True 386 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 431 557 0,00666679647857044 0,00666456711703727 0,00671396963454643 0,00659189745937285 0,001839584732847 0,00180639627680041 272194 290447 623 665 0 True 430 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 475 558 0,00673375982666927 0,00681637717548621 0,00669871061264973 0,00685130083161669 0,00183613750474244 0,0018241811258242 274928 297063 623 665 0 True 474 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 520 558 0,00669488973397255 0,00669343305620426 0,00672922865644312 0,00672922865644312 0,00191945773742941 0,00191078110653448 273341 291705 623 665 0 True 518 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 562 553 0,00653071441491387 0,00667470920377162 0,00663767452506294 0,00672922865644312 0,0017058039093595 0,00173406187385608 266638 290889 623 665 0 False 562 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 607 558 0,0064292162018482 0,00659887301223992 0,00643930724040589 0,00665293354695964 0,00152662523448992 0,0015296697326383 262494 287584 623 665 0 True 607 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 651 557 0,00640937702410129 0,00646323981159124 0,00643930724040589 0,00645456626230259 0,00174197552726309 0,00177182762399419 261684 281673 623 665 0 True 651 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 253 596 0,00721705199370878 0,00723569050802791 0,00714122224765393 0,0072327763790341 0,00132223774901132 0,00129583119685863 294660 315337 623 665 0 False 253 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 298 596 0,00703240068379033 0,00690774773968568 0,00708018616006714 0,00698863202868696 0,00144974735366789 0,00148070183478056 287121 301045 623 665 0 False 298 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 343 601 0,00660928735591644 0,00666704527397689 0,00657663843747616 0,00657663843747616 0,00143800310308431 0,00152235731821549 269846 290555 623 665 0 True 342 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 387 602 0,00641238963998138 0,00662028153469047 0,00643930724040589 0,00657663843747616 0,00125261576120423 0,00129267294650998 261807 288517 623 665 0 True 386 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 430 596 0,00661156518743553 0,00657016769435605 0,00657663843747616 0,00656137941557946 0,00187237663433714 0,00179815349614865 269939 286333 623 665 0 False 430 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 474 596 0,00678766850595439 0,00672406582948559 0,00674448767833982 0,0068207827878233 0,00192210853243099 0,00180917601153224 277129 293040 623 665 0 False 474 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 518 596 0,0067407892637228 0,00676656163182045 0,00674448767833982 0,00672922865644312 0,00196960785747453 0,0019548945419502 275215 294892 623 665 0 False 518 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 562 596 0,00658403526671019 0,00680495011848688 0,00650034332799268 0,00675974670023652 0,00173726935112521 0,00180134905179392 268815 296565 623 665 0 False 562 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 607 596 0,00655398258634543 0,00654942460293558 0,0063935301747158 0,00662241550316625 0,0015475165546908 0,00145048211971689 267588 285429 623 665 0 False 607 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 651 596 0,00658535787855998 0,00650289032262506 0,00653086137178607 0,00654612039368277 0,00153886075589815 0,00150323916455639 268869 283401 623 665 0 False 651 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 254 645 0,00854975488206038 0,652365406535336 0,00834668497749294 0,659143968871595 0,00178792581735898 0,218692830619823 349072 28430590 623 665 7 True 253 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 297 639 0,00735898783944129 0,0069841575786571 0,00717174029144732 0,00698863202868696 0,00181326221341749 0,00125949933628039 300455 304375 623 665 0 False 297 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 342 639 0,0064662248408304 0,00628437653988485 0,00650034332799268 0,00628671702143893 0,00124482239830225 0,00131884018238737 264005 273878 623 665 0 False 342 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 386 639 0,00642064371763658 0,00627028775876519 0,0064087891966125 0,00619516289005875 0,00120698048174067 0,00119935761598058 262144 273264 623 665 0 False 386 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 430 639 0,00646747397424409 0,00635996032654307 0,0063935301747158 0,0063782711528191 0,00164101974345966 0,00151468289626493 264056 277172 623 665 0 False 430 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 474 639 0,00646353063150674 0,00639116674726413 0,00650034332799268 0,00633249408712902 0,00170162796402001 0,00169760939429637 263895 278532 623 665 0 False 474 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 518 639 0,00653340862423752 0,00656720767356707 0,00654612039368277 0,00654612039368277 0,00187277486901858 0,0016774911456395 266748 286204 623 665 0 False 518 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 562 639 0,00652591382375536 0,00654421588418288 0,00650034332799268 0,00657663843747616 0,00156098798414061 0,00150309430199017 266442 285202 623 665 0 False 562 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 607 639 0,00680483796718967 0,00670426351986627 0,00671396963454643 0,00663767452506294 0,00148673249286852 0,00130324708727407 277830 292177 623 665 0 False 607 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 651 645 0,00827555785134847 0,697416877051865 0,00817883573662928 0,699855039291981 0,00167611732329857 0,200894681151114 337877 30393968 623 665 9 True 651 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F4_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F4_3.csv new file mode 100755 index 0000000..b2eacb3 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F4_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 254 249 0,00100827110015956 0,0646081901939559 0,000747692072938125 0,0648355840390631 0,000822538179469357 0,0205512680079022 41166 2815675 623 665 0 True 253 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 298 250 0,000923207563968183 0,000917170472530606 0,000793469138628214 0,000793469138628214 0,000702981696347926 0,000662320856833436 37693 39971 623 665 0 False 298 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 342 248 0,000889627918670638 0,000848401617456321 0,000762951094834821 0,000732433051041428 0,000607346101293742 0,000633030790567099 36322 36974 623 665 0 True 342 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 386 248 0,000919313206854901 0,000909093516579271 0,000823987182421607 0,00080872816052491 0,000642744635943477 0,000603251057633082 37534 39619 623 665 0 True 386 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 430 248 0,000851345653462714 0,000900810047549636 0,000656137941557946 0,000701915007248035 0,000747934284843421 0,000777071708466536 34759 39258 623 665 0 True 430 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 474 248 0,000987525688367421 0,000903448825772373 0,000778210116731518 0,000762951094834821 0,000850137465557271 0,000733855596964601 40319 39373 623 665 0 True 474 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 519 248 0,000952035603731284 0,00099433752612247 0,00080872816052491 0,000793469138628214 0,000777959249873917 0,000841139427951287 38870 43334 623 665 0 True 518 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 562 248 0,000934082372510933 0,0010320835276564 0,000732433051041428 0,000900282291905089 0,000806847925646585 0,000759947452310781 38137 44979 623 665 0 True 563 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 607 250 0,00107354444422809 0,00102737961865065 0,000686655985351339 0,000671396963454643 0,0010895170649114 0,00104642858491981 43831 44774 623 665 0 False 607 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 649 249 0,0011141780193912 0,0677157301585389 0,000839246204318303 0,067353322652018 0,000944289638506652 0,0225566693133447 45490 2951104 623 665 0 True 651 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 253 293 0,000881594276323742 0,000899203834718405 0,000671396963454643 0,000732433051041428 0,000751306159942632 0,000762474974516234 35994 39188 623 665 0 False 253 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 298 293 0,000883872107842831 0,000868685790925012 0,000762951094834821 0,000747692072938125 0,000650889860929631 0,000654246361531541 36087 37858 623 665 0 False 298 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 342 293 0,000973809713628817 0,000884128380002421 0,000854505226215 0,000717174029144732 0,000695936328549237 0,00068813712957347 39759 38531 623 665 0 True 342 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 386 293 0,000868025258457337 0,000941057151920772 0,000747692072938125 0,000839246204318303 0,000653132657130961 0,000659971391131878 35440 41012 623 665 0 True 386 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 430 293 0,000837580693100044 0,000902737502947114 0,000579842832074464 0,000686655985351339 0,00078987482090693 0,000794163782724738 34197 39342 623 665 0 True 430 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 474 293 0,000882745438489303 0,000852004123377797 0,000610360875867857 0,000564583810177768 0,000839601078492217 0,000893322644716087 36041 37131 623 665 0 True 474 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 518 293 0,000943732540452022 0,000983300549382153 0,00080872816052491 0,000793469138628214 0,000749173049584724 0,000837402019631074 38531 42853 623 665 0 True 518 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 563 292 0,000934866142495996 0,00100684304030848 0,000747692072938125 0,000778210116731518 0,000831967163086606 0,00085050055537339 38169 43879 623 665 0 True 563 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 607 293 0,000934229329383133 0,00100014283821249 0,000625619897764553 0,000701915007248035 0,000989321693268066 0,000976956462413234 38143 43587 623 665 0 False 607 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 651 293 0,000967025204695615 0,00104330407157743 0,000625619897764553 0,000579842832074464 0,000935867967733699 0,00107708608765264 39482 45468 623 665 0 False 651 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 254 338 0,000851296667838648 0,000913751533789842 0,00064087891966125 0,000747692072938125 0,000721791550776412 0,000724785328340077 34757 39822 623 665 0 True 253 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 298 337 0,000858987410817079 0,000895876679567998 0,000717174029144732 0,000778210116731518 0,000663702556215599 0,000651316413499593 35071 39043 623 665 0 True 298 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 342 337 0,000926244672660303 0,000968500445437237 0,000823987182421607 0,000869764248111696 0,000682838501782905 0,000688924056325981 37817 42208 623 665 0 True 342 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 387 338 0,000967123175943748 0,000907097223489027 0,000778210116731518 0,000823987182421607 0,000736000020302356 0,00064499171076299 39486 39532 623 665 0 True 386 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 431 337 0,00095725257269436 0,000958450142293247 0,000732433051041428 0,00064087891966125 0,000832098325010794 0,000887630022155769 39083 41770 623 665 0 True 430 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 475 337 0,000954141985566141 0,000978871991147473 0,000778210116731518 0,00080872816052491 0,000792420718998861 0,000817182173510579 38956 42660 623 665 0 True 474 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 519 337 0,000936850060270687 0,000967926797997512 0,000747692072938125 0,000762951094834821 0,000829827314816786 0,000846206303297368 38250 42183 623 665 0 True 518 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 563 337 0,000973687249568651 0,00100340115567013 0,000717174029144732 0,00080872816052491 0,0008981644209971 0,00080552998040989 39754 43729 623 665 0 True 563 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 607 337 0,00100065383561723 0,00100828863185659 0,000595101853971161 0,000534065766384375 0,00110468983614763 0,00117062932965532 40855 43942 623 665 0 True 607 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 651 336 0,00091892132186237 0,000969877199292578 0,000488288700694286 0,000625619897764553 0,000982582910736347 0,000967740135359938 37518 42268 623 665 0 True 651 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 254 382 0,000867706851900905 0,000869924869394819 0,000747692072938125 0,000717174029144732 0,000716695914474978 0,000747388077814562 35427 37912 623 665 0 True 253 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 299 382 0,000873830054909211 0,000925866967716843 0,000732433051041428 0,000778210116731518 0,000668556403836068 0,000722780811717066 35677 40350 623 665 0 True 298 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 343 381 0,00092546090267524 0,000948996432486572 0,000823987182421607 0,00080872816052491 0,00069213270381635 0,000739976713901592 37785 41358 623 665 0 True 342 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 387 382 0,000877014120473529 0,000889658341321374 0,000732433051041428 0,000778210116731518 0,000709947775032175 0,000660125253646394 35807 38772 623 665 0 True 386 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 430 381 0,000900478234401355 0,000922356245385723 0,000671396963454643 0,000717174029144732 0,000796286907787944 0,000821273047234794 36765 40197 623 665 0 True 430 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 475 382 0,000888305306820844 0,000878437797400345 0,000610360875867857 0,000564583810177768 0,000855674652805428 0,000885909633042673 36268 38283 623 665 0 True 474 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 519 381 0,000967515060936279 0,00100039524308597 0,000732433051041428 0,000762951094834821 0,000865091456435623 0,00092805986839387 39502 43598 623 665 0 True 518 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 563 381 0,000981941327223846 0,000981602552960566 0,000717174029144732 0,000747692072938125 0,000939643798615695 0,000879690257433744 40091 42779 623 665 0 True 563 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 607 381 0,000966045492214286 0,000968018581587868 0,000518806744487678 0,00064087891966125 0,00107354493401716 0,00103593197782968 39442 42187 623 665 0 True 607 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 651 381 0,00092112567494536 0,000915105341747594 0,000549324788281071 0,000595101853971161 0,000955482174190251 0,000915320711588891 37608 39881 623 665 0 True 651 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 255 426 0,00081534121977388 0,00087924090381596 0,000671396963454643 0,000686655985351339 0,000729687000840532 0,000782262229463262 33289 38318 623 665 0 True 253 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 298 425 0,000926097715788103 0,000937569375487242 0,00080872816052491 0,00080872816052491 0,000731521358228609 0,000739355368705981 37811 40860 623 665 0 True 298 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 342 425 0,000859746687990109 0,000933691518794698 0,000717174029144732 0,000823987182421607 0,000676827571322109 0,000652996204061241 35102 40691 623 665 0 True 342 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 386 425 0,000925093510494741 0,000909185300169628 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,000715630587157504 0,000713057000020939 37770 39623 623 665 0 True 386 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 431 425 0,00100048238593299 0,000926578290542102 0,000762951094834821 0,000610360875867857 0,000883926534072716 0,000909888174046327 40848 40381 623 665 0 True 430 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 474 426 0,00103006970286912 0,000920038709729233 0,000793469138628214 0,000717174029144732 0,000926403071593406 0,000809498263328953 42056 40096 623 665 0 True 474 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 519 426 0,000906234045229162 0,000972378302129781 0,000671396963454643 0,000701915007248035 0,000867672801405296 0,000885846692270632 37000 42377 623 665 0 True 518 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 564 426 0,000893154883603422 0,000990941533279296 0,000656137941557946 0,000778210116731518 0,000874787543088898 0,000926524404102358 36466 43186 623 665 0 True 563 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 608 426 0,000977018272005169 0,000972837220081561 0,000671396963454643 0,000625619897764553 0,00100441278160129 0,000941778970382511 39890 42397 623 665 0 True 607 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 652 425 0,000895971556987242 0,000900580588573746 0,000534065766384375 0,000534065766384375 0,000934951899981293 0,000955401205526823 36581 39248 623 665 0 True 651 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 253 470 0,000919778570283533 0,000886583591044446 0,000778210116731518 0,000717174029144732 0,00076195921615465 0,000753851336592838 37553 38638 623 665 0 True 253 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 298 470 0,000893963146400518 0,00095886316844985 0,000686655985351339 0,00080872816052491 0,00080450672585938 0,000829482203050112 36499 41788 623 665 0 True 298 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 341 470 0,000886100953737854 0,000926601236439691 0,000701915007248035 0,000793469138628214 0,000757784450568016 0,00081203160629735 36178 40382 623 665 0 True 342 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 386 469 0,00088546414062499 0,000966756557220472 0,000686655985351339 0,000823987182421607 0,00077220844166766 0,000797223062720664 36152 42132 623 665 0 True 386 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 431 469 0,000959897796393948 0,00101551658959713 0,000717174029144732 0,000625619897764553 0,000932209332564448 0,00107292800439347 39191 44257 623 665 0 True 430 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 474 470 0,000857542334907119 0,000885137999496338 0,000442511635004196 0,000457770656900893 0,00097898416851481 0,000977650422191393 35012 38575 623 665 0 True 474 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 519 469 0,000914904500688922 0,00100060175616427 0,000610360875867857 0,000701915007248035 0,000918667975850215 0,000913982450789946 37354 43607 623 665 0 True 518 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 562 469 0,000874074983029543 0,000918799631259426 0,000503547722590982 0,000488288700694286 0,000948656037694649 0,00100336777838146 35687 40042 623 665 0 True 563 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 607 468 0,000917108853771911 0,000883761245640997 0,000503547722590982 0,000488288700694286 0,000947847899007452 0,000904605081456853 37444 38515 623 665 0 True 607 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 651 469 0,000880026736353615 0,000923457648469996 0,000442511635004196 0,000579842832074464 0,000959196866129432 0,000918564037995567 35930 40245 623 665 0 True 651 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 254 514 0,000983165967825507 0,00090585814501922 0,000839246204318303 0,000747692072938125 0,000749419532519327 0,000752533716800112 40141 39478 623 665 0 True 253 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 298 514 0,000975083339854545 0,000856570356998011 0,00080872816052491 0,000701915007248035 0,000820197281600187 0,000742120471706076 39811 37330 623 665 0 True 298 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 342 514 0,000998351511286104 0,000884862648725269 0,000869764248111696 0,000732433051041428 0,00085045044894129 0,000794267194146167 40761 38563 623 665 0 True 342 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 386 513 0,000910299852026676 0,00096609112619039 0,000701915007248035 0,000747692072938125 0,000820203538761203 0,000852653399503153 37166 42103 623 665 0 True 386 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 431 514 0,000894257060144917 0,000967238421069841 0,000518806744487678 0,000549324788281071 0,000964776505248046 0,00100016031504562 36511 42153 623 665 0 True 430 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 475 514 0,000892052707061927 0,000990184318658858 0,000473029678797589 0,000747692072938125 0,000954043269824766 0,000856717911673694 36421 43153 623 665 0 True 474 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 519 513 0,00094699008445244 0,000966710665425294 0,000595101853971161 0,000732433051041428 0,000958354199637226 0,000827651219831331 38664 42130 623 665 0 True 518 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 563 514 0,000862636839810029 0,000879768659460508 0,000564583810177768 0,000579842832074464 0,000852157486830124 0,00084594163106246 35220 38341 623 665 0 True 563 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 607 513 0,000901727367815049 0,000924559051554269 0,000625619897764553 0,000595101853971161 0,000868281042111013 0,000937928726646051 36816 40293 623 665 0 True 607 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 651 514 0,000952280531851616 0,000985641030936233 0,000549324788281071 0,000686655985351339 0,00101558252227071 0,00100722796222284 38880 42955 623 665 0 True 651 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 254 558 0,00088401906471503 0,000833785080692117 0,000732433051041428 0,000717174029144732 0,000681031526144012 0,000606941774473266 36093 36337 623 665 0 True 253 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 298 558 0,000879953257917516 0,000927909152602266 0,000732433051041428 0,000747692072938125 0,000732104421936075 0,000751934656664592 35927 40439 623 665 0 True 298 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 342 558 0,000918627408117971 0,000933324384433274 0,00080872816052491 0,000839246204318303 0,00068665803100263 0,000678954166356809 37506 40675 623 665 0 True 342 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 386 558 0,000879267459180586 0,000914577586103047 0,000732433051041428 0,000762951094834821 0,000675609414570998 0,000678332869768462 35899 39858 623 665 0 True 386 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 431 557 0,000827391683294224 0,000941148935511128 0,000488288700694286 0,000564583810177768 0,000882858918997469 0,00101508700262163 33781 41016 623 665 0 True 430 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 475 558 0,000884337471271462 0,000970175495961235 0,000473029678797589 0,00064087891966125 0,00103122909161521 0,000986869250471955 36106 42281 623 665 0 True 474 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 520 558 0,00097101753305703 0,000922402137180901 0,00064087891966125 0,000473029678797589 0,0010076512580292 0,00103667203752291 39645 40199 623 665 0 True 518 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 562 553 0,00082682834861746 0,000941676691155676 0,000518806744487678 0,00064087891966125 0,000841986573222391 0,000931709290725988 33758 41039 623 665 0 False 562 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 607 558 0,000967172161567814 0,000959597437172698 0,000686655985351339 0,000701915007248035 0,00087214159577914 0,000826254123217599 39488 41820 623 665 0 True 607 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 651 557 0,000954925755551204 0,000895601328796929 0,000701915007248035 0,000656137941557946 0,000921028741925085 0,000826008493026576 38988 39031 623 665 0 True 651 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 253 596 0,000935968319037491 0,00084399600511923 0,000823987182421607 0,000762951094834821 0,000668370159651381 0,000564819906785335 38214 36782 623 665 0 False 253 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 298 596 0,000917598710012576 0,000925063861301227 0,000778210116731518 0,000823987182421607 0,000695850981764653 0,000755673284642719 37464 40315 623 665 0 False 298 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 343 601 0,000887644000895947 0,00102129895578957 0,000762951094834821 0,000869764248111696 0,000732480663212532 0,000824937363428224 36241 44509 623 665 0 True 342 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 387 602 0,000910030431094311 0,000799939881748317 0,00080872816052491 0,000732433051041428 0,00063439805069487 0,000588481145544149 37155 34862 623 665 0 True 386 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 430 596 0,00081024671487097 0,000869488897340628 0,000549324788281071 0,000457770656900893 0,000833754052213674 0,000934908887529588 33081 37893 623 665 0 False 430 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 474 596 0,000954607348994772 0,000892251227748933 0,000564583810177768 0,000534065766384375 0,0010203225590784 0,000951359776646528 38975 38885 623 665 0 False 474 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 518 596 0,000921370603065692 0,000909070570681682 0,000457770656900893 0,000488288700694286 0,00107350104545864 0,00106730555691885 37618 39618 623 665 0 False 518 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 562 596 0,000845344914514575 0,000905032092706015 0,000518806744487678 0,000579842832074464 0,000866310884182934 0,000918320540969237 34514 39442 623 665 0 False 562 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 607 596 0,00090432360589057 0,000950074889673256 0,000686655985351339 0,000762951094834821 0,000789319307818418 0,000743280457582037 36922 41405 623 665 0 False 607 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 651 596 0,00104305089324673 0,000967812068509566 0,000823987182421607 0,000762951094834821 0,000872050653173528 0,000801114452678529 42586 42178 623 665 0 False 651 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 254 645 0,000966535348454951 0,0639750440417822 0,000793469138628214 0,0637674525062943 0,000723605347908032 0,0229987377364334 39462 2788082 623 665 0 True 253 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 297 639 0,00100954472638529 0,000859255027015926 0,000854505226215 0,000717174029144732 0,000743578699224962 0,000665583316446714 41218 37447 623 665 0 False 297 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 342 639 0,000852129423447777 0,000875638397894484 0,000701915007248035 0,000778210116731518 0,000672868786916657 0,00061216046530574 34791 38161 623 665 0 False 342 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 386 639 0,000934376286255332 0,000905789307326453 0,00080872816052491 0,000793469138628214 0,000650858948708241 0,000661993535770171 38149 39475 623 665 0 False 386 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 430 639 0,000851198696590515 0,00092102538332556 0,000656137941557946 0,000686655985351339 0,000775848197945787 0,000834171521562504 34753 40139 623 665 0 False 430 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 474 639 0,000864890178517085 0,000896129084441477 0,000549324788281071 0,000595101853971161 0,000881260997036722 0,000890083356170282 35312 39054 623 665 0 False 474 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 518 639 0,000909075211425015 0,000930593822620181 0,000564583810177768 0,000579842832074464 0,000933948787317012 0,00092205825078699 37116 40556 623 665 0 False 518 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 562 639 0,000970062313387734 0,000982336821683414 0,000747692072938125 0,000747692072938125 0,000909275928568821 0,000855267481185903 39606 42811 623 665 0 False 562 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 607 639 0,000970895068996864 0,000906454738356534 0,000854505226215 0,000747692072938125 0,000686344204111413 0,000695912983649544 39640 39504 623 665 0 False 607 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 651 645 0,00103367014623801 0,0690208928134022 0,000930800335698482 0,0677958342870222 0,000714722222779312 0,0218260587747248 42203 3007984 623 665 0 True 651 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F5_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F5_1.csv new file mode 100755 index 0000000..7367544 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F5_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 267 278 0,0103281044853564 0,0467225743461423 0,0103150988021668 0,0471656366826886 0,00150896601478112 0,00819958997813128 421679 2036206 623 665 0 True 267 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 311 278 0,0103220547607842 0,010357686388092 0,0103608758678569 0,0104219119554437 0,00123966335110201 0,00125232421126903 421432 451396 623 665 0 False 311 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 355 279 0,0102941819406904 0,0671262041576819 0,0103456168459602 0,0673838406958114 0,00142434950057662 0,00981435313159567 420294 2925412 623 665 0 True 355 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 399 279 0,0104766288975259 0,0884965446346468 0,010605020218204 0,0876630807965209 0,00143020685387142 0,011147592843268 427743 3856748 623 665 0 True 399 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 443 278 0,0104133639640441 0,0777745003387388 0,0104829480430304 0,0764171816586557 0,00168633222799461 0,015717326877168 425160 3389473 623 665 0 True 443 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 487 279 0,0102890139573514 0,0689226155340285 0,0103913939116503 0,0712901503013657 0,00172989877051135 0,0194627704022506 420083 3003701 623 665 0 True 488 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 531 278 0,0104931860384603 0,0840198688527223 0,0104829480430304 0,0846875715266651 0,00160585241949087 0,0215402210884359 428419 3661651 623 665 0 True 532 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 575 279 0,010222369015809 0,0724141321488661 0,01025406271458 0,0698558022430762 0,00169412245619279 0,0179874762098488 417362 3155864 623 665 0 True 576 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 620 279 0,0100705870596391 0,0103225791647808 0,0100862134737163 0,0103150988021668 0,00197294449319742 0,00186692554949008 411165 449866 623 665 0 False 620 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 664 278 0,0103766492388063 0,0466624560944591 0,0103913939116503 0,0462806134126802 0,00193456665203491 0,00861856893954275 423661 2033586 623 665 0 True 665 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 267 322 0,0102382403580065 0,0102247608033588 0,0102693217364767 0,01025406271458 0,00147612020006225 0,00148627553974049 418010 445603 623 665 0 False 267 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 311 322 0,0102196992992974 0,0102689316562177 0,0102082856488899 0,0102998397802701 0,00130801111051293 0,00132317191378589 417253 447528 623 665 0 False 311 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 354 323 0,0105690402773272 0,107612611294774 0,0105592431525139 0,105409323262379 0,00130761699452637 0,0239269560453557 431516 4689841 623 665 0 True 355 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 399 323 0,0105770739196741 0,0541335715117503 0,0105134660868238 0,0529182879377432 0,00139418844194701 0,00858959606106918 431844 2359183 623 665 0 True 399 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 444 323 0,0106982888464265 0,0827563300560855 0,0108186465247578 0,0785839627679866 0,00167988993609397 0,0202973323941126 436793 3606585 623 665 0 True 443 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 488 324 0,0105719794147712 0,0434288972603172 0,010605020218204 0,0444190127412833 0,00168277807482881 0,00820067680862536 431636 1892665 623 665 0 True 488 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 531 323 0,0103546057079764 0,0453535303123912 0,0103608758678569 0,0479591058213169 0,00157169920686121 0,00858431991735492 422761 1976542 623 665 0 True 532 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 576 324 0,0103509807717954 0,0530174830530205 0,0103150988021668 0,0537575341420615 0,00182316207640027 0,0102384998730293 422613 2310543 623 665 0 True 576 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 620 322 0,0102620228784908 0,0102448155178516 0,0103761348897536 0,0102998397802701 0,00203771372566464 0,00205487819798966 418981 446477 623 665 0 False 620 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 665 322 0,0101249611023529 0,0100672601623078 0,0100709544518196 0,0101472495613031 0,0018949069438441 0,00179510100667949 413385 438739 623 665 0 False 665 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 267 368 0,0104747674438113 0,0534272738380628 0,0105134660868238 0,0522163729304952 0,00148375847043112 0,0100099329246419 427667 2328402 623 665 0 True 266 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 310 368 0,0106265004143571 0,0649036645172097 0,0106355382619974 0,0678110933089189 0,00131062334968237 0,0165482907299999 433862 2828552 623 665 0 True 311 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 355 367 0,0105439596378052 0,0417087121557613 0,0104829480430304 0,0422980086976425 0,0014064627857226 0,0075903202290071 430492 1817698 623 665 0 True 355 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 399 367 0,0104694280107881 0,0359774923690549 0,0104829480430304 0,0365148393987945 0,00155141504056852 0,00501396141716419 427449 1567927 623 665 0 True 399 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 444 367 0,0105258839425247 0,0745001666445812 0,0105592431525139 0,0729381246662089 0,00181002719678082 0,0114936128909246 429754 3246775 623 665 0 True 443 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 487 367 0,0108258229186835 0,0370933513688088 0,0106507972838941 0,0363775082017243 0,00206268959560332 0,00762100417584637 442000 1616557 623 665 0 True 488 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 533 368 0,0104577694322603 0,0285664952034469 0,0104676890211337 0,0288700694285496 0,0016914575615726 0,00313753938200947 426973 1244950 623 665 0 True 532 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 576 367 0,0105092288303421 0,0520934288112132 0,0104371709773404 0,0525062943465324 0,00198011678458373 0,0087206973064671 429074 2270272 623 665 0 True 576 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 620 367 0,0105549569104081 0,0587566650661903 0,0106355382619974 0,0585030899519341 0,00207548358216503 0,011968427333315 430941 2560661 623 665 0 True 620 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 664 366 0,010184037764977 0,0662124526238921 0,01025406271458 0,0650339513237202 0,0019120483631568 0,017573126640091 415797 2885590 623 665 0 True 664 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 267 412 0,0102585448991821 0,0452714069449201 0,0102235446707866 0,0479438467994202 0,00157408582266722 0,00883413062931039 418839 1972963 623 665 0 True 266 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 311 412 0,0104478498433868 0,0342568712924449 0,0104371709773404 0,0339818417639429 0,00130244920981099 0,00441369860132381 426568 1492941 623 665 0 True 311 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 355 411 0,0107246920977983 0,0888944723906356 0,0107270923933776 0,0843518730449378 0,00133412171149121 0,0188964680795484 437871 3874090 623 665 0 True 355 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 399 411 0,0107662563998187 0,0686851943316749 0,0106813153276875 0,0673685816739147 0,00152579723259127 0,0160863589541293 439568 2993354 623 665 0 True 399 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 444 412 0,0107703956850523 0,0442885194216945 0,0107728694590677 0,0452429999237049 0,00169375447845175 0,00660195789140844 439737 1930128 623 665 0 True 443 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 488 412 0,011382103665582 0,0544372834122385 0,0112764171816587 0,0547188525215534 0,00208795935372881 0,0108043967958054 464712 2372419 623 665 0 True 488 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 532 412 0,010882989141969 0,0427462338611463 0,0109102006561379 0,044083314259556 0,00175770173920286 0,00537313056939962 444334 1862914 623 665 0 True 532 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 576 412 0,010848282827318 0,0536294042499244 0,0107881284809644 0,0532387273975738 0,00218659215264593 0,00948930693397652 442917 2337211 623 665 0 True 576 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 620 411 0,0104278637087677 0,0415517622162525 0,010452429999237 0,0423590447852293 0,00196726643095799 0,00646066509197149 425752 1810858 623 665 0 True 620 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 664 411 0,0105385467263459 0,0913597107899068 0,0104982070649271 0,0852826733806363 0,00188707030207875 0,0190333864052724 430271 3981527 623 665 0 True 664 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 268 457 0,0103541893301718 0,0423341943781404 0,0104676890211337 0,0427862973983368 0,00157434105487899 0,0056008285224303 422744 1844957 623 665 0 True 266 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 311 455 0,0105585083681529 0,0720260940747382 0,0105439841306172 0,0701762417029068 0,00162496564090828 0,0184022200308608 431086 3138953 623 665 0 True 311 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 356 456 0,0111904474114221 0,0367845454790558 0,0108949416342412 0,0370489051651789 0,0031920171347318 0,00385962497465923 456887 1603099 623 665 0 True 355 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 399 455 0,0109067471696413 0,0555839816983521 0,0108796826123445 0,0545204852368963 0,00171569910953274 0,00968774518927498 445304 2422393 623 665 0 True 399 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 444 455 0,0112344854874578 0,093987979791548 0,0112306401159686 0,0927443350881209 0,0020015303845627 0,0111358558378856 458685 4096069 623 665 0 True 443 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 488 456 0,0109823074947637 0,0633074331514297 0,0108644235904479 0,0629434653238727 0,00203487868030705 0,0141057149853268 448389 2758987 623 665 0 True 488 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 532 455 0,0111588761767112 0,0554979575282909 0,0110627908751049 0,0548561837186236 0,00237789369638027 0,00806272617401387 455598 2418644 623 665 0 True 532 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 576 452 0,0110745229320688 0,0311142011586531 0,0110170138094148 0,0320592050049592 0,00192120463200539 0,0057297007150327 452154 1355981 623 665 0 False 576 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 621 455 0,0104473110015221 0,0402632582830388 0,0104371709773404 0,0408331425955596 0,00186809048287085 0,00579777410710376 426546 1754704 623 665 0 True 620 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 665 455 0,0104613943684412 0,0682860963349091 0,0104676890211337 0,0675516899366751 0,00186055149941409 0,0113343824556845 427121 2975961 623 665 0 True 664 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 267 500 0,0103607289109847 0,0591109726708623 0,0103608758678569 0,0598611429007401 0,00156645800600804 0,0178811031712168 423011 2576102 623 665 0 True 266 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 311 500 0,010686850703207 0,0592670277203652 0,0108339055466545 0,0573281452658885 0,00165055927927028 0,0093493416632044 436326 2582903 623 665 0 True 311 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 355 500 0,0109327830288326 0,073282657318508 0,0110017547875181 0,0717631799801633 0,00162511133067799 0,0153793503591768 446367 3193715 623 665 0 True 355 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 400 499 0,0110140746719708 0,094008080397836 0,0110017547875181 0,0905012588693065 0,0016496468385628 0,0187940869582408 449686 4096945 623 665 0 True 399 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 444 499 0,0114806137555796 0,0971729392145964 0,0114137483787289 0,0924544136720836 0,00209436996231264 0,0270584397455034 468734 4234872 623 665 0 True 443 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 488 500 0,0111119724416676 0,0456186242672371 0,0111390859845884 0,0470283054856184 0,00194436045274812 0,00663206217627094 453683 1988095 623 665 0 True 487 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 532 500 0,0116315139705163 0,0437226047494566 0,0113527122911421 0,044937819485771 0,00245644162166377 0,0079778547447167 474895 1905465 623 665 0 True 532 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 575 499 0,0114773072259551 0,0993989895773997 0,0110017547875181 0,0968490119783322 0,0031428187885213 0,0159487759748714 468599 4331885 623 665 0 True 576 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 619 499 0,0105011462023711 0,0628249268169279 0,0105439841306172 0,0647287708857862 0,00177737970907492 0,015942187344849 428744 2737959 623 665 0 True 620 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 664 499 0,010717809617617 0,0748790722514687 0,0107118333714809 0,0720225833524071 0,00185439390924768 0,0110056272748385 437590 3263288 623 665 0 True 664 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 267 544 0,0103662397936921 0,0588675855351356 0,0104676890211337 0,0603952086671244 0,0014844961937559 0,0140226164994464 423236 2565495 623 665 0 True 266 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 310 543 0,0106139845874082 0,107691361615299 0,010605020218204 0,10757610437171 0,00143278370165284 0,0271438783985215 433351 4693273 623 665 0 True 311 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 355 544 0,0106525117807364 0,0570018775480702 0,0106507972838941 0,0591134508278019 0,00149450141117014 0,0108857406377223 434924 2484186 623 665 0 True 355 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 399 544 0,0108247697277661 0,0596921922567921 0,0107270923933776 0,0590829327840085 0,00166108659710612 0,00838455622243964 441957 2601432 623 665 0 True 399 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 443 543 0,0110961500850942 0,0574597170426639 0,011108567940795 0,0579385061417563 0,00191759886858814 0,00731001655077724 453037 2504139 623 665 0 True 443 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 487 544 0,0108270230664731 0,0606997007281307 0,0108644235904479 0,0602578774700542 0,00200329815592043 0,0125836443393738 442049 2645340 623 665 0 True 487 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 531 544 0,010906575719957 0,071261880955536 0,0109102006561379 0,0699015793087663 0,00196571452174079 0,0162741878997898 445297 3105648 623 665 0 True 532 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 576 544 0,010904346874062 0,0575459936175986 0,0108644235904479 0,0575417715724422 0,00181600845662023 0,0129089974399444 445206 2507899 623 665 0 True 576 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 620 543 0,0105106983990641 0,0453483904313312 0,0105745021744106 0,0443274586099031 0,00180379230348225 0,00687567770625193 429134 1976318 623 665 0 True 620 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 664 543 0,0105416818062861 0,0665721525144975 0,0105897611963073 0,0665293354695964 0,00182260848953338 0,0126709984347595 430399 2901266 623 665 0 True 664 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 267 588 0,0102468618278422 0,0475412380803233 0,0102845807583734 0,0485847257190814 0,00131107222971379 0,00958562486651726 418362 2071884 623 665 0 True 266 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 311 588 0,0105683544785903 0,0545728248292969 0,0105745021744106 0,0554818036163882 0,00137757904801324 0,011108158074722 431488 2378326 623 665 0 True 310 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 355 588 0,0106714202316261 0,0517924474725381 0,0107270923933776 0,0517433432516976 0,00139729786771638 0,00874252261621395 435696 2257155 623 665 0 True 355 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 400 588 0,0107675790116685 0,0522451470860718 0,0108339055466545 0,0506752117189288 0,00146202001655414 0,00673226453894813 439622 2276884 623 665 0 True 399 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 444 587 0,0107929535649349 0,088858378493728 0,0107881284809644 0,0838635843442435 0,00185008663891504 0,0181511248289532 440658 3872517 623 665 0 True 443 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 488 588 0,0106382324713211 0,0628251103841086 0,0105592431525139 0,0607309071488518 0,00211312453452655 0,0112105370514798 434341 2737967 623 665 0 True 487 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 532 588 0,0106045793475874 0,0564187763985381 0,0105592431525139 0,0559395742732891 0,0019246308665629 0,00685169854521194 432967 2458774 623 665 0 True 532 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 576 582 0,0106908675243805 0,0341394112426867 0,0106355382619974 0,0380865186541543 0,00190831733000543 0,0111770763774571 436490 1487822 623 665 0 False 576 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 620 588 0,0104891692172869 0,049094491779919 0,0104219119554437 0,0494392309452964 0,00149570857084118 0,00653232397044543 428255 2139576 623 665 0 True 620 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 663 587 0,0103450290184714 0,0555112432029949 0,0103456168459602 0,0554512855725948 0,00163938893708769 0,00781001494826244 422370 2419223 623 665 0 True 664 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 266 625 0,0107131314905186 0,0100021167590526 0,0100709544518196 0,00999465934233616 0,00358094555848935 0,00138875116488408 437399 435900 623 665 0 False 266 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 310 625 0,0109363344865774 0,0100537679745255 0,0104219119554437 0,0100709544518196 0,00325457776132906 0,00134627866654339 446512 438151 623 665 0 False 310 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 355 631 0,0105776127615388 0,0785873817067273 0,0105897611963073 0,076554512855726 0,0013118140141807 0,0120219504810365 431866 3424899 623 665 0 True 355 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 399 631 0,0105316642461645 0,0786562193994944 0,0105439841306172 0,0759899290455482 0,00139245666786001 0,0195545302345306 429990 3427899 623 665 0 True 399 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 443 625 0,0109628846948214 0,0104063775827759 0,010605020218204 0,010406652933547 0,00359481373934074 0,00183079786441193 447596 453518 623 665 0 False 443 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 487 625 0,010759839283066 0,0102779723398678 0,0105439841306172 0,0103150988021668 0,00287029797529055 0,00187781835119747 439306 447922 623 665 0 False 487 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 532 625 0,0105517973376558 0,0101041342197334 0,0103150988021668 0,0102235446707866 0,00234610597694116 0,00194361449132535 430812 440346 623 665 0 False 532 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 576 625 0,0102942799119385 0,0100487428229535 0,01025406271458 0,0100556954299229 0,00180321183521351 0,00172139619740389 420298 437932 623 665 0 False 576 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 620 625 0,0104130945431117 0,0101248084734611 0,0103303578240635 0,010101472495613 0,00187751162395915 0,00138778161571475 425149 441247 623 665 0 False 620 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 664 626 0,0102647660734385 0,0102225579971903 0,01025406271458 0,0102845807583734 0,00158839028033686 0,00151345076132547 419093 445507 623 665 0 False 664 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 269 675 0,0102536708295875 0,0454456121994159 0,0102693217364767 0,0456244754711223 0,00136221455950225 0,00920237072929871 418640 1980555 623 665 0 True 266 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 310 669 0,0102323620831186 0,0103203075209195 0,0102235446707866 0,0102845807583734 0,001278307285662 0,00123695637008411 417770 449767 623 665 0 False 310 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 355 669 0,0113037756526998 0,010229831846726 0,0103456168459602 0,0102388036926833 0,0056737557001015 0,00128451781392341 461514 445824 623 665 0 False 355 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 399 669 0,0107993216960636 0,0100405740834118 0,0103303578240635 0,0100556954299229 0,00359621665662129 0,00137613141500977 440918 437576 623 665 0 False 399 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 443 669 0,0102375790520816 0,0100972733963542 0,0102235446707866 0,0101167315175097 0,00158842645832177 0,00148695618474025 417983 440047 623 665 0 False 443 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 487 669 0,0102360115121115 0,0101522517669775 0,0101777676050965 0,0102082856488899 0,00170783758120322 0,00160593590872374 417919 442443 623 665 0 False 487 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 532 669 0,0101644190225384 0,0100712986402835 0,0102235446707866 0,0100556954299229 0,00181072845990049 0,00178770597785894 414996 438915 623 665 0 False 532 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 576 669 0,0100548136886897 0,00998940473178827 0,00999465934233616 0,0100404364080262 0,00151486696364236 0,00137831654858694 410521 435346 623 665 0 False 576 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 620 669 0,0100406078577105 0,0100946575640291 0,0100099183642329 0,0100099183642329 0,00133745933359164 0,00153396910632889 409941 439933 623 665 0 False 620 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 665 675 0,0101603287229289 0,0438619551855147 0,010101472495613 0,0445716029602502 0,00141826832749067 0,00938469598582889 414829 1911538 623 665 0 True 664 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F5_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F5_2.csv new file mode 100755 index 0000000..d77e522 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F5_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 267 278 0,00839015971885191 0,739842809128566 0,00830090791180285 0,738857099259937 0,00188987054104405 0,178268393243535 342556 32242923 623 665 12 True 267 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 311 278 0,00707232396740448 0,00674763126630951 0,00697337300679027 0,00679026474402991 0,00140772344580419 0,00116295428643395 288751 294067 623 665 0 False 311 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 355 279 0,00648780300823167 0,00650663050393207 0,00653086137178607 0,00648508430609598 0,00126843761021056 0,00127346902709876 264886 283564 623 665 0 True 355 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 399 279 0,00636475112057677 0,0066329706160572 0,00636301213092241 0,00665293354695964 0,00133545482133433 0,00125903944986747 259862 289070 623 665 0 True 399 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 443 278 0,00673699287785765 0,0065675748079285 0,0068055237659266 0,00657663843747616 0,00162807189600359 0,00168455112014917 275060 286220 623 665 0 True 443 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 487 279 0,00682555888616978 0,00690382399119795 0,00677500572213321 0,00689707789730678 0,001728473316462 0,00151909479226409 278676 300874 623 665 0 True 488 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 531 278 0,00711903175995183 0,00726469412258043 0,00717174029144732 0,00718699931334401 0,00144577720354987 0,00147564726007002 290658 316601 623 665 0 True 532 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 575 279 0,0075167705345593 0,00738318673773011 0,00753795681696803 0,00740062561989776 0,00169513559110385 0,0017577582360189 306897 321765 623 665 0 True 576 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 620 279 0,00805671457583164 0,00793138717702932 0,00791943236438544 0,00802624551766232 0,00191369494421245 0,00176551434467517 328942 345656 623 665 0 False 620 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 664 278 0,009390715583221 0,744532973541659 0,0093690394445716 0,735088120851453 0,00193599490230755 0,176245614436034 383407 32447324 623 665 14 True 665 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 267 322 0,00684823923011254 0,00673090370696712 0,00677500572213321 0,00674448767833982 0,00156269215423607 0,0013482267187438 279602 293338 623 665 0 False 267 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 311 322 0,00662809783555795 0,00635573828138669 0,00666819256885634 0,00634775310902571 0,00127465999821459 0,00112572356693957 270614 276988 623 665 0 False 311 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 354 323 0,00655890564156411 0,00671603476532944 0,00660715648126955 0,00675974670023652 0,00126615522608013 0,00118241927532395 267789 292690 623 665 0 True 355 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 399 323 0,00666170197366753 0,00671970610894368 0,00666819256885634 0,00671396963454643 0,00131049984656982 0,00128009318283207 271986 292850 623 665 0 True 399 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 444 323 0,00689372238205823 0,00703383544693732 0,00692759594110018 0,00706492713817044 0,00164591600896586 0,00165689276542197 281459 306540 623 665 0 True 443 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 488 324 0,00720945922197848 0,00697089484985065 0,00718699931334401 0,00697337300679027 0,00161060337094248 0,00159351832239563 294350 303797 623 665 0 True 488 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 531 323 0,00723965885921544 0,007200399717536 0,0072327763790341 0,00720225833524071 0,00149479773506098 0,00155148163235546 295583 313799 623 665 0 True 532 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 576 324 0,00729763334529807 0,00751519448655973 0,00729381246662089 0,00753795681696803 0,00181020419775361 0,00174401951156993 297950 327518 623 665 0 True 576 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 620 322 0,00764677838083163 0,00773607169675161 0,00764476997024491 0,00773632410162509 0,00189090407511173 0,00195169314158889 312205 337144 623 665 0 False 620 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 665 322 0,00785099944756463 0,00764024962841987 0,00791943236438544 0,00773632410162509 0,00206368267046609 0,00177241319607507 320543 332968 623 665 0 False 665 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 267 368 0,00625987289945052 0,00649942549208912 0,00619516289005875 0,00650034332799268 0,00137406395056917 0,00144613938141017 255580 283250 623 665 0 True 266 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 310 368 0,00652319512161967 0,00646950404163304 0,00656137941557946 0,00643930724040589 0,00135608890392319 0,00129230584149164 266331 281946 623 665 0 True 311 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 355 367 0,00679905766354983 0,00671041302042013 0,0068055237659266 0,00663767452506294 0,00122939509202902 0,00133527253556098 277594 292445 623 665 0 True 355 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 399 367 0,00694537772263629 0,00706756591639318 0,00695811398489357 0,00706492713817044 0,00139757867781151 0,00128261162214446 283568 308010 623 665 0 True 399 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 444 367 0,00713583382900662 0,00731618471677018 0,00714122224765393 0,00733958953231098 0,00158725574669465 0,00170474328205051 291344 318845 623 665 0 True 443 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 487 367 0,00727519792947564 0,00722364391179368 0,0072632944228275 0,0072327763790341 0,0016785439399644 0,00164316035910081 297034 314812 623 665 0 True 488 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 533 368 0,0072908733291769 0,00729987018358439 0,00738536659800107 0,00729381246662089 0,0016268687052985 0,00162151904942315 297674 318134 623 665 0 True 532 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 576 367 0,00721560691779882 0,00736207651194822 0,00717174029144732 0,00733958953231098 0,00192381013481194 0,00184796940701762 294601 320845 623 665 0 True 576 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 620 367 0,0070952737322796 0,00717265812735088 0,00708018616006714 0,00720225833524071 0,00198531289698211 0,00194716494857795 289688 312590 623 665 0 True 620 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 664 366 0,00662493826280567 0,00686192478220041 0,00672922865644312 0,0068055237659266 0,00183937954524741 0,00188774622974695 270485 299048 623 665 0 True 664 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 267 412 0,00635270065705642 0,00642391054312366 0,00636301213092241 0,00642404821850919 0,00144038332736961 0,00139883062238441 259370 279959 623 665 0 True 266 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 311 412 0,00657396872096454 0,00678613448246388 0,00659189745937285 0,00677500572213321 0,00130957346994798 0,00118752945958941 268404 295745 623 665 0 True 311 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 355 411 0,00688732975811756 0,00694533311993649 0,00688181887541009 0,00697337300679027 0,00136466104086301 0,00129964857740144 281198 302683 623 665 0 True 355 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 399 411 0,00701432498850981 0,00713504980120248 0,00697337300679027 0,00720225833524071 0,00146659930894504 0,00150275085515476 286383 310951 623 665 0 True 399 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 444 412 0,00706847859591526 0,00712488476857055 0,00704966811627375 0,00708018616006714 0,00157371016317933 0,00149015571277028 288594 310508 623 665 0 True 443 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 488 412 0,00749514338153396 0,00735328823317162 0,00744640268558785 0,00727855344472419 0,00174054395318796 0,00166086659611405 306014 320462 623 665 0 True 488 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 532 412 0,00728433374836403 0,00746638856238789 0,0072480354009308 0,00741588464179446 0,00156344445773239 0,00170038687109212 297407 325391 623 665 0 True 532 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 576 412 0,00731115337754041 0,00687225043611547 0,0072632944228275 0,00683604180972 0,00188507353523779 0,00175908496218709 298502 299498 623 665 0 True 576 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 620 411 0,00637866303781164 0,00656043863377831 0,00630197604333562 0,00662241550316625 0,0018201522937908 0,00173138724872263 260430 285909 623 665 0 True 620 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 664 411 0,00621140162443677 0,00617324955786124 0,00627145799954223 0,00613412680247196 0,00171859432235224 0,00181002547797645 253601 269035 623 665 0 True 664 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 268 457 0,00634253614006264 0,00638313568310798 0,00642404821850919 0,00631723506523232 0,00152925819977985 0,0014969907149949 258955 278182 623 665 0 True 266 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 311 455 0,00665090064356088 0,00674955872170699 0,00660715648126955 0,00679026474402991 0,00148487528620491 0,00143063254709678 271545 294151 623 665 0 True 311 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 356 456 0,00682666106271127 0,00679978729152935 0,00671396963454643 0,00675974670023652 0,00175124468182389 0,00129782687045322 278721 296340 623 665 0 True 355 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 399 455 0,00709858026190409 0,00700161940672234 0,00706492713817044 0,00701915007248035 0,00148430858130197 0,00153267024679861 289823 305136 623 665 0 True 399 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 444 455 0,00705270522496587 0,00733931418153991 0,00698863202868696 0,00744640268558785 0,00167850858710996 0,00204486251037319 287950 319853 623 665 0 True 443 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 488 456 0,007226800132898 0,00751813156145112 0,0072327763790341 0,00750743877317464 0,00183777229784459 0,00195600316648526 295058 327646 623 665 0 True 488 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 532 455 0,00708025963850324 0,00712171823470326 0,00698863202868696 0,00711070420386053 0,00186354532708973 0,00176420543322281 289075 310370 623 665 0 True 532 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 576 452 0,00660867503561561 0,00640224961579963 0,00656137941557946 0,00634775310902571 0,00191508941720329 0,00196209943217427 269821 279015 623 665 0 False 576 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 621 455 0,00602138638868305 0,00603766224900773 0,005981536583505 0,00601205462729839 0,00166098650702205 0,00173303750428154 245843 263126 623 665 0 True 620 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 665 455 0,00603666990339178 0,00623823233983333 0,00607309071488518 0,00628671702143893 0,0017529345394545 0,00185407340489399 246467 271867 623 665 0 True 664 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 267 500 0,0065527089601197 0,00663990027712908 0,00666819256885634 0,00662241550316625 0,00146189190701422 0,00159563771826173 267536 289372 623 665 0 True 266 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 311 500 0,00663887467285257 0,00668849968822262 0,00663767452506294 0,00677500572213321 0,0014859870120359 0,00141128301308036 271054 291490 623 665 0 True 311 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 355 500 0,00662172970442932 0,00674767715810469 0,00665293354695964 0,00671396963454643 0,00141468531473573 0,0013884064463745 270354 294069 623 665 0 True 355 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 400 499 0,00689166498584744 0,00713596763710604 0,00694285496299687 0,00711070420386053 0,00152406517661291 0,00165719535434268 281375 310991 623 665 0 True 399 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 444 499 0,00705471363555259 0,00714945982488838 0,00711070420386053 0,00715648126955062 0,00181179025256314 0,00189438226881213 288032 311579 623 665 0 True 443 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 488 500 0,00689435919517109 0,00691600826281772 0,00691233691920348 0,00685130083161669 0,00174343364075927 0,00175425753787578 281485 301405 623 665 0 True 487 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 532 500 0,00696413921665374 0,00673083486927435 0,00677500572213321 0,00669871061264973 0,00190899062824126 0,00163089276792396 284334 293335 623 665 0 True 532 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 575 499 0,00683334760039634 0,00641021184226302 0,00668345159075303 0,00636301213092241 0,0020966585133701 0,0018320346558518 278994 279362 623 665 0 True 576 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 619 499 0,00617299689516868 0,00623031600516512 0,00619516289005875 0,00613412680247196 0,00159488869415148 0,00175083853930789 252033 271522 623 665 0 True 620 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 664 499 0,00621157307412101 0,00624986590991096 0,00625619897764553 0,00633249408712902 0,00159418801113874 0,0019020284723565 253608 272374 623 665 0 True 664 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 267 544 0,00670892411526758 0,00665756861827262 0,00666819256885634 0,00669871061264973 0,00133587971319919 0,0013934408065899 273914 290142 623 665 0 True 266 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 310 543 0,00681299407359674 0,00675570822226085 0,0068055237659266 0,0068055237659266 0,00142287834599566 0,00144156899783711 278163 294419 623 665 0 True 311 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 355 544 0,00682979614265153 0,00693833462117184 0,00683604180972 0,00692759594110018 0,00136693975465315 0,00140784363008271 278849 302378 623 665 0 True 355 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 399 544 0,00683513557567477 0,00683181976456362 0,0068207827878233 0,0068055237659266 0,00152879410807254 0,00144580322563377 279067 297736 623 665 0 True 399 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 443 543 0,00661384301895462 0,00665669667416424 0,00660715648126955 0,00665293354695964 0,00180515832562431 0,00181990209889636 270032 290104 623 665 0 True 443 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 487 544 0,00659978414484755 0,00704608855624986 0,00648508430609598 0,00714122224765393 0,00182830687327897 0,00215828330301386 269458 307074 623 665 0 True 487 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 531 544 0,00652219091632631 0,00683673018664767 0,00656137941557946 0,00683604180972 0,00180385698301316 0,00189484718453227 266290 297950 623 665 0 True 532 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 576 544 0,00656368173991058 0,00648070163965648 0,00656137941557946 0,00651560234988937 0,00162904058392029 0,00150547859810129 267984 282434 623 665 0 True 576 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 620 543 0,00638299826554152 0,00638090993104184 0,0063935301747158 0,00646982528419928 0,00161577898885999 0,00170477795347903 260607 278085 623 665 0 True 620 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 664 543 0,00637699752659338 0,00637274119150015 0,00628671702143893 0,00633249408712902 0,00174034491000105 0,00187603576032937 260362 277729 623 665 0 True 664 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 267 588 0,00678188820231455 0,00695313472511675 0,00674448767833982 0,00694285496299687 0,00129139658767059 0,00126382836030306 276893 303023 623 665 0 True 266 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 311 588 0,00694579410044086 0,00700384515878848 0,00694285496299687 0,00694285496299687 0,00130667714160544 0,00139003887949639 283585 305233 623 665 0 True 310 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 355 588 0,00669097088404723 0,00683505513612367 0,00671396963454643 0,00679026474402991 0,00129503672200441 0,001405996757067 273181 297877 623 665 0 True 355 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 400 588 0,00652922035337984 0,00665607713492934 0,00653086137178607 0,00666819256885634 0,00134975879185322 0,00128524670995846 266577 290077 623 665 0 True 399 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 444 587 0,00654582647993837 0,00662936811013572 0,00653086137178607 0,00657663843747616 0,00177557810413522 0,00191742890341706 267255 288913 623 665 0 True 443 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 488 588 0,00649909419457898 0,00669453445928853 0,00669871061264973 0,00669871061264973 0,00179239501100828 0,00196580027633076 265347 291753 623 665 0 True 487 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 532 588 0,00658165946394297 0,00680107226179433 0,00653086137178607 0,0068207827878233 0,00184387721651391 0,00185963149298938 268718 296396 623 665 0 True 532 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 576 582 0,00642456256756189 0,00658411880009018 0,00645456626230259 0,00660715648126955 0,00157799916442308 0,00154458511485408 262304 286941 623 665 0 False 576 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 620 588 0,00660066588608075 0,00646558029314531 0,00653086137178607 0,00651560234988937 0,00149330359359498 0,00137674415301648 269494 281775 623 665 0 True 620 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 663 587 0,00637138867263777 0,00635511874215179 0,00631723506523232 0,00634775310902571 0,00155409771744642 0,001603406534281 260133 276961 623 665 0 True 664 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 266 625 0,00703636851933971 0,00718743528539821 0,00698863202868696 0,00720225833524071 0,00139524214125304 0,00132107050584621 287283 313234 623 665 0 False 266 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 310 625 0,00680427463251291 0,00692376397620281 0,00677500572213321 0,00688181887541009 0,00128381632709282 0,00127248489341777 277807 301743 623 665 0 False 310 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 355 631 0,00641998241171168 0,00687321416381421 0,0064087891966125 0,00683604180972 0,00132167562041676 0,0012419406287125 262117 299540 623 665 0 True 355 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 399 631 0,00642137850199757 0,0065180575609314 0,0063935301747158 0,00656137941557946 0,00132737145883245 0,00137357808972648 262174 284062 623 665 0 True 399 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 443 625 0,00638863161230916 0,00637246584072908 0,00645456626230259 0,00636301213092241 0,00168362380200838 0,00169655860677418 260837 277717 623 665 0 False 443 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 487 625 0,00642860388154737 0,00670162474164353 0,00648508430609598 0,00663767452506294 0,00180744414074988 0,0018586264958012 262469 292062 623 665 0 False 487 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 532 625 0,00650992001749766 0,00649641957950495 0,00651560234988937 0,00654612039368277 0,00176157621134772 0,00183737591410952 265789 283119 623 665 0 False 532 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 576 625 0,00652277874381511 0,00640286915503453 0,00650034332799268 0,00634775310902571 0,00166141567853778 0,00155335482645255 266314 279042 623 665 0 False 576 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 620 625 0,00661435736800732 0,00643643900320726 0,00659189745937285 0,0063782711528191 0,0013664804334705 0,00129900683659278 270053 280505 623 665 0 False 620 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 664 626 0,00660553995567536 0,00675848467586912 0,00654612039368277 0,00679026474402991 0,00144650891027724 0,00145461409832688 269693 294540 623 665 0 False 664 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 269 675 0,00867202299973021 0,730551441547334 0,00860608834973678 0,727885862516213 0,00183812178169858 0,200125411521232 354064 31837998 623 665 13 True 266 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 310 669 0,00798646919092037 0,00747421311346574 0,00730907148851759 0,00746166170748455 0,00344960349835216 0,00135853963195965 326074 325732 623 665 0 False 310 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 355 669 0,00671886819695307 0,00658721649626469 0,00671396963454643 0,00654612039368277 0,001333803047474 0,00124827337888326 274320 287076 623 665 0 False 355 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 399 669 0,00656062013840643 0,00636356283246454 0,00657663843747616 0,00634775310902571 0,00138148964749075 0,00133032111225387 267859 277329 623 665 0 False 399 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 443 669 0,00660593184066789 0,00639297947317366 0,00660715648126955 0,0063782711528191 0,00151988296407159 0,00145972210514002 269709 278611 623 665 0 False 443 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 487 669 0,00652025598417568 0,00643974321246008 0,00650034332799268 0,00642404821850919 0,00154397931633246 0,00146451595090912 266211 280649 623 665 0 False 487 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 532 669 0,00639855120118261 0,00648632338456579 0,00642404821850919 0,00651560234988937 0,00168042773294206 0,00166699821208978 261242 282679 623 665 0 False 532 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 576 669 0,00653602935512508 0,00657624835721714 0,00645456626230259 0,00656137941557946 0,00136570541818205 0,00122729391606285 266855 286598 623 665 0 False 576 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 620 669 0,00685539113122624 0,00673255581159353 0,00691233691920348 0,00671396963454643 0,00131579162148272 0,00138576376073641 279894 293410 623 665 0 False 620 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 665 675 0,00859114773439652 0,722822115944473 0,00840772106507973 0,725566491187915 0,00215390176186703 0,213433049853787 350762 31501148 623 665 14 True 664 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F5_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F5_3.csv new file mode 100755 index 0000000..05a92f4 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F5_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 267 278 0,00105461150052641 0,0742148114621642 0,000885023270008392 0,0719310292210269 0,000798469910429801 0,0208149341509059 43058 3234339 623 665 0 True 267 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 311 278 0,000968323323733376 0,000939932802938911 0,000869764248111696 0,000793469138628214 0,000656504008764064 0,000683614987609497 39535 40963 623 665 0 False 311 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 355 279 0,000980912629118451 0,000879034390737659 0,000885023270008392 0,000762951094834821 0,000721054167141918 0,000650085814246466 40049 38309 623 665 0 True 355 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 399 279 0,000996073679767015 0,000885711646936063 0,000900282291905089 0,000747692072938125 0,00068591153367359 0,000642639142468679 40668 38600 623 665 0 True 399 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 443 278 0,000931437148811346 0,000972584815208082 0,000701915007248035 0,000717174029144732 0,000831489313110953 0,00088112266879239 38029 42386 623 665 0 True 443 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 487 279 0,00102970231068863 0,000959758058455821 0,000793469138628214 0,000701915007248035 0,000903733013015816 0,000882917465969534 42041 41827 623 665 0 True 488 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 531 278 0,00090576868180053 0,000960675894359382 0,000701915007248035 0,000793469138628214 0,000784424359599357 0,000835077180970432 36981 41867 623 665 0 True 532 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 575 279 0,000959163012032951 0,000994199850736936 0,000686655985351339 0,000747692072938125 0,000914174731815248 0,000922329748792599 39161 43328 623 665 0 True 576 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 620 279 0,0010138309684911 0,0010124418393202 0,000610360875867857 0,00064087891966125 0,00100249767099956 0,000973934574310675 41393 44123 623 665 0 False 620 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 664 278 0,00101400241817533 0,075167593967753 0,000717174029144732 0,0717936980239567 0,000952285005181085 0,0216846060892591 41400 3275862 623 665 0 True 665 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 267 322 0,000868564100322068 0,00092336586487964 0,000717174029144732 0,000762951094834821 0,000700752005206254 0,000730107555057104 35462 40241 623 665 0 False 267 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 311 322 0,000913998266643692 0,000918845523054604 0,000778210116731518 0,000854505226215 0,00065703377525165 0,000628553402139163 37317 40044 623 665 0 False 311 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 354 323 0,000948190232242068 0,000937477591896886 0,000854505226215 0,000793469138628214 0,000664655103682135 0,00069532142670906 38713 40856 623 665 0 True 355 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 399 323 0,000968617237477774 0,00100252921156175 0,000839246204318303 0,000839246204318303 0,000714518275045163 0,000718337089856093 39547 43691 623 665 0 True 399 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 444 323 0,000979516538832558 0,00100147370027265 0,000747692072938125 0,000701915007248035 0,000877944596902088 0,000889904158462023 39992 43645 623 665 0 True 443 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 488 324 0,000929894101653253 0,000971965275973179 0,000701915007248035 0,000793469138628214 0,000842581687651526 0,00085936948386353 37966 42359 623 665 0 True 488 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 531 323 0,000978732768847494 0,00104408423209546 0,00080872816052491 0,000854505226215 0,000829169613666226 0,000864282106684476 39960 45502 623 665 0 True 532 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 576 324 0,00103516420777203 0,000956132606636757 0,000747692072938125 0,000610360875867857 0,000958583140904465 0,000961856218184712 42264 41669 623 665 0 True 576 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 620 322 0,00114317750883854 0,00101081268059138 0,000823987182421607 0,000610360875867857 0,00110689361462815 0,00108801889636433 46674 44052 623 665 0 False 620 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 665 322 0,00102590592482348 0,000948721081715504 0,000671396963454643 0,000549324788281071 0,00103217828337061 0,000968235314661508 41886 41346 623 665 0 False 665 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 267 368 0,000916104648478549 0,00090282928653747 0,000778210116731518 0,000747692072938125 0,000707524383075774 0,000741795484753143 37403 39346 623 665 0 True 266 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 310 368 0,000821831814962683 0,000942456851673702 0,000717174029144732 0,000823987182421607 0,000640647236962417 0,000711543099897501 33554 41073 623 665 0 True 311 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 355 367 0,000955342133355769 0,000930685606210537 0,000839246204318303 0,000747692072938125 0,000695553842365335 0,000736241957049492 39005 40560 623 665 0 True 355 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 399 367 0,00089572662886691 0,000907097223489027 0,000747692072938125 0,000732433051041428 0,00067593408667616 0,000674708742220387 36571 39532 623 665 0 True 399 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 444 367 0,00107055632116004 0,000990161372761269 0,000854505226215 0,000686655985351339 0,000904711707346427 0,000928296992491375 43709 43152 623 665 0 True 443 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 487 367 0,000986545975886092 0,000963865374124256 0,000671396963454643 0,000671396963454643 0,000904267483356654 0,000886368237018412 40279 42006 623 665 0 True 488 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 533 368 0,000968960136846239 0,00103318493074068 0,000732433051041428 0,000778210116731518 0,000860048372799782 0,000907578300391172 39561 45027 623 665 0 True 532 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 576 367 0,00107290763111523 0,00103017901815652 0,000823987182421607 0,000717174029144732 0,00102590031764646 0,00102413740823098 43805 44896 623 665 0 True 576 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 620 367 0,000974471019553714 0,000980156961412458 0,000579842832074464 0,000610360875867857 0,000996280978033505 0,0010222939162865 39786 42716 623 665 0 True 620 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 664 366 0,000886737766850718 0,000835804319679951 0,000534065766384375 0,000442511635004196 0,000936721837227928 0,000941908919633441 36204 36425 623 665 0 True 664 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 267 412 0,000823815732737374 0,000894339304429533 0,00064087891966125 0,000717174029144732 0,000732210265582801 0,000769865515253712 33635 38976 623 665 0 True 266 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 311 412 0,000907556657078955 0,000893926278272931 0,00080872816052491 0,000732433051041428 0,00067887885821057 0,000721535286100572 37054 38958 623 665 0 True 311 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 355 411 0,00092820409762296 0,000872816052491035 0,000839246204318303 0,000747692072938125 0,000680764674381913 0,000661887486118068 37897 38038 623 665 0 True 355 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 399 411 0,000936311218405956 0,000918547226385946 0,000732433051041428 0,000717174029144732 0,000767268166770536 0,000769222407523826 38228 40031 623 665 0 True 399 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 444 412 0,000978781754471561 0,0010481686018663 0,000793469138628214 0,00080872816052491 0,00082736141529188 0,00090984867571902 39962 45680 623 665 0 True 443 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 488 412 0,000983753795314305 0,00106285397632328 0,000747692072938125 0,00080872816052491 0,000908050814779442 0,000908784908508247 40165 46320 623 665 0 True 488 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 532 412 0,00100016397937656 0,000980455258081115 0,000778210116731518 0,000747692072938125 0,000881385885869868 0,000850324181248414 40835 42729 623 665 0 True 532 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 576 412 0,000970821590560764 0,00105149575701671 0,000671396963454643 0,000778210116731518 0,00093229347193088 0,00101137386537032 39637 45825 623 665 0 True 576 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 620 411 0,00101554546533343 0,000992846042779184 0,000701915007248035 0,000625619897764553 0,000983239293120508 0,000983006383394878 41463 43269 623 665 0 True 620 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 664 411 0,000979981902261189 0,000947504949143286 0,00064087891966125 0,000518806744487678 0,000959775452341428 0,000998197110797305 40011 41293 623 665 0 True 664 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 268 457 0,000846569555116236 0,00085170582670914 0,000701915007248035 0,000671396963454643 0,000752526147544133 0,000777177004621799 34564 37118 623 665 0 True 266 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 311 455 0,0008616571273287 0,000854436388522233 0,000701915007248035 0,000701915007248035 0,000765052412797749 0,000729112947884074 35180 37237 623 665 0 True 311 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 356 456 0,0009050828830636 0,000888717559520224 0,000793469138628214 0,000762951094834821 0,00073446831534189 0,000737508503882879 36953 38731 623 665 0 True 355 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 399 455 0,000966559841266984 0,000859553323684583 0,000823987182421607 0,000686655985351339 0,000819378829884903 0,000763552319952597 39463 37460 623 665 0 True 399 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 444 455 0,000972830001147488 0,00102437370606649 0,000610360875867857 0,000686655985351339 0,000997911334100251 0,00106687013294216 39719 44643 623 665 0 True 443 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 488 456 0,000971139997117196 0,000907624979133574 0,000625619897764553 0,000473029678797589 0,000961815861599741 0,00100478116336366 39650 39555 623 665 0 True 488 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 532 455 0,000985958148397294 0,000928161557475745 0,000717174029144732 0,000610360875867857 0,000945311941544867 0,000921442549585444 40255 40450 623 665 0 True 532 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 576 452 0,000957791414559091 0,000933485005716397 0,000564583810177768 0,000503547722590982 0,00100371285814091 0,00102583416671127 39105 40682 623 665 0 False 576 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 621 455 0,000924946553622542 0,000844041896914408 0,000579842832074464 0,000442511635004196 0,00096267081405502 0,000924703904942613 37764 36784 623 665 0 True 620 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 665 455 0,000956836194889795 0,000902416260380867 0,000656137941557946 0,000473029678797589 0,000951651534797055 0,000975611402195515 39066 39328 623 665 0 True 664 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 267 500 0,000931339177563213 0,000942961661420661 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,000764806672793254 0,000819464113465711 38025 41095 623 665 0 True 266 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 311 500 0,000934425271879398 0,000885023270008392 0,00080872816052491 0,000717174029144732 0,000794590973879267 0,000781435878256635 38151 38570 623 665 0 True 311 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 355 500 0,000977704070742099 0,000920222276909945 0,000839246204318303 0,000778210116731518 0,000802938129706416 0,000770096356425735 39918 40104 623 665 0 True 355 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 400 499 0,000920905239637061 0,000926853641313171 0,000671396963454643 0,000717174029144732 0,00087902501145814 0,00080149349766681 37599 40393 623 665 0 True 399 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 444 499 0,00105924064200069 0,00101753582858497 0,000717174029144732 0,00064087891966125 0,00102860705925121 0,00106064685736563 43247 44345 623 665 0 True 443 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 488 500 0,000923795391456981 0,000946839518113205 0,000671396963454643 0,00064087891966125 0,000853667403233638 0,000918828200010726 37717 41264 623 665 0 True 487 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 532 500 0,000974568990801847 0,000913017265066993 0,000717174029144732 0,00064087891966125 0,000862853498187601 0,000829202301960984 39790 39790 623 665 0 True 532 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 575 499 0,000999404702203532 0,000977908263448734 0,00064087891966125 0,000671396963454643 0,000956438287343574 0,000980604875086585 40804 42618 623 665 0 True 576 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 619 499 0,000944124425444554 0,000909713055814175 0,000595101853971161 0,000656137941557946 0,00092759146236645 0,000897181586350516 38547 39646 623 665 0 True 620 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 664 499 0,000879659344173117 0,000971345736738275 0,000564583810177768 0,00064087891966125 0,000891434482248389 0,00100272237602469 35915 42332 623 665 0 True 664 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 267 544 0,000971972752726326 0,000954939419962128 0,000839246204318303 0,000778210116731518 0,000761897487003273 0,000783539786419131 39684 41617 623 665 0 True 266 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 310 543 0,000825652693639866 0,000876280883026977 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000655973186163507 0,000735583895238764 33710 38189 623 665 0 True 311 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 355 544 0,000925656845171505 0,000937271078818585 0,000823987182421607 0,000854505226215 0,000750448236037877 0,00070271676163387 37793 40847 623 665 0 True 355 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 399 544 0,000954925755551204 0,000939405047294363 0,000671396963454643 0,000762951094834821 0,000863378834407882 0,000791952274116084 38988 40940 623 665 0 True 399 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 443 543 0,00100927530545292 0,000946816572215616 0,000656137941557946 0,000503547722590982 0,000996759560355289 0,00106238572782482 41207 41263 623 665 0 True 443 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 487 544 0,000890142267723335 0,00101673272216935 0,000488288700694286 0,000701915007248035 0,00100523800954097 0,00109143597890807 36343 44310 623 665 0 True 487 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 531 544 0,000858522047388448 0,000889153531574416 0,000457770656900893 0,000442511635004196 0,000924032544909185 0,00100585826264159 35052 38750 623 665 0 True 532 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 576 544 0,000898886201619195 0,00095512298714284 0,000595101853971161 0,000671396963454643 0,000889002384893128 0,000876672787256531 36700 41625 623 665 0 True 576 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 620 543 0,000933421066586036 0,000959230302811274 0,000610360875867857 0,000671396963454643 0,000928213677994111 0,00091955884387419 38110 41804 623 665 0 True 620 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 664 543 0,000929747144781053 0,000922356245385723 0,00064087891966125 0,000518806744487678 0,000932785956469367 0,000995832143445662 37960 40197 623 665 0 True 664 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 267 588 0,00088409254315113 0,000843376465884326 0,000762951094834821 0,000717174029144732 0,000658940848060537 0,000614333443410552 36096 36755 623 665 0 True 266 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 311 588 0,000888305306820844 0,000961547838467765 0,000686655985351339 0,000839246204318303 0,000737241630393729 0,000764198297751723 36268 41905 623 665 0 True 310 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 355 588 0,000928424532931259 0,000921461355379752 0,000854505226215 0,000793469138628214 0,000696329694993559 0,000745650121070459 37906 40158 623 665 0 True 355 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 400 588 0,000930432943517983 0,000981694336550922 0,000793469138628214 0,000869764248111696 0,000740020869717436 0,000688576476810696 37988 42783 623 665 0 True 399 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 444 587 0,00100209891152719 0,00101342851291653 0,00064087891966125 0,00064087891966125 0,000998936197672664 0,00108966062891815 40914 44166 623 665 0 True 443 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 488 588 0,000910520287334975 0,000965723991828966 0,000579842832074464 0,000503547722590982 0,000958331163784831 0,00108851018937027 37175 42087 623 665 0 True 487 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 532 588 0,000847941152590097 0,00100700366159161 0,000396734569314107 0,000686655985351339 0,000998127274512083 0,00104597194391576 34620 43886 623 665 0 True 532 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 576 582 0,00103457638028324 0,00100041818898356 0,000747692072938125 0,000610360875867857 0,000958520244835739 0,00101296978676096 42240 43599 623 665 0 False 576 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 620 588 0,000995951215706849 0,00093504532675245 0,000793469138628214 0,000701915007248035 0,000779850773591753 0,000794274381200281 40663 40750 623 665 0 True 620 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 663 587 0,000974887397358279 0,000903701230645852 0,000747692072938125 0,000625619897764553 0,000871048604813124 0,000840611962422594 39803 39384 623 665 0 True 664 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 266 625 0,000907115786462357 0,000901337803194184 0,000717174029144732 0,000732433051041428 0,00071961837733992 0,000712483050275119 37036 39281 623 665 0 False 266 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 310 625 0,000972364637718857 0,000899525077284651 0,000869764248111696 0,00080872816052491 0,000711779788784784 0,000676721556188269 39700 39202 623 665 0 False 310 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 355 631 0,00100800167922719 0,000991905260978035 0,000900282291905089 0,000869764248111696 0,00075570571474016 0,000685442856970632 41155 43228 623 665 0 True 355 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 399 631 0,000956444309897264 0,000866024066804686 0,00080872816052491 0,000732433051041428 0,000700262308591705 0,000678646548183393 39050 37742 623 665 0 True 399 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 443 625 0,00102659172356041 0,00091776706586792 0,000732433051041428 0,000549324788281071 0,000945957224931632 0,000966926289788212 41914 39997 623 665 0 False 443 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 487 625 0,000915761749110084 0,000869557735033395 0,000549324788281071 0,000503547722590982 0,000976598233448043 0,000930673913686117 37389 37896 623 665 0 False 487 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 532 625 0,00094699008445244 0,000952346533534569 0,000518806744487678 0,000549324788281071 0,00101125539696002 0,00102285711617087 38664 41504 623 665 0 False 532 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 576 625 0,000896828805408405 0,000948262163763724 0,000656137941557946 0,000717174029144732 0,000856922023795231 0,000847193568207773 36616 41326 623 665 0 False 576 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 620 625 0,000968078395613043 0,000921140112813505 0,000793469138628214 0,000762951094834821 0,000753103577660558 0,000679965890200386 39525 40144 623 665 0 False 620 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 664 626 0,000945520515730447 0,000857901219058174 0,000762951094834821 0,000686655985351339 0,00079399019886589 0,000693133920913726 38604 37388 623 665 0 False 664 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 269 675 0,00106181238726418 0,0739885419660389 0,000915541313801785 0,0717174029144732 0,000719326207919179 0,0238655303241947 43352 3224478 623 665 0 True 266 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 310 669 0,00105713426016583 0,000947504949143286 0,000930800335698482 0,000839246204318303 0,0007731593496402 0,000657535094964714 43161 41293 623 665 0 False 310 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 355 669 0,00101027951074628 0,000943305849884496 0,000900282291905089 0,000793469138628214 0,000707305852442024 0,000697656686617096 41248 41110 623 665 0 False 355 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 399 669 0,000929330766976489 0,00096329172668453 0,000762951094834821 0,000869764248111696 0,000681292673244936 0,000673146103176571 37943 41981 623 665 0 False 399 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 443 669 0,00103957291393801 0,000997779410760823 0,000854505226215 0,000823987182421607 0,000848695931049804 0,000799096987814802 42444 43484 623 665 0 False 443 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 487 669 0,00103102492253842 0,000967949743895101 0,00080872816052491 0,000778210116731518 0,000898811074954228 0,000812905303239916 42095 42184 623 665 0 False 487 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 532 669 0,00092599974453997 0,000948262163763724 0,000610360875867857 0,000610360875867857 0,000926672644243657 0,000899412872327779 37807 41326 623 665 0 False 532 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 576 669 0,000967539553748313 0,000911892916085132 0,000839246204318303 0,000762951094834821 0,000744235455714065 0,000712642786124886 39503 39741 623 665 0 False 576 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 620 669 0,00100376442274545 0,000951772886094843 0,000823987182421607 0,000793469138628214 0,000722417509217739 0,00073286167101757 40982 41479 623 665 0 False 620 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 665 675 0,00101588836470189 0,0736568590163897 0,00080872816052491 0,070771343556878 0,000797448222977743 0,0251814892104059 41477 3210023 623 665 0 True 664 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F6_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F6_1.csv new file mode 100755 index 0000000..a39de4c --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F6_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 278 261 0,010661010786512 0,0458084786238886 0,0106660563057908 0,0469825284199283 0,00147880607609188 0,0103183458605234 435271 1996369 623 665 0 True 278 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 322 262 0,0107094085830896 0,0104820760989221 0,0107270923933776 0,0105287251087205 0,00134783378296452 0,00127217926382151 437247 456817 623 665 0 False 322 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 367 262 0,0108764985467802 0,0665757320745214 0,0109254596780346 0,066300450141146 0,00136680170892372 0,0129270004905023 444069 2901422 623 665 0 True 366 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 411 261 0,0108612395248835 0,0992155141802779 0,0108796826123445 0,0968184939345388 0,0014089387677704 0,0248090512499751 443446 4323889 623 665 0 True 410 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 455 261 0,0106154296633181 0,0801566516428402 0,0106507972838941 0,0810101472495613 0,00167231118449329 0,0191212707977126 433410 3493289 623 665 0 True 455 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 498 261 0,0107002482713892 0,0707855470674856 0,0106813153276875 0,0724650949874113 0,00162833450977543 0,0235040419244858 436873 3084889 623 665 0 True 499 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 542 261 0,0107069593018863 0,0827912078204208 0,0107270923933776 0,0807660028992142 0,00159172710173631 0,0263811388802885 437147 3608105 623 665 0 True 543 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 587 262 0,0107699303216237 0,0738932247074541 0,0107118333714809 0,0721904325932708 0,0018423494468265 0,0207541020682604 439718 3220324 623 665 0 True 587 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 631 263 0,0105214262507346 0,0102753794534402 0,0105287251087205 0,0103150988021668 0,00185895833624503 0,00183990978561981 429572 447809 623 665 0 False 631 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 675 261 0,0106900102759593 0,0464742308965364 0,0107728694590677 0,045990691996643 0,00179052867685178 0,00884014461345388 436455 2025383 623 665 0 True 676 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 278 306 0,0103340807314925 0,0104044960191736 0,0103303578240635 0,0103456168459602 0,0014582858348923 0,00150977534486727 421923 453436 623 665 0 False 278 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 322 306 0,0106321582539368 0,0103454791705746 0,0106660563057908 0,0104219119554437 0,00127212034214442 0,0012847673138004 434093 450864 623 665 0 False 322 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 367 307 0,0105923574343828 0,111959160891471 0,0106202792401007 0,108781567101549 0,0012955333281157 0,030828648939635 432468 4879267 623 665 0 True 366 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 411 306 0,0105749430450272 0,0544885445474524 0,010605020218204 0,0532692454413672 0,00152339984792091 0,00995447331452057 431757 2374653 623 665 0 True 410 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 455 306 0,0106246634534547 0,0838392616927992 0,0106507972838941 0,0780041199359121 0,00181381105113205 0,0220656043410717 433787 3653780 623 665 0 True 455 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 499 306 0,0106220672153791 0,0452394892013738 0,0106355382619974 0,0450751506828412 0,00176340014617033 0,0107602558357142 433681 1971572 623 665 0 True 499 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 543 306 0,0106484459739389 0,0498844272503185 0,0106355382619974 0,0498207064927138 0,00160227733115713 0,0147294829978911 434758 2174002 623 665 0 True 543 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 587 306 0,0108056653343802 0,0563031749664847 0,0107728694590677 0,0557564660105287 0,00188536433320937 0,0135836261667401 441177 2453736 623 665 0 True 587 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 631 306 0,0108250146558864 0,0105042418359931 0,0108186465247578 0,0105439841306172 0,00190195206253805 0,00197765108591116 441967 457783 623 665 0 False 631 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 676 306 0,0103515685992842 0,0104375610575994 0,0103761348897536 0,010406652933547 0,00185048895018636 0,00188913418718991 422637 454877 623 665 0 False 676 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 279 351 0,0106540058422705 0,0538631311627661 0,010605020218204 0,0529640650034333 0,00156569571577021 0,0109900983943552 434985 2347397 623 665 0 True 278 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 324 351 0,0106526097519846 0,0687787218102478 0,0106660563057908 0,0693980315861753 0,00140001983360071 0,0220808971984016 434928 2997430 623 665 0 True 322 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 367 350 0,0106615006427526 0,0415510738393248 0,0106507972838941 0,0423132677195392 0,00136650329952608 0,00955913114238484 435291 1810828 623 665 0 True 366 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 412 350 0,0109508342313011 0,0355399599938276 0,0108491645685512 0,0364538033112078 0,00177720247386606 0,00518859752760295 447104 1548859 623 665 0 True 410 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 456 350 0,0108495074679196 0,0729276383910107 0,0108033875028611 0,0698863202868696 0,00164206368316532 0,0147742242452278 442967 3178243 623 665 0 True 454 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 499 349 0,0105997297708048 0,0332774485997553 0,010605020218204 0,0345616845960174 0,00171381643520502 0,00634241435586419 432769 1450257 623 665 0 False 499 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 543 349 0,0104781474518719 0,0299765665020872 0,010452429999237 0,0303501945525292 0,00160584739160811 0,00394651109843007 427805 1306402 623 665 0 False 543 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 588 349 0,0105633089593114 0,0543971969291505 0,0106660563057908 0,0535439078355077 0,00199176626104792 0,0122740346486775 431282 2370672 623 665 0 True 587 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 632 350 0,0105628435958828 0,059171067976648 0,0105134660868238 0,0590218966964218 0,00201977218663654 0,0139566186647206 431263 2578721 623 665 0 True 631 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 677 349 0,0103370688545606 0,0661675475023104 0,0103456168459602 0,0658731975280385 0,00198222889299402 0,0197948842402711 422045 2883633 623 665 0 True 675 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 279 395 0,0104200260089171 0,0447433071119089 0,0104829480430304 0,0464637216754406 0,00144114609442283 0,0104297785652832 425432 1949948 623 665 0 True 278 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 324 394 0,0105045996888678 0,0356457864735081 0,0104676890211337 0,0339971007858396 0,00133044476379818 0,00742053859141141 428885 1553471 623 665 0 True 322 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 368 394 0,0106202302544766 0,0922521455848364 0,0107118333714809 0,0876173037308308 0,00135520066803977 0,0246197458635107 433606 4020420 623 665 0 True 366 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 412 394 0,0107866099266183 0,0699998106963449 0,0108339055466545 0,0684977492942702 0,001678625981536 0,0191351754445014 440399 3050646 623 665 0 True 410 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 456 393 0,0108001299588606 0,042754402600688 0,0108033875028611 0,0437170977340352 0,00159692659475654 0,00873718612378342 440951 1863270 623 665 0 True 454 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 501 394 0,0110802297572726 0,0558626596245707 0,0109864957656214 0,0554360265506981 0,00206120214069559 0,0121498904008282 452387 2434538 623 665 0 True 499 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 545 394 0,0111013425612452 0,0423052596012806 0,010955977721828 0,0429999237048905 0,00215030268711564 0,00547709085619209 453249 1843696 623 665 0 True 543 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 589 394 0,0105891488760065 0,0545257857392394 0,0105287251087205 0,0539711604486152 0,00201395541131276 0,0110926387610007 432337 2376276 623 665 0 True 587 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 633 394 0,0104845400758126 0,0440474039298292 0,010406652933547 0,0441443503471428 0,00182481625913437 0,010350156361813 428066 1919620 623 665 0 True 631 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 677 393 0,0104572305903956 0,0876430260820281 0,0105439841306172 0,0825970855268177 0,00177401229115664 0,019666229234083 426951 3819551 623 665 0 True 675 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 280 438 0,0103377546532975 0,0437593640773942 0,0103761348897536 0,0445563439383536 0,00168202607507245 0,00711280816431415 422073 1907067 623 665 0 True 278 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 324 438 0,0107643459604801 0,0666647162653716 0,0107118333714809 0,0645304036011292 0,0015041309420036 0,0137932526274032 439490 2905300 623 665 0 True 322 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 368 438 0,0108696160665989 0,0375641094037451 0,0108033875028611 0,0368657969024186 0,00150164542863418 0,00630904249964652 443788 1637073 623 665 0 True 366 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 413 438 0,0109654809328969 0,053440490675074 0,0108796826123445 0,0542915999084459 0,00171068764472012 0,00831912255712597 447702 2328978 623 665 0 True 410 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 456 437 0,011204408314281 0,0957531618012759 0,011108567940795 0,094697489890898 0,00182617706981829 0,0135619763183341 457457 4172997 623 665 0 True 454 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 501 438 0,0114407884432136 0,0650304176554914 0,0114137483787289 0,0627756160830091 0,0019482176271054 0,0170059854451463 467108 2834076 623 665 0 True 499 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 545 438 0,0110409187939592 0,0549462463666605 0,0110170138094148 0,0534523537041276 0,00181747642554103 0,0108729390892743 450782 2394600 623 665 0 True 543 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 588 438 0,010699366530156 0,0318604017482479 0,0107118333714809 0,0319981689173724 0,00197490777124877 0,00463633967635386 436837 1388501 623 665 0 True 587 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 633 437 0,0104018523423884 0,0407216714250722 0,0104371709773404 0,0408331425955596 0,00196497454851179 0,00659113592580469 424690 1774682 623 665 0 True 631 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 677 437 0,0106409266806447 0,0671954548766056 0,0106355382619974 0,0660410467689021 0,0019311337364011 0,00874649290499418 434451 2928430 623 665 0 True 675 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 279 482 0,0104807926755715 0,0541226722103955 0,0105134660868238 0,0558175020981155 0,00148893984351394 0,017134044621122 427913 2358708 623 665 0 True 278 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 323 482 0,0108347872878877 0,0569997894713896 0,0107270923933776 0,0579995422293431 0,0017761663341309 0,0111515764493347 442366 2484095 623 665 0 True 322 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 367 481 0,0115342775067444 0,0698523603584379 0,0112764171816587 0,0704356450751507 0,00225953809908154 0,0214087058779937 470925 3044220 623 665 0 True 366 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 412 481 0,0111054818464788 0,0893908609931788 0,0110780498970016 0,0855420767528801 0,00181299954098601 0,0265934692598913 453418 3895723 623 665 0 True 410 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 457 481 0,0115323670674058 0,0954519739495225 0,0114137483787289 0,0924696726939803 0,00241940143457285 0,0326477378076526 470847 4159871 623 665 0 True 454 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 500 482 0,0111356569909037 0,0482714912710937 0,011108567940795 0,0498512245365072 0,00189792157991131 0,00957004383999911 454650 2103709 623 665 0 True 499 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 544 481 0,0113532756258189 0,0415933860744789 0,011261158159762 0,0428320744640269 0,00209187154341146 0,00762486595153908 463535 1812672 623 665 0 True 543 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 588 481 0,0112317667853221 0,103853316055072 0,011261158159762 0,101213092240787 0,00202442465331626 0,0214447825749194 458574 4526008 623 665 0 True 587 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 633 481 0,0106525607663605 0,0639508590657234 0,0107423514152743 0,0649271381704433 0,00199786405927809 0,0186016445721834 434926 2787028 623 665 0 True 631 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 676 481 0,0104875771845047 0,073370425376786 0,0105897611963073 0,0703135728999771 0,00196354100159456 0,0153425643275979 428190 3197540 623 665 0 True 675 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 280 526 0,0101267000920072 0,0550877766629896 0,0101625085831998 0,0577096208133059 0,00158348186397757 0,0150297088839616 413456 2400768 623 665 0 True 278 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 324 526 0,0106237327265974 0,11064103380447 0,010605020218204 0,106385900663767 0,00156361662025397 0,032777885587772 433749 4821822 623 665 0 True 322 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 367 525 0,0111790337610146 0,0579082405028364 0,0110475318532082 0,0599984740978103 0,00170809578149823 0,0157925430246967 456421 2523686 623 665 0 True 366 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 412 525 0,0115869860382399 0,0584705067773577 0,0115358205539025 0,057953765163653 0,00205172945446761 0,0124517076797873 473077 2548190 623 665 0 True 410 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 457 526 0,0112303706950362 0,0590750852870331 0,0112153810940719 0,0578622110322728 0,00197725125224711 0,0104319858641431 458517 2574538 623 665 0 True 454 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 501 526 0,0111848385574664 0,0620667025769964 0,011261158159762 0,062729839017319 0,00199238868325196 0,013577444681993 456658 2704915 623 665 0 True 499 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 544 525 0,0109024854203475 0,0745187757675259 0,0109102006561379 0,072281986724651 0,00180996951837394 0,0215906363523863 445130 3247586 623 665 0 True 543 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 589 526 0,010896950044828 0,0565630143107827 0,0108644235904479 0,0573586633096818 0,00174624238391516 0,0128389793128273 444904 2465060 623 665 0 True 587 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 632 525 0,0106832012742141 0,0422735942626078 0,010605020218204 0,0425421530479896 0,00193796737601513 0,00636609385509789 436177 1842316 623 665 0 True 631 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 677 525 0,010545306742467 0,0674495577465064 0,0105134660868238 0,0674296177615015 0,00197483208983529 0,0170061441330348 430547 2939504 623 665 0 True 675 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 280 570 0,0102308435287725 0,0466872147179576 0,01025406271458 0,04785229266804 0,00136054431495601 0,0124117367702 417708 2034665 623 665 0 True 277 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 324 570 0,0103868872342362 0,0534178660200513 0,0103761348897536 0,055390249485008 0,00153558551674006 0,0135092125521741 424079 2327992 623 665 0 True 322 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 368 570 0,0107781599064669 0,0517637192087566 0,0107728694590677 0,0513771267261769 0,00143008141067658 0,0129247770862773 440054 2255903 623 665 0 True 366 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 412 570 0,0110638930516464 0,050787646617115 0,0110017547875181 0,0504921034561685 0,00169824934979375 0,0101009722962282 451720 2213365 623 665 0 True 410 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 457 569 0,0110699182834066 0,0888811867159315 0,0111238269626917 0,0827954528114748 0,00206560249370026 0,0255294391799735 451966 3873511 623 665 0 True 454 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 500 570 0,010893276123023 0,0621736763515564 0,0107728694590677 0,0614328221560998 0,00213873406142143 0,0152018307010987 444754 2709577 623 665 0 True 498 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 545 570 0,0109656768753932 0,0553997031948147 0,0110475318532082 0,0549782558937972 0,00188285397528392 0,00836867291375596 447710 2414362 623 665 0 True 543 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 589 569 0,0106272841843422 0,0384503717522233 0,0106202792401007 0,0394445716029602 0,00180020241765952 0,00814451133080802 433894 1675697 623 665 0 True 587 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 633 569 0,0103969047943577 0,0507300065223714 0,0103913939116503 0,0499732967116808 0,00164011426235102 0,00974366928453432 424488 2210853 623 665 0 True 631 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 677 569 0,0104676155426976 0,0545283097879742 0,0104829480430304 0,0534523537041276 0,00160339070265034 0,00860974069468702 427375 2376386 623 665 0 True 675 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 277 609 0,0100846704265582 0,00998291104277058 0,0100862134737163 0,0100556954299229 0,00150887340733313 0,00141669506747429 411740 435063 623 665 0 False 277 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 322 609 0,00997506509270958 0,0101333443473642 0,00991836423285267 0,0101930266269932 0,00146579432956287 0,00134220317026065 407265 441619 623 665 0 False 322 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 368 613 0,0105140539143126 0,0795810079100245 0,0105439841306172 0,0740520332646677 0,00148481552409885 0,0222853546650745 429271 3468202 623 665 0 True 366 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 412 613 0,0107014729119908 0,0766043513452893 0,0107270923933776 0,07348744945449 0,00160733358252571 0,0245861057658321 436923 3338477 623 665 0 True 410 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 454 609 0,0106519239532476 0,0105714274241337 0,0106507972838941 0,0106202792401007 0,00195355187160382 0,00190494171340426 434900 460711 623 665 0 False 454 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 498 609 0,0104912755991217 0,0103551852852548 0,0105592431525139 0,0104219119554437 0,00199097451124848 0,0020218958410617 428341 451287 623 665 0 False 498 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 543 609 0,0103065753035792 0,0104314345029431 0,0102388036926833 0,0105745021744106 0,00193875906740345 0,00205056288993076 420800 454610 623 665 0 False 543 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 587 609 0,0103774085159793 0,0103920593426803 0,0103913939116503 0,0104219119554437 0,0016512103235877 0,00166296251207982 423692 452894 623 665 0 False 587 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 631 609 0,0102896262776522 0,0100958507507037 0,0103150988021668 0,0100709544518196 0,0015039048482231 0,00137274059292006 420108 439985 623 665 0 False 631 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 675 609 0,0102201891555381 0,0103733584361453 0,0102082856488899 0,0103303578240635 0,00157966855942493 0,00172563776422042 417273 452079 623 665 0 False 675 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 280 659 0,00985509929937086 0,0447649909851305 0,00985732814526589 0,044785229266804 0,00140370351245598 0,00898374470112595 402367 1950893 623 665 0 True 277 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 322 652 0,00977397910591684 0,00999298429181216 0,00978103303578241 0,00996414129854276 0,00128026069667888 0,00132250364630475 399055 435502 623 665 0 False 322 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 366 652 0,010278433062553 0,00991159519306391 0,0100556954299229 0,00988784618905928 0,00197930019339852 0,001293056986506 419651 431955 623 665 0 False 366 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 410 652 0,0103800292468668 0,010220951784359 0,0103761348897536 0,0102693217364767 0,0016571028650502 0,00145077670400128 423799 445437 623 665 0 False 410 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 454 652 0,0100781063529333 0,0103343963020391 0,0100556954299229 0,0104219119554437 0,00170663750057605 0,00160791444075821 411472 450381 623 665 0 False 454 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 498 652 0,0100337743631532 0,0101384842284241 0,0100404364080262 0,0102693217364767 0,00172121907324441 0,00168033901378525 409662 441843 623 665 0 False 498 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 543 652 0,0100491558491101 0,0100943363214628 0,00999465934233616 0,0101167315175097 0,00175273164070873 0,00176558541388534 410290 439919 623 665 0 False 543 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 587 652 0,00995630359869213 0,00997740402734922 0,00999465934233616 0,0100099183642329 0,00134522425820209 0,00118675146521795 406499 434823 623 665 0 False 587 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 631 653 0,0100978475594321 0,00987015490201815 0,010101472495613 0,00987258716716258 0,00134169865724342 0,00137969510321358 412278 430149 623 665 0 False 631 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 676 658 0,0103007949999394 0,0447932373850626 0,0102998397802701 0,0454718852521553 0,00142762996625784 0,00946904987211879 420564 1952124 623 665 0 True 675 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F6_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F6_2.csv new file mode 100755 index 0000000..16d8edd --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F6_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 278 261 0,00895104511441266 0,73624792124509 0,00877393759060044 0,770840009155413 0,00188890650691431 0,218886550708606 365456 32086255 623 665 14 True 278 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 322 262 0,00741693783271189 0,00696352921672458 0,00733958953231098 0,00689707789730678 0,00141558711984801 0,00131633958589755 302821 303476 623 665 0 False 322 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 367 262 0,00659040339783883 0,00666403936139272 0,00654612039368277 0,00669871061264973 0,00127278994791079 0,00122624720102442 269075 290424 623 665 0 True 366 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 411 261 0,00684578994890922 0,00701639656476967 0,00686655985351339 0,00704966811627375 0,00144876050835567 0,00135081541822288 279502 305780 623 665 0 True 410 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 455 261 0,00722596737728887 0,00698216128556686 0,00718699931334401 0,00691233691920348 0,00177926875768765 0,00163286817423973 295024 304288 623 665 0 True 455 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 498 261 0,00715799982389668 0,0069327587680577 0,0072480354009308 0,00691233691920348 0,00160797428259973 0,00149772009533449 292249 302135 623 665 0 True 499 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 542 261 0,00720713240483532 0,00748153285479664 0,00718699931334401 0,00750743877317464 0,00155204493040828 0,00148696367334094 294255 326051 623 665 0 True 543 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 587 262 0,0076102595980901 0,00759789150147055 0,00759899290455482 0,00756847486076143 0,00184123698628347 0,00175456458310103 310714 331122 623 665 0 True 587 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 631 263 0,00811517891815494 0,00793994599683002 0,00814831769283589 0,00793469138628214 0,00180750494784885 0,00172441050880321 331329 346029 623 665 0 False 631 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 675 261 0,00959393244466063 0,755129779128526 0,00947585259784848 0,756328679331655 0,00202788152253366 0,180917173217746 391704 32909141 623 665 15 True 676 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 278 306 0,00720203789993241 0,00684884562057467 0,00721751735713741 0,0068207827878233 0,0015296343554101 0,00140507848728487 294047 298478 623 665 0 False 278 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 322 306 0,00666121211742687 0,0064190230669372 0,00666819256885634 0,00648508430609598 0,00128747707162621 0,00127193526278597 271966 279746 623 665 0 False 322 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 367 307 0,0065828596117326 0,00650722709726938 0,00660715648126955 0,00653086137178607 0,00128667531670645 0,00119064205002515 268767 283590 623 665 0 True 366 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 411 306 0,00657301350129524 0,00651872299196148 0,00656137941557946 0,00659189745937285 0,00147908973108675 0,00148907290299765 268365 284091 623 665 0 True 410 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 455 306 0,00684013210932955 0,00696545667212205 0,0068207827878233 0,00695811398489357 0,0017947327241295 0,00172015308385413 279271 303560 623 665 0 True 455 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 499 306 0,00690317660750306 0,00703167853256396 0,00695811398489357 0,00694285496299687 0,0017115513853878 0,00167848007050527 281845 306446 623 665 0 True 499 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 543 306 0,00715278285493361 0,00725023820709935 0,00717174029144732 0,00729381246662089 0,00144376827518806 0,00146228338477136 292036 315971 623 665 0 True 543 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 587 306 0,00754481480433733 0,00768191937844153 0,00755321583886473 0,00764476997024491 0,00171899188366017 0,00201085379187937 308042 334784 623 665 0 True 587 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 631 306 0,00782557590867414 0,00772494293642093 0,00784313725490196 0,00775158312352178 0,0019242345248705 0,00192829534490197 319505 336659 623 665 0 False 631 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 676 306 0,00783427085694594 0,00786066792065997 0,00778210116731518 0,00785839627679866 0,00186591340285312 0,00189770263720946 319860 342574 623 665 0 False 676 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 279 351 0,00641270804653781 0,00638866564442693 0,00645456626230259 0,00631723506523232 0,00132978266805529 0,00137291117678115 261820 278423 623 665 0 True 278 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 324 351 0,00644236884191004 0,00641617777563616 0,00645456626230259 0,0063782711528191 0,00129248511035036 0,00123405792502668 263031 279622 623 665 0 True 322 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 367 350 0,00656191825744419 0,00668606742307818 0,00657663843747616 0,00668345159075303 0,00133646980078036 0,00122402128052233 267912 291384 623 665 0 True 366 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 412 350 0,00710627100488252 0,00697876529272368 0,00709544518196384 0,00695811398489357 0,00153454673969839 0,00151449998733525 290137 304140 623 665 0 True 410 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 456 350 0,00709723315724226 0,00726361566539374 0,00708018616006714 0,00715648126955062 0,0015848609688715 0,00200931730935918 289768 316554 623 665 0 True 454 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 499 349 0,00682636714896688 0,00713039178399191 0,00691233691920348 0,00701915007248035 0,00164585284687808 0,00171805027492682 278709 310748 623 665 0 False 499 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 543 349 0,00715077444434688 0,00735046588776817 0,00708018616006714 0,00727855344472419 0,00156511680210555 0,00162204787403318 291954 320339 623 665 0 False 543 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 588 349 0,00736425379402843 0,00745117543228637 0,00744640268558785 0,00750743877317464 0,00192541209623378 0,0020610736465933 300670 324728 623 665 0 True 587 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 632 350 0,00725207671491628 0,00733876347999777 0,0072480354009308 0,00738536659800107 0,00192428031146611 0,00193653689385645 296090 319829 623 665 0 True 631 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 677 349 0,00663762553943888 0,00670697113578178 0,00663767452506294 0,00671396963454643 0,00177527268467905 0,00204940002268234 271003 292295 623 665 0 True 675 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 279 395 0,00643090620587849 0,00658370577393358 0,00646982528419928 0,00662241550316625 0,00134061426778053 0,00133375454399719 262563 286923 623 665 0 True 278 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 324 394 0,00661259388554093 0,00688395284388587 0,00657663843747616 0,00689707789730678 0,00131560821286256 0,00129101422591887 269981 300008 623 665 0 True 322 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 368 394 0,00679594707642161 0,00712756943858846 0,00679026474402991 0,00712596322575723 0,00137710089892744 0,00137691162420526 277467 310625 623 665 0 True 366 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 412 394 0,00694011176804915 0,0071147426818362 0,00692759594110018 0,00714122224765393 0,00146452722845319 0,00149774213415636 283353 310066 623 665 0 True 410 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 456 393 0,0069083690836541 0,00734702400312982 0,00697337300679027 0,00727855344472419 0,00153901876870366 0,00160302763166651 282057 320189 623 665 0 True 454 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 501 394 0,00725624049296193 0,00734812540621409 0,0072327763790341 0,00744640268558785 0,00187134168110112 0,00179645002966673 296260 320237 623 665 0 True 499 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 545 394 0,00746202909966505 0,00733963542410616 0,00746166170748455 0,00733958953231098 0,00177095809655328 0,00149527573358321 304662 319867 623 665 0 True 543 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 589 394 0,00707580194671319 0,00709691371940953 0,00709544518196384 0,00709544518196384 0,00183932565937408 0,00197599421755505 288893 309289 623 665 0 True 587 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 633 394 0,00675852205963485 0,00660176419533613 0,00666819256885634 0,00654612039368277 0,00180277028292582 0,00177440800382887 275939 287710 623 665 0 True 631 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 677 393 0,00614323812854832 0,00612855094935783 0,00622568093385214 0,00602731364919509 0,00184906935595219 0,00187592998669918 250818 267087 623 665 0 True 675 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 280 438 0,00644072782350382 0,00665284176336928 0,00642404821850919 0,00662241550316625 0,00157909989510806 0,001456612440293 262964 289936 623 665 0 True 278 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 324 438 0,00676555149668839 0,00692534724313645 0,0068207827878233 0,00675974670023652 0,00140584401423598 0,0022993378465509 276226 301812 623 665 0 True 322 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 368 438 0,00711572523032734 0,00694127169606323 0,00712596322575723 0,00700389105058366 0,00133025652443778 0,0013591166599039 290523 302506 623 665 0 True 366 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 413 438 0,00715824475201701 0,00729314703559081 0,00715648126955062 0,00721751735713741 0,00156114733292823 0,00191607594392701 292259 317841 623 665 0 True 410 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 456 437 0,00729917639245616 0,00737123192508623 0,00730907148851759 0,00738536659800107 0,00171593075171564 0,00173567368098326 298013 321244 623 665 0 True 454 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 501 438 0,00735609768762137 0,00761044290745174 0,00732433051041428 0,00752269779507134 0,00190528508177575 0,00231005580077691 300337 331669 623 665 0 True 499 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 545 438 0,00704266317203225 0,0072380080436844 0,00703440909437705 0,00727855344472419 0,00176397571088098 0,00171463154036029 287540 315438 623 665 0 True 543 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 588 438 0,0064592198965889 0,00661284706387163 0,0063782711528191 0,00665293354695964 0,00177760502087206 0,00187101828880629 263719 288193 623 665 0 True 587 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 633 437 0,00625056563087789 0,00612990475731558 0,00628671702143893 0,00608834973678187 0,00170877087497279 0,00178035494435331 255200 267146 623 665 0 True 631 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 677 437 0,00600120431156767 0,00630693235721485 0,00599679560540169 0,00627145799954223 0,00176030559121 0,00186613935176455 245019 274861 623 665 0 True 675 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 279 482 0,00658072873708571 0,00659251699860776 0,00665293354695964 0,00662241550316625 0,0013630347356845 0,00149446554828002 268680 287307 623 665 0 True 278 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 323 482 0,00684010761651751 0,00665118965874287 0,00677500572213321 0,00677500572213321 0,00162369271142954 0,00150789391629941 279270 289864 623 665 0 True 322 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 367 481 0,00716706216434897 0,0069515744040807 0,00695811398489357 0,00700389105058366 0,00171297701357382 0,00142210923529587 292619 302955 623 665 0 True 366 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 412 481 0,00722616331978513 0,00717949600483241 0,0072632944228275 0,0072327763790341 0,00166415329645911 0,00166862925654606 295032 312888 623 665 0 True 410 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 457 481 0,00748566466327711 0,00759892406686205 0,00749217975127794 0,00762951094834821 0,0020511206068208 0,00185703004810803 305627 331167 623 665 0 True 454 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 500 482 0,00685382359125612 0,00678870442299385 0,0068207827878233 0,00675974670023652 0,00174400663239508 0,00187380690293338 279830 295857 623 665 0 True 499 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 544 481 0,00654168719470475 0,00670788897168534 0,00657663843747616 0,00650034332799268 0,00172973672900936 0,00265851535360679 267086 292335 623 665 0 True 543 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 588 481 0,00634131149946097 0,00651677259066641 0,00636301213092241 0,00648508430609598 0,0018330942168664 0,00201133985158585 258905 284006 623 665 0 True 587 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 633 481 0,0060679472243582 0,00610645404997961 0,00608834973678187 0,00616464484626535 0,00171025401762828 0,00169743178637886 247744 266124 623 665 0 True 631 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 676 481 0,00617960995441765 0,00628368816295718 0,00619516289005875 0,00625619897764553 0,00180121204996586 0,00186163187365316 252303 273848 623 665 0 True 675 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 280 526 0,00668318216982067 0,00688500835517496 0,00671396963454643 0,00691233691920348 0,00145332236550411 0,00149082476959232 272863 300054 623 665 0 True 278 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 324 526 0,00660737691657785 0,00667289647786209 0,00665293354695964 0,00668345159075303 0,00141580924971395 0,00140619666031559 269768 290810 623 665 0 True 322 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 367 525 0,0067275876380369 0,00680088869461362 0,00666819256885634 0,00679026474402991 0,00148576449309759 0,00145044202699766 274676 296388 623 665 0 True 366 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 412 525 0,0069074873424209 0,00707807513748895 0,00700389105058366 0,00709544518196384 0,00170527242126271 0,00174254178966541 282021 308468 623 665 0 True 410 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 457 526 0,00684507965736026 0,00650768601522116 0,00686655985351339 0,00653086137178607 0,00176663372832968 0,00188928796205044 279473 283610 623 665 0 True 454 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 501 526 0,00634794905152198 0,00631964438447916 0,00645456626230259 0,00633249408712902 0,00185594366203535 0,00176729766497606 259176 275415 623 665 0 True 499 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 544 525 0,00625749709668329 0,00643143679753286 0,00636301213092241 0,00648508430609598 0,00162580467401723 0,00161086891626288 255483 280287 623 665 0 True 543 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 589 526 0,00623626182865049 0,0062391272298393 0,00617990386816205 0,00627145799954223 0,00162379521444748 0,00158706663837034 254616 271906 623 665 0 True 587 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 632 525 0,0060682411381026 0,00637024008866295 0,00602731364919509 0,00624093995574884 0,00170932719738826 0,00221826456558192 247756 277620 623 665 0 True 631 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 677 525 0,00642666894939675 0,00636021273141655 0,00643930724040589 0,00628671702143893 0,00177622027414087 0,00177527913622852 262390 277183 623 665 0 True 675 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 280 570 0,00679665736797058 0,00683673018664767 0,00675974670023652 0,00683604180972 0,00136728352991704 0,00130991896335655 277496 297950 623 665 0 True 277 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 324 570 0,00666799662636007 0,00688152057874143 0,00669871061264973 0,00683604180972 0,00148748131365786 0,00141199728673157 272243 299902 623 665 0 True 322 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 368 570 0,00652520353220639 0,00668368104972892 0,00653086137178607 0,00671396963454643 0,00138345040565195 0,00115601210245949 266413 291280 623 665 0 True 366 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 412 570 0,00654582647993837 0,00660020387430008 0,00653086137178607 0,00657663843747616 0,00150307035212194 0,00161846442944634 267255 287642 623 665 0 True 410 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 457 569 0,00643127359805899 0,00661470568157634 0,0063935301747158 0,00675974670023652 0,00186881541433803 0,00181177378871594 262578 288274 623 665 0 True 454 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 500 570 0,00635216181519169 0,00640341985657667 0,00630197604333562 0,00642404821850919 0,00194616586489146 0,00205586919654766 259348 279066 623 665 0 True 498 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 545 570 0,00631062200598335 0,00648139001658415 0,0063935301747158 0,0064087891966125 0,00186570181031364 0,00169292817776098 257652 282464 623 665 0 True 543 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 589 569 0,00651920279325826 0,00641131324534729 0,00650034332799268 0,00633249408712902 0,00158054647751076 0,0014579732631176 266168 279410 623 665 0 True 587 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 633 569 0,00630092285241819 0,00646314802800088 0,00627145799954223 0,0064087891966125 0,00158428070524496 0,00159077747489266 257256 281669 623 665 0 True 631 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 677 569 0,00632355421073689 0,00620000447445003 0,00642404821850919 0,00625619897764553 0,0016318922405875 0,00173970219716677 258180 270201 623 665 0 True 675 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 277 609 0,00705483609961276 0,00698115166607294 0,00712596322575723 0,00701915007248035 0,00131268501131142 0,00139707717995328 288037 304244 623 665 0 False 277 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 322 609 0,00663417205294219 0,00663381961426799 0,00663767452506294 0,00657663843747616 0,00137235399164962 0,00134674154042815 270862 289107 623 665 0 False 322 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 368 613 0,00641067514313905 0,00654534023316474 0,00643930724040589 0,00659189745937285 0,00131850016492377 0,00132438695986747 261737 285251 623 665 0 True 366 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 412 613 0,00626624103057915 0,00625546470892269 0,00631723506523232 0,00631723506523232 0,00143905704171465 0,0014763070953199 255840 272618 623 665 0 True 410 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 454 609 0,00637143765826184 0,00633226462815312 0,00645456626230259 0,00634775310902571 0,00180192570930305 0,00182850435618035 260135 275965 623 665 0 False 454 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 498 609 0,00631740651491655 0,00635979970525995 0,0063935301747158 0,0063935301747158 0,00185812174225866 0,00193174895562446 257929 277165 623 665 0 False 498 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 543 609 0,00642365633351666 0,00630365109385962 0,00648508430609598 0,00631723506523232 0,00183903893499743 0,00185974215915125 262267 274718 623 665 0 False 543 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 587 609 0,00639766945994942 0,00643618659833378 0,00634775310902571 0,00643930724040589 0,00162356603869315 0,00161377756706492 261206 280494 623 665 0 False 587 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 631 609 0,00630917693007339 0,00638868859032452 0,00634775310902571 0,00634775310902571 0,00143663595435436 0,00142816546677406 257593 278424 623 665 0 False 631 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 675 609 0,00660198849793054 0,00641218518945567 0,00665293354695964 0,0064087891966125 0,00143969050978403 0,00156275403061728 269548 279448 623 665 0 False 675 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 280 659 0,00883350410946523 0,747487946233173 0,00865186541542687 0,755489433127337 0,00197413523489822 0,19209038167073 360657 32576104 623 665 15 True 277 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 322 652 0,00729170608478603 0,00666107934060374 0,00697337300679027 0,00665293354695964 0,00190478435318148 0,0011744183753345 297708 290295 623 665 0 False 322 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 366 652 0,00627226626233933 0,00621898073175615 0,00627145799954223 0,00625619897764553 0,00118316906500763 0,00125419489729136 256086 271028 623 665 0 False 366 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 410 652 0,00606491011566608 0,00597536413705355 0,00610360875867857 0,00602731364919509 0,00139027555277983 0,00128137646909001 247620 260411 623 665 0 False 410 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 454 652 0,00595870928269004 0,00595413918178371 0,00593575951781491 0,00604257267109178 0,00152075660449101 0,00161449946244839 243284 259486 623 665 0 False 454 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 498 652 0,00618516982274919 0,00623758985470084 0,00613412680247196 0,00633249408712902 0,00161251170571037 0,00159657124306066 252530 271839 623 665 0 False 498 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 543 652 0,00629526501283852 0,00629369257430599 0,00628671702143893 0,00627145799954223 0,00164548254768223 0,00161428245512447 257025 274284 623 665 0 False 543 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 587 652 0,0064798673371329 0,00636487074862712 0,00650034332799268 0,00642404821850919 0,0013748829903808 0,00116645384383296 264562 277386 623 665 0 False 587 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 631 653 0,0065246157047176 0,00641305713356405 0,00642404821850919 0,0063935301747158 0,00140185410741213 0,00134386335039419 266389 279486 623 665 0 False 631 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 676 658 0,0086457667052306 0,751950992151929 0,00834668497749294 0,77441062027924 0,00240024444096839 0,207605413702575 352992 32770607 623 665 16 True 675 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F6_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F6_3.csv new file mode 100755 index 0000000..c7fef6b --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F6_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 278 261 0,000977336678561601 0,0735217765172831 0,00080872816052491 0,0745708400091554 0,000755711316740108 0,0247733897484709 39903 3204136 623 665 0 True 278 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 322 262 0,000894477495453216 0,000896358543417367 0,000778210116731518 0,000778210116731518 0,000679270558121987 0,000659800139865919 36520 39064 623 665 0 False 322 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 367 262 0,000878091804202991 0,00088018168561711 0,000793469138628214 0,000762951094834821 0,000608123166073102 0,000634319442546547 35851 38359 623 665 0 True 366 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 411 261 0,000919337699666934 0,000976347942412681 0,000778210116731518 0,00080872816052491 0,000687710933977763 0,000753691268221486 37535 42550 623 665 0 True 410 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 455 261 0,000988382936788583 0,000962970484118284 0,000762951094834821 0,000747692072938125 0,000865918126333208 0,000868247531191107 40354 41967 623 665 0 True 455 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 498 261 0,000966829262199349 0,000917698228175153 0,000747692072938125 0,000747692072938125 0,000868587526411844 0,000776869486829312 39474 39994 623 665 0 True 499 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 542 261 0,000959260983281084 0,000945095629896439 0,00080872816052491 0,000778210116731518 0,000779658089577453 0,000751200265735252 39165 41188 623 665 0 True 543 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 587 262 0,00103193115658365 0,0010222626834883 0,000747692072938125 0,000671396963454643 0,000949615903597352 0,00100703077321164 42132 44551 623 665 0 True 587 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 631 263 0,000951031398437922 0,000966435314654225 0,000579842832074464 0,00064087891966125 0,000992520827932159 0,00091895355335192 38829 42118 623 665 0 False 631 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 675 261 0,00107712039478494 0,0756682963990429 0,000778210116731518 0,0737621118486305 0,000959531037540241 0,0218519466089725 43977 3297683 623 665 0 True 676 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 278 306 0,000898910694431229 0,000958518979986014 0,000762951094834821 0,000839246204318303 0,000715179512278733 0,000722615635780285 36701 41773 623 665 0 False 278 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 322 306 0,000774952572731099 0,00088789150720702 0,000656137941557946 0,000793469138628214 0,000600336498270079 0,000611781153082685 31640 38695 623 665 0 False 322 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 367 307 0,000832192274452736 0,000872219459153721 0,000671396963454643 0,000762951094834821 0,000673415383468541 0,000626450654637278 33977 38012 623 665 0 True 366 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 411 306 0,000959824317957848 0,000921920273331532 0,000778210116731518 0,000717174029144732 0,000738770960975167 0,000792432317919039 39188 40178 623 665 0 True 410 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 455 306 0,000955978946468633 0,00102409835529543 0,00064087891966125 0,000793469138628214 0,000932554680033658 0,000950699576657258 39031 44631 623 665 0 True 455 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 499 306 0,000990464825811407 0,000891952931080276 0,000823987182421607 0,00064087891966125 0,000873621683951124 0,000819721557784315 40439 38872 623 665 0 True 499 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 543 306 0,000989607577390244 0,000901750829350786 0,000854505226215 0,000717174029144732 0,000815937742447682 0,000769470585836426 40404 39299 623 665 0 True 543 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 587 306 0,000971458403673628 0,000999087326923397 0,000656137941557946 0,000610360875867857 0,000947476683758929 0,00107261261914694 39663 43541 623 665 0 True 587 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 631 306 0,00102012562118364 0,000963911265919434 0,000625619897764553 0,000503547722590982 0,00107969042818387 0,00106959280945291 41650 42008 623 665 0 False 631 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 676 306 0,000921272631817559 0,000982956360918318 0,000549324788281071 0,000610360875867857 0,000976783675890795 0,000979366683723794 37614 42838 623 665 0 False 676 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 279 351 0,000956395324273197 0,000957279901516208 0,000823987182421607 0,00080872816052491 0,000756174738624904 0,000768056779069485 39048 41719 623 665 0 True 278 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 324 351 0,000834861990964357 0,000916550933295702 0,000717174029144732 0,000793469138628214 0,000644126361077462 0,000687526889874916 34086 39944 623 665 0 True 322 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 367 350 0,000910912172327507 0,000864624367051756 0,000854505226215 0,000747692072938125 0,000665863742967562 0,000623752770673019 37191 37681 623 665 0 True 366 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 412 350 0,000879242966368552 0,000904412553471112 0,000656137941557946 0,000656137941557946 0,000768159738477054 0,000780545357413392 35898 39415 623 665 0 True 410 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 456 350 0,000944491817625052 0,000955467175606675 0,000701915007248035 0,000686655985351339 0,000875630138802091 0,000870156699076481 38562 41640 623 665 0 True 454 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 499 349 0,000935135563428362 0,000866551822449234 0,000701915007248035 0,000625619897764553 0,000850550262589746 0,000803636222256372 38180 37765 623 665 0 False 499 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 543 349 0,00095945692577735 0,000957784711263166 0,000701915007248035 0,000762951094834821 0,000885784063208322 0,000853829353199141 39173 41741 623 665 0 False 543 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 588 349 0,00106102861727912 0,00102024344450047 0,000732433051041428 0,000564583810177768 0,00107733494659034 0,00108833884390932 43320 44463 623 665 0 True 587 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 632 350 0,000934915128120063 0,000950740320703338 0,000534065766384375 0,000518806744487678 0,00104381839720664 0,00103827995779094 38171 41434 623 665 0 True 631 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 677 349 0,000872850342427882 0,000957073388437906 0,000457770656900893 0,000595101853971161 0,000967898715099144 0,00101843803494765 35637 41710 623 665 0 True 675 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 279 395 0,000854333776530767 0,000859025568040036 0,000656137941557946 0,000747692072938125 0,000764931687787948 0,000728696878770617 34881 37437 623 665 0 True 278 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 324 394 0,000851149710966448 0,000947000139396328 0,000762951094834821 0,000854505226215 0,0006743853587243 0,000683443559303684 34751 41271 623 665 0 True 322 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 368 394 0,000930971785382714 0,000947619678631231 0,00080872816052491 0,000778210116731518 0,000678201796367162 0,000716746240463568 38010 41298 623 665 0 True 366 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 412 394 0,000909075211425015 0,000886147618990254 0,000732433051041428 0,000686655985351339 0,000770863404258595 0,000778157561984259 37116 38619 623 665 0 True 410 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 456 393 0,000986105105269494 0,0010448414467159 0,000747692072938125 0,00080872816052491 0,000844849956476908 0,000886546632639177 40261 45535 623 665 0 True 454 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 501 394 0,00100545442677574 0,00106271630093774 0,000686655985351339 0,000823987182421607 0,000933232144967592 0,000937585504865647 41051 46314 623 665 0 True 499 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 545 394 0,00103151477877908 0,000942410959878524 0,000793469138628214 0,000762951094834821 0,000878709788909174 0,00078361825096401 42115 41071 623 665 0 True 543 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 589 394 0,000992081351405599 0,000966412368756636 0,00064087891966125 0,000549324788281071 0,00101675639504813 0,00105158956712807 40505 42117 623 665 0 True 587 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 633 394 0,000931902512239977 0,000862215047804909 0,000595101853971161 0,000503547722590982 0,000953644584432585 0,000945514093200542 38048 37576 623 665 0 True 631 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 677 393 0,000842846647687187 0,000922884001030271 0,000503547722590982 0,000457770656900893 0,000868447797608377 0,00100919975227253 34412 40220 623 665 0 True 675 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 280 438 0,000926856992961133 0,00100640706825429 0,000762951094834821 0,000869764248111696 0,000764838965754972 0,000811758193315323 37842 43860 623 665 0 True 278 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 324 438 0,00091884784342627 0,000927381396957718 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,000731604865168327 0,000768937054765037 37515 40416 623 665 0 True 322 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 368 438 0,000827783568286756 0,000898653133176269 0,000671396963454643 0,000793469138628214 0,000714506500627435 0,000684291653820552 33797 39164 623 665 0 True 366 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 413 438 0,000957399529566559 0,000946770680420438 0,000686655985351339 0,000686655985351339 0,000911341964863925 0,000855831280438459 39089 41261 623 665 0 True 410 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 456 437 0,000990219897691075 0,0010093211972481 0,000671396963454643 0,000686655985351339 0,000948392976796899 0,00100061232662839 40429 43987 623 665 0 True 454 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 501 438 0,000967172161567814 0,00100663652723018 0,000671396963454643 0,000701915007248035 0,000925829943259398 0,000949762940784815 39488 43870 623 665 0 True 499 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 545 438 0,000964428966620094 0,000852807229793412 0,000747692072938125 0,000610360875867857 0,000879503006945192 0,000835091215100123 39376 37166 623 665 0 True 543 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 588 438 0,000973515799884418 0,00084236684639041 0,00064087891966125 0,000457770656900893 0,000963279481876581 0,000926562471596984 39747 36711 623 665 0 True 587 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 633 437 0,000894722423573548 0,00094507268399885 0,000534065766384375 0,000625619897764553 0,000910912777880817 0,000971195061156482 36530 41187 623 665 0 True 631 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 677 437 0,000907238250522524 0,000945669277336165 0,000564583810177768 0,000473029678797589 0,000928034870970654 0,000995810029576626 37041 41213 623 665 0 True 675 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 279 482 0,000992522222022198 0,000839383879703837 0,00080872816052491 0,000686655985351339 0,000798795110779995 0,000749259401810933 40523 36581 623 665 0 True 278 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 323 482 0,000852104930635744 0,000924375484373557 0,000686655985351339 0,000793469138628214 0,000724107309291601 0,000793286456176891 34790 40285 623 665 0 True 322 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 367 481 0,000899008665679361 0,000964484913359159 0,000778210116731518 0,000793469138628214 0,000772860619895188 0,000813378514178685 36705 42033 623 665 0 True 366 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 412 481 0,00093253932535284 0,000966045234395212 0,00064087891966125 0,000747692072938125 0,00091796349175318 0,000880219323705338 38074 42101 623 665 0 True 410 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 457 481 0,00108437026714677 0,0011075066930315 0,000762951094834821 0,000778210116731518 0,00106051782428556 0,00106324104702427 44273 48266 623 665 0 True 454 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 500 482 0,000956689238017596 0,000972217680846658 0,000610360875867857 0,000579842832074464 0,000963197176078806 0,000992322530254248 39060 42370 623 665 0 True 499 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 544 481 0,000974715947674046 0,000895693112387285 0,000747692072938125 0,000595101853971161 0,000885396227241296 0,000884284707180629 39796 39035 623 665 0 True 543 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 588 481 0,000913704352899294 0,000945921682209644 0,000549324788281071 0,000564583810177768 0,000943476179083122 0,000978928666841966 37305 41224 623 665 0 True 587 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 633 481 0,000899400550671893 0,000910630891717736 0,000503547722590982 0,000534065766384375 0,00095738739461682 0,000941396722054871 36721 39686 623 665 0 True 631 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 676 481 0,000833123001309998 0,000906064658097521 0,000457770656900893 0,000549324788281071 0,000906579142158824 0,000944753594576031 34015 39487 623 665 0 True 675 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 280 526 0,000839785046183034 0,000919006144337727 0,000671396963454643 0,00080872816052491 0,000725741774063176 0,000737053242587542 34287 40051 623 665 0 True 278 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 324 526 0,000866947574727876 0,000886285294375788 0,000747692072938125 0,000793469138628214 0,000717856056886248 0,00074592911959825 35396 38625 623 665 0 True 322 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 367 525 0,000943193698587291 0,000876349720719744 0,000778210116731518 0,000747692072938125 0,000783649647997294 0,000731764718580991 38509 38192 623 665 0 True 366 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 412 525 0,000854064355598402 0,000905812253224042 0,000564583810177768 0,000610360875867857 0,000857708541411175 0,00091688642003254 34870 39476 623 665 0 True 410 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 457 526 0,000945177616361982 0,00093550424470423 0,000549324788281071 0,000534065766384375 0,000981237505810552 0,00101110954916136 38590 40770 623 665 0 True 454 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 501 526 0,000953750100573609 0,000932383602632124 0,00064087891966125 0,000595101853971161 0,000953221625207825 0,000940579000237966 38940 40634 623 665 0 True 499 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 544 525 0,000913410439154895 0,000928574583632347 0,000671396963454643 0,00064087891966125 0,000882374685050454 0,000902416812323821 37293 40468 623 665 0 True 543 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 589 526 0,000877944847330792 0,000951336914040652 0,000564583810177768 0,000656137941557946 0,000824575466067622 0,000857914179575053 35845 41460 623 665 0 True 587 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 632 525 0,000885145734068558 0,000913613858404308 0,000473029678797589 0,000503547722590982 0,000929054480902827 0,000996636806587852 36139 39816 623 665 0 True 631 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 677 525 0,000892444592054458 0,000894041007760876 0,000534065766384375 0,000579842832074464 0,000924116023331689 0,000920660524221239 36437 38963 623 665 0 True 675 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 280 570 0,000871503237766055 0,000878506635093111 0,000762951094834821 0,000747692072938125 0,000658290322248497 0,000672458600720841 35582 38286 623 665 0 True 277 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 324 570 0,000888329799632877 0,000826855419620234 0,000732433051041428 0,000701915007248035 0,000708768223505093 0,000681205482052167 36269 36035 623 665 0 True 322 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 368 570 0,000884753849076027 0,00092430664668079 0,000717174029144732 0,000823987182421607 0,000723108474527712 0,000710080291475859 36123 40282 623 665 0 True 366 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 412 570 0,000853256092801305 0,000900236400109911 0,000625619897764553 0,000671396963454643 0,000799620970839947 0,000810842263264361 34837 39233 623 665 0 True 410 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 457 569 0,000879732822609217 0,000904137202700044 0,000473029678797589 0,000564583810177768 0,000976277148126807 0,000933918492962398 35918 39403 623 665 0 True 454 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 500 570 0,000896657355724172 0,000917193418428195 0,000457770656900893 0,000518806744487678 0,00104000182245068 0,00101525653277783 36609 39972 623 665 0 True 498 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 545 570 0,000919411178103034 0,00087224240505131 0,000564583810177768 0,000503547722590982 0,000956376582521987 0,000898386960834564 37538 38013 623 665 0 True 543 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 589 569 0,00090150693250675 0,000957486414594509 0,00064087891966125 0,000762951094834821 0,000844021849199364 0,000814786576999055 36807 41728 623 665 0 True 587 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 633 569 0,000877210062969795 0,000835070050957102 0,000625619897764553 0,000625619897764553 0,000794853108453324 0,000739649879564199 35815 36393 623 665 0 True 631 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 677 569 0,000898910694431229 0,000826442393463632 0,00064087891966125 0,000473029678797589 0,00083169965386722 0,00088531000444547 36701 36017 623 665 0 True 675 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 277 609 0,000864816700080986 0,000834634078902911 0,000701915007248035 0,000717174029144732 0,000668939428251879 0,000689151342140222 35309 36374 623 665 0 False 277 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 322 609 0,000897588082581435 0,000917927687151043 0,00080872816052491 0,000778210116731518 0,000696268151738127 0,000730675038754647 36647 40004 623 665 0 False 322 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 368 613 0,000824795445218703 0,000888602830032279 0,000717174029144732 0,00080872816052491 0,000648576287134542 0,000667278949583038 33675 38726 623 665 0 True 366 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 412 613 0,000837213300919546 0,000853518552618672 0,00064087891966125 0,000656137941557946 0,00071886229155456 0,00071224157264098 34182 37197 623 665 0 True 410 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 454 609 0,000892028214249894 0,000961754351546066 0,000549324788281071 0,00064087891966125 0,000942180495956417 0,00101282266736013 36420 41914 623 665 0 False 454 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 498 609 0,000872703385555683 0,000857717651877462 0,0004272526131075 0,000457770656900893 0,000976082231351127 0,000991494210258923 35631 37380 623 665 0 False 498 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 543 609 0,000926808007337067 0,00088740964335765 0,000549324788281071 0,000473029678797589 0,000953342889516826 0,00103346442678409 37840 38674 623 665 0 False 543 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 587 609 0,000959848810769881 0,000913154940452528 0,000701915007248035 0,000625619897764553 0,000850369100371199 0,000866562582620038 39189 39796 623 665 0 False 587 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 631 609 0,000847230861041133 0,000821669646765116 0,00064087891966125 0,000671396963454643 0,000726476315488566 0,000685341880959238 34591 35809 623 665 0 False 631 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 675 609 0,000893277347663588 0,000956086714841579 0,000701915007248035 0,000717174029144732 0,000769054466989991 0,000817380713110381 36471 41667 623 665 0 False 675 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 280 659 0,000992546714834231 0,0751593563905185 0,000869764248111696 0,0732738231479362 0,000703832849963799 0,0232000630467346 40524 3275503 623 665 0 True 277 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 322 652 0,000965972013778187 0,000870750921708024 0,000869764248111696 0,000778210116731518 0,000645002041854538 0,000617137675578513 39439 37948 623 665 0 False 322 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 366 652 0,00087032758278846 0,000933507951613986 0,000762951094834821 0,000854505226215 0,00063423201826698 0,000613254681861896 35534 40683 623 665 0 False 366 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 410 652 0,000825554722391733 0,00077816422493634 0,000656137941557946 0,000625619897764553 0,000673452722414806 0,000621886202606341 33706 33913 623 665 0 False 410 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 454 652 0,000928498011367359 0,000876120261743854 0,000701915007248035 0,000686655985351339 0,000866334252790872 0,000785908098829746 37909 38182 623 665 0 False 454 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 498 652 0,000921419588689758 0,000924650835144625 0,000656137941557946 0,000656137941557946 0,000859882747626688 0,000848378009675484 37620 40297 623 665 0 False 498 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 543 652 0,000898004460385999 0,000904596120651824 0,000610360875867857 0,000595101853971161 0,00081135159533278 0,000868926490700333 36664 39423 623 665 0 False 543 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 587 652 0,000895432715122511 0,000953080802257417 0,000732433051041428 0,000854505226215 0,00070590003599817 0,000674054781230798 36559 41536 623 665 0 False 587 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 631 653 0,00087983079385735 0,000858038894443708 0,000717174029144732 0,000732433051041428 0,000697621452860557 0,000691447032251835 35922 37394 623 665 0 False 631 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 676 658 0,00102397099267285 0,0756375259503761 0,000885023270008392 0,0758068207827878 0,000738058320192491 0,0244667227731523 41807 3296342 623 665 0 True 675 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F7_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F7_1.csv new file mode 100755 index 0000000..d74b78c --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F7_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 271 272 0,0106962844545223 0,0460089569311239 0,0107270923933776 0,0466010528725109 0,00149273520178155 0,00858044392795535 405868 2005106 579 665 0 True 271 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 315 272 0,0106107390571532 0,0105290463512868 0,0106660563057908 0,0104982070649271 0,00139153637942218 0,00135038032678828 402622 458864 579 665 0 False 315 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 361 272 0,0106842933405965 0,0643784329213971 0,0106660563057908 0,0656748302433814 0,00132055939197097 0,0105067270065001 405413 2805662 579 665 0 True 359 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 405 272 0,0107735810196743 0,0980883887448078 0,0108339055466545 0,0946211947814145 0,00149027370961559 0,0195442459339747 408801 4274768 579 665 0 True 404 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 449 272 0,0105584525296177 0,0743636844457218 0,0105897611963073 0,074036774242771 0,00174689372068529 0,0139702919311123 400638 3240827 579 665 0 True 448 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 493 271 0,010398799412778 0,0681532395878687 0,0103761348897536 0,0706797894254978 0,00176566390621846 0,0199199199464873 394580 2970171 579 665 0 True 492 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 537 272 0,0106501647855771 0,083007266392119 0,0106355382619974 0,0811932555123217 0,0016435603654852 0,0239729078228795 404118 3617521 579 665 0 True 536 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 581 273 0,0116156998205154 0,0727448743167142 0,0106813153276875 0,0746623941405356 0,00598797031507634 0,0246191113425461 440755 3170278 579 665 0 True 580 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 624 273 0,0179296933318733 0,0106486862613159 0,0110322728313115 0,0106660563057908 0,0218382241159616 0,00180868867311027 680338 464078 579 665 0 False 624 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 667 271 0,0108429450017677 0,0465727605807836 0,0108491645685512 0,046845197222858 0,00178991706977062 0,00856037259254815 411433 2029677 579 665 0 True 668 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 271 316 0,0107771388227072 0,0105333831259311 0,0105134660868238 0,0105134660868238 0,00243543748494711 0,00148208912897835 408936 459053 579 665 0 False 271 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 315 316 0,0105109624476525 0,010222351484112 0,0104676890211337 0,0102693217364767 0,00131044106205258 0,00133846424379559 398836 445498 579 665 0 False 315 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 361 317 0,0107879440022886 0,105003548009415 0,0107881284809644 0,104585336079957 0,00145069189648984 0,025583787450063 409346 4576136 579 665 0 True 359 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 405 317 0,0108211238098325 0,0555345103431502 0,010757610437171 0,0564736400396735 0,00149915163110709 0,00956022397712359 410605 2420237 579 665 0 True 403 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 449 316 0,0108735948160438 0,10667786426469 0,0108644235904479 0,108506904707408 0,00169804477430479 0,0240339365116872 412596 4649104 579 665 0 True 448 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 493 317 0,0106493741626809 0,0420978745788711 0,0105439841306172 0,0437323567559319 0,00181531992498096 0,00787833549525609 404088 1834658 579 665 0 True 492 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 537 317 0,0104907752097028 0,0469714684972904 0,0104982070649271 0,0485236896314946 0,00158591427430641 0,0109433735996415 398070 2047053 579 665 0 True 536 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 581 317 0,0104512177107962 0,0569052064815277 0,0105134660868238 0,0561074235141527 0,00197552143477365 0,0144982857191125 396569 2479973 579 665 0 True 580 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 624 316 0,0104347991086517 0,0104080296874023 0,0103913939116503 0,0103608758678569 0,00216800901174244 0,00190173089078375 395946 453590 579 665 0 False 624 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 668 316 0,0107051921391528 0,0105960942640419 0,0106660563057908 0,0105592431525139 0,00191045313384089 0,00191547188719746 406206 461786 579 665 0 False 668 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 273 362 0,0111759817197445 0,0581835912739046 0,0107423514152743 0,0580453192950332 0,00447645911410141 0,0141167724348092 424070 2535686 579 665 0 True 271 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 317 362 0,0104726699453798 0,0684852208341866 0,0105439841306172 0,0672617685206378 0,00147013038670936 0,0229778614800214 397383 2984639 579 665 0 True 315 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 361 361 0,0107259064590333 0,040621351960813 0,0106507972838941 0,041718165865568 0,00164973883999733 0,00801131659030706 406992 1770310 579 665 0 True 359 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 403 359 0,0109769819367705 0,0333124410935785 0,010757610437171 0,0363012130922408 0,00165504113483322 0,00888477139044668 416519 1451782 579 665 0 False 403 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 450 361 0,0108996326634254 0,0723225091797931 0,0108186465247578 0,0697947661554894 0,00198666596243142 0,0137513895980528 413584 3151871 579 665 0 True 448 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 492 359 0,0106872186453125 0,0330242176739629 0,010757610437171 0,0346684977492943 0,00174089298077847 0,00784246978705824 405524 1439221 579 665 0 False 492 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 536 359 0,0107200294955048 0,0292900023003262 0,0105897611963073 0,0306401159685664 0,00200847391581811 0,00603411878409823 406769 1276481 579 665 0 False 536 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 582 362 0,0106355909701905 0,0532824622783785 0,0106355382619974 0,0529335469596399 0,00193325803128932 0,01120305380981 403565 2322091 579 665 0 True 580 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 626 361 0,0107251685443302 0,0595027738721948 0,010757610437171 0,0607003891050584 0,0020550114048766 0,0129191907363927 406964 2593177 579 665 0 True 624 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 670 361 0,0107766117407764 0,0661434772557395 0,0106813153276875 0,0658274204623484 0,0018028799300653 0,0182149121536144 408916 2882584 579 665 0 True 668 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 273 406 0,0103708904245421 0,0446207301269883 0,0103761348897536 0,0474555580987259 0,00152803545994622 0,0103479995258239 393521 1944606 579 665 0 True 271 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 317 407 0,0107215316790076 0,034293768295768 0,0106507972838941 0,0339208056763561 0,00149008134959195 0,00509325622309769 406826 1494549 579 665 0 True 315 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 361 406 0,0109938749126526 0,0891603923977947 0,0110627908751049 0,0854810406652934 0,00138510901860018 0,0220272756389631 417160 3885679 579 665 0 True 359 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 405 405 0,0107700495707379 0,0670371970209341 0,0108339055466545 0,0673380636301213 0,00159049680714363 0,0179221541524044 408667 2921533 579 665 0 True 403 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 450 406 0,0116600537649924 0,0438989210265306 0,0112001220721752 0,0454261081864652 0,00318301576772843 0,00752517103735019 442438 1913149 579 665 0 True 447 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 494 406 0,0113084374089548 0,0544979982572591 0,0110627908751049 0,0562142366674296 0,00238022760899655 0,0104412094755875 429096 2375065 579 665 0 True 492 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 538 406 0,0107075903619379 0,0436319913998776 0,0106507972838941 0,0444953078507668 0,00173728512878876 0,00616560072612771 406297 1901516 579 665 0 True 536 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 582 406 0,0105495184908906 0,0515553016209556 0,0105897611963073 0,0514839398794537 0,00185350139981025 0,00817346093798209 400299 2246820 579 665 0 True 580 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 626 405 0,0105593485689001 0,0430992106037582 0,0105287251087205 0,0436102845807584 0,00178192464078621 0,00822577298298547 400672 1878297 579 665 0 True 624 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 671 406 0,0108198851672951 0,0889997940605691 0,0108339055466545 0,0870374608987564 0,00202275067931572 0,0177390016112111 410558 3878680 579 665 0 True 668 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 274 451 0,0105517058809035 0,0460946598586189 0,0105287251087205 0,045288776989395 0,00160084560826565 0,00975235515614634 400382 2008841 579 665 0 True 271 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 318 451 0,0110169874553183 0,0685937090379875 0,0109102006561379 0,0652170595864805 0,00166361293892641 0,0149174118520608 418037 2989367 579 665 0 True 315 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 362 450 0,0110695902320122 0,0348294632208812 0,0109254596780346 0,0358281834134432 0,00192766497053129 0,00433132605934471 420033 1517895 579 665 0 True 359 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 406 450 0,0109860213918837 0,0520565776996852 0,0109407186999313 0,05297932402533 0,00162690864809125 0,00893473675883414 416862 2268666 579 665 0 True 403 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 450 449 0,0113638864280751 0,0928131039431951 0,011108567940795 0,0916914625772488 0,00223029071765218 0,0144708714068776 431200 4044867 579 665 0 True 447 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 495 451 0,0112229974279719 0,0618376795731604 0,0112306401159686 0,0612954909590295 0,00183873116584525 0,0138119024165248 425854 2694934 579 665 0 True 492 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 539 451 0,010882924166219 0,0545641283341106 0,0109712367437247 0,0536049439230945 0,00180280651023983 0,0102542227881801 412950 2377947 579 665 0 True 536 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 583 450 0,0106934645661925 0,0310229912157368 0,0107728694590677 0,0314030670634012 0,00195714645294013 0,00431700174952159 405761 1352006 579 665 0 True 580 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 627 450 0,0105945312877811 0,0404958149551035 0,0105745021744106 0,0409552147707332 0,00187983293194126 0,00614286038700988 402007 1764839 579 665 0 True 624 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 671 450 0,0108181985051166 0,071326588386737 0,0108796826123445 0,0706034943160143 0,00193207580764966 0,0108926587587698 410494 3108468 579 665 0 True 668 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 271 489 0,01350763405703 0,0421043912137864 0,0110322728313115 0,0453650720988785 0,00734893061523971 0,0233251259505913 512544 1834942 579 665 0 False 271 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 318 495 0,0107672560365046 0,0587311721739689 0,0107423514152743 0,0578469520103761 0,00162696836571018 0,00924442218044498 408561 2559550 579 665 0 True 315 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 361 494 0,0109729234059033 0,0707779519753836 0,0109102006561379 0,0711985961699855 0,0015383243513612 0,021350905224706 416365 3084558 579 665 0 True 359 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 406 494 0,0113483375111165 0,0877380679898419 0,0112916762035554 0,0850690470740826 0,00193466703926916 0,0248435396997137 430610 3823693 579 665 0 True 403 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 451 495 0,0116789496522116 0,0983736980354296 0,0116884107728695 0,0955672541390097 0,00214265964345486 0,0312950486498748 443155 4287202 579 665 0 True 447 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 494 495 0,0110745184480652 0,0497239206966833 0,0110475318532082 0,0493629358358129 0,00172248766838148 0,0117452069724219 420220 2167007 579 665 0 True 492 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 536 495 0,0110158542291671 0,0399832036029648 0,0110170138094148 0,0425879301136797 0,00164240823489434 0,00862031706870424 417994 1742499 579 665 0 True 536 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 581 494 0,0109288593564883 0,0976221739975941 0,0108491645685512 0,0949111161974517 0,00186165211075776 0,0194697764636833 414693 4254450 579 665 0 True 580 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 625 494 0,010755950129089 0,0603321303946522 0,0108339055466545 0,0627145799954223 0,00184418121672614 0,0162622200662904 408132 2629321 579 665 0 True 624 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 669 494 0,0108408893822376 0,0759866018903978 0,0109102006561379 0,075898374914168 0,00189972864180046 0,014990326764128 411355 3311555 579 665 0 True 668 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 274 539 0,010435642439741 0,0552883238079176 0,0103913939116503 0,0578469520103761 0,00170889164191317 0,0139419865232617 395978 2409508 579 665 0 True 271 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 318 539 0,0105782444561193 0,101807390988343 0,0105745021744106 0,0948805981536583 0,00156722783094719 0,0276892698233539 401389 4436845 579 665 0 True 315 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 362 539 0,0109122826297646 0,0565585628066504 0,0109102006561379 0,0586861982146944 0,00153404892347176 0,0118572191903017 414064 2464866 579 665 0 True 359 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 405 538 0,011227635748963 0,0546289046030044 0,0111238269626917 0,0564888990615702 0,00173628270679971 0,0103802325660447 426030 2380770 579 665 0 True 403 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 449 538 0,011090805279727 0,0546971457024342 0,010955977721828 0,0559548332951858 0,00216149525086775 0,00952216888167453 420838 2383744 579 665 0 True 447 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 493 539 0,0108363564776327 0,0603466551478261 0,0109254596780346 0,0617837796597238 0,00193588799691571 0,0150989095881398 411183 2629954 579 665 0 True 491 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 537 539 0,0108323243008621 0,0705262354788321 0,0107881284809644 0,070572976272221 0,00199208081567151 0,0187299252799943 411030 3073588 579 665 0 True 536 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 582 539 0,0104477389700529 0,0580073438345234 0,0103456168459602 0,0591287098496986 0,00163985698884522 0,0138732198765269 396437 2528005 579 665 0 True 580 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 626 539 0,0106064169853206 0,0429530452361162 0,0106202792401007 0,0432745860990311 0,00167269265094229 0,006383854019153 402458 1871927 579 665 0 True 624 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 670 538 0,0105542358741713 0,0664512735259986 0,0104676890211337 0,066498817425803 0,00202130567520489 0,0156442578703863 400478 2895998 579 665 0 True 668 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 271 575 0,0139992697279849 0,0348882965022995 0,0106965743495842 0,0366521705958648 0,00846979348931218 0,0200342935295258 531199 1520459 579 665 0 False 271 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 315 575 0,015390950503976 0,0387149150055271 0,0112916762035554 0,0418402380407416 0,0106335065228502 0,0226039242747807 584006 1687226 579 665 0 False 315 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 359 575 0,0147733158974631 0,037929867011314 0,0113374532692454 0,0419928282597086 0,0092539871324986 0,0209778694561455 560570 1653013 579 665 0 False 359 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 403 575 0,0156542279284112 0,0387687231353733 0,0115205615320058 0,0443884946974899 0,0099959243230934 0,0204301404824054 593996 1689571 579 665 0 False 403 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 447 575 0,0199106517065002 0,0625708468929247 0,0119783321889067 0,0694895857175555 0,0190509429948292 0,0420685682818202 755505 2726886 579 665 0 False 447 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 491 575 0,0166371830211625 0,0473215311109084 0,0120851453421836 0,0552986953536278 0,0120119864717789 0,0276884498793127 631294 2062309 579 665 0 False 491 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 536 575 0,0152440527698617 0,0427884543127101 0,0115968566414893 0,0518654154268711 0,0105770418223326 0,0217475573921533 578432 1864754 579 665 0 False 536 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 580 575 0,0122146230184849 0,0303192864284768 0,0109712367437247 0,035034714274815 0,00444746890298361 0,0136835483113797 463481 1321338 579 665 0 False 580 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 627 583 0,0103268000210306 0,0494543981836027 0,0103456168459602 0,0501869230182345 0,00154251205283882 0,00811143026701214 391848 2155261 579 665 0 True 624 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 671 583 0,0105028980941113 0,0543433887993043 0,0104982070649271 0,0532234683756771 0,00164464810757694 0,00880123776459392 398530 2368327 579 665 0 True 668 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 271 618 0,0110743076152929 0,0100784577603312 0,0102082856488899 0,0100709544518196 0,00448706107673961 0,0014191348293136 420212 439227 579 665 0 False 271 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 315 618 0,0113502877142605 0,0101893323374814 0,0104676890211337 0,0102082856488899 0,00471689576388041 0,00127528633241235 430684 444059 579 665 0 False 315 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 359 618 0,0198477444780591 0,0521918896577677 0,0112764171816587 0,0639810788128481 0,0181542091279363 0,0338910495806312 753118 2274563 579 665 0 False 359 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 403 618 0,0198159614376318 0,0651084337072941 0,0117799649042496 0,0599832150759136 0,017129314272418 0,0797618450073533 751912 2837476 579 665 0 False 403 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 447 618 0,0124457484451412 0,010478840727362 0,0106813153276875 0,0104371709773404 0,00898075434612824 0,00199556876310093 472251 456676 579 665 0 False 447 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 491 619 0,011055622560846 0,0100943363214628 0,010406652933547 0,0100404364080262 0,00432808658269559 0,00196993127586661 419503 439919 579 665 0 False 491 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 535 619 0,010857307984382 0,0101423850310142 0,0103608758678569 0,0100556954299229 0,00389327676945167 0,0020114781809668 411978 442013 579 665 0 False 535 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 580 619 0,0104425735671311 0,0101494294215741 0,0105592431525139 0,0101167315175097 0,00164879753174924 0,00164043548006365 396241 442320 579 665 0 False 580 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 624 619 0,0105460661042439 0,0104420584535268 0,0102998397802701 0,0104371709773404 0,00217283929946375 0,00143472182949953 400168 455073 579 665 0 False 624 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 668 619 0,0105514423399381 0,0103413030172134 0,0103303578240635 0,0103303578240635 0,00226211199703906 0,00151709570923179 400372 450682 579 665 0 False 668 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 271 662 0,0115942475859318 0,0366691735059783 0,0102693217364767 0,0428931105516136 0,00518064477734054 0,0162441727112143 439941 1598071 579 665 0 False 271 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 315 662 0,0101315952279583 0,00994344409891747 0,0100862134737163 0,00996414129854276 0,00125932472852632 0,00130049370594749 384441 433343 579 665 0 False 315 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 359 662 0,0121512677704026 0,0100341721779844 0,0102235446707866 0,0100251773861295 0,00945246436444151 0,00130561868461296 461077 437297 579 665 0 False 359 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 403 662 0,0119710321041651 0,0102423603068096 0,01025406271458 0,0103303578240635 0,00747221801525457 0,00142347059762935 454238 446370 579 665 0 False 403 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 447 662 0,0179864073476275 0,0101949081905955 0,0106202792401007 0,01025406271458 0,0320726652756036 0,00157277168952277 682490 444302 579 665 0 False 447 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 491 662 0,0100529282497862 0,00991785942310572 0,0100099183642329 0,00996414129854276 0,00166399952920876 0,00162524106189593 381456 432228 579 665 0 False 491 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 535 662 0,00984802514918725 0,0100207488278949 0,00990310521095598 0,00994888227664607 0,00180276199937041 0,00177550843346821 373681 436712 579 665 0 False 535 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 580 662 0,00989854595225455 0,010217601683311 0,00993362325474937 0,0101930266269932 0,00143253623462131 0,0013506191607776 375598 445291 579 665 0 False 580 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 624 662 0,0101498059086675 0,0100651032479344 0,0101472495613031 0,0100862134737163 0,00140670607431928 0,0014997124576632 385132 438645 579 665 0 False 624 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 668 667 0,010442520858938 0,0446788979773765 0,0104676890211337 0,0451209277485313 0,00143016368486287 0,00845342229997138 396239 1947141 579 665 0 True 668 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F7_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F7_2.csv new file mode 100755 index 0000000..5f45999 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F7_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 271 272 0,00865046864831025 0,705145215981129 0,0085145342183566 0,714335851071946 0,00193575900262943 0,192302511540731 328240 30730775 579 665 8 True 271 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 315 272 0,00705051144736303 0,00697736559297075 0,00706492713817044 0,00698863202868696 0,00139608435080277 0,00130871610459623 267530 304079 579 665 0 False 315 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 361 272 0,00661529989710043 0,00667156561580192 0,00666819256885634 0,00671396963454643 0,00119485188915427 0,00128593327042941 251016 290752 579 665 0 True 359 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 405 272 0,00650740622586541 0,00664224075868316 0,00651560234988937 0,00663767452506294 0,00129514110098929 0,0012900993182816 246922 289474 579 665 0 True 404 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 449 272 0,00658794434489185 0,00660063984635427 0,00665293354695964 0,00663767452506294 0,00159228790215688 0,00171267016534902 249978 287661 579 665 0 True 448 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 493 271 0,0065945592231234 0,00690120815887281 0,00653086137178607 0,00692759594110018 0,00155989965587743 0,00156035018719398 250229 300760 579 665 0 True 492 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 537 272 0,00709389029026797 0,00711855170083598 0,00708018616006714 0,00717174029144732 0,00146125649511955 0,00158228293158005 269176 310232 579 665 0 True 536 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 581 273 0,00736338728148666 0,00746588375264093 0,00735484855420768 0,00738536659800107 0,00165489203394155 0,00184218395882969 279402 325369 579 665 0 True 580 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 624 273 0,0081542473645574 0,00804187167392044 0,00814831769283589 0,00799572747386892 0,00205115685506606 0,00186019683258093 309411 350471 579 665 0 False 624 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 667 271 0,0097595808011988 0,715455450253007 0,00965896086060884 0,710811017013809 0,00195749034788054 0,180388000169498 370325 31180103 579 665 10 True 668 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 271 316 0,00752849569631015 0,00665506751543542 0,00703440909437705 0,00663767452506294 0,00430719268399472 0,00142383202056105 285667 290033 579 665 0 False 271 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 315 316 0,00657779801772392 0,00664038214097845 0,00656137941557946 0,00663767452506294 0,00135011815833925 0,00116739118078176 249593 289393 579 665 0 False 315 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 361 317 0,0063187372487351 0,0064137914022869 0,00634775310902571 0,00645456626230259 0,00135616989990377 0,00132329124606936 239763 279518 579 665 0 True 359 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 405 317 0,0065672563791079 0,006475424083211 0,00659189745937285 0,00654612039368277 0,00140898439542362 0,00134835156098338 249193 282204 579 665 0 True 403 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 449 316 0,00668624512498628 0,00693287349754565 0,00668345159075303 0,00688181887541009 0,0016693480952733 0,00153080570258574 253708 302140 579 665 0 True 448 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 493 317 0,00691470878789209 0,00726322558513473 0,00686655985351339 0,0072480354009308 0,0017065697804108 0,00168698105431402 262377 316537 579 665 0 True 492 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 537 317 0,00700626291927226 0,00719415843339179 0,00709544518196384 0,0072327763790341 0,00151304733183172 0,00149596419207353 265851 313527 579 665 0 True 536 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 581 317 0,00726751107827391 0,00745126721587673 0,00732433051041428 0,00735484855420768 0,00179198192668494 0,00192211953395624 275764 324732 579 665 0 True 580 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 624 316 0,00774401949781478 0,00769720134623581 0,00764476997024491 0,00776684214541848 0,00217409083272769 0,00199030191860481 293845 335450 579 665 0 False 624 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 668 316 0,00760289331084275 0,0078658307476175 0,00741588464179446 0,00782787823300526 0,00203538943637477 0,00180227636454491 288490 342799 579 665 0 False 668 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 273 362 0,0139231327430806 0,00647035303984383 0,00645456626230259 0,00650034332799268 0,0578929048558307 0,00137196492184957 528310 281983 579 665 0 True 271 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 317 362 0,00619793007019545 0,0064476366012307 0,00614938582436866 0,00645456626230259 0,00136546148096684 0,00132606342244768 235179 280993 579 665 0 True 315 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 361 361 0,00669275458683167 0,00675049950350814 0,00666819256885634 0,00666819256885634 0,00147118265318262 0,00137687146448736 253955 294192 579 665 0 True 359 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 403 359 0,00686790391243693 0,0069202303079741 0,00685130083161669 0,00697337300679027 0,00153454694887308 0,00132867947138604 260601 301589 579 665 0 False 403 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 450 361 0,00685741498201399 0,00696738412751953 0,00677500572213321 0,00694285496299687 0,0016422799773147 0,00183697355163912 260203 303644 579 665 0 True 448 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 492 359 0,00692440709541883 0,00694056037323797 0,00686655985351339 0,0068207827878233 0,00167096409475141 0,00169050633137218 262745 302475 579 665 0 False 492 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 536 359 0,0073570359442205 0,00713105721502199 0,00718699931334401 0,00712596322575723 0,00280524279774447 0,00162769091918914 279161 310777 579 665 0 False 536 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 582 362 0,0071818602645187 0,00739766559910878 0,00729381246662089 0,00744640268558785 0,00180027481355317 0,00204243036779536 272514 322396 579 665 0 True 580 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 626 361 0,00701232436147648 0,00720547076090317 0,00697337300679027 0,0072480354009308 0,00206516157422328 0,00196659452388863 266081 314020 579 665 0 True 624 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 670 361 0,0068132191621163 0,0067614446966581 0,00686655985351339 0,00677500572213321 0,00191550171611112 0,00185406100755233 258526 294669 579 665 0 True 668 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 273 406 0,00631307111797899 0,00633506402765899 0,00630197604333562 0,00633249408712902 0,00140751259286861 0,00152436233231861 239548 276087 579 665 0 True 271 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 317 407 0,00671726389661393 0,00686949692840478 0,00674448767833982 0,0068055237659266 0,00141807092326425 0,0015971741469315 254885 299378 579 665 0 True 315 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 361 406 0,00697487519029305 0,00683891004691862 0,00695811398489357 0,0068055237659266 0,00126770170578582 0,00133397033524835 264660 298045 579 665 0 True 359 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 405 405 0,00710419474201514 0,00709562874914455 0,00704966811627375 0,00715648126955062 0,00141735351149614 0,00141702745422154 269567 309233 579 665 0 True 403 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 450 406 0,00732606988078593 0,00726008199716503 0,00714122224765393 0,00727855344472419 0,00199899458185262 0,00165025213911694 277986 316400 579 665 0 True 447 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 494 406 0,00720710748900408 0,00742113925234235 0,00718699931334401 0,00735484855420768 0,00176065267772872 0,00170156140102061 273472 323419 579 665 0 True 492 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 538 406 0,00711681835425783 0,00725753500253265 0,00715648126955062 0,00712596322575723 0,00158629336279788 0,00152576017797468 270046 316289 579 665 0 True 536 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 582 406 0,00675795462167179 0,00699308353281923 0,00679026474402991 0,00698863202868696 0,00168106021014222 0,0018803632656686 256429 304764 579 665 0 True 580 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 626 405 0,00650392748512212 0,00634387525233317 0,00650034332799268 0,0063935301747158 0,0017838637321877 0,00184510642949049 246790 276471 579 665 0 True 624 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 671 406 0,00617750564537691 0,0063241647263042 0,00622568093385214 0,00630197604333562 0,00178645347664388 0,00189022091964534 234404 275612 579 665 0 True 668 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 274 451 0,0064415473386118 0,00662776189730449 0,00646982528419928 0,00660715648126955 0,00147215580692257 0,00144976266463591 244423 288843 579 665 0 True 271 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 318 451 0,00683282660994211 0,0068834709800365 0,0068055237659266 0,00683604180972 0,00155444737288697 0,001686582015971 259270 299987 579 665 0 True 315 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 362 450 0,00693394727836633 0,00683051184840104 0,00691233691920348 0,00671396963454643 0,00147311677470549 0,00136095066483824 263107 297679 579 665 0 True 359 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 406 450 0,0068641352766317 0,0072016617419034 0,0068055237659266 0,00694285496299687 0,00149280155142475 0,00205048357270166 260458 313854 579 665 0 True 403 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 450 449 0,00706693004950749 0,00721547517225199 0,00711070420386053 0,00718699931334401 0,00192512143493828 0,00176628466598875 268153 314456 579 665 0 True 447 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 495 451 0,00701622476776441 0,00728821366760917 0,00697337300679027 0,00741588464179446 0,00174337306936785 0,00192938725298946 266229 317626 579 665 0 True 492 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 539 451 0,0067217177389292 0,00690616447275203 0,00672922865644312 0,00692759594110018 0,00169542962990954 0,00172888974435016 255054 300976 579 665 0 True 536 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 583 450 0,00623158425147711 0,00648292739172261 0,00630197604333562 0,00646982528419928 0,00181904617089441 0,00190061614424276 236456 282531 579 665 0 True 580 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 627 450 0,00618077355334787 0,00601588659219576 0,00625619897764553 0,00602731364919509 0,00174455683988018 0,00181315974072511 234528 262177 579 665 0 True 624 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 671 450 0,00628568921167386 0,00627469337110228 0,00627145799954223 0,00621042191195544 0,00184687838625104 0,001872122392211 238509 273456 579 665 0 True 668 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 271 489 0,00660931751718584 0,00655532169861596 0,00656137941557946 0,00659189745937285 0,00153155789008141 0,00153965970415024 250789 285686 579 665 0 False 271 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 318 495 0,00668350429894611 0,00671734268149201 0,00666819256885634 0,00665293354695964 0,00149107118182543 0,00148699619798279 253604 292747 579 665 0 True 315 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 361 494 0,00676936594547364 0,00692454413672084 0,00677500572213321 0,00688181887541009 0,00141705177746518 0,00145545318626031 256862 301777 579 665 0 True 359 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 406 494 0,00711481544292078 0,00685885003192348 0,00703440909437705 0,00689707789730678 0,00166940125693288 0,00159644166139468 269970 298914 579 665 0 True 403 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 451 495 0,00708962092662848 0,0071816070274106 0,00706492713817044 0,0072632944228275 0,00178529786356585 0,00187448683320389 269014 312980 579 665 0 True 447 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 494 495 0,00665519999926209 0,00664735769384551 0,00666819256885634 0,00650034332799268 0,00170275015076147 0,00189739707026057 252530 289697 579 665 0 True 492 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 536 495 0,00632917347096497 0,00638843618545104 0,00628671702143893 0,00627145799954223 0,00166007316130212 0,00163371252969935 240159 278413 579 665 0 True 536 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 581 494 0,00625646251861093 0,00623105027388797 0,00622568093385214 0,00624093995574884 0,00172469141793778 0,00181400675652028 237400 271554 579 665 0 True 580 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 625 494 0,0061101445746205 0,00626117823742235 0,00611886778057527 0,00617990386816205 0,00174516789042616 0,00183026176345391 231848 272867 579 665 0 True 624 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 669 494 0,00637966791993573 0,00623972382317662 0,00646982528419928 0,00622568093385214 0,00175411629396674 0,00183396740572682 242075 271932 579 665 0 True 668 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 274 539 0,00689860643490611 0,0066283584906418 0,00662241550316625 0,00662241550316625 0,00225046696148857 0,00139780452560761 261766 288869 579 665 0 True 271 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 318 539 0,00668202846953987 0,00667344717940422 0,00668345159075303 0,00674448767833982 0,00142508142930827 0,00142607393997134 253548 290834 579 665 0 True 315 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 362 539 0,00690105736588433 0,00685061245468902 0,00694285496299687 0,00685130083161669 0,00141162545675771 0,00133031420508696 261859 298555 579 665 0 True 359 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 405 538 0,00698607568132258 0,00687757388435612 0,00701915007248035 0,0068055237659266 0,0016189360420029 0,00153917528613646 265085 299730 579 665 0 True 403 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 449 538 0,00653800333194843 0,00654492720700814 0,00659189745937285 0,00653086137178607 0,00185478821865172 0,00203333000621191 248083 285233 579 665 0 True 447 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 493 539 0,00638731060793235 0,00641620072153375 0,0064087891966125 0,00646982528419928 0,00184060396426817 0,00198461817889205 242365 279623 579 665 0 True 491 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 537 539 0,00640169994464322 0,00624679115963404 0,00636301213092241 0,00624093995574884 0,00180301541290053 0,00183606268902557 242911 272240 579 665 0 True 536 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 582 539 0,00608624140905867 0,00610340224560027 0,00611886778057527 0,00608834973678187 0,0015874251130718 0,00160905240404472 230941 265991 579 665 0 True 580 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 626 539 0,00619811454887123 0,00615539764953698 0,00624093995574884 0,00604257267109178 0,00181812263427189 0,00175764283487364 235186 268257 579 665 0 True 624 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 670 538 0,00647280329710831 0,00640321334349837 0,00653086137178607 0,00645456626230259 0,00179672249584801 0,00186482236574472 245609 279057 579 665 0 True 668 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 271 575 0,00667016912609684 0,00668099637971101 0,00662241550316625 0,00672922865644312 0,00114930165578388 0,00124578578320055 253098 291163 579 665 0 False 271 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 315 575 0,00668060534832671 0,00682408699707612 0,00672922865644312 0,00686655985351339 0,00146207235455803 0,00137143636930448 253494 297399 579 665 0 False 315 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 359 575 0,00661216375961216 0,00654745125574293 0,00656137941557946 0,00651560234988937 0,00132275631164805 0,00133340083470459 250897 285343 579 665 0 False 359 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 403 575 0,00654986267539145 0,00640142356348642 0,00651560234988937 0,00643930724040589 0,00156550541038717 0,00140143911740592 248533 278979 579 665 0 False 403 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 447 575 0,00651452183193123 0,0066120669033536 0,00656137941557946 0,00659189745937285 0,00175381043686122 0,00186829589946098 247192 288159 579 665 0 False 447 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 491 575 0,00622966040242969 0,0065241152778949 0,00621042191195544 0,00662241550316625 0,00193708056436436 0,0019558682441283 236383 284326 579 665 0 False 491 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 536 575 0,00656467367764697 0,0065251478432864 0,00659189745937285 0,00656137941557946 0,00187572323202933 0,00178006471098306 249095 284371 579 665 0 False 536 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 580 575 0,00632548389744936 0,00643432798062907 0,00634775310902571 0,00642404821850919 0,0017009475263915 0,00171696218934759 240019 280413 579 665 0 False 580 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 627 583 0,0061427709461371 0,00629947494049842 0,00614938582436866 0,00636301213092241 0,00149591653696739 0,00150241937847991 233086 274536 579 665 0 True 624 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 671 583 0,0065377924991761 0,00647060544471731 0,00659189745937285 0,00642404821850919 0,00154322074367818 0,00157251079762278 248075 281994 579 665 0 True 668 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 271 618 0,00683145619692203 0,00676451944693503 0,00688181887541009 0,00669871061264973 0,00139154505453449 0,00136840795495541 259218 294803 579 665 0 False 271 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 315 618 0,00665166855032572 0,00684421054926169 0,00668345159075303 0,00685130083161669 0,00133549226144102 0,00127430132726124 252396 298276 579 665 0 False 315 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 359 618 0,00651117486167064 0,00648682819431274 0,00650034332799268 0,00648508430609598 0,00133316460068548 0,00143029718555868 247065 282701 579 665 0 False 359 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 403 618 0,00631286028520667 0,0065566984524713 0,00636301213092241 0,00650034332799268 0,00140548682514976 0,00160724078237609 239540 285746 579 665 0 False 403 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 447 618 0,00619974850285672 0,00621168393632284 0,00624093995574884 0,00622568093385214 0,00177645417633387 0,00190637257510907 235248 270710 579 665 0 False 447 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 491 619 0,00623843631657753 0,00628065930447543 0,00622568093385214 0,0063782711528191 0,0018052525713058 0,00192224856935752 236716 273716 579 665 0 False 491 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 535 619 0,0060581742962435 0,00627033365056037 0,00602731364919509 0,00627145799954223 0,00170734659405676 0,0018281008077795 229876 273266 579 665 0 False 535 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 580 619 0,00628640077228045 0,0063076666259377 0,00624093995574884 0,00633249408712902 0,00163154139407845 0,00155525737707058 238536 274893 579 665 0 False 580 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 624 619 0,00619258018859782 0,00636152064757912 0,00619516289005875 0,0063935301747158 0,00136826958086247 0,00134537737223288 234976 277240 579 665 0 False 624 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 668 619 0,00663008454525941 0,00663180037528015 0,00671396963454643 0,00665293354695964 0,00154506655201905 0,0014539379227947 251577 289019 579 665 0 False 668 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 271 662 0,0375319230465652 0,548898866530024 0,00828564888990616 0,642618448157473 0,0919721994707364 0,347698117122085 1424140 23921438 579 665 9 False 271 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 315 662 0,00710084777175455 0,00668237313356635 0,00691233691920348 0,00665293354695964 0,00169089202127618 0,00130531839690215 269440 291223 579 665 0 False 315 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 359 662 0,00623450955619306 0,00606980945152995 0,00631723506523232 0,00611886778057527 0,0012715275742822 0,00113486742201376 236567 264527 579 665 0 False 359 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 403 662 0,00610906405666236 0,00613185515861065 0,00604257267109178 0,00602731364919509 0,0013612805985199 0,00131748390750094 231807 267231 579 665 0 False 403 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 447 662 0,00904135260819246 0,00612146066700282 0,00616464484626535 0,00611886778057527 0,0127937739816793 0,00154206910171171 343072 266778 579 665 0 False 447 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 491 662 0,00608044350781985 0,00627439507443362 0,00613412680247196 0,00621042191195544 0,00162856132765379 0,00151825966204655 230721 273443 579 665 0 False 491 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 535 662 0,00620818181374954 0,0061089780987144 0,00611886778057527 0,00611886778057527 0,00167662916065383 0,00174064701684253 235568 266234 579 665 0 False 535 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 580 662 0,00635331382339567 0,00626953054414475 0,00631723506523232 0,00628671702143893 0,0014378827367583 0,0012506107784402 241075 273231 579 665 0 False 580 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 624 662 0,00673942769180413 0,00654217369929745 0,00669871061264973 0,00657663843747616 0,00132929300275891 0,00128147200984915 255726 285113 579 665 0 False 624 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 668 667 0,00829263272548927 0,71506502580553 0,00822461280231937 0,711207751583124 0,0019115338581754 0,191729127378805 314662 31163088 579 665 11 True 668 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F7_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F7_3.csv new file mode 100755 index 0000000..33c4156 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F7_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 271 272 0,000953069547274835 0,070886187774311 0,000762951094834821 0,0705271992065309 0,000743208868802072 0,0210356624391602 36164 3089275 579 665 0 True 271 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 315 272 0,000957470681397025 0,000908313356061245 0,000854505226215 0,000762951094834821 0,000693216154583597 0,000651173194022329 36331 39585 579 665 0 False 315 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 361 272 0,000963136812153139 0,000874766453786102 0,000869764248111696 0,000747692072938125 0,000672077864752629 0,000651131453071887 36546 38123 579 665 0 True 359 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 405 272 0,00093438449282793 0,000883646516153051 0,000762951094834821 0,000732433051041428 0,000737181724377796 0,000679667197078639 35455 38510 579 665 0 True 404 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 449 272 0,000921497339619839 0,000933324384433274 0,000656137941557946 0,000701915007248035 0,00091371222230535 0,000853430970696663 34966 40675 579 665 0 True 448 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 493 271 0,00101877030994921 0,001063427623763 0,000839246204318303 0,000869764248111696 0,000897278957869287 0,000906758676399146 38657 46345 579 665 0 True 492 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 537 272 0,00106409935599812 0,00109447342320094 0,000930800335698482 0,000915541313801785 0,000814387312558094 0,000847598500169994 40377 47698 579 665 0 True 536 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 581 273 0,00102667653891123 0,000990253156351625 0,000762951094834821 0,000656137941557946 0,000932090047120435 0,000965021714520475 38957 43156 579 665 0 True 580 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 624 273 0,00102043061803124 0,00104197320951727 0,000671396963454643 0,000701915007248035 0,000983658235897536 0,000999640284076587 38720 45410 579 665 0 False 624 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 667 271 0,00113306802664346 0,0725898288867052 0,000793469138628214 0,0709697108415351 0,00104424441812044 0,0205127117890037 42994 3163521 579 665 0 True 668 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 271 316 0,000995815891862817 0,000939106750625706 0,000793469138628214 0,00080872816052491 0,000843674615790184 0,000735154479630118 37786 40927 579 665 0 False 271 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 315 316 0,00093433178463485 0,00090773970862152 0,000793469138628214 0,000839246204318303 0,000691851508951365 0,000626963075813292 35453 39560 579 665 0 False 315 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 361 317 0,000884891499525692 0,000925408049765063 0,000732433051041428 0,000839246204318303 0,000674481977000598 0,00064947028553305 33577 40330 579 665 0 True 359 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 405 317 0,000894378974280115 0,000924168971295256 0,000732433051041428 0,000747692072938125 0,000756622885094434 0,000716832299060779 33937 40276 579 665 0 True 403 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 449 316 0,000904604363737659 0,000912030591470666 0,000656137941557946 0,000656137941557946 0,000826182761759739 0,000855345984311577 34325 39747 579 665 0 True 448 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 493 317 0,00105376855015442 0,000960813569744916 0,00080872816052491 0,000747692072938125 0,000926012096636132 0,000819487544200041 39985 41873 579 665 0 True 492 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 537 317 0,000989201013631261 0,00101060616751308 0,00080872816052491 0,000900282291905089 0,000808041600681326 0,000803935323389926 37535 44043 579 665 0 True 536 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 581 317 0,00105113314050041 0,000971414574431042 0,00080872816052491 0,000549324788281071 0,000989661950569397 0,00105444693076041 39885 42335 579 665 0 True 580 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 624 316 0,000992416213409149 0,00109676801295984 0,000579842832074464 0,000747692072938125 0,00105032342153858 0,00108141231315809 37657 47798 579 665 0 False 624 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 668 316 0,00104254170502835 0,000953447936618842 0,000671396963454643 0,000610360875867857 0,00104885819603788 0,000948842834893899 39559 41552 579 665 0 False 668 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 273 362 0,00158190464481728 0,000875844910972786 0,000747692072938125 0,000671396963454643 0,00567277113948635 0,000735314121576326 60025 38170 579 665 0 True 271 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 317 362 0,000889898777868304 0,000968225094666169 0,000793469138628214 0,000869764248111696 0,000662619341314292 0,000698006003073082 33767 42196 579 665 0 True 315 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 361 361 0,000917069851401109 0,000969946036985345 0,000793469138628214 0,000854505226215 0,000699373017589482 0,000729526397306851 34798 42271 579 665 0 True 359 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 403 359 0,000941052079252566 0,000944590820149481 0,000747692072938125 0,000762951094834821 0,000758387053331042 0,000752540145905357 35708 41166 579 665 0 False 403 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 450 361 0,000912826841858159 0,00102616348607844 0,000595101853971161 0,000762951094834821 0,000864364239247616 0,000915020018627075 34637 44721 579 665 0 True 448 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 492 359 0,000983982902516329 0,000990987425074474 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,000848553562996283 0,000881942155797891 37337 43188 579 665 0 False 492 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 536 359 0,00108346961695507 0,000994957065357374 0,000885023270008392 0,000778210116731518 0,000917028450193937 0,000857522649124873 41112 43361 579 665 0 False 536 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 582 362 0,000944188216740834 0,000922470974873668 0,000610360875867857 0,000442511635004196 0,000978853614918155 0,00108450493419545 35827 40202 579 665 0 True 580 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 626 361 0,000926372847479751 0,000899961049338843 0,000518806744487678 0,000442511635004196 0,000999550928392205 0,00101162363434134 35151 39221 579 665 0 True 624 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 670 361 0,000991177570871766 0,00103545657460199 0,000656137941557946 0,000686655985351339 0,000991300463315659 0,00102968860714853 37610 45126 579 665 0 True 668 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 273 406 0,000874349860909667 0,000854665847498123 0,000762951094834821 0,000686655985351339 0,000712637630111202 0,000735052547222905 33177 37247 579 665 0 True 271 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 317 407 0,000852212419816014 0,00103226709483712 0,000747692072938125 0,000946059357595178 0,000639762895908477 0,000680573460357712 32337 44987 579 665 0 True 315 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 361 406 0,000881649945651264 0,000941974987824333 0,000732433051041428 0,000793469138628214 0,000685019701944867 0,000694030801782732 33454 41052 579 665 0 True 359 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 405 405 0,00101352584473774 0,000917973578946221 0,000854505226215 0,000671396963454643 0,000814341044065467 0,000805912191497365 38458 40006 579 665 0 True 403 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 450 406 0,000939075522012061 0,000914279289434389 0,000717174029144732 0,000732433051041428 0,000831755696782977 0,000784276906533289 35633 39845 579 665 0 True 447 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 494 406 0,000982796968172026 0,00104748022493863 0,000762951094834821 0,000762951094834821 0,000875600548480863 0,000957898265588002 37292 45650 579 665 0 True 492 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 538 406 0,00110647674323454 0,00101838482679576 0,000885023270008392 0,000854505226215 0,000921206749798662 0,000832373720045345 41985 44382 579 665 0 True 536 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 582 406 0,000999821714536907 0,000934311058029601 0,000701915007248035 0,000549324788281071 0,000976768127791969 0,000999339381960389 37938 40718 579 665 0 True 580 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 626 405 0,000978079584891355 0,000942502743468881 0,000701915007248035 0,000595101853971161 0,000949026636259195 0,000968276015209388 37113 41075 579 665 0 True 624 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 671 406 0,000937151672964637 0,000951589318914131 0,000564583810177768 0,000564583810177768 0,000934186873440898 0,000975716489833312 35560 41471 579 665 0 True 668 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 274 451 0,000931617312691224 0,000884403730773489 0,000823987182421607 0,000701915007248035 0,000788066742287104 0,000837027721336031 35350 38543 579 665 0 True 271 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 318 451 0,000979054686463337 0,000920612357168958 0,00080872816052491 0,000762951094834821 0,000825182678708329 0,000797795783923264 37150 40121 579 665 0 True 315 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 362 450 0,000883758273374469 0,000984264277080892 0,000732433051041428 0,000885023270008392 0,000749856704017679 0,000738074240675272 33534 42895 579 665 0 True 359 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 406 450 0,000930879397988102 0,000989197645062531 0,000778210116731518 0,000793469138628214 0,000815162792521754 0,000837889236863602 35322 43110 579 665 0 True 403 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 450 449 0,00104454461636539 0,000973869785473067 0,000701915007248035 0,000610360875867857 0,00106912152439578 0,000990904746155961 39635 42442 579 665 0 True 447 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 495 451 0,00107756629933009 0,00102487851581345 0,000854505226215 0,000656137941557946 0,000985316406492957 0,00102520516859301 40888 44665 579 665 0 True 492 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 539 451 0,00103052423700608 0,00097474172958145 0,000762951094834821 0,000747692072938125 0,000938319983095803 0,000905213699740755 39103 42480 579 665 0 True 536 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 583 450 0,000954835271743019 0,000932314764939357 0,000625619897764553 0,000518806744487678 0,000972401536936606 0,00102052614180178 36231 40631 579 665 0 True 580 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 627 450 0,000897699590444163 0,00092781736901191 0,000534065766384375 0,000503547722590982 0,000942107641617135 0,000984523183430993 34063 40435 579 665 0 True 624 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 671 450 0,000915620376091405 0,00101095035597692 0,000549324788281071 0,000671396963454643 0,000937264879798032 0,00102028768521145 34743 44058 579 665 0 True 668 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 271 489 0,000942264367693409 0,000964966777208528 0,000823987182421607 0,000839246204318303 0,000805603186895303 0,00077149352380337 35754 42054 579 665 0 False 271 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 318 495 0,000982638843592786 0,000969739523907044 0,00080872816052491 0,000854505226215 0,000781419637439163 0,000777577601255746 37286 42262 579 665 0 True 315 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 361 494 0,000967274405309929 0,000918180092024522 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,000812481321378694 0,000801745432805216 36703 40015 579 665 0 True 359 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 406 494 0,000941658223472988 0,000968729904413127 0,000686655985351339 0,000701915007248035 0,000869004694807507 0,000888348946698535 35731 42218 579 665 0 True 403 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 451 495 0,000918097661166171 0,000914210451741622 0,000564583810177768 0,000549324788281071 0,000948770529140179 0,000975951735477818 34837 39842 579 665 0 True 447 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 494 495 0,000943476656134252 0,000926394723361391 0,000595101853971161 0,000610360875867857 0,000946058807725435 0,000929562232872027 35800 40373 579 665 0 True 492 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 536 495 0,000986196646625694 0,000870888597093558 0,000701915007248035 0,00064087891966125 0,000873452452752648 0,000834605475841106 37421 37954 579 665 0 True 536 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 581 494 0,000963110458056599 0,000912879589681459 0,000656137941557946 0,000473029678797589 0,000926230075937288 0,000937489809485575 36545 39784 579 665 0 True 580 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 625 494 0,000965060661200563 0,000935481298806641 0,000610360875867857 0,000579842832074464 0,000962809403520301 0,000923750390753332 36619 40769 579 665 0 True 624 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 669 494 0,000977341670188233 0,000929698932614209 0,00064087891966125 0,000610360875867857 0,000984645803754923 0,000953140631741196 37085 40517 579 665 0 True 668 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 274 539 0,000924501706625407 0,000869557735033395 0,000732433051041428 0,000717174029144732 0,000783046142119097 0,000734516939013932 35080 37896 579 665 0 True 271 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 318 539 0,000836610794664297 0,000905995820404754 0,000717174029144732 0,000778210116731518 0,000692822599838718 0,000730067180576335 31745 39484 579 665 0 True 315 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 362 539 0,000970278772315496 0,00101056027571791 0,000854505226215 0,000900282291905089 0,000732324976289546 0,00074332750714466 36817 44041 579 665 0 True 359 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 405 538 0,00095538870777036 0,000913980992765732 0,000686655985351339 0,000625619897764553 0,00088319375987543 0,000899562523236126 36252 39832 579 665 0 True 403 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 449 538 0,000942369784079569 0,000926945424903527 0,000564583810177768 0,000473029678797589 0,000983172511553156 0,0010640915703893 35758 40397 579 665 0 True 447 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 493 539 0,000904393530965339 0,00100659063543501 0,000549324788281071 0,000701915007248035 0,000970669797778943 0,00105319607682097 34317 43868 579 665 0 True 491 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 537 539 0,00104414930491729 0,00101333672932618 0,000717174029144732 0,00064087891966125 0,00104914018546858 0,0010490128110756 39620 44162 579 665 0 True 536 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 582 539 0,000873163926565364 0,000847667348733473 0,000579842832074464 0,000610360875867857 0,000854966359439017 0,000782903351652587 33132 36942 579 665 0 True 580 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 626 539 0,000972466162328321 0,000883049922815737 0,000701915007248035 0,000534065766384375 0,000913636119663916 0,000903511847136895 36900 38484 579 665 0 True 624 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 670 538 0,000897910423216483 0,000935251839830751 0,000518806744487678 0,000579842832074464 0,000911325495924455 0,000965480134640788 34071 40759 579 665 0 True 668 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 271 575 0,000934621679696791 0,000926394723361391 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,000694096050352996 0,000685399329089214 35464 40373 579 665 0 False 271 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 315 575 0,000896935321644501 0,000966894232606006 0,000732433051041428 0,000900282291905089 0,000773090436585891 0,000727036228417969 34034 42138 579 665 0 False 315 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 359 575 0,000893667413673533 0,000987063676586752 0,000778210116731518 0,000869764248111696 0,000710262641138751 0,000742473558254881 33910 43017 579 665 0 False 359 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 403 575 0,000978343125856755 0,000853013742871713 0,000778210116731518 0,000701915007248035 0,000811836011736866 0,000683552716358904 37123 37175 579 665 0 False 403 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 447 575 0,000943397593844632 0,000932177089553823 0,000579842832074464 0,000549324788281071 0,000973254711433942 0,000993586460894531 35797 40625 579 665 0 False 447 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 491 575 0,000948141331221843 0,000993534419706855 0,000488288700694286 0,000595101853971161 0,00105512532790062 0,00107527752771434 35977 43299 579 665 0 False 491 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 536 575 0,000988410390735059 0,000971162169557563 0,000701915007248035 0,000625619897764553 0,00102085665618574 0,000960573122294406 37505 42324 579 665 0 False 536 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 580 575 0,000935781259944554 0,000961524892570176 0,000656137941557946 0,000701915007248035 0,000877875919308733 0,000887549425871713 35508 41904 579 665 0 False 580 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 627 583 0,000994181937877333 0,000969900145190167 0,000747692072938125 0,000762951094834821 0,000856268970331668 0,000774810897783696 37724 42269 579 665 0 True 624 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 671 583 0,000901599996732092 0,000814831769283589 0,000686655985351339 0,000488288700694286 0,000802178924132549 0,000812205129036219 34211 35511 579 665 0 True 668 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 271 618 0,000913538402464741 0,000957738819467988 0,000747692072938125 0,000839246204318303 0,000722209893658163 0,000725179068243753 34664 41739 579 665 0 False 271 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 315 618 0,000912826841858159 0,000974099244448957 0,000762951094834821 0,000854505226215 0,000725843067679137 0,000720675583432665 34637 42452 579 665 0 False 315 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 359 618 0,000886736286283497 0,000949684809414243 0,000762951094834821 0,000839246204318303 0,000681074549599712 0,000733770450694361 33647 41388 579 665 0 False 359 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 403 618 0,000894405328376655 0,000936743323174037 0,000701915007248035 0,000778210116731518 0,00073748361619112 0,00072690905922399 33938 40824 579 665 0 False 403 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 447 618 0,000919468074186255 0,000948078596583012 0,00064087891966125 0,000625619897764553 0,000908299259671707 0,000973301462957901 34889 41318 579 665 0 False 447 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 491 619 0,000898332088761124 0,000936858052661982 0,000564583810177768 0,000595101853971161 0,000957915510815419 0,00101360411907475 34087 40829 579 665 0 False 491 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 535 619 0,000993628501849992 0,000876074369948676 0,000610360875867857 0,000473029678797589 0,00103171862054092 0,000979290798655321 37703 38180 579 665 0 False 535 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 580 619 0,000878513808162997 0,000915541313801785 0,000656137941557946 0,000671396963454643 0,000792869262514569 0,000823279805201742 33335 39900 579 665 0 False 580 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 624 619 0,000991520174126787 0,000943535308860386 0,000823987182421607 0,000747692072938125 0,000769074864028871 0,000706224536514811 37623 41120 579 665 0 False 624 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 668 619 0,00100256254057707 0,000959987517431712 0,000869764248111696 0,000747692072938125 0,000737463383913565 0,000817043763876913 38042 41837 579 665 0 False 668 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 271 662 0,00385779171382403 0,0559890685743886 0,00115968566414893 0,0643778133821622 0,00919084611682427 0,0365383528763601 146383 2440047 579 665 0 False 271 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 315 662 0,000998635780192604 0,00103490587305985 0,000854505226215 0,000961318379491875 0,000685886610970746 0,000679736346333512 37893 45102 579 665 0 False 315 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 359 662 0,000926425555672831 0,000939037912932939 0,000778210116731518 0,000823987182421607 0,000675557723616922 0,000658079119625639 35153 40924 579 665 0 False 359 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 403 662 0,00089646094790678 0,000951681102504487 0,000778210116731518 0,000793469138628214 0,000685010011062973 0,000707200284253507 34016 41475 579 665 0 False 403 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 447 662 0,00114772090431974 0,000949661863516654 0,000762951094834821 0,000778210116731518 0,00138597065406164 0,000804392086248561 43550 41387 579 665 0 False 447 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 491 662 0,000937520630316198 0,000981717282448511 0,000686655985351339 0,000732433051041428 0,000856492812305078 0,00085996784985186 35574 42784 579 665 0 False 491 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 535 662 0,000967300759406469 0,000990620290713049 0,000686655985351339 0,000717174029144732 0,00094269706181405 0,000934810197745839 36704 43172 579 665 0 False 535 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 580 662 0,00100127118984661 0,00101714574832595 0,000854505226215 0,000900282291905089 0,00074572628227794 0,000692255033452525 37993 44328 579 665 0 False 580 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 624 662 0,000929113673519918 0,000979904556538979 0,000762951094834821 0,000793469138628214 0,000733822166486144 0,000746913469942382 35255 42705 579 665 0 False 624 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 668 667 0,0010073853402439 0,072621608954866 0,000854505226215 0,0718089570458534 0,00076030868235813 0,0216109709510932 38225 3164906 579 665 0 True 668 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F8_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F8_1.csv new file mode 100755 index 0000000..468e5c8 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F8_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 243 248 0,0108993748332193 0,0447374100162285 0,0108796826123445 0,0455939574273289 0,00169163814929821 0,00919026573481915 445003 1949691 623 665 0 True 243 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 287 249 0,0106338237651551 0,0105956353460901 0,0105897611963073 0,010605020218204 0,0015055908245105 0,0014792333302748 434161 461766 623 665 0 False 287 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 331 248 0,010697137684261 0,0636968479794129 0,0107423514152743 0,0637064164187076 0,00134595536560313 0,0097096139946011 436746 2775958 623 665 0 True 332 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 376 247 0,0108665299722827 0,0819798867734683 0,0109102006561379 0,0801861600671397 0,00135182950357187 0,0114398843927158 443662 3572747 623 665 0 True 376 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 419 247 0,0105977458530301 0,0736741143313766 0,0106355382619974 0,0746471351186389 0,00156170069233255 0,0148723072181215 432688 3210775 623 665 0 True 420 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 464 247 0,0108492380469873 0,0659687442455991 0,0108033875028611 0,0677805752651255 0,00169753872610165 0,0186159590773994 442956 2874969 623 665 0 True 464 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 508 247 0,0106717876238066 0,0786274452439178 0,0106355382619974 0,0769970244907301 0,00179913659610274 0,0204611806728201 435711 3426645 623 665 0 True 508 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 552 247 0,0105380078844811 0,0714543970363079 0,0106507972838941 0,0715648126955062 0,00155070946719127 0,0188483986011928 430249 3114038 623 665 0 True 552 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 597 249 0,0102085305770102 0,0102518369625139 0,0101319905394064 0,01025406271458 0,00188997238571109 0,00198760953206691 416797 446783 623 665 0 False 597 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 640 248 0,0103346195733573 0,0452920353068526 0,0103761348897536 0,0454566262302586 0,00177960432948144 0,00898159911425606 421945 1973862 623 665 0 True 641 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 243 292 0,010673575599085 0,0111339231576309 0,0107118333714809 0,0107423514152743 0,00156612010370957 0,00352249279267672 435784 485225 623 665 0 False 243 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 287 292 0,0103156621368435 0,0106526100098036 0,0103608758678569 0,010605020218204 0,00140634840548532 0,00144072961799622 421171 464249 623 665 0 False 287 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 332 291 0,0107878100744079 0,10289190589199 0,010757610437171 0,10106050202182 0,00130465510629398 0,0255204838215823 440448 4484109 623 665 0 True 332 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 376 292 0,0108469357226561 0,0511312155417154 0,0108033875028611 0,0514534218356603 0,00140289148068826 0,0085683213213557 442862 2228338 623 665 0 True 376 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 420 291 0,0111481973106647 0,077542677935397 0,0109864957656214 0,0774242771038376 0,00255964653010206 0,0162069512748992 455162 3379370 623 665 0 True 420 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 465 293 0,0106714692172501 0,042580266183885 0,0106813153276875 0,0433356221866178 0,0017604092618164 0,00854516588961493 435698 1855681 623 665 0 True 464 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 508 292 0,010597647881782 0,0477983239169106 0,0106202792401007 0,0485084306095979 0,00158660000171336 0,012551147097956 432684 2083088 623 665 0 True 508 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 553 292 0,0106469519124049 0,0516850836177191 0,0106507972838941 0,0532234683756771 0,00165285316817882 0,0101588346285843 434697 2252476 623 665 0 True 552 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 597 292 0,0104019748064486 0,0103812518249159 0,0104219119554437 0,0103608758678569 0,00203440223184445 0,00206457486370403 424695 452423 623 665 0 False 597 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 641 292 0,0102862707624037 0,0101166167880218 0,0103303578240635 0,0100251773861295 0,00182876775273802 0,00195823903419008 419971 440890 623 665 0 False 641 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 244 336 0,0106853076560489 0,0512672388226231 0,0106965743495842 0,0518043793392844 0,00160729179341883 0,0114998591036881 436263 2234266 623 665 0 True 243 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 288 337 0,010588071192277 0,0656302234184683 0,0105897611963073 0,0652475776302739 0,00135235762249698 0,0218994649777995 432293 2860216 623 665 0 True 287 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 332 336 0,0105458455843318 0,0389391652626646 0,0105439841306172 0,0402838178072786 0,00134611981859103 0,00667659393213285 430569 1696999 623 665 0 True 331 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 376 336 0,0106982153679904 0,0362415308126118 0,010757610437171 0,0365148393987945 0,00130578887618597 0,00580657044379657 436790 1579434 623 665 0 True 376 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 420 336 0,0106714202316261 0,068791273216229 0,0106355382619974 0,0660410467689021 0,0017681697351404 0,0137348583087726 435696 2997977 623 665 0 True 420 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 465 337 0,0105133191299516 0,0321415807773038 0,010605020218204 0,0330968184939345 0,00170622430451484 0,00464174229302896 429241 1400755 623 665 0 True 464 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 509 337 0,0106494501792323 0,0289207569163238 0,0106355382619974 0,0293583581292439 0,00170912090099691 0,00334600305120932 434799 1260389 623 665 0 True 508 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 553 335 0,0106684566013701 0,0512757746965262 0,010605020218204 0,0518959334706645 0,00178258201740968 0,00903632356932786 435575 2234638 623 665 0 True 552 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 597 336 0,0103619290587743 0,0587601298967263 0,010406652933547 0,0588235294117647 0,00202021416999122 0,0133325753257374 423060 2560812 623 665 0 True 597 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 641 335 0,0105189524767193 0,063842118457049 0,0105134660868238 0,0622568093385214 0,00196758986408448 0,0187225983400278 429471 2782289 623 665 0 True 641 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 244 381 0,0106560877312933 0,0436525050323222 0,0107728694590677 0,0462195773250935 0,00156926165691309 0,00880608817854114 435070 1902410 623 665 0 True 243 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 288 381 0,0106262799790488 0,0346327939326458 0,0106660563057908 0,0335851071946288 0,00143023500990067 0,0063912547907024 433853 1509324 623 665 0 True 287 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 332 380 0,0105921859846986 0,0866279913562804 0,0106507972838941 0,0840009155413138 0,00142658881049034 0,024255323002307 432461 3775315 623 665 0 True 331 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 377 380 0,0109082902167994 0,0681028962885584 0,0109712367437247 0,0671396963454643 0,00133363497636977 0,0167888843511121 445367 2967977 623 665 0 True 376 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 420 380 0,0107006401563817 0,041958019333066 0,0107423514152743 0,0437933928435187 0,00159933897731938 0,00701360645943545 436889 1828563 623 665 0 True 420 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 465 380 0,0106296599871094 0,0527954585479492 0,0106813153276875 0,0532692454413672 0,00178952553684012 0,00952566300994842 433991 2300867 623 665 0 True 464 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 509 380 0,01082325117342 0,0411290528908676 0,0107881284809644 0,0421149004348821 0,00168267116573491 0,00508579656761088 441895 1792436 623 665 0 True 508 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 552 380 0,0107102168458867 0,0510104512827044 0,0106965743495842 0,0516670481422141 0,00172615136026025 0,00849818213517991 437280 2223075 623 665 0 True 552 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 597 380 0,0103247489701079 0,0425612669806813 0,0102998397802701 0,0426794842450599 0,00202940846051897 0,00793576623077643 421542 1854853 623 665 0 True 597 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 641 380 0,0104500052108458 0,095922273066507 0,0103608758678569 0,0944075684748608 0,00204349026086632 0,0238194750515915 426656 4180367 623 665 0 True 641 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 245 425 0,0106026444154368 0,0428213128380576 0,0105897611963073 0,0432898451209277 0,00163102502444367 0,00600975494538963 432888 1866186 623 665 0 True 243 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 288 425 0,010752442453832 0,0561798637128413 0,0106813153276875 0,0563210498207065 0,00160119330853808 0,00833851963864423 439004 2448362 623 665 0 True 287 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 333 425 0,0106525852591725 0,0363257422567634 0,0106813153276875 0,0366521705958648 0,00141305511751792 0,00489748046546816 434927 1583104 623 665 0 True 331 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 376 424 0,0109780212526579 0,05498156010305 0,0109407186999313 0,0525825894560159 0,00172833253576815 0,0193395172078627 448214 2396139 623 665 0 True 376 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 421 424 0,011268554988996 0,0913893568895918 0,0110780498970016 0,0904554818036164 0,00281973733652712 0,0110762083988525 460076 3982819 623 665 0 True 420 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 465 425 0,0115668039611245 0,0584124536564575 0,0112153810940719 0,0588845654993515 0,00281264710322188 0,0119900845532526 472253 2545660 623 665 0 True 464 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 509 424 0,0107514627413506 0,0537947982797461 0,0106660563057908 0,0530556191348135 0,00183794610854834 0,00939559189167596 438964 2344419 623 665 0 True 508 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 552 422 0,0111437151260627 0,0307241897373326 0,0109102006561379 0,0320744640268559 0,00240847925184318 0,00590631808948856 454979 1338984 623 665 0 False 552 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 598 424 0,0106029873148053 0,0429384516452495 0,0107270923933776 0,0418402380407416 0,00197548003340036 0,008607632593313 432902 1871291 623 665 0 True 597 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 641 424 0,0103701831364295 0,0686994437340777 0,0102388036926833 0,0683146410315099 0,00193953256125973 0,0097749001264272 423397 2993975 623 665 0 True 641 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 243 469 0,0104430247594163 0,0518475864644445 0,0104829480430304 0,0538643472953384 0,00161191553501097 0,0146711787261813 426371 2259558 623 665 0 True 243 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 288 469 0,0106105800865356 0,0536436307064296 0,0105897611963073 0,0539101243610285 0,00151996414538312 0,00668689189369745 433212 2337831 623 665 0 True 287 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 332 468 0,010697137684261 0,0670216855941639 0,0106965743495842 0,0660105287251087 0,00156006301637044 0,0171126504267458 436746 2920857 623 665 0 True 331 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 376 468 0,0118401437434153 0,0867205551071545 0,0115205615320058 0,0854200045777066 0,0024592834144384 0,0221151538348493 483413 3779349 623 665 0 True 376 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 420 468 0,011525876472217 0,0939451627466469 0,0112306401159686 0,0913252460517281 0,00266737661500757 0,0327557448428332 470582 4094203 623 665 0 True 420 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 464 469 0,0111282356688577 0,0460812824003245 0,0112001220721752 0,047547112230106 0,00237620853301663 0,00758134594098496 454347 2008258 623 665 0 True 464 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 509 468 0,010919801838455 0,0399317130087751 0,0108796826123445 0,0412909132524605 0,00206188896126026 0,00584307383566645 445837 1740255 623 665 0 True 508 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 553 469 0,0109834341641173 0,0937862165140478 0,0109102006561379 0,0922713054093233 0,00194949715754315 0,015341592520787 448435 4087276 623 665 0 True 552 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 596 469 0,0107942026983486 0,059748983353325 0,0107881284809644 0,0626230258640421 0,00201118598579885 0,0173314864144737 440709 2603907 623 665 0 True 597 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 641 468 0,0103780208362801 0,0741410174555179 0,0104219119554437 0,0722514686808576 0,00185759555081525 0,0128114131389021 423717 3231123 623 665 0 True 641 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 244 513 0,0106294150589891 0,052004054540104 0,0107118333714809 0,054337376974136 0,00150222121473533 0,013882580107289 433981 2266377 623 665 0 True 243 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 288 513 0,0105247082875471 0,0957702794408773 0,0104982070649271 0,0901503013656825 0,00159239536373558 0,0270449048160067 429706 4173743 623 665 0 True 287 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 332 513 0,0108056163487561 0,055580356246533 0,0107728694590677 0,0572365911345083 0,00159060228265117 0,0133285821570505 441175 2422235 623 665 0 True 331 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 376 512 0,0112047512136495 0,0573624952745792 0,0110322728313115 0,0567940794995041 0,00187485166843181 0,0124164774875517 457471 2499902 623 665 0 True 376 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 420 513 0,0109307991110579 0,0559798213776602 0,0109407186999313 0,0560311284046693 0,00187555083463116 0,00910528985623875 446286 2439644 623 665 0 True 420 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 464 512 0,0109844628622227 0,0580758373388266 0,0109712367437247 0,0594338902876326 0,00194798322017738 0,0125512837150386 448477 2530990 623 665 0 True 464 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 509 513 0,0108322645282482 0,0672845996887389 0,0109102006561379 0,0673075455863279 0,0018853655897282 0,016118260933715 442263 2932315 623 665 0 True 508 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 553 513 0,0106031587644895 0,056708606030985 0,0105439841306172 0,0571145189593347 0,00171480332393032 0,0138622403603918 432909 2471405 623 665 0 True 552 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 597 513 0,010481160067752 0,0436997965272531 0,0104982070649271 0,0428625925078202 0,00182318917943107 0,00764079815521717 427928 1904471 623 665 0 True 596 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 640 512 0,0102855849636667 0,064996664240138 0,0102235446707866 0,0646066987106127 0,00193594938967173 0,0174105651516111 419943 2832605 623 665 0 True 641 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 244 557 0,0104134864281042 0,0441614679867442 0,0103303578240635 0,0455176623178454 0,00154373989996761 0,0100034556984751 425165 1924591 623 665 0 True 243 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 288 557 0,0104758206347288 0,0503910267772888 0,0104676890211337 0,0515602349889372 0,0014965994296846 0,0123751472668666 427710 2196080 623 665 0 True 287 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 332 556 0,0105775147902907 0,0477943083848325 0,0105592431525139 0,0489356832227054 0,0013735675859981 0,00988105095483852 431862 2082913 623 665 0 True 331 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 376 557 0,0107465151933199 0,0474066603909637 0,010757610437171 0,0476081483176928 0,00144539937481927 0,00789463427886768 438762 2066019 623 665 0 True 376 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 422 555 0,0107503360719971 0,0855371663307961 0,0107118333714809 0,0823071641107805 0,00184801899060078 0,0209163568949383 438918 3727776 623 665 0 True 420 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 465 558 0,0108912187268122 0,0597402639122411 0,0109102006561379 0,0585793850614176 0,00205031147566908 0,0125536831357898 444670 2603527 623 665 0 True 464 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 509 557 0,0106107025505957 0,0527229036197727 0,0106507972838941 0,052674143587396 0,00202484229868933 0,00878202318350672 433217 2297705 623 665 0 True 508 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 552 552 0,0105021014220404 0,0337721392058769 0,0104676890211337 0,0373388265812161 0,00198730053425909 0,0112275001268431 428783 1471816 623 665 0 False 552 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 597 557 0,0105667379529961 0,0463118886710941 0,0105592431525139 0,046845197222858 0,00162464052517695 0,00655622922505549 431422 2018308 623 665 0 True 596 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 641 556 0,0103597002128793 0,0511089121292588 0,0104219119554437 0,0500801098649577 0,00186216896864091 0,006970807998645 422969 2227366 623 665 0 True 641 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 243 595 0,0104960761902802 0,00990459669429927 0,01025406271458 0,00987258716716258 0,00205474034904557 0,00124675375636294 428537 431650 623 665 0 False 243 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 287 595 0,0103409877044859 0,00998628408971616 0,01025406271458 0,00997940032043946 0,00194178475685862 0,00150989476784972 422205 435210 623 665 0 False 287 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 332 600 0,0104522830423648 0,0775358171120179 0,0104676890211337 0,0778820477607385 0,00143475264622215 0,0161656647918229 426749 3379071 623 665 0 True 331 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 377 601 0,0105116536187334 0,0728979005077354 0,0105592431525139 0,0714427405203326 0,0013079630750997 0,0191548534149146 429173 3176947 623 665 0 True 375 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 420 595 0,0104597288572229 0,0104577534474777 0,0105439841306172 0,010452429999237 0,00171750534381474 0,00166824950719069 427053 455757 623 665 0 False 420 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 464 595 0,0106711508106937 0,0103858868962289 0,0106355382619974 0,0105134660868238 0,00213609218244588 0,00185059240333703 435685 452625 623 665 0 False 464 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 508 595 0,0105904714878563 0,0104777163783801 0,0105592431525139 0,0105287251087205 0,00203896696288204 0,00224551315644221 432391 456627 623 665 0 False 508 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 552 595 0,0102817150993655 0,0103445842805687 0,0103303578240635 0,0102845807583734 0,00204302436189044 0,00177926163459947 419785 450825 623 665 0 False 552 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 596 595 0,0103170092415054 0,0102584912728147 0,0102082856488899 0,0102235446707866 0,00170345272579629 0,00159314173121952 421226 447073 623 665 0 False 596 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 641 595 0,0102543321355124 0,0103276272622504 0,0102082856488899 0,0103456168459602 0,00162248372240891 0,00159909908835034 418667 450086 623 665 0 False 641 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 245 645 0,00995765070335396 0,0431095362576733 0,00987258716716258 0,0437628747997253 0,00136882412404074 0,00816221645905221 406554 1878747 623 665 0 True 243 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 287 639 0,00989330808614269 0,0100106985247509 0,00988784618905928 0,0100404364080262 0,0013283961220618 0,00140250504450597 403927 436274 623 665 0 False 287 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 331 639 0,0100665212528416 0,0100347228795266 0,00991836423285267 0,0100709544518196 0,00176056315308936 0,00121959886042684 410999 437321 623 665 0 False 331 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 375 639 0,0103707709639183 0,00995578899182036 0,0101930266269932 0,0100099183642329 0,00205483576307741 0,00126861329410663 423421 433881 623 665 0 False 375 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 420 639 0,0101284145888496 0,0100633823056153 0,0101777676050965 0,0100404364080262 0,00161064334368721 0,00153530036769898 413526 438570 623 665 0 False 420 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 464 639 0,0100736241683313 0,0101270801173224 0,0100404364080262 0,0101167315175097 0,00179305098571221 0,0017919203704287 411289 441346 623 665 0 False 464 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 508 639 0,0100038441468486 0,010142958678454 0,00994888227664607 0,0101930266269932 0,00178550549974505 0,00183037139754683 408440 442038 623 665 0 False 508 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 552 639 0,0102012562118364 0,0100758648739037 0,0102082856488899 0,0101167315175097 0,0017098039650587 0,00174040375599993 416500 439114 623 665 0 False 552 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 596 639 0,00996007549174525 0,00998123599224658 0,00997940032043946 0,00994888227664607 0,00143212632070014 0,00129253133128361 406653 434990 623 665 0 False 596 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 642 644 0,0103435104641253 0,0441093578533195 0,0103150988021668 0,0443579766536965 0,00143349083100191 0,00756197333252783 422308 1922320 623 665 0 True 641 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F8_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F8_2.csv new file mode 100755 index 0000000..af73763 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F8_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 243 248 0,00835621268137387 0,664771174904531 0,00820935378042268 0,675883115892271 0,00193633215274835 0,205091096138658 341170 28971243 623 665 4 True 243 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 287 249 0,00702113399025504 0,00691031768021565 0,00700389105058366 0,00689707789730678 0,00153497338377701 0,00135115415189935 286661 301157 623 665 0 False 287 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 331 248 0,00664614903802644 0,00676883327568176 0,00671396963454643 0,00666819256885634 0,00126747650583721 0,00123931493106417 271351 294991 623 665 0 True 332 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 376 247 0,00673603765818836 0,006927550049305 0,00669871061264973 0,00692759594110018 0,00124540375829609 0,00125482596833128 275021 301908 623 665 0 True 376 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 419 247 0,00666326951363766 0,00693851818835255 0,00671396963454643 0,00659189745937285 0,00144768520243912 0,00345458969652161 272050 302386 623 665 0 True 420 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 464 247 0,00704104664643805 0,0066975174259751 0,00695811398489357 0,00666819256885634 0,00165004713952195 0,00146179074489535 287474 291883 623 665 0 True 464 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 508 247 0,00726968704676817 0,0072166913048242 0,00730907148851759 0,00718699931334401 0,00154979519407211 0,00156197269067403 296809 314509 623 665 0 True 508 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 552 247 0,00755162380608257 0,00766083209855722 0,00747692072938125 0,0076752880140383 0,00154227331970731 0,00128479936404776 308320 333865 623 665 0 True 552 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 597 249 0,00803354437564822 0,00767023991656872 0,00804150453955901 0,00775158312352178 0,0017985614372091 0,00188285524664998 327996 334275 623 665 0 False 597 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 640 248 0,00961409002896398 0,69138127993364 0,00961318379491875 0,689768825818265 0,00189634225106076 0,193183183107542 392527 30130932 623 665 8 True 641 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 243 292 0,00691591286976033 0,00736035556962904 0,00688181887541009 0,00697337300679027 0,00154659229392921 0,00270992664020275 282365 320770 623 665 0 False 243 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 287 292 0,00651371640336281 0,00688314973747025 0,00650034332799268 0,0068207827878233 0,00135665730866774 0,00136256758370516 265944 299973 623 665 0 False 287 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 332 291 0,00625781550323973 0,00670878386169131 0,00627145799954223 0,00663767452506294 0,00121822813399347 0,00117030764532396 255496 292374 623 665 0 True 332 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 376 292 0,00649282403469848 0,0065458450429117 0,00646982528419928 0,00654612039368277 0,00131574752126953 0,00122329897947747 265091 285273 623 665 0 True 376 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 420 291 0,00712723685198296 0,00669464918877647 0,00683604180972 0,00675974670023652 0,00236954500688415 0,00151739282781793 290993 291758 623 665 0 True 420 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 465 293 0,00691738243848232 0,00714074038380456 0,00694285496299687 0,00720225833524071 0,00174061979042563 0,0018077936190188 282425 311199 623 665 0 True 464 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 508 292 0,00727710836881423 0,00714750942359332 0,00727855344472419 0,00711070420386053 0,00160043429441326 0,00166172986705425 297112 311494 623 665 0 True 508 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 553 292 0,00754870916145062 0,00753272515231774 0,00753795681696803 0,00752269779507134 0,00149237871389659 0,00138609476665102 308201 328282 623 665 0 True 552 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 597 292 0,00780245469411478 0,00792987274778845 0,00775158312352178 0,00796520943007553 0,00183002204247558 0,00182079016180024 318561 345590 623 665 0 False 597 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 641 292 0,00815985380730354 0,00785777673756375 0,00814831769283589 0,00782787823300526 0,00191593942298311 0,0019179588375374 333153 342448 623 665 0 False 641 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 244 336 0,00636734735865229 0,00632035570730442 0,00636301213092241 0,0063935301747158 0,00145243668183469 0,00140860638129514 259968 275446 623 665 0 True 243 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 288 337 0,00612810157071179 0,00637331483893988 0,00610360875867857 0,00634775310902571 0,00137643436573281 0,00135672567161312 250200 277754 623 665 0 True 287 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 332 336 0,00658009192397284 0,0063241647263042 0,00659189745937285 0,00633249408712902 0,00138178092918399 0,00127180477202635 268654 275612 623 665 0 True 331 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 376 336 0,00675203146444605 0,00649368901769186 0,00674448767833982 0,00648508430609598 0,00121651670602898 0,00127129517764116 275674 283000 623 665 0 True 376 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 420 336 0,00679709823858718 0,00705336240578558 0,00674448767833982 0,00709544518196384 0,00153932935241523 0,00164974980560151 277514 307391 623 665 0 True 420 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 465 337 0,00707795731417212 0,00725886586459282 0,00714122224765393 0,00733958953231098 0,00164673493756065 0,00143752803079794 288981 316347 623 665 0 True 464 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 509 337 0,00735795914133589 0,0070903053009039 0,00740062561989776 0,00709544518196384 0,0016360148887532 0,00174378504080575 300413 309001 623 665 0 True 508 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 553 335 0,00774903587107033 0,00740275958837354 0,00762951094834821 0,00740062561989776 0,00169758294025701 0,00136163641717868 316380 322618 623 665 0 True 552 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 597 336 0,00771719521542714 0,00761351765772867 0,00785839627679866 0,00762951094834821 0,00189803789527597 0,00206267918093005 315080 331803 623 665 0 True 597 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 641 335 0,0073349603908367 0,00767388831428537 0,00735484855420768 0,00775158312352178 0,00190398713861349 0,00185381961260764 299474 334434 623 665 0 True 641 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 244 381 0,00636815562144938 0,00641076254380515 0,0064087891966125 0,00628671702143893 0,00146857655595076 0,00184728142204191 260001 279386 623 665 0 True 243 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 288 381 0,0063787855018718 0,00623086670670726 0,00642404821850919 0,00619516289005875 0,00139628649906185 0,001324763760817 260435 271546 623 665 0 True 287 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 332 380 0,00665572572753143 0,00671307474454045 0,00669871061264973 0,00677500572213321 0,00129121003585511 0,0013727158487565 271742 292561 623 665 0 True 331 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 377 380 0,00678759502751829 0,00701240397858918 0,00683604180972 0,00698863202868696 0,00139246861745629 0,00136851453006827 277126 305606 623 665 0 True 376 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 420 380 0,00728928129639474 0,00720287787447561 0,00729381246662089 0,0072480354009308 0,00157219150731655 0,00163458413932642 297609 313907 623 665 0 True 420 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 465 380 0,00726444558499306 0,00729707078407853 0,00727855344472419 0,00733958953231098 0,00167232307184069 0,00169807510806866 296595 318012 623 665 0 True 464 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 509 380 0,0075458190096307 0,00732710696402255 0,00752269779507134 0,00735484855420768 0,00177040984147312 0,00178850766181863 308083 319321 623 665 0 True 508 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 552 380 0,00735193390957572 0,00736785887814065 0,00746166170748455 0,00740062561989776 0,00179191635353124 0,00153002064719824 300167 321097 623 665 0 True 552 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 597 380 0,00702385269239073 0,0071458802648645 0,00694285496299687 0,00712596322575723 0,0020876505829243 0,00197298098830934 286772 311423 623 665 0 True 597 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 641 380 0,00690947126019559 0,00690850495430611 0,00689707789730678 0,00689707789730678 0,00185011313448572 0,00171070607743941 282102 301078 623 665 0 True 641 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 245 425 0,00610209020433251 0,00640541614966691 0,00607309071488518 0,00645456626230259 0,00155086507867257 0,00147995449900833 249138 279153 623 665 0 True 243 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 288 425 0,00647225007259057 0,00693324063190707 0,00651560234988937 0,00695811398489357 0,00142060234196778 0,00146508538612602 264251 302156 623 665 0 True 287 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 333 425 0,00655128837702177 0,00680476655130617 0,00653086137178607 0,00672922865644312 0,00136075994540975 0,00135401082240085 267478 296557 623 665 0 True 331 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 376 424 0,0070241955917592 0,0078497456734076 0,00698863202868696 0,00718699931334401 0,0014842544681699 0,00425431841491463 286786 342098 623 665 0 True 376 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 421 424 0,00738345615866248 0,00711410019670371 0,00733958953231098 0,00706492713817044 0,00189398480247757 0,00152841305091545 301454 310038 623 665 0 True 420 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 465 425 0,00773162148171471 0,00763240213144443 0,0076600289921416 0,00753795681696803 0,00204169581892456 0,00181639033168138 315669 332626 623 665 0 True 464 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 509 424 0,00739376763252846 0,00758786414422414 0,00741588464179446 0,00762951094834821 0,00171524280457765 0,00165882912986484 301875 330685 623 665 0 True 508 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 552 422 0,00759051839159132 0,00724934331709337 0,00740062561989776 0,0072632944228275 0,00243143572937693 0,0015939427319015 309908 315932 623 665 0 False 552 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 598 424 0,00658041033052927 0,00662675227781057 0,00663767452506294 0,00659189745937285 0,00187923826341525 0,00194147080424957 268667 288799 623 665 0 True 597 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 641 424 0,00627606264820448 0,00647930193990355 0,00624093995574884 0,00663767452506294 0,00177930145379288 0,0017592227926889 256241 282373 623 665 0 True 641 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 243 469 0,0061399071061118 0,00648602508789713 0,00610360875867857 0,00645456626230259 0,00137477485482998 0,00139571118395457 250682 282666 623 665 0 True 243 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 288 469 0,00652456671909353 0,00639676554627585 0,00648508430609598 0,00636301213092241 0,00147522856004285 0,00152956650664597 266387 278776 623 665 0 True 287 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 332 468 0,00671641891574975 0,00664577442691187 0,00679026474402991 0,00657663843747616 0,00143646095462624 0,00161415779884417 274220 289628 623 665 0 True 331 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 376 468 0,00728012098469432 0,00716765592167647 0,0072327763790341 0,0072480354009308 0,00171864455563617 0,00150367464509285 297235 312372 623 665 0 True 376 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 420 468 0,00760886350780421 0,00723252397416062 0,00733958953231098 0,00721751735713741 0,0023543295340421 0,00175652793122187 310657 315199 623 665 0 True 420 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 464 469 0,00745901648378496 0,00751340470654778 0,00744640268558785 0,00750743877317464 0,00203222585568594 0,00195004767482636 304539 327440 623 665 0 True 464 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 509 468 0,0072256244779204 0,0070075623941979 0,00721751735713741 0,00708018616006714 0,00186056457197491 0,00173284640724803 295010 305395 623 665 0 True 508 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 553 469 0,00653282079674873 0,00644536495736939 0,00654612039368277 0,00650034332799268 0,00181659761192711 0,00174153321445896 266724 280894 623 665 0 True 552 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 596 469 0,00612886084788482 0,00605712037016322 0,00608834973678187 0,00601205462729839 0,00180979348654831 0,00169971972261608 250231 263974 623 665 0 True 597 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 641 468 0,00619893478311186 0,00601802056067153 0,00624093995574884 0,005981536583505 0,00173396595753497 0,00170120293125843 253092 262270 623 665 0 True 641 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 244 513 0,00652074584041635 0,00665222222413438 0,00660715648126955 0,00669871061264973 0,00151189428352867 0,00153673408205334 266231 289909 623 665 0 True 243 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 288 513 0,0064671065820636 0,00686931336122407 0,00643930724040589 0,00685130083161669 0,00153746153586475 0,00151914000452125 264041 299370 623 665 0 True 287 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 332 513 0,00659517949618531 0,00666362633523612 0,00660715648126955 0,00665293354695964 0,00151021462851927 0,0014580370989477 269270 290406 623 665 0 True 331 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 376 512 0,00678455791882617 0,00686871676788676 0,00668345159075303 0,0068055237659266 0,00161946554695212 0,00152079146294262 277002 299344 623 665 0 True 376 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 420 513 0,00699250189298821 0,0076711118606771 0,00698863202868696 0,00720225833524071 0,00177267544615467 0,00369091083350587 285492 334313 623 665 0 True 420 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 464 512 0,00671514528952402 0,0066826943761326 0,00669871061264973 0,00668345159075303 0,00186614299340425 0,00160053431860209 274168 291237 623 665 0 True 464 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 509 513 0,00651839453046116 0,00637487515997593 0,00654612039368277 0,00642404821850919 0,00164747549090883 0,00156905343926731 266135 277822 623 665 0 True 508 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 553 513 0,006365657354622 0,00660536670125761 0,00643930724040589 0,00665293354695964 0,00171617328767511 0,00156079078529462 259899 287867 623 665 0 True 552 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 597 513 0,00627567076321194 0,00662923043475018 0,00628671702143893 0,00663767452506294 0,00166379904233705 0,00165450761941181 256225 288907 623 665 0 True 596 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 640 512 0,00622399092982185 0,00627267413211445 0,00616464484626535 0,00633249408712902 0,00182987017468425 0,00186228166157432 254115 273368 623 665 0 True 641 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 244 557 0,0070167497769011 0,0064503671630438 0,00698863202868696 0,00642404821850919 0,00144876706648619 0,00138263493959918 286482 281112 623 665 0 True 243 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 288 557 0,00687770408298851 0,0065337296089847 0,00689707789730678 0,00659189745937285 0,00131975658074663 0,00134295395246225 280805 284745 623 665 0 True 287 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 332 556 0,00641760660894446 0,00713722966147344 0,00643930724040589 0,00704966811627375 0,0013290825362148 0,00148859153909355 262020 311046 623 665 0 True 331 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 376 557 0,00656189376463216 0,00712490771446813 0,00660715648126955 0,00712596322575723 0,00137985640837637 0,0013466405664741 267911 310509 623 665 0 True 376 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 422 555 0,00655310084511223 0,00674501543398437 0,00648508430609598 0,00679026474402991 0,00178135194044981 0,00172594018264116 267552 293953 623 665 0 True 420 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 465 558 0,00650345391512089 0,00659015357115609 0,00643930724040589 0,00660715648126955 0,00193018449906856 0,00184881666028646 265525 287204 623 665 0 True 464 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 509 557 0,00655121489858568 0,00622393704563538 0,00653086137178607 0,00631723506523232 0,00200934816091657 0,00196322337099378 267475 271244 623 665 0 True 508 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 552 552 0,00639531814999423 0,00659173683808973 0,0063935301747158 0,00666819256885634 0,00171644321454082 0,00176153698578936 261110 287273 623 665 0 False 552 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 597 557 0,0064006085973934 0,00639568708908917 0,00643930724040589 0,0063935301747158 0,00159608037353139 0,00149036493699408 261326 278729 623 665 0 True 596 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 641 556 0,00652304816474747 0,00637317716355434 0,00657663843747616 0,00628671702143893 0,00170866660651987 0,00170327191249886 266325 277748 623 665 0 True 641 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 243 595 0,0072124228522345 0,00700187181159582 0,00718699931334401 0,00701915007248035 0,00127425838375696 0,00125564860348154 294471 305147 623 665 0 False 243 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 287 595 0,00699162015175501 0,00650311978160095 0,00700389105058366 0,0064087891966125 0,0013567113885322 0,00133487496908952 285456 283411 623 665 0 False 287 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 332 600 0,0064883418500964 0,00643382317088211 0,00643930724040589 0,00633249408712902 0,00141199970130739 0,00148244723737213 264908 280391 623 665 0 True 331 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 377 601 0,00633915613200205 0,00638499430081269 0,00633249408712902 0,0064087891966125 0,00133495858987775 0,00130966972344225 258817 278263 623 665 0 True 375 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 420 595 0,00641988444046355 0,00607683089619219 0,00643930724040589 0,00608834973678187 0,0016552342821994 0,00159056345465686 262113 264833 623 665 0 False 420 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 464 595 0,00645544800353578 0,00643965142886973 0,00645456626230259 0,00642404821850919 0,00185721650730191 0,0017036353908992 263565 280645 623 665 0 False 464 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 508 595 0,00656471043801598 0,00689106607213846 0,00650034332799268 0,00685130083161669 0,00210397620942841 0,00199716423317871 268026 300318 623 665 0 False 508 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 552 595 0,00655866071344377 0,00687713791230193 0,00659189745937285 0,00695811398489357 0,00204389586915031 0,00172483048331387 267779 299711 623 665 0 False 552 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 596 595 0,00657793655651392 0,00640537025787173 0,00650034332799268 0,00643930724040589 0,00163109589582929 0,00162710181304259 268566 279151 623 665 0 False 596 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 641 595 0,00674598173987385 0,0066703494832297 0,00675974670023652 0,00663767452506294 0,00141979152011814 0,00149605091655142 275427 290699 623 665 0 False 641 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 245 645 0,00835893138350955 0,686139978006357 0,00830090791180285 0,688807507438773 0,00171447789668076 0,194693043683688 341281 29902512 623 665 6 True 243 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 287 639 0,00728151707498021 0,0070188517758117 0,00706492713817044 0,00701915007248035 0,00214707687028679 0,001323041475732 297292 305887 623 665 0 False 287 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 331 639 0,00634442208658919 0,00615280476310942 0,00631723506523232 0,00614938582436866 0,00128353180284124 0,00124179064792733 259032 268144 623 665 0 False 331 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 375 639 0,00603419612937642 0,00610672940075067 0,00601205462729839 0,00613412680247196 0,00125154446347856 0,00117640295935436 246366 266136 623 665 0 False 375 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 420 639 0,00615594989799356 0,00622453363897269 0,00616464484626535 0,00630197604333562 0,00145722491695187 0,00145716114290207 251337 271270 623 665 0 False 420 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 464 639 0,00630692359136633 0,00606253560199423 0,00624093995574884 0,00607309071488518 0,00177957021299729 0,00169303549171512 257501 264210 623 665 0 False 464 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 508 639 0,00630929939413356 0,00634164950026703 0,00616464484626535 0,00630197604333562 0,00173994992556183 0,00166656610759599 257598 276374 623 665 0 False 508 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 552 639 0,00628201440152855 0,00636145180988635 0,00627145799954223 0,00627145799954223 0,00163614277963687 0,0015545486853734 256484 277237 623 665 0 False 552 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 596 639 0,0067559013287473 0,00670224428087844 0,00677500572213321 0,00671396963454643 0,00138654878707969 0,00127072918732606 275832 292089 623 665 0 False 596 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 642 644 0,00833696133111575 0,710785776526462 0,00820935378042268 0,702555886167697 0,00178234691334778 0,181188159378155 340384 30976595 623 665 8 True 641 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F8_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F8_3.csv new file mode 100755 index 0000000..0b9c834 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F8_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 243 248 0,00110945090666879 0,0654982615614339 0,000839246204318303 0,0662088960097658 0,000921219677791971 0,021032450194891 45297 2854465 623 665 0 True 243 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 287 249 0,000961832728544572 0,000912260050446556 0,00080872816052491 0,000762951094834821 0,000711395273327497 0,000690862405492432 39270 39757 623 665 0 False 287 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 331 248 0,000951570240302653 0,000983461170665276 0,000869764248111696 0,000854505226215 0,000645965410069616 0,000684124634910522 38851 42860 623 665 0 True 332 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 376 247 0,000897416632897202 0,000817264034428025 0,000732433051041428 0,000701915007248035 0,000643845314868144 0,000615784110836656 36640 35617 623 665 0 True 376 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 419 247 0,000888476756505077 0,000915380692518662 0,000686655985351339 0,000701915007248035 0,000738827633836092 0,000780681184440387 36275 39893 623 665 0 True 420 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 464 247 0,000889382990550306 0,000994957065357374 0,000717174029144732 0,000885023270008392 0,000788088652548957 0,000777400557263375 36312 43361 623 665 0 True 464 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 508 247 0,000980030887885255 0,000934448733415136 0,000778210116731518 0,000762951094834821 0,00083252834605526 0,000797979086871121 40013 40724 623 665 0 True 508 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 552 247 0,000932563818164874 0,00104114715720407 0,000747692072938125 0,000869764248111696 0,000764000546217649 0,000780642032166934 38075 45374 623 665 0 True 552 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 597 249 0,0010359479777571 0,000985182112984452 0,00064087891966125 0,000579842832074464 0,00100017556773541 0,00102479555351893 42296 42935 623 665 0 False 597 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 640 248 0,0012589060456955 0,0686501330001589 0,00103761348897536 0,0676127260242618 0,00104872554622311 0,0207392483251989 51399 2991826 623 665 0 True 641 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 243 292 0,00096736810406408 0,00101631969601275 0,000793469138628214 0,00080872816052491 0,000744736113663087 0,000842196447537499 39496 44292 623 665 0 False 243 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 287 292 0,000921468574313825 0,000937202241125817 0,000762951094834821 0,000793469138628214 0,000699681542195929 0,000731587854586714 37622 40844 623 665 0 False 287 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 332 291 0,000902658094672311 0,000852325365944043 0,000778210116731518 0,000701915007248035 0,000664171080355487 0,000654075018423345 36854 37145 623 665 0 True 332 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 376 292 0,000873732083661078 0,000834496403517377 0,000762951094834821 0,000732433051041428 0,000691571481725617 0,000615208042443244 35673 36368 623 665 0 True 376 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 420 291 0,000834935469400456 0,000865220960389071 0,000610360875867857 0,000656137941557946 0,00077872844237014 0,000814830404262912 34089 37707 623 665 0 True 420 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 465 293 0,000895898078551142 0,000894706438790958 0,000579842832074464 0,000488288700694286 0,000910458738952389 0,00099768296356948 36578 38992 623 665 0 True 464 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 508 292 0,000883602686910466 0,000848975264896046 0,000686655985351339 0,00064087891966125 0,000808324066883253 0,000784120907176457 36076 36999 623 665 0 True 508 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 553 292 0,000967245640003914 0,000977632912677666 0,000778210116731518 0,000793469138628214 0,000836634546147836 0,000796613296659538 39491 42606 623 665 0 True 552 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 597 292 0,000981010600366584 0,00104369415183645 0,000656137941557946 0,000686655985351339 0,000991928627677724 0,0010374615285106 40053 45485 623 665 0 False 597 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 641 292 0,00110621785548041 0,00101957801347039 0,00080872816052491 0,000671396963454643 0,00105029952788749 0,00103729033737933 45165 44434 623 665 0 False 641 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 244 336 0,000861289735148202 0,000939634506270253 0,000717174029144732 0,000778210116731518 0,00074480806543883 0,000743027255258562 35165 40950 623 665 0 True 243 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 288 337 0,000884215007211296 0,000920474681783424 0,000762951094834821 0,000747692072938125 0,000698622386341909 0,000724351543402874 36101 40115 623 665 0 True 287 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 332 336 0,000923476984900549 0,000905995820404754 0,000839246204318303 0,000823987182421607 0,00064925539115427 0,000634142153180621 37704 39484 623 665 0 True 331 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 376 336 0,000852080437823711 0,000901567262170074 0,000686655985351339 0,00080872816052491 0,000658908967913871 0,000628121674543882 34789 39291 623 665 0 True 376 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 420 336 0,000822713556195879 0,000934884705469327 0,000579842832074464 0,000671396963454643 0,000790961648452099 0,000852548970623526 33590 40743 623 665 0 True 420 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 465 337 0,000952672416844148 0,000970863872888906 0,000686655985351339 0,000778210116731518 0,000884262607171906 0,000840537016743484 38896 42311 623 665 0 True 464 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 509 337 0,00091588421317025 0,000916872175861948 0,000656137941557946 0,000717174029144732 0,000863831510745353 0,000844692149283542 37394 39958 623 665 0 True 508 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 553 335 0,00103166173565128 0,00097006076647329 0,00080872816052491 0,000823987182421607 0,000890112898845581 0,000777050645490533 42121 42276 623 665 0 True 552 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 597 336 0,00101042646761848 0,00101758172038014 0,00064087891966125 0,000595101853971161 0,001087557584128 0,00114346035602756 41254 44347 623 665 0 True 597 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 641 335 0,00110697713265344 0,00103827892000544 0,000732433051041428 0,000671396963454643 0,00107430902903879 0,00103094648864177 45196 45249 623 665 0 True 641 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 244 381 0,000878287746699257 0,000981556661165388 0,000701915007248035 0,000823987182421607 0,00077530701274443 0,000803094846210704 35859 42777 623 665 0 True 243 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 288 381 0,000890681109588066 0,000891562850821262 0,000762951094834821 0,000778210116731518 0,000693577157664297 0,000721693763981506 36365 38855 623 665 0 True 287 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 332 380 0,000897294168837036 0,000850466748239333 0,000762951094834821 0,000686655985351339 0,000734131319398289 0,000699082311749995 36635 37064 623 665 0 True 331 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 377 380 0,000933029181593505 0,000828186281680397 0,000778210116731518 0,000686655985351339 0,000748595938155094 0,000625141108071705 38094 36093 623 665 0 True 376 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 420 380 0,000840152438363532 0,000884311947183133 0,000610360875867857 0,000686655985351339 0,000768961664781458 0,000754565452120854 34302 38539 623 665 0 True 420 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 465 380 0,000913557396027094 0,00088506916180357 0,000656137941557946 0,000534065766384375 0,000834952870115852 0,000868455144276217 37299 38572 623 665 0 True 464 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 509 380 0,000931608598495578 0,000991400451231076 0,000610360875867857 0,000762951094834821 0,000896441232746505 0,000896718518606679 38036 43206 623 665 0 True 508 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 552 380 0,000862881767930361 0,000930020175180455 0,000579842832074464 0,000747692072938125 0,000844669040400524 0,000812146210447151 35230 40531 623 665 0 True 552 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 597 380 0,000999135281271167 0,00102907761507224 0,000579842832074464 0,000610360875867857 0,00107314907690713 0,00109385295859198 40793 44848 623 665 0 True 597 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 641 380 0,000989068735525513 0,00102320346528945 0,000564583810177768 0,000793469138628214 0,001031356611945 0,000912063172770127 40382 44592 623 665 0 True 641 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 245 425 0,000890093282099269 0,000905582794248152 0,000717174029144732 0,000732433051041428 0,000825230891749658 0,000794161793121112 36341 39466 623 665 0 True 243 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 288 425 0,000908315934251985 0,000886354132068556 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000805555504974939 0,000762960030225564 37085 38628 623 665 0 True 287 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 333 425 0,000962053163852871 0,000995071794845319 0,000778210116731518 0,000885023270008392 0,000749588000915402 0,00070916515656518 39279 43366 623 665 0 True 331 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 376 424 0,000838878812137805 0,000887226076176938 0,000701915007248035 0,000701915007248035 0,000690237735989604 0,000843104167337395 34250 38666 623 665 0 True 376 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 421 424 0,000823546311805009 0,000963658861045954 0,000579842832074464 0,000701915007248035 0,000811760158618267 0,000837365736985049 33624 41997 623 665 0 True 420 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 465 425 0,000910667244207174 0,000909781893506942 0,000610360875867857 0,000701915007248035 0,000870498815737363 0,000799890130741375 37181 39649 623 665 0 True 464 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 509 424 0,00092242379398312 0,00090842808554919 0,000610360875867857 0,000656137941557946 0,000907108022480183 0,000902492979547533 37661 39590 623 665 0 True 508 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 552 422 0,000958722141416353 0,0009420438255171 0,000747692072938125 0,000717174029144732 0,000874023937975209 0,000835034439700635 39143 41055 623 665 0 False 552 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 598 424 0,000912038841681035 0,00103346028151174 0,000564583810177768 0,000747692072938125 0,0009781311100836 0,000981246081786294 37237 45039 623 665 0 True 597 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 641 424 0,000979883931013056 0,000978022992936679 0,000656137941557946 0,000610360875867857 0,000957454892598648 0,00100565177953349 40007 42623 623 665 0 True 641 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 243 469 0,000891293429888897 0,000917193418428195 0,000778210116731518 0,000762951094834821 0,00071507860586119 0,000747621640819984 36390 39972 623 665 0 True 243 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 288 469 0,000911940870432902 0,00083954450098696 0,000747692072938125 0,000656137941557946 0,000776967510691985 0,000783539107730444 37233 36588 623 665 0 True 287 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 332 468 0,000894991844505913 0,000885298620779461 0,000762951094834821 0,000701915007248035 0,000773661839806845 0,000799181034909919 36541 38582 623 665 0 True 331 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 376 468 0,000884459935331628 0,000974420487015203 0,000747692072938125 0,000869764248111696 0,000736639895075352 0,00074213389267982 36111 42466 623 665 0 True 376 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 420 468 0,000910544780147008 0,000874743507888513 0,000564583810177768 0,000579842832074464 0,000954563439081338 0,000943277368298686 37176 38122 623 665 0 True 420 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 464 469 0,000981696399103514 0,000980134015514869 0,000686655985351339 0,000564583810177768 0,00100832691933118 0,00110051503553044 40081 42715 623 665 0 True 464 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 509 468 0,000922252344298888 0,000920382898193068 0,000610360875867857 0,000610360875867857 0,000921454680713214 0,000942993342084635 37654 40111 623 665 0 True 508 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 553 469 0,000883063845045735 0,000924949131813282 0,000488288700694286 0,000564583810177768 0,000946739722199578 0,000954877453772866 36054 40310 623 665 0 True 552 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 596 469 0,000910348837650743 0,000853243201847604 0,000503547722590982 0,000457770656900893 0,000978271267194466 0,000904312420507144 37168 37185 623 665 0 True 597 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 641 468 0,000935674405293093 0,000900557642676157 0,000564583810177768 0,000518806744487678 0,00098531580918058 0,000934348079097016 38202 39247 623 665 0 True 641 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 244 513 0,00092310959272005 0,00103155577201186 0,000747692072938125 0,000900282291905089 0,000758543801136441 0,000790529972415163 37689 44956 623 665 0 True 243 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 288 513 0,000890044296475203 0,000899777482158131 0,000717174029144732 0,00080872816052491 0,000766577587541831 0,000762165314568328 36339 39213 623 665 0 True 287 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 332 513 0,000879414416052785 0,000910699729410503 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000773405215642067 0,000763421811176646 35905 39689 623 665 0 True 331 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 376 512 0,000831775896648171 0,000789040580393534 0,000656137941557946 0,000625619897764553 0,000754955818181574 0,00071165898686798 33960 34387 623 665 0 True 376 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 420 513 0,000921933937742456 0,000991262775845542 0,000564583810177768 0,000534065766384375 0,000969480011028932 0,00106869881125571 37641 43200 623 665 0 True 420 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 464 512 0,000871552223390121 0,000878185392526865 0,000457770656900893 0,000579842832074464 0,000968211803616896 0,000836927438764824 35584 38272 623 665 0 True 464 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 509 513 0,000864718728832853 0,000866850119117891 0,000549324788281071 0,000579842832074464 0,000877857537679335 0,000829109600183018 35305 37778 623 665 0 True 508 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 553 513 0,000876891656413363 0,00100353883105567 0,000595101853971161 0,000717174029144732 0,000867297735448059 0,000916023217598547 35802 43735 623 665 0 True 552 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 597 513 0,000891121980204664 0,000955536013299442 0,000549324788281071 0,000625619897764553 0,000914063915484428 0,000970065317540088 36383 41643 623 665 0 True 596 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 640 512 0,000944908195429617 0,000927932098499855 0,000595101853971161 0,000473029678797589 0,00097416215100201 0,00100754096705096 38579 40440 623 665 0 True 641 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 244 557 0,000894232567332883 0,000895899625465587 0,000717174029144732 0,000778210116731518 0,000698791365778045 0,00069780065671871 36510 39044 623 665 0 True 243 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 288 557 0,000906944336778125 0,000914279289434389 0,000778210116731518 0,000762951094834821 0,000714677735321052 0,000732689821091059 37029 39845 623 665 0 True 287 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 332 556 0,000848553472890927 0,000975934916256079 0,000732433051041428 0,000839246204318303 0,000707681796226326 0,00075533840398143 34645 42532 623 665 0 True 331 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 376 557 0,000906870858342025 0,000978091830629446 0,000762951094834821 0,00080872816052491 0,000726873218610999 0,000730550370341056 37026 42626 623 665 0 True 376 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 422 555 0,000838193013400875 0,000862857532937402 0,000503547722590982 0,000503547722590982 0,000907135168352042 0,000901707651271631 34222 37604 623 665 0 True 420 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 465 558 0,000867731344712939 0,000855354224425793 0,000473029678797589 0,000503547722590982 0,000964675602382794 0,000899184096743742 35428 37277 623 665 0 True 464 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 509 557 0,000907532164266922 0,000959643328967876 0,000473029678797589 0,000518806744487678 0,00103862213219159 0,00107874552339201 37053 41822 623 665 0 True 508 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 552 552 0,000917378274704277 0,000885390404369817 0,000595101853971161 0,000488288700694286 0,000914803777192148 0,000922298727576797 37455 38586 623 665 0 False 552 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 597 557 0,000929477723848688 0,000944063064504934 0,000656137941557946 0,000732433051041428 0,000837377843457587 0,000795517420841838 37949 41143 623 665 0 True 596 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 641 556 0,000991175117360371 0,000942938715523072 0,000701915007248035 0,000625619897764553 0,000976680692419714 0,000918000905299098 40468 41094 623 665 0 True 641 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 243 595 0,000984072201870737 0,000976485617798215 0,000869764248111696 0,000885023270008392 0,000726589045796177 0,000695416671418816 40178 42556 623 665 0 False 243 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 287 595 0,000968396802169475 0,000877657636882318 0,000885023270008392 0,000778210116731518 0,00069611364112578 0,000681822643641297 39538 38249 623 665 0 False 287 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 332 600 0,000884435442519595 0,000837066344047347 0,000793469138628214 0,000732433051041428 0,000691426959536149 0,0007149826258748 36110 36480 623 665 0 True 331 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 377 601 0,000885047762820426 0,000916298528422223 0,000732433051041428 0,00080872816052491 0,000724672362354804 0,000666510836909327 36135 39933 623 665 0 True 375 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 420 595 0,000862465390125796 0,000784198996002251 0,000595101853971161 0,000457770656900893 0,000846068106117922 0,000817971363210361 35213 34176 623 665 0 False 420 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 464 595 0,000927763227006362 0,000899777482158131 0,000488288700694286 0,000473029678797589 0,00100546522745656 0,000971799288785325 37879 39213 623 665 0 False 464 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 508 595 0,00092972265196902 0,000890874473893592 0,000503547722590982 0,000274662394140536 0,00104545021046726 0,00109214928076241 37959 38825 623 665 0 False 508 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 552 595 0,000965065779732957 0,00087878198586418 0,000488288700694286 0,000549324788281071 0,00103438612078578 0,000907425469441586 39402 38298 623 665 0 False 552 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 596 595 0,000939103398977743 0,000942089717312278 0,000656137941557946 0,00064087891966125 0,000869563885887546 0,000877617950542538 38342 41057 623 665 0 False 596 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 641 595 0,000951300819370287 0,00105335437472142 0,000762951094834821 0,000869764248111696 0,000815722612244474 0,00080422675237788 38840 45906 623 665 0 False 641 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 245 645 0,00107062979959614 0,0681540656401819 0,000946059357595178 0,0672770275425345 0,000744924837764554 0,0207389204883779 43712 2970207 623 665 0 True 243 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 287 639 0,000948214725054102 0,000888143912080499 0,00080872816052491 0,000762951094834821 0,000694940792294321 0,000686870416075467 38714 38706 623 665 0 False 287 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 331 639 0,000850757825973917 0,00085987456625083 0,000793469138628214 0,000732433051041428 0,000617666051758722 0,000657843502662784 34735 37474 623 665 0 False 331 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 375 639 0,00091884784342627 0,000824629667554099 0,000823987182421607 0,000701915007248035 0,000665982186049539 0,00064531854850507 37515 35938 623 665 0 False 375 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 420 639 0,000854113341222468 0,000857258733925682 0,000610360875867857 0,000701915007248035 0,000779832776082069 0,000712734990714236 34872 37360 623 665 0 False 420 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 464 639 0,000901996788747414 0,000884036596412065 0,00064087891966125 0,000579842832074464 0,000876284360694765 0,000862556588614159 36827 38527 623 665 0 False 464 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 508 639 0,000841695485521625 0,000845280975384215 0,000534065766384375 0,000488288700694286 0,00089993910889911 0,000881956853668838 34365 36838 623 665 0 False 508 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 552 639 0,000867290474096341 0,000943328795782085 0,000579842832074464 0,00064087891966125 0,000894814088909332 0,000856510987578455 35410 41111 623 665 0 False 552 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 596 639 0,00096805390280101 0,000956453849203003 0,000793469138628214 0,000823987182421607 0,000787696476769587 0,000688303923720808 39524 41683 623 665 0 False 596 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 642 644 0,00106085716759488 0,070713726408032 0,000961318379491875 0,0697947661554894 0,00073942235671263 0,0197569316491841 43313 3081759 623 665 0 True 641 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F9_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F9_1.csv new file mode 100755 index 0000000..709fd4e --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F9_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 255 277 0,0110343317697983 0,0462865334542582 0,0110780498970016 0,0469672693980316 0,00143652992693165 0,00904342307991821 482331 2017203 667 665 0 True 256 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 300 278 0,0109779168552597 0,0108912243988318 0,0110170138094148 0,0108339055466545 0,00132940860619541 0,0013055030444134 479865 474648 667 665 0 False 300 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 344 277 0,0107761408835523 0,0635561437353971 0,0107423514152743 0,0639963378347448 0,00133064010506281 0,00808716331741934 471045 2769826 667 665 0 True 344 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 388 277 0,0107344816948358 0,0912922269050975 0,0106660563057908 0,0910353246356908 0,00140012407959776 0,0123751572701732 469224 3978586 667 665 0 True 388 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 432 276 0,010764290548706 0,0744375472900608 0,0108186465247578 0,0743572137026017 0,00176379005259813 0,0147646116476426 470527 3244046 667 665 0 True 433 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 476 278 0,0104888503333593 0,0683376557667917 0,010605020218204 0,0699626153963531 0,00171348994295433 0,019927580681001 458487 2978208 667 665 0 True 477 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 520 277 0,010538745276023 0,0850624616014745 0,0105592431525139 0,0864728770885786 0,00164660141911704 0,0205724027365524 460668 3707088 667 665 0 True 521 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 565 277 0,010423627737516 0,0682006687581852 0,0104219119554437 0,0656900892652781 0,00175750833670797 0,0170267910646561 455636 2972238 667 665 0 True 565 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 610 278 0,0103296715112345 0,0101921087910896 0,0102845807583734 0,0102235446707866 0,0019465640742488 0,00193294439712555 451529 444180 667 665 0 False 610 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 654 276 0,0102299960113786 0,0461888298223242 0,0100556954299229 0,0467841611352712 0,00185794544614159 0,0085509141135765 447172 2012945 667 665 0 True 654 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 256 321 0,0108483181160621 0,0108039152585056 0,0108491645685512 0,0106813153276875 0,00140494718410512 0,00145324646566654 474200 470843 667 665 0 False 256 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 300 321 0,0107404526164476 0,0109529488633463 0,0107881284809644 0,0108186465247578 0,00129602060796032 0,0017681708860348 469485 477338 667 665 0 False 300 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 344 322 0,0109112530024756 0,112596437305211 0,0108644235904479 0,10933089188983 0,00145485759667726 0,0282883235759784 476951 4907040 667 665 0 True 344 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 388 321 0,0109713968833848 0,0518955892822007 0,010955977721828 0,0512855725947967 0,00141521036408484 0,00793515489447375 479580 2261650 667 665 0 True 388 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 433 321 0,0107126340697813 0,0849273332105728 0,0107118333714809 0,0857557030594339 0,00161916959471085 0,0118097344573295 468269 3701199 667 665 0 True 433 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 477 323 0,0105186820643238 0,0428210374872865 0,0105439841306172 0,043228809033341 0,00164387448355263 0,0080469626372035 459791 1866174 667 665 0 True 477 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 521 321 0,0106490586247275 0,0477597977548586 0,0106660563057908 0,0503852903028916 0,00159431388591509 0,01065833649278 465490 2081409 667 665 0 True 521 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 565 321 0,0106011997434563 0,0514374055991432 0,010605020218204 0,0528572518501564 0,00175186439340783 0,00993336845618846 463398 2241682 667 665 0 True 565 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 609 321 0,0103779421802031 0,0103920593426803 0,0102998397802701 0,0104371709773404 0,00202603600099498 0,0021567685709387 453639 452894 667 665 0 False 609 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 654 321 0,0102535594185054 0,0101930495728908 0,0103303578240635 0,0102082856488899 0,00204474472406475 0,00183160218272247 448202 444221 667 665 0 False 654 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 256 366 0,0106645921717557 0,0532367999421763 0,0106660563057908 0,0537422751201648 0,00155022096342029 0,01038680773629 466169 2320101 667 665 0 True 255 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 300 366 0,010921570572004 0,0648589429628087 0,0110017547875181 0,0671091783016709 0,001387622610728 0,018800773392995 477402 2826603 667 665 0 True 300 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 344 366 0,0115838166977395 0,0412198039158322 0,0109102006561379 0,0417792019531548 0,00535008819448811 0,00699770137651716 506350 1796391 667 665 0 True 344 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 388 366 0,0110928742541066 0,0360223057070463 0,0110780498970016 0,0365606164644846 0,0016008977299392 0,00517623917032476 484890 1569880 667 665 0 True 388 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 433 366 0,0109734329447773 0,0719793532813494 0,0110170138094148 0,0704509040970474 0,00170580774084016 0,0104524339096223 479669 3136916 667 665 0 True 432 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 477 366 0,0107709935373352 0,0337764989264188 0,0106660563057908 0,034332799267567 0,00183444855964549 0,00463732556978532 470820 1472006 667 665 0 True 477 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 521 366 0,010629979128083 0,0294148968209033 0,0105897611963073 0,0295872434576944 0,00168676356942587 0,00304382231971853 464656 1281924 667 665 0 True 521 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 564 366 0,0105470725383474 0,0517452936529926 0,0105592431525139 0,0519111924925612 0,00176720826165941 0,008415284544119 461032 2255100 667 665 0 True 565 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 609 366 0,0105648022864283 0,0571437979246583 0,0105134660868238 0,0572213321126116 0,00196692691438909 0,0118802035005994 461807 2490371 667 665 0 True 609 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 654 365 0,0103928122914967 0,0637562778541685 0,010406652933547 0,0628061341268025 0,00189176152546774 0,016718809048714 454289 2778548 667 665 0 True 654 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 257 411 0,0106473885968437 0,0446437219163725 0,0106355382619974 0,0459449149309529 0,00154421858094057 0,0088594608076589 465417 1945608 667 665 0 True 255 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 300 411 0,0105825091574149 0,0319795827403253 0,0105745021744106 0,0319371328297856 0,00141778436132311 0,00302400763978274 462581 1393695 667 665 0 True 300 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 345 410 0,010934244482245 0,0895014831654554 0,0109407186999313 0,0868390936140993 0,00140391591616968 0,0174961202482175 477956 3900544 667 665 0 True 344 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 388 410 0,0110079316029786 0,0693659991131411 0,0110017547875181 0,068909742885481 0,00151531485350832 0,015083203551058 481177 3023024 667 665 0 True 388 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 433 410 0,0109212960468724 0,046323843483738 0,0108949416342412 0,0457618066681926 0,00161516184102023 0,0091483033153044 477390 2018829 667 665 0 True 432 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 477 411 0,0109827896763452 0,0551231133452767 0,0110170138094148 0,0547341115434501 0,0018137553818078 0,0112612372609507 480078 2402308 667 665 0 True 477 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 521 411 0,0106391299658022 0,0432481294791109 0,0105897611963073 0,0431219958800641 0,00168662299789822 0,0077546088143403 465056 1884787 667 665 0 True 521 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 565 410 0,0105598150798714 0,0512715526513698 0,0105134660868238 0,0514229037918669 0,00184512716295404 0,00696574966245587 461589 2234454 667 665 0 True 565 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 609 410 0,0105163714777997 0,0425330205807492 0,0104676890211337 0,0426337071793698 0,00199736022454964 0,00760817538695818 459690 1853622 667 665 0 True 609 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 654 410 0,0105640702194108 0,0875427984013593 0,0105745021744106 0,0845044632639048 0,00199656445563381 0,0185254586483073 461775 3815183 667 665 0 True 654 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 257 455 0,0106883157185427 0,0431399854637739 0,0106813153276875 0,0434119172961013 0,00164089624456412 0,005619059982315 467206 1880074 667 665 0 True 255 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 301 455 0,0107410702979936 0,0565735005859809 0,0106965743495842 0,0561532005798428 0,00154976438884328 0,0058053810749561 469512 2465517 667 665 0 True 300 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 345 455 0,0107232261644412 0,0361688611549473 0,0107270923933776 0,0363164721141375 0,001499282664383 0,00413198037787422 468732 1576267 667 665 0 True 344 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 388 454 0,0109455686439225 0,0557039199050499 0,0109407186999313 0,0540474555580987 0,001498161672321 0,01121581604519 478451 2427620 667 665 0 True 388 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 433 454 0,0112281922668787 0,0971056159510702 0,0110627908751049 0,0967116807812619 0,00214828106385524 0,0117858742736426 490805 4231938 667 665 0 True 432 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 477 455 0,0110749614892714 0,0598998296840751 0,0109864957656214 0,0599832150759136 0,00199159534913285 0,0133930722904022 484107 2610481 667 665 0 True 477 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 521 454 0,0106002160284015 0,0529304951552605 0,0106813153276875 0,0522926680399786 0,00174990341247641 0,00792791420997839 463355 2306752 667 665 0 True 521 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 565 451 0,0104233074581958 0,0303972106966891 0,010452429999237 0,0313267719539178 0,00193589691509067 0,00515774238791712 455622 1324734 667 665 0 False 565 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 609 454 0,0104506684629761 0,0541336403494431 0,0104676890211337 0,041367208361944 0,00180460581540929 0,0630689175247838 456818 2359186 667 665 0 True 609 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 652 453 0,0105769500235005 0,0704520284460292 0,010605020218204 0,0700999465934234 0,00194077748832637 0,0122637259975219 462338 3070354 667 665 0 True 654 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 256 499 0,0105855289338622 0,0527946554415336 0,0106202792401007 0,0531471732661936 0,00145816538522526 0,012436942215672 462713 2300832 667 665 0 True 255 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 300 499 0,0108522529762814 0,0559382204653313 0,0108339055466545 0,0560158693827726 0,00155166233920091 0,00796798653730132 474372 2437831 667 665 0 True 300 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 344 498 0,01094630071094 0,0696679900713101 0,0109407186999313 0,0679942015716793 0,00156789216958488 0,0144596055927565 478483 3036185 667 665 0 True 344 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 388 498 0,0111889809272521 0,0872003308798432 0,011108567940795 0,0838483253223468 0,00156871581285818 0,0190684350581326 489091 3800258 667 665 0 True 388 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 433 498 0,0113543365648373 0,0960307153785127 0,0114290074006256 0,0927138170443275 0,00183811217594489 0,027089032530559 496319 4185093 667 665 0 True 432 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 477 499 0,0109854891734723 0,0491680333816918 0,0109712367437247 0,048706797894255 0,0018699455240189 0,00896974102122183 480196 2142781 667 665 0 True 477 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 521 498 0,0107503126440899 0,044221494454837 0,0106965743495842 0,0458686198214694 0,00179716086446953 0,00888198194922207 469916 1927207 667 665 0 True 521 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 565 498 0,0106819330092335 0,112762382036575 0,0107118333714809 0,11279468986038 0,00176813230014217 0,0163394078464106 466927 4914272 667 665 0 True 565 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 609 497 0,0103821515655539 0,0623457476375764 0,010406652933547 0,064438849469749 0,00181867584047372 0,0144644782844616 453823 2717076 667 665 0 True 609 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 653 498 0,0106241683461314 0,0838043839284639 0,0106355382619974 0,082230869001297 0,00201163367651874 0,0156772723176948 464402 3652260 667 665 0 True 654 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 256 543 0,010478692903491 0,055272445246786 0,010452429999237 0,0574807354848554 0,00133273715685283 0,0121567227723864 458043 2408816 667 665 0 True 255 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 301 542 0,0107232719186298 0,119166490270079 0,0107270923933776 0,118242160677501 0,00154759664558211 0,0289116948983688 468734 5193368 667 665 0 True 300 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 344 542 0,0109372413815981 0,0553681296397322 0,0108796826123445 0,0569771877622644 0,00147958474399478 0,0111079257296338 478087 2412986 667 665 0 True 344 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 388 542 0,0111895528546095 0,0569795970815113 0,0111696040283818 0,0560006103608759 0,00156251781843023 0,00941676997080426 489116 2483215 667 665 0 True 388 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 433 542 0,0111196175773409 0,0582856775722781 0,0110170138094148 0,057450217441062 0,00188053839278093 0,00886293648128313 486059 2540135 667 665 0 True 432 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 476 543 0,0110180204015639 0,0599627014434691 0,0110322728313115 0,0598458838788434 0,00191667867448058 0,0129243390599079 481618 2613221 667 665 0 True 477 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 521 543 0,0107425115549344 0,069698370439718 0,0108339055466545 0,0687418936446174 0,00190651900546246 0,0141146072489559 469575 3037509 667 665 0 True 521 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 565 542 0,0105164629861769 0,0578087011990952 0,010605020218204 0,0578164339665827 0,00173807371456888 0,0127301874114129 459694 2519348 667 665 0 True 565 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 610 542 0,01055464485656 0,0448592297865286 0,0104829480430304 0,0431982909895476 0,00177114907264213 0,00771390238706596 461363 1955000 667 665 0 True 609 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 653 542 0,010784491022971 0,0689777545259349 0,0107881284809644 0,066346227206836 0,00190778454886658 0,0176173039978033 471410 3006104 667 665 0 True 654 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 256 587 0,0103647649738875 0,0461735937463251 0,0104371709773404 0,0473029678797589 0,00132713063829 0,00963426731085624 453063 2012281 667 665 0 True 255 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 301 587 0,0104967200537978 0,0526312347589046 0,0105745021744106 0,0535439078355077 0,00151169326185127 0,0102666318812861 458831 2293710 667 665 0 True 300 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 344 586 0,0108251207424441 0,0508250943219803 0,0109712367437247 0,0526131074998093 0,00146551258604292 0,0104726215123393 473186 2214997 667 665 0 True 344 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 388 587 0,0108648353781452 0,054331456932558 0,0108796826123445 0,0522316319523919 0,00158777016009596 0,00941583903296631 474922 2367807 667 665 0 True 388 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 433 586 0,0108345689823891 0,0890370581982537 0,0108491645685512 0,0860303654535744 0,0017726403751209 0,0177779371002525 473599 3880304 667 665 0 True 432 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 477 587 0,0107930241791441 0,0620159233056319 0,0108339055466545 0,0601358052948806 0,00205866561235372 0,0118487433468355 471783 2702702 667 665 0 True 477 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 521 587 0,0105954804698818 0,0550824761606465 0,0106660563057908 0,0548104066529335 0,00202883069971005 0,00791973827721792 463148 2400537 667 665 0 True 521 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 565 581 0,0105789174536101 0,0350117224854308 0,0105592431525139 0,0390936140993362 0,00188735216831187 0,0115215802121779 462424 1525838 667 665 0 False 565 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 610 586 0,0104614435743904 0,0557353098929517 0,010452429999237 0,0546120393682765 0,00156706778214414 0,0106526483717252 457289 2428988 667 665 0 True 609 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 654 586 0,0107529663870285 0,0570754879875358 0,0108186465247578 0,0566567483024338 0,00164113615382434 0,00756599449365776 470032 2487394 667 665 0 True 654 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 255 624 0,0108503084232661 0,0102273536897864 0,0103761348897536 0,0101777676050965 0,00322792824950849 0,00140441533240963 474287 445716 667 665 0 False 255 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 300 625 0,0103852170961898 0,00993144339447842 0,0103150988021668 0,00994888227664607 0,00162671497663802 0,00138377918937805 453957 432820 667 665 0 False 300 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 344 630 0,0106227499662849 0,0708919701405035 0,0105134660868238 0,0680704966811627 0,00159697187593859 0,0112095843681487 464340 3089527 667 665 0 True 344 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 388 630 0,0107317135664258 0,0723114492571553 0,0107881284809644 0,0698252841992828 0,00148979622605811 0,018940502742419 469103 3151389 667 665 0 True 388 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 432 625 0,0104365532957943 0,010436689113491 0,0104219119554437 0,0105134660868238 0,00170000788047379 0,00169590504671592 456201 454839 667 665 0 False 432 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 477 625 0,0103081212884059 0,0104739532511755 0,01025406271458 0,0104982070649271 0,0020261453977551 0,00180566737794245 450587 456463 667 665 0 False 477 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 521 625 0,0103053302829016 0,0102596385676941 0,0102845807583734 0,0102235446707866 0,00197388790564443 0,00191797365184383 450465 447123 667 665 0 False 521 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 565 625 0,0100936256522689 0,0100831846152346 0,0100556954299229 0,010101472495613 0,00176116159649349 0,00172562080322014 441211 439433 667 665 0 False 565 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 609 625 0,0104747809203661 0,0103314821730453 0,0104676890211337 0,0103456168459602 0,00154426878825895 0,00136982427690789 457872 450254 667 665 0 False 609 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 654 625 0,0107334522255924 0,0106939355713615 0,0106813153276875 0,0106965743495842 0,00151649105763832 0,00148696872013161 469179 466050 667 665 0 False 654 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 258 674 0,0101044007636832 0,0442978354561157 0,0101167315175097 0,0448920424200809 0,00134570207469992 0,00839302029231325 441682 1930534 667 665 0 True 255 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 300 668 0,0101724143650308 0,0100134061406664 0,0101625085831998 0,00993362325474937 0,00142486113207799 0,00164753655602324 444655 436392 667 665 0 False 300 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 344 668 0,0107632610794626 0,00998736254690285 0,0101167315175097 0,0100404364080262 0,00421840119315442 0,00126913801590148 470482 435257 667 665 0 False 344 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 388 668 0,0105135118410124 0,0101315545673522 0,01025406271458 0,0101472495613031 0,00249072818554484 0,00129971808165336 459565 441541 667 665 0 False 388 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 432 668 0,0100145624143753 0,00997373268373497 0,00997940032043946 0,00996414129854276 0,00154912364057171 0,0014638409768694 437755 434663 667 665 0 False 432 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 477 668 0,0100086372469522 0,00998449430970422 0,0100556954299229 0,0100404364080262 0,00172548217143045 0,00147166405177285 437496 435132 667 665 0 False 477 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 521 668 0,00999662677244578 0,00994445371841139 0,0100251773861295 0,0100099183642329 0,00174887705558579 0,00173452906832627 436971 433387 667 665 0 False 521 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 565 668 0,0101597404547898 0,010348921055213 0,0101625085831998 0,0103608758678569 0,00162722866881214 0,0015168094976433 444101 451014 667 665 0 False 565 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 609 668 0,0103431918739646 0,0104846919312472 0,0103150988021668 0,0105134660868238 0,00141463431346666 0,00140287934763542 452120 456931 667 665 0 False 609 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 655 674 0,0105898298275902 0,0453923777170094 0,0107118333714809 0,0462806134126802 0,00154304571935034 0,0084559010722795 462901 1978235 667 665 0 True 654 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F9_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F9_2.csv new file mode 100755 index 0000000..4711c41 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F9_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 255 277 0,00901041811435779 0,715988460508103 0,00871290150301366 0,730708781567102 0,00228165281236662 0,193687929126107 393862 31203332 667 665 8 True 256 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 300 278 0,00731696408605036 0,00708830900781365 0,0072327763790341 0,00711070420386053 0,00143301722934036 0,00121033810399199 319838 308914 667 665 0 False 300 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 344 277 0,00669502740046777 0,00685724381909225 0,00671396963454643 0,00685130083161669 0,00130989745440821 0,00133702971277235 292652 298844 667 665 0 True 344 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 388 277 0,00676596926988554 0,00652842910664163 0,0068207827878233 0,00656137941557946 0,00131195624046716 0,00119388276572808 295753 284514 667 665 0 True 388 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 432 276 0,00661976176022769 0,00672642925693726 0,00662241550316625 0,0068055237659266 0,00158411394324863 0,00156264901089407 289362 293143 667 665 0 True 433 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 476 278 0,00684155518944579 0,00697917831888029 0,00686655985351339 0,00706492713817044 0,00165740956713937 0,00174425102854121 299057 304158 667 665 0 True 477 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 520 277 0,00714243473365171 0,00724704872733447 0,00715648126955062 0,00732433051041428 0,00149494904295143 0,00164182979198017 312209 315832 667 665 0 True 521 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 565 277 0,00755744810130984 0,00751246392474663 0,00752269779507134 0,00756847486076143 0,00160209889065363 0,00160731871060679 330350 327399 667 665 0 True 565 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 610 278 0,00808131068363735 0,00790690390430184 0,00801098649576562 0,00798046845197223 0,0020976818926053 0,00184100486617661 353249 344589 667 665 0 False 610 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 654 276 0,00952581617179508 0,720627524407265 0,00943007553215839 0,717097734035248 0,00211782403066147 0,181172085664896 416391 31405506 667 665 10 True 654 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 256 321 0,00726567364063448 0,00695295115793604 0,00730907148851759 0,00692759594110018 0,00157479420369886 0,00140251485693445 317596 303015 667 665 0 False 256 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 300 321 0,00689886231066202 0,00691410375331783 0,00695811398489357 0,00689707789730678 0,00139002981991103 0,00130792470204304 301562 301322 667 665 0 False 300 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 344 322 0,00682686809490654 0,00696722350623641 0,00683604180972 0,00704966811627375 0,00126224741844644 0,00126454926468315 298415 303637 667 665 0 True 344 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 388 321 0,00679387932492897 0,00667530579710893 0,0068207827878233 0,00672922865644312 0,00127090499500617 0,0012221429231474 296973 290915 667 665 0 True 388 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 433 321 0,00704747191522115 0,0071738742599231 0,00708018616006714 0,0072480354009308 0,00153860423799634 0,0016673357477999 308058 312643 667 665 0 True 433 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 477 323 0,00711074995804913 0,00723364832314249 0,00711070420386053 0,00720225833524071 0,00156099185332694 0,00154386495962186 310824 315248 667 665 0 True 477 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 521 321 0,00726665735568929 0,00724484592116593 0,00729381246662089 0,00733958953231098 0,00156947035255819 0,00162243030816513 317639 315736 667 665 0 True 521 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 565 321 0,00745612545066446 0,00755209148988287 0,00741588464179446 0,00753795681696803 0,00169285540049094 0,00148792985354242 325921 329126 667 665 0 True 565 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 609 321 0,00763625969116609 0,0077036950352535 0,00755321583886473 0,00775158312352178 0,00199947835791076 0,0020709677689337 333795 335733 667 665 0 False 609 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 654 321 0,0079350802968852 0,00784836891955226 0,00787365529869535 0,00779736018921187 0,00193639391812365 0,00183346838641252 346857 342038 667 665 0 False 654 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 256 366 0,0064229501179829 0,0065786347305664 0,00634775310902571 0,00656137941557946 0,00146406024278065 0,0015014746047644 280759 286702 667 665 0 True 255 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 300 366 0,00659699905140129 0,00661445327670286 0,00656137941557946 0,00663767452506294 0,0013627691935754 0,00129773998638418 288367 288263 667 665 0 True 300 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 344 366 0,00771159396268906 0,00696265727261619 0,00709544518196384 0,00692759594110018 0,00491264702988486 0,00136666823874333 337088 303438 667 665 0 True 344 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 388 366 0,00707769255678867 0,00715868407571917 0,00703440909437705 0,00721751735713741 0,00140094642732806 0,00130197572744841 309379 311981 667 665 0 True 388 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 433 366 0,00711571428751177 0,00737146138406212 0,00711070420386053 0,00737010757610437 0,00152581332037442 0,00166861955817363 311041 321254 667 665 0 True 432 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 477 366 0,00742986254641048 0,00750447875238566 0,0072632944228275 0,00758373388265812 0,00181255310953023 0,00165306495085476 324773 327051 667 665 0 True 477 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 521 366 0,0075719979332833 0,00718383277947673 0,00759899290455482 0,00708018616006714 0,00165347163253 0,00171428676437258 330986 313077 667 665 0 True 521 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 564 366 0,00752315533695729 0,00750266602647612 0,00752269779507134 0,00753795681696803 0,00183852252895218 0,00174172075684797 328851 326972 667 665 0 True 565 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 609 366 0,0073056170472786 0,00745333234665974 0,0072480354009308 0,00752269779507134 0,00195567134336265 0,00204502765618504 319342 324822 667 665 0 True 609 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 654 365 0,00700810043593447 0,00696784304547131 0,00708018616006714 0,00695811398489357 0,00184174843983245 0,00185803930217184 306337 303664 667 665 0 True 654 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 257 411 0,00672417281860329 0,00645530053102543 0,00677500572213321 0,00643930724040589 0,00155033714360102 0,0015250656351807 293926 281327 667 665 0 True 255 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 300 411 0,0066304911174534 0,00680283909590869 0,00656137941557946 0,00668345159075303 0,00138905298461917 0,00154974648765446 289831 296473 667 665 0 True 300 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 345 410 0,00704516132869706 0,00690467298940875 0,00703440909437705 0,00688181887541009 0,00134189840802744 0,00124300115361912 307957 300911 667 665 0 True 344 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 388 410 0,00704873015540753 0,00728805304632605 0,00706492713817044 0,0072480354009308 0,00137682172264278 0,00134469477836539 308113 317619 667 665 0 True 388 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 433 410 0,00730149917030498 0,00742765588725763 0,0072632944228275 0,00744640268558785 0,00161426946055264 0,00154519580082064 319162 323703 667 665 0 True 432 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 477 411 0,00742256475332945 0,00753006342819741 0,00749217975127794 0,00756847486076143 0,0015815742303128 0,00149943447107409 324454 328166 667 665 0 True 477 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 521 411 0,00721511526223613 0,00761523860004784 0,00715648126955062 0,00756847486076143 0,00148078528408163 0,00205404221458486 315386 331878 667 665 0 True 521 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 565 410 0,00714572903523061 0,00733706548357619 0,00727855344472419 0,00737010757610437 0,00176757614249243 0,00153882564009051 312353 319755 667 665 0 True 565 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 609 410 0,00656819678968023 0,00673530931930421 0,00659189745937285 0,00674448767833982 0,00193199855554679 0,00188858613479081 287108 293530 667 665 0 True 609 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 654 410 0,0063347817965588 0,00636959760353046 0,0064087891966125 0,00636301213092241 0,0018480609802913 0,00168920391266494 276905 277592 667 665 0 True 654 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 257 455 0,00688339739491664 0,00672172534793151 0,00685130083161669 0,00666819256885634 0,00148439590155329 0,00145639250882828 300886 292938 667 665 0 True 255 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 301 455 0,00677429653220998 0,00664240137996628 0,00675974670023652 0,00665293354695964 0,00147778586838674 0,00147529401035227 296117 289481 667 665 0 True 300 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 345 455 0,00671813326570864 0,00668618215256613 0,00665293354695964 0,00668345159075303 0,00138200979385279 0,00145602938379281 293662 291389 667 665 0 True 344 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 388 454 0,00677017865523636 0,00714906974462937 0,00675974670023652 0,00717174029144732 0,00151106821197672 0,00138261638665799 295937 311562 667 665 0 True 388 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 433 454 0,00717965576607439 0,00750227594621711 0,00717174029144732 0,00750743877317464 0,00189405770994754 0,0020134450864228 313836 326955 667 665 0 True 432 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 477 455 0,00734217464396664 0,00734844664878034 0,00740062561989776 0,00741588464179446 0,00182904751862427 0,00197459532611343 320940 320251 667 665 0 True 477 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 521 454 0,00694377004676879 0,00713206683451591 0,00691233691920348 0,00718699931334401 0,00159900402612629 0,00175802375641047 303525 310821 667 665 0 True 521 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 565 451 0,00668027167464563 0,00658579385061418 0,00666819256885634 0,00665293354695964 0,00176466480848855 0,00188257186087994 292007 287014 667 665 0 False 565 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 609 454 0,00618351844906112 0,0286160353963416 0,00616464484626535 0,00692759594110018 0,00177285667067352 0,106632156087477 270293 1247109 667 665 0 True 609 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 652 453 0,00621117685606727 0,00623908133804413 0,00619516289005875 0,00621042191195544 0,00178907984835658 0,0017925607602104 271502 271904 667 665 0 True 654 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 256 499 0,00658029877256382 0,00676222485717613 0,00657663843747616 0,00675974670023652 0,00138830104419855 0,00144807631923084 287637 294703 667 665 0 True 255 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 300 499 0,00681039658701206 0,00692029914566687 0,0068055237659266 0,00695811398489357 0,00150287525338111 0,00155978917692993 297695 301592 667 665 0 True 300 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 344 498 0,0069077386232496 0,00678601975297594 0,00694285496299687 0,00672922865644312 0,00147992032783491 0,00154290916729051 301950 295740 667 665 0 True 344 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 388 498 0,00704484104937689 0,00732561548067927 0,00701915007248035 0,00720225833524071 0,00154748555859819 0,00217964926162179 307943 319256 667 665 0 True 388 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 433 498 0,00718418543074537 0,00737685366999554 0,00714122224765393 0,00743114366369116 0,00178921086062037 0,0020293142181985 314034 321489 667 665 0 True 432 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 477 499 0,00723359995442883 0,0070597872571105 0,0072632944228275 0,00712596322575723 0,00179838179960969 0,00177799177988451 316194 307671 667 665 0 True 477 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 521 498 0,00690533652834832 0,00668296972690366 0,00688181887541009 0,00669871061264973 0,00168444773416274 0,0015882851524345 301845 291249 667 665 0 True 521 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 565 498 0,00626786629573746 0,0066170920549256 0,00622568093385214 0,00657663843747616 0,00175732057585737 0,00173958717450128 273980 288378 667 665 0 True 565 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 609 497 0,00622485735845742 0,00619782461417907 0,00628671702143893 0,00624093995574884 0,00173565253660204 0,00179832691783197 272100 270106 667 665 0 True 609 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 653 498 0,00624947311192195 0,00647579121757243 0,00622568093385214 0,00653086137178607 0,00180785656924091 0,00193438289956186 273176 282220 667 665 0 True 654 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 256 543 0,00668713480293499 0,00673253286569594 0,00669871061264973 0,00669871061264973 0,00138582115033562 0,0015509243029177 292307 293409 667 665 0 True 255 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 301 542 0,00665407740167453 0,00649274823589071 0,00666819256885634 0,00643930724040589 0,00146368247918519 0,0013294300500598 290862 282959 667 665 0 True 300 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 344 542 0,00692526247748179 0,00661663313697381 0,00700389105058366 0,00659189745937285 0,00140535503883585 0,00135328439953074 302716 288358 667 665 0 True 344 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 388 542 0,00680755982731912 0,00716919329681494 0,00675974670023652 0,00721751735713741 0,00147372884460599 0,00149667797736994 297571 312439 667 665 0 True 388 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 433 542 0,00700466887178979 0,00681151264519734 0,00700389105058366 0,00683604180972 0,00182939468934507 0,00199570330990702 306187 296851 667 665 0 True 432 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 476 543 0,00670157024943697 0,00666938575553096 0,00666819256885634 0,00668345159075303 0,0017916880638279 0,00195321018889218 292938 290657 667 665 0 True 477 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 521 543 0,00642649606759907 0,00670933456323344 0,00643930724040589 0,00663767452506294 0,00178838552862155 0,00193569078440684 280914 292398 667 665 0 True 521 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 565 542 0,00634999506426691 0,00651716267092543 0,0063782711528191 0,00659189745937285 0,00169546372973485 0,00174096072159044 277570 284023 667 665 0 True 565 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 610 542 0,00636884578996837 0,00640190542733579 0,0064087891966125 0,00643930724040589 0,00169339468663662 0,00165036184107804 278394 279000 667 665 0 True 609 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 653 542 0,00666119217800118 0,00669430500031264 0,00663767452506294 0,0068055237659266 0,00181422945058634 0,00198216583759787 291173 291743 667 665 0 True 654 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 256 587 0,00691668356712008 0,00676954459850702 0,00689707789730678 0,00675974670023652 0,00137652040541393 0,0012027759109121 302341 295022 667 665 0 True 255 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 301 587 0,00691842222628672 0,00702068744761882 0,00695811398489357 0,00708018616006714 0,00136273556946164 0,00130778042571557 302417 305967 667 665 0 True 300 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 344 586 0,00683999954703353 0,0068508648595625 0,00688181887541009 0,0068055237659266 0,00149153164464214 0,00146730762112725 298989 298566 667 665 0 True 344 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 388 587 0,00652731542216989 0,00649056837561975 0,00650034332799268 0,00651560234988937 0,00137428072567184 0,00117699790632883 285321 282864 667 665 0 True 388 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 433 586 0,00670621429957944 0,00671041302042013 0,00669871061264973 0,00675974670023652 0,00183038137755229 0,00188518159929838 293141 292445 667 665 0 True 432 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 477 587 0,00659821153739907 0,00650525375007672 0,00665293354695964 0,00651560234988937 0,00192810566584518 0,00180639537294502 288420 283504 667 665 0 True 477 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 521 587 0,00657135382869334 0,00645860474027825 0,00651560234988937 0,00646982528419928 0,00191672219372093 0,00199370760159524 287246 281471 667 665 0 True 521 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 565 581 0,00644447746371721 0,0066538513828632 0,00651560234988937 0,00662241550316625 0,00171043104269327 0,00179471297140786 281700 289980 667 665 0 False 565 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 610 586 0,00655081019801383 0,00643955964527937 0,00654612039368277 0,00643930724040589 0,00151410807725812 0,00143203877183018 286348 280641 667 665 0 True 609 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 654 586 0,00672344075158576 0,00653012710306322 0,00672922865644312 0,00656137941557946 0,00156076921992232 0,00149336992605269 293894 284588 667 665 0 True 654 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 255 624 0,0072914790030025 0,00691531988589005 0,00729381246662089 0,00685130083161669 0,00139583837991522 0,00136681881346946 318724 301375 667 665 0 False 255 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 300 625 0,00675000105806561 0,00658336158546974 0,0068207827878233 0,00666819256885634 0,0013480997589634 0,00131193243730831 295055 286908 667 665 0 False 300 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 344 630 0,00672893125421725 0,0064434604478695 0,00675974670023652 0,0063782711528191 0,00129602977589542 0,00137315895578927 294134 280811 667 665 0 True 344 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 388 630 0,00638456235375102 0,00640378699093809 0,0063935301747158 0,00642404821850919 0,00136104329386763 0,00126236644979041 279081 279082 667 665 0 True 388 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 432 625 0,0064576775471271 0,00648423530788519 0,0063935301747158 0,00642404821850919 0,00166317811033988 0,00164323591102871 282277 282588 667 665 0 False 432 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 477 625 0,00648625103790517 0,00656059925506143 0,00643930724040589 0,00662241550316625 0,00187228596461734 0,00186873635995317 283526 285916 667 665 0 False 477 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 521 625 0,00649018589812441 0,00647631897321697 0,00642404821850919 0,00645456626230259 0,00184634216411931 0,00177789764877152 283698 282243 667 665 0 False 521 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 565 625 0,00631867632217309 0,00612614163011098 0,00628671702143893 0,00611886778057527 0,00163600099869287 0,00167070443132892 276201 266982 667 665 0 False 565 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 609 625 0,00683894720069583 0,00669256111209587 0,00683604180972 0,00665293354695964 0,00144538985288897 0,00119873606190567 298943 291667 667 665 0 False 609 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 654 625 0,00712774763911246 0,00709872644531907 0,00720225833524071 0,00715648126955062 0,00145823926047173 0,00152906043567856 311567 309368 667 665 0 False 654 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 258 674 0,00847333257152609 0,713408102540627 0,00819409475852598 0,716792553597314 0,00195394336983999 0,195032151663885 370385 31090878 667 665 10 True 255 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 300 668 0,00766673198077089 0,00681185683366117 0,00738536659800107 0,00683604180972 0,00219879854414649 0,00131129170197803 335127 296866 667 665 0 False 300 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 344 668 0,00641210637528569 0,0062842618103969 0,00648508430609598 0,00624093995574884 0,00136017583625868 0,0013194821578924 280285 273873 667 665 0 False 344 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 388 668 0,00613861071295435 0,00613240586015279 0,00608834973678187 0,00614938582436866 0,00140536224262247 0,00125226138615348 268330 267255 667 665 0 False 388 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 432 668 0,0061923718845544 0,00602088879787016 0,00622568093385214 0,005981536583505 0,00147205874213143 0,00138805916759486 270680 262395 667 665 0 False 432 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 477 668 0,00624441727408212 0,00632701001760524 0,00630197604333562 0,00628671702143893 0,00174576990617164 0,00147747760319786 272955 275736 667 665 0 False 477 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 521 668 0,00625402565368723 0,00639013418187263 0,00630197604333562 0,0063935301747158 0,0016928132581971 0,00157700016401462 273375 278487 667 665 0 False 521 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 565 668 0,00648110369168815 0,00672317093947962 0,00648508430609598 0,00674448767833982 0,0015365741654231 0,0015375918530145 283301 293001 667 665 0 False 565 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 609 668 0,00709501051717218 0,00689978551322229 0,00704966811627375 0,00691233691920348 0,0014442228250196 0,00138876816980055 310136 300698 667 665 0 False 609 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 655 674 0,00894466934534564 0,723276765959302 0,00877393759060044 0,723292896925307 0,00234722298965896 0,19139561928248 390988 31520962 667 665 11 True 654 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F9_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F9_3.csv new file mode 100755 index 0000000..2628670 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_F9_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 255 277 0,00105257510864618 0,0717768327892287 0,000900282291905089 0,0725108720531014 0,000801677992411006 0,0206291667157267 46010 3128090 667 665 0 True 256 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 300 278 0,000890147739131121 0,000932681899300781 0,000747692072938125 0,000823987182421607 0,000674736712839335 0,000663629667534384 38910 40647 667 665 0 False 300 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 344 277 0,000938830195797043 0,000860746510359212 0,000839246204318303 0,000747692072938125 0,000633083332541568 0,000652546349329957 41038 37512 667 665 0 True 344 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 388 277 0,000861734388013135 0,000903563555260318 0,000686655985351339 0,000793469138628214 0,000711424723554807 0,000647543444952769 37668 39378 667 665 0 True 388 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 432 276 0,00086711050517314 0,000967674393124032 0,000625619897764553 0,000778210116731518 0,000822336647093188 0,000839305573277628 37903 42172 667 665 0 True 433 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 476 278 0,00096092946888881 0,000868846412208135 0,000686655985351339 0,000579842832074464 0,00088508096706186 0,000912432909190371 42004 37865 667 665 0 True 477 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 520 277 0,000978933742101254 0,000942388013980935 0,00080872816052491 0,000778210116731518 0,000813420344183546 0,000817967284181366 42791 41070 667 665 0 True 521 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 565 277 0,000936199329952785 0,000942502743468881 0,000701915007248035 0,000732433051041428 0,000894548929994497 0,000829837350520792 40923 41075 667 665 0 True 565 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 610 278 0,000983669300620919 0,00100782971390481 0,000671396963454643 0,000671396963454643 0,000967499096508428 0,000972462214803071 42998 43922 667 665 0 False 610 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 654 276 0,000998882568329019 0,0727196797211615 0,000671396963454643 0,0716868848706798 0,000964003011740652 0,0202515801729638 43663 3169180 667 665 0 True 654 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 256 321 0,00092233581080826 0,00102320346528945 0,000747692072938125 0,000854505226215 0,000736225300118571 0,000791327634038926 40317 44592 667 665 0 False 256 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 300 321 0,000961615781717747 0,000970359063141947 0,00080872816052491 0,000869764248111696 0,000726434887130025 0,000651881160034348 42034 42289 667 665 0 False 300 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 344 322 0,000907305559854543 0,00086733198296726 0,000778210116731518 0,000747692072938125 0,000679961207857524 0,000637031335939715 39660 37799 667 665 0 True 344 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 388 321 0,000876810393155448 0,000905032092706015 0,000686655985351339 0,000778210116731518 0,000711360805714767 0,000651887606131337 38327 39442 667 665 0 True 388 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 433 321 0,000908678185512417 0,000920841816144848 0,000671396963454643 0,000610360875867857 0,000833891284446704 0,000875802965925623 39720 40131 667 665 0 True 433 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 477 323 0,000926064777178817 0,000936261459324668 0,000686655985351339 0,000732433051041428 0,000841199664234578 0,000846720365777838 40480 40803 667 665 0 True 477 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 521 321 0,00100350374137719 0,000855583683401683 0,00080872816052491 0,000686655985351339 0,000853745050926496 0,000784539642678836 43865 37287 667 665 0 True 521 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 565 321 0,000892366817278017 0,000996769791266906 0,000671396963454643 0,000823987182421607 0,000873511933810694 0,000787308849844117 39007 43440 667 665 0 True 565 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 609 321 0,00094702019555569 0,00100083121514016 0,000488288700694286 0,000549324788281071 0,00107162590695802 0,00111437495106453 41396 43617 667 665 0 False 609 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 654 321 0,0009545238824854 0,000904963255013248 0,000534065766384375 0,000518806744487678 0,0010114887936432 0,000924737623415356 41724 39439 667 665 0 False 654 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 256 366 0,000951046564152119 0,000931809955192399 0,00080872816052491 0,00080872816052491 0,000790097005394321 0,000778852806357812 41572 40609 667 665 0 True 255 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 300 366 0,000901426146619984 0,000889612449526196 0,000762951094834821 0,000778210116731518 0,000677992233790596 0,000667680877783688 39403 38770 667 665 0 True 300 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 344 366 0,000962965530281323 0,000857235788028093 0,00080872816052491 0,000732433051041428 0,000761294419310584 0,000683116946153703 42093 37359 667 665 0 True 344 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 388 366 0,000922999246542899 0,000839246204318303 0,000793469138628214 0,000686655985351339 0,000706025984440884 0,000673522352863311 40346 36575 667 665 0 True 388 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 433 366 0,00085612949991015 0,000941332502691841 0,000625619897764553 0,00064087891966125 0,000817428278609407 0,000871330643538276 37423 41024 667 665 0 True 432 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 477 366 0,000869695616828802 0,000902852232435059 0,000579842832074464 0,000579842832074464 0,000857574840859628 0,000915146394139319 38016 39347 667 665 0 True 477 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 521 366 0,000936016313198402 0,000990964479176885 0,000686655985351339 0,000686655985351339 0,000878596729661787 0,000907313388463124 40915 43187 667 665 0 True 521 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 564 366 0,000952693714941568 0,000880204631514699 0,00064087891966125 0,000579842832074464 0,00099848421038374 0,000891025361789573 41644 38360 667 665 0 True 565 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 609 366 0,000967014775972051 0,000980776500647361 0,000549324788281071 0,000503547722590982 0,00105926285622751 0,00116079750006744 42270 42743 667 665 0 True 609 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 654 365 0,000897056621609086 0,000961157758208751 0,000473029678797589 0,000579842832074464 0,00100029064388151 0,00101997421463027 39212 41888 667 665 0 True 654 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 257 411 0,000982090781114364 0,000870085490677942 0,000793469138628214 0,000701915007248035 0,000860244022547539 0,000745857593780226 42929 37919 667 665 0 True 255 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 300 411 0,000909433129624247 0,000944774387330193 0,000762951094834821 0,00080872816052491 0,000737357027407948 0,000746371818880019 39753 41174 667 665 0 True 300 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 345 410 0,000909661900567226 0,0008783230679124 0,00080872816052491 0,000762951094834821 0,000672596413327349 0,000634508669754247 39763 38278 667 665 0 True 344 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 388 410 0,00091265879992025 0,0008486540223298 0,000778210116731518 0,000717174029144732 0,000739628347143769 0,000711325393715045 39894 36985 667 665 0 True 388 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 433 410 0,000924783659898135 0,000928184503373334 0,00064087891966125 0,000686655985351339 0,000840104342596505 0,000858929390862695 40424 40451 667 665 0 True 432 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 477 411 0,000872852655841912 0,000936192621631901 0,000595101853971161 0,000671396963454643 0,000848601265771506 0,000840154986210074 38154 40800 667 665 0 True 477 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 521 411 0,000902867403560751 0,000978688423966761 0,00064087891966125 0,000732433051041428 0,0008574398642016 0,000877927741584573 39466 42652 667 665 0 True 521 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 565 410 0,000912452906071569 0,000928781096710648 0,000686655985351339 0,000732433051041428 0,00090762933756317 0,000816201561157094 39885 40477 667 665 0 True 565 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 609 410 0,000903439330918198 0,000871462244533283 0,000442511635004196 0,000473029678797589 0,000998967176147705 0,000964369124694813 39491 37979 667 665 0 True 609 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 654 410 0,000909089973209779 0,000848263942070787 0,000518806744487678 0,0004272526131075 0,00096468771301443 0,000936121690813332 39738 36968 667 665 0 True 654 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 257 455 0,000897582794777937 0,000930800335698482 0,000732433051041428 0,000778210116731518 0,000801115289643886 0,000769660346079611 39235 40565 667 665 0 True 255 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 301 455 0,000979597177835893 0,000899570969079829 0,000823987182421607 0,000793469138628214 0,000798647076941838 0,000764128127156694 42820 39204 667 665 0 True 300 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 345 455 0,000836249304965279 0,000960584110769026 0,000686655985351339 0,000839246204318303 0,000722556300147363 0,00078081472012525 36554 41863 667 665 0 True 344 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 388 454 0,000879281119339621 0,000854298713136698 0,000701915007248035 0,000717174029144732 0,000733699382089069 0,000746108505384654 38435 37231 667 665 0 True 388 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 433 454 0,00088211787903256 0,000943053445011017 0,000503547722590982 0,000534065766384375 0,000955858821296714 0,00102819688737398 38559 41099 667 665 0 True 432 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 477 455 0,000906825140874287 0,000945761060926521 0,000518806744487678 0,000473029678797589 0,000949470633425337 0,00104237644215229 39639 41217 667 665 0 True 477 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 521 454 0,000895981398177085 0,000929469473638319 0,000595101853971161 0,000610360875867857 0,000889137306263579 0,000925022217671986 39165 40507 667 665 0 True 521 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 565 451 0,000980420753230617 0,000874491103015033 0,000686655985351339 0,000488288700694286 0,000964344049542175 0,000946235540973353 42856 38111 667 665 0 False 565 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 609 454 0,00088863785090746 0,00307126250049477 0,000503547722590982 0,000610360875867857 0,000953666141748815 0,0109516449902784 38844 133848 667 665 0 True 609 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 652 453 0,00088081388465758 0,000863729477045785 0,000442511635004196 0,000411993591210803 0,000971285827398141 0,00104437886139676 38502 37642 667 665 0 True 654 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 256 499 0,000917851900325873 0,00101838482679576 0,000732433051041428 0,000869764248111696 0,000774154498689184 0,000752683004938538 40121 44382 667 665 0 True 255 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 300 499 0,000842609137180094 0,000954388718419991 0,000701915007248035 0,000793469138628214 0,000742598248227552 0,000770860586001278 36832 41593 667 665 0 True 300 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 344 498 0,000922038408582388 0,000948675189920326 0,000762951094834821 0,000854505226215 0,000809764751522004 0,000788889347650861 40304 41344 667 665 0 True 344 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 388 498 0,000898543632738449 0,000879608038177384 0,000717174029144732 0,000656137941557946 0,000810944275770323 0,000784824450644853 39277 38334 667 665 0 True 388 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 433 498 0,000881500197486517 0,000962626295654449 0,000518806744487678 0,000564583810177768 0,000899278910248882 0,00103376597399384 38532 41952 667 665 0 True 432 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 477 499 0,000859561064054835 0,000834450511722199 0,000503547722590982 0,000564583810177768 0,000909382632358387 0,000821946574300449 37573 36366 667 665 0 True 477 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 521 498 0,00095440949701391 0,00100094594462811 0,00064087891966125 0,000686655985351339 0,000928433158404206 0,000924788845583587 41719 43622 667 665 0 True 521 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 565 498 0,000874728577574339 0,000867446712455205 0,000564583810177768 0,000595101853971161 0,000948385239448441 0,000876967342641163 38236 37804 667 665 0 True 565 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 609 497 0,000856792935644789 0,000811458722338003 0,000488288700694286 0,000442511635004196 0,000898188348969846 0,000879403006627479 37452 35364 667 665 0 True 609 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 653 498 0,000854299332366319 0,000799435072001358 0,000488288700694286 0,000305180437933928 0,00092269654745445 0,000953010915139941 37343 34840 667 665 0 True 654 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 256 543 0,000938166760062404 0,000963888320021845 0,000793469138628214 0,000823987182421607 0,000694219577404622 0,000748482150303642 41009 42007 667 665 0 True 255 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 301 542 0,000873493214482253 0,0009478950294023 0,000732433051041428 0,000900282291905089 0,000709401931952642 0,000700610461981739 38182 41310 667 665 0 True 300 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 344 542 0,000874751454668637 0,000893077280062137 0,000762951094834821 0,000762951094834821 0,000720769315610034 0,000740572278681606 38237 38921 667 665 0 True 344 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 388 542 0,000915884470216254 0,000859966349841186 0,000732433051041428 0,000656137941557946 0,000819487312357024 0,000764994403303744 40035 37478 667 665 0 True 388 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 433 542 0,000864159360008712 0,000912810751988692 0,000488288700694286 0,000503547722590982 0,000930946963979142 0,0010022787960662 37774 39781 667 665 0 True 432 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 476 543 0,000888340448681587 0,000774584664912453 0,000503547722590982 0,000274662394140536 0,000956990035099177 0,000993499746413898 38831 33757 667 665 0 True 477 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 521 543 0,000830438523013613 0,000925522779253008 0,000411993591210803 0,000473029678797589 0,000950443955928377 0,00101811841490454 36300 40335 667 665 0 True 521 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 565 542 0,000911263297168079 0,000865106230901126 0,000625619897764553 0,000534065766384375 0,000871225062880282 0,000908671357155115 39833 37702 667 665 0 True 565 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 610 542 0,000817261316698025 0,000834335782234254 0,000534065766384375 0,000549324788281071 0,000812562296489257 0,000815428344864419 35724 36361 667 665 0 True 609 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 653 542 0,000865646371138075 0,000872173567358543 0,000503547722590982 0,000457770656900893 0,000902016261513401 0,000978153377163279 37839 38010 667 665 0 True 654 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 256 587 0,000916067486970637 0,00095161226481172 0,000839246204318303 0,000839246204318303 0,000661823855453828 0,000658235720939737 40043 41472 667 665 0 True 255 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 301 587 0,000932310223922143 0,000941240719101485 0,00080872816052491 0,000869764248111696 0,000724896660564859 0,000706405443198635 40753 41020 667 665 0 True 300 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 344 586 0,00089309888429555 0,00085893378444968 0,00080872816052491 0,000717174029144732 0,000695480469829306 0,000725099297409113 39039 37433 667 665 0 True 344 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 388 587 0,000888180309021502 0,000834450511722199 0,000762951094834821 0,000717174029144732 0,000674392754999433 0,000651068207465844 38824 36366 667 665 0 True 388 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 433 586 0,000854756874252277 0,000963406456172475 0,000457770656900893 0,000534065766384375 0,000940234113423675 0,00105305665178755 37363 41986 667 665 0 True 432 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 477 587 0,00085276656704836 0,000883118760508504 0,0004272526131075 0,000488288700694286 0,00101492525548024 0,00093180144981921 37276 38487 667 665 0 True 477 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 521 587 0,000859995728846495 0,000799893989953139 0,000350957503624018 0,000350957503624018 0,000997516317628053 0,000953430344344021 37592 34860 667 665 0 True 521 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 565 581 0,000946539776575434 0,000906408846561356 0,000625619897764553 0,000549324788281071 0,000950216500576278 0,000926560886761153 41375 39502 667 665 0 False 565 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 610 586 0,000909067096115481 0,000905009146808426 0,000656137941557946 0,000656137941557946 0,000812091851917531 0,000803279243221209 39737 39441 667 665 0 True 609 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 654 586 0,000898452124361257 0,000861411941389294 0,000656137941557946 0,000625619897764553 0,00080186034630423 0,000762971001952787 39273 37541 667 665 0 True 654 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 255 624 0,000958024077912978 0,000928345124656457 0,00080872816052491 0,000778210116731518 0,000727383376931675 0,000727245106235923 41877 40458 667 665 0 False 255 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 300 625 0,000928283855325713 0,000898056539838954 0,000793469138628214 0,000762951094834821 0,000745412761839425 0,000705261830942946 40577 39138 667 665 0 False 300 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 344 630 0,000874362544065573 0,000764947387925066 0,000793469138628214 0,000595101853971161 0,00069254054122757 0,000665800817576815 38220 33337 667 665 0 True 344 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 388 630 0,000900533939942366 0,00082857636193941 0,000793469138628214 0,000717174029144732 0,000667462747770722 0,00061802086717508 39364 36110 667 665 0 True 388 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 432 625 0,000826869696303142 0,000881053629725492 0,000564583810177768 0,000595101853971161 0,000807842633863832 0,000857968772636405 36144 38397 667 665 0 False 432 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 477 625 0,000888477711247375 0,000901268965501417 0,000610360875867857 0,000442511635004196 0,000905870961148094 0,00101631611414208 38837 39278 667 665 0 False 477 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 521 625 0,00085569483511849 0,000825983475511851 0,000457770656900893 0,0004272526131075 0,000962101137579149 0,000924214627239527 37404 35997 667 665 0 False 521 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 565 625 0,000839154695941112 0,000864922663720413 0,000579842832074464 0,000549324788281071 0,000819012491073284 0,000881558392588018 36681 37694 667 665 0 False 565 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 609 625 0,000920299749415748 0,000879906334846042 0,000701915007248035 0,000701915007248035 0,000765828898792269 0,000723336892905443 40228 38347 667 665 0 False 609 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 654 625 0,000885869722497415 0,000909254137862395 0,000671396963454643 0,000732433051041428 0,000755233813362569 0,000757040073823011 38723 39626 667 665 0 False 654 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 258 674 0,00101377555671695 0,0721462158486167 0,000885023270008392 0,0715190356298161 0,000688073199550413 0,0215238129917241 44314 3144188 667 665 0 True 255 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 300 668 0,000971635949020226 0,000949065270179339 0,000823987182421607 0,000839246204318303 0,000701364261609419 0,000660206016613669 42472 41361 667 665 0 False 300 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 344 668 0,000900350923187983 0,000855400116220971 0,000793469138628214 0,000717174029144732 0,000674889371971009 0,000661366308369095 39356 37279 667 665 0 False 344 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 388 668 0,000861253969032879 0,000872770160695857 0,000717174029144732 0,000701915007248035 0,000692989538201857 0,000669587325062987 37647 38036 667 665 0 False 388 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 432 668 0,000855031399383851 0,000886675374634802 0,000656137941557946 0,000671396963454643 0,000758001872886543 0,000758453337926264 37375 38642 667 665 0 False 432 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 477 668 0,000865760756609564 0,000890874473893592 0,000595101853971161 0,000686655985351339 0,000817781722735028 0,000763475737160285 37844 38825 667 665 0 False 477 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 521 668 0,000878983717113748 0,000935183002137984 0,000564583810177768 0,000579842832074464 0,000875436231974324 0,000865175269115637 38422 40756 667 665 0 False 521 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 565 668 0,000816437741303301 0,000848309833865965 0,00064087891966125 0,000610360875867857 0,000763185487652149 0,0007830933793008 35688 36970 667 665 0 False 565 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 609 668 0,000852606427388274 0,00093433400392719 0,000732433051041428 0,000778210116731518 0,000642601285308815 0,000708999550320629 37269 40719 667 665 0 False 609 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 655 674 0,00104761077918354 0,073438872989294 0,000869764248111696 0,0717631799801633 0,000802301286745581 0,0215276088219066 45793 3200523 667 665 0 True 654 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G10_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G10_1.csv new file mode 100755 index 0000000..383832a --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G10_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 274 261 0,010931626536625 0,0439740458952371 0,0108949416342412 0,0445563439383536 0,00145629204672327 0,00954025245245914 414798 1916423 579 665 0 True 274 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 318 262 0,0106473185431508 0,0109030185901926 0,0106965743495842 0,0108491645685512 0,00136886526398107 0,00132679735589099 404010 475162 579 665 0 False 318 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 363 260 0,0108340636712337 0,056319122365309 0,0108491645685512 0,057450217441062 0,00127452960301424 0,0104809879793565 411096 2454431 579 665 0 True 362 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 407 260 0,0109723172616829 0,0723330872385817 0,010955977721828 0,0718089570458534 0,00148463690141662 0,0106105153119889 416342 3152332 579 665 0 True 407 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 451 260 0,0105833307967515 0,0645561030064289 0,0104829480430304 0,0643625543602655 0,00169380249669451 0,0137553632380212 401582 2813405 579 665 0 True 451 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 493 260 0,0104347727545552 0,0578612243586765 0,0104219119554437 0,0601358052948806 0,00157997065623253 0,0173262895496008 395945 2521637 579 665 0 True 495 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 539 261 0,0106676902597763 0,0718551241918025 0,0107118333714809 0,0707560845349813 0,00157296552035862 0,0223680373108237 404783 3131502 579 665 0 True 539 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 583 261 0,0107137572205283 0,0637551993969818 0,0107118333714809 0,0622720683604181 0,00174029303580753 0,0178141378217067 406531 2778501 579 665 0 True 583 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 627 262 0,0107782456947618 0,010783401626061 0,0107881284809644 0,0107270923933776 0,00193395995254523 0,00179177743856121 408978 469949 579 665 0 False 627 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 670 261 0,010873410337368 0,0443364992935532 0,0108339055466545 0,044937819485771 0,00179580877777713 0,00916499810163334 412589 1932219 579 665 0 True 671 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 274 305 0,010809923318803 0,0105778981672538 0,0108186465247578 0,0106813153276875 0,00145395436587142 0,0015214822667047 410180 460993 579 665 0 False 274 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 318 305 0,010476385872992 0,0103011935882278 0,0104982070649271 0,0103150988021668 0,00134052044644939 0,00121232071244719 397524 448934 579 665 0 False 318 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 363 305 0,0108546462206315 0,0962273158290554 0,0108796826123445 0,0915846494239719 0,0014501088693874 0,0246712363584276 411877 4193661 579 665 0 True 362 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 407 304 0,0106352220128389 0,0467714032162117 0,0105897611963073 0,0477149614709697 0,00143419325484556 0,00923552376255643 403551 2038334 579 665 0 True 406 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 452 305 0,0103318863616628 0,0749700297895115 0,01025406271458 0,0727702754253452 0,00173718998524125 0,0173322562622267 392041 3267252 579 665 0 True 451 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 495 305 0,0104093146972975 0,0382340378297541 0,0104982070649271 0,0392004272526131 0,00170085999980109 0,00728355091751608 394979 1666269 579 665 0 True 495 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 539 305 0,0104097363628421 0,0427613093158623 0,0104219119554437 0,0433051041428244 0,001486981733068 0,0116646057699389 394995 1863571 579 665 0 True 539 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 584 305 0,0105871521407499 0,0496355789909656 0,0106813153276875 0,0514076447699702 0,001908370614089 0,00999435973369659 401727 2163157 579 665 0 True 583 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 627 306 0,0104198563359135 0,0105385688987862 0,0105745021744106 0,010605020218204 0,00197929765002491 0,00195469356578811 395379 459279 579 665 0 False 627 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 671 306 0,0104807342989211 0,0103295776635455 0,0104676890211337 0,010452429999237 0,00197134601754841 0,00198995328059988 397689 450171 579 665 0 False 671 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 275 349 0,0106435499073456 0,0498231158119607 0,0106355382619974 0,050766765850309 0,00151916655272537 0,0122169496170084 403867 2171330 579 665 0 True 274 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 319 349 0,0104193292539827 0,06350405654787 0,0103608758678569 0,0641947051194018 0,00127391600441384 0,02148762307179 395359 2767556 579 665 0 True 318 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 363 349 0,0106094213523262 0,0367599474768404 0,0106660563057908 0,0375677119096666 0,00138501062807068 0,00683493845701372 402572 1602027 579 665 0 True 362 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 408 349 0,0104754898337096 0,0326405852121721 0,0105134660868238 0,0336308842603189 0,00147890413730405 0,00560741712515964 397490 1422502 579 665 0 True 406 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 452 348 0,010556660451053 0,0644674400581449 0,0105439841306172 0,0636758983749142 0,00175359182790095 0,0131434779005977 400570 2809541 579 665 0 True 450 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 496 349 0,0103747644767335 0,0321611995197424 0,010406652933547 0,0322117952239261 0,00178459614999967 0,00663333149471658 393668 1401610 579 665 0 True 495 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 539 349 0,0104525090615267 0,0285363901858101 0,0104829480430304 0,0283817807278553 0,00166557555786112 0,00415650483066381 396618 1243638 579 665 0 True 539 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 584 349 0,0107008437132237 0,0494989820626182 0,0108033875028611 0,0496528572518502 0,00185126718046933 0,010248521580642 406041 2157204 579 665 0 True 583 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 627 349 0,010534944675504 0,056226329155459 0,010605020218204 0,0563668268863966 0,00198218752162188 0,0132632408248646 399746 2450387 579 665 0 True 627 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 671 348 0,0105233225189298 0,0641566608211993 0,0104676890211337 0,064286259250782 0,00186784803556989 0,0193910038971648 399305 2795997 579 665 0 True 671 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 276 394 0,0104320582826116 0,045953565534344 0,0104982070649271 0,0464484626535439 0,00151099983745118 0,0128565792213693 395842 2002692 579 665 0 True 274 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 319 392 0,0105205553387931 0,0319586101899289 0,0106202792401007 0,0316929884794385 0,00140588899732381 0,00582333106208023 399200 1392781 579 665 0 True 318 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 363 393 0,0105391876850469 0,083113735356932 0,0105287251087205 0,0833600366216525 0,00143993473123705 0,0221563907776227 399907 3622161 579 665 0 True 362 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 407 392 0,0106467387530269 0,0614819263769403 0,0106507972838941 0,0621194781414511 0,00151786874378684 0,0164494490742759 403988 2679430 579 665 0 True 406 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 452 392 0,0106948876874056 0,0389197300874067 0,0106813153276875 0,0400396734569314 0,00164936504568298 0,007409356044171 405815 1696152 579 665 0 True 450 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 496 394 0,0105232961648333 0,0510524193293947 0,0105134660868238 0,0511482413977264 0,00183554100276942 0,0109927063885048 399304 2224904 579 665 0 True 494 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 539 392 0,0107136781582387 0,0404529520184072 0,0106813153276875 0,0415960936903944 0,00166621942248955 0,00724020696721353 406528 1762971 579 665 0 True 539 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 584 393 0,0105972984679178 0,0504105537361371 0,010605020218204 0,0499275196459907 0,00187757665869433 0,00940076032291728 402112 2196931 579 665 0 True 583 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 628 393 0,0103122262056439 0,0428083025141246 0,0103150988021668 0,0424963759822995 0,00203062138826076 0,00976264778068291 391295 1865619 579 665 0 True 627 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 672 393 0,0106155355027235 0,0907760818847301 0,0105745021744106 0,087708857862211 0,00185888681800015 0,0216116258731588 402804 3956092 579 665 0 True 671 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 275 437 0,0103701261557424 0,0412776964154492 0,0104371709773404 0,0425421530479896 0,0016944867185142 0,00842836821960859 393492 1798914 579 665 0 True 274 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 319 437 0,0105619839785541 0,0517022012573205 0,010605020218204 0,0523994811932555 0,00150570479271515 0,00732922191385939 400772 2253222 579 665 0 True 318 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 363 437 0,0105911316093274 0,0343697651085829 0,0105745021744106 0,0345922026398108 0,00140213478488186 0,00610793030076182 401878 1497861 579 665 0 True 362 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 407 437 0,0107256429180679 0,048359970652197 0,0106965743495842 0,0494239719233997 0,00172455104083287 0,00827464699916286 406982 2107565 579 665 0 True 406 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 452 436 0,0108525115388117 0,0891247803647365 0,0108796826123445 0,0877393759060044 0,00184103403145678 0,0150902570004601 411796 3884127 579 665 0 True 450 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 496 437 0,0108403095921137 0,058220694790306 0,0108796826123445 0,0577401388570993 0,00189297577473727 0,0145002542524385 411333 2537303 579 665 0 True 494 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 541 437 0,0106203846564869 0,0494608230349277 0,0106813153276875 0,0501106279087511 0,00171514652663903 0,00937181995983956 402988 2155541 579 665 0 True 538 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 584 437 0,0104979171698652 0,030043407901764 0,0104829480430304 0,0304875257495995 0,00183369693151206 0,00466970844755064 398341 1309315 579 665 0 True 583 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 628 436 0,010603017306867 0,0400426105318228 0,0106660563057908 0,0402990768291753 0,00182540285898435 0,00761809088710684 402329 1745088 579 665 0 True 627 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 672 436 0,0106264197445945 0,0657713177427432 0,0104829480430304 0,0650949874113069 0,00209477042474008 0,00858289062787052 403217 2866365 579 665 0 True 671 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 275 482 0,0102685838217736 0,0519959087464599 0,01025406271458 0,051972228580148 0,00146717255459617 0,0149511462021691 389639 2266022 579 665 0 True 274 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 318 481 0,0107465417166242 0,0507247519118235 0,0107423514152743 0,0528114747844663 0,00178330494629107 0,0102676293039098 407775 2210624 579 665 0 True 318 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 363 481 0,0108570180893201 0,0640196279207976 0,0109102006561379 0,0643015182726787 0,00157898737598217 0,0179407696459973 411967 2790025 579 665 0 True 362 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 407 480 0,0110932562107052 0,0820106572221352 0,011108567940795 0,0819714656290532 0,00178273689182559 0,0219786922349006 420931 3574088 579 665 0 True 406 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 451 480 0,0108847689529768 0,0888612008391315 0,0108339055466545 0,0884870679789426 0,00202448467766056 0,0309074699213987 413020 3872640 579 665 0 True 450 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 496 481 0,0107367116386147 0,0470045105898186 0,0107270923933776 0,0474097810330358 0,00191645902422402 0,0102514498256955 407402 2048493 579 665 0 True 494 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 539 480 0,0104066792876435 0,0389447411157787 0,0104371709773404 0,0405737392233158 0,00181180003727665 0,00666422535927445 394879 1697242 579 665 0 True 538 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 583 481 0,0106846359438515 0,0887533780663607 0,010605020218204 0,0850690470740826 0,0019579943145838 0,0206133371968526 405426 3867941 579 665 0 True 582 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 628 480 0,0104940958258669 0,0566469045123681 0,010406652933547 0,0590981918059052 0,00183562044758217 0,0142911407484974 398196 2468716 579 665 0 True 627 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 671 480 0,0102746189098812 0,067711760518256 0,01025406271458 0,0660563057907988 0,00192121616906362 0,0155780257580216 389868 2950931 579 665 0 True 671 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 275 526 0,0102308447555282 0,0495629552250964 0,0102388036926833 0,052628366521706 0,00150867057749871 0,0134719699583005 388207 2159992 579 665 0 True 274 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 319 525 0,0106331663933088 0,09930562272011 0,0105439841306172 0,0974746318760967 0,00156888772100143 0,026099977590623 403473 4327816 579 665 0 True 318 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 363 525 0,0107186063742917 0,0534952395867214 0,0107118333714809 0,0559853513389792 0,00155024719537487 0,0140239664330002 406715 2331364 579 665 0 True 362 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 407 525 0,0107776395505414 0,0558163089114409 0,010757610437171 0,0564126039520867 0,00175017308407404 0,0108753822698119 408955 2432518 579 665 0 True 406 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 451 524 0,0109247744715246 0,0530392128180373 0,010955977721828 0,0551461051346609 0,002102567417014 0,00984220390274623 414538 2311490 579 665 0 True 450 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 495 525 0,0108268690028783 0,0601990671345335 0,0108949416342412 0,0609597924773022 0,00188337529448592 0,0165881829660564 410823 2623522 579 665 0 True 494 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 540 525 0,0104630770542392 0,068955474059376 0,0104982070649271 0,0679789425497826 0,00183186474975787 0,0183705981421402 397019 3005133 579 665 0 True 538 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 583 524 0,010495808842142 0,0547430833894074 0,0105439841306172 0,0563515678644999 0,00167713135026353 0,0144081879242737 398261 2385746 579 665 0 True 582 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 627 524 0,0103085102780318 0,0406278227039331 0,0103913939116503 0,0407568474860761 0,0018698110982833 0,00765075481089731 391154 1770592 579 665 0 True 626 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 671 524 0,0104201462309755 0,0609552491895796 0,010452429999237 0,0614480811779965 0,00195192351848606 0,0156584984512725 395390 2656477 579 665 0 True 671 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 275 569 0,0100974139647459 0,0421539772984762 0,0101167315175097 0,0441290913252461 0,0013673698888552 0,0104237117391283 383144 1837103 579 665 0 True 274 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 319 569 0,0104368547281819 0,0506537802505807 0,0104676890211337 0,0513008316166934 0,00150030477056552 0,013087462517835 396024 2207531 579 665 0 True 318 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 363 569 0,0104666085031756 0,0470513890585929 0,0104219119554437 0,0477759975585565 0,00146545457198041 0,010987670917413 397153 2050536 579 665 0 True 362 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 407 569 0,0106912771761796 0,0476087908028253 0,0106813153276875 0,0483253223468376 0,00162908703484892 0,00816317662757212 405678 2074828 579 665 0 True 406 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 451 568 0,0105138613982719 0,0852381583393136 0,0105134660868238 0,0813458457312886 0,0020554141677329 0,0266224881968669 398946 3714745 579 665 0 True 450 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 496 569 0,0105437469437484 0,0613020993775352 0,0106507972838941 0,0612344548714427 0,00207069133167541 0,0127609523332275 400080 2671593 579 665 0 True 494 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 540 569 0,0104253116338973 0,0538051698254563 0,010452429999237 0,0539101243610285 0,00195215641286815 0,00890197814716071 395586 2344871 579 665 0 True 538 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 582 565 0,0102642090417479 0,0352022881649076 0,0102693217364767 0,037949187457084 0,00173031541897472 0,0114980263564954 389473 1534143 579 665 0 False 582 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 627 568 0,0103623516972631 0,050295434167933 0,0103761348897536 0,0493476768139162 0,0015231536944021 0,0128576317394691 393197 2191914 579 665 0 True 626 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 672 569 0,0105083533920951 0,0515738648521051 0,0105439841306172 0,0509803921568627 0,0016782208194717 0,0089541289512992 398737 2247629 579 665 0 True 670 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 273 607 0,00989841418177185 0,0096335368060802 0,00993362325474937 0,00970473792629892 0,00145073713032249 0,0015222668877054 375593 419837 579 665 0 False 273 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 318 608 0,00996954388833348 0,0101391726053518 0,00990310521095598 0,010101472495613 0,00139585449733832 0,00145953338678406 378292 441873 579 665 0 False 318 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 363 613 0,0105029508023044 0,0706334157664704 0,0104219119554437 0,069916838330663 0,00165761834894123 0,0148809492013208 398532 3078259 579 665 0 True 362 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 407 613 0,0105117267164522 0,0749073415972984 0,010452429999237 0,0741741054398413 0,00158558838310072 0,0238475228888548 398865 3264520 579 665 0 True 406 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 450 608 0,0102973624951953 0,0101531007651883 0,010406652933547 0,0100556954299229 0,00189554597300084 0,001952013737293 390731 442480 579 665 0 False 450 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 494 608 0,0101444823811664 0,0100734326087593 0,0101472495613031 0,0100404364080262 0,0019961882500982 0,0019389059916794 384930 439008 579 665 0 False 494 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 538 608 0,0102096824160065 0,0100020708672574 0,0101930266269932 0,0100709544518196 0,00200300407045582 0,00202975121561835 387404 435898 579 665 0 False 538 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 582 608 0,0100177982390983 0,00997926264505393 0,0100709544518196 0,0100709544518196 0,00161487959694636 0,00184453248852789 380123 434904 579 665 0 False 582 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 626 608 0,0103697308442943 0,0101543627895557 0,0103303578240635 0,0101472495613031 0,00130953541560595 0,00144306487239582 393477 442535 579 665 0 False 626 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 670 608 0,0102190117661817 0,0100705873174582 0,0102388036926833 0,0100709544518196 0,00157913333695161 0,00165462710383774 387758 438884 579 665 0 False 670 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 275 658 0,0100179563636776 0,0422340584810619 0,00997940032043946 0,0430609597924773 0,00126553785160296 0,00828610386003665 380129 1840593 579 665 0 True 273 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 318 651 0,00983271341909747 0,00994043818633331 0,00984206912336919 0,00997940032043946 0,00128729332020834 0,00125582091817265 373100 433212 579 665 0 False 318 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 362 651 0,00997665949439929 0,00984206912336919 0,00993362325474937 0,0097962920576791 0,00145776393218964 0,00131242742401515 378562 428925 579 665 0 False 362 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 406 651 0,0100970450073943 0,00995289780872415 0,00999465934233616 0,00997940032043946 0,00157117592075845 0,00132365427067259 383130 433755 579 665 0 False 406 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 450 651 0,00981149837138272 0,00977079916545771 0,00984206912336919 0,0098268101014725 0,00159446050742032 0,00166148056259483 372295 425819 579 665 0 False 450 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 494 651 0,0100423075488806 0,00992846042779184 0,0100556954299229 0,00988784618905928 0,00172098856723115 0,00171724936170274 381053 432690 579 665 0 False 494 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 538 651 0,0100556690758264 0,0100286422166655 0,0101167315175097 0,0100556954299229 0,0017213823329182 0,00170453390024759 381560 437056 579 665 0 False 538 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 582 651 0,0101395541651134 0,0100069124516487 0,0101167315175097 0,0100556954299229 0,00140352157168273 0,0013710626026258 384743 436109 579 665 0 False 582 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 626 651 0,0100689515404826 0,0101165938421242 0,0100556954299229 0,0101472495613031 0,001414311046427 0,00137310263026939 382064 440889 579 665 0 False 626 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 671 657 0,0103046625799369 0,0425889397331736 0,0103303578240635 0,0430457007705806 0,00141431376700185 0,00901167737475251 391008 1856059 579 665 0 True 670 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G10_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G10_2.csv new file mode 100755 index 0000000..4c02ed0 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G10_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 274 261 0,00934142035139762 0,711713616841371 0,0089723048752575 0,735133897917144 0,00254261300573666 0,212773626941704 354458 31017031 579 665 11 True 274 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 318 262 0,00756333581193611 0,00723199621851608 0,00755321583886473 0,00721751735713741 0,00151072573189288 0,00123341741872352 286989 315176 579 665 0 False 318 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 363 260 0,00690817297195015 0,00696086749260425 0,00697337300679027 0,00700389105058366 0,00125745883317583 0,00113103436110506 262129 303360 579 665 0 True 362 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 407 260 0,00680114898590095 0,0068159870952272 0,00685130083161669 0,00685130083161669 0,00139994089398697 0,00138631798493842 258068 297046 579 665 0 True 407 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 451 260 0,00692796489845174 0,00693220806651557 0,00691233691920348 0,00698863202868696 0,00149260600308937 0,00157563736718159 262880 302111 579 665 0 True 451 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 493 260 0,00708872488734612 0,00715083657874372 0,00708018616006714 0,00714122224765393 0,00147816515918285 0,00147695732904453 268980 311639 579 665 0 True 495 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 539 261 0,0072963161057922 0,00745920649644253 0,00720225833524071 0,00746166170748455 0,00141479140360942 0,00138502507891427 276857 325078 579 665 0 True 539 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 583 261 0,00760882298256426 0,00762742287166761 0,0076752880140383 0,0076600289921416 0,00165037239341192 0,00184674036702403 288715 332409 579 665 0 True 583 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 627 262 0,00828066796566009 0,00835886924911271 0,00830090791180285 0,00828564888990616 0,00188250429888115 0,00173085516291187 314208 364286 579 665 0 False 627 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 670 261 0,00983545424513764 0,713860825100058 0,00961318379491875 0,727473868925002 0,00246967778751139 0,19496794842321 373204 31110608 579 665 9 True 671 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 274 305 0,0072819794772744 0,00716669219397773 0,00721751735713741 0,00715648126955062 0,00145573516044384 0,00139975484645054 276313 312330 579 665 0 False 274 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 318 305 0,00696298949275348 0,0066515567931043 0,00691233691920348 0,00657663843747616 0,00138803988341813 0,00114510496464392 264209 289880 579 665 0 False 318 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 363 305 0,00665327615021466 0,00671571352276319 0,00669871061264973 0,00663767452506294 0,00129037563346618 0,00122123725359813 252457 292676 579 665 0 True 362 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 407 304 0,00661203198912946 0,00673127084132854 0,00657663843747616 0,00669871061264973 0,00133240494688051 0,00126247968498029 250892 293354 579 665 0 True 406 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 452 305 0,00682463048591815 0,00687208981483234 0,0068207827878233 0,00685130083161669 0,00170501044144836 0,00171037372066897 258959 299491 579 665 0 True 451 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 495 305 0,00684660980243256 0,00694129464196082 0,0068207827878233 0,00689707789730678 0,00159109516824522 0,00149192902652753 259793 302507 579 665 0 True 495 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 539 305 0,00716270083633408 0,00719468618903634 0,00720225833524071 0,00720225833524071 0,00146008956917479 0,00145254567403769 271787 313550 579 665 0 True 539 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 584 305 0,00730751659682172 0,00741294756690307 0,00729381246662089 0,00746166170748455 0,00179375065743922 0,00188758436904405 277282 323062 579 665 0 True 583 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 627 306 0,00774201658647774 0,00772244183358373 0,007690547035935 0,00782787823300526 0,00188842717916592 0,00185965796331076 293769 336550 579 665 0 False 627 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 671 306 0,00775234739232144 0,00795839449849159 0,00779736018921187 0,00798046845197223 0,00204424193614219 0,00192714056716229 294161 346833 579 665 0 False 671 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 275 349 0,00645923093739018 0,00642687056391264 0,00643930724040589 0,00645456626230259 0,00142242781290511 0,00143169440643622 245094 280088 579 665 0 True 274 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 319 349 0,00657972186677135 0,00671509398352829 0,00656137941557946 0,00669871061264973 0,00136933014943201 0,00125188007262486 249666 292649 579 665 0 True 318 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 363 349 0,00670933131355538 0,00670894448297443 0,00665293354695964 0,00671396963454643 0,0012999545740894 0,00124322628668176 254584 292381 579 665 0 True 362 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 408 349 0,00702378839347141 0,00692254784363059 0,00698863202868696 0,00689707789730678 0,00142270563671817 0,00143424787618085 266516 301690 579 665 0 True 406 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 452 348 0,00717793350413423 0,00719863288342165 0,0072327763790341 0,00718699931334401 0,00161973554041666 0,00156886078315404 272365 313722 579 665 0 True 450 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 496 349 0,00713961464776498 0,00718509480384413 0,00721751735713741 0,00717174029144732 0,00156593939020653 0,00152021830393556 270911 313132 579 665 0 True 495 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 539 349 0,00718963472299802 0,00724321676243711 0,0072480354009308 0,00732433051041428 0,00153273090112881 0,00152852834613266 272809 315665 579 665 0 True 539 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 584 349 0,00745032944597232 0,00752556603226996 0,00743114366369116 0,00753795681696803 0,0019122045132189 0,00193876775499749 282701 327970 579 665 0 True 583 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 627 349 0,00735616625903468 0,00744454406788314 0,00735484855420768 0,00735484855420768 0,00201177881313451 0,00192606603673184 279128 324439 579 665 0 True 627 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 671 348 0,00682565829568321 0,00683595002612964 0,00677500572213321 0,00685130083161669 0,00174572706577673 0,00178262800118727 258998 297916 579 665 0 True 671 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 276 394 0,00659698380000509 0,00639867005577574 0,00662241550316625 0,0063935301747158 0,0014323205373002 0,00137196062711162 250321 278859 579 665 0 True 274 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 319 392 0,00664291899027442 0,00671406141813678 0,00660715648126955 0,00671396963454643 0,0013028502607052 0,00127331076974452 252064 292604 579 665 0 True 318 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 363 393 0,00689070020594409 0,00699787922541534 0,00691233691920348 0,00701915007248035 0,00135534760504041 0,00137429074578905 261466 304973 579 665 0 True 362 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 407 392 0,0071071991090207 0,00709331121348806 0,00706492713817044 0,00717174029144732 0,00137187440012286 0,00149136485055325 269681 309132 579 665 0 True 406 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 452 392 0,00714591327683806 0,00720969280605955 0,0072327763790341 0,00720225833524071 0,00165525049013099 0,00159206679809873 271150 314204 579 665 0 True 450 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 496 394 0,0071389030871584 0,00715785802340596 0,00712596322575723 0,00715648126955062 0,00167341114959707 0,00163927366033954 270884 311945 579 665 0 True 494 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 539 392 0,00706374120382614 0,00724092217267821 0,00712596322575723 0,0072632944228275 0,00156796129723701 0,00151426965417894 268032 315565 579 665 0 True 539 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 584 393 0,0070947599754538 0,00725865935151452 0,00706492713817044 0,00727855344472419 0,00182447789084968 0,00188532829760149 269209 316338 579 665 0 True 583 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 628 393 0,00673136333826287 0,00671468095737169 0,00665293354695964 0,00669871061264973 0,00185188757333862 0,00185865501748144 255420 292631 579 665 0 True 627 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 672 393 0,0063443270764755 0,00623786520547191 0,00622568093385214 0,00622568093385214 0,00174150310186141 0,00190210151055926 240734 271851 579 665 0 True 671 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 275 437 0,00652790971297358 0,00666511781857941 0,00653086137178607 0,00669871061264973 0,00147651446552134 0,00150645959882098 247700 290471 579 665 0 True 274 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 319 437 0,00706055235814479 0,00734578492466001 0,00703440909437705 0,00733958953231098 0,00141513685220905 0,00174635142057838 267911 320135 579 665 0 True 318 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 363 437 0,00693421081933173 0,00699326709999994 0,00688181887541009 0,00701915007248035 0,00138052986541329 0,00128858988858679 263117 304772 579 665 0 True 362 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 407 437 0,00707391388509061 0,00717839460174813 0,00704966811627375 0,00717174029144732 0,0015079256084846 0,00156315306210086 268418 312840 579 665 0 True 406 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 452 436 0,00720101969270333 0,00733658361972682 0,0072632944228275 0,00735484855420768 0,00179017198036488 0,0017379170277012 273241 319734 579 665 0 True 450 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 496 437 0,00731028377695843 0,00723268459544375 0,0072480354009308 0,0072632944228275 0,00172184241329684 0,00174895945626283 277387 315206 579 665 0 True 494 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 541 437 0,00700810770603007 0,00696873793547728 0,00703440909437705 0,00704966811627375 0,00169336210323544 0,00160995038593834 265921 303703 579 665 0 True 538 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 584 437 0,00653418198795012 0,00658772130601165 0,00654612039368277 0,00663767452506294 0,00164789561549503 0,0018727180706413 247938 287098 579 665 0 True 583 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 628 436 0,00619988027333942 0,00641365372690137 0,00625619897764553 0,00643930724040589 0,00174168261102528 0,0017443549728877 235253 279512 579 665 0 True 627 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 672 436 0,00628605816902542 0,00628630399528232 0,00624093995574884 0,00634775310902571 0,00190910503741822 0,00179600224554435 238523 273962 579 665 0 True 671 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 275 482 0,00673344531188953 0,00661534816670883 0,00675974670023652 0,00666819256885634 0,00150740543629279 0,00149638656287294 255499 288302 579 665 0 True 274 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 318 481 0,0070617382924891 0,00749243215615142 0,00715648126955062 0,00747692072938125 0,00152406970539011 0,00156748500982659 267956 326526 579 665 0 True 318 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 363 481 0,00688379543265059 0,00717047826707992 0,00686655985351339 0,00718699931334401 0,00142873420332143 0,0015316590625762 261204 312495 579 665 0 True 362 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 407 480 0,00699885741814451 0,00706795599665219 0,00701915007248035 0,00709544518196384 0,00161202821300703 0,00162709688346187 265570 308027 579 665 0 True 406 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 451 480 0,00701337852533808 0,00717022586220644 0,00708018616006714 0,00709544518196384 0,00178328181297039 0,00192508126038796 266121 312484 579 665 0 True 450 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 496 481 0,00679197776030501 0,00683985082871977 0,00669871061264973 0,00683604180972 0,00173747324645326 0,00174735241648556 257720 298086 579 665 0 True 494 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 539 480 0,00654928288526757 0,00650892509369097 0,00657663843747616 0,00656137941557946 0,00165871224469048 0,00162742155508905 248511 283664 579 665 0 True 538 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 583 481 0,00623730309042631 0,00617864184379466 0,00625619897764553 0,00619516289005875 0,0017665371834835 0,00178134146892983 236673 269270 579 665 0 True 582 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 628 480 0,00622030469815797 0,00629323365635421 0,00625619897764553 0,00634775310902571 0,00167218217248152 0,00163495839483718 236028 274264 579 665 0 True 627 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 671 480 0,0062158508558427 0,0062729724287831 0,00625619897764553 0,00636301213092241 0,00178719414137349 0,00174719700470471 235859 273381 579 665 0 True 671 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 275 526 0,00644803044636065 0,00657312771514504 0,0064087891966125 0,00659189745937285 0,0014941759107621 0,00145282087049739 244669 286462 579 665 0 True 274 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 319 525 0,00677711404985642 0,00696924274522424 0,00679026474402991 0,00703440909437705 0,00154666356324161 0,00148011522151368 257156 303725 579 665 0 True 318 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 363 525 0,00683675337032658 0,00680235723205932 0,0068055237659266 0,00685130083161669 0,00137834600197291 0,00144626210044491 259419 296452 579 665 0 True 362 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 407 525 0,00668511189883506 0,00693973432092477 0,00660715648126955 0,00706492713817044 0,00171112525379617 0,00172159645796433 253665 302439 579 665 0 True 406 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 451 524 0,00677179052235532 0,00669811401931241 0,0068055237659266 0,00671396963454643 0,00186837498921705 0,0019868991504909 256954 291909 579 665 0 True 450 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 495 525 0,00659031621358045 0,00658868503371039 0,00659189745937285 0,00666819256885634 0,00175666507747572 0,00176857190169545 250068 287140 579 665 0 True 494 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 540 525 0,00641279501928659 0,00626597393001845 0,00650034332799268 0,00625619897764553 0,00181605425547832 0,00166025597599253 243332 273076 579 665 0 True 538 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 583 524 0,00622863259266463 0,00631521582624449 0,00617990386816205 0,00634775310902571 0,00160579765788677 0,00161244617774453 236344 275222 579 665 0 True 582 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 627 524 0,00612495557687602 0,00625739216432016 0,00613412680247196 0,00633249408712902 0,0018299153004435 0,00180070069196414 232410 272702 579 665 0 True 626 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 671 524 0,00638196072633471 0,00628540910527635 0,0063935301747158 0,00633249408712902 0,00172670156556274 0,00186153391214706 242162 273923 579 665 0 True 671 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 275 569 0,00672195492579806 0,00676715822515777 0,00675974670023652 0,00679026474402991 0,00125225537160257 0,00131570183798663 255063 294918 579 665 0 True 274 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 319 569 0,00670384966147504 0,00684471535900865 0,00669871061264973 0,0068207827878233 0,00136666480160061 0,00127748429921396 254376 298298 579 665 0 True 318 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 363 569 0,00669950123554593 0,00680029210127631 0,00671396963454643 0,00679026474402991 0,00141789345177853 0,00130167580107068 254211 296362 579 665 0 True 362 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 407 569 0,00663266724672033 0,006585747958819 0,00665293354695964 0,00660715648126955 0,00148414378295951 0,00147070828456358 251675 287012 579 665 0 True 406 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 451 568 0,00669939581915977 0,00670185420061942 0,00675974670023652 0,00669871061264973 0,00193230956660984 0,00184486301695646 254207 292072 579 665 0 True 450 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 496 569 0,00654949371803989 0,00645812287642888 0,00645456626230259 0,00654612039368277 0,00210025082651289 0,00201738851153576 248519 281450 579 665 0 True 494 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 540 569 0,00642238791042717 0,00667968846354843 0,0063782711528191 0,00671396963454643 0,00184042352676472 0,00172924789831752 243696 291106 579 665 0 True 538 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 582 565 0,00628977409663757 0,00637501283536146 0,00625619897764553 0,00634775310902571 0,00166819672151141 0,00145718942852617 238664 277828 579 665 0 False 582 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 627 568 0,00627327643220349 0,00652289914532268 0,0063935301747158 0,00650034332799268 0,00153202996541699 0,00147509745780117 238038 284273 579 665 0 True 626 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 672 569 0,00624929420435204 0,00646697999289824 0,0063782711528191 0,0064087891966125 0,00169703686067729 0,00162541357282256 237128 281836 579 665 0 True 670 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 273 607 0,0069291244786995 0,00695301999562881 0,00698863202868696 0,00697337300679027 0,00133277677452125 0,00130606685417287 262924 303018 579 665 0 False 273 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 318 608 0,00661398219227343 0,00668911922745752 0,00660715648126955 0,00669871061264973 0,0014445986597441 0,00128404373331125 250966 291517 579 665 0 False 318 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 363 613 0,00645933635377634 0,00640316745170319 0,0064087891966125 0,00642404821850919 0,00136396404380794 0,00132500736044612 245098 279055 579 665 0 True 362 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 407 613 0,00645137741662124 0,00634456362926084 0,00648508430609598 0,00634775310902571 0,00139492872991805 0,00136791007355482 244796 276501 579 665 0 True 406 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 450 608 0,00644747701033331 0,00652980586049697 0,00646982528419928 0,00650034332799268 0,00179816342263994 0,00199797525263221 244648 284574 579 665 0 False 450 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 494 608 0,0065277252342978 0,00653320185334015 0,00642404821850919 0,00660715648126955 0,00183463550601212 0,00189275427965524 247693 284722 579 665 0 False 494 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 538 608 0,00634857008601845 0,00624245438498971 0,00634775310902571 0,00636301213092241 0,00184490624604385 0,00181052892503553 240895 272051 579 665 0 False 538 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 582 608 0,00610529542085713 0,00626645579386782 0,00602731364919509 0,00627145799954223 0,00161296727546927 0,00169861121476193 231664 273097 579 665 0 False 582 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 626 608 0,00629920886319892 0,00636381523733802 0,00633249408712902 0,0063935301747158 0,00144855322102803 0,00133628723179079 239022 277340 579 665 0 False 626 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 670 608 0,00661240094648102 0,00654692350009838 0,00659189745937285 0,00656137941557946 0,00143645464344815 0,0014951529314466 250906 285320 579 665 0 False 670 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 275 658 0,00896932686234847 0,72405024922113 0,00846875715266651 0,729716945143816 0,00255977749100246 0,193112616468872 340339 31554671 579 665 11 True 273 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 318 651 0,00728087260521972 0,00690923922302896 0,00717174029144732 0,00689707789730678 0,00175213860791024 0,00133519422483845 276271 301110 579 665 0 False 318 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 362 651 0,00628674337553547 0,00608828089908911 0,00628671702143893 0,00608834973678187 0,00121929367708614 0,00123380749924749 238549 265332 579 665 0 False 362 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 406 651 0,0061850692710839 0,00621003183169643 0,00619516289005875 0,00621042191195544 0,00131873202398621 0,00129126324731535 234691 270638 579 665 0 False 406 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 450 651 0,00612946212738437 0,00629864888818521 0,00608834973678187 0,00634775310902571 0,001470139083234 0,00146901431847104 232581 274500 579 665 0 False 450 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 494 651 0,00610819437147654 0,00615819704904284 0,00611886778057527 0,00614938582436866 0,00158854831790438 0,00161749141724787 231774 268379 579 665 0 False 494 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 538 651 0,00619239570992204 0,00629665259509497 0,00614938582436866 0,00633249408712902 0,00163690604907815 0,00163052179225473 234969 274413 579 665 0 False 538 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 582 651 0,00646811226792418 0,0062796726308791 0,00650034332799268 0,00627145799954223 0,00126001956899644 0,00127352183829713 245431 273673 579 665 0 False 582 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 626 651 0,00669069896730155 0,00663969376405078 0,00666819256885634 0,00663767452506294 0,00138653232247027 0,00135471852316001 253877 289363 579 665 0 False 626 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 671 657 0,00899475856550963 0,730618627135474 0,00828564888990616 0,745922026398108 0,0033256778873071 0,199498157595228 341304 31840926 579 665 12 True 670 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G10_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G10_3.csv new file mode 100755 index 0000000..7271fe5 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G10_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 274 261 0,0010156078183644 0,0713698872954875 0,000823987182421607 0,0725261310749981 0,000796602336592201 0,0232324908347221 38537 3110355 579 665 0 True 274 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 318 262 0,000904472593254959 0,000924123079500078 0,000778210116731518 0,000778210116731518 0,000630662881268257 0,000679404180042449 34320 40274 579 665 0 False 318 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 363 260 0,000910534035459173 0,000928781096710648 0,00080872816052491 0,000793469138628214 0,000648545914701093 0,000644445918387207 34550 40477 579 665 0 True 362 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 407 260 0,000907766855322467 0,000893077280062137 0,000778210116731518 0,000747692072938125 0,000714468949735485 0,000663247533623999 34445 38921 579 665 0 True 407 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 451 260 0,000917148913690729 0,000894683492893369 0,000717174029144732 0,000686655985351339 0,000837871208559215 0,000810697696381444 34801 38991 579 665 0 True 451 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 493 260 0,000906976232426265 0,00100278161643523 0,000701915007248035 0,000839246204318303 0,000845378576942877 0,000804289119065344 34415 43702 579 665 0 True 495 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 539 261 0,000931090230760422 0,000964576696949515 0,000747692072938125 0,000793469138628214 0,000752954535651601 0,000814801749608719 35330 42037 579 665 0 True 539 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 583 261 0,00106770986722411 0,00105296429446241 0,000823987182421607 0,000732433051041428 0,00091647850362653 0,00101301995919385 40514 45889 579 665 0 True 583 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 627 262 0,00106064696935137 0,0010554883431972 0,000778210116731518 0,000762951094834821 0,00100585138190435 0,000960195825778341 40246 45999 579 665 0 False 627 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 670 261 0,00119009829155616 0,0715127484538767 0,000961318379491875 0,0718852521553368 0,00100045547772752 0,021594640746565 45158 3116581 579 665 0 True 671 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 274 305 0,000884364417594891 0,00095232358763698 0,000778210116731518 0,000793469138628214 0,000679963078012923 0,000722413389153453 33557 41503 579 665 0 False 274 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 318 305 0,000887289722310838 0,000884059542309654 0,000762951094834821 0,000762951094834821 0,000662304088626133 0,000663641131857154 33668 38528 579 665 0 False 318 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 363 305 0,000827624047744135 0,000913384399428418 0,000701915007248035 0,000823987182421607 0,000627782373579135 0,000644968465054943 31404 39806 579 665 0 True 362 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 407 304 0,000897963131409563 0,000883531786665106 0,000671396963454643 0,000686655985351339 0,000773306661923675 0,00075852314431183 34073 38505 579 665 0 True 406 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 452 305 0,000924448998432327 0,000961272487696697 0,000656137941557946 0,000701915007248035 0,000869218891189071 0,000898582495188796 35078 41893 579 665 0 True 451 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 495 305 0,000974785322823847 0,00103671859896939 0,000686655985351339 0,000823987182421607 0,000912761130772442 0,000869659115889226 36988 45181 579 665 0 True 495 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 539 305 0,000991203924968306 0,000967766176714388 0,00080872816052491 0,00080872816052491 0,000825348906908609 0,000812496634885626 37611 42176 579 665 0 True 539 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 584 305 0,000936387404164975 0,00101625085831998 0,000579842832074464 0,000656137941557946 0,000947621965219005 0,00106150412725833 35531 44289 579 665 0 True 583 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 627 306 0,000974416365472286 0,000943695930143509 0,000625619897764553 0,000579842832074464 0,00101148270796334 0,000993008803506735 36974 41127 579 665 0 False 627 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 671 306 0,00100704273698888 0,000985411571960343 0,000671396963454643 0,000656137941557946 0,00100064076583068 0,000987440326414038 38212 42945 579 665 0 False 671 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 275 349 0,000851316380533652 0,00083022846656582 0,000671396963454643 0,000656137941557946 0,000734202598683591 0,000712179267152464 32303 36182 579 665 0 True 274 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 319 349 0,000767035979798531 0,000854390496727055 0,000595101853971161 0,000778210116731518 0,00065385480144295 0,000598502826483582 29105 37235 579 665 0 True 318 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 363 349 0,000861251874929256 0,000945577493745809 0,000762951094834821 0,000854505226215 0,000648015906190913 0,000716774399661835 32680 41209 579 665 0 True 362 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 408 349 0,000826069156048272 0,000900282291905089 0,000625619897764553 0,000762951094834821 0,000689848892467302 0,000699662195235022 31345 39235 579 665 0 True 406 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 452 348 0,000981452909248483 0,000921438409482163 0,000656137941557946 0,000671396963454643 0,000914184365674842 0,000852221860966653 37241 40157 579 665 0 True 450 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 496 349 0,000989569970982822 0,00106482732351593 0,000762951094834821 0,000839246204318303 0,000917360404766325 0,000891055448555773 37549 46406 579 665 0 True 495 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 539 349 0,000995815891862817 0,000934058653156122 0,000762951094834821 0,000747692072938125 0,000865353925000186 0,000821652247645317 37786 40707 579 665 0 True 539 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 584 349 0,00104596773757856 0,0010924771301107 0,000656137941557946 0,000717174029144732 0,00106174215639273 0,00118236810066539 39689 47611 579 665 0 True 583 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 627 349 0,0010986232224656 0,00104619525467365 0,000717174029144732 0,000717174029144732 0,0011275772411988 0,00107002283918079 41687 45594 579 665 0 True 627 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 671 348 0,000962319835160397 0,000866138796292631 0,000671396963454643 0,000442511635004196 0,000940656110299319 0,000968947567056656 36515 37747 579 665 0 True 671 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 276 394 0,000869447998953215 0,000884793811032502 0,000701915007248035 0,000762951094834821 0,000720573152409845 0,000723203677079313 32991 38560 579 665 0 True 274 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 319 392 0,00085468970489078 0,000820751810861555 0,000762951094834821 0,000686655985351339 0,000660435494403097 0,000643938473334529 32431 35769 579 665 0 True 318 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 363 393 0,000880674844079282 0,000869534789135806 0,000732433051041428 0,000762951094834821 0,000698396504517286 0,000701924447332354 33417 37895 579 665 0 True 362 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 407 392 0,00100055962924003 0,000893329684935617 0,000823987182421607 0,000701915007248035 0,000779292665832972 0,000745240790764877 37966 38932 579 665 0 True 406 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 452 392 0,00102285519491292 0,000943328795782085 0,000778210116731518 0,000717174029144732 0,000892000138044786 0,000840217027186731 38812 41111 579 665 0 True 450 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 496 394 0,00106707736890715 0,000934861759571738 0,000823987182421607 0,000625619897764553 0,000938829248321554 0,000880050192553686 40490 40742 579 665 0 True 494 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 539 392 0,00092993065051266 0,00105583253166104 0,000732433051041428 0,000854505226215 0,000819102348697635 0,00090247794345945 35286 46014 579 665 0 True 539 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 584 393 0,000980135204421479 0,00103559424998752 0,000656137941557946 0,000579842832074464 0,000971239599779196 0,00111389906720883 37191 45132 579 665 0 True 583 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 628 393 0,000894299911990495 0,000900741209856869 0,000488288700694286 0,000473029678797589 0,000956456303470958 0,000972239489223629 33934 39255 579 665 0 True 627 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 672 393 0,000934990637048352 0,000991584018411788 0,000564583810177768 0,000625619897764553 0,000970735536549095 0,00100520982487004 35478 43214 579 665 0 True 671 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 275 437 0,000865863841823767 0,000908290410163656 0,000686655985351339 0,000717174029144732 0,000772072061790217 0,0008479651700919 32855 39584 579 665 0 True 274 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 319 437 0,000852107003429854 0,000936949836252338 0,000732433051041428 0,000854505226215 0,000744923990276091 0,000754752530059504 32333 40833 579 665 0 True 318 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 363 437 0,000916569123566848 0,000904251932187989 0,000823987182421607 0,000747692072938125 0,000692724976807547 0,00071610967110572 34779 39408 579 665 0 True 362 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 407 437 0,000886683578090416 0,000929400635945552 0,000686655985351339 0,000701915007248035 0,000798292015292749 0,000834007871524497 33645 40504 579 665 0 True 406 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 452 436 0,000895933865975979 0,0009936491491948 0,000656137941557946 0,00064087891966125 0,000882510606714502 0,000966459195678815 33996 43304 579 665 0 True 450 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 496 437 0,000990386947975564 0,000889681287218963 0,000686655985351339 0,000579842832074464 0,00094886271783554 0,000899711581020482 37580 38773 579 665 0 True 494 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 541 437 0,000965403264455584 0,000907510249645629 0,000686655985351339 0,000686655985351339 0,0009209646280338 0,000869596523488819 36632 39550 579 665 0 True 538 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 584 437 0,000879119952383418 0,000886744212327569 0,000503547722590982 0,000457770656900893 0,000941813054245304 0,00100085578552476 33358 38645 579 665 0 True 583 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 628 436 0,000916938080918409 0,000831261031957325 0,000518806744487678 0,000442511635004196 0,000978550760090654 0,000895110225955675 34793 36227 579 665 0 True 627 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 672 436 0,000995025268966615 0,000980065177822102 0,000610360875867857 0,000564583810177768 0,00103284439642971 0,00100973134010685 37756 42712 579 665 0 True 671 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 275 482 0,000947113521456781 0,000815520146211259 0,000778210116731518 0,00064087891966125 0,000777982259085475 0,000736910605173485 35938 35541 579 665 0 True 274 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 318 481 0,000844885980977877 0,000896817461369147 0,000671396963454643 0,000778210116731518 0,000746507864456724 0,000782690053980096 32059 39084 579 665 0 True 318 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 363 481 0,000946243836270959 0,000944476090661536 0,000778210116731518 0,000839246204318303 0,000787246691345207 0,000766978904328632 35905 41161 579 665 0 True 362 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 407 480 0,000928375758816796 0,00093924442601124 0,000778210116731518 0,000701915007248035 0,000852934155889966 0,00085325998640451 35227 40933 579 665 0 True 406 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 451 480 0,00095512516680496 0,000888258641568444 0,000625619897764553 0,000442511635004196 0,000998382791453816 0,00103596194340983 36242 38711 579 665 0 True 450 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 496 481 0,000974969801499627 0,000959436815889575 0,000625619897764553 0,000625619897764553 0,000961153876825801 0,000998810559461307 36995 41813 579 665 0 True 494 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 539 480 0,000919678906958575 0,000939978694734089 0,000625619897764553 0,00064087891966125 0,000862501209383036 0,000880436327069895 34897 40965 579 665 0 True 538 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 583 481 0,000922077129743721 0,000951268076347885 0,000518806744487678 0,000549324788281071 0,000966413966652167 0,00101463304118813 34988 41457 579 665 0 True 582 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 628 480 0,000975496883430428 0,000900832993447225 0,000610360875867857 0,000579842832074464 0,000976137950224256 0,000859364368011881 37015 39259 579 665 0 True 627 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 671 480 0,00090057218696703 0,000983277603484564 0,000534065766384375 0,000671396963454643 0,000941452494704325 0,00092620598346228 34172 42852 579 665 0 True 671 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 275 526 0,0008461509776118 0,000808842890012855 0,000686655985351339 0,000595101853971161 0,00074692914778518 0,000760156895679414 32107 35250 579 665 0 True 274 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 319 525 0,000916015687539506 0,000851568151323605 0,00080872816052491 0,000686655985351339 0,000716582904372641 0,000750795588315585 34758 37112 579 665 0 True 318 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 363 525 0,000911957156672337 0,000857786489570229 0,000732433051041428 0,000762951094834821 0,000800532038236143 0,000725367548104954 34604 37383 579 665 0 True 362 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 407 525 0,000941473744797207 0,000924627889247036 0,000656137941557946 0,000671396963454643 0,000883038058983067 0,000900688067975322 35724 40296 579 665 0 True 406 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 451 524 0,00091754422513883 0,000919327386903973 0,000625619897764553 0,000488288700694286 0,000971168070901568 0,00101964206466774 34816 40065 579 665 0 True 450 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 495 525 0,000901889891794033 0,000958289521010124 0,000595101853971161 0,000671396963454643 0,000914754871410452 0,000914465628047884 34222 41763 579 665 0 True 494 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 540 525 0,000891427315467628 0,000924008350012133 0,000534065766384375 0,000564583810177768 0,000924453283836804 0,000905322357547924 33825 40269 579 665 0 True 538 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 583 524 0,000887052535441977 0,000908519869139546 0,000595101853971161 0,000595101853971161 0,000842957700844861 0,00085863680738374 33659 39594 579 665 0 True 582 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 627 524 0,000902680514690235 0,00085590492596793 0,000564583810177768 0,000488288700694286 0,00095835455887333 0,000927050419854826 34252 37301 579 665 0 True 626 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 671 524 0,000946033003498638 0,000931190415957495 0,000534065766384375 0,000610360875867857 0,00101442218527233 0,000953517826492664 35897 40582 579 665 0 True 671 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 275 569 0,000880042345762321 0,000875776073280019 0,000762951094834821 0,000717174029144732 0,000672591808937597 0,000671077411661391 33393 38167 579 665 0 True 274 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 319 569 0,000861963435535837 0,000891700526206796 0,000671396963454643 0,000747692072938125 0,000730249730308905 0,000710019909005492 32707 38861 579 665 0 True 318 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 363 569 0,000878223913101056 0,000902714557049525 0,000717174029144732 0,000823987182421607 0,000683209013045047 0,000660830434881044 33324 39341 579 665 0 True 362 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 407 569 0,000948431226283784 0,000860448213690555 0,000762951094834821 0,000610360875867857 0,000806426362678156 0,000772243156911433 35988 37499 579 665 0 True 406 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 451 568 0,000950302367138128 0,000962442728473736 0,000610360875867857 0,000625619897764553 0,00100985569444054 0,000977428787269079 36059 41944 579 665 0 True 450 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 496 569 0,000983745715647468 0,000844982678715557 0,000534065766384375 0,000274662394140536 0,001093863978367 0,00105291158718303 37328 36825 579 665 0 True 494 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 540 569 0,000872794969213803 0,000947023085293917 0,000442511635004196 0,000534065766384375 0,000983736391274276 0,000957905464950957 33118 41272 579 665 0 True 538 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 582 565 0,000851869816560993 0,000972515977515315 0,000564583810177768 0,000701915007248035 0,000846387900250357 0,000851461088675621 32324 42383 579 665 0 False 582 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 627 568 0,000974258240893046 0,000918340713307645 0,000732433051041428 0,000671396963454643 0,000852155687387309 0,000803412051228665 36968 40022 579 665 0 True 626 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 672 569 0,000931828145463544 0,000951979399173145 0,000625619897764553 0,000625619897764553 0,000826004309141276 0,000921299055343034 35358 41488 579 665 0 True 670 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 273 607 0,000882967650478268 0,000853082580564481 0,000778210116731518 0,000686655985351339 0,000634344773430337 0,00072682044857503 33504 37178 579 665 0 False 273 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 318 608 0,000928929194844137 0,000861343103696527 0,000778210116731518 0,000717174029144732 0,000724611974205318 0,000736704418506036 35248 37538 579 665 0 False 318 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 363 613 0,000908056750384407 0,000892595416212768 0,000778210116731518 0,000747692072938125 0,000726246294156595 0,000720754231647621 34456 38900 579 665 0 True 362 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 407 613 0,000912009864865417 0,000853266147745193 0,000762951094834821 0,000686655985351339 0,000718746818249837 0,000691448874999935 34606 37186 579 665 0 True 406 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 450 608 0,000840484846855686 0,000900144616519555 0,000473029678797589 0,000549324788281071 0,000927830152781122 0,000949192196981509 31892 39229 579 665 0 False 450 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 494 608 0,000953622983302176 0,00100360766874843 0,000534065766384375 0,000534065766384375 0,00106657036851769 0,00109904711515872 36185 43738 579 665 0 False 494 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 538 608 0,000906343734109303 0,000950143727366023 0,000488288700694286 0,000564583810177768 0,000996932707613809 0,00102490877708326 34391 41408 579 665 0 False 538 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 582 608 0,000948589350863024 0,000987293135562642 0,000701915007248035 0,000717174029144732 0,000848293218147069 0,000941240483041758 35994 43027 579 665 0 False 582 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 626 608 0,00091319579920972 0,000976256158822325 0,000732433051041428 0,00080872816052491 0,000777138244599193 0,000738492877649907 34651 42546 579 665 0 False 626 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 670 608 0,000872241533186462 0,000865725770136029 0,000656137941557946 0,000579842832074464 0,000768747726703179 0,000845899677138568 33097 37729 579 665 0 False 670 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 275 658 0,00103350224991511 0,0734876100757731 0,000900282291905089 0,0726939803158618 0,000735906293305271 0,0222378631496725 39216 3202647 579 665 0 True 273 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 318 651 0,000883204837347128 0,000870659138117668 0,000778210116731518 0,000762951094834821 0,000651784196197056 0,000671155652523824 33513 37944 579 665 0 False 318 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 362 651 0,000901257393477071 0,000806020544609406 0,00080872816052491 0,000717174029144732 0,000648841921243284 0,000581996670582118 34198 35127 579 665 0 False 362 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 406 651 0,000937757817185058 0,000833349108637926 0,000762951094834821 0,000701915007248035 0,000703440634161111 0,000692174145018232 35583 36318 579 665 0 False 406 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 450 651 0,000903313013007196 0,000981602552960566 0,00064087891966125 0,000778210116731518 0,000832706750573945 0,000857937529245982 34276 42779 579 665 0 False 450 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 494 651 0,000950328721234668 0,00091962568357263 0,000656137941557946 0,000625619897764553 0,000894487555932014 0,000868458442353171 36060 40078 579 665 0 False 494 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 538 651 0,000926952637603633 0,000943604146553153 0,000549324788281071 0,000564583810177768 0,000907771480762581 0,000935199087098637 35173 41123 579 665 0 False 538 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 582 651 0,000908320291349808 0,000923319973084462 0,000717174029144732 0,00080872816052491 0,000778025961210705 0,000654300012173173 34466 40239 579 665 0 False 582 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 626 651 0,00095106663593779 0,00098196968732199 0,00080872816052491 0,000839246204318303 0,00070376127632352 0,000713892325486562 36088 42795 579 665 0 False 626 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 671 657 0,0010462576326405 0,0738844823204727 0,000869764248111696 0,073838406958114 0,000797110367534497 0,0223726310937932 39700 3219943 579 665 0 True 670 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G11_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G11_1.csv new file mode 100755 index 0000000..5546ddb --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G11_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 267 271 0,0106805247047913 0,0442707822428582 0,0107270923933776 0,045136186770428 0,0015374485677096 0,00931602370042713 405270 1929355 579 665 0 True 266 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 310 272 0,0107474641100031 0,0108966625765604 0,0107270923933776 0,0108796826123445 0,00137674761459467 0,00131095269737822 407810 474885 579 665 0 False 310 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 354 271 0,010674410554394 0,054577115712146 0,0106660563057908 0,056595712214847 0,00136596403586002 0,0106718497953751 405038 2378513 579 665 0 True 354 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 399 271 0,0108441836443051 0,0723502278240807 0,0108186465247578 0,0735179674982834 0,00154631386588005 0,0122820373983097 411480 3153079 579 665 0 True 398 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 443 271 0,0110427090535414 0,0637390913768743 0,0110322728313115 0,0635080491340505 0,00163610536431582 0,0142079607850316 419013 2777799 579 665 0 True 442 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 487 270 0,0108646607773167 0,0556106677772481 0,0108796826123445 0,0584878309300374 0,00176392257512063 0,0154096216036954 412257 2423556 579 665 0 True 486 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 532 272 0,0106364870094728 0,0689079531054691 0,0106507972838941 0,0684672312504769 0,0015276476459405 0,0206356814953179 403599 3003062 579 665 0 True 530 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 575 272 0,0104439176260546 0,0623926261063508 0,010452429999237 0,0616617074845502 0,00171698898049788 0,0174023181030051 396292 2719119 579 665 0 True 574 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 618 272 0,0100823130674284 0,0100640706825429 0,0100556954299229 0,0100556954299229 0,00194516657632771 0,00185633944078656 382571 438600 579 665 0 False 618 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 660 270 0,0100221466650274 0,0433678611727304 0,00999465934233616 0,0432898451209277 0,00182097938131225 0,00889079640108402 380288 1890005 579 665 0 True 663 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 266 315 0,0106731719118566 0,0106962989988131 0,0106202792401007 0,0106660563057908 0,00153142288575243 0,00152600748286308 404991 466153 579 665 0 False 266 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 310 315 0,0105027926777251 0,0104569503410621 0,0105134660868238 0,010452429999237 0,00131987507277104 0,00122282789423205 398526 455722 579 665 0 False 310 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 356 316 0,0106920150908828 0,0938461970903454 0,0107423514152743 0,0922102693217365 0,00130397279088165 0,0245325865909537 405706 4089890 579 665 0 True 354 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 400 316 0,010453405100809 0,0481462525620529 0,0104219119554437 0,0472114137483787 0,00138707055211514 0,0104579825106107 396652 2098251 579 665 0 True 398 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 444 316 0,0105220575222959 0,0681894482142642 0,0104982070649271 0,0648050659952697 0,00165623767361316 0,0169790918884861 399257 2971749 579 665 0 True 442 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 487 316 0,010661576109379 0,0385399295905133 0,0106660563057908 0,0391088731212329 0,0017645397467459 0,00875858418049098 404551 1679600 579 665 0 True 486 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 531 316 0,0109382414148566 0,0381426213737594 0,010757610437171 0,0398718242160677 0,00212720920013686 0,00770870602102376 415049 1662285 579 665 0 True 530 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 575 316 0,0108093962368722 0,0486735951804437 0,0108186465247578 0,0491645685511559 0,00185632932491715 0,010915841504508 410160 2121233 579 665 0 True 574 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 618 315 0,0104798909678318 0,0103850149521205 0,0104371709773404 0,0103761348897536 0,00208037328391349 0,00191779105166222 397657 452587 579 665 0 False 618 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 662 315 0,0102554858357932 0,0102783853660244 0,0102235446707866 0,0103608758678569 0,00196105585632497 0,0018075848246105 389142 447940 579 665 0 False 662 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 267 361 0,0104975745666102 0,0494253486772551 0,0105287251087205 0,0491493095292592 0,00144407771008441 0,0113252323556973 398328 2153995 579 665 0 True 266 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 312 361 0,0105500455728214 0,0589484239323417 0,0105439841306172 0,0613260090028229 0,00136107315088541 0,0167302706629206 400319 2569018 579 665 0 True 310 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 356 361 0,0104475544913771 0,0381398219742536 0,0104829480430304 0,0386053253986419 0,00144673648076629 0,008183057766987 396430 1662163 579 665 0 True 354 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 400 360 0,0106536435263204 0,0334202638663493 0,010605020218204 0,0337224383916991 0,0014636771946609 0,00625286380331958 404250 1456481 579 665 0 True 398 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 444 360 0,010599406795641 0,0632715916593957 0,0106813153276875 0,0628213931486992 0,00165230570825095 0,0126026789728715 402192 2757425 579 665 0 True 442 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 486 358 0,0105859925605021 0,0299672275217685 0,0106813153276875 0,0317998016327153 0,00177586143499847 0,00814218768607396 401683 1305995 579 665 0 False 486 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 532 360 0,0106838716750519 0,026966799007131 0,0107423514152743 0,0271763179980163 0,00165560484731844 0,00354079606551688 405397 1175234 579 665 0 True 530 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 576 361 0,0107968516869191 0,0490624134150896 0,0108339055466545 0,0498664835584039 0,0018485900464627 0,010303447094061 409684 2138178 579 665 0 True 574 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 620 361 0,0107618534467139 0,0548362207877212 0,0107881284809644 0,0547951476310369 0,00200336121197994 0,013153371636969 408356 2389805 579 665 0 True 618 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 663 360 0,0106840297996311 0,0654352521266545 0,0107728694590677 0,063935301747158 0,00191874210015782 0,0227007042025868 405403 2851719 579 665 0 True 662 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 266 401 0,0107487818148301 0,0367951923755371 0,0106355382619974 0,0426642252231632 0,00208158148948421 0,0146462829338271 407860 1603563 579 665 0 False 266 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 311 405 0,0105782708102159 0,0330312620645227 0,0106202792401007 0,0318760967421988 0,00144603581810587 0,0068432831579465 401390 1439528 579 665 0 True 310 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 355 405 0,0106080245852096 0,0828842304892467 0,0105745021744106 0,0809643701838712 0,00138877841489326 0,0230913736760461 402519 3612159 579 665 0 True 354 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 400 405 0,0107637245875683 0,059850312437078 0,0107881284809644 0,0601205462729839 0,00154810098604769 0,0155415040672427 408427 2608323 579 665 0 True 398 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 444 405 0,0108570444434166 0,040123609550312 0,0108949416342412 0,0414892805371176 0,00153049625042207 0,00760407428060033 411968 1748618 579 665 0 True 442 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 488 405 0,0107805912093539 0,0482945518981707 0,0107881284809644 0,0493171587701228 0,00164356033167867 0,00923870958733275 409067 2104714 579 665 0 True 486 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 532 405 0,0107164453383754 0,0386342372296041 0,0108186465247578 0,0395819028000305 0,00170972140714615 0,0059162315116752 406633 1683710 579 665 0 True 530 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 576 405 0,010654987585244 0,0485282329192172 0,0106202792401007 0,0491340505073625 0,00180487917876928 0,00881705548978223 404301 2114898 579 665 0 True 574 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 621 405 0,0109697345602219 0,0426463733148389 0,010955977721828 0,0420386053253986 0,00192139639744871 0,0105045565525418 416244 1858562 579 665 0 True 618 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 665 405 0,0110127444457753 0,0824129217527683 0,0110780498970016 0,0799877927824826 0,0021250516662993 0,0210404714959611 417876 3591619 579 665 0 True 662 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 268 450 0,0103213447230468 0,038853324659784 0,0102998397802701 0,0395666437781338 0,00154370957970527 0,00691570237347017 391641 1693258 579 665 0 True 266 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 312 449 0,010458333316862 0,049086896687817 0,0104676890211337 0,0496375982299535 0,00151114705129325 0,00732110357256833 396839 2139245 579 665 0 True 310 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 356 449 0,0107397687138134 0,033260881661696 0,0107118333714809 0,0339208056763561 0,00149678394374571 0,00516710674688203 407518 1449535 579 665 0 True 354 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 400 448 0,010772447793523 0,0492324654621218 0,0107423514152743 0,0494239719233997 0,00171845811347868 0,0108136078945453 408758 2145589 579 665 0 True 398 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 444 448 0,0108500606078335 0,0865547251052786 0,0108033875028611 0,0859693293659876 0,00183455237123946 0,0156453554995032 411703 3772122 579 665 0 True 442 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 489 450 0,0109770346449635 0,0550916774655797 0,0109864957656214 0,0561989776455329 0,00188708224859336 0,0130213214703999 416521 2400938 579 665 0 True 486 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 533 449 0,0106457900055515 0,0502382988829363 0,010757610437171 0,0498664835584039 0,0017714586075931 0,0103326631969185 403952 2189424 579 665 0 True 530 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 576 449 0,0105779809151539 0,0307124643836646 0,0105592431525139 0,0309910734721904 0,00190835689957016 0,00549354462621057 401379 1338473 579 665 0 True 574 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 621 449 0,0106279219280973 0,0411673266480461 0,0106813153276875 0,0401770046540017 0,00183422800522777 0,0092105848245248 403274 1794104 579 665 0 True 618 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 665 449 0,0108975243357022 0,0642647589447411 0,0108949416342412 0,0642404821850919 0,0020825928021538 0,0107288053938231 413504 2800708 579 665 0 True 662 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 268 494 0,0102232811298212 0,0508537078562738 0,0101472495613031 0,0507209887846189 0,00157855043638119 0,0152809695843723 387920 2216244 579 665 0 True 266 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 311 493 0,010710910978102 0,0511090039128492 0,0107423514152743 0,0523384451056687 0,00161383116646475 0,0109241020178697 406423 2227370 579 665 0 True 310 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 355 493 0,0108024914635787 0,062835527821614 0,0107728694590677 0,0626688029297322 0,00157073111786515 0,018268115732422 409898 2738421 579 665 0 True 354 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 399 493 0,0111567695833668 0,0779099040804116 0,0112306401159686 0,0793011367971313 0,00172494386524718 0,0209093233513004 423341 3395374 579 665 0 True 398 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 444 493 0,011146043466075 0,0906770014989408 0,0111238269626917 0,0881513694972152 0,0020001508894404 0,0308408603216937 422934 3951774 579 665 0 True 442 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 488 494 0,0107348141436638 0,044988736432521 0,0108186465247578 0,0463263904783703 0,00181266675556282 0,0092049562807508 407330 1960644 579 665 0 True 486 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 530 491 0,0106319013966749 0,0397601924242972 0,0107423514152743 0,0412603952086671 0,00172697251137779 0,0082338996405709 403425 1732780 579 665 0 True 530 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 575 493 0,0107068524472348 0,0907494416976293 0,0107270923933776 0,0900587472343023 0,00187105563587595 0,0202208130653929 406269 3954931 579 665 0 True 574 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 620 492 0,0107525504506353 0,0603111807901535 0,0107728694590677 0,0601815823605707 0,0017855953581777 0,0196670271172778 408003 2628408 579 665 0 True 618 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 663 493 0,0106445777171106 0,0679093935341902 0,0106507972838941 0,0671396963454643 0,00194093437155289 0,0157293258855361 403906 2959544 579 665 0 True 662 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 266 530 0,0131799999288439 0,0360318282545457 0,0108186465247578 0,0385595483329519 0,00718222531944609 0,020039240363077 500112 1570295 579 665 0 False 266 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 310 531 0,0155489433127337 0,0760846038190005 0,0114137483787289 0,0845349813076982 0,0127006288707139 0,04696115483594 590001 3315826 579 665 0 False 310 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 356 537 0,0106653710992808 0,0530250322533273 0,0106507972838941 0,0551461051346609 0,00146511793122843 0,0127363203421982 404695 2310872 579 665 0 True 354 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 400 537 0,010940165263904 0,0550390395765105 0,0110322728313115 0,0554512855725948 0,00161368904596777 0,0102004653019404 415122 2398644 579 665 0 True 398 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 443 536 0,0110617894194364 0,0528696196889569 0,0110170138094148 0,0546578164339666 0,00201625718019879 0,00979890679274448 419737 2304099 579 665 0 True 442 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 487 537 0,0106827120948041 0,0578239602209919 0,010757610437171 0,0588387884336614 0,00190870838130404 0,0140069040833669 405353 2520013 579 665 0 True 486 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 532 538 0,0108147724725664 0,0678486557432721 0,0108033875028611 0,0685893034256504 0,00198881169371969 0,0191296615140122 410364 2956897 579 665 0 True 530 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 575 537 0,010625075685671 0,054677504014098 0,0106507972838941 0,0561989776455329 0,00174352727125973 0,0145207461439054 403166 2382888 579 665 0 True 574 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 620 537 0,0104831588758028 0,0420734142520412 0,0105592431525139 0,0415960936903944 0,00173936619012247 0,00852167579485985 397781 1833592 579 665 0 True 618 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 664 537 0,0104706406799462 0,0595211764820612 0,010452429999237 0,0596017395284962 0,00202544443026434 0,0154730996693725 397306 2593979 579 665 0 True 662 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 266 574 0,0123336908266529 0,033484374704213 0,0106660563057908 0,0366521705958648 0,00511323709203554 0,0164571874942322 467999 1459275 579 665 0 False 266 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 312 581 0,0102740918279504 0,0490049798334243 0,0102998397802701 0,0500801098649577 0,00149827498006833 0,0116722002239961 389848 2135675 579 665 0 True 310 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 355 581 0,0104529570811679 0,0467438681391049 0,0104982070649271 0,046997787441825 0,00144564331857251 0,0113166933035929 396635 2037134 579 665 0 True 354 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 399 581 0,0108678232689015 0,0472034285760177 0,0108033875028611 0,0473792629892424 0,00150308743431947 0,00929467431962711 412377 2057162 579 665 0 True 398 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 445 581 0,0106983927822455 0,0836517019259066 0,0106965743495842 0,0804455634393835 0,00200038863641546 0,0236516362950731 405948 3645606 579 665 0 True 442 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 489 582 0,010799724283442 0,0598215153356038 0,0108491645685512 0,0595559624628061 0,00196243161216211 0,0133806275789953 409793 2607068 579 665 0 True 486 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 533 582 0,010828371186381 0,0535612778799826 0,0108186465247578 0,0530861371786069 0,00198500974829763 0,0096236742033998 410880 2334242 579 665 0 True 530 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 574 574 0,0118353612151768 0,0303791063834913 0,010955977721828 0,0331273365377279 0,00391471384795379 0,0137922633469774 449090 1323945 579 665 0 False 574 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 620 581 0,0105250091811084 0,0474596195225991 0,0105134660868238 0,0479438467994202 0,00154429281877706 0,00994056330189634 399369 2068327 579 665 0 True 618 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 664 581 0,0104082078252428 0,0502204928664073 0,010406652933547 0,0498054474708171 0,00174097540338212 0,00924046137877427 394937 2188648 579 665 0 True 662 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 266 617 0,0104268401714966 0,0100327036405387 0,0100709544518196 0,0100099183642329 0,00261292997235303 0,00132462936202085 395644 437233 579 665 0 False 266 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 310 617 0,0104983651895064 0,0101524582800558 0,0101167315175097 0,0101930266269932 0,00282403744947094 0,00140091554292797 398358 442452 579 665 0 False 310 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 354 617 0,0175569673445072 0,0543514198634604 0,0109407186999313 0,0669565880827039 0,0157334624204564 0,0324166228999775 666195 2368677 579 665 0 False 354 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 398 617 0,0160946839438853 0,0564992247154852 0,0112916762035554 0,056946669718471 0,0118256022253315 0,0367664761998253 610709 2462280 579 665 0 False 398 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 442 617 0,0117394850119641 0,0106066034851377 0,0107118333714809 0,0106202792401007 0,00622966194660744 0,00190855209910572 445452 462244 579 665 0 False 442 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 486 617 0,0111327082932257 0,010452039918978 0,0106660563057908 0,0103761348897536 0,00377835945391177 0,0019849062962528 422428 455508 579 665 0 False 486 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 530 617 0,0109067482694912 0,0103761578356512 0,0105897611963073 0,0103761348897536 0,00301175142894771 0,00200926967582303 413854 452201 579 665 0 False 530 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 574 617 0,0102824987847467 0,0103478655439239 0,0102693217364767 0,0102998397802701 0,00191479109770875 0,00183352660457746 390167 450968 579 665 0 False 574 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 618 617 0,0106869551043471 0,0101802687079337 0,0103456168459602 0,0101930266269932 0,00264370298605428 0,0013865997932723 405514 443664 579 665 0 False 618 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 662 618 0,0104071009531881 0,0103090181393057 0,010406652933547 0,0103150988021668 0,00168882120302682 0,00159661460433342 394895 449275 579 665 0 False 662 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 266 667 0,0102862410664554 0,0424550045289465 0,0103150988021668 0,0429083695735103 0,00123982074081338 0,00873797954790641 390309 1850222 579 665 0 True 265 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 309 660 0,0102334538110857 0,00996317757084403 0,0102693217364767 0,00994888227664607 0,00134537502027893 0,00130132950591289 388306 434203 579 665 0 False 309 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 353 660 0,0125634985484822 0,0100419508372671 0,0103303578240635 0,00999465934233616 0,0102720294788164 0,00122356937919231 476719 437636 579 665 0 False 353 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 398 660 0,0114626615819073 0,0102441500868215 0,010452429999237 0,0102845807583734 0,00535182586651415 0,00131938763205562 434948 446448 579 665 0 False 398 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 442 660 0,0101982447381081 0,0103074119264745 0,0102082856488899 0,0103761348897536 0,00156032276077222 0,00160651658652537 386970 449205 579 665 0 False 442 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 486 660 0,0100369840213795 0,0101187278106 0,00993362325474937 0,0102235446707866 0,00164746152229234 0,00158098584926805 380851 440982 579 665 0 False 486 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 530 660 0,0100161642851128 0,0100059028321548 0,0100251773861295 0,0100404364080262 0,00183544868736391 0,00178198177950545 380061 436065 579 665 0 False 530 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 574 661 0,0100984417745109 0,0101149646833954 0,0101472495613031 0,0100862134737163 0,001472479692462 0,00145773288696044 383183 440818 579 665 0 False 574 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 618 661 0,0102293425720254 0,0102379776403701 0,0102082856488899 0,0102388036926833 0,00128374672197139 0,00135420044371811 388150 446179 579 665 0 False 618 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 662 667 0,0106938862317371 0,0422359629905618 0,0107270923933776 0,0426489662012665 0,00145631339218596 0,00978060410792664 405777 1840676 579 665 0 True 662 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G11_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G11_2.csv new file mode 100755 index 0000000..6c47c16 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G11_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 267 271 0,00876083960462003 0,719578162618724 0,00860608834973678 0,747814145113298 0,00183978803725616 0,205188123270655 332428 31359774 579 665 11 True 266 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 310 272 0,00732738758561293 0,00715723848417106 0,0072327763790341 0,00715648126955062 0,00153721763245034 0,00128195660127296 278036 311918 579 665 0 False 310 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 354 271 0,00679411244212476 0,00665428735491739 0,00677500572213321 0,00669871061264973 0,00118396359081558 0,00141080765131664 257801 289999 579 665 0 True 354 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 399 271 0,00664818980958243 0,00673964609394854 0,00663767452506294 0,00675974670023652 0,00125477557573594 0,00123328481376112 252264 293719 579 665 0 True 398 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 443 271 0,00676285648362824 0,00691580174973942 0,00683604180972 0,00694285496299687 0,00160641354624177 0,00163956049968824 256615 301396 579 665 0 True 442 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 487 270 0,00701651466282635 0,00722173940229379 0,00698863202868696 0,0072480354009308 0,00159753735899641 0,00153076872177283 266240 314729 579 665 0 True 486 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 532 272 0,0071894238902257 0,00725909532356871 0,00721751735713741 0,00718699931334401 0,00144331565725577 0,00154691779153112 272801 316357 579 665 0 True 530 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 575 272 0,00741580557950484 0,00741255748664405 0,00747692072938125 0,00746166170748455 0,00165461940143517 0,00179436409464775 281391 323045 579 665 0 True 574 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 618 272 0,00826121864241352 0,00789699127654338 0,00820935378042268 0,00799572747386892 0,00209746356147197 0,00190330523581353 313470 344157 579 665 0 False 618 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 660 270 0,00973312128827257 0,717580492774624 0,00961318379491875 0,72664988174258 0,0021945646478553 0,192903015528827 369321 31272714 579 665 10 True 663 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 266 315 0,00689294030414999 0,00707986491750089 0,0068207827878233 0,00703440909437705 0,00152175506427159 0,00145205306671744 261551 308546 579 665 0 False 266 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 310 315 0,0068270287087033 0,00660534375536002 0,00686655985351339 0,00659189745937285 0,00122603142402561 0,00116540405682176 259050 287866 579 665 0 False 310 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 356 316 0,00650073863944078 0,00653398201385817 0,00650034332799268 0,00653086137178607 0,00122196282892835 0,0013073870628437 246669 284756 579 665 0 True 354 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 400 316 0,00652010890039772 0,0065230597666058 0,00653086137178607 0,00653086137178607 0,00138730331729807 0,00125217185848113 247404 284280 579 665 0 True 398 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 444 316 0,00686887901400892 0,00684565614080979 0,00686655985351339 0,00694285496299687 0,00148764000711489 0,00163193070477665 260638 298339 579 665 0 True 442 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 487 316 0,00709536611967422 0,00717174029144732 0,00717174029144732 0,00711070420386053 0,0016211341282759 0,00158752703919987 269232 312550 579 665 0 True 486 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 531 316 0,00739690969228562 0,00738364565568189 0,00743114366369116 0,00735484855420768 0,00169207672134528 0,00157511955138372 280674 321785 579 665 0 True 530 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 575 316 0,00734860263332768 0,00765679362058155 0,00733958953231098 0,00770580605783169 0,00177131244593974 0,00175832381888619 278841 333689 579 665 0 True 574 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 618 315 0,00775827706404296 0,00776434104258128 0,00784313725490196 0,00776684214541848 0,00193258131544264 0,00199199350549629 294386 338376 579 665 0 False 618 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 662 315 0,00778969114711871 0,00782232532578872 0,00779736018921187 0,00782787823300526 0,00194850670412655 0,00181870892284127 295578 340903 579 665 0 False 662 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 267 361 0,00640027682343006 0,00648586446661401 0,00643930724040589 0,00643930724040589 0,00135109925307773 0,00143265739699501 242857 282659 579 665 0 True 266 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 312 361 0,00658965736116695 0,00643880243065893 0,00659189745937285 0,00646982528419928 0,00130738921154524 0,00128035016487997 250043 280608 579 665 0 True 310 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 356 361 0,00648229077186273 0,00650715825957661 0,00651560234988937 0,00651560234988937 0,00127706112195253 0,00128515075580245 245969 283587 579 665 0 True 354 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 400 360 0,00678412423953607 0,00659214986424633 0,00674448767833982 0,00663767452506294 0,00139907065212224 0,00137082222784485 257422 287291 579 665 0 True 398 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 444 360 0,0070568100764361 0,00702419816994994 0,00708018616006714 0,00700389105058366 0,00156488866071337 0,00165847321837873 267769 306120 579 665 0 True 442 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 486 358 0,00698908004832814 0,00690304383067993 0,00703440909437705 0,00698863202868696 0,00167706778451535 0,00161584328015412 265199 300840 579 665 0 False 486 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 532 360 0,00723775730328018 0,00734225125643131 0,00729381246662089 0,00737010757610437 0,00156014814277433 0,00160283231197917 274635 319981 579 665 0 True 530 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 576 361 0,00753474161719014 0,007573132877972 0,00740062561989776 0,00764476997024491 0,00175159408156053 0,00183058989678484 285904 330043 579 665 0 True 574 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 620 361 0,00742979960476761 0,00757297225668887 0,00735484855420768 0,00764476997024491 0,00204046708140316 0,00198298648942248 281922 330036 579 665 0 True 618 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 663 360 0,00698939629748662 0,00703569406464204 0,00700389105058366 0,00698863202868696 0,00189597306608757 0,00193358205492693 265211 306621 579 665 0 True 662 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 266 401 0,00651325683529731 0,0064223731679852 0,00646982528419928 0,0063935301747158 0,00139313986770604 0,00142063839403359 247144 279892 579 665 0 False 266 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 311 405 0,00661709197566515 0,00677018708363952 0,00663767452506294 0,00683604180972 0,0013613306006916 0,00128303120732166 251084 295050 579 665 0 True 310 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 355 405 0,00683706961948506 0,00744160699299175 0,00685130083161669 0,00689707789730678 0,00140308622703458 0,00476515658813775 259431 324311 579 665 0 True 354 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 400 405 0,0068624222603566 0,00681699671472111 0,00697337300679027 0,00675974670023652 0,00146460918590415 0,00146630477982681 260393 297090 579 665 0 True 398 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 444 405 0,00722147047161842 0,00699604355360821 0,00735484855420768 0,00691233691920348 0,00162528878173713 0,00145829458530708 274017 304893 579 665 0 True 442 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 488 405 0,00701862299054955 0,00719459440544598 0,00708018616006714 0,00729381246662089 0,00153137315231187 0,0015851059875408 266320 313546 579 665 0 True 486 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 532 405 0,00736483675679636 0,00727928771344704 0,00735484855420768 0,0072632944228275 0,00155583373337779 0,00154664025132648 279457 317237 579 665 0 True 530 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 576 405 0,00723406772976457 0,00724379040987683 0,00718699931334401 0,00721751735713741 0,00160818978845045 0,00174407545580501 274495 315690 579 665 0 True 574 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 621 405 0,00684102273396607 0,00671045891221531 0,00689707789730678 0,00672922865644312 0,00187279572400974 0,00189878679381168 259581 292447 579 665 0 True 618 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 665 405 0,00641379647495511 0,00627496872187335 0,00656137941557946 0,00625619897764553 0,00173036127844598 0,00175863211156878 243370 273468 579 665 0 True 662 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 268 450 0,00643263965398125 0,0065953622899088 0,00645456626230259 0,00657663843747616 0,00147841920052764 0,00153259970697784 244085 287431 579 665 0 True 266 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 312 449 0,00665691301553719 0,00685247107239373 0,00671396963454643 0,00674448767833982 0,00151650299215693 0,00151073194593879 252595 298636 579 665 0 True 310 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 356 449 0,0068528820774091 0,00676417525847119 0,00689707789730678 0,00677500572213321 0,001432129483897 0,00134164887991749 260031 294788 579 665 0 True 354 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 400 448 0,0068290052659438 0,00691242870279384 0,0068207827878233 0,00698863202868696 0,00151217158113198 0,0014509236946584 259125 301249 579 665 0 True 398 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 444 448 0,00707860491427474 0,00714158938201535 0,00706492713817044 0,00729381246662089 0,00176030047480725 0,00184446336080157 268596 311236 579 665 0 True 442 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 489 450 0,00713162935651334 0,00712385220317904 0,00712596322575723 0,00714122224765393 0,00174624612623592 0,00181368860114987 270608 310463 579 665 0 True 486 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 533 449 0,00697629831150621 0,00702665338099196 0,00701915007248035 0,00703440909437705 0,00170014681137492 0,00164965898668923 264714 306227 579 665 0 True 530 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 576 449 0,00660067337352069 0,00650977409190176 0,00660715648126955 0,00666819256885634 0,00176499837996625 0,00187594965695827 250461 283701 579 665 0 True 574 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 621 449 0,00621608804271156 0,00622290448024387 0,00625619897764553 0,00627145799954223 0,00168337102844312 0,00184420644482569 235868 271199 579 665 0 True 618 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 665 449 0,00623851537886715 0,00652810786407539 0,00628671702143893 0,00645456626230259 0,00184312150519028 0,00199654418697116 236719 284500 579 665 0 True 662 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 268 494 0,00681140072945504 0,00663668785146662 0,00683604180972 0,00660715648126955 0,00148022729178937 0,00141945208035394 258457 289232 579 665 0 True 266 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 311 493 0,00661321792347376 0,00658863914191521 0,00666819256885634 0,00656137941557946 0,00146247342455612 0,00144914043988651 250937 287138 579 665 0 True 310 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 355 493 0,00661371865130803 0,00679701083792108 0,00654612039368277 0,00674448767833982 0,00149214013784176 0,00148532577307927 250956 296219 579 665 0 True 354 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 399 493 0,0069530012901648 0,00713429258658204 0,00686655985351339 0,00712596322575723 0,00152709806504061 0,00157536030654101 263830 310918 579 665 0 True 398 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 444 493 0,00697218707244596 0,00738851018597076 0,00695811398489357 0,00746166170748455 0,00182102457965608 0,00188447364611044 264558 321997 579 665 0 True 442 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 488 494 0,00690092559540163 0,00676344098974835 0,00697337300679027 0,0068207827878233 0,00169191825716526 0,00176278032859328 261854 294756 579 665 0 True 486 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 530 491 0,00636372369152899 0,00645335012973037 0,00645456626230259 0,00643930724040589 0,00156886564277201 0,00165838724484783 241470 281242 579 665 0 True 530 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 575 493 0,00614603885410807 0,00619282240850467 0,00613412680247196 0,00619516289005875 0,0017427353240282 0,0018129066860172 233210 269888 579 665 0 True 574 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 620 492 0,00598946916656356 0,00608571095855914 0,00599679560540169 0,00605783169298848 0,00167706514934975 0,00170485558638413 227269 265220 579 665 0 True 618 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 663 493 0,00624460317516791 0,00628130178960792 0,00621042191195544 0,00628671702143893 0,00178748403535573 0,00180537119141588 236950 273744 579 665 0 True 662 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 266 530 0,00664236555424707 0,00657500927874734 0,00656137941557946 0,00656137941557946 0,00154358418099623 0,00150715953541529 252043 286544 579 665 0 False 266 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 310 531 0,00663838608566953 0,00649777338746271 0,00665293354695964 0,00643930724040589 0,0014092438986079 0,00141716251074205 251892 283178 579 665 0 False 310 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 356 537 0,00688015856732806 0,00663141029502114 0,00688181887541009 0,00662241550316625 0,00128016338874453 0,00141343034028288 261066 289002 579 665 0 True 354 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 400 537 0,00674108799988615 0,00682300853988943 0,00669871061264973 0,0068055237659266 0,0015393350770466 0,00156957571954081 255789 297352 579 665 0 True 398 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 443 536 0,00668795814126138 0,006579047756723 0,00669871061264973 0,00668345159075303 0,001826588185247 0,00194222621939534 253773 286720 579 665 0 True 442 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 487 537 0,00650181915739892 0,00652358752225035 0,00645456626230259 0,00656137941557946 0,00179253308114587 0,00191379554423817 246710 284303 579 665 0 True 486 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 532 538 0,00634543394853019 0,00651629072681704 0,00636301213092241 0,00646982528419928 0,00167916964718695 0,00176682828549072 240776 283985 579 665 0 True 530 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 575 537 0,00624576275541567 0,00626514787770525 0,00625619897764553 0,00621042191195544 0,00172636838053626 0,00160375296176435 236994 273040 579 665 0 True 574 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 620 537 0,0061431662575852 0,00610964352974448 0,00614938582436866 0,00613412680247196 0,00169261055574338 0,00164639044152201 233101 266263 579 665 0 True 618 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 664 537 0,0062657128064965 0,00639467746959525 0,00636301213092241 0,00634775310902571 0,00165412582851522 0,00185006738014011 237751 278685 579 665 0 True 662 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 266 574 0,00684086460938683 0,00669260700389105 0,0068055237659266 0,00671396963454643 0,00115873013572447 0,00119659750028279 259575 291669 579 665 0 False 266 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 312 581 0,00684758490400454 0,00690650866121587 0,00688181887541009 0,0068207827878233 0,00139012728024027 0,00143897359439272 259830 300991 579 665 0 True 310 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 355 581 0,00664207565918513 0,00685554582267066 0,00663767452506294 0,00689707789730678 0,00133999190373374 0,00137566465503245 252032 298770 579 665 0 True 354 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 399 581 0,00647290871349447 0,00658232902007823 0,00646982528419928 0,00656137941557946 0,00138846996838895 0,00128700655373199 245613 286863 579 665 0 True 398 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 445 581 0,00659121225286281 0,00658069986134941 0,00671396963454643 0,00669871061264973 0,0017869542779022 0,0018385188152687 250102 286792 579 665 0 True 442 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 489 582 0,00655220818998352 0,00668570028871676 0,00668345159075303 0,00672922865644312 0,00183448231684739 0,00199127451523759 248622 291368 579 665 0 True 486 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 533 582 0,00661385042179073 0,00655841939479048 0,00663767452506294 0,00653086137178607 0,00186731189161441 0,0018276832858639 250961 285821 579 665 0 True 530 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 574 574 0,00640791951142668 0,00632957995813521 0,00643930724040589 0,00634775310902571 0,00176783858884893 0,00165737055992104 243147 275848 579 665 0 False 574 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 620 581 0,00623603809379238 0,00645449742460982 0,00624093995574884 0,00643930724040589 0,00147964486474007 0,00142648106041581 236625 281292 579 665 0 True 618 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 664 581 0,00649280605638222 0,00662613273857567 0,00648508430609598 0,00659189745937285 0,00159007773679445 0,00165343393800133 246368 288772 579 665 0 True 662 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 266 617 0,00701970350850769 0,00708690930806072 0,00704966811627375 0,00711070420386053 0,00134902423185801 0,0013717522814444 266361 308853 579 665 0 False 266 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 310 617 0,00684779573677687 0,00672771422720225 0,00685130083161669 0,0068055237659266 0,00144469487707386 0,00132276578347195 259838 293199 579 665 0 False 310 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 354 617 0,00647767880496822 0,00647792518604821 0,00648508430609598 0,00643930724040589 0,00136775709724196 0,00142230160291049 245794 282313 579 665 0 False 354 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 398 617 0,00653805604014151 0,00643430503473148 0,00650034332799268 0,0063782711528191 0,00128980637933964 0,00128458587927825 248085 280412 579 665 0 False 398 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 442 617 0,00647000976287506 0,00626393174513303 0,00643930724040589 0,00625619897764553 0,00167102368187551 0,00188600989157464 245503 272987 579 665 0 False 442 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 486 617 0,00641811854678768 0,00657455036079556 0,00653086137178607 0,00650034332799268 0,00182821498517002 0,00197558935314099 243534 286524 579 665 0 False 486 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 530 617 0,00656812606429372 0,00642693940160541 0,00665293354695964 0,00645456626230259 0,00183400985440926 0,001934918940664 249226 280091 579 665 0 False 530 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 574 617 0,0063530766365268 0,00652143060787698 0,0063935301747158 0,00662241550316625 0,0015800985267449 0,00170757337187481 241066 284209 579 665 0 False 574 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 618 617 0,0065611422287106 0,00649954022157706 0,00660715648126955 0,00650034332799268 0,00141643128169942 0,00128589088313701 248961 283255 579 665 0 False 618 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 662 618 0,00689976601515387 0,00692101046849213 0,00701915007248035 0,00691233691920348 0,00153618779204801 0,00147009550000565 261810 301623 579 665 0 False 662 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 266 667 0,00879430930722591 0,715641128456298 0,00834668497749294 0,727840085450523 0,00228213128879226 0,194844141137742 333698 31188195 579 665 11 True 265 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 309 660 0,00735616625903468 0,00708307734316336 0,00709544518196384 0,00706492713817044 0,0018107341946211 0,00130292306741792 279128 308686 579 665 0 False 309 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 353 660 0,00654356404631838 0,00630980059441348 0,00653086137178607 0,00631723506523232 0,00126281846261288 0,00113698005103922 248294 274986 579 665 0 False 353 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 398 660 0,00612716932098539 0,00618394234613772 0,00610360875867857 0,00616464484626535 0,00135812469918722 0,00130039016729403 232494 269501 579 665 0 False 398 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 442 660 0,00616930952135295 0,00638439770747537 0,00625619897764553 0,00645456626230259 0,00146400122529845 0,00148829271288279 234093 278237 579 665 0 False 442 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 486 660 0,00631502132112295 0,00637407205356031 0,00627145799954223 0,0063935301747158 0,00154724909270654 0,0015143451637295 239622 277787 579 665 0 False 486 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 530 660 0,00650708997670693 0,00635656433369989 0,00651560234988937 0,00634775310902571 0,00172485101020877 0,00155641193935989 246910 277024 579 665 0 False 530 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 574 661 0,00638572936213994 0,00641812817693123 0,00648508430609598 0,0063935301747158 0,00143319792452603 0,00133682540709853 242305 279707 579 665 0 False 574 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 618 661 0,00689528581874206 0,00700492361597516 0,00685130083161669 0,00704966811627375 0,00135074936502315 0,0014012472170954 261640 305280 579 665 0 False 618 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 662 667 0,0101877294535887 0,708668879798489 0,00872816052491035 0,724406805523766 0,00519652158679806 0,222440859559935 386571 30884339 579 665 12 True 662 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G11_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G11_3.csv new file mode 100755 index 0000000..beb8115 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G11_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 267 271 0,00107089871290546 0,071794684697553 0,000854505226215 0,0733501182574197 0,000825144475726555 0,0222809091697499 40635 3128868 579 665 0 True 266 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 310 272 0,000978527604532536 0,000935389515216285 0,000869764248111696 0,000869764248111696 0,000634620810947928 0,000620735418312548 37130 40765 579 665 0 False 310 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 354 271 0,000922525149384902 0,000917331093813729 0,000823987182421607 0,00080872816052491 0,000657205551821161 0,000653648083612093 35005 39978 579 665 0 True 354 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 399 271 0,000943160406975771 0,000922585704361613 0,000823987182421607 0,000854505226215 0,000684387572903707 0,000673158168812056 35788 40207 579 665 0 True 398 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 443 271 0,000876431834536332 0,000966297639268691 0,000625619897764553 0,000671396963454643 0,000793990081626311 0,000925507578857685 33256 42112 579 665 0 True 442 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 487 270 0,00097618208994047 0,000966068180292801 0,000747692072938125 0,000717174029144732 0,000895890459271656 0,000879468869702799 37041 42102 579 665 0 True 486 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 532 272 0,001022907903106 0,00092524742848194 0,000869764248111696 0,000701915007248035 0,000807563076455214 0,000839487504949622 38814 40323 579 665 0 True 530 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 575 272 0,000973731158962244 0,00103646619409591 0,000671396963454643 0,000747692072938125 0,000928261014860719 0,000947347566379678 36948 45170 579 665 0 True 574 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 618 272 0,0010649426870874 0,00104119304899924 0,000686655985351339 0,000656137941557946 0,00105271642065952 0,00102606128449379 40409 45376 579 665 0 False 618 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 660 270 0,00110713559564804 0,071457127598121 0,000793469138628214 0,0709697108415351 0,00101890608377641 0,0214219159666783 42010 3114157 579 665 0 True 663 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 266 315 0,00103782432174768 0,000996494440495838 0,000900282291905089 0,000869764248111696 0,000782109252690043 0,000755913027726407 39380 43428 579 665 0 False 266 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 310 315 0,00100058598333657 0,000933760356487465 0,000854505226215 0,000823987182421607 0,000702440068174454 0,000655067943948561 37967 40694 579 665 0 False 310 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 356 316 0,000882625047223247 0,000924168971295256 0,000747692072938125 0,000762951094834821 0,000666741513122474 0,000675330415794169 33491 40276 579 665 0 True 354 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 400 316 0,000831023726197804 0,000931649333909275 0,00064087891966125 0,000778210116731518 0,000721979293831811 0,00070141124916224 31533 40602 579 665 0 True 398 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 444 316 0,000889661590999444 0,000875018858659581 0,000625619897764553 0,000579842832074464 0,000850336404428137 0,000871561257776128 33758 38134 579 665 0 True 442 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 487 316 0,000857825842379048 0,000929469473638319 0,000625619897764553 0,000701915007248035 0,000814554199628531 0,000814520079748836 32550 40507 579 665 0 True 486 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 531 316 0,000920364113468617 0,000858337191112365 0,000747692072938125 0,000671396963454643 0,000792786466599903 0,000817322718401411 34923 37407 579 665 0 True 530 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 575 316 0,000992337151119529 0,000964209562588091 0,000732433051041428 0,000701915007248035 0,00095067629130302 0,000926168622724678 37654 42021 579 665 0 True 574 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 618 315 0,000978290417663675 0,000914508748410279 0,000549324788281071 0,000549324788281071 0,0010526132736107 0,00101057892752145 37121 39855 579 665 0 False 618 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 662 315 0,00108486638407169 0,00103251949971059 0,000732433051041428 0,000717174029144732 0,00100763088671827 0,000953675585295189 41165 44998 579 665 0 False 662 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 267 361 0,000988489453024679 0,000990436723532337 0,000869764248111696 0,00080872816052491 0,000788512554043663 0,000805762790728605 37508 43164 579 665 0 True 266 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 312 361 0,00088837024026898 0,000961501946672587 0,00080872816052491 0,000854505226215 0,000663756060577862 0,000701102427653541 33709 41903 579 665 0 True 310 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 356 361 0,000882809525899027 0,000939221480113651 0,000747692072938125 0,000839246204318303 0,00067250406478311 0,00068405446375506 33498 40932 579 665 0 True 354 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 400 360 0,00087158268077296 0,000881902627936286 0,000747692072938125 0,000762951094834821 0,000673455649062511 0,000666985774075986 33072 38434 579 665 0 True 398 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 444 360 0,000918677451290053 0,000821463133686815 0,000686655985351339 0,000503547722590982 0,000817679673327958 0,000852260094736377 34859 35800 579 665 0 True 442 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 486 358 0,00085482147537348 0,000901475478579718 0,000579842832074464 0,000595101853971161 0,000843928186912204 0,000909422215243484 32436 39287 579 665 0 False 486 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 532 360 0,0010146854249855 0,000995783117670578 0,000747692072938125 0,000762951094834821 0,000926097370561292 0,00090020188292981 38502 43397 579 665 0 True 530 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 576 361 0,0010226443621406 0,00104082591463782 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000975946509281021 0,00104841481688849 38804 45360 579 665 0 True 574 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 620 361 0,00101149657930415 0,00100503031439895 0,000701915007248035 0,000656137941557946 0,00106308311471559 0,0010349215848415 38381 43800 579 665 0 True 618 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 663 360 0,000954044648846817 0,000959253248708863 0,000579842832074464 0,000549324788281071 0,000996536474209501 0,0010009154788591 36201 41805 579 665 0 True 662 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 266 401 0,000933778348607509 0,000974053352653779 0,000778210116731518 0,000869764248111696 0,000838272441660619 0,00076323873731147 35432 42450 579 665 0 False 266 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 311 405 0,000935913030427254 0,000838511935595455 0,000823987182421607 0,000671396963454643 0,000721527743585632 0,000673191765453731 35513 36543 579 665 0 True 310 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 355 405 0,0008796997425073 0,000863431180377127 0,000778210116731518 0,000732433051041428 0,000684528704230025 0,000742963011599807 33380 37629 579 665 0 True 354 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 400 405 0,00101144387111107 0,000881420764086917 0,000885023270008392 0,000671396963454643 0,00078461339206865 0,000765994062212273 38379 38413 579 665 0 True 398 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 444 405 0,000930984814374262 0,000823665939855361 0,000686655985351339 0,000595101853971161 0,000840237949591378 0,000784585615209943 35326 35896 579 665 0 True 442 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 488 405 0,000886156496159615 0,000885000324110803 0,00064087891966125 0,000595101853971161 0,000814150563420775 0,00086350365213829 33625 38569 579 665 0 True 486 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 532 405 0,000932460643780506 0,000960698840256971 0,000717174029144732 0,000762951094834821 0,000843540791580739 0,000874144920877121 35382 41868 579 665 0 True 530 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 576 405 0,000964059205532041 0,000949593025823887 0,000701915007248035 0,000656137941557946 0,000943371101336802 0,000942688509840654 36581 41384 579 665 0 True 574 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 621 405 0,000910507681362633 0,000915495422006607 0,000549324788281071 0,000549324788281071 0,000956031136406947 0,00097968735401921 34549 39898 579 665 0 True 618 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 665 405 0,000905579465309642 0,000924329592578379 0,000595101853971161 0,000518806744487678 0,000883814978365973 0,000951409574935189 34362 40283 579 665 0 True 662 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 268 450 0,000953570275109096 0,000938808453957049 0,000778210116731518 0,000778210116731518 0,000813051039184871 0,000823343136951252 36183 40914 579 665 0 True 266 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 312 449 0,000956943599466224 0,000948032704787834 0,000823987182421607 0,000762951094834821 0,000796091196637769 0,000796535949614095 36311 41316 579 665 0 True 310 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 356 449 0,000870396746428658 0,000868525169641889 0,000762951094834821 0,000747692072938125 0,000685316477875824 0,000685649354169924 33027 37851 579 665 0 True 354 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 400 448 0,000885075978201473 0,000944361361173591 0,000701915007248035 0,000793469138628214 0,000787381810274176 0,000791345957052693 33584 41156 579 665 0 True 398 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 444 448 0,000940156039970204 0,000915243017133128 0,00064087891966125 0,000564583810177768 0,000955188100571262 0,000966649580459367 35674 39887 579 665 0 True 442 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 489 450 0,000951330176903191 0,000865289798081838 0,000625619897764553 0,0004272526131075 0,000972353033109793 0,000993383679654471 36098 37710 579 665 0 True 486 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 533 449 0,000851843462464453 0,000907602033235985 0,000549324788281071 0,000610360875867857 0,000883418163538476 0,00091711213806023 32323 39554 579 665 0 True 530 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 576 449 0,000902996763848715 0,000918524280488357 0,000595101853971161 0,000579842832074464 0,00092166587405364 0,000977505657151826 34264 40030 579 665 0 True 574 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 621 449 0,000951330176903191 0,000816047901855807 0,000579842832074464 0,000457770656900893 0,000953841112518956 0,000856545789229809 36098 35564 579 665 0 True 618 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 665 449 0,00085869552756487 0,000919488008187096 0,000442511635004196 0,000488288700694286 0,000958870677580397 0,00101417708495552 32583 40072 579 665 0 True 662 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 268 494 0,000958893802610189 0,000930800335698482 0,000839246204318303 0,000762951094834821 0,000778584766736236 0,000788851519834082 36385 40565 579 665 0 True 266 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 311 493 0,000972966890162582 0,000863339396786771 0,000854505226215 0,000762951094834821 0,000818553643100113 0,000759539697819487 36919 37625 579 665 0 True 310 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 355 493 0,000944741652768175 0,0008923200654417 0,000823987182421607 0,000778210116731518 0,000817261321819464 0,000790848965571248 35848 38888 579 665 0 True 354 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 399 493 0,000895064180790156 0,000850489694136922 0,000686655985351339 0,000579842832074464 0,00078202554138231 0,000850588676415853 33963 37065 579 665 0 True 398 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 444 493 0,000986012167949914 0,000916505041500524 0,000595101853971161 0,000488288700694286 0,0010022824366957 0,00104237318419109 37414 39942 579 665 0 True 442 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 488 494 0,000948431226283784 0,000933301438535685 0,000625619897764553 0,000549324788281071 0,000911821786002255 0,000986976956892755 35988 40674 579 665 0 True 486 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 530 491 0,000880121408051941 0,000938533103185981 0,000518806744487678 0,000701915007248035 0,000904997433473141 0,000876814527049945 33396 40902 579 665 0 True 530 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 575 493 0,00097193908039752 0,000914302235331978 0,000625619897764553 0,000564583810177768 0,000949277691032399 0,000932836647219364 36880 39846 579 665 0 True 574 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 620 492 0,000863386556749001 0,00101150105751906 0,000473029678797589 0,000701915007248035 0,000905116646354492 0,000971567465763166 32761 44082 579 665 0 True 618 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 663 493 0,000906765399653944 0,00098499854580374 0,0004272526131075 0,00064087891966125 0,00101547423198352 0,00100974541888619 34407 42927 579 665 0 True 662 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 266 530 0,000993997459201553 0,000942823986035127 0,00080872816052491 0,000732433051041428 0,000795482264469497 0,000844737777629608 37717 41089 579 665 0 False 266 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 310 531 0,000974600844148066 0,000962672187449627 0,000854505226215 0,000869764248111696 0,000783211217324622 0,000737131395512083 36981 41954 579 665 0 False 310 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 356 537 0,000842461404096191 0,000893673873399452 0,000686655985351339 0,00080872816052491 0,000706494929040361 0,00070471711211127 31967 38947 579 665 0 True 354 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 400 537 0,00094260697094843 0,000854872360576424 0,000717174029144732 0,000686655985351339 0,000818490947973335 0,000797866891567334 35767 37256 579 665 0 True 398 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 443 536 0,000860909271674235 0,000915357746621073 0,000442511635004196 0,0004272526131075 0,00092859434969113 0,0010631228125631 32667 39892 579 665 0 True 442 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 487 537 0,000803009321575717 0,000955880201763278 0,000411993591210803 0,000595101853971161 0,000923147938187418 0,00102573451860233 30470 41658 579 665 0 True 486 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 532 538 0,000967142634827228 0,00093107568646955 0,000549324788281071 0,000610360875867857 0,00101502766524297 0,000974037102822749 36698 40577 579 665 0 True 530 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 575 537 0,000977895106215574 0,00096749082594332 0,000671396963454643 0,000625619897764553 0,000934960318723316 0,000924312092342245 37106 42164 579 665 0 True 574 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 620 537 0,000924580768915027 0,000983323495279742 0,000656137941557946 0,000671396963454643 0,000878832900417077 0,000934895075078738 35083 42854 579 665 0 True 618 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 664 537 0,000940788538287166 0,000945921682209644 0,000701915007248035 0,000518806744487678 0,000925321550506469 0,00103629392654719 35698 41224 579 665 0 True 662 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 266 574 0,000899544377201967 0,000943328795782085 0,000778210116731518 0,00080872816052491 0,000646586973588511 0,000689151204619532 34133 41111 579 665 0 False 266 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 312 581 0,000944135508547754 0,00096026286820278 0,000778210116731518 0,000869764248111696 0,000759192649937637 0,00071033671313591 35825 41849 579 665 0 True 310 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 355 581 0,000803430987120358 0,000914829990976526 0,000610360875867857 0,000747692072938125 0,000670695584964736 0,000761917727493965 30486 39869 579 665 0 True 354 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 399 581 0,000930773981601942 0,000859668053172529 0,000823987182421607 0,000701915007248035 0,000703495332907299 0,00067669297207177 35318 37465 579 665 0 True 398 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 445 581 0,000821931562891482 0,000868892304003313 0,000411993591210803 0,000457770656900893 0,000914329429476244 0,000999166292714557 31188 37867 579 665 0 True 442 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 489 582 0,000874929651033548 0,000878024771243742 0,000473029678797589 0,000442511635004196 0,000986603830580577 0,00105003672135898 33199 38265 579 665 0 True 486 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 533 582 0,000890215027026785 0,000942961661420661 0,000473029678797589 0,000579842832074464 0,00099560054627783 0,000968512605468871 33779 41095 579 665 0 True 530 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 574 574 0,000954176419329517 0,000871439298635694 0,00064087891966125 0,000595101853971161 0,000911046605368647 0,000833551316072632 36206 37978 579 665 0 False 574 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 620 581 0,000864546136996764 0,00100266688694728 0,000671396963454643 0,000793469138628214 0,000742260961489935 0,000815003112105412 32805 43697 579 665 0 True 618 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 664 581 0,000933119496194007 0,00101299254086234 0,00064087891966125 0,000762951094834821 0,000868222235781034 0,000894316950503526 35407 44147 579 665 0 True 662 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 266 617 0,000972756057390262 0,000973709164189944 0,000854505226215 0,000839246204318303 0,000705497666021954 0,000723249101105611 36911 42435 579 665 0 False 266 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 310 617 0,000968618464233472 0,000871416352738105 0,000869764248111696 0,000747692072938125 0,000727158746435911 0,000685709759598252 36754 37977 579 665 0 False 310 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 354 617 0,000837085168402018 0,000855331278528204 0,000717174029144732 0,000762951094834821 0,000669688477795465 0,000697747946765824 31763 37276 579 665 0 False 354 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 398 617 0,000855058662242341 0,000966940124401184 0,000686655985351339 0,000823987182421607 0,000684431386872526 0,000715277688903063 32445 42140 579 665 0 False 398 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 442 617 0,000815501163335707 0,000892756037495891 0,000488288700694286 0,000473029678797589 0,000862386154905441 0,000977143395046947 30944 38907 579 665 0 False 442 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 486 617 0,00082938977221232 0,000916665662783647 0,000381475547417411 0,000442511635004196 0,000970434131796916 0,00104874219383022 31471 39949 579 665 0 False 486 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 530 617 0,00097612938174739 0,000932521278017658 0,000473029678797589 0,000488288700694286 0,0010868632658564 0,00100771419311565 37039 40640 579 665 0 False 530 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 574 617 0,000967485238082249 0,000954732906883827 0,000701915007248035 0,000686655985351339 0,000877076233294277 0,000899154151390533 36711 41608 579 665 0 False 574 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 618 617 0,000912167989444657 0,00092384772872901 0,000747692072938125 0,000778210116731518 0,000734566192157075 0,000699823050315791 34612 40262 579 665 0 False 618 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 662 618 0,00100216722912897 0,000987545540436121 0,000793469138628214 0,00080872816052491 0,000823051716527295 0,000800513679477179 38027 43038 579 665 0 False 662 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 266 667 0,00117676311870689 0,0716071249306604 0,00106813153276875 0,071274891279469 0,000770266909187495 0,0217855592467474 44652 3120694 579 665 0 True 265 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 309 660 0,00101637208716407 0,000967880906202334 0,000885023270008392 0,000869764248111696 0,000738179312928004 0,000638729600568933 38566 42181 579 665 0 False 309 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 353 660 0,00085047304944437 0,000868203927075643 0,000717174029144732 0,000762951094834821 0,000657507406531266 0,000596531621130684 32271 37837 579 665 0 False 353 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 398 660 0,000905421340730401 0,000924100133602489 0,000793469138628214 0,000747692072938125 0,000669976330232757 0,000737476638564581 34356 40273 579 665 0 False 398 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 442 660 0,000882625047223247 0,000844064842811997 0,000701915007248035 0,000671396963454643 0,000755202301618035 0,000726759618976867 33491 36785 579 665 0 False 442 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 486 660 0,000893140331742732 0,000904412553471112 0,000610360875867857 0,000717174029144732 0,000845004979523172 0,000767138993534004 33890 39415 579 665 0 False 486 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 530 660 0,000899807918167368 0,00088018168561711 0,000595101853971161 0,000549324788281071 0,000914841221972431 0,000888456921464093 34143 38359 579 665 0 False 530 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 574 661 0,000879515263831519 0,000912191212753789 0,000686655985351339 0,000762951094834821 0,000771487802836767 0,000680525763426623 33373 39754 579 665 0 False 574 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 618 661 0,000950038826172728 0,000961593730262943 0,000762951094834821 0,000778210116731518 0,000697784631893212 0,00075737916845037 36049 41907 579 665 0 False 618 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 662 667 0,00119067808168004 0,0712784249476977 0,00103761348897536 0,0709849698634318 0,000881388811255083 0,0246278840027969 45180 3106369 579 665 0 True 662 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G12_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G12_1.csv new file mode 100755 index 0000000..627fb8b --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G12_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 239 251 0,0101532319412177 0,0408414260645893 0,0101319905394064 0,0420996414129854 0,00168887852912953 0,00855042333614854 385262 1779901 579 665 0 True 240 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 284 251 0,00983057873727772 0,010128663384256 0,0098268101014725 0,0101625085831998 0,0014002179618837 0,00145174772663249 373019 441415 579 665 0 False 284 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 328 251 0,0101767925035245 0,0528043615562137 0,0100709544518196 0,0533150225070573 0,00145081742573455 0,0087443942023512 386156 2301255 579 665 0 True 328 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 370 250 0,0105039522579729 0,0695612916475212 0,0104371709773404 0,0688487067978943 0,00168979118383836 0,0109952203130019 398570 3031535 579 665 0 True 372 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 415 249 0,0102504258492575 0,0586297054148303 0,0101472495613031 0,0580148012512398 0,00164107970612515 0,0107326313702108 388950 2555128 579 665 0 True 416 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 460 250 0,0101260872217814 0,0567352003262907 0,0101167315175097 0,0572365911345083 0,00164482171019997 0,0158914048506758 384232 2472564 579 665 0 True 461 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 504 249 0,010268847362739 0,0663962722094777 0,0102388036926833 0,0664682993820096 0,00170251422632649 0,0184596916774923 389649 2893601 579 665 0 True 505 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 548 248 0,0102840800305391 0,0580052557578428 0,0102388036926833 0,0581826504921035 0,00154204830345541 0,015390396728049 390227 2527914 579 665 0 True 549 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 593 251 0,0100174029276502 0,0102211582974373 0,0100251773861295 0,0102388036926833 0,00172913830608644 0,0020124985918193 380108 445446 579 665 0 False 593 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 634 248 0,0100037251515459 0,041729111058718 0,00993362325474937 0,0429846646829938 0,00174430354876803 0,0093724105929303 379589 1818587 579 665 0 True 637 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 240 294 0,0100202491700766 0,00982013284527409 0,00996414129854276 0,0098268101014725 0,00158410377066375 0,00154423138844317 380216 427969 579 665 0 False 240 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 284 294 0,0101127784030287 0,0100594815030251 0,0100556954299229 0,0100709544518196 0,00138861242581887 0,00143106108319088 383727 438400 579 665 0 False 284 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 327 295 0,0103633531529316 0,0894918688343656 0,0102082856488899 0,0874647135118639 0,00166358921834277 0,0231918100763918 393235 3900125 579 665 0 True 328 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 372 295 0,0102295797588943 0,0439039691240002 0,0102082856488899 0,0440375371938659 0,00155784740640373 0,00659460896749421 388159 1913369 579 665 0 True 372 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 416 295 0,0102299750703424 0,0634784948179559 0,0101625085831998 0,0630197604333562 0,00152808869497033 0,0106289250607197 388174 2766442 579 665 0 True 416 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 460 294 0,0100898239849423 0,0353427170581524 0,010101472495613 0,0364843213550011 0,00171215670425209 0,00633167708443506 382856 1540263 579 665 0 True 461 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 505 293 0,00992806254037942 0,0374046813072966 0,00994888227664607 0,0387426565957122 0,00172711163766408 0,00735526941572971 376718 1630125 579 665 0 True 505 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 548 293 0,010233322040603 0,0471453066174248 0,0101930266269932 0,0470588235294118 0,00163260650897725 0,0111809668055284 388301 2054629 579 665 0 True 549 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 593 294 0,010219169890761 0,0100940839165894 0,0102235446707866 0,0100862134737163 0,0019497049704609 0,00193690461552404 387764 439908 579 665 0 False 593 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 637 294 0,0100512679417042 0,00998635292740893 0,0101167315175097 0,00994888227664607 0,00179891862720403 0,00196713857498855 381393 435213 579 665 0 False 637 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 240 341 0,0100786498480093 0,0460221737681351 0,00993362325474937 0,0462348363469902 0,0015713990248217 0,00904205796836452 382432 2005682 579 665 0 True 240 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 285 338 0,0100107880494187 0,0569952920754622 0,0100251773861295 0,0577859159227894 0,0013982126749503 0,0162612704168783 379857 2483899 579 665 0 True 284 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 328 338 0,0100528755415932 0,036714468707819 0,010101472495613 0,036743724727245 0,00131566249267484 0,00747187463914012 381454 1600045 579 665 0 True 328 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 373 338 0,0101750794872494 0,0316138480786539 0,0101930266269932 0,0321965362020294 0,0015878148196366 0,00480423327734247 386091 1377756 579 665 0 True 372 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 416 339 0,010235614847002 0,0598263339740975 0,0103150988021668 0,0596475165941863 0,00163343963834036 0,011180006503342 388388 2607278 579 665 0 True 416 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 460 338 0,0101572114097953 0,028845930344286 0,0101472495613031 0,0296025024795911 0,00164691683860841 0,00430559691297222 385413 1257128 579 665 0 True 461 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 505 336 0,0100778855792097 0,0256338029784922 0,0101472495613031 0,0260471503776608 0,00161169484212783 0,00316556431653359 382403 1117141 579 665 0 True 505 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 548 337 0,0099873856116911 0,0444222022210482 0,0100556954299229 0,0458991378652628 0,00165037942643133 0,0086197106447145 378969 1935954 579 665 0 True 549 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 593 337 0,0101695187728795 0,0516001149589469 0,0100709544518196 0,0520027466239414 0,00195137403902928 0,0117557377412472 385880 2248773 579 665 0 True 593 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 637 336 0,0105066140217234 0,0606847400029027 0,0104219119554437 0,0607003891050584 0,00203605643956463 0,0182534288854877 398671 2644688 579 665 0 True 637 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 241 383 0,0100999703121102 0,0408003987997001 0,0100709544518196 0,0420233463035019 0,00146543636354376 0,00859498283240656 383241 1778113 579 665 0 True 240 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 284 384 0,0100451801454035 0,0310315270896399 0,00997940032043946 0,0302738994430457 0,00153669241545445 0,00579981919044945 381162 1352378 579 665 0 True 284 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 329 384 0,010332044486242 0,0767850043970076 0,01025406271458 0,0764782177462425 0,00153737408359981 0,0154347523410797 392047 3346350 579 665 0 True 328 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 372 383 0,0106383581503272 0,0563870192762749 0,010605020218204 0,0572365911345083 0,00150135477120436 0,0136373005587251 403670 2457390 579 665 0 True 372 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 417 382 0,0100949630337676 0,0381870216855942 0,0101319905394064 0,0392919813839933 0,00154856752493467 0,0065087232322 383051 1664220 579 665 0 True 416 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 461 381 0,0101379202111279 0,0464217995205455 0,0101625085831998 0,0479285877775235 0,0017579049096638 0,00949152901853964 384681 2023098 579 665 0 True 461 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 504 381 0,0101271677397396 0,0373304283826986 0,0100862134737163 0,0383306630045014 0,00177726275379121 0,00585833130212597 384273 1626889 579 665 0 True 505 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 549 381 0,0100241232222679 0,046327583665045 0,00999465934233616 0,0466315709163043 0,00164128677141619 0,00776001792563512 380363 2018992 579 665 0 True 549 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 593 381 0,0101647750355023 0,0403509116118288 0,0102388036926833 0,0402685587853819 0,00202805526431993 0,00820530447700488 385700 1758524 579 665 0 True 593 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 637 380 0,010360296077733 0,0768299783562821 0,0104219119554437 0,0749980926222629 0,0018230091685533 0,0176411146157724 393119 3348310 579 665 0 True 637 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 240 428 0,0101926576696417 0,0376864798755873 0,0101777676050965 0,0382238498512245 0,00157588729172327 0,00697905629811198 386758 1642406 579 665 0 True 240 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 285 428 0,010224493418262 0,0461595738028982 0,0101930266269932 0,0464484626535439 0,0016133944005653 0,00641385293884392 387966 2011670 579 665 0 True 284 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 329 427 0,0103102496484034 0,0300012333419954 0,0103150988021668 0,0306706340123598 0,00142416213310332 0,00350741434498468 391220 1307477 579 665 0 True 328 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 373 427 0,0103980878521714 0,0481097915307839 0,0103456168459602 0,0469214923323415 0,00147806747285427 0,0102895790028008 394553 2096662 579 665 0 True 372 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 417 427 0,0106521676969142 0,0801933880248802 0,0105745021744106 0,079468986037995 0,0018443544755019 0,00905460194092981 404194 3494890 579 665 0 True 416 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 460 426 0,0103511775603301 0,0525384644949522 0,0103761348897536 0,0530708781567102 0,00175972998392521 0,0108775184542103 392773 2289667 579 665 0 True 461 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 505 425 0,0101222395236866 0,0474420888568411 0,0101319905394064 0,0476386663614862 0,00169541692159611 0,00894940395203247 384086 2067563 579 665 0 True 505 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 549 424 0,0101024739512816 0,0287487315220989 0,010101472495613 0,0293125810635538 0,00165055474185688 0,00388724318697086 383336 1252892 579 665 0 True 549 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 593 425 0,0101404502043958 0,0364893235606755 0,0100862134737163 0,0370794232089723 0,00196563222085813 0,00527418472859423 384777 1590233 579 665 0 True 593 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 637 425 0,0105050854841241 0,0663232354174518 0,0105592431525139 0,0658121614404517 0,00193205570626421 0,00987071576815354 398613 2890418 579 665 0 True 637 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 241 472 0,0100130281476246 0,0458526494767475 0,00993362325474937 0,0459601739528496 0,00152058361799859 0,0112545583094393 379942 1998294 579 665 0 True 240 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 286 471 0,0101085090393892 0,0467602744558811 0,0101319905394064 0,0469214923323415 0,00161336176275754 0,00562880961731638 383565 2037849 579 665 0 True 284 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 329 471 0,0102191962448575 0,058316838101204 0,0102845807583734 0,0581979095140002 0,00167914466310305 0,0125562795102072 387765 2541493 579 665 0 True 328 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 374 472 0,0109115183609649 0,0767334679110227 0,0107728694590677 0,0735484855420768 0,00167975784851613 0,0172847629321727 414035 3344104 579 665 0 True 372 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 418 470 0,0106660826598873 0,0853924236088046 0,0106202792401007 0,0826276035706111 0,00175975865082155 0,0242517541664587 404722 3721468 579 665 0 True 416 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 462 470 0,0104170628016803 0,0423206104067677 0,010452429999237 0,0432440680552377 0,00200445462890605 0,00666429853207716 395273 1844365 579 665 0 True 461 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 505 469 0,010190285800953 0,0371104919543078 0,0102235446707866 0,038101777676051 0,00183962091919647 0,00514992617505792 386668 1617304 579 665 0 True 505 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 550 468 0,0100954374075054 0,0854442354455606 0,00999465934233616 0,0838330663004501 0,00183277602078126 0,0142315527495626 383069 3723726 579 665 0 True 549 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 594 469 0,010078781618492 0,0552883238079176 0,0100862134737163 0,0570229648279545 0,0020005990910507 0,0126985353601788 382437 2409508 579 665 0 True 593 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 639 469 0,0103884422528378 0,0674117887990748 0,010452429999237 0,0666971847104601 0,00181555133364207 0,0103908061319319 394187 2937858 579 665 0 True 637 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 242 516 0,0098435185986789 0,0437477534532142 0,00991836423285267 0,0456092164492256 0,00151135572835329 0,00888868316891405 373510 1906561 579 665 0 True 240 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 285 515 0,0102970726001334 0,0846585220203175 0,0103303578240635 0,0795910582131685 0,00158293246160261 0,0202131467528298 390720 3689484 579 665 0 True 284 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 330 514 0,0103747117685404 0,049303138826696 0,0103913939116503 0,0504310673685817 0,00157278343212183 0,0098961288734089 393666 2148669 579 665 0 True 328 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 374 515 0,010567544692924 0,0500563149691578 0,0105287251087205 0,050263218127718 0,00168825071141707 0,00548634830454594 400983 2181493 579 665 0 True 372 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 418 515 0,0107343397699261 0,0506351252358408 0,0106813153276875 0,0511024643320363 0,00183291731376133 0,00656664049526544 407312 2206718 579 665 0 True 416 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 462 514 0,0103744745816715 0,0542397192339971 0,0102845807583734 0,0549172198062104 0,00198914311905924 0,00984600604054182 393657 2363809 579 665 0 True 461 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 507 512 0,0102644989368099 0,0643425684834655 0,0102082856488899 0,063782711528191 0,00183919567927234 0,0155524457726328 389484 2804099 579 665 0 True 505 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 550 513 0,0100711389304954 0,052160660291149 0,010101472495613 0,0524452582589456 0,00171433168604955 0,0111236176787398 382147 2273202 579 665 0 True 549 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 595 513 0,00996933305556116 0,0386921526751188 0,0100251773861295 0,0387579156176089 0,00188550588041776 0,0050758437998415 378284 1686234 579 665 0 True 593 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 638 512 0,010072482989419 0,057198753349384 0,0101930266269932 0,0577096208133059 0,00189824168161033 0,0122579899836141 382198 2492766 579 665 0 True 637 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 242 560 0,00991752090176339 0,0380971884965332 0,00993362325474937 0,0386358434424353 0,0013473726663665 0,00745161766217832 376318 1660305 579 665 0 True 240 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 286 559 0,00985366492584682 0,0440354950089804 0,00993362325474937 0,0446173800259403 0,00141393561878439 0,00775994219485175 373895 1919101 579 665 0 True 284 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 329 559 0,010213609176391 0,043170182265001 0,01025406271458 0,0435492484931716 0,0015305318437705 0,00727476901960973 387553 1881390 579 665 0 True 328 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 374 559 0,0101676739861217 0,0435200383655408 0,0101777676050965 0,0436255436026551 0,00148416004023343 0,00522649060655764 385810 1896637 579 665 0 True 372 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 418 559 0,0105386869572127 0,0772885980113938 0,0105745021744106 0,0741435873960479 0,00179203684299087 0,016699980946825 399888 3368297 579 665 0 True 416 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 463 558 0,0104004333667635 0,0562625607277521 0,0104676890211337 0,055741206988632 0,00201291269110553 0,00957541620613738 394642 2451966 579 665 0 True 461 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 506 557 0,0102410174367927 0,0502845348665782 0,0102845807583734 0,0498970016021973 0,0019930182759416 0,00695416267623624 388593 2191439 579 665 0 True 505 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 549 557 0,0100759353760657 0,0343370672045185 0,0100862134737163 0,0354772259098192 0,00183088795993601 0,0069830196027125 382329 1496436 579 665 0 True 549 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 595 558 0,010131726998441 0,045674795824535 0,0101319905394064 0,045288776989395 0,00171163934902112 0,00711357454646514 384446 1990543 579 665 0 True 593 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 638 557 0,0104876917804077 0,0488995434340027 0,0104982070649271 0,0484779125658045 0,00184068460779848 0,00724581418117541 397953 2131080 579 665 0 True 637 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 240 596 0,0095596059166528 0,00938969075240172 0,00947585259784848 0,00946059357595178 0,00161219193624013 0,00125339400969032 362737 409210 579 665 0 False 240 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 284 596 0,00971282863393672 0,00964592759077827 0,00968947890440223 0,00964370183871214 0,00148963546250786 0,00144534469400447 368551 420377 579 665 0 False 284 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 330 603 0,0101664616976808 0,0659301262999568 0,0100709544518196 0,0636606393530175 0,00182330252708761 0,0103067637455674 385764 2873286 579 665 0 True 328 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 374 603 0,0104113439627311 0,0668916282466294 0,010452429999237 0,0649576562142367 0,00147028000105319 0,0165971032845908 395056 2915189 579 665 0 True 372 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 417 596 0,0104377244133677 0,0101569097841881 0,0103456168459602 0,0102082856488899 0,00195882774959059 0,00164118032241729 396057 442646 579 665 0 False 417 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 461 596 0,0102495561640716 0,0103915545329334 0,01025406271458 0,0104219119554437 0,00209599535434677 0,00188856198968703 388917 452872 579 665 0 False 461 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 505 596 0,010094883971478 0,0102458710291407 0,0101777676050965 0,01025406271458 0,00204565353542997 0,00218444013543247 383048 446523 579 665 0 False 505 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 549 596 0,00998063896297684 0,00980338234003411 0,0100099183642329 0,00988784618905928 0,00195740011497124 0,00191067839473632 378713 427239 579 665 0 False 549 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 593 596 0,00997921584176368 0,0100768286016024 0,0100099183642329 0,0101472495613031 0,00180917395316987 0,0017057859139204 378659 439156 579 665 0 False 593 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 637 596 0,0102018816034307 0,0100147370027265 0,0101930266269932 0,0100404364080262 0,0015954263053958 0,00150012382285418 387108 436450 579 665 0 False 637 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 242 646 0,00958646074102712 0,0405095136559641 0,00964370183871214 0,0405279621576257 0,00139338359691398 0,0072415686554357 363756 1765436 579 665 0 True 240 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 284 640 0,00953694139362834 0,00941399045794849 0,00946059357595178 0,00935378042267491 0,00135183350096147 0,00131275926563459 361877 410269 579 665 0 False 284 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 328 640 0,0101048194658736 0,00983130749739994 0,00993362325474937 0,0097962920576791 0,00181156099227522 0,00138524176672935 383425 428456 579 665 0 False 328 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 372 640 0,0100559062626953 0,0100913074629811 0,00997940032043946 0,0100404364080262 0,00164666368992546 0,00135151916405987 381569 439787 579 665 0 False 372 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 417 640 0,00990584603699614 0,0100215978261057 0,00985732814526589 0,0100099183642329 0,00135305161027285 0,0015551977048234 375875 436749 579 665 0 False 417 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 461 640 0,00993538897921755 0,00998431074252351 0,00988784618905928 0,00999465934233616 0,00171457801000445 0,00175310948380396 376996 435124 579 665 0 False 461 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 505 640 0,00974490156942598 0,00974509976015801 0,00968947890440223 0,00984206912336919 0,00175125889709803 0,00175678001096614 369768 424699 579 665 0 False 505 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 549 640 0,00943943123643011 0,00960703429436489 0,009399557488365 0,00961318379491875 0,00178490596433967 0,00181023403915889 358177 418682 579 665 0 False 549 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 593 640 0,00962857458729814 0,00980113364207039 0,00962844281681544 0,00978103303578241 0,00138979026921851 0,00134759876067708 365354 427141 579 665 0 False 593 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 640 644 0,00989143034618873 0,0419835581170826 0,00991836423285267 0,0424353398947128 0,00143008751428946 0,00789943923510705 375328 1829676 579 665 0 True 637 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G12_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G12_2.csv new file mode 100755 index 0000000..0f38c2e --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G12_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 239 251 0,00924591310553643 0,661071837295229 0,00798046845197223 0,678278782330053 0,00509503037353668 0,198713548333475 350834 28810023 579 665 1 True 240 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 284 251 0,00691636909597411 0,0066007775217398 0,00688181887541009 0,00665293354695964 0,00162535699920763 0,00137744668842131 262440 287667 579 665 0 False 284 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 328 251 0,0062488725388074 0,00626117823742235 0,00625619897764553 0,00630197604333562 0,00118928916026427 0,00120593334684543 237112 272867 579 665 0 True 328 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 370 250 0,00611325435801223 0,00605785463888607 0,00605783169298848 0,00602731364919509 0,00120022282922107 0,00126995809410209 231966 264006 579 665 0 True 372 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 415 249 0,00597718815757589 0,00603566595591749 0,00593575951781491 0,00604257267109178 0,00139848168662962 0,00130907406038599 226803 263039 579 665 0 True 416 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 460 250 0,0061849375006012 0,00638292917002967 0,00619516289005875 0,00628671702143893 0,0015876805787618 0,00144462651417131 234686 278173 579 665 0 True 461 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 504 249 0,00634654082058487 0,00648276677043949 0,00633249408712902 0,00646982528419928 0,00164651818784231 0,00145310568963588 240818 282524 579 665 0 True 505 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 548 248 0,00667272547346123 0,00664919336565263 0,00671396963454643 0,00662241550316625 0,0014848507088053 0,00141954887251397 253195 289777 579 665 0 True 549 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 593 251 0,0073822304605128 0,00737625707665823 0,00727855344472419 0,00749217975127794 0,00193185246734635 0,0019162764161161 280117 321463 579 665 0 False 593 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 634 248 0,00926146202249507 0,679963883157195 0,00883497367818723 0,696040283817807 0,00280761616823535 0,212475258138265 351424 29633353 579 665 5 True 637 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 240 294 0,00628339640527488 0,00614550796767611 0,00630197604333562 0,00608834973678187 0,00147458686590595 0,00144569145473606 238422 267826 579 665 0 False 240 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 284 294 0,00609997189335604 0,00603727216874872 0,00611886778057527 0,00601205462729839 0,0014122963915538 0,00136003770540938 231462 263109 579 665 0 False 284 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 327 295 0,00591604665360294 0,00594122064144109 0,00593575951781491 0,0059510185397116 0,0012841149396586 0,00126155966412656 224483 258923 579 665 0 True 328 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 372 295 0,00600549245725991 0,00615519113645868 0,00599679560540169 0,00614938582436866 0,00134568047873159 0,0012061781602724 227877 268248 579 665 0 True 372 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 416 295 0,00604267808747794 0,00611129563437089 0,00605783169298848 0,00613412680247196 0,00145425528327315 0,00147628643557436 229288 266335 579 665 0 True 416 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 460 294 0,00632437702539468 0,00645628720462176 0,0063935301747158 0,00650034332799268 0,00170616020477877 0,00179494267096828 239977 281370 579 665 0 True 461 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 505 293 0,00640496785261419 0,00647686967475911 0,0064087891966125 0,00646982528419928 0,00149411278499383 0,00162747142627891 243035 282267 579 665 0 True 505 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 548 293 0,006760062949395 0,00681112256493832 0,00675974670023652 0,00671396963454643 0,00143092660139254 0,00137309759749791 256509 296834 579 665 0 True 549 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 593 294 0,00698238610780697 0,00701449205526978 0,00695811398489357 0,00701915007248035 0,00178275448606187 0,00183788330793565 264945 305697 579 665 0 False 593 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 637 294 0,00728717123429279 0,00720092747318055 0,0072480354009308 0,00717174029144732 0,00176760554911523 0,00192140192244218 276510 313822 579 665 0 False 637 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 240 341 0,00575952967425151 0,00575785997380726 0,00578316929884794 0,00578316929884794 0,00140867558186525 0,00142488184823843 218544 250932 579 665 0 True 240 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 285 338 0,00582778678429027 0,00583580718791715 0,00584420538643473 0,00576791027695125 0,00134258018061559 0,001268168559925 221134 254329 579 665 0 True 284 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 328 338 0,00591970987302201 0,0059756853796198 0,00588998245212482 0,0059662775616083 0,00118481772615154 0,00123594029442961 224622 260425 579 665 0 True 328 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 373 338 0,00628057651694509 0,00611999212955713 0,00621042191195544 0,00608834973678187 0,00134374551715906 0,00125728032786859 238315 266714 579 665 0 True 372 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 416 339 0,0061857281234974 0,00637772045127697 0,00622568093385214 0,00645456626230259 0,0014908530688665 0,00144818254306938 234716 277946 579 665 0 True 416 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 460 338 0,00630131719092212 0,00640603568890182 0,0063782711528191 0,0063935301747158 0,00161175402329757 0,00155257433252351 239102 279180 579 665 0 True 461 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 505 336 0,00641174085542498 0,00639788989525771 0,00636301213092241 0,00643930724040589 0,00151626388082147 0,00158682108495224 243292 278825 579 665 0 True 505 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 548 337 0,00673805727878404 0,00659040597602957 0,00674448767833982 0,00665293354695964 0,00156475824231026 0,00148210987267207 255674 287215 579 665 0 True 549 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 593 337 0,00690100465769125 0,00685143850700223 0,00689707789730678 0,00686655985351339 0,0018906425922669 0,00200324830120619 261857 298591 579 665 0 True 593 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 637 336 0,00676140700831854 0,00675602946482709 0,00675974670023652 0,00671396963454643 0,00193286216281456 0,00182090984825335 256560 294433 579 665 0 True 637 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 241 383 0,00579376364565705 0,00583337492277271 0,00576791027695125 0,00588998245212482 0,00139510964298407 0,00147380006669183 219843 254223 579 665 0 True 240 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 284 384 0,00579571384880101 0,00594103707426038 0,00576791027695125 0,00592050049591821 0,00133030762243219 0,00133975464747233 219917 258915 579 665 0 True 284 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 329 384 0,00624681691927727 0,00623492813058051 0,00624093995574884 0,00622568093385214 0,00130730471285088 0,00136758071802715 237034 271723 579 665 0 True 328 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 372 383 0,0063618261965781 0,00653680435926162 0,00630197604333562 0,00654612039368277 0,00130092138988287 0,00147560155121389 241398 284879 579 665 0 True 372 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 417 382 0,00655046881961188 0,00636319569810312 0,00654612039368277 0,0063935301747158 0,0014853569437345 0,00145539538968206 248556 277313 579 665 0 True 416 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 461 381 0,00632838284806877 0,00666213485189284 0,00627145799954223 0,00672922865644312 0,00165382094392529 0,0016395517954009 240129 290341 579 665 0 True 461 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 504 381 0,00629960417464702 0,00660275086893246 0,00631723506523232 0,00657663843747616 0,00162336847611654 0,00163340738666867 239037 287753 579 665 0 True 505 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 549 381 0,00664645043921078 0,00680389460719778 0,00663767452506294 0,00683604180972 0,00164716371377444 0,00145749476001611 252198 296519 579 665 0 True 549 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 593 381 0,00671396963454643 0,006634209694527 0,00672922865644312 0,00663767452506294 0,00186559939122086 0,00196678503376895 254760 289124 579 665 0 True 593 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 637 380 0,00628234224141328 0,00620785197142547 0,00636301213092241 0,00622568093385214 0,00191941429980224 0,00183454372211963 238382 270543 579 665 0 True 637 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 240 428 0,00600670474570076 0,00607903370236073 0,00602731364919509 0,00611886778057527 0,00142236291993541 0,00145920954895569 227923 264929 579 665 0 True 240 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 285 428 0,00609372597247604 0,00629913075203458 0,00619516289005875 0,00633249408712902 0,00146390717502469 0,00144633248958973 231225 274521 579 665 0 True 284 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 329 427 0,00638088020837657 0,00648317979659609 0,00633249408712902 0,00650034332799268 0,00130641741719223 0,00134257418117789 242121 282542 579 665 0 True 328 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 373 427 0,00638868102095243 0,00643336425293033 0,00634775310902571 0,00643930724040589 0,00131919726555614 0,00127287102528525 242417 280371 579 665 0 True 372 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 417 427 0,0064518781444555 0,00660063984635427 0,00645456626230259 0,00663767452506294 0,0016292710263746 0,00156887040787986 244815 287661 579 665 0 True 416 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 460 426 0,00655136485889424 0,00649254172281241 0,00665293354695964 0,00653086137178607 0,00165565267927519 0,00153891441603726 248590 282950 579 665 0 True 461 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 505 425 0,00652801512935974 0,0066770496853257 0,00654612039368277 0,00665293354695964 0,00164253153474172 0,00162599627010971 247704 290991 579 665 0 True 505 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 549 424 0,0063845170736991 0,00653136618153303 0,0063782711528191 0,00648508430609598 0,0014788366071313 0,00161849237232069 242259 284642 579 665 0 True 549 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 593 425 0,00596021611940409 0,00612102469494863 0,00599679560540169 0,00602731364919509 0,00191439122805516 0,00182161425789101 226159 266759 579 665 0 True 593 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 637 425 0,00570381711416581 0,00577321077929431 0,00563057907988098 0,00582894636453803 0,00180067633510428 0,00169690838225134 216430 251601 579 665 0 True 637 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 241 472 0,00621693137380084 0,00615101498309748 0,00614938582436866 0,00608834973678187 0,00144040451232036 0,0013558287811429 235900 268066 579 665 0 True 240 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 286 471 0,00614595979181845 0,00626698354951237 0,00613412680247196 0,00627145799954223 0,00150764778514405 0,00146467246170761 233207 273120 579 665 0 True 284 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 329 471 0,00637518772352392 0,00643386906267729 0,00643930724040589 0,00642404821850919 0,00149550963955948 0,00153291126934004 241905 280393 579 665 0 True 328 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 374 472 0,00651027882238828 0,00652668521842487 0,00650034332799268 0,00650034332799268 0,00140689656319633 0,00142114714668074 247031 284438 579 665 0 True 372 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 418 470 0,00659405849528914 0,00671692965533541 0,00657663843747616 0,00671396963454643 0,00162409838386574 0,00168525304563515 250210 292729 579 665 0 True 416 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 462 470 0,00653716000085914 0,00664416821408064 0,00659189745937285 0,00660715648126955 0,00191697466744093 0,00190971234437534 248051 289558 579 665 0 True 461 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 505 469 0,006377875841371 0,00642560853954525 0,00630197604333562 0,00654612039368277 0,00186881964385351 0,00180793119472344 242007 280033 579 665 0 True 505 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 550 468 0,00590558407727654 0,0057473278068139 0,00585946440833143 0,00575265125505455 0,00175628421740599 0,0016884571305313 224086 250473 579 665 0 True 549 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 594 469 0,00570626804514404 0,00562227266495376 0,00564583810177768 0,00569161516746777 0,0018034299964965 0,00175188235161203 216523 245023 579 665 0 True 593 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 639 469 0,0055204716645366 0,00560598107766555 0,00549324788281071 0,00566109712367437 0,00161255773375495 0,0016557345304731 209473 244313 579 665 0 True 637 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 242 516 0,0062077601482049 0,00619181278901075 0,00628671702143893 0,00625619897764553 0,0013364379360538 0,00145104699856608 235552 269844 579 665 0 True 240 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 285 515 0,00606428844664079 0,00616788021782541 0,00605783169298848 0,00617990386816205 0,00142647564334665 0,00153028213852607 230108 268801 579 665 0 True 284 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 330 514 0,00633721147040969 0,00637457686330727 0,00636301213092241 0,00630197604333562 0,00139413311584168 0,00143160046523117 240464 277809 579 665 0 True 328 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 374 515 0,00633792303101627 0,00646140413978411 0,00636301213092241 0,00657663843747616 0,00149320386706633 0,00139491521881767 240491 281593 579 665 0 True 372 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 418 515 0,00640670722298583 0,00657546819669912 0,0063782711528191 0,00660715648126955 0,00177336928792792 0,00171125819351956 243101 286564 579 665 0 True 416 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 462 514 0,00609770544105359 0,00635231934264593 0,00608834973678187 0,0063782711528191 0,00188648599921528 0,00170644857416993 231376 276839 579 665 0 True 461 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 507 512 0,00580643996609282 0,00571733751866505 0,00578316929884794 0,00573739223315786 0,00171709151210749 0,00152097639570198 220324 249166 579 665 0 True 505 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 550 513 0,00566855533299521 0,00568984833335341 0,00566109712367437 0,00567635614557107 0,00158720770944063 0,00144509482175946 215092 247968 579 665 0 True 549 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 595 513 0,00539737167959796 0,00562408539086329 0,00535591668574044 0,00573739223315786 0,0016570107079696 0,0016430338637659 204802 245102 579 665 0 True 593 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 638 512 0,00583126552503356 0,00566387357728264 0,00576791027695125 0,00569161516746777 0,00193345320091767 0,00169213948767437 221266 246836 579 665 0 True 637 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 242 560 0,00615523643380055 0,00617942200431268 0,00614938582436866 0,00617990386816205 0,00135526037520932 0,0012497743646607 233559 269304 579 665 0 True 240 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 286 559 0,0062585444922376 0,00624651580886297 0,00627145799954223 0,00634775310902571 0,00137120896089458 0,00121438863414138 237479 272228 579 665 0 True 284 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 329 559 0,00616366974469337 0,00640475071863683 0,00619516289005875 0,0063935301747158 0,00142159070225441 0,00137176778946318 233879 279124 579 665 0 True 328 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 374 559 0,00624365442769246 0,00630059928948028 0,00622568093385214 0,00633249408712902 0,00134103853661501 0,00125002651471125 236914 274585 579 665 0 True 372 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 418 559 0,00620773379410836 0,00637297065047604 0,00625619897764553 0,00645456626230259 0,00159497090210415 0,00162997602377236 235551 277739 579 665 0 True 416 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 463 558 0,00641218887506617 0,00607579833080068 0,0063935301747158 0,00613412680247196 0,00200027560239161 0,00176400552140081 243309 264788 579 665 0 True 461 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 506 557 0,00626750488506122 0,00587759166742675 0,00614938582436866 0,00587472343022812 0,00213259831592519 0,00198552561303755 237819 256150 579 665 0 True 505 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 549 557 0,00579716332411072 0,00575492289891586 0,00576791027695125 0,00581368734264134 0,00169462457319994 0,0017826616156138 219972 250804 579 665 0 True 549 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 595 558 0,00604333693989144 0,0064800362086264 0,005981536583505 0,00642404821850919 0,00165895859581977 0,00163871424093562 229313 282405 579 665 0 True 593 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 638 557 0,00652495805416109 0,00609165394603469 0,00650034332799268 0,0059662775616083 0,00173650431713716 0,00166119351051521 247588 265479 579 665 0 True 637 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 240 596 0,00635558027569811 0,00669949077316776 0,00630197604333562 0,00666819256885634 0,00127678871961393 0,00112519910895389 241161 291969 579 665 0 False 240 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 284 596 0,00629791751246845 0,00642829320956316 0,00633249408712902 0,00643930724040589 0,00139248731265649 0,00139288952010068 238973 280150 579 665 0 False 284 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 330 603 0,00616061266949472 0,00613433331555026 0,00617990386816205 0,00622568093385214 0,00146497790643625 0,00144540937606874 233763 267339 579 665 0 True 328 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 374 603 0,006351231849769 0,00617671438839718 0,00630197604333562 0,00619516289005875 0,00138409210262634 0,00122305025273639 240996 269186 579 665 0 True 372 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 417 596 0,00640541587225537 0,00648747067944524 0,0063935301747158 0,00645456626230259 0,00170530836323845 0,00175353889041851 243052 282729 579 665 0 False 417 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 461 596 0,00649820864617293 0,00693459443986483 0,00656137941557946 0,00700389105058366 0,0020332279774475 0,00203689231211512 246573 302215 579 665 0 False 461 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 505 596 0,0063003157352536 0,00655139795012824 0,00624093995574884 0,00668345159075303 0,0020345049056142 0,00210463188900612 239064 285515 579 665 0 False 505 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 549 596 0,0061743431537921 0,00629064076992665 0,00610360875867857 0,00633249408712902 0,00186171927261908 0,00176067851936526 234284 274151 579 665 0 False 549 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 593 596 0,00627994401862813 0,0061346775040141 0,00630197604333562 0,00608834973678187 0,00158174065983381 0,00152183823760427 238291 267354 579 665 0 False 593 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 637 596 0,00633080742495045 0,00631388496418432 0,00633249408712902 0,00627145799954223 0,00154393579983872 0,0014981858314654 240221 275164 579 665 0 False 637 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 242 646 0,00847191964425132 0,706265595322708 0,0081177996490425 0,699732967116808 0,00212439949974619 0,178934596880072 321465 30779602 579 665 3 True 240 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 284 640 0,00730153421690713 0,00666725178705519 0,00701915007248035 0,00665293354695964 0,00229212945345503 0,00129424141610071 277055 290564 579 665 0 False 284 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 328 640 0,00641095023252878 0,00648230785248771 0,00648508430609598 0,00651560234988937 0,00138508198762529 0,00132444653783118 243262 282504 579 665 0 False 328 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 372 640 0,00640262233802212 0,00666945459322373 0,0064087891966125 0,00674448767833982 0,00124627851172645 0,00118508731502757 242946 290660 579 665 0 False 372 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 417 640 0,00616211485299751 0,00615571889210323 0,00614938582436866 0,00617990386816205 0,00143568477726125 0,00140221582145621 233820 268271 579 665 0 False 417 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 461 640 0,00598823052402617 0,00620789786322065 0,00602731364919509 0,00627145799954223 0,0016422216411925 0,00161558122587815 227222 270545 579 665 0 False 461 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 505 640 0,00613931855949035 0,00591988095668331 0,00619516289005875 0,00599679560540169 0,00170494803121892 0,00179835886160665 232955 257993 579 665 0 False 505 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 549 640 0,00599091864187326 0,00584654586798881 0,00601205462729839 0,00578316929884794 0,00167966680498674 0,00164284992498321 227324 254797 579 665 0 False 549 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 593 640 0,00626800561289548 0,00608681236164341 0,00624093995574884 0,00607309071488518 0,001454723832893 0,00119855791459443 237838 265268 579 665 0 False 593 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 640 644 0,0087468719334538 0,722725903795883 0,00787365529869535 0,723292896925307 0,00342538842675785 0,189085304813141 331898 31496955 579 665 10 True 637 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G12_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G12_3.csv new file mode 100755 index 0000000..0c1e164 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G12_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 239 251 0,00106502174937702 0,0657576649336778 0,000732433051041428 0,0672922865644312 0,000945685640425049 0,0204978599218637 40412 2865770 579 665 0 True 240 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 284 251 0,000830417581977382 0,000905422172965029 0,000717174029144732 0,000762951094834821 0,000645785583715463 0,000670994911094419 31510 39459 579 665 0 False 284 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 328 251 0,000861330937218876 0,00088929120695995 0,000717174029144732 0,000778210116731518 0,000670998881617122 0,000647341114540323 32683 38756 579 665 0 True 328 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 370 250 0,00095114569822741 0,000813684474404138 0,000823987182421607 0,000671396963454643 0,000656946350876144 0,000632179610679232 36091 35461 579 665 0 True 372 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 415 249 0,000925028788556208 0,000859255027015926 0,000717174029144732 0,000671396963454643 0,000754886327268052 0,000682090782234729 35100 37447 579 665 0 True 416 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 460 250 0,000869237166180895 0,000843720654348162 0,000595101853971161 0,000671396963454643 0,000846793695246071 0,000720333802298617 32983 36770 579 665 0 True 461 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 504 249 0,000835293089837294 0,000845326867179393 0,000656137941557946 0,000656137941557946 0,00076315745637102 0,000740921505316268 31695 36840 579 665 0 True 505 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 548 248 0,000998161406454883 0,00100668241902536 0,000823987182421607 0,000885023270008392 0,000837085145584977 0,000737701106468062 37875 43872 579 665 0 True 549 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 593 251 0,000895195951272857 0,000929102339276894 0,00064087891966125 0,000579842832074464 0,000878237124056267 0,000951902098535537 33968 40491 579 665 0 False 593 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 634 248 0,0010481024193983 0,0680347469727191 0,000747692072938125 0,069214923323415 0,00098083796896016 0,0222540188161829 39770 2965007 579 665 0 True 637 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 240 294 0,000840142243600665 0,000893880386477753 0,000610360875867857 0,000701915007248035 0,00077317856383601 0,000743462500800879 31879 38956 579 665 0 False 240 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 284 294 0,000839272558414843 0,000869718356316518 0,000701915007248035 0,000762951094834821 0,000662272445302733 0,000672200109425397 31846 37903 579 665 0 False 284 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 327 295 0,000861225520832716 0,000869947815292408 0,000747692072938125 0,000762951094834821 0,00066630409289927 0,000675774719465128 32679 37913 579 665 0 True 328 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 372 295 0,000872030700414141 0,00083839720610751 0,000778210116731518 0,000717174029144732 0,000642014661568452 0,000636080820394266 33089 36538 579 665 0 True 372 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 416 295 0,000848944511845046 0,000894362250327122 0,000686655985351339 0,000671396963454643 0,000731700289626243 0,000797395945924796 32213 38977 579 665 0 True 416 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 460 294 0,000823143851332325 0,000886101727195076 0,000564583810177768 0,000564583810177768 0,000848438775784454 0,000923994883750834 31234 38617 579 665 0 True 461 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 505 293 0,000907819563515547 0,000961593730262943 0,000686655985351339 0,000747692072938125 0,000826534402057321 0,0008229526468091 34447 41907 579 665 0 True 505 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 548 293 0,000970357834605116 0,000895050627254793 0,000762951094834821 0,000671396963454643 0,000837696303850921 0,000775306052818234 36820 39007 579 665 0 True 549 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 593 294 0,000967353467599549 0,00088718018438176 0,000579842832074464 0,000442511635004196 0,000993177027624527 0,00100393729467182 36706 38664 579 665 0 False 593 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 637 294 0,00100374847492138 0,000934655246493437 0,000656137941557946 0,000518806744487678 0,000993828443432262 0,0010365641212602 38087 40733 579 665 0 False 637 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 240 341 0,000926214722900511 0,000893192009550083 0,000747692072938125 0,000717174029144732 0,00079600413151528 0,000754121689021406 35145 38926 579 665 0 True 240 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 285 338 0,000847126079183782 0,000844776165637256 0,000701915007248035 0,000656137941557946 0,000679346747463034 0,000723336273465463 32144 36816 579 665 0 True 284 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 328 338 0,000910744868231494 0,000844271355890298 0,00080872816052491 0,000732433051041428 0,000621174621310187 0,000658083292015935 34558 36794 579 665 0 True 328 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 373 338 0,000881439112878944 0,000895394815718628 0,000747692072938125 0,000762951094834821 0,000684210966305751 0,00070565241553791 33446 39022 579 665 0 True 372 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 416 339 0,000827808526419916 0,000888258641568444 0,000671396963454643 0,000656137941557946 0,000711320753639129 0,000785733323899772 31411 38711 579 665 0 True 416 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 460 338 0,000860303127453813 0,000806846596922611 0,000595101853971161 0,000564583810177768 0,000835219559128819 0,000771451975143371 32644 35163 579 665 0 True 461 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 505 336 0,000957760576458966 0,00089606024674871 0,000701915007248035 0,000671396963454643 0,000854919619980314 0,000811920019567844 36342 39051 579 665 0 True 505 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 548 337 0,000922656919867602 0,000873687996599418 0,000686655985351339 0,000671396963454643 0,000835717180859502 0,000750071856042777 35010 38076 579 665 0 True 549 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 593 337 0,000935649489461853 0,000833440892228282 0,000534065766384375 0,000259403372243839 0,00102537924379345 0,00106728461563582 35503 36322 579 665 0 True 593 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 637 336 0,000828599149316118 0,000847644402835884 0,000457770656900893 0,000411993591210803 0,000939228990484785 0,000936068917636687 31441 36941 579 665 0 True 637 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 241 383 0,000852634085360655 0,000930318471849112 0,000671396963454643 0,00080872816052491 0,000765765868237953 0,000774455781064665 32353 40544 579 665 0 True 240 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 284 384 0,000849287115100067 0,000933186709047739 0,000671396963454643 0,000839246204318303 0,000713950826591374 0,000689144099346524 32226 40669 579 665 0 True 284 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 329 384 0,000797501315398843 0,000919281495108795 0,000671396963454643 0,000762951094834821 0,000618109398248444 0,000740017803507838 30261 40063 579 665 0 True 328 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 372 383 0,000896065636458679 0,000905812253224042 0,000717174029144732 0,000762951094834821 0,000700312391442216 0,000734654873906828 34001 39476 579 665 0 True 372 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 417 382 0,000872109762703762 0,000831742895806695 0,000656137941557946 0,000595101853971161 0,000789517159840981 0,000728790944075725 33092 36248 579 665 0 True 416 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 461 381 0,000783849893391091 0,000883279381791627 0,000518806744487678 0,000534065766384375 0,000768877489788935 0,000848525605857239 29743 38494 579 665 0 True 461 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 504 381 0,000879172660576498 0,000822885779337334 0,000610360875867857 0,000473029678797589 0,000831956599204502 0,000865072550254333 33360 35862 579 665 0 True 505 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 549 381 0,000894985118500536 0,000959987517431712 0,000625619897764553 0,000793469138628214 0,00086066242529451 0,000788583597687849 33960 41837 579 665 0 True 549 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 593 381 0,000870317684139037 0,000877910041755797 0,0004272526131075 0,000457770656900893 0,00101306775089981 0,00100632811473767 33024 38260 579 665 0 True 593 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 637 380 0,000787223217748219 0,000862375669088032 0,000381475547417411 0,000518806744487678 0,000896989823890367 0,00092322237273209 29871 37583 579 665 0 True 637 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 240 428 0,000902285203242134 0,000855537791606505 0,000778210116731518 0,000717174029144732 0,000730047971888035 0,000755492083925646 34237 37285 579 665 0 True 240 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 285 428 0,000890056902447545 0,000913361453530829 0,000717174029144732 0,000778210116731518 0,000787061518834124 0,000754467972737464 33773 39805 579 665 0 True 284 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 329 427 0,000877064332853294 0,000976669184978927 0,000793469138628214 0,000854505226215 0,000673198149926915 0,000713412013772103 33280 42564 579 665 0 True 328 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 373 427 0,000854294393442679 0,000854367550829466 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000688361288066072 0,000653439436817358 32416 37234 579 665 0 True 372 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 417 427 0,000881254634203163 0,00084119660561337 0,000671396963454643 0,000579842832074464 0,000773336577522986 0,000802532225281332 33439 36660 579 665 0 True 416 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 460 426 0,000877117041046374 0,0008822927081953 0,00064087891966125 0,000625619897764553 0,000827299326143499 0,00079717325047716 33282 38451 579 665 0 True 461 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 505 425 0,000929798880029959 0,000838580773288222 0,000671396963454643 0,000549324788281071 0,000875047802269724 0,000848830575702253 35281 36546 579 665 0 True 505 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 549 424 0,000928639299782197 0,000890163151068332 0,00064087891966125 0,000671396963454643 0,000898780953025047 0,000805314909203177 35237 38794 579 665 0 True 549 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 593 425 0,000836531732374677 0,000869557735033395 0,000442511635004196 0,0004272526131075 0,000920047902432271 0,000982009948115454 31742 37896 579 665 0 True 593 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 637 425 0,000796315381054541 0,000838075963541263 0,000457770656900893 0,0004272526131075 0,000872806030256762 0,00091959930669099 30216 36524 579 665 0 True 637 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 241 472 0,000939971561294424 0,000947527895040875 0,000793469138628214 0,00080872816052491 0,000756886856631983 0,000734273066063883 35667 41294 579 665 0 True 240 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 286 471 0,000901441872152852 0,000979698043460677 0,000793469138628214 0,000839246204318303 0,000757422174086088 0,000853259951849043 34205 42696 579 665 0 True 284 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 329 471 0,000983429466488987 0,000973778001882711 0,000885023270008392 0,000793469138628214 0,00079805348080299 0,000831408968749785 37316 42438 579 665 0 True 328 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 374 472 0,000839193496125223 0,000863270559094004 0,000717174029144732 0,000732433051041428 0,000704756070881222 0,000748166660159424 31843 37622 579 665 0 True 372 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 418 470 0,000918835575869293 0,000920359952295479 0,000656137941557946 0,000625619897764553 0,000934916947710261 0,000923587821415548 34865 40110 579 665 0 True 416 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 462 470 0,000849497947872388 0,000884518460261434 0,000396734569314107 0,000442511635004196 0,000985349669629419 0,00100773377718099 32234 38548 579 665 0 True 461 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 505 469 0,000788830817637163 0,000881099521520671 0,0004272526131075 0,000473029678797589 0,000895924996735157 0,000982705706708056 29932 38399 579 665 0 True 505 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 550 468 0,00084638816448066 0,00083605672455343 0,000473029678797589 0,000488288700694286 0,000924803641610645 0,000913568124522813 32116 36436 579 665 0 True 549 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 594 469 0,000969672628095075 0,000855744304684807 0,000610360875867857 0,000473029678797589 0,000992682726875983 0,000930287601000249 36794 37294 579 665 0 True 593 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 639 469 0,000834818716099573 0,000839590392782138 0,000457770656900893 0,000488288700694286 0,000901708360474254 0,000874929382895115 31677 36590 579 665 0 True 637 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 242 516 0,000937467922123118 0,000892526578520001 0,000793469138628214 0,000717174029144732 0,00073105872669814 0,000726456646986936 35572 38897 579 665 0 True 240 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 285 515 0,000837559542139739 0,000840714741764 0,000671396963454643 0,000701915007248035 0,000731227161604821 0,000729290811321557 31781 36639 579 665 0 True 284 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 330 514 0,000907977688094787 0,000823298805493936 0,000778210116731518 0,000732433051041428 0,000747443479997643 0,000664279554200642 34453 35880 579 665 0 True 328 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 374 515 0,000851105547761332 0,000904573174754235 0,000686655985351339 0,000732433051041428 0,000772038749728771 0,000772213751064611 32295 39422 579 665 0 True 372 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 418 515 0,000921497339619839 0,000921254842301451 0,000564583810177768 0,000564583810177768 0,000968205756228196 0,000917332356531722 34966 40149 579 665 0 True 416 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 462 514 0,00085880094395103 0,000884518460261434 0,000473029678797589 0,000564583810177768 0,000988481775400406 0,000855602906921123 32587 38548 579 665 0 True 461 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 507 512 0,000841828905779229 0,000851591097221194 0,000534065766384375 0,000488288700694286 0,000853220772293201 0,000857609319896781 31943 37113 579 665 0 True 505 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 550 513 0,000847152433280322 0,000880525874080945 0,000518806744487678 0,000595101853971161 0,000872226387631116 0,000859886759808089 32145 38374 579 665 0 True 549 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 595 513 0,000847468682438803 0,000837364640716004 0,000564583810177768 0,000503547722590982 0,000851203615338083 0,000868897284073531 32157 36493 579 665 0 True 593 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 638 512 0,000825963739662111 0,000872104729665776 0,000442511635004196 0,000457770656900893 0,000902209947715745 0,000955336265362507 31341 38007 579 665 0 True 637 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 242 560 0,000812733983199 0,000837800612770195 0,000686655985351339 0,00064087891966125 0,000628609759519282 0,000683943529972101 30839 36512 579 665 0 True 240 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 286 559 0,000864546136996764 0,000892274173646522 0,000732433051041428 0,000762951094834821 0,000697239426158911 0,000690705681577548 32805 38886 579 665 0 True 284 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 329 559 0,000869184457987815 0,000913545020711541 0,000732433051041428 0,000778210116731518 0,000721176578856997 0,00071221340351729 32981 39813 579 665 0 True 328 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 374 559 0,000809281596552252 0,000919786304855754 0,000686655985351339 0,000762951094834821 0,000696630666803387 0,000698179234190965 30708 40085 579 665 0 True 372 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 418 559 0,000879119952383418 0,00087201294607542 0,000625619897764553 0,000534065766384375 0,000844901984082015 0,00088751168781854 33358 38003 579 665 0 True 416 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 463 558 0,000882783171802487 0,000851384584142893 0,000488288700694286 0,000473029678797589 0,000989868358117772 0,000924972488404266 33497 37104 579 665 0 True 461 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 506 557 0,000888923676296322 0,000878850823556947 0,000503547722590982 0,000457770656900893 0,00102512324141406 0,00104929772100889 33730 38301 579 665 0 True 505 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 549 557 0,000924633477108107 0,000928551637734758 0,00064087891966125 0,000488288700694286 0,0009342718316576 0,000978512898363535 35085 40467 579 665 0 True 549 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 595 558 0,000865811133630687 0,000843399411781915 0,000564583810177768 0,00064087891966125 0,000820513599223303 0,000756120208605623 32853 36756 579 665 0 True 593 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 638 557 0,000886499099414636 0,000869328276057505 0,000579842832074464 0,000549324788281071 0,000883255913495515 0,00088261987706479 33638 37886 579 665 0 True 637 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 240 596 0,00090513144566846 0,00089443108801989 0,000762951094834821 0,000747692072938125 0,000670728652348271 0,000651655710883266 34345 38980 579 665 0 False 240 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 284 596 0,000952937776792135 0,000902462152176046 0,000854505226215 0,000793469138628214 0,000696174223830474 0,000730124648183031 36159 39330 579 665 0 False 284 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 330 603 0,000863702805907482 0,000884793811032502 0,000732433051041428 0,000747692072938125 0,000697080899568475 0,000701769796978686 32773 38560 579 665 0 True 328 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 374 603 0,000850130446189349 0,000982015579117168 0,000717174029144732 0,000869764248111696 0,00070438462703317 0,000682658272169169 32258 42797 579 665 0 True 372 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 417 596 0,000853398354160317 0,000870292003756243 0,000610360875867857 0,000579842832074464 0,000816664061226485 0,000817234281914938 32382 37928 579 665 0 False 417 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 461 596 0,000876616313212112 0,000967353150557786 0,0004272526131075 0,000671396963454643 0,00099165887139551 0,000983972931792829 33263 42158 579 665 0 False 461 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 505 596 0,000791070915843068 0,000842206225107286 0,000289921416037232 0,000274662394140536 0,000988040188819275 0,00106115416590105 30017 36704 579 665 0 False 505 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 549 596 0,000809914094869213 0,000869167654774382 0,000381475547417411 0,000534065766384375 0,000952375477993596 0,000896239790648428 30732 37879 579 665 0 False 549 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 593 596 0,000824356139773168 0,000872288296846488 0,000518806744487678 0,000564583810177768 0,000825015731751066 0,000875424098019755 31280 38015 579 665 0 False 593 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 637 596 0,000848549200396945 0,000860631780871267 0,000656137941557946 0,00064087891966125 0,000733073994823709 0,000743063937513427 32198 37507 579 665 0 False 637 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 242 646 0,00108963647554544 0,0705978266793099 0,000961318379491875 0,07006942854963 0,000768691032945373 0,018700703792952 41346 3076708 579 665 0 True 240 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 284 640 0,000983139571427047 0,000942823986035127 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,000744527433450772 0,000714323586772945 37305 41089 579 665 0 False 284 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 328 640 0,000840906512400327 0,000853472660823494 0,000732433051041428 0,000747692072938125 0,000621287693914946 0,000665283764422421 31908 37195 579 665 0 False 328 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 372 640 0,000907108002908965 0,000936284405222257 0,000762951094834821 0,000839246204318303 0,000661777429079087 0,000647354941324817 34420 40804 579 665 0 False 372 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 417 640 0,000931828145463544 0,000845694001540817 0,000732433051041428 0,000656137941557946 0,000764857901110253 0,000719331910789249 35358 36856 579 665 0 False 417 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 461 640 0,000901679059021712 0,000867033686298603 0,000564583810177768 0,000564583810177768 0,000939871871584341 0,000846782987112606 34214 37786 579 665 0 False 461 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 505 640 0,000954887979936099 0,000881994411526642 0,000686655985351339 0,000534065766384375 0,000917590943882587 0,000901141924558175 36233 38438 579 665 0 False 505 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 549 640 0,000830918309811643 0,000913866263277787 0,000457770656900893 0,000595101853971161 0,000917445511565446 0,000864061407644602 31529 39827 579 665 0 False 549 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 593 640 0,000782242293502147 0,000808452809753842 0,000595101853971161 0,000671396963454643 0,000674558769313664 0,000659381513734048 29682 35233 579 665 0 False 593 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 640 644 0,000974021054024185 0,0729274089320348 0,00080872816052491 0,0719920653086137 0,000752537827103042 0,020883343922195 36959 3178233 579 665 0 True 637 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G1_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G1_1.csv new file mode 100755 index 0000000..cc73dac --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G1_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 261 280 0,00981838457413307 0,0433393623679249 0,0098268101014725 0,0441290913252461 0,00152557003767118 0,00882389258009542 400868 1888763 623 665 0 True 260 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 304 281 0,00977917158206788 0,00970712429964818 0,00970473792629892 0,00970473792629892 0,00135710644357767 0,0012371177348349 399267 423044 623 665 0 False 304 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 349 281 0,00990881203615972 0,0591105596447057 0,00990310521095598 0,0590371557183185 0,00129462197024703 0,00818525764136902 404560 2576084 623 665 0 True 349 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 393 280 0,00994266110238963 0,0743034744104482 0,00999465934233616 0,0732738231479362 0,00136487857061957 0,0092600121999184 405942 3238203 623 665 0 True 393 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 437 280 0,0100855276749794 0,0627612748970159 0,00999465934233616 0,0602273594262608 0,00165948420359872 0,011318620889601 411775 2735185 623 665 0 True 437 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 481 281 0,0100354643671835 0,0585928313574047 0,010101472495613 0,0609140154116121 0,00165177214116035 0,0157050957247996 409731 2553521 623 665 0 True 481 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 525 281 0,0099641657913548 0,0683513315217547 0,00996414129854276 0,0668955519951171 0,00158117825377468 0,0164122120984903 406820 2978804 623 665 0 True 525 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 569 280 0,0102490171953012 0,0614343824771358 0,0103303578240635 0,0592050049591821 0,00167437031514701 0,0160474399516005 418450 2677358 623 665 0 True 569 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 614 281 0,0103006970286912 0,0103746204605127 0,0103303578240635 0,0103913939116503 0,00192833000686972 0,00184716793882311 420560 452134 623 665 0 False 614 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 657 281 0,0104232100744814 0,0427445358647248 0,010452429999237 0,0426947432669566 0,00191943062919692 0,00921424138625571 425562 1862840 623 665 0 True 658 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 260 324 0,00963245963798889 0,00980301520567268 0,00968947890440223 0,00978103303578241 0,00153310089297148 0,00146099794594705 393277 427223 623 665 0 False 260 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 304 325 0,00999612891105815 0,00987488175692149 0,00996414129854276 0,00988784618905928 0,00131568992970786 0,00128357787262989 408125 430355 623 665 0 False 304 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 349 325 0,0100129064873009 0,0955200085358739 0,00996414129854276 0,0905165178912032 0,00135066341276506 0,0212126487445423 408810 4162836 623 665 0 True 349 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 393 325 0,010068235749684 0,047954241291028 0,0100556954299229 0,0475318532082094 0,00136368647527643 0,00641344542443144 411069 2089883 623 665 0 True 393 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 438 325 0,0101265776279471 0,0721708367967297 0,0101472495613031 0,0696879530022126 0,00168913227523809 0,0117092923473459 413451 3145261 623 665 0 True 437 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 482 326 0,0100884913052354 0,0385756104612642 0,0101777676050965 0,0400396734569314 0,00166901511427118 0,00656669647135494 411896 1681155 623 665 0 True 481 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 525 325 0,0100842050631296 0,0381426672655546 0,0100251773861295 0,0399328603036545 0,0015442473934831 0,00704648777235367 411721 1662287 623 665 0 True 525 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 570 325 0,0100089631445636 0,0482725008905876 0,0100709544518196 0,0485389486533913 0,00173115787151497 0,00930072559532991 408649 2103753 623 665 0 True 569 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 614 325 0,0100699257537142 0,00998543509150537 0,0100251773861295 0,0100251773861295 0,00201039697747127 0,00223525379239928 411138 435173 623 665 0 False 614 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 658 325 0,0102122534844393 0,0101243036637141 0,0101167315175097 0,010101472495613 0,00190715051596243 0,00176870193781095 416949 441225 623 665 0 False 658 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 261 370 0,0100135922860378 0,0546437735446421 0,0100556954299229 0,0526131074998093 0,00160516854116329 0,0106350205967962 408838 2381418 623 665 0 True 260 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 305 370 0,00998500917439507 0,0638662575413127 0,00993362325474937 0,0661020828564889 0,00137546032717551 0,0164141737322539 407671 2783341 623 665 0 True 304 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 349 370 0,0100101877851652 0,0397260259827871 0,0100404364080262 0,0395513847562371 0,00137139349742525 0,0072617814327351 408699 1731291 623 665 0 True 349 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 393 369 0,01001964201061 0,0336718426875153 0,0100251773861295 0,0344548714427405 0,0013970210080273 0,00432572555974424 409085 1467445 623 665 0 True 393 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 437 369 0,0102999132587062 0,0677066665289913 0,0103303578240635 0,0647287708857862 0,00160736371572172 0,0111887230977622 420528 2950709 623 665 0 True 437 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 481 368 0,0104850299320533 0,030215203837013 0,0105439841306172 0,0313115129320211 0,00169513354135018 0,00494892342146963 428086 1316802 623 665 0 False 481 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 525 368 0,0104348931458213 0,0264534074944743 0,010452429999237 0,0267032883192187 0,00174029653267518 0,00327803486129581 426039 1152860 623 665 0 False 525 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 570 369 0,0103288882553415 0,0477030296042234 0,0103150988021668 0,0479591058213169 0,00172964984770523 0,0080692769451937 421711 2078935 623 665 0 True 569 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 614 368 0,0102763511735302 0,0552533313140943 0,0102845807583734 0,0552681773098344 0,00211804079150011 0,012538759444209 419566 2407983 623 665 0 True 614 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 657 369 0,0101054648239744 0,0621455676270098 0,0100404364080262 0,0615701533531701 0,00205078093101084 0,0169176843562897 412589 2708352 623 665 0 True 658 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 261 414 0,00984434695488828 0,0450352936587291 0,0098268101014725 0,0474708171206226 0,0015659952192309 0,00949774597587512 401928 1962673 623 665 0 True 260 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 305 414 0,00996453318353529 0,0310945365244193 0,0100556954299229 0,0312809948882277 0,00142751255351569 0,00313231304059513 406835 1355124 623 665 0 True 304 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 349 414 0,0101204544249388 0,0891452710512835 0,0101472495613031 0,0858472571908141 0,00143245446697825 0,0181101285359271 413201 3885020 623 665 0 True 349 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 394 413 0,0102235691635986 0,0658225788779571 0,0102388036926833 0,0641184100099184 0,00151628576830638 0,0161977947695435 417411 2868599 623 665 0 True 393 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 438 413 0,0102187685724401 0,0412712486182267 0,0102998397802701 0,0422064545662623 0,00163059945993314 0,00615840951224528 417215 1798633 623 665 0 True 437 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 482 413 0,0105866995948032 0,0514551198320819 0,0106355382619974 0,0517128252079042 0,00163619589809937 0,00896444983777478 432237 2242454 623 665 0 True 481 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 525 413 0,0106788660464842 0,0404340445987939 0,0107270923933776 0,041214618142977 0,00174914028689272 0,00531887696325974 436000 1762147 623 665 0 True 525 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 570 414 0,0104164745511723 0,0502961913825534 0,0104982070649271 0,0497291523613336 0,00170013334328971 0,00864916216839061 425287 2191947 623 665 0 True 569 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 614 414 0,0102172500180941 0,0396579455046405 0,0101625085831998 0,0401770046540017 0,00199592203308593 0,00732868795044729 417153 1728324 623 665 0 True 614 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 658 413 0,0103244060707394 0,0834386033749973 0,0103303578240635 0,0780804150453956 0,00183122041676504 0,0162187781666709 421528 3636319 623 665 0 True 658 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 262 458 0,00988804213155555 0,0409364909183006 0,00985732814526589 0,0409857328145266 0,00159444381310762 0,00570993666685013 403712 1784044 623 665 0 True 260 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 305 457 0,0100277981170171 0,0555693881074855 0,00994888227664607 0,0553597314412146 0,00149598567617206 0,00717332689784763 409418 2421757 623 665 0 True 304 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 350 457 0,0104011420508395 0,0337992153650319 0,0103761348897536 0,0344396124208438 0,00181607991209624 0,00387226533847322 424661 1472996 623 665 0 True 349 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 393 457 0,0104821152874213 0,0504039912094266 0,0103913939116503 0,050614175631342 0,00168191814517001 0,00707350461788261 427967 2196645 623 665 0 True 393 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 438 457 0,0106419308859381 0,0936614826147539 0,0106202792401007 0,0925459678034638 0,0019072982470954 0,0130697246395881 434492 4081840 623 665 0 True 437 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 482 458 0,0107711059766013 0,0581682404684176 0,0106813153276875 0,0584115358205539 0,00195859245238705 0,011091103115007 439766 2535017 623 665 0 True 481 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 526 457 0,0105803559564866 0,0521994159121769 0,0105745021744106 0,0509803921568627 0,00179821997869057 0,00813001126291628 431978 2274891 623 665 0 True 525 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 569 454 0,0103468659793739 0,028529529362431 0,010406652933547 0,0296787975890745 0,0016966351364082 0,00548393338637915 422445 1243339 623 665 0 False 569 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 615 457 0,0102595001188514 0,0390579561744829 0,0102845807583734 0,0390325780117494 0,00181831233473329 0,00660045392737279 418878 1702176 623 665 0 True 614 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 659 457 0,010185482840887 0,0623441184788476 0,0100709544518196 0,0617990386816205 0,00195730534287806 0,00936879947251349 415856 2717005 623 665 0 True 658 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 260 502 0,00975600138188445 0,0521434967597524 0,00975051499198901 0,0531929503318837 0,00156676211733719 0,0152099951033339 398321 2272454 623 665 0 True 260 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 305 502 0,010259989975092 0,0555576168620223 0,0102998397802701 0,0549324788281071 0,00156685878723529 0,00716843239828723 418898 2421244 623 665 0 True 304 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 348 502 0,0104310722671441 0,067778257729469 0,010452429999237 0,0665293354695964 0,00158488915266622 0,0164641744888632 425883 2953829 623 665 0 True 349 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 393 502 0,0107457559161469 0,089410387952027 0,0106965743495842 0,0866102082856489 0,0017326888588041 0,0188927891695688 438731 3896574 623 665 0 True 393 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 437 501 0,0108093147633731 0,0940075526421914 0,0108339055466545 0,0931105516136416 0,00209304661188069 0,0281734354370117 441326 4096922 623 665 0 True 437 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 482 502 0,0106040894913468 0,0433179997372695 0,0105287251087205 0,0447547112230106 0,00188097045013925 0,00580647364099129 432947 1887832 623 665 0 True 481 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 526 502 0,0104706526513898 0,0383386481768624 0,0103913939116503 0,039658197909514 0,00170474375966445 0,00559293511134789 427499 1670828 623 665 0 True 525 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 570 502 0,0106314724551999 0,0958387270533854 0,0106355382619974 0,0927290760662242 0,00179720757566675 0,0162759789568737 434065 4176726 623 665 0 True 569 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 614 501 0,0101754652807654 0,0570103904760757 0,010101472495613 0,059510185397116 0,00185727183567634 0,0126563625614417 415447 2484557 623 665 0 True 614 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 658 502 0,0103418449529071 0,0682195991236962 0,010452429999237 0,0659037155718318 0,00195855602984539 0,0111842418073946 422240 2973063 623 665 0 True 658 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 261 546 0,00973253726795663 0,0539986037421317 0,00973525597009232 0,055542839703975 0,00139818093862603 0,0125648312475221 397363 2353301 623 665 0 True 260 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 304 545 0,0102399058692248 0,101174405457452 0,0102235446707866 0,0966811627374685 0,00148309722751409 0,0286748948799603 418078 4409259 623 665 0 True 304 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 348 546 0,0102123759484995 0,0554746444963404 0,0101472495613031 0,0570687418936446 0,00142526768904033 0,0120726653347976 416954 2417628 623 665 0 True 349 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 393 546 0,010484074712384 0,0580908210099522 0,0103761348897536 0,0579079880979629 0,00156697143975794 0,00747473033461455 428047 2531643 623 665 0 True 393 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 437 545 0,0107242267343697 0,0570640609305365 0,010757610437171 0,0573434042877852 0,00206597373119438 0,00735225033926292 437852 2486896 623 665 0 True 437 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 482 546 0,0106345830423281 0,0601875482939438 0,0106965743495842 0,0604257267109178 0,001908184414459 0,0118455023866582 434192 2623020 623 665 0 True 481 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 526 546 0,0104272024028428 0,0713001547127145 0,0105287251087205 0,068863965819791 0,00189540748461817 0,0172203086734276 425725 3107316 623 665 0 True 525 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 570 546 0,0103880628892137 0,0560108671770982 0,0103608758678569 0,0564736400396735 0,00171547289906534 0,0122909282631468 424127 2440997 623 665 0 True 569 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 614 546 0,0102450248669397 0,0412592479137877 0,0102082856488899 0,0409246967269398 0,0016960988458054 0,00585573272622647 418287 1798110 623 665 0 True 614 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 658 546 0,0102801965450194 0,0591412153638846 0,010452429999237 0,0596322575722896 0,00186671921422009 0,011955185290017 419723 2577420 623 665 0 True 658 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 261 590 0,00954928204832407 0,0450550730224508 0,00959792477302205 0,0456702525368124 0,00131177041180289 0,0092784976265144 389881 1963535 623 665 0 True 260 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 305 590 0,00990898348584395 0,0522533387715111 0,0098115510795758 0,0527046616311894 0,00172435688155395 0,0108958925019429 404567 2277241 623 665 0 True 304 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 348 589 0,0100362236443565 0,0489969717151657 0,0101319905394064 0,049057755397879 0,00136652436488029 0,0110134225854966 409762 2135326 623 665 0 True 349 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 393 590 0,0104630108940354 0,050382812145952 0,010406652933547 0,0491645685511559 0,00153841647497176 0,00628152689123049 427187 2195722 623 665 0 True 393 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 438 589 0,0103717506763996 0,0906046989756378 0,0103761348897536 0,0844586861982147 0,00188541492612377 0,0219634043846246 423461 3948623 623 665 0 True 437 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 482 590 0,0104282555937603 0,0640625138033915 0,010452429999237 0,0622415503166247 0,00192597725470858 0,0123930709942918 425768 2791894 623 665 0 True 481 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 526 590 0,0101601082876206 0,0559011628407251 0,0102693217364767 0,0551308461127642 0,00190815190399316 0,00809185948924809 414820 2436216 623 665 0 True 525 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 571 589 0,0101596184313799 0,0366689211011048 0,0100862134737163 0,0379644464789807 0,0017344400468943 0,00698763843692851 414800 1598060 623 665 0 True 569 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 614 589 0,0100996600275226 0,0474440622040338 0,0101472495613031 0,0477454795147631 0,00153920032213214 0,00668277794160246 412352 2067649 623 665 0 True 614 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 658 589 0,0100826130303475 0,0499592079305611 0,0100862134737163 0,0494392309452964 0,00164844536627077 0,00654633086378391 411656 2177261 623 665 0 True 658 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 260 628 0,00968631933164994 0,0095221803650807 0,00952162966353857 0,00949111161974517 0,00205696978523026 0,00145316755014568 395476 414984 623 665 0 False 260 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 304 628 0,00986399019013893 0,00949274077847399 0,00958266575112535 0,00949111161974517 0,00185153554914662 0,00124107057457546 402730 413701 623 665 0 False 304 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 349 633 0,00997148914215273 0,0767083650990603 0,00994888227664607 0,0726787212939651 0,00137144428550991 0,0155051607456746 407119 3343010 623 665 0 True 349 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 393 633 0,0102037054930397 0,0799207907615227 0,0101930266269932 0,0802471961547265 0,00135490732791432 0,0232042093833868 416600 3483010 623 665 0 True 393 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 437 628 0,0100881239130549 0,00987341321947579 0,00999465934233616 0,00991836423285267 0,00185264651149665 0,00181202285815416 411881 430291 623 665 0 False 437 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 481 628 0,00980474207783056 0,00991299489281684 0,0098268101014725 0,00985732814526589 0,00182428836581391 0,00188096351671719 400311 432016 623 665 0 False 481 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 525 628 0,00990195404879042 0,00971678452253316 0,00991836423285267 0,0098268101014725 0,00184872345150403 0,00186101174572629 404280 423465 623 665 0 False 525 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 569 628 0,00990080288662485 0,00988307344236077 0,00987258716716258 0,00990310521095598 0,00168629547348106 0,00161636439246118 404233 430712 623 665 0 False 569 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 614 628 0,00991865814659707 0,0103296694471358 0,00987258716716258 0,0101472495613031 0,00143542140187905 0,00237463486611174 404962 450175 623 665 0 False 614 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 658 628 0,00991581698040122 0,00976733433492176 0,00991836423285267 0,00973525597009232 0,00145256609691846 0,0014864729718222 404846 425668 623 665 0 False 658 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 262 677 0,00943764381107665 0,0427694551095064 0,00949111161974517 0,0430304417486839 0,00127473361024573 0,00951112766524232 385323 1863926 623 665 0 True 260 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 304 671 0,00940607257636583 0,00949069859358857 0,0093690394445716 0,00946059357595178 0,0013452265909454 0,00130792703485865 384034 413612 623 665 0 False 304 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 349 671 0,01065665106597 0,00942612883777308 0,00958266575112535 0,009399557488365 0,00602460730866078 0,00130195896956072 435093 410798 623 665 0 False 349 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 393 671 0,0102935451275775 0,00949675631055207 0,00967421988250553 0,00946059357595178 0,0040538637488566 0,00135613470904695 420268 413876 623 665 0 False 393 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 437 671 0,00962111946601751 0,00968658772130601 0,00965896086060884 0,00970473792629892 0,00147029745556046 0,00149193431626146 392814 422149 623 665 0 False 437 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 481 671 0,00951636370895143 0,00963945684765817 0,00958266575112535 0,00973525597009232 0,00160546944020231 0,00158334599525009 388537 420095 623 665 0 False 481 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 525 671 0,00954531421277469 0,00934737851724757 0,00944533455405508 0,0093690394445716 0,00178673175660267 0,0016950037872791 389719 407366 623 665 0 False 525 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 569 671 0,00946857823267461 0,00974420487015203 0,00950637064164187 0,00976577401388571 0,00166191389311567 0,00141606142368089 386586 424660 623 665 0 False 569 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 614 671 0,00964982504172044 0,0097599457558981 0,00961318379491875 0,00975051499198901 0,00130897112733204 0,00158086839854741 393986 425346 623 665 0 False 614 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 659 676 0,00992674077456803 0,0418369108855912 0,00985732814526589 0,0420538643472953 0,00142101071818186 0,00786125767476392 405292 1823285 623 665 0 True 658 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G1_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G1_2.csv new file mode 100755 index 0000000..197382c --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G1_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 261 280 0,00805686153270384 0,679166444378284 0,00798046845197223 0,689646753643091 0,0017481693236946 0,194013422021 328948 29598600 623 665 5 True 260 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 304 281 0,00670385410317671 0,00640573739223316 0,00659189745937285 0,00646982528419928 0,00156560784184263 0,00124313524896645 273707 279167 623 665 0 False 304 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 349 281 0,00626504088278953 0,00636172716065742 0,00630197604333562 0,00636301213092241 0,00128161230541608 0,00138578092921143 255791 277249 623 665 0 True 349 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 393 280 0,00635955864442572 0,00630973175672071 0,00634775310902571 0,00628671702143893 0,00129267350941272 0,00127088208251504 259650 274983 623 665 0 True 393 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 437 280 0,00635282312111659 0,00636255321297063 0,00633249408712902 0,0063935301747158 0,0015638493052751 0,00158232135511997 259375 277285 623 665 0 True 437 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 481 281 0,00710847535796551 0,00723447437545569 0,00711070420386053 0,00727855344472419 0,00169429930877874 0,00167799354966331 290227 315284 623 665 0 True 481 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 525 281 0,00695468499120892 0,0070226149030163 0,00694285496299687 0,00703440909437705 0,00145221097516274 0,00147636641594258 283948 306051 623 665 0 True 525 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 569 280 0,00742066074014094 0,00739433844395837 0,00741588464179446 0,00740062561989776 0,00164321861461887 0,00161384492407014 302973 322251 623 665 0 True 569 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 614 281 0,00818500792526165 0,00812199874830129 0,00825513084611276 0,00817883573662928 0,00199948905532951 0,00184916048160522 334180 353963 623 665 0 False 614 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 657 281 0,00986795802568831 0,674443765628307 0,0098268101014725 0,679896238651102 0,00194166946358412 0,190596499527181 402892 29392782 623 665 4 True 658 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 260 324 0,00666694343544264 0,00641888539155166 0,00669871061264973 0,00642404821850919 0,00158511237397774 0,00136022950150384 272200 279740 623 665 0 False 260 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 304 325 0,0064728623928914 0,00618499785742681 0,00653086137178607 0,00624093995574884 0,00123011311186039 0,00113184939858286 264276 269547 623 665 0 False 304 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 349 325 0,00640979340190586 0,00649843881849279 0,00645456626230259 0,00653086137178607 0,0012254644963757 0,00134036685280551 261701 283207 623 665 0 True 349 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 393 325 0,00649218722158561 0,00644933459765229 0,00650034332799268 0,00650034332799268 0,00128545718566753 0,00124052037454824 265065 281067 623 665 0 True 393 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 438 325 0,00674679000267094 0,00680527136105312 0,00675974670023652 0,00683604180972 0,0015018634304872 0,00161727889385956 275460 296579 623 665 0 True 437 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 482 326 0,00722770636694323 0,00759961244378972 0,0072632944228275 0,00759899290455482 0,00151594696916285 0,0015078078363295 295095 331197 623 665 0 True 481 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 525 325 0,00702720820763928 0,0069987970613189 0,00706492713817044 0,00711070420386053 0,00149882483397849 0,00159200475085097 286909 305013 623 665 0 True 525 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 570 325 0,00728249678746154 0,00721269871864371 0,0072632944228275 0,00720225833524071 0,00166654744467799 0,00157865854682378 297332 314335 623 665 0 True 569 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 614 325 0,00773284612231637 0,00760390332663887 0,00781261921110857 0,00761425192645151 0,00198487560974793 0,00202582762278699 315719 331384 623 665 0 False 614 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 658 325 0,00787495341773311 0,00772131748460187 0,00791943236438544 0,00761425192645151 0,00196392876052087 0,00176049374599065 321521 336501 623 665 0 False 658 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 261 370 0,00623339616964261 0,00627462453340951 0,00625619897764553 0,00625619897764553 0,0013961576712981 0,00146308950973086 254499 273453 623 665 0 True 260 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 305 370 0,0065392868991255 0,00638627927107767 0,00650034332799268 0,00636301213092241 0,00128501475238718 0,00137448143826546 266988 278319 623 665 0 True 304 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 349 370 0,00670236004164268 0,0067217482938291 0,00671396963454643 0,0068207827878233 0,00117551366649746 0,00140134144447166 273646 292939 623 665 0 True 349 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 393 369 0,00673500896008296 0,00683262287097923 0,00671396963454643 0,00683604180972 0,00130484815016684 0,00131599207429292 274979 297771 623 665 0 True 393 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 437 369 0,00694082205959811 0,00703913594928039 0,00698863202868696 0,00712596322575723 0,00154777281329212 0,00165136434126414 283382 306771 623 665 0 True 437 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 481 368 0,00740143388269486 0,00756730461998439 0,00749217975127794 0,00746166170748455 0,0017676895700858 0,00172749797423417 302188 329789 623 665 0 False 481 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 525 368 0,0074144395658845 0,00717777506251323 0,00741588464179446 0,00711070420386053 0,0016826245382489 0,00164772374540239 302719 312813 623 665 0 False 525 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 570 369 0,00721455372688139 0,00727967779370605 0,0072480354009308 0,00740062561989776 0,00170838899826036 0,00179019774827024 294558 317254 623 665 0 True 569 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 614 368 0,00728553389615366 0,0071751133383929 0,00720225833524071 0,00720225833524071 0,00191801592673167 0,00195320181488344 297456 312697 623 665 0 True 614 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 657 369 0,00665717080344139 0,00675713086791137 0,00663767452506294 0,00672922865644312 0,00193938348179565 0,00179489565127788 271801 294481 623 665 0 True 658 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 261 414 0,00610757659422795 0,00621700738456349 0,00613412680247196 0,00617990386816205 0,00140484288941619 0,00152139505527054 249362 270942 623 665 0 True 260 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 305 414 0,0062773362744302 0,00653012710306322 0,00624093995574884 0,00651560234988937 0,00149110948187872 0,00135755571301083 256293 284588 623 665 0 True 304 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 349 414 0,00674759826546804 0,00679384430405379 0,00677500572213321 0,00671396963454643 0,00135835757642965 0,0012797188683234 275493 296081 623 665 0 True 349 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 394 413 0,0067340782332257 0,00692110225208248 0,00671396963454643 0,0068207827878233 0,00139402219931857 0,00141440076877887 274941 301627 623 665 0 True 393 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 438 413 0,00708099442286424 0,00699363423436137 0,00712596322575723 0,00697337300679027 0,00154208296322376 0,00156421967869132 289105 304788 623 665 0 True 437 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 482 413 0,00720269920585731 0,00733353181534748 0,00721751735713741 0,00733958953231098 0,00156458440040352 0,0016090746335856 294074 319601 623 665 0 True 481 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 525 413 0,0072038013823988 0,0076376796878899 0,00727855344472419 0,00764476997024491 0,00161790736829844 0,00163646092305224 294119 332856 623 665 0 True 525 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 570 414 0,00685490127498558 0,00700157351492717 0,00692759594110018 0,00712596322575723 0,00176190404360691 0,00172722803923911 279874 305134 623 665 0 True 569 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 614 414 0,00654981880829978 0,00653678141336404 0,00653086137178607 0,00662241550316625 0,00184060642382263 0,00173063494837732 267418 284878 623 665 0 True 614 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 658 413 0,00622418687231811 0,00632974057941833 0,00627145799954223 0,00633249408712902 0,00172723078137611 0,00178828793460049 254123 275855 623 665 0 True 658 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 262 458 0,00622568093385214 0,00628575329374019 0,00624093995574884 0,00631723506523232 0,00144139224718302 0,00140781039165881 254184 273938 623 665 0 True 260 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 305 457 0,00651273669088148 0,00658948814012601 0,00651560234988937 0,00665293354695964 0,00143833575897215 0,00146135217153076 265904 287175 623 665 0 True 304 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 350 457 0,00651014045280596 0,00674909980375521 0,0063782711528191 0,00674448767833982 0,00146709264074737 0,00153633834904084 265798 294131 623 665 0 True 349 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 393 457 0,00657311147254337 0,00678741945272887 0,00656137941557946 0,00677500572213321 0,00147087679730724 0,00140427724836319 268369 295801 623 665 0 True 393 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 438 457 0,00692558753051345 0,00698622270944011 0,00691233691920348 0,00704966811627375 0,00175526859824625 0,00192138310552792 282760 304465 623 665 0 True 437 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 482 458 0,0069951471166878 0,00701942542325142 0,00694285496299687 0,00688181887541009 0,00182779155357558 0,00202110207000713 285600 305912 623 665 0 True 481 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 526 457 0,00698204346225003 0,00726019672665298 0,00704966811627375 0,00729381246662089 0,00170781085138777 0,00165177004612358 285065 316405 623 665 0 True 525 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 569 454 0,00640450295450668 0,00632671172093658 0,0063935301747158 0,00642404821850919 0,0018017522847148 0,00190107367312356 261485 275723 623 665 0 False 569 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 615 457 0,00617889966286869 0,0061422037584233 0,00613412680247196 0,00613412680247196 0,00174825016841712 0,0017284092525119 252274 267682 623 665 0 True 614 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 659 457 0,0060750256470358 0,00619302892158297 0,00611886778057527 0,00616464484626535 0,00186467208418794 0,00188783000315413 248033 269897 623 665 0 True 658 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 260 502 0,00629384442974059 0,00665979437033876 0,00631723506523232 0,00643930724040589 0,00131385259701431 0,00228620735995977 256967 290239 623 665 0 True 260 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 305 502 0,0065681884173247 0,0063283408796654 0,00657663843747616 0,0063935301747158 0,00153454595236847 0,00137609703946971 268168 275794 623 665 0 True 304 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 348 502 0,00652941629587611 0,00648416647019242 0,00662241550316625 0,0064087891966125 0,00144661101558306 0,00145233056614498 266585 282585 623 665 0 True 349 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 393 502 0,00671764355635141 0,00671419909352232 0,00669871061264973 0,00679026474402991 0,00157898880505048 0,00145991718580609 274270 292610 623 665 0 True 393 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 437 501 0,00682898787985443 0,00690478771889669 0,00691233691920348 0,00697337300679027 0,00181469966179688 0,00183118054962241 278816 300916 623 665 0 True 437 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 482 502 0,00649892274489475 0,00670974758939005 0,00660715648126955 0,00672922865644312 0,00175664815581716 0,00160791505800443 265340 292416 623 665 0 True 481 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 526 502 0,00659841254737369 0,00634378346874281 0,00662241550316625 0,00630197604333562 0,00162254909637758 0,00150883271704955 269402 276467 623 665 0 True 525 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 570 502 0,00647709964937315 0,00643006004367752 0,00650034332799268 0,00645456626230259 0,00176356322346726 0,00158297192932906 264449 280227 623 665 0 True 569 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 614 501 0,00628382686961901 0,0060916310001371 0,00628671702143893 0,00613412680247196 0,00173836724064335 0,00170912991541732 256558 265478 623 665 0 True 614 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 658 502 0,00622007207989653 0,00640417707119711 0,00621042191195544 0,0064087891966125 0,00177651716058426 0,00196680493069235 253955 279099 623 665 0 True 658 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 261 546 0,00633136741777549 0,00633995150384545 0,00628671702143893 0,0063782711528191 0,00135337551851324 0,0013242859528657 258499 276300 623 665 0 True 260 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 304 545 0,00629911038432773 0,00663439326170771 0,00627145799954223 0,00666819256885634 0,00143990329564769 0,00144841186093899 257182 289132 623 665 0 True 304 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 348 546 0,00663260451297207 0,00658421058368053 0,00665293354695964 0,00653086137178607 0,00135352678820204 0,00147295445837504 270798 286945 623 665 0 True 349 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 393 546 0,00651246726994912 0,00660233784277586 0,00656137941557946 0,00659189745937285 0,00146314213330014 0,00144373270411353 265893 287735 623 665 0 True 393 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 437 545 0,00652588933094332 0,00655463332168829 0,00659189745937285 0,00660715648126955 0,00188956646784699 0,00194137708972614 266441 285656 623 665 0 True 437 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 482 546 0,00635101065302613 0,00648221606889735 0,00642404821850919 0,00643930724040589 0,0019314232672882 0,00199845734911475 259301 282500 623 665 0 True 481 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 526 546 0,00618661489865915 0,00643662257038798 0,00613412680247196 0,00648508430609598 0,00176455665046479 0,00185015804691 252589 280513 623 665 0 True 525 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 570 546 0,00632206014920286 0,00676507014847717 0,0063935301747158 0,00679026474402991 0,00170800887378544 0,00165307756244474 258119 294827 623 665 0 True 569 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 614 546 0,00632551363569955 0,00645722798642291 0,0063782711528191 0,0064087891966125 0,0016367523096775 0,0015708804867384 258260 281411 623 665 0 True 614 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 658 546 0,0063070460554265 0,00647514873243993 0,00633249408712902 0,00656137941557946 0,00163591381219819 0,00184294082374768 257506 282192 623 665 0 True 658 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 261 590 0,0065898645559741 0,00643090904188831 0,00660715648126955 0,00645456626230259 0,00124369956627304 0,00120510825980413 269053 280264 623 665 0 True 260 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 305 590 0,00683182904605028 0,00659077311039099 0,00679026474402991 0,00662241550316625 0,00137207595807886 0,00140102249382207 278932 287231 623 665 0 True 304 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 348 589 0,00659329354965875 0,00660890036948632 0,00660715648126955 0,00662241550316625 0,001290113819076 0,00142678076547737 269193 288021 623 665 0 True 349 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 393 590 0,00627983454125759 0,00629901602254664 0,00625619897764553 0,00625619897764553 0,00139125685214429 0,00131632811231864 256395 274516 623 665 0 True 393 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 438 589 0,00621882294648284 0,00636546734196443 0,00624093995574884 0,00642404821850919 0,00179818099268084 0,00186173004635364 253904 277412 623 665 0 True 437 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 482 590 0,00625041867400569 0,00661449916849804 0,0064087891966125 0,00654612039368277 0,00184818655469344 0,00188102218450748 255194 288265 623 665 0 True 481 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 526 590 0,00623655574239489 0,00644318509709843 0,00619516289005875 0,0063782711528191 0,0018249038483061 0,00197730290326788 254628 280799 623 665 0 True 525 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 571 589 0,00659108919657576 0,0066273259252503 0,00665293354695964 0,00669871061264973 0,00175260590259167 0,00173377497235734 269103 288824 623 665 0 True 569 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 614 589 0,00652547295313876 0,00647854472528311 0,00654612039368277 0,00646982528419928 0,00149623744085748 0,00144228598340538 266424 282340 623 665 0 True 614 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 658 589 0,00624809185686254 0,00626292212563912 0,00628671702143893 0,00628671702143893 0,00157011071149156 0,0015427485346566 255099 272943 623 665 0 True 658 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 260 628 0,0066472267217559 0,0065472906344598 0,00660715648126955 0,00651560234988937 0,00131595573254367 0,00142758051755321 271395 285336 623 665 0 False 260 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 304 628 0,0066461980236505 0,00657461919848832 0,00659189745937285 0,00657663843747616 0,00132082162561861 0,00122783039508838 271353 286527 623 665 0 False 304 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 349 633 0,00641562269116977 0,00629630840663113 0,0063935301747158 0,00627145799954223 0,00125056726538058 0,00132372414286486 261939 274398 623 665 0 True 349 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 393 633 0,00626371827093973 0,00611046958205768 0,00622568093385214 0,00607309071488518 0,00126470525161131 0,00148516789114922 255737 266299 623 665 0 True 393 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 437 628 0,00613329404686283 0,00601925963914134 0,00610360875867857 0,00602731364919509 0,00164449749668817 0,00166091578736595 250412 262324 623 665 0 False 437 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 481 628 0,00638699059390293 0,00629704267535398 0,0064087891966125 0,00634775310902571 0,00181774389412255 0,00170365643884724 260770 274430 623 665 0 False 481 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 525 628 0,00605508849804076 0,00607132388077082 0,00608834973678187 0,00608834973678187 0,00186192525970477 0,00174298065090292 247219 264593 623 665 0 False 525 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 569 628 0,0063068990985543 0,00627455569571675 0,00636301213092241 0,00628671702143893 0,00166443637464953 0,00154027385793921 257500 273450 623 665 0 False 569 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 614 628 0,00657433611314504 0,00691821106898627 0,00653086137178607 0,00675974670023652 0,00134852634327095 0,00215110629115841 268419 301501 623 665 0 False 614 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 658 628 0,00657661394466413 0,0065103247934439 0,00653086137178607 0,00650034332799268 0,00140625656578002 0,00141836635898886 268512 283725 623 665 0 False 658 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 262 677 0,00825451852581193 0,683923335461565 0,00785839627679866 0,684336614023041 0,00233825399473442 0,20513936108615 337018 29805909 623 665 8 True 260 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 304 671 0,00739242052786664 0,00667877062764487 0,00686655985351339 0,00663767452506294 0,00287111538126883 0,00130396387786993 301820 291066 623 665 0 False 304 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 349 671 0,00612288460174871 0,00619204224798664 0,00611886778057527 0,00617990386816205 0,00118934848036936 0,00120931774839082 249987 269854 623 665 0 False 349 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 393 671 0,00605195341810051 0,00602359641378567 0,00599679560540169 0,00599679560540169 0,00125687888603801 0,00127814704260689 247091 262513 623 665 0 False 393 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 437 671 0,00598224687505396 0,00602084290607498 0,00605783169298848 0,00610360875867857 0,0014349312920622 0,00142786760844793 244245 262393 623 665 0 False 437 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 481 671 0,00615296177492551 0,00591402975279811 0,00617990386816205 0,00592050049591821 0,00165801799131642 0,00145346837142852 251215 257738 623 665 0 False 481 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 525 671 0,00581650401602516 0,0059259616195444 0,00585946440833143 0,00592050049591821 0,00158370189911793 0,00163519096051841 237478 258258 623 665 0 False 525 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 569 671 0,00608558204902212 0,00614947760795901 0,00614938582436866 0,00614938582436866 0,00147179324472185 0,0014310344040493 248464 267999 623 665 0 False 569 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 614 671 0,00659148108156829 0,00657916248621095 0,00660715648126955 0,00659189745937285 0,00142613227409016 0,00134369500781459 269119 286725 623 665 0 False 614 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 659 676 0,00843456518706814 0,681673949120914 0,00828564888990616 0,68226138704509 0,0018562175073886 0,183481906318653 344369 29707879 623 665 2 True 658 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G1_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G1_3.csv new file mode 100755 index 0000000..e0114e8 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G1_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 261 280 0,00102355461486829 0,0673883151458413 0,000869764248111696 0,0683604180972 0,000795701707780824 0,0201021693680187 41790 2936835 623 665 0 True 260 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 304 281 0,000886443853106319 0,000909208246067217 0,000778210116731518 0,000793469138628214 0,000631304955005414 0,000647742178736028 36192 39624 623 665 0 False 304 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 349 281 0,000872997299300081 0,000866184688087809 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000658229322684588 0,000678365402155822 35643 37749 623 665 0 True 349 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 393 280 0,00091458609413249 0,00091333850763324 0,000778210116731518 0,000793469138628214 0,000721386811525214 0,000664419083979166 37341 39804 623 665 0 True 393 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 437 280 0,000849753620680555 0,00102313462759669 0,000625619897764553 0,000762951094834821 0,000795145499671717 0,000924808962230823 34694 44589 623 665 0 True 437 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 481 281 0,000955856482408466 0,000879745713562919 0,000747692072938125 0,000564583810177768 0,000856009156230086 0,000885646635136629 39026 38340 623 665 0 True 481 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 525 281 0,00099634310069938 0,00099550776689951 0,000762951094834821 0,000823987182421607 0,000832368643729743 0,000843603064809789 40679 43385 623 665 0 True 525 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 569 280 0,000976210009208073 0,000937684104975187 0,000717174029144732 0,000671396963454643 0,000888389410269939 0,000839359186829996 39857 40865 623 665 0 True 569 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 614 281 0,000952770388092281 0,000963727698738721 0,000564583810177768 0,000625619897764553 0,000992233973633874 0,00097292835671006 38900 42000 623 665 0 False 614 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 657 281 0,00114800259280908 0,0668778836539736 0,000854505226215 0,0668039978637369 0,00103603390229325 0,0194970153890362 46871 2914590 623 665 0 True 658 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 260 324 0,000879414416052785 0,000896496218802901 0,000717174029144732 0,000732433051041428 0,000728033795361184 0,000723764145186756 35905 39070 623 665 0 False 260 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 304 325 0,000933592516270269 0,000839383879703837 0,00080872816052491 0,000732433051041428 0,000690581072033169 0,000600121995045022 38117 36581 623 665 0 False 304 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 349 325 0,000827955017970988 0,000865748716033618 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000633106603883908 0,000640511392373609 33804 37730 623 665 0 True 349 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 393 325 0,000862195969193431 0,0009121682668562 0,000701915007248035 0,00080872816052491 0,00068638616849951 0,000651857511415076 35202 39753 623 665 0 True 393 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 438 325 0,000834910976588423 0,000967995635690279 0,000579842832074464 0,000671396963454643 0,000783725399222991 0,000915267004247399 34088 42186 623 665 0 True 437 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 482 326 0,000891562850821262 0,00100817390236865 0,000656137941557946 0,000823987182421607 0,000840621033501207 0,000835796955856986 36401 43937 623 665 0 True 481 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 525 325 0,00099702889943631 0,000990689128405816 0,000778210116731518 0,000747692072938125 0,000868151137822493 0,000883430705410818 40707 43175 623 665 0 True 525 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 570 325 0,000904152156206338 0,000968454553642059 0,000701915007248035 0,000732433051041428 0,000892210163433285 0,000847560777340387 36915 42206 623 665 0 True 569 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 614 325 0,000915075950373154 0,00094064412576417 0,000381475547417411 0,000488288700694286 0,00108758887434729 0,00107830681563935 37361 40994 623 665 0 False 614 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 658 325 0,00105203975526292 0,000892526578520001 0,000671396963454643 0,000549324788281071 0,00107103735151683 0,000911047076223949 42953 38897 623 665 0 False 658 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 261 370 0,000902364180927913 0,00092173670615082 0,000732433051041428 0,000778210116731518 0,00074886141583311 0,000770169315974373 36842 40170 623 665 0 True 260 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 305 370 0,000897490111333302 0,000872907836081391 0,000793469138628214 0,000793469138628214 0,000666428566052882 0,000680497164244213 36643 38042 623 665 0 True 304 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 349 370 0,000875250638007138 0,000916413257910168 0,000732433051041428 0,000778210116731518 0,000676119010347161 0,000714608489825215 35735 39938 623 665 0 True 349 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 393 369 0,000920341904960297 0,000917675282277564 0,000747692072938125 0,000762951094834821 0,000737101488786385 0,000697240425103063 37576 39993 623 665 0 True 393 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 437 369 0,000841401571777227 0,000866941902708247 0,000595101853971161 0,000579842832074464 0,000793752538108919 0,000854511013811298 34353 37782 623 665 0 True 437 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 481 368 0,000923746405832914 0,000938969075240172 0,000656137941557946 0,000610360875867857 0,000868493961934048 0,000900764885819021 37715 40921 623 665 0 False 481 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 525 368 0,000965506650349555 0,00100234564438104 0,000686655985351339 0,000732433051041428 0,000904981585800955 0,000911353011477983 39420 43683 623 665 0 False 525 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 570 369 0,000948753566918832 0,00097100154827444 0,000671396963454643 0,000686655985351339 0,000965593091443151 0,00096573700215849 38736 42317 623 665 0 True 569 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 614 368 0,000980471758501853 0,000926050534897555 0,000549324788281071 0,000488288700694286 0,0010640243127837 0,00105997303076149 40031 40358 623 665 0 True 614 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 657 369 0,00088264746724117 0,000841999712028985 0,000503547722590982 0,0004272526131075 0,000937439286012983 0,000961755589881394 36037 36695 623 665 0 True 658 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 261 414 0,000836429530934483 0,000881833790243519 0,000671396963454643 0,000686655985351339 0,00069996025405642 0,000811748984302952 34150 38431 623 665 0 True 260 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 305 414 0,000835474311265187 0,000950671483010571 0,000686655985351339 0,000854505226215 0,000703596589612343 0,000679960167918599 34111 41431 623 665 0 True 304 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 349 414 0,000880932970398845 0,000907211952976972 0,000762951094834821 0,000823987182421607 0,000696483271373765 0,000680047341157196 35967 39537 623 665 0 True 349 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 394 413 0,000918553929681871 0,000934196328541656 0,000762951094834821 0,000793469138628214 0,000752838276339758 0,00073876908357729 37503 40713 623 665 0 True 393 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 438 413 0,000927567284510097 0,000954641123293471 0,000686655985351339 0,000701915007248035 0,000819186675478644 0,000837660743108832 37871 41604 623 665 0 True 437 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 482 413 0,000928228590434994 0,000940690017559348 0,000671396963454643 0,000747692072938125 0,000878523439692392 0,000800527510561002 37898 40996 623 665 0 True 481 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 525 413 0,0009195336421632 0,00104848984443255 0,000656137941557946 0,000823987182421607 0,000856569827646835 0,000885066814979812 37543 45694 623 665 0 True 525 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 570 414 0,000949439365655763 0,000918294821512467 0,000686655985351339 0,000686655985351339 0,000920613082359309 0,000863704208269942 38764 40020 623 665 0 True 569 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 614 414 0,00090287852998061 0,000820338784704953 0,000488288700694286 0,000473029678797589 0,000995509753634914 0,000860240275749788 36863 35751 623 665 0 True 614 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 658 413 0,000927003949833333 0,000935871379065655 0,000473029678797589 0,000534065766384375 0,00100669242746488 0,000994768204034356 37848 40786 623 665 0 True 658 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 262 458 0,000920317412148263 0,000878024771243742 0,000778210116731518 0,000717174029144732 0,00075485934836215 0,000761059180326396 37575 38265 623 665 0 True 260 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 305 457 0,000851247682214581 0,000837135181740114 0,000732433051041428 0,000686655985351339 0,000728002937658419 0,000770688971451636 34755 36483 623 665 0 True 304 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 350 457 0,000881177898519177 0,00087224240505131 0,000778210116731518 0,000701915007248035 0,000718647408971896 0,000772705558067458 35977 38013 623 665 0 True 349 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 393 457 0,000908928254552816 0,000882338599990478 0,000747692072938125 0,000732433051041428 0,00076256915275464 0,000772623527926543 37110 38453 623 665 0 True 393 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 438 457 0,000878655138879755 0,000866804227322713 0,000518806744487678 0,000473029678797589 0,000916982294701215 0,00101624303324607 35874 37776 623 665 0 True 437 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 482 458 0,000927028442645366 0,000916092015343922 0,000610360875867857 0,000579842832074464 0,00094405433967368 0,00100081390837462 37849 39924 623 665 0 True 481 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 526 457 0,000937339916511352 0,00100250626566416 0,000610360875867857 0,000701915007248035 0,000965958786674845 0,00094098838948522 38270 43690 623 665 0 True 525 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 569 454 0,000915051457561121 0,000931328091343029 0,000610360875867857 0,000488288700694286 0,000950724669686735 0,000995000241772293 37360 40588 623 665 0 False 569 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 615 457 0,000917304796268177 0,000918340713307645 0,000579842832074464 0,000564583810177768 0,000916111753088707 0,000944214414261633 37452 40022 623 665 0 True 614 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 659 457 0,000889456468986405 0,000904435499368701 0,000488288700694286 0,000473029678797589 0,000929383776848968 0,0009951880514662 36315 39416 623 665 0 True 658 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 260 502 0,000920586833080629 0,000935940216758422 0,000793469138628214 0,000762951094834821 0,000763707519443372 0,000809032795958301 37586 40789 623 665 0 True 260 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 305 502 0,000797951323230293 0,000981327202189498 0,000686655985351339 0,000854505226215 0,000715576111222666 0,000821334054794446 32579 42767 623 665 0 True 304 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 348 502 0,000938050208060315 0,000889727179014141 0,00080872816052491 0,00080872816052491 0,000800832126797109 0,000747363922477168 38299 38775 623 665 0 True 349 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 393 502 0,000923819884269014 0,000874445211219855 0,000686655985351339 0,000656137941557946 0,000831887389889762 0,000769481410676861 37718 38109 623 665 0 True 393 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 437 501 0,00084637361261997 0,00105101389316734 0,000534065766384375 0,000717174029144732 0,000895134895266355 0,00105942233553492 34556 45804 623 665 0 True 437 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 482 502 0,000884043557527064 0,000908060951187766 0,000518806744487678 0,000610360875867857 0,00090387027839242 0,000856417059398308 36094 39574 623 665 0 True 481 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 526 502 0,000978781754471561 0,00101817831371746 0,000610360875867857 0,000747692072938125 0,0009811474379054 0,000892163122305022 39962 44373 623 665 0 True 525 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 570 502 0,000914071745079792 0,00095629322791988 0,000595101853971161 0,000595101853971161 0,000906958443731759 0,000935878568407561 37320 41676 623 665 0 True 569 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 614 501 0,0008905586455279 0,00101193702957325 0,000503547722590982 0,000701915007248035 0,000929218405226389 0,000961293439368387 36360 44101 623 665 0 True 614 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 658 502 0,000953725607761576 0,000868525169641889 0,000579842832074464 0,000366216525520714 0,000959491491013204 0,000996583093798463 38939 37851 623 665 0 True 658 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 261 546 0,000939103398977743 0,000880089902026754 0,00080872816052491 0,000686655985351339 0,000714329707387606 0,000742680679844461 38342 38355 623 665 0 True 260 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 304 545 0,000903294907785175 0,000862719857551868 0,00080872816052491 0,000747692072938125 0,000698080116087472 0,000707760148614405 36880 37598 623 665 0 True 304 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 348 546 0,000879120502308386 0,000902989907820593 0,000747692072938125 0,000793469138628214 0,000703173069147464 0,000725912020736074 35893 39353 623 665 0 True 349 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 393 546 0,000882451524744904 0,00089137928364055 0,00064087891966125 0,000686655985351339 0,000760450518983674 0,000783806479009935 36029 38847 623 665 0 True 393 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 437 545 0,000881177898519177 0,000835161834547458 0,000473029678797589 0,000381475547417411 0,000966521739586232 0,000967524217841133 35977 36397 623 665 0 True 437 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 482 546 0,000906038102732896 0,000915105341747594 0,000488288700694286 0,000473029678797589 0,000990569025468249 0,00104776370890385 36992 39881 623 665 0 True 481 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 526 546 0,000980569729749986 0,000980684717057005 0,000595101853971161 0,000579842832074464 0,00100836314361813 0,00104378258173591 40035 42739 623 665 0 True 525 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 570 546 0,00100687500987366 0,000882889301532614 0,000701915007248035 0,000564583810177768 0,000949836523725139 0,000866462829538811 41109 38477 623 665 0 True 569 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 614 546 0,000886394867482253 0,000911778186597187 0,000610360875867857 0,000656137941557946 0,000872861578451124 0,000830284196426058 36190 39736 623 665 0 True 614 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 658 546 0,00100966719044545 0,000931052740571961 0,000686655985351339 0,000549324788281071 0,000986972717616239 0,000984740849821757 41223 40576 623 665 0 True 658 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 261 590 0,00096516375098109 0,000896243813929422 0,000854505226215 0,000793469138628214 0,00068965130086746 0,000616858817667628 39406 39059 623 665 0 True 260 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 305 590 0,000896094021047408 0,000852508933124755 0,000717174029144732 0,000732433051041428 0,000767377348379453 0,000705738458678884 36586 37153 623 665 0 True 304 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 348 589 0,000919215235606768 0,0008983777824052 0,000823987182421607 0,000701915007248035 0,000705355240252509 0,000782166022204365 37530 39152 623 665 0 True 349 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 393 590 0,000896191992295541 0,000882155032809765 0,000747692072938125 0,000747692072938125 0,000735048661117133 0,000640303785937416 36590 38445 623 665 0 True 393 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 438 589 0,000886811245286818 0,00087410102275602 0,000534065766384375 0,000442511635004196 0,000920370083386624 0,000976921042546111 36207 38094 623 665 0 True 437 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 482 590 0,00090804651331962 0,000854711739293301 0,000625619897764553 0,000473029678797589 0,000934631139114134 0,000945943673256847 37074 37249 623 665 0 True 481 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 526 590 0,000913238989470663 0,000915243017133128 0,000473029678797589 0,000488288700694286 0,00102643567330865 0,00103929573764602 37286 39887 623 665 0 True 525 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 571 589 0,000938736006797245 0,000920520573578602 0,000656137941557946 0,000503547722590982 0,00087968154632186 0,00098587076254983 38327 40117 623 665 0 True 569 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 614 589 0,000889236033678106 0,000909965460687654 0,000701915007248035 0,000656137941557946 0,000768300313052075 0,000767386084384568 36306 39657 623 665 0 True 614 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 658 589 0,000850194491297153 0,000878736094069002 0,00064087891966125 0,000579842832074464 0,000793760709499576 0,00085383894205909 34712 38296 623 665 0 True 658 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 260 628 0,000976601894200604 0,000851820556197085 0,000885023270008392 0,000747692072938125 0,000731174927521622 0,000667135427078746 39873 37123 623 665 0 False 260 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 304 628 0,000982798575645009 0,000873320862237994 0,000869764248111696 0,000747692072938125 0,000713239027540509 0,000648222386643662 40126 38060 623 665 0 False 304 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 349 633 0,000900894612205919 0,00091730814791614 0,000747692072938125 0,00080872816052491 0,000722481575308641 0,000683235944627098 36782 39977 623 665 0 True 349 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 393 633 0,000832878073189666 0,000905881090916809 0,000747692072938125 0,000793469138628214 0,000622649962663383 0,000680778986756976 34005 39479 623 665 0 True 393 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 437 628 0,000875152666759005 0,000914531694307868 0,000625619897764553 0,000595101853971161 0,000814421257941301 0,000930419221997508 35731 39856 623 665 0 False 437 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 481 628 0,000874246432713775 0,0008306873845176 0,000564583810177768 0,000457770656900893 0,000923808934583345 0,000916526268881302 35694 36202 623 665 0 False 481 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 525 628 0,000905817667424597 0,000816185577241341 0,000595101853971161 0,000381475547417411 0,000943849661789522 0,000926351963027139 36983 35570 623 665 0 False 525 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 569 628 0,000946696170708042 0,000924031295909722 0,000717174029144732 0,000686655985351339 0,000848512099920803 0,000822640801717391 38652 40270 623 665 0 False 569 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 614 628 0,000959309968905151 0,000931006848776783 0,000793469138628214 0,000732433051041428 0,000747789589724162 0,000723834001884638 39167 40574 623 665 0 False 614 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 658 628 0,000943267177023391 0,000946380600161424 0,000747692072938125 0,000778210116731518 0,000785118635089527 0,000756301237946467 38512 41244 623 665 0 False 658 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 262 677 0,00104554916007412 0,06847576712438 0,000930800335698482 0,0679942015716793 0,000746930533292771 0,0219749353922547 42688 2984227 623 665 0 True 260 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 304 671 0,00100467065679068 0,000888992910291292 0,000823987182421607 0,000762951094834821 0,00075575726157489 0,000670021928967778 41019 38743 623 665 0 False 304 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 349 671 0,000923060607095984 0,000963108159503818 0,000793469138628214 0,000839246204318303 0,000690619110728498 0,00069477313998507 37687 41973 623 665 0 False 349 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 393 671 0,000782569837273431 0,000938372481902857 0,000671396963454643 0,000854505226215 0,000584336973444655 0,000660678655602226 31951 40895 623 665 0 False 393 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 437 671 0,000892273142370226 0,000893788602887397 0,000686655985351339 0,000762951094834821 0,000752985864459546 0,000747523838435343 36430 38952 623 665 0 False 437 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 481 671 0,000890901544896365 0,000834588187107733 0,000610360875867857 0,000625619897764553 0,000846211234705953 0,000689063133024969 36374 36372 623 665 0 False 481 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 525 671 0,000908462891124185 0,000843789492040929 0,000549324788281071 0,000518806744487678 0,000910449988768252 0,000838783413707735 37091 36773 623 665 0 False 525 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 569 671 0,00087108685996149 0,000970129604166057 0,000656137941557946 0,000747692072938125 0,000784210372218417 0,000811765011471569 35565 42279 623 665 0 False 569 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 614 671 0,00100952023357325 0,000923251135391695 0,000869764248111696 0,000717174029144732 0,00076854076307426 0,000719334823940057 41217 40236 623 665 0 False 614 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 659 676 0,00097603855952384 0,0675546958492592 0,00080872816052491 0,0680399786373693 0,00079428339488723 0,0187075688108498 39850 2944086 623 665 0 True 658 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G2_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G2_1.csv new file mode 100755 index 0000000..d10798a --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G2_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 283 263 0,0104074611963441 0,0442712182149124 0,0103150988021668 0,0441443503471428 0,00195704082144082 0,0100383564035197 424919 1929374 623 665 0 True 283 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 327 264 0,0100927040689051 0,0100038606472694 0,0100709544518196 0,00999465934233616 0,00133530891983208 0,0013763493503789 412068 435976 623 665 0 False 327 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 372 263 0,0103172786624377 0,0596574521678424 0,0103303578240635 0,058960860608835 0,00136287186158103 0,0125222765608198 421237 2599918 623 665 0 True 371 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 416 262 0,0104933329953325 0,0737237463078617 0,0104676890211337 0,0736400396734569 0,00158310752730406 0,0116428812242355 428425 3212938 623 665 0 True 415 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 460 262 0,0103564181760668 0,0638315403982605 0,0102693217364767 0,0614938582436866 0,00166130135820622 0,0136634134980359 422835 2781828 623 665 0 True 459 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 503 263 0,0102184011802596 0,0585999675315549 0,0102845807583734 0,0615396353093767 0,00169932751918574 0,0166579698877008 417200 2553832 623 665 0 True 504 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 548 263 0,0103301618815672 0,0717552865913927 0,0103456168459602 0,0701609826810101 0,00156735173079781 0,0209443696827352 421763 3127151 623 665 0 True 548 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 592 263 0,0101653252565836 0,0653488149304366 0,01025406271458 0,0648508430609598 0,00189476857909436 0,0188762601894306 415033 2847952 623 665 0 True 592 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 636 264 0,0102246223545161 0,00999757347132996 0,0102693217364767 0,0100556954299229 0,00182505409436949 0,00183191181415195 417454 435702 623 665 0 False 636 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 679 263 0,0100502825184636 0,0438288672011913 0,0100862134737163 0,0435339894712749 0,00169636128072121 0,00909701682846182 410336 1910096 623 665 0 True 680 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 283 307 0,0101104123720052 0,0102220990792385 0,0100709544518196 0,0102693217364767 0,00134453028479403 0,00136681400332599 412791 445487 623 665 0 False 283 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 327 307 0,00995823853084276 0,0100759107656989 0,00997940032043946 0,0100709544518196 0,0013531428643502 0,00135722649556311 406578 439116 623 665 0 False 327 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 372 308 0,0103266594094465 0,0965488337460727 0,0103608758678569 0,0934767681391623 0,00136201464825546 0,0218552875213995 421620 4207673 623 665 0 True 371 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 416 307 0,0103209525842427 0,045769149355421 0,0103456168459602 0,0469672693980316 0,00155143893823598 0,00823764275400206 421387 1994655 623 665 0 True 415 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 460 307 0,0104845155830006 0,0788929981167154 0,0104829480430304 0,077103837644007 0,00178993606979658 0,0210119675183757 428065 3438218 623 665 0 True 459 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 504 307 0,0103021421046012 0,0410796962651536 0,0102845807583734 0,0409094377050431 0,00168440389505138 0,0103340091255034 420619 1790285 623 665 0 True 504 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 548 308 0,0101867809599247 0,0407559984878653 0,0102082856488899 0,0419165331502251 0,00154234606585816 0,0103778300303295 415909 1776178 623 665 0 True 548 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 593 308 0,0102697870999053 0,050224026534636 0,01025406271458 0,0498054474708171 0,00192794266920936 0,0123599618005911 419298 2188802 623 665 0 True 592 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 636 307 0,00991797234786014 0,00996967125986172 0,00993362325474937 0,0100099183642329 0,00199926768991149 0,00188655574829 404934 434486 623 665 0 False 636 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 680 307 0,0100207686799636 0,00973252540827922 0,00993362325474937 0,00978103303578241 0,00189299985557505 0,00192243494334379 409131 424151 623 665 0 False 680 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 284 352 0,0100753386651736 0,0534936792656854 0,0101319905394064 0,0527656977187762 0,00148806005027572 0,0130403790689707 411359 2331296 623 665 0 True 283 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 329 352 0,0102172500180941 0,0680818549004693 0,0101930266269932 0,0683604180972 0,00139650712956709 0,0240433658251987 417153 2967060 623 665 0 True 327 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 372 352 0,0107516831766589 0,0393851646741023 0,0105592431525139 0,0402532997634852 0,00254395909070641 0,00781801307291178 438973 1716436 623 665 0 True 371 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 417 351 0,0104889977676026 0,0345117084310685 0,0104982070649271 0,0350957503624018 0,00150954035021843 0,00633318291427862 428248 1504047 623 665 0 True 415 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 460 351 0,010454609859508 0,0673706009129025 0,0104982070649271 0,0659800106813153 0,00175918340084984 0,0149285190800818 426844 2936063 623 665 0 True 459 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 505 352 0,0104587981303657 0,0309958462188889 0,0103761348897536 0,0316624704356451 0,00169885353051803 0,00517617333405439 427015 1350823 623 665 0 True 503 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 548 351 0,0103996479893055 0,0289476265624005 0,0104219119554437 0,028702220187686 0,0017868671546745 0,00485883433291369 424600 1261560 623 665 0 False 548 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 593 352 0,0102964597722095 0,05036360642967 0,0103303578240635 0,0493934538796063 0,00209153985762409 0,0108167292413905 420387 2194885 623 665 0 True 592 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 637 351 0,0102751020401165 0,0568661755097288 0,0102388036926833 0,0567330434119173 0,00195928909601264 0,0141302757539875 419515 2478272 623 665 0 True 636 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 681 351 0,0100700727105864 0,0643048683737267 0,0100099183642329 0,0641336690318151 0,00187140869013614 0,0197853896169464 411144 2802456 623 665 0 True 680 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 284 397 0,0101896956045567 0,0446182060782535 0,0101472495613031 0,0472571908140688 0,00143815090824523 0,0105969056076719 416028 1944496 623 665 0 True 283 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 328 396 0,0102199442274177 0,0337564901037212 0,0102388036926833 0,0331273365377279 0,00136531304239572 0,00589207688375787 417263 1471134 623 665 0 True 327 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 372 395 0,0109411105849239 0,0845346830110295 0,0106507972838941 0,0829175249866484 0,0027163573906213 0,0225183406287572 446707 3684087 623 665 0 True 371 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 417 395 0,0104325663286781 0,0641973668435222 0,0103150988021668 0,0649729152361334 0,00155379528015705 0,0173625295872549 425944 2797771 623 665 0 True 415 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 459 394 0,0105620843187098 0,0405767910276951 0,0105592431525139 0,0426031891355764 0,00182630052979756 0,0110699504224301 431232 1768368 623 665 0 False 459 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 505 396 0,0106179279301455 0,0514297646152461 0,0107423514152743 0,0515754940108339 0,00189178795500635 0,0109465693565511 433512 2241349 623 665 0 True 503 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 548 395 0,0106461926352319 0,0405742899248579 0,010605020218204 0,041367208361944 0,00170169059010124 0,0066579157602124 434666 1768259 623 665 0 True 548 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 593 396 0,0102694931861609 0,0502284092010755 0,0102998397802701 0,0500038147554742 0,00208735840614761 0,00996930646609036 419286 2188993 623 665 0 True 592 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 637 395 0,0101511439184164 0,0426257220070088 0,0101930266269932 0,0422064545662623 0,00182947687082712 0,00978204838180496 414454 1857662 623 665 0 True 636 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 682 395 0,0105111147768686 0,0877806785216647 0,0104982070649271 0,0841992828259709 0,00189780230914291 0,0222613665289536 429151 3825550 623 665 0 True 680 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 285 440 0,0100279450738893 0,0431427389714846 0,00993362325474937 0,0438086518654154 0,00150424634005651 0,00797960295650192 409424 1880194 623 665 0 True 283 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 328 439 0,0105029096848375 0,0552031715819648 0,0104676890211337 0,0556954299229419 0,00156374517689715 0,00829533845743444 428816 2405797 623 665 0 True 327 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 373 440 0,0105130252162072 0,0352326455874178 0,0105439841306172 0,035736629282063 0,00140742365916767 0,00543058885426756 429229 1535466 623 665 0 True 371 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 417 439 0,0104873567491964 0,0534389532999356 0,010452429999237 0,052674143587396 0,00174811694708666 0,01207148439385 428181 2328911 623 665 0 True 415 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 461 439 0,0107103882955709 0,0928114518385687 0,0107118333714809 0,0900892652780957 0,00190648446243229 0,0147284866217755 437287 4044795 623 665 0 True 459 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 505 439 0,0105450618143467 0,057491588894415 0,0105287251087205 0,0582436865796902 0,00169399588783545 0,0124800713262746 430537 2505528 623 665 0 True 503 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 549 439 0,0102950391891116 0,050917566289264 0,0102845807583734 0,0503700312809949 0,00174394452421193 0,0105910934764784 420329 2219027 623 665 0 True 548 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 593 439 0,0102266062722908 0,0304637308537996 0,0102235446707866 0,0307927061875334 0,00190321695677264 0,00533502639095789 417535 1327633 623 665 0 True 592 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 637 439 0,01015672827956 0,0385449776879828 0,0102235446707866 0,0380407415884642 0,00179431935688944 0,00693280287099811 414682 1679820 623 665 0 True 636 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 682 439 0,0102775268285078 0,064398372906402 0,0102998397802701 0,0638132295719844 0,00194871510971297 0,0111268970047949 419614 2806531 623 665 0 True 680 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 284 484 0,0101388730195878 0,0545459322373225 0,0100251773861295 0,054535744258793 0,00177573811850542 0,0169114738003137 413953 2377154 623 665 0 True 283 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 327 484 0,0102471067559626 0,053141735088465 0,01025406271458 0,0549324788281071 0,00170440797506254 0,00990858386766227 418372 2315958 623 665 0 True 327 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 372 484 0,0104009706011553 0,068821194666685 0,0104219119554437 0,0673685816739147 0,00154197515287583 0,0190422238578871 424654 2999281 623 665 0 True 371 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 416 483 0,0108560960343566 0,0852423115467772 0,0108339055466545 0,0848706797894255 0,0018076203031283 0,0233484199644495 443236 3714926 623 665 0 True 415 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 461 483 0,0108406165771516 0,0938808453957049 0,0109102006561379 0,0910048065918975 0,00201906439796229 0,0325481273473548 442604 4091400 623 665 0 True 459 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 505 483 0,0105021993932886 0,046156177810055 0,0105287251087205 0,0467383840695811 0,00195436073526726 0,00891714871915462 428787 2011522 623 665 0 True 503 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 548 483 0,0103054486342257 0,0379551533904572 0,0102998397802701 0,0401159685664149 0,00180500070633587 0,00721441199140512 420754 1654115 623 665 0 True 547 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 593 484 0,0102435552982177 0,0962233232428749 0,0103303578240635 0,0914015411612116 0,00195332008295088 0,0212352559394536 418227 4193487 623 665 0 True 592 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 637 482 0,0101134984663213 0,0574891566292706 0,0101472495613031 0,0597848477912566 0,00182028888023743 0,0163727042151796 412917 2505422 623 665 0 True 636 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 681 483 0,0101300311144438 0,0708603277477282 0,0100709544518196 0,0691386282139315 0,00187922929352037 0,0138736654580495 413592 3088148 623 665 0 True 680 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 284 528 0,00984755551326463 0,0524292420224285 0,0098115510795758 0,0557717250324254 0,00156969699584018 0,0143973331458765 402059 2284907 623 665 0 True 282 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 328 528 0,0102972435421946 0,104507090569179 0,0103150988021668 0,0966811627374685 0,0015124643061536 0,0324363923117331 420419 4554500 623 665 0 True 327 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 372 527 0,0105164542098919 0,0565187746202311 0,0105439841306172 0,058457312886244 0,00147856321251322 0,0154357077911118 429369 2463132 623 665 0 True 371 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 416 527 0,010810735346471 0,0574057712374321 0,0106965743495842 0,058609903105211 0,00184380870520871 0,0119643809083995 441384 2501788 623 665 0 True 415 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 460 527 0,0106414410296974 0,0554126446810549 0,0106202792401007 0,0580758373388266 0,00195289816363308 0,0103741965827105 434472 2414926 623 665 0 True 459 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 505 528 0,0103944555131544 0,0611727762987235 0,0104371709773404 0,0608377203021286 0,00190710407589637 0,0160609697353705 424388 2665957 623 665 0 True 503 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 548 527 0,0102778207422522 0,0701795688580572 0,0102082856488899 0,0695048447394522 0,00171832728509861 0,0213116040354183 419626 3058480 623 665 0 True 547 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 593 527 0,0103586225291498 0,0548247707848243 0,0103456168459602 0,0561837186236362 0,00162464313761567 0,012751205838868 422925 2389306 623 665 0 True 592 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 637 527 0,0102862217767796 0,0403398287432933 0,0102235446707866 0,040360112916762 0,00199763826630011 0,00587857481015018 419969 1758041 623 665 0 True 636 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 682 527 0,0101659865625085 0,0618675551318213 0,0101930266269932 0,0605783169298848 0,00183142137615403 0,0161377554879744 415060 2696236 623 665 0 True 680 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 284 572 0,00990447680842984 0,0446901414671951 0,00991836423285267 0,0454413672083619 0,00135529373661095 0,0121410311506821 404383 1947631 623 665 0 True 282 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 328 571 0,0102557527186103 0,0515663615435935 0,0100862134737163 0,0539253833829252 0,00184254138889084 0,013189093291434 418725 2247302 623 665 0 True 327 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 372 572 0,0108720653478022 0,049344900360308 0,0104982070649271 0,0495155260547799 0,00271331859923722 0,0109192081926658 443888 2150489 623 665 0 True 371 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 416 571 0,0103971497224781 0,0495141493009246 0,0104219119554437 0,0505073624780652 0,00164445820348871 0,00996971217856932 424498 2157865 623 665 0 True 415 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 461 571 0,0106040649985347 0,090708643891716 0,0106202792401007 0,0848706797894255 0,00205997299599615 0,0256547289587746 432946 3953153 623 665 0 True 459 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 504 572 0,0103672439989855 0,061963101849382 0,0104371709773404 0,0616769665064469 0,00219182341640476 0,0162645570327552 423277 2700400 623 665 0 True 503 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 549 571 0,0100814863609939 0,0555887773909482 0,0100404364080262 0,0554818036163882 0,00186389106791576 0,0101421276746761 411610 2422602 623 665 0 True 547 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 593 572 0,0100353419031233 0,0353931291951554 0,0100862134737163 0,0379186694132906 0,00169659215138274 0,00888296766706714 409726 1542460 623 665 0 True 592 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 637 571 0,0101002968406354 0,0459679067203371 0,0101777676050965 0,0469214923323415 0,00161930012209086 0,00827530285735326 412378 2003317 623 665 0 True 636 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 681 571 0,0100094285079922 0,0508048101485116 0,0100404364080262 0,0507057297627222 0,00165701320500448 0,00866088571958285 408668 2214113 623 665 0 True 680 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 282 610 0,00974534700865 0,00952341944355051 0,00962844281681544 0,00950637064164187 0,00166279701338702 0,00155742872212548 397886 415038 623 665 0 False 282 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 327 610 0,00976469633015625 0,00957027496642728 0,00968947890440223 0,00956740672922866 0,00149782529789824 0,00147556446107866 398676 417080 623 665 0 False 327 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 372 615 0,00999710862353948 0,0765851226831097 0,0100862134737163 0,0744640268558785 0,00145638283689384 0,0176766858243282 408165 3337639 623 665 0 True 371 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 417 615 0,0101349541696624 0,0809736632723948 0,0101472495613031 0,0784771496147097 0,00168780806040514 0,0251120653480405 413793 3528895 623 665 0 True 415 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 459 610 0,0100742364886321 0,0100423638634237 0,0101167315175097 0,00999465934233616 0,00204065090621458 0,00200312397864859 411314 437654 623 665 0 False 459 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 503 610 0,00999145078395981 0,010001198923149 0,00993362325474937 0,0100404364080262 0,00204023771305759 0,00207260922944434 407934 435860 623 665 0 False 503 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 547 610 0,00976486777984048 0,00968066767972805 0,00968947890440223 0,00971999694819562 0,0018046869867981 0,00206366939548046 398683 421891 623 665 0 False 547 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 591 610 0,00964796358800592 0,00972844103850838 0,00970473792629892 0,00970473792629892 0,00159373594684828 0,00169908955274953 393910 423973 623 665 0 False 591 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 636 610 0,00984422449082812 0,0098232534873462 0,00984206912336919 0,0097962920576791 0,00149551154928594 0,00150216950252281 401923 428105 623 665 0 False 636 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 680 610 0,0098538746587692 0,00968686307207708 0,0098115510795758 0,00962844281681544 0,00154917306944235 0,0015997983624634 402317 422161 623 665 0 False 680 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 284 660 0,00952322169632073 0,0428828307894938 0,00952162966353857 0,0424963759822995 0,00135805256604362 0,00884779401016438 388817 1868867 623 665 0 True 282 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 326 653 0,00959601433368346 0,00942433905776113 0,00944533455405508 0,00943007553215839 0,00167313219646412 0,0012299697727148 391789 410720 623 665 0 False 326 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 371 653 0,0101216300799164 0,00949450761258835 0,00956740672922866 0,00953688868543526 0,00357708275966379 0,00126844607154266 413249 413778 623 665 0 False 371 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 415 653 0,00995603417775977 0,00957227125951753 0,00975051499198901 0,00956740672922866 0,00195782878584112 0,0014504794157828 406488 417167 623 665 0 False 415 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 459 653 0,00966804769387316 0,00967855665714986 0,00958266575112535 0,00967421988250553 0,00167497735698299 0,00152934675861417 394730 421799 623 665 0 False 459 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 503 653 0,00969219760653792 0,00955047265680796 0,00956740672922866 0,00950637064164187 0,001739259400719 0,00165999190791359 395716 416217 623 665 0 False 503 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 547 653 0,00952013560200454 0,00961917267418948 0,00952162966353857 0,00964370183871214 0,00172607687983901 0,00173747186770495 388691 419211 623 665 0 False 547 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 591 654 0,00963329239359802 0,00968858401439626 0,00961318379491875 0,00970473792629892 0,00142332629708927 0,0012762398632894 393311 422236 623 665 0 False 591 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 636 654 0,00966432478644411 0,00966692308707222 0,00964370183871214 0,00968947890440223 0,00142510192655942 0,00135141268979929 394578 421292 623 665 0 False 636 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 681 659 0,00982203400312602 0,0427893721486137 0,0097962920576791 0,0424505989166094 0,00151098392142329 0,00850296559508927 401017 1864794 623 665 0 True 680 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G2_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G2_2.csv new file mode 100755 index 0000000..309968d --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G2_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 283 263 0,00888386133100554 0,743709651790268 0,00830090791180285 0,76928358892195 0,00287551714460728 0,208416499275268 362713 32411443 623 665 15 True 283 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 327 264 0,00680309897753532 0,00681355483008276 0,00672922865644312 0,00679026474402991 0,00137379456685119 0,00127207081627892 277759 296940 623 665 0 False 327 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 372 263 0,00644873697303868 0,00639997797193831 0,00643930724040589 0,00643930724040589 0,00123379627336176 0,00121818937735889 263291 278916 623 665 0 True 371 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 416 262 0,00645615829508475 0,00641383729408208 0,00648508430609598 0,0063782711528191 0,00144740869393694 0,00147083674454804 263594 279520 623 665 0 True 415 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 460 262 0,00664578164584594 0,00655165035500172 0,00662241550316625 0,00656137941557946 0,00153513342391851 0,00160670350904555 271336 285526 623 665 0 True 459 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 503 263 0,0067782387733216 0,00663799576762919 0,00674448767833982 0,00665293354695964 0,00158922882547116 0,00149177655138721 276744 289289 623 665 0 True 504 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 548 263 0,00682428525994405 0,00695249223998426 0,0068207827878233 0,00697337300679027 0,00154138031894114 0,0014940987093916 278624 302995 623 665 0 True 548 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 592 263 0,0069797411379189 0,00728582729425991 0,00695811398489357 0,0072632944228275 0,00174115795450352 0,0019242086287289 284971 317522 623 665 0 True 592 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 636 264 0,00795083214941203 0,00787007573867147 0,00798046845197223 0,00784313725490196 0,00194088900956014 0,00176796885580282 324619 342984 623 665 0 False 636 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 679 263 0,00941711883459282 0,746922559316579 0,00933852140077821 0,759639887083238 0,00209712292229584 0,192637682326818 384485 32551464 623 665 14 True 680 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 283 307 0,00697464663301599 0,00654713001317668 0,00683604180972 0,00656137941557946 0,00161983057299373 0,00130327948135469 284763 285329 623 665 0 False 283 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 327 307 0,00647413601911713 0,00649740625310128 0,00646982528419928 0,00646982528419928 0,00129534555895488 0,00119055392883794 264328 283162 623 665 0 False 327 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 372 308 0,00656412261052718 0,0067046306542277 0,00660715648126955 0,00679026474402991 0,00123628506165869 0,00127159677067649 268002 292193 623 665 0 True 371 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 416 307 0,00670522570065057 0,00660020387430008 0,00671396963454643 0,00662241550316625 0,00157685268584812 0,00146772473095809 273763 287642 623 665 0 True 415 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 460 307 0,00676684961572615 0,00694365806941249 0,00686655985351339 0,00691233691920348 0,00167166920536379 0,00172223503996204 276279 302610 623 665 0 True 459 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 504 307 0,00675631770655186 0,00694980756996634 0,00677500572213321 0,00695811398489357 0,00160296660155912 0,00162902309126596 275849 302878 623 665 0 True 504 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 548 308 0,00692421593303959 0,00692463592031119 0,00685130083161669 0,00688181887541009 0,00152475076842391 0,00152441066298008 282704 301781 623 665 0 True 548 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 593 308 0,00716363317066432 0,00718027616535043 0,00718699931334401 0,00709544518196384 0,0019020339671876 0,00203898687720066 292479 312922 623 665 0 True 592 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 636 307 0,00753915696475766 0,00753520330925735 0,00755321583886473 0,00753795681696803 0,00192763022411017 0,00189230175037608 307811 328390 623 665 0 False 636 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 680 307 0,00766144957523953 0,00740301199324702 0,00764476997024491 0,00743114366369116 0,00189263147387208 0,00184344219116468 312804 322629 623 665 0 False 680 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 284 352 0,00629734690186134 0,00639956494578171 0,00624093995574884 0,0063935301747158 0,00126793845142322 0,00137553732028637 257110 278898 623 665 0 True 283 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 329 352 0,006372294906683 0,00657081017948855 0,00633249408712902 0,00645456626230259 0,00119675952921254 0,00128519170741516 260170 286361 623 665 0 True 327 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 372 352 0,00695010483535871 0,00701350538167346 0,00675974670023652 0,00679026474402991 0,00198487050046753 0,00211982604708453 283761 305654 623 665 0 True 371 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 417 351 0,0070014172765683 0,00704519366624389 0,00697337300679027 0,00708018616006714 0,0015772745381442 0,00153115370867861 285856 307035 623 665 0 True 415 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 460 351 0,00709211415952732 0,00711513276209521 0,00706492713817044 0,00701915007248035 0,00171920386794941 0,00169212417607892 289559 310083 623 665 0 True 459 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 505 352 0,00709791895597919 0,00700659866649916 0,00714122224765393 0,00698863202868696 0,00154956427006139 0,00163519505460897 289796 305353 623 665 0 True 503 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 548 351 0,0071248365564037 0,00695781568822491 0,00720225833524071 0,00700389105058366 0,00157641938542408 0,00156966984231876 290895 303227 623 665 0 False 548 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 593 352 0,0072343194261922 0,00705969547352015 0,00720225833524071 0,00704966811627375 0,00191736733789231 0,00196090123419201 295365 307667 623 665 0 True 592 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 637 351 0,00702708574357912 0,00724934331709337 0,00695811398489357 0,00730907148851759 0,00208701949340149 0,00185745376455564 286904 315932 623 665 0 True 636 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 681 351 0,00662288086659488 0,00652340395506964 0,00665293354695964 0,00648508430609598 0,00179222231235665 0,0018129808292438 270401 284295 623 665 0 True 680 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 284 397 0,00621287119315877 0,00640275442554659 0,00617990386816205 0,0063782711528191 0,00136004296947988 0,00142445759559737 253661 279037 623 665 0 True 283 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 328 396 0,00665766065968205 0,00663409496503906 0,00660715648126955 0,00663767452506294 0,00129208532537018 0,00133190463067146 271821 289119 623 665 0 True 327 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 372 395 0,00712897584163731 0,00684368279361714 0,00691233691920348 0,00686655985351339 0,00213222149003837 0,00133448005941716 291064 298253 623 665 0 True 371 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 417 395 0,00699686161353012 0,00707348595797115 0,00695811398489357 0,00704966811627375 0,00156906107422758 0,00139069788359857 285670 308268 623 665 0 True 415 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 459 394 0,00713867499520247 0,00709787744710827 0,00706492713817044 0,00711070420386053 0,0016892957819108 0,00154867461573681 291460 309331 623 665 0 False 459 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 505 396 0,00701185121449445 0,00708330680213925 0,00698863202868696 0,00711070420386053 0,00169086305886287 0,00173682463479495 286282 308696 623 665 0 True 503 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 548 395 0,00712319553799748 0,00700320267365599 0,00712596322575723 0,00697337300679027 0,00157637100871409 0,00151552826696155 290828 305205 623 665 0 True 548 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 593 396 0,00685343170626358 0,00683714321280427 0,00671396963454643 0,00674448767833982 0,00197466038855416 0,00194743635706147 279814 297968 623 665 0 True 592 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 637 395 0,00639166872100128 0,00634919870057382 0,00636301213092241 0,00630197604333562 0,00182215596878796 0,00177368200930167 260961 276703 623 665 0 True 636 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 682 395 0,00623562501553763 0,00633880420896599 0,00627145799954223 0,00643930724040589 0,0017159831762709 0,00169846410930083 254590 276250 623 665 0 True 680 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 285 440 0,00628127961716755 0,00659315948374025 0,00631723506523232 0,00653086137178607 0,00154201287655927 0,00143400241861023 256454 287335 623 665 0 True 283 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 328 439 0,00664117699718369 0,00652819964766574 0,00672922865644312 0,00651560234988937 0,00138859160631897 0,00145575787464024 271148 284504 623 665 0 True 327 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 373 440 0,00657200929600188 0,00674423527346634 0,00651560234988937 0,00675974670023652 0,00131494653646458 0,00123600171060153 268324 293919 623 665 0 True 371 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 417 439 0,00698045142946787 0,00714638507461145 0,00703440909437705 0,00712596322575723 0,00162796666750399 0,00164204246518067 285000 311445 623 665 0 True 415 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 461 439 0,00703389474532435 0,00703314707000965 0,00708018616006714 0,00715648126955062 0,0017376796268512 0,00173692102032444 287182 306510 623 665 0 True 459 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 505 439 0,00695199078188526 0,00718103337997087 0,00694285496299687 0,00714122224765393 0,00166637075215838 0,00167767871110941 283838 312955 623 665 0 True 503 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 549 439 0,00671703123605058 0,00677291764545261 0,0068207827878233 0,00686655985351339 0,00168279450406411 0,00169340964143757 274245 295169 623 665 0 True 548 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 593 439 0,0063002615464933 0,00614105646354384 0,00625619897764553 0,00607309071488518 0,00180844049269412 0,00182939789627224 257229 267632 623 665 0 True 592 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 637 439 0,00607017607025322 0,00609704623196811 0,005981536583505 0,00611886778057527 0,00190626536750556 0,00165306760083821 247835 265714 623 665 0 True 636 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 682 439 0,00594717316822239 0,00617994975995723 0,00599679560540169 0,00621042191195544 0,00179321246480874 0,00176787919890817 242813 269327 623 665 0 True 680 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 284 484 0,00646446135836401 0,00613814233455004 0,00642404821850919 0,00616464484626535 0,00156581322031681 0,00146301192157157 263933 267505 623 665 0 True 283 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 327 484 0,00656799247482843 0,00649251877691482 0,00657663843747616 0,00650034332799268 0,00148079889988481 0,00141874025799976 268160 282949 623 665 0 True 327 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 372 484 0,00656054665997033 0,00670960991400451 0,00657663843747616 0,00669871061264973 0,00145509662995559 0,00156975627251251 267856 292410 623 665 0 True 371 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 416 483 0,00671548818889249 0,0068799143659102 0,00674448767833982 0,00689707789730678 0,001851192225847 0,00167170261032713 274182 299832 623 665 0 True 415 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 461 483 0,00703832794430237 0,00713470561273864 0,00712596322575723 0,00714122224765393 0,00192206118004674 0,00172314737086113 287363 310936 623 665 0 True 459 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 505 483 0,00676800077789171 0,00682624391144949 0,00675974670023652 0,00688181887541009 0,00165340381236022 0,00168431835965402 276326 297493 623 665 0 True 503 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 548 483 0,00623687414895132 0,00625665789559731 0,00616464484626535 0,00631723506523232 0,00171342742134643 0,00165717055594159 254641 272670 623 665 0 True 547 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 593 484 0,00594033967366512 0,00631055780903392 0,005981536583505 0,00627145799954223 0,00173899353284287 0,00184294316042446 242534 275019 623 665 0 True 592 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 637 482 0,00614289522917985 0,00613054724244807 0,00617990386816205 0,00605783169298848 0,00175015751629856 0,00175294792948187 250804 267174 623 665 0 True 636 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 681 483 0,00607054346243372 0,00625796581175989 0,00599679560540169 0,00624093995574884 0,0018538371898892 0,00174343418152941 247850 272727 623 665 0 True 680 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 284 528 0,00644761030368515 0,0062403892542067 0,00648508430609598 0,00634775310902571 0,00146806791295778 0,00139941110402486 263245 271961 623 665 0 True 282 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 328 528 0,00649250562814205 0,00673248697390076 0,00650034332799268 0,00669871061264973 0,0013993950859948 0,00147712547771446 265078 293407 623 665 0 True 327 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 372 527 0,00657323393660354 0,00675111904274304 0,00665293354695964 0,00669871061264973 0,00138282955253701 0,00149852436698924 268374 294219 623 665 0 True 371 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 416 527 0,00669917597607836 0,00681612477061273 0,00665293354695964 0,0068055237659266 0,00166486904168225 0,0017393440166795 273516 297052 623 665 0 True 415 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 460 527 0,00675019450354356 0,00648467127993938 0,00679026474402991 0,00643930724040589 0,00182752974965916 0,00188130151195355 275599 282607 623 665 0 True 459 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 505 528 0,00655466838508236 0,00652351868455758 0,00659189745937285 0,00645456626230259 0,00170426225494892 0,00171859218811267 267616 284300 623 665 0 True 503 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 548 527 0,00644119318693245 0,00642163889926235 0,00646982528419928 0,0063782711528191 0,0016702248144991 0,00176094789628687 262983 279860 623 665 0 True 547 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 593 527 0,00636783721489295 0,00630344458078132 0,0063935301747158 0,00627145799954223 0,00163512298591261 0,00157836488582448 259988 274709 623 665 0 True 592 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 637 527 0,00634038077260371 0,00622386820794261 0,0064087891966125 0,00625619897764553 0,00179913217806346 0,00192540281073907 258867 271241 623 665 0 True 636 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 682 527 0,00646081192937106 0,00646507548339836 0,00653086137178607 0,00645456626230259 0,00175773861695067 0,00175529440612577 263784 281753 623 665 0 True 680 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 284 572 0,00653845414351637 0,00671341893300429 0,00651560234988937 0,00668345159075303 0,00142382047449236 0,00132072785883988 266954 292576 623 665 0 True 282 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 328 571 0,0123262280910266 0,00671208807094413 0,00668345159075303 0,00668345159075303 0,0465371528443213 0,00142887967045826 503259 292518 623 665 0 True 327 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 372 572 0,020184501903765 0,00769754553469965 0,00692759594110018 0,00738536659800107 0,0771485122318907 0,00223973096851386 824099 335465 623 665 0 True 371 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 416 571 0,00653181659145536 0,00641028067995578 0,00656137941557946 0,00634775310902571 0,0017012516418241 0,0016152950020464 266683 279365 623 665 0 True 415 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 461 571 0,00655437447133796 0,00651828701990729 0,00648508430609598 0,00645456626230259 0,0019287487606067 0,0017408880543315 267604 284072 623 665 0 True 459 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 504 572 0,00656613102111391 0,00655601007554363 0,00646982528419928 0,00657663843747616 0,00199451497209719 0,00194254953459123 268084 285716 623 665 0 True 503 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 549 571 0,00649632650681923 0,00657443563130761 0,00653086137178607 0,00665293354695964 0,00170263094230227 0,00167285097665765 265234 286519 623 665 0 True 547 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 593 572 0,00644033593851129 0,00639531995472774 0,00642404821850919 0,0064087891966125 0,00157914682366484 0,00157055069742292 262948 278713 623 665 0 True 592 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 637 571 0,00644244232034614 0,00643694381295422 0,00651560234988937 0,0063782711528191 0,00162670752232388 0,0013543670699907 263034 280527 623 665 0 True 636 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 681 571 0,00634493643564189 0,00652666227252728 0,00634775310902571 0,00656137941557946 0,00152316557517184 0,00171059489437516 259053 284437 623 665 0 True 680 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 282 610 0,00674666753861078 0,00683755623896087 0,0068207827878233 0,00677500572213321 0,00134244155793654 0,00142385482290865 275455 297986 623 665 0 False 282 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 327 610 0,00649816346772172 0,00662911570526224 0,00662241550316625 0,00656137941557946 0,00145503988393108 0,0014703001503892 265309 288902 623 665 0 False 327 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 372 615 0,00622095382112973 0,00635101142648335 0,00619516289005875 0,00636301213092241 0,00133322730325375 0,00129128590381535 253991 276782 623 665 0 True 371 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 417 615 0,00626567769590239 0,00616661819345801 0,00636301213092241 0,00611886778057527 0,00160028894239758 0,00140931768417386 255817 268746 623 665 0 True 415 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 459 610 0,00622915891316086 0,00615252941233835 0,00624093995574884 0,00613412680247196 0,00192287891486068 0,00195760453447425 254326 268132 623 665 0 False 459 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 503 610 0,00626014232038288 0,00648891627099334 0,00624093995574884 0,00648508430609598 0,0018589384261187 0,00203696604941479 255591 282792 623 665 0 False 503 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 547 610 0,00634491194282986 0,00637104319507856 0,00643930724040589 0,00631723506523232 0,00176843481277106 0,00190102590504987 259052 277655 623 665 0 False 547 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 591 610 0,00610537224114496 0,0064227861941418 0,00614938582436866 0,00646982528419928 0,00158504645513124 0,00153811291862555 249272 279910 623 665 0 False 591 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 636 610 0,00635500298138754 0,00628079697986096 0,00636301213092241 0,00630197604333562 0,00151630676418908 0,00142267232598521 259464 273722 623 665 0 False 636 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 680 610 0,00650098014110554 0,0065907501644934 0,00643930724040589 0,00656137941557946 0,00141429904879255 0,00155016934847665 265424 287230 623 665 0 False 680 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 284 660 0,00859428281433677 0,744238830080465 0,00833142595559625 0,753933012893873 0,00195817216783334 0,194347103967954 350890 32434505 623 665 14 True 282 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 326 653 0,00739959692179237 0,00665963374905563 0,00703440909437705 0,00665293354695964 0,00226709175253771 0,00125831591523273 302113 290232 623 665 0 False 326 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 371 653 0,00621225887285794 0,00609149332475157 0,00622568093385214 0,00619516289005875 0,0012050653492465 0,00128563158733765 253636 265472 623 665 0 False 371 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 415 653 0,00600823374862121 0,00586368645348781 0,00599679560540169 0,00590524147402152 0,0014040569456719 0,00141887659683643 245306 255544 623 665 0 False 415 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 459 653 0,0058360737728397 0,00604991535832027 0,00584420538643473 0,0059510185397116 0,00160429461932119 0,00159571113413631 238277 263660 623 665 0 False 459 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 503 653 0,00597374786927843 0,00612040515571373 0,0059510185397116 0,00611886778057527 0,0017305458418959 0,0017005888663605 243898 266732 623 665 0 False 503 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 547 653 0,00607649521575779 0,00599452396154038 0,00604257267109178 0,005981536583505 0,00164909430220647 0,00165216730799458 248093 261246 623 665 0 False 547 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 591 654 0,0060614566291694 0,00628121000601756 0,00607309071488518 0,00625619897764553 0,00129308829276749 0,00123180043804376 247479 273740 623 665 0 False 591 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 636 654 0,00670096395135678 0,00671835230098593 0,00666819256885634 0,00666819256885634 0,00135464022651087 0,0012867171439887 273589 292791 623 665 0 False 636 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 681 659 0,00861257894492559 0,756288042147025 0,00843823910887312 0,776577401388571 0,00214344194238413 0,19148680715249 351637 32959619 623 665 15 True 680 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G2_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G2_3.csv new file mode 100755 index 0000000..3a57bf7 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G2_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 283 263 0,00109186506762894 0,0754997587812516 0,000976577401388571 0,0754558632791638 0,000758265890586939 0,0244132020479986 44579 3290338 623 665 0 True 283 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 327 264 0,000966535348454951 0,000931396929035796 0,000839246204318303 0,000823987182421607 0,000705159773883195 0,000652756175306624 39462 40591 623 665 0 False 327 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 372 263 0,000906478973349494 0,000846015244107063 0,000778210116731518 0,000717174029144732 0,000621115300289807 0,000615615280724539 37010 36870 623 665 0 True 371 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 416 262 0,000851933480951512 0,000977977101141501 0,00064087891966125 0,000793469138628214 0,000741523505835244 0,0007717481796199 34783 42621 623 665 0 True 415 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 460 262 0,000932049469112176 0,000893283793140439 0,000717174029144732 0,000671396963454643 0,000838818099947337 0,000823825931936333 38054 38930 623 665 0 True 459 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 503 263 0,000893399811723754 0,000881673168960396 0,00064087891966125 0,000671396963454643 0,000854664470818189 0,000778305256724639 36476 38424 623 665 0 True 504 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 548 263 0,000934841649683963 0,00095955154537752 0,000732433051041428 0,000793469138628214 0,000781566151617431 0,000763345222878214 38168 41818 623 665 0 True 548 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 592 263 0,000956664745205563 0,000943053445011017 0,000610360875867857 0,000534065766384375 0,000955550524332283 0,00101887072010896 39059 41099 623 665 0 True 592 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 636 264 0,00101025501793425 0,00104890287058915 0,000671396963454643 0,000747692072938125 0,000973570160799836 0,000955337665230991 41247 45712 623 665 0 False 636 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 679 263 0,00104109146828407 0,0757547335952607 0,000762951094834821 0,0752269779507134 0,00096187390140885 0,0232774518764036 42506 3301450 623 665 0 True 680 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 283 307 0,000871307295269789 0,000880066956129165 0,000717174029144732 0,000747692072938125 0,000681051371776587 0,000694266733513878 35574 38354 623 665 0 False 283 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 327 307 0,000917574217200543 0,000840439390992932 0,00080872816052491 0,000732433051041428 0,00069477200399839 0,000633955550657466 37463 36627 623 665 0 False 327 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 372 308 0,000880786013526645 0,000817516439301504 0,000747692072938125 0,000686655985351339 0,000673395985391281 0,000627813657090744 35961 35628 623 665 0 True 371 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 416 307 0,000860334515478906 0,000778967331351955 0,00064087891966125 0,000579842832074464 0,000779785685659045 0,000716269869865284 35126 33948 623 665 0 True 415 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 460 307 0,000893718218280186 0,000891884093387509 0,000625619897764553 0,000564583810177768 0,000868295526077427 0,000918442158820846 36489 38869 623 665 0 True 459 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 504 307 0,000931633091307611 0,00092850574593958 0,000717174029144732 0,000732433051041428 0,000815319247021675 0,00085030460401896 38037 40465 623 665 0 True 504 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 548 308 0,000910299852026676 0,000942846931932716 0,000717174029144732 0,000778210116731518 0,00077431839297455 0,000745623501498275 37166 41090 623 665 0 True 548 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 593 308 0,000908756804868583 0,00091987808844611 0,000610360875867857 0,000473029678797589 0,00092914275208559 0,00105316815289629 37103 40089 623 665 0 True 592 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 636 307 0,00101691706280729 0,000955214770733196 0,000625619897764553 0,000503547722590982 0,00106746527662393 0,00102424431850803 41519 41629 623 665 0 False 636 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 680 307 0,000978414362291063 0,000985296842472397 0,000595101853971161 0,000549324788281071 0,00100116444566825 0,00104028305908922 39947 42940 623 665 0 False 680 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 284 352 0,000914096237891825 0,000861687292160362 0,000762951094834821 0,000686655985351339 0,000751755439068803 0,000697245367477611 37321 37553 623 665 0 True 283 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 329 352 0,00096964593558317 0,000819558624186927 0,000839246204318303 0,000701915007248035 0,000722574798702319 0,000653996204985868 39589 35717 623 665 0 True 327 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 372 352 0,000904495055574803 0,00094929472915523 0,000778210116731518 0,000823987182421607 0,000684979041227046 0,000707386506619211 36929 41371 623 665 0 True 371 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 417 351 0,000931535120059478 0,000843789492040929 0,000732433051041428 0,000610360875867857 0,000794982612235153 0,000755831968474365 38033 36773 623 665 0 True 415 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 460 351 0,000948410667550367 0,00088112246741826 0,000701915007248035 0,000595101853971161 0,00089465840607057 0,000836202552675741 38722 38400 623 665 0 True 459 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 505 352 0,000972340144906824 0,000911915861982721 0,000701915007248035 0,000656137941557946 0,000886432376763616 0,000874752443753778 39699 39742 623 665 0 True 503 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 548 351 0,000969915356515535 0,000835322455830581 0,000747692072938125 0,000595101853971161 0,00082324145739884 0,000782178195334778 39600 36404 623 665 0 False 548 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 593 352 0,000937486873383551 0,000962029702317134 0,000549324788281071 0,000518806744487678 0,0010222938493712 0,00112034167855424 38276 41926 623 665 0 True 592 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 637 351 0,000982137269720112 0,000997985923839124 0,000610360875867857 0,000610360875867857 0,00102951225436355 0,001016182051715 40099 43493 623 665 0 True 636 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 681 351 0,000923452492088516 0,000910975080181571 0,000564583810177768 0,000503547722590982 0,000928710989896365 0,00098522546767203 37703 39701 623 665 0 True 680 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 284 397 0,000878973545436187 0,000918891414849782 0,000701915007248035 0,00080872816052491 0,000745351613676042 0,000707944815845523 35887 40046 623 665 0 True 283 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 328 396 0,000890828066460266 0,000903976581416921 0,000778210116731518 0,000793469138628214 0,000663704694757921 0,000650877457396787 36371 39396 623 665 0 True 327 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 372 395 0,000885121241256525 0,000877772366370263 0,000747692072938125 0,000762951094834821 0,000717513454195845 0,000723247730309288 36138 38254 623 665 0 True 371 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 417 395 0,000895555179182677 0,000861090698823048 0,000701915007248035 0,000610360875867857 0,000764939575735949 0,000764479856518147 36564 37527 623 665 0 True 415 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 459 394 0,000984439594051235 0,000908703436320258 0,000732433051041428 0,000610360875867857 0,000909772144089378 0,000852535439414856 40193 39602 623 665 0 False 459 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 505 396 0,000966045492214286 0,000939519776782308 0,00064087891966125 0,000625619897764553 0,000959941171083523 0,00090392678530424 39442 40945 623 665 0 True 503 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 548 395 0,000909956952658211 0,000984792032725439 0,000656137941557946 0,00080872816052491 0,000843277293577629 0,000772676288384749 37152 42918 623 665 0 True 548 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 593 396 0,000869592798427464 0,000879768659460508 0,000473029678797589 0,000457770656900893 0,000966062539910546 0,00097695596066635 35504 38341 623 665 0 True 592 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 637 395 0,000955072712423403 0,000898010648043776 0,000549324788281071 0,000564583810177768 0,00098759681786704 0,000914327103127144 38994 39136 623 665 0 True 636 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 682 395 0,000842895633311253 0,000917927687151043 0,000503547722590982 0,000503547722590982 0,000911590541721139 0,000991756062673606 34414 40004 623 665 0 True 680 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 285 440 0,000835425325641121 0,000919992817934055 0,000732433051041428 0,000717174029144732 0,000726659829049082 0,000804411558197759 34109 40094 623 665 0 True 283 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 328 439 0,000826265013940696 0,000870475570936955 0,000686655985351339 0,000747692072938125 0,000737414460791001 0,000724019889613681 33735 37936 623 665 0 True 327 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 373 440 0,000865747426938248 0,000865427473467372 0,000717174029144732 0,000747692072938125 0,000702841615825249 0,000685955085352605 35347 37716 623 665 0 True 371 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 417 439 0,000907238250522524 0,000932154143656234 0,000671396963454643 0,000671396963454643 0,00084276346894835 0,000866468844737568 37041 40624 623 665 0 True 415 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 461 439 0,000898518809438697 0,000950671483010571 0,000595101853971161 0,000625619897764553 0,000896756867931638 0,000948357124131387 36685 41431 623 665 0 True 459 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 505 439 0,00101603532157409 0,000970336117244358 0,000717174029144732 0,000656137941557946 0,000948747999492079 0,000964151800221997 41483 42288 623 665 0 True 503 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 549 439 0,000891121980204664 0,000936559755993325 0,00064087891966125 0,000686655985351339 0,00085510279057945 0,00087276844681009 36383 40816 623 665 0 True 548 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 593 439 0,000896828805408405 0,000919373278699151 0,000610360875867857 0,000518806744487678 0,00089323274526762 0,000988202560456524 36616 40067 623 665 0 True 592 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 637 439 0,000883823122218765 0,000913407345326007 0,000503547722590982 0,000488288700694286 0,000957726416052952 0,000975868329771834 36085 39807 623 665 0 True 636 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 682 439 0,000902805051544511 0,000946541221444548 0,000534065766384375 0,000579842832074464 0,00093668390038615 0,000941754300824868 36860 41251 623 665 0 True 680 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 284 484 0,000845369407326608 0,00088415132590001 0,000732433051041428 0,000747692072938125 0,000715680674230498 0,000813492249636413 34515 38532 623 665 0 True 283 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 327 484 0,000938711513985212 0,000833372054535515 0,00080872816052491 0,000732433051041428 0,000775656402107483 0,000758164122268563 38326 36319 623 665 0 True 327 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 372 484 0,000730938989507402 0,000934288112132012 0,000579842832074464 0,000793469138628214 0,00068466428790599 0,000804304008555596 29843 40717 623 665 0 True 371 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 416 483 0,00083412720660336 0,000893857440580164 0,000503547722590982 0,00064087891966125 0,000902734022917919 0,000856715439249902 34056 38955 623 665 0 True 415 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 461 483 0,000871723673074354 0,000926486506951746 0,000518806744487678 0,000549324788281071 0,00093282435859387 0,000985674462576764 35591 40377 623 665 0 True 459 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 505 483 0,00088120239133121 0,000874651724298157 0,000549324788281071 0,000442511635004196 0,000884951675763114 0,000966399989704205 35978 38118 623 665 0 True 503 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 548 483 0,000863396116983059 0,000953906854570622 0,000564583810177768 0,00064087891966125 0,000886858221576725 0,000957071129053763 35251 41572 623 665 0 True 547 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 593 484 0,000840421859295898 0,000843078169215669 0,000457770656900893 0,000457770656900893 0,000935202906613981 0,000940192378728047 34313 36742 623 665 0 True 592 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 637 482 0,000900135335032889 0,000880112847924343 0,000488288700694286 0,000610360875867857 0,000973861417353089 0,000820700028120511 36751 38356 623 665 0 True 636 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 681 483 0,000915908705982284 0,000947986812992656 0,000564583810177768 0,000610360875867857 0,000965955704454592 0,000934266309696397 37395 41314 623 665 0 True 680 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 284 528 0,000896755326972305 0,000886973671303459 0,000778210116731518 0,000732433051041428 0,000720189092302722 0,000752544867124291 36613 38655 623 665 0 True 282 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 328 528 0,000864400322276421 0,000889015856188881 0,000762951094834821 0,000778210116731518 0,000724676234883617 0,00076592241800529 35292 38744 623 665 0 True 327 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 372 527 0,000812059182961428 0,000826419447566043 0,000656137941557946 0,000671396963454643 0,000712583693559916 0,000753052989036802 33155 36016 623 665 0 True 371 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 416 527 0,000834641555656058 0,0008208665403495 0,000534065766384375 0,000488288700694286 0,000899499482624638 0,00085571234940009 34077 35774 623 665 0 True 415 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 460 527 0,000907409700206756 0,000909965460687654 0,000549324788281071 0,000534065766384375 0,000969900775760715 0,000944343188155602 37048 39657 623 665 0 True 459 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 505 528 0,00087542208769137 0,000927932098499855 0,000488288700694286 0,000549324788281071 0,000955030052873738 0,000939102173152707 35742 40440 623 665 0 True 503 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 548 527 0,000913851309771493 0,000906294117073411 0,000595101853971161 0,000549324788281071 0,000899957674135668 0,000922050257035559 37311 39497 623 665 0 True 547 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 593 527 0,000874907738638672 0,000876785692773935 0,000579842832074464 0,000595101853971161 0,000862549815004492 0,00087861382088484 35721 38211 623 665 0 True 592 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 637 527 0,000902364180927913 0,000849617750028539 0,000549324788281071 0,000381475547417411 0,000925846915685206 0,000951755879403288 36842 37027 623 665 0 True 636 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 682 527 0,000912185798553234 0,000974512270605559 0,000610360875867857 0,000656137941557946 0,000927127574378292 0,000961030751439415 37243 42470 623 665 0 True 680 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 284 572 0,000881986161316273 0,000894545817507835 0,000762951094834821 0,000747692072938125 0,000698061003796028 0,000698319758731007 36010 38985 623 665 0 True 282 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 328 571 0,00144441460403512 0,000937477591896886 0,00080872816052491 0,000778210116731518 0,004641473842807 0,00073248794230008 58973 40856 623 665 0 True 327 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 372 572 0,0022004832186886 0,000917790011765509 0,000885023270008392 0,000793469138628214 0,00758164371890167 0,000658380820452152 89842 39998 623 665 0 True 371 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 416 571 0,000833955756919128 0,000851499313630838 0,000625619897764553 0,000595101853971161 0,000784085449462074 0,000790139674224887 34049 37109 623 665 0 True 415 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 461 571 0,000906625930221693 0,000860953023437513 0,000473029678797589 0,000549324788281071 0,00100510609757665 0,000888760360399933 37016 37521 623 665 0 True 459 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 504 572 0,000896289963543674 0,000868708736822601 0,000442511635004196 0,000473029678797589 0,00105990391192196 0,00103552479783121 36594 37859 623 665 0 True 503 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 549 571 0,000892640534550724 0,000987935620695135 0,000442511635004196 0,000610360875867857 0,000998026739872167 0,00103109706699488 36445 43055 623 665 0 True 547 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 593 572 0,000920390890584363 0,000884059542309654 0,000595101853971161 0,000625619897764553 0,000895848568597531 0,000812693350646816 37578 38528 623 665 0 True 592 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 637 571 0,000905964624296796 0,000947573786836053 0,00064087891966125 0,000732433051041428 0,000849060448491359 0,000805444223564846 36989 41296 623 665 0 True 636 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 681 571 0,000964135052875695 0,000926188210283089 0,000701915007248035 0,000610360875867857 0,000868222148246172 0,000859259063540757 39364 40364 623 665 0 True 680 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 282 610 0,000904960419003434 0,000908015059392588 0,00080872816052491 0,00080872816052491 0,000703372531591835 0,000712121122521134 36948 39572 623 665 0 False 282 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 327 610 0,000852741743748608 0,00085310552646207 0,000747692072938125 0,000762951094834821 0,000702508355460896 0,000689778807818404 34816 37179 623 665 0 False 327 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 372 615 0,000841401571777227 0,000842550413571122 0,000701915007248035 0,000701915007248035 0,000683946242979157 0,00068432117619537 34353 36719 623 665 0 True 371 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 417 615 0,000764077764188349 0,000935205948035573 0,000549324788281071 0,000717174029144732 0,000728577686643625 0,00081961043407383 31196 40757 623 665 0 True 415 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 459 610 0,000871576716202154 0,000837892396360551 0,000442511635004196 0,000320439459830625 0,000993761989640817 0,000982971240982987 35585 36516 623 665 0 False 459 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 503 610 0,000969009122470306 0,000893123171857316 0,000488288700694286 0,000488288700694286 0,00109715717859155 0,00102409834372762 39563 38923 623 665 0 False 503 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 547 610 0,000835596775325353 0,000903127583206127 0,000442511635004196 0,000488288700694286 0,000925139408250399 0,00102075451592821 34116 39359 623 665 0 False 547 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 591 610 0,000906503466161527 0,000832844298890967 0,00064087891966125 0,000564583810177768 0,000838752516261601 0,00080803666212813 37011 36296 623 665 0 False 591 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 636 610 0,000881177898519177 0,000876234991231799 0,000686655985351339 0,000701915007248035 0,000703863059299419 0,000758622789255329 35977 38187 623 665 0 False 636 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 680 610 0,000916178126914649 0,000914141614048855 0,000732433051041428 0,00064087891966125 0,000807072024994494 0,000812024872077547 37406 39839 623 665 0 False 680 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 284 660 0,000955978946468633 0,0751541476717658 0,000854505226215 0,0740978103303578 0,000706305117215282 0,0229790163464329 39031 3275276 623 665 0 True 282 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 326 653 0,000979394074772391 0,000869603626828573 0,000839246204318303 0,000762951094834821 0,00071483630738885 0,000641391426154235 39987 37898 623 665 0 False 326 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 371 653 0,000816051511322843 0,000782707512658965 0,000717174029144732 0,000686655985351339 0,000619674693570829 0,00056939904075856 33318 34111 623 665 0 False 371 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 415 653 0,000850121012861053 0,000761367827901179 0,000732433051041428 0,000579842832074464 0,000677997497472424 0,000660557178055591 34709 33181 623 665 0 False 415 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 459 653 0,000866653660983477 0,000849044102588814 0,000610360875867857 0,00064087891966125 0,000824130750124545 0,000796547805310886 35384 37002 623 665 0 False 459 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 503 653 0,000909663038913812 0,000875156534045115 0,000610360875867857 0,000564583810177768 0,000914384429105983 0,000894946327552554 37140 38140 623 665 0 False 503 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 547 653 0,000922644229291419 0,00087201294607542 0,000579842832074464 0,000488288700694286 0,000879125982176718 0,000890282344169461 37670 38003 623 665 0 False 547 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 591 654 0,000855631895568528 0,000839452717396604 0,000671396963454643 0,000732433051041428 0,000723631282304354 0,000609512113050501 34934 36584 623 665 0 False 591 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 636 654 0,000982382197840444 0,000893513252116329 0,000839246204318303 0,000747692072938125 0,000721188432641919 0,000684212523419127 40109 38940 623 665 0 False 636 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 681 659 0,00103374362467411 0,0765936126652176 0,000900282291905089 0,0759136339360647 0,0007817527734975 0,0229003246694013 42206 3338009 623 665 0 True 680 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G3_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G3_1.csv new file mode 100755 index 0000000..f8d099e --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G3_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 278 273 0,0103857541349907 0,0448727908120037 0,010406652933547 0,0449683375295644 0,00139292762978937 0,00886366323653096 394085 1955591 579 665 0 True 278 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 322 273 0,0103716546933418 0,0102403410678218 0,0103608758678569 0,0102693217364767 0,00137982794869971 0,00133678354565622 393550 446282 579 665 0 False 322 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 366 272 0,010591210671617 0,0564223100667668 0,0106355382619974 0,0580605783169299 0,00142232078594305 0,0102425748272951 401881 2458928 579 665 0 True 366 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 411 272 0,0106229673579478 0,0764378329664858 0,0106813153276875 0,0771190966659037 0,00159042838837088 0,0117705767660516 403086 3331220 579 665 0 True 410 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 455 272 0,0107866526515581 0,0642935331003178 0,0107118333714809 0,0641336690318151 0,00179369164966903 0,0136124601732632 409297 2801962 579 665 0 True 454 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 499 272 0,0106271313052011 0,0601384899648985 0,010605020218204 0,0638437476157778 0,00175210792431579 0,0171239614679327 403244 2620882 579 665 0 True 498 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 544 273 0,0103569754615689 0,0755793122081927 0,0103150988021668 0,075745784695201 0,00163502316439987 0,0202760995982447 392993 3293805 579 665 0 True 542 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 588 273 0,0101377884406452 0,063509471779701 0,0101777676050965 0,0626840619516289 0,00191631774873316 0,0172864226291832 384676 2767792 579 665 0 True 586 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 630 274 0,00980535786688888 0,00972229153795452 0,00987258716716258 0,00976577401388571 0,00191014571497315 0,00189256194123235 372062 423705 579 665 0 False 630 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 672 271 0,00959692331735353 0,0438850617043869 0,00959792477302205 0,0440070191500725 0,00189656515516324 0,00852090259175283 364153 1912545 579 665 0 True 674 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 278 316 0,0103117518319062 0,010312964833691 0,0102998397802701 0,0102998397802701 0,00150049149951219 0,00145649609673465 391277 449447 579 665 0 False 278 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 322 316 0,0102468153380315 0,0102699871675068 0,01025406271458 0,0103150988021668 0,00128758303674216 0,00128785292970639 388813 447574 579 665 0 False 322 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 368 318 0,0106108181194428 0,0960313808095427 0,0106507972838941 0,0923018234531167 0,00139187224960756 0,0217539835178319 402625 4185122 579 665 0 True 366 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 412 317 0,0104333759874386 0,0480649323009974 0,0104829480430304 0,0483405813687343 0,00156189615234068 0,00834351304240836 395892 2094707 579 665 0 True 410 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 456 317 0,0106672949483282 0,0729938602514526 0,0106813153276875 0,0706492713817044 0,00175294568175866 0,0170978451756397 404768 3181129 579 665 0 True 454 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 500 317 0,0107239826099859 0,0394527403425019 0,0106660563057908 0,0411230640115969 0,00157103728067117 0,00742940928903067 406919 1719381 579 665 0 True 498 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 544 317 0,0106498748905152 0,044053943510642 0,0106355382619974 0,0441138323033494 0,00153217460290341 0,0121371356227619 404107 1919905 579 665 0 True 542 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 588 318 0,0106755174264487 0,0515272617341018 0,010757610437171 0,0513618677042802 0,0019864508943552 0,0118778639420969 405080 2245598 579 665 0 True 586 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 630 317 0,0103374734301293 0,0103684709599588 0,0103150988021668 0,0103456168459602 0,0020153299929418 0,00218793017963373 392253 451866 579 665 0 False 630 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 674 317 0,00993143586473655 0,0100662275969163 0,00987258716716258 0,0101930266269932 0,00207273357442668 0,00194749026231861 376846 438694 579 665 0 False 674 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 280 362 0,0105310179151195 0,0545670883548996 0,0105287251087205 0,0538796063172351 0,00148457322360575 0,0129902049627877 399597 2378076 579 665 0 True 278 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 323 362 0,0103159948414491 0,0655834826250795 0,0102998397802701 0,0676737621118486 0,00140827053223901 0,0217585106170612 391438 2858179 579 665 0 True 322 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 367 361 0,0105477264123259 0,0409450497381013 0,0105745021744106 0,0410467689021134 0,0014127991628227 0,0110068974907199 400231 1784417 579 665 0 True 366 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 412 362 0,0104108695889934 0,0351750284385718 0,0104371709773404 0,0351873044937819 0,00150258671812871 0,0061473710832657 395038 1532955 579 665 0 True 410 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 456 362 0,0104812613808519 0,0677397315674171 0,010605020218204 0,0656900892652781 0,00181131832324693 0,0115800207827609 397709 2952150 579 665 0 True 454 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 501 361 0,0105163913915398 0,0331435363414258 0,0105287251087205 0,0333104448004883 0,00168778998496312 0,00693386038318705 399042 1444421 579 665 0 True 498 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 542 360 0,0105663060503867 0,0262447604476974 0,0106355382619974 0,0274052033264668 0,0017290817050085 0,00480254130922801 400936 1143767 579 665 0 False 542 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 588 362 0,0107114380600328 0,050994389154392 0,0106660563057908 0,0508430609597925 0,0018391597604921 0,00932731592608545 406443 2222375 579 665 0 True 586 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 632 361 0,0103436139346231 0,056609617428786 0,010406652933547 0,0569161516746777 0,00191907461281658 0,0133895178710959 392486 2467091 579 665 0 True 630 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 676 362 0,0103247971096935 0,0659616310173465 0,0103456168459602 0,0660105287251087 0,00185402119536627 0,0184098456536891 391772 2874659 579 665 0 True 674 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 280 406 0,0106099747883535 0,0460141197580814 0,0106355382619974 0,0483405813687343 0,0015308633156634 0,0118267912232935 402593 2005331 579 665 0 True 278 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 324 407 0,0104885351114969 0,0334332741902823 0,0104829480430304 0,0328526741435874 0,00146593283174974 0,00679359367071157 397985 1457048 579 665 0 True 322 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 368 406 0,0108135601841255 0,0867300547087563 0,0106813153276875 0,0843060959792477 0,0016949281318627 0,0236543005428369 410318 3779763 579 665 0 True 366 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 412 406 0,0109683377931053 0,0644584682121876 0,0107881284809644 0,0648508430609598 0,00198645562075393 0,0163163896462947 416191 2809150 579 665 0 True 410 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 457 406 0,0107016343361199 0,0408074202443623 0,0107728694590677 0,0419012741283284 0,00168709561687593 0,0071471172856017 406071 1778419 579 665 0 True 454 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 500 407 0,0105810379903526 0,0520030219747125 0,0106660563057908 0,0519111924925612 0,00175176046248161 0,0109814002406943 401495 2266332 579 665 0 True 498 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 545 406 0,0103629841955801 0,0406332379357641 0,0103913939116503 0,0414435034714275 0,00168372380358611 0,00527248403426431 393221 1770828 579 665 0 True 542 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 589 406 0,0102059137802013 0,0498973228447635 0,0102845807583734 0,0495765621423667 0,00191239265506986 0,00864649466549647 387261 2174564 579 665 0 True 586 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 633 406 0,010226733516468 0,0410756348412804 0,0102388036926833 0,0419775692378119 0,00185026258185449 0,00772663693174033 388051 1790108 579 665 0 True 630 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 677 406 0,010277096194956 0,0876790740871405 0,0103303578240635 0,082887006942855 0,00181705072698626 0,0203852658343319 389962 3821122 579 665 0 True 674 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 280 451 0,0102602559272669 0,0423995213485763 0,0102845807583734 0,0432745860990311 0,0015296477305614 0,0074866410074378 389323 1847804 579 665 0 True 278 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 324 451 0,0106739361806563 0,0594494934979931 0,0107118333714809 0,060318913557641 0,00154500172312397 0,0123111331423441 405020 2590855 579 665 0 True 322 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 368 451 0,0106071021918307 0,0340534559103183 0,0106355382619974 0,0348210879682612 0,00155472026954301 0,0039698558606512 402484 1484076 579 665 0 True 366 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 412 450 0,0109091464922763 0,0515710195608041 0,0107270923933776 0,052475776302739 0,00191041492000347 0,00914708668001668 413945 2247505 579 665 0 True 410 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 457 450 0,0107530775325661 0,09257141480389 0,0107881284809644 0,0906385900663767 0,0018797191740575 0,0146315427194294 408023 4034334 579 665 0 True 454 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 501 451 0,0104859260559395 0,0594241382811572 0,010452429999237 0,059510185397116 0,00190501726295185 0,0128622398858418 397886 2589750 579 665 0 True 498 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 546 451 0,0105127808803138 0,052713954719713 0,0105897611963073 0,0522011139085985 0,00180933708791014 0,0108539339649957 398905 2297315 579 665 0 True 542 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 590 451 0,0103900498527267 0,0301414098303667 0,0102845807583734 0,030411230640116 0,00191727002812904 0,00448941526798529 394248 1313586 579 665 0 True 586 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 634 450 0,0102597815535292 0,0388045187356122 0,0102235446707866 0,0387884336614023 0,00182796554307678 0,00611693472829258 389305 1691131 579 665 0 True 630 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 677 450 0,010202435039458 0,0654279323853236 0,0102082856488899 0,0640573739223316 0,00182829761377644 0,00880375560449493 387129 2851400 579 665 0 True 674 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 279 495 0,0102003794199279 0,0545466206142502 0,0102388036926833 0,0540932326237888 0,00142291846983396 0,0180381902299773 387051 2377184 579 665 0 True 278 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 323 495 0,0105991696087721 0,0543150047239867 0,0104982070649271 0,0555886167696651 0,00157472185631377 0,0108065998315677 402183 2367090 579 665 0 True 322 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 367 495 0,0108199905836813 0,0681711373879882 0,0107270923933776 0,0673838406958114 0,00158350530155369 0,0196159858043699 410562 2970951 579 665 0 True 366 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 412 495 0,0107825150584013 0,0890541758378551 0,0106813153276875 0,0857709620813306 0,0017415342554532 0,0248270420001599 409140 3881050 579 665 0 True 410 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 456 494 0,0108170389248688 0,0927726273798481 0,0108644235904479 0,0925459678034638 0,00205509131940844 0,0316090367348789 410450 4043103 579 665 0 True 454 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 501 495 0,0106006454381784 0,04652606567919 0,0106202792401007 0,0478065156023499 0,00179392298483992 0,00734131979046932 402239 2027642 579 665 0 True 498 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 544 493 0,0103587411860371 0,0401851045558506 0,0104829480430304 0,0419775692378119 0,00171193815180944 0,00660004654494492 393060 1751298 579 665 0 True 542 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 588 495 0,0104207260210994 0,096250284672542 0,0104371709773404 0,0938277256427863 0,00185435317443229 0,0187608935938155 395412 4194662 579 665 0 True 586 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 632 495 0,0100770422481204 0,0617616368685504 0,0101167315175097 0,062073701075761 0,00182442851854263 0,0198212315192271 382371 2691620 579 665 0 True 630 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 676 494 0,0100283135236178 0,071248985361091 0,0100251773861295 0,069413290608072 0,00189413315127604 0,0139418857609249 380522 3105086 579 665 0 True 674 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 278 532 0,0133708562959871 0,0406093742022715 0,0107423514152743 0,0460822461280232 0,00769532043420422 0,022667252760714 507354 1769788 579 665 0 False 278 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 324 539 0,0105656999061662 0,103259682738547 0,0105287251087205 0,0956130312046998 0,00153433818349949 0,0313820318529564 400913 4500137 579 665 0 True 322 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 368 539 0,0108855859299695 0,0576292183881539 0,010955977721828 0,060166323338674 0,00143491811031704 0,013546319633989 413051 2511526 579 665 0 True 366 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 411 538 0,010794110860879 0,0569320761276044 0,010757610437171 0,058655680170901 0,00167352065274897 0,0116444426046121 409580 2481144 579 665 0 True 410 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 456 538 0,0108834248940532 0,056139960796934 0,0108033875028611 0,0573739223315785 0,00195366237997686 0,0100706159307768 412969 2446623 579 665 0 True 454 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 500 539 0,0108484002997515 0,0621631671304606 0,0108033875028611 0,0625162127107652 0,00199182460476189 0,015608413724638 411640 2709119 579 665 0 True 498 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 544 539 0,0105115422377764 0,0721660869959288 0,010452429999237 0,0703135728999771 0,00176934504082351 0,0188653678629462 398858 3145054 579 665 0 True 542 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 588 539 0,0101622186881379 0,0565511283358316 0,0102082856488899 0,0578316929884794 0,0017144831996091 0,0147213571666252 385603 2464542 579 665 0 True 586 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 632 539 0,0101028165545366 0,0436281594349802 0,0101319905394064 0,0425879301136797 0,00179057395829381 0,00917667788480455 383349 1901349 579 665 0 True 630 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 676 538 0,00995323070257518 0,0639800462474566 0,00991836423285267 0,0636148622873274 0,00180195679026513 0,0176626070080027 377673 2788300 579 665 0 True 674 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 278 575 0,0135000967854195 0,0340382657261143 0,0106660563057908 0,0371862363622492 0,00750067333936959 0,0186018318141088 512258 1483414 579 665 0 False 278 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 322 575 0,014943668777498 0,0415774845674498 0,0111696040283818 0,0444647898069734 0,0105874954256532 0,0244515632956604 567034 1811979 579 665 0 False 322 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 366 576 0,0131641874709199 0,0400670938045503 0,010955977721828 0,0457465476462959 0,00719999197245665 0,0201296953373325 499512 1746155 579 665 0 False 366 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 410 576 0,0136540047092135 0,0408372269653305 0,0112153810940719 0,0472114137483787 0,0077811684664612 0,0194362039989634 518098 1779718 579 665 0 False 410 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 454 576 0,0175270027367412 0,0675009565571058 0,0114290074006256 0,0739299610894942 0,0164859300465391 0,0431603967985933 665058 2941744 579 665 0 False 454 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 498 576 0,0146118970561552 0,0503323770630513 0,0114900434882124 0,0564431219958801 0,00985133635606004 0,027169027700868 554445 2193524 579 665 0 False 498 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 546 583 0,0102138727173564 0,0568443998529168 0,0102998397802701 0,0564278629739834 0,00188803435020139 0,00879249225739479 387563 2477323 579 665 0 True 542 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 586 576 0,0116061069293748 0,0307113170887851 0,0106813153276875 0,0349431601434348 0,00418189199393198 0,0138338826866909 440391 1338423 579 665 0 False 586 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 633 583 0,0100740378811148 0,0462699206244038 0,0100556954299229 0,0468757152666514 0,00157293663054797 0,00802623712996445 382257 2016479 579 665 0 True 630 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 677 582 0,0100541405382271 0,051756720709992 0,0101167315175097 0,0511635004196231 0,00157455331634147 0,00790615835388402 381502 2255598 579 665 0 True 674 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 278 619 0,0108315073238693 0,0101605581819048 0,0104219119554437 0,0102082856488899 0,0028211223903212 0,00130738571694434 410999 442805 579 665 0 False 278 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 322 619 0,0109555297021868 0,019203169287375 0,0103150988021668 0,0105439841306172 0,00321066090321816 0,0621615066445643 415705 836889 579 665 0 False 322 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 366 619 0,018268923262537 0,0580908210099522 0,0108644235904479 0,0725566491187915 0,017506648840508 0,0352470364444548 693210 2531643 579 665 0 False 366 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 410 619 0,0176849955454988 0,055807704199845 0,0112153810940719 0,0581368734264134 0,0153074981259971 0,0386093765011644 671053 2432143 579 665 0 False 410 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 454 619 0,0115212994467089 0,010164114796031 0,0103608758678569 0,0101319905394064 0,0074423851036954 0,00192173333715953 437173 442960 579 665 0 False 454 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 498 619 0,0106116878046286 0,00994016283556224 0,0100862134737163 0,00994888227664607 0,00435971566828837 0,00200341564032843 402658 433200 579 665 0 False 498 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 542 619 0,0103167591102488 0,00992187495518379 0,0100556954299229 0,00994888227664607 0,0028561602131084 0,00197617458786576 391467 432403 579 665 0 False 542 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 586 619 0,0101666988845497 0,00975629735818145 0,0101319905394064 0,00978103303578241 0,00180768746766775 0,00161321600059954 385773 425187 579 665 0 False 586 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 630 619 0,0100410689063432 0,00977839425755967 0,0098268101014725 0,00978103303578241 0,0018870592972971 0,00145643637204544 381006 426150 579 665 0 False 630 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 674 619 0,00992231734733368 0,0122510671276497 0,00991836423285267 0,00999465934233616 0,00175125367276023 0,0126558283621339 376500 533911 579 665 0 False 674 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 278 669 0,0104860578264222 0,0438282935537516 0,0105134660868238 0,0440985732814527 0,00132074742093654 0,00845067411545274 397891 1910071 579 665 0 True 277 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 322 662 0,0103184194183308 0,0102309561957079 0,0102998397802701 0,0102845807583734 0,00131364597626617 0,00130359363841295 391530 445873 579 665 0 False 322 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 366 662 0,0122388160791087 0,00978727431992662 0,0100709544518196 0,0098268101014725 0,0104803788577812 0,00121131826427108 464399 426537 579 665 0 False 366 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 410 662 0,0114964475336716 0,0099126736502506 0,00999465934233616 0,00985732814526589 0,00747567421158573 0,00141732684620724 436230 432002 579 665 0 False 410 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 454 662 0,00982422740001157 0,00978121660296312 0,00978103303578241 0,0098115510795758 0,00157979308069603 0,00149911147566243 372778 426273 579 665 0 False 454 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 498 662 0,00973064400319781 0,00987093506253618 0,0098115510795758 0,00993362325474937 0,00168006981148059 0,00169671250173665 369227 430183 579 665 0 False 498 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 542 662 0,00982085407565444 0,00963484472224278 0,00985732814526589 0,00961318379491875 0,00168691796355986 0,00175245276078792 372650 419894 579 665 0 False 542 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 586 662 0,00970631917209133 0,00991040200638929 0,00971999694819562 0,0098115510795758 0,00151864119833946 0,00183832665313044 368304 431903 579 665 0 False 586 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 630 662 0,00972089298747798 0,00966433020064466 0,00975051499198901 0,00970473792629892 0,00136041639499108 0,00134795383587356 368857 421179 579 665 0 False 630 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 674 668 0,0098884523332797 0,0423764607214993 0,00991836423285267 0,0427710383764401 0,00134441044948985 0,00941495098105251 375215 1846799 579 665 0 True 674 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G3_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G3_2.csv new file mode 100755 index 0000000..7347704 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G3_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 278 273 0,00851951514260267 0,722487656541216 0,00843823910887312 0,730418860151064 0,00190963276861643 0,185617602773784 323271 31486572 579 665 10 True 278 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 322 273 0,00733471402445107 0,0068899417231566 0,0072632944228275 0,00688181887541009 0,00153577044521057 0,00131040840648644 278314 300269 579 665 0 False 322 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 366 272 0,00722687306140913 0,0073556287147257 0,0072480354009308 0,00737010757610437 0,00130482091249557 0,0014192552316498 274222 320564 579 665 0 True 366 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 411 272 0,00751740062166678 0,0077417163875585 0,00750743877317464 0,00781261921110857 0,00140372161803158 0,00144281693899424 285246 337390 579 665 0 True 410 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 455 272 0,00740708237355008 0,0073825901443928 0,00735484855420768 0,00727855344472419 0,00162759564714236 0,00186850932988892 281060 321739 579 665 0 True 454 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 499 272 0,00725852433135375 0,00693893121450915 0,00714122224765393 0,00694285496299687 0,00176626550727119 0,00148454212729364 275423 302404 579 665 0 True 498 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 544 273 0,00732902153959841 0,00715154790156898 0,0072632944228275 0,0072480354009308 0,00155007836096147 0,00142843137388861 278098 311670 579 665 0 True 542 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 588 273 0,00712799249119081 0,00734466057567815 0,00721751735713741 0,00730907148851759 0,00164013327323127 0,00177465085266632 270470 320086 579 665 0 True 586 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 630 274 0,00812080401604806 0,00764529772588946 0,00804150453955901 0,00759899290455482 0,00215516004089379 0,0018056688592181 308142 333188 579 665 0 False 630 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 672 271 0,00931580416956068 0,715529152476063 0,00935378042267491 0,712199588006409 0,0020543358706543 0,180014503110349 353486 31183315 579 665 9 True 674 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 278 316 0,00725934130834649 0,00703860819363584 0,00717174029144732 0,00704966811627375 0,00155541032945733 0,0014653329098665 275454 306748 579 665 0 False 278 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 322 316 0,00679919878275699 0,00670635159654687 0,00679026474402991 0,00672922865644312 0,00116517107751762 0,0012223343925889 257994 292268 579 665 0 False 322 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 368 318 0,0066441576328118 0,00691683431513093 0,00659189745937285 0,00694285496299687 0,00133164349426539 0,00125506677979299 252111 301441 579 665 0 True 366 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 412 317 0,0067944023371867 0,00697167501036868 0,0068055237659266 0,00709544518196384 0,0014761644591362 0,00146825766266182 257812 303831 579 665 0 True 410 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 456 317 0,0070203623609212 0,00721045002067999 0,00700389105058366 0,00733958953231098 0,00165974607531716 0,00152913154506871 266386 314237 579 665 0 True 454 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 500 317 0,0073911117910468 0,00738197060515789 0,00737010757610437 0,00738536659800107 0,00163494049174639 0,00156445519754189 280454 321712 579 665 0 True 498 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 544 317 0,00770617501518325 0,00756923207538186 0,00772106507972839 0,00755321583886473 0,00154770747743075 0,00142049918307726 292409 329873 579 665 0 True 542 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 588 318 0,00804503598849538 0,00781842452319859 0,00804150453955901 0,00787365529869535 0,00194810795723669 0,00207897733094413 305267 340733 579 665 0 True 586 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 630 317 0,00786711948275342 0,0081219758024037 0,00784313725490196 0,00805676356145571 0,00209007206253499 0,00203139206825607 298516 353962 579 665 0 False 630 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 674 317 0,00746672169402024 0,00784281601233571 0,00752269779507134 0,00782787823300526 0,00192009591846674 0,00199319124140367 283323 341796 579 665 0 False 674 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 280 362 0,00660710377307647 0,00668159297304832 0,00671396963454643 0,00666819256885634 0,00137321709166616 0,00139564654285889 250705 291189 579 665 0 True 278 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 323 362 0,00669046178043269 0,00656640456715146 0,00666819256885634 0,00653086137178607 0,00130709285878199 0,00129099319151205 253868 286169 579 665 0 True 322 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 367 361 0,00677421509923701 0,00670837083553471 0,00677500572213321 0,00671396963454643 0,00127793274011399 0,00120339924173526 257046 292356 579 665 0 True 366 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 412 362 0,00681804196178313 0,00699012351203025 0,0068055237659266 0,00706492713817044 0,00140164110696018 0,0013567939047244 258709 304635 579 665 0 True 410 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 456 362 0,00705828590584235 0,00707103074692912 0,00704966811627375 0,00706492713817044 0,00161960974781179 0,00162290195657542 267825 308161 579 665 0 True 454 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 501 361 0,00726772191104623 0,00708071391571169 0,00727855344472419 0,00717174029144732 0,00158963870045021 0,00164901427249052 275772 308583 579 665 0 True 498 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 542 360 0,00741127267489995 0,00726889322183922 0,00733958953231098 0,00727855344472419 0,00145812316536276 0,0016874354729897 281219 316784 579 665 0 False 542 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 588 362 0,00746964699873619 0,00758802476550727 0,00744640268558785 0,00761425192645151 0,00198762247861776 0,00194049554308798 283434 330692 579 665 0 True 586 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 632 361 0,00733740214229815 0,00721616354917966 0,0072480354009308 0,0072632944228275 0,00198361538386417 0,00179154738460747 278416 314486 579 665 0 True 630 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 676 362 0,00670016008795943 0,00678462005322301 0,00674448767833982 0,0068207827878233 0,00180997695730912 0,00181043702046771 254236 295679 579 665 0 True 674 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 280 406 0,00657508354578029 0,00665504456953783 0,00657663843747616 0,00660715648126955 0,00146561110051041 0,00137334502159886 249490 290032 579 665 0 True 278 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 324 407 0,00678117258072359 0,00721086304683659 0,00675974670023652 0,00709544518196384 0,00126749423484381 0,00250046832580551 257310 314255 579 665 0 True 322 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 368 406 0,00693518592090371 0,00691990906540785 0,00698863202868696 0,00691233691920348 0,0013880770906945 0,00129563035537148 263154 301575 579 665 0 True 366 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 412 406 0,00716797165564209 0,00692185946670292 0,0072327763790341 0,00694285496299687 0,00160908034550398 0,0014144427831773 271987 301660 579 665 0 True 410 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 457 406 0,00709468091316417 0,00699039886280132 0,00712596322575723 0,00703440909437705 0,00161826682313217 0,00153009324839749 269206 304647 579 665 0 True 454 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 500 407 0,00708118761573566 0,00710313205765616 0,00709544518196384 0,0072632944228275 0,00164382049544258 0,00162414898050165 268694 309560 579 665 0 True 498 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 545 406 0,00726759014056353 0,00739387952600659 0,0072327763790341 0,00747692072938125 0,00163752172254111 0,00146446425725386 275767 322231 579 665 0 True 542 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 589 406 0,00683886169804978 0,00690049683604755 0,0068207827878233 0,00694285496299687 0,00176551547255016 0,00192342983282182 259499 300729 579 665 0 True 586 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 633 406 0,00645743885882545 0,0063256332637499 0,0063935301747158 0,0064087891966125 0,0018034106406063 0,00185732901491803 245026 275676 579 665 0 True 630 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 677 406 0,00617726845850804 0,00634449479156807 0,00628671702143893 0,00636301213092241 0,00171534824130727 0,00172527602603356 234395 276498 579 665 0 True 674 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 280 451 0,00649586313158087 0,00663320007503309 0,00646982528419928 0,00660715648126955 0,00148745178017442 0,00146711233922279 246484 289080 579 665 0 True 278 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 324 451 0,00680997760824187 0,00681447266598632 0,0068055237659266 0,00679026474402991 0,00148836794023053 0,00139412920054725 258403 296980 579 665 0 True 322 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 368 451 0,00692946708195452 0,0067890256655601 0,00691233691920348 0,00675974670023652 0,00132640442265876 0,00138710781346268 262937 295871 579 665 0 True 366 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 412 450 0,00702892744229672 0,00719987196189145 0,00704966811627375 0,00732433051041428 0,00170445751523639 0,00163126639949677 266711 313776 579 665 0 True 410 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 457 450 0,00722065349462568 0,00707130609770019 0,0072632944228275 0,00706492713817044 0,00188526534778392 0,00186630501077048 273986 308173 579 665 0 True 454 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 501 451 0,00703406649112203 0,0071362659337747 0,00694285496299687 0,00709544518196384 0,00175061399101319 0,00181986230110309 266906 311004 579 665 0 True 498 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 546 451 0,00663912400037265 0,00673427675391271 0,00679026474402991 0,00672922865644312 0,00177532491257964 0,00171665413552665 251920 293485 579 665 0 True 542 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 590 451 0,00620090808310448 0,00624743364476653 0,00614938582436866 0,00621042191195544 0,00184968199574111 0,00179275933923593 235292 272268 579 665 0 True 586 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 634 450 0,00605572336526527 0,00591841241923761 0,00607309071488518 0,0059510185397116 0,00174486360176736 0,00186091485275121 229783 257929 579 665 0 True 630 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 677 450 0,006249926702669 0,00607699151747531 0,00625619897764553 0,00605783169298848 0,00176833339550411 0,00186091278252932 237152 264840 579 665 0 True 674 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 279 495 0,00641959437619392 0,00660004325301696 0,00642404821850919 0,00657663843747616 0,00142966081937205 0,00155127606807234 243590 287635 579 665 0 True 278 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 323 495 0,00666914131633178 0,00673546994058733 0,00665293354695964 0,00672922865644312 0,00155434071543621 0,00142564895296852 253059 293537 579 665 0 True 322 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 367 495 0,00673328718731029 0,00690552198761954 0,00666819256885634 0,00689707789730678 0,00155527767918851 0,00138283114684731 255493 300948 579 665 0 True 366 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 412 495 0,00700357480142518 0,0069969154977166 0,00712596322575723 0,00701915007248035 0,00176366891756964 0,00162964693370651 265749 304931 579 665 0 True 410 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 456 494 0,00693792674694388 0,0070850736362536 0,00686655985351339 0,00709544518196384 0,00186262178588873 0,00186070338114063 263258 308773 579 665 0 True 454 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 501 495 0,00658631039090636 0,00639488398267355 0,00660715648126955 0,0064087891966125 0,00166972382309698 0,00163399196162584 249916 278694 579 665 0 True 498 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 544 493 0,006134812008982 0,00628059046678266 0,00621042191195544 0,00631723506523232 0,00161868912753943 0,0015716102823206 232784 273713 579 665 0 True 542 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 588 495 0,00600214548699933 0,00613047840475531 0,00604257267109178 0,00610360875867857 0,00170140801357557 0,00182775349617527 227750 267171 579 665 0 True 586 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 632 495 0,00604333693989144 0,00596281273107236 0,00611886778057527 0,0059510185397116 0,0016357666786919 0,00165314487847543 229313 259864 579 665 0 True 630 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 676 494 0,00608858692365073 0,00626730479207862 0,00611886778057527 0,00622568093385214 0,00179712419349144 0,00185938523721149 231030 273134 579 665 0 True 674 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 278 532 0,00648658648959876 0,00653313301564738 0,00651560234988937 0,00660715648126955 0,00138642689234418 0,00149532025442872 246132 284719 579 665 0 False 278 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 324 539 0,00660578606824947 0,00658368282803599 0,00662241550316625 0,00659189745937285 0,00139938421874593 0,00140370845485956 250655 286922 579 665 0 True 322 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 368 539 0,00675405421538386 0,00682801074556384 0,00675974670023652 0,00688181887541009 0,00137933027288236 0,00139507225550145 256281 297570 579 665 0 True 366 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 411 538 0,00655840140267043 0,00669822874880036 0,00660715648126955 0,00675974670023652 0,00165014458009468 0,00167457078922775 248857 291914 579 665 0 True 410 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 456 538 0,00648795690261885 0,00640016153911903 0,00651560234988937 0,0063935301747158 0,00181601931088406 0,00188660026641481 246184 278924 579 665 0 True 454 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 500 539 0,00647253975614291 0,00642338278747911 0,00643930724040589 0,00634775310902571 0,00179916377395694 0,00186629468784103 245599 279936 579 665 0 True 498 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 544 539 0,00619334445739748 0,00636927636096421 0,00617990386816205 0,0063935301747158 0,00165376924899887 0,00177269983939429 235005 277578 579 665 0 True 542 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 588 539 0,00615289091920849 0,00636028156910932 0,00613412680247196 0,00645456626230259 0,00158204717992181 0,00154740243361368 233470 277186 579 665 0 True 586 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 632 539 0,00613879147755955 0,00614316748612203 0,00610360875867857 0,00624093995574884 0,00161492146879456 0,00180979091912293 232935 267724 579 665 0 True 630 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 676 538 0,00632740774649678 0,00652383992712383 0,00636301213092241 0,00656137941557946 0,00170713671570921 0,00166345864062431 240092 284314 579 665 0 True 674 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 278 575 0,00682631714809671 0,00667353896299458 0,00675974670023652 0,00668345159075303 0,00126056426463318 0,00131367421916414 259023 290838 579 665 0 False 278 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 322 575 0,00674359163905746 0,00685166796597812 0,00674448767833982 0,00679026474402991 0,00140805320863179 0,00136500716616857 255884 298601 579 665 0 False 322 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 366 576 0,00667493921757059 0,00669090900746946 0,00662241550316625 0,00671396963454643 0,00129337050045027 0,0012748928590292 253279 291595 579 665 0 False 366 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 410 576 0,00645430272133719 0,00651381256987743 0,00653086137178607 0,00651560234988937 0,00149372477633808 0,00152152619582813 244907 283877 579 665 0 False 410 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 454 576 0,00652490534596801 0,00627058605543385 0,00653086137178607 0,00622568093385214 0,00192005062254527 0,00179612645564766 247586 273277 579 665 0 False 454 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 498 576 0,0065100943437125 0,0065880425485779 0,0063782711528191 0,00656137941557946 0,00190450788953378 0,00204219837524539 247024 287112 579 665 0 False 498 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 546 583 0,00620472942710279 0,00633930901871295 0,00617990386816205 0,00634775310902571 0,00187164359216038 0,00171403092951274 235437 276272 579 665 0 True 542 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 586 576 0,00621579814764962 0,00628878215222194 0,00614938582436866 0,00628671702143893 0,00157935961162602 0,00148314532070313 235857 274070 579 665 0 False 586 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 633 583 0,00620454494842701 0,00628921812427613 0,00614938582436866 0,00628671702143893 0,00147834176721146 0,0013901070307226 235430 274089 579 665 0 True 630 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 677 582 0,00616158777106671 0,00638871153622211 0,00619516289005875 0,00633249408712902 0,00149880046196691 0,00168327915684746 233800 278425 579 665 0 True 674 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 278 619 0,00704495073299308 0,00679597827252957 0,00703440909437705 0,0068055237659266 0,00141408777448452 0,00143150700373069 267319 296174 579 665 0 False 278 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 322 619 0,0074641917007524 0,0172667879357354 0,00701915007248035 0,0072480354009308 0,00343529367248914 0,0717607197189205 283227 752500 579 665 0 False 322 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 366 619 0,00639163267976492 0,00644704000789339 0,00643930724040589 0,00643930724040589 0,00138366772040214 0,00123445707945853 242529 280967 579 665 0 False 366 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 410 619 0,00624022839514225 0,0061860763146135 0,00630197604333562 0,00625619897764553 0,00147087729102902 0,00135074256027569 236784 269594 579 665 0 False 410 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 454 619 0,00619247477221166 0,00632593156041856 0,00613412680247196 0,00636301213092241 0,00173374108355158 0,00188370913760417 234972 275689 579 665 0 False 454 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 498 619 0,0063590590164414 0,00635681673857337 0,00628671702143893 0,00636301213092241 0,00177820400345953 0,00183670228632555 241293 277035 579 665 0 False 498 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 542 619 0,00631739318981156 0,00641668258538312 0,00634775310902571 0,0064087891966125 0,00185202787629915 0,00206210600340494 239712 279644 579 665 0 False 542 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 586 619 0,00629868178126811 0,00620523613910033 0,00633249408712902 0,00631723506523232 0,00145696988863464 0,00150695436333878 239002 270429 579 665 0 False 586 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 630 619 0,00641940989751814 0,00630131061230554 0,0063782711528191 0,00630197604333562 0,00152592676478056 0,00129609933994068 243583 274616 579 665 0 False 630 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 674 619 0,00662742278150886 0,00766542127807502 0,00669871061264973 0,00677500572213321 0,00149727690010666 0,00587291480514799 251476 334065 579 665 0 False 674 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 278 669 0,00842155696576326 0,714181884099124 0,00807202258335241 0,723292896925307 0,00221621800075287 0,18723865575595 319554 31124600 579 665 9 True 277 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 322 662 0,00711233815784602 0,00657544525080153 0,00704966811627375 0,00665293354695964 0,00154653152978156 0,00126778381780024 269876 286563 579 665 0 False 322 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 366 662 0,00604072788433398 0,00606372878866886 0,00602731364919509 0,00608834973678187 0,00120201283530147 0,0011831649326904 229214 264262 579 665 0 False 366 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 410 662 0,00583519228541803 0,00614064343738724 0,00584420538643473 0,00619516289005875 0,00133236300926745 0,00137049089789371 221415 267614 579 665 0 False 410 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 454 662 0,00604383766772571 0,00600631815290114 0,00607309071488518 0,0059662775616083 0,00141967196856491 0,0013800839471588 229332 261760 579 665 0 False 454 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 498 662 0,00611960569527839 0,00612187369315943 0,00608834973678187 0,00607309071488518 0,0015431864907554 0,00158416836334343 232207 266796 579 665 0 False 498 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 542 662 0,00600941921764438 0,00623479045519498 0,005981536583505 0,00617990386816205 0,00166628859022019 0,00162179139858832 228026 271717 579 665 0 False 542 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 586 662 0,0063504412268728 0,00630865329953403 0,0064087891966125 0,00627145799954223 0,0013077566525946 0,00144304111518087 240966 274936 579 665 0 False 586 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 630 662 0,00667509734214983 0,00654543201675509 0,00666819256885634 0,00653086137178607 0,00136605117503072 0,00131750628214056 253285 285255 579 665 0 False 630 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 674 668 0,00871313868988252 0,706095589167471 0,00816357671473259 0,715632867933166 0,00318993138723154 0,20860622875049 330618 30772193 579 665 11 True 674 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G3_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G3_3.csv new file mode 100755 index 0000000..09f46b6 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G3_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 278 273 0,000986512895784175 0,0710693648747641 0,00080872816052491 0,070923933775845 0,000763793835771068 0,0203353041411787 37433 3097258 579 665 0 True 278 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 322 273 0,000952305278475173 0,000833578567613816 0,000839246204318303 0,000717174029144732 0,000638409423053552 0,000614852431678691 36135 36328 579 665 0 False 322 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 366 272 0,000962952333477359 0,000930524984927414 0,000854505226215 0,00080872816052491 0,000681215550638516 0,00068311184066888 36539 40553 579 665 0 True 366 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 411 272 0,000970384188701656 0,000901291911399006 0,000747692072938125 0,000701915007248035 0,000760107358793891 0,000685925940340154 36821 39279 579 665 0 True 410 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 455 272 0,000909453517501031 0,000893650927501863 0,000656137941557946 0,000595101853971161 0,0008483223143157 0,000865722903490548 34509 38946 579 665 0 True 454 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 499 272 0,000920943903592498 0,000939382101396774 0,000686655985351339 0,000732433051041428 0,000867912732562717 0,000810109073618169 34945 40939 579 665 0 True 498 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 544 273 0,000932987725711307 0,000888327479261211 0,000747692072938125 0,000686655985351339 0,000790984695574936 0,00077689114365527 35402 38714 579 665 0 True 542 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 588 273 0,0009552832913842 0,00100431899157369 0,000656137941557946 0,000671396963454643 0,000899611001192297 0,00097127450926276 36248 43769 579 665 0 True 586 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 630 274 0,00102361946371258 0,00102788442839761 0,000625619897764553 0,000732433051041428 0,000986518306620963 0,00100125086421762 38841 44796 579 665 0 False 630 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 672 271 0,00106744632625871 0,0708869908807266 0,00080872816052491 0,07006942854963 0,00097376433925156 0,0201124651457635 40504 3089310 579 665 0 True 674 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 278 316 0,000950117888462348 0,000987224297869875 0,00080872816052491 0,000854505226215 0,000762280626030171 0,000754846291237445 36052 43024 579 665 0 False 278 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 322 316 0,000920759424916718 0,000981281310394319 0,000762951094834821 0,000885023270008392 0,000676779858451428 0,000621000457156638 34938 42765 579 665 0 False 322 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 368 318 0,000864282596031363 0,000905215659886728 0,000762951094834821 0,000793469138628214 0,000643488709705035 0,000659326740148574 32795 39450 579 665 0 True 366 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 412 317 0,000907740501225927 0,000920750032554492 0,000701915007248035 0,000717174029144732 0,000767978357353627 0,000768240492862225 34444 40127 579 665 0 True 410 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 456 317 0,000914039130299002 0,000930226688258756 0,000671396963454643 0,000671396963454643 0,000851626224028207 0,000865577425873389 34683 40540 579 665 0 True 454 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 500 317 0,000960316923823352 0,000980386420388348 0,000717174029144732 0,000793469138628214 0,000854231171677702 0,000841887410337333 36439 42726 579 665 0 True 498 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 544 317 0,000973441263900304 0,000960584110769026 0,000778210116731518 0,000823987182421607 0,000840630698985008 0,000751123149059187 36937 41863 579 665 0 True 542 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 588 318 0,00100670013373386 0,000997641735375289 0,000686655985351339 0,000579842832074464 0,0010264660156975 0,00107605010624377 38199 43478 579 665 0 True 586 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 630 317 0,00107437745364874 0,00100046408077874 0,000701915007248035 0,000625619897764553 0,00110101158371031 0,00104812404127192 40767 43601 579 665 0 False 630 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 674 317 0,000993786626429232 0,00101274013598886 0,000579842832074464 0,000671396963454643 0,00100437140789562 0,00103029068476297 37709 44136 579 665 0 False 674 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 280 362 0,000862516871563179 0,00091776706586792 0,000717174029144732 0,000747692072938125 0,000690074500124333 0,000742062209649212 32728 39997 579 665 0 True 278 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 323 362 0,000968802942909252 0,00101948622988003 0,000823987182421607 0,000915541313801785 0,000701749615163427 0,000725106182513143 36761 44430 579 665 0 True 322 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 367 361 0,000944399049513154 0,000915265963030717 0,000869764248111696 0,000793469138628214 0,000671365860431389 0,000681641790654766 35835 39888 579 665 0 True 366 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 412 362 0,000921892651067941 0,00087410102275602 0,000656137941557946 0,000701915007248035 0,000828612203044993 0,000729949556485098 34981 38094 579 665 0 True 410 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 456 362 0,000857746780089427 0,00085310552646207 0,000579842832074464 0,000549324788281071 0,000809665393280747 0,000832120751345708 32547 37179 579 665 0 True 454 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 501 361 0,0009383112532124 0,000979445638587198 0,000671396963454643 0,000625619897764553 0,000880766094462791 0,000948678135297877 35604 42685 579 665 0 True 498 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 542 360 0,000925186913135448 0,000942938715523072 0,000686655985351339 0,000732433051041428 0,000838860301801195 0,000854956278109395 35106 41094 579 665 0 False 542 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 588 362 0,000950750386779309 0,0010299954509758 0,000595101853971161 0,000579842832074464 0,000996093463935995 0,00113057392499251 36076 44888 579 665 0 True 586 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 632 361 0,00103679651198261 0,000935687811884942 0,000717174029144732 0,000625619897764553 0,00101975436577214 0,000963692311144285 39341 40778 579 665 0 True 630 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 676 362 0,000922946814929543 0,000938762562161871 0,000503547722590982 0,000579842832074464 0,000964362191127638 0,000987486391052564 35021 40912 579 665 0 True 674 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 280 406 0,000873295697048065 0,000890805636200825 0,000671396963454643 0,000701915007248035 0,000789188478534965 0,000770402982988197 33137 38822 579 665 0 True 278 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 324 407 0,000863702805907482 0,000932636007505603 0,000732433051041428 0,000839246204318303 0,000705958065686573 0,000686188590677627 32773 40645 579 665 0 True 322 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 368 406 0,000931590958594684 0,000898171269326899 0,00080872816052491 0,000762951094834821 0,000667343700888164 0,000713910304671206 35349 39143 579 665 0 True 366 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 412 406 0,00102332956865064 0,000900374075495445 0,00080872816052491 0,000671396963454643 0,000847554449590518 0,000784412952617893 38830 39239 579 665 0 True 410 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 457 406 0,000889213571358262 0,000928322178758868 0,000625619897764553 0,000717174029144732 0,000865143320392615 0,000798374209025679 33741 40457 579 665 0 True 454 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 500 407 0,000948694767249184 0,00098453962785196 0,000671396963454643 0,000717174029144732 0,000913026914990851 0,000914844245361913 35998 42907 579 665 0 True 498 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 545 406 0,00101776885428069 0,000932131197758645 0,000793469138628214 0,000747692072938125 0,00089392654544475 0,000779464817560781 38619 40623 579 665 0 True 542 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 589 406 0,00108976824602814 0,000974581108298326 0,000793469138628214 0,000579842832074464 0,00100314633808867 0,00103143982123645 41351 42473 579 665 0 True 586 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 633 406 0,000897515111768382 0,000878598418683468 0,000534065766384375 0,000457770656900893 0,000918680843922941 0,000940488960323054 34056 38290 579 665 0 True 630 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 677 406 0,000877064332853294 0,000950740320703338 0,000595101853971161 0,000579842832074464 0,000846035702291381 0,000961740494892018 33280 41434 579 665 0 True 674 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 280 451 0,000848654616783106 0,000973456759316465 0,000671396963454643 0,000839246204318303 0,000783380019563641 0,000845158600447844 32202 42424 579 665 0 True 278 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 324 451 0,000969277316646974 0,00088695072540587 0,000823987182421607 0,000732433051041428 0,000796937884970899 0,000780120916451517 36779 38654 579 665 0 True 322 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 368 451 0,000941078433349106 0,00089583078777282 0,000823987182421607 0,000747692072938125 0,000721185540101567 0,000701562600615002 35709 39041 579 665 0 True 366 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 412 450 0,000902285203242134 0,000958748438961905 0,000717174029144732 0,000732433051041428 0,000834201006601692 0,000885185288196355 34237 41783 579 665 0 True 410 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 457 450 0,000969698982191615 0,000959115573323329 0,00064087891966125 0,000549324788281071 0,0010225669194302 0,00101160259694642 36795 41799 579 665 0 True 454 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 501 451 0,000951989029316692 0,000990964479176885 0,000625619897764553 0,000610360875867857 0,00096357310273363 0,00102287401316717 36123 43187 579 665 0 True 498 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 546 451 0,000935939384523794 0,000942342122185757 0,000671396963454643 0,000671396963454643 0,000912520835537618 0,000881381728674421 35514 41068 579 665 0 True 542 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 590 451 0,000953543921012556 0,000884541406159023 0,000610360875867857 0,000488288700694286 0,000982711549682622 0,000935604944590978 36182 38549 579 665 0 True 586 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 634 450 0,000791492581387709 0,000998605463074027 0,000442511635004196 0,000656137941557946 0,000844285856815855 0,00103574916998301 30033 43520 579 665 0 True 630 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 677 450 0,000904630717834199 0,000911663457109241 0,000564583810177768 0,000473029678797589 0,000950758689057818 0,000997424958641159 34326 39731 579 665 0 True 674 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 279 495 0,000937573338509278 0,000894499925712657 0,000823987182421607 0,000732433051041428 0,000754944060473463 0,000773724427077008 35576 38983 579 665 0 True 278 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 323 495 0,000914408087650563 0,000914852936874115 0,00080872816052491 0,000732433051041428 0,00076358907333615 0,000809293740753175 34697 39870 579 665 0 True 322 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 367 495 0,000907529668453606 0,000943695930143509 0,000778210116731518 0,000778210116731518 0,000751565072554404 0,000787857789308102 34436 41127 579 665 0 True 366 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 412 495 0,000856139180200484 0,000871416352738105 0,00064087891966125 0,000625619897764553 0,0008524870748589 0,000860488768395725 32486 37977 579 665 0 True 410 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 456 494 0,000895433138141717 0,00079636032172443 0,000473029678797589 0,000442511635004196 0,00100552525929083 0,000880820149365321 33977 34706 579 665 0 True 454 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 501 495 0,000895301367659017 0,000895624274694518 0,00064087891966125 0,000534065766384375 0,000884738624004978 0,000940786170933906 33972 39032 579 665 0 True 498 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 544 493 0,000992547983891849 0,000961065974618395 0,000732433051041428 0,000686655985351339 0,000903337030161179 0,00090186063967884 37662 41884 579 665 0 True 542 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 588 495 0,000931248355339663 0,000907097223489027 0,000564583810177768 0,000534065766384375 0,000975498861676626 0,000950653731079666 35336 39532 579 665 0 True 586 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 632 495 0,000928850132554517 0,000906844818615548 0,000625619897764553 0,000549324788281071 0,000934737248908581 0,000962509007471516 35245 39521 579 665 0 True 630 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 676 494 0,000909664350273351 0,000913430291223596 0,000579842832074464 0,000579842832074464 0,000934837175985444 0,000954754252153581 34517 39808 579 665 0 True 674 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 278 532 0,000882256089871686 0,0010178800170488 0,000701915007248035 0,000885023270008392 0,000771402938908597 0,000809408635633969 33477 44360 579 665 0 False 278 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 324 539 0,000917939536586931 0,000914439910717512 0,000823987182421607 0,000778210116731518 0,000700381556996238 0,000747624528248597 34831 39852 579 665 0 True 322 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 368 539 0,000922156192033341 0,000870108436575531 0,000793469138628214 0,000747692072938125 0,000725736551475355 0,000729138320918761 34991 37920 579 665 0 True 366 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 411 538 0,000905263216151161 0,000861480779082061 0,000656137941557946 0,000595101853971161 0,00086693659756205 0,00083890904645807 34350 37544 579 665 0 True 410 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 456 538 0,000838534643711722 0,000860585889076089 0,000381475547417411 0,000366216525520714 0,000934594664573909 0,00100102244188203 31818 37505 579 665 0 True 454 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 500 539 0,00088813305340012 0,000916780392271592 0,000488288700694286 0,000473029678797589 0,000964236525905001 0,00103954784979683 33700 39954 579 665 0 True 498 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 544 539 0,000963268582635839 0,000949776593004599 0,000595101853971161 0,000503547722590982 0,000951722679836624 0,00103342966589472 36551 41392 579 665 0 True 542 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 588 539 0,000902759576979855 0,00100739374185062 0,000671396963454643 0,00080872816052491 0,000822677890499179 0,000804765207315598 34255 43903 579 665 0 True 586 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 632 539 0,00089242877113615 0,000925775184126487 0,000549324788281071 0,000503547722590982 0,000902257937728779 0,000973662665396013 33863 40346 579 665 0 True 630 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 676 538 0,000902100724566353 0,0008883504251588 0,000579842832074464 0,000518806744487678 0,000905937756303753 0,000926899707780037 34230 38715 579 665 0 True 674 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 278 575 0,000919072762738154 0,000990826803791351 0,000762951094834821 0,000869764248111696 0,000724758109175326 0,000683450377171097 34874 43181 579 665 0 False 278 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 322 575 0,000907055294715885 0,000930823281596071 0,000778210116731518 0,000823987182421607 0,000713308040096769 0,000740839652915087 34418 40566 579 665 0 False 322 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 366 576 0,000986960915425356 0,00097939974679202 0,000823987182421607 0,000823987182421607 0,000734316016289602 0,000722500460484373 37450 42683 579 665 0 False 366 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 410 576 0,000820508441678318 0,000907303736567328 0,000610360875867857 0,000701915007248035 0,000751109463909931 0,000790261967718731 31134 39541 579 665 0 False 410 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 454 576 0,000977895106215574 0,000884541406159023 0,000671396963454643 0,000473029678797589 0,00100654339161728 0,0009597030401025 37106 38549 579 665 0 False 454 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 498 576 0,000890610338474886 0,000953379098926075 0,000457770656900893 0,000488288700694286 0,00101973642994778 0,00111664694923215 33794 41549 579 665 0 False 498 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 546 583 0,000937731463088518 0,000873091403262104 0,000579842832074464 0,000488288700694286 0,00102496305372121 0,000906925776496124 35582 38050 579 665 0 True 542 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 586 576 0,000923315772281104 0,00102854985942769 0,000671396963454643 0,000778210116731518 0,000860532399502099 0,000887484233079508 35035 44825 579 665 0 False 586 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 633 583 0,0009050260292823 0,000892182390056166 0,000701915007248035 0,000671396963454643 0,000797849576137717 0,000741511081014816 34341 38882 579 665 0 True 630 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 677 582 0,000865442176279126 0,000838374260209921 0,000610360875867857 0,000503547722590982 0,000806600263095591 0,000845238892738987 32839 36537 579 665 0 True 674 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 278 619 0,000963321290828919 0,000926738911825226 0,00080872816052491 0,000762951094834821 0,000752437698418619 0,000719071363714113 36553 40388 579 665 0 False 278 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 322 619 0,00090078301973935 0,00200430120850306 0,000762951094834821 0,000854505226215 0,000717021881603567 0,00880685207407222 34180 87349 579 665 0 False 322 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 366 619 0,000927954093272155 0,000856065547251053 0,000854505226215 0,000747692072938125 0,000684042205412818 0,000630618933686052 35211 37308 579 665 0 False 366 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 410 619 0,000868683730153553 0,000850558531829689 0,000686655985351339 0,000671396963454643 0,000736081718526393 0,000688032510015502 32962 37068 579 665 0 False 410 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 454 619 0,000906686337364324 0,000851315746450126 0,000579842832074464 0,000442511635004196 0,00093107248092446 0,000938706965284356 34404 37101 579 665 0 False 454 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 498 619 0,000935359594399913 0,000903311150386839 0,000534065766384375 0,000488288700694286 0,000981177567939061 0,00100530751971554 35492 39367 579 665 0 False 498 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 542 619 0,00089250783342577 0,000932222981349001 0,000473029678797589 0,000534065766384375 0,000956275220281896 0,00100327295212042 33866 40627 579 665 0 False 542 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 586 619 0,000944873423250875 0,000972080005461124 0,000717174029144732 0,000747692072938125 0,000767607229019529 0,000864451795230633 35853 42364 579 665 0 False 586 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 630 619 0,00096780148724073 0,000968064473383046 0,000823987182421607 0,00080872816052491 0,000717832714172257 0,000743310857881541 36723 42189 579 665 0 False 630 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 674 619 0,000941552807086827 0,000919143819723261 0,000717174029144732 0,000671396963454643 0,000800710459427768 0,000898436742847124 35727 40057 579 665 0 False 674 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 278 669 0,00108410211527203 0,0701787428057441 0,000930800335698482 0,0702525368123903 0,000753251145131285 0,0199562917767551 41136 3058444 579 665 0 True 277 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 322 662 0,000907766855322467 0,000895739004182464 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,000664188968386002 0,0006709324212232 34445 39037 579 665 0 False 322 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 366 662 0,000946217482174419 0,000942915769625483 0,000854505226215 0,000869764248111696 0,000654440791462258 0,000619895790585846 35904 41093 579 665 0 False 366 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 410 662 0,000880121408051941 0,000819696299572461 0,000686655985351339 0,000656137941557946 0,000728658601374825 0,000687635691990251 33396 35723 579 665 0 False 410 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 454 662 0,000873348405241145 0,000816483873909998 0,000656137941557946 0,000595101853971161 0,000761874575698537 0,000769397860445877 33139 35583 579 665 0 False 454 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 498 662 0,000865468530375666 0,000936972782149927 0,000549324788281071 0,000701915007248035 0,000832002090095011 0,00084330266151892 32840 40834 579 665 0 False 498 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 542 662 0,000926399201576291 0,000936032000348778 0,000625619897764553 0,000595101853971161 0,000847220879429329 0,00091801952580054 35152 40793 579 665 0 False 542 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 586 662 0,000983113217330507 0,000999821595646245 0,000778210116731518 0,000869764248111696 0,000760405727731903 0,000674099112728837 37304 43573 579 665 0 False 586 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 630 662 0,00101031064495985 0,00096866106672036 0,000839246204318303 0,000839246204318303 0,000794903707652746 0,000695113013430458 38336 42215 579 665 0 False 630 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 674 668 0,00104765439975712 0,0701177296640549 0,000869764248111696 0,0702220187685969 0,000771951245419749 0,0229344166310814 39753 3055785 579 665 0 True 674 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G4_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G4_1.csv new file mode 100755 index 0000000..4d209b9 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G4_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 255 249 0,0100245448878126 0,0445470049580348 0,00993362325474937 0,0445258258945602 0,00152555572642032 0,0092965667895576 380379 1941393 579 665 0 True 255 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 299 250 0,00982441187868735 0,00981478645113585 0,0097962920576791 0,00985732814526589 0,0013714566625227 0,00128317247961094 372785 427736 579 665 0 False 299 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 343 248 0,0101421895747674 0,0569293914575865 0,010101472495613 0,0582131685358969 0,00136907770888176 0,00966647055419921 384843 2481027 579 665 0 True 343 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 387 248 0,00996511640011475 0,0752302592140686 0,00993362325474937 0,0749217975127794 0,001351447417818 0,0100256087256662 378124 3278593 579 665 0 True 387 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 432 247 0,0102547742751866 0,0624991868547542 0,0102082856488899 0,06152437628748 0,00168612108375833 0,0133028930322169 389115 2723763 579 665 0 True 431 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 476 248 0,00980285422771758 0,0582677568262611 0,0098115510795758 0,0607766842145418 0,00166319577939355 0,0154340667461667 371967 2539354 579 665 0 True 475 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 520 249 0,00996783087205837 0,0703038438393994 0,00996414129854276 0,068863965819791 0,00157135646749872 0,0187371709127401 378227 3063896 579 665 0 True 519 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 564 248 0,00991601871826061 0,0619089495310719 0,00985732814526589 0,0608224612802319 0,00153156247616752 0,0155420244588931 376261 2698040 579 665 0 True 563 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 607 250 0,0098526634701783 0,00995448107565779 0,00991836423285267 0,00985732814526589 0,00193819165992991 0,00202829672339583 373857 433824 579 665 0 False 607 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 650 248 0,0100074410791581 0,04380403974 0,00994888227664607 0,0441596093690394 0,00176130775312378 0,00813665571575307 379730 1909014 579 665 0 True 652 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 255 293 0,00976087215192926 0,00990996603433509 0,00968947890440223 0,00996414129854276 0,0014605390461695 0,00152823132088284 370374 431884 579 665 0 False 255 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 299 293 0,00994888227664607 0,0100168709712023 0,00997940032043946 0,0100404364080262 0,00127774070179604 0,00133425895114274 377508 436543 579 665 0 False 299 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 344 293 0,0101611118160832 0,0967033514204371 0,0101319905394064 0,0930342565041581 0,00127816207329665 0,0208215204826517 385561 4214407 579 665 0 True 343 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 387 292 0,0101131737144768 0,0476440357015221 0,0101777676050965 0,0476234073395895 0,00135950054561997 0,00862012231196689 383742 2076364 579 665 0 True 387 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 432 292 0,0103921054722568 0,0681371315677612 0,0103608758678569 0,0666666666666667 0,00178134114651767 0,0153909164971972 394326 2969469 579 665 0 True 431 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 476 292 0,00991644038380525 0,0377191318878565 0,00993362325474937 0,038956282902266 0,00175089824714333 0,00739657917766995 376277 1643829 579 665 0 True 475 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 519 293 0,00998290541527929 0,0407934691386282 0,0100709544518196 0,0425268940260929 0,00166303432270498 0,0101478567743977 378799 1777811 579 665 0 False 519 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 565 292 0,0100394085982612 0,0449693012572631 0,00999465934233616 0,0467689021133745 0,00173488401805896 0,00781602703944199 380943 1959797 579 665 0 True 563 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 607 293 0,0100018013024985 0,00981366210215399 0,00997940032043946 0,00975051499198901 0,00196502953758566 0,00189625862905802 379516 427687 579 665 0 False 607 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 651 293 0,00977144014464182 0,00971194293814187 0,00984206912336919 0,0097962920576791 0,00177513591975809 0,00200905033682942 370775 423254 579 665 0 False 651 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 256 337 0,0101841452964592 0,0537397281255324 0,0100862134737163 0,0536049439230945 0,00148235428609464 0,0118170747407216 386435 2342019 579 665 0 True 255 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 300 338 0,0101150185012346 0,0667037013453753 0,0100709544518196 0,0669413290608072 0,00142626904094575 0,021363761552625 383812 2906999 579 665 0 True 299 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 344 337 0,0101095895573474 0,0383618464793249 0,0101167315175097 0,0394445716029602 0,00133124793603957 0,00775394939083527 383606 1671839 579 665 0 True 343 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 388 337 0,010093223663396 0,0354613473486876 0,0101472495613031 0,0357671473258564 0,00142084104018158 0,00634075262282309 382985 1545433 579 665 0 True 387 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 432 336 0,0103077723633286 0,0707125102754598 0,0101930266269932 0,0710917830167086 0,00164893802340984 0,0140080876199793 391126 3081706 579 665 0 True 431 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 477 337 0,0101072703968518 0,0308831130240341 0,010101472495613 0,0314030670634012 0,00166392611435826 0,00551879470608556 383518 1345910 579 665 0 True 475 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 520 336 0,0101912872566216 0,0278002628452569 0,0101930266269932 0,0279850461585412 0,0016857471640276 0,00398770282556249 386706 1211557 579 665 0 True 519 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 564 337 0,00988592234001186 0,048249141966842 0,00994888227664607 0,048706797894255 0,00184942998788535 0,00818013385261685 375119 2102735 579 665 0 True 563 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 608 336 0,0102225695692146 0,0546326906761066 0,0102388036926833 0,0555733577477684 0,00207878450617986 0,0122340335869604 387893 2380935 579 665 0 True 607 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 652 336 0,00998135052358342 0,0628634759248774 0,00994888227664607 0,0624704356450752 0,00193749892872188 0,0169317792168008 378740 2739639 579 665 0 True 651 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 256 382 0,00987393122608613 0,0457991855353651 0,00987258716716258 0,0482795452811475 0,00156381109407306 0,0107938073708121 374664 1995964 579 665 0 True 255 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 300 382 0,0100492386762706 0,0339585287319925 0,0100556954299229 0,0329137102311742 0,00141272403825243 0,00611684147495409 381316 1479939 579 665 0 True 299 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 344 381 0,0102390408795522 0,0867033456839627 0,01025406271458 0,0852521553368429 0,00149243938434722 0,0212873937189259 388518 3778599 579 665 0 True 343 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 388 380 0,0102613627993216 0,0650110054261311 0,0102845807583734 0,0639505607690547 0,00142209157021946 0,0176668473496956 389365 2833230 579 665 0 True 387 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 432 380 0,0104799436760249 0,0427529111173448 0,010452429999237 0,0432135500114443 0,0016777633863787 0,0100253097258734 397659 1863205 579 665 0 True 431 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 476 381 0,0105712079123431 0,0519857437138279 0,0105439841306172 0,0524452582589456 0,00166241729921858 0,0107759665039134 401122 2265579 579 665 0 True 475 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 520 380 0,010291590948053 0,0413919899313401 0,0102845807583734 0,041870756084535 0,00169944346767073 0,00726345822420009 390512 1803895 579 665 0 True 519 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 564 381 0,0100617568721272 0,0495340892859294 0,0101167315175097 0,0495002670328832 0,00183919780835806 0,00842115017771377 381791 2158734 579 665 0 True 563 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 609 381 0,0101470387285308 0,0430554298311584 0,0101472495613031 0,0431525139238575 0,00192978820569778 0,00965530464172028 385027 1876389 579 665 0 True 607 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 653 381 0,0102590699929226 0,0878111277277653 0,0103150988021668 0,0834973678187228 0,00192792182128206 0,0191255429827259 389278 3826877 579 665 0 True 651 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 256 425 0,00987769986189136 0,043854681335979 0,00984206912336919 0,0442053864347295 0,00157561158665517 0,00747614092197887 374807 1911221 579 665 0 True 255 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 299 425 0,0101509918430118 0,0550080626147653 0,0101777676050965 0,0540016784924086 0,0015249743981661 0,00962046198347403 385177 2397294 579 665 0 True 299 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 344 426 0,0101646959732126 0,0351842526894026 0,0101319905394064 0,0352788586251621 0,00138214601586131 0,00509329548892425 385697 1533357 579 665 0 True 343 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 388 425 0,0104041756484722 0,0537877768350838 0,010452429999237 0,0525520714122225 0,00143488944017241 0,0130637638010705 394784 2344113 579 665 0 True 387 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 432 424 0,0105883117209976 0,0909920027810428 0,0107270923933776 0,0890516517891203 0,00177513462977577 0,0138099408986637 401771 3965502 579 665 0 True 431 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 477 425 0,0104864267837737 0,0579597310970262 0,0105287251087205 0,0585946440833143 0,00171172980903034 0,0119179281595086 397905 2525930 579 665 0 True 475 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 521 425 0,0104268401714966 0,0513005103741271 0,010406652933547 0,0505531395437552 0,00176391160294552 0,0101804336019986 395644 2235716 579 665 0 True 519 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 565 425 0,0101554720394236 0,0298538977335763 0,0101930266269932 0,0304875257495995 0,00187459904395192 0,00418281563276039 385347 1301056 579 665 0 True 563 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 608 424 0,0101125148620633 0,0400277415901851 0,010101472495613 0,0401312275883116 0,00216034093346147 0,00704245368595728 383717 1744440 579 665 0 True 607 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 653 425 0,0100612034360998 0,075786880797783 0,0100556954299229 0,0723582818341344 0,00210611428644358 0,0156422577142451 381770 3302851 579 665 0 True 651 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 255 470 0,00987192831474908 0,0509258497582937 0,00987258716716258 0,0520027466239414 0,00154743102940753 0,0144190050728533 374588 2219388 579 665 0 True 255 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 299 469 0,010099126981021 0,0511771532286886 0,0101777676050965 0,0529488059815366 0,00156862821487938 0,00995755212980645 383209 2230340 579 665 0 True 299 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 343 469 0,0103142554710775 0,071422731697635 0,0103150988021668 0,072281986724651 0,00157510988896769 0,0209834198006064 391372 3112658 579 665 0 True 343 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 388 468 0,0105708916631846 0,0860324305843574 0,0105287251087205 0,0855573357747768 0,00163193729100341 0,0229422106469195 401110 3749360 579 665 0 True 387 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 433 469 0,0106322439999299 0,0938992938973664 0,0105897611963073 0,0911879148546578 0,0019244234073453 0,0306585832346353 403438 4092204 579 665 0 True 431 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 475 469 0,0104508223993481 0,0464661768864826 0,0104219119554437 0,0477454795147631 0,00198889690854527 0,0110373483687757 396554 2025032 579 665 0 True 475 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 521 468 0,0104072063695743 0,0384545479055845 0,0104371709773404 0,0398870832379644 0,00183601914948876 0,00574891353005763 394899 1675879 579 665 0 True 519 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 564 469 0,0104035695042518 0,0975680905169768 0,0104829480430304 0,0979324025329976 0,0018285477345274 0,0156824222357397 394761 4252093 579 665 0 True 563 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 609 468 0,0100796776577744 0,0610501993138029 0,0100709544518196 0,0622415503166247 0,00190001587869585 0,0175471248965692 382471 2660615 579 665 0 True 607 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 652 469 0,0100877156572191 0,0722894211954698 0,0101472495613031 0,0712138551918822 0,00192844026929276 0,0138037339570094 382776 3150429 579 665 0 True 651 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 256 514 0,0101831438407907 0,049848838163158 0,010101472495613 0,0523689631494621 0,00155546578355826 0,0128206486473727 386397 2172451 579 665 0 True 255 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 300 514 0,0106945977923437 0,0993483250355231 0,0106660563057908 0,0947585259784848 0,00186375778810617 0,0265936827179468 405804 4329677 579 665 0 True 299 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 343 513 0,0105792722658844 0,0534730738496504 0,0105287251087205 0,0561226825360494 0,00158529110454707 0,0140111154687862 401428 2330398 579 665 0 True 343 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 388 513 0,0104790476367425 0,0573775248375 0,0105439841306172 0,0567177843900206 0,00164954487814415 0,0108232244267832 397625 2500557 579 665 0 True 387 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 432 513 0,0105044002776141 0,0559848924210274 0,0104829480430304 0,0568551155870909 0,0018416305202156 0,00956606055568176 398587 2439865 579 665 0 True 431 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 476 514 0,0106646068304811 0,0599603839078126 0,0105287251087205 0,0599069199664302 0,00221994324283851 0,0153104210157676 404666 2613120 579 665 0 True 475 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 520 513 0,0104054933532992 0,0703992758274721 0,0105134660868238 0,0693064774547952 0,00176120317104807 0,0192240665178203 394834 3068055 579 665 0 True 519 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 564 513 0,0100332153855743 0,0555003209557425 0,00999465934233616 0,0567330434119173 0,00174392434601723 0,0141653588328575 380708 2418747 579 665 0 True 563 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 608 513 0,0100508989843527 0,0424426596360436 0,0101167315175097 0,0419775692378119 0,00175952186585087 0,0077833450499565 381379 1849684 579 665 0 True 607 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 653 513 0,00996899045230614 0,0615416774942621 0,00999465934233616 0,0618905928130007 0,00200617021611048 0,0133058426624198 378271 2682034 579 665 0 True 651 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 255 558 0,0101486463284197 0,0426939860523361 0,0101930266269932 0,0448310063324941 0,00141536043857955 0,0110888991533104 385088 1860637 579 665 0 True 254 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 300 557 0,0103651452314964 0,0526916054154613 0,0103761348897536 0,0520485236896315 0,00145236576443739 0,0127146545825042 393303 2296341 579 665 0 True 299 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 343 557 0,0106453683400068 0,0490349701215731 0,0106507972838941 0,0505989166094453 0,00151400764876327 0,0106842498068322 403936 2136982 579 665 0 True 343 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 388 557 0,0107497305623055 0,0485386733026202 0,0107118333714809 0,0489356832227054 0,00155644304691688 0,00823212091673904 407896 2115353 579 665 0 True 387 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 433 557 0,0107545006537792 0,0870537065942494 0,0107881284809644 0,0830548561837186 0,00190312502693168 0,0195128298000758 408077 3793868 579 665 0 True 431 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 476 557 0,0107260909377091 0,0611032961208239 0,0107728694590677 0,0612497138933394 0,00215433775083831 0,0134158943654999 406999 2662929 579 665 0 True 475 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 521 557 0,0105794303904636 0,0553209528742892 0,0105592431525139 0,0545204852368963 0,00177638727051427 0,00784608554129137 401434 2410930 579 665 0 True 519 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 563 553 0,0104394374296428 0,0337928593513998 0,0103608758678569 0,0374914168001831 0,0017923238313304 0,0106174690087816 396122 1472719 579 665 0 False 563 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 609 557 0,0103327033386555 0,0480415274854566 0,0103608758678569 0,0480811779964904 0,00182286248739414 0,00670352926374955 392072 2093687 579 665 0 True 607 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 653 557 0,0102718780838411 0,0528216627629958 0,0103150988021668 0,052628366521706 0,00193989348630171 0,00841023308975492 389764 2302009 579 665 0 True 651 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 254 596 0,00991528080355749 0,00975710046459706 0,00985732814526589 0,00975051499198901 0,00142945880047395 0,001258306086328 376233 425222 579 665 0 False 254 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 299 596 0,00992273901287832 0,0098771534007828 0,00994888227664607 0,00985732814526589 0,00139650601312376 0,00146733160155033 376516 430454 579 665 0 False 299 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 344 601 0,0101666725304531 0,0724036688195655 0,010101472495613 0,0713511863889525 0,00153812722803278 0,0147920892601316 385772 3155408 579 665 0 True 343 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 389 601 0,0104223599750848 0,0768241271523969 0,010406652933547 0,0751201647974365 0,00148824592267911 0,021449918671427 395474 3348055 579 665 0 True 387 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 431 596 0,0106420213697463 0,010422508548781 0,0107270923933776 0,0104676890211337 0,00181028106133829 0,00190436209637297 403809 454221 579 665 0 False 431 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 475 596 0,0104899582327101 0,0103361860820511 0,0105439841306172 0,0103608758678569 0,00193689497944746 0,00190466378323689 398039 450459 579 665 0 False 475 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 519 596 0,0102084964816622 0,0102627821556638 0,0102693217364767 0,0102998397802701 0,00200215301179256 0,00202561621182525 387359 447260 579 665 0 False 519 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 563 596 0,0102526923015599 0,0100239841994549 0,0103150988021668 0,0100404364080262 0,00193153507661817 0,00191484631683326 389036 436853 579 665 0 False 563 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 607 596 0,0103814584172547 0,0101778593886869 0,0101319905394064 0,0101319905394064 0,00259507492868073 0,00146428803535331 393922 443559 579 665 0 False 607 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 651 596 0,010448476884756 0,0101821961633312 0,010452429999237 0,0101930266269932 0,00173290646243205 0,00152519104376553 396465 443748 579 665 0 False 651 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 255 645 0,00991638767561217 0,0410196468511632 0,00996414129854276 0,0419012741283284 0,00130656904105431 0,00980614270868169 376275 1787668 579 665 0 True 254 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 299 639 0,00983808965479164 0,00981444226267202 0,00987258716716258 0,00978103303578241 0,00131774943266489 0,00141863092363485 373304 427721 579 665 0 False 299 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 343 639 0,00984947462449695 0,0097714416505902 0,0097962920576791 0,00978103303578241 0,00160263692872911 0,00132775831294342 373736 425847 579 665 0 False 343 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 387 639 0,0100645240522639 0,0100671683787174 0,0100556954299229 0,0100099183642329 0,00136667066417777 0,00129662605532257 381896 438735 579 665 0 False 387 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 431 639 0,0101381046898037 0,00993571133142997 0,0100862134737163 0,00990310521095598 0,0015520300947567 0,00173482795284537 384688 433006 579 665 0 False 431 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 475 639 0,0101696505433622 0,00991889198849722 0,0101777676050965 0,00994888227664607 0,00176842026303656 0,00185610380360016 385885 432273 579 665 0 False 475 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 519 639 0,00996603879349365 0,0100182706709553 0,00988784618905928 0,0100251773861295 0,00178898661554631 0,00182924553304663 378159 436604 579 665 0 False 519 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 563 639 0,00998912498206274 0,0100754289018495 0,00997940032043946 0,0100556954299229 0,00170785469735282 0,00155875264819523 379035 439095 579 665 0 False 563 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 607 639 0,0100664215472147 0,00990039759504047 0,0100862134737163 0,00993362325474937 0,00144660291602997 0,00144321208995926 381968 431467 579 665 0 False 607 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 653 645 0,0102411492072754 0,043282181191133 0,01025406271458 0,0439459830624857 0,00141269500175758 0,00953685985151466 388598 1886271 579 665 0 True 651 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G4_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G4_2.csv new file mode 100755 index 0000000..bab2ce4 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G4_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 255 249 0,00840975033051331 0,725482486256841 0,00817883573662928 0,742015716792554 0,00211426676921148 0,195334183929783 319106 31617089 579 665 12 True 255 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 299 250 0,00691581565994677 0,00654791017369471 0,0068055237659266 0,00657663843747616 0,00139398372609446 0,00120183411872183 262419 285363 579 665 0 False 299 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 343 248 0,00620024923069098 0,00632967174172557 0,00617990386816205 0,00634775310902571 0,00118006499116693 0,0011057120993609 235267 275852 579 665 0 True 343 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 387 248 0,00621324180028523 0,00623449215852632 0,00622568093385214 0,00625619897764553 0,00118975817718303 0,00108601182250132 235760 271704 579 665 0 True 387 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 432 247 0,00660910668441352 0,00648997178228244 0,00659189745937285 0,00643930724040589 0,00152713118480442 0,00149774837079019 250781 282838 579 665 0 True 431 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 476 248 0,00662673757499882 0,00666954637681409 0,00663767452506294 0,00663767452506294 0,00153863835740143 0,00147283934709023 251450 290664 579 665 0 True 475 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 520 249 0,00702600213758077 0,00685949251705597 0,00709544518196384 0,00686655985351339 0,00143775731727431 0,00159313297987338 266600 298942 579 665 0 True 519 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 564 248 0,0072496166467232 0,00738857902366353 0,00720225833524071 0,00740062561989776 0,00155552106422671 0,0013533040654049 275085 322000 579 665 0 True 563 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 607 250 0,00786124251922498 0,00772372680384872 0,00779736018921187 0,00764476997024491 0,00194745935212345 0,00193398513931159 298293 336606 579 665 0 False 607 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 650 248 0,00948473392838248 0,73420247804221 0,00947585259784848 0,746654459449149 0,00189703998437089 0,180493742175539 359896 31997113 579 665 10 True 652 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 255 293 0,00662924121417012 0,00655311889244741 0,00660715648126955 0,00657663843747616 0,00149850776255561 0,00146318544002803 251545 285590 579 665 0 False 255 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 299 293 0,00627456778293396 0,00629688205407086 0,00624093995574884 0,00634775310902571 0,00128412531781763 0,0012710977396445 238087 274423 579 665 0 False 299 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 344 293 0,00632999044795771 0,0062694387605544 0,00634775310902571 0,00631723506523232 0,00122940442879333 0,00137410826268517 240190 273227 579 665 0 True 343 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 387 292 0,0062769660057191 0,00637297065047604 0,00627145799954223 0,00636301213092241 0,00126499773804937 0,00123252694694533 238178 277739 579 665 0 True 387 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 432 292 0,0065961404689158 0,0066367107973642 0,00656137941557946 0,00662241550316625 0,00160820096320041 0,00167560952889054 250289 289233 579 665 0 True 431 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 476 292 0,00674324903580244 0,00680166885513165 0,00668345159075303 0,00674448767833982 0,0015863889507466 0,00182030338161842 255871 296422 579 665 0 True 475 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 519 293 0,00698512693384713 0,00708218245315738 0,00695811398489357 0,00709544518196384 0,00149908318852663 0,00156124978268616 265049 308647 579 665 0 False 519 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 565 292 0,00701920278067343 0,0072565942207315 0,00698863202868696 0,0072480354009308 0,00161794504026079 0,00158340108430835 266342 316248 579 665 0 True 563 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 607 293 0,00745915806831324 0,0074339889549922 0,00755321583886473 0,00730907148851759 0,00185251261549799 0,00179873156458082 283036 323979 579 665 0 False 607 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 651 293 0,00753587484334137 0,00764940504155789 0,00755321583886473 0,00772106507972839 0,001838177703808 0,00191220894794185 285947 333367 579 665 0 False 651 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 256 337 0,00604059611385128 0,00619585126698642 0,00604257267109178 0,00619516289005875 0,00143545160196711 0,00140357716866546 229209 270020 579 665 0 True 255 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 300 338 0,00614669770652157 0,00598555211558308 0,00624093995574884 0,005981536583505 0,00134014362782321 0,00129977256346241 233235 260855 579 665 0 True 299 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 344 337 0,00634282489297272 0,00629412854636018 0,00631723506523232 0,00624093995574884 0,00120710117551439 0,00129049070678737 240677 274303 579 665 0 True 343 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 388 337 0,00660404669787782 0,0066122734164319 0,00662241550316625 0,00666819256885634 0,00124968199798213 0,0012092045422378 250589 288168 579 665 0 True 387 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 432 336 0,00692435438722575 0,0069421665860692 0,00697337300679027 0,00698863202868696 0,00149739389132172 0,00160286167969212 262743 302545 579 665 0 True 431 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 477 337 0,00700958353543631 0,00715948718213478 0,00704966811627375 0,00714122224765393 0,0016119313478125 0,00151525592177154 265977 312016 579 665 0 True 475 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 520 336 0,00710854316794425 0,00696173943671263 0,00703440909437705 0,00698863202868696 0,0014915671256161 0,00167083400133955 269732 303398 579 665 0 True 519 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 564 337 0,0072054735350186 0,00718743528539821 0,00721751735713741 0,00718699931334401 0,0016307185125428 0,00151846847959921 273410 313234 579 665 0 True 563 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 608 336 0,00732193228762914 0,00747579638039938 0,00737010757610437 0,00747692072938125 0,0021018037542143 0,00207178961869892 277829 325801 579 665 0 True 607 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 652 336 0,00689931799551269 0,0071272711419198 0,00692759594110018 0,00718699931334401 0,00181123857365989 0,00178047795602983 261793 310612 579 665 0 True 651 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 256 382 0,00610221199156195 0,00619018363028193 0,00608834973678187 0,00625619897764553 0,00139204410812046 0,00146292639017908 231547 269773 579 665 0 True 255 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 300 382 0,00616024371214316 0,0061361460414598 0,00617990386816205 0,00613412680247196 0,0013449195639859 0,0012702777812589 233749 267418 579 665 0 True 299 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 344 381 0,00656364586788191 0,00649472158308337 0,00660715648126955 0,00656137941557946 0,00129973379340342 0,00139454471962727 249056 283045 579 665 0 True 343 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 388 380 0,00668355700713919 0,00667347012530181 0,00666819256885634 0,00671396963454643 0,00137647579184925 0,00127588998763741 253606 290835 579 665 0 True 387 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 432 380 0,00708427104503085 0,00712022675135997 0,00718699931334401 0,00715648126955062 0,00163445237383216 0,00158671078933689 268811 310305 579 665 0 True 431 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 476 381 0,00703032420941334 0,00731219213058969 0,00701915007248035 0,00730907148851759 0,00157452911951274 0,00173792055260291 266764 318671 579 665 0 True 475 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 520 380 0,00699801408705522 0,00707286641873624 0,00691233691920348 0,00709544518196384 0,00165558108751008 0,00169645203305841 265538 308241 579 665 0 True 519 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 564 381 0,00727684042844909 0,00722304731845636 0,00727855344472419 0,0072632944228275 0,00162172225980091 0,00158197216980455 276118 314786 579 665 0 True 563 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 609 381 0,00671692129335891 0,0069553375312853 0,00668345159075303 0,00694285496299687 0,0018700571507093 0,00198668221146496 254872 303119 579 665 0 True 607 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 653 381 0,00619819361116085 0,00625238995864576 0,00605783169298848 0,00628671702143893 0,00185264272098743 0,00182097599537377 235189 272484 579 665 0 True 651 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 256 425 0,0061773738748942 0,00606065403839193 0,00614938582436866 0,00601205462729839 0,00145641059528644 0,00158153904029041 234399 264128 579 665 0 True 255 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 299 425 0,00618451583505656 0,0064363701655145 0,00616464484626535 0,00630197604333562 0,00145692215105557 0,00152826944418892 234670 280502 579 665 0 True 299 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 344 426 0,00652290243463097 0,00660947401692604 0,00659189745937285 0,00660715648126955 0,00128600111647316 0,00121513824339333 247510 288046 579 665 0 True 343 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 388 425 0,00642025322860742 0,00674070160523763 0,00645456626230259 0,00674448767833982 0,00138302951159436 0,00131221025355959 243615 293765 579 665 0 True 387 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 432 424 0,00670925225126575 0,00696635156212803 0,00672922865644312 0,00692759594110018 0,00166590879442882 0,00156594504024664 254581 303599 579 665 0 True 431 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 477 425 0,00708234719598342 0,00719631534776516 0,00703440909437705 0,00712596322575723 0,00169643758300912 0,00151441076653357 268738 313621 579 665 0 True 475 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 521 425 0,00695155181485509 0,00717536574326638 0,00695811398489357 0,00727855344472419 0,00166610313483355 0,00167781729427235 263775 312708 579 665 0 True 519 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 565 425 0,0067601947198777 0,00681043418801065 0,00686655985351339 0,00683604180972 0,00176575020886871 0,00165914337068893 256514 296804 579 665 0 True 563 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 608 424 0,00610376688325781 0,00621262471812399 0,00602731364919509 0,00621042191195544 0,00192439038260281 0,00170373295686455 231606 270751 579 665 0 True 607 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 653 425 0,00580986599864303 0,00600728188059987 0,00575265125505455 0,00605783169298848 0,00180848762859083 0,00181353315758558 220454 261802 579 665 0 True 651 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 255 470 0,00626829550795742 0,00634231493129711 0,00625619897764553 0,0064087891966125 0,00135698742992593 0,00140583740971355 237849 276403 579 665 0 True 255 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 299 469 0,00632701243504868 0,00638338808798145 0,00624093995574884 0,0063782711528191 0,00143956136019831 0,00154585991388473 240077 278193 579 665 0 True 299 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 343 469 0,0063757675136478 0,0063517456952062 0,0063935301747158 0,00636301213092241 0,00149319534394479 0,00153464117546974 241927 276814 579 665 0 True 343 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 388 468 0,00658899850875345 0,00647976085785533 0,00666819256885634 0,00645456626230259 0,00149244696150292 0,00148297878976931 250018 282393 579 665 0 True 387 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 433 469 0,00660691929440069 0,00677642836778373 0,00662241550316625 0,0068207827878233 0,00177891370957446 0,00201535195012239 250698 295322 579 665 0 True 431 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 475 469 0,00667543994540485 0,00680969991928781 0,00674448767833982 0,00686655985351339 0,00190266374060191 0,00189305983561319 253298 296772 579 665 0 True 475 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 521 468 0,00645145647891086 0,00662115347879885 0,00659189745937285 0,00662241550316625 0,00180897534181067 0,0016827021294097 244799 288555 579 665 0 True 519 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 564 469 0,00606874228895607 0,00622650698616534 0,00616464484626535 0,00627145799954223 0,00174563216709787 0,00192798064819617 230277 271356 579 665 0 True 563 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 609 468 0,00570476586164126 0,00600083408337736 0,00560006103608759 0,0059510185397116 0,00172311509874617 0,00176289050219757 216466 261521 579 665 0 True 607 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 652 469 0,00569720223593426 0,00599188518331764 0,00575265125505455 0,005981536583505 0,00185464470807709 0,0017158115577178 216179 261131 579 665 0 True 651 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 256 514 0,00686756130918191 0,00757001223589989 0,00677500572213321 0,00759899290455482 0,00165708617739962 0,00178943020079157 260588 329907 579 665 0 True 255 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 300 514 0,00685401530356032 0,00654380285802627 0,0068207827878233 0,00657663843747616 0,00175593774690848 0,00155001952592584 260074 285184 579 665 0 True 299 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 343 513 0,0067957200420137 0,00641819701462399 0,00677500572213321 0,0064087891966125 0,00161378333657674 0,00146033243659236 257862 279710 579 665 0 True 343 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 388 513 0,0066263949717438 0,00652003090812405 0,00662241550316625 0,00651560234988937 0,00147530215812843 0,00141462433898711 251437 284148 579 665 0 True 387 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 432 513 0,00666176216930056 0,00676399169129048 0,00656137941557946 0,00669871061264973 0,00185544948317879 0,00182035319678882 252779 294780 579 665 0 True 431 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 476 514 0,00656786252332832 0,00655901598812779 0,00656137941557946 0,00656137941557946 0,00188147161625975 0,00157634350052979 249216 285847 579 665 0 True 475 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 520 513 0,00605946564697396 0,00642170773695511 0,00611886778057527 0,00656137941557946 0,00165402875598257 0,0015704583439774 229925 279863 579 665 0 True 519 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 564 513 0,00620414963697891 0,00628850680145087 0,00611886778057527 0,00628671702143893 0,00159124439207929 0,00155790098497018 235415 274058 579 665 0 True 563 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 608 513 0,00598335501616626 0,00601207757319598 0,0059662775616083 0,00601205462729839 0,00164862000855943 0,00169924807975632 227037 262011 579 665 0 True 607 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 653 513 0,00583943529496098 0,00598747957098055 0,00576791027695125 0,00604257267109178 0,00182408194135071 0,00181461045445663 221576 260939 579 665 0 True 651 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 255 558 0,0069526059787167 0,00702738764971481 0,00695811398489357 0,00697337300679027 0,00139019914953083 0,00129116028968733 263815 306259 579 665 0 True 254 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 300 557 0,00699748700512442 0,00695102370253856 0,00692759594110018 0,00698863202868696 0,00123382925520269 0,00140647620280729 265518 302931 579 665 0 True 299 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 343 557 0,0069719498855771 0,00726673630746585 0,00700389105058366 0,0072632944228275 0,0014149033252075 0,00138513129839638 264549 316690 579 665 0 True 343 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 388 557 0,00696420178119432 0,00722348329051055 0,00695811398489357 0,00717174029144732 0,001444516773356 0,00148405917956576 264255 314805 579 665 0 True 387 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 433 557 0,00670706486125293 0,00728454232399493 0,00672922865644312 0,00729381246662089 0,00186387323710644 0,00194902057470585 254498 317466 579 665 0 True 431 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 476 557 0,00669926404867707 0,00729711667587371 0,00669871061264973 0,00735484855420768 0,00199732575966294 0,00193570400480845 254202 318014 579 665 0 True 475 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 521 557 0,00677345083043735 0,00706958515538101 0,00671396963454643 0,00709544518196384 0,00205138616901141 0,00196200897271474 257017 308098 579 665 0 True 519 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 563 553 0,00683193057065975 0,00657755627337972 0,00686655985351339 0,00654612039368277 0,00183962120877293 0,00183390180786975 259236 286655 579 665 0 False 563 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 609 557 0,00667912951892046 0,00641204751407014 0,00672922865644312 0,00642404821850919 0,00171262297493652 0,00152047175087661 253438 279442 579 665 0 True 607 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 653 557 0,00656533253006047 0,00614598983152548 0,00656137941557946 0,00610360875867857 0,00201943582795912 0,0016539059404526 249120 267847 579 665 0 True 651 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 254 596 0,00719345606699633 0,0070606362553213 0,0072480354009308 0,00701915007248035 0,00128621230721329 0,00120954214524816 272954 307708 579 665 0 False 254 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 299 596 0,00699435086763615 0,00673602064212947 0,00698863202868696 0,00669871061264973 0,00142007692466206 0,00134834062534104 265399 293561 579 665 0 False 299 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 344 601 0,00676011565758808 0,00691102900304091 0,00671396963454643 0,00689707789730678 0,00140652723748862 0,00148070162960844 256511 301188 579 665 0 True 343 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 389 601 0,00668247648918105 0,00670391933140244 0,00672922865644312 0,00668345159075303 0,00139990817946474 0,00125353696549126 253565 292162 579 665 0 True 387 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 431 596 0,00658472914511396 0,00676284439641103 0,00656137941557946 0,00677500572213321 0,00175091115769262 0,00193373219199989 249856 294730 579 665 0 False 431 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 475 596 0,00667515005034291 0,0066147745192691 0,00653086137178607 0,00665293354695964 0,00186101318767923 0,00177442105619456 253287 288277 579 665 0 False 475 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 519 596 0,00684784844496995 0,00686086927091131 0,00692759594110018 0,00683604180972 0,00201080967288758 0,00194900844416796 259840 299002 579 665 0 False 519 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 563 596 0,00682665975135173 0,0068857655697954 0,0068055237659266 0,00692759594110018 0,00173937257380704 0,00183963938200616 259036 300087 579 665 0 False 563 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 607 596 0,0071069355680553 0,00681883238652823 0,00697337300679027 0,00683604180972 0,00158128128218885 0,00140794702302367 269671 297170 579 665 0 False 607 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 651 596 0,00723464751988845 0,00686481596529662 0,0072632944228275 0,0068055237659266 0,00167776898775464 0,00158156749540288 274517 299174 579 665 0 False 651 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 255 645 0,0097265591182341 0,6963677447223 0,00907911802853437 0,719218738078889 0,00331681247863981 0,226392659881085 369072 30348246 579 665 11 True 254 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 299 639 0,00734412243691587 0,00700251429672832 0,00717174029144732 0,00697337300679027 0,00174486013994577 0,00135885885661755 278671 305175 579 665 0 False 299 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 343 639 0,00656414659571617 0,00662838143653939 0,00656137941557946 0,00660715648126955 0,00131220998986904 0,00123267573553186 249075 288870 579 665 0 False 343 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 387 639 0,0063430093716485 0,00645559882769409 0,00642404821850919 0,00645456626230259 0,00126644119295435 0,00119642636528726 240684 281340 579 665 0 False 387 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 431 639 0,00643066309674075 0,00644837086995355 0,00643930724040589 0,00642404821850919 0,00153567935890523 0,00152482890516795 244010 281025 579 665 0 False 431 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 475 639 0,0063598496393376 0,00659065838090305 0,0063782711528191 0,00663767452506294 0,00164674101104173 0,00165432299552397 241323 287226 579 665 0 False 475 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 519 639 0,0067185552473444 0,00676885622157935 0,00671396963454643 0,00669871061264973 0,00173863103601155 0,00173829098976312 254934 294992 579 665 0 False 519 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 563 639 0,00669768280288467 0,00683064952378658 0,00674448767833982 0,00694285496299687 0,00165091514862155 0,00151891868218543 254142 297685 579 665 0 False 563 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 607 639 0,00691075567341108 0,00680065923563773 0,00686655985351339 0,00675974670023652 0,00133190593964232 0,00122677456096946 262227 296378 579 665 0 False 607 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 653 645 0,00919220345678778 0,734960518714961 0,0085297932402533 0,759090562294957 0,00328988611432634 0,211177914350873 348796 32030149 579 665 13 True 651 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G4_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G4_3.csv new file mode 100755 index 0000000..60daa12 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G4_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 255 249 0,000926399201576291 0,0730662086665508 0,000717174029144732 0,0730144197756924 0,000788538994084699 0,0220946710933589 35152 3184282 579 665 0 True 255 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 299 250 0,000817978448410472 0,000897391108808873 0,000671396963454643 0,000778210116731518 0,000652994648071089 0,000666440115508724 31038 39109 579 665 0 False 299 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 343 248 0,000925503162293929 0,00090982778530212 0,000839246204318303 0,000823987182421607 0,000621668517764777 0,000591904598915228 35118 39651 579 665 0 True 343 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 387 248 0,000997950573682562 0,000909391813247929 0,000854505226215 0,000778210116731518 0,000710737183462434 0,000656086976736069 37867 39632 579 665 0 True 387 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 432 247 0,00102796788964169 0,000991193938152775 0,000823987182421607 0,000854505226215 0,000837080851821696 0,000823410107956828 39006 43197 579 665 0 True 431 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 476 248 0,000939918853101343 0,00106723664276278 0,000839246204318303 0,000930800335698482 0,000782278228789644 0,000828193120665079 35665 46511 579 665 0 True 475 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 520 249 0,000978185001277515 0,00096609112619039 0,000778210116731518 0,000793469138628214 0,000820576681509848 0,000814709197464562 37117 42103 579 665 0 True 519 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 564 248 0,00101977176561773 0,00106049054887161 0,000885023270008392 0,000915541313801785 0,000817103782663473 0,000777843627107649 38695 46217 579 665 0 True 563 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 607 250 0,00106847413602377 0,00113063615780123 0,000793469138628214 0,000762951094834821 0,0010048774034035 0,00109453708806101 40543 49274 579 665 0 False 607 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 650 248 0,00112199930609664 0,0740423959876804 0,000823987182421607 0,0737315938048371 0,000968743981880275 0,0203331952059394 42574 3226825 579 665 0 True 652 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 255 293 0,000880543073596582 0,000873458537623528 0,000686655985351339 0,000656137941557946 0,000745077663020357 0,000762596732712815 33412 38066 579 665 0 False 255 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 299 293 0,00080430067230618 0,000843009331522902 0,000686655985351339 0,000762951094834821 0,000638567907891745 0,000643640016243126 30519 36739 579 665 0 False 299 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 344 293 0,000883494732409069 0,000938601940878748 0,000778210116731518 0,000762951094834821 0,000627341854041893 0,000736602634106968 33524 40905 579 665 0 True 343 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 387 292 0,000825568428214011 0,000893283793140439 0,000686655985351339 0,000778210116731518 0,000637178595353723 0,000644903969256755 31326 38930 579 665 0 True 387 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 432 292 0,000945848524822858 0,00106693834609412 0,000717174029144732 0,000885023270008392 0,000843567903592177 0,000871084634466163 35890 46498 579 665 0 True 431 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 476 292 0,0010145536545028 0,000934907651366916 0,000778210116731518 0,00064087891966125 0,000888507121464964 0,000933050042337654 38497 40744 579 665 0 True 475 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 519 293 0,000941658223472988 0,000983392332972509 0,000717174029144732 0,00080872816052491 0,000821127395748912 0,000803164635770249 35731 42857 579 665 0 False 519 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 565 292 0,000897330633092602 0,00101553953549472 0,000701915007248035 0,000823987182421607 0,00080530566015933 0,000827191329060949 34049 44258 579 665 0 True 563 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 607 293 0,00100261524877015 0,00108623584596648 0,000656137941557946 0,000762951094834821 0,0010368648568128 0,00104218868059629 38044 47339 579 665 0 False 607 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 651 293 0,00107000267362309 0,00113125569703614 0,000747692072938125 0,000778210116731518 0,000991550803820245 0,00109435004921499 40601 49301 579 665 0 False 651 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 256 337 0,000823038434946164 0,000861480779082061 0,00064087891966125 0,000656137941557946 0,000717901695174366 0,000763961657829501 31230 37544 579 665 0 True 255 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 300 338 0,000848654616783106 0,000879057336635248 0,000732433051041428 0,000762951094834821 0,00065350456555661 0,00066762332140052 32202 38310 579 665 0 True 299 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 344 337 0,000914618920422883 0,000912787806091103 0,00080872816052491 0,000778210116731518 0,000678029656870577 0,000685732772861606 34705 39780 579 665 0 True 343 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 388 337 0,000894774285728216 0,000876510342002867 0,000793469138628214 0,000717174029144732 0,00067371796927047 0,000653054082112963 33952 38199 579 665 0 True 387 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 432 336 0,00100137660623277 0,00104936178854093 0,00080872816052491 0,000793469138628214 0,000836685151919295 0,000885099185726483 37997 45732 579 665 0 True 431 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 477 337 0,00096769607085457 0,000964553751051926 0,000747692072938125 0,00080872816052491 0,000838058915803292 0,000799349979948432 36719 42036 579 665 0 True 475 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 520 336 0,000967142634827228 0,000944361361173591 0,000732433051041428 0,000686655985351339 0,000908814014706683 0,00090309533542121 36698 41156 579 665 0 True 519 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 564 337 0,00101452730040626 0,000962442728473736 0,000732433051041428 0,000747692072938125 0,000957830729652066 0,00084325101076004 38496 41944 579 665 0 True 563 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 608 336 0,00104781252433636 0,00101886669064513 0,000503547722590982 0,000656137941557946 0,00119974523221325 0,00113751131087789 39759 44403 579 665 0 True 607 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 652 336 0,00100232535370821 0,00104174375054138 0,000656137941557946 0,000732433051041428 0,00101202366569582 0,000942326482103564 38033 45400 579 665 0 True 651 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 256 382 0,000814842310922205 0,00089046144773699 0,000671396963454643 0,000732433051041428 0,000712547148120063 0,000767208651984706 30919 38807 579 665 0 True 255 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 300 382 0,000853345645967237 0,000835299509932992 0,000701915007248035 0,000701915007248035 0,000672828936406595 0,000699819691050021 32380 36403 579 665 0 True 299 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 344 381 0,000885155040491093 0,000985778706321767 0,000778210116731518 0,000885023270008392 0,000645280922924491 0,000739650117319554 33587 42961 579 665 0 True 343 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 388 380 0,000825990093758652 0,000860241700612254 0,00064087891966125 0,000747692072938125 0,000687949346154188 0,000663516784552423 31342 37490 579 665 0 True 387 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 432 380 0,000983244987813207 0,00104968303110718 0,000762951094834821 0,000762951094834821 0,000803818218453955 0,0009609134531586 37309 45746 579 665 0 True 431 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 476 381 0,00095525693728766 0,00100358472285084 0,000686655985351339 0,000701915007248035 0,000874126156892207 0,000937484960435001 36247 43737 579 665 0 True 475 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 520 380 0,000916569123566848 0,00100753141723616 0,000656137941557946 0,000762951094834821 0,000858076830252529 0,000941631997341693 34779 43909 579 665 0 True 519 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 564 381 0,000957207140431625 0,00106003163091983 0,000701915007248035 0,000885023270008392 0,000927516041916702 0,000893148699783632 36321 46197 579 665 0 True 563 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 609 381 0,000986381125301474 0,00100486969311583 0,000656137941557946 0,000671396963454643 0,00104971023465361 0,00106330968956912 37428 43793 579 665 0 True 607 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 653 381 0,000957207140431625 0,00102093182142814 0,000579842832074464 0,000762951094834821 0,00102869850519155 0,000943084337078545 36321 44493 579 665 0 True 651 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 256 425 0,000767035979798531 0,00085939270240146 0,000595101853971161 0,000656137941557946 0,000715127406468766 0,000814141676957325 29105 37453 579 665 0 True 255 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 299 425 0,000842408695903111 0,000842068549721752 0,000701915007248035 0,000717174029144732 0,000708589000589518 0,000681573076509657 31965 36698 579 665 0 True 299 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 344 426 0,000852607731264115 0,000858773163166557 0,000747692072938125 0,000762951094834821 0,000679306627765066 0,000614608860546759 32352 37426 579 665 0 True 343 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 388 425 0,000778183762634977 0,000950189619161201 0,000595101853971161 0,00080872816052491 0,000687352550978296 0,000775575941252095 29528 41410 579 665 0 True 387 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 432 424 0,00105677291715998 0,000981763174243689 0,000778210116731518 0,000732433051041428 0,00090711627355548 0,000851355257489421 40099 42786 579 665 0 True 431 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 477 425 0,000996395681986698 0,00109355558729738 0,000717174029144732 0,000839246204318303 0,000931683062164519 0,000900255629295459 37808 47658 579 665 0 True 475 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 521 425 0,000983534882875148 0,000954962365859717 0,000717174029144732 0,000747692072938125 0,000950469685463715 0,000860531372411799 37320 41618 579 665 0 True 519 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 565 425 0,00102641299794583 0,000959413869991986 0,000778210116731518 0,00064087891966125 0,000951585873208207 0,000945984713977526 38947 41812 579 665 0 True 563 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 608 424 0,000935254178013752 0,000944820279125371 0,000579842832074464 0,000595101853971161 0,000957394628263446 0,000903119343481465 35488 41176 579 665 0 True 607 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 653 425 0,00108692200360181 0,0010607200078475 0,000778210116731518 0,000717174029144732 0,00102279963400884 0,00103357967464454 41243 46227 579 665 0 True 651 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 255 470 0,000834080801396451 0,000899456239591884 0,000686655985351339 0,000747692072938125 0,000732440641839126 0,00073682788061419 31649 39199 579 665 0 True 255 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 299 469 0,000826095510144812 0,000847231376679281 0,000686655985351339 0,000717174029144732 0,000728961717228929 0,000740084712426546 31346 36923 579 665 0 True 299 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 343 469 0,000870554871007898 0,000894683492893369 0,000747692072938125 0,000747692072938125 0,000752863644374158 0,000802111174266668 33033 38991 579 665 0 True 343 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 388 468 0,000880964739141223 0,000921989111024299 0,000686655985351339 0,000762951094834821 0,000771412604185571 0,000759658196260281 33428 40181 579 665 0 True 387 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 433 469 0,000998820258868384 0,00102565867633148 0,000717174029144732 0,000701915007248035 0,000999217443217621 0,00104732825426792 37900 44699 579 665 0 True 431 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 475 469 0,0010149489659509 0,000958886114347439 0,000671396963454643 0,000579842832074464 0,00105335205103918 0,00102203661763119 38512 41789 579 665 0 True 475 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 521 468 0,000903523845779517 0,000977632912677666 0,000579842832074464 0,000625619897764553 0,000896081266554818 0,000943298271177392 34284 42606 579 665 0 True 519 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 564 469 0,00101139116291799 0,000884220163592777 0,000671396963454643 0,0004272526131075 0,00102642615257984 0,00100719889768741 38377 38535 579 665 0 True 563 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 609 468 0,000961002130333394 0,000971185115455152 0,000625619897764553 0,000610360875867857 0,000962699670215856 0,00095563667587015 36465 42325 579 665 0 True 607 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 652 469 0,000891453669564168 0,000968110365178224 0,000549324788281071 0,000610360875867857 0,000891290885082228 0,000960095869077409 33826 42191 579 665 0 True 651 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 256 514 0,000855506681883522 0,000913522074813952 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000708271793294624 0,000798254889742959 32462 39812 579 665 0 True 255 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 300 514 0,000862437809273559 0,000740303493914461 0,000671396963454643 0,000579842832074464 0,000788802529530934 0,000686888231019779 32725 32263 579 665 0 True 299 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 343 513 0,00090075666564281 0,000855514845708916 0,000762951094834821 0,000732433051041428 0,000776575593485892 0,000784687665353772 34179 37284 579 665 0 True 343 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 388 513 0,000943450302037712 0,000930203742361167 0,000747692072938125 0,000717174029144732 0,000859332760101332 0,000825400326762449 35799 40539 579 665 0 True 387 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 432 513 0,00101133845472491 0,00102237741297625 0,000671396963454643 0,000656137941557946 0,00100541621393312 0,00103017921185961 38375 44556 579 665 0 True 431 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 476 514 0,00097607667355431 0,000966710665425294 0,000671396963454643 0,000671396963454643 0,00095490578349596 0,000899259442898204 37037 42130 579 665 0 True 475 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 520 513 0,00091741245465613 0,000979422692689609 0,000595101853971161 0,000732433051041428 0,00093135302301265 0,000864806257839084 34811 42684 579 665 0 True 519 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 564 513 0,000946059357595178 0,000879149120225604 0,000656137941557946 0,000595101853971161 0,00091325839897641 0,000849887064617553 35898 38314 579 665 0 True 563 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 608 513 0,00100954637616019 0,000962419782576147 0,000671396963454643 0,00064087891966125 0,000955576339062186 0,00094129990445503 38307 41943 579 665 0 True 607 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 653 513 0,0009384430236951 0,000924949131813282 0,000518806744487678 0,000503547722590982 0,0010033222866461 0,00101866004679888 35609 40310 579 665 0 True 651 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 255 558 0,000827255090392575 0,000875844910972786 0,000686655985351339 0,000701915007248035 0,000664362332279113 0,000690110189709528 31390 38170 579 665 0 True 254 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 300 557 0,000872109762703762 0,000915495422006607 0,000732433051041428 0,00080872816052491 0,000700715822383943 0,000717109825110349 33092 39898 579 665 0 True 299 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 343 557 0,00103959004621586 0,000969005255184195 0,000915541313801785 0,000839246204318303 0,000741841237405293 0,000715746848809067 39447 42230 579 665 0 True 343 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 388 557 0,000970647729667057 0,000965976396702445 0,00080872816052491 0,000869764248111696 0,0007784391478668 0,00071554498078932 36831 42098 579 665 0 True 387 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 433 557 0,00107432474545566 0,00100044113488115 0,000793469138628214 0,00064087891966125 0,000995742642970133 0,00105189777916563 40765 43600 579 665 0 True 431 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 476 557 0,000976577401388571 0,00105330848292624 0,000564583810177768 0,000686655985351339 0,00106784235153517 0,00109043233301504 37056 45904 579 665 0 True 475 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 521 557 0,00107234818821516 0,00100386007362191 0,000732433051041428 0,000610360875867857 0,0011013683319604 0,00104895779684712 40690 43749 579 665 0 True 519 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 563 553 0,000923157647701864 0,000933026087764616 0,00064087891966125 0,000564583810177768 0,000897811387041052 0,000945073808534911 35029 40662 579 665 0 False 563 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 609 557 0,00101629302487445 0,00101306137855511 0,000793469138628214 0,000747692072938125 0,000849268394047892 0,00086201494229293 38563 44150 579 665 0 True 607 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 653 557 0,000983271341909747 0,000916665662783647 0,000686655985351339 0,00064087891966125 0,000963077385603565 0,000877291023159092 37310 39949 579 665 0 True 651 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 254 596 0,000805539314843563 0,000933599735204342 0,000656137941557946 0,000839246204318303 0,000622879727928222 0,000635463650545436 30566 40687 579 665 0 False 254 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 299 596 0,000881122863720463 0,000793905110682405 0,000762951094834821 0,000656137941557946 0,000713537242178792 0,000698479795281012 33434 34599 579 665 0 False 299 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 344 601 0,000876510896825952 0,000908703436320258 0,000778210116731518 0,000701915007248035 0,000686693996201973 0,000813034304661803 33259 39602 579 665 0 True 343 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 389 601 0,000975549591623509 0,000881764952550752 0,000793469138628214 0,00080872816052491 0,000761708376031866 0,000657066507495831 37017 38428 579 665 0 True 387 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 431 596 0,00103292245979123 0,00102772380711449 0,000686655985351339 0,000671396963454643 0,000969189099604978 0,00101082899448663 39194 44789 579 665 0 False 431 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 475 596 0,000994129229684253 0,00100243742797139 0,000579842832074464 0,000656137941557946 0,00103860360650265 0,00102512511691361 37722 43687 579 665 0 False 475 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 519 596 0,000925476808197389 0,000960423489485903 0,000488288700694286 0,000503547722590982 0,00108366418082155 0,0011025759832294 35117 41856 579 665 0 False 519 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 563 596 0,000961977231905376 0,000940047532426856 0,000595101853971161 0,000595101853971161 0,00100188540400606 0,000936655276575912 36502 40968 579 665 0 False 563 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 607 596 0,000957128078142005 0,000952369479432158 0,000747692072938125 0,000747692072938125 0,000815052367821783 0,000777855111807716 36318 41505 579 665 0 False 607 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 651 596 0,00100546149119648 0,000950969779679228 0,000762951094834821 0,000747692072938125 0,00084386138028299 0,000810396756311936 38152 41444 579 665 0 False 651 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 255 645 0,000913854651623221 0,0701904911053096 0,000778210116731518 0,0706034943160143 0,000695615878450389 0,0254038165975343 34676 3058956 579 665 0 True 254 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 299 639 0,000918651097193513 0,000888442208749156 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,000677032836742227 0,000641273690153942 34858 38719 579 665 0 False 299 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 343 639 0,000973915637638025 0,000932865466481493 0,000885023270008392 0,00080872816052491 0,000662307171708649 0,000675002777049923 36955 40655 579 665 0 False 343 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 387 639 0,00086741873351963 0,000906362954766178 0,000762951094834821 0,000778210116731518 0,000623594527182959 0,000628205314871672 32914 39500 579 665 0 False 387 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 431 639 0,000959157343575589 0,000936353242915024 0,000762951094834821 0,000732433051041428 0,0008293009908086 0,000803838661046407 36395 40807 579 665 0 False 431 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 475 639 0,000933251266676708 0,000870727975810435 0,000701915007248035 0,000549324788281071 0,000864997057655285 0,000864070800695207 35412 37947 579 665 0 False 475 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 519 639 0,00094252790865881 0,000972722490593616 0,000610360875867857 0,00064087891966125 0,000941141950342232 0,000933491752063413 35764 42392 579 665 0 False 519 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 563 639 0,000966167533255246 0,000945990519902411 0,000717174029144732 0,000762951094834821 0,00089436500580873 0,000797822868928703 36661 41227 579 665 0 False 563 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 607 639 0,00100077046201235 0,00102953653302402 0,000854505226215 0,000946059357595178 0,000738894389410621 0,000688193850897749 37974 44868 579 665 0 False 607 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 653 645 0,00119257557663093 0,0743768324450403 0,00103761348897536 0,0740215152208743 0,000801237501133815 0,0240693963988752 45252 3241400 579 665 0 True 651 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G5_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G5_1.csv new file mode 100755 index 0000000..6b0fe26 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G5_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 269 277 0,00995456460903777 0,0451030299484119 0,00991836423285267 0,0453955901426719 0,00142488130135819 0,00743667284281505 406428 1965625 623 665 0 True 268 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 313 277 0,0102639333178294 0,0100551676742784 0,010101472495613 0,0100404364080262 0,00168821797298321 0,00124423346212806 419059 438212 623 665 0 False 313 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 357 277 0,0103887976735747 0,0583465300926842 0,0103913939116503 0,0585793850614176 0,00140571336186229 0,00816106971551769 424157 2542787 623 665 0 True 357 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 401 276 0,0103960230531245 0,0807766268497979 0,0105134660868238 0,0773479819943542 0,00143266536129978 0,0161948556592077 424452 3520308 623 665 0 True 401 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 445 276 0,0103843399817847 0,0630585848920768 0,010452429999237 0,0621347371633478 0,00169006178016158 0,0105034781109515 423975 2748142 623 665 0 True 445 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 488 276 0,0104167194792926 0,0494688082072886 0,010406652933547 0,0508735790035859 0,00157793611189002 0,0118000256686915 425297 2155889 623 665 0 True 489 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 533 277 0,0101915080726472 0,0725163561226252 0,0102082856488899 0,0721141374837873 0,00156461095683068 0,0177353639411979 416102 3160319 623 665 0 True 533 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 577 277 0,0102999622443302 0,0647548374254473 0,0103456168459602 0,0635690852216373 0,00173126715075233 0,0154374660801157 420530 2822066 623 665 0 True 577 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 622 277 0,00995093967285686 0,0101059239997453 0,0100556954299229 0,0100251773861295 0,00193360823573401 0,00190227862115666 406280 440424 623 665 0 False 622 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 665 276 0,0100758775070383 0,0441731015568218 0,0100709544518196 0,0440375371938659 0,00180279704297784 0,00771810703368168 411381 1925098 623 665 0 True 666 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 268 320 0,0100965984260184 0,010011249226293 0,010101472495613 0,0100404364080262 0,001486619454261 0,00140203046905584 412227 436298 623 665 0 False 268 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 313 320 0,0102519318399331 0,0103812518249159 0,0102998397802701 0,0103913939116503 0,00137193135859905 0,00121762877337389 418569 452423 623 665 0 False 313 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 357 321 0,0104571326191474 0,0960101329083753 0,0104371709773404 0,0929732204165713 0,00139738784362241 0,0203395316862881 426947 4184196 623 665 0 True 357 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 401 321 0,0104336195195955 0,0490772135190345 0,0103456168459602 0,0487830930037385 0,00151373947977751 0,00727125962452281 425987 2138823 623 665 0 True 401 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 446 321 0,0105437636953089 0,0710386862096876 0,0105745021744106 0,0689250019073777 0,00174733202795476 0,0125920106457992 430484 3095921 623 665 0 True 445 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 490 322 0,0105145192777413 0,03949025688506 0,0105439841306172 0,0407110704203861 0,00171350291863272 0,00643012690407442 429290 1721016 623 665 0 True 489 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 534 322 0,0102663336134086 0,0404424886891066 0,0102998397802701 0,0423895628290227 0,00150789563222244 0,00735376533758738 419157 1762515 623 665 0 True 533 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 577 322 0,0104511318801993 0,0498921141260108 0,0104982070649271 0,0503395132372015 0,00201261461490726 0,00995503787538207 426702 2174337 623 665 0 True 577 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 622 321 0,0100664477744055 0,0100863511491019 0,0100862134737163 0,0101930266269932 0,00193026413106956 0,00204541738980519 410996 439571 623 665 0 False 622 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 666 321 0,00993450499598257 0,00983362503305643 0,0100251773861295 0,00990310521095598 0,00188947598350512 0,00190385581058067 405609 428557 623 665 0 False 666 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 269 366 0,0103762328610017 0,055476847302509 0,010406652933547 0,0553292133974212 0,00140721419307263 0,0104755212426799 423644 2417724 623 665 0 True 268 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 313 366 0,0104674440930134 0,0675660081767706 0,0105134660868238 0,0676279850461585 0,00141822636903657 0,0188460868956418 427368 2944579 623 665 0 True 313 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 357 365 0,0104886303754221 0,0396653340836642 0,0105134660868238 0,0410925459678035 0,00136001324383287 0,00644642598272831 428233 1728646 623 665 0 True 357 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 402 365 0,0103767961956785 0,0362470837198283 0,0103913939116503 0,0363622491798276 0,00144471558324402 0,00628080391085578 423667 1579676 623 665 0 True 401 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 446 365 0,0106917492656136 0,0686328547392744 0,0107423514152743 0,0667124437323568 0,00165660957661184 0,0105580483538895 436526 2991073 623 665 0 True 445 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 489 364 0,0106355382619974 0,0317281415945448 0,0105592431525139 0,0324559395742733 0,0017097516366428 0,00464874837778908 434231 1382737 623 665 0 False 489 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 534 366 0,0103951413118913 0,029081928900989 0,0104219119554437 0,029251544975967 0,00173559331675819 0,00382605007559004 424416 1267413 623 665 0 True 533 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 577 365 0,010512118982162 0,0514422930753297 0,0104829480430304 0,050766765850309 0,00188671548512518 0,00908481392567909 429192 2241895 623 665 0 True 577 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 622 365 0,0103136537262568 0,0581288653081548 0,0103608758678569 0,0571297779812314 0,00205573818729947 0,0127952863794792 421089 2533301 623 665 0 True 621 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 666 365 0,010283552060268 0,0660967823541458 0,0102388036926833 0,063782711528191 0,00199794463620135 0,0191801714307108 419860 2880549 623 665 0 True 666 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 269 410 0,0102912183104344 0,0457018490377925 0,0102998397802701 0,0480811779964904 0,00152609433803168 0,00981332593728253 420173 1991722 623 665 0 True 268 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 313 410 0,0104641375633889 0,0331301129913362 0,0105592431525139 0,0328068970778973 0,00144888761891604 0,00416806884621387 427233 1443836 623 665 0 True 312 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 357 409 0,0107593004412013 0,0847028076026642 0,010757610437171 0,082887006942855 0,00138669270589569 0,0170340794556045 439284 3691414 623 665 0 True 357 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 402 409 0,0106598596243464 0,0656994052996992 0,0107118333714809 0,0645304036011292 0,0015092661501204 0,0154400701076723 435224 2863231 623 665 0 True 401 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 446 409 0,0109096373214612 0,0436571859954303 0,0108644235904479 0,0440070191500725 0,00163489571031951 0,0080049599996677 445422 1902614 623 665 0 True 445 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 490 410 0,0109232553249516 0,0529644780295899 0,0109102006561379 0,0531166552224002 0,00194817670484927 0,0100175094850793 445978 2308233 623 665 0 True 489 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 534 410 0,0108168340566673 0,0405214455227104 0,0108339055466545 0,0415503166247044 0,00183350817817434 0,00591039309232771 441633 1765956 623 665 0 True 533 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 578 409 0,0105776372543509 0,0516943078685498 0,0106202792401007 0,0511787594415198 0,00177567618133817 0,00842075694464207 431867 2252878 623 665 0 True 577 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 622 409 0,010253352423031 0,0431454924791952 0,0102693217364767 0,0434729533836881 0,00194671632487912 0,00828959781668697 418627 1880314 623 665 0 True 621 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 666 409 0,0104640150993288 0,0863933236616375 0,0104371709773404 0,0830243381399252 0,00210388841879721 0,016383329026923 427228 3765088 623 665 0 True 666 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 270 454 0,0100967698757027 0,0430116261126609 0,0100709544518196 0,0431525139238575 0,00166619952107336 0,00607145080938729 412234 1874480 623 665 0 True 268 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 313 454 0,0106233653344169 0,0570851711563184 0,010605020218204 0,0561989776455329 0,00160120999491236 0,00696141990186781 433734 2487816 623 665 0 True 312 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 357 454 0,0106910634668767 0,0355792433705 0,0107423514152743 0,0356603341725795 0,00140914020134914 0,00403503335109054 436498 1550571 623 665 0 True 357 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 401 453 0,0107743635206017 0,0501285257088705 0,0106813153276875 0,0512855725947967 0,0016716450617005 0,00679400529019224 439899 2184640 623 665 0 True 401 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 446 453 0,0114480383155754 0,0917815940629785 0,0112306401159686 0,0906385900663767 0,00224202102460033 0,00921653394685514 467404 3999913 623 665 0 True 445 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 490 454 0,0112335792534126 0,0592578034695344 0,0112001220721752 0,059159227893492 0,00204265296144132 0,0121982709490503 458648 2582501 623 665 0 True 489 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 533 453 0,0109775069036052 0,0541264812293953 0,0110170138094148 0,0529182879377432 0,00189390414996143 0,00982364454895951 448193 2358874 623 665 0 True 533 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 578 454 0,0105996562923687 0,030508154111532 0,0105897611963073 0,0308995193408103 0,0018367411146875 0,0040486281851801 432766 1329569 623 665 0 True 577 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 622 454 0,01040150944302 0,0419791754506431 0,0103608758678569 0,0412603952086671 0,00180416860345659 0,00783737474967217 424676 1829485 623 665 0 True 621 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 666 453 0,0104810865893159 0,0710098661623158 0,0104371709773404 0,0694590676737621 0,00204368553000318 0,0126771130748522 427925 3094665 623 665 0 True 666 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 268 498 0,010515817396779 0,0513523681026783 0,0105287251087205 0,053177691309987 0,00165767120700619 0,0133596848297076 429343 2237976 623 665 0 True 268 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 313 498 0,010594684251526 0,0549659798385871 0,0105592431525139 0,0545815213244831 0,0016525633431426 0,00696905441614694 432563 2395460 623 665 0 True 312 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 357 497 0,0108326809060528 0,0686913438322288 0,0108644235904479 0,0665903715571832 0,0015909584829863 0,0169812637845091 442280 2993622 623 665 0 True 356 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 401 497 0,0110615172488792 0,0879748237611653 0,0109102006561379 0,0847486076142519 0,00184794135526121 0,0199758960565009 451623 3834011 623 665 0 True 401 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 446 497 0,0111993138093781 0,0951267846888909 0,0112306401159686 0,0923781185626001 0,00190218645068022 0,0278404416714423 457249 4145699 623 665 0 True 445 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 490 498 0,0113830833780633 0,0467484573186227 0,011306935225452 0,0478065156023499 0,00232232598190296 0,00741627780871328 464752 2037334 623 665 0 True 489 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 535 498 0,0106235367841011 0,0413921046608281 0,0106813153276875 0,042572671091783 0,00179926356691577 0,00598517066982924 433741 1803900 623 665 0 True 533 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 577 496 0,010636713916975 0,0959692433188717 0,0106965743495842 0,0925917448691539 0,00190261246877036 0,0157958076499526 434279 4182414 623 665 0 True 577 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 621 496 0,0103509562789834 0,0589341056922462 0,0103761348897536 0,0619821469443809 0,00184094257560327 0,0141156000326199 422612 2568394 623 665 0 True 621 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 665 497 0,0104868179073317 0,0710716135727279 0,0105287251087205 0,0681467917906462 0,00184189509345254 0,0109716420095206 428159 3097356 623 665 0 True 665 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 269 542 0,0102480864684439 0,0529610361449515 0,01025406271458 0,0548409246967269 0,00151056541180576 0,0120467247811868 418412 2308083 623 665 0 True 268 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 314 541 0,010478220930308 0,104955866434225 0,010452429999237 0,101808194094759 0,00144031206296556 0,0256405462170802 427808 4574058 623 665 0 True 312 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 357 542 0,0109595536723849 0,057002336466022 0,0110170138094148 0,0580300602731365 0,00163024872283311 0,0119267036239737 447460 2484206 623 665 0 True 356 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 401 542 0,0110297990572962 0,0555425414073063 0,0109102006561379 0,0559395742732891 0,00184380739661853 0,00653152732497518 450328 2420587 623 665 0 True 401 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 445 541 0,010986936636238 0,0549434240212571 0,0110017547875181 0,0552681773098344 0,00213206940830273 0,00729391862305447 448578 2394477 623 665 0 True 445 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 490 542 0,0110114539410833 0,0600754116924263 0,0110322728313115 0,0598458838788434 0,001929451788471 0,0115719917274355 449579 2618133 623 665 0 True 489 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 533 541 0,0107704691634884 0,070933869349501 0,0108033875028611 0,0693217364766918 0,00197087387051581 0,0163893228541723 439740 3091353 623 665 0 True 533 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 578 542 0,0105328643939541 0,058383840122164 0,0105439841306172 0,0584267948424506 0,00172076323742904 0,013307799122559 430039 2544413 623 665 0 True 577 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 622 541 0,0104845400758126 0,0432729569403022 0,010452429999237 0,0427557793545434 0,00169189946958729 0,0062580433717987 428066 1885869 623 665 0 True 621 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 666 541 0,0103988642193204 0,0622988921146997 0,010452429999237 0,0624246585793851 0,0019709204333575 0,0122526240000692 424568 2715034 623 665 0 True 665 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 269 586 0,0101097265732682 0,0456226168534176 0,010101472495613 0,0463111314564736 0,00140886155259426 0,00962069500700676 412763 1988269 623 665 0 True 268 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 313 586 0,0104071427897876 0,0533141505629489 0,0103913939116503 0,0537270160982681 0,00152105635136698 0,0110119900839796 424906 2323472 623 665 0 True 312 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 357 586 0,0106588799118651 0,0492580960297287 0,0106507972838941 0,0487983520256352 0,00155452318970691 0,00916321728503598 435184 2146706 623 665 0 True 356 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 401 586 0,0108046366362748 0,0503285221522564 0,0107118333714809 0,0495918211642634 0,00157575639863174 0,0069409410863862 441135 2193356 623 665 0 True 401 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 445 585 0,0109414289914803 0,0878710165204726 0,0108339055466545 0,0848859388113222 0,00201951934623827 0,01942813556722 446720 3829487 623 665 0 True 445 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 490 586 0,010824010450593 0,0630341704570421 0,0109102006561379 0,0614785992217899 0,00198289495457331 0,0126424010321347 441926 2747078 623 665 0 True 489 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 534 586 0,010588046699465 0,0555532341955828 0,0106507972838941 0,0552834363317311 0,00217578851754305 0,00768567906226729 432292 2421053 623 665 0 True 533 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 577 580 0,0106781067693111 0,0343428725166085 0,0105592431525139 0,0382696269169146 0,00191208595522526 0,0112259244796606 435969 1496689 623 665 0 False 577 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 622 586 0,0103094654553991 0,0483884235652074 0,0101777676050965 0,0487983520256352 0,0017045029796117 0,00754771263206308 420918 2108805 623 665 0 True 621 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 665 585 0,0102302801940957 0,0518401519936256 0,01025406271458 0,0513466086823835 0,00167178865534806 0,0076213099480818 417685 2259234 623 665 0 True 665 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 268 623 0,0104097635206752 0,00966226506986165 0,00988784618905928 0,00973525597009232 0,00299877030468539 0,00141745348463882 425013 421089 623 665 0 False 268 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 312 623 0,0103703790789258 0,0097856451611978 0,0100251773861295 0,00976577401388571 0,00280466940509372 0,0013419496496606 423405 426466 623 665 0 False 312 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 357 629 0,0107472254848689 0,0761263882985101 0,0102998397802701 0,0736247806515602 0,00284971388232714 0,0143623995433817 438791 3317647 623 665 0 True 356 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 401 629 0,0104435880940931 0,0781509966263794 0,010452429999237 0,0757000076295109 0,00162073685843007 0,020354607185431 426394 3405881 623 665 0 True 400 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 445 623 0,0109954356420135 0,0103973368991258 0,0105439841306172 0,0104829480430304 0,00360035398817111 0,00187473358013857 448925 453124 623 665 0 False 445 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 489 623 0,0106609128152638 0,0104348763875815 0,0104676890211337 0,0105287251087205 0,00250225938602257 0,0020118496532632 435267 454760 623 665 0 False 489 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 533 623 0,0102040728852202 0,00998341585251754 0,0100404364080262 0,00999465934233616 0,00229105433521875 0,00201459648322566 416615 435085 623 665 0 False 533 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 577 623 0,0100057790789992 0,00990709779713647 0,00988784618905928 0,00991836423285267 0,00171714600887833 0,00166085093534305 408519 431759 623 665 0 False 577 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 621 623 0,0100236343389715 0,00988204087696926 0,00985732814526589 0,00990310521095598 0,00163615646236329 0,00139809338494191 409248 430667 623 665 0 False 621 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 665 623 0,00996979913812244 0,00993300371551447 0,00994888227664607 0,00994888227664607 0,00168530155418918 0,00155269966508279 407050 432888 623 665 0 False 665 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 270 672 0,0100615737048109 0,0428976997311314 0,0100251773861295 0,0439765011062791 0,00140274812602976 0,00890732648328587 410797 1869515 623 665 0 True 268 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 312 666 0,00996034491267761 0,00979626911178151 0,00993362325474937 0,00988784618905928 0,00131767972406797 0,00131825421280714 406664 426929 623 665 0 False 312 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 356 666 0,0116634770902196 0,00992614289213535 0,00996414129854276 0,00985732814526589 0,00809168113281438 0,00122495941413562 476200 432589 623 665 0 False 356 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 400 666 0,0111574555936133 0,00992873577856291 0,0100709544518196 0,00990310521095598 0,00612058191854226 0,00146403775712011 455540 432702 623 665 0 False 400 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 445 666 0,0100725954702259 0,00999759641722755 0,0100099183642329 0,010101472495613 0,00157108808203737 0,00161706547514594 411247 435703 623 665 0 False 445 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 489 667 0,0100517765799976 0,00995936855184425 0,0100404364080262 0,0100099183642329 0,00177785991188845 0,00164349690677562 410397 434037 623 665 0 False 489 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 533 667 0,0100075915470897 0,00983183525304449 0,00996414129854276 0,00984206912336919 0,00178376493921524 0,00170662434717775 408593 428479 623 665 0 False 533 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 577 667 0,00982205849593805 0,00962940654451418 0,0098115510795758 0,00964370183871214 0,00144704655605288 0,00142042252227384 401018 419657 623 665 0 False 577 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 621 667 0,00980567280468783 0,00984514387364612 0,00978103303578241 0,0098268101014725 0,00128354537643634 0,00143386452607052 400349 429059 623 665 0 False 621 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 666 672 0,00994866184133777 0,0425852454436618 0,00996414129854276 0,0434119172961013 0,00153872016654269 0,00813734733420247 406187 1855898 623 665 0 True 665 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G5_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G5_2.csv new file mode 100755 index 0000000..ca5a121 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G5_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 269 277 0,00802071014214281 0,662926783656326 0,00778210116731518 0,651560234988937 0,0019801891721174 0,148104288186894 327472 28890863 623 665 0 True 268 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 313 277 0,00677182165656889 0,00668680169180103 0,00669871061264973 0,00665293354695964 0,00153083696652385 0,00123089941902588 276482 291416 623 665 0 False 313 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 357 277 0,00633692728610703 0,00638958348033049 0,0063935301747158 0,0063935301747158 0,00125324785141804 0,00134430509556181 258726 278463 623 665 0 True 357 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 401 276 0,00648329633081755 0,00634369168515246 0,00643930724040589 0,0063935301747158 0,00131888772836721 0,00123135132236894 264702 276463 623 665 0 True 401 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 445 276 0,00663370668951356 0,00656227430558543 0,00662241550316625 0,00650034332799268 0,00157807916554353 0,00168258791837104 270843 285989 623 665 0 True 445 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 488 276 0,00679215069055647 0,00668625099025889 0,00679026474402991 0,00672922865644312 0,00168227512272505 0,00163008308704336 277312 291392 623 665 0 True 489 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 533 277 0,00695108454784003 0,0070948944804217 0,00694285496299687 0,00711070420386053 0,00141881561055357 0,00153850789642425 283801 309201 623 665 0 True 533 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 577 277 0,00711900726713979 0,00725895764818317 0,00714122224765393 0,00730907148851759 0,0016653496054034 0,00178305370658649 290657 316351 623 665 0 True 577 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 622 277 0,00781036587240151 0,00771140485684341 0,00796520943007553 0,00773632410162509 0,00194094663155385 0,00175664848838018 318884 336069 623 665 0 False 622 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 665 276 0,00914167267046722 0,664960019641688 0,0089723048752575 0,652948805981537 0,00213238564367878 0,158148317667911 373239 28979473 623 665 0 True 666 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 268 320 0,00655033315735248 0,00632423356399697 0,00653086137178607 0,00630197604333562 0,00148768212987102 0,0013992642265788 267439 275615 623 665 0 False 268 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 313 320 0,00642840793905111 0,00647517167833752 0,0063935301747158 0,0063935301747158 0,00140080470677411 0,00111153011553159 262461 282193 623 665 0 False 313 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 357 321 0,00650759320035451 0,00657494044105457 0,00645456626230259 0,00659189745937285 0,00127625868544386 0,00120188290324684 265694 286541 623 665 0 True 357 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 401 321 0,00665788109499035 0,00693413552191305 0,00662241550316625 0,00686655985351339 0,00138790946234648 0,00126451255823347 271830 302195 623 665 0 True 401 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 446 321 0,0070525827609057 0,00705350008117111 0,00706492713817044 0,00711070420386053 0,0016169257416295 0,00166862997597019 287945 307397 623 665 0 True 445 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 490 322 0,00702906966135381 0,00707064066667011 0,00706492713817044 0,00706492713817044 0,00161876127509121 0,00150328333608037 286985 308144 623 665 0 True 489 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 534 322 0,006922305493701 0,00703528103848543 0,00694285496299687 0,00708018616006714 0,001531027899981 0,00156252220963049 282626 306603 623 665 0 True 533 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 577 322 0,0071313271515925 0,00715925772315889 0,00718699931334401 0,0072327763790341 0,00169660354683962 0,00182932766675751 291160 312006 623 665 0 True 577 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 622 321 0,00728813013422918 0,00741595347948723 0,00727855344472419 0,00750743877317464 0,00193620471164863 0,00189950057275217 297562 323193 623 665 0 False 622 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 666 321 0,00749974803019621 0,00725209682480406 0,00738536659800107 0,00729381246662089 0,00185974469073565 0,00190458610530029 306202 316052 623 665 0 False 666 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 269 366 0,00615293728211348 0,00616480546754848 0,00617990386816205 0,00616464484626535 0,00134692203104073 0,00145005311922143 251214 268667 623 665 0 True 268 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 313 366 0,00630829518884019 0,00634885451210998 0,00628671702143893 0,00634775310902571 0,00132297707019954 0,00126659606218538 257557 276688 623 665 0 True 313 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 357 365 0,00651925177888232 0,0067485032104179 0,00654612039368277 0,00677500572213321 0,00130469329645283 0,00134488597314484 266170 294105 623 665 0 True 357 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 402 365 0,00694030771054542 0,00695944484695373 0,00695811398489357 0,00711070420386053 0,00138928670328362 0,00126061041800095 283361 303298 623 665 0 True 401 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 446 365 0,00723248246528971 0,00733541337894978 0,00730907148851759 0,00733958953231098 0,00152211798316077 0,00163201536333811 295290 319683 623 665 0 True 445 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 489 364 0,0071476883500307 0,00731086126852953 0,00714122224765393 0,0072632944228275 0,00167888070042193 0,00159335708081904 291828 318613 623 665 0 False 489 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 534 366 0,00712295060987714 0,00719491564801223 0,00717174029144732 0,00715648126955062 0,00160657317109858 0,00158315851555222 290818 313560 623 665 0 True 533 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 577 365 0,00710095606467131 0,0072035433055057 0,00717174029144732 0,0072480354009308 0,00177480860385854 0,00196317093404958 289920 313936 623 665 0 True 577 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 622 365 0,00717073608615396 0,00701208273602294 0,00718699931334401 0,00701915007248035 0,00193030872545715 0,00191983234098182 292769 305592 623 665 0 True 621 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 666 365 0,00665070470106462 0,00651101317037157 0,00668345159075303 0,00654612039368277 0,00176627566690284 0,00195260634119296 271537 283755 623 665 0 True 666 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 269 410 0,00615225148337655 0,00617740276532485 0,00622568093385214 0,00616464484626535 0,00146474988766348 0,00147511848791671 251186 269216 623 665 0 True 268 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 313 410 0,00659263224373385 0,00652845205253922 0,00663767452506294 0,00657663843747616 0,00139944701963081 0,00128467716942234 269166 284515 623 665 0 True 312 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 357 409 0,00678855024718758 0,00676637806463974 0,0068207827878233 0,00674448767833982 0,00137703502058751 0,00130695758739906 277165 294884 623 665 0 True 357 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 402 409 0,00702522428986459 0,0069927393443554 0,00697337300679027 0,00698863202868696 0,00144812751069861 0,00146239216837474 286828 304749 623 665 0 True 401 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 446 409 0,00724965192652499 0,00730741938389118 0,00721751735713741 0,00732433051041428 0,00158499473741816 0,00156993631708721 295991 318463 623 665 0 True 445 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 490 410 0,00722530607136397 0,00767017107887595 0,00720225833524071 0,00761425192645151 0,00162156216846135 0,00178739978627893 294997 334272 623 665 0 True 489 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 534 410 0,00719500846287888 0,00735179674982834 0,00714122224765393 0,00737010757610437 0,0016648956365105 0,00160913656153317 293760 320397 623 665 0 True 533 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 578 409 0,00669452234179205 0,00687082779046495 0,0068207827878233 0,00685130083161669 0,00182289167487162 0,00174944025721286 273326 299436 623 665 0 True 577 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 622 409 0,00641540225586147 0,00641422737434109 0,0063782711528191 0,00646982528419928 0,00196183972092337 0,00179581732745338 261930 279537 623 665 0 True 621 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 666 409 0,00610929109107028 0,00606476135406036 0,00614938582436866 0,00613412680247196 0,00173665461990167 0,00186203930495169 249432 264307 623 665 0 True 666 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 270 454 0,00617471139201101 0,0063055785492571 0,00624093995574884 0,00633249408712902 0,00150852551178988 0,001523599659711 252103 274802 623 665 0 True 268 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 313 454 0,00652319512161967 0,00641408969895556 0,00648508430609598 0,0063935301747158 0,00146892090679902 0,00145033533987905 266331 279531 623 665 0 True 312 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 357 454 0,00663258002016003 0,0066703494832297 0,00665293354695964 0,00666819256885634 0,00135786821577071 0,00147055528296805 270797 290699 623 665 0 True 357 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 401 453 0,00683395992069717 0,00687702318281398 0,00685130083161669 0,00691233691920348 0,00149547554162146 0,00145865939086882 279019 299706 623 665 0 True 401 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 446 453 0,00719980905403739 0,00743015699009483 0,00720225833524071 0,00749217975127794 0,00198516878848174 0,00192238453966804 293956 323812 623 665 0 True 445 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 490 454 0,00730287480707318 0,00742104746875199 0,00733958953231098 0,00741588464179446 0,00177309077066517 0,00208875662704275 298164 323415 623 665 0 True 489 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 533 453 0,0069009967472321 0,00705430318758673 0,00685130083161669 0,00692759594110018 0,00171518318318627 0,00191704098386465 281756 307432 623 665 0 True 533 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 578 454 0,00633974395949085 0,00617758633250556 0,0064087891966125 0,00631723506523232 0,00182245054335119 0,00192536917254184 258841 269224 623 665 0 True 577 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 622 454 0,00609364018418105 0,00619110146618549 0,00611886778057527 0,00619516289005875 0,00171494742251756 0,00184233265852035 248793 269813 623 665 0 True 621 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 666 453 0,00608156522784867 0,00601691915758726 0,00614938582436866 0,00601205462729839 0,00176965565064193 0,00192480851028297 248300 262222 623 665 0 True 666 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 268 498 0,00636712692334399 0,00637248878662667 0,00633249408712902 0,0063782711528191 0,00152949212725811 0,00144383271784983 259959 277718 623 665 0 True 268 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 313 498 0,00651361843211468 0,00650890214779338 0,00643930724040589 0,00657663843747616 0,00139430788298013 0,00140541136611711 265940 283663 623 665 0 True 312 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 357 497 0,00664377323525922 0,00688661456800619 0,00666819256885634 0,00691233691920348 0,00141027168425172 0,00149865706443106 271254 300124 623 665 0 True 356 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 401 497 0,00675977119304855 0,00691444794178167 0,00675974670023652 0,00689707789730678 0,00157006927659194 0,001497638084248 275990 301337 623 665 0 True 401 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 446 497 0,00685497475342168 0,0070635503843151 0,0068055237659266 0,00718699931334401 0,0017804551409402 0,00189719392403777 279877 307835 623 665 0 True 445 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 490 498 0,00699796379007162 0,00660862501871525 0,00689707789730678 0,00663767452506294 0,00193403354251594 0,00174804291261978 285715 288009 623 665 0 True 489 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 535 498 0,00635181891582323 0,0064294634503402 0,0063782711528191 0,00642404821850919 0,00161804286016473 0,00160653489444065 259334 280201 623 665 0 True 533 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 577 496 0,00611938212962796 0,00618724655539054 0,00607309071488518 0,00621042191195544 0,00165944293861413 0,00178325091936633 249844 269645 623 665 0 True 577 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 621 496 0,00602990988727061 0,0061225620700871 0,00602731364919509 0,00610360875867857 0,00169812172717071 0,0017864898267003 246191 266826 623 665 0 True 621 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 665 497 0,00613581680650225 0,00600728188059987 0,00607309071488518 0,00602731364919509 0,00169428228508466 0,00189683478355369 250515 261802 623 665 0 True 665 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 269 542 0,00636749431552449 0,00646817317957287 0,00633249408712902 0,00651560234988937 0,00138693523425959 0,0013498212595729 259974 281888 623 665 0 True 268 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 314 541 0,00651447568053584 0,00653896127363499 0,00642404821850919 0,00657663843747616 0,00141020796424056 0,00139299485112772 265975 284973 623 665 0 True 312 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 357 542 0,00663664582695755 0,00682248078424489 0,00660715648126955 0,0068055237659266 0,0013915449184722 0,00132833892387315 270963 297329 623 665 0 True 356 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 401 542 0,00674426724303152 0,00676396874539289 0,00674448767833982 0,00672922865644312 0,00145268885064387 0,00151705327052144 275357 294779 623 665 0 True 401 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 445 541 0,0066969961158074 0,00659019946295127 0,00671396963454643 0,00663767452506294 0,00182520841512595 0,00195821461030934 273427 287206 623 665 0 True 445 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 490 542 0,00656997639260312 0,00659081900218617 0,00654612039368277 0,00656137941557946 0,00181005495219777 0,00195681283245181 268241 287233 623 665 0 True 489 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 533 541 0,00635948516598962 0,00653542760540628 0,00634775310902571 0,00657663843747616 0,00177293314679418 0,00173751024510705 259647 284819 623 665 0 True 533 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 578 542 0,00642466053881002 0,00649713090233021 0,0063935301747158 0,00662241550316625 0,0016641221930329 0,00154772922700088 262308 283150 623 665 0 True 577 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 622 541 0,00628230831527295 0,00640814671148 0,0063782711528191 0,0063782711528191 0,00157637379324172 0,00164904215268142 256496 279272 623 665 0 True 621 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 666 541 0,0062045681298795 0,00625115088017595 0,00627145799954223 0,00631723506523232 0,00171908093013519 0,00181862549226875 253322 272430 623 665 0 True 665 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 269 586 0,00632725262535391 0,00637939550180097 0,00631723506523232 0,00643930724040589 0,00131765760831294 0,00125300781355827 258331 278019 623 665 0 True 268 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 313 586 0,0065170964114234 0,00664148354406272 0,00645456626230259 0,00671396963454643 0,00145513321506204 0,0013169185587938 266082 289441 623 665 0 True 312 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 357 586 0,00649177084378105 0,00636631634017523 0,00648508430609598 0,0064087891966125 0,00152179919381922 0,00134244641039391 265048 277449 623 665 0 True 356 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 401 586 0,00616731456277698 0,00630273325795606 0,00616464484626535 0,00630197604333562 0,00136832979437437 0,0012637240741136 251801 274678 623 665 0 True 401 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 445 585 0,00635377834078588 0,00633263176251455 0,00630197604333562 0,0063782711528191 0,00170888501658957 0,0019597679752539 259414 275981 623 665 0 True 445 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 490 586 0,00648307589550925 0,00659196629706562 0,00651560234988937 0,00665293354695964 0,00191138938014178 0,00194312760905646 264693 287283 623 665 0 True 489 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 534 586 0,00641381022307931 0,00656195306301919 0,00628671702143893 0,00659189745937285 0,00182226414041872 0,00171382518314286 261865 285975 623 665 0 True 533 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 577 580 0,00642101110981707 0,00656498192150094 0,00645456626230259 0,00659189745937285 0,00168920492595019 0,00164199374808214 262159 286107 623 665 0 False 577 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 622 586 0,00629181152634184 0,00639589360216747 0,00624093995574884 0,00633249408712902 0,00146830847098495 0,00138732000962037 256884 278738 623 665 0 True 621 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 665 585 0,0064085687613042 0,00621420798505763 0,00633249408712902 0,00631723506523232 0,00160494675063838 0,0016490847485649 261651 270820 623 665 0 True 665 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 268 623 0,00634285454661907 0,00629607894765524 0,00633249408712902 0,00630197604333562 0,00134824972179946 0,00136302705403183 258968 274388 623 665 0 False 268 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 312 623 0,0063291630646925 0,0063740949994579 0,0063935301747158 0,00631723506523232 0,00133017683986406 0,00127765381320331 258409 277788 623 665 0 False 312 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 357 629 0,00628750079142399 0,00628841501786051 0,00611886778057527 0,00627145799954223 0,00239594905227634 0,0012988351646838 256708 274054 623 665 0 True 356 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 401 629 0,00593597995312321 0,00585017131980787 0,0059510185397116 0,00590524147402152 0,00128180024471534 0,00126747451941436 242356 254955 623 665 0 True 400 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 445 623 0,00598121817694857 0,00597511173218007 0,00599679560540169 0,00592050049591821 0,00169477537608141 0,00176087469337009 244203 260400 623 665 0 False 445 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 489 623 0,00609883266033209 0,00605305894628996 0,005981536583505 0,00602731364919509 0,00179218180908976 0,00182610874900274 249005 263797 623 665 0 False 489 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 533 623 0,00615323119585787 0,0060590478255607 0,00619516289005875 0,00607309071488518 0,00187501470023918 0,00181693756461612 251226 264058 623 665 0 False 533 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 577 623 0,00630082488117006 0,00612999654090594 0,00625619897764553 0,00608834973678187 0,00156996697111867 0,00153484978446433 257252 267150 623 665 0 False 577 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 621 623 0,00628387585524307 0,00619598894237195 0,00619516289005875 0,00622568093385214 0,001333934541465 0,0012456081825978 256560 270026 623 665 0 False 621 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 665 623 0,00650582971788812 0,00621081199221446 0,00654612039368277 0,00622568093385214 0,00142645626817389 0,00144191738847005 265622 270672 623 665 0 False 665 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 270 672 0,00853251194238899 0,650330334878166 0,0081025406271458 0,650385290302892 0,00266688531717795 0,193034688784712 348368 28341900 623 665 0 True 268 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 312 666 0,00725222367178848 0,0064524552397244 0,00660715648126955 0,00642404821850919 0,00349887047745604 0,00135653022421681 296096 281203 623 665 0 False 312 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 356 666 0,00575243081974625 0,00578390356757079 0,00569161516746777 0,00575265125505455 0,00129800799045736 0,00120912465708559 234862 252067 623 665 0 False 356 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 400 666 0,00573033830329229 0,00589888546038936 0,00578316929884794 0,00590524147402152 0,00126568702829588 0,00125565770261729 233960 257078 623 665 0 False 400 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 445 666 0,0058732293686941 0,00587105208661388 0,00585946440833143 0,00584420538643473 0,0015247490030579 0,00148658184367478 239794 255865 623 665 0 False 445 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 489 667 0,00603039974351127 0,00578947942068492 0,00605783169298848 0,00584420538643473 0,00171799608641184 0,00150952631858533 246211 252310 623 665 0 False 489 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 533 667 0,00597864643168508 0,00587224527328851 0,00602731364919509 0,00585946440833143 0,00168764066548243 0,00163164784462538 244098 255917 623 665 0 False 533 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 577 667 0,00593137530446096 0,00586834447069838 0,00590524147402152 0,00582894636453803 0,00134242920860707 0,00128928409414007 242168 255747 623 665 0 False 577 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 621 667 0,00625242708459242 0,00627682733957806 0,00622568093385214 0,00625619897764553 0,00136965112174233 0,00137847753225847 255276 273549 623 665 0 False 621 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 666 672 0,00871226468990079 0,65591910653264 0,00813305867093919 0,652429999237049 0,00306977042405324 0,171629937318236 355707 28585463 623 665 0 True 665 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G5_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G5_3.csv new file mode 100755 index 0000000..b6484ce --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G5_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 269 277 0,0010706053067841 0,0641607451909701 0,000900282291905089 0,0634470130464637 0,000826931633081014 0,0148991261673048 43711 2796175 623 665 0 True 268 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 313 277 0,0009269059785852 0,000875799019177608 0,000823987182421607 0,000762951094834821 0,000629561404300625 0,000641841101881542 37844 38168 623 665 0 False 313 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 357 277 0,000883578194098432 0,000842022657926574 0,000778210116731518 0,000717174029144732 0,000634132205580167 0,00067005406337281 36075 36696 623 665 0 True 357 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 401 276 0,000867168010036175 0,000874950020966814 0,000717174029144732 0,000717174029144732 0,000689241630624207 0,000690003584711276 35405 38131 623 665 0 True 401 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 445 276 0,000919876541531665 0,000926853641313171 0,00064087891966125 0,00064087891966125 0,000867965327093952 0,000903015804016808 37557 40393 623 665 0 True 445 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 488 276 0,000875593537375602 0,000938234806517323 0,00064087891966125 0,000717174029144732 0,000835100706065 0,000834817463182435 35749 40889 623 665 0 True 489 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 533 277 0,00090865883362045 0,000913017265066993 0,000701915007248035 0,000717174029144732 0,000808605515443153 0,000813683752592567 37099 39790 623 665 0 True 533 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 577 277 0,000846863468860635 0,00079170230451386 0,000579842832074464 0,0004272526131075 0,000838089067454315 0,000874820010530749 34576 34503 623 665 0 True 577 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 622 277 0,000932759760661139 0,000916711554578825 0,00064087891966125 0,000534065766384375 0,000979988903112062 0,000954936829950832 38083 39951 623 665 0 False 622 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 665 276 0,00111706817121112 0,064214851617485 0,00080872816052491 0,0627145799954223 0,00104389386946894 0,0157576319435991 45608 2798533 623 665 0 True 666 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 268 320 0,000908217963003852 0,000929171176969661 0,000747692072938125 0,000732433051041428 0,000722716777704303 0,000727946633967625 37081 40494 623 665 0 False 268 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 313 320 0,000871184831209623 0,000826396501668453 0,000747692072938125 0,000747692072938125 0,000670895397201359 0,000577694746554426 35569 36015 623 665 0 False 313 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 357 321 0,00086956830561543 0,000846680675137145 0,000778210116731518 0,000747692072938125 0,000621115192115747 0,000623893534991517 35503 36899 623 665 0 True 357 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 401 321 0,000910422316086842 0,000835987886860663 0,000747692072938125 0,000686655985351339 0,000737787327427857 0,000661625922393135 37171 36433 623 665 0 True 401 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 446 321 0,000887692986520014 0,000940139316017212 0,000610360875867857 0,000686655985351339 0,000856604639888624 0,000874599818485111 36243 40972 623 665 0 True 445 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 490 322 0,000956762716453696 0,00093481586777656 0,000686655985351339 0,000686655985351339 0,00088332074783151 0,000905490712946035 39063 40740 623 665 0 True 489 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 534 322 0,000864939164141152 0,000916023177651155 0,000656137941557946 0,000717174029144732 0,000759844151657956 0,000795120922096751 35314 39921 623 665 0 True 533 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 577 322 0,000845614335446941 0,000838466043800277 0,000518806744487678 0,000534065766384375 0,000918848705554568 0,000870858775501018 34525 36541 623 665 0 True 577 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 622 321 0,000929624680720887 0,000880273469207466 0,000411993591210803 0,000473029678797589 0,00108599905564971 0,00100087957806537 37955 38363 623 665 0 False 622 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 666 321 0,00104794945565338 0,000887524372845595 0,000671396963454643 0,000503547722590982 0,00103740026269976 0,00090779550093578 42786 38679 623 665 0 False 666 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 269 366 0,000841793456769758 0,000941745528848443 0,000686655985351339 0,000823987182421607 0,000704139433620253 0,000698921880562445 34369 41042 623 665 0 True 268 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 313 366 0,000875911943932034 0,000906477684254124 0,000762951094834821 0,000778210116731518 0,000666561108949608 0,000714990203405188 35762 39505 623 665 0 True 313 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 357 365 0,00082317891962451 0,000895945517260765 0,000717174029144732 0,000793469138628214 0,00062607680621968 0,000693469816029384 33609 39046 623 665 0 True 357 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 402 365 0,000825995593008331 0,000859323864708693 0,00064087891966125 0,000656137941557946 0,00069202672222495 0,000680711406063188 33724 37450 623 665 0 True 401 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 446 365 0,000828910237640284 0,000951841723787611 0,000595101853971161 0,000595101853971161 0,000805564978258308 0,000939232843679473 33843 41482 623 665 0 True 445 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 489 364 0,000843801867356482 0,000946082303492767 0,000564583810177768 0,000610360875867857 0,00082090313355522 0,000924705359724795 34451 41231 623 665 0 False 489 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 534 366 0,000910030431094311 0,000937684104975187 0,000686655985351339 0,000610360875867857 0,000860186547370991 0,000895805199919243 37155 40865 623 665 0 True 533 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 577 365 0,000869396855931198 0,00087598258635832 0,000534065766384375 0,000457770656900893 0,000938182673426639 0,000991038566945117 35496 38176 623 665 0 True 577 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 622 365 0,000779704178265544 0,000878460743297934 0,000244144350347143 0,000473029678797589 0,00100543023229267 0,000992918173450961 31834 38284 623 665 0 True 621 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 666 365 0,000801429302539011 0,000910011352482832 0,0004272526131075 0,000457770656900893 0,000904610944470788 0,00101651891445418 32721 39659 623 665 0 True 666 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 269 410 0,00090158041094285 0,000901842612941142 0,000762951094834821 0,000686655985351339 0,000751454373091584 0,000801384176039118 36810 39303 623 665 0 True 268 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 313 410 0,000872335993375184 0,000996104360236825 0,000732433051041428 0,000900282291905089 0,000688467235727361 0,000747429079797021 35616 43411 623 665 0 True 312 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 357 409 0,000874001504593443 0,000828759929120122 0,000778210116731518 0,000671396963454643 0,000638675724716389 0,000665271919238682 35684 36118 623 665 0 True 357 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 402 409 0,000912945075726264 0,00093061676851777 0,000717174029144732 0,000762951094834821 0,000767672894889052 0,000751736215400455 37274 40557 623 665 0 True 401 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 446 409 0,000834102713791327 0,000960469381281081 0,000549324788281071 0,000717174029144732 0,00079436667255362 0,00083030599524528 34055 41858 623 665 0 True 445 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 490 410 0,000946867620392274 0,000916734500476414 0,000656137941557946 0,000671396963454643 0,000872234568146776 0,000857640181727228 38659 39952 623 665 0 True 489 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 534 410 0,000897269676025003 0,00099013842686368 0,000717174029144732 0,00080872816052491 0,00080733311201137 0,000866171787192842 36634 43151 623 665 0 True 533 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 578 409 0,000883725150970632 0,000880044010231576 0,000503547722590982 0,000473029678797589 0,00093550421792246 0,0009809531667517 36081 38353 623 665 0 True 577 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 622 409 0,000886443853106319 0,00084982426310684 0,000488288700694286 0,000488288700694286 0,000947637551150642 0,000929302836544598 36192 37036 623 665 0 True 621 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 666 409 0,000823301383684677 0,000876808638671524 0,000488288700694286 0,000488288700694286 0,000859726959264877 0,000943119801761177 33614 38212 623 665 0 True 666 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 270 454 0,000946157328843311 0,000937041619842694 0,000793469138628214 0,000823987182421607 0,000813523540077114 0,000801293665065561 38630 40837 623 665 0 True 268 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 313 454 0,000933690487518402 0,000970473792629892 0,000854505226215 0,000839246204318303 0,000751240770125861 0,000807469182563633 38121 42294 623 665 0 True 312 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 357 454 0,000914561601320456 0,000921323679994218 0,000823987182421607 0,000854505226215 0,000731223595431753 0,000712994363331218 37340 40152 623 665 0 True 357 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 401 453 0,000919313206854901 0,000812560125422276 0,000701915007248035 0,000610360875867857 0,00081847097375436 0,000756597320952218 37534 35412 623 665 0 True 401 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 446 453 0,000882353553496771 0,000881076575623081 0,000488288700694286 0,000488288700694286 0,000954989075550321 0,000961159659591767 36025 38398 623 665 0 True 445 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 490 454 0,000932808746285206 0,00102391478811471 0,000564583810177768 0,000671396963454643 0,000994645014189215 0,00105132203007781 38085 44623 623 665 0 True 489 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 533 453 0,000878214268263157 0,000857121058540148 0,000549324788281071 0,000579842832074464 0,000912105454343044 0,000838188661885467 35856 37354 623 665 0 True 533 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 578 454 0,000866555689735344 0,000852004123377797 0,000442511635004196 0,000411993591210803 0,000939163090883954 0,0010110083127843 35380 37131 623 665 0 True 577 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 622 454 0,000752002807855972 0,000885528079755351 0,000396734569314107 0,000488288700694286 0,000812560127891776 0,00095003236385789 30703 38592 623 665 0 True 621 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 666 453 0,000839858524619134 0,000920750032554492 0,000442511635004196 0,000473029678797589 0,000936354273970225 0,000976475844876065 34290 40127 623 665 0 True 666 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 268 498 0,000941013838316335 0,000935183002137984 0,00080872816052491 0,000839246204318303 0,000768430516417919 0,000707006527806342 38420 40756 623 665 0 True 268 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 313 498 0,000877601947962327 0,00088649180745409 0,000747692072938125 0,000732433051041428 0,000760161562727204 0,000777089198853679 35831 38634 623 665 0 True 312 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 357 497 0,000853280585613339 0,000932750736993548 0,000717174029144732 0,000854505226215 0,000715898483562846 0,000765320053897523 34838 40650 623 665 0 True 356 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 401 497 0,000981867848787747 0,000914416964819923 0,000778210116731518 0,000686655985351339 0,000866652846263454 0,000811096862244197 40088 39851 623 665 0 True 401 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 446 497 0,000954925755551204 0,000948606352227559 0,000579842832074464 0,000518806744487678 0,00101266803612986 0,00105072329162188 38988 41341 623 665 0 True 445 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 490 498 0,000865894383810447 0,000891012149279126 0,000488288700694286 0,000549324788281071 0,000906196133534936 0,000945037076712395 35353 38831 623 665 0 True 489 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 535 498 0,000924677132690177 0,000808177458982774 0,000579842832074464 0,000564583810177768 0,000897818988211826 0,00079787205198682 37753 35221 623 665 0 True 533 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 577 496 0,000862661332622062 0,000799939881748317 0,000579842832074464 0,000396734569314107 0,000879463889732165 0,000948427669496562 35221 34862 623 665 0 True 577 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 621 496 0,000865061628201318 0,0008068695428202 0,000503547722590982 0,000473029678797589 0,000903891654558518 0,000828845703381591 35319 35164 623 665 0 True 621 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 665 497 0,000896289963543674 0,000862605128063923 0,000503547722590982 0,000457770656900893 0,000970447657586831 0,000974195584131841 36594 37593 623 665 0 True 665 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 269 542 0,000901776353439115 0,000913958046868143 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,00071460864630913 0,000724003999909503 36818 39831 623 665 0 True 268 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 314 541 0,000836013153129918 0,00089092036568877 0,000717174029144732 0,000717174029144732 0,000700274743131949 0,000738041848329993 34133 38827 623 665 0 True 312 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 357 542 0,000923770898644947 0,000895853733670409 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,000750145772143263 0,000728534057380756 37716 39042 623 665 0 True 356 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 401 542 0,000918504944057805 0,000903402933977195 0,000686655985351339 0,000717174029144732 0,000836124131935298 0,000807679586299953 37501 39371 623 665 0 True 401 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 445 541 0,00097611203795994 0,000890186096965921 0,000656137941557946 0,000457770656900893 0,0010004243721191 0,00104137635175404 39853 38795 623 665 0 True 445 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 490 542 0,000894036624836618 0,00089466054699578 0,000488288700694286 0,000473029678797589 0,00097740456867286 0,00103271864088252 36502 38990 623 665 0 True 489 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 533 541 0,000812793967322425 0,00089885964625457 0,0004272526131075 0,000457770656900893 0,000906795977735511 0,000996698079059744 33185 39173 623 665 0 True 533 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 578 542 0,00089283647704699 0,000911089809669516 0,000579842832074464 0,000671396963454643 0,000887028913855269 0,000836415414363937 36453 39706 623 665 0 True 577 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 622 541 0,000858203640832016 0,000817585276994271 0,000564583810177768 0,000442511635004196 0,000882340704620201 0,000871058911741957 35039 35631 623 665 0 True 621 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 666 541 0,00092820409762296 0,000885413350267406 0,000579842832074464 0,000473029678797589 0,000950973199972121 0,000977010868893672 37897 38587 623 665 0 True 665 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 269 586 0,000967808974680678 0,000911365160440584 0,000839246204318303 0,000778210116731518 0,000679389236941921 0,000678316053434776 39514 39718 623 665 0 True 268 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 313 586 0,000953162273084812 0,000893582089809096 0,000869764248111696 0,000823987182421607 0,000706356254522137 0,00067053013979068 38916 38943 623 665 0 True 312 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 357 586 0,000907997527695553 0,000922218570000189 0,000793469138628214 0,000793469138628214 0,000729846464375307 0,000712443450668747 37072 40191 623 665 0 True 356 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 401 586 0,000892420099242425 0,000890254934658688 0,000778210116731518 0,000732433051041428 0,000700113433335767 0,000728191993714217 36436 38798 623 665 0 True 401 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 445 585 0,000771058215617817 0,000835551914806471 0,000411993591210803 0,000442511635004196 0,000865171567027672 0,00099373365023879 31481 36414 623 665 0 True 445 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 490 586 0,000893105897979355 0,000864509637563811 0,000518806744487678 0,000457770656900893 0,000987847793858663 0,00101818576400953 36464 37676 623 665 0 True 489 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 534 586 0,000902021281559448 0,000888947018496114 0,000473029678797589 0,0004272526131075 0,000988188936911697 0,0010306980751242 36828 38741 623 665 0 True 533 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 577 580 0,000840421859295898 0,000913613858404308 0,000518806744487678 0,000564583810177768 0,00084250483702985 0,000907738851340108 34313 39816 623 665 0 False 577 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 622 586 0,00086971526248763 0,000737802391077258 0,000610360875867857 0,000518806744487678 0,000801531995328767 0,000699484935524435 35509 32154 623 665 0 True 621 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 665 585 0,000923991333953246 0,000798792586868866 0,00064087891966125 0,000534065766384375 0,000855711072523668 0,000809538667088754 37725 34812 623 665 0 True 665 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 268 623 0,000871037874337424 0,000855354224425793 0,000747692072938125 0,000701915007248035 0,000673419489286124 0,000696648857903909 35563 37277 623 665 0 False 268 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 312 623 0,000891415893949063 0,000819925758548351 0,000747692072938125 0,000671396963454643 0,000702878525849339 0,000656819797810317 36395 35733 623 665 0 False 312 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 357 629 0,00090074765533372 0,000865679878340851 0,00080872816052491 0,000717174029144732 0,000686368929612489 0,000701185935461135 36776 37727 623 665 0 True 356 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 401 629 0,000940646446135836 0,000884564352056612 0,000854505226215 0,000778210116731518 0,000697053011827862 0,000659032451764963 38405 38550 623 665 0 True 400 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 445 623 0,000814141071984252 0,000884908540520447 0,000518806744487678 0,000518806744487678 0,000853166827556242 0,000915506695896548 33240 38565 623 665 0 False 445 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 489 623 0,000830061399805845 0,000927427288752896 0,000381475547417411 0,000564583810177768 0,000958547529991256 0,000999016768998322 33890 40418 623 665 0 False 489 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 533 623 0,000904960419003434 0,000842688088956656 0,000488288700694286 0,000442511635004196 0,000966098812070289 0,000959114351616407 36948 36725 623 665 0 False 533 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 577 623 0,000825971100196298 0,000829333576559848 0,000564583810177768 0,000549324788281071 0,000823282592337676 0,000831771008613918 33723 36143 623 665 0 False 577 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 621 623 0,00081252454639006 0,000821325458301281 0,00064087891966125 0,000656137941557946 0,000697208437983142 0,00067339023651803 33174 35794 623 665 0 False 621 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 665 623 0,000870425554036593 0,000857557030594339 0,000671396963454643 0,00064087891966125 0,000734983473643402 0,000750011956814259 35538 37373 623 665 0 False 665 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 270 672 0,00105882426419613 0,0631433011459755 0,000930800335698482 0,0632028686961166 0,000729640193813258 0,0192333066143002 43230 2751834 623 665 0 True 268 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 312 666 0,000966216941898519 0,000901268965501417 0,000839246204318303 0,000778210116731518 0,000684245142360185 0,000660149540041861 39449 39278 623 665 0 False 312 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 356 666 0,000852962179056907 0,000862788695244635 0,000747692072938125 0,000747692072938125 0,000640602624691364 0,000632900086465814 34825 37601 623 665 0 False 356 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 400 666 0,000902045774371481 0,000777315226725546 0,000732433051041428 0,000595101853971161 0,000706643677351964 0,00064487399931725 36829 33876 623 665 0 False 400 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 445 666 0,000856685086485956 0,000814258121843863 0,000671396963454643 0,000595101853971161 0,000743566218370548 0,000763497392550408 34977 35486 623 665 0 False 445 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 489 667 0,000851786524079312 0,000855560737504094 0,000564583810177768 0,000610360875867857 0,000841661332804272 0,000765514164357488 34777 37286 623 665 0 False 489 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 533 667 0,00084142606458926 0,000914944720464471 0,000564583810177768 0,000595101853971161 0,000850515455047437 0,000917114621040018 34354 39874 623 665 0 False 533 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 577 667 0,00073777248406467 0,00084725432257687 0,000549324788281071 0,000701915007248035 0,000721777638467892 0,000667592770379106 30122 36924 623 665 0 False 577 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 621 667 0,000827514147354391 0,000861113644720637 0,000656137941557946 0,000686655985351339 0,000696967250060935 0,000702367611863716 33786 37528 623 665 0 False 621 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 666 672 0,00103393956717037 0,063608965191647 0,000854505226215 0,0642252231631952 0,000803944124211679 0,0171345362770112 42214 2772128 623 665 0 True 665 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G6_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G6_1.csv new file mode 100755 index 0000000..9d663e1 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G6_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 280 260 0,0103577407879166 0,0438964887613862 0,0103608758678569 0,0440985732814527 0,00151477565040046 0,0092040908525591 422889 1913043 623 665 0 True 280 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 324 260 0,0102197237921094 0,0101042948410165 0,0102693217364767 0,0100862134737163 0,00128574003621878 0,00139833221769234 417254 440353 623 665 0 False 324 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 368 259 0,0103487519259004 0,0581559414673098 0,0102845807583734 0,061173418783856 0,00146809351876952 0,0108137223207192 422522 2534481 623 665 0 True 368 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 413 259 0,0103001092012025 0,0784126716424846 0,0102998397802701 0,0768596932936599 0,00144119190775657 0,0144868599303771 420536 3417285 623 665 0 True 413 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 457 259 0,0102838704668244 0,065175940538001 0,0102082856488899 0,065140764476997 0,00167166234642846 0,0123899008644241 419873 2840418 623 665 0 True 457 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 500 259 0,0101519521812135 0,0606159252560332 0,0101472495613031 0,0614023041123064 0,00167337483074486 0,018560141350981 414487 2641689 623 665 0 True 501 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 545 260 0,0105515279167235 0,0734695057625754 0,010605020218204 0,0722209506370642 0,00161227909655643 0,0229574042783016 430801 3201858 623 665 0 True 545 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 590 260 0,0104994806911529 0,0642330706601707 0,0104676890211337 0,0626230258640421 0,00180546743678993 0,0198184709629018 428676 2799327 623 665 0 True 589 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 633 261 0,010510673906252 0,0106184894600888 0,0104982070649271 0,0106660563057908 0,00176697711887744 0,00175050936302724 429133 462762 623 665 0 False 633 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 678 259 0,010414025269969 0,0441561215926059 0,0103456168459602 0,0449073014419776 0,00189861648076218 0,00978305414678369 425187 1924358 623 665 0 True 677 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 280 303 0,0104110126540889 0,0102429798460445 0,0104829480430304 0,0102845807583734 0,00140350240392419 0,00147170810129122 425064 446397 623 665 0 False 280 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 324 303 0,0103676603767901 0,0102372433716472 0,0103761348897536 0,0102082856488899 0,00131911318754442 0,00127680905116746 423294 446147 623 665 0 False 324 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 369 304 0,0103844379530328 0,0955740690705936 0,010406652933547 0,0947737850003815 0,00137280658230437 0,0210668415614408 423979 4165192 623 665 0 True 368 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 413 303 0,0104116249743897 0,0480046075362359 0,0103608758678569 0,0485389486533913 0,00152164415612243 0,00955329687182185 425089 2092078 623 665 0 True 412 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 457 303 0,0104099349703594 0,0700507735348901 0,0103608758678569 0,0681773098344396 0,0017376556332524 0,015013876090806 425020 3052867 623 665 0 True 457 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 502 304 0,0102367218036605 0,0405261494317162 0,0102235446707866 0,040512703135729 0,00166223117180663 0,00952304840886891 417948 1766161 623 665 0 True 501 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 544 303 0,0103501480161863 0,0412956630532614 0,0104219119554437 0,042374303807126 0,00149267900026941 0,010789318446794 422579 1799697 623 665 0 True 545 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 589 304 0,0105233366900732 0,0550322475908242 0,0105287251087205 0,053330281528954 0,00185648551852314 0,0156043209467568 429650 2398348 623 665 0 True 589 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 633 304 0,0104318805299412 0,0104452249873941 0,010406652933547 0,0104219119554437 0,00187301856653284 0,00193593939955485 425916 455211 623 665 0 False 633 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 677 304 0,0103337868177481 0,0104581664736343 0,0102998397802701 0,0103913939116503 0,00189359171427152 0,00189790297421311 421911 455775 623 665 0 False 677 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 281 348 0,0103741999576029 0,0544048838048428 0,0104676890211337 0,0546272983901732 0,00152332569528601 0,0140276158414623 423561 2371007 623 665 0 True 280 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 326 348 0,0103069671885718 0,0656491996757745 0,0103150988021668 0,0666361486228733 0,00131450555115754 0,0216492799378759 420816 2861043 623 665 0 True 324 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 370 347 0,0103524503405174 0,0395764187305067 0,0103303578240635 0,040009155413138 0,0013683803401891 0,0103645479142573 422673 1724771 623 665 0 True 368 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 412 347 0,0105207159591857 0,0337727128533166 0,0105287251087205 0,0350652323186084 0,00159244142732587 0,00715328714416482 429543 1471841 623 665 0 False 412 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 458 347 0,0106573123718949 0,0685508919930864 0,0106507972838941 0,0680857557030594 0,00172296559818372 0,0131215663113762 435120 2987501 623 665 0 True 457 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 501 348 0,0104839032626997 0,0311242973535923 0,0105134660868238 0,0313878080415045 0,00159253145269903 0,00505017178247073 428040 1356421 623 665 0 True 501 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 545 347 0,0103560262910743 0,0289225696422333 0,0102998397802701 0,02905317769131 0,00169751892079746 0,00391255136621287 422819 1260468 623 665 0 True 545 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 590 347 0,0103702811076776 0,0500173069432565 0,0103456168459602 0,0506294346532387 0,00207003099665494 0,00929068193475289 423401 2179793 623 665 0 True 589 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 635 347 0,0104734938175856 0,0555562171622694 0,0104676890211337 0,0570077058060578 0,00204779734246993 0,0124105158195748 427615 2421183 623 665 0 True 633 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 678 347 0,010614621400521 0,0644062662951726 0,0106507972838941 0,0649271381704433 0,00194002070269621 0,018519004453878 433377 2806875 623 665 0 True 677 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 280 390 0,0103376566820494 0,0444920265874115 0,0103761348897536 0,0476386663614862 0,00173178263592014 0,0163009925712831 422069 1938997 623 665 0 False 280 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 326 391 0,0103759389472573 0,0335281325309153 0,0104982070649271 0,033325703822385 0,00142563706759208 0,00640067333555426 423632 1461182 623 665 0 True 324 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 370 392 0,0105720284003953 0,0871761000119892 0,0105287251087205 0,0847638666361486 0,00139263913348983 0,0226231387260837 431638 3799202 623 665 0 True 368 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 415 391 0,0106942720252531 0,0654644393083877 0,0107728694590677 0,0644846265354391 0,00155362744628551 0,0183889255881879 436629 2852991 623 665 0 True 412 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 458 390 0,0106139356017841 0,0417054538383037 0,0106355382619974 0,0431982909895476 0,00176959266019442 0,00900040550615706 433349 1817556 623 665 0 True 456 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 503 392 0,0107151154082933 0,0503577552257848 0,0107728694590677 0,0519264515144579 0,00179536576241177 0,0102476951731201 437480 2194630 623 665 0 True 501 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 546 391 0,0104308763246478 0,0411975693410684 0,0104982070649271 0,0423895628290227 0,00169171155977155 0,00597971324382839 425875 1795422 623 665 0 True 545 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 591 391 0,0103728283601291 0,0513365124874443 0,0103913939116503 0,0507972838941024 0,00203756720258454 0,00945220188642132 423505 2237285 623 665 0 True 589 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 635 391 0,0104755022281723 0,0424947927153659 0,0106202792401007 0,0428931105516136 0,00201337742183567 0,00831925312824761 427697 1851956 623 665 0 True 633 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 679 391 0,0108056163487561 0,0868825760900305 0,0108186465247578 0,0835584039063096 0,00198754117244926 0,0201226987110303 441175 3786410 623 665 0 True 677 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 282 436 0,0102593041763551 0,0425161324001237 0,0102693217364767 0,0434424353398947 0,00161196181077719 0,00672193340191352 418870 1852886 623 665 0 True 280 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 326 435 0,010596153820248 0,0546879673433986 0,0105897611963073 0,0541084916456855 0,00149496866713502 0,00922420698529428 432623 2383344 623 665 0 True 324 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 370 435 0,010543788188121 0,0335620465675519 0,0105745021744106 0,0344853894865339 0,00139411935847028 0,00434736289154154 430485 1462660 623 665 0 True 368 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 414 435 0,0108312113373308 0,0531579119462653 0,0108339055466545 0,052475776302739 0,00163675207620604 0,0114521269247955 442220 2316663 623 665 0 True 412 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 458 434 0,010870399836584 0,0913052372290305 0,0108796826123445 0,0907148851758602 0,00190709432798489 0,0158625704446959 443820 3979153 623 665 0 True 456 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 503 435 0,010823275666232 0,0608927216186495 0,0108186465247578 0,0600595101853971 0,00181905220825327 0,0157468022551364 441896 2653752 623 665 0 True 501 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 547 435 0,0106348524632605 0,0538172393675881 0,0106355382619974 0,0527809567406729 0,00175497426497752 0,0106796132119326 434203 2345397 623 665 0 True 545 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 591 435 0,0103988152336963 0,0307835278284978 0,0103761348897536 0,030960555428397 0,00192694050319194 0,00482776919504253 424566 1341570 623 665 0 True 589 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 635 434 0,0106208180819654 0,0413490352110535 0,0106355382619974 0,0406958113984894 0,00220960390866964 0,00924829592971113 433630 1802023 623 665 0 True 633 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 679 435 0,0109073594899421 0,0709079404852254 0,0108033875028611 0,0704814221408408 0,00250940642855338 0,010422091144568 445329 3090223 623 665 0 True 677 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 282 480 0,0101973373619111 0,0543995374107046 0,0101167315175097 0,0552681773098344 0,00156551964148283 0,0162757451977526 416340 2370774 623 665 0 True 280 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 325 479 0,0106121966121297 0,0540223527461363 0,0104982070649271 0,055237659266041 0,0017221446817674 0,012436588180736 433278 2354336 623 665 0 True 324 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 370 479 0,0105936065677965 0,0674726413194809 0,0105745021744106 0,0664682993820096 0,00161094284102669 0,0184507070183667 432519 2940510 623 665 0 True 368 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 414 478 0,0110445437301402 0,0843377842638182 0,0109712367437247 0,08378728923476 0,00175197381859188 0,0232879883222365 450930 3675506 623 665 0 True 412 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 458 479 0,0109303582404413 0,0947495311866299 0,0108491645685512 0,0927748531319142 0,0020877254994648 0,0320551097794503 446268 4129258 623 665 0 True 456 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 501 479 0,0104151029536984 0,0448293542278677 0,0103456168459602 0,046845197222858 0,00180895312980235 0,0088417212615438 425231 1953698 623 665 0 True 500 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 545 477 0,0105469232680612 0,0394786921526751 0,0105134660868238 0,0422064545662623 0,00181771246870211 0,00904160526252182 430613 1720512 623 665 0 False 545 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 590 479 0,0104647743765018 0,095569020973124 0,0105134660868238 0,0917372396429389 0,00183120266596793 0,020875994631976 427259 4164972 623 665 0 True 589 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 634 478 0,0103089266135344 0,0604081730992622 0,0103761348897536 0,0614480811779965 0,00196826392555929 0,0177770959889256 420896 2632635 623 665 0 True 633 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 678 479 0,0105193198688998 0,07103799783276 0,010605020218204 0,0702525368123903 0,00196882183576917 0,0135910802683822 429486 3095891 623 665 0 True 677 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 283 523 0,0101454860788367 0,0526854100231123 0,0102388036926833 0,0549629968719005 0,00155184483997862 0,0143117417123494 414223 2296071 623 665 0 True 280 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 326 523 0,0104489275271163 0,0992785465609549 0,0104829480430304 0,0925764858472572 0,00158766443798706 0,0310041544654071 426612 4326636 623 665 0 True 324 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 369 523 0,0108748085427499 0,0570007531990884 0,0109254596780346 0,0591439688715953 0,0015325450521965 0,0168410310828719 444000 2484137 623 665 0 True 368 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 414 523 0,0110617621769995 0,0570683059215904 0,0111238269626917 0,0581673914702068 0,00179002728569973 0,0116958815654904 451633 2487081 623 665 0 True 412 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 458 522 0,0109683955775289 0,056094459082015 0,0110475318532082 0,0577859159227894 0,00195159414033225 0,0105904648079299 447821 2444640 623 665 0 True 456 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 502 524 0,0105693341910716 0,0609776902774216 0,0106202792401007 0,0626077668421454 0,0018797423085172 0,0165469212498248 431528 2657455 623 665 0 True 500 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 546 523 0,0104397672154159 0,0720625780519048 0,0103608758678569 0,0715037766079194 0,00180994290546642 0,0207316427785175 426238 3140543 623 665 0 True 545 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 591 523 0,0103456658315842 0,0567018140452987 0,0102693217364767 0,0573128862439918 0,00171630358898558 0,0139182853697332 422396 2471109 623 665 0 True 589 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 634 523 0,0103346930517934 0,0431160528925885 0,0103761348897536 0,042374303807126 0,00189059665620173 0,00920251813740555 421948 1879031 623 665 0 True 633 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 679 523 0,0101571201645525 0,0598381052195607 0,0101625085831998 0,0604867627985046 0,00192239126229357 0,0132553737571988 414698 2607791 623 665 0 True 677 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 282 568 0,0100610103701342 0,0439542206397201 0,0100099183642329 0,0460669871061265 0,00146268965310021 0,0108136330630905 410774 1915559 623 665 0 True 280 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 326 567 0,0104186544114432 0,052175735745865 0,0103456168459602 0,0537880521858549 0,00139930788129998 0,01351959070714 425376 2273859 623 665 0 True 324 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 370 567 0,0106667421045277 0,0499688910993437 0,0106660563057908 0,0517280842298009 0,00145003393241347 0,0115043956635356 435505 2177683 623 665 0 True 368 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 414 567 0,0107456089592747 0,049645606348212 0,0108186465247578 0,0500038147554742 0,00175170634417447 0,00824050098182008 438725 2163594 623 665 0 True 412 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 459 567 0,0106244430181464 0,0896888134733721 0,0106660563057908 0,0857404440375372 0,00205512726146149 0,0257366140217941 433778 3908708 623 665 0 True 456 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 502 567 0,0104764329550296 0,0611606608647965 0,0105592431525139 0,0608529793240253 0,00212623987348085 0,0147234436699062 427735 2665429 623 665 0 True 500 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 547 567 0,0104353340164379 0,0569353114991645 0,0104371709773404 0,0556038757915618 0,00199119877379435 0,0118122414177223 426057 2481285 623 665 0 True 544 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 589 563 0,0102557037329862 0,0354760327231445 0,0103608758678569 0,0379797055008774 0,00175191896015909 0,011141435835663 418723 1546073 623 665 0 False 589 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 634 566 0,0102326315040509 0,0479504322720282 0,0102235446707866 0,048203250171664 0,00167083094683557 0,0106217172033123 417781 2089717 623 665 0 True 633 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 679 566 0,010332929569327 0,0518865485985506 0,0103303578240635 0,0507057297627222 0,00168874200603454 0,00890012247630663 421876 2261256 623 665 0 True 677 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 279 606 0,0100759754782864 0,00986496912916303 0,00997940032043946 0,00990310521095598 0,00154908699616867 0,00149799024398324 411385 429923 623 665 0 False 279 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 324 606 0,010157487556733 0,0100098724724377 0,0100556954299229 0,0100709544518196 0,00145320236177615 0,00144639362817356 414713 436238 623 665 0 False 324 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 370 611 0,0105393304963309 0,0736017659162785 0,010605020218204 0,0720073243305104 0,00155057420869512 0,015495576978408 430303 3207622 623 665 0 True 368 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 415 611 0,0104778780309396 0,0778297999519283 0,0103761348897536 0,0751049057755398 0,00165904447224791 0,024592221198072 427794 3391883 623 665 0 True 412 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 456 607 0,0104783923799923 0,0103558736621825 0,0104371709773404 0,0104219119554437 0,00208673160518022 0,00189036240338254 427815 451317 623 665 0 False 456 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 500 607 0,0101405630236181 0,0101355242076351 0,0102693217364767 0,0102388036926833 0,00208398389571681 0,0021683718990647 414022 441714 623 665 0 False 500 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 544 607 0,0100731832977147 0,010080591728807 0,0101472495613031 0,0101472495613031 0,00199963443703442 0,00187910254935105 411271 439320 623 665 0 False 544 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 589 607 0,0100724974989777 0,00988417484544504 0,0101167315175097 0,0098115510795758 0,00164330102200076 0,00166187339193873 411243 430760 623 665 0 False 589 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 633 607 0,0101277532829247 0,0100351359056832 0,0101319905394064 0,0100709544518196 0,00145299112551104 0,00145951144596233 413499 437339 623 665 0 False 633 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 677 607 0,0101468821691226 0,0101560378400797 0,0102082856488899 0,0101167315175097 0,00160729554704065 0,00168064819050154 414280 442608 623 665 0 False 677 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 281 656 0,00986156540174763 0,0430076794182756 0,00991836423285267 0,0440527962157626 0,00135575224772612 0,00905204545442245 402631 1874308 623 665 0 True 279 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 324 650 0,00993847283153195 0,00979239125508897 0,00991836423285267 0,0098115510795758 0,0011941610507603 0,00121420673945804 405771 426760 623 665 0 False 324 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 368 650 0,0101142332506823 0,00995269129564584 0,010101472495613 0,00997940032043946 0,0015561641544736 0,00127648179335388 412947 433746 623 665 0 False 368 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 412 650 0,0101243487820521 0,0100916057596498 0,0100099183642329 0,0100556954299229 0,0015297869175039 0,00144883262496913 413360 439800 623 665 0 False 412 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 456 650 0,00999394905078719 0,0100557872135133 0,0100404364080262 0,0101472495613031 0,00165770778084927 0,00165262390830129 408036 438239 623 665 0 False 456 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 500 650 0,00989950476758709 0,0099124671371723 0,00984206912336919 0,00991836423285267 0,00171987068904818 0,00172638961842176 404180 431993 623 665 0 False 500 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 544 650 0,00996619869475355 0,00996063057621164 0,0100099183642329 0,00996414129854276 0,00168027150028011 0,00175301248331654 406903 434092 623 665 0 False 544 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 588 650 0,0100350234965669 0,0100085416103775 0,0100556954299229 0,00996414129854276 0,00139033437863057 0,00129348345329987 409713 436180 623 665 0 False 588 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 633 650 0,00994680038762324 0,00994654179509199 0,00996414129854276 0,0100099183642329 0,00139958279270518 0,00133775571936051 406111 433478 623 665 0 False 633 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 678 655 0,010224597861704 0,0430927628065357 0,01025406271458 0,0430151827267872 0,0014899541318674 0,00904504376073975 417453 1878016 623 665 0 True 677 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G6_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G6_2.csv new file mode 100755 index 0000000..527490d --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G6_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 280 260 0,00839799741870254 0,698099861693602 0,0080872816052491 0,70923933775845 0,00207115285113429 0,203762181395643 342876 30423733 623 665 10 True 280 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 324 260 0,00705515450616919 0,00671878827304012 0,00698863202868696 0,00674448767833982 0,00145165097737265 0,00122996744828785 288050 292810 623 665 0 False 324 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 368 259 0,00710460549366426 0,00818822060874319 0,00698863202868696 0,00746166170748455 0,00146383493362985 0,00455375037715542 290069 356849 623 665 0 True 368 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 413 259 0,00640668281477764 0,00635447625701929 0,00645456626230259 0,00633249408712902 0,00133423425781636 0,00139636395575964 261574 276933 623 665 0 True 413 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 457 259 0,00643558433297684 0,00671369428377536 0,00648508430609598 0,00674448767833982 0,00154281709278789 0,00167136883926223 262754 292588 623 665 0 True 457 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 500 259 0,00661225098617246 0,00678260081423518 0,00665293354695964 0,00675974670023652 0,00165002351968645 0,00150919215651494 269967 295591 623 665 0 True 501 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 545 260 0,00710105403591944 0,00707449557746506 0,00718699931334401 0,00703440909437705 0,00163221417342864 0,00154203001560416 289924 308312 623 665 0 True 545 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 590 260 0,00749262062189454 0,00739137842316939 0,00752269779507134 0,00744640268558785 0,00176267060472995 0,00190699732738889 305911 322122 623 665 0 True 589 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 633 261 0,00793478935753027 0,00804850303832367 0,00787365529869535 0,0081025406271458 0,00182284594475441 0,00172448309275972 323964 350760 623 665 0 False 633 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 678 259 0,00964482850806567 0,686046221068808 0,00930800335698482 0,694834821087968 0,0028517238912585 0,208651298007097 393782 29898426 623 665 9 True 677 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 280 303 0,00691091633610555 0,00682603739837119 0,00688181887541009 0,00683604180972 0,00152680945215567 0,00143123797569109 282161 297484 623 665 0 False 280 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 324 303 0,00698650115404007 0,00661390257516072 0,00685130083161669 0,00657663843747616 0,00134200169178617 0,00124577035857294 285247 288239 623 665 0 False 324 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 369 304 0,00726143296911297 0,0075503476016661 0,0072632944228275 0,00753795681696803 0,00151005172731892 0,00136957275452468 296472 329050 623 665 0 True 368 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 413 303 0,00653622529762134 0,00659267761989088 0,00654612039368277 0,00656137941557946 0,00146596684657186 0,00142717199562936 266863 287314 623 665 0 True 412 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 457 303 0,00673493548164686 0,00688528370594603 0,00671396963454643 0,00688181887541009 0,00163559869787686 0,00175419937733726 274976 300066 623 665 0 True 457 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 502 304 0,00679303243178966 0,00698473122609683 0,00691233691920348 0,00695811398489357 0,00162814085395543 0,00160765737329309 277348 304400 623 665 0 True 501 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 544 303 0,00694216916425994 0,00723323529698588 0,00695811398489357 0,0072480354009308 0,00155091651763573 0,00142366152276004 283437 315230 623 665 0 True 545 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 589 304 0,0072986865362155 0,00735975897629172 0,00721751735713741 0,00732433051041428 0,00180248162393488 0,00198216111848582 297993 320744 623 665 0 True 589 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 633 304 0,00772980901362425 0,00771399774327097 0,00781261921110857 0,007690547035935 0,00192623931154557 0,00194548381756483 315595 336182 623 665 0 False 633 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 677 304 0,00778325232948074 0,00777260156571332 0,00776684214541848 0,00778210116731518 0,00188734661877002 0,00179829172532753 317777 338736 623 665 0 False 677 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 281 348 0,00630991171443439 0,00637267235380738 0,00628671702143893 0,00636301213092241 0,00133989194142627 0,00131132868577079 257623 277726 623 665 0 True 280 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 326 348 0,0066264323243397 0,0066302400542441 0,00659189745937285 0,00665293354695964 0,00126895071649102 0,00125919327356948 270546 288951 623 665 0 True 324 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 370 347 0,00666449415423932 0,00720510362654175 0,00665293354695964 0,00666819256885634 0,00125255848679867 0,00377290651432576 272100 314004 623 665 0 True 368 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 412 347 0,00666388183393849 0,00693929834887057 0,00671396963454643 0,00692759594110018 0,00140290887297697 0,00137111210294529 272075 302420 623 665 0 False 412 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 458 347 0,00678507226787886 0,00695609474590574 0,00672922865644312 0,00697337300679027 0,00172201562264552 0,001580529205488 277023 303152 623 665 0 True 457 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 501 348 0,00690097225442006 0,00685446736548398 0,00685130083161669 0,00685130083161669 0,00158667924704824 0,00147075368010905 281755 298723 623 665 0 True 501 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 545 347 0,00712860844945682 0,00702759416279311 0,00709544518196384 0,00701915007248035 0,00155631977099381 0,0015821800583672 291049 306268 623 665 0 True 545 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 590 347 0,00725060714619429 0,00733378422022096 0,00729381246662089 0,00729381246662089 0,00183052505603836 0,00205973081319805 296030 319612 623 665 0 True 589 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 635 347 0,00714690458004563 0,00727467558803165 0,00727855344472419 0,0072480354009308 0,00188638935009833 0,00198370179800381 291796 317036 623 665 0 True 633 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 678 347 0,00695218672438153 0,00685375604265872 0,00695811398489357 0,00683604180972 0,00187299810251671 0,00174842864099127 283846 298692 623 665 0 True 677 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 280 390 0,00644097275162415 0,00632691823401488 0,00646982528419928 0,00636301213092241 0,00134224141374711 0,00128438684700345 262974 275732 623 665 0 False 280 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 326 391 0,00674120564152737 0,00677622185470543 0,00672922865644312 0,00679026474402991 0,00128707272057272 0,00122810646199315 275232 295313 623 665 0 True 324 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 370 392 0,00677236049843362 0,00697823753707914 0,0068055237659266 0,00695811398489357 0,0013776788015791 0,00136412717097578 276504 304117 623 665 0 True 368 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 415 391 0,00701591702129197 0,00687580705024176 0,00700389105058366 0,00683604180972 0,00148009621613195 0,00151015957811664 286448 299653 623 665 0 True 412 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 458 390 0,00713142512284064 0,00699501098821671 0,00712596322575723 0,00704966811627375 0,00164740879886142 0,00158844578883739 291164 304848 623 665 0 True 456 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 503 392 0,00682482410180878 0,00690341096504135 0,0068055237659266 0,0068207827878233 0,00171495833955904 0,00158133548411657 278646 300856 623 665 0 True 501 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 546 391 0,00709708620037006 0,00723275343313652 0,00714122224765393 0,00712596322575723 0,00157458275192813 0,00146558692767842 289762 315209 623 665 0 True 545 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 591 391 0,00700428293557619 0,00709202624322307 0,00695811398489357 0,00703440909437705 0,00191319331966482 0,00184071156859236 285973 309076 623 665 0 True 589 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 635 391 0,00659471413275667 0,0065826043708493 0,00663767452506294 0,00657663843747616 0,00188051797984759 0,00174131075578945 269251 286875 623 665 0 True 633 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 679 391 0,00649992695018811 0,00636188778194055 0,00651560234988937 0,0064087891966125 0,0018223809371712 0,00185546243490583 265381 277256 623 665 0 True 677 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 282 436 0,00649679187024786 0,00657159034000657 0,00654612039368277 0,00659189745937285 0,00151317299415492 0,00143154900561278 265253 286395 623 665 0 True 280 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 326 435 0,00673287808543607 0,00672624568975655 0,00674448767833982 0,00666819256885634 0,00133363121135752 0,00138750897137511 274892 293135 623 665 0 True 324 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 370 435 0,0067478676864004 0,00684723940774344 0,00665293354695964 0,00688181887541009 0,00136477355358054 0,00126441440099034 275504 298408 623 665 0 True 368 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 414 435 0,00674157303370787 0,00683262287097923 0,00666819256885634 0,00683604180972 0,00156344680867699 0,00150835827837109 275247 297771 623 665 0 True 412 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 458 434 0,00694035669616948 0,0071385605235336 0,00689707789730678 0,00715648126955062 0,0016786041032941 0,00173619792776691 283363 311104 623 665 0 True 456 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 503 435 0,0070093774404791 0,00718041384073597 0,00701915007248035 0,00715648126955062 0,00161792987116079 0,0016713893012457 286181 312928 623 665 0 True 501 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 547 435 0,00690846705490223 0,00706013144557434 0,00697337300679027 0,00704966811627375 0,00176336363721164 0,00155371491342332 282061 307686 623 665 0 True 545 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 591 435 0,00635855443913236 0,00632618396529204 0,00625619897764553 0,00631723506523232 0,00179192225201118 0,00185598411579649 259609 275700 623 665 0 True 589 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 635 434 0,00639438742313696 0,0061739608806865 0,00628671702143893 0,00628671702143893 0,00221242202742731 0,0016870457192345 261072 269066 623 665 0 True 633 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 679 435 0,00636154256220042 0,00637856944948776 0,00633249408712902 0,00628671702143893 0,0022449186896308 0,00172529115205533 259731 277983 623 665 0 True 677 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 282 480 0,00657683437997242 0,00658042451057835 0,00650034332799268 0,00662241550316625 0,00134067361034688 0,00148134537350029 268521 286780 623 665 0 True 280 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 325 479 0,00670226207039455 0,00656895156178384 0,00674448767833982 0,00657663843747616 0,00145432268811349 0,0014119310147331 273642 286280 623 665 0 True 324 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 370 479 0,00669518364771695 0,00682213659578105 0,00669871061264973 0,0068055237659266 0,0014255294255667 0,00144655650605175 273353 297314 623 665 0 True 368 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 414 478 0,00669305277307006 0,00680481244310134 0,00669871061264973 0,00685130083161669 0,00169623974371156 0,00166542133938774 273266 296559 623 665 0 True 412 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 458 479 0,00697520996769276 0,00725992137588191 0,00703440909437705 0,00738536659800107 0,00187489515516275 0,00183921328628262 284786 316393 623 665 0 True 456 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 501 479 0,00682330554746272 0,00681350893828758 0,00675974670023652 0,0068055237659266 0,00185171304186686 0,00170860494710743 278584 296938 623 665 0 True 500 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 545 477 0,00644861450897851 0,00622600217641839 0,00650034332799268 0,00624093995574884 0,00173486002690327 0,00163608884042999 263286 271334 623 665 0 False 545 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 590 479 0,00607394796330634 0,00611863832159937 0,00604257267109178 0,00608834973678187 0,00180287673944566 0,00173688044124914 247989 266655 623 665 0 True 589 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 634 478 0,00612129256896655 0,00619809996495014 0,00602731364919509 0,00625619897764553 0,0017395219721057 0,00161972003415837 249922 270118 623 665 0 True 633 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 678 479 0,00636021995035062 0,00631833646831659 0,00634775310902571 0,00634775310902571 0,00191180033606024 0,00177126329637558 259677 275358 623 665 0 True 677 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 283 523 0,00651219784901675 0,00658852441242727 0,00657663843747616 0,00657663843747616 0,00144572078966959 0,00142039604290378 265882 287133 623 665 0 True 280 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 326 523 0,00650563377539185 0,00668909628155993 0,00653086137178607 0,00666819256885634 0,00139188945179448 0,00138853997727875 265614 291516 623 665 0 True 324 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 369 523 0,0067850967606909 0,00684597738337604 0,00674448767833982 0,00688181887541009 0,00136803035408835 0,00146912963448776 277024 298353 623 665 0 True 368 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 414 523 0,00675477465939377 0,00685061245468902 0,00674448767833982 0,00692759594110018 0,00168025950921748 0,0017515903017327 275786 298555 623 665 0 True 412 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 458 522 0,00657382176409234 0,00647549292090377 0,00660715648126955 0,00653086137178607 0,00191885548820949 0,00170136005411886 268398 282207 623 665 0 True 456 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 502 524 0,00621514902467785 0,00657702851773517 0,00631723506523232 0,00642404821850919 0,00177040853318485 0,00236513044914828 253754 286632 623 665 0 True 500 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 546 523 0,00607767087073539 0,00613974854738127 0,00608834973678187 0,00617990386816205 0,00164773949718916 0,00172278199306359 248141 267575 623 665 0 True 545 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 591 523 0,00602209668023201 0,00620124355291984 0,00605783169298848 0,00622568093385214 0,00162030424298848 0,00172139604049532 245872 270255 623 665 0 True 589 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 634 523 0,00603784555836937 0,00613954203430297 0,00614938582436866 0,00613412680247196 0,00172905196804912 0,00184394511577973 246515 267566 623 665 0 True 633 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 679 523 0,00628818659016092 0,00628345870398129 0,00630197604333562 0,00625619897764553 0,00173929646737756 0,00173987201454282 256736 273838 623 665 0 True 677 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 282 568 0,00666074675399824 0,00676759419721196 0,00665293354695964 0,00672922865644312 0,00135830509949762 0,0013197257757188 271947 294937 623 665 0 True 280 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 326 567 0,00655349273010476 0,00664604977768293 0,00653086137178607 0,00662241550316625 0,0013840732570764 0,00134735770626698 267568 289640 623 665 0 True 324 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 370 567 0,00658530889293592 0,00651232108653414 0,00657663843747616 0,00650034332799268 0,00133769291311633 0,00119165903686547 268867 283812 623 665 0 True 368 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 414 567 0,00637298070541993 0,00659825347300501 0,00628671702143893 0,00660715648126955 0,00167284165789624 0,00163127003575296 260198 287557 623 665 0 True 412 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 459 567 0,00644173202879718 0,00660417351458298 0,00646982528419928 0,00672922865644312 0,00200525263768085 0,00169790219660574 263005 287815 623 665 0 True 456 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 502 567 0,00631939043269124 0,00637684850716859 0,00631723506523232 0,0063782711528191 0,00195699368159586 0,00194178051395478 258010 277908 623 665 0 True 500 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 547 567 0,00614394842009728 0,0063887344821197 0,00613412680247196 0,00645456626230259 0,00185866814725221 0,00176698945631806 250847 278426 623 665 0 True 544 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 589 563 0,00622435832200235 0,00625163274402532 0,00614938582436866 0,00624093995574884 0,00156095240732882 0,00143805969194823 254130 272451 623 665 0 False 589 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 634 566 0,00609895512439226 0,00627925960472249 0,00611886778057527 0,00631723506523232 0,00159271490327904 0,00143898298434282 249010 273655 623 665 0 True 633 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 679 566 0,00630535605139621 0,0064810687740179 0,00624093995574884 0,00657663843747616 0,00163344680820878 0,00162387805163889 257437 282450 623 665 0 True 677 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 279 606 0,00707315672301361 0,00709292113322904 0,00704966811627375 0,00715648126955062 0,0014018463973451 0,00142688143606324 288785 309115 623 665 0 False 279 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 324 606 0,00665033730888412 0,00663641250069555 0,00660715648126955 0,00662241550316625 0,00138446263329038 0,00137370001401207 271522 289220 623 665 0 False 324 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 370 611 0,00637942231498467 0,00643749451449636 0,00651560234988937 0,00646982528419928 0,00142358443951728 0,00126930238677559 260461 280551 623 665 0 True 368 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 415 611 0,00631032809223895 0,00645525463923026 0,00627145799954223 0,00650034332799268 0,00154371475770984 0,00146839917222792 257640 281325 623 665 0 True 412 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 456 607 0,00644979016395611 0,00632875390582201 0,00643930724040589 0,00630197604333562 0,0018486794318804 0,00185653279656261 263334 275812 623 665 0 False 456 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 500 607 0,00641501037086894 0,00634541262747163 0,00643930724040589 0,00630197604333562 0,00188368589617113 0,00187819095580599 261914 276538 623 665 0 False 500 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 544 607 0,00634371179504023 0,0063692993068618 0,00633249408712902 0,00642404821850919 0,00193105157919246 0,00181496052915366 259003 277579 623 665 0 False 544 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 589 607 0,00624250749571896 0,00626122412921753 0,00628671702143893 0,00616464484626535 0,00159368811008995 0,00160915032166683 254871 272869 623 665 0 False 589 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 633 607 0,00639837975149838 0,00635631192882642 0,00634775310902571 0,00624093995574884 0,00143958868455174 0,00138019046908874 261235 277013 623 665 0 False 633 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 677 607 0,00669148523309993 0,00681961254704626 0,00674448767833982 0,00691233691920348 0,00152927764538219 0,00151879340810986 273202 297204 623 665 0 False 677 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 281 656 0,00925696033670759 0,699145506246734 0,00842298008697642 0,722072175173571 0,00361713342809984 0,211601624983601 377946 30469303 623 665 8 True 279 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 324 650 0,00738134977682762 0,0066452925630625 0,00701915007248035 0,00662241550316625 0,00224841478297349 0,00124846982494561 301368 289607 623 665 0 False 324 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 368 650 0,0062768954038136 0,00630615219669682 0,00625619897764553 0,00630197604333562 0,00120100639543001 0,00117974742787676 256275 274827 623 665 0 False 368 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 412 650 0,00613907435050267 0,00614475075305568 0,00621042191195544 0,00621042191195544 0,00134571492776379 0,00134322183108812 250648 267793 623 665 0 False 412 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 456 650 0,00625945652164595 0,00639798167884807 0,00627145799954223 0,00642404821850919 0,00156972094155228 0,00150243805353735 255563 278829 623 665 0 False 456 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 500 650 0,00618928461517077 0,00620601629961835 0,00627145799954223 0,00621042191195544 0,0016554984285234 0,00164802945164878 252698 270463 623 665 0 False 500 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 544 650 0,00634816948683028 0,00643095493368349 0,0063782711528191 0,00648508430609598 0,00162287408474684 0,00159976512830149 259185 280266 623 665 0 False 544 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 588 650 0,00631476129121696 0,00619970617778137 0,00628671702143893 0,00622568093385214 0,00134377114430361 0,00120181521051147 257821 270188 623 665 0 False 588 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 633 650 0,00651986409918315 0,00671362544608259 0,00650034332799268 0,00675974670023652 0,00146536625723886 0,00127033846160328 266195 292585 623 665 0 False 633 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 678 655 0,00891947387970184 0,708248029090809 0,00831616693369955 0,697856107423514 0,00286719351007185 0,200604203762982 364167 30865998 623 665 11 True 677 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G6_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G6_3.csv new file mode 100755 index 0000000..566f401 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G6_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 280 260 0,000962592005717602 0,0685612405928991 0,000762951094834821 0,068055237659266 0,00075633770087183 0,0219664433084119 39301 2987952 623 665 0 True 280 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 324 260 0,000893963146400518 0,000973273192135753 0,000778210116731518 0,000885023270008392 0,000633000124833587 0,00070405986976211 36499 42416 623 665 0 False 324 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 368 259 0,000901164033138285 0,00103837070359579 0,000793469138628214 0,000900282291905089 0,000664293183735366 0,000818937498861124 36793 45253 623 665 0 True 368 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 413 259 0,00100516051303134 0,000894798222381314 0,00080872816052491 0,000701915007248035 0,000778560136913123 0,000728540333312146 41039 38996 623 665 0 True 413 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 457 259 0,000896363441979774 0,00094461376604707 0,000701915007248035 0,000747692072938125 0,000834094003712077 0,000858391257678158 36597 41167 623 665 0 True 457 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 500 259 0,000962836933837934 0,000903815960133798 0,000823987182421607 0,000717174029144732 0,000830632371614393 0,000759113687003716 39311 39389 623 665 0 True 501 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 545 260 0,000963179833206399 0,000963429402070064 0,00080872816052491 0,00080872816052491 0,000819046760274021 0,000782365787294994 39325 41987 623 665 0 True 545 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 590 260 0,000985982641209328 0,000959000843835384 0,000686655985351339 0,000534065766384375 0,000944322984294253 0,00101936862317649 40256 41794 623 665 0 True 589 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 633 261 0,0010648494959563 0,00104151429156549 0,000732433051041428 0,000747692072938125 0,00102612783718262 0,000947292181558687 43476 45390 623 665 0 False 633 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 678 259 0,00119076704261908 0,0679178146786054 0,000961318379491875 0,0678873884184024 0,000976429314059335 0,0220466616720937 48617 2959911 623 665 0 True 677 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 280 303 0,00082766110422659 0,000884334893080722 0,000686655985351339 0,000671396963454643 0,000654358628001205 0,000743391549321546 33792 38540 623 665 0 False 280 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 324 303 0,000896730834160272 0,000881948519731464 0,000747692072938125 0,000778210116731518 0,000663191058674498 0,000647684756795493 36612 38436 623 665 0 False 324 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 369 304 0,00092105219650926 0,000966595935937348 0,000762951094834821 0,000854505226215 0,000652524340593538 0,000671917334104475 37605 42125 623 665 0 True 368 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 413 303 0,00091884784342627 0,000920222276909945 0,000747692072938125 0,000686655985351339 0,000714579546070433 0,000801814934005483 37515 40104 623 665 0 True 412 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 457 303 0,00090067417689762 0,000943741821938687 0,000671396963454643 0,000625619897764553 0,00085241895102306 0,000945288812961245 36773 41129 623 665 0 True 457 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 502 304 0,000906405494913394 0,000940850638842471 0,000686655985351339 0,000701915007248035 0,000839586959071429 0,000868633631657385 37007 41003 623 665 0 True 501 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 544 303 0,000956664745205563 0,000859094405732803 0,000778210116731518 0,000717174029144732 0,000794809471905517 0,000713385479888796 39059 37440 623 665 0 True 545 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 589 304 0,00109600435286255 0,000906936602205904 0,000854505226215 0,000457770656900893 0,00104671038152422 0,00103356026701934 44748 39525 623 665 0 True 589 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 633 304 0,000994995996037553 0,00103499765665021 0,00064087891966125 0,000732433051041428 0,00101353028148286 0,00100845467333575 40624 45106 623 665 0 False 633 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 677 304 0,00111344323503021 0,00103632851871037 0,000854505226215 0,000671396963454643 0,000998789754473212 0,00105654116820074 45460 45164 623 665 0 False 677 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 281 348 0,000815929047262677 0,00074640710267314 0,000701915007248035 0,000595101853971161 0,000657363789049364 0,000651192414886057 33313 32529 623 665 0 True 280 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 326 348 0,000837923592468509 0,000870062544780353 0,000701915007248035 0,000747692072938125 0,000668870373691333 0,000636219465382256 34211 37918 623 665 0 True 324 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 370 347 0,000866923081915842 0,000916252636627045 0,000732433051041428 0,000793469138628214 0,000653272691192004 0,000753405908230961 35395 39931 623 665 0 True 368 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 412 347 0,000844585637341545 0,000986765379918095 0,000625619897764553 0,000778210116731518 0,000731579825977318 0,000768350332346711 34483 43004 623 665 0 False 412 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 458 347 0,000932073961924209 0,000985205058882041 0,000732433051041428 0,000747692072938125 0,000856839714349603 0,000847407883482709 38055 42936 623 665 0 True 457 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 501 348 0,000905866653048663 0,000880273469207466 0,00064087891966125 0,000610360875867857 0,000860248854008822 0,000853427844664786 36985 38363 623 665 0 True 501 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 545 347 0,000909834488598045 0,000917858849458276 0,000717174029144732 0,00064087891966125 0,000812627640899983 0,000829014348243257 37147 40001 623 665 0 True 545 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 590 347 0,000950296614076925 0,00101131749033834 0,000579842832074464 0,000625619897764553 0,00108233062889658 0,00109440420520132 38799 44074 623 665 0 True 589 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 635 347 0,000920439876208429 0,000936284405222257 0,000518806744487678 0,000503547722590982 0,00098808963199473 0,00102211164046534 37580 40804 623 665 0 True 633 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 678 347 0,000938711513985212 0,000980776500647361 0,000610360875867857 0,000579842832074464 0,000931246025822695 0,000990986291274032 38326 42743 623 665 0 True 677 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 280 390 0,000837188808107513 0,000856180276738998 0,00064087891966125 0,000701915007248035 0,0007683893664879 0,000707146378541023 34181 37313 623 665 0 False 280 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 326 391 0,000851247682214581 0,000883417057177161 0,000717174029144732 0,000793469138628214 0,000646165236635552 0,000661032146637638 34755 38500 623 665 0 True 324 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 370 392 0,000850904782846116 0,000883279381791627 0,000686655985351339 0,000793469138628214 0,000678903879455579 0,000637778453379642 34741 38494 623 665 0 True 368 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 415 391 0,000820239782180524 0,000919419170494329 0,000625619897764553 0,000701915007248035 0,000753574803837734 0,000784761946666693 33489 40069 623 665 0 True 412 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 458 390 0,000911671449500536 0,000990023697375735 0,000625619897764553 0,000701915007248035 0,000849617160461217 0,000906743580397428 37222 43146 623 665 0 True 456 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 503 392 0,00097246260896699 0,00100078532334498 0,00064087891966125 0,000701915007248035 0,000949268142528592 0,000922831130387796 39704 43615 623 665 0 True 501 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 546 391 0,000944271382316753 0,00081854900469301 0,000671396963454643 0,000671396963454643 0,000878728283139815 0,000734338079284904 38553 35673 623 665 0 True 545 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 591 391 0,000843703896108349 0,000939152642420884 0,000488288700694286 0,000518806744487678 0,000935762328959592 0,00102096885584668 34447 40929 623 665 0 True 589 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 635 391 0,000921542052749924 0,000892618362110357 0,000473029678797589 0,000579842832074464 0,00102592667210602 0,000942679950420538 37625 38901 623 665 0 True 633 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 679 391 0,000967515060936279 0,000881030683827903 0,000595101853971161 0,000518806744487678 0,000981348781432602 0,000954483424233258 39502 38396 623 665 0 True 677 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 282 436 0,00092181147368229 0,000807993891802062 0,000762951094834821 0,000701915007248035 0,000786002037662137 0,000723786978547107 37636 35213 623 665 0 True 280 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 326 435 0,000787003036251444 0,000855996709558286 0,000625619897764553 0,000686655985351339 0,000693257215176406 0,000703743968077564 32132 37305 623 665 0 True 324 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 370 435 0,00090006185659679 0,000970657359810604 0,000732433051041428 0,000869764248111696 0,000705547812612846 0,000699888328971395 36748 42302 623 665 0 True 368 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 414 435 0,000889774875542837 0,000979973394231746 0,000656137941557946 0,000717174029144732 0,000835260127339158 0,000866577800169856 36328 42708 623 665 0 True 412 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 458 434 0,000951839661235018 0,000959161465118507 0,000686655985351339 0,000656137941557946 0,000928540962440657 0,000957454193124692 38862 41801 623 665 0 True 456 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 503 435 0,000908022020507587 0,000982795739635195 0,000671396963454643 0,000732433051041428 0,000839011645627586 0,000912472235066538 37073 42831 623 665 0 True 501 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 547 435 0,000899351565047827 0,000927519072343252 0,00064087891966125 0,000686655985351339 0,000897567525747511 0,00082898533025449 36719 40422 623 665 0 True 545 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 591 435 0,000895236772626245 0,000965884613112089 0,000534065766384375 0,000534065766384375 0,000934834690306075 0,00103798620001289 36551 42094 623 665 0 True 589 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 635 434 0,00088637037467022 0,000911066863771927 0,000534065766384375 0,000564583810177768 0,000950221121086592 0,000929710862512879 36189 39705 623 665 0 True 633 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 679 435 0,000943218191399325 0,000999569190772766 0,00064087891966125 0,00064087891966125 0,000939130647171195 0,00100385594456867 38510 43562 623 665 0 True 677 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 282 480 0,000914390151636224 0,000899020267537693 0,000747692072938125 0,000747692072938125 0,000791607255986234 0,00076319622115844 37333 39180 623 665 0 True 280 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 325 479 0,000884410949707562 0,000851407530040482 0,000701915007248035 0,000686655985351339 0,000795612660718913 0,000754939367057489 36109 37105 623 665 0 True 324 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 370 479 0,000905744188988497 0,000887386697460061 0,000747692072938125 0,000747692072938125 0,000817453259337004 0,000739995092443866 36980 38673 623 665 0 True 368 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 414 478 0,000905254332747833 0,00103077561149383 0,000656137941557946 0,000778210116731518 0,000882810842088635 0,000923645210780896 36960 44922 623 665 0 True 412 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 458 479 0,00102698360855294 0,000920864762042437 0,000671396963454643 0,000595101853971161 0,00109972089759704 0,000992250432958279 41930 40132 623 665 0 True 456 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 501 479 0,000951913139671118 0,000887730885923896 0,000732433051041428 0,000488288700694286 0,000904423740139422 0,000945881521583401 38865 38688 623 665 0 True 500 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 545 477 0,000880271664473948 0,000859048513937625 0,000595101853971161 0,000549324788281071 0,00087796092279088 0,000875286350428451 35940 37438 623 665 0 False 545 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 590 479 0,000870352075600493 0,000871118056069448 0,000457770656900893 0,000457770656900893 0,000933892551431104 0,000958306796346711 35535 37964 623 665 0 True 589 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 634 478 0,000878116297015024 0,000849480074643005 0,000457770656900893 0,000534065766384375 0,000951652537723996 0,000832172814543169 35852 37021 623 665 0 True 633 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 678 479 0,000935845854977325 0,000881650223062807 0,000579842832074464 0,000473029678797589 0,000979192313079388 0,000949209268187799 38209 38423 623 665 0 True 677 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 283 523 0,000872287007751118 0,000834312836336665 0,000747692072938125 0,000701915007248035 0,000716158414164289 0,00073405694111045 35614 36360 623 665 0 True 280 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 326 523 0,000864694236020819 0,000889015856188881 0,000732433051041428 0,000747692072938125 0,000720723276157253 0,000763463642369297 35304 38744 623 665 0 True 324 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 369 523 0,00092249727241922 0,000907946221699821 0,000732433051041428 0,000778210116731518 0,000806400196256769 0,000756585100196782 37664 39569 623 665 0 True 368 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 414 523 0,000947259505384806 0,000893329684935617 0,000671396963454643 0,000579842832074464 0,000874094742391061 0,000898858898534189 38675 38932 623 665 0 True 412 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 458 522 0,000835229383144855 0,000902003234224265 0,000488288700694286 0,000549324788281071 0,000911497771010463 0,000903774097129873 34101 39310 623 665 0 True 456 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 502 524 0,000937609337443717 0,000877657636882318 0,000564583810177768 0,000549324788281071 0,00099692596167643 0,000893862367558252 38281 38249 623 665 0 True 500 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 546 523 0,000952011110919251 0,000819856920855584 0,000701915007248035 0,000518806744487678 0,000887271266066981 0,000849732112699291 38869 35730 623 665 0 True 545 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 591 523 0,000853990877162302 0,00087387156378013 0,000595101853971161 0,000595101853971161 0,000790724562904975 0,000846955209364337 34867 38084 623 665 0 True 589 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 634 523 0,000899645478792225 0,000921369571789396 0,000488288700694286 0,000473029678797589 0,000993143462213801 0,00101238570032344 36731 40154 623 665 0 True 633 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 679 523 0,000920096976839964 0,00088623940258061 0,000595101853971161 0,000549324788281071 0,000945066179874565 0,000933733499240209 37566 38623 623 665 0 True 677 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 282 568 0,000909246661109248 0,000913866263277787 0,000823987182421607 0,00080872816052491 0,000674205253779532 0,000665295614143656 37123 39827 623 665 0 True 280 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 326 567 0,000917966102193074 0,000916550933295702 0,00080872816052491 0,00080872816052491 0,000710304578175318 0,000739056241604676 37479 39944 623 665 0 True 324 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 370 567 0,000901090554702185 0,000780298193412118 0,000762951094834821 0,00064087891966125 0,000684252094789101 0,000614649469433936 36790 34006 623 665 0 True 368 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 414 567 0,000956199381776931 0,000993327906628553 0,000732433051041428 0,000671396963454643 0,000878333595672362 0,000928718139190248 39040 43290 623 665 0 True 412 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 459 567 0,00094424688950472 0,000963567077455598 0,000503547722590982 0,000625619897764553 0,00104837115711045 0,000927130891983304 38552 41993 623 665 0 True 456 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 502 567 0,000794546822357676 0,000882177978707354 0,000305180437933928 0,000274662394140536 0,000948575786420144 0,00108683760084682 32440 38446 623 665 0 True 500 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 547 567 0,000922031908990589 0,000901246019603828 0,000503547722590982 0,000579842832074464 0,000979823862183454 0,000908400881009611 37645 39277 623 665 0 True 544 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 589 563 0,000856758564922056 0,000946977193498739 0,000579842832074464 0,000732433051041428 0,000854620337767121 0,000812818334603161 34980 41270 623 665 0 False 589 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 634 566 0,000890338210219601 0,000888878180803347 0,000610360875867857 0,00064087891966125 0,000844368809802399 0,000793706848531851 36351 38738 623 665 0 True 633 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 679 566 0,00104508379664549 0,00107873253745488 0,000793469138628214 0,00080872816052491 0,000910160285151615 0,0009366037370338 42669 47012 623 665 0 True 677 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 279 606 0,000824795445218703 0,000910424378639434 0,000671396963454643 0,000778210116731518 0,000674071165835536 0,000694747782805651 33675 39677 623 665 0 False 279 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 324 606 0,000812940924194624 0,000788489878851397 0,000656137941557946 0,00064087891966125 0,000719635115668247 0,000693070049627485 33191 34363 623 665 0 False 324 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 370 611 0,000899204608175627 0,000838810232264112 0,000762951094834821 0,000701915007248035 0,000660399491460967 0,000665542254585235 36713 36556 623 665 0 True 368 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 415 611 0,000919852048719632 0,000899020267537693 0,000671396963454643 0,000671396963454643 0,000865010669876193 0,000798799931605203 37556 39180 623 665 0 True 412 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 456 607 0,000933763965954501 0,000870865651195969 0,000549324788281071 0,000442511635004196 0,000989081961385755 0,000983263416678899 38124 37953 623 665 0 False 456 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 500 607 0,000915418849741619 0,00087878198586418 0,000503547722590982 0,000457770656900893 0,000992877002783474 0,0010290644561953 37375 38298 623 665 0 False 500 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 544 607 0,000922668722103453 0,000915862556368032 0,000503547722590982 0,000610360875867857 0,00095674250996822 0,000980631076286106 37671 39914 623 665 0 False 544 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 589 607 0,000912553190733732 0,00092127778819904 0,000656137941557946 0,00064087891966125 0,00083810475533099 0,000877753190794728 37258 40150 623 665 0 False 589 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 633 607 0,000864669743208786 0,000879332687406316 0,000701915007248035 0,000701915007248035 0,000684404276545501 0,000733776427830063 35303 38322 623 665 0 False 633 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 677 607 0,001013757490055 0,000938900237547405 0,000823987182421607 0,000656137941557946 0,000854669059895763 0,000823125754902549 41390 40918 623 665 0 False 677 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 281 656 0,00104430002666043 0,0688688532959774 0,000854505226215 0,0707560845349813 0,000796400827860308 0,0218068051684855 42637 3001358 623 665 0 True 279 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 324 650 0,000835743732197553 0,000874238698141554 0,000671396963454643 0,000793469138628214 0,000685717317115048 0,000609993579234791 34122 38100 623 665 0 False 324 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 368 650 0,000915051457561121 0,000801569040477137 0,000762951094834821 0,000701915007248035 0,000682293389269685 0,000572282267266886 37360 34933 623 665 0 False 368 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 412 650 0,000885145734068558 0,000965310965672364 0,000701915007248035 0,000778210116731518 0,000725517659060177 0,000762645961725773 36139 42069 623 665 0 False 412 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 456 650 0,000977900013238365 0,000887845615411842 0,000747692072938125 0,000656137941557946 0,000857239959904097 0,000844655528390627 39926 38693 623 665 0 False 456 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 500 650 0,000836674459054815 0,000894981789562026 0,000503547722590982 0,000595101853971161 0,000861233353865393 0,000852349435477022 34160 39004 623 665 0 False 500 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 544 650 0,000907630135515055 0,000927128992084239 0,000564583810177768 0,000610360875867857 0,000896784344527951 0,000922244797465869 37057 40405 623 665 0 False 544 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 588 650 0,000903319400597208 0,000851109233371825 0,000747692072938125 0,000747692072938125 0,000728359826684281 0,000632153917400214 36881 37092 623 665 0 False 588 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 633 650 0,000890485167091801 0,000932613061608014 0,000747692072938125 0,000793469138628214 0,000662637408021183 0,000659525885365732 36357 40644 623 665 0 False 633 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 678 655 0,00103705015429859 0,0705197876816096 0,000869764248111696 0,0680857557030594 0,000744380496771495 0,0220470216381699 42341 3073307 623 665 0 True 677 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G7_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G7_1.csv new file mode 100755 index 0000000..ed0d31d --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G7_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 274 271 0,0106126629062006 0,0443631853724492 0,0106355382619974 0,0446021210040436 0,00151285499311188 0,00891400665963566 402695 1933382 579 665 0 True 274 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 318 271 0,0104056251237819 0,0102971551102522 0,0104371709773404 0,0102845807583734 0,00137574440401284 0,00121021354041216 394839 448758 579 665 0 False 318 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 363 270 0,010539582996495 0,0565958728361302 0,0105287251087205 0,0584420538643473 0,0014059194326277 0,0117215391734214 399922 2466492 579 665 0 True 362 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 407 270 0,010534602072249 0,072554446312623 0,0105592431525139 0,0725871671625849 0,0013494708348957 0,010044078393765 399733 3161979 579 665 0 True 406 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 452 271 0,010485952410036 0,0666523025347759 0,0105439841306172 0,0661631189440757 0,00169067786181198 0,0142743776990378 397887 2904759 579 665 0 True 450 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 495 270 0,0107261963540952 0,059809055713213 0,0107270923933776 0,0613565270466163 0,00162706171430926 0,0183482539454408 407003 2606525 579 665 0 True 494 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 540 271 0,010533969573932 0,0726447154737381 0,0105897611963073 0,07177843900206 0,00152691314111656 0,0221465785766747 399709 3165913 579 665 0 True 538 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 584 271 0,0106743842002975 0,0638026056214007 0,0106355382619974 0,0636606393530175 0,00179272768072064 0,0177461861530299 405037 2780567 579 665 0 True 582 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 626 272 0,0106100011424501 0,010539922706744 0,0106965743495842 0,010605020218204 0,0018534306118023 0,00188693397056699 402594 459338 579 665 0 False 626 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 669 270 0,010710910978102 0,0447448215411497 0,0107270923933776 0,0445868619821469 0,00179855640790196 0,00897756925162837 406423 1950014 579 665 0 True 670 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 274 314 0,0103763720766224 0,0106057085951317 0,010406652933547 0,0105745021744106 0,00145105525789347 0,0015057272556366 393729 462205 579 665 0 False 274 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 318 314 0,0104858206395533 0,0103362549197439 0,0104829480430304 0,0103913939116503 0,0013076115726631 0,00120278855304312 397882 450462 579 665 0 False 318 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 365 316 0,0106560944572987 0,0973405589964841 0,0106660563057908 0,0971389333943694 0,00143963845029964 0,0236845887238496 404343 4242177 579 665 0 True 362 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 408 315 0,0107524713883457 0,0495766998177522 0,0107728694590677 0,0498054474708171 0,00148762928908128 0,00990497250827942 408000 2160591 579 665 0 True 406 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 452 315 0,010760245846825 0,0758595275095498 0,010757610437171 0,0771343556878004 0,00179467113317393 0,0187822124445409 408295 3306017 579 665 0 True 450 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 496 316 0,0106069967754445 0,0392862678554936 0,0105439841306172 0,0394750896467536 0,00170336408784517 0,0081806443618771 402480 1712126 579 665 0 True 494 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 538 315 0,0108797616746342 0,0409182718756149 0,0108491645685512 0,0426947432669566 0,0018108245036706 0,0116069600607731 412830 1783250 579 665 0 False 538 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 583 315 0,0106645804763846 0,051796417112821 0,0106507972838941 0,0513466086823835 0,00194567099184425 0,0137554315346837 404665 2257328 579 665 0 True 582 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 626 315 0,0104061258516162 0,0105721846387541 0,0103913939116503 0,010605020218204 0,00199469385271431 0,00193449053216909 394858 460744 579 665 0 False 626 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 670 315 0,0104570419661316 0,0104166343989982 0,0105287251087205 0,010452429999237 0,00190301389425924 0,00182568817512509 396790 453965 579 665 0 False 670 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 275 360 0,0104930943701984 0,0538172164216905 0,0104829480430304 0,053528648813611 0,00152534377572923 0,0150505250294117 398158 2345396 579 665 0 True 274 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 320 360 0,010620147469618 0,0628913322445505 0,0106355382619974 0,0644083314259556 0,00135652443296659 0,0195897636186495 402979 2740853 579 665 0 True 318 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 364 360 0,010523770538571 0,0402003176859521 0,0105134660868238 0,0404058899824521 0,00133943541290836 0,00953427371964683 399322 1751961 579 665 0 True 362 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 409 361 0,010606627818093 0,0337862738787917 0,0106202792401007 0,0345006485084306 0,00157302498635992 0,00525697133458916 402466 1472432 579 665 0 True 406 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 453 360 0,010644156051566 0,0685392354771112 0,0105897611963073 0,0684519722285802 0,00174146217294129 0,0133046834383913 403890 2986993 579 665 0 True 450 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 496 360 0,0106559363327194 0,0327900777349646 0,0106965743495842 0,0329137102311742 0,00169363987619251 0,00628768326594931 404337 1429017 579 665 0 True 494 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 538 358 0,0108700633671074 0,0301855347914304 0,0109102006561379 0,0297856107423514 0,00164610056098292 0,00825913473897585 412462 1315509 579 665 0 False 538 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 584 360 0,0108150360135318 0,0488043179590083 0,010757610437171 0,049256122682536 0,00195907432894112 0,00918760597190355 410374 2126930 579 665 0 True 582 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 628 360 0,0106455528186826 0,0562573520089994 0,0106355382619974 0,0563668268863966 0,0019718833384855 0,0136722273348519 403943 2451739 579 665 0 True 626 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 673 360 0,0105860189145986 0,0646263174530513 0,0106813153276875 0,0645609216449226 0,00196569872380466 0,0197416793303532 401684 2816465 579 665 0 True 670 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 277 405 0,0103973762915649 0,0433410603643464 0,0104219119554437 0,0453345540550851 0,00148288687525986 0,0100926858811751 394526 1888837 579 665 0 True 274 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 320 404 0,0106031227232531 0,0320820132271627 0,0106355382619974 0,0321965362020294 0,00147074732541353 0,00558026623318882 402333 1398159 579 665 0 True 318 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 364 404 0,0106959682053638 0,0860018207569737 0,0106965743495842 0,0834210727092393 0,00145337623735779 0,0260645719128501 405856 3748026 579 665 0 True 362 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 408 404 0,0107584537682603 0,063161864377125 0,0106965743495842 0,0633707179369802 0,00157720406270109 0,0172731575196021 408227 2752643 579 665 0 True 406 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 452 404 0,010848373945655 0,0400421975056662 0,0108949416342412 0,0410467689021134 0,00166113769497836 0,00836587850045384 411639 1745070 579 665 0 True 450 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 497 405 0,0107743452884739 0,0507744756718989 0,0107270923933776 0,0507820248722057 0,00166259007534212 0,010627946340441 408830 2212791 579 665 0 True 494 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 541 404 0,0108451850999736 0,040575850245894 0,0107881284809644 0,0417944609750515 0,0016570444501543 0,00624643877777883 411518 1768327 579 665 0 True 538 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 585 405 0,0107917917003834 0,0497873431576194 0,0108796826123445 0,0503395132372015 0,00184609122835051 0,00922246366380132 409492 2169771 579 665 0 True 582 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 629 404 0,0105829881934965 0,0400625734627253 0,0106660563057908 0,0413519493400473 0,0019038191365726 0,00708183521058792 401569 1745958 579 665 0 True 626 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 673 405 0,0107297805112247 0,0860357806854054 0,0107881284809644 0,0818341344319829 0,00199067554442404 0,0201239562397207 407139 3749506 579 665 0 True 670 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 277 449 0,0103779006142218 0,041504218316448 0,0103608758678569 0,0423895628290227 0,00153067368208752 0,00841471105091958 393787 1808786 579 665 0 True 274 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 321 449 0,010597113989242 0,0532385897221883 0,010605020218204 0,0534981307698177 0,00151932645167476 0,00728207021916542 402105 2320179 579 665 0 True 318 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 365 449 0,0107615108434589 0,0329347286733657 0,0107423514152743 0,0336919203479057 0,00144095754466242 0,00389618416556699 408343 1435321 579 665 0 True 362 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 409 449 0,0106770986722411 0,0531327861884053 0,0107423514152743 0,0528725108720531 0,00179188677453828 0,0121914703731545 405140 2315568 579 665 0 True 406 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 453 448 0,0111073292982576 0,0935742193662228 0,0109864957656214 0,0905470359349966 0,00198889939664961 0,0168253668384141 421465 4078037 579 665 0 True 450 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 498 450 0,0114594727362259 0,057460382473694 0,0112916762035554 0,0580148012512398 0,00236304618752589 0,0139871120170403 434827 2504168 579 665 0 True 494 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 542 450 0,0107487554607335 0,0525160234071101 0,010757610437171 0,0523994811932555 0,00184788370199556 0,0107090930398923 407859 2288689 579 665 0 True 538 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 585 449 0,010828661081443 0,0306416303978073 0,0108644235904479 0,0308079652094301 0,00188385701114515 0,00497607775093689 410891 1335386 579 665 0 True 582 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 629 448 0,0104390948263878 0,041787508368082 0,0104371709773404 0,04101625085832 0,00185540576991041 0,00925547520317195 396109 1821132 579 665 0 True 626 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 674 449 0,0109078814956424 0,0652355310340397 0,0108033875028611 0,065491721980621 0,00195520920033503 0,00962205107237443 413897 2843015 579 665 0 True 670 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 277 493 0,0103246653392108 0,0509204115805651 0,0102693217364767 0,0506446936751354 0,00162322125173564 0,0145901716913786 391767 2219151 579 665 0 True 273 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 320 493 0,0106490052053294 0,0538211631160758 0,0105745021744106 0,0551766231784543 0,00150983409514843 0,0110556452530685 404074 2345568 579 665 0 True 318 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 364 493 0,0108197270427159 0,0667359862232831 0,0108339055466545 0,065644312199588 0,00161659163785442 0,0204031802132196 410552 2908406 579 665 0 True 362 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 409 493 0,0111202428055622 0,0887973194602436 0,011108567940795 0,0845502403295949 0,00170511290272822 0,0269766656966234 421955 3869856 579 665 0 True 406 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 453 493 0,0114832968394982 0,0925410803272773 0,0114747844663157 0,0900587472343023 0,00217680392530628 0,0316323646392566 435731 4033012 579 665 0 True 450 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 496 493 0,0111226410283474 0,045729177601821 0,0110170138094148 0,0468909742885481 0,00229215759201343 0,00960503887178745 422046 1992913 579 665 0 True 494 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 540 491 0,0109175007408795 0,0398822645994708 0,0110170138094148 0,0415960936903944 0,00170060996621802 0,00719480152317249 414262 1738100 579 665 0 True 538 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 583 493 0,0108394135528313 0,0912486067537808 0,0108491645685512 0,0885786221103227 0,00181333559791071 0,0221974442606612 411299 3976685 579 665 0 True 582 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 628 492 0,0104993402910784 0,0606734047294937 0,0105287251087205 0,0609140154116121 0,00178154025428447 0,0186263899246719 398395 2644194 579 665 0 True 626 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 672 492 0,0105115158836799 0,0739304429533435 0,0105439841306172 0,0727855344472419 0,00192045278678003 0,0154849679874967 398857 3221946 579 665 0 True 670 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 277 537 0,0101064270657626 0,0519512330838541 0,0101319905394064 0,0547035934996567 0,00142638283935644 0,0141186592562448 383486 2264075 579 665 0 True 273 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 320 537 0,0107114117059362 0,102060598968238 0,0106202792401007 0,0963149462119478 0,00152113883635349 0,033127098136883 406442 4447880 579 665 0 True 317 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 364 537 0,0106459481301307 0,0547253003187759 0,0106507972838941 0,0571755550469215 0,00153270791735096 0,0127769680613067 403958 2384971 579 665 0 True 361 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 409 537 0,0108842682251425 0,0582468990053527 0,0108339055466545 0,0582131685358969 0,00179706387036399 0,0119429298542622 413001 2538445 579 665 0 True 405 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 452 536 0,0109032431746514 0,0543319387964074 0,0108796826123445 0,0561074235141527 0,00196762004133788 0,0102011583315652 413721 2367828 579 665 0 True 450 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 497 538 0,0107981166835531 0,0591707926258769 0,0108491645685512 0,0598306248569467 0,00203797942558735 0,0139908504438287 409732 2578709 579 665 0 True 494 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 540 537 0,0107967726246295 0,0705679970124441 0,0107728694590677 0,0684519722285802 0,00185798169462571 0,0204013348544062 409681 3075408 579 665 0 True 538 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 584 537 0,0106083408343681 0,0567715236821741 0,0105439841306172 0,0579842832074464 0,00157575675047499 0,0152622607098423 402531 2474147 579 665 0 True 582 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 628 537 0,0104901163572893 0,0412373575274878 0,0104371709773404 0,0415808346684977 0,0017084270591746 0,00696990478287378 398045 1797156 579 665 0 True 626 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 672 537 0,0106154827945304 0,0620057123812048 0,0106202792401007 0,0619516289005875 0,00174793695280851 0,0166680411935023 402802 2702257 579 665 0 True 670 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 273 573 0,0144216468332325 0,0316981971981912 0,0107728694590677 0,0318303196765087 0,00861048878625454 0,0184045265562236 547226 1381432 579 665 0 False 273 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 317 573 0,0161228301189901 0,0390798695066804 0,0113221942473487 0,0400701915007248 0,0109942880642319 0,0240964827182326 611777 1703131 579 665 0 False 317 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 361 573 0,0151167361294766 0,0373371515306921 0,0115663385976959 0,0381628137636378 0,00886916878375402 0,0217749203864365 573601 1627182 579 665 0 False 361 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 405 573 0,0160096919825436 0,035788831199078 0,0115358205539025 0,0426947432669566 0,0101191569950673 0,0181563880479988 607484 1559705 579 665 0 False 405 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 449 573 0,0203879507489373 0,0615035643583667 0,0122072175173571 0,0641641870756084 0,0185708124831126 0,0436798994264688 773616 2680373 579 665 0 False 449 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 493 574 0,0167157709370449 0,0473624895381048 0,011810482948043 0,0501564049744411 0,0121379986757339 0,0279197698577834 634276 2064094 579 665 0 False 493 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 537 574 0,0158524634425856 0,0437446098652445 0,0115358205539025 0,0524605172808423 0,0110724705738926 0,0228872367414005 601518 1906424 579 665 0 False 537 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 581 574 0,0122077182451914 0,0293850212622424 0,0111390859845884 0,0330815594720378 0,00401734667968379 0,0127321027516119 463219 1280622 579 665 0 False 581 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 629 581 0,0103337311484206 0,046917614475649 0,0102845807583734 0,0475776302738994 0,00164778886340478 0,00908948583442173 392111 2044706 579 665 0 True 626 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 673 581 0,0105445902748377 0,0527344224603624 0,0105287251087205 0,0508735790035859 0,00167481414847551 0,0103899362624542 400112 2298207 579 665 0 True 670 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 273 616 0,0108010946964621 0,00989484468782393 0,00996414129854276 0,00997940032043946 0,00432974252858158 0,00138904749370284 409845 431225 579 665 0 False 273 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 317 616 0,0111173175008463 0,00996554099829569 0,0102388036926833 0,00996414129854276 0,00469894747403076 0,00131872668936139 421844 434306 579 665 0 False 317 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 361 616 0,0208764502824039 0,0496417055456219 0,0110322728313115 0,0555886167696651 0,0193766759175469 0,0335110556236369 792152 2163424 579 665 0 False 361 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 405 617 0,0197996218977769 0,0521447817300174 0,0118257419699397 0,0479133287556268 0,0165770786813526 0,0386789744922509 751292 2272510 579 665 0 False 405 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 449 617 0,0120511749117434 0,0101120964461967 0,010757610437171 0,0100404364080262 0,00583546616300022 0,00184904100014164 457279 440693 579 665 0 False 449 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 493 617 0,0109031377582652 0,0101822879469215 0,0103456168459602 0,0101930266269932 0,00412235645690634 0,00197342740107856 413717 443752 579 665 0 False 493 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 537 617 0,0106515879067903 0,0101394020643277 0,0102998397802701 0,0101472495613031 0,00343305968410624 0,0020308461223965 404172 441883 579 665 0 False 537 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 581 617 0,0102280775753915 0,0102781788529461 0,0102693217364767 0,01025406271458 0,00173802484274252 0,00167701821178353 388102 447931 579 665 0 False 581 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 625 617 0,0104271827747517 0,0101919252239089 0,0102388036926833 0,0101777676050965 0,00218255995596062 0,00142514242067625 395657 444172 579 665 0 False 625 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 669 617 0,0106776257541719 0,0102124388563535 0,0104219119554437 0,0102082856488899 0,00259801216699116 0,00160818142102108 405160 445066 579 665 0 False 669 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 274 666 0,00981199909921698 0,042775283367494 0,0098268101014725 0,0434576943617914 0,00137652232015172 0,00930929812149708 372314 1864180 579 665 0 True 273 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 317 660 0,009878121527436 0,00983839777975495 0,00985732814526589 0,0097962920576791 0,00120281186799662 0,00124651486334216 374823 428765 579 665 0 False 317 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 361 660 0,0122635098675667 0,00982201440887639 0,0101167315175097 0,00985732814526589 0,00946361425171197 0,00126570601166291 465336 428051 579 665 0 False 361 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 405 660 0,0118691208128447 0,0098788284513068 0,01025406271458 0,00985732814526589 0,00733219668193055 0,00139732333472488 450371 430527 579 665 0 False 405 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 449 660 0,0101620342094621 0,00990342645352222 0,0101319905394064 0,00996414129854276 0,00150685653458143 0,00158256189930917 385596 431599 579 665 0 False 449 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 493 660 0,00992790441580018 0,00979289606483593 0,00993362325474937 0,00985732814526589 0,00174390928090402 0,00162334648676048 376712 426782 579 665 0 False 493 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 537 660 0,0099798219859841 0,0100206111525093 0,0100251773861295 0,0100556954299229 0,00176050192907683 0,00178180380492493 378682 436706 579 665 0 False 537 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 581 660 0,0100500820073599 0,0100431899157369 0,0100556954299229 0,00994888227664607 0,00137629474468046 0,00125627668403488 381348 437690 579 665 0 False 581 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 625 660 0,00998108698261802 0,00994261804660426 0,0100251773861295 0,00993362325474937 0,00142881042756887 0,00144998019602467 378730 433307 579 665 0 False 625 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 670 665 0,0102634447729483 0,043416460583824 0,0101625085831998 0,0432745860990311 0,00145976058512846 0,00871464963719708 389444 1892123 579 665 0 True 669 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G7_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G7_2.csv new file mode 100755 index 0000000..0eb3924 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G7_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 274 271 0,00866667641768239 0,732311001812152 0,00842298008697642 0,749004348821241 0,00212215113212459 0,193586948921789 328855 31914681 579 665 12 True 274 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 318 271 0,00703151014375764 0,00665837172468824 0,00695811398489357 0,00665293354695964 0,00159971534356869 0,00126477221063769 266809 290177 579 665 0 False 318 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 363 270 0,00640834117697132 0,00655089314038128 0,0063935301747158 0,00656137941557946 0,00123807845538577 0,00126979348053733 243163 285493 579 665 0 True 362 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 407 270 0,00647638745423776 0,00640943168174499 0,00643930724040589 0,0063782711528191 0,00138108928485574 0,00128752162195178 245745 279328 579 665 0 True 406 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 452 271 0,00654888757381947 0,00669678315725225 0,00656137941557946 0,00669871061264973 0,0016500135884323 0,0017469496920423 248496 291851 579 665 0 True 450 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 495 270 0,00694910088387687 0,00700058684133084 0,00694285496299687 0,00694285496299687 0,0016074033116558 0,00166904746385083 263682 305091 579 665 0 True 494 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 540 271 0,0070894364479527 0,00722967868285959 0,00708018616006714 0,00720225833524071 0,00146768139330949 0,00149609174162936 269007 315075 579 665 0 True 538 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 584 271 0,00730445952162307 0,0076002778748198 0,00727855344472419 0,00759899290455482 0,00169514372061885 0,00173102631934991 277166 331226 579 665 0 True 582 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 626 272 0,00799630726399281 0,00804196345751079 0,00784313725490196 0,00820935378042268 0,00218969098375485 0,00185678647207279 303418 350475 579 665 0 False 626 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 669 270 0,00999205028677869 0,733628027496069 0,00971999694819562 0,746318760967422 0,00263170925380652 0,192982039797497 379146 31972078 579 665 12 True 670 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 274 314 0,00685593915260774 0,00680570733310732 0,00692759594110018 0,0068055237659266 0,00150304037868625 0,00139914471252329 260147 296598 579 665 0 False 274 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 318 314 0,00662086061147038 0,00651716267092543 0,00660715648126955 0,00646982528419928 0,00119157687445929 0,00116252612522523 251227 284023 579 665 0 False 318 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 365 316 0,0064022797347671 0,00656507370509129 0,00636301213092241 0,00656137941557946 0,00127088958288688 0,00121848477469547 242933 286111 579 665 0 True 362 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 408 315 0,00675874524456799 0,00665492984004988 0,0068055237659266 0,00675974670023652 0,00140490546644113 0,0013692148116643 256459 290027 579 665 0 True 406 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 452 315 0,0067021102911034 0,0069277565623833 0,00679026474402991 0,00695811398489357 0,00163354753350875 0,00161050533023416 254310 301917 579 665 0 True 450 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 496 316 0,00710559150913176 0,00709170500065683 0,00717174029144732 0,00709544518196384 0,00159559466814697 0,00146987040182236 269620 309062 579 665 0 True 494 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 538 315 0,00723417314615073 0,00720439230371649 0,00729381246662089 0,00715648126955062 0,00157667821892706 0,00143679995242024 274499 313973 579 665 0 False 538 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 583 315 0,00752720434557969 0,00743247452575132 0,00747692072938125 0,00733958953231098 0,00179989226103309 0,00187296435709006 285618 323913 579 665 0 True 582 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 626 315 0,00772372684347894 0,00762611495550504 0,00775158312352178 0,00762951094834821 0,00186042812610107 0,0020090129824269 293075 332352 579 665 0 False 626 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 670 315 0,00774338699949782 0,00757808919185122 0,00779736018921187 0,00761425192645151 0,00197885371622924 0,0018669650096017 293821 330259 579 665 0 False 670 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 275 360 0,00626241854442899 0,00632544969656919 0,00633249408712902 0,00630197604333562 0,00140725413506756 0,00139710137507076 237626 275668 579 665 0 True 274 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 320 360 0,00643487975218716 0,00653703381823751 0,0063935301747158 0,00653086137178607 0,00132006267201796 0,00122184847571413 244170 284889 579 665 0 True 318 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 364 360 0,0066295574633286 0,00679907596870409 0,00665293354695964 0,00689707789730678 0,00134758663484565 0,00136065870930014 251557 296309 579 665 0 True 362 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 409 361 0,00701596122679901 0,00705517513169511 0,00703440909437705 0,00715648126955062 0,00149481227543476 0,00138787820459709 266219 307470 579 665 0 True 406 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 453 360 0,00707164743278816 0,00740585728454806 0,00706492713817044 0,00737010757610437 0,00167990926503474 0,00174748518890137 268332 322753 579 665 0 True 450 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 496 360 0,007247508319 0,00738832661879005 0,00727855344472419 0,00746166170748455 0,00168655099067191 0,00172769100618904 275005 321989 579 665 0 True 494 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 538 358 0,00726911867816285 0,00736756058147199 0,0072327763790341 0,0072632944228275 0,00155769564266353 0,00175040691333296 275825 321084 579 665 0 False 538 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 584 360 0,00737392892010268 0,00744227242402183 0,00735484855420768 0,00744640268558785 0,00180197070559503 0,00201420629866605 279802 324340 579 665 0 True 582 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 628 360 0,00727499564169128 0,00718367215819361 0,00727855344472419 0,00732433051041428 0,00201462803376129 0,00190038352162567 276048 313070 579 665 0 True 626 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 673 360 0,00674393424231248 0,00666068926034473 0,00677500572213321 0,00660715648126955 0,00187311337679904 0,00191477045682788 255897 290278 579 665 0 True 670 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 277 405 0,00655621401265761 0,00643577357217718 0,00651560234988937 0,00646982528419928 0,00140552391202468 0,00134366928010022 248774 280476 579 665 0 True 274 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 320 404 0,0066263949717438 0,00670442414114939 0,00662241550316625 0,00674448767833982 0,00134702303232976 0,00129075570887403 251437 292184 579 665 0 True 318 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 364 404 0,00690601193603386 0,00701485918963121 0,00686655985351339 0,00703440909437705 0,00131932269795338 0,00129814469016601 262047 305713 579 665 0 True 362 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 408 404 0,00683741222274008 0,0070976020963372 0,0068207827878233 0,00711070420386053 0,00148608360087752 0,00149518847396544 259444 309319 579 665 0 True 406 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 452 404 0,00732593811030323 0,00746645740008065 0,00735484855420768 0,00737010757610437 0,0015442217155598 0,00196570918122038 277981 325394 579 665 0 True 450 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 497 405 0,00731278741612974 0,00739681660089799 0,00718699931334401 0,00735484855420768 0,00154691596909418 0,00165582700827767 277482 322359 579 665 0 True 494 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 541 404 0,00721901954064019 0,00737905647616409 0,00730907148851759 0,00738536659800107 0,0015544710561733 0,00160785214613438 273924 321585 579 665 0 True 538 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 585 405 0,00684236679288961 0,00709764798813238 0,0068055237659266 0,0072327763790341 0,00183280630959247 0,00182697894930917 259632 309321 579 665 0 True 582 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 629 404 0,00641000148505334 0,00653570295617735 0,00633249408712902 0,00651560234988937 0,00172774766253393 0,001747716214847 243226 284831 579 665 0 True 626 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 673 405 0,00641840844184962 0,00628460599886074 0,0063935301747158 0,00627145799954223 0,00198315065301217 0,00182025565117779 243545 273888 579 665 0 True 670 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 277 449 0,00631533757028143 0,00656599154099485 0,00631723506523232 0,00665293354695964 0,0014166890741852 0,00149777238726521 239634 286151 579 665 0 True 274 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 321 449 0,00662207289991123 0,00669106962875259 0,00663767452506294 0,00668345159075303 0,00145130408244278 0,00141965877594085 251273 291602 579 665 0 True 318 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 365 449 0,00679846086805387 0,00692052860464276 0,00679026474402991 0,00692759594110018 0,00143328676631173 0,00127758710365105 257966 301602 579 665 0 True 362 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 409 449 0,00683037567896388 0,00709663836863847 0,00686655985351339 0,00703440909437705 0,00164248003548184 0,00165172408319168 259177 309277 579 665 0 True 406 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 453 448 0,00710406297153244 0,00764635323717855 0,00711070420386053 0,00744640268558785 0,00174774639521526 0,00251536452908281 269562 333234 579 665 0 True 450 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 498 450 0,00745262225237131 0,00740590317634324 0,00738536659800107 0,00741588464179446 0,00196253265222874 0,00182842934994067 282788 322755 579 665 0 True 494 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 542 450 0,00695774502754201 0,0068817959295125 0,00709544518196384 0,00685130083161669 0,0016969873601284 0,00169479070539637 264010 299914 579 665 0 True 538 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 585 449 0,006301896981046 0,00630762073414252 0,00627145799954223 0,00628671702143893 0,00173551723776326 0,00189059636400892 239124 274891 579 665 0 True 582 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 629 448 0,00611296446295029 0,00613240586015279 0,00611886778057527 0,00611886778057527 0,00174093201851151 0,00180860903787566 231955 267255 579 665 0 True 626 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 674 449 0,00609327795283486 0,00618332280690281 0,00611886778057527 0,00617990386816205 0,00175327684739561 0,00178329721685709 231208 269474 579 665 0 True 670 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 277 493 0,00636707066178958 0,00654942460293558 0,00633249408712902 0,00653086137178607 0,00150561341255935 0,00146294609087476 241597 285429 579 665 0 True 273 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 320 493 0,00660209649473386 0,00665694907903772 0,00665293354695964 0,00665293354695964 0,00141449731710868 0,00139501367080452 250515 290115 579 665 0 True 318 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 364 493 0,00672553908292751 0,00683808399460542 0,00672922865644312 0,00691233691920348 0,00149274158074359 0,00140999653541999 255199 298009 579 665 0 True 362 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 409 493 0,00681609175863917 0,00669910069290874 0,0068207827878233 0,00671396963454643 0,00160086100057764 0,00160132791260592 258635 291952 579 665 0 True 406 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 453 493 0,00688021127552114 0,00725436846866537 0,00674448767833982 0,00717174029144732 0,00194254197619171 0,00195232637426598 261068 316151 579 665 0 True 450 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 496 493 0,00690780401459859 0,0067487097234962 0,00685130083161669 0,00669871061264973 0,00199932733241781 0,00172443984313098 262115 294114 579 665 0 True 494 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 540 491 0,00643303496542936 0,00644885273380292 0,00648508430609598 0,00646982528419928 0,0016121669291783 0,00155134110119533 244100 281046 579 665 0 True 538 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 583 493 0,00623026654665011 0,00633540821612282 0,00617990386816205 0,00619516289005875 0,00170362640759846 0,00170630486875666 236406 276102 579 665 0 True 582 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 628 492 0,00585166359575557 0,00603344020385135 0,0059510185397116 0,00604257267109178 0,00172540648593159 0,00175866257258711 222040 262942 579 665 0 True 626 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 672 492 0,00613966116274537 0,00623027011336994 0,00601205462729839 0,00630197604333562 0,00180612584827322 0,00184585050874643 232968 271520 579 665 0 True 670 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 277 537 0,00650616758332803 0,00659398553605345 0,00656137941557946 0,00668345159075303 0,00147913687488267 0,00147609103032637 246875 287371 579 665 0 True 273 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 320 537 0,00647820588689902 0,00678262376013277 0,00645456626230259 0,0068055237659266 0,00144808722597829 0,00132299721416368 245814 295592 579 665 0 True 317 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 364 537 0,00671916139156482 0,00665935839828456 0,00679026474402991 0,00660715648126955 0,00143141807494347 0,00149860622452456 254957 290220 579 665 0 True 361 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 409 537 0,00646555592055979 0,0066663798429468 0,00648508430609598 0,00660715648126955 0,00160477988614016 0,00168135191196667 245334 290526 579 665 0 True 405 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 452 536 0,00658388581402468 0,00670329979216753 0,00666819256885634 0,00672922865644312 0,00180798854746275 0,00186188200536442 249824 292135 579 665 0 True 450 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 497 538 0,00653434011252936 0,00639676554627585 0,00648508430609598 0,00634775310902571 0,0018947423069585 0,0020021315830535 247944 278776 579 665 0 True 494 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 540 537 0,00646587216971827 0,00649513460923997 0,00648508430609598 0,00646982528419928 0,00165899005860332 0,00177614276751255 245346 283063 579 665 0 True 538 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 584 537 0,00641564126171291 0,00643024361085823 0,00643930724040589 0,00642404821850919 0,00168904058374675 0,00153755418652094 243440 280235 579 665 0 True 582 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 628 537 0,00623084633677399 0,00626519376950043 0,00619516289005875 0,00627145799954223 0,00164186715702245 0,00172810994763651 236428 273042 579 665 0 True 626 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 672 537 0,00636203702935043 0,00627643725931905 0,00643930724040589 0,00636301213092241 0,00178165794655862 0,00175260282502426 241406 273532 579 665 0 True 670 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 273 573 0,00665530541564825 0,00659882712044474 0,00663767452506294 0,00659189745937285 0,00132444136006029 0,00129194560185801 252534 287582 579 665 0 False 273 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 317 573 0,00646542415007709 0,00675905832330884 0,00653086137178607 0,0068207827878233 0,00137533401294256 0,00139225153439657 245329 294565 579 665 0 False 317 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 361 573 0,00657018168382384 0,00666050569316402 0,00656137941557946 0,00668345159075303 0,00134989574359263 0,00132947771837786 249304 290270 579 665 0 False 361 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 405 573 0,00628210505454441 0,00631214107596756 0,00624093995574884 0,00630197604333562 0,00149116073398096 0,0014519592866669 238373 275088 579 665 0 False 405 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 449 573 0,00635494777738115 0,00637024008866295 0,00646982528419928 0,0063782711528191 0,00178896427548373 0,00190102130053111 241137 277620 579 665 0 False 449 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 493 574 0,00652319232969291 0,00632033276140684 0,00653086137178607 0,00633249408712902 0,00184241547869955 0,00199200145555383 247521 275445 579 665 0 False 493 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 537 574 0,00638702071287041 0,00642893569469565 0,00642404821850919 0,0064087891966125 0,00182539620657251 0,0018182571109388 242354 280178 579 665 0 False 537 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 581 574 0,00617734752079767 0,00639970262116725 0,00614938582436866 0,00642404821850919 0,0016007850697233 0,00164049510918046 234398 278904 579 665 0 False 581 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 629 581 0,00624889889290394 0,00628731361477624 0,00624093995574884 0,00630197604333562 0,0014876175508387 0,00147469662364116 237113 274006 579 665 0 True 626 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 673 581 0,00616311630866603 0,00625629076123589 0,00622568093385214 0,00627145799954223 0,00153458647722992 0,00165220754256564 233858 272654 579 665 0 True 670 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 273 616 0,0069304421835265 0,006742858519611 0,00691233691920348 0,00668345159075303 0,00136503465859751 0,00135893136620465 262974 293859 579 665 0 False 273 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 317 616 0,00655386849806554 0,0065801032680121 0,00651560234988937 0,00656137941557946 0,00131770840114087 0,00140378121779781 248685 286766 579 665 0 False 317 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 361 616 0,00646621477297329 0,00640172186015508 0,00645456626230259 0,0064087891966125 0,00133820655519817 0,00143894760312453 245359 278992 579 665 0 False 361 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 405 617 0,00619679684404423 0,00610643110408202 0,00621042191195544 0,00608834973678187 0,00140013778562712 0,0013319454876273 235136 266123 579 665 0 False 405 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 449 617 0,00622934415327121 0,00608096115775821 0,00625619897764553 0,00605783169298848 0,00172491405322321 0,00190130070967679 236371 265013 579 665 0 False 449 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 493 617 0,00613267732716226 0,00632448596887045 0,00621042191195544 0,00628671702143893 0,00180532567544313 0,00183550620972162 232703 275626 579 665 0 False 493 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 537 617 0,00636372369152899 0,00639320893214955 0,0063782711528191 0,00634775310902571 0,00184444936402019 0,00179050012468048 241470 278621 579 665 0 False 537 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 581 617 0,00622417875034936 0,00614305275663409 0,00622568093385214 0,00608834973678187 0,00158024484085693 0,00168077037608582 236175 267719 579 665 0 False 581 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 625 617 0,0063249831696151 0,00611363611592497 0,00630197604333562 0,00607309071488518 0,00139650749718576 0,00136226444547183 240000 266437 579 665 0 False 625 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 669 617 0,00658944652839463 0,0065353817136111 0,00657663843747616 0,00650034332799268 0,00161837920474042 0,00156224755284034 250035 284817 579 665 0 False 669 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 274 666 0,00864082304897658 0,725159339181095 0,00814831769283589 0,735484855420768 0,00260072753610824 0,204720901427942 327874 31603006 579 665 13 True 273 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 317 660 0,00691795034176651 0,00664290618971324 0,00663767452506294 0,00669871061264973 0,00195407869091794 0,00122377945402215 262500 289503 579 665 0 False 317 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 361 660 0,00620077631262178 0,00632808847479192 0,00624093995574884 0,00628671702143893 0,00128775140604755 0,00130537752623302 235287 275783 579 665 0 False 361 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 405 660 0,00605754179792654 0,00602054460940633 0,00613412680247196 0,00607309071488518 0,00140003631392239 0,00126491610076735 229852 262380 579 665 0 False 405 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 449 660 0,00600317329676439 0,00588713716082378 0,00607309071488518 0,00590524147402152 0,00157415048499438 0,00147056792164418 227789 256566 579 665 0 False 449 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 493 660 0,00595259978550401 0,00619486459339009 0,00604257267109178 0,00614938582436866 0,00159946930836756 0,0015169844517694 225870 269977 579 665 0 False 493 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 537 660 0,00613301993041728 0,00621813173354535 0,00616464484626535 0,00622568093385214 0,0016260776068539 0,0016957871446409 232716 270991 579 665 0 False 537 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 581 660 0,00621416419366413 0,00614663231665798 0,00622568093385214 0,00613412680247196 0,00141773301921564 0,00116730439135514 235795 267875 579 665 0 False 581 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 625 660 0,00667588796504603 0,00656456889534433 0,00662241550316625 0,00662241550316625 0,00133733272527284 0,0013594659576256 253315 286089 579 665 0 False 625 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 670 665 0,00886190756485117 0,743116087311435 0,00837720302128634 0,752941176470588 0,00282037858764813 0,189969838928581 336263 32385575 579 665 14 True 669 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G7_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G7_3.csv new file mode 100755 index 0000000..f4a2c05 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G7_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 274 271 0,0010568519794496 0,0734358211849147 0,000946059357595178 0,0735332265201801 0,000745821987178135 0,0218053576998945 40102 3200390 579 665 0 True 274 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 318 271 0,000968328569171531 0,000920245222807534 0,000839246204318303 0,000823987182421607 0,000679538275349446 0,000657500155376915 36743 40105 579 665 0 False 318 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 363 270 0,0010454670097443 0,000912145320958611 0,000961318379491875 0,000793469138628214 0,000703395755936776 0,000660569162780306 39670 39752 579 665 0 True 362 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 407 270 0,000944478111802774 0,000909414759145518 0,00080872816052491 0,000793469138628214 0,000696085387382108 0,000642975531084735 35838 39633 579 665 0 True 406 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 452 271 0,000933620224028268 0,000883118760508504 0,000656137941557946 0,000610360875867857 0,00085602517082013 0,000884288031362672 35426 38487 579 665 0 True 450 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 495 270 0,00081270762910246 0,000923962458216955 0,000625619897764553 0,000717174029144732 0,000761909824407583 0,000788761959116042 30838 40267 579 665 0 True 494 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 540 271 0,000932566060166666 0,000903494717567551 0,000747692072938125 0,000732433051041428 0,00078698008525552 0,000759421314003939 35386 39375 579 665 0 True 538 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 584 271 0,000952647881730194 0,00091076856710327 0,000671396963454643 0,000595101853971161 0,000881363400893677 0,000914938583161503 36148 39692 579 665 0 True 582 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 626 272 0,0010059358649342 0,000984241331183303 0,000656137941557946 0,000656137941557946 0,000971717939510743 0,000965598504176451 38170 42894 579 665 0 False 626 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 669 270 0,00112271086670322 0,0739297545764159 0,000793469138628214 0,07348744945449 0,001006883258352 0,022176517472747 42601 3221916 579 665 0 True 670 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 274 314 0,000973678450769164 0,000962006756419545 0,000839246204318303 0,000793469138628214 0,000734711634749596 0,000743154131115012 36946 41925 579 665 0 False 274 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 318 314 0,000917175267787269 0,000914394018922334 0,000793469138628214 0,000762951094834821 0,000644335588335919 0,000639899211584297 34802 39850 579 665 0 False 318 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 365 316 0,000903813740841457 0,000892870766983836 0,00080872816052491 0,00080872816052491 0,000647927834254922 0,00060302112933932 34295 38912 579 665 0 True 362 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 408 315 0,000873269342951524 0,000933622681101931 0,000686655985351339 0,000778210116731518 0,000741933700854868 0,000724924780815648 33136 40688 579 665 0 True 406 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 452 315 0,000874797880550848 0,000900305237802678 0,000579842832074464 0,000625619897764553 0,000852906482504064 0,000889232338802054 33194 39236 579 665 0 True 450 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 496 316 0,000851764400174833 0,000901796721145964 0,000564583810177768 0,000732433051041428 0,000875900748258084 0,0007706204078506 32320 39301 579 665 0 True 494 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 538 315 0,000889239925454803 0,00101386448497072 0,000732433051041428 0,000854505226215 0,000771765117219132 0,000857099937414765 33742 44185 579 665 0 False 538 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 583 315 0,000972439808231781 0,000943971280914578 0,000686655985351339 0,000579842832074464 0,000964183241049898 0,000991048456583683 36899 41139 579 665 0 True 582 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 626 315 0,000840853804207247 0,000920359952295479 0,000366216525520714 0,000610360875867857 0,000989053901055118 0,000987194493459513 31906 40110 579 665 0 False 626 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 670 315 0,00102604404059427 0,000879149120225604 0,000701915007248035 0,000488288700694286 0,000988561313596121 0,000962686592928835 38933 38314 579 665 0 False 670 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 275 360 0,000870818411973299 0,000921002437427971 0,000732433051041428 0,000762951094834821 0,00071529207450394 0,000755947254313202 33043 40138 579 665 0 True 274 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 320 360 0,000964718057945543 0,000861870859341074 0,000839246204318303 0,000686655985351339 0,000720453855022701 0,000708005672010592 36606 37561 579 665 0 True 318 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 364 360 0,000960712235271453 0,000909873677097298 0,000823987182421607 0,000778210116731518 0,000721326818354517 0,000692407698926727 36454 39653 579 665 0 True 362 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 409 361 0,000924870663976968 0,000970611468015426 0,000732433051041428 0,000793469138628214 0,000782359016340783 0,000757413969710061 35094 42300 579 665 0 True 406 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 453 360 0,000909374455211411 0,000954916474064539 0,000625619897764553 0,000656137941557946 0,000890426502914645 0,000869000044634239 34506 41616 579 665 0 True 450 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 496 360 0,00085888000624065 0,000863821260636141 0,000564583810177768 0,000595101853971161 0,000863813155481475 0,000861776031627474 32590 37646 579 665 0 True 494 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 538 358 0,00095944723863753 0,000943535308860386 0,000778210116731518 0,000671396963454643 0,000828966311604478 0,000895162623487615 36406 41120 579 665 0 False 538 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 584 360 0,00103144663038498 0,000883990704616887 0,000778210116731518 0,000335698481727321 0,000970023594642339 0,00105051691613085 39138 38525 579 665 0 True 582 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 628 360 0,000912484238603138 0,000940712963456937 0,000564583810177768 0,000564583810177768 0,000976621205841764 0,000988288707779864 34624 40997 579 665 0 True 626 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 673 360 0,000933567515835188 0,000840806525354356 0,000549324788281071 0,000381475547417411 0,000954104373392838 0,000966112325420959 35424 36643 579 665 0 True 670 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 277 405 0,000935833968137634 0,000862995208322936 0,000823987182421607 0,000701915007248035 0,00076438025482311 0,00077029517986843 35510 37610 579 665 0 True 274 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 320 404 0,000835082257064973 0,000879630984074973 0,000717174029144732 0,000778210116731518 0,000676973120038941 0,00063171368374242 31687 38335 579 665 0 True 318 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 364 404 0,000880174116245021 0,000980271690900403 0,000778210116731518 0,000854505226215 0,000652250080738615 0,000715424350154501 33398 42721 579 665 0 True 362 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 408 404 0,000940709475997545 0,000931901738782755 0,00080872816052491 0,000732433051041428 0,000779873511563941 0,000765783449996661 35695 40613 579 665 0 True 406 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 452 404 0,000894405328376655 0,000949019378384161 0,000671396963454643 0,000732433051041428 0,000794597283354936 0,000837153218192418 33938 41359 579 665 0 True 450 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 497 405 0,000905447694826941 0,000856157330841409 0,000610360875867857 0,000579842832074464 0,000901042365159813 0,000845885766312863 34357 37312 579 665 0 True 494 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 541 404 0,000876985270563673 0,000871714649406763 0,000610360875867857 0,000717174029144732 0,000811342273560356 0,00074578305077375 33277 37990 579 665 0 True 538 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 585 405 0,000916068395732587 0,000836768047378689 0,000549324788281071 0,000396734569314107 0,000954078104298393 0,00101036418287494 34760 36467 579 665 0 True 582 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 629 404 0,000907345189777826 0,000828714037324944 0,000595101853971161 0,000442511635004196 0,000966941491033572 0,000926036309446164 34429 36116 579 665 0 True 626 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 673 405 0,000919309949607014 0,000872632485310323 0,000625619897764553 0,000457770656900893 0,000896189596621369 0,000962171097675726 34883 38030 579 665 0 True 670 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 277 449 0,000844358899047075 0,000901819667043553 0,000671396963454643 0,000732433051041428 0,000781964528194107 0,000795763555035737 32039 39302 579 665 0 True 274 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 321 449 0,00091343298607858 0,000940896530637649 0,000762951094834821 0,000839246204318303 0,00075405237875985 0,000795030322585311 34660 41005 579 665 0 True 318 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 365 449 0,000860092294681493 0,000904756741934947 0,000701915007248035 0,000778210116731518 0,000734295886851331 0,000723139760471629 32636 39430 579 665 0 True 362 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 409 449 0,000964032851435501 0,000918799631259426 0,000762951094834821 0,000686655985351339 0,000869304010872858 0,000843595215146386 36580 40042 579 665 0 True 406 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 453 448 0,000905579465309642 0,000986558866839794 0,000564583810177768 0,000656137941557946 0,000962836561862861 0,0010459569598992 34362 42995 579 665 0 True 450 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 498 450 0,000945664046147077 0,000928849934403415 0,000701915007248035 0,000595101853971161 0,000879480324000348 0,000935068480706485 35883 40480 579 665 0 True 494 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 542 450 0,000924422644335787 0,0009499831060829 0,000656137941557946 0,000686655985351339 0,000874317564887881 0,000927989173246331 35077 41401 579 665 0 True 538 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 585 449 0,000887395138696998 0,000843881275631285 0,000534065766384375 0,0004272526131075 0,000933341336006293 0,000969392684117617 33672 36777 579 665 0 True 582 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 629 448 0,000884311709401811 0,000835781373782362 0,000473029678797589 0,000457770656900893 0,000920206345515324 0,000904096786024862 33555 36424 579 665 0 True 626 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 674 449 0,000864888740251784 0,000855767250582396 0,000473029678797589 0,000442511635004196 0,000935488821679514 0,000949783779092374 32818 37295 579 665 0 True 670 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 277 493 0,000895591262720958 0,000983530008358043 0,000747692072938125 0,000854505226215 0,000769859190801469 0,000823281281241496 33983 42863 579 665 0 True 273 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 320 493 0,000937546984412738 0,000871990000177831 0,000839246204318303 0,000732433051041428 0,000764368895962058 0,000745603385430616 35575 38002 579 665 0 True 318 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 364 493 0,000903023117945255 0,000958840222552261 0,000732433051041428 0,000839246204318303 0,000790634893374078 0,000800668945640257 34265 41787 579 665 0 True 362 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 409 493 0,000840985574689947 0,000964094833100146 0,000595101853971161 0,000701915007248035 0,000824341050903779 0,00088640230894668 31911 42016 579 665 0 True 406 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 453 493 0,000865573946761826 0,000925568671048186 0,000518806744487678 0,000488288700694286 0,000922352959868224 0,00104148409748108 32844 40337 579 665 0 True 450 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 496 493 0,000853820019704958 0,000898882592152159 0,000564583810177768 0,000534065766384375 0,000854642358275502 0,000932793442480227 32398 39174 579 665 0 True 494 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 540 491 0,000903523845779517 0,000881191305111027 0,000595101853971161 0,000701915007248035 0,000882139812677631 0,000809305079065852 34284 38403 579 665 0 True 538 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 583 493 0,000886551807607716 0,00091333850763324 0,000564583810177768 0,000488288700694286 0,000908052075533796 0,00100087250738201 33640 39804 579 665 0 True 582 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 628 492 0,000978817499594476 0,000890025475682798 0,000595101853971161 0,000503547722590982 0,00098745348392897 0,000956210736734163 37141 38788 579 665 0 True 626 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 672 492 0,000841407240234588 0,000912558347115213 0,000473029678797589 0,000549324788281071 0,000889533410984801 0,000956622228248542 31927 39770 579 665 0 True 670 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 277 537 0,000939312708880922 0,000984470790159193 0,000793469138628214 0,000869764248111696 0,000742917983932625 0,000759845713841821 35642 42904 579 665 0 True 273 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 320 537 0,000937019902481936 0,00090377006833862 0,000793469138628214 0,000793469138628214 0,000736225307983598 0,00072639134949422 35555 39387 579 665 0 True 317 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 364 537 0,000902206140952513 0,0010072331205675 0,000747692072938125 0,000885023270008392 0,000734563480434371 0,000804099095274754 34234 43896 579 665 0 True 361 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 409 537 0,000902258849145594 0,000851269854654948 0,00064087891966125 0,000656137941557946 0,000848553719329164 0,000760282662953751 34236 37099 579 665 0 True 405 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 452 536 0,000857193344062086 0,000919488008187096 0,000473029678797589 0,000503547722590982 0,000933328414636725 0,00104556708356201 32526 40072 579 665 0 True 450 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 497 538 0,000897963131409563 0,000906362954766178 0,000518806744487678 0,000488288700694286 0,000952864129482791 0,00106484182690955 34073 39500 579 665 0 True 494 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 540 537 0,000876300064053632 0,00083814480123403 0,000549324788281071 0,0004272526131075 0,000889857805034492 0,00090393795592935 33251 36527 579 665 0 True 538 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 584 537 0,000874903296937008 0,000840783579456767 0,000579842832074464 0,000595101853971161 0,000813010137281196 0,000808386335035664 33198 36642 579 665 0 True 582 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 628 537 0,000935702197654934 0,000785415128574469 0,000625619897764553 0,000366216525520714 0,000920853001417723 0,000929186844124642 35505 34229 579 665 0 True 626 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 672 537 0,000845360354715598 0,000869924869394819 0,000518806744487678 0,0004272526131075 0,00089373968517061 0,00098275521208323 32077 37912 579 665 0 True 670 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 273 573 0,00095114569822741 0,00084982426310684 0,000793469138628214 0,000717174029144732 0,000725816470953889 0,000636823628471877 36091 37036 579 665 0 False 273 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 317 573 0,000924738893494267 0,000899708644465363 0,000793469138628214 0,000732433051041428 0,0007308029479942 0,000744558086712405 35089 39210 579 665 0 False 317 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 361 573 0,000880595781789662 0,000953883908673033 0,000747692072938125 0,00080872816052491 0,000692673564668498 0,00071566610460845 33414 41571 579 665 0 False 361 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 405 573 0,000860461252033054 0,000919097927928083 0,00064087891966125 0,000732433051041428 0,000757720266698337 0,000758871622004671 32650 40055 579 665 0 False 405 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 449 573 0,000962846917091198 0,000944086010402523 0,000549324788281071 0,000457770656900893 0,00101825846419687 0,00108950821981605 36535 41144 579 665 0 False 449 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 493 574 0,00087993692937616 0,000855010035961958 0,000473029678797589 0,000274662394140536 0,000967361177933414 0,00104909567129493 33389 37262 579 665 0 False 493 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 537 574 0,00079199330922197 0,000928804042608237 0,000366216525520714 0,000534065766384375 0,000915027392884626 0,000963049530685834 30052 40478 579 665 0 False 537 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 581 574 0,000845782020260239 0,000929813662102154 0,000549324788281071 0,000701915007248035 0,000811743012715707 0,000843232082907151 32093 40522 579 665 0 False 581 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 629 581 0,000832341431024807 0,000839475663294193 0,00064087891966125 0,000610360875867857 0,000740134473627614 0,00075446250148279 31583 36585 579 665 0 True 626 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 673 581 0,000867445087616171 0,000915403638416251 0,000595101853971161 0,000595101853971161 0,000805306731325431 0,000875460121671863 32915 39894 579 665 0 True 670 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 273 616 0,000933857410897129 0,000960652948461793 0,000762951094834821 0,000839246204318303 0,000774051532070962 0,000721590632035781 35435 41866 579 665 0 False 273 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 317 616 0,000970674083763597 0,000958610763576371 0,000869764248111696 0,000915541313801785 0,00071761640048945 0,000645411386958076 36832 41777 579 665 0 False 317 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 361 616 0,00087972609660384 0,000960056355124479 0,000762951094834821 0,000854505226215 0,000693019482316616 0,000727759273503005 33381 41840 579 665 0 False 361 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 405 617 0,000847969410273064 0,000887753831821485 0,000686655985351339 0,000762951094834821 0,00069556120212051 0,000686478693998711 32176 38689 579 665 0 False 405 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 449 617 0,000907239773391665 0,000816369144422053 0,000534065766384375 0,000366216525520714 0,000969733811303418 0,000945698862455093 34425 35578 579 665 0 False 449 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 493 617 0,000897225216706442 0,000822564536771088 0,000457770656900893 0,0004272526131075 0,00101484344553901 0,000939309208253366 34045 35848 579 665 0 False 493 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 537 617 0,000864967802541405 0,000887203130279349 0,0004272526131075 0,000488288700694286 0,000962775491486116 0,000984187555515907 32821 38665 579 665 0 False 537 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 581 617 0,000911403720644995 0,000805951706916639 0,00064087891966125 0,000579842832074464 0,000851373332863724 0,000771481270119397 34583 35124 579 665 0 False 581 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 625 617 0,000849893259320489 0,000886354132068556 0,000671396963454643 0,000717174029144732 0,000720478929944483 0,000737813923166801 32249 38628 579 665 0 False 625 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 669 617 0,000840537555048766 0,000908290410163656 0,000671396963454643 0,000686655985351339 0,000746393639080244 0,000782832996028859 31894 39584 579 665 0 False 669 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 274 666 0,0010973055176386 0,0725753959171217 0,000946059357595178 0,0719005111772335 0,000762212429291984 0,0227433407140951 41637 3162892 579 665 0 True 273 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 317 660 0,00102077322128626 0,000898125377531721 0,000915541313801785 0,000747692072938125 0,000725749737063413 0,000665094999097452 38733 39141 579 665 0 False 317 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 361 660 0,000942053534921089 0,000942617472956826 0,000823987182421607 0,00080872816052491 0,000675829613743306 0,000633810896205513 35746 41080 579 665 0 False 361 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 405 660 0,000766008170033468 0,000979468584484787 0,000595101853971161 0,000793469138628214 0,000652996046730368 0,000750130459701026 29066 42686 579 665 0 False 405 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 449 660 0,000809782324386513 0,000823482372674648 0,000595101853971161 0,000595101853971161 0,000759200976748875 0,000805987385155423 30727 35888 579 665 0 False 449 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 493 660 0,000872373303669162 0,000869167654774382 0,000625619897764553 0,000610360875867857 0,000822375584014047 0,000835197959196752 33102 37879 579 665 0 False 493 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 537 660 0,000830206749205062 0,000884449622568667 0,000503547722590982 0,000534065766384375 0,000840600863146939 0,000904088526888411 31502 38545 579 665 0 False 537 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 581 660 0,000929456276774939 0,000892503632622412 0,000778210116731518 0,000762951094834821 0,000748976809150618 0,000667343166999371 35268 38896 579 665 0 False 581 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 625 660 0,000845913790742939 0,000820063433933885 0,000686655985351339 0,000656137941557946 0,000687471145862897 0,000680244551187455 32098 35739 579 665 0 False 625 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 670 665 0,00106075238573753 0,0750120207820995 0,000885023270008392 0,0737315938048371 0,000792242368539457 0,0222279479464961 40250 3269082 579 665 0 True 669 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G8_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G8_1.csv new file mode 100755 index 0000000..389d0e0 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G8_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 246 248 0,0105569767002115 0,0433279582568231 0,0106813153276875 0,0440680552376593 0,00160867587077535 0,00863427800849397 400582 1888266 579 665 0 True 246 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 290 249 0,0103092218386383 0,010428313860871 0,01025406271458 0,010452429999237 0,00137450604065959 0,00136007492958444 391181 454474 579 665 0 False 290 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 334 248 0,010718474603809 0,0576519807185623 0,0107423514152743 0,0581673914702068 0,00131918580286119 0,0098418224796576 406710 2512518 579 665 0 True 334 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 378 248 0,0107390044450137 0,0838460077866904 0,0107728694590677 0,0820477607385367 0,00129972418914066 0,0128310029854094 407489 3654074 579 665 0 True 378 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 422 247 0,0107546324242619 0,0632380677030181 0,0108186465247578 0,0633859769588769 0,0015643636733026 0,0112612532607713 408082 2755964 579 665 0 True 422 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 466 248 0,0105454336059269 0,0565505776342894 0,0104829480430304 0,058655680170901 0,00169130856435918 0,0139346789686234 400144 2464518 579 665 0 True 466 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 510 248 0,0106302410885929 0,0733879101507488 0,0105592431525139 0,0732433051041428 0,00162106321126663 0,0181359976782426 403362 3198302 579 665 0 True 510 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 555 248 0,0106672158860386 0,0621383396692693 0,0106202792401007 0,0610818646524758 0,00163698966024919 0,0148697051986974 404765 2708037 579 665 0 True 554 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 599 250 0,0107048495358978 0,0107384506126841 0,0107728694590677 0,0107423514152743 0,00198824626561859 0,00203848613904638 406193 467990 579 665 0 False 599 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 642 249 0,0110507997611792 0,0442746830454484 0,0110475318532082 0,0442969405661097 0,00183001381560284 0,00816471188114928 419320 1929525 579 665 0 True 643 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 245 292 0,0104721955716421 0,0104999738990415 0,0105897611963073 0,0104676890211337 0,00162233596681313 0,00176133077069125 397365 457597 579 665 0 False 245 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 290 292 0,0103786385289249 0,0103177375803895 0,0104371709773404 0,0103150988021668 0,00138903810740382 0,00132763645819168 393815 449655 579 665 0 False 290 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 335 291 0,0107935047166585 0,0948684597738338 0,0107270923933776 0,0953536278324559 0,00138002000015542 0,0214510818738004 409557 4134441 579 665 0 True 334 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 379 294 0,0106286598428004 0,0465585800160736 0,0106507972838941 0,0464179446097505 0,00133289310978069 0,00670941715871203 403302 2029059 579 665 0 True 378 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 422 292 0,010742483185757 0,0695150327179817 0,0106355382619974 0,0690165560387579 0,00162534591335309 0,0122540008258516 407621 3029519 579 665 0 True 422 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 467 293 0,0105525228578962 0,0377731924225762 0,0106660563057908 0,0385748073548486 0,001832801063049 0,00651748231197143 400413 1646185 579 665 0 True 466 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 510 293 0,0107052184932493 0,0395941329634455 0,0107118333714809 0,0414892805371176 0,00166856037473971 0,00703672781075209 406207 1725543 579 665 0 True 510 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 555 293 0,0107743716425705 0,0477184033556081 0,0107728694590677 0,0491035324635691 0,00190900365989057 0,00899211805261597 408831 2079605 579 665 0 True 554 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 598 293 0,0109980652140025 0,0107800285791154 0,0110475318532082 0,0108339055466545 0,00210689055462415 0,00202476134371508 417319 469802 579 665 0 False 598 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 643 293 0,0106303992131721 0,0105769114936575 0,0106355382619974 0,0105897611963073 0,00192240450747267 0,00195057100094095 403368 460950 579 665 0 False 643 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 247 338 0,0105684934403995 0,0520163994330069 0,0104982070649271 0,0511024643320363 0,00147345844729183 0,00994155580157129 401019 2266915 579 665 0 True 245 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 291 337 0,0105989324219033 0,0589314669140234 0,0106202792401007 0,0615091172655833 0,00135417214343745 0,0147072828708292 402174 2568279 579 665 0 True 290 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 334 336 0,0107373441369317 0,0393370012350629 0,0107118333714809 0,0398718242160677 0,00144505769510516 0,00892054783858703 407426 1714337 579 665 0 True 334 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 378 337 0,0106197258040734 0,0330811005540861 0,0105745021744106 0,0337682154573892 0,00132989063385381 0,00425647241604399 402963 1441700 579 665 0 True 378 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 423 336 0,0107507056638775 0,0643548674845732 0,0108033875028611 0,0630045014114595 0,00165821059915194 0,0119144174572834 407933 2804635 579 665 0 True 422 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 466 336 0,0106295031738897 0,0302689201832689 0,0107881284809644 0,0311436636911574 0,00177176150043906 0,00435714614314276 403334 1319143 579 665 0 False 466 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 510 336 0,0113521061469217 0,0300861331630748 0,0110322728313115 0,0298161287861448 0,0028648574913425 0,00477635960700616 430753 1311177 579 665 0 False 510 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 555 336 0,0116952364838733 0,0487938546297077 0,0111848630502785 0,049408712901503 0,00307713341807923 0,0073607122315276 443773 2126474 579 665 0 True 554 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 599 336 0,0106763080493449 0,0555347856939212 0,0105592431525139 0,0558785381857023 0,0020168105859203 0,012633386551769 405110 2420249 579 665 0 True 598 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 643 335 0,0107751622654667 0,0684783141190123 0,0106813153276875 0,0679026474402991 0,00196441936595344 0,0198660543637642 408861 2984338 579 665 0 True 642 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 246 381 0,0106650284960257 0,0445362662779632 0,010757610437171 0,047196154726482 0,00156398181660965 0,00980910924450664 404682 1940925 579 665 0 True 245 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 290 382 0,0105174982635945 0,0321347658457198 0,0104676890211337 0,0323491264209964 0,00143370652479359 0,00399892149309631 399084 1400458 579 665 0 True 289 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 334 381 0,0109332077824174 0,0824950910120345 0,010955977721828 0,0813916227969787 0,00151479631021622 0,0170131343051707 414858 3595200 579 665 0 True 334 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 379 380 0,0108219671409218 0,06259734940464 0,0108033875028611 0,0618142977035172 0,00137814684215898 0,0145396150223853 410637 2728041 579 665 0 True 378 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 422 381 0,0107911064938734 0,0399204236271613 0,0108033875028611 0,0407415884641794 0,00161428013778821 0,00652131442915219 409466 1739763 579 665 0 True 422 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 467 381 0,0108093962368722 0,0501345375340388 0,0106965743495842 0,0500343327992676 0,00172518383770296 0,0090854608409292 410160 2184902 579 665 0 True 466 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 511 381 0,0108076568665006 0,0397682923261461 0,010757610437171 0,0404058899824521 0,00172891944538561 0,00454808757093584 410094 1733133 579 665 0 True 510 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 555 380 0,0106156936273027 0,0498303667155988 0,0106355382619974 0,0493781948577096 0,00176570365855229 0,00867657462058103 402810 2171646 579 665 0 True 554 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 599 381 0,0105755299841757 0,041294905838641 0,0106813153276875 0,0421606775005722 0,00216236511667107 0,00730125841340825 401286 1799664 579 665 0 True 598 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 643 381 0,0106596786144281 0,0871851865874345 0,0105592431525139 0,0857099259937438 0,00205412681548521 0,0171793676466259 404479 3799598 579 665 0 True 642 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 247 424 0,010628343593642 0,043603492595072 0,0106813153276875 0,0439002059967956 0,00153319647262136 0,00650490522045959 403290 1900274 579 665 0 True 245 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 291 425 0,0106884309337533 0,0555906589545505 0,0106965743495842 0,0549935149156939 0,00155349296315327 0,00763007725706496 405570 2422684 579 665 0 True 289 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 335 425 0,0107537363849796 0,0347829289405707 0,0108186465247578 0,0350194552529183 0,0014227100430365 0,0042500595016574 408048 1515867 579 665 0 True 333 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 379 424 0,0108056803092601 0,0515503223611787 0,0108033875028611 0,0511329823758297 0,00145294810962506 0,0104194785388076 410019 2246603 579 665 0 True 378 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 424 424 0,0112543060946615 0,0861481238000013 0,0112153810940719 0,0853894865339132 0,00203702380217601 0,0102147405948287 427042 3754402 579 665 0 True 422 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 467 425 0,0112019141507399 0,0569427459699833 0,0112153810940719 0,0570382238498512 0,00222021370155012 0,0114316149400986 425054 2481609 579 665 0 True 466 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 511 425 0,0106627356896268 0,0514687496952498 0,0106507972838941 0,0502784771496147 0,00176978395425664 0,00902158029797319 404595 2243048 579 665 0 True 510 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 556 425 0,010742825789012 0,0311327184980074 0,0106965743495842 0,0305638208590829 0,00177813031158157 0,00540908676239061 407634 1356788 579 665 0 True 554 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 599 425 0,0107001848608102 0,0397551902186228 0,0107118333714809 0,0396429388876173 0,00193596636288082 0,00611844974855763 406016 1732562 579 665 0 True 598 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 642 424 0,010470482555367 0,074393766517461 0,0105439841306172 0,0711528191042954 0,00197891047838434 0,0133910295685189 397300 3242138 579 665 0 True 642 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 246 470 0,0106613916307032 0,0498676079073858 0,0105439841306172 0,0503089951934081 0,00150686927109495 0,0121661214120271 404544 2173269 579 665 0 True 245 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 290 469 0,0108291091010842 0,0523268803732839 0,010757610437171 0,0529335469596399 0,00167212020590177 0,00830675064852297 410908 2280446 579 665 0 True 289 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 334 468 0,0110610778588298 0,0657342142263418 0,0110627908751049 0,0649118791485466 0,00166389316039446 0,0180977740547823 419710 2864748 579 665 0 True 333 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 379 469 0,0112323794863402 0,0850656281353418 0,0112916762035554 0,0826581216144045 0,00162469006735752 0,0188866926883633 426210 3707226 579 665 0 True 377 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 423 468 0,0112041806030423 0,089945761634574 0,0110627908751049 0,0867475394827192 0,00193963748537449 0,0283655267893625 425140 3919906 579 665 0 True 422 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 467 469 0,0112765225980448 0,045524890275586 0,0111390859845884 0,0463874265659571 0,00226671436376921 0,0073777883779431 427885 1984010 579 665 0 True 466 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 511 468 0,0109904488801024 0,0376527723520291 0,0109712367437247 0,0382848859388113 0,00189494044621316 0,00465387722600678 417030 1640937 579 665 0 True 510 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 554 469 0,0110184896388211 0,0915350174474869 0,0108796826123445 0,0878461890592813 0,00195634152065329 0,0155453553060692 418094 3989167 579 665 0 True 554 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 599 468 0,0105406108062601 0,0600907395520158 0,0105745021744106 0,0616922255283436 0,00192738610309369 0,014961884052238 399961 2618801 579 665 0 True 598 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 643 469 0,0106367769045348 0,073343624568402 0,010605020218204 0,0724650949874113 0,00189224933187119 0,0113533693847347 403610 3196372 579 665 0 True 642 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 246 513 0,0104368547281819 0,0480058695606033 0,010406652933547 0,0511329823758297 0,00153037763489384 0,0118145471444556 396024 2092133 579 665 0 True 245 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 291 513 0,010882634271157 0,0939121436000163 0,0107728694590677 0,0889143205920501 0,00174683454514812 0,0240056044908512 412939 4092764 579 665 0 True 289 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 335 513 0,0110117166360103 0,0551843330000442 0,0109712367437247 0,0557869840543221 0,00165261946556593 0,0125716110238916 417837 2404976 579 665 0 True 333 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 379 513 0,0112281101227007 0,0532681899300781 0,0111543450064851 0,0536659800106813 0,00164655015028774 0,00615500192493016 426048 2321469 579 665 0 True 377 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 423 513 0,0110843485260747 0,0549685727250146 0,0111390859845884 0,0556496528572518 0,00198255515300971 0,00798952096297629 420593 2395573 579 665 0 True 422 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 467 513 0,0112297177225897 0,0582686976080623 0,0111390859845884 0,0578927290760662 0,00192881907859653 0,0120732415012265 426109 2539395 579 665 0 True 466 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 511 513 0,0109481505551556 0,0680018425555764 0,0109102006561379 0,0679179064621958 0,00174593653423478 0,016667544739678 415425 2963573 579 665 0 True 510 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 555 513 0,0106911190516004 0,0564345172842842 0,0106355382619974 0,0563668268863966 0,00178651653807231 0,0139841145538547 405672 2459460 579 665 0 True 554 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 599 513 0,010664896725543 0,0429968030628184 0,0106355382619974 0,0422980086976425 0,00176938627586724 0,00733891708620478 404677 1873834 579 665 0 True 598 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 643 512 0,0106080245852096 0,0648884513871082 0,0107270923933776 0,0639047837033646 0,00199309431686248 0,0178532286089832 402519 2827889 579 665 0 True 642 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 247 558 0,0101920778795178 0,0432678858969351 0,0102082856488899 0,0432593270771344 0,00140764042391705 0,00883646207941508 386736 1885648 579 665 0 True 245 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 290 557 0,0105455917305062 0,049144743295639 0,0104982070649271 0,0502937361715114 0,0015093647957074 0,0113168711473456 400150 2141766 579 665 0 True 289 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 335 557 0,0108077622828867 0,0479279223464934 0,0108491645685512 0,0481727321278706 0,00145026930551782 0,00879126213268903 410098 2088736 579 665 0 True 333 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 379 557 0,010875703143767 0,0474213457654206 0,0108339055466545 0,0467689021133745 0,00156160974912517 0,00602876920246037 412676 2066659 579 665 0 True 377 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 424 556 0,0108753078323189 0,0852794839008714 0,0108491645685512 0,0820782787823301 0,00182540576512646 0,018494422340429 412661 3716546 579 665 0 True 421 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 467 557 0,0109212430225882 0,0601305047925375 0,010955977721828 0,0594949263752193 0,00210611125319468 0,0110611869791877 414404 2620534 579 665 0 True 466 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 512 557 0,0106657664107289 0,0545784695201038 0,0105592431525139 0,0536354619668879 0,00213057305427309 0,00832934872308749 404710 2378572 579 665 0 True 510 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 554 552 0,0106695086924375 0,0342818823208169 0,0105897611963073 0,0368657969024186 0,00190196856953325 0,0106776302782127 404852 1494031 579 665 0 False 554 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 599 557 0,0105338114493528 0,0464323546334364 0,0106965743495842 0,0467078660257877 0,00173391835645327 0,00674584371053252 399703 2023558 579 665 0 True 598 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 643 555 0,0105246665778534 0,0508952169850123 0,0105592431525139 0,0494697489890898 0,0019125296506048 0,00828470430988678 399356 2218053 579 665 0 True 642 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 245 595 0,0102737228705989 0,00999355793925188 0,0100709544518196 0,0100251773861295 0,00175329797485653 0,00132993434592674 389834 435527 579 665 0 False 245 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 289 595 0,0103323870894971 0,0100805228911143 0,0103608758678569 0,0101167315175097 0,00140417039366954 0,00136106358278394 392060 439317 579 665 0 False 289 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 335 601 0,0108243390096104 0,0722559201849898 0,010757610437171 0,0707408255130846 0,00164765362131876 0,0118038577209469 410727 3148969 579 665 0 True 333 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 380 601 0,0106136380077726 0,0715058876304976 0,0105745021744106 0,0680247196154726 0,00148093961113323 0,0185692403301242 402732 3116282 579 665 0 True 377 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 421 595 0,0108782858452279 0,010497151553638 0,0108949416342412 0,010452429999237 0,00189241604133175 0,00176042632342497 412774 457474 579 665 0 False 421 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 465 595 0,0104617857035088 0,0105389819249428 0,0105287251087205 0,0105134660868238 0,00203157044196875 0,00184092107151246 396970 459297 579 665 0 False 465 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 510 595 0,0102956494789202 0,010284213624012 0,0102693217364767 0,0103150988021668 0,00202885976584213 0,00205055278155376 390666 448194 579 665 0 False 510 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 554 596 0,00997534178957229 0,0101698742163259 0,00991836423285267 0,010101472495613 0,001884956082286 0,00177112388315864 378512 443211 579 665 0 False 554 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 598 596 0,0102512164721537 0,010381137095428 0,0102845807583734 0,0103150988021668 0,00160944895354366 0,00161671761216691 388980 452418 579 665 0 False 598 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 642 596 0,0104401226361528 0,0104008017296618 0,0105745021744106 0,0104219119554437 0,0015216755078577 0,00154315238095593 396148 453275 579 665 0 False 642 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 246 644 0,0100726938221913 0,0409017737752484 0,0100862134737163 0,0419470511940185 0,0012827480064391 0,0092117817874178 382206 1782531 579 665 0 True 245 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 289 638 0,0101740780315809 0,00998325523123441 0,0101930266269932 0,00997940032043946 0,0013741931078918 0,0012868552903928 386053 435078 579 665 0 False 289 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 333 638 0,010793478362562 0,0101683368411874 0,0103761348897536 0,0101777676050965 0,00270389811994272 0,00128621946836284 409556 443144 579 665 0 False 333 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 377 638 0,0104454461636539 0,010382307336205 0,0101472495613031 0,010406652933547 0,00252178946981058 0,00128429033828572 396350 452469 579 665 0 False 377 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 421 639 0,0102839482600564 0,0101070483487272 0,0102082856488899 0,0101472495613031 0,00153820855149924 0,00152766871308017 390222 440473 579 665 0 False 421 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 465 639 0,010309300900928 0,0101581259167603 0,0103456168459602 0,0101167315175097 0,00165993045431685 0,00170136405520862 391184 442699 579 665 0 False 465 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 509 639 0,010101762390675 0,00998084591198757 0,0101167315175097 0,00994888227664607 0,00179545410524107 0,00174086900957933 383309 434973 579 665 0 False 509 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 554 639 0,0100811798412772 0,0100156318927325 0,0100556954299229 0,00988784618905928 0,0016956875866067 0,00173956812428452 382528 436489 579 665 0 False 554 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 598 639 0,0100116577346045 0,010230612007244 0,0100404364080262 0,0101625085831998 0,00143184229719733 0,0013397001433416 379890 445858 579 665 0 False 598 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 643 645 0,0104097100087456 0,0431017117065954 0,0104371709773404 0,0436255436026551 0,00144592694997082 0,00794373699417119 394994 1878406 579 665 0 True 642 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G8_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G8_2.csv new file mode 100755 index 0000000..a8eff8d --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G8_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 246 248 0,00865768967076222 0,645251214555042 0,00827038986800946 0,645609216449226 0,00268193342680988 0,192580180997683 328514 28120548 579 665 1 True 246 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 290 249 0,00695837752585897 0,00688475595030148 0,0068207827878233 0,00683604180972 0,00150577937290177 0,00129606444067225 264034 300043 579 665 0 False 290 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 334 248 0,0065366065648318 0,00659205808065598 0,00650034332799268 0,00659189745937285 0,0012920790786819 0,00118514735969455 248030 287287 579 665 0 True 334 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 378 248 0,00655869129773238 0,00654983762909219 0,00653086137178607 0,00662241550316625 0,00127336387460354 0,00122299766089439 248868 285447 579 665 0 True 378 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 422 247 0,0066698792310349 0,00665018003924896 0,00665293354695964 0,00668345159075303 0,00143037218071102 0,00133592732556244 253087 289820 579 665 0 True 422 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 466 248 0,00673428864297881 0,00663877592814722 0,00679026474402991 0,00666819256885634 0,00166572009575943 0,00144233231110584 255531 289323 579 665 0 True 466 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 510 248 0,00693687258308228 0,00686481596529662 0,00695811398489357 0,00688181887541009 0,0015347782610959 0,00151906244225679 263218 299174 579 665 0 True 510 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 555 248 0,00740133718050435 0,00741813333975818 0,00733958953231098 0,00741588464179446 0,00151411163642491 0,00143809963451636 280842 323288 579 665 0 True 554 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 599 250 0,00833197939162359 0,00803356525899321 0,00830090791180285 0,00804150453955901 0,00196802840816255 0,00194076397114551 316155 350109 579 665 0 False 599 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 642 249 0,0100530863743655 0,668809561096607 0,00991836423285267 0,672816052491035 0,00231755878221347 0,179907835784539 381462 29147239 579 665 3 True 643 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 245 292 0,00679904065817775 0,00678606564477112 0,00677500572213321 0,00672922865644312 0,00151104940305937 0,00164447848682428 257988 295742 579 665 0 False 245 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 290 292 0,00649209449577564 0,00656397230200702 0,00650034332799268 0,00662241550316625 0,00124560497475021 0,00123752013609197 246341 286063 579 665 0 False 290 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 335 291 0,00641421814049975 0,00661711500082318 0,00643930724040589 0,00662241550316625 0,00125961625675373 0,00135547718274085 243386 288379 579 665 0 True 334 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 379 294 0,00659772171470821 0,00665355308619454 0,00659189745937285 0,00666819256885634 0,00126079119268976 0,00123138629878097 250349 289967 579 665 0 True 378 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 422 292 0,00659023715129083 0,00673978376933407 0,00662241550316625 0,00674448767833982 0,00149579689962552 0,00145693208221615 250065 293725 579 665 0 True 422 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 467 293 0,00683174609198397 0,00686371456221235 0,0068055237659266 0,00688181887541009 0,00164529665225116 0,00181689479357739 259229 299126 579 665 0 True 466 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 510 293 0,00712799249119081 0,0071544390846652 0,00711070420386053 0,00720225833524071 0,00154890080991051 0,00153238612846227 270470 311796 579 665 0 True 510 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 555 293 0,00749526318057313 0,00744624206430473 0,00737010757610437 0,00750743877317464 0,00174910558357038 0,00152593763221605 284406 324513 579 665 0 True 554 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 598 293 0,00808965347393771 0,0080212662578855 0,00781261921110857 0,00796520943007553 0,00261212596761863 0,00198856542582508 306960 349573 579 665 0 False 598 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 643 293 0,00818194552002101 0,00810272419432651 0,00823987182421607 0,00804150453955901 0,00181932498720895 0,00192237358282731 310462 353123 579 665 0 False 643 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 247 338 0,00642291499235797 0,00648139001658415 0,00645456626230259 0,00654612039368277 0,00137378389244757 0,00147083374547923 243716 282464 579 665 0 True 245 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 291 337 0,00638153906079007 0,00641030362585337 0,00624093995574884 0,00643930724040589 0,00130942369792968 0,00128624375897524 242146 279366 579 665 0 True 290 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 334 336 0,00669726113734003 0,00658522020317445 0,00666819256885634 0,00656137941557946 0,00123546639983244 0,00124223916737158 254126 286989 579 665 0 True 334 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 378 337 0,00680186054650754 0,00682865323069633 0,00677500572213321 0,00686655985351339 0,00121415337942202 0,00136064453350268 258095 297598 579 665 0 True 378 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 423 336 0,00681572280128761 0,00703840168055754 0,00683604180972 0,00704966811627375 0,00149939753559493 0,00155827644764301 258621 306739 579 665 0 True 422 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 466 336 0,00697326759040411 0,00701575407963718 0,00703440909437705 0,00706492713817044 0,00164478511399677 0,00141678666500066 264599 305752 579 665 0 False 466 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 510 336 0,00813332221190459 0,00757808919185122 0,0076752880140383 0,00750743877317464 0,00298012082750202 0,00195420116004183 308617 330259 579 665 0 False 510 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 555 336 0,00816484171136651 0,00760413278561476 0,00759899290455482 0,00755321583886473 0,00338692468480162 0,00162441975786472 309813 331394 579 665 0 True 554 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 599 336 0,0074506456951308 0,00767769733328515 0,00740062561989776 0,00775158312352178 0,00195357397647011 0,00206977847755687 282713 334600 579 665 0 True 598 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 643 335 0,00730348442005109 0,00751914118094504 0,00732433051041428 0,00761425192645151 0,00189751132256432 0,00176385405060349 277129 327690 579 665 0 True 642 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 246 381 0,00644244337789416 0,00643035834034617 0,00643930724040589 0,0064087891966125 0,00149952334415919 0,0015309995141023 244457 280240 579 665 0 True 245 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 290 382 0,00660204378654078 0,00662991881167786 0,00659189745937285 0,00665293354695964 0,00138039073840207 0,00125205861283684 250513 288937 579 665 0 True 289 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 334 381 0,00682592183664861 0,0067635327733387 0,0068055237659266 0,00679026474402991 0,00137502089684622 0,00142915631427185 259008 294760 579 665 0 True 334 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 379 380 0,00708688010058832 0,00703684135952149 0,00706492713817044 0,00704966811627375 0,00133984720662974 0,00124238479972267 268910 306671 579 665 0 True 378 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 422 381 0,00696051220767871 0,00718633388231393 0,00697337300679027 0,00718699931334401 0,00153809164653521 0,00162292030934201 264115 313186 579 665 0 True 422 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 467 381 0,00713589872015283 0,00700074746261396 0,00715648126955062 0,00706492713817044 0,00160303620986921 0,0017339164958156 270770 305098 579 665 0 True 466 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 511 381 0,00735028929550624 0,00783375238278805 0,00732433051041428 0,00759899290455482 0,0016421085954973 0,00246202537000566 278905 341401 579 665 0 True 510 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 555 380 0,00730843899020063 0,00741560929102339 0,0072632944228275 0,00743114366369116 0,00171364707278984 0,00158191574425248 277317 323178 579 665 0 True 554 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 599 381 0,00700180907695699 0,0073460143836359 0,00706492713817044 0,00732433051041428 0,00196147160153617 0,0019508843584196 265682 320145 579 665 0 True 598 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 643 381 0,00664368325907408 0,0067923757666081 0,00666819256885634 0,00683604180972 0,00194406477499925 0,00171857683248402 252093 296017 579 665 0 True 642 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 247 424 0,00651757890712988 0,00654717590497186 0,00654612039368277 0,00656137941557946 0,00156032417760392 0,00156376346176344 247308 285331 579 665 0 True 245 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 291 425 0,00711995449174609 0,00682126465167267 0,00711070420386053 0,00674448767833982 0,00146200666687195 0,00151322149287288 270165 297276 579 665 0 True 289 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 335 425 0,00697664091476123 0,00696050035824283 0,00703440909437705 0,00697337300679027 0,00126786760868379 0,00121837036285843 264727 303344 579 665 0 True 333 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 379 424 0,00721680579653083 0,00708335269393442 0,00718699931334401 0,00715648126955062 0,00130473714283384 0,00135754938151037 273840 308698 579 665 0 True 378 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 424 424 0,00717967287450588 0,00744936270637684 0,00717174029144732 0,00737010757610437 0,00164928356063809 0,0017660159325702 272431 324649 579 665 0 True 422 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 467 425 0,00734891888248616 0,00706930980460995 0,00732433051041428 0,00714122224765393 0,0017258500615382 0,00161537514663718 278853 308086 579 665 0 True 466 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 511 425 0,00721654225556543 0,0072421841970456 0,0072327763790341 0,0072480354009308 0,00159068078775907 0,00157059443312746 273830 315620 579 665 0 True 510 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 556 425 0,00684270939614463 0,00715221333259906 0,0068055237659266 0,00700389105058366 0,00174797257306089 0,00198355864119236 259645 311699 579 665 0 True 554 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 599 425 0,00642394280212303 0,00634956583493524 0,00642404821850919 0,00633249408712902 0,00179962407452788 0,0018537412495489 243755 276719 579 665 0 True 598 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 642 424 0,00617299909486855 0,00633403146226748 0,00622568093385214 0,00628671702143893 0,00170006777544144 0,00190925738781786 234233 276042 579 665 0 True 642 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 246 470 0,00649986895425496 0,00668980760438519 0,00645456626230259 0,00671396963454643 0,0015087376083061 0,00134099976949359 246636 291547 579 665 0 True 245 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 290 469 0,00667578254865987 0,00672328566896757 0,00659189745937285 0,0068055237659266 0,00152822363571825 0,00149577887166295 253311 293006 579 665 0 True 289 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 334 468 0,00677869529564882 0,00693392900883474 0,00677500572213321 0,00691233691920348 0,00141665374795578 0,00144722460015067 257216 302186 579 665 0 True 333 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 379 469 0,00687256858752452 0,00702045798864293 0,00689707789730678 0,00692759594110018 0,00148773753407758 0,00149535254977735 260778 305957 579 665 0 True 377 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 423 468 0,00692651542314203 0,0072664150648996 0,00706492713817044 0,0072632944228275 0,0018298831339533 0,00207190865845771 262825 316676 579 665 0 True 422 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 467 469 0,0073672349795815 0,00744353444838923 0,00733958953231098 0,00743114366369116 0,00205567963212855 0,00195173482323858 279548 324395 579 665 0 True 466 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 511 468 0,00709075415277971 0,0069446676889064 0,00708018616006714 0,00697337300679027 0,00176859752554733 0,00175528373929468 269057 302654 579 665 0 True 510 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 554 469 0,00652906929322134 0,00626133885870547 0,00643930724040589 0,00630197604333562 0,00172946425252172 0,00171430628840573 247744 272874 579 665 0 True 554 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 599 468 0,00622647155674834 0,00625477633199501 0,00617990386816205 0,00617990386816205 0,00180258673332697 0,00185977277456663 236262 272588 579 665 0 True 598 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 643 469 0,00619163144112238 0,00616544795268097 0,00616464484626535 0,00611886778057527 0,00174757228564292 0,00167870340980089 234940 268695 579 665 0 True 642 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 246 513 0,00655874400592546 0,00666940870142855 0,00659189745937285 0,00669871061264973 0,00148808760246945 0,00145782856226572 248870 290658 579 665 0 True 245 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 291 513 0,00663377411877501 0,00671745741097996 0,00663767452506294 0,00675974670023652 0,00147064330063617 0,0015187996519005 251717 292752 579 665 0 True 289 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 335 513 0,00665780905481955 0,00677991614421726 0,00671396963454643 0,00675974670023652 0,0014677136794383 0,0015089456237373 252629 295474 579 665 0 True 333 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 379 513 0,00699395555618805 0,006869038010453 0,00691233691920348 0,00686655985351339 0,00150258855687255 0,00145703958069695 265384 299358 579 665 0 True 377 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 423 513 0,00694957525761459 0,00750390510494593 0,00708018616006714 0,00737010757610437 0,00189300314476599 0,00226385429816142 263700 327026 579 665 0 True 422 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 467 513 0,0071048272403321 0,00688422819465693 0,00706492713817044 0,00691233691920348 0,00189027101914029 0,00159429594628908 269591 300020 579 665 0 True 466 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 511 513 0,00656928564454148 0,00647324422294005 0,00663767452506294 0,00650034332799268 0,00174896845981248 0,00159019585636072 249270 282109 579 665 0 True 510 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 555 513 0,0062072330662741 0,00624371640935711 0,00625619897764553 0,00621042191195544 0,00168112045573562 0,00156684113852242 235532 272106 579 665 0 True 554 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 599 513 0,00604858140510292 0,00616976178142771 0,00604257267109178 0,00627145799954223 0,00175629423593578 0,00183803467842075 229512 268883 579 665 0 True 598 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 643 512 0,00638296218200324 0,0063469500026101 0,00650034332799268 0,00634775310902571 0,00176820707678318 0,00186275054125772 242200 276605 579 665 0 True 642 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 247 558 0,00675062818283365 0,00664051981636398 0,00675974670023652 0,00656137941557946 0,00131197695019237 0,00125178798140692 256151 289399 579 665 0 True 245 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 290 557 0,00685130083161669 0,00672005029740752 0,00683604180972 0,0068055237659266 0,00141279301824488 0,00140610273658462 259971 292865 579 665 0 True 289 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 335 557 0,00694116830081831 0,00693544343807562 0,00689707789730678 0,00685130083161669 0,00129609878212411 0,00132443399791916 263381 302252 579 665 0 True 333 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 379 557 0,00705480716509906 0,0069699540680495 0,00704966811627375 0,00700389105058366 0,00147598722495974 0,00128155562836168 267693 303756 579 665 0 True 377 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 424 556 0,00679748576648188 0,00690917038533619 0,00679026474402991 0,00700389105058366 0,00181046196987856 0,00172884449871525 257929 301107 579 665 0 True 421 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 467 557 0,00657777166362738 0,00658414174598777 0,00654612039368277 0,00650034332799268 0,00194434437909835 0,001757727438219 249592 286942 579 665 0 True 466 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 512 557 0,00649317501373378 0,00654327510238173 0,00650034332799268 0,00643930724040589 0,0020151815429125 0,00198652023145105 246382 285161 579 665 0 True 510 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 554 552 0,0062175638721178 0,00638485662542715 0,00616464484626535 0,00633249408712902 0,00179252271379587 0,00172681764589028 235924 278257 579 665 0 False 554 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 599 557 0,00622106896695763 0,00621023834477473 0,00628671702143893 0,00621042191195544 0,00163805441464795 0,00142800878157338 236057 270647 579 665 0 True 598 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 643 555 0,00634577655178521 0,00638536143517411 0,00642404821850919 0,0063782711528191 0,00170832596593932 0,00162739893880262 240789 278279 579 665 0 True 642 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 245 595 0,00707594315052419 0,00708686341626554 0,00703440909437705 0,00706492713817044 0,00129438517354275 0,00126089128970613 268495 308851 579 665 0 False 245 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 289 595 0,00690822568014323 0,00691499864332381 0,00695811398489357 0,00688181887541009 0,00140644236412656 0,00138756337339009 262131 301361 579 665 0 False 289 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 335 601 0,0066445529442599 0,00661936369878691 0,00663767452506294 0,00660715648126955 0,00145149451736608 0,00149260398400116 252126 288477 579 665 0 True 333 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 380 601 0,00649599490206357 0,00654595977239964 0,00650034332799268 0,00662241550316625 0,00127797640628478 0,00132633721215664 246489 285278 579 665 0 True 377 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 421 595 0,00652469451319569 0,00656034685018796 0,00653086137178607 0,00659189745937285 0,0017207940446428 0,00163188124540152 247578 285905 579 665 0 False 421 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 465 595 0,00644903190202917 0,00632925871556896 0,00650034332799268 0,00634775310902571 0,00188701207620381 0,00168235633746624 244707 275834 579 665 0 False 465 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 510 595 0,00647910192618139 0,0064606010333685 0,00651560234988937 0,00645456626230259 0,00188481516165702 0,00192668545062506 245848 281558 579 665 0 False 510 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 554 596 0,00633755407366471 0,00635491222907348 0,00627145799954223 0,00636301213092241 0,00181311035459056 0,00175811955263607 240477 276952 579 665 0 False 554 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 598 596 0,00613702575309137 0,00620197782164269 0,00628671702143893 0,00621042191195544 0,00155192490288419 0,00149394492754844 232868 270287 579 665 0 False 598 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 642 596 0,00656678200537018 0,00652985175229215 0,00653086137178607 0,00656137941557946 0,00147071634221923 0,00148789122602397 249175 284576 579 665 0 False 642 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 246 644 0,00922019150731333 0,65365799483832 0,0081025406271458 0,65626001373312 0,00389303615144818 0,218312774561926 349858 28486922 579 665 5 True 245 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 289 638 0,00759609395393541 0,00678432175655435 0,00715648126955062 0,00677500572213321 0,00270645998211945 0,00136220613848987 288232 295666 579 665 0 False 289 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 333 638 0,00642578758888084 0,00651037068523908 0,00634775310902571 0,00653086137178607 0,00123545089011051 0,00120226593658351 243825 283727 579 665 0 False 333 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 377 638 0,00635410444629187 0,00627561120700584 0,00634775310902571 0,00630197604333562 0,00127884124622831 0,00119651383175948 241105 273496 579 665 0 False 377 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 421 639 0,00625509210559085 0,00611967088699088 0,00622568093385214 0,00614938582436866 0,00143634466710462 0,00147194681941318 237348 266700 579 665 0 False 421 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 465 639 0,00614696124748697 0,00617630136224058 0,00608834973678187 0,00622568093385214 0,00156862719739815 0,00163065630517345 233245 269168 579 665 0 False 465 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 509 639 0,00632263765502303 0,00619933904341995 0,0063782711528191 0,00621042191195544 0,00165935377231969 0,0017421725301594 239911 270172 579 665 0 False 509 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 554 639 0,00612901410774319 0,00617446569043345 0,00614938582436866 0,00611886778057527 0,00163779624066382 0,0016384816865856 232564 269088 579 665 0 False 554 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 598 639 0,00652469451319569 0,00652225666019019 0,00650034332799268 0,00646982528419928 0,0014345994417327 0,00130325589933232 247578 284245 579 665 0 False 598 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 643 645 0,00908707696568947 0,700997171344475 0,00799572747386892 0,705012588693065 0,00416694340111083 0,191530455291545 344807 30550000 579 665 6 True 642 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G8_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G8_3.csv new file mode 100755 index 0000000..74e7d60 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G8_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 246 248 0,00103189465002616 0,0641623055120061 0,000778210116731518 0,063782711528191 0,000863799949060126 0,019661657033982 39155 2796243 579 665 0 True 246 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 290 249 0,000928375758816796 0,000963245834889352 0,000732433051041428 0,000823987182421607 0,000744836176232109 0,000702035559997393 35227 41979 579 665 0 False 290 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 334 248 0,000912378822216978 0,000978206560117391 0,000793469138628214 0,000900282291905089 0,000691327646770941 0,000672270274228006 34620 42631 579 665 0 True 334 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 378 248 0,000931801791367004 0,000918868468952193 0,00080872816052491 0,00080872816052491 0,000652688902636914 0,000619856988093364 35357 40045 579 665 0 True 378 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 422 247 0,000936255633682275 0,000923916566421777 0,000747692072938125 0,000732433051041428 0,000776943053764188 0,000738327619081776 35526 40265 579 665 0 True 422 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 466 248 0,000903892803131077 0,00100009694641731 0,000732433051041428 0,000854505226215 0,000805672668501519 0,000758211609999839 34298 43585 579 665 0 True 466 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 510 248 0,000990518718458264 0,000965540424648254 0,000747692072938125 0,00080872816052491 0,000889791350363272 0,000808770173961287 37585 42079 579 665 0 True 510 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 555 248 0,000993944751008472 0,00103529595331887 0,000793469138628214 0,000900282291905089 0,000846317630935419 0,000708693136555453 37715 45119 579 665 0 True 554 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 599 250 0,000984931649991771 0,00105463934498641 0,000625619897764553 0,000610360875867857 0,000993599859190207 0,00109196474427123 37373 45962 579 665 0 False 599 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 642 249 0,00108391763659625 0,0661869597316707 0,000778210116731518 0,0658884565499352 0,000977660470782523 0,0185474393682632 41129 2884479 579 665 0 True 643 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 245 292 0,000938074066343539 0,000895647220592107 0,000732433051041428 0,000686655985351339 0,000780323180950353 0,000787771923262351 35595 39033 579 665 0 False 245 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 290 292 0,000933093142097467 0,000899593914977418 0,000793469138628214 0,000762951094834821 0,000663128945349546 0,000670196091965679 35406 39205 579 665 0 False 290 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 335 291 0,000905763943985422 0,00100663652723018 0,000793469138628214 0,000885023270008392 0,00066494009125014 0,000712281680209277 34369 43870 579 665 0 True 334 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 379 294 0,000951725488351292 0,000942433905776113 0,000839246204318303 0,00080872816052491 0,000676690983330734 0,000656796494554484 36113 41072 579 665 0 True 378 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 422 292 0,000974943447403087 0,000875730181484841 0,000793469138628214 0,000625619897764553 0,000788743093731919 0,000821377915381515 36994 38165 579 665 0 True 422 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 467 293 0,00096790690362689 0,000945921682209644 0,000717174029144732 0,000625619897764553 0,00090372965395245 0,000970262989633313 36727 41224 579 665 0 True 466 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 510 293 0,000942896866010371 0,000925637508740953 0,000747692072938125 0,000717174029144732 0,000818626974361328 0,000838050470364339 35778 40340 579 665 0 True 510 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 555 293 0,000903840094937997 0,000905468064760207 0,000625619897764553 0,000732433051041428 0,000854108769413143 0,000738187361967392 34296 39461 579 665 0 True 554 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 598 293 0,00110515903840754 0,000961960864624367 0,000686655985351339 0,000518806744487678 0,001116737283477 0,00102261297319693 41935 41923 579 665 0 False 598 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 643 293 0,000899886980456988 0,000954480502010347 0,000473029678797589 0,000610360875867857 0,000946495504793669 0,0010048408268113 34146 41597 579 665 0 False 643 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 247 338 0,00085453158031154 0,000837502316101538 0,000656137941557946 0,000701915007248035 0,000734942000798686 0,000745713840927093 32425 36499 579 665 0 True 245 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 291 337 0,000808359203173349 0,000994062175351402 0,000686655985351339 0,000885023270008392 0,000642076805346755 0,000676972830957111 30673 43322 579 665 0 True 290 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 334 336 0,000847626807018043 0,000960698840256971 0,000747692072938125 0,000869764248111696 0,000590089123173711 0,000668734105580524 32163 41868 579 665 0 True 334 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 378 337 0,000940445935032145 0,000916183798934278 0,00080872816052491 0,000778210116731518 0,000677851632526582 0,000696662900179917 35685 39928 579 665 0 True 378 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 423 336 0,00101236626448998 0,000987843837104778 0,000793469138628214 0,000762951094834821 0,000794653913594194 0,000856951296511796 38414 43051 579 665 0 True 422 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 466 336 0,00100037515056425 0,00104885697879398 0,00080872816052491 0,000915541313801785 0,000859091869795624 0,000816856045215265 37959 45710 579 665 0 False 466 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 510 336 0,0010401434822432 0,000991148046357597 0,000823987182421607 0,000793469138628214 0,000919165314807743 0,000863696161510459 39468 43195 579 665 0 False 510 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 555 336 0,00110584424491758 0,000942112663209867 0,000885023270008392 0,000747692072938125 0,00096056286618773 0,000775478023877764 41961 41058 579 665 0 True 554 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 599 336 0,00094690268868446 0,00091076856710327 0,000564583810177768 0,000305180437933928 0,00104015166194355 0,00113120191711026 35930 39692 579 665 0 True 598 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 643 335 0,000848997220038126 0,00094158490756532 0,000411993591210803 0,000534065766384375 0,00097503190208307 0,000970962788579218 32215 41035 579 665 0 True 642 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 246 381 0,000945795816629778 0,000950763266600927 0,000762951094834821 0,000823987182421607 0,00079909500890913 0,000800239259094002 35888 41435 579 665 0 True 245 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 290 382 0,00095520422909458 0,000992065882261157 0,000823987182421607 0,000900282291905089 0,000753441525270957 0,000678517761405661 36245 43235 579 665 0 True 289 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 334 381 0,00108265263996232 0,000903379988079606 0,00102235446707866 0,000747692072938125 0,000748969866301291 0,000703220610248891 41081 39370 579 665 0 True 334 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 379 380 0,00101571323475056 0,000996196143827181 0,000854505226215 0,000885023270008392 0,000794589997898188 0,000723265127509279 38541 43415 579 665 0 True 378 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 422 381 0,000984061964805949 0,000950992725576817 0,000717174029144732 0,000732433051041428 0,000840539839772473 0,000814575217978908 37340 41445 579 665 0 True 422 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 467 381 0,000935175115724132 0,000966618881834937 0,000656137941557946 0,000656137941557946 0,000844289934603643 0,000900264743546726 35485 42126 579 665 0 True 466 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 511 381 0,000964691703849003 0,00110101300401381 0,000686655985351339 0,00080872816052491 0,000910052366464341 0,00100574056010506 36605 47983 579 665 0 True 510 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 555 380 0,000920126926599756 0,000919143819723261 0,00064087891966125 0,000686655985351339 0,000891017094070509 0,000873155428109987 34914 40057 579 665 0 True 554 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 599 381 0,000907582376646686 0,000976898643954817 0,000457770656900893 0,000595101853971161 0,00105291098717635 0,00103755472308063 34438 42574 579 665 0 True 598 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 643 381 0,000901046560704751 0,000877772366370263 0,000518806744487678 0,000595101853971161 0,000959562460492564 0,000884058589406416 34190 38254 579 665 0 True 642 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 247 424 0,00100322139299057 0,000847300214372048 0,000854505226215 0,000671396963454643 0,000780138985166764 0,000785409883962322 38067 36926 579 665 0 True 245 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 291 425 0,00094265967914151 0,000986604758634972 0,000762951094834821 0,000900282291905089 0,000812058145925485 0,000753751653218809 35769 42997 579 665 0 True 289 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 335 425 0,00104762804566058 0,000910378486844256 0,000915541313801785 0,000793469138628214 0,000775170774546695 0,000667273038019391 39752 39675 579 665 0 True 333 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 379 424 0,000926768158927852 0,00104119304899924 0,00080872816052491 0,000946059357595178 0,000741810686462298 0,000760865538053726 35166 45376 579 665 0 True 378 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 424 424 0,000935517718979153 0,000994085121248991 0,000747692072938125 0,000823987182421607 0,000812821744977013 0,000836798387047566 35498 43323 579 665 0 True 422 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 467 425 0,000981558325634643 0,000964576696949515 0,000686655985351339 0,000747692072938125 0,00093787057798713 0,000850156912277854 37245 42037 579 665 0 True 466 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 511 425 0,000932038978235865 0,000970932710581673 0,000671396963454643 0,000701915007248035 0,000872497124582766 0,000919091998524036 35366 42314 579 665 0 True 510 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 556 425 0,000996606514759019 0,00105704866423325 0,000778210116731518 0,000869764248111696 0,000911275280049432 0,000913632556214967 37816 46067 579 665 0 True 554 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 599 425 0,000818874487692835 0,000927128992084239 0,000442511635004196 0,000595101853971161 0,000939376883889977 0,00099011336717605 31072 40405 579 665 0 True 598 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 642 424 0,000985485086019112 0,000946197032980712 0,00064087891966125 0,000625619897764553 0,00100251913802494 0,000963046318179524 37394 41236 579 665 0 True 642 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 246 470 0,000934648033793331 0,00100608582568805 0,000793469138628214 0,000885023270008392 0,000791001493716797 0,000772033424261192 35465 43846 579 665 0 True 245 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 290 469 0,000898569275629985 0,000920268168705123 0,000793469138628214 0,000839246204318303 0,000753835495319745 0,000786380772167286 34096 40106 579 665 0 True 289 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 334 468 0,000876010168991691 0,000961043028720806 0,000762951094834821 0,000823987182421607 0,000727519094510452 0,000803730162821136 33240 41883 579 665 0 True 333 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 379 469 0,000992600692084929 0,000987660269924066 0,000823987182421607 0,000869764248111696 0,000823617543701851 0,000779661820543591 37664 43043 579 665 0 True 377 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 423 468 0,000966879093861828 0,00100425015388093 0,000671396963454643 0,000717174029144732 0,000966547182729793 0,000991959242987065 36688 43766 579 665 0 True 422 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 467 469 0,000930773981601942 0,000936559755993325 0,000473029678797589 0,000579842832074464 0,00104460265859485 0,00099313982257034 35318 40816 579 665 0 True 466 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 511 468 0,000890952941729907 0,000989174699164941 0,000534065766384375 0,00064087891966125 0,000921414278943113 0,000930254508187066 33807 43109 579 665 0 True 510 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 554 469 0,000869658831725536 0,000888694613622635 0,000595101853971161 0,000488288700694286 0,00089785555488066 0,000970866085261163 32999 38730 579 665 0 True 554 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 599 468 0,00081276033729554 0,000888924072598525 0,000396734569314107 0,000549324788281071 0,000927775840771964 0,00090446884528599 30840 38740 579 665 0 True 598 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 643 469 0,000927927739175615 0,000881397818189328 0,000579842832074464 0,000564583810177768 0,000969828117977226 0,00089911274212817 35210 38412 579 665 0 True 642 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 246 513 0,00085901177672335 0,00103885256744516 0,000656137941557946 0,000900282291905089 0,000756431831971204 0,000829998246363297 32595 45274 579 665 0 True 245 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 291 513 0,000900124167325848 0,000863041100118114 0,000747692072938125 0,000701915007248035 0,000785243540040627 0,00076952156184131 34155 37612 579 665 0 True 289 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 335 513 0,00102812601422093 0,000957302847413797 0,000900282291905089 0,000854505226215 0,000851202266573967 0,000811956643617657 39012 41720 579 665 0 True 333 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 379 513 0,000906870816040105 0,000902576881663991 0,000732433051041428 0,000747692072938125 0,000760278339092908 0,000774929127188769 34411 39335 579 665 0 True 377 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 423 513 0,00097612938174739 0,00106354235325095 0,000701915007248035 0,000762951094834821 0,000975704958923836 0,00101858384706061 37039 46350 579 665 0 True 422 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 467 513 0,000981215722379622 0,00103017901815652 0,000610360875867857 0,000762951094834821 0,00103217737819701 0,00090787360221183 37232 44896 579 665 0 True 466 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 511 513 0,000990360593879024 0,000899180888820816 0,00064087891966125 0,000610360875867857 0,000974227945472691 0,000842739961958331 37579 39187 579 665 0 True 510 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 555 513 0,000866628110623429 0,000927519072343252 0,000549324788281071 0,000625619897764553 0,000859273436405916 0,000891088736215812 32884 40422 579 665 0 True 554 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 599 513 0,000797975689136565 0,000840186986119453 0,000442511635004196 0,000534065766384375 0,000872467467788158 0,000888888428150658 30279 36616 579 665 0 True 598 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 643 512 0,000858300216116769 0,00091939622459674 0,000457770656900893 0,000503547722590982 0,000950541727041078 0,00100650972995339 32568 40068 579 665 0 True 642 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 247 558 0,000909611642080271 0,00096820214876858 0,000747692072938125 0,000823987182421607 0,000660168331928717 0,000683424652269658 34515 42195 579 665 0 True 245 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 290 557 0,000943634780713492 0,00097660034728616 0,000823987182421607 0,000839246204318303 0,000700856430542884 0,000717086633757548 35806 42561 579 665 0 True 289 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 335 557 0,000973230431127983 0,000986375299659081 0,000885023270008392 0,000839246204318303 0,000700046864124828 0,000776392077495269 36929 42987 579 665 0 True 333 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 379 557 0,0010398799412778 0,000965609262341021 0,000915541313801785 0,000823987182421607 0,000768899017285523 0,000702817401883668 39458 42082 579 665 0 True 377 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 424 556 0,000930484086540001 0,00101840777269335 0,000656137941557946 0,000671396963454643 0,000924471713704561 0,00100332308206152 35307 44383 579 665 0 True 421 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 467 557 0,000945848524822858 0,000985595139141055 0,000488288700694286 0,000701915007248035 0,00103689002793052 0,000975232840366132 35890 42953 579 665 0 True 466 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 512 557 0,000880411303113881 0,000881558439472451 0,000473029678797589 0,000473029678797589 0,0009745183979689 0,0010200115943025 33407 38419 579 665 0 True 510 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 554 552 0,000857641363703267 0,000955329500221141 0,000518806744487678 0,000595101853971161 0,000918476527244634 0,00101046503879975 32543 41634 579 665 0 False 554 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 599 557 0,000848074826659224 0,000919373278699151 0,000564583810177768 0,000701915007248035 0,000847338192282916 0,000770415834726145 32180 40067 579 665 0 True 598 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 643 555 0,000879172660576498 0,000833372054535515 0,000595101853971161 0,000534065766384375 0,000845799055035741 0,000898657198675789 33360 36319 579 665 0 True 642 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 245 595 0,000940946662866406 0,000977128102930707 0,00080872816052491 0,000869764248111696 0,000673613934798928 0,000655074132833776 35704 42584 579 665 0 False 245 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 289 595 0,00096795961181997 0,000929377690047963 0,000869764248111696 0,00080872816052491 0,000720940434732537 0,000761814017031557 36729 40503 579 665 0 False 289 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 335 601 0,000809281596552252 0,000971850546485233 0,000701915007248035 0,000839246204318303 0,000674779805645391 0,000795752541190934 30708 42354 579 665 0 True 333 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 380 601 0,000961028484429934 0,000962465674371325 0,000854505226215 0,000854505226215 0,000682359060447607 0,000677192448459078 36466 41945 579 665 0 True 377 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 421 595 0,000918940992255453 0,000890346718249044 0,000701915007248035 0,000595101853971161 0,000852793379865842 0,000863545428192538 34869 38802 579 665 0 False 421 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 465 595 0,00099302235762957 0,000966664773630116 0,000518806744487678 0,000610360875867857 0,0010231570674659 0,000992460066586959 37680 42128 579 665 0 False 465 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 510 595 0,000873611946206545 0,000922746325644737 0,000473029678797589 0,000473029678797589 0,000985579317459719 0,00110405497446137 33149 40214 579 665 0 False 510 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 554 596 0,000776707933228734 0,000917376985608907 0,000350957503624018 0,000518806744487678 0,000908202899990682 0,000960811865775012 29472 39980 579 665 0 False 554 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 598 596 0,0008799632834727 0,000852279474148865 0,000656137941557946 0,000625619897764553 0,00083226189639754 0,000796924427310772 33390 37143 579 665 0 False 598 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 642 596 0,000853503770546477 0,000863178775503648 0,00064087891966125 0,000656137941557946 0,000745170873171844 0,000740711123170034 32386 37618 579 665 0 False 642 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 246 644 0,00112123503729698 0,0651645593727968 0,000946059357595178 0,0655222400244144 0,000808516683911421 0,0225056697117892 42545 2839922 579 665 0 True 245 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 289 638 0,000994445478842734 0,000890943311586359 0,000854505226215 0,000762951094834821 0,00074903038200663 0,000661728638761958 37734 38828 579 665 0 False 289 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 333 638 0,000943160406975771 0,000897574675989585 0,000778210116731518 0,000839246204318303 0,000691649237990934 0,000613312915031227 35788 39117 579 665 0 False 333 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 377 638 0,000862095206018538 0,000940988314228005 0,000732433051041428 0,000823987182421607 0,000645482741837175 0,000697952527855936 32712 41009 579 665 0 False 377 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 421 639 0,000885181394587633 0,000964140724895324 0,000701915007248035 0,000747692072938125 0,00074687490159087 0,000774651948182221 33588 42018 579 665 0 False 421 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 465 639 0,000937283443447337 0,000972217680846658 0,000701915007248035 0,000747692072938125 0,000868657708271601 0,000860121567481592 35565 42370 579 665 0 False 465 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 509 639 0,000964454516980142 0,00098782089120719 0,00064087891966125 0,000671396963454643 0,000942204772410827 0,000927691419065426 36596 43050 579 665 0 False 509 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 554 639 0,000886578161704256 0,00084748378155276 0,000564583810177768 0,000564583810177768 0,000885906824404252 0,000835816543438738 33641 36934 579 665 0 False 554 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 598 639 0,000805196711588542 0,000884403730773489 0,000625619897764553 0,000732433051041428 0,000669982831103022 0,000679014009705601 30553 38543 579 665 0 False 598 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 643 645 0,0011305907415687 0,069689605106839 0,000961318379491875 0,0697032120241093 0,000847377532291126 0,0200993012684921 42900 3037127 579 665 0 True 642 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G9_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G9_1.csv new file mode 100755 index 0000000..a52e626 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G9_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 257 277 0,0104603411775238 0,0446892924689843 0,0104219119554437 0,0452582589456016 0,00158436722092057 0,00822038722683446 427078 1947594 623 665 0 True 257 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 301 278 0,010379392433754 0,0102624379672 0,0103456168459602 0,0102845807583734 0,00128077025372592 0,00134660102495218 423773 447245 623 665 0 False 301 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 346 277 0,0106090370393775 0,0563284154538326 0,0105745021744106 0,0572213321126116 0,00142474873535335 0,00788454418131761 433149 2454836 623 665 0 True 345 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 389 277 0,0108728491177873 0,0810487651952036 0,0108033875028611 0,0783703364614328 0,00141051978810027 0,0174956855190619 443920 3532168 623 665 0 True 389 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 433 277 0,0105667134601841 0,0647912984567163 0,010605020218204 0,064087891966125 0,00176467125160005 0,011025068413053 431421 2823655 623 665 0 True 434 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 477 278 0,0105709507166658 0,0586722930007555 0,0105439841306172 0,0604104676890211 0,00177406463364465 0,0154729125739996 431594 2556984 623 665 0 True 478 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 521 277 0,0105269371334421 0,0721614519246158 0,0104829480430304 0,0708781567101549 0,00169082404486524 0,0185834538930159 429797 3144852 623 665 0 True 522 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 565 278 0,0102415713804431 0,0624556355411302 0,0102845807583734 0,0610513466086824 0,00167856505096531 0,015297568019903 418146 2721865 623 665 0 True 566 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 610 278 0,0104172828139694 0,0103545198542247 0,010406652933547 0,0103913939116503 0,00251764573619985 0,00186231671070492 425320 451258 623 665 0 False 610 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 654 277 0,0102027747661824 0,043942059313998 0,0102235446707866 0,0438544289311055 0,00193042561087672 0,00778062949939407 416562 1915029 623 665 0 True 654 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 257 321 0,0103703056004897 0,010403188103011 0,0103150988021668 0,0104219119554437 0,00151280466803874 0,00146088084807604 423402 453379 623 665 0 False 257 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 301 321 0,0102318477340659 0,0105415289195752 0,0102082856488899 0,010452429999237 0,00145196749481502 0,00152419954713369 417749 459408 623 665 0 False 301 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 345 322 0,010707473650939 0,0938682022061333 0,0107118333714809 0,0908827344167239 0,0013940838702574 0,0184922663115482 437168 4090849 623 665 0 True 345 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 390 321 0,0111548838483498 0,0475738442007973 0,0108186465247578 0,0471503776607919 0,00305064364159459 0,00742012072855759 455435 2073305 623 665 0 True 389 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 434 321 0,0108681220050649 0,0704385133123493 0,0108644235904479 0,0687571526665141 0,00177615754723941 0,0126725823925952 443727 3069765 623 665 0 True 434 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 478 322 0,0104793231068495 0,0380161435862488 0,0104371709773404 0,039154650186923 0,00162543410903828 0,00592403281187337 427853 1656773 623 665 0 True 478 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 522 321 0,0104895121166553 0,04015722529028 0,0105287251087205 0,0417639429312581 0,00163501395620239 0,00736113367877478 428269 1750083 623 665 0 True 522 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 566 322 0,0105856953895098 0,0487138193389172 0,0105897611963073 0,0498207064927138 0,00179129925099287 0,00897744787137656 432196 2122986 623 665 0 True 566 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 610 321 0,0103564916545029 0,0103734731656332 0,0103761348897536 0,010406652933547 0,00194351448008815 0,00216004602059918 422838 452084 623 665 0 False 610 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 654 321 0,0101081835261101 0,0100724459351629 0,0100251773861295 0,010101472495613 0,00196762633647914 0,00179077631174754 412700 438965 623 665 0 False 654 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 258 367 0,0104378322832652 0,0539124648425825 0,0104371709773404 0,054184786755169 0,00160836494463417 0,00938075938043872 426159 2349547 623 665 0 True 257 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 302 367 0,0105884385844575 0,0614468191536291 0,0105897611963073 0,0639505607690547 0,00140249309791906 0,0152608832513406 432308 2677900 623 665 0 True 301 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 346 366 0,0107663298782548 0,0380797725602631 0,010757610437171 0,0391241321431296 0,00135588395668459 0,00568083000516632 439571 1659546 623 665 0 True 345 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 390 365 0,0108237655224727 0,033634899792397 0,0108339055466545 0,034378576333257 0,0016631711295693 0,00476760083923364 441916 1465835 623 665 0 True 389 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 434 365 0,0108377999037677 0,0650233962108292 0,0108339055466545 0,0636606393530175 0,00171696788216221 0,0096170641792955 442489 2833770 623 665 0 True 434 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 478 364 0,010656602080346 0,0309457094326569 0,0106507972838941 0,0319981689173724 0,00166572953791914 0,00518413382019534 435091 1348638 623 665 0 False 478 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 522 365 0,010543102389384 0,0273784713557756 0,0105592431525139 0,027695124742504 0,00171540357488572 0,00292850900777525 430457 1193175 623 665 0 True 522 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 566 366 0,0105190749407794 0,0490659011915231 0,0104982070649271 0,0493171587701228 0,00182679553316675 0,00762765856478301 429476 2138330 623 665 0 True 566 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 610 366 0,0106340931860874 0,0557286555826508 0,0106355382619974 0,056595712214847 0,00194254214908506 0,0117739243796142 434172 2428698 623 665 0 True 610 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 654 365 0,0104452780981233 0,0626443196570047 0,0104371709773404 0,0625009536888685 0,00200694311337093 0,0163804042119784 426463 2730088 623 665 0 True 654 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 258 411 0,0105347748332927 0,0456713309939991 0,0105439841306172 0,0463874265659571 0,00153827442743127 0,0100361352176618 430117 1990392 623 665 0 True 257 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 302 411 0,0107577818868552 0,0316199975792078 0,0106660563057908 0,0318455786984054 0,00166665368660002 0,00342824914244952 439222 1378024 623 665 0 True 301 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 346 410 0,0107615292870963 0,0832836956203739 0,0107881284809644 0,0803540093080034 0,00141183059685329 0,0159270109198743 439375 3629568 623 665 0 True 345 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 390 410 0,0108154379663814 0,0636439117936751 0,010757610437171 0,063431754024567 0,00156272223267672 0,013308944854348 441576 2773651 623 665 0 True 389 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 434 410 0,0111394288839569 0,0413059887071765 0,0110780498970016 0,0424048218509194 0,00166367562379704 0,00606922546210957 454804 1800147 623 665 0 True 434 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 478 411 0,0108345913453914 0,0501010594694564 0,0108186465247578 0,0516365300984207 0,00159447039894747 0,00891785181916206 442358 2183443 623 665 0 True 478 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 523 410 0,0107012279838705 0,0397567046478637 0,010757610437171 0,0408026245517662 0,00180012034299602 0,00572696033642556 436913 1732628 623 665 0 True 522 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 566 410 0,0104805722402632 0,0511135013087766 0,0104982070649271 0,0504615854123751 0,00185406370138402 0,00928142451186013 427904 2227566 623 665 0 True 566 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 611 410 0,0105872139438559 0,0424115908907081 0,0104371709773404 0,0429541466392004 0,00199810563919003 0,00880860800456161 432258 1848330 623 665 0 True 610 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 654 410 0,0105583614112807 0,0836905493305248 0,0105439841306172 0,0799420157167925 0,00197757965476478 0,0169715403275191 431080 3647299 623 665 0 True 654 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 258 455 0,0104793720924736 0,0419709608193062 0,0104371709773404 0,0422827496757458 0,00171598147409568 0,0060141718950319 427855 1829127 623 665 0 True 257 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 302 454 0,0105546629966637 0,0535756420118734 0,0105439841306172 0,0532539864194705 0,00162520094643556 0,00667282114465295 430929 2334868 623 665 0 True 301 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 346 454 0,0107792375901963 0,0328171080023244 0,010757610437171 0,0330968184939345 0,00146899363948334 0,00351763123377291 440098 1430195 623 665 0 True 345 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 390 454 0,0109661667316339 0,0532862712973783 0,0109254596780346 0,0521400778210117 0,00157061443483962 0,0106181543904617 447730 2322257 623 665 0 True 389 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 434 454 0,0114360368376792 0,0899676979126691 0,0113527122911421 0,0893415732051576 0,0021412007771413 0,0113037321356045 466914 3920862 623 665 0 True 434 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 478 454 0,0114401271372887 0,0576300673863647 0,0111848630502785 0,0575417715724422 0,00273568401768727 0,0114073958073063 467081 2511563 623 665 0 True 478 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 522 454 0,0110453030073132 0,0508943450409039 0,0108796826123445 0,0506446936751354 0,00203819954287003 0,00777051848804471 450961 2218015 623 665 0 True 522 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 566 451 0,0105392325250828 0,0297388240571674 0,0104829480430304 0,0305790798809796 0,00185100827102762 0,00513444691250574 430299 1296041 623 665 0 False 566 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 610 454 0,0104878955910612 0,0365237653529567 0,0104982070649271 0,037094682230869 0,001780056121261 0,00535163633193388 428203 1591734 623 665 0 True 610 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 654 453 0,0105243408953666 0,0613430578047316 0,0104982070649271 0,0593728542000458 0,0018718437695959 0,00842655553876165 429691 2673378 623 665 0 True 654 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 257 499 0,0106539568566464 0,0513142320208854 0,0106813153276875 0,0520790417334249 0,00153493245659213 0,0131493623816151 434983 2236314 623 665 0 True 257 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 301 499 0,0107187158516622 0,0527877028345641 0,0106813153276875 0,053482871747921 0,00161168052275302 0,00659671720465543 437627 2300529 623 665 0 True 301 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 345 499 0,0111627950266365 0,0668190044807602 0,011261158159762 0,0670328831921874 0,00168387308789379 0,0136990235629109 455758 2912024 623 665 0 True 345 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 390 498 0,0117072947309471 0,0831372319560632 0,0113527122911421 0,0798504615854124 0,00270626112983223 0,016571125023332 477989 3623185 623 665 0 True 389 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 434 498 0,0119069601346419 0,0909617141962253 0,0115663385976959 0,0896009765774014 0,00244759799619637 0,0259708792549544 486141 3964182 623 665 0 True 434 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 479 499 0,0109285702651629 0,0458731172173969 0,0108949416342412 0,046845197222858 0,0020199482245858 0,00745899442079838 446195 1999186 623 665 0 True 478 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 523 498 0,0109450784204732 0,0398693231132305 0,0108949416342412 0,040863660639353 0,00181326654045549 0,00471155004132989 446869 1737536 623 665 0 True 522 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 566 498 0,0108318481504437 0,0920958840222552 0,0108186465247578 0,0888380254825666 0,00192142735451925 0,0143410905714771 442246 4013610 623 665 0 True 566 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 610 496 0,0107585656568403 0,0454794803442573 0,0106507972838941 0,0451819638361181 0,00201881644237887 0,00786054726605782 439254 1982031 623 665 0 True 610 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 654 498 0,0105699954969965 0,0692019818371748 0,0105897611963073 0,0666208896009766 0,00202413396319734 0,011832859905174 431555 3015876 623 665 0 True 654 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 258 543 0,0105089594094097 0,0503507567270201 0,0104676890211337 0,0522316319523919 0,0014467856832105 0,0104922974157438 429063 2194325 623 665 0 True 257 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 301 542 0,0109764292198758 0,100017014383062 0,0108186465247578 0,100129701686122 0,0018515190590843 0,0267456889994237 448149 4358819 623 665 0 True 301 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 346 542 0,0109950682498331 0,0556036922243811 0,0110170138094148 0,0569314106965743 0,00150106162014204 0,0119440360156805 448910 2423252 623 665 0 True 345 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 389 542 0,0112905740270139 0,0555533259791732 0,0112001220721752 0,056092164492256 0,001691637192164 0,00782323847540236 460975 2421057 623 665 0 True 389 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 434 542 0,011042216912997 0,0542331567072866 0,0110933089188983 0,0549629968719005 0,00199638696120513 0,00669452622153532 450835 2363523 623 665 0 True 434 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 478 543 0,0110917658717402 0,0588972316348206 0,0111696040283818 0,0590524147402152 0,002067677078787 0,0121750199336655 452858 2566787 623 665 0 True 478 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 522 542 0,0107736777218648 0,0703457889401921 0,0106507972838941 0,0681467917906462 0,00193330945077387 0,0171853644033085 439871 3065724 623 665 0 True 522 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 566 542 0,0106221896794393 0,0566047528984971 0,0106660563057908 0,0561837186236362 0,00182580746547671 0,0125608866316886 433686 2466879 623 665 0 True 566 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 611 542 0,0103407917619896 0,0439787727501404 0,010406652933547 0,0423895628290227 0,00180304792718156 0,00811632529000961 422197 1916629 623 665 0 True 610 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 654 542 0,010505505922913 0,0624143788172652 0,0105287251087205 0,0624856946669718 0,00188664766964793 0,0135071110105445 428922 2720067 623 665 0 True 654 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 258 587 0,0101695135274413 0,0443370499950953 0,0102082856488899 0,0449988555733577 0,00142695624616331 0,00842590932099936 415204 1932243 623 665 0 True 257 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 301 586 0,0104651907543064 0,0524464973374154 0,0104371709773404 0,0524910353246357 0,00146843837303477 0,0118307023155087 427276 2285659 623 665 0 True 301 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 345 586 0,0107117354002328 0,0495688982125719 0,0108339055466545 0,0510566872663462 0,00147788207632563 0,00968602721299347 437342 2160251 623 665 0 True 345 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 390 586 0,0107572675378025 0,0501717328340306 0,0107423514152743 0,0489509422446021 0,00144885181972274 0,00780720006036512 439201 2186523 623 665 0 True 389 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 434 586 0,0109332728850732 0,0885275904340847 0,0109102006561379 0,0838788433661402 0,00199768727043178 0,020041199680068 446387 3858101 623 665 0 True 434 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 478 587 0,010892541338662 0,0607882260010291 0,010955977721828 0,0595254444190127 0,00207294470235682 0,0122755370299104 444724 2649198 623 665 0 True 478 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 522 586 0,0105082491178608 0,0550130877663373 0,0105745021744106 0,0547188525215534 0,00208757515477039 0,00766769527582618 429034 2397513 623 665 0 True 522 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 566 581 0,0107132784473908 0,0356730461998439 0,0107270923933776 0,0386053253986419 0,00184042519332422 0,011633786995218 437405 1554659 623 665 0 False 566 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 610 586 0,0102903610620132 0,0478729439758701 0,0103303578240635 0,0479896238651102 0,00158638598603172 0,00720512930489364 420138 2086340 623 665 0 True 610 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 654 585 0,0103451269897195 0,0518796877751715 0,0103608758678569 0,0510414282444495 0,00178890617999627 0,0070986959257589 422374 2260957 623 665 0 True 654 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 257 624 0,0104918634266105 0,00992988307344236 0,0101319905394064 0,00991836423285267 0,00280677544127708 0,00140836138060468 428365 432752 623 665 0 False 257 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 301 624 0,0104202464442254 0,0100164349991481 0,0101625085831998 0,0100099183642329 0,00228860479779386 0,00135261079092287 425441 436524 623 665 0 False 301 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 346 630 0,0104636721999603 0,0768141227410481 0,0104219119554437 0,0758373388265812 0,00151197061798788 0,0108131266100429 427214 3347619 623 665 0 True 345 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 390 630 0,0105477070380463 0,0803338398640226 0,0104829480430304 0,0805523765926604 0,00142715819302235 0,0195835879652488 430645 3501011 623 665 0 True 389 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 434 624 0,0107610149380436 0,0108454473331417 0,0104829480430304 0,0104371709773404 0,00273152315950511 0,00300818005230702 439354 472653 623 665 0 False 434 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 478 624 0,0103400814704407 0,0101934625990474 0,0102845807583734 0,0101472495613031 0,00245513684571139 0,00200720569860189 422168 444239 623 665 0 False 478 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 522 624 0,0102739263851389 0,0101549364369954 0,0102388036926833 0,0101930266269932 0,00215938937484245 0,00185683897284788 419467 442560 623 665 0 False 522 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 566 624 0,0102507316921435 0,0100800869190601 0,0103150988021668 0,0100556954299229 0,00169505647313121 0,00176241718288504 418520 439298 623 665 0 False 566 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 610 624 0,0102076733285891 0,0100802934321384 0,0101930266269932 0,0101167315175097 0,00150558360862172 0,0013510605423037 416762 439307 623 665 0 False 610 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 654 624 0,0101402201242496 0,0101878179082405 0,0101625085831998 0,01025406271458 0,00158957551454322 0,00149797519878899 414008 443993 623 665 0 False 654 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 259 673 0,0100552790521184 0,0425667051584099 0,0100862134737163 0,0432440680552377 0,0013405055920046 0,0090380693389066 410540 1855090 623 665 0 True 257 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 301 667 0,00995238474876682 0,0100970898291735 0,0100099183642329 0,010101472495613 0,00137885984056262 0,00127234965798366 406339 440039 623 665 0 False 301 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 345 667 0,011451369338012 0,0100870854178247 0,00987258716716258 0,0100709544518196 0,00765943682400354 0,00134895196989229 467540 439603 623 665 0 False 345 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 389 667 0,0109479195866691 0,00990507855814863 0,0100099183642329 0,00991836423285267 0,00519451625764432 0,00120842461282401 446985 431671 623 665 0 False 389 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 434 667 0,0101143557147425 0,0101812094897349 0,0101472495613031 0,0102082856488899 0,00159418712532107 0,00151486986490671 412952 443705 623 665 0 False 434 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 478 667 0,00994021182118631 0,0100370633610807 0,00990310521095598 0,010101472495613 0,00156132102744736 0,00148843723707817 405842 437423 623 665 0 False 478 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 522 667 0,00992798990798173 0,00962057237394241 0,00991836423285267 0,00964370183871214 0,00175490636688023 0,00175774933764079 405343 419272 623 665 0 False 522 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 566 667 0,00990129274286552 0,00987563897154192 0,00990310521095598 0,00987258716716258 0,00154809722283045 0,0016139227327481 404253 430388 623 665 0 False 566 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 610 667 0,0099623288304523 0,0100257510335693 0,00993362325474937 0,00997940032043946 0,00132457024622111 0,00143265248449631 406745 436930 623 665 0 False 610 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 656 673 0,0101160212259608 0,0425776044597647 0,0101472495613031 0,0426947432669566 0,001473259121281 0,00906051905796286 413020 1855565 623 665 0 True 654 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G9_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G9_2.csv new file mode 100755 index 0000000..d8674c8 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G9_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 257 277 0,00893083854448525 0,702728921181416 0,0085145342183566 0,702098115510796 0,00256200909414298 0,18297765083936 364631 30625471 623 665 5 True 257 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 301 278 0,00725418309675114 0,00704654747420164 0,00714122224765393 0,00706492713817044 0,00161666726071854 0,00130309505009077 296176 307094 623 665 0 False 301 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 346 277 0,0067564156778 0,00669143676311401 0,00674448767833982 0,00671396963454643 0,00125720307276648 0,00129078719151467 275853 291618 623 665 0 True 345 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 389 277 0,00668842363159578 0,00677927365908477 0,00666819256885634 0,00679026474402991 0,00126325450705377 0,0011695080817721 273077 295446 623 665 0 True 389 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 433 277 0,00668325564825677 0,00709452734606028 0,00662241550316625 0,00714122224765393 0,00161570134825933 0,00154706840930323 272866 309185 623 665 0 True 434 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 477 278 0,00709191821703105 0,0071734382878689 0,00708018616006714 0,00704966811627375 0,00165943780631182 0,00181210166550051 289551 312624 623 665 0 True 478 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 521 277 0,00715018661685808 0,00733612470177504 0,0072480354009308 0,00730907148851759 0,00152454284327453 0,00157045882977123 291930 319714 623 665 0 True 522 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 565 278 0,00751091675248336 0,00753534098464288 0,00759899290455482 0,00756847486076143 0,00164960115847594 0,00163721227787203 306658 328396 623 665 0 True 566 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 610 278 0,00814204753295538 0,00817690828123181 0,00802624551766232 0,00823987182421607 0,00224468948219892 0,00184942902625523 332426 356356 623 665 0 False 610 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 654 277 0,00984647782953517 0,708517895792353 0,0098115510795758 0,70586709391928 0,00210217651849796 0,175171746624021 402015 30877759 623 665 8 True 654 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 257 321 0,00701824383843512 0,00694898151765314 0,00694285496299687 0,00701915007248035 0,00164198687915686 0,00137497935451157 286543 302842 623 665 0 False 257 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 301 321 0,00687344233369473 0,00673787925983418 0,00677500572213321 0,00671396963454643 0,00132938736043002 0,00119234799326199 280631 293642 623 665 0 False 301 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 345 322 0,00678088399702118 0,00679168738968043 0,0068055237659266 0,0068055237659266 0,00126230930429558 0,00131614113948645 276852 295987 623 665 0 True 345 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 390 321 0,00702186877461604 0,00698268904121141 0,00692759594110018 0,00700389105058366 0,00162029260007927 0,00115076892541512 286691 304311 623 665 0 True 389 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 434 321 0,00706583337221567 0,00709560580324696 0,00701915007248035 0,00714122224765393 0,00160255459807716 0,00160407556842528 288486 309232 623 665 0 True 434 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 478 322 0,00717945552723778 0,0072674705761887 0,00721751735713741 0,00727855344472419 0,00156859426267089 0,00164853072907208 293125 316722 623 665 0 True 478 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 522 321 0,0073128433815707 0,0073019353143674 0,00733958953231098 0,00737010757610437 0,00159318271962735 0,0016222798414625 298571 318224 623 665 0 True 522 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 566 322 0,00758745679008717 0,00760438519048824 0,00756847486076143 0,00755321583886473 0,00159921315180599 0,00150922460226751 309783 331405 623 665 0 True 566 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 610 321 0,00758081923802617 0,00780803003159076 0,00749217975127794 0,00790417334248875 0,0019705719269662 0,00201547648027986 309512 340280 623 665 0 False 610 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 654 321 0,00803726728307727 0,00770656327245213 0,00801098649576562 0,00779736018921187 0,00199669840564086 0,00170405344026171 328148 335858 623 665 0 False 654 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 258 367 0,00652809368402632 0,00651057719831738 0,00653086137178607 0,00653086137178607 0,00140604333891857 0,00139489418662918 266531 283736 623 665 0 True 257 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 302 367 0,00673030634017258 0,00679281173866229 0,00674448767833982 0,0068207827878233 0,00134421416146145 0,00129375247488441 274787 296036 623 665 0 True 301 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 346 366 0,00682088075907143 0,0071356234486422 0,00679026474402991 0,00715648126955062 0,00127317615908265 0,00135628153971262 278485 310976 623 665 0 True 345 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 390 365 0,0071835948124714 0,00718156113561542 0,00712596322575723 0,00715648126955062 0,0013695616249872 0,00127399288340445 293294 312978 623 665 0 True 389 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 434 365 0,00717193623394358 0,00738337030491082 0,00715648126955062 0,0072632944228275 0,0016104015511644 0,00166085801299891 292818 321773 623 665 0 True 434 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 478 364 0,00733625850987446 0,0073992947578376 0,00729381246662089 0,00747692072938125 0,00168048030513648 0,00166201806705645 299527 322467 623 665 0 False 478 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 522 365 0,00735235028738029 0,00726281255897813 0,00735484855420768 0,00727855344472419 0,00161505323520422 0,0015672530789922 300184 316519 623 665 0 True 522 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 566 366 0,00739589850717535 0,0075766665462007 0,00747692072938125 0,00756847486076143 0,0017059742780597 0,00174683464022825 301962 330197 623 665 0 True 566 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 610 366 0,00752010155699582 0,0074981227387535 0,00750743877317464 0,00744640268558785 0,00202628962512219 0,00200249084291439 307033 326774 623 665 0 True 610 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 654 365 0,00698598680498737 0,00717800452148912 0,00703440909437705 0,00711070420386053 0,00198030158691885 0,00219337244784986 285226 312823 623 665 0 True 654 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 258 411 0,00649336287656321 0,00660715648126955 0,00645456626230259 0,00662241550316625 0,00140743044955335 0,00162946354463369 265113 287945 623 665 0 True 257 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 302 411 0,00684155269242747 0,00672879268438893 0,00691233691920348 0,00674448767833982 0,00146501710013653 0,00133254236480632 279329 293246 623 665 0 True 301 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 346 410 0,00717458145764317 0,00718103337997087 0,00717174029144732 0,00718699931334401 0,00133298721042355 0,00127135973460139 292926 312955 623 665 0 True 345 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 390 410 0,00713774426834521 0,0071101535023184 0,00717174029144732 0,00708018616006714 0,00134364806946917 0,0014306090004098 291422 309866 623 665 0 True 389 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 434 410 0,00720274819148138 0,00743444787294398 0,00721751735713741 0,00740062561989776 0,00164351533018571 0,00161745467782454 294076 323999 623 665 0 True 434 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 478 411 0,00720343399021831 0,00782285308143327 0,00712596322575723 0,0076752880140383 0,00167258953746201 0,00210945872286534 294104 340926 623 665 0 True 478 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 523 410 0,00718499090275729 0,00747297403499594 0,00718699931334401 0,00758373388265812 0,00161935977216464 0,00168549211490701 293351 325678 623 665 0 True 522 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 566 410 0,00710734868861198 0,00747882523888114 0,00720225833524071 0,00750743877317464 0,00172240027444647 0,00168203159077074 290181 325933 623 665 0 True 566 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 611 410 0,00659662457209527 0,00662597211729255 0,00659189745937285 0,00653086137178607 0,00177162490586344 0,00182478374496588 269329 288765 623 665 0 True 610 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 654 410 0,00641665138927516 0,00632074578756344 0,00648508430609598 0,0063782711528191 0,00192810134877804 0,00172566807874417 261981 275463 623 665 0 True 654 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 258 455 0,00682825309549343 0,00667693495583775 0,00685130083161669 0,00671396963454643 0,00153758653311202 0,00142773277133906 278786 290986 623 665 0 True 257 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 302 454 0,00674194042588836 0,00669196451875856 0,00674448767833982 0,00666819256885634 0,00153342457297424 0,00153493929014146 275262 291641 623 665 0 True 301 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 346 454 0,00692404448335536 0,00719856404572888 0,00691233691920348 0,00711070420386053 0,0014787857777615 0,00172950203476575 282697 313719 623 665 0 True 345 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 390 454 0,00694356525454584 0,00753013226589018 0,00692759594110018 0,0072480354009308 0,00148721668808992 0,00211279706968624 283494 328169 623 665 0 True 389 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 434 454 0,00731950542644374 0,00743373655011872 0,00737010757610437 0,0072327763790341 0,00176577951090276 0,00260629361547256 298843 323968 623 665 0 True 434 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 478 454 0,00768182759485117 0,00742598083673363 0,00741588464179446 0,00738536659800107 0,00242667271525289 0,0020245504726108 313636 323630 623 665 0 True 478 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 522 454 0,00709191821703105 0,00709404548221091 0,00703440909437705 0,00704966811627375 0,00193890027701085 0,00171229546332715 289551 309164 623 665 0 True 522 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 566 451 0,00659361195621518 0,00653806638362902 0,00665293354695964 0,00653086137178607 0,00177281566541445 0,00195191351349828 269206 284934 623 665 0 False 566 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 610 454 0,00618352880434297 0,00634621573388725 0,00624093995574884 0,00634775310902571 0,0016552071001213 0,00178549806659816 252463 276573 623 665 0 True 610 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 654 453 0,00613522897901346 0,00636817495787994 0,00604257267109178 0,00643930724040589 0,00172539780649259 0,00190915071100209 250491 277530 623 665 0 True 654 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 257 499 0,00677329122529089 0,00678264670603035 0,00683604180972 0,00679026474402991 0,00141864640263597 0,00146803211267541 276542 295593 623 665 0 True 257 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 301 499 0,00656698826953507 0,00689817930039105 0,00656137941557946 0,00692759594110018 0,00148804287798762 0,0014681845430738 268119 300628 623 665 0 True 301 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 345 499 0,00680280506379092 0,00751175260192137 0,00685130083161669 0,00720225833524071 0,00148938979001297 0,00248178728597869 277747 327368 623 665 0 True 345 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 390 498 0,00734140200040144 0,00723642477675076 0,00715648126955062 0,00720225833524071 0,00235569234811523 0,00167317712634386 299737 315369 623 665 0 True 389 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 434 498 0,00722594288447684 0,00749043586306118 0,0072327763790341 0,00746166170748455 0,00189616991919423 0,00200061114561331 295023 326439 623 665 0 True 434 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 479 499 0,00689298759769724 0,00693863291784049 0,00679026474402991 0,00689707789730678 0,00193413269603251 0,00170968344281841 281429 302391 623 665 0 True 478 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 523 498 0,00676160815395104 0,00655158151730895 0,00666819256885634 0,00657663843747616 0,00178546399707699 0,00159345793719177 276065 285523 623 665 0 True 522 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 566 498 0,00635598269386887 0,0062777910672768 0,0063782711528191 0,00624093995574884 0,00179401920723297 0,00167593046826939 259504 273591 623 665 0 True 566 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 610 496 0,00616364064097199 0,00621471279480459 0,00616464484626535 0,00621042191195544 0,00177172248035586 0,00182884560551814 251651 270842 623 665 0 True 610 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 654 498 0,00618940707923094 0,00627680439368047 0,00617990386816205 0,00634775310902571 0,001703565726076 0,00185542676707837 252703 273548 623 665 0 True 654 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 258 543 0,00700942642610317 0,00686912979404336 0,00698863202868696 0,0068207827878233 0,00142436375721819 0,00152467261296676 286183 299362 623 665 0 True 257 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 301 542 0,00681634958884529 0,00677066894748889 0,00685130083161669 0,00685130083161669 0,00149574479829701 0,0014323664199081 278300 295071 623 665 0 True 301 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 346 542 0,00697743881358778 0,00687752799256094 0,00691233691920348 0,00685130083161669 0,00147658619779399 0,0013924237626251 284877 299728 623 665 0 True 345 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 389 542 0,00702321587927787 0,00678916334094564 0,00711070420386053 0,00674448767833982 0,00153293108491251 0,0013704719696337 286746 295877 623 665 0 True 389 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 434 542 0,00680045375383573 0,00680795603107104 0,00674448767833982 0,0068207827878233 0,00182908989204764 0,00197406322475713 277651 296696 623 665 0 True 434 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 478 543 0,0066678006838638 0,00674854910221307 0,00665293354695964 0,00671396963454643 0,0018189445382022 0,00194315706107431 272235 294107 623 665 0 True 478 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 522 542 0,00664859831922976 0,00664607272358052 0,00671396963454643 0,00662241550316625 0,00178971549035654 0,00181030469034307 271451 289641 623 665 0 True 522 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 566 542 0,00639348118909173 0,00647347368191594 0,00633249408712902 0,00642404821850919 0,00164257210154853 0,00174708573446211 261035 282119 623 665 0 True 566 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 611 542 0,00623248993559738 0,00641110673226899 0,00624093995574884 0,00642404821850919 0,00161687069225078 0,00160413741956343 254462 279401 623 665 0 True 610 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 654 542 0,00624020517138784 0,00631576652778662 0,00628671702143893 0,00634775310902571 0,00186304223349553 0,00189877886857528 254777 275246 623 665 0 True 654 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 258 587 0,00684919444978184 0,00672427234256389 0,00686655985351339 0,00672922865644312 0,0013229334199202 0,0012095646409299 279641 293049 623 665 0 True 257 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 301 586 0,00697721837827948 0,00689937248706568 0,00695811398489357 0,00689707789730678 0,0014255968968812 0,00147342013905353 284868 300680 623 665 0 True 301 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 345 586 0,00678602748754816 0,00676738768413366 0,0068207827878233 0,0068055237659266 0,00149464805066118 0,00143291251947627 277062 294928 623 665 0 True 345 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 390 586 0,00669207306058873 0,00672016502689546 0,00671396963454643 0,00672922865644312 0,00133320458372211 0,00120905572414077 273226 292870 623 665 0 True 389 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 434 586 0,00653411891578649 0,00662748654653342 0,00651560234988937 0,00668345159075303 0,00170475966578269 0,00193789962520767 266777 288831 623 665 0 True 434 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 478 587 0,00660140067044174 0,00656865326511518 0,00672922865644312 0,00654612039368277 0,00192304340904793 0,00179759003889853 269524 286267 623 665 0 True 478 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 522 586 0,00661636577859404 0,00666257082394703 0,00660715648126955 0,00660715648126955 0,00188974033838255 0,00183770438389382 270135 290360 623 665 0 True 522 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 566 581 0,00647901008871174 0,00667044126682006 0,00648508430609598 0,00665293354695964 0,00159247544741266 0,00181969295864796 264527 290703 623 665 0 False 566 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 610 586 0,0063492961561838 0,00653779103285795 0,00634775310902571 0,00653086137178607 0,00149412131175434 0,0014549303976062 259231 284922 623 665 0 True 610 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 654 585 0,0063651430055693 0,00630532614438362 0,00630197604333562 0,00636301213092241 0,00160687580928994 0,00140698675708674 259878 274791 623 665 0 True 654 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 257 624 0,00703401720938452 0,00710439408202355 0,00703440909437705 0,00715648126955062 0,00127422275259801 0,00130192666637353 287187 309615 623 665 0 False 257 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 301 624 0,0068211501800038 0,00674919158734557 0,00679026474402991 0,00674448767833982 0,00139710375373393 0,00134275948213439 278496 294135 623 665 0 False 301 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 346 630 0,00638508015456434 0,00664185067842414 0,0063782711528191 0,00662241550316625 0,00125133058718426 0,00133918764607312 260692 289457 623 665 0 True 345 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 390 630 0,00624978186089283 0,00648529081917428 0,00628671702143893 0,00648508430609598 0,00137423637441175 0,00120623681504118 255168 282634 623 665 0 True 389 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 434 624 0,0061759605254247 0,00633178276430376 0,00619516289005875 0,00628671702143893 0,00152955329945633 0,00176769456135054 252154 275944 623 665 0 False 434 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 478 624 0,00636325705904274 0,00646750774854279 0,00642404821850919 0,00645456626230259 0,00176202023153931 0,00190217225546967 259801 281859 623 665 0 False 478 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 522 624 0,00640638890103324 0,00640268558785382 0,00645456626230259 0,0063782711528191 0,0018868482432085 0,00187720763651148 261562 279034 623 665 0 False 522 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 566 624 0,00646992325544742 0,00611239703745516 0,00643930724040589 0,00617990386816205 0,00164086040060646 0,00171005790003025 264156 266383 623 665 0 False 566 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 610 624 0,00649973100769185 0,00647347368191594 0,00651560234988937 0,0063935301747158 0,00148625897335728 0,00140637731480667 265373 282119 623 665 0 False 610 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 654 624 0,00655040663578858 0,00664109346380371 0,00659189745937285 0,00669871061264973 0,00147285066431118 0,00143929919738868 267442 289424 623 665 0 False 654 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 259 673 0,00912472364454023 0,691492888779513 0,00839246204318303 0,69256122682536 0,0032930193417692 0,20477813124473 372547 30135796 623 665 8 True 257 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 301 667 0,00778371769290937 0,00687895063821146 0,00677500572213321 0,00689707789730678 0,0043773275958174 0,00121830739233284 317796 299790 623 665 0 False 301 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 345 667 0,00620094319369859 0,00643336425293033 0,00624093995574884 0,00642404821850919 0,00121862038866728 0,00129699568688464 253174 280371 623 665 0 False 345 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 389 667 0,00594864273694438 0,00625092142120006 0,005981536583505 0,00627145799954223 0,00123871110996868 0,00121913263915751 242873 272420 623 665 0 False 389 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 434 667 0,00612410924235037 0,00625764456919364 0,00607309071488518 0,00630197604333562 0,00150002339730522 0,00147781999039969 250037 272713 623 665 0 False 434 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 478 667 0,00642541981598305 0,00626032923921156 0,00631723506523232 0,00628671702143893 0,00164442509101716 0,00147750108465401 262339 272830 623 665 0 False 478 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 522 667 0,0064588525044084 0,00599082967202855 0,00634775310902571 0,00601205462729839 0,00165945459929636 0,00160480983734308 263704 261085 623 665 0 False 522 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 566 667 0,00617390312921391 0,00628162303217416 0,00622568093385214 0,00630197604333562 0,00147880162392683 0,00156879421155194 252070 273758 623 665 0 False 566 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 610 667 0,00667938578395552 0,0065318480453824 0,00669871061264973 0,0064087891966125 0,00129871479730448 0,00138453360698627 272708 284663 623 665 0 False 610 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 656 673 0,00903314502034802 0,688901585618888 0,00839246204318303 0,681101701380942 0,00321338227999185 0,20041719395776 368808 30022865 623 665 8 True 654 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G9_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G9_3.csv new file mode 100755 index 0000000..7f6fe02 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_G9_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 257 277 0,00120673635606474 0,0690315856016787 0,00105287251087205 0,0689555199511711 0,000863991138142236 0,0187941847417071 49269 3008450 623 665 0 True 257 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 301 278 0,000992056858593566 0,00100349293926049 0,000869764248111696 0,000900282291905089 0,000695605539786583 0,000697348367802954 40504 43733 623 665 0 False 301 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 346 277 0,000970870576184831 0,000898997321640104 0,000839246204318303 0,000762951094834821 0,000698009748646971 0,000697976037390672 39639 39179 623 665 0 True 345 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 389 277 0,000848896372259392 0,00096680244901565 0,000671396963454643 0,00080872816052491 0,000700269617712313 0,000703334995385494 34659 42134 623 665 0 True 389 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 433 277 0,000860628429223305 0,00085962216137735 0,000610360875867857 0,000595101853971161 0,000821394503304055 0,000811598926504127 35138 37463 623 665 0 True 434 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 477 278 0,000970258255884 0,000963911265919434 0,000793469138628214 0,00064087891966125 0,000825712834345082 0,000966763136743055 39614 42008 623 665 0 True 478 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 521 277 0,000959505911401416 0,000974168082141724 0,000747692072938125 0,000793469138628214 0,000823609546053486 0,000879297633768412 39175 42455 623 665 0 True 522 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 565 278 0,00102495070515418 0,00100592520440492 0,000839246204318303 0,000747692072938125 0,000854324564905903 0,000862478418253329 41847 43839 623 665 0 True 566 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 610 278 0,00107464662076959 0,00109975097964642 0,000686655985351339 0,000778210116731518 0,00108210122872215 0,00105690617782516 43876 47928 623 665 0 False 610 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 654 277 0,00127215665700548 0,0701133469976153 0,00100709544518196 0,0690012970168612 0,00104182838027456 0,0188118213049536 51940 3055594 623 665 0 True 654 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 257 321 0,000899694464416292 0,00094110304371595 0,000686655985351339 0,000778210116731518 0,000749312858922887 0,000712583053778454 36733 41014 623 665 0 False 257 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 301 321 0,000991958887345433 0,000885826376424008 0,000900282291905089 0,000762951094834821 0,000678659040566546 0,000652953047569758 40500 38605 623 665 0 False 301 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 345 322 0,000918357987185606 0,000896083192646299 0,000823987182421607 0,000747692072938125 0,000622194901998212 0,000696216919658977 37495 39052 623 665 0 True 345 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 390 321 0,000990023955194809 0,00093855604908357 0,000854505226215 0,000839246204318303 0,000721303046452722 0,000651618364110908 40421 40903 623 665 0 True 389 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 434 321 0,000914120730703859 0,000986903055303629 0,000656137941557946 0,000671396963454643 0,000851666912766259 0,000921579404512589 37322 43010 623 665 0 True 434 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 478 322 0,00101179806509234 0,00103607611383689 0,000778210116731518 0,000854505226215 0,000869340425271899 0,000847337814584808 41310 45153 623 665 0 True 478 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 522 321 0,000974250584245415 0,000962029702317134 0,00080872816052491 0,000762951094834821 0,000856906633512093 0,000838788946340976 39777 41926 623 665 0 True 522 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 566 322 0,00109068941265135 0,0010953912591045 0,000854505226215 0,000869764248111696 0,000955474918120107 0,000866457512503424 44531 47738 623 665 0 True 566 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 610 321 0,00107991257535673 0,000998972597435452 0,000625619897764553 0,000518806744487678 0,00116045171935795 0,00113041400400346 44091 43536 623 665 0 False 610 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 654 321 0,00109879653343434 0,00105975628014876 0,000717174029144732 0,000671396963454643 0,00105959384691556 0,000974519902099188 44862 46185 623 665 0 False 654 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 258 367 0,000889725889918771 0,00102501619119899 0,000701915007248035 0,000915541313801785 0,000798071468347576 0,000792292678730279 36326 44671 623 665 0 True 257 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 302 367 0,000925558873923373 0,000903861851928976 0,000793469138628214 0,000793469138628214 0,00069802437445202 0,000658705634014377 37789 39391 623 665 0 True 301 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 346 366 0,0009268325001491 0,000886744212327569 0,000823987182421607 0,000762951094834821 0,000658222464505201 0,000739285847692753 37841 38645 623 665 0 True 345 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 390 365 0,00100256427495582 0,000938005347541433 0,000823987182421607 0,000793469138628214 0,000720425521944615 0,000726813105943073 40933 40879 623 665 0 True 389 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 434 365 0,000927812212630429 0,000956935713052372 0,000625619897764553 0,000671396963454643 0,000837290090553744 0,000910440023435188 37881 41704 623 665 0 True 434 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 478 364 0,000959432432965317 0,000960239922305191 0,000717174029144732 0,00064087891966125 0,000837433221528338 0,000897859733369991 39172 41848 623 665 0 False 478 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 522 365 0,00111106743226299 0,000877519961496784 0,000823987182421607 0,000595101853971161 0,000945277318872229 0,000884418994072113 45363 38243 623 665 0 True 522 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 566 366 0,00102328519393592 0,00102026639039806 0,000747692072938125 0,00080872816052491 0,00098141798235466 0,000959349489585314 41779 44464 623 665 0 True 566 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 610 366 0,000959358954529217 0,00101925677090414 0,000503547722590982 0,000701915007248035 0,00106467590767763 0,00107948409789284 39169 44420 623 665 0 True 610 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 654 365 0,000935282520300561 0,00104812271007113 0,000610360875867857 0,000701915007248035 0,000966529436571415 0,00106241888268611 38186 45678 623 665 0 True 654 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 258 411 0,000947455447881072 0,000930341417746701 0,000778210116731518 0,000732433051041428 0,000795152125981981 0,000798724305865569 38683 40545 623 665 0 True 257 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 302 411 0,000923476984900549 0,000921392517686985 0,000823987182421607 0,00080872816052491 0,000691894473630772 0,000683496515782789 37704 40155 623 665 0 True 301 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 346 410 0,000908022020507587 0,000944820279125371 0,00080872816052491 0,000778210116731518 0,000678736893167471 0,00070722773139029 37073 41176 623 665 0 True 345 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 390 410 0,00103825030208822 0,00100709544518196 0,000885023270008392 0,000854505226215 0,000813454383122057 0,000810072408935499 42390 43890 623 665 0 True 389 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 434 410 0,000945177616361982 0,000972515977515315 0,000671396963454643 0,000747692072938125 0,000883300322480674 0,000781711363079608 38590 42383 623 665 0 True 434 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 478 411 0,000995289909781951 0,00103869194616204 0,000732433051041428 0,000823987182421607 0,000902501364019765 0,000843805202967529 40636 45267 623 665 0 True 478 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 523 410 0,000957693443310958 0,000943305849884496 0,000762951094834821 0,000732433051041428 0,000838425481089707 0,000848125054888703 39101 41110 623 665 0 True 522 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 566 410 0,000955562568664068 0,00102019755270529 0,000717174029144732 0,000793469138628214 0,000935175342552806 0,000870645751698371 39014 44461 623 665 0 True 566 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 611 410 0,000977263200125501 0,000968867579798661 0,000579842832074464 0,000656137941557946 0,00101323274235328 0,000958283863225053 39900 42224 623 665 0 True 610 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 654 410 0,00102465679140978 0,000984608465544727 0,000701915007248035 0,000534065766384375 0,000989496826753034 0,000997534780902346 41835 42910 623 665 0 True 654 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 258 455 0,000845589842634907 0,000907854438109465 0,000656137941557946 0,000701915007248035 0,000754631406451966 0,000803872701978718 34524 39565 623 665 0 True 257 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 302 454 0,000945569501354514 0,00106221149119078 0,00080872816052491 0,000854505226215 0,000793505254799836 0,000861333015217876 38606 46292 623 665 0 True 301 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 346 454 0,000931020771006781 0,000865220960389071 0,000823987182421607 0,000717174029144732 0,000733283394337058 0,000733134727132715 38012 37707 623 665 0 True 345 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 390 454 0,000975769138591475 0,000998513679483671 0,00080872816052491 0,000839246204318303 0,000808248387030079 0,000772734829366948 39839 43516 623 665 0 True 389 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 434 454 0,000933641501894335 0,000958977897937795 0,00064087891966125 0,000549324788281071 0,000928766696610801 0,00102479603543965 38119 41793 623 665 0 True 434 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 478 454 0,000913287975094729 0,000945348034769919 0,000564583810177768 0,000564583810177768 0,000953917440233504 0,000992690799674862 37288 41199 623 665 0 True 478 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 522 454 0,00094782284006157 0,000913131994554939 0,000625619897764553 0,000610360875867857 0,000889423503404359 0,000914311432993799 38698 39795 623 665 0 True 522 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 566 451 0,000991591495164935 0,000946334708366246 0,000625619897764553 0,000564583810177768 0,00101477874487677 0,00101017345043117 40485 41242 623 665 0 False 566 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 610 454 0,000990979174864105 0,00100466318003753 0,000595101853971161 0,000747692072938125 0,000979363509272635 0,000955275561454503 40460 43784 623 665 0 True 610 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 654 453 0,000913410439154895 0,000941401340384608 0,000579842832074464 0,000534065766384375 0,000915259776814037 0,00100318758770071 37293 41027 623 665 0 True 654 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 257 499 0,000985198871224265 0,000956224390227113 0,000839246204318303 0,00080872816052491 0,000788113780320906 0,000768777729677891 40224 41673 623 665 0 True 257 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 301 499 0,000881153405707144 0,000942915769625483 0,000747692072938125 0,000793469138628214 0,000755615979440585 0,000791591702855619 35976 41093 623 665 0 True 301 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 345 499 0,000979834945388989 0,00104885697879398 0,000885023270008392 0,000854505226215 0,00078768912134707 0,000879027322577354 40005 45710 623 665 0 True 345 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 390 498 0,000937266438075252 0,000918661955873892 0,000747692072938125 0,000686655985351339 0,000803919541984962 0,000812986873019171 38267 40036 623 665 0 True 389 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 434 498 0,0010499578662401 0,000967330204660197 0,000732433051041428 0,000671396963454643 0,00102733180541849 0,000985313478909256 42868 42157 623 665 0 True 434 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 479 499 0,000942067029233763 0,000933530897511575 0,000610360875867857 0,000595101853971161 0,000904410731545603 0,000910981643848663 38463 40684 623 665 0 True 478 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 523 498 0,000893816189528319 0,000889084693881648 0,000595101853971161 0,000610360875867857 0,000874957362242564 0,000852954128056445 36493 38747 623 665 0 True 522 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 566 498 0,000975205803914711 0,000965448641057898 0,00064087891966125 0,000701915007248035 0,000966884675024666 0,000917742101674589 39816 42075 623 665 0 True 566 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 610 496 0,000940377025203471 0,00094252568936647 0,000595101853971161 0,000610360875867857 0,000956465613702347 0,000934942321871681 38394 41076 623 665 0 True 610 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 654 498 0,000950566035009291 0,000864922663720413 0,000625619897764553 0,000396734569314107 0,000973149597452695 0,00100378406249119 38810 37694 623 665 0 True 654 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 258 543 0,000937119481203053 0,00096306226770864 0,000793469138628214 0,000793469138628214 0,00074996598575703 0,000782370272001173 38261 41971 623 665 0 True 257 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 301 542 0,00104447147634466 0,000883462948972339 0,000946059357595178 0,000701915007248035 0,000772897974607124 0,000728165840774675 42644 38502 623 665 0 True 301 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 346 542 0,000998522960970337 0,000911548727621296 0,000839246204318303 0,000793469138628214 0,000775117486095421 0,000736520945112992 40768 39726 623 665 0 True 345 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 389 542 0,00100356848024918 0,000983484116562865 0,000854505226215 0,00080872816052491 0,000798055519701141 0,000807629855720864 40974 42861 623 665 0 True 389 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 434 542 0,00092964917353292 0,000945600439643398 0,000564583810177768 0,000518806744487678 0,000956810161283341 0,00102879335786027 37956 41210 623 665 0 True 434 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 478 543 0,000918994800298469 0,0009221956241026 0,000564583810177768 0,000488288700694286 0,000975814973237635 0,00103800341731676 37521 40190 623 665 0 True 478 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 522 542 0,000941013838316335 0,000881145413315849 0,000549324788281071 0,000457770656900893 0,000979729187121159 0,000985540393173867 38420 38401 623 665 0 True 522 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 566 542 0,000908952747364849 0,000959459761787164 0,000595101853971161 0,00064087891966125 0,000905307115339559 0,000941411599063851 37111 41814 623 665 0 True 566 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 611 542 0,000876303828924566 0,000889199423369594 0,000579842832074464 0,000610360875867857 0,000849957706704901 0,000825862403236293 35778 38752 623 665 0 True 610 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 654 542 0,000930677871638316 0,000943604146553153 0,000595101853971161 0,000534065766384375 0,000969368074749227 0,000999352342688208 37998 41123 623 665 0 True 654 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 258 587 0,001042512051382 0,000923755945138653 0,000900282291905089 0,000762951094834821 0,000705858929181211 0,000682569724568094 42564 40258 623 665 0 True 257 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 301 586 0,000975793631403508 0,000956637416383715 0,00080872816052491 0,000778210116731518 0,000776952608988621 0,000765816571301827 39840 41691 623 665 0 True 301 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 345 586 0,000950590527821324 0,000971758762894877 0,000823987182421607 0,000854505226215 0,000751723285525921 0,000773415102858781 38811 42350 623 665 0 True 345 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 390 586 0,000986594961510158 0,000962006756419545 0,000839246204318303 0,000869764248111696 0,000732538793974502 0,000694100996001362 40281 41925 623 665 0 True 389 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 434 586 0,000929673666344954 0,00095558190509462 0,000549324788281071 0,000564583810177768 0,000942219745264094 0,0010275211934991 37957 41645 623 665 0 True 434 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 478 587 0,00087975731542125 0,000914807045078937 0,000488288700694286 0,000534065766384375 0,000962723512621581 0,000962289167335673 35919 39868 623 665 0 True 478 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 522 586 0,000981280021298949 0,000878529580990701 0,000518806744487678 0,000411993591210803 0,00109186672222073 0,0010611450244021 40064 38287 623 665 0 True 522 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 566 581 0,000896730834160272 0,000961479000774998 0,000564583810177768 0,000564583810177768 0,000886424005937336 0,000989961546961759 36612 41902 623 665 0 False 566 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 610 586 0,00092827757605906 0,000966435314654225 0,000701915007248035 0,000717174029144732 0,000792586900121144 0,000824476171531783 37900 42118 623 665 0 True 610 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 654 585 0,000932808746285206 0,000886514753351679 0,000686655985351339 0,000747692072938125 0,000827564711802114 0,000734018580712961 38085 38635 623 665 0 True 654 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 257 624 0,000950590527821324 0,000950969779679228 0,000762951094834821 0,00080872816052491 0,000689713789415445 0,00070285843077018 38811 41444 623 665 0 False 257 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 301 624 0,00106227775069281 0,000963567077455598 0,000976577401388571 0,000854505226215 0,000760302575384393 0,000671938465888676 43371 41993 623 665 0 False 301 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 346 630 0,000936727596210521 0,000968064473383046 0,000823987182421607 0,000854505226215 0,000674441086575556 0,000693975221392811 38245 42189 623 665 0 True 345 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 390 630 0,000904544041198869 0,000864968555515591 0,000762951094834821 0,000762951094834821 0,000639197031515827 0,000622167455723505 36931 37696 623 665 0 True 389 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 434 624 0,00096660882689105 0,000830297304258587 0,000656137941557946 0,000442511635004196 0,000923305497207203 0,000861202798197965 39465 36185 623 665 0 False 434 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 478 624 0,000965898535342087 0,000907579087338396 0,000564583810177768 0,000579842832074464 0,00101081683390122 0,000926347383627846 39436 39553 623 665 0 False 478 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 522 624 0,000892518070490558 0,000889589503628607 0,000503547722590982 0,000534065766384375 0,000988546424350112 0,000961006273656893 36440 38769 623 665 0 False 522 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 566 624 0,00089648590603994 0,000953034910462239 0,000656137941557946 0,000671396963454643 0,000854046395653014 0,000887355738381201 36602 41534 623 665 0 False 566 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 610 624 0,00100271123182802 0,000976439726003037 0,000839246204318303 0,000839246204318303 0,000797233414418021 0,000728053050613984 40939 42554 623 665 0 False 610 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 654 624 0,0010493700387513 0,00103148693431909 0,000885023270008392 0,000885023270008392 0,000794029020248412 0,000797604904286123 42844 44953 623 665 0 False 654 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 259 673 0,00109661667316339 0,0684381587982316 0,000946059357595178 0,067505912870985 0,000765137116506219 0,0213154065859991 44773 2982588 623 665 0 True 257 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 301 667 0,00106710283466335 0,00100748552544098 0,000915541313801785 0,000900282291905089 0,000795088526062985 0,000683053607386684 43568 43907 623 665 0 False 301 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 345 667 0,000962738962589801 0,000979124396020952 0,000839246204318303 0,000854505226215 0,000674815749945817 0,00070820702229892 39307 42671 623 665 0 False 345 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 389 667 0,000896877791032471 0,000912604238910391 0,000732433051041428 0,000793469138628214 0,000711729241759699 0,00066342953757794 36618 39772 623 665 0 False 389 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 434 667 0,000873830054909211 0,000855721358787218 0,00064087891966125 0,000686655985351339 0,000777052996164392 0,000707625453495106 35677 37293 623 665 0 False 434 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 478 667 0,000894085610460684 0,000946816572215616 0,000625619897764553 0,000747692072938125 0,000832942407102669 0,000773071800426152 36504 41263 623 665 0 False 478 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 522 667 0,000974789426110146 0,000881994411526642 0,00064087891966125 0,000610360875867857 0,000909107807212639 0,000824064047273906 39799 38438 623 665 0 False 522 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 566 667 0,00090158041094285 0,000904137202700044 0,000671396963454643 0,000686655985351339 0,000793694367801385 0,000803251645426838 36810 39403 623 665 0 False 566 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 610 667 0,000972756522711389 0,000930249634156345 0,000854505226215 0,000762951094834821 0,000707607518199324 0,000701674815843004 39716 40541 623 665 0 False 610 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 656 673 0,00115008448183191 0,0681199909822622 0,000961318379491875 0,0666361486228733 0,000852077283371227 0,0208869748516041 46956 2968722 623 665 0 True 654 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H10_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H10_1.csv new file mode 100755 index 0000000..183eced --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H10_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 276 259 0,011320059565529 0,0427793218454697 0,0113221942473487 0,0434424353398947 0,00146650869787157 0,00807561817307218 429537 1864356 579 665 0 True 276 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 319 259 0,0109552661612214 0,0107228932941188 0,010955977721828 0,0107118333714809 0,00139552189935718 0,00138199841280693 415695 467312 579 665 0 False 319 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 365 259 0,010946753788039 0,0538866048159997 0,0109407186999313 0,0543984130617227 0,00140243576739636 0,00830850170509407 415372 2348420 579 665 0 True 363 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 409 257 0,0112620014908512 0,0745063849828279 0,0110322728313115 0,0747386892500191 0,00194476443788756 0,0123846516109049 427334 3247046 579 665 0 True 407 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 452 258 0,0106573594539326 0,0618738881995559 0,0107118333714809 0,0612802319371328 0,00179271381568313 0,0128861348288946 404391 2696512 579 665 0 True 450 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 495 258 0,0107373704910282 0,0563657484292099 0,0106660563057908 0,0575722896162356 0,00170153959705517 0,0167353968882533 407427 2456463 579 665 0 True 494 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 541 258 0,0108281339995122 0,0722401334074486 0,0107270923933776 0,0730754558632792 0,00156865857386024 0,0191926796955184 410871 3148281 579 665 0 True 538 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 584 258 0,0109631723901835 0,0665300926842168 0,0109712367437247 0,0679636835278859 0,00184630977163581 0,0190314133472902 415995 2899433 579 665 0 True 582 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 625 259 0,0107636982334717 0,0106397832530514 0,0107728694590677 0,0107118333714809 0,00189116833049901 0,00191178271750784 408426 463690 579 665 0 False 625 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 670 258 0,0106095531228089 0,0431595353685197 0,0107118333714809 0,0433966582742046 0,001795912985172 0,00859675262968092 402577 1880926 579 665 0 True 669 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 275 301 0,0108936502835108 0,0105831298319041 0,0108796826123445 0,0105897611963073 0,00149502897595366 0,00146340249877397 413357 461221 579 665 0 False 275 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 319 301 0,0105527863988616 0,0105051137801014 0,0105287251087205 0,0104676890211337 0,00136406765968847 0,0012783048511445 400423 457821 579 665 0 False 319 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 365 302 0,0110587323442377 0,0963398195649343 0,0110475318532082 0,0992446784161135 0,00135882736665504 0,0255580810113504 419621 4198564 579 665 0 True 363 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 409 303 0,0107404802744199 0,0436816233763626 0,0106813153276875 0,044281681544213 0,00169642951229183 0,00703832878527521 407545 1903679 579 665 0 True 407 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 452 302 0,0110160123537463 0,0704067332441885 0,0108949416342412 0,0705577172503243 0,00200153425151499 0,0149904986165873 418000 3068380 579 665 0 True 450 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 494 302 0,0110249463924734 0,0348702380808969 0,0109864957656214 0,0370641641870756 0,00198960323443774 0,00880082437342541 418339 1519672 579 665 0 False 494 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 539 302 0,0106287125509935 0,0390905622949569 0,0106660563057908 0,0395361257343404 0,00164143743649772 0,0100619665729616 403304 1703597 579 665 0 True 538 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 584 302 0,0108943354900208 0,0442615579920274 0,0107728694590677 0,0452582589456016 0,00200481757741266 0,00943181585159816 413383 1928953 579 665 0 True 582 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 625 302 0,0105585052378108 0,0106621784490983 0,0104982070649271 0,0106660563057908 0,00201962474782575 0,00194535285711632 400640 464666 579 665 0 False 625 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 669 302 0,0106100011424501 0,0106314538922266 0,010757610437171 0,0106507972838941 0,00209171719170285 0,00193347875274656 402594 463327 579 665 0 False 669 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 277 341 0,0107137045123352 0,0454221156002848 0,0107270923933776 0,0460212100404364 0,00152435920650153 0,0102992980299046 406529 1979531 579 665 0 True 275 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 321 341 0,0106702202530441 0,0570938217597094 0,0106507972838941 0,0575875486381323 0,00146486594893854 0,0174167288415151 404879 2488193 579 665 0 True 319 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 365 340 0,0113328676564475 0,0348171871656711 0,0109712367437247 0,0358281834134432 0,0026567407783857 0,00622642034796327 430023 1517360 579 665 0 True 363 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 408 341 0,0111673375760793 0,0332541126219073 0,0110017547875181 0,0330815594720378 0,00209966766983782 0,00647684226895061 423742 1449240 579 665 0 True 407 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 453 340 0,0114659558439748 0,0626111169431934 0,0112764171816587 0,0615854123750668 0,00261992923002771 0,0122970101537273 435073 2728641 579 665 0 True 450 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 494 345 0,0116582353323311 0,0281858916001379 0,0114290074006256 0,0300450141145953 0,00215454094409916 0,00896719324408322 442369 1228363 579 665 0 False 494 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 540 341 0,0106372776323691 0,0247057561505044 0,0106660563057908 0,024933241779202 0,00177408574895642 0,003257704615592 403629 1076696 579 665 0 True 538 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 585 340 0,0107979322048773 0,0468022425025714 0,0106813153276875 0,0467078660257877 0,0021241764860391 0,00927354541040278 409725 2039678 579 665 0 True 582 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 629 340 0,0104536159335814 0,0495353054185016 0,0103761348897536 0,0502174410620279 0,00200276829091652 0,0112668496148837 396660 2158787 579 665 0 True 625 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 673 340 0,0105295947939064 0,0594254461973198 0,0105592431525139 0,0589913786526284 0,00193810744450848 0,0166066499169737 399543 2589807 579 665 0 True 669 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 275 387 0,0110772065659123 0,03836446231165 0,011108567940795 0,0418097199969482 0,00174930063725881 0,0111737730755438 420322 1671953 579 665 0 False 275 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 321 385 0,0108343799203922 0,0306827265003892 0,0107881284809644 0,0302891584649424 0,00136643352024616 0,00516527913794033 411108 1337177 579 665 0 True 319 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 365 385 0,0110162231865186 0,0769373422111011 0,0109864957656214 0,0763561455710689 0,00146819124115355 0,016745343658601 418008 3352989 579 665 0 True 363 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 409 384 0,0109029532795894 0,0596330147869101 0,0108644235904479 0,0588845654993515 0,0015273805164287 0,0164513085405338 413710 2598853 579 665 0 True 407 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 454 385 0,0109517083581885 0,0390130969446964 0,0110017547875181 0,0391088731212329 0,00172707538045958 0,00792902876917585 415560 1700221 579 665 0 True 450 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 497 385 0,0109477552437075 0,0478681023914788 0,0109102006561379 0,0482795452811475 0,00171164428849847 0,00985937720579035 415410 2086129 579 665 0 True 494 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 541 385 0,0108312174288074 0,0383884407746306 0,0108949416342412 0,0386816205081254 0,00178630415144874 0,00588319909371877 410988 1672998 579 665 0 True 538 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 585 384 0,010747068798555 0,0474255907564746 0,010757610437171 0,0467841611352712 0,00189894906444372 0,00940879521264437 407795 2066844 579 665 0 True 581 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 629 384 0,0106851630257823 0,040240633628016 0,0107118333714809 0,0397344930189975 0,00197246024783084 0,00907851641727215 405446 1753718 579 665 0 True 625 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 673 385 0,0109757432942331 0,080731285756162 0,0108339055466545 0,0792401007095445 0,00213671183783233 0,0174666139302074 416472 3518332 579 665 0 True 669 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 277 429 0,0108039936470815 0,0426270987608642 0,0108339055466545 0,0426184481574731 0,00159914825168599 0,00849048006569875 409955 1857722 579 665 0 True 275 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 321 429 0,0107051921391528 0,0494516446758921 0,0107270923933776 0,0496528572518502 0,00153723510224042 0,00610829007424489 406206 2155141 579 665 0 True 319 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 366 428 0,0107917389921904 0,0318979871284987 0,0107423514152743 0,0327763790341039 0,00144605401963407 0,00457588251937277 409490 1390139 579 665 0 True 363 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 410 428 0,0111761925525168 0,047799585941278 0,0112306401159686 0,0488441290913252 0,00158149290248616 0,00838596832110896 424078 2083143 579 665 0 True 406 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 454 428 0,0112767597849137 0,0879558245579616 0,0112153810940719 0,088014038300145 0,00180092576711841 0,0130545555219093 427894 3833183 579 665 0 True 450 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 498 428 0,010972712573131 0,0544720005552907 0,0110627908751049 0,0540474555580987 0,0017578080294496 0,0115974109084652 416357 2373932 579 665 0 True 494 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 542 428 0,0109740039238614 0,0492488717788979 0,0110322728313115 0,0490882734416724 0,00176570163712877 0,00917616723658173 416406 2146304 579 665 0 True 538 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 581 430 0,0114072652709801 0,0272883169241483 0,0112764171816587 0,0293583581292439 0,00224571818334949 0,0067819222710624 432846 1189246 579 665 0 False 581 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 629 428 0,0108062600993839 0,0400825822854229 0,0108339055466545 0,0396276798657206 0,00212675712160834 0,00804500044934828 410041 1746830 579 665 0 True 625 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 674 428 0,011073727825169 0,0717157278639492 0,0109254596780346 0,0719157701991302 0,00228208834117625 0,00994713895691064 420190 3125427 579 665 0 True 669 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 277 473 0,0109554506398972 0,0505607575817548 0,0108796826123445 0,0515602349889372 0,00161063104105169 0,0132949685163203 415702 2203477 579 665 0 True 275 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 320 473 0,0112873804858193 0,050262047886941 0,0112306401159686 0,0516670481422141 0,00185585710705015 0,00894335396724511 428297 2190459 579 665 0 True 319 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 365 473 0,0111557681276982 0,0658976349089708 0,0110933089188983 0,0667124437323568 0,00162155081213015 0,0130690803186735 423303 2871870 579 665 0 True 363 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 409 472 0,0114365183181395 0,080105688804295 0,011306935225452 0,079316395819028 0,0018232846152245 0,0195592116423457 433956 3491068 579 665 0 True 406 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 453 473 0,0112510381866906 0,0890626887658606 0,011306935225452 0,0866712443732357 0,00201295479607882 0,0272311988124517 426918 3881421 579 665 0 True 450 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 498 472 0,0111098065833324 0,0435853882818743 0,0111238269626917 0,0446021210040436 0,00192256451234684 0,00693596342976233 421559 1899485 579 665 0 True 494 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 542 471 0,0110459242533193 0,03556829817735 0,0109864957656214 0,0372320134279393 0,00184555843711471 0,00571367495592338 419135 1550094 579 665 0 True 538 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 584 472 0,0111567695833668 0,0888998417306714 0,0111390859845884 0,0868696116578927 0,00202689000669602 0,018221749328562 423341 3874324 579 665 0 True 581 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 629 471 0,0105974302384005 0,0603036545357443 0,0106202792401007 0,0609140154116121 0,0019597152966446 0,017589348469149 402117 2628080 579 665 0 True 625 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 673 472 0,0109338402807344 0,0714939787096489 0,0109102006561379 0,0703135728999771 0,00203608726049488 0,0136871126153635 414882 3115763 579 665 0 True 669 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 277 517 0,0106496377036463 0,048307378654923 0,0105287251087205 0,0503700312809949 0,00164944571318797 0,0116811133532067 404098 2105273 579 665 0 True 275 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 321 517 0,0110295320052713 0,0982833141448265 0,0109254596780346 0,095399404898146 0,00166094678414656 0,0256406825463942 418513 4283263 579 665 0 True 319 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 365 516 0,0112343823976773 0,0517049318191335 0,011261158159762 0,0539406424048219 0,00159329830467689 0,0112570135490846 426286 2253341 579 665 0 True 363 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 409 516 0,0113790927417787 0,0538198322540157 0,0113832303349355 0,0540627145799954 0,00174072193068219 0,00989186533857731 431777 2345510 579 665 0 True 406 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 452 516 0,0114954197239066 0,0532144047461295 0,0113527122911421 0,0545662623025864 0,00197604713858104 0,0106491867805104 436191 2319125 579 665 0 True 450 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 497 517 0,0112325376109195 0,0577622816482727 0,0111238269626917 0,0576638437476158 0,00197298779485131 0,0129361261161986 426216 2517325 579 665 0 True 494 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 541 516 0,0109467274339425 0,0702554968331793 0,0108949416342412 0,0674296177615015 0,00180188406287 0,0256258364078175 415371 3061789 579 665 0 True 538 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 585 516 0,0109303351858945 0,0545821867555132 0,0109864957656214 0,0550087739375906 0,00179352229618323 0,0129434563182687 414749 2378734 579 665 0 True 581 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 629 516 0,0105420075733767 0,0408306414927224 0,0106355382619974 0,0398718242160677 0,0019548781033297 0,00803907343376362 400014 1779431 579 665 0 True 625 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 673 516 0,0107455402609556 0,0582243661339203 0,0107423514152743 0,0580605783169299 0,00199082802455524 0,0143451600985 407737 2537463 579 665 0 True 669 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 277 561 0,0105463823534024 0,0414711532780222 0,0104676890211337 0,0420996414129854 0,00151794897190734 0,00870708751009166 400180 1807345 579 665 0 True 275 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 320 561 0,0110464776893466 0,0485257088704825 0,0109254596780346 0,0498207064927138 0,00165383568739021 0,0117846928962032 419156 2114788 579 665 0 True 319 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 365 560 0,010983596815002 0,0460109991160093 0,0110017547875181 0,0466163118944076 0,00155963071416719 0,00971888118433751 416770 2005195 579 665 0 True 362 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 409 560 0,0112958137967121 0,0489407083742774 0,0112916762035554 0,0488441290913252 0,00173833318483603 0,00924104197609258 428617 2132874 579 665 0 True 406 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 453 560 0,0113810956531158 0,0823087244318166 0,0115663385976959 0,0791485465781643 0,0021322144087202 0,0208862890632611 431853 3587078 579 665 0 True 450 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 497 561 0,0114675370897672 0,0599529035451985 0,0114442664225223 0,0593423361562524 0,00225803645691816 0,0133857585991962 435133 2612794 579 665 0 True 494 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 541 561 0,0111826493061691 0,0515253113328067 0,0112153810940719 0,0519264515144579 0,00197900163901273 0,00917515497452538 424323 2245513 579 665 0 True 537 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 586 560 0,010695783726688 0,0341499893014753 0,0107728694590677 0,0348668650339513 0,00167538051267078 0,00633300473014135 405849 1488283 579 665 0 True 581 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 630 561 0,0108386229299351 0,0447715076200458 0,0108644235904479 0,0450446326390478 0,0017911154826631 0,00728642250209115 411269 1951177 579 665 0 True 625 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 673 560 0,0108685348295081 0,0468148168544502 0,0108033875028611 0,04614328221561 0,00183282621562622 0,00712808088490546 412404 2040226 579 665 0 True 669 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 275 601 0,0100421757783979 0,0103675531240553 0,0100556954299229 0,0104219119554437 0,00135709105031931 0,00144299501383755 381048 451826 579 665 0 False 275 601 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 319 602 0,0106511135330526 0,0108701141730499 0,0106965743495842 0,010757610437171 0,00147530571955255 0,00173810280194168 404154 473728 579 665 0 False 319 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 365 604 0,0110253417039215 0,0687666981599111 0,010955977721828 0,0679636835278859 0,00156988033110342 0,0139493564019515 418354 2996906 579 665 0 True 362 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 409 604 0,011182253994721 0,073432172787198 0,0111390859845884 0,0712138551918822 0,00170359741624504 0,0226418257402524 424308 3200231 579 665 0 True 406 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 450 602 0,0111219031136443 0,0108517574549787 0,0109254596780346 0,0108186465247578 0,00227097545620938 0,0019981109723142 422018 472928 579 665 0 False 450 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 494 602 0,0126589267320538 0,0108208263850287 0,0108796826123445 0,0108033875028611 0,00889446431490828 0,00236980866139643 480340 471580 579 665 0 False 494 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 537 602 0,0103485685047727 0,0103226021106784 0,0103456168459602 0,0103303578240635 0,00195256898844395 0,00199688453679236 392674 449867 579 665 0 False 537 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 581 602 0,0104283160009029 0,0105225297163715 0,0104219119554437 0,0105592431525139 0,00179199956851659 0,00185000985895127 395700 458580 579 665 0 False 581 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 625 602 0,0106272103674907 0,0106845048074524 0,0106813153276875 0,0106202792401007 0,00146753196506458 0,00169574416849916 403247 465639 579 665 0 False 625 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 669 602 0,0103331250042002 0,0105703719128446 0,0102998397802701 0,0105745021744106 0,00162495210216606 0,0016417953568416 392088 460665 579 665 0 False 669 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 275 649 0,0106399657502161 0,0406167168895 0,0106660563057908 0,0418554970626383 0,0014469492956568 0,0092234270684145 403731 1770108 579 665 0 True 275 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 319 644 0,0105113314050041 0,010254567524327 0,0104371709773404 0,0102388036926833 0,00126640842733208 0,00133339063725963 398850 446902 579 665 0 False 319 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 362 644 0,0105493867204079 0,0102226727266782 0,0105592431525139 0,0101930266269932 0,00144047246234079 0,00123909138658025 400294 445512 579 665 0 False 362 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 406 645 0,0104647637164178 0,0101540186010919 0,010452429999237 0,0101625085831998 0,00148525348438881 0,00133006644830413 397083 442520 579 665 0 False 406 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 450 645 0,0106829756357695 0,010563763494339 0,0107423514152743 0,0106202792401007 0,00166225499267837 0,00168134410544903 405363 460377 579 665 0 False 450 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 494 645 0,0104846610593055 0,0104735172791214 0,0104219119554437 0,0104371709773404 0,00178971462048656 0,00184450828969391 397838 456444 579 665 0 False 494 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 537 645 0,01041226635611 0,0103122305649682 0,0104676890211337 0,0102998397802701 0,00181714920268019 0,00167395294344352 395091 449415 579 665 0 False 537 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 581 645 0,0104118446905654 0,0103643636442904 0,010452429999237 0,0102845807583734 0,00151953916306731 0,00132814167968326 395075 451687 579 665 0 False 581 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 625 645 0,0105225846042267 0,0103568144439836 0,0105134660868238 0,0103913939116503 0,00141786775463266 0,00141621355441368 399277 451358 579 665 0 False 625 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 673 649 0,011052987151192 0,0422948192178776 0,0109407186999313 0,0435034714274815 0,00153540500726272 0,00866380662427667 419403 1843241 579 665 0 True 669 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H10_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H10_2.csv new file mode 100755 index 0000000..a39a3a1 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H10_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 276 259 0,00995815891862817 0,67241846892351 0,0089723048752575 0,680399786373693 0,00402894196615439 0,184333937396319 377860 29304518 579 665 3 True 276 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 319 259 0,00745965879614751 0,00677601534162713 0,00706492713817044 0,00679026474402991 0,00256820884536317 0,00122993434163569 283055 295304 579 665 0 False 319 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 365 259 0,00640394004284913 0,00649440034051712 0,00651560234988937 0,00648508430609598 0,00115096705308958 0,00117776797918293 242996 283031 579 665 0 True 363 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 409 257 0,00606030897806325 0,00608825795319152 0,00599679560540169 0,00616464484626535 0,00130488892893832 0,00131314860106871 229957 265331 579 665 0 True 407 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 452 258 0,00592801141343213 0,00606857037306014 0,00601205462729839 0,00605783169298848 0,00159970901040961 0,00155753278391775 224937 264473 579 665 0 True 450 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 495 258 0,0061153363316389 0,00619871950418505 0,00614938582436866 0,00614938582436866 0,00153775620447223 0,00149885301593997 232045 270145 579 665 0 True 494 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 541 258 0,00622952863194699 0,00644880684200774 0,00619516289005875 0,0064087891966125 0,00142993553691214 0,00141074194409459 236378 281044 579 665 0 True 538 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 584 258 0,00659195016756593 0,00641888539155166 0,00660715648126955 0,00645456626230259 0,00150346351454376 0,00168767556742928 250130 279740 579 665 0 True 582 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 625 259 0,00698072579972494 0,0069848000637896 0,00695811398489357 0,00703440909437705 0,00178508971101998 0,00165704353441066 264882 304403 579 665 0 False 625 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 670 258 0,00909034487366044 0,664636298918503 0,00883497367818723 0,666086823834592 0,002261930120556 0,187035287207482 344931 28965365 579 665 3 True 669 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 275 301 0,00701706809885369 0,00662526079446729 0,00674448767833982 0,00668345159075303 0,00221611686216486 0,00144595769713848 266261 288734 579 665 0 False 275 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 319 301 0,00645909916690748 0,00614615045280861 0,00646982528419928 0,00613412680247196 0,00126393541554024 0,00110866144829452 245089 267854 579 665 0 False 319 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 365 302 0,00640169994464322 0,00642556264775007 0,00631723506523232 0,00636301213092241 0,00134067284687586 0,00133196614925225 242911 280031 579 665 0 True 363 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 409 303 0,00608497641242474 0,00602430773661093 0,00607309071488518 0,00604257267109178 0,0013969124519046 0,00140689010550371 230893 262544 579 665 0 True 407 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 452 302 0,00588381559353444 0,00624158244088133 0,00585946440833143 0,00633249408712902 0,00160131236406693 0,00170846794385048 223260 272013 579 665 0 True 450 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 494 302 0,00614978113581676 0,00639456274010731 0,00611886778057527 0,0063782711528191 0,00175553164716934 0,00161360287630917 233352 278680 579 665 0 False 494 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 539 302 0,00615626424356561 0,00629100790428807 0,00616464484626535 0,00630197604333562 0,00153494638071211 0,00142013964547226 233598 274167 579 665 0 True 538 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 584 302 0,006291697945685 0,00631471101649753 0,00622568093385214 0,00633249408712902 0,00172524317051269 0,00193652945861885 238737 275200 579 665 0 True 582 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 625 302 0,00662534080788219 0,00666647162653716 0,00665293354695964 0,00662241550316625 0,0018559869631207 0,00191540764329624 251397 290530 579 665 0 False 625 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 669 302 0,00705064321784573 0,00708165469751284 0,00709544518196384 0,00709544518196384 0,00185161795818977 0,00181064344405994 267535 308624 579 665 0 False 669 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 277 341 0,00620667963024675 0,00648985705279449 0,00621042191195544 0,00648508430609598 0,00132922536404206 0,00141418939360109 235511 282833 579 665 0 True 275 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 321 341 0,00623603809379238 0,00632517434579812 0,00621042191195544 0,00636301213092241 0,00125003596690687 0,00122961758349869 236625 275656 579 665 0 True 319 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 365 340 0,00635117914157592 0,0064931842079449 0,0063782711528191 0,00657663843747616 0,00128032023472036 0,00132311145469947 240994 282978 579 665 0 True 363 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 408 341 0,00638960341433133 0,00650438180596834 0,0063935301747158 0,00648508430609598 0,00141181360975916 0,00137039492462646 242452 283466 579 665 0 True 407 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 453 340 0,00646555592055979 0,00637248878662667 0,00653086137178607 0,0063782711528191 0,00159112238783692 0,00154220563496702 245334 277718 579 665 0 True 450 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 494 345 0,00637321116628341 0,006390616045722 0,00636301213092241 0,0063782711528191 0,00153364072948813 0,0015326650478462 241830 278508 579 665 0 False 494 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 540 341 0,00622238667178463 0,00632184719064771 0,00622568093385214 0,00631723506523232 0,0015913826037439 0,00150553140322745 236107 275511 579 665 0 True 538 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 585 340 0,00646379019609161 0,00664182773252656 0,00643930724040589 0,00663767452506294 0,00185972041860645 0,00198748999553719 245267 289456 579 665 0 True 582 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 629 340 0,00631459965557831 0,00648937518894513 0,00630197604333562 0,00660715648126955 0,00181939381424062 0,00186265836629889 239606 282812 579 665 0 True 625 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 673 340 0,0061674383804986 0,00616824735218683 0,00622568093385214 0,00610360875867857 0,00180768582784266 0,00186993712732324 234022 268817 579 665 0 True 669 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 275 387 0,006191710503412 0,00637884480025883 0,00619516289005875 0,0063782711528191 0,00136939064560843 0,00143301805157474 234943 277995 579 665 0 False 275 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 321 385 0,00656865314622452 0,00646971055471134 0,00659189745937285 0,00645456626230259 0,00126546446275229 0,00128688731482341 249246 281955 579 665 0 True 319 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 365 385 0,0065612739991933 0,00659813874351707 0,00657663843747616 0,00656137941557946 0,00132481628204324 0,00136702323874276 248966 287552 579 665 0 True 363 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 409 384 0,00651918650701882 0,00666243314856149 0,00657663843747616 0,00674448767833982 0,0015379864550877 0,00142167060129797 247369 290354 579 665 0 True 407 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 454 385 0,00662913579778396 0,00670853145681783 0,00666819256885634 0,00666819256885634 0,00160586306341384 0,00160471647571199 251541 292363 579 665 0 True 450 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 497 385 0,00652453638861645 0,00663269526528613 0,00645456626230259 0,00665293354695964 0,001634493832232 0,00174900311947921 247572 289058 579 665 0 True 494 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 541 385 0,00637916719210147 0,00664579737280946 0,00646982528419928 0,00671396963454643 0,00161337424136422 0,00158760550461806 242056 289629 579 665 0 True 538 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 585 384 0,00630318833177647 0,00646594742750674 0,00636301213092241 0,00654612039368277 0,00181049928661216 0,00192659722572293 239173 281791 579 665 0 True 581 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 629 384 0,00611035540739282 0,00591848125693038 0,00605783169298848 0,0059510185397116 0,00187011203644516 0,00183445604293142 231856 257932 579 665 0 True 625 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 673 385 0,00606998093149345 0,00594103707426038 0,00607309071488518 0,0059662775616083 0,00175656780267993 0,00193519327736305 230324 258915 579 665 0 True 669 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 277 429 0,00623045102532589 0,00616976178142771 0,00628671702143893 0,00619516289005875 0,00156223523022682 0,00144623654196754 236413 268883 579 665 0 True 275 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 321 429 0,0065352888600048 0,00663361310118969 0,00659189745937285 0,00657663843747616 0,0013587927723767 0,00149774639690771 247980 289098 579 665 0 True 319 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 366 428 0,0064704314284197 0,00668278615972295 0,00642404821850919 0,00666819256885634 0,00130888040544488 0,00126064552401711 245519 291241 579 665 0 True 363 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 410 428 0,00658122405027413 0,00668335980716268 0,00665293354695964 0,00675974670023652 0,00150329442344521 0,00153965092409903 249723 291266 579 665 0 True 406 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 454 428 0,00662874048633586 0,00672973346619008 0,00659189745937285 0,00679026474402991 0,00181241003508242 0,0016007578652456 251526 293287 579 665 0 True 450 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 498 428 0,0066033087831747 0,00667945900457254 0,00659189745937285 0,00669871061264973 0,00163467473772871 0,00162619894325006 250561 291096 579 665 0 True 494 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 542 428 0,00624009662465955 0,00636266794245857 0,00631723506523232 0,0063935301747158 0,00156660791827814 0,00160740538343126 236779 277290 579 665 0 True 538 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 581 430 0,00602206918398361 0,00609381086040806 0,00605783169298848 0,00610360875867857 0,00175462704922446 0,00190670225739743 228506 265573 579 665 0 False 581 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 629 428 0,00594867302511954 0,00584464135848892 0,00581368734264134 0,0059510185397116 0,00246363780340787 0,00172113394560744 225721 254714 579 665 0 True 625 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 674 428 0,00595755435565354 0,00597745221373415 0,00578316929884794 0,00607309071488518 0,0023654079060074 0,00177732602803642 226058 260502 579 665 0 True 669 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 277 473 0,00640633826563427 0,00637824820692152 0,00645456626230259 0,0063935301747158 0,00152768427539459 0,00153222136939655 243087 277969 579 665 0 True 275 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 320 473 0,00659142308563513 0,00655261408270046 0,00653086137178607 0,00659189745937285 0,00151787091635017 0,0014330865245832 250110 285568 579 665 0 True 319 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 365 473 0,00660589148463563 0,00668035389457852 0,00662241550316625 0,00665293354695964 0,00142201317329911 0,00140740447438319 250659 291135 579 665 0 True 363 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 409 472 0,00657792978820662 0,00665619186441728 0,00657663843747616 0,00662241550316625 0,0015862601292851 0,00172861748674068 249598 290082 579 665 0 True 406 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 453 473 0,00683414431476911 0,00701378073244452 0,0068055237659266 0,00701915007248035 0,00186940683213699 0,00201328342428471 259320 305666 579 665 0 True 450 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 498 472 0,00634878091879077 0,0067315691379972 0,0063782711528191 0,00669871061264973 0,00179563322990153 0,00182555161285364 240903 293367 579 665 0 True 494 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 542 471 0,00617492294391598 0,00600546915469034 0,00611886778057527 0,005981536583505 0,00169640640124291 0,00171765019191252 234306 261723 579 665 0 True 538 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 584 472 0,00596401110930586 0,0059405781563086 0,00601205462729839 0,0059662775616083 0,0018911198891269 0,00191232824007635 226303 258895 579 665 0 True 581 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 629 471 0,00598129939663614 0,00613543471863454 0,0059510185397116 0,00610360875867857 0,00195931040272731 0,00165672455314448 226959 267387 579 665 0 True 625 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 673 472 0,00597758346902399 0,00597841594143289 0,0059510185397116 0,00592050049591821 0,00185361218831246 0,00177812978378201 226818 260544 579 665 0 True 669 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 277 517 0,00640312306585638 0,00661633484030516 0,0064087891966125 0,00662241550316625 0,00154375922704925 0,0016061712330582 242965 288345 579 665 0 True 275 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 321 517 0,00637806032004678 0,00664079516713505 0,0063782711528191 0,00662241550316625 0,00136759439047043 0,00143023511261709 242014 289411 579 665 0 True 319 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 365 516 0,00652319232969291 0,0065523157860318 0,00659189745937285 0,00654612039368277 0,00144062632299626 0,00145002769909727 247521 285555 579 665 0 True 363 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 409 516 0,00666487195269229 0,00645192748407985 0,00662241550316625 0,0063935301747158 0,00169097028345635 0,00160890684769013 252897 281180 579 665 0 True 406 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 452 516 0,00669791998975353 0,00657305887745227 0,00666819256885634 0,00656137941557946 0,00188711613528052 0,00172450017730533 254151 286459 579 665 0 True 450 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 497 517 0,0062338770578761 0,00661130968873316 0,00622568093385214 0,00657663843747616 0,00173432154295364 0,00174022435596645 236543 288126 579 665 0 True 494 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 541 516 0,0061243494326556 0,00962988840836355 0,00613412680247196 0,00645456626230259 0,00166565526683098 0,016571917973333 232387 419678 579 665 0 True 538 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 585 516 0,00594643292691363 0,00623311540467098 0,00590524147402152 0,00611886778057527 0,00172204901917187 0,00176191909149018 225636 271644 579 665 0 True 581 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 629 516 0,00602117314470125 0,00651970966555781 0,00605783169298848 0,00645456626230259 0,00185195766464273 0,00226464668415418 228472 284134 579 665 0 True 625 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 673 516 0,00617755835356998 0,0061739608806865 0,00621042191195544 0,00616464484626535 0,00189768201768183 0,00187690568958346 234406 269066 579 665 0 True 669 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 277 561 0,00648284420789007 0,00667470920377162 0,00642404821850919 0,00668345159075303 0,00132866485153421 0,00131418443607631 245990 290889 579 665 0 True 275 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 320 561 0,00666481924449921 0,00683053479429863 0,00666819256885634 0,00683604180972 0,00141682654766521 0,00135751508113564 252895 297680 579 665 0 True 319 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 365 560 0,00658428112547278 0,006541026404418 0,00657663843747616 0,00659189745937285 0,00134881324010741 0,00135776040721311 249839 285063 579 665 0 True 362 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 409 560 0,0064174069861811 0,00647934783169873 0,00642404821850919 0,00657663843747616 0,00153729029844228 0,00146755141986113 243507 282375 579 665 0 True 406 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 453 560 0,00654619945597238 0,00656775837510921 0,00663767452506294 0,00666819256885634 0,0019863392025532 0,00193179818802094 248394 286228 579 665 0 True 450 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 497 561 0,00643119017867155 0,00641503048075671 0,00643930724040589 0,0064087891966125 0,00200402872651969 0,00198441163272369 244030 279572 579 665 0 True 494 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 541 561 0,00625409064992233 0,00627641431342146 0,00622568093385214 0,00619516289005875 0,00185261675887933 0,00175057626644414 237310 273531 579 665 0 True 537 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 586 560 0,00643182267698851 0,00610096998045583 0,00636301213092241 0,00610360875867857 0,00173847178028811 0,00138902027028411 244054 265885 579 665 0 True 581 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 630 561 0,00639382006977774 0,00617974324687893 0,00633249408712902 0,00614938582436866 0,00158994243501928 0,00160814105439475 242612 269318 579 665 0 True 625 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 673 560 0,00623079362858091 0,00623309245877339 0,00619516289005875 0,00630197604333562 0,00168389791389442 0,00165349657333399 236426 271643 579 665 0 True 669 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 275 601 0,00700808135193353 0,00707646892465772 0,00700389105058366 0,00701915007248035 0,00127638529946506 0,00130839021056556 265920 308398 579 665 0 False 275 601 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 319 602 0,00695835117176243 0,00713004759552807 0,00697337300679027 0,00714122224765393 0,00139405569350511 0,00160628599682064 264033 310733 579 665 0 False 319 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 365 604 0,00667934035169278 0,00667794457533167 0,00666819256885634 0,00665293354695964 0,0013536278703356 0,00135894553236449 253446 291030 579 665 0 True 362 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 409 604 0,00647752068038898 0,00641849531129265 0,00654612039368277 0,00645456626230259 0,00149378008777543 0,0014440649465594 245788 279723 579 665 0 True 406 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 450 602 0,00662418122763443 0,00650775485291393 0,00663767452506294 0,00648508430609598 0,00182016067849725 0,001877146505759 251353 283613 579 665 0 False 450 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 494 602 0,00849455781317924 0,00696256548902584 0,00660715648126955 0,00686655985351339 0,0100567745834973 0,00237651677509073 322324 303434 579 665 0 False 494 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 537 602 0,00637126096313945 0,00633811583203832 0,00642404821850919 0,00634775310902571 0,00183000374598288 0,00194571537237357 241756 276220 579 665 0 False 537 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 581 602 0,00646241978307153 0,00624729596938099 0,00646982528419928 0,0063935301747158 0,00165452675716857 0,001717852238056 245215 272262 579 665 0 False 581 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 625 602 0,00642584029707392 0,00649022418715592 0,0063782711528191 0,00653086137178607 0,00146994501254867 0,00144986303083671 243827 282849 579 665 0 False 625 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 669 602 0,0063518907021825 0,00669602594263181 0,00631723506523232 0,00671396963454643 0,00156280529462257 0,0016931085562158 241021 291818 579 665 0 False 669 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 275 649 0,0114623980409419 0,672041628447406 0,00868238345922026 0,693583581292439 0,00839424244443189 0,228399578714278 434938 29288095 579 665 6 True 275 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 319 644 0,00786735666962228 0,00662888624628635 0,00730907148851759 0,00662241550316625 0,00317212861575307 0,00121730152298768 298525 288892 579 665 0 False 319 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 362 644 0,00655985087798014 0,00618206078253542 0,00654612039368277 0,00624093995574884 0,00126443948994867 0,00120652905551378 248912 269419 579 665 0 False 362 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 406 645 0,0063011063581498 0,00633276943790008 0,00627145799954223 0,00633249408712902 0,00134613779967383 0,00128828758722184 239094 275987 579 665 0 False 406 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 450 645 0,0063511000792863 0,00649690144335432 0,0063782711528191 0,00648508430609598 0,00154070557625674 0,00169718829492509 240991 283140 579 665 0 False 450 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 494 645 0,00616659504940932 0,0064651902128863 0,00610360875867857 0,0063935301747158 0,00170293474458077 0,00174262189613623 233990 281758 579 665 0 False 494 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 537 645 0,00633199335929475 0,00618625988179421 0,00631723506523232 0,00614938582436866 0,00176041110819503 0,00163268817413922 240266 269602 579 665 0 False 537 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 581 645 0,00632118817971333 0,00652347279276241 0,00631723506523232 0,00654612039368277 0,00147314795634777 0,00127234359602964 239856 284298 579 665 0 False 581 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 625 645 0,00661638041505857 0,00651645134810017 0,00663767452506294 0,00654612039368277 0,00138783627600605 0,00133261494677933 251057 283992 579 665 0 False 625 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 673 649 0,0116190204366795 0,69943249058788 0,00885023270008392 0,712962539101244 0,00793449563992724 0,204878984711863 440881 30481810 579 665 7 True 669 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H10_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H10_3.csv new file mode 100755 index 0000000..bbc8786 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H10_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 276 259 0,00104870856361872 0,0663568741033173 0,000885023270008392 0,066498817425803 0,000806250532165416 0,0188947324696919 39793 2891884 579 665 0 True 276 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 319 259 0,000991968193767968 0,000972240626744247 0,000900282291905089 0,000885023270008392 0,000644787784927458 0,000669719631072926 37640 42371 579 665 0 False 319 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 365 259 0,000830707477039323 0,000921208950506273 0,000717174029144732 0,000839246204318303 0,000615699497960295 0,000650902534548558 31521 40147 579 665 0 True 363 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 409 257 0,000918782867676213 0,000973158462647807 0,000732433051041428 0,000793469138628214 0,000739989777760228 0,000727849996432119 34863 42411 579 665 0 True 407 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 452 258 0,00095109299003433 0,000895670166489696 0,000717174029144732 0,000671396963454643 0,000880915674280527 0,000851982009909751 36089 39034 579 665 0 True 450 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 495 258 0,000972255329556001 0,000894018061863287 0,000839246204318303 0,000656137941557946 0,000834108812510369 0,000830988849507178 36892 38962 579 665 0 True 494 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 541 258 0,000809966803062293 0,000890713852610469 0,00064087891966125 0,000717174029144732 0,000768176397506727 0,000731465221170751 30734 38818 579 665 0 True 538 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 584 258 0,000851421796919812 0,000900924777037581 0,000564583810177768 0,000579842832074464 0,000820193551632038 0,000943444133573861 32307 39263 579 665 0 True 582 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 625 259 0,000943529364327332 0,000942617472956826 0,000518806744487678 0,000595101853971161 0,00101422218819609 0,000962971823953939 35802 41080 579 665 0 False 625 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 670 258 0,00108149305971456 0,0658130792763552 0,000793469138628214 0,06494239719234 0,000975544319294867 0,0195623190618199 41037 2868185 579 665 0 True 669 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 275 301 0,000898569275629985 0,000963934211817023 0,000747692072938125 0,000778210116731518 0,000677263184365551 0,000754446863524899 34096 42009 579 665 0 False 275 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 319 301 0,000885392227359953 0,000917514660994441 0,000778210116731518 0,000778210116731518 0,000684654450098671 0,000643441246153693 33596 39986 579 665 0 False 319 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 365 302 0,000840669325531467 0,00088695072540587 0,000717174029144732 0,000778210116731518 0,000628112773615659 0,000619114885367559 31899 38654 579 665 0 True 363 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 409 303 0,000908478415929048 0,000868984087593669 0,000732433051041428 0,000686655985351339 0,000718269677293135 0,000739320354063376 34472 37871 579 665 0 True 407 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 452 302 0,000875193191998949 0,000906317062971 0,000625619897764553 0,000595101853971161 0,000836732982161584 0,00091469325874213 33209 39498 579 665 0 True 450 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 494 302 0,000807700350759848 0,000856317952124532 0,000579842832074464 0,000579842832074464 0,000766350152024329 0,000808941705610928 30648 37319 579 665 0 False 494 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 539 302 0,000883521086505609 0,000938143022926967 0,000701915007248035 0,000747692072938125 0,000794280984079925 0,000820101868487094 33525 40885 579 665 0 True 538 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 584 302 0,000847995764369604 0,00090796916759741 0,000534065766384375 0,000457770656900893 0,000890603115517202 0,00105471077479115 32177 39570 579 665 0 True 582 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 625 302 0,000919520782379335 0,000956040823046401 0,000534065766384375 0,000534065766384375 0,00102133846810222 0,00102832070637999 34891 41665 579 665 0 False 625 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 669 302 0,000856771678517445 0,000991813477387678 0,0004272526131075 0,000595101853971161 0,000971210554635596 0,00101206885622731 32510 43224 579 665 0 False 669 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 277 341 0,000900018750939688 0,000968500445437237 0,000778210116731518 0,000823987182421607 0,000690260207868802 0,00075110012537193 34151 42208 579 665 0 True 275 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 321 341 0,000893746475963153 0,000861434887286883 0,00080872816052491 0,000793469138628214 0,000671444811048465 0,000581572321213701 33913 37542 579 665 0 True 319 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 365 340 0,000831339975356284 0,000892939604676603 0,000701915007248035 0,000778210116731518 0,000655174255047886 0,000677874015851663 31545 38915 579 665 0 True 363 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 408 341 0,000858563757082169 0,000920497627681013 0,000671396963454643 0,000747692072938125 0,000740340800719189 0,000720807083172112 32578 40116 579 665 0 True 407 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 453 340 0,000871872575834901 0,000933439113921219 0,000595101853971161 0,000671396963454643 0,00082288663890446 0,000885546343768966 33083 40680 579 665 0 True 450 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 494 345 0,00085026221667205 0,000863339396786771 0,000625619897764553 0,000610360875867857 0,000785460723427555 0,000835934858571773 32263 37625 579 665 0 False 494 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 540 341 0,000869342582567055 0,000858658433678612 0,000671396963454643 0,000610360875867857 0,000816086895577787 0,000819641441285208 32987 37421 579 665 0 True 538 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 585 340 0,000925397745907769 0,000879929280743631 0,000610360875867857 0,000457770656900893 0,000951181230065315 0,00104204605830064 35114 38348 579 665 0 True 582 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 629 340 0,000861436353605036 0,000962809862835161 0,000442511635004196 0,000579842832074464 0,00102659743129316 0,00102521009371371 32687 41960 579 665 0 True 625 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 673 340 0,000976577401388571 0,000957142226130673 0,00064087891966125 0,000503547722590982 0,000969633943515033 0,00100145445828739 37056 41713 579 665 0 True 669 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 275 387 0,000927427011341354 0,000891654634411618 0,000778210116731518 0,000732433051041428 0,000743423081594882 0,000751629431506685 35191 38859 579 665 0 False 275 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 321 385 0,000867945815450432 0,000968041527485457 0,000762951094834821 0,000823987182421607 0,000681363533527672 0,000728374221163915 32934 42188 579 665 0 True 319 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 365 385 0,000891400961371088 0,000893765656989808 0,000778210116731518 0,00080872816052491 0,000684618970280257 0,000679342090913183 33824 38951 579 665 0 True 363 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 409 384 0,000905236862054621 0,000986948947098807 0,000686655985351339 0,00080872816052491 0,000777100375277332 0,000778218164837469 34349 43012 579 665 0 True 407 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 454 385 0,000913696527043981 0,000901911450633909 0,000625619897764553 0,000579842832074464 0,000870864076029623 0,00088270892341374 34670 39306 579 665 0 True 450 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 497 385 0,000831023726197804 0,000835001213264335 0,000473029678797589 0,000488288700694286 0,000853076174698888 0,000868154237236379 31533 36390 579 665 0 True 494 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 541 385 0,000832051535962866 0,000961869081034011 0,000579842832074464 0,000732433051041428 0,000817054287350925 0,000848485542018638 31572 41919 579 665 0 True 538 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 585 384 0,000948483934476864 0,000968982309286606 0,000671396963454643 0,000610360875867857 0,000975693600148082 0,00105081955294372 35990 42229 579 665 0 True 581 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 629 384 0,000891216482695307 0,000848172158480431 0,000503547722590982 0,000473029678797589 0,00100316653541143 0,000940116849804187 33817 36964 579 665 0 True 625 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 673 385 0,000918572034903893 0,000948399839149258 0,000549324788281071 0,000534065766384375 0,000940210253646123 0,000993985247844766 34855 41332 579 665 0 True 669 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 277 429 0,00100772794349893 0,000934127490848889 0,000915541313801785 0,00080872816052491 0,000799838750053284 0,000766223820685398 38238 40710 579 665 0 True 275 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 321 429 0,000856455429358964 0,00097988161064139 0,000717174029144732 0,000915541313801785 0,000699472011448132 0,000690587807094288 32498 42704 579 665 0 True 319 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 366 428 0,000879067244190338 0,000909758947609353 0,000717174029144732 0,000762951094834821 0,00074576595429458 0,000655204367978733 33356 39648 579 665 0 True 363 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 410 428 0,000938179482729699 0,00091565604328973 0,000686655985351339 0,000717174029144732 0,000863418798305859 0,000806518430866041 35599 39905 579 665 0 True 406 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 454 428 0,000909479871597571 0,000941057151920772 0,000595101853971161 0,00064087891966125 0,000890010732615389 0,000920046086311291 34510 41012 579 665 0 True 450 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 498 428 0,00086291218301128 0,000885505133857762 0,000549324788281071 0,000610360875867857 0,000938674607212599 0,000848571618143569 32743 38591 579 665 0 True 494 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 542 428 0,000935280532110292 0,000872838998388624 0,000747692072938125 0,000686655985351339 0,000851008054869493 0,000763444959823275 35489 38039 579 665 0 True 538 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 581 430 0,000966694615186047 0,000903701230645852 0,00064087891966125 0,000473029678797589 0,000951553984450512 0,000998465862433337 36681 39384 579 665 0 False 581 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 629 428 0,000852001587043694 0,000928345124656457 0,000488288700694286 0,000610360875867857 0,000929933792594415 0,00090763091963908 32329 40458 579 665 0 True 625 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 674 428 0,00080862274413875 0,000866781281425124 0,000457770656900893 0,000503547722590982 0,000838827062897651 0,000898104383850686 30683 37775 579 665 0 True 669 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 277 473 0,000828203837868017 0,000967008962093951 0,000717174029144732 0,000885023270008392 0,000702096536526125 0,00079186693716324 31426 42143 579 665 0 True 275 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 320 473 0,000921497339619839 0,000948560460432381 0,000823987182421607 0,000839246204318303 0,000795025996373765 0,00080306322503018 34966 41339 579 665 0 True 319 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 365 473 0,00083376455223797 0,000830044899385107 0,000686655985351339 0,000701915007248035 0,000749070970347423 0,000750905132811606 31637 36174 579 665 0 True 363 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 409 472 0,000961371087684955 0,000953792125082677 0,000747692072938125 0,000686655985351339 0,000883452442521223 0,000882094844702652 36479 41567 579 665 0 True 406 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 453 473 0,000979291873332198 0,000948376893251669 0,000671396963454643 0,000625619897764553 0,00102421166384655 0,00100952749597135 37159 41331 579 665 0 True 450 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 498 472 0,000898384796954204 0,000807512027952692 0,000579842832074464 0,000411993591210803 0,000923426989498656 0,000904511859249464 34089 35192 579 665 0 True 494 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 542 471 0,000864915094348324 0,000881420764086917 0,000549324788281071 0,000579842832074464 0,000886846532792024 0,000858770290786126 32819 38413 579 665 0 True 538 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 584 472 0,000905315924344241 0,000918684901771481 0,000595101853971161 0,000473029678797589 0,000941584730284365 0,00105660835493309 34352 40037 579 665 0 True 581 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 629 471 0,000881280988299704 0,000867377874762438 0,000488288700694286 0,000549324788281071 0,000945340972787731 0,000866054950987113 33440 37801 579 665 0 True 625 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 673 472 0,00087124007751794 0,00095349382841402 0,000549324788281071 0,000534065766384375 0,000904346297480361 0,000987783866334823 33059 41554 579 665 0 True 669 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 277 517 0,000835108611161513 0,000916298528422223 0,000656137941557946 0,000823987182421607 0,000756153191020356 0,000784898753223744 31688 39933 579 665 0 True 275 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 321 517 0,000930773981601942 0,00094929472915523 0,000793469138628214 0,000823987182421607 0,00078779513722104 0,000813987340316907 35318 41371 579 665 0 True 319 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 365 516 0,000915989333442966 0,000819581570084516 0,000793469138628214 0,000686655985351339 0,000760047277281726 0,00074560989265339 34757 35718 579 665 0 True 363 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 409 516 0,000964217330111282 0,000912420671729679 0,000732433051041428 0,000610360875867857 0,000893376065982623 0,000898018923210028 36587 39764 579 665 0 True 406 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 452 516 0,000915778500670646 0,000996700953574139 0,000534065766384375 0,000671396963454643 0,000978200301188825 0,000982769015666608 34749 43437 579 665 0 True 450 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 497 517 0,000869052687505114 0,000917376985608907 0,000503547722590982 0,000610360875867857 0,000941666673400288 0,000875052573448611 32976 39980 579 665 0 True 494 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 541 516 0,000933620224028268 0,00124270392162599 0,00064087891966125 0,000762951094834821 0,000926993288765963 0,00170028429416137 35426 54158 579 665 0 True 538 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 585 516 0,000866285507368408 0,000909965460687654 0,000534065766384375 0,000564583810177768 0,000884287300011454 0,0009230786486607 32871 39657 579 665 0 True 581 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 629 516 0,00090913726834255 0,000894706438790958 0,000549324788281071 0,000473029678797589 0,000971003045664766 0,000976426843991723 34497 38992 579 665 0 True 625 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 673 516 0,000810283052220774 0,000937913563951077 0,000411993591210803 0,000579842832074464 0,0009576956012764 0,000982540454463249 30746 40875 579 665 0 True 669 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 277 561 0,000841328177944968 0,00095069442890816 0,000717174029144732 0,000839246204318303 0,000664271161121195 0,000710168567248364 31924 41432 579 665 0 True 275 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 320 561 0,000940445935032145 0,000895257140333094 0,000793469138628214 0,000762951094834821 0,00077576040515305 0,000681287554541554 35685 39016 579 665 0 True 319 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 365 560 0,000877275165625614 0,000915862556368032 0,000747692072938125 0,00080872816052491 0,000667653443828374 0,000671339519400953 33288 39914 579 665 0 True 362 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 409 560 0,000886630869897336 0,000868708736822601 0,000686655985351339 0,000625619897764553 0,000827154949679024 0,000808035551154584 33643 37859 579 665 0 True 406 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 453 560 0,000902153432759433 0,000929790716204565 0,000473029678797589 0,000534065766384375 0,000995021228871784 0,00100915171269485 34232 40521 579 665 0 True 450 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 497 561 0,000927031699893253 0,000814992390566712 0,000473029678797589 0,000305180437933928 0,00105946724804201 0,00102656338361416 35176 35518 579 665 0 True 494 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 541 561 0,000882756817705947 0,000909713055814175 0,000457770656900893 0,000534065766384375 0,000979540875795549 0,000959615958865421 33496 39646 579 665 0 True 537 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 586 560 0,000916384644891067 0,0008306873845176 0,00064087891966125 0,000610360875867857 0,000849611997678718 0,000727871683850708 34772 36202 579 665 0 True 581 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 630 561 0,000980583224062661 0,000947619678631231 0,000701915007248035 0,000625619897764553 0,000915713059796428 0,00087685662005765 37208 41298 579 665 0 True 625 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 673 560 0,00089635553152062 0,000974145136244135 0,00064087891966125 0,000717174029144732 0,000860961276020897 0,000914734621165295 34012 42454 579 665 0 True 669 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 275 601 0,000973177722934903 0,000891792309797153 0,000885023270008392 0,000701915007248035 0,000665098819442128 0,000722027297137255 36927 38865 579 665 0 False 275 601 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 319 602 0,000999505465378426 0,000938716670366693 0,000854505226215 0,000854505226215 0,00079773029040388 0,000728101638085398 37926 40910 579 665 0 False 319 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 365 604 0,000857298760448246 0,000899639806772596 0,000701915007248035 0,000778210116731518 0,000711216697192743 0,000728917914246313 32530 39207 579 665 0 True 362 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 409 604 0,000845834728453319 0,000918547226385946 0,00064087891966125 0,000732433051041428 0,000786616895173198 0,000771248006939774 32095 40031 579 665 0 True 406 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 450 602 0,000954729855356859 0,00095535244611873 0,000518806744487678 0,000442511635004196 0,00101154505900955 0,0011044247860827 36227 41635 579 665 0 False 450 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 494 602 0,000997792449103322 0,000923021676415805 0,000488288700694286 0,000442511635004196 0,0013237415817523 0,00109314281256305 37861 40226 579 665 0 False 494 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 537 602 0,00086733967123001 0,000876854530466702 0,000473029678797589 0,000396734569314107 0,0010010468614796 0,00106578312969307 32911 38214 579 665 0 False 537 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 581 602 0,000856771678517445 0,000914784099181348 0,000579842832074464 0,000549324788281071 0,000862729359515439 0,000924839836624355 32510 39867 579 665 0 False 581 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 625 602 0,000840010473117965 0,000966458260551814 0,00064087891966125 0,000778210116731518 0,000680174659965816 0,000752574739271849 31874 42119 579 665 0 False 625 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 669 602 0,000983851132033628 0,000950877996088872 0,000747692072938125 0,000671396963454643 0,000873988086277485 0,000854787431407967 37332 41440 579 665 0 False 669 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 275 649 0,00130210320185143 0,0667593222011311 0,00103761348897536 0,069062333104448 0,0010863662749664 0,0235890619783324 49408 2909423 579 665 0 True 275 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 319 644 0,000983034155040886 0,000922562758464024 0,000854505226215 0,000823987182421607 0,000724972347518389 0,00062686339128198 37301 40206 579 665 0 False 319 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 362 644 0,000878909119611098 0,000900901831139992 0,000762951094834821 0,000778210116731518 0,000638608143149387 0,00063813480806556 33350 39262 579 665 0 False 362 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 406 645 0,000912774133665079 0,000858084786238886 0,000747692072938125 0,000717174029144732 0,000726239444816985 0,000632105269797538 34635 37396 579 665 0 False 406 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 450 645 0,000827966650999156 0,000938946129342583 0,000564583810177768 0,000717174029144732 0,000822460065212955 0,00091891721730578 31417 40920 579 665 0 False 450 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 494 645 0,000825041346283209 0,000868180981178054 0,000534065766384375 0,000518806744487678 0,000859820045979953 0,000864140999470987 31306 37836 579 665 0 False 494 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 537 645 0,000840853804207247 0,000902003234224265 0,000534065766384375 0,000595101853971161 0,000855704572074952 0,000897809595060291 31906 39310 579 665 0 False 537 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 581 645 0,000921998067454101 0,000935412461113874 0,000686655985351339 0,000793469138628214 0,000803685352148111 0,000680654454159456 34985 40766 579 665 0 False 581 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 625 645 0,000981294784669242 0,000981120689111196 0,000869764248111696 0,000839246204318303 0,000722206451779431 0,000734557972772765 37235 42758 579 665 0 False 625 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 673 649 0,00129577821868181 0,0697086272559403 0,00105287251087205 0,0705577172503243 0,00106780755127812 0,021709632455213 49168 3037956 579 665 0 True 669 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H11_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H11_1.csv new file mode 100755 index 0000000..9120670 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H11_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 269 269 0,0102678459070704 0,0403751195337852 0,010406652933547 0,0410925459678035 0,00150300159459519 0,00897774649187616 389611 1759579 579 665 0 True 269 270 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 312 270 0,0100612034360998 0,00993529830527337 0,0100556954299229 0,0100099183642329 0,00139950752678643 0,00128863232274996 381770 432988 579 665 0 False 312 270 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 356 269 0,0110950219351734 0,0535506998211941 0,0106507972838941 0,05468833447776 0,00358519186747552 0,0118616201575224 420998 2333781 579 665 0 True 356 270 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 401 269 0,0105090122445086 0,0686457273878218 0,0104982070649271 0,0688334477759976 0,00142465367135454 0,0104863912868091 398762 2991634 579 665 0 True 399 270 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 445 269 0,0104012239896597 0,0607059649581725 0,010452429999237 0,0593575951781491 0,00170685708476301 0,0137751577511039 394672 2645613 579 665 0 True 443 270 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 489 268 0,010072193094357 0,0553713191194971 0,0101167315175097 0,0567788204776074 0,00170439993561532 0,0164850555272326 382187 2413125 579 665 0 True 487 270 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 533 269 0,0105443530879688 0,0715058876304976 0,0104982070649271 0,0725108720531014 0,00158952642745265 0,0214256477719933 400103 3116282 579 665 0 True 530 270 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 577 270 0,0105071411036542 0,0592910291292433 0,0104982070649271 0,0575570305943389 0,00183836608743176 0,0161310409009677 398691 2583949 579 665 0 True 574 270 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 618 270 0,0105898139045004 0,0103673007191818 0,0105592431525139 0,010406652933547 0,00190079609387087 0,00191444987005695 401828 451815 579 665 0 False 618 270 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 663 268 0,0107708138395375 0,0416346657442416 0,0108644235904479 0,042374303807126 0,00188024651269502 0,0092275611010612 408696 1814471 579 665 0 True 661 270 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 268 312 0,0100972031319735 0,0101549823287906 0,0101167315175097 0,0102998397802701 0,00147758339477937 0,00156263877134613 383136 442562 579 665 0 False 268 312 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 312 312 0,0102318989193898 0,0105384541692983 0,0102235446707866 0,0103913939116503 0,00127340925733651 0,00174720003174213 388247 459274 579 665 0 False 312 312 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 358 313 0,0105579254476869 0,088704342683213 0,0105592431525139 0,0898451209277485 0,00150649864906602 0,0250734062224225 400618 3865804 579 665 0 True 356 312 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 401 313 0,0105899720290796 0,0441352408257999 0,0105897611963073 0,0438696879530022 0,0014511335503972 0,00899683792287134 401834 1923448 579 665 0 True 399 313 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 446 314 0,0107073531750691 0,0686235157589556 0,0106813153276875 0,0682993820096132 0,00185281657136114 0,0156457191373426 406288 2990666 579 665 0 True 443 313 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 487 313 0,0107281992654323 0,0343012486583821 0,0105287251087205 0,0370183871213855 0,00194765686332348 0,0087637198177878 407079 1494875 579 665 0 False 487 313 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 530 313 0,0105312551019884 0,0385383463235796 0,010452429999237 0,0405584802014191 0,00160749438571307 0,0138943600052147 399606 1679531 579 665 0 False 530 313 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 577 314 0,0107752413277563 0,0455904696508954 0,0108644235904479 0,0455634393835355 0,00189883516647558 0,0107314153757174 408864 1986868 579 665 0 True 574 313 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 618 313 0,0106519832182384 0,010441324184804 0,0106507972838941 0,0105439841306172 0,00213592283553833 0,00201804088182671 404187 455041 579 665 0 False 618 313 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 661 313 0,0106657400566323 0,0107768849911458 0,0106660563057908 0,0109102006561379 0,00196735454945027 0,00183438471488202 404709 469665 579 665 0 False 661 313 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 270 353 0,010554025041399 0,0452874002355396 0,0105439841306172 0,0459143968871595 0,00155684136277127 0,010139675374791 400470 1973660 579 665 0 True 268 355 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 314 352 0,0103515201635851 0,0526235478832123 0,0103456168459602 0,0542610818646525 0,00133413976558881 0,0159372690420771 392786 2293375 579 665 0 True 312 355 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 356 355 0,0107204248069529 0,0342632502519746 0,0106813153276875 0,0352483405813687 0,00145983569842493 0,00928898962433049 406784 1493219 579 665 0 False 356 355 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 399 355 0,0108863501987692 0,0292226560909025 0,0106813153276875 0,031113145647364 0,00182015219479111 0,00765969173074908 413080 1273546 579 665 0 False 399 355 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 446 352 0,0110630807701668 0,059310143061935 0,0108186465247578 0,058655680170901 0,00248768065547314 0,0124072550829879 419786 2584782 579 665 0 True 443 355 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 487 356 0,0110345656377105 0,0272171846416224 0,0109102006561379 0,0291905088883803 0,00207106097363749 0,00814504868905286 418704 1186146 579 665 0 False 487 356 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 534 352 0,010618829764791 0,0256552115009428 0,0106507972838941 0,0258945601586938 0,00171146030698096 0,0034010717146659 402929 1118074 579 665 0 True 530 356 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 578 352 0,0107415607923781 0,0434883959727655 0,0108644235904479 0,0439459830624857 0,00200445873351056 0,00833520906649121 407586 1895258 579 665 0 True 574 356 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 622 352 0,0106445513630141 0,0488073697633876 0,0107270923933776 0,0495002670328832 0,00202016540666563 0,0113099255033581 403905 2127063 579 665 0 True 618 356 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 666 352 0,0106539597754789 0,0571713100558675 0,0105745021744106 0,0568856336308843 0,00191549524897627 0,0167251757409514 404262 2491570 579 665 0 True 661 356 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 268 398 0,0105696530206472 0,038337386152495 0,0105592431525139 0,0408178835736629 0,00166425127748624 0,0113125784291139 401063 1670773 579 665 0 False 268 398 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 312 398 0,0108610239119942 0,0285399926917316 0,0109102006561379 0,0290989547570001 0,00158846585905271 0,00496831724526639 412119 1243795 579 665 0 False 312 398 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 357 396 0,0108117944596573 0,0795636608114473 0,0107728694590677 0,0783245593957427 0,00146235251638983 0,0225272541379348 410251 3467446 579 665 0 True 356 398 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 402 397 0,010862526095497 0,0592250596736749 0,0108339055466545 0,0597390707255665 0,00145650736559427 0,0150680428703788 412176 2581074 579 665 0 True 399 398 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 446 396 0,0108189627739162 0,0376656679464741 0,0106965743495842 0,0387426565957122 0,00159880994668523 0,00759965959522277 410523 1641499 579 665 0 True 443 398 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 490 397 0,010876045747022 0,0469504500550988 0,0109407186999313 0,0469520103761349 0,00177352244820936 0,010738582168129 412689 2046137 579 665 0 True 486 398 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 534 396 0,0105063768348546 0,0370618237055215 0,0104219119554437 0,0374151216906996 0,00176089185586166 0,00613857379374241 398662 1615183 579 665 0 True 530 398 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 578 396 0,0103757395783055 0,0458107961595451 0,0103456168459602 0,0448615243762875 0,00176571059368124 0,00945646394020319 393705 1996470 579 665 0 True 574 399 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 622 396 0,0103103550647896 0,0391663296487958 0,0103456168459602 0,0384679942015717 0,00193135921712717 0,00940662837489042 391224 1706899 579 665 0 True 617 399 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 666 397 0,0107093560864061 0,0892240443177066 0,0104371709773404 0,090424963759823 0,00235480207715609 0,0250554988976738 406364 3888453 579 665 0 True 661 399 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 270 441 0,010380694148455 0,0408249738560179 0,0103150988021668 0,0412298771648737 0,0018624677038681 0,00757117938936481 393893 1779184 579 665 0 True 268 441 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 314 441 0,0104135577068405 0,04919013028107 0,0104676890211337 0,0500343327992676 0,00163379481981676 0,00630597105348861 395140 2143744 579 665 0 True 312 441 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 357 441 0,0107131510763079 0,0328097423691983 0,0106813153276875 0,0330052643625544 0,00146777009174224 0,00568136831693556 406508 1429874 579 665 0 True 355 441 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 402 440 0,0107862836942066 0,0490159479724718 0,010757610437171 0,0482642862592508 0,0016940655775043 0,0130414659395362 409283 2136153 579 665 0 True 399 441 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 446 440 0,0108665846263641 0,0838518819364731 0,0106965743495842 0,0839551384756237 0,00177806166536165 0,014801793969778 412330 3654330 579 665 0 True 443 441 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 491 441 0,0106373566946587 0,0547174987135956 0,0106507972838941 0,0544441901274128 0,00177314166451333 0,013569078599166 403632 2384631 579 665 0 True 486 441 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 535 441 0,0104669774605272 0,046701096985999 0,010452429999237 0,0467536430914778 0,0018740334712236 0,00905767174190165 397167 2035270 579 665 0 True 530 441 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 574 441 0,0107108846240054 0,0269050057049238 0,0105439841306172 0,028702220187686 0,00209349481526528 0,00715475681569362 406422 1172541 579 665 0 False 574 441 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 622 441 0,010367227205123 0,0396281846754676 0,0103761348897536 0,0392156862745098 0,00186138666030968 0,00847090582070533 393382 1727027 579 665 0 True 617 441 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 667 440 0,010607998231113 0,0672026598884485 0,0103761348897536 0,0670786602578775 0,00211686050206957 0,0102614528883158 402518 2928744 579 665 0 True 661 442 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 270 485 0,0103359976007231 0,0472288067387512 0,0102845807583734 0,0480048828870069 0,00155714311154848 0,0131847499273902 392197 2058268 579 665 0 True 268 483 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 313 485 0,0104446818948543 0,0484921619682073 0,0103608758678569 0,0494239719233997 0,00164774164113148 0,00826925471092661 396321 2113326 579 665 0 True 312 484 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 357 485 0,0108339582548475 0,06064022496158 0,0108644235904479 0,0597695887693599 0,00172636917630886 0,0169535331563571 411092 2642748 579 665 0 True 355 484 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 401 484 0,0111448575317307 0,0775314344455783 0,0110780498970016 0,0781567101548791 0,00176661310688549 0,0223615710935045 422889 3378880 579 665 0 True 399 484 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 446 485 0,0107321523799133 0,0865050472369984 0,0106355382619974 0,0856183718623636 0,00188593989038362 0,0295369779128866 407229 3769957 579 665 0 True 443 484 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 489 486 0,0106025692872258 0,0423420648210134 0,0104676890211337 0,0438696879530022 0,00188792036213307 0,00914387334415329 402312 1845300 579 665 0 True 486 484 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 533 485 0,010527723653052 0,0383823371658719 0,0105134660868238 0,039658197909514 0,00177547460217406 0,0075259554229704 399472 1672732 579 665 0 True 530 484 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 577 485 0,0103588202483267 0,0952638864269853 0,0102998397802701 0,0965743495841917 0,00191513583724369 0,0199949665153211 393063 4151674 579 665 0 True 574 484 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 622 485 0,0104113439627311 0,0589496171190164 0,0104829480430304 0,0586404211490043 0,00176091871831299 0,0187075191547726 395056 2569070 579 665 0 True 617 484 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 665 485 0,010434667338169 0,0676468924657719 0,010452429999237 0,0665445944914931 0,00187446148236538 0,0159903023673031 395941 2948104 579 665 0 True 661 484 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 269 530 0,0102510319934779 0,0448584955178057 0,0102235446707866 0,0471046005951019 0,0015760396913463 0,012087863542997 388973 1954968 579 665 0 True 268 526 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 314 529 0,0105700219779988 0,0926138417685321 0,0104676890211337 0,0874647135118639 0,00163993997268746 0,0267621468811408 401077 4036183 579 665 0 True 312 526 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 356 529 0,0108955477784617 0,0498428722297848 0,0108491645685512 0,0520332646677348 0,00177042341872246 0,0133120549525444 413429 2172191 579 665 0 True 355 526 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 401 528 0,0109506805484235 0,0526627165303967 0,0109102006561379 0,0537270160982681 0,00167109278499944 0,0111232229256232 415521 2295082 579 665 0 True 399 527 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 445 528 0,0108660838985299 0,051513127061187 0,0108644235904479 0,0531166552224002 0,00195640725238137 0,00916797899926509 412311 2244982 579 665 0 True 443 527 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 490 530 0,0108289246224084 0,0546887475039166 0,0108644235904479 0,0563057907988098 0,00187094709530484 0,0122754059526362 410901 2383378 579 665 0 True 486 527 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 534 529 0,0104689013095746 0,0668518859520052 0,0104676890211337 0,0674448767833982 0,0016878796439149 0,016590911731537 397240 2913457 579 665 0 True 530 527 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 578 529 0,0103884158987412 0,0529209726077611 0,0104829480430304 0,0531013962005035 0,00173494736343991 0,0134664004205959 394186 2306337 579 665 0 True 573 527 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 621 528 0,0105005525795192 0,040054381777286 0,0106202792401007 0,0401007095445182 0,00183175731307124 0,00833579720289396 398441 1745601 579 665 0 True 617 527 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 665 528 0,0101884410141952 0,0596382464515604 0,0101319905394064 0,0589456015869383 0,00213258290710957 0,0165596147125849 386598 2599081 579 665 0 True 661 527 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 269 573 0,0100258625926396 0,0384577832771446 0,00996414129854276 0,0395666437781338 0,00135090458724617 0,00913292134718925 380429 1676020 579 665 0 True 268 569 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 313 573 0,0102981794721881 0,0464000009178359 0,0102998397802701 0,0477302204928664 0,00151114050551244 0,0110548236816126 390762 2022148 579 665 0 True 311 569 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 357 573 0,0106086834376231 0,0451828587261241 0,0105439841306172 0,0460364690623331 0,00148329164970273 0,00971962875705495 402544 1969104 579 665 0 True 355 569 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 401 573 0,0111287024705516 0,0476003008207174 0,0107881284809644 0,0465400167849241 0,00270154188597051 0,010278402883707 422276 2074458 579 665 0 True 399 569 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 447 573 0,0106899067631596 0,0859154753443462 0,0105897611963073 0,0838788433661402 0,00201467283805467 0,0221711619720581 405626 3744263 579 665 0 True 442 569 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 490 573 0,0107087762962822 0,0580756308257483 0,0107270923933776 0,0587167162584878 0,00221139008576088 0,0138717754411107 406342 2530981 579 665 0 True 486 569 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 534 573 0,0105227427288059 0,0515948144566039 0,0105592431525139 0,0515602349889372 0,00211657050003856 0,0101608373899303 399283 2248542 579 665 0 True 530 570 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 573 570 0,0112843761188138 0,0305612279726554 0,0106202792401007 0,0330968184939345 0,00323009000681666 0,0127288908252815 428183 1331882 579 665 0 False 573 570 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 622 573 0,0103253241916243 0,0448809595515454 0,0103761348897536 0,0451056687266346 0,00156654961722674 0,00919414903987145 391792 1955947 579 665 0 True 617 570 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 666 573 0,0102571197897786 0,0477647081769427 0,0102082856488899 0,0476844434271763 0,001704589099636 0,00800246201729771 389204 2081623 579 665 0 True 661 570 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 268 612 0,00995215018461704 0,0101000727958601 0,00999465934233616 0,0101472495613031 0,00131125095876502 0,00143249207280527 377632 440169 579 665 0 False 268 612 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 311 612 0,0101121986129048 0,00996859280267503 0,0101472495613031 0,00999465934233616 0,00143638973528213 0,00135225723640877 383705 434439 579 665 0 False 311 612 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 358 617 0,0104413876327868 0,0699011203908145 0,0102998397802701 0,0683451590753033 0,00153175183647526 0,0159754772494074 396196 3046345 579 665 0 True 355 612 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 403 617 0,0110855871686121 0,075620890174624 0,0108033875028611 0,0739452201113909 0,00303478917205573 0,0229257183317986 420640 3295617 579 665 0 True 399 612 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 442 612 0,0115402743962178 0,0102057157083599 0,0110780498970016 0,0102998397802701 0,00365245537495973 0,00192821336942458 437893 444773 579 665 0 False 442 612 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 486 612 0,0102789146276173 0,010130843244527 0,0102998397802701 0,0101472495613031 0,0020099803320661 0,00199172518447377 390031 441510 579 665 0 False 486 612 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 530 612 0,00984454640844396 0,0100653097610127 0,0097962920576791 0,0100709544518196 0,00187112327533713 0,00207365754297667 373549 438654 579 665 0 False 530 612 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 573 612 0,00979012519908873 0,00993107626011699 0,00994888227664607 0,00993362325474937 0,00176359089910489 0,00180597019160943 371484 432804 579 665 0 False 573 612 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 617 613 0,00988573786133608 0,00998791324844498 0,00993362325474937 0,00990310521095598 0,00138052618878626 0,00142803478574333 375112 435281 579 665 0 False 617 613 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 661 613 0,009928774100986 0,00984750730109779 0,00991836423285267 0,0097962920576791 0,00158998476613843 0,00155932922961348 376745 429162 579 665 0 False 661 613 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 267 659 0,0100403573457366 0,0402149112768187 0,00997940032043946 0,0408941786831464 0,00138425756804445 0,00917193549242534 380979 1752597 579 665 0 True 268 655 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 311 655 0,00984520526085746 0,0100922252988847 0,0098268101014725 0,0100709544518196 0,00129942610750212 0,001269248479935 373574 439827 579 665 0 False 311 655 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 355 655 0,0101767134412349 0,00997487997861442 0,0100709544518196 0,00996414129854276 0,00174563668890887 0,00120794003180467 386153 434713 579 665 0 False 355 655 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 399 655 0,0101386844799276 0,0099442242594355 0,0100251773861295 0,00994888227664607 0,00150836669111888 0,0013255532255123 384710 433377 579 665 0 False 399 655 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 442 655 0,00997138867509128 0,00989612965808892 0,0100404364080262 0,00984206912336919 0,00161414554160151 0,00175940534259341 378362 431281 579 665 0 False 442 655 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 486 655 0,00992279172107141 0,00982559396890028 0,00997940032043946 0,00987258716716258 0,00153966381331263 0,00162743436863443 376518 428207 579 665 0 False 486 655 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 530 655 0,00969543493022028 0,00977892201320422 0,00964370183871214 0,0097962920576791 0,00173017954695455 0,00171385002689207 367891 426173 579 665 0 False 530 655 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 573 655 0,00979911194600889 0,00996127306134414 0,00978103303578241 0,00999465934233616 0,00148106708185623 0,00133148212750103 371825 434120 579 665 0 False 573 655 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 617 655 0,0098612812597469 0,00979725578537784 0,00988784618905928 0,00984206912336919 0,00135496039288635 0,00143123787857254 374184 426972 579 665 0 False 617 655 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 663 658 0,0102091289799792 0,0404180513081743 0,01025406271458 0,0410620279240101 0,00147329059320843 0,00827307058112286 387383 1761450 579 665 0 True 661 655 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H11_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H11_2.csv new file mode 100755 index 0000000..554e46c --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H11_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 269 269 0,00835925588154255 0,672655591829195 0,00755321583886473 0,694895857175555 0,00327952875954973 0,211212449630118 317190 29314852 579 665 5 True 269 270 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 312 270 0,00670424497292314 0,00608121356263169 0,00642404821850919 0,00607309071488518 0,00196042692003556 0,00119299740979767 254391 265024 579 665 0 False 312 270 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 356 269 0,00613056899943905 0,00587231411098128 0,00581368734264134 0,00587472343022812 0,00305605901822082 0,00126585581258216 232623 255920 579 665 0 True 356 270 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 401 269 0,00571815374268361 0,00586648585299367 0,00567635614557107 0,00592050049591821 0,00126549134413554 0,00133210358879108 216974 255666 579 665 0 True 399 270 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 445 269 0,00577579015181673 0,00577123743210166 0,00578316929884794 0,00575265125505455 0,0015323231111672 0,00166040446564728 219161 251515 579 665 0 True 443 270 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 489 268 0,00567506479484061 0,00596132124772907 0,00567635614557107 0,0059510185397116 0,0015488595406448 0,00163780876882682 215339 259799 579 665 0 True 487 270 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 533 269 0,0060898782743812 0,00612065756058721 0,00611886778057527 0,00604257267109178 0,00145223804806454 0,00149019203447903 231079 266743 579 665 0 True 530 270 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 577 270 0,00629306835870508 0,0063283408796654 0,00624093995574884 0,00621042191195544 0,00159160908931556 0,00171593058311277 238789 275794 579 665 0 True 574 270 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 618 270 0,00703910012356118 0,00665141911771876 0,00701915007248035 0,00659189745937285 0,00176271391867627 0,00180060069889304 267097 289874 579 665 0 False 618 270 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 663 268 0,00970768958511141 0,662457930130889 0,00846875715266651 0,677958342870222 0,00463343778306383 0,208028751708055 368356 28870430 579 665 3 True 661 270 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 268 312 0,00651460089422085 0,00631966733037675 0,00634775310902571 0,00633249408712902 0,00153697128212008 0,00145918711109658 247195 275416 579 665 0 False 268 312 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 312 312 0,00595623665082654 0,00611033190667215 0,00599679560540169 0,00602731364919509 0,00121401735442968 0,00134029204527605 226008 266293 579 665 0 False 312 312 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 358 313 0,00585145276298325 0,00601457867603318 0,00590524147402152 0,00599679560540169 0,00120041743616176 0,00126967557765039 222032 262120 579 665 0 True 356 312 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 401 313 0,00607367050500906 0,0059405781563086 0,00605783169298848 0,005981536583505 0,00132890796493776 0,00128097739807417 230464 258895 579 665 0 True 399 313 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 446 314 0,00590811407054438 0,00612169012597871 0,005981536583505 0,00613412680247196 0,00161275179694079 0,00165152399571871 224182 266788 579 665 0 True 443 313 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 487 313 0,00618638697591091 0,00616565446575927 0,00621042191195544 0,00613412680247196 0,00152087946092541 0,00148238488141762 234741 268704 579 665 0 False 487 313 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 530 313 0,00614261282155786 0,00619862772059469 0,00616464484626535 0,00621042191195544 0,00134901062186132 0,00155813221585736 233080 270141 579 665 0 False 530 313 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 577 314 0,00642199259897907 0,0063857974072283 0,0063782711528191 0,00630197604333562 0,00164787449592434 0,00173174189170289 243681 278298 579 665 0 True 574 313 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 618 313 0,00680544470363698 0,00652324333378651 0,00685130083161669 0,00643930724040589 0,00197314126029018 0,00187034698609734 258231 284288 579 665 0 False 618 313 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 661 313 0,00697790591139516 0,00715560932544224 0,00700389105058366 0,00714122224765393 0,00191009953367958 0,00178775720967011 264775 311847 579 665 0 False 661 313 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 270 353 0,00576601278200036 0,00588819267211288 0,00584420538643473 0,00587472343022812 0,00144126908305569 0,00141282577006939 218790 256612 579 665 0 True 268 355 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 314 352 0,00614696124748697 0,00626046691459709 0,00614938582436866 0,00627145799954223 0,00120365434668356 0,00128460978845782 233245 272836 579 665 0 True 312 355 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 356 355 0,00615708122055836 0,00617790757507181 0,00616464484626535 0,00616464484626535 0,00136945603933692 0,00136075846506364 233629 269238 579 665 0 False 356 355 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 399 355 0,00632653806131096 0,00643084020419554 0,00631723506523232 0,00648508430609598 0,00132225856595089 0,00132785442729956 240059 280261 579 665 0 False 399 355 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 446 352 0,00634841196143921 0,0064860939255899 0,0063935301747158 0,00645456626230259 0,00154932487474951 0,00166462451457472 240889 282669 579 665 0 True 443 355 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 487 356 0,00629538751920061 0,00646223019209732 0,00636301213092241 0,00645456626230259 0,00162078272267765 0,00153395220321015 238877 281629 579 665 0 False 487 356 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 534 352 0,00660296617991968 0,00636321864400071 0,00656137941557946 0,00634775310902571 0,00155685622118027 0,00157592495871193 250548 277314 579 665 0 True 530 356 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 578 352 0,006509435491299 0,00682408699707612 0,00648508430609598 0,00700389105058366 0,0018336770447786 0,00194608172388475 246999 297399 579 665 0 True 574 356 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 622 352 0,00636456702261827 0,00649033891664386 0,00648508430609598 0,00646982528419928 0,00195574371400765 0,00201782784667185 241502 282854 579 665 0 True 618 356 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 666 352 0,00584502236342747 0,00563360793836273 0,00584420538643473 0,00566109712367437 0,0018466367852852 0,00180237035647039 221788 245517 579 665 0 True 661 356 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 268 398 0,00599613675298819 0,00624598805321842 0,00607309071488518 0,00625619897764553 0,00142429997758571 0,00133873304007761 227522 272205 579 665 0 False 268 398 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 312 398 0,00633642084751348 0,00647654843219287 0,00636301213092241 0,00645456626230259 0,00128821568340131 0,001281406214016 240434 282253 579 665 0 False 312 398 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 357 396 0,00654179832185019 0,00656865326511518 0,00646982528419928 0,00653086137178607 0,00131859386189436 0,00131360205802882 248227 286267 579 665 0 True 356 398 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 402 397 0,00667486015528097 0,00705662072324322 0,00668345159075303 0,00706492713817044 0,0014373658549977 0,00150500137804203 253276 307533 579 665 0 True 399 398 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 446 396 0,00649570500700163 0,00675504279123077 0,00657663843747616 0,00675974670023652 0,00147123304518736 0,00159515412424548 246478 294390 579 665 0 True 443 398 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 490 397 0,00626297198045633 0,00654391758751422 0,00621042191195544 0,00653086137178607 0,0017601201219712 0,00180466471700072 237647 285189 579 665 0 True 486 398 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 534 396 0,00634604009275061 0,00591171221714162 0,00633249408712902 0,00593575951781491 0,00171387992926671 0,00156381625695691 240799 257637 579 665 0 True 530 398 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 578 396 0,00577025579154331 0,00585655027933762 0,00572213321126116 0,00588998245212482 0,00172076855898787 0,00187890596244578 218951 255233 579 665 0 True 574 399 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 622 396 0,00549614683343012 0,00549099918484699 0,00552376592660411 0,00534065766384375 0,00174899197471059 0,00186282557538483 208550 239302 579 665 0 True 617 399 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 666 397 0,00524963061439437 0,00522847517053104 0,00518806744487678 0,00526436255436027 0,00170497979449707 0,0018870231996955 199196 227861 579 665 0 True 661 399 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 270 441 0,00592229257448294 0,00589945910782908 0,00585946440833143 0,00587472343022812 0,0015092826589625 0,00149382025652364 224720 257103 579 665 0 True 268 441 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 314 441 0,00608950931702964 0,00605473399681396 0,005981536583505 0,00604257267109178 0,00144916532602762 0,00139136387598787 231065 263870 579 665 0 True 312 441 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 357 441 0,00627654434017446 0,00614355756638105 0,00625619897764553 0,00616464484626535 0,0013931293818377 0,00127751881171515 238162 267741 579 665 0 True 355 441 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 402 440 0,00612629963579956 0,00617969735508375 0,00619516289005875 0,00614938582436866 0,00149395962718123 0,00144124148921431 232461 269316 579 665 0 True 399 441 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 446 440 0,00608368506169428 0,00626891100490985 0,00608834973678187 0,00625619897764553 0,00165962378112972 0,00170672626726815 230844 273204 579 665 0 True 443 441 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 491 441 0,0060583060667262 0,00592424067722522 0,00608834973678187 0,00579842832074464 0,00170589046081582 0,00177097195209367 229881 258183 579 665 0 True 486 441 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 535 441 0,00574081826570806 0,00580783613875614 0,00572213321126116 0,00576791027695125 0,00158452819102895 0,00153546466950701 217834 253110 579 665 0 True 530 441 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 574 441 0,00546736816000837 0,00552174668761627 0,00546272983901732 0,00550850690470741 0,00169192792080109 0,00189884714220541 207458 240642 579 665 0 False 574 441 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 622 441 0,00520659437474445 0,0054368698124345 0,00524910353246357 0,00556954299229419 0,00171479731430127 0,00168795812630239 197563 236943 579 665 0 True 617 441 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 667 440 0,00539992802696235 0,00541442872459244 0,00541695277332723 0,00531013962005036 0,0017742714719079 0,00185804591121892 204899 235965 579 665 0 True 661 442 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 270 485 0,0059052941822146 0,00587818826076406 0,00593575951781491 0,00584420538643473 0,00144410040383342 0,00148492247030757 224075 256176 579 665 0 True 268 483 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 313 485 0,00604109684168554 0,00591366261843668 0,00607309071488518 0,00592050049591821 0,00156400627031645 0,0013645796127961 229228 257722 579 665 0 True 312 484 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 357 485 0,00607941569805479 0,00593199639061031 0,00605783169298848 0,00582894636453803 0,0015140692441312 0,00146677696070098 230682 258521 579 665 0 True 355 484 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 401 484 0,00600327871315055 0,00611957910340053 0,0059662775616083 0,00607309071488518 0,00146710167806104 0,0015114322258136 227793 266696 579 665 0 True 399 484 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 446 485 0,00605885950275354 0,0062677637100304 0,00599679560540169 0,00630197604333562 0,00182069914255835 0,00196081536374796 229902 273154 579 665 0 True 443 484 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 489 486 0,00589757243192836 0,00593385500831502 0,00585946440833143 0,005981536583505 0,00172170349173566 0,00177842930373497 223782 258602 579 665 0 True 486 484 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 533 485 0,00554611420047008 0,00566045463854188 0,00560006103608759 0,00567635614557107 0,00162188347182371 0,00159299335833486 210446 246687 579 665 0 True 530 484 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 577 485 0,00540970539677871 0,00555270070346385 0,00543221179522393 0,0055390249485008 0,00159484109545923 0,00185750293687956 205270 241991 579 665 0 True 574 484 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 622 485 0,00532065490456984 0,00539540657549114 0,00529488059815366 0,00535591668574044 0,00173138567669611 0,00165074414639065 201891 235136 579 665 0 True 617 484 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 665 485 0,00530626556785897 0,00555107154473504 0,00526436255436027 0,00560006103608759 0,0018029578301162 0,00165791443554356 201345 241920 579 665 0 True 661 484 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 269 530 0,00593473170804985 0,00576199023537328 0,005981536583505 0,00578316929884794 0,00136669026063514 0,00140909196084427 225192 251112 579 665 0 True 268 526 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 314 529 0,00619178956570162 0,00605074141063347 0,00628671702143893 0,005981536583505 0,00141942631499468 0,00139129313955411 234946 263696 579 665 0 True 312 526 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 356 529 0,00600565058183915 0,0059188483912918 0,00605783169298848 0,00599679560540169 0,0013218036970879 0,00139746107544027 227883 257948 579 665 0 True 355 526 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 401 528 0,00593420462611904 0,00619330427235404 0,00599679560540169 0,00622568093385214 0,00147379147837678 0,00157403135833901 225172 269909 579 665 0 True 399 527 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 445 528 0,00594443001557659 0,00601650613143066 0,0059662775616083 0,00607309071488518 0,00173477758398001 0,00191263853019464 225560 262204 579 665 0 True 443 527 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 490 530 0,00559315626279409 0,00590154718450968 0,00564583810177768 0,00592050049591821 0,00178396510423007 0,00172628459355217 212231 257194 579 665 0 True 486 527 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 534 529 0,00564412508550257 0,00576850687028856 0,00572213321126116 0,00581368734264134 0,00177427560326542 0,00171085813324561 214165 251396 579 665 0 True 530 527 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 578 529 0,00571172334312783 0,00550325229415952 0,00572213321126116 0,00552376592660411 0,00151701759594531 0,00162264137485804 216730 239836 579 665 0 True 573 527 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 621 528 0,0052697124359579 0,00532718842195899 0,00526436255436027 0,00531013962005036 0,00166041168845777 0,00169373012287266 199958 232163 579 665 0 True 617 527 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 665 528 0,00546681472398103 0,00550506502006906 0,00552376592660411 0,0055542839703975 0,00177571263341977 0,00185554761136714 207437 239915 579 665 0 True 661 527 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 269 573 0,00613020004208749 0,00611829413313554 0,00616464484626535 0,00616464484626535 0,00125159916499588 0,00130873424197212 232609 266640 579 665 0 True 268 569 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 313 573 0,00615911048599194 0,00610617869920854 0,00616464484626535 0,00616464484626535 0,00138223776913358 0,0012979478790308 233706 266112 579 665 0 True 311 569 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 357 573 0,00609485919862727 0,00599535001385359 0,00607309071488518 0,005981536583505 0,00137969556192309 0,00127618284167167 231268 261282 579 665 0 True 355 569 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 401 573 0,0064439192073004 0,00593956853681468 0,00605783169298848 0,00593575951781491 0,00364545476590592 0,00142276863225375 244513 258851 579 665 0 True 399 569 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 447 573 0,00578648991501199 0,00610441186509418 0,00585946440833143 0,00601205462729839 0,00171882629263851 0,00193555028064432 219567 266035 579 665 0 True 442 569 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 490 573 0,00587625196782745 0,00599424861076931 0,00585946440833143 0,0059510185397116 0,0019401749197577 0,00183802079647278 222973 261234 579 665 0 True 486 569 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 534 573 0,00577370817819006 0,00605622548015725 0,00570687418936446 0,00601205462729839 0,00184348790990577 0,00195283323181918 219082 263935 579 665 0 True 530 570 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 573 570 0,00576150623149201 0,00560575161868966 0,00575265125505455 0,00567635614557107 0,00157293428588793 0,00162944544263727 218619 244303 579 665 0 False 573 570 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 622 573 0,00550737367855619 0,00565988099110216 0,00561532005798428 0,00570687418936446 0,00143712709798649 0,00151205701364596 208976 246662 579 665 0 True 617 570 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 666 573 0,00535960625925605 0,00559967095582857 0,00540169375143053 0,00561532005798428 0,00165326477274291 0,00165642721893484 203369 244038 579 665 0 True 661 570 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 268 612 0,00666068165134242 0,00666057453085678 0,00662241550316625 0,00660715648126955 0,00138951098208984 0,00133051074493794 252738 290273 579 665 0 False 268 612 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 311 612 0,0062504537845998 0,00620750778296164 0,00628671702143893 0,00627145799954223 0,00141403150303797 0,00131471105774374 237172 270528 579 665 0 False 311 612 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 358 617 0,00592218715809678 0,00598183488017365 0,00590524147402152 0,00601205462729839 0,00141397931707584 0,00137462190674777 224716 260693 579 665 0 True 355 612 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 403 617 0,00638889185372475 0,00577201759261968 0,0059662775616083 0,00579842832074464 0,0030634121361333 0,00134215635129234 242425 251549 579 665 0 True 399 612 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 442 612 0,00629836553210963 0,00588259387310115 0,005981536583505 0,00590524147402152 0,00325013179753666 0,00176592533573623 238990 256368 579 665 0 False 442 612 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 486 612 0,00581737691615695 0,00584702773183818 0,00587472343022812 0,00593575951781491 0,00188313595282244 0,0019839949675475 220739 254818 579 665 0 False 486 612 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 530 612 0,00569108808553696 0,00587093735712593 0,00563057907988098 0,00587472343022812 0,00169099415143131 0,00189480740199347 215947 255860 579 665 0 False 530 612 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 573 612 0,00562030098223036 0,00558789971036541 0,00561532005798428 0,00560006103608759 0,0015496216994487 0,00172760929401794 213261 243525 579 665 0 False 573 612 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 617 613 0,00562739023419963 0,00540488323119541 0,00573739223315786 0,00541695277332723 0,00135261618903876 0,00125647226473964 213530 235549 579 665 0 False 617 613 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 661 613 0,00593670826529035 0,0059980346838715 0,00587472343022812 0,00601205462729839 0,00150190544132983 0,0014657016698934 225267 261399 579 665 0 False 661 613 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 267 659 0,0100331099691881 0,680365849391159 0,00823987182421607 0,697871366445411 0,00590399226400263 0,222922450578725 380704 29650871 579 665 7 True 268 655 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 311 655 0,00707686554390309 0,00660630748305876 0,00686655985351339 0,00651560234988937 0,00214468041267972 0,0012677510915143 268530 287908 579 665 0 False 311 655 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 355 655 0,00625008482724824 0,00602306865814112 0,00622568093385214 0,00599679560540169 0,00129544086505782 0,00115706983045866 237158 262490 579 665 0 False 355 655 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 399 655 0,00576891173261977 0,00581485758341838 0,00573739223315786 0,00578316929884794 0,00133507748317129 0,00131603537123389 218900 253416 579 665 0 False 399 655 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 442 655 0,00575449604181236 0,00576545506590922 0,00570687418936446 0,00575265125505455 0,00148268991812167 0,00151448239724299 218353 251263 579 665 0 False 442 655 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 486 655 0,00565224214723691 0,00558638528112453 0,00566109712367437 0,00556954299229419 0,00154835526897599 0,00146871569653802 214473 243459 579 665 0 False 486 655 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 530 655 0,00553575704052983 0,00556541273072817 0,0055390249485008 0,00552376592660411 0,00157894189171505 0,00151377635367332 210053 242545 579 665 0 False 530 655 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 573 655 0,00559560719377232 0,00547528124499851 0,0055542839703975 0,00544747081712062 0,00153710630565399 0,00133429964090954 212324 238617 579 665 0 False 573 655 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 617 655 0,0057661709065796 0,00585519647137987 0,00578316929884794 0,00587472343022812 0,00127557740995 0,00137732901829864 218796 255174 579 665 0 False 617 655 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 663 658 0,00908910623112306 0,698843744747541 0,00741588464179446 0,71284046692607 0,00554955729652565 0,201109437628222 344884 30456152 579 665 7 True 661 655 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H11_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H11_3.csv new file mode 100755 index 0000000..995c207 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H11_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 269 269 0,00101484354956474 0,0672399469720307 0,000823987182421607 0,0680704966811627 0,000823062003930387 0,021935910689368 38508 2930369 579 665 0 True 269 270 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 312 270 0,000972255329556001 0,00098476908682785 0,000900282291905089 0,000900282291905089 0,000653736718525304 0,000660413916819655 36892 42917 579 665 0 False 312 270 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 356 269 0,000941394682507587 0,000884426676671078 0,00080872816052491 0,000747692072938125 0,000740609585299864 0,000685810031181031 35721 38544 579 665 0 True 356 270 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 401 269 0,000835134965258053 0,000845258029486626 0,000686655985351339 0,000732433051041428 0,000664062800744182 0,000633565188812303 31689 36837 579 665 0 True 399 270 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 445 269 0,000945057901926656 0,000769238270774212 0,000701915007248035 0,000503547722590982 0,000821299930528205 0,000798672951029688 35860 33524 579 665 0 True 443 270 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 489 268 0,000850762944506311 0,000855973763660697 0,000595101853971161 0,000610360875867857 0,000836978166652681 0,000783869511891497 32282 37304 579 665 0 True 487 270 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 533 269 0,00092574034916279 0,000881466655882095 0,000701915007248035 0,000686655985351339 0,000822574644321383 0,000802785390794652 35127 38415 579 665 0 True 530 270 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 577 270 0,000902179786855973 0,000900121670621966 0,00064087891966125 0,000564583810177768 0,000866255786643745 0,000911560903432874 34233 39228 579 665 0 True 574 270 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 618 270 0,00092595118193511 0,000906592413742069 0,000549324788281071 0,000610360875867857 0,000950582623580603 0,000930022535664987 35135 39510 579 665 0 False 618 270 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 663 268 0,00115030360578067 0,0657552097226357 0,000793469138628214 0,0669871061264973 0,00107672139238647 0,0215147832896306 43648 2865663 579 665 0 True 661 270 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 268 312 0,000862754058432039 0,000955719580480154 0,000717174029144732 0,000793469138628214 0,000703350924222462 0,000760735082583385 32737 41651 579 665 0 False 268 312 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 312 312 0,00094252790865881 0,000888006236694965 0,000823987182421607 0,000793469138628214 0,000662827805464757 0,000591901292539823 35764 38700 579 665 0 False 312 312 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 358 313 0,000941368328411047 0,000970886818786495 0,000869764248111696 0,000839246204318303 0,000648897897918828 0,000731333574511531 35720 42312 579 665 0 True 356 312 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 401 313 0,000886446391221556 0,000794524649917309 0,000717174029144732 0,00064087891966125 0,000708541847893658 0,000654418432953521 33636 34626 579 665 0 True 399 313 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 446 314 0,00091348569427166 0,000774722340297987 0,000717174029144732 0,000518806744487678 0,000814742005501279 0,000826948522762598 34662 33763 579 665 0 True 443 313 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 487 313 0,000814895019115285 0,000836538588402799 0,000564583810177768 0,000625619897764553 0,000806328972157339 0,000787065010587765 30921 36457 579 665 0 False 487 313 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 530 313 0,000824909575800509 0,000811458722338003 0,000579842832074464 0,000610360875867857 0,000786080649920773 0,000779724131702303 31301 35364 579 665 0 False 530 313 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 577 314 0,000968671172426552 0,000872104729665776 0,000778210116731518 0,000625619897764553 0,000907233387524709 0,000889558174342014 36756 38007 579 665 0 True 574 313 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 618 313 0,000914039130299002 0,00087013138247312 0,000488288700694286 0,000503547722590982 0,00105418412573143 0,00094188985912449 34683 37921 579 665 0 False 618 313 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 661 313 0,000957365265010865 0,000874353427629499 0,000579842832074464 0,000473029678797589 0,000984728623968046 0,000910456119323179 36327 38105 579 665 0 False 661 313 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 270 353 0,00093412095186253 0,000882476275376012 0,00080872816052491 0,000701915007248035 0,00071934455952147 0,000782804064663376 35445 38459 579 665 0 True 268 355 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 314 352 0,000882783171802487 0,00090142958678454 0,000778210116731518 0,000793469138628214 0,000651175490942976 0,000645995708523416 33497 39285 579 665 0 True 312 355 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 356 355 0,000900967498415131 0,000999454461284821 0,000793469138628214 0,000885023270008392 0,000705056384899857 0,000715175255790658 34187 43557 579 665 0 False 356 355 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 399 355 0,00099289058714687 0,000917629390482386 0,000869764248111696 0,000778210116731518 0,000705968490207456 0,000685578096474354 37675 39991 579 665 0 False 399 355 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 446 352 0,000887210660021218 0,000922815163337504 0,000610360875867857 0,000595101853971161 0,000824601663065436 0,000895606862285537 33665 40217 579 665 0 True 443 355 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 487 356 0,000972676995100642 0,000897620567784763 0,000671396963454643 0,000595101853971161 0,000889396824007016 0,000866891016612926 36908 39119 579 665 0 False 487 356 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 534 352 0,000907134357005505 0,000860700618564034 0,000625619897764553 0,000579842832074464 0,000838080123158238 0,000855905903756283 34421 37510 579 665 0 True 530 356 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 578 352 0,00096369024818048 0,000950740320703338 0,000717174029144732 0,00064087891966125 0,000976366547987099 0,00100193738685039 36567 41434 579 665 0 True 574 356 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 622 352 0,000859328025881831 0,000919717467162986 0,000473029678797589 0,000473029678797589 0,000970043023150032 0,0010432560298323 32607 40082 579 665 0 True 618 356 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 666 352 0,000884364417594891 0,000818755517771311 0,000457770656900893 0,000366216525520714 0,000975988358039497 0,000957628449987558 33557 35682 579 665 0 True 661 356 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 268 398 0,000961687336843435 0,000894683492893369 0,000823987182421607 0,000717174029144732 0,000771954728220138 0,000792702391111277 36491 38991 579 665 0 False 268 398 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 312 398 0,000894010016928554 0,00101572310267543 0,000762951094834821 0,000869764248111696 0,000709102714119078 0,000750832438714016 33923 44266 579 665 0 False 312 398 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 357 396 0,00102680830939393 0,000911961753777899 0,000900282291905089 0,000778210116731518 0,000720580385249443 0,000713731793733931 38962 39744 579 665 0 True 356 398 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 402 397 0,000944873423250875 0,000922172678205011 0,000778210116731518 0,000747692072938125 0,000759236535285287 0,000759374487805067 35853 40189 579 665 0 True 399 398 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 446 396 0,000844332544950535 0,000877932987653386 0,000549324788281071 0,000610360875867857 0,00082772213801481 0,000824437355596264 32038 38261 579 665 0 True 443 398 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 490 397 0,000874270798620047 0,000874995912761992 0,000564583810177768 0,000579842832074464 0,000854277538231688 0,000916596184609111 33174 38133 579 665 0 True 486 398 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 534 396 0,000862226976501238 0,000852990796974124 0,00064087891966125 0,00064087891966125 0,000809550122113964 0,00079021107103149 32717 37174 579 665 0 True 530 398 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 578 396 0,000839483391187164 0,000846313540775721 0,000503547722590982 0,000473029678797589 0,000892625775506335 0,000924526310943508 31854 36883 579 665 0 True 574 399 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 622 396 0,000834476112844552 0,000766392979473174 0,000503547722590982 0,000320439459830625 0,000911772479561926 0,000955141598633997 31664 33400 579 665 0 True 617 399 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 666 397 0,000858537402985629 0,000867171361684137 0,000442511635004196 0,000473029678797589 0,000939566844908355 0,000937070305849295 32577 37792 579 665 0 True 661 399 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 270 441 0,000920733070820178 0,000851292800552537 0,000732433051041428 0,000686655985351339 0,00080922698728471 0,000769851962205995 34937 37100 579 665 0 True 268 441 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 314 441 0,000969488149419294 0,000915013558157238 0,00080872816052491 0,000778210116731518 0,000801883184330719 0,000759828699631475 36787 39877 579 665 0 True 312 441 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 357 441 0,000989095597245101 0,000958404250498069 0,000900282291905089 0,000869764248111696 0,000761397604718413 0,00071839833066803 37531 41768 579 665 0 True 355 441 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 402 440 0,00089221793836383 0,000936376188812613 0,000717174029144732 0,000778210116731518 0,000751051739259252 0,000759085059200127 33855 40808 579 665 0 True 399 441 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 446 440 0,000886393683028476 0,00086710252399137 0,000534065766384375 0,000503547722590982 0,000928005268326583 0,000907719637699569 33634 37789 579 665 0 True 443 441 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 491 441 0,000869632477628996 0,000929951337487688 0,000503547722590982 0,000579842832074464 0,000936644255551271 0,000952808200635656 32998 40528 579 665 0 True 486 441 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 535 441 0,000857904904668668 0,000808338080265897 0,000595101853971161 0,000579842832074464 0,000836234338682771 0,00079657456194416 32553 35228 579 665 0 True 530 441 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 574 441 0,000854847829470021 0,000862651019859101 0,000488288700694286 0,000457770656900893 0,000935377654934728 0,000919626795999699 32437 37595 579 665 0 False 574 441 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 622 441 0,000772043258141143 0,00084913588617917 0,000396734569314107 0,000518806744487678 0,000873526694904248 0,000867732705431422 29295 37006 579 665 0 True 617 441 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 667 440 0,000839351620704463 0,000825501611662482 0,000442511635004196 0,0004272526131075 0,000950814940289964 0,000911801419773188 31849 35976 579 665 0 True 661 442 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 270 485 0,00100322139299057 0,000886629482839624 0,000885023270008392 0,000732433051041428 0,000786106431369919 0,000768654464781011 38067 38640 579 665 0 True 268 483 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 313 485 0,000886235558449235 0,000924581997451858 0,000732433051041428 0,000778210116731518 0,000754891169512198 0,00077584028296944 33628 40294 579 665 0 True 312 484 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 357 485 0,000976524693195491 0,000995943738953702 0,000854505226215 0,000869764248111696 0,000796794946446943 0,00078499275022036 37054 43404 579 665 0 True 355 484 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 401 484 0,000911614553417316 0,000918363659205234 0,000671396963454643 0,000686655985351339 0,000813845464071252 0,000837823029843012 34591 40023 579 665 0 True 399 484 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 446 485 0,000893166685839272 0,000851820556197085 0,000503547722590982 0,000350957503624018 0,000969628571330511 0,00104233842944573 33891 37123 579 665 0 True 443 484 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 489 486 0,000882229735775146 0,000877955933550975 0,000549324788281071 0,000549324788281071 0,000901069353356943 0,000938788908743791 33476 38262 579 665 0 True 486 484 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 533 485 0,00087137184800064 0,000848080374890075 0,000595101853971161 0,000564583810177768 0,000844840400782741 0,000819070613081784 33064 36960 579 665 0 True 530 484 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 577 485 0,000769908576321398 0,000922769271542326 0,000442511635004196 0,000564583810177768 0,000835723324096872 0,000991099549086933 29214 40215 579 665 0 True 574 484 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 622 485 0,000808912639200691 0,000821899105741006 0,000411993591210803 0,000488288700694286 0,000860781024800133 0,000849598035365286 30694 35819 579 665 0 True 617 484 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 665 485 0,000841539010717289 0,000836607426095566 0,000457770656900893 0,000473029678797589 0,000897925412462385 0,000863790706200151 31932 36460 579 665 0 True 661 484 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 269 530 0,000924211811563466 0,000876189099436621 0,000778210116731518 0,000732433051041428 0,000775151956026111 0,000744554335272453 35069 38185 579 665 0 True 268 526 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 314 529 0,000873928195365026 0,000955306554323552 0,000732433051041428 0,000778210116731518 0,000724627677091545 0,000810103696079235 33161 41633 579 665 0 True 312 526 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 356 529 0,000936888131999236 0,000883715353845818 0,000793469138628214 0,000747692072938125 0,000745424829127216 0,00074978730876639 35550 38513 579 665 0 True 355 526 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 401 528 0,00092589847374203 0,000978022992936679 0,000671396963454643 0,000732433051041428 0,000825850420877735 0,000874571219729138 35133 42623 579 665 0 True 399 527 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 445 528 0,000837322355270879 0,000814808823386 0,000442511635004196 0,000289921416037232 0,000946760413550989 0,000978875632578268 31772 35510 579 665 0 True 443 527 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 490 530 0,000763952550503343 0,000890828582098414 0,000473029678797589 0,0004272526131075 0,000846069217848367 0,000994762430065878 28988 38823 579 665 0 True 486 527 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 534 529 0,000803035675672257 0,000833578567613816 0,000534065766384375 0,000473029678797589 0,000851165239594066 0,000868232016045833 30471 36328 579 665 0 True 530 527 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 578 529 0,00079623631876492 0,000856019655455875 0,000488288700694286 0,000534065766384375 0,000807227807093945 0,000875908640779526 30213 37306 579 665 0 True 573 527 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 621 528 0,000893403872708133 0,000817516439301504 0,000564583810177768 0,000503547722590982 0,000922994082302115 0,000895043046729209 33900 35628 579 665 0 True 617 527 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 665 528 0,000806909727863646 0,000816231469036519 0,000411993591210803 0,000305180437933928 0,000925428424047381 0,000978464707098527 30618 35572 579 665 0 True 661 527 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 269 573 0,000874165382233887 0,000995530712797099 0,000747692072938125 0,000885023270008392 0,000670874719371464 0,000701164380052444 33170 43386 579 665 0 True 268 569 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 313 573 0,000946270190367499 0,00101723753191631 0,000869764248111696 0,000946059357595178 0,000729854565234091 0,000754138589026401 35906 44332 579 665 0 True 311 569 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 357 573 0,000902416973724834 0,000922402137180901 0,00080872816052491 0,000823987182421607 0,000673982374103828 0,000691907737738802 34242 40199 579 665 0 True 355 569 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 401 573 0,000931485542208523 0,000881443709984506 0,000701915007248035 0,000717174029144732 0,000826878822132346 0,00068010411629546 35345 38414 579 665 0 True 399 569 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 447 573 0,000917992244780011 0,000959345032299219 0,000473029678797589 0,000534065766384375 0,000970399248733142 0,00103564280526041 34833 41809 579 665 0 True 442 569 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 490 573 0,000907476960260526 0,00089489000597167 0,000488288700694286 0,000473029678797589 0,00100230643627329 0,00104795742609447 34434 39000 579 665 0 True 486 569 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 534 573 0,000812127838978578 0,000981923795526812 0,000335698481727321 0,000595101853971161 0,00098709050644192 0,00102868614135226 30816 42793 579 665 0 True 530 570 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 573 570 0,000886209204352695 0,000963888320021845 0,000595101853971161 0,000625619897764553 0,000863872997135963 0,000938922380150379 33627 42007 579 665 0 False 573 570 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 622 573 0,000753041954535757 0,000881260142803794 0,000488288700694286 0,000656137941557946 0,000728611021189993 0,000794871912864493 28574 38406 579 665 0 True 617 570 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 666 573 0,000853161167291456 0,000769788972316348 0,000549324788281071 0,000503547722590982 0,000826245782759728 0,000788369009151449 32373 33548 579 665 0 True 661 570 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 268 612 0,000916094749829127 0,000960997136925628 0,000793469138628214 0,000854505226215 0,000685529225102428 0,000680954146973247 34761 41881 579 665 0 False 268 612 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 311 612 0,000941025725156026 0,00100498442260377 0,000823987182421607 0,000869764248111696 0,000724547511456118 0,000737038648980476 35707 43798 579 665 0 False 311 612 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 358 617 0,000906870816040105 0,000941516069872553 0,000778210116731518 0,000778210116731518 0,000739668315235517 0,000771072262811974 34411 41032 579 665 0 True 355 612 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 403 617 0,000939497187556703 0,000955054149450073 0,000762951094834821 0,00080872816052491 0,000813356449341103 0,000706226797715008 35649 41622 579 665 0 True 399 612 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 442 612 0,000938811981046661 0,00081971924547005 0,000534065766384375 0,000442511635004196 0,000990422305874144 0,000887405640839829 35623 35724 579 665 0 False 442 612 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 486 612 0,0008883175320759 0,000882476275376012 0,000442511635004196 0,0004272526131075 0,00100383063341473 0,00101840106592191 33707 38459 579 665 0 False 486 612 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 530 612 0,000897567819961462 0,000856524465202833 0,000518806744487678 0,000289921416037232 0,000992976632079431 0,00101415375390082 34058 37328 579 665 0 False 530 612 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 573 612 0,000878592870452617 0,000842963439727724 0,000579842832074464 0,000488288700694286 0,000880864357962683 0,000841529247847565 33338 36737 579 665 0 False 573 612 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 617 613 0,000793679971400534 0,000842298008697643 0,000625619897764553 0,000701915007248035 0,000661468890983669 0,000665615361386739 30116 36708 579 665 0 False 617 613 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 661 613 0,0008377967290086 0,000854780576986068 0,000625619897764553 0,000625619897764553 0,000741146097344092 0,000772940993717402 31790 37252 579 665 0 False 661 613 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 267 659 0,00113312073483654 0,0680541133102842 0,00102235446707866 0,0698252841992828 0,000856157146649167 0,0235634820931446 42996 2965851 579 665 0 True 268 655 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 311 655 0,000976788234160891 0,000941974987824333 0,000869764248111696 0,000854505226215 0,000660582518975456 0,000644047551258238 37064 41052 579 665 0 False 311 655 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 355 655 0,000933303974869788 0,000928551637734758 0,000747692072938125 0,000854505226215 0,00070955377402929 0,000624655022474871 35414 40467 579 665 0 False 355 655 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 399 655 0,000818742717210134 0,000940116370119623 0,000686655985351339 0,000778210116731518 0,000670568875598753 0,000690715892302585 31067 40971 579 665 0 False 399 655 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 442 655 0,000838455581422101 0,000872999619671747 0,000595101853971161 0,000671396963454643 0,000782879758147948 0,000773770266463477 31815 38046 579 665 0 False 442 655 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 486 655 0,00082941612630886 0,000910217865561133 0,000579842832074464 0,000671396963454643 0,000830817939770309 0,000812614443541816 31472 39668 579 665 0 False 486 655 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 530 655 0,000886235558449235 0,000841471956384438 0,000564583810177768 0,000488288700694286 0,000873668685292758 0,000859468606514577 33628 36672 579 665 0 False 530 655 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 573 655 0,000887342430503918 0,000900993614730348 0,00064087891966125 0,000717174029144732 0,000811969589514613 0,000724019406019134 33670 39266 579 665 0 False 573 655 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 617 655 0,000895617616817498 0,000884357838978311 0,000747692072938125 0,000732433051041428 0,000704369350436018 0,000714274724014077 33984 38541 579 665 0 False 617 655 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 663 658 0,00109751635041092 0,0695941042810735 0,000915541313801785 0,0700846875715267 0,000829538907615636 0,0213153029520399 41645 3032965 579 665 0 True 661 655 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H12_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H12_1.csv new file mode 100755 index 0000000..3342c4f --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H12_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 242 247 0,0108174605904135 0,040257498862744 0,0108491645685512 0,0404669260700389 0,00170305646774614 0,00817988323198295 410466 1754453 579 665 0 True 242 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 285 247 0,0105984844022621 0,0105728959615794 0,0106355382619974 0,0105592431525139 0,00147903915083264 0,0013570617408829 402157 460775 579 665 0 False 285 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 331 245 0,0108294517043392 0,050509771797312 0,0108339055466545 0,0518654154268711 0,00140521030087668 0,00765057384454291 410921 2201255 579 665 0 True 329 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 373 245 0,011206605179924 0,0664780513884849 0,0110627908751049 0,0674448767833982 0,00175001190015134 0,00963797770504042 425232 2897165 579 665 0 True 373 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 419 244 0,0107439326610667 0,0584292729993902 0,0107881284809644 0,0588387884336614 0,00157792157925402 0,0114153704963968 407676 2546393 579 665 0 True 417 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 462 245 0,0105626691850641 0,0560269522513081 0,010452429999237 0,0559700923170825 0,00159119873046442 0,0167221434772207 400798 2441698 579 665 0 True 460 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 507 246 0,0104317683875496 0,0640420231168445 0,010406652933547 0,0640421149004349 0,00170600160350411 0,0164292374385815 395831 2791001 579 665 0 True 504 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 551 245 0,01043168932526 0,0562390411827233 0,010452429999237 0,0554055085069047 0,00156430561893877 0,0141343777815813 395828 2450941 579 665 0 True 548 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 592 247 0,0102809702471474 0,0101877261246501 0,0102235446707866 0,0101777676050965 0,00196503674369771 0,00203948950890016 390109 443989 579 665 0 False 592 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 638 245 0,010402067320749 0,0415939826678163 0,0103608758678569 0,0418860151064317 0,00185600819559156 0,00791692392905414 394704 1812698 579 665 0 True 635 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 241 289 0,0103859386136665 0,0103362090279487 0,010406652933547 0,0103913939116503 0,0014768993443867 0,00155592515525305 394092 450460 579 665 0 False 241 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 285 289 0,0104328225514112 0,0103314592271477 0,010406652933547 0,0103456168459602 0,0013760462649856 0,00146453747702053 395871 450253 579 665 0 False 285 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 331 291 0,0108131121644843 0,0785347897094533 0,0108491645685512 0,0771343556878004 0,00152877075032005 0,0171639845362812 410301 3422607 579 665 0 True 329 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 375 290 0,0106134798831934 0,0410150806175429 0,0104829480430304 0,0417792019531548 0,00145745600162117 0,00665491873110646 402726 1787469 579 665 0 True 373 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 419 289 0,0105758989415272 0,0635685804118903 0,0105439841306172 0,0618905928130007 0,00157399072229355 0,011035663737218 401300 2770368 579 665 0 True 417 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 463 291 0,0103201324346059 0,0349436420072842 0,0102082856488899 0,035385671778439 0,00193618314843069 0,00604597692787663 391595 1522871 579 665 0 True 460 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 504 290 0,0107775077800587 0,0333335054275652 0,0107270923933776 0,0358281834134432 0,00184700555545265 0,00794778256572736 408950 1452700 579 665 0 False 504 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 551 290 0,0103503078751443 0,045897623436022 0,0102693217364767 0,045136186770428 0,00186179154282807 0,0109403195628373 392740 2000254 579 665 0 True 548 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 592 290 0,0102388827549729 0,0102444713293878 0,0102388036926833 0,01025406271458 0,00197328269648252 0,00194385852636522 388512 446462 579 665 0 False 592 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 635 290 0,0102107365798681 0,0100907338155414 0,0102082856488899 0,0100862134737163 0,00209076809104731 0,00189277169463151 387444 439762 579 665 0 False 635 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 242 330 0,010659625906235 0,0399206760320348 0,0106355382619974 0,0395971618219272 0,00145818040023004 0,00855271732275964 404477 1739774 579 665 0 True 241 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 287 329 0,0104457360587159 0,0496162814910933 0,010452429999237 0,0493629358358129 0,00147860743306748 0,0137538828623309 396361 2162316 579 665 0 True 285 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 332 329 0,0109339720512171 0,0324722082156639 0,0105287251087205 0,0329594872968643 0,00282300764283596 0,00541527811317185 414887 1415164 579 665 0 True 329 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 375 328 0,0104842393937609 0,031713112031624 0,0102388036926833 0,0311436636911574 0,0020923030516003 0,00608324231676114 397822 1382082 579 665 0 True 373 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 419 328 0,0108662683772057 0,0545286310305404 0,0107881284809644 0,0542763408865492 0,00191989371861938 0,00919913208209397 412318 2376400 579 665 0 True 416 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 460 332 0,0108242863014173 0,0251404661803284 0,0106355382619974 0,0270389868009461 0,00225913986823197 0,00610185360252153 410725 1095641 579 665 0 False 460 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 504 333 0,0111626729009917 0,0215070062430051 0,0108033875028611 0,0234988937209125 0,00250859282586727 0,00551101774101278 423565 937292 579 665 0 False 504 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 551 328 0,0103243227359558 0,042412990590461 0,0102693217364767 0,0430914778362707 0,00164351894435786 0,00712938597145818 391754 1848391 579 665 0 True 548 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 596 328 0,0102541154227731 0,0462446571911583 0,0102998397802701 0,0471656366826886 0,00192523464649459 0,00913327192239132 389090 2015378 579 665 0 True 592 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 640 328 0,0101693342942037 0,0545677537859297 0,0102082856488899 0,054383154039826 0,00208376897032464 0,0147191326611147 385873 2378105 579 665 0 True 635 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 244 372 0,0103845154924533 0,0372036064067241 0,0103303578240635 0,0384679942015717 0,00166064314933615 0,00816353297313348 394038 1621362 579 665 0 True 241 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 287 374 0,0105410588259013 0,0280827956822704 0,0105134660868238 0,0279545281147478 0,00159834883432157 0,00420990499743452 399978 1223870 579 665 0 True 285 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 332 373 0,0103591101433887 0,0679476213995736 0,0103456168459602 0,0681162737468528 0,00148121885597018 0,0138254388977662 393074 2961210 579 665 0 True 329 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 376 372 0,0104543274941879 0,0515722356933763 0,0104829480430304 0,0523537041275654 0,00149051024818893 0,0118640466392662 396687 2247558 579 665 0 True 373 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 419 372 0,0102110791831232 0,0350557556629041 0,0102082856488899 0,0356298161287861 0,00156161322223641 0,00618834014658004 387457 1527757 579 665 0 True 416 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 463 373 0,0101760282347249 0,044675295471455 0,0102845807583734 0,045136186770428 0,00188321457145717 0,00925911210370832 386127 1946984 579 665 0 True 460 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 507 372 0,0103344954172203 0,0357726084494826 0,01025406271458 0,0361333638513771 0,00163273842457852 0,0051735778933503 392140 1558998 579 665 0 True 504 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 552 372 0,0102878223122478 0,0419241052964294 0,0103150988021668 0,0424353398947128 0,00171790123115554 0,00634376705530068 390369 1827085 579 665 0 True 548 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 596 371 0,0100444158766038 0,0377718845064137 0,010101472495613 0,0372167544060426 0,00216069400718485 0,00799674926178225 381133 1646128 579 665 0 True 591 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 639 372 0,0100269167565012 0,0730948451467419 0,0100099183642329 0,0710307469291218 0,00199545669307844 0,0133598497433746 380469 3185530 579 665 0 True 635 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 244 418 0,010109326016382 0,0393480841035984 0,0100251773861295 0,0395971618219272 0,00157707840830686 0,00648854406968408 383596 1714820 579 665 0 True 241 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 288 417 0,0101119877801325 0,044823640699368 0,010101472495613 0,0447699702449073 0,00157361305016724 0,00542403722892921 383697 1953449 579 665 0 True 285 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 332 416 0,0102134246977152 0,0304364940733615 0,01025406271458 0,0305943389028763 0,00136423067813149 0,00457767445004542 387546 1326446 579 665 0 True 329 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 376 417 0,0106078137524373 0,0459015471845097 0,0105745021744106 0,0446631570916304 0,00139402796212621 0,00946883046198845 402511 2000425 579 665 0 True 373 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 420 416 0,0105916323371617 0,076981903144219 0,010605020218204 0,0762645914396887 0,00167660466854221 0,0088872130630944 401897 3354931 579 665 0 True 416 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 463 417 0,010505322670993 0,0514695528016654 0,0105134660868238 0,0513160906385901 0,00172339059697965 0,0115700356236401 398622 2243083 579 665 0 True 460 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 508 416 0,010438567744457 0,0454114687038035 0,0104676890211337 0,0446784161135271 0,00168564716878767 0,00779498294849486 396089 1979067 579 665 0 True 504 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 548 418 0,0107768225735487 0,025847819365305 0,0107881284809644 0,0276493476768139 0,0019803028568936 0,00628434622273785 408924 1126468 579 665 0 False 548 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 596 416 0,0101012353087442 0,0364866388906576 0,00997940032043946 0,0367132066834516 0,00200810877130383 0,00634102533838036 383289 1590116 579 665 0 True 591 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 640 416 0,0103750280176989 0,0611860390275299 0,0104219119554437 0,061020828564889 0,0019853471408192 0,00687888575732572 393678 2666535 579 665 0 True 635 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 243 461 0,0100770422481204 0,0458635028863071 0,0101472495613031 0,0461738002594034 0,00154993042156382 0,0114027751522534 382371 1998767 579 665 0 True 241 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 287 460 0,01043793524614 0,0474863285473927 0,0104982070649271 0,0473334859235523 0,00169552697344701 0,00934439997700252 396065 2069491 579 665 0 True 285 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 331 460 0,0102970989542299 0,0575258930113106 0,0103456168459602 0,0569161516746777 0,00163107962374531 0,0146676321391626 390721 2507023 579 665 0 True 329 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 375 461 0,010442863462193 0,0734864627808936 0,0103913939116503 0,0719920653086137 0,00171165927118148 0,0154991060555734 396252 3202597 579 665 0 True 373 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 418 459 0,0108592318334295 0,0781768795988598 0,0107423514152743 0,0783703364614328 0,00204369955640783 0,0252339918212442 412051 3407009 579 665 0 True 416 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 463 461 0,010593503478016 0,0410354795204996 0,0106660563057908 0,0413366903181506 0,00198479816906652 0,00770948699547293 401968 1788358 579 665 0 True 460 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 507 460 0,0104287376664475 0,0355998028947397 0,0105134660868238 0,0365453574425879 0,00186256203914325 0,00487844579038785 395716 1551467 579 665 0 True 504 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 550 460 0,0107115171223224 0,0831976485044151 0,0106813153276875 0,083237964446479 0,00186479862435756 0,014654143237744 406446 3625818 579 665 0 True 548 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 596 460 0,0103224515951015 0,05292583713805 0,0103303578240635 0,0547035934996567 0,00193602244379035 0,0117356859881676 391683 2306549 579 665 0 True 591 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 639 461 0,0105226109583232 0,0672164044811043 0,0105287251087205 0,0666819256885634 0,00199606264849489 0,0119798730093222 399278 2929343 579 665 0 True 635 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 242 505 0,00997262731762866 0,0410151265093381 0,00993362325474937 0,0436865796902419 0,00152202015885535 0,0100976516170754 378409 1787471 579 665 0 True 241 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 286 505 0,0106827384489007 0,0794136864248054 0,0104676890211337 0,0780804150453956 0,00192158742938714 0,0224741507208046 405354 3460910 579 665 0 True 285 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 331 504 0,0103830133089505 0,0476749667714721 0,01025406271458 0,0489814602883955 0,00162199396755245 0,0119951928866878 393981 2077712 579 665 0 True 329 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 375 504 0,0107566089815025 0,0469673611816219 0,0107270923933776 0,0481727321278706 0,00186526476789559 0,00682302590601763 408157 2046874 579 665 0 True 373 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 420 504 0,0105660425094213 0,0488468137613432 0,0105592431525139 0,0495307850766766 0,00194056111080934 0,00659789164477204 400926 2128782 579 665 0 True 416 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 463 504 0,0105315449970503 0,0513140713996022 0,0105897611963073 0,0520332646677348 0,00194490080375903 0,0105732916569569 399617 2236307 579 665 0 True 460 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 508 504 0,0106525630083623 0,0623387720847094 0,0107423514152743 0,062226291294728 0,00178311076890038 0,0147827794225526 404209 2716772 579 665 0 True 504 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 551 504 0,0105074309987162 0,0487152190386701 0,0104219119554437 0,0496528572518502 0,0017668933295748 0,0102132030747444 398702 2123047 579 665 0 True 548 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 596 505 0,0104131360412958 0,0390044004495101 0,0105287251087205 0,0383306630045014 0,00177596014027746 0,00624949530583648 395124 1699842 579 665 0 True 591 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 639 503 0,0102437055546398 0,0550589107238226 0,0102998397802701 0,0558022430762188 0,0017949287450925 0,0120710314535676 388695 2399510 579 665 0 True 635 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 243 549 0,0097611620469912 0,0351552490748501 0,00978103303578241 0,0363164721141375 0,00143910439109944 0,00771680912627864 370385 1532093 579 665 0 True 241 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 287 548 0,0100661580062493 0,0427504100145075 0,00997940032043946 0,0434729533836881 0,00146731262792489 0,0109549745384646 381958 1863096 579 665 0 True 285 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 331 549 0,010384304659681 0,0415410005902832 0,0103456168459602 0,0420080872816053 0,00143057530524242 0,00834962411739064 394030 1810389 579 665 0 True 329 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 375 548 0,0104600463331371 0,0419758482954927 0,0103913939116503 0,0425116350041962 0,00175772088401947 0,00625474332598835 396904 1829340 579 665 0 True 373 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 419 548 0,010832956799179 0,0761488064404545 0,0106202792401007 0,0745098039215686 0,00216682915506836 0,0197099801284053 411054 3318624 579 665 0 True 416 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 464 548 0,0106126629062006 0,0544948546692894 0,0105745021744106 0,0548104066529335 0,00217123230510301 0,0111701542896755 402695 2374928 579 665 0 True 460 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 507 548 0,0104933842652603 0,0480059842900912 0,0104676890211337 0,0486457618066682 0,00205909185334628 0,00737229351461819 398169 2092138 579 665 0 True 504 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 548 547 0,0105484379729325 0,0317924589454869 0,0104982070649271 0,0337682154573892 0,00220712352645837 0,00976525463429328 400258 1385540 579 665 0 False 548 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 596 549 0,0100446794175692 0,0438026400402471 0,0100862134737163 0,0435339894712749 0,0017194332725696 0,00778789048592177 381143 1908953 579 665 0 True 591 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 639 548 0,0104381987871054 0,0454308579872662 0,0104371709773404 0,0455176623178454 0,00180229891711571 0,00801966167577452 396075 1979912 579 665 0 True 635 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 241 590 0,00942390867356801 0,00957635562928837 0,00943007553215839 0,00949111161974517 0,00118505647365299 0,00133716733982603 357588 417345 579 665 0 False 241 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 285 590 0,00961057473936128 0,00961931034957501 0,00961318379491875 0,00961318379491875 0,00131567270855854 0,00144199281160666 364671 419217 579 665 0 False 285 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 332 592 0,0102827886798087 0,0615526456333096 0,0100404364080262 0,0613107499809262 0,00181047459493204 0,0111099113222949 390178 2682512 579 665 0 True 329 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 375 592 0,010305347786447 0,0644812075966983 0,0101930266269932 0,0659494926375219 0,00162552683925035 0,0165384519142787 391034 2810141 579 665 0 True 372 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 416 590 0,0103690192836877 0,0100082433137089 0,0102235446707866 0,0100404364080262 0,00213770904835393 0,00173162409146525 393450 436167 579 665 0 False 416 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 460 590 0,0101270096151604 0,00993708808528531 0,010101472495613 0,00993362325474937 0,00200348496659186 0,00181371827655771 384267 433066 579 665 0 False 460 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 504 590 0,0098372726777989 0,00986781442046407 0,0098115510795758 0,00990310521095598 0,0020640018240787 0,00200318231948089 373273 430047 579 665 0 False 504 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 548 590 0,00985574689947348 0,00965572548904878 0,00985732814526589 0,00973525597009232 0,00186046080827229 0,00185205620541093 373974 420804 579 665 0 False 548 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 591 590 0,00966027856543584 0,00985549247345877 0,00965896086060884 0,00987258716716258 0,00171676000879172 0,00170991354217449 366557 429510 579 665 0 False 591 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 635 590 0,0101423476993467 0,0098334873576709 0,0101472495613031 0,00987258716716258 0,00168047142273922 0,00154528059027509 384849 428551 579 665 0 False 635 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 243 636 0,00964040757664463 0,0379345938662174 0,00959792477302205 0,0378271152819104 0,00138382857094387 0,00782007037970182 365803 1653219 579 665 0 True 241 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 285 633 0,00946502106417051 0,00935235777702439 0,00944533455405508 0,00926222629129473 0,00125938039296249 0,00124974297034922 359148 407583 579 665 0 False 285 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 329 633 0,00950608074657993 0,00951756823966531 0,00947585259784848 0,00956740672922866 0,00129582538644621 0,00126145767382749 360706 414783 579 665 0 False 329 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 372 633 0,00969256233369742 0,00964751085771192 0,00968947890440223 0,00968947890440223 0,00130463290338433 0,0012675043833 367782 420446 579 665 0 False 372 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 416 633 0,0096290753151324 0,00964881877387449 0,00968947890440223 0,00961318379491875 0,00152578135203513 0,00145430401019019 365373 420503 579 665 0 False 416 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 460 633 0,00947050271625085 0,0097181612763885 0,00947585259784848 0,00967421988250553 0,00187487767867052 0,00179993524830628 359356 423525 579 665 0 False 460 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 504 633 0,00967171624333423 0,00982974717636389 0,00959792477302205 0,0098115510795758 0,00180798532521151 0,00172225681381061 366991 428388 579 665 0 False 504 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 547 633 0,0096591980474777 0,00953757706236293 0,00968947890440223 0,00964370183871214 0,00177796853589639 0,0018454476473616 366516 415655 579 665 0 False 547 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 591 633 0,00959781935663589 0,00976164375231969 0,00958266575112535 0,0098115510795758 0,0014597783343388 0,00151866063715632 364187 425420 579 665 0 False 591 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 640 636 0,010079414116809 0,0403154143082586 0,0100862134737163 0,0410620279240101 0,00143275906854257 0,00756974236923774 382461 1756977 579 665 0 True 635 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H12_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H12_2.csv new file mode 100755 index 0000000..093262a --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H12_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 242 247 0,00923505521776192 0,658751364563847 0,00807202258335241 0,666590371557183 0,00444820804407282 0,1964144181995 350422 28708895 579 665 1 True 242 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 285 247 0,00727554907771863 0,0065019724867215 0,00674448767833982 0,00648508430609598 0,00303879088640776 0,00137578324094726 276069 283361 579 665 0 False 285 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 331 245 0,00634912352204579 0,00618183132355953 0,00633249408712902 0,00614938582436866 0,00119243416977207 0,00117115404623336 240916 269409 579 665 0 True 329 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 373 245 0,00612545630471028 0,0062142768227504 0,00613412680247196 0,00630197604333562 0,001229820861175 0,00119414410874542 232429 270823 579 665 0 True 373 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 419 244 0,0059487784415057 0,0061885774174507 0,0059510185397116 0,00619516289005875 0,0013839472035983 0,00144190434530058 225725 269703 579 665 0 True 417 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 462 245 0,00592780058065981 0,00602008569145455 0,00588998245212482 0,005981536583505 0,0014532193989478 0,0013619719179853 224929 262360 579 665 0 True 460 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 507 246 0,00598678104871647 0,00609264061963102 0,00602731364919509 0,00607309071488518 0,00153628184195435 0,00149877937676002 227167 265522 579 665 0 True 504 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 551 245 0,00634530217804749 0,00621891189406338 0,00633249408712902 0,00625619897764553 0,00141017561269525 0,00125853242749336 240771 271025 579 665 0 True 548 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 592 247 0,00668168586628485 0,00665162563079707 0,00672922865644312 0,00662241550316625 0,00168920842637952 0,00186737372071181 253535 289883 579 665 0 False 592 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 638 245 0,00912291853698395 0,681876492558932 0,00869764248111696 0,687479972533761 0,00287591655314812 0,185871950128423 346167 29716706 579 665 3 True 635 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 241 289 0,00659450651493032 0,00645107848586906 0,00645456626230259 0,00643930724040589 0,00164429484557562 0,00146057673813289 250227 281143 579 665 0 False 241 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 285 289 0,00622357260612894 0,00624773194143519 0,00621042191195544 0,00628671702143893 0,00130186099132159 0,00133805352176192 236152 272281 579 665 0 False 285 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 331 291 0,00593618118335955 0,00590615930992508 0,00585946440833143 0,00592050049591821 0,00129178892044102 0,00120774304998588 225247 257395 579 665 0 True 329 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 375 290 0,00583516593132149 0,00592180841208079 0,00587472343022812 0,00590524147402152 0,00127854139718471 0,0012360152081867 221414 258077 579 665 0 True 373 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 419 289 0,00606088876818713 0,00596588748134929 0,00605783169298848 0,00607309071488518 0,00137615245859921 0,00143996862418392 229979 259998 579 665 0 True 417 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 463 291 0,00621498117065687 0,00619536940313705 0,00627145799954223 0,00614938582436866 0,00167759916349226 0,00174466571071172 235826 269999 579 665 0 True 460 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 504 290 0,00618607072675243 0,00604121886313403 0,00614938582436866 0,00610360875867857 0,00159939660219486 0,00157377782336515 234729 263281 579 665 0 False 504 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 551 290 0,00600082778217232 0,00638540732696929 0,00590524147402152 0,00633249408712902 0,00145042875806099 0,00182340005276406 227700 278281 579 665 0 True 548 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 592 290 0,00627164247821801 0,0063331595181591 0,00627145799954223 0,00634775310902571 0,00176149681014414 0,00184661818709823 237976 276004 579 665 0 False 592 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 635 290 0,00667831254192772 0,00633036011865324 0,00668345159075303 0,00630197604333562 0,00184883710375943 0,0019248759574953 253407 275882 579 665 0 False 635 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 242 330 0,00605319337199743 0,00581616549958095 0,00605783169298848 0,00581368734264134 0,00145940481032276 0,00148179183901274 229687 253473 579 665 0 True 241 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 287 329 0,00593441545889137 0,00591786171769548 0,00593575951781491 0,00601205462729839 0,00129733268557058 0,00136564283107352 225180 257905 579 665 0 True 285 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 332 329 0,00579218239986465 0,00569742047955779 0,00570687418936446 0,00561532005798428 0,0013557055519967 0,00114742857878258 219783 248298 579 665 0 True 329 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 375 328 0,00570708502213678 0,00588683886415512 0,00567635614557107 0,0059510185397116 0,00117975607532133 0,00118111549649632 216554 256553 579 665 0 True 373 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 419 328 0,00598148387531192 0,00597912726425815 0,00593575951781491 0,0059662775616083 0,00142485863034936 0,00146105408556177 226966 260575 579 665 0 True 416 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 460 332 0,00609472742814457 0,00601533589065362 0,00611886778057527 0,00590524147402152 0,00162662182253378 0,00166325646400835 231263 262153 579 665 0 False 460 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 504 333 0,00591435999142438 0,00598096293606527 0,00582894636453803 0,00602731364919509 0,00161195128291066 0,00153288449089096 224419 260655 579 665 0 False 504 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 551 328 0,00585039859912164 0,00593642494884499 0,00579842832074464 0,0059662775616083 0,00159739498930406 0,00128242251553419 221992 258714 579 665 0 True 548 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 596 328 0,00600702099485924 0,00591102384021395 0,005981536583505 0,00599679560540169 0,00185213101795303 0,00209309664337319 227935 257607 579 665 0 True 592 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 640 328 0,00594408741232157 0,00601221524858151 0,00584420538643473 0,00601205462729839 0,00189258490605405 0,00172947540323204 225547 262017 579 665 0 True 635 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 244 372 0,0056652610709277 0,00551768526374301 0,00563057907988098 0,00547798886091402 0,00153088432094366 0,00135501222953619 214967 240465 579 665 0 True 241 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 287 374 0,00571322552663062 0,00544258334093416 0,00563057907988098 0,00543221179522393 0,00142454795931567 0,00138654520459608 216787 237192 579 665 0 True 285 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 332 373 0,00579637270121452 0,00574019163266371 0,00582894636453803 0,00572213321126116 0,00116354108280445 0,00125390310897285 219942 250162 579 665 0 True 329 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 376 372 0,00611760278394134 0,00601639140194271 0,00610360875867857 0,00599679560540169 0,00126601562302534 0,00131823087750121 232131 262199 579 665 0 True 373 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 419 372 0,00607635862285614 0,00618167070227641 0,00608834973678187 0,00622568093385214 0,00139485863594237 0,0014453152887975 230566 269402 579 665 0 True 416 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 463 373 0,00604544526761465 0,00619741158802247 0,00602731364919509 0,00613412680247196 0,00164075736377982 0,00157865631490629 229393 270088 579 665 0 True 460 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 507 372 0,00594833042186452 0,00596685120904803 0,00588998245212482 0,00601205462729839 0,00174134482833327 0,00167356139942299 225708 260040 579 665 0 True 504 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 552 372 0,005908193132834 0,00601434921705729 0,00585946440833143 0,00604257267109178 0,00171262987682062 0,00161786052556715 224185 262110 579 665 0 True 548 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 596 371 0,00578730689200473 0,00586331931912638 0,00585946440833143 0,00592050049591821 0,00185794319406607 0,00199515909919113 219598 255528 579 665 0 True 591 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 639 372 0,00559481657087611 0,00561238298309289 0,00558480201419089 0,00569161516746777 0,00179468299508327 0,00184108166680877 212294 244592 579 665 0 True 635 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 244 418 0,0053058966105074 0,00541275367406844 0,00523384451056687 0,00538643472953384 0,00151822625791043 0,00151000977927525 201331 235892 579 665 0 True 241 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 288 417 0,00547466824474997 0,00540905938455661 0,00544747081712062 0,00538643472953384 0,00138579431455085 0,00144782913818993 207735 235731 579 665 0 True 285 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 332 416 0,00572938058780968 0,00575935145715054 0,00576791027695125 0,00578316929884794 0,00129265138211603 0,00118973642942313 217400 250997 579 665 0 True 329 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 376 417 0,00597929648529909 0,00591735690794852 0,00599679560540169 0,00590524147402152 0,00132712673568819 0,00119738013820578 226883 257883 579 665 0 True 373 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 420 416 0,00587988883314997 0,00613889954917048 0,00584420538643473 0,00617990386816205 0,00149650507254769 0,00139342099378618 223111 267538 579 665 0 True 416 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 463 417 0,00608170850445378 0,00615057901104329 0,00605783169298848 0,00619516289005875 0,0016674665751128 0,00146671923736589 230769 268047 579 665 0 True 460 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 508 416 0,00588666183596077 0,00602405533173745 0,00588998245212482 0,00599679560540169 0,00157213329648561 0,00161296238851487 223368 262533 579 665 0 True 504 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 548 418 0,00564146332175203 0,00584755548748273 0,00570687418936446 0,00584420538643473 0,0016409186179966 0,00144895973402686 214064 254841 579 665 0 False 548 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 596 416 0,00544662748603134 0,00555345791808429 0,00550850690470741 0,0055542839703975 0,00174462104866265 0,00196498683786461 206671 242024 579 665 0 True 591 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 640 416 0,00537639381875207 0,00538978483058183 0,00532539864194705 0,00540169375143053 0,00168919188607147 0,00169789058250663 204006 234891 579 665 0 True 635 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 243 461 0,0053458230667656 0,00544556630762073 0,00540169375143053 0,00546272983901732 0,00141057159760551 0,00143534617984495 202846 237322 579 665 0 True 241 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 287 460 0,00548339145070473 0,00548308285017878 0,00550850690470741 0,00560006103608759 0,0014653286557222 0,00147022729138552 208066 238957 579 665 0 True 285 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 331 460 0,00560939038626277 0,00569845304494929 0,00564583810177768 0,00566109712367437 0,00142109599274529 0,00149344143391376 212847 248343 579 665 0 True 329 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 375 461 0,00571217136276901 0,00572582750077299 0,00569161516746777 0,00576791027695125 0,00140263515306496 0,00140937546321146 216747 249536 579 665 0 True 373 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 418 459 0,00597323504309488 0,00603743279003184 0,00601205462729839 0,00608834973678187 0,00163803176981477 0,00169706434278638 226653 263116 579 665 0 True 416 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 463 461 0,00612764369472311 0,00598020572144484 0,00613412680247196 0,005981536583505 0,00180524366858572 0,00201560060856326 232512 260622 579 665 0 True 460 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 507 460 0,00578627908223967 0,0058087539746597 0,00575265125505455 0,00578316929884794 0,00168600042421082 0,00159694352505743 219559 253150 579 665 0 True 504 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 550 460 0,00554295170888527 0,00541371740176718 0,00552376592660411 0,00543221179522393 0,00168255855131445 0,00164681381839082 210326 235934 579 665 0 True 548 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 596 460 0,00532982613016578 0,00525048028631891 0,00535591668574044 0,00534065766384375 0,00180764229854922 0,00170159581022168 202239 228820 579 665 0 True 591 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 639 461 0,00526541671822187 0,00529226476582851 0,00529488059815366 0,00535591668574044 0,00169862091636476 0,00170981055014818 199795 230641 579 665 0 True 635 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 242 505 0,0054364020965738 0,00566183139239722 0,00540169375143053 0,00564583810177768 0,00143763034136991 0,00136151330121851 206283 246747 579 665 0 True 241 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 286 505 0,00555557532112796 0,00547521240730574 0,00558480201419089 0,00541695277332723 0,00146605167377345 0,00136515149017811 210805 238614 579 665 0 True 285 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 331 504 0,00554094879754823 0,00540639766043628 0,00549324788281071 0,00543221179522393 0,00137311924961343 0,00146821021149457 210250 235615 579 665 0 True 329 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 375 504 0,00552023447766774 0,00570673651397893 0,00550850690470741 0,00573739223315786 0,00139527193117765 0,00144351906119661 209464 248704 579 665 0 True 373 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 420 504 0,00581474150650294 0,00569911847597937 0,00587472343022812 0,00572213321126116 0,00178766171182358 0,00162854062942173 220639 248372 579 665 0 True 416 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 463 504 0,00565614255352484 0,00579207230711248 0,00563057907988098 0,00584420538643473 0,00182688784607841 0,00161702501250465 214621 252423 579 665 0 True 460 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 508 504 0,00569206318710895 0,00565396094952419 0,00570687418936446 0,00564583810177768 0,00176123237946098 0,00160090881196479 215984 246404 579 665 0 True 504 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 551 504 0,00570969407769425 0,00566144131213821 0,00569161516746777 0,00570687418936446 0,00163516839980179 0,00161075290676031 216653 246730 579 665 0 True 548 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 596 505 0,00546085869816297 0,00540311639708105 0,00544747081712062 0,00535591668574044 0,00160232044254708 0,00172055445247293 207211 235472 579 665 0 True 591 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 639 503 0,00558387962081199 0,00544448785043405 0,00561532005798428 0,00547798886091402 0,00171789631694614 0,00184802442756008 211879 237275 579 665 0 True 635 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 243 549 0,00539679188947408 0,00567571366043858 0,00537117570763714 0,00561532005798428 0,00130923063479382 0,00132993201410377 204780 247352 579 665 0 True 241 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 287 548 0,00543329231318207 0,00550983776676757 0,00546272983901732 0,0055390249485008 0,0012573781145715 0,00128467642269063 206165 240123 579 665 0 True 285 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 331 549 0,00543099950678308 0,00571596076480971 0,00538643472953384 0,00575265125505455 0,00131995468831728 0,00130018993203688 206078 249106 579 665 0 True 329 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 375 548 0,00548196832949156 0,0056585271831444 0,0055542839703975 0,00563057907988098 0,00132556606933536 0,00138162169001508 208012 246603 579 665 0 True 373 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 419 548 0,00561110340253787 0,005679430895848 0,00566109712367437 0,00560006103608759 0,00156896766211622 0,0016178750293229 212912 247514 579 665 0 True 416 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 464 548 0,00569504120001797 0,00591972033540018 0,00575265125505455 0,00593575951781491 0,0019592149567349 0,00182901003874093 216097 257986 579 665 0 True 460 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 507 548 0,005629603978309 0,00560286043559345 0,00564583810177768 0,00558480201419089 0,00188245039467341 0,00197644209048609 213614 244177 579 665 0 True 504 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 548 547 0,00555309803605319 0,00571490525352062 0,00552376592660411 0,00572213321126116 0,0016824663944914 0,00185209010993824 210711 249060 579 665 0 False 548 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 596 549 0,00551720375656563 0,00570978831835827 0,0055390249485008 0,00561532005798428 0,00151612988529741 0,00134118162839608 209349 248837 579 665 0 True 591 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 639 548 0,00581276494926243 0,0057163967368639 0,00585946440833143 0,00578316929884794 0,00156972577647819 0,00172748915009733 220564 249125 579 665 0 True 635 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 241 590 0,00592498069233002 0,00585173164084393 0,00592050049591821 0,00584420538643473 0,00130454362357158 0,001276179986687 224822 255023 579 665 0 False 241 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 285 590 0,00570777022864682 0,00550421602185826 0,00569161516746777 0,00546272983901732 0,00134181367640519 0,00134048567362749 216580 239878 579 665 0 False 285 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 332 592 0,00540841404604825 0,00551745580476712 0,00544747081712062 0,00556954299229419 0,00134878699512645 0,00148466125711698 205221 240455 579 665 0 True 329 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 375 592 0,00543305512631321 0,00530559633232773 0,00541695277332723 0,00532539864194705 0,0012862537176383 0,00124754719945198 206156 231222 579 665 0 True 372 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 416 590 0,0055321201752073 0,0054345752226756 0,00549324788281071 0,00544747081712062 0,00152689112870578 0,00152836494121102 209915 236843 579 665 0 False 416 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 460 590 0,00557381235593368 0,00560263097661756 0,00566109712367437 0,00558480201419089 0,0019254830565985 0,00172921181481306 211497 244167 579 665 0 False 460 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 504 590 0,00553957838452814 0,00561458578926143 0,0055542839703975 0,00560006103608759 0,00189540271404251 0,00194845729680528 210198 244688 579 665 0 False 504 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 548 590 0,00558891325325114 0,00560056584583454 0,00561532005798428 0,00556954299229419 0,00188199054713295 0,00169911046023822 212070 244077 579 665 0 False 548 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 591 590 0,00581532129662682 0,0057343633746761 0,00584420538643473 0,00575265125505455 0,00154311518083046 0,00159368237402666 220661 249908 579 665 0 False 591 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 635 590 0,0061235588097594 0,00584966651006092 0,00619516289005875 0,00602731364919509 0,00156082846704453 0,00132602407613933 232357 254933 579 665 0 False 635 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 243 636 0,00824327150266974 0,661401615735379 0,00727855344472419 0,668207827878233 0,0037350501628811 0,19439454094639 312789 28824395 579 665 1 True 241 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 285 633 0,00715988094800429 0,00588341992541436 0,00613412680247196 0,00581368734264134 0,00497165451391877 0,00134428497334632 271680 256404 579 665 0 False 285 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 329 633 0,00528317937928987 0,00540079886142456 0,00526436255436027 0,00537117570763714 0,00125846814491958 0,00126376000187857 200469 235371 579 665 0 False 329 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 372 633 0,00522459422268131 0,0052998139661353 0,00520332646677348 0,00534065766384375 0,00119372491681139 0,00119750334281057 198246 230970 579 665 0 False 372 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 416 633 0,0052690535835444 0,00536899584736618 0,00527962157625696 0,00544747081712062 0,00135691277069982 0,00134502713440441 199933 233985 579 665 0 False 416 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 460 633 0,00545853953766745 0,00539334144470813 0,00550850690470741 0,00529488059815366 0,00156432310722237 0,00163375891459722 207123 235046 579 665 0 False 460 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 504 633 0,00534247609650501 0,00553319669051319 0,00541695277332723 0,00558480201419089 0,0016682702456814 0,00168530737536716 202719 241141 579 665 0 False 504 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 547 633 0,00544027614876519 0,00551077854856872 0,00546272983901732 0,00552376592660411 0,00171484079618308 0,00172734161587326 206430 240164 579 665 0 False 547 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 591 633 0,00582599470572555 0,00571981567560467 0,00587472343022812 0,00569161516746777 0,00140587187939895 0,00130616413338343 221066 249274 579 665 0 False 591 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 640 636 0,00954563824548657 0,702346986716046 0,0076752880140383 0,710460059510185 0,00614979127925341 0,194644764316752 362207 30608826 579 665 6 True 635 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H12_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H12_3.csv new file mode 100755 index 0000000..c0692cd --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H12_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 242 247 0,00107390307991102 0,0642588847949583 0,00080872816052491 0,0645761806668193 0,000940975972706227 0,0197452002306859 40749 2800452 579 665 0 True 242 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 285 247 0,000944451757706234 0,000998238328712603 0,000778210116731518 0,000839246204318303 0,000747403621031065 0,000715736014587332 35837 43504 579 665 0 False 285 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 331 245 0,000921022965882118 0,000882545113068779 0,000823987182421607 0,00080872816052491 0,000626217489766051 0,000607324020773111 34948 38462 579 665 0 True 329 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 373 245 0,000873427467530765 0,00092781736901191 0,000762951094834821 0,000823987182421607 0,000608906251193431 0,000623461944233609 33142 40435 579 665 0 True 373 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 419 244 0,000897778652733783 0,00088975012491173 0,000701915007248035 0,000686655985351339 0,000766027114356188 0,000746347636295318 34066 38776 579 665 0 True 417 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 462 245 0,000966404720124107 0,0009817402283461 0,000778210116731518 0,000823987182421607 0,000846670061073025 0,000805860439478142 36670 42785 579 665 0 True 460 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 507 246 0,000948510288573404 0,000996632115881372 0,000747692072938125 0,000793469138628214 0,000876602163111823 0,000856161730966713 35991 43434 579 665 0 True 504 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 551 245 0,000876010168991691 0,000897872972658242 0,000717174029144732 0,000747692072938125 0,000752407759585379 0,000693803255950507 33240 39130 579 665 0 True 548 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 592 247 0,000945216026505896 0,000904733796037358 0,000686655985351339 0,000473029678797589 0,000915115647015908 0,000987918067766932 35866 39429 579 665 0 False 592 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 638 245 0,00116556262767736 0,0668080592876102 0,00080872816052491 0,0668955519951171 0,00103760091494551 0,0190733497085939 44227 2911547 579 665 0 True 635 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 241 289 0,000870238621849417 0,000847575565143116 0,000625619897764553 0,000656137941557946 0,000762093957748419 0,000754634424372433 33021 36938 579 665 0 False 241 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 285 289 0,00088826482388282 0,000864027773714442 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000703770767227639 0,000651962111634246 33705 37655 579 665 0 False 285 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 331 291 0,000823749995552746 0,000946541221444548 0,000671396963454643 0,000839246204318303 0,000650144695161379 0,000690595797152914 31257 41251 579 665 0 True 329 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 375 290 0,000844174420371295 0,000824950910120345 0,000701915007248035 0,000732433051041428 0,000665976265730873 0,000604040211900579 32032 35952 579 665 0 True 373 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 419 289 0,000929403568581858 0,0008983777824052 0,000732433051041428 0,000671396963454643 0,000795429122118761 0,000795175590568769 35266 39152 579 665 0 True 417 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 463 291 0,000891901689205349 0,000866735389629946 0,000579842832074464 0,000473029678797589 0,000883352148259931 0,000957941002012233 33843 37773 579 665 0 True 460 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 504 290 0,00087142455619372 0,000917399931506496 0,000671396963454643 0,000701915007248035 0,000813913029472864 0,000809728531447368 33066 39981 579 665 0 False 504 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 551 290 0,000855322203207742 0,000909093516579271 0,000610360875867857 0,000686655985351339 0,000821976287926074 0,000786318897443642 32455 39619 579 665 0 True 548 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 592 290 0,000923711083729205 0,000936399134710202 0,000564583810177768 0,000457770656900893 0,000978793577252827 0,00104005847538207 35050 40809 579 665 0 False 592 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 635 290 0,000917017143208029 0,000885023270008392 0,000503547722590982 0,000473029678797589 0,000968082141752134 0,00097998573157673 34796 38570 579 665 0 False 635 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 242 330 0,000841196407462268 0,000922012056921888 0,000671396963454643 0,000732433051041428 0,000732549587907229 0,000746565333167064 31919 40182 579 665 0 True 241 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 287 329 0,00086296489120436 0,000927404342855307 0,000686655985351339 0,000793469138628214 0,000676674305565128 0,000685903473196002 32745 40417 579 665 0 True 285 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 332 329 0,000881808070230505 0,000826901311415412 0,000778210116731518 0,000717174029144732 0,000671571923955706 0,000604044674753838 33460 36037 579 665 0 True 329 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 375 328 0,00087985786708654 0,000844707327944489 0,000747692072938125 0,000732433051041428 0,000667191590331004 0,00063043340044853 33386 36813 579 665 0 True 373 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 419 328 0,000957549743686646 0,000877290502520894 0,000747692072938125 0,000610360875867857 0,000820433350990788 0,000805200048766294 36334 38233 579 665 0 True 416 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 460 332 0,00088821211568974 0,000936559755993325 0,000595101853971161 0,000732433051041428 0,000882129519804095 0,000800598056617545 33703 40816 579 665 0 False 460 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 504 333 0,000869527061242835 0,000898515457790735 0,00064087891966125 0,00064087891966125 0,000831755007050449 0,000859475783144698 32994 39158 579 665 0 False 504 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 551 328 0,00083769131262244 0,000879493308689439 0,000564583810177768 0,000717174029144732 0,000833716624590153 0,000720334735696739 31786 38329 579 665 0 True 548 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 596 328 0,000847863993886904 0,000938326590107679 0,000473029678797589 0,000488288700694286 0,000954182842236362 0,00110481527370899 32172 40893 579 665 0 True 592 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 640 328 0,000929140027616458 0,000949455350438353 0,000473029678797589 0,000518806744487678 0,000995987456299055 0,000977078687498902 35256 41378 579 665 0 True 635 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 244 372 0,000840274014083366 0,000790463226044053 0,000656137941557946 0,000625619897764553 0,000756539711008902 0,000727952351527593 31884 34449 579 665 0 True 241 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 287 374 0,000909717058466431 0,000849342399257471 0,000762951094834821 0,000717174029144732 0,000758186324270125 0,000655649458264725 34519 37015 579 665 0 True 285 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 332 373 0,000914012776202462 0,000883875975128942 0,00080872816052491 0,000762951094834821 0,000705375532453659 0,000689586612715431 34682 38520 579 665 0 True 329 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 376 372 0,000852555023071035 0,000851476367733249 0,000717174029144732 0,000717174029144732 0,000696104093465131 0,000660427290533205 32350 37108 579 665 0 True 373 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 419 372 0,000893509289094293 0,000815130065952246 0,000671396963454643 0,000595101853971161 0,00077506502094928 0,000748519293964093 33904 35524 579 665 0 True 416 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 463 373 0,000913564756561281 0,000958335412805302 0,000625619897764553 0,000610360875867857 0,000891183972586005 0,000900880161961737 34665 41765 579 665 0 True 460 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 507 372 0,000851658983788673 0,000967651447226443 0,000503547722590982 0,000656137941557946 0,000899104711946701 0,000941814363466476 32316 42171 579 665 0 True 504 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 552 372 0,000835925588154255 0,000977587020882488 0,000564583810177768 0,000778210116731518 0,000826387419350816 0,000865967894894531 31719 42604 579 665 0 True 548 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 596 371 0,000871793513545281 0,000918088308434166 0,000457770656900893 0,000488288700694286 0,000987022163400877 0,00107640337324127 33080 40011 579 665 0 True 591 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 639 372 0,000871977992221061 0,000783625348562526 0,000473029678797589 0,000442511635004196 0,00095127495420356 0,000863030988172973 33087 34151 579 665 0 True 635 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 244 418 0,000818057510700093 0,000892274173646522 0,000656137941557946 0,000717174029144732 0,0007371641341605 0,000820415143283252 31041 38886 579 665 0 True 241 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 288 417 0,000910006953528372 0,000963658861045954 0,000793469138628214 0,000823987182421607 0,000768845304912835 0,00078139607920459 34530 41997 579 665 0 True 285 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 332 416 0,000843910879405894 0,000883072868713326 0,000701915007248035 0,00080872816052491 0,000668727163603714 0,000641867599267118 32022 38485 579 665 0 True 329 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 376 417 0,000774257002250508 0,000827773255523795 0,000610360875867857 0,000701915007248035 0,000663413665010671 0,000691077209057554 29379 36075 579 665 0 True 373 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 420 416 0,000928349404720256 0,000905995820404754 0,000701915007248035 0,000701915007248035 0,000786669040097711 0,000783732801783623 35226 39484 579 665 0 True 416 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 463 417 0,000973045952452202 0,000936766269071626 0,000732433051041428 0,000717174029144732 0,000865957224781195 0,0007793415945558 36922 40825 579 665 0 True 460 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 508 416 0,000925002434459668 0,000900649426266513 0,000610360875867857 0,000671396963454643 0,000905659755769114 0,000854761611238598 35099 39251 579 665 0 True 504 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 548 418 0,000945532275664377 0,000914371073024745 0,00064087891966125 0,000762951094834821 0,000924084393585148 0,000756706996198269 35878 39849 579 665 0 False 548 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 596 416 0,000882730463609407 0,000900006941134021 0,000503547722590982 0,000503547722590982 0,000956935055086102 0,000992752914997985 33495 39223 579 665 0 True 591 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 640 416 0,000798924436612007 0,000757489971208635 0,000442511635004196 0,000396734569314107 0,000883621074303775 0,000863426977369233 30315 33012 579 665 0 True 635 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 243 461 0,000849893259320489 0,000786608315249098 0,000671396963454643 0,000564583810177768 0,000792350355161647 0,000735941242544366 32249 34281 579 665 0 True 241 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 287 460 0,000848364721721165 0,000887294913869705 0,000656137941557946 0,000701915007248035 0,000744894983946951 0,000774512274587825 32191 38669 579 665 0 True 285 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 331 460 0,000857035219482846 0,000872357134539255 0,000686655985351339 0,000732433051041428 0,000785044337829412 0,000764460313777137 32520 38018 579 665 0 True 329 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 375 461 0,000860645730708834 0,000849158832076759 0,000701915007248035 0,000762951094834821 0,000750128877713538 0,000720022053487915 32657 37007 579 665 0 True 373 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 418 459 0,0008128657536817 0,000903586501157907 0,000488288700694286 0,000564583810177768 0,000875227684005864 0,000944951535744502 30844 39379 579 665 0 True 416 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 463 461 0,00094695539687754 0,000866460038858878 0,000488288700694286 0,000488288700694286 0,00103065515503031 0,000945042681484354 35932 37761 579 665 0 True 460 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 507 460 0,000866496340140728 0,000988073296080669 0,000549324788281071 0,00064087891966125 0,000893307270003958 0,000969222715293533 32879 43061 579 665 0 True 504 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 550 460 0,000857325114544786 0,000909024678886504 0,000488288700694286 0,000518806744487678 0,000941615316232504 0,000988220214090415 32531 39616 579 665 0 True 548 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 596 460 0,000855638452366222 0,000914784099181348 0,000457770656900893 0,000564583810177768 0,000988651547500506 0,000930030457496735 32467 39867 579 665 0 True 591 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 639 461 0,00077523210382249 0,00083162816631875 0,000396734569314107 0,000411993591210803 0,000893073940903097 0,000930128126048781 29416 36243 579 665 0 True 635 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 242 505 0,000802139636389895 0,000811757019006661 0,000656137941557946 0,000656137941557946 0,000717324583622535 0,000691286862686548 30437 35377 579 665 0 True 241 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 286 505 0,000909796120756052 0,000901360749091773 0,00080872816052491 0,000747692072938125 0,000749186556347664 0,00080253910607347 34522 39282 579 665 0 True 285 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 331 504 0,000896223761037919 0,000830251412463409 0,000747692072938125 0,000732433051041428 0,000780369201297666 0,000762286964055044 34007 36183 579 665 0 True 329 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 375 504 0,000784482391708052 0,000841540794077205 0,000610360875867857 0,000671396963454643 0,000756589620780183 0,000766686026373338 29767 36675 579 665 0 True 373 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 420 504 0,000882994004574808 0,000819443894698981 0,000610360875867857 0,000457770656900893 0,000884934379522384 0,000833859167384507 33505 35712 579 665 0 True 416 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 463 504 0,000888739197620541 0,000964255454383269 0,000503547722590982 0,000671396963454643 0,000959505697113943 0,000881435917758829 33723 42023 579 665 0 True 460 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 508 504 0,000889424404130583 0,000857648814184695 0,000534065766384375 0,000564583810177768 0,000908872904742598 0,000859347997694634 33749 37377 579 665 0 True 504 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 551 504 0,000946243836270959 0,000930410255439469 0,000610360875867857 0,000732433051041428 0,000934224372490059 0,000852021115878055 35905 40548 579 665 0 True 548 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 596 505 0,000953622983302176 0,00087995222664122 0,000579842832074464 0,000549324788281071 0,000985813811127668 0,000904674962272276 36185 38349 579 665 0 True 591 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 639 503 0,000835187673451134 0,000859576269582172 0,0004272526131075 0,0004272526131075 0,000952382558445013 0,000961534074937477 31691 37461 579 665 0 True 635 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 243 549 0,000895617616817498 0,00086944300554545 0,000747692072938125 0,000717174029144732 0,000717177923706576 0,000690407514443184 33984 37891 579 665 0 True 241 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 287 548 0,000785220306411174 0,000825662232945605 0,00064087891966125 0,000686655985351339 0,000664821701902613 0,000674492474320626 29795 35983 579 665 0 True 285 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 331 549 0,000919678906958575 0,00084236684639041 0,000793469138628214 0,000671396963454643 0,000722427131587634 0,000709479856292925 34897 36711 579 665 0 True 329 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 375 548 0,000831919765480166 0,000860884185744746 0,000671396963454643 0,000671396963454643 0,000703660377839523 0,000693231083923895 31567 37518 579 665 0 True 373 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 419 548 0,000795340279482558 0,000898285998814844 0,000518806744487678 0,000579842832074464 0,000818008070972232 0,000873874455811591 30179 39148 579 665 0 True 416 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 464 548 0,000875272254288569 0,000923778891036243 0,000473029678797589 0,00064087891966125 0,000970222591875397 0,000954471818032271 33212 40259 579 665 0 True 460 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 507 548 0,000840906512400327 0,000849319453359882 0,0004272526131075 0,000442511635004196 0,00095274796269445 0,000997169221287217 31908 37014 579 665 0 True 504 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 548 547 0,000933593869931728 0,000942365068083346 0,000503547722590982 0,000488288700694286 0,000966111991519957 0,000995697765499532 35425 41069 579 665 0 False 548 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 596 549 0,000899702501781208 0,000853885686980096 0,000579842832074464 0,00064087891966125 0,000841261589196768 0,000743026736558154 34139 37213 579 665 0 True 591 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 639 548 0,000796578922019941 0,000902324476790511 0,000442511635004196 0,000564583810177768 0,000906957504857996 0,0009628083600855 30226 39324 579 665 0 True 635 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 241 590 0,000912009864865417 0,000883600624357873 0,00080872816052491 0,000732433051041428 0,000650480512870145 0,000635092342810526 34606 38508 579 665 0 False 241 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 285 590 0,000792862994407793 0,000824583775758921 0,000686655985351339 0,000717174029144732 0,000634570604872107 0,000680945220312773 30085 35936 579 665 0 False 285 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 332 592 0,000896856259354881 0,000828507524246643 0,000839246204318303 0,00064087891966125 0,000719631910058239 0,000737312553283628 34031 36107 579 665 0 True 329 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 375 592 0,000856350012972804 0,000769857810009115 0,000747692072938125 0,000625619897764553 0,000630974038139874 0,000619677725111679 32494 33551 579 665 0 True 372 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 416 590 0,000742052296278551 0,000839498609191782 0,000473029678797589 0,000610360875867857 0,000789958534246371 0,000796554837606979 28157 36586 579 665 0 False 416 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 460 590 0,000949748931110787 0,000823964236524018 0,000473029678797589 0,0004272526131075 0,00105431815749888 0,000900841375654089 36038 35909 579 665 0 False 460 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 504 590 0,000973731158962244 0,000936077892143956 0,000488288700694286 0,000488288700694286 0,00109040307719768 0,00109119562790116 36948 40795 579 665 0 False 504 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 548 590 0,000848628262686566 0,000804322548187819 0,000366216525520714 0,000473029678797589 0,000990484167238923 0,000862525402141344 32201 35053 579 665 0 False 548 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 591 590 0,000891374607274548 0,000876074369948676 0,000595101853971161 0,000610360875867857 0,00085080592455034 0,000810703484981159 33823 38180 579 665 0 False 591 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 635 590 0,000845729312067159 0,000793469138628214 0,000625619897764553 0,000595101853971161 0,000794344797858942 0,000706879206826892 32091 34580 579 665 0 False 635 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 243 636 0,00103289610569469 0,0649041922728543 0,000854505226215 0,0648355840390631 0,000818784284913286 0,0199324549072875 39193 2828575 579 665 0 True 241 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 285 633 0,000982243532144684 0,000866001120907097 0,000854505226215 0,000717174029144732 0,000764847593628903 0,000685436872386908 37271 37741 579 665 0 False 285 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 329 633 0,000824514264352408 0,00080615821999494 0,000717174029144732 0,000671396963454643 0,000651685636065807 0,000632342226439685 31286 35133 579 665 0 False 329 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 372 633 0,000878513808162997 0,000834978267366746 0,000732433051041428 0,000717174029144732 0,000679167670419849 0,000657968651671102 33335 36389 579 665 0 False 372 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 416 633 0,000788778109444083 0,00082554750345766 0,000610360875867857 0,000595101853971161 0,000683829776599914 0,000760724168583988 29930 35978 579 665 0 False 416 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 460 633 0,000827940296902616 0,000934471679312725 0,000579842832074464 0,000595101853971161 0,000829318145114649 0,000944990938036218 31416 40725 579 665 0 False 460 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 504 633 0,000895538554527878 0,000879791605358097 0,000564583810177768 0,000549324788281071 0,000933108219323549 0,000906149540344876 33981 38342 579 665 0 False 504 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 547 633 0,00092571399506625 0,00084516624589627 0,000564583810177768 0,000488288700694286 0,000947953398006402 0,000877480281530898 35126 36833 579 665 0 False 547 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 591 633 0,000860276773357273 0,000894339304429533 0,000686655985351339 0,000732433051041428 0,000753182920171175 0,000693533138054863 32643 38976 579 665 0 False 591 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 640 636 0,00109622499968046 0,0695070934374159 0,000854505226215 0,0693522545204852 0,000889230240416076 0,0204787400603041 41596 3029173 579 665 0 True 635 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H1_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H1_1.csv new file mode 100755 index 0000000..89525df --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H1_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 261 278 0,00962641355138186 0,0420492522218799 0,00956740672922866 0,0417639429312581 0,00152262506485281 0,00904063288195709 365272 1832539 579 665 0 True 261 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 304 279 0,00945708848111195 0,00950354829623842 0,00944533455405508 0,00952162966353857 0,00129251885840735 0,00125059774024795 358847 414172 579 665 0 False 304 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 348 277 0,0096853149571489 0,0553848113072794 0,00965896086060884 0,0568245975432975 0,00134798387259435 0,00982833717723625 367507 2413713 579 665 0 True 348 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 393 277 0,00985337503078488 0,0743168518687426 0,00984206912336919 0,0736552986953536 0,00145923349674705 0,0136687795006694 373884 3238786 579 665 0 True 392 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 437 277 0,00980641203075049 0,0658565158604912 0,0097962920576791 0,06494239719234 0,00167280770618362 0,0167938303453576 372102 2870078 579 665 0 True 436 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 481 278 0,00960227319895116 0,0596065122751947 0,00965896086060884 0,0616464484626535 0,00167921339522052 0,017774956791232 364356 2597698 579 665 0 True 480 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 525 278 0,00961763763723402 0,0768953512185132 0,00962844281681544 0,076554512855726 0,00159574041971494 0,0225787404816909 364939 3351159 579 665 0 True 524 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 568 277 0,00953622983302176 0,0625836507037794 0,00946059357595178 0,0643778133821622 0,00162732465658691 0,017724714886557 361850 2727444 579 665 0 True 567 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 611 279 0,00948317903668662 0,00950403016008779 0,00953688868543526 0,00952162966353857 0,0019696663205355 0,00184602449050695 359837 414193 579 665 0 False 611 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 658 277 0,00966921260416292 0,0396860312832895 0,00975051499198901 0,0396887159533074 0,00191543882922405 0,00736980056535906 366896 1729548 579 665 0 True 655 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 260 321 0,00954779928140285 0,00947346622449922 0,00955214770733196 0,00946059357595178 0,00149236273992015 0,00143608402874554 362289 412861 579 665 0 False 260 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 304 321 0,00945566535989879 0,00946997844806569 0,00956740672922866 0,00947585259784848 0,00134594353138652 0,00123679189278059 358793 412709 579 665 0 False 304 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 348 322 0,010067264878304 0,0923915878044849 0,0100709544518196 0,0886854352635996 0,00131500011428376 0,0252008391585057 382000 4026497 579 665 0 True 348 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 394 322 0,00985508804705998 0,0445130220837055 0,00988784618905928 0,0453498130769818 0,00136182397705148 0,00686491580707395 373949 1939912 579 665 0 True 392 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 437 322 0,00991804798369419 0,0740837215492382 0,00996414129854276 0,0737315938048371 0,00166924055108818 0,0164099465769372 376338 3228626 579 665 0 True 436 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 482 323 0,00974566583822564 0,0362876750126633 0,00975051499198901 0,037094682230869 0,00171782288715894 0,00874328114032921 369797 1581445 579 665 0 True 480 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 524 322 0,00963655987854978 0,0381553792928189 0,00973525597009232 0,0389410238803693 0,00163452995434005 0,0122593012122129 365657 1662841 579 665 0 False 524 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 569 322 0,00978822770413784 0,0465717280153921 0,00978103303578241 0,0460975051499199 0,00179211639834342 0,0120871583573922 371412 2029632 579 665 0 True 567 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 611 322 0,00943365968928784 0,00955001373885618 0,00944533455405508 0,00959792477302205 0,00215215571251975 0,00222085055344972 357958 416197 579 665 0 False 611 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 655 322 0,00961497587348347 0,00942931831753795 0,00956740672922866 0,00961318379491875 0,00194139595234264 0,00187133768595791 364838 410937 579 665 0 False 655 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 261 361 0,00969849200541893 0,0523586833873422 0,00967421988250553 0,0516670481422141 0,00151576063638196 0,0148469100521579 368007 2281832 579 665 0 True 260 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 306 361 0,00968900453066451 0,0605087908601901 0,00971999694819562 0,0614175631342031 0,00134405824453749 0,0194904114745709 367647 2637020 579 665 0 True 304 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 350 361 0,00993277992366009 0,0337482066346916 0,00973525597009232 0,0347753109025711 0,00190907684392202 0,00571126886269797 376897 1470773 579 665 0 True 348 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 392 364 0,00986895030184006 0,0294042499244219 0,0098268101014725 0,0305485618371862 0,00153877211031915 0,00763282070306684 374475 1281460 579 665 0 False 392 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 438 360 0,0101209745270527 0,064239862645857 0,00994888227664607 0,0639047837033646 0,00210995996352508 0,0111418790287614 384038 2799623 579 665 0 True 436 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 480 365 0,010027101235177 0,0270600281890352 0,00997940032043946 0,028397039749752 0,00183491772204863 0,00948430273996888 380476 1179297 579 665 0 False 480 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 525 361 0,0095687507881522 0,0237260351611462 0,00964370183871214 0,023773556115053 0,0017316544388865 0,00294533303555983 363084 1033999 579 665 0 True 524 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 570 360 0,00985466638151534 0,0441710593719364 0,0098268101014725 0,0438544289311055 0,00189545502715056 0,00951652567515569 373933 1925009 579 665 0 True 567 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 613 360 0,00944053810848479 0,047859268220907 0,00946059357595178 0,0487678339818418 0,0020164601363764 0,0115769299857233 358219 2085744 579 665 0 True 611 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 658 360 0,00964048663893425 0,0556977474585984 0,00962844281681544 0,0554970626382849 0,00191202697314212 0,0169399580083317 365806 2427351 579 665 0 True 655 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 260 407 0,00983026248811924 0,0458283268253031 0,00975051499198901 0,0470893415732052 0,00170837328936979 0,0169374024809616 373007 1997234 579 665 0 False 260 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 306 405 0,00983698278273696 0,0308203559941281 0,00984206912336919 0,0304264896620127 0,00137148187460383 0,00528881644956338 373262 1343175 579 665 0 True 304 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 349 405 0,00996261276094344 0,0904726912268082 0,00999465934233616 0,0869459067673762 0,00134473855769922 0,0238071317396683 378029 3942870 579 665 0 True 348 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 393 404 0,00992242276371984 0,0622871438151341 0,00991836423285267 0,0638895246814679 0,00144898693825015 0,0161262959525947 376504 2714522 579 665 0 True 392 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 438 404 0,0098793074617803 0,0369168056327589 0,00993362325474937 0,0378576333257038 0,00163665308041915 0,00694722351701975 374868 1608863 579 665 0 True 436 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 482 405 0,0100515841908627 0,04728392278476 0,0100862134737163 0,0475623712520027 0,00162293094187518 0,00919678416546084 381405 2060670 579 665 0 True 480 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 526 405 0,00977349576417195 0,0370434440415527 0,00973525597009232 0,0378271152819104 0,00166906093987115 0,0064859467936997 370853 1614382 579 665 0 True 524 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 570 404 0,00988676567110114 0,048507811070363 0,00997940032043946 0,0481727321278706 0,00173903186984965 0,0106148857808688 375151 2114008 579 665 0 True 567 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 614 405 0,00977536690502629 0,0376120663297062 0,00973525597009232 0,0373998626688029 0,00189447393936413 0,0082275836790211 370924 1639163 579 665 0 True 611 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 658 404 0,00981935189215166 0,0859950058253898 0,0097962920576791 0,0834210727092393 0,00200257242728591 0,0197909574951942 372593 3747729 579 665 0 True 655 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 262 449 0,00990429114530028 0,0434158639904866 0,00991836423285267 0,0440680552376593 0,00170495764625904 0,00777215783556041 375816 1892097 579 665 0 True 260 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 305 449 0,0101186290124606 0,0614251811722027 0,0101777676050965 0,060318913557641 0,00169438357899532 0,0121934486995073 383949 2676957 579 665 0 True 304 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 350 449 0,0100310279955614 0,0341444363942587 0,0100556954299229 0,0340123598077363 0,00139823018467961 0,00633204226190067 380625 1488041 579 665 0 True 348 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 393 448 0,01014026572572 0,0558486626270414 0,0101930266269932 0,053681239032578 0,00153077882750895 0,0171985020098763 384770 2433928 579 665 0 True 392 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 438 448 0,0102019606657203 0,0948420031539136 0,0101777676050965 0,0917372396429389 0,00197516315373507 0,0176382866421043 387111 4133288 579 665 0 True 436 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 482 449 0,00999887599778257 0,0577631077005859 0,00994888227664607 0,0570687418936446 0,00182101953182277 0,0141336144529145 379405 2517361 579 665 0 True 480 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 526 449 0,00997009732436082 0,0497031317134677 0,0101167315175097 0,0494697489890898 0,00190992382381029 0,00980736167084324 378313 2166101 579 665 0 True 524 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 567 451 0,00997099336364318 0,0257957321777779 0,00996414129854276 0,0275272755016403 0,00198866484744128 0,00785738184422718 378347 1124198 579 665 0 False 567 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 614 448 0,0097029458477342 0,0347043851331235 0,0098115510795758 0,0354009308003357 0,00177569004421764 0,00554949136853422 368176 1512444 579 665 0 True 611 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 658 448 0,00998401228733397 0,063129258256651 0,00985732814526589 0,0622415503166247 0,00217818082898986 0,00906943693711601 378841 2751222 579 665 0 True 655 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 260 493 0,00971072030621352 0,0507126823696917 0,00975051499198901 0,0516060120546273 0,00160863522056901 0,0165672072103334 368471 2210098 579 665 0 True 260 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 304 493 0,00996928034736808 0,052922096956743 0,00988784618905928 0,0551155870908675 0,00219090037020404 0,0105379097135851 378282 2306386 579 665 0 True 304 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 348 493 0,0101576067212434 0,0683416254070746 0,0101625085831998 0,0674906538490883 0,00159363257384333 0,021134695326509 385428 2978381 579 665 0 True 348 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 393 492 0,010221515405353 0,090755040496641 0,0102235446707866 0,0877851529716945 0,00152383710310898 0,0261479478460672 387853 3955175 579 665 0 True 392 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 437 493 0,0103274325193475 0,0966907311767631 0,0103761348897536 0,0971541924162661 0,00191466272072523 0,0327231251190859 391872 4213857 579 665 0 True 436 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 481 493 0,0102549060456693 0,0427419659241948 0,010101472495613 0,0444495307850767 0,00196338431160559 0,00857191041027102 389120 1862728 579 665 0 True 480 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 526 492 0,0100433090045491 0,0368295882760231 0,00996414129854276 0,038452735179675 0,00193054726228812 0,00668052019917396 381091 1605062 579 665 0 True 524 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 569 492 0,00988173203866199 0,0908210099522094 0,00987258716716258 0,0894331273365377 0,00185151483784589 0,0175258335622367 374960 3958050 579 665 0 True 567 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 614 492 0,00978459083881531 0,0591785253933644 0,00978103303578241 0,0603036545357443 0,00183300804740798 0,0181601641757928 371274 2579046 579 665 0 True 611 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 657 493 0,00971649185335579 0,0680466329476702 0,00965896086060884 0,0668802929732204 0,00200878148081724 0,0151863999295995 368690 2965525 579 665 0 True 655 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 261 537 0,00954777292730631 0,0494061888527682 0,00953688868543526 0,053330281528954 0,00133968659882084 0,0130921435183884 362288 2153160 579 665 0 True 260 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 304 537 0,00984109402179721 0,10208817993714 0,00975051499198901 0,0951552605477989 0,00169121617263911 0,034565660025577 373418 4449082 579 665 0 True 304 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 348 537 0,0102302649654043 0,0526073480795144 0,0102998397802701 0,0556649118791486 0,00159943120679018 0,0149793942609148 388185 2292669 579 665 0 True 348 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 393 537 0,0102648151859683 0,0593797609152201 0,0103150988021668 0,0585946440833143 0,00161053381237633 0,0122015974151946 389496 2587816 579 665 0 True 392 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 437 536 0,0102858984632004 0,0571749584535842 0,0103456168459602 0,0579995422293431 0,00191463163195566 0,0125369041705564 390296 2491729 579 665 0 True 436 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 482 537 0,0101614280652417 0,0595489639640415 0,0102235446707866 0,0595407034409094 0,00187838087558058 0,0133063701457529 385573 2595190 579 665 0 True 480 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 525 537 0,00983985537925983 0,0696002537816273 0,0098268101014725 0,0700846875715267 0,00182672922569944 0,0181029335385736 373371 3033233 579 665 0 True 524 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 570 537 0,00982767978665832 0,0537532891510075 0,00973525597009232 0,0544747081712062 0,00172449499923884 0,0133509529920601 372909 2342610 579 665 0 True 567 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 614 537 0,00958719865573024 0,038401313423178 0,00964370183871214 0,0384985122453651 0,00169980583933887 0,00729283093537667 363784 1673559 579 665 0 True 611 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 658 537 0,00967082020405186 0,056705141200449 0,00962844281681544 0,0578469520103761 0,00195229360183524 0,0119839308115852 366957 2471254 579 665 0 True 655 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 261 581 0,00938450929924062 0,0411498189281857 0,00933852140077821 0,0428015564202335 0,00138319723012586 0,0102079532976181 356093 1793341 579 665 0 True 260 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 305 581 0,0100297629989275 0,0519097239551155 0,00988784618905928 0,0537727931639582 0,00207868652939106 0,0135159532582723 380577 2262266 579 665 0 True 304 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 349 581 0,015093333691749 0,0503453873869843 0,0101930266269932 0,050263218127718 0,036743659413171 0,0126904117782147 572713 2194091 579 665 0 True 348 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 393 581 0,0132424327835473 0,049168974163493 0,0101777676050965 0,0490272373540856 0,0199615567374712 0,00799281072334181 502481 2142822 579 665 0 True 392 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 437 581 0,0101384209389622 0,0901594108870253 0,0100709544518196 0,0849774929427024 0,00206589263867916 0,0270847816092644 384700 3929217 579 665 0 True 436 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 481 581 0,00993976375924321 0,0637904672415761 0,00994888227664607 0,0651102464332036 0,00204586260704587 0,0140963354913231 377162 2780038 579 665 0 True 480 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 526 581 0,00992305526203681 0,0558248906771392 0,00991836423285267 0,0547341115434501 0,0020666874696601 0,0106614185369951 376528 2432892 579 665 0 True 523 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 571 579 0,00932407935587426 0,0339896204232256 0,00941481651026169 0,0349279011215381 0,00177716208198924 0,00784598555987557 353800 1481294 579 665 0 True 567 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 614 580 0,00940208748163284 0,0442632789343466 0,0093842984664683 0,0452429999237049 0,00157558313945004 0,00782973680397439 356760 1929028 579 665 0 True 611 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 658 580 0,00959088822924585 0,0465313891274306 0,00953688868543526 0,0457465476462959 0,00173858525805172 0,00833853298813848 363924 2027874 579 665 0 True 655 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 260 622 0,009169328100991 0,00923381927007953 0,00929274433508812 0,00923170824750134 0,00131479617937163 0,00135892026812041 347928 402417 579 665 0 False 260 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 304 622 0,00914310577493364 0,00922409020950178 0,00912489509422446 0,00924696726939803 0,00135999337605408 0,00138575603756988 346933 401993 579 665 0 False 304 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 348 625 0,0097428723039924 0,0886238025826755 0,00962844281681544 0,0864576180666819 0,00147021154943774 0,0297941333772958 369691 3862294 579 665 0 True 348 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 393 625 0,0100456281650446 0,0804536862871301 0,00994888227664607 0,0760357061112383 0,00156425994886201 0,0268348970065834 381179 3506234 579 665 0 True 392 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 436 622 0,00953952409508927 0,00974399835707373 0,00958266575112535 0,0098115510795758 0,00178227471533052 0,00184376856134206 361975 424651 579 665 0 False 436 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 480 622 0,00946673408044562 0,00941738645079166 0,00947585259784848 0,00949111161974517 0,00181648634971001 0,00189651229985456 359213 410417 579 665 0 False 480 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 523 622 0,00934824606240149 0,00923544842880835 0,00923170824750134 0,0093690394445716 0,00188036631545157 0,00197751192947978 354717 402488 579 665 0 False 523 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 567 622 0,00923587219475466 0,009130448001441 0,00923170824750134 0,00912489509422446 0,00169454755077389 0,00175941259686535 350453 397912 579 665 0 False 567 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 611 622 0,0093072654422817 0,00929283611867848 0,00943007553215839 0,00933852140077821 0,00139892109457682 0,00131839191764896 353162 404989 579 665 0 False 611 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 655 622 0,0092074097704914 0,00932766799121861 0,00914015411612116 0,00935378042267491 0,00149379153814343 0,00152182643851157 349373 406507 579 665 0 False 655 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 262 669 0,00922994252303315 0,0394250216982144 0,00923170824750134 0,0401159685664149 0,00138548794128079 0,00904060267678242 350228 1718173 579 665 0 True 260 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 304 665 0,0092082003933876 0,00922874822671235 0,00921644922560464 0,00921644922560464 0,00134932669874374 0,00124284420830988 349403 402196 579 665 0 False 304 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 348 665 0,00926520430420376 0,00902166150097147 0,00923170824750134 0,00903334096284428 0,0013325771289304 0,00129651821910919 351566 393171 579 665 0 False 348 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 392 665 0,00943595249568682 0,0094007965668348 0,00944533455405508 0,00944533455405508 0,0014203124318685 0,00125112920471253 358045 409694 579 665 0 False 392 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 436 665 0,00926578409432764 0,00925509011714454 0,00926222629129473 0,00926222629129473 0,00158576705459748 0,00147434074631907 351588 403344 579 665 0 False 436 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 480 665 0,0091739927760786 0,00915412816775287 0,00914015411612116 0,00920119020370794 0,00172379965208278 0,00143207208028636 348105 398944 579 665 0 False 480 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 523 665 0,00900856811209662 0,00919283789698554 0,00901808194094758 0,00909437705043107 0,00175454698275454 0,00174098925054259 341828 400631 579 665 0 False 523 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 567 665 0,00901331184947383 0,00904919657807829 0,00909437705043107 0,00906385900663768 0,00162943520158043 0,00161093074189649 342008 394371 579 665 0 False 567 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 611 665 0,00924633477108107 0,00921050623812908 0,00915541313801785 0,00923170824750134 0,00132079995039378 0,00132222101470742 350850 401401 579 665 0 False 611 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 659 668 0,00933296068640826 0,0394889030771022 0,00943007553215839 0,0402227817196918 0,00138374459914181 0,00803980222728576 354137 1720957 579 665 0 True 655 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H1_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H1_2.csv new file mode 100755 index 0000000..5d731c3 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H1_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 261 278 0,00728213760185364 0,637080318098978 0,00714122224765393 0,627786678873884 0,001816980276853 0,212268302130714 276319 27764454 579 665 3 True 261 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 304 279 0,00591570405034792 0,00561713278389381 0,00587472343022812 0,00560006103608759 0,0014224512636667 0,00115683378890035 224470 244799 579 665 0 False 304 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 348 277 0,00557149319543816 0,00576687771155974 0,0055542839703975 0,00581368734264134 0,00117669397051877 0,00131353942765564 211409 251325 579 665 0 True 348 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 393 277 0,00549862411850488 0,00579301308891363 0,00546272983901732 0,00579842832074464 0,00134284305908348 0,00117170921742475 208644 252464 579 665 0 True 392 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 437 277 0,00554408493503649 0,00594062404810378 0,0055542839703975 0,00588998245212482 0,00155185924385347 0,0015156111775845 210369 258897 579 665 0 True 436 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 481 278 0,00568399883356769 0,0056453791838259 0,00566109712367437 0,00569161516746777 0,00158269602755208 0,00156294897797378 215678 246030 579 665 0 True 480 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 525 278 0,00577233776516998 0,00576740546720429 0,00576791027695125 0,00584420538643473 0,00153123921348217 0,00153417416786167 219030 251348 579 665 0 True 524 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 568 277 0,00584001508508486 0,00596930642009005 0,00593575951781491 0,00601205462729839 0,00165745983827408 0,00158586517149171 221598 260147 579 665 0 True 567 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 611 279 0,00650313686222592 0,0064198491192504 0,00657663843747616 0,00636301213092241 0,00196920486005265 0,00180043163276306 246760 279782 579 665 0 False 611 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 658 277 0,00797108639360397 0,641540449888741 0,007690547035935 0,635004196231022 0,00242858831852638 0,166092607326706 302461 27958830 579 665 0 True 655 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 260 321 0,00586491970631522 0,00577105386492094 0,00590524147402152 0,00573739223315786 0,00142350681359512 0,00139430015838906 222543 251507 579 665 0 False 260 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 304 321 0,00559133783013283 0,00556298046558374 0,00556954299229419 0,00556954299229419 0,00122179813446813 0,00122740409397609 212162 242439 579 665 0 False 304 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 348 322 0,00550318337720631 0,0054669518841737 0,00556954299229419 0,00546272983901732 0,00121319115192863 0,00122662252492667 208817 238254 579 665 0 True 348 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 394 322 0,00582744418103525 0,00582662882888154 0,00582894636453803 0,00581368734264134 0,00124857863894004 0,00117893447047327 221121 253929 579 665 0 True 392 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 437 322 0,00592751068559787 0,00582343934911667 0,0059662775616083 0,00581368734264134 0,00158269793910516 0,00154507458263684 224918 253790 579 665 0 True 436 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 482 323 0,00580211789426025 0,00560474199919575 0,00584420538643473 0,00561532005798428 0,00147192081747944 0,00149238029947632 220160 244259 579 665 0 True 480 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 524 322 0,00574529846211987 0,00580180136769023 0,00578316929884794 0,00579842832074464 0,00155386910206536 0,00153156145493343 218004 252847 579 665 0 False 524 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 569 322 0,00599948372324878 0,00589383736291977 0,00602731364919509 0,00590524147402152 0,00162845285730609 0,00145723482608871 227649 256858 579 665 0 True 567 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 611 322 0,00598475178328288 0,00621345077043719 0,00602731364919509 0,00627145799954223 0,0020410495492426 0,00193953840832606 227090 270787 579 665 0 False 611 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 655 322 0,00621400606908489 0,00623545588622506 0,00619516289005875 0,00627145799954223 0,0018805960121842 0,00171112969830433 235789 271746 579 665 0 False 655 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 261 361 0,00545237267907707 0,00551006722574346 0,00546272983901732 0,0055390249485008 0,00144757989945377 0,00149508242917077 206889 240133 579 665 0 True 260 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 306 361 0,00549480277450658 0,00542500678338097 0,00549324788281071 0,00547798886091402 0,00125121327851309 0,00118508632294308 208499 236426 579 665 0 True 304 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 350 361 0,0056811789452379 0,00569960033982874 0,00569161516746777 0,00569161516746777 0,00129351046215108 0,00132479953232596 215571 248393 579 665 0 True 348 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 392 364 0,00591154010309459 0,00593206522830308 0,0059510185397116 0,00587472343022812 0,00126603282705978 0,00126354461539569 224312 258524 579 665 0 False 392 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 438 360 0,00603450831755052 0,00598415241583015 0,00605783169298848 0,00599679560540169 0,00159057683506701 0,00164845068440683 228978 260794 579 665 0 True 436 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 480 365 0,00594856760873338 0,00582417361783952 0,00593575951781491 0,00588998245212482 0,00154901988392329 0,00159775733778952 225717 253822 579 665 0 False 480 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 525 361 0,00577217964059074 0,00578801088323923 0,00578316929884794 0,00575265125505455 0,00159576625043973 0,00159091287436574 219024 252246 579 665 0 True 524 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 570 360 0,00607696476707657 0,00603174220742977 0,00608834973678187 0,00607309071488518 0,00165725582133173 0,00167352028072014 230589 262868 579 665 0 True 567 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 613 360 0,00602338688881062 0,00596031162823516 0,00607309071488518 0,0059510185397116 0,00192795821975712 0,00192981819209772 228556 259755 579 665 0 True 611 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 658 360 0,0056729564671174 0,00566295574137908 0,00567635614557107 0,00570687418936446 0,00179396802512659 0,00188235215527881 215259 246796 579 665 0 True 655 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 260 407 0,00553349058822739 0,00563626966248306 0,00561532005798428 0,00566109712367437 0,00153917095332942 0,00145065092539154 209967 245633 579 665 0 False 260 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 306 405 0,00559703031498548 0,00557562365515528 0,00556954299229419 0,00556954299229419 0,00130898671660242 0,00131614262644873 212378 242990 579 665 0 True 304 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 349 405 0,00570429148790354 0,00575368382044606 0,00575265125505455 0,00573739223315786 0,00127171419373024 0,00121724824416874 216448 250750 579 665 0 True 348 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 393 404 0,00577534213217555 0,00592323105773131 0,00578316929884794 0,00593575951781491 0,0013221130117874 0,00137736787760307 219144 258139 579 665 0 True 392 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 438 404 0,00592163372206943 0,00597375792422232 0,00605783169298848 0,00599679560540169 0,0015481314774938 0,00148966555835619 224695 260341 579 665 0 True 436 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 482 405 0,00583632551156925 0,0059763049188547 0,00585946440833143 0,00610360875867857 0,00155147130747598 0,00152651195012752 221458 260452 579 665 0 True 480 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 526 405 0,00586049221809649 0,00596948998727076 0,0059662775616083 0,00601205462729839 0,00167106982146002 0,00160418618712642 222375 260155 579 665 0 True 524 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 570 404 0,00592471715136462 0,00590487433966009 0,00602731364919509 0,0059510185397116 0,00163841227101184 0,00160233678392867 224812 257339 579 665 0 True 567 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 614 405 0,00554748461349016 0,00558459550111259 0,00560006103608759 0,00561532005798428 0,00169689225779017 0,00189290601002383 210498 243381 579 665 0 True 611 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 658 404 0,00528555124797848 0,00550745139341831 0,00531013962005036 0,00552376592660411 0,00178246026926306 0,00175564247532047 200559 240019 579 665 0 True 655 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 262 449 0,00574232044921085 0,00569686977801565 0,00564583810177768 0,00566109712367437 0,00169444452070983 0,00150302785425253 217891 248274 579 665 0 True 260 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 305 449 0,00562749565058579 0,00575136628478957 0,00569161516746777 0,00581368734264134 0,00139600356947528 0,00140900068855131 213534 250649 579 665 0 True 304 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 350 449 0,0056573021337726 0,00564434661843439 0,00567635614557107 0,00569161516746777 0,00133861992652188 0,00135182803298423 214665 245985 579 665 0 True 348 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 393 448 0,0057991925895443 0,00584675238106711 0,00576791027695125 0,00588998245212482 0,00144521518135802 0,00134702241327141 220049 254806 579 665 0 True 392 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 438 448 0,00589327671419233 0,00596813617931301 0,00593575951781491 0,00590524147402152 0,00176440481681383 0,00181762600167499 223619 260096 579 665 0 True 436 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 482 449 0,00601832690227493 0,00611443922234059 0,00601205462729839 0,005981536583505 0,00182062623150698 0,00190338133009032 228364 266472 579 665 0 True 480 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 526 449 0,00594782969403026 0,00597541002884873 0,00593575951781491 0,0059662775616083 0,00158886851821617 0,00166682599180031 225689 260413 579 665 0 True 524 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 567 451 0,00573159433191904 0,00579005306812465 0,00567635614557107 0,00579842832074464 0,00173334352280336 0,00187405107177479 217484 252335 579 665 0 False 567 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 614 448 0,00540865123291711 0,00529671626996078 0,00537117570763714 0,00527962157625696 0,00170573041136834 0,00164210190223905 205230 230835 579 665 0 True 611 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 658 448 0,00541676829465145 0,00563431926118799 0,00543221179522393 0,00567635614557107 0,00173271126318741 0,00184322216930505 205538 245548 579 665 0 True 655 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 260 493 0,00558930856469924 0,0058010212071722 0,00552376592660411 0,00578316929884794 0,00139886415444037 0,00137561556578787 212085 252813 579 665 0 True 260 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 304 493 0,00557465568702297 0,00579276068404015 0,00558480201419089 0,00578316929884794 0,00144265010396291 0,00143259544138756 211529 252453 579 665 0 True 304 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 348 493 0,00574793387177388 0,00579840537484705 0,00570687418936446 0,00581368734264134 0,00141672776553423 0,00149128256093393 218104 252699 579 665 0 True 348 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 393 492 0,00577889993520845 0,00587116681610182 0,00570687418936446 0,00593575951781491 0,00145419039543467 0,00149642885796 219279 255870 579 665 0 True 392 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 437 493 0,00573212141384984 0,00601478518911148 0,00572213321126116 0,005981536583505 0,00166704768724357 0,00199106087952767 217504 262129 579 665 0 True 436 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 481 493 0,00586260054581969 0,00583181460173666 0,00588998245212482 0,00584420538643473 0,00188801732835752 0,00182015372341374 222455 254155 579 665 0 True 480 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 526 492 0,005815769316268 0,00576513382334298 0,00582894636453803 0,00582894636453803 0,00171695096872115 0,001561693242528 220678 251249 579 665 0 True 524 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 569 492 0,00583355833143254 0,00592444719030352 0,00581368734264134 0,0059510185397116 0,00160563634518884 0,00186313248038709 221353 258192 579 665 0 True 567 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 614 492 0,0054143700718663 0,00549964978823805 0,00543221179522393 0,00558480201419089 0,00174200256697256 0,00168898095248665 205447 239679 579 665 0 True 611 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 657 493 0,00534513786025556 0,00549990219311153 0,0055542839703975 0,00550850690470741 0,00171809331377783 0,00167946081473125 202820 239690 579 665 0 True 655 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 261 537 0,00578641085272237 0,00572869573797162 0,00579842832074464 0,00573739223315786 0,00137040303893967 0,00146014898096169 219564 249661 579 665 0 True 260 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 304 537 0,0057401857673911 0,00603520703796571 0,00569161516746777 0,00608834973678187 0,00139632893341272 0,00136088665336404 217810 263019 579 665 0 True 304 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 348 537 0,00585801493302172 0,00575785997380726 0,00581368734264134 0,00573739223315786 0,00158626480941915 0,00138358789924114 222281 250932 579 665 0 True 348 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 393 537 0,00557080798892812 0,00579025958120295 0,00558480201419089 0,00575265125505455 0,0014343581542175 0,00166529244534601 211383 252344 579 665 0 True 392 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 437 536 0,00572637622080411 0,00575060907016913 0,00576791027695125 0,00576791027695125 0,00179101563333432 0,00182630815834748 217286 250616 579 665 0 True 436 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 482 537 0,00564038280379388 0,00577681328521579 0,00563057907988098 0,00578316929884794 0,00180296979814295 0,00187295899907282 214023 251758 579 665 0 True 480 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 525 537 0,00572914340094081 0,00563204761732668 0,00581368734264134 0,00570687418936446 0,00182390814178119 0,00184257855987161 217391 245449 579 665 0 True 524 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 570 537 0,00585453619227843 0,00572373942409239 0,00588998245212482 0,00572213321126116 0,00156688414378355 0,00157504575969233 222149 249445 579 665 0 True 567 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 614 537 0,00556016093392593 0,00569659442724458 0,00549324788281071 0,00563057907988098 0,00168108258853298 0,00159624513375393 210979 248262 579 665 0 True 611 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 658 537 0,00555051533459227 0,00557477465694449 0,00558480201419089 0,00558480201419089 0,00177575590776005 0,00177790249960818 210613 242953 579 665 0 True 655 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 261 581 0,00568489487285005 0,00578757491118504 0,00572213321126116 0,00578316929884794 0,00121548693049336 0,00122177287603505 215712 252227 579 665 0 True 260 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 305 581 0,00582204159124454 0,00591559007383416 0,00584420538643473 0,00585946440833143 0,00134960497611265 0,00139240423936875 220916 257806 579 665 0 True 304 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 349 581 0,0138544703522683 0,00849073932255679 0,00648508430609598 0,00671396963454643 0,0672357521026707 0,0174760276520811 518441 370033 571 665 0 True 348 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 393 581 0,0235470285174165 0,00636347104887419 0,00616464484626535 0,00631723506523232 0,102420096453006 0,00147928658037365 888857 277325 576 665 0 True 392 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 437 581 0,00578395992174415 0,00572933822310411 0,00587472343022812 0,00570687418936446 0,00167399522013566 0,00185885979139313 219471 249689 579 665 0 True 436 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 481 581 0,00559916499680522 0,00592910520751409 0,0055390249485008 0,00590524147402152 0,00179051191486803 0,00181603497851707 212459 258395 579 665 0 True 480 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 526 581 0,00575383718939885 0,00563799060480223 0,00575265125505455 0,00573739223315786 0,0018520510622121 0,00188161383719433 218328 245708 579 665 0 True 523 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 571 579 0,00574606273091953 0,00582121359705053 0,00567635614557107 0,00575265125505455 0,00157667489133074 0,00165662924724439 218033 253693 579 665 0 True 567 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 614 580 0,00558385326671545 0,00568734723051621 0,00558480201419089 0,00569161516746777 0,00149510979092171 0,00143963320617167 211878 247859 579 665 0 True 611 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 658 580 0,0055223164512944 0,00578149424832395 0,00561532005798428 0,00564583810177768 0,00154416301728426 0,00221454866600974 209543 251962 579 665 0 True 655 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 260 622 0,00598743990112997 0,00603550533463437 0,00592050049591821 0,00601205462729839 0,00133541838358995 0,00129036117808094 227192 263032 579 665 0 False 260 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 304 622 0,00575489135326046 0,00576208201896364 0,00576791027695125 0,00578316929884794 0,0012918640922773 0,00129122154551285 218368 251116 579 665 0 False 304 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 348 625 0,00586159909015117 0,00591994979437608 0,00582894636453803 0,00590524147402152 0,00125949444905931 0,00127565433127251 222417 257996 579 665 0 True 348 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 393 625 0,0058995753432654 0,00580304044616003 0,00592050049591821 0,00582894636453803 0,00137368573279949 0,00124025001238334 223858 252901 579 665 0 True 392 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 436 622 0,00558055900464794 0,00567208820861951 0,00552376592660411 0,00573739223315786 0,00162168686529489 0,00174270681751321 211753 247194 579 665 0 False 436 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 480 622 0,00557816078186279 0,00574048992933237 0,00556954299229419 0,00581368734264134 0,0017813053174124 0,00185289827981804 211662 250175 579 665 0 False 480 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 523 622 0,00559009918759544 0,00555118627422298 0,00567635614557107 0,00566109712367437 0,0018085517270482 0,00187540743907966 212115 241925 579 665 0 False 523 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 567 622 0,00561049725831745 0,00547337673549862 0,0055542839703975 0,00544747081712062 0,00159867655956017 0,00170268701833339 212889 238534 579 665 0 False 567 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 611 622 0,00560077259669417 0,00569604372570245 0,0055542839703975 0,00570687418936446 0,00138194999347738 0,00130641519232602 212520 248238 579 665 0 False 611 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 655 622 0,00584344111763507 0,00577369264314368 0,00588998245212482 0,00578316929884794 0,00144307047324089 0,00146879658885807 221728 251622 579 665 0 False 655 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 262 669 0,00797606731785004 0,632482740382657 0,00744640268558785 0,642984664682994 0,00287722782251126 0,20403174276977 302650 27564088 579 665 2 True 260 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 304 665 0,00689552300561092 0,00602488138405065 0,00619516289005875 0,005981536583505 0,00388681167221702 0,00126154138565404 261649 262569 579 665 0 False 304 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 348 665 0,00582620553849787 0,0057535920368557 0,00582894636453803 0,00581368734264134 0,00135072842149077 0,00125592018597488 221074 250746 579 665 0 False 348 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 392 665 0,00564491570839877 0,00570161957881658 0,00569161516746777 0,00572213321126116 0,00132779416224693 0,00124856684130354 214195 248481 579 665 0 False 392 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 436 665 0,00559811083294362 0,00538778853749159 0,00564583810177768 0,00541695277332723 0,0014881073045055 0,00141612923087492 212419 234804 579 665 0 False 436 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 480 665 0,00543766709320772 0,00546743374802307 0,00546272983901732 0,00543221179522393 0,00159677297698017 0,00141013369089391 206331 238275 579 665 0 False 480 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 523 665 0,00548051885418186 0,00570276687369603 0,00558480201419089 0,00556954299229419 0,00167503527373447 0,00246028800724166 207957 248531 579 665 0 False 523 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 567 665 0,00559489563316574 0,00554753787650633 0,00560006103608759 0,00558480201419089 0,00143237064982947 0,00147127764172095 212297 241766 579 665 0 False 567 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 611 665 0,00577642265013369 0,00562459020061025 0,00570687418936446 0,00560006103608759 0,00130515209737785 0,00129192632078308 219185 245124 579 665 0 False 611 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 659 668 0,00752936538149597 0,660031906270597 0,00715648126955062 0,66323338673991 0,00240755031066382 0,194928574670776 285700 28764702 579 665 3 True 655 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H1_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H1_3.csv new file mode 100755 index 0000000..8df620d --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H1_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 261 278 0,000835424860319994 0,0624658923573525 0,000625619897764553 0,0615854123750668 0,000744417447893696 0,0216339834659641 31700 2722312 579 665 0 True 261 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 304 279 0,00083795485358784 0,000842389792287999 0,000732433051041428 0,000717174029144732 0,000646975633180396 0,000616300426874058 31796 36712 579 665 0 False 304 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 348 277 0,000832973929341768 0,000786355910375619 0,000701915007248035 0,000656137941557946 0,000631353972973254 0,000616595980334599 31607 34270 579 665 0 True 348 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 393 277 0,000790491125719187 0,000858107732136475 0,000656137941557946 0,000701915007248035 0,000636575324014579 0,000652941458483075 29995 37397 579 665 0 True 392 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 437 277 0,000931617312691224 0,000935183002137984 0,000671396963454643 0,000717174029144732 0,000849129337328233 0,000819659896407622 35350 40756 579 665 0 True 436 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 481 278 0,000806698895091326 0,000822931671132512 0,000534065766384375 0,000503547722590982 0,000840480049027979 0,000881452890326662 30610 35864 579 665 0 True 480 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 525 278 0,000891690856433028 0,000886675374634802 0,000686655985351339 0,000686655985351339 0,00079619576427902 0,00082892449835859 33835 38642 579 665 0 True 524 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 568 277 0,000892138876074209 0,000841701415360328 0,000656137941557946 0,000534065766384375 0,000856855530863295 0,000848445647563694 33852 36682 579 665 0 True 567 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 611 279 0,000860724792998454 0,000934058653156122 0,000442511635004196 0,000610360875867857 0,000953123892122508 0,000946464095533562 32660 40707 579 665 0 False 611 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 658 277 0,00112252638802744 0,0624619227170696 0,00080872816052491 0,0609292744335088 0,00101008306638844 0,016799372990392 42594 2722139 579 665 0 True 655 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 260 321 0,000726213484257973 0,000819512732391748 0,000564583810177768 0,00064087891966125 0,000653547308527478 0,000692285457440576 27556 35715 579 665 0 False 260 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 304 321 0,000772886589230425 0,000824927964222756 0,00064087891966125 0,000717174029144732 0,000598303887003282 0,000659997900143875 29327 35951 579 665 0 False 304 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 348 322 0,000826490821592913 0,000940162261914801 0,000732433051041428 0,000823987182421607 0,00060050706574934 0,000689338647352057 31361 40973 579 665 0 True 348 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 394 322 0,000823275621815025 0,000918340713307645 0,000686655985351339 0,00080872816052491 0,000675121052793812 0,00066642999976234 31239 40022 579 665 0 True 392 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 437 322 0,000891032004019527 0,000866184688087809 0,000625619897764553 0,000579842832074464 0,000817051318964918 0,000863017429134493 33810 37749 579 665 0 True 436 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 482 323 0,000824277077483547 0,00086967246452134 0,000534065766384375 0,000656137941557946 0,000844491954171752 0,00081072134280738 31277 37901 579 665 0 True 480 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 524 322 0,000859222609495671 0,000850007830287552 0,000564583810177768 0,000625619897764553 0,000852926206723606 0,000837791264552325 32603 37044 579 665 0 False 524 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 569 322 0,000894695223438596 0,000826327663975686 0,000671396963454643 0,000610360875867857 0,000909970321131118 0,000737365669630449 33949 36012 579 665 0 True 567 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 611 322 0,000928981903037217 0,00094764262452882 0,000335698481727321 0,000503547722590982 0,00109892347444022 0,00106399487384547 35250 41299 579 665 0 False 611 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 655 322 0,000848944511845046 0,00085193528568503 0,0004272526131075 0,000549324788281071 0,000949257273406095 0,000856372280819273 32213 37128 579 665 0 False 655 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 261 361 0,000744661351836017 0,000801477256886781 0,000610360875867857 0,000595101853971161 0,000635952525818157 0,00076259715041853 28256 34929 579 665 0 True 260 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 306 361 0,000888844614006702 0,000748541071148918 0,000762951094834821 0,000610360875867857 0,000704185432379875 0,000632859122855518 33727 32622 579 665 0 True 304 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 350 361 0,000856798032613985 0,000876349720719744 0,000762951094834821 0,000732433051041428 0,000647003315333735 0,000706549032313158 32511 38192 579 665 0 True 348 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 392 364 0,000890294089316405 0,000806181165892529 0,000732433051041428 0,000671396963454643 0,000692723392669583 0,000658539523114845 33782 35134 579 665 0 False 392 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 438 360 0,000881122863720463 0,000875913748665553 0,000610360875867857 0,000579842832074464 0,000788202677585586 0,00085018251124336 33434 38173 579 665 0 True 436 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 480 365 0,000800532036500951 0,000801087176627768 0,000488288700694286 0,000473029678797589 0,000852580610193044 0,000828567086305461 30376 34912 579 665 0 False 480 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 525 361 0,000819427923720176 0,000867377874762438 0,000473029678797589 0,000564583810177768 0,000885462844674024 0,000860528141237567 31093 37801 579 665 0 True 524 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 570 360 0,000901520934442472 0,000823482372674648 0,00064087891966125 0,000457770656900893 0,000914044755877911 0,000899238284523701 34208 35888 579 665 0 True 567 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 613 360 0,000822010625181102 0,000850329072853798 0,000305180437933928 0,000457770656900893 0,000998694434121999 0,00101450892070764 31191 37058 579 665 0 True 611 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 658 360 0,000838560997808261 0,000880319361002644 0,000457770656900893 0,000381475547417411 0,000930149428159169 0,000991838683367342 31819 38365 579 665 0 True 655 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 260 407 0,000790517479815727 0,000715843167084569 0,000625619897764553 0,000503547722590982 0,000721242700687263 0,000721794204107682 29996 31197 579 665 0 False 260 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 306 405 0,000725633694134092 0,00077231302105114 0,000564583810177768 0,000656137941557946 0,000635271409112898 0,000630237557873896 27534 33658 579 665 0 True 304 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 349 405 0,000815000435501445 0,000809645996428471 0,000671396963454643 0,000671396963454643 0,000646701252054348 0,000640079027472904 30925 35285 579 665 0 True 348 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 393 404 0,000809255242455712 0,000883600624357873 0,00064087891966125 0,000717174029144732 0,000722356678991435 0,000720547738117375 30707 38508 579 665 0 True 392 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 438 404 0,000850710236313231 0,000860517051383322 0,000579842832074464 0,00064087891966125 0,000765884513587783 0,000795476302268956 32280 37502 579 665 0 True 436 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 482 405 0,000820798336740259 0,000874445211219855 0,000534065766384375 0,000625619897764553 0,000840062476076581 0,000819929667618918 31145 38109 579 665 0 True 480 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 526 405 0,000848338367624625 0,000820820648554322 0,000595101853971161 0,000549324788281071 0,000835021895460796 0,000823686145753685 32190 35772 579 665 0 True 524 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 570 404 0,000887105243635057 0,00085613438494382 0,000595101853971161 0,000595101853971161 0,000885888039120412 0,000849964094197313 33661 37311 579 665 0 True 567 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 614 405 0,000835530276706154 0,00084282576434219 0,000381475547417411 0,000457770656900893 0,000978762894265087 0,000955693729566914 31704 36731 579 665 0 True 611 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 658 404 0,000872004346317601 0,000772955506183633 0,000473029678797589 0,000411993591210803 0,000957035610837832 0,00086511294386777 33088 33686 579 665 0 True 655 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 262 449 0,000794048928752095 0,0008605629431785 0,000610360875867857 0,000656137941557946 0,000754608465856886 0,000819487527495248 30130 37504 579 665 0 True 260 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 305 449 0,000829152585343459 0,000825639287048016 0,000656137941557946 0,000686655985351339 0,000746039795420366 0,000742595983918341 31462 35982 579 665 0 True 304 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 350 449 0,00082967966727426 0,000813340285940303 0,000747692072938125 0,000671396963454643 0,000662881930549375 0,000723998294802487 31482 35446 579 665 0 True 348 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 393 448 0,000827123319909874 0,000798310723019497 0,000610360875867857 0,000656137941557946 0,000753646852333651 0,000697383040627724 31385 34791 579 665 0 True 392 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 438 448 0,000820798336740259 0,000897620567784763 0,000518806744487678 0,000488288700694286 0,000860762991066233 0,000978947233157372 31145 39119 579 665 0 True 436 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 482 449 0,000828520087026498 0,000848516346944266 0,0004272526131075 0,000442511635004196 0,000928068007814587 0,000946966499994012 31438 36979 579 665 0 True 480 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 526 449 0,000820851044933339 0,000946059357595178 0,000564583810177768 0,00064087891966125 0,000833842399273011 0,000924302208101193 31147 41230 579 665 0 True 524 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 567 451 0,000819955005650977 0,000888166857978088 0,000442511635004196 0,000442511635004196 0,000908517926337499 0,00100822520567127 31113 38707 579 665 0 False 567 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 614 448 0,000868920917022414 0,00087036084144901 0,000488288700694286 0,000534065766384375 0,000890641179268053 0,000907710615123659 32971 37931 579 665 0 True 611 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 658 448 0,000960027028761411 0,000898721970869036 0,000534065766384375 0,000442511635004196 0,00101752613720022 0,00104729252073141 36428 39167 579 665 0 True 655 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 260 493 0,000864730615672544 0,000740831249559009 0,000717174029144732 0,000549324788281071 0,000750471564694108 0,000692655764331764 32812 32286 579 665 0 True 260 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 304 493 0,000789041650409483 0,000834542295312555 0,00064087891966125 0,000686655985351339 0,000756875277949458 0,00075598314529151 29940 36370 579 665 0 True 304 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 348 493 0,000817767615638152 0,000822793995746978 0,000717174029144732 0,000671396963454643 0,000759555404552635 0,000765474168918606 31030 35858 579 665 0 True 348 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 393 492 0,000930932106181182 0,000803221145103546 0,000747692072938125 0,000579842832074464 0,000818975634120763 0,00076897525010612 35324 35005 579 665 0 True 392 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 437 493 0,00082962695908118 0,000875477776611361 0,000442511635004196 0,000442511635004196 0,000912641042813029 0,00100994188810428 31480 38154 579 665 0 True 436 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 481 493 0,000855243140918121 0,00080943948335017 0,000503547722590982 0,0004272526131075 0,000895285635897002 0,000850940676427875 32452 35276 579 665 0 True 480 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 526 492 0,00087548308706089 0,000882843409737436 0,000579842832074464 0,000595101853971161 0,000862392857153742 0,000846881747033566 33220 38475 579 665 0 True 524 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 569 492 0,000899755209974288 0,000890484393634579 0,000549324788281071 0,000595101853971161 0,000944461738705907 0,000953930150123599 34141 38808 579 665 0 True 567 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 614 492 0,000876721729598273 0,000864486691666222 0,000488288700694286 0,000549324788281071 0,000902628462848576 0,000886820413836994 33267 37675 579 665 0 True 611 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 657 493 0,000895090534886697 0,000917354039711318 0,000518806744487678 0,000488288700694286 0,00091637152459223 0,000998620145282503 33964 39979 579 665 0 True 655 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 261 537 0,00079997860047361 0,000777567631599025 0,000625619897764553 0,000595101853971161 0,0007069254943695 0,000752428701704503 30355 33887 579 665 0 True 260 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 304 537 0,000796394443344161 0,000783097592917978 0,000656137941557946 0,00064087891966125 0,00067472899324852 0,000686223899495308 30219 34128 579 665 0 True 304 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 348 537 0,000854188977056519 0,000829035279891191 0,000686655985351339 0,000701915007248035 0,000752294380171654 0,000719766189917423 32412 36130 579 665 0 True 348 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 393 537 0,000875061421516249 0,000783831861640827 0,000717174029144732 0,000610360875867857 0,000761873828171596 0,000737981372916824 33204 34160 579 665 0 True 392 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 437 536 0,000861304583122336 0,00081971924547005 0,000473029678797589 0,000396734569314107 0,000958334907897872 0,000971621414812381 32682 35724 579 665 0 True 436 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 482 537 0,000910033307624912 0,000844340193583065 0,000488288700694286 0,000396734569314107 0,000966727203951152 0,00101364672638721 34531 36797 579 665 0 True 480 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 525 537 0,000849656072451628 0,000881787898448341 0,000488288700694286 0,000442511635004196 0,000924308093425701 0,000997625915679499 32240 38429 579 665 0 True 524 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 570 537 0,000817714907445072 0,000831559328625982 0,000534065766384375 0,000518806744487678 0,000829469185342764 0,000838845440007753 31028 36240 579 665 0 True 567 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 614 537 0,000833105699824469 0,000881673168960396 0,000549324788281071 0,000610360875867857 0,000846635523354407 0,000842073579946689 31612 38424 579 665 0 True 611 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 658 537 0,000843858171212814 0,000870429679141777 0,000488288700694286 0,000473029678797589 0,000905255089692836 0,000969054390651928 32020 37934 579 665 0 True 655 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 261 581 0,000841090991076108 0,000820453514192898 0,000717174029144732 0,000732433051041428 0,000646381356178239 0,00057997395210065 31915 35756 579 665 0 True 260 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 305 581 0,000821430835057221 0,000795740782489527 0,000762951094834821 0,000671396963454643 0,000665455602877385 0,000665364888805174 31169 34679 579 665 0 True 304 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 349 581 0,00612174037709813 0,00105323964523348 0,000869764248111696 0,000747692072938125 0,0380512773042907 0,00180306624482547 232288 45901 579 665 0 True 348 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 393 581 0,00431793423941353 0,000838511935595455 0,000823987182421607 0,000732433051041428 0,0218043561962273 0,000609496482728844 163843 36543 579 665 0 True 392 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 437 581 0,000848891803651966 0,000927977990295033 0,000442511635004196 0,000518806744487678 0,0009513816528042 0,00100079381221258 32211 40442 579 665 0 True 436 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 481 581 0,000769434202583677 0,00085333498543796 0,000366216525520714 0,000442511635004196 0,000916659687572172 0,00094249363461578 29196 37189 579 665 0 True 480 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 526 581 0,000887922220627799 0,000804483169470942 0,000473029678797589 0,000366216525520714 0,00103389848806556 0,000945131728271623 33692 35060 579 665 0 True 523 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 571 579 0,000812338671750899 0,000802601605868643 0,000518806744487678 0,0004272526131075 0,000849940027994794 0,000894472389093336 30824 34978 579 665 0 True 567 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 614 580 0,000793574555014374 0,000826098204999796 0,000579842832074464 0,000564583810177768 0,000751479346036147 0,000747844313345713 30112 36002 579 665 0 True 611 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 658 580 0,000898674692016145 0,000911709348904419 0,000625619897764553 0,000656137941557946 0,000826705120321986 0,000835698374732603 34100 39733 579 665 0 True 655 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 260 622 0,000830048624625821 0,000781124245725323 0,000671396963454643 0,000595101853971161 0,000661107290743122 0,000679422496859781 31496 34042 579 665 0 False 260 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 304 622 0,000831155496680504 0,000738651389288052 0,000717174029144732 0,000610360875867857 0,000667803254716925 0,000612897026274986 31538 32191 579 665 0 False 304 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 348 625 0,000822353228436123 0,000934724084186204 0,000701915007248035 0,000793469138628214 0,000680783887192884 0,000717066133463226 31204 40736 579 665 0 True 348 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 393 625 0,000843779108923194 0,000887616156435951 0,000701915007248035 0,000762951094834821 0,000661786471548272 0,000651115660642734 32017 38683 579 665 0 True 392 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 436 622 0,000884970561815312 0,000892182390056166 0,000564583810177768 0,000595101853971161 0,000861738925105342 0,000922861547209347 33580 38882 579 665 0 False 436 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 480 622 0,000852054295236774 0,000803106415615601 0,000488288700694286 0,000335698481727321 0,000946223007093802 0,000955294553300676 32331 35000 579 665 0 False 480 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 523 622 0,000792467682959692 0,00083768588328225 0,000350957503624018 0,0004272526131075 0,000934139696950369 0,000943515799065502 30070 36507 579 665 0 False 523 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 567 622 0,000857720425992887 0,000807833270518939 0,000579842832074464 0,000473029678797589 0,000853280835055013 0,000877580990134177 32546 35206 579 665 0 False 567 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 611 622 0,000903128534331416 0,000895945517260765 0,000747692072938125 0,000701915007248035 0,000721639999324291 0,00071482733656372 34269 39046 579 665 0 False 611 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 655 622 0,000953201317757535 0,000872494809924789 0,00080872816052491 0,000671396963454643 0,000762344751548791 0,000757427689706497 36169 38024 579 665 0 False 655 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 262 669 0,000959710779602931 0,0615636596641524 0,000793469138628214 0,0626230258640421 0,00071954634039824 0,0202680423770456 36416 2682992 579 665 0 True 260 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 304 665 0,000874297152716587 0,00080569930204316 0,000717174029144732 0,000686655985351339 0,000694061350385632 0,000587389358984036 33175 35113 579 665 0 False 304 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 348 665 0,000851316380533652 0,000930639714415359 0,000762951094834821 0,00080872816052491 0,000623991767876996 0,00065758778150229 32303 40558 579 665 0 False 348 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 392 665 0,000919573490572415 0,000885482187960173 0,00080872816052491 0,00080872816052491 0,000688825181944705 0,000648896275364978 34893 38590 579 665 0 False 392 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 436 665 0,000826200926530972 0,000848240996173198 0,000671396963454643 0,00064087891966125 0,000685451663686607 0,000746510579177887 31350 36967 579 665 0 False 436 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 480 665 0,000879225368769579 0,000818847301361667 0,000564583810177768 0,000595101853971161 0,000869572213646232 0,000743511619377373 33362 35686 579 665 0 False 480 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 523 665 0,000912721425471999 0,000817768844174983 0,000549324788281071 0,000503547722590982 0,000898220789213265 0,000840986528028103 34633 35639 579 665 0 False 523 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 567 665 0,000873717362592706 0,000879309741508727 0,000610360875867857 0,000656137941557946 0,000812046478945132 0,000773723807147449 33153 38321 579 665 0 False 567 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 611 665 0,000884548896270671 0,000873917455575308 0,000747692072938125 0,000717174029144732 0,000681687079592174 0,000678779306055343 33564 38086 579 665 0 False 611 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 659 668 0,000986433833494555 0,0648051577788601 0,000793469138628214 0,0648966201266499 0,000795888106954428 0,0199219549550346 37430 2824259 579 665 0 True 655 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H2_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H2_1.csv new file mode 100755 index 0000000..80aa615 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H2_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 284 261 0,00999299903425413 0,0432264914976845 0,0100556954299229 0,0432593270771344 0,00136756178838853 0,00890609372495202 379182 1883844 579 665 0 True 285 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 328 261 0,00997692303536469 0,00975776589562714 0,0100099183642329 0,00976577401388571 0,00134666371155498 0,00132980471926653 378572 425251 579 665 0 False 328 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 372 259 0,0101418206174159 0,057432296695045 0,0101472495613031 0,0599221789883269 0,00133690565651181 0,0129216848224268 384829 2502944 579 665 0 True 372 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 416 260 0,0108169335084827 0,0788613786698378 0,010757610437171 0,0775310902571145 0,00167192357850617 0,0146523371896348 410446 3436840 579 665 0 True 416 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 461 260 0,0109057995220158 0,0732535848662627 0,0109254596780346 0,0729686427100023 0,00187355436085663 0,0181367362716421 413818 3192448 579 665 0 True 460 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 503 261 0,0107446178675767 0,0589598509893411 0,0107881284809644 0,0620126649881743 0,00179547140001228 0,0157038606629522 407702 2569516 579 665 0 True 504 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 549 260 0,0108102395679615 0,0759845138137172 0,0107728694590677 0,0754406042572671 0,00160151825452596 0,0218551953691554 410192 3311464 579 665 0 True 548 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 592 261 0,0106466333366408 0,0643894698981374 0,0106507972838941 0,0648203250171664 0,00187908389145018 0,018509836005675 403984 2806143 579 665 0 True 591 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 635 262 0,0103426915412442 0,0104519251894901 0,0104371709773404 0,0104371709773404 0,00192205413224754 0,00176553937750293 392451 455503 579 665 0 False 635 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 680 260 0,0102679513234566 0,041943953497844 0,010452429999237 0,0421911955443656 0,00183306045888072 0,00878090783267116 389615 1827950 579 665 0 True 679 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 285 304 0,00986470729229711 0,0100096200675642 0,00985732814526589 0,00997940032043946 0,0012754847388403 0,00140198823929223 374314 436227 579 665 0 False 285 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 328 304 0,00978654104195928 0,00997855132222867 0,0097962920576791 0,0100404364080262 0,00136845504203749 0,00132660961777349 371348 434873 579 665 0 False 328 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 373 305 0,0102600450944946 0,10558290897764 0,0101472495613031 0,107072556649119 0,00145057395356088 0,0244810476706402 389315 4601385 579 665 0 True 372 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 417 304 0,0103223461787153 0,046270746676717 0,0102998397802701 0,0466926070038911 0,0014743285585112 0,00821243903907848 391679 2016515 579 665 0 True 416 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 460 304 0,010586282455564 0,0739271157981931 0,0104982070649271 0,072129396505684 0,00176916321959262 0,0175645338059981 401694 3221801 579 665 0 True 460 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 505 304 0,0108220198491149 0,039933112708528 0,0108644235904479 0,0400244144350347 0,00182218579987404 0,00938329770740479 410639 1740316 579 665 0 True 504 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 548 305 0,0109738457992822 0,0394033148790952 0,0109102006561379 0,0400396734569314 0,00165984004761812 0,0093996240282637 416400 1717227 579 665 0 True 547 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 594 306 0,0108596534989741 0,0478173231201143 0,0107423514152743 0,0479591058213169 0,0022115898970259 0,0112279674645417 412067 2083916 579 665 0 True 591 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 635 305 0,010536262380331 0,0104835216904702 0,0105592431525139 0,0104829480430304 0,00212536351070707 0,00189663478343883 399796 456880 579 665 0 False 635 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 679 305 0,0103068763240463 0,0103373792687257 0,010406652933547 0,0103608758678569 0,00196580803687748 0,00187169051224989 391092 450511 579 665 0 False 679 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 285 343 0,00994005365430515 0,0474706106075443 0,00996414129854276 0,0482337682154574 0,00141719937609739 0,00942339767289396 377173 2068806 579 665 0 True 284 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 329 343 0,00988934837256207 0,0628284604851566 0,00994888227664607 0,0629434653238727 0,00134878411714847 0,0198901445049706 375249 2738113 579 665 0 True 328 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 373 343 0,0103918155771949 0,0374830644934607 0,0100556954299229 0,0382696269169146 0,00262836708553503 0,00732896203210305 394315 1633541 579 665 0 True 372 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 417 343 0,0103047679963231 0,0314954472470946 0,0103150988021668 0,0315861753261616 0,00166071255726153 0,00518645538181801 391012 1372596 579 665 0 True 416 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 462 343 0,0106026483495154 0,0655646440431589 0,0105745021744106 0,0648661020828565 0,00188457789493167 0,0140577602978262 402315 2857358 579 665 0 True 460 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 504 347 0,010351072143944 0,0292238492775771 0,0103303578240635 0,0298619058518349 0,00177475618039746 0,00924296901475609 392769 1273598 579 665 0 False 504 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 547 347 0,0107127030566667 0,0243753352252226 0,0105897611963073 0,0261081864652476 0,00217769716192149 0,00684222384704958 406491 1062296 579 665 0 False 547 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 593 343 0,0109250116583935 0,0473914472608622 0,0108644235904479 0,0472571908140688 0,00220197902198861 0,00980596439331509 414547 2065356 579 665 0 True 591 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 638 343 0,010807973115659 0,0535868166639992 0,0108644235904479 0,0540016784924086 0,00199948288583522 0,0133294967212698 410106 2335355 579 665 0 True 635 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 681 343 0,0104600463331371 0,0597346421673318 0,010406652933547 0,0592050049591821 0,0019192871584503 0,0186018337974283 396904 2603282 579 665 0 True 679 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 285 387 0,00999747923066594 0,043104304593023 0,00997940032043946 0,0442359044785229 0,00150349096158337 0,0120057850933254 379352 1878519 579 665 0 True 284 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 329 388 0,00999447486366038 0,028906507513921 0,0100404364080262 0,0290989547570001 0,00135951317496698 0,00339858650707588 379238 1259768 579 665 0 True 328 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 374 388 0,01046360413617 0,0873865597846757 0,0104982070649271 0,0862745098039216 0,00130484281962235 0,0235812382126967 397039 3808374 579 665 0 True 372 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 417 387 0,0103274588734441 0,0632235200039467 0,0103761348897536 0,0639505607690547 0,00154879544182512 0,0172665543348551 391873 2755330 579 665 0 True 416 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 461 387 0,0104584387332482 0,0393550826023631 0,010452429999237 0,0403143358510719 0,00171903797157447 0,00808462294703731 396843 1715125 579 665 0 True 460 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 506 388 0,0104058096024577 0,0491607595321561 0,0104219119554437 0,0506752117189288 0,00179536176229249 0,00855575745051677 394846 2142464 579 665 0 True 504 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 549 387 0,0102467889839349 0,0384969978161242 0,0102235446707866 0,0394293125810636 0,00178258151496007 0,00587811136719469 388812 1677729 579 665 0 True 547 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 594 388 0,0102362473453189 0,0463594325708985 0,0102082856488899 0,047348744945449 0,00190243317651738 0,00857044554784744 388412 2020380 579 665 0 True 591 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 638 387 0,0104489776125903 0,0368795414950744 0,010452429999237 0,0377660791943236 0,00208653168088601 0,00630392793273541 396484 1607239 579 665 0 True 635 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 682 387 0,0106228355874651 0,0827320532964363 0,0105134660868238 0,079514763103685 0,00188480564018058 0,0196313239988227 403081 3605527 579 665 0 True 679 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 285 431 0,0100096284691709 0,0451611289611073 0,00997940032043946 0,045838101777676 0,0015781276153935 0,00954039705902601 379813 1968157 579 665 0 True 284 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 329 431 0,0102255475821236 0,0519245011131629 0,0101777676050965 0,0525825894560159 0,00141009005411671 0,00826887242360257 388006 2262910 579 665 0 True 328 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 373 431 0,0100871095129987 0,0329999409143137 0,0100556954299229 0,0335393301289387 0,00135413400763917 0,00465404426218412 382753 1438163 579 665 0 True 372 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 418 431 0,0102623379008936 0,0522687584146909 0,0102082856488899 0,0509803921568627 0,00166156846308978 0,012744910036818 389402 2277913 579 665 0 True 416 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 462 430 0,0105854391244747 0,0903034422861916 0,0105592431525139 0,0868390936140993 0,00174820734436203 0,0164578405882752 401662 3935494 579 665 0 True 460 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 506 432 0,0104720901552559 0,0580985308315421 0,0104676890211337 0,0583504997329671 0,00166119075773467 0,0146174595917687 397361 2531979 579 665 0 True 503 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 550 431 0,010243231180902 0,0491663812770654 0,0102998397802701 0,0494544899671931 0,00172549954493883 0,00898346391725878 388677 2142709 579 665 0 True 547 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 594 431 0,0101995624429351 0,0281161360714673 0,0101930266269932 0,0286717021438926 0,0017778575824531 0,00472845982484247 387020 1225323 579 665 0 True 591 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 638 430 0,00992482098650499 0,0385123256757137 0,0100404364080262 0,0384832532234684 0,00189180279351226 0,00768107431266743 376595 1678397 579 665 0 True 635 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 682 431 0,0100869513884195 0,0710244368072849 0,0101319905394064 0,068207827878233 0,00186585465951672 0,0117324507484762 382747 3095300 579 665 0 True 679 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 284 476 0,00975133196898176 0,0534796593222585 0,00967421988250553 0,0551155870908675 0,00153803107237796 0,0158146238496542 370012 2330685 579 665 0 True 284 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 329 476 0,0100093649282055 0,0551462428100464 0,0100709544518196 0,0557869840543221 0,00151067341323381 0,0094868925462343 379803 2403316 579 665 0 True 328 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 372 475 0,0104093674054906 0,0684939861670656 0,0103913939116503 0,0681925688563363 0,00159330480411673 0,0213388696954753 394981 2985021 579 665 0 True 372 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 417 475 0,0105324410363327 0,0908672000440561 0,0106507972838941 0,0884260318913558 0,00182480229055913 0,0263380381876684 399651 3960063 579 665 0 True 416 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 462 475 0,010691488008952 0,0951908266890619 0,0106507972838941 0,0939040207522698 0,0022264650259911 0,0336949203136471 405686 4148490 579 665 0 True 460 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 505 475 0,0104477389700529 0,041541344778747 0,0103761348897536 0,0428625925078202 0,00188930707524945 0,00603763673966587 396437 1810404 579 665 0 True 503 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 549 474 0,0102774915064041 0,0367332155061492 0,0103303578240635 0,0380560006103609 0,00186037826345131 0,00565630452241499 389977 1600862 579 665 0 True 547 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 592 475 0,0103283022045334 0,0939953224787765 0,0102845807583734 0,0932936598764019 0,00198130316003357 0,0218509621778316 391905 4096389 579 665 0 True 591 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 637 474 0,00999840162404484 0,0561686202230227 0,0100251773861295 0,0599069199664302 0,00184776380639223 0,0133361336352596 379387 2447872 579 665 0 True 635 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 681 475 0,00990798071881589 0,074644060368362 0,00988784618905928 0,0711070420386053 0,00184060375484298 0,0177873490249338 375956 3253046 579 665 0 True 679 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 286 519 0,00979268154645311 0,0511277966029746 0,00978103303578241 0,0534523537041276 0,00155431546710015 0,0132159258493437 371581 2228189 579 665 0 True 284 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 329 519 0,0100859235786544 0,107452288308319 0,00997940032043946 0,102037079423209 0,00241670798558534 0,03239084970089 382708 4682854 579 665 0 True 328 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 373 520 0,0100867405556471 0,0542710633301037 0,0100862134737163 0,0564583810177768 0,00158794718023384 0,0124313054881529 382739 2365175 579 665 0 True 372 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 418 520 0,0105056125660549 0,0583955654758319 0,0105134660868238 0,0587624933241779 0,00179828335583487 0,0100347329689091 398633 2544924 579 665 0 True 416 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 461 519 0,0103264047095825 0,0588273154848669 0,010452429999237 0,0595254444190127 0,00200360658204652 0,0124140789470323 391833 2563740 579 665 0 True 459 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 506 520 0,010284659820663 0,0604682913509455 0,0103303578240635 0,0619211108567941 0,00172589007092797 0,0143571519282339 390249 2635255 579 665 0 True 503 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 549 519 0,0100229899961167 0,070833985857296 0,00999465934233616 0,0708628976882582 0,00176941087206145 0,0189708482265403 380320 3087000 579 665 0 True 547 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 594 520 0,0100791769299401 0,056055932919963 0,010101472495613 0,0566567483024338 0,00185160983992349 0,0148200758610494 382452 2442961 579 665 0 True 591 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 638 519 0,00986460187591095 0,0408085445933442 0,00990310521095598 0,0399786373693446 0,00199466392704383 0,00881270066301956 374310 1778468 579 665 0 True 635 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 682 519 0,00976427183038293 0,061812301410427 0,00975051499198901 0,0620889600976577 0,00177074607903381 0,0159139049431798 370503 2693828 579 665 0 True 679 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 284 563 0,00963081468550405 0,0417861545601243 0,00962844281681544 0,0439917601281758 0,0014503003060181 0,0109514865790326 365439 1821073 579 665 0 True 284 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 329 564 0,00986473364639365 0,0476374043371188 0,00985732814526589 0,0503700312809949 0,00157908109572779 0,0123252050785382 374315 2076075 579 665 0 True 328 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 373 564 0,0100757772514865 0,0494938421815583 0,0100709544518196 0,0493781948577096 0,0014353762229747 0,0118923976067078 382323 2156980 579 665 0 True 372 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 417 563 0,0103241909654731 0,04936734144815 0,0103150988021668 0,0498207064927138 0,00163211529892419 0,0105082811929304 391749 2151467 579 665 0 True 416 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 462 563 0,0105801419510702 0,0906768408776576 0,0105287251087205 0,0864271000228885 0,0020481634084929 0,026349599575597 401461 3951767 579 665 0 True 459 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 505 564 0,0100828665034557 0,0644199649960332 0,0100862134737163 0,0639963378347448 0,00226147784071911 0,0160335898769719 382592 2807472 579 665 0 True 503 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 550 563 0,00999869151910679 0,0525202225063689 0,00999465934233616 0,0525368123903258 0,00184089831857355 0,00841034685553753 379398 2288872 579 665 0 True 547 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 593 562 0,0100337161134085 0,0355737593009762 0,0100099183642329 0,0366521705958648 0,00171805640297429 0,00815374001934271 380727 1550332 579 665 0 True 591 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 638 563 0,00974490156942598 0,0457448267039767 0,00978103303578241 0,0449835965514611 0,00163505495013581 0,00955140971788891 369768 1993595 579 665 0 True 635 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 682 563 0,00973941991734565 0,0478186539821745 0,0098115510795758 0,048050659952697 0,00172024611695443 0,00817527128620648 369560 2083974 579 665 0 True 679 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 284 605 0,00935752270438359 0,00935306909984965 0,0093690394445716 0,00930800335698482 0,00128506777749859 0,00144204619949904 355069 407614 579 665 0 False 284 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 328 605 0,00965687888698217 0,0095399404898146 0,00970473792629892 0,00953688868543526 0,00140403227063498 0,00147353959634537 366428 415758 579 665 0 False 328 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 373 607 0,00987256081306604 0,0752015080043895 0,00988784618905928 0,0719920653086137 0,00151210019249093 0,0184891043571542 374612 3277340 579 665 0 True 372 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 418 608 0,0098552988798323 0,0803663083091111 0,00990310521095598 0,0794232089723049 0,00167832981514418 0,0245224095839854 373957 3502426 579 665 0 True 416 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 459 605 0,0100223047896067 0,0100482150673089 0,0100099183642329 0,0101167315175097 0,00212740312672535 0,00186616208653892 380294 437909 579 665 0 False 459 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 503 605 0,0097135401945433 0,00966556927911447 0,00978103303578241 0,00971999694819562 0,00190931328880455 0,00198121746371929 368578 421233 579 665 0 False 503 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 547 605 0,00949509108832272 0,00963523480250179 0,00952162966353857 0,00967421988250553 0,00195880613001818 0,00192575071325261 360289 419911 579 665 0 False 547 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 591 605 0,00948078081390147 0,00964090243920628 0,00953688868543526 0,00962844281681544 0,00168544657741733 0,00164329777361223 359746 420158 579 665 0 False 591 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 635 605 0,00976830400715356 0,00943062623370053 0,0098268101014725 0,00949111161974517 0,00144369964329952 0,00147116734812712 370656 410994 579 665 0 False 635 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 678 605 0,00968621099643126 0,00956524981485529 0,00965896086060884 0,00959792477302205 0,00165611541769033 0,00169544421024802 367541 416861 579 665 0 False 678 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 285 653 0,00949835899629369 0,0406061388307115 0,00943007553215839 0,040863660639353 0,00126844520496656 0,00884946888302764 360413 1769647 579 665 0 True 284 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 328 648 0,0093329870405048 0,0091745270707095 0,00923170824750134 0,00918593118181125 0,00133214716491574 0,00127014343047726 354138 399833 579 665 0 False 328 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 372 648 0,00943866696763045 0,00939457822858818 0,00944533455405508 0,0093690394445716 0,00138418428034796 0,00121197386166227 358148 409423 579 665 0 False 372 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 415 648 0,00950615980886955 0,00966951597349978 0,00952162966353857 0,00962844281681544 0,00151864597892787 0,00134896286818287 360709 421405 579 665 0 False 415 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 459 648 0,00960981047056162 0,00952174439302651 0,00959792477302205 0,00959792477302205 0,00173933888699853 0,00158445961455794 364642 414965 579 665 0 False 459 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 503 648 0,00937818431607101 0,00960086184791344 0,00947585259784848 0,00967421988250553 0,00168978084582526 0,00176832588517263 355853 418413 579 665 0 False 503 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 547 648 0,0094492876685361 0,00964597348257345 0,00952162966353857 0,00962844281681544 0,00167420308640411 0,00176029957032552 358551 420379 579 665 0 False 547 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 591 648 0,00949622431447395 0,00930628241466564 0,00950637064164187 0,00930800335698482 0,00142780700002371 0,00124478296968978 360332 405575 579 665 0 False 591 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 635 648 0,00951469853614853 0,00960496916358188 0,00949111161974517 0,00968947890440223 0,00140574389889192 0,00133937392776895 361033 418592 579 665 0 False 635 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 681 651 0,00966270314231752 0,0409267389118252 0,00964370183871214 0,0410009918364233 0,00136705136581817 0,00813679592907157 366649 1783619 579 665 0 True 678 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H2_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H2_2.csv new file mode 100755 index 0000000..501dfeb --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H2_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 284 261 0,00804927899803833 0,675459442839188 0,00747692072938125 0,680125123979553 0,00294333794351296 0,204056380286959 305428 29437046 579 665 5 True 285 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 328 261 0,00644745065623677 0,0059779799693787 0,00636301213092241 0,00604257267109178 0,00153516836634516 0,00127490943415593 244647 260525 579 665 0 False 328 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 372 259 0,00587348478769074 0,00604034691902565 0,00588998245212482 0,00599679560540169 0,00129827166802254 0,00157395858641583 222868 263243 579 665 0 True 372 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 416 260 0,00652461545090607 0,00645018359586308 0,00643930724040589 0,00634775310902571 0,00162407604992468 0,00155912820902677 247575 281104 579 665 0 True 416 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 461 260 0,00686677068628571 0,0071801384899649 0,00685130083161669 0,00703440909437705 0,00170534800173469 0,00205588971029356 260558 312916 579 665 0 True 460 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 503 261 0,00680230856614872 0,00676149058845328 0,00679026474402991 0,0068207827878233 0,00159088879238649 0,00143333286963105 258112 294671 579 665 0 True 504 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 549 260 0,00648627024044028 0,00662454947164203 0,00648508430609598 0,00660715648126955 0,00157398169762779 0,00138088972487609 246120 288703 579 665 0 True 548 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 592 261 0,00666136685785246 0,00666823846065151 0,00665293354695964 0,00668345159075303 0,00175558714189733 0,0018507846782334 252764 290607 579 665 0 True 591 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 635 262 0,00710345682731202 0,00708560139189815 0,00706492713817044 0,00712596322575723 0,00190898712336058 0,00170766084894877 269539 308796 579 665 0 False 635 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 680 260 0,00875780888351792 0,661307032745517 0,00837720302128634 0,66665140764477 0,00248099078486419 0,19824523124246 332313 28820273 579 665 5 True 679 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 285 304 0,00622757842880302 0,00621246409684087 0,00616464484626535 0,00622568093385214 0,00137336541674148 0,00131399371181753 236304 270744 579 665 0 False 285 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 328 304 0,0059649598567813 0,00591471812972578 0,005981536583505 0,00592050049591821 0,0012431246490327 0,00115752500171819 226339 257768 579 665 0 False 328 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 373 305 0,00574930428479396 0,00579351789866059 0,00579842832074464 0,00576791027695125 0,00128782299415593 0,00116394745093592 218156 252486 579 665 0 True 372 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 417 304 0,00597102129898551 0,00595668617641609 0,0059662775616083 0,005981536583505 0,00150569580850727 0,00150999825701302 226569 259597 579 665 0 True 416 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 460 304 0,00635146903663786 0,00608444893419174 0,00624093995574884 0,00608834973678187 0,00184275593407014 0,00172810443816545 241005 265165 579 665 0 True 460 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 505 304 0,00673373520695147 0,00699237220999397 0,00662241550316625 0,00686655985351339 0,00167927691821501 0,00173659569658508 255510 304733 579 665 0 True 504 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 548 305 0,00715231732229729 0,0072340384034015 0,00721751735713741 0,00735484855420768 0,00159574636863564 0,00165396832616358 271393 315265 579 665 0 True 547 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 594 306 0,00723377783470263 0,00703383544693732 0,00720225833524071 0,00711070420386053 0,00199604657816495 0,00203877652450367 274484 306540 579 665 0 True 591 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 635 305 0,00703469898943899 0,00687543991588034 0,00703440909437705 0,00686655985351339 0,00187234683783734 0,00181520847273565 266930 299637 579 665 0 False 635 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 679 305 0,00691955794165546 0,00676640101053733 0,00703440909437705 0,0068055237659266 0,00184632894450168 0,00183231837628022 262561 294885 579 665 0 False 679 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 285 343 0,00555378324256324 0,00594379058197106 0,0055390249485008 0,00605783169298848 0,00127657700523306 0,00134132534118205 210737 259035 579 665 0 True 284 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 329 343 0,00601345139441501 0,00601423448756935 0,00599679560540169 0,00601205462729839 0,00129123352847719 0,00113625325712871 228179 262105 579 665 0 True 328 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 373 343 0,00591794414855383 0,00593458927703787 0,0059662775616083 0,00593575951781491 0,00129017835423564 0,00126216902965155 224555 258634 579 665 0 True 372 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 417 343 0,00609976106058372 0,00610707358921451 0,00605783169298848 0,00607309071488518 0,00153920300425566 0,00143967439753038 231454 266151 579 665 0 True 416 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 462 343 0,00633460241485222 0,00644164772195997 0,00628671702143893 0,00653086137178607 0,00165262089194531 0,00147561249320908 240365 280732 579 665 0 True 460 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 504 347 0,00613652502525711 0,00615980326187407 0,00607309071488518 0,00622568093385214 0,00166759853358389 0,00159950655096909 232849 268449 579 665 0 False 504 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 547 347 0,00645256335096554 0,00600712125931675 0,00648508430609598 0,00592050049591821 0,00172610989998039 0,00156967907063936 244841 261795 579 665 0 False 547 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 593 343 0,00717353237001204 0,00763611936685385 0,00720225833524071 0,00761425192645151 0,00218465490102834 0,00220731335264329 272198 332788 579 665 0 True 591 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 638 343 0,00736143707834269 0,00704923214421956 0,00738536659800107 0,00697337300679027 0,00193718627500745 0,00184859158001912 279328 307211 579 665 0 True 635 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 681 343 0,00645575219664689 0,00676894800516971 0,00646982528419928 0,00685130083161669 0,00176222133077552 0,00182554670664047 244962 294996 579 665 0 True 679 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 285 387 0,00562417503442174 0,00569340494747971 0,00572213321126116 0,00567635614557107 0,00130317499397305 0,00125636621590711 213408 248123 579 665 0 True 284 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 329 388 0,00589994430061696 0,00605668439810903 0,00584420538643473 0,00604257267109178 0,0012772394379802 0,0012563087201572 223872 263955 579 665 0 True 328 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 374 388 0,00597763617721707 0,00617171218272277 0,00601205462729839 0,00613412680247196 0,00133703220518099 0,00134196179519849 226820 268968 579 665 0 True 372 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 417 387 0,00603071332764876 0,00626872743772914 0,00614938582436866 0,00627145799954223 0,00146636179260506 0,00146628324662526 228834 273196 579 665 0 True 416 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 461 387 0,00626112719369852 0,00636670642043424 0,00630197604333562 0,00648508430609598 0,00157384105671364 0,00162175685840607 237577 277466 579 665 0 True 460 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 506 388 0,00612769640291619 0,00624725007758582 0,00617990386816205 0,00621042191195544 0,0016716796058178 0,00164707958016697 232514 272260 579 665 0 True 504 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 549 387 0,0060169301351583 0,00599693328078723 0,00613412680247196 0,00601205462729839 0,00154835330470742 0,00144950091479239 228311 261351 579 665 0 True 547 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 594 388 0,00605092691969498 0,00628153124858381 0,0059662775616083 0,00630197604333562 0,00193100786444538 0,00190984990412156 229601 273754 579 665 0 True 591 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 638 387 0,00622781561567189 0,00607361847052972 0,00619516289005875 0,00604257267109178 0,00207870915979922 0,00193940395042388 236313 264693 579 665 0 True 635 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 682 387 0,00674121977036885 0,00710852434358958 0,00665293354695964 0,00706492713817044 0,00201861287007489 0,00199895467660936 255794 309795 579 665 0 True 679 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 285 431 0,00581273859516589 0,00577444985776412 0,00578316929884794 0,00570687418936446 0,00145680313446949 0,00144165733607925 220563 251655 579 665 0 True 284 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 329 431 0,0058810220593012 0,00585967092140973 0,00593575951781491 0,00592050049591821 0,00135468868554582 0,00121430252066847 223154 255369 579 665 0 True 328 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 373 431 0,00590366022822911 0,00587286481252341 0,00588998245212482 0,00585946440833143 0,00132871709934685 0,00124411511628141 224013 255944 579 665 0 True 372 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 418 431 0,00600757443088658 0,00594220731503742 0,00605783169298848 0,00593575951781491 0,00146872410486285 0,00157266442407032 227956 258966 579 665 0 True 416 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 462 430 0,00613080618630791 0,00618793493231821 0,00621042191195544 0,00622568093385214 0,00158660407469491 0,00163163124930985 232632 269675 579 665 0 True 460 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 506 432 0,0059344418129879 0,00595723687795823 0,005981536583505 0,00602731364919509 0,00171732584483194 0,0016830880799383 225181 259621 579 665 0 True 503 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 550 431 0,00574875084876662 0,00581304485750884 0,00578316929884794 0,00579842832074464 0,00171622333294337 0,00152359999146061 218135 253337 579 665 0 True 547 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 594 431 0,0053895708670221 0,00544205558528961 0,00540169375143053 0,00540169375143053 0,00172039638296147 0,00180009221035716 204506 237169 579 665 0 True 591 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 638 430 0,00565018652770679 0,00555882725812012 0,00566109712367437 0,00558480201419089 0,00171209274687397 0,00178880168685257 214395 242258 579 665 0 True 635 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 682 431 0,00554126504670671 0,00575958091612643 0,00561532005798428 0,00582894636453803 0,00176072199597652 0,00168928243895027 210262 251007 579 665 0 True 679 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 284 476 0,00570958866130809 0,00571150926067744 0,00570687418936446 0,00570687418936446 0,00145628034490646 0,0013870064668779 216649 248912 579 665 0 True 284 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 329 476 0,00576970235551597 0,005838216507164 0,00579842832074464 0,00588998245212482 0,00143338693514045 0,00149383831090542 218930 254434 579 665 0 True 328 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 372 475 0,00572824736165845 0,00583534826996537 0,00561532005798428 0,00582894636453803 0,00147883539026275 0,00143290246398551 217357 254309 579 665 0 True 372 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 417 475 0,00597249712839176 0,00604550974598318 0,00593575951781491 0,00608834973678187 0,00168763416412142 0,00165812971062199 226625 263468 579 665 0 True 416 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 462 475 0,00586876740441007 0,00610787669563013 0,00592050049591821 0,00613412680247196 0,00190767443856123 0,00187435103525599 222689 266186 579 665 0 True 460 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 505 475 0,00586022867713109 0,00584236971462761 0,00587472343022812 0,00593575951781491 0,00170076166084568 0,00170799093826745 222365 254615 579 665 0 True 503 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 549 474 0,0055870421123968 0,00555231062320484 0,00558480201419089 0,00563057907988098 0,0016533803523879 0,0017013810061207 211999 241974 579 665 0 True 547 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 592 475 0,00549930932501493 0,00543996750860901 0,0055542839703975 0,00552376592660411 0,00182910880981249 0,00168741179079056 208670 237078 579 665 0 True 591 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 637 474 0,00549648943668514 0,00554721663394008 0,00549324788281071 0,00567635614557107 0,00181345460658726 0,00164918700746309 208563 241752 579 665 0 True 635 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 681 475 0,00550244546250319 0,0055902172460219 0,00543221179522393 0,00561532005798428 0,00178026160971204 0,00171540104938659 208789 243626 579 665 0 True 679 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 286 519 0,00560609612419526 0,00575790586560244 0,00558480201419089 0,00579842832074464 0,00139043182604663 0,00143826914962507 212722 250934 579 665 0 True 284 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 329 519 0,00577921618436693 0,00584544446490454 0,00570687418936446 0,00585946440833143 0,00170756520622497 0,00143968691050251 219291 254749 579 665 0 True 328 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 373 520 0,00578005951545622 0,00572451958461042 0,00579842832074464 0,00570687418936446 0,00138682950956139 0,00142474131280326 219323 249479 579 665 0 True 372 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 418 520 0,00589593847794287 0,00593715921756784 0,0059662775616083 0,00604257267109178 0,00168371339490644 0,0017168014086812 223720 258746 579 665 0 True 416 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 461 519 0,00567369438182052 0,00578101238447458 0,00567635614557107 0,00575265125505455 0,00186313088949043 0,00172130748948081 215287 251941 579 665 0 True 459 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 506 520 0,00580759954634058 0,00587325489278242 0,00575265125505455 0,00575265125505455 0,00170501558954768 0,00165182709222562 220368 255961 579 665 0 True 503 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 549 519 0,00563382063375541 0,00576171488460221 0,00572213321126116 0,00576791027695125 0,00163311526916188 0,00161067918504414 213774 251100 579 665 0 True 547 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 594 520 0,00564654966238426 0,00542842572212174 0,0055390249485008 0,00544747081712062 0,00158916208702541 0,00154549292784375 214257 236575 579 665 0 True 591 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 638 519 0,00543861584068316 0,00546940709521572 0,00550850690470741 0,00549324788281071 0,00173242346447802 0,00165933503199595 206367 238361 579 665 0 True 635 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 682 519 0,00548260082780853 0,00579721218817242 0,0055542839703975 0,00582894636453803 0,00178801832277833 0,00181982352692748 208036 252647 579 665 0 True 679 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 284 563 0,00590460897570455 0,00588415419413721 0,0059510185397116 0,00585946440833143 0,00126518328786528 0,0012841530356843 224049 256436 579 665 0 True 284 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 329 564 0,00574479773428561 0,00589200169111265 0,00572213321126116 0,00585946440833143 0,00138070673190704 0,00133941249668348 217985 256778 579 665 0 True 328 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 373 564 0,00582467700089854 0,00582740898939957 0,00578316929884794 0,00581368734264134 0,00129822078909144 0,00121657501765617 221016 253963 579 665 0 True 372 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 417 563 0,00567725218485343 0,00568955003668475 0,00569161516746777 0,00576791027695125 0,00164311046915397 0,00161769613331176 215422 247955 579 665 0 True 416 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 462 563 0,00578227325956558 0,00583355848995343 0,00581368734264134 0,00585946440833143 0,00185231208968005 0,00179361472813294 219407 254231 579 665 0 True 459 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 505 564 0,00560741382902226 0,00590794908993702 0,00567635614557107 0,00601205462729839 0,00194785172303802 0,00188341190800604 212772 257473 579 665 0 True 503 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 550 563 0,00588966620296634 0,00579271479224497 0,00584420538643473 0,00578316929884794 0,00169145882369323 0,00171089279923683 223482 252451 579 665 0 True 547 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 593 562 0,00580109008449519 0,00575012720631976 0,00581368734264134 0,00567635614557107 0,00153986597424446 0,00146475038858276 220121 250595 579 665 0 True 591 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 638 563 0,00560419862924438 0,00569829242366617 0,00567635614557107 0,00578316929884794 0,00162621899445991 0,00149368397245505 212650 248336 579 665 0 True 635 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 682 563 0,00549851870211872 0,00573199994722444 0,00556954299229419 0,00584420538643473 0,00152228223436503 0,00152792490148281 208640 249805 579 665 0 True 679 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 284 605 0,00605899127323624 0,00610248440969671 0,00614938582436866 0,00614938582436866 0,00141272678892311 0,0014301919283308 229907 265951 579 665 0 False 284 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 328 605 0,00579592468157333 0,00585751400703636 0,00578316929884794 0,00587472343022812 0,00126373981081379 0,00145635475558601 219925 255275 579 665 0 False 328 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 373 607 0,00574561471127835 0,00562849100320038 0,00569161516746777 0,00561532005798428 0,00124465739897988 0,00119304715409061 218016 245294 579 665 0 True 372 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 418 608 0,00547469459884651 0,00577525296417973 0,00546272983901732 0,00573739223315786 0,00151396373003328 0,00146044641455015 207736 251690 579 665 0 True 416 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 459 605 0,00575887082183801 0,0056092164492256 0,00578316929884794 0,00563057907988098 0,0018514740882199 0,00182104665944515 218519 244454 579 665 0 False 459 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 503 605 0,00557478745750567 0,00567078029245694 0,00558480201419089 0,00566109712367437 0,00186086721385634 0,00189675607964826 211534 247137 579 665 0 False 503 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 547 605 0,00558108608657874 0,00573220646030274 0,00550850690470741 0,00578316929884794 0,00183919409435183 0,00174403165654108 211773 249814 579 665 0 False 547 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 591 605 0,00564438862646797 0,00570049522983472 0,00575265125505455 0,00567635614557107 0,00158692076378249 0,00157778179709594 214175 248432 579 665 0 False 591 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 635 605 0,00597948096397487 0,00581258593955706 0,00601205462729839 0,00573739223315786 0,0014710426546882 0,00137957955868128 226890 253317 579 665 0 False 635 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 678 605 0,00612052808865729 0,00579608783919056 0,00616464484626535 0,00578316929884794 0,00143468447444962 0,00152471225108198 232242 252598 579 665 0 False 678 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 285 653 0,00730416962656113 0,681443916497584 0,00701915007248035 0,69228656443122 0,00193777368169048 0,202215710846745 277155 29697854 579 665 7 True 284 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 328 648 0,00626594999336536 0,00583374205713414 0,00614938582436866 0,00587472343022812 0,00152201337280618 0,00118590614215881 237760 254239 579 665 0 False 328 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 372 648 0,00548868862410928 0,00543643384038031 0,0055390249485008 0,00540169375143053 0,00119681799801887 0,00115791069188097 208267 236924 579 665 0 False 372 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 415 648 0,0055136986617258 0,00549136631920841 0,00547798886091402 0,00558480201419089 0,00132522721453961 0,0014180895372136 209216 239318 579 665 0 False 415 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 459 648 0,00530265505663298 0,00543267071317571 0,00534065766384375 0,00552376592660411 0,00144657091829004 0,00154203363557077 201208 236760 579 665 0 False 459 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 503 648 0,0052613581873547 0,00556651413381244 0,00529488059815366 0,0055542839703975 0,00157968261977279 0,00162747406455562 199641 242593 579 665 0 False 503 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 547 648 0,00558893960734768 0,00560047406224419 0,00560006103608759 0,00566109712367437 0,00162896622338194 0,00168350044272404 212071 244073 579 665 0 False 547 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 591 648 0,00571116990710049 0,00557835421696838 0,00567635614557107 0,00552376592660411 0,00131649603580124 0,00125411121063921 216709 243109 579 665 0 False 591 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 635 648 0,00599057603861824 0,00579943794023856 0,0059662775616083 0,00579842832074464 0,001394033041014 0,00129774688719373 227311 252744 579 665 0 False 635 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 681 651 0,00781622972233456 0,688018788100946 0,00756847486076143 0,682658121614405 0,00215629824014837 0,190694634585523 296585 29984392 579 665 7 True 678 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H2_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H2_3.csv new file mode 100755 index 0000000..08cffb8 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H2_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 284 261 0,0010740875585868 0,0669891024195875 0,000900282291905089 0,0670786602578775 0,000783547068476532 0,0210506312521667 40756 2919437 579 665 0 True 285 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 328 261 0,000973625742576084 0,000870544408629723 0,000869764248111696 0,000747692072938125 0,000646187468575638 0,000632596637917776 36944 37939 579 665 0 False 328 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 372 259 0,000868499251477773 0,000831467545035626 0,000732433051041428 0,000717174029144732 0,000631865185512782 0,000628778231830091 32955 36236 579 665 0 True 372 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 416 260 0,000887237014117758 0,00093947388498713 0,000671396963454643 0,000732433051041428 0,000766857264984187 0,000740226923143527 33666 40943 579 665 0 True 416 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 461 260 0,000961423795878035 0,000944292523480824 0,000656137941557946 0,000762951094834821 0,000920119427343982 0,000813522432511516 36481 41153 579 665 0 True 460 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 503 261 0,00103062965339224 0,00096352118566042 0,000839246204318303 0,000793469138628214 0,000887888437274809 0,000799779790087013 39107 41991 579 665 0 True 504 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 549 260 0,000962873271187738 0,000877680582779907 0,000732433051041428 0,000701915007248035 0,000844491048672073 0,00076150735315788 36536 38250 579 665 0 True 548 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 592 261 0,00105181834701045 0,000923870674626599 0,00080872816052491 0,000564583810177768 0,000971441987764505 0,000998339830034209 39911 40263 579 665 0 True 591 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 635 262 0,000993444023174211 0,00095769292767281 0,000732433051041428 0,000595101853971161 0,00091950180045107 0,000932473029406259 37696 41737 579 665 0 False 635 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 680 260 0,00107124131616048 0,0660228965639092 0,000762951094834821 0,0659189745937285 0,000974986201880342 0,0208667366889855 40648 2877329 579 665 0 True 679 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 285 304 0,000838508289615182 0,000819650407777283 0,000686655985351339 0,000671396963454643 0,000643853994682115 0,000670686642730597 31817 35721 579 665 0 False 285 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 328 304 0,000886261912545775 0,000826809527825056 0,000747692072938125 0,000701915007248035 0,000684139002511966 0,000593157469175324 33629 36033 579 665 0 False 328 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 373 305 0,000846730767735681 0,000867790900919041 0,000717174029144732 0,000778210116731518 0,000643490403175808 0,000644673122804273 32129 37819 579 665 0 True 372 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 417 304 0,000882783171802487 0,000946380600161424 0,000701915007248035 0,000701915007248035 0,000764039407351555 0,000782067772640847 33497 41244 579 665 0 True 416 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 460 304 0,000922630565771062 0,000871278677352571 0,000625619897764553 0,000564583810177768 0,000901894483842353 0,00091778333701954 35009 37971 579 665 0 True 460 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 505 304 0,000858221153827148 0,000923159351801339 0,000595101853971161 0,000686655985351339 0,000835170027221626 0,000855840832103946 32565 40232 579 665 0 True 504 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 548 305 0,000887237014117758 0,000926945424903527 0,000686655985351339 0,000793469138628214 0,000833283084226314 0,000730927006578477 33666 40397 579 665 0 True 547 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 594 306 0,00102072051309318 0,000961823189238833 0,000671396963454643 0,000549324788281071 0,00103221416762035 0,00107775484183288 38731 41917 579 665 0 True 591 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 635 305 0,000891216482695307 0,000938601940878748 0,000534065766384375 0,000564583810177768 0,000924111876798097 0,00099182003720442 33817 40905 579 665 0 False 635 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 679 305 0,000918150369359251 0,000998559571278849 0,000595101853971161 0,00064087891966125 0,000937244518383192 0,00103463805028675 34839 43518 579 665 0 False 679 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 285 343 0,000905263216151161 0,000880847116647191 0,000778210116731518 0,000732433051041428 0,000697498634741368 0,000670003689921024 34350 38388 579 665 0 True 284 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 329 343 0,000886393683028476 0,000866345309370932 0,000778210116731518 0,000762951094834821 0,000678453721155443 0,00060788043663345 33634 37756 579 665 0 True 328 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 373 343 0,000853846373801498 0,000864945609618002 0,000717174029144732 0,000747692072938125 0,000649812784703728 0,000639247050726174 32399 37695 579 665 0 True 372 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 417 343 0,000829020814860759 0,000797553508399059 0,00064087891966125 0,000549324788281071 0,000710556938932859 0,00072550126795352 31457 34758 579 665 0 True 416 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 462 343 0,000878830057321478 0,000880755333056835 0,000595101853971161 0,000625619897764553 0,000891489936289173 0,000801916794122011 33347 38384 579 665 0 True 460 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 504 347 0,000848285659431545 0,000908909949398559 0,000564583810177768 0,000610360875867857 0,000830080221997098 0,000868611439955957 32188 39611 579 665 0 False 504 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 547 347 0,000947825082063362 0,000922379191283312 0,000717174029144732 0,000686655985351339 0,000874912621401385 0,000858329954968812 35965 40198 579 665 0 False 547 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 593 343 0,00103945827573316 0,00101794885474157 0,000686655985351339 0,000579842832074464 0,00110161982935682 0,00110247655965687 39442 44363 579 665 0 True 591 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 638 343 0,000928296696527176 0,000880434090490589 0,000473029678797589 0,000473029678797589 0,00103928357846777 0,000986045775592984 35224 38370 579 665 0 True 635 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 681 343 0,000912299759927358 0,000993695040989978 0,000549324788281071 0,000610360875867857 0,000931962618573073 0,00102378435513588 34617 43306 579 665 0 True 679 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 285 387 0,000866918005685369 0,000863477072172305 0,000686655985351339 0,000732433051041428 0,0007271668689011 0,000707754170478849 32895 37631 579 665 0 True 284 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 329 388 0,00091749151694575 0,000869167654774382 0,000778210116731518 0,000762951094834821 0,0006634219701436 0,00069501049393401 34814 37879 579 665 0 True 328 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 374 388 0,000862490517466639 0,000880732387159246 0,000701915007248035 0,000747692072938125 0,000702309759453856 0,000709539130833875 32727 38383 579 665 0 True 372 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 417 387 0,000895933865975979 0,000880227577412288 0,000671396963454643 0,00064087891966125 0,000806146055690389 0,000809800346770895 33996 38361 579 665 0 True 416 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 461 387 0,000915989333442966 0,00084025582381222 0,000686655985351339 0,000518806744487678 0,000871197631632681 0,000824703948822451 34757 36619 579 665 0 True 460 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 506 388 0,000922683273964142 0,000931649333909275 0,000625619897764553 0,000671396963454643 0,000913657288471139 0,000877114112019222 35011 40602 579 665 0 True 504 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 549 387 0,000897752298637243 0,0008843807848759 0,000610360875867857 0,000717174029144732 0,000848986477495579 0,000751245819172176 34065 38542 579 665 0 True 547 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 594 388 0,000935096053434512 0,00077534187953289 0,000518806744487678 0,000274662394140536 0,00101334416418036 0,000924247564318333 35482 33790 579 665 0 True 591 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 638 387 0,000939391771170542 0,000939657452167842 0,000534065766384375 0,000579842832074464 0,0010159103366238 0,000964103717931823 35645 40951 579 665 0 True 635 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 682 387 0,000987593413742317 0,00100877049570596 0,000656137941557946 0,000656137941557946 0,000950382228922216 0,00105399692229649 37474 43963 579 665 0 True 679 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 285 431 0,000849524301968928 0,00089046144773699 0,000717174029144732 0,000747692072938125 0,000733485170544964 0,000765300015247981 32235 38807 579 665 0 True 284 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 329 431 0,000797343190819603 0,000806227057687707 0,00064087891966125 0,000671396963454643 0,000696860217359609 0,000637046184059621 30255 35136 579 665 0 True 328 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 373 431 0,00087993692937616 0,000940690017559348 0,000762951094834821 0,00080872816052491 0,000693152189863229 0,000713065848832767 33389 40996 579 665 0 True 372 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 418 431 0,000792678515732012 0,000866069958599864 0,000518806744487678 0,000610360875867857 0,000813800445802092 0,000818282379956852 30078 37744 579 665 0 True 416 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 462 430 0,000784640516287293 0,000870498516834545 0,000473029678797589 0,000579842832074464 0,000887784591704065 0,000883564699008775 29773 37937 579 665 0 True 460 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 506 432 0,00088415358482257 0,000945095629896439 0,000595101853971161 0,000671396963454643 0,00086598790414003 0,000936573515222995 33549 41188 579 665 0 True 503 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 550 431 0,000910823930521114 0,000887776777719075 0,00064087891966125 0,000625619897764553 0,000893440108467325 0,000845478396801512 34561 38690 579 665 0 True 547 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 594 431 0,000901283747573611 0,000840393499197754 0,000549324788281071 0,0004272526131075 0,000903619616059841 0,000914537691563776 34199 36625 579 665 0 True 591 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 638 430 0,000780661047709743 0,000906867764513137 0,0004272526131075 0,000549324788281071 0,000877590662148763 0,000941191395876388 29622 39522 579 665 0 True 635 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 682 431 0,000838982663352903 0,000890966257483948 0,000442511635004196 0,000518806744487678 0,00095367475893834 0,000912777539791909 31835 38829 579 665 0 True 679 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 284 476 0,000783006562301809 0,000886744212327569 0,000610360875867857 0,000747692072938125 0,000725416926256316 0,00077347641015785 29711 38645 579 665 0 True 284 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 329 476 0,000789674148726445 0,000870154328370709 0,000656137941557946 0,000778210116731518 0,000711447236868207 0,000751404672136602 29964 37922 579 665 0 True 328 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 372 475 0,00081276033729554 0,000848011537197308 0,00064087891966125 0,000671396963454643 0,000734570261613366 0,000770924107782072 30840 36957 579 665 0 True 372 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 417 475 0,000868657376057013 0,000879378579201494 0,00064087891966125 0,000595101853971161 0,000864589450863744 0,000853884436802969 32961 38324 579 665 0 True 416 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 462 475 0,00093862750237088 0,000825822854228728 0,000503547722590982 0,0004272526131075 0,00103158114547928 0,000936006041081625 35616 35990 579 665 0 True 460 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 505 475 0,000923711083729205 0,000919419170494329 0,000488288700694286 0,000610360875867857 0,00100449541663122 0,000924066948827663 35050 40069 579 665 0 True 503 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 549 474 0,000822221457953423 0,000868754628617779 0,000534065766384375 0,000534065766384375 0,000865427259229546 0,000922819332638244 31199 37861 579 665 0 True 547 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 592 475 0,000879330785155739 0,000865060339105948 0,000488288700694286 0,000488288700694286 0,000973721510439182 0,000945987520239299 33366 37700 579 665 0 True 591 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 637 474 0,000906791753750484 0,000762056204828849 0,000488288700694286 0,000442511635004196 0,000998772617313658 0,000795283037353684 34408 33211 579 665 0 True 635 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 681 475 0,000815448455142626 0,000879630984074973 0,0004272526131075 0,000503547722590982 0,000953825888259215 0,000934361226813092 30942 38335 579 665 0 True 679 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 286 519 0,000856086472007403 0,000901842612941142 0,000717174029144732 0,000732433051041428 0,000736524566698797 0,000805265016897095 32484 39303 579 665 0 True 284 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 329 519 0,000765296609426887 0,000836194399938964 0,000625619897764553 0,000656137941557946 0,000694168071489359 0,000760755777156049 29039 36442 579 665 0 True 328 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 373 520 0,000883099420960968 0,000854665847498123 0,000762951094834821 0,000747692072938125 0,000742883606702407 0,000716818505729192 33509 37247 579 665 0 True 372 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 418 520 0,000866944359781909 0,000835941995065485 0,000579842832074464 0,0004272526131075 0,000877268734626129 0,000926739045337297 32896 36431 579 665 0 True 416 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 461 519 0,000876827145984433 0,000819879866753173 0,000518806744487678 0,000503547722590982 0,000956095902895404 0,000833817548912338 33271 35731 579 665 0 True 459 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 506 520 0,000863571035424781 0,000822954617030101 0,000564583810177768 0,000473029678797589 0,000875016577765524 0,000876398680653736 32768 35865 579 665 0 True 503 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 549 519 0,000835635693092315 0,000786424748068386 0,000518806744487678 0,000488288700694286 0,000863163060995074 0,000834285297649688 31708 34273 579 665 0 True 547 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 594 520 0,000884627958560292 0,000833188487354803 0,000610360875867857 0,000549324788281071 0,000849668410722253 0,000900094464804051 33567 36311 579 665 0 True 591 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 638 519 0,000782505834467548 0,000865656932443262 0,000442511635004196 0,000457770656900893 0,0008875539871176 0,000954184475428993 29692 37726 579 665 0 True 635 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 682 519 0,000855111370435421 0,000832155921963297 0,000503547722590982 0,000518806744487678 0,000936873736843735 0,000883392097647962 32447 36266 579 665 0 True 679 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 284 563 0,00079586736141336 0,00095558190509462 0,000656137941557946 0,00080872816052491 0,000649944827183281 0,000695449910485644 30199 41645 579 665 0 True 284 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 329 564 0,000785299368700794 0,000881283088701383 0,000671396963454643 0,000732433051041428 0,000658657893662379 0,000700040179664816 29798 38407 579 665 0 True 328 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 373 564 0,000830259457398142 0,000877795312267852 0,000717174029144732 0,000778210116731518 0,00063647083605539 0,000653512263635602 31504 38255 579 665 0 True 372 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 417 563 0,000775416582498271 0,000870062544780353 0,000534065766384375 0,000595101853971161 0,000782830482928933 0,000829159007665491 29423 37918 579 665 0 True 416 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 462 563 0,000840669325531467 0,000774033963370316 0,0004272526131075 0,000411993591210803 0,000972225654670461 0,000851092212457903 31899 33733 579 665 0 True 459 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 505 564 0,000779685946137761 0,000874146914551198 0,000274662394140536 0,000259403372243839 0,000937037796486908 0,00108474273368361 29585 38096 579 665 0 True 503 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 550 563 0,000912115281251577 0,000849089994383992 0,000503547722590982 0,000442511635004196 0,0009784777441223 0,000909759862018654 34610 37004 579 665 0 True 547 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 593 562 0,000918466618517732 0,000871508136328461 0,000610360875867857 0,000671396963454643 0,000906921538081898 0,000740344734288141 34851 37981 579 665 0 True 591 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 638 563 0,00085903813081989 0,000928849934403415 0,000549324788281071 0,000701915007248035 0,000892165695316189 0,000857718603352088 32596 40480 579 665 0 True 635 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 682 563 0,000864361658320983 0,000895922571363176 0,000610360875867857 0,000595101853971161 0,000814031173310122 0,000888210120496369 32798 39045 579 665 0 True 679 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 284 605 0,0008965400101964 0,000952736613793582 0,000762951094834821 0,00080872816052491 0,000676696334826484 0,000768171703866756 34019 41521 579 665 0 False 284 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 328 605 0,000835872879961175 0,0008983777824052 0,000701915007248035 0,000732433051041428 0,000704433522143581 0,000771429906263848 31717 39152 579 665 0 False 328 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 373 607 0,000864019055065962 0,00087761174508714 0,000793469138628214 0,000717174029144732 0,000688333255180222 0,000722986329547851 32785 38247 579 665 0 True 372 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 418 608 0,00080422161001656 0,000917491715096852 0,000610360875867857 0,000625619897764553 0,000781757637121513 0,00083305701375365 30516 39985 579 665 0 True 416 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 459 605 0,000823749995552746 0,00079658978070032 0,000411993591210803 0,000350957503624018 0,000971890538483888 0,000922666244330874 31257 34716 579 665 0 False 459 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 503 605 0,000820113130230218 0,000834932375571568 0,000305180437933928 0,000320439459830625 0,000982909380070501 0,00102601682806464 31119 36387 579 665 0 False 503 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 547 605 0,000854188977056519 0,000955260662528374 0,000442511635004196 0,000473029678797589 0,00094453932253622 0,0010738284257438 32412 41631 579 665 0 False 547 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 591 605 0,000961054838526474 0,000838443097902688 0,000717174029144732 0,000564583810177768 0,000887633435487256 0,000812055432382333 36467 36540 579 665 0 False 591 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 635 605 0,000860935625770775 0,000890254934658688 0,00064087891966125 0,000717174029144732 0,000752630916193059 0,000736059047215553 32668 38798 579 665 0 False 635 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 678 605 0,000944504465899314 0,000878116554834098 0,000747692072938125 0,000579842832074464 0,000783242974154123 0,000813349972798251 35839 38269 579 665 0 False 678 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 285 653 0,000980609578159201 0,0680572568982539 0,000854505226215 0,0685282673380636 0,000681124401200256 0,021528628723084 37209 2965988 579 665 0 True 284 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 328 648 0,000902390619628294 0,000789178255779068 0,000823987182421607 0,00064087891966125 0,00063699086053496 0,000627627915367422 34241 34393 579 665 0 False 328 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 372 648 0,00080422161001656 0,000965356857467542 0,000656137941557946 0,000823987182421607 0,000648168450355798 0,000685856599861248 30516 42071 579 665 0 False 372 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 415 648 0,000835266735740754 0,000901980288326676 0,000701915007248035 0,000686655985351339 0,000668396559631246 0,000765002857829507 31694 39309 579 665 0 False 415 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 459 648 0,000878803703224938 0,000834771754288445 0,00064087891966125 0,000610360875867857 0,000841427598439142 0,000785110717178522 33346 36380 579 665 0 False 459 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 503 648 0,000952278924378633 0,000872793106593446 0,000686655985351339 0,000579842832074464 0,00091420590164613 0,000875546475090466 36134 38037 579 665 0 False 503 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 547 648 0,000841222761558808 0,000852554824919933 0,000534065766384375 0,000488288700694286 0,000844546355567683 0,000865861358284558 31920 37155 579 665 0 False 547 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 591 648 0,00084198703035847 0,000844133680504764 0,000656137941557946 0,000717174029144732 0,000710918862387233 0,000624717018024498 31949 36788 579 665 0 False 591 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 635 648 0,00089659271838948 0,000826740690132289 0,000732433051041428 0,000701915007248035 0,000701628533765653 0,000631917725846549 34021 36030 579 665 0 False 635 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 681 651 0,00101083772689065 0,0686666311005254 0,000839246204318303 0,06665140764477 0,000750181932232544 0,0203875240222746 38356 2992545 579 665 0 True 678 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H3_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H3_1.csv new file mode 100755 index 0000000..d3f28c7 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H3_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 281 271 0,00985785522719669 0,0428532994192967 0,00987258716716258 0,0432135500114443 0,00141385166959576 0,00902693694915835 374054 1867580 579 665 0 True 280 271 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 324 271 0,0100328991364158 0,00995987336159121 0,00994888227664607 0,00999465934233616 0,00134505110428101 0,00135957284100367 380696 434059 579 665 0 False 324 271 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 369 271 0,0102952278133756 0,0576616638873448 0,0102388036926833 0,0579385061417563 0,00130276746043412 0,0138291239099339 390650 2512940 579 665 0 True 368 271 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 413 270 0,010428078814034 0,076218125997071 0,0104829480430304 0,0757763027389944 0,00147966703927917 0,0156580529744564 395691 3321645 579 665 0 True 411 271 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 457 271 0,0102155066713419 0,0648365707126594 0,0101777676050965 0,0628519111924926 0,00170407019397023 0,0156769895460535 387625 2825628 579 665 0 True 455 271 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 501 271 0,0101620869176552 0,0606414869859474 0,0102082856488899 0,0618295567254139 0,00160903134534038 0,0205390589837866 385598 2642803 579 665 0 True 499 272 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 546 272 0,0101355483424393 0,0711394187001034 0,0101930266269932 0,0709849698634318 0,0015975611208249 0,0236449875758142 384591 3100311 579 665 0 True 542 272 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 589 271 0,0102948061478309 0,0616242138878898 0,0103303578240635 0,0604257267109178 0,00187877581427935 0,01934912135319 390634 2685631 579 665 0 True 586 272 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 630 272 0,0100036197351598 0,00982807212583989 0,0100556954299229 0,00984206912336919 0,00184282573047665 0,00184670793694373 379585 428315 579 665 0 False 630 272 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 673 270 0,0102388036926833 0,0419885373768594 0,0101625085831998 0,042221713588159 0,00175175773350601 0,00835451574280933 388509 1829893 579 665 0 True 673 272 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 280 314 0,00987485361946503 0,00992412365314752 0,00994888227664607 0,00994888227664607 0,00145028910610846 0,00153524449576297 374699 432501 579 665 0 False 280 314 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 324 314 0,0100394349523577 0,00985294547882639 0,0100251773861295 0,00988784618905928 0,00132131812491552 0,00124033073486003 380944 429399 579 665 0 False 324 314 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 370 316 0,0102805485816028 0,0909331694996245 0,0101930266269932 0,0886091401541161 0,00151221422227911 0,0237586939642053 390093 3962938 579 665 0 True 368 314 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 414 316 0,010184329775135 0,0482834919755328 0,0101930266269932 0,0475165941863127 0,00150998296214479 0,0115022226840727 386442 2104232 579 665 0 True 411 314 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 458 316 0,0103745009357681 0,0795683188286578 0,0103303578240635 0,081025406271458 0,00185908878802971 0,0201932502953623 393658 3467649 579 665 0 True 455 314 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 499 314 0,0106290815083451 0,0355651086975851 0,010605020218204 0,0378881513694972 0,00170075265015897 0,0126116016596997 403318 1549955 579 665 0 False 499 314 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 542 314 0,0105130971294723 0,0375462116036257 0,0104676890211337 0,0401464866102083 0,00172815182690923 0,014955332970112 398917 1636293 579 665 0 False 542 314 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 590 316 0,0101828539457287 0,0469194272015585 0,0100862134737163 0,0469672693980316 0,00199440446559497 0,01293691955359 386386 2044785 579 665 0 True 586 314 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 630 315 0,00991815340008036 0,00985131632009757 0,00999465934233616 0,00985732814526589 0,00204609754866025 0,00185760499858877 376342 429328 579 665 0 False 630 315 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 673 315 0,0100673439405936 0,00990691422995576 0,0101930266269932 0,0100099183642329 0,00201628301625319 0,00187272689281851 382003 431751 579 665 0 False 673 315 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 281 355 0,0100144512688377 0,0488885523490576 0,0100404364080262 0,0481269550621805 0,00150261282780312 0,0149625397998315 379996 2130601 579 665 0 True 280 357 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 326 355 0,0102278140344261 0,0579581019382973 0,0102082856488899 0,0602731364919509 0,00138641315607183 0,0181762203144064 388092 2525859 579 665 0 True 324 357 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 369 354 0,0104748836894892 0,0344639809640834 0,0101777676050965 0,0354009308003357 0,00219292296908773 0,00740708018276136 397467 1501967 579 665 0 True 367 357 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 414 355 0,0103939502590146 0,0310870791077029 0,0103608758678569 0,0319066147859922 0,00168817700216943 0,00520303079962517 394396 1354799 579 665 0 True 411 357 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 458 354 0,0108029131291233 0,0629559249462636 0,0106813153276875 0,06323338673991 0,00239437578351087 0,0147274359642573 409914 2743668 579 665 0 True 455 357 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 498 357 0,0108458175982906 0,0266910581558038 0,0107881284809644 0,0290684367132067 0,00196417873584164 0,00826705657557671 411542 1163217 579 665 0 False 498 357 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 546 355 0,0103535230749222 0,0265844285697076 0,0102845807583734 0,0269016556038758 0,00167556293747371 0,00416359122480943 392862 1158570 579 665 0 True 542 357 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 590 355 0,0102924606332389 0,0452538533332645 0,0102388036926833 0,0460822461280232 0,00199900807201006 0,0097527810501843 390545 1972198 579 665 0 True 586 357 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 633 354 0,00993538897921755 0,0503415554220869 0,00991836423285267 0,0514839398794537 0,00190308036683619 0,0138171385793909 376996 2193924 579 665 0 True 629 357 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 678 354 0,00983540153694456 0,0594456385871981 0,00985732814526589 0,0570382238498512 0,00182693533587173 0,0208754539104216 373202 2590687 579 665 0 True 673 357 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 282 400 0,0100667905045663 0,0443682105240212 0,0100251773861295 0,0451056687266346 0,00143872553445175 0,0134207912171619 381982 1933601 579 665 0 True 280 400 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 324 400 0,0103026596685999 0,0303371842285962 0,0103150988021668 0,0312199588006409 0,00135638780390808 0,00749693329122784 390932 1322118 579 665 0 False 324 400 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 370 399 0,0105713133287293 0,0849338039536929 0,0105592431525139 0,083436331731136 0,00148310376862624 0,0262095088605085 401126 3701481 579 665 0 True 367 400 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 414 398 0,0103952679638417 0,0629688434866062 0,0103761348897536 0,0616769665064469 0,00149861463738491 0,021356582527116 394446 2744231 579 665 0 True 411 400 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 455 400 0,0106986563232109 0,0359100314301432 0,0106965743495842 0,0392004272526131 0,00175537468323685 0,0115908051039395 405958 1564987 579 665 0 False 455 400 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 502 399 0,0105889705734111 0,0483199071150066 0,0106813153276875 0,0488288700694286 0,00172273762618458 0,0110395657761011 401796 2105819 579 665 0 True 498 400 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 547 399 0,010395136193359 0,0372361666354029 0,010452429999237 0,0386053253986419 0,00169256225034471 0,00717360593436684 394441 1622781 579 665 0 True 542 400 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 591 399 0,0102569616651994 0,0486256382544826 0,0102235446707866 0,0482795452811475 0,00191449504404249 0,0127037938549379 389198 2119143 579 665 0 True 586 400 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 634 399 0,00998406499552705 0,038800847391998 0,00988784618905928 0,0389410238803693 0,00180185043810483 0,00926284263234108 378843 1690971 579 665 0 True 629 400 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 678 398 0,0102654213301888 0,0802274167910047 0,01025406271458 0,0757152666514076 0,00184469183957789 0,0225000995677211 389519 3496373 579 665 0 True 673 400 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 283 444 0,010116942350282 0,0434656106964596 0,0102082856488899 0,0449988555733577 0,00160451539631636 0,00885640074244077 383885 1894265 579 665 0 True 280 442 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 326 443 0,0101575276589537 0,0528121172695988 0,0102693217364767 0,0547188525215534 0,00148847001796895 0,00875942013794834 385425 2301593 579 665 0 True 324 442 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 370 443 0,0103848317416118 0,0327829186149168 0,0102998397802701 0,0336308842603189 0,00146032394792746 0,00611335415698158 394050 1428705 579 665 0 True 367 443 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 415 442 0,0105971403433385 0,0530457982906454 0,0105897611963073 0,0520943007553216 0,0017555630273526 0,0154997006060847 402106 2311777 579 665 0 True 411 443 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 458 442 0,0106194359090114 0,088949496653054 0,0106965743495842 0,0862439917601282 0,00186691921862193 0,0182788622869313 402952 3876488 579 665 0 True 455 443 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 502 443 0,0106055209460383 0,0575400047383278 0,0105745021744106 0,0568093385214008 0,00180133944823565 0,0161583381036786 402424 2507638 579 665 0 True 498 443 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 547 443 0,010373815729258 0,0494950353682329 0,0103456168459602 0,049912260624094 0,00174670542629984 0,0120126481378447 393632 2157032 579 665 0 True 542 443 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 590 443 0,010146169043345 0,0285681931998685 0,0101472495613031 0,0290379186694133 0,00189595848930959 0,00529063786884798 384994 1245024 579 665 0 True 586 443 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 635 444 0,0101549976656859 0,0367124953606263 0,0101930266269932 0,0372320134279393 0,00185938330777001 0,00718566546669795 385329 1599959 579 665 0 True 629 443 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 678 442 0,0100872939916745 0,0682508973280076 0,0101625085831998 0,0672159914549477 0,0019929747210237 0,0106101804700996 382760 2974427 579 665 0 True 673 443 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 281 488 0,0100940933485818 0,0498662082076328 0,0101472495613031 0,052323186083772 0,00156144248092122 0,0159713685454079 383018 2173208 579 665 0 True 280 485 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 325 488 0,0103420853970238 0,0529235884400863 0,0102998397802701 0,0546425574120699 0,00160490295925421 0,0126234556321452 392428 2306451 579 665 0 True 324 485 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 370 488 0,0109313893497562 0,0664519848488238 0,0103913939116503 0,065293354695964 0,00415264065190119 0,0206306882097774 414789 2896029 579 665 0 True 367 485 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 414 487 0,0106440769892764 0,0874509918651057 0,0107881284809644 0,0852368963149462 0,00179915036501567 0,0277483852776127 403887 3811182 579 665 0 True 411 485 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 458 486 0,0105341276985112 0,0919924209700264 0,0105745021744106 0,0909132524605173 0,00192190000178475 0,0338827607597285 399715 4009101 579 665 0 True 455 485 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 502 488 0,0106118459292079 0,0446283711108855 0,0107423514152743 0,0460822461280232 0,00186383846800116 0,0104374738650994 402664 1944939 579 665 0 True 498 486 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 542 486 0,0107854403631173 0,0335937119062247 0,0108644235904479 0,0379339284351873 0,00202308075673714 0,00994564432877488 409251 1464040 579 665 0 False 542 486 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 589 487 0,0104552235334703 0,093509167746558 0,0105439841306172 0,0909590295262074 0,00193411157997219 0,0250321365549921 396721 4075202 579 665 0 True 586 486 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 634 486 0,00999297268015759 0,0568129639732198 0,00993362325474937 0,0588998245212482 0,00183326267222554 0,0165742125236102 379181 2475953 579 665 0 True 629 486 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 677 487 0,0101926049614486 0,0709665443076678 0,0101625085831998 0,0700236514839399 0,00193862573051165 0,0189696232665553 386756 3092777 579 665 0 True 673 486 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 281 531 0,0102981004098984 0,0489007366206774 0,0098115510795758 0,0522316319523919 0,00398021473535905 0,0139019229706456 390759 2131132 579 665 0 True 280 528 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 325 532 0,0104128461462339 0,10494762885699 0,0103761348897536 0,0996414129854276 0,00152400926844284 0,0352920753635455 395113 4573699 579 665 0 True 324 528 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 370 531 0,0103601379531537 0,0536906927423847 0,0103150988021668 0,0561532005798428 0,00142286082746177 0,0141921006312626 393113 2339882 579 665 0 True 367 528 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 413 530 0,0107766117407764 0,0558806721541781 0,0107270923933776 0,0565651941710536 0,00185759065664978 0,0112257241284385 408916 2435323 579 665 0 True 411 528 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 457 530 0,0106376992979137 0,0534146077025936 0,0105592431525139 0,0564583810177768 0,00193302425444393 0,0114474178338921 403645 2327850 579 665 0 True 455 528 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 501 531 0,0104911178129579 0,0581370111017989 0,0103608758678569 0,0597238117036698 0,00190752942778381 0,016255895779069 398083 2533656 579 665 0 True 498 528 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 545 530 0,0102582266618333 0,0694578974329851 0,0102845807583734 0,0696421759365225 0,00177631599119823 0,0201977281041349 389246 3027029 579 665 0 True 542 528 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 590 531 0,0103238483622181 0,0543168633416914 0,0102998397802701 0,0545662623025864 0,00167072220185189 0,0157146059486339 391736 2367171 579 665 0 True 585 528 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 633 531 0,0100209870847797 0,0379861532980999 0,0100099183642329 0,0383764400701915 0,0018994576300784 0,00772038547626327 380244 1655466 579 665 0 True 629 529 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 677 530 0,00997452481257955 0,0589330731268547 0,00999465934233616 0,0587777523460746 0,00190667014481725 0,0162660910779017 378481 2568349 579 665 0 True 673 529 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 281 576 0,00970476428039546 0,0419394102101213 0,00967421988250553 0,0427862973983368 0,00135103320370836 0,0120855568004588 368245 1827752 579 665 0 True 280 571 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 325 576 0,0100673966487867 0,0479714736601173 0,0101319905394064 0,0503852903028916 0,0015017667076331 0,0130557961855951 382005 2090634 579 665 0 True 323 571 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 369 575 0,0101237153530928 0,0478809291482311 0,0100709544518196 0,0481574731059739 0,00142968051480026 0,012431762567143 384142 2086688 579 665 0 True 367 571 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 413 575 0,0103758977028847 0,0482051087893687 0,0103303578240635 0,0484321355001144 0,00185116445141824 0,0120837182539121 393711 2100816 579 665 0 True 411 571 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 458 575 0,0104795483645768 0,0886282999786029 0,0103456168459602 0,0844129091325246 0,00207802562624274 0,0300406773156239 397644 3862490 579 665 0 True 454 571 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 502 576 0,0104167992607149 0,0606254478035326 0,0104219119554437 0,0607003891050584 0,00222722767148593 0,0173080049149524 395263 2642104 579 665 0 True 498 571 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 547 576 0,0102981531180915 0,0515673252712922 0,0101777676050965 0,0525978484779126 0,00199658114183789 0,0108473028287878 390761 2247344 579 665 0 True 542 571 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 585 571 0,0120997191575702 0,0290163724715772 0,0108796826123445 0,0313420309758145 0,00461553629906505 0,0137559195975827 459121 1264556 579 665 0 False 585 571 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 635 576 0,0100231744747925 0,0463315762512255 0,00988784618905928 0,0458228427557794 0,00167805224040599 0,0117096317892536 380327 2019166 579 665 0 True 629 571 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 679 575 0,00987791069466368 0,0493094948403281 0,00987258716716258 0,0482490272373541 0,00175811946878854 0,0107517196579179 374815 2148946 579 665 0 True 673 571 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 280 614 0,00959676519277429 0,00952224920277347 0,00958266575112535 0,00953688868543526 0,00139272375700769 0,00143723753974832 364147 414987 579 665 0 False 280 614 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 323 614 0,00955212135323542 0,00962479441909879 0,00955214770733196 0,00959792477302205 0,00151045015804133 0,00139200560159334 362453 419456 579 665 0 False 323 614 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 369 619 0,0102112636617989 0,0715432664976701 0,0102235446707866 0,0713664454108492 0,00158648853997286 0,0181921995005351 387464 3117911 579 665 0 True 367 614 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 415 619 0,0100387497458477 0,0788087407807686 0,00997940032043946 0,0756237125200275 0,00168025564079582 0,0287160772737914 380918 3434546 579 665 0 True 411 614 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 454 614 0,0105639605357946 0,00990755671508825 0,0103913939116503 0,00978103303578241 0,00265369204672134 0,00191204788010643 400847 431779 579 665 0 False 454 614 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 498 614 0,010078439015237 0,00991595491360583 0,0100251773861295 0,00991836423285267 0,00204068506030734 0,00195583874204843 382424 432145 579 665 0 False 498 614 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 542 614 0,00994100240178059 0,00990186613248617 0,00996414129854276 0,00988784618905928 0,00184273039388265 0,00207804535241765 377209 431531 579 665 0 False 542 614 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 585 614 0,00980699182087437 0,00983676862102613 0,0097962920576791 0,00996414129854276 0,00161413917900324 0,00166258106461372 372124 428694 579 665 0 False 585 614 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 629 614 0,00986557697748293 0,0107735578359953 0,00975051499198901 0,00985732814526589 0,00170219347543913 0,00785337298714696 374347 469520 579 665 0 False 629 614 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 673 614 0,00965363733310774 0,00972219975436417 0,00975051499198901 0,00971999694819562 0,00158367201608672 0,00145703786026622 366305 423701 579 665 0 False 673 614 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 279 662 0,00972113017434684 0,0403966886775189 0,00964370183871214 0,0409246967269398 0,00143239958858379 0,0093010445224217 368866 1760519 579 665 0 True 280 656 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 323 656 0,00939125594795488 0,0095177976986412 0,0093690394445716 0,00950637064164187 0,00122288147454688 0,0012748325606708 356349 414793 579 665 0 False 323 656 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 367 656 0,00971559581407343 0,00953544309388716 0,00949111161974517 0,00959792477302205 0,00211504189731264 0,00121096301060441 368656 415562 579 665 0 False 367 656 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 411 657 0,00970004689711479 0,00961635032878603 0,00970473792629892 0,00962844281681544 0,00142378565175634 0,00134875826484284 368066 419088 579 665 0 False 411 657 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 454 657 0,00957425879432907 0,00971850546485233 0,00955214770733196 0,00971999694819562 0,00165693567900365 0,00164883701599335 363293 423540 579 665 0 False 454 657 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 498 657 0,00969248327140779 0,00953459409567636 0,00975051499198901 0,00955214770733196 0,00178070417087153 0,0016471698895365 367779 415525 579 665 0 False 498 657 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 542 657 0,00952616256814346 0,00974812861863976 0,00955214770733196 0,00978103303578241 0,00174459392690706 0,00171021056608432 361468 424831 579 665 0 False 542 657 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 585 657 0,00946346617247465 0,0095773423028847 0,00949111161974517 0,00950637064164187 0,00148502938637419 0,00138884783646227 359089 417388 579 665 0 False 585 657 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 629 657 0,00968476152112156 0,00957708989801122 0,00962844281681544 0,00959792477302205 0,00137595591298006 0,00138131464492682 367486 417377 579 665 0 False 629 657 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 675 660 0,00982077501336482 0,0413245289924284 0,00994888227664607 0,0418097199969482 0,00146870389028518 0,00849970849199611 372647 1800955 579 665 0 True 673 657 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H3_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H3_2.csv new file mode 100755 index 0000000..70f61ee --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H3_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 281 271 0,00767499811897636 0,694559447371003 0,00753795681696803 0,705470359349966 0,00179802082166583 0,198608286083465 291226 30269439 579 665 8 True 280 271 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 324 271 0,00640541587225537 0,00620418062781123 0,00631723506523232 0,00622568093385214 0,00148708400217141 0,00122154075250545 243052 270383 579 665 0 False 324 271 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 369 271 0,0059919991598314 0,00592027103694232 0,00601205462729839 0,00590524147402152 0,001213766327373 0,00117947786539706 227365 258010 579 665 0 True 368 271 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 413 270 0,00593536420636681 0,00584629346311533 0,0059510185397116 0,00588998245212482 0,00140721252840525 0,00133328629070448 225216 254786 579 665 0 True 411 271 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 457 271 0,00593855305204815 0,00600519380391927 0,0059510185397116 0,005981536583505 0,00163174606117748 0,00161913597209569 225337 261711 579 665 0 True 455 271 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 501 271 0,00604125496626478 0,00600234851261824 0,00607309071488518 0,005981536583505 0,00157727946162924 0,00152127800185412 229234 261587 579 665 0 True 499 272 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 546 272 0,00625791199392064 0,00620670467654602 0,00624093995574884 0,00624093995574884 0,0014396052764149 0,00145163064752486 237455 270493 579 665 0 True 542 272 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 589 271 0,00646379019609161 0,00634061693487553 0,00646982528419928 0,00633249408712902 0,00180205413866191 0,00182113701958898 245267 276329 579 665 0 True 586 272 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 630 272 0,00693895455670894 0,00673934779727988 0,00686655985351339 0,00688181887541009 0,00198265553746516 0,00179744459759447 263297 293706 579 665 0 False 630 272 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 673 270 0,00874863765792198 0,674888044097426 0,00866712443732357 0,682352941176471 0,00219220565439181 0,18741710387859 331965 29412144 579 665 5 True 673 272 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 280 314 0,0063199231830794 0,00648866386611987 0,00631723506523232 0,00650034332799268 0,00142568109855001 0,00147106908470478 239808 282781 579 665 0 False 280 314 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 324 314 0,0059058212641454 0,00585498995830157 0,00587472343022812 0,00585946440833143 0,00121069121325638 0,00119673241629675 224095 255165 579 665 0 False 324 314 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 370 316 0,00600232996567511 0,0063341920835506 0,00599679560540169 0,00613412680247196 0,00125863913977436 0,00205959541402671 227757 276049 579 665 0 True 368 314 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 414 316 0,00613997741190386 0,00609571536990795 0,00611886778057527 0,00605783169298848 0,00142526003002802 0,0014073918434874 232980 265656 579 665 0 True 411 314 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 458 316 0,00615594799440713 0,00633352665252052 0,00616464484626535 0,00625619897764553 0,00171041910039061 0,00161046761312622 233586 276020 579 665 0 True 455 314 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 499 314 0,00611233196463333 0,0061758424442888 0,00614938582436866 0,00625619897764553 0,00154066990013109 0,00149483098757902 231931 269148 579 665 0 False 499 314 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 542 314 0,00611080342703401 0,00623297772928545 0,00610360875867857 0,00624093995574884 0,00150670799158906 0,00139155012474856 231873 271638 579 665 0 False 542 314 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 590 316 0,00636027130488224 0,00645445153281464 0,00634775310902571 0,0064087891966125 0,00175486684439393 0,00195633103031882 241339 281290 579 665 0 True 586 314 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 630 315 0,00646347394693313 0,00657246228411496 0,00642404821850919 0,00653086137178607 0,00186857196027977 0,00180965970873946 245255 286433 579 665 0 False 630 315 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 673 315 0,00683688514080928 0,00658494485240338 0,00689707789730678 0,00657663843747616 0,00183500806080148 0,00183169202099662 259424 286977 579 665 0 False 673 315 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 281 355 0,00580617642512742 0,00598977416073945 0,00579842832074464 0,0059510185397116 0,00143963167538629 0,00139464771297367 220314 261039 579 665 0 True 280 357 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 326 355 0,00590763969680666 0,00600397767134706 0,00590524147402152 0,00602731364919509 0,00134367450854072 0,00129887316228041 224164 261658 579 665 0 True 324 357 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 369 354 0,00607786080635893 0,00632444007707527 0,00602731364919509 0,00628671702143893 0,0012109019897335 0,00116590389694856 230623 275624 579 665 0 True 367 357 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 414 355 0,00618852165773065 0,00627781401317439 0,00613412680247196 0,00630197604333562 0,00139872239702072 0,00152213321667371 234822 273592 579 665 0 True 411 357 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 458 354 0,0063329421067702 0,00632267324296092 0,00631723506523232 0,00627145799954223 0,00162709810727334 0,001648142258152 240302 275547 579 665 0 True 455 357 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 498 357 0,00628916795241715 0,00636459539785605 0,00631723506523232 0,0064087891966125 0,00158399428515935 0,0015458761786364 238641 277374 579 665 0 False 498 357 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 546 355 0,00632435067129814 0,00603853419311612 0,00634775310902571 0,00601205462729839 0,0015168355471068 0,00154430074064819 239976 263164 579 665 0 True 542 357 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 590 355 0,00636854649119582 0,00690146056374629 0,00633249408712902 0,00650034332799268 0,00190075778381064 0,00371802241317254 241653 300771 579 665 0 True 586 357 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 633 354 0,00610221199156195 0,00611730745953921 0,00610360875867857 0,00610360875867857 0,00192476818329945 0,00181468617868262 231547 266597 579 665 0 True 629 357 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 678 354 0,00597887481975445 0,00602189841736408 0,00590524147402152 0,00604257267109178 0,00177102221121302 0,00173143717507952 226867 262439 579 665 0 True 673 357 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 282 400 0,00588344663618288 0,00589716451807018 0,00584420538643473 0,00588998245212482 0,00135773203873089 0,00141926946827741 223246 257003 579 665 0 True 280 400 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 324 400 0,00599948372324878 0,00588527854311907 0,00592050049591821 0,00590524147402152 0,00134835868816173 0,00122882085898525 227649 256485 579 665 0 False 324 400 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 370 399 0,00641282137338313 0,00624564386475459 0,00636301213092241 0,00630197604333562 0,00138473966697109 0,00133141747631472 243333 272190 579 665 0 True 367 400 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 414 398 0,00610719291580802 0,00632198486603325 0,00613412680247196 0,00624093995574884 0,00143065570255608 0,00150672030163133 231736 275517 579 665 0 True 411 400 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 455 400 0,00635112643338284 0,00634142004129114 0,00636301213092241 0,00631723506523232 0,00154216112990804 0,00157258306937742 240992 276364 579 665 0 False 455 400 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 502 399 0,00637745417582636 0,00628981471761344 0,00631723506523232 0,00627145799954223 0,00162420719761761 0,00164645302885797 241991 274115 579 665 0 True 498 400 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 547 399 0,00611314894162607 0,00614172189457393 0,00621042191195544 0,00619516289005875 0,00166474511923636 0,00150275808495914 231962 267661 579 665 0 True 542 400 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 591 399 0,00598709729787495 0,00620854034835314 0,00604257267109178 0,00613412680247196 0,00176623792276887 0,00193127994386766 227179 270573 579 665 0 True 586 400 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 634 399 0,00573180516469136 0,00583034606429096 0,00569161516746777 0,00588998245212482 0,00172823754089605 0,00185138990039752 217492 254091 579 665 0 True 629 400 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 678 398 0,00568750392840752 0,00588454427439622 0,00572213321126116 0,00584420538643473 0,00175220853251664 0,00181018767058469 215811 256453 579 665 0 True 673 400 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 283 444 0,00595431280177911 0,00594541974069988 0,0059510185397116 0,0059510185397116 0,00142674465651674 0,0013671179675079 225935 259106 579 665 0 True 280 442 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 326 443 0,00592498069233002 0,00599002656561293 0,0059662775616083 0,00601205462729839 0,00136465136567955 0,00140757121343006 224822 261050 579 665 0 True 324 442 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 370 443 0,00614179584456512 0,00621315247376854 0,00621042191195544 0,00621042191195544 0,00136307754463689 0,00127588247588751 233049 270774 579 665 0 True 367 443 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 415 442 0,00641716979931224 0,00632735420606908 0,00648508430609598 0,00634775310902571 0,00159702031302479 0,00164186991879027 243498 275751 579 665 0 True 411 443 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 458 442 0,00611578435128008 0,00628084287165614 0,00607309071488518 0,00622568093385214 0,00180011733023367 0,00175982324714045 232062 273724 579 665 0 True 455 443 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 502 443 0,00630566561685123 0,00620798964681101 0,00634775310902571 0,00619516289005875 0,00169068839809798 0,0017654378208884 239267 270549 579 665 0 True 498 443 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 547 443 0,00597455274792188 0,00606129652352442 0,0059662775616083 0,00599679560540169 0,0015984844377968 0,00164603373219888 226703 264156 579 665 0 True 542 443 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 590 443 0,00576042571353387 0,00584397592745884 0,00563057907988098 0,00585946440833143 0,00200067768840475 0,0018324347746487 218578 254685 579 665 0 True 586 443 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 635 444 0,00560224842610041 0,00567110153502318 0,00563057907988098 0,00561532005798428 0,00172473003833368 0,00181591279762875 212576 247151 579 665 0 True 629 443 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 678 442 0,00566054368764703 0,00578447721501052 0,00570687418936446 0,00582894636453803 0,00169230480839463 0,00169098999877094 214788 252092 579 665 0 True 673 443 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 281 488 0,00608523995339014 0,00600849801317209 0,00610360875867857 0,00611886778057527 0,00142087559116918 0,0013873808098785 230903 261855 579 665 0 True 280 485 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 325 488 0,00592382111208226 0,00614126297662215 0,00593575951781491 0,00614938582436866 0,00144434746679561 0,00141902026548732 224778 267641 579 665 0 True 324 485 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 370 488 0,00647011517926122 0,00611058431154563 0,00601205462729839 0,00616464484626535 0,00351716384622479 0,00147224292236886 245507 266304 579 665 0 True 367 485 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 414 487 0,00611328071210877 0,00623607542545996 0,00613412680247196 0,00622568093385214 0,00156113285616434 0,00160638953868565 231967 271773 579 665 0 True 411 485 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 458 486 0,00612208298035315 0,00630470660514872 0,00625619897764553 0,0064087891966125 0,00186335695842455 0,00183739331954178 232301 274764 579 665 0 True 455 485 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 502 488 0,00603938382541044 0,0058478078923562 0,00611886778057527 0,00579842832074464 0,00173754221830689 0,00167781890881903 229163 254852 579 665 0 True 498 486 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 542 486 0,00571762666075281 0,00583530237817019 0,00579842832074464 0,00581368734264134 0,00160239124069093 0,00156107978139995 216954 254307 579 665 0 False 542 486 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 589 487 0,00578150899076592 0,00648272087864431 0,00579842832074464 0,00605783169298848 0,00169877632063463 0,00569613039780578 219378 282522 579 665 0 True 586 486 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 634 486 0,00570010118655367 0,00565765523903602 0,00567635614557107 0,00564583810177768 0,00167538393067837 0,00169423892611875 216289 246565 579 665 0 True 629 486 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 677 487 0,00564826267865936 0,00590303866785297 0,00556954299229419 0,00599679560540169 0,00171297818328033 0,00179137288894664 214322 257259 579 665 0 True 673 486 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 281 531 0,00642757966744556 0,00600501023673856 0,00607309071488518 0,00599679560540169 0,00291695520478184 0,00146088474985578 243893 261703 579 665 0 True 280 528 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 325 532 0,00618976030026803 0,00617586539018638 0,00616464484626535 0,00611886778057527 0,00151579544765693 0,00142091692102456 234869 269149 579 665 0 True 324 528 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 370 531 0,0060352198781571 0,00630589979182334 0,00602731364919509 0,00627145799954223 0,00139797213315085 0,00153445779351397 229005 274816 579 665 0 True 367 528 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 413 530 0,00607232644608551 0,00625151801453737 0,00608834973678187 0,00627145799954223 0,00157580332013388 0,00173181944807004 230413 272446 579 665 0 True 411 528 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 457 530 0,00615573716163481 0,00593922434835085 0,00616464484626535 0,00590524147402152 0,00180646656885072 0,00178888268683504 233578 258836 579 665 0 True 455 528 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 501 531 0,00587448624335926 0,00610955174615412 0,00584420538643473 0,00619516289005875 0,00180137589057439 0,00182529917105665 222906 266259 579 665 0 True 498 528 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 545 530 0,00601200191910531 0,00590962414046102 0,00593575951781491 0,00579842832074464 0,00160010529968765 0,0017219254848228 228124 257546 579 665 0 True 542 528 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 590 531 0,00580319841221839 0,0060324994220502 0,00570687418936446 0,00602731364919509 0,00160236186801358 0,00157596098581539 220201 262901 579 665 0 True 585 528 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 633 531 0,00580949704129147 0,00576708422463804 0,00581368734264134 0,00572213321126116 0,00185253626848329 0,00185665471935638 220440 251334 579 665 0 True 629 529 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 677 530 0,00572890621407195 0,0057713521615896 0,00579842832074464 0,00570687418936446 0,00172111832121691 0,00174561743934422 217382 251520 579 665 0 True 673 529 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 281 576 0,00603226821934462 0,00614865155564581 0,00593575951781491 0,00619516289005875 0,0013316609300633 0,00129437396769749 228893 267963 579 665 0 True 280 571 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 325 576 0,00606257543036569 0,00631952965499122 0,00607309071488518 0,0063935301747158 0,00136252268657577 0,00132748478737856 230043 275410 579 665 0 True 323 571 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 369 575 0,00605095327379152 0,00605177397602498 0,00605783169298848 0,0059510185397116 0,00126025630074979 0,00128332501399529 229602 263741 579 665 0 True 367 571 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 413 575 0,00612279454095973 0,00606870804844567 0,00610360875867857 0,00610360875867857 0,00156401964983959 0,00150610036685132 232328 264479 579 665 0 True 411 571 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 458 575 0,0060089711980032 0,00608527498650494 0,00604257267109178 0,00611886778057527 0,00182476842925658 0,00178365544021558 228009 265201 579 665 0 True 454 571 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 502 576 0,00592903922319719 0,00615544354133216 0,0059510185397116 0,00616464484626535 0,00196790871060274 0,00196534666304985 224976 268259 579 665 0 True 498 571 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 547 576 0,00619468851632103 0,0060527835955189 0,00605783169298848 0,00611886778057527 0,00197109546207271 0,00161036273793611 235056 263785 579 665 0 True 542 571 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 585 571 0,00591533509299636 0,00591825179795449 0,00590524147402152 0,00593575951781491 0,00156432289055692 0,00146621278465399 224456 257922 579 665 0 False 585 571 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 635 576 0,00597173285959209 0,00590794908993702 0,00604257267109178 0,00587472343022812 0,00145607464971032 0,00146889820160417 226596 257473 579 665 0 True 629 571 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 679 575 0,00593499524901525 0,0057889057732452 0,00593575951781491 0,00585946440833143 0,0015340928743118 0,00161038565396489 225202 252285 579 665 0 True 673 571 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 280 614 0,00634229781104192 0,00630232023179946 0,00631723506523232 0,00634775310902571 0,0013086835906769 0,00139317795446019 240657 274660 579 665 0 False 280 614 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 323 614 0,00606837333160451 0,00590675590326239 0,00607309071488518 0,00587472343022812 0,00133480217290718 0,00124707201442856 230263 257421 579 665 0 False 323 614 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 369 619 0,0058803632068877 0,006040438702616 0,00592050049591821 0,00605783169298848 0,00120215356839394 0,00127522839698464 223129 263247 579 665 0 True 367 614 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 415 619 0,00582235784040302 0,00659825347300501 0,00578316929884794 0,00585946440833143 0,00151692011179317 0,00441757336560296 220928 287557 579 665 0 True 411 614 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 454 614 0,00590268512665713 0,00582467842758648 0,0059662775616083 0,00590524147402152 0,00182386723689063 0,0017785201931913 223976 253844 579 665 0 False 454 614 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 498 614 0,00592363663340648 0,00592671883416484 0,00592050049591821 0,00585946440833143 0,00187508257967268 0,00191875156788243 224771 258291 579 665 0 False 498 614 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 542 614 0,00575009490769017 0,00585398033880765 0,00575265125505455 0,00593575951781491 0,00181639840493776 0,00191973292109993 218186 255121 579 665 0 False 542 614 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 585 614 0,00605045254595726 0,00591249237765965 0,00605783169298848 0,0059662775616083 0,00159935425615356 0,0015924221207896 229583 257671 579 665 0 False 585 614 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 629 614 0,00603861955661077 0,00649015534946315 0,00605783169298848 0,00590524147402152 0,00141103386252923 0,00570372996699083 229134 282846 579 665 0 False 629 614 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 673 614 0,00615402414535971 0,00623692442367076 0,00613412680247196 0,00621042191195544 0,00157533738612326 0,0015926537527627 233513 271810 579 665 0 False 673 614 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 279 662 0,00853738322005684 0,673050467780805 0,00772106507972839 0,681467917906462 0,00321233596111485 0,213065320069453 323949 29332061 579 665 7 True 280 656 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 323 656 0,00644961169215305 0,00612572860395438 0,00636301213092241 0,00610360875867857 0,00158554684967937 0,00120287164241891 244729 266964 579 665 0 False 323 656 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 367 656 0,00586152002786155 0,00590907343891888 0,00590524147402152 0,0059662775616083 0,00116663299758537 0,00115842160153318 222414 257522 579 665 0 False 367 656 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 411 657 0,00569119350192312 0,00560724310203295 0,00561532005798428 0,00563057907988098 0,00128048837981947 0,00137649542509552 215951 244368 579 665 0 False 411 657 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 454 657 0,00574500856705793 0,0056785818976372 0,00567635614557107 0,00566109712367437 0,00155721307661714 0,00150250673503069 217993 247477 579 665 0 False 454 657 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 498 657 0,00574938334708358 0,00561144220129174 0,00575265125505455 0,00566109712367437 0,00170083423586788 0,0016424203901218 218159 244551 579 665 0 False 498 657 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 542 657 0,00571852270003517 0,00569712218288913 0,00575265125505455 0,00567635614557107 0,00162655602667706 0,00160702771033826 216988 248285 579 665 0 False 542 657 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 585 657 0,00587042771249209 0,00586003805577115 0,00590524147402152 0,00584420538643473 0,00134458647294663 0,00118240687405638 222752 255385 579 665 0 False 585 657 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 629 657 0,00613072712401829 0,0060830721803364 0,00611886778057527 0,00611886778057527 0,00131933180262525 0,00130153116254958 232629 265105 579 665 0 False 629 657 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 675 660 0,00853756769873262 0,697304694558552 0,0076600289921416 0,698603799496452 0,00339935031298632 0,19623339038656 323956 30389079 579 665 8 True 673 657 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H3_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H3_3.csv new file mode 100755 index 0000000..1071683 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H3_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 281 271 0,00109098053446898 0,069910528208826 0,000946059357595178 0,0699015793087663 0,000751267612495755 0,0216258645705099 41397 3046755 579 665 0 True 280 271 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 324 271 0,000943977383968513 0,00085285312158859 0,000839246204318303 0,000701915007248035 0,000673045729975916 0,000642807353866707 35819 37168 579 665 0 False 324 271 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 369 271 0,000988436744831599 0,000863316450889182 0,000885023270008392 0,000762951094834821 0,000672666228521782 0,000633028208022932 37506 37624 579 665 0 True 368 271 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 413 270 0,000948958308214585 0,000824308424987853 0,00080872816052491 0,000671396963454643 0,000728461786311308 0,000657542196683545 36008 35924 579 665 0 True 411 271 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 457 271 0,000860909271674235 0,000805355113579325 0,000625619897764553 0,000518806744487678 0,000821545081324435 0,000853682569152709 32667 35098 579 665 0 True 455 271 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 501 271 0,000862780412528579 0,000906133495790288 0,00064087891966125 0,000717174029144732 0,000827818096515251 0,000800462242112392 32738 39490 579 665 0 True 499 272 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 546 272 0,000837612250332819 0,000880801224852013 0,000579842832074464 0,000717174029144732 0,000803223388291296 0,000721851477675928 31783 38386 579 665 0 True 542 272 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 589 271 0,000829152585343459 0,000871554028123639 0,000518806744487678 0,000473029678797589 0,000853984492048642 0,000929125254573908 31462 37983 579 665 0 True 586 272 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 630 272 0,000870528516911358 0,00094578400682411 0,000534065766384375 0,000610360875867857 0,000906957415260637 0,000937627616161842 33032 41218 579 665 0 False 630 272 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 673 270 0,00112518815177799 0,0672580971770236 0,000930800335698482 0,0678110933089189 0,000935516704845529 0,0194714985123935 42695 2931160 579 665 0 True 673 272 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 280 314 0,000999979839116147 0,000895234194435505 0,000793469138628214 0,000762951094834821 0,000778532265898699 0,000720256853095416 37944 39015 579 665 0 False 280 314 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 324 314 0,000955942143797702 0,000888786397212991 0,000854505226215 0,00080872816052491 0,000630315521296013 0,000608366934656169 36273 38734 579 665 0 False 324 314 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 370 316 0,000890135964737165 0,000870177274268298 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,000642854001619497 0,000653652010417906 33776 37923 579 665 0 True 368 314 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 414 316 0,000876827145984433 0,000851636989016373 0,000701915007248035 0,000595101853971161 0,000756476342052317 0,000777694901610816 33271 37115 579 665 0 True 411 314 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 458 316 0,00095926275996175 0,000864830880130057 0,000701915007248035 0,00064087891966125 0,000881023287313367 0,000807187692269872 36399 37690 579 665 0 True 455 314 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 499 314 0,000978237709470595 0,00086010402522672 0,000762951094834821 0,000656137941557946 0,000865727592336452 0,000784216639625245 37119 37484 579 665 0 False 499 314 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 542 314 0,000869606123532456 0,000883187598201271 0,000686655985351339 0,000701915007248035 0,000771049406362595 0,000747911051489293 32997 38490 579 665 0 False 542 314 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 590 316 0,00101176012026955 0,000879126174328015 0,00064087891966125 0,000381475547417411 0,00104763946446932 0,00106540201988081 38391 38313 579 665 0 True 586 314 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 630 315 0,000962873271187738 0,000919946926138877 0,000488288700694286 0,000457770656900893 0,00109016317267043 0,000995200511280868 36536 40092 579 665 0 False 630 315 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 673 315 0,000996448390179779 0,000918180092024522 0,000579842832074464 0,000549324788281071 0,000997239925439899 0,000954868267495611 37810 40015 579 665 0 False 673 315 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 281 355 0,000857667717799807 0,000872517755822378 0,000732433051041428 0,000717174029144732 0,000659378885559114 0,000736407764457271 32544 38025 579 665 0 True 280 357 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 326 355 0,000899438960815807 0,000896725677778791 0,000747692072938125 0,000778210116731518 0,000685409544356528 0,000687637845100794 34129 39080 579 665 0 True 324 357 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 369 354 0,000905553111213101 0,000906936602205904 0,000762951094834821 0,000778210116731518 0,000725091481954974 0,000689197901248561 34361 39525 579 665 0 True 367 357 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 414 355 0,000913116736920099 0,000841862036643451 0,000732433051041428 0,000610360875867857 0,000734126370778021 0,000762896127596067 34648 36689 579 665 0 True 411 357 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 458 354 0,000901494580345932 0,000861802021648307 0,000610360875867857 0,000564583810177768 0,000893295318331636 0,000845197075243382 34207 37558 579 665 0 True 455 357 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 498 357 0,000778921677338099 0,000831398707342859 0,000488288700694286 0,000518806744487678 0,000817564386117306 0,000830057408084476 29556 36233 579 665 0 False 498 357 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 546 355 0,00084638816448066 0,000897299325218517 0,000579842832074464 0,000610360875867857 0,000824834021432568 0,000862222929467315 32116 39105 579 665 0 True 542 357 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 590 355 0,000851158255954412 0,000902416260380867 0,000473029678797589 0,0004272526131075 0,000957412158513139 0,00109724930218993 32297 39328 579 665 0 True 586 357 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 633 354 0,000838297456842861 0,000931993522373111 0,000350957503624018 0,000503547722590982 0,000997635769455735 0,000998093788208255 31809 40617 579 665 0 True 629 357 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 678 354 0,000912484238603138 0,000956385011510236 0,000549324788281071 0,000564583810177768 0,000952352519583222 0,00101125457745047 34624 41680 579 665 0 True 673 357 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 282 400 0,000908320291349808 0,000891792309797153 0,000778210116731518 0,000747692072938125 0,000696131762539949 0,000720594850814448 34466 38865 579 665 0 True 280 400 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 324 400 0,000923131293605323 0,000918386605102823 0,000823987182421607 0,000778210116731518 0,000673474150426102 0,000688948247654815 35028 40024 579 665 0 False 324 400 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 370 399 0,000939997915390964 0,000925775184126487 0,000823987182421607 0,00080872816052491 0,000680426797657196 0,000702976917833927 35668 40346 579 665 0 True 367 400 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 414 398 0,000905289570247701 0,00081386804158485 0,000701915007248035 0,00064087891966125 0,000759201616213463 0,000713894432595494 34351 35469 579 665 0 True 411 400 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 455 400 0,000978474896339456 0,000879126174328015 0,000747692072938125 0,000610360875867857 0,000844642953428987 0,000835522937341818 37128 38313 579 665 0 False 455 400 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 502 399 0,000812180547171659 0,000913728587892253 0,000503547722590982 0,00064087891966125 0,000878205687904303 0,000861261003007777 30818 39821 579 665 0 True 498 400 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 547 399 0,00077499491695363 0,000770133160780183 0,000518806744487678 0,000564583810177768 0,000772241874290527 0,000739759573477113 29407 33563 579 665 0 True 542 400 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 591 399 0,000987435289163077 0,000842275062800054 0,000686655985351339 0,000473029678797589 0,00100100296302681 0,000954632955083752 37468 36707 579 665 0 True 586 400 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 634 399 0,000840985574689947 0,000803748900748094 0,000488288700694286 0,0004272526131075 0,000871445465630238 0,000898150698211085 31911 35028 579 665 0 True 629 400 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 678 398 0,00100227264551513 0,000923870674626599 0,000717174029144732 0,000488288700694286 0,000907739579245249 0,000983044095948918 38031 40263 579 665 0 True 673 400 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 283 444 0,000915725792477566 0,000880571765876123 0,00080872816052491 0,000762951094834821 0,000735749703413319 0,000756387735600742 34747 38376 579 665 0 True 280 442 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 326 443 0,000827017903523714 0,000894476979815068 0,000686655985351339 0,000747692072938125 0,000687217730004157 0,000724005186013425 31381 38982 579 665 0 True 324 442 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 370 443 0,000843410151571633 0,000900970668832759 0,000747692072938125 0,000793469138628214 0,000676199854233745 0,000700578544719109 32003 39265 579 665 0 True 367 443 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 415 442 0,000873005801986124 0,000884220163592777 0,000686655985351339 0,000595101853971161 0,000821361956314322 0,00086579928918791 33126 38535 579 665 0 True 411 443 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 458 442 0,000902179786855973 0,000791174548869312 0,000595101853971161 0,000442511635004196 0,000948417458167593 0,000890032457980594 34233 34480 579 665 0 True 455 443 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 502 443 0,000875193191998949 0,000880938900237547 0,000610360875867857 0,000518806744487678 0,000857122206278068 0,000936945603954491 33209 38392 579 665 0 True 498 443 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 547 443 0,000824962283993589 0,00088903880208647 0,000534065766384375 0,000625619897764553 0,000869758615617018 0,000862812835973254 31303 38745 579 665 0 True 542 443 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 590 443 0,000873875487171946 0,000862123264214553 0,000457770656900893 0,000411993591210803 0,000990054292610672 0,000984527035523603 33159 37572 579 665 0 True 586 443 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 635 444 0,000873559238013465 0,000881374872291739 0,000503547722590982 0,000442511635004196 0,000948779734504172 0,000969287996177 33147 38411 579 665 0 True 629 443 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 678 442 0,000890742108957586 0,000928918772096182 0,000488288700694286 0,000564583810177768 0,000970137643405881 0,000958384273163355 33799 40483 579 665 0 True 673 443 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 281 488 0,000864124471452123 0,000914829990976526 0,000671396963454643 0,000778210116731518 0,000765769179634213 0,000808217248330485 32789 39869 579 665 0 True 280 485 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 325 488 0,000860197711067653 0,000925912859512021 0,000671396963454643 0,000793469138628214 0,000804355087154237 0,000798711456754085 32640 40352 579 665 0 True 324 485 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 370 488 0,000922815044446843 0,000826832473722645 0,000778210116731518 0,00064087891966125 0,000833582871441029 0,00074613196889203 35016 36034 579 665 0 True 367 485 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 414 487 0,000900124167325848 0,000821944997536184 0,000686655985351339 0,000518806744487678 0,000877989202635704 0,000875900174156147 34155 35821 579 665 0 True 411 485 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 458 486 0,000839193496125223 0,000867584387840739 0,000518806744487678 0,000442511635004196 0,000921571039356355 0,000945543568744905 31843 37810 579 665 0 True 455 485 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 502 488 0,000919099116834694 0,000855010035961958 0,000579842832074464 0,0004272526131075 0,000924440779175303 0,000972063707475888 34875 37262 579 665 0 True 498 486 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 542 486 0,000841196407462268 0,000820522351885665 0,000534065766384375 0,000549324788281071 0,000849409939893479 0,000817139701137615 31919 35759 579 665 0 False 542 486 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 589 487 0,00089221793836383 0,000951428697631008 0,000488288700694286 0,000564583810177768 0,000985037130893536 0,00105182290460971 33855 41464 579 665 0 True 586 486 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 634 486 0,00086317572397668 0,000848103320787664 0,000564583810177768 0,000488288700694286 0,000918393666776541 0,00088508497370106 32753 36961 579 665 0 True 629 486 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 677 487 0,000775627415270591 0,000991262775845542 0,000411993591210803 0,000625619897764553 0,000876627244829219 0,000979737399377423 29431 43200 579 665 0 True 673 486 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 281 531 0,000910665805941874 0,000826694798337111 0,000778210116731518 0,000671396963454643 0,000736858122521448 0,000751246807376752 34555 36028 579 665 0 True 280 528 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 325 532 0,000873269342951524 0,000911479889928529 0,000732433051041428 0,000793469138628214 0,000702131091629668 0,0007292442517617 33136 39723 579 665 0 True 324 528 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 370 531 0,000872136116800302 0,000762882257142054 0,000686655985351339 0,000579842832074464 0,000747609512925521 0,000708391533644257 33093 33247 579 665 0 True 367 528 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 413 530 0,000780977296868224 0,000893123171857316 0,000518806744487678 0,000595101853971161 0,000796345128287201 0,000899579760164866 29634 38923 579 665 0 True 411 528 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 457 530 0,000818927195885915 0,000866299417575754 0,000381475547417411 0,000442511635004196 0,000935990439462596 0,000977412546151863 31074 37754 579 665 0 True 455 528 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 501 531 0,000948642059056104 0,000806525354356365 0,000549324788281071 0,000411993591210803 0,000993190183652202 0,00092276299770235 35996 35149 579 665 0 True 498 528 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 545 530 0,000860408543839974 0,000932222981349001 0,000549324788281071 0,000579842832074464 0,000890843685229488 0,000981458455352795 32648 40627 579 665 0 True 542 528 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 590 531 0,000834423404651472 0,000916573879193291 0,000579842832074464 0,000625619897764553 0,000762795895751359 0,00086892348949201 31662 39945 579 665 0 True 585 528 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 633 531 0,000849656072451628 0,000881260142803794 0,000457770656900893 0,000442511635004196 0,000923373092448365 0,000985556292001349 32240 38406 579 665 0 True 629 529 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 677 530 0,000938153128633159 0,000898997321640104 0,000656137941557946 0,000595101853971161 0,000926292278083691 0,000892622388737349 35598 39179 579 665 0 True 673 529 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 281 576 0,00101017887447715 0,000959941625636534 0,000915541313801785 0,000854505226215 0,000744960876378514 0,00069093090601701 38331 41835 579 665 0 True 280 571 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 325 576 0,000964375454690522 0,000938969075240172 0,000778210116731518 0,00080872816052491 0,000750272408738161 0,000724158151681987 36593 40921 579 665 0 True 323 571 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 369 575 0,00090932174701833 0,00085496414416678 0,000839246204318303 0,000747692072938125 0,000686252592539953 0,000642424101701147 34504 37260 579 665 0 True 367 571 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 413 575 0,000880411303113881 0,000837708829179839 0,00064087891966125 0,000579842832074464 0,000798763374374682 0,000796098760594833 33407 36508 579 665 0 True 411 571 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 458 575 0,000894721577535136 0,000824262533192675 0,000457770656900893 0,000457770656900893 0,00100992455819429 0,000894627382820674 33950 35922 579 665 0 True 454 571 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 502 576 0,000801717970845254 0,000884220163592777 0,000396734569314107 0,000473029678797589 0,00094060829024254 0,0010547248696785 30421 38535 579 665 0 True 498 571 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 547 576 0,000901072914801291 0,00081829659981953 0,000473029678797589 0,000473029678797589 0,000985664031524017 0,000836481993384145 34191 35662 579 665 0 True 542 571 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 585 571 0,000876405480439792 0,000883692407948229 0,000549324788281071 0,000656137941557946 0,000872872021186658 0,000820053820921061 33255 38512 579 665 0 False 585 571 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 635 576 0,000897304278996062 0,000828369848861109 0,000625619897764553 0,000610360875867857 0,000829625953639975 0,000750162202315022 34048 36101 579 665 0 True 629 571 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 679 575 0,000905184153861541 0,000871255731454982 0,000686655985351339 0,000579842832074464 0,000801319365778371 0,000843647710448726 34347 37970 579 665 0 True 673 571 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 280 614 0,000950381429427748 0,000903494717567551 0,00080872816052491 0,000762951094834821 0,000731126684980811 0,00073625659576813 36062 39375 579 665 0 False 280 614 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 323 614 0,000887579617372779 0,000889841908502086 0,000747692072938125 0,000747692072938125 0,000693648071559987 0,000705356358173864 33679 38780 579 665 0 False 323 614 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 369 619 0,000828124775578397 0,000844822057432434 0,000701915007248035 0,000701915007248035 0,000677091778853937 0,000663986840882529 31423 36818 579 665 0 True 367 614 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 415 619 0,000780555631323583 0,00087621204533421 0,000610360875867857 0,000686655985351339 0,000717573244139999 0,000786923355139095 29618 38186 579 665 0 True 411 614 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 454 614 0,00088415358482257 0,000825662232945605 0,000564583810177768 0,000381475547417411 0,000914842470080114 0,00096533136062855 33549 35983 579 665 0 False 454 614 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 498 614 0,000828704565702278 0,000882177978707354 0,0004272526131075 0,000457770656900893 0,000955364973376909 0,000963421979204543 31445 38446 579 665 0 False 498 614 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 542 614 0,000904103635903398 0,000811206317464524 0,000534065766384375 0,000320439459830625 0,000953341761433472 0,000965462556015254 34306 35353 579 665 0 False 542 614 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 585 614 0,00085052575763745 0,000831972354782585 0,000610360875867857 0,000564583810177768 0,000797458753281132 0,000811369744034519 32273 36258 579 665 0 False 585 614 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 629 614 0,000908083104480948 0,000925981697204788 0,000747692072938125 0,000717174029144732 0,000735325925515631 0,000890533640691893 34457 40355 579 665 0 False 629 614 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 673 614 0,000915093294160604 0,00092384772872901 0,000732433051041428 0,000671396963454643 0,000769231909473597 0,000827275681216216 34723 40262 579 665 0 False 673 614 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 279 662 0,00119357703229945 0,0673771404937154 0,00100709544518196 0,067704280155642 0,000815633956083199 0,0227987938844729 45290 2936348 579 665 0 True 280 656 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 323 656 0,000958709323934408 0,000896243813929422 0,00080872816052491 0,000747692072938125 0,000716288397516814 0,000670676236976806 36378 39059 579 665 0 False 323 656 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 367 656 0,000804168901823479 0,000908038005290177 0,000656137941557946 0,000793469138628214 0,000644012200866853 0,000631461515494702 30514 39573 579 665 0 False 367 656 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 411 657 0,000823670933263126 0,000851017449781469 0,000671396963454643 0,000686655985351339 0,000651132022678684 0,000705968036021609 31254 37088 579 665 0 False 411 657 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 454 657 0,000726450671126834 0,00075409397836546 0,000503547722590982 0,000534065766384375 0,000738105765352157 0,000737001278913844 27565 32864 579 665 0 False 454 657 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 498 657 0,000828361962447257 0,000849089994383992 0,000579842832074464 0,000549324788281071 0,000805539844236024 0,000860005652318278 31432 37004 579 665 0 False 498 657 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 542 657 0,000924027332887686 0,000946931301703561 0,00064087891966125 0,00064087891966125 0,000861794206639953 0,000909222355507374 35062 41268 579 665 0 False 542 657 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 585 657 0,000923473896860344 0,000871875270689886 0,000732433051041428 0,000762951094834821 0,000737136573110971 0,000606517750426984 35041 37997 579 665 0 False 585 657 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 629 657 0,000883073066864428 0,000931328091343029 0,000747692072938125 0,000793469138628214 0,000663492886698479 0,000721349550046443 33508 40588 579 665 0 False 629 657 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 675 660 0,00109361594412299 0,0701381974047043 0,000930800335698482 0,070267795834287 0,000791021017782794 0,0211906176980683 41497 3056677 579 665 0 True 673 657 28 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H4_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H4_1.csv new file mode 100755 index 0000000..d4e48c1 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H4_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 257 247 0,0109826744216231 0,0427566283527542 0,0110322728313115 0,0439612420843824 0,00158973172061649 0,00968728068995031 416735 1863367 579 665 0 True 258 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 301 248 0,0105287514628171 0,0104051385043061 0,0105592431525139 0,0104371709773404 0,00138051337937743 0,00137846124948775 399511 453464 579 665 0 False 301 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 346 247 0,0107814872486363 0,0570120425807022 0,0107423514152743 0,057953765163653 0,00160532602975342 0,0111538712983691 409101 2484629 579 665 0 True 345 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 390 247 0,0109378197493119 0,0721166615325221 0,0108033875028611 0,0722514686808576 0,00152165473147712 0,00967714145672442 415033 3142900 579 665 0 True 389 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 435 247 0,0108110301908577 0,0641818324708544 0,0108033875028611 0,0637521934843976 0,00166561319383008 0,0130611752437228 410222 2797094 579 665 0 True 432 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 479 247 0,0104838967905059 0,0588699489625873 0,0103913939116503 0,0603952086671244 0,00145699607451609 0,0154686219961617 397809 2565598 579 665 0 True 476 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 522 247 0,0104133995822612 0,0699872592903637 0,010406652933547 0,068863965819791 0,00154616868014501 0,0194457988951444 395134 3050099 579 665 0 True 520 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 566 248 0,0107090134831511 0,060841942347285 0,0106202792401007 0,0592202639810788 0,00166799523827015 0,0152769490354362 406351 2651539 579 665 0 True 563 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 607 248 0,0104545383269603 0,0106139461723661 0,0103913939116503 0,0106507972838941 0,00199871236767647 0,0020709909459595 396695 462564 579 665 0 False 607 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 652 247 0,0104133732281647 0,0427703270536148 0,0103761348897536 0,0430457007705806 0,00190404658987 0,00784938916205276 395133 1863964 579 665 0 True 651 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 257 290 0,0108500606078335 0,0111138454972405 0,0108644235904479 0,0111238269626917 0,00153261483543982 0,00153924636266131 411703 484350 579 665 0 False 257 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 301 290 0,0106018577266192 0,010358856628869 0,0106507972838941 0,0104219119554437 0,00124131040075936 0,00131369620660041 402285 451447 579 665 0 False 301 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 346 292 0,0109627507246388 0,0868123386975105 0,0109712367437247 0,0851911192492561 0,00148675097237748 0,0207405782301452 415979 3783349 579 665 0 True 345 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 391 291 0,0107975105393326 0,0456296382980798 0,0108186465247578 0,0460822461280232 0,00138007900561901 0,00735139369185438 409709 1988575 579 665 0 True 389 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 434 291 0,0108249187997343 0,0697122527077593 0,0107118333714809 0,0697795071335927 0,00189459100254816 0,0153864431162122 410749 3038114 579 665 0 True 432 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 476 291 0,0108594426662018 0,0361487146568642 0,010757610437171 0,038300144960708 0,00199940581441588 0,00916873333159539 412059 1575389 579 665 0 False 476 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 523 292 0,0103220826377499 0,0382172414327189 0,010406652933547 0,0402075226977951 0,00171513500756151 0,00691923806884673 391669 1665537 579 665 0 True 520 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 567 292 0,0107365008058424 0,044763178259221 0,0107270923933776 0,0461127641718166 0,0018875960138291 0,00819148738306559 407394 1950814 579 665 0 True 563 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 607 291 0,0104629452837565 0,010416198426944 0,0105439841306172 0,0104829480430304 0,00208088385242689 0,00192093252257037 397014 453946 579 665 0 False 607 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 651 291 0,0103290137651399 0,0103451579280084 0,0103913939116503 0,0102845807583734 0,00205788077748164 0,00191304287146177 391932 450850 579 665 0 False 651 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 258 330 0,0105794303904636 0,048144738132812 0,0105897611963073 0,0486305027847715 0,00164246160419827 0,0097749599165169 401434 2098185 579 665 0 True 257 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 303 330 0,0104447873112404 0,0599008163576715 0,0104676890211337 0,060013733119707 0,00140978697241743 0,0186437075473241 396325 2610524 579 665 0 True 301 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 347 330 0,0109917138767364 0,0355902344554451 0,0105287251087205 0,0366674296177615 0,0032620617990911 0,00622038600777216 417078 1551050 579 665 0 True 345 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 391 330 0,0106955992480122 0,0332601932847683 0,0106355382619974 0,0330052643625544 0,00163928935580428 0,00620828624629615 405842 1449505 579 665 0 True 388 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 435 329 0,0113175032181646 0,0645531659315375 0,0107728694590677 0,0647592889295796 0,003126438886392 0,0122103490328708 429440 2813277 579 665 0 True 432 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 480 330 0,0103835667449779 0,028540359826093 0,0103150988021668 0,0293583581292439 0,00173602827768272 0,00429394172950517 394002 1243811 579 665 0 True 476 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 520 334 0,0108017799029721 0,0241255002922734 0,010757610437171 0,0261234454871443 0,00196691736191625 0,00601607767195763 409871 1051408 579 665 0 False 520 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 567 330 0,0105219257518132 0,0450452980700779 0,0105745021744106 0,0450141145952544 0,00186556975619555 0,00842093307529856 399252 1963109 579 665 0 True 563 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 611 330 0,0103035820619788 0,0508488433259849 0,0103456168459602 0,0516517891203174 0,00207021900279486 0,0103466819225306 390967 2216032 579 665 0 True 607 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 655 330 0,0102963610395268 0,0590913080366285 0,0103608758678569 0,0585336079957275 0,00200851235329893 0,0163147974348687 390693 2575245 579 665 0 True 651 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 259 375 0,0105461451665335 0,042168226700879 0,0104676890211337 0,0439002059967956 0,00219357791368375 0,00876152408199168 400171 1837724 579 665 0 True 257 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 303 375 0,0105140722310443 0,0316482439791399 0,0105439841306172 0,0312352178225376 0,0014111192083511 0,00504087148828069 398954 1379255 579 665 0 True 301 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 347 375 0,010597456592497 0,0862861433739992 0,0105439841306172 0,0834821087968261 0,00146180290586783 0,0215196875575763 402118 3760417 579 665 0 True 345 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 391 374 0,0104966258191347 0,0607822830135536 0,0105134660868238 0,0617532616159304 0,00146129540711601 0,0151665632506778 398292 2648939 579 665 0 True 388 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 435 373 0,0105320720789811 0,0383173314380022 0,0104676890211337 0,0394140535591669 0,00166199429998065 0,00682667160209907 399637 1669899 579 665 0 True 432 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 479 374 0,0107177103350093 0,0479156233453857 0,0107728694590677 0,0487525749599451 0,00162619756518491 0,00825449855770843 406681 2088200 579 665 0 True 476 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 523 375 0,0103468554884976 0,0375293463688978 0,0103150988021668 0,0383611810482948 0,00172659781257223 0,00500366943250608 392609 1635558 579 665 0 True 519 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 567 374 0,0105938987894641 0,0477380450439443 0,0105897611963073 0,0476386663614862 0,0019242867824908 0,0089808788008275 401983 2080461 579 665 0 True 563 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 611 374 0,0104573318611935 0,0381508589509939 0,0104676890211337 0,0386053253986419 0,00205837958244552 0,00656681856245941 396801 1662644 579 665 0 True 607 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 655 374 0,0104350890037137 0,0780895016208408 0,0102998397802701 0,0749065384908827 0,00199326971064801 0,0164939824186012 395957 3403201 579 665 0 True 651 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 259 419 0,0101056100887698 0,0459588201448919 0,0100404364080262 0,0460975051499199 0,00155113066286334 0,0078077182713486 383455 2002921 579 665 0 True 257 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 302 418 0,0106955992480122 0,0570332904818696 0,0107118333714809 0,0571297779812314 0,00159379310300664 0,0114265999185065 405842 2485555 579 665 0 True 301 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 348 418 0,0105665432372555 0,033786090311611 0,0105287251087205 0,0338902876325628 0,00134643849623075 0,00546410925352848 400945 1472424 579 665 0 True 345 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 391 419 0,0105589269033554 0,0517835674101711 0,0105287251087205 0,0501411459525444 0,0014739683847451 0,0121753191900156 400656 2256768 579 665 0 True 388 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 436 418 0,0107253793771025 0,0912245823990051 0,0107728694590677 0,0909437705043107 0,00164089770068127 0,011893903597947 406972 3975638 579 665 0 True 432 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 479 419 0,0107557129422201 0,0544032087543188 0,0108949416342412 0,0550240329594873 0,00175899615281348 0,011660648573775 408123 2370934 579 665 0 True 476 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 523 418 0,0106376992979137 0,0491562621362287 0,0106202792401007 0,0482642862592508 0,00169964489696166 0,00954151793282342 403645 2142268 579 665 0 True 519 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 563 420 0,0112854829908684 0,0281861210591138 0,0110780498970016 0,0298619058518349 0,00249994153096787 0,00865851785740743 428225 1228373 579 665 0 False 563 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 612 418 0,0102527977179461 0,0383894503941245 0,0102845807583734 0,0384985122453651 0,00194502432077524 0,00737588749910121 389040 1673042 579 665 0 True 607 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 656 418 0,0105149155621335 0,0665400741496681 0,0105134660868238 0,0663614862287327 0,0020353297295914 0,00908896341512239 398986 2899868 579 665 0 True 650 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 258 463 0,0104125562511719 0,0525159545694174 0,010406652933547 0,0526894026092927 0,0016741212014533 0,0145625778382778 395102 2288686 579 665 0 True 257 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 302 463 0,0107113589977432 0,0554045677251036 0,0107881284809644 0,0557717250324254 0,00166527306023237 0,00876537593981894 406440 2414574 579 665 0 True 301 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 346 462 0,0106939916481233 0,0662430165594806 0,0106507972838941 0,0647745479514763 0,00143797129345055 0,0173712537494325 405781 2886922 579 665 0 True 344 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 390 462 0,0110677454452544 0,0838859795402904 0,0108949416342412 0,0828717479209583 0,00178350603934752 0,019568674855319 419963 3655816 579 665 0 True 388 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 435 462 0,0109403497425798 0,0879101392758619 0,0109407186999313 0,0860608834973678 0,00194791562937892 0,0282562083973327 415129 3831192 579 665 0 True 432 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 479 462 0,0106985772609212 0,0435918360790968 0,010757610437171 0,0439002059967956 0,00186727285254215 0,00769620216638415 405955 1899766 579 665 0 True 476 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 523 462 0,0103771890536152 0,0399323784398052 0,0103456168459602 0,0407415884641794 0,00180473210972152 0,00663341971296069 393760 1740284 579 665 0 True 519 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 567 463 0,0106653183910877 0,0907139443940591 0,0106660563057908 0,0896314946211948 0,00213223958468568 0,0160768436852337 404693 3953384 579 665 0 True 563 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 611 461 0,0103922372427395 0,0607560099608141 0,0103608758678569 0,0607614251926452 0,0018354232986498 0,0174289498486584 394331 2647794 579 665 0 True 607 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 655 462 0,0104930416620053 0,0730470029502688 0,0104371709773404 0,0706492713817044 0,00190674393711018 0,013218928651355 398156 3183445 579 665 0 True 650 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 258 507 0,0107518652441252 0,047273482401357 0,010452429999237 0,0498359655146105 0,00288161961866855 0,0122653057868164 407977 2060215 579 665 0 True 257 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 302 507 0,0108633167183932 0,0982525895879548 0,0108339055466545 0,0951400015259022 0,00187687918594294 0,0274069682053375 412206 4281924 579 665 0 True 301 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 346 506 0,0108522743519429 0,0526925920890576 0,0109864957656214 0,0545510032806897 0,00180736138062542 0,0123116040371546 411787 2296384 579 665 0 True 344 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 390 506 0,0110627381669118 0,0546481562110816 0,0110780498970016 0,0546578164339666 0,00181185164046049 0,0104673417240643 419773 2381609 579 665 0 True 388 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 435 506 0,0110071310232123 0,053702119799384 0,0110475318532082 0,0546730754558633 0,00200778125081313 0,00756139849674807 417663 2340380 579 665 0 True 432 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 479 506 0,0107766117407764 0,0564651730034631 0,0108339055466545 0,0580605783169299 0,00188340489863119 0,0128949741697126 408916 2460796 579 665 0 True 475 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 523 506 0,0105372111278064 0,0664352572894814 0,0104829480430304 0,0671396963454643 0,00179977322036572 0,0158514395469295 399832 2895300 579 665 0 True 519 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 567 506 0,0104141902051574 0,0423394489886882 0,0104676890211337 0,0424505989166094 0,00178350308245567 0,00753094458892985 395164 1845186 579 665 0 True 563 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 611 506 0,0104007232618254 0,0405968457421879 0,0103761348897536 0,0406805523765927 0,00178007896280447 0,00683688087418901 394653 1769242 579 665 0 True 607 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 655 506 0,0104646583000316 0,0585548329509973 0,0105287251087205 0,0592813000686656 0,00196444723010451 0,0121633113822576 397079 2551865 579 665 0 True 650 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 259 551 0,0102481330428585 0,0409861687865808 0,0102693217364767 0,0421454184786755 0,00143084338696548 0,00905365834361201 388863 1786209 579 665 0 True 257 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 303 550 0,0102627332123417 0,0483522608306071 0,0102082856488899 0,0493781948577096 0,00151631025584351 0,0104841832144712 389417 2107229 579 665 0 True 301 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 346 550 0,0105941623304295 0,047087115821139 0,010605020218204 0,0488441290913252 0,00155495441466847 0,0108056482288522 401993 2052093 579 665 0 True 344 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 391 550 0,0105282507349828 0,0466886373636082 0,0104676890211337 0,0480048828870069 0,00160023490587475 0,00797324000642994 399492 2034727 579 665 0 True 388 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 435 550 0,0107692325937451 0,0829989140853966 0,0106660563057908 0,0800335698481727 0,00200440182269308 0,0206065330899864 408636 3617157 579 665 0 True 432 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 479 551 0,0108542772632799 0,0581131244224087 0,0107728694590677 0,0579385061417563 0,00212014878488889 0,0119775332231613 411863 2532615 579 665 0 True 475 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 523 550 0,010527038446542 0,052553103977614 0,0105287251087205 0,0524452582589456 0,001949017452475 0,00836717168414829 399446 2290305 579 665 0 True 519 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 563 548 0,0111002927544814 0,031652649591477 0,0107118333714809 0,0358129243915465 0,00273773978818616 0,0111229479259472 421198 1379447 579 665 0 False 563 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 611 550 0,0100467613911959 0,0445804830226172 0,0101472495613031 0,045288776989395 0,00165109760117872 0,00733419337321987 381222 1942852 579 665 0 True 606 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 655 550 0,0100382226639169 0,0483706863863711 0,0101167315175097 0,0473182269016556 0,00189391778235982 0,00814582986415223 380898 2108032 579 665 0 True 650 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 257 590 0,00981363305320246 0,00978165257501731 0,0098268101014725 0,00971999694819562 0,00136243121597724 0,00124749988792513 372376 426292 579 665 0 False 257 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 300 590 0,00984828869015265 0,00974528332733872 0,0097962920576791 0,00971999694819562 0,00143740745086087 0,00145395651115948 373691 424707 579 665 0 False 300 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 347 594 0,0103838039318467 0,071560751271633 0,0103913939116503 0,0704356450751507 0,00144991410703413 0,0132201299760587 394011 3118673 579 665 0 True 344 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 391 594 0,0103893382921201 0,0728485438820214 0,0103150988021668 0,0709544518196384 0,00149300359108438 0,0208913378022069 394221 3174796 579 665 0 True 388 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 432 591 0,0105513369235519 0,0100374763872373 0,0104371709773404 0,0101167315175097 0,00206162131075017 0,00194530119432016 400368 437441 579 665 0 False 432 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 475 591 0,0101293024215593 0,0099968621485047 0,0101472495613031 0,0100404364080262 0,00199202734498798 0,00195113166040305 384354 435671 579 665 0 False 475 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 519 591 0,0101773459395519 0,0099045278566065 0,010101472495613 0,00988784618905928 0,00240257422402278 0,00208976443783684 386177 431647 579 665 0 False 519 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 563 591 0,00970990332922078 0,00995684450310946 0,00971999694819562 0,00985732814526589 0,00196539781602607 0,00191979208887232 368440 433927 579 665 0 False 563 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 606 591 0,00988033527154536 0,00973225005750816 0,00976577401388571 0,00978103303578241 0,0017065142512653 0,00154309156944704 374907 424139 579 665 0 False 606 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 650 591 0,0100050165022764 0,00973553132086338 0,00999465934233616 0,00970473792629892 0,00162143316920777 0,00158300610309943 379638 424282 579 665 0 False 650 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 258 638 0,00981595221369799 0,0413390307997047 0,0098115510795758 0,0418554970626383 0,00136873466406801 0,00823379547227436 372464 1801587 579 665 0 True 257 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 300 633 0,00968036038699937 0,00970003401729318 0,00961318379491875 0,00967421988250553 0,00150156743035748 0,00132100892944865 367319 422735 579 665 0 False 300 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 344 633 0,00974068491397957 0,00973734404677292 0,00970473792629892 0,00970473792629892 0,00143536719437813 0,00131585942803581 369608 424361 579 665 0 False 344 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 388 633 0,00981637387924263 0,00976063413282577 0,00975051499198901 0,00975051499198901 0,00144725746437718 0,001220919148994 372480 425376 579 665 0 False 388 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 431 633 0,00973955168782835 0,00980175318130529 0,00973525597009232 0,00976577401388571 0,00163614959990856 0,00168039092370471 369565 427168 579 665 0 False 431 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 475 634 0,00987184925245946 0,00980269396310644 0,0098115510795758 0,00988784618905928 0,00172906248207962 0,00187713977519336 374585 427209 579 665 0 False 475 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 519 634 0,00970276136905842 0,0097037512527026 0,00975051499198901 0,00968947890440223 0,00193370887157502 0,00185317987459522 368169 422897 579 665 0 False 519 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 563 634 0,00991691475754297 0,00979863253923318 0,0098115510795758 0,00990310521095598 0,00200227873015626 0,0016506999484298 376295 427032 579 665 0 False 563 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 606 634 0,00970207616254838 0,00976669184978927 0,00971999694819562 0,00971999694819562 0,00133274134978586 0,00136933320059285 368143 425640 579 665 0 False 606 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 654 637 0,00996321890516386 0,0419245412684836 0,00999465934233616 0,0419470511940185 0,0014938902093674 0,00807319197688763 378052 1827104 579 665 0 True 650 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H4_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H4_2.csv new file mode 100755 index 0000000..35ea4df --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H4_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 257 247 0,0103620354481046 0,688970331528065 0,00859082932784009 0,72295719844358 0,00616511367878406 0,223091153907684 393185 30025861 579 665 8 True 258 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 301 248 0,00731326178986746 0,00694517249865336 0,00704966811627375 0,00692759594110018 0,00213089187439004 0,00119437368310506 277500 302676 579 665 0 False 301 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 346 247 0,00645050773143542 0,00636936814455457 0,00645456626230259 0,00630197604333562 0,00113772043908328 0,00112582429352747 244763 277582 579 665 0 True 345 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 390 247 0,00640625920334465 0,00636234669989233 0,00642404821850919 0,0063782711528191 0,00127621212234538 0,0011597562712572 243084 277276 579 665 0 True 389 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 435 247 0,00623303372678682 0,00621728273533456 0,00616464484626535 0,00621042191195544 0,00149120906711475 0,00158206987150627 236511 270954 579 665 0 True 432 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 479 247 0,00624671150289111 0,00655245346141733 0,00624093995574884 0,00656137941557946 0,00140854351889138 0,00153050638784016 237030 285561 579 665 0 True 476 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 522 247 0,00640080390536086 0,00651177038499201 0,00653086137178607 0,00643930724040589 0,00143019329424476 0,00156473067650186 242877 283788 579 665 0 True 520 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 566 248 0,00665467291733128 0,00661321419823305 0,00657663843747616 0,00659189745937285 0,00152961130023677 0,00137063478661311 252510 288209 579 665 0 True 563 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 607 248 0,00694380371047231 0,00702507011405832 0,00689707789730678 0,00692759594110018 0,0018401658520089 0,00190827506890756 263481 306158 579 665 0 False 607 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 652 247 0,00890605067655578 0,707119595739176 0,00863660639353018 0,70785076676585 0,00235421980004277 0,182052803808088 337938 30816820 579 665 7 True 651 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 257 290 0,00734976221357544 0,00750971041703595 0,00718699931334401 0,00753795681696803 0,00182325814288888 0,00163169782155312 278885 327279 579 665 0 False 257 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 301 290 0,00669301812779708 0,00640087286194429 0,00657663843747616 0,0063782711528191 0,00143134129955738 0,00129931037003845 253965 278955 579 665 0 False 301 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 346 292 0,00618609708084897 0,00624261500627283 0,00611886778057527 0,00628671702143893 0,00129710965843001 0,0013848272757977 234730 272058 579 665 0 True 345 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 391 291 0,0063755039726824 0,00630617514259441 0,00630197604333562 0,00625619897764553 0,00130381189928208 0,00118203882804807 241917 274828 579 665 0 True 389 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 434 291 0,00627093091761143 0,0064169349902566 0,00630197604333562 0,00631723506523232 0,00158047638887331 0,00158452154555852 237949 279655 579 665 0 True 432 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 476 291 0,00641574667809907 0,00635615130754329 0,00648508430609598 0,00630197604333562 0,00161691716895445 0,00171234895042644 243444 277006 579 665 0 False 476 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 523 292 0,00628445056913648 0,00651911307222049 0,00627145799954223 0,00656137941557946 0,0015091458626051 0,00158381188573458 238462 284108 579 665 0 True 520 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 567 292 0,00646307863548503 0,00662051099366636 0,00642404821850919 0,00665293354695964 0,00162146349642362 0,00164360466986906 245240 288527 579 665 0 True 563 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 607 291 0,00680997760824187 0,00676864970850105 0,00672922865644312 0,00671396963454643 0,00188481555299498 0,00181843376517559 258403 294983 579 665 0 False 607 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 651 291 0,00699730252644864 0,00734966278135256 0,00698863202868696 0,00730907148851759 0,00180426153516432 0,00185018802097992 265511 320304 579 665 0 False 651 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 258 330 0,0061269848423096 0,00606797377972283 0,00616464484626535 0,00607309071488518 0,00136278210907044 0,00137234538128597 232487 264447 579 665 0 True 257 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 303 330 0,00616762285917438 0,00609931787582942 0,00619516289005875 0,00604257267109178 0,00127961555465848 0,00122344159883197 234029 265813 579 665 0 True 301 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 347 330 0,00613515461223702 0,00624392292243541 0,00607309071488518 0,00621042191195544 0,00121768963236275 0,00122488858304876 232797 272115 579 665 0 True 345 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 391 330 0,00648729805020534 0,00639988618834796 0,00650034332799268 0,00642404821850919 0,0013037727054143 0,00123749889060893 246159 278912 579 665 0 True 388 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 435 329 0,00634875456469423 0,00639449390241454 0,00628671702143893 0,0063782711528191 0,00152412825336261 0,00153167356652795 240902 278677 579 665 0 True 432 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 480 330 0,00641303220615545 0,00643611776064102 0,00634775310902571 0,00646982528419928 0,00145433191445916 0,00145374314911167 243341 280491 579 665 0 True 476 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 520 334 0,00634914987614234 0,00630654227695584 0,0063782711528191 0,0063935301747158 0,00159915882120682 0,00163170996552275 240917 274844 579 665 0 False 520 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 567 330 0,00625704230873481 0,00640284620913694 0,00634775310902571 0,00646982528419928 0,00174839350627245 0,00143452674765103 237422 279041 579 665 0 True 563 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 611 330 0,00651602401543401 0,00643386906267729 0,00651560234988937 0,00646982528419928 0,00198137095627226 0,00201939033721315 247249 280393 579 665 0 True 607 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 655 330 0,00629056471953377 0,00665839467058583 0,00633249408712902 0,00660715648126955 0,0018987836155063 0,00170565262957331 238694 290178 579 665 0 True 651 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 259 375 0,00629246221448466 0,00601545062014157 0,00611886778057527 0,00602731364919509 0,00206025069859041 0,00144444691159681 238766 262158 579 665 0 True 257 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 303 375 0,00603332238320622 0,00627668966419253 0,00602731364919509 0,00630197604333562 0,00128697790457003 0,00124228513270446 228933 273543 579 665 0 True 301 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 347 375 0,0062859791067358 0,00630415590360658 0,00631723506523232 0,00633249408712902 0,00138763780858393 0,00133908662270608 238520 274740 579 665 0 True 345 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 391 374 0,00657421386059447 0,00653054012921982 0,00656137941557946 0,00653086137178607 0,00141063114143886 0,00129096916563701 249457 284606 579 665 0 True 388 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 435 373 0,00652176920847975 0,00657900186492783 0,00651560234988937 0,00657663843747616 0,0015011504151111 0,00164624880599295 247467 286718 579 665 0 True 432 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 479 374 0,00637929896258417 0,00670318506267959 0,0064087891966125 0,00669871061264973 0,00157880574602978 0,00175025842032463 242061 292130 579 665 0 True 476 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 523 375 0,00656780981513524 0,00635576122728428 0,00650034332799268 0,00634775310902571 0,00158095185014276 0,00169263051848668 249214 276989 579 665 0 True 519 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 567 374 0,00645828218991474 0,00642450713646097 0,0063935301747158 0,00642404821850919 0,00180023341449068 0,00160000680666627 245058 279985 579 665 0 True 563 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 611 374 0,00618066813696171 0,00628231140910183 0,00625619897764553 0,00631723506523232 0,00198261571975379 0,00195055270457852 234524 273788 579 665 0 True 607 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 655 374 0,005990417914039 0,00612249323239433 0,00604257267109178 0,00604257267109178 0,00187271579568934 0,00184959420634928 227305 266823 579 665 0 True 651 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 259 419 0,00605443201453481 0,00607400855078874 0,00590524147402152 0,00610360875867857 0,00147674648434879 0,00149589818541239 229734 264710 579 665 0 True 257 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 302 418 0,0060262067771404 0,00604908930600706 0,00593575951781491 0,00601205462729839 0,00137493485654944 0,00130153496395442 228663 263624 579 665 0 True 301 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 348 418 0,00626310375093903 0,0062290998725929 0,00628671702143893 0,00616464484626535 0,00137714486824205 0,00120532397397026 237652 271469 579 665 0 True 345 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 391 419 0,00625132346978562 0,00652553792354542 0,00631723506523232 0,00653086137178607 0,00133855108574073 0,00140845883400815 237205 284388 579 665 0 True 388 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 436 418 0,00664982376356791 0,00669159738439713 0,00662241550316625 0,00668345159075303 0,00163665839473433 0,00147587550949122 252326 291625 579 665 0 True 432 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 479 419 0,00652071504461815 0,00662432001266614 0,00651560234988937 0,00662241550316625 0,00167928512017224 0,00154624065539883 247427 288693 579 665 0 True 476 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 523 418 0,00621803824585552 0,00637749099230108 0,00624093995574884 0,00643930724040589 0,00159084410812012 0,00157577335922253 235942 277936 579 665 0 True 519 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 563 420 0,0062945968963044 0,00628745129016177 0,0063935301747158 0,00634775310902571 0,00199640848989167 0,00157217056164065 238847 274012 579 665 0 False 563 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 612 418 0,00567464312929596 0,00596595631904205 0,00573739223315786 0,00601205462729839 0,00182011344810004 0,0016984932196874 215323 260001 579 665 0 True 607 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 656 418 0,0057489353274424 0,00599909019516059 0,00579842832074464 0,00602731364919509 0,00170258759186531 0,00182800116975951 218142 261445 579 665 0 True 650 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 258 463 0,00612050173456075 0,00620617692090148 0,00601205462729839 0,00627145799954223 0,00147051001713931 0,00137643130531779 232241 270470 579 665 0 True 257 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 302 463 0,00618351437938804 0,00608070875288473 0,00617990386816205 0,00611886778057527 0,00153648966293602 0,00145909222528491 234632 265002 579 665 0 True 301 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 346 462 0,0061852010415666 0,00620062401368493 0,00621042191195544 0,00622568093385214 0,00143369651874245 0,0014514837843226 234696 270228 579 665 0 True 344 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 390 462 0,00639020955855175 0,00643292828087614 0,00634775310902571 0,00646982528419928 0,00142795986737019 0,00143377768849037 242475 280352 579 665 0 True 388 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 435 462 0,00632023943223789 0,00634389819823076 0,00636301213092241 0,00631723506523232 0,00175712786892382 0,00201828392658953 239820 276472 579 665 0 True 432 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 479 462 0,00641158273084574 0,00641847236539506 0,0064087891966125 0,0063935301747158 0,00183989669011204 0,00189765115488438 243286 279722 579 665 0 True 476 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 523 462 0,0061919740443774 0,00604374291186882 0,00610360875867857 0,00601205462729839 0,0017399036217479 0,00166776944574566 234953 263391 579 665 0 True 519 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 567 463 0,00580501684487966 0,00581657852573755 0,00579842832074464 0,00590524147402152 0,00169971749269884 0,00183014965125752 220270 253491 579 665 0 True 563 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 611 461 0,0056159262022047 0,00572596517615852 0,0055542839703975 0,00575265125505455 0,00177217200385542 0,00183030546311553 213095 249542 579 665 0 True 607 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 655 462 0,0057413717017354 0,00570269803600326 0,00572213321126116 0,00576791027695125 0,00174294927197298 0,00169757651183353 217855 248528 579 665 0 True 650 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 258 507 0,00616583078060966 0,00617951378790304 0,00605783169298848 0,00628671702143893 0,00150856195702541 0,00144994803610358 233961 269308 579 665 0 True 257 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 302 507 0,00607108780354813 0,00604716185060959 0,00614938582436866 0,00602731364919509 0,00142219584740654 0,00143082077527351 230366 263540 579 665 0 True 301 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 346 506 0,00610374052916127 0,00598665351866735 0,00607309071488518 0,00592050049591821 0,00153468615330676 0,00156463682193689 231605 260903 579 665 0 True 344 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 390 506 0,006428528414921 0,00619993563675726 0,00636301213092241 0,00621042191195544 0,00184189454897967 0,00152777330623944 243929 270198 579 665 0 True 388 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 435 506 0,00646558227465633 0,00630805670619671 0,00643930724040589 0,00631723506523232 0,00179739955967691 0,00178249398552998 245335 274910 579 665 0 True 432 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 479 506 0,00633568293281036 0,0061545257054286 0,00645456626230259 0,00610360875867857 0,00167409794589652 0,00155635977967602 240406 268219 579 665 0 True 475 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 523 506 0,00594290147797727 0,00606207668404245 0,00601205462729839 0,00605783169298848 0,00150956961007761 0,00156875422125395 225502 264190 579 665 0 True 519 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 567 506 0,00597315598080526 0,00607836827133065 0,00604257267109178 0,00604257267109178 0,00163647452162037 0,0016362917848339 226650 264900 579 665 0 True 563 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 611 506 0,00587195625009142 0,00593541532935107 0,00588998245212482 0,00608834973678187 0,00166938776593558 0,00170943599070487 222810 258670 579 665 0 True 607 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 655 506 0,00589630743529443 0,00599892957387747 0,00588998245212482 0,00611886778057527 0,00176690813346863 0,00193037507794289 223734 261438 579 665 0 True 650 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 259 551 0,00591723258794724 0,00595634198795226 0,00588998245212482 0,00599679560540169 0,00129892635146082 0,0013657161489997 224528 259582 579 665 0 True 257 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 303 550 0,00630160708598406 0,00611657319081636 0,00625619897764553 0,00605783169298848 0,00148779395086671 0,00132002326339005 239113 266565 579 665 0 True 301 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 346 550 0,00619706038500963 0,00631808406344311 0,00616464484626535 0,00633249408712902 0,00136034176057608 0,00129342097062606 235146 275347 579 665 0 True 344 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 391 550 0,00607772903587623 0,00624468013705585 0,00610360875867857 0,00622568093385214 0,00147357529149416 0,00139527368279116 230618 272148 579 665 0 True 388 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 435 550 0,00620794462688068 0,00606705594381926 0,00628671702143893 0,00607309071488518 0,00177138404343735 0,00185705361596388 235559 264407 579 665 0 True 432 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 479 551 0,00619687590633385 0,00623111911158074 0,00617990386816205 0,00624093995574884 0,00173283017844446 0,00202222994716472 235139 271557 579 665 0 True 475 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 523 550 0,00603614227153601 0,00613736217403201 0,00607309071488518 0,00614938582436866 0,00180112007535793 0,00185093214876584 229040 267471 579 665 0 True 519 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 563 548 0,00594508886799009 0,00612604984652063 0,00592050049591821 0,00599679560540169 0,00169584974085254 0,0017475146269982 225585 266978 579 665 0 False 563 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 611 550 0,00590084033989932 0,00618873803873382 0,00599679560540169 0,00617990386816205 0,00158490857951902 0,00146509364380826 223906 269710 579 665 0 True 606 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 655 550 0,00597421014466686 0,00595280831972355 0,0059662775616083 0,00590524147402152 0,00170820770184115 0,00167132956686204 226690 259428 579 665 0 True 650 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 257 590 0,00659160756431091 0,00651138030473299 0,00656137941557946 0,00646982528419928 0,00134630055109579 0,00125554106682967 250117 283771 579 665 0 False 257 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 300 590 0,00626099542321582 0,00616838502757236 0,00621042191195544 0,00613412680247196 0,0014223376106843 0,00134952770586588 237572 268823 579 665 0 False 300 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 347 594 0,00618636062181437 0,00614133181431491 0,00622568093385214 0,00617990386816205 0,00126351957542057 0,00142784128705969 234740 267644 579 665 0 True 344 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 391 594 0,00599070780910094 0,00607990564646911 0,005981536583505 0,00605783169298848 0,00129950197222222 0,0011574369529932 227316 264967 579 665 0 True 388 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 432 591 0,00595810779168088 0,00604066816159189 0,0059510185397116 0,00611886778057527 0,00166288942104712 0,00180834419445248 226079 263257 579 665 0 False 432 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 475 591 0,00606631771207438 0,00605957558120524 0,00611886778057527 0,00607309071488518 0,00186199366516173 0,00177129460551289 230185 264081 579 665 0 False 475 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 519 591 0,00678293830519177 0,00605432097065736 0,00613412680247196 0,00611886778057527 0,00453739337674641 0,00190637269884058 257377 263852 579 665 0 False 519 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 563 591 0,00612108152468463 0,0061373851199296 0,00602731364919509 0,00602731364919509 0,00237726208928465 0,00165371271228943 232263 267472 579 665 0 False 563 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 606 591 0,005972655252971 0,00603213228768878 0,0059510185397116 0,00607309071488518 0,00153100540907019 0,00148171518753686 226631 262885 579 665 0 False 606 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 650 591 0,00611183123679907 0,0060910114609022 0,00601205462729839 0,00608834973678187 0,00154892224407876 0,00149018062892185 231912 265451 579 665 0 False 650 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 258 638 0,00903961323782082 0,712080659419205 0,00807202258335241 0,719066147859922 0,00383642898090406 0,197507817712392 343006 31033027 579 665 10 True 257 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 300 633 0,0075320798534396 0,00641794460975051 0,00665293354695964 0,0063935301747158 0,00457441222457301 0,00131422078760002 285803 279699 579 665 0 False 300 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 344 633 0,00594132023218486 0,00597848477912566 0,00592050049591821 0,00599679560540169 0,00125343074819669 0,00131928267721848 225442 260547 579 665 0 False 344 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 388 633 0,00586025503122763 0,00592325400362889 0,00587472343022812 0,00588998245212482 0,00130477362012252 0,0012436581597628 222366 258140 579 665 0 False 388 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 431 633 0,00595486623780645 0,00593803116167622 0,00599679560540169 0,00584420538643473 0,00156355863711317 0,0015967576738684 225956 258784 579 665 0 False 431 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 475 634 0,00572637622080411 0,00598706654482395 0,00579842832074464 0,00602731364919509 0,00174027483109466 0,00168766527593472 217286 260921 579 665 0 False 475 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 519 634 0,00594951635620882 0,0059123776481717 0,00592050049591821 0,00582894636453803 0,00185817704109429 0,00169088040395321 225753 257666 579 665 0 False 519 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 563 634 0,00605177025078427 0,00577518412648697 0,00593575951781491 0,00575265125505455 0,00198271805474508 0,00157066784999944 229633 251687 579 665 0 False 563 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 606 634 0,00611172582041291 0,0060738708754032 0,00602731364919509 0,00604257267109178 0,00141622107382447 0,00123533716650013 231908 264704 579 665 0 False 606 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 654 637 0,00846699142819833 0,728208894862471 0,00778210116731518 0,72826733806363 0,00308604779226175 0,194144848103575 321278 31735908 579 665 12 True 650 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H4_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H4_3.csv new file mode 100755 index 0000000..dc7d23b --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H4_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 257 247 0,00117536635159027 0,0694240292881437 0,000946059357595178 0,0715190356298161 0,0009720739649956 0,0239122456475464 44599 3025553 579 665 0 True 258 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 301 248 0,000897541465864922 0,000895555437001751 0,000778210116731518 0,000778210116731518 0,000697133591679805 0,000641845793266667 34057 39029 579 665 0 False 301 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 346 247 0,000874956005130088 0,00081597906416304 0,000778210116731518 0,000701915007248035 0,000612231775654377 0,000615910308107243 33200 35561 579 665 0 True 345 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 390 247 0,00075393799381812 0,000816759224681066 0,000625619897764553 0,000717174029144732 0,000598352433916281 0,000585214998954558 28608 35595 579 665 0 True 389 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 435 247 0,000860303127453813 0,000782225648809596 0,00064087891966125 0,000534065766384375 0,000736181227349386 0,000766049600318313 32644 34090 579 665 0 True 432 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 479 247 0,00090062489516011 0,000782065027526472 0,000732433051041428 0,000625619897764553 0,000765063011173227 0,000702871986429414 34174 34083 579 665 0 True 476 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 522 247 0,000870291330042497 0,000852233582353687 0,000671396963454643 0,000595101853971161 0,000792027808554161 0,000834203244176689 33023 37141 579 665 0 True 520 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 566 248 0,000987646121935398 0,000895165356742738 0,000823987182421607 0,000747692072938125 0,000853448370299023 0,000720116107691117 37476 39012 579 665 0 True 563 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 607 248 0,000968065028206131 0,00099504884894773 0,000579842832074464 0,000534065766384375 0,00100972638245733 0,00106332873445193 36733 43365 579 665 0 False 607 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 652 247 0,00107930566970174 0,0714797522531437 0,000778210116731518 0,071625848783093 0,000923404008590895 0,0196806282837487 40954 3115143 579 665 0 True 651 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 257 290 0,000818979904078995 0,000832224759656064 0,00064087891966125 0,000671396963454643 0,00070983205995674 0,000681107223504246 31076 36269 579 665 0 False 257 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 301 290 0,000905394986633861 0,000914669369693403 0,00080872816052491 0,000793469138628214 0,000659023803524088 0,000668820470070713 34355 39862 579 665 0 False 301 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 346 292 0,000765006714364946 0,00080732846077198 0,000656137941557946 0,000656137941557946 0,000565810611046323 0,000653149879838478 29028 35184 579 665 0 True 345 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 391 291 0,000793390076338594 0,000717426434018211 0,000671396963454643 0,000579842832074464 0,000631044601539131 0,000590505460739801 30105 31266 579 665 0 True 389 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 434 291 0,000797448607205764 0,000797369941218347 0,000534065766384375 0,000503547722590982 0,000803869038487138 0,000824348403687174 30259 34750 579 665 0 True 432 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 476 291 0,000829969562336201 0,000744364917787717 0,000595101853971161 0,000396734569314107 0,000773526958897999 0,000838234386083047 31493 32440 579 665 0 False 476 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 523 292 0,000841433594331128 0,000884793811032502 0,000610360875867857 0,000686655985351339 0,000793949221262426 0,00078889187580346 31928 38560 579 665 0 True 520 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 567 292 0,000840353076372986 0,000826075259102207 0,000549324788281071 0,000534065766384375 0,000868071767274113 0,000829817029184589 31887 36001 579 665 0 True 563 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 607 291 0,00101123303833875 0,00091845544279559 0,000625619897764553 0,000564583810177768 0,00105679262816313 0,000978096519276961 38371 40027 579 665 0 False 607 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 651 291 0,000916700894049548 0,000961685513853299 0,000595101853971161 0,000534065766384375 0,000921191035207512 0,00102655019917609 34784 41911 579 665 0 False 651 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 258 330 0,000830549352460082 0,000736402691324328 0,00064087891966125 0,000564583810177768 0,000728701555846415 0,000654243770184865 31515 32093 579 665 0 True 257 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 303 330 0,000781557086992106 0,000863247613196415 0,000656137941557946 0,000747692072938125 0,000619098345808838 0,000624639090845811 29656 37621 579 665 0 True 301 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 347 330 0,000767194104377771 0,000825363936276948 0,000625619897764553 0,000701915007248035 0,000613058919188708 0,000611798059829167 29111 35970 579 665 0 True 345 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 391 330 0,000853899081994578 0,000838488989697866 0,000747692072938125 0,000686655985351339 0,000660169709077209 0,000668303971074097 32401 36542 579 665 0 True 388 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 435 329 0,000698014600960106 0,000827429067059959 0,000457770656900893 0,000473029678797589 0,000712246596127628 0,000906785389051985 26486 36060 579 665 0 True 432 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 480 330 0,000781478024702485 0,000792551302724653 0,000503547722590982 0,000595101853971161 0,000779571702090465 0,000743515162219581 29653 34540 579 665 0 True 476 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 520 334 0,000865521238568746 0,000801293689706069 0,000671396963454643 0,000549324788281071 0,000772515198573688 0,000809699777524135 32842 34921 579 665 0 False 520 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 567 330 0,000861884373246217 0,000857740597775051 0,000610360875867857 0,000595101853971161 0,000856815755441044 0,000837236679878024 32704 37381 579 665 0 True 563 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 611 330 0,000930431378346921 0,000942342122185757 0,000442511635004196 0,000488288700694286 0,00106410223407801 0,00113622199632445 35305 41068 579 665 0 True 607 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 655 330 0,000926399201576291 0,000925293320277118 0,000518806744487678 0,000595101853971161 0,000940267281451985 0,000890404218922814 35152 40325 579 665 0 True 651 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 259 375 0,000839061725642523 0,000757788267877292 0,000671396963454643 0,000595101853971161 0,000755572881732642 0,000675912257973485 31838 33025 579 665 0 True 257 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 303 375 0,000807146914732507 0,000827727363728617 0,00064087891966125 0,000686655985351339 0,000667771808534324 0,000666632617245906 30627 36073 579 665 0 True 301 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 347 375 0,000800532036500951 0,000764947387925066 0,000595101853971161 0,000625619897764553 0,000713893840033847 0,000677680709232381 30376 33337 579 665 0 True 345 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 391 374 0,000845992853032559 0,000824629667554099 0,000671396963454643 0,000686655985351339 0,000708048426106373 0,000703735055920103 32101 35938 579 665 0 True 388 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 435 373 0,000780423860840883 0,000881833790243519 0,000518806744487678 0,000610360875867857 0,000743736783057318 0,000832894302832692 29613 38431 579 665 0 True 432 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 479 374 0,000836241837312736 0,000834060431463185 0,000534065766384375 0,000442511635004196 0,00083413966906978 0,000885720312239508 31731 36349 579 665 0 True 476 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 523 375 0,000840168597697205 0,000853266147745193 0,000579842832074464 0,000549324788281071 0,000824512360615051 0,000867842441957496 31880 37186 579 665 0 True 519 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 567 374 0,000891717210529568 0,000793285571447502 0,000625619897764553 0,000457770656900893 0,000912922929922225 0,000853545447017544 33836 34572 579 665 0 True 563 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 611 374 0,000853530124643017 0,000907234898874561 0,000381475547417411 0,000473029678797589 0,00100675770384278 0,00102997457719491 32387 39538 579 665 0 True 607 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 655 374 0,000820561149871399 0,000895807841875231 0,000473029678797589 0,000534065766384375 0,000921056168066958 0,000910775248744697 31136 39040 579 665 0 True 651 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 259 419 0,000795340279482558 0,000840691795866411 0,000610360875867857 0,000656137941557946 0,000736874059277784 0,0007731958129036 30179 36638 579 665 0 True 257 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 302 418 0,000777235015159535 0,000737572932101368 0,000656137941557946 0,000610360875867857 0,000670081754519494 0,000681343485259822 29492 32144 579 665 0 True 301 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 348 418 0,000747665718841585 0,000802211525609629 0,000595101853971161 0,000671396963454643 0,000666475566459285 0,000633444684901008 28370 34961 579 665 0 True 345 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 391 419 0,000754570492135081 0,000764947387925066 0,000579842832074464 0,000579842832074464 0,000652867505405826 0,000720182569981978 28632 33337 579 665 0 True 388 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 436 418 0,000786880614493198 0,000840990092535068 0,000503547722590982 0,000610360875867857 0,000810327976198478 0,000765498726719241 29858 36651 579 665 0 True 432 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 479 419 0,000805618377133183 0,000772794884900509 0,000534065766384375 0,000534065766384375 0,00079563278725339 0,000741403090711042 30569 33679 579 665 0 True 476 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 523 418 0,000864836032058704 0,000793308517345091 0,000625619897764553 0,000534065766384375 0,000841913218907808 0,000825789635245625 32816 34573 579 665 0 True 519 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 563 420 0,000860988333963855 0,000842435684083177 0,000595101853971161 0,000549324788281071 0,000897082955621624 0,000853408434878442 32670 36714 579 665 0 False 563 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 612 418 0,000908214874963648 0,000855377170323382 0,000473029678797589 0,000503547722590982 0,00103893432978938 0,000889467931307196 34462 37278 579 665 0 True 607 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 656 418 0,000900308646001629 0,000904045419109688 0,000488288700694286 0,000549324788281071 0,000959784853495379 0,000957634981164703 34162 39399 579 665 0 True 650 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 258 463 0,000820376671195618 0,000784841481134743 0,000656137941557946 0,000595101853971161 0,000737431668327112 0,000711938487413324 31129 34204 579 665 0 True 257 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 302 463 0,000831313621259744 0,000745718725745469 0,000656137941557946 0,000610360875867857 0,00077953019555302 0,000731993332583882 31544 32499 579 665 0 True 301 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 346 462 0,000792862994407793 0,000811596397723538 0,000610360875867857 0,000686655985351339 0,000708806598471428 0,000748789978193998 30085 35370 579 665 0 True 344 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 390 462 0,000795709236834119 0,000759646885582003 0,000610360875867857 0,000610360875867857 0,000735486649243772 0,000709400553377493 30193 33106 579 665 0 True 388 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 435 462 0,000729982120063202 0,000817332872120792 0,000381475547417411 0,000289921416037232 0,000876076741476735 0,000988151976205847 27699 35620 579 665 0 True 432 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 479 462 0,000901626350828632 0,000757971835058004 0,000534065766384375 0,000274662394140536 0,000969651052649958 0,00092461167732944 34212 33033 579 665 0 True 476 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 523 462 0,000821852500601862 0,000777544685701436 0,000518806744487678 0,000473029678797589 0,000844090640430959 0,000840706115793264 31185 33886 579 665 0 True 519 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 567 463 0,000874033611751186 0,000931970576475522 0,000549324788281071 0,000564583810177768 0,000913859403951552 0,00100717420367365 33165 40616 579 665 0 True 563 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 611 461 0,000789436961857584 0,000877703528677496 0,000396734569314107 0,0004272526131075 0,0008974404015741 0,000957015860777084 29955 38251 579 665 0 True 607 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 655 462 0,000939576249846323 0,000883026976918148 0,000503547722590982 0,000473029678797589 0,000973639747725934 0,000969709208700201 35652 38483 579 665 0 True 650 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 258 507 0,00077942240517236 0,000786975449610522 0,000595101853971161 0,000610360875867857 0,000680332144038483 0,000689072668946477 29575 34297 579 665 0 True 257 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 302 507 0,000816555327197309 0,000819673353674872 0,000656137941557946 0,000701915007248035 0,000729593011568543 0,000750186171397552 30984 35722 579 665 0 True 301 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 346 506 0,000797053295757662 0,000742919326239609 0,000610360875867857 0,000610360875867857 0,000766650163557556 0,000698953462932955 30244 32377 579 665 0 True 344 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 390 506 0,000838350165035941 0,000786929557815344 0,000564583810177768 0,000579842832074464 0,000835744586563192 0,000726673659366464 31811 34295 579 665 0 True 388 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 435 506 0,000734989398405814 0,000832913136583734 0,000350957503624018 0,000335698481727321 0,000869517258875868 0,00101214227441003 27889 36299 579 665 0 True 432 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 479 506 0,000845940144839479 0,000807007218205734 0,000488288700694286 0,000534065766384375 0,000898933553977617 0,000815395154413397 32099 35170 579 665 0 True 475 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 523 506 0,000817688553348532 0,000803267036898724 0,000503547722590982 0,000534065766384375 0,000824801888783964 0,000813899095165047 31027 35007 579 665 0 True 519 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 567 506 0,000820640212161019 0,000839521555089371 0,000488288700694286 0,000534065766384375 0,000881088020352545 0,000835862745735972 31139 36587 579 665 0 True 563 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 611 506 0,000957734222362426 0,000908932895296148 0,000595101853971161 0,000610360875867857 0,000974630622375573 0,000906298569195199 36341 39612 579 665 0 True 607 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 655 506 0,000849049928231207 0,000884885594622858 0,000442511635004196 0,000442511635004196 0,000946202805418428 0,000998979870250783 32217 38564 579 665 0 True 650 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 259 551 0,000787381342327459 0,000838718448673756 0,000656137941557946 0,00064087891966125 0,000636599926819275 0,000724579349244323 29877 36552 579 665 0 True 257 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 303 550 0,000860355835646894 0,000758224239931484 0,000732433051041428 0,000610360875867857 0,000695806035418427 0,000667838791875208 32646 33044 579 665 0 True 301 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 346 550 0,00082533124134515 0,000821531971379582 0,000701915007248035 0,000686655985351339 0,000662394941257682 0,00068128162001325 31317 35803 579 665 0 True 344 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 391 550 0,000806962436056726 0,000809118240783924 0,000671396963454643 0,000671396963454643 0,000716706300833713 0,000677489762080494 30620 35262 579 665 0 True 388 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 435 550 0,000757970170588749 0,000825914637819084 0,000366216525520714 0,000442511635004196 0,000894809534569499 0,000947718776191276 28761 35994 579 665 0 True 432 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 479 551 0,000817899386120852 0,000787870339616494 0,000457770656900893 0,000381475547417411 0,000905986152944153 0,000951310584559417 31035 34336 579 665 0 True 475 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 523 550 0,000893957308735474 0,000849778371311662 0,000488288700694286 0,000457770656900893 0,00098378960545064 0,000940961661325174 33921 37034 579 665 0 True 519 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 563 548 0,000857931258765208 0,000886629482839624 0,000503547722590982 0,000549324788281071 0,000902252185158671 0,000906450261153836 32554 38640 579 665 0 False 563 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 611 550 0,000927163470375953 0,000872747214798268 0,000671396963454643 0,000595101853971161 0,000841364343467916 0,000861760685905584 35181 38035 579 665 0 True 606 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 655 550 0,000890135964737165 0,000886629482839624 0,000534065766384375 0,000534065766384375 0,000939531839645593 0,00093353171080353 33776 38640 579 665 0 True 650 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 257 590 0,000778341887214218 0,000857717651877462 0,00064087891966125 0,000747692072938125 0,000626136468028524 0,000625676847538342 29534 37380 579 665 0 False 257 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 300 590 0,000844965043267497 0,000820155217524241 0,000732433051041428 0,000701915007248035 0,000682133567627058 0,000701419765232559 32062 35743 579 665 0 False 300 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 347 594 0,000802429531451835 0,000766599492551475 0,000671396963454643 0,000564583810177768 0,00067333668160929 0,000740385799914479 30448 33409 579 665 0 True 344 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 391 594 0,000792889348504333 0,000727407899469434 0,00064087891966125 0,000595101853971161 0,000653377877158638 0,00059485818872615 30086 31701 579 665 0 True 388 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 432 591 0,00081257585861976 0,000755929650172582 0,000442511635004196 0,000305180437933928 0,000886595210112795 0,000925033620771922 30833 32944 579 665 0 False 432 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 475 591 0,000796526213826861 0,000830434979644121 0,000335698481727321 0,000457770656900893 0,000934386174567876 0,000934018719496088 30224 36191 579 665 0 False 475 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 519 591 0,000910692160038414 0,000813592690813782 0,000473029678797589 0,000320439459830625 0,0011043764625848 0,000976048501334445 34556 35457 579 665 0 False 519 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 563 591 0,000909769766659512 0,000909162354272039 0,000518806744487678 0,000595101853971161 0,000954324405256678 0,000931532958806141 34521 39622 579 665 0 False 563 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 606 591 0,000930457732443461 0,000879447416894261 0,000686655985351339 0,000671396963454643 0,000827710487922796 0,000737665672840806 35306 38327 579 665 0 False 606 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 650 591 0,000916516415373768 0,000938143022926967 0,000717174029144732 0,000732433051041428 0,000788665918248878 0,000772083519795005 34777 40885 579 665 0 False 650 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 258 638 0,000962214418774237 0,0720305226329729 0,000793469138628214 0,0717936980239567 0,000724513102328177 0,0218206186070465 36511 3139146 579 665 0 True 257 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 300 633 0,000949353619662686 0,000829815440409217 0,000778210116731518 0,000717174029144732 0,000752534424258966 0,000637426914133221 36023 36164 579 665 0 False 300 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 344 633 0,000847099725087242 0,000758935562756743 0,000686655985351339 0,000656137941557946 0,000679930166565675 0,00059814000403003 32143 33075 579 665 0 False 344 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 388 633 0,000748588112220487 0,000756250892738828 0,00064087891966125 0,000595101853971161 0,000596980504741766 0,000628183127650175 28405 32958 579 665 0 False 388 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 431 633 0,000794786843455217 0,000713456793735311 0,000579842832074464 0,0004272526131075 0,000766153691282431 0,000748207834807737 30158 31093 579 665 0 False 431 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 475 634 0,000750406544881751 0,000851132179269414 0,0004272526131075 0,000534065766384375 0,000827093229004943 0,00085191055272863 28474 37093 579 665 0 False 475 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 519 634 0,000830127686915441 0,000702098574428748 0,000457770656900893 0,000320439459830625 0,000932942109274426 0,000829263124906692 31499 30598 579 665 0 False 519 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 563 634 0,00084209244674463 0,000872448918129611 0,000564583810177768 0,000610360875867857 0,00086181495483696 0,000808256856253391 31953 38022 579 665 0 False 563 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 606 634 0,000823381038201185 0,000854436388522233 0,000671396963454643 0,000671396963454643 0,000697358169223089 0,000671903925012744 31243 37237 579 665 0 False 606 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 654 637 0,00109814884872788 0,0741557946135653 0,000961318379491875 0,0728770885786221 0,000821021493743755 0,0219966675658509 41669 3231767 579 665 0 True 650 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H5_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H5_1.csv new file mode 100755 index 0000000..daebf8e --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H5_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 269 276 0,0106475293759231 0,0426247353334125 0,0107881284809644 0,0434119172961013 0,00151078750198082 0,00864895921797338 404018 1857619 579 665 0 True 270 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 313 275 0,0102647624777753 0,0102858657286384 0,0103150988021668 0,0102235446707866 0,00138643239182455 0,00118296747376048 389494 448266 579 665 0 False 313 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 357 277 0,0106761499247656 0,0556026137671944 0,0106507972838941 0,0569314106965743 0,00172440574657233 0,00913050503171845 405104 2423205 579 665 0 True 357 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 402 277 0,0106452365695241 0,0744552615229995 0,0106355382619974 0,0733806363012131 0,00156911174132566 0,00851196056963349 403931 3244818 579 665 0 True 401 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 446 276 0,0106570959129672 0,067896566777438 0,0106660563057908 0,0673228046082246 0,00190944734475571 0,0111337027926683 404381 2958985 579 665 0 True 445 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 490 276 0,0104323745317701 0,0591680161722686 0,0104219119554437 0,0608072022583352 0,00165972892671155 0,0153112053082736 395854 2578588 579 665 0 True 489 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 533 275 0,0106280800526766 0,0683924046784391 0,0105439841306172 0,0687266346227207 0,00162985127811607 0,0188160312860495 403280 2980594 579 665 0 True 532 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 578 275 0,0105056125660549 0,0600148115768937 0,010452429999237 0,0590981918059052 0,00178584490884305 0,0152574936655886 398633 2615492 579 665 0 True 576 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 620 275 0,0102276032016538 0,0102601204315435 0,0101777676050965 0,01025406271458 0,00192345367116098 0,00183902811202005 388084 447144 579 665 0 False 620 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 666 274 0,0102360101584501 0,0425520197839529 0,0102998397802701 0,0426031891355764 0,00183934669738927 0,00827952575543611 388403 1854450 579 665 0 True 664 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 270 318 0,0103417164396722 0,0103681956091878 0,0103456168459602 0,010406652933547 0,00151272891498932 0,00145353239496075 392414 451854 579 665 0 False 270 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 313 318 0,010376108535657 0,0102834564093915 0,0103608758678569 0,0102845807583734 0,00141895130805678 0,00120698119699449 393719 448161 579 665 0 False 313 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 357 321 0,0109938222044596 0,087023303279944 0,0108644235904479 0,0868696116578927 0,00177121397338205 0,0177047325511278 417158 3792543 579 665 0 True 357 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 402 321 0,0108414428182649 0,0457332390256942 0,0108949416342412 0,0455329213397421 0,00164123207024514 0,00646892578944201 411376 1993090 579 665 0 True 401 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 446 321 0,0110985533841098 0,066526903204452 0,0109407186999313 0,0651865415426871 0,00231794435287652 0,0113564210424145 421132 2899294 579 665 0 True 445 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 490 320 0,0107796161077819 0,0380529946977767 0,0107881284809644 0,0391088731212329 0,00170948109199626 0,00665406583049394 409030 1658379 579 665 0 True 489 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 534 320 0,0106066014639964 0,039097537847824 0,0106202792401007 0,0405737392233158 0,0016714085468632 0,00703931118913556 402465 1703901 579 665 0 True 532 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 577 320 0,010776690803066 0,0458806205259085 0,0106660563057908 0,0472419317921721 0,00206888714520286 0,00838167558101826 408919 1999513 579 665 0 True 576 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 620 318 0,0103661203330683 0,0101490622872127 0,010406652933547 0,0102082856488899 0,00207394633610832 0,00202282729063258 393340 442304 579 665 0 False 620 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 664 318 0,0103290401192365 0,0101554871385376 0,0103456168459602 0,0101625085831998 0,00199593155487662 0,00186760143264723 391933 442584 579 665 0 False 664 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 269 360 0,0105080898511297 0,0511241940970531 0,010452429999237 0,0511940184634165 0,00174581877188918 0,0127123382645268 398727 2228032 579 665 0 True 270 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 314 359 0,0107621960499689 0,0589780241402316 0,0106813153276875 0,0593575951781491 0,00174998113402319 0,0160571823566176 408369 2570308 579 665 0 True 313 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 358 360 0,0108150623676283 0,0357144864908896 0,010605020218204 0,0365758754863813 0,00162808240116506 0,00587872686016879 410375 1556465 579 665 0 True 357 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 402 359 0,0106847150061412 0,0329186206532582 0,0106813153276875 0,0334172579537652 0,00167615080213359 0,00433895305566458 405429 1434619 579 665 0 True 401 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 447 359 0,0110321147067323 0,0638072406927137 0,0108033875028611 0,0624856946669718 0,00231089704358664 0,00955889436134264 418611 2780769 579 665 0 True 445 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 489 361 0,0109297290416741 0,0308976148313104 0,0109712367437247 0,0319829098954757 0,00175170592894794 0,00710321986897908 414726 1346542 579 665 0 False 489 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 532 361 0,0111789070244604 0,0256191405499329 0,011108567940795 0,0268101014724956 0,00181145162212342 0,0049715962076267 424181 1116502 579 665 0 False 532 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 578 357 0,0110103198688936 0,0464642264851876 0,0108033875028611 0,0474708171206226 0,00255086875852298 0,00815269439855545 417784 2024947 579 665 0 True 576 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 622 357 0,0106440242810833 0,0506045842461498 0,0106355382619974 0,0511635004196231 0,00192899212110079 0,0108725139258804 403885 2205387 579 665 0 True 620 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 666 357 0,0104507169829619 0,0579456423159065 0,0105592431525139 0,0585183489738308 0,00191523706642453 0,0150870746970815 396550 2525316 579 665 0 True 664 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 271 404 0,0105479108910017 0,0441097479335785 0,0106355382619974 0,045792324711986 0,00153302786208837 0,00887524246088175 400238 1922337 579 665 0 True 270 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 314 404 0,0104880870918558 0,0335438504707638 0,0104219119554437 0,032623788815137 0,00152142376586994 0,0064338981821652 397968 1461867 579 665 0 True 313 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 358 404 0,0110834261326958 0,0792592146422362 0,0108796826123445 0,0783855954833295 0,00177216451985649 0,0160540062606991 420558 3454178 579 665 0 True 357 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 402 403 0,0110021764530628 0,0621634883730269 0,0109712367437247 0,0625009536888685 0,00155983961068579 0,0133338767115277 417475 2709133 579 665 0 True 401 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 447 403 0,0109197935472785 0,0397106981231977 0,0110322728313115 0,0407873655298695 0,00163032992950898 0,00642517189430843 414349 1730623 579 665 0 True 445 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 490 401 0,0108330885696617 0,048756934680487 0,0109102006561379 0,0508278019378958 0,00168689740912108 0,00958821960135627 411059 2124865 579 665 0 True 489 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 534 401 0,0107029783950434 0,0389739971352047 0,0106202792401007 0,0397955291065843 0,0017081366631727 0,00610174244937892 406122 1698517 579 665 0 True 532 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 578 402 0,0106585453882769 0,0474841257412242 0,0106660563057908 0,0473029678797589 0,00190465771149228 0,00790751777770589 404436 2069395 579 665 0 True 576 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 622 401 0,0106702466071407 0,040838144801234 0,010605020218204 0,0404974441138323 0,0019508653217443 0,00867750569334448 404880 1779758 579 665 0 True 620 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 666 401 0,0107079066110964 0,0823515873685128 0,010757610437171 0,0800335698481727 0,00208677308999713 0,0173296367392512 406309 3588946 579 665 0 True 664 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 270 448 0,0105965605532147 0,0454736061944745 0,0105134660868238 0,0453192950331884 0,0015841949579393 0,00817705202388948 402084 1981775 579 665 0 True 270 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 313 447 0,0109781151629217 0,055246149248149 0,0108491645685512 0,0554970626382849 0,00183257249357478 0,00828698423217555 416562 2407670 579 665 0 True 313 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 357 448 0,0109271199861167 0,0332940155378146 0,0107728694590677 0,034332799267567 0,00169283010963294 0,00501005830720224 414627 1450979 579 665 0 True 357 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 402 447 0,0109819892151131 0,0528817351228839 0,0110322728313115 0,0521400778210117 0,00167233732412602 0,0108139833274079 416709 2304627 579 665 0 True 401 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 447 448 0,0112410763381984 0,0866150728159378 0,0112306401159686 0,0856946669718471 0,00212106814196111 0,00977817804590799 426540 3774752 579 665 0 True 445 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 490 445 0,0110069465445365 0,0564449806135848 0,0110017547875181 0,0571908140688182 0,00183301884658629 0,0128116673024599 417656 2459916 579 665 0 True 489 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 534 445 0,0109253279075519 0,0497602211066692 0,0109864957656214 0,0499732967116808 0,00178474640224134 0,00895323587030619 414559 2168589 579 665 0 True 532 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 579 445 0,010813191226774 0,0293368348773054 0,0108339055466545 0,0296177615014878 0,00189343819099304 0,00384716503880259 410304 1278522 579 665 0 True 576 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 623 445 0,0106181182041844 0,0404000158326693 0,0105287251087205 0,0400244144350347 0,00180279686460983 0,00725255168966091 402902 1760664 579 665 0 True 620 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 666 444 0,0106511398871491 0,074494040089925 0,0106355382619974 0,0725719081406882 0,00203862967400398 0,0155392569272328 404155 3246508 579 665 0 True 664 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 272 492 0,0104689013095746 0,0525931675148044 0,0104676890211337 0,052674143587396 0,00158182626177491 0,0137142304447966 397240 2292051 579 665 0 True 270 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 315 492 0,0109044027548991 0,0527424076327234 0,0108644235904479 0,0530861371786069 0,00165816803316465 0,00745190488905313 413765 2298555 579 665 0 True 313 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 359 491 0,0110275290939343 0,0683370132816592 0,0109864957656214 0,06665140764477 0,00156940335664899 0,0149253984137971 418437 2978180 579 665 0 True 357 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 404 491 0,0111387170272368 0,0836759786855557 0,0111390859845884 0,0797131303883421 0,00170698276793225 0,0185331315479794 422656 3646664 579 665 0 True 401 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 447 490 0,0110910688206924 0,0931019239561481 0,0111390859845884 0,090775921263447 0,0019278357640766 0,0277697682366233 420848 4057454 579 665 0 True 445 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 492 490 0,0108401251134379 0,0430216305240097 0,0108339055466545 0,0439459830624857 0,00180087341466897 0,00512818235622264 411326 1874916 579 665 0 True 489 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 536 490 0,0108805259434338 0,0402271643861313 0,0108796826123445 0,0410467689021134 0,00177846146496214 0,00559402210676328 412859 1753131 579 665 0 True 532 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 579 489 0,0108091590500033 0,0899587490126093 0,0108033875028611 0,0878461890592813 0,00174939051238747 0,0141699607353994 410151 3920472 579 665 0 True 576 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 624 489 0,0106263406823049 0,0576591857304052 0,0106355382619974 0,0589761196307317 0,00194310601999282 0,0136496944846152 403214 2512832 579 665 0 True 620 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 668 489 0,0108540400764111 0,0679413571695318 0,0108949416342412 0,0666361486228733 0,00210867629649618 0,0118563461025799 411854 2960937 579 665 0 True 664 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 271 536 0,0101836709227215 0,0487078992973392 0,0101625085831998 0,0505836575875486 0,00167345064591464 0,0108343802987559 386417 2122728 579 665 0 True 270 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 315 535 0,0107624068827413 0,0952054432258261 0,0106202792401007 0,0887312123292897 0,00166379709854557 0,0228136655056157 408377 4149127 579 665 0 True 313 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 360 536 0,0107696806133863 0,0522375749398674 0,0107423514152743 0,0542305638208591 0,00166586800486611 0,0104173893073939 408653 2276554 579 665 0 True 357 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 403 535 0,0109103324266206 0,0556957282196106 0,0108796826123445 0,0555886167696651 0,00168432747983395 0,00727581317298195 413990 2427263 579 665 0 True 401 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 448 535 0,0109976435484579 0,0549472559861544 0,0110017547875181 0,0551766231784543 0,00202474838123559 0,00776374187707861 417303 2394644 579 665 0 True 445 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 492 534 0,0108818172941643 0,0586095818626447 0,0108796826123445 0,0585946440833143 0,0018441310108217 0,0117541357341346 412908 2554251 579 665 0 True 489 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 535 533 0,0106331136851157 0,0698929287053753 0,0105592431525139 0,0686350804913405 0,00179127844393694 0,016179707720607 403471 3045988 579 665 0 True 533 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 580 534 0,0107013707951545 0,0562714178442214 0,0107118333714809 0,0562142366674296 0,00176723791748992 0,0126375050475981 406061 2452352 579 665 0 True 576 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 624 534 0,0106166160206816 0,0412789813857142 0,0105439841306172 0,0405432211795224 0,00178398067902327 0,00661455438898517 402845 1798970 579 665 0 True 620 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 668 533 0,0105169448275671 0,0597307413647417 0,0105439841306172 0,0604715037766079 0,0020745209078155 0,0119684494771163 399063 2603112 579 665 0 True 664 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 271 580 0,0101420050960916 0,0433122862087698 0,0100862134737163 0,0443884946974899 0,00151041549441236 0,00823283228087839 384836 1887583 579 665 0 True 270 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 315 579 0,0103392918627906 0,050151219201586 0,01025406271458 0,0500343327992676 0,00149384224380205 0,00986476388204423 392322 2185629 579 665 0 True 313 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 359 579 0,0104677153752303 0,0508497382159909 0,0104982070649271 0,0506599526970321 0,00158791421883686 0,00969692126113774 397195 2216071 579 665 0 True 357 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 404 579 0,010791475451225 0,0503355894887138 0,0107728694590677 0,0500343327992676 0,00160787747427899 0,0068227234684748 409480 2193664 579 665 0 True 401 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 448 579 0,0108108193580854 0,0847964039189298 0,0107728694590677 0,0806897077897307 0,00200738769607227 0,019473461077088 410214 3695493 579 665 0 True 445 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 492 578 0,0105462505829197 0,0611305099553645 0,0105439841306172 0,0597543297474632 0,00197220273958339 0,0115956224111411 400175 2664115 579 665 0 True 489 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 536 577 0,010491565832599 0,054918022912626 0,0104982070649271 0,0545662623025864 0,0020000126295123 0,00787415807257053 398100 2393370 579 665 0 True 533 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 576 576 0,0107409546481577 0,034595093822907 0,0107270923933776 0,0378423743038071 0,00193538233040129 0,00980823676687271 407563 1507681 579 665 0 False 576 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 624 577 0,0103760821815605 0,0467580028120198 0,0104219119554437 0,0470435645075151 0,00158490314470708 0,00734232728099161 393718 2037750 579 665 0 True 620 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 668 577 0,0104642629885835 0,0498895441854809 0,0104829480430304 0,0492713817044327 0,00173983440937814 0,00684230056674216 397064 2174225 579 665 0 True 664 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 270 619 0,00968357558677725 0,0098719217361325 0,0097962920576791 0,00988784618905928 0,00132034779305463 0,00138844046406383 367441 430226 579 665 0 False 270 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 313 619 0,0098303679045054 0,0098318123071469 0,00976577401388571 0,00987258716716258 0,00136607856376217 0,00132871405569149 373011 428478 579 665 0 False 313 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 359 623 0,0106255500594087 0,0722184724801245 0,0104371709773404 0,0708934157320516 0,00189333750942306 0,0107229843475704 403184 3147337 579 665 0 True 357 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 404 623 0,0104170364475837 0,075385786507927 0,0103150988021668 0,0721141374837873 0,00157121157832163 0,0192800029186687 395272 3285371 579 665 0 True 401 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 445 619 0,0104563040514284 0,00995342556436869 0,0105134660868238 0,00994888227664607 0,00186990912652712 0,00193215441931829 396762 433778 579 665 0 False 445 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 489 619 0,0100866614933575 0,0100143010306724 0,0100099183642329 0,00999465934233616 0,00203449960398261 0,00198557028332888 382736 436431 579 665 0 False 489 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 533 619 0,0101444296729733 0,0100705643715606 0,0100556954299229 0,0100556954299229 0,00222921760572399 0,00205965668124377 384928 438883 579 665 0 False 533 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 576 619 0,0102726950608338 0,0100757730903133 0,0102693217364767 0,0100709544518196 0,00186302019507042 0,00169018058029601 389795 439110 579 665 0 False 576 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 620 619 0,00990985185967023 0,0100633593597177 0,00999465934233616 0,010101472495613 0,00142989329964968 0,00142427584673138 376027 438569 579 665 0 False 620 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 664 619 0,0100762779793207 0,010009574175769 0,0100709544518196 0,0100862134737163 0,0015769066512728 0,00146863616889577 382342 436225 579 665 0 False 664 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 273 667 0,00973285774730717 0,0419856461937632 0,00968947890440223 0,0417334248874647 0,00129842707705027 0,00782103527745635 369311 1829767 579 665 0 True 270 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 313 662 0,00988136308131042 0,00969505475751636 0,0098115510795758 0,00968947890440223 0,00140155362151724 0,00125349628141415 374946 422518 579 665 0 False 313 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 357 662 0,00983237081584245 0,00975120336891668 0,00984206912336919 0,0098115510795758 0,00127298107049263 0,00129422574882413 373087 424965 579 665 0 False 357 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 401 662 0,00977086035451794 0,0098301372566229 0,0098268101014725 0,00990310521095598 0,00143571146843074 0,00142741253900813 370753 428405 579 665 0 False 401 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 445 662 0,00979565955936214 0,00979709516409472 0,0098115510795758 0,0097962920576791 0,00153489839133773 0,00158955032257982 371694 426965 579 665 0 False 445 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 489 662 0,00997341794052486 0,00967277429095742 0,00990310521095598 0,00968947890440223 0,00157331300031884 0,00154776774158328 378439 421547 579 665 0 False 489 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 533 662 0,00976901556776014 0,00970466908860616 0,0097962920576791 0,00975051499198901 0,00172497317990165 0,00168612905631154 370683 422937 579 665 0 False 533 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 576 662 0,00976698630232655 0,00989865370682371 0,00964370183871214 0,00990310521095598 0,0015170837090324 0,00131659506461481 370606 431391 579 665 0 False 576 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 620 662 0,00983005165534692 0,00986515269634374 0,0097962920576791 0,00993362325474937 0,0013729694521802 0,00145942788557175 372999 429931 579 665 0 False 620 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 671 665 0,0102582793700264 0,041460781732312 0,0101930266269932 0,0423437857633326 0,00149309251286324 0,00901667932415475 389248 1806893 579 665 0 True 664 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H5_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H5_2.csv new file mode 100755 index 0000000..608d948 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H5_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 269 276 0,00994076521491173 0,660195510520407 0,00802624551766232 0,670511940184634 0,00661078502095325 0,188854350219597 377200 28771832 579 665 0 True 270 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 313 275 0,00695281681148902 0,00639075372110753 0,00660715648126955 0,0064087891966125 0,00232580919700565 0,00123512581172461 263823 278514 579 665 0 False 313 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 357 277 0,00604786984449634 0,00588771080826351 0,00602731364919509 0,00582894636453803 0,0012707195882848 0,00132583202660711 229485 256591 579 665 0 True 357 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 402 277 0,00608268360602576 0,00617866478969224 0,00604257267109178 0,00616464484626535 0,00129705750233169 0,00137259964920365 230806 269271 579 665 0 True 401 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 446 276 0,00617969303538973 0,00626246320768733 0,00619516289005875 0,00619516289005875 0,00159972248120473 0,00157079078929363 234487 272923 579 665 0 True 445 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 490 276 0,00613365242873424 0,00615021187668186 0,00610360875867857 0,00624093995574884 0,0016102137929076 0,00164327416918215 232740 268031 579 665 0 True 489 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 533 275 0,0061000773097422 0,00624490959603174 0,00613412680247196 0,00621042191195544 0,00141541198331167 0,00160034471203901 231466 272158 579 665 0 True 532 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 578 275 0,00634996685313508 0,00654476658572501 0,00630197604333562 0,00650034332799268 0,00164244363405795 0,00172094304640812 240948 285226 579 665 0 True 576 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 620 275 0,00692098106286862 0,00675033888222502 0,00698863202868696 0,00668345159075303 0,00184260704611023 0,00192156703852437 262615 294185 579 665 0 False 620 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 666 274 0,00858803579360684 0,673365790305473 0,00840772106507973 0,666025787747005 0,00242760466725762 0,183353285271851 325871 29345803 579 665 3 True 664 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 270 318 0,00633729053269931 0,00658964876140913 0,00630197604333562 0,00656137941557946 0,00157518527437841 0,00140409231620843 240467 287182 579 665 0 False 270 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 313 318 0,00615349706342891 0,00606349932969297 0,00617990386816205 0,00604257267109178 0,00127081843944705 0,00112473832178691 233493 264252 579 665 0 False 313 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 357 321 0,0061337578451204 0,00628940169145684 0,00621042191195544 0,00627145799954223 0,00122664490385145 0,00120990075134819 232744 274097 579 665 0 True 357 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 402 321 0,00614387781819179 0,00609576126170312 0,00613412680247196 0,00611886778057527 0,00131224578361276 0,00131762552934749 233128 265658 579 665 0 True 401 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 446 321 0,00630384718418997 0,00613688031018264 0,0063782711528191 0,00616464484626535 0,00164625853900057 0,001617875824362 239198 267450 579 665 0 True 445 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 490 320 0,00624568369312605 0,00632290270193681 0,00624093995574884 0,0063782711528191 0,0015742178221897 0,00155406821793429 236991 275557 579 665 0 True 489 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 534 320 0,00622676145181028 0,00611014833949144 0,00624093995574884 0,00614938582436866 0,00148515118697388 0,00145703578353271 236273 266285 579 665 0 True 532 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 577 320 0,00625864990862376 0,00657308182334986 0,00628671702143893 0,00662241550316625 0,00164205725977375 0,00176997798506867 237483 286460 579 665 0 True 576 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 620 318 0,00649876208220027 0,00647854472528311 0,00648508430609598 0,00660715648126955 0,00179447808971273 0,0018913686480614 246594 282340 579 665 0 False 620 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 664 318 0,0068803166919073 0,00659630307170995 0,00679026474402991 0,00665293354695964 0,00196415542092602 0,00180414802233038 261072 287472 579 665 0 False 664 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 269 360 0,00594859396282992 0,00602423889891816 0,0059662775616083 0,0059662775616083 0,00138443801937844 0,00140321495445622 225718 262541 579 665 0 True 270 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 314 359 0,00607815070142087 0,00603784581618845 0,00610360875867857 0,00599679560540169 0,0013343873586606 0,00131851968099592 230634 263134 579 665 0 True 313 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 358 360 0,00619142060835006 0,00632857033864129 0,00624093995574884 0,00633249408712902 0,00127283275632948 0,00122240181694003 234932 275804 579 665 0 True 357 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 402 359 0,00619086717232272 0,00641395202357003 0,00617990386816205 0,0064087891966125 0,00129032614410665 0,00131430034719446 234911 279525 579 665 0 True 401 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 447 359 0,00659073787912509 0,00646264321825392 0,00656137941557946 0,00646982528419928 0,00164046864070429 0,00171775298117384 250084 281647 579 665 0 True 445 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 489 361 0,00643793682738581 0,00644600744250188 0,00646982528419928 0,00642404821850919 0,00173622292479101 0,00169383006320952 244286 280922 579 665 0 False 489 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 532 361 0,00633004315615079 0,00637498988946388 0,0063782711528191 0,0064087891966125 0,00163772565542345 0,00165039468101641 240192 277827 579 665 0 False 532 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 578 357 0,00645833489810782 0,00653249053051489 0,00654612039368277 0,00648508430609598 0,00174822461191797 0,00188186552286248 245060 284691 579 665 0 True 576 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 622 357 0,00642504967417772 0,00628639577887268 0,00634775310902571 0,00630197604333562 0,00179334444049917 0,00188326565647861 243797 273966 579 665 0 True 620 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 666 357 0,00608091788155757 0,00634435711618254 0,00617990386816205 0,0063935301747158 0,00183840394507025 0,00184243843372427 230739 276492 579 665 0 True 664 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 271 404 0,00606036168625633 0,00603472517411634 0,00605783169298848 0,00601205462729839 0,00146659540387643 0,00142627745953144 229959 262998 579 665 0 True 270 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 314 404 0,00616928316725641 0,0062424773308873 0,00621042191195544 0,00621042191195544 0,00126737478834125 0,0012774416946339 234092 272052 579 665 0 True 313 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 358 404 0,00635805756077288 0,00655759334247727 0,0063935301747158 0,00659189745937285 0,00134761987736483 0,00121551628407704 241255 285785 579 665 0 True 357 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 402 403 0,00644020327968825 0,00639121263905931 0,00642404821850919 0,00643930724040589 0,00139993652713363 0,00137979058986174 244372 278534 579 665 0 True 401 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 447 403 0,00645967895703136 0,00652817670176815 0,00651560234988937 0,00650034332799268 0,00148975812290711 0,00145562133370316 245111 284503 579 665 0 True 445 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 490 401 0,00638130187392121 0,00644772838482106 0,00636301213092241 0,00642404821850919 0,00161665507725973 0,00157602666538034 242137 280997 579 665 0 True 489 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 534 401 0,006393003092785 0,00644731535866446 0,00636301213092241 0,00643930724040589 0,00159902040211754 0,00154108815107373 242581 280979 579 665 0 True 532 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 578 402 0,00623084633677399 0,00626613455130158 0,00614938582436866 0,00628671702143893 0,00162347841473013 0,00185775599641331 236428 273083 579 665 0 True 576 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 622 401 0,00592505975461964 0,00601384440731033 0,00605783169298848 0,00599679560540169 0,00178136299539513 0,00185039879132183 224825 262088 579 665 0 True 620 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 666 401 0,00585111015972823 0,00582832682530313 0,00570687418936446 0,00575265125505455 0,0017460508641814 0,0018003043725066 222019 254003 579 665 0 True 664 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 270 448 0,00598451459641402 0,00622535969128589 0,0059662775616083 0,00617990386816205 0,00148718665606769 0,00151474245371155 227081 271306 579 665 0 True 270 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 313 447 0,0062097367054454 0,00613311718297804 0,00622568093385214 0,00614938582436866 0,00127361662198208 0,00146534443265282 235627 267286 579 665 0 True 313 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 357 448 0,00627193237327995 0,00633201222327965 0,0063782711528191 0,00621042191195544 0,00137573257543136 0,00135308126137209 237987 275954 579 665 0 True 357 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 402 447 0,00631080466567654 0,00635541703882044 0,00636301213092241 0,00634775310902571 0,00147837196952009 0,00141803921209109 239462 276974 579 665 0 True 401 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 447 448 0,00652161108390051 0,00654586798880929 0,00648508430609598 0,00654612039368277 0,00174743826656571 0,00184047351775268 247461 285274 579 665 0 True 445 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 490 445 0,00645511969832993 0,00639671965448067 0,00643930724040589 0,00643930724040589 0,00166710694649482 0,00181823892985393 244938 278774 579 665 0 True 489 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 534 445 0,00619545278512069 0,00628522553809564 0,00619516289005875 0,00634775310902571 0,00167012843664802 0,00170903612773532 235085 273915 579 665 0 True 532 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 579 445 0,00594885750379532 0,00601040252267198 0,00601205462729839 0,00607309071488518 0,0017108775599284 0,00186357769005393 225728 261938 579 665 0 True 576 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 623 445 0,00593652378661457 0,00569459813415434 0,00593575951781491 0,00575265125505455 0,00172107353264515 0,00173909514585054 225260 248175 579 665 0 True 620 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 666 444 0,00586984792236821 0,00602417006122539 0,00588998245212482 0,0059662775616083 0,00192125600811112 0,00172980696900368 222730 262538 579 665 0 True 664 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 272 492 0,00611565258079738 0,00618935757796873 0,00610360875867857 0,00622568093385214 0,00136795137698369 0,00147632467948576 232057 269737 579 665 0 True 270 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 315 492 0,00605374680802477 0,00629908486023941 0,00601205462729839 0,00630197604333562 0,0014312471897832 0,00142471678550908 229708 274519 579 665 0 True 313 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 359 491 0,00618562270711124 0,00629995680434779 0,00614938582436866 0,00631723506523232 0,00150934629193045 0,00147480196259383 234712 274557 579 665 0 True 357 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 404 491 0,00632888357590303 0,00628852974734846 0,00634775310902571 0,00625619897764553 0,00168894455321229 0,00156865959444268 240148 274059 579 665 0 True 401 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 447 490 0,00622944956965737 0,00663228223912953 0,00621042191195544 0,00668345159075303 0,00178456509275069 0,00195451906538253 236375 289040 579 665 0 True 445 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 492 490 0,00630877540024296 0,00633171392661099 0,00625619897764553 0,00628671702143893 0,00182657547536435 0,00175097668185624 239385 275941 579 665 0 True 489 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 536 490 0,00612071256733307 0,00638304389951762 0,00613412680247196 0,00631723506523232 0,00158074711974042 0,00174816720407154 232249 278178 579 665 0 True 532 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 579 489 0,00608276266831538 0,00616898162090968 0,00616464484626535 0,00621042191195544 0,0016742255730437 0,0018384890484495 230809 268849 579 665 0 True 576 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 624 489 0,00596517068955362 0,00602965413074917 0,0059662775616083 0,005981536583505 0,00175153170937413 0,00165394270103974 226347 262777 579 665 0 True 620 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 668 489 0,00597544878720424 0,00585778935780743 0,0059662775616083 0,00588998245212482 0,00164798105576606 0,00171918769207196 226737 255287 579 665 0 True 664 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 271 536 0,00630982956410456 0,00611687148748502 0,00636301213092241 0,00617990386816205 0,0013952208639927 0,00144538306158143 239425 266578 579 665 0 True 270 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 315 535 0,00612347974746978 0,00626326631410295 0,00605783169298848 0,00627145799954223 0,00140834507473961 0,00142459257786346 232354 272958 579 665 0 True 313 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 360 536 0,00628869357867943 0,00630436241668488 0,00633249408712902 0,00631723506523232 0,00144870303100248 0,00137751073647325 238623 274749 579 665 0 True 357 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 403 535 0,00615634330585523 0,00637606834665056 0,00611886778057527 0,00625619897764553 0,00158085931637415 0,00214209190581215 233601 277874 579 665 0 True 401 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 448 535 0,00628026026778661 0,0062023679019017 0,00631723506523232 0,00621042191195544 0,00177617409030092 0,00196424684463771 238303 270304 579 665 0 True 445 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 492 534 0,00629122357194728 0,00626627222668711 0,00627145799954223 0,00624093995574884 0,00176619743963083 0,00188031762543102 238719 273089 579 665 0 True 489 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 535 533 0,0061406626184139 0,00622182602305719 0,00611886778057527 0,00621042191195544 0,00174130484657759 0,00174769953740285 233006 271152 579 665 0 True 533 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 580 534 0,00619102529690196 0,00615007420129633 0,00625619897764553 0,00616464484626535 0,00169642265381007 0,00157061844564413 234917 268025 579 665 0 True 576 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 624 534 0,00603118770138648 0,00599521233846805 0,00613412680247196 0,00604257267109178 0,00173395418978353 0,00173581513123126 228852 261276 579 665 0 True 620 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 668 533 0,00581526858843374 0,0059834181471073 0,00588998245212482 0,00593575951781491 0,001762387255805 0,00182761660942568 220659 260762 579 665 0 True 664 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 271 580 0,00629388533569782 0,00633582124227942 0,00621042191195544 0,00633249408712902 0,00122106368466265 0,00123200166639957 238820 276120 579 665 0 True 270 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 315 579 0,00607577883273226 0,00633033717275565 0,00604257267109178 0,00630197604333562 0,00135980821597258 0,00137805443863131 230544 275881 579 665 0 True 313 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 359 579 0,00607066613800349 0,00621267060991917 0,00607309071488518 0,00624093995574884 0,00135607886277194 0,0012206766561756 230350 270753 579 665 0 True 357 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 404 579 0,00600330506724709 0,0060174698591294 0,0059662775616083 0,00599679560540169 0,00141713985093913 0,00134280934315462 227794 262246 579 665 0 True 401 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 448 579 0,00624360171949938 0,00633389378688194 0,00624093995574884 0,0063935301747158 0,00172129453687996 0,00185380280305133 236912 276036 579 665 0 True 445 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 492 578 0,00635979693114452 0,00620188603805233 0,00634775310902571 0,00625619897764553 0,0019184001979345 0,00200879135868249 241321 270283 579 665 0 True 489 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 536 577 0,00603134582596572 0,00635167685751343 0,00610360875867857 0,00627145799954223 0,00179607483327824 0,00187505729772703 228858 276811 579 665 0 True 533 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 576 576 0,00606531625640586 0,00622460247666546 0,005981536583505 0,00616464484626535 0,00159988069279803 0,00159920483752175 230147 271273 579 665 0 False 576 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 624 577 0,00601418930911814 0,00601313308448507 0,00599679560540169 0,0059510185397116 0,00149900314145803 0,00151600746584322 228207 262057 579 665 0 True 620 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 668 577 0,00601801065311644 0,00599860833131123 0,00604257267109178 0,0059662775616083 0,00149924216682146 0,00163110218015818 228352 261424 579 665 0 True 664 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 270 619 0,00643000424432725 0,00646583269801879 0,00642404821850919 0,00650034332799268 0,00127196562042996 0,00126756016953957 243985 281786 579 665 0 False 270 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 313 619 0,00626560739011034 0,00607258590513822 0,00627145799954223 0,00608834973678187 0,00138595801323761 0,00123280992771234 237747 264648 579 665 0 False 313 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 359 623 0,00606526354821278 0,00604856155036252 0,00605783169298848 0,00599679560540169 0,00135424160307988 0,00134105968281342 230145 263601 579 665 0 True 357 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 404 623 0,00602628583943002 0,00595567655692218 0,00593575951781491 0,0059662775616083 0,00133764716685216 0,00129267064929875 228666 259553 579 665 0 True 401 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 445 619 0,00603801341239035 0,00591513115588238 0,00590524147402152 0,00585946440833143 0,00164813800945399 0,00184960227059854 229111 257786 579 665 0 False 445 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 489 619 0,00617721575031496 0,0060191449096534 0,00622568093385214 0,00599679560540169 0,00184793190604221 0,00189757266491507 234393 262319 579 665 0 False 489 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 533 619 0,00611017092871704 0,00572355585691168 0,00608834973678187 0,00569161516746777 0,0019544981852848 0,00185704543635698 231849 249437 579 665 0 False 533 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 576 619 0,00600098590675156 0,00593309779369458 0,00593575951781491 0,005981536583505 0,00159729953908006 0,00162283595530085 227706 258569 579 665 0 False 576 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 620 619 0,0060260750066577 0,00604594571803737 0,00601205462729839 0,00605783169298848 0,00142986663442206 0,00128916605343519 228658 263487 579 665 0 False 620 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 664 619 0,00619985391924288 0,00611721567594886 0,00617990386816205 0,00616464484626535 0,00155953894255591 0,00142697423676523 235252 266593 579 665 0 False 664 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 273 667 0,0086897098980584 0,673514640343133 0,00785839627679866 0,65963225757229 0,00369090552256271 0,182831081598432 329729 29352290 579 665 6 True 270 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 313 662 0,00881025353563265 0,00642443829876821 0,00660715648126955 0,00646982528419928 0,00931534997599415 0,00129528904039674 334303 279982 579 665 0 False 313 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 357 662 0,0059646963158159 0,00596067876259658 0,00592050049591821 0,005981536583505 0,00118968424696926 0,00118587235952129 226329 259771 579 665 0 False 357 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 401 662 0,00583777498687895 0,00584546741080213 0,00578316929884794 0,00582894636453803 0,00123270530028 0,00141810960572429 221513 254750 579 665 0 False 401 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 445 662 0,00574387534090671 0,00575602430200014 0,00572213321126116 0,00569161516746777 0,00146525031115205 0,00146909620215043 217950 250852 579 665 0 False 445 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 489 662 0,00584077935388452 0,0056405605453322 0,00576791027695125 0,00566109712367437 0,00150485732108158 0,00149430183770741 221627 245820 579 665 0 False 489 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 533 662 0,00572656069947989 0,00590813265711773 0,00569161516746777 0,00593575951781491 0,00156582468249558 0,00164259775471191 217293 257481 579 665 0 False 533 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 576 662 0,0058893763079044 0,00587451691714982 0,005981536583505 0,00592050049591821 0,00140511448789624 0,00139321266324677 223471 256016 579 665 0 False 576 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 620 662 0,00621376888221603 0,00614477369895327 0,00628671702143893 0,00614938582436866 0,00130843714839822 0,00139825133818682 235780 267794 579 665 0 False 620 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 671 665 0,0101800604114955 0,670066262015763 0,0081177996490425 0,683237964446479 0,00659469698544947 0,213374976573406 386280 29202007 579 665 5 True 664 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H5_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H5_3.csv new file mode 100755 index 0000000..980e936 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H5_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 269 276 0,00118240289536646 0,0647318456360631 0,000915541313801785 0,0655222400244144 0,00102898045752076 0,0190497685338798 44866 2821064 579 665 0 True 270 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 313 275 0,000945690400243617 0,000859989295738775 0,00080872816052491 0,000762951094834821 0,000706718409848873 0,000624485034353759 35884 37479 579 665 0 False 313 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 357 277 0,00082949518859848 0,000835001213264335 0,000686655985351339 0,000701915007248035 0,000629723003343321 0,000638182988621784 31475 36390 579 665 0 True 357 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 402 277 0,000863571035424781 0,000882177978707354 0,000732433051041428 0,000732433051041428 0,000664955313804738 0,000670309510627133 32768 38446 579 665 0 True 401 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 446 276 0,000872452365958783 0,000948101542480601 0,000595101853971161 0,000671396963454643 0,000845935297080705 0,000884141607247804 33105 41319 579 665 0 True 445 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 490 276 0,000921602756006 0,000831880571192229 0,000656137941557946 0,000518806744487678 0,000888636546069385 0,000832679062680521 34970 36254 579 665 0 True 489 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 533 275 0,000936571882840755 0,000903357042182017 0,000747692072938125 0,000701915007248035 0,000772017890050999 0,000825502979128673 35538 39369 579 665 0 True 532 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 578 275 0,00097597125716815 0,00084002636483633 0,000717174029144732 0,000488288700694286 0,000876041401686393 0,000910077320632171 37033 36609 579 665 0 True 576 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 620 275 0,00106847413602377 0,000888855234905758 0,000686655985351339 0,000610360875867857 0,00102956651444666 0,000904364419364156 40543 38737 579 665 0 False 620 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 666 274 0,00108507721684401 0,0663173612676691 0,00080872816052491 0,0660105287251087 0,00100296233346498 0,0186736713643929 41173 2890162 579 665 0 True 664 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 270 318 0,000832578617893667 0,000868112143485287 0,000656137941557946 0,000701915007248035 0,000707116267726887 0,000709184683271512 31592 37833 579 665 0 False 270 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 313 318 0,000893430226804673 0,000870796813503202 0,000823987182421607 0,000793469138628214 0,000628148716236773 0,000587947668663193 33901 37950 579 665 0 False 313 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 357 321 0,000965087015297104 0,000835941995065485 0,000869764248111696 0,000717174029144732 0,000703544686676107 0,00063937770657399 36620 36431 579 665 0 True 357 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 402 321 0,000857351468641326 0,000813730366199316 0,000717174029144732 0,00064087891966125 0,000662756474015734 0,000673798476831519 32532 35463 579 665 0 True 401 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 446 321 0,000914618920422883 0,000928941717993771 0,000610360875867857 0,000656137941557946 0,000897109717640424 0,000915207224411205 34705 40484 579 665 0 True 445 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 490 320 0,000876537250922492 0,000780389977002474 0,000625619897764553 0,000610360875867857 0,000843094644242213 0,000744560289481251 33260 34010 579 665 0 True 489 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 534 320 0,000940683121901005 0,000908588706832313 0,000793469138628214 0,000717174029144732 0,000773799357138001 0,00079416139268046 35694 39597 579 665 0 True 532 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 577 320 0,000922208900226421 0,000954457556112758 0,000595101853971161 0,000610360875867857 0,000925387070313093 0,000970970134546734 34993 41596 579 665 0 True 576 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 620 318 0,000985432377826032 0,00106546980864842 0,000549324788281071 0,000701915007248035 0,00102945759428978 0,00110856048736655 37392 46434 579 665 0 False 620 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 664 318 0,00093433178463485 0,000900603534471335 0,000534065766384375 0,000518806744487678 0,000984650590375797 0,00094452104735086 35453 39249 579 665 0 False 664 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 269 360 0,000818400113955114 0,000842963439727724 0,000610360875867857 0,000671396963454643 0,000731926761146035 0,000733474087307357 31054 36737 579 665 0 True 270 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 314 359 0,000799135269384327 0,000825157423198647 0,00064087891966125 0,000701915007248035 0,000644088955352628 0,000624470452467591 30323 35961 579 665 0 True 313 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 358 360 0,000891980751494969 0,000953539720209198 0,000762951094834821 0,00080872816052491 0,000705760087642108 0,000721531056667307 33846 41556 579 665 0 True 357 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 402 359 0,00094279144962421 0,000888901126700936 0,000762951094834821 0,000732433051041428 0,000739283672170436 0,000696204198657387 35774 38739 579 665 0 True 401 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 447 359 0,000932750538842446 0,000922861055132682 0,000701915007248035 0,00064087891966125 0,000825398977690544 0,000857921836854434 35393 40219 579 665 0 True 445 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 489 361 0,00087155632667642 0,000768389272563418 0,000595101853971161 0,000442511635004196 0,000848507447631589 0,000827737215845705 33071 33487 579 665 0 False 489 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 532 361 0,000915936625249886 0,000929767770306976 0,000671396963454643 0,000701915007248035 0,000855557944269382 0,000853922356281211 34755 40520 579 665 0 False 532 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 578 357 0,00097193908039752 0,000983690629641166 0,000625619897764553 0,000549324788281071 0,00101664990225399 0,00109566502408464 36880 42870 579 665 0 True 576 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 622 357 0,000973599388479544 0,000979055558328185 0,000518806744487678 0,000534065766384375 0,00106517936080175 0,00105473604062277 36943 42668 579 665 0 True 620 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 666 357 0,000870897474262919 0,000960790623847327 0,000442511635004196 0,000564583810177768 0,000929659672307196 0,000995014317325747 33046 41872 579 665 0 True 664 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 271 404 0,000850815652699391 0,000857419355208805 0,000656137941557946 0,000717174029144732 0,000780905232866864 0,000746383889421371 32284 37367 579 665 0 True 270 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 314 404 0,000954650793067239 0,000902439206278456 0,000823987182421607 0,000778210116731518 0,000718560330324456 0,000708813935214445 36224 39329 579 665 0 True 313 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 358 404 0,000826965195330634 0,000897941810351009 0,000717174029144732 0,000778210116731518 0,000626233437325355 0,000632444437381018 31379 39133 579 665 0 True 357 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 402 403 0,000873717362592706 0,000842068549721752 0,000671396963454643 0,00064087891966125 0,000769403005980002 0,000740912727676431 33153 36698 579 665 0 True 401 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 447 403 0,0010555342746226 0,000923732999241064 0,00080872816052491 0,000701915007248035 0,000874697058452188 0,000854907370583938 40052 40257 579 665 0 True 445 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 490 401 0,000885049624104933 0,00091519712533795 0,000610360875867857 0,000595101853971161 0,000854341673575373 0,000864879491921766 33583 39885 579 665 0 True 489 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 534 401 0,000931327417629283 0,000861847913443485 0,000778210116731518 0,000671396963454643 0,000810141173741792 0,000810278556341942 35339 37560 579 665 0 True 532 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 578 402 0,000985774981081053 0,000952874289179116 0,000732433051041428 0,000549324788281071 0,000928396337556855 0,00103524235056059 37405 41527 579 665 0 True 576 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 622 401 0,000957628805976266 0,000909736001711764 0,000595101853971161 0,000534065766384375 0,000996224434651351 0,000970482513811299 36337 39647 579 665 0 True 620 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 666 401 0,000896302823327539 0,000920268168705123 0,000549324788281071 0,000473029678797589 0,000907340441220921 0,00100237494287468 34010 40106 579 665 0 True 664 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 270 448 0,000858036675151368 0,000862765749347046 0,000656137941557946 0,000717174029144732 0,00079144920909428 0,000794099263591039 32558 37600 579 665 0 True 270 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 313 447 0,000867708628581571 0,00088112246741826 0,000778210116731518 0,000717174029144732 0,000731642960694855 0,000764157678097527 32925 38400 579 665 0 True 313 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 357 448 0,00080032120372863 0,000838075963541263 0,000625619897764553 0,000717174029144732 0,00069446806765993 0,00071008830985442 30368 36524 579 665 0 True 357 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 402 447 0,000879119952383418 0,000945348034769919 0,000625619897764553 0,000747692072938125 0,000822706388204771 0,000797603972857556 33358 41199 579 665 0 True 401 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 447 448 0,000888950030392862 0,000890736798508058 0,000579842832074464 0,000488288700694286 0,000926200691646773 0,00095518258094773 33731 38819 579 665 0 True 445 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 490 445 0,000830285811494682 0,000921094221018327 0,000518806744487678 0,000564583810177768 0,000898085374988183 0,000957445639776911 31505 40142 579 665 0 True 489 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 534 445 0,00086707613026461 0,000889497720038251 0,000610360875867857 0,000610360875867857 0,000828292159551331 0,000883481747339889 32901 38765 579 665 0 True 532 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 579 445 0,000950012472076188 0,000998857867947507 0,000579842832074464 0,000579842832074464 0,000970437182099797 0,00107543567440879 36048 43531 579 665 0 True 576 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 623 445 0,000978843853691016 0,000953218477642951 0,00064087891966125 0,000579842832074464 0,000967827603803041 0,000981544320231907 37142 41542 579 665 0 True 620 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 666 444 0,000819217090947855 0,000957968278443878 0,000411993591210803 0,000503547722590982 0,000912332441786645 0,00106420679305381 31085 41749 579 665 0 True 664 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 272 492 0,000822221457953423 0,000799366234308591 0,000671396963454643 0,000595101853971161 0,00072117102581496 0,000744709403547747 31199 34837 579 665 0 True 270 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 315 492 0,000839536099380244 0,000858520758293078 0,000671396963454643 0,000701915007248035 0,000764163156053802 0,000740818372851285 31856 37415 579 665 0 True 313 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 359 491 0,000856771678517445 0,000851384584142893 0,000732433051041428 0,000701915007248035 0,000728476173450379 0,000745156980061374 32510 37104 579 665 0 True 357 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 404 491 0,000861910727342757 0,000954618177395882 0,000610360875867857 0,000701915007248035 0,000844968921326949 0,000854091645860111 32705 41603 579 665 0 True 401 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 447 490 0,000890056902447545 0,000921759652048409 0,000488288700694286 0,000518806744487678 0,000920568609119303 0,00101354424837465 33773 40171 579 665 0 True 445 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 492 490 0,000954334543908758 0,000911411052235762 0,000656137941557946 0,000473029678797589 0,000930226571300505 0,000949286131961636 36212 39720 579 665 0 True 489 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 536 490 0,000832156952349026 0,000901498424477307 0,000534065766384375 0,000610360875867857 0,000836679949621032 0,000862908159606716 31576 39288 579 665 0 True 532 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 579 489 0,000946085711691718 0,000942066771414689 0,000686655985351339 0,000534065766384375 0,000897986110220154 0,0010365483998352 35899 41056 579 665 0 True 576 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 624 489 0,000941552807086827 0,000912145320958611 0,000595101853971161 0,000610360875867857 0,000956484997174254 0,000916187598148224 35727 39752 579 665 0 True 620 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 668 489 0,000826253634724052 0,000849089994383992 0,0004272526131075 0,000457770656900893 0,000926875285293905 0,000901803068451319 31352 37004 579 665 0 True 664 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 271 536 0,000832736742472908 0,00084422546409512 0,000671396963454643 0,000686655985351339 0,000703264537946128 0,000742981093756048 31598 36792 579 665 0 True 270 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 315 535 0,000826016447855192 0,000841150713818192 0,000656137941557946 0,000686655985351339 0,000753171866424836 0,000722666757789577 31343 36658 579 665 0 True 313 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 360 536 0,000832394139217887 0,000840622958173644 0,000701915007248035 0,000701915007248035 0,000708323952961834 0,00070873881678165 31585 36635 579 665 0 True 357 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 403 535 0,000847600452921503 0,000976508563695804 0,000610360875867857 0,000747692072938125 0,000799155802336509 0,000892603502098102 32162 42557 579 665 0 True 401 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 448 535 0,000865046864831025 0,000925339212072296 0,000534065766384375 0,000473029678797589 0,000899943792866005 0,00103396387295258 32824 40327 579 665 0 True 445 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 492 534 0,000947113521456781 0,000878116554834098 0,000518806744487678 0,000457770656900893 0,000984104450164925 0,000976414034067618 35938 38269 579 665 0 True 489 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 535 533 0,00090478884241344 0,000866414147063699 0,000564583810177768 0,000442511635004196 0,000925513095118975 0,000946216624932989 34332 37759 579 665 0 True 533 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 580 534 0,000960896713947234 0,000918501334590768 0,000686655985351339 0,000625619897764553 0,000867448606959824 0,000894023329828207 36461 40029 579 665 0 True 576 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 624 534 0,000916384644891067 0,000937661159077598 0,000625619897764553 0,000595101853971161 0,000907544428035812 0,000922288277711652 34772 40864 579 665 0 True 620 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 668 533 0,000993997459201553 0,000943053445011017 0,000671396963454643 0,000534065766384375 0,000978223225224609 0,000990137712446296 37717 41099 579 665 0 True 664 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 271 580 0,000849945967513569 0,000821990889331362 0,000717174029144732 0,000717174029144732 0,0006649890854493 0,000630666839380969 32251 35823 579 665 0 True 270 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 315 579 0,000824435202062788 0,00081714930494008 0,000656137941557946 0,000717174029144732 0,000670225730391851 0,000649854689038408 31283 35612 579 665 0 True 313 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 359 579 0,000838929955159822 0,000862995208322936 0,000686655985351339 0,000701915007248035 0,000713340970387547 0,000729948321614699 31833 37610 579 665 0 True 357 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 404 579 0,000826016447855192 0,000836813939173867 0,000656137941557946 0,000656137941557946 0,000721136874533094 0,000722600490468385 31343 36469 579 665 0 True 401 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 448 579 0,000888923676296322 0,000923801836933832 0,000518806744487678 0,000518806744487678 0,00092903361917581 0,000993752868734091 33730 40260 579 665 0 True 445 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 492 578 0,000985221545053712 0,000860517051383322 0,000534065766384375 0,000396734569314107 0,00106062476792413 0,00102372068037322 37384 37502 579 665 0 True 489 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 536 577 0,00087550944115743 0,00101524123882607 0,000457770656900893 0,000701915007248035 0,000971788137879827 0,000977660186064916 33221 44245 579 665 0 True 533 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 576 576 0,000832236014638647 0,000980914176032895 0,000564583810177768 0,000656137941557946 0,000812155581459425 0,00095242417622636 31579 42749 579 665 0 False 576 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 624 577 0,000992047256057588 0,000871898216587475 0,000762951094834821 0,000656137941557946 0,000828237261594577 0,000774942463030396 37643 37998 579 665 0 True 620 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 668 577 0,000899623439491587 0,000952966072769472 0,000656137941557946 0,000656137941557946 0,000828394081927764 0,000909849628809883 34136 41531 579 665 0 True 664 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 270 619 0,000826069156048272 0,00081386804158485 0,000686655985351339 0,000686655985351339 0,000667618962220203 0,000647109732346299 31345 35469 579 665 0 False 270 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 313 619 0,000829099877150379 0,000875156534045115 0,000671396963454643 0,000762951094834821 0,000728481078741987 0,000699986887678356 31460 38140 579 665 0 False 313 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 359 623 0,000861884373246217 0,000903471771669962 0,000732433051041428 0,000762951094834821 0,00068521013980201 0,000725860140066583 32704 39374 579 665 0 True 357 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 404 623 0,00084638816448066 0,000870062544780353 0,00064087891966125 0,000686655985351339 0,000693593402327584 0,000702998799633375 32116 37918 579 665 0 True 401 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 445 619 0,000873954549461566 0,000884059542309654 0,000595101853971161 0,000518806744487678 0,000853515748043704 0,000926072069381725 33162 38528 579 665 0 False 445 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 489 619 0,000915699438381026 0,00079915972123029 0,000503547722590982 0,000350957503624018 0,00102597331166224 0,000939351569612432 34746 34828 579 665 0 False 489 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 533 619 0,000969567211708914 0,000887822669514253 0,000595101853971161 0,000488288700694286 0,00101960301494655 0,00100806628717025 36790 38692 579 665 0 False 533 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 576 619 0,000977895106215574 0,000885711646936063 0,000686655985351339 0,000610360875867857 0,000875210971647793 0,000866470639141232 37106 38600 579 665 0 False 576 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 620 619 0,000983613945164768 0,000934540517005492 0,000823987182421607 0,000747692072938125 0,000774387880331182 0,000699052667869632 37323 40728 579 665 0 False 620 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 664 619 0,000952437048957873 0,000925522779253008 0,000839246204318303 0,000717174029144732 0,000716697212839865 0,000788036733933478 36140 40335 579 665 0 False 664 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 273 667 0,00106512716576318 0,066132394387204 0,000961318379491875 0,0639200427252613 0,000737808654146643 0,0194685916270229 40416 2882101 579 665 0 True 270 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 313 662 0,00110705653335842 0,000816277360831697 0,000915541313801785 0,000686655985351339 0,0010129603718165 0,000619212953504402 42007 35574 579 665 0 False 313 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 357 662 0,000906791753750484 0,000747531451655002 0,00080872816052491 0,000625619897764553 0,000670880952720531 0,000590930475008885 34408 32578 579 665 0 False 357 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 401 662 0,000918940992255453 0,000850971557986291 0,000778210116731518 0,000717174029144732 0,000712894492932608 0,000657697832303242 34869 37086 579 665 0 False 401 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 445 662 0,000935728551751474 0,000890048421580387 0,000778210116731518 0,000686655985351339 0,000764190997499966 0,000779155246320781 35506 38789 579 665 0 False 445 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 489 662 0,000904129989999938 0,000836263237631731 0,000656137941557946 0,000595101853971161 0,000845544721679703 0,000763614077788338 34307 36445 579 665 0 False 489 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 533 662 0,000820086776133677 0,000824285479090264 0,000442511635004196 0,000503547722590982 0,000848387570335768 0,000825125351215347 31118 35923 579 665 0 False 533 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 576 662 0,000958472137065548 0,000943581200655564 0,000732433051041428 0,000793469138628214 0,000783153341953167 0,000711538800710512 36369 41122 579 665 0 False 576 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 620 662 0,000982823322268566 0,000984379006568837 0,000854505226215 0,000778210116731518 0,000738837097910727 0,000754119540712222 37293 42900 579 665 0 False 620 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 671 665 0,00121086531962973 0,0661504528086066 0,000961318379491875 0,0670481422140841 0,000961927137457498 0,0219097226253372 45946 2882888 579 665 0 True 664 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H6_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H6_1.csv new file mode 100755 index 0000000..2ce98c3 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H6_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 282 258 0,0107035581851673 0,0426534635971939 0,0107423514152743 0,0438239108873121 0,001462586581418 0,0087098998400113 406144 1858871 579 665 0 True 281 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 324 259 0,0105524965037997 0,0104991478467283 0,0105439841306172 0,0104982070649271 0,00137378960128679 0,00128934230250245 400412 457561 579 665 0 False 324 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 369 258 0,010814166328346 0,0540328849131297 0,010757610437171 0,0564583810177768 0,00143437610639362 0,00965602267993665 410341 2354795 579 665 0 True 368 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 414 257 0,0110099245574455 0,0700011645043026 0,0109864957656214 0,0711375600823987 0,00171465432506427 0,012543142633688 417769 3050705 579 665 0 True 412 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 459 258 0,0108257884849201 0,0625431053027396 0,0108033875028611 0,0615091172655833 0,0017228358637295 0,0146724755723139 410782 2725677 579 665 0 True 456 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 502 257 0,0106702729612372 0,0570692925951868 0,0106202792401007 0,0588540474555581 0,00163080327866914 0,0175412821163432 404881 2487124 579 665 0 True 500 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 546 258 0,0107272505179568 0,0702084347972242 0,0107270923933776 0,0692301823453117 0,00169129883517578 0,0203644959586835 407043 3059738 579 665 0 True 543 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 591 259 0,0108446316639463 0,0611489814029237 0,010955977721828 0,0608377203021286 0,00195961948121435 0,0179146687202853 411497 2664920 579 665 0 True 587 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 631 259 0,0104605470609714 0,0105299641871903 0,010406652933547 0,0105134660868238 0,00196030982196148 0,00179484582536547 396923 458904 579 665 0 False 631 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 678 257 0,0105185260733595 0,0425170043442321 0,0105134660868238 0,0422522316319524 0,00183427816488305 0,00845395599381934 399123 1852924 579 665 0 True 675 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 280 301 0,0105104090116252 0,0104988724959572 0,0105287251087205 0,0105592431525139 0,001475872985393 0,0013789257772135 398815 457549 579 665 0 False 280 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 324 301 0,010529673856196 0,0105119746034805 0,0105287251087205 0,0104829480430304 0,00135822716510523 0,0012683071624605 399546 458120 579 665 0 False 324 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 370 302 0,0108986048536603 0,0874112266245839 0,0109254596780346 0,0867627985046159 0,00144775203935297 0,0210704100648343 413545 3809449 579 665 0 True 368 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 414 302 0,0107505211852017 0,0455119946811409 0,0107728694590677 0,0461585412375067 0,00160126849029985 0,00944819491198495 407926 1983448 579 665 0 True 412 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 459 302 0,0106666360959147 0,0679173557606536 0,010605020218204 0,0656900892652781 0,00176833100710218 0,0178412163675726 404743 2959891 579 665 0 True 456 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 503 303 0,0106270522429115 0,0376834739630032 0,0106660563057908 0,0384222171358816 0,00166994713378708 0,00755159916858011 403241 1642275 579 665 0 True 500 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 543 302 0,0107806175634505 0,0362667942458573 0,0107270923933776 0,0390325780117494 0,00161884114754192 0,0105695558876162 409068 1580535 579 665 0 False 543 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 591 303 0,0109051406696022 0,0467808569260184 0,0107423514152743 0,0472877088578622 0,00219132845707417 0,0108188301198 413793 2038746 579 665 0 True 587 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 631 302 0,010642153140229 0,0105766361428864 0,0105745021744106 0,0106202792401007 0,00204073526000133 0,00192932024484916 403814 460938 579 665 0 False 631 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 675 302 0,0106745950330698 0,0103664976127662 0,0106660563057908 0,010406652933547 0,00202228715747721 0,00203881436424661 405045 451780 579 665 0 False 675 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 282 341 0,0106394913764784 0,0459482420861033 0,0106965743495842 0,0462195773250935 0,00145461211798718 0,0107370202457742 403713 2002460 579 665 0 True 280 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 327 341 0,0106012779364953 0,0583700266918154 0,0106202792401007 0,0587930113679713 0,001393349683647 0,0182744913834114 402263 2543811 579 665 0 True 324 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 371 340 0,0110794730182148 0,0351759921662706 0,010605020218204 0,0361486228732738 0,00269548004555625 0,00644287959760433 420408 1532997 579 665 0 True 368 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 412 345 0,0113087800122099 0,0295190482500598 0,011108567940795 0,0317692835889219 0,00204199261242963 0,00951884338153595 429109 1286463 579 665 0 False 412 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 460 340 0,0111783535884331 0,0605293274385322 0,0108796826123445 0,0608987563897154 0,00262559941060218 0,0123330556030805 424160 2637915 579 665 0 True 456 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 500 345 0,0111901338695865 0,0280617084023861 0,0111390859845884 0,0303654535744259 0,0019472438704555 0,00863258217288052 424607 1222951 579 665 0 False 500 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 543 345 0,0110453181090988 0,0236665135028003 0,0109254596780346 0,0259403372243839 0,00217177630238956 0,00709623627415966 419112 1031405 579 665 0 False 543 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 591 340 0,0108078676992729 0,0445219939296628 0,0106660563057908 0,044632639047837 0,00219845075288726 0,00856391708108339 410102 1940303 579 665 0 True 587 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 636 341 0,0106699567120787 0,0489196440402907 0,0105745021744106 0,0502174410620279 0,00195812057852877 0,0111772120189027 404869 2131956 579 665 0 True 631 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 675 345 0,012648543218017 0,0492870766983836 0,0113221942473487 0,0534065766384375 0,0050900343528935 0,0246698797834064 479946 2147969 579 665 0 False 675 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 280 387 0,0108368308513704 0,0392549008134894 0,0106813153276875 0,0432440680552377 0,00185166933016466 0,0144571740017512 411201 1710759 579 665 0 False 280 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 327 384 0,0106422322025186 0,0299088761041996 0,0106813153276875 0,0300144960708019 0,00137950127621115 0,00463611792736916 403817 1303452 579 665 0 True 324 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 372 384 0,0107278039539842 0,0794019151793423 0,0108186465247578 0,0796826123445487 0,00142613595930304 0,0215417539667684 407064 3460397 579 665 0 True 368 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 416 384 0,0106681119253209 0,0592102366238324 0,010605020218204 0,0599984740978103 0,00160926400082776 0,0158653958393438 404799 2580428 579 665 0 True 412 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 460 385 0,0106314270229372 0,0376305836690605 0,0106507972838941 0,0387426565957122 0,00178406321751241 0,00659018166840388 403407 1639970 579 665 0 True 456 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 504 384 0,0104812877349484 0,0486936957867317 0,0104982070649271 0,0496375982299535 0,00172680589833929 0,00900177132712361 397710 2122109 579 665 0 True 499 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 548 384 0,0105163913915398 0,037921606488182 0,0105439841306172 0,0388799877927825 0,0016957458929336 0,00586930302659949 399042 1652653 579 665 0 True 543 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 592 384 0,0104503480256104 0,0471702258622064 0,0103913939116503 0,0468146791790646 0,00191803814000759 0,00900272409265926 396536 2055715 579 665 0 True 587 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 635 383 0,0104214112276094 0,0367025597869703 0,0102693217364767 0,0371099412527657 0,00199372401055387 0,00685438871609318 395438 1599526 579 665 0 True 631 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 680 384 0,0107350776846292 0,0783329346483627 0,0106965743495842 0,0748455024032959 0,00198705630386634 0,01640690230842 407340 3413810 579 665 0 True 675 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 283 429 0,0104178007163834 0,0433576273024057 0,010406652933547 0,0438391699092088 0,00160856696837912 0,00803836362596187 395301 1889559 579 665 0 True 280 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 327 428 0,0107644888563679 0,0520070375067906 0,0107270923933776 0,0525215533684291 0,00147388538800088 0,00739281936339739 408456 2266507 579 665 0 True 324 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 368 430 0,011160880822427 0,029805734294537 0,0108949416342412 0,0325474937056535 0,0018957253401421 0,00702499012778558 423497 1298957 579 665 0 False 368 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 416 427 0,0107050340145736 0,0510567790499366 0,0106813153276875 0,0506599526970321 0,00175876523254763 0,0120893429588259 406200 2225094 579 665 0 True 412 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 460 428 0,0109433804636819 0,0883478322723724 0,0110017547875181 0,0864423590447852 0,00185186843289448 0,0122585012132201 415244 3850267 579 665 0 True 456 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 504 428 0,0107368697631939 0,0541480274272314 0,0107881284809644 0,0547035934996567 0,00186599955459768 0,0118628184783491 407408 2359813 579 665 0 True 499 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 548 428 0,0108200432918744 0,0504787718896692 0,0108339055466545 0,0507057297627222 0,00176609266142648 0,00857810274652356 410564 2199904 579 665 0 True 543 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 587 431 0,011701271571981 0,0268208401525673 0,0114900434882124 0,0290226596475166 0,00260717382356433 0,00790220419390971 444002 1168873 579 665 0 False 587 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 636 427 0,0106558572704298 0,0378356741017111 0,0107118333714809 0,0381628137636378 0,00183510054976259 0,00550301599186245 404334 1648908 579 665 0 True 631 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 680 427 0,0106128473848764 0,068802379030662 0,0105745021744106 0,0677653162432288 0,00194501735654008 0,00920842217141918 402702 2998461 579 665 0 True 675 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 283 472 0,0104866903247391 0,0532056853050456 0,0105134660868238 0,0540779736018921 0,0016962864327713 0,0167363867258689 397915 2318745 579 665 0 True 280 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 327 472 0,0107601404304388 0,0524396135681387 0,0106965743495842 0,0535133897917143 0,0017153155788099 0,0095883050374274 408291 2285359 579 665 0 True 324 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 371 472 0,0108696944097559 0,0666162545296636 0,0108491645685512 0,0666666666666667 0,00163255079585447 0,0183214436170745 412448 2903188 579 665 0 True 368 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 415 471 0,0110360151130202 0,0846105421484588 0,0110017547875181 0,0820019836728466 0,00199444665763543 0,0264650965717884 418759 3687393 579 665 0 True 412 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 459 472 0,0110560442263907 0,0877620923446176 0,0109864957656214 0,0864271000228885 0,00220625473007748 0,0283609114109755 419519 3824740 579 665 0 True 456 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 503 472 0,0108416009428442 0,0413190908146998 0,0108339055466545 0,0431525139238575 0,00196939212951721 0,007124494865122 411382 1800718 579 665 0 True 499 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 547 471 0,0105499665105318 0,0366583200964187 0,010605020218204 0,0381170366979477 0,00195727117546445 0,00561226623832045 400316 1597598 579 665 0 True 543 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 591 472 0,0107814872486363 0,0923973242788821 0,0107118333714809 0,0916609445334554 0,00204881725752534 0,018304427818083 409101 4026747 579 665 0 True 587 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 635 471 0,010663236417461 0,0597566013913245 0,0107270923933776 0,0603341725795377 0,00187597632602277 0,0179633593996535 404614 2604239 579 665 0 True 631 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 679 471 0,0106335089965638 0,0711865954655464 0,010605020218204 0,0695201037613489 0,00198432639753166 0,0152970463719888 403486 3102367 579 665 0 True 675 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 283 516 0,0103305950109323 0,0476473858025701 0,0102235446707866 0,0503852903028916 0,00169186236249286 0,012677511201294 391992 2076510 579 665 0 True 280 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 328 517 0,0108964174636475 0,0967027777729974 0,0108491645685512 0,0923476005188067 0,00163034663075678 0,0253064169963522 413462 4214382 579 665 0 True 324 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 372 516 0,0109553188694145 0,0536955802185711 0,0109254596780346 0,0547035934996567 0,00166280887693861 0,0128763290622938 415697 2340095 579 665 0 True 368 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 415 515 0,0109509440893889 0,0554744150373645 0,0109102006561379 0,0565194171053635 0,00191883047091976 0,0126625220807054 415531 2417618 579 665 0 True 412 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 460 515 0,0108125323743605 0,0528486930303557 0,0107728694590677 0,0542000457770657 0,00194541907569077 0,00828000618195183 410279 2303187 579 665 0 True 456 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 504 516 0,0108012001128482 0,0567276052341887 0,0108339055466545 0,0583657587548638 0,00193683324330957 0,0132192772273396 409849 2472233 579 665 0 True 499 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 548 516 0,010634932117777 0,0663444374268241 0,0106507972838941 0,0660715648126955 0,00185922254066742 0,0161413255326748 403540 2891342 579 665 0 True 543 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 592 516 0,0103917892230984 0,0525786886534257 0,0103608758678569 0,0542000457770657 0,00174401753518954 0,0123872769145164 394314 2291420 579 665 0 True 587 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 636 516 0,0104231769520776 0,0389110794840156 0,0103761348897536 0,038803692683299 0,00195723439984582 0,00571181885329819 395505 1695775 579 665 0 True 631 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 680 515 0,0104091038645252 0,0603611569551023 0,010406652933547 0,0605783169298848 0,00185061446122561 0,0141015268037811 394971 2630586 579 665 0 True 675 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 283 561 0,0102002212953486 0,0409084739773444 0,01025406271458 0,0428015564202335 0,0014636376892383 0,00955429971217341 387045 1782823 579 665 0 True 280 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 327 560 0,0104816039841069 0,0484876186804847 0,0105287251087205 0,0495765621423667 0,00157685577217187 0,0111870403967323 397722 2113128 579 665 0 True 324 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 371 560 0,0109590611511232 0,0471889956064343 0,0109864957656214 0,0480964370183871 0,00145315781003764 0,0103871166475173 415839 2056533 579 665 0 True 368 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 416 559 0,0109217964586156 0,0480863867152431 0,0108339055466545 0,0486610208285649 0,00174978027212718 0,00913198959282137 414425 2095642 579 665 0 True 412 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 460 559 0,0110088967476805 0,0834548031786952 0,0110170138094148 0,0797589074540322 0,00213649441928424 0,0248903358065199 417730 3637025 579 665 0 True 455 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 504 560 0,0106916197794347 0,0593539008886372 0,010757610437171 0,0589761196307317 0,00208675461890959 0,0117836428371782 405691 2586689 579 665 0 True 499 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 548 560 0,0106198575745561 0,0514628525995694 0,010605020218204 0,0517128252079042 0,00196252504515432 0,00991604976284162 402968 2242791 579 665 0 True 543 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 587 559 0,0114342782199336 0,0319039989536671 0,0110017547875181 0,035736629282063 0,00287306693011909 0,0111528237789778 433871 1390401 579 665 0 False 587 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 636 560 0,010456330405525 0,0448266466119522 0,0104219119554437 0,0452429999237049 0,00172206658693513 0,00773941187457182 396763 1953580 579 665 0 True 631 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 680 559 0,0104507169829619 0,0491102097197675 0,0105134660868238 0,0474860761425193 0,00177732209637768 0,00837002951698988 396550 2140261 579 665 0 True 675 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 280 602 0,0099375236610373 0,0100595503407179 0,00988784618905928 0,010101472495613 0,00137391742059588 0,00136684404188816 377077 438403 579 665 0 False 280 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 324 602 0,0101132000685734 0,0101014266038179 0,0100709544518196 0,0100251773861295 0,00161971162749499 0,00156259594915982 383743 440228 579 665 0 False 324 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 371 604 0,0107224013641935 0,0749832007347276 0,0105897611963073 0,0726634622720684 0,00180023728063483 0,0193594172185572 406859 3267826 579 665 0 True 368 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 416 604 0,0107740026852189 0,0735542449623716 0,0107881284809644 0,0715037766079194 0,00166738041424335 0,0221244817619054 408817 3205551 579 665 0 True 412 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 455 602 0,0109768501662878 0,0102762972893438 0,0105897611963073 0,0102693217364767 0,00287786269472755 0,00193455002125596 416514 447849 579 665 0 False 455 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 499 602 0,0102900887645503 0,0102363025898461 0,0103608758678569 0,0101319905394064 0,00201880212670044 0,00239093272358649 390455 446106 579 665 0 False 499 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 543 602 0,0101024212430885 0,00991258186666024 0,0101319905394064 0,00993362325474937 0,00183711368692389 0,00197098062465571 383334 431998 579 665 0 False 543 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 587 602 0,0100614933311618 0,0100336214764423 0,0100556954299229 0,0100862134737163 0,00168003154976999 0,00165751691360517 381781 437273 579 665 0 False 587 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 631 602 0,00996996555387812 0,00991473878103361 0,00994888227664607 0,00988784618905928 0,00148504457323578 0,00145694778180444 378308 432092 579 665 0 False 631 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 675 602 0,010171152726865 0,0100961949391676 0,0101625085831998 0,0100862134737163 0,00165462246440061 0,00166068648944069 385942 440000 579 665 0 False 675 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 283 649 0,00982077501336482 0,0409096442181214 0,0098268101014725 0,041214618142977 0,00127591720667403 0,00806695988280445 372647 1782874 579 665 0 True 280 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 324 645 0,0101352320932809 0,00980760438519049 0,00997940032043946 0,00978103303578241 0,00170838853206434 0,00129260055999174 384579 427423 579 665 0 False 324 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 368 645 0,00982430646230119 0,0100092070414076 0,00984206912336919 0,0100404364080262 0,00125384892891305 0,00119838602971237 372781 436209 579 665 0 False 368 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 412 645 0,00992832608134482 0,00997169049884955 0,00993362325474937 0,00999465934233616 0,00147593244669331 0,00142039428364936 376728 434574 579 665 0 False 412 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 455 645 0,0100012742205677 0,0100230204717562 0,0100404364080262 0,0100251773861295 0,0015318036079522 0,00165149817995793 379496 436811 579 665 0 False 455 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 499 645 0,0100436516078041 0,00983433635588169 0,00984206912336919 0,0098268101014725 0,00365466358104713 0,00175716761031867 381104 428588 579 665 0 False 499 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 543 645 0,00982267250831571 0,00988149017542712 0,00968947890440223 0,00996414129854276 0,0023484733906531 0,00173343995756638 372719 430643 579 665 0 False 543 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 587 645 0,00988602775639802 0,00982267983990647 0,00987258716716258 0,0097962920576791 0,00138021444533251 0,00125050773011237 375123 428080 579 665 0 False 587 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 631 645 0,0099206833933482 0,00999635733875774 0,00990310521095598 0,0100251773861295 0,00137877435904203 0,00134719360461253 376438 435649 579 665 0 False 631 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 679 648 0,0100125801279834 0,0414226227046215 0,0100862134737163 0,0419775692378119 0,00150023127699399 0,00827960210306452 379925 1805230 579 665 0 True 675 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H6_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H6_2.csv new file mode 100755 index 0000000..99a72da --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H6_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 282 258 0,0083684271071385 0,667987684936764 0,00802624551766232 0,679285877775235 0,0020910217159381 0,198161192864246 317538 29111421 579 665 3 True 281 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 324 259 0,00716768176058015 0,00662301209650356 0,0068055237659266 0,00662241550316625 0,00217214782584903 0,0012970354855226 271976 288636 579 665 0 False 324 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 369 258 0,00613892324804225 0,0059738038160175 0,00614938582436866 0,00601205462729839 0,00118240620592413 0,00117317073449868 232940 260343 579 665 0 True 368 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 414 257 0,00604652578557279 0,0060623749807111 0,00604257267109178 0,00604257267109178 0,00132723712180419 0,00130793500343555 229434 264203 579 665 0 True 412 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 459 258 0,00614640781145963 0,00617737981942726 0,00614938582436866 0,00625619897764553 0,00156131323462787 0,00151155734364902 233224 269215 579 665 0 True 456 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 502 257 0,00608397495675622 0,00589826592115445 0,00614938582436866 0,005981536583505 0,00143779272108852 0,0015069197244535 230855 257051 579 665 0 True 500 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 546 258 0,00630413707925191 0,00630463776745595 0,00631723506523232 0,00630197604333562 0,00145838490643108 0,00150656706233987 239209 274761 579 665 0 True 543 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 591 259 0,00659121225286281 0,00657484865746421 0,00653086137178607 0,00669871061264973 0,00164686966429043 0,00184508411328905 250102 286537 579 665 0 True 587 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 631 259 0,00691597378452601 0,00680724470824578 0,00685130083161669 0,00677500572213321 0,00181738116338363 0,00170547461606173 262425 296665 579 665 0 False 631 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 678 257 0,00876616313212112 0,6649656184407 0,00836194399938964 0,666544594491493 0,00269419653991601 0,189831589368455 332630 28979717 579 665 5 True 675 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 280 301 0,0065607469172625 0,00654306858930343 0,00650034332799268 0,00651560234988937 0,00155997024217662 0,00139925913287614 248946 285152 579 665 0 False 280 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 324 301 0,00616923045906333 0,0062023679019017 0,00621042191195544 0,00619516289005875 0,00119492620178293 0,00120227582467502 234090 270304 579 665 0 False 324 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 370 302 0,00578411804632339 0,00610893220691922 0,00587472343022812 0,00611886778057527 0,00129044778536204 0,00120379088575303 219477 266232 579 665 0 True 368 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 414 302 0,00593960721590976 0,00605849712401856 0,00590524147402152 0,00605783169298848 0,00143097345355115 0,00143221173427017 225377 264034 579 665 0 True 412 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 459 302 0,0057751840075963 0,00617120737297581 0,00585946440833143 0,00625619897764553 0,00157096080580108 0,0017462885269239 219138 268946 579 665 0 True 456 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 503 303 0,00595070229055312 0,0059129971874066 0,0059662775616083 0,00581368734264134 0,00142222125684995 0,0014417735857532 225798 257693 579 665 0 True 500 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 543 302 0,00624428692600942 0,00625071490812176 0,00627145799954223 0,00630197604333562 0,00137630446004574 0,00140217607556346 236938 272411 579 665 0 False 543 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 591 303 0,00638601925720188 0,00662521490267211 0,00646982528419928 0,00659189745937285 0,00180585629450912 0,00196243227662569 242316 288732 579 665 0 True 587 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 631 302 0,00656860043803144 0,0065782217044098 0,00654612039368277 0,00660715648126955 0,00176020413009673 0,00188361627673676 249244 286684 579 665 0 False 631 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 675 302 0,00676686230630233 0,00670814137655882 0,00672922865644312 0,00662241550316625 0,00198494494555044 0,00181267130241132 256767 292346 579 665 0 False 675 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 282 341 0,00591617842408564 0,00577495466751108 0,00587472343022812 0,00578316929884794 0,00134573690232241 0,00128094836825603 224488 251677 579 665 0 True 280 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 327 341 0,00590824584102708 0,00597238117036698 0,00584420538643473 0,00599679560540169 0,00121349010655489 0,00117498470658542 224187 260281 579 665 0 True 324 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 371 340 0,00588015237411538 0,00592924288289963 0,0059662775616083 0,00590524147402152 0,00127467927154154 0,00123502229926815 223121 258401 579 665 0 True 368 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 412 345 0,00607519904260838 0,00613084553911673 0,00610360875867857 0,00611886778057527 0,00144071455678265 0,00137465571975709 230522 267187 579 665 0 False 412 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 460 340 0,00607775538997277 0,00625199987838674 0,00613412680247196 0,00617990386816205 0,00162633724908282 0,00147243573735954 230619 272467 579 665 0 True 456 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 500 345 0,00606297074181379 0,00608350815239059 0,00599679560540169 0,00605783169298848 0,00160789050256521 0,00157074053806453 230058 265124 579 665 0 False 500 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 543 345 0,00611051353197207 0,00624520789270039 0,00617990386816205 0,00627145799954223 0,00149875681914293 0,00149733304024168 231862 272171 579 665 0 False 543 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 591 340 0,00641290043567275 0,00629855710459486 0,0063782711528191 0,00625619897764553 0,00187792115992975 0,0019291561460729 243336 274496 579 665 0 True 587 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 636 341 0,00615705486646182 0,00631553706881073 0,00619516289005875 0,00619516289005875 0,0018108233668335 0,00187767556586262 233628 275236 579 665 0 True 631 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 675 345 0,00621774835079358 0,00607175985282501 0,00631723506523232 0,00601205462729839 0,00167499787393709 0,00175779563525351 235931 264612 579 665 0 False 675 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 280 387 0,00581302849022784 0,00580056228922042 0,00582894636453803 0,00578316929884794 0,00133698253998498 0,00137608256930862 220574 252793 579 665 0 False 280 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 327 384 0,00606344511555151 0,00607926316133662 0,00602731364919509 0,00602731364919509 0,00122278397084818 0,00123241777556577 230076 264939 579 665 0 True 324 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 372 384 0,00616032277443278 0,00629940610280565 0,00613412680247196 0,00627145799954223 0,00134559913766306 0,00130235283752735 233752 274533 579 665 0 True 368 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 416 384 0,00634988779084546 0,00643859591758063 0,0063782711528191 0,0064087891966125 0,00155028179182269 0,0014559223524549 240945 280599 579 665 0 True 412 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 460 385 0,00620428140746161 0,00639809640833602 0,00621042191195544 0,00636301213092241 0,00161242471245136 0,00169825652504291 235420 278834 579 665 0 True 456 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 504 384 0,00621722126886278 0,00631094788929293 0,00616464484626535 0,00631723506523232 0,00174432423026319 0,00171223695000147 235911 275036 579 665 0 True 499 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 548 384 0,00619202675257048 0,00617724214404172 0,00627145799954223 0,00622568093385214 0,00159467292274435 0,00149155849873856 234955 269209 579 665 0 True 543 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 592 384 0,00602090960373585 0,00621269355581676 0,00601205462729839 0,00624093995574884 0,00183236463674215 0,00197435276773213 228462 270754 579 665 0 True 587 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 635 383 0,0059644327748505 0,00586907873942122 0,00590524147402152 0,00581368734264134 0,00173722000279135 0,00179092825846726 226319 255779 579 665 0 True 631 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 680 384 0,00590273783485021 0,00584473314207928 0,00590524147402152 0,00579842832074464 0,00161949541622152 0,00182915762177027 223978 254718 579 665 0 True 675 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 283 429 0,00588357840666558 0,00604472958546515 0,00584420538643473 0,00607309071488518 0,0014835160298808 0,00138587358028961 223251 263434 579 665 0 True 280 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 327 428 0,00616728025591936 0,00630355931026926 0,00614938582436866 0,00634775310902571 0,00134885050424005 0,00134608183486969 234016 274714 579 665 0 True 324 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 368 430 0,00632332286153307 0,00641792166385293 0,00631723506523232 0,0064087891966125 0,00126338358964939 0,00127639857463519 239937 279698 579 665 0 False 368 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 416 427 0,00638594019491226 0,00643492457396639 0,0063935301747158 0,00642404821850919 0,00153919693787411 0,00150145391154428 242313 280439 579 665 0 True 412 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 460 428 0,00639714068594179 0,00646138119388652 0,00636301213092241 0,00650034332799268 0,00170637731845486 0,00153202064861299 242738 281592 579 665 0 True 456 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 504 428 0,00624415515552672 0,00636477896503676 0,00621042191195544 0,00631723506523232 0,0016887475984668 0,00169168784208116 236933 277382 579 665 0 True 499 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 548 428 0,00619044550677808 0,00622696590411713 0,00616464484626535 0,00625619897764553 0,00169719398674619 0,00150431681887087 234895 271376 579 665 0 True 543 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 587 431 0,00591815498132615 0,00589932143244355 0,00590524147402152 0,0059662775616083 0,0017747145245772 0,00178419075943351 224563 257097 579 665 0 False 587 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 636 427 0,00575162344528949 0,00565400684131937 0,00582894636453803 0,00561532005798428 0,00183733613920523 0,00179302482027663 218244 246406 579 665 0 True 631 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 680 427 0,00566855533299521 0,00590948646507548 0,00566109712367437 0,00593575951781491 0,00177824352662701 0,0016746938533409 215092 257540 579 665 0 True 675 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 283 472 0,00572732496827955 0,00593383206241743 0,00579842832074464 0,0059510185397116 0,00146672124027124 0,00152673666320336 217322 258601 579 665 0 True 280 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 327 472 0,00604425933327035 0,00613453982862856 0,00610360875867857 0,00607309071488518 0,00146873435036542 0,00145769438752621 229348 267348 579 665 0 True 324 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 371 472 0,00619503111957605 0,00620509846371479 0,00624093995574884 0,00619516289005875 0,00138590463536649 0,00141210171709065 235069 270423 579 665 0 True 368 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 415 471 0,00630144896140482 0,00670846261912506 0,0063782711528191 0,00660715648126955 0,00175829532981798 0,00179876275827396 239107 292360 579 665 0 True 412 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 459 472 0,00649393928253344 0,00655151267961618 0,00660715648126955 0,00651560234988937 0,00185865867851821 0,00182872149784969 246411 285520 579 665 0 True 456 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 503 472 0,00613926585129727 0,00616533322319303 0,00608834973678187 0,00622568093385214 0,00185821144406298 0,00176376847094767 232953 268690 579 665 0 True 499 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 547 471 0,00585016141225278 0,00574351878781412 0,00578316929884794 0,00581368734264134 0,00164928444624316 0,00168432511331598 221983 250307 579 665 0 True 543 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 591 472 0,00583058031852352 0,00583991450358558 0,00581368734264134 0,0059510185397116 0,00187950099646043 0,00178860822792752 221240 254508 579 665 0 True 587 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 635 471 0,00584494330113785 0,00586217202424693 0,00584420538643473 0,00584420538643473 0,001830485021875 0,00159947185609791 221785 255478 579 665 0 True 631 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 679 471 0,00579241958673351 0,0058622408619397 0,00584420538643473 0,00584420538643473 0,00185434652924591 0,00185559354078515 219792 255481 579 665 0 True 675 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 283 516 0,00587077031574711 0,00591770109641235 0,00587472343022812 0,00585946440833143 0,00147659382861744 0,00142112613444805 222765 257898 579 665 0 True 280 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 328 517 0,00612946212738437 0,00602898869971908 0,00608834973678187 0,00602731364919509 0,00155075657338751 0,00137436516426108 232581 262748 579 665 0 True 324 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 372 516 0,00627161612412147 0,00608203961494489 0,00622568093385214 0,00605783169298848 0,00158196221380519 0,00140161689382988 237975 265060 579 665 0 True 368 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 415 515 0,0061406626184139 0,00624034336241152 0,00619516289005875 0,00624093995574884 0,0016517053192218 0,0016880466912945 233006 271959 579 665 0 True 412 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 460 515 0,00622987123520201 0,00617391498889132 0,00621042191195544 0,00622568093385214 0,0018215359329505 0,0016614090886497 236391 269064 579 665 0 True 456 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 504 516 0,00587127104358137 0,00573236708158586 0,00588998245212482 0,00573739223315786 0,0017049448928659 0,00159209326965138 222784 249821 579 665 0 True 499 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 548 516 0,0058995753432654 0,00598619460071557 0,00585946440833143 0,005981536583505 0,00170813055960099 0,00151912371934938 223858 260883 579 665 0 True 543 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 592 516 0,00584138549810494 0,00575432630557855 0,00590524147402152 0,00576791027695125 0,00162469659554089 0,00163978517056175 221650 250778 579 665 0 True 587 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 636 516 0,00586697532584534 0,00586561390888528 0,00587472343022812 0,00587472343022812 0,00176300379092074 0,0018120471990867 222621 255628 579 665 0 True 631 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 680 515 0,0058137927590275 0,00581430688187624 0,00581368734264134 0,00590524147402152 0,00174982512610866 0,00170281467759776 220603 253392 579 665 0 True 675 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 283 561 0,00610221199156195 0,00625574005969375 0,00602731364919509 0,00625619897764553 0,00140180905520342 0,00136849091219182 231547 272630 579 665 0 True 280 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 327 560 0,00606984916101075 0,00621893483996097 0,00602731364919509 0,00624093995574884 0,00138503211931476 0,00137869193659887 230319 271026 579 665 0 True 324 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 371 560 0,00621450679691915 0,0061390601704536 0,00617990386816205 0,00616464484626535 0,00130269420854614 0,0011905383604536 235808 267545 579 665 0 True 368 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 416 559 0,006039752782762 0,00600381705006393 0,00605783169298848 0,00588998245212482 0,00157550671419133 0,00164151381837131 229177 261651 579 665 0 True 412 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 460 559 0,00585356109070645 0,00618263442997514 0,00585946440833143 0,00630197604333562 0,00182741390350283 0,00177705329611512 222112 269444 579 665 0 True 455 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 504 560 0,00584315122257313 0,00597423978807169 0,00578316929884794 0,0059662775616083 0,00184225226159375 0,00202610576278227 221717 260362 579 665 0 True 499 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 548 560 0,00595816049987396 0,00609482047990198 0,005981536583505 0,00614938582436866 0,00175806281469611 0,00174908681923983 226081 265617 579 665 0 True 543 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 587 559 0,00597956002626449 0,00616280917445823 0,00593575951781491 0,00617990386816205 0,0016124050158098 0,00145262161820715 226893 268580 579 665 0 False 587 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 636 560 0,00565424505857396 0,0060245601414844 0,00566109712367437 0,00602731364919509 0,0016405694608536 0,00155420892156364 214549 262555 579 665 0 True 631 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 680 559 0,00594659105149287 0,00606779021254211 0,0059510185397116 0,00604257267109178 0,0015387360643795 0,0016208103865266 225642 264439 579 665 0 True 675 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 280 602 0,00637661084473708 0,00638276854874655 0,00636301213092241 0,00636301213092241 0,001299214039493 0,00137596122578377 241959 278166 579 665 0 False 280 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 324 602 0,00632964784470269 0,00619770988469113 0,00631723506523232 0,00624093995574884 0,00161916443938214 0,00138446535748417 240177 270101 579 665 0 False 324 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 371 604 0,00602886854089095 0,00613536588094177 0,00613412680247196 0,00608834973678187 0,00137912523811221 0,0012704455294245 228764 267384 579 665 0 True 368 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 416 604 0,00603129311777264 0,00609537118144411 0,005981536583505 0,00607309071488518 0,00163942316626079 0,00157200694586773 228856 265641 579 665 0 True 412 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 455 602 0,00592975078380377 0,00592217554644221 0,00588998245212482 0,00592050049591821 0,00197487827008076 0,00181754103502051 225003 258093 579 665 0 False 455 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 499 602 0,0060589649191397 0,00625578595148893 0,00601205462729839 0,00611886778057527 0,00191689908960911 0,0026976712484324 229906 272632 579 665 0 False 499 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 543 602 0,00603632675021179 0,00596719539751186 0,00602731364919509 0,0059662775616083 0,00173138241898654 0,00181645870977755 229047 260055 579 665 0 False 543 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 587 602 0,00607024447245885 0,00609796406787167 0,00611886778057527 0,00611886778057527 0,00158491835091517 0,00161437940161507 230334 265754 579 665 0 False 587 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 631 602 0,00598815146173655 0,00593624138166428 0,00592050049591821 0,005981536583505 0,0014310609905456 0,00128696885012643 227219 258706 579 665 0 False 631 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 675 602 0,00626645072119962 0,00629543646252275 0,00625619897764553 0,00633249408712902 0,00156199443296708 0,00156334403882734 237779 274360 579 665 0 False 675 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 283 649 0,0086317572397668 0,680717242866838 0,00764476997024491 0,683604180972 0,00382171480517573 0,196891809019458 327530 29666185 579 665 6 True 280 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 324 645 0,00867621660062989 0,00644965584021854 0,00662241550316625 0,00648508430609598 0,00815857205077212 0,00122617316030914 329217 281081 579 665 0 False 324 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 368 645 0,00575183427806181 0,00599119680638997 0,00578316929884794 0,00592050049591821 0,0011753293826506 0,00111729276674855 218252 261101 579 665 0 False 368 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 412 645 0,0058982576384384 0,00576634995591519 0,00590524147402152 0,00573739223315786 0,00134572347997341 0,00138999341987805 223808 251302 579 665 0 False 412 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 455 645 0,00586784501103117 0,00602121004043641 0,00579842832074464 0,005981536583505 0,00165720894844928 0,0015893095967614 222654 262409 579 665 0 False 455 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 499 645 0,00606866322666645 0,00587619196767382 0,00585946440833143 0,00582894636453803 0,00304300505700244 0,00161249714978767 230274 256089 579 665 0 False 499 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 543 645 0,00621940865887561 0,00580526619822617 0,00617990386816205 0,00581368734264134 0,00219864976699844 0,00163955620166112 235994 252998 579 665 0 False 543 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 587 645 0,00596701547631142 0,00606079171377746 0,00593575951781491 0,00608834973678187 0,00138302289075498 0,00125643771428022 226417 264134 579 665 0 False 587 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 631 645 0,00638101197885927 0,0061948416474925 0,0064087891966125 0,00619516289005875 0,00127744503314607 0,00128031932209224 242126 269976 579 665 0 False 631 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 679 648 0,00886372599751244 0,687695480403917 0,00802624551766232 0,689127946898604 0,00360543756480087 0,194470007147448 336332 29970302 579 665 4 True 675 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H6_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H6_3.csv new file mode 100755 index 0000000..2f96f39 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H6_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 282 258 0,00104865585542564 0,0658181044279272 0,000854505226215 0,0666971847104601 0,000786528379505288 0,020527163941746 39791 2868404 579 665 0 True 281 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 324 259 0,000845386708812138 0,000902462152176046 0,000778210116731518 0,000732433051041428 0,000598443576136491 0,000680980812596534 32078 39330 579 665 0 False 324 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 369 258 0,000868578313767393 0,000858153623931653 0,000701915007248035 0,000717174029144732 0,000661913033209686 0,000621489991590861 32958 37399 579 665 0 True 368 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 414 257 0,000868314772801993 0,000895394815718628 0,000701915007248035 0,000747692072938125 0,000715877799338906 0,00070225830764022 32948 39022 579 665 0 True 412 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 459 258 0,000841670781199989 0,0009478950294023 0,000549324788281071 0,000701915007248035 0,000860714791939969 0,000863693268925948 31937 41310 579 665 0 True 456 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 502 257 0,000962451605643097 0,000927977990295033 0,000778210116731518 0,000732433051041428 0,000860472840492967 0,000816973761437104 36520 40442 579 665 0 True 500 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 546 258 0,000902179786855973 0,000938716670366693 0,000762951094834821 0,00080872816052491 0,000768779716006447 0,000743713019057446 34233 40910 579 665 0 True 543 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 591 259 0,000982770614075486 0,000975108863942874 0,00064087891966125 0,00064087891966125 0,00100790044475411 0,00100260120487501 37291 42496 579 665 0 True 587 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 631 259 0,00104752262927442 0,00102572751402425 0,000701915007248035 0,000701915007248035 0,0010278345747798 0,000948871325878461 39748 44702 579 665 0 False 631 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 678 257 0,00119945399582788 0,0658623670643764 0,000930800335698482 0,0643167772945754 0,00100320994803216 0,0199938638639775 45513 2870333 579 665 0 True 675 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 280 301 0,000891901689205349 0,000898446620097968 0,000762951094834821 0,000732433051041428 0,00068412259159558 0,000730598517880348 33843 39155 579 665 0 False 280 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 324 301 0,000774204294057428 0,000855308332630615 0,000671396963454643 0,000762951094834821 0,000569520040941715 0,0006258001252326 29377 37275 579 665 0 False 324 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 370 302 0,000881412758782404 0,00090491736321807 0,000762951094834821 0,000793469138628214 0,000654540527327093 0,000657651063823662 33445 39437 579 665 0 True 368 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 414 302 0,000882704109512867 0,000878736094069002 0,000701915007248035 0,000671396963454643 0,000715097354678454 0,000763674718550519 33494 38296 579 665 0 True 412 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 459 302 0,000895406784045177 0,000841724361257917 0,000656137941557946 0,000549324788281071 0,000881878338983025 0,000875080998834545 33976 36683 579 665 0 True 456 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 503 303 0,000965851284096765 0,000824446100373387 0,000686655985351339 0,00064087891966125 0,000889264953761928 0,000740252526919707 36649 35930 579 665 0 True 500 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 543 302 0,000940076977680584 0,000913728587892253 0,000778210116731518 0,000732433051041428 0,000781775513943331 0,000745364972191347 35671 39821 579 665 0 False 543 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 591 303 0,00091757057923537 0,000922861055132682 0,000625619897764553 0,000503547722590982 0,000926659962623295 0,00103641488179578 34817 40219 579 665 0 True 587 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 631 302 0,000922077129743721 0,000957555252287276 0,000579842832074464 0,000518806744487678 0,00095250726756701 0,00102499540890155 34988 41731 579 665 0 False 631 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 675 302 0,00107232183411862 0,000948927594793805 0,00064087891966125 0,000564583810177768 0,00103489571680824 0,000996976137726153 40689 41355 579 665 0 False 675 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 282 341 0,000866680818816509 0,000826327663975686 0,000686655985351339 0,000656137941557946 0,000730717850073373 0,000724392838268334 32886 36012 579 665 0 True 280 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 327 341 0,000788646338961382 0,000859851620353241 0,00064087891966125 0,000762951094834821 0,000614296413916178 0,000626778533602737 29925 37473 579 665 0 True 324 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 371 340 0,000816133661652668 0,000853472660823494 0,000686655985351339 0,000732433051041428 0,000603580727847652 0,000641302719987187 30968 37195 579 665 0 True 368 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 412 345 0,000883073066864428 0,000876625071490812 0,000671396963454643 0,000671396963454643 0,000753066617633513 0,000728303231910347 33508 38204 579 665 0 False 412 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 460 340 0,000883521086505609 0,000847896807709363 0,000625619897764553 0,00064087891966125 0,000823773732615387 0,000748732875038798 33525 36952 579 665 0 True 456 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 500 345 0,000949221849179986 0,000909391813247929 0,000732433051041428 0,000656137941557946 0,000819858555064284 0,00084728238926248 36018 39632 579 665 0 False 500 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 543 345 0,000932038978235865 0,000918799631259426 0,000717174029144732 0,000701915007248035 0,000832758670013571 0,000856493812751294 35366 40042 579 665 0 False 543 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 591 340 0,000822801248077304 0,000938716670366693 0,000473029678797589 0,000518806744487678 0,000929445029811489 0,00104684894461897 31221 40910 579 665 0 True 587 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 636 341 0,000891084712212607 0,000894614655200602 0,000503547722590982 0,000457770656900893 0,00096602458507969 0,000985865269726628 33812 38988 579 665 0 True 631 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 675 345 0,000992020901961048 0,000974236919834491 0,000671396963454643 0,000549324788281071 0,000975130749092041 0,00102746195849877 37642 42458 579 665 0 False 675 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 280 387 0,00079191424693235 0,000814808823386 0,00064087891966125 0,000686655985351339 0,000652268410542561 0,000712557885562826 30049 35510 579 665 0 False 280 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 327 384 0,000863386556749001 0,000823482372674648 0,000747692072938125 0,000671396963454643 0,000684576089531411 0,000716247850265633 32761 35888 579 665 0 True 324 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 372 384 0,000860803855288075 0,000933324384433274 0,000778210116731518 0,000793469138628214 0,000635557882658927 0,000710384274007508 32663 40675 579 665 0 True 368 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 416 384 0,000896302823327539 0,00085916324342557 0,000732433051041428 0,000625619897764553 0,000778383884520535 0,000752935330726339 34010 37443 579 665 0 True 412 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 460 385 0,000890373151606025 0,00093341616802363 0,000579842832074464 0,000686655985351339 0,00088770909074921 0,000853988471176111 33785 40679 579 665 0 True 456 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 504 384 0,000942264367693409 0,000890553231327346 0,000656137941557946 0,000610360875867857 0,000887090149853753 0,000838571043859782 35754 38811 579 665 0 True 499 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 548 384 0,000904103635903398 0,000950786212498516 0,000610360875867857 0,000747692072938125 0,000858194526995934 0,000819249295366968 34306 41436 579 665 0 True 543 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 592 384 0,000925371391811229 0,000892159444158577 0,000473029678797589 0,000473029678797589 0,00106432688826819 0,000974535871042613 35113 38881 579 665 0 True 587 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 635 383 0,00095080309497239 0,000949661863516654 0,000564583810177768 0,000610360875867857 0,00100677396202918 0,000951835551131966 36078 41387 579 665 0 True 631 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 680 384 0,000910876638714194 0,000924444322066324 0,000579842832074464 0,000549324788281071 0,000905658087022159 0,00100623836723888 34563 40288 579 665 0 True 675 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 283 429 0,00077515304153287 0,000875363047123416 0,000656137941557946 0,000717174029144732 0,00072139278777457 0,000768263499057869 29413 38149 579 665 0 True 280 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 327 428 0,000853793665608418 0,000899043213435282 0,000762951094834821 0,000793469138628214 0,000684691476026566 0,00065642299976678 32397 39181 579 665 0 True 324 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 368 430 0,000912958612340859 0,000858842000859324 0,000793469138628214 0,000701915007248035 0,0007375491292495 0,000674452060253499 34642 37429 579 665 0 False 368 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 416 427 0,000838929955159822 0,000881328980496561 0,000656137941557946 0,000610360875867857 0,000729187532469141 0,000858187080703845 31833 38409 579 665 0 True 412 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 460 428 0,000828124775578397 0,000912351834036912 0,000564583810177768 0,000610360875867857 0,000844404244494808 0,000876862389824727 31423 39761 579 665 0 True 456 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 504 428 0,000906633629171244 0,00088275162614708 0,000671396963454643 0,000579842832074464 0,000865838728664651 0,000884805704615819 34402 38471 579 665 0 True 499 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 548 428 0,000945031547830116 0,00088555102565294 0,000671396963454643 0,000656137941557946 0,000875682424936496 0,000856001587508221 35859 38593 579 665 0 True 543 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 587 431 0,000916305582601447 0,000921897327433943 0,000579842832074464 0,000564583810177768 0,000932979245195171 0,000989150343233808 34769 40177 579 665 0 False 587 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 636 427 0,000956600996211203 0,000908015059392588 0,000549324788281071 0,000518806744487678 0,000979089270372426 0,000915904593754775 36298 39572 579 665 0 True 631 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 680 427 0,000915146002353684 0,00097988161064139 0,000579842832074464 0,000671396963454643 0,000947247651069215 0,000925417654789432 34725 42704 579 665 0 True 675 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 283 472 0,000778394595407298 0,000769077649491089 0,000610360875867857 0,00064087891966125 0,000718619220982821 0,000730524572828147 29536 33517 579 665 0 True 280 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 327 472 0,000773202838388906 0,000858635487781023 0,00064087891966125 0,000686655985351339 0,000721016661867914 0,000782130800240174 29339 37420 579 665 0 True 324 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 371 472 0,000870449454621738 0,00103903613462588 0,000717174029144732 0,000915541313801785 0,00072700895837058 0,000849817184643406 33029 45282 579 665 0 True 368 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 415 471 0,000831155496680504 0,00092967598671662 0,000549324788281071 0,000656137941557946 0,000856261667771216 0,000873739375073034 31538 40516 579 665 0 True 412 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 459 472 0,000917254330076889 0,000931695225704453 0,000488288700694286 0,00064087891966125 0,00101378230046297 0,000959415941662078 34805 40604 579 665 0 True 456 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 503 472 0,000948457580380324 0,000996586224086194 0,000595101853971161 0,000595101853971161 0,000951183825869964 0,0010482628591545 35989 43432 579 665 0 True 499 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 547 471 0,000890452213895645 0,00081129810105488 0,000564583810177768 0,000518806744487678 0,000910630389481115 0,000856702163140118 33788 35357 579 665 0 True 543 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 591 472 0,000864440720610603 0,000909460650940696 0,000457770656900893 0,000518806744487678 0,000978271966924291 0,00100701015905662 32801 39635 579 665 0 True 587 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 635 471 0,000873401113434225 0,000924949131813282 0,000534065766384375 0,000579842832074464 0,000908642416234407 0,000912826080176414 33141 40310 579 665 0 True 631 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 679 471 0,000870554871007898 0,000930708552108126 0,000534065766384375 0,000625619897764553 0,000897068378513406 0,000943886991318081 33033 40561 579 665 0 True 675 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 283 516 0,000902838639269475 0,000764281956894984 0,000717174029144732 0,000610360875867857 0,000772143566768261 0,000735309251057109 34258 33308 579 665 0 True 280 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 328 517 0,000802798488803396 0,000838718448673756 0,00064087891966125 0,000656137941557946 0,000694747788659688 0,000786577549768428 30462 36552 579 665 0 True 324 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 372 516 0,000837269647077799 0,000917858849458276 0,000625619897764553 0,000793469138628214 0,000759796652039155 0,000765011529746814 31770 40001 579 665 0 True 368 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 415 515 0,000920943903592498 0,000873114349159693 0,000686655985351339 0,000564583810177768 0,000898330736921054 0,000884262948751969 34945 38051 579 665 0 True 412 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 460 515 0,00085455793440808 0,00093761526728242 0,000457770656900893 0,000595101853971161 0,000969638089388554 0,000911217726409313 32426 40862 579 665 0 True 456 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 504 516 0,000877459644301394 0,000963176997196585 0,000488288700694286 0,000625619897764553 0,000922063285980821 0,000909277287874047 33295 41976 579 665 0 True 499 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 548 516 0,000871002890649079 0,000886973671303459 0,000579842832074464 0,000671396963454643 0,000844512999980678 0,000873629718126285 33050 38655 579 665 0 True 543 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 592 516 0,000953385796433316 0,000872586593515145 0,00064087891966125 0,000595101853971161 0,000894628676656503 0,000845275846520163 36176 38028 579 665 0 True 587 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 636 516 0,000954413606198378 0,000877336394316072 0,000564583810177768 0,000549324788281071 0,000982954744406264 0,00092465599150853 36215 38235 579 665 0 True 631 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 680 515 0,000966984510247988 0,000944361361173591 0,000625619897764553 0,00064087891966125 0,000983831430504367 0,000923842556740447 36692 41156 579 665 0 True 675 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 283 561 0,000904630717834199 0,000831008627083846 0,000762951094834821 0,000671396963454643 0,000723693940419535 0,000675582285916216 34326 36216 579 665 0 True 280 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 327 560 0,000877512352494475 0,000796704510188265 0,000762951094834821 0,00064087891966125 0,000660391591305492 0,000673703004182012 33297 34721 579 665 0 True 324 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 371 560 0,000861330937218876 0,000970129604166057 0,000717174029144732 0,000885023270008392 0,000687881278059373 0,000647436919957177 32683 42279 579 665 0 True 368 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 416 559 0,0008377967290086 0,000858084786238886 0,000579842832074464 0,000564583810177768 0,000830910157964542 0,000866738258393932 31790 37396 579 665 0 True 412 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 460 559 0,000916410998987607 0,000801247797910891 0,000564583810177768 0,000411993591210803 0,00102152183401989 0,000885059307481534 34773 34919 579 665 0 True 455 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 504 560 0,000843568276150874 0,000971299844943097 0,000396734569314107 0,000534065766384375 0,000999601275987226 0,00110024100486222 32009 42330 579 665 0 True 499 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 548 560 0,000923526605053424 0,00100149664617024 0,000564583810177768 0,00064087891966125 0,000986943461047878 0,00100527663933229 35043 43646 579 665 0 True 543 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 587 559 0,000920047864310136 0,000929859553897332 0,00064087891966125 0,000732433051041428 0,000862324500153346 0,000789099697879994 34911 40524 579 665 0 False 587 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 636 560 0,000927954093272155 0,000894063953658465 0,000686655985351339 0,000625619897764553 0,000863858648348712 0,000834773512126522 35211 38964 579 665 0 True 631 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 680 559 0,000914381733554022 0,000881260142803794 0,000625619897764553 0,000579842832074464 0,000864979064446122 0,000839961510039471 34696 38406 579 665 0 True 675 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 280 602 0,000901758121311332 0,000918409551000412 0,00080872816052491 0,000762951094834821 0,000653409087053826 0,000779977307265946 34217 40025 579 665 0 False 280 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 324 602 0,00087158268077296 0,000827314337572014 0,000732433051041428 0,000701915007248035 0,000692729738223199 0,000702330749453586 33072 36055 579 665 0 False 324 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 371 604 0,000877248811529074 0,000870475570936955 0,000732433051041428 0,000762951094834821 0,000694548972141082 0,000666280231776389 33287 37936 579 665 0 True 368 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 416 604 0,000790543833912267 0,000968110365178224 0,000564583810177768 0,000717174029144732 0,000794864607742703 0,000842578684749792 29997 42191 579 665 0 True 412 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 455 602 0,000850235862575509 0,000819811029060406 0,0004272526131075 0,000442511635004196 0,000990017879078947 0,000916973965283589 32262 35728 579 665 0 False 455 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 499 602 0,000767088687991611 0,00102173492784376 0,000305180437933928 0,000656137941557946 0,000912963422586037 0,00110139104382529 29107 44528 579 665 0 False 499 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 543 602 0,000854320747539219 0,000898974375742515 0,000366216525520714 0,000473029678797589 0,00101025476126296 0,00104685899504996 32417 39178 579 665 0 False 543 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 587 602 0,000869975080884017 0,000909437705043107 0,000579842832074464 0,000656137941557946 0,000837069141144539 0,000879904508303546 33011 39634 579 665 0 False 587 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 631 602 0,000953043193178295 0,000908611652729902 0,000732433051041428 0,000701915007248035 0,000780356491814559 0,000756053319726044 36163 39598 579 665 0 False 631 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 675 602 0,000939787082618643 0,000965448641057898 0,000747692072938125 0,000717174029144732 0,000804226276982233 0,00085649863654028 35660 42075 579 665 0 False 675 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 283 649 0,00105297792725821 0,0673611013113007 0,000854505226215 0,067002365148394 0,000813431611004755 0,020338485771644 39955 2935649 579 665 0 True 280 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 324 645 0,0010315256926746 0,000864853826027646 0,000823987182421607 0,000732433051041428 0,000908413076489785 0,000644134739973941 39141 37691 579 665 0 False 324 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 368 645 0,000812733983199 0,000876716855081168 0,00064087891966125 0,000747692072938125 0,000669280537266573 0,000624161396590379 30839 38208 579 665 0 False 368 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 412 645 0,000861041042156935 0,000841999712028985 0,000732433051041428 0,000671396963454643 0,000667314573804243 0,00066454770720775 32672 36695 579 665 0 False 412 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 455 645 0,000804142547726939 0,000875707235587252 0,000610360875867857 0,00064087891966125 0,000741720458758643 0,00083447095430675 30513 38164 579 665 0 False 455 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 499 645 0,00095960536321677 0,000896083192646299 0,000671396963454643 0,000579842832074464 0,000930558516885974 0,000872215529994934 36412 39052 579 665 0 False 499 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 543 645 0,000883389316022909 0,000867010740401014 0,000595101853971161 0,000534065766384375 0,000877888758124062 0,000850410707736648 33520 37785 579 665 0 False 543 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 587 645 0,00092584576554895 0,000883049922815737 0,000732433051041428 0,000762951094834821 0,000763135803313702 0,00064967913403642 35131 38484 579 665 0 False 587 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 631 645 0,000935465010786073 0,000971621087509343 0,000762951094834821 0,000839246204318303 0,000731753813710855 0,000730988386850711 35496 42344 579 665 0 False 631 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 679 648 0,00106575966408014 0,0677606811719158 0,000900282291905089 0,0678721293965057 0,000841231675834269 0,0197591320385912 40440 2953063 579 665 0 True 675 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H7_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H7_1.csv new file mode 100755 index 0000000..aee91a8 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H7_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 276 268 0,0101355746965359 0,0409021638555074 0,0101777676050965 0,0417029068436713 0,00151566300998068 0,00938521213301863 384592 1782548 579 665 0 True 276 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 319 269 0,0103176551495312 0,00995989630748879 0,0103303578240635 0,0100099183642329 0,00134377626835679 0,00143735345053306 391501 434060 579 665 0 False 319 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 364 268 0,0109341301757963 0,0541579400549898 0,0106965743495842 0,0554818036163882 0,00176345209945318 0,0126748182178344 414893 2360245 579 665 0 True 363 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 409 268 0,0107232446952827 0,0756279116192863 0,0106813153276875 0,0776989394979782 0,00166719968613232 0,0158620400484248 406891 3295923 579 665 0 True 407 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 454 269 0,0106129000930695 0,0633767527080461 0,010605020218204 0,0636911573968109 0,00173739002568583 0,0149862179464389 402704 2762008 579 665 0 True 450 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 497 268 0,010393871196725 0,0559430849956202 0,0103761348897536 0,0559395742732891 0,00159619561390195 0,0162505020492206 394393 2438043 579 665 0 True 494 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 542 269 0,0103846736170325 0,0708766881727092 0,0104676890211337 0,0698710612649729 0,00152727049943565 0,0217011560411607 394044 3088861 579 665 0 True 538 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 585 270 0,0105098028674048 0,0606477741618867 0,0105592431525139 0,0591134508278019 0,00175314530545764 0,0183725275582983 398792 2643077 579 665 0 True 582 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 625 269 0,0104347200463621 0,0100685221866752 0,0104371709773404 0,0101472495613031 0,00193632916047493 0,00182300920387527 395943 438794 579 665 0 False 625 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 670 267 0,0102373542173736 0,04160203667787 0,0102235446707866 0,0416266117341878 0,00180493537385322 0,00849227973298871 388454 1813049 579 665 0 True 669 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 275 312 0,010266264661278 0,0100367421185144 0,0102845807583734 0,0100404364080262 0,00133591447025755 0,00141611863087024 389551 437409 579 665 0 False 275 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 319 312 0,0100744331925629 0,0100875443357765 0,0100862134737163 0,0100709544518196 0,00134729352351229 0,00126563680074784 382272 439623 579 665 0 False 319 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 366 314 0,0105489123466702 0,0914415588066068 0,0105287251087205 0,0929121843289845 0,00144984835328992 0,0215480261245859 400276 3985094 579 665 0 True 363 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 410 314 0,0107188962693536 0,0452444684611506 0,0106965743495842 0,0450446326390478 0,00149288028641674 0,00869685584086383 406726 1971789 579 665 0 True 407 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 454 314 0,0107440907856459 0,0638291769708088 0,0107881284809644 0,0610360875867857 0,00188989180942185 0,0138134722169742 407682 2781725 579 665 0 True 450 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 497 314 0,010648741664364 0,0372070253454648 0,010605020218204 0,0373693446250095 0,00173102974861255 0,00811848846386253 404064 1621511 579 665 0 True 494 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 538 312 0,010749704208209 0,0353719730775784 0,0107423514152743 0,0383154039826047 0,00177557686819569 0,0113918388512658 407895 1541538 579 665 0 False 538 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 585 313 0,010455012700698 0,0446936062977311 0,0103913939116503 0,0452124818799115 0,00202262306362259 0,00966317716409926 396713 1947782 579 665 0 True 582 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 625 312 0,0103192627494201 0,0102367385619003 0,0102998397802701 0,01025406271458 0,00192981852484835 0,00204575850976061 391562 446125 579 665 0 False 625 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 669 312 0,0101927367319313 0,00998839511229435 0,0102235446707866 0,0100404364080262 0,0019126702864634 0,0018961435606948 386761 435302 579 665 0 False 669 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 278 353 0,0105367367540687 0,0454732161142155 0,010605020218204 0,0453803311207752 0,00160555898813642 0,00969304869968649 399814 1981758 579 665 0 True 275 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 322 353 0,010596428782732 0,057186523185969 0,0106965743495842 0,0570229648279545 0,00134086666569118 0,0180710405818415 402079 2492233 579 665 0 True 319 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 365 352 0,0111745322444348 0,036029579556582 0,0109102006561379 0,0363622491798276 0,00239320833741014 0,00799336378020803 424015 1570197 579 665 0 True 363 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 407 355 0,0109618019771634 0,0303635949567212 0,0108033875028611 0,0318760967421988 0,00176835755506282 0,00787909482443526 415943 1323269 579 665 0 False 407 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 454 352 0,0110724628285351 0,0606580080322114 0,0110170138094148 0,0602883955138476 0,00202955466971727 0,0115544615554975 420142 2643523 579 665 0 True 450 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 494 355 0,0112696178247513 0,0269416273574759 0,010955977721828 0,0290836957351034 0,00234422643208341 0,0073619742486432 427623 1174137 579 665 0 False 494 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 542 352 0,0106118722833044 0,0251890885373195 0,010605020218204 0,0255283436331731 0,00169819851437823 0,0032274898340975 402665 1097760 579 665 0 True 538 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 586 352 0,0106856637536166 0,0444026982080975 0,0108033875028611 0,0443121995880064 0,00211719548889892 0,00857081050432071 405465 1935104 579 665 0 True 582 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 630 353 0,0104463158488398 0,0513316479571554 0,010406652933547 0,0511787594415198 0,00206021157450715 0,0131636266833942 396383 2237073 579 665 0 True 625 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 674 353 0,0103510457898474 0,0562757546188658 0,010406652933547 0,0554512855725948 0,00193955555540617 0,016703541561426 392768 2452541 579 665 0 True 669 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 275 398 0,0108350651269022 0,0419099247317194 0,0106965743495842 0,0441443503471428 0,0018126019665426 0,0162320712339394 411134 1826467 579 665 0 False 275 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 322 396 0,0104739349420137 0,0299264067699576 0,0105134660868238 0,0305485618371862 0,00152825484960504 0,00541033927418309 397431 1304216 579 665 0 True 319 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 366 396 0,0108996326634254 0,0804217455976861 0,0108033875028611 0,0795452811474784 0,00152550831350271 0,0233735235426514 413584 3504842 579 665 0 True 363 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 411 397 0,0106121885324629 0,0593194590963561 0,010605020218204 0,0594491493095293 0,00158157454447029 0,0160694542526831 402677 2585188 579 665 0 True 407 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 455 396 0,0108630531774278 0,0383709330547701 0,0108949416342412 0,0390173189898528 0,00170289351187977 0,00829818266828344 412196 1672235 579 665 0 True 450 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 499 398 0,0107602722009215 0,048242946574493 0,0108491645685512 0,0485999847409781 0,00191893749638437 0,0113733445637126 408296 2102465 579 665 0 True 494 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 542 396 0,0107285155145907 0,0377005916026046 0,0107728694590677 0,0387884336614023 0,0017013523669875 0,00645916000210144 407091 1643021 579 665 0 True 538 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 587 398 0,0106460535465169 0,046470903741386 0,0106660563057908 0,0473334859235523 0,00199590801791714 0,00881926159573462 403962 2025238 579 665 0 True 582 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 630 397 0,0107952967952233 0,0391746590096206 0,0109254596780346 0,0392767223620966 0,00194664625519908 0,00862987077914345 409625 1707262 579 665 0 True 625 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 674 397 0,0111049047213759 0,0800102568162223 0,0112458991378653 0,0764171816586557 0,0020292771796059 0,0188366569459998 421373 3486909 579 665 0 True 669 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 278 441 0,010433296925149 0,0421536331100124 0,0104829480430304 0,043076218814374 0,00167515862034779 0,00871777749356072 395889 1837088 579 665 0 True 275 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 322 441 0,0107772969472864 0,0531663789824756 0,0107881284809644 0,053681239032578 0,00153327266174846 0,00851690914761922 408942 2317032 579 665 0 True 319 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 366 441 0,0111244331069121 0,0337596107457933 0,0106660563057908 0,0342412451361868 0,00389420947209631 0,00579880243349995 422114 1471270 579 665 0 True 363 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 410 441 0,0108806577139165 0,0516765477438159 0,0107881284809644 0,0500801098649577 0,00165822141419417 0,0137346416784041 412864 2252104 579 665 0 True 407 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 455 441 0,0114301933349699 0,0855591026088912 0,011459525444419 0,0836194399938964 0,00180931360299092 0,0138375247113908 433716 3728732 579 665 0 True 450 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 499 442 0,011189817620428 0,0537322248170208 0,0111848630502785 0,053833829251545 0,00189782586066943 0,0124851071449326 424595 2341692 579 665 0 True 494 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 544 442 0,0114869864130138 0,0506731695340434 0,0114137483787289 0,0501716639963378 0,00186584540421614 0,0115246754389517 435871 2208376 579 665 0 True 538 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 581 441 0,012350873697597 0,0288241317415764 0,01196307316701 0,0307469291218433 0,00293660698524206 0,00855626329899042 468651 1256178 579 665 0 False 581 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 631 441 0,0111760607820341 0,0400544735608763 0,0111848630502785 0,0393835355153735 0,00197519153617981 0,00849305850643398 424073 1745605 579 665 0 True 625 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 675 441 0,0111371357814444 0,0692838069079772 0,0111543450064851 0,068909742885481 0,00214970190752502 0,00988537771173306 422596 3019442 579 665 0 True 669 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 278 486 0,0108741482520711 0,0487908028253284 0,0105897611963073 0,049408712901503 0,00226929029994332 0,013831258556242 412617 2126341 579 665 0 True 275 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 322 486 0,0107400059006822 0,0516779015517737 0,0106965743495842 0,0527504386968795 0,0016435374043524 0,00978534658573132 407527 2252163 579 665 0 True 319 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 366 486 0,0109790375563006 0,0655853412427842 0,0109712367437247 0,0631113145647364 0,00166078980936554 0,0195923572268279 416597 2858260 579 665 0 True 363 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 410 485 0,011260525661445 0,0808651521226963 0,0111696040283818 0,0812085145342184 0,00196067399823782 0,0237674456697139 427278 3524166 579 665 0 True 406 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 455 486 0,010967784357078 0,0910180463748063 0,0108949416342412 0,0874799725337606 0,00196836217415168 0,0318499083914553 416170 3966637 579 665 0 True 450 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 498 484 0,0111630418583433 0,042840885688701 0,0111696040283818 0,0442206454566262 0,00187890508332556 0,00770410076770834 423579 1867039 579 665 0 True 494 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 538 484 0,0116010469428392 0,035530666905304 0,0115358205539025 0,0389410238803693 0,0019251186475777 0,00902263462540582 440199 1548454 579 665 0 False 538 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 585 485 0,0109038493188718 0,0885511329250111 0,0109712367437247 0,0858930342565042 0,00202917046899643 0,0187800984613442 413744 3859127 579 665 0 True 581 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 630 484 0,0106447094875933 0,0544680079691102 0,0106660563057908 0,0562752727550164 0,00193342722434218 0,0136444955314726 403911 2373758 579 665 0 True 625 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 673 484 0,0106528529034242 0,069621822925361 0,0108033875028611 0,0680094605935759 0,00198354406129585 0,0160964463643298 404220 3034173 579 665 0 True 669 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 279 529 0,0103605596186984 0,0476193688616139 0,0103456168459602 0,050263218127718 0,00144635059887336 0,0119031616020865 393129 2075289 579 665 0 True 275 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 322 530 0,0107594288698322 0,0940710668867178 0,0107270923933776 0,0886091401541161 0,00173767634032721 0,0271640228001878 408264 4099690 579 665 0 True 319 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 365 529 0,0110259214940454 0,0517462344347938 0,0108949416342412 0,053528648813611 0,00168995142851674 0,0135762336733948 418376 2255141 579 665 0 True 363 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 410 529 0,0112556765076816 0,0551991331039891 0,0111848630502785 0,055039291981384 0,00177066907765907 0,0121860312815186 427094 2405621 579 665 0 True 406 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 454 528 0,0110170138094148 0,052024155146392 0,0110780498970016 0,054032196536202 0,00194213674379037 0,0106332432763839 418038 2267253 579 665 0 True 450 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 498 530 0,0110913850698509 0,057148501833664 0,0110780498970016 0,0578469520103761 0,00191023057411626 0,0141193094114802 420860 2490576 579 665 0 True 494 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 542 530 0,011019754635455 0,0671551618804393 0,0111390859845884 0,0672770275425345 0,00197657142247166 0,0184032378036979 418142 2926674 579 665 0 True 538 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 586 530 0,0107318888389479 0,0542006882621982 0,0107423514152743 0,0543221179522393 0,00171145102756142 0,0148361719859008 407219 2362108 579 665 0 True 581 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 629 529 0,0103630632578697 0,0406807359437734 0,0103608758678569 0,0399938963912413 0,00182631171259977 0,00922180124403906 393224 1772898 579 665 0 True 625 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 674 530 0,0107487818148301 0,0581940316573076 0,0105592431525139 0,0583657587548638 0,00211867812603109 0,015189442627519 407860 2536141 579 665 0 True 669 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 277 574 0,0106264460986911 0,0412158113296517 0,0105134660868238 0,0424811169604028 0,00155434558819632 0,0104317770616866 403218 1796217 579 665 0 True 275 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 321 574 0,0106696668170168 0,0487519783666078 0,0106202792401007 0,0493018997482261 0,00159485423198095 0,0137050741414965 404858 2124649 579 665 0 True 319 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 366 574 0,0106525103001692 0,0474240763272337 0,0107118333714809 0,0472571908140688 0,00151894356048358 0,0106332906161669 404207 2066778 579 665 0 True 363 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 410 574 0,0107697596756759 0,0477597518630635 0,0108339055466545 0,046646829938201 0,00171075739521315 0,00970881769032716 408656 2081407 579 665 0 True 406 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 455 574 0,0109657814457409 0,082946299142225 0,0109254596780346 0,0808422980086976 0,00219455725642495 0,0240301225973181 416094 3614864 579 665 0 True 450 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 499 574 0,0108090009254241 0,0584260835196253 0,0108339055466545 0,0577096208133059 0,00207158096481362 0,0130693705429759 410145 2546254 579 665 0 True 494 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 543 574 0,0107629339646721 0,0521208950506273 0,0106202792401007 0,0525825894560159 0,00198933429670651 0,00983854510593504 408397 2271469 579 665 0 True 538 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 581 569 0,0121651563792792 0,029759337689612 0,0110933089188983 0,0327153429465171 0,00398189549764478 0,0121695912374144 461604 1296935 579 665 0 False 581 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 631 574 0,0105209506502412 0,0442896208247788 0,0105439841306172 0,0445258258945602 0,00168375577791503 0,00834532784962979 399215 1930176 579 665 0 True 625 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 675 574 0,0108249978620239 0,048124637526524 0,010757610437171 0,0477454795147631 0,0017959310980967 0,00853221577491749 410752 2097309 579 665 0 True 669 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 275 612 0,0103429814363062 0,0102073448670888 0,0103303578240635 0,0101930266269932 0,00143253194240338 0,00163692375878318 392462 444844 579 665 0 False 275 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 319 612 0,0105986952350344 0,0103242542153048 0,0105745021744106 0,0103303578240635 0,00156662900378292 0,00139048585645474 402165 449939 579 665 0 False 319 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 367 618 0,0107082228602549 0,0703696756195823 0,0106507972838941 0,0683909361409934 0,00154044525544799 0,0139165707386391 406321 3066765 579 665 0 True 363 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 411 618 0,0106533536312585 0,0716999181405104 0,0106355382619974 0,0684367132066835 0,00164381893509487 0,0232706412381154 404239 3124738 579 665 0 True 406 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 450 612 0,0113583257137052 0,0103558048244897 0,0107728694590677 0,0103303578240635 0,00348967170931646 0,0020507824223532 430989 451314 579 665 0 False 450 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 494 612 0,0103562902550589 0,0103530283708814 0,0103150988021668 0,0103761348897536 0,00192602505508669 0,00203046506732259 392967 451193 579 665 0 False 494 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 538 612 0,0102920126135977 0,0101048455425586 0,0102082856488899 0,0101777676050965 0,00189736193599902 0,00195576338120881 390528 440377 579 665 0 False 538 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 581 612 0,0102087073144345 0,0103320099286899 0,0102388036926833 0,0103150988021668 0,00165153120378363 0,00173877456055854 387367 450277 579 665 0 False 581 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 625 612 0,010171152726865 0,010016389107353 0,0102082856488899 0,0100099183642329 0,00150866680710859 0,00134461642159816 385942 436522 579 665 0 False 625 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 669 612 0,0103443518493263 0,0102696429790429 0,0102998397802701 0,0102235446707866 0,0015645614791979 0,00167865799738853 392514 447559 579 665 0 False 669 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 275 659 0,0102374859878563 0,0404641955082258 0,0102693217364767 0,0411841000991836 0,00153624428905126 0,00963780009988205 388459 1763461 579 665 0 True 275 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 319 655 0,0101501748660191 0,0102698953839164 0,0101472495613031 0,0102693217364767 0,00133956972326009 0,00124549124361762 385146 447570 579 665 0 False 319 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 363 655 0,0104610477888056 0,0100768744933976 0,0102998397802701 0,0101167315175097 0,00222272235190868 0,00123469497928666 396942 439158 579 665 0 False 363 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 406 655 0,0103762139520432 0,0100858463393549 0,01025406271458 0,0101472495613031 0,0018818686422255 0,00154687195377107 393723 439549 579 665 0 False 406 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 450 655 0,0100140032491966 0,020077385039619 0,0100709544518196 0,0110627908751049 0,00155282695555841 0,020727707057575 379979 874988 579 665 0 False 450 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 494 655 0,0101387371881207 0,0105697064818145 0,0101472495613031 0,0104371709773404 0,00167089034203469 0,00236762246746025 384712 460636 579 665 0 False 494 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 537 655 0,010015294599927 0,0100080826924257 0,00994888227664607 0,0100709544518196 0,00162258947765706 0,00168726053688607 380028 436160 579 665 0 False 537 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 581 655 0,0100961226140154 0,00995094740742908 0,0101625085831998 0,00987258716716258 0,00147324468138701 0,0013610772563586 383095 433670 579 665 0 False 581 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 625 655 0,0101892843452845 0,010092317082475 0,0101625085831998 0,010101472495613 0,00135004287640963 0,00141633267907569 386630 439831 579 665 0 False 625 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 672 658 0,0106115033259529 0,0410929589939601 0,0105134660868238 0,041214618142977 0,00146901504347091 0,00849074312494119 402651 1790863 579 665 0 True 669 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H7_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H7_2.csv new file mode 100755 index 0000000..3489eae --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H7_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 276 268 0,00815211268273766 0,653222688215159 0,00747692072938125 0,672281986724651 0,0030422637904805 0,213613510289307 309330 28467951 579 665 3 True 276 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 319 269 0,00658920934152577 0,00611251176694311 0,00636301213092241 0,00607309071488518 0,00186049974165968 0,00127327084815856 250026 266388 579 665 0 False 319 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 364 268 0,00615774007297186 0,00606898339921674 0,00616464484626535 0,00607309071488518 0,00129761115626514 0,00118544953340887 233654 264491 579 665 0 True 363 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 409 268 0,00592972442970723 0,00614208902893535 0,00590524147402152 0,00614938582436866 0,00129223881039035 0,00126307011394775 225002 267677 579 665 0 True 407 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 454 269 0,00612521911784142 0,00618892160591453 0,00614938582436866 0,00617990386816205 0,00161296799370442 0,00164997844200778 232420 269718 579 665 0 True 450 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 497 268 0,00608805984171993 0,0062000733121428 0,00608834973678187 0,00625619897764553 0,00157952264536777 0,00147683288176191 231010 270204 579 665 0 True 494 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 542 269 0,00617410596692324 0,00603330252846582 0,00622568093385214 0,00601205462729839 0,00144658422160021 0,00147765170875217 234275 262936 579 665 0 True 538 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 585 270 0,00626721498999928 0,0064342820888339 0,00627145799954223 0,00648508430609598 0,00168477642723928 0,0018484558117304 237808 280411 579 665 0 True 582 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 625 269 0,00668042086965093 0,00663586179915341 0,00660715648126955 0,00668345159075303 0,00185393856013315 0,00177914608462927 253487 289196 579 665 0 False 625 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 670 267 0,00871653836833619 0,668538730667364 0,00825513084611276 0,671351186388952 0,00283628370808897 0,190085383399564 330747 29135436 579 665 4 True 669 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 275 312 0,0060931725364487 0,00614596688562789 0,00602731364919509 0,00613412680247196 0,00139848760752898 0,00138603158744505 231204 267846 579 665 0 False 275 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 319 312 0,00588705714740887 0,00585455398624738 0,00588998245212482 0,00579842832074464 0,00127113258614873 0,00118150826956546 223383 255146 579 665 0 False 319 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 366 314 0,00600530797858413 0,00607857478440895 0,0059662775616083 0,00610360875867857 0,0012005541788234 0,00116758282461945 227870 264909 579 665 0 True 363 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 410 314 0,00617518648488138 0,00620101409394395 0,00614938582436866 0,00625619897764553 0,0014378972173981 0,00141613064668154 234316 270245 579 665 0 True 407 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 454 314 0,00634888633517693 0,00635622014523606 0,00631723506523232 0,00646982528419928 0,00160699995041678 0,00163572269403433 240907 277009 579 665 0 True 450 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 497 314 0,00613937126768343 0,00632028686961166 0,00605783169298848 0,0063935301747158 0,00157852098395515 0,00148376141422961 232957 275443 579 665 0 True 494 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 538 312 0,00622083178008877 0,00636395291272356 0,00617990386816205 0,00633249408712902 0,00140334890201206 0,00140058596531568 236048 277346 579 665 0 False 538 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 585 313 0,00629844459439925 0,00631477985419029 0,00636301213092241 0,00627145799954223 0,00161308869529644 0,00184482097925808 238993 275203 579 665 0 True 582 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 625 312 0,00649127751878289 0,00643715032603252 0,00651560234988937 0,00642404821850919 0,0017820369841674 0,00184263849894862 246310 280536 579 665 0 False 625 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 669 312 0,00649109304010711 0,00666197423060971 0,00651560234988937 0,00672922865644312 0,00191216997748227 0,00185722231310222 246303 290334 579 665 0 False 669 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 278 353 0,00585680264458088 0,00601618488886441 0,00593575951781491 0,00599679560540169 0,00128080707353379 0,00142121379988027 222235 262190 579 665 0 True 275 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 322 353 0,00599708550046363 0,00598669941046253 0,005981536583505 0,005981536583505 0,00123604288168536 0,00120112014791264 227558 260905 579 665 0 True 319 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 365 352 0,00620404422059275 0,00611533411234656 0,00614938582436866 0,00614938582436866 0,00132418155679981 0,0012661622333543 235411 266511 579 665 0 True 363 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 407 355 0,00626647707529616 0,0063181070093407 0,00625619897764553 0,00625619897764553 0,00143676573411121 0,00134947306271839 237780 275348 579 665 0 False 407 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 454 352 0,00651257162878726 0,00654641869035142 0,00653086137178607 0,00651560234988937 0,00165757639290578 0,00157972068521487 247118 285298 579 665 0 True 450 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 494 355 0,00631502132112295 0,00640608158069699 0,00634775310902571 0,00648508430609598 0,00164408447413738 0,00157008560797702 239622 279182 579 665 0 False 494 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 542 352 0,0064197788548697 0,00634396703592352 0,0064087891966125 0,00636301213092241 0,00157847411695009 0,00156967333481111 243597 276475 579 665 0 True 538 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 586 352 0,0062263134321691 0,00637237405713873 0,00627145799954223 0,0063782711528191 0,0019211008107266 0,00200809018281161 236256 277713 579 665 0 True 582 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 630 353 0,00612861879629509 0,00627735509522261 0,00611886778057527 0,00627145799954223 0,00185984422336389 0,00185397526126271 232549 273572 579 665 0 True 625 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 674 353 0,00580182799919831 0,00597433157166205 0,00587472343022812 0,0059510185397116 0,0017688009000852 0,00185538792822458 220149 260366 579 665 0 True 669 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 275 398 0,00591638925685796 0,00594314809683857 0,005981536583505 0,0059662775616083 0,00142915474541192 0,00139418128830471 224496 259007 579 665 0 False 275 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 322 396 0,00586586845379066 0,00608855624986017 0,00588998245212482 0,00610360875867857 0,00134003814651516 0,0012487612654477 222579 265344 579 665 0 True 319 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 366 396 0,00606695021039134 0,00625638254482625 0,00610360875867857 0,00628671702143893 0,0012586310567338 0,00133022882943203 230209 272658 579 665 0 True 363 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 411 397 0,00630590280372009 0,00639148798983038 0,00634775310902571 0,00651560234988937 0,00141296872374887 0,00139319358980946 239276 278546 579 665 0 True 407 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 455 396 0,00655684651097457 0,00654139353877943 0,00659189745937285 0,00653086137178607 0,00155354095664136 0,00154254679201508 248798 285079 579 665 0 True 450 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 499 398 0,00627401434690662 0,00646326275748882 0,00630197604333562 0,00643930724040589 0,00171588431291147 0,00161728605769488 238066 281674 579 665 0 True 494 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 542 396 0,00632311202876075 0,00643728800141806 0,00631723506523232 0,00643930724040589 0,00159714970599169 0,00147027902413866 239929 280542 579 665 0 True 538 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 587 398 0,00631884266512126 0,00631468807059994 0,00642404821850919 0,0063782711528191 0,00173259819401466 0,00180342165515801 239767 275199 579 665 0 True 582 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 630 397 0,00609567617562001 0,00600611163982283 0,00613412680247196 0,00588998245212482 0,00175793544387506 0,0018571919192982 231299 261751 579 665 0 True 625 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 674 397 0,00612835525532969 0,00592224438413498 0,00604257267109178 0,00599679560540169 0,001766725553532 0,00172223769876905 232539 258096 579 665 0 True 669 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 278 441 0,00591296322430775 0,00604957116985643 0,00582894636453803 0,00608834973678187 0,00145174901910011 0,00142611186904651 224366 263645 579 665 0 True 275 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 322 441 0,0058658948078872 0,00617455747402381 0,00585946440833143 0,00627145799954223 0,00138255329878931 0,00145643976769139 222580 269092 579 665 0 True 319 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 366 441 0,00675313182200496 0,00618316218561969 0,00622568093385214 0,00619516289005875 0,00398632421646312 0,00128983443646349 256246 269467 579 665 0 True 363 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 410 441 0,00624876712242124 0,00627184807980124 0,00630197604333562 0,00627145799954223 0,00144529101839759 0,0016052526986853 237108 273332 579 665 0 True 407 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 455 441 0,00652171650028667 0,00636996473789188 0,00648508430609598 0,00634775310902571 0,00174602248894553 0,0017633368789233 247465 277608 579 665 0 True 450 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 499 442 0,0068543315527188 0,0065299664817801 0,00686655985351339 0,00657663843747616 0,00174826193061419 0,00175729996263707 260086 284581 579 665 0 True 494 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 544 442 0,00763493989223546 0,0080789292985267 0,00750743877317464 0,0080872816052491 0,00193809578239379 0,00196940129630217 289706 352086 579 665 0 True 538 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 581 441 0,00728345530668064 0,00903981170596438 0,0072632944228275 0,00904859998474098 0,00201726062508827 0,00210317987176375 276369 393962 579 665 0 False 581 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 631 441 0,0066376481709664 0,0067121339627393 0,00669871061264973 0,00688181887541009 0,00193970092186799 0,0019666292279429 251864 292520 579 665 0 True 625 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 675 441 0,00635368278074723 0,00681548228548024 0,0064087891966125 0,0068207827878233 0,00183115219722792 0,00190084548875402 241089 297024 579 665 0 True 669 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 278 486 0,00612719567508193 0,00605888720427757 0,00601205462729839 0,00607309071488518 0,00174609187010529 0,00146551380022314 232495 264051 579 665 0 True 275 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 322 486 0,0060062040178665 0,00618580096384243 0,00602731364919509 0,00624093995574884 0,00140524338374038 0,00147543776518951 227904 269582 579 665 0 True 319 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 366 486 0,00606890041353531 0,00623309245877339 0,005981536583505 0,00614938582436866 0,00148929731842435 0,00152966917021337 230283 271643 579 665 0 True 363 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 410 485 0,00618209125817488 0,00639293358137849 0,00621042191195544 0,00645456626230259 0,001499012991433 0,00156322803559177 234578 278609 579 665 0 True 406 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 455 486 0,00634580290588175 0,00630704708670279 0,00636301213092241 0,00621042191195544 0,00185157776899146 0,00191601215226062 240790 274866 579 665 0 True 450 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 498 484 0,0066548837501036 0,00661530227491365 0,00660715648126955 0,00657663843747616 0,00176773888671112 0,00174544165655238 252518 288300 579 665 0 True 494 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 538 484 0,00691887273514541 0,007184934182561 0,00695811398489357 0,0072480354009308 0,00172627131404629 0,0017940167744742 262535 313125 579 665 0 False 538 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 585 485 0,00614880603424478 0,00615631548544054 0,00614938582436866 0,00617990386816205 0,00180346980753474 0,00182106408390475 233315 268297 579 665 0 True 581 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 630 484 0,00589050953405562 0,00597490521910177 0,00588998245212482 0,00601205462729839 0,00166164731180131 0,00175642413471443 223514 260391 579 665 0 True 625 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 673 484 0,00596625120751176 0,00611829413313554 0,005981536583505 0,00607309071488518 0,0018723958286943 0,0017887978713312 226388 266640 579 665 0 True 669 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 279 529 0,00625298377786765 0,00611560946311762 0,00624093995574884 0,00614938582436866 0,00143423679112891 0,00146643844787176 237268 266523 579 665 0 True 275 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 322 530 0,00632561566793206 0,00620971058913018 0,00634775310902571 0,00625619897764553 0,00141456000547879 0,00143498180540323 240024 270624 579 665 0 True 319 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 365 529 0,00634153354224226 0,00624793845451349 0,0063782711528191 0,00630197604333562 0,00136554038413786 0,00144537985123874 240628 272290 579 665 0 True 363 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 410 529 0,0061991423586363 0,00634750070415223 0,00611886778057527 0,00633249408712902 0,00161996666674152 0,00174815357227889 235225 276629 579 665 0 True 406 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 454 528 0,00622981852700893 0,00632705590940042 0,00621042191195544 0,00628671702143893 0,00174879828933596 0,00187333498448609 236389 275738 579 665 0 True 450 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 498 530 0,00635742506245591 0,00661743624338943 0,0064087891966125 0,00665293354695964 0,00184995378673831 0,00193442234398068 241231 288393 579 665 0 True 494 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 542 530 0,00619076175593656 0,00641211635176291 0,00613412680247196 0,00642404821850919 0,00167432914790378 0,00176597820385836 234907 279445 579 665 0 True 538 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 586 530 0,00612284724915281 0,00610996477231073 0,00608834973678187 0,00614938582436866 0,00160732470745413 0,0015930872956119 232330 266277 579 665 0 True 581 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 629 529 0,00596991442693083 0,00603075553383344 0,00604257267109178 0,00610360875867857 0,00174351669815627 0,00182023727108831 226527 262825 579 665 0 True 625 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 674 530 0,00604581422496621 0,00588493435465523 0,00604257267109178 0,00584420538643473 0,00170358995673795 0,00176399382615685 229407 256470 579 665 0 True 669 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 277 574 0,00622188594395037 0,00621436860634075 0,00624093995574884 0,00617990386816205 0,00130745282926276 0,00122317070770498 236088 270827 579 665 0 True 275 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 321 574 0,0062513761779787 0,00644008740092392 0,00624093995574884 0,00646982528419928 0,00137321726261799 0,00137169106712134 237207 280664 579 665 0 True 319 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 366 574 0,00622649791084488 0,00624892512810981 0,00624093995574884 0,00628671702143893 0,00130063478117622 0,00118803008348797 236263 272333 579 665 0 True 363 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 410 574 0,00613665679573981 0,00610592629433506 0,00621042191195544 0,00617990386816205 0,00151038081297365 0,00147597777533495 232854 266101 579 665 0 True 406 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 455 574 0,00648078858835995 0,00650080224594446 0,00636301213092241 0,00659189745937285 0,00205449681404448 0,00179851962352319 245912 283310 579 665 0 True 450 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 499 574 0,00638296218200324 0,00618676469154117 0,00625619897764553 0,00617990386816205 0,00193879164194209 0,00203509637178769 242200 269624 579 665 0 True 494 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 543 574 0,00612864515039163 0,0062550057909709 0,00613412680247196 0,00633249408712902 0,00177454343398372 0,00167628438848262 232550 272598 579 665 0 True 538 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 581 569 0,00612730109146808 0,00620750778296164 0,00613412680247196 0,00616464484626535 0,00159073697445397 0,00155490785284073 232499 270528 579 665 0 False 581 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 631 574 0,00595707998191582 0,00599945732952202 0,00599679560540169 0,0059510185397116 0,00154936909156172 0,00146709133107703 226040 261461 579 665 0 True 625 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 675 574 0,00622085813418531 0,00605617958836207 0,00625619897764553 0,00607309071488518 0,00157945547804809 0,00160457046434062 236049 263933 579 665 0 True 669 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 275 612 0,00654770163947517 0,00668411702178311 0,00654612039368277 0,00660715648126955 0,00145107644777238 0,00142939120256958 248451 291299 579 665 0 False 275 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 319 612 0,00651120121576718 0,00646824201726564 0,00648508430609598 0,00654612039368277 0,00140544940372791 0,00140845569912552 247066 281891 579 665 0 False 319 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 367 618 0,00630550749227199 0,00636890922660279 0,00634775310902571 0,0064087891966125 0,00130959529142813 0,00126235107594061 239261 277562 579 665 0 True 363 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 411 618 0,00627556923860248 0,00610654583356996 0,00624093995574884 0,00605783169298848 0,00142053337992449 0,00137836877857095 238125 266128 579 665 0 True 406 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 450 612 0,00661132042852288 0,00642505783800311 0,00657663843747616 0,00643930724040589 0,00175500817789999 0,00185271700627932 250865 280009 579 665 0 False 450 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 494 612 0,00620238391251072 0,00636668347453665 0,00621042191195544 0,00646982528419928 0,00185741455635728 0,00199095763403415 235348 277465 579 665 0 False 494 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 538 612 0,00600609860148034 0,00597327606037295 0,00601205462729839 0,00599679560540169 0,00172303024488856 0,00190084828440685 227900 260320 579 665 0 False 538 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 581 612 0,0059644327748505 0,00609693150248017 0,00593575951781491 0,00607309071488518 0,00169590807068166 0,00169236425431461 226319 265709 579 665 0 False 581 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 625 612 0,00614904322111364 0,0060960136665766 0,00619516289005875 0,00610360875867857 0,00141949190048934 0,00130572585835966 233324 265669 579 665 0 False 625 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 669 612 0,00648355576849666 0,00648180304274075 0,00654612039368277 0,00645456626230259 0,00148322692844703 0,0015378210369092 246017 282482 579 665 0 False 669 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 275 659 0,010209023563593 0,654052228304797 0,00822461280231937 0,668009460593576 0,00626958663225566 0,224118957123634 387379 28504103 579 665 5 True 275 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 319 655 0,00699029233676898 0,00667716441481364 0,00665293354695964 0,00668345159075303 0,00235054301209593 0,00124266546320151 265245 290996 579 665 0 False 319 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 363 655 0,00624744941759423 0,00614461307767014 0,00630197604333562 0,00611886778057527 0,00122795979784094 0,00119956776775038 237058 267787 579 665 0 False 363 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 406 655 0,00606170574517987 0,00593332725267047 0,00614938582436866 0,0059510185397116 0,00133723543576348 0,00137486925490224 230010 258579 579 665 0 False 406 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 450 655 0,00605005723450916 0,0120386569536682 0,00613412680247196 0,00686655985351339 0,00152717281066526 0,0130714490346782 229568 524654 579 665 0 False 450 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 494 655 0,00608755911388567 0,00634454068336325 0,00604257267109178 0,00625619897764553 0,00161372047118778 0,00193453784951442 230991 276500 579 665 0 False 494 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 537 655 0,00595563050660612 0,00597176163113208 0,005981536583505 0,00602731364919509 0,00172547051213634 0,00157063298673238 225985 260254 579 665 0 False 537 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 581 655 0,00593541691455989 0,00587532002356544 0,00592050049591821 0,00585946440833143 0,00141577130160897 0,00121100174713633 225218 256051 579 665 0 False 581 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 625 655 0,00628703327059741 0,00629415149225777 0,00631723506523232 0,00634775310902571 0,00132957846322238 0,00138181263011812 238560 274304 579 665 0 False 625 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 672 658 0,00982620395725207 0,675972283650302 0,00833142595559625 0,669962615396353 0,00530119623580571 0,198867166154399 372853 29459396 579 665 6 True 669 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H7_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H7_3.csv new file mode 100755 index 0000000..04e0c09 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H7_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 276 268 0,000882862234092107 0,0636207364371102 0,000762951094834821 0,064789806973373 0,000708265797819698 0,0216510742861748 33500 2772641 579 665 0 True 276 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 319 269 0,000843383797475093 0,000740119926733749 0,000717174029144732 0,000625619897764553 0,000644328432024585 0,000568646505323809 32002 32255 579 665 0 False 319 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 364 268 0,000808332849076809 0,000843582978962627 0,000717174029144732 0,000717174029144732 0,000609679443493356 0,000637510483269243 30672 36764 579 665 0 True 363 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 409 268 0,000814710540439505 0,00085799300264853 0,000656137941557946 0,000671396963454643 0,000661487163777855 0,000697007195050993 30914 37392 579 665 0 True 407 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 454 269 0,000889108154972102 0,000876854530466702 0,000610360875867857 0,000595101853971161 0,000854859875474871 0,000872637084131532 33737 38214 579 665 0 True 450 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 497 268 0,000907450606163986 0,000913613858404308 0,000686655985351339 0,000686655985351339 0,000840689460368678 0,000822751722197552 34433 39816 579 665 0 True 494 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 542 269 0,000927558781824054 0,000886537699249268 0,000717174029144732 0,000686655985351339 0,000805219899288583 0,000789918136478633 35196 38636 579 665 0 True 538 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 585 270 0,000890109610640625 0,000814028662867973 0,000564583810177768 0,000442511635004196 0,000930136422125794 0,000892636014191651 33775 35476 579 665 0 True 582 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 625 269 0,000933778348607509 0,00097194233007559 0,000564583810177768 0,000625619897764553 0,000978020651924801 0,000999352142483121 35432 42358 579 665 0 False 625 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 670 267 0,00103964275440894 0,0656017475595604 0,000762951094834821 0,0657663843747616 0,000933184221030486 0,0195088690694098 39449 2858975 579 665 0 True 669 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 275 312 0,000845413062908678 0,000879103228430426 0,000717174029144732 0,000686655985351339 0,000668404925463804 0,000723148980275852 32079 38312 579 665 0 False 275 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 319 312 0,000767642124018952 0,000750422634751218 0,00064087891966125 0,00064087891966125 0,000615097199275885 0,000572987284545914 29128 32704 579 665 0 False 319 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 366 314 0,000954018294750277 0,000791358116050024 0,00080872816052491 0,000656137941557946 0,000732857470644637 0,000615619585258341 36200 34488 579 665 0 True 363 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 410 314 0,000864256241934823 0,000797163428140046 0,000686655985351339 0,000595101853971161 0,000720863241836606 0,000687075262728863 32794 34741 579 665 0 True 407 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 454 314 0,000906791753750484 0,000936399134710202 0,00064087891966125 0,000686655985351339 0,000869628914012422 0,000894287350855676 34408 40809 579 665 0 True 450 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 497 314 0,000812444088137059 0,000862054426521786 0,000579842832074464 0,000656137941557946 0,000814951050646654 0,000783729331912335 30828 37569 579 665 0 True 494 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 538 312 0,000880674844079282 0,00083371624299935 0,000717174029144732 0,000671396963454643 0,000739503543288021 0,000721380967248269 33417 36334 579 665 0 False 538 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 585 313 0,000860224065164193 0,000835964940963074 0,000595101853971161 0,000442511635004196 0,000854276402452327 0,000970011490377572 32641 36432 579 665 0 True 582 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 625 312 0,000847178787376862 0,000920474681783424 0,000473029678797589 0,000503547722590982 0,000931411360432455 0,000999050236049898 32146 40115 579 665 0 False 625 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 669 312 0,000965983054579466 0,000824744397042044 0,000610360875867857 0,000381475547417411 0,000959421081083676 0,000908810126568771 36654 35943 579 665 0 False 669 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 278 353 0,000830918309811643 0,000828714037324944 0,000625619897764553 0,000656137941557946 0,000707794711962236 0,000673493288990673 31529 36116 579 665 0 True 275 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 322 353 0,00088407452253295 0,000754254599648584 0,000762951094834821 0,000610360875867857 0,000678487041004262 0,000629120267659736 33546 32871 579 665 0 True 319 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 365 352 0,000969330024840054 0,000829448306047793 0,000839246204318303 0,000717174029144732 0,000713898469017639 0,000615718979716559 36781 36148 579 665 0 True 363 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 407 355 0,000949248203276526 0,00083302786607168 0,000778210116731518 0,000656137941557946 0,000755138137975831 0,000673772501414502 36019 36304 579 665 0 False 407 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 454 352 0,000979265519235657 0,000899249726513583 0,000686655985351339 0,000625619897764553 0,000959548312848935 0,000841315241808887 37158 39190 579 665 0 True 450 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 494 355 0,000927400657244814 0,000910676783512914 0,00064087891966125 0,00064087891966125 0,000855258870235325 0,000878522403288998 35190 39688 579 665 0 False 494 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 542 352 0,000838692768290962 0,000922402137180901 0,000610360875867857 0,000671396963454643 0,000794680056661847 0,000850630582907645 31824 40199 579 665 0 True 538 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 586 352 0,000816608035390389 0,000876097315846265 0,000442511635004196 0,000473029678797589 0,000921172686727883 0,000986485559191507 30986 38181 579 665 0 True 582 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 630 353 0,000891928043301889 0,000803083469718012 0,000534065766384375 0,000305180437933928 0,000984964698008906 0,00096645111373279 33844 34999 579 665 0 True 625 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 674 353 0,000880912030948143 0,000852508933124755 0,000518806744487678 0,000442511635004196 0,000925419992088388 0,000953423644648598 33426 37153 579 665 0 True 669 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 275 398 0,00080016307914939 0,000737091068251999 0,000625619897764553 0,000595101853971161 0,000720020111928166 0,000659885041386236 30362 32123 579 665 0 False 275 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 322 396 0,000737045017935939 0,000740280548016872 0,00064087891966125 0,000625619897764553 0,000611325367884029 0,000633119423252098 27967 32262 579 665 0 True 319 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 366 396 0,000869553415339376 0,000887753831821485 0,000701915007248035 0,000747692072938125 0,000660986613547957 0,000697220767773578 32995 38689 579 665 0 True 363 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 411 397 0,000799082561191247 0,000797553508399059 0,000625619897764553 0,000579842832074464 0,000694973805746451 0,000718569772192204 30321 34758 579 665 0 True 407 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 455 396 0,000816608035390389 0,000890805636200825 0,000549324788281071 0,00064087891966125 0,000812731927527305 0,00082864151022252 30986 38822 579 665 0 True 450 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 499 398 0,00091738610055959 0,000869397113750272 0,000656137941557946 0,000610360875867857 0,000883106327391891 0,000823081940117988 34810 37889 579 665 0 True 494 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 542 396 0,000807331393408287 0,000909231191964806 0,000534065766384375 0,000717174029144732 0,000783512774570131 0,000847782941789619 30634 39625 579 665 0 True 538 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 587 398 0,000908293937253268 0,000894775276483725 0,000579842832074464 0,000473029678797589 0,000923037005256632 0,000994376350284976 34465 38995 579 665 0 True 582 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 630 397 0,000919178179124314 0,000829012333993602 0,000579842832074464 0,000442511635004196 0,000953589004229411 0,00093440336847051 34878 36129 579 665 0 True 625 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 674 397 0,000865336759892965 0,000797048698652101 0,000518806744487678 0,000381475547417411 0,000876228478819232 0,000909363205692596 32835 34736 579 665 0 True 669 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 278 441 0,000895354075852097 0,000809645996428471 0,000732433051041428 0,00064087891966125 0,000790801523415749 0,000772619263320382 33974 35285 579 665 0 True 275 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 322 441 0,000825647490503631 0,00078468085985162 0,000701915007248035 0,000656137941557946 0,000676551012420687 0,000708969444782521 31329 34197 579 665 0 True 319 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 366 441 0,000943028636493071 0,000915082395850005 0,000778210116731518 0,000823987182421607 0,00084941979114407 0,000691205211193551 35783 39880 579 665 0 True 363 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 410 441 0,000849418885582768 0,00087387156378013 0,000656137941557946 0,000656137941557946 0,000792006828165297 0,000811799205166148 32231 38084 579 665 0 True 407 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 455 441 0,000900308646001629 0,000928023882090211 0,00064087891966125 0,000549324788281071 0,000909844501474662 0,000972884912142257 34162 40444 579 665 0 True 450 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 499 442 0,000872505074151863 0,000905055038603604 0,000579842832074464 0,000488288700694286 0,00085518858753022 0,000975087459919829 33107 39443 579 665 0 True 494 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 544 442 0,000878830057321478 0,000970382009039536 0,000610360875867857 0,000717174029144732 0,000869915567576559 0,000915542532981497 33347 42290 579 665 0 True 538 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 581 441 0,000953306734143696 0,00103100507046972 0,000595101853971161 0,000686655985351339 0,000971796510571404 0,00103638537129735 36173 44932 579 665 0 False 581 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 631 441 0,000865178635313725 0,000928138611578156 0,000488288700694286 0,000564583810177768 0,000958900531808342 0,000968315590675444 32829 40449 579 665 0 True 625 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 675 441 0,000918677451290053 0,00102044995757877 0,000564583810177768 0,000686655985351339 0,000959114982385428 0,000984683571859453 34859 44472 579 665 0 True 669 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 278 486 0,000829811437756961 0,000796452105314786 0,000717174029144732 0,000610360875867857 0,000738908030126311 0,0007622519770516 31487 34710 579 665 0 True 275 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 322 486 0,000778420949503838 0,0007849332647251 0,000610360875867857 0,000656137941557946 0,000757023668598272 0,000717863271906373 29537 34208 579 665 0 True 319 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 366 486 0,000789832273305685 0,000872517755822378 0,000595101853971161 0,000732433051041428 0,000762316516503876 0,000748473077246232 29970 38025 579 665 0 True 363 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 410 485 0,000838877246966742 0,000844569652558955 0,000625619897764553 0,000564583810177768 0,000827150838637338 0,000837060172282622 31831 36807 579 665 0 True 406 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 455 486 0,000829047168957299 0,000951291022245474 0,000442511635004196 0,000518806744487678 0,000925130183201198 0,00101727161530954 31458 41458 579 665 0 True 450 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 498 484 0,000863386556749001 0,000870269057858654 0,000564583810177768 0,000442511635004196 0,000865571203344494 0,000947795596407866 32761 37927 579 665 0 True 494 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 538 484 0,000874455277295827 0,000919189711518439 0,000595101853971161 0,000656137941557946 0,000854703159749367 0,000869419182749564 33181 40059 579 665 0 False 538 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 585 485 0,000894089079218174 0,000910194919663544 0,000503547722590982 0,000488288700694286 0,000991727072090434 0,000993912154470799 33926 39667 579 665 0 True 581 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 630 484 0,000798318292391585 0,000833922756077651 0,000457770656900893 0,000518806744487678 0,000841349626491775 0,000809888922801708 30292 36343 579 665 0 True 625 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 673 484 0,000951778196544372 0,000876969259954647 0,000625619897764553 0,000488288700694286 0,000994796774715589 0,000920056209128912 36115 38219 579 665 0 True 669 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 279 529 0,000899333544429647 0,000777315226725546 0,000762951094834821 0,000579842832074464 0,000751849507156912 0,000735983144068549 34125 33876 579 665 0 True 275 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 322 530 0,000797501315398843 0,000840003418938741 0,00064087891966125 0,000656137941557946 0,0007016154719828 0,000754036241361102 30261 36608 579 665 0 True 319 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 365 529 0,000813630022481362 0,000832339489144009 0,00064087891966125 0,000671396963454643 0,000730582701021228 0,000729278548834484 30873 36274 579 665 0 True 363 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 410 529 0,000910270494493773 0,000847805024119007 0,000610360875867857 0,000595101853971161 0,000879965396375717 0,000841144141994309 34540 36948 579 665 0 True 406 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 454 528 0,000777683034800716 0,000828071552192452 0,0004272526131075 0,000442511635004196 0,000906755596569461 0,000939248845270959 29509 36088 579 665 0 True 450 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 498 530 0,000922287962516041 0,000938487211390803 0,000564583810177768 0,000579842832074464 0,000967932634891718 0,00096593276809748 34996 40900 579 665 0 True 494 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 542 530 0,000922261608419501 0,000899066159332871 0,000610360875867857 0,000488288700694286 0,000914733356715877 0,000945976966380981 34995 39182 579 665 0 True 538 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 586 530 0,000958129533810527 0,000854711739293301 0,000671396963454643 0,000595101853971161 0,000910454394549454 0,000818850171683567 36356 37249 579 665 0 True 581 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 629 529 0,000995894954152437 0,000899295618308761 0,000671396963454643 0,000534065766384375 0,000987849761512131 0,000975380293585328 37789 39192 579 665 0 True 625 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 674 530 0,00091762328742845 0,000893995115965698 0,000549324788281071 0,000518806744487678 0,000952113378197776 0,000954869365883473 34819 38961 579 665 0 True 669 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 277 574 0,000811521694758157 0,000800513529188042 0,000701915007248035 0,000701915007248035 0,000620174192991917 0,00060944156523935 30793 34887 579 665 0 True 275 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 321 574 0,000720152042053759 0,000871209839659804 0,000549324788281071 0,000747692072938125 0,000667506532483977 0,000704093241450492 27326 37968 579 665 0 True 319 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 366 574 0,000792994764890493 0,00086827276476841 0,000671396963454643 0,000762951094834821 0,000662786685845581 0,000650441211446689 30090 37840 579 665 0 True 363 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 410 574 0,000872715906924183 0,000850787990805579 0,000686655985351339 0,000595101853971161 0,000773739125213451 0,000782844780133765 33115 37078 579 665 0 True 406 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 455 574 0,000864730615672544 0,000849984884389963 0,0004272526131075 0,000488288700694286 0,000947616791468121 0,000904879498523847 32812 37043 579 665 0 True 450 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 499 574 0,000823301975911565 0,000912282996344145 0,000320439459830625 0,000488288700694286 0,000991860715883751 0,00107978668880201 31240 39758 579 665 0 True 494 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 543 574 0,000872478720055323 0,000892228281851344 0,000473029678797589 0,000579842832074464 0,0009304830986434 0,000888987146110091 33106 38884 579 665 0 True 538 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 581 569 0,000948457580380324 0,000911319268645406 0,000625619897764553 0,00064087891966125 0,000887737373847373 0,000845503811732647 35989 39716 579 665 0 False 581 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 631 574 0,000851158255954412 0,000901039506525526 0,00064087891966125 0,000701915007248035 0,000770542089574168 0,000761261176742804 32297 39268 579 665 0 True 625 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 675 574 0,000887395138696998 0,00095932208640163 0,000656137941557946 0,00064087891966125 0,000827352174228581 0,000913694911180649 33672 41808 579 665 0 True 669 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 275 612 0,000854979599952721 0,000865725770136029 0,000701915007248035 0,000732433051041428 0,000676145899521043 0,000721605597161597 32442 37729 579 665 0 False 275 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 319 612 0,000773782628512787 0,0007730243438764 0,00064087891966125 0,000579842832074464 0,000657333895707907 0,000673161269268446 29361 33689 579 665 0 False 319 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 367 618 0,000847574098824963 0,000839934581245974 0,000717174029144732 0,000701915007248035 0,000663530158739913 0,000635411037018665 32161 36605 579 665 0 True 363 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 411 618 0,000834344342361851 0,000819443894698981 0,000671396963454643 0,000625619897764553 0,000718196973655546 0,000732589125462285 31659 35712 579 665 0 True 406 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 450 612 0,000884944207718772 0,000871003326581503 0,000473029678797589 0,000396734569314107 0,000962937997979815 0,00101872473198536 33579 37959 579 665 0 False 450 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 494 612 0,000792599453442392 0,00093387508597541 0,000366216525520714 0,000457770656900893 0,000930983957936603 0,00106033011975601 30075 40699 579 665 0 False 494 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 538 612 0,000826359051110212 0,00087598258635832 0,000411993591210803 0,000488288700694286 0,000912943508934403 0,000983502330011602 31356 38176 579 665 0 False 538 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 581 612 0,000863992700969422 0,000879447416894261 0,000579842832074464 0,000625619897764553 0,000815821895640946 0,000831226722613137 32784 38327 579 665 0 False 581 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 625 612 0,000852818564036436 0,000889337098755128 0,000656137941557946 0,000732433051041428 0,00076841448375572 0,000686851214725928 32360 38758 579 665 0 False 625 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 669 612 0,000886051079773455 0,000905697523736097 0,000656137941557946 0,000671396963454643 0,000756254215462489 0,000811610580331116 33621 39471 579 665 0 False 669 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 275 659 0,00112165670284162 0,0638861516345223 0,000915541313801785 0,0647135118638895 0,000837263403199161 0,0225932867918777 42561 2784208 579 665 0 True 275 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 319 655 0,000870238621849417 0,000827635580138261 0,000762951094834821 0,000717174029144732 0,00065492036817203 0,000615277021991402 33021 36069 579 665 0 False 319 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 363 655 0,000877934018039116 0,000818801409566489 0,000762951094834821 0,000762951094834821 0,000673802265123008 0,000565583302722046 33313 35684 579 665 0 False 363 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 406 655 0,000933910119090209 0,000802303309199986 0,000778210116731518 0,000625619897764553 0,000705089784301502 0,000678041885673482 35437 34965 579 665 0 False 406 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 450 655 0,000833316532596789 0,00136828681913068 0,000625619897764553 0,000946059357595178 0,000787427665057322 0,00140573359230898 31620 59631 579 665 0 False 450 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 494 655 0,000827729464130296 0,000868479277846711 0,000503547722590982 0,000625619897764553 0,00086080771403296 0,000832260410157961 31408 37849 579 665 0 False 494 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 537 655 0,000839641515766404 0,000855859034172752 0,000534065766384375 0,000503547722590982 0,000821250746463896 0,000854885339913307 31860 37299 579 665 0 False 537 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 581 655 0,000971675539432119 0,000898790808561803 0,000778210116731518 0,000762951094834821 0,000758366531584172 0,000690190156682343 36870 39170 579 665 0 False 581 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 625 655 0,00087967338841076 0,000874789399683691 0,000732433051041428 0,000747692072938125 0,000689460432961185 0,000658404570633179 33379 38124 579 665 0 False 625 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 672 658 0,00112634773202575 0,0664185756219342 0,000961318379491875 0,0655527580682078 0,000822670677272457 0,0206441797612796 42739 2894573 579 665 0 True 669 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H8_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H8_1.csv new file mode 100755 index 0000000..ee4ee49 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H8_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 248 246 0,010945093479957 0,0413377458294397 0,010955977721828 0,0422369726100557 0,00181390886884074 0,00895754247594978 415309 1801531 579 665 0 True 248 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 291 247 0,0105979573203313 0,0107203462994864 0,010605020218204 0,010605020218204 0,00150226688806717 0,0018728358388814 402137 467201 579 665 0 False 291 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 337 243 0,0109244582223661 0,0533732821410358 0,0108339055466545 0,0549935149156939 0,00148306632189986 0,00885244003742909 414526 2326049 579 665 0 True 335 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 380 244 0,0109958514698931 0,0732536766498531 0,0108491645685512 0,0736552986953536 0,00167698491707334 0,0103744466560652 417235 3192452 579 665 0 True 379 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 424 244 0,0108243390096104 0,0622809713686826 0,0108033875028611 0,0629129472800793 0,00175656842859035 0,0136398909050921 410727 2714253 579 665 0 True 423 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 468 245 0,0104161404083014 0,0575909905227706 0,0104219119554437 0,0580758373388266 0,0016182003008492 0,0160380151585909 395238 2509860 579 665 0 True 466 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 512 245 0,0105945839959741 0,0693474358819915 0,0106507972838941 0,069062333104448 0,00157256738830493 0,0179028519194144 402009 3022215 579 665 0 True 510 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 557 245 0,0105632226210915 0,0609492144185137 0,010605020218204 0,0600289921416037 0,00158407800581964 0,0164639740290095 400819 2656214 579 665 0 True 554 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 598 247 0,0104762013943162 0,0102370598044665 0,0104371709773404 0,0102082856488899 0,00197456146217924 0,00201940150134991 397517 446139 579 665 0 False 598 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 644 245 0,0106205954892592 0,0419213976805139 0,0105897611963073 0,0423895628290227 0,00185504334298935 0,00786603420416949 402996 1826967 579 665 0 True 641 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 247 289 0,0105166022243121 0,0105633963599775 0,0104676890211337 0,010605020218204 0,00149567596781876 0,00157858203281083 399050 460361 579 665 0 False 247 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 291 289 0,0105679136502756 0,0104490569522915 0,0106507972838941 0,0104219119554437 0,00135731676748626 0,00135181247421202 400997 455378 579 665 0 False 291 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 337 289 0,0108684030590254 0,0872569154632978 0,0108186465247578 0,0861829556725414 0,00142885443069182 0,0184608114681256 412399 3802724 579 665 0 True 335 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 381 290 0,0107723687312334 0,0442847104026948 0,0106660563057908 0,0449835965514611 0,0015531655069562 0,00735572543983378 408755 1929962 579 665 0 True 379 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 425 288 0,0110576518262796 0,0633692493995345 0,0109864957656214 0,0624399176012818 0,00185744778849372 0,0136139599838205 419580 2761681 579 665 0 True 423 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 466 290 0,0113107829235469 0,0349307693587367 0,0111238269626917 0,0365148393987945 0,00240204220705366 0,00776500901854054 429185 1522310 579 665 0 False 466 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 512 289 0,0105959807630908 0,0425224654678582 0,0105592431525139 0,0419928282597086 0,00173884451994355 0,0117590190440231 402062 1853162 579 665 0 True 510 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 556 289 0,0106966534118738 0,046901254050668 0,010605020218204 0,046845197222858 0,00185719118106534 0,0106763869556655 405882 2043993 579 665 0 True 554 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 598 290 0,010784254428773 0,0104541279956586 0,010757610437171 0,010406652933547 0,00213730621459321 0,00193079817101868 409206 455599 579 665 0 False 598 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 641 290 0,010803044899606 0,010269138169296 0,010452429999237 0,0103303578240635 0,00263758572521279 0,00203835846203727 409919 447537 579 665 0 False 641 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 249 328 0,0108996853716185 0,0478082824364642 0,0108796826123445 0,0484321355001144 0,00176308924879968 0,0107409500283986 413586 2083522 579 665 0 True 247 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 293 328 0,0107767698653556 0,0582550447989968 0,0108644235904479 0,0578774700541695 0,00143607127766641 0,0177844791883838 408922 2538800 579 665 0 True 291 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 335 332 0,0112520923505522 0,0345381650509887 0,011108567940795 0,0367589837491417 0,00166786026962157 0,0099104472998395 426958 1505200 579 665 0 False 335 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 381 327 0,0113890809443674 0,0318705667808799 0,0109864957656214 0,0323033493553063 0,00279366657242886 0,00530156754025184 432156 1388944 579 665 0 True 379 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 425 327 0,0113239599718169 0,0622110093269337 0,0108186465247578 0,0621347371633478 0,00269265173727429 0,0118980441028944 429685 2711204 579 665 0 True 422 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 466 332 0,0119720862680267 0,0279640047704521 0,0115358205539025 0,0302281223773556 0,00274520323382016 0,00822184800627467 454278 1218693 579 665 0 False 466 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 513 328 0,0107507056638775 0,0254398642520699 0,0108339055466545 0,0254978255893797 0,00174515540899589 0,00263740368721039 407933 1108689 579 665 0 True 510 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 557 327 0,010811873521947 0,0442017839288081 0,0106813153276875 0,0447699702449073 0,00192322513143205 0,00727260838850785 410254 1926348 579 665 0 True 554 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 601 327 0,0106516669690799 0,0482304640062046 0,0105745021744106 0,0489967193102922 0,00205044599204815 0,0101701008533537 404175 2101921 579 665 0 True 598 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 645 326 0,0106749903445179 0,0563583827960838 0,0106660563057908 0,0559853513389792 0,00194935472824685 0,0150888611767693 405060 2456142 579 665 0 True 641 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 249 373 0,0106888262452014 0,040689019412803 0,010757610437171 0,0420843823910887 0,00159334973409336 0,00849392141562285 405585 1773259 579 665 0 True 247 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 291 375 0,0107821461010498 0,031233909906375 0,0108033875028611 0,0311284046692607 0,00141370897872795 0,006889559833511 409126 1361198 579 665 0 False 291 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 337 372 0,0109064320203327 0,0751152543753524 0,0108949416342412 0,074891279468986 0,00152957044546047 0,0167782085139434 413842 3273581 579 665 0 True 335 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 381 371 0,0108831086448948 0,0576835313277472 0,0108491645685512 0,0576485847257191 0,00153201369567869 0,0144268983065174 412957 2513893 579 665 0 True 379 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 425 371 0,010811873521947 0,0382845417503475 0,010757610437171 0,0392767223620966 0,00161646039218716 0,00642546241477336 410254 1668470 579 665 0 True 422 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 469 372 0,0112846660138757 0,047765694850539 0,0111238269626917 0,0485084306095979 0,00221273272278597 0,00884351803950294 428194 2081666 579 665 0 True 466 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 513 372 0,0108775479305248 0,0370747651917617 0,0108796826123445 0,0376592660410468 0,00164374418708518 0,0049628317140379 412746 1615747 579 665 0 True 510 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 557 371 0,0107545006537792 0,0464731524393497 0,0108186465247578 0,0460212100404364 0,00182717431149648 0,00789639535208438 408077 2025336 579 665 0 True 554 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 601 372 0,010818119442827 0,0397206566427513 0,0108491645685512 0,0393835355153735 0,00217424236913922 0,00858106813263137 410491 1731057 579 665 0 True 597 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 645 371 0,0109884459687654 0,0779100417557971 0,0108644235904479 0,0770580605783169 0,00210393483848352 0,0160934851044178 416954 3395380 579 665 0 True 641 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 248 415 0,0111153672977023 0,0438959839516392 0,010955977721828 0,0453498130769818 0,00254293862956744 0,00898265334298225 421770 1913021 579 665 0 True 247 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 293 416 0,0108252877570859 0,0523983797901712 0,0108033875028611 0,0521705958648051 0,00144628895276986 0,00673178124254017 410763 2283562 579 665 0 True 291 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 338 416 0,0107137308664318 0,0326877849235127 0,0106507972838941 0,0330968184939345 0,00141536340740136 0,0042169512002014 406530 1424559 579 665 0 True 335 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 381 415 0,0110031252005382 0,0485798841346901 0,0109407186999313 0,0478370336461433 0,00143447916811605 0,0101523964019405 417511 2117149 579 665 0 True 379 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 425 415 0,0113236964308515 0,0870244964666186 0,011306935225452 0,0884260318913558 0,00185251760563605 0,0114824469508894 429675 3792595 579 665 0 True 422 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 469 416 0,0110709869991289 0,0532509575609888 0,0111543450064851 0,0537727931639582 0,00178358416447238 0,0112301792836549 420086 2320718 579 665 0 True 466 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 513 415 0,0109578225085858 0,0472221065366552 0,0110017547875181 0,0469825284199283 0,00178884145353847 0,00839029849704002 415792 2057976 579 665 0 True 510 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 558 416 0,0107509955589394 0,028887301797639 0,0107270923933776 0,0294651712825208 0,00176076763624808 0,00387477615761799 407944 1258931 579 665 0 True 554 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 601 416 0,0106851103175893 0,0372332525064091 0,0106507972838941 0,0373083085374228 0,00194785767162558 0,00594582272100007 405444 1622654 579 665 0 True 597 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 645 415 0,010850376856992 0,0694584940263224 0,0108949416342412 0,0674601358052949 0,00201794886744726 0,0123303867311078 411715 3027055 579 665 0 True 641 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 248 460 0,0107567143978886 0,0527101227548156 0,0106813153276875 0,0537575341420615 0,00178941825862067 0,0146160761291462 408161 2297148 579 665 0 True 247 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 293 461 0,0110299800249125 0,0529551161033736 0,0109864957656214 0,0528114747844663 0,00168129198485248 0,00735257911373396 418530 2307825 579 665 0 True 291 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 337 460 0,0109877344081588 0,0638716727731437 0,010955977721828 0,0623025864042115 0,00159772972157629 0,0163728850823007 416927 2783577 579 665 0 True 335 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 380 459 0,0115035631397375 0,0792138506027027 0,0112764171816587 0,0785839627679866 0,00197975097470865 0,0194486940819323 436500 3452201 579 665 0 True 379 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 424 458 0,0113687882900316 0,0836778143573629 0,0113221942473487 0,0836041809719997 0,00188950417006113 0,026550052216581 431386 3646744 579 665 0 True 422 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 469 460 0,0112335917747811 0,0430359717100029 0,0112306401159686 0,0437476157778286 0,00192918655260514 0,00670826003171539 426256 1875541 579 665 0 True 466 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 513 459 0,0108547779911142 0,0380571937970355 0,0108796826123445 0,039154650186923 0,00182443797481295 0,00543443515651258 411882 1658562 579 665 0 True 510 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 556 460 0,0111552937539605 0,0885318813169339 0,0112153810940719 0,0870374608987564 0,00205500729207884 0,0163551374606952 423285 3858288 579 665 0 True 554 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 601 459 0,0107920288872523 0,0587483127594679 0,0108491645685512 0,0588998245212482 0,00193334229197881 0,0163639630224553 409501 2560297 579 665 0 True 597 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 645 460 0,0109051670236988 0,0718549176787242 0,0108949416342412 0,0696421759365225 0,00204932493358625 0,0137359817553192 413794 3131493 579 665 0 True 641 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 248 504 0,010879313654993 0,0452156713596764 0,0107423514152743 0,0484168764782177 0,00170675400059118 0,0121872052831974 412813 1970534 579 665 0 True 247 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 293 504 0,0109556878267661 0,0894670643190719 0,0108491645685512 0,0873426413366903 0,00179098852775394 0,0233958391615459 415711 3899044 579 665 0 True 291 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 336 504 0,0110934143352845 0,0527559227664033 0,0110780498970016 0,0538948653391318 0,00175402525767281 0,0131582465858892 420937 2299144 579 665 0 True 335 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 381 504 0,0112742824998389 0,0517309065752043 0,0112458991378653 0,0518654154268711 0,00171993714014286 0,00741755511918659 427800 2254473 579 665 0 True 379 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 425 504 0,0112339870862292 0,0518792747490149 0,0111543450064851 0,0529182879377432 0,00199855142228124 0,00733202938771285 426271 2260939 579 665 0 True 422 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 469 504 0,0112141424515345 0,0544105514415473 0,0112153810940719 0,0552529182879377 0,00200530805961555 0,0114468340586282 425518 2371254 579 665 0 True 466 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 513 503 0,0109421418211445 0,0668355025811267 0,0110170138094148 0,0652628366521706 0,00171917139482213 0,0165587388703861 415197 2912743 579 665 0 True 510 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 557 504 0,0110569666197696 0,0528472474388076 0,0111696040283818 0,0527351796749828 0,0018953505640236 0,0120850867625174 419554 2303124 579 665 0 True 554 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 601 504 0,0109315211202389 0,0411092276353507 0,0108796826123445 0,0405584802014191 0,0018578702739661 0,00680067660239704 414794 1791572 579 665 0 True 597 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 645 503 0,0109959832403758 0,0567245075380142 0,0110017547875181 0,0574196993972686 0,0019398094679312 0,0131209567327822 417240 2472098 579 665 0 True 641 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 249 548 0,0105219784600063 0,0395108164092997 0,0104676890211337 0,0402838178072786 0,00151718476023582 0,00923352527971444 399254 1721912 579 665 0 True 247 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 293 547 0,0108171970494481 0,0466957047000656 0,010757610437171 0,0475623712520027 0,00163769860989036 0,0102388514069416 410456 2035035 579 665 0 True 291 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 337 547 0,0109723963239725 0,0454177558797428 0,0109254596780346 0,0460669871061265 0,00167970266229981 0,00949730205602297 416345 1979341 579 665 0 True 335 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 381 548 0,0110749401136099 0,0469861309258498 0,0110475318532082 0,0461280231937133 0,00164371853355616 0,00831970151244454 420236 2047692 579 665 0 True 379 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 425 547 0,0112711200082541 0,077285293802141 0,0112001220721752 0,0759746700236515 0,00211635363051362 0,0192382759933615 427680 3368153 579 665 0 True 422 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 469 548 0,0111749275558829 0,0584069236951385 0,0111238269626917 0,0584115358205539 0,00205343745729624 0,0117871063777342 424030 2545419 579 665 0 True 466 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 514 547 0,0107504684770086 0,0515955716712243 0,0108491645685512 0,0509803921568627 0,00200841647244932 0,00737096912957458 407924 2248575 579 665 0 True 510 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 554 547 0,011157560206263 0,0328757347706644 0,0109864957656214 0,0358587014572366 0,00229017098720858 0,00887516860566956 423371 1432750 579 665 0 False 554 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 601 548 0,0109147599148394 0,0451154666249051 0,0108491645685512 0,0458228427557794 0,00178692192536147 0,00737788967619329 414158 1966167 579 665 0 True 597 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 645 547 0,0108302686813319 0,0465544038627124 0,0108033875028611 0,0464332036316472 0,0019152118077718 0,00685198761105665 410952 2028877 579 665 0 True 641 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 247 590 0,0102677668447808 0,00999800944338415 0,0102845807583734 0,00994888227664607 0,00135851598950384 0,00126011912565108 389608 435721 579 665 0 False 247 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 291 590 0,0101797705164336 0,0102189784371664 0,0102388036926833 0,01025406271458 0,00138468469975832 0,00137381559812527 386269 445351 579 665 0 False 291 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 338 591 0,0111675220547551 0,0667591845257456 0,010955977721828 0,0663767452506294 0,0019608232262469 0,011356334718515 423749 2909417 579 665 0 True 335 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 381 591 0,0110971039088001 0,0686447407142255 0,0110475318532082 0,0675211718928817 0,00166638216105916 0,0202806325829007 421077 2991591 579 665 0 True 378 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 422 590 0,0110102144525075 0,0105038058639389 0,0107881284809644 0,0105134660868238 0,00223006834529205 0,00170553517104279 417780 457764 579 665 0 False 422 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 466 590 0,0103939239049181 0,0104612871157064 0,0104219119554437 0,0104371709773404 0,00196519549165789 0,0018494016274728 394395 455911 579 665 0 False 466 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 510 590 0,0104010658650805 0,0133989127086427 0,0103913939116503 0,0108186465247578 0,00213786652246788 0,0148343805972155 394666 583935 579 665 0 False 510 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 554 590 0,0103071135109151 0,0104254456236724 0,0103761348897536 0,0104371709773404 0,00193268658830757 0,00184952396228786 391101 454349 579 665 0 False 554 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 597 590 0,0104751735845511 0,0104475425230506 0,0104829480430304 0,0103913939116503 0,00183173485195264 0,00165109850192298 397478 455312 579 665 0 False 597 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 641 590 0,0104378561838504 0,010503071595216 0,0104219119554437 0,0105592431525139 0,0016284848118021 0,00151431022451932 396062 457732 579 665 0 False 641 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 249 637 0,0101307782509656 0,0405145846993313 0,0100251773861295 0,0413214312962539 0,00138880487932611 0,00799265453910064 384410 1765657 579 665 0 True 247 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 291 633 0,0102291317392531 0,0100739374185062 0,0101319905394064 0,0100556954299229 0,0014627851727912 0,0012734092918583 388142 439030 579 665 0 False 291 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 335 633 0,010006703164455 0,0101371304204664 0,00999465934233616 0,0101777676050965 0,00133059229052652 0,00133379722842136 379702 441784 579 665 0 False 335 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 378 633 0,0101217387958523 0,0101141615769798 0,0101472495613031 0,0101167315175097 0,00134603929315702 0,00131601435947275 384067 440783 579 665 0 False 378 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 422 633 0,0100750920449764 0,0102508502889175 0,00997940032043946 0,0102845807583734 0,00196322292803546 0,00159754449355507 382297 446740 579 665 0 False 422 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 466 633 0,0103350488532476 0,0101908926585174 0,0102998397802701 0,010101472495613 0,0017864726756917 0,0018704242748344 392161 444127 579 665 0 False 466 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 510 633 0,0100797040118709 0,0102948146286981 0,0100404364080262 0,01025406271458 0,00184381805894497 0,00186020504503243 382472 448656 579 665 0 False 510 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 553 633 0,0100319503889403 0,0102041094955287 0,0100251773861295 0,0102845807583734 0,00175031697268158 0,00181876516147381 380660 444703 579 665 0 False 553 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 597 633 0,0101869915388855 0,0103962354960415 0,0102082856488899 0,010406652933547 0,00146174316581581 0,0014374736007964 386543 453076 579 665 0 False 597 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 645 635 0,010529673856196 0,0417314515402721 0,0105134660868238 0,0423285267414359 0,00140649608746491 0,00800487395267152 399546 1818689 579 665 0 True 641 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H8_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H8_2.csv new file mode 100755 index 0000000..c921321 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H8_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 248 246 0,00923916645682217 0,621906035402078 0,00799572747386892 0,632059205004959 0,00454974374240321 0,202388401173192 350578 27103147 579 665 1 True 248 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 291 247 0,00707636481606883 0,00643579651807477 0,00663767452506294 0,0063935301747158 0,00283398756030389 0,00143052660088374 268511 280477 579 665 0 False 291 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 337 243 0,00599856132986988 0,00600170602748574 0,005981536583505 0,0059510185397116 0,0011536262929917 0,0012641445550552 227614 261559 579 665 0 True 335 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 380 244 0,00591739071252648 0,00590166191399763 0,0059510185397116 0,005981536583505 0,0012556437774614 0,00107476091140623 224534 257199 579 665 0 True 379 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 424 244 0,00591446540781054 0,00594489198505534 0,00584420538643473 0,00593575951781491 0,00144085543510702 0,00132687363452204 224423 259083 579 665 0 True 423 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 468 245 0,00591093395887417 0,00591366261843668 0,00601205462729839 0,00593575951781491 0,0014995223890966 0,00139347068490629 224289 257722 579 665 0 True 466 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 512 245 0,00599413384165115 0,00615516819056109 0,0059510185397116 0,00608834973678187 0,00146890470577409 0,00138285015570579 227446 268247 579 665 0 True 510 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 557 245 0,00613027910437711 0,00629070960761942 0,00608834973678187 0,00625619897764553 0,00137855421735984 0,0012712110275178 232612 274154 579 665 0 True 554 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 598 247 0,0068357782687546 0,00664875739359844 0,00675974670023652 0,00669871061264973 0,00209069382400964 0,00195077721738242 259382 289758 579 665 0 False 598 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 644 245 0,00918616836868011 0,646936200652696 0,00846875715266651 0,65131609063859 0,00368576403126463 0,18358462441047 348567 28193981 579 665 1 True 641 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 247 289 0,00651465360241393 0,00649407909795087 0,0064087891966125 0,00657663843747616 0,00172340059192627 0,00141744164125237 247197 283017 579 665 0 False 247 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 291 289 0,00581922170291475 0,00586680709555991 0,00582894636453803 0,00587472343022812 0,00136523850277701 0,00127609161185092 220809 255680 579 665 0 False 291 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 337 289 0,00591478165696902 0,00606528910970491 0,00592050049591821 0,00608834973678187 0,00127658287946851 0,00128029586617314 224435 264330 579 665 0 True 335 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 381 290 0,00582077659461061 0,00613497580068276 0,00581368734264134 0,00610360875867857 0,00118159942039928 0,00116636316072602 220868 267367 579 665 0 True 379 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 425 288 0,00584823756320536 0,0059180223389786 0,00582894636453803 0,00590524147402152 0,00145707732917239 0,00151465655090936 221910 257912 579 665 0 True 423 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 466 290 0,00620891972845266 0,00594922875969966 0,00607309071488518 0,005981536583505 0,0019338669269211 0,00186751215941444 235596 259272 579 665 0 False 466 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 512 289 0,00624976857808976 0,00605477988860914 0,00627145799954223 0,00607309071488518 0,00161095407404633 0,00152361212273396 237146 263872 579 665 0 True 510 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 556 289 0,0062357218446339 0,00637985441975275 0,00625619897764553 0,0063935301747158 0,00167007973756908 0,00157090389828642 236613 278039 579 665 0 True 554 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 598 290 0,0063343915820799 0,00639580181857711 0,0063782711528191 0,00633249408712902 0,0018436829860961 0,0019538507875418 240357 278734 579 665 0 False 598 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 641 290 0,00681306103753706 0,00672284969691338 0,00675974670023652 0,00669871061264973 0,0018251002181965 0,00191622870774104 258520 292987 579 665 0 False 641 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 249 328 0,00598317053749048 0,00611730745953921 0,00601205462729839 0,00613412680247196 0,00146010079998488 0,00140223250087784 227030 266597 579 665 0 True 247 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 293 328 0,00584423174053127 0,00602006274555696 0,00587472343022812 0,00601205462729839 0,00133519848734807 0,00142331623880868 221758 262359 579 665 0 True 291 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 335 332 0,00586441897848096 0,00603724922285113 0,00584420538643473 0,00607309071488518 0,0012332603726223 0,00120286851319473 222524 263108 579 665 0 False 335 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 381 327 0,00588465892462373 0,00591545239844863 0,00588998245212482 0,00588998245212482 0,00120115406222524 0,00122950755769035 223292 257800 579 665 0 True 379 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 425 327 0,0061320448288453 0,00625789697406712 0,00616464484626535 0,00630197604333562 0,00152300843051111 0,00157723312815505 232679 272724 579 665 0 True 422 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 466 332 0,0066633697691895 0,00627558826110825 0,00651560234988937 0,00622568093385214 0,00216604670412227 0,00148188408572075 252840 273495 579 665 0 False 466 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 513 328 0,0062438125522717 0,00621195928709391 0,00622568093385214 0,00617990386816205 0,00153218609815552 0,00157014082091638 236920 270722 579 665 0 True 510 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 557 327 0,00623556372005466 0,00627143505364464 0,00616464484626535 0,00625619897764553 0,00163142485218085 0,00131350544712483 236607 273314 579 665 0 True 554 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 601 327 0,00637062846482249 0,00625248174223611 0,00630197604333562 0,00624093995574884 0,00189390471716485 0,00198552023737754 241732 272488 579 665 0 True 598 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 645 326 0,00639055216180677 0,00634440300797772 0,00631723506523232 0,00633249408712902 0,00188731968477212 0,00174271103365383 242488 276494 579 665 0 True 641 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 249 373 0,00575346823204729 0,00582341640321908 0,00576791027695125 0,00579842832074464 0,00147031748008383 0,00149684350233182 218314 253789 579 665 0 True 247 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 291 375 0,00574611543911262 0,00599060021305266 0,00576791027695125 0,0059510185397116 0,00128925058638276 0,00128928580401424 218035 261075 579 665 0 False 291 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 337 372 0,00606368230242037 0,00612061166879203 0,00607309071488518 0,00614938582436866 0,00129785494229554 0,00137965985476869 230085 266741 579 665 0 True 335 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 381 371 0,00618053636647901 0,00612648581857482 0,00611886778057527 0,00619516289005875 0,00128328123695887 0,0012651649375668 234519 266997 579 665 0 True 379 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 425 371 0,00617866522562467 0,00652060455556378 0,00622568093385214 0,00653086137178607 0,00163432242097208 0,00154118410451133 234448 284173 579 665 0 True 422 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 469 372 0,00651620849410979 0,00636101583783216 0,0063782711528191 0,0063935301747158 0,00200501313893159 0,00171783511712439 247256 277218 579 665 0 True 466 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 513 372 0,00639165903386146 0,00617497050018041 0,00633249408712902 0,00627145799954223 0,00160383233814389 0,00163387878817129 242530 269110 579 665 0 True 510 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 557 371 0,00618878519869605 0,00642053749617807 0,00614938582436866 0,0064087891966125 0,00168769648002784 0,00156141754329907 234832 279812 579 665 0 True 554 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 601 372 0,00636546306190063 0,00612341106829789 0,00634775310902571 0,00608834973678187 0,00190285074638582 0,00198065078029463 241536 266863 579 665 0 True 597 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 645 371 0,00612419130807636 0,00596891633983104 0,00611886778057527 0,00593575951781491 0,00182018479119272 0,00184257640046829 232381 260130 579 665 0 True 641 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 248 415 0,00616696400676088 0,00610695885972657 0,00608834973678187 0,00611886778057527 0,0023761845334695 0,00135435193342061 234004 266146 579 665 0 True 247 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 293 416 0,00601239723055341 0,0060548716721995 0,00599679560540169 0,00602731364919509 0,00137873966277481 0,00141757811761471 228139 263876 579 665 0 True 291 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 338 416 0,00593628659974571 0,00606602337842776 0,00599679560540169 0,00613412680247196 0,00125988258251378 0,00124149705792343 225251 264362 579 665 0 True 335 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 381 415 0,00621176597087899 0,00628556972655948 0,00621042191195544 0,00630197604333562 0,00129984103965668 0,0013734091355697 235704 273930 579 665 0 True 379 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 425 415 0,00634461697153744 0,00637944139359614 0,00651560234988937 0,0063782711528191 0,00164304788001399 0,00153047752143041 240745 278021 579 665 0 True 422 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 469 416 0,00627701871391218 0,00628570740194501 0,00631723506523232 0,00625619897764553 0,00158891412484068 0,00134819349025185 238180 273936 579 665 0 True 466 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 513 415 0,0063354457459415 0,00631427504444333 0,0064087891966125 0,00622568093385214 0,001675361537109 0,00161548349988797 240397 275181 579 665 0 True 510 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 558 416 0,00633368002147332 0,00620282681985348 0,0064087891966125 0,00617990386816205 0,00172189182694305 0,00156772326561322 240330 270324 579 665 0 True 554 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 601 416 0,00592492798413694 0,00585912021986759 0,00593575951781491 0,00585946440833143 0,00192939988028795 0,00183857735375614 224820 255345 579 665 0 True 597 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 645 415 0,00586025503122763 0,00584069466410361 0,00582894636453803 0,00576791027695125 0,00176731387877598 0,00175075846144316 222366 254542 579 665 0 True 641 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 248 460 0,00619484664090027 0,006150762578224 0,00619516289005875 0,00610360875867857 0,00144625439516978 0,00152830120036704 235062 268055 579 665 0 True 247 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 293 461 0,00602159481024589 0,00617882541097537 0,00608834973678187 0,00617990386816205 0,00146403237147786 0,00147628755473454 228488 269278 579 665 0 True 291 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 337 460 0,00610740374858034 0,0061169173792802 0,00610360875867857 0,00613412680247196 0,00140867827092219 0,0015991803659549 231744 266580 579 665 0 True 335 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 380 459 0,00607287988211286 0,00607348079514419 0,00605783169298848 0,00611886778057527 0,00142383262279744 0,00138326331726578 230434 264687 579 665 0 True 379 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 424 458 0,00626679332445464 0,00617529174274666 0,00619516289005875 0,00616464484626535 0,00168829683354809 0,00180953723763538 237792 269124 579 665 0 True 422 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 469 460 0,00636670170443802 0,00640034510629974 0,0064087891966125 0,00630197604333562 0,00182201304077623 0,00188542112581062 241583 278932 579 665 0 True 466 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 513 459 0,00643978161414361 0,00622444185538233 0,00646982528419928 0,00625619897764553 0,00166589669808207 0,00177863000606821 244356 271266 579 665 0 True 510 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 556 460 0,00616772827556054 0,00628873626042676 0,00627145799954223 0,00636301213092241 0,0017345206392726 0,00173899687074211 234033 274068 579 665 0 True 554 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 601 459 0,00607725466213851 0,00594298747555545 0,00617990386816205 0,00602731364919509 0,00164391215534936 0,0018127685361189 230600 259000 579 665 0 True 597 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 645 460 0,00585659181180856 0,00578147130242636 0,00584420538643473 0,00581368734264134 0,00170867328440659 0,00180361145398135 222227 251961 579 665 0 True 641 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 248 504 0,00594756615306486 0,00617873362738501 0,005981536583505 0,00624093995574884 0,00134027855227069 0,00141435949244761 225679 269274 579 665 0 True 247 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 293 504 0,00611968475756801 0,00626813084439182 0,00610360875867857 0,00628671702143893 0,00147057701248976 0,00140990543521156 232210 273170 579 665 0 True 291 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 336 504 0,0061323083698107 0,00626161420947654 0,00604257267109178 0,00628671702143893 0,00152621455615376 0,00157105482987567 232689 272886 579 665 0 True 335 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 381 504 0,00618986571665419 0,00620941229246153 0,00621042191195544 0,00622568093385214 0,0015742414745227 0,00142039956585425 234873 270611 579 665 0 True 379 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 425 504 0,00634385270273778 0,00644474541813449 0,0063935301747158 0,00642404821850919 0,00172678750357436 0,00179771748251605 240716 280867 579 665 0 True 422 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 469 504 0,00644304952211458 0,00656576208201896 0,00650034332799268 0,00648508430609598 0,0019284811184193 0,00159062477032096 244480 286141 579 665 0 True 466 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 513 503 0,00648155285715961 0,00632964879582798 0,00654612039368277 0,00631723506523232 0,00163578013108096 0,00165577333137035 245941 275851 579 665 0 True 510 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 557 504 0,00642357384477147 0,00625615308585036 0,00646982528419928 0,00624093995574884 0,00166583924528098 0,00167544179480881 243741 272648 579 665 0 True 554 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 601 504 0,00630471686937579 0,0062723528895482 0,00628671702143893 0,00627145799954223 0,00171395684312957 0,00178144998981714 239231 273354 579 665 0 True 597 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 645 503 0,00623155789738057 0,00606971766793959 0,00627145799954223 0,00619516289005875 0,00180856461121409 0,00176535168602029 236455 264523 579 665 0 True 641 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 249 548 0,00626244489852553 0,00631115440237123 0,00621042191195544 0,00625619897764553 0,00131604798278329 0,00140859261215478 237627 275045 579 665 0 True 247 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 293 547 0,00621482304607763 0,00633180571020134 0,00630197604333562 0,00631723506523232 0,00142780613173309 0,00129243601165663 235820 275945 579 665 0 True 291 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 337 547 0,00605161212620502 0,00640555382505245 0,00614938582436866 0,0063782711528191 0,00139625192283658 0,00144414679601711 229627 279159 579 665 0 True 335 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 381 548 0,00614817353592782 0,00633242524943625 0,00616464484626535 0,00634775310902571 0,0013514330916556 0,00141488296202833 233291 275972 579 665 0 True 379 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 425 547 0,00641134554397688 0,00620353814267874 0,00653086137178607 0,00633249408712902 0,00182654241959728 0,00176753442292974 243277 270355 579 665 0 True 422 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 469 548 0,00641469251423747 0,00632072284166585 0,0063782711528191 0,0063782711528191 0,00194211182819381 0,00183889484043497 243404 275462 579 665 0 True 466 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 514 547 0,00659479640999226 0,00644850854533909 0,00660715648126955 0,00651560234988937 0,00193056003345293 0,00194257706964203 250238 281031 579 665 0 True 510 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 554 547 0,00651051600925714 0,00653249053051489 0,00645456626230259 0,00653086137178607 0,0018051602632786 0,00185135756228528 247040 284691 579 665 0 False 554 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 601 548 0,00626726769819236 0,00642673288852711 0,00627145799954223 0,00636301213092241 0,00159437341007699 0,0015236521098095 237810 280082 579 665 0 True 597 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 645 547 0,00628864087048635 0,00610158951969074 0,00628671702143893 0,00611886778057527 0,00171627226047987 0,00171478780184824 238621 265912 579 665 0 True 641 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 247 590 0,006619621968933 0,00648804432688496 0,00660715648126955 0,00646982528419928 0,00130446355195258 0,00127333359268171 251180 282754 579 665 0 False 247 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 291 590 0,00647035236613008 0,0063688862807052 0,00651560234988937 0,00642404821850919 0,00138168044487506 0,00139262303082333 245516 277561 579 665 0 False 291 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 338 591 0,00629675793222069 0,00614727480179047 0,00628671702143893 0,00621042191195544 0,00150406337928604 0,00146780730786133 238929 267903 579 665 0 True 335 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 381 591 0,00624138797539002 0,00600404650903982 0,00622568093385214 0,00599679560540169 0,00126762130629184 0,00115127201658269 236828 261661 579 665 0 True 378 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 422 590 0,00600520256219797 0,00592855450597196 0,00607309071488518 0,00599679560540169 0,00160395807123283 0,00173804299419234 227866 258371 579 665 0 False 422 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 466 590 0,006427210710094 0,00610686707613621 0,00656137941557946 0,00608834973678187 0,00189357901127023 0,00180702409782251 243879 266142 579 665 0 False 466 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 510 590 0,00608489735013512 0,0073512460482862 0,00602731364919509 0,00671396963454643 0,0019296847892045 0,00547141852490982 230890 320373 579 665 0 False 510 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 554 590 0,00635523767244309 0,0067315691379972 0,00636301213092241 0,00669871061264973 0,0018265307451976 0,00173405456879252 241148 293367 579 665 0 False 554 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 597 590 0,0063432729126139 0,00644093639913471 0,00630197604333562 0,0063935301747158 0,00166571089217919 0,00155095981425049 240694 280701 579 665 0 False 597 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 641 590 0,00668735199704096 0,00646360694595266 0,00669871061264973 0,00642404821850919 0,00151995541796156 0,00143220327891233 253750 281689 579 665 0 False 641 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 249 637 0,0102423351416197 0,656928152379117 0,0081177996490425 0,651544975967041 0,00676033181878247 0,196959934938028 388643 28629438 579 665 1 True 247 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 291 633 0,0081932514274367 0,00662030448058806 0,00675974670023652 0,00663767452506294 0,00645655588405861 0,00128365920018183 310891 288518 579 665 0 False 291 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 335 633 0,00608571432712787 0,00613291066989974 0,00601205462729839 0,00610360875867857 0,00126633238336186 0,00121768204937954 230921 267277 579 665 0 False 335 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 378 633 0,0061235588097594 0,00621189044940114 0,00605783169298848 0,00617990386816205 0,00126802076935948 0,00127883982068168 232357 270719 579 665 0 False 378 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 422 633 0,00607042895113463 0,00609470575041403 0,0059510185397116 0,00616464484626535 0,00150218596804547 0,00147235856947886 230341 265612 579 665 0 False 422 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 466 633 0,00603954194998968 0,00599833298054016 0,00608834973678187 0,00604257267109178 0,00169209329748582 0,00173813913586135 229169 261412 579 665 0 False 466 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 510 633 0,0061517840471538 0,00609284713270932 0,00610360875867857 0,00611886778057527 0,00179815298694048 0,00172947492800771 233428 265531 579 665 0 False 510 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 553 633 0,00604842328052368 0,00626735068387379 0,00613412680247196 0,00631723506523232 0,001649569830974 0,00167047901461928 229506 273136 579 665 0 False 553 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 597 633 0,00626937602591556 0,00648008210042157 0,00630197604333562 0,00643930724040589 0,00140569936947249 0,00130265947351114 237890 282407 579 665 0 False 597 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 645 635 0,00898882889378811 0,684014109432427 0,00823987182421607 0,676188296330205 0,00349544002686119 0,193448262699007 341079 29809865 579 665 6 True 641 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H8_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H8_3.csv new file mode 100755 index 0000000..4f1949f --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H8_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 248 246 0,00114503278647265 0,0608968289343179 0,000900282291905089 0,0621499961852445 0,000961731816974055 0,0203888192783581 43448 2653931 579 665 0 True 248 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 291 247 0,00102907476169638 0,000956545632793359 0,000839246204318303 0,00080872816052491 0,000793466273704815 0,00070114912957223 39048 41687 579 665 0 False 291 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 337 243 0,00092168181829562 0,000967674393124032 0,00080872816052491 0,000854505226215 0,000664014131483763 0,000627272790140583 34973 42172 579 665 0 True 335 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 380 244 0,000956785474886984 0,00089908910523046 0,000823987182421607 0,00080872816052491 0,00067800712493494 0,000616171211117643 36305 39183 579 665 0 True 379 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 424 244 0,00098437821396443 0,000957876494853522 0,00080872816052491 0,000747692072938125 0,000817958019867193 0,000767090358305754 37352 41745 579 665 0 True 423 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 468 245 0,000942238013596869 0,00103405687484906 0,000793469138628214 0,000900282291905089 0,000785694266888124 0,000839222814233592 35753 45065 579 665 0 True 466 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 512 245 0,000957576097783186 0,000882315654092889 0,000823987182421607 0,000701915007248035 0,000794593250358099 0,000791668724901688 36335 38452 579 665 0 True 510 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 557 245 0,000863360202652461 0,000940024586529267 0,00064087891966125 0,000823987182421607 0,000776119655160114 0,000676488591347218 32760 40967 579 665 0 True 554 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 598 247 0,000911799032093096 0,000962075594112312 0,000564583810177768 0,000534065766384375 0,000929967902954209 0,00106413464199725 34598 41928 579 665 0 False 598 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 644 245 0,00102259165394752 0,0633755824672691 0,000701915007248035 0,0641641870756084 0,000963420197067286 0,0185523278898806 38802 2761957 579 665 0 True 641 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 247 289 0,000909743412562971 0,000932980195969438 0,000717174029144732 0,000717174029144732 0,000756773565495012 0,000792896923853206 34520 40660 579 665 0 False 247 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 291 289 0,000908610186411749 0,000795855511977472 0,000778210116731518 0,00064087891966125 0,000675531272237147 0,000655620316819937 34477 34684 579 665 0 False 291 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 337 289 0,000965640451324445 0,000900190508314733 0,000839246204318303 0,000762951094834821 0,000686841770506298 0,000680253545092273 36641 39231 579 665 0 True 335 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 381 290 0,000926293785190131 0,000923572377957941 0,000793469138628214 0,000854505226215 0,000680518356920052 0,000617423998001917 35148 40250 579 665 0 True 379 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 425 288 0,000926899929410552 0,000911135701464694 0,000747692072938125 0,000671396963454643 0,000814604946710974 0,000801831777635767 35171 39708 579 665 0 True 423 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 466 290 0,000878171204907976 0,000939175588318473 0,000625619897764553 0,000625619897764553 0,000866869785440778 0,0009516237802939 33322 40930 579 665 0 False 466 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 512 289 0,000945400505181677 0,000817034575452135 0,000747692072938125 0,000625619897764553 0,000842345693116813 0,000778992120746013 35873 35607 579 665 0 True 510 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 556 289 0,000918809221772753 0,000901314857296595 0,000686655985351339 0,000671396963454643 0,000850917169995871 0,000782288066026361 34864 39280 579 665 0 True 554 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 598 290 0,000851000131375171 0,000891471067230906 0,000442511635004196 0,000473029678797589 0,000934141191396093 0,000968602016263421 32291 38851 579 665 0 False 598 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 641 290 0,000888686489427461 0,000906615359639658 0,000549324788281071 0,000488288700694286 0,000896896936484961 0,000994134783684863 33721 39511 579 665 0 False 641 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 249 328 0,000903655616262217 0,000860517051383322 0,000717174029144732 0,000701915007248035 0,000763212931336205 0,000710871308765496 34289 37502 579 665 0 True 247 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 293 328 0,000907292481584746 0,000865266852184249 0,000747692072938125 0,000717174029144732 0,000726172949692283 0,000656042210580761 34427 37709 579 665 0 True 291 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 335 332 0,00095106663593779 0,000951359859938241 0,000885023270008392 0,000839246204318303 0,000610473414326284 0,000698935883951076 36088 41461 579 665 0 False 335 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 381 327 0,000887869512434719 0,000976003753948846 0,000732433051041428 0,000885023270008392 0,000707889677902321 0,000667245538933578 33690 42535 579 665 0 True 379 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 425 327 0,000906343734109303 0,000913728587892253 0,000732433051041428 0,00064087891966125 0,00078891776674802 0,000825176878903108 34391 39821 579 665 0 True 422 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 466 332 0,000989042889052021 0,000918111254331755 0,000747692072938125 0,000762951094834821 0,000870002695524853 0,000765219626967661 37529 40012 579 665 0 False 466 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 513 328 0,000940182394066744 0,00096306226770864 0,000793469138628214 0,000762951094834821 0,000803528667517687 0,000864035539819277 35675 41971 579 665 0 True 510 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 557 327 0,000992732462567629 0,000944774387330193 0,000747692072938125 0,000778210116731518 0,000886038230284741 0,000761948453885702 37669 41174 579 665 0 True 554 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 601 327 0,000903840094937997 0,000889084693881648 0,000473029678797589 0,000289921416037232 0,0010134168652583 0,00110545932069502 34296 38747 579 665 0 True 598 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 645 326 0,000920205988889376 0,00086687306501548 0,000488288700694286 0,000473029678797589 0,000995578516286971 0,000917257230395966 34917 37779 579 665 0 True 641 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 249 373 0,000912431530410058 0,00085496414416678 0,000762951094834821 0,000671396963454643 0,000760283072086192 0,000751106120220626 34622 37260 579 665 0 True 247 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 291 375 0,000834924132485733 0,000912718968398336 0,000732433051041428 0,000793469138628214 0,000637372877337279 0,000695996513449782 31681 39777 579 665 0 False 291 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 337 372 0,000910982055100354 0,000906661251434836 0,00080872816052491 0,000762951094834821 0,000669735590858331 0,000723186715957678 34567 39513 579 665 0 True 335 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 381 371 0,000927822322789455 0,000889727179014141 0,000778210116731518 0,000793469138628214 0,000722568650569227 0,000662987771558029 35206 38775 579 665 0 True 379 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 425 371 0,000894616161148975 0,000931282199547851 0,000671396963454643 0,000686655985351339 0,00078960676013953 0,000816022654138768 33946 40586 579 665 0 True 422 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 469 372 0,000967195343020309 0,000961111866413573 0,000610360875867857 0,000686655985351339 0,000915250738430699 0,000857577501641854 36700 41886 579 665 0 True 466 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 513 372 0,000832736742472908 0,000834014539668007 0,000549324788281071 0,000518806744487678 0,00081541697304967 0,000874717893964215 31598 36347 579 665 0 True 510 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 557 371 0,000856165534297023 0,000915472476109018 0,000518806744487678 0,000671396963454643 0,000921852482439243 0,000839957639973735 32487 39897 579 665 0 True 554 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 601 372 0,000869816956304776 0,000959597437172698 0,000381475547417411 0,000503547722590982 0,00101126911068491 0,00107483830285191 33005 41820 579 665 0 True 597 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 645 371 0,000815369392853006 0,000841288389203726 0,000457770656900893 0,000442511635004196 0,000914012448694889 0,000934109962521251 30939 36664 579 665 0 True 641 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 248 415 0,000888396594365521 0,00100714133697714 0,000747692072938125 0,000854505226215 0,000757697954106857 0,000848603730641304 33710 43892 579 665 0 True 247 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 293 416 0,000853872727898038 0,00089583078777282 0,000717174029144732 0,000793469138628214 0,000690044959634882 0,000711626617365467 32400 39041 579 665 0 True 291 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 338 416 0,000880780260465442 0,00093527478572834 0,000778210116731518 0,000839246204318303 0,000635644524958782 0,000642442746743522 33421 40760 579 665 0 True 335 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 381 415 0,000961871815519216 0,000996127306134414 0,000823987182421607 0,000885023270008392 0,000758530364046642 0,000751654355479773 36498 43412 579 665 0 True 379 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 425 415 0,000926847221217472 0,00101209765085637 0,000686655985351339 0,00080872816052491 0,000856993744813905 0,000801719977009385 35169 44108 579 665 0 True 422 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 469 416 0,000988173203866199 0,000982313875785825 0,000747692072938125 0,000778210116731518 0,000866032136742098 0,000832681157532526 37496 42810 579 665 0 True 466 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 513 415 0,000874297152716587 0,000915472476109018 0,000625619897764553 0,000656137941557946 0,00083606664615312 0,000894178210614714 33175 39897 579 665 0 True 510 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 558 416 0,00088396910614679 0,000868295710665999 0,00064087891966125 0,000671396963454643 0,000863086803991602 0,000802942599290371 33542 37841 579 665 0 True 554 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 601 416 0,000844437961336696 0,000878759039966591 0,000473029678797589 0,0004272526131075 0,000978334950110695 0,00101961645902712 32042 38297 579 665 0 True 597 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 645 415 0,00075847089842301 0,000833303216842748 0,000366216525520714 0,000442511635004196 0,000904023741956995 0,000874335602751794 28780 36316 579 665 0 True 641 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 248 460 0,000889872423771764 0,000897115758037804 0,000747692072938125 0,000732433051041428 0,00075121803885257 0,000756168279374812 33766 39097 579 665 0 True 247 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 293 461 0,000928850132554517 0,000966366476961458 0,000778210116731518 0,000823987182421607 0,00078204514655156 0,000795958222047731 35245 42115 579 665 0 True 291 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 337 460 0,000974337303182666 0,000948675189920326 0,000823987182421607 0,000762951094834821 0,000805556346621339 0,000824047616543052 36971 41344 579 665 0 True 335 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 380 459 0,00091316944511318 0,000952690721998404 0,00080872816052491 0,000793469138628214 0,000724756173399192 0,000747840598808003 34650 41519 579 665 0 True 379 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 424 458 0,00100266795696323 0,000975040026250107 0,000686655985351339 0,000625619897764553 0,00105025720006663 0,000983621884819677 38046 42493 579 665 0 True 422 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 469 460 0,000970199710025876 0,000957165172028262 0,000610360875867857 0,000534065766384375 0,001006028907784 0,0010195695516385 36814 41714 579 665 0 True 466 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 513 459 0,000826886133041014 0,000899593914977418 0,000488288700694286 0,000534065766384375 0,000864732265412354 0,000968087199013046 31376 39205 579 665 0 True 510 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 556 460 0,000871898929931441 0,000866964848605836 0,000503547722590982 0,000473029678797589 0,000960389402266935 0,00094564098692015 33084 37783 579 665 0 True 554 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 601 459 0,000914803399098664 0,000945233305281974 0,000564583810177768 0,000610360875867857 0,000975701279455213 0,000978546621151887 34712 41194 579 665 0 True 597 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 645 460 0,000890109610640625 0,000858153623931653 0,000503547722590982 0,000457770656900893 0,000941996921972398 0,000951747088413676 33775 37399 579 665 0 True 641 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 248 504 0,000849181698713907 0,00099059734481546 0,000717174029144732 0,000869764248111696 0,000662080699980563 0,00075986220175459 32222 43171 579 665 0 True 247 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 293 504 0,000927110762182873 0,000912994319169404 0,000793469138628214 0,000778210116731518 0,000762459735395732 0,000749238028494489 35179 39789 579 665 0 True 291 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 336 504 0,000990334239782484 0,00094087358474006 0,000869764248111696 0,000793469138628214 0,000781450708056905 0,00082777330927094 37578 41004 579 665 0 True 335 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 381 504 0,000987066331811516 0,000988532214032449 0,000839246204318303 0,00080872816052491 0,000829178791599728 0,000846971745234567 37454 43081 579 665 0 True 379 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 425 504 0,000924501706625407 0,000933622681101931 0,000625619897764553 0,00064087891966125 0,000977973653268942 0,000900947331386813 35080 40688 579 665 0 True 422 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 469 504 0,000987698830128478 0,000938280698312501 0,000595101853971161 0,000701915007248035 0,000987393597773427 0,000851979120813379 37478 40891 579 665 0 True 466 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 513 503 0,000927427011341354 0,00086524390628666 0,000610360875867857 0,000625619897764553 0,000898970041218397 0,000832532423222283 35191 37708 579 665 0 True 510 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 557 504 0,00089253418752231 0,000879929280743631 0,000549324788281071 0,000595101853971161 0,000909857698337245 0,000878832711262299 33867 38348 579 665 0 True 554 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 601 504 0,000961423795878035 0,000826396501668453 0,000625619897764553 0,000564583810177768 0,000938696611254641 0,000847827780296373 36481 36015 579 665 0 True 597 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 645 503 0,00089648730200332 0,000838534881493044 0,000625619897764553 0,000411993591210803 0,000895341677534519 0,000985868518960891 34017 36544 579 665 0 True 641 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 249 548 0,000817978448410472 0,000863270559094004 0,00064087891966125 0,000717174029144732 0,000666376972781828 0,000706717853870776 31038 37622 579 665 0 True 247 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 293 547 0,000903260304814116 0,000951199238655118 0,00080872816052491 0,00080872816052491 0,000719929173390933 0,000754386550228353 34274 41454 579 665 0 True 291 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 337 547 0,000781082713254384 0,000984631411442316 0,000686655985351339 0,000854505226215 0,000627860316768227 0,000730567692376158 29638 42911 579 665 0 True 335 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 381 548 0,000920285051178997 0,00103983924104149 0,000762951094834821 0,000900282291905089 0,000755948841478234 0,000775318025346924 34920 45317 579 665 0 True 379 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 425 547 0,0010201407229693 0,000976623293183749 0,000778210116731518 0,000610360875867857 0,000971081067344944 0,00100093684765511 38709 42562 579 665 0 True 422 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 469 548 0,000894563452955895 0,000997113979730741 0,000503547722590982 0,000595101853971161 0,000983975402542577 0,0010358908553828 33944 43455 579 665 0 True 466 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 514 547 0,000923658375536125 0,000903471771669962 0,000518806744487678 0,000473029678797589 0,00100525819830401 0,00104274774462964 35048 39374 579 665 0 True 510 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 554 547 0,000950355075331208 0,000864211340895154 0,000595101853971161 0,000457770656900893 0,000960361649673757 0,000979338467022955 36061 37663 579 665 0 False 554 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 601 548 0,000884680666753372 0,000783349997791457 0,000610360875867857 0,000549324788281071 0,000852368510165884 0,000750693727515826 33569 34139 579 665 0 True 597 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 645 547 0,000911298304258835 0,000824790288837222 0,000564583810177768 0,0004272526131075 0,000921459376155961 0,000952116036036984 34579 35945 579 665 0 True 641 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 247 590 0,000952463403054413 0,000854895306474013 0,000823987182421607 0,000747692072938125 0,000657715457089901 0,000608141576895345 36141 37257 579 665 0 False 247 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 291 590 0,000899544377201967 0,000878942607147303 0,000747692072938125 0,000747692072938125 0,000729855875602718 0,000746597454437702 34133 38305 579 665 0 False 291 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 338 591 0,000968328569171531 0,000913315561735651 0,000823987182421607 0,000793469138628214 0,000764675286200653 0,000759488699337282 36743 39803 579 665 0 True 335 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 381 591 0,000978369479953295 0,000942479797571292 0,000839246204318303 0,000869764248111696 0,000705826290839318 0,000641973216186687 37124 41074 579 665 0 True 378 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 422 590 0,00100032244237117 0,000960584110769026 0,000762951094834821 0,000671396963454643 0,000905616355078133 0,000894723004855356 37957 41863 579 665 0 False 422 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 466 590 0,000911324658355375 0,00101381859317555 0,000503547722590982 0,000656137941557946 0,00100032158037931 0,00097694229914759 34580 44183 579 665 0 False 466 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 510 590 0,000924290873853086 0,000946449437854191 0,000350957503624018 0,000488288700694286 0,00110800346081193 0,00118690796263732 35072 41247 579 665 0 False 510 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 554 590 0,000936993548385397 0,00100246037386898 0,000518806744487678 0,000656137941557946 0,000988817044494199 0,000978649412150643 35554 43688 579 665 0 False 554 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 597 590 0,000809018055586851 0,000875592506099306 0,000503547722590982 0,000656137941557946 0,000784295767331221 0,000747965028594871 30698 38159 579 665 0 False 597 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 641 590 0,000934700741986411 0,000869121762979204 0,000701915007248035 0,000671396963454643 0,000819078549605095 0,000744224780422295 35467 37877 579 665 0 False 641 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 249 637 0,00114389956032143 0,0644913267375351 0,000976577401388571 0,0638590066376745 0,000858377870118567 0,0201105557527092 43405 2810582 579 665 0 True 247 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 291 633 0,00109300979990257 0,000879263849713549 0,000946059357595178 0,000732433051041428 0,000870154826377365 0,000687137492131616 41474 38319 579 665 0 False 291 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 335 633 0,000966378366027567 0,000956866875359605 0,000869764248111696 0,000839246204318303 0,000695172738547247 0,000713094264856206 36669 41701 579 665 0 False 335 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 378 633 0,00101479084137166 0,00096235094488338 0,000885023270008392 0,000854505226215 0,00071633967192737 0,000700193438926294 38506 41940 579 665 0 False 378 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 422 633 0,000921312860944059 0,00100425015388093 0,000717174029144732 0,000747692072938125 0,000762677006694 0,000871322343925203 34959 43766 579 665 0 False 422 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 466 633 0,000901731767214792 0,000989174699164941 0,000595101853971161 0,000671396963454643 0,000907636488247887 0,000966957958219587 34216 43109 579 665 0 False 466 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 510 633 0,000977763335732874 0,000926050534897555 0,000686655985351339 0,000610360875867857 0,000962789841306094 0,000943906389689286 37101 40358 579 665 0 False 510 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 553 633 0,000826833424847934 0,000871049218376681 0,000473029678797589 0,000564583810177768 0,000852532003862225 0,000896417585571754 31374 37961 579 665 0 False 553 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 597 633 0,000864177179645203 0,000939978694734089 0,000717174029144732 0,00080872816052491 0,000728201530252619 0,000677241864282739 32791 40965 579 665 0 False 597 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 645 635 0,00105972457597247 0,0672261335416821 0,000946059357595178 0,0656595712214847 0,000756734465048833 0,0199668455758316 40211 2929767 579 665 0 True 641 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H9_1.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H9_1.csv new file mode 100755 index 0000000..b07c6a9 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H9_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 259 275 0,0106336407670465 0,0423352957812246 0,0106202792401007 0,0430304417486839 0,00165066894812847 0,0080287398232387 403491 1845005 579 665 0 True 259 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 302 276 0,0104730916109245 0,0104069971220108 0,010452429999237 0,0103608758678569 0,00140485206937924 0,00129248965247144 397399 453545 579 665 0 False 302 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 347 275 0,0108984203749845 0,052604020924364 0,0108033875028611 0,0536964980544747 0,00155162439665632 0,00788546429596653 413538 2292524 579 665 0 True 346 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 390 274 0,0112720951098261 0,0797764840115854 0,0111238269626917 0,0775768673228046 0,00176405328074073 0,0155697899586453 427717 3476721 579 665 0 True 390 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 435 274 0,0110717776220251 0,0609044240264199 0,0109712367437247 0,0602273594262608 0,00185349275769293 0,0117866910846152 420116 2654262 579 665 0 True 434 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 479 276 0,0108686665999908 0,0589203381536928 0,0107881284809644 0,0589913786526284 0,0018300180772989 0,0160248951816685 412409 2567794 579 665 0 True 478 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 522 275 0,0109084876398628 0,068093373741059 0,0108644235904479 0,0675822079804684 0,00158200539767742 0,0171245149549207 413920 2967562 579 665 0 True 521 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 567 275 0,0108618672430835 0,0597033898548156 0,0108339055466545 0,0585793850614176 0,00170811403093309 0,0151936080974347 412151 2601920 579 665 0 True 565 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 609 276 0,0107065098439798 0,0108542356119183 0,0107270923933776 0,010757610437171 0,00198129808937549 0,00195003862627227 406256 473036 579 665 0 False 609 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 655 275 0,0108351968973849 0,0426615864449405 0,0107881284809644 0,0426184481574731 0,00208871970743733 0,00806195946019912 411139 1859225 579 665 0 True 653 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 258 318 0,0104327171350251 0,0104368726806717 0,0103456168459602 0,0103913939116503 0,00157543861959194 0,00182462562028618 395867 454847 579 665 0 False 258 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 302 318 0,010290563138288 0,0104149822943718 0,0102998397802701 0,010452429999237 0,00142972302795972 0,00135696552903959 390473 453893 579 665 0 False 302 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 346 319 0,0111322075653914 0,0858339256243149 0,010955977721828 0,0853589684901198 0,00179488540365231 0,0165927756247817 422409 3740709 579 665 0 True 346 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 391 320 0,0108193053771713 0,0441836796156103 0,0108033875028611 0,0444800488288701 0,00158824377840976 0,00628815126219154 410536 1925559 579 665 0 True 390 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 435 319 0,011043130719086 0,0746224682787307 0,0108491645685512 0,071274891279469 0,00204546488483816 0,0188755777205363 419029 3252105 579 665 0 True 434 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 480 319 0,0109198462554716 0,0368496659364135 0,0108339055466545 0,0375219348439765 0,0017632229712544 0,00643454800943581 414351 1605937 579 665 0 True 478 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 523 320 0,0107251421902336 0,0370815112856529 0,0106813153276875 0,0380865186541543 0,00170463767171599 0,00648052406954296 406963 1616041 579 665 0 True 521 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 568 320 0,0112058409111244 0,0445234854130061 0,0111238269626917 0,0449530785076677 0,00211513704110861 0,00850251413951814 425203 1940368 579 665 0 True 565 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 609 319 0,0107157074236723 0,0107202315699985 0,0107118333714809 0,0107118333714809 0,00216069029034459 0,00216336275141105 406605 467196 579 665 0 False 609 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 653 319 0,0109689702914223 0,010588384442452 0,0109864957656214 0,0106202792401007 0,00222751042370208 0,00190519493776022 416215 461450 579 665 0 False 653 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 259 358 0,0110044165512687 0,0455708968002519 0,0109254596780346 0,0463874265659571 0,00167770464138607 0,00875601152485019 417560 1986015 579 665 0 True 258 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 303 358 0,0109005550568043 0,0554804498084304 0,0108644235904479 0,0568703746089876 0,00141488253165752 0,0143638194639762 413619 2417881 579 665 0 True 302 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 346 358 0,0111514460558657 0,0347329298297242 0,0108644235904479 0,0354314488441291 0,002338539033944 0,00501241954058546 423139 1513688 579 665 0 True 346 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 390 362 0,0114340673871613 0,0306332551451873 0,011261158159762 0,0325017166399634 0,00199428123025091 0,00802383833624172 433863 1335021 579 665 0 False 390 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 435 357 0,0115224063187636 0,0595812488419492 0,0112001220721752 0,0590218966964218 0,0027362355353092 0,0113655703153597 437215 2596597 579 665 0 True 434 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 478 362 0,0115277825544578 0,0285060327632999 0,011261158159762 0,0302433813992523 0,002577164206794 0,00708040155716553 437419 1242315 579 665 0 False 478 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 524 359 0,0109024261976586 0,0255887142897298 0,0108644235904479 0,0256046387426566 0,00179594341459552 0,00284230125199428 413690 1115176 579 665 0 True 521 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 566 357 0,0111277273689796 0,0447174700312236 0,0110627908751049 0,0452277409018082 0,00208501943482067 0,00736969142420199 422239 1948822 579 665 0 True 565 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 611 358 0,0108919372672357 0,0492284958218389 0,0109102006561379 0,0497749294270237 0,00211917975985862 0,0101180755651018 413292 2145416 579 665 0 True 609 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 655 357 0,010711886079674 0,0567242780790383 0,0108491645685512 0,0562752727550164 0,00204114999990315 0,0135651076185559 406460 2472088 579 665 0 True 653 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 259 403 0,0105727100958459 0,0436793517325013 0,010605020218204 0,0441596093690394 0,00171599390451813 0,0101009381711691 401179 1903580 579 665 0 True 258 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 304 403 0,0105788769544363 0,0301427177465293 0,0107270923933776 0,0304264896620127 0,00147319699171304 0,0035799908341066 401413 1313643 579 665 0 True 302 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 347 402 0,0112224439919446 0,0786473163912298 0,0111848630502785 0,0768444342717632 0,00158796929364109 0,0183798521036319 425833 3427511 579 665 0 True 346 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 391 402 0,0108945199686966 0,0590024385752663 0,0110017547875181 0,0595712214847028 0,00150666866069048 0,0117884344039942 413390 2571372 579 665 0 True 390 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 435 402 0,0109824372347543 0,0394027412316555 0,0110627908751049 0,0394903486686503 0,00164083536999552 0,00727027851294175 416726 1717202 579 665 0 True 434 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 479 402 0,010943485880068 0,0500411477308515 0,0110322728313115 0,0511635004196231 0,00177399025823562 0,00900490834983215 415248 2180832 579 665 0 True 477 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 523 402 0,0109860741000768 0,0377056397000742 0,0110017547875181 0,038300144960708 0,00168753881783719 0,00498890098896806 416864 1643241 579 665 0 True 521 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 568 402 0,0110238395204187 0,0456968927239132 0,0110933089188983 0,045838101777676 0,00174935752271284 0,0068932316114973 418297 1991506 579 665 0 True 565 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 612 402 0,0110629489996841 0,037852768795415 0,0111238269626917 0,037949187457084 0,00190561614716203 0,00695402031984062 419781 1649653 579 665 0 True 609 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 655 402 0,0111918732399581 0,0757490200667611 0,0110933089188983 0,073334859235523 0,00220292055656057 0,0146154889532764 424673 3301201 579 665 0 True 653 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 259 447 0,0106896168680976 0,0424982346000042 0,0106355382619974 0,0426642252231632 0,00166871068961241 0,00676349729156732 405615 1852106 579 665 0 True 258 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 303 446 0,0109564520955658 0,0539314640457862 0,0109254596780346 0,0549477378500038 0,00172017324493517 0,00827708476513477 415740 2350375 579 665 0 True 302 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 348 446 0,0106943078972817 0,0326444401229671 0,0106813153276875 0,033173113603418 0,00150098107407594 0,00396653102814327 405793 1422670 579 665 0 True 346 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 392 446 0,0108515100831432 0,0507849390011995 0,0108186465247578 0,0494239719233997 0,00150597558351201 0,0113103269277947 411758 2213247 579 665 0 True 390 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 436 446 0,0113141035397109 0,0849342858175423 0,0112153810940719 0,0839246204318303 0,00213025984738677 0,00949154358187326 429311 3701502 579 665 0 True 434 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 480 446 0,0110439213419822 0,0560562082707341 0,0110017547875181 0,0552529182879377 0,00180113898734672 0,0121717586411717 419059 2442973 579 665 0 True 477 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 524 446 0,0110869575816321 0,049234461755212 0,0112153810940719 0,049210345616846 0,00166116338513509 0,00801008213478529 420692 2145676 579 665 0 True 521 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 568 447 0,0109983024008714 0,0290434256848347 0,0109407186999313 0,029251544975967 0,00195495936485882 0,00415822699763348 417328 1265735 579 665 0 True 565 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 612 446 0,0107881021268678 0,0379431526860181 0,010757610437171 0,0384832532234684 0,00202723714131654 0,00611653412077421 409352 1653592 579 665 0 True 609 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 656 445 0,0109337348643482 0,0658283382982519 0,0109864957656214 0,0655832761120012 0,00215472301064582 0,00809422061947225 414878 2868850 579 665 0 True 653 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 259 490 0,0109719746584278 0,0489754255173296 0,0109407186999313 0,0496375982299535 0,00155995653318051 0,0126308641861158 416329 2134387 579 665 0 True 258 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 303 490 0,0110949692269803 0,0502989907820593 0,0109864957656214 0,0509346150911727 0,00184212138454313 0,00795109425466688 420996 2192069 579 665 0 True 302 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 346 490 0,0114261611581993 0,0620151890369091 0,0112153810940719 0,0612497138933394 0,00189955041246118 0,0154466947865924 433563 2702670 579 665 0 True 346 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 391 490 0,0113708439095617 0,0815854238480156 0,011261158159762 0,0783245593957427 0,00191130545862325 0,0180392309697811 431464 3555556 579 665 0 True 390 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 435 490 0,0115684732795156 0,0874508312438225 0,0115053025101091 0,0851758602273594 0,00197170662665566 0,0263514652852226 438963 3811175 579 665 0 True 434 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 480 489 0,0110932562107052 0,0442644032833285 0,0111390859845884 0,0451819638361181 0,00187736217434266 0,00770391179689388 420931 1929077 579 665 0 True 477 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 524 489 0,0109517083581885 0,0395724031984287 0,0109864957656214 0,0404821850919356 0,0018149696288998 0,00611293895169246 415560 1724596 579 665 0 True 521 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 567 490 0,0113468616817102 0,0894653433767527 0,0111543450064851 0,0893415732051576 0,00212317324930148 0,0141089202351563 430554 3898969 579 665 0 True 565 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 611 489 0,0108937029917039 0,0565586086984456 0,0109254596780346 0,0573891813534752 0,0018756989168488 0,0134098330892201 413359 2464868 579 665 0 True 609 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 655 490 0,0109200570882439 0,0690893404259103 0,010757610437171 0,0673685816739147 0,00209048902171385 0,0120019860013641 414359 3010967 579 665 0 True 653 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 259 534 0,0106240478759059 0,0466224155031662 0,0105897611963073 0,0488746471351186 0,00165597776203821 0,011161678543583 403127 2031841 579 665 0 True 258 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 303 534 0,0111340523521492 0,0917971513815438 0,0108491645685512 0,0879530022125582 0,00202831289927107 0,0239748867894156 422479 4000591 579 665 0 True 302 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 347 534 0,0110584951573689 0,0512133848009816 0,0110780498970016 0,0530403601129168 0,00164952232073732 0,0104462007238639 419612 2231919 579 665 0 True 346 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 391 534 0,0112272404375149 0,0529424270220068 0,0111238269626917 0,0532234683756771 0,00175439689078276 0,00749538473345485 426015 2307272 579 665 0 True 390 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 435 534 0,0113449641867594 0,0534518488943806 0,0114290074006256 0,0537117570763714 0,00190775695750566 0,00752107372677183 430482 2329473 579 665 0 True 434 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 479 534 0,011389160006657 0,0562825236586545 0,0113832303349355 0,0567940794995041 0,00198185799952243 0,0109389783030374 432159 2452836 579 665 0 True 477 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 523 534 0,0109669937341818 0,0660806743340384 0,0110780498970016 0,0658579385061418 0,00198126487405324 0,0147175716322149 416140 2879847 579 665 0 True 521 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 566 533 0,0110952591220423 0,0534831929904872 0,0110933089188983 0,053681239032578 0,00173843660179998 0,0121359142739784 421007 2330839 579 665 0 True 565 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 612 534 0,0108851115562318 0,0395194899585884 0,0108949416342412 0,0399176012817578 0,00181276746976898 0,00547961948946918 413033 1722290 579 665 0 True 609 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 655 533 0,0106811572031083 0,0561871146164794 0,0107728694590677 0,0570840009155413 0,00210670156683693 0,0108394179959568 405294 2448678 579 665 0 True 653 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 259 579 0,0107473323395204 0,041683999424058 0,0105745021744106 0,042221713588159 0,0016188635777296 0,00842532234173773 407805 1816621 579 665 0 True 258 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 303 578 0,0108905141460225 0,0498813754459392 0,0108644235904479 0,0507209887846189 0,00165162271793829 0,0102084303993496 413238 2173869 579 665 0 True 302 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 347 578 0,010810898420375 0,045829841254544 0,010757610437171 0,046494239719234 0,00165172904984301 0,00981060161791083 410217 1997300 579 665 0 True 346 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 391 578 0,0109555560562834 0,0459850243599385 0,0109254596780346 0,0457007705806058 0,00166301172650528 0,00660681785518923 415706 2004063 579 665 0 True 390 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 435 577 0,0112633982579679 0,0807336262377161 0,0110627908751049 0,0780956740672923 0,00227367787975215 0,0223157973780962 427387 3518434 579 665 0 True 433 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 479 578 0,0113485483438888 0,0585083675083796 0,0112306401159686 0,0582742046234836 0,00229934337815866 0,012777589091332 430618 2549840 579 665 0 True 477 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 523 578 0,0110546211051775 0,0515139990052953 0,0110475318532082 0,0515297169451438 0,0022595676728649 0,00786141894888632 419465 2245020 579 665 0 True 521 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 565 576 0,0110100299738317 0,0332870399849475 0,0109712367437247 0,0357518883039597 0,00203775336100883 0,00899775779134739 417773 1450675 579 665 0 False 565 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 611 577 0,0108438146869535 0,0451444702394576 0,0108491645685512 0,0453345540550851 0,00166490721764658 0,0066986591809365 411466 1967431 579 665 0 True 609 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 655 577 0,0107525240965387 0,0483158915829285 0,0107728694590677 0,0475165941863127 0,00181047955401055 0,00679891447853386 408002 2105644 579 665 0 True 653 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 258 619 0,0104616802871226 0,0103887092416323 0,0103913939116503 0,0103761348897536 0,00140573112312551 0,00139304019390118 396966 452748 579 665 0 False 258 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 302 619 0,0104571473825177 0,0104180570446487 0,0104371709773404 0,0104676890211337 0,00155988422403505 0,00133792494422422 396794 454027 579 665 0 False 302 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 347 622 0,0109553979317042 0,0677292682381165 0,0105897611963073 0,0664377813382162 0,00211094765034632 0,0118990194828634 415700 2951694 579 665 0 True 346 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 391 621 0,0110871420603079 0,0710207654636706 0,0108491645685512 0,0691996643015183 0,00177907268568957 0,0198912411693316 420699 3095140 579 665 0 True 390 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 433 619 0,0110510896562411 0,0105152329209382 0,0108644235904479 0,0105592431525139 0,00208880640789915 0,00180947201376223 419331 458262 579 665 0 False 433 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 477 619 0,0104349045250379 0,0106033910594752 0,0103913939116503 0,0105897611963073 0,00190879318863834 0,00202068483798968 395950 462104 579 665 0 False 477 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 521 619 0,0104380406625262 0,0103674383945673 0,0104982070649271 0,0103303578240635 0,00189736113763337 0,00203312706828345 396069 451821 579 665 0 False 521 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 565 619 0,0104323745317701 0,0103238641350458 0,0104371709773404 0,0103456168459602 0,00168355587332199 0,00182844448879047 395854 449922 579 665 0 False 565 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 609 619 0,0103980087898818 0,0103139973990825 0,0103913939116503 0,0103761348897536 0,0014198932021591 0,00144603053954781 394550 449492 579 665 0 False 609 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 653 619 0,0105183152405872 0,0105372839285212 0,0104371709773404 0,010452429999237 0,00150391621788369 0,00148659435955551 399115 459223 579 665 0 False 653 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 260 666 0,0104890885475243 0,0411034911609534 0,0104982070649271 0,0415045395590143 0,00145009305656746 0,00892376853804812 398006 1791322 579 665 0 True 258 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 302 662 0,0102072578391248 0,010090756761439 0,0101930266269932 0,0101167315175097 0,00157236551116558 0,00131218263496126 387312 439763 579 665 0 False 302 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 346 662 0,0102024877476511 0,00996269570699466 0,0101319905394064 0,00994888227664607 0,00131538908431988 0,00121210831154543 387131 434182 579 665 0 False 346 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 390 662 0,0102041217016366 0,0102016083926915 0,0102235446707866 0,01025406271458 0,00125983208220005 0,00138899135078731 387193 444594 579 665 0 False 390 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 433 662 0,0102757521360325 0,0101601222098506 0,0103150988021668 0,0101777676050965 0,00139156520608111 0,00155222174052506 389911 442786 579 665 0 False 433 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 477 662 0,0101892316370914 0,0104418748863461 0,0101625085831998 0,0103608758678569 0,00154989764515079 0,00149120118266496 386628 455065 579 665 0 False 477 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 521 662 0,010215559379535 0,010207666109655 0,0102082856488899 0,0102082856488899 0,00176402146690984 0,00175071147398781 387627 444858 579 665 0 False 521 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 565 662 0,0101904175714357 0,0102752417780547 0,0101777676050965 0,0102235446707866 0,00165068856266382 0,0015230813561428 386673 447803 579 665 0 False 565 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 609 662 0,010365566897041 0,0101715033750547 0,010406652933547 0,0101777676050965 0,00132233908058273 0,00140946873403755 393319 443282 579 665 0 False 609 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 657 665 0,0105969031564697 0,0418160530646828 0,0105897611963073 0,0421759365224689 0,00156824603915715 0,00780066191336012 402097 1822376 579 665 0 True 653 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H9_2.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H9_2.csv new file mode 100755 index 0000000..1e8960c --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H9_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 259 275 0,00958068919388485 0,662899294471014 0,00843823910887312 0,672800793469139 0,00415805631647949 0,183945979417362 363537 28889665 579 665 1 True 259 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 302 276 0,00720805623647953 0,00655704264093514 0,00683604180972 0,00656137941557946 0,00258014220971842 0,00119575532942704 273508 285761 579 665 0 False 302 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 347 275 0,00615768736477878 0,00604238910391107 0,00617990386816205 0,00607309071488518 0,00131772990268741 0,00126499606211504 233652 263332 579 665 0 True 346 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 390 274 0,0061003408507076 0,00598692886943842 0,00613412680247196 0,00602731364919509 0,00127718878106638 0,00120111739067123 231476 260915 579 665 0 True 390 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 435 274 0,00605119046066038 0,00599319309948022 0,00608834973678187 0,00590524147402152 0,00157311800656592 0,00152234026334003 229611 261188 579 665 0 True 434 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 479 276 0,00622336177335662 0,00631861181908766 0,00628671702143893 0,00634775310902571 0,00156544368885467 0,00167905705251158 236144 275370 579 665 0 True 478 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 522 275 0,00626463228853835 0,00633538527022523 0,00621042191195544 0,0064087891966125 0,00147068937158907 0,00147918370289383 237710 276101 579 665 0 True 521 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 567 275 0,00645085033469044 0,00673097254465989 0,0064087891966125 0,00659189745937285 0,00167682584223713 0,0019318702803252 244776 293341 579 665 0 True 565 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 609 276 0,00700246792937049 0,00705297232552657 0,00692759594110018 0,00712596322575723 0,00182345600719346 0,00173025768383733 265707 307374 579 665 0 False 609 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 655 275 0,00923531875872733 0,66663855794212 0,00878919661249714 0,667261768520638 0,00292698161681426 0,177937257635942 350432 29052625 579 665 3 True 653 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 258 318 0,00677495301394013 0,00638650873005356 0,00666819256885634 0,0063935301747158 0,00162163277630008 0,00139304883745382 257074 278329 579 665 0 False 258 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 302 318 0,00615144144389878 0,00605386205270558 0,00605783169298848 0,00599679560540169 0,00127054271490951 0,00116237265493572 233415 263832 579 665 0 False 302 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 346 319 0,0059727870234537 0,00610558210587122 0,00601205462729839 0,00616464484626535 0,0011912647696052 0,00129071869648506 226636 266086 579 665 0 True 346 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 391 320 0,00614451031650875 0,00597937966913163 0,00611886778057527 0,005981536583505 0,00124908975026141 0,00119891257278712 233152 260586 579 665 0 True 390 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 435 319 0,00624455046697483 0,00639644430370961 0,00630197604333562 0,00645456626230259 0,00152701690125423 0,00163121198895551 236948 278762 579 665 0 True 434 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 480 319 0,0063362363688377 0,0063847648418368 0,00636301213092241 0,0063782711528191 0,0015647392244374 0,00161659698163287 240427 278253 579 665 0 True 478 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 523 320 0,006460100622576 0,00632639047837034 0,00645456626230259 0,00625619897764553 0,00150295360095262 0,00157159110054108 245127 275709 579 665 0 True 521 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 568 320 0,00661116230394364 0,00648669051892721 0,00659189745937285 0,00650034332799268 0,00170184359348992 0,00147144714505648 250859 282695 579 665 0 True 565 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 609 319 0,00677764113178722 0,00693094604214817 0,00675974670023652 0,00689707789730678 0,00203154662800484 0,00196525123782276 257176 302056 579 665 0 False 609 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 653 319 0,00697424269197609 0,00698987110715677 0,00689707789730678 0,00698863202868696 0,00191418855985885 0,00163712535892048 264636 304624 579 665 0 False 653 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 259 358 0,0063835946803202 0,00597793407758352 0,0063935301747158 0,00599679560540169 0,00137968417950433 0,00148334598346443 242224 260523 579 665 0 True 258 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 303 358 0,00607627956056652 0,00613121267347816 0,00611886778057527 0,00610360875867857 0,00129382792642757 0,00124120927528004 230563 267203 579 665 0 True 302 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 346 358 0,00619005019532998 0,00621207401658185 0,00622568093385214 0,00624093995574884 0,00128201805934022 0,00140014187988932 234880 270727 579 665 0 True 346 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 390 362 0,00634748956806031 0,00628917223248095 0,00634775310902571 0,00633249408712902 0,00128015925513416 0,0012885191237382 240854 274087 579 665 0 False 390 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 435 357 0,00655937650424242 0,00639509049575185 0,00659189745937285 0,00646982528419928 0,00158815542349915 0,00161318089853013 248894 278703 579 665 0 True 434 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 478 362 0,00670427132701968 0,00640073518655875 0,00662241550316625 0,00645456626230259 0,00201610705047422 0,00165977029108726 254392 278949 579 665 0 False 478 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 524 359 0,00650303144583976 0,00621583714378645 0,00651560234988937 0,00625619897764553 0,00167201717918385 0,00158732635156833 246756 270891 579 665 0 True 521 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 566 357 0,00655165475395618 0,0065930447542523 0,00662241550316625 0,00663767452506294 0,00169787958092388 0,00170556614601451 248601 287330 579 665 0 True 565 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 611 358 0,00654517164620732 0,00652576738252131 0,00650034332799268 0,00654612039368277 0,00192171516559909 0,00207893195450822 248355 284398 579 665 0 True 609 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 655 357 0,00617713668802534 0,0062623255323018 0,00614938582436866 0,00633249408712902 0,00181945539499864 0,00188613144731559 234390 272917 579 665 0 True 653 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 259 403 0,00601497993201434 0,00604640463598915 0,00604257267109178 0,00608834973678187 0,00151284448952801 0,00144153276441866 228237 263507 579 665 0 True 258 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 304 403 0,00619500476547951 0,0063979128411553 0,00619516289005875 0,00636301213092241 0,00137296843690699 0,0013250099242556 235068 278826 579 665 0 True 302 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 347 402 0,00628363359214374 0,00642989942239439 0,00631723506523232 0,00642404821850919 0,00133185575475335 0,00130962231108789 238431 280220 579 665 0 True 346 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 391 402 0,00647138017589515 0,00650961347061864 0,00650034332799268 0,00648508430609598 0,0013621570962009 0,00139315582574961 245555 283694 579 665 0 True 390 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 435 402 0,00648474170284096 0,00647285414268103 0,00650034332799268 0,00648508430609598 0,00158653058632582 0,00153719633089204 246062 282092 579 665 0 True 434 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 479 402 0,00664710929162429 0,0064194360930938 0,00665293354695964 0,0064087891966125 0,00163133716196124 0,00162107774544442 252223 279764 579 665 0 True 477 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 523 402 0,00662636861764726 0,00667195569606093 0,00656137941557946 0,00671396963454643 0,00157774920747497 0,00160154600097935 251436 290769 579 665 0 True 521 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 568 402 0,00649143564336213 0,00613639844633327 0,00646982528419928 0,00611886778057527 0,00167084387658808 0,00160028238628597 246316 267429 579 665 0 True 565 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 612 402 0,00608845515316803 0,00596228497542781 0,00610360875867857 0,00593575951781491 0,0018036768112308 0,00192528922990101 231025 259841 579 665 0 True 609 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 655 402 0,00585590660529852 0,00571107328862325 0,00592050049591821 0,00569161516746777 0,00182555348335654 0,00169047812995139 222201 248893 579 665 0 True 653 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 259 447 0,0061398719955177 0,00642436946107544 0,00605783169298848 0,00643930724040589 0,00155643443367697 0,00150389296772948 232976 279979 579 665 0 True 258 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 303 446 0,00629957782055048 0,00636285150963928 0,0063782711528191 0,00646982528419928 0,00143550110491267 0,00143018526162546 239036 277298 579 665 0 True 302 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 348 446 0,00641355928808625 0,00657746448978936 0,0064087891966125 0,00660715648126955 0,00135518315620192 0,00135095326762648 243361 286651 579 665 0 True 346 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 392 446 0,00645886198003862 0,00642693940160541 0,0063935301747158 0,00642404821850919 0,00139407217234207 0,00140432128579076 245080 280091 579 665 0 True 390 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 436 446 0,00660958105815124 0,00664375518792403 0,00659189745937285 0,00668345159075303 0,00195631179681698 0,00185336135541429 250799 289540 579 665 0 True 434 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 480 446 0,00667103881128266 0,00660605507818528 0,00675974670023652 0,00659189745937285 0,00173284295987785 0,001800039137028 253131 287897 579 665 0 True 477 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 524 446 0,00632316473695383 0,00646544261775978 0,00630197604333562 0,00650034332799268 0,00171219698210193 0,0016762685356686 239931 281769 579 665 0 True 521 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 568 447 0,00613122785185255 0,00611056136564804 0,00613412680247196 0,00604257267109178 0,00182518134163568 0,00192584277301645 232648 266303 579 665 0 True 565 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 612 446 0,00584178080955304 0,00578413302654668 0,00584420538643473 0,00585946440833143 0,0018399225667132 0,00174198934829531 221665 252077 579 665 0 True 609 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 656 445 0,00577020308335023 0,00600106354235325 0,00567635614557107 0,00604257267109178 0,00177350236058391 0,00187427780756041 218949 261531 579 665 0 True 653 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 259 490 0,00637582022184088 0,00611769753979823 0,0063935301747158 0,00614938582436866 0,00143179589743132 0,00148381081363388 241929 266614 579 665 0 True 258 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 303 490 0,00637141908771869 0,00628194427474041 0,00633249408712902 0,00630197604333562 0,00144579907794771 0,00148167799991965 241762 273772 579 665 0 True 302 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 346 490 0,00655639849133339 0,00639568708908917 0,00654612039368277 0,00643930724040589 0,00149693168939112 0,00146896919068069 248781 278729 579 665 0 True 346 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 391 490 0,00651826411363992 0,00641562707409402 0,00650034332799268 0,00653086137178607 0,00149886440093441 0,00149853710742327 247334 279598 579 665 0 True 390 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 435 490 0,00629762761740651 0,00664949166232129 0,00628671702143893 0,00659189745937285 0,00164491664658354 0,00209644103662209 238962 289790 579 665 0 True 434 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 480 489 0,00646547685827017 0,0065915991627042 0,00645456626230259 0,00657663843747616 0,00183951868453079 0,00168278663729635 245331 287267 579 665 0 True 477 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 524 489 0,00626194417069127 0,00613896838686324 0,00627145799954223 0,00607309071488518 0,00165022389888888 0,00166461451958845 237608 267541 579 665 0 True 521 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 567 490 0,00599703279227055 0,00611873010518973 0,0059510185397116 0,00622568093385214 0,00172131713744534 0,0018054700684543 227556 266659 579 665 0 True 565 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 611 489 0,00587857112832297 0,00595888898258464 0,00590524147402152 0,00599679560540169 0,00177114729743681 0,00177393753559044 223061 259693 579 665 0 True 609 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 655 490 0,0060062040178665 0,00599112796869721 0,0059510185397116 0,00602731364919509 0,00169939484971313 0,00171955488169744 227904 261098 579 665 0 True 653 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 259 534 0,00628803472626593 0,00630234317769705 0,00634775310902571 0,00633249408712902 0,00136973423399091 0,00143361599681938 238598 274661 579 665 0 True 258 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 303 534 0,00611024999100666 0,00645059662201969 0,00616464484626535 0,00648508430609598 0,00137995446230123 0,00138768477045161 231852 281122 579 665 0 True 302 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 347 534 0,00622391520938396 0,00653026477844875 0,00616464484626535 0,00657663843747616 0,00143118927236555 0,00135369577566664 236165 284594 579 665 0 True 346 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 391 534 0,00634303572574504 0,00639653608729996 0,00628671702143893 0,00631723506523232 0,00156312886835011 0,00155550653790238 240685 278766 579 665 0 True 390 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 435 534 0,00647485891663844 0,00659832231069778 0,00646982528419928 0,00660715648126955 0,00172061345617123 0,00207038447665409 245687 287560 579 665 0 True 434 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 479 534 0,00639389913206736 0,00692151527823909 0,00646982528419928 0,00668345159075303 0,00190280251920173 0,00327870115785485 242615 301645 579 665 0 True 477 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 523 534 0,00626136438056739 0,00616661819345801 0,00627145799954223 0,00622568093385214 0,00175958275723624 0,00178623765534372 237586 268746 579 665 0 True 521 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 566 533 0,00618383062854652 0,00633240230353866 0,00625619897764553 0,00630197604333562 0,00154620039016957 0,00167458392396369 234644 275971 579 665 0 True 565 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 612 534 0,00603340144549584 0,00625367492891074 0,00604257267109178 0,00622568093385214 0,00163622084188867 0,0015970145955178 228936 272540 579 665 0 True 609 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 655 533 0,00589448900263317 0,00609931787582942 0,00590524147402152 0,00621042191195544 0,00182523481385447 0,00194279868318127 223665 265813 579 665 0 True 653 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 259 579 0,00657308063444325 0,00687023119712763 0,00651560234988937 0,00686655985351339 0,00135906121439197 0,00127547678601716 249414 299410 579 665 0 True 258 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 303 578 0,00648052504739455 0,00683140673840702 0,00643930724040589 0,00688181887541009 0,00132656070449323 0,00145544792274804 245902 297718 579 665 0 True 302 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 347 578 0,00638899727011091 0,00661679375825694 0,00642404821850919 0,00663767452506294 0,00133086828536165 0,00126845127131443 242429 288365 579 665 0 True 346 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 391 578 0,006284134319978 0,00654811668677301 0,00634775310902571 0,00653086137178607 0,00130910610240719 0,00133404279098391 238450 285372 579 665 0 True 390 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 435 577 0,00636216879983313 0,00667317182863315 0,0064087891966125 0,00671396963454643 0,00167352476514076 0,00205916411400926 241411 290822 579 665 0 True 433 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 479 578 0,00654577779042774 0,00667560409377759 0,00663767452506294 0,00650034332799268 0,00188588832831778 0,00213435853593278 248378 290928 579 665 0 True 477 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 523 578 0,0063448541584063 0,00638377816824047 0,00624093995574884 0,00633249408712902 0,00193105905834014 0,00174097121337002 240754 278210 579 665 0 True 521 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 565 576 0,00634058479476681 0,00645222578074851 0,00634775310902571 0,00642404821850919 0,00167673921166856 0,00179202013830194 240592 281193 579 665 0 False 565 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 611 577 0,00623917423128065 0,00655734093760379 0,00622568093385214 0,00659189745937285 0,00151996402681043 0,0015739955764179 236744 285774 579 665 0 True 609 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 655 577 0,0061166540364659 0,00605544531963922 0,00601205462729839 0,00602731364919509 0,00152022335877636 0,00151361379601068 232095 263901 579 665 0 True 653 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 258 619 0,00702792598662819 0,00712052504802863 0,00695811398489357 0,00712596322575723 0,00133560449176545 0,00145640480947556 266673 310318 579 665 0 False 258 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 302 619 0,00669346614743826 0,00661459095208839 0,00668345159075303 0,00663767452506294 0,00136011582642969 0,00136487923139071 253982 288269 579 665 0 False 302 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 347 622 0,00623748756910209 0,00631195750878684 0,00627145799954223 0,00625619897764553 0,00136761077933156 0,00133072180586403 236680 275080 579 665 0 True 346 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 391 621 0,00612221475083585 0,00637363608150612 0,00608834973678187 0,00633249408712902 0,00134890005530664 0,00130934094791503 232306 277768 579 665 0 True 390 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 433 619 0,00636614826841068 0,00629442684302884 0,0063935301747158 0,00622568093385214 0,00159036372242278 0,00173099223146313 241562 274316 579 665 0 False 433 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 477 619 0,00642331030380607 0,00634587154542341 0,00650034332799268 0,0063782711528191 0,00187728341568723 0,00191905695203506 243731 276558 579 665 0 False 477 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 521 619 0,00640681263937199 0,00628164597807175 0,0063782711528191 0,00628671702143893 0,00189909640978837 0,00187455048952927 243105 273759 579 665 0 False 521 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 565 619 0,00633117638230201 0,00619178984311316 0,00636301213092241 0,00616464484626535 0,00172870905155854 0,00178843870346651 240235 269843 579 665 0 False 565 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 609 619 0,00628397619539876 0,00616060636828969 0,00628671702143893 0,00616464484626535 0,00141710036264627 0,00138914911133606 238444 268484 579 665 0 False 609 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 653 619 0,00671415411322221 0,00634187895924292 0,00674448767833982 0,00636301213092241 0,00148336529333385 0,00150643245781448 254767 276384 579 665 0 False 653 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 260 666 0,0119036973875052 0,666627291506404 0,00865186541542687 0,673563744563974 0,00955995148173729 0,207514467770154 451683 29052134 579 665 4 True 258 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 302 662 0,00951290645758381 0,006571957474368 0,00709544518196384 0,00656137941557946 0,00986034126703043 0,0012571154589545 360965 286411 579 665 0 False 302 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 346 662 0,00631702423246 0,00626344988128366 0,00633249408712902 0,00628671702143893 0,00119462802238642 0,00125514037243562 239698 272966 579 665 0 False 346 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 390 662 0,00615233748318115 0,0060891298972999 0,00614938582436866 0,00605783169298848 0,00134694641258268 0,00119680591461248 233449 265369 579 665 0 False 390 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 433 662 0,00626357812467675 0,00594376763607348 0,00631723506523232 0,00590524147402152 0,00150304948781883 0,00145982940430132 237670 259034 579 665 0 False 433 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 477 662 0,00613020004208749 0,00625727743483222 0,00605783169298848 0,00617990386816205 0,00157173524483083 0,00140024133797543 232609 272697 579 665 0 False 477 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 521 662 0,00620649515157097 0,00599590071539572 0,00627145799954223 0,00602731364919509 0,00165986555701222 0,00154739394928686 235504 261306 579 665 0 False 521 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 565 662 0,00633449699846606 0,00625567122200099 0,00634775310902571 0,00625619897764553 0,00152015619570259 0,00153980398938271 240361 272627 579 665 0 False 565 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 609 662 0,00654920382297795 0,00662039626417841 0,00651560234988937 0,00656137941557946 0,0013059622740555 0,0012748654211146 248508 288522 579 665 0 False 609 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 657 665 0,0107224013641935 0,68650350986186 0,00868238345922026 0,687129015030137 0,00658706133376358 0,18811181813611 406859 29918355 579 665 5 True 653 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H9_3.csv b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H9_3.csv new file mode 100755 index 0000000..51519c4 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_H9_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 259 275 0,0010209313458655 0,0651487725952556 0,000762951094834821 0,0659647516594186 0,000859600602917059 0,0182879920358665 38739 2839234 579 665 0 True 259 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 302 276 0,000908715602797909 0,000887157238484171 0,000747692072938125 0,000793469138628214 0,000707245548462953 0,000615594196370173 34481 38663 579 665 0 False 302 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 347 275 0,000862200622404698 0,000952048236865912 0,000762951094834821 0,000854505226215 0,000647299352394803 0,000715115112097044 32716 41491 579 665 0 True 346 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 390 274 0,000882888588188647 0,000827061932698535 0,000762951094834821 0,000701915007248035 0,000677808034689624 0,000642325882158265 33501 36044 579 665 0 True 390 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 435 274 0,000863281140362841 0,000858750217268968 0,000671396963454643 0,000595101853971161 0,000790193832595981 0,000838165493872605 32757 37425 579 665 0 True 434 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 479 276 0,000923315772281104 0,000884541406159023 0,000717174029144732 0,000579842832074464 0,000877156757374944 0,000889682540356557 35035 38549 579 665 0 True 478 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 522 275 0,00098042509948342 0,00089651916470049 0,000778210116731518 0,000686655985351339 0,000816980679756749 0,000833677440453465 37202 39071 579 665 0 True 521 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 567 275 0,000937863233571219 0,000889773070809319 0,000701915007248035 0,000610360875867857 0,000847894887219295 0,000856581472132594 35587 38777 579 665 0 True 565 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 609 276 0,00102678195529739 0,000946816572215616 0,00064087891966125 0,000610360875867857 0,00102645634727609 0,00097245769661072 38961 41263 579 665 0 False 609 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 655 275 0,00116711751937323 0,0654398183602747 0,000839246204318303 0,0640115968566415 0,0010771596870845 0,0183584492473158 44286 2851918 579 665 0 True 653 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 258 318 0,000918124015262712 0,000859025568040036 0,000762951094834821 0,000671396963454643 0,000746182560439959 0,00069330554204175 34838 37437 579 665 0 False 258 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 302 318 0,000915594021994866 0,000829104117583958 0,000793469138628214 0,000701915007248035 0,000632099339443028 0,000615660234378542 34742 36133 579 665 0 False 302 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 346 319 0,00087975245070038 0,000839200312523125 0,000778210116731518 0,000747692072938125 0,000652229546146407 0,0006388362093631 33382 36573 579 665 0 True 346 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 391 320 0,000821615313733001 0,000842091495619341 0,000686655985351339 0,000717174029144732 0,000627384102270611 0,000640099617886449 31176 36699 579 665 0 True 390 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 435 319 0,000803325570734197 0,000929698932614209 0,000564583810177768 0,000595101853971161 0,000751893540287066 0,000899344042146277 30482 40517 579 665 0 True 434 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 480 319 0,000898648337919605 0,000784612022158853 0,000610360875867857 0,000610360875867857 0,000903341842434062 0,000732316865280202 34099 34194 579 665 0 True 478 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 523 320 0,000887237014117758 0,00088112246741826 0,000717174029144732 0,000610360875867857 0,000828831809468976 0,000904349219353649 33666 38400 579 665 0 True 521 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 568 320 0,000926847221217472 0,000891677580309207 0,000732433051041428 0,00064087891966125 0,000863143157108044 0,000802881481539603 35169 38860 579 665 0 True 565 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 609 319 0,000935596781268773 0,000927771477216731 0,000503547722590982 0,0004272526131075 0,00106820735288775 0,00108275867929017 35501 40433 579 665 0 False 609 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 653 319 0,000976709171871271 0,000962305053088202 0,000564583810177768 0,000625619897764553 0,00103195653940801 0,000909247461256869 37061 41938 579 665 0 False 653 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 259 358 0,000991151216775226 0,000852485987227166 0,000839246204318303 0,000701915007248035 0,000735027856010537 0,000724875539508711 37609 37152 579 665 0 True 258 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 303 358 0,000823908120131987 0,000819856920855584 0,000656137941557946 0,000701915007248035 0,000671892412696136 0,000640399410908902 31263 35730 579 665 0 True 302 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 346 358 0,000827492277261435 0,000838557827390633 0,000701915007248035 0,000701915007248035 0,000666334194952865 0,000649524380125697 31399 36545 579 665 0 True 346 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 390 362 0,000911166533776135 0,000939772181655787 0,000762951094834821 0,000839246204318303 0,000692137255611754 0,000695619326833076 34574 40956 579 665 0 False 390 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 435 357 0,000967116280730688 0,000924788510530159 0,000732433051041428 0,000625619897764553 0,000826222396224125 0,000877559856859566 36697 40303 579 665 0 True 434 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 478 362 0,000866628110623429 0,00088789150720702 0,000564583810177768 0,000564583810177768 0,00084562541637679 0,00085825959437785 32884 38695 579 665 0 False 478 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 524 359 0,000887078889538517 0,000879539200484617 0,000610360875867857 0,000579842832074464 0,000879139354719133 0,00086795892835847 33660 38331 579 665 0 True 521 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 566 357 0,000954439960294918 0,000877015151749825 0,000747692072938125 0,000503547722590982 0,000919841722378353 0,000925317958408924 36216 38221 579 665 0 True 565 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 611 358 0,000948642059056104 0,000902645719356758 0,000579842832074464 0,000366216525520714 0,00103231624459081 0,00104545247273733 35996 39338 579 665 0 True 609 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 655 357 0,000950618616296609 0,00105574074807068 0,000503547722590982 0,000671396963454643 0,00102925020584725 0,00108458542610272 36071 46010 579 665 0 True 653 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 259 403 0,000851685337885213 0,00101687039755489 0,000717174029144732 0,00080872816052491 0,000737244774368038 0,000834469900610044 32317 44316 579 665 0 True 258 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 304 403 0,000825779260986331 0,000905972874507165 0,000686655985351339 0,000793469138628214 0,00066334118619504 0,000673888102734278 31334 39483 579 665 0 True 302 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 347 402 0,000915462251512165 0,000859277972913515 0,000823987182421607 0,000747692072938125 0,00069966068558699 0,000630262352706175 34737 37448 579 665 0 True 346 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 391 402 0,00086317572397668 0,000946908355805972 0,000701915007248035 0,000823987182421607 0,000715022959846815 0,000743246067767639 32753 41267 579 665 0 True 390 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 435 402 0,000937705108991978 0,000900305237802678 0,000671396963454643 0,000701915007248035 0,000843177280984338 0,000785432009170188 35581 39236 579 665 0 True 434 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 479 402 0,000947930498449523 0,000846107027697419 0,000717174029144732 0,000595101853971161 0,0008021494997419 0,000813443770236088 35969 36874 579 665 0 True 477 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 523 402 0,000905210507958081 0,000833372054535515 0,000701915007248035 0,000579842832074464 0,000836887217127455 0,000817687279123885 34348 36319 579 665 0 True 521 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 568 402 0,000939760728522103 0,000909162354272039 0,000686655985351339 0,000671396963454643 0,000906151146975092 0,000878104501394706 35659 39622 579 665 0 True 565 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 612 402 0,00101444823811664 0,000869029979388847 0,000656137941557946 0,000457770656900893 0,00100604923501518 0,000983672111640439 38493 37873 579 665 0 True 609 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 655 402 0,000964428162883602 0,000928368070554046 0,00064087891966125 0,000564583810177768 0,000976926932442647 0,000922728650732242 36595 40459 579 665 0 True 653 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 259 447 0,000746927804138463 0,000915265963030717 0,000595101853971161 0,000747692072938125 0,00071326987835489 0,000839740601916433 28342 39888 579 665 0 True 258 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 303 446 0,000838560997808261 0,000904642012447002 0,000717174029144732 0,000762951094834821 0,000730912497357507 0,000755446608814353 31819 39425 579 665 0 True 302 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 348 446 0,000968302215074991 0,000752877845793243 0,000839246204318303 0,000595101853971161 0,000784500559241766 0,000670676178098072 36742 32811 579 665 0 True 346 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 392 446 0,000885998371580375 0,000897666459579941 0,000747692072938125 0,000778210116731518 0,000743695370337451 0,00071454445574879 33619 39121 579 665 0 True 390 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 436 446 0,000963980143242421 0,000937638213180009 0,000610360875867857 0,000595101853971161 0,000952111511481521 0,000942751671769418 36578 40863 579 665 0 True 434 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 480 446 0,0008795679720246 0,000925844021819254 0,000534065766384375 0,000518806744487678 0,000925532321091246 0,00100156627055966 33375 40349 579 665 0 True 477 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 524 446 0,000901204685283991 0,000859943403943597 0,000595101853971161 0,000579842832074464 0,000919230238287093 0,000875719762428172 34196 37477 579 665 0 True 521 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 568 447 0,00110202290091927 0,000793951002477583 0,000717174029144732 0,000381475547417411 0,00106186756519991 0,000928974786159493 41816 34601 579 665 0 True 565 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 612 446 0,0008883175320759 0,000887776777719075 0,000579842832074464 0,000503547722590982 0,000887382002250386 0,000913637951394357 33707 38690 579 665 0 True 609 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 656 445 0,000896065636458679 0,00092547688745783 0,000488288700694286 0,000579842832074464 0,000951180673664072 0,000975271311858747 34001 40333 579 665 0 True 653 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 259 490 0,000803193800251497 0,000945279197077152 0,000625619897764553 0,000793469138628214 0,000724057774969037 0,000767019628560375 30477 41196 579 665 0 True 258 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 303 490 0,000742579378209353 0,000845923460516707 0,000595101853971161 0,000701915007248035 0,000705451012608675 0,000751725446010326 28177 36866 579 665 0 True 302 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 346 490 0,000868288418705453 0,000888924072598525 0,000732433051041428 0,000747692072938125 0,000790935247382132 0,000769029239907562 32947 38740 579 665 0 True 346 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 391 490 0,000879304431059199 0,000998697246664383 0,00064087891966125 0,000839246204318303 0,000790818575750462 0,000840074676818225 33365 43524 579 665 0 True 390 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 435 490 0,000850736590409771 0,000930066066975633 0,000488288700694286 0,000503547722590982 0,000883254797680037 0,00103839478274245 32281 40533 579 665 0 True 434 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 480 489 0,0009218662969714 0,000881237196906205 0,000610360875867857 0,000457770656900893 0,000876386630579486 0,000951808720994213 34980 38405 579 665 0 True 477 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 524 489 0,000919547136475875 0,000847552619245527 0,000625619897764553 0,000579842832074464 0,000889013756956594 0,000798304581072059 34892 36937 579 665 0 True 521 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 567 490 0,000883073066864428 0,000895463653411395 0,000625619897764553 0,000549324788281071 0,000882838759753561 0,000963182598633808 33508 39025 579 665 0 True 565 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 611 489 0,000947693311580662 0,000903609447055496 0,000564583810177768 0,000579842832074464 0,000947555546447417 0,00091748914275397 35960 39380 579 665 0 True 609 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 655 490 0,00094698175097408 0,00104679184801096 0,000579842832074464 0,000701915007248035 0,000992623871999865 0,00100492600730856 35933 45620 579 665 0 True 653 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 259 534 0,000911667261610396 0,000918203037922111 0,000778210116731518 0,000778210116731518 0,000741328358605642 0,00078203241698493 34593 40016 579 665 0 True 258 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 303 534 0,000860882917577695 0,000866069958599864 0,000717174029144732 0,000732433051041428 0,000722409436881377 0,000738092689416238 32666 37744 579 665 0 True 302 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 347 534 0,0008966717806791 0,00088649180745409 0,000732433051041428 0,000747692072938125 0,000728653174935266 0,000714042360878699 34024 38634 579 665 0 True 346 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 391 534 0,000949564452435007 0,000963383510274886 0,000793469138628214 0,000839246204318303 0,000823342828809232 0,000799920674152005 36031 41985 579 665 0 True 390 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 435 534 0,000854320747539219 0,000887478481050417 0,000473029678797589 0,000411993591210803 0,000942088327053299 0,00101043337132472 32417 38677 579 665 0 True 434 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 479 534 0,000893482934997753 0,000914348127127156 0,000503547722590982 0,000473029678797589 0,00097574751987854 0,00101551027902795 33903 39848 579 665 0 True 477 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 523 534 0,000872636844634563 0,00088506916180357 0,000549324788281071 0,000549324788281071 0,000894160163161534 0,000934198212940527 33112 38572 579 665 0 True 521 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 566 533 0,000971201165694398 0,000914990612259649 0,000671396963454643 0,000610360875867857 0,000911291542893995 0,000918431593416454 36852 39876 579 665 0 True 565 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 612 534 0,000928085863754855 0,000978986720635418 0,000671396963454643 0,000701915007248035 0,000829868698419631 0,000890188121253722 35216 42665 579 665 0 True 609 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 655 533 0,000981769158406963 0,00100014283821249 0,00064087891966125 0,00064087891966125 0,000968890453899437 0,00105155711228141 37253 43587 579 665 0 True 653 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 259 579 0,000907819563515547 0,00101551658959713 0,000778210116731518 0,000900282291905089 0,00067511181651178 0,000671546215183296 34447 44257 579 665 0 True 258 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 303 578 0,000840642971434926 0,000922470974873668 0,000717174029144732 0,000762951094834821 0,000703468222993943 0,000740787155962642 31898 40202 579 665 0 True 302 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 347 578 0,000778500011793458 0,000881007737930314 0,000610360875867857 0,000747692072938125 0,000669904738738305 0,000727187128690611 29540 38395 579 665 0 True 346 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 391 578 0,000873585592110005 0,000905032092706015 0,000686655985351339 0,000778210116731518 0,000721561096702976 0,000674636660623676 33148 39442 579 665 0 True 390 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 435 577 0,000896961675741041 0,000860861239847157 0,000503547722590982 0,000534065766384375 0,000953745334278877 0,000923835706874333 34035 37517 579 665 0 True 433 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 479 578 0,000907898625805167 0,00088623940258061 0,000488288700694286 0,000488288700694286 0,000989997990885598 0,000945858148037567 34450 38623 579 665 0 True 477 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 523 578 0,00080867545233183 0,000806479462561187 0,000411993591210803 0,000289921416037232 0,000936674960559304 0,00095136378238859 30685 35147 579 665 0 True 521 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 565 576 0,000925318683618149 0,000872380080436844 0,000686655985351339 0,000518806744487678 0,000841120111373871 0,000915971535711759 35111 38019 579 665 0 False 565 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 611 577 0,000944715298671635 0,000911525781723707 0,000686655985351339 0,000671396963454643 0,000847564383046954 0,0007796242669442 35847 39725 579 665 0 True 609 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 655 577 0,000907898625805167 0,000919556845879863 0,000671396963454643 0,000686655985351339 0,00083279574726968 0,000840637647240425 34450 40075 579 665 0 True 653 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 258 619 0,00100200910454973 0,000936582701890914 0,000854505226215 0,00080872816052491 0,000730333426813257 0,000671387186674462 38021 40817 579 665 0 False 258 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 302 619 0,00084219786313079 0,000818250708024352 0,000747692072938125 0,000701915007248035 0,000623328466341014 0,000657140662183596 31957 35660 579 665 0 False 302 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 347 622 0,000798476416970826 0,000911961753777899 0,000656137941557946 0,000793469138628214 0,000677441869814665 0,000734398360745314 30298 39744 579 665 0 True 346 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 391 621 0,000920943903592498 0,000945852844516877 0,00080872816052491 0,000839246204318303 0,000678842760894392 0,000709304317434272 34945 41221 579 665 0 True 390 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 433 619 0,000798186521908885 0,000870796813503202 0,000518806744487678 0,000549324788281071 0,000819070078531664 0,000881269580766696 30287 37950 579 665 0 False 433 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 477 619 0,000918097661166171 0,000819535678289337 0,000579842832074464 0,000366216525520714 0,000961272729257587 0,000935291861013236 34837 35716 579 665 0 False 477 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 521 619 0,000907898625805167 0,00086010402522672 0,000473029678797589 0,000335698481727321 0,00102433260144125 0,00103633185613307 34450 37484 579 665 0 False 521 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 565 619 0,000873137572468824 0,000932567169812836 0,000579842832074464 0,000564583810177768 0,000863859543999155 0,000955221860514657 33131 40642 579 665 0 False 565 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 609 619 0,000984325505771349 0,000979789827051034 0,000823987182421607 0,00080872816052491 0,00076199508477233 0,000763822661888136 37350 42700 579 665 0 False 609 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 653 619 0,00102852132566903 0,000985824598116945 0,000823987182421607 0,000793469138628214 0,000808869970437576 0,000833244580037549 39027 42963 579 665 0 False 653 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 260 666 0,00126265111933095 0,0655417899291603 0,00100709544518196 0,0661783779659724 0,000990288876146449 0,0210087811481998 47911 2856362 579 665 0 True 258 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 302 662 0,00109588239642544 0,000874789399683691 0,000854505226215 0,000762951094834821 0,00106753349604399 0,000675070999423764 41583 38124 579 665 0 False 302 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 346 662 0,000851975232947154 0,000824285479090264 0,000732433051041428 0,000686655985351339 0,000637716179761078 0,000634001061645407 32328 35923 579 665 0 False 346 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 390 662 0,000835293089837294 0,000910584999922558 0,000701915007248035 0,000823987182421607 0,000653246144792076 0,000634453501535057 31695 39684 579 665 0 False 390 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 433 662 0,000847152433280322 0,000938923183444994 0,000595101853971161 0,000793469138628214 0,00079488404478614 0,000763161606997487 32145 40919 579 665 0 False 433 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 477 662 0,000823038434946164 0,000900351129597856 0,000534065766384375 0,000701915007248035 0,000803470774026285 0,000777323266824607 31230 39238 579 665 0 False 477 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 521 662 0,000912510592699678 0,000852050015172975 0,000595101853971161 0,000534065766384375 0,000929827568360622 0,000844405850020668 34625 37133 579 665 0 False 521 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 565 662 0,000933514807642108 0,000926784803620404 0,000701915007248035 0,000701915007248035 0,000816570428948444 0,00080968870874717 35422 40390 579 665 0 False 565 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 609 662 0,000869474353049755 0,000956729199974071 0,000701915007248035 0,000823987182421607 0,000649399529716678 0,000681778427447699 32992 41695 579 665 0 False 609 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 657 665 0,00128481491452115 0,0677309203427429 0,00103761348897536 0,067353322652018 0,000937250672724347 0,0195169785461824 48752 2951766 579 665 0 True 653 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/Parameters/Assay/S QC 10x10 Cy3 100ms Cy5 150-15ms/S QC 10x10 Cy3 100ms Cy5 150-15ms.svalg b/example_data/mtp_with_parameters/Parameters/Assay/S QC 10x10 Cy3 100ms Cy5 150-15ms/S QC 10x10 Cy3 100ms Cy5 150-15ms.svalg new file mode 100755 index 0000000..ffa263a --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/Parameters/Assay/S QC 10x10 Cy3 100ms Cy5 150-15ms/S QC 10x10 Cy3 100ms Cy5 150-15ms.svalg @@ -0,0 +1,25 @@ + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + \ No newline at end of file diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/Parameters/Assay/S QC 10x10 Cy3 100ms Cy5 150-15ms/S QC 10x10 Cy3 100ms Cy5 150-15ms.svary b/example_data/mtp_with_parameters/Parameters/Assay/S QC 10x10 Cy3 100ms Cy5 150-15ms/S QC 10x10 Cy3 100ms Cy5 150-15ms.svary new file mode 100755 index 0000000..fc336c3 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/Parameters/Assay/S QC 10x10 Cy3 100ms Cy5 150-15ms/S QC 10x10 Cy3 100ms Cy5 150-15ms.svary @@ -0,0 +1,27 @@ + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + \ No newline at end of file diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/Parameters/Assay/S QC 10x10 Cy3 100ms Cy5 150-15ms/S QC 10x10 Cy3 100ms Cy5 150-15ms.svexp b/example_data/mtp_with_parameters/Parameters/Assay/S QC 10x10 Cy3 100ms Cy5 150-15ms/S QC 10x10 Cy3 100ms Cy5 150-15ms.svexp new file mode 100755 index 0000000..33be21d --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/Parameters/Assay/S QC 10x10 Cy3 100ms Cy5 150-15ms/S QC 10x10 Cy3 100ms Cy5 150-15ms.svexp @@ -0,0 +1,19 @@ + + + + + + + + + + + + + + + + + + + \ No newline at end of file diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/Parameters/PlateHolder/SinglePlateHolder.svph b/example_data/mtp_with_parameters/Parameters/PlateHolder/SinglePlateHolder.svph new file mode 100755 index 0000000..9e1b963 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/Parameters/PlateHolder/SinglePlateHolder.svph @@ -0,0 +1,8 @@ + + + + + + + + \ No newline at end of file diff --git a/example_data/mtp_with_parameters/Parameters/Rack/Microplate (96 wells).svmpd b/example_data/mtp_with_parameters/Parameters/Rack/Microplate (96 wells).svmpd new file mode 100755 index 0000000..5695a27 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_with_parameters/Parameters/Rack/Microplate (96 wells).svmpd @@ -0,0 +1,21 @@ + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + \ No newline at end of file diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A10_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A10_1.csv new file mode 100755 index 0000000..898b2d5 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A10_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 257 248 0.00999516263841071 0.0403554319536539 0.0100099183642329 0.0410620279240101 0.00158617405046463 0.00860069627497357 436907 1758721 667 665 0 True 257 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 301 248 0.00969991085940207 0.00980085829129932 0.00975051499198901 0.0098268101014725 0.00139891629885178 0.00128932940034306 424001 427129 667 665 0 False 301 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 345 249 0.00972830133342576 0.0602767160519748 0.00975051499198901 0.0597848477912566 0.00131065292615776 0.00801853629944179 425242 2626906 667 665 0 True 346 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 390 249 0.00965642150314177 0.0861606522600849 0.00967421988250553 0.0844586861982147 0.00129550037090356 0.0170526610503743 422100 3754948 667 665 0 True 391 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 434 249 0.00947324460909852 0.0682082409043896 0.00958266575112535 0.0655680170901045 0.00161272100867917 0.0111139622503379 414093 2972568 667 665 0 True 436 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 481 248 0.00964278675494022 0.0582241366749444 0.00959792477302205 0.064286259250782 0.00148437423528572 0.0200849392893008 421504 2537453 667 665 0 False 481 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 523 248 0.00970462354082744 0.076631611071625 0.00970473792629892 0.074891279468986 0.0015450558116872 0.0216131677266276 424207 3339665 667 665 0 True 526 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 568 247 0.00970002524487356 0.0661478369762814 0.0097962920576791 0.0650492103456169 0.00168619020040891 0.0169776322130641 424006 2882774 667 665 0 True 570 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 615 247 0.00954677159017196 0.00966692308707222 0.00953688868543526 0.00978103303578241 0.00187007723230241 0.00192722737224397 417307 421292 667 665 0 False 615 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 654 248 0.00960245443769303 0.0418940691164854 0.00959792477302205 0.0412603952086671 0.00168039836352827 0.00789319118942953 419741 1825776 667 665 0 True 660 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 257 292 0.00970654521674846 0.00946272754442756 0.00971999694819562 0.00952162966353857 0.00150479827568327 0.00152412881736125 424291 412393 667 665 0 False 257 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 301 292 0.00972402331679205 0.00969402219212485 0.00973525597009232 0.00971999694819562 0.00133940482261318 0.00136995330680804 425055 422473 667 665 0 False 301 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 346 294 0.00977298029858955 0.096443236725368 0.0098115510795758 0.0924696726939803 0.00135562622465016 0.0203015410885967 427195 4203071 667 665 0 True 346 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 391 294 0.00970476080339322 0.0528709964428122 0.00961318379491875 0.051972228580148 0.00137289973965957 0.0072193158985761 424213 2304159 667 665 0 True 391 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 436 293 0.00958330630976569 0.0724166332517033 0.00958266575112535 0.068558785381857 0.00166277660324788 0.0141782447526667 418904 3155973 667 665 0 True 436 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 481 292 0.00942254896813438 0.0437712271064477 0.00930800335698482 0.0437170977340352 0.00170437182346334 0.010747334681349 411877 1907584 667 665 0 True 481 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 523 291 0.00969467200480785 0.0419801391783418 0.00967421988250553 0.0444037537193866 0.00160886145369989 0.00738942953873012 423772 1829527 667 665 0 True 526 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 569 292 0.00960259170025882 0.0501430045702492 0.00959792477302205 0.0517128252079042 0.00185264087979973 0.00780542776573601 419747 2185271 667 665 0 True 571 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 615 291 0.00946445980488813 0.00936316529478881 0.00952162966353857 0.00935378042267491 0.00198165002382497 0.0019554990268821 413709 408054 667 665 0 False 615 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 660 291 0.00924710453196382 0.00944964838280182 0.00929274433508812 0.00952162966353857 0.00187387315326134 0.00203917446661325 404208 411823 667 665 0 False 660 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 258 338 0.0098582889832264 0.0507572433028096 0.00988784618905928 0.0495918211642634 0.00149210133927215 0.0103387111767905 430924 2212040 667 665 0 True 257 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 302 337 0.00975678331582664 0.0661975607363568 0.00973525597009232 0.0663309681849393 0.0013612448505172 0.0212550532567791 426487 2884941 667 665 0 True 302 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 347 337 0.0098974545686644 0.0406556560777086 0.00988784618905928 0.0406042572671092 0.00137379326265499 0.00777575779222246 432636 1771805 667 665 0 True 346 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 391 338 0.00976131298049762 0.0332301800507219 0.00973525597009232 0.0341802090486 0.00138344901705611 0.004354087195014 426685 1448197 667 665 0 True 391 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 435 337 0.00981395317447708 0.0679622149904402 0.00978103303578241 0.0650492103456169 0.00163763393611726 0.010817272156852 428986 2961846 667 665 0 True 436 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 478 335 0.00979466778398395 0.0308953661333466 0.00978103303578241 0.0325322346837568 0.00161143983378356 0.00630749033393416 428143 1346444 667 665 0 True 481 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 522 335 0.00975884225431345 0.0283379999552555 0.00973525597009232 0.028900587472343 0.00164046132133774 0.00408322187546517 426577 1234992 667 665 0 True 526 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 568 335 0.00958264287403106 0.0505700506702783 0.00952162966353857 0.0502479591058213 0.0019768298551048 0.00799348551623754 418875 2203882 667 665 0 True 571 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 611 336 0.00957367505306628 0.0599417977307655 0.00955214770733196 0.0606240939955749 0.00214773465872146 0.0126998873799529 418483 2612310 667 665 0 True 616 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 656 336 0.0093146605914255 0.0643114079545396 0.00933852140077821 0.0648813611047532 0.00196539519552933 0.0170047328755492 407161 2802741 667 665 0 True 660 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 258 380 0.00964786546987436 0.044798514941508 0.00967421988250553 0.048050659952697 0.00145528265395257 0.0104004984989319 421726 1952354 667 665 0 True 257 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 302 380 0.00984900088294145 0.0324830157334283 0.00985732814526589 0.0323643854428931 0.00148299004877385 0.00430001116220227 430518 1415635 667 665 0 True 302 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 347 381 0.00977625172307415 0.0835519102172919 0.00978103303578241 0.0800640878919661 0.00138645897587489 0.0171712722181484 427338 3641257 667 665 0 True 347 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 392 381 0.00976353205864452 0.0661572906860881 0.00976577401388571 0.0632486457618067 0.00148682035207501 0.0155414916763456 426782 2883186 667 665 0 True 391 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 436 381 0.00984753674890639 0.0433506746954362 0.00988784618905928 0.04443427176318 0.00162173250093797 0.00763541789296662 430454 1889256 667 665 0 True 436 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 480 380 0.00995798736017663 0.0544027727822647 0.0100251773861295 0.0536049439230945 0.00172148791814998 0.012176721437689 435282 2370915 667 665 0 True 481 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 524 379 0.00992406062933285 0.0424577580366572 0.00987258716716258 0.0434119172961013 0.0018175968724516 0.0069367491893193 433799 1850342 667 665 0 True 526 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 568 378 0.0098692013572065 0.0516097981277295 0.00997940032043946 0.0520943007553216 0.00183479174331022 0.0094912838241959 431401 2249195 667 665 0 True 571 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 612 380 0.00988317926182251 0.0455383595174707 0.00990310521095598 0.0465857938506142 0.00216679815488985 0.00903548271110955 432012 1984597 667 665 0 True 616 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 656 379 0.00966637303916135 0.0988545293194075 0.00962844281681544 0.0958876935988403 0.00195369829180899 0.0293506475881304 422535 4308157 667 665 0 True 661 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 259 425 0.00981187135889597 0.0441771859265926 0.00985732814526589 0.0447394522011139 0.00157906881003565 0.00645854472980596 428895 1925276 667 665 0 True 257 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 303 424 0.0100051828057132 0.0482729598085394 0.0100556954299229 0.0484473945220111 0.00147384581039583 0.00733303118671568 437345 2103773 667 665 0 True 302 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 346 423 0.00993954842217253 0.0350500880261996 0.00997940032043946 0.0358739604791333 0.00144571291562816 0.00421340704298411 434476 1527510 667 665 0 True 347 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 392 425 0.0102168874363459 0.0517619064828471 0.0101472495613031 0.0515754940108339 0.00156842701457518 0.00856673392676455 446599 2255824 667 665 0 True 392 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 436 425 0.0103940019004002 0.0963414946154583 0.010406652933547 0.0936751354238193 0.00165770489130499 0.0223773944289518 454341 4198637 667 665 0 True 436 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 480 423 0.0102235217936923 0.0597103654076826 0.0102388036926833 0.061173418783856 0.00175790399264126 0.0162273336259797 446889 2602224 667 665 0 True 481 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 523 423 0.0102365617374421 0.0529001606786479 0.0102693217364767 0.0515754940108339 0.00166156678458962 0.0115520786112811 447459 2305430 667 665 0 True 526 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 568 422 0.0101997982469054 0.033542496662806 0.0102235446707866 0.0341496910048066 0.00185594938715247 0.00489205523005897 445852 1461808 667 665 0 True 571 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 612 424 0.00980105049329306 0.0399924737455908 0.0098115510795758 0.0408789196612497 0.00195800864710745 0.00580073417313426 428422 1742903 667 665 0 True 616 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 656 423 0.00968245563645277 0.072857722241057 0.00967421988250553 0.0739604791332876 0.00201557029651484 0.0151234856270266 423238 3175196 667 665 0 True 661 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 260 469 0.00970668247931425 0.0510881231460432 0.00978103303578241 0.0520180056458381 0.0015391055645253 0.0122772242488008 424297 2226460 667 665 0 True 257 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 305 468 0.010005320068279 0.0532996717015702 0.00993362325474937 0.0527199206530861 0.00160982937740659 0.00688862486975785 437351 2322841 667 665 0 True 302 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 348 469 0.0101126593947247 0.0672820526941065 0.0101167315175097 0.0634927901121538 0.00151087070814023 0.0149797872306856 442043 2932204 667 665 0 True 347 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 393 468 0.0102305679387361 0.091882785471346 0.0102998397802701 0.0843213550011444 0.0016372588579394 0.022264340173102 447197 4004323 667 665 0 True 392 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 437 469 0.0103529375161355 0.0973087330365282 0.0103608758678569 0.0936446173800259 0.00198000440998807 0.0287104424801461 452546 4240790 667 665 0 True 437 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 482 468 0.0101997524927168 0.0440398088377272 0.0103150988021668 0.0446631570916304 0.00208019095606379 0.00570114994491617 445850 1919289 667 665 0 True 481 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 525 467 0.0103052616516187 0.0426795071909575 0.0102845807583734 0.0434424353398947 0.0018542692013637 0.00584043727002714 450462 1860006 667 665 0 True 526 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 570 466 0.0103096082995353 0.105687198082182 0.0102845807583734 0.103227283131151 0.00204237171414714 0.0212124094146036 450652 4605930 667 665 0 True 571 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 613 467 0.00990159532273232 0.0672804464812753 0.00991836423285267 0.0676890211337453 0.00187906840182542 0.0186764036575296 432817 2932134 667 665 0 True 616 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 657 467 0.00966580111180391 0.0765185795801015 0.00970473792629892 0.0723430228122377 0.0019512437167237 0.0129793555448327 422510 3334739 667 665 0 True 661 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 260 513 0.00968211248003831 0.0455736044161674 0.00975051499198901 0.0487983520256352 0.00153268624448669 0.0096571738676049 423223 1986133 667 665 0 True 257 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 305 512 0.00990349412155904 0.0961121733149537 0.00990310521095598 0.0906385900663767 0.00158539954894847 0.0259340238275298 432900 4188643 667 665 0 True 302 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 349 512 0.0100807916023677 0.0571797541461803 0.010101472495613 0.0593270771343557 0.00148104649974296 0.0107680036778191 440650 2491938 667 665 0 True 347 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 392 512 0.0104166273466608 0.0588468883355103 0.0103456168459602 0.0591134508278019 0.0020129014745684 0.00639041810195218 455330 2564593 667 665 0 True 392 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 438 513 0.0101044007636832 0.0567782238842701 0.0101472495613031 0.0572060730907149 0.00186860246826302 0.00631915632526607 441682 2474439 667 665 0 True 437 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 482 510 0.0102792732724963 0.0639255497406827 0.0102998397802701 0.0640573739223316 0.00186100064205792 0.0144201899070282 449326 2785925 667 665 0 True 482 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 525 510 0.0101032797860626 0.0746511047589218 0.0100862134737163 0.072632944228275 0.00175434848589399 0.0170391038575151 441633 3253353 667 665 0 True 526 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 570 508 0.0101234802603276 0.0569065143976903 0.0100709544518196 0.058609903105211 0.00185597664901802 0.0143304200410776 442516 2480030 667 665 0 True 571 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 613 509 0.00992513585276485 0.0487068437860502 0.00999465934233616 0.0479591058213169 0.00188421057320743 0.00588560511402736 433846 2122682 667 665 0 True 616 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 658 509 0.00994366629914615 0.0628215996617775 0.00997940032043946 0.0635385671778439 0.00190043031085958 0.0109014659387636 434656 2737814 667 665 0 True 661 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 261 554 0.00982870890029922 0.0422608133976507 0.00984206912336919 0.0433356221866178 0.00136030918152444 0.00819909289016802 429631 1841759 667 665 0 True 258 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 305 553 0.00988837236222813 0.051385157790333 0.00994888227664607 0.0524452582589456 0.0015247100798262 0.0128247897324578 432239 2239405 667 665 0 True 302 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 349 555 0.0100451490894516 0.0440164728598792 0.00996414129854276 0.0448157473105974 0.00137790542865785 0.00653903188273896 439092 1918272 667 665 0 True 347 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 393 554 0.010669373484464 0.0507005439898671 0.0105897611963073 0.0500038147554742 0.00203383950037037 0.00574534233609502 466378 2209569 667 665 0 True 392 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 437 554 0.0102288292795694 0.08993894670299 0.0101472495613031 0.0837720302128633 0.00187448492472821 0.0197444432462435 447121 3919609 667 665 0 True 437 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 481 551 0.0103337207569253 0.0622120189464276 0.0103913939116503 0.0625314717326619 0.00203477034286977 0.0113483653736123 451706 2711248 667 665 0 True 482 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 526 552 0.010089873808804 0.0552081049499464 0.0100709544518196 0.0551613641565576 0.0019693938038541 0.00670767651973269 441047 2406012 667 665 0 True 527 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 569 552 0.00989658523908108 0.0375426549894994 0.00987258716716258 0.0395361257343404 0.00174860979712336 0.00776968321647278 432598 1636138 667 665 0 True 571 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 614 551 0.00993307420448622 0.048591334137587 0.00990310521095598 0.0484931715877012 0.0017321068204207 0.00630607059123191 434193 2117648 667 665 0 True 616 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 658 552 0.00974680890271275 0.054697099810639 0.00973525597009232 0.0535133897917143 0.00183210482006832 0.00807668540378405 426051 2383742 667 665 0 True 661 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 258 598 0.00920194514781977 0.0093836789272334 0.00918593118181125 0.0093690394445716 0.00133237030607482 0.00139131308142941 402234 408948 667 665 0 False 258 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 303 598 0.00961187980054377 0.00952539279074317 0.00967421988250553 0.00956740672922866 0.00145359702899025 0.00150104406313259 420153 415124 667 665 0 False 303 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 347 597 0.00978169647151705 0.0721284098320877 0.00971999694819562 0.0699320973525597 0.00154686728754165 0.0132045502781117 427576 3143412 667 665 0 True 347 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 392 597 0.0100014995935312 0.0865056208844381 0.0100556954299229 0.083436331731136 0.00144113997778468 0.0247331629760738 437184 3769982 667 665 0 True 392 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 437 597 0.0100014309622483 0.0097384225039596 0.0100099183642329 0.00976577401388571 0.00178325499177646 0.00198660082052425 437181 424408 667 665 0 False 437 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 482 597 0.00995759844957357 0.00986278926889208 0.0100251773861295 0.0097962920576791 0.00203245940450838 0.00195574156821615 435265 429828 667 665 0 False 482 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 527 597 0.009905026886877 0.00975191469174194 0.0098268101014725 0.00975051499198901 0.00198313599117622 0.00208708274849762 432967 424996 667 665 0 False 527 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 572 597 0.0097006886806082 0.00954771914909728 0.00965896086060884 0.00953688868543526 0.00179758849266622 0.00194566140901235 424035 416097 667 665 0 False 572 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 616 596 0.00948562111711368 0.00960866345309371 0.00953688868543526 0.00958266575112535 0.00148152098776303 0.00147261216770502 414634 418753 667 665 0 False 616 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 661 596 0.00952908759627968 0.0093784472625831 0.00953688868543526 0.00944533455405508 0.00163690605848301 0.0016752458890651 416534 408720 667 665 0 False 661 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 259 647 0.00944476262669764 0.0382979421545395 0.00935378042267491 0.0389410238803693 0.001333661697302 0.00749663103463138 412848 1669054 667 665 0 True 258 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 303 641 0.00941980371681863 0.00933010025636304 0.00941481651026169 0.00930800335698482 0.00135604467357017 0.00130425639600989 411757 406613 667 665 0 False 303 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 348 641 0.00955374910393281 0.0095434971039409 0.00959792477302205 0.00956740672922866 0.00143790695180655 0.00124426878731756 417612 415913 667 665 0 False 348 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 392 641 0.00960817371126751 0.00965960334574133 0.00973525597009232 0.00968947890440223 0.00146964546773867 0.00130100222050848 419991 420973 667 665 0 False 392 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 437 641 0.00949760871452578 0.00973796358600782 0.00952162966353857 0.00973525597009232 0.00171634104318054 0.00175883450450656 415158 424388 667 665 0 False 437 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 482 641 0.00946974441367094 0.0095238554156047 0.00956740672922866 0.00950637064164187 0.00178213271243545 0.00172245659252224 413940 415057 667 665 0 False 482 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 527 640 0.00952547301538061 0.00947624267810749 0.00958266575112535 0.00949111161974517 0.0018300589427569 0.00184873496407803 416376 412982 667 665 0 False 527 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 572 640 0.00947459435766209 0.00958998549245625 0.00950637064164187 0.00959792477302205 0.00169485138583711 0.00156251527960715 414152 417939 667 665 0 False 572 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 617 640 0.00948003910610499 0.00953151934539943 0.00950637064164187 0.00947585259784848 0.00137357970721635 0.00145231008193619 414390 415391 667 665 0 False 617 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 657 646 0.00974351460113386 0.0409270601543915 0.0097962920576791 0.0403295948729686 0.00131462554699639 0.00788300680324556 425907 1783633 667 665 0 True 661 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A10_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A10_2.csv new file mode 100755 index 0000000..9201256 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A10_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 257 248 0.00847250899613137 0.73653020167723 0.00823987182421607 0.752742809185931 0.00216119719371306 0.195190921972804 370349 32098557 667 665 11 True 257 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 301 248 0.00688309999269077 0.00660337040816736 0.0068207827878233 0.00659189745937285 0.00151696761168296 0.00130315521886657 300873 287780 667 665 0 False 301 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 345 249 0.00635354101388308 0.00629623956893837 0.0063782711528191 0.00633249408712902 0.00125132670238057 0.00122483819109304 277725 274395 667 665 0 True 346 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 390 249 0.00616286043291012 0.00590927995199718 0.00607309071488518 0.00588998245212482 0.00126776109750839 0.0012498322271482 269390 257531 667 665 0 True 391 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 434 249 0.00611321713828369 0.00601074671113582 0.00608834973678187 0.00599679560540169 0.00147140715980984 0.00148184827028289 267220 261953 667 665 0 True 436 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 481 248 0.00606032529626695 0.00635337485393502 0.00610360875867857 0.00633249408712902 0.00154988352821806 0.00154864631338781 264908 276885 667 665 0 False 481 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 523 248 0.00623945294461947 0.00655750155888692 0.00617990386816205 0.00660715648126955 0.00148870647694385 0.00156099796258854 272738 285781 667 665 0 True 526 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 568 247 0.0064956992778502 0.00671844408457628 0.00643930724040589 0.00666819256885634 0.00165922003882969 0.00145379130281599 283939 292795 667 665 0 True 570 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 615 247 0.00799327962477905 0.00723137667928117 0.00750743877317464 0.00720225833524071 0.00341760377253386 0.00198910283385653 349401 315149 667 665 0 False 615 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 654 248 0.00912459769199859 0.757337518665054 0.00904859998474098 0.740825513084611 0.00189496207849508 0.16366771239539 398853 33005356 667 665 14 True 660 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 257 292 0.00669598823842828 0.00655226989423662 0.00663767452506294 0.00660715648126955 0.00162343601993317 0.00153762450692648 292694 285553 667 665 0 False 257 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 301 292 0.00633068679667948 0.00623107321978556 0.00631723506523232 0.00625619897764553 0.00127878058304775 0.00124528768162346 276726 271555 667 665 0 False 301 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 346 294 0.00596021513161936 0.00594122064144109 0.00593575951781491 0.0059662775616083 0.00131874396510718 0.0013120470473469 260532 258923 667 665 0 True 346 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 391 294 0.00586307898923049 0.00608029572672813 0.00585946440833143 0.00608834973678187 0.00140254888116993 0.00126098293321995 256286 264984 667 665 0 True 391 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 436 293 0.00612216208215416 0.00621744335661768 0.00611886778057527 0.00614938582436866 0.00159604745344886 0.001704867300965 267611 270961 667 665 0 True 436 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 481 292 0.00629845297081375 0.00639818819192637 0.00627145799954223 0.00636301213092241 0.00168321450783911 0.00179592636120076 275317 278838 667 665 0 True 481 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 523 291 0.00642583263186443 0.0063770320743493 0.00643930724040589 0.00631723506523232 0.00157710042584039 0.00148524699019038 280885 277916 667 665 0 True 526 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 569 292 0.00633894542772102 0.00665038655232726 0.00636301213092241 0.00668345159075303 0.00168171568839888 0.0017071114922586 277087 289829 667 665 0 True 571 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 615 291 0.00691563122078238 0.00676481774360369 0.00691233691920348 0.00674448767833982 0.00184943313271172 0.00185477978496365 302295 294816 667 665 0 False 615 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 660 291 0.00749227125965513 0.00713156202476895 0.00747692072938125 0.00715648126955062 0.00197627944369236 0.00195454490766198 327501 310799 667 665 0 False 660 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 258 338 0.00593859627750785 0.00595195932151275 0.00588998245212482 0.0059662775616083 0.00137380513105792 0.0014564860576575 259587 259391 667 665 0 True 257 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 302 337 0.00601646990649788 0.00603880954388718 0.00607309071488518 0.00610360875867857 0.00126855500555077 0.0013068405306631 262991 263176 667 665 0 True 302 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 347 337 0.00616462196917106 0.00622616279770151 0.00617990386816205 0.00621042191195544 0.00122829133296858 0.00131598525275438 269467 271341 667 665 0 True 346 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 391 338 0.00630671160185529 0.0063438064146404 0.00630197604333562 0.00633249408712902 0.00128422873829931 0.00127616260497344 275678 276468 667 665 0 True 391 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 435 337 0.00643329056460554 0.00665596240544139 0.00650034332799268 0.00669871061264973 0.00152740279524577 0.00170174860703742 281211 290072 667 665 0 True 436 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 478 335 0.00649405212706075 0.00655853412427842 0.00650034332799268 0.00654612039368277 0.00164742475894983 0.00155394988811108 283867 285826 667 665 0 True 481 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 522 335 0.00647925064705002 0.00630612925079923 0.00651560234988937 0.0063935301747158 0.00168142285117784 0.0016029264560604 283220 274826 667 665 0 True 526 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 568 335 0.00660578385561168 0.00664127703098442 0.00663767452506294 0.00663767452506294 0.00171421041021039 0.00150963540634767 288751 289432 667 665 0 True 571 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 611 336 0.00667281374190451 0.00672278085922061 0.00677500572213321 0.00674448767833982 0.00202271284910542 0.00207870629200347 291681 292984 667 665 0 True 616 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 656 336 0.00667130385368085 0.00667521401351858 0.00668345159075303 0.00669871061264973 0.0019309643489911 0.00181952724879628 291615 290911 667 665 0 True 660 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 258 380 0.00579364700803638 0.00591788466359306 0.00582894636453803 0.00593575951781491 0.00144751876489826 0.00148721986494228 253251 257906 667 665 0 True 257 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 302 380 0.00606888132953436 0.0721435311785988 0.00605783169298848 0.0720988784618906 0.00134317540564095 0.0156362032897874 265282 3144071 667 665 0 True 302 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 347 381 0.00636191403039611 0.0065073877185525 0.00631723506523232 0.00648508430609598 0.00130073505409062 0.00130857253555803 278091 283597 667 665 0 True 347 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 392 381 0.00658441664953744 0.00667232283042236 0.00660715648126955 0.00668345159075303 0.00140953455047237 0.00137782963396883 287817 290785 667 665 0 True 391 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 436 381 0.00679012748146412 0.00671741151918478 0.00677500572213321 0.00666819256885634 0.00155106877733727 0.00168068753869161 296809 292750 667 665 0 True 436 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 480 380 0.00670285136671765 0.00679180211916837 0.00662241550316625 0.00683604180972 0.00160302685654865 0.00179773225675102 292994 295992 667 665 0 True 481 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 524 379 0.00651846198667661 0.0066814323517652 0.00654612039368277 0.0068207827878233 0.00161405826284928 0.00172386587930618 284934 291182 667 665 0 True 526 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 568 378 0.00659731933072146 0.00670759067501668 0.00668345159075303 0.00672922865644312 0.00173345433629851 0.00179860337052555 288381 292322 667 665 0 True 571 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 612 380 0.00648478690387011 0.00645488750486883 0.00656137941557946 0.0063782711528191 0.00192255493955071 0.00197028229081677 283462 281309 667 665 0 True 616 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 656 379 0.00616828230425872 0.0061927535708119 0.00622568093385214 0.00614938582436866 0.00196073805582436 0.00176965170993899 269627 269885 667 665 0 True 661 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 259 425 0.00602678747602623 0.00594340050171205 0.00607309071488518 0.0059510185397116 0.00154993544532846 0.00162807380807185 263442 259018 667 665 0 True 257 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 303 424 0.0063652998403522 0.00638008387872864 0.0064087891966125 0.00634775310902571 0.0014216445430632 0.00149885006590371 278239 278049 667 665 0 True 302 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 346 423 0.00651153022710435 0.0067388888793281 0.00653086137178607 0.00674448767833982 0.00132417870775858 0.00126199638644104 284631 293686 667 665 0 True 347 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 392 425 0.00672957181285759 0.00680974581108298 0.00674448767833982 0.0068055237659266 0.00150381796198385 0.00144411236602505 294162 296774 667 665 0 True 392 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 436 425 0.00687170719973042 0.00729172438994029 0.00691233691920348 0.00737010757610437 0.00166187994982182 0.00169840857973164 300375 317779 667 665 0 True 436 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 480 423 0.00674018678461181 0.0069404915355452 0.00671396963454643 0.00688181887541009 0.00169956111206469 0.00164699409720527 294626 302472 667 665 0 True 481 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 523 423 0.0066098331013024 0.00675979259203169 0.00662241550316625 0.00683604180972 0.00170630968701094 0.00164484054428793 288928 294597 667 665 0 True 526 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 568 422 0.00637806525897042 0.00650743361034768 0.00627145799954223 0.00643930724040589 0.00176053774127277 0.00173817007384742 278797 283599 667 665 0 True 571 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 612 424 0.00594914261797918 0.00622040337740667 0.0059510185397116 0.00613412680247196 0.00197945139522502 0.00181870666243253 260048 271090 667 665 0 True 616 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 656 423 0.00577468189686342 0.00597043076907191 0.00569161516746777 0.00593575951781491 0.00189174606244012 0.00186642432051871 252422 260196 667 665 0 True 661 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 260 469 0.00599185415303335 0.0061275642757615 0.00602731364919509 0.00608834973678187 0.00154499560884702 0.00155697117476466 261915 267044 667 665 0 True 257 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 305 468 0.00623005045886304 0.00624821380528456 0.00624093995574884 0.00622568093385214 0.00141521176751979 0.00148128649823561 272327 272302 667 665 0 True 302 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 348 469 0.00642709087205081 0.00653040245383429 0.00650034332799268 0.00646982528419928 0.00146964610731942 0.00143651376079304 280940 284600 667 665 0 True 347 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 393 468 0.00668123251260614 0.00660233784277586 0.00668345159075303 0.00650034332799268 0.00147254825827637 0.00154544825419576 292049 287735 667 665 0 True 392 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 437 469 0.00681993633533428 0.00683918539768969 0.00677500572213321 0.00686655985351339 0.00192967356250212 0.00201664641039895 298112 298057 667 665 0 True 437 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 482 468 0.00667482692620273 0.00698619976354253 0.00671396963454643 0.00700389105058366 0.00190134134403149 0.0019190939174222 291769 304464 667 665 0 True 481 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 525 467 0.00633292875192067 0.00647264762960273 0.00633249408712902 0.00648508430609598 0.00181130749748749 0.0016374023649579 276824 282083 667 665 0 True 526 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 570 466 0.00592299409919668 0.00610154362789556 0.00590524147402152 0.00610360875867857 0.00180471482268191 0.00195713703887612 258905 265910 667 665 0 True 571 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 613 467 0.00577246281871653 0.00581992862678555 0.00588998245212482 0.00593575951781491 0.00171687734798031 0.00181978408184252 252325 253637 667 665 0 True 616 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 657 467 0.00569097460882742 0.00588610459543228 0.00570687418936446 0.005981536583505 0.00185704695033718 0.00184799349414514 248763 256521 667 665 0 True 661 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 260 513 0.00615606593590364 0.00621579125199127 0.00619516289005875 0.00627145799954223 0.00146305246625129 0.00153300161700691 269093 270889 667 665 0 True 257 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 305 512 0.00629774378089051 0.00637976263616239 0.00631723506523232 0.00642404821850919 0.00154069914823161 0.00146432804704982 275286 278035 667 665 0 True 302 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 349 512 0.00644834369265356 0.00632879979761718 0.0064087891966125 0.00630197604333562 0.00145347490137949 0.00147082041461956 281869 275814 667 665 0 True 347 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 392 512 0.00643011064849814 0.00639736213961317 0.00634775310902571 0.00643930724040589 0.00174422237424658 0.00151859766988602 281072 278802 667 665 0 True 392 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 438 513 0.0064533766533991 0.00656929575024767 0.00651560234988937 0.00668345159075303 0.00182452995528908 0.00180931468512591 282089 286295 667 665 0 True 437 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 482 510 0.00633029788607642 0.0064069076330102 0.00634775310902571 0.00642404821850919 0.00173635935762667 0.00158430723421995 276709 279218 667 665 0 True 482 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 525 510 0.0059619309136917 0.00604709301291682 0.00602731364919509 0.00605783169298848 0.00165972622757959 0.00155672104767441 260607 263537 667 665 0 True 526 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 570 508 0.00582098513572236 0.0060314668566587 0.00578316929884794 0.00607309071488518 0.00183804352026664 0.00161805775275064 254446 262856 667 665 0 True 571 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 613 509 0.00577918868444011 0.0059623079213254 0.00575265125505455 0.00588998245212482 0.00171998447411594 0.00173747604230557 252619 259842 667 665 0 True 616 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 658 509 0.00581723329225751 0.00609344372604663 0.00587472343022812 0.00605783169298848 0.00191161407803516 0.00186223213026329 254282 265557 667 665 0 True 661 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 261 554 0.00624745992762374 0.00631762514549133 0.00631723506523232 0.00634775310902571 0.00136158687480667 0.00138314864904067 273088 275327 667 665 0 True 258 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 305 553 0.00640931536978135 0.00638724299877641 0.00642404821850919 0.0063782711528191 0.00145804933460149 0.00129004037636985 280163 278361 667 665 0 True 302 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 349 555 0.00649940536712646 0.00664733474794792 0.00651560234988937 0.00660715648126955 0.00137256959640932 0.00141998604508468 284101 289696 667 665 0 True 347 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 393 554 0.00655314366163222 0.00633492635227345 0.00646982528419928 0.00631723506523232 0.00165524507211461 0.00136851057499593 286450 276081 667 665 0 True 392 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 437 554 0.00632052936681122 0.00643354782011105 0.00642404821850919 0.00650034332799268 0.00196221251366244 0.00191467372749023 276282 280379 667 665 0 True 437 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 481 551 0.00631892797021036 0.0061683161898796 0.00633249408712902 0.00619516289005875 0.00192915854158468 0.0020618339299875 276212 268820 667 665 0 True 482 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 526 552 0.00604259554818608 0.00611278711771418 0.00601205462729839 0.00616464484626535 0.00194984438044591 0.00187225183595546 264133 266400 667 665 0 True 527 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 569 552 0.00594497898681696 0.00614438361869425 0.00601205462729839 0.00614938582436866 0.00171729938419219 0.00173387487318268 259866 267777 667 665 0 True 571 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 614 551 0.00602376769957891 0.00596228497542781 0.0059662775616083 0.00599679560540169 0.00169181628113086 0.00156684063446911 263310 259841 667 665 0 True 616 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 658 552 0.00587238996660974 0.006162878012151 0.00592050049591821 0.00610360875867857 0.0018161351497985 0.00181904715781625 256693 268583 667 665 0 True 661 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 258 598 0.00660367916293627 0.00662039626417841 0.00665293354695964 0.00656137941557946 0.00130671792892193 0.00138294179053878 288659 288522 667 665 0 False 258 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 303 598 0.00639332428086712 0.00647094963318114 0.00636301213092241 0.0063935301747158 0.00136839793316725 0.00137818003291775 279464 282009 667 665 0 False 303 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 347 597 0.0062978352892677 0.00632538085887642 0.00625619897764553 0.00631723506523232 0.00139674233965477 0.00154830564473497 275290 275665 667 665 0 True 347 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 392 597 0.00636555148838947 0.00620223022651616 0.00636301213092241 0.00619516289005875 0.00138589701789324 0.00124276270050932 278250 270298 667 665 0 True 392 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 437 597 0.00618994691255883 0.00619759515520318 0.00624093995574884 0.00630197604333562 0.00179175006763886 0.00201608434969534 270574 270096 667 665 0 False 437 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 482 597 0.00639879190640432 0.00638274560284896 0.00645456626230259 0.00648508430609598 0.00193795897914289 0.00194725505472841 279703 278165 667 665 0 False 482 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 527 597 0.00633583414289651 0.00621817762534053 0.00636301213092241 0.00625619897764553 0.00194623473745158 0.00203488402408864 276951 270993 667 665 0 False 527 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 572 597 0.006147875936145 0.00619947671880548 0.00607309071488518 0.00622568093385214 0.00166378407413616 0.00184957512375136 268735 270178 667 665 0 False 572 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 616 596 0.00604376227999527 0.00601928258503893 0.00608834973678187 0.00607309071488518 0.0014226346089301 0.0014423344053596 264184 262325 667 665 0 False 616 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 661 596 0.00622364487245963 0.00631388496418432 0.00627145799954223 0.00631723506523232 0.00152657910136548 0.00161667748245413 272047 275164 667 665 0 False 661 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 259 647 0.00888104814610319 0.743416816245237 0.00840772106507973 0.75043869687953 0.00236923615281539 0.188037884511006 388207 32398681 667 665 10 True 258 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 303 641 0.00693672390172504 0.00641207045996773 0.0068055237659266 0.00642404821850919 0.00164378213435808 0.00130206152579682 303217 279443 667 665 0 False 303 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 348 641 0.00617786780676954 0.00616363522677144 0.00611886778057527 0.00622568093385214 0.00120890070321567 0.00122609062756299 270046 268616 667 665 0 False 348 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 392 641 0.00614151610393018 0.00598860391996241 0.00614938582436866 0.00601205462729839 0.00120366127278655 0.00129014218477076 268457 260988 667 665 0 False 392 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 437 641 0.00615274875723045 0.00627574888239138 0.00617990386816205 0.00631723506523232 0.00155164737016267 0.00158217984372558 268948 273502 667 665 0 False 437 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 482 641 0.00616114465083778 0.00617836649302359 0.00627145799954223 0.00617990386816205 0.00174990979812587 0.00167913250316471 269315 269258 667 665 0 False 482 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 527 640 0.00610800116078376 0.00623667201879728 0.00604257267109178 0.00624093995574884 0.00175676315916017 0.0016426039202396 266992 271799 667 665 0 False 527 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 572 640 0.00616388990215352 0.00624022863292358 0.00605783169298848 0.00628671702143893 0.00164641261978436 0.00148414755683936 269435 271954 667 665 0 False 572 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 617 640 0.00708968015420077 0.00638054279668042 0.0068055237659266 0.0063782711528191 0.00228324188327966 0.00135180803949876 309903 278069 667 665 0 False 617 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 657 646 0.00826956629261474 0.772937746058899 0.00819409475852598 0.774563210498207 0.00171020291928476 0.175759402921473 361478 33685226 667 665 15 True 661 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A10_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A10_3.csv new file mode 100755 index 0000000..2bb80a4 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A10_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 257 248 0.00116076088758093 0.075142858290152 0.000946059357595178 0.0749675745784695 0.00090635115457428 0.0218725922899403 50739 3274784 667 665 0 True 257 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 301 248 0.000959556843230937 0.000975934916256079 0.000823987182421607 0.000854505226215 0.00072364512031699 0.000699292985918004 41944 42532 667 665 0 False 301 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 345 249 0.000916959693648255 0.000960331705895547 0.00080872816052491 0.000839246204318303 0.000652297512229466 0.000662978375064428 40082 41852 667 665 0 True 346 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 390 249 0.000935078352332188 0.000983231711689386 0.00080872816052491 0.000900282291905089 0.000648403408899068 0.000641762692677758 40874 42850 667 665 0 True 391 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 434 249 0.000879441258999706 0.000918203037922111 0.000686655985351339 0.000732433051041428 0.000751401970410338 0.000808888931517439 38442 40016 667 665 0 True 436 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 481 248 0.00100396128326315 0.000892526578520001 0.00080872816052491 0.000732433051041428 0.000850984882482431 0.000772642060085959 43885 38897 667 665 0 False 481 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 523 248 0.00101585737229806 0.000930685606210537 0.00080872816052491 0.000717174029144732 0.000846117407438075 0.000805760087460359 44405 40560 667 665 0 True 526 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 568 247 0.00105218619804312 0.00105220707984197 0.000854505226215 0.000885023270008392 0.00092904570591707 0.000777859265806408 45993 45856 667 665 0 True 570 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 615 247 0.00113399468725239 0.0009957372258754 0.000732433051041428 0.000549324788281071 0.00110337216534234 0.00106329284489757 49569 43395 667 665 0 False 615 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 654 248 0.00113861586030057 0.0781248841949231 0.000823987182421607 0.074036774242771 0.00100933616841932 0.0208229149024887 49771 3404743 667 665 0 True 660 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 257 292 0.000998562289008849 0.000952231804046624 0.000854505226215 0.000747692072938125 0.000778897339684874 0.000775040544532584 43649 41499 667 665 0 False 257 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 301 292 0.000893670811652997 0.000900121670621966 0.000778210116731518 0.000793469138628214 0.000658005560816522 0.000651864607140957 39064 39228 667 665 0 False 301 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 346 294 0.0008925498340324 0.000897712351375119 0.000793469138628214 0.000762951094834821 0.000663434459831392 0.000701799055253218 39015 39123 667 665 0 True 346 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 391 294 0.000908769693889608 0.000801523148681959 0.000747692072938125 0.000671396963454643 0.000713916536341796 0.000647900615431329 39724 34931 667 665 0 True 391 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 436 293 0.000932104330073462 0.000913751533789842 0.000656137941557946 0.000656137941557946 0.000871635974309069 0.000867500901053009 40744 39822 667 665 0 True 436 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 481 292 0.000953563044524888 0.000938464265493214 0.000671396963454643 0.000595101853971161 0.000944961118607784 0.000986752925644643 41682 40899 667 665 0 True 481 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 523 291 0.000990852708230458 0.000893123171857316 0.00080872816052491 0.000686655985351339 0.000824999978806224 0.000825355919527005 43312 38923 667 665 0 True 526 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 569 292 0.00103363287456752 0.00107597902974419 0.000778210116731518 0.00080872816052491 0.000926886426008064 0.000948821806672384 45182 46892 667 665 0 True 571 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 615 291 0.00102292639443611 0.00103557130408993 0.000564583810177768 0.000671396963454643 0.00106882514743983 0.0010537361343553 44714 45131 667 665 0 False 615 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 660 291 0.00104557471779102 0.00101159284110941 0.000701915007248035 0.000564583810177768 0.00100952172931242 0.00103937683917963 45704 44086 667 665 0 False 660 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 258 338 0.000938212514251 0.00089674862367638 0.000778210116731518 0.000732433051041428 0.00078613050489544 0.000749024869823566 41011 39081 667 665 0 True 257 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 302 337 0.000917096956214042 0.000919855142548521 0.00080872816052491 0.000778210116731518 0.000685716891085742 0.000683005494702904 40088 40088 667 665 0 True 302 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 347 337 0.000923067877825793 0.00093341616802363 0.000793469138628214 0.000823987182421607 0.000687398763717543 0.000710527354714454 40349 40679 667 665 0 True 346 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 391 338 0.00091526678867021 0.000849503020540594 0.000747692072938125 0.000701915007248035 0.000717436041831495 0.000668910168688946 40008 37022 667 665 0 True 391 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 435 337 0.00102885156185926 0.00107024255534694 0.000747692072938125 0.00080872816052491 0.00092224134383403 0.00095294458440214 44973 46642 667 665 0 True 436 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 478 335 0.00093418614565457 0.00103577781716824 0.000732433051041428 0.000854505226215 0.000816435580386833 0.00086278715406445 40835 45140 667 665 0 True 481 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 522 335 0.000998196255500082 0.000953906854570622 0.000778210116731518 0.000686655985351339 0.000870429262176815 0.000917218292220014 43633 41572 667 665 0 True 526 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 568 335 0.00105902644923819 0.00101611318293445 0.000778210116731518 0.000839246204318303 0.00105421701003245 0.000846391541599266 46292 44283 667 665 0 True 571 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 611 336 0.00098289147941479 0.000964645534642282 0.000625619897764553 0.000534065766384375 0.00103840779274763 0.00110952143906739 42964 42040 667 665 0 True 616 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 656 336 0.000924875168275327 0.000925408049765063 0.000518806744487678 0.000564583810177768 0.000985406728139353 0.000943753437080681 40428 40330 667 665 0 True 660 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 258 380 0.000918400950589022 0.00094904232428175 0.000762951094834821 0.000778210116731518 0.000784941538186894 0.000790743290694514 40145 41360 667 665 0 True 257 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 302 380 0.000902913157749347 0.00687654131896461 0.000747692072938125 0.00677500572213321 0.000748628087529026 0.00200113201448222 39468 299685 667 665 0 True 302 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 347 381 0.00090700815762867 0.000924742618734981 0.000762951094834821 0.000762951094834821 0.000717406512982578 0.000735607808967902 39647 40301 667 665 0 True 347 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 392 381 0.000929747989360779 0.000916849229964359 0.000747692072938125 0.000747692072938125 0.000747223605816758 0.00068884691184604 40641 39957 667 665 0 True 391 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 436 381 0.000896484694251638 0.000980937121930484 0.000579842832074464 0.000732433051041428 0.00084534547026999 0.000904350607905123 39187 42750 667 665 0 True 436 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 480 380 0.00101146497019286 0.00104702130698685 0.000747692072938125 0.000732433051041428 0.000885736177444263 0.00100862561162773 44213 45630 667 665 0 True 481 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 524 379 0.000965756535785666 0.00096726136696743 0.000656137941557946 0.000671396963454643 0.000938694816051249 0.000923572361995578 42215 42154 667 665 0 True 526 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 568 378 0.0010665072590736 0.00105365267139008 0.000778210116731518 0.000747692072938125 0.00103385913313758 0.000978871494685475 46619 45919 667 665 0 True 571 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 612 380 0.000963034161564217 0.000964829101822994 0.000473029678797589 0.000473029678797589 0.00110170206007992 0.00110074836416209 42096 42048 667 665 0 True 616 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 656 379 0.000928947291060352 0.0010657222135219 0.000488288700694286 0.000762951094834821 0.000996422386142083 0.00105504604079103 40606 46445 667 665 0 True 661 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 259 425 0.000948575837967947 0.00102497029940381 0.000778210116731518 0.000823987182421607 0.000815330572693154 0.000916646344177952 41464 44669 667 665 0 True 257 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 303 424 0.000903896872804156 0.000955008257654895 0.000762951094834821 0.000854505226215 0.000728691806434584 0.000743800407239987 39511 41620 667 665 0 True 302 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 346 423 0.000903690978955475 0.000913361453530829 0.000747692072938125 0.000793469138628214 0.000697402596243524 0.000680046974945498 39502 39805 667 665 0 True 347 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 392 425 0.000981084188965256 0.000925339212072296 0.000823987182421607 0.00080872816052491 0.000801668863149423 0.000744999703834957 42885 40327 667 665 0 True 392 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 436 425 0.00102569452284615 0.000977885317551145 0.000762951094834821 0.000701915007248035 0.000915823429168854 0.000894216021193377 44835 42617 667 665 0 True 436 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 480 423 0.00103669840520344 0.000967307258762608 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.000986770216075083 0.00084308598185104 45316 42156 667 665 0 True 481 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 523 423 0.000960517681191448 0.00103479114357191 0.000717174029144732 0.000869764248111696 0.000873478493617289 0.000874400098297465 41986 45097 667 665 0 True 526 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 568 422 0.000924440503483667 0.00100920646776015 0.000610360875867857 0.000686655985351339 0.000938315525248828 0.000976643955163175 40409 43982 667 665 0 True 571 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 612 424 0.000923662682277538 0.000952117074558679 0.000503547722590982 0.000732433051041428 0.000971981886251991 0.000843521648073523 40375 41494 667 665 0 True 616 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 656 423 0.00101830522138793 0.000892664253905535 0.00064087891966125 0.000442511635004196 0.0010140888905176 0.00100413005901001 44512 38903 667 665 0 True 661 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 260 469 0.000919270280172342 0.000993832716375512 0.000747692072938125 0.00080872816052491 0.000797004827664637 0.000813792142042456 40183 43312 667 665 0 True 257 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 305 468 0.000909021341926885 0.000890094313375565 0.000762951094834821 0.000732433051041428 0.000813298483164526 0.000768410025825525 39735 38791 667 665 0 True 302 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 348 469 0.000917279972968425 0.000992731313291239 0.000732433051041428 0.000885023270008392 0.000827081080497018 0.000839533544732271 40096 43264 667 665 0 True 347 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 393 468 0.000947065949744286 0.00099667800767655 0.000732433051041428 0.000869764248111696 0.000824684870890996 0.000868091020181001 41398 43436 667 665 0 True 392 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 437 469 0.00102567164575186 0.00103476819767432 0.000671396963454643 0.000732433051041428 0.0010514193892338 0.0011068784663436 44834 45096 667 665 0 True 437 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 482 468 0.00101766466274759 0.000998766084357151 0.00064087891966125 0.000686655985351339 0.00105761479492925 0.00104912697273166 44484 43527 667 665 0 True 481 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 525 467 0.000991584775247991 0.000911112755567105 0.000671396963454643 0.000595101853971161 0.000964897215455493 0.000911646949670324 43344 39707 667 665 0 True 526 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 570 466 0.000981495976662619 0.000989886021990201 0.000625619897764553 0.000564583810177768 0.000993245126543194 0.00107252061030459 42903 43140 667 665 0 True 571 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 613 467 0.000930685950226992 0.000972080005461124 0.000595101853971161 0.00064087891966125 0.000964001054025522 0.000940245104138979 40682 42364 667 665 0 True 616 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 657 467 0.000869489722980121 0.00089931856420635 0.000457770656900893 0.000488288700694286 0.000955645330265684 0.000961499807488074 38007 39193 667 665 0 True 661 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 260 513 0.000874545560819956 0.00104075707694505 0.000717174029144732 0.000900282291905089 0.000723656553037413 0.000824660576704029 38228 45357 667 665 0 True 257 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 305 512 0.000979505669458702 0.000931970576475522 0.000854505226215 0.00080872816052491 0.000836070352694347 0.000770590792495229 42816 40616 667 665 0 True 302 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 349 512 0.000883970923670689 0.000943902443221811 0.000732433051041428 0.000854505226215 0.000793098361150289 0.000799589455850479 38640 41136 667 665 0 True 347 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 392 512 0.000955233072408634 0.000853908632877685 0.000671396963454643 0.00064087891966125 0.00088581531483917 0.000780257253958076 41755 37214 667 665 0 True 392 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 438 513 0.000958801899119106 0.0010439924485051 0.00064087891966125 0.000732433051041428 0.000969469619563731 0.00107496977563699 41911 45498 667 665 0 True 437 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 482 510 0.00100043821074128 0.000932383602632124 0.00064087891966125 0.000625619897764553 0.00099465773914909 0.000889948047361849 43731 40634 667 665 0 True 482 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 525 510 0.000970743742342608 0.000979445638587198 0.000656137941557946 0.000762951094834821 0.000947362732960896 0.000868207062671732 42433 42685 667 665 0 True 526 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 570 508 0.00103223737181535 0.000944223685788057 0.000717174029144732 0.000610360875867857 0.00101162432089812 0.000939223872690759 45121 41150 667 665 0 True 571 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 613 509 0.000940523100775087 0.00101556248139231 0.000579842832074464 0.000610360875867857 0.000959754056090184 0.00100512159720665 41112 44259 667 665 0 True 616 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 658 509 0.000919361788549534 0.000965609262341021 0.000549324788281071 0.000625619897764553 0.000966211463336475 0.00102557439357591 40187 42082 667 665 0 True 661 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 261 554 0.000848465673320355 0.000958702547166727 0.000701915007248035 0.00080872816052491 0.000691157298971664 0.000746286241601897 37088 41781 667 665 0 True 258 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 305 553 0.000876238465798001 0.000856203222636587 0.000793469138628214 0.000732433051041428 0.000707648888375395 0.000694314118930059 38302 37314 667 665 0 True 302 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 349 555 0.000829454807958804 0.000872288296846488 0.000686655985351339 0.000732433051041428 0.000672675138232268 0.000687807618694992 36257 38015 667 665 0 True 347 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 393 554 0.000914305950709699 0.00100307991310389 0.000762951094834821 0.000823987182421607 0.000785000251517212 0.000815024154233238 39966 43715 667 665 0 True 392 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 437 554 0.00100483061284647 0.000982267983990647 0.000625619897764553 0.000534065766384375 0.00102544729720747 0.00108592078071406 43923 42808 667 665 0 True 437 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 481 551 0.00103797952248412 0.0010260258106929 0.000610360875867857 0.000595101853971161 0.00110221098124968 0.00116024702402152 45372 44715 667 665 0 True 482 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 526 552 0.000934780950106316 0.000889864854399675 0.000534065766384375 0.0004272526131075 0.000986097308985626 0.00101548133695864 40861 38781 667 665 0 True 527 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 569 552 0.000939447877343086 0.000975384214713942 0.000686655985351339 0.000701915007248035 0.000866936292387899 0.000885837857025299 41065 42508 667 665 0 True 571 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 614 551 0.000980191982287639 0.000947986812992656 0.000671396963454643 0.000686655985351339 0.00090727252302149 0.000833406471407643 42846 41314 667 665 0 True 616 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 658 552 0.000949994217814416 0.000974420487015203 0.000671396963454643 0.00064087891966125 0.000959601181030419 0.000948162991945381 41526 42466 667 665 0 True 661 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 258 598 0.00101480502596035 0.00104137661617996 0.000885023270008392 0.000900282291905089 0.000722778854251347 0.000728310681693638 44359 45384 667 665 0 False 258 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 303 598 0.000907191174383053 0.000961846135136422 0.000717174029144732 0.000823987182421607 0.000745650952373522 0.000756837725797856 39655 41918 667 665 0 False 303 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 347 597 0.000844302042158138 0.000968752850310716 0.000686655985351339 0.000793469138628214 0.000679234913174838 0.000852396958523691 36906 42219 667 665 0 True 347 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 392 597 0.000920825922584599 0.000892274173646522 0.000747692072938125 0.000747692072938125 0.000750541610628012 0.000696657627935523 40251 38886 667 665 0 True 392 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 437 597 0.000939974050511938 0.00100755436313374 0.000564583810177768 0.000564583810177768 0.000973382952365316 0.00107951812252827 41088 43910 667 665 0 False 437 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 482 597 0.000938670056136958 0.000919832196650932 0.000518806744487678 0.000473029678797589 0.00103615482013299 0.00104908384706843 41031 40087 667 665 0 False 482 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 527 597 0.000927643296685372 0.000986581812737382 0.000488288700694286 0.000625619897764553 0.00104572225673111 0.00105165619806498 40549 42996 667 665 0 False 527 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 572 597 0.000922290056619665 0.000963085213606229 0.00064087891966125 0.00064087891966125 0.000913318111832011 0.00096105484510334 40315 41972 667 665 0 False 572 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 616 596 0.000937732095270744 0.000965884613112089 0.000732433051041428 0.000762951094834821 0.000791543664835951 0.000787541839930443 40990 42094 667 665 0 False 616 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 661 596 0.00101823659010504 0.00102058763296431 0.000793469138628214 0.000732433051041428 0.000869381760192109 0.000917082761459157 44509 44478 667 665 0 False 661 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 259 647 0.00107156309691343 0.0755642367534767 0.000915541313801785 0.0763408865491722 0.000761056410050442 0.0206081979089107 46840 3293148 667 665 0 True 258 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 303 641 0.000983463406772238 0.000963039321811051 0.000869764248111696 0.000793469138628214 0.0007285515725846 0.000723734267518265 42989 41970 667 665 0 False 303 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 348 641 0.000932333101016441 0.000938143022926967 0.000823987182421607 0.00080872816052491 0.000684878235948077 0.000677725759895113 40754 40885 667 665 0 False 348 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 392 641 0.000948232681553478 0.000869810139906874 0.00080872816052491 0.000732433051041428 0.000735281778759664 0.00064536878139965 41449 37907 667 665 0 False 392 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 437 641 0.000907328436948841 0.00100895406288667 0.00064087891966125 0.000717174029144732 0.000837695113009106 0.00092210500476486 39661 43971 667 665 0 False 437 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 482 641 0.000918034917080256 0.000967008962093951 0.000579842832074464 0.00064087891966125 0.000949802539044468 0.000970320287007013 40129 42143 667 665 0 False 482 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 527 640 0.000952739469130164 0.000899570969079829 0.000610360875867857 0.000488288700694286 0.000954865931465674 0.000944895720726805 41646 39204 667 665 0 False 527 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 572 640 0.00100853670212273 0.00102460316504238 0.000793469138628214 0.000854505226215 0.000880706930035736 0.000761444714317316 44085 44653 667 665 0 False 572 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 617 640 0.000993758099206291 0.000941539015770142 0.000823987182421607 0.000778210116731518 0.000732992235273205 0.000735456301172776 43439 41033 667 665 0 False 617 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 657 646 0.00106369337647496 0.0809281845033733 0.000885023270008392 0.0775768673228046 0.000798758898426263 0.023285513842801 46496 3526913 667 665 0 True 661 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A11_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A11_1.csv new file mode 100755 index 0000000..78b8783 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A11_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 249 265 0.00951087742921856 0.0391915471902462 0.00955214770733196 0.0397802700846876 0.00153836924175024 0.00820150073140967 415738 1707998 667 665 0 True 250 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 294 264 0.00937571955610659 0.00927310264675192 0.009399557488365 0.00929274433508812 0.00139794724814418 0.00123203957179718 409830 404129 667 665 0 False 294 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 336 266 0.00960293485667329 0.0579220080413898 0.00953688868543526 0.0564278629739834 0.00134132705419076 0.00922689887372691 419762 2524286 667 665 0 True 339 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 382 266 0.00969577010533415 0.0766668559703218 0.00962844281681544 0.076554512855726 0.00130557542255361 0.0103914092874145 423820 3341201 667 665 0 True 384 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 427 266 0.00968444594365669 0.0641442470906036 0.00968947890440223 0.0617685206378271 0.00165265830033937 0.00986554601850252 423325 2795456 667 665 0 True 429 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 469 263 0.00946009027987723 0.0588960613940436 0.00944533455405508 0.0634927901121538 0.00172480450015641 0.0162829288749366 413518 2566736 667 665 0 True 473 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 514 263 0.00963171424130004 0.0719961726242822 0.00965896086060884 0.0735332265201801 0.00163147559032711 0.0235013681776811 421020 3137649 667 665 0 True 518 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 559 263 0.00932676257430909 0.0621371923743899 0.00933852140077821 0.0628213931486992 0.00154978900894891 0.0179412577733414 407690 2707987 667 665 0 True 563 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 608 264 0.00960009809698035 0.00916732205886655 0.00933852140077821 0.00910963607232776 0.00308306286513197 0.00187698532681999 419638 399519 667 665 0 False 608 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 652 264 0.0108894511316097 0.0333055802701994 0.00962844281681544 0.0389868009460594 0.00537210805169031 0.0164300397596177 475998 1451483 667 665 0 False 652 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 250 308 0.0095440949701391 0.00951915150659895 0.00953688868543526 0.00944533455405508 0.00150749917571214 0.00159413101087979 417190 414852 667 665 0 False 250 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 294 308 0.00956088675735376 0.00958073829572788 0.00956740672922866 0.00964370183871214 0.00135023167973341 0.00132441328160038 417924 417536 667 665 0 False 294 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 338 310 0.00959611748257252 0.0967872416220226 0.00961318379491875 0.09570458533608 0.00135933868103854 0.0198881456489251 419464 4218063 667 665 0 True 339 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 382 311 0.00980894309082584 0.0459643271603132 0.00976577401388571 0.0462806134126802 0.00133679746480474 0.00628942343479968 428767 2003161 667 665 0 True 384 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 426 310 0.00973042890319546 0.0670176471161883 0.00964370183871214 0.065293354695964 0.00169866075290147 0.013569428327635 425335 2920681 667 665 0 True 429 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 471 309 0.00943389600690614 0.0388380656378873 0.00943007553215839 0.0404364080262455 0.00177412571530479 0.00819796526081851 412373 1692593 667 665 0 True 473 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 514 309 0.00935323137241176 0.0399545212309786 0.0093690394445716 0.0423132677195392 0.00167758385229566 0.00805982121625193 408847 1741249 667 665 0 True 518 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 559 308 0.00933120073060288 0.0485408761087888 0.00926222629129473 0.0500495918211643 0.0016553997327658 0.00834029380519806 407884 2115449 667 665 0 True 563 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 608 307 0.00915738056812747 0.00903074807641672 0.00921644922560464 0.00912489509422446 0.00195980829255114 0.00200552719942272 400286 393567 667 665 0 False 608 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 652 307 0.0091886535560327 0.00936816750046322 0.00926222629129473 0.009399557488365 0.00187306223129613 0.00188001302201418 401653 408272 667 665 0 False 652 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 251 356 0.00939363232094184 0.0483020781525799 0.00935378042267491 0.0480354009308003 0.0015920330580166 0.00918766099265639 410613 2105042 667 665 0 True 250 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 295 354 0.0095441178472334 0.062087996369959 0.00956740672922866 0.0633554589150835 0.00137237092829538 0.0186930478812881 417191 2705843 667 665 0 True 294 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 339 355 0.00953039159065466 0.0395813520984884 0.00955214770733196 0.0390173189898528 0.00131053221850207 0.00890434699059932 416591 1724986 667 665 0 True 339 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 383 355 0.00968403415595933 0.0324717951895073 0.00975051499198901 0.0330663004501411 0.00132726746278275 0.00491493851607098 423307 1415146 667 665 0 True 384 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 428 354 0.00969899577563015 0.065153889530418 0.00973525597009232 0.0626840619516289 0.00174384876301454 0.00915152776421945 423961 2839457 667 665 0 True 429 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 472 354 0.0095712958352593 0.0309202165404355 0.00964370183871214 0.0313572899977111 0.00166985578491417 0.0045878976036394 418379 1347527 667 665 0 True 473 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 514 353 0.00968147192139797 0.0279614807217173 0.00965896086060884 0.0287327382314794 0.00181626545876517 0.0044428835704072 423195 1218583 667 665 0 True 518 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 560 353 0.00956701781862559 0.0497132279084069 0.00952162966353857 0.0499427786678874 0.00173367601855738 0.00995468033406016 418192 2166541 667 665 0 True 563 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 603 352 0.0094299611466869 0.0576891989644516 0.00950637064164187 0.0599984740978103 0.00213103701592309 0.0149332384604658 412201 2514140 667 665 0 True 608 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 647 352 0.00940314919216977 0.0634691558376371 0.00944533455405508 0.0641336690318151 0.00193260819567375 0.0195061088464549 411029 2766035 667 665 0 True 652 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 251 400 0.00939681223704925 0.0417280784933265 0.00941481651026169 0.0437476157778286 0.00159196376581284 0.00973439487393883 410752 1818542 667 665 0 True 250 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 295 399 0.00952382586459116 0.0307265531647842 0.00953688868543526 0.0308995193408103 0.00151112341600793 0.0044607552315679 416304 1339087 667 665 0 True 294 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 339 399 0.00983456543643948 0.0807764203367196 0.0098115510795758 0.0780346379797055 0.00139967823538491 0.0190891602474894 429887 3520299 667 665 0 True 339 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 384 400 0.00972260493694558 0.0630035606296584 0.00971999694819562 0.0611429007400626 0.00153102338570033 0.0154512388136542 424993 2745744 667 665 0 True 384 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 428 399 0.00974356035532245 0.0415611470883664 0.00976577401388571 0.0423437857633326 0.00167594398777608 0.00645142022564268 425909 1811267 667 665 0 True 429 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 472 397 0.00978181085698854 0.0507249354790042 0.00988784618905928 0.0515602349889372 0.00176455879810493 0.0107665367972267 427581 2210632 667 665 0 True 473 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 516 397 0.00976078680732877 0.0402236995555953 0.0097962920576791 0.0413977264057374 0.00167422714436436 0.00581815545621188 426662 1752980 667 665 0 True 518 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 560 396 0.00965010742511555 0.0505150264078599 0.00968947890440223 0.0508278019378958 0.00176337163755405 0.00872217128052169 421824 2201484 667 665 0 True 563 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 604 397 0.00954533033323119 0.0482882188304361 0.00946059357595178 0.0493171587701228 0.00195547088461902 0.00809158656316233 417244 2104438 667 665 0 True 608 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 648 397 0.00938935430430813 0.0839982767630911 0.00943007553215839 0.0795910582131685 0.00199521085767731 0.0180200438156315 410426 3660710 667 665 0 True 653 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 251 444 0.00949250712249734 0.0391943924815472 0.00955214770733196 0.0397192339971008 0.00157154980801886 0.0057651307554292 414935 1708122 667 665 0 True 250 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 295 444 0.00957845636577454 0.045669380592704 0.00955214770733196 0.0456702525368124 0.00155202153055045 0.00601370294843593 418692 1990307 667 665 0 True 295 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 340 443 0.009837676721264 0.0336287961836383 0.0097962920576791 0.0340428778515297 0.00148835354014198 0.00328185790209997 430023 1465569 667 665 0 True 339 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 384 444 0.00987862672005723 0.0535357620418636 0.00991836423285267 0.0512550545510033 0.00148877598221382 0.0115425026961573 431813 2333130 667 665 0 True 384 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 428 443 0.00998690400736917 0.0914035604001994 0.00997940032043946 0.0910963607232776 0.00180321160251554 0.012508265393242 436546 3983438 667 665 0 True 429 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 472 441 0.00985753403911457 0.0555190677540728 0.0098268101014725 0.0569619287403677 0.00183977140632876 0.0129623696026262 430891 2419564 667 665 0 True 474 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 517 442 0.00987585859164718 0.0516279942245176 0.00987258716716258 0.0507820248722057 0.00172924518358395 0.00951993243338867 431692 2249988 667 665 0 True 518 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 560 440 0.00959403566699141 0.0324453385695872 0.00962844281681544 0.0331578545815213 0.00190130634617063 0.00513428106315861 419373 1413993 667 665 0 True 563 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 604 440 0.00950971069740936 0.0386522956510067 0.00947585259784848 0.039658197909514 0.0020020854630389 0.00674508071374912 415687 1684497 667 665 0 True 608 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 649 441 0.00938008908111749 0.0735597060859978 0.00941481651026169 0.0730144197756924 0.0019393635239247 0.0175435925492638 410021 3205789 667 665 0 True 653 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 250 482 0.011024403110873 0.0378466651866563 0.00978103303578241 0.0438849469748989 0.00505647878267897 0.019726145999209 481897 1649387 667 665 0 False 250 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 297 488 0.0096060461414978 0.0515775591416169 0.00953688868543526 0.0502327000839246 0.00156253525134573 0.0075072179814127 419898 2247790 667 665 0 True 295 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 341 487 0.009900725993149 0.0652526257277435 0.00990310521095598 0.0620431830319677 0.00152744855930628 0.0161297809524924 432779 2843760 667 665 0 True 339 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 385 487 0.0101594659296582 0.0837860960480854 0.0102693217364767 0.0797283894102388 0.0015748086891791 0.0169017152081177 444089 3651463 667 665 0 True 384 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 429 487 0.0100077907944631 0.0954649154357627 0.0100251773861295 0.0907301441977569 0.00197448966894715 0.0290521329341153 437459 4160435 667 665 0 True 429 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 473 484 0.00996240263937612 0.0441793887327612 0.00988784618905928 0.0453040360112917 0.00188532617094306 0.00806904166101712 435475 1925372 667 665 0 True 474 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 516 484 0.00989148364705265 0.0391426953742791 0.00994888227664607 0.0401922636758984 0.00174272625290139 0.00550107173246903 432375 1705869 667 665 0 True 518 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 561 486 0.00966671619557582 0.101889422572224 0.00973525597009232 0.0997329671168078 0.00184516638584487 0.0191025217857069 422550 4440420 667 665 0 True 563 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 605 485 0.00962821404587246 0.06946432228431 0.00968947890440223 0.0683146410315099 0.00185983453295019 0.0243126764620401 420867 3027309 667 665 0 True 608 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 649 485 0.00959140480114715 0.074098246302412 0.00964370183871214 0.0713206683451591 0.0018714051797685 0.0121680150415717 419258 3229259 667 665 0 True 653 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 252 531 0.00936407511510896 0.0441165169733673 0.009399557488365 0.0469062333104448 0.00140966601530598 0.00849071576219638 409321 1922632 667 665 0 True 250 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 296 532 0.00956598834938219 0.0940618655817846 0.00962844281681544 0.0874494544899672 0.00152848011782617 0.0229963567462569 418147 4099289 667 665 0 True 295 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 340 530 0.00980642661045307 0.0539361220629968 0.00985732814526589 0.0564278629739834 0.00157470364839812 0.01102480656676 428657 2350578 667 665 0 True 339 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 385 531 0.0101348272990994 0.0552999573779952 0.0101167315175097 0.0556649118791486 0.00154689134476127 0.00573366275361164 443012 2410015 667 665 0 True 384 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 429 532 0.0100268016598247 0.0552635192926239 0.00999465934233616 0.0551461051346609 0.00187825694898404 0.00661646114244119 438290 2408427 667 665 0 True 429 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 473 528 0.00996672641019843 0.0632436435561323 0.00994888227664607 0.0628519111924926 0.00196687272895312 0.016284394980588 435664 2756207 667 665 0 True 474 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 517 528 0.00982992138629701 0.0769972998415012 0.00990310521095598 0.0728007934691386 0.00191448797877601 0.0220814689271058 429684 3355602 667 665 0 True 518 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 561 528 0.00983493146994825 0.0555449277806556 0.00985732814526589 0.0584267948424506 0.00173558777333552 0.012248349023344 429903 2420691 667 665 0 True 563 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 604 527 0.00949937025078671 0.0473643711017071 0.00941481651026169 0.0468909742885481 0.00198522344973076 0.00799664945201621 415235 2064176 667 665 0 True 608 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 648 527 0.00946045631338599 0.0616921337447533 0.00949111161974517 0.0631723506523232 0.00194967795957354 0.0135765838186578 413534 2688591 667 665 0 True 653 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 252 575 0.00934568193129345 0.0391708729365185 0.00932326237888151 0.0404516670481422 0.00132530068332112 0.00681129230050017 408517 1707097 667 665 0 True 250 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 296 575 0.00945068779412079 0.0506904707408255 0.00950637064164187 0.050766765850309 0.00148103107529639 0.0112321895118837 413107 2209130 667 665 0 True 295 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 340 574 0.00981020133101222 0.0418516880436385 0.00978103303578241 0.0426947432669566 0.00142165347774549 0.00656293289739984 428822 1823929 667 665 0 True 340 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 385 574 0.010076742356677 0.0504034863996797 0.0101167315175097 0.048905165178912 0.00144398527482227 0.00799947735904498 440473 2196623 667 665 0 True 384 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 428 573 0.0100135558222262 0.0875988552291693 0.0100556954299229 0.081376363775082 0.00182292010271748 0.0203300040138212 437711 3817626 667 665 0 True 429 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 472 572 0.00991452088101063 0.0604728805304633 0.00991836423285267 0.0603799496452277 0.00206441408175693 0.0111700251119347 433382 2635455 667 665 0 True 474 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 517 571 0.00969503803831662 0.0545190625912458 0.00965896086060884 0.0543984130617227 0.00203630640096186 0.0093586894296946 423788 2375983 667 665 0 True 519 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 561 572 0.00955134700903153 0.0372777904936294 0.00965896086060884 0.038651102464332 0.00177439958573331 0.00805855057925409 417507 1624595 667 665 0 True 563 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 605 570 0.00946176030776097 0.0457172686809723 0.00946059357595178 0.0465705348287175 0.00157419794876924 0.0079556168757882 413591 1992394 667 665 0 True 608 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 648 571 0.00943231748739958 0.0533659853456025 0.00947585259784848 0.0520485236896315 0.001719187785937 0.00787565865635008 412304 2325731 667 665 0 True 653 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 250 613 0.00923838835903632 0.00914855231463874 0.00924696726939803 0.00917067215991455 0.00140379099457238 0.00134241168803478 403827 398701 667 665 0 False 250 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 295 613 0.00935297972437448 0.00923023971005564 0.00927748531319142 0.00927748531319142 0.00151825617187895 0.00140409110462985 408836 402261 667 665 0 False 295 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 339 617 0.00962828267715536 0.0661513706445101 0.00970473792629892 0.0647135118638895 0.00142896413979303 0.00913241325935338 420870 2882928 667 665 0 True 340 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 385 617 0.00962157968852607 0.072818805998746 0.00967421988250553 0.0696574349584192 0.00131570178724397 0.0195813974982746 420577 3173500 667 665 0 True 384 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 429 613 0.00958804186828536 0.00957782416673407 0.00958266575112535 0.00961318379491875 0.00172405781824069 0.00175677441098564 419111 417409 667 665 0 False 429 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 474 613 0.00951085455212426 0.00973479705214054 0.00953688868543526 0.00968947890440223 0.00190555396383072 0.00211184838168703 415737 424250 667 665 0 False 474 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 519 613 0.00949381111687233 0.00947633446169785 0.00955214770733196 0.00950637064164187 0.00180946032565512 0.00218209832452467 414992 412986 667 665 0 False 519 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 563 613 0.00929571835734685 0.0093224592724659 0.0093842984664683 0.0093842984664683 0.00176526850738444 0.00198460239283288 406333 406280 667 665 0 False 563 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 608 612 0.0091940754273813 0.00910802985949653 0.00914015411612116 0.00906385900663768 0.00156328682943584 0.00144707618841657 401890 396935 667 665 0 False 608 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 653 612 0.00934158693141413 0.00902253344507985 0.0093690394445716 0.00906385900663768 0.00148203284414699 0.00168667451934094 408338 393209 667 665 0 False 653 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 250 657 0.00990903037837913 0.0316099702219614 0.00918593118181125 0.0363012130922408 0.00345137142880186 0.0136363234059086 433142 1377587 667 665 0 False 250 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 295 657 0.00938660905299239 0.00920224571499704 0.00930800335698482 0.00918593118181125 0.00165330370518423 0.00120077232476666 410306 401041 667 665 0 False 295 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 340 656 0.00938848497472481 0.00931215656444843 0.009399557488365 0.00929274433508812 0.00144595343375108 0.00119508671790235 410388 405831 667 665 0 False 340 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 384 656 0.00941390142648978 0.00933808542872402 0.00935378042267491 0.0093842984664683 0.0014190187553823 0.00126824253605273 411499 406961 667 665 0 False 384 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 429 656 0.00915808975805071 0.00930362069054531 0.00917067215991455 0.0093842984664683 0.00157933128149221 0.00150883528674952 400317 405459 667 665 0 False 429 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 474 656 0.00920629179573637 0.0091147759533877 0.00920119020370794 0.00921644922560464 0.00173683217151232 0.00165225401242725 402424 397229 667 665 0 False 474 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 519 656 0.00926211190582324 0.00926465855643916 0.00921644922560464 0.0093690394445716 0.00190712130994733 0.0016944287266179 404864 403761 667 665 0 False 519 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 563 656 0.00928601846936454 0.00919260843800965 0.00932326237888151 0.00923170824750134 0.00159307007573585 0.00158326020682186 405909 400621 667 665 0 False 563 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 608 656 0.00924767645932126 0.00910197214253303 0.00921644922560464 0.00914015411612116 0.00142512345363765 0.00136421390141925 404233 396671 667 665 0 False 608 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 648 661 0.00918744107003491 0.0403835406782004 0.00927748531319142 0.0399938963912413 0.00146045627544024 0.00823369101336679 401600 1759946 667 665 0 True 653 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A11_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A11_2.csv new file mode 100755 index 0000000..020459d --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A11_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 249 265 0.00883627767256221 0.752508348004367 0.00863660639353018 0.76725413900969 0.00255469774246262 0.187049549071492 386250 32794897 667 665 12 True 250 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 294 264 0.00657272645435122 0.00642815553417763 0.0064087891966125 0.0064087891966125 0.00158595724623608 0.00127367572851201 287306 280144 667 665 0 False 294 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 336 266 0.00604955018485264 0.00621957732509346 0.00604257267109178 0.00621042191195544 0.00126839406651013 0.00125014457302218 264437 271054 667 665 0 True 339 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 382 266 0.00623835484409317 0.00635573828138669 0.00625619897764553 0.0063935301747158 0.00130563320658097 0.00124368821917809 272690 276988 667 665 0 True 384 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 427 266 0.00641407380539531 0.0064802427217047 0.00642404821850919 0.0063935301747158 0.00166047388284153 0.00149533498127308 280371 282414 667 665 0 True 429 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 469 263 0.00656769349360568 0.00677617596291025 0.00651560234988937 0.00685130083161669 0.00174665973925202 0.00170733612737824 287086 295311 667 665 0 True 473 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 514 263 0.00673085293013827 0.00672560320462406 0.00679026474402991 0.00671396963454643 0.00161750071951504 0.00150063357684344 294218 293107 667 665 0 True 518 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 559 263 0.0069947402128645 0.00698142701684401 0.00703440909437705 0.00704966811627375 0.00154010772597807 0.00148758158753661 305753 304256 667 665 0 True 563 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 608 264 0.0208232116489249 0.00801408419194014 0.00834668497749294 0.00805676356145571 0.0601643763141649 0.00190240508308691 910221 349260 667 665 0 False 608 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 652 264 0.050305380612509 0.58699031855216 0.00953688868543526 0.724010070954452 0.123499619106291 0.377292313949598 2198941 25581493 667 665 15 False 652 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 250 308 0.00692773320366596 0.00644203780221898 0.00688181887541009 0.00650034332799268 0.00174005217703509 0.00147913228692189 302824 280749 667 665 0 False 250 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 294 308 0.00626999386550716 0.00628013154883088 0.00628671702143893 0.00631723506523232 0.00126554849079286 0.00134029063892443 274073 273693 667 665 0 False 294 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 338 310 0.00614444437200031 0.00610039633301611 0.00611886778057527 0.00608834973678187 0.00130348585367643 0.00122163243965233 268585 265860 667 665 0 True 339 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 382 311 0.00647593346837682 0.00629619367714319 0.00645456626230259 0.00628671702143893 0.00143949082366311 0.00121314018886646 283075 274393 667 665 0 True 384 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 426 310 0.00651164461257584 0.00660002030711937 0.00643930724040589 0.00656137941557946 0.00162376458616029 0.00164080277994147 284636 287634 667 665 0 True 429 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 471 309 0.00673902005280262 0.0066152104913233 0.00668345159075303 0.00659189745937285 0.00161212768695069 0.00175540023973892 294575 288296 667 665 0 True 473 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 514 309 0.00677226047081746 0.006794670356367 0.00672922865644312 0.00674448767833982 0.00153324231344404 0.00153499295667322 296028 296117 667 665 0 True 518 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 559 308 0.00695763356591331 0.00690120815887281 0.00689707789730678 0.0068207827878233 0.00168292101432906 0.00147784963489582 304131 300760 667 665 0 True 563 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 608 307 0.00742990830059907 0.00752095390685457 0.00743114366369116 0.00755321583886473 0.00197379505588315 0.00195298855574698 324775 327769 667 665 0 False 608 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 652 307 0.00770612633715186 0.00771374533839749 0.00764476997024491 0.007690547035935 0.0019133842877811 0.00186499826354689 336849 336171 667 665 0 False 652 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 251 356 0.00607098602220977 0.00616319925471725 0.00613412680247196 0.00616464484626535 0.00144523654266413 0.00149076242358528 265374 268597 667 665 0 True 250 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 295 354 0.00623938431333658 0.00605773990939812 0.00628671702143893 0.00605783169298848 0.0013928193901376 0.00133785119812572 272735 264001 667 665 0 True 294 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 339 355 0.00614799032161649 0.00614514083331469 0.00617990386816205 0.00608834973678187 0.00141208469480893 0.00132061099525384 268740 267810 667 665 0 True 339 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 383 355 0.00646104047998889 0.0065704889369223 0.0064087891966125 0.00651560234988937 0.00133910498811349 0.00131609614978207 282424 286347 667 665 0 True 384 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 428 354 0.00675105340440331 0.00663719266121357 0.00674448767833982 0.00663767452506294 0.0015943809029441 0.00165703416064376 295101 289254 667 665 0 True 429 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 472 354 0.0066860367024087 0.0069780998616936 0.00674448767833982 0.00700389105058366 0.00174601688730332 0.00163046307426435 292259 304111 667 665 0 True 473 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 514 353 0.00683919884873311 0.0067915267683973 0.0068055237659266 0.00683604180972 0.00180856537005598 0.00165653479466688 298954 295980 667 665 0 True 518 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 560 353 0.00688401507646268 0.00713126372810029 0.0068207827878233 0.00721751735713741 0.00176137877986563 0.00170606620693054 300913 310786 667 665 0 True 563 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 603 352 0.00701027375989277 0.00724613089143091 0.00703440909437705 0.0072480354009308 0.00196754015999541 0.00203676454941285 306432 315792 667 665 0 True 608 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 647 352 0.00675201424236383 0.00664749536923104 0.00679026474402991 0.00657663843747616 0.00187609694242132 0.00194166495713801 295143 289703 667 665 0 True 652 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 251 400 0.00582324996805786 0.00622317983101494 0.00578316929884794 0.00621042191195544 0.00150057082447771 0.00138217049052956 254545 271211 667 665 0 True 250 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 295 399 0.00633235682456323 0.00653283471897872 0.00634775310902571 0.00659189745937285 0.0013153120909075 0.00136723044696099 276799 284706 667 665 0 True 294 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 339 399 0.00662269002829782 0.00673790220573177 0.00666819256885634 0.00675974670023652 0.00124555556656151 0.00138381305752461 289490 293643 667 665 0 True 339 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 384 400 0.00668885058500734 0.00681913068319689 0.00677500572213321 0.00686655985351339 0.00142317464931445 0.00135311333090306 292382 297183 667 665 0 True 384 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 428 399 0.00687385764659442 0.00693597119372017 0.00677500572213321 0.00695811398489357 0.00159099514363787 0.00154658231918505 300469 302275 667 665 0 True 429 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 472 397 0.00702603607786402 0.00710476121638498 0.00706492713817044 0.00718699931334401 0.00163023933625134 0.00162599478220105 307121 309631 667 665 0 True 473 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 516 397 0.00685287935112325 0.00695061067638196 0.00689707789730678 0.00698863202868696 0.00162744412533529 0.00169074711236503 299552 302913 667 665 0 True 518 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 560 396 0.00681309608413921 0.00711598176030601 0.00674448767833982 0.00715648126955062 0.0016328908393801 0.00150344667801242 297813 310120 667 665 0 True 563 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 604 397 0.00651541933313499 0.00657783162415079 0.00663767452506294 0.00665293354695964 0.00183085917186831 0.00209667732671935 284801 286667 667 665 0 True 608 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 648 397 0.00615389261194534 0.0062604439686995 0.00613412680247196 0.00631723506523232 0.00186040362844977 0.00180578397132263 268998 272835 667 665 0 True 653 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 251 444 0.0060869542340297 0.00633125500865921 0.00616464484626535 0.00634775310902571 0.00147304866916531 0.00160411995310064 266072 275921 667 665 0 True 250 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 295 444 0.00638765076148124 0.0065481396326706 0.00642404821850919 0.00645456626230259 0.00138857513762251 0.00149526851689758 279216 285373 667 665 0 True 295 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 340 443 0.00677528024726479 0.00677312415853091 0.00688181887541009 0.00668345159075303 0.00142124384748159 0.00136886523605939 296160 295178 667 665 0 True 339 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 384 444 0.00677770521926036 0.00699239515589156 0.0068055237659266 0.00698863202868696 0.00146202314306653 0.00134689492216995 296266 304734 667 665 0 True 384 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 428 443 0.00701256146932256 0.00719464029724116 0.00711070420386053 0.0072480354009308 0.00178630450759507 0.00181973458585408 306532 313548 667 665 0 True 429 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 472 441 0.00696198021382991 0.00710104398097556 0.00694285496299687 0.00709544518196384 0.00183839899280347 0.00176677852689398 304321 309469 667 665 0 True 474 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 517 442 0.00697961845353359 0.00696446999852573 0.00700389105058366 0.00701915007248035 0.00178105555695246 0.0017100371387045 305092 303517 667 665 0 True 518 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 560 440 0.00636125059466147 0.00663361310118969 0.00646982528419928 0.00660715648126955 0.00180571639683876 0.00181634327412054 278062 289098 667 665 0 True 563 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 604 440 0.00586582424054624 0.00588612754132986 0.00593575951781491 0.00588998245212482 0.00178064752904891 0.00172356679659121 256406 256522 667 665 0 True 608 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 649 441 0.00581837714697241 0.00575847951304216 0.00578316929884794 0.00584420538643473 0.00185780482879511 0.00198894982513297 254332 250959 667 665 0 True 653 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 250 482 0.00640233785602049 0.0063780646397408 0.0063782711528191 0.00648508430609598 0.00141965885358222 0.0013937242418595 279858 277961 667 665 0 False 250 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 297 488 0.00651464151192886 0.00651149503422094 0.00648508430609598 0.00662241550316625 0.0014955787467087 0.00154015760586795 284767 283776 667 665 0 True 295 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 341 487 0.00671927712042354 0.0065422884287854 0.00677500572213321 0.00663767452506294 0.00140628607249803 0.00150279732220191 293712 285118 667 665 0 True 339 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 385 487 0.00675928915835056 0.00677624480060302 0.00679026474402991 0.00671396963454643 0.00151785723021377 0.00153454958587435 295461 295314 667 665 0 True 384 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 429 487 0.00689227370750422 0.00692722880673875 0.00689707789730678 0.00697337300679027 0.00181446824559228 0.00193686769592783 301274 301894 667 665 0 True 429 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 473 484 0.00672748999727648 0.00702387692738369 0.00677500572213321 0.00718699931334401 0.0019512258599346 0.00183277622553429 294071 306106 667 665 0 True 474 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 516 484 0.00636017537122947 0.00637930371821061 0.00627145799954223 0.00642404821850919 0.00174690046578724 0.00168699879641976 278015 278015 667 665 0 True 518 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 561 486 0.0059358739032864 0.00586910168531881 0.005981536583505 0.00588998245212482 0.0017862118086574 0.00176929734991031 259468 255780 667 665 0 True 563 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 605 485 0.00557141891402662 0.00561355322386993 0.00558480201419089 0.00569161516746777 0.00179010436974792 0.00168257307842121 243537 244643 667 665 0 True 608 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 649 485 0.00565748254277531 0.00577128332389683 0.00564583810177768 0.00573739223315786 0.00189106594431095 0.00170295990063382 247299 251517 667 665 0 True 653 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 252 531 0.00641327310709488 0.00650020565260714 0.00653086137178607 0.00648508430609598 0.0014742246816456 0.00154593054820366 280336 283284 667 665 0 True 250 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 296 532 0.00636317227058249 0.00669962844855329 0.00643930724040589 0.00668345159075303 0.00148168418186278 0.00137871727808984 278146 291975 667 665 0 True 295 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 340 530 0.0066534139659399 0.00659001589577055 0.00666819256885634 0.00659189745937285 0.00141473094137422 0.00144682419811686 290833 287198 667 665 0 True 339 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 385 531 0.00647426344049308 0.00693564995115392 0.00650034332799268 0.00688181887541009 0.00152193237655727 0.0016935464280919 283002 302261 667 665 0 True 384 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 429 532 0.0063815883314923 0.00648313390480091 0.00643930724040589 0.00650034332799268 0.0018739632714333 0.00193570593275348 278951 282540 667 665 0 True 429 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 473 528 0.00630188453495843 0.00619748042571524 0.00633249408712902 0.00621042191195544 0.00178322321393827 0.00176435289863546 275467 270091 667 665 0 True 474 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 517 528 0.00589682270331989 0.00584168133769994 0.00593575951781491 0.00587472343022812 0.00178531337975396 0.00170779673708786 257761 254585 667 665 0 True 518 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 561 528 0.00590691150190526 0.00575854835073493 0.00587472343022812 0.00572213321126116 0.00169304271171629 0.00166074080267532 258202 250962 667 665 0 True 563 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 604 527 0.00575468731644706 0.00589225409598613 0.00579842832074464 0.0059662775616083 0.00173293674765103 0.00164004855948726 251548 256789 667 665 0 True 608 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 648 527 0.00573466985893641 0.00594654408968175 0.00578316929884794 0.00590524147402152 0.00187970849791287 0.001925933390668 250673 259155 667 665 0 True 653 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 252 575 0.00659066209628077 0.00661013944795612 0.00662241550316625 0.00657663843747616 0.00127375030409256 0.00120739351663661 288090 288075 667 665 0 True 250 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 296 575 0.00648856162442926 0.0066302400542441 0.00646982528419928 0.00668345159075303 0.0013966213050782 0.0014057882958019 283627 288951 667 665 0 True 295 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 340 574 0.00655163377340856 0.00669031241413215 0.00660715648126955 0.00669871061264973 0.00134701512491717 0.00136559686661872 286384 291569 667 665 0 True 340 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 385 574 0.0063402722991903 0.00624431300269442 0.00633249408712902 0.00628671702143893 0.00131860882097618 0.00124221166432701 277145 272132 667 665 0 True 384 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 428 573 0.00634146190809379 0.00630280209564883 0.00625619897764553 0.00630197604333562 0.0017792662177144 0.00188084143802487 277197 274681 667 665 0 True 429 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 472 572 0.00611401783658411 0.00610298921944367 0.00611886778057527 0.00611886778057527 0.00195380138632043 0.00176955925872074 267255 265973 667 665 0 True 474 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 517 571 0.00605536096680431 0.00624350989627881 0.00608834973678187 0.00621042191195544 0.00190386822883238 0.00192544931995903 264691 272097 667 665 0 True 519 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 561 572 0.00601765951540138 0.00607942378261974 0.00605783169298848 0.00604257267109178 0.00174419128204165 0.0017730537997302 263043 264946 667 665 0 True 563 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 605 570 0.0059532147407642 0.00607811586645717 0.00601205462729839 0.00610360875867857 0.00158145945438288 0.0016002218466905 260226 264889 667 665 0 True 608 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 648 571 0.00595637177977731 0.0060101501177985 0.00605783169298848 0.00613412680247196 0.00169409711834153 0.00154210416313026 260364 261927 667 665 0 True 653 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 250 613 0.00696168281160404 0.00694124875016564 0.00697337300679027 0.00689707789730678 0.0013352513152717 0.00127213423708947 304308 302505 667 665 0 False 250 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 295 613 0.00669264818266079 0.00669637013109565 0.00665293354695964 0.00669871061264973 0.00140652291475006 0.00138083728368078 292548 291833 667 665 0 False 295 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 339 617 0.00632100978579147 0.00632992414659905 0.0063935301747158 0.0064087891966125 0.00141932063982111 0.00148890676558885 276303 275863 667 665 0 True 340 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 385 617 0.00607206124564177 0.00602614340841805 0.00604257267109178 0.00610360875867857 0.00134206113533065 0.0013215449197614 265421 262624 667 665 0 True 384 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 429 613 0.00618134512510282 0.00626000799664531 0.00613412680247196 0.00625619897764553 0.00166119166986197 0.00180979149951908 270198 272816 667 665 0 False 429 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 474 613 0.00601280957141022 0.00623699326136353 0.00601205462729839 0.00624093995574884 0.00191452910422268 0.0019382251722127 262831 271813 667 665 0 False 474 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 519 613 0.00607183247469879 0.00617125326477099 0.00608834973678187 0.00610360875867857 0.00188026431262026 0.00182267442413415 265411 268948 667 665 0 False 519 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 563 613 0.00599796233721089 0.00600512496622651 0.00602731364919509 0.00607309071488518 0.00165646605981206 0.00178943906461954 262182 261708 667 665 0 False 563 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 608 612 0.00611886778057527 0.00605035133037446 0.00613412680247196 0.00605783169298848 0.00141280347137344 0.00135262288899925 267467 263679 667 665 0 False 608 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 653 612 0.00625805202228366 0.00628148535678863 0.00627145799954223 0.00631723506523232 0.00157131986213963 0.00153117474738804 273551 273752 667 665 0 False 653 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 250 657 0.0362994744330742 0.600169065373436 0.00906385900663768 0.72124818799115 0.0877863194936257 0.351732129709749 1586717 26155833 667 665 12 False 250 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 295 657 0.00701597015637295 0.00667264407298861 0.0068055237659266 0.00668345159075303 0.0017895766153294 0.00126167242087044 306681 290799 667 665 0 False 295 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 340 656 0.00612870493112336 0.00630587684592576 0.00621042191195544 0.00628671702143893 0.00127219779780965 0.00119614547591162 267897 274815 667 665 0 False 340 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 384 656 0.00591146404367054 0.00612935405577345 0.0059510185397116 0.00624093995574884 0.00130394734043133 0.00123363550916629 258401 267122 667 665 0 False 384 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 429 656 0.00589574747988789 0.00571637379096631 0.00590524147402152 0.00573739223315786 0.00144734213900855 0.00142415046896552 257714 249124 667 665 0 False 429 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 474 656 0.0059347071714772 0.00600776374444924 0.00605783169298848 0.005981536583505 0.00164673926204313 0.00154445025819351 259417 261823 667 665 0 False 474 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 519 656 0.00600509999063183 0.00583337492277271 0.00604257267109178 0.00587472343022812 0.00175113177443487 0.00166147488415081 262494 254223 667 665 0 False 519 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 563 656 0.00616034395253735 0.00623024716747235 0.00621042191195544 0.00628671702143893 0.00153689700285542 0.0015826503660634 269280 271519 667 665 0 False 563 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 608 656 0.00805845646643375 0.00663340658811139 0.00677500572213321 0.00659189745937285 0.00653960653414384 0.00135018536627047 352250 289089 667 665 0 False 608 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 648 661 0.00845750162227195 0.776737265457074 0.00825513084611276 0.77279316395819 0.00199076711369378 0.180634714438466 369693 33850812 667 665 17 True 653 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A11_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A11_3.csv new file mode 100755 index 0000000..015a68d --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A11_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 249 265 0.00118590281421432 0.0766955842341032 0.000946059357595178 0.0761120012207217 0.000921403675982725 0.021776113685466 51838 3342453 667 665 0 True 250 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 294 264 0.000967289301103625 0.00100154253796542 0.000839246204318303 0.000869764248111696 0.000693929457424095 0.000676476932243094 42282 43648 667 665 0 False 294 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 336 266 0.000907602962080416 0.000873206132750049 0.000762951094834821 0.000762951094834821 0.000680990479856587 0.000662553616446947 39673 38055 667 665 0 True 339 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 382 266 0.000883124471181667 0.000892801929291069 0.000762951094834821 0.000762951094834821 0.000664964901174922 0.000639174884426844 38603 38909 667 665 0 True 384 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 427 266 0.000869260952037142 0.000918616064078714 0.000625619897764553 0.000656137941557946 0.000812013689227314 0.000815381941006812 37997 40034 667 665 0 True 429 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 469 263 0.000894540141236317 0.00103545657460199 0.00064087891966125 0.000823987182421607 0.000856242231393263 0.000903462598276158 39102 45126 667 665 0 True 473 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 514 263 0.000918652598626299 0.000931832901089988 0.000701915007248035 0.000701915007248035 0.000830315568120977 0.000818593807883913 40156 40610 667 665 0 True 518 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 559 263 0.000955004301465655 0.00100737079595303 0.000732433051041428 0.00080872816052491 0.000915768491976409 0.000787164368140299 41745 43902 667 665 0 True 563 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 608 264 0.00226771484937321 0.00102531448786764 0.000762951094834821 0.000656137941557946 0.00595860309380758 0.00104212603890686 99126 44684 667 665 0 False 608 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 652 264 0.00511650789391297 0.0607845776033125 0.00111390859845884 0.072983901731899 0.012194839062193 0.0405700298483355 223652 2649039 667 665 0 False 652 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 250 308 0.00103077323778029 0.000956820983564427 0.000869764248111696 0.000717174029144732 0.00079092238691462 0.000798284688422675 45057 41699 667 665 0 False 250 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 294 308 0.00090657349283701 0.000892044714670632 0.000793469138628214 0.000747692072938125 0.000675258746313015 0.000686035195134859 39628 38876 667 665 0 False 294 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 338 310 0.000831971288331572 0.000917514660994441 0.000686655985351339 0.000778210116731518 0.000675606253522955 0.000697722561867867 36367 39986 667 665 0 True 339 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 382 311 0.000918950000852172 0.000889153531574416 0.000793469138628214 0.000793469138628214 0.000691637000241493 0.000653107495330694 40169 38750 667 665 0 True 384 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 426 310 0.000884954638725499 0.000863477072172305 0.000625619897764553 0.000595101853971161 0.000844928353750171 0.000843777697032072 38683 37631 667 665 0 True 429 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 471 309 0.00090657349283701 0.000965127398491651 0.000656137941557946 0.000717174029144732 0.000869495023152191 0.000923703227004919 39628 42061 667 665 0 True 473 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 514 309 0.00091842382768332 0.000974810567274217 0.000701915007248035 0.00080872816052491 0.000835938145128904 0.000873202774520581 40146 42483 667 665 0 True 518 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 559 308 0.000974038043921505 0.000970175495961235 0.000793469138628214 0.000823987182421607 0.000839363810908418 0.000740426696155769 42577 42281 667 665 0 True 563 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 608 307 0.00100640913235303 0.00103518122383092 0.000564583810177768 0.000656137941557946 0.00111793827851058 0.00110786151603922 43992 45114 667 665 0 False 608 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 652 307 0.000965115977145325 0.000923205243596517 0.000534065766384375 0.000503547722590982 0.000985504896666859 0.000995678112855291 42187 40234 667 665 0 False 652 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 251 356 0.000953151256827526 0.00101200586726601 0.000793469138628214 0.000839246204318303 0.000780049083959716 0.000836579018264784 41664 44104 667 665 0 True 250 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 295 354 0.00092059715164162 0.000884449622568667 0.00080872816052491 0.000778210116731518 0.000728481280657156 0.000670763060215059 40241 38545 667 665 0 True 294 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 339 355 0.000884108186236477 0.000915334800723484 0.000793469138628214 0.000762951094834821 0.000672033477160841 0.00074040941988496 38646 39891 667 665 0 True 339 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 383 355 0.00087504885689451 0.000980822392442539 0.000732433051041428 0.000869764248111696 0.000688318408277587 0.000686188375832896 38250 42745 667 665 0 True 384 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 428 354 0.000930228408341034 0.000907602033235985 0.000701915007248035 0.000595101853971161 0.000831186600442748 0.000890098351420848 40662 39554 667 665 0 True 429 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 472 354 0.000869146566565653 0.000965494532853076 0.000564583810177768 0.000671396963454643 0.000867268047545932 0.000896786794102388 37992 42077 667 665 0 True 473 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 514 353 0.000967884105555371 0.000934609354698259 0.000701915007248035 0.000610360875867857 0.000931913242616364 0.000900290373959591 42308 40731 667 665 0 True 518 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 560 353 0.00100087287553294 0.000976302050617503 0.000686655985351339 0.000671396963454643 0.000973053884598952 0.000932635849715495 43750 42548 667 665 0 True 563 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 603 352 0.0009740837981101 0.000995071794845319 0.000503547722590982 0.000488288700694286 0.00110515050344356 0.00115040360090814 42579 43366 667 665 0 True 608 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 647 352 0.000942902318582069 0.000893582089809096 0.000473029678797589 0.000442511635004196 0.00106790428157339 0.0010206486747172 41216 38943 667 665 0 True 652 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 251 400 0.000917531621005702 0.000921759652048409 0.000793469138628214 0.000732433051041428 0.000787142963733478 0.000774565684710558 40107 40171 667 665 0 True 250 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 295 399 0.000933659972485719 0.000891792309797153 0.000778210116731518 0.00080872816052491 0.000750295662663231 0.000666044917599351 40812 38865 667 665 0 True 294 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 339 399 0.00092766617377967 0.000960630002564204 0.000793469138628214 0.000885023270008392 0.000716208126082491 0.000706705983473823 40550 41865 667 665 0 True 339 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 384 400 0.000914466090369784 0.000979216179611308 0.000747692072938125 0.000854505226215 0.000717049091842406 0.000753283571010591 39973 42675 667 665 0 True 384 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 428 399 0.000930640196038397 0.000863522963967483 0.000686655985351339 0.000625619897764553 0.000849422614833892 0.000794968636271809 40680 37633 667 665 0 True 429 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 472 397 0.000947203212310073 0.000883830083333764 0.000656137941557946 0.000610360875867857 0.00091654587770786 0.000854507671144951 41404 38518 667 665 0 True 473 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 516 397 0.000951778631169652 0.00095324142354054 0.000701915007248035 0.000671396963454643 0.000891036928240355 0.000946242107385665 41604 41543 667 665 0 True 518 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 560 396 0.000969897289853586 0.000986008165297657 0.000701915007248035 0.000762951094834821 0.000942626762970195 0.000843868127979392 42396 42971 667 665 0 True 563 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 604 397 0.000963720474393154 0.000875454830713772 0.000564583810177768 0.000457770656900893 0.00102631094585037 0.000984965659983526 42126 38153 667 665 0 True 608 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 648 397 0.00089831486179547 0.000904183094495222 0.000488288700694286 0.000595101853971161 0.000997022286057898 0.000894919838083075 39267 39405 667 665 0 True 653 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 251 444 0.00093951650862598 0.000947917975299889 0.000823987182421607 0.000778210116731518 0.000811318698569972 0.000858715492388323 41068 41311 667 665 0 True 250 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 295 444 0.000855397432892618 0.000950579699420215 0.000701915007248035 0.000823987182421607 0.000751142688312311 0.000814283556178118 37391 41427 667 665 0 True 295 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 340 443 0.000944114804579857 0.000896473272905312 0.000793469138628214 0.000762951094834821 0.00077519642967896 0.000746351946609192 41269 39069 667 665 0 True 339 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 384 444 0.000920871676773195 0.000929698932614209 0.000762951094834821 0.00080872816052491 0.000743464809956901 0.000726449015115383 40253 40517 667 665 0 True 384 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 428 443 0.000964109384996218 0.00101039965443478 0.000701915007248035 0.000656137941557946 0.000945030747024667 0.0010089906649763 42143 44034 667 665 0 True 429 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 472 441 0.000987283881519986 0.00100021167590526 0.000656137941557946 0.000656137941557946 0.00100148038522016 0.0010366477362781 43156 43590 667 665 0 True 474 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 517 442 0.00101480502596035 0.00102407540939784 0.000732433051041428 0.000762951094834821 0.000997557801466253 0.000967515928203244 44359 44630 667 665 0 True 518 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 560 440 0.000898475001455555 0.00102022049860288 0.00064087891966125 0.000625619897764553 0.000893080283387466 0.00103310291375028 39274 44462 667 665 0 True 563 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 604 440 0.000901929442694537 0.000989633617116722 0.000503547722590982 0.000625619897764553 0.000994740945097394 0.00102008872742292 39425 43129 667 665 0 True 608 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 649 441 0.000934666564634826 0.00100252921156175 0.000503547722590982 0.000564583810177768 0.00102534139989188 0.00106560801864754 40856 43691 667 665 0 True 653 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 250 482 0.000963743351487451 0.000996494440495838 0.000839246204318303 0.000823987182421607 0.000773991574876556 0.000779907618643843 42127 43428 667 665 0 False 250 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 297 488 0.000928329609514309 0.000812996097476468 0.000793469138628214 0.000595101853971161 0.000790445473621466 0.000770508749044782 40579 35431 667 665 0 True 295 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 341 487 0.000912864693768932 0.000924880294120515 0.000732433051041428 0.000778210116731518 0.000782954421894088 0.000833925687841352 39903 40307 667 665 0 True 339 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 385 487 0.00100897136691439 0.000919923980241288 0.000762951094834821 0.000778210116731518 0.000920478209616609 0.000762623848588504 44104 40091 667 665 0 True 384 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 429 487 0.000947203212310073 0.000899938103441254 0.000549324788281071 0.000457770656900893 0.0010153690088776 0.00100968581059777 41404 39220 667 665 0 True 429 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 473 484 0.000938853072891341 0.000952002345070734 0.000595101853971161 0.000579842832074464 0.000990610022430395 0.000990452195040713 41039 41489 667 665 0 True 474 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 516 484 0.000953380027770505 0.000938992021137761 0.000625619897764553 0.00064087891966125 0.00093289095637794 0.000922786371968824 41674 40922 667 665 0 True 518 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 561 486 0.00088113416397775 0.000968729904413127 0.000518806744487678 0.000625619897764553 0.000932498755218009 0.000995855657893808 38516 42218 667 665 0 True 563 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 605 485 0.000951572737320971 0.000875684289689663 0.000579842832074464 0.000518806744487678 0.000979803092249335 0.00090053094904607 41595 38163 667 665 0 True 608 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 649 485 0.00084819114818878 0.000963383510274886 0.0004272526131075 0.000656137941557946 0.000927282766407209 0.000907914419366295 37076 41985 667 665 0 True 653 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 252 531 0.000984813155335814 0.000969923091087756 0.00080872816052491 0.00080872816052491 0.000805776960801513 0.000795497156021509 43048 42270 667 665 0 True 250 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 296 532 0.000853727405008871 0.000998766084357151 0.000656137941557946 0.000869764248111696 0.000746589720491783 0.000792015784844508 37318 43527 667 665 0 True 295 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 340 530 0.000982525445906024 0.000869718356316518 0.000854505226215 0.000732433051041428 0.000816829167069379 0.000765453141741841 42948 37903 667 665 0 True 339 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 385 531 0.000870473438034931 0.000911204539157461 0.000686655985351339 0.000717174029144732 0.000754714243840307 0.000826654635034906 38050 39711 667 665 0 True 384 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 429 532 0.000899847627113429 0.000955467175606675 0.000518806744487678 0.000534065766384375 0.000975659466021949 0.00105970157946325 39334 41640 667 665 0 True 429 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 473 528 0.000940317206926406 0.00084679540462509 0.000564583810177768 0.000503547722590982 0.00100256016928027 0.000937490270014903 41103 36904 667 665 0 True 474 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 517 528 0.00094212449737594 0.000872425972232022 0.00064087891966125 0.000488288700694286 0.000971047946877198 0.000931837733220187 41182 38021 667 665 0 True 518 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 561 528 0.000874202404405488 0.000905835199121631 0.000488288700694286 0.000518806744487678 0.00092267814078364 0.000928122144719868 38213 39477 667 665 0 True 563 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 604 527 0.000895935643988489 0.000937110457535461 0.000534065766384375 0.00064087891966125 0.000915052352547055 0.000889620936567771 39163 40840 667 665 0 True 608 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 648 527 0.000865028689592032 0.000847759132323829 0.000442511635004196 0.000366216525520714 0.000978710284141923 0.00102912931725367 37812 36946 667 665 0 True 653 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 252 575 0.000975479300862272 0.000948032704787834 0.000885023270008392 0.000839246204318303 0.000665864571347883 0.000629323339298137 42640 41316 667 665 0 True 250 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 296 575 0.000911377682639568 0.000962442728473736 0.000762951094834821 0.000839246204318303 0.000722772963704512 0.000782799797003103 39838 41944 667 665 0 True 295 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 340 574 0.000898520755644151 0.000909758947609353 0.000762951094834821 0.000732433051041428 0.000727661002537189 0.000751199137289799 39276 39648 667 665 0 True 340 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 385 574 0.000886144247628989 0.000958496034088425 0.000747692072938125 0.000854505226215 0.000677462514866155 0.000696604956960779 38735 41772 667 665 0 True 384 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 428 573 0.000923159386202985 0.000919143819723261 0.000534065766384375 0.000503547722590982 0.000981247238127449 0.000987147010305222 40353 40057 667 665 0 True 429 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 472 572 0.000897216761269171 0.000891585796718851 0.000488288700694286 0.000534065766384375 0.00100723531147655 0.000922946790325943 39219 38856 667 665 0 True 474 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 517 571 0.000872669639087529 0.000953149639950184 0.000411993591210803 0.000473029678797589 0.00100803311140748 0.0011110071015321 38146 41539 667 665 0 True 519 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 561 572 0.000962691005149748 0.000922746325644737 0.000656137941557946 0.000503547722590982 0.00093028819844149 0.000987004379100644 42081 40214 667 665 0 True 563 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 605 570 0.00097451846290176 0.000976462671900626 0.000686655985351339 0.000732433051041428 0.000880286841981544 0.000817267004691343 42598 42555 667 665 0 True 608 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 648 571 0.000959694105796724 0.000914646423795814 0.00064087891966125 0.000656137941557946 0.000902586525655638 0.000864082828403783 41950 39861 667 665 0 True 653 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 250 613 0.0010056084340526 0.00100624644697117 0.000885023270008392 0.000885023270008392 0.000720388520162916 0.000682407524628111 43957 43853 667 665 0 False 250 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 295 613 0.000888706482190354 0.00095652268689577 0.000762951094834821 0.00080872816052491 0.000695897437616727 0.00077602320507685 38847 41686 667 665 0 False 295 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 339 617 0.000951938770829737 0.000903632392953085 0.000823987182421607 0.000793469138628214 0.000749801022381297 0.000753165694260458 41611 39381 667 665 0 True 340 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 385 617 0.000908289274909352 0.000870773867605613 0.000778210116731518 0.000762951094834821 0.000736338516152207 0.000671895092826306 39703 37949 667 665 0 True 384 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 429 613 0.000941598324207088 0.000856501519305244 0.000671396963454643 0.000503547722590982 0.000924538134872539 0.000930665023693836 41159 37327 667 665 0 False 429 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 474 613 0.000907099666005862 0.00100110656591123 0.000518806744487678 0.000503547722590982 0.000984289215107079 0.0010861366332316 39651 43629 667 665 0 False 474 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 519 613 0.00088765413585265 0.000892021768773043 0.000473029678797589 0.000442511635004196 0.00102215541227041 0.00102290161675913 38801 38875 667 665 0 False 519 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 563 613 0.000976394384634188 0.000880342306900233 0.000671396963454643 0.000442511635004196 0.000966301910942432 0.00096756457881368 42680 38366 667 665 0 False 563 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 608 612 0.0009490791340425 0.000943879497324222 0.000762951094834821 0.000747692072938125 0.000741861563824602 0.000759875060623113 41486 41135 667 665 0 False 608 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 653 612 0.000889415672113588 0.000888602830032279 0.000701915007248035 0.000671396963454643 0.000753096682723619 0.000804098106544684 38878 38726 667 665 0 False 653 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 250 657 0.00370123933226795 0.0609107570941545 0.00114442664225223 0.071122301060502 0.00862522304013298 0.0369210105294342 161788 2654538 667 665 0 False 250 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 295 657 0.000980420753230617 0.000973135516750218 0.000823987182421607 0.000885023270008392 0.000703984245258631 0.000651263621414751 42856 42410 667 665 0 False 295 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 340 656 0.000931532402716014 0.000852440095431988 0.000793469138628214 0.000732433051041428 0.00068460962131498 0.000647063542808804 40719 37150 667 665 0 False 340 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 384 656 0.000879715784131281 0.0009380741852342 0.000747692072938125 0.00080872816052491 0.000690217179876409 0.000670054299892159 38454 40882 667 665 0 False 384 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 429 656 0.000908540922946629 0.000864968555515591 0.000717174029144732 0.000686655985351339 0.000808564252452835 0.000753579642119166 39714 37696 667 665 0 False 429 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 474 656 0.00086765955543629 0.000854872360576424 0.00064087891966125 0.00064087891966125 0.000842015236474402 0.000753736738868439 37927 37256 667 665 0 False 474 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 519 656 0.000870359052563441 0.000988233917363792 0.000503547722590982 0.000671396963454643 0.000890479007311452 0.00091852361727544 38045 43068 667 665 0 False 519 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 563 656 0.000923022123637197 0.00100581047491698 0.000717174029144732 0.000732433051041428 0.000816625297446091 0.000905694147041952 40347 43834 667 665 0 False 563 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 608 656 0.00115071784318415 0.000997343438706632 0.000946059357595178 0.000885023270008392 0.00097368374075883 0.000723657061461409 50300 43465 667 665 0 False 608 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 648 661 0.00110178373848095 0.0807712575097621 0.000930800335698482 0.07690547035935 0.000783289270980037 0.0234892171879105 48161 3520074 667 665 0 True 653 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A12_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A12_1.csv new file mode 100755 index 0000000..7177b36 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A12_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 224 236 0.00945185452592998 0.0372747616351476 0.00956740672922866 0.0375066758220798 0.00189673142664718 0.00741061791089385 413158 1624463 667 665 0 True 223 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 268 236 0.00943204296226801 0.00960811275155157 0.00952162966353857 0.00961318379491875 0.00157629364475033 0.00165265733791444 412292 418729 667 665 0 False 268 236 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 312 236 0.00969551845729687 0.0527176490092248 0.00971999694819562 0.0522926680399786 0.00137768920034303 0.00553502621792717 423809 2297476 667 665 0 True 313 236 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 355 236 0.00960211128127856 0.0788206726475149 0.00964370183871214 0.0757000076295109 0.00144291535124212 0.0161470393519 419726 3435066 667 665 0 True 357 236 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 401 236 0.0094212678508537 0.0627640742965218 0.0093690394445716 0.0603799496452277 0.0014393293862982 0.0100393187713784 411821 2735307 667 665 0 True 402 236 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 444 235 0.00928912975418905 0.0571026788761788 0.00933852140077821 0.0594949263752193 0.0015708314161978 0.0130597586792499 406045 2488579 667 665 0 True 447 236 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 490 234 0.00952153815516137 0.0738169295979707 0.00943007553215839 0.0726024261844816 0.00170856919190983 0.0179508244815426 416204 3216999 667 665 0 True 492 235 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 533 234 0.00951238731744222 0.062640005828258 0.00946059357595178 0.0604715037766079 0.00159969567483631 0.0145512876249056 415804 2729900 667 665 0 True 537 235 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 582 235 0.00939640044935188 0.00936293583581293 0.0093690394445716 0.00935378042267491 0.00185016444833349 0.00195407292483079 410734 408044 667 665 0 False 582 235 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 620 234 0.00970624781452258 0.0432761005282719 0.00971999694819562 0.0432745860990311 0.00205846942473216 0.00779437697626988 424278 1886006 667 665 0 True 626 235 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 223 280 0.00954823572420702 0.0095092388788405 0.00947585259784848 0.00946059357595178 0.00170651350951265 0.00169410080302783 417371 414420 667 665 0 False 223 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 268 280 0.00984653015675728 0.00964046646715209 0.00990310521095598 0.00964370183871214 0.00151912076141795 0.001438498325362 430410 420139 667 665 0 False 268 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 313 280 0.0100592642566334 0.097148616563152 0.0101167315175097 0.0943160143434806 0.00132786257424861 0.0232031621561183 439709 4233812 667 665 0 True 313 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 357 281 0.00998990090672219 0.0443330344630172 0.0100404364080262 0.0438849469748989 0.00134928587491567 0.00551279164650844 436677 1932068 667 665 0 True 358 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 401 281 0.00979251733711995 0.0695785010707129 0.0098268101014725 0.0702220187685969 0.00162392152210328 0.00961141736510878 428049 3032285 667 665 0 True 402 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 446 281 0.00955262812631222 0.0376892104374004 0.00967421988250553 0.0387273975738155 0.00171114265025008 0.0060198298330497 417563 1642525 667 665 0 True 447 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 489 280 0.00944018720783806 0.0427094745332087 0.00952162966353857 0.0425879301136797 0.00169368940366437 0.0091393337578078 412648 1861312 667 665 0 True 492 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 534 280 0.00951394295985447 0.0494889088135766 0.00959792477302205 0.0504921034561685 0.00167381926105487 0.00935442396261743 415872 2156765 667 665 0 True 537 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 582 279 0.0094299382695926 0.00943009847805598 0.00935378042267491 0.00946059357595178 0.00181234304254331 0.00197097498386454 412200 410971 667 665 0 False 582 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 627 279 0.00941859123082084 0.0102184736274194 0.0093842984664683 0.0100099183642329 0.00193749324478208 0.00258163989018233 411704 445329 667 665 0 False 627 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 224 325 0.00963912641985256 0.0430091479557213 0.00970473792629892 0.0424658579385061 0.00155427077286615 0.0059485268874972 421344 1874372 667 665 0 True 223 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 268 324 0.0100614375805917 0.054633172539956 0.00994888227664607 0.0562752727550164 0.0019070749617744 0.0135603373943189 439804 2380956 667 665 0 True 268 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 311 325 0.009839827168128 0.0381002173550149 0.0098115510795758 0.0378271152819104 0.00138382261430029 0.00807166884543138 430117 1660437 667 665 0 True 313 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 356 325 0.00951714575305618 0.0313746829880836 0.00952162966353857 0.0320134279392691 0.00142264987851986 0.00431176194522776 416012 1367333 667 665 0 True 358 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 401 325 0.00948658195507419 0.0671284758015432 0.00949111161974517 0.0602426184481575 0.00143006916241473 0.0207618270203942 414676 2925511 667 665 0 True 403 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 445 323 0.00947681343580899 0.0292291956717153 0.00956740672922866 0.0296177615014878 0.00166464113380466 0.00357598629353303 414249 1273831 667 665 0 True 447 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 489 324 0.00965159443624491 0.0274791579543962 0.00959792477302205 0.027496757457847 0.00165675342513029 0.00244797237226802 421889 1197563 667 665 0 True 492 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 533 322 0.0102985129088008 0.048424288003139 0.0103761348897536 0.0481422140840772 0.00166854184136845 0.00828927036225585 450167 2110368 667 665 0 True 537 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 577 323 0.0104961938806289 0.05819077333985 0.0104829480430304 0.05810635538262 0.00192256071745058 0.0117098521045628 458808 2535999 667 665 0 True 582 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 622 323 0.0100148598166012 0.0661142212363135 0.00996414129854276 0.0650949874113069 0.00205859089213083 0.0186494371964259 437768 2881309 667 665 0 True 627 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 224 369 0.00952981966329721 0.038204116379298 0.00961318379491875 0.0399633783474479 0.00160444561308073 0.00847050331709866 416566 1664965 667 665 0 True 224 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 267 369 0.00963400195072983 0.0301426948006317 0.00964370183871214 0.0299382009613184 0.00156941117296751 0.00443773591957631 421120 1313642 667 665 0 True 268 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 312 369 0.00968824354131014 0.073427262365114 0.00968947890440223 0.0701304646372168 0.00136394434042224 0.0156419379093826 423491 3200017 667 665 0 True 313 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 357 370 0.00975252817628723 0.0582344623288595 0.00973525597009232 0.0564126039520867 0.00146446336098431 0.012785596916898 426301 2537903 667 665 0 True 358 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 401 369 0.00972869024402882 0.0437993587768919 0.00971999694819562 0.043579766536965 0.0013982597683729 0.00874752072170226 425259 1908810 667 665 0 True 403 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 445 368 0.00978828507467484 0.0502871277530058 0.00994888227664607 0.0498817425803006 0.00174603852822536 0.00805437251513438 427864 2191552 667 665 0 True 448 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 490 367 0.00985332465376376 0.039866225417056 0.00993362325474937 0.0404058899824521 0.00173634075129679 0.00476269861410169 430707 1737401 667 665 0 True 492 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 534 367 0.0097354161097524 0.0513607892470935 0.0097962920576791 0.0500801098649577 0.00167493738330586 0.00803486352474893 425553 2238343 667 665 0 True 537 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 577 368 0.00989075158003512 0.0431054518879024 0.00987258716716258 0.0436713206683452 0.00185080973783802 0.00727170947013064 432343 1878569 667 665 0 True 582 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 622 369 0.009880067976998 0.0890926331622143 0.0098268101014725 0.0854047455558099 0.00205930998086635 0.0165390973109505 431876 3882726 667 665 0 True 627 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 223 415 0.00978400705804113 0.0385145743736774 0.00975051499198901 0.0382543678950179 0.00158047273866916 0.0061166578849226 427677 1678495 667 665 0 True 224 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 268 412 0.00967037653066348 0.041758367078144 0.00970473792629892 0.041718165865568 0.00156878393375598 0.00582824762021099 422710 1819862 667 665 0 True 269 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 313 414 0.00982939521312816 0.0319873155078128 0.0098115510795758 0.0319371328297856 0.00135316088761869 0.00315337906126162 429661 1394032 667 665 0 True 313 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 357 413 0.00990763487562696 0.0473710483579055 0.00990310521095598 0.0467689021133745 0.00135563304680853 0.00615300765515659 433081 2064467 667 665 0 True 358 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 402 413 0.010271723831378 0.0846395687089089 0.0102388036926833 0.0840161745632105 0.00170457864926938 0.0112362306156196 448996 3688658 667 665 0 True 403 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 446 412 0.0103732294987777 0.0565493615017172 0.010406652933547 0.0555123216601816 0.00172680997864859 0.0111143882765724 453433 2464465 667 665 0 True 448 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 490 412 0.0103158308691843 0.0485202936386515 0.0103608758678569 0.0477759975585565 0.00173963329271135 0.0066924072487011 450924 2114552 667 665 0 True 493 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 533 412 0.0102098870454908 0.0330742626766045 0.0102998397802701 0.0332951857785916 0.00162833262927495 0.00351552006843096 446293 1441402 667 665 0 True 537 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 578 412 0.0101715221583532 0.0399846262486154 0.0101625085831998 0.0403295948729686 0.0018406366529777 0.00456536985573998 444616 1742561 667 665 0 True 582 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 621 413 0.00993719208145984 0.0722724412312539 0.00988784618905928 0.0730144197756924 0.00192712790779147 0.0160360255811026 434373 3149689 667 665 0 True 627 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 224 457 0.00981200862146176 0.042784943590379 0.0098268101014725 0.043579766536965 0.00160809053778443 0.00950092922644518 428901 1864601 667 665 0 True 224 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 270 458 0.0100148140624126 0.0451340069101571 0.00978103303578241 0.0444190127412833 0.00215945072520257 0.00555136540037824 437766 1966975 667 665 0 True 269 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 314 459 0.0100771083901858 0.0574523055177426 0.0101167315175097 0.0554970626382849 0.00157878369532441 0.010469679247183 440489 2503816 667 665 0 True 314 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 359 457 0.0101402720475423 0.0806169004566807 0.0101167315175097 0.0766613260090028 0.00144854453524373 0.0151804691611057 443250 3513347 667 665 0 True 358 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 402 458 0.0101984942525304 0.090460025091339 0.0101777676050965 0.0867475394827192 0.00167591731772225 0.0235094612015306 445795 3942318 667 665 0 True 403 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 447 456 0.0105635211691476 0.0405100873034039 0.0105439841306172 0.0410315098802167 0.00196556290330584 0.00477424286935279 461751 1765461 667 665 0 True 448 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 491 456 0.0105203520922075 0.0421366990375917 0.0104219119554437 0.04272526131075 0.0018816117564708 0.00667016436058137 459864 1836350 667 665 0 True 493 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 534 455 0.0103670984375059 0.110038245074807 0.010406652933547 0.110002288853285 0.00185965726787866 0.0227261207733226 453165 4795552 667 665 0 True 538 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 580 456 0.0102894307023645 0.0669489700447043 0.0102082856488899 0.0663920042725261 0.0019930017132336 0.0183463117036385 449770 2917688 667 665 0 True 582 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 623 457 0.00999756473331199 0.0744601031073908 0.00996414129854276 0.072129396505684 0.00197538889541555 0.0106489542044195 437012 3245029 667 665 0 True 627 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 225 501 0.00952677700975559 0.0392081829659982 0.00955214770733196 0.0410467689021134 0.00146955306711865 0.00675047416564942 416433 1708723 667 665 0 True 224 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 270 501 0.0100536593685304 0.10540312787003 0.00999465934233616 0.101625085831998 0.0015387309399163 0.0381893969258957 439464 4593550 667 665 0 True 269 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 313 503 0.0105299604718126 0.049475095383228 0.0102235446707866 0.0509498741130694 0.00254743600598685 0.00975697562941041 460284 2156163 667 665 0 True 314 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 359 502 0.0104921217578439 0.052486216686142 0.0102388036926833 0.0519417105363546 0.00220617231819949 0.00691975000759383 458630 2287390 667 665 0 True 359 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 402 503 0.0104649895240066 0.052764596315692 0.0104676890211337 0.0521400778210117 0.00182802590067395 0.00737290405867838 457444 2299522 667 665 0 True 403 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 446 502 0.0118433802096434 0.059050188988149 0.0107423514152743 0.0577859159227894 0.00852319002436317 0.0105404534219059 517696 2573453 667 665 0 True 448 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 490 500 0.0120157819922723 0.0679761431502767 0.0107423514152743 0.0668345159075303 0.00905483576684257 0.0138184986403153 525232 2962453 667 665 0 True 493 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 536 500 0.0102667823790096 0.054817473989391 0.01025406271458 0.0554207675288014 0.00178253445458723 0.0105397246369747 448780 2388988 667 665 0 True 538 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 579 500 0.0101317388913691 0.046601213493794 0.010101472495613 0.0457770656900893 0.00195100413862875 0.00505332320062577 442877 2030917 667 665 0 True 583 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 622 502 0.00979375270021204 0.0617404348591782 0.00973525597009232 0.0626840619516289 0.00192909274124047 0.0101321035594816 428103 2690696 667 665 0 True 627 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 226 544 0.009314774976897 0.035002612964088 0.0093690394445716 0.0359502555886168 0.00140681536476593 0.00573053939555487 407166 1525441 667 665 0 True 224 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 270 545 0.00958790460571957 0.0432742878023624 0.00961318379491875 0.0437018387121385 0.00148757226724226 0.00737782380390384 419105 1885927 667 665 0 True 269 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 313 545 0.00980878295116575 0.038270613590511 0.0098115510795758 0.038300144960708 0.00139405469575758 0.00521757215512147 428760 1667863 667 665 0 True 314 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 357 545 0.00996178495783008 0.0442433618952394 0.00994888227664607 0.0437933928435187 0.00153461557171937 0.00433421136787607 435448 1928160 667 665 0 True 359 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 402 545 0.0101661002870046 0.0792803478139157 0.0101319905394064 0.0754100862134737 0.00172340023387333 0.013497401625943 444379 3455099 667 665 0 True 404 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 446 542 0.0101808560128267 0.0572514830220435 0.0102082856488899 0.0562600137331197 0.00197392929102794 0.00912342182593117 445024 2495064 667 665 0 True 448 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 490 543 0.0103085788302919 0.0503437123364603 0.0103913939116503 0.0508430609597925 0.0019584625139298 0.00603380725714759 450607 2194018 667 665 0 True 493 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 538 541 0.0102186718497012 0.0349288189574417 0.01025406271458 0.0381628137636378 0.00196546259350129 0.0105628990013803 446677 1522225 667 665 0 False 538 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 579 543 0.00999907462153565 0.0458099242154367 0.0100404364080262 0.0458686198214694 0.00171215511596695 0.00554390639740656 437078 1996432 667 665 0 True 583 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 622 542 0.00986286440208598 0.0502940574140777 0.00985732814526589 0.0494239719233997 0.00181015693122141 0.0057938598558374 431124 2191854 667 665 0 True 628 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 224 586 0.00931996807730262 0.00896741739907104 0.0093690394445716 0.00898756389715419 0.00134372310586683 0.00131412156662032 407393 390807 667 665 0 False 224 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 269 585 0.00917712350050656 0.00929363922509409 0.00915541313801785 0.00929274433508812 0.00136613558411648 0.00126397802593373 401149 405024 667 665 0 False 269 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 313 589 0.00969730287065211 0.063012234178947 0.0098115510795758 0.0592965590905623 0.00153293130311917 0.0105727834303697 423887 2746122 667 665 0 True 314 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 356 587 0.00992541037789643 0.0646879501339754 0.00996414129854276 0.0632028686961166 0.00150616449294861 0.0147828354920428 433858 2819151 667 665 0 True 359 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 404 585 0.00995519635467229 0.00970324644295564 0.0098268101014725 0.00968947890440223 0.00169671058355637 0.00145948528364184 435160 422875 667 665 0 False 404 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 449 585 0.0097832978681179 0.0100447043449778 0.0097962920576791 0.0100862134737163 0.00202829724210053 0.00199426919934223 427646 437756 667 665 0 False 449 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 493 585 0.00989379423357673 0.00981896260449705 0.00991836423285267 0.0097962920576791 0.00208269440723502 0.00216012174575936 432476 427918 667 665 0 False 493 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 538 584 0.00971317957409485 0.00966735905912641 0.00970473792629892 0.00964370183871214 0.00210671830508738 0.00194676400406726 424581 421311 667 665 0 False 538 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 583 584 0.00967252697752749 0.00969964393703416 0.00967421988250553 0.00975051499198901 0.0017745383383721 0.00172962631916979 422804 422718 667 665 0 False 583 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 628 584 0.00981443359345733 0.00979564957254661 0.00984206912336919 0.00990310521095598 0.00155454701952889 0.00168634498578591 429007 426902 667 665 0 False 628 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 224 634 0.00935046324400171 0.0359212978658594 0.0093842984664683 0.0367895017929351 0.00137035528871341 0.00698505007392666 408726 1565478 667 665 0 True 225 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 269 629 0.0092778055925116 0.00921846846459247 0.00929274433508812 0.00917067215991455 0.00140101102702485 0.00138053068960409 405550 401748 667 665 0 False 269 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 314 629 0.00928011617903568 0.0092704409226316 0.00921644922560464 0.00924696726939803 0.00142760918199322 0.00135986372912936 405651 404013 667 665 0 False 314 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 359 629 0.00954853312643289 0.00924777037581365 0.00950637064164187 0.00924696726939803 0.00141894753238338 0.00137048482323736 417384 403025 667 665 0 False 359 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 404 629 0.00968135753592647 0.00925346095841572 0.00976577401388571 0.00929274433508812 0.00159493107743608 0.00141887677903583 423190 403273 667 665 0 False 404 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 449 628 0.00942705575571107 0.00952550752023111 0.00950637064164187 0.00958266575112535 0.00183679146498782 0.0018838744698804 412074 415129 667 665 0 False 449 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 494 628 0.00957035787439309 0.00950678366779847 0.00949111161974517 0.00941481651026169 0.0018777806006387 0.00189490399150502 418338 414313 667 665 0 False 494 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 538 628 0.00976067242185728 0.00954590642318775 0.00976577401388571 0.00961318379491875 0.00182034873195529 0.00177158470526049 426657 416018 667 665 0 False 538 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 583 628 0.00971617647344787 0.00965703340521136 0.00964370183871214 0.00975051499198901 0.00160643813152647 0.0014981266381801 424712 420861 667 665 0 False 583 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 623 632 0.0100586008208988 0.0411388966809333 0.0100556954299229 0.0410009918364233 0.00149677769421202 0.007504715414079 439680 1792865 667 665 0 True 628 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A12_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A12_2.csv new file mode 100755 index 0000000..5115a3e --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A12_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 224 236 0.00824835922620059 0.703751390377982 0.00822461280231937 0.696299687190051 0.00254648626164027 0.17088292799948 360551 30670031 667 665 6 True 223 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 268 236 0.00651075240589822 0.00619500226877562 0.00642404821850919 0.00625619897764553 0.00168300318206033 0.00151030774104675 284597 269983 667 665 0 False 268 236 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 312 236 0.00607759750246186 0.00601331665166579 0.00608834973678187 0.00607309071488518 0.00126254784647107 0.00123408039107641 265663 262065 667 665 0 True 313 236 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 355 236 0.0059782880361147 0.00603589541489338 0.00602731364919509 0.00602731364919509 0.00124509052273637 0.0012314690042089 261322 263049 667 665 0 True 357 236 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 401 236 0.00582869471650076 0.00581478874572561 0.00579842832074464 0.00582894636453803 0.00132910169492618 0.00128519055663035 254783 253413 667 665 0 True 402 236 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 444 235 0.00587371683807902 0.00577316488749913 0.0059662775616083 0.00581368734264134 0.0014329481119241 0.00152655992301441 256751 251599 667 665 0 True 447 236 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 490 234 0.00618832263886368 0.00609521056016099 0.00621042191195544 0.00608834973678187 0.00158647989547462 0.00152063902567341 270503 265634 667 665 0 True 492 235 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 533 234 0.00635338087422299 0.00645513990974231 0.00643930724040589 0.00642404821850919 0.00144024471036796 0.00153412359170962 277718 281320 667 665 0 True 537 235 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 582 235 0.00981653828613274 0.00742712813161308 0.00737010757610437 0.00737010757610437 0.0121857741524298 0.00181272808648678 429099 323680 667 665 0 False 582 235 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 620 234 0.00954704611530353 0.78876575737811 0.00961318379491875 0.794720378423743 0.00236516473583534 0.156762404523109 417319 34375023 667 665 15 True 626 235 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 223 280 0.00654067564523987 0.00606600043253017 0.00651560234988937 0.00611886778057527 0.00180999713929204 0.00147758522540437 285905 264361 667 665 0 False 223 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 268 280 0.0064109167663822 0.00604321515622428 0.0063935301747158 0.00613412680247196 0.00146399270320669 0.00132641322350948 280233 263368 667 665 0 False 268 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 313 280 0.00611436099299858 0.00646190894953107 0.00608834973678187 0.00654612039368277 0.00122219112328839 0.00136759546987042 267270 281615 667 665 0 True 313 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 357 281 0.00592402356844009 0.00624323454550774 0.0059510185397116 0.00622568093385214 0.00122013230173219 0.00129752804399938 258950 272085 667 665 0 True 358 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 401 281 0.00607508102208909 0.00608298039674604 0.00610360875867857 0.00610360875867857 0.00133369881111176 0.00135368112011152 265553 265101 667 665 0 True 402 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 446 281 0.00617018110308545 0.00607295303949964 0.00625619897764553 0.00602731364919509 0.00163336103328046 0.00175986885743242 269710 264664 667 665 0 True 447 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 489 280 0.00632645453423437 0.00646163359876 0.00630197604333562 0.00654612039368277 0.00163315085920374 0.00166219969464237 276541 281603 667 665 0 True 492 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 534 280 0.00669809293110369 0.00632923576967137 0.00675974670023652 0.00643930724040589 0.00151941991174477 0.00153873187971228 292786 275833 667 665 0 True 537 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 582 279 0.00712209699682088 0.00664522372536973 0.00709544518196384 0.00662241550316625 0.00174603831211121 0.00184686394861553 311320 289604 667 665 0 False 582 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 627 279 0.00769770756645024 0.00838929550931575 0.0076600289921416 0.00802624551766232 0.00201898868315527 0.00267559518754619 336481 365612 667 665 0 False 627 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 224 325 0.00570341974812548 0.00584012101666388 0.00564583810177768 0.00584420538643473 0.00143407969163247 0.00138551852547857 249307 254517 667 665 0 True 223 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 268 324 0.00591494136200382 0.00600540031699758 0.00581368734264134 0.00608834973678187 0.00149752611043765 0.00144513618607381 258553 261720 667 665 0 True 268 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 311 325 0.00587120035770625 0.00617804525045734 0.00587472343022812 0.00625619897764553 0.00124411708351812 0.00121847200374459 256641 269244 667 665 0 True 313 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 356 325 0.00588824379295818 0.00576862159977651 0.00590524147402152 0.00582894636453803 0.00126732630381187 0.0013342792375823 257386 251401 667 665 0 True 358 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 401 325 0.00622252389483903 0.00956437787074691 0.00619516289005875 0.00662241550316625 0.00142204478420324 0.00904656795729267 271998 416823 667 665 0 True 403 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 445 323 0.00635793341598827 0.00638187365874058 0.0064087891966125 0.00643930724040589 0.00157704522520683 0.0016209278096536 277917 278127 667 665 0 True 447 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 489 324 0.0065925151409189 0.00662925338064777 0.00650034332799268 0.00659189745937285 0.00162040347625883 0.00150277511821973 288171 288908 667 665 0 True 492 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 533 322 0.00707659445626237 0.00754697455472052 0.00717174029144732 0.00756847486076143 0.00163556469438458 0.00171530312433801 309331 328903 667 665 0 True 537 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 577 323 0.00766410111492663 0.00783359176150493 0.00775158312352178 0.00784313725490196 0.00185370355894362 0.0018647479715855 335012 341394 667 665 0 True 582 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 622 323 0.00776908410065967 0.0082575631112572 0.00781261921110857 0.00827038986800946 0.00205488454499767 0.00210433546433202 339601 359871 667 665 0 True 627 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 224 369 0.00582146555470262 0.00604679471624816 0.00573739223315786 0.00611886778057527 0.00158826379078277 0.00152908480396826 254467 263524 667 665 0 True 224 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 267 369 0.00584203206247643 0.00588679297235995 0.00582894636453803 0.00588998245212482 0.00146946094134158 0.00142633856370458 255366 256551 667 665 0 True 268 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 312 369 0.00604536367659613 0.00596393708005422 0.00607309071488518 0.0059510185397116 0.00123194310535383 0.00133503199253778 264254 259913 667 665 0 True 313 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 357 370 0.00635619475682164 0.00632728536837631 0.00636301213092241 0.00634775310902571 0.00135139634755937 0.00136077955048816 277841 275748 667 665 0 True 358 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 401 369 0.00643871243595415 0.0068978810037224 0.00643930724040589 0.00698863202868696 0.00143856499376737 0.00145989455866104 281448 300615 667 665 0 True 403 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 445 368 0.00673522245514917 0.00683149852199737 0.00675974670023652 0.00677500572213321 0.00164450346210234 0.0017638616110496 294409 297722 667 665 0 True 448 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 490 367 0.00682286460340441 0.00673872825804497 0.00686655985351339 0.00675974670023652 0.00170205007618599 0.0017590362707288 298240 293679 667 665 0 True 492 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 534 367 0.00691611163976263 0.00677787395933184 0.00695811398489357 0.00677500572213321 0.00164776296935972 0.00166484560761887 302316 295385 667 665 0 True 537 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 577 368 0.00703893875904803 0.00688356276362685 0.00708018616006714 0.00694285496299687 0.0018415334890197 0.00184712053771616 307685 299991 667 665 0 True 582 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 622 369 0.00707972861818118 0.00685834522217652 0.00704966811627375 0.00688181887541009 0.00198460437672947 0.00197158512100485 309468 298892 667 665 0 True 627 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 223 415 0.00622725945335869 0.00625826410842855 0.00624093995574884 0.00642404821850919 0.00153550799968956 0.00146070145550798 272205 272740 667 665 0 True 224 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 268 412 0.0060412915538111 0.0061647595757533 0.00604257267109178 0.00614938582436866 0.00144559156105326 0.00143773041638991 264076 268665 667 665 0 True 269 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 313 414 0.00654744726515204 0.00633068136121948 0.00653086137178607 0.00633249408712902 0.0014092143261102 0.00138678013528363 286201 275896 667 665 0 True 313 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 357 413 0.00654776754447221 0.00663611420402689 0.00659189745937285 0.00668345159075303 0.00141499146962509 0.001243337268341 286215 289207 667 665 0 True 358 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 402 413 0.00701203529615371 0.00703544165976856 0.00698863202868696 0.00703440909437705 0.00155586839293864 0.00145179458362953 306509 306610 667 665 0 True 403 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 446 412 0.00722058288777333 0.00711315941490256 0.00720225833524071 0.00709544518196384 0.00155598114208271 0.00162837330760895 315625 309997 667 665 0 True 448 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 490 412 0.00717999892248886 0.00696316208236315 0.0072327763790341 0.00700389105058366 0.00170139970123077 0.00169071698232163 313851 303460 667 665 0 True 493 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 533 412 0.00723920484253181 0.00732267840578787 0.00718699931334401 0.00740062561989776 0.00163422748333025 0.0015268993454876 316439 319128 667 665 0 True 537 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 578 412 0.0069588918060997 0.00758233418290519 0.00692759594110018 0.00756847486076143 0.00172806141107346 0.00210559382317876 304186 330444 667 665 0 True 582 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 621 413 0.00643608157010989 0.00658909805986699 0.00650034332799268 0.00662241550316625 0.00183176378015048 0.00187954473896405 281333 287158 667 665 0 True 627 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 224 457 0.00628136378137322 0.00640112526681776 0.00622568093385214 0.00627145799954223 0.0015192528765344 0.00157013479973199 274570 278966 667 665 0 True 224 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 270 458 0.00661408824084181 0.00686851025480846 0.00656137941557946 0.00689707789730678 0.00162198561755765 0.00153359150551813 289114 299335 667 665 0 True 269 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 314 459 0.00656947790696092 0.00708998405833765 0.00653086137178607 0.00711070420386053 0.00155065058079526 0.00160649311156743 287164 308987 667 665 0 True 314 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 359 457 0.00685365717232938 0.00690155234733664 0.0068207827878233 0.00691233691920348 0.00149377150268309 0.00141829913466535 299586 300775 667 665 0 True 358 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 402 458 0.00704415473654795 0.00731492269240279 0.00698863202868696 0.00721751735713741 0.00162301108801141 0.00164281229345439 307913 318790 667 665 0 True 403 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 447 456 0.00746907388603707 0.0073786205041099 0.00753795681696803 0.00741588464179446 0.00189114698383164 0.00210346183281389 326487 321566 667 665 0 True 448 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 491 456 0.00727317732756419 0.00720643448860191 0.00735484855420768 0.0072632944228275 0.00188585609688043 0.00189484159885526 317924 314062 667 665 0 True 493 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 534 455 0.00683739155828357 0.00700554315521007 0.00683604180972 0.00701915007248035 0.00175578574785444 0.0017027264954563 298875 305307 667 665 0 True 538 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 580 456 0.00650718357918775 0.00632496783271982 0.00656137941557946 0.00636301213092241 0.00182591779464983 0.00200687369585001 284441 275647 667 665 0 True 582 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 623 457 0.00611575649575075 0.00574138481933834 0.00608834973678187 0.00582894636453803 0.00174195902163798 0.00170970877388552 267331 250214 667 665 0 True 627 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 225 501 0.00631563366863147 0.00640780252301617 0.00631723506523232 0.0063782711528191 0.00144132038735787 0.00135582656025977 276068 279257 667 665 0 True 224 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 270 501 0.00632583685268833 0.00644568619993564 0.00631723506523232 0.00653086137178607 0.00147160103560913 0.00145889442428425 276514 280908 667 665 0 True 269 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 313 503 0.00659706768268418 0.00639295652727608 0.00659189745937285 0.0064087891966125 0.00164315119381614 0.00155601908524498 288370 278610 667 665 0 True 314 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 359 502 0.00690890535505879 0.00708367393650067 0.00679026474402991 0.0068207827878233 0.00179954047152907 0.00230131898316998 302001 308712 667 665 0 True 359 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 402 503 0.00694226015854513 0.00719069360285585 0.00701915007248035 0.00721751735713741 0.00171116209670293 0.00167928218969881 303459 313376 667 665 0 True 403 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 446 502 0.00729559687997613 0.00754332615700386 0.00714122224765393 0.00753795681696803 0.00255321382744922 0.00187247121163867 318904 328744 667 665 0 True 448 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 490 500 0.00695589490674667 0.00660091519712534 0.00674448767833982 0.00654612039368277 0.00251715066492713 0.00178359279454974 304055 287673 667 665 0 True 493 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 536 500 0.00615402987451113 0.00624906280349535 0.00617990386816205 0.00621042191195544 0.00171018385057873 0.00159395255531467 269004 272339 667 665 0 True 538 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 579 500 0.00612865917693476 0.00611446216823817 0.00622568093385214 0.00621042191195544 0.00180463398485579 0.00182861586583554 267895 266473 667 665 0 True 583 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 622 502 0.00600153116392136 0.00608949703166132 0.00604257267109178 0.00614938582436866 0.00180591324903084 0.00185326791855815 262338 265385 667 665 0 True 627 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 226 544 0.00614192789162754 0.00619550707852258 0.00622568093385214 0.00625619897764553 0.0014682321576884 0.00130138941202101 268475 270005 667 665 0 True 224 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 270 545 0.00624208381046373 0.00646670464212718 0.00622568093385214 0.0064087891966125 0.00142297739709064 0.00147086328306935 272853 281824 667 665 0 True 269 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 313 545 0.00632906252298433 0.00661319125233546 0.00628671702143893 0.00660715648126955 0.00147519471276664 0.00137029394421869 276655 288208 667 665 0 True 314 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 357 545 0.00647561318905665 0.00686380634580271 0.00650034332799268 0.00688181887541009 0.00147621742037676 0.00140202465085014 283061 299130 667 665 0 True 359 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 402 545 0.00649261087011999 0.00652650165124416 0.00654612039368277 0.00651560234988937 0.00167546831902775 0.00149710991247074 283804 284430 667 665 0 True 404 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 446 542 0.0063772874377643 0.00610594924023265 0.00636301213092241 0.00616464484626535 0.00195146136276112 0.00198539783587628 278763 266102 667 665 0 True 448 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 490 543 0.00658574352100672 0.00630879097491956 0.00651560234988937 0.00645456626230259 0.00192362625758022 0.00201929530436408 287875 274942 667 665 0 True 493 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 538 541 0.00637538863893757 0.00636092405424181 0.0063935301747158 0.00627145799954223 0.00184709844242267 0.001863950066385 278680 277214 667 665 0 False 538 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 579 543 0.00635088727094452 0.00664701350538167 0.00627145799954223 0.00669871061264973 0.00162587571719377 0.00163971459084029 277609 289682 667 665 0 True 583 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 622 542 0.00632089540031998 0.00643402968396042 0.00636301213092241 0.00643930724040589 0.00172045374814218 0.00175146274533723 276298 280400 667 665 0 True 628 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 224 586 0.00665757759710211 0.00656509665098888 0.00665293354695964 0.00651560234988937 0.00129288057577511 0.00127833796253896 291015 286112 667 665 0 False 224 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 269 585 0.00654701260036038 0.00661929486109414 0.00662241550316625 0.00666819256885634 0.00129511851943319 0.00125161025907309 286182 288474 667 665 0 False 269 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 313 589 0.00633862514840085 0.0066782887637955 0.0063935301747158 0.00666819256885634 0.00136757337621789 0.00134472610311424 277073 291045 667 665 0 True 314 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 356 587 0.00652042941678623 0.00618974765822774 0.00642404821850919 0.00617990386816205 0.00136718634407932 0.00134340501528466 285020 269754 667 665 0 True 359 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 404 585 0.00630360031703077 0.00611700916287056 0.00630197604333562 0.00605783169298848 0.00156899639668309 0.00142391134093769 275542 266584 667 665 0 False 404 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 449 585 0.00619184571138555 0.00644038569759257 0.00625619897764553 0.0064087891966125 0.00189896406244172 0.00189413130261368 270657 280677 667 665 0 False 449 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 493 585 0.00626864411694359 0.00646027979080225 0.00624093995574884 0.00645456626230259 0.00202039578455938 0.00200076274016945 274014 281544 667 665 0 False 493 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 538 584 0.00640432816322441 0.0063396302612792 0.00643930724040589 0.00634775310902571 0.00183101952300695 0.00177239728513818 279945 276286 667 665 0 False 538 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 583 584 0.00674377848841658 0.00656814845536822 0.00683604180972 0.00660715648126955 0.00163095569770615 0.00178784987428045 294783 286245 667 665 0 False 583 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 628 584 0.00680865792784542 0.00692055155054035 0.00688181887541009 0.00688181887541009 0.00158158136971697 0.00144141328381627 297619 301603 667 665 0 False 628 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 224 634 0.00993961705345542 0.718506199121057 0.00883497367818723 0.726237888151369 0.00393834553946986 0.181544480345717 434479 31313057 667 665 6 True 225 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 269 629 0.007316552298353 0.00706143936173691 0.00706492713817044 0.00704966811627375 0.0020472790019803 0.00138088101055215 319820 307743 667 665 0 False 269 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 314 629 0.00617127920361174 0.00622038043150908 0.00613412680247196 0.00624093995574884 0.0012782847912966 0.00127946731611668 269758 271089 667 665 0 False 314 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 359 629 0.00633533084682195 0.00590937173558754 0.00625619897764553 0.00601205462729839 0.00136154145962948 0.00127932644749976 276929 257535 667 665 0 False 359 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 404 629 0.00613325747288864 0.0059963596333475 0.00614938582436866 0.00593575951781491 0.00142135044765408 0.00133412321122405 268096 261326 667 665 0 False 404 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 449 628 0.00598318373429445 0.00607481165720435 0.00599679560540169 0.00614938582436866 0.00182494281949013 0.00182633705472057 261536 264745 667 665 0 False 449 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 494 628 0.00622584107351223 0.0061210935326414 0.00610360875867857 0.00602731364919509 0.00192139127212156 0.00175551882619072 272143 266762 667 665 0 False 494 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 538 628 0.00653754148332105 0.00643336425293033 0.00660715648126955 0.0064087891966125 0.00185931419879468 0.00189643134178135 285768 280371 667 665 0 False 538 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 583 628 0.00809542585081915 0.00726301907205643 0.00773632410162509 0.00729381246662089 0.00288534274168689 0.00148250447332961 353866 316528 667 665 0 False 583 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 623 632 0.00970407449056428 0.772310497002405 0.00949111161974517 0.766720073243305 0.00237043747503359 0.170547278920087 424183 33657890 667 665 15 True 628 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A12_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A12_3.csv new file mode 100755 index 0000000..c9b1abd --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A12_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 224 236 0.00119686094238301 0.0705350008117111 0.000839246204318303 0.069413290608072 0.00110783037510288 0.018131718020833 52317 3073970 667 665 0 True 223 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 268 236 0.00106408228707802 0.00107118333714809 0.000854505226215 0.00080872816052491 0.000880809380766402 0.00084878616297881 46513 46683 667 665 0 False 268 236 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 312 236 0.00101565147844938 0.00100523682747725 0.000869764248111696 0.000885023270008392 0.000724051225528582 0.000654216780940538 44396 43809 667 665 0 True 313 236 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 355 236 0.00102587753960054 0.00103944916078248 0.000885023270008392 0.000946059357595178 0.000699896045700686 0.000637215785122416 44843 45300 667 665 0 True 357 236 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 401 236 0.000949033379853905 0.00099667800767655 0.000793469138628214 0.000854505226215 0.000718545261810621 0.000733271065195603 41484 43436 667 665 0 True 402 236 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 444 235 0.000880310588583026 0.000821784376253061 0.000686655985351339 0.00064087891966125 0.00076181884002372 0.000800140006391068 38480 35814 667 665 0 True 447 236 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 490 234 0.000945212905106156 0.000896565056495668 0.000747692072938125 0.000732433051041428 0.000830617097663059 0.000788749102580136 41317 39073 667 665 0 True 492 235 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 533 234 0.000988244719480498 0.000963154051298996 0.00080872816052491 0.000747692072938125 0.000810921612539555 0.000836876380402708 43198 41975 667 665 0 True 537 235 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 582 235 0.00126233518626359 0.000993327906628553 0.000900282291905089 0.000732433051041428 0.00142368840723735 0.000902901246637317 55179 43290 667 665 0 False 582 235 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 620 234 0.00120697261806268 0.0812699407020642 0.000946059357595178 0.0795452811474784 0.0010751061245178 0.0197931312071643 52759 3541807 667 665 0 True 626 235 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 223 280 0.000931029106641461 0.000965196236184418 0.000701915007248035 0.000671396963454643 0.000849096847714403 0.000884753426878312 40697 42064 667 665 0 False 223 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 268 280 0.000984149719601174 0.000959987517431712 0.000778210116731518 0.00080872816052491 0.00080713982407731 0.000753680836941447 43019 41837 667 665 0 False 268 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 313 280 0.000935375754558061 0.00107421219562984 0.000823987182421607 0.000976577401388571 0.0006953092532085 0.000664084702233334 40887 46815 667 665 0 True 313 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 357 281 0.000979734440401681 0.000991974098670801 0.000839246204318303 0.000839246204318303 0.00072289493131396 0.000725621328451188 42826 43231 667 665 0 True 358 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 401 281 0.000884314080085158 0.000933898031872999 0.000717174029144732 0.000778210116731518 0.000721170415969273 0.00072685112803584 38655 40700 667 665 0 True 402 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 446 281 0.000909341621247056 0.000897551730091996 0.000625619897764553 0.000610360875867857 0.000868392124183992 0.000869866634180767 39749 39116 667 665 0 True 447 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 489 280 0.000903553716389688 0.000911801132494776 0.000625619897764553 0.000656137941557946 0.000862851846750119 0.000854668095142155 39496 39737 667 665 0 True 492 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 534 280 0.000898680895304236 0.00091239772583209 0.000732433051041428 0.000701915007248035 0.000774526632235325 0.000806782296840119 39283 39763 667 665 0 True 537 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 582 279 0.00101475927177176 0.000961685513853299 0.000762951094834821 0.000656137941557946 0.000932756287353333 0.000956902372033933 44357 41911 667 665 0 False 582 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 627 279 0.00111276474374394 0.00120527916265831 0.000823987182421607 0.000854505226215 0.00104847744248957 0.00112496315914716 48641 52527 667 665 0 False 627 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 224 325 0.00106444832058679 0.00090328820448925 0.000854505226215 0.000732433051041428 0.000863336341719369 0.000744388101695642 46529 39366 667 665 0 True 223 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 268 324 0.00101388994218844 0.000933462059818808 0.000854505226215 0.000762951094834821 0.000814199240438167 0.000726018296131326 44319 40681 667 665 0 True 268 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 311 325 0.00106595820881045 0.000978068884731857 0.000946059357595178 0.000915541313801785 0.000734416257354208 0.000630899146253853 46595 42625 667 665 0 True 313 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 356 325 0.000992339719359821 0.00091262718480798 0.00080872816052491 0.000823987182421607 0.000762425031840104 0.000651174526531941 43377 39773 667 665 0 True 358 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 401 325 0.00101281471875644 0.00113180639857827 0.000823987182421607 0.000839246204318303 0.000748828363769371 0.00105359192040107 44272 49325 667 665 0 True 403 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 445 323 0.000920116732661364 0.000939405047294363 0.000656137941557946 0.000686655985351339 0.000848132668158484 0.000871723017763834 40220 40940 667 665 0 True 447 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 489 324 0.000971201284228565 0.000943971280914578 0.000717174029144732 0.000762951094834821 0.00086250827237436 0.000842711712122202 42453 41139 667 665 0 True 492 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 533 322 0.000988519244612073 0.0010584254180886 0.000823987182421607 0.000900282291905089 0.000838881438846817 0.000863365157098456 43210 46127 667 665 0 True 537 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 577 323 0.000958733267836212 0.0010951847460262 0.000732433051041428 0.000854505226215 0.00090797084038411 0.00100140420273132 41908 47729 667 665 0 True 582 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 622 323 0.00108268136474221 0.00110989306638076 0.000747692072938125 0.000686655985351339 0.00109421351522083 0.00117402141356848 47326 48370 667 665 0 True 627 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 224 369 0.000928924413966054 0.000940804747047293 0.000732433051041428 0.000793469138628214 0.00083372692953291 0.000818681954093647 40605 41001 667 665 0 True 224 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 267 369 0.000985545222353346 0.00104452020414965 0.000869764248111696 0.000900282291905089 0.00078147751226547 0.000853872496054728 43080 45521 667 665 0 True 268 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 312 369 0.000955804999766082 0.000982841631430373 0.000823987182421607 0.000869764248111696 0.000747646532603184 0.000743447190239776 41780 42833 667 665 0 True 313 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 357 370 0.00103015555623424 0.000958128899727001 0.000869764248111696 0.00080872816052491 0.000797587035287265 0.000741269359225929 45030 41756 667 665 0 True 358 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 401 369 0.000931097737924354 0.000959735112558232 0.000732433051041428 0.00080872816052491 0.000763624927277555 0.000736640582617367 40700 41826 667 665 0 True 403 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 445 368 0.000883948046576391 0.00092756496413843 0.000625619897764553 0.000625619897764553 0.000863472907167873 0.000879004251006988 38639 40424 667 665 0 True 448 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 490 367 0.000914122933955316 0.000908978787091326 0.000610360875867857 0.000549324788281071 0.000888945933893888 0.000926350230622076 39958 39614 667 665 0 True 492 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 534 367 0.000854276455272021 0.00099130866764072 0.000610360875867857 0.000732433051041428 0.000828405833697053 0.000946232584097612 37342 43202 667 665 0 True 537 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 577 368 0.00106209197987411 0.00104160607515585 0.000747692072938125 0.000656137941557946 0.00106832425624906 0.00107951537757595 46426 45394 667 665 0 True 582 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 622 369 0.00111191829125492 0.00101682450575971 0.000732433051041428 0.000549324788281071 0.00113976986182787 0.00110483578431881 48604 44314 667 665 0 True 627 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 223 415 0.000983943825752493 0.00102591108120496 0.000839246204318303 0.000930800335698482 0.000839462375776154 0.000791347529249841 43010 44710 667 665 0 True 224 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 268 412 0.000992797261245779 0.00101980747244628 0.000839246204318303 0.000823987182421607 0.000807321583471738 0.000877226581706658 43397 44444 667 665 0 True 269 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 313 414 0.00101240293105908 0.000998559571278849 0.000915541313801785 0.000869764248111696 0.00073095916596651 0.000711031151228735 44254 43518 667 665 0 True 313 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 357 413 0.00100098726100443 0.00100023462180285 0.000900282291905089 0.000915541313801785 0.000745748055391749 0.000715148894817845 43755 43591 667 665 0 True 358 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 402 413 0.00100265728888817 0.000907418466055273 0.000793469138628214 0.000686655985351339 0.000834745352927724 0.000818976018077702 43828 39546 667 665 0 True 403 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 446 412 0.00096266812805545 0.000862880478834991 0.000701915007248035 0.000610360875867857 0.000861921534973022 0.00083753680087718 42080 37605 667 665 0 True 448 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 490 412 0.000982411060434534 0.000971253953147919 0.000686655985351339 0.000762951094834821 0.000889948946674435 0.000871990384199399 42943 42328 667 665 0 True 493 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 533 412 0.000966740250840476 0.000973961569063423 0.000762951094834821 0.000732433051041428 0.000893759978913602 0.000877933561285645 42258 42446 667 665 0 True 537 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 578 412 0.00105177441034575 0.00105179405368537 0.000762951094834821 0.000732433051041428 0.0010026217971322 0.00104234972656987 45975 45838 667 665 0 True 582 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 621 413 0.00103077323778029 0.00100624644697117 0.000701915007248035 0.000701915007248035 0.00101219434877984 0.000950677042103367 45057 43853 667 665 0 True 627 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 224 457 0.000980008965533255 0.000976347942412681 0.000823987182421607 0.00080872816052491 0.000786596099352819 0.000814267046420963 42838 42550 667 665 0 True 224 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 270 458 0.000987993071443221 0.000993740932785156 0.00080872816052491 0.000900282291905089 0.000858238636578441 0.000811312942061175 43187 43308 667 665 0 True 269 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 314 459 0.000972184999283375 0.00101902731192825 0.000854505226215 0.000946059357595178 0.000784953802996529 0.000810255085439522 42496 44410 667 665 0 True 314 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 359 457 0.000923388157145964 0.00109513885423102 0.000778210116731518 0.000991836423285267 0.000776570572395457 0.000844501631601089 40363 47727 667 665 0 True 358 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 402 458 0.000966854636311965 0.000972447139822548 0.000717174029144732 0.000747692072938125 0.000893301208424551 0.000868973720343723 42263 42380 667 665 0 True 403 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 447 456 0.00083938346688409 0.00101877490705477 0.0004272526131075 0.000579842832074464 0.00100203241712618 0.00116063562840097 36691 44399 667 665 0 True 448 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 491 456 0.000947843770950414 0.000991790531490089 0.000610360875867857 0.000534065766384375 0.000971971618537931 0.00105280849219683 41432 43223 667 665 0 True 493 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 534 455 0.000893602180370103 0.000990689128405816 0.000656137941557946 0.000701915007248035 0.000870642599664451 0.000955187066752554 39061 43175 667 665 0 True 538 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 580 456 0.000980443630324915 0.000970749143400961 0.000610360875867857 0.000518806744487678 0.0010160103215031 0.00108310805439323 42857 42306 667 665 0 True 582 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 623 457 0.00102681550046675 0.000946174087083123 0.000671396963454643 0.000549324788281071 0.000984539060252692 0.000969708729265579 44884 41235 667 665 0 True 627 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 225 501 0.000963057038658515 0.000940276991402746 0.000823987182421607 0.000823987182421607 0.000740598350136305 0.000730604778960541 42097 40978 667 665 0 True 224 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 270 501 0.00101935756772564 0.00097565956548501 0.000885023270008392 0.00080872816052491 0.000819828152072984 0.000865623444141649 44558 42520 667 665 0 True 269 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 313 503 0.00098419547378977 0.0009896795089119 0.000839246204318303 0.000915541313801785 0.000824727548610675 0.000763925836374729 43021 43131 667 665 0 True 314 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 359 502 0.00106078798549912 0.00100030345949561 0.000946059357595178 0.000869764248111696 0.000813009845802498 0.000793573325273664 46369 43594 667 665 0 True 359 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 402 503 0.00090961614637863 0.000971047440069618 0.000671396963454643 0.000732433051041428 0.000825814144453567 0.000882075680721415 39761 42319 667 665 0 True 403 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 446 502 0.000933934497617293 0.000944108956300112 0.000549324788281071 0.000488288700694286 0.0010098194838362 0.00102673615765297 40824 41145 667 665 0 True 448 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 490 500 0.000892160923429336 0.000878804931761769 0.000518806744487678 0.000488288700694286 0.000901817055919787 0.00090071224249698 38998 38299 667 665 0 True 493 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 536 500 0.000980100473910447 0.000928918772096182 0.000671396963454643 0.000671396963454643 0.00090372538834126 0.000879556316505413 42842 40483 667 665 0 True 538 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 579 500 0.000948049664799095 0.0009280468279878 0.000579842832074464 0.000595101853971161 0.000961307603988516 0.000955372913133111 41441 40445 667 665 0 True 583 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 622 502 0.000894013968067465 0.000955145933040429 0.000549324788281071 0.000625619897764553 0.000924780402407865 0.000926645224218878 39079 41626 667 665 0 True 627 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 226 544 0.000972276507660567 0.000969900145190167 0.000762951094834821 0.000839246204318303 0.0007974312840543 0.000717650525529767 42500 42269 667 665 0 True 224 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 270 545 0.00110546695066292 0.000952369479432158 0.000961318379491875 0.000793469138628214 0.000818774386231469 0.000758711598215643 48322 41505 667 665 0 True 269 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 313 545 0.000954706899239783 0.000975269485225997 0.000839246204318303 0.000839246204318303 0.000743362954908458 0.00078530074102216 41732 42503 667 665 0 True 314 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 357 545 0.000967472317858009 0.000978206560117391 0.000793469138628214 0.000854505226215 0.000787841768688139 0.000761102035151256 42290 42631 667 665 0 True 359 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 402 545 0.000903919749898454 0.000970863872888906 0.000671396963454643 0.000762951094834821 0.000842371655102531 0.000846251090952839 39512 42311 667 665 0 True 404 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 446 542 0.000863793326499945 0.000839682176372495 0.000457770656900893 0.000289921416037232 0.000945001414360999 0.00104619527430101 37758 36594 667 665 0 True 448 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 490 543 0.000866149667212628 0.000888052128490143 0.000457770656900893 0.000442511635004196 0.000962386033027398 0.00104376463197961 37861 38702 667 665 0 True 493 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 538 541 0.000900808465073941 0.000976416780105448 0.000488288700694286 0.000549324788281071 0.000951791560346287 0.00104397680464977 39376 42553 667 665 0 False 538 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 579 543 0.000959419580665149 0.00097845896499087 0.000671396963454643 0.000747692072938125 0.000923823238327612 0.00084021206480409 41938 42642 667 665 0 True 583 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 622 542 0.000983692177715216 0.000931947630577933 0.000747692072938125 0.000564583810177768 0.000914849018241304 0.000963831719990597 42999 40615 667 665 0 True 628 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 224 586 0.00102219432741858 0.00106026108989572 0.000869764248111696 0.000946059357595178 0.000748179785775386 0.000698868083667148 44682 46207 667 665 0 False 224 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 269 585 0.00104404195247307 0.00104185848002932 0.000930800335698482 0.000930800335698482 0.000749780220981644 0.000742910719263437 45637 45405 667 665 0 False 269 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 313 589 0.000994101255620759 0.00101783412525362 0.000900282291905089 0.000961318379491875 0.000738587891806874 0.00074424261544297 43454 44358 667 665 0 True 314 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 356 587 0.000971864719963205 0.000971850546485233 0.000839246204318303 0.000869764248111696 0.000742701606220732 0.000780896266715273 42482 42354 667 665 0 True 359 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 404 585 0.0009045145543502 0.000913636804301897 0.000701915007248035 0.000717174029144732 0.000803825954421271 0.000766446613975537 39538 39817 667 665 0 False 404 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 449 585 0.000889255532453503 0.000951176292757529 0.000442511635004196 0.000518806744487678 0.00100018114429245 0.0010583389345331 38871 41453 667 665 0 False 449 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 493 585 0.00097017181498516 0.000939405047294363 0.000473029678797589 0.000473029678797589 0.00108684198867088 0.00110616851184932 42408 40940 667 665 0 False 493 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 538 584 0.00087809151043613 0.000970473792629892 0.000442511635004196 0.000595101853971161 0.000989309042309804 0.000985244329487914 38383 42294 667 665 0 False 538 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 583 584 0.00101141921600427 0.00103469935998155 0.000747692072938125 0.000778210116731518 0.000902729615157899 0.000954374886952194 44211 45093 667 665 0 False 583 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 628 584 0.000996091562824676 0.00105229886343233 0.000793469138628214 0.000854505226215 0.000853878354248689 0.000831387583894225 43541 45860 667 665 0 False 628 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 224 634 0.00114314552497155 0.0720771257509762 0.000946059357595178 0.072129396505684 0.000845080856727496 0.0193071761427204 49969 3141177 667 665 0 True 225 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 269 629 0.00107675619731906 0.00108896640777958 0.000946059357595178 0.000930800335698482 0.000763274488516289 0.000769760013074895 47067 47458 667 665 0 False 269 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 314 629 0.00106236650500568 0.000970932710581673 0.000930800335698482 0.000869764248111696 0.000751725256453526 0.000728396115609033 46438 42314 667 665 0 False 314 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 359 629 0.000929862374832268 0.000912351834036912 0.00080872816052491 0.000839246204318303 0.000707961953428578 0.000653691763668948 40646 39761 667 665 0 False 359 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 404 629 0.00085841720933994 0.000902576881663991 0.000656137941557946 0.000732433051041428 0.000756381600196045 0.000718828122774196 37523 39335 667 665 0 False 404 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 449 628 0.00100974918812052 0.000919648629470219 0.000610360875867857 0.000549324788281071 0.00104881358905294 0.000955663946173793 44138 40079 667 665 0 False 449 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 494 628 0.001084969074172 0.000883761245640997 0.000732433051041428 0.000457770656900893 0.00108300010152463 0.000947764782627556 47426 38515 667 665 0 False 494 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 538 628 0.00102862279091628 0.000918157146126933 0.000732433051041428 0.000549324788281071 0.00097660339554831 0.000960262918372427 44963 40014 667 665 0 False 538 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 583 628 0.00113710597207691 0.00109651560808636 0.000946059357595178 0.000900282291905089 0.000893600157735389 0.000852579697588961 49705 47787 667 665 0 False 583 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 623 632 0.00121115912631919 0.0798159280095409 0.00108339055466545 0.0770885786221103 0.000801772759808599 0.0213645814178932 52942 3478440 667 665 0 True 628 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A1_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A1_1.csv new file mode 100755 index 0000000..b1ed63c --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A1_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 249 280 0.0110588331377914 0.0440312270720289 0.0107423514152743 0.0440985732814527 0.0025375704508995 0.00794929838935621 483402 1918915 667 665 0 True 248 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 292 279 0.0108432851553166 0.0117473587837756 0.0108186465247578 0.0107728694590677 0.00126217358371589 0.00492602862299648 473980 511959 667 665 0 False 292 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 337 280 0.0107820660509754 0.067718850800611 0.0108033875028611 0.0660563057907988 0.00131392355769566 0.0107382645511685 471304 2951240 667 665 0 True 337 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 382 281 0.0105947941570529 0.0876913042505554 0.0105592431525139 0.0873273823147936 0.00132235542385263 0.010950215267501 463118 3821655 667 665 0 True 382 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 426 281 0.0102331988045803 0.0756996404951495 0.0103303578240635 0.073334859235523 0.00173285635960833 0.0117205272362239 447312 3299049 667 665 0 True 427 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 469 281 0.0100368218271272 0.0674287687632907 0.010101472495613 0.0709086747539483 0.00172765939945271 0.0189327310510547 438728 2938598 667 665 0 True 472 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 514 279 0.0100606597593856 0.0809595285994799 0.0101625085831998 0.0786755168993667 0.0017394039121168 0.0197166884610637 439770 3528279 667 665 0 True 516 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 558 279 0.00980274339827111 0.0695723515701591 0.00988784618905928 0.0663767452506294 0.00179714807743425 0.0167240309328442 428496 3032017 667 665 0 True 561 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 606 278 0.00950943617227779 0.00975198352943471 0.00956740672922866 0.00988784618905928 0.002166324572941 0.00206474390622002 415675 424999 667 665 0 False 606 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 645 279 0.00941220852151173 0.0421315132647366 0.00946059357595178 0.0422369726100557 0.00192478768358677 0.00815106682149173 411425 1836124 667 665 0 True 651 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 248 323 0.0110201937255222 0.0108076554398126 0.0109407186999313 0.0107881284809644 0.00169097309195574 0.00139256049223959 481713 471006 667 665 0 False 248 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 292 323 0.0109828583076281 0.0107899641527715 0.0109864957656214 0.0108033875028611 0.00128463210538089 0.00130206853431343 480081 470235 667 665 0 False 292 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 337 324 0.0110123926363666 0.113076442536875 0.0109102006561379 0.108979934386206 0.00170881525315682 0.0280704829918257 481372 4927959 667 665 0 True 337 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 381 325 0.0105180415056834 0.0549185965600658 0.0104829480430304 0.0535744258793011 0.00135055284621443 0.00743420184945908 459763 2393395 667 665 0 True 382 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 426 325 0.0102130212074096 0.0804614878923103 0.0103150988021668 0.0786449988555734 0.00181770794649571 0.0123668831287364 446430 3506574 667 665 0 True 427 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 470 324 0.0101840359289341 0.0440220487129933 0.0102082856488899 0.0447089341573205 0.00183615122393755 0.00707622866327108 445163 1918515 667 665 0 True 472 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 514 323 0.00995952012549459 0.0441467826122872 0.00997940032043946 0.0464332036316472 0.00174693802102856 0.00804192182412682 435349 1923951 667 665 0 True 517 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 558 323 0.0100045880012614 0.0514238904654633 0.0101167315175097 0.0531013962005035 0.00193747517563163 0.0081435587294916 437319 2241093 667 665 0 True 561 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 606 322 0.00970370845705552 0.00963693279892338 0.00990310521095598 0.0098115510795758 0.00223594254817223 0.00226559433328872 424167 419985 667 665 0 False 606 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 651 321 0.00947555519562261 0.00948204799019751 0.00962844281681544 0.00967421988250553 0.00219577910744917 0.00208292861391379 414194 413235 667 665 0 False 651 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 249 369 0.0108652471658426 0.0590587248620521 0.0108186465247578 0.0562600137331197 0.00141365689819167 0.0112011910261132 474940 2573825 667 665 0 True 248 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 293 368 0.0109340157113021 0.0672035318325569 0.0108491645685512 0.0712901503013657 0.00137832767498659 0.0177860586176874 477946 2928782 667 665 0 True 293 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 337 366 0.0119229009894229 0.03096519049971 0.0110170138094148 0.0328374151216907 0.00357716794593256 0.0179107829764356 521172 1349487 667 665 0 False 337 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 381 369 0.0109348392866968 0.037295619456056 0.0105592431525139 0.0373846036469062 0.00250701226332232 0.00537506399287048 477982 1625372 667 665 0 True 382 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 425 368 0.010771359570844 0.0741750232757449 0.010605020218204 0.0710154879072251 0.00237292271909043 0.0113741968877009 470836 3232605 667 665 0 True 427 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 469 367 0.0104681923172083 0.0329968661640368 0.0104982070649271 0.0341039139391165 0.00197983892421807 0.00483883895532438 457584 1438029 667 665 0 True 472 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 514 367 0.0112789107849371 0.0304926656306594 0.0105897611963073 0.0308079652094301 0.00476084369155444 0.00341395709321406 493022 1328894 667 665 0 True 517 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 558 366 0.0131295762052597 0.0531612620473133 0.0105287251087205 0.0534218356603342 0.0137684809187582 0.00765540283327724 573918 2316809 667 665 0 True 562 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 602 368 0.00992440378574732 0.0622957255808324 0.00999465934233616 0.0613412680247196 0.00234876690143946 0.0131377672255299 433814 2714896 667 665 0 True 606 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 646 367 0.00985460577104444 0.0677774316771558 0.00993362325474937 0.0670481422140841 0.00221292723611059 0.0177884365681204 430763 2953793 667 665 0 True 651 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 249 412 0.0106910838469527 0.049726674204394 0.0107728694590677 0.0526131074998093 0.00143783108259917 0.0106193381934147 467327 2167127 667 665 0 True 248 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 293 412 0.0109358458788459 0.0358699449470552 0.0108339055466545 0.0354619668879225 0.00163853520649461 0.00485075486740827 478026 1563240 667 665 0 True 293 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 337 413 0.0109113216337585 0.0923744701648835 0.0108796826123445 0.0876630807965209 0.00130729777548079 0.0179061895875718 476954 4025751 667 665 0 True 338 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 382 413 0.010709156751448 0.0707998882534787 0.0107728694590677 0.0678873884184024 0.00149077296002037 0.0160843669321315 468117 3085514 667 665 0 True 382 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 425 412 0.0105241725669553 0.0470324357471844 0.0106507972838941 0.048355840390631 0.00176992402777206 0.00720050969608292 460031 2049710 667 665 0 True 427 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 470 411 0.0106112656649473 0.0574510893851704 0.0107423514152743 0.0565651941710536 0.00184753108914628 0.0110331681424556 463838 2503763 667 665 0 True 472 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 514 411 0.0107784057158878 0.0438596605957558 0.0107881284809644 0.0443121995880064 0.0021124625100841 0.00453391959704558 471144 1911438 667 665 0 True 517 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 557 410 0.0117743600161467 0.0566346055112604 0.0105592431525139 0.0556954299229419 0.00859244345401835 0.0100204316949584 514679 2468180 667 665 0 True 562 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 602 411 0.00994185900869661 0.0461368114724899 0.00997940032043946 0.0467078660257877 0.00210883014970436 0.00720379579943745 434577 2010678 667 665 0 True 607 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 646 410 0.00983010440305139 0.100859358283555 0.00991836423285267 0.0991378652628366 0.00225237212885245 0.0215428900500977 429692 4395529 667 665 0 True 651 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 249 457 0.0104221178492923 0.0470956516950421 0.0103761348897536 0.0462195773250935 0.00143948873311106 0.00631904945045293 455570 2052465 667 665 0 True 248 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 293 456 0.0107458516107019 0.0621640161286714 0.0107881284809644 0.0613412680247196 0.00144142177315251 0.0105015811974568 469721 2709156 667 665 0 True 293 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 338 457 0.0108995399301951 0.0383426866548381 0.0108949416342412 0.0386053253986419 0.00141626883733995 0.0033220007512523 476439 1671004 667 665 0 True 338 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 381 456 0.0108413634793956 0.0599867716900399 0.0108796826123445 0.0578469520103761 0.00153362251380948 0.012478675894926 473896 2614270 667 665 0 True 383 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 426 456 0.0109686973862577 0.135915159838254 0.0110322728313115 0.135347524223697 0.00197389930222876 0.0293446052371728 479462 5923288 667 665 0 True 427 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 470 455 0.0107476131469628 0.0707610867406557 0.0107728694590677 0.0662241550316625 0.00197064012871858 0.0189877796361661 469798 3083823 667 665 0 True 472 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 515 455 0.0104567308929651 0.0559699316957994 0.0105287251087205 0.0543526359960327 0.00191330522520694 0.00738533604116849 457083 2439213 667 665 0 True 517 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 558 454 0.0103178211763882 0.0352514612234408 0.0104371709773404 0.0355077439536126 0.00209557761480967 0.00502283799727376 451011 1536286 667 665 0 True 562 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 602 455 0.0100963022723017 0.0424571384974223 0.0100404364080262 0.0425268940260929 0.00205497762164857 0.00534476637732341 441328 1850315 667 665 0 True 607 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 646 455 0.00990280780873011 0.0740248194301271 0.00993362325474937 0.0734111543450065 0.00218227910751652 0.0149270401502143 432870 3226059 667 665 0 True 652 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 250 501 0.0104853272608374 0.0578885070309098 0.0104676890211337 0.0574959945067521 0.00135221739172 0.0130290737959511 458333 2522826 667 665 0 True 248 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 294 500 0.0106641117527755 0.0615366523426901 0.010605020218204 0.0601510643167773 0.00141418895778132 0.00741897759922179 466148 2681815 667 665 0 True 293 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 339 501 0.0108964286453706 0.0787893514973059 0.0108796826123445 0.0756847486076142 0.00135358477906644 0.0159066935883054 476303 3433701 667 665 0 True 338 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 383 501 0.011364608380177 0.105625244158692 0.011306935225452 0.0935683222705425 0.00205305455629899 0.0396845595197493 496768 4603230 667 665 0 True 383 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 426 500 0.0109131060471138 0.105387295200693 0.0110017547875181 0.0982375829709316 0.00208728324287736 0.0296745677342645 477032 4592860 667 665 0 True 428 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 472 499 0.0105457456668782 0.0454562590958972 0.0106202792401007 0.0462500953688869 0.00194114027123623 0.00489092284619018 460974 1981019 667 665 0 True 472 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 515 498 0.0105089592992471 0.0421598055564638 0.0105592431525139 0.0432440680552377 0.0020276870784932 0.00617598235497949 459366 1837357 667 665 0 True 517 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 559 498 0.0103226939974737 0.114008275437965 0.0104676890211337 0.114335851071946 0.00209196545289593 0.0214934128429658 451224 4968569 667 665 0 True 562 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 604 500 0.0100459040335634 0.0638179105350926 0.01025406271458 0.067002365148394 0.00198555397937726 0.0138896202063675 439125 2781234 667 665 0 True 607 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 647 499 0.00990843557392739 0.0875055572095723 0.00999465934233616 0.0878919661249714 0.00202324905515696 0.015206056031931 433116 3813560 667 665 0 True 652 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 250 545 0.0104728363673508 0.0561558852498608 0.0103913939116503 0.0578927290760662 0.00132090081372497 0.0103887674607521 457787 2447317 667 665 0 True 249 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 294 544 0.0107486883703948 0.108733724905076 0.0107728694590677 0.1057755397879 0.00143085260414965 0.0214171412189726 469845 4738700 667 665 0 True 293 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 340 544 0.010685273065001 0.0642623266795967 0.0107423514152743 0.0654001678492409 0.00145640096377791 0.0127394338769354 467073 2800602 667 665 0 True 338 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 383 545 0.0109737532240975 0.0651819064713741 0.0109864957656214 0.0638742656595712 0.00152184616454018 0.00853659490326937 479683 2840678 667 665 0 True 383 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 427 543 0.0106478461387297 0.0616582655999119 0.0106965743495842 0.0608072022583352 0.00208992761153693 0.00600901784335632 465437 2687115 667 665 0 True 428 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 472 542 0.0105161884610453 0.0714821845182882 0.0106813153276875 0.0693675135423819 0.00206802550455004 0.0117362931588356 459682 3115249 667 665 0 True 473 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 516 541 0.0104126924864416 0.0826341202055264 0.0105134660868238 0.0802777141985199 0.00217216853321397 0.0164567562092459 455158 3601259 667 665 0 True 517 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 560 540 0.0101318990310292 0.0614373195520272 0.0101625085831998 0.061875333791104 0.00194381398080399 0.0110501182603659 442884 2677486 667 665 0 True 562 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 604 541 0.00985927269828121 0.0507042612252765 0.00988784618905928 0.0498664835584039 0.00187724290761483 0.00474164619729103 430967 2209731 667 665 0 True 607 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 649 541 0.0108114859942425 0.066820518910001 0.0102082856488899 0.0667887388418402 0.00442423652470144 0.0113911247150175 472590 2912090 667 665 0 True 652 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 251 587 0.010361653689063 0.0507876695630126 0.0103913939116503 0.0516670481422141 0.00118300856311125 0.00769041279667554 452927 2213366 667 665 0 True 249 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 295 585 0.0103582450020126 0.0622533903997806 0.0103913939116503 0.0623025864042115 0.00129635920308253 0.0102683863777539 452778 2713051 667 665 0 True 294 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 340 586 0.010483908880991 0.0513794213159358 0.0104982070649271 0.0508430609597925 0.00140968569636483 0.00590743408888222 458271 2239155 667 665 0 True 338 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 384 586 0.010671981473214 0.057660034728616 0.0107423514152743 0.0562905317769131 0.00144654619598335 0.00727490315905828 466492 2512869 667 665 0 True 383 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 429 585 0.0105543474543342 0.0957533912602518 0.0105134660868238 0.0907454032196536 0.00195220904743731 0.0190362046739042 461350 4173007 667 665 0 True 428 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 473 584 0.0104655156971754 0.069372309234978 0.0104982070649271 0.0673838406958114 0.00213999673275777 0.0105386673499457 457467 3023299 667 665 0 True 473 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 517 583 0.0103022647522657 0.0622770476201949 0.0103761348897536 0.06152437628748 0.00235187818067311 0.00865175321835504 450331 2714082 667 665 0 True 518 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 560 582 0.00977398689073865 0.0410322441489395 0.00988784618905928 0.0413519493400473 0.00200966773937547 0.00759699972421987 427239 1788217 667 665 0 True 562 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 605 583 0.00987174071467356 0.0511521880921117 0.0100404364080262 0.0498512245365072 0.0017174300273281 0.0085100049721095 431512 2229252 667 665 0 True 607 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 649 582 0.00978359527034377 0.0620155791171681 0.0098115510795758 0.0581979095140002 0.00201149628004003 0.0168225081563491 427659 2702687 667 665 0 True 652 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 249 629 0.00984296133004681 0.0099373175442612 0.0098115510795758 0.00993362325474937 0.00123959595891558 0.0013445851224879 430254 433076 667 665 0 False 249 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 294 628 0.0100337105423027 0.0101164332208411 0.00996414129854276 0.0101319905394064 0.00126729973253743 0.00125676048038036 438592 440882 667 665 0 False 294 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 339 628 0.0103361914831094 0.0800919671575368 0.0103150988021668 0.0782177462424659 0.00142443914185405 0.0118482946111992 451814 3490470 667 665 0 True 339 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 384 628 0.0103062224895792 0.0841577048595396 0.0103456168459602 0.079667353322652 0.00134075609782708 0.0167045618364068 450504 3667658 667 665 0 True 383 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 428 628 0.0103449991644141 0.0100085645562751 0.0103913939116503 0.0101319905394064 0.00173442683886632 0.00179851070403479 452199 436181 667 665 0 False 428 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 473 628 0.00976035214253711 0.00985599728320573 0.00978103303578241 0.00999465934233616 0.00192413251964951 0.00212911616077948 426643 429532 667 665 0 False 473 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 518 627 0.00967799460306468 0.0117938701181886 0.00967421988250553 0.0101777676050965 0.00208763838218673 0.00779165770462464 423043 513986 667 665 0 False 518 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 563 627 0.00957399533238645 0.00947289257705949 0.00967421988250553 0.00952162966353857 0.001942518883141 0.00196576285350917 418497 412836 667 665 0 False 563 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 607 627 0.00951730589271626 0.00941089276177397 0.00955214770733196 0.00953688868543526 0.00159474649265904 0.00154797290680324 416019 410134 667 665 0 False 607 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 652 627 0.0094723066482323 0.00924295173731995 0.00955214770733196 0.00930800335698482 0.00166873368196093 0.00162275452607606 414052 402815 667 665 0 False 652 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 250 678 0.010008316967632 0.0410291005609698 0.00999465934233616 0.0419928282597086 0.00117342336278716 0.00965748049065608 437482 1788080 667 665 0 True 249 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 294 672 0.00987599585421297 0.00992786383445453 0.0098115510795758 0.00990310521095598 0.0012160326233235 0.00122953020323506 431698 432664 667 665 0 False 294 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 339 672 0.0100592413795391 0.00988396833236674 0.0100251773861295 0.00985732814526589 0.00125169013943446 0.00134645377093529 439708 430751 667 665 0 False 339 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 384 672 0.00971384300982949 0.00979638384126946 0.00968947890440223 0.00975051499198901 0.00129598422390829 0.00131481135349202 424610 426934 667 665 0 False 384 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 428 671 0.00986393962551798 0.00962270634241819 0.00984206912336919 0.00958266575112535 0.00160557092731914 0.00156278012677211 431171 419365 667 665 0 False 428 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 473 671 0.00953448659053398 0.00953351563848968 0.00964370183871214 0.00962844281681544 0.00182903040029106 0.00160488643289024 416770 415478 667 665 0 False 473 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 518 671 0.00932280483699556 0.00950836693473212 0.00950637064164187 0.00965896086060884 0.00193793094286253 0.00186551537779448 407517 414382 667 665 0 False 518 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 563 671 0.00941353539298101 0.00941623915591221 0.00950637064164187 0.00952162966353857 0.00169637740608 0.00184725747754763 411483 410367 667 665 0 False 563 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 608 671 0.00929796031258804 0.00931532309831571 0.00930800335698482 0.00935378042267491 0.00151424387480566 0.00151151080383717 406431 405969 667 665 0 False 608 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 648 677 0.00953414343411952 0.0412382524174937 0.00967421988250553 0.0411078049897002 0.00164235272982899 0.00869003614593051 416755 1797195 667 665 0 True 652 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A1_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A1_2.csv new file mode 100755 index 0000000..16244cb --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A1_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 249 280 0.00843773581279857 0.788110261921685 0.00796520943007553 0.793286030365454 0.00309619139328864 0.161812866034729 368829 34346456 667 665 15 True 248 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 292 279 0.00672778739950235 0.00729847048383146 0.00656137941557946 0.00659189745937285 0.00169101283261755 0.00341866246068567 294084 318073 667 665 0 False 292 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 337 280 0.00600946951564273 0.00653813522132179 0.00608834973678187 0.00636301213092241 0.00120252550522146 0.00178101883733456 262685 284937 667 665 0 True 337 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 382 281 0.00589663968656551 0.00604973179113956 0.00585946440833143 0.00604257267109178 0.0012910276763948 0.00118897747380949 257753 263652 667 665 0 True 382 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 426 281 0.00590286225621453 0.00605856596171133 0.00576791027695125 0.00613412680247196 0.00148738281035363 0.00156637955973969 258025 264037 667 665 0 True 427 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 469 281 0.00589693708879138 0.00602506495123136 0.00588998245212482 0.00608834973678187 0.00173732562711551 0.00191819921513791 257766 262577 667 665 0 True 472 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 514 279 0.0061934699850807 0.00635608246985052 0.00627145799954223 0.00643930724040589 0.0015653224250857 0.00171700569233996 270728 277003 667 665 0 True 516 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 558 279 0.00635612612553874 0.00646064692516368 0.0063935301747158 0.00646982528419928 0.00173925727780466 0.00150784957535267 277838 281560 667 665 0 True 561 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 606 278 0.00772582351534235 0.00677537285649464 0.00733958953231098 0.00688181887541009 0.00336494861736579 0.00199515559438721 337710 295276 667 665 0 False 606 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 645 279 0.00844539963938836 0.787001057232231 0.00859082932784009 0.7898374914168 0.00196049101722718 0.164406737728867 369164 34298116 667 665 16 True 651 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 248 323 0.00663225265371434 0.00607497227848748 0.0064087891966125 0.00604257267109178 0.00221532329672921 0.00145609192680914 289908 264752 667 665 0 False 248 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 292 323 0.00608594764188059 0.00605856596171133 0.00608834973678187 0.00605783169298848 0.00136445366524064 0.00131579209491634 266028 264037 667 665 0 False 292 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 337 324 0.00593610267422938 0.00620704886500986 0.0059662775616083 0.00616464484626535 0.00136411542713654 0.00122316598350365 259478 270508 667 665 0 True 337 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 381 325 0.00601145982284665 0.00586751841838517 0.0059510185397116 0.00592050049591821 0.00126910247426324 0.00133389004631195 262772 255711 667 665 0 True 382 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 426 325 0.00602356180573023 0.0065163825104074 0.0059510185397116 0.00643930724040589 0.00151640422081471 0.00180855674024865 263301 283989 667 665 0 True 427 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 470 324 0.0063511846731704 0.00629438095123366 0.0064087891966125 0.0063782711528191 0.00171844980930765 0.00158784440871955 277622 274314 667 665 0 True 472 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 514 323 0.00625430017881881 0.00637037776404848 0.00627145799954223 0.00634775310902571 0.0016102270467936 0.00155612033893459 273387 277626 667 665 0 True 517 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 558 323 0.00633967749473855 0.00663951019687006 0.00636301213092241 0.00665293354695964 0.00179068171648397 0.00146834358129718 277119 289355 667 665 0 True 561 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 606 322 0.00665350547431709 0.0066152104913233 0.00657663843747616 0.00665293354695964 0.0020628016705482 0.00205168984253148 290837 288296 667 665 0 False 606 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 651 321 0.00708682051741353 0.0069735106821758 0.00711070420386053 0.00691233691920348 0.00205442567661088 0.00183131914111404 309778 303911 667 665 0 False 651 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 249 369 0.00568516382687576 0.00581309074930402 0.00570687418936446 0.00581368734264134 0.00154534134571953 0.00154190393255303 248509 253339 667 665 0 True 248 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 293 368 0.00591489560781523 0.00600482666955785 0.00587472343022812 0.005981536583505 0.00142781601259607 0.00134376014777101 258551 261695 667 665 0 True 293 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 337 366 0.00642098268787328 0.00586595809734912 0.00634775310902571 0.00588998245212482 0.00165978461305235 0.00141925181529794 280673 255643 667 665 0 False 337 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 381 369 0.00644589584356368 0.00628221962551148 0.0063935301747158 0.00630197604333562 0.00148640496589465 0.00136653490705038 281762 273784 667 665 0 True 382 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 425 368 0.00649759807667693 0.00657521579182564 0.00634775310902571 0.00659189745937285 0.00180411018429832 0.00163670639868134 284022 286553 667 665 0 True 427 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 469 367 0.00674480795765999 0.0064712479298498 0.00675974670023652 0.00654612039368277 0.00177683784045978 0.00168524372161478 294828 282022 667 665 0 True 472 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 514 367 0.00731682682348457 0.00645575944897721 0.00698863202868696 0.00651560234988937 0.00257470950612551 0.00178344763798224 319832 281347 667 665 0 True 517 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 558 366 0.00840518170761266 0.00671564468507042 0.00669871061264973 0.0068055237659266 0.00797086504438656 0.00165545633200908 367406 292673 667 665 0 True 562 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 602 368 0.00655151938793707 0.00662262201624455 0.00666819256885634 0.00669871061264973 0.00205554466557848 0.00210796020401417 286379 288619 667 665 0 True 606 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 646 367 0.00607919889906271 0.00627577182828896 0.00607309071488518 0.0063935301747158 0.00201599997844142 0.00187162855990382 265733 273503 667 665 0 True 651 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 249 412 0.00572073770850899 0.00585815649216885 0.00573739223315786 0.00587472343022812 0.00154791468451428 0.00157248139009848 250064 255303 667 665 0 True 248 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 293 412 0.00613083250089307 0.00609968501019085 0.00604257267109178 0.00610360875867857 0.00152512084111938 0.00139910431264487 267990 265829 667 665 0 True 293 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 337 413 0.00619477397945568 0.0066425620012494 0.00619516289005875 0.00646982528419928 0.00134195794650299 0.00175315797948232 270785 289488 667 665 0 True 338 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 382 413 0.00645813508901306 0.00648455655045143 0.00643930724040589 0.00653086137178607 0.00152358452572236 0.00139640561659433 282297 282602 667 665 0 True 382 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 425 412 0.00650045771346416 0.0068199567355101 0.00648508430609598 0.00672922865644312 0.00168072382988139 0.00152832748517902 284147 297219 667 665 0 True 427 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 470 411 0.00679822597284558 0.00677413377802483 0.00685130083161669 0.00677500572213321 0.00175070123158013 0.00145521686293236 297163 295222 667 665 0 True 472 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 514 411 0.0068958425342147 0.0067595631330558 0.00675974670023652 0.00677500572213321 0.00186772686817657 0.00171154633645727 301430 294587 667 665 0 True 517 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 557 410 0.00772783669964057 0.00653446387770754 0.00668345159075303 0.00653086137178607 0.00582646398987474 0.0014284730976192 337798 284777 667 665 0 True 562 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 602 411 0.00582446245405565 0.00591453456254507 0.00587472343022812 0.00584420538643473 0.00197083211548647 0.00194298555651433 254598 257760 667 665 0 True 607 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 646 410 0.00569390287689755 0.00585877603140376 0.00569161516746777 0.00584420538643473 0.00176861703259354 0.00183767522446537 248891 255330 667 665 0 True 651 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 249 457 0.0059141177866091 0.00602715302791196 0.00581368734264134 0.00602731364919509 0.001580621558952 0.00150749954522619 258517 262668 667 665 0 True 248 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 293 456 0.00606528962572959 0.00618699415051706 0.00608834973678187 0.00616464484626535 0.00152326706569421 0.00154643275344779 265125 269634 667 665 0 True 293 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 338 457 0.00616178520947812 0.00609004773320346 0.00622568093385214 0.00605783169298848 0.00151868312616726 0.00148042087951893 269343 265409 667 665 0 True 338 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 381 456 0.00661017625771687 0.00666456711703727 0.00656137941557946 0.00665293354695964 0.00167528716621258 0.00149276279186684 288943 290447 667 665 0 True 383 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 426 456 0.00666068888192663 0.00678161414063885 0.00663767452506294 0.00674448767833982 0.00185072730248413 0.00186335382204081 291151 295548 667 665 0 True 427 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 470 455 0.00661761131336369 0.00675554760097772 0.00656137941557946 0.00685130083161669 0.00191775828268011 0.00200009053175423 289268 294412 667 665 0 True 472 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 515 455 0.00647138092661154 0.00654781839010435 0.00643930724040589 0.00659189745937285 0.00174036782965886 0.00187911811044906 282876 285359 667 665 0 True 517 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 558 454 0.00591468971396655 0.00624139887370062 0.0059510185397116 0.00604257267109178 0.00188114920102212 0.00280895725737363 258542 272005 667 665 0 True 562 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 602 455 0.00564650153751232 0.00553292133974212 0.00561532005798428 0.00564583810177768 0.00186685197178089 0.00180129866400146 246819 241129 667 665 0 True 607 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 646 455 0.00531855839075198 0.0055789278644081 0.00540169375143053 0.00566109712367437 0.00173413146095612 0.00190825833041317 232484 243134 667 665 0 True 652 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 250 501 0.00581110223098567 0.00597219760318627 0.00582894636453803 0.00593575951781491 0.00145269591231343 0.00144242083694398 254014 260273 667 665 0 True 248 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 294 500 0.00604666767097111 0.00615900015545846 0.00604257267109178 0.00613412680247196 0.0014841081577017 0.00157768184550894 264311 268414 667 665 0 True 293 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 339 501 0.00607192398307598 0.00627707974445154 0.00604257267109178 0.00628671702143893 0.00164813291882773 0.00159202793675122 265415 273560 667 665 0 True 338 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 383 501 0.00652189355082129 0.00690513190736053 0.00657663843747616 0.00694285496299687 0.00150688070225402 0.00169006954604147 285084 300931 667 665 0 True 383 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 426 500 0.00655634645483392 0.00662493955190104 0.00653086137178607 0.00671396963454643 0.00190194597527274 0.00186852421022779 286590 288720 667 665 0 True 428 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 472 499 0.00620904928629757 0.00616923402578316 0.00617990386816205 0.00610360875867857 0.00191201994508304 0.00169808605395961 271409 268860 667 665 0 True 472 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 515 498 0.00590693437899956 0.00568475434408865 0.00585946440833143 0.00564583810177768 0.00173668738856921 0.00161888251174527 258203 247746 667 665 0 True 517 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 559 498 0.00552497841260189 0.0057293611690017 0.0055390249485008 0.00573739223315786 0.00179777517769884 0.00164036444204752 241507 249690 667 665 0 True 562 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 604 500 0.00540089305313011 0.00547546481217922 0.00529488059815366 0.00547798886091402 0.00188212836656901 0.00175961635334795 236083 238625 667 665 0 True 607 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 647 499 0.005396660790685 0.00549083856356387 0.00523384451056687 0.00549324788281071 0.00177035273490645 0.00187090721263807 235898 239295 667 665 0 True 652 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 250 545 0.00607350250258254 0.00606287979045806 0.00602731364919509 0.00610360875867857 0.00146638801020767 0.0015080705984633 265484 264225 667 665 0 True 249 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 294 544 0.00602783982236394 0.00618497491152922 0.00607309071488518 0.00624093995574884 0.00137716671544105 0.00138833704512485 263488 269546 667 665 0 True 293 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 340 544 0.00616375263958774 0.00628341281218611 0.00624093995574884 0.00633249408712902 0.00149292899621339 0.00148591813180458 269429 273836 667 665 0 True 338 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 383 545 0.00623316174368755 0.00628517964630046 0.00616464484626535 0.00627145799954223 0.0014852686847099 0.0014237536051213 272463 273913 667 665 0 True 383 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 427 543 0.00617997249944495 0.00611735335133439 0.00621042191195544 0.00613412680247196 0.00189685507840195 0.00183853058084905 270138 266599 667 665 0 True 428 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 472 542 0.00579506538788285 0.00583544005355572 0.00579842832074464 0.00585946440833143 0.00194653555588029 0.00199191189676249 253313 254313 667 665 0 True 473 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 516 541 0.00557979193053965 0.00569214292311231 0.00561532005798428 0.00570687418936446 0.00188363045479712 0.00197538992993861 243903 248068 667 665 0 True 517 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 560 540 0.00566047944212833 0.00574083411779621 0.00566109712367437 0.00570687418936446 0.00168260108778012 0.00180830755386161 247430 250190 667 665 0 True 562 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 604 541 0.00564188036446414 0.00563702687710349 0.00560006103608759 0.00564583810177768 0.00171434068672405 0.00163480264956769 246617 245666 667 665 0 True 607 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 649 541 0.00698355331375283 0.00563507647580843 0.00570687418936446 0.00572213321126116 0.0054389013505381 0.00192083541169598 305264 245581 667 665 0 True 652 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 251 587 0.00602866339775866 0.00618885276822177 0.005981536583505 0.00619516289005875 0.00128945084023978 0.00129288843528295 263524 269715 667 665 0 True 249 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 295 585 0.00608317951347055 0.00645110143176664 0.00604257267109178 0.00642404821850919 0.00135386698406397 0.00154513931623094 265907 281144 667 665 0 True 294 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 340 586 0.00622773987233895 0.00606430243610858 0.00621042191195544 0.00602731364919509 0.00148472650992418 0.00159553848463902 272226 264287 667 665 0 True 338 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 384 586 0.00583450549845242 0.00577318783339672 0.00576791027695125 0.00578316929884794 0.00134824172373883 0.00128918994628371 255037 251600 667 665 0 True 383 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 429 585 0.00589760052452602 0.00575579484302425 0.00599679560540169 0.00587472343022812 0.0017440663645322 0.00185697270998694 257795 250842 667 665 0 True 428 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 473 584 0.00588577306677401 0.00567091796784247 0.00584420538643473 0.00569161516746777 0.00199224793794991 0.00186520819587112 257278 247143 667 665 0 True 473 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 517 583 0.0059108463621245 0.00575384444172918 0.0059510185397116 0.00570687418936446 0.00194562525386394 0.00196127617670676 258374 250757 667 665 0 True 518 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 560 582 0.00573126117188602 0.00608426536701103 0.00567635614557107 0.00614938582436866 0.00187911009356408 0.00175955810541989 250524 265157 667 665 0 True 562 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 605 583 0.00600592356602655 0.00571635084506873 0.005981536583505 0.00566109712367437 0.00166319175807603 0.00154550974289793 262530 249123 667 665 0 True 607 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 649 582 0.00561724173390531 0.0054366632993562 0.00560006103608759 0.00546272983901732 0.00162011450772976 0.00149523843285542 245540 236934 667 665 0 True 652 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 249 629 0.00625487210617626 0.00632345340347894 0.00622568093385214 0.0063782711528191 0.00135844282604106 0.00153925774876188 273412 275581 667 665 0 False 249 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 294 628 0.0061706386449714 0.00618722360949295 0.00614938582436866 0.00619516289005875 0.00138778239954848 0.00138839762374753 269730 269644 667 665 0 False 294 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 339 628 0.00592642566334137 0.00588006982436636 0.0059510185397116 0.00587472343022812 0.00141534522172357 0.00131655596562823 259055 256258 667 665 0 True 339 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 384 628 0.00568532396653584 0.00551899317990559 0.00567635614557107 0.00556954299229419 0.00135099238497581 0.00127475069601115 248516 240522 667 665 0 True 383 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 428 628 0.00571668846281826 0.00557316844411326 0.00584420538643473 0.0055390249485008 0.00166683798311586 0.00153344062326573 249887 242883 667 665 0 False 428 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 473 628 0.00574949421604144 0.00560894109845454 0.00573739223315786 0.00564583810177768 0.001871800239628 0.0019399398493348 251321 244442 667 665 0 False 473 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 518 627 0.00581231471698346 0.00729555635483765 0.00588998245212482 0.00601205462729839 0.00196564495501193 0.00549929122687885 254067 317946 667 665 0 False 518 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 563 627 0.00565377645349905 0.00562351174342356 0.00564583810177768 0.00552376592660411 0.00168381500597237 0.00172410035145426 247137 245077 667 665 0 False 563 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 607 627 0.00583425385041514 0.00574443662371768 0.00588998245212482 0.00573739223315786 0.00151287565177543 0.00133264967153734 255026 250347 667 665 0 False 607 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 652 627 0.00576475323793814 0.0057926689004498 0.00576791027695125 0.00584420538643473 0.00149155333080323 0.00145237862131364 251988 252449 667 665 0 False 652 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 250 678 0.0084427687735441 0.757288139093442 0.00776684214541848 0.780880445563439 0.00297644439855799 0.214705907091499 369049 33003204 667 665 16 True 249 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 294 672 0.00657167410801351 0.00630422474129935 0.00634775310902571 0.00631723506523232 0.00192266257740872 0.0013529429722702 287260 274743 667 665 0 False 294 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 339 672 0.00580419334850771 0.00559267245706392 0.00576791027695125 0.00560006103608759 0.00134654816418825 0.00133589505392838 253712 243733 667 665 0 False 339 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 384 672 0.00541228584609046 0.00577481699212554 0.00535591668574044 0.00578316929884794 0.00139345916878404 0.0013712670852244 236581 251671 667 665 0 False 384 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 428 671 0.00561708159424522 0.00566972478116784 0.00561532005798428 0.00570687418936446 0.00151885993867504 0.00143659273023354 245533 247091 667 665 0 False 428 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 473 671 0.00551395165315031 0.00571036196579799 0.00547798886091402 0.00570687418936446 0.00164105169175733 0.00137523899921926 241025 248862 667 665 0 False 473 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 518 671 0.00565732240311522 0.00549694217232254 0.00570687418936446 0.00547798886091402 0.00178037344593731 0.0017024953325816 247292 239561 667 665 0 False 518 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 563 671 0.00561749338194258 0.00557924910697435 0.00560006103608759 0.00556954299229419 0.00155036097650347 0.00161478827631257 245551 243148 667 665 0 False 563 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 608 671 0.00657066751586441 0.00606437127380135 0.00624093995574884 0.00604257267109178 0.00207569328770685 0.00148470672251941 287216 264290 667 665 0 False 608 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 648 677 0.00766853927122042 0.779387333061424 0.00761425192645151 0.786953536278325 0.0018604741519274 0.185194728540544 335206 33966304 667 665 18 True 652 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A1_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A1_3.csv new file mode 100755 index 0000000..ede8607 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A1_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 249 280 0.00115080935156134 0.0811029404594113 0.000915541313801785 0.0784313725490196 0.000910109102762095 0.021274531688274 50304 3534529 667 665 0 True 248 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 292 279 0.000954684022145485 0.00104390066491475 0.000793469138628214 0.000915541313801785 0.000728476042578835 0.000719822588383022 41731 45494 667 665 0 False 292 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 337 280 0.000946722793329817 0.000936949836252338 0.000869764248111696 0.00080872816052491 0.00065177110654732 0.000747898322019582 41383 40833 667 665 0 True 337 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 382 281 0.000962896898998429 0.000945370980667508 0.000839246204318303 0.000839246204318303 0.000697262466055823 0.000648066205953995 42090 41200 667 665 0 True 382 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 426 281 0.00093125787758444 0.000910309649151489 0.00064087891966125 0.000671396963454643 0.000895962581985635 0.000812576691242843 40707 39672 667 665 0 True 427 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 469 281 0.000856037991532959 0.00086733198296726 0.000579842832074464 0.000503547722590982 0.00086355832293837 0.000924467183388323 37419 37799 667 665 0 True 472 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 514 279 0.000932836397090994 0.000961800243341244 0.000701915007248035 0.000701915007248035 0.000838727383711248 0.000913955973836933 40776 41916 667 665 0 True 516 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 558 279 0.000985247820127473 0.00099784824845359 0.000762951094834821 0.000778210116731518 0.000893155328675793 0.000831295920681925 43067 43487 667 665 0 True 561 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 606 278 0.00104749639371205 0.000968821688003483 0.000656137941557946 0.000625619897764553 0.00110033042507707 0.00101173931450043 45788 42222 667 665 0 False 606 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 645 279 0.00110773178299841 0.0809726536529009 0.000747692072938125 0.0781872281986725 0.00103664491607047 0.0220425106051643 48421 3528851 667 665 0 True 651 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 248 323 0.000946311005632455 0.00095769292767281 0.000732433051041428 0.000793469138628214 0.000811397315216965 0.000760434934490352 41365 41737 667 665 0 False 248 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 292 323 0.000893236146861337 0.000937431700101708 0.000762951094834821 0.000793469138628214 0.000692377545875573 0.000737477023378247 39045 40854 667 665 0 False 292 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 337 324 0.000862946874010923 0.00092267748795197 0.000732433051041428 0.00080872816052491 0.000660204871612956 0.000671906678631372 37721 40211 667 665 0 True 337 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 381 325 0.00089559248757402 0.000925132698993994 0.000747692072938125 0.000823987182421607 0.000683077578756934 0.000699281078329351 39148 40318 667 665 0 True 382 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 426 325 0.000949056256948203 0.000972515977515315 0.000732433051041428 0.00064087891966125 0.00082781555521377 0.000927800665485206 41485 42383 667 665 0 True 427 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 470 324 0.000989114049063818 0.000946357654263835 0.000686655985351339 0.000762951094834821 0.00094259187754932 0.000834660715375814 43236 41243 667 665 0 True 472 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 514 323 0.000934094637277379 0.000942296230390579 0.000717174029144732 0.000747692072938125 0.000852799775502776 0.00088880985818615 40831 41066 667 665 0 True 517 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 558 323 0.00101519393656342 0.000996632115881372 0.000793469138628214 0.000869764248111696 0.00091900827781684 0.00076794414760023 44376 43434 667 665 0 True 561 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 606 322 0.000961181116926087 0.00094649532964937 0.000473029678797589 0.000442511635004196 0.00110664114837315 0.00113788357119595 42015 41249 667 665 0 False 606 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 651 321 0.00104637541609145 0.00101879785295236 0.000610360875867857 0.000595101853971161 0.00108180541022469 0.00102187863517859 45739 44400 667 665 0 False 651 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 249 369 0.000973923658450015 0.000942732202444771 0.000823987182421607 0.000762951094834821 0.000802054793851185 0.000798534906880878 42572 41085 667 665 0 True 248 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 293 368 0.000946837178801307 0.00101932560859691 0.000793469138628214 0.000869764248111696 0.000763359631410984 0.000766122921194826 41388 44423 667 665 0 True 293 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 337 366 0.00093592480482121 0.000868066251690109 0.00080872816052491 0.000747692072938125 0.00074176107050652 0.000734220593685113 40911 37831 667 665 0 False 337 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 381 369 0.00095354016743059 0.000943099336806195 0.000778210116731518 0.000793469138628214 0.00075325518250665 0.000719711403056713 41681 41101 667 665 0 True 382 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 425 368 0.000984538630204239 0.00095115334685994 0.000701915007248035 0.000686655985351339 0.000874333571319848 0.000893309858427485 43036 41452 667 665 0 True 427 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 469 367 0.000942421899601813 0.000963131105401407 0.000610360875867857 0.000579842832074464 0.000911359572240168 0.000965955490734805 41195 41974 667 665 0 True 472 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 514 367 0.00100492212122366 0.000944315469378413 0.000717174029144732 0.000579842832074464 0.000969160915685888 0.000966521089649617 43927 41154 667 665 0 True 517 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 558 366 0.00112939639129851 0.000961960864624367 0.000747692072938125 0.000686655985351339 0.00120270953463241 0.000897400462488738 49368 41923 667 665 0 True 562 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 602 368 0.000996960892407996 0.000959849842046178 0.000549324788281071 0.000473029678797589 0.00112542298077598 0.00112169319275423 43579 41831 667 665 0 True 606 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 646 367 0.0010284397741619 0.000960102246919657 0.000579842832074464 0.000595101853971161 0.00111044075513953 0.00100782506484481 44955 41842 667 665 0 True 651 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 249 412 0.000934597933351932 0.000824583775758921 0.000732433051041428 0.000656137941557946 0.000852063014840666 0.000750580016272281 40853 35936 667 665 0 True 248 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 293 412 0.000957932569535786 0.000920933599735204 0.000793469138628214 0.000793469138628214 0.000776262714524344 0.000732712162164932 41873 40135 667 665 0 True 293 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 337 413 0.000979734440401681 0.000900832993447225 0.000854505226215 0.000793469138628214 0.000745572341287236 0.000681054257505687 42826 39259 667 665 0 True 338 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 382 413 0.000927711927968266 0.00103421749613218 0.000762951094834821 0.000869764248111696 0.00077406114577027 0.000808829908714651 40552 45072 667 665 0 True 382 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 425 412 0.000883948046576391 0.00109153634830955 0.000610360875867857 0.000854505226215 0.000842354786769681 0.000873878837221022 38639 47570 667 665 0 True 427 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 470 411 0.000961753044283535 0.0010137038636876 0.000686655985351339 0.000732433051041428 0.000905737935086192 0.000862995899567061 42040 44178 667 665 0 True 472 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 514 411 0.0010197007241401 0.000916505041500524 0.000686655985351339 0.000686655985351339 0.000990053368218579 0.000912529941532808 44573 39942 667 665 0 True 517 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 557 410 0.00113690007822822 0.000929240014662429 0.00080872816052491 0.000671396963454643 0.00111409782290784 0.000841033257023752 49696 40497 667 665 0 True 562 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 602 411 0.000927597542496776 0.00100133602488712 0.000473029678797589 0.000671396963454643 0.00106607070667453 0.00101749091350226 40547 43639 667 665 0 True 607 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 646 410 0.000902364107486197 0.000943604146553153 0.000457770656900893 0.000503547722590982 0.000986438505265581 0.000992327482217716 39444 41123 667 665 0 True 651 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 249 457 0.00101892290293398 0.000901452532682129 0.000854505226215 0.000747692072938125 0.000851266117956154 0.000797094052105611 44539 39286 667 665 0 True 248 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 293 456 0.000922839106882814 0.000938257752414912 0.00080872816052491 0.000747692072938125 0.00076731146206451 0.000861082627946222 40339 40890 667 665 0 True 293 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 338 457 0.000975753825993847 0.000883990704616887 0.000839246204318303 0.000747692072938125 0.000797199905451041 0.000786290330716336 42652 38525 667 665 0 True 338 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 381 456 0.000921741006356515 0.00100381418182673 0.000793469138628214 0.000839246204318303 0.000783331169415567 0.000849696051689499 40291 43747 667 665 0 True 383 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 426 456 0.00100160494255047 0.000948285109661313 0.000656137941557946 0.0004272526131075 0.00105075319286227 0.0010552700966622 43782 41327 667 665 0 True 427 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 470 455 0.000941323799075514 0.000871393406840516 0.000518806744487678 0.000442511635004196 0.001045309793665 0.00103361207709849 41147 37976 667 665 0 True 472 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 515 455 0.000944229190051347 0.000983552954255632 0.000595101853971161 0.00064087891966125 0.000988991960515369 0.000982809738992023 41274 42864 667 665 0 True 517 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 558 454 0.000899550224887556 0.000839337987908659 0.000595101853971161 0.000442511635004196 0.000918347172599109 0.000952562886716739 39321 36579 667 665 0 True 562 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 602 455 0.000870450560940633 0.000917606444584797 0.0004272526131075 0.000503547722590982 0.000943163676585482 0.000986623682401702 38049 39990 667 665 0 True 607 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 646 455 0.000900762710885345 0.000971185115455152 0.000457770656900893 0.000457770656900893 0.000993637386881839 0.00110807337913416 39374 42325 667 665 0 True 652 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 250 501 0.000871731678221315 0.000938533103185981 0.000686655985351339 0.00080872816052491 0.000786011112002983 0.000716763135821453 38105 40902 667 665 0 True 248 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 294 500 0.000952098910489823 0.000909483596838285 0.000717174029144732 0.000747692072938125 0.000861701939315844 0.000804766174944479 41618 39636 667 665 0 True 293 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 339 501 0.000943611508505303 0.000955375392016319 0.000762951094834821 0.000732433051041428 0.000842391284694822 0.000855227742410624 41247 41636 667 665 0 True 338 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 383 501 0.00102811949484173 0.000980753554749772 0.00080872816052491 0.000762951094834821 0.000874006192129731 0.000876881604694724 44941 42742 667 665 0 True 383 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 426 500 0.000947523491630243 0.00101592961575374 0.000579842832074464 0.000564583810177768 0.00100172961918715 0.0010778417143748 41418 44275 667 665 0 True 428 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 472 499 0.000963743351487451 0.000920818870247259 0.000579842832074464 0.000595101853971161 0.00098721683773747 0.000908692052529698 42127 40130 667 665 0 True 472 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 515 498 0.000909067096115481 0.000929056447481716 0.000564583810177768 0.000625619897764553 0.000925101481106956 0.000880664549089173 39737 40489 667 665 0 True 517 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 559 498 0.000908037626872076 0.000960102246919657 0.000534065766384375 0.000610360875867857 0.000955867565311873 0.00100355289991136 39692 41842 667 665 0 True 562 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 604 500 0.000916570783045191 0.000981579607062977 0.000579842832074464 0.00064087891966125 0.000932362723334864 0.000980469825709952 40065 42778 667 665 0 True 607 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 647 499 0.000911629330676845 0.000984585519647138 0.000488288700694286 0.000534065766384375 0.0010188708997357 0.00109214136578057 39849 42909 667 665 0 True 652 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 250 545 0.000951458351849481 0.00103915086411382 0.00080872816052491 0.000854505226215 0.00075420827752186 0.000860727594099504 41590 45287 667 665 0 True 249 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 294 544 0.000900167906433599 0.000928138611578156 0.000762951094834821 0.000793469138628214 0.000764577515500605 0.000763334141340604 39348 40449 667 665 0 True 293 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 340 544 0.000843432712574818 0.000954801744576594 0.000717174029144732 0.00080872816052491 0.000710307180342941 0.000774077365359856 36868 41611 667 665 0 True 338 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 383 545 0.000971727457397417 0.000985618085038644 0.000854505226215 0.000839246204318303 0.000759309663615126 0.000829275086043617 42476 42954 667 665 0 True 383 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 427 543 0.000952053156301227 0.000933186709047739 0.000579842832074464 0.000534065766384375 0.00100093847234007 0.00100186824756695 41616 40669 667 665 0 True 428 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 472 542 0.00094125516779262 0.000931603442114097 0.000503547722590982 0.000473029678797589 0.00103448299571253 0.00109080870345805 41144 40600 667 665 0 True 473 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 516 541 0.000919750699152598 0.000986467083249437 0.000518806744487678 0.000488288700694286 0.000998126375755222 0.0010944356492278 40204 42991 667 665 0 True 517 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 560 540 0.000828608355469782 0.000888717559520224 0.000518806744487678 0.000442511635004196 0.000862743108811607 0.000984235686970601 36220 38731 667 665 0 True 562 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 604 541 0.000952487821092887 0.000911319268645406 0.000671396963454643 0.000686655985351339 0.000951431406112279 0.00083855255286282 41635 39716 667 665 0 True 607 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 649 541 0.00106469996862407 0.00101489705036223 0.000671396963454643 0.000610360875867857 0.00115363609170763 0.00106531927986497 46540 44230 667 665 0 True 652 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 251 587 0.000973077205960993 0.000941011260125594 0.000854505226215 0.000823987182421607 0.000720979274596014 0.00068255534761149 42535 41010 667 665 0 True 249 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 295 585 0.000999706143723744 0.000922287407692956 0.000900282291905089 0.000778210116731518 0.000751349900060149 0.000711809775563272 43699 40194 667 665 0 True 294 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 340 586 0.0008588518741316 0.000948514568637203 0.000701915007248035 0.000793469138628214 0.00071710317408163 0.000769279436628045 37542 41337 667 665 0 True 338 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 384 586 0.00099821913259438 0.000960171084612424 0.000854505226215 0.000839246204318303 0.000765620368145512 0.000694525501836584 43634 41845 667 665 0 True 383 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 429 585 0.000999179970554892 0.000971598141611754 0.000625619897764553 0.000503547722590982 0.00100026853961078 0.0010702522818012 43676 42343 667 665 0 True 428 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 473 584 0.000931944190413376 0.000980294636797992 0.000473029678797589 0.000610360875867857 0.00105555487346636 0.000979834327647414 40737 42722 667 665 0 True 473 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 517 583 0.000857639388133811 0.000943512362962797 0.000335698481727321 0.000488288700694286 0.00106783455669772 0.00111741842317707 37489 41119 667 665 0 True 518 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 560 582 0.000818222154658537 0.000936238513427079 0.0004272526131075 0.000534065766384375 0.000919502073177187 0.0010117874742366 35766 40802 667 665 0 True 562 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 605 583 0.00101890002583968 0.000937454645999297 0.000732433051041428 0.000671396963454643 0.000928334935686181 0.000851759093056397 44538 40855 667 665 0 True 607 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 649 582 0.000921054693527578 0.000964760264130227 0.000656137941557946 0.000732433051041428 0.000890578757178726 0.000794790112255326 40261 42045 667 665 0 True 652 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 249 629 0.00101578874101516 0.000927220775674595 0.000885023270008392 0.000762951094834821 0.000746555877415202 0.000723659485734622 44402 40409 667 665 0 False 249 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 294 628 0.000949673938494246 0.00095326436943813 0.000823987182421607 0.00080872816052491 0.000750515930290843 0.000763728503963524 41512 41544 667 665 0 False 294 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 339 628 0.000992911646717268 0.000880388198695411 0.000869764248111696 0.000778210116731518 0.00075700451185048 0.00068012348258334 43402 38368 667 665 0 True 339 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 384 628 0.000896965113231894 0.000913935100970554 0.000762951094834821 0.000747692072938125 0.000713795466632334 0.000713574115312517 39208 39830 667 665 0 True 383 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 428 628 0.000939333491871597 0.000969051146979373 0.000656137941557946 0.000656137941557946 0.00092187739322598 0.000954432754185659 41060 42232 667 665 0 False 428 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 473 628 0.000956376927123529 0.000854482280317411 0.000579842832074464 0.000411993591210803 0.0010299225132315 0.000973195810489991 41805 37239 667 665 0 False 473 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 518 627 0.000984698769864324 0.00109922322400187 0.000549324788281071 0.000610360875867857 0.00107560873102713 0.00121459503257019 43043 47905 667 665 0 False 518 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 563 627 0.000861825896390326 0.000961020082823217 0.000564583810177768 0.000595101853971161 0.000868991195940031 0.000937022281359616 37672 41882 667 665 0 False 563 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 607 627 0.000899778995830535 0.000932337710836946 0.000701915007248035 0.000778210116731518 0.000744615139513146 0.000739890802570771 39331 40632 667 665 0 False 607 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 652 627 0.00100553980276971 0.000972125897256302 0.00080872816052491 0.00080872816052491 0.000807688973674099 0.000778463920974785 43954 42366 667 665 0 False 652 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 250 678 0.00108785158805354 0.077791686816033 0.000930800335698482 0.0773937590600443 0.000786091733022545 0.0256236709520934 47552 3390222 667 665 0 True 249 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 294 672 0.00105255223155188 0.000901498424477307 0.000976577401388571 0.000762951094834821 0.000747950377512675 0.000673511117712174 46009 39288 667 665 0 False 294 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 339 672 0.000919956593001279 0.000952690721998404 0.000762951094834821 0.00080872816052491 0.000708546178841825 0.000728349584879499 40213 41519 667 665 0 False 339 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 384 672 0.000915724330556168 0.000909300029657573 0.000778210116731518 0.00080872816052491 0.000717758593699569 0.000687414755585144 40028 39628 667 665 0 False 384 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 428 671 0.000947088826838584 0.00095209412866109 0.000762951094834821 0.00080872816052491 0.000829497802745918 0.000736121634633636 41399 41493 667 665 0 False 428 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 473 671 0.000847573466642737 0.000853885686980096 0.000610360875867857 0.000671396963454643 0.000792602713742504 0.000734692105330624 37049 37213 667 665 0 False 473 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 518 671 0.000836134919493789 0.00087481234558128 0.000488288700694286 0.000534065766384375 0.00090155732402882 0.000920502773848715 36549 38125 667 665 0 False 518 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 563 671 0.00086809422022795 0.00081038026515132 0.00064087891966125 0.000534065766384375 0.000808231188667496 0.000835961266537823 37946 35317 667 665 0 False 563 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 608 671 0.00101073290317533 0.000967054853889129 0.000885023270008392 0.000762951094834821 0.000724958208255931 0.000753525441836503 44181 42145 667 665 0 False 608 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 648 677 0.00109929013520248 0.0807009971713445 0.000915541313801785 0.0779278248264286 0.000872280264990535 0.0243653671369567 48052 3517012 667 665 0 True 652 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A2_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A2_1.csv new file mode 100755 index 0000000..9a5be34 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A2_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 268 261 0.00913038559685596 0.040880021064334 0.00924696726939803 0.0408484016174563 0.00159118988198252 0.00927431545514264 399106 1781583 667 665 0 True 268 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 313 261 0.00903128202435747 0.00887930515232921 0.00900282291905089 0.0089417868314641 0.00132065220667425 0.00131080612659602 394774 386967 667 665 0 False 313 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 357 261 0.00888759099507239 0.0637540979938975 0.00886549172198062 0.0635538261997406 0.00133417003141418 0.0105772912006525 388493 2778453 667 665 0 True 357 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 400 261 0.00928068810639313 0.0841373518483781 0.00926222629129473 0.0836194399938964 0.00138624961835603 0.0119001759438456 405676 3666771 667 665 0 True 402 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 446 261 0.00931946478122806 0.0713437748640312 0.00918593118181125 0.0699626153963531 0.00180957757532279 0.0119717935289379 407371 3109217 667 665 0 True 447 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 489 260 0.00933669123323438 0.0609199354531901 0.00926222629129473 0.0646066987106127 0.00194072771572879 0.0157919377646432 408124 2654938 667 665 0 True 492 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 533 259 0.00928768849724829 0.0780451701466989 0.00924696726939803 0.0761425192645151 0.0017790753256105 0.0263832326541817 405982 3401269 667 665 0 True 536 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 577 259 0.00902597453848036 0.0665328461919275 0.0089723048752575 0.0651865415426871 0.00180337032377702 0.0188725051457538 394542 2899553 667 665 0 True 581 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 626 260 0.00887969839753961 0.00878651194247922 0.00883497367818723 0.00878919661249714 0.00193961564787407 0.00190808318518395 388148 382923 667 665 0 False 626 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 665 260 0.0106685956632579 0.0410556489644803 0.00906385900663768 0.0407873655298695 0.011059328784898 0.00817473710711923 466344 1789237 667 665 0 True 671 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 268 305 0.00895768641200114 0.00886989733431771 0.00898756389715419 0.00883497367818723 0.00155493956334412 0.00151484309981 391557 386557 667 665 0 False 268 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 313 305 0.00907785978834799 0.00896585707803498 0.00909437705043107 0.0089417868314641 0.001368693767605 0.00129654507006969 396810 390739 667 665 0 False 313 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 357 305 0.00948145748595146 0.12034861702207 0.00950637064164187 0.121553368429084 0.00144166527609519 0.0319118901316462 414452 5244886 667 665 0 True 357 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 402 306 0.0091375003731826 0.0554543373769741 0.00915541313801785 0.0545967803463798 0.00143143457634355 0.00807828861917328 399417 2416743 667 665 0 True 402 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 446 305 0.00934609371899081 0.076757905291955 0.0093842984664683 0.0722362096589609 0.00171603427346639 0.0141269334632105 408535 3345169 667 665 0 True 447 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 491 304 0.00925216036980365 0.0433450758964245 0.00926222629129473 0.044083314259556 0.00196107599680289 0.00940510326048524 404429 1889012 667 665 0 True 492 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 534 303 0.00920745852754556 0.0434532199117616 0.00921644922560464 0.0458075837338827 0.00152047150571095 0.00923634156481058 402475 1893725 667 665 0 True 537 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 578 304 0.00912494084841306 0.0511816965164112 0.00918593118181125 0.0529945830472267 0.00193399870279964 0.00942016544531773 398868 2230538 667 665 0 True 581 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 626 303 0.00899449565672645 0.00903428174464543 0.00900282291905089 0.00909437705043107 0.00192500247956771 0.00209815875061595 393166 393721 667 665 0 False 626 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 671 303 0.00932843260219284 0.00874842175248145 0.00885023270008392 0.00885023270008392 0.00450146110736551 0.00193936498415044 407763 381263 667 665 0 False 671 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 269 350 0.00929112006139297 0.0566071392718464 0.0093842984664683 0.0547951476310369 0.00161218810785116 0.0127923671034386 406132 2466983 667 665 0 True 268 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 313 349 0.00914941933931181 0.0682400209725504 0.00918593118181125 0.0712901503013657 0.00138746315921192 0.020583515558969 399938 2973953 667 665 0 True 313 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 357 349 0.0093082092508335 0.0418680025768243 0.00933852140077821 0.0421911955443656 0.00151071316989328 0.00907279566597548 406879 1824640 667 665 0 True 358 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 402 350 0.00927711927968266 0.0351357450618994 0.00932326237888151 0.0359197375448234 0.00151424405383971 0.00527890816613946 405520 1531243 667 665 0 True 402 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 447 350 0.00955649435524856 0.0716354172223876 0.00959792477302205 0.068055237659266 0.0018375454283531 0.0122198015815166 417732 3121927 667 665 0 True 447 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 491 348 0.00924833989505591 0.0319461046757429 0.00926222629129473 0.0327611200122072 0.00178770951903222 0.00436583339023728 404262 1392236 667 665 0 True 492 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 534 347 0.00917428674081362 0.0284687686256153 0.00914015411612116 0.0289463645380331 0.00168517446122338 0.00350003220457468 401025 1240691 667 665 0 True 537 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 579 348 0.00975488451699991 0.0522907176386836 0.00917067215991455 0.052323186083772 0.00594034449580034 0.00944124375906601 426404 2278870 667 665 0 True 581 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 624 348 0.00908977875447719 0.0630542251715349 0.00910963607232776 0.0630960555428397 0.00206297075251156 0.0142280758472494 397331 2747952 667 665 0 True 626 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 667 348 0.00893878993211108 0.0655635655859722 0.0089723048752575 0.0653391317616541 0.00206235157942702 0.0186605123723128 390731 2857311 667 665 0 True 671 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 269 393 0.00921166791289638 0.0496958349180344 0.00927748531319142 0.0533760585946441 0.00154820039915203 0.0132729912897976 402659 2165783 667 665 0 True 268 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 314 393 0.0092690894195841 0.0345952544441901 0.00921644922560464 0.0341191729610132 0.00141947003246071 0.00575978335496638 405169 1507688 667 665 0 True 313 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 358 393 0.0094375792190881 0.0909532930518101 0.00933852140077821 0.0851300831616693 0.00152038050144545 0.0244177713985069 412534 3963815 667 665 0 True 358 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 402 393 0.00947484600569937 0.0710628482398489 0.00946059357595178 0.0681010147249561 0.00155485562915231 0.018672854404174 414163 3096974 667 665 0 True 403 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 447 393 0.00974422379105709 0.0468444400082376 0.00976577401388571 0.0479133287556268 0.0016881106263867 0.00850606241981627 425938 2041517 667 665 0 True 447 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 491 391 0.00966566384923812 0.0542809759578622 0.0097962920576791 0.0550240329594873 0.00180347385660102 0.0126868733727631 422504 2365607 667 665 0 True 492 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 535 391 0.00954757228847238 0.0421807551609626 0.00958266575112535 0.0433203631647211 0.00176849199286609 0.00522025435754636 417342 1838270 667 665 0 True 537 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 579 392 0.00952533575281483 0.0518800090177378 0.00947585259784848 0.0511482413977264 0.002510751657763 0.00821052806865469 416370 2260971 667 665 0 True 582 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 623 392 0.0091549327190376 0.0457848214034744 0.00910963607232776 0.0469367513542382 0.00197228487835407 0.00853436299502736 400179 1995338 667 665 0 True 626 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 668 391 0.00925321271614136 0.0942104861604687 0.00924696726939803 0.0891126878767071 0.00193063339993708 0.0180199198525846 404475 4105766 667 665 0 True 671 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 271 437 0.00911583576488249 0.0487240532092419 0.00915541313801785 0.0488136110475319 0.00152636548270638 0.00825639215102147 398470 2123432 667 665 0 True 269 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 314 436 0.00929009059214956 0.0549497111971965 0.00932326237888151 0.0554970626382849 0.00149530872263978 0.00977969846499428 406087 2394751 667 665 0 True 313 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 359 437 0.00950774326729974 0.0368136179313011 0.00947585259784848 0.0375677119096666 0.00147501276928853 0.00335373556305452 415601 1604366 667 665 0 True 358 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 403 437 0.00953659128320939 0.0551799503336047 0.00949111161974517 0.0562142366674296 0.00162316323323376 0.00850199404373409 416862 2404785 667 665 0 True 403 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 447 436 0.00989695127258984 0.101320570825094 0.00990310521095598 0.10235751888304 0.00189821160191232 0.0171627089119165 432614 4415629 667 665 0 True 448 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 491 435 0.0102234760395037 0.063328520431314 0.0101930266269932 0.0636301213092241 0.0021816751859788 0.0161371122755072 446887 2759906 667 665 0 True 492 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 535 435 0.00996555967838923 0.0545583459679182 0.00993362325474937 0.0532692454413672 0.00188953000958809 0.0116078687652387 435613 2377695 667 665 0 True 537 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 579 435 0.009234293359157 0.0334362801028665 0.00930800335698482 0.0339513237201495 0.0020346810664628 0.00444955388651861 403648 1457179 667 665 0 True 582 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 624 436 0.0104936545231619 0.0409147382073862 0.00976577401388571 0.0413977264057374 0.00538590893990428 0.00546496329881743 458697 1783096 667 665 0 True 627 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 668 435 0.00952222446799031 0.0735667734224552 0.00944533455405508 0.0734264133669032 0.00224160350769116 0.0120303102956906 416234 3206097 667 665 0 True 671 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 272 481 0.00901815057223048 0.0554534654328658 0.00903334096284428 0.0561226825360494 0.00154771120519388 0.0139307200853595 394200 2416705 667 665 0 True 269 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 316 480 0.00941671530908842 0.058776444429912 0.00941481651026169 0.0576943617914092 0.00160224802794324 0.0108578205472974 411622 2561523 667 665 0 True 314 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 360 480 0.00936105533866164 0.075818087218504 0.00941481651026169 0.0725871671625849 0.00163156759871358 0.0193976331168438 409189 3304211 667 665 0 True 358 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 404 481 0.00972274219951137 0.096212928751267 0.00976577401388571 0.0894789044022278 0.0017634221126108 0.0214502200785349 424999 4193034 667 665 0 True 403 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 448 480 0.0104431876531407 0.101447163342093 0.0104371709773404 0.0958571755550469 0.00206771451238822 0.031538348716673 456491 4421146 667 665 0 True 448 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 493 480 0.0110726966569359 0.0469039846124811 0.0110627908751049 0.0481269550621805 0.0020151984356385 0.0062273786301273 484008 2044112 667 665 0 True 493 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 537 479 0.0107056565560205 0.0440912994319169 0.0106660563057908 0.0458686198214694 0.00189753088171122 0.00700572325553509 467964 1921533 667 665 0 True 537 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 580 479 0.0101008319369727 0.114947382188591 0.0101930266269932 0.115220874341955 0.00202973592670299 0.0211924617207204 441526 5009496 667 665 0 True 582 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 625 480 0.00937167031041586 0.0636080244098459 0.0093690394445716 0.0669108110170138 0.00191465106343311 0.0149262069577909 409653 2772087 667 665 0 True 627 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 670 480 0.00933600492040544 0.0795063419592699 0.00935378042267491 0.0780804150453956 0.00204911961486951 0.0142690262961674 408094 3464948 667 665 0 True 672 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 272 525 0.0090298865216053 0.0529826970722756 0.00904859998474098 0.0561989776455329 0.00164496272599594 0.0119410348521107 394713 2309027 667 665 0 True 269 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 316 524 0.00939308327067869 0.108100165726745 0.00943007553215839 0.104005493247883 0.0014990235860843 0.0272651535479426 410589 4711089 667 665 0 True 314 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 361 524 0.0094168754487485 0.0648675017826094 0.00946059357595178 0.0651102464332036 0.00158156470499035 0.0256604503921108 411629 2826976 667 665 0 True 358 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 405 525 0.00955246798665213 0.0619429324054012 0.00946059357595178 0.0622110322728313 0.00165191824338053 0.00749699240438216 417556 2699521 667 665 0 True 403 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 449 524 0.0106295673403857 0.0613000801385473 0.0107118333714809 0.0610055695429923 0.00215857499594553 0.0072126402360598 464638 2671505 667 665 0 True 448 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 493 522 0.0112677238858255 0.0686488480298939 0.0112153810940719 0.0689402609292744 0.00192664075723884 0.0122128206327891 492533 2991770 667 665 0 True 493 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 537 522 0.0110228474684608 0.0794510423460803 0.0110322728313115 0.0762951094834821 0.00180137765294526 0.0172513617527288 481829 3462538 667 665 0 True 538 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 582 522 0.0101837385267083 0.060194799197582 0.0101472495613031 0.0612039368276493 0.00193696190647912 0.0124784382128079 445150 2623336 667 665 0 True 582 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 626 522 0.00959696393506154 0.0499136832697445 0.00946059357595178 0.049057755397879 0.00222410184806999 0.00672788473606373 419501 2175277 667 665 0 True 627 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 669 521 0.00937709218176446 0.0657207908762522 0.00927748531319142 0.0644083314259556 0.00197850312268047 0.0129296208109631 409890 2864163 667 665 0 True 672 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 272 567 0.00897724632762584 0.0459859880876373 0.00901808194094758 0.0467078660257877 0.0014140082430167 0.00937686927824503 392412 2004105 667 665 0 True 269 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 316 565 0.00920640618120786 0.0565008997660092 0.00926222629129473 0.056946669718471 0.00157877546457361 0.0130581149099981 402429 2462353 667 665 0 True 314 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 360 567 0.00952535862990912 0.0462979834571551 0.00943007553215839 0.0471808957045853 0.00173819601386519 0.00741818867691887 416371 2017702 667 665 0 True 359 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 405 567 0.00950204687081957 0.0523009744549059 0.009399557488365 0.0518959334706645 0.00171161721351327 0.00614023732639704 415352 2279317 667 665 0 True 403 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 449 566 0.0102129068219381 0.0947863134604651 0.0101472495613031 0.0879377431906615 0.00267559555498065 0.0216658915007687 446425 4130861 667 665 0 True 448 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 493 565 0.0105066029585345 0.0686987094653548 0.0105287251087205 0.0672922865644312 0.00215794890781032 0.0126126615708922 459263 2993943 667 665 0 True 493 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 537 564 0.0100335732797369 0.0579297637547749 0.0100709544518196 0.0580605783169299 0.00210915120818107 0.00896076727452396 438586 2524624 667 665 0 True 538 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 581 564 0.00949788323965735 0.0379167190119955 0.00952162966353857 0.0396124208438239 0.0018817497317794 0.00734487799538843 415170 1652440 667 665 0 True 582 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 625 565 0.00947894100557869 0.0486272444673139 0.0093842984664683 0.0491950865949493 0.00198047325171986 0.00835074341538267 414342 2119213 667 665 0 True 627 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 670 564 0.00924724179452961 0.0549694676150206 0.00929274433508812 0.0539406424048219 0.00175882205827862 0.00667468733272337 404214 2395612 667 665 0 True 672 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 269 610 0.00869482859851832 0.00850459864470056 0.00866712443732357 0.00849927519645991 0.00136727979965679 0.00139547567789635 380067 370637 667 665 0 False 269 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 314 610 0.0087015544642419 0.00881328980496561 0.00865186541542687 0.00881971465629053 0.00152483313006324 0.00146636471908566 380361 384090 667 665 0 False 314 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 360 609 0.00894702568605832 0.0760352242473889 0.00900282291905089 0.0742046234836347 0.00150570744518176 0.0129394767457906 391091 3313674 667 665 0 True 359 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 404 610 0.00917316576319302 0.0821252031428996 0.00921644922560464 0.0787823300526436 0.00149459902052398 0.0213978193835511 400976 3579080 667 665 0 True 404 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 448 609 0.00934247913809175 0.00917904741253454 0.00943007553215839 0.00929274433508812 0.00201172490500033 0.00206364465821152 408377 400030 667 665 0 False 448 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 493 609 0.017643341295706 0.0089994498721053 0.00959792477302205 0.00904859998474098 0.0344246343477878 0.0020126411423277 771223 392203 667 665 0 False 493 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 538 609 0.00959307482903089 0.00917193418428195 0.00912489509422446 0.00912489509422446 0.00506052843672766 0.00212984582204211 419331 399720 667 665 0 False 538 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 583 609 0.00897264803167196 0.00897758243170297 0.0089570458533608 0.0089570458533608 0.00170028411986055 0.00172114960910928 392211 391250 667 665 0 False 583 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 627 608 0.00900474459497191 0.00895186008050568 0.00906385900663768 0.00901808194094758 0.00156116553887975 0.00152038165356215 393614 390129 667 665 0 False 627 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 672 608 0.00916547905950893 0.00902379546944725 0.00921644922560464 0.00907911802853437 0.00152445174969543 0.00176491224476873 400640 393264 667 665 0 False 672 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 270 659 0.00854333648007766 0.0391009338406671 0.00848401617456321 0.0391393911650263 0.00132039217868325 0.00832376249318795 373445 1704049 667 665 0 True 270 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 314 653 0.00852254120136087 0.00840618368994126 0.0085297932402533 0.00833142595559625 0.00126590074915453 0.00126525294039215 372536 366348 667 665 0 False 314 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 359 653 0.00864626052732389 0.00871964759690483 0.00868238345922026 0.00880445563439384 0.00138936266727842 0.00121451027244153 377944 380009 667 665 0 False 359 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 404 653 0.00860716357316878 0.00901959637018846 0.00860608834973678 0.0089417868314641 0.00138696926148508 0.00148279442966129 376235 393081 667 665 0 False 404 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 449 653 0.00879212488056727 0.00875117526019214 0.00868238345922026 0.00863660639353018 0.0016308779878864 0.00165351204074338 384320 381383 667 665 0 False 449 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 493 653 0.00894460071406274 0.00882675904685036 0.0089723048752575 0.00889600976577401 0.00174093810910034 0.00175929909450183 390985 384677 667 665 0 False 493 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 538 652 0.00874657658582016 0.00885186185881275 0.00885023270008392 0.00892652780956741 0.00181730813064461 0.00175486377860511 382329 385771 667 665 0 False 538 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 583 652 0.00903771048785518 0.00892730797008543 0.00900282291905089 0.00891126878767071 0.00149037855936327 0.00130813137416685 395055 389059 667 665 0 False 583 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 628 652 0.00882930015880135 0.00889665225090651 0.00877393759060044 0.0089417868314641 0.00136636490085369 0.00144016024667419 385945 387723 667 665 0 False 628 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 668 657 0.00904260618603493 0.0408513845841429 0.00903334096284428 0.0404974441138323 0.00136210925702241 0.00820599656520914 395269 1780335 667 665 0 True 672 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A2_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A2_2.csv new file mode 100755 index 0000000..b6e4278 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A2_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 268 261 0.00712992096307076 0.724930040826488 0.00703440909437705 0.7228656443122 0.00187752107156606 0.196750846871212 311662 31593013 667 665 12 True 268 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 313 261 0.00578197968994445 0.00555648677656604 0.00575265125505455 0.00556954299229419 0.00137389774671774 0.00121456592860218 252741 242156 667 665 0 False 313 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 357 261 0.00537769567951204 0.00554037875645855 0.00537117570763714 0.00549324788281071 0.00124308167955388 0.00134757326104289 235069 241454 667 665 0 True 357 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 400 261 0.00543806833136419 0.00549237593870233 0.00550850690470741 0.00549324788281071 0.00134922360161975 0.00129435792250306 237708 239362 667 665 0 True 402 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 446 261 0.00559701838254597 0.00571059142477388 0.00563057907988098 0.00572213321126116 0.00163596210315782 0.00162430594599232 244656 248872 667 665 0 True 447 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 489 260 0.00552138670879712 0.00567626436198071 0.00556954299229419 0.00567635614557107 0.00153832192526274 0.00156625499476817 241350 247376 667 665 0 True 492 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 533 259 0.0057912449131351 0.00584966651006092 0.00575265125505455 0.00576791027695125 0.00145301935832431 0.00155300145660915 253146 254933 667 665 0 True 536 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 577 259 0.00604229814596021 0.00609075905602872 0.00604257267109178 0.00614938582436866 0.00170692591368972 0.00171063560360145 264120 265440 667 665 0 True 581 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 626 260 0.00749902000247301 0.00670534197705296 0.00694285496299687 0.00668345159075303 0.00415318825431372 0.0018606311808982 327796 292224 667 665 0 False 626 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 665 260 0.0087124439611277 0.752970501327707 0.00807202258335241 0.734157320515755 0.00415743155079566 0.167613295700384 380837 32815038 667 665 12 True 671 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 268 305 0.00574892228868399 0.00546913174444465 0.00572213321126116 0.00544747081712062 0.00148367438483396 0.00149390058352533 251296 238349 667 665 0 False 268 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 313 305 0.00533184998253906 0.00545068324278308 0.00531013962005036 0.00546272983901732 0.00124541696774571 0.00116243689357343 233065 237545 667 665 0 False 313 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 357 305 0.00531933621195811 0.00538783442928677 0.00529488059815366 0.00537117570763714 0.00118359937927549 0.00128597722893599 232518 234806 667 665 0 True 357 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 402 306 0.00545783414083757 0.00549914497849109 0.00541695277332723 0.00552376592660411 0.00143600633888612 0.00134041270121496 238572 239657 667 665 0 True 402 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 446 305 0.00560445343819278 0.00577968152241441 0.00563057907988098 0.00576791027695125 0.0016676926118769 0.00175043119516793 244981 251883 667 665 0 True 447 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 491 304 0.00586333063726777 0.00569758110084091 0.00590524147402152 0.00573739223315786 0.00170667050304094 0.00158448915731786 256297 248305 667 665 0 True 492 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 534 303 0.00584532636405533 0.00585774346601225 0.00588998245212482 0.00587472343022812 0.00159348537260858 0.00154408931869904 255510 255285 667 665 0 True 537 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 578 304 0.00604296158169485 0.00604544090829041 0.00610360875867857 0.00610360875867857 0.001800688907483 0.00179399781240887 264149 263465 667 665 0 True 581 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 626 303 0.00647327972543826 0.00638051985078283 0.00656137941557946 0.00650034332799268 0.00189893697867703 0.00197700535032415 282959 278068 667 665 0 False 626 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 671 303 0.00684782351328341 0.00652230255198536 0.00665293354695964 0.00646982528419928 0.00275838904904077 0.00193134519952705 299331 284247 667 665 0 False 671 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 269 350 0.00523853431489794 0.0051857269633227 0.00521858548867018 0.00518806744487678 0.00149803740180044 0.00147621814237279 228986 225998 667 665 0 True 268 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 313 349 0.0052292004604244 0.00552137955325485 0.00523384451056687 0.00552376592660411 0.00125637648878721 0.0012275844715093 228578 240626 667 665 0 True 313 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 357 349 0.00558008933276552 0.00556357705892105 0.0055390249485008 0.00558480201419089 0.00131656555966584 0.00131818559883973 243916 242465 667 665 0 True 358 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 402 350 0.00595337488042429 0.00595409328998853 0.00590524147402152 0.00602731364919509 0.00134694634056305 0.00132447720533477 260233 259484 667 665 0 True 402 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 447 350 0.0061696320528223 0.00616595276242793 0.00616464484626535 0.00611886778057527 0.00164343450165309 0.00171445798867007 269686 268717 667 665 0 True 447 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 491 348 0.005966254684514 0.00611407208797916 0.00611886778057527 0.00616464484626535 0.00169037420724483 0.00163616048885641 260796 266456 667 665 0 True 492 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 534 347 0.00589158384872567 0.00591347905125597 0.0059662775616083 0.00590524147402152 0.00154769267266951 0.00161127131248658 257532 257714 667 665 0 True 537 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 579 348 0.0062347860173827 0.00613350726323706 0.00613412680247196 0.00607309071488518 0.00245072543483889 0.00196318222532885 272534 267303 667 665 0 True 581 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 624 348 0.00597357535468933 0.00629871772587798 0.00592050049591821 0.00633249408712902 0.00198418104317788 0.00190342278259774 261116 274503 667 665 0 True 626 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 667 348 0.00598700420904219 0.00595301483280185 0.00601205462729839 0.00601205462729839 0.00179144682212701 0.00187448512065058 261703 259437 667 665 0 True 671 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 269 393 0.00531217568144287 0.0056131860895085 0.00537117570763714 0.00550850690470741 0.00139359663413516 0.00148422380706432 232205 244627 667 665 0 True 268 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 314 393 0.00558420720973915 0.0759323807343949 0.0055390249485008 0.074036774242771 0.00145311362858745 0.0192912314435369 244096 3309192 667 665 0 True 313 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 358 393 0.00578811075121629 0.00590228145323253 0.00581368734264134 0.00590524147402152 0.00131334642045912 0.00139552020208686 253009 257226 667 665 0 True 358 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 402 393 0.00587206968728957 0.00592414889363487 0.00587472343022812 0.00602731364919509 0.00150639022484573 0.00149211628524052 256679 258179 667 665 0 True 403 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 447 393 0.00611227917741747 0.00630176953025732 0.00611886778057527 0.00634775310902571 0.00153415812008524 0.00160965221913153 267179 274636 667 665 0 True 447 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 491 391 0.00602342454316444 0.00660912982846221 0.00604257267109178 0.00630197604333562 0.00167574227051654 0.00286146495711982 263295 288031 667 665 0 True 492 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 535 391 0.00604653040840532 0.00603043429126719 0.00604257267109178 0.00602731364919509 0.00170078658502788 0.00164436601621336 264305 262811 667 665 0 True 537 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 579 392 0.00610742923342632 0.00600629520700355 0.00608834973678187 0.00604257267109178 0.00193958112477021 0.00188797821104761 266967 261759 667 665 0 True 582 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 623 392 0.0057173747756472 0.00574666237578382 0.00569161516746777 0.00576791027695125 0.00194799824898545 0.00198816855133435 249917 250444 667 665 0 True 626 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 668 391 0.00532388875372339 0.00556956593819178 0.00527962157625696 0.0055390249485008 0.00178103617338972 0.00189690714573974 232717 242726 667 665 0 True 671 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 271 437 0.00534630830613533 0.00550967714548445 0.00535591668574044 0.00540169375143053 0.00146793384569788 0.00144612043515464 233697 240116 667 665 0 True 269 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 314 436 0.00550633358074911 0.00539001428955772 0.00552376592660411 0.00543221179522393 0.00140232223454036 0.00137265318952114 240692 234901 667 665 0 True 313 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 359 437 0.00571975399345418 0.00589509938728717 0.00567635614557107 0.00593575951781491 0.00138613442833886 0.00128462235930903 250021 256913 667 665 0 True 358 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 403 437 0.00592704334488741 0.0059497794612418 0.0059510185397116 0.00592050049591821 0.00152750747369271 0.0015176878913747 259082 259296 667 665 0 True 403 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 447 436 0.00617342965047575 0.00629442684302884 0.00628671702143893 0.00628671702143893 0.00181310880723031 0.00175986550364275 269852 274316 667 665 0 True 448 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 491 435 0.00603513761544497 0.00626381701564509 0.00602731364919509 0.00619516289005875 0.00178564767286431 0.00187827856125015 263807 272982 667 665 0 True 492 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 535 435 0.00603852342540106 0.00604835503728422 0.00608834973678187 0.00607309071488518 0.00173136429225195 0.00163290120542475 263955 263592 667 665 0 True 537 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 579 435 0.00565709363217224 0.00566832508141491 0.00569161516746777 0.00561532005798428 0.00179596303353897 0.00182398891004318 247282 247030 667 665 0 True 582 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 624 436 0.00600745633134451 0.00537553542817905 0.00550850690470741 0.00549324788281071 0.00351594283913832 0.00177496592252924 262597 234270 667 665 0 True 627 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 668 435 0.00520055833836343 0.00533760585946441 0.00517280842298009 0.00535591668574044 0.00184236962381874 0.00185597384581614 227326 232617 667 665 0 True 671 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 272 481 0.00537440137793314 0.00551038846830971 0.00537117570763714 0.0055542839703975 0.00162315962520412 0.00142828704206142 234925 240147 667 665 0 True 269 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 316 480 0.00541967514754868 0.00541208824303836 0.00538643472953384 0.00538643472953384 0.00148573480244198 0.00147522093793707 236904 235863 667 665 0 True 314 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 360 480 0.00570385441291714 0.00588589808235397 0.00576791027695125 0.00587472343022812 0.00155977617024198 0.00148099626231673 249326 256512 667 665 0 True 358 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 404 481 0.00582903787291522 0.00580104415306979 0.00582894636453803 0.00582894636453803 0.00162925391598432 0.00156574281812458 254798 252814 667 665 0 True 403 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 448 480 0.00632123855673445 0.00609901957916077 0.00645456626230259 0.00607309071488518 0.00185867883793843 0.00205688314962797 276313 265800 667 665 0 True 448 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 493 480 0.00619260065549738 0.00630339868898614 0.00617990386816205 0.00634775310902571 0.00185566164186664 0.00195922837251192 270690 274707 667 665 0 True 493 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 537 479 0.00594390376338496 0.00585590779420513 0.00590524147402152 0.00581368734264134 0.00179408880151465 0.00163529695342981 259819 255205 667 665 0 True 537 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 580 479 0.005420544477132 0.00556621583714379 0.00541695277332723 0.00558480201419089 0.00184821445139461 0.00196910211536889 236942 242580 667 665 0 True 582 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 625 480 0.00521028110344004 0.00521014139835742 0.00512703135729 0.00524910353246357 0.00177273861041288 0.00167392981500914 227751 227062 667 665 0 True 627 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 670 480 0.00502783627641432 0.00530532098155666 0.00505073624780652 0.00543221179522393 0.00182552523576717 0.0017807933132828 219776 231210 667 665 0 True 672 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 272 525 0.00544735643164913 0.0053217502442304 0.00541695277332723 0.00527962157625696 0.00154912721731734 0.00153327079537874 238114 231926 667 665 0 True 269 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 316 524 0.00560557441581338 0.00569416216210015 0.00563057907988098 0.00570687418936446 0.00148548034143128 0.00142421810286952 245030 248156 667 665 0 True 314 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 361 524 0.00564586097887197 0.00706536311022463 0.00560006103608759 0.00607309071488518 0.0014093287705191 0.00590712633751566 246791 307914 667 665 0 True 358 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 405 525 0.00580227167258669 0.00577977330600477 0.00584420538643473 0.00576791027695125 0.00157780887887242 0.00170637918155525 253628 251887 667 665 0 True 403 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 449 524 0.00581119373936287 0.00613720155274889 0.00584420538643473 0.00624093995574884 0.00182011713447415 0.00203004469305511 254018 267464 667 665 0 True 448 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 493 522 0.00589787504965759 0.00583371911123655 0.00592050049591821 0.00593575951781491 0.00176423415793152 0.00180215288098918 257807 254238 667 665 0 True 493 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 537 522 0.00595136169612607 0.00610448070278695 0.00590524147402152 0.00602731364919509 0.00165305062736926 0.00176039002659355 260145 266038 667 665 0 True 538 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 582 522 0.00563062483406958 0.00548728194943757 0.00564583810177768 0.00550850690470741 0.00160839166208381 0.00172156250999296 246125 239140 667 665 0 True 582 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 626 522 0.00543653556604623 0.00527526185571505 0.00537117570763714 0.00535591668574044 0.0019481952079504 0.00181480335603224 237641 229900 667 665 0 True 627 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 669 521 0.00509168624659975 0.0056382659555733 0.00517280842298009 0.00563057907988098 0.0017782742405211 0.00193681713557697 222567 245720 667 665 0 True 672 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 272 567 0.0055977046953749 0.00551366973166494 0.00556954299229419 0.00549324788281071 0.00142761748619096 0.00127652105935023 244686 240290 667 665 0 True 269 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 316 565 0.00562950385644898 0.00572082529509858 0.00561532005798428 0.00570687418936446 0.00138364477105472 0.00139858232052808 246076 249318 667 665 0 True 314 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 360 567 0.00569209558644802 0.00549942032926216 0.00573739223315786 0.00549324788281071 0.00138087646225942 0.0013511186280523 248812 239669 667 665 0 True 359 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 405 567 0.00526061071089541 0.00557342084898674 0.00531013962005036 0.00544747081712062 0.0015940185258005 0.00168243260623032 229951 242894 667 665 0 True 403 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 449 566 0.00599324965578552 0.00554655120291 0.00572213321126116 0.0055542839703975 0.00320427601544503 0.00189549894071865 261976 241723 667 665 0 True 448 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 493 565 0.00580513130937392 0.0059050579068408 0.00590524147402152 0.0059662775616083 0.00193459752784859 0.00200562025945666 253753 257347 667 665 0 True 493 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 537 564 0.00587314491072157 0.0059859192499445 0.00593575951781491 0.00605783169298848 0.00187210442744879 0.0018731540168097 256726 260871 667 665 0 True 538 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 581 564 0.00572133251296073 0.00581593604060506 0.00573739223315786 0.00575265125505455 0.00163830661251876 0.00164987900151359 250090 253463 667 665 0 True 582 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 625 565 0.00560941776765543 0.00543200528214563 0.0055542839703975 0.00537117570763714 0.00163024544293918 0.00167888420355702 245198 236731 667 665 0 True 627 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 670 564 0.00548016218487232 0.00537521418561281 0.00549324788281071 0.00538643472953384 0.00153025286920281 0.00176042538878923 239548 234256 667 665 0 True 672 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 269 610 0.00590162689312245 0.00586088705398195 0.00588998245212482 0.00585946440833143 0.00139646923012915 0.00142526202403837 257971 255422 667 665 0 False 269 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 314 610 0.0055879361761097 0.00548333525505226 0.00561532005798428 0.00549324788281071 0.00141870177773231 0.00141175433237472 244259 238968 667 665 0 False 314 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 360 609 0.00541148514779003 0.00551681331963463 0.00541695277332723 0.00560006103608759 0.00137069403399261 0.00144555229661415 236546 240427 667 665 0 True 359 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 404 610 0.00518150171881329 0.0053501572654456 0.00517280842298009 0.00534065766384375 0.00138916372325602 0.00136499314122004 226493 233164 667 665 0 True 404 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 448 609 0.00548210673788764 0.00549804357540682 0.00558480201419089 0.00556954299229419 0.00185109438625912 0.00201673274486956 239633 239609 667 665 0 False 448 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 493 609 0.012799299594881 0.00554879990087372 0.0059662775616083 0.00558480201419089 0.0255684014128231 0.00202014412370058 559481 241821 667 665 0 False 493 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 538 609 0.00660146008478937 0.00565776996852397 0.00592050049591821 0.00564583810177768 0.00723557268500909 0.00194614924221471 288562 246570 667 665 0 False 538 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 583 609 0.00549857824578212 0.00554432545084386 0.00543221179522393 0.00541695277332723 0.00156274362640075 0.00176397016023547 240353 241626 667 665 0 False 583 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 627 608 0.00558461899743651 0.00553289839384453 0.00558480201419089 0.00549324788281071 0.00143678895134895 0.00139074446162246 244114 241128 667 665 0 False 627 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 672 608 0.0056357721802866 0.00552401833147758 0.00569161516746777 0.00560006103608759 0.00151516361315171 0.00163421191097939 246350 240741 667 665 0 False 672 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 270 659 0.00760006812798682 0.739298624221345 0.00718699931334401 0.726787212939651 0.00231322638407503 0.190371336815464 332213 32219207 667 665 13 True 270 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 314 653 0.00596945747771571 0.00568817328282941 0.00588998245212482 0.00572213321126116 0.00165945111594663 0.00130107560128324 260936 247895 667 665 0 False 314 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 359 653 0.00529083135246293 0.0053106673756949 0.00529488059815366 0.00527962157625696 0.00127637806197797 0.00115454801994245 231272 231443 667 665 0 False 359 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 404 653 0.00524210314160841 0.005185933476401 0.00523384451056687 0.00518806744487678 0.00141135105493677 0.00134513757740622 229142 226007 667 665 0 False 404 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 449 653 0.00508660753166562 0.00524889701938527 0.00508125429159991 0.00524910353246357 0.00153287907026014 0.00161995839780112 222345 228751 667 665 0 False 449 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 493 653 0.0052531070239657 0.00521404220094755 0.00531013962005036 0.00521858548867018 0.0018117542365772 0.00166359585522956 229623 227232 667 665 0 False 493 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 538 652 0.0054259663484806 0.0056783753845589 0.00543221179522393 0.00567635614557107 0.00171315061001619 0.00170362241153643 237179 247468 667 665 0 False 538 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 583 652 0.00538078408724226 0.0055574046124696 0.00532539864194705 0.0055542839703975 0.0013439468446552 0.00127250678530912 235204 242196 667 665 0 False 583 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 628 652 0.00625015942475089 0.00573138040798953 0.0059510185397116 0.00570687418936446 0.00205238035128325 0.0014263089626774 273206 249778 667 665 0 False 628 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 668 657 0.00716942970492323 0.773056399295332 0.00714122224765393 0.765697718776227 0.00156741151458598 0.168903685446301 313389 33690397 667 665 15 True 672 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A2_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A2_3.csv new file mode 100755 index 0000000..7512371 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A2_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 268 261 0.000994718937166802 0.0736799425893642 0.000778210116731518 0.0715800717174029 0.000787812897782832 0.0226042986500714 43481 3211029 667 665 0 True 268 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 313 261 0.000957680921498509 0.000904756741934947 0.000854505226215 0.000823987182421607 0.000698522265349631 0.000671137681994076 41862 39430 667 665 0 False 313 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 357 261 0.000886212878911883 0.000968316878256525 0.000762951094834821 0.000869764248111696 0.000661706153797846 0.00068353132201599 38738 42200 667 665 0 True 357 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 400 261 0.000957932569535786 0.000875776073280019 0.000778210116731518 0.000717174029144732 0.000706168983217804 0.000655898240130901 41873 38167 667 665 0 True 402 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 446 261 0.000912635922825953 0.000917858849458276 0.000701915007248035 0.000625619897764553 0.000819930241103476 0.000888648745527 39893 40001 667 665 0 True 447 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 489 260 0.000885823968308819 0.000905215659886728 0.000671396963454643 0.000671396963454643 0.000809828569179288 0.000846270065759152 38721 39450 667 665 0 True 492 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 533 259 0.000973122960149589 0.00106390948761237 0.000762951094834821 0.000854505226215 0.000844031720513203 0.000923986814441681 42537 46366 667 665 0 True 536 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 577 259 0.000886556035326351 0.000847621456938295 0.00064087891966125 0.000564583810177768 0.000884059988876919 0.000864294715050613 38753 36940 667 665 0 True 581 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 626 260 0.00105104234332822 0.0010214366311751 0.00064087891966125 0.000625619897764553 0.0010813382762012 0.00104743335193041 45943 44515 667 665 0 False 626 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 665 260 0.00128642476655927 0.0771947951820499 0.00102235446707866 0.0738841840238041 0.00111414558734088 0.0212058640450636 56232 3364209 667 665 0 True 671 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 268 305 0.000951641368603865 0.000889956637990031 0.000778210116731518 0.000686655985351339 0.00076929433573906 0.000769691163557348 41598 38785 667 665 0 False 268 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 313 305 0.000816643635151982 0.000905445118862618 0.000671396963454643 0.00080872816052491 0.0006325466549694 0.000625010659584188 35697 39460 667 665 0 False 313 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 357 305 0.000859263661828962 0.000902186801404977 0.000732433051041428 0.000701915007248035 0.000635906503702969 0.000720847107850941 37560 39318 667 665 0 True 357 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 402 306 0.000899229945567386 0.000838764340468934 0.000732433051041428 0.00064087891966125 0.000731309979791928 0.000720650775287562 39307 36554 667 665 0 True 402 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 446 305 0.000933957374711591 0.000920589411271369 0.000671396963454643 0.000610360875867857 0.000881939240847377 0.000922142611218049 40825 40120 667 665 0 True 447 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 491 304 0.000959465334853745 0.000920612357168958 0.000717174029144732 0.000701915007248035 0.000921988099058194 0.000843241495062073 41940 40121 667 665 0 True 492 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 534 303 0.000987970194348923 0.000988601051725216 0.000762951094834821 0.000823987182421607 0.000875865716605994 0.000841330879096556 43186 43084 667 665 0 True 537 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 578 304 0.000901654917562963 0.000874399319424677 0.000503547722590982 0.000442511635004196 0.000979443306873934 0.000996836552402107 39413 38107 667 665 0 True 581 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 626 303 0.000983074496169173 0.00093224592724659 0.000625619897764553 0.000518806744487678 0.00102594432014595 0.00103388195671337 42972 40628 667 665 0 False 626 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 671 303 0.00105255223155188 0.00109176580728544 0.000701915007248035 0.000732433051041428 0.00110122146360292 0.00104026552420908 46009 47580 667 665 0 False 671 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 269 350 0.000950749161926247 0.000971414574431042 0.000747692072938125 0.000793469138628214 0.000791732978169387 0.000806860865303793 41559 42335 667 665 0 True 268 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 313 349 0.000880058940545749 0.00080150020278437 0.000732433051041428 0.000610360875867857 0.000726109885547981 0.000675355919657059 38469 34930 667 665 0 True 313 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 357 349 0.000868002711850758 0.000900328183700267 0.000747692072938125 0.00080872816052491 0.000655728449707025 0.000686031826682943 37942 39237 667 665 0 True 358 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 402 350 0.000920414134887237 0.000945095629896439 0.000686655985351339 0.000793469138628214 0.000789313317678754 0.000709223473753164 40233 41188 667 665 0 True 402 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 447 350 0.000920734414207408 0.000953172585847773 0.000625619897764553 0.000625619897764553 0.00089843214359843 0.000938677786052413 40247 41540 667 665 0 True 447 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 491 348 0.000837255897114386 0.000982038525014757 0.000579842832074464 0.000701915007248035 0.000822065734418395 0.000909844253410645 36598 42798 667 665 0 True 492 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 534 347 0.000977057820368827 0.00097614142933438 0.000778210116731518 0.000747692072938125 0.000843560412666967 0.000887422701550349 42709 42541 667 665 0 True 537 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 579 348 0.000961547150434853 0.000864371962178277 0.000549324788281071 0.000473029678797589 0.00109223764747742 0.0010074586818794 42031 37670 667 665 0 True 581 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 624 348 0.000938006620402319 0.000919327386903973 0.000442511635004196 0.000411993591210803 0.00105422921607086 0.00105707106372865 41002 40065 667 665 0 True 626 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 667 348 0.00104621527643137 0.0010155854272899 0.000671396963454643 0.00064087891966125 0.00103704073774746 0.00101934397398223 45732 44260 667 665 0 True 671 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 269 393 0.0009740837981101 0.000944889116818138 0.000823987182421607 0.00080872816052491 0.000787201397853778 0.000747053550485456 42579 41179 667 665 0 True 268 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 314 393 0.000903347822541007 0.0073088420295417 0.000747692072938125 0.0072327763790341 0.000713803193882865 0.00235439346620932 39487 318525 667 665 0 True 313 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 358 393 0.00095136684347229 0.000971345736738275 0.00080872816052491 0.000839246204318303 0.000727258202641945 0.00073726629606467 41586 42332 667 665 0 True 358 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 402 393 0.000923136509108687 0.000915701935084908 0.000686655985351339 0.000732433051041428 0.000807776203757471 0.000763915343592453 40352 39907 667 665 0 True 403 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 447 393 0.000858142684208365 0.000946633005034904 0.000625619897764553 0.00064087891966125 0.000832751032352712 0.000906085827615509 37511 41255 667 665 0 True 447 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 491 391 0.000884268325896562 0.00106326700247988 0.000579842832074464 0.000732433051041428 0.000886259223038775 0.000994365616367385 38653 46338 667 665 0 True 492 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 535 391 0.000977561116443381 0.00091730814791614 0.000778210116731518 0.000686655985351339 0.000876781130913502 0.000904881712502774 42731 39977 667 665 0 True 537 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 579 392 0.000966031060917241 0.000971024494172029 0.000610360875867857 0.000564583810177768 0.001027522108787 0.00103435815237274 42227 42318 667 665 0 True 582 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 623 392 0.000903279191258113 0.000917331093813729 0.000549324788281071 0.000473029678797589 0.000969718293906959 0.0010292825467408 39484 39978 667 665 0 True 626 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 668 391 0.00104831996910677 0.00113813946631284 0.000701915007248035 0.000686655985351339 0.00101460228589605 0.00113753683482119 45824 49601 667 665 0 True 671 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 271 437 0.000901037236016919 0.00097146046622622 0.000732433051041428 0.000793469138628214 0.000788327873980994 0.00085811367981376 39386 42337 667 665 0 True 269 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 314 436 0.000911675084865441 0.000896473272905312 0.000793469138628214 0.000717174029144732 0.000716727343737546 0.000787442937875612 39851 39069 667 665 0 True 313 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 359 437 0.000876627376401065 0.000954434610215169 0.000701915007248035 0.000839246204318303 0.00076298519637753 0.000707024484749551 38319 41595 667 665 0 True 358 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 403 437 0.0009338658663344 0.000935596028294586 0.000732433051041428 0.000747692072938125 0.000841452416411407 0.000803820231758885 40821 40774 667 665 0 True 403 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 447 436 0.000932516117770824 0.000955857255865689 0.000671396963454643 0.000595101853971161 0.000944627083629024 0.000996662703602584 40762 41657 667 665 0 True 448 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 491 435 0.000968639049667201 0.000911984699675488 0.000717174029144732 0.000579842832074464 0.000916691780983626 0.000941614226245584 42341 39745 667 665 0 True 492 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 535 435 0.000964292401750601 0.000931488712626152 0.000686655985351339 0.000686655985351339 0.000921193698277867 0.000879264627870096 42151 40595 667 665 0 True 537 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 579 435 0.000994330026563738 0.000881168359213438 0.000625619897764553 0.000442511635004196 0.00100889855429319 0.00102308993669461 43464 38402 667 665 0 True 582 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 624 436 0.00101077865736392 0.000935343623421107 0.00064087891966125 0.000564583810177768 0.00103649664348286 0.00094568383018913 44183 40763 667 665 0 True 627 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 668 435 0.00103333547234165 0.00107831951129827 0.000671396963454643 0.000656137941557946 0.00102542827897185 0.00108023988959977 45169 46994 667 665 0 True 671 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 272 481 0.000944252067145644 0.000951222184552707 0.000778210116731518 0.000762951094834821 0.000806056330292341 0.000832969321763682 41275 41455 667 665 0 True 269 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 316 480 0.000935993436104104 0.000993350852526143 0.000762951094834821 0.000900282291905089 0.000817795096223768 0.000829903290552819 40914 43291 667 665 0 True 314 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 360 480 0.000907968995589182 0.000918134200229344 0.000747692072938125 0.000762951094834821 0.000822387779640982 0.000818187763963865 39689 40013 667 665 0 True 358 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 404 481 0.000862123298616199 0.000969142930569729 0.000564583810177768 0.000762951094834821 0.000884636000243265 0.000867575422448077 37685 42236 667 665 0 True 403 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 448 480 0.000963834859864643 0.000895234194435505 0.000595101853971161 0.000457770656900893 0.00102217226365097 0.00104925618202361 42131 39015 667 665 0 True 448 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 493 480 0.000906459107365521 0.00095092388788405 0.000503547722590982 0.000457770656900893 0.000994537118916108 0.0010740669478116 39623 41442 667 665 0 True 493 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 537 479 0.000927025615139329 0.000936789214969215 0.000579842832074464 0.00064087891966125 0.000938857798641939 0.000908107364216924 40522 40826 667 665 0 True 537 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 580 479 0.000884474219745243 0.000819306219313447 0.000442511635004196 0.000289921416037232 0.000992149286208716 0.000998505803730431 38662 35706 667 665 0 True 582 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 625 480 0.000919682067869704 0.000904733796037358 0.000503547722590982 0.000564583810177768 0.000993095076113004 0.00090640521605791 40201 39429 667 665 0 True 627 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 670 480 0.000890101984942525 0.0010272878350603 0.000503547722590982 0.000625619897764553 0.000961317128684936 0.00104114174714874 38908 44770 667 665 0 True 672 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 272 525 0.000908838325172502 0.000934884705469327 0.000732433051041428 0.000762951094834821 0.000769194851802514 0.000812857696954905 39727 40743 667 665 0 True 269 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 316 524 0.000906161705139648 0.000853977470570452 0.000762951094834821 0.000747692072938125 0.000792096199784549 0.000743586881493428 39610 37217 667 665 0 True 314 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 361 524 0.000925401341444178 0.00102616348607844 0.000747692072938125 0.000854505226215 0.000773001265566975 0.000948929267393185 40451 44721 667 665 0 True 358 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 405 525 0.000834876679307405 0.000875936694563142 0.000534065766384375 0.000549324788281071 0.000832132329263401 0.000911493541084385 36494 38174 667 665 0 True 403 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 449 524 0.000911972487091314 0.000945049738101261 0.000488288700694286 0.000457770656900893 0.000988337537933468 0.00108016266971838 39864 41186 667 665 0 True 448 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 493 522 0.000941483938735599 0.000985205058882041 0.000564583810177768 0.000625619897764553 0.000965680373979113 0.000973529338210391 41154 42936 667 665 0 True 493 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 537 522 0.000907328436948841 0.000890392610044223 0.000625619897764553 0.000564583810177768 0.000921401547667368 0.00092506398907882 39661 38804 667 665 0 True 538 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 582 522 0.000893373409427124 0.000857052220847381 0.000549324788281071 0.000564583810177768 0.000959700053822809 0.000882769421847028 39051 37351 667 665 0 True 582 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 626 522 0.000897971705381001 0.000863752422943374 0.000503547722590982 0.000457770656900893 0.00101642657530556 0.000947400515464992 39252 37643 667 665 0 True 627 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 669 521 0.00091494650935004 0.00101911909551861 0.000564583810177768 0.000579842832074464 0.000982290861634187 0.00107004368997174 39994 44414 667 665 0 True 672 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 272 567 0.000944137681674155 0.000989564779423955 0.000793469138628214 0.000869764248111696 0.000724112725100869 0.000761523042484406 41270 43126 667 665 0 True 269 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 316 565 0.000886739052080735 0.000969785415702222 0.000732433051041428 0.000793469138628214 0.000753206029385488 0.000789631034330814 38761 42264 667 665 0 True 314 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 360 567 0.00102638083567509 0.00092196616512671 0.000869764248111696 0.000747692072938125 0.000800682572596367 0.000745921058745443 44865 40180 667 665 0 True 359 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 405 567 0.000914237319426805 0.000918753739464248 0.000701915007248035 0.000732433051041428 0.000801793241051035 0.000811851328321534 39963 40040 667 665 0 True 403 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 449 566 0.000943725893976793 0.000884449622568667 0.000564583810177768 0.000473029678797589 0.00100458109507745 0.00098918404828725 41252 38545 667 665 0 True 448 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 493 565 0.000866492823627097 0.000924903240018104 0.000473029678797589 0.000488288700694286 0.000976520625551209 0.00105120889566933 37876 40308 667 665 0 True 493 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 537 564 0.000903141928692326 0.000922723379747148 0.000534065766384375 0.000473029678797589 0.000984497856079716 0.000976707481299921 39478 40213 667 665 0 True 538 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 581 564 0.000945007011257475 0.000902301530892922 0.000701915007248035 0.00064087891966125 0.000853957394943172 0.000834209979238629 41308 39323 667 665 0 True 582 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 625 565 0.00092158086669643 0.000989518887628777 0.00064087891966125 0.000671396963454643 0.000867257099508281 0.000933106862156898 40284 43124 667 665 0 True 627 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 670 564 0.000981770501794193 0.00106349646145577 0.000732433051041428 0.000686655985351339 0.000892142885786215 0.00102130589098558 42915 46348 667 665 0 True 672 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 269 610 0.000950749161926247 0.00097848191088846 0.000762951094834821 0.000854505226215 0.000757442995775424 0.000729192096239853 41559 42643 667 665 0 False 269 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 314 610 0.000946333882726753 0.000878942607147303 0.000793469138628214 0.000747692072938125 0.000757218470872163 0.000681583645752926 41366 38305 667 665 0 False 314 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 360 609 0.000875323382026085 0.000991400451231076 0.000762951094834821 0.000885023270008392 0.000723023133900857 0.000786810376315484 38262 43206 667 665 0 True 359 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 404 610 0.000831513746445615 0.000863706531148196 0.000625619897764553 0.000686655985351339 0.000746705306896951 0.000725698347298214 36347 37641 667 665 0 True 404 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 448 609 0.000908769693889608 0.000888189803875677 0.000518806744487678 0.000411993591210803 0.000960078156906061 0.00101827847298876 39724 38708 667 665 0 False 448 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 493 609 0.00159535704795805 0.000870337895551421 0.000625619897764553 0.000335698481727321 0.00274930808080903 0.00104062684651558 69736 37930 667 665 0 False 493 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 538 609 0.000946127988878072 0.000943168174498962 0.000534065766384375 0.000473029678797589 0.00112468640884772 0.00108785566222403 41357 41104 667 665 0 False 538 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 583 609 0.000994513043318121 0.000884587297954201 0.000701915007248035 0.000549324788281071 0.000918549756468293 0.000922209670150708 43472 38551 667 665 0 False 583 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 627 608 0.00101011522162929 0.000947390219655341 0.00080872816052491 0.000732433051041428 0.000803372049172552 0.000788527651569661 44154 41288 667 665 0 False 627 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 672 608 0.00101125907634418 0.0011355006880901 0.000823987182421607 0.000885023270008392 0.000847177307147555 0.000944675938983673 44204 49486 667 665 0 False 672 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 270 659 0.00113678569275673 0.0750825105794929 0.00100709544518196 0.0723582818341344 0.000787402600003711 0.0217627647137138 49691 3272154 667 665 0 True 270 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 314 653 0.00090613882804535 0.000971162169557563 0.000823987182421607 0.000885023270008392 0.00063046800429709 0.000662139196993514 39609 42324 667 665 0 False 314 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 359 653 0.000928192346948522 0.000931970576475522 0.000762951094834821 0.000854505226215 0.000727565626766447 0.000626852190867512 40573 40616 667 665 0 False 359 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 404 653 0.0008816832142409 0.000885986997707131 0.000701915007248035 0.000701915007248035 0.000702800200934199 0.000736261070995884 38540 38612 667 665 0 False 404 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 449 653 0.000904423045973008 0.00090842808554919 0.000625619897764553 0.000686655985351339 0.000834774690283841 0.000819091854762771 39534 39590 667 665 0 False 449 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 493 653 0.000881866230995283 0.000901223073706239 0.000579842832074464 0.000595101853971161 0.000904039179177117 0.000898434899183186 38548 39276 667 665 0 False 493 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 538 652 0.000911560699393951 0.000960239922305191 0.000518806744487678 0.000625619897764553 0.000946140274235498 0.000902714902628989 39846 41848 667 665 0 False 538 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 583 652 0.00090526949846203 0.000891356337742961 0.000717174029144732 0.000732433051041428 0.000755572958925902 0.000653474667647025 39571 38846 667 665 0 False 583 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 628 652 0.00101773329403049 0.000941011260125594 0.000854505226215 0.000793469138628214 0.000777071669941652 0.000740938474746108 44487 41010 667 665 0 False 628 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 668 657 0.0011501916700153 0.07982021889239 0.00100709544518196 0.076401922636759 0.000796167740444178 0.0215880771073536 50277 3478627 667 665 0 True 672 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A3_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A3_1.csv new file mode 100755 index 0000000..4047d1e --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A3_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 266 273 0.00966731100002757 0.0413648449344923 0.00964370183871214 0.0416418707560845 0.00155405236457974 0.00952798137152255 422576 1802712 667 665 0 True 265 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 309 273 0.00957442999717811 0.00943656922117608 0.00964370183871214 0.00946059357595178 0.00136992193809349 0.00125873472721466 418516 411253 667 665 0 False 309 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 354 274 0.00978860535399501 0.0647408174820205 0.00984206912336919 0.0644235904478523 0.00144963931734156 0.0124401157529577 427878 2821455 667 665 0 True 354 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 398 273 0.00970709426701161 0.0863736590274037 0.00965896086060884 0.0844892042420081 0.00145201080571477 0.0156968547843031 424315 3764231 667 665 0 True 398 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 442 273 0.00944476262669764 0.0711293225051643 0.00944533455405508 0.0681925688563363 0.00172781855990058 0.0169732443654092 412848 3099871 667 665 0 True 443 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 486 272 0.00940799913616092 0.0624911098988029 0.00941481651026169 0.0671244373235676 0.00170342409704143 0.0202404833504345 411241 2723411 667 665 0 True 488 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 531 271 0.00942183977821115 0.0784076464909126 0.00941481651026169 0.0788586251621271 0.0015429265723175 0.0274879683744439 411846 3417066 667 665 0 True 532 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 575 271 0.00954221904840667 0.0646298052294848 0.00941481651026169 0.0638284885938811 0.00231859951991114 0.0208060606510639 417108 2816617 667 665 0 True 577 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 622 272 0.00941749313029455 0.00922358539975482 0.00932326237888151 0.00914015411612116 0.0020089904244515 0.0019371350342161 411656 401971 667 665 0 False 622 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 660 272 0.00897964842252712 0.04163620311938 0.0089570458533608 0.0409552147707332 0.00179160359552175 0.00917613906578713 392517 1814538 667 665 0 True 666 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 265 317 0.00945739078275008 0.0093232853247791 0.00949111161974517 0.00935378042267491 0.00154467841496277 0.00150419737937397 413400 406316 667 665 0 False 265 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 309 317 0.00938594561725775 0.00932271167733938 0.0093842984664683 0.00929274433508812 0.00135544441196168 0.00122364802443498 410277 406291 667 665 0 False 309 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 353 318 0.00975218501987276 0.104897216719987 0.00965896086060884 0.103242542153048 0.00144468665735462 0.0253209429544885 426286 4571502 667 665 0 True 354 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 398 319 0.00974022029955496 0.0507935207668978 0.0097962920576791 0.0506294346532387 0.00145971881592058 0.0074181084446582 425763 2213621 667 665 0 True 399 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 441 318 0.00983282677727284 0.0728546704366776 0.00985732814526589 0.0709086747539483 0.00172762956837619 0.0169511579150244 429811 3175063 667 665 0 True 443 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 486 316 0.0095125474571023 0.0410776999720634 0.00961318379491875 0.0433051041428244 0.00177060996688331 0.00788183987341288 415811 1790198 667 665 0 True 488 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 532 316 0.00940847955514118 0.0400796222646339 0.00933852140077821 0.0434882124055848 0.00165007284566282 0.00929778981915265 411262 1746701 667 665 0 False 532 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 575 316 0.0094473934925419 0.0515642505210153 0.00947585259784848 0.0537727931639582 0.00191032960469455 0.0115682690243162 412963 2247210 667 665 0 True 577 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 622 316 0.00923658106858679 0.00916608298039675 0.00923170824750134 0.00914015411612116 0.00202613845866479 0.00210107083017828 403748 399465 667 665 0 False 622 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 666 316 0.00920800757780872 0.00931364804779171 0.00927748531319142 0.00929274433508812 0.00193516318130915 0.00191185189574915 402499 405896 667 665 0 False 666 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 265 362 0.00963313262114651 0.0587927819089954 0.00967421988250553 0.057801174944686 0.00164974850228606 0.0172456423066241 421082 2562235 667 665 0 True 265 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 310 362 0.00979096169470769 0.0669495436921441 0.00978103303578241 0.0710612649729152 0.00147027056962942 0.0196091525299496 427981 2917713 667 665 0 True 309 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 354 362 0.00973344867964278 0.0405482922228896 0.00975051499198901 0.0413519493400473 0.00151315924468452 0.00906420634746445 425467 1767126 667 665 0 True 354 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 398 362 0.00960229429803295 0.0348748960981075 0.00961318379491875 0.0365453574425879 0.00153518382935902 0.00615693360357644 419734 1519875 667 665 0 True 399 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 442 362 0.00955038617107102 0.0745772189686852 0.00953688868543526 0.0720073243305104 0.00184748468821798 0.0152950053747157 417465 3250133 667 665 0 True 443 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 487 361 0.00996645188506685 0.0318104255832991 0.00971999694819562 0.0328374151216907 0.00270525472621377 0.00473852080020082 435652 1386323 667 665 0 True 488 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 531 360 0.00939484480693963 0.0287775745153683 0.009399557488365 0.0294956893263142 0.00173582452171124 0.00420051202223303 410666 1254149 667 665 0 True 533 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 575 360 0.00966989611168323 0.0514436927750826 0.00967421988250553 0.0524605172808423 0.00190779226573777 0.00998502100280477 422689 2241956 667 665 0 True 577 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 619 360 0.00954565061255136 0.0615600571582309 0.00959792477302205 0.0626535439078355 0.00207204167994892 0.0153999350328416 417258 2682835 667 665 0 True 622 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 664 360 0.0095060046081331 0.068339537330394 0.00950637064164187 0.0688487067978943 0.00202200158549502 0.0206528937407108 415525 2978290 667 665 0 True 667 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 266 406 0.00942417324182953 0.0453742734038117 0.00941481651026169 0.0492408636606394 0.00157299482665037 0.0115320541590109 411948 1977446 667 665 0 True 265 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 311 408 0.00946441405069953 0.0348274898736886 0.00952162966353857 0.034378576333257 0.00143327476814973 0.00685046069823874 413707 1517809 667 665 0 True 310 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 354 406 0.00966861499440255 0.0896830081612821 0.00967421988250553 0.0865186541542687 0.00145430852634574 0.0259529259741071 422633 3908455 667 665 0 True 354 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 399 406 0.00954649706504038 0.0690090756761439 0.00955214770733196 0.0680704966811627 0.00153160184280661 0.0200324526488916 417295 3007469 667 665 0 True 399 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 444 407 0.00975216214277846 0.0459918851833176 0.00978103303578241 0.0470283054856184 0.001655412780711 0.00889098655983835 426285 2004362 667 665 0 True 443 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 487 405 0.00986748557513415 0.0540554636763573 0.00994888227664607 0.0550240329594873 0.00190148863248095 0.0134468042310307 431326 2355779 667 665 0 True 488 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 531 405 0.00977449018681321 0.0420557459108976 0.00973525597009232 0.0441138323033494 0.00164524967116391 0.00782337992230133 427261 1832822 667 665 0 True 533 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 576 405 0.00966932418432578 0.0555911178725023 0.00967421988250553 0.054184786755169 0.00179671181143226 0.0104214981506178 422664 2422704 667 665 0 True 577 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 619 404 0.00975291708689029 0.0505665858397424 0.0098268101014725 0.0520332646677348 0.00194237033478252 0.0112613439580494 426318 2203731 667 665 0 True 622 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 664 405 0.00975994035483975 0.0916815958412855 0.00978103303578241 0.0856183718623636 0.00188416378062057 0.0201491672428552 426625 3995555 667 665 0 True 667 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 266 450 0.00945638419060097 0.0439894196466217 0.00952162966353857 0.0453955901426719 0.00160003452498736 0.00991955283599426 413356 1917093 667 665 0 True 265 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 311 451 0.00961128499609202 0.0625805759535024 0.00962844281681544 0.0617074845502403 0.00156258670288543 0.0121396465969407 420127 2727310 667 665 0 True 310 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 354 450 0.009822394822273 0.0362146382206374 0.00985732814526589 0.0381628137636378 0.00145280684213819 0.00721360616095142 429355 1578262 667 665 0 True 354 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 399 451 0.00975962007551958 0.0539413537276471 0.00985732814526589 0.055741206988632 0.00166958774566497 0.0104163901826438 426611 2350806 667 665 0 True 399 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 444 450 0.010071137468574 0.101203477909698 0.0102235446707866 0.0998092622262913 0.00186526900926977 0.0159676472013063 440228 4410526 667 665 0 True 444 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 487 449 0.0101756857895154 0.0635715404326793 0.0101777676050965 0.064438849469749 0.00183371166182378 0.0214126015094964 444798 2770497 667 665 0 True 488 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 532 449 0.00987908426194319 0.0540835953468014 0.00996414129854276 0.0537575341420615 0.00182211238272448 0.0130660026416193 431833 2357005 667 665 0 True 533 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 576 448 0.00978606599652794 0.0347278587863571 0.00971999694819562 0.0355535210193027 0.00194347520332586 0.00631102356618414 427767 1513467 667 665 0 True 578 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 620 449 0.00957616865634475 0.040527273780698 0.00965896086060884 0.0414282444495308 0.00183939949300415 0.00669220277679917 418592 1766210 667 665 0 True 622 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 665 450 0.00969007370885397 0.0760133109151914 0.00970473792629892 0.0748455024032959 0.00187298537246748 0.0148795179249665 423571 3312719 667 665 0 True 667 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 268 496 0.00946137139715791 0.0554394684353365 0.00946059357595178 0.0564888990615702 0.00155526768338204 0.0153378178727386 413574 2416095 667 665 0 True 265 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 312 496 0.0097386646571427 0.0575930556535537 0.00973525597009232 0.057099259937438 0.00152105572637307 0.0081152250600705 425695 2509950 667 665 0 True 310 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 356 496 0.00993348599218358 0.0743038415448096 0.00993362325474937 0.0709544518196384 0.00156326650397418 0.019744437145892 434211 3238219 667 665 0 True 354 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 400 496 0.0100330928607566 0.0984021050566448 0.0100251773861295 0.0914473182269017 0.00165163323470107 0.0301247815692645 438565 4288440 667 665 0 True 399 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 444 495 0.0102508599213783 0.106723756059868 0.0101777676050965 0.101991302357519 0.00190484214951214 0.0374391267909449 448084 4651104 667 665 0 True 444 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 489 493 0.0100850696190014 0.0496674049509216 0.010101472495613 0.0503395132372015 0.00178696203868742 0.0117343897928699 440837 2164544 667 665 0 True 488 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 533 490 0.010033893559057 0.0394185050632991 0.0101167315175097 0.0441596093690394 0.00182102984803607 0.011891500386773 438600 1717889 667 665 0 False 533 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 577 493 0.0100212882800989 0.119231633673334 0.00994888227664607 0.120454718852522 0.00196105738861371 0.027441122230514 438049 5196207 667 665 0 True 578 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 621 492 0.00963098217428251 0.0638152488109723 0.00961318379491875 0.0692912184328985 0.00186725216056771 0.0173722638939521 420988 2781118 667 665 0 True 622 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 666 494 0.009488640893561 0.0775386394574213 0.00950637064164187 0.0743877317463951 0.00203487566932684 0.014513379141379 414766 3379194 667 665 0 True 667 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 268 539 0.00930038528458362 0.0534007483804499 0.00935378042267491 0.057099259937438 0.00156837968556996 0.0128016270645339 406537 2327246 667 665 0 True 265 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 312 540 0.00955889645014984 0.115575136054832 0.00953688868543526 0.113481345845731 0.00152649648121579 0.0274181198246987 417837 5036854 667 665 0 True 310 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 357 540 0.00976177052238358 0.0621793669341585 0.00984206912336919 0.0647592889295796 0.00147880663749844 0.0129182676756351 426705 2709825 667 665 0 True 355 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 401 539 0.0100557869383001 0.0639302307037908 0.00996414129854276 0.0630502784771496 0.00158099383471529 0.00830005818583402 439557 2786129 667 665 0 True 399 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 446 539 0.0100868082781681 0.0615287589539195 0.0101472495613031 0.0614175631342031 0.0019252967402548 0.00856092845207234 440913 2681471 667 665 0 True 444 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 489 537 0.0100428613800218 0.0687215635793535 0.0100404364080262 0.0674448767833982 0.00194211751423927 0.014672159060717 438992 2994939 667 665 0 True 488 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 534 537 0.00996498775103179 0.0820968879052748 0.00996414129854276 0.08378728923476 0.00192305403434553 0.0199717902998058 435588 3577846 667 665 0 True 533 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 578 537 0.00988263021155936 0.0614666673550436 0.00991836423285267 0.0619058518348974 0.00168314955398574 0.0126152926114119 431988 2678765 667 665 0 True 578 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 622 537 0.00970208418336037 0.0511877083415795 0.00965896086060884 0.0502937361715114 0.00183423712347913 0.00654872838622121 424096 2230800 667 665 0 True 622 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 666 537 0.00943437642588639 0.069717071346253 0.00946059357595178 0.0686808575570306 0.00188785757928228 0.0148927896829034 412394 3038324 667 665 0 True 667 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 270 584 0.00905246621367732 0.0481942094880139 0.00903334096284428 0.0488746471351186 0.00131418608420015 0.00936419407651491 395700 2100341 667 665 0 True 265 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 313 583 0.00932390293752185 0.0589670789470816 0.00926222629129473 0.0597695887693599 0.00150705434426508 0.0114304882121294 407565 2569831 667 665 0 True 310 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 357 583 0.00974987443334867 0.0481661007634674 0.00970473792629892 0.0484016174563211 0.0014941324812944 0.00719769667070414 426185 2099116 667 665 0 True 355 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 402 583 0.00989784347926746 0.0541794633069283 0.00991836423285267 0.0531013962005035 0.00150288172332019 0.00743008501585241 432653 2361183 667 665 0 True 399 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 446 582 0.010001247945494 0.099032268242132 0.0100862134737163 0.0937056534676127 0.00194307607119151 0.0225156611718995 437173 4315903 667 665 0 True 444 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 490 580 0.010027053307862 0.0689965013242651 0.0100862134737163 0.0658121614404517 0.00191222417029069 0.0131832926398694 438301 3006921 667 665 0 True 489 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 534 580 0.00989338244587937 0.0584513469528708 0.00971999694819562 0.0579842832074464 0.00292690231099042 0.00763886448720534 432458 2547355 667 665 0 True 533 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 578 579 0.00969261306632104 0.0390786763200058 0.00976577401388571 0.0411383230334936 0.00175750935900714 0.00781571915390787 423682 1703079 667 665 0 True 578 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 622 579 0.00944986421872607 0.0501860281282286 0.0093690394445716 0.0497901884489204 0.00164762600555795 0.00746737501275396 413071 2187146 667 665 0 True 623 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 666 580 0.00939209955562388 0.0570468973991399 0.00941481651026169 0.0559090562294957 0.00159187037873625 0.00846477793946881 410546 2486148 667 665 0 True 667 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 266 621 0.00932731162457224 0.00908159618547399 0.00906385900663768 0.00915541313801785 0.0022893601870699 0.00142673918747462 407714 395783 667 665 0 False 266 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 310 621 0.00921871405794013 0.00903614036235014 0.00914015411612116 0.00898756389715419 0.00142208048346302 0.0013115103898888 402967 393802 667 665 0 False 310 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 357 625 0.00960018960535754 0.0815348281438318 0.00950637064164187 0.0785687037460899 0.00145442941375931 0.0130039768140042 419642 3553351 667 665 0 True 355 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 401 625 0.00957635167309913 0.0859863552219987 0.00955214770733196 0.0829785610742351 0.00138498430935166 0.0204774604429037 418600 3747352 667 665 0 True 399 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 444 621 0.00942485955465847 0.00946633005034904 0.00946059357595178 0.00956740672922866 0.00181032892894693 0.00189582455093516 411978 412550 667 665 0 False 444 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 489 621 0.00945249508457033 0.00945465058847623 0.00949111161974517 0.00947585259784848 0.00194689146016223 0.00207655894169156 413186 412041 667 665 0 False 489 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 533 620 0.00925447095632774 0.00948200209840233 0.00929274433508812 0.009399557488365 0.00195964813722857 0.00208385744127158 404530 413233 667 665 0 False 533 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 578 620 0.00919647752228258 0.00937115046714979 0.00920119020370794 0.00947585259784848 0.00172488597041904 0.00177264555653752 401995 408402 667 665 0 False 578 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 623 620 0.00928384514540624 0.0092593580540961 0.00930800335698482 0.00930800335698482 0.00150625515320876 0.00141737773376952 405814 403530 667 665 0 False 623 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 667 620 0.00914585051260133 0.00917948338458873 0.00915541313801785 0.00912489509422446 0.00161520049575731 0.00160992642175709 399782 400049 667 665 0 False 667 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 266 671 0.00890669336881113 0.0403987767541995 0.00892652780956741 0.0401464866102083 0.00136222444314225 0.00921091405937319 389328 1760610 667 665 0 True 266 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 310 665 0.00908826886625353 0.00879819140435203 0.00903334096284428 0.00875867856870375 0.0014134358814102 0.00127167345595905 397265 383432 667 665 0 False 310 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 355 664 0.00917071791410315 0.00896496218802901 0.00923170824750134 0.00901808194094758 0.00137235893536967 0.00131065773531055 400869 390700 667 665 0 False 355 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 400 664 0.00907431383873181 0.00913434880403114 0.00909437705043107 0.00926222629129473 0.00137563278246732 0.00136500141155985 396655 398082 667 665 0 False 400 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 444 664 0.00921320067821434 0.0090905450855337 0.00912489509422446 0.00906385900663768 0.00153736582277763 0.00156774636025671 402726 396173 667 665 0 False 444 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 489 664 0.00916227626630722 0.00905977463686683 0.00918593118181125 0.00900282291905089 0.00165303145312314 0.00159147445900664 400500 394832 667 665 0 False 489 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 534 664 0.0088656976158293 0.00889550495602706 0.00883497367818723 0.00892652780956741 0.00179043867332055 0.0018219337361796 387536 387673 667 665 0 False 534 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 578 664 0.00910226964796384 0.00898529225329288 0.00920119020370794 0.0089417868314641 0.00157846482935247 0.00138316987429433 397877 391586 667 665 0 False 578 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 623 664 0.00912832665836914 0.00914332064998844 0.00915541313801785 0.00917067215991455 0.00133419741270724 0.0014852780777521 399016 398473 667 665 0 False 623 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 661 669 0.0091352812950357 0.0405924401298508 0.00924696726939803 0.0412909132524605 0.00147838685687733 0.0102894827295597 399320 1769050 667 665 0 True 667 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A3_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A3_2.csv new file mode 100755 index 0000000..1120606 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A3_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 266 273 0.00801652275258571 0.741902203437181 0.00793469138628214 0.747920958266575 0.00166158617563237 0.197721296228233 350417 32332673 667 665 13 True 265 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 309 273 0.00645925606663366 0.00629933726511289 0.0063782711528191 0.00625619897764553 0.0014691856482545 0.00131623143909526 282346 274530 667 665 0 False 309 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 354 274 0.0059205920042954 0.00579418332969067 0.005981536583505 0.00581368734264134 0.00125202657266259 0.00125595796939456 258800 252515 667 665 0 True 354 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 398 273 0.00576669779095346 0.00607247117565027 0.00573739223315786 0.00604257267109178 0.00125637503997615 0.00125657285208147 252073 264643 667 665 0 True 398 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 442 273 0.00597323219827486 0.00601639140194271 0.0059510185397116 0.00613412680247196 0.00160017613432778 0.00163061286172974 261101 262199 667 665 0 True 443 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 486 272 0.00627928196579211 0.0065519027598752 0.00631723506523232 0.00657663843747616 0.00164931664450012 0.00159532935033841 274479 285537 667 665 0 True 488 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 531 271 0.00622112839208686 0.00646418059339238 0.00625619897764553 0.0064087891966125 0.00150978129060266 0.00157331157623259 271937 281714 667 665 0 True 532 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 575 271 0.00662998782137885 0.00665543464979684 0.00662241550316625 0.00669871061264973 0.00185008909821891 0.00179883163930792 289809 290049 667 665 0 True 577 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 622 272 0.0109252995383746 0.00720184530908411 0.00755321583886473 0.00727855344472419 0.0199351893799157 0.00183400775869265 477565 313862 667 665 0 False 622 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 660 272 0.00852025349193108 0.754040147289717 0.00856031128404669 0.745952544441901 0.0019206819794111 0.175869890520994 372436 32861654 667 665 13 True 666 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 265 317 0.00628772361358803 0.00591471812972578 0.00631723506523232 0.00590524147402152 0.00155513691590361 0.00148135393506737 274848 257768 667 665 0 False 265 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 309 317 0.00585093125215831 0.00576772670977054 0.00576791027695125 0.00575265125505455 0.00122776081512441 0.00115192935931332 255755 251362 667 665 0 False 309 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 353 318 0.00579749035987843 0.00579569775893155 0.00576791027695125 0.00578316929884794 0.00127485083829387 0.00132285713456883 253419 252581 667 665 0 True 354 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 398 319 0.00602047339800002 0.00603243058435744 0.00602731364919509 0.00602731364919509 0.00135469331020159 0.00129305049920836 263166 262898 667 665 0 True 399 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 441 318 0.00624583565392859 0.00631138386134712 0.00617990386816205 0.00631723506523232 0.00161021541253954 0.001728844484097 273017 275055 667 665 0 True 443 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 486 316 0.0062218147049158 0.00680098047820398 0.00619516289005875 0.00683604180972 0.00165154442743348 0.00163601579245857 271967 296392 667 665 0 True 488 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 532 316 0.00647645964154567 0.00665816521160994 0.00650034332799268 0.00672922865644312 0.00148957069085219 0.00158406057233312 283098 290168 667 665 0 False 532 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 575 316 0.00674409876773675 0.00684287968720152 0.00679026474402991 0.00685130083161669 0.00177595264073482 0.00171784355961011 294797 298218 667 665 0 True 577 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 622 316 0.00679232368251672 0.00710244368072849 0.00689707789730678 0.0072327763790341 0.00195531976491222 0.00202649067663502 296905 309530 667 665 0 False 622 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 666 316 0.00714065032029648 0.00740507712403003 0.0072480354009308 0.00740062561989776 0.00205580970779786 0.00178993193293116 312131 322719 667 665 0 False 666 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 265 362 0.00587508946373689 0.00571433160608089 0.00584420538643473 0.00569161516746777 0.00150447601876957 0.00142232850286383 256811 249035 667 665 0 True 265 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 310 362 0.00594978317661952 0.00600292216005796 0.0059662775616083 0.00610360875867857 0.00137470671794061 0.0012621921524992 260076 261612 667 665 0 True 309 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 354 362 0.00629154408833578 0.00605243940705506 0.00625619897764553 0.00607309071488518 0.00134576806778076 0.00131206321009237 275015 263770 667 665 0 True 354 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 398 362 0.00626187249703141 0.00647468981448815 0.00627145799954223 0.00645456626230259 0.0013586538909492 0.00135871865690424 273718 282172 667 665 0 True 399 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 442 362 0.00653305757283867 0.00648230785248771 0.00651560234988937 0.00651560234988937 0.00162240683545514 0.00175473883058562 285572 282504 667 665 0 True 443 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 487 361 0.00664600178738738 0.00670800370117328 0.00662241550316625 0.00675974670023652 0.00192587090758838 0.00163343801587066 290509 292340 667 665 0 True 488 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 531 360 0.00649643134486774 0.00663271821118372 0.00656137941557946 0.00662241550316625 0.00158163834679829 0.00173730634076759 283971 289059 667 665 0 True 533 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 575 360 0.00669440971892173 0.00677344540109716 0.00677500572213321 0.00675974670023652 0.00178460953342663 0.00192607039166482 292625 295192 667 665 0 True 577 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 619 360 0.00669658304288002 0.00678383989270498 0.00675974670023652 0.00685130083161669 0.00189667407854554 0.00185201243986995 292720 295645 667 665 0 True 622 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 664 360 0.00633064104249089 0.00637407205356031 0.00636301213092241 0.00634775310902571 0.00186818374451006 0.00189537669263467 276724 277787 667 665 0 True 667 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 266 406 0.00583894365474621 0.00579884134690124 0.00584420538643473 0.00587472343022812 0.00148636281484233 0.00151615525177227 255231 252718 667 665 0 True 265 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 311 408 0.00592617401530409 0.00602944761767087 0.0059510185397116 0.0059662775616083 0.00131437089517786 0.00129400867414342 259044 262768 667 665 0 True 310 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 354 406 0.00620639554335901 0.00637281002919292 0.00624093995574884 0.00643930724040589 0.00132819167793146 0.00128135469586449 271293 277732 667 665 0 True 354 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 399 406 0.00644056548059227 0.00645922427951316 0.00650034332799268 0.0063935301747158 0.00143153780695652 0.00158926304923101 281529 281498 667 665 0 True 399 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 444 407 0.0067316307513444 0.00652361046814794 0.00672922865644312 0.00654612039368277 0.0015935726766406 0.0016613245021049 294252 284304 667 665 0 True 443 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 487 405 0.00671364935522626 0.00674028857908103 0.00666819256885634 0.00677500572213321 0.00167183901072772 0.00172833763707055 293466 293747 667 665 0 True 488 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 531 405 0.00664385134052338 0.00652361046814794 0.00671396963454643 0.00659189745937285 0.00166399798854558 0.00168317683111195 290415 284304 667 665 0 True 533 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 576 405 0.00657608938721301 0.00652042098838307 0.00662241550316625 0.00654612039368277 0.00178402888976494 0.00182689419631007 287453 284165 667 665 0 True 577 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 619 404 0.00614012060117801 0.00610849623486503 0.00619516289005875 0.00608834973678187 0.00192339310538 0.00199098060770513 268396 266213 667 665 0 True 622 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 664 405 0.00590116935123649 0.005928049696225 0.00588998245212482 0.00590524147402152 0.00175036642066832 0.00194382276948964 257951 258349 667 665 0 True 667 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 266 450 0.0057792801928173 0.00584376941438054 0.00573739223315786 0.00582894636453803 0.00147350872235581 0.00154613828000191 252623 254676 667 665 0 True 265 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 311 451 0.0059825889298427 0.00598715832841431 0.00599679560540169 0.0059662775616083 0.00148801506815532 0.00138330307826927 261510 260925 667 665 0 True 310 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 354 450 0.00620198026415952 0.0064388712683517 0.00621042191195544 0.00646982528419928 0.00135618343373309 0.00145230222214148 271100 280611 667 665 0 True 354 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 399 451 0.00671053807040174 0.00672392815410006 0.00675974670023652 0.00671396963454643 0.0015978066446915 0.00159564670466736 293330 293034 667 665 0 True 399 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 444 450 0.00660239804565559 0.00685598179472485 0.00660715648126955 0.00697337300679027 0.0018671720143582 0.00200179931187021 288603 298789 667 665 0 True 444 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 487 449 0.00686264787038845 0.00680974581108298 0.00698863202868696 0.00692759594110018 0.00174627291000143 0.00188677486812958 299979 296774 667 665 0 True 488 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 532 449 0.00644191522915585 0.00651934253119638 0.0063935301747158 0.00657663843747616 0.00164389576681344 0.00171538949667399 281588 284118 667 665 0 True 533 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 576 448 0.00601784253215576 0.00603562006412231 0.00602731364919509 0.00601205462729839 0.001793179041397 0.00200659267382957 263051 263037 667 665 0 True 578 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 620 449 0.00566494047551642 0.00576754314258982 0.00566109712367437 0.00581368734264134 0.00173889782547993 0.00185880703894806 247625 251354 667 665 0 True 622 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 665 450 0.0056999195526979 0.00567165223656532 0.00567635614557107 0.00566109712367437 0.00184557429867603 0.00188726682089337 249154 247175 667 665 0 True 667 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 268 496 0.00605469753106967 0.00581907962857476 0.00608834973678187 0.00579842832074464 0.00148770560798726 0.00149221565480363 264662 253600 667 665 0 True 265 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 312 496 0.00606810350832823 0.00600622636931078 0.00614938582436866 0.00602731364919509 0.0015332510036694 0.00149110505054689 265248 261756 667 665 0 True 310 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 356 496 0.00609898758563039 0.00624463424526067 0.00610360875867857 0.00622568093385214 0.00151616814547912 0.00155340780864195 266598 272146 667 665 0 True 354 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 400 496 0.00635193961728223 0.00654511077418885 0.00634775310902571 0.00656137941557946 0.00158357009730503 0.00156391193297116 277655 285241 667 665 0 True 399 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 444 495 0.00626857548566069 0.00646562618494049 0.00627145799954223 0.00656137941557946 0.00180078250382366 0.00203397793859897 274011 281777 667 665 0 True 444 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 489 493 0.00622741959301878 0.00623736039572495 0.00624093995574884 0.00633249408712902 0.00181950811082648 0.00168777167575266 272212 271829 667 665 0 True 488 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 533 490 0.0057683906959315 0.0057423026552419 0.00576791027695125 0.00578316929884794 0.00178387481228063 0.00159954213087254 252147 250254 667 665 0 False 533 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 577 493 0.00556810173535343 0.00563195583373632 0.00552376592660411 0.00569161516746777 0.00171627656543025 0.00183893418968213 243392 245445 667 665 0 True 578 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 621 492 0.00552038011664802 0.00556770732048707 0.00549324788281071 0.00549324788281071 0.00182544878431512 0.00171307568453059 241306 242645 667 665 0 True 622 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 666 494 0.00552330838471815 0.00585820238396403 0.0055390249485008 0.00585946440833143 0.00187818780602024 0.00177602970348165 241434 255305 667 665 0 True 667 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 268 539 0.0058847893517192 0.00591157454175608 0.00601205462729839 0.00592050049591821 0.00143184591386007 0.0015576848316154 257235 257631 667 665 0 True 265 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 312 540 0.00599819110815387 0.00603936024542932 0.005981536583505 0.00601205462729839 0.00152041456439972 0.00145539161536067 262192 263200 667 665 0 True 310 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 357 540 0.0061130341215293 0.00616319925471725 0.00607309071488518 0.00614938582436866 0.00142177989545713 0.0013665350095379 267212 268597 667 665 0 True 355 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 401 539 0.00606311630177129 0.00617230877606009 0.00608834973678187 0.00619516289005875 0.00165482969505357 0.00146257165704078 265030 268994 667 665 0 True 399 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 446 539 0.00595742412611502 0.00578438543142016 0.00607309071488518 0.00578316929884794 0.00185820843846009 0.00212388615170822 260410 252088 667 665 0 True 444 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 489 537 0.00560264614774325 0.0060254091396952 0.00556954299229419 0.0059662775616083 0.00189257692628817 0.00194997192952194 244902 262592 667 665 0 True 488 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 534 537 0.00571087768086659 0.00585916611166277 0.00569161516746777 0.00585946440833143 0.00176448231733638 0.00190830101678772 249633 255347 667 665 0 True 533 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 578 537 0.00581867454919828 0.00583706921228455 0.00582894636453803 0.00579842832074464 0.00166148622790162 0.00171485795797965 254345 254384 667 665 0 True 578 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 622 537 0.00579357837675349 0.00573920495906739 0.00582894636453803 0.00575265125505455 0.00176444784687424 0.00188946434598165 253248 250119 667 665 0 True 622 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 666 537 0.00578733293001016 0.00584695889414541 0.00576791027695125 0.00584420538643473 0.00181605691197633 0.00184897848281654 252975 254815 667 665 0 True 667 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 270 584 0.00587907007814472 0.00602637286739394 0.00593575951781491 0.00602731364919509 0.00126260301355478 0.00121828655168756 256985 262634 667 665 0 True 265 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 313 583 0.00613650602027894 0.00604606044752531 0.00608834973678187 0.00607309071488518 0.00135736887787877 0.00142490319491953 268238 263492 667 665 0 True 310 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 357 583 0.0059108692392188 0.00595418507357889 0.00585946440833143 0.0059510185397116 0.00128961427667665 0.00141286028051968 258375 259488 667 665 0 True 355 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 402 583 0.00579026119808029 0.00574638702501275 0.00579842832074464 0.00581368734264134 0.00149583017359719 0.00146205599123518 253103 250432 667 665 0 True 399 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 446 582 0.00578413013680846 0.00581667030932791 0.00582894636453803 0.00581368734264134 0.0018018136039762 0.00192185339640409 252835 253495 667 665 0 True 444 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 490 580 0.0059955831194039 0.00600035221952799 0.00605783169298848 0.00610360875867857 0.00196628526263154 0.00199923801267645 262078 261500 667 665 0 True 489 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 534 580 0.00590201580372551 0.00581786349600254 0.00584420538643473 0.00588998245212482 0.00196925709887067 0.00181810684787532 257988 253547 667 665 0 True 533 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 578 579 0.0059738498798209 0.00592024809104473 0.00593575951781491 0.00592050049591821 0.0016637837878857 0.00172398575623694 261128 258009 667 665 0 True 578 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 622 579 0.00582368463284952 0.00602127887812918 0.00581368734264134 0.00602731364919509 0.00152826844188562 0.00156431552894928 254564 262412 667 665 0 True 623 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 666 580 0.005877171279318 0.00592642053749618 0.00582894636453803 0.00587472343022812 0.00165956615804595 0.00168354311844003 256902 258278 667 665 0 True 667 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 266 621 0.00626326799978358 0.00613371377631536 0.00624093995574884 0.00617990386816205 0.00136327774930129 0.0013994887111231 273779 267312 667 665 0 False 266 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 310 621 0.00596270873489783 0.00581311369520161 0.0059510185397116 0.00581368734264134 0.00139518488674932 0.00130131937759289 260641 253340 667 665 0 False 310 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 357 625 0.00584713365450486 0.00579622551457609 0.00588998245212482 0.00584420538643473 0.00134025209038841 0.00128335842828366 255589 252604 667 665 0 True 355 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 401 625 0.00572044030628311 0.00572837449540537 0.00570687418936446 0.00570687418936446 0.00131811170074737 0.00134520613097586 250051 249647 667 665 0 True 399 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 444 621 0.00564961282233683 0.0056602022336684 0.00561532005798428 0.00556954299229419 0.00179380024452359 0.00186928435848982 246955 246676 667 665 0 False 444 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 489 621 0.00583846323576596 0.00594730130430218 0.00581368734264134 0.00599679560540169 0.00186489379906439 0.00194169362870126 255210 259188 667 665 0 False 489 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 533 620 0.00565876366005599 0.00587699507408943 0.00564583810177768 0.00590524147402152 0.00180532606857986 0.00193626026432417 247355 256124 667 665 0 False 533 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 578 620 0.00608121208336093 0.00601249059935258 0.00592050049591821 0.005981536583505 0.00162860673436882 0.00159226716997999 265821 262029 667 665 0 False 578 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 623 620 0.00575843915991192 0.00580294866256968 0.00573739223315786 0.00576791027695125 0.00138711036843353 0.00131985265599019 251712 252897 667 665 0 False 623 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 667 620 0.00587289326268429 0.00588516381363112 0.00587472343022812 0.00593575951781491 0.00149328736802223 0.00151915398751046 256715 256480 667 665 0 False 667 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 266 671 0.0077285230124695 0.746828595865952 0.00755321583886473 0.751171129930571 0.00186387149431319 0.196449889166565 337828 32547369 667 665 15 True 266 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 310 665 0.00623647892236075 0.00590650349838891 0.00613412680247196 0.00584420538643473 0.00159048071203646 0.00138888658274278 272608 257410 667 665 0 False 310 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 355 664 0.0056434131297821 0.00543390979164551 0.00569161516746777 0.00547798886091402 0.00127948734036455 0.00114197197525764 246684 236814 667 665 0 False 355 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 400 664 0.00551857282619848 0.00545155518689147 0.00556954299229419 0.00541695277332723 0.00124776794751979 0.00127535254346616 241227 237583 667 665 0 False 400 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 444 664 0.00543168562205507 0.00525527597891502 0.00540169375143053 0.00526436255436027 0.00156274704404239 0.00157727757251387 237429 229029 667 665 0 False 444 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 489 664 0.00553829288148327 0.00555903377119842 0.00556954299229419 0.00552376592660411 0.00166284920287534 0.00162135637934319 242089 242267 667 665 0 False 489 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 534 664 0.00546172324686821 0.00546917763623983 0.00552376592660411 0.0055542839703975 0.00177515093835297 0.0017240395189302 238742 238351 667 665 0 False 534 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 578 664 0.00590988552416399 0.00567000013193891 0.0059662775616083 0.00567635614557107 0.00143774848205009 0.00132148617158588 258332 247103 667 665 0 False 578 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 623 664 0.00671159041673944 0.00603532176745365 0.00625619897764553 0.005981536583505 0.00240208519374575 0.00137747745222315 293376 263024 667 665 0 False 623 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 661 669 0.0073436845321903 0.748707750149005 0.00732433051041428 0.770565346761273 0.00153947893598808 0.219950747945225 321006 32629264 667 665 16 True 667 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A3_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A3_3.csv new file mode 100755 index 0000000..901f1ae --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A3_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 266 273 0.00106655301326219 0.076179095025272 0.000869764248111696 0.0744182497901884 0.000804185492060352 0.0234115018744898 46621 3319944 667 665 0 True 265 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 309 273 0.00104552896360243 0.000995622496387455 0.000946059357595178 0.000854505226215 0.000692287982960667 0.000711299020342935 45702 43390 667 665 0 False 309 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 354 274 0.000925081062124008 0.000970313171346769 0.00080872816052491 0.000869764248111696 0.000666526309937961 0.00070410117172377 40437 42287 667 665 0 True 354 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 398 273 0.0010491435445015 0.000965746937726555 0.000900282291905089 0.000839246204318303 0.000727831540494563 0.000695535738109085 45860 42088 667 665 0 True 398 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 442 273 0.000937594832704957 0.000981051851418429 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.000872669953343159 0.000899159735917367 40984 42755 667 665 0 True 443 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 486 272 0.000970629356871118 0.000950006051980489 0.000717174029144732 0.000686655985351339 0.000880760755100587 0.000874892735585788 42428 41402 667 665 0 True 488 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 531 271 0.000842471874614306 0.000926371777463802 0.00064087891966125 0.000717174029144732 0.000792334413825416 0.000859501631381171 36826 40372 667 665 0 True 532 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 575 271 0.000906733632497095 0.000939542722679897 0.00064087891966125 0.000625619897764553 0.000909501814998267 0.000958681395529005 39635 40946 667 665 0 True 577 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 622 272 0.00130383423531997 0.000956706254076482 0.000625619897764553 0.000595101853971161 0.00223129468905626 0.000974951953559871 56993 41694 667 665 0 False 622 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 660 272 0.0011459136533816 0.0768216489954573 0.00080872816052491 0.0744640268558785 0.00100936857283463 0.021014229082798 50090 3347947 667 665 0 True 666 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 265 317 0.000879578521565493 0.000933094925457383 0.000701915007248035 0.000747692072938125 0.000711471529382706 0.000757634122121458 38448 40665 667 665 0 False 265 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 309 317 0.000924669274426646 0.000890759744405647 0.000823987182421607 0.000717174029144732 0.000685082607174742 0.000681324848379463 40419 38820 667 665 0 False 309 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 353 318 0.00096985153566499 0.00102127600989198 0.000900282291905089 0.000915541313801785 0.000654069734465652 0.000716230350982357 42394 44508 667 665 0 True 354 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 398 319 0.000878777823265067 0.00100509915209172 0.000732433051041428 0.000869764248111696 0.000703559550755046 0.000716711207037201 38413 43803 667 665 0 True 399 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 441 318 0.000938670056136958 0.000971575195714165 0.000701915007248035 0.000747692072938125 0.000871446212337331 0.000878077935575738 41031 42342 667 665 0 True 443 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 486 316 0.000986849216728326 0.000953631503799554 0.000747692072938125 0.000701915007248035 0.000884356180807799 0.000907089232556023 43137 41560 667 665 0 True 488 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 532 316 0.000850638997278655 0.000976210267027147 0.000671396963454643 0.000762951094834821 0.000779059510306162 0.000859972138643457 37183 42544 667 665 0 False 532 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 575 316 0.00091059986143344 0.000929102339276894 0.000610360875867857 0.000549324788281071 0.000928973072082501 0.000976654440171522 39804 40491 667 665 0 True 577 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 622 316 0.000946219497255263 0.00101418572753697 0.000518806744487678 0.000579842832074464 0.00107759162936818 0.00109976529919509 41361 44199 667 665 0 False 622 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 666 316 0.000974564217090356 0.00104447431235447 0.000534065766384375 0.000686655985351339 0.00105261973667972 0.00100743654465968 42600 45519 667 665 0 False 666 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 265 362 0.000962050446509407 0.000867653225533507 0.000793469138628214 0.000717174029144732 0.000800912498769463 0.000728472126273408 42053 37813 667 665 0 True 265 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 310 362 0.000955164441125741 0.000871347515045338 0.000839246204318303 0.000732433051041428 0.000708706614242209 0.000666085842551787 41752 37974 667 665 0 True 309 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 354 362 0.000941117905226833 0.00100190967232685 0.00080872816052491 0.000885023270008392 0.000734555650874008 0.000747041389273262 41138 43664 667 665 0 True 354 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 398 362 0.000974472708713165 0.000981327202189498 0.000823987182421607 0.000839246204318303 0.000778768008036519 0.00075225505196297 42596 42767 667 665 0 True 399 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 442 362 0.00100432731677192 0.00101909614962102 0.000701915007248035 0.000747692072938125 0.000914430538412044 0.000952159156407098 43901 44413 667 665 0 True 443 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 487 361 0.00102912608699084 0.0010768050820574 0.000823987182421607 0.000732433051041428 0.000888301764865073 0.00102383804789014 44985 46928 667 665 0 True 488 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 531 360 0.000946928687178498 0.000897299325218517 0.000671396963454643 0.000579842832074464 0.000901488703022877 0.000910367421562501 41392 39105 667 665 0 True 533 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 575 360 0.000838925924998133 0.000938441319595625 0.000534065766384375 0.000457770656900893 0.000901792601177687 0.00105132889117366 36671 40898 667 665 0 True 577 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 619 360 0.000870427683846335 0.000968867579798661 0.000366216525520714 0.000457770656900893 0.00107425707912572 0.00108171958544874 38048 42224 667 665 0 True 622 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 664 360 0.000952556452375781 0.000869993707087586 0.000534065766384375 0.000396734569314107 0.00101178043143353 0.000996558190094137 41638 37915 667 665 0 True 667 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 266 406 0.000963011284469919 0.000946839518113205 0.00080872816052491 0.000793469138628214 0.0007994880169031 0.000758211413480107 42095 41264 667 665 0 True 265 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 311 408 0.000985590976541942 0.000877221664828127 0.000839246204318303 0.000793469138628214 0.00078350814986102 0.000639243348420074 43082 38230 667 665 0 True 310 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 354 406 0.00100030094817549 0.00103479114357191 0.000885023270008392 0.000915541313801785 0.000751437280017447 0.000689913523241758 43725 45097 667 665 0 True 354 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 399 406 0.00104822846072958 0.00103885256744516 0.000885023270008392 0.000869764248111696 0.000769131977399093 0.000812819200662774 45820 45274 667 665 0 True 399 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 444 407 0.00104294385194677 0.000911388106338173 0.00080872816052491 0.000656137941557946 0.000926317369599874 0.000841035481940584 45589 39719 667 665 0 True 443 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 487 405 0.000940912011378152 0.000966687719527705 0.000671396963454643 0.000701915007248035 0.000857355432108295 0.000892404344325572 41129 42129 667 665 0 True 488 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 531 405 0.000849083354866398 0.000896886299061914 0.000595101853971161 0.000671396963454643 0.000880861447432389 0.000841635447542032 37115 39087 667 665 0 True 533 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 576 405 0.000954661145051187 0.000859438594196638 0.000610360875867857 0.000488288700694286 0.00100641931133964 0.000964345837807135 41730 37455 667 665 0 True 577 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 619 404 0.000954112094788037 0.000895670166489696 0.000518806744487678 0.000473029678797589 0.00104564927942339 0.00100946586048622 41706 39034 667 665 0 True 622 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 664 405 0.0010088798585372 0.000884472568466256 0.000595101853971161 0.0004272526131075 0.00102974062656557 0.000930147113983993 44100 38546 667 665 0 True 667 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 266 450 0.000983051619074876 0.000915747826880087 0.000854505226215 0.000778210116731518 0.000772183998328028 0.000805721829067246 42971 39909 667 665 0 True 265 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 311 451 0.000951298212189396 0.000982979306815907 0.000823987182421607 0.000854505226215 0.000777548952010279 0.000824792857918347 41583 42839 667 665 0 True 310 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 354 450 0.00103196284668378 0.00101810947602469 0.000930800335698482 0.000869764248111696 0.000819799678578369 0.000795193840145937 45109 44370 667 665 0 True 354 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 399 451 0.00102574027703475 0.00109642382449601 0.000823987182421607 0.000930800335698482 0.000860370466532203 0.000914932825626074 44837 47783 667 665 0 True 399 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 444 450 0.00104223466202353 0.00107792943103926 0.000717174029144732 0.000671396963454643 0.00104284702162671 0.00115107477088922 45558 46977 667 665 0 True 444 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 487 449 0.000927963576005543 0.000932980195969438 0.000579842832074464 0.000473029678797589 0.000942826493529379 0.00100483054212377 40563 40660 667 665 0 True 488 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 532 449 0.000975410669579378 0.000951726994299665 0.000656137941557946 0.000656137941557946 0.0009644731651962 0.000907816737677998 42637 41477 667 665 0 True 533 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 576 448 0.000905086481707647 0.00088252216717119 0.000534065766384375 0.000381475547417411 0.000979765675422735 0.00102122437928622 39563 38461 667 665 0 True 578 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 620 449 0.000902753018089262 0.000904481391163879 0.000549324788281071 0.000457770656900893 0.000921902404034526 0.00098493031217528 39461 39418 667 665 0 True 622 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 665 450 0.000932744888713803 0.000873779780189774 0.000488288700694286 0.000381475547417411 0.00100803473024287 0.00101508317624745 40772 38080 667 665 0 True 667 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 268 496 0.00102322379666198 0.000940712963456937 0.000946059357595178 0.00080872816052491 0.000808502128083488 0.000800470584473411 44727 40997 667 665 0 True 265 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 312 496 0.000925858883330136 0.000911640511211652 0.000793469138628214 0.000762951094834821 0.00080438648769891 0.000814749937988203 40471 39730 667 665 0 True 310 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 356 496 0.00108483181160621 0.00103577781716824 0.000976577401388571 0.000915541313801785 0.000856746906564496 0.000862627654033295 47420 45140 667 665 0 True 354 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 400 496 0.00113520717325018 0.000991239829947953 0.000946059357595178 0.000747692072938125 0.000943216760701737 0.000851534917704768 49622 43199 667 665 0 True 399 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 444 495 0.00102638083567509 0.00104362531414368 0.000671396963454643 0.000747692072938125 0.00101447565276743 0.00103919534360727 44865 45482 667 665 0 True 444 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 489 493 0.000982113658208662 0.000864716150642112 0.000656137941557946 0.000457770656900893 0.000960703260543061 0.000912129252570169 42930 37685 667 665 0 True 488 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 533 490 0.000883833661104902 0.000894752330586136 0.000579842832074464 0.00064087891966125 0.000881623820834275 0.000819909648485912 38634 38994 667 665 0 False 533 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 577 493 0.00081623184745462 0.000894591709303013 0.000457770656900893 0.000473029678797589 0.000886771779455802 0.0010098399137014 35679 38987 667 665 0 True 578 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 621 492 0.000833801455875404 0.000904045419109688 0.0004272526131075 0.000549324788281071 0.000980520222654852 0.000926062278405895 36447 39399 667 665 0 True 622 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 666 494 0.000909867794415907 0.000893283793140439 0.000564583810177768 0.000473029678797589 0.000958736480384518 0.000962664709247874 39772 38930 667 665 0 True 667 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 268 539 0.00098419547378977 0.000902737502947114 0.000793469138628214 0.000717174029144732 0.000832931611370373 0.000804187883516827 43021 39342 667 665 0 True 265 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 312 540 0.000918950000852172 0.000900075778826788 0.00080872816052491 0.000747692072938125 0.000763430383019027 0.000774447313479332 40169 39226 667 665 0 True 310 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 357 540 0.000933088045128271 0.00101895847423549 0.000793469138628214 0.000900282291905089 0.000734080971102 0.000799152398907041 40787 44407 667 665 0 True 355 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 401 539 0.000993575082451908 0.000941424286282197 0.000717174029144732 0.000762951094834821 0.000870903010766772 0.000816258674424153 43431 41028 667 665 0 True 399 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 446 539 0.00095180150826395 0.00103685627435492 0.000595101853971161 0.000549324788281071 0.00100629278848969 0.00113024329577321 41605 45187 667 665 0 True 444 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 489 537 0.000941278044886918 0.000945898736312055 0.000625619897764553 0.000457770656900893 0.000946784414862875 0.00108871544817702 41145 41223 667 665 0 True 488 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 534 537 0.000871777432409911 0.000966045234395212 0.000488288700694286 0.000503547722590982 0.000948094777271813 0.00103576777104566 38107 42101 667 665 0 True 533 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 578 537 0.000826846819208844 0.000857052220847381 0.000579842832074464 0.000579842832074464 0.000819002602253124 0.000833467614212431 36143 37351 667 665 0 True 578 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 622 537 0.000904377291784412 0.000897666459579941 0.000564583810177768 0.000503547722590982 0.000937815909648987 0.000956895939850197 39532 39121 667 665 0 True 622 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 666 537 0.000838033718320515 0.000952461263022514 0.000534065766384375 0.000549324788281071 0.000893033992011428 0.00106083900816628 36632 41509 667 665 0 True 667 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 270 584 0.000915198157387317 0.000961937918726778 0.000793469138628214 0.000869764248111696 0.000712528969782782 0.000679700505297199 40005 41922 667 665 0 True 265 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 313 583 0.000922907738165708 0.000950900941986461 0.000778210116731518 0.00080872816052491 0.000792648780070746 0.000788724579792262 40342 41441 667 665 0 True 310 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 357 583 0.000857730896511003 0.000974076298551368 0.000717174029144732 0.000823987182421607 0.000685938335489943 0.00073004976372713 37493 42451 667 665 0 True 355 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 402 583 0.00105804273418338 0.000972561869310493 0.000854505226215 0.000854505226215 0.000867460730181542 0.000717820603862225 46249 42385 667 665 0 True 399 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 446 582 0.00102743318201279 0.000967903852099923 0.000686655985351339 0.00064087891966125 0.00100150835425191 0.00104691936702404 44911 42182 667 665 0 True 444 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 490 580 0.000931440894338823 0.000841701415360328 0.000549324788281071 0.000442511635004196 0.00101458047176226 0.00100791556328391 40715 36682 667 665 0 True 489 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 534 580 0.00093473519591772 0.000859461540094227 0.000457770656900893 0.000396734569314107 0.00102458317699581 0.000950367787519973 40859 37456 667 665 0 True 533 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 578 579 0.000896393185874447 0.000935481298806641 0.000518806744487678 0.000549324788281071 0.000932275615169897 0.000973824570592446 39183 40769 667 665 0 True 578 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 622 579 0.000854299332366319 0.000914095722253677 0.00064087891966125 0.000671396963454643 0.000795947625706488 0.000807015802809505 37343 39837 667 665 0 True 623 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 666 580 0.000970766619436905 0.000921392517686985 0.000701915007248035 0.000656137941557946 0.000909495386187884 0.000866377000700433 42434 40155 667 665 0 True 667 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 266 621 0.000900991481828324 0.00095418220534169 0.000778210116731518 0.000747692072938125 0.000709044196669299 0.000769492816965317 39384 41584 667 665 0 False 266 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 310 621 0.000959419580665149 0.000900213454212322 0.00080872816052491 0.000747692072938125 0.000744183100052883 0.000717791346551384 41938 39232 667 665 0 False 310 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 357 625 0.00105097371204533 0.000969142930569729 0.000946059357595178 0.00080872816052491 0.000785283255616088 0.000766765297518922 45940 42236 667 665 0 True 355 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 401 625 0.000974815865127633 0.000992088828158747 0.000793469138628214 0.000869764248111696 0.000769869357326578 0.00072493699275225 42611 43236 667 665 0 True 399 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 444 621 0.000933545587014229 0.000978275397810158 0.000610360875867857 0.000595101853971161 0.00097383086347726 0.0010072028271989 40807 42634 667 665 0 False 444 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 489 621 0.000866126790118331 0.000932727791095959 0.000488288700694286 0.000473029678797589 0.000943287000577828 0.00105047282605117 37860 40649 667 665 0 False 489 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 533 620 0.000925561481104264 0.000885183891291516 0.000473029678797589 0.000396734569314107 0.00102474648699986 0.0010300374620496 40458 38577 667 665 0 False 533 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 578 620 0.000818862713298878 0.000788283365773096 0.000534065766384375 0.000457770656900893 0.000828316267331914 0.000828491641430502 35794 34354 667 665 0 False 578 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 623 620 0.000925721620764349 0.000879332687406316 0.000747692072938125 0.000671396963454643 0.000786088651136845 0.00071780513292497 40465 38322 667 665 0 False 623 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 667 620 0.000953174133921824 0.000952071182763501 0.000747692072938125 0.000732433051041428 0.000836057942593224 0.000827162634765309 41665 41492 667 665 0 False 667 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 266 671 0.00112296792780081 0.0769830274932008 0.000991836423285267 0.0749370565346761 0.000750269914614768 0.0238820972551356 49087 3354980 667 665 0 True 266 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 310 665 0.00100295469111404 0.000975315377021175 0.000869764248111696 0.000885023270008392 0.000709456234931467 0.000669232505828653 43841 42505 667 665 0 False 310 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 355 664 0.00100162781964477 0.000917285202018551 0.000854505226215 0.00080872816052491 0.000720442959025056 0.000620269743244748 43783 39976 667 665 0 False 355 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 400 664 0.000991287373022118 0.000915701935084908 0.00080872816052491 0.000762951094834821 0.000773240717065465 0.000722503047502961 43331 39907 667 665 0 False 400 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 444 664 0.000971727457397417 0.000914852936874115 0.000778210116731518 0.000701915007248035 0.000805002616479248 0.000818641004062373 42476 39870 667 665 0 False 444 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 489 664 0.000927323017365202 0.000960285814100369 0.000625619897764553 0.000671396963454643 0.000888065695775003 0.000879865581851753 40535 41850 667 665 0 False 489 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 534 664 0.000891177208374526 0.000888648721827457 0.000503547722590982 0.000549324788281071 0.000933555668814014 0.000888827763318788 38955 38728 667 665 0 False 534 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 578 664 0.000863221399142498 0.000821256620608514 0.000671396963454643 0.000671396963454643 0.000747834076560049 0.000680560686780264 37733 35791 667 665 0 False 578 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 623 664 0.00093505547523789 0.000870544408629723 0.000778210116731518 0.000671396963454643 0.000694260200795109 0.000774248674283098 40873 37939 667 665 0 False 623 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 661 669 0.00108078256591549 0.077430288929006 0.000885023270008392 0.0762035553521019 0.000818725281334672 0.0263781803415284 47243 3374472 667 665 0 True 667 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A4_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A4_1.csv new file mode 100755 index 0000000..b36d98b --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A4_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 240 243 0.00932177536775215 0.0426541749200192 0.00932326237888151 0.0422369726100557 0.00181236121744541 0.0074160298112486 407472 1858902 667 665 0 True 240 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 284 242 0.00918478732709635 0.00904892122730722 0.00923170824750134 0.00909437705043107 0.00150946896072241 0.00155874275190893 401484 394359 667 665 0 False 284 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 327 242 0.0096147165602367 0.0634740892056188 0.00955214770733196 0.0631113145647364 0.00132347989614171 0.00789708294009083 420277 2766250 667 665 0 True 329 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 372 242 0.00964228345886567 0.0860294705635685 0.00959792477302205 0.0847638666361486 0.0013977876826495 0.0126313882523542 421482 3749231 667 665 0 True 374 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 416 242 0.00966280421245088 0.069848666068926 0.00965896086060884 0.0676585030899519 0.00159317451561501 0.00882112225403875 422379 3044059 667 665 0 True 418 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 460 240 0.00989045417780924 0.0647504318131103 0.00988784618905928 0.0685740444037537 0.00172323336875121 0.017433164331053 432330 2821874 667 665 0 True 463 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 504 240 0.0102219432741857 0.0794255265079614 0.0101319905394064 0.0797894254978256 0.00208308104972056 0.0209874986034114 446820 3461426 667 665 0 True 508 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 549 240 0.00988592451313826 0.0669661106302033 0.00994888227664607 0.065995269703212 0.0015285937562465 0.0159063476811117 432132 2918435 667 665 0 True 552 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 597 241 0.00984300708423541 0.00955152816809706 0.00985732814526589 0.00958266575112535 0.00210594895617142 0.00212834417430068 430256 416263 667 665 0 False 597 241 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 636 242 0.00966726524583897 0.0427138571996482 0.00967421988250553 0.0420843823910887 0.00193605739593092 0.0087100907308964 422574 1861503 667 665 0 True 642 241 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 240 286 0.00932722011619505 0.00933230306253159 0.00933852140077821 0.00935378042267491 0.0016550620511002 0.00156966045327203 407710 406709 667 665 0 False 240 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 284 286 0.00937027480766369 0.00955733348018708 0.00935378042267491 0.00956740672922866 0.00140428122104052 0.00145316225661521 409592 416516 667 665 0 False 284 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 327 287 0.00983925524077055 0.111136298058031 0.0097962920576791 0.10794232089723 0.00137020458224353 0.0270632820922964 430092 4843406 667 665 0 True 329 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 371 287 0.00992737780800605 0.0514714573111653 0.00993362325474937 0.0506904707408255 0.0016504968858537 0.00718636766403271 433944 2243166 667 665 0 True 374 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 415 286 0.0100765822170169 0.0927352485126756 0.0101167315175097 0.0780651560234989 0.00158682578740683 0.0536628320412772 440466 4041474 667 665 0 True 418 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 460 285 0.010182640426182 0.0411156983784708 0.0101167315175097 0.0426184481574731 0.00188027290064536 0.00740690405436335 445102 1791854 667 665 0 True 463 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 504 286 0.00999063297373973 0.0443517124236547 0.00997940032043946 0.0451209277485313 0.00179819112616004 0.00885610322001755 436709 1932882 667 665 0 True 508 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 549 285 0.00998534836495691 0.0513910319401158 0.00993362325474937 0.0533913176165408 0.00162066075829359 0.00856632959865809 436478 2239661 667 665 0 True 553 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 597 285 0.00989450342349997 0.0100730654743978 0.00990310521095598 0.00994888227664607 0.00202588027191543 0.00261005040396243 432507 438992 667 665 0 False 597 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 642 285 0.00989365697101095 0.00965092979645268 0.00990310521095598 0.00967421988250553 0.00200038676527954 0.0018997238553633 432470 420595 667 665 0 False 642 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 240 331 0.00995853641043978 0.0559143337859412 0.00997940032043946 0.0546730754558633 0.00159124641239911 0.0103406380202762 435306 2436790 667 665 0 True 240 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 284 331 0.00990365426121913 0.0675399186912119 0.00993362325474937 0.0694743266956588 0.0013927058588413 0.0175541322824351 432907 2943442 667 665 0 True 284 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 328 331 0.00984916102260154 0.0440387303805405 0.00988784618905928 0.0433508812085145 0.00142068841516181 0.00916598218858082 430525 1919242 667 665 0 True 329 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 372 332 0.0101016555123674 0.0351742712239514 0.0101167315175097 0.0365758754863813 0.00138343310936819 0.00497909517830866 441562 1532922 667 665 0 True 374 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 416 331 0.0102195640563788 0.0728238999880108 0.0102082856488899 0.0693217364766918 0.00152228705628497 0.0130092896268934 446716 3173722 667 665 0 True 419 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 460 329 0.00998562289008849 0.0325340703555639 0.00994888227664607 0.0334935530632486 0.00177488170335724 0.00491830826523565 436490 1417860 667 665 0 True 463 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 504 329 0.0098702994577328 0.0295046382263739 0.0098115510795758 0.0298008697642481 0.00176801829064792 0.00366479253963123 431449 1285835 667 665 0 True 508 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 549 329 0.00992364884163549 0.0510450995880638 0.00988784618905928 0.0516365300984207 0.00165708339944797 0.00759607673014076 433781 2224585 667 665 0 True 553 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 593 329 0.00994261395280844 0.0599807139730764 0.00990310521095598 0.0603036545357443 0.00205234734863705 0.013461058209741 434610 2614006 667 665 0 True 597 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 638 330 0.0100014538393426 0.0677001269481784 0.00987258716716258 0.0671091783016709 0.00199973657441642 0.0180451373949598 437182 2950424 667 665 0 True 642 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 240 375 0.00984655303385158 0.0472937895207233 0.00987258716716258 0.0513313496604868 0.00165159792619896 0.011153462989043 430411 2061100 667 665 0 True 240 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 284 375 0.00996851082355366 0.0389880629704268 0.00994888227664607 0.0364995803768978 0.00146360544946007 0.00960889527812202 435742 1699130 667 665 0 True 285 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 329 375 0.0103614706723086 0.0892028193624368 0.0103913939116503 0.0844739452201114 0.00149858269968858 0.0176929882870176 452919 3887528 667 665 0 True 329 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 372 375 0.0104360499997198 0.0695128299118132 0.010452429999237 0.0682230869001297 0.00153462425041689 0.0154043012713934 456179 3029423 667 665 0 True 374 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 417 375 0.0104121434361785 0.0460762572487525 0.0104676890211337 0.0471503776607919 0.00158006108804375 0.00723903423642487 455134 2008039 667 665 0 True 419 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 462 374 0.0100987501213916 0.0566788910936072 0.0101472495613031 0.0565651941710536 0.00178282125505402 0.0100411532266054 441435 2470110 667 665 0 True 463 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 505 374 0.0099528171368653 0.0438432542789797 0.00996414129854276 0.0444800488288701 0.0018404068157059 0.00557534356614472 435056 1910723 667 665 0 True 508 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 549 373 0.0103518394156092 0.0557034380412005 0.01025406271458 0.0545662623025864 0.00243372379697237 0.00935707759078253 452498 2427599 667 665 0 True 553 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 593 373 0.0101093422160515 0.0470428761305874 0.0101930266269932 0.0472114137483787 0.00200131451975751 0.00971588122624602 441898 2050165 667 665 0 True 597 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 637 373 0.0102024977440325 0.0995797344127084 0.0102998397802701 0.0977492942702373 0.0020270379586467 0.0243917220482712 445970 4339762 667 665 0 True 642 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 241 419 0.00983049331365446 0.047252601634551 0.00984206912336919 0.0472419317921721 0.00159256575851928 0.00749596764393874 429709 2059305 667 665 0 True 240 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 284 420 0.0101982654815874 0.0588646943520394 0.0101625085831998 0.0581368734264134 0.00158775090751061 0.0112405880605459 445785 2565369 667 665 0 True 285 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 328 419 0.0101052472161722 0.038020709819869 0.0101472495613031 0.0382848859388113 0.00147286224488203 0.00544221193086886 441719 1656972 667 665 0 True 329 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 373 420 0.0100785267700322 0.0561749303448596 0.0100862134737163 0.055237659266041 0.00156825325688241 0.0119501709723319 440551 2448147 667 665 0 True 374 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 417 419 0.0102120603694491 0.0989475290423358 0.0101319905394064 0.0988632028686961 0.00160899428417016 0.0156383797950025 446388 4312210 667 665 0 True 419 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 462 418 0.0101022731939135 0.0631997709999421 0.010101472495613 0.0628519111924926 0.0017657025650742 0.0129778903562017 441589 2754295 667 665 0 True 464 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 506 418 0.0100275337268422 0.0571511406118868 0.00999465934233616 0.0549324788281071 0.00182358064428647 0.010510395493975 438322 2490691 667 665 0 True 508 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 549 417 0.0101472724383974 0.0350210385198519 0.0100556954299229 0.0355687800411994 0.00197864574620366 0.00444142503611638 443556 1526244 667 665 0 True 553 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 594 418 0.00992001138364212 0.0420806651556793 0.00994888227664607 0.0421759365224689 0.00195621099233419 0.00464864458519643 433622 1833908 667 665 0 True 598 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 638 418 0.00994728088004521 0.0867112849645285 0.00990310521095598 0.0856794079499504 0.00187841001338665 0.0197552301630197 434814 3778945 667 665 0 True 642 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 242 464 0.00978565420883058 0.054714515746909 0.00984206912336919 0.0549172198062104 0.00161793934674806 0.0132270109569667 427749 2384501 667 665 0 True 240 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 286 464 0.00984168021276613 0.0571759451271805 0.00987258716716258 0.056244754711223 0.00159747477824377 0.00629508694086784 430198 2491772 667 665 0 True 285 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 330 463 0.0100031009901321 0.0766740380362671 0.00996414129854276 0.0737926298924239 0.00159906114205771 0.016657060243401 437254 3341514 667 665 0 True 330 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 374 463 0.0104004532409922 0.107285701091823 0.0103303578240635 0.106645304036011 0.00151147251133955 0.0264594720795219 454623 4675594 667 665 0 True 374 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 418 463 0.0103140464558291 0.104699308353282 0.0103913939116503 0.100373846036469 0.00194370109429875 0.0296520572091775 450846 4562877 667 665 0 True 419 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 463 462 0.0101676330523225 0.0457979005651001 0.0101167315175097 0.0462958724345769 0.0020474295644204 0.00588271916994711 444446 1995908 667 665 0 True 464 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 506 462 0.0102048540847452 0.0421786900301796 0.0103150988021668 0.0430457007705806 0.00196031527869534 0.00496072741763224 446073 1838180 667 665 0 True 508 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 551 462 0.0104198987711454 0.107932958971014 0.0104676890211337 0.106919966430152 0.00194745333663038 0.0167714283053129 455473 4703802 667 665 0 True 553 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 596 461 0.0102436765137688 0.0646652107494646 0.0102082856488899 0.0686655985351339 0.00200132013591353 0.0152197073062954 447770 2818160 667 665 0 True 598 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 640 462 0.010200232911697 0.081234718749265 0.0101930266269932 0.0792401007095445 0.00196743813520656 0.0130665642730618 445871 3540272 667 665 0 True 642 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 243 508 0.00959561418649796 0.0496679097606686 0.00968947890440223 0.052674143587396 0.00141095873196423 0.00855121451455423 419442 2164566 667 665 0 True 240 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 286 508 0.00983383336942195 0.10643489015512 0.00987258716716258 0.102418554970626 0.00168393288393571 0.0218725687455437 429855 4638515 667 665 0 True 285 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 330 508 0.0100578687538812 0.0608133058670939 0.0100709544518196 0.0625619897764553 0.00162717701236879 0.0127533129699362 439648 2650291 667 665 0 True 330 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 375 507 0.0102613833847553 0.063876009547788 0.0102998397802701 0.0613107499809262 0.00162424783383957 0.009044217811038 448544 2783766 667 665 0 True 374 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 419 508 0.0103285962878025 0.060023003262333 0.0103456168459602 0.0599984740978103 0.00186790520938432 0.00687021081332949 451482 2615849 667 665 0 True 419 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 464 505 0.0103208638299299 0.0676206882507252 0.0104371709773404 0.0663157091630426 0.00201804241354352 0.012055858238419 451144 2946962 667 665 0 True 464 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 508 505 0.0101912193365437 0.0789866403247762 0.0101625085831998 0.0762645914396887 0.00173985011474286 0.0155602212310719 445477 3442299 667 665 0 True 508 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 552 505 0.0102664849767838 0.0614272463029857 0.0102388036926833 0.062027924010071 0.00177260603141508 0.0108309979145557 448767 2677047 667 665 0 True 553 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 596 505 0.0108218264408652 0.0521362458561143 0.0104219119554437 0.0505073624780652 0.00394097535304382 0.00620680527497291 473042 2272138 667 665 0 True 598 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 640 504 0.0102955160094478 0.0674976752937505 0.0102082856488899 0.067200732433051 0.00210983203081104 0.011752629043316 450036 2941601 667 665 0 True 643 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 243 550 0.00942517983397864 0.0460385341931161 0.00943007553215839 0.0462195773250935 0.00145880224296992 0.00728462361073485 411992 2006395 667 665 0 True 240 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 287 551 0.00954487279134523 0.0576359644820451 0.00953688868543526 0.0574959945067521 0.00151580081862577 0.00959463105410298 417224 2511820 667 665 0 True 285 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 332 550 0.00992961976324724 0.0486612502875408 0.0100251773861295 0.0485084306095979 0.00144079356699052 0.0068553458539791 434042 2120695 667 665 0 True 330 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 375 550 0.01000984973295 0.0546460451885034 0.00999465934233616 0.0537727931639582 0.00148047554855708 0.00569843899644493 437549 2381517 667 665 0 True 375 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 420 549 0.0103246614275833 0.0929518118941207 0.0102388036926833 0.0876630807965209 0.00201070466631096 0.0159975741352956 451310 4050912 667 665 0 True 419 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 464 548 0.0103621798622319 0.0677278455924659 0.010452429999237 0.0662088960097658 0.00209596390904 0.0106877413427612 452950 2951632 667 665 0 True 464 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 508 547 0.0098626127540487 0.0577647368593147 0.00991836423285267 0.0577401388570993 0.00205546115269089 0.00765408108782399 431113 2517432 667 665 0 True 509 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 552 547 0.00994865350570309 0.0413956383290568 0.0100099183642329 0.0426642252231632 0.00181412652899145 0.00803795475168697 434874 1804054 667 665 0 True 553 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 597 547 0.0107398806890901 0.050882504957748 0.0102235446707866 0.0499427786678874 0.00417589874447388 0.00793742945047067 469460 2217499 667 665 0 True 598 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 641 548 0.0100602937258768 0.0580620927461708 0.010101472495613 0.0561074235141527 0.00183986888851288 0.00923843759875802 439754 2530391 667 665 0 True 643 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 241 591 0.00934124377499966 0.00927353861880611 0.00933852140077821 0.00930800335698482 0.0013240259660126 0.00134228139411064 408323 404148 667 665 0 False 241 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 285 591 0.00931610184836627 0.00928475916272714 0.00932326237888151 0.00926222629129473 0.00141687156134809 0.00150945123629766 407224 404637 667 665 0 False 285 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 332 593 0.00966012759241803 0.0771673289426358 0.00967421988250553 0.0748149843595026 0.00151773529959349 0.0107130645635917 422262 3363012 667 665 0 True 330 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 376 593 0.00989665387036397 0.0870027437557042 0.00993362325474937 0.0832074464026856 0.00143351922672465 0.0222659764435017 432601 3791647 667 665 0 True 375 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 419 590 0.00986641035170215 0.00996710131933175 0.0098115510795758 0.00991836423285267 0.00177955902215929 0.00180578653481293 431279 434374 667 665 0 False 419 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 464 590 0.00991946233337897 0.00972901468594811 0.00994888227664607 0.00975051499198901 0.00197516301582315 0.00185276837653663 433598 423998 667 665 0 False 464 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 509 590 0.00983314705659301 0.00978195087168597 0.00984206912336919 0.00988784618905928 0.0021552905032578 0.00211069415569494 429825 426305 667 665 0 False 509 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 553 590 0.00977201946062904 0.00977249716187929 0.0097962920576791 0.00975051499198901 0.00188561258046086 0.00183013241169108 427153 425893 667 665 0 False 553 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 598 590 0.00959655214736418 0.00957449701158366 0.00955214770733196 0.00955214770733196 0.00170543611112424 0.00161177409462409 419483 417264 667 665 0 False 598 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 643 589 0.00965662739699045 0.0098065259280038 0.00967421988250553 0.0098268101014725 0.00164276141168677 0.00156873249840209 422109 427376 667 665 0 False 643 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 241 640 0.00909757984363277 0.0405559561526843 0.00923170824750134 0.0403143358510719 0.00130590011210089 0.00853432114005876 397672 1767460 667 665 0 True 241 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 285 634 0.00898465850617836 0.0088500720788008 0.0089417868314641 0.00891126878767071 0.00146072363951408 0.00141194250683073 392736 385693 667 665 0 False 285 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 330 634 0.00918586255052835 0.00921995994793576 0.00918593118181125 0.00924696726939803 0.00138223415750598 0.00125043808304599 401531 401813 667 665 0 False 330 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 375 634 0.00925669003447464 0.00936325707837917 0.00918593118181125 0.009399557488365 0.00141750855415555 0.00129849582664121 404627 408058 667 665 0 False 375 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 419 634 0.0092929731060311 0.00950164378673853 0.00932326237888151 0.00952162966353857 0.00151285287122909 0.00160146976939473 406213 414089 667 665 0 False 419 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 464 633 0.00948697086567725 0.00966364182371699 0.00953688868543526 0.00973525597009232 0.00192551329754424 0.0017968403290662 414693 421149 667 665 0 False 464 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 509 633 0.00947260405045818 0.00942610589187549 0.00949111161974517 0.00946059357595178 0.00180228475640569 0.00188816882268719 414065 410797 667 665 0 False 509 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 554 633 0.00945007011257475 0.0094572205290062 0.009399557488365 0.00953688868543526 0.0018487886105576 0.00175995028315062 413080 412153 667 665 0 False 554 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 598 633 0.00934323408220358 0.00937879145104694 0.00935378042267491 0.0093690394445716 0.0014975808784747 0.00129535078058669 408410 408735 667 665 0 False 598 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 639 639 0.00943288941475703 0.0429076582506851 0.00946059357595178 0.0419623102159152 0.00148551117210606 0.00848769063389356 412329 1869949 667 665 0 True 643 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A4_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A4_2.csv new file mode 100755 index 0000000..2acf292 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A4_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 240 243 0.00764035469104541 0.741757047689033 0.00762951094834821 0.714579995422293 0.00194240004972799 0.154933367054748 333974 32326347 667 665 10 True 240 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 284 242 0.00620165998483935 0.00607091085461422 0.00616464484626535 0.00605783169298848 0.00150095171610734 0.00138785474818068 271086 264575 667 665 0 False 284 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 327 242 0.00579460784599689 0.00588381000567337 0.00584420538643473 0.00590524147402152 0.00128632311097816 0.00121928021178116 253293 256421 667 665 0 True 329 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 372 242 0.00590425775896671 0.00591659969332808 0.00590524147402152 0.00587472343022812 0.00133084181541966 0.00117565781011082 258086 257850 667 665 0 True 374 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 416 242 0.00575548801474749 0.00586939998198747 0.00578316929884794 0.00576791027695125 0.00145036422836099 0.00149616446123438 251583 255793 667 665 0 True 418 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 460 240 0.00607400579865709 0.00601260532884053 0.00611886778057527 0.00602731364919509 0.00155963133231577 0.00145451645124499 265506 262034 667 665 0 True 463 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 504 240 0.00636708425370743 0.00631794638805758 0.00642404821850919 0.00628671702143893 0.00180129209301024 0.00152912767625753 278317 275341 667 665 0 True 508 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 549 240 0.00660727086674104 0.00665068484899592 0.00663767452506294 0.00657663843747616 0.0014497867099368 0.00136103400465481 288816 289842 667 665 0 True 552 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 597 241 0.00907600674370986 0.0072879383168381 0.00759899290455482 0.00729381246662089 0.0089106190441219 0.00198881114290844 396729 317614 667 665 0 False 597 241 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 636 242 0.00900899973451132 0.757331185597319 0.00888075074387732 0.734905012588693 0.00205266277709978 0.17462648636678 393800 33005080 667 665 13 True 642 241 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 240 286 0.00628021992665832 0.00603210934179119 0.00624093995574884 0.00605783169298848 0.00159139251801118 0.0015298972688751 274520 262884 667 665 0 False 240 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 284 286 0.00573302270814696 0.00587068495225246 0.00578316929884794 0.00587472343022812 0.00139354943868324 0.00128893530059849 250601 255849 667 665 0 False 284 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 327 287 0.00565835187235862 0.00573922790496498 0.00576791027695125 0.00575265125505455 0.00134889842730431 0.00127297090705581 247337 250120 667 665 0 True 329 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 371 287 0.00595401543906463 0.00598713538251672 0.00588998245212482 0.00604257267109178 0.00131785816059906 0.00123066451401291 260261 260924 667 665 0 True 374 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 415 286 0.005922788205348 0.00605888720427757 0.00588998245212482 0.00614938582436866 0.00143949941889049 0.00144893760801835 258896 264051 667 665 0 True 418 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 460 285 0.00607263317299922 0.00606964883024682 0.00604257267109178 0.00607309071488518 0.00166900376805744 0.00182175316761238 265446 264520 667 665 0 True 463 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 504 286 0.00640512886152483 0.00630128766640795 0.0063935301747158 0.00633249408712902 0.00160853377501029 0.00156070887981341 279980 274615 667 665 0 True 508 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 549 285 0.00653619173475748 0.00658336158546974 0.00651560234988937 0.00651560234988937 0.00157745948595084 0.00145726922605359 285709 286908 667 665 0 True 553 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 597 285 0.00706247928908057 0.00703711671029255 0.00704966811627375 0.00709544518196384 0.00186284985121607 0.00194873244754682 308714 306683 667 665 0 False 597 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 642 285 0.0076470119254861 0.00735907059936405 0.00756847486076143 0.00741588464179446 0.00212733144566482 0.0019587975351475 334265 320714 667 665 0 False 642 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 240 331 0.00593903094229951 0.00599147215716104 0.00593575951781491 0.00607309071488518 0.00155218696235383 0.00144603738297954 259606 261113 667 665 0 True 240 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 284 331 0.00589140083197129 0.00576490436436709 0.00587472343022812 0.00576791027695125 0.00139960734518593 0.00133312276065157 257524 251239 667 665 0 True 284 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 328 331 0.00588963929571035 0.00582307221475524 0.00587472343022812 0.00582894636453803 0.00129429130872106 0.00114617629851044 257447 253774 667 665 0 True 329 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 372 332 0.00601857459917329 0.00604303158904356 0.00599679560540169 0.00599679560540169 0.0013265463810486 0.00124185631171733 263083 263360 667 665 0 True 374 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 416 331 0.00617205702481787 0.00631067253852186 0.00613412680247196 0.00621042191195544 0.00143770858950028 0.00149787205719842 269792 275024 667 665 0 True 419 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 460 329 0.00625235562580349 0.00633965320717679 0.00627145799954223 0.00634775310902571 0.00174852080415797 0.00160187499903936 273302 276287 667 665 0 True 463 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 504 329 0.0062446460450251 0.00636799139069922 0.00622568093385214 0.0063782711528191 0.00160127101604103 0.00154356810489744 272965 277522 667 665 0 True 508 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 549 329 0.00636774768944207 0.00642251084337073 0.0063935301747158 0.00643930724040589 0.00162032407269777 0.00134662775232053 278346 279898 667 665 0 True 553 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 593 329 0.00681119728531248 0.00692174473721498 0.0068207827878233 0.00694285496299687 0.00193459387383292 0.00216700596891773 297730 301655 667 665 0 True 597 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 638 330 0.00689678049508091 0.00713693136480478 0.00703440909437705 0.00720225833524071 0.00195496275299602 0.00180247531474472 301471 311033 667 665 0 True 642 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 240 375 0.00569541276512122 0.00602630402970117 0.00578316929884794 0.00604257267109178 0.00152480697743726 0.00150345676632772 248957 262631 667 665 0 True 240 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 284 375 0.00586687658688394 0.00584649997619363 0.00593575951781491 0.00584420538643473 0.0014035632490303 0.00131913863411823 256452 254795 667 665 0 True 285 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 329 375 0.00611648856276828 0.00625973264587424 0.00617990386816205 0.00617990386816205 0.0013371725649347 0.00153946857154948 267363 272804 667 665 0 True 329 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 372 375 0.0062684839772835 0.00639238287983635 0.00631723506523232 0.0064087891966125 0.00140606008559823 0.00130218413987541 274007 278585 667 665 0 True 374 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 417 375 0.00631217922739248 0.00643733389321323 0.00630197604333562 0.00654612039368277 0.00144913269720112 0.00154067107720645 275917 280544 667 665 0 True 419 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 462 374 0.00623599850338049 0.00638375522234288 0.00624093995574884 0.00630197604333562 0.00166110393443728 0.00168395310860095 272587 278209 667 665 0 True 463 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 505 374 0.00641924402870664 0.00636484780272953 0.00646982528419928 0.00630197604333562 0.00168140794170741 0.00175626315451252 280597 277385 667 665 0 True 508 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 549 373 0.00671515924344992 0.00635929489551299 0.00668345159075303 0.00633249408712902 0.0017336586395629 0.00159751118053467 293532 277143 667 665 0 True 553 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 593 373 0.0067761724539424 0.00680329801386047 0.00679026474402991 0.00677500572213321 0.0020337708119927 0.00212820786982952 296199 296493 667 665 0 True 597 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 637 373 0.00653520801970267 0.00664182773252656 0.0063782711528191 0.00669871061264973 0.00208935577267624 0.0018215428527509 285666 289456 667 665 0 True 642 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 241 419 0.00590139812217947 0.00618951819925185 0.00582894636453803 0.00607309071488518 0.00154204395629 0.00158387148485715 257961 269744 667 665 0 True 240 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 284 420 0.00593708638928419 0.00595657144692815 0.00588998245212482 0.0059510185397116 0.00155629137138342 0.00151876491916769 259521 259592 667 665 0 True 285 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 328 419 0.00605513219586133 0.00600634109879872 0.00604257267109178 0.00601205462729839 0.00135682604410636 0.00128378691316621 264681 261761 667 665 0 True 329 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 373 420 0.00642157749232502 0.00625801170355506 0.0063935301747158 0.00627145799954223 0.00130238851788067 0.00139834766249658 280699 272729 667 665 0 True 374 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 417 419 0.00628891322249152 0.00641441094152181 0.00627145799954223 0.00646982528419928 0.0015434487163579 0.00158159820340586 274900 279545 667 665 0 True 419 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 462 418 0.00648462676421002 0.00634355400976692 0.00653086137178607 0.00634775310902571 0.00168751101702854 0.00153832121426539 283455 276457 667 665 0 True 464 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 506 418 0.00664412586565495 0.00641626955922652 0.00672922865644312 0.00636301213092241 0.00179635481126009 0.00172960205727958 290427 279626 667 665 0 True 508 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 549 417 0.00653262290804701 0.00627154978313259 0.00657663843747616 0.00624093995574884 0.00164331293074965 0.00149608359521433 285553 273319 667 665 0 True 553 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 594 418 0.00620378755460905 0.00633327424764704 0.00605783169298848 0.00633249408712902 0.00184085840556341 0.00194329547348298 271179 276009 667 665 0 True 598 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 638 418 0.00601491426408563 0.00607396265899356 0.00611886778057527 0.00607309071488518 0.00174245325940838 0.0017943366247163 262923 264708 667 665 0 True 642 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 242 464 0.00604076538064225 0.00603330252846582 0.00610360875867857 0.00607309071488518 0.00148719267829199 0.0015209921930224 264053 262936 667 665 0 True 240 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 286 464 0.00600137102426127 0.00612880335423131 0.00599679560540169 0.00622568093385214 0.00146674106575592 0.00156975887630938 262331 267098 667 665 0 True 285 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 330 463 0.00605927294992925 0.00634378346874281 0.00610360875867857 0.0063782711528191 0.00145263069277598 0.0015278687619044 264862 276467 667 665 0 True 330 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 374 463 0.00653932589667629 0.0066465316415323 0.00654612039368277 0.00662241550316625 0.00154400822441139 0.00157112321419819 285846 289661 667 665 0 True 374 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 418 463 0.00649430377509803 0.00672893035977446 0.00642404821850919 0.00669871061264973 0.00177740727469038 0.0017992782543015 283878 293252 667 665 0 True 419 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 463 462 0.006758785862276 0.00686816606634462 0.00679026474402991 0.00689707789730678 0.00188491655967632 0.00195936886964958 295439 299320 667 665 0 True 464 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 506 462 0.00651008897016358 0.00661968494135315 0.00663767452506294 0.00663767452506294 0.00186497085974733 0.00186812034428641 284568 288491 667 665 0 True 508 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 551 462 0.00623199501187836 0.00620748483706405 0.00627145799954223 0.00624093995574884 0.00186521640945037 0.00175071581971873 272412 270527 667 665 0 True 553 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 596 461 0.0060065183704783 0.0057280991446343 0.00605783169298848 0.00581368734264134 0.00180240952909609 0.00187470801385574 262556 249635 667 665 0 True 598 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 640 462 0.00585406541407712 0.00579269184634739 0.00588998245212482 0.00576791027695125 0.00178266585188546 0.00186314850126371 255892 252450 667 665 0 True 642 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 243 508 0.00610919076968726 0.00615704975416339 0.00611886778057527 0.00605783169298848 0.00134713987747176 0.00152815842622313 267044 268329 667 665 0 True 240 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 286 508 0.00605524658133282 0.00612744954627356 0.00610360875867857 0.00624093995574884 0.00154518062367196 0.00156323774248817 264686 267039 667 665 0 True 285 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 330 508 0.0062750725804413 0.00621893483996097 0.00625619897764553 0.00616464484626535 0.00148730404311422 0.00156615350608351 274295 271026 667 665 0 True 330 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 375 507 0.00662136315682854 0.00672349218204587 0.00671396963454643 0.00672922865644312 0.00148163115966939 0.00158906530608481 289432 293015 667 665 0 True 374 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 419 508 0.00655625494645673 0.00696270316441137 0.00656137941557946 0.00701915007248035 0.00182681916675785 0.00173497218143835 286586 303440 667 665 0 True 419 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 464 505 0.00646245885983536 0.00657461919848832 0.00645456626230259 0.00654612039368277 0.00191346865136275 0.0016625370071519 282486 286527 667 665 0 True 464 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 508 505 0.00613074099251587 0.00624302803242944 0.00604257267109178 0.00627145799954223 0.00172765804444219 0.00167777431412341 267986 272076 667 665 0 True 508 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 552 505 0.00578513672895756 0.00578674885887183 0.00575265125505455 0.00582894636453803 0.00167486318435832 0.00157855671054118 252879 252191 667 665 0 True 553 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 596 505 0.00619049596282198 0.00571871427252039 0.00613412680247196 0.00572213321126116 0.00226906627718892 0.00174054060045731 270598 249226 667 665 0 True 598 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 640 504 0.00617196551644068 0.00593729689295337 0.00619516289005875 0.0059510185397116 0.0017763136767766 0.00182035018813895 269788 258752 667 665 0 True 643 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 243 550 0.00614108143913852 0.00622724125488819 0.00614938582436866 0.00627145799954223 0.00125968744375449 0.0014265554376713 268438 271388 667 665 0 True 240 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 287 551 0.00603673901204582 0.00624669937604368 0.00601205462729839 0.00622568093385214 0.00134857038346884 0.00135768438015554 263877 272236 667 665 0 True 285 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 332 550 0.00615952037714263 0.00642060633387084 0.00621042191195544 0.0063782711528191 0.00147987555082198 0.0014131597122155 269244 279815 667 665 0 True 330 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 375 550 0.00632647741132867 0.00655883242094708 0.00633249408712902 0.00659189745937285 0.00146996968203705 0.00138331975013032 276542 285839 667 665 0 True 375 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 420 549 0.00629122380901561 0.00641195573047978 0.00628671702143893 0.0063935301747158 0.0017990836344126 0.00164519145699852 275001 279438 667 665 0 True 419 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 464 548 0.0059629832600294 0.00608486196034834 0.00592050049591821 0.00610360875867857 0.00199700663818483 0.00196128129345064 260653 265183 667 665 0 True 464 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 508 547 0.00580236318096388 0.00575859424253011 0.00578316929884794 0.00575265125505455 0.00190065435606305 0.00195344986171398 253632 250964 667 665 0 True 509 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 552 547 0.00584596692269567 0.00594186312657359 0.00592050049591821 0.00588998245212482 0.00172486165766713 0.00185061096532191 255538 258951 667 665 0 True 553 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 597 547 0.00626807218958614 0.00598220201453508 0.00607309071488518 0.00601205462729839 0.00218041334419499 0.00155717476086542 273989 260709 667 665 0 True 598 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 641 548 0.00611166149587143 0.00613252058964073 0.00605783169298848 0.00619516289005875 0.00186695130720385 0.00179231419403493 267152 267260 667 665 0 True 643 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 241 591 0.0063489427179292 0.00656353632995283 0.00633249408712902 0.00651560234988937 0.00129551026241445 0.00117846320918764 277524 286044 667 665 0 False 241 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 285 591 0.00623714235809539 0.00638258498156584 0.00619516289005875 0.0064087891966125 0.00137485107815004 0.00140047726297897 272637 278158 667 665 0 False 285 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 332 593 0.00606361959784585 0.00624215608832105 0.00605783169298848 0.00617990386816205 0.0014719922646469 0.00142412693008294 265052 272038 667 665 0 True 330 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 376 593 0.00594765560684981 0.00595489639640415 0.00590524147402152 0.00601205462729839 0.00133901891770419 0.00133136596428582 259983 259519 667 665 0 True 375 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 419 590 0.00599791658302229 0.00593888015988701 0.00604257267109178 0.00604257267109178 0.00173641175026843 0.00167748626181454 262180 258821 667 665 0 False 419 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 464 590 0.00584097971613873 0.00581010778261745 0.00575265125505455 0.00578316929884794 0.00183778737174778 0.00177360249050942 255320 253209 667 665 0 False 464 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 509 590 0.00594026630539159 0.00580391239026842 0.005981536583505 0.00581368734264134 0.00200342067696105 0.00196616385003335 259660 252939 667 665 0 False 509 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 553 590 0.00609502984831686 0.00599055432125748 0.00619516289005875 0.00607309071488518 0.00189175173912028 0.00173326292002296 266425 261073 667 665 0 False 553 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 598 590 0.00609843853536724 0.00595368026383193 0.00607309071488518 0.00592050049591821 0.00159086447777776 0.00157091258242403 266574 259466 667 665 0 False 598 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 643 589 0.00630790121075878 0.00630098936973929 0.00628671702143893 0.00630197604333562 0.00151885262056964 0.00151012218514862 275730 274602 667 665 0 False 643 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 241 640 0.00824682646088263 0.736019816077158 0.00794995040817884 0.728145265888457 0.00216875677710937 0.186417812361276 360484 32076314 667 665 12 True 241 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 285 634 0.00665956790430603 0.00648285855402984 0.00648508430609598 0.00653086137178607 0.00180991100800537 0.00138447172789951 291102 282528 667 665 0 False 285 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 330 634 0.00571048877026353 0.00600900282291905 0.00573739223315786 0.00604257267109178 0.00136329986287627 0.00127497170944352 249616 261877 667 665 0 False 330 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 375 634 0.00558663218173472 0.00561981745391173 0.0055542839703975 0.0055542839703975 0.00132351631242258 0.00130640678283947 244202 244916 667 665 0 False 375 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 419 634 0.00567981058681005 0.00555006192524112 0.00569161516746777 0.00552376592660411 0.00145719683302802 0.00143568916689883 248275 241876 667 665 0 False 419 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 464 633 0.00572018865824584 0.00578429364782981 0.00575265125505455 0.00581368734264134 0.00170379859627928 0.00180877714987536 250040 252084 667 665 0 False 464 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 509 633 0.00574702348985727 0.00569014663002207 0.00573739223315786 0.00570687418936446 0.00174224666687846 0.00185455289316069 251213 247981 667 665 0 False 509 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 554 633 0.00599116784020441 0.00589785289499785 0.0059662775616083 0.00592050049591821 0.00170647363145922 0.00170136672465967 261885 257033 667 665 0 False 554 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 598 633 0.00674457918671701 0.0062955511920107 0.00651560234988937 0.00630197604333562 0.00187582221638055 0.00133024701744249 294818 274365 667 665 0 False 598 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 639 639 0.00790948082836586 0.786689796131436 0.00770580605783169 0.765484092469673 0.00188688232876004 0.166271956663318 345738 34284551 667 665 18 True 643 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A4_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A4_3.csv new file mode 100755 index 0000000..303716d --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A4_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 240 243 0.00108037077821812 0.0750641997532169 0.000839246204318303 0.0711528191042954 0.000939257730310106 0.0181781267525653 47225 3271356 667 665 0 True 240 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 284 242 0.000948072541893393 0.000933209654945329 0.000823987182421607 0.000732433051041428 0.00073181615580792 0.000758931495615849 41442 40670 667 665 0 False 284 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 327 242 0.000893876705501678 0.000858245407522009 0.000778210116731518 0.000762951094834821 0.000647171490112002 0.00060652980812812 39073 37403 667 665 0 True 329 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 372 242 0.00102869142219918 0.000988669889417983 0.000946059357595178 0.000915541313801785 0.000681722985839973 0.000629191045798453 44966 43087 667 665 0 True 374 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 416 242 0.00101713848957874 0.000921943219229121 0.000854505226215 0.000701915007248035 0.000834662231193731 0.000773922482412703 44461 40179 667 665 0 True 418 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 460 240 0.000912430028977271 0.000871806432997119 0.000717174029144732 0.000732433051041428 0.000789152603619595 0.000731357410522502 39884 37994 667 665 0 True 463 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 504 240 0.000956193910369146 0.000931029794674372 0.000717174029144732 0.000762951094834821 0.000871036362615915 0.000816240488791191 41797 40575 667 665 0 True 508 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 549 240 0.000948164050270585 0.00092850574593958 0.000778210116731518 0.000793469138628214 0.000779323638744888 0.000695800469515555 41446 40465 667 665 0 True 552 242 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 597 241 0.00108336767757115 0.000983116982201441 0.000732433051041428 0.000564583810177768 0.00119033641680041 0.00105292669125067 47356 42845 667 665 0 False 597 241 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 636 242 0.00101242580815337 0.0774242082661449 0.000701915007248035 0.0741283283741512 0.000959588805398409 0.0215111821880729 44255 3374207 667 665 0 True 642 241 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 240 286 0.00101048125513805 0.00100521388157966 0.000732433051041428 0.000747692072938125 0.00090379930131361 0.000882010625372211 44170 43808 667 665 0 False 240 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 284 286 0.000981816255982789 0.000953402044823664 0.000823987182421607 0.000839246204318303 0.000744116887779145 0.000697557728477464 42917 41550 667 665 0 False 284 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 327 287 0.000861642879635943 0.000995829009465756 0.000717174029144732 0.000854505226215 0.000632290409852557 0.000746237919491468 37664 43399 667 665 0 True 329 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 371 287 0.000943222597902239 0.000955513067401853 0.000793469138628214 0.000869764248111696 0.000690594786736954 0.000630435045716137 41230 41642 667 665 0 True 374 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 415 286 0.000918034917080256 0.000966664773630116 0.000701915007248035 0.000762951094834821 0.000766170245428351 0.000828413489790522 40129 42128 667 665 0 True 418 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 460 285 0.000942032988998749 0.000967536717738498 0.000656137941557946 0.000610360875867857 0.000921822324023349 0.00100149927427801 41178 42166 667 665 0 True 463 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 504 286 0.000948896117288117 0.000990207264556447 0.000717174029144732 0.000732433051041428 0.000887074102712385 0.000909948650494062 41478 43154 667 665 0 True 508 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 549 285 0.0009838751944696 0.000941194827306306 0.000793469138628214 0.000732433051041428 0.000837974821097581 0.000782825520990165 43007 41018 667 665 0 True 553 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 597 285 0.00100517376926094 0.000926532398746924 0.000625619897764553 0.000503547722590982 0.0010373849319407 0.000990875226205006 43938 40379 667 665 0 False 597 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 642 285 0.00103900899172753 0.0011371757386141 0.000656137941557946 0.000762951094834821 0.00101042884415303 0.00113912192871629 45417 49559 667 665 0 False 642 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 240 331 0.000968593295478605 0.00101053732982032 0.000762951094834821 0.000823987182421607 0.000787042894477498 0.000811687349075478 42339 44040 667 665 0 True 240 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 284 331 0.000898772403681428 0.000897666459579941 0.00080872816052491 0.000732433051041428 0.000698357423393032 0.000730490700407296 39287 39121 667 665 0 True 284 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 328 331 0.000870770840260803 0.000907785600416698 0.000747692072938125 0.000778210116731518 0.000662605316774592 0.000642093956310289 38063 39562 667 665 0 True 329 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 372 332 0.000970697988154012 0.00102893993968671 0.000869764248111696 0.000915541313801785 0.000714269809792875 0.000765374723231156 42431 44842 667 665 0 True 374 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 416 331 0.000956491312595019 0.000929928391590099 0.000701915007248035 0.000701915007248035 0.000805359778056204 0.00078645281884996 41810 40527 667 665 0 True 419 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 460 329 0.000895889889799893 0.000904710850139769 0.000625619897764553 0.000686655985351339 0.000880949409517778 0.00078798042358383 39161 39428 667 665 0 True 463 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 504 329 0.000909844917321609 0.000929653040819031 0.000671396963454643 0.000701915007248035 0.000839925804159079 0.000897811096353298 39771 40515 667 665 0 True 508 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 549 329 0.000882140756126858 0.000921897327433943 0.000625619897764553 0.000778210116731518 0.000830130547148957 0.000730463657417526 38560 40177 667 665 0 True 553 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 593 329 0.000965047345862432 0.00102412130119301 0.000534065766384375 0.000518806744487678 0.00105123040661282 0.00116735744190678 42184 44632 667 665 0 True 597 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 638 330 0.00097332885399827 0.000908909949398559 0.000625619897764553 0.000473029678797589 0.000980909751417187 0.000980366057478449 42546 39611 667 665 0 True 642 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 240 375 0.000908655308418119 0.000934540517005492 0.000717174029144732 0.000778210116731518 0.000776929777828069 0.000778061639599169 39719 40728 667 665 0 True 240 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 284 375 0.000961661535906343 0.000956775091769249 0.000839246204318303 0.000793469138628214 0.00075382498202374 0.00077578488110755 42036 41697 667 665 0 True 285 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 329 375 0.000980352121947724 0.000920382898193068 0.000839246204318303 0.000762951094834821 0.000729932841001451 0.000728925895150079 42853 40111 667 665 0 True 329 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 372 375 0.00101638354546691 0.000911479889928529 0.000900282291905089 0.000747692072938125 0.000741516804942504 0.000719563473867425 44428 39723 667 665 0 True 374 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 417 375 0.000977698379009168 0.000983759467333933 0.000747692072938125 0.000778210116731518 0.000802304487047218 0.000826626763511516 42737 42873 667 665 0 True 419 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 462 374 0.000988725138460753 0.000946587113239726 0.000671396963454643 0.00064087891966125 0.000931990172311553 0.000894392219838781 43219 41253 667 665 0 True 463 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 505 374 0.000960449049908554 0.000927220775674595 0.000732433051041428 0.000595101853971161 0.000912793432476446 0.000937007831389479 41983 40409 667 665 0 True 508 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 549 373 0.000967014775972051 0.000845694001540817 0.000717174029144732 0.000595101853971161 0.000892374163875861 0.000848784484406586 42270 36856 667 665 0 True 553 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 593 373 0.000997281171728167 0.000983392332972509 0.000549324788281071 0.000488288700694286 0.00108933615206085 0.00115146519869925 43593 42857 667 665 0 True 597 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 637 373 0.000957703798592807 0.00102634705325915 0.000503547722590982 0.000686655985351339 0.00104325528173744 0.00100323704961905 41863 44729 667 665 0 True 642 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 241 419 0.000993094663471652 0.000976049645744024 0.000854505226215 0.00080872816052491 0.000811289245844181 0.000884624436720759 43410 42537 667 665 0 True 240 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 284 420 0.000994467289129525 0.00094672478862526 0.000839246204318303 0.00080872816052491 0.00079808462484303 0.000828113430194265 43470 41259 667 665 0 True 285 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 328 419 0.000958618882364723 0.000936123783939134 0.000839246204318303 0.000869764248111696 0.000712761267037958 0.000681060408158359 41903 40797 667 665 0 True 329 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 373 420 0.000976142736596911 0.000987660269924066 0.000869764248111696 0.000839246204318303 0.000725856977253168 0.000749056153901441 42669 43043 667 665 0 True 374 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 417 419 0.000979665809118787 0.000912282996344145 0.000793469138628214 0.000686655985351339 0.00084051278021897 0.000820269565735853 42823 39758 667 665 0 True 419 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 462 418 0.00103221449472105 0.000987017784791574 0.000778210116731518 0.000793469138628214 0.000935978936094216 0.000837447547239255 45120 43015 667 665 0 True 464 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 506 418 0.0010066836574846 0.0010042960456761 0.000762951094834821 0.000717174029144732 0.000940017023701384 0.0010176879604921 44004 43768 667 665 0 True 508 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 549 417 0.000985957010050708 0.000903815960133798 0.000778210116731518 0.000625619897764553 0.000896934261182197 0.000844201518122279 43098 39389 667 665 0 True 553 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 594 418 0.000930937598264269 0.000943351741679674 0.000534065766384375 0.000488288700694286 0.000993333733268708 0.00103723364150166 40693 41112 667 665 0 True 598 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 638 418 0.000912247012222888 0.000931787009294809 0.000564583810177768 0.000518806744487678 0.000939651053718318 0.00101740143291687 39876 40608 667 665 0 True 642 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 242 464 0.00103672128229774 0.0010114092739287 0.000885023270008392 0.000839246204318303 0.000857196139657095 0.000784297978180397 45317 44078 667 665 0 True 240 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 286 464 0.00100030094817549 0.00103155577201186 0.000839246204318303 0.000885023270008392 0.000840799110724476 0.000852099731481803 43725 44956 667 665 0 True 285 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 330 463 0.000997670082331231 0.000971621087509343 0.00080872816052491 0.00080872816052491 0.000864321839691857 0.000825439109533976 43610 42344 667 665 0 True 330 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 374 463 0.000955095809842847 0.000966045234395212 0.000778210116731518 0.000778210116731518 0.000782069931409158 0.000833103676236857 41749 42101 667 665 0 True 374 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 418 463 0.00095527882659723 0.00090142958678454 0.000656137941557946 0.000595101853971161 0.000998887510446101 0.000884361991330015 41757 39285 667 665 0 True 419 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 463 462 0.00108041653240672 0.0010045025587544 0.000686655985351339 0.000595101853971161 0.00113510541075401 0.0011067175914175 47227 43777 667 665 0 True 464 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 506 462 0.000945304413483348 0.00095441166431758 0.000625619897764553 0.000579842832074464 0.000953781949491591 0.000983049065729097 41321 41594 667 665 0 True 508 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 551 462 0.000958115586290169 0.000916918067657126 0.00064087891966125 0.000579842832074464 0.000977606438337082 0.000964653877328486 41881 39960 667 665 0 True 553 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 596 461 0.000918927123757874 0.00085005372208273 0.000442511635004196 0.0004272526131075 0.00101590603589745 0.000948760047762227 40168 37046 667 665 0 True 598 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 640 462 0.000964292401750601 0.000937362862408941 0.000579842832074464 0.000549324788281071 0.000989540012799611 0.0010058293218476 42151 40851 667 665 0 True 642 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 243 508 0.00096593955254005 0.000898974375742515 0.00080872816052491 0.000762951094834821 0.000787701809996962 0.000733446776722518 42223 39178 667 665 0 True 240 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 286 508 0.000876627376401065 0.00098756848633371 0.000747692072938125 0.000885023270008392 0.000775222299705906 0.000798578882355778 38319 43039 667 665 0 True 285 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 330 508 0.00098039787613632 0.000969968982882934 0.000778210116731518 0.000854505226215 0.000863716954659493 0.000828347956821526 42855 42272 667 665 0 True 330 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 375 507 0.00104223466202353 0.000994934119459785 0.000854505226215 0.000869764248111696 0.000857714824184218 0.000800107942037246 45558 43360 667 665 0 True 374 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 419 508 0.000960128770588384 0.000994980011254963 0.000625619897764553 0.000610360875867857 0.00100368582970897 0.00100821409279271 41969 43362 667 665 0 True 419 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 464 505 0.000938372653911085 0.000887799723616664 0.000564583810177768 0.000564583810177768 0.00101834237594416 0.000875876168414418 41018 38691 667 665 0 True 464 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 508 505 0.000866630086192884 0.000994016283556224 0.000549324788281071 0.000747692072938125 0.000862883911944264 0.000900896260334326 37882 43320 667 665 0 True 508 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 552 505 0.000886121370534691 0.000833647405306583 0.000564583810177768 0.000549324788281071 0.000887924801169791 0.000837438513841182 38734 36331 667 665 0 True 553 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 596 505 0.00100711832227626 0.000939037912932939 0.000625619897764553 0.000503547722590982 0.0010085022701718 0.000991840340669117 44023 40924 667 665 0 True 598 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 640 504 0.000862901119822327 0.000951359859938241 0.000488288700694286 0.000503547722590982 0.000906624066038366 0.00104078609849469 37719 41461 667 665 0 True 643 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 243 550 0.000944823994503092 0.000939611560372664 0.000778210116731518 0.000747692072938125 0.000739119726576737 0.000766073210457431 41300 40949 667 665 0 True 240 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 287 551 0.000944778240314496 0.000986099948888013 0.000839246204318303 0.000839246204318303 0.000741337992625877 0.000807476210380482 41298 42975 667 665 0 True 285 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 332 550 0.000946860055895605 0.000954434610215169 0.000823987182421607 0.000823987182421607 0.000737346859026202 0.000761805845731444 41389 41595 667 665 0 True 330 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 375 550 0.000972802680829418 0.0009917675855925 0.000839246204318303 0.000869764248111696 0.000755604706018198 0.000756663939770519 42523 43222 667 665 0 True 375 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 420 549 0.000848214025283078 0.000915678989187319 0.000579842832074464 0.000564583810177768 0.000902031779173121 0.000925365654356373 37077 39906 667 665 0 True 419 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 464 548 0.000869169443659951 0.000928368070554046 0.000411993591210803 0.000473029678797589 0.00103644795063226 0.00104111814142045 37993 40459 667 665 0 True 464 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 508 547 0.000853750282103169 0.000847414943859993 0.000457770656900893 0.000335698481727321 0.000961327887476871 0.00106827336498313 37319 36931 667 665 0 True 509 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 552 547 0.000835105450250384 0.000853357931335549 0.000457770656900893 0.000457770656900893 0.00090764860757758 0.000939218255618647 36504 37190 667 665 0 True 553 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 597 547 0.000950772039020545 0.000887134292586582 0.000595101853971161 0.000625619897764553 0.000921974319953426 0.000796505265833708 41560 38662 667 665 0 True 598 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 641 548 0.000931509525621716 0.000947046031191506 0.000595101853971161 0.000610360875867857 0.000946738334733571 0.000994826394916098 40718 41273 667 665 0 True 643 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 241 591 0.000995656898033016 0.000926302939771034 0.000823987182421607 0.000854505226215 0.000730751366797358 0.000619434568973499 43522 40369 667 665 0 False 241 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 285 591 0.000904102766652838 0.000989977805580557 0.000762951094834821 0.000900282291905089 0.000713303240916589 0.000760213126871866 39520 43144 667 665 0 False 285 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 332 593 0.00096669449665188 0.000964301346178447 0.00080872816052491 0.00080872816052491 0.000808647699054581 0.000784271579454984 42256 42025 667 665 0 True 330 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 376 593 0.00106483723118985 0.000955627796889798 0.000946059357595178 0.000854505226215 0.000730739358234904 0.000658419629270779 46546 41647 667 665 0 True 375 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 419 590 0.000975959719842528 0.000826534177053988 0.000793469138628214 0.000473029678797589 0.000893385555569611 0.000861582279240926 42661 36021 667 665 0 False 419 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 464 590 0.00103127653385484 0.000946082303492767 0.000549324788281071 0.000610360875867857 0.00110561075046878 0.000940304454068396 45079 41231 667 665 0 False 464 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 509 590 0.000923365280051666 0.000928345124656457 0.000473029678797589 0.000244144350347143 0.00107414901128668 0.00119128282079535 40362 40458 667 665 0 False 509 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 553 590 0.000887356733626778 0.000842458629980766 0.000411993591210803 0.000503547722590982 0.000994927300728622 0.000893532974528153 38788 36715 667 665 0 False 553 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 598 590 0.00100089575262723 0.000952667776100815 0.000778210116731518 0.000671396963454643 0.000898578836516966 0.000836529240872777 43751 41518 667 665 0 False 598 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 643 589 0.000996846506936506 0.000957876494853522 0.000793469138628214 0.000747692072938125 0.000845489660347254 0.000826326503044475 43574 41745 667 665 0 False 643 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 241 640 0.00113259918450022 0.0746196918251224 0.000991836423285267 0.0723582818341344 0.000809094815978363 0.0214881680742337 49508 3251984 667 665 0 True 241 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 285 634 0.00101901441131117 0.000970359063141947 0.000869764248111696 0.00080872816052491 0.000762354694257163 0.000758829101934409 44543 42289 667 665 0 False 285 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 330 634 0.000972001982528992 0.000956499740998181 0.000839246204318303 0.000854505226215 0.000736055837329837 0.000673741612643535 42488 41685 667 665 0 False 330 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 375 634 0.000946562653669732 0.000856157330841409 0.00080872816052491 0.000717174029144732 0.000703240446850878 0.000675762880529216 41376 37312 667 665 0 False 375 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 419 634 0.000911858101619824 0.00090982778530212 0.000717174029144732 0.000671396963454643 0.000809182367306409 0.000798788384855713 39859 39651 667 665 0 False 419 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 464 633 0.000798456345185155 0.000896243813929422 0.000457770656900893 0.000518806744487678 0.000883111114799736 0.000949332630366916 34902 39059 667 665 0 False 464 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 509 633 0.000918126425457448 0.00102058763296431 0.000564583810177768 0.000625619897764553 0.000951542798078747 0.00102840031527355 40133 44478 667 665 0 False 509 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 554 633 0.000861139583561389 0.000833693297101761 0.000503547722590982 0.000442511635004196 0.000930763377777148 0.000920426832780556 37642 36333 667 665 0 False 554 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 598 633 0.000915541313801785 0.000963222888991763 0.000701915007248035 0.00080872816052491 0.000803041771977928 0.000728773272761379 40020 41978 667 665 0 False 598 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 639 639 0.00101311212098231 0.0816746145519441 0.000854505226215 0.0766613260090028 0.000801816570243986 0.0229965525208226 44285 3559443 667 665 0 True 643 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A5_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A5_1.csv new file mode 100755 index 0000000..77f7a60 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A5_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 252 274 0.00956708644990849 0.042035851817688 0.00952162966353857 0.0419012741283284 0.00158250357101016 0.00874684184724631 418195 1831955 667 665 0 True 253 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 297 273 0.00966907253628851 0.0096644678760302 0.00971999694819562 0.00967421988250553 0.00141884968003739 0.00128604910312254 422653 421185 667 665 0 False 297 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 340 274 0.00997818783444167 0.0667314429355605 0.00996414129854276 0.0640573739223316 0.00132572345838659 0.0128337494895957 436165 2908208 667 665 0 True 342 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 384 274 0.00993103814309371 0.0826674605947233 0.00987258716716258 0.0820782787823301 0.00131316962838989 0.0108756957466489 434104 3602712 667 665 0 True 387 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 429 274 0.00989928473620823 0.0707303392378864 0.00973525597009232 0.0686808575570306 0.00246220265680008 0.0109670975943675 432716 3082483 667 665 0 True 431 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 472 274 0.0097006886806082 0.0638378275741999 0.00970473792629892 0.0668802929732204 0.00182140042003295 0.0179126817675681 424035 2782102 667 665 0 True 476 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 517 272 0.0098267643472839 0.0789142460178829 0.00988784618905928 0.0767071030746929 0.00164564985244324 0.0215277707865238 429546 3439144 667 665 0 True 521 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 561 272 0.00952277351825346 0.0706008096459964 0.00950637064164187 0.0682536049439231 0.00178635303062009 0.0173053353345018 416258 3076838 667 665 0 True 565 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 610 273 0.00957527644966713 0.00945187413486796 0.00952162966353857 0.00935378042267491 0.00190959091780636 0.00197938870958513 418553 411920 667 665 0 False 610 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 649 271 0.00962622373866855 0.0421377545488808 0.00953688868543526 0.0420538643472953 0.00183397761760071 0.00890564464417679 420780 1836396 667 665 0 True 655 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 253 317 0.0094658095534517 0.00953073918488141 0.00952162966353857 0.00950637064164187 0.00152152433282495 0.00151707068469284 413768 415357 667 665 0 False 253 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 297 317 0.00969421446292189 0.00972892290235775 0.00975051499198901 0.00975051499198901 0.00135877194217238 0.00134549328215108 423752 423994 667 665 0 False 297 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 340 318 0.00993183884139413 0.0976361021574307 0.00991836423285267 0.0922102693217365 0.00132630289860453 0.0215072458578606 434139 4255057 667 665 0 True 342 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 384 318 0.00994371205333474 0.0520801431365092 0.00990310521095598 0.0508888380254826 0.00141145392045712 0.00797583123346457 434658 2269693 667 665 0 True 387 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 429 319 0.00996308895220506 0.0747087219077678 0.0100556954299229 0.0720988784618906 0.00167740756187111 0.0133352040691741 435505 3255864 667 665 0 True 431 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 473 315 0.00996100713662395 0.0430250494627505 0.0100099183642329 0.0446173800259403 0.00183695328380505 0.00958343016896706 435414 1875065 667 665 0 True 476 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 517 317 0.00995094121513288 0.0456142186549 0.0100099183642329 0.046845197222858 0.00174795134315462 0.0102005094047418 434974 1987903 667 665 0 True 521 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 561 315 0.0097539236790394 0.0513786641013153 0.00971999694819562 0.0528877698939498 0.00187823894638956 0.00943907001197825 426362 2239122 667 665 0 True 565 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 610 316 0.00976318890223005 0.00964386245999526 0.00973525597009232 0.00970473792629892 0.00202992862832343 0.0021055580315054 426767 420287 667 665 0 False 610 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 655 316 0.00972834708761435 0.00946986371857774 0.00968947890440223 0.00950637064164187 0.00192295349552993 0.00195677318876025 425244 412704 667 665 0 False 655 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 252 363 0.0100382173298793 0.0550609758546056 0.00985732814526589 0.0537880521858549 0.00269749762771062 0.0109455551686643 438789 2399600 667 665 0 True 253 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 296 363 0.0099974274707462 0.0670600740808304 0.00991836423285267 0.0695048447394522 0.00136421834600395 0.0198806046853488 437006 2922530 667 665 0 True 297 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 342 360 0.00992659998679992 0.0328885156356214 0.00996414129854276 0.0358587014572366 0.00150922952191812 0.0178069786622111 433910 1433307 667 665 0 False 342 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 384 362 0.00995801023727093 0.0354301868197617 0.0100099183642329 0.0361181048294804 0.00137961239926115 0.00460026365682521 435283 1544075 667 665 0 True 387 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 429 361 0.0103459371252803 0.0736467398755529 0.0103913939116503 0.068863965819791 0.00165422487286185 0.0123289535331533 452240 3209582 667 665 0 True 431 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 473 361 0.0102064326042518 0.0361331343924012 0.0102235446707866 0.0358129243915465 0.00178781130539716 0.00623183857675228 446142 1574710 667 665 0 True 476 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 517 361 0.0101570180805683 0.0294077835926507 0.010101472495613 0.029556725413901 0.00179237511898325 0.00299599626412287 443982 1281614 667 665 0 True 521 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 561 359 0.00994080666235891 0.051729919901608 0.00987258716716258 0.0520332646677348 0.00197433763143136 0.00842101088211643 434531 2254430 667 665 0 True 565 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 606 359 0.0100308737826097 0.0630771940150215 0.00999465934233616 0.0628061341268025 0.00221674506409805 0.0133084359172455 438468 2748953 667 665 0 True 610 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 649 359 0.00967328192163932 0.0715194716018703 0.00970473792629892 0.0696421759365225 0.00202143617894755 0.0215884697493329 422837 3116874 667 665 0 True 655 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 253 406 0.0098822641780506 0.0491871932061786 0.0098268101014725 0.0506294346532387 0.00164164949890538 0.0111577045058854 431972 2143616 667 665 0 True 253 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 296 406 0.0100883639205803 0.0346667309151799 0.0101167315175097 0.0343633173113603 0.00143254873565482 0.00508639491718595 440981 1510803 667 665 0 True 297 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 341 406 0.0103693403927471 0.0891044732453702 0.010406652933547 0.0832074464026856 0.00140470612686328 0.0183076624257208 453263 3883242 667 665 0 True 342 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 385 406 0.0102432647260714 0.0694967218917057 0.0103303578240635 0.0664530403601129 0.00150114182323303 0.0161020348825023 447752 3028721 667 665 0 True 387 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 429 405 0.0101800553145263 0.0488517700752224 0.01025406271458 0.0488136110475319 0.00176493708114334 0.0102425307010818 444989 2128998 667 665 0 True 431 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 473 404 0.0104315203350488 0.055440891080987 0.010452429999237 0.0558022430762188 0.00190679130996077 0.010092969375293 455981 2416157 667 665 0 True 476 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 517 404 0.0101631948960288 0.0455103884683097 0.0100251773861295 0.0453955901426719 0.00180517468357783 0.00678309102908457 444252 1983378 667 665 0 True 521 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 561 403 0.00995334331003416 0.0558676388843475 0.00999465934233616 0.0545204852368963 0.00175838577680645 0.00979543379551727 435079 2434755 667 665 0 True 565 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 606 403 0.00988899004377418 0.046997282632078 0.00990310521095598 0.0469672693980316 0.00204839482102523 0.00831067204458876 432266 2048178 667 665 0 True 610 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 650 403 0.00994018898081287 0.0959529976233787 0.00996414129854276 0.0900892652780957 0.00193023577517971 0.0184939523727474 434504 4181706 667 665 0 True 655 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 253 451 0.0097583160811446 0.045961826057476 0.00976577401388571 0.0462806134126802 0.00160518984224711 0.00692713559785602 426554 2003052 667 665 0 True 253 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 297 450 0.0100113824982679 0.0685770962081331 0.00999465934233616 0.0686045624475471 0.00153887462121502 0.0110639091446648 437616 2988643 667 665 0 True 298 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 340 450 0.0101942162358967 0.0375925393708579 0.0101930266269932 0.037949187457084 0.00149990044795334 0.00419186220614431 445608 1638312 667 665 0 True 342 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 385 449 0.0104996025676793 0.0579814838079405 0.0104829480430304 0.0568551155870909 0.00169987414805686 0.00998344674271559 458957 2526878 667 665 0 True 387 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 429 450 0.0107359229517766 0.102801177812923 0.0107118333714809 0.100679026474403 0.00189713475252659 0.021027706960081 469287 4480155 667 665 0 True 432 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 474 448 0.011635541807947 0.065455880488587 0.0107881284809644 0.0647135118638895 0.00764446509428172 0.0138834683981376 508611 2852618 667 665 0 True 476 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 518 448 0.0102507684130011 0.0566679459004572 0.0102082856488899 0.0556649118791486 0.0019373062828386 0.00764092395939796 448080 2469633 667 665 0 True 521 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 562 448 0.0101687769070374 0.0346714118782881 0.0101319905394064 0.0348973830777447 0.00188882001075486 0.00379677836073889 444496 1511007 667 665 0 True 566 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 607 447 0.0099354991764818 0.0428368472107254 0.00993362325474937 0.0424353398947128 0.00194237999004085 0.00538327792913249 434299 1866863 667 665 0 True 610 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 650 447 0.00997054688494617 0.0791666049995669 0.00994888227664607 0.0785381857022965 0.00189663785961384 0.0160793466973519 435831 3450142 667 665 0 True 655 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 255 495 0.00998777333695249 0.0554723728524791 0.00999465934233616 0.0559700923170825 0.00156187216113928 0.0131583813065706 436584 2417529 667 665 0 True 253 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 298 494 0.0102788157306103 0.0582845761691939 0.0103303578240635 0.0573891813534752 0.00167852431060825 0.00663715898129998 449306 2540087 667 665 0 True 298 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 342 494 0.0106617096578742 0.074066030262197 0.0106355382619974 0.071274891279469 0.00157063554418087 0.015365027746187 466043 3227855 667 665 0 True 342 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 386 493 0.0110158699546999 0.093070442184656 0.0110627908751049 0.0873273823147936 0.00167067919203022 0.0179535843205296 481524 4056082 667 665 0 True 387 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 430 493 0.0109832243411368 0.102466098870431 0.0110170138094148 0.095201037613489 0.00204726072790219 0.0299639457385753 480097 4465552 667 665 0 True 432 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 475 493 0.0106787302160318 0.0451813442968832 0.0106813153276875 0.0460364690623331 0.0019611402655672 0.00496987576256113 466787 1969038 667 665 0 True 476 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 519 492 0.0105278786562315 0.0461589542636633 0.0105592431525139 0.0468299382009613 0.00187141000393665 0.00654315650641121 460193 2011643 667 665 0 True 521 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 563 491 0.0102977350875947 0.108582993303813 0.0103761348897536 0.108125429159991 0.00188408464936511 0.0174164098444894 450133 4732131 667 665 0 True 566 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 607 491 0.0102001185262256 0.0662978113629232 0.0102845807583734 0.0686808575570306 0.00194589336937743 0.0135205914842878 445866 2889310 667 665 0 True 610 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 652 491 0.0101433604552725 0.078911951428124 0.0101625085831998 0.0767681391622797 0.00200871518676402 0.0122439331069134 443385 3439044 667 665 0 True 655 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 255 538 0.00993584233289627 0.0543867335998499 0.00994888227664607 0.0561379415579461 0.00146502514806174 0.00970910412215546 434314 2370216 667 665 0 True 253 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 298 537 0.0103171577406536 0.109635980544173 0.0102388036926833 0.103700312809949 0.001597855537648 0.0237182415477559 450982 4778021 667 665 0 True 298 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 342 538 0.0104676890211337 0.0603412169700975 0.0104982070649271 0.0626382848859388 0.0014626214738969 0.0101799040029569 457562 2629717 667 665 0 True 342 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 387 537 0.0105497491583803 0.0647729646845427 0.0105745021744106 0.0636301213092241 0.00155661050448737 0.00736292949319997 461149 2822856 667 665 0 True 387 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 430 536 0.0108124697092973 0.0632933214244125 0.0107728694590677 0.0618448157473106 0.00202172025367378 0.00778930753375169 472633 2758372 667 665 0 True 432 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 475 535 0.0108557302946147 0.0696378621077757 0.0108186465247578 0.0670176241702907 0.0020193430431002 0.0113523162647374 474524 3034872 667 665 0 True 476 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 519 534 0.0104166959779437 0.0821205680715866 0.0104676890211337 0.0798046845197223 0.00202376335713274 0.016038740152317 455333 3578878 667 665 0 True 521 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 563 534 0.0100949067695495 0.0636425350398197 0.0100862134737163 0.062928206301976 0.00182628506965313 0.0131993119651127 441267 2773591 667 665 0 True 566 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 607 533 0.0099724685608672 0.0538418603157011 0.0100404364080262 0.0516975661860075 0.00170052253693953 0.00787909959387751 435915 2346470 667 665 0 True 610 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 652 533 0.00988942470856584 0.0717553324831878 0.00990310521095598 0.0696879530022126 0.0020447067029624 0.0156200037084034 432285 3127153 667 665 0 True 655 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 254 580 0.00962210586169492 0.0487650116364383 0.00962844281681544 0.0488593881132219 0.00142000123965508 0.00810970516273056 420600 2125217 667 665 0 True 253 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 299 580 0.0098322548499154 0.0595484362083969 0.00985732814526589 0.0596169985503929 0.0014982484018446 0.010880391839835 429786 2595167 667 665 0 True 298 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 343 579 0.010209521011982 0.0489004383240087 0.01025406271458 0.0486457618066682 0.0014749520667984 0.00631699474357749 446277 2131119 667 665 0 True 343 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 387 579 0.0104133330450819 0.0562730699488479 0.0103608758678569 0.0554055085069047 0.00148252493943031 0.00720075571177855 455186 2452424 667 665 0 True 387 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 432 578 0.0105895324253643 0.0967789581529929 0.0106660563057908 0.0914015411612116 0.00196849423425116 0.0183902200178414 462888 4217702 667 665 0 True 432 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 476 577 0.0106425844070412 0.0692789423776883 0.0105592431525139 0.0696421759365225 0.00206803495781773 0.0112548190573446 465207 3019230 667 665 0 True 477 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 520 576 0.010070062245142 0.060381051048312 0.010101472495613 0.059311818112459 0.00219469873831201 0.00874522118549969 440181 2631453 667 665 0 True 521 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 564 576 0.00979464490688965 0.0398357532650578 0.00978103303578241 0.041214618142977 0.00183676508119565 0.00629130168701216 428142 1736073 667 665 0 True 566 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 608 576 0.00981713309058448 0.0517988952697606 0.00984206912336919 0.0512245365072099 0.00167512242623569 0.0073971259949703 429125 2257436 667 665 0 True 611 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 653 575 0.00970814661334931 0.055253629610763 0.0098268101014725 0.0543068589303426 0.00179018781072723 0.0072103563474646 424361 2407996 667 665 0 True 655 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 253 621 0.00928578969842156 0.00939115928984742 0.00923170824750134 0.0093842984664683 0.00134199395808148 0.00144945702586301 405899 409274 667 665 0 False 253 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 298 621 0.00945734502856148 0.00949276372437158 0.00947585259784848 0.00955214770733196 0.00138589868552273 0.0014402598475386 413398 413702 667 665 0 False 298 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 343 622 0.00976577401388571 0.075749249525737 0.0097962920576791 0.0737926298924239 0.00145726165391365 0.0102259786447633 426880 3301211 667 665 0 True 343 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 387 621 0.0102445000891635 0.0840135587308853 0.01025406271458 0.0796978713664454 0.00133347322371724 0.0188234586920736 447806 3661376 667 665 0 True 387 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 432 621 0.0098942060212741 0.0100445437236947 0.00988784618905928 0.0101472495613031 0.00174221269101978 0.00183155552145672 432494 437749 667 665 0 False 432 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 477 621 0.00965962429634347 0.00970969424017815 0.00962844281681544 0.00973525597009232 0.00194351061484165 0.00198890307375955 422240 423156 667 665 0 False 477 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 521 621 0.0094831961451181 0.00951814188710504 0.0093842984664683 0.00961318379491875 0.00197171489179531 0.00212524926459967 414528 414808 667 665 0 False 521 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 566 621 0.00931230425071282 0.00932555696864041 0.00929274433508812 0.00932326237888151 0.00186793967982599 0.00178134112606657 407058 406415 667 665 0 False 566 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 611 621 0.00933623369134842 0.00924822929376543 0.00932326237888151 0.00920119020370794 0.00147075880492438 0.00144558348242047 408104 403045 667 665 0 False 611 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 655 620 0.00946720505620387 0.0093398063710432 0.00946059357595178 0.00932326237888151 0.00153394514336953 0.00153163286897067 413829 407036 667 665 0 False 655 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 255 671 0.00939269436007563 0.0403040331430545 0.00943007553215839 0.0392767223620966 0.00124999894426699 0.00824168872314259 410572 1756481 667 665 0 True 253 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 298 665 0.00912548989867621 0.00926975254570393 0.00914015411612116 0.00924696726939803 0.00138907620624324 0.00125667375984806 398892 403983 667 665 0 False 298 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 343 665 0.00959751298532469 0.00923937217729607 0.00967421988250553 0.00929274433508812 0.001238383148306 0.00134067187275522 419525 402659 667 665 0 False 343 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 387 665 0.00949211821189428 0.00957346444619216 0.00955214770733196 0.00961318379491875 0.00139118081475851 0.00120892175442091 414918 417219 667 665 0 False 387 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 432 664 0.00948880103322109 0.00956630532614438 0.00947585259784848 0.00958266575112535 0.00156220565134272 0.00142382815258639 414773 416907 667 665 0 False 432 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 477 664 0.00953023145099458 0.00951752234787013 0.00953688868543526 0.00950637064164187 0.00173694588650801 0.00153346829192024 416584 414781 667 665 0 False 477 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 521 664 0.00935076064622759 0.00936734144815002 0.00933852140077821 0.0093690394445716 0.00188345631462961 0.00174986548072943 408739 408236 667 665 0 False 521 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 566 664 0.00907861473245982 0.0091678498145111 0.00907911802853437 0.00924696726939803 0.00153756261942956 0.00166039401336497 396843 399542 667 665 0 False 566 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 611 664 0.00924287226951871 0.00972412720976164 0.00932326237888151 0.00932326237888151 0.00141363577338612 0.00298893646539772 404023 423785 667 665 0 False 611 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 652 668 0.00924580053758884 0.0413913933380028 0.00924696726939803 0.0411383230334936 0.00154230895389267 0.00888200754309207 404151 1803869 667 665 0 True 655 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A5_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A5_2.csv new file mode 100755 index 0000000..dd9d3e1 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A5_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 252 274 0.00800002836759693 0.737178560959506 0.00772106507972839 0.727275501640345 0.00206934435843029 0.185186304143942 349696 32126813 667 665 12 True 253 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 297 273 0.00665746321163062 0.00627033365056037 0.00657663843747616 0.00628671702143893 0.00143509979042901 0.00125002690727186 291010 273266 667 665 0 False 297 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 340 274 0.00615341219296509 0.00615558121671769 0.00616464484626535 0.00622568093385214 0.00124001335224091 0.00139073396040756 268977 268265 667 665 0 True 342 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 384 274 0.00591770949041387 0.00603901605696548 0.00590524147402152 0.00613412680247196 0.00126439826541945 0.00126743425987865 258674 263185 667 665 0 True 387 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 429 274 0.00627809235688862 0.00599062315895025 0.00619516289005875 0.00605783169298848 0.00169810720482248 0.00153739406939806 274427 261076 667 665 0 True 431 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 472 274 0.00623547233021164 0.00624401470602576 0.00628671702143893 0.00631723506523232 0.00170840567127152 0.00161400501760518 272564 272119 667 665 0 True 476 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 517 272 0.00651983461233448 0.00665912893930867 0.00654612039368277 0.00665293354695964 0.0016403760237095 0.00168534533109695 284994 290210 667 665 0 True 521 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 561 272 0.00665133215035879 0.00674563497321927 0.00663767452506294 0.00675974670023652 0.00164498053459087 0.00158775377679598 290742 293980 667 665 0 True 565 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 610 273 0.00830767953171503 0.00757634530363446 0.00788891432059205 0.00762951094834821 0.00295259814899648 0.00193138619770415 363144 330183 667 665 0 False 610 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 649 271 0.00904269769441212 0.749031677385269 0.0089723048752575 0.732280460822461 0.00188820676574203 0.180736896913937 395273 32643381 667 665 14 True 655 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 253 317 0.00631895084730466 0.00631064959262427 0.00633249408712902 0.00627145799954223 0.0015122035002574 0.00149265168898217 276213 275023 667 665 0 False 253 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 297 317 0.00607096314511547 0.00600455131878678 0.00608834973678187 0.00601205462729839 0.00133982390342911 0.00118565765189463 265373 261683 667 665 0 False 297 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 340 318 0.00610424931731891 0.00615975737007889 0.00604257267109178 0.00616464484626535 0.00120340026408294 0.00138856213897723 266828 268447 667 665 0 True 342 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 384 318 0.00610161845147465 0.00605477988860914 0.00610360875867857 0.00605783169298848 0.00122890173873225 0.00129113875893231 266713 263872 667 665 0 True 387 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 429 319 0.00645387994947365 0.00655559704938703 0.0063782711528191 0.00662241550316625 0.00158699004141154 0.00171176956988055 282111 285698 667 665 0 True 431 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 473 315 0.00665641086529292 0.00659715206992074 0.00665293354695964 0.00660715648126955 0.00173806247628895 0.00166698293456329 290964 287509 667 665 0 True 476 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 517 317 0.00662767723485476 0.00715648126955062 0.00668345159075303 0.00712596322575723 0.00161070131672524 0.00161425089330016 289708 311885 667 665 0 True 521 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 561 315 0.00703559870328054 0.00717995492278419 0.00709544518196384 0.0072480354009308 0.00175911599115572 0.00139101123395734 307539 312908 667 665 0 True 565 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 610 316 0.00723732892079939 0.00721519982148092 0.00718699931334401 0.00718699931334401 0.0021861513058901 0.00197461923861255 316357 314444 667 665 0 False 610 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 655 316 0.00772127097357707 0.00765140133464813 0.00772106507972839 0.00775158312352178 0.00192641492807018 0.00189198560621493 337511 333454 667 665 0 False 655 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 252 363 0.00602184602365789 0.00586926230660194 0.00599679560540169 0.00576791027695125 0.00156629417492145 0.00146184857495802 263226 255787 667 665 0 True 253 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 296 363 0.00600507711353753 0.00617435096094551 0.00605783169298848 0.00614938582436866 0.00136291302914584 0.00133012670328292 262493 269083 667 665 0 True 297 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 342 360 0.00625663364243719 0.00669744858828233 0.00625619897764553 0.00668345159075303 0.00134546664682621 0.00142264802837824 273489 291880 667 665 0 False 342 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 384 362 0.00653003779639134 0.00684014912538843 0.00645456626230259 0.00692759594110018 0.00137028887409739 0.00129241544566465 285440 298099 667 665 0 True 387 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 429 361 0.00686386035638624 0.00672938927772625 0.00691233691920348 0.00672922865644312 0.00158453514639035 0.00166993104239014 300032 293272 667 665 0 True 431 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 473 361 0.00695118222532131 0.00688732589083145 0.00700389105058366 0.00686655985351339 0.00168428004300089 0.00164998933202362 303849 300155 667 665 0 True 476 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 517 361 0.0068272570055096 0.00679072366198169 0.00686655985351339 0.00685130083161669 0.00166106788013302 0.00160989196518122 298432 295945 667 665 0 True 521 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 561 359 0.0068860053836666 0.00703078364255799 0.00683604180972 0.00698863202868696 0.00176468941275663 0.00170907196068527 301000 306407 667 665 0 True 565 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 606 359 0.00706311984772091 0.00715836283315292 0.00701915007248035 0.00711070420386053 0.00205318522409258 0.00212770397192618 308742 311967 667 665 0 True 610 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 649 359 0.00670635156214523 0.00679207746993944 0.00674448767833982 0.0068207827878233 0.00196946037300463 0.00200004615180791 293147 296004 667 665 0 True 655 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 253 406 0.00616885423161617 0.0062330695128758 0.00616464484626535 0.00631723506523232 0.00158576729045446 0.00148531941587041 269652 271642 667 665 0 True 253 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 296 406 0.00636477366718335 0.00646964171701857 0.00631723506523232 0.00646982528419928 0.00139507111353371 0.00140946960068508 278216 281952 667 665 0 True 297 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 341 406 0.00642807458710562 0.00684721646184585 0.00643930724040589 0.00688181887541009 0.00133508686810089 0.0012578662552628 280983 298407 667 665 0 True 342 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 385 406 0.00685807245152887 0.006806785790294 0.00689707789730678 0.00688181887541009 0.00145453097604805 0.0014674061680073 299779 296645 667 665 0 True 387 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 429 405 0.00672632326546729 0.00678388578450016 0.00677500572213321 0.00679026474402991 0.00167425926077253 0.00158038868700322 294020 295647 667 665 0 True 431 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 473 404 0.00692356957250375 0.00710276492329473 0.00698863202868696 0.00714122224765393 0.00171490824039479 0.00167693449107501 302642 309544 667 665 0 True 476 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 517 404 0.00699650174912544 0.00678920923274081 0.00700389105058366 0.00679026474402991 0.00159082510735375 0.00172232181271949 305830 295879 667 665 0 True 521 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 561 403 0.00694976384547484 0.00668326802357232 0.00701915007248035 0.00679026474402991 0.00173012399355349 0.00159646618912339 303787 291262 667 665 0 True 565 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 606 403 0.00651681483588716 0.00650626336957064 0.00648508430609598 0.00651560234988937 0.0019586742163316 0.00190098889492821 284862 283548 667 665 0 True 610 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 650 403 0.00596712401409732 0.00637895952974678 0.00602731364919509 0.00643930724040589 0.00184625561709812 0.00175691836182982 260834 278000 667 665 0 True 655 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 253 451 0.00633240257875182 0.00640185953554061 0.00631723506523232 0.0063935301747158 0.00153163243430067 0.00159391535458604 276801 278998 667 665 0 True 253 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 297 450 0.00625988218982749 0.00648574973712606 0.00627145799954223 0.00653086137178607 0.00151049262644159 0.00147516816639868 273631 282654 667 665 0 True 298 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 340 450 0.00648513006028458 0.00646787488290422 0.00646982528419928 0.00654612039368277 0.00143158456820762 0.00151174152181478 283477 281875 667 665 0 True 342 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 385 449 0.00675345549930459 0.00671316652813081 0.0068055237659266 0.00671396963454643 0.0014919682447556 0.0013075457270981 295206 292565 667 665 0 True 387 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 429 450 0.00669774977468922 0.00689258050137934 0.00662241550316625 0.00703440909437705 0.00179556066793096 0.0019752066504292 292771 300384 667 665 0 True 432 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 474 448 0.00744226193151994 0.00713833106455771 0.0072480354009308 0.00715648126955062 0.00289759918270005 0.00190685955992664 325315 311094 667 665 0 True 476 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 518 448 0.00681510926843742 0.00700060978722843 0.00694285496299687 0.00695811398489357 0.0017349814290067 0.0017259917140251 297901 305092 667 665 0 True 521 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 562 448 0.00632034635005683 0.00648584152071642 0.00642404821850919 0.00648508430609598 0.00183391150854575 0.00193364109300253 276274 282658 667 665 0 True 566 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 607 447 0.00623910978820501 0.00613522820555623 0.00622568093385214 0.00617990386816205 0.00177134162022382 0.0018517640457795 272723 267378 667 665 0 True 610 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 650 447 0.00587838376531579 0.00614130886841732 0.00587472343022812 0.00617990386816205 0.00183444643789545 0.00197518107527888 256955 267643 667 665 0 True 655 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 255 495 0.00641363914060365 0.00653134323563544 0.00646982528419928 0.00660715648126955 0.00137222546581106 0.00143144763707092 280352 284641 667 665 0 True 253 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 298 494 0.00658478268304621 0.00670407995268556 0.00656137941557946 0.00671396963454643 0.00151339434731297 0.001510531291967 287833 292169 667 665 0 True 298 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 342 494 0.00671559390824158 0.00676874149209141 0.00672922865644312 0.00677500572213321 0.001599613420312 0.00152118052660684 293551 294987 667 665 0 True 342 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 386 493 0.00659333871631362 0.006856922576526 0.00666819256885634 0.00685130083161669 0.00164204818530984 0.00163220420599305 288207 298830 667 665 0 True 387 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 430 493 0.00698506320197649 0.00677174740467557 0.00692759594110018 0.00660715648126955 0.00189913097391102 0.0019101395872513 305330 295118 667 665 0 True 432 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 475 493 0.00683091734059727 0.00695760917514661 0.00674448767833982 0.00706492713817044 0.00181467032750121 0.0017562556680826 298592 303218 667 665 0 True 476 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 519 492 0.00642409397269779 0.00640768779352822 0.0063782711528191 0.00645456626230259 0.00176141978534354 0.001714799050345 280809 279252 667 665 0 True 521 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 563 491 0.00609983403811942 0.00621090377580481 0.00608834973678187 0.00621042191195544 0.00188331788799771 0.00183441748623919 266635 270676 667 665 0 True 566 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 607 491 0.00590146675346236 0.00595512585538004 0.00590524147402152 0.00585946440833143 0.00176215411429907 0.00171848714107037 257964 259529 667 665 0 True 610 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 652 491 0.00587284750849569 0.00596246854260852 0.00588998245212482 0.005981536583505 0.00178860901995403 0.00186246832841022 256713 259849 667 665 0 True 655 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 255 538 0.00662470321259604 0.00678136173576537 0.00662241550316625 0.0068207827878233 0.00138744478267477 0.00145704933193416 289578 295537 667 665 0 True 253 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 298 537 0.00651720374649022 0.00648455655045143 0.00651560234988937 0.00651560234988937 0.00147735861451503 0.0014649918455243 284879 282602 667 665 0 True 298 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 342 538 0.00662113438588557 0.00669974317804123 0.00659189745937285 0.00669871061264973 0.00149786417220595 0.00135826317817342 289422 291980 667 665 0 True 342 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 387 537 0.00664499519523827 0.0068168131475404 0.00668345159075303 0.0068207827878233 0.00146867738608895 0.00145179482951598 290465 297082 667 665 0 True 387 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 430 536 0.00656579469477896 0.00637083668200026 0.00650034332799268 0.00631723506523232 0.00193616302593758 0.00188712974544849 287003 277646 667 665 0 True 432 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 475 535 0.00647474385947333 0.00645133089074254 0.00648508430609598 0.00646982528419928 0.00192392595006802 0.00185285363734615 283023 281154 667 665 0 True 476 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 519 534 0.00627454640727245 0.00614736658538082 0.00636301213092241 0.00619516289005875 0.00179290595798545 0.0018587261104336 274272 267907 667 665 0 True 521 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 563 534 0.00613595697001579 0.00604890573882635 0.00613412680247196 0.00601205462729839 0.00167513489471586 0.00174202513539639 268214 263616 667 665 0 True 566 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 607 533 0.005942370998067 0.00623343664723723 0.00593575951781491 0.00628671702143893 0.00172441693226399 0.00159016245329414 259752 271658 667 665 0 True 610 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 652 533 0.00600251487897617 0.00613123561937574 0.0059662775616083 0.00604257267109178 0.00173011441306895 0.00190679474200142 262381 267204 667 665 0 True 655 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 254 580 0.00647867871969257 0.00642218960080448 0.00651560234988937 0.00645456626230259 0.00126467332349473 0.0012080795172804 283195 279884 667 665 0 True 253 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 299 580 0.00658958687284877 0.00655020476345361 0.00657663843747616 0.00659189745937285 0.00147330272284888 0.00132915112625802 288043 285463 667 665 0 True 298 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 343 579 0.00654429022613893 0.0065038540503238 0.00659189745937285 0.00648508430609598 0.00138824808695176 0.00149980754309179 286063 283443 667 665 0 True 343 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 387 579 0.00639117383400312 0.00632308626911752 0.0063935301747158 0.00631723506523232 0.00137541874515328 0.00133624321984106 279370 275565 667 665 0 True 387 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 432 578 0.00603506898416207 0.00615197871079622 0.00602731364919509 0.00608834973678187 0.00172088699771479 0.00192652796012935 263804 268108 667 665 0 True 432 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 476 577 0.00632512766276509 0.00637905131333713 0.00642404821850919 0.00625619897764553 0.00190985084530132 0.00173511287776137 276483 278004 667 665 0 True 477 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 520 576 0.00619591783417058 0.00626521671539802 0.00614938582436866 0.00628671702143893 0.00197031705622146 0.00197203290303748 270835 273043 667 665 0 True 521 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 564 576 0.00618463942668172 0.00627001240799412 0.00621042191195544 0.00628671702143893 0.00176946670384025 0.0017498389951289 270342 273252 667 665 0 True 566 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 608 576 0.00607212987692466 0.006157852860579 0.00613412680247196 0.00622568093385214 0.00154094175198051 0.00149731600168658 265424 268364 667 665 0 True 611 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 653 575 0.00590871879235479 0.00614995947180838 0.00585946440833143 0.00610360875867857 0.00167360533547069 0.00154142484648518 258281 268020 667 665 0 True 655 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 253 621 0.00678086225827347 0.00665559527107997 0.00674448767833982 0.00672922865644312 0.00133794820479231 0.00135540705100452 296404 290056 667 665 0 False 253 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 298 621 0.00631476433904815 0.00641438799562422 0.00625619897764553 0.0064087891966125 0.00145200568711033 0.00133394447720694 276030 279544 667 665 0 False 298 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 343 622 0.00614513068482925 0.0063241647263042 0.00610360875867857 0.00636301213092241 0.00135120715572183 0.00139518130876413 268615 275612 667 665 0 True 343 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 387 621 0.00606787473738526 0.006098950741468 0.00611886778057527 0.00613412680247196 0.00140628418081464 0.00124385362546679 265238 265797 667 665 0 True 387 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 432 621 0.00598252029855981 0.00597052255266227 0.00607309071488518 0.0059662775616083 0.0016985057931291 0.00166685138095974 261507 260200 667 665 0 False 432 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 477 621 0.00610500426143074 0.00609140154116121 0.00616464484626535 0.00605783169298848 0.0018613045039731 0.00190167324561038 266861 265468 667 665 0 False 477 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 521 621 0.0061000399319681 0.00611999212955713 0.00613412680247196 0.00614938582436866 0.00187223939086577 0.00188144498701855 266644 266714 667 665 0 False 521 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 566 621 0.00586664781594097 0.00598959059355874 0.00582894636453803 0.0059510185397116 0.001701611895198 0.00171922300136771 256442 261031 667 665 0 False 566 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 611 621 0.00607752887117897 0.00603573479361026 0.00608834973678187 0.00602731364919509 0.00148199898387274 0.00133584451782561 265660 263042 667 665 0 False 611 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 655 620 0.0060988732001589 0.00604032397312806 0.00610360875867857 0.00604257267109178 0.00148072072351836 0.0014628655218146 266593 263242 667 665 0 False 655 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 255 671 0.00833423983819489 0.730475077600157 0.00820935378042268 0.702006561379416 0.00193449666073886 0.181614223257691 364305 31834670 667 665 12 True 253 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 298 665 0.00672270868456822 0.00639795873295048 0.00662241550316625 0.0063782711528191 0.00165233950919214 0.00126486805401497 293862 278828 667 665 0 False 298 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 343 665 0.0059553880647225 0.00593670029961606 0.00592050049591821 0.00599679560540169 0.00124346874111484 0.00122738119772004 260321 258726 667 665 0 False 343 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 387 665 0.00572835578091019 0.00588325930413124 0.00576791027695125 0.00587472343022812 0.00132362875561687 0.00133256593983115 250397 256397 667 665 0 False 387 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 432 664 0.00569067720660155 0.00566231325624659 0.00564583810177768 0.00572213321126116 0.00146322142141661 0.00140953255634703 248750 246768 667 665 0 False 432 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 477 664 0.00571291374225911 0.00576412420384906 0.00573739223315786 0.00579842832074464 0.00161871790095809 0.00143645461205166 249722 251205 667 665 0 False 477 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 521 664 0.00591505574747531 0.00590370409888305 0.00584420538643473 0.00599679560540169 0.00172220951553108 0.00160337707606395 258558 257288 667 665 0 False 521 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 566 664 0.00597103599722226 0.00594188607247118 0.00599679560540169 0.00592050049591821 0.0015095594835436 0.00152582437797443 261005 258952 667 665 0 False 566 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 611 664 0.00661719952566633 0.00682695523427475 0.0063935301747158 0.00651560234988937 0.00199684643835123 0.00268936059837631 289250 297524 667 665 0 False 611 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 652 668 0.0079807658541981 0.757408008462447 0.00798046845197223 0.756450751506828 0.00173522476163148 0.190001388793712 348854 33008428 667 665 14 True 655 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A5_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A5_3.csv new file mode 100755 index 0000000..b1ad595 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A5_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 252 274 0.00105282675668346 0.0755625617029527 0.00080872816052491 0.0728465705348287 0.000868938071688102 0.0219256079859897 46021 3293075 667 665 0 True 253 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 297 273 0.000996251702484761 0.0010268748089037 0.000885023270008392 0.000930800335698482 0.000702277255719501 0.000693540335772039 43548 44752 667 665 0 False 297 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 340 274 0.00098039787613632 0.000998559571278849 0.000839246204318303 0.000915541313801785 0.000726323018262041 0.000711994673258548 42855 43518 667 665 0 True 342 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 384 274 0.000891634750260484 0.000955398337913908 0.000793469138628214 0.00080872816052491 0.000637082546039606 0.000696023591473011 38975 41637 667 665 0 True 387 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 429 274 0.000924669274426646 0.000936812160866804 0.000717174029144732 0.000717174029144732 0.000835060764018168 0.000853970086505896 40419 40827 667 665 0 True 431 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 472 274 0.000877153549569916 0.000874284589936732 0.000610360875867857 0.000579842832074464 0.000825891952870136 0.000903388947834098 38342 38102 667 665 0 True 476 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 517 272 0.000897674303155129 0.0008962897057246 0.000671396963454643 0.000686655985351339 0.000834541866509252 0.000830219023573222 39239 39061 667 665 0 True 521 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 561 272 0.00100277167435966 0.00098151076937021 0.000717174029144732 0.000717174029144732 0.000932107246415546 0.000846779634458718 43833 42775 667 665 0 True 565 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 610 273 0.00114428937968644 0.00106085768323303 0.000778210116731518 0.000747692072938125 0.0010985771214664 0.00100986459571094 50019 46233 667 665 0 False 610 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 649 271 0.00114390046908338 0.0771520010830464 0.000778210116731518 0.0728770885786221 0.00103720569308056 0.0225641756477954 50002 3362344 667 665 0 True 655 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 253 317 0.000978087289612232 0.000979583313972732 0.00080872816052491 0.00080872816052491 0.000781072221335672 0.000791047119665243 42754 42691 667 665 0 False 253 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 297 317 0.000984332736355558 0.00100349293926049 0.000854505226215 0.000869764248111696 0.000712390809274741 0.00067139225270651 43027 43733 667 665 0 False 297 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 340 318 0.000963308686695791 0.000979239125508897 0.000823987182421607 0.000839246204318303 0.000700103302910024 0.000723710857754189 42108 42676 667 665 0 True 342 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 384 318 0.000905795671630882 0.000917032797145071 0.000793469138628214 0.000778210116731518 0.000664892255526407 0.000662827956652003 39594 39965 667 665 0 True 387 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 429 319 0.000950108603285906 0.000899961049338843 0.000717174029144732 0.000610360875867857 0.000867721177602743 0.000888513600459703 41531 39221 667 665 0 True 431 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 473 315 0.000880058940545749 0.000906110549892699 0.000625619897764553 0.000610360875867857 0.000885263920454381 0.000903136279332389 38469 39489 667 665 0 True 476 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 517 317 0.00095788681534719 0.000924650835144625 0.000778210116731518 0.000701915007248035 0.000855834386613693 0.00086258455109872 41871 40297 667 665 0 True 521 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 561 315 0.000918766984097789 0.00100542039465797 0.000686655985351339 0.000823987182421607 0.000871785557651726 0.000775442686890915 40161 43817 667 665 0 True 565 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 610 316 0.00102336105922777 0.000943466471167619 0.000671396963454643 0.000534065766384375 0.00111755983086014 0.00106478796626748 44733 41117 667 665 0 False 610 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 655 316 0.00101624628290112 0.00111416100333232 0.000610360875867857 0.000900282291905089 0.00103237082997423 0.000992840207517771 44422 48556 667 665 0 False 655 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 252 363 0.000937045782441807 0.00099107920866483 0.000747692072938125 0.000839246204318303 0.000845442625880498 0.00080763475557544 40960 43192 667 665 0 True 253 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 296 363 0.000908266397815054 0.00107090798637702 0.000717174029144732 0.000915541313801785 0.000726519371780783 0.000799783038909265 39702 46671 667 665 0 True 297 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 342 360 0.00104731337695766 0.00103538773690922 0.000946059357595178 0.000930800335698482 0.000744614951146194 0.00078951587281138 45780 45123 667 665 0 False 342 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 384 362 0.0010534215611352 0.000977196940623475 0.000930800335698482 0.00080872816052491 0.000743299405033026 0.000759709272767401 46047 42587 667 665 0 True 387 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 429 361 0.000962210586169492 0.00100996368238059 0.000717174029144732 0.000701915007248035 0.000847261440270582 0.000897764153368937 42060 44015 667 665 0 True 431 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 473 361 0.000894563018330615 0.000923572377957941 0.000564583810177768 0.000549324788281071 0.000924848506807191 0.000937282137128921 39103 40250 667 665 0 True 476 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 517 361 0.000874316789876977 0.000960790623847327 0.000549324788281071 0.000671396963454643 0.000930106381291087 0.000924886560998671 38218 41872 667 665 0 True 521 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 561 359 0.00110489502330547 0.0010047320177303 0.000823987182421607 0.000701915007248035 0.00105898323035642 0.000943847126793111 48297 43787 667 665 0 True 565 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 606 359 0.00103466234381093 0.00098990896788779 0.000595101853971161 0.000579842832074464 0.00114326955170552 0.00108218674348647 45227 43141 667 665 0 True 610 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 649 359 0.000928169469854224 0.000991721693797322 0.000518806744487678 0.000625619897764553 0.00098902633324354 0.00103479084108309 40572 43220 667 665 0 True 655 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 253 406 0.000935993436104104 0.00100197851001961 0.00080872816052491 0.00080872816052491 0.000780220870439488 0.000852016524429447 40914 43667 667 665 0 True 253 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 296 406 0.000850272963769889 0.000964324292076036 0.000717174029144732 0.000854505226215 0.000713879140700861 0.000729418351343271 37167 42026 667 665 0 True 297 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 341 406 0.000976874803614444 0.000992157665851514 0.000930800335698482 0.000900282291905089 0.000692496262625167 0.000701493300895586 42701 43239 667 665 0 True 342 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 385 406 0.00105223195223171 0.000964416075666392 0.000930800335698482 0.00080872816052491 0.00077990606864992 0.000738927488581096 45995 42030 667 665 0 True 387 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 429 405 0.000954775530522676 0.000978160668322213 0.000747692072938125 0.000762951094834821 0.000814931764178678 0.000806751280299786 41735 42629 667 665 0 True 431 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 473 404 0.000982548323000322 0.000931878792885166 0.000717174029144732 0.000686655985351339 0.000928389844636756 0.000841013821617873 42949 40612 667 665 0 True 476 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 517 404 0.000941758463867174 0.000902921070127826 0.000656137941557946 0.000595101853971161 0.000894617708318512 0.000897369696039523 41166 39350 667 665 0 True 521 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 561 403 0.000917920531608766 0.00095721106382344 0.000701915007248035 0.000762951094834821 0.000881024111130108 0.000813687843388896 40124 41716 667 665 0 True 565 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 606 403 0.000980649524173597 0.000966458260551814 0.000564583810177768 0.000503547722590982 0.00104019681424484 0.00105855797660568 42866 42119 667 665 0 True 610 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 650 403 0.000921969777299494 0.00101551658959713 0.000503547722590982 0.000717174029144732 0.00103510214766923 0.000950888332760879 40301 44257 667 665 0 True 655 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 253 451 0.0010024056408509 0.000981533715267799 0.000869764248111696 0.000854505226215 0.000819464166898096 0.000820382707808684 43817 42776 667 665 0 True 253 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 297 450 0.000975685194710953 0.000944797333227782 0.000854505226215 0.000732433051041428 0.000810496766905894 0.000852388396108435 42649 41175 667 665 0 True 298 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 340 450 0.000981724747605597 0.00111404627384437 0.000823987182421607 0.000991836423285267 0.000784531735363477 0.000872016259376312 42913 48551 667 665 0 True 342 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 385 449 0.00101704698120155 0.00104188142592691 0.000900282291905089 0.000915541313801785 0.000818867845513538 0.0008043093888668 44457 45406 667 665 0 True 387 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 429 450 0.000989731730609861 0.00101170757059736 0.000747692072938125 0.000579842832074464 0.00094112297968166 0.00104797284372738 43263 44091 667 665 0 True 432 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 474 448 0.00097984882587317 0.000948055650685423 0.000671396963454643 0.000534065766384375 0.000975850844465826 0.00103471109594296 42831 41317 667 665 0 True 476 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 518 448 0.000985659607824835 0.000964025995407379 0.000671396963454643 0.00064087891966125 0.000954300306231192 0.000939335830411552 43085 42013 667 665 0 True 521 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 562 448 0.000913322235654889 0.0010168474516573 0.000595101853971161 0.000625619897764553 0.000980127780585001 0.00105036282734892 39923 44315 667 665 0 True 566 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 607 447 0.000906504861554116 0.000957784711263166 0.000457770656900893 0.000625619897764553 0.000995168081739035 0.000954371143211105 39625 41741 667 665 0 True 610 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 650 447 0.000898658018209938 0.00105060086701074 0.000488288700694286 0.000625619897764553 0.000947433096890831 0.00113874509542553 39282 45786 667 665 0 True 655 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 255 495 0.000934689441729124 0.00100564985363386 0.000778210116731518 0.000839246204318303 0.000741938446247969 0.000814936100174341 40857 43827 667 665 0 True 253 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 298 494 0.000929656480983587 0.00103706278743322 0.00080872816052491 0.000961318379491875 0.00076785897508652 0.000810212682088049 40637 45196 667 665 0 True 298 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 342 494 0.000956491312595019 0.000979193233713719 0.00080872816052491 0.000854505226215 0.000792046018421118 0.000779239629420775 41810 42674 667 665 0 True 342 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 386 493 0.000863267153331094 0.00101290075727199 0.000671396963454643 0.000869764248111696 0.000770820738550089 0.000859433549515067 37735 44143 667 665 0 True 387 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 430 493 0.000897285392552065 0.00096049232717867 0.000549324788281071 0.000534065766384375 0.000972866992858259 0.00101019186675732 39222 41859 667 665 0 True 432 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 475 493 0.000957223379612551 0.000924260754885612 0.000564583810177768 0.000579842832074464 0.000996150103105923 0.000924830654857855 41842 40280 667 665 0 True 476 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 519 492 0.000979597177835893 0.000886193510785432 0.000686655985351339 0.000579842832074464 0.000936083616068015 0.000887149756094708 42820 38621 667 665 0 True 521 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 563 491 0.000932081452979164 0.000959230302811274 0.000564583810177768 0.000625619897764553 0.000951012803715007 0.000976575706862756 40743 41804 667 665 0 True 566 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 607 491 0.000999477372780765 0.000960515273076259 0.000656137941557946 0.000610360875867857 0.000962642115338722 0.000919862756997039 43689 41860 667 665 0 True 610 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 652 491 0.000996434719239144 0.000895739004182464 0.000564583810177768 0.000518806744487678 0.00101631850988527 0.000938468424178977 43556 39037 667 665 0 True 655 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 255 538 0.000947431983253052 0.000939772181655787 0.000762951094834821 0.000701915007248035 0.000767873147841903 0.000801320397271241 41414 40956 667 665 0 True 253 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 298 537 0.0010512482371769 0.000984470790159193 0.000961318379491875 0.000885023270008392 0.000791683473199613 0.000759092865124444 45952 42904 667 665 0 True 298 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 342 538 0.00106426530383241 0.00113818535810802 0.000946059357595178 0.00100709544518196 0.000800425001926648 0.000831379726556835 46521 49603 667 665 0 True 342 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 387 537 0.00097245952441495 0.000944659657842248 0.000839246204318303 0.000732433051041428 0.000764052843576982 0.000815518997979426 42508 41169 667 665 0 True 387 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 430 536 0.000922267179525367 0.000859828674455652 0.000579842832074464 0.0004272526131075 0.000966993920626467 0.000986730360711014 40314 37472 667 665 0 True 432 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 475 535 0.000901243129865601 0.000839957527143563 0.000518806744487678 0.000473029678797589 0.00098336783522098 0.00094256021651145 39395 36606 667 665 0 True 476 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 519 534 0.000922930615260006 0.000880594711773712 0.000564583810177768 0.000442511635004196 0.000953655894706432 0.000999439088305503 40343 38377 667 665 0 True 521 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 563 534 0.000907282682760245 0.000947160760679451 0.000595101853971161 0.000534065766384375 0.00086626516494059 0.00099957142467945 39659 41278 667 665 0 True 566 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 607 533 0.000930045391586651 0.000975498944201887 0.00064087891966125 0.000701915007248035 0.000916589507925478 0.000893002084143344 40654 42513 667 665 0 True 610 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 652 533 0.000940843380095258 0.000963383510274886 0.000503547722590982 0.000473029678797589 0.00102660062881683 0.00110529586505856 41126 41985 667 665 0 True 655 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 254 580 0.000975204775730697 0.00100369945233879 0.000854505226215 0.000915541313801785 0.000678842366642353 0.000632019312327491 42628 43742 667 665 0 True 253 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 299 580 0.0010502187679335 0.00103284074227684 0.000946059357595178 0.000869764248111696 0.000790300455031369 0.00083096609980155 45907 45012 667 665 0 True 298 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 343 579 0.000990921339513352 0.000953562666106787 0.000823987182421607 0.000778210116731518 0.000776515951062326 0.000783397319461348 43315 41557 667 665 0 True 343 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 387 579 0.000947912402233308 0.000902553935766402 0.000823987182421607 0.000778210116731518 0.000724070238435652 0.000650273136782889 41435 39334 667 665 0 True 387 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 432 578 0.000874842963045829 0.000883256435894038 0.000518806744487678 0.0004272526131075 0.000939783150371353 0.00102410833826231 38241 38493 667 665 0 True 432 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 476 577 0.000889141146982014 0.00086570282423844 0.000396734569314107 0.000534065766384375 0.00104391840750065 0.000896606729348067 38866 37728 667 665 0 True 477 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 520 576 0.000899733241641939 0.000908542815037135 0.0004272526131075 0.000396734569314107 0.00104831776546675 0.00107178533645627 39329 39595 667 665 0 True 521 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 564 576 0.00100711832227626 0.000963957157714612 0.000656137941557946 0.000625619897764553 0.000956044724170596 0.00100736573814226 44023 42010 667 665 0 True 566 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 608 576 0.000907236928571649 0.000931970576475522 0.000656137941557946 0.000671396963454643 0.000826932100236133 0.000852501890848817 39657 40616 667 665 0 True 611 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 653 575 0.000906230336422542 0.000974053352653779 0.000625619897764553 0.000762951094834821 0.000873156217125436 0.000852144644366231 39613 42450 667 665 0 True 655 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 253 621 0.000961387010774768 0.000971276899045508 0.000793469138628214 0.000823987182421607 0.00072225470092247 0.000707704117606557 42024 42329 667 665 0 False 253 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 298 621 0.00094397754201407 0.00100236859027863 0.000778210116731518 0.000839246204318303 0.000733834501443154 0.000778395278550032 41263 43684 667 665 0 False 298 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 343 622 0.00106993882321828 0.00108685538520139 0.000946059357595178 0.000976577401388571 0.000750385933592854 0.000809191645845855 46769 47366 667 665 0 True 343 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 387 621 0.000909204358681268 0.000913223778145295 0.000732433051041428 0.000762951094834821 0.000711559077079076 0.000725077247499749 39743 39799 667 665 0 True 387 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 432 621 0.000961981815226513 0.00093293430417426 0.000686655985351339 0.000549324788281071 0.000905794450177885 0.000968466764266399 42050 40658 667 665 0 False 432 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 477 621 0.00087200620335289 0.000854183983648753 0.000457770656900893 0.000335698481727321 0.000956393471215653 0.00101321932237161 38117 37226 667 665 0 False 477 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 521 621 0.000860567656203942 0.000916321474319812 0.000473029678797589 0.000411993591210803 0.000949680607833787 0.00101814383068213 37617 39934 667 665 0 False 521 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 566 621 0.000987032233482709 0.000905422172965029 0.000686655985351339 0.000503547722590982 0.000906783998511943 0.000968681952072415 43145 39459 667 665 0 False 566 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 611 621 0.000868162851510843 0.000937294024716174 0.000671396963454643 0.000762951094834821 0.000748617708007674 0.000738615867591413 37949 40848 667 665 0 False 611 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 655 620 0.000950703407737651 0.000971024494172029 0.000747692072938125 0.00080872816052491 0.000786147512466175 0.000809029633740912 41557 42318 667 665 0 False 655 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 255 671 0.00114303113950006 0.074630269883911 0.00100709544518196 0.0699931334401465 0.000759513943697282 0.021744754375542 49964 3252445 667 665 0 True 253 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 298 665 0.00112871007846958 0.00101010135776613 0.00102235446707866 0.000885023270008392 0.000719768175385375 0.000705013644035693 49338 44021 667 665 0 False 298 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 343 665 0.00102008963474317 0.000982749847840017 0.000900282291905089 0.000839246204318303 0.000702895626721755 0.000696749179899183 44590 42829 667 665 0 False 343 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 387 665 0.00090005352096211 0.000907395520157684 0.000747692072938125 0.000839246204318303 0.00068210126298484 0.000660659377599824 39343 39545 667 665 0 False 387 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 432 664 0.000873264443539274 0.000877657636882318 0.000656137941557946 0.000686655985351339 0.000813181015114363 0.000734946108157758 38172 38249 667 665 0 False 432 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 477 664 0.000902249722014708 0.000908588706832313 0.000625619897764553 0.000701915007248035 0.000841322521441252 0.000775985220267752 39439 39597 667 665 0 False 477 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 521 664 0.000866401315249905 0.000825134477301058 0.000457770656900893 0.000518806744487678 0.000956086641118921 0.00085018256202559 37872 35960 667 665 0 False 521 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 566 664 0.000957726675687105 0.00087784120406303 0.000762951094834821 0.000625619897764553 0.00083559937647197 0.000801591382085674 41864 38257 667 665 0 False 566 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 611 664 0.000997830221991316 0.00110369767403173 0.000839246204318303 0.000930800335698482 0.00073029786162526 0.000818801497661652 43617 48100 667 665 0 False 611 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 652 668 0.00104516293009366 0.0786636309244156 0.000854505226215 0.0757305256733043 0.000797261792582057 0.0235355196289974 45686 3428222 667 665 0 True 655 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A6_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A6_1.csv new file mode 100755 index 0000000..c381898 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A6_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 265 254 0.00984765113437788 0.0418186918429055 0.00988784618905928 0.0410925459678035 0.00167541602480911 0.00876925502088724 430459 1822491 667 665 0 True 265 254 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 309 253 0.00963800544223196 0.00982859988148444 0.00967421988250553 0.00978103303578241 0.00139380889833043 0.00131615638707085 421295 428338 667 665 0 False 309 253 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 353 254 0.00975888800850204 0.0656649635074181 0.00973525597009232 0.0650034332799268 0.00137775680845628 0.0102211768243967 426579 2861730 667 665 0 True 354 253 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 397 254 0.00987343361965161 0.0925156792186463 0.00990310521095598 0.0914930952925917 0.00134835233828474 0.0150643257040933 431586 4031905 667 665 0 True 399 253 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 441 253 0.0100648005134535 0.071194213503546 0.00997940032043946 0.0679179064621958 0.00175889913717 0.0129213079915154 439951 3102699 667 665 0 True 443 253 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 486 252 0.00970418887603578 0.0636190613865862 0.00968947890440223 0.0677347981994354 0.00159983661966401 0.0177790288341896 424188 2772568 667 665 0 True 488 253 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 530 252 0.00975817881857881 0.079460220705116 0.00978103303578241 0.0761425192645151 0.0015050152886892 0.0252857638868226 426548 3462938 667 665 0 True 533 253 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 574 252 0.00970659097093705 0.0660528409602629 0.00967421988250553 0.0646524757763027 0.00182881325896368 0.0180439878688315 424293 2878634 667 665 0 True 578 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 622 252 0.00966662468719863 0.0095831935067699 0.00953688868543526 0.00956740672922866 0.00195978102523346 0.00194567771451186 422546 417643 667 665 0 False 622 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 662 253 0.00955978865682746 0.0423981904865161 0.00956740672922866 0.0415350576028077 0.00177706719994789 0.00831428984015218 417876 1847746 667 665 0 True 667 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 265 297 0.00990969381411377 0.00973858312524272 0.00997940032043946 0.00958266575112535 0.00154442585389762 0.00172958193482133 433171 424415 667 665 0 False 265 297 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 309 297 0.00983344445881888 0.00995851955363345 0.00988784618905928 0.00999465934233616 0.00131010634044216 0.00121610732064487 429838 434000 667 665 0 False 309 297 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 354 298 0.0100427927487389 0.116320097565957 0.0100709544518196 0.117387655451286 0.00140322601561385 0.0291327902777229 438989 5069320 667 665 0 True 354 297 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 398 298 0.0102384834133631 0.056168207196866 0.01025406271458 0.0549477378500038 0.00160955475093808 0.00843614960789583 447543 2447854 667 665 0 True 399 297 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 442 297 0.0100941289483434 0.0825684949384218 0.0100251773861295 0.080521858548867 0.00185803973833481 0.0194914909138613 441233 3598399 667 665 0 True 444 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 487 297 0.0100499304021599 0.045536615629254 0.010101472495613 0.0462348363469902 0.00186429023661822 0.0101945522092772 439301 1984521 667 665 0 True 488 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 530 296 0.00985206641357737 0.0421214859074902 0.00985732814526589 0.0441596093690394 0.00166727307663343 0.00803724048223452 430652 1835687 667 665 0 True 533 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 575 297 0.00978046110842496 0.0534103627115397 0.0098115510795758 0.05468833447776 0.00182357997127932 0.00985795505378672 427522 2327665 667 665 0 True 578 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 622 296 0.00977041806402818 0.00979936680795603 0.00973525597009232 0.0098115510795758 0.00196398951373131 0.00196163096388535 427083 427064 667 665 0 False 622 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 667 296 0.00964136837509375 0.00980016991437165 0.00965896086060884 0.0097962920576791 0.00195842358336445 0.00184161453199948 421442 427099 667 665 0 False 667 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 265 342 0.0100130525261517 0.055043032162691 0.0100862134737163 0.0560311284046693 0.00151482502708278 0.0134312313026011 437689 2398818 667 665 0 True 265 341 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 308 342 0.00995949724840029 0.0666232759743258 0.00993362325474937 0.0704356450751507 0.00139807522508616 0.0198848535763695 435348 2903494 667 665 0 True 310 340 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 354 343 0.0099746647619198 0.0439668179374965 0.00996414129854276 0.0443427176317998 0.00136910131049398 0.00981960209341752 436011 1916108 667 665 0 True 354 340 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 398 342 0.0100334817713597 0.0348772365796616 0.0100251773861295 0.0359044785229267 0.00141839719790145 0.00510381267155197 438582 1519977 667 665 0 True 399 340 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 443 342 0.0100249486151866 0.0712426293474588 0.00999465934233616 0.0681467917906462 0.00177312062777396 0.0113396731572893 438209 3104809 667 665 0 True 444 340 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 486 340 0.00994442124325798 0.0339482719157702 0.00994888227664607 0.0349584191653315 0.00170902740498816 0.00528650094319422 434689 1479492 667 665 0 True 488 340 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 530 341 0.0100763534460739 0.0303177261074407 0.0100251773861295 0.0305027847714961 0.00172716752018153 0.00363838378579257 440456 1321270 667 665 0 True 533 340 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 575 340 0.0100120688110969 0.0545842518862962 0.00994888227664607 0.0538796063172351 0.00191393819765446 0.0110268155104982 437646 2378824 667 665 0 True 578 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 619 341 0.00988448325619749 0.063037750017066 0.00984206912336919 0.0628519111924926 0.00208191654382491 0.0148897708397618 432069 2747234 667 665 0 True 623 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 663 340 0.00970094032864547 0.0661257400769032 0.00962844281681544 0.0661936369878691 0.0019785710896171 0.0188588861437968 424046 2881811 667 665 0 True 667 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 266 386 0.00978286320332624 0.0492833824088718 0.00985732814526589 0.0532234683756771 0.00163224954641307 0.0126378768830881 427627 2147808 667 665 0 True 265 384 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 311 386 0.0101737183594058 0.0349698232764332 0.010101472495613 0.0351567864499886 0.00142787065708599 0.00435873089294846 444712 1524012 667 665 0 True 310 384 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 355 386 0.0102040305093505 0.0903437352823579 0.0101930266269932 0.0859388113221942 0.00150172378537532 0.021231901558847 446037 3937250 667 665 0 True 354 384 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 398 387 0.0102339995028807 0.0707320142884104 0.0102388036926833 0.0679789425497826 0.00169827452852406 0.0194072869598829 447347 3082556 667 665 0 True 399 384 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 443 386 0.0102163841402714 0.0470625866566164 0.0101625085831998 0.0477454795147631 0.00175327350739376 0.00855795887450952 446577 2051024 667 665 0 True 444 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 488 384 0.0102889731604786 0.0585105244227529 0.0103303578240635 0.0557259479667353 0.00185664011484556 0.0142398365514396 449750 2549934 667 665 0 True 489 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 532 384 0.0106149488771293 0.043682495320471 0.0103456168459602 0.0445410849164569 0.00265532220910843 0.00474096578860348 463999 1903717 667 665 0 True 533 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 575 384 0.0101075578026963 0.0538038389633961 0.0101777676050965 0.0534370946822309 0.00182385061491851 0.00976456358229276 441820 2344813 667 665 0 True 578 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 620 385 0.010189938219263 0.0468397360992318 0.0101930266269932 0.0480048828870069 0.0023756371376592 0.0083593278168666 445421 2041312 667 665 0 True 623 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 664 384 0.0100104445374017 0.0955211558307534 0.00996414129854276 0.0886701762417029 0.00193479707851156 0.0216562290754206 437575 4162886 667 665 0 True 668 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 267 430 0.00993627699768793 0.0483904428041952 0.00997940032043946 0.0491035324635691 0.00167598256060952 0.00757127851416048 434333 2108893 667 665 0 True 265 428 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 311 429 0.0100656698430368 0.0552703112783102 0.0100862134737163 0.0542305638208591 0.00163588896742499 0.0100310235150523 439989 2408723 667 665 0 True 310 428 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 355 430 0.0101762119626843 0.0375181258249767 0.0101777676050965 0.0383764400701915 0.00145990206783741 0.00439911403984959 444821 1635069 667 665 0 True 355 427 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 399 429 0.0105597922027771 0.0593654197292269 0.0105134660868238 0.0565804531929503 0.00161926423448562 0.0144202278668754 461588 2587191 667 665 0 True 399 427 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 444 428 0.0103695920407844 0.099055994300239 0.0103913939116503 0.0982833600366217 0.00180880275636344 0.0180584408429403 453274 4316937 667 665 0 True 444 427 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 488 428 0.0104694963115833 0.0655439697894312 0.0104829480430304 0.0646677347981994 0.00188644495832214 0.0168095027830536 457641 2856457 667 665 0 True 489 427 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 531 428 0.0104927851935785 0.0543010077264574 0.010452429999237 0.0538185702296483 0.00172706224577224 0.0102474375622622 458659 2366480 667 665 0 True 533 427 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 576 428 0.0100883181663917 0.0354950319263483 0.0100862134737163 0.0360112916762036 0.00190904998858315 0.00473554975762481 440979 1546901 667 665 0 True 578 427 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 620 429 0.00996535378454055 0.0416995567426233 0.010101472495613 0.0427710383764401 0.00200178055061487 0.00581874128184025 435604 1817299 667 665 0 True 623 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 664 428 0.0100840859039466 0.0756420921839963 0.0100251773861295 0.0768596932936599 0.00191988663876236 0.0142461353934507 440794 3296541 667 665 0 True 668 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 268 473 0.010020373196327 0.0564031272963824 0.00999465934233616 0.0572213321126116 0.00164039115361359 0.0157747510887395 438009 2458092 667 665 0 True 265 471 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 312 473 0.00995981752772046 0.0585798439793693 0.00991836423285267 0.0583352407110704 0.00167743884206612 0.00754809578692909 435362 2552955 667 665 0 True 310 471 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 357 474 0.0102335648380891 0.0738496963397278 0.0102235446707866 0.0700846875715267 0.00155231695138256 0.0190540331658018 447328 3218427 667 665 0 True 355 471 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 401 474 0.0107399035661844 0.0963618935184149 0.0107118333714809 0.0883802548256657 0.00170964413617315 0.0259252362038149 469461 4199526 667 665 0 True 399 471 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 445 473 0.0107610420013157 0.10111141896857 0.0108033875028611 0.094544899671931 0.00204346074997646 0.0310211016321423 470385 4406514 667 665 0 True 444 471 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 489 472 0.0105672272584239 0.0498192150093705 0.0104982070649271 0.0505073624780652 0.00206836582912672 0.0094004516773846 461913 2171160 667 665 0 True 489 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 533 472 0.0101698521304694 0.0446111846335913 0.0101472495613031 0.0460059510185397 0.001907974965959 0.00678165295689531 444543 1944190 667 665 0 True 534 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 577 471 0.0103605555885367 0.116823851801626 0.0103913939116503 0.115388723582818 0.00206083970291356 0.0311263485491701 452879 5091274 667 665 0 True 578 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 622 473 0.0100244224420177 0.0726073595524632 0.0100251773861295 0.0730754558632792 0.0019336181198997 0.0221180995329021 438186 3164285 667 665 0 True 623 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 665 472 0.00999568881157956 0.0791448981804477 0.00990310521095598 0.0761272602426184 0.00202797001282251 0.0121209638990276 436930 3449196 667 665 0 True 668 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 268 518 0.00977883683472981 0.0521926468723881 0.00970473792629892 0.0547646295872435 0.00161275668739468 0.0116532498591698 427451 2274596 667 665 0 True 265 515 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 313 517 0.010118058388979 0.106292832103146 0.0101319905394064 0.0999923704890517 0.00154885205067936 0.0274608906599294 442279 4632324 667 665 0 True 310 515 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 357 518 0.0103311127681753 0.0641531500988681 0.0102845807583734 0.0650949874113069 0.0015525502436984 0.0157721241462305 451592 2795844 667 665 0 True 355 514 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 401 517 0.0105056192434797 0.0640691451677947 0.0104371709773404 0.0628366521705959 0.00175406322054914 0.00846376865631143 459220 2792183 667 665 0 True 400 514 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 445 516 0.010826264597159 0.0623205989338189 0.0107881284809644 0.0620584420538643 0.00196271376386605 0.00745602806027289 473236 2715980 667 665 0 True 444 514 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 489 514 0.0103762492752251 0.0670881139676841 0.0103761348897536 0.0664377813382162 0.00182485432318501 0.0149511481960787 453565 2923752 667 665 0 True 489 514 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 533 514 0.0103333089692279 0.0782863315303594 0.0104219119554437 0.0758525978484779 0.00184297953619259 0.0193988265057504 451688 3411779 667 665 0 True 534 514 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 577 515 0.0102932054229237 0.0607806079630296 0.0102693217364767 0.0616159304188602 0.00179316335839706 0.0143601643747156 449935 2648866 667 665 0 True 579 514 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 622 515 0.00998134487345478 0.0508173156626976 0.0100099183642329 0.0507209887846189 0.0019491259023936 0.00772130793377804 436303 2214658 667 665 0 True 623 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 665 514 0.00972477826090388 0.0648117203055705 0.00970473792629892 0.0646982528419928 0.00199628917157887 0.0121633715617534 425088 2824545 667 665 0 True 668 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 269 560 0.00968078560856903 0.0467371679370089 0.00975051499198901 0.0465247577630274 0.0014474010741923 0.00954700084570151 423165 2036842 667 665 0 True 266 558 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 314 559 0.0100275566039365 0.0627417479381677 0.00991836423285267 0.0597238117036698 0.00149158543313947 0.0181131487561467 438323 2734334 667 665 0 True 310 558 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 357 560 0.0102032069339558 0.0495578153440365 0.0102082856488899 0.0503242542153048 0.0014219992057208 0.00790352266345446 446001 2159768 667 665 0 True 355 558 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 401 559 0.0103411786896664 0.0573282370494788 0.0102082856488899 0.0552681773098344 0.0016594491744523 0.00905555272543864 452032 2498409 667 665 0 True 400 558 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 446 558 0.0104027180733277 0.0976856423503253 0.010406652933547 0.0889448386358434 0.00207642932947055 0.0250576518845339 454722 4257216 667 665 0 True 445 558 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 489 557 0.0102656156472004 0.0670826757899555 0.0101472495613031 0.0659037155718318 0.00206610915232011 0.0119181449803839 448729 2923515 667 665 0 True 489 558 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 534 557 0.0100518749551752 0.0590502578258418 0.0100862134737163 0.0591744869153887 0.00198114130503454 0.00826382911468977 439386 2573456 667 665 0 True 534 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 577 556 0.00998509671691964 0.0413370803984096 0.0100099183642329 0.042374303807126 0.00176072542121755 0.00929673624406391 436467 1801502 667 665 0 True 579 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 622 557 0.00983591518500306 0.0504555965331043 0.0098115510795758 0.0496833752956435 0.00176232945642046 0.0075882574359867 429946 2198894 667 665 0 True 623 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 666 557 0.00981894038103402 0.0571164923065274 0.0097962920576791 0.0544441901274128 0.00183327528386788 0.00915609412548141 429204 2489181 667 665 0 True 668 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 266 602 0.0093756280477294 0.00926240985847544 0.00935378042267491 0.00929274433508812 0.00134289032520776 0.00129127373259643 409826 403663 667 665 0 False 266 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 310 602 0.00952261337859338 0.00950437434855163 0.00944533455405508 0.00953688868543526 0.00142756798619674 0.00136490096911347 416251 414208 667 665 0 False 310 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 356 603 0.00991134096490322 0.0796542512151287 0.0100099183642329 0.0756542305638209 0.0014501089284637 0.0168932466237502 433243 3471394 667 665 0 True 355 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 400 602 0.00998143638183197 0.0861240306075328 0.00991836423285267 0.0780498970016022 0.0014866695569363 0.0289254670971646 436307 3753352 667 665 0 True 400 601 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 445 601 0.00975378641647361 0.0099782759714576 0.0097962920576791 0.0100099183642329 0.00188804278731397 0.00206506552945687 426356 434861 667 665 0 False 445 601 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 489 601 0.00985533783806197 0.00973798653190541 0.00988784618905928 0.00962844281681544 0.00204620424650677 0.00205419591988529 430795 424389 667 665 0 False 489 601 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 534 601 0.00968799189327287 0.00960434962434698 0.00973525597009232 0.00971999694819562 0.002072001380021 0.00199611604424388 423480 418565 667 665 0 False 534 601 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 579 601 0.00950625625617038 0.00961921856598466 0.00943007553215839 0.00959792477302205 0.00186230475545376 0.00184613891671879 415536 419213 667 665 0 False 579 601 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 624 601 0.00960677820851534 0.00966733611322883 0.00964370183871214 0.00970473792629892 0.00150546956870717 0.00153281946027772 419930 421310 667 665 0 False 624 601 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 668 600 0.00955345170170694 0.00963358269787538 0.00962844281681544 0.00967421988250553 0.0016338687459591 0.00163502090873266 417599 419839 667 665 0 False 668 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 267 651 0.00935920229402351 0.0396313282634373 0.0093842984664683 0.0392919813839933 0.00135228464008332 0.00893185700154594 409108 1727164 667 665 0 True 266 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 311 645 0.00937782424878199 0.00931972871065281 0.0093842984664683 0.0093842984664683 0.00137205988643389 0.00131756762861742 409922 406161 667 665 0 False 311 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 355 645 0.00932866137313582 0.00954744379832621 0.0093690394445716 0.00953688868543526 0.00133308264390879 0.00126774872505544 407773 416085 667 665 0 False 355 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 400 645 0.00957626016472194 0.00956102776969891 0.00961318379491875 0.00949111161974517 0.00131564811074648 0.0014279339822407 418596 416677 667 665 0 False 400 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 445 645 0.00957060952243036 0.00947780299914354 0.00952162966353857 0.00952162966353857 0.00167431157205313 0.00162784108529259 418349 413050 667 665 0 False 445 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 490 645 0.00966735675421616 0.00955203297784401 0.00964370183871214 0.00956740672922866 0.00183984143775097 0.00169478491705354 422578 416285 667 665 0 False 490 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 534 644 0.00953521865755152 0.00934269755413941 0.00950637064164187 0.00935378042267491 0.00184340253508502 0.0017308633748896 416802 407162 667 665 0 False 534 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 579 644 0.00929324763116267 0.00958447847703488 0.00924696726939803 0.00958266575112535 0.00153592549934079 0.00137474503756275 406225 417699 667 665 0 False 579 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 624 644 0.00961949787294496 0.00963163229658032 0.00965896086060884 0.00959792477302205 0.00136775759207949 0.0013995383011732 420486 419754 667 665 0 False 624 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 664 650 0.00956017756743052 0.0412684033269257 0.00961318379491875 0.0407873655298695 0.00138667709799342 0.0079460833446568 417893 1798509 667 665 0 True 668 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A6_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A6_2.csv new file mode 100755 index 0000000..c77c42a --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A6_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 265 254 0.00799904465254212 0.736290554722811 0.00790417334248875 0.72632944228275 0.00177459338764113 0.184149802471303 349653 32088113 667 665 14 True 265 254 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 309 253 0.00641107690604229 0.00646902217778367 0.00631723506523232 0.00636301213092241 0.00142965752162615 0.00128183557410081 280240 281925 667 665 0 False 309 253 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 353 254 0.00606350521237436 0.00647108730856668 0.00604257267109178 0.00625619897764553 0.00126812381129194 0.00206013294329416 265047 282015 667 665 0 True 354 253 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 397 254 0.00580057876760864 0.00601652907732825 0.00579842832074464 0.00605783169298848 0.0012903694733337 0.00132337052652509 253554 262205 667 665 0 True 399 253 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 441 253 0.0059292853001286 0.00609417799476948 0.00590524147402152 0.00604257267109178 0.00143859483335331 0.00162052372332046 259180 265589 667 665 0 True 443 253 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 486 252 0.00607693406672722 0.00643063369111724 0.00608834973678187 0.00643930724040589 0.00138645245148388 0.00149804667661393 265634 280252 667 665 0 True 488 253 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 530 252 0.00647192997687469 0.00644935754354988 0.00645456626230259 0.00651560234988937 0.00153271798895903 0.00155723724310667 282900 281068 667 665 0 True 533 253 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 574 252 0.00679708211813068 0.00686949692840478 0.00677500572213321 0.00688181887541009 0.00162668452083879 0.00157165969134358 297113 299378 667 665 0 True 578 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 622 252 0.00795281004496607 0.00758497296112793 0.00775158312352178 0.00761425192645151 0.00276735947784491 0.0018557954876873 347632 330559 667 665 0 False 622 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 662 253 0.00886624666609245 0.763399618294994 0.0089417868314641 0.746501869230182 0.00194388540012579 0.168542519883188 387560 33269547 667 665 15 True 667 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 265 297 0.00671650899201349 0.00650835144625124 0.00674448767833982 0.00648508430609598 0.00157109895043838 0.00142924619663866 293591 283639 667 665 0 False 265 297 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 309 297 0.00619692442631968 0.00643994972553838 0.00614938582436866 0.00642404821850919 0.00121648242996026 0.00110584549456673 270879 280658 667 665 0 False 309 297 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 354 298 0.00607345674839394 0.00626746541336174 0.00607309071488518 0.00627145799954223 0.00126596186587426 0.00128042416258111 265482 273141 667 665 0 True 354 297 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 398 298 0.00619932652122096 0.00649134853613778 0.00614938582436866 0.00646982528419928 0.00134119838556123 0.00131100162389142 270984 282898 667 665 0 True 399 297 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 442 297 0.00638861159944175 0.00634800551389919 0.00636301213092241 0.0063782711528191 0.00164900199883362 0.00167660173014834 279258 276651 667 665 0 True 444 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 487 297 0.00656950078405521 0.00650653872034171 0.00663767452506294 0.00648508430609598 0.00167254965578828 0.00163826625291713 287165 283560 667 665 0 True 488 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 530 296 0.00682906429595914 0.00670710881116731 0.0068055237659266 0.00668345159075303 0.00160569352006037 0.00165889174144906 298511 292301 667 665 0 True 533 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 575 297 0.00690517638868824 0.0069701605811278 0.00692759594110018 0.00706492713817044 0.00172398673884298 0.00179263433689849 301838 303765 667 665 0 True 578 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 622 296 0.00707261384185454 0.00717020291630885 0.00711070420386053 0.00727855344472419 0.00202376772786224 0.0019287216560005 309157 312483 667 665 0 False 622 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 667 296 0.00771715309660345 0.00738509124723 0.00770580605783169 0.00749217975127794 0.00197318493586706 0.00182814853528474 337331 321848 667 665 0 False 667 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 265 342 0.00603923261532429 0.00607857478440895 0.00601205462729839 0.00604257267109178 0.00136612756933595 0.00137466397907489 263986 264909 667 665 0 True 265 341 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 308 342 0.00615153627123266 0.00615794464416936 0.00617990386816205 0.00607309071488518 0.00134949769718888 0.00120939904482567 268895 268368 667 665 0 True 310 340 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 354 343 0.00626784341864316 0.00640472777273924 0.00624093995574884 0.00645456626230259 0.00121137075141708 0.00130338328533629 273979 279123 667 665 0 True 354 340 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 398 342 0.0064967973783765 0.00651746096759408 0.00653086137178607 0.00650034332799268 0.00132981066893973 0.00134631244248518 283987 284036 667 665 0 True 399 340 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 443 342 0.00658187729207038 0.00680068218153532 0.00666819256885634 0.00674448767833982 0.00169341806999416 0.001680427931769 287706 296379 667 665 0 True 444 340 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 486 340 0.00673348379598253 0.00673510280622591 0.00677500572213321 0.00672922865644312 0.00167479202893686 0.00156850399469589 294333 293521 667 665 0 True 488 340 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 530 341 0.00685459513319559 0.00695942190105614 0.0068055237659266 0.00701915007248035 0.00173227970711945 0.00179902481129603 299627 303297 667 665 0 True 533 340 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 575 340 0.00686296814970862 0.00701685548272145 0.00700389105058366 0.00703440909437705 0.00183594385275094 0.00170929817001312 299993 305800 667 665 0 True 578 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 619 341 0.0068903520315832 0.00706527132663428 0.00689707789730678 0.00704966811627375 0.0020157811228163 0.00195473551745645 301190 307910 667 665 0 True 623 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 663 340 0.0067457459185262 0.00682950222890713 0.0068207827878233 0.00672922865644312 0.00189557447133929 0.00189607652344157 294869 297635 667 665 0 True 667 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 266 386 0.00596172501984302 0.00622217021152102 0.005981536583505 0.00617990386816205 0.00143094404821817 0.00144311052384054 260598 271167 667 665 0 True 265 384 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 311 386 0.0064979183559971 0.0817756682849261 0.00654612039368277 0.0839093614099336 0.00148646385431308 0.0152623385852926 284036 3563847 667 665 0 True 310 384 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 355 386 0.00659274391186188 0.00653717149362305 0.00656137941557946 0.00650034332799268 0.0013083469719677 0.00133068928809859 288181 284895 667 665 0 True 354 384 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 398 387 0.00660509754278274 0.00686750063531454 0.00653086137178607 0.00688181887541009 0.00143582893323562 0.00137699856765264 288721 299291 667 665 0 True 399 384 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 443 386 0.00683418876508187 0.00690400755837867 0.00683604180972 0.00685130083161669 0.00154802605714975 0.00175740059189613 298735 300882 667 665 0 True 444 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 488 384 0.0068882015847192 0.00687521045690445 0.00691233691920348 0.00685130083161669 0.00170835018762465 0.00198578285922353 301096 299627 667 665 0 True 489 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 532 384 0.0069980116373491 0.00696343743313422 0.00697337300679027 0.00697337300679027 0.00177328029813062 0.00174447586876731 305896 303472 667 665 0 True 533 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 575 384 0.00672371527671733 0.00700579556008355 0.00669871061264973 0.00694285496299687 0.00186910479037671 0.00182813195481533 293906 305318 667 665 0 True 578 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 620 385 0.00660420533610512 0.00649107318536671 0.00662241550316625 0.00653086137178607 0.00194949712410018 0.00184482693671419 288682 282886 667 665 0 True 623 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 664 384 0.00610820705463245 0.00624566681065217 0.00614938582436866 0.00633249408712902 0.00189941612816666 0.00191032072738768 267001 272191 667 665 0 True 668 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 267 430 0.00626546420083618 0.0061735249086323 0.00627145799954223 0.00617990386816205 0.00156105526091138 0.00159182064598543 273875 269047 667 665 0 True 265 428 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 311 429 0.00624858090524433 0.00634086933974901 0.00630197604333562 0.0063935301747158 0.00145115031204718 0.00135063115506729 273137 276340 667 665 0 True 310 428 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 355 430 0.0063685483877425 0.00665621481031487 0.0063935301747158 0.00672922865644312 0.0013158873828422 0.00131619860453618 278381 290083 667 665 0 True 355 427 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 399 429 0.00665046282077547 0.00664958344591164 0.00672922865644312 0.00665293354695964 0.00158108574374196 0.00149955564523536 290704 289794 667 665 0 True 399 427 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 444 428 0.00664064854732167 0.00682752888171447 0.00672922865644312 0.0068055237659266 0.0016403229250073 0.00172540208355559 290275 297549 667 665 0 True 444 427 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 488 428 0.00669644578031424 0.00669944488137258 0.00671396963454643 0.00677500572213321 0.00164494420929425 0.00169901661313106 292714 291967 667 665 0 True 489 427 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 531 428 0.00662447444165306 0.00673799398932213 0.00665293354695964 0.0068207827878233 0.00163923117066953 0.0016449304324432 289568 293647 667 665 0 True 533 427 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 576 428 0.00644983070378292 0.00644598449660429 0.00643930724040589 0.00648508430609598 0.00176490066329817 0.00183622805817654 281934 280921 667 665 0 True 578 427 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 620 429 0.00600727331459013 0.00601898428837027 0.00602731364919509 0.00602731364919509 0.00179232018311453 0.00169016392140179 262589 262312 667 665 0 True 623 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 664 428 0.00595360365136727 0.00607747338132468 0.005981536583505 0.00607309071488518 0.00180845635207667 0.00188829641108981 260243 264861 667 665 0 True 668 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 268 473 0.00623222378282134 0.0064246677577441 0.00627145799954223 0.0063935301747158 0.00146640894147505 0.00149467029998293 272422 279992 667 665 0 True 265 471 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 312 473 0.0062326813247073 0.00612900986730961 0.00617990386816205 0.00610360875867857 0.00151733303217941 0.00160520663774284 272442 267107 667 665 0 True 310 471 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 357 474 0.00636278335997943 0.00639401203856517 0.0064087891966125 0.00643930724040589 0.00149795908615378 0.00149543265187907 278129 278656 667 665 0 True 355 471 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 401 474 0.00652173341116121 0.00653035656203911 0.00654612039368277 0.00650034332799268 0.00169934762167176 0.00159016697455635 285077 284598 667 665 0 True 399 471 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 445 473 0.00649446391475812 0.0067090133206672 0.00656137941557946 0.00665293354695964 0.00182256933224221 0.00207979559289091 283885 292384 667 665 0 True 444 471 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 489 472 0.00652658335515236 0.00667886241123523 0.00642404821850919 0.00675974670023652 0.00196435859047506 0.00196970253977226 285289 291070 667 665 0 True 489 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 533 472 0.00635958056677772 0.00630447714617282 0.00631723506523232 0.00625619897764553 0.00178519344761529 0.0016840558223727 277989 274754 667 665 0 True 534 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 577 471 0.00624601867068297 0.00611579303029834 0.00625619897764553 0.00611886778057527 0.0019121555466823 0.00188664235693589 273025 266531 667 665 0 True 578 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 622 473 0.00577543684097525 0.00582224616244204 0.00579842832074464 0.00578316929884794 0.00181064982958773 0.00174727438944304 252455 253738 667 665 0 True 623 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 665 472 0.00579357837675349 0.00579317371019676 0.00575265125505455 0.00579842832074464 0.0018432578147982 0.0019079343363248 253248 252471 667 665 0 True 668 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 268 518 0.00616292906419301 0.00618518142460753 0.00619516289005875 0.00621042191195544 0.00148628224241615 0.00144401239389922 269393 269555 667 665 0 True 265 515 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 313 517 0.00612298565754889 0.00635998327244066 0.00605783169298848 0.0063782711528191 0.0014282001005547 0.00135492804097176 267647 277173 667 665 0 True 310 515 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 357 518 0.00639632118022014 0.00630576211643781 0.00633249408712902 0.00628671702143893 0.00153091977291034 0.00149110071549054 279595 274810 667 665 0 True 355 514 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 401 517 0.00636811372295084 0.00660181008713131 0.00634775310902571 0.00659189745937285 0.00172752784366457 0.00160997460452132 278362 287712 667 665 0 True 400 514 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 445 516 0.00643294740819108 0.00633880420896599 0.00643930724040589 0.00628671702143893 0.00182284053765489 0.00184406122795426 281196 276250 667 665 0 True 444 514 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 489 514 0.0061413330871758 0.00623063724773137 0.00621042191195544 0.00625619897764553 0.00175705955664806 0.00170752055693654 268449 271536 667 665 0 True 489 514 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 533 514 0.00611465839522445 0.00614011568174269 0.00614938582436866 0.00614938582436866 0.00170799449339349 0.00149516457057714 267283 267591 667 665 0 True 534 514 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 577 515 0.00581867454919828 0.00609872128249211 0.00584420538643473 0.00610360875867857 0.00174061770188323 0.00164687054989947 254345 265787 667 665 0 True 579 514 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 622 515 0.00602646719670606 0.0058509514803259 0.00605783169298848 0.00585946440833143 0.00191125411451689 0.0018321091707827 263428 254989 667 665 0 True 623 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 665 514 0.00593381496479959 0.00587724747896291 0.0059510185397116 0.00590524147402152 0.00187818955010448 0.00180683925200077 259378 256135 667 665 0 True 668 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 269 560 0.00645998813365119 0.00654160005185773 0.00642404821850919 0.00653086137178607 0.00133199237151177 0.00132332459813613 282378 285088 667 665 0 True 266 558 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 314 559 0.00630925095932235 0.00620590157013041 0.00634775310902571 0.00627145799954223 0.00134788436107113 0.00139997737940939 275789 270458 667 665 0 True 310 558 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 357 560 0.00640142277224857 0.00633444448842408 0.0063935301747158 0.0064087891966125 0.00138747869101905 0.00136915606155875 279818 276060 667 665 0 True 355 558 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 401 559 0.00622780850362184 0.00621299185248541 0.00621042191195544 0.00622568093385214 0.00160142070953364 0.00144986068708049 272229 270767 667 665 0 True 400 558 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 446 558 0.00605353079926048 0.00618132651381257 0.00607309071488518 0.00621042191195544 0.00187178565211003 0.00195311789355316 264611 269387 667 665 0 True 445 558 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 489 557 0.00606732568712211 0.00610989593461796 0.00607309071488518 0.00614938582436866 0.00189600427363671 0.00214880821172209 265214 266274 667 665 0 True 489 558 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 534 557 0.00617869138216426 0.00617614074095745 0.00619516289005875 0.00611886778057527 0.00185070411013648 0.00191277455438946 270082 269161 667 665 0 True 534 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 577 556 0.00604714808995136 0.00621524055044914 0.00616464484626535 0.00625619897764553 0.00169159146856205 0.0015208410734286 264332 270865 667 665 0 True 579 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 622 557 0.00619866308548633 0.00607322839027071 0.00625619897764553 0.00616464484626535 0.0017042050118094 0.0016165691913186 270955 264676 667 665 0 True 623 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 666 557 0.00593306002068776 0.00589250650085961 0.00593575951781491 0.00592050049591821 0.00169997535586259 0.0017267003107453 259345 256800 667 665 0 True 668 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 266 602 0.00661898393902156 0.00656245787276614 0.00662241550316625 0.00657663843747616 0.0013647516604366 0.00131015910817686 289328 285997 667 665 0 False 266 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 310 602 0.00645568723992318 0.00634268206565854 0.00650034332799268 0.00642404821850919 0.00150420147835346 0.00140999386176423 282190 276419 667 665 0 False 310 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 356 603 0.00612442691448965 0.00630888275850992 0.00614938582436866 0.00630197604333562 0.00135264930518546 0.00147172363288172 267710 274946 667 665 0 True 355 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 400 602 0.00597263739382312 0.00611916607724392 0.00601205462729839 0.00607309071488518 0.00144222875745603 0.00130839452040976 261075 266678 667 665 0 True 400 601 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 445 601 0.00594314881927313 0.00596496964544573 0.0059510185397116 0.00590524147402152 0.00180107910772351 0.00201548727398366 259786 259958 667 665 0 False 445 601 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 489 601 0.0062239422746855 0.00610780785793736 0.00625619897764553 0.00610360875867857 0.00197491033763568 0.00193056648328063 272060 266183 667 665 0 False 489 601 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 534 601 0.00603417677748445 0.00615771518519347 0.005981536583505 0.00619516289005875 0.00199810550863999 0.0019502486267953 263765 268358 667 665 0 False 534 601 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 579 601 0.00612010314366735 0.00598454249608916 0.00610360875867857 0.00604257267109178 0.00169013036433606 0.00174286665814973 267521 260811 667 665 0 False 579 601 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 624 601 0.00607215275401896 0.00618979355002292 0.00607309071488518 0.00619516289005875 0.00135873285547105 0.00137778902294658 265425 269756 667 665 0 False 624 601 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 668 600 0.00613332610417154 0.00620913694169046 0.00616464484626535 0.00624093995574884 0.00155499056177139 0.00168678556232361 268099 270599 667 665 0 False 668 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 267 651 0.00851400804518775 0.736141957090024 0.00831616693369955 0.727504386968795 0.00191871462091805 0.198024467691178 372163 32081637 667 665 14 True 266 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 311 645 0.00676198865547771 0.00637918898872266 0.00662241550316625 0.00646982528419928 0.00166404192710535 0.00116023043996731 295579 278010 667 665 0 False 311 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 355 645 0.00608734314463277 0.00599764460361249 0.00607309071488518 0.005981536583505 0.00126498831750502 0.00119120010498495 266089 261382 667 665 0 False 355 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 400 645 0.00593511895917457 0.00567562187684822 0.00593575951781491 0.00567635614557107 0.00124728093221439 0.00128556073336751 259435 247348 667 665 0 False 400 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 445 645 0.0057488536574011 0.00582474726527924 0.00581368734264134 0.00587472343022812 0.00156992470082414 0.00169239725080443 251293 253847 667 665 0 False 445 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 490 645 0.00588742021756345 0.00593011482700801 0.00585946440833143 0.00592050049591821 0.00169893969607269 0.00174179916114531 257350 258439 667 665 0 False 490 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 534 644 0.00586797468741024 0.00585861541012063 0.0059662775616083 0.00587472343022812 0.00173077913490785 0.00166938329998745 256500 255323 667 665 0 False 534 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 579 644 0.00600809688998485 0.00607185163641537 0.0059510185397116 0.00608834973678187 0.0015060215257566 0.00127260190550476 262625 264616 667 665 0 False 579 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 624 644 0.00679728801197936 0.00649226637204134 0.00650034332799268 0.00646982528419928 0.00206211801777958 0.00142397927312429 297122 282938 667 665 0 False 624 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 664 650 0.0079731935359855 0.768210982939151 0.00788891432059205 0.744686045624475 0.00167632000709873 0.169565751218617 348523 33479230 667 665 15 True 668 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A6_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A6_3.csv new file mode 100755 index 0000000..f9dd22d --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A6_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 265 254 0.00110086865470904 0.0755844291433551 0.000930800335698482 0.0726024261844816 0.000830725088269136 0.02215954465491 48121 3294028 667 665 0 True 265 254 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 309 253 0.000983898071563898 0.00103040847713241 0.000869764248111696 0.000930800335698482 0.00069903515871211 0.00069719918115058 43008 44906 667 665 0 False 309 253 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 353 254 0.000913367989843485 0.000994842335869429 0.000793469138628214 0.000869764248111696 0.000680295794251387 0.000683871385454367 39925 43356 667 665 0 True 354 253 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 397 254 0.00090222684492041 0.000979514476279965 0.000747692072938125 0.000869764248111696 0.0007022297871305 0.000681821439755807 39438 42688 667 665 0 True 399 253 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 441 253 0.000945075642540369 0.000930685606210537 0.000732433051041428 0.000671396963454643 0.000801771058073644 0.000859852297285426 41311 40560 667 665 0 True 443 253 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 486 252 0.000998608043197445 0.00100849514493489 0.00080872816052491 0.000854505226215 0.000834483748254022 0.00084985162476327 43651 43951 667 665 0 True 488 253 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 530 252 0.000958962038779191 0.00105085327188422 0.000762951094834821 0.00080872816052491 0.00083579884459143 0.000944965900459857 41918 45797 667 665 0 True 533 253 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 574 252 0.000931486648527419 0.00107017371765417 0.000656137941557946 0.00080872816052491 0.000904596433838949 0.000916657923845095 40717 46639 667 665 0 True 578 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 622 252 0.0010077588809166 0.00113589076834912 0.000625619897764553 0.000778210116731518 0.0010074388444613 0.00110539819252724 44051 49503 667 665 0 False 622 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 662 253 0.00117297725593601 0.078750985956537 0.000900282291905089 0.0739299610894942 0.00103820625887501 0.0222311359227514 51273 3432029 667 665 0 True 667 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 265 297 0.0010305673439316 0.000950143727366023 0.000839246204318303 0.000762951094834821 0.000790278799781687 0.00077898344900876 45048 41408 667 665 0 False 265 297 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 309 297 0.000956354050029231 0.000984746140930261 0.000854505226215 0.000885023270008392 0.000647085705006467 0.00062909589649934 41804 42916 667 665 0 False 309 297 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 354 298 0.000935375754558061 0.00103591549255377 0.000823987182421607 0.000930800335698482 0.000661345234346536 0.000741699494515971 40887 45146 667 665 0 True 354 297 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 398 298 0.000909021341926885 0.000926142318487911 0.000762951094834821 0.000762951094834821 0.000708912157887742 0.000728842546773792 39735 40362 667 665 0 True 399 297 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 442 297 0.00100187946768204 0.00100670536492295 0.000717174029144732 0.000701915007248035 0.000947011978865343 0.000964051895965693 43794 43873 667 665 0 True 444 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 487 297 0.00101583449520376 0.000927610855933608 0.000747692072938125 0.00064087891966125 0.000926227225904265 0.000872140320226093 44404 40426 667 665 0 True 488 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 530 296 0.000953883323845059 0.00092430664668079 0.000717174029144732 0.000717174029144732 0.000852597484041968 0.000829758381433876 41696 40282 667 665 0 True 533 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 575 297 0.000948735977628032 0.000961800243341244 0.000671396963454643 0.000595101853971161 0.000892782159491334 0.000984920659931713 41471 41916 667 665 0 True 578 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 622 296 0.000967906982649669 0.000961226595901519 0.000518806744487678 0.000549324788281071 0.00105638518914488 0.00103019025389827 42309 41891 667 665 0 False 622 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 667 296 0.00106081086259342 0.00106537802505807 0.000671396963454643 0.000717174029144732 0.00105972518778963 0.00103520243918475 46370 46430 667 665 0 False 667 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 265 342 0.000928581257551586 0.000973296138033342 0.000762951094834821 0.000793469138628214 0.000741226761025182 0.000784253199917873 40590 42417 667 665 0 True 265 341 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 308 342 0.000933888743428698 0.000944544928354303 0.000839246204318303 0.000839246204318303 0.00067202934108537 0.000696691202290409 40822 41164 667 665 0 True 310 340 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 354 343 0.000894768912179296 0.00103440106331289 0.000762951094834821 0.000930800335698482 0.000709252017805932 0.000697231017504019 39112 45080 667 665 0 True 354 340 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 398 342 0.000935535894218146 0.000965333911569953 0.000778210116731518 0.00080872816052491 0.000738934831007759 0.00070841771945413 40894 42070 667 665 0 True 399 340 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 443 342 0.000936450977990062 0.000974718783683861 0.000686655985351339 0.000656137941557946 0.000884883143069621 0.00094232459747625 40934 42479 667 665 0 True 444 340 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 486 340 0.0010642881809267 0.000993672095092389 0.000793469138628214 0.000793469138628214 0.00097441807681376 0.000860781313869733 46522 43305 667 665 0 True 488 340 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 530 341 0.0010795243257291 0.00110450078044734 0.000854505226215 0.000900282291905089 0.000931993901012924 0.000950681512614984 47188 48135 667 665 0 True 533 340 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 575 340 0.000947935279327606 0.00109862663066455 0.000671396963454643 0.000869764248111696 0.000960728281461657 0.00098247051929681 41436 47879 667 665 0 True 578 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 619 341 0.00096179879847213 0.000903838906031387 0.000473029678797589 0.000350957503624018 0.00107020355043786 0.00109522416207968 42042 39390 667 665 0 True 623 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 663 340 0.000910119442453184 0.00103015607225893 0.000488288700694286 0.000686655985351339 0.000966686370311746 0.00103606553878999 39783 44895 667 665 0 True 667 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 266 386 0.00100714119937056 0.000917468769199263 0.000854505226215 0.000762951094834821 0.000788977794779834 0.000764435487060463 44024 39984 667 665 0 True 265 384 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 311 386 0.000950840670303438 0.00791516442743389 0.00080872816052491 0.00798046845197223 0.000761364866531271 0.00196204938758105 41563 344949 667 665 0 True 310 384 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 355 386 0.00101469064048887 0.000966687719527705 0.000885023270008392 0.000793469138628214 0.000795154259248164 0.000755187468308566 44354 42129 667 665 0 True 354 384 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 398 387 0.000942719301827685 0.000989105861472175 0.000732433051041428 0.000823987182421607 0.000796360033723432 0.000768520776928072 41208 43106 667 665 0 True 399 384 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 443 386 0.000978796479535467 0.000986604758634972 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.000874740409133086 0.000875577272943115 42785 42997 667 665 0 True 444 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 488 384 0.00098430985926126 0.00094298460731825 0.000686655985351339 0.000610360875867857 0.000902119835748626 0.000976013809147034 43026 41096 667 665 0 True 489 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 532 384 0.00102619781892071 0.00104507090569179 0.000778210116731518 0.000656137941557946 0.00091288441826302 0.00104458924194611 44857 45545 667 665 0 True 533 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 575 384 0.000950909301586332 0.00097822950601498 0.000671396963454643 0.000656137941557946 0.000974864158915732 0.00101013054337322 41566 42632 667 665 0 True 578 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 620 385 0.000931601033998908 0.000846634783341967 0.000518806744487678 0.000411993591210803 0.00101942989719416 0.000990208591200006 40722 36897 667 665 0 True 623 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 664 384 0.000905246621367732 0.000868525169641889 0.000518806744487678 0.0004272526131075 0.000927976807944039 0.0010208554830967 39570 37851 667 665 0 True 668 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 267 430 0.000994513043318121 0.000998651354869205 0.000854505226215 0.00080872816052491 0.00083298938806153 0.000880183954242581 43472 43522 667 665 0 True 265 428 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 311 429 0.000958458742704638 0.000995943738953702 0.000793469138628214 0.000900282291905089 0.000773233592598514 0.000749316614507538 41896 43404 667 665 0 True 310 428 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 355 430 0.000971086898757076 0.00100464023413994 0.000839246204318303 0.000915541313801785 0.000747900889047883 0.000708450545483867 42448 43783 667 665 0 True 355 427 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 399 429 0.000908518045852331 0.000960630002564204 0.000732433051041428 0.000793469138628214 0.00078401332312487 0.000816374054383069 39713 41865 667 665 0 True 399 427 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 444 428 0.000981427345379725 0.00091565604328973 0.000747692072938125 0.000656137941557946 0.000884297732769136 0.000884098415717174 42900 39905 667 665 0 True 444 427 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 488 428 0.00104266932681519 0.00101560837318749 0.000793469138628214 0.000762951094834821 0.000968793867638543 0.000962568849887789 45577 44261 667 665 0 True 489 427 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 531 428 0.000969439747967628 0.00106374886632925 0.000732433051041428 0.000839246204318303 0.000916696651524309 0.000914508958265472 42376 46359 667 665 0 True 533 427 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 576 428 0.000953380027770505 0.000976669184978927 0.000625619897764553 0.000595101853971161 0.000976734753945347 0.0010276469173711 41674 42564 667 665 0 True 578 427 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 620 429 0.000946768547518413 0.000866115850395042 0.000473029678797589 0.000534065766384375 0.00103617452438832 0.000866835927384981 41385 37746 667 665 0 True 623 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 664 428 0.000961890306849322 0.00085613438494382 0.000518806744487678 0.000457770656900893 0.000998776469468653 0.000942451344653365 42046 37311 667 665 0 True 668 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 268 473 0.000877565337267279 0.00100324053438701 0.000717174029144732 0.000839246204318303 0.000794344730694229 0.000834104036618988 38360 43722 667 665 0 True 265 471 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 312 473 0.00100485348994077 0.00107526770691893 0.000854505226215 0.000961318379491875 0.000869658003848263 0.000835089074593766 43924 46861 667 665 0 True 310 471 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 357 474 0.000983989579941089 0.0010168474516573 0.00080872816052491 0.000915541313801785 0.000829986385729001 0.000809191358251036 43012 44315 667 665 0 True 355 471 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 401 474 0.00104703885182609 0.000932429494427302 0.000793469138628214 0.000747692072938125 0.000921847307939431 0.000817798168414909 45768 40636 667 665 0 True 399 471 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 445 473 0.000918309442211831 0.000851338692347715 0.000534065766384375 0.000366216525520714 0.000984283219469292 0.00103202992895556 40141 37102 667 665 0 True 444 471 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 489 472 0.00100073561296715 0.0010009688905257 0.000656137941557946 0.000625619897764553 0.00102132193808849 0.00101732013938345 43744 43623 667 665 0 True 489 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 533 472 0.00100261153469958 0.00103745286769223 0.000701915007248035 0.000778210116731518 0.000976597133540517 0.000918333954270562 43826 45213 667 665 0 True 534 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 577 471 0.000919316034360938 0.000918776685361837 0.000564583810177768 0.000396734569314107 0.000951185837223805 0.00108358220120346 40185 40041 667 665 0 True 578 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 622 473 0.000891428856411803 0.000859140297527981 0.000518806744487678 0.000503547722590982 0.000974780693598087 0.000909933109214793 38966 37442 667 665 0 True 623 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 665 472 0.000942216005753132 0.00092079592434967 0.000473029678797589 0.000549324788281071 0.0010283186934923 0.000997099511116577 41186 40129 667 665 0 True 668 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 268 518 0.000975181898636399 0.000966664773630116 0.000823987182421607 0.000793469138628214 0.000769033074741836 0.000841030824883679 42627 42128 667 665 0 True 265 515 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 313 517 0.00102690700884394 0.0010584254180886 0.000915541313801785 0.000930800335698482 0.000804030893407085 0.000869473336827248 44888 46127 667 665 0 True 310 515 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 357 518 0.000964109384996218 0.000886583591044446 0.000854505226215 0.000732433051041428 0.000782445362383635 0.000744553145839288 42143 38638 667 665 0 True 355 514 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 401 517 0.00095788681534719 0.00100874754980837 0.000701915007248035 0.000762951094834821 0.000869149412950357 0.000874075283987716 41871 43962 667 665 0 True 400 514 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 445 516 0.000966969021783455 0.000972607761105671 0.000625619897764553 0.000671396963454643 0.000971641622492884 0.00098091315484894 42268 42387 667 665 0 True 444 514 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 489 514 0.000951298212189396 0.00100897700878426 0.000610360875867857 0.000686655985351339 0.000949848698080389 0.000951987084646193 41583 43972 667 665 0 True 489 514 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 533 514 0.000952350558527099 0.000944544928354303 0.000595101853971161 0.000671396963454643 0.000919563730291434 0.000876781628246239 41629 41164 667 665 0 True 534 514 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 577 515 0.000859652572432026 0.000960836515642505 0.000549324788281071 0.000656137941557946 0.000892456515060753 0.00090180696853492 37577 41874 667 665 0 True 579 514 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 622 515 0.000947637877101733 0.000880365252797822 0.000549324788281071 0.000488288700694286 0.000990283236007573 0.000982635158538469 41423 38367 667 665 0 True 623 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 665 514 0.000872463745238848 0.000919465062289507 0.000503547722590982 0.000366216525520714 0.000950303707830335 0.00104390269954922 38137 40071 667 665 0 True 668 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 269 560 0.000955095809842847 0.000938349536005268 0.000823987182421607 0.000839246204318303 0.000716900931594398 0.000703313869670969 41749 40894 667 665 0 True 266 558 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 314 559 0.000999477372780765 0.000961685513853299 0.000869764248111696 0.00080872816052491 0.000796407090566321 0.000770285516164338 43689 41911 667 665 0 True 310 558 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 357 560 0.000976966311991635 0.000995874901260934 0.000869764248111696 0.000869764248111696 0.000743206276978541 0.000723995676765098 42705 43401 667 665 0 True 355 558 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 401 559 0.000941392430358407 0.000983438224767687 0.000686655985351339 0.000823987182421607 0.000836669742526599 0.000783596709508376 41150 42859 667 665 0 True 400 558 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 446 558 0.000960403295719959 0.000974902350864573 0.000549324788281071 0.000503547722590982 0.00102426796739367 0.00108406772959525 41981 42487 667 665 0 True 445 558 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 489 557 0.000924600643143752 0.00101269424419368 0.000503547722590982 0.000564583810177768 0.00101050164646682 0.00113734465522143 40416 44134 667 665 0 True 489 558 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 534 557 0.000899321453944577 0.000977380507804187 0.000534065766384375 0.000564583810177768 0.00100503428574198 0.0010024757065568 39311 42595 667 665 0 True 534 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 577 556 0.000932927905468186 0.000882384491785656 0.000610360875867857 0.000610360875867857 0.00092010081013422 0.000815356630048824 40780 38455 667 665 0 True 579 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 622 557 0.000934163268560272 0.000808223350777952 0.000656137941557946 0.000473029678797589 0.000871965210335882 0.000827500035308674 40834 35223 667 665 0 True 623 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 666 557 0.000939768156663257 0.00094975364710701 0.000610360875867857 0.000625619897764553 0.000939472847388915 0.000938236516136373 41079 41391 667 665 0 True 668 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 266 602 0.00089918419137879 0.00103788883974642 0.000747692072938125 0.000961318379491875 0.000697389289247387 0.000715642533187827 39305 45232 667 665 0 False 266 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 310 602 0.000943703016882495 0.00103203763586123 0.000839246204318303 0.000900282291905089 0.000755540235181035 0.000816333214320879 41251 44977 667 665 0 False 310 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 356 603 0.000922633213034133 0.000958564871781192 0.00080872816052491 0.00080872816052491 0.000736411895119644 0.000757794324805765 40330 41775 667 665 0 True 355 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 400 602 0.000856747181456193 0.000988119187875847 0.000671396963454643 0.000854505226215 0.000725983723925056 0.000728808318764669 37450 43063 667 665 0 True 400 601 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 445 601 0.000883444750501838 0.000925683400536131 0.000503547722590982 0.000473029678797589 0.000940562824904199 0.00101921998190188 38617 40342 667 665 0 False 445 601 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 489 601 0.000955461843351613 0.000937271078818585 0.000579842832074464 0.000457770656900893 0.00102075775545437 0.00107448901815772 41765 40847 667 665 0 False 489 601 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 534 601 0.00103678991358063 0.00105298724036 0.000717174029144732 0.000656137941557946 0.00103722013983614 0.00111281985914609 45320 45890 667 665 0 False 534 601 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 579 601 0.000977561116443381 0.00103111979995766 0.000686655985351339 0.000671396963454643 0.000951458118072942 0.00102450527738003 42731 44937 667 665 0 False 579 601 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 624 601 0.000887425364909671 0.000913751533789842 0.000656137941557946 0.000732433051041428 0.000766095812580886 0.000726038330448817 38791 39822 667 665 0 False 624 601 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 668 600 0.000926224916838903 0.000890599123122524 0.000671396963454643 0.000534065766384375 0.000855026752643161 0.00095019689355363 40487 38813 667 665 0 False 668 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 267 651 0.00107183762204501 0.0755748148122653 0.000930800335698482 0.0721904325932708 0.000762499516894107 0.0234883113586203 46852 3293609 667 665 0 True 266 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 311 645 0.000995542512561527 0.000998811976152329 0.000869764248111696 0.000885023270008392 0.000713224314472499 0.000673746639090977 43517 43529 667 665 0 False 311 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 355 645 0.000890330755885504 0.000900442913188212 0.000778210116731518 0.000747692072938125 0.000644291946464669 0.000645979092030091 38918 39242 667 665 0 False 355 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 400 645 0.000918652598626299 0.000955627796889798 0.000747692072938125 0.00080872816052491 0.000722120151498202 0.00069447692008688 40156 41647 667 665 0 False 400 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 445 645 0.000937022905347509 0.000881696114857985 0.000701915007248035 0.00064087891966125 0.00083331381248521 0.000840735611631447 40959 38425 667 665 0 False 445 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 490 645 0.000901449023714282 0.000957234009721029 0.000579842832074464 0.00064087891966125 0.000888372195083038 0.000907095430512509 39404 41717 667 665 0 False 490 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 534 644 0.000967174915632136 0.00101413983574179 0.000564583810177768 0.00064087891966125 0.000980008611466393 0.000978932123043113 42277 44197 667 665 0 False 534 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 579 644 0.000965138854239623 0.000996540332291016 0.000778210116731518 0.000854505226215 0.000795785404452082 0.000739364761588879 42188 43430 667 665 0 False 579 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 624 644 0.000972619664075035 0.000917698228175153 0.000823987182421607 0.000717174029144732 0.000732131327939246 0.000747476564162947 42515 39994 667 665 0 False 624 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 664 650 0.000964132262090516 0.079841214388684 0.00080872816052491 0.0750591287098497 0.000754714881819951 0.0227217308451125 42144 3479542 667 665 0 True 668 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A7_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A7_1.csv new file mode 100755 index 0000000..6312e98 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A7_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 260 270 0.00982232619099011 0.0418569197082888 0.00985732814526589 0.0416723887998779 0.00160926569817447 0.00858506375899873 429352 1824157 667 665 0 True 260 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 304 267 0.0096114908899407 0.00957931565007736 0.00961318379491875 0.00956740672922866 0.00136985187293104 0.00129904409191113 420136 417474 667 665 0 False 304 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 347 269 0.00988427736234881 0.0616193264117033 0.00996414129854276 0.0616006713969635 0.00135446969318602 0.00933646599942516 432060 2685418 667 665 0 True 349 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 392 269 0.00999555154901377 0.0800963957157715 0.00999465934233616 0.0806286717021439 0.00136492359457917 0.0109453461337131 436924 3490663 667 665 0 True 393 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 436 268 0.0100321777769847 0.069648233653486 0.0100251773861295 0.065796902418555 0.00162892795710784 0.014278773258333 438525 3035324 667 665 0 True 438 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 479 267 0.00987311334033144 0.0631663388271549 0.00987258716716258 0.0673228046082246 0.00173301320059747 0.0181385595739784 431572 2752838 667 665 0 True 482 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 524 267 0.0096821582342269 0.0764240195361372 0.00967421988250553 0.0764782177462425 0.00167700478785699 0.0211018534665306 423225 3330618 667 665 0 True 527 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 568 267 0.0097235428978118 0.064803712187312 0.00971999694819562 0.0634622720683604 0.0018037272768028 0.0152958884961794 425034 2824196 667 665 0 True 572 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 616 267 0.00952361997074249 0.00953606263312206 0.00952162966353857 0.00964370183871214 0.00192773482856358 0.0017958365822566 416295 415589 667 665 0 False 616 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 654 265 0.00963745639196881 0.0407230481789275 0.00964370183871214 0.0408026245517662 0.00186034137356771 0.00962491638022247 421271 1774742 667 665 0 True 661 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 260 311 0.00979260884549714 0.0101431651915323 0.00973525597009232 0.0100556954299229 0.00152379491383948 0.00196654786166581 428053 442047 667 665 0 False 260 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 304 311 0.00969911016110164 0.00977990868680055 0.00968947890440223 0.00976577401388571 0.00138272455696159 0.00130289555786302 423966 426216 667 665 0 False 304 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 349 313 0.0102702139431543 0.105160750353797 0.0100709544518196 0.100663767452506 0.00199877606411262 0.0235593699679161 448930 4582987 667 665 0 True 349 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 392 313 0.0100885469373347 0.0511887867987662 0.0100404364080262 0.0499427786678874 0.00152381716537082 0.00753139635502734 440989 2230847 667 665 0 True 393 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 437 312 0.0103092880202151 0.0747365552815433 0.0102998397802701 0.0712596322575723 0.00184602099013786 0.0141076675521164 450638 3257077 667 665 0 True 438 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 481 311 0.00997837085119605 0.0426331335319301 0.00993362325474937 0.0435187304493782 0.00173546768408301 0.00812605868937984 436173 1857985 667 665 0 True 483 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 525 311 0.00982147973850109 0.0458394096938386 0.00985732814526589 0.0472724498359655 0.00164540521408442 0.0105313745296218 429315 1997717 667 665 0 True 527 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 569 311 0.00988885278120839 0.0534400776489174 0.00988784618905928 0.0540474555580987 0.00199805711696408 0.0108105381405621 432260 2328960 667 665 0 True 572 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 616 310 0.00948948734605002 0.00950439729444921 0.00956740672922866 0.00956740672922866 0.00202220752171583 0.00200515347558125 414803 414209 667 665 0 False 616 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 661 310 0.00953778089211288 0.00948801392357066 0.00962844281681544 0.00946059357595178 0.00202220711409477 0.00188587579165391 416914 413495 667 665 0 False 661 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 260 358 0.00994906529340045 0.0611456083559781 0.00987258716716258 0.0578316929884794 0.00156563506616704 0.0183478595595342 434892 2664773 667 665 0 True 260 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 304 357 0.00991941657919038 0.0724301942771784 0.00988784618905928 0.0724650949874113 0.00141518469854576 0.0235205689545307 433596 3156564 667 665 0 True 304 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 348 357 0.00989299353527631 0.042756582460959 0.00990310521095598 0.0426642252231632 0.00146367089403737 0.00940394749516981 432441 1863365 667 665 0 True 349 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 393 357 0.00995467018150343 0.0364193156271315 0.00994888227664607 0.0366369115739681 0.00159528615153513 0.00559600930661668 435137 1587182 667 665 0 True 393 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 438 357 0.00999175395136032 0.0727879667123864 0.00997940032043946 0.0682993820096132 0.00181938814732591 0.0128045530526365 436758 3172156 667 665 0 True 438 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 481 355 0.00995059805871841 0.0327371415492267 0.0100556954299229 0.0336308842603189 0.0017652048212054 0.00523914606932598 434959 1426710 667 665 0 True 483 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 525 355 0.00996507925940898 0.0312154155129183 0.0100099183642329 0.031265735866331 0.00170646066294783 0.00484202561241505 435592 1360392 667 665 0 True 527 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 570 356 0.00995457867312624 0.0542476355686653 0.00997940032043946 0.0529945830472267 0.00192580408423714 0.0111511212323772 435133 2364154 667 665 0 True 572 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 614 355 0.00975483876281132 0.0625429446814565 0.0098268101014725 0.0624856946669718 0.00210493201886716 0.014107939288703 426402 2725670 667 665 0 True 616 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 658 355 0.00949163779291403 0.06813809529546 0.00947585259784848 0.0673685816739147 0.00196094965000995 0.0205688871769531 414897 2969511 667 665 0 True 661 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 261 401 0.0100171704031253 0.0471063674292162 0.00993362325474937 0.0499885557335775 0.00156096572747948 0.0106734041284979 437869 2052932 667 665 0 True 260 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 305 401 0.00998926034808185 0.0342383539530906 0.00996414129854276 0.0340428778515297 0.00148023307843639 0.00508654794089113 436649 1492134 667 665 0 True 304 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 349 402 0.0102570824910273 0.0901337803194184 0.01025406271458 0.0862287327382315 0.00141574564193705 0.0233380608736694 448356 3928100 667 665 0 True 349 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 393 401 0.0103824947219684 0.0704013639041527 0.0103761348897536 0.0675822079804684 0.001508504046657 0.0187709362758238 453838 3068146 667 665 0 True 393 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 438 401 0.0102619324350185 0.0476986010459887 0.0102693217364767 0.0480659189745937 0.00166173642358175 0.0105621398494315 448568 2078742 667 665 0 True 438 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 482 400 0.0102844206187133 0.0550290122192641 0.0103150988021668 0.05468833447776 0.0017666168721737 0.012838880956287 449551 2398207 667 665 0 True 483 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 527 400 0.010303980534338 0.0434674693141643 0.010406652933547 0.0440680552376593 0.00167224092330219 0.00575871521310974 450406 1894346 667 665 0 True 527 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 570 399 0.0101427427737264 0.054867220695364 0.0101625085831998 0.0542153047989624 0.00187370836118555 0.00910721140388703 443358 2391156 667 665 0 True 572 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 615 400 0.0100545058210195 0.0515914184637607 0.0100709544518196 0.0522621499961852 0.00199811798950989 0.00908486920118921 439501 2248394 667 665 0 True 616 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 658 399 0.00995654610323586 0.0890901550052747 0.00991836423285267 0.0841077286945907 0.00194174177831513 0.0206641206970962 435219 3882618 667 665 0 True 661 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 262 447 0.009861560407711 0.0462487645068267 0.00988784618905928 0.0460975051499199 0.00159826400433898 0.00841346407223247 431067 2015557 667 665 0 True 260 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 305 446 0.0100257721905813 0.0581674832537971 0.0100404364080262 0.0588998245212482 0.00150451260585583 0.0111099308368228 438245 2534984 667 665 0 True 304 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 350 446 0.010143246069801 0.0376561453989747 0.0101472495613031 0.0376745250629435 0.00158545002774701 0.00471603685331744 443380 1641084 667 665 0 True 349 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 394 446 0.0103695920407844 0.06358266919301 0.0103456168459602 0.0589150835431449 0.00164830513520665 0.0181887992705992 453274 2770982 667 665 0 True 394 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 439 445 0.0106383063904075 0.0982683534195984 0.0106355382619974 0.0967727168688487 0.00195220955787448 0.0158575733851329 465020 4282611 667 665 0 True 438 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 482 444 0.0106003990451558 0.0633167491858509 0.0104982070649271 0.0643015182726787 0.00191129757243961 0.0186809840686223 463363 2759393 667 665 0 True 483 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 526 444 0.0103669154207515 0.0548562525563164 0.010406652933547 0.0537727931639582 0.00180380861020654 0.0101157540717252 453157 2390678 667 665 0 True 527 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 570 443 0.0100606368822913 0.0347840532895526 0.0100862134737163 0.0354924849317159 0.00202691129352217 0.00566429033263206 439769 1515916 667 665 0 True 572 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 616 444 0.00972379454584907 0.0417761960405706 0.00970473792629892 0.0420233463035019 0.00183403013141721 0.00513346498326964 425045 1820639 667 665 0 True 616 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 658 443 0.00980210283963077 0.0727829415608144 0.00973525597009232 0.0738841840238041 0.00199458593386075 0.0130119034087296 428468 3171937 667 665 0 True 661 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 262 490 0.00992845303143805 0.0568970147960884 0.00987258716716258 0.0568093385214008 0.00151958434620349 0.0159950551440986 433991 2479616 667 665 0 True 260 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 307 490 0.00988423160816021 0.0591301324953492 0.00991836423285267 0.0572671091783017 0.00163490105552279 0.00880052542572544 432058 2576937 667 665 0 True 304 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 351 490 0.0102644717924855 0.0755921619108426 0.0102235446707866 0.071122301060502 0.0015798210271062 0.0198400903545444 448679 3294365 667 665 0 True 349 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 395 489 0.0103665036330542 0.0954638599244736 0.0103761348897536 0.0875410086213474 0.00181447453554706 0.0237777260382129 453139 4160389 667 665 0 True 394 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 439 488 0.0132896472340621 0.104340916378839 0.0106355382619974 0.0967421988250553 0.0232808178842809 0.0362654131243795 580915 4547258 667 665 0 True 438 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 483 488 0.0102500134688893 0.047999743005947 0.01025406271458 0.0487983520256352 0.00188824927042013 0.00831301920386662 448047 2091866 667 665 0 True 483 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 528 487 0.00997496216414567 0.045269961353372 0.00991836423285267 0.0466163118944076 0.00177020761644336 0.00854554838870187 436024 1972900 667 665 0 True 527 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 571 487 0.00990802378623003 0.111142814692947 0.00996414129854276 0.111055161364157 0.00191446294622358 0.0225576259803559 433098 4843690 667 665 0 True 572 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 616 487 0.00988086867529842 0.0671105321096286 0.00991836423285267 0.0680094605935759 0.00187560461682152 0.0182902854404368 431911 2924729 667 665 0 True 617 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 660 487 0.00963034161564217 0.0778813134920157 0.00968947890440223 0.0731670099946593 0.00186163617477714 0.01438394260464 420960 3394128 667 665 0 True 661 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 263 534 0.00991056314369709 0.0525547331363428 0.00991836423285267 0.0546730754558633 0.00148807017815464 0.0105442038040078 433209 2290376 667 665 0 True 260 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 307 534 0.0098691098488293 0.113476343640057 0.00988784618905928 0.106996261539635 0.00147009079713253 0.029125160957939 431397 4945387 667 665 0 True 305 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 351 534 0.0102095667661706 0.0620543576840935 0.0102693217364767 0.0636453803311208 0.00149675512741471 0.0126640270689806 446279 2704377 667 665 0 True 349 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 395 533 0.010392446257988 0.0648011881385772 0.010406652933547 0.0629434653238727 0.00163232957540797 0.00855593770638677 454273 2824086 667 665 0 True 394 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 439 533 0.0117248768611803 0.061572447942929 0.0106965743495842 0.0609140154116121 0.00830319683326195 0.00831502318019689 512516 2683375 667 665 0 True 438 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 483 531 0.010292381847529 0.0680182718182501 0.0103150988021668 0.0664835584039063 0.00195423354107228 0.0132635013626762 449899 2964289 667 665 0 True 483 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 527 530 0.0099756942311632 0.0790183974470394 0.0100099183642329 0.0768291752498665 0.00201839542403697 0.017668346893516 436056 3443683 667 665 0 True 527 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 572 531 0.00992175004280876 0.0615213244831006 0.00993362325474937 0.0616159304188602 0.00185799001094538 0.0135079508355347 433698 2681147 667 665 0 True 572 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 617 532 0.00961510547083977 0.0506955876759879 0.00967421988250553 0.0496375982299535 0.001913911994377 0.0069975233743811 420294 2209353 667 665 0 True 617 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 660 530 0.00970345680901824 0.069051892721045 0.00976577401388571 0.0681010147249561 0.00191288173870239 0.0152185315572799 424156 3009335 667 665 0 True 661 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 263 578 0.00960412446557678 0.0477774890418998 0.00959792477302205 0.0487373159380484 0.00136408500380799 0.0101688364878136 419814 2082180 667 665 0 True 260 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 307 577 0.0098767965525134 0.0581105085900836 0.00990310521095598 0.0590829327840085 0.00155889429106049 0.0117805839774442 431733 2532501 667 665 0 True 305 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 351 576 0.00993474423236997 0.0487751537231727 0.00994888227664607 0.048355840390631 0.00145960533779944 0.00919620268512647 434266 2125659 667 665 0 True 349 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 395 576 0.0102680634962903 0.0562290138254769 0.0102388036926833 0.0538643472953384 0.00144860537534728 0.00930245798259514 448836 2450504 667 665 0 True 394 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 439 575 0.0104130813970447 0.0975714406180248 0.0104371709773404 0.0894789044022278 0.00197251692817844 0.0250251468134471 455175 4252239 667 665 0 True 438 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 483 574 0.00999566593448526 0.06797506469309 0.00999465934233616 0.0657358663309682 0.00213467407686185 0.0144762946875062 436929 2962406 667 665 0 True 483 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 528 574 0.00983898071563898 0.0583826239895917 0.0098268101014725 0.057602807660029 0.00207430426039286 0.00657239995014657 430080 2544360 667 665 0 True 528 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 571 574 0.00973557624941249 0.0408580388944437 0.00976577401388571 0.0419165331502251 0.0017350743734879 0.00947768369083562 425560 1780625 667 665 0 True 572 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 616 573 0.00968243275935848 0.052371372468709 0.00973525597009232 0.051468680857557 0.00162990725298252 0.0106116417472006 423237 2282385 667 665 0 True 617 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 660 573 0.0095104427644269 0.0577992933810837 0.00955214770733196 0.0548104066529335 0.00179173354958392 0.0110813037208954 415719 2518938 667 665 0 True 661 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 260 615 0.00958136175675037 0.00941213184024378 0.00952162966353857 0.00946059357595178 0.00169137086221819 0.00138990492248095 418819 410188 667 665 0 False 260 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 305 615 0.00952954513816564 0.00944762914381399 0.00952162966353857 0.00944533455405508 0.00152065184485988 0.00140240427074424 416554 411735 667 665 0 False 305 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 351 619 0.00977298029858955 0.0778177992474893 0.00973525597009232 0.0724956130312047 0.00144826239553694 0.0142461284668186 427195 3391360 667 665 0 True 349 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 396 620 0.0100793274683327 0.0840035543195365 0.010101472495613 0.0779736018921187 0.00142707333263956 0.0249431106001676 440586 3660940 667 665 0 True 394 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 438 614 0.0100199385315353 0.00978681540197484 0.0100099183642329 0.00970473792629892 0.00187774103359876 0.0019405554544904 437990 426517 667 665 0 False 438 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 483 614 0.0099550590921065 0.00975560898125378 0.00996414129854276 0.00975051499198901 0.00188782999934505 0.00199771789733404 435154 425157 667 665 0 False 483 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 528 614 0.00950955055774928 0.00949760530876287 0.00949111161974517 0.00958266575112535 0.00199183391894933 0.0020995792251312 415680 413913 667 665 0 False 528 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 572 614 0.00957955446630084 0.00942592232469478 0.00961318379491875 0.00950637064164187 0.00170355477661116 0.00193921614168806 418740 410789 667 665 0 False 572 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 617 614 0.00943439930298069 0.0093573370368012 0.00947585259784848 0.00932326237888151 0.0014847835935795 0.00142158595293268 412395 407800 667 665 0 False 617 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 661 614 0.00944929229136862 0.00948367714892633 0.00950637064164187 0.00955214770733196 0.00161502781326965 0.00166853356374573 413046 413306 667 665 0 False 661 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 261 665 0.00934652838378247 0.0400696407991827 0.00941481651026169 0.040161745632105 0.00132622939331066 0.00780342789688724 408554 1746266 667 665 0 True 260 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 305 658 0.00939420424829929 0.00934354655235021 0.0093842984664683 0.00935378042267491 0.00135863489284845 0.00127575200463804 410638 407199 667 665 0 False 305 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 349 658 0.00946809726288149 0.00949820190210018 0.00946059357595178 0.00955214770733196 0.00139181119724614 0.00132308814099182 413868 413939 667 665 0 False 349 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 394 658 0.00981200862146176 0.00953119810283319 0.0098115510795758 0.00953688868543526 0.00150847966381479 0.00129581616925222 428901 415377 667 665 0 False 394 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 439 658 0.00975751538284417 0.00962724963014081 0.00975051499198901 0.00965896086060884 0.00161561275961827 0.00149860854088058 426519 419563 667 665 0 False 439 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 483 658 0.00942643807416502 0.00950451202393716 0.00943007553215839 0.00952162966353857 0.00169494104391408 0.00160594055245612 412047 414214 667 665 0 False 483 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 528 658 0.00950662228967915 0.0101255197962863 0.00956740672922866 0.00975051499198901 0.00176193328233554 0.00403986099030945 415552 441278 667 665 0 False 528 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 572 658 0.00957383519272637 0.00935616679602416 0.00959792477302205 0.00930800335698482 0.00147922528745642 0.00141972382163208 418490 407749 667 665 0 False 572 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 617 658 0.00947905539105018 0.00942236571056848 0.00947585259784848 0.00947585259784848 0.00147649354263 0.00150356728265135 414347 410634 667 665 0 False 617 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 657 663 0.00929464313391485 0.0410325424456082 0.00918593118181125 0.0401922636758984 0.00141879402302074 0.00810085120417681 406286 1788230 667 665 0 True 661 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A7_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A7_2.csv new file mode 100755 index 0000000..939a67c --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A7_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 260 270 0.00821207615464412 0.738838375407505 0.00819409475852598 0.724834058136873 0.00184751980027503 0.187048553348171 358965 32199149 667 665 12 True 260 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 304 267 0.00660308435848452 0.00636828968736788 0.00653086137178607 0.0063782711528191 0.00152418137634511 0.0012009754915899 288633 277535 667 665 0 False 304 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 347 269 0.00591423217208059 0.00617219404657214 0.0059510185397116 0.00611886778057527 0.00126419225529331 0.00128125296177094 258522 268989 667 665 0 True 349 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 392 269 0.00599876303551131 0.00615665967390438 0.0059662775616083 0.00607309071488518 0.00128733193934978 0.00129111997800082 262217 268312 667 665 0 True 393 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 436 268 0.00607519540756058 0.00603779992439327 0.00614938582436866 0.00607309071488518 0.00155202873575849 0.00164867968779602 265558 263132 667 665 0 True 438 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 479 267 0.00631275115474993 0.00624075638856812 0.00631723506523232 0.00625619897764553 0.00158997389247412 0.00168009846885035 275942 271977 667 665 0 True 482 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 524 267 0.00635303771780853 0.00661300768515475 0.0063935301747158 0.00666819256885634 0.00153555018615129 0.0015399659958881 277703 288200 667 665 0 True 527 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 568 267 0.00672904563968874 0.00680361925642672 0.00669871061264973 0.00683604180972 0.00172028820171969 0.00161554295623491 294139 296507 667 665 0 True 572 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 616 267 0.00832076522965343 0.0075083566090782 0.00756847486076143 0.00749217975127794 0.00454228290430767 0.00186244868595342 363716 327220 667 665 0 False 616 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 654 265 0.00896322266882123 0.727149597500274 0.00891126878767071 0.71103990234226 0.00215139875077799 0.206358063312223 391799 31689743 667 665 14 True 661 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 260 311 0.00677157415798853 0.00685540814728513 0.00675974670023652 0.00669871061264973 0.00169512239529547 0.00185606764259456 295998 298764 667 665 0 False 260 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 304 311 0.006151101606441 0.00606118179403648 0.00613412680247196 0.00601205462729839 0.00134326757687547 0.00126198299609888 268876 264151 667 665 0 False 304 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 349 313 0.0063990206773473 0.00619908663854647 0.00607309071488518 0.00613412680247196 0.00204879793701921 0.00137172715557931 279713 270161 667 665 0 True 349 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 392 313 0.00647840419456099 0.00621895778585856 0.0063935301747158 0.00633249408712902 0.0016685710485599 0.0012897519421332 283183 271027 667 665 0 True 393 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 437 312 0.00639318701830133 0.00660628453716117 0.0063935301747158 0.00662241550316625 0.00171941407715984 0.00171234642170348 279458 287907 667 665 0 True 438 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 481 311 0.00634509936608716 0.00656209073840472 0.00633249408712902 0.00659189745937285 0.00167516317527688 0.00161083647237288 277356 285981 667 665 0 True 483 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 525 311 0.00665112625651011 0.00653343131231604 0.00665293354695964 0.00659189745937285 0.00161200212227182 0.0015166396307383 290733 284732 667 665 0 True 527 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 569 311 0.00683549275945685 0.00674106873959906 0.0068207827878233 0.00674448767833982 0.00174114611153487 0.0015493403504879 298792 293781 667 665 0 True 572 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 616 310 0.00708693490288502 0.00696077570901389 0.00695811398489357 0.00686655985351339 0.00201737872820388 0.00197441656514235 309783 303356 667 665 0 False 616 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 661 310 0.00748309754484168 0.00739979956758456 0.00738536659800107 0.00746166170748455 0.0020479663855019 0.00180628361900789 327100 322489 667 665 0 False 661 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 260 358 0.00609429778129933 0.00608509141932423 0.00610360875867857 0.00608834973678187 0.00147347981713473 0.00143001666563559 266393 265193 667 665 0 True 260 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 304 357 0.00606254437441385 0.0061142097633647 0.00608834973678187 0.00613412680247196 0.0013311890772392 0.0013355960937708 265005 266462 667 665 0 True 304 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 348 357 0.00620067626978454 0.00630351341847409 0.00621042191195544 0.00636301213092241 0.00136199095748 0.00129783661425747 271043 274712 667 665 0 True 349 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 393 357 0.00665975092106041 0.00664754126102622 0.00665293354695964 0.00666819256885634 0.00144134511619606 0.0012906797792007 291110 289705 667 665 0 True 393 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 438 357 0.00677695027514853 0.00678558378092175 0.00672922865644312 0.00686655985351339 0.00164559047505447 0.00172907010116377 296233 295721 667 665 0 True 438 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 481 355 0.00670003748411901 0.00674207835909297 0.0068055237659266 0.00674448767833982 0.00164932704876115 0.00158346461683623 292871 293825 667 665 0 True 483 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 525 355 0.00658446240372604 0.00654254083365888 0.00674448767833982 0.00651560234988937 0.00170697733241945 0.00157778974393497 287819 285129 667 665 0 True 527 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 570 356 0.00669276256813228 0.00686798249916391 0.00662241550316625 0.00691233691920348 0.001784140371025 0.0018437878842251 292553 299312 667 665 0 True 572 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 614 355 0.00685411471421533 0.0068890927249458 0.00683604180972 0.00692759594110018 0.00204694133236753 0.00198266048783285 299606 300232 667 665 0 True 616 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 658 355 0.00636486517556054 0.0064948592584689 0.00633249408712902 0.00648508430609598 0.00194814608613101 0.00174593301366749 278220 283051 667 665 0 True 661 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 261 401 0.00614812758418227 0.00609924903813666 0.00616464484626535 0.00611886778057527 0.00141008768176448 0.00149170097454202 268746 265810 667 665 0 True 260 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 305 401 0.00612637146750498 0.00625388144198904 0.00610360875867857 0.00627145799954223 0.00137029838233918 0.00127696899798665 267795 272549 667 665 0 True 304 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 349 402 0.00636012961704087 0.0066105983659079 0.00631723506523232 0.00660715648126955 0.00131225037196848 0.00129566655694971 278013 288095 667 665 0 True 349 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 393 401 0.00664314215060014 0.0066152104913233 0.00668345159075303 0.00666819256885634 0.00151765643687503 0.00144085332654701 290384 288296 667 665 0 True 393 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 438 401 0.00682318488272458 0.00690485655658946 0.00686655985351339 0.00695811398489357 0.00156749578277764 0.00159113229629868 298254 300919 667 665 0 True 438 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 482 400 0.00695415624758003 0.00704305969776811 0.00697337300679027 0.00711070420386053 0.00161110821742871 0.001638059453679 303979 306942 667 665 0 True 483 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 527 400 0.00671978041649809 0.00671231752992002 0.0068055237659266 0.00675974670023652 0.00159023172117443 0.00169496725122916 293734 292528 667 665 0 True 527 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 570 399 0.00672451597501776 0.00680953929800468 0.00668345159075303 0.00683604180972 0.00183781255705826 0.00168524753695866 293941 296765 667 665 0 True 572 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 615 400 0.00646390011677613 0.00612233261111121 0.00645456626230259 0.00605783169298848 0.00183878311111614 0.00194082681904602 282549 266816 667 665 0 True 616 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 658 399 0.00594104412659772 0.00610927639538306 0.00593575951781491 0.00619516289005875 0.00178604764215534 0.00185372912748294 259694 266247 667 665 0 True 661 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 262 447 0.00600562616380068 0.0062606504817778 0.005981536583505 0.00633249408712902 0.00151962767041323 0.00148636206792554 262517 272844 667 665 0 True 260 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 305 446 0.00623293297274457 0.00614179073226669 0.00631723506523232 0.00616464484626535 0.00144057806978682 0.00148141937461393 272453 267664 667 665 0 True 304 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 350 446 0.00631435255135078 0.00639203869137251 0.00630197604333562 0.0063782711528191 0.00141381790837324 0.00139757136786826 276012 278570 667 665 0 True 349 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 394 446 0.00652758994730147 0.00662227782778071 0.00651560234988937 0.00662241550316625 0.0015126708598112 0.00139493372858729 285333 288604 667 665 0 True 394 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 439 445 0.00665217860284781 0.006741183469087 0.00677500572213321 0.00666819256885634 0.00188089904664214 0.00174284512456597 290779 293786 667 665 0 True 438 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 482 444 0.0066718300268497 0.00654155416006255 0.00666819256885634 0.00648508430609598 0.0018230949302696 0.00188101152192038 291638 285086 667 665 0 True 483 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 526 444 0.00657208589571088 0.00669217103183686 0.00653086137178607 0.00660715648126955 0.00179403194986334 0.00165738240205267 287278 291650 667 665 0 True 527 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 570 443 0.00643745419576776 0.00594429539171802 0.00654612039368277 0.00592050049591821 0.00197017742284738 0.00188711655025062 281393 259057 667 665 0 True 572 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 616 444 0.00562534022528676 0.00580347641821422 0.00564583810177768 0.00582894636453803 0.00173497686047394 0.00173862403351424 245894 252920 667 665 0 True 616 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 658 443 0.00568921307256649 0.00577316488749913 0.00558480201419089 0.00569161516746777 0.00173871601619303 0.00194163949553466 248686 251599 667 665 0 True 661 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 262 490 0.00602447688950215 0.0060999833068595 0.00607309071488518 0.00611886778057527 0.00145546741694465 0.00137639275734714 263341 265842 667 665 0 True 260 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 307 490 0.00611671733371126 0.0063137243429012 0.00616464484626535 0.00636301213092241 0.00157137024568339 0.00158152083652668 267373 275157 667 665 0 True 304 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 351 490 0.00629810981439928 0.00632776723222568 0.00628671702143893 0.00642404821850919 0.00148414922743336 0.00141154633720972 275302 275769 667 665 0 True 349 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 395 489 0.00642089117949608 0.00654703822958633 0.00650034332799268 0.00663767452506294 0.00153743799135122 0.00160401343129587 280669 285325 667 665 0 True 394 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 439 488 0.00729074693598497 0.00655995676992894 0.00677500572213321 0.00653086137178607 0.00515896958475741 0.00195833569586566 318692 285888 667 665 0 True 438 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 483 488 0.00636738165593331 0.00666280028292292 0.0063935301747158 0.00672922865644312 0.00192144353942367 0.00193794952727652 278330 290370 667 665 0 True 483 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 528 487 0.00600148540973276 0.00607061255794556 0.0059662775616083 0.00610360875867857 0.00175089219818315 0.00158707136451742 262336 264562 667 665 0 True 527 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 571 487 0.00575992617104128 0.00590019337655193 0.00578316929884794 0.00593575951781491 0.00176753699660544 0.00195778986145027 251777 257135 667 665 0 True 572 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 616 487 0.00573389203773028 0.00578323813654071 0.00575265125505455 0.00570687418936446 0.00181226367992209 0.00174725567345126 250639 252038 667 665 0 True 617 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 660 487 0.00572611382566899 0.0058747693220233 0.00573739223315786 0.00587472343022812 0.00178859913357765 0.00183944052595598 250299 256027 667 665 0 True 661 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 263 534 0.0063000543674146 0.00599874600669676 0.00631723506523232 0.0059510185397116 0.00151424564509894 0.00150228665342642 275387 261430 667 665 0 True 260 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 307 534 0.0062413288663519 0.0060369050343873 0.00622568093385214 0.00604257267109178 0.00148513422760645 0.00146649498346181 272820 263093 667 665 0 True 305 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 351 534 0.00624428001151633 0.00624029747061634 0.00627145799954223 0.00627145799954223 0.00139611390443193 0.00146084371144853 272949 271957 667 665 0 True 349 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 395 533 0.00619575769451049 0.00636571974683791 0.00625619897764553 0.00646982528419928 0.00152678944704533 0.00162270296999837 270828 277423 667 665 0 True 394 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 439 533 0.00663177223473409 0.00626581330873533 0.00622568093385214 0.0064087891966125 0.003360188172434 0.002019563061419 289887 273069 667 665 0 True 438 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 483 531 0.00597002940507316 0.00606999301871066 0.00604257267109178 0.00599679560540169 0.00178242646301777 0.00188656650652609 260961 264535 667 665 0 True 483 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 527 530 0.00592217052380196 0.00602403238583986 0.00590524147402152 0.00605783169298848 0.00181775194849911 0.00176888246886528 258869 262532 667 665 0 True 527 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 572 531 0.00588627636284856 0.00585219055879571 0.00601205462729839 0.00579842832074464 0.00167816987859256 0.00165737321572743 257300 255043 667 665 0 True 572 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 617 532 0.0057043119548031 0.00598486373865541 0.00573739223315786 0.0059662775616083 0.00163809288760796 0.0017205606758739 249346 260825 667 665 0 True 617 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 660 530 0.00581050742653393 0.00565756345544566 0.00579842832074464 0.0055542839703975 0.00177140306902838 0.00204193490860101 253988 246561 667 665 0 True 661 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 263 578 0.00631286554022142 0.00645284531998341 0.00634775310902571 0.00643930724040589 0.00133901210079514 0.00119083551459388 275947 281220 667 665 0 True 260 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 307 577 0.00625210397776621 0.00640950051943776 0.00625619897764553 0.00643930724040589 0.00133524130856542 0.00142676729793738 273291 279331 667 665 0 True 305 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 351 576 0.00604714808995136 0.00635330601624225 0.00604257267109178 0.00636301213092241 0.00144343192553039 0.00134682582164487 264332 276882 667 665 0 True 349 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 395 576 0.00600205733709021 0.00609057548884801 0.00608834973678187 0.00611886778057527 0.00146915317900688 0.0013688676611843 262361 265432 667 665 0 True 394 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 439 575 0.00608720588206698 0.00612595806293027 0.00607309071488518 0.00619516289005875 0.00178849448421903 0.00207125416079725 266083 266974 667 665 0 True 438 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 483 574 0.00624121448088041 0.00635117204776647 0.00625619897764553 0.00633249408712902 0.0018786723191242 0.00196230202737417 272815 276789 667 665 0 True 483 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 528 574 0.00608075454147497 0.00627480810059023 0.00601205462729839 0.00636301213092241 0.00201715413202196 0.00189887716013088 265801 273461 667 665 0 True 528 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 571 574 0.00593900806520521 0.00620197782164269 0.00587472343022812 0.00627145799954223 0.00164214031044139 0.0017961621801086 259605 270287 667 665 0 True 572 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 616 573 0.00591706893177353 0.00580395828206359 0.0059662775616083 0.00579842832074464 0.00154908387283383 0.00163608412747577 258646 252941 667 665 0 True 617 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 660 573 0.00572432941231376 0.00588858275237189 0.00572213321126116 0.00590524147402152 0.0015751278234756 0.00150826122137556 250221 256629 667 665 0 True 661 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 260 615 0.0064620699492323 0.00652604273329237 0.00646982528419928 0.00653086137178607 0.0014564511267374 0.00131558148991697 282469 284410 667 665 0 False 260 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 305 615 0.00632997760675625 0.00608860214165535 0.00630197604333562 0.00613412680247196 0.00143376066098602 0.00129046122837817 276695 265346 667 665 0 False 305 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 351 619 0.00607601898295531 0.00604711595881441 0.00610360875867857 0.00605783169298848 0.00136668366041683 0.00131931699862237 265594 263538 667 665 0 True 349 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 396 620 0.00581135387902295 0.00591559007383416 0.00581368734264134 0.00590524147402152 0.00138294861316467 0.00122687997477238 254025 257806 667 665 0 True 394 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 438 614 0.00594513912647705 0.00586859687557185 0.00599679560540169 0.0059510185397116 0.00177209049087494 0.00194356657521008 259873 255758 667 665 0 False 438 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 483 614 0.00609226171990681 0.00595914138745812 0.00607309071488518 0.00599679560540169 0.00192762902803464 0.00189063938064364 266304 259704 667 665 0 False 483 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 528 614 0.00631606833342313 0.00618765958154714 0.00634775310902571 0.00621042191195544 0.00188827247807167 0.0020412591909982 276087 269663 667 665 0 False 528 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 572 614 0.00603438267133314 0.00618031689431865 0.00607309071488518 0.00624093995574884 0.0015960490871004 0.00180875335207009 263774 269343 667 665 0 False 572 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 617 614 0.00616496512558553 0.00602726775739991 0.00624093995574884 0.00601205462729839 0.00146038674651329 0.00134546811084945 269482 262673 667 665 0 False 617 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 661 614 0.00624155763729488 0.00613396618118884 0.00631723506523232 0.00604257267109178 0.00146578517591565 0.0015847000172462 272830 267323 667 665 0 False 661 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 261 665 0.00825206531547685 0.740858302772266 0.00820935378042268 0.727092393377584 0.00185460900433948 0.180532752929604 360713 32287179 667 665 12 True 260 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 305 658 0.00681067111214363 0.00651518932373277 0.00672922865644312 0.00651560234988937 0.00152567467149491 0.00132913889772487 297707 283937 667 665 0 False 305 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 349 658 0.00588927326220158 0.00595021543329599 0.0059662775616083 0.0059510185397116 0.0012660429243216 0.00118022678281235 257431 259315 667 665 0 False 349 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 394 658 0.00585202935268461 0.00577015897491497 0.00587472343022812 0.00578316929884794 0.00133815938007664 0.0013889028562601 255803 251468 667 665 0 False 394 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 439 658 0.00590046016131326 0.00585985448859044 0.00585946440833143 0.00587472343022812 0.00157166754038301 0.00152517125263446 257920 255377 667 665 0 False 439 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 483 658 0.00607702557510441 0.00594151893810975 0.00610360875867857 0.00599679560540169 0.00159886539678102 0.00150075417670258 265638 258936 667 665 0 False 483 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 528 658 0.00585880097259679 0.00602171485018337 0.00579842832074464 0.00592050049591821 0.00173684235104766 0.00192659671877525 256099 262431 667 665 0 False 528 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 572 658 0.00603882082762693 0.00599831003464257 0.00607309071488518 0.00599679560540169 0.00150322045689087 0.00139881203770968 263968 261411 667 665 0 False 572 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 617 658 0.00725867324977932 0.00621914135303927 0.00669871061264973 0.00622568093385214 0.00304920322181941 0.00138560678130694 317290 271035 667 665 0 False 617 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 657 663 0.00797399423428592 0.760657537641311 0.00791943236438544 0.732738231479362 0.00163410062896077 0.177180193394711 348558 33150045 667 665 15 True 661 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A7_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A7_3.csv new file mode 100755 index 0000000..aaec24a --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A7_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 260 270 0.00107357628121165 0.0761930920228013 0.000885023270008392 0.073136491950866 0.000783352600498657 0.0221994770646984 46928 3320554 667 665 0 True 260 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 304 267 0.000965115977145325 0.000938005347541433 0.000915541313801785 0.00080872816052491 0.000672299660412965 0.000667669835323461 42187 40879 667 665 0 False 304 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 347 269 0.000895295085348148 0.000963108159503818 0.000778210116731518 0.000823987182421607 0.000677888863929085 0.000685706861002543 39135 41973 667 665 0 True 349 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 392 269 0.000975913965653932 0.000967536717738498 0.000854505226215 0.000823987182421607 0.000708205310668937 0.000706068040590958 42659 42166 667 665 0 True 393 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 436 268 0.0010316654444579 0.000943856551426633 0.000732433051041428 0.000671396963454643 0.000909542475078026 0.000858728745342372 45096 41134 667 665 0 True 438 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 479 267 0.000989136926158116 0.00100679714851331 0.000717174029144732 0.000717174029144732 0.000886343068232624 0.000917419182017857 43237 43877 667 665 0 True 482 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 524 267 0.000966305586048816 0.000952461263022514 0.000732433051041428 0.000717174029144732 0.000852119972808742 0.000848748530155673 42239 41509 667 665 0 True 527 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 568 267 0.00102832538869041 0.00100434193747128 0.000762951094834821 0.000793469138628214 0.000978677132534783 0.000872003892473138 44950 43770 667 665 0 True 572 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 616 267 0.00123220605307326 0.000997297546911453 0.000900282291905089 0.00064087891966125 0.0011705024674006 0.000998082367339662 53862 43463 667 665 0 False 616 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 654 265 0.00112779499469766 0.0753908346053965 0.000823987182421607 0.0713359273670558 0.000999377190341634 0.0248223879114657 49298 3285591 667 665 0 True 661 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 260 311 0.00100389265198026 0.000994888227664607 0.000854505226215 0.000823987182421607 0.000782204615781768 0.000808419717501183 43882 43358 667 665 0 False 260 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 304 311 0.000889324163736397 0.000863798314738552 0.000778210116731518 0.000747692072938125 0.000663275086432243 0.000615165293902956 38874 37645 667 665 0 False 304 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 349 313 0.000991012847890543 0.000947023085293917 0.000854505226215 0.000793469138628214 0.000700607322274457 0.000751875802181843 43319 41272 667 665 0 True 349 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 392 313 0.000951229580906503 0.00112730900265082 0.00080872816052491 0.00105287251087205 0.000728911862563801 0.000727111094485343 41580 49129 667 665 0 True 393 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 437 312 0.00101347815449108 0.000999431515387232 0.000762951094834821 0.000671396963454643 0.000893579027415256 0.000967008737497129 44301 43556 667 665 0 True 438 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 481 311 0.000992156702605438 0.000964209562588091 0.000717174029144732 0.000717174029144732 0.000928809156234501 0.000901667532987275 43369 42021 667 665 0 True 483 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 525 311 0.000959602597419532 0.000915174179440361 0.000762951094834821 0.000686655985351339 0.000818061587320342 0.000830129008514625 41946 39884 667 665 0 True 527 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 569 311 0.0009947418142611 0.000915128287645183 0.000701915007248035 0.000701915007248035 0.000971782318111155 0.000808325968899481 43482 39882 667 665 0 True 572 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 616 310 0.00102237734417296 0.000943305849884496 0.000717174029144732 0.000473029678797589 0.0010499205427221 0.00106070638501387 44690 41110 667 665 0 False 616 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 661 310 0.000949856955248629 0.00100078532334498 0.000488288700694286 0.000595101853971161 0.00104723323859854 0.000977944822324327 41520 43615 667 665 0 False 661 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 260 358 0.000943451368845218 0.000855606629299272 0.000778210116731518 0.000671396963454643 0.000755219384701516 0.000784560362997956 41240 37288 667 665 0 True 260 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 304 357 0.000972734049546524 0.000925752238228898 0.000839246204318303 0.000762951094834821 0.000703999121091308 0.000712047121261063 42520 40345 667 665 0 True 304 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 348 357 0.00095875614493051 0.000983851250924289 0.00080872816052491 0.000869764248111696 0.00073222979641287 0.000731477277848477 41909 42877 667 665 0 True 349 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 393 357 0.00099746418848255 0.000966412368756636 0.000839246204318303 0.000839246204318303 0.000746006201393418 0.000702540724543333 43601 42117 667 665 0 True 393 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 438 357 0.0010219426793813 0.00103655797768626 0.000793469138628214 0.000732433051041428 0.000842234148151013 0.000969221859700445 44671 45174 667 665 0 True 438 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 481 355 0.000988908155215137 0.00103162460970462 0.000717174029144732 0.000778210116731518 0.000933972303682482 0.000909809183778855 43227 44959 667 665 0 True 483 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 525 355 0.000989663099326967 0.00111071911869397 0.000701915007248035 0.000930800335698482 0.000932091521417934 0.000932023741580039 43260 48406 667 665 0 True 527 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 570 356 0.000921420727036344 0.00108694716879174 0.000656137941557946 0.000762951094834821 0.000931094874067482 0.00103861635962412 40277 47370 667 665 0 True 572 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 614 355 0.000942101620281642 0.00100877049570596 0.000503547722590982 0.000564583810177768 0.00104915706913697 0.00114485794178477 41181 43963 667 665 0 True 616 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 658 355 0.000958046955007275 0.000977242832418653 0.000503547722590982 0.000503547722590982 0.00103920732683106 0.0010434099893655 41878 42589 667 665 0 True 661 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 261 401 0.00089385382840738 0.000901704937555608 0.000762951094834821 0.000701915007248035 0.000712868392373841 0.00081906166049156 39072 39297 667 665 0 True 260 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 305 401 0.000910828632376419 0.000930570876722592 0.000717174029144732 0.000762951094834821 0.000741369795129194 0.000726657997965675 39814 40555 667 665 0 True 304 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 349 402 0.000999934914666722 0.000943237012191729 0.000869764248111696 0.000839246204318303 0.000726055009474948 0.00074374555801119 43709 41107 667 665 0 True 349 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 393 401 0.00108046228659532 0.000973617380599588 0.000885023270008392 0.000885023270008392 0.000845761359428013 0.000758772672416002 47229 42431 667 665 0 True 393 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 438 401 0.00109050533099209 0.00102552100094594 0.000854505226215 0.000823987182421607 0.000911253253601408 0.000884094534587408 47668 44693 667 665 0 True 438 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 482 400 0.00103184846121229 0.000999454461284821 0.000762951094834821 0.000717174029144732 0.000930434566279466 0.000903586126777089 45104 43557 667 665 0 True 483 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 527 400 0.000972184999283375 0.000996563278188605 0.000762951094834821 0.000747692072938125 0.000873468016481156 0.000953956827320336 42496 43431 667 665 0 True 527 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 570 399 0.00093082321279278 0.000974581108298326 0.000686655985351339 0.000686655985351339 0.000895563057404507 0.000944112804588934 40688 42473 667 665 0 True 572 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 615 400 0.000935307123275167 0.000858543704190667 0.000564583810177768 0.000320439459830625 0.000978120174949334 0.00101693728412741 40884 37416 667 665 0 True 616 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 658 399 0.000903736733144071 0.000974328703424847 0.000488288700694286 0.000595101853971161 0.000991228729825737 0.000982444246571518 39504 42462 667 665 0 True 661 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 262 447 0.000899824750019131 0.000972447139822548 0.000747692072938125 0.000778210116731518 0.000815888160551055 0.000859678469560863 39333 42380 667 665 0 True 260 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 305 446 0.000927711927968266 0.00093433400392719 0.000762951094834821 0.000823987182421607 0.000780144790847548 0.000770942676694986 40552 40719 667 665 0 True 304 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 350 446 0.000929633603889289 0.000911571673518885 0.000823987182421607 0.000793469138628214 0.000764106679792518 0.000734719767348499 40636 39727 667 665 0 True 349 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 394 446 0.0010436301647757 0.00100457139644717 0.000869764248111696 0.000823987182421607 0.000868274013424146 0.000807902293621888 45619 43780 667 665 0 True 394 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 439 445 0.00103859720403017 0.00103176228509016 0.000732433051041428 0.00064087891966125 0.00099019834258289 0.00107401557150841 45399 44965 667 665 0 True 438 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 482 444 0.00102015826602606 0.000982841631430373 0.000686655985351339 0.000610360875867857 0.0010053198970261 0.00105347689966827 44593 42833 667 665 0 True 483 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 526 444 0.000926019022990222 0.000907579087338396 0.000610360875867857 0.000595101853971161 0.000935047382052253 0.000937210811247923 40478 39553 667 665 0 True 527 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 570 443 0.000897720057343725 0.000889314152857539 0.000610360875867857 0.0004272526131075 0.000914803457696285 0.00100546747645112 39241 38757 667 665 0 True 572 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 616 444 0.000931418017244525 0.000938028293439022 0.000625619897764553 0.000579842832074464 0.000951197897418887 0.000968012174588196 40714 40880 667 665 0 True 616 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 658 443 0.000898955420435811 0.000887753831821485 0.000488288700694286 0.000442511635004196 0.000968488835936977 0.000991715103598962 39295 38689 667 665 0 True 661 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 262 490 0.000928329609514309 0.000919235603313617 0.000778210116731518 0.000747692072938125 0.000753034516553093 0.000774326850265995 40579 40061 667 665 0 True 260 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 307 490 0.000875643661346255 0.000949615971721476 0.000701915007248035 0.000793469138628214 0.000783144220367711 0.000833575654525713 38276 41385 667 665 0 True 304 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 351 490 0.000900373800282281 0.00100246037386898 0.000778210116731518 0.000869764248111696 0.000828050552124705 0.000815745921352484 39357 43688 667 665 0 True 349 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 395 489 0.000943611508505303 0.000899456239591884 0.000747692072938125 0.000671396963454643 0.000847104678893454 0.000841601539545417 41247 39199 667 665 0 True 394 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 439 488 0.00107940994025761 0.00102900877737948 0.000671396963454643 0.000595101853971161 0.00115325995914146 0.00111819696833103 47183 44845 667 665 0 True 438 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 483 488 0.000925012430841114 0.00108157782875591 0.000549324788281071 0.000671396963454643 0.000935822007147577 0.00107405768973848 40434 47136 667 665 0 True 483 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 528 487 0.00102711290269262 0.000816231469036519 0.000686655985351339 0.000518806744487678 0.00100204307564381 0.000809736978612361 44897 35572 667 665 0 True 527 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 571 487 0.000929427710040608 0.000877818258165441 0.000595101853971161 0.000457770656900893 0.00097162959951776 0.00101297498447635 40627 38256 667 665 0 True 572 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 616 487 0.000927414525742393 0.000919786304855754 0.000549324788281071 0.000549324788281071 0.000958104068468932 0.00094082682999697 40539 40085 667 665 0 True 617 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 660 487 0.000867956957662162 0.000866024066804686 0.000442511635004196 0.000457770656900893 0.00102004719143754 0.000937897051460654 37940 37742 667 665 0 True 661 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 263 534 0.000950634776454757 0.000947711462221587 0.000793469138628214 0.000747692072938125 0.000797863019911063 0.00080993715603215 41554 41302 667 665 0 True 260 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 307 534 0.000946448268198242 0.000971437520328631 0.000854505226215 0.000839246204318303 0.000735063617491951 0.000790219289745857 41371 42336 667 665 0 True 305 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 351 534 0.000968661926761499 0.00103970156565596 0.000793469138628214 0.000930800335698482 0.000831920916876387 0.000781371029160479 42342 45311 667 665 0 True 349 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 395 533 0.000980512261607809 0.000974649945991093 0.000793469138628214 0.00080872816052491 0.000851975123413281 0.000833912144250681 42860 42476 667 665 0 True 394 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 439 533 0.0010012389090417 0.000908405139651601 0.000579842832074464 0.000503547722590982 0.00104402479363409 0.00100651320809858 43766 39589 667 665 0 True 438 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 483 531 0.000930640196038397 0.00106647942814234 0.000564583810177768 0.000701915007248035 0.000972858678146076 0.00106521805300975 40680 46478 667 665 0 True 483 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 527 530 0.0009469058100842 0.000934884705469327 0.000579842832074464 0.000503547722590982 0.000982420558194452 0.000967384158427712 41391 40743 667 665 0 True 527 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 572 531 0.000951298212189396 0.000883256435894038 0.000686655985351339 0.000579842832074464 0.000894000852234948 0.000881909430962111 41583 38493 667 665 0 True 572 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 617 532 0.000855671958024192 0.00085893378444968 0.000534065766384375 0.000534065766384375 0.000906770373918798 0.000894343045728645 37403 37433 667 665 0 True 617 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 660 530 0.000875025979800212 0.000873481483521117 0.000473029678797589 0.000350957503624018 0.000963070999198561 0.00101906268757443 38249 38067 667 665 0 True 661 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 263 578 0.000945624692803518 0.000911732294802008 0.000823987182421607 0.00080872816052491 0.000692420572079989 0.000652220525280573 41335 39734 667 665 0 True 260 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 307 577 0.000950680530643353 0.000911135701464694 0.000854505226215 0.000778210116731518 0.000728130200093005 0.000756639317203359 41556 39708 667 665 0 True 305 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 351 576 0.000947065949744286 0.000980776500647361 0.000823987182421607 0.000869764248111696 0.000706681898226939 0.000721978925128259 41398 42743 667 665 0 True 349 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 395 576 0.000946539776575434 0.000887088400791404 0.000793469138628214 0.000778210116731518 0.000721540323502297 0.000655148071826241 41375 38660 667 665 0 True 394 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 439 575 0.00100046108783557 0.00106358824504612 0.00064087891966125 0.000564583810177768 0.00101361234100802 0.00116937440977718 43732 46352 667 665 0 True 438 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 483 574 0.00104196013689196 0.000898423674200379 0.000701915007248035 0.000473029678797589 0.00109814264889418 0.00103574798656348 45546 39154 667 665 0 True 483 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 528 574 0.000964681312353665 0.00098359884605081 0.000549324788281071 0.000503547722590982 0.00103223835365246 0.0010564715581082 42168 42866 667 665 0 True 528 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 571 574 0.000902409861674793 0.000943604146553153 0.000564583810177768 0.000610360875867857 0.000896414546741097 0.000936384412818307 39446 41123 667 665 0 True 572 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 616 573 0.000866149667212628 0.000907326682464917 0.000656137941557946 0.000671396963454643 0.000770151443975012 0.000794027866950098 37861 39542 667 665 0 True 617 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 660 573 0.000897742934438023 0.000927266667469773 0.000625619897764553 0.000610360875867857 0.000866405169166704 0.000905449992962869 39242 40411 667 665 0 True 661 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 260 615 0.00100974918812052 0.000978160668322213 0.000854505226215 0.000823987182421607 0.000742447624170482 0.000731470086334055 44138 42629 667 665 0 False 260 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 305 615 0.000936565363461551 0.00103977040334872 0.000854505226215 0.000946059357595178 0.000698172780672276 0.00073680047639101 40939 45314 667 665 0 False 305 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 351 619 0.000924120224163496 0.000939175588318473 0.000762951094834821 0.00080872816052491 0.000725187633334 0.000792368441888151 40395 40930 667 665 0 True 349 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 396 620 0.000908357906192246 0.000921094221018327 0.000732433051041428 0.000762951094834821 0.000728616976218889 0.000692684923385599 39706 40142 667 665 0 True 394 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 438 614 0.00101208265173891 0.000964668480539871 0.000671396963454643 0.000579842832074464 0.000990052825854899 0.00100426598666663 44240 42041 667 665 0 False 438 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 483 614 0.000948484329590755 0.000928092719782978 0.000595101853971161 0.0004272526131075 0.000988836421885695 0.00105761860832248 41460 40447 667 665 0 False 483 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 528 614 0.000989388574195393 0.0009380741852342 0.000549324788281071 0.000518806744487678 0.00105264716977233 0.00108729577379317 43248 40882 667 665 0 False 528 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 572 614 0.000984447121827047 0.00099550776689951 0.000671396963454643 0.000610360875867857 0.000936954851074849 0.00102094875003077 43032 43385 667 665 0 False 572 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 617 614 0.000945373044766241 0.000879080282532837 0.000762951094834821 0.000717174029144732 0.000760595843031688 0.000696951149450541 41324 38311 667 665 0 False 617 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 661 614 0.000992957400905864 0.0008605629431785 0.000793469138628214 0.000579842832074464 0.000826072164195622 0.000804239999795211 43404 37504 667 665 0 False 661 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 261 665 0.00108295588987379 0.0764825545208868 0.000946059357595178 0.0728160524910353 0.000749126225552409 0.0218225528998517 47338 3333169 667 665 0 True 260 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 305 658 0.00101462200920597 0.000978986720635418 0.000915541313801785 0.000839246204318303 0.000679029037054318 0.000695933670523589 44351 42665 667 665 0 False 305 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 349 658 0.000896278800402957 0.000962190323600257 0.000793469138628214 0.000823987182421607 0.000649383719207186 0.000691002162614039 39178 41933 667 665 0 False 349 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 394 658 0.000978453323120998 0.00100209323950756 0.000854505226215 0.000869764248111696 0.000712129881104282 0.000708539191501035 42770 43672 667 665 0 False 394 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 439 658 0.00098202214983147 0.00100819684826624 0.000762951094834821 0.000778210116731518 0.000844981666990491 0.000880414282761391 42926 43938 667 665 0 False 439 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 483 658 0.000939104720928618 0.000976875698057228 0.00064087891966125 0.00080872816052491 0.000877627411554368 0.000814840652362287 41050 42573 667 665 0 False 483 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 528 658 0.000881362934920729 0.00097051968442507 0.000564583810177768 0.000610360875867857 0.000883121564056035 0.00095458259523097 38526 42296 667 665 0 False 528 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 572 658 0.000896187292025766 0.000892113552363399 0.000656137941557946 0.000686655985351339 0.000780663957258714 0.000744191987912895 39174 38879 667 665 0 False 572 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 617 658 0.00100553980276971 0.000932200035451412 0.000839246204318303 0.000778210116731518 0.000759625999564072 0.00073019225596491 43954 40626 667 665 0 False 617 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 657 663 0.00108318466081676 0.0793534075518391 0.000930800335698482 0.0744335088120851 0.000786467969852979 0.0227392870339261 47348 3458283 667 665 0 True 661 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A8_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A8_1.csv new file mode 100755 index 0000000..817919b --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A8_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 230 239 0.0102269762349313 0.0436134052228305 0.0102998397802701 0.0429083695735103 0.00182246861098095 0.00745742046593051 447040 1900706 667 665 0 True 229 239 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 273 238 0.0102151945313679 0.0101050061638417 0.0101930266269932 0.0101472495613031 0.00147389134477091 0.00156194425410541 446525 440384 667 665 0 False 273 238 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 318 239 0.0103393485221226 0.0622285170467941 0.0103456168459602 0.0609597924773022 0.00133420960195228 0.0068963872737345 451952 2711967 667 665 0 True 318 238 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 362 239 0.0104160325422091 0.0832185751630163 0.0104219119554437 0.0829480430304417 0.00126685060394848 0.0122976033350141 455304 3626730 667 665 0 True 363 238 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 406 238 0.0104244513129107 0.0707865566869795 0.0103761348897536 0.0673838406958114 0.00150112607254005 0.0109059379357199 455672 3084933 667 665 0 True 408 238 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 450 236 0.0103602581863108 0.0647958646903365 0.010452429999237 0.0691081101701381 0.00167014437705539 0.0175884304364068 452866 2823854 667 665 0 True 452 238 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 495 237 0.010373938688701 0.0778476518602526 0.0103150988021668 0.0751506828412299 0.00195497538052878 0.0185743551815277 453464 3392661 667 665 0 True 497 238 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 539 236 0.00995869655009986 0.068541369445587 0.0100251773861295 0.0668192568856336 0.00154128941722371 0.0175007692406537 435313 2987086 667 665 0 True 542 238 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 587 237 0.00974207334419309 0.00965207709133213 0.00975051499198901 0.00961318379491875 0.00196231284344994 0.0019638971646233 425844 420645 667 665 0 False 587 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 626 238 0.00962745910176063 0.0429624760000252 0.00956740672922866 0.0422980086976425 0.00195162199254114 0.00784964580662507 420834 1872338 667 665 0 True 631 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 229 282 0.00995004900845526 0.0102184506815218 0.00997940032043946 0.0101319905394064 0.00167211057586887 0.00208999778885949 434935 445328 667 665 0 False 229 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 273 282 0.0101716136667304 0.010025819871262 0.0101167315175097 0.0100709544518196 0.00136353003075434 0.00153432884295026 444620 436933 667 665 0 False 273 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 317 283 0.0102159265983854 0.0998557735607042 0.0102845807583734 0.0989394979781796 0.00133922878382017 0.0213641848757609 446557 4351792 667 665 0 True 318 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 361 283 0.0101454193937593 0.0514162953733613 0.0102235446707866 0.0505226214999619 0.00136989144963991 0.00772774845103085 443475 2240762 667 665 0 True 363 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 406 283 0.0102663019600294 0.0901040653820406 0.0102998397802701 0.089570458533608 0.00146963677211935 0.0196927599729416 448759 3926805 667 665 0 True 408 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 450 281 0.0101661689182875 0.0431667633262603 0.0102235446707866 0.0437323567559319 0.00180042281965449 0.00868450321767959 444382 1881241 667 665 0 True 452 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 494 282 0.00995048367324692 0.0498066865492869 0.00996414129854276 0.0492866407263294 0.00170785810558322 0.0129295245378942 434954 2170614 667 665 0 True 497 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 538 281 0.00976938859478478 0.0567433690658324 0.00985732814526589 0.0547493705653468 0.00164698151471844 0.0154183438520389 427038 2472920 667 665 0 True 542 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 587 281 0.00974747233844739 0.00967034202581299 0.00973525597009232 0.00964370183871214 0.0017735124265533 0.00198077001266348 426080 421441 667 665 0 False 587 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 631 281 0.00961679837581781 0.00963071446067675 0.00958266575112535 0.00965896086060884 0.00200610394393789 0.00189859947919249 420368 419714 667 665 0 False 631 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 230 328 0.010018451520406 0.0568651199984397 0.0100709544518196 0.0551155870908675 0.00157124246547037 0.0100752236766252 437925 2478226 667 665 0 True 229 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 274 327 0.0103292826006315 0.0696645252407742 0.0102693217364767 0.069916838330663 0.00148774090135248 0.0194722736722101 451512 3036034 667 665 0 True 274 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 318 327 0.0104732939092367 0.0414920799366234 0.0104219119554437 0.0421149004348821 0.00142262394252392 0.00685750727792061 457807 1808257 667 665 0 True 318 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 362 328 0.0101011522162929 0.0357939251883428 0.0101777676050965 0.0361638818951705 0.0014288047045563 0.00542560422593731 441540 1559927 667 665 0 True 363 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 406 328 0.0100798307644072 0.0709920371998892 0.0100709544518196 0.0667582207980468 0.00150735769059703 0.012278858635652 440608 3093888 667 665 0 True 408 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 451 326 0.00999822816904663 0.0386649847323734 0.00990310521095598 0.0369268329900053 0.00178774397482842 0.0102587576369924 437041 1685050 667 665 0 True 453 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 494 325 0.00993140417660248 0.0294882319095978 0.00991836423285267 0.0298466468299382 0.00159544324184683 0.0032168121408311 434120 1285120 667 665 0 True 497 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 539 325 0.0099659028348037 0.0523312171479282 0.00999465934233616 0.0527351796749828 0.00161719818973762 0.00971273657509917 435628 2280635 667 665 0 True 542 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 583 325 0.00984691906736035 0.0639213965332191 0.00987258716716258 0.0621805142290379 0.00188641951174946 0.0156861617638539 430427 2785744 667 665 0 True 587 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 627 326 0.0099344468301441 0.068793223617524 0.00990310521095598 0.0671091783016709 0.0020213924513652 0.0195751362126615 434253 2998062 667 665 0 True 632 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 230 371 0.0100714348707999 0.0481523102790164 0.0100709544518196 0.0500190737773709 0.00180685935485829 0.0113218021018504 440241 2098515 667 665 0 True 229 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 275 372 0.0102058835539886 0.035763820170706 0.0102235446707866 0.0350804913405051 0.00154776347312269 0.00522285628680147 446118 1558615 667 665 0 True 274 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 319 372 0.0104172907823955 0.0877995171035852 0.010452429999237 0.0819867246509499 0.00145504066088244 0.0182552195650185 455359 3826371 667 665 0 True 318 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 363 371 0.0102946466798645 0.0701943689620022 0.0103608758678569 0.0665751125352865 0.00142535591372756 0.0170238422771945 449998 3059125 667 665 0 True 363 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 407 371 0.0103414989689866 0.0493101373254606 0.0103456168459602 0.0476691844052796 0.00152438873979197 0.0114568831258271 452046 2148974 667 665 0 True 408 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 452 370 0.0103474012593154 0.0551865587521103 0.0102845807583734 0.0547493705653468 0.00176283987069794 0.00907786378588647 452304 2405073 667 665 0 True 453 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 495 370 0.0101447788351189 0.0428970113542038 0.0100709544518196 0.0433356221866178 0.0018565949693574 0.00549888046105124 443447 1869485 667 665 0 True 497 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 539 369 0.0100747978036617 0.0572466873294474 0.0100404364080262 0.0556496528572518 0.00175111624924456 0.00976158697559407 440388 2494855 667 665 0 True 542 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 584 370 0.0100077221631803 0.0469766772160431 0.00997940032043946 0.0467231250476844 0.00191170275218153 0.00858517401739888 437456 2047280 667 665 0 True 587 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 628 370 0.0101348959303823 0.107431659946387 0.0102082856488899 0.104081788357366 0.00199031112667734 0.0283889284833375 443015 4681955 667 665 0 True 632 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 231 416 0.0100425639777959 0.0466381104971171 0.00996414129854276 0.0461127641718166 0.00154054148385412 0.00607485138022852 438979 2032525 667 665 0 True 229 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 274 416 0.00996308895220506 0.0592171892308019 0.00999465934233616 0.057602807660029 0.00153364848061778 0.0108540480733427 435505 2580731 667 665 0 True 274 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 318 416 0.0101229083329702 0.0365585054419064 0.0101625085831998 0.0372320134279393 0.00139464548965734 0.00428642101353758 442491 1593248 667 665 0 True 319 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 364 415 0.0101633092815002 0.0592756094860635 0.0101319905394064 0.0555123216601816 0.00147390104361844 0.0138940933078326 444257 2583277 667 665 0 True 363 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 407 416 0.0106071249108794 0.098140911904389 0.0106202792401007 0.0984206912336919 0.00180552840209406 0.0160539995941658 463657 4277057 667 665 0 True 408 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 452 414 0.0105816398278316 0.064203906424335 0.0104982070649271 0.0634775310902571 0.00189961199752649 0.0130267447371439 462543 2798056 667 665 0 True 453 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 496 414 0.0101401347849765 0.0557347821373071 0.0101472495613031 0.0534218356603342 0.00170193228665612 0.00842935630273958 443244 2428965 667 665 0 True 498 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 539 413 0.0100073790067658 0.0354238308061295 0.0100251773861295 0.0360112916762036 0.00170147057811443 0.00541261074386494 437441 1543798 667 665 0 True 542 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 584 414 0.0100790529432011 0.0432724750764529 0.0100404364080262 0.0426947432669566 0.00192611711132698 0.00568503038492774 440574 1885848 667 665 0 True 587 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 628 415 0.00992467831087889 0.0815521752424091 0.00990310521095598 0.0810406652933547 0.00187791088904585 0.0171066349896075 433826 3554107 667 665 0 True 632 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 232 460 0.00987553831232701 0.0536115523416002 0.00994888227664607 0.0541695277332723 0.00159398965924051 0.0121415843361399 431678 2336433 667 665 0 True 229 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 277 460 0.0100218144532678 0.0559092856884716 0.00997940032043946 0.0544899671931029 0.0015420048965639 0.00747817440333261 438072 2436570 667 665 0 True 274 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 321 460 0.0100498846479713 0.0706730892234018 0.0100862134737163 0.0670328831921874 0.0016093807560296 0.0168359614601111 439299 3079988 667 665 0 True 319 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 365 460 0.0103113469587019 0.0924933758061898 0.0102845807583734 0.0869001297016861 0.00147414242685499 0.0208002051572876 450728 4030933 667 665 0 True 363 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 409 460 0.0106351035972057 0.101586421994561 0.0106355382619974 0.095551995117113 0.0016927836651228 0.026203580261709 464880 4427215 667 665 0 True 408 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 453 458 0.0103775532696 0.0462254514748763 0.010406652933547 0.0468604562447547 0.00193168896194516 0.0059597334660892 453622 2014541 667 665 0 True 453 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 497 458 0.0103495745832737 0.0424502547281456 0.0104371709773404 0.0431219958800641 0.00195895127573934 0.00588605973541031 452399 1850015 667 665 0 True 498 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 541 458 0.0103578560914095 0.122795315136089 0.0103456168459602 0.115831235217823 0.00179867001091084 0.0378464810558999 452761 5351515 667 665 0 True 542 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 585 457 0.0102302476594159 0.0688614417710562 0.01025406271458 0.0698100251773861 0.00194595547187886 0.0171382768558289 447183 3001035 667 665 0 True 587 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 629 458 0.00991708311557199 0.0803190397600777 0.00988784618905928 0.0770428015564202 0.00179785580779487 0.0121920855215146 433494 3500366 667 665 0 True 632 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 232 503 0.00976497331558528 0.049549463037314 0.00976577401388571 0.0515602349889372 0.00154824094509365 0.00950462601536219 426845 2159404 667 665 0 True 229 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 276 504 0.0100443026369626 0.11100135323431 0.00997940032043946 0.107209887846189 0.00156822002777812 0.0262965945283145 439055 4837525 667 665 0 True 274 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 320 504 0.0101521910136715 0.0584962750203501 0.0101930266269932 0.0597543297474632 0.00150903572249688 0.01132563329585 443771 2549313 667 665 0 True 319 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 365 504 0.0101499033042417 0.0622034142348318 0.0101625085831998 0.0603341725795377 0.0016609235917539 0.00881220458239224 443671 2710873 667 665 0 True 364 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 409 503 0.0104417006420113 0.0614709352919952 0.0104829480430304 0.0594796673533226 0.00191789728555303 0.0084860612545429 456426 2678951 667 665 0 True 408 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 454 502 0.0105288166170977 0.0673661953005654 0.0106202792401007 0.0652018005645838 0.00186200191264304 0.0116849988510092 460234 2935871 667 665 0 True 453 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 497 501 0.0103256680197324 0.0756778189465424 0.0103608758678569 0.071976806286717 0.00180843590434225 0.0167140132061235 451354 3298098 667 665 0 True 498 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 541 501 0.0101621425496911 0.0595587389164144 0.0101777676050965 0.0590981918059052 0.00168647641167273 0.011993665288215 444206 2595616 667 665 0 True 543 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 585 500 0.0100170788947481 0.0515747138503159 0.0101472495613031 0.0505073624780652 0.00186857096020126 0.00615364088061894 437865 2247666 667 665 0 True 587 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 630 501 0.00978393842675824 0.0670667513370288 0.00984206912336919 0.0661936369878691 0.00188078986374863 0.0131360373868205 427674 2922821 667 665 0 True 632 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 232 547 0.00967335055292221 0.0449238683800368 0.00965896086060884 0.0454566262302586 0.00147811019497922 0.00786935314862784 422840 1957817 667 665 0 True 229 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 277 548 0.00971093761885365 0.0581863447816153 0.00975051499198901 0.0554512855725948 0.00140898764179161 0.0137549334157422 424483 2535806 667 665 0 True 274 543 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 321 547 0.0102196098105674 0.0495124971962981 0.0102235446707866 0.0489967193102922 0.0013947136878749 0.00902910714634426 446718 2157793 667 665 0 True 319 543 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 365 546 0.0101789800910943 0.0552520692897269 0.0102235446707866 0.0524910353246357 0.00148166555324204 0.00811717782032881 444942 2407928 667 665 0 True 364 543 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 410 546 0.0105104691874708 0.0943547699645084 0.0105287251087205 0.0887922484168765 0.00180266023136184 0.0185691679619109 459432 4112054 667 665 0 True 408 543 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 454 545 0.0103025392773972 0.0659389834164262 0.0103303578240635 0.0640268558785382 0.00196041845744756 0.010243458455809 450343 2873672 667 665 0 True 453 543 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 498 544 0.0102326040001286 0.0594748716607265 0.01025406271458 0.0577248798352026 0.00199886724343413 0.00835165789639943 447286 2591961 667 665 0 True 498 543 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 542 544 0.00980118775585885 0.0393738294006933 0.00973525597009232 0.0403906309605554 0.00182817448308955 0.00660939512703722 428428 1715942 667 665 0 True 543 543 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 586 544 0.00977039518693388 0.0507746133472844 0.0098115510795758 0.0494544899671931 0.00174542088948828 0.00699426388197143 427082 2212797 667 665 0 True 587 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 630 544 0.00966374217331709 0.0578904803781025 0.00970473792629892 0.0570534828717479 0.00183717871115509 0.00791532390692976 422420 2522912 667 665 0 True 632 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 230 587 0.00942266335360587 0.00948429668816124 0.0093842984664683 0.00946059357595178 0.00130140689566543 0.00127656569625721 411882 413333 667 665 0 False 230 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 274 587 0.00964461692248405 0.0094983625233833 0.00968947890440223 0.00949111161974517 0.00140904248198154 0.00137385336684971 421584 413946 667 665 0 False 274 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 321 590 0.0101230684726302 0.078683433234035 0.0101930266269932 0.0752117189288167 0.00148861611450288 0.0132169635839836 442498 3429085 667 665 0 True 319 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 365 589 0.0100617121057233 0.0815052967736347 0.0100556954299229 0.0751506828412299 0.00149510274261847 0.0189717610901993 439816 3552064 667 665 0 True 364 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 409 587 0.0100731964070608 0.0100589078555854 0.0100709544518196 0.0101472495613031 0.00159007852715977 0.00159885458596302 440318 438375 667 665 0 False 409 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 453 586 0.0100618264911948 0.0101538120880136 0.0100709544518196 0.0100862134737163 0.00200405042316253 0.00197804355535985 439821 442511 667 665 0 False 453 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 498 586 0.00988386557465145 0.0097797939573126 0.00987258716716258 0.0098268101014725 0.0021037407148085 0.00224343213413377 432042 426211 667 665 0 False 498 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 543 586 0.00955434390838456 0.00951334619450893 0.00946059357595178 0.00944533455405508 0.00193995499278951 0.00185396349089126 417638 414599 667 665 0 False 543 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 588 586 0.00978117029834819 0.0096063918092324 0.00975051499198901 0.00964370183871214 0.00176073215224846 0.00163158859436659 427553 418654 667 665 0 False 588 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 632 586 0.00960771616938155 0.00963482177634519 0.00961318379491875 0.00958266575112535 0.00165075955991427 0.00155768824078808 419971 419893 667 665 0 False 632 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 231 637 0.00947612712298005 0.0402706927538576 0.00944533455405508 0.0395513847562371 0.00134499972671934 0.00719230392323334 414219 1755028 667 665 0 True 230 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 274 631 0.00946095960946055 0.00968984603876365 0.00952162966353857 0.00953688868543526 0.00140485234983354 0.00196672138100117 413556 422291 667 665 0 False 274 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 319 630 0.00966117993875573 0.00965228360441043 0.00971999694819562 0.00958266575112535 0.00138500536783196 0.00122375024665926 422308 420654 667 665 0 False 319 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 364 630 0.00967575264782349 0.00975384214713942 0.00965896086060884 0.00965896086060884 0.00139459262059133 0.00135186102180299 422945 425080 667 665 0 False 364 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 409 630 0.00986206370378555 0.00954556223472391 0.00988784618905928 0.00947585259784848 0.00152080865469179 0.00145306562763578 431089 416003 667 665 0 False 409 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 453 630 0.0097843959686442 0.00972878522697222 0.00984206912336919 0.00968947890440223 0.00181764762833065 0.00182292328371322 427694 423988 667 665 0 False 453 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 498 630 0.00961197130892096 0.00963778179713417 0.00965896086060884 0.00956740672922866 0.00201143081795444 0.00189974966866651 420157 420022 667 665 0 False 498 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 543 630 0.00967069680998366 0.00966616587245179 0.00961318379491875 0.00962844281681544 0.00187435599867981 0.00195810070767303 422724 421259 667 665 0 False 543 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 588 630 0.00942485955465847 0.00950871112319595 0.00947585259784848 0.00946059357595178 0.0015758853516993 0.00137621415497683 411978 414397 667 665 0 False 588 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 629 635 0.00952302516629074 0.041655133484891 0.00964370183871214 0.0404974441138323 0.00135575409416345 0.00734123636253545 416269 1815363 667 665 0 True 632 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A8_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A8_2.csv new file mode 100755 index 0000000..afc0a00 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A8_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 230 239 0.0084710448620963 0.757071759279178 0.00848401617456321 0.733592736705577 0.00200827132317581 0.154644829425273 370285 32993774 667 665 12 True 229 239 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 273 238 0.00669079513802266 0.00642673288852711 0.00648508430609598 0.0064087891966125 0.00175063902712639 0.00145603524041026 292467 280082 667 665 0 False 273 238 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 318 239 0.00608718300497268 0.00608052518570402 0.00605783169298848 0.00605783169298848 0.00133194654843793 0.00121196692123603 266082 264994 667 665 0 True 318 238 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 362 239 0.00591363736762884 0.00608795965652286 0.00590524147402152 0.00610360875867857 0.001339418310952 0.00121037701364331 258496 265318 667 665 0 True 363 238 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 406 238 0.00618930635391849 0.00617682911788512 0.00607309071488518 0.00621042191195544 0.00142287503361244 0.00148670425379987 270546 269191 667 665 0 True 408 238 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 450 236 0.00622803727456482 0.00623898955445377 0.00622568093385214 0.00631723506523232 0.00149426451092757 0.00157955415587325 272239 271900 667 665 0 True 452 238 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 495 237 0.00625457470395038 0.00646693410110307 0.00628671702143893 0.00643930724040589 0.00156225031214868 0.00149930884656522 273399 281834 667 665 0 True 497 238 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 539 236 0.00631249950671265 0.00655906187992297 0.0064087891966125 0.00654612039368277 0.00150900966406699 0.00148416998096561 275931 285849 667 665 0 True 542 238 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 587 237 0.0078601349359653 0.00704342683212953 0.00730907148851759 0.00711070420386053 0.0034040156009554 0.00191365730624501 343581 306958 667 665 0 False 587 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 626 238 0.00872349359767358 0.769235769671375 0.00872816052491035 0.737804226749065 0.00203974965409094 0.157967646726217 381320 33523891 667 665 15 True 631 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 229 282 0.00657437360514067 0.00641771515077462 0.00651560234988937 0.00636301213092241 0.00169694166714705 0.00162662917487332 287378 279689 667 665 0 False 229 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 273 282 0.00603518336963356 0.00620645227167254 0.005981536583505 0.00619516289005875 0.00134574217145337 0.00131852894963157 263809 270482 667 665 0 False 273 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 317 283 0.00592589949017252 0.00605858890760892 0.00593575951781491 0.00613412680247196 0.00132516823706395 0.00128593719901288 259032 264038 667 665 0 True 318 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 361 283 0.00584475443669788 0.00591978917309295 0.00578316929884794 0.00581368734264134 0.00130427525377452 0.00126532534514455 255485 257989 667 665 0 True 363 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 406 283 0.00588375988247579 0.00603483990360428 0.00582894636453803 0.00599679560540169 0.00137624106512859 0.00139525099410648 257190 263003 667 665 0 True 408 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 450 281 0.00616535403618859 0.00612710535780972 0.00616464484626535 0.00611886778057527 0.00173117249112504 0.00169507703934675 269499 267024 667 665 0 True 452 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 494 282 0.0062902172168665 0.00635681673857337 0.00625619897764553 0.00631723506523232 0.00166044034082608 0.00166271622115925 274957 277035 667 665 0 True 497 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 538 281 0.00635754450538521 0.00651300946346181 0.00630197604333562 0.00654612039368277 0.00150170416952351 0.00156197512811826 277900 283842 667 665 0 True 542 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 587 281 0.00677434228639857 0.00669047303541527 0.00683604180972 0.00672922865644312 0.00184896240628042 0.00198884104883061 296119 291576 667 665 0 False 587 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 631 281 0.00727859919891279 0.00730269252898784 0.00729381246662089 0.00738536659800107 0.00189054119795268 0.00189362604733294 318161 318257 667 665 0 False 631 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 230 328 0.00601553194563167 0.00611301657669007 0.00601205462729839 0.00621042191195544 0.00140960001412732 0.00147653129138791 262950 266410 667 665 0 True 229 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 274 327 0.00585129728566708 0.00606251265609664 0.00584420538643473 0.00607309071488518 0.0013469412644835 0.00141594893447877 255771 264209 667 665 0 True 274 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 318 327 0.00595307747819842 0.00582720247632127 0.00599679560540169 0.00587472343022812 0.00123417935213506 0.00117556440667278 260220 253954 667 665 0 True 318 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 362 328 0.00604179484988565 0.0059681591252106 0.00602731364919509 0.00592050049591821 0.00123516218986712 0.00124271882505769 264098 260097 667 665 0 True 363 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 406 328 0.00620731062713093 0.00618782020283026 0.00621042191195544 0.00617990386816205 0.00150572041561076 0.00136407937798899 271333 269670 667 665 0 True 408 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 451 326 0.00615906283525667 0.00631083315980498 0.00616464484626535 0.00627145799954223 0.00169662344481926 0.00164028206587253 269224 275031 667 665 0 True 453 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 494 325 0.00630227344556149 0.00639334660753509 0.00636301213092241 0.0063782711528191 0.00167422922908465 0.00150978475933646 275484 278627 667 665 0 True 497 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 539 325 0.00649867330010893 0.00647884302195177 0.00657663843747616 0.00645456626230259 0.00153015129987238 0.00144740667940802 284069 282353 667 665 0 True 542 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 583 325 0.00664188391041376 0.00669614067211976 0.00662241550316625 0.00679026474402991 0.0017823498427925 0.0018820803787211 290329 291823 667 665 0 True 587 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 627 326 0.00685418334549823 0.00688971226418071 0.00692759594110018 0.00677500572213321 0.00182606244009652 0.00186622042318807 299609 300259 667 665 0 True 632 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 230 371 0.00598343538233172 0.00592472254107459 0.005981536583505 0.00599679560540169 0.00152930327410291 0.001522315326397 261547 258204 667 665 0 True 229 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 275 372 0.00602687898440343 0.00599516644667287 0.00602731364919509 0.00599679560540169 0.00128066450954828 0.00138946841917928 263446 261274 667 665 0 True 274 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 319 372 0.00613863359004865 0.00614270856817025 0.00613412680247196 0.00614938582436866 0.00134628163995883 0.00139860854995124 268331 267704 667 665 0 True 318 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 363 371 0.00629696595968438 0.0063918551241918 0.00630197604333562 0.00645456626230259 0.00131559433180992 0.00134910395332536 275252 278562 667 665 0 True 363 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 407 371 0.0064717927143089 0.00669813696521 0.00651560234988937 0.00679026474402991 0.00144583683766649 0.00147433558166365 282894 291910 667 665 0 True 408 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 452 370 0.00641839757621761 0.00635957024628405 0.00648508430609598 0.00648508430609598 0.00179426853376543 0.00165633078557201 280560 277155 667 665 0 True 453 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 495 370 0.00654346665074421 0.00640316745170319 0.00653086137178607 0.0064087891966125 0.00163776772796802 0.00174413700651885 286027 279055 667 665 0 True 497 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 539 369 0.00658672723606153 0.00649814052182413 0.00662241550316625 0.00654612039368277 0.00166486613833631 0.0017105506308951 287918 283194 667 665 0 True 542 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 584 370 0.00667933371377941 0.00655965847326028 0.00668345159075303 0.00648508430609598 0.00193535912464905 0.00192738493452812 291966 285875 667 665 0 True 587 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 628 370 0.00650992883050349 0.00672135821357009 0.00663767452506294 0.00669871061264973 0.00194672036869682 0.00193522002142908 284561 292922 667 665 0 True 632 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 231 416 0.00597538264513886 0.00606650524227713 0.0059662775616083 0.00605783169298848 0.00145379182409593 0.00149538591795902 261195 264383 667 665 0 True 229 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 274 416 0.0059684737626609 0.00602655643457465 0.005981536583505 0.00604257267109178 0.00141007922979183 0.00156898741947244 260893 262642 667 665 0 True 274 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 318 416 0.00616761886852408 0.00653907600312294 0.00617990386816205 0.00660715648126955 0.00131277943672916 0.00129649065528073 269598 284978 667 665 0 True 319 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 364 415 0.00643946738006598 0.00645651666359765 0.00653086137178607 0.0064087891966125 0.001355822518916 0.00136578319818688 281481 281380 667 665 0 True 363 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 407 416 0.00650178458493344 0.00658483012291544 0.00659189745937285 0.00660715648126955 0.00154375004362701 0.00166693706197742 284205 286972 667 665 0 True 408 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 452 414 0.00674208558343854 0.00665265819618857 0.00675974670023652 0.00659189745937285 0.00166784077683488 0.00150655033126817 294709 289928 667 665 0 True 453 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 496 414 0.00654305486304685 0.0064231992202984 0.00660715648126955 0.0063782711528191 0.00178643108078738 0.00169532651712478 286009 279928 667 665 0 True 498 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 539 413 0.00628641961921305 0.0064982093595169 0.0063782711528191 0.00654612039368277 0.00163382373039687 0.00152309814794907 274791 283197 667 665 0 True 542 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 584 414 0.00613625437224167 0.0060120316814008 0.00613412680247196 0.00602731364919509 0.0019124235180755 0.00196595565560724 268227 262009 667 665 0 True 587 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 628 415 0.00571000835128327 0.00583913434306756 0.00563057907988098 0.00585946440833143 0.00177571815749634 0.00175007234130958 249595 254474 667 665 0 True 632 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 232 460 0.00606814926251683 0.00609782639248614 0.00607309071488518 0.00607309071488518 0.00149501667252763 0.00141442205029395 265250 265748 667 665 0 True 229 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 277 460 0.0061652625278114 0.00607254001334304 0.00619516289005875 0.00604257267109178 0.00151377257552193 0.00150336897151661 269495 264646 667 665 0 True 274 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 321 460 0.00630122109922379 0.00635016242827256 0.00631723506523232 0.00633249408712902 0.00143320367006287 0.00152513702990747 275438 276745 667 665 0 True 319 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 365 460 0.00651173612095303 0.00649157799511367 0.00654612039368277 0.00646982528419928 0.00144905686351254 0.00150752900005605 284640 282908 667 665 0 True 363 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 409 460 0.00661459153691637 0.00669765510136063 0.00663767452506294 0.00665293354695964 0.00175479006858394 0.00167479998383748 289136 291889 667 665 0 True 408 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 453 458 0.00650391215470315 0.00663333775041862 0.00659189745937285 0.00654612039368277 0.00197872976809594 0.00201202875515489 284298 289086 667 665 0 True 453 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 497 458 0.0063554855668984 0.00670889859117925 0.00631723506523232 0.00679026474402991 0.00190457696290952 0.00196292874365915 277810 292379 667 665 0 True 498 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 541 458 0.006071695212133 0.0061958971587816 0.00611886778057527 0.00613412680247196 0.00175439999915069 0.00175258227478002 265405 270022 667 665 0 True 542 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 585 457 0.00581707315259743 0.00561077677026166 0.00588998245212482 0.00558480201419089 0.00189146043778672 0.00201103327150345 254275 244522 667 665 0 True 587 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 629 458 0.00556089545064959 0.00574113241446486 0.00563057907988098 0.00569161516746777 0.00174196638731183 0.0018639275718521 243077 250203 667 665 0 True 632 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 232 503 0.00615615744428084 0.00615718742954892 0.00610360875867857 0.00617990386816205 0.00137071457091068 0.00124835089715117 269097 268335 667 665 0 True 229 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 276 504 0.00615091858968662 0.00619302892158297 0.00617990386816205 0.00619516289005875 0.00154377460302485 0.00155859901797049 268868 269897 667 665 0 True 274 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 320 504 0.00604920702843817 0.00622210137382825 0.00604257267109178 0.00616464484626535 0.00149254257526029 0.00146113999320938 264422 271164 667 665 0 True 319 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 365 504 0.00628708305494769 0.00630447714617282 0.00633249408712902 0.00624093995574884 0.00156570325993184 0.00151943992068589 274820 274754 667 665 0 True 364 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 409 503 0.00631675464625206 0.00635190631648932 0.00631723506523232 0.00634775310902571 0.00168031268153549 0.00162602316394544 276117 276821 667 665 0 True 408 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 454 502 0.0060673714413107 0.00635695441395891 0.00605783169298848 0.00636301213092241 0.00194298522241114 0.00178272043268987 265216 277041 667 665 0 True 453 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 497 501 0.00597336946084065 0.00597508878628248 0.0059510185397116 0.0059662775616083 0.001727563759092 0.00168734996164462 261107 260399 667 665 0 True 498 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 541 501 0.00561552595183296 0.00573977860650711 0.00560006103608759 0.00573739223315786 0.00168720788285269 0.00160529077807866 245465 250144 667 665 0 True 543 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 585 500 0.00556743829961879 0.00554136543005488 0.00556954299229419 0.00560006103608759 0.00172378658971916 0.00176022777351725 243363 241497 667 665 0 True 587 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 630 501 0.00560358410860946 0.00568691125846202 0.00558480201419089 0.00576791027695125 0.00172491957181424 0.00190162863375189 244943 247840 667 665 0 True 632 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 232 547 0.00613275417681409 0.00638462716645126 0.00614938582436866 0.0064087891966125 0.00135924172929773 0.00128271514771978 268074 278247 667 665 0 True 229 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 277 548 0.0062609574132595 0.00627164156672294 0.00616464484626535 0.00633249408712902 0.00143650845500825 0.00143971515654183 273678 273323 667 665 0 True 274 543 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 321 547 0.00603342183337263 0.00639802757064325 0.00601205462729839 0.00646982528419928 0.00131113074667316 0.00138590560485786 263732 278831 667 665 0 True 319 543 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 365 546 0.00606240711184806 0.00638130001130085 0.00605783169298848 0.00642404821850919 0.0014251705406594 0.0012854930968547 264999 278102 667 665 0 True 364 543 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 410 546 0.00605677934665078 0.00615906899315122 0.00607309071488518 0.00619516289005875 0.001707342963736 0.00158922220008573 264753 268417 667 665 0 True 408 543 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 454 545 0.00589485527321027 0.00601281184191883 0.00590524147402152 0.00610360875867857 0.00183924670428289 0.0019707998513861 257675 262043 667 665 0 True 453 543 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 498 544 0.00581480832026193 0.00609103440679979 0.00579842832074464 0.00605783169298848 0.00183786165914855 0.00207963839713718 254176 265452 667 665 0 True 498 543 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 542 544 0.00582025306870483 0.00595677796000645 0.0059510185397116 0.00585946440833143 0.0018892502169468 0.00179310984487168 254414 259601 667 665 0 True 543 543 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 586 544 0.00578294052790496 0.00610360875867857 0.00585946440833143 0.00617990386816205 0.00165258673735336 0.0015113785322842 252783 266000 667 665 0 True 587 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 630 544 0.00590508133436143 0.00593800821577863 0.00590524147402152 0.00585946440833143 0.00178658406339081 0.00182965957792933 258122 258783 667 665 0 True 632 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 230 587 0.00667414061337379 0.00666172182573623 0.00669871061264973 0.00666819256885634 0.00129633812891625 0.00125422736859826 291739 290323 667 665 0 False 230 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 274 587 0.00666599636780374 0.0065368502510568 0.00662241550316625 0.00656137941557946 0.00137587767817162 0.00141964894923518 291383 284881 667 665 0 False 274 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 321 590 0.00635338087422299 0.00646994001368723 0.0064087891966125 0.00636301213092241 0.0014070861336315 0.00136775201047614 277718 281965 667 665 0 True 319 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 365 589 0.00622842618516789 0.00618738423077607 0.00617990386816205 0.00621042191195544 0.00141876914052772 0.00132565480400045 272256 269651 667 665 0 True 364 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 409 587 0.00593354043966801 0.00587327783868001 0.00590524147402152 0.00582894636453803 0.00151504025013233 0.00152520252719873 259366 255962 667 665 0 False 409 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 453 586 0.0060641457710147 0.00606957999255406 0.00608834973678187 0.00605783169298848 0.0018636178064283 0.00182732403707471 265075 264517 667 665 0 False 453 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 498 586 0.00599119071729871 0.00596581864365652 0.0059662775616083 0.00601205462729839 0.00200339368582904 0.0021088842244805 261886 259995 667 665 0 False 498 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 543 586 0.00622305006800788 0.00601519821526809 0.00624093995574884 0.00601205462729839 0.00190761071896358 0.00177163767434834 272021 262147 667 665 0 False 543 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 588 586 0.00627820674236011 0.00612152950469559 0.00627145799954223 0.00616464484626535 0.00164927345475512 0.00164361842333861 274432 266781 667 665 0 False 588 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 632 586 0.0061424083106078 0.00606827207639148 0.00619516289005875 0.00602731364919509 0.00157261322199775 0.00148927927746843 268496 264460 667 665 0 False 632 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 231 637 0.0090624635038855 0.749516615984915 0.00848401617456321 0.715541313801785 0.00288662377091408 0.173478815382857 396137 32664515 667 665 13 True 230 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 274 631 0.00730115601389051 0.00696150997773674 0.00701915007248035 0.00686655985351339 0.00240068085538428 0.00154215211735164 319147 303388 667 665 0 False 274 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 319 630 0.00623137733033232 0.00604785022753726 0.00625619897764553 0.00608834973678187 0.00134642984777715 0.00128486085551664 272385 263570 667 665 0 False 319 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 364 630 0.00601017870556596 0.00585106620981385 0.00605783169298848 0.00581368734264134 0.00140023319550765 0.00125521104759847 262716 254994 667 665 0 False 364 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 409 630 0.00595371803683876 0.0057335373223629 0.00593575951781491 0.00575265125505455 0.00138385030240925 0.00134920472106705 260248 249872 667 665 0 False 409 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 453 630 0.00588792351363801 0.00589218525829336 0.00585946440833143 0.00590524147402152 0.00173594412229278 0.00182138084542818 257372 256786 667 665 0 False 453 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 498 630 0.00572263650733571 0.00601526705296085 0.00563057907988098 0.00604257267109178 0.00179475638373848 0.0018346980591108 250147 262150 667 665 0 False 498 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 543 630 0.00617892015310724 0.00611092850000947 0.00631723506523232 0.00607309071488518 0.00184467836211077 0.00175650671798899 270092 266319 667 665 0 False 543 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 588 630 0.00681396541372253 0.00638084109334907 0.00659189745937285 0.0064087891966125 0.00211406784356566 0.00140980854975662 297851 278082 667 665 0 False 588 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 629 635 0.00800206442898944 0.775745865005843 0.00779736018921187 0.744060425726711 0.00170211133485992 0.160617812963798 349785 33807606 667 665 15 True 632 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A8_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A8_3.csv new file mode 100755 index 0000000..3be20a6 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A8_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 230 239 0.00106481435409555 0.0766035252929761 0.000793469138628214 0.072327763790341 0.000974036432255556 0.0190174014098153 46545 3338441 667 665 0 True 229 239 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 273 238 0.00104054175704549 0.00101092741007933 0.000823987182421607 0.00080872816052491 0.000848488084409922 0.000845921540368755 45484 44057 667 665 0 False 273 238 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 318 239 0.000981747624699896 0.000996242035622359 0.000854505226215 0.000900282291905089 0.00069264462069224 0.000643459662068816 42914 43417 667 665 0 True 318 238 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 362 239 0.00104081628217706 0.000932154143656234 0.000930800335698482 0.000854505226215 0.000656363910965867 0.000645625285133223 45496 40624 667 665 0 True 363 238 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 406 238 0.00103354136619033 0.000899708644465363 0.000854505226215 0.000732433051041428 0.000776132592532406 0.00069722587868725 45178 39210 667 665 0 True 408 238 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 450 236 0.000934506424974741 0.000887111346688993 0.000671396963454643 0.000686655985351339 0.000840356808276579 0.000826103676636884 40849 38661 667 665 0 True 452 238 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 495 237 0.000946882932989902 0.000956224390227113 0.000747692072938125 0.00080872816052491 0.00083211549676755 0.000793886002135026 41390 41673 667 665 0 True 497 238 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 539 236 0.00105957549950134 0.000927610855933608 0.000869764248111696 0.000747692072938125 0.000864817011848953 0.000815578360447186 46316 40426 667 665 0 True 542 238 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 587 237 0.00106639287360211 0.00103871489205963 0.000762951094834821 0.000579842832074464 0.00105769720019912 0.00109424766006345 46614 45268 667 665 0 False 587 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 626 238 0.00101240293105908 0.0784993841894735 0.000686655985351339 0.073685816739147 0.00100456040226591 0.0201366337943517 44254 3421064 667 665 0 True 631 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 229 282 0.00103461658962233 0.000911548727621296 0.000839246204318303 0.000671396963454643 0.000833603268052233 0.000795854237792426 45225 39726 667 665 0 False 229 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 273 282 0.00103987832131085 0.000941561961667731 0.000869764248111696 0.000793469138628214 0.000759475078919492 0.000720231820720456 45455 41034 667 665 0 False 273 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 317 283 0.000966854636311965 0.000928712259017881 0.000823987182421607 0.000823987182421607 0.000704386900690583 0.000656017744037409 42263 40474 667 665 0 True 318 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 361 283 0.00101608614324104 0.000959345032299219 0.000885023270008392 0.000823987182421607 0.000743972164491091 0.000724905612729863 44415 41809 667 665 0 True 363 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 406 283 0.000916936816553957 0.000907074277591438 0.000762951094834821 0.000762951094834821 0.000753704747007019 0.000725760837931737 40081 39531 667 665 0 True 408 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 450 281 0.000922427319185452 0.000968133311075813 0.00064087891966125 0.000656137941557946 0.000891617513472642 0.000940756643155068 40321 42192 667 665 0 True 452 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 494 282 0.000901837934317346 0.000870705029912846 0.000671396963454643 0.000610360875867857 0.00083539611499227 0.000844733087380657 39421 37946 667 665 0 True 497 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 538 281 0.000893785197124486 0.000895303032128272 0.000656137941557946 0.000686655985351339 0.000797779677913802 0.00078628281287829 39069 39018 667 665 0 True 542 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 587 281 0.0010381854163328 0.00100427309977851 0.000701915007248035 0.000564583810177768 0.00102401001945815 0.00106252230780674 45381 43767 667 665 0 False 587 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 631 281 0.000976874803614444 0.00101441518651286 0.000625619897764553 0.000686655985351339 0.000992384925339696 0.00102280694497311 42701 44209 667 665 0 False 631 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 230 328 0.00100384689779166 0.000825731070638372 0.000869764248111696 0.000625619897764553 0.000784457572973816 0.000715386002622028 43880 35986 667 665 0 True 229 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 274 327 0.00094777513966752 0.000979147341918541 0.000778210116731518 0.000839246204318303 0.000726010401769818 0.000745837743811038 41429 42672 667 665 0 True 274 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 318 327 0.000895844135611297 0.000961708459750888 0.000762951094834821 0.000854505226215 0.000677743843493356 0.000653346361887888 39159 41912 667 665 0 True 318 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 362 328 0.00096006013930549 0.000979216179611308 0.000839246204318303 0.000854505226215 0.000689392597065194 0.000724741429597429 41966 42675 667 665 0 True 363 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 406 328 0.00091396279429523 0.000963819482329077 0.000717174029144732 0.000778210116731518 0.000728551739243826 0.000753360730018702 39951 42004 667 665 0 True 408 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 451 326 0.000922930615260006 0.000867423766557616 0.000625619897764553 0.000625619897764553 0.000896362470325404 0.000811415585707006 40343 37803 667 665 0 True 453 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 494 325 0.000869169443659951 0.000941630799360498 0.000671396963454643 0.000747692072938125 0.000798256463820444 0.000844133216447123 37993 41037 667 665 0 True 497 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 539 325 0.000948141173176287 0.000832821352993378 0.000747692072938125 0.000610360875867857 0.000790210509012559 0.000763688702501816 41445 36295 667 665 0 True 542 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 583 325 0.00101555997007219 0.000980317582695581 0.000747692072938125 0.000534065766384375 0.000986505416262062 0.00106991900529528 44392 42723 667 665 0 True 587 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 627 326 0.000967495194952306 0.00102178081963893 0.000564583810177768 0.000595101853971161 0.00103785345282154 0.00108866899736532 42291 44530 667 665 0 True 632 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 230 371 0.000966946144689157 0.00101152400341664 0.00080872816052491 0.000839246204318303 0.000842179385794525 0.000847556528866596 42267 44083 667 665 0 True 229 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 275 372 0.00093690851987602 0.000991744639694911 0.000762951094834821 0.000869764248111696 0.000764424357333316 0.000738714795182085 40954 43221 667 665 0 True 274 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 319 372 0.000928741397211671 0.00103210647355399 0.000793469138628214 0.000930800335698482 0.000726436114779141 0.000762699424817872 40597 44980 667 665 0 True 318 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 363 371 0.00108709664394171 0.00103033963943964 0.000915541313801785 0.000885023270008392 0.000806030131158795 0.000751762294251499 47519 44903 667 665 0 True 363 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 407 371 0.00098300586488628 0.000968844633901072 0.000823987182421607 0.000778210116731518 0.000774085259362914 0.000799118039620013 42969 42223 667 665 0 True 408 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 452 370 0.0009653905022769 0.000915059449952416 0.000671396963454643 0.000595101853971161 0.000920748677678455 0.000880125870803398 42199 39879 667 665 0 True 453 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 495 370 0.000933202430599761 0.000884334893080722 0.000625619897764553 0.000518806744487678 0.000903505192779016 0.000945874781778577 40792 38540 667 665 0 True 497 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 539 369 0.000951389720566588 0.000946426491956602 0.000778210116731518 0.000686655985351339 0.000838596369535022 0.000901484129901456 41587 41246 667 665 0 True 542 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 584 370 0.000992454104831311 0.000965333911569953 0.000656137941557946 0.000473029678797589 0.00104120401130141 0.00110641116845567 43382 42070 667 665 0 True 587 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 628 370 0.000957680921498509 0.000921484301277341 0.000549324788281071 0.000503547722590982 0.00107436355387707 0.00102627056570827 41862 40159 667 665 0 True 632 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 231 416 0.00087983016960277 0.000930983902879194 0.000732433051041428 0.000762951094834821 0.000798866001090874 0.000820127460562332 38459 40573 667 665 0 True 229 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 274 416 0.000945190028011858 0.000950579699420215 0.000762951094834821 0.000823987182421607 0.000816856770882997 0.000799536015722786 41316 41427 667 665 0 True 274 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 318 416 0.00106028468942457 0.000993144339447841 0.000930800335698482 0.000854505226215 0.000770626780952156 0.000744779086360429 46347 43282 667 665 0 True 319 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 364 415 0.000990784076947564 0.00106973774559998 0.000885023270008392 0.000946059357595178 0.000726943621852859 0.000769930208499774 43309 46620 667 665 0 True 363 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 407 416 0.00100798765185958 0.00104353353055332 0.000823987182421607 0.000854505226215 0.000841664306815072 0.000858497073372168 44061 45478 667 665 0 True 408 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 452 414 0.000873516091576551 0.000952943126871883 0.000610360875867857 0.000732433051041428 0.000829602523593169 0.000846683529144557 38183 41530 667 665 0 True 453 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 496 414 0.000916410643385105 0.000925293320277118 0.000625619897764553 0.000671396963454643 0.000889963523301454 0.000878792769135657 40058 40325 667 665 0 True 498 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 539 413 0.000954478128296804 0.000952162966353857 0.000701915007248035 0.000778210116731518 0.000894973493493129 0.000793694064797919 41722 41496 667 665 0 True 542 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 584 414 0.000855740589307086 0.00102299695221115 0.000518806744487678 0.000610360875867857 0.000898156210951673 0.00106486474851417 37406 44583 667 665 0 True 587 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 628 415 0.000859034890885983 0.000943971280914578 0.000457770656900893 0.000579842832074464 0.00094451226953506 0.000943680457283303 37550 41139 667 665 0 True 632 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 232 460 0.000955461843351613 0.0010717799304854 0.00080872816052491 0.000946059357595178 0.000755608300807125 0.000869386964602253 41765 46709 667 665 0 True 229 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 277 460 0.000999820529195233 0.000987453756845765 0.000930800335698482 0.00080872816052491 0.000781305687922874 0.000835687707643427 43704 43034 667 665 0 True 274 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 321 460 0.000900465308659472 0.00101762761217532 0.000793469138628214 0.000900282291905089 0.000778694624785052 0.000851951174866394 39361 44349 667 665 0 True 319 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 365 460 0.00101960921576291 0.000980248745002814 0.000946059357595178 0.000869764248111696 0.000780426802818836 0.000784324909026533 44569 42720 667 665 0 True 363 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 409 460 0.000889003884416226 0.000975498944201887 0.000656137941557946 0.000747692072938125 0.000876683656879254 0.000859889904608306 38860 42513 667 665 0 True 408 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 453 458 0.00097277980373512 0.000890943311586359 0.000625619897764553 0.000442511635004196 0.00102757142119784 0.00102808224320014 42522 38828 667 665 0 True 453 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 497 458 0.000905109358801945 0.000964163670792913 0.000549324788281071 0.000534065766384375 0.000974316789239092 0.00104760336504057 39564 42019 667 665 0 True 498 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 541 458 0.000891863521203463 0.000842275062800054 0.000595101853971161 0.000564583810177768 0.000904434788823739 0.00088325343956354 38985 36707 667 665 0 True 542 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 585 457 0.000799394306051369 0.000953379098926075 0.000411993591210803 0.000518806744487678 0.000901519408497724 0.00102056088355152 34943 41549 667 665 0 True 587 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 629 458 0.000839429221072686 0.000944269577583235 0.000488288700694286 0.000518806744487678 0.000862158454927395 0.000979645691493147 36693 41152 667 665 0 True 632 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 232 503 0.000941941480621557 0.000985319788369987 0.000823987182421607 0.00080872816052491 0.000729409757350767 0.000805066214634793 41174 42941 667 665 0 True 229 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 276 504 0.00103113927128905 0.00104530036466768 0.000900282291905089 0.000885023270008392 0.000843177250024667 0.000862767647263615 45073 45555 667 665 0 True 274 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 320 504 0.000964292401750601 0.00101622791242239 0.000854505226215 0.000854505226215 0.000774402680803992 0.00085292332198423 42151 44288 667 665 0 True 319 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 365 504 0.00100428156258332 0.000974948242659751 0.000854505226215 0.000854505226215 0.000881730795413651 0.000858359928455471 43899 42489 667 665 0 True 364 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 409 503 0.000990486674721692 0.000948950540691394 0.000717174029144732 0.000686655985351339 0.000936017589427954 0.000869384778327571 43296 41356 667 665 0 True 408 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 454 502 0.000877245057947108 0.000925224482584351 0.000488288700694286 0.000595101853971161 0.000952267587870706 0.000966254590777181 38346 40322 667 665 0 True 453 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 497 501 0.000896004275271382 0.000898974375742515 0.000549324788281071 0.000564583810177768 0.00093082313239009 0.000905794815197043 39166 39178 667 665 0 True 498 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 541 501 0.000930045391586651 0.000894568763405424 0.000625619897764553 0.000656137941557946 0.000900332768859919 0.000843018120045041 40654 38986 667 665 0 True 543 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 585 500 0.000944503715182921 0.000901498424477307 0.000595101853971161 0.000503547722590982 0.000959739301581635 0.000955409639956737 41286 39288 667 665 0 True 587 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 630 501 0.000976005474031124 0.000960423489485903 0.000656137941557946 0.000595101853971161 0.000961944402153121 0.00100830332867469 42663 41856 667 665 0 True 632 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 232 547 0.00104296672904106 0.000954709960986238 0.000885023270008392 0.00080872816052491 0.000770149933319362 0.0007271222030944 45590 41607 667 665 0 True 229 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 277 548 0.000976028351125421 0.00100757730903133 0.000854505226215 0.000900282291905089 0.00075738564822022 0.000767516595467404 42664 43911 667 665 0 True 274 543 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 321 547 0.000942856564393473 0.00101861428577165 0.000793469138628214 0.000961318379491875 0.000780322621410267 0.00076004958656874 41214 44392 667 665 0 True 319 543 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 365 546 0.00100869684178282 0.000964668480539871 0.000900282291905089 0.000869764248111696 0.000794728283321669 0.000727047242578949 44092 42041 667 665 0 True 364 543 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 410 546 0.000893716565841593 0.000905284497579495 0.00064087891966125 0.00064087891966125 0.000867253476885521 0.000851289728518064 39066 39453 667 665 0 True 408 543 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 454 545 0.000990372289250202 0.000932314764939357 0.000579842832074464 0.000518806744487678 0.0010711848328056 0.00109152559257809 43291 40631 667 665 0 True 453 543 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 498 544 0.000933408324448442 0.00100314875079665 0.000503547722590982 0.000488288700694286 0.00101534155000544 0.001179627123191 40801 43718 667 665 0 True 498 543 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 542 544 0.000864044974537222 0.000931695225704453 0.0004272526131075 0.000488288700694286 0.000947496994085381 0.000992654674089932 37769 40604 667 665 0 True 543 543 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 586 544 0.001022995025719 0.000813684474404138 0.000747692072938125 0.000564583810177768 0.000896497643561416 0.000761735333784637 44717 35461 667 665 0 True 587 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 630 544 0.000981793378888491 0.000877038097647414 0.000656137941557946 0.000534065766384375 0.000971211575983459 0.000923149516815116 42916 38222 667 665 0 True 632 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 230 587 0.000962187709075195 0.00104573633672187 0.000823987182421607 0.000915541313801785 0.00071414562820723 0.000701036915817212 42059 45574 667 665 0 False 230 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 274 587 0.00112939639129851 0.00102267570964491 0.000991836423285267 0.000915541313801785 0.000766678243691704 0.00071301970222408 49368 44569 667 665 0 False 274 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 321 590 0.00107144871144194 0.000991423397128665 0.000946059357595178 0.000900282291905089 0.000815205034168585 0.000785272517421879 46835 43207 667 665 0 True 319 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 365 589 0.0010132036293595 0.000969165876467318 0.000885023270008392 0.000823987182421607 0.000769593624374508 0.000717421781121695 44289 42237 667 665 0 True 364 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 409 587 0.00100595159046707 0.00100778382210963 0.000732433051041428 0.000823987182421607 0.000910103724270625 0.00082255322824734 43972 43920 667 665 0 False 409 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 453 586 0.000905566900687903 0.000940827692944882 0.000473029678797589 0.000503547722590982 0.00103616634442266 0.00105975784788128 39584 41002 667 665 0 False 453 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 498 586 0.000903828241521263 0.000964622588744693 0.000442511635004196 0.000488288700694286 0.00102267230352162 0.00114822230224247 39508 42039 667 665 0 False 498 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 543 586 0.000921260587376259 0.000988394538646915 0.000473029678797589 0.000686655985351339 0.00101166988526439 0.000970163786867293 40270 43075 667 665 0 False 543 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 588 586 0.000894151230633253 0.000947986812992656 0.000564583810177768 0.00064087891966125 0.000899318867457543 0.000896121489830706 39085 41314 667 665 0 False 588 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 632 586 0.000941941480621557 0.000901291911399006 0.000717174029144732 0.000686655985351339 0.000832691573552764 0.000763262886231957 41174 39279 667 665 0 False 632 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 231 637 0.001183958261199 0.0764037583085661 0.00106813153276875 0.0717631799801633 0.00078346047592263 0.0205375119531161 51753 3329735 667 665 0 True 230 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 274 631 0.00103043008136582 0.00104367120593886 0.000869764248111696 0.000869764248111696 0.000773098731777061 0.000778220958364265 45042 45484 667 665 0 False 274 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 319 630 0.00106717069480824 0.000941263664999074 0.000930800335698482 0.000823987182421607 0.000755995257753294 0.00067941233649633 46648 41021 667 665 0 False 319 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 364 630 0.000988702261366456 0.00100262099515211 0.000823987182421607 0.000869764248111696 0.000780204118043458 0.000694069511435993 43218 43695 667 665 0 False 364 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 409 630 0.000873287320633572 0.000966366476961458 0.000671396963454643 0.000778210116731518 0.000752296139624558 0.000747884563783111 38173 42115 667 665 0 False 409 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 453 630 0.000946928687178498 0.000892893712881425 0.000595101853971161 0.000534065766384375 0.000958538758412506 0.000974231607859309 41392 38913 667 665 0 False 453 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 498 630 0.000948301312836372 0.000932429494427302 0.00064087891966125 0.000549324788281071 0.000958953428858397 0.00100132565398598 41452 40636 667 665 0 False 498 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 543 630 0.0009512524580008 0.000868456331949122 0.000534065766384375 0.000457770656900893 0.000977417370361735 0.000944333160648047 41581 37848 667 665 0 False 543 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 588 630 0.00100117027775881 0.000991652856104555 0.000762951094834821 0.000778210116731518 0.000848902483896532 0.000793022870696683 43763 43217 667 665 0 False 588 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 629 635 0.00110013658769151 0.079435989837262 0.000976577401388571 0.0741283283741512 0.000783470590903621 0.0208036425636912 48089 3461882 667 665 0 True 632 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A9_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A9_1.csv new file mode 100755 index 0000000..8e52a84 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A9_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 241 267 0.00963622102887673 0.0416623843885291 0.00964370183871214 0.042069123369192 0.00165600127139935 0.00808331718740227 421217 1815679 667 665 0 True 240 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 284 267 0.00960982086205696 0.00976614114824713 0.00973525597009232 0.0098115510795758 0.00149740933523581 0.00137174280052516 420063 425616 667 665 0 False 284 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 329 269 0.00984428820151609 0.0623665366207921 0.00988784618905928 0.0606088349736782 0.00131951155089642 0.00849300209608934 430312 2717982 667 665 0 True 329 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 373 268 0.00992065194228246 0.0892193404087009 0.00993362325474937 0.0871900511177233 0.00134722049854079 0.0159898753788632 433650 3888248 667 665 0 True 374 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 417 269 0.00983701328552936 0.0706901380253105 0.0098115510795758 0.0688487067978943 0.00152757356418121 0.0107254675201658 429994 3080731 667 665 0 True 419 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 461 268 0.00964479993923844 0.0622035289643197 0.00968947890440223 0.0657663843747616 0.00181453121915018 0.0158364513815031 421592 2710878 667 665 0 True 463 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 506 267 0.00970379996543271 0.0783316037863026 0.00975051499198901 0.0775463492790112 0.00171580985589071 0.0186652015449339 424171 3413752 667 665 0 True 508 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 550 266 0.00959000929839498 0.0657075510933433 0.00968947890440223 0.063782711528191 0.00165550011023597 0.0159922455122536 419197 2863586 667 665 0 True 553 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 598 266 0.00955889645014984 0.00930306998900318 0.00961318379491875 0.00927748531319142 0.00190391186798717 0.00193523064217444 417837 405435 667 665 0 False 598 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 638 266 0.00938727248872703 0.0424065657391361 0.00935378042267491 0.0422522316319524 0.00185622698647207 0.00819138960841977 410335 1848111 667 665 0 True 643 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 240 311 0.00952936212141126 0.00959861314994972 0.00950637064164187 0.00959792477302205 0.00155183635092559 0.00159861916836861 416546 418315 667 665 0 False 240 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 284 311 0.00965488873782381 0.00964154492433877 0.00959792477302205 0.00962844281681544 0.00141732043249009 0.00143868325066545 422033 420186 667 665 0 False 284 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 328 312 0.00991221029448654 0.106219061042398 0.00993362325474937 0.10281528953994 0.0013208114078299 0.0227464506746574 433281 4629109 667 665 0 True 329 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 372 312 0.0101036000653827 0.0499353441970685 0.0101472495613031 0.0487678339818418 0.00137672810583724 0.00647339542066486 441647 2176221 667 665 0 True 374 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 418 312 0.0100725558484205 0.077045830414902 0.0100862134737163 0.0762188143739986 0.00156417806331715 0.0127955198475795 440290 3357717 667 665 0 True 419 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 462 311 0.0099115697358462 0.0437291443302695 0.00996414129854276 0.0438544289311055 0.00179684192353515 0.00783710937542231 433253 1905750 667 665 0 True 464 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 507 310 0.00993963993054972 0.041486802380178 0.00985732814526589 0.0437323567559319 0.00177775131288656 0.00794014371887638 434480 1808027 667 665 0 True 508 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 550 311 0.00981843708495947 0.051193880788031 0.0097962920576791 0.0522011139085985 0.00157474204230397 0.00884513625329496 429182 2231069 667 665 0 True 553 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 598 310 0.00938349776816787 0.00950345651264807 0.009399557488365 0.00950637064164187 0.00201509443374577 0.00200777832043255 410170 414168 667 665 0 False 598 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 643 310 0.00945514882750888 0.00940935538663551 0.00941481651026169 0.0093690394445716 0.00194362568461794 0.00193800091550371 413302 410067 667 665 0 False 643 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 240 356 0.0100065554313711 0.0532774600727041 0.00985732814526589 0.0512550545510033 0.00160216239515733 0.0101143911160437 437405 2321873 667 665 0 True 240 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 284 356 0.0100168043696165 0.0636464358424099 0.00994888227664607 0.0667734798199435 0.00143599100285091 0.016653274739569 437853 2773761 667 665 0 True 285 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 329 354 0.0100280599000111 0.0366336303106129 0.0100404364080262 0.0379644464789807 0.00130692052024569 0.0140978880118996 438345 1596522 667 665 0 False 329 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 373 357 0.0100832852056462 0.0353733268855361 0.0100709544518196 0.0356908522163729 0.00138243169363344 0.00429505870229422 440759 1541597 667 665 0 True 374 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 416 357 0.0100182456265573 0.0727460216115936 0.0100404364080262 0.0696879530022126 0.00162692211576866 0.0111501734081575 437916 3170328 667 665 0 True 419 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 461 354 0.00977705242137457 0.0337949933198756 0.00978103303578241 0.0346074616617075 0.00181561939296237 0.00613186219076849 427373 1472812 667 665 0 True 464 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 505 354 0.00983371898395046 0.0306913082660875 0.00978103303578241 0.0306401159685664 0.00163540922487616 0.00387982939296416 429850 1337551 667 665 0 True 509 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 549 354 0.00995746118700778 0.0520787893285514 0.00987258716716258 0.0525215533684291 0.00176183276590908 0.00846224325953515 435259 2269634 667 665 0 True 553 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 593 355 0.00987267867553978 0.0627960379318633 0.00985732814526589 0.0617074845502403 0.00205033646502927 0.0123577558751786 431553 2736700 667 665 0 True 598 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 637 355 0.00984938979354452 0.069424625881481 0.00985732814526589 0.0664377813382162 0.00204997519259915 0.0202307103007084 430535 3025579 667 665 0 True 643 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 241 400 0.00979706987888523 0.0457244048551225 0.00987258716716258 0.0481422140840772 0.00162144004379061 0.00885013736849796 428248 1992705 667 665 0 True 240 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 284 400 0.00993337160671209 0.0361454563394065 0.00996414129854276 0.0342870222018769 0.00151050102484258 0.0074791132247216 434206 1575247 667 665 0 True 285 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 328 401 0.0101576586392087 0.0839187692279451 0.0101625085831998 0.0790112153810941 0.00141983021046471 0.0172387775068702 444010 3657245 667 665 0 True 330 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 373 401 0.01021659003412 0.0647996048716435 0.01025406271458 0.0630502784771496 0.00141641955393327 0.013305828028222 446586 2824017 667 665 0 True 374 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 417 400 0.0101660774099103 0.0453598174883306 0.0101930266269932 0.0461738002594034 0.00163828321148422 0.00645269519909605 444378 1976816 667 665 0 True 419 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 462 399 0.010243539251203 0.056114330229327 0.01025406271458 0.054184786755169 0.00175363610011496 0.0113938086269256 447764 2445506 667 665 0 True 464 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 505 399 0.0100791444515783 0.0424193236581956 0.010101472495613 0.0426794842450599 0.00183220134276444 0.00453281373659087 440578 1848667 667 665 0 True 509 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 550 398 0.0101744733035176 0.0553624390571301 0.0102693217364767 0.0540932326237888 0.00164231218549453 0.00745391060369843 444745 2412738 667 665 0 True 553 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 593 399 0.00991536733349965 0.0459112762450874 0.00996414129854276 0.0463263904783703 0.00192060027916924 0.00828369164805998 433419 2000849 667 665 0 True 598 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 638 399 0.0100796019934642 0.0902935755502283 0.0101777676050965 0.0854047455558099 0.00187953057970389 0.016121535338543 440598 3935064 667 665 0 True 643 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 240 444 0.009734386640509 0.0419113244314724 0.00970473792629892 0.041519798580911 0.00163539242317097 0.00678335339037123 425508 1826528 667 665 0 True 240 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 285 444 0.00992275663495787 0.0594589701536974 0.00993362325474937 0.0569314106965743 0.00160139397357967 0.0132876219185628 433742 2591268 667 665 0 True 285 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 329 444 0.0102092236097561 0.0351502239232781 0.0101625085831998 0.0354467078660258 0.00148363101150738 0.00300565747748678 446264 1531874 667 665 0 True 330 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 373 444 0.0102130898386925 0.0556662197953111 0.0101625085831998 0.0537422751201648 0.00150790177025678 0.010418521409841 446433 2425977 667 665 0 True 374 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 418 444 0.0103844392749837 0.0935850498298849 0.010406652933547 0.0936446173800259 0.00176516535618153 0.0138940708082934 453923 4078509 667 665 0 True 419 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 461 443 0.0103502151419141 0.063237907081735 0.0103303578240635 0.0616311894407569 0.00189309391631761 0.0140379267783246 452427 2755957 667 665 0 True 464 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 505 443 0.010006624062654 0.0545301225138837 0.0100404364080262 0.0531624322880903 0.00182666821467179 0.00879275793756863 437408 2376465 667 665 0 True 509 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 549 442 0.0100448516872257 0.0345662967214328 0.00994888227664607 0.0348668650339513 0.00177942135513562 0.00403750904674007 439079 1506426 667 665 0 True 554 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 593 443 0.00994936269562632 0.0417788348187934 0.00987258716716258 0.0419012741283284 0.00185593713290128 0.0047869280744019 434905 1820754 667 665 0 True 598 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 638 443 0.00991225604867514 0.0807618496917506 0.00993362325474937 0.0789501792935073 0.00191112654807959 0.017842314018823 433283 3519664 667 665 0 True 643 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 242 488 0.00964312991135469 0.0516932064654656 0.00958266575112535 0.0525215533684291 0.00143186106804 0.011298460193386 421519 2252830 667 665 0 True 240 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 286 488 0.00985472015651593 0.0547845695722483 0.0098268101014725 0.0530403601129168 0.00165495979358984 0.00641128493529808 430768 2387554 667 665 0 True 285 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 330 489 0.0100038788113382 0.0694402520377391 0.0100099183642329 0.0662088960097658 0.00159863109525767 0.0150723825582841 437288 3026260 667 665 0 True 330 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 374 488 0.0104805688252235 0.0906375345550876 0.010452429999237 0.0851300831616693 0.00196810635947905 0.0169926718776608 458125 3950054 667 665 0 True 375 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 418 488 0.01063496633464 0.0986028357687535 0.0104676890211337 0.093690394445716 0.00241687110033022 0.0258725531169537 464874 4297188 667 665 0 True 419 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 463 487 0.0103040491656209 0.0456073578315209 0.0102998397802701 0.0466010528725109 0.00204015552570504 0.00580200650903826 450409 1987604 667 665 0 True 464 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 508 487 0.0101259509865118 0.043687520472043 0.0101167315175097 0.0444495307850767 0.00176948926766875 0.00553014419777973 442624 1903936 667 665 0 True 509 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 551 486 0.0100956617136614 0.107148989433988 0.0101472495613031 0.108079652094301 0.00185729059479763 0.0180099248751395 441300 4669636 667 665 0 True 554 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 596 488 0.00990553018295156 0.0677549676434162 0.00990310521095598 0.0682230869001297 0.0019267914667982 0.0189640344124541 432989 2952814 667 665 0 True 599 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 640 487 0.00966522918444646 0.0766061181794036 0.00961318379491875 0.0742656595712215 0.00188249466395422 0.0105780580579515 422485 3338554 667 665 0 True 643 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 242 532 0.00963603801212234 0.0492109651560809 0.00959792477302205 0.0510719462882429 0.0015513481405652 0.00933382369456647 421209 2144652 667 665 0 True 240 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 286 532 0.00985243244708614 0.0986067365713437 0.00990310521095598 0.0923781185626001 0.00153436149242016 0.0213101266895528 430668 4297358 667 665 0 True 285 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 330 532 0.0101097768808432 0.0599645830070714 0.0100709544518196 0.0604104676890211 0.00153206831328786 0.0123555415631499 441917 2613303 667 665 0 True 330 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 374 532 0.0104988476235675 0.0615620534513211 0.0104982070649271 0.0594949263752193 0.00149626848379911 0.00816476223713321 458924 2682922 667 665 0 True 375 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 418 531 0.0104993737967363 0.0618210208515108 0.0105592431525139 0.0609750514991989 0.00174433438542527 0.00690908079560597 458947 2694208 667 665 0 True 420 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 463 529 0.0101512759298995 0.065973608775888 0.0101930266269932 0.0639047837033646 0.00195029535692082 0.0119821346551825 443731 2875181 667 665 0 True 464 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 507 529 0.0101976706771357 0.0773231774790604 0.0102845807583734 0.0741283283741512 0.00194282665641939 0.0143272900685864 445759 3369804 667 665 0 True 509 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 551 529 0.0100883867976746 0.0607058961204797 0.010101472495613 0.0604867627985046 0.00176267120588543 0.0113754169341924 440982 2645610 667 665 0 True 554 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 595 529 0.00983088222425752 0.0512929152820252 0.00978103303578241 0.0502327000839246 0.00172067539107618 0.00596601279807521 429726 2235385 667 665 0 True 599 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 639 529 0.0099257306572166 0.0666088430047423 0.00985732814526589 0.0666208896009766 0.00196783467869666 0.0103056087948747 433872 2902865 667 665 0 True 643 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 242 574 0.00939708676218082 0.0451647544129263 0.009399557488365 0.0445410849164569 0.00136100390977541 0.00863942532218432 410764 1968315 667 665 0 True 241 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 287 574 0.00974760960101318 0.0547468924084071 0.0097962920576791 0.0537575341420615 0.00142691917496639 0.00989234129660268 426086 2385912 667 665 0 True 285 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 331 574 0.00996816766713919 0.046085665066764 0.00993362325474937 0.0460517280842298 0.00149840478853594 0.00575490482553026 435727 2008449 667 665 0 True 330 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 374 574 0.0103880767329771 0.054404929696638 0.0104829480430304 0.0516975661860075 0.00141482607674586 0.00884845862067819 454082 2371009 667 665 0 True 375 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 419 572 0.0103965412578673 0.0973240838420152 0.0104829480430304 0.0913099870298314 0.00175262361223695 0.019373014407589 454452 4241459 667 665 0 True 420 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 462 571 0.00998777333695249 0.0643882996573604 0.00997940032043946 0.0622720683604181 0.00212842842297204 0.0104478688995489 436584 2806092 667 665 0 True 465 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 507 571 0.00995794160598803 0.0615567300030805 0.0100251773861295 0.0594186312657359 0.00211423279813595 0.00941459272700956 435280 2682690 667 665 0 True 509 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 550 570 0.00979661233699927 0.0400766851897425 0.0098115510795758 0.0410772869459068 0.00188758932140677 0.00736748841764133 428228 1746573 667 665 0 True 554 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 595 572 0.00964253510690295 0.0492714046503303 0.00965896086060884 0.0488288700694286 0.00166684845698096 0.00583625302673144 421493 2147286 667 665 0 True 599 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 639 571 0.00979125909693357 0.0577613408664715 0.00968947890440223 0.0566262302586404 0.00165245783603922 0.00902475799030229 427994 2517284 667 665 0 True 644 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 241 616 0.0094429553362481 0.00952812335255626 0.00950637064164187 0.00952162966353857 0.00132665749991783 0.00127857075725981 412769 415243 667 665 0 False 241 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 286 616 0.00949836365863761 0.00950100130160604 0.00953688868543526 0.00949111161974517 0.00146309233240065 0.0013887753045015 415191 414061 667 665 0 False 286 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 330 616 0.00964502871018142 0.0764370528059678 0.00962844281681544 0.0736095216296635 0.00153751558617536 0.0111085269382697 421602 3331186 667 665 0 True 330 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 374 616 0.0100060750123908 0.0819835581170826 0.00996414129854276 0.0735637445639735 0.00133393540723703 0.0223384777364832 437384 3572907 667 665 0 True 375 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 420 616 0.00992358021035259 0.00984443255082086 0.00988784618905928 0.00988784618905928 0.00171189584772851 0.00174263158117826 433778 429028 667 665 0 False 420 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 465 615 0.00968588720059746 0.00969301257263094 0.00970473792629892 0.00973525597009232 0.00189126303322365 0.00204009454186902 423388 422429 667 665 0 False 465 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 509 615 0.00946674751431792 0.00958661244551066 0.00949111161974517 0.00968947890440223 0.00209999988380494 0.00194889975518855 413809 417792 667 665 0 False 509 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 554 615 0.00947642452520593 0.0094835394735408 0.00952162966353857 0.00946059357595178 0.00180856292016888 0.00200559829223847 414232 413300 667 665 0 False 554 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 599 615 0.00954233343387816 0.00951756823966531 0.00953688868543526 0.00952162966353857 0.00154708609753348 0.00165260334810026 417113 414783 667 665 0 False 599 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 644 615 0.00952423765228853 0.00946692664368635 0.00949111161974517 0.00949111161974517 0.00155871236862083 0.00151930837306017 416322 412576 667 665 0 False 644 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 242 666 0.00922301495166813 0.0385029408035997 0.00921644922560464 0.0378881513694972 0.00123928034544983 0.00855538799342224 403155 1677988 667 665 0 True 241 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 286 660 0.00921596880662438 0.00925710935613238 0.00923170824750134 0.00923170824750134 0.00131767392849353 0.00129995751592166 402847 403432 667 665 0 False 286 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 330 660 0.00956566807006202 0.0093107568646955 0.00956740672922866 0.00927748531319142 0.00143480398720039 0.00128006833745339 418133 405770 667 665 0 False 330 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 375 659 0.00950181809987659 0.00944590820149481 0.00953688868543526 0.00952162966353857 0.00138849665616588 0.00126962542269683 415342 411660 667 665 0 False 375 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 420 659 0.00951707712177329 0.00977525066958997 0.00952162966353857 0.00976577401388571 0.00149006763262697 0.00148982165463127 416009 426013 667 665 0 False 420 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 465 659 0.00956829893590628 0.00946543516034306 0.00952162966353857 0.00952162966353857 0.0016920392884025 0.00146461200814387 418248 412511 667 665 0 False 465 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 510 659 0.0095115408649532 0.00961396395543677 0.00959792477302205 0.00962844281681544 0.00172506578020486 0.00168740992924997 415767 418984 667 665 0 False 510 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 554 659 0.0093669347518962 0.00927542018240841 0.0093690394445716 0.00923170824750134 0.0016610998637479 0.00171584733816044 409446 404230 667 665 0 False 554 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 599 659 0.0093908413154375 0.00947711462221587 0.00941481651026169 0.00949111161974517 0.00141064890156659 0.00126125428297801 410491 413020 667 665 0 False 599 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 640 664 0.00950552418915285 0.041710685502954 0.00950637064164187 0.0408941786831464 0.00142121844593276 0.00816909647196037 415504 1817784 667 665 0 True 644 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A9_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A9_2.csv new file mode 100755 index 0000000..c677f5e --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A9_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 241 267 0.00830642129152865 0.771601858847164 0.00816357671473259 0.777843900205997 0.00212222859577584 0.172950391836926 363089 33627007 667 665 14 True 240 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 284 267 0.00659299555989915 0.00644114291221301 0.00642404821850919 0.00642404821850919 0.00170321440885581 0.00120555296714942 288192 280710 667 665 0 False 284 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 329 269 0.00598130781256202 0.00630050750588992 0.00599679560540169 0.00631723506523232 0.00125308894197113 0.00134955193728975 261454 274581 667 665 0 True 329 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 373 268 0.00601049898488613 0.00604344461520017 0.00604257267109178 0.00604257267109178 0.00121048177673651 0.00121992180051181 262730 263378 667 665 0 True 374 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 417 269 0.00613282280809698 0.00614206608303776 0.00608834973678187 0.00605783169298848 0.00144473197689574 0.0013941169818884 268077 267676 667 665 0 True 419 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 461 268 0.00632913115426722 0.00616884394552414 0.00634775310902571 0.00624093995574884 0.00163307167389136 0.00161706453090979 276658 268843 667 665 0 True 463 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 506 267 0.00645431461426531 0.00646119762670581 0.00642404821850919 0.00645456626230259 0.00160353492209937 0.00156378435029588 282130 281584 667 665 0 True 508 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 550 266 0.00664751167561104 0.00681734090318495 0.00669871061264973 0.00685130083161669 0.00160523400160057 0.0014670617850144 290575 297105 667 665 0 True 553 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 598 266 0.00787502792435323 0.00739020818239235 0.00756847486076143 0.00737010757610437 0.00258409535132215 0.00186375164588543 344232 322071 667 665 0 False 598 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 638 266 0.0090157942315178 0.791062366376 0.00900282291905089 0.809353780422675 0.00187019845038998 0.166223600160118 394097 34475111 667 665 16 True 643 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 240 311 0.00655616343807954 0.00614984474232044 0.00646982528419928 0.00622568093385214 0.00164696514026272 0.00150843694252601 286582 268015 667 665 0 False 240 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 284 311 0.00615528811469752 0.0058806205259085 0.00614938582436866 0.00584420538643473 0.00133210078958732 0.00128383299244075 269059 256282 667 665 0 False 284 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 328 312 0.00606986504458917 0.00609376496861288 0.00610360875867857 0.00616464484626535 0.001275655171015 0.00119809451005613 265325 265571 667 665 0 True 329 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 372 312 0.00614876814282262 0.00620227611831134 0.00617990386816205 0.00619516289005875 0.00122603852125895 0.00123272532019088 268774 270300 667 665 0 True 374 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 418 312 0.00642862363736877 0.00633699148305646 0.00651560234988937 0.00634775310902571 0.00152899524417957 0.00150124216582617 281007 276171 667 665 0 True 419 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 462 311 0.00671040080783595 0.00650128410979383 0.00668345159075303 0.00651560234988937 0.00170472107979568 0.00171870448725639 293324 283331 667 665 0 True 464 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 507 310 0.00654550271213672 0.00686745474351936 0.00651560234988937 0.00689707789730678 0.00163108158282454 0.00163002392041611 286116 299289 667 665 0 True 508 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 550 311 0.00689959437767955 0.00694439233813534 0.00688181887541009 0.00700389105058366 0.00159551183022356 0.00142407572615178 301594 302642 667 665 0 True 553 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 598 310 0.00708940562906919 0.00714923036591249 0.00717174029144732 0.00715648126955062 0.00196789738262346 0.00206033444937354 309891 311569 667 665 0 False 598 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 643 310 0.00762154971953254 0.00756891083281562 0.00759899290455482 0.00756847486076143 0.00197930259322288 0.0018897066054049 333152 329859 667 665 0 False 643 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 240 356 0.00595472462898786 0.00591951382232188 0.00593575951781491 0.00593575951781491 0.00148864456972373 0.00154622679477684 260292 257977 667 665 0 True 240 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 284 356 0.00582290681164339 0.0059272006980142 0.00581368734264134 0.00582894636453803 0.00135437793884241 0.0013427532212424 254530 258312 667 665 0 True 285 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 329 354 0.00613412680247196 0.00630108115332965 0.00610360875867857 0.00633249408712902 0.00131937782614459 0.00132964289734449 268134 274606 667 665 0 False 329 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 373 357 0.00641990746444127 0.00644465363454413 0.0064087891966125 0.00646982528419928 0.00128806591120357 0.00131095894989503 280626 280863 667 665 0 True 374 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 416 357 0.00656620648247632 0.00676578147130243 0.00648508430609598 0.00672922865644312 0.0015443549482154 0.00153087872501206 287021 294858 667 665 0 True 419 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 461 354 0.00676960672787891 0.00684281084950876 0.00689707789730678 0.00685130083161669 0.00176953256872139 0.00152580950095556 295912 298215 667 665 0 True 464 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 505 354 0.00669871061264973 0.00687576115844659 0.00666819256885634 0.00685130083161669 0.00160318539388027 0.0015105639205287 292813 299651 667 665 0 True 509 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 549 354 0.00689618569062916 0.00688945985930723 0.00686655985351339 0.00688181887541009 0.00166521995955807 0.00164824950670157 301445 300248 667 665 0 True 553 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 593 355 0.00700487476563847 0.00703294055693135 0.00698863202868696 0.00712596322575723 0.00195303256984441 0.00209533275532639 306196 306501 667 665 0 True 598 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 637 355 0.00669553069654232 0.00689886767731873 0.00662241550316625 0.00711070420386053 0.00195487662049396 0.0020049102183228 292674 300658 667 665 0 True 643 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 241 400 0.00587479206151102 0.00602364230558084 0.00582894636453803 0.00605783169298848 0.001599087570418 0.00153862308913504 256798 262515 667 665 0 True 240 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 284 400 0.00600240049350468 0.00604594571803737 0.00602731364919509 0.00604257267109178 0.00139377721111163 0.00137039864027951 262376 263487 667 665 0 True 285 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 328 401 0.00627891593228334 0.00655364664809196 0.00624093995574884 0.00653086137178607 0.00129718690300588 0.00126390925777826 274463 285613 667 665 0 True 330 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 373 401 0.00669765826631203 0.00676699760387464 0.00665293354695964 0.00677500572213321 0.0013391417310337 0.00132023662104823 292767 294911 667 665 0 True 374 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 417 400 0.0066708005576063 0.00665768334776057 0.00677500572213321 0.00668345159075303 0.00154042325037743 0.00155757211481096 291593 290147 667 665 0 True 419 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 462 399 0.00685688284262538 0.00699402431462038 0.00694285496299687 0.00704966811627375 0.00166083835524228 0.00160821519104071 299727 304805 667 665 0 True 464 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 505 399 0.00685475527285568 0.00684086044821369 0.00688181887541009 0.00683604180972 0.00174681512336399 0.00171694561980395 299634 298130 667 665 0 True 509 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 550 398 0.0068077428440735 0.00728087098038068 0.00677500572213321 0.0072480354009308 0.00167609368401676 0.00161032103999731 297579 317306 667 665 0 True 553 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 593 399 0.00658327279482255 0.00661401730464867 0.00660715648126955 0.00660715648126955 0.00189096989137518 0.00194478191080411 287767 288244 667 665 0 True 598 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 638 399 0.00619589495707628 0.00628226551730666 0.00622568093385214 0.00631723506523232 0.00181004047403675 0.00171062321875708 270834 273786 667 665 0 True 643 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 240 444 0.00607016244681504 0.00592786612904429 0.00604257267109178 0.00593575951781491 0.00153997957980323 0.00154781151623723 265338 258341 667 665 0 True 240 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 285 444 0.00619815978941177 0.00609794112197408 0.00617990386816205 0.00607309071488518 0.00155897871347196 0.00148945671841011 270933 265753 667 665 0 True 285 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 329 444 0.00635612612553874 0.00636402175041632 0.00633249408712902 0.00633249408712902 0.00151751793976991 0.00136342687905626 277838 277349 667 665 0 True 330 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 373 444 0.00655264036555767 0.00648386817352376 0.00657663843747616 0.00654612039368277 0.00143119280855948 0.00135757690247616 286428 282572 667 665 0 True 374 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 418 444 0.00669871061264973 0.00667507633813304 0.00669871061264973 0.00669871061264973 0.00167771440712393 0.00165702996894724 292813 290905 667 665 0 True 419 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 461 443 0.00675187697979804 0.00678675402169879 0.00688181887541009 0.00685130083161669 0.00185182925176036 0.00190190792599082 295137 295772 667 665 0 True 464 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 505 443 0.00674412164483105 0.00680157707154129 0.00675974670023652 0.00686655985351339 0.00172050751580853 0.00178615695694049 294798 296418 667 665 0 True 509 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 549 442 0.00662193508418599 0.00659244816091499 0.00666819256885634 0.00657663843747616 0.00168382722328458 0.00164590827182292 289457 287304 667 665 0 True 554 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 593 443 0.00603980454268174 0.00616808673090371 0.00607309071488518 0.00621042191195544 0.0017871517908513 0.00186442915914498 264011 268810 667 665 0 True 598 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 638 443 0.00593877929426223 0.00608332458520988 0.005981536583505 0.00608834973678187 0.00184177143408039 0.00185553786646752 259595 265116 667 665 0 True 643 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 242 488 0.00602273823033551 0.00624208725062829 0.00610360875867857 0.00619516289005875 0.00135286807640765 0.00142998686312677 263265 272035 667 665 0 True 240 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 286 488 0.00607800929015922 0.00630000269614297 0.00605783169298848 0.00630197604333562 0.00141868588683532 0.00157230199928825 265681 274559 667 665 0 True 285 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 330 489 0.00627749755243687 0.00622870979233389 0.00627145799954223 0.00628671702143893 0.00153645044840121 0.00156114932946491 274401 271452 667 665 0 True 330 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 374 488 0.00651603701468103 0.00650286737672747 0.00653086137178607 0.00650034332799268 0.00154519108388386 0.00157897324995253 284828 283400 667 665 0 True 375 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 418 488 0.00664659659183912 0.00652592800380443 0.00660715648126955 0.00663767452506294 0.00190938629171668 0.00172433572057353 290535 284405 667 665 0 True 419 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 463 487 0.00647707732309172 0.00678634099554219 0.00642404821850919 0.0068207827878233 0.00197122422390616 0.0017956048447861 283125 295754 667 665 0 True 464 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 508 487 0.00635946618130623 0.00642189130413583 0.0063782711528191 0.0063935301747158 0.00177943801306953 0.00175487827306163 277984 279871 667 665 0 True 509 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 551 486 0.00592011158531515 0.00594982535303698 0.00593575951781491 0.00592050049591821 0.00167904828891135 0.00176788988772566 258779 259298 667 665 0 True 554 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 596 488 0.00579652952191792 0.00584131420333851 0.00585946440833143 0.00585946440833143 0.00184969375663833 0.00175613194460034 253377 254569 667 665 0 True 599 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 640 487 0.00592791267447073 0.00582327872783355 0.00590524147402152 0.00585946440833143 0.0018423400243672 0.00180382512720415 259120 253783 667 665 0 True 643 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 242 532 0.00599247183457939 0.00608353109828818 0.00601205462729839 0.00602731364919509 0.00140974389962014 0.00145932010697778 261942 265125 667 665 0 True 240 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 286 532 0.00623533506764585 0.00626801611490388 0.00633249408712902 0.00625619897764553 0.00145324358994879 0.00146850808003252 272558 273165 667 665 0 True 285 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 330 532 0.00653102151144615 0.00669173505978267 0.00651560234988937 0.00665293354695964 0.00144163887299943 0.0014600314817904 285483 291631 667 665 0 True 330 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 374 532 0.00628415478687756 0.00649451507000507 0.00634775310902571 0.00646982528419928 0.00136809640864907 0.00146228588000617 274692 283036 667 665 0 True 375 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 418 531 0.00643530374890376 0.00656280206122998 0.00636301213092241 0.00654612039368277 0.00166799195021408 0.00176776078220235 281299 286012 667 665 0 True 420 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 463 529 0.00620712761037655 0.00616966999783735 0.00617990386816205 0.00613412680247196 0.00186599023398718 0.00191068732436747 271325 268879 667 665 0 True 464 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 507 529 0.00613296007066277 0.00619123914157103 0.00621042191195544 0.00625619897764553 0.00185051041540898 0.00177317618778744 268083 269819 667 665 0 True 509 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 551 529 0.00609720317227516 0.00603277477282127 0.00607309071488518 0.00605783169298848 0.00166490000424317 0.00175160071361109 266520 262913 667 665 0 True 554 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 595 529 0.00595474750608216 0.00596721834340945 0.00599679560540169 0.005981536583505 0.00164811979387823 0.00157113642120694 260293 260056 667 665 0 True 599 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 639 529 0.0058684093522019 0.00605539942784404 0.00585946440833143 0.00602731364919509 0.00180972698670713 0.00188685689041794 256519 263899 667 665 0 True 643 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 242 574 0.00620383330879765 0.00620776018783512 0.00625619897764553 0.00621042191195544 0.00128663549342453 0.00120289335723334 271181 270539 667 665 0 True 241 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 287 574 0.0061293912439523 0.00628605159040884 0.00616464484626535 0.00628671702143893 0.00130876364005891 0.00145264636734829 267927 273951 667 665 0 True 285 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 331 574 0.00649039179197309 0.0066879030948853 0.0063782711528191 0.00671396963454643 0.00142839951950241 0.00142109383246651 283707 291464 667 665 0 True 330 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 374 574 0.00638707883412379 0.00641936725540103 0.00636301213092241 0.00642404821850919 0.00137480411589238 0.00117183548855979 279191 279761 667 665 0 True 375 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 419 572 0.00619447657722981 0.00612848211166506 0.00624093995574884 0.00614938582436866 0.0017924718151969 0.00167318759097144 270772 267084 667 665 0 True 420 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 462 571 0.00624533235785403 0.00610514613381703 0.00628671702143893 0.00613412680247196 0.00192240876719907 0.00164841561589231 272995 266067 667 665 0 True 465 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 507 571 0.00607993096608025 0.00621631900763582 0.00602731364919509 0.00619516289005875 0.001908992173546 0.00210824079449023 265765 270912 667 665 0 True 509 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 550 570 0.00604078825773655 0.00642457597415374 0.00599679560540169 0.00642404821850919 0.00182964756454758 0.00168442888279546 264054 279988 667 665 0 True 554 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 595 572 0.00608201278166136 0.00626794727721111 0.00619516289005875 0.00625619897764553 0.00158015921312977 0.00144269752021993 265856 273162 667 665 0 True 599 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 639 571 0.00599146524243028 0.00604181545647135 0.0059662775616083 0.00607309071488518 0.00161768395447877 0.00153772917789914 261898 263307 667 665 0 True 644 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 241 616 0.0065533724325752 0.00648974232330655 0.00654612039368277 0.00648508430609598 0.00131790227270048 0.00121495488090254 286460 282828 667 665 0 False 241 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 286 616 0.00633347780218382 0.00630897454210027 0.00636301213092241 0.00628671702143893 0.00132534205044111 0.00153191423067965 276848 274950 667 665 0 False 286 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 330 616 0.00643953601134887 0.00659416910323417 0.00643930724040589 0.00663767452506294 0.00130547197405444 0.00139814391133033 281484 287379 667 665 0 True 330 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 374 616 0.00640135414096568 0.00644151004657444 0.0063782711528191 0.00645456626230259 0.00132153882501072 0.0012197823496919 279815 280726 667 665 0 True 375 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 420 616 0.00610715470829474 0.00616944053886146 0.00614938582436866 0.00617990386816205 0.00162845528509598 0.00155244070437129 266955 268869 667 665 0 False 420 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 465 615 0.00613936565706618 0.00592873807315267 0.00608834973678187 0.00605783169298848 0.00191407568016036 0.00190469303113324 268363 258379 667 665 0 False 465 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 509 615 0.00602514032523679 0.00619050487284818 0.00607309071488518 0.00621042191195544 0.00199939585894694 0.00194430353691523 263370 269787 667 665 0 False 509 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 554 615 0.00611875339510378 0.00608309512623399 0.00605783169298848 0.00614938582436866 0.00175849624921111 0.00191316537829401 267462 265106 667 665 0 False 554 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 599 615 0.00614741839425904 0.00613649022992363 0.00624093995574884 0.00605783169298848 0.00140443052311741 0.00161025008958434 268715 267433 667 665 0 False 599 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 644 615 0.0061565692319782 0.00621039896605786 0.00616464484626535 0.00621042191195544 0.00147186670592845 0.00153454654937721 269115 270654 667 665 0 False 644 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 242 666 0.0089537286746876 0.726490430700234 0.00831616693369955 0.703044174868391 0.00285620415537219 0.201103237559463 391384 31661016 667 665 14 True 241 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 286 660 0.00697218339788677 0.0065387318146591 0.00686655985351339 0.00645456626230259 0.00186949079460514 0.00128690787301425 304767 284963 667 665 0 False 286 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 330 660 0.00617219428738366 0.0060521411103864 0.00616464484626535 0.00604257267109178 0.00128653633596912 0.00123586157850516 269798 263757 667 665 0 False 330 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 375 659 0.00610042884257116 0.00623072903132172 0.00611886778057527 0.00624093995574884 0.00129024979672031 0.00113428462305633 266661 271540 667 665 0 False 375 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 420 659 0.00594589407058888 0.00586772493146347 0.005981536583505 0.00593575951781491 0.00147510958181797 0.00140435431923504 259906 255720 667 665 0 False 420 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 465 659 0.0059239091829686 0.00595859068591598 0.005981536583505 0.00604257267109178 0.00170112126819848 0.00134770556672634 258945 259680 667 665 0 False 465 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 510 659 0.00615206244440151 0.0061704042665602 0.00617990386816205 0.00619516289005875 0.00165884542574002 0.00159403917769778 268918 268911 667 665 0 False 510 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 554 659 0.00607034546356943 0.00619624134724543 0.00601205462729839 0.00622568093385214 0.0015392845334973 0.0016406389009032 265346 270037 667 665 0 False 554 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 599 659 0.00681391965953393 0.00653710265593028 0.00669871061264973 0.00657663843747616 0.00166924194489247 0.00127348162523423 297849 284892 667 665 0 False 599 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 640 664 0.00817078299943642 0.789111116082722 0.00814831769283589 0.7930724040589 0.00157039086201643 0.176486926841104 357160 34390074 667 665 19 True 644 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A9_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A9_3.csv new file mode 100755 index 0000000..30d0e8e --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A9_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 241 267 0.00100057547330706 0.0787873093124204 0.000747692072938125 0.0772106507972839 0.000837629154115444 0.0207427550068475 43737 3433612 667 665 0 True 240 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 284 267 0.0010023598866623 0.000887317859767294 0.000885023270008392 0.000762951094834821 0.000730571148146698 0.000667975293128888 43815 38670 667 665 0 False 284 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 329 269 0.000929725112266481 0.00096375064463631 0.000823987182421607 0.000885023270008392 0.000645591618921346 0.00068048129815843 40640 42001 667 665 0 True 329 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 373 268 0.00100828505408545 0.000971414574431042 0.000930800335698482 0.000900282291905089 0.00064655452746295 0.000626133415489309 44074 42335 667 665 0 True 374 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 417 269 0.000989548713855478 0.000973594434701999 0.000854505226215 0.000793469138628214 0.000770913103011014 0.000773976462487 43255 42430 667 665 0 True 419 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 461 268 0.00092331952586307 0.00100675125671813 0.000686655985351339 0.000762951094834821 0.00088587772852852 0.000911765171740863 40360 43875 667 665 0 True 463 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 506 267 0.000995336618712846 0.000975315377021175 0.000793469138628214 0.000762951094834821 0.000858475372547867 0.000866165862327021 43508 42505 667 665 0 True 508 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 550 266 0.000903302068352411 0.00100321758848942 0.000671396963454643 0.00080872816052491 0.000830203225548501 0.00084006164978249 39485 43721 667 665 0 True 553 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 598 266 0.00099746418848255 0.0010076461467241 0.000671396963454643 0.000656137941557946 0.000983306405775075 0.00103149744554167 43601 43914 667 665 0 False 598 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 638 266 0.00114632544107896 0.0817244071497122 0.000885023270008392 0.0789349202716106 0.00103251664971277 0.0218599943586791 50108 3561613 667 665 0 True 643 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 240 311 0.000980260613570532 0.000957256955618619 0.00080872816052491 0.000762951094834821 0.000806065098857992 0.000786211049296463 42849 41718 667 665 0 False 240 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 284 311 0.000915792961839062 0.000916688608681236 0.000747692072938125 0.000747692072938125 0.000754187986286278 0.000719575237527157 40031 39950 667 665 0 False 284 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 328 312 0.000904308660501519 0.000907234898874561 0.000762951094834821 0.00080872816052491 0.000712260172705813 0.000635649670364006 39529 39538 667 665 0 True 329 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 372 312 0.000927597542496776 0.000925430995662652 0.000793469138628214 0.000823987182421607 0.000723057930057089 0.000646066007853809 40547 40331 667 665 0 True 374 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 418 312 0.000998470780631657 0.000911411052235762 0.000778210116731518 0.000732433051041428 0.000855558131664349 0.000764835672265925 43645 39720 667 665 0 True 419 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 462 311 0.000926270671027498 0.000933943923668177 0.000656137941557946 0.000701915007248035 0.000927860340780189 0.000878509721630357 40489 40702 667 665 0 True 464 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 507 310 0.000941438184547003 0.000961983810521956 0.000717174029144732 0.000778210116731518 0.000880049862272743 0.000850268114629956 41152 41924 667 665 0 True 508 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 550 311 0.000915106649010125 0.00099621908972477 0.000656137941557946 0.000839246204318303 0.000853505087309974 0.000759344225831262 40001 43416 667 665 0 True 553 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 598 310 0.000947981033516201 0.00104621820057124 0.000534065766384375 0.000564583810177768 0.00102385615391679 0.00113413711275235 41438 45595 667 665 0 False 598 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 643 310 0.000982090781114364 0.00103160166380703 0.000579842832074464 0.000610360875867857 0.00104888915588962 0.00107097578674992 42929 44958 667 665 0 False 643 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 240 356 0.000987993071443221 0.000982543334761715 0.00080872816052491 0.000823987182421607 0.000781256828518447 0.000813329220745486 43187 42820 667 665 0 True 240 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 284 356 0.000919659190775407 0.000909552434531052 0.000839246204318303 0.000717174029144732 0.00070388450438277 0.000751804833019999 40200 39639 667 665 0 True 285 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 329 354 0.000968776312232989 0.000980317582695581 0.000839246204318303 0.000915541313801785 0.000706831449707585 0.000694317467675401 42347 42723 667 665 0 False 329 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 373 357 0.00106261815304296 0.000977495237292132 0.000946059357595178 0.000869764248111696 0.000767641107449346 0.00069004174276652 46449 42600 667 665 0 True 374 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 416 357 0.00092940483294631 0.000967674393124032 0.000717174029144732 0.000747692072938125 0.000823494207540606 0.000805485990926404 40626 42172 667 665 0 True 419 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 461 354 0.000979803071684574 0.00100021167590526 0.000656137941557946 0.000686655985351339 0.000931751722886762 0.00093439021289514 42829 43590 667 665 0 True 464 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 505 354 0.000929450587134906 0.00101404805215144 0.00064087891966125 0.000778210116731518 0.0008854037725611 0.000922709647084733 40628 44193 667 665 0 True 509 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 549 354 0.000990189272495819 0.000956201444329524 0.000732433051041428 0.000747692072938125 0.000898003569090092 0.000837663367942262 43283 41672 667 665 0 True 553 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 593 355 0.00099659485889923 0.00103075266559624 0.000534065766384375 0.000518806744487678 0.00110506520764276 0.00118826593247337 43563 44921 667 665 0 True 598 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 637 355 0.000899595979076152 0.00098359884605081 0.000457770656900893 0.000488288700694286 0.00100943911955224 0.00103940664516636 39323 42866 667 665 0 True 643 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 241 400 0.000961936061037918 0.000970657359810604 0.000793469138628214 0.000854505226215 0.000806559029651449 0.000822608830352544 42048 42302 667 665 0 True 240 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 284 400 0.000892183800523634 0.00100154253796542 0.000701915007248035 0.000900282291905089 0.000761636845106088 0.000737779040898434 38999 43648 667 665 0 True 285 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 328 401 0.000932150084262058 0.00095675214587166 0.000854505226215 0.000854505226215 0.000685651907914752 0.000699013700135179 40746 41696 667 665 0 True 330 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 373 401 0.00101162510985295 0.000883004031020559 0.000854505226215 0.000762951094834821 0.000775252504278446 0.000685777706082235 44220 38482 667 665 0 True 374 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 417 400 0.000970126060796564 0.00102155136066304 0.000747692072938125 0.000778210116731518 0.000856983953848457 0.000830025569521695 42406 44520 667 665 0 True 419 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 462 399 0.00102171390843832 0.000913499128916363 0.000778210116731518 0.000671396963454643 0.000948557931275309 0.000818276190057081 44661 39811 667 665 0 True 464 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 505 399 0.00101876276327389 0.000952438317124925 0.000671396963454643 0.000686655985351339 0.000962623855945638 0.000917918440832372 44532 41508 667 665 0 True 509 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 550 398 0.000920940308056089 0.00101457580779598 0.000701915007248035 0.000869764248111696 0.000853842043321772 0.000822140131727247 40256 44216 667 665 0 True 553 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 593 399 0.00090961614637863 0.000976279104719914 0.000442511635004196 0.000579842832074464 0.000994100682298099 0.00105369653572355 39761 42547 667 665 0 True 598 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 638 399 0.000920002347189875 0.000928528691837169 0.000549324788281071 0.000610360875867857 0.000981099810186139 0.000937769222165988 40215 40466 667 665 0 True 643 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 240 444 0.000935146983615082 0.000917101634837838 0.000732433051041428 0.000747692072938125 0.000812313401531275 0.000811869985169658 40877 39968 667 665 0 True 240 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 285 444 0.000832657601160509 0.000841770253053095 0.000656137941557946 0.000717174029144732 0.000757665021996685 0.000755397036082255 36397 36685 667 665 0 True 285 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 329 444 0.00093516986070938 0.000972125897256302 0.000854505226215 0.000885023270008392 0.000734107909341905 0.000754924017953744 40878 42366 667 665 0 True 330 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 373 444 0.00101597175776955 0.000971873492382823 0.000961318379491875 0.000869764248111696 0.000762318577668347 0.000770719076266513 44410 42355 667 665 0 True 374 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 418 444 0.000967472317858009 0.000948468676842025 0.000732433051041428 0.00064087891966125 0.000896452413131214 0.000930289258156864 42290 41335 667 665 0 True 419 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 461 443 0.0009360391902927 0.000979996340129335 0.00064087891966125 0.000625619897764553 0.000953680381618256 0.000975322748238083 40916 42709 667 665 0 True 464 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 505 443 0.00100805628314248 0.00107939796848496 0.000732433051041428 0.000823987182421607 0.000976833904882693 0.00096582333470857 44064 47041 667 665 0 True 509 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 549 442 0.00098039787613632 0.000974948242659751 0.000717174029144732 0.000671396963454643 0.000941936034975048 0.000911975349513469 42855 42489 667 665 0 True 554 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 593 443 0.000844896846609883 0.000923549432060352 0.000503547722590982 0.000457770656900893 0.000902004672267093 0.00101160289101495 36932 40249 667 665 0 True 598 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 638 443 0.000982433937528832 0.000937523483692064 0.000595101853971161 0.000534065766384375 0.0010359494853638 0.0010120319947851 42944 40858 667 665 0 True 643 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 242 488 0.00091146919101676 0.00101017019545889 0.000762951094834821 0.000885023270008392 0.000716860373455618 0.000733531001609837 39842 44024 667 665 0 True 240 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 286 488 0.000893693688747295 0.000895509545206573 0.000656137941557946 0.000732433051041428 0.00085791032470005 0.000794781912983636 39065 39027 667 665 0 True 285 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 330 489 0.00100002642304391 0.000981556661165388 0.000854505226215 0.000823987182421607 0.000846257003936879 0.000828755943215375 43713 42777 667 665 0 True 330 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 374 488 0.000966122569294433 0.000976416780105448 0.00080872816052491 0.000823987182421607 0.000836414000196368 0.000826561372346095 42231 42553 667 665 0 True 375 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 418 488 0.000847985254340099 0.00102972010020473 0.000534065766384375 0.000701915007248035 0.000899819633731736 0.000978831395000255 37067 44876 667 665 0 True 419 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 463 487 0.000935146983615082 0.00101354324240448 0.000534065766384375 0.000656137941557946 0.000988373274690584 0.00100188791016844 40877 44171 667 665 0 True 464 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 508 487 0.000969645641816309 0.000930662660312948 0.00064087891966125 0.000625619897764553 0.000931999739432981 0.000940329578247234 42385 40559 667 665 0 True 509 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 551 486 0.00096191318394362 0.000950786212498516 0.000610360875867857 0.000595101853971161 0.000976735917226384 0.000977365165257747 42047 41436 667 665 0 True 554 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 596 488 0.000902867403560751 0.000919327386903973 0.000549324788281071 0.000503547722590982 0.00097043090361796 0.000993317456622766 39466 40065 667 665 0 True 599 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 640 487 0.000916822431082467 0.000903379988079606 0.000473029678797589 0.000488288700694286 0.000944537045578119 0.000997300252869131 40076 39370 667 665 0 True 643 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 242 532 0.000935398631652359 0.000921346625891807 0.000747692072938125 0.000747692072938125 0.00076506941636885 0.000788978616296499 40888 40153 667 665 0 True 240 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 286 532 0.000920368380698641 0.000919465062289507 0.000778210116731518 0.000701915007248035 0.000792098023396279 0.000815446356197908 40231 40071 667 665 0 True 285 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 330 532 0.000914145811049614 0.000833073757866858 0.000778210116731518 0.000717174029144732 0.000780930968984026 0.000714296892892226 39959 36306 667 665 0 True 330 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 374 532 0.000957909692441488 0.0010034699933629 0.000762951094834821 0.000869764248111696 0.000803974468852354 0.000836259897893583 41872 43732 667 665 0 True 375 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 418 531 0.000915083771915827 0.00092547688745783 0.000625619897764553 0.00064087891966125 0.000922330730305546 0.000920249002107254 40000 40333 667 665 0 True 420 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 463 529 0.000925218324689795 0.000969418281340798 0.000549324788281071 0.000503547722590982 0.00100546026692751 0.0010625330781486 40443 42248 667 665 0 True 464 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 507 529 0.00100284030564256 0.000969624794419099 0.000610360875867857 0.000610360875867857 0.00102870772694738 0.000979382978451191 43836 42257 667 665 0 True 509 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 551 529 0.000866218298495522 0.000915105341747594 0.000564583810177768 0.000595101853971161 0.000873508829628196 0.000916155762650421 37864 39881 667 665 0 True 554 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 595 529 0.000904262906312923 0.000879447416894261 0.000625619897764553 0.000579842832074464 0.000889964459509464 0.000903207459485896 39527 38327 667 665 0 True 599 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 639 529 0.000885755337025925 0.000900167562417144 0.000488288700694286 0.000503547722590982 0.00098469549452738 0.000986544034216168 38718 39230 667 665 0 True 643 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 242 574 0.000897925951192406 0.000959207356913685 0.000778210116731518 0.000854505226215 0.000662025019183456 0.00063320822147238 39250 41803 667 665 0 True 241 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 287 574 0.000925584358198562 0.000995347145616387 0.000762951094834821 0.000915541313801785 0.000730610640006306 0.000709387469084463 40459 43378 667 665 0 True 285 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 331 574 0.000875620784251957 0.000967376096455375 0.000793469138628214 0.00080872816052491 0.000725487843035296 0.000782551472602658 38275 42159 667 665 0 True 330 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 374 574 0.000957955446630084 0.00095629322791988 0.000854505226215 0.000900282291905089 0.000676259095038306 0.00064359794379502 41874 41676 667 665 0 True 375 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 419 572 0.00102809661774743 0.00093573370368012 0.000793469138628214 0.000671396963454643 0.000946109638954965 0.000888734206707505 44940 40780 667 665 0 True 420 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 462 571 0.000998013238745699 0.000863568855762661 0.000595101853971161 0.000473029678797589 0.00107118268939497 0.000933802043179204 43625 37635 667 665 0 True 465 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 507 571 0.00092320514039158 0.000987774999412011 0.000473029678797589 0.000488288700694286 0.00104490429669323 0.00113779855411087 40355 43048 667 665 0 True 509 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 550 570 0.000908449414569438 0.000962396836678558 0.000473029678797589 0.000549324788281071 0.00099280645194685 0.000978390895497544 39710 41942 667 665 0 True 554 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 595 572 0.000898475001455555 0.000921621976662875 0.000625619897764553 0.000671396963454643 0.00086057340784273 0.000812251641784641 39274 40165 667 665 0 True 599 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 639 571 0.000961753044283535 0.000948331001456491 0.000671396963454643 0.000701915007248035 0.000888365388906582 0.000879573109846027 42040 41329 667 665 0 True 644 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 241 616 0.00106179457764823 0.00100365356054361 0.000915541313801785 0.000900282291905089 0.000756104363810518 0.000687918166620285 46413 43740 667 665 0 False 241 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 286 616 0.000942010111904451 0.000958817276654672 0.000793469138628214 0.000793469138628214 0.000749114009921533 0.000753455999800486 41177 41786 667 665 0 False 286 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 330 616 0.000973740641695632 0.000985847544014534 0.000839246204318303 0.000823987182421607 0.000749112825724821 0.000775519346657366 42564 42964 667 665 0 True 330 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 374 616 0.000965596396125581 0.000968225094666169 0.00080872816052491 0.000839246204318303 0.000706083313285709 0.000677068482528238 42208 42196 667 665 0 True 375 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 420 616 0.00101077865736392 0.000881558439472451 0.000778210116731518 0.000595101853971161 0.00091586270686102 0.000826068956461339 44183 38419 667 665 0 False 420 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 465 615 0.000954226480259527 0.000938418373698035 0.00064087891966125 0.000473029678797589 0.000984322030952905 0.00100672828728575 41711 40897 667 665 0 False 465 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 509 615 0.000904972096236157 0.000904206040392811 0.000457770656900893 0.000442511635004196 0.00106404866440403 0.001052796691666 39558 39406 667 665 0 False 509 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 554 615 0.000912063995468505 0.000895899625465587 0.000579842832074464 0.000473029678797589 0.000980288834867624 0.00098974068570723 39868 39044 667 665 0 False 554 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 599 615 0.000906642124119904 0.000898400728302789 0.000656137941557946 0.000732433051041428 0.000819408815938484 0.000744942615469509 39631 39153 667 665 0 False 599 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 644 615 0.000863495924274073 0.000938762562161871 0.00064087891966125 0.000778210116731518 0.000754902445252811 0.000784714625767733 37745 40912 667 665 0 False 644 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 242 666 0.00114984851360083 0.0746198753923031 0.00100709544518196 0.0701457236591135 0.000768536632669712 0.0245309294504803 50262 3251992 667 665 0 True 241 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 286 660 0.000986460306125262 0.000980753554749772 0.000854505226215 0.000885023270008392 0.000726649527051945 0.000669421803333847 43120 42742 667 665 0 False 286 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 330 660 0.000940797625906662 0.000939427993191952 0.000793469138628214 0.000839246204318303 0.000710119887280344 0.00065731736912059 41124 40941 667 665 0 False 330 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 375 659 0.00100103301519302 0.000933553843409164 0.000823987182421607 0.000823987182421607 0.000696356671878236 0.000674088323812295 43757 40685 667 665 0 False 375 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 420 659 0.00092450913476656 0.000999638028465533 0.000747692072938125 0.000854505226215 0.000811172019114016 0.000755796557264938 40412 43565 667 665 0 False 420 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 465 659 0.000914443213275486 0.000873596213009062 0.000671396963454643 0.000625619897764553 0.000839550943789346 0.000793208541119612 39972 38072 667 665 0 False 465 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 510 659 0.000961753044283535 0.000984172493490536 0.000610360875867857 0.000625619897764553 0.000931603211483164 0.000960524277626973 42040 42891 667 665 0 False 510 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 554 659 0.000937503324327765 0.000948285109661313 0.000671396963454643 0.000595101853971161 0.000857925510954474 0.000904173489543615 40980 41327 667 665 0 False 554 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 599 659 0.000993597959546205 0.00097006076647329 0.000823987182421607 0.000793469138628214 0.000735428142470556 0.000769456223186646 43432 42276 667 665 0 False 599 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 640 664 0.00104420209213315 0.0822395884423808 0.000900282291905089 0.0784924086366064 0.000769020869754929 0.0239879011112179 45644 3584065 667 665 0 True 644 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B10_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B10_1.csv new file mode 100755 index 0000000..a552608 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B10_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 261 252 0.00996601722027519 0.0403945547090432 0.0100556954299229 0.0405279621576257 0.00157061043379565 0.00801202100548278 435633 1760426 667 665 0 True 261 253 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 305 252 0.00982301250381904 0.00998366825739102 0.00976577401388571 0.00994888227664607 0.00136397979454165 0.00143209465804874 429382 435096 667 665 0 False 305 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 350 253 0.0101874446159845 0.0591787319064427 0.0101472495613031 0.0590218966964218 0.0013333934682381 0.0082925759624316 445312 2579055 667 665 0 True 350 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 393 252 0.010440831312428 0.0879739288711594 0.0104371709773404 0.0857404440375372 0.00144186582654533 0.0163570334413263 456388 3833972 667 665 0 True 395 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 438 252 0.0104797910040173 0.0703533610863965 0.0104371709773404 0.0671244373235676 0.0015249217568636 0.0118661789105608 458091 3066054 667 665 0 True 439 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 482 252 0.0103618367058174 0.0623813826165322 0.0102998397802701 0.0662546730754559 0.00175682144146789 0.017276220719503 452935 2718629 667 665 0 True 484 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 527 251 0.0101920429119384 0.0776637404910766 0.0102388036926833 0.0750896467536431 0.00160134857686307 0.0238135295019098 445513 3384646 667 665 0 True 529 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 571 250 0.0100809974962164 0.0641453026018927 0.010101472495613 0.0628976882581826 0.00175510588497628 0.0164645211555574 440659 2795502 667 665 0 True 573 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 618 251 0.0100772227756573 0.010038050034677 0.010101472495613 0.0100099183642329 0.00190362572110441 0.00199110748239548 440494 437466 667 665 0 False 618 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 658 252 0.00977821915318377 0.0425352233869177 0.00971999694819562 0.0423895628290227 0.00181045004544439 0.00785661199396368 427424 1853718 667 665 0 True 663 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 261 296 0.00992483845053898 0.00956839340282498 0.00990310521095598 0.00956740672922866 0.00169116392266712 0.00162602730734725 433833 416998 667 665 0 False 261 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 305 296 0.0100114053753622 0.00969076387466721 0.00999465934233616 0.00976577401388571 0.00130425163784698 0.00125077509457476 437617 422331 667 665 0 False 305 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 349 297 0.0101018385291218 0.0977582890620922 0.0101167315175097 0.0978255893797208 0.0014161555983035 0.0239947540218282 441570 4260382 667 665 0 True 350 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 393 296 0.0101718653147677 0.052431949638344 0.0101625085831998 0.0520637827115282 0.00143758786073461 0.00789380811543872 444631 2285025 667 665 0 True 395 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 438 297 0.0102715636917179 0.0716441366634714 0.0103150988021668 0.0697337300679026 0.0017674022210917 0.0148687135433718 448989 3122307 667 665 0 True 439 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 483 296 0.00996766437106464 0.04156530029583 0.00999465934233616 0.0430609597924773 0.00177139581807401 0.00686245691551827 435705 1811448 667 665 0 True 484 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 527 295 0.00981996985027742 0.0421767396288845 0.0098268101014725 0.0442969405661097 0.001671304734426 0.00873057996200252 429249 1838095 667 665 0 True 529 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 572 295 0.0100486950390678 0.0489870590874072 0.010101472495613 0.0502174410620279 0.00179401132313651 0.00841232126014206 439247 2134894 667 665 0 True 574 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 618 295 0.00973614817676994 0.00962536806653851 0.0097962920576791 0.00959792477302205 0.00202646989379817 0.00203138731187553 425585 419481 667 665 0 False 618 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 663 295 0.00981386166609989 0.0096162126534005 0.00985732814526589 0.00961318379491875 0.00190069091038624 0.00191547977910056 428982 419082 667 665 0 False 663 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 263 340 0.010131807522652 0.0467499029101708 0.0101930266269932 0.0466620889600977 0.00161164285092043 0.00904414967010721 442880 2037397 667 665 0 True 261 340 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 306 340 0.00979391283987212 0.0595798950339915 0.00971999694819562 0.0615091172655833 0.00137590908799721 0.0182546575915031 428110 2596538 667 665 0 True 305 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 350 342 0.0101357881370599 0.0360504373774904 0.0101777676050965 0.0364995803768978 0.00148584157635184 0.00614782736712393 443054 1571106 667 665 0 True 350 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 395 341 0.0100474139217871 0.0327140579762521 0.0101472495613031 0.0336156252384222 0.00143505239426633 0.00434923168240601 439191 1425704 667 665 0 True 395 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 439 340 0.0100195953751209 0.0650825736807113 0.0100862134737163 0.0631723506523232 0.00167350994655563 0.00994840418242359 437975 2836349 667 665 0 True 440 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 482 340 0.010038651994671 0.0314382890162004 0.0100709544518196 0.0323338673990997 0.00162251298223002 0.00490242006438419 438808 1370105 667 665 0 True 484 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 526 339 0.00971356848469791 0.0278978288018054 0.00975051499198901 0.0283054856183719 0.00167115743966812 0.00336367216753199 424598 1215809 667 665 0 True 529 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 572 339 0.00998081870028593 0.0486218062895853 0.00993362325474937 0.0489204242008087 0.00187200134437188 0.00748444004186847 436280 2118976 667 665 0 True 574 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 615 337 0.00981230602368763 0.0545356983669978 0.00975051499198901 0.0560311284046693 0.00206627022164838 0.0133782661318105 428914 2376708 667 665 0 True 618 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 660 339 0.00968302756381022 0.0615607914269537 0.00970473792629892 0.0615396353093767 0.00213785200565274 0.0172842156278828 423263 2682867 667 665 0 True 663 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 263 385 0.0101020901771591 0.0429605255987302 0.010101472495613 0.0455786984054322 0.00145938463521578 0.00900039615632451 441581 1872253 667 665 0 True 261 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 307 385 0.0102050142244053 0.0320485810543755 0.0102082856488899 0.0314488441290913 0.00138848844931688 0.0044303243240634 446080 1396702 667 665 0 True 306 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 351 385 0.0102176195033634 0.0790911359423966 0.0102082856488899 0.0764629587243458 0.00138266714108273 0.0155835662824763 446631 3446853 667 665 0 True 350 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 396 384 0.0102296071007755 0.0609023588956369 0.0102845807583734 0.0605020218204013 0.00156186864641862 0.0123820445161933 447155 2654172 667 665 0 True 395 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 439 383 0.0102208451736595 0.0428949232775232 0.01025406271458 0.0435492484931716 0.00179076933611732 0.00748295820497834 446772 1869394 667 665 0 True 440 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 483 383 0.010261818049547 0.0522030643098935 0.01025406271458 0.0523994811932555 0.00176822694523912 0.010960158416694 448563 2275050 667 665 0 True 484 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 528 383 0.0101294740590337 0.0408956013287969 0.0100862134737163 0.0414282444495308 0.00175035339374096 0.00535732552301933 442778 1782262 667 665 0 True 529 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 572 382 0.0101556683320047 0.0479712212552439 0.0101472495613031 0.0480964370183871 0.00190917923218364 0.00700933570490364 443923 2090623 667 665 0 True 574 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 616 383 0.00985490317327031 0.0426664739211269 0.00962844281681544 0.0434729533836881 0.00246442867098105 0.00642078412720239 430776 1859438 667 665 0 True 618 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 660 383 0.00999168532007743 0.0868117421041732 0.00997940032043946 0.0833600366216525 0.00193682275187779 0.0172707296816762 436755 3783323 667 665 0 True 663 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 264 428 0.0100230269392655 0.0447373182326381 0.010101472495613 0.0454261081864652 0.00164289276693522 0.00611835113256563 438125 1949687 667 665 0 True 261 427 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 307 428 0.0101222448972355 0.0472055395985959 0.010101472495613 0.0468604562447547 0.00143941465143945 0.00683591185300119 442462 2057254 667 665 0 True 306 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 351 428 0.0100659672452627 0.0335780398581714 0.00997940032043946 0.0342107270923934 0.00141479144403096 0.00376571832561813 440002 1463357 667 665 0 True 350 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 396 428 0.0103214815114759 0.0516775344174123 0.0102998397802701 0.0513618677042802 0.00144351659992419 0.00940785057743381 451171 2252147 667 665 0 True 395 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 440 428 0.0103466463152036 0.0944644743008815 0.0103608758678569 0.0943312733653773 0.00169930177577711 0.0186033644159 452271 4116835 667 665 0 True 440 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 485 426 0.0104853501379317 0.0577450033873881 0.0106202792401007 0.0578469520103761 0.00174155359294202 0.0139258611127315 458334 2516572 667 665 0 True 485 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 528 426 0.0103309068743266 0.0524926185915693 0.0103456168459602 0.0516365300984207 0.00166390488662131 0.0125191933542463 451583 2287669 667 665 0 True 529 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 573 426 0.010157681516303 0.0330525788033829 0.0100862134737163 0.0334019989318685 0.00179386544264697 0.00433091124753028 444011 1440457 667 665 0 True 574 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 617 426 0.00997994937070261 0.0409405523421738 0.010101472495613 0.0412298771648737 0.00188509857989074 0.00501743853923321 436242 1784221 667 665 0 True 619 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 661 426 0.0100227066599454 0.0782189164832429 0.0100862134737163 0.0789349202716106 0.00188726591627455 0.0157760687778642 438111 3408841 667 665 0 True 663 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 264 471 0.00994142434390495 0.0538838972000842 0.00994888227664607 0.05468833447776 0.00144935488833302 0.0157622387930044 434558 2348302 667 665 0 True 261 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 309 472 0.00998239721979249 0.0534251857613822 0.00996414129854276 0.0532082093537804 0.0015841791086061 0.00529054975429295 436349 2328311 667 665 0 True 306 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 353 473 0.010365108130302 0.0678047602411843 0.0104219119554437 0.0642252231631952 0.00154555264469885 0.0147157517637382 453078 2954984 667 665 0 True 351 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 397 472 0.010408345838525 0.0865697087764043 0.0103913939116503 0.0841382467383841 0.00169603459104504 0.01692184112924 454968 3772775 667 665 0 True 395 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 441 472 0.01060010164293 0.0947549693643585 0.0106660563057908 0.0908522163729305 0.00194243172840986 0.0290604780940675 463350 4129495 667 665 0 True 440 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 487 471 0.0104845723167256 0.0432382856890452 0.0105745021744106 0.0443427176317998 0.00193195813436162 0.0062752442558055 458300 1884358 667 665 0 True 485 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 529 470 0.0103545160356421 0.0401151884058969 0.0104371709773404 0.0413824673838407 0.00179155172904325 0.0062341825529119 452615 1748251 667 665 0 True 529 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 574 470 0.010202223218901 0.0857123353129906 0.0101319905394064 0.0850995651178759 0.0018991181255275 0.0171372820439084 445958 3735410 667 665 0 True 574 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 618 470 0.010199844001094 0.0669768034184798 0.0101625085831998 0.0693217364766918 0.00190370543530193 0.0169853707733217 445854 2918901 667 665 0 True 619 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 662 470 0.0100866023843194 0.0818227303208812 0.0101319905394064 0.0768444342717632 0.00203362589451476 0.0138064424648356 440904 3565898 667 665 0 True 663 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 265 516 0.0096669678436131 0.0475031478903255 0.00971999694819562 0.0491798275730526 0.00156488956493027 0.0104217612877449 422561 2070224 667 665 0 True 261 514 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 308 517 0.00992952825487005 0.10334169137653 0.00997940032043946 0.0990920881971466 0.00154159264064413 0.0238666343705513 434038 4503711 667 665 0 True 306 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 353 515 0.010160907186599 0.0562331899788381 0.0101319905394064 0.058609903105211 0.00146553160925709 0.0112530314472263 444152 2450686 667 665 0 True 351 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 397 516 0.0105642761132595 0.0593745521964674 0.0105897611963073 0.0587472343022812 0.00169542459286315 0.0071883497977151 461784 2587589 667 665 0 True 395 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 442 516 0.0104706401662982 0.0574339946914666 0.0104982070649271 0.0574349584191653 0.00187620368035416 0.0074385963149102 457691 2503018 667 665 0 True 440 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 486 513 0.0105788488223272 0.0658459836934979 0.0106202792401007 0.0651560234988937 0.0018033098629873 0.0162273321501673 462421 2869619 667 665 0 True 485 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 530 513 0.010373938688701 0.0741939536412558 0.0104829480430304 0.0716411078049897 0.00175066312149877 0.0172798471528804 453464 3233430 667 665 0 True 529 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 574 511 0.0102205706485279 0.0600699276229025 0.0101625085831998 0.0605630579079881 0.00181184321010733 0.0156215833457124 446760 2617894 667 665 0 True 574 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 617 511 0.0101637897004805 0.0524128815974475 0.0102082856488899 0.0490424963759823 0.00189830196714887 0.0112654354069423 444278 2284194 667 665 0 True 619 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 661 512 0.0098158977274924 0.0610445316770984 0.00985732814526589 0.0626077668421454 0.00183098061933144 0.0111843681741867 429071 2660368 667 665 0 True 664 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 265 557 0.00964292401750601 0.0405771581620566 0.00958266575112535 0.0415655756466011 0.00141518290270612 0.00772767116227319 421510 1768384 667 665 0 True 261 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 309 558 0.00968515513357992 0.0519387964073608 0.00968947890440223 0.0530556191348135 0.0015293122645944 0.00992317342275332 423356 2263533 667 665 0 True 306 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 353 557 0.010047940094956 0.0446726108014371 0.0100556954299229 0.0447241931792172 0.00147887103460473 0.00694512920337075 439214 1946867 667 665 0 True 351 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 397 556 0.0103826777387228 0.0501891258244031 0.010406652933547 0.0495002670328832 0.00158225513149103 0.00582898883655957 453846 2187281 667 665 0 True 396 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 441 557 0.0103743962305869 0.0885961986678759 0.0103456168459602 0.0818646524757763 0.00192062391367001 0.0204407206205062 453484 3861091 667 665 0 True 440 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 485 555 0.0101667179685506 0.0628231599828135 0.0102388036926833 0.0618295567254139 0.00203281781171503 0.011892902372985 444406 2737882 667 665 0 True 485 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 529 555 0.0100993678029376 0.0558504065152582 0.0101930266269932 0.0554970626382849 0.00197005127748011 0.00834519455106531 441462 2434004 667 665 0 True 530 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 573 554 0.00995755269538497 0.0382705218069206 0.00999465934233616 0.0402990768291753 0.00175865869213723 0.00900820159469043 435263 1667859 667 665 0 True 574 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 617 553 0.00990255616069283 0.0488384844005183 0.00993362325474937 0.0484168764782177 0.00173185064907266 0.00914664783507193 432859 2128419 667 665 0 True 619 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 661 555 0.00983239211248118 0.0550775198467673 0.0098115510795758 0.0537727931639582 0.00184303282545414 0.00870805542103084 429792 2400321 667 665 0 True 664 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 262 601 0.00935890489179764 0.0093028175841297 0.00929274433508812 0.0093690394445716 0.00144251320816362 0.00136831996581774 409095 405424 667 665 0 False 262 601 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 306 601 0.00924975827490238 0.00947828486299291 0.00926222629129473 0.00944533455405508 0.00147599425215355 0.00144789891151182 404324 413071 667 665 0 False 306 601 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 352 599 0.00978695820320556 0.07150843462513 0.0097962920576791 0.0691844052796216 0.00143203175969837 0.00991943322517122 427806 3116393 667 665 0 True 351 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 397 600 0.0101479816283207 0.0769298618484871 0.0100862134737163 0.0720683604180972 0.00146074534415176 0.0197103236378442 443587 3352663 667 665 0 True 396 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 440 600 0.0101171433052071 0.00999862898261906 0.0100862134737163 0.0100404364080262 0.00186627499838232 0.00207458321141893 442239 435748 667 665 0 False 440 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 485 600 0.00981070462708678 0.00996186965468145 0.00978103303578241 0.0100709544518196 0.00199866675142526 0.00197230875149838 428844 434146 667 665 0 False 485 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 530 600 0.00953501276370284 0.00968697780156503 0.00952162966353857 0.00973525597009232 0.00197817471725616 0.00198987822533439 416793 422166 667 665 0 False 530 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 574 600 0.00950559282043574 0.00969342559878754 0.00955214770733196 0.00959792477302205 0.00166230894421621 0.00183717852858104 415507 422447 667 665 0 False 574 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 619 600 0.00953046022193756 0.00960203208869048 0.00961318379491875 0.00965896086060884 0.00148030100981047 0.00150541192719168 416594 418464 667 665 0 False 619 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 664 599 0.00965376776020321 0.00944944186972352 0.00970473792629892 0.00950637064164187 0.00159535953262849 0.00170425986923845 421984 411814 667 665 0 False 664 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 263 650 0.00922491375049486 0.0382894521724315 0.00924696726939803 0.0384222171358816 0.00135338387554687 0.0082174112883185 403238 1668684 667 665 0 True 262 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 306 644 0.00919540229885057 0.00937741469719159 0.00917067215991455 0.0093842984664683 0.00126780572540911 0.00135916751531769 401948 408675 667 665 0 False 306 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 351 644 0.00939436438795937 0.00935641920089764 0.00932326237888151 0.0093842984664683 0.001295445025527 0.0012641359659955 410645 407760 667 665 0 False 351 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 396 644 0.00929276721218242 0.009496480959781 0.00932326237888151 0.00952162966353857 0.00138145836282186 0.00138076873135885 406204 413864 667 665 0 False 396 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 440 644 0.00965772549751675 0.00950604939907562 0.00970473792629892 0.00956740672922866 0.00155876333023694 0.00167665235992599 422157 414281 667 665 0 False 440 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 485 643 0.00970423463022437 0.00930589233440663 0.00965896086060884 0.00933852140077821 0.00184276579373087 0.00179018971788566 424190 405558 667 665 0 False 485 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 530 643 0.00939383821479052 0.00942470619212256 0.00943007553215839 0.009399557488365 0.00178373038491833 0.0017172686076934 410622 410736 667 665 0 False 530 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 575 643 0.00956026907580771 0.00928684723940774 0.00965896086060884 0.00932326237888151 0.00155678757572258 0.00138638571599226 417897 404728 667 665 0 False 575 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 619 643 0.00950394566964629 0.00949331442591372 0.00955214770733196 0.00950637064164187 0.001360487325848 0.00143492722047621 415435 413726 667 665 0 False 619 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 660 648 0.00966198063705616 0.0408400034189387 0.00968947890440223 0.0407721065079728 0.00148342340116401 0.0082805746777544 422343 1779839 667 665 0 True 664 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B10_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B10_2.csv new file mode 100755 index 0000000..ec6ea68 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B10_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 261 252 0.00843890254460776 0.75219538890715 0.00827038986800946 0.760296025024796 0.0019255495427566 0.181412906317732 368880 32781258 667 665 13 True 261 253 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 305 252 0.00704079180368616 0.00690591206787855 0.00695811398489357 0.00691233691920348 0.0015148268056797 0.00125527625473729 307766 300965 667 665 0 False 305 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 350 253 0.00653571131577722 0.00669022063054179 0.00651560234988937 0.00669871061264973 0.0012251126364468 0.00130398089021141 285688 291565 667 665 0 True 350 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 393 252 0.00650567369096409 0.00657161328590416 0.00653086137178607 0.00656137941557946 0.00126142130880879 0.00121859552267443 284375 286396 667 665 0 True 395 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 438 252 0.00689874792519053 0.00678260081423518 0.00704966811627375 0.00674448767833982 0.00151985190134826 0.00162935570001058 301557 295591 667 665 0 True 439 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 482 252 0.0068023209727249 0.00698482300968718 0.0068055237659266 0.00692759594110018 0.00159606623050338 0.00161137684902238 297342 304404 667 665 0 True 484 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 527 251 0.00712237152195246 0.00726219301974322 0.00715648126955062 0.0072480354009308 0.00154610662594595 0.00153199850044288 311332 316492 667 665 0 True 529 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 571 250 0.00749298044957837 0.00715822515776739 0.00747692072938125 0.00718699931334401 0.00165497061933544 0.00162894381888123 327532 311961 667 665 0 True 573 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 618 251 0.00836679394338079 0.0081704375381117 0.00820935378042268 0.00820935378042268 0.00262049343865022 0.00191037501324534 365728 356074 667 665 0 False 618 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 658 252 0.00946095960946055 0.778853427916323 0.0093690394445716 0.765651941710536 0.00188130900045134 0.158919597900517 413556 33943036 667 665 15 True 663 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 261 296 0.00694511979533236 0.00666328214677229 0.00677500572213321 0.00662241550316625 0.00178252385775567 0.00146358788023598 303584 290391 667 665 0 False 261 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 305 296 0.00660248955403278 0.00624869566913392 0.00657663843747616 0.00622568093385214 0.00130670513878125 0.00126683428134805 288607 272323 667 665 0 False 305 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 349 297 0.00656835692934032 0.00661199806566083 0.00659189745937285 0.00672922865644312 0.0012671310227953 0.00131147360553049 287115 288156 667 665 0 True 350 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 393 296 0.00639002997928822 0.00644091345323712 0.0063935301747158 0.00645456626230259 0.00133596332666582 0.00129274535015375 279320 280700 667 665 0 True 395 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 438 297 0.0065826779903708 0.00653203161256311 0.00648508430609598 0.00648508430609598 0.0015702580683264 0.00161695155037744 287741 284671 667 665 0 True 439 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 483 296 0.00701736565912512 0.00696990817625432 0.00694285496299687 0.00701915007248035 0.00177288426709149 0.00173645371683808 306742 303754 667 665 0 True 484 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 527 295 0.00687271379187952 0.0069613952482488 0.00686655985351339 0.00700389105058366 0.00155770469108485 0.00161367060702275 300419 303383 667 665 0 True 529 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 572 295 0.00711498222049424 0.00714360862100318 0.00708018616006714 0.00704966811627375 0.00171473062883057 0.001755334815673 311009 311324 667 665 0 True 574 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 618 295 0.00751228871716579 0.00755463848451525 0.00753795681696803 0.00755321583886473 0.00197287791990494 0.00176817904649538 328376 329237 667 665 0 False 618 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 663 295 0.0078720767791888 0.00753947124620891 0.00791943236438544 0.00749217975127794 0.00215638380681435 0.00192909115480202 344103 328576 667 665 0 False 663 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 263 340 0.00661292150903262 0.00629098495839048 0.00654612039368277 0.00628671702143893 0.00139602998272574 0.00143227654660646 289063 274166 667 665 0 True 261 340 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 306 340 0.00656524564451581 0.00648662168123444 0.00656137941557946 0.00645456626230259 0.00132138766261557 0.00124746962406685 286979 282692 667 665 0 True 305 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 350 342 0.00650521614907813 0.00653744684439412 0.00653086137178607 0.00657663843747616 0.00132410179165621 0.00127094970740542 284355 284907 667 665 0 True 350 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 395 341 0.00654495366187357 0.00658884565499352 0.00650034332799268 0.00662241550316625 0.00132689315264185 0.00130250167048965 286092 287147 667 665 0 True 395 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 439 340 0.00676946946531312 0.00681894711601618 0.00683604180972 0.0068207827878233 0.00153146128582177 0.00175685197085042 295906 297175 667 665 0 True 440 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 482 340 0.00673323214794525 0.00679769921484875 0.00675974670023652 0.0068207827878233 0.00160914949862786 0.00158753830288983 294322 296249 667 665 0 True 484 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 526 339 0.00694665256065032 0.00687144732969985 0.00698863202868696 0.00692759594110018 0.00156605984443192 0.00159671409357088 303651 299463 667 665 0 True 529 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 572 339 0.00712600897994582 0.0072116890991498 0.00708018616006714 0.00718699931334401 0.00188881063615508 0.00179700103872906 311491 314291 667 665 0 True 574 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 615 337 0.00714030716388201 0.00750854017625891 0.00704966811627375 0.00756847486076143 0.0019713360753881 0.00217709470331504 312116 327228 667 665 0 True 618 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 660 339 0.00702640211137279 0.0071571467005807 0.00704966811627375 0.0072632944228275 0.00180059447324472 0.00189833403760959 307137 311914 667 665 0 True 663 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 263 385 0.00643507497796078 0.00671224869222725 0.00645456626230259 0.00668345159075303 0.00143500497793799 0.00142998151324135 281289 292525 667 665 0 True 261 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 307 385 0.00701528384354401 0.0732025761359223 0.00701915007248035 0.0718547341115434 0.00136710003102466 0.0161005534830623 306651 3190225 667 665 0 True 306 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 351 385 0.00694306085684555 0.00697986669580796 0.00686655985351339 0.00706492713817044 0.00140321902315171 0.00145309953387651 303494 304188 667 665 0 True 350 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 396 384 0.00695278362192216 0.00702178885070309 0.00695811398489357 0.00708018616006714 0.00144364226139184 0.00145825244751849 303919 306015 667 665 0 True 395 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 439 383 0.00711157353344385 0.00699829225157194 0.00712596322575723 0.00697337300679027 0.00161731342301256 0.00158682558155909 310860 304991 667 665 0 True 440 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 483 383 0.00703694845184412 0.00714932214950285 0.00703440909437705 0.0072632944228275 0.00166113550683163 0.00173884679079205 307598 311573 667 665 0 True 484 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 528 383 0.00713230018087775 0.007034523823865 0.00715648126955062 0.00704966811627375 0.00164906807395428 0.00170326873382216 311766 306570 667 665 0 True 529 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 572 382 0.00719438861480223 0.00727378069802568 0.0072632944228275 0.0072480354009308 0.00173791959125291 0.0017780306125805 314480 316997 667 665 0 True 574 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 616 383 0.00683089446350297 0.00687190624765163 0.0068207827878233 0.00694285496299687 0.00205809729401474 0.00200654210759638 298591 299483 667 665 0 True 618 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 660 383 0.0063391513215697 0.00625468454840466 0.00633249408712902 0.00630197604333562 0.00185605352866635 0.00187875191120899 277096 272584 667 665 0 True 663 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 264 428 0.00660891801753049 0.00681844230626922 0.00659189745937285 0.00688181887541009 0.00144055792904253 0.00173267999112926 288888 297153 667 665 0 True 261 427 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 307 428 0.00691135320414867 0.00701114195422179 0.00695811398489357 0.00706492713817044 0.0014019777655519 0.00143235279903793 302108 305551 667 665 0 True 306 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 351 428 0.00713747040418907 0.00711841402545044 0.00711070420386053 0.00709544518196384 0.00136365101268015 0.00130564540850557 311992 310226 667 665 0 True 350 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 396 428 0.00712349249957306 0.0070309672097387 0.00711070420386053 0.00703440909437705 0.00143359419533122 0.0015431168656717 311381 306415 667 665 0 True 395 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 440 428 0.00745921385839468 0.00726627738951407 0.00746166170748455 0.0072632944228275 0.00163969385383354 0.00166173571223846 326056 316670 667 665 0 True 440 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 485 426 0.00715071624178755 0.00732100335526388 0.00717174029144732 0.00738536659800107 0.00174869799005687 0.00154607950526617 312571 319055 667 665 0 True 485 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 528 426 0.00705403764128465 0.00735030526648505 0.00704966811627375 0.0072632944228275 0.0016506306595435 0.00156595821561279 308345 320332 667 665 0 True 529 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 573 426 0.00682563273181445 0.00697546108347087 0.00686655985351339 0.00700389105058366 0.00181192027086664 0.00188820818573417 298361 303996 667 665 0 True 574 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 617 426 0.0064174367382571 0.00633506402765899 0.00651560234988937 0.00631723506523232 0.00192421769522882 0.00162742945914902 280518 276087 667 665 0 True 619 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 661 426 0.00623711948100109 0.00618309334792692 0.00633249408712902 0.00622568093385214 0.00185999982291887 0.00185206573750622 272636 269464 667 665 0 True 663 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 264 471 0.00645275897185305 0.00670300149549888 0.00636301213092241 0.00674448767833982 0.00151020504753595 0.00152776889154204 282062 292122 667 665 0 True 261 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 309 472 0.00689824462911598 0.00676986584107327 0.00691233691920348 0.0068055237659266 0.00152155565388554 0.001579309686069 301535 295036 667 665 0 True 306 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 353 473 0.00697486001791963 0.00708020910596473 0.00694285496299687 0.00712596322575723 0.00158641429051541 0.00151164156366183 304884 308561 667 665 0 True 351 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 397 472 0.00700768864823711 0.00697805396989842 0.00700389105058366 0.00698863202868696 0.00157204765407935 0.00167410268990173 306319 304109 667 665 0 True 395 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 441 472 0.00709450722109762 0.00698427230814505 0.00704966811627375 0.00700389105058366 0.00192371753225713 0.00202591789030084 310114 304380 667 665 0 True 440 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 487 471 0.0070077344024257 0.00717327766658578 0.00708018616006714 0.00714122224765393 0.00190345079322288 0.00185664002860636 306321 312617 667 665 0 True 485 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 529 470 0.00655513396883614 0.00682186124500998 0.00654612039368277 0.00683604180972 0.00171561094954898 0.00172661776647015 286537 297302 667 665 0 True 529 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 574 470 0.00632025484167964 0.0064946527453906 0.00636301213092241 0.00642404821850919 0.00189024646814266 0.00196404984588664 276270 283042 667 665 0 True 574 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 618 470 0.00642885240831175 0.00622478604384617 0.00642404821850919 0.00625619897764553 0.00191326717242781 0.0017932780043692 281017 271281 667 665 0 True 619 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 662 470 0.00615400699741683 0.00632684939632212 0.00616464484626535 0.00627145799954223 0.0018378184877544 0.00184000529435496 269003 275729 667 665 0 True 663 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 265 516 0.00643999355323483 0.0063759765630602 0.00646982528419928 0.00636301213092241 0.00143499001269228 0.00160835223737105 281504 277870 667 665 0 True 261 514 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 308 517 0.00653058684665449 0.00648402879480688 0.00654612039368277 0.00651560234988937 0.00142891489705151 0.0015124135789115 285464 282579 667 665 0 True 306 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 353 515 0.00665618209434994 0.00666293795830845 0.00665293354695964 0.00665293354695964 0.00147511537915621 0.00147736420859395 290954 290376 667 665 0 True 351 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 397 516 0.00674014103042322 0.00693181798625655 0.00679026474402991 0.00691233691920348 0.00160051013771794 0.0016447367785299 294624 302094 667 665 0 True 395 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 442 516 0.00699119426324833 0.0070054743175173 0.00695811398489357 0.00704966811627375 0.00184118883286335 0.00192580976558019 305598 305304 667 665 0 True 440 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 486 513 0.00680714803962175 0.00688236957695222 0.0068055237659266 0.00694285496299687 0.00175559901399424 0.00173810377099742 297553 299939 667 665 0 True 485 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 530 513 0.00630584227227197 0.00671988967612439 0.00619516289005875 0.00669871061264973 0.00166288612026128 0.00167171719434122 275640 292858 667 665 0 True 529 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 574 511 0.00623091978844636 0.00608332458520988 0.00627145799954223 0.00614938582436866 0.00188941732451804 0.00175407963189318 272365 265116 667 665 0 True 574 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 617 511 0.00630508732816014 0.00610670645485309 0.00625619897764553 0.00616464484626535 0.00183602430060177 0.00183987766296348 275607 266135 667 665 0 True 619 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 661 512 0.00623826333571598 0.00635002475288702 0.00628671702143893 0.00634775310902571 0.00186148407676873 0.0018689630553703 272686 276739 667 665 0 True 664 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 265 557 0.00655893156648959 0.00659329715912578 0.00660715648126955 0.00653086137178607 0.00124340438562854 0.00127342012757266 286703 287341 667 665 0 True 261 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 309 558 0.00654451899708191 0.00667679728045222 0.00653086137178607 0.00669871061264973 0.00135721493281215 0.00137106596586089 286073 290980 667 665 0 True 306 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 353 557 0.00667654270827507 0.00687046065610352 0.00665293354695964 0.00688181887541009 0.00144793154013102 0.00127871889626675 291844 299420 667 665 0 True 351 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 397 556 0.00658288388421948 0.00663512753043056 0.00662241550316625 0.00665293354695964 0.00152844574839283 0.00143555275784471 287750 289164 667 665 0 True 396 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 441 557 0.00636488805265484 0.00674235370986404 0.00634775310902571 0.0068055237659266 0.00194547318240689 0.00199563395889827 278221 293837 667 665 0 True 440 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 485 555 0.0067436183487565 0.00663308534554514 0.00677500572213321 0.00657663843747616 0.00199965601868951 0.00206744789833743 294776 289075 667 665 0 True 485 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 529 555 0.00634395551137226 0.00663342953400898 0.0063782711528191 0.00659189745937285 0.00189182356719862 0.00183785268369234 277306 289090 667 665 0 True 530 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 573 554 0.00661495757042513 0.00678643277913254 0.00662241550316625 0.00677500572213321 0.001688200685238 0.00166331633321294 289152 295758 667 665 0 True 574 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 617 553 0.00634825640510027 0.00661638073210034 0.0064087891966125 0.00659189745937285 0.00158977396341242 0.00167285671625843 277494 288347 667 665 0 True 619 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 661 555 0.00643836927953968 0.00692055155054035 0.00636301213092241 0.00689707789730678 0.00178047248884332 0.00188144739536877 281433 301603 667 665 0 True 664 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 262 601 0.00681282155900763 0.00697775567322977 0.0068055237659266 0.00700389105058366 0.00130112465835519 0.00126156040242171 297801 304096 667 665 0 False 262 601 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 306 601 0.00655964075641282 0.00670410289858315 0.00659189745937285 0.00672922865644312 0.00140578133524167 0.0013317096312969 286734 292170 667 665 0 False 306 601 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 352 599 0.00670623717667374 0.00667661371327151 0.00672922865644312 0.00666819256885634 0.00137450826733805 0.00147848411014329 293142 290972 667 665 0 True 351 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 397 600 0.00652145888602963 0.00652005385402164 0.00650034332799268 0.00654612039368277 0.00147938328922736 0.00138894014611189 285065 284149 667 665 0 True 396 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 440 600 0.00657693583970203 0.00647494221936163 0.00650034332799268 0.00648508430609598 0.00180156825437041 0.00194975084398735 287490 282183 667 665 0 False 440 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 485 600 0.00649620257392476 0.00664666931691784 0.00651560234988937 0.00669871061264973 0.00193764815951874 0.00207165268522915 283961 289667 667 665 0 False 485 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 530 600 0.00657588349336433 0.00652730475765977 0.00657663843747616 0.00648508430609598 0.00182159966773788 0.0020147855595648 287444 284465 667 665 0 False 530 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 574 600 0.00646129212802617 0.00651287178807628 0.00648508430609598 0.00654612039368277 0.00161090001269324 0.00170978671872477 282435 283836 667 665 0 False 574 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 619 600 0.00644008506161202 0.00635686263036855 0.00648508430609598 0.00642404821850919 0.00152550822577386 0.00144517064559456 281508 277037 667 665 0 False 619 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 664 599 0.00656945502986662 0.00654903452267657 0.00660715648126955 0.00643930724040589 0.0016092472354684 0.00167314257294061 287163 285412 667 665 0 False 664 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 263 650 0.00908993889413728 0.748989525771398 0.00865186541542687 0.758113984893568 0.00239331539669554 0.188786831030372 397338 32641544 667 665 12 True 262 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 306 644 0.00745660586964472 0.00693959664553923 0.00717174029144732 0.00697337300679027 0.00208390865538618 0.00133203846617077 325942 302433 667 665 0 False 306 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 351 644 0.00649418938962654 0.00631666141779259 0.0064087891966125 0.00630197604333562 0.00125426881065661 0.00119381838447308 283873 275285 667 665 0 False 351 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 396 644 0.00624304464842424 0.00616196017624744 0.00627145799954223 0.00619516289005875 0.00138838523706708 0.00138054819698877 272895 268543 667 665 0 False 396 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 440 644 0.00642850925189728 0.00608155775109552 0.00643930724040589 0.00611886778057527 0.00169788785410582 0.00164302594504649 281002 265039 667 665 0 False 440 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 485 643 0.00637772210255595 0.00643648489500244 0.00634775310902571 0.0064087891966125 0.00172052633625451 0.00166416477672444 278782 280507 667 665 0 False 485 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 530 643 0.00648860737861786 0.00653056307511741 0.00656137941557946 0.00648508430609598 0.00171344412847521 0.00159649698553088 283629 284607 667 665 0 False 530 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 575 643 0.00656686991821096 0.00639180923239662 0.00653086137178607 0.0064087891966125 0.00156901844513931 0.00144779630789142 287050 278560 667 665 0 False 575 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 619 643 0.00716155998448475 0.00670327684626994 0.00698863202868696 0.00668345159075303 0.00181599749318629 0.00139913589702281 313045 292134 667 665 0 False 619 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 660 648 0.00837466366381927 0.782888464007352 0.00833142595559625 0.790402075226978 0.00160131525633659 0.180101857616812 366072 34118886 667 665 16 True 664 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B10_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B10_3.csv new file mode 100755 index 0000000..35f6e27 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B10_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 261 252 0.001109927984051 0.0775072953613147 0.000915541313801785 0.0760662241550317 0.000855659863715687 0.0219088000269395 48517 3377828 667 665 0 True 261 253 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 305 252 0.000954684022145485 0.000965058560798884 0.000823987182421607 0.000854505226215 0.000673695792825523 0.000664000245715925 41731 42058 667 665 0 False 305 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 350 253 0.000984653015675728 0.000910332595049078 0.000915541313801785 0.000762951094834821 0.000656693454837409 0.00068542562359397 43041 39673 667 665 0 True 350 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 393 252 0.000895775504328403 0.000939450939089541 0.000823987182421607 0.000793469138628214 0.000642325846351566 0.000673198737983952 39156 40942 667 665 0 True 395 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 438 252 0.000890307878791206 0.00094764262452882 0.000717174029144732 0.000671396963454643 0.000763950854790072 0.000888880425752546 38917 41299 667 665 0 True 439 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 482 252 0.00100155918836187 0.000959184411016096 0.00080872816052491 0.00080872816052491 0.000859401642995612 0.000825189264236499 43780 41802 667 665 0 True 484 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 527 251 0.000930411425095418 0.00101179935418771 0.000732433051041428 0.000839246204318303 0.000794798979860387 0.000864361381539027 40670 44095 667 665 0 True 529 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 571 250 0.000941278044886918 0.000899708644465363 0.000762951094834821 0.000686655985351339 0.000863412632057006 0.000775380616319829 41145 39210 667 665 0 True 573 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 618 251 0.00107245530359105 0.00103144104252391 0.000717174029144732 0.000671396963454643 0.00103762685269152 0.00100871013063024 46879 44951 667 665 0 False 618 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 658 252 0.00117686636196665 0.0811586530987574 0.000946059357595178 0.0779888609140154 0.000967059802262666 0.0209613612621092 51443 3536957 667 665 0 True 663 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 261 296 0.00095539321206872 0.000943856551426633 0.000793469138628214 0.000747692072938125 0.000756892618282332 0.000780561250918543 41762 41134 667 665 0 False 261 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 305 296 0.000976623155577167 0.000961800243341244 0.000839246204318303 0.000854505226215 0.000700830489911516 0.000657388991047183 42690 41916 667 665 0 False 305 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 349 297 0.000929061676531842 0.000902439206278456 0.00080872816052491 0.000747692072938125 0.000656099193088099 0.000711985036875807 40611 39329 667 665 0 True 350 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 393 296 0.000880585113714601 0.00103320787663827 0.000747692072938125 0.000946059357595178 0.000681810954433181 0.000721619460968306 38492 45028 667 665 0 True 395 296 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 438 297 0.000968730558044393 0.000896679785983613 0.000717174029144732 0.000595101853971161 0.000891047960009602 0.000896318887677727 42345 39078 667 665 0 True 439 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 483 296 0.000909936425698801 0.000974145136244135 0.000701915007248035 0.00064087891966125 0.000842713450322914 0.000936785415000366 39775 42454 667 665 0 True 484 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 527 295 0.00100316058496273 0.000969624794419099 0.00080872816052491 0.00080872816052491 0.000881436455531416 0.000835334605016377 43850 42257 667 665 0 True 529 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 572 295 0.000962576619678259 0.000979973394231746 0.000656137941557946 0.000671396963454643 0.000914149798888468 0.000942927807587556 42076 42708 667 665 0 True 574 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 618 295 0.000977789887386359 0.000990964479176885 0.000625619897764553 0.00064087891966125 0.00101516176965083 0.00100161520907868 42741 43187 667 665 0 False 618 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 663 295 0.00116259105512476 0.0010406652933547 0.000869764248111696 0.000701915007248035 0.00105957864734453 0.00101424766409856 50819 45353 667 665 0 False 663 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 263 340 0.000924898045369625 0.000841265443306137 0.000747692072938125 0.000701915007248035 0.000743368689338035 0.000698763434922351 40429 36663 667 665 0 True 261 340 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 306 340 0.00093505547523789 0.000976898643954817 0.000823987182421607 0.000885023270008392 0.000630326351537997 0.000694169358977766 40873 42574 667 665 0 True 305 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 350 342 0.0009240744699749 0.000925798130024076 0.000793469138628214 0.000823987182421607 0.000693643046762557 0.000676736863887493 40393 40347 667 665 0 True 350 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 395 341 0.000909204358681268 0.00091519712533795 0.000793469138628214 0.000762951094834821 0.000694032850511206 0.000707346798847037 39743 39885 667 665 0 True 395 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 439 340 0.000942444776696111 0.000944269577583235 0.000686655985351339 0.000595101853971161 0.000823416449670542 0.000934251592799949 41196 41152 667 665 0 True 440 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 482 340 0.000986597568691049 0.0010429598831136 0.00080872816052491 0.000869764248111696 0.000836149040655181 0.000893547244868285 43126 45453 667 665 0 True 484 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 526 339 0.000844988354987075 0.00100688893210366 0.000610360875867857 0.000747692072938125 0.000802659698591758 0.000921908625550715 36936 43881 667 665 0 True 529 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 572 339 0.000888226063210098 0.000915265963030717 0.000595101853971161 0.000610360875867857 0.000928503344221894 0.000914755420532639 38826 39888 667 665 0 True 574 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 615 337 0.000944206312957049 0.000954228097136868 0.000503547722590982 0.000488288700694286 0.00105164043260289 0.00110764948075046 41273 41586 667 665 0 True 618 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 660 339 0.00102720441106981 0.00093084622749366 0.00064087891966125 0.000503547722590982 0.00105545803161388 0.000981494445863562 44901 40567 667 665 0 True 663 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 263 385 0.000936725503121637 0.000868341602461177 0.000778210116731518 0.000701915007248035 0.000803074032310273 0.000760568854311136 40946 37843 667 665 0 True 261 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 307 385 0.0010774196330537 0.00721997256817943 0.00100709544518196 0.0072327763790341 0.00072105406782243 0.00211651467225708 47096 314652 667 665 0 True 306 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 351 385 0.000958024077912978 0.0010331390389455 0.000839246204318303 0.000885023270008392 0.000742601141305398 0.000796210809606335 41877 45025 667 665 0 True 350 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 396 384 0.00101029823838367 0.00102813683327109 0.000823987182421607 0.000839246204318303 0.000792219728756789 0.000825703470188844 44162 44807 667 665 0 True 395 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 439 383 0.000926476564876179 0.000960859461540094 0.000671396963454643 0.000732433051041428 0.000837532508739343 0.0008559568370187 40498 41875 667 665 0 True 440 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 483 383 0.000965619273219879 0.000959803950250999 0.000671396963454643 0.000610360875867857 0.000890510764748854 0.000989280920634698 42209 41829 667 665 0 True 484 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 528 383 0.000889278409547801 0.000983438224767687 0.00064087891966125 0.000671396963454643 0.000852122304261337 0.000984892260211671 38872 42859 667 665 0 True 529 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 572 382 0.000902066705260325 0.000994452255610415 0.000595101853971161 0.000671396963454643 0.000948773204650727 0.00095751923709144 39431 43339 667 665 0 True 574 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 616 383 0.00103347273490744 0.00110344526915825 0.000686655985351339 0.000778210116731518 0.00104999316883551 0.00110466965692263 45175 48089 667 665 0 True 618 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 660 383 0.00104317262288975 0.00100959654801917 0.00064087891966125 0.000625619897764553 0.00110137785239569 0.000998139250937621 45599 43999 667 665 0 True 663 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 264 428 0.000924646397332348 0.000964576696949515 0.000778210116731518 0.00080872816052491 0.00079621196182894 0.000823339700360631 40418 42037 667 665 0 True 261 427 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 307 428 0.000951938770829737 0.000974856459069395 0.000793469138628214 0.000839246204318303 0.000792989449262132 0.000763286614301045 41611 42485 667 665 0 True 306 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 351 428 0.000934460670786145 0.000998743138459561 0.00080872816052491 0.000885023270008392 0.000742748428122557 0.000716694386857979 40847 43526 667 665 0 True 350 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 396 428 0.000922129916959579 0.000909965460687654 0.000762951094834821 0.000732433051041428 0.000781809788718699 0.000772366035176462 40308 39657 667 665 0 True 395 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 440 428 0.000953723184184973 0.00101769644986809 0.000701915007248035 0.000762951094834821 0.000862792859717497 0.000913334515554854 41689 44352 667 665 0 True 440 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 485 426 0.00104788530431511 0.000987843837104778 0.000793469138628214 0.000732433051041428 0.00095386125467754 0.000900840107354603 45805 43051 667 665 0 True 485 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 528 426 0.000990601060193181 0.00100796738929035 0.000762951094834821 0.000747692072938125 0.000881610295384626 0.000919142822137263 43301 43928 667 665 0 True 529 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 573 426 0.000983303267112152 0.000933462059818808 0.000686655985351339 0.000595101853971161 0.000959834109945738 0.000980465760059699 42982 40681 667 665 0 True 574 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 617 426 0.000954798407616974 0.000973732110087533 0.000488288700694286 0.000701915007248035 0.00103374834119088 0.000913767192205398 41736 42436 667 665 0 True 619 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 661 426 0.000948621592156543 0.000936582701890914 0.000534065766384375 0.000488288700694286 0.000997113713743473 0.00104587294384897 41466 40817 667 665 0 True 663 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 264 471 0.000927734805062564 0.000918822577157015 0.000778210116731518 0.000732433051041428 0.000781044424274315 0.00078883470874285 40553 40043 667 665 0 True 261 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 309 472 0.000928055084382734 0.00102044995757877 0.000762951094834821 0.000900282291905089 0.000825560051259558 0.000795674757113417 40567 44472 667 665 0 True 306 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 353 473 0.000901883688505942 0.00102827450865663 0.000747692072938125 0.000885023270008392 0.000787267793759604 0.000873018671687607 39423 44813 667 665 0 True 351 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 397 472 0.00092766617377967 0.00094858340632997 0.000686655985351339 0.000793469138628214 0.000843404496109783 0.00082145111584528 40550 41340 667 665 0 True 395 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 441 472 0.000963285809601494 0.000966366476961458 0.000564583810177768 0.000534065766384375 0.00101500084760886 0.0010665981736361 42107 42115 667 665 0 True 440 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 487 471 0.000897056621609086 0.00102595697300014 0.000442511635004196 0.00064087891966125 0.000976791706472668 0.00107798298503434 39212 44712 667 665 0 True 485 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 529 470 0.000825863104154034 0.000908818165808203 0.000534065766384375 0.000595101853971161 0.000872491361138383 0.000898422317511585 36100 39607 667 665 0 True 529 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 574 470 0.000914191565238209 0.000930066066975633 0.000503547722590982 0.000473029678797589 0.000953459892789397 0.00107877627199969 39961 40533 667 665 0 True 574 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 618 470 0.000942513407979004 0.000937431700101708 0.000595101853971161 0.000503547722590982 0.000963748990237273 0.000932214835567775 41199 40854 667 665 0 True 619 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 662 470 0.000946768547518413 0.00100278161643523 0.000595101853971161 0.000625619897764553 0.00099191922773382 0.00101391800953134 41385 43702 667 665 0 True 663 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 265 516 0.000940271452737811 0.000953356153028486 0.00080872816052491 0.000762951094834821 0.000780682306713157 0.000836382872931898 41101 41548 667 665 0 True 261 514 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 308 517 0.000891543241883293 0.000922861055132682 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.000820963387842472 0.000833109936086462 38971 40219 667 665 0 True 306 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 353 515 0.00095093217868063 0.000874491103015033 0.000793469138628214 0.000717174029144732 0.000827723981951603 0.000783863335713936 41567 38111 667 665 0 True 351 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 397 516 0.00102095896432649 0.00090188850473632 0.000762951094834821 0.00064087891966125 0.00089624228728417 0.000804296907196693 44628 39305 667 665 0 True 395 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 442 516 0.00104443086307613 0.000972378302129781 0.000656137941557946 0.000488288700694286 0.0010626181173352 0.0010775636977834 45654 42377 667 665 0 True 440 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 486 513 0.00100114740066451 0.000999913379236601 0.000671396963454643 0.000732433051041428 0.000948238777916063 0.000900115953432324 43762 43577 667 665 0 True 485 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 530 513 0.000950680530643353 0.000960538218973848 0.000625619897764553 0.000686655985351339 0.000951507389746899 0.00090297639924288 41556 41861 667 665 0 True 529 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 574 511 0.000913276481466294 0.00092242508307849 0.000488288700694286 0.000579842832074464 0.000962307995452734 0.000916828565100704 39921 40200 667 665 0 True 574 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 617 511 0.000994330026563738 0.000999959271031779 0.000610360875867857 0.000656137941557946 0.00103021821917568 0.000992377543785255 43464 43579 667 665 0 True 619 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 661 512 0.00102260611511594 0.000924880294120515 0.000625619897764553 0.000442511635004196 0.00109593509981661 0.00101804988217619 44700 40307 667 665 0 True 664 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 265 557 0.000899161314284492 0.00100184083463408 0.000747692072938125 0.00080872816052491 0.000693582398764957 0.000793555653482228 39304 43661 667 665 0 True 261 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 309 558 0.000966305586048816 0.000913292615838062 0.00080872816052491 0.000778210116731518 0.000751715494777459 0.000737355033814147 42239 39802 667 665 0 True 306 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 353 557 0.000954981424371357 0.000987706161719244 0.000823987182421607 0.000900282291905089 0.000736943102252487 0.000700941445524204 41744 43045 667 665 0 True 351 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 397 556 0.000999408741497871 0.000919946926138877 0.000778210116731518 0.000747692072938125 0.000827561124746714 0.000755299406099043 43686 40092 667 665 0 True 396 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 441 557 0.00103804815376702 0.00097051968442507 0.000656137941557946 0.000549324788281071 0.00104151652639291 0.00105746269092711 45375 42296 667 665 0 True 440 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 485 555 0.000963766228581749 0.000949776593004599 0.000503547722590982 0.000457770656900893 0.00109188826346854 0.00113202673938935 42128 41392 667 665 0 True 485 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 529 555 0.000907740224646203 0.000932750736993548 0.000503547722590982 0.000518806744487678 0.00101466611310433 0.00101041056193662 39679 40650 667 665 0 True 530 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 573 554 0.000925652989481455 0.000892113552363399 0.00064087891966125 0.000625619897764553 0.000893736214300796 0.000851209703897198 40462 38879 667 665 0 True 574 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 617 553 0.000913619637880762 0.00093713340343305 0.000625619897764553 0.00064087891966125 0.000884066928838232 0.000892282274834556 39936 40841 667 665 0 True 619 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 661 555 0.00104516293009366 0.00101000957417577 0.000762951094834821 0.000717174029144732 0.00097562445069903 0.000968894498357954 45686 44017 667 665 0 True 664 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 262 601 0.00095180150826395 0.00101010135776613 0.000869764248111696 0.000946059357595178 0.000685150941181925 0.000657369512449854 41605 44021 667 665 0 False 262 601 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 306 601 0.00100572281952409 0.000987430810948176 0.000839246204318303 0.000869764248111696 0.000767059876182071 0.000775310735233062 43962 43033 667 665 0 False 306 601 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 352 599 0.000964498295599282 0.000948399839149258 0.000823987182421607 0.000854505226215 0.0007685391863569 0.000745047060358891 42160 41332 667 665 0 True 351 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 397 600 0.000843020924877456 0.000890323772351455 0.00064087891966125 0.000747692072938125 0.000700384099220375 0.000676817628344559 36850 38801 667 665 0 True 396 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 440 600 0.000949719692682841 0.000918983198440138 0.000610360875867857 0.000457770656900893 0.000941233193982523 0.00102993535119305 41514 40050 667 665 0 False 440 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 485 600 0.000940957765566747 0.000909965460687654 0.000488288700694286 0.000442511635004196 0.00106704079141957 0.00103325070489934 41131 39657 667 665 0 False 485 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 530 600 0.000925264078878391 0.000956660362281304 0.000503547722590982 0.000534065766384375 0.00102821387933063 0.00104910230605296 40445 41692 667 665 0 False 530 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 574 600 0.000921672375073621 0.00099947740718241 0.000595101853971161 0.00064087891966125 0.000893058916902449 0.00101262141457968 40288 43558 667 665 0 False 574 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 619 600 0.0009175544981 0.000897551730091996 0.000671396963454643 0.000732433051041428 0.00081699362929838 0.000689850959623227 40108 39116 667 665 0 False 619 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 664 599 0.000945464553143433 0.000996012576646469 0.000686655985351339 0.000732433051041428 0.00081965860585661 0.000891591920564353 41328 43407 667 665 0 False 664 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 263 650 0.00107126569468756 0.0770979634942242 0.000915541313801785 0.0760357061112383 0.000762868472153056 0.022187561341126 46827 3359989 667 665 0 True 262 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 306 644 0.00102368133854794 0.00104408423209546 0.000869764248111696 0.000900282291905089 0.000729691475572588 0.000721997783684006 44747 45502 667 665 0 False 306 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 351 644 0.00089483754346219 0.000840760633559178 0.000793469138628214 0.000762951094834821 0.000652294525929939 0.000615050625538118 39115 36641 667 665 0 False 351 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 396 644 0.000870770840260803 0.000924375484373557 0.000671396963454643 0.000762951094834821 0.000708400811147722 0.000710115186407475 38063 40285 667 665 0 False 396 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 440 644 0.00100229125537941 0.00092127778819904 0.000762951094834821 0.00064087891966125 0.00087626093645243 0.00086719676075475 43812 40150 667 665 0 False 440 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 485 643 0.00098071815545649 0.000885665755140885 0.000671396963454643 0.000534065766384375 0.000971509465015253 0.000949999479439529 42869 38598 667 665 0 False 485 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 530 643 0.000938372653911085 0.000920291114602712 0.000534065766384375 0.000579842832074464 0.000979303609294108 0.000884931593513958 41018 40107 667 665 0 False 530 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 575 643 0.000951938770829737 0.000885642809243296 0.000747692072938125 0.000717174029144732 0.000830197780121602 0.000728224707065688 41611 38597 667 665 0 False 575 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 619 643 0.00104555184069673 0.00092919412286725 0.000900282291905089 0.000762951094834821 0.000795794899127459 0.000774691808257311 45703 40495 667 665 0 False 619 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 660 648 0.00106961854389811 0.0819146515866228 0.000915541313801785 0.0799267566948959 0.000799231864010376 0.0230751370805858 46755 3569904 667 665 0 True 664 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B11_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B11_1.csv new file mode 100755 index 0000000..5ad02e1 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B11_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 253 267 0.00966351340237412 0.0397017262772404 0.00973525597009232 0.039658197909514 0.00156943843775361 0.00769190799781901 422410 1730232 667 665 0 True 253 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 297 266 0.00962823692296676 0.00963298610453807 0.00964370183871214 0.00961318379491875 0.00141273192354623 0.00132527056729944 420868 419813 667 665 0 False 297 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 341 267 0.00997436735969392 0.0570189492958765 0.00991836423285267 0.0569161516746777 0.00137447407213998 0.00880814863137343 435998 2484930 667 665 0 True 342 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 385 267 0.00997125607486941 0.0779550386609692 0.00993362325474937 0.0776989394979782 0.0013493108219839 0.014070870811095 435862 3397341 667 665 0 True 387 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 430 266 0.0096854525358058 0.0672994686303766 0.00971999694819562 0.0650186923018235 0.00170024540822576 0.0125938934317666 423369 2932963 667 665 0 True 431 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 473 265 0.00981445647055163 0.0602664821816501 0.0098115510795758 0.0642557412069886 0.00180485617722465 0.0161129912918082 429008 2626460 667 665 0 True 476 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 518 266 0.010068758250767 0.0746031248870632 0.0100862134737163 0.0742504005493248 0.00164291012968826 0.0224917712830276 440124 3251262 667 665 0 True 521 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 562 265 0.00998388423092185 0.0606698251694698 0.0100099183642329 0.0605477988860914 0.00170106613736883 0.0156070706638316 436414 2644038 667 665 0 True 565 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 610 266 0.0103605327114424 0.0102755171288257 0.010452429999237 0.0102693217364767 0.0021711068986485 0.00201399743811271 452878 447815 667 665 0 False 610 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 655 266 0.0124970016708286 0.033792790513707 0.0106660563057908 0.0400396734569314 0.00638375677744615 0.0161770600523361 546267 1472716 667 665 0 False 655 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 253 310 0.00967110859768102 0.00996836334369914 0.00964370183871214 0.00996414129854276 0.00148149278643116 0.00153228147735132 422742 434429 667 665 0 False 253 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 297 310 0.00970796359659493 0.0096958119721368 0.00970473792629892 0.00971999694819562 0.00139847067136365 0.00136173251436927 424353 422551 667 665 0 False 297 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 342 311 0.0102132499783526 0.0881715618870936 0.01025406271458 0.086152437628748 0.00129771690003047 0.0174077511628359 446440 3842585 667 665 0 True 342 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 386 312 0.00987059685995867 0.0449678097739198 0.00996414129854276 0.0455329213397421 0.00141415902585609 0.00618711196248776 431462 1959732 667 665 0 True 387 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 430 311 0.00987158057501348 0.0659406814128478 0.00987258716716258 0.0636301213092241 0.00168129491490614 0.0135979315195949 431505 2873746 667 665 0 True 431 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 475 310 0.00990644526672347 0.0399200794386975 0.00988784618905928 0.0409399557488365 0.00171267136445647 0.00707505476643018 433029 1739748 667 665 0 True 476 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 518 310 0.0101344383884963 0.0408404393909929 0.0101930266269932 0.0427862973983368 0.00163544706664307 0.00886041493863122 442995 1779858 667 665 0 True 521 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 563 309 0.0100621467705149 0.0475848352857424 0.0101319905394064 0.0491493095292592 0.0017360244478469 0.00975230749316582 439835 2073784 667 665 0 True 565 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 610 309 0.0100749350662275 0.0100357554449181 0.0100404364080262 0.0102082856488899 0.00215333134365147 0.00208282145362695 440394 437366 667 665 0 False 610 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 655 309 0.00996201372877306 0.0101525730095438 0.00996414129854276 0.0101625085831998 0.00199266796584518 0.00204672230688135 435458 442457 667 665 0 False 655 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 255 357 0.00982543747581462 0.0436619816880264 0.00985732814526589 0.0435645075150683 0.00160297946157823 0.00665288886293064 429488 1902823 667 665 0 True 253 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 299 356 0.010062993223004 0.0555046118385917 0.0100404364080262 0.0573281452658885 0.00140533566804887 0.0139108170983437 439872 2418934 667 665 0 True 297 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 343 356 0.0100826217699116 0.0366861764160917 0.0100709544518196 0.0372625314717327 0.00136747557463114 0.00657643560158808 440730 1598812 667 665 0 True 342 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 387 357 0.0100112681127964 0.031723277064256 0.0100404364080262 0.0325932707713436 0.00135972692925282 0.00427467397665205 437611 1382525 667 665 0 True 387 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 432 356 0.0101554395610618 0.0629587702375646 0.0102235446707866 0.0609445334554055 0.00175668378547301 0.0084907539801615 443913 2743792 667 665 0 True 431 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 476 354 0.00999154805751164 0.0298630760926119 0.00999465934233616 0.0301213092240787 0.00176673852421418 0.00389939996527958 436749 1301456 667 665 0 True 476 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 519 354 0.0102374081899311 0.0278014101401363 0.0101777676050965 0.0278019378957809 0.00179360652821082 0.00289021168380482 447496 1211607 667 665 0 True 521 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 564 355 0.0101391968241103 0.049341045449513 0.0101625085831998 0.0482337682154574 0.00173176065767145 0.0094442853679116 443203 2150321 667 665 0 True 565 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 607 353 0.010207370565118 0.0551428927089984 0.0101319905394064 0.0558022430762188 0.00287344548559729 0.0122613487213954 446183 2403170 667 665 0 True 610 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 652 354 0.010890160321533 0.0595952458394785 0.0104219119554437 0.0605020218204013 0.00466950125922109 0.0161909031791169 476029 2597207 667 665 0 True 655 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 255 401 0.00996464459461732 0.0396616397941524 0.00997940032043946 0.0421911955443656 0.00145622012525453 0.00766148244864457 435573 1728485 667 665 0 True 253 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 299 400 0.00987391403863186 0.0304946619237496 0.00991836423285267 0.0299839780270085 0.00145686598377136 0.00457492091379633 431607 1328981 667 665 0 True 297 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 343 400 0.0101723457337479 0.0759693006836157 0.0101930266269932 0.0739604791332876 0.00143602717761272 0.0142641099334613 444652 3310801 667 665 0 True 342 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 387 400 0.0101900297276402 0.0600662103874931 0.0100862134737163 0.0589761196307317 0.00175901491445264 0.0137155988446042 445425 2617732 667 665 0 True 387 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 431 400 0.0101383274945269 0.0413786583648409 0.0100862134737163 0.042374303807126 0.00162775770085326 0.00780910686034113 443165 1803314 667 665 0 True 431 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 476 398 0.010191859895184 0.0497434017637364 0.0101319905394064 0.050614175631342 0.00177689023568817 0.0096295341958305 445505 2167856 667 665 0 True 476 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 518 398 0.0105150674834247 0.0393655918234588 0.0104829480430304 0.0410772869459068 0.00184801221235337 0.00650113664786324 459633 1715583 667 665 0 True 521 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 564 397 0.0103863380738104 0.0501170757059736 0.0104829480430304 0.0504005493247883 0.00185359294609544 0.00843213136565081 454006 2184141 667 665 0 True 565 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 607 398 0.010135033192948 0.0456132090354061 0.0100862134737163 0.0473640039673457 0.00211083238511856 0.00888265001307259 443021 1987859 667 665 0 True 610 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 652 397 0.0102551836922006 0.0866389136035328 0.0103761348897536 0.0841382467383841 0.00193761820963586 0.0209636169002693 448273 3775791 667 665 0 True 655 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 255 445 0.0098941831441798 0.0417263575510073 0.00984206912336919 0.0423285267414359 0.0014574080052311 0.00607039822257258 432493 1818467 667 665 0 True 253 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 299 445 0.0101296799528823 0.0468148627462453 0.0101625085831998 0.0461127641718166 0.00151390952496715 0.00625683611090965 442787 2040228 667 665 0 True 298 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 344 444 0.0103243411482631 0.0337787705702801 0.0102998397802701 0.0339360646982528 0.00140241506161936 0.002943427446513 451296 1472105 667 665 0 True 342 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 388 445 0.0103228998913224 0.0524797688889195 0.0103608758678569 0.0513313496604868 0.00160163177187957 0.00940225303012237 451233 2287109 667 665 0 True 387 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 432 445 0.0105909279281165 0.0925581750209812 0.010605020218204 0.091783016708629 0.00186380935414143 0.0148317842314645 462949 4033757 667 665 0 True 432 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 476 442 0.0105798096602877 0.0564127416274722 0.0105439841306172 0.0574807354848554 0.00181761984801695 0.0142095680234684 462463 2458511 667 665 0 True 476 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 520 442 0.0105362974269331 0.0499399104306888 0.0104219119554437 0.0506904707408255 0.0021039162765866 0.010206269958105 460561 2176420 667 665 0 True 521 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 563 442 0.0102622527143386 0.0327503124944428 0.0101777676050965 0.0330205233844511 0.00208921258102307 0.00472921744541991 448582 1427284 667 665 0 True 566 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 609 443 0.010319880114875 0.0400892365957237 0.0104371709773404 0.0404974441138323 0.00197472421732683 0.00448659658500745 451101 1747120 667 665 0 True 610 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 652 442 0.0101654826054585 0.0776171373730733 0.0102235446707866 0.0787975890745403 0.00199154758422745 0.0178604581900235 444352 3382615 667 665 0 True 655 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 256 488 0.00960348390693644 0.0496409024392063 0.00962844281681544 0.0504005493247883 0.0015571461282978 0.0112581754326174 419786 2163389 667 665 0 True 253 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 301 489 0.0102550006754462 0.0509217424426252 0.0101777676050965 0.0507057297627222 0.00163306888189584 0.00649863254909846 448265 2219209 667 665 0 True 298 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 343 487 0.0105359085163301 0.0637102483836049 0.0104982070649271 0.0618142977035172 0.00161336047110114 0.0135282559850842 460544 2776542 667 665 0 True 342 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 389 488 0.0105942451067897 0.0835792158354228 0.010605020218204 0.0786602578774701 0.00163049190777172 0.0173492896663035 463094 3642447 667 665 0 True 387 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 432 487 0.0107549795713267 0.0951500747749438 0.0107728694590677 0.0899061570153353 0.00187303179718103 0.0290553173849203 470120 4146714 667 665 0 True 432 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 477 486 0.0106404110830829 0.0467736519141755 0.0107270923933776 0.0469367513542382 0.00189051802341139 0.0108073933564132 465112 2038432 667 665 0 True 476 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 520 486 0.0107558717780043 0.0434300445551966 0.010757610437171 0.0443579766536965 0.00178555624796942 0.00613500774477649 470159 1892715 667 665 0 True 521 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 565 486 0.0104478088261889 0.109398054532073 0.0104982070649271 0.11288624399176 0.00190916258041746 0.0258757544253381 456693 4767652 667 665 0 True 566 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 609 486 0.0102971402831429 0.0668218956638564 0.0103913939116503 0.0667277027542535 0.00187399863136534 0.0197757452555302 450107 2912150 667 665 0 True 610 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 653 486 0.0101654368512699 0.0758830929463737 0.0102235446707866 0.0725261310749981 0.00186429254393334 0.0131626356181159 444350 3307044 667 665 0 True 655 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 256 533 0.00998123048798329 0.0448710469237869 0.0100099183642329 0.047501335164416 0.00151871195365287 0.00881144875146817 436298 1955515 667 665 0 True 253 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 300 532 0.0101335004276301 0.093395769120673 0.00994888227664607 0.0867933165484092 0.00155693885929356 0.0222447548402752 442954 4070260 667 665 0 True 298 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 344 532 0.0103299917905547 0.0547409035291364 0.0103303578240635 0.0571450370031281 0.0015508720261228 0.0107559385968557 451543 2385651 667 665 0 True 342 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 388 531 0.0104700682389407 0.057895253124801 0.0104982070649271 0.0571297779812314 0.00156678936387661 0.00706085782224563 457666 2523120 667 665 0 True 387 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 434 532 0.0106821617801765 0.0560250706877058 0.0105897611963073 0.0557259479667353 0.0019218149095962 0.00819394277139548 466937 2441616 667 665 0 True 432 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 476 529 0.0106783184283345 0.0649354445853705 0.0106965743495842 0.0629129472800793 0.0020559685697987 0.0149643220352295 466769 2829937 667 665 0 True 476 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 521 529 0.0105386995218344 0.0733586770772204 0.0105745021744106 0.0711375600823987 0.00189924782702028 0.0165488156830458 460666 3197028 667 665 0 True 521 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 565 529 0.0214844740596056 0.0581066536792886 0.0110475318532082 0.0593575951781491 0.0423387542878635 0.0122046023908127 939126 2532333 667 665 0 True 566 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 608 528 0.033081262069812 0.0504361613578464 0.0108186465247578 0.0489356832227054 0.0653710613580482 0.0104066817317647 1446043 2198047 667 665 0 True 610 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 652 528 0.0102166586654029 0.0674296636532967 0.01025406271458 0.0677500572213321 0.00190455372640372 0.0165474250909422 446589 2938637 667 665 0 True 655 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 257 576 0.0096245537107848 0.0381289456187964 0.00956740672922866 0.0394140535591669 0.001318651705386 0.00767344488922794 420707 1661689 667 665 0 True 253 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 299 575 0.00990957942864228 0.050192980735198 0.00987258716716258 0.0507209887846189 0.00148130646985181 0.00899210775415766 433166 2187449 667 665 0 True 298 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 344 574 0.0100838113788151 0.043058298068357 0.010101472495613 0.0427862973983368 0.00150788007695229 0.00705005366051808 440782 1876514 667 665 0 True 343 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 389 575 0.0101335461818187 0.0519223441987895 0.0101319905394064 0.0489814602883955 0.00153037760021544 0.00995942773263154 442956 2262816 667 665 0 True 387 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 432 573 0.0101946051464998 0.0892140169604602 0.0101625085831998 0.0836041809719997 0.00198287479124249 0.0199261616323606 445625 3888016 667 665 0 True 432 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 476 572 0.010153540762235 0.0632329737137534 0.010101472495613 0.06323338673991 0.00209689783558009 0.0114908569038736 443830 2755742 667 665 0 True 477 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 520 572 0.0102252375757646 0.0536615743983442 0.0102388036926833 0.0534981307698177 0.00214713940127758 0.00720596111782255 446964 2338613 667 665 0 True 521 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 564 572 0.0103181185786141 0.0388439168417725 0.0103456168459602 0.040161745632105 0.00194195760130537 0.0087566574562094 451024 1692848 667 665 0 True 566 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 609 571 0.011869460097143 0.0462078749173231 0.0106507972838941 0.0467994201571679 0.00757169384718388 0.00674123633498246 518836 2013775 667 665 0 True 611 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 652 571 0.0104160554193034 0.0386267109751949 0.0104219119554437 0.0366979476615549 0.00178941701773536 0.00830682685120844 455305 1683382 667 665 0 True 655 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 253 614 0.00933790371923217 0.00930703962928608 0.00926222629129473 0.00927748531319142 0.00136658333572042 0.00131830392591609 408177 405608 667 665 0 False 253 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 298 614 0.00968886122285618 0.00953262074848371 0.00968947890440223 0.00946059357595178 0.00130044831448975 0.00150462619426467 423518 415439 667 665 0 False 298 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 343 617 0.00993842744455193 0.0665962915987612 0.00988784618905928 0.0645609216449226 0.00147421467464828 0.00928982158736548 434427 2902318 667 665 0 True 343 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 388 617 0.00991756353455225 0.0735826519835868 0.00997940032043946 0.0718547341115434 0.0013967927338486 0.017268838455062 433515 3206789 667 665 0 True 387 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 432 614 0.009983358057753 0.00971639444227415 0.00997940032043946 0.00971999694819562 0.0018829953379557 0.00192966048333659 436391 423448 667 665 0 False 432 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 477 614 0.00976517920943397 0.00970643592272051 0.00970473792629892 0.00976577401388571 0.00191323424874477 0.0019875298117346 426854 423014 667 665 0 False 477 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 521 614 0.00962473672753918 0.00965480765314522 0.00968947890440223 0.00978103303578241 0.00201175930793917 0.00198261190951093 420715 420764 667 665 0 False 521 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 566 614 0.0097517274779868 0.0096563220823861 0.00978103303578241 0.00970473792629892 0.00186837578799704 0.00181594489798801 426266 420830 667 665 0 False 566 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 611 614 0.00984385353672443 0.00952162966353857 0.0098268101014725 0.00949111161974517 0.00157805479474966 0.00147232674888723 430293 414960 667 665 0 False 611 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 655 613 0.00984097102284289 0.0100226074455996 0.00985732814526589 0.0100251773861295 0.00154611684260412 0.0016104762205823 430167 436793 667 665 0 False 655 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 253 664 0.00941422170580995 0.0383281619016642 0.00941481651026169 0.0382696269169146 0.00129770030074644 0.00711789507026596 411513 1670371 667 665 0 True 253 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 298 658 0.00959092438216689 0.00930095896642499 0.00956740672922866 0.0093690394445716 0.00126546873857857 0.00130125281226215 419237 405343 667 665 0 False 298 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 343 658 0.00954597089187153 0.00965460114006692 0.00961318379491875 0.00965896086060884 0.00124160136603291 0.0012520006564321 417272 420755 667 665 0 False 343 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 387 658 0.00958207094667361 0.00946371421802389 0.00962844281681544 0.00943007553215839 0.00133011251633457 0.00130116951998172 418850 412436 667 665 0 False 387 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 432 657 0.00961647809649764 0.00965854783445223 0.00971999694819562 0.00965896086060884 0.0015282867404562 0.00156557767200929 420354 420927 667 665 0 False 432 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 477 657 0.00940664938759734 0.00944157142685048 0.00946059357595178 0.00944533455405508 0.00167602547676952 0.00157488424226791 411182 411471 667 665 0 False 477 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 521 657 0.00934138103756545 0.00942748264573083 0.0093690394445716 0.00959792477302205 0.00182017394081628 0.00171361696357134 408329 410857 667 665 0 False 521 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 566 657 0.00952663974718981 0.00971166758737081 0.00955214770733196 0.00973525597009232 0.00158456157954778 0.00157707052069615 416427 423242 667 665 0 False 566 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 611 657 0.00954937957892192 0.00954810922935629 0.00953688868543526 0.00958266575112535 0.00142107206038447 0.00150630298825641 417421 416114 667 665 0 False 611 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 650 661 0.0097506751316491 0.0422863751275649 0.00973525597009232 0.0419012741283284 0.00157530807378777 0.00930563406944349 426220 1842873 667 665 0 True 655 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B11_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B11_2.csv new file mode 100755 index 0000000..65712d1 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B11_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 253 267 0.00883643781222229 0.753570215307093 0.00869764248111696 0.759731441214618 0.00213469327199506 0.173980594397872 386257 32841174 667 665 12 True 253 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 297 266 0.00704404035107647 0.00669079427798152 0.00683604180972 0.00665293354695964 0.00158143926684339 0.00130914697705192 307908 291590 667 665 0 False 297 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 341 267 0.00648718899877139 0.00667188685836817 0.00648508430609598 0.00669871061264973 0.00118357749436422 0.00130032374146423 283567 290766 667 665 0 True 342 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 385 267 0.00635651503614181 0.00650123821799865 0.0063935301747158 0.00650034332799268 0.00126210652707497 0.00131325428268407 277855 283329 667 665 0 True 387 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 430 266 0.00633658908700834 0.0065508472485861 0.00630197604333562 0.00643930724040589 0.00157684409768067 0.00153349995691944 276984 285491 667 665 0 True 431 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 473 265 0.00659391064367107 0.00681791455062467 0.00659189745937285 0.00688181887541009 0.00164156504093379 0.00166433637173733 288232 297130 667 665 0 True 476 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 518 266 0.00699775998931182 0.00723052768107038 0.00692759594110018 0.00721751735713741 0.00165192781734927 0.0016099561401536 305885 315112 667 665 0 True 521 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 562 265 0.00727388651748742 0.00699487331283117 0.00732433051041428 0.00692759594110018 0.00165917505592283 0.00149683778146417 317955 304842 667 665 0 True 565 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 610 266 0.0130627750899098 0.00843204371652409 0.00863660639353018 0.00848401617456321 0.0240640163468342 0.00199608712568256 570998 367475 667 665 0 False 610 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 655 266 0.0513857971449158 0.577161213860928 0.0108339055466545 0.720851453421836 0.125283976846243 0.375889002172303 2246168 25153133 667 665 14 False 655 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 253 310 0.00713545721989086 0.00687672488614532 0.00708018616006714 0.00685130083161669 0.00167098344639259 0.00134227726956156 311904 299693 667 665 0 False 253 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 297 310 0.00658963262703736 0.00646443299826586 0.00656137941557946 0.00650034332799268 0.00132130366784866 0.00128724626884166 288045 281725 667 665 0 False 297 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 342 311 0.00647698581471452 0.00678863558530109 0.00654612039368277 0.00663767452506294 0.00124836599468436 0.00158480037770401 283121 295854 667 665 0 True 342 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 386 312 0.00646815525631554 0.00663772041685812 0.00653086137178607 0.00666819256885634 0.00133423911041623 0.00123232938943345 282735 289277 667 665 0 True 387 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 430 311 0.0067859638503019 0.00666968405219962 0.00677500572213321 0.00671396963454643 0.00159079267741752 0.00172794620285221 296627 290670 667 665 0 True 431 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 475 310 0.0068588273956407 0.00682291675629908 0.00692759594110018 0.00683604180972 0.00174305388822022 0.00166351239744994 299812 297348 667 665 0 True 476 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 518 310 0.00708366347840042 0.00727047648877286 0.00708018616006714 0.00727855344472419 0.00155839038215628 0.00161654447093654 309640 316853 667 665 0 True 521 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 563 309 0.00726256235580996 0.00717997786868178 0.00727855344472419 0.00718699931334401 0.00168615853441859 0.00140761388053371 317460 312909 667 665 0 True 565 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 610 309 0.00781637105457342 0.00765934061521393 0.00793469138628214 0.007690547035935 0.00198356159708301 0.00201673164523031 341668 333800 667 665 0 False 610 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 655 309 0.00819402612724309 0.007973837087569 0.00819409475852598 0.00788891432059205 0.00217399399542261 0.00194081587679678 358176 347506 667 665 0 False 655 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 255 357 0.006396847353389 0.0064551628556399 0.0064087891966125 0.00650034332799268 0.00140970477905553 0.00147534204486388 279618 281321 667 665 0 True 253 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 299 356 0.00638234327560413 0.00657693673414481 0.00636301213092241 0.00645456626230259 0.00133915524312643 0.00170105375048589 278984 286628 667 665 0 True 297 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 343 356 0.00664192966460235 0.00656532610996477 0.00671396963454643 0.00654612039368277 0.00128675384673414 0.00136911659922902 290331 286122 667 665 0 True 342 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 387 357 0.00670712938335136 0.00682229721706418 0.00677500572213321 0.00679026474402991 0.00134288087856688 0.00132690498953144 293181 297321 667 665 0 True 387 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 432 356 0.00690652613725181 0.00717463147454353 0.00695811398489357 0.00721751735713741 0.00158762502159798 0.00160261236140654 301897 312676 667 665 0 True 431 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 476 354 0.00707652582497948 0.00701414786680595 0.00714122224765393 0.00708018616006714 0.00169841221501525 0.00162903379428244 309328 305682 667 665 0 True 476 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 519 354 0.00714680425866261 0.00720696224424646 0.00717174029144732 0.0072632944228275 0.00171707386064959 0.00162110296799962 312400 314085 667 665 0 True 521 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 564 355 0.00725162710473557 0.00733162730584759 0.00727855344472419 0.00740062561989776 0.00171416514470994 0.00167360511129959 316982 319518 667 665 0 True 565 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 607 353 0.00823392377969862 0.00761477968209606 0.00735484855420768 0.00761425192645151 0.00758126546250453 0.00230526001479321 359920 331858 667 665 0 True 610 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 652 354 0.00925444807923344 0.00720411695294542 0.00721751735713741 0.00721751735713741 0.0128778671680922 0.00198884298006556 404529 313961 667 665 0 True 655 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 255 401 0.00636914319219424 0.00622191780664754 0.00643930724040589 0.00622568093385214 0.00149398732752856 0.00153294998654448 278407 271156 667 665 0 True 253 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 299 400 0.00658848877232247 0.00638104760642738 0.00663767452506294 0.00631723506523232 0.00127939656136132 0.00133830506189977 287995 278091 667 665 0 True 297 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 343 400 0.00677985566612437 0.00667358485478976 0.00686655985351339 0.00669871061264973 0.0013399789938613 0.00128192254134385 296360 290840 667 665 0 True 342 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 387 400 0.00696131677809527 0.00684907507955056 0.00694285496299687 0.00686655985351339 0.00141818591736709 0.00142169628698779 304292 298488 667 665 0 True 387 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 431 400 0.00712161657784063 0.00703989316390083 0.00712596322575723 0.00701915007248035 0.00158630945900242 0.0015879882677409 311299 306804 667 665 0 True 431 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 476 398 0.00723080894892449 0.00697458913936248 0.0072632944228275 0.00709544518196384 0.00164114250251116 0.0017358840074428 316072 303958 667 665 0 True 476 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 518 398 0.00724016568049232 0.00711334298208327 0.00727855344472419 0.00715648126955062 0.00179410131193253 0.00182907578037173 316481 310005 667 665 0 True 521 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 564 397 0.00715538316902432 0.00752600200432415 0.0072480354009308 0.00761425192645151 0.00173483180413349 0.00157874605571354 312775 327989 667 665 0 True 565 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 607 398 0.00700816906721736 0.00728842018068747 0.00697337300679027 0.00732433051041428 0.00189273727092407 0.00199126769263755 306340 317635 667 665 0 True 610 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 652 397 0.00667976837857107 0.00671686081764264 0.00671396963454643 0.00675974670023652 0.00200479266046355 0.00169144898393016 291985 292726 667 665 0 True 655 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 255 445 0.00642786869325694 0.00639786694936013 0.0064087891966125 0.00643930724040589 0.00152913235504915 0.00151056648066111 280974 278824 667 665 0 True 253 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 299 445 0.00658807698462511 0.0068565095503694 0.00662241550316625 0.00689707789730678 0.00143394585025209 0.00154091816044751 287977 298812 667 665 0 True 298 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 344 444 0.00672440158954627 0.00707415138900123 0.00671396963454643 0.00715648126955062 0.00140285768123543 0.00140994884425754 293936 308297 667 665 0 True 342 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 388 445 0.00705616521105435 0.00700586439777631 0.00708018616006714 0.00714122224765393 0.0015485096723608 0.00147259507695116 308438 305321 667 665 0 True 387 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 432 445 0.00701995077078078 0.00730292198796373 0.00703440909437705 0.00741588464179446 0.00172162749060916 0.00185115316472606 306855 318267 667 665 0 True 432 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 476 442 0.00726860190870461 0.00711364127875193 0.00730907148851759 0.00711070420386053 0.00171903525804476 0.00190436930165239 317724 310018 667 665 0 True 476 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 520 442 0.00706028308802797 0.0070313802358953 0.00706492713817044 0.00708018616006714 0.00171996647265982 0.00168160534528294 308618 306433 667 665 0 True 521 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 563 442 0.00685040862493908 0.00677551053188017 0.00689707789730678 0.0068055237659266 0.00191389898051889 0.00183311940336816 299444 295282 667 665 0 True 566 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 609 443 0.00647559031196235 0.00654784133600194 0.00663767452506294 0.00656137941557946 0.00177713379502977 0.00176020790066358 283060 285360 667 665 0 True 610 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 652 442 0.00658279237584229 0.00661580708466061 0.00660715648126955 0.00665293354695964 0.00193087415901206 0.00188491602598053 287746 288322 667 665 0 True 655 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 256 488 0.00621371621353434 0.00655975025685064 0.00630197604333562 0.00662241550316625 0.00140625251232447 0.00147015674196521 271613 285879 667 665 0 True 253 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 301 489 0.00656346123116057 0.0063707678443075 0.00659189745937285 0.00628671702143893 0.00143747644603774 0.00146946005350834 286901 277643 667 665 0 True 298 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 343 487 0.00685178125059695 0.0066977239390534 0.00679026474402991 0.00677500572213321 0.00152952486262907 0.0015379380568406 299504 291892 667 665 0 True 342 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 389 488 0.0070751989535102 0.007176168849682 0.00711070420386053 0.00712596322575723 0.00152055728970792 0.00161354917438947 309270 312743 667 665 0 True 387 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 432 487 0.00721843244090932 0.00739484325370533 0.0072327763790341 0.00743114366369116 0.0019278208369663 0.00193441802853621 315531 322273 667 665 0 True 432 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 477 486 0.00725528743982323 0.00714009789867206 0.00721751735713741 0.00720225833524071 0.00184434282451757 0.00188067792341337 317142 311171 667 665 0 True 476 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 520 486 0.00677756795669458 0.00672950400721419 0.00677500572213321 0.00677500572213321 0.00173410088589897 0.0016464234892315 296260 293277 667 665 0 True 521 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 565 486 0.00655190829854013 0.00670196893010737 0.00660715648126955 0.0068207827878233 0.00181244060727058 0.00175341927733274 286396 292077 667 665 0 True 566 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 609 486 0.00657785092347395 0.0065644312199588 0.00654612039368277 0.00651560234988937 0.00183707964468909 0.00160853742484452 287530 286083 667 665 0 True 610 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 653 486 0.0066848699705995 0.00654818552446578 0.00663767452506294 0.00657663843747616 0.00172994995811423 0.00171822887592078 292208 285375 667 665 0 True 655 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 256 533 0.00658018438709233 0.0064060586347994 0.00657663843747616 0.00646982528419928 0.00138412748388778 0.00152895434960308 287632 279181 667 665 0 True 253 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 300 532 0.00635319785746861 0.00629926842742012 0.0063782711528191 0.00633249408712902 0.00142537297535435 0.00145928356275907 277710 274527 667 665 0 True 298 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 344 532 0.0065011669033874 0.00656188422532642 0.00660715648126955 0.00657663843747616 0.00134175158209568 0.00141479267030527 284178 285972 667 665 0 True 342 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 388 531 0.00659777687260741 0.00692055155054035 0.00657663843747616 0.00692759594110018 0.0014616977698463 0.00157789091830676 288401 301603 667 665 0 True 387 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 434 532 0.00673863114219956 0.00671456622788374 0.00671396963454643 0.00669871061264973 0.00190124126518354 0.00193716589011891 294558 292626 667 665 0 True 432 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 476 529 0.00718640450889227 0.00734291668746139 0.0072632944228275 0.00735484855420768 0.00200387280148919 0.00192658189917344 314131 320010 667 665 0 True 476 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 521 529 0.00691734700285472 0.0070322062882085 0.00685130083161669 0.00703440909437705 0.00191125832877793 0.00181347438728229 302370 306469 667 665 0 True 521 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 565 529 0.0135352099642557 0.00672144999716044 0.00698863202868696 0.00677500572213321 0.0237914670328047 0.00174096727185307 591649 292926 667 665 0 True 566 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 608 528 0.0205231099259251 0.0066797573012412 0.00729381246662089 0.00663767452506294 0.0365471687419532 0.00171046300918263 897103 291109 667 665 0 True 610 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 652 528 0.00669367765190419 0.00671851292226905 0.00669871061264973 0.00662241550316625 0.00191397692616623 0.00199479154285555 292593 292798 667 665 0 True 655 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 257 576 0.00687497862421502 0.00663161680809944 0.00686655985351339 0.00663767452506294 0.00122035751772112 0.00131520504553598 300518 289011 667 665 0 True 253 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 299 575 0.00672213675721077 0.00670469949192046 0.00666819256885634 0.00674448767833982 0.00141158802357755 0.00142743034446733 293837 292196 667 665 0 True 298 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 344 574 0.00655026114775068 0.00680460593002304 0.00657663843747616 0.00686655985351339 0.00139764028469261 0.00140847953317965 286324 296550 667 665 0 True 343 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 389 575 0.00652559964009755 0.00666511781857941 0.00653086137178607 0.00663767452506294 0.00133849273327813 0.0012531340563685 285246 290471 667 665 0 True 387 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 432 573 0.00673769318133334 0.00674425821936393 0.00675974670023652 0.0068207827878233 0.00181557845365505 0.00184796960218438 294517 293920 667 665 0 True 432 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 476 572 0.0067022794393602 0.00658097521212048 0.00683604180972 0.00654612039368277 0.00198344929961967 0.0018283032312771 292969 286804 667 665 0 True 477 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 520 572 0.00692100733794238 0.00689120374752399 0.00695811398489357 0.00691233691920348 0.00205776147720925 0.00199697704751794 302530 300324 667 665 0 True 521 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 564 572 0.00697762814632967 0.00737065827764651 0.00694285496299687 0.00732433051041428 0.00197612807461981 0.00181992110495764 305005 321219 667 665 0 True 566 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 609 571 0.00818860425589448 0.00706986050615208 0.00712596322575723 0.00700389105058366 0.006403816555367 0.00165781527575189 357939 308110 667 665 0 True 611 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 652 571 0.00703514116139458 0.00735698252268345 0.00703440909437705 0.00727855344472419 0.00162925332556775 0.00160738832032795 307519 320623 667 665 0 True 655 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 253 614 0.00699133152581411 0.00665591651364621 0.00701915007248035 0.00669871061264973 0.00138168401335932 0.00130197847653181 305604 290070 667 665 0 False 253 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 298 614 0.00674242873985301 0.00660318684098665 0.00674448767833982 0.00662241550316625 0.00133434308560951 0.00147704468364661 294724 287772 667 665 0 False 298 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 343 617 0.00661658184412028 0.00653239874692453 0.00659189745937285 0.00657663843747616 0.00135955359111674 0.00139719372013218 289223 284687 667 665 0 True 343 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 388 617 0.00636568875095526 0.00660364575893843 0.0063782711528191 0.00663767452506294 0.00133346804454236 0.0012817518021465 278256 287792 667 665 0 True 387 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 432 614 0.00661603279385713 0.00637060722302437 0.00654612039368277 0.00642404821850919 0.00185325981436374 0.00179912077084847 289199 277636 667 665 0 False 432 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 477 614 0.00658606380032689 0.00665600829723657 0.00659189745937285 0.00671396963454643 0.00195804201938745 0.00197621384981695 287889 290074 667 665 0 False 477 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 521 614 0.00645898154150208 0.00662978113629232 0.0064087891966125 0.00663767452506294 0.00192440793338533 0.0019650757503646 282334 288931 667 665 0 False 521 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 566 614 0.00653912000282761 0.00642216665490689 0.00656137941557946 0.0063935301747158 0.00172547552734297 0.00179797410114073 285837 279883 667 665 0 False 566 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 611 614 0.00684807516132069 0.00668099637971101 0.00685130083161669 0.00669871061264973 0.00144934652199267 0.00135032796055115 299342 291163 667 665 0 False 611 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 655 613 0.00727715794197202 0.00714762415308126 0.00735484855420768 0.00715648126955062 0.00153260115952924 0.00149793083875077 318098 311499 667 665 0 False 655 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 253 664 0.0092135895888174 0.751716989888317 0.00865186541542687 0.749355306324865 0.00255758088895836 0.176137987992723 402743 32760409 667 665 12 True 253 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 298 658 0.00703308222290777 0.0066872835556504 0.00695811398489357 0.00674448767833982 0.0015726495617125 0.00128046225215672 307429 291437 667 665 0 False 298 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 343 658 0.00622984456501436 0.00624993474760373 0.00630197604333562 0.00625619897764553 0.0012496804388187 0.00124517984596236 272318 272377 667 665 0 False 343 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 387 658 0.00622195196748158 0.00618527320819788 0.00628671702143893 0.00614938582436866 0.00126925377418212 0.00113855435448966 271973 269559 667 665 0 False 387 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 432 657 0.00640977291166731 0.00633281532969526 0.0063935301747158 0.00633249408712902 0.00152882722273693 0.00148358292373329 280183 275989 667 665 0 False 432 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 477 657 0.00639947821923325 0.00635938667910334 0.00636301213092241 0.00633249408712902 0.00162754051626583 0.00151815762318741 279733 277147 667 665 0 False 477 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 521 657 0.00633722964564868 0.00640826144096795 0.00634775310902571 0.0063935301747158 0.00166684863061334 0.00159862306233543 277012 279277 667 665 0 False 521 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 566 657 0.00641066511834492 0.00656293973661551 0.00642404821850919 0.00653086137178607 0.00150449206382061 0.00150243591445078 280222 286018 667 665 0 False 566 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 611 657 0.00799973096537106 0.00714725701871984 0.00733958953231098 0.00720225833524071 0.00370121779899254 0.00147694262963866 349683 311483 667 665 0 False 611 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 650 661 0.00893105747423839 0.776545552482718 0.00881971465629053 0.785061417563134 0.00177497100756216 0.185336040663357 390393 33842457 667 665 16 True 655 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B11_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B11_3.csv new file mode 100755 index 0000000..697d5d5 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B11_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 253 267 0.00112504974338191 0.0775172309349707 0.000900282291905089 0.0764629587243458 0.000905041414219063 0.0211966949763776 49178 3378261 667 665 0 True 253 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 297 266 0.000976623155577167 0.00106556159223878 0.000854505226215 0.000976577401388571 0.000713774074198495 0.000699517840527724 42690 46438 667 665 0 False 297 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 341 267 0.000902318353297602 0.00095581136407051 0.000793469138628214 0.00080872816052491 0.000651219586487748 0.000715491239434341 39442 41655 667 665 0 True 342 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 385 267 0.000986940725105518 0.0010195550675728 0.000869764248111696 0.000885023270008392 0.000693832480165365 0.000685810193171205 43141 44433 667 665 0 True 387 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 430 266 0.00102667823790096 0.000959620383070287 0.00080872816052491 0.000717174029144732 0.000839870401498747 0.000854785399971981 44878 41821 667 665 0 True 431 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 473 265 0.000886716174986437 0.00106900347687713 0.000595101853971161 0.000823987182421607 0.000879648937451511 0.000953811773274599 38760 46588 667 665 0 True 476 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 518 266 0.000918034917080256 0.000996930412550029 0.000732433051041428 0.00080872816052491 0.000815550467281678 0.000871138083031226 40129 43447 667 665 0 True 521 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 562 265 0.000996777875653613 0.00106774145250974 0.000747692072938125 0.000854505226215 0.000894295546029993 0.00085283193118896 43571 46533 667 665 0 True 565 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 610 266 0.00149961640832136 0.00107506119384063 0.000854505226215 0.000778210116731518 0.00247395963913348 0.000981771741511361 65551 46852 667 665 0 False 610 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 655 266 0.00526850330842818 0.0602456473066392 0.0012817578393225 0.0718547341115434 0.0125624337592462 0.0407615303828179 230296 2625552 667 665 0 False 655 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 253 310 0.00103708731580651 0.000941607853462909 0.000869764248111696 0.000793469138628214 0.000781411529885372 0.000762981705083303 45333 41036 667 665 0 False 253 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 297 310 0.000972619664075035 0.000972263572641836 0.000839246204318303 0.000854505226215 0.000707309220811292 0.000705550213319544 42515 42372 667 665 0 False 297 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 342 311 0.00097332885399827 0.00100486969311583 0.000869764248111696 0.000839246204318303 0.000687039900332072 0.000764722492709139 42546 43793 667 665 0 True 342 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 386 312 0.000963743351487451 0.000923067568210983 0.000839246204318303 0.000823987182421607 0.000690404752276412 0.000657097024693168 42127 40228 667 665 0 True 387 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 430 311 0.000957955446630084 0.000984723195032672 0.000671396963454643 0.000717174029144732 0.000874716007527068 0.00092712445883154 41874 42915 667 665 0 True 431 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 475 310 0.000906184582233946 0.00101294664906716 0.000671396963454643 0.00080872816052491 0.000858060977238036 0.000916670553327187 39611 44145 667 665 0 True 476 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 518 310 0.00101901441131117 0.00104839806084219 0.00080872816052491 0.000854505226215 0.000879055507722152 0.000884877634566883 44543 45690 667 665 0 True 521 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 563 309 0.000996388965050549 0.000928551637734758 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.000950745971656451 0.00080982634111272 43554 40467 667 665 0 True 565 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 610 309 0.00107723661629931 0.00103433222562013 0.000717174029144732 0.000656137941557946 0.00111003901918909 0.0011017559872688 47088 45077 667 665 0 False 610 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 655 309 0.00108178915806459 0.00105732401500432 0.00080872816052491 0.000747692072938125 0.00102932115999941 0.00101854217669755 47287 46079 667 665 0 False 655 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 255 357 0.000900648325413855 0.000887983290797376 0.000747692072938125 0.000686655985351339 0.000752350236263587 0.000771424308919596 39369 38699 667 665 0 True 253 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 299 356 0.00107048787348143 0.000957279901516208 0.000946059357595178 0.000778210116731518 0.000761551355661007 0.000776251947163319 46793 41719 667 665 0 True 297 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 343 356 0.00097332885399827 0.000844959732817968 0.000854505226215 0.000747692072938125 0.000707547962822383 0.000677640446460592 42546 36824 667 665 0 True 342 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 387 357 0.000987375389897178 0.000972607761105671 0.000854505226215 0.000854505226215 0.000715172896548415 0.000711122759230295 43160 42387 667 665 0 True 387 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 432 356 0.0009066878783085 0.000973296138033342 0.00064087891966125 0.000717174029144732 0.000810119328426934 0.000907719345359075 39633 42417 667 665 0 True 431 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 476 354 0.000953036871356036 0.000999110272820986 0.000686655985351339 0.000717174029144732 0.000878796452358427 0.000871003427833844 41659 43542 667 665 0 True 476 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 519 354 0.00105577790184789 0.000995393037411565 0.000869764248111696 0.000793469138628214 0.000927019402137344 0.000898743576966101 46150 43380 667 665 0 True 521 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 564 355 0.000924692151520944 0.00102538332556041 0.00064087891966125 0.000717174029144732 0.000935593892405261 0.000975294061477266 40420 44687 667 665 0 True 565 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 607 353 0.00106900086235207 0.000977357561906598 0.000625619897764553 0.000518806744487678 0.00128045043224177 0.00110317307674273 46728 42594 667 665 0 True 610 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 652 354 0.0012567302981606 0.00105463934498641 0.000778210116731518 0.000656137941557946 0.00159420772263854 0.00105924731669062 54934 45962 667 665 0 True 655 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 255 401 0.00101205977464461 0.00089908910523046 0.000900282291905089 0.000717174029144732 0.000802039685779116 0.000781814832249835 44239 39183 667 665 0 True 253 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 299 400 0.000999225724743488 0.000956912767154783 0.000854505226215 0.000823987182421607 0.000788561471529127 0.000727648156200557 43678 41703 667 665 0 True 297 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 343 400 0.000933088045128271 0.000983920088617057 0.000762951094834821 0.000900282291905089 0.000737723576119181 0.000704827586568472 40787 42880 667 665 0 True 342 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 387 400 0.000983920948658196 0.000973410867521287 0.000778210116731518 0.00080872816052491 0.000811513832236505 0.000786743379628478 43009 42422 667 665 0 True 387 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 431 400 0.000923868576126219 0.000909437705043107 0.000701915007248035 0.00064087891966125 0.000810627826426231 0.000855044612369521 40384 39634 667 665 0 True 431 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 476 398 0.000980260613570532 0.00108740608674352 0.000701915007248035 0.000839246204318303 0.000907132760770346 0.00096971053189509 42849 47390 667 665 0 True 476 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 518 398 0.00102965226015969 0.000919533899982274 0.000793469138628214 0.000549324788281071 0.000908311907122369 0.000950692792366701 45008 40074 667 665 0 True 521 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 564 397 0.000993254803131737 0.000971391628533453 0.000701915007248035 0.000839246204318303 0.000962133844762838 0.0007937050037226 43417 42334 667 665 0 True 565 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 607 398 0.00100437307096051 0.000977931209346323 0.000595101853971161 0.000686655985351339 0.00109049921048353 0.00104022397328407 43903 42619 667 665 0 True 610 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 652 397 0.00101157935566435 0.000918799631259426 0.000671396963454643 0.000579842832074464 0.00104218931560113 0.000922345812441248 44218 40042 667 665 0 True 655 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 255 445 0.000990097764118627 0.000925362157969885 0.000778210116731518 0.000732433051041428 0.00089224179619948 0.000824975077249613 43279 40328 667 665 0 True 253 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 299 445 0.000993826730489185 0.000961823189238833 0.000823987182421607 0.000839246204318303 0.00083552242257953 0.000797592497251504 43442 41917 667 665 0 True 298 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 344 444 0.00106021605814168 0.000993786824580334 0.000946059357595178 0.000869764248111696 0.000764910179644725 0.000764585875876659 46344 43310 667 665 0 True 342 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 388 445 0.000865669248232373 0.000927220775674595 0.000732433051041428 0.00080872816052491 0.00073602001380503 0.00074448598009015 37840 40409 667 665 0 True 387 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 432 445 0.000940454469492194 0.00103449284690325 0.000671396963454643 0.000701915007248035 0.000923423054214945 0.00100462681099104 41109 45084 667 665 0 True 432 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 476 442 0.000929633603889289 0.000970382009039536 0.000625619897764553 0.000671396963454643 0.000930144563516913 0.000971149663192999 40636 42290 667 665 0 True 476 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 520 442 0.00100855957921703 0.000937041619842694 0.000762951094834821 0.000686655985351339 0.000933390256017265 0.000911744066813451 44086 40837 667 665 0 True 521 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 563 442 0.000961592904623449 0.000907326682464917 0.00064087891966125 0.000549324788281071 0.000971592446447909 0.000961299489402115 42033 39542 667 665 0 True 566 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 609 443 0.00100281742854826 0.000887203130279349 0.00064087891966125 0.000518806744487678 0.000997000168642912 0.000927811145196505 43835 38665 667 665 0 True 610 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 652 442 0.000955942262331869 0.000928643421325114 0.000564583810177768 0.000488288700694286 0.000978028340550966 0.00101458113947529 41786 40471 667 665 0 True 655 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 256 488 0.000933454078637038 0.00101723753191631 0.00080872816052491 0.000839246204318303 0.000777247523006745 0.000775268205372861 40803 44332 667 665 0 True 253 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 301 489 0.000956125279086252 0.00101393332266349 0.000793469138628214 0.000869764248111696 0.00079324996011942 0.000824671548595822 41794 44188 667 665 0 True 298 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 343 487 0.00103397603098199 0.000959345032299219 0.000869764248111696 0.000854505226215 0.000850342710902789 0.000826316908414427 45197 41809 667 665 0 True 342 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 389 488 0.000968730558044393 0.000990551453020282 0.000823987182421607 0.000823987182421607 0.000784586354976745 0.000861725072660184 42345 43169 667 665 0 True 387 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 432 487 0.00104836572329537 0.00100023462180285 0.000701915007248035 0.000595101853971161 0.00104373704737168 0.00105519008345275 45826 43591 667 665 0 True 432 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 477 486 0.000914168688143911 0.0010210236050185 0.000518806744487678 0.000701915007248035 0.000952214416923433 0.00100512415664343 39960 44497 667 665 0 True 476 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 520 486 0.000929198939097629 0.000920543519476191 0.000595101853971161 0.000610360875867857 0.000916120045991214 0.00087397159539615 40617 40118 667 665 0 True 521 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 565 486 0.000924989553746816 0.000968546337232415 0.000625619897764553 0.000595101853971161 0.000932369333511738 0.0010361357652028 40433 42210 667 665 0 True 566 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 609 486 0.0009240744699749 0.000996150252032003 0.000518806744487678 0.000671396963454643 0.000941546679941763 0.00095189347040824 40393 43413 667 665 0 True 610 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 653 486 0.00103786513701263 0.00102340997836776 0.000671396963454643 0.00064087891966125 0.00105644287951509 0.00101542561100286 45367 44601 667 665 0 True 655 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 256 533 0.000979482792364404 0.000920107547422 0.000854505226215 0.000701915007248035 0.000775525686054925 0.000801549835464176 42815 40099 667 665 0 True 253 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 300 532 0.000938166760062404 0.000862169156009731 0.000839246204318303 0.000701915007248035 0.00076549138246739 0.000756586951311879 41009 37574 667 665 0 True 298 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 344 532 0.000977492485160487 0.00091239772583209 0.000839246204318303 0.000778210116731518 0.000779559726995943 0.000757629919776022 42728 39763 667 665 0 True 342 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 388 531 0.000952030279206929 0.00103926559360177 0.000793469138628214 0.000900282291905089 0.000748047253408582 0.000837169995470682 41615 45292 667 665 0 True 387 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 434 532 0.000896644833911724 0.000938211860619734 0.000549324788281071 0.000686655985351339 0.000936467497147465 0.000970314261204395 39194 40888 667 665 0 True 432 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 476 529 0.00102779921552156 0.000933209654945329 0.000701915007248035 0.000518806744487678 0.00100417004729861 0.000989154733014527 44927 40670 667 665 0 True 476 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 521 529 0.00100471622737498 0.000935894324963244 0.000686655985351339 0.000625619897764553 0.00100441730652158 0.000922703375977763 43918 40787 667 665 0 True 521 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 565 529 0.00164097397398806 0.000932911358276671 0.000900282291905089 0.000595101853971161 0.00255168431396658 0.000954737015937735 71730 40657 667 665 0 True 566 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 608 528 0.00231008322801291 0.00096166256795571 0.00100709544518196 0.000671396963454643 0.00375741012442778 0.000925363519542304 100978 41910 667 665 0 True 610 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 652 528 0.00101793918787917 0.00102797621198797 0.000610360875867857 0.000595101853971161 0.00106806308793462 0.00113070839963248 44496 44800 667 665 0 True 655 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 257 576 0.000926613827441967 0.000945531601950631 0.00080872816052491 0.000839246204318303 0.00069066904894531 0.00064209722808438 40504 41207 667 665 0 True 253 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 299 575 0.000921626620885026 0.000959643328967876 0.00080872816052491 0.000793469138628214 0.000709698287029993 0.000772807170556535 40286 41822 667 665 0 True 298 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 344 574 0.000992316842265523 0.00107912261771389 0.000854505226215 0.000961318379491875 0.000760647173112776 0.000776581272590049 43376 47029 667 665 0 True 343 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 389 575 0.00100718695355916 0.00100929825135051 0.000869764248111696 0.000900282291905089 0.000757403816741659 0.000695607004393159 44026 43986 667 665 0 True 387 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 432 573 0.000950108603285906 0.000920841816144848 0.000579842832074464 0.000473029678797589 0.00097477202205963 0.00103241142937166 41531 40131 667 665 0 True 432 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 476 572 0.000877473828890087 0.000932062360065878 0.000473029678797589 0.000518806744487678 0.00100581606842383 0.000960582636602365 38356 40620 667 665 0 True 477 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 520 572 0.000919110140512257 0.00101689334345247 0.000488288700694286 0.000579842832074464 0.00103431588424884 0.00111409117956997 40176 44317 667 665 0 True 521 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 564 572 0.000992476981925608 0.00107877842925005 0.000701915007248035 0.000671396963454643 0.000931138147439126 0.00105753438160032 43383 47014 667 665 0 True 566 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 609 571 0.00113838708935759 0.00104413012389064 0.000869764248111696 0.000778210116731518 0.000990797348362424 0.000872144087328172 49761 45504 667 665 0 True 611 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 652 571 0.00106026181233027 0.00101941739218727 0.00080872816052491 0.000854505226215 0.000926589975742159 0.000825498814855406 46346 44427 667 665 0 True 655 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 253 614 0.000946699916235519 0.00103206058175881 0.000854505226215 0.000946059357595178 0.000705573967869159 0.000691440347299217 41382 44978 667 665 0 False 253 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 298 614 0.000901403269525686 0.0009896795089119 0.000778210116731518 0.000885023270008392 0.000697119651557545 0.000736836115973614 39402 43131 667 665 0 False 298 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 343 617 0.000899641733264748 0.000989427104038421 0.000793469138628214 0.000885023270008392 0.000698441733795117 0.000793083470212452 39325 43120 667 665 0 True 343 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 388 617 0.000938784441608447 0.000971529303918987 0.000747692072938125 0.000854505226215 0.000741179074738155 0.000691097767939548 41036 42340 667 665 0 True 387 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 432 614 0.000908723939701012 0.00095115334685994 0.000610360875867857 0.000564583810177768 0.000905249178487904 0.000986671957028763 39722 41452 667 665 0 False 432 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 477 614 0.000941987234810153 0.000905536902452974 0.000549324788281071 0.000442511635004196 0.00103415471244074 0.00101774653672798 41176 39464 667 665 0 False 477 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 521 614 0.000941621201301386 0.000995163578435675 0.000564583810177768 0.000595101853971161 0.00102934641200847 0.0011142502801656 41160 43370 667 665 0 False 521 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 566 614 0.000965687904502773 0.00092453610565668 0.000686655985351339 0.000534065766384375 0.000923478490412664 0.000969461358797185 42212 40292 667 665 0 False 566 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 611 614 0.00100661502620171 0.00102547510915077 0.00080872816052491 0.000823987182421607 0.000804477245413819 0.000777141090422251 44001 44691 667 665 0 False 611 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 655 613 0.00100581432790128 0.0010705408520156 0.00080872816052491 0.000854505226215 0.00080895566892768 0.000853012114899618 43966 46655 667 665 0 False 655 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 253 664 0.00112511837466481 0.0771364896562762 0.000991836423285267 0.0755931944762341 0.000733208086304696 0.0205181904547346 49181 3361668 667 665 0 True 253 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 298 658 0.00102418463462249 0.000996264981519948 0.000915541313801785 0.000885023270008392 0.000697636984987891 0.000663587220047725 44769 43418 667 665 0 False 298 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 343 658 0.00094136955326411 0.000934861759571738 0.000885023270008392 0.000869764248111696 0.000648212102922808 0.000620206680031501 41149 40742 667 665 0 False 343 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 387 658 0.000908220643626459 0.000879126174328015 0.000747692072938125 0.000762951094834821 0.000678339744078431 0.000649617369655795 39700 38313 667 665 0 False 387 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 432 657 0.000866996119701651 0.00088344000307475 0.000686655985351339 0.000686655985351339 0.000779569454871484 0.0007580450547961 37898 38501 667 665 0 False 432 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 477 657 0.00090309617450373 0.000907097223489027 0.000610360875867857 0.000686655985351339 0.000842526052063681 0.000795584480095456 39476 39532 667 665 0 False 477 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 521 657 0.000886693297892139 0.00100149664617024 0.000518806744487678 0.000686655985351339 0.000926152936262879 0.000924112116977502 38759 43646 667 665 0 False 521 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 566 657 0.000930640196038397 0.00099410806714658 0.000701915007248035 0.00080872816052491 0.000802056339030784 0.000781855658495556 40680 43324 667 665 0 False 566 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 611 657 0.00112504974338191 0.0010421108849028 0.000991836423285267 0.000885023270008392 0.000783911738753638 0.000750246232164032 49178 45416 667 665 0 False 611 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 650 661 0.00120543985274472 0.081584001202365 0.00109864957656214 0.0791943236438544 0.000791225992105061 0.0241094626379305 52692 3555494 667 665 0 True 655 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B12_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B12_1.csv new file mode 100755 index 0000000..b03ff65 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B12_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 227 237 0.00951636793185005 0.0371108361427717 0.00956740672922866 0.0372167544060426 0.00188145939177017 0.00735087657300693 415978 1617319 667 665 0 True 227 238 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 272 237 0.00931898436224781 0.00921475122918305 0.00923170824750134 0.00923170824750134 0.00171666373736603 0.00160647338108945 407350 401586 667 665 0 False 272 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 317 238 0.00926261520189779 0.0524936511569608 0.00929274433508812 0.0518196383611811 0.00142648019174781 0.00564465299099957 404886 2287714 667 665 0 True 317 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 360 239 0.00972370303747188 0.0707342629863742 0.00976577401388571 0.0705271992065309 0.00134520304451278 0.00920603724676036 425041 3082654 667 665 0 True 361 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 405 237 0.00966124857003862 0.0637500136241267 0.00967421988250553 0.062378881513695 0.00146917103723531 0.00941871231238054 422311 2778275 667 665 0 True 406 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 449 237 0.00972605937818456 0.059601028205671 0.00971999694819562 0.062928206301976 0.00156187512798761 0.0136719555412278 425144 2597459 667 665 0 True 451 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 494 235 0.00978402993513543 0.0728058415666082 0.0098115510795758 0.0733043411917296 0.00150734275031135 0.0184265192921778 427678 3172935 667 665 0 True 496 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 538 236 0.00984145144182315 0.0623307410205532 0.00978103303578241 0.0601358052948806 0.00161013179002297 0.0139058420951321 430188 2716422 667 665 0 True 540 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 585 237 0.00996926576766549 0.00986322524094626 0.00996414129854276 0.00987258716716258 0.00192455591321785 0.00194121401341941 435775 429847 667 665 0 False 585 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 624 237 0.0102722728816411 0.0420582240678372 0.0102693217364767 0.0417639429312581 0.00201934965902697 0.0073802926670896 449020 1832930 667 665 0 True 630 236 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 227 281 0.00950378552998621 0.00961302317363562 0.00950637064164187 0.00967421988250553 0.00172521596751619 0.00165475801100031 415428 418943 667 665 0 False 227 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 272 281 0.00918471869581346 0.0093550424470423 0.00927748531319142 0.0093842984664683 0.00156534416821316 0.00140439113545557 401481 407700 667 665 0 False 272 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 316 282 0.0094332096940772 0.0864569067438567 0.0093842984664683 0.0885175860227359 0.00140290204914936 0.018800847866732 412343 3767859 667 665 0 True 317 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 361 282 0.00937768698621621 0.04329943650612 0.00935378042267491 0.0429388876173037 0.00129499952175956 0.00465364898507029 409916 1887023 667 665 0 True 362 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 405 282 0.00955015740012804 0.066896561614611 0.00952162966353857 0.065644312199588 0.00134926472673887 0.00885173646008211 417455 2915404 667 665 0 True 406 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 449 281 0.0095962547451383 0.038975488618548 0.00964370183871214 0.0393530174715801 0.00169006730420872 0.00675013419786999 419470 1698582 667 665 0 True 451 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 493 281 0.00966772278772493 0.042295576432498 0.00967421988250553 0.0430914778362707 0.00179597586106642 0.00828664873200933 422594 1843274 667 665 0 True 496 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 537 281 0.00997226266701852 0.0496511822013262 0.0100251773861295 0.0501411459525444 0.00161582691634895 0.00979972478060963 435906 2163837 667 665 0 True 541 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 585 280 0.00985307300572648 0.0100400233818696 0.0098268101014725 0.00999465934233616 0.00179856717142108 0.00197981820730104 430696 437552 667 665 0 False 585 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 630 280 0.0100993678029376 0.0102071154081129 0.0101777676050965 0.0102082856488899 0.00196357800773269 0.00222942275958356 441462 444834 667 665 0 False 630 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 229 326 0.00971064021662778 0.039272179074374 0.00984206912336919 0.038452735179675 0.00154195934797763 0.0051205348856996 424470 1711512 667 665 0 True 227 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 274 327 0.00961727879479807 0.0469641487559595 0.00964370183871214 0.0497749294270237 0.00141408093466663 0.00892645605307332 420389 2046734 667 665 0 True 272 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 316 327 0.00971414041205536 0.0327785130025797 0.00973525597009232 0.0335088120851453 0.00136071907910451 0.00447680535856035 424623 1428513 667 665 0 True 317 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 360 326 0.00981033859357801 0.0300542154195285 0.0098115510795758 0.0307469291218433 0.00131533476140892 0.00398263013101024 428828 1309786 667 665 0 True 362 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 406 326 0.00984319010098979 0.0598155494022307 0.00985732814526589 0.0579842832074464 0.00152583943654391 0.00760005640252455 430264 2606808 667 665 0 True 406 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 449 324 0.00987480624530948 0.0295620488621416 0.00988784618905928 0.0300450141145953 0.00172352407602634 0.00407876776596917 431646 1288337 667 665 0 True 451 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 493 325 0.0100349001512062 0.0279728159951263 0.0100404364080262 0.0278629739833677 0.00167024368572988 0.00336606681514205 438644 1219077 667 665 0 True 496 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 537 324 0.00996000054447484 0.0449015420216827 0.00996414129854276 0.045136186770428 0.00159505712236926 0.00758613329451219 435370 1956844 667 665 0 True 541 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 581 324 0.010037348000296 0.0527872439166123 0.0101167315175097 0.0530403601129168 0.00188892796118463 0.00960171779580322 438751 2300509 667 665 0 True 585 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 626 325 0.0109371041190323 0.0606043375777507 0.0102845807583734 0.0607614251926452 0.00508781864821405 0.014888492989694 478081 2641184 667 665 0 True 630 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 229 370 0.0101659630244388 0.0377419171641624 0.0101472495613031 0.0385137712672618 0.00178500479230141 0.00811092814550334 444373 1644822 667 665 0 True 227 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 272 371 0.00976742116467516 0.0276352130038991 0.0097962920576791 0.0274357213702602 0.00152111591298405 0.00320690571975336 426952 1204364 667 665 0 True 272 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 317 371 0.0098376309670754 0.0685451325727916 0.00988784618905928 0.0667124437323568 0.0013516428470313 0.0111220147443598 430021 2987250 667 665 0 True 317 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 362 371 0.00995601993006701 0.0547143092338307 0.0100099183642329 0.0539864194705119 0.00143189836761991 0.00999382407757845 435196 2384492 667 665 0 True 362 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 406 370 0.0101870785824758 0.0395406001843703 0.01025406271458 0.0398718242160677 0.00151720937228223 0.0061617940061315 445296 1723210 667 665 0 True 407 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 449 369 0.0103306781033836 0.0490966486942924 0.010452429999237 0.0485389486533913 0.00179808067730007 0.0079337510046218 451573 2139670 667 665 0 True 451 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 494 369 0.0100256806822041 0.0386364400357727 0.00993362325474937 0.0388647287708858 0.00172662969365943 0.00415603091214093 438241 1683806 667 665 0 True 496 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 538 368 0.0103703469848962 0.0480359745782401 0.0103150988021668 0.0474097810330358 0.00191227502113657 0.00666485026928572 453307 2093445 667 665 0 True 541 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 583 368 0.0100216085594191 0.0404372799703539 0.0100099183642329 0.0408484016174563 0.00191881280050483 0.00601211053083263 438063 1762288 667 665 0 True 586 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 626 371 0.0101526485555574 0.0849623715961912 0.010101472495613 0.0817578393224994 0.0021949918430482 0.0146218990342756 443791 3702726 667 665 0 True 630 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 229 415 0.0103578560914095 0.0391298456716293 0.010406652933547 0.0388799877927825 0.00160534785006665 0.00476296742655397 452761 1705309 667 665 0 True 228 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 273 414 0.0107081730363932 0.0416963672628584 0.0106660563057908 0.0414282444495308 0.001782433507901 0.0056672406268044 468074 1817160 667 665 0 True 272 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 318 416 0.0102272736371572 0.0306077163611707 0.0101625085831998 0.0308537422751202 0.00166281925625144 0.00254977976030054 447053 1333908 667 665 0 True 317 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 361 414 0.0100381029444079 0.0478194570885901 0.0100251773861295 0.0460212100404364 0.00150244587850269 0.00902085848467343 438784 2084009 667 665 0 True 362 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 407 414 0.0104313373182944 0.0827527963878568 0.0103913939116503 0.082734416723888 0.00162760409470158 0.0114467062014642 455973 3606431 667 665 0 True 407 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 451 413 0.0102813093338888 0.0544305832101425 0.0102235446707866 0.053330281528954 0.00176769241465244 0.01027710469513 449415 2372127 667 665 0 True 451 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 494 413 0.0103133372659058 0.0488929579613947 0.0102235446707866 0.0483863584344244 0.00172624277112146 0.00897356935486347 450815 2130793 667 665 0 True 496 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 538 413 0.0102815381048318 0.0320021385576553 0.0103150988021668 0.0319218738078889 0.00175238452187301 0.00356944461458292 449425 1394678 667 665 0 True 541 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 583 412 0.0100946779986066 0.0374638128853835 0.010101472495613 0.0377813382162203 0.00191220343523329 0.00496686895639489 441257 1632702 667 665 0 True 586 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 626 415 0.0100966454287162 0.0725930872041628 0.010101472495613 0.0720683604180972 0.00192470386889287 0.0159952349241463 441343 3163663 667 665 0 True 631 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 230 459 0.0102249630506331 0.0463299700383942 0.0102082856488899 0.0472266727702754 0.0015261673392514 0.00882159803162135 446952 2019096 667 665 0 True 228 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 274 460 0.0105955948553533 0.04692369513851 0.0105745021744106 0.046341649500267 0.00172109377134341 0.00482507149654504 463153 2044971 667 665 0 True 272 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 319 460 0.0104930368416158 0.0573622199238081 0.0105439841306172 0.0558785381857023 0.00159177353255969 0.0108475556525405 458670 2499890 667 665 0 True 317 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 364 458 0.0104940434337649 0.0744100810506468 0.0104676890211337 0.0705424582284276 0.00153005722847185 0.012113703281031 458714 3242849 667 665 0 True 362 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 407 459 0.0107468810799453 0.0869043058550473 0.010757610437171 0.083237964446479 0.00171692081757772 0.0218003842564434 469766 3787357 667 665 0 True 407 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 451 458 0.0104673458647193 0.0404447373870703 0.0104829480430304 0.0406958113984894 0.00209062757109299 0.0043191857473329 457547 1762613 667 665 0 True 452 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 495 458 0.0105469810299703 0.0409654715869555 0.0106202792401007 0.0419165331502251 0.00184202457944563 0.00539462816357004 461028 1785307 667 665 0 True 496 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 540 457 0.0103421624047212 0.0966934846844738 0.0103913939116503 0.0955825131609064 0.00174733822398493 0.015915805526261 452075 4213977 667 665 0 True 541 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 584 456 0.0101407753436168 0.0613191481794438 0.0102082856488899 0.0618142977035172 0.00198444232910785 0.015895211240296 443272 2672336 667 665 0 True 586 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 627 459 0.0101329513773669 0.0742217870150313 0.0101319905394064 0.0715190356298161 0.00189369541134378 0.0113249630741496 442930 3234643 667 665 0 True 631 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 230 503 0.0102495788040976 0.0386024112696481 0.0102235446707866 0.0403906309605554 0.00151613517251882 0.00638399075574905 448028 1682323 667 665 0 True 228 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 275 504 0.010390684721727 0.0812889399052679 0.0103456168459602 0.0777447165636683 0.00165078284210561 0.0158422102462953 454196 3542635 667 665 0 True 273 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 317 504 0.0104144082685139 0.0486650822524381 0.0103608758678569 0.0501411459525444 0.0016250647757678 0.00807558008111152 455233 2120862 667 665 0 True 317 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 363 503 0.0103743962305869 0.051007399478325 0.0102998397802701 0.0507057297627222 0.00164107554412275 0.00573795773007941 453484 2222942 667 665 0 True 362 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 407 503 0.010814208368464 0.0501740274237895 0.0108491645685512 0.0502784771496147 0.00173924728332187 0.00506288760256468 472709 2186623 667 665 0 True 407 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 451 503 0.0107262459408886 0.0577811431760908 0.0107423514152743 0.0568245975432975 0.00199471856207836 0.00931448010242131 468864 2518147 667 665 0 True 452 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 494 502 0.0103235862041513 0.0669990609391412 0.0103303578240635 0.0652018005645838 0.00189848266376699 0.01346480528411 451263 2919871 667 665 0 True 496 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 539 501 0.0103260111761469 0.0536932626829147 0.01025406271458 0.054032196536202 0.00171006634096456 0.0105140822794101 451369 2339994 667 665 0 True 541 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 584 501 0.0100595616588593 0.0455573587206744 0.0101319905394064 0.0449073014419776 0.00203469722138205 0.00483654879821156 439722 1985425 667 665 0 True 586 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 626 502 0.0101179668806018 0.0600703177031615 0.00999465934233616 0.0597695887693599 0.00214252381886923 0.00980917452466928 442275 2617911 667 665 0 True 631 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 231 545 0.00971379725564089 0.0351531839440671 0.00968947890440223 0.0357824063477531 0.00157120563853631 0.00521349337389367 424608 1532003 667 665 0 True 228 543 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 275 548 0.0100023002918317 0.0426892133056376 0.0100404364080262 0.0430457007705806 0.00156206610255238 0.00702733832023362 437219 1860429 667 665 0 True 273 543 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 317 546 0.010229103804701 0.0378374179899279 0.0102845807583734 0.0381628137636378 0.0015950565301224 0.00484636720249454 447133 1648984 667 665 0 True 317 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 363 545 0.0104676432669451 0.0440646592448161 0.0104371709773404 0.0435034714274815 0.00147458924497202 0.00411216867287842 457560 1920372 667 665 0 True 362 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 407 546 0.0108665969144062 0.0797064760780413 0.0108644235904479 0.0760814831769284 0.00184197380881737 0.0134894313537012 474999 3473670 667 665 0 True 407 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 451 543 0.010839396049286 0.0567639744818673 0.0107881284809644 0.0557564660105287 0.00205144229171252 0.00667416141009764 473810 2473818 667 665 0 True 452 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 496 545 0.0103727719568918 0.0508124511324087 0.0103456168459602 0.0507362478065156 0.00204041348203609 0.00551315790448067 453413 2214446 667 665 0 True 497 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 539 543 0.0100488780558222 0.0361303808846906 0.010101472495613 0.0371709773403525 0.00196019210016133 0.00610819674694042 439255 1574590 667 665 0 True 541 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 583 543 0.00983966702846791 0.0447364233426322 0.00984206912336919 0.0443732356755932 0.00181759864185083 0.00469516494255979 430110 1949648 667 665 0 True 586 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 626 543 0.00983335295044169 0.0503661763701999 0.0097962920576791 0.0496528572518502 0.00182594402476376 0.00609930332284225 429834 2194997 667 665 0 True 631 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 228 586 0.0092462123252862 0.00936669896301752 0.00927748531319142 0.00943007553215839 0.0012790248395593 0.00122488226127822 404169 408208 667 665 0 False 228 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 273 586 0.00946331595017323 0.00928246457296824 0.00947585259784848 0.00917067215991455 0.00145022640771857 0.00137849385532344 413659 404537 667 665 0 False 273 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 318 590 0.0097788825889184 0.0572501980517786 0.00976577401388571 0.0565804531929503 0.00155726878189457 0.00719930344974369 427453 2495008 667 665 0 True 318 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 362 589 0.0100583034186729 0.0637218360618874 0.0100862134737163 0.0612649729152361 0.00151352956953488 0.0130073888057251 439667 2777047 667 665 0 True 362 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 407 586 0.0103766381858281 0.0101960784313725 0.0101625085831998 0.0101777676050965 0.00196803164028561 0.00158442662623631 453582 444353 667 665 0 False 407 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 452 586 0.0103906160904441 0.0101132896328714 0.0103456168459602 0.0101319905394064 0.00199196134693168 0.00187116487039341 454193 440745 667 665 0 False 452 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 497 586 0.00991889040602153 0.0101231793147322 0.0100251773861295 0.0101167315175097 0.00204174507363211 0.00209699127878616 433573 441176 667 665 0 False 497 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 541 585 0.00983067633040884 0.00979028023251078 0.0097962920576791 0.0098268101014725 0.00192868533342014 0.00183391261229289 429717 426668 667 665 0 False 541 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 586 585 0.00961176541507228 0.00963277959145977 0.00964370183871214 0.00970473792629892 0.00171513363248019 0.00177203472238056 420148 419804 667 665 0 False 586 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 631 585 0.00970979376413876 0.00974808272684458 0.00968947890440223 0.00984206912336919 0.00163258115099213 0.00158645006169616 424433 424829 667 665 0 False 631 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 229 635 0.00918952288561602 0.0348212485895444 0.00914015411612116 0.0348973830777447 0.00137254003882189 0.00644805121945161 401691 1517537 667 665 0 True 228 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 273 630 0.00920517081811578 0.00916968548631822 0.00917067215991455 0.00917067215991455 0.00132875782040679 0.00140748888557189 402375 399622 667 665 0 False 273 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 318 630 0.00953716321056684 0.00933090336277866 0.00952162966353857 0.00932326237888151 0.00140005990250557 0.0013559425100389 416887 406648 667 665 0 False 318 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 362 630 0.00963855449249511 0.0095951024276186 0.00959792477302205 0.00956740672922866 0.00136182040015748 0.00143033328469393 421319 418162 667 665 0 False 362 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 407 629 0.00980491672222941 0.0099985371990287 0.0098268101014725 0.0100404364080262 0.00135688068748013 0.00143782966265804 428591 435744 667 665 0 False 407 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 452 629 0.00979041264444454 0.0100858692852525 0.00970473792629892 0.0101167315175097 0.00166308950416295 0.00188276035395753 427957 439550 667 665 0 False 452 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 497 629 0.00947756837992082 0.00949388807335345 0.00953688868543526 0.00950637064164187 0.001942565868523 0.00191341689711357 414282 413751 667 665 0 False 497 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 542 629 0.00946375061496489 0.00957440522799331 0.00952162966353857 0.00956740672922866 0.00189269622279415 0.0018323664893069 413678 417260 667 665 0 False 542 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 586 629 0.00950785765277123 0.0101559001646942 0.00955214770733196 0.00978103303578241 0.00169522539985962 0.00247674646670892 415606 442602 667 665 0 False 586 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 627 634 0.00979260884549714 0.0410464706054447 0.00978103303578241 0.0402838178072786 0.00143715167308886 0.0074371141658887 428053 1788837 667 665 0 True 631 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B12_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B12_2.csv new file mode 100755 index 0000000..6e01f87 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B12_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 227 237 0.008074218784405 0.695598208154857 0.00787365529869535 0.692454413672084 0.00266206559809086 0.180611188224188 352939 30314709 667 665 5 True 227 238 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 272 237 0.00639252358256669 0.00618896749770971 0.00631723506523232 0.00621042191195544 0.0015812379227318 0.00154785181800429 279429 269720 667 665 0 False 272 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 317 238 0.00590132949089657 0.00602270152377969 0.00588998245212482 0.00599679560540169 0.0013114926622691 0.00116933626327926 257958 262474 667 665 0 True 317 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 360 239 0.00611058627243943 0.00614665526255557 0.00604257267109178 0.00624093995574884 0.00128029553090802 0.00112497620020274 267105 267876 667 665 0 True 361 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 405 237 0.00617960646593618 0.00616948643065664 0.00621042191195544 0.00619516289005875 0.00138685889971869 0.00136746310568375 270122 268871 667 665 0 True 406 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 449 237 0.0064109167663822 0.00649430855692676 0.0064087891966125 0.00645456626230259 0.00158017711482319 0.00160492837274127 280233 283027 667 665 0 True 451 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 494 235 0.00670362918792378 0.00669552113288486 0.00671396963454643 0.00669871061264973 0.00161565662955607 0.00152463228797891 293028 291796 667 665 0 True 496 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 538 236 0.00677246636466614 0.00687812458589825 0.00688181887541009 0.00686655985351339 0.00153930699801521 0.00147535735655061 296037 299754 667 665 0 True 540 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 585 237 0.00883222842687148 0.00791013927586189 0.00807202258335241 0.00788891432059205 0.00380328570203698 0.00181662358049893 386073 344730 667 665 0 False 585 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 624 237 0.0100376454025219 0.764876209750744 0.0100251773861295 0.744106202792401 0.00221041731726153 0.156575709388224 438764 33333898 667 665 12 True 630 236 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 227 281 0.00671907122657486 0.00619477280979973 0.00660715648126955 0.00624093995574884 0.00181846499283129 0.00150690665902099 293703 269973 667 665 0 False 227 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 272 281 0.00602447688950215 0.00596278978517477 0.00607309071488518 0.00602731364919509 0.0013876727066463 0.00142836320152118 263341 259863 667 665 0 False 272 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 316 282 0.00612660023844795 0.0059955335810343 0.00613412680247196 0.005981536583505 0.00126068568100807 0.00117937167639739 267805 261290 667 665 0 True 317 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 361 282 0.00593644583064384 0.00603497757898982 0.00593575951781491 0.00608834973678187 0.00126714577774567 0.00128121033251468 259493 263009 667 665 0 True 362 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 405 282 0.0061804529184252 0.00594564919967577 0.00622568093385214 0.00587472343022812 0.00128019540775884 0.00134223680751417 270159 259116 667 665 0 True 406 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 449 281 0.00625235562580349 0.0064900635658728 0.00625619897764553 0.00659189745937285 0.0016968253717677 0.00167650538913303 273302 282842 667 665 0 True 451 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 493 281 0.00661678773796897 0.00657650076209062 0.00663767452506294 0.00662241550316625 0.00174760315683634 0.00164547071706399 289232 286609 667 665 0 True 496 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 537 281 0.00699425979388424 0.00717844049354331 0.00701915007248035 0.0072632944228275 0.0015799326817229 0.00151056422063431 305732 312842 667 665 0 True 541 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 585 280 0.00767480759505804 0.0077864379419595 0.00762951094834821 0.00775158312352178 0.00177578985881013 0.0018927138533712 335480 339339 667 665 0 False 585 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 630 280 0.00851359625749039 0.00838238879414146 0.0085297932402533 0.00846875715266651 0.00203095833512002 0.00205620038016585 372145 365311 667 665 0 False 630 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 229 326 0.0058967083178484 0.00595441453255478 0.00592050049591821 0.0059510185397116 0.00144035294449501 0.00145380782945679 257756 259498 667 665 0 True 227 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 274 327 0.00625894422896128 0.00609323721296833 0.00617990386816205 0.00605783169298848 0.00166595934196322 0.00140379020478709 273590 265548 667 665 0 True 272 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 316 327 0.00614876814282262 0.0062140703096721 0.00613412680247196 0.00621042191195544 0.0011868548210015 0.00118395114602117 268774 270814 667 665 0 True 317 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 360 326 0.00638929791227069 0.0065109443326788 0.00634775310902571 0.00656137941557946 0.0013682602740203 0.00130758346633638 279288 283752 667 665 0 True 362 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 406 326 0.0066609405299639 0.00653460155309308 0.00666819256885634 0.00660715648126955 0.00147552739234473 0.00130770262068264 291162 284783 667 665 0 True 406 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 449 324 0.00670051790309926 0.00710845550589681 0.00671396963454643 0.00715648126955062 0.00167735416210782 0.00168068435050812 292892 309792 667 665 0 True 451 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 493 325 0.00676297237053252 0.00694489714788229 0.00689707789730678 0.00685130083161669 0.00161150392727397 0.00143504909026046 295622 302664 667 665 0 True 496 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 537 324 0.0069132291258811 0.00712070861520934 0.00698863202868696 0.0072327763790341 0.00152624744827897 0.00157874465000399 302190 310326 667 665 0 True 541 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 581 324 0.00742835265818681 0.00758910322269395 0.00741588464179446 0.00759899290455482 0.00183514677855178 0.0019040797319628 324707 330739 667 665 0 True 585 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 626 325 0.00828558025862326 0.00880688789953827 0.00804150453955901 0.00892652780956741 0.00270215171726078 0.00204795996692482 362178 383811 667 665 0 True 630 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 229 370 0.00663456324023843 0.00611533411234656 0.00665293354695964 0.00616464484626535 0.00186415742517278 0.00161676177027661 290009 266511 667 665 0 True 227 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 272 371 0.00624839788848995 0.00605581245400065 0.00625619897764553 0.00608834973678187 0.00135999247522397 0.00140475257975031 273129 263917 667 665 0 True 272 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 317 371 0.00651464151192886 0.00646399702621167 0.00657663843747616 0.00646982528419928 0.00133216697636989 0.0012378003729983 284767 281706 667 665 0 True 317 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 362 371 0.00681186072104712 0.00665465448927882 0.00679026474402991 0.00662241550316625 0.00135404082715265 0.00128343869081787 297759 290015 667 665 0 True 362 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 406 370 0.00709533079649235 0.00710744588640289 0.00698863202868696 0.00721751735713741 0.00147549529037023 0.00142975955562208 310150 309748 667 665 0 True 407 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 449 369 0.00709221951166783 0.00742756410366727 0.00703440909437705 0.00747692072938125 0.00162051929611244 0.0017014658447933 310014 323699 667 665 0 True 451 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 494 369 0.00705069758551715 0.00724528189322012 0.00706492713817044 0.00721751735713741 0.00174547600223043 0.00169473465034259 308199 315755 667 665 0 True 496 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 538 368 0.00743210450165167 0.00722857727977531 0.00755321583886473 0.0072632944228275 0.00172629001372588 0.00166040396558054 324871 315027 667 665 0 True 541 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 583 368 0.0074621878806534 0.00734890556673212 0.00750743877317464 0.00737010757610437 0.00189866336358603 0.00205836903701508 326186 320271 667 665 0 True 586 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 626 371 0.00741034838497437 0.00758680863293505 0.00738536659800107 0.00749217975127794 0.00211202257173115 0.00196369019571776 323920 330639 667 665 0 True 630 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 229 415 0.00675658966122341 0.00662592622549737 0.0068055237659266 0.00660715648126955 0.00150616097853578 0.00147636630752754 295343 288763 667 665 0 True 228 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 273 414 0.00696840867732762 0.00716965221476672 0.00697337300679027 0.00715648126955062 0.00160737738506958 0.00159663556333273 304602 312459 667 665 0 True 272 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 318 416 0.00713131646582294 0.00704491831547282 0.00711070420386053 0.00708018616006714 0.0013666242057476 0.00136928295190741 311723 307023 667 665 0 True 317 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 361 414 0.0070414781165151 0.00697126198421208 0.00706492713817044 0.00694285496299687 0.00140455988382633 0.00134482925940692 307796 303813 667 665 0 True 362 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 407 414 0.0071729985316337 0.00761861164699343 0.00712596322575723 0.00762951094834821 0.00149414342007988 0.0015835868120351 313545 332025 667 665 0 True 407 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 451 413 0.00717498883883762 0.00762081445316197 0.00727855344472419 0.0076600289921416 0.00156703687445806 0.00163473204958367 313632 332121 667 665 0 True 451 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 494 413 0.00710615166209525 0.00712144288393219 0.00714122224765393 0.00714122224765393 0.00170980051288981 0.00166295713314648 310623 310358 667 665 0 True 496 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 538 413 0.00728786442210344 0.00730909443441517 0.0072632944228275 0.00730907148851759 0.0015580627776549 0.0015724282714078 318566 318536 667 665 0 True 541 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 583 412 0.00710523657832334 0.00735592701139436 0.00709544518196384 0.0072632944228275 0.00175174644295744 0.00208909460323465 310583 320577 667 665 0 True 586 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 626 415 0.00672774164531376 0.00698633743892806 0.00668345159075303 0.00697337300679027 0.00195496613844317 0.00182500056046513 294082 304470 667 665 0 True 631 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 230 459 0.00668063770815439 0.00667776100815096 0.00663767452506294 0.00669871061264973 0.00149553987917045 0.00149335480962984 292023 291022 667 665 0 True 228 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 274 460 0.00706222764104329 0.00694983051586393 0.00708018616006714 0.00689707789730678 0.00160000854960016 0.00157561478786147 308703 302879 667 665 0 True 272 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 319 460 0.00694640091261305 0.00734920386340078 0.00694285496299687 0.00744640268558785 0.0014879315676459 0.00156698906611952 303640 320284 667 665 0 True 317 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 364 458 0.00723643671412177 0.00744096450785926 0.0072632944228275 0.00749217975127794 0.00145117278811714 0.00153667358669048 316318 324283 667 665 0 True 362 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 407 459 0.00739039955874661 0.0071621718521527 0.00743114366369116 0.00715648126955062 0.00167940011724843 0.00167791005679514 323048 312133 667 665 0 True 407 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 451 458 0.00734503428075388 0.00747425900526092 0.00741588464179446 0.0076600289921416 0.00188532170273172 0.00201337490849839 321065 325734 667 665 0 True 452 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 495 458 0.00718322459278486 0.0075875429016579 0.0072327763790341 0.00770580605783169 0.00188197673892161 0.00205515266074401 313992 330671 667 665 0 True 496 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 540 457 0.00686834426686863 0.00722894441413674 0.00689707789730678 0.0072480354009308 0.00175508687204568 0.00173604518898428 300228 315043 667 665 0 True 541 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 584 456 0.00651292572985652 0.00677078367697683 0.00651560234988937 0.00685130083161669 0.00180218681582435 0.00188818598409949 284692 295076 667 665 0 True 586 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 627 459 0.00627363132350053 0.00645153740382084 0.00630197604333562 0.00648508430609598 0.00177746461862149 0.00188202760571769 274232 281163 667 665 0 True 631 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 230 503 0.00690201934967513 0.00712359979830556 0.00695811398489357 0.00706492713817044 0.001364540594436 0.00146889057215498 301700 310452 667 665 0 True 228 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 275 504 0.00704923345148209 0.00698268904121141 0.00704966811627375 0.00694285496299687 0.00152962848881701 0.00162917624420228 308135 304311 667 665 0 True 273 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 317 504 0.00701166926264494 0.00673631893879813 0.00698863202868696 0.00671396963454643 0.00153135306595443 0.00148676435691303 306493 293574 667 665 0 True 317 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 363 503 0.0070817646795737 0.007688871985411 0.00715648126955062 0.00764476997024491 0.00152182781432037 0.00163115534744024 309557 335087 667 665 0 True 362 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 407 503 0.00737273844194863 0.00694453001352087 0.00737010757610437 0.00694285496299687 0.00170444560188072 0.00178507059482234 322276 302648 667 665 0 True 407 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 451 503 0.00737358489443765 0.00732947039147422 0.00735484855420768 0.00741588464179446 0.00188553131611899 0.00189473815137462 322313 319424 667 665 0 True 452 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 494 502 0.00700119155345651 0.00685637187498387 0.00712596322575723 0.00689707789730678 0.00176748789187899 0.00171045907216409 306035 298806 667 665 0 True 496 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 539 501 0.00656719019753113 0.00665300238465241 0.00663767452506294 0.00654612039368277 0.00164160745218464 0.00159961719400554 287064 289943 667 665 0 True 541 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 584 501 0.00647234176457205 0.00629880950946834 0.00648508430609598 0.00625619897764553 0.00171540793127259 0.00177732002028873 282918 274507 667 665 0 True 586 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 626 502 0.00628829554094548 0.00612274563726781 0.00628671702143893 0.00608834973678187 0.00178076394786544 0.00183970033667728 274873 266834 667 665 0 True 631 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 231 545 0.00669953418804445 0.00740425107171683 0.00666819256885634 0.00746166170748455 0.0014442803021291 0.00161188477589996 292849 322683 667 665 0 True 228 543 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 275 548 0.00677978703484147 0.00668374988742169 0.00668345159075303 0.00672922865644312 0.00150025365028694 0.00141557961809264 296357 291283 667 665 0 True 273 543 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 317 546 0.00703548431780905 0.00684010323359325 0.00704966811627375 0.00691233691920348 0.0014760266535289 0.00138458313032016 307534 298097 667 665 0 True 317 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 363 545 0.00705522725018814 0.007321163976547 0.00708018616006714 0.00732433051041428 0.00139705178707843 0.00141710818315688 308397 319062 667 665 0 True 362 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 407 546 0.00718487174357431 0.0073896804267478 0.00711070420386053 0.00743114366369116 0.00171038783715577 0.00160407184951508 314064 322048 667 665 0 True 407 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 451 543 0.00732886017508527 0.00734124163693739 0.00735484855420768 0.00738536659800107 0.00187284430156242 0.00208944020965458 320358 319937 667 665 0 True 452 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 496 545 0.00685823259118896 0.0070138266242397 0.0068055237659266 0.00700389105058366 0.00194893060440314 0.00204269204486599 299786 305668 667 665 0 True 497 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 539 543 0.0065870932695703 0.0065627561694348 0.00662241550316625 0.00653086137178607 0.00184044420407913 0.00187270128086531 287934 286010 667 665 0 True 541 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 583 543 0.00632332037231556 0.00657900186492783 0.0064087891966125 0.00656137941557946 0.00165463254454883 0.0015729140667618 276404 286718 667 665 0 True 586 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 626 543 0.00656620648247632 0.00642391054312366 0.00659189745937285 0.0063935301747158 0.00173764777022224 0.00181890123807703 287021 279959 667 665 0 True 631 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 228 586 0.00686960250705501 0.00675173858197795 0.00686655985351339 0.00679026474402991 0.00139181718850411 0.00129052621168687 300283 294246 667 665 0 False 228 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 273 586 0.00659590095087499 0.00658666579472256 0.00656137941557946 0.00657663843747616 0.0013184434039301 0.00123359675095391 288319 287052 667 665 0 False 273 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 318 590 0.00705369448487018 0.00691951898514884 0.00711070420386053 0.00692759594110018 0.00148469896626848 0.00142578782174866 308330 301558 667 665 0 True 318 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 362 589 0.00686241909944547 0.00696825607162791 0.00685130083161669 0.00698863202868696 0.0013651186125248 0.00136263378628501 299969 303682 667 665 0 True 362 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 407 586 0.00678834306810888 0.00655268292039322 0.00668345159075303 0.00657663843747616 0.00161930350039797 0.00141054446252125 296731 285571 667 665 0 False 407 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 452 586 0.00705277940109826 0.00656215957609749 0.00718699931334401 0.00660715648126955 0.00189740463651149 0.00182014379335724 308290 285984 667 665 0 False 452 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 497 586 0.00680971027418312 0.00680137055846299 0.00666819256885634 0.0068207827878233 0.0018829002936618 0.00208597693557697 297665 296409 667 665 0 False 497 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 541 585 0.00667587927254043 0.00666897272937436 0.00666819256885634 0.00671396963454643 0.00188039002304097 0.0016698024409623 291815 290639 667 665 0 False 541 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 586 585 0.0065946655877829 0.00665011120155619 0.00657663843747616 0.00669871061264973 0.00167246668971458 0.00163187012000552 288265 289817 667 665 0 False 586 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 631 585 0.00694386155514598 0.00654327510238173 0.00700389105058366 0.00651560234988937 0.00157617185899444 0.00145490200364654 303529 285161 667 665 0 False 631 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 229 635 0.00885865147078555 0.696060613883071 0.00845349813076982 0.692957961394675 0.00259148981828646 0.183236182816277 387228 30334861 667 665 6 True 228 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 273 630 0.00743809830035772 0.00682989230916614 0.00727855344472419 0.00689707789730678 0.00201961321404048 0.00136508980706449 325133 297652 667 665 0 False 273 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 318 630 0.00669802429982079 0.00639258939291465 0.00663767452506294 0.00636301213092241 0.00135390040321491 0.00130458467471594 292783 278594 667 665 0 False 318 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 362 630 0.00658606380032689 0.0065431144810986 0.00654612039368277 0.00656137941557946 0.00135999335378309 0.00124707450540802 287889 285154 667 665 0 False 362 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 407 629 0.0064457128268093 0.00626333515179572 0.00646982528419928 0.00633249408712902 0.00141414480816396 0.00140932273703887 281754 272961 667 665 0 False 407 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 452 629 0.0064000959007793 0.00690090986220415 0.0063935301747158 0.00689707789730678 0.00164919376149312 0.00177520511990945 279760 300747 667 665 0 False 452 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 497 629 0.00657748488996518 0.00648513019789116 0.00660715648126955 0.00648508430609598 0.00200043315516436 0.00190335695690567 287514 282627 667 665 0 False 497 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 542 629 0.00648133246263112 0.00644958700252577 0.00645456626230259 0.00651560234988937 0.0017900382376234 0.0017642926219957 283311 281078 667 665 0 False 542 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 586 629 0.00721184383775153 0.00727052238056804 0.00711070420386053 0.00709544518196384 0.00208280445250518 0.00199127629392733 315243 316855 667 665 0 False 586 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 627 634 0.00880660608125784 0.772861014977361 0.00865186541542687 0.760814831769284 0.00184710435350392 0.172543944521137 384953 33681882 667 665 15 True 631 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B12_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B12_3.csv new file mode 100755 index 0000000..7066890 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B12_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 227 237 0.00101370692543406 0.0692546426721416 0.000717174029144732 0.0687724116884108 0.000970566134920739 0.0189753502632676 44311 3018171 667 665 0 True 227 238 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 272 237 0.000941506815829897 0.000921071275120738 0.000701915007248035 0.00064087891966125 0.000788203934266953 0.000823882147286693 41155 40141 667 665 0 False 272 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 317 238 0.00086178014220173 0.000843950113324052 0.000717174029144732 0.000747692072938125 0.000660071489155714 0.000601709130999781 37670 36780 667 665 0 True 317 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 360 239 0.000870816594449399 0.000921186004608684 0.000747692072938125 0.000823987182421607 0.00064748274655336 0.000618567093311251 38065 40146 667 665 0 True 361 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 405 237 0.00100647776363592 0.000928413962349224 0.000854505226215 0.000793469138628214 0.000746497987244966 0.000701270663887293 43995 40461 667 665 0 True 406 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 449 237 0.000901220252771303 0.000882132086912176 0.000671396963454643 0.000686655985351339 0.0007991374750898 0.00078177725545799 39394 38444 667 665 0 True 451 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 494 235 0.000980786786739384 0.000932567169812836 0.000823987182421607 0.000778210116731518 0.000803183306747944 0.00080016318573592 42872 40642 667 665 0 True 496 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 538 236 0.000936565363461551 0.000995897847158524 0.000762951094834821 0.000839246204318303 0.000783944549981362 0.00084525630310771 40939 43402 667 665 0 True 540 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 585 237 0.00108023351565234 0.00101670977627176 0.000762951094834821 0.000686655985351339 0.00107645470964693 0.000991065140974506 47219 44309 667 665 0 False 585 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 624 237 0.00112424904508149 0.0775736548971421 0.000778210116731518 0.0743877317463951 0.00107990516449935 0.0193225217763887 49143 3380720 667 665 0 True 630 236 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 227 281 0.000905795671630882 0.00095115334685994 0.000671396963454643 0.000732433051041428 0.000845064049285525 0.000860189988467141 39594 41452 667 665 0 False 227 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 272 281 0.000939425000248788 0.000811206317464524 0.000793469138628214 0.00064087891966125 0.0007089581211995 0.000673199567018075 41064 35353 667 665 0 False 272 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 316 282 0.000823003467366797 0.000968293932358936 0.000671396963454643 0.000869764248111696 0.000632825759032768 0.000686586641532711 35975 42199 667 665 0 True 317 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 361 282 0.000941072151038237 0.000899249726513583 0.00080872816052491 0.000793469138628214 0.000705156752484804 0.000675529099504604 41136 39190 667 665 0 True 362 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 405 282 0.00094788952513901 0.000848516346944266 0.000778210116731518 0.00064087891966125 0.000727095249359374 0.000704508728839108 41434 36979 667 665 0 True 406 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 449 281 0.000859355170206154 0.000844936786920379 0.00064087891966125 0.000610360875867857 0.000821725732378474 0.000835356939517693 37564 36823 667 665 0 True 451 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 493 281 0.000963583211827366 0.000871829378894708 0.000762951094834821 0.00064087891966125 0.000849616851039315 0.0008179031415595 42120 37995 667 665 0 True 496 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 537 281 0.000947409106158754 0.000939519776782308 0.000717174029144732 0.000732433051041428 0.000846595997853616 0.00081964808851745 41413 40945 667 665 0 True 541 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 585 280 0.000994993462298377 0.000955191824835607 0.000671396963454643 0.000595101853971161 0.000948004024060211 0.000993569054695245 43493 41628 667 665 0 False 585 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 630 280 0.00109400552641967 0.0010866259262255 0.000762951094834821 0.000717174029144732 0.00105005821857896 0.00103172008934208 47821 47356 667 665 0 False 630 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 229 326 0.000874659946291446 0.000911594619416474 0.000717174029144732 0.000732433051041428 0.00073367958794319 0.000753214404459335 38233 39728 667 665 0 True 227 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 274 327 0.000976463015917081 0.00080943948335017 0.00080872816052491 0.000656137941557946 0.000764718125698677 0.000702765374629397 42683 35276 667 665 0 True 272 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 316 327 0.000916822431082467 0.000954251043034457 0.000762951094834821 0.000823987182421607 0.000711026917806621 0.000681294356116681 40076 41587 667 665 0 True 317 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 360 326 0.00103573756724293 0.000875064750454759 0.000930800335698482 0.000717174029144732 0.000709390307126909 0.000691993808392785 45274 38136 667 665 0 True 362 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 406 326 0.000862100421521901 0.000871186893762215 0.000671396963454643 0.000701915007248035 0.00074520079641397 0.000704197460773013 37684 37967 667 665 0 True 406 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 449 324 0.000842929416500264 0.000955421283811497 0.000579842832074464 0.000732433051041428 0.000826601643872202 0.000841380520724605 36846 41638 667 665 0 True 451 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 493 325 0.000848465673320355 0.000940345829095513 0.000656137941557946 0.000778210116731518 0.000759699164922746 0.000837737671327138 37088 40981 667 665 0 True 496 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 537 324 0.00095756653602702 0.000866735389629946 0.000747692072938125 0.000686655985351339 0.000835409613711875 0.000799858950286638 41857 37773 667 665 0 True 541 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 581 324 0.000932950782562484 0.000980868284237717 0.000701915007248035 0.000610360875867857 0.00093856858738574 0.0010433986941334 40781 42747 667 665 0 True 585 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 626 325 0.00105120248298831 0.00108490498390632 0.00064087891966125 0.000701915007248035 0.00109179253567975 0.00111538471535593 45950 47281 667 665 0 True 630 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 229 370 0.000995107847769867 0.000939978694734089 0.000854505226215 0.000793469138628214 0.00082593078652774 0.00081913372584139 43498 40965 667 665 0 True 227 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 272 371 0.000893144638484145 0.000917078688940249 0.000732433051041428 0.000778210116731518 0.000769291458006905 0.000762314826521967 39041 39967 667 665 0 True 272 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 317 371 0.0009632171783186 0.000988165079671025 0.000854505226215 0.000823987182421607 0.000713580543840494 0.000763524871571479 42104 43065 667 665 0 True 317 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 362 371 0.000929381955852012 0.000893536198013918 0.000732433051041428 0.000793469138628214 0.000761130247225996 0.000676690164790905 40625 38941 667 665 0 True 362 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 406 370 0.000984515753109941 0.00097497118855734 0.000793469138628214 0.00080872816052491 0.000815858440422912 0.000753872140512382 43035 42490 667 665 0 True 407 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 449 369 0.000949307904985479 0.00092641766925898 0.000671396963454643 0.000610360875867857 0.000874345815254797 0.000888984469077188 41496 40374 667 665 0 True 451 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 494 369 0.000909410252529949 0.00096120365000393 0.000595101853971161 0.000595101853971161 0.00088990164141401 0.000975821500867316 39752 41890 667 665 0 True 496 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 538 368 0.000916502151762297 0.000953470882516431 0.000671396963454643 0.000717174029144732 0.000853468051010157 0.000900863357864399 40062 41553 667 665 0 True 541 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 583 368 0.00096625983186022 0.00101801769243434 0.000625619897764553 0.000549324788281071 0.00100002588216401 0.00114103239018032 42237 44366 667 665 0 True 586 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 626 371 0.00095440949701391 0.00102712721377718 0.000473029678797589 0.000686655985351339 0.00106371484518321 0.00100569528341166 41719 44763 667 665 0 True 630 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 229 415 0.00094516715091756 0.000966848340810828 0.000778210116731518 0.000793469138628214 0.000825436637248295 0.000831875038816277 41315 42136 667 665 0 True 228 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 273 414 0.000930114022869545 0.000911411052235762 0.000762951094834821 0.000717174029144732 0.000812552896617864 0.000782287914591468 40657 39720 667 665 0 True 272 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 318 416 0.00097463284837325 0.00102845807583734 0.000885023270008392 0.000946059357595178 0.000746109817498864 0.000712194225993949 42603 44821 667 665 0 True 317 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 361 414 0.000942467653790409 0.00101606729113927 0.000793469138628214 0.000946059357595178 0.000758970170811077 0.000710281575509875 41197 44281 667 665 0 True 362 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 407 414 0.000940545977869385 0.00103742992179464 0.000717174029144732 0.000823987182421607 0.000807502859286174 0.000860426856344226 41113 45212 667 665 0 True 407 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 451 413 0.000878114387530428 0.000876372666617333 0.000610360875867857 0.000656137941557946 0.000798912213311387 0.000831293498055083 38384 38193 667 665 0 True 451 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 494 413 0.000918835615380682 0.0010299954509758 0.000625619897764553 0.000732433051041428 0.000883572325951408 0.000947327240276385 40164 44888 667 665 0 True 496 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 538 413 0.000997647205236933 0.000945646331438576 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.000934943546078379 0.000801538491892093 43609 41212 667 665 0 True 541 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 583 412 0.00103482248347101 0.000951405751733419 0.000732433051041428 0.000534065766384375 0.00100590021974624 0.00105563376469631 45234 41463 667 665 0 True 586 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 626 415 0.000885252040951371 0.000887730885923896 0.000503547722590982 0.000503547722590982 0.000965954672066342 0.000882416071589885 38696 38688 667 665 0 True 631 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 230 459 0.000937983743308021 0.00100647590594706 0.000747692072938125 0.000915541313801785 0.000791062553838822 0.000784618682305868 41001 43863 667 665 0 True 228 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 274 460 0.00101718424376734 0.000881512547677273 0.000885023270008392 0.000747692072938125 0.000842663826890507 0.000773197797894911 44463 38417 667 665 0 True 272 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 319 460 0.0010110531824955 0.000921048329223149 0.000900282291905089 0.000823987182421607 0.000807652033128361 0.000757626363018279 44195 40140 667 665 0 True 317 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 364 458 0.00100318346205702 0.000971414574431042 0.000869764248111696 0.000839246204318303 0.000797472027341423 0.000789953911018184 43851 42335 667 665 0 True 362 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 407 459 0.00102137075202385 0.000983415278870098 0.000762951094834821 0.000762951094834821 0.000928490864675858 0.000870497696365748 44646 42858 667 665 0 True 407 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 451 458 0.000964132262090516 0.000989977805580557 0.00064087891966125 0.000534065766384375 0.000983199373152037 0.00108149054115393 42144 43144 667 665 0 True 452 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 495 458 0.00096179879847213 0.00086267396575669 0.000625619897764553 0.0004272526131075 0.000969471866387933 0.00098076383799258 42042 37596 667 665 0 True 496 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 540 457 0.000926842598384946 0.00102132190168715 0.00064087891966125 0.000701915007248035 0.000895678648285906 0.000995572560441008 40514 44510 667 665 0 True 541 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 584 456 0.000878297404284811 0.000921002437427971 0.000457770656900893 0.000411993591210803 0.000986917513392561 0.00104996998113139 38392 40138 667 665 0 True 586 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 627 459 0.000935032598143592 0.000868548115539478 0.000595101853971161 0.0004272526131075 0.000923129784629014 0.000950082025014278 40872 37852 667 665 0 True 631 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 230 503 0.000934209022748868 0.00098453962785196 0.000778210116731518 0.000885023270008392 0.000750193331409171 0.000712406166571717 40836 42907 667 665 0 True 228 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 275 504 0.000916021732782041 0.000935458352909052 0.000778210116731518 0.000793469138628214 0.000760374521173652 0.000822303832800239 40041 40768 667 665 0 True 273 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 317 504 0.000948964748571011 0.00095372328738991 0.000839246204318303 0.000854505226215 0.000800964440992331 0.000802927425535617 41481 41564 667 665 0 True 317 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 363 503 0.000934369162408953 0.00102116128040403 0.000793469138628214 0.000839246204318303 0.000773451150956665 0.000841957146141073 40843 44503 667 665 0 True 362 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 407 503 0.000907785978834799 0.000895303032128272 0.000625619897764553 0.00064087891966125 0.000895534934767449 0.000828808328951475 39681 39018 667 665 0 True 407 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 451 503 0.000995634020938718 0.000887340805664883 0.00064087891966125 0.000518806744487678 0.00101538867992574 0.000928351431382308 43521 38671 667 665 0 True 452 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 494 502 0.000954455251202506 0.000903930689621743 0.000610360875867857 0.000503547722590982 0.000951738902806876 0.000954100105003422 41721 39394 667 665 0 True 496 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 539 501 0.000920391257792939 0.000840806525354356 0.000610360875867857 0.000610360875867857 0.000925695172792078 0.000841600498529976 40232 36643 667 665 0 True 541 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 584 501 0.00088298720861588 0.000807970945904473 0.000549324788281071 0.000442511635004196 0.000916898278105514 0.000895494551491809 38597 35212 667 665 0 True 586 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 626 502 0.00090581854872518 0.000799228558923057 0.000518806744487678 0.000411993591210803 0.000974201046974728 0.000920769953531885 39595 34831 667 665 0 True 631 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 231 545 0.000925401341444178 0.000954732906883827 0.00080872816052491 0.000823987182421607 0.000713307476641971 0.000722191427303408 40451 41608 667 665 0 True 228 543 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 275 548 0.000851279555918996 0.00102868753481323 0.000656137941557946 0.000869764248111696 0.000733521095680217 0.000791880630044595 37211 44831 667 665 0 True 273 543 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 317 546 0.000908586677135225 0.000974764675479039 0.000793469138628214 0.000823987182421607 0.000730560800065458 0.000763520311341631 39716 42481 667 665 0 True 317 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 363 545 0.00099963751244085 0.000992111774056335 0.000839246204318303 0.000854505226215 0.000802918452453851 0.000794111316118007 43696 43237 667 665 0 True 362 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 407 546 0.000874705700480042 0.00101269424419368 0.000610360875867857 0.000823987182421607 0.000867300679023284 0.000890195604424644 38235 44134 667 665 0 True 407 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 451 543 0.000956628575160806 0.000861870859341074 0.000518806744487678 0.000457770656900893 0.00103649796640669 0.0010252263849611 41816 37561 667 665 0 True 452 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 496 545 0.000903873995709859 0.000953631503799554 0.000457770656900893 0.000518806744487678 0.00100051899975489 0.00110200447308494 39510 41560 667 665 0 True 497 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 539 543 0.000953585921619186 0.000820430568295309 0.000610360875867857 0.000411993591210803 0.000986173790453396 0.000965628713430808 41683 35755 667 665 0 True 541 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 583 543 0.000979734440401681 0.000814671148000466 0.000671396963454643 0.000579842832074464 0.000928559517575953 0.000781968471129067 42826 35504 667 665 0 True 586 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 626 543 0.000893830951313082 0.000991584018411788 0.000610360875867857 0.000564583810177768 0.000904881977117658 0.00102978179089462 39071 43214 667 665 0 True 631 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 228 586 0.000997967484557103 0.00096726136696743 0.000900282291905089 0.000885023270008392 0.000688883984990622 0.000714900031476466 43623 42154 667 665 0 False 228 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 273 586 0.000922290056619665 0.000995002957152552 0.000793469138628214 0.000839246204318303 0.000711668117455253 0.000724505692447909 40315 43363 667 665 0 False 273 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 318 590 0.000917462989722809 0.000981304256291908 0.000778210116731518 0.000854505226215 0.000729886268250587 0.000758300515719157 40104 42766 667 665 0 True 318 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 362 589 0.00102047854534623 0.000905055038603604 0.000946059357595178 0.000793469138628214 0.000712639500935693 0.000696705648778857 44607 39443 667 665 0 True 362 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 407 586 0.000856198131193044 0.000878414851502756 0.00064087891966125 0.000686655985351339 0.00080342547459557 0.000746913443860343 37426 38282 667 665 0 False 407 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 452 586 0.00096680888212337 0.000858130678034064 0.000595101853971161 0.0004272526131075 0.00101416833847553 0.000940902918590454 42261 37398 667 665 0 False 452 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 497 586 0.000978407568932403 0.000904320769880756 0.000488288700694286 0.000473029678797589 0.00108775698451867 0.00111105342736034 42768 39411 667 665 0 False 497 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 541 585 0.000965298993899708 0.000863935990124086 0.000579842832074464 0.000473029678797589 0.001008449588187 0.000945151630868036 42195 37651 667 665 0 False 541 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 586 585 0.000870633577695016 0.000946564167342137 0.000549324788281071 0.000671396963454643 0.000884039764821579 0.000900751641104975 38057 41252 667 665 0 False 586 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 631 585 0.000999042707989105 0.000959666274865465 0.000778210116731518 0.000747692072938125 0.000880215931299812 0.000782355255133338 43670 41823 667 665 0 False 631 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 229 635 0.00115222773140781 0.0696251959723066 0.000976577401388571 0.0685740444037537 0.000811969277804736 0.0196117895018404 50366 3034320 667 665 0 True 228 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 273 630 0.000954112094788037 0.000956155552534346 0.000823987182421607 0.000732433051041428 0.000742910701054032 0.000798797393944805 41706 41670 667 665 0 False 273 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 318 630 0.000947363351970158 0.000920199331012356 0.000762951094834821 0.000778210116731518 0.000759323343226359 0.00071489486574155 41411 40103 667 665 0 False 318 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 362 630 0.000922839106882814 0.000888212749773266 0.00080872816052491 0.000747692072938125 0.000697717048348919 0.000657668980165312 40339 38709 667 665 0 False 362 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 407 629 0.000895546733385424 0.000859530377786994 0.000701915007248035 0.000701915007248035 0.000787031000699438 0.000699236920223766 39146 37459 667 665 0 False 407 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 452 629 0.000928627011740182 0.00084725432257687 0.000625619897764553 0.000503547722590982 0.000950712896919857 0.000910315354953322 40592 36924 667 665 0 False 452 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 497 629 0.000878343158473407 0.0008565933028956 0.000488288700694286 0.0004272526131075 0.00094610698649109 0.000933606329299755 38394 37331 667 665 0 False 497 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 542 629 0.00093896745836283 0.000930502039029825 0.000595101853971161 0.000473029678797589 0.000967089491937852 0.00101542559855849 41044 40552 667 665 0 False 542 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 586 629 0.000941964357715855 0.000933829194180232 0.000717174029144732 0.000732433051041428 0.000803833179512481 0.000758558952282202 41175 40697 667 665 0 False 586 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 627 634 0.00109624748166086 0.0795251117034977 0.000961318379491875 0.0763256275272755 0.000754057831408274 0.0219972296273492 47919 3465766 667 665 0 True 631 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B1_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B1_1.csv new file mode 100755 index 0000000..c2e4f72 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B1_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 251 284 0.00928450858114088 0.0420750204648724 0.00930800335698482 0.0418554970626383 0.00146257752204074 0.00796872060226207 405843 1833662 667 665 0 True 251 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 295 284 0.00946544351994294 0.00932911358276671 0.0093842984664683 0.00935378042267491 0.0013467451512943 0.00130838468219373 413752 406570 667 665 0 False 295 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 340 285 0.0095202112836921 0.0622312476086072 0.00952162966353857 0.0614938582436866 0.00136649116036089 0.0077120230886039 416146 2712086 667 665 0 True 340 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 384 284 0.00964685887772525 0.1009959781578 0.00965896086060884 0.0939650568398566 0.00141189927813917 0.0267582430874408 421682 4401483 667 665 0 True 385 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 428 284 0.00943904335312316 0.0739421912529091 0.00943007553215839 0.0727855344472419 0.00171576277067664 0.0114704945482497 412598 3222458 667 665 0 True 429 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 471 285 0.00938205651122711 0.0646351057318279 0.00929274433508812 0.0685130083161669 0.00177523357864097 0.017116652971444 410107 2816848 667 665 0 True 474 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 516 283 0.0094865133237913 0.077826243337802 0.00949111161974517 0.0759136339360647 0.00158690312849791 0.0199720238321974 414673 3391728 667 665 0 True 519 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 560 282 0.00905990126932414 0.0662879216810623 0.00898756389715419 0.0651865415426871 0.00173399368152045 0.0172560804048918 396025 2888879 667 665 0 True 563 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 608 283 0.00885604348203559 0.00870303476705038 0.00892652780956741 0.00860608834973678 0.00191413339196301 0.00183804665420575 387114 379285 667 665 0 False 608 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 648 283 0.00883190814755131 0.0405278703740353 0.00892652780956741 0.0398413061722744 0.00184869045358078 0.00790008871412901 386059 1766236 667 665 0 True 653 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 251 328 0.00923831972775343 0.00933826899590473 0.00924696726939803 0.00933852140077821 0.00155001647576744 0.00153370938609995 403824 406969 667 665 0 False 251 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 295 327 0.00949996505523846 0.00932870055661011 0.00944533455405508 0.0093690394445716 0.00142757486122729 0.0013576624946988 415261 406552 667 665 0 False 295 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 339 328 0.00972297097045435 0.134751963451774 0.00967421988250553 0.129167620355535 0.00135754360180148 0.0470317016960676 425009 5872595 667 665 0 True 340 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 383 328 0.00980887445954294 0.048641470923819 0.00984206912336919 0.0480964370183871 0.00134490741697156 0.00559695583329197 428764 2119833 667 665 0 True 385 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 428 328 0.00991253057380671 0.0757041837828722 0.0098115510795758 0.0732585641260395 0.00231556409728333 0.0124978091260015 433295 3299247 667 665 0 True 430 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 473 327 0.00933005687588799 0.0426093615820279 0.00946059357595178 0.0431982909895476 0.00179725121506998 0.00774047414094671 407834 1856949 667 665 0 True 474 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 516 327 0.00922637788452992 0.0404559120391962 0.00920119020370794 0.0420386053253986 0.00168558156683811 0.00625868871469909 403302 1763100 667 665 0 True 519 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 560 326 0.0100548489774339 0.0469348238988407 0.009399557488365 0.0487373159380484 0.00898249932930531 0.00772089968133026 439516 2045456 667 665 0 True 564 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 608 326 0.00873811206092994 0.00886689142173355 0.00877393759060044 0.0089570458533608 0.00210286263255169 0.0021047164787915 381959 386426 667 665 0 False 608 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 653 326 0.00888033895617995 0.00886237107990851 0.00892652780956741 0.00877393759060044 0.0019490903823813 0.00172426492437929 388176 386229 667 665 0 False 653 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 251 373 0.00938855360600771 0.0529038779140573 0.00943007553215839 0.0508125429159991 0.00166011678213993 0.0108279332639047 410391 2305592 667 665 0 True 251 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 294 372 0.00959028382352655 0.0601913114211484 0.00958266575112535 0.0650644693675135 0.00147235360220637 0.016546488825317 419209 2623184 667 665 0 True 296 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 340 371 0.00948607865899964 0.0318081080476426 0.00947585259784848 0.0367284657053483 0.00133524137049513 0.0141545620692783 414654 1386222 667 665 0 False 340 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 383 371 0.00947262692755247 0.0351887041935349 0.00949111161974517 0.0353398947127489 0.00145093649589717 0.00613865972229873 414066 1533551 667 665 0 True 385 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 428 372 0.00970647658546557 0.0723377452557923 0.00976577401388571 0.0698252841992828 0.00162533398015487 0.0112538152308869 424288 3152535 667 665 0 True 430 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 472 371 0.00952547301538061 0.0321793726706329 0.00953688868543526 0.0324864576180667 0.00179856576944041 0.0043079536937534 416376 1402402 667 665 0 True 474 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 515 370 0.00933989402643608 0.0275479956471632 0.00943007553215839 0.0279392690928512 0.00172263487036205 0.00336404102587219 408264 1200563 667 665 0 True 519 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 560 370 0.00924868305147037 0.0477768236108697 0.00923170824750134 0.0478217746242466 0.00186488631357229 0.00650360260722331 404277 2082151 667 665 0 True 564 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 604 371 0.00914996838957495 0.0554010570027724 0.00918593118181125 0.0552681773098344 0.00206836689970217 0.00975474553481365 399962 2414421 667 665 0 True 608 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 648 371 0.00896233046214361 0.0622201417941742 0.00889600976577401 0.0622568093385214 0.00201801112171625 0.0158997530986369 391760 2711602 667 665 0 True 653 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 250 416 0.010004016073904 0.0472308718695342 0.00946059357595178 0.0501411459525444 0.00423461943659258 0.0108678554685231 437294 2058358 667 665 0 True 251 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 295 416 0.00946667888303502 0.0343763964729861 0.009399557488365 0.0341191729610132 0.00154499175289383 0.00503850008128674 413806 1498150 667 665 0 True 296 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 339 416 0.00963294960439213 0.0848000982084417 0.00962844281681544 0.0803692683299001 0.00133773620901893 0.0177572440577886 421074 3695654 667 665 0 True 340 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 384 416 0.00969350527299866 0.0732032874587476 0.00975051499198901 0.0725261310749981 0.00143662028539705 0.0163839428248634 423721 3190256 667 665 0 True 385 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 428 415 0.00962487399010497 0.0445936080760381 0.00968947890440223 0.0452429999237049 0.00162450281951097 0.00771468166801948 420721 1943424 667 665 0 True 430 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 471 414 0.00968266153030145 0.0546253709347757 0.00976577401388571 0.0528877698939498 0.00172758305008705 0.0122555869436302 423247 2380616 667 665 0 True 475 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 516 414 0.00943728181686223 0.0417438882167653 0.00947585259784848 0.0421911955443656 0.00168607693981041 0.00469649407246724 412521 1819231 667 665 0 True 519 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 559 414 0.00933488394278484 0.0528131957267855 0.0093690394445716 0.0515297169451438 0.00181624515830767 0.00750647555596455 408045 2301640 667 665 0 True 564 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 605 415 0.00935975134428666 0.0432427371931775 0.00932326237888151 0.0438391699092088 0.00187403195084112 0.00666289489628598 409132 1884552 667 665 0 True 609 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 647 414 0.00929434573168897 0.0940972481558669 0.00929274433508812 0.089570458533608 0.00193103669481484 0.0238805568341587 406273 4100831 667 665 0 True 653 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 252 460 0.00960675533142104 0.0507231227530947 0.00935378042267491 0.0499427786678874 0.00260423384981012 0.00822524834494234 419929 2210553 667 665 0 True 251 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 295 459 0.00960783055485304 0.0604157681913642 0.00956740672922866 0.0599832150759136 0.00147299540541087 0.0112138362410947 419976 2632966 667 665 0 True 296 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 339 460 0.00954203603165229 0.0358044573553362 0.00949111161974517 0.0363012130922408 0.00146901659704436 0.0040511154364607 417100 1560386 667 665 0 True 341 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 383 460 0.0100441653743968 0.0583208077414869 0.00996414129854276 0.0552986953536278 0.0017629497982982 0.0133636922306217 439049 2541666 667 665 0 True 385 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 428 460 0.00993755811496861 0.0966912818783053 0.00988784618905928 0.0959182116426337 0.0019215989887174 0.0160016396233547 434389 4213881 667 665 0 True 430 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 472 459 0.0100293638943861 0.0641515209401393 0.00993362325474937 0.0617074845502403 0.00217378891994072 0.0154925982703001 438402 2795773 667 665 0 True 475 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 516 458 0.0097876216389402 0.0525723785315888 0.00990310521095598 0.0511482413977264 0.00190711661343499 0.00796072811962047 427835 2291145 667 665 0 True 519 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 560 458 0.00963278946473204 0.0331959906633143 0.00965896086060884 0.0335088120851453 0.00189315084346941 0.00449747802946095 421067 1446707 667 665 0 True 564 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 606 459 0.00939392972316771 0.0390789057789817 0.00930800335698482 0.0392767223620966 0.00186066465710653 0.00345284750364267 410626 1703089 667 665 0 True 609 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 649 458 0.00938628877367222 0.0781052195606893 0.00943007553215839 0.076600289921416 0.00189547587030347 0.0158047505005757 410292 3403886 667 665 0 True 654 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 253 504 0.00928331897223739 0.0536969110806313 0.00927748531319142 0.0538796063172351 0.00149350021062143 0.0118184937082299 405791 2340153 667 665 0 True 251 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 297 504 0.00946242374349561 0.0579022057317705 0.00953688868543526 0.0570840009155413 0.0015911599095944 0.00574202386371301 413620 2523423 667 665 0 True 296 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 341 504 0.00969929317785602 0.0807961308627485 0.00976577401388571 0.0763256275272755 0.00160276455900184 0.0211792286117161 423974 3521158 667 665 0 True 341 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 385 504 0.0100016139790027 0.0916898104726224 0.0100709544518196 0.0852521553368429 0.00157168685645331 0.0177181624802841 437189 3995913 667 665 0 True 385 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 429 504 0.0100723957087604 0.0991210459199039 0.0100862134737163 0.0931105516136416 0.0019116593713656 0.0271510506263451 440283 4319772 667 665 0 True 430 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 473 503 0.0101078552049221 0.0474990405746571 0.0100709544518196 0.0476844434271763 0.00188622239342908 0.00641011049723145 441833 2070045 667 665 0 True 475 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 518 502 0.00987400554700905 0.0422139349288763 0.00990310521095598 0.0434424353398947 0.00178018913363833 0.00559629486639224 431611 1839716 667 665 0 True 520 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 562 502 0.00975955144423668 0.1242589651056 0.0097962920576791 0.124116884107729 0.00177687982138808 0.0261737396253065 426608 5415302 667 665 0 True 564 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 606 502 0.00940802201325522 0.0650772961242658 0.00955214770733196 0.0669871061264973 0.0018286826538443 0.0145983453821464 411242 2836119 667 665 0 True 609 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 650 503 0.00951570449611541 0.0877603025646056 0.00950637064164187 0.0834668497749294 0.00194148842628339 0.0237432236820317 415949 3824662 667 665 0 True 654 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 253 548 0.00940774748812364 0.0509641464613697 0.0093690394445716 0.0527962157625696 0.00138673745879706 0.00990288118043858 411230 2221057 667 665 0 True 251 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 296 547 0.00957436136589522 0.138247013734841 0.00956740672922866 0.128633554589151 0.00151100597401781 0.0603529427460555 418513 6024912 667 665 0 True 296 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 341 548 0.00965848044162858 0.0623744759013579 0.00962844281681544 0.06323338673991 0.00146255038930721 0.0127989969207463 422190 2718328 667 665 0 True 341 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 385 548 0.00979071004667042 0.0653211880697395 0.00985732814526589 0.0634927901121538 0.00150892476078778 0.00964481106411441 427970 2846748 667 665 0 True 386 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 429 547 0.0100511428881577 0.0593479349552641 0.0100404364080262 0.0586404211490043 0.00185095617011418 0.0057230007902166 439354 2586429 667 665 0 True 430 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 473 545 0.0101975105374756 0.0671500678911745 0.0100251773861295 0.0656137941557946 0.00215858821926295 0.010891722671604 445752 2926452 667 665 0 True 475 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 518 545 0.0097463513608268 0.0784140025045447 0.00987258716716258 0.074189364461738 0.00186880224661555 0.0155570352123448 426031 3417343 667 665 0 True 520 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 562 544 0.00940479634295921 0.0595450631614513 0.00943007553215839 0.0595407034409094 0.00180627754499234 0.01048317253491 411101 2595020 667 665 0 True 564 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 607 545 0.009448400084691 0.0526302480853083 0.00946059357595178 0.0502021820401312 0.00161915449406048 0.00827770400196888 413007 2293667 667 665 0 True 609 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 651 544 0.00940086148273998 0.0667868343323404 0.00944533455405508 0.0673075455863279 0.00184950497153274 0.0108650734143127 410929 2910622 667 665 0 True 654 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 254 590 0.00903567442646267 0.052072502152612 0.00907911802853437 0.0505531395437552 0.00132065360042593 0.0138438938869727 394966 2269360 667 665 0 True 252 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 298 588 0.00919551668432207 0.0597216318433988 0.00920119020370794 0.0597848477912566 0.00137580328756319 0.0111988443978019 401953 2602715 667 665 0 True 296 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 342 589 0.00945512595041459 0.0478243445647766 0.00950637064164187 0.0474250400549325 0.00147997067918155 0.00626907865980611 413301 2084222 667 665 0 True 341 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 386 588 0.00974516175192331 0.0536931020616315 0.00973525597009232 0.0520485236896315 0.00137453762420748 0.00604643518566903 425979 2339987 667 665 0 True 386 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 431 588 0.00972791242282269 0.0931390963102423 0.00976577401388571 0.0871900511177233 0.00195536392006305 0.018298842615847 425225 4059074 667 665 0 True 430 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 475 587 0.0100060521352965 0.0695534441505457 0.0100556954299229 0.0657206073090715 0.00208110950742599 0.0129986329200923 437383 3031193 667 665 0 True 475 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 519 586 0.00968639049667201 0.0586336521092156 0.00967421988250553 0.0581521324483101 0.00203871297471016 0.00608747816549448 423410 2555300 667 665 0 True 520 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 562 585 0.0094713229331775 0.039321925780347 0.00955214770733196 0.0401464866102083 0.00177132081111551 0.00687541788678937 414009 1713680 667 665 0 True 565 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 607 586 0.00948685648020577 0.0479242280569816 0.00947585259784848 0.0473334859235523 0.00164196942780334 0.00566190056625784 414688 2088575 667 665 0 True 609 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 651 585 0.00920592576222761 0.055320012092488 0.00918593118181125 0.0538948653391318 0.00157888962979963 0.00845725493924957 402408 2410889 667 665 0 True 654 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 252 632 0.00870736524619357 0.00868116732664805 0.00865186541542687 0.00868238345922026 0.00140049821408486 0.00145294558068333 380615 378332 667 665 0 False 252 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 297 632 0.00902679811387508 0.00867185129222691 0.00907911802853437 0.00871290150301366 0.0015890687468 0.00134344488327927 394578 377926 667 665 0 False 297 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 342 631 0.00924630383366339 0.0748954556223472 0.00926222629129473 0.073136491950866 0.00136379104050561 0.0090162431928591 404173 3264002 667 665 0 True 341 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 386 631 0.00944043885587534 0.0858093964597922 0.00941481651026169 0.0830395971618219 0.00135452198814753 0.0172234194469078 412659 3739640 667 665 0 True 386 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 431 632 0.0092418656773696 0.00932847109763422 0.00927748531319142 0.00932326237888151 0.00166963478142295 0.00174002775073765 403979 406542 667 665 0 False 431 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 475 631 0.00936087232190726 0.00941412813333402 0.00944533455405508 0.00941481651026169 0.00197794512094211 0.00193016200355278 409181 410275 667 665 0 False 475 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 520 631 0.00912240149094599 0.00910858056103867 0.00904859998474098 0.00914015411612116 0.00201272597989084 0.00186308298978228 398757 396959 667 665 0 False 520 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 565 631 0.00913168959123093 0.00911232074234568 0.00915541313801785 0.00920119020370794 0.00193907402110787 0.00163904700770128 399163 397122 667 665 0 False 565 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 609 631 0.00924971252071378 0.0090934821604251 0.00909437705043107 0.00909437705043107 0.00198117559580797 0.00140181240747097 404322 396301 667 665 0 False 609 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 654 631 0.0089690334507729 0.00903891681595841 0.00891126878767071 0.00909437705043107 0.00160434101114223 0.00138267438852424 392053 393923 667 665 0 False 654 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 253 681 0.00871699650289298 0.0404457699524618 0.00871290150301366 0.0401007095445182 0.00124887437849712 0.0091867221652323 381036 1762658 667 665 0 True 252 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 297 676 0.00873257580410985 0.00874146914551198 0.00877393759060044 0.00871290150301366 0.00128789479215598 0.00135073503640993 381717 380960 667 665 0 False 297 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 341 675 0.00872541527359461 0.0085966575858277 0.00866712443732357 0.00857557030594339 0.00125698582815728 0.00142025558816045 381404 374649 667 665 0 False 341 675 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 386 675 0.00902997802998249 0.00893641749142827 0.00907911802853437 0.00892652780956741 0.00139126029364867 0.00132985814347811 394717 389456 667 665 0 False 386 675 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 431 675 0.00915202732806176 0.00905718175043927 0.00915541313801785 0.00915541313801785 0.00153653378915702 0.00145829645156255 400052 394719 667 665 0 False 431 675 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 476 675 0.00899387797518041 0.00906489157202918 0.00903334096284428 0.00912489509422446 0.00167822033562288 0.00155533621963075 393139 395055 667 665 0 False 476 675 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 520 675 0.00872276153065605 0.00893171358242253 0.00877393759060044 0.00891126878767071 0.0017861845980542 0.00168764883774076 381288 389251 667 665 0 False 520 675 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 565 675 0.00893833239022512 0.00878791164223215 0.0089723048752575 0.00885023270008392 0.00159917355996258 0.00160264067101552 390711 382984 667 665 0 False 565 675 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 610 674 0.00894970230609117 0.00892733091598302 0.0089723048752575 0.0089417868314641 0.00131448412745538 0.00139712692305606 391208 389060 667 665 0 False 610 674 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 650 680 0.00903384425891884 0.0412719828869496 0.00904859998474098 0.0410925459678035 0.00146203915822983 0.00851583499314833 394886 1798665 667 665 0 True 654 674 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B1_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B1_2.csv new file mode 100755 index 0000000..03a9071 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B1_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 251 284 0.00788330943248907 0.790635113762892 0.00762951094834821 0.803112840466926 0.00229663314529289 0.157280635410283 344594 34456491 667 665 15 True 251 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 295 284 0.00649059768582177 0.00601150392575625 0.00617990386816205 0.0059510185397116 0.00209400451846468 0.00118875004098937 283716 261986 667 665 0 False 295 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 340 285 0.00578056131009798 0.00580017220896141 0.00588998245212482 0.00579842832074464 0.00117971327893571 0.001382382272998 252679 252776 667 665 0 True 340 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 384 284 0.00579458496890259 0.00596909990701175 0.00573739223315786 0.0059510185397116 0.00127344826363424 0.00114566676969132 253292 260138 667 665 0 True 385 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 428 284 0.00575841628281762 0.00592362113799032 0.00570687418936446 0.00593575951781491 0.00155650106282251 0.00151237600145827 251711 258156 667 665 0 True 429 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 471 285 0.00588568155839682 0.0058770639117822 0.00588998245212482 0.0059510185397116 0.00168868389098324 0.00181707414636816 257274 256127 667 665 0 True 474 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 516 283 0.00598334387395453 0.00599466163692591 0.00593575951781491 0.00588998245212482 0.00154647975217877 0.00162927207858066 261543 261252 667 665 0 True 519 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 560 282 0.00622327883895086 0.00629584948867935 0.00619516289005875 0.00633249408712902 0.00161379361626679 0.00156308163703477 272031 274378 667 665 0 True 563 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 608 283 0.00731739875084202 0.00684336155105089 0.00701915007248035 0.00688181887541009 0.00269606756128211 0.00187235867026359 319857 298239 667 665 0 False 608 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 648 283 0.00839674005981674 0.780648233079839 0.00839246204318303 0.762951094834821 0.00195705704091009 0.159411899744017 367037 34021255 667 665 16 True 653 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 251 328 0.00589869862505232 0.00602210493044238 0.00588998245212482 0.0059662775616083 0.00155253068212051 0.00146355969632747 257843 262448 667 665 0 False 251 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 295 327 0.00576553105914427 0.00577126037799924 0.00578316929884794 0.00570687418936446 0.0014286168215213 0.00128566252096339 252022 251516 667 665 0 False 295 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 339 328 0.00576042946711584 0.0059681591252106 0.00575265125505455 0.0059662775616083 0.00129049363114881 0.00128212709062151 251799 260097 667 665 0 True 340 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 383 328 0.00584962725778333 0.00574016868676613 0.00584420538643473 0.00572213321126116 0.0013165295537787 0.00121025210081164 255698 250161 667 665 0 True 385 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 428 328 0.00606538113410678 0.00602322927942424 0.00604257267109178 0.00599679560540169 0.00166351037922319 0.00156231789312703 265129 262497 667 665 0 True 430 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 473 327 0.0061957348174162 0.00613323191246599 0.00628671702143893 0.00617990386816205 0.00167725264273716 0.00149924259137057 270827 267291 667 665 0 True 474 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 516 327 0.00612849903727468 0.00606118179403648 0.00619516289005875 0.00608834973678187 0.00163335409521278 0.00162573009574806 267888 264151 667 665 0 True 519 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 560 326 0.00716142272191897 0.00629068666172183 0.00648508430609598 0.00625619897764553 0.0080568981810035 0.00147852715523183 313039 274153 667 665 0 True 564 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 608 326 0.00647694006052593 0.00641330953843753 0.00650034332799268 0.0063782711528191 0.00201514335671273 0.00212830096858126 283119 279497 667 665 0 False 608 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 653 326 0.00693100462815056 0.00666192833881453 0.00685130083161669 0.00666819256885634 0.00211208385105443 0.00186828407332974 302967 290332 667 665 0 False 653 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 251 373 0.00552975972531015 0.00536881228018547 0.00549324788281071 0.00526436255436027 0.0013648024094808 0.00141785855921993 241716 233977 667 665 0 True 251 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 294 372 0.00569744882651373 0.0058540950682956 0.00582894636453803 0.00578316929884794 0.00132481902335069 0.00146537389046026 249046 255126 667 665 0 True 296 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 340 371 0.00578847678472506 0.00610397589303999 0.00582894636453803 0.00599679560540169 0.00131461090096168 0.0019483483214366 253025 266016 667 665 0 False 340 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 383 371 0.00599107633182722 0.00604475253136274 0.0059662775616083 0.00602731364919509 0.00132524223088585 0.00131647831609067 261881 263435 667 665 0 True 385 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 428 372 0.00609770646834971 0.00625282593069995 0.00614938582436866 0.00622568093385214 0.0015477350247667 0.00155486459086097 266542 272503 667 665 0 True 430 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 472 371 0.00631249950671265 0.00652443652046114 0.00633249408712902 0.00653086137178607 0.00167578685836903 0.0017091049075561 275931 284340 667 665 0 True 474 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 515 370 0.00622215786133026 0.00612586627933991 0.00611886778057527 0.00611886778057527 0.00164695712631996 0.00174373068304377 271982 266970 667 665 0 True 519 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 560 370 0.00610008568615669 0.00627249056493373 0.00607309071488518 0.00631723506523232 0.0017129746674042 0.00163333486703072 266646 273360 667 665 0 True 564 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 604 371 0.00617789068386384 0.00645631015051935 0.00613412680247196 0.00645456626230259 0.00193368879934846 0.00192423077564595 270047 281371 667 665 0 True 608 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 648 371 0.00592955982526018 0.00616450717087982 0.00599679560540169 0.00613412680247196 0.00190458540997961 0.00185358431607659 259192 268654 667 665 0 True 653 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 250 416 0.00621602680005843 0.00556286573609579 0.00566109712367437 0.0055542839703975 0.00356216432471787 0.00151195893138984 271714 242434 667 665 0 True 251 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 295 416 0.005670591117808 0.00575551949225318 0.00566109712367437 0.00582894636453803 0.00137777779051378 0.00144458149015049 247872 250830 667 665 0 True 296 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 339 416 0.00602877778323015 0.00613623782505015 0.00605783169298848 0.00610360875867857 0.00133609187231442 0.00120148278309571 263529 267422 667 665 0 True 340 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 384 416 0.00620124819714199 0.00625119677197113 0.00614938582436866 0.00625619897764553 0.00137967180936623 0.0014427480887991 271068 272432 667 665 0 True 385 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 428 415 0.0064413661788927 0.00635355842111573 0.00643930724040589 0.00634775310902571 0.00156849665620818 0.00144868868112943 281564 276893 667 665 0 True 430 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 471 414 0.00641784852595446 0.00670077574343274 0.00650034332799268 0.00662241550316625 0.00170030816443814 0.0015330865962919 280536 292025 667 665 0 True 475 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 516 414 0.00640236073311479 0.00639089139649306 0.00643930724040589 0.0064087891966125 0.0016775136718001 0.00170360193709141 279859 278520 667 665 0 True 519 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 559 414 0.00614817333837087 0.00634669759773662 0.00616464484626535 0.0063782711528191 0.00171908109857159 0.00151974172401918 268748 276594 667 665 0 True 564 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 605 415 0.00587570714528293 0.00599640552514268 0.00581368734264134 0.00599679560540169 0.00192811892175332 0.00187209989884537 256838 261328 667 665 0 True 609 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 647 414 0.00565407385572492 0.0057638259071804 0.00575265125505455 0.00570687418936446 0.0017628557934814 0.00173251226045199 247150 251192 667 665 0 True 653 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 252 460 0.00608414035143106 0.00558232385725128 0.00581368734264134 0.00564583810177768 0.00234913737090962 0.00146289100031295 265949 243282 667 665 0 True 251 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 295 459 0.00571819835104192 0.00593497935729688 0.00582894636453803 0.005981536583505 0.00150027739936543 0.00147109774785911 249953 258651 667 665 0 True 296 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 339 460 0.00599507982332935 0.00589381441702218 0.00602731364919509 0.00593575951781491 0.00142543242379984 0.00160010502215751 262056 256857 667 665 0 True 341 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 383 460 0.00619248627002589 0.00619741158802247 0.00619516289005875 0.00624093995574884 0.00137810962016239 0.00141110813758074 270685 270088 667 665 0 True 385 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 428 460 0.00639773956006661 0.00632122765141281 0.00642404821850919 0.00636301213092241 0.00176192361609279 0.00191020711387588 279657 275484 667 665 0 True 430 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 472 459 0.00645902729569068 0.00653207750435829 0.00648508430609598 0.00659189745937285 0.00184148029449451 0.00200876616106234 282336 284673 667 665 0 True 475 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 516 458 0.00628429204944335 0.00633793226485761 0.00622568093385214 0.00646982528419928 0.00173614110937793 0.00175094091533393 274698 276212 667 665 0 True 519 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 560 458 0.00576216812628248 0.00569487348492541 0.00569161516746777 0.00578316929884794 0.00179695593944728 0.0018970242288543 251875 248187 667 665 0 True 564 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 606 459 0.00555835609318252 0.00556894639895688 0.00549324788281071 0.00546272983901732 0.00174043095391524 0.00178155142984095 242966 242699 667 665 0 True 609 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 649 458 0.00536227651795526 0.00566630584242708 0.00537117570763714 0.00575265125505455 0.00176082158349363 0.00184243695629113 234395 246942 667 665 0 True 654 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 253 504 0.0057955915610517 0.00565272187105438 0.00572213321126116 0.00560006103608759 0.001498333194045 0.00136869241494163 253336 246350 667 665 0 True 251 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 297 504 0.00580179125360643 0.00590648055249132 0.00587472343022812 0.00588998245212482 0.00149764057640799 0.00142441490297528 253607 257409 667 665 0 True 296 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 341 504 0.00586802044159884 0.00603449571514045 0.00581368734264134 0.00604257267109178 0.00138342079393049 0.00145409037904258 256502 262988 667 665 0 True 341 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 385 504 0.00621760531956498 0.00613295656169492 0.00624093995574884 0.00610360875867857 0.00156780816805436 0.00152715143678522 271783 267279 667 665 0 True 385 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 429 504 0.00629637115523264 0.00628875920632435 0.0063935301747158 0.00625619897764553 0.00183193641213565 0.0017134154163868 275226 274069 667 665 0 True 430 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 473 503 0.00626043124009064 0.00611877599698491 0.00627145799954223 0.00605783169298848 0.00190100677876473 0.00165947643423913 273655 266661 667 665 0 True 475 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 518 502 0.00573679742870611 0.00572396888306828 0.00576791027695125 0.00579842832074464 0.00168554650248778 0.00153086081547115 250766 249455 667 665 0 True 520 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 562 502 0.00551271629005822 0.00567071145476417 0.0055390249485008 0.00567635614557107 0.00169465187283368 0.00159901186420428 240971 247134 667 665 0 True 564 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 606 502 0.00538179067939136 0.00565526886568676 0.00532539864194705 0.00567635614557107 0.00173623802768545 0.00171832456228228 235248 246461 667 665 0 True 609 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 650 503 0.00569394863108615 0.0055925118357808 0.00578316929884794 0.00569161516746777 0.00182711242681847 0.00186581439591674 248893 243726 667 665 0 True 654 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 253 548 0.00584246672726809 0.00583901961357961 0.00584420538643473 0.00581368734264134 0.00136094861323258 0.00144194466080112 255385 254469 667 665 0 True 251 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 296 547 0.00574395795922135 0.0058837641138782 0.00575265125505455 0.0059510185397116 0.00140152468521645 0.00132130850116909 251079 256419 667 665 0 True 296 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 341 548 0.00589506116705895 0.00598686003174565 0.00593575951781491 0.005981536583505 0.00137191755345712 0.00143909939516992 257684 260912 667 665 0 True 341 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 385 548 0.00588714569243188 0.00600383999596152 0.00584420538643473 0.0059510185397116 0.00152849915482115 0.0013274959059325 257338 261652 667 665 0 True 386 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 429 547 0.00581265787339793 0.00581336610007509 0.00581368734264134 0.00573739223315786 0.00175510408507844 0.00176530777398888 254082 253351 667 665 0 True 430 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 473 545 0.00583562647607302 0.00613201577989377 0.00578316929884794 0.00604257267109178 0.00190179645190056 0.0020362710019058 255086 267238 667 665 0 True 475 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 518 545 0.0056335988563283 0.00560226384225613 0.00566109712367437 0.00567635614557107 0.00183750458393055 0.00200426267158657 246255 244151 667 665 0 True 520 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 562 544 0.00571204441267579 0.005803935336166 0.00570687418936446 0.00569161516746777 0.00169187595687696 0.00172308871514547 249684 252940 667 665 0 True 564 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 607 545 0.00573238214950662 0.00579005306812465 0.00573739223315786 0.00579842832074464 0.00165145088583091 0.00158359730845916 250573 252335 667 665 0 True 609 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 651 544 0.00575903396436366 0.00570781497116561 0.00579842832074464 0.00573739223315786 0.00174935537855557 0.00183215909257362 251738 248751 667 665 0 True 654 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 254 590 0.00589156097163137 0.0060373180605439 0.00587472343022812 0.00602731364919509 0.00130717686890693 0.001116515273655 257531 263111 667 665 0 True 252 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 298 588 0.00582668153220254 0.0061363525545381 0.00584420538643473 0.00610360875867857 0.001385820163902 0.0013958055526923 254695 267427 667 665 0 True 296 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 342 589 0.00589721161392295 0.00592529618851432 0.00590524147402152 0.00593575951781491 0.00144422377156304 0.00137209189434061 257778 258229 667 665 0 True 341 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 386 588 0.00564210913540712 0.00570625465012956 0.00564583810177768 0.00572213321126116 0.0012800323395692 0.00120989083810286 246627 248683 667 665 0 True 386 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 431 588 0.00577635192474717 0.00577880957830603 0.00570687418936446 0.00578316929884794 0.00173553938068531 0.00181329342813498 252495 251845 667 665 0 True 430 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 475 587 0.00568157212307099 0.006140322194821 0.00563057907988098 0.00616464484626535 0.00200404221409896 0.00183979133834393 248352 267600 667 665 0 True 475 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 519 586 0.00570081175937552 0.00576981478645114 0.00576791027695125 0.00570687418936446 0.00183259739076145 0.00201303201866652 249193 251453 667 665 0 True 520 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 562 585 0.00560552866162478 0.00588454427439622 0.00564583810177768 0.00579842832074464 0.00172270992397138 0.00172552409099793 245028 256453 667 665 0 True 565 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 607 586 0.00583665594531642 0.00603245353025503 0.00581368734264134 0.00610360875867857 0.00145092392956847 0.00152217955830863 255131 262899 667 665 0 True 609 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 651 585 0.00575393237233523 0.00586006100166874 0.00578316929884794 0.00587472343022812 0.00156363863345072 0.00148143836948625 251515 255386 667 665 0 True 654 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 252 632 0.00610257928943516 0.00612347990599066 0.00616464484626535 0.00611886778057527 0.00134058498567507 0.00130904189577405 266755 266866 667 665 0 False 252 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 297 632 0.00590935935099514 0.0057477408329705 0.00592050049591821 0.00582894636453803 0.00131033540509039 0.00126812777644816 258309 250491 667 665 0 False 297 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 342 631 0.00576020069617286 0.00571004072323175 0.00579842832074464 0.00573739223315786 0.00137163236624312 0.00127982720384741 251789 248848 667 665 0 True 341 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 386 631 0.00560161667849984 0.00558629349753418 0.00563057907988098 0.00552376592660411 0.00128899558040847 0.00123076837928691 244857 243455 667 665 0 True 386 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 431 632 0.00576701807027363 0.00573954914753122 0.00570687418936446 0.00579842832074464 0.00155848618006751 0.00169854444614724 252087 250134 667 665 0 False 431 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 475 631 0.0056509854479947 0.0057809664926794 0.0055542839703975 0.00581368734264134 0.00172197194383574 0.00174726681056027 247015 251939 667 665 0 False 475 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 520 631 0.00563954690084576 0.00560618759074385 0.00567635614557107 0.00561532005798428 0.00171488280164789 0.0018471475003002 246515 244322 667 665 0 False 520 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 565 631 0.00581590642078823 0.00568546566691391 0.00578316929884794 0.00563057907988098 0.00176080203217518 0.00161527910772834 254224 247777 667 665 0 False 565 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 609 631 0.00611548197061918 0.00608091526596303 0.00610360875867857 0.00616464484626535 0.0015634061976895 0.00129133314581424 267319 265011 667 665 0 False 609 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 654 631 0.00624588140811718 0.00616430065780152 0.00622568093385214 0.00624093995574884 0.00148909724315792 0.00137926737014699 273019 268645 667 665 0 False 654 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 253 681 0.00828580902956624 0.770974472115285 0.00784313725490196 0.781628137636378 0.0023435098075179 0.191268693983577 362188 33599665 667 665 16 True 252 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 297 676 0.00644237277104181 0.006276942069066 0.0063782711528191 0.00628671702143893 0.00186453984662925 0.00133677344254922 281608 273554 667 665 0 False 297 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 341 675 0.00559704125964026 0.00546660769570986 0.00558480201419089 0.00550850690470741 0.0012767619692818 0.00133905401985835 244657 238239 667 665 0 False 341 675 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 386 675 0.00554840455716294 0.00564315343175976 0.0055542839703975 0.00561532005798428 0.00127084448376556 0.00127856964128391 242531 245933 667 665 0 False 386 675 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 431 675 0.00571929645156822 0.00556424248995113 0.00570687418936446 0.0055390249485008 0.00143731936164221 0.00152040002660874 250001 242494 667 665 0 False 431 675 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 476 675 0.00562861164977136 0.00554205380698255 0.00563057907988098 0.00550850690470741 0.00159506204965779 0.00145242677965674 246037 241527 667 665 0 False 476 675 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 520 675 0.00555261394251375 0.0055423750495488 0.00549324788281071 0.00564583810177768 0.0016723197382752 0.00161471542163185 242715 241541 667 665 0 False 520 675 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 565 675 0.00574258533356348 0.00579858894202776 0.00575265125505455 0.00575265125505455 0.00156412127499995 0.00145374904753542 251019 252707 667 665 0 False 565 675 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 610 674 0.00691380105323854 0.00644180834324309 0.00657663843747616 0.00646982528419928 0.00212263763394214 0.00136476519824556 302215 280739 667 665 0 False 610 674 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 650 680 0.00816133475949139 0.790836303392953 0.00805676356145571 0.79847409781033 0.00178807297292627 0.182545193474823 356747 34465259 667 665 19 True 654 674 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B1_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B1_3.csv new file mode 100755 index 0000000..1c1db20 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B1_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 251 284 0.00107055650476433 0.0823572320593197 0.000915541313801785 0.079819943541619 0.00080683148736846 0.021354343172892 46796 3589192 667 665 0 True 251 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 295 284 0.000949422290456969 0.000868364548358766 0.000778210116731518 0.000747692072938125 0.000728288818511458 0.00065314023056514 41501 37844 667 665 0 False 295 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 340 285 0.000883787906916306 0.000837433478408771 0.000762951094834821 0.000686655985351339 0.000659684581389879 0.000699987803077478 38632 36496 667 665 0 True 340 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 384 284 0.000913825531729443 0.000956545632793359 0.00080872816052491 0.000869764248111696 0.000659827159723183 0.000655957535681319 39945 41687 667 665 0 True 385 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 428 284 0.000884794499065414 0.000844110734607175 0.000610360875867857 0.000610360875867857 0.000832840892213753 0.000766613742172405 38676 36787 667 665 0 True 429 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 471 285 0.000948735977628032 0.000962993430015873 0.000671396963454643 0.000579842832074464 0.000896463698768057 0.0010027889204309 41471 41968 667 665 0 True 474 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 516 283 0.000864044974537222 0.000828759929120122 0.000656137941557946 0.000595101853971161 0.000783730226399702 0.000794977487971111 37769 36118 667 665 0 True 519 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 560 282 0.000929450587134906 0.000891746418001974 0.000671396963454643 0.000686655985351339 0.000885875185795123 0.000773231783696582 40628 38863 667 665 0 True 563 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 608 283 0.000936176452858487 0.000991446343026254 0.000488288700694286 0.000625619897764553 0.00101921158243441 0.00102434053721217 40922 43208 667 665 0 False 608 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 648 283 0.000990257903778713 0.0811996803636466 0.000656137941557946 0.0773327229724575 0.000981972549209343 0.0219433351392919 43286 3538745 667 665 0 True 653 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 251 328 0.000882323772881241 0.000899203834718405 0.000717174029144732 0.000717174029144732 0.000713845750551639 0.000760870662942366 38568 39188 667 665 0 False 251 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 295 327 0.00088516053257418 0.000813799203892083 0.000747692072938125 0.000671396963454643 0.000673572986303268 0.000625073030073325 38692 35466 667 665 0 False 295 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 339 328 0.000875986817760724 0.000864417853973455 0.000762951094834821 0.000717174029144732 0.000621294026909389 0.000655107866052803 38291 37672 667 665 0 True 340 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 383 328 0.000905040727519051 0.000838924961752057 0.000778210116731518 0.000701915007248035 0.000686608739077289 0.000615902310883612 39561 36561 667 665 0 True 385 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 428 328 0.000879738661225579 0.000840577066378466 0.000625619897764553 0.000549324788281071 0.000850089362451645 0.000845167456639897 38455 36633 667 665 0 True 430 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 473 327 0.00097017181498516 0.000858245407522009 0.000732433051041428 0.000625619897764553 0.000868039824985501 0.000811763024145791 42408 37403 667 665 0 True 474 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 516 327 0.000906848017968585 0.000880365252797822 0.000671396963454643 0.00064087891966125 0.000876802885112484 0.000863551098497741 39640 38367 667 665 0 True 519 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 560 326 0.000957223379612551 0.00089254952441759 0.000625619897764553 0.000747692072938125 0.00125887848674722 0.000708496614408926 41842 38898 667 665 0 True 564 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 608 326 0.000820441232805433 0.000930731498005715 0.000289921416037232 0.000488288700694286 0.000997468257198082 0.00108999146596321 35863 40562 667 665 0 False 608 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 653 326 0.000904354414690114 0.000851682880811551 0.000442511635004196 0.000442511635004196 0.00100458771404058 0.000892835937036014 39531 37117 667 665 0 False 653 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 251 373 0.000905155112990541 0.000973204354442985 0.000717174029144732 0.000793469138628214 0.000789476052757777 0.000825747993271668 39566 42413 667 665 0 True 251 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 294 372 0.00092288486107141 0.000929148231072072 0.000747692072938125 0.000793469138628214 0.00075730806933407 0.000747701720574821 40341 40493 667 665 0 True 296 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 340 371 0.00084874019845193 0.000827750309626206 0.000732433051041428 0.000671396963454643 0.00066648506328327 0.000705218812592018 37100 36074 667 665 0 False 340 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 383 371 0.000886761929175033 0.000838511935595455 0.000747692072938125 0.000686655985351339 0.000703843319621767 0.000683876317431312 38762 36543 667 665 0 True 385 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 428 372 0.000904926342047562 0.000922723379747148 0.000656137941557946 0.00064087891966125 0.000820605281397132 0.00086711836142841 39556 40213 667 665 0 True 430 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 472 371 0.000913573883692166 0.000977357561906598 0.000610360875867857 0.000610360875867857 0.000869419801684349 0.000956522609282862 39934 42594 667 665 0 True 474 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 515 370 0.000869009303999865 0.000890369664146634 0.000579842832074464 0.000595101853971161 0.000891316818186638 0.000918196770441189 37986 38803 667 665 0 True 519 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 560 370 0.000908289274909352 0.000908864057603381 0.000595101853971161 0.000625619897764553 0.000952931902167349 0.00086106219406418 39703 39609 667 665 0 True 564 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 604 371 0.00098865650717786 0.00093855604908357 0.000503547722590982 0.000549324788281071 0.00109763266916953 0.00107507895261977 43216 40903 667 665 0 True 608 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 648 371 0.000871800309504209 0.00088695072540587 0.000473029678797589 0.000549324788281071 0.000959364964943836 0.000898338423866481 38108 38654 667 665 0 True 653 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 250 416 0.000985316451410367 0.000902485098073635 0.00080872816052491 0.000747692072938125 0.000875761496512547 0.000787268524414925 43070 39331 667 665 0 True 251 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 295 416 0.000896942236137596 0.000880388198695411 0.000778210116731518 0.000686655985351339 0.000711842599368826 0.000770818749810067 39207 38368 667 665 0 True 296 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 339 416 0.000940774748812364 0.000928023882090211 0.00080872816052491 0.000854505226215 0.000717293271805132 0.000658580065425709 41123 40444 667 665 0 True 340 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 384 416 0.000920025224284173 0.000892388903134467 0.000701915007248035 0.000747692072938125 0.000780404436338173 0.000743040907861659 40216 38891 667 665 0 True 385 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 428 415 0.000877062041192725 0.000963957157714612 0.000656137941557946 0.000717174029144732 0.000822503587927926 0.000826221614271018 38338 42010 667 665 0 True 430 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 471 414 0.000927506034119585 0.000954962365859717 0.000625619897764553 0.000747692072938125 0.000907236035281739 0.000772699476633434 40543 41618 667 665 0 True 475 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 516 414 0.000833046511763574 0.000872058837870598 0.000579842832074464 0.000610360875867857 0.000818613644628662 0.000894685926010872 36414 38005 667 665 0 True 519 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 559 414 0.000810169417465678 0.000900006941134021 0.000503547722590982 0.00064087891966125 0.000864771551482543 0.000863961069599924 35414 39223 667 665 0 True 564 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 605 415 0.000936062067386998 0.000902668665254347 0.000473029678797589 0.000564583810177768 0.00105698726918258 0.0009367788053447 40917 39339 667 665 0 True 609 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 647 414 0.000939013212551426 0.000790164929375396 0.000564583810177768 0.0004272526131075 0.000967013299540518 0.000873016047612233 41046 34436 667 665 0 True 653 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 252 460 0.000910462598867652 0.000952461263022514 0.000732433051041428 0.000762951094834821 0.000817322933448356 0.000810981284633271 39798 41509 667 665 0 True 251 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 295 459 0.000870862348637995 0.000884564352056612 0.000762951094834821 0.000732433051041428 0.000745951749221947 0.000811245779125879 38067 38550 667 665 0 True 296 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 339 460 0.000871594415655528 0.000938418373698035 0.000717174029144732 0.000823987182421607 0.000730996678010699 0.000796253558557869 38099 40897 667 665 0 True 341 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 383 460 0.000891337348034612 0.000956591524588537 0.000686655985351339 0.000823987182421607 0.00078350203054636 0.00079304015202578 38962 41689 667 665 0 True 385 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 428 460 0.000898154722135385 0.000948560460432381 0.000518806744487678 0.000549324788281071 0.000960827492005179 0.00104429607513657 39260 41339 667 665 0 True 430 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 472 459 0.000961958938132216 0.000945508656053042 0.000625619897764553 0.000473029678797589 0.000997182615035491 0.00106329096670362 42049 41206 667 665 0 True 475 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 516 458 0.000892206677617932 0.000947826191709533 0.000595101853971161 0.000610360875867857 0.000892548641068682 0.000986228315021142 39000 41307 667 665 0 True 519 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 560 458 0.000897605671872235 0.000838787286366523 0.000595101853971161 0.0004272526131075 0.000929653050567186 0.000966320029676305 39236 36555 667 665 0 True 564 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 606 459 0.000929885251926566 0.000900672372164102 0.000473029678797589 0.000534065766384375 0.000957573148482994 0.000954944433729866 40647 39252 667 665 0 True 609 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 649 458 0.000830621539767997 0.000956729199974071 0.0004272526131075 0.000503547722590982 0.000887417376379456 0.00103798289428627 36308 41695 667 665 0 True 654 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 253 504 0.000885389303517159 0.000958771384859494 0.000732433051041428 0.000778210116731518 0.00076743273574461 0.000777834224378196 38702 41784 667 665 0 True 251 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 297 504 0.000856426902136023 0.000845235083589037 0.000747692072938125 0.000671396963454643 0.000770882404571907 0.000769938378372702 37436 36836 667 665 0 True 296 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 341 504 0.000915998855687743 0.000948721081715504 0.000793469138628214 0.000778210116731518 0.000777367783859008 0.000819237666010169 40040 41346 667 665 0 True 341 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 385 504 0.000951893016641142 0.000906867764513137 0.000732433051041428 0.000717174029144732 0.000863080633785516 0.000801207228071621 41609 39522 667 665 0 True 385 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 429 504 0.000856404025041725 0.000909850731199709 0.000457770656900893 0.000549324788281071 0.000952745485293678 0.000934561227690884 37435 39652 667 665 0 True 430 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 473 503 0.000929427710040608 0.000887157238484171 0.000549324788281071 0.000549324788281071 0.000993737202354841 0.000851988944319055 40627 38663 667 665 0 True 475 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 518 502 0.000854505226215 0.000890966257483948 0.000503547722590982 0.000595101853971161 0.000893299606645155 0.000851811830060499 37352 38829 667 665 0 True 520 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 562 502 0.00091016519664178 0.000787388475767124 0.000595101853971161 0.000488288700694286 0.000937549587057361 0.000829343236280167 39785 34315 667 665 0 True 564 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 606 502 0.000904651816915987 0.000855262440835437 0.000534065766384375 0.000503547722590982 0.000941949954342735 0.000914583464466419 39544 37273 667 665 0 True 609 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 650 503 0.000903942626992752 0.000926578290542102 0.000473029678797589 0.000396734569314107 0.000985471410691065 0.0010891064708624 39513 40381 667 665 0 True 654 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 253 548 0.000911080280413696 0.0009121682668562 0.000717174029144732 0.000732433051041428 0.000737926305500812 0.000737654827219785 39825 39753 667 665 0 True 251 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 296 547 0.000953197011016122 0.000857144004437737 0.00080872816052491 0.000747692072938125 0.000790652910463649 0.000680115881984933 41666 37355 667 665 0 True 296 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 341 548 0.000949971340720118 0.000915128287645183 0.000854505226215 0.000778210116731518 0.000728636374935652 0.000713813249459776 41525 39882 667 665 0 True 341 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 385 548 0.000895180699876658 0.000873091403262104 0.000732433051041428 0.000747692072938125 0.000752881507855692 0.000702891370358161 39130 38050 667 665 0 True 386 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 429 547 0.000866584332004289 0.000919052036132905 0.000534065766384375 0.000503547722590982 0.000919511799828888 0.000995162027192323 37880 40053 667 665 0 True 430 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 473 545 0.000885572320271542 0.00091099802607916 0.000488288700694286 0.000442511635004196 0.000979445184029025 0.001050653406821 38710 39702 667 665 0 True 475 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 518 545 0.00088678480626933 0.000918730793566659 0.000473029678797589 0.000488288700694286 0.000939320581769436 0.00101839719357819 38763 40039 667 665 0 True 520 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 562 544 0.00082144782495454 0.000777361118520724 0.000488288700694286 0.000381475547417411 0.000848115895277784 0.000912048968728617 35907 33878 667 665 0 True 564 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 607 545 0.00086276385725654 0.000850329072853798 0.000579842832074464 0.000595101853971161 0.000850508650979804 0.000806550387903613 37713 37058 667 665 0 True 609 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 651 544 0.000864479639328882 0.000898263052917255 0.000503547722590982 0.000457770656900893 0.000935848111603929 0.00103327682261206 37788 39147 667 665 0 True 654 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 254 590 0.000887745644229842 0.0009399557488365 0.000732433051041428 0.000854505226215 0.000704736589148074 0.000639100220348973 38805 40964 667 665 0 True 252 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 298 588 0.000865440477289394 0.000903173475001305 0.000762951094834821 0.00080872816052491 0.000671601122251505 0.000715358792695232 37830 39361 667 665 0 True 296 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 342 589 0.0008795098902826 0.00090982778530212 0.000778210116731518 0.000732433051041428 0.000681374173983459 0.000797148227931394 38445 39651 667 665 0 True 341 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 386 588 0.000906298967705435 0.000809600104633293 0.000793469138628214 0.000686655985351339 0.000678868770795026 0.000610696891606099 39616 35283 667 665 0 True 386 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 431 588 0.000881523074580814 0.000886973671303459 0.000549324788281071 0.000442511635004196 0.000931234693633768 0.000977778478443392 38533 38655 667 665 0 True 430 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 475 587 0.000873996510556807 0.000955444229709086 0.0004272526131075 0.000564583810177768 0.00100835111540949 0.000982876787850929 38204 41639 667 665 0 True 475 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 519 586 0.000832039919614466 0.000940758855252115 0.000350957503624018 0.000473029678797589 0.000985227780753459 0.00108359636271012 36370 40999 667 665 0 True 520 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 562 585 0.000916730922705276 0.000917744119970331 0.000488288700694286 0.000534065766384375 0.000989565638423635 0.000950248836682439 40072 39996 667 665 0 True 565 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 607 586 0.000936199329952785 0.000916780392271592 0.000671396963454643 0.000686655985351339 0.000840807361353918 0.00079817840363771 40923 39954 667 665 0 True 609 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 651 585 0.000913276481466294 0.000910837404796037 0.000686655985351339 0.000671396963454643 0.000840782410654941 0.000796734373792588 39921 39695 667 665 0 True 654 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 252 632 0.000968364524535627 0.000980156961412458 0.00080872816052491 0.000823987182421607 0.000700588816324172 0.000746537425249902 42329 42716 667 665 0 False 252 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 297 632 0.000833343913989446 0.000911388106338173 0.000701915007248035 0.000762951094834821 0.000664784691608483 0.000739690481233932 36427 39719 667 665 0 False 297 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 342 631 0.000919865084624088 0.000848126266685253 0.000793469138628214 0.000732433051041428 0.000711266499455613 0.000655912388229505 40209 36962 667 665 0 True 341 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 386 631 0.000916456397573701 0.000870888597093558 0.000762951094834821 0.000762951094834821 0.000701043047585274 0.000658253129450865 40060 37954 667 665 0 True 386 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 431 632 0.000910897263659313 0.000887294913869705 0.000625619897764553 0.000610360875867857 0.00089071579879112 0.000848153109521435 39817 38669 667 665 0 False 431 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 475 631 0.000875254750743191 0.000890071367477976 0.000549324788281071 0.000518806744487678 0.00092964651058835 0.000949589625296101 38259 38790 667 665 0 False 475 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 520 631 0.000868711901773993 0.00086944300554545 0.000503547722590982 0.000457770656900893 0.000967335078015661 0.000940058795833321 37973 37891 667 665 0 False 520 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 565 631 0.000890536649734185 0.000802624551766232 0.000610360875867857 0.000518806744487678 0.000875273209665079 0.000814922043928614 38927 34979 667 665 0 False 565 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 609 631 0.000969393993779032 0.000864945609618002 0.000823987182421607 0.000701915007248035 0.000740942083420684 0.000704883636337485 42374 37695 667 665 0 False 609 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 654 631 0.000939219106400107 0.00095489352816695 0.000793469138628214 0.000778210116731518 0.0007594664973912 0.000747781768518591 41055 41615 667 665 0 False 654 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 253 681 0.00111603616822854 0.080775617230304 0.000991836423285267 0.0778362706950484 0.000740256233228294 0.0249157396491765 48784 3520264 667 665 0 True 252 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 297 676 0.000925355587255583 0.000892618362110357 0.000793469138628214 0.000717174029144732 0.000726569505515826 0.000703514470989345 40449 38901 667 665 0 False 297 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 341 675 0.000871228382146761 0.000950396132239502 0.000732433051041428 0.00080872816052491 0.000676693400486682 0.000736433661879216 38083 41419 667 665 0 False 341 675 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 386 675 0.000816323355831812 0.000878208338424454 0.000686655985351339 0.000762951094834821 0.000674780162736458 0.000664142420998158 35683 38273 667 665 0 False 386 675 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 431 675 0.000882278018692645 0.000913177886350117 0.000671396963454643 0.000747692072938125 0.000817115825689709 0.000776237880239161 38566 39797 667 665 0 False 431 675 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 476 675 0.000882598298012816 0.000877749420472674 0.00064087891966125 0.000625619897764553 0.000820421901901876 0.000785358204208047 38580 38253 667 665 0 False 476 675 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 520 675 0.000890170616225419 0.000821761430355472 0.000564583810177768 0.000473029678797589 0.000923905312778011 0.000905750890225539 38911 35813 667 665 0 False 520 675 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 565 675 0.00084135089699371 0.000834358728131843 0.000579842832074464 0.000610360875867857 0.000835326797413583 0.000773939861648289 36777 36362 667 665 0 False 565 675 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 610 674 0.000981610362134108 0.000961272487696697 0.00080872816052491 0.00080872816052491 0.000744464205757321 0.000730139170138792 42908 41893 667 665 0 False 610 674 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 650 680 0.00104726762276907 0.0829220453284734 0.000869764248111696 0.080521858548867 0.000828378686753574 0.0237615461371345 45778 3613807 667 665 0 True 654 674 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B2_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B2_1.csv new file mode 100755 index 0000000..a5f8a3b --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B2_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 272 264 0.00909206646390698 0.0411656286516245 0.00917067215991455 0.040665293354696 0.00148355868500476 0.00811013659937519 397431 1794030 667 665 0 True 271 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 316 264 0.00897296831099214 0.00898393844533513 0.00901808194094758 0.00901808194094758 0.00136568411982909 0.00134865664195358 392225 391527 667 665 0 False 316 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 360 264 0.00922809366660227 0.0616763928590072 0.00926222629129473 0.0610818646524758 0.00135548411704925 0.00897362775819356 403377 2687905 667 665 0 True 361 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 404 264 0.00941648653814544 0.103462295014258 0.00943007553215839 0.100816357671473 0.00138806131939053 0.0236076592920488 411612 4508967 667 665 0 True 405 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 448 263 0.00921329218659153 0.074509780975671 0.00927748531319142 0.0715190356298161 0.0016664807000637 0.0157637823066246 402730 3247194 667 665 0 True 450 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 493 262 0.00927224645859721 0.0635210135661883 0.00932326237888151 0.0674296177615015 0.00165847711008227 0.0174076130572501 405307 2768295 667 665 0 True 495 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 536 261 0.00902874266689041 0.0754428529552308 0.00906385900663768 0.074692912184329 0.0015890119659957 0.0259682446404234 394663 3287858 667 665 0 True 539 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 582 262 0.00893565577019227 0.0640089121866236 0.00892652780956741 0.0634622720683604 0.00186859320985786 0.0172174070651015 390594 2789558 667 665 0 True 584 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 629 263 0.00888626412360311 0.0089635165964809 0.00898756389715419 0.0089723048752575 0.00190036233295037 0.00185226408407545 388435 390637 667 665 0 False 629 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 669 262 0.00901911141019099 0.041319916867013 0.00898756389715419 0.0403143358510719 0.00170847643028088 0.00808419928531555 394242 1800754 667 665 0 True 673 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 271 308 0.00905200867179136 0.00909726823352728 0.00906385900663768 0.00909437705043107 0.00161764857596974 0.00150390884822049 395680 396466 667 665 0 False 271 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 316 307 0.00939877966715887 0.00924435143707288 0.00932326237888151 0.00918593118181125 0.00182452348084778 0.0012931442177902 410838 402876 667 665 0 False 316 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 361 308 0.00968703105531235 0.0996256950455792 0.00952162966353857 0.0977035172045472 0.0022578668172516 0.0205984007833564 423438 4341765 667 665 0 True 361 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 406 308 0.00960510818063159 0.0548547840188707 0.00961318379491875 0.0535591668574044 0.00154906245488139 0.00825460333667568 419857 2390614 667 665 0 True 405 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 449 307 0.00954096080822029 0.0731819477739898 0.00956740672922866 0.0699931334401465 0.00171020643426143 0.0129453711084083 417053 3189326 667 665 0 True 450 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 494 306 0.00920569699128463 0.0414515574814812 0.00920119020370794 0.0428015564202335 0.00168530664221137 0.00823749181532191 402398 1806491 667 665 0 True 495 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 539 306 0.00912912735666957 0.0403468731338532 0.00909437705043107 0.0432898451209277 0.00153313294292293 0.00900078805602379 399051 1758348 667 665 0 True 540 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 583 306 0.00910549531825985 0.0485546665932398 0.00914015411612116 0.050965133134966 0.00176687619779619 0.0109113217767872 398018 2116050 667 665 0 True 584 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 629 306 0.00896297102078395 0.00896688964342649 0.0089723048752575 0.00903334096284428 0.00204554671538666 0.00185318875711182 391788 390784 667 665 0 False 629 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 674 306 0.00884160803553362 0.00899818784773791 0.00885023270008392 0.00900282291905089 0.00186341438333551 0.00196891747077328 386483 392148 667 665 0 False 674 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 272 352 0.00927018752011039 0.0512435357104136 0.00927748531319142 0.0504615854123751 0.00142010921376708 0.013566057599202 405217 2233233 667 665 0 True 272 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 316 352 0.00930452603865154 0.0625310128147102 0.00926222629129473 0.0662699320973526 0.00138045713682236 0.0197556314668418 406718 2725150 667 665 0 True 316 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 361 352 0.0092625694477092 0.0391083912573836 0.00926222629129473 0.0401159685664149 0.00137245033492788 0.00696553238251454 404884 1704374 667 665 0 True 361 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 405 352 0.00934893047868375 0.0333485120445885 0.00929274433508812 0.0340581368734264 0.00140563050785229 0.00468331962636172 408659 1453354 667 665 0 True 406 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 449 351 0.00962409616889884 0.0675275049606162 0.00962844281681544 0.0654764629587243 0.00169739721504584 0.0124736061473081 420687 2942901 667 665 0 True 450 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 495 350 0.00947024770974549 0.0315983366518838 0.00955214770733196 0.032623788815137 0.00173978865429994 0.00559627063516672 413962 1377080 667 665 0 False 495 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 538 351 0.00925588933617421 0.0281100324627086 0.00930800335698482 0.0286411841000992 0.00167774124419944 0.00375312529947585 404592 1225057 667 665 0 True 540 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 582 350 0.00939221394109537 0.0500053521306126 0.00924696726939803 0.0500190737773709 0.00220388460122797 0.0109387416738154 410551 2179272 667 665 0 True 584 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 626 350 0.00932628215532884 0.0563870651680701 0.00920119020370794 0.0566720073243305 0.00199830997554095 0.0132567675686981 407669 2457392 667 665 0 True 629 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 670 350 0.00908083381060671 0.0606928628506492 0.00910963607232776 0.0619058518348974 0.00194387832462445 0.0158917044663014 396940 2645042 667 665 0 True 674 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 273 396 0.00913361126715196 0.0471692162427125 0.00910963607232776 0.0509498741130694 0.00143222468079003 0.0113926360111911 399247 2055671 667 665 0 True 272 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 318 396 0.00911313626775534 0.0322337773938164 0.00915541313801785 0.0325627527275502 0.00136216343603124 0.00328790199505745 398352 1404773 667 665 0 True 316 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 361 396 0.00942856564393473 0.0854351947619105 0.009399557488365 0.0818036163881895 0.00146930438233312 0.0210223300433197 412140 3723332 667 665 0 True 361 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 405 395 0.00959113027601557 0.0657168441818669 0.00958266575112535 0.0645304036011292 0.00150402060873631 0.0169835578810473 419246 2863991 667 665 0 True 406 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 450 396 0.00958369522036876 0.0445018244856821 0.00958266575112535 0.0458838788433661 0.00175543262948501 0.00894168746485334 418921 1939424 667 665 0 True 450 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 494 394 0.00970075731189109 0.0532268873144179 0.00970473792629892 0.0534218356603342 0.00175469159171202 0.0120844990388484 424038 2319669 667 665 0 True 495 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 539 394 0.00929500916742361 0.0423599396752352 0.00929274433508812 0.0429541466392004 0.0016984603799404 0.00585137866796967 406302 1846079 667 665 0 True 540 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 583 394 0.00935526743380427 0.0505997885535537 0.00935378042267491 0.0505226214999619 0.00189705324102048 0.00725994122975325 408936 2205178 667 665 0 True 585 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 627 394 0.00918410101426741 0.0424622095407895 0.00917067215991455 0.0434882124055848 0.00192341191877623 0.00641813652054924 401454 1850536 667 665 0 True 629 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 671 393 0.00926012159861932 0.0947549005266657 0.00918593118181125 0.0943770504310674 0.00187761339897476 0.0171629156999598 404777 4129492 667 665 0 True 674 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 274 440 0.00912812076452046 0.0506278972781003 0.00918593118181125 0.0505836575875486 0.00155497305470558 0.00878379043904132 399007 2206403 667 665 0 True 272 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 318 438 0.00923129645980397 0.0561927593072863 0.00930800335698482 0.0568856336308843 0.00148682433319485 0.00988466945241142 403517 2448924 667 665 0 True 317 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 362 440 0.0096908744071544 0.0358782284160848 0.00967421988250553 0.0365453574425879 0.0014025646668286 0.00370713511231074 423606 1563601 667 665 0 True 361 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 406 440 0.00964786546987436 0.056505879025786 0.00978103303578241 0.0540169375143053 0.00171930197146106 0.0142246682785893 421726 2462570 667 665 0 True 406 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 451 439 0.00986464881544121 0.100846852769369 0.00985732814526589 0.0999313344014649 0.00179699128827003 0.0166499532890453 431202 4394984 667 665 0 True 451 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 495 438 0.0097114866691168 0.0599938619723949 0.00971999694819562 0.0613260090028229 0.00181884639583948 0.0131178975126403 424507 2614579 667 665 0 True 495 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 539 437 0.00965482010654092 0.0523923450191053 0.00970473792629892 0.0518654154268711 0.00178566949382336 0.0087957112623841 422030 2283299 667 665 0 True 540 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 583 437 0.00949506935705871 0.0332704959927858 0.00950637064164187 0.0336919203479057 0.00182619070176468 0.00482332072076684 415047 1449954 667 665 0 True 585 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 628 438 0.00933909332813566 0.0404940940127843 0.00926222629129473 0.0409246967269398 0.00206874584101269 0.00438540626837753 408229 1764764 667 665 0 True 629 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 671 437 0.00938731824291562 0.0873344037594559 0.00933852140077821 0.0865949492637522 0.00185558495272203 0.019561014534068 410337 3806101 667 665 0 True 674 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 275 483 0.00918982028784189 0.0564061561548642 0.00918593118181125 0.0576638437476158 0.001526775692711 0.0147380259161066 401704 2458224 667 665 0 True 272 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 320 483 0.00924365009072484 0.0619287288947936 0.00923170824750134 0.0590676737621118 0.00154898575473555 0.0137200314817819 404057 2698902 667 665 0 True 317 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 363 483 0.0096397441013986 0.0739083919457605 0.00964370183871214 0.0710917830167086 0.00153978334119982 0.0156447097244156 421371 3220985 667 665 0 True 361 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 408 483 0.00996928864475979 0.0928092490324002 0.010101472495613 0.0875867856870375 0.00187408077530891 0.018700212260864 435776 4044699 667 665 0 True 406 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 452 483 0.00995970314224897 0.099970411265059 0.00999465934233616 0.0935072861829557 0.00199695932402018 0.0315629698395673 435357 4356788 667 665 0 True 451 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 496 482 0.00974703767365573 0.0466095428546188 0.00976577401388571 0.0473334859235523 0.0017906734490408 0.00724565508899875 426061 2031280 667 665 0 True 496 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 540 481 0.00965239513454534 0.0433049894133365 0.00959792477302205 0.0445716029602502 0.00175657107562873 0.00707860095918764 421924 1887265 667 665 0 True 540 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 584 481 0.00954937957892192 0.139429760026067 0.00958266575112535 0.137438010223545 0.00188725986198975 0.0356530425850354 417421 6076457 667 665 0 True 585 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 628 482 0.00923664969986968 0.0634671365986493 0.00921644922560464 0.0665293354695964 0.00194160166381512 0.0143942640617788 403751 2765947 667 665 0 True 630 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 673 482 0.00935865324376036 0.0901413295197252 0.00944533455405508 0.0919966430151827 0.00192440773621453 0.0175261384691277 409084 3928429 667 665 0 True 674 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 275 528 0.00942437913567821 0.0528335028461518 0.00929274433508812 0.056244754711223 0.00216043906519733 0.0114776220246516 411957 2302525 667 665 0 True 272 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 320 527 0.00943851717995431 0.110548699512572 0.00944533455405508 0.106691081101701 0.00149769677962054 0.0276345706523263 412575 4817798 667 665 0 True 317 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 364 527 0.00960444474489695 0.0613405337559968 0.00961318379491875 0.0645304036011292 0.00149934751195879 0.0115793313084746 419828 2673268 667 665 0 True 362 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 408 526 0.00990376864669062 0.0623921212966038 0.00999465934233616 0.0619058518348974 0.00174601067775574 0.00691335090546813 432912 2719097 667 665 0 True 406 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 453 527 0.0100790300661068 0.0576091636736611 0.0100709544518196 0.0581826504921035 0.00193258111355333 0.00720133941053288 440573 2510652 667 665 0 True 451 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 497 525 0.00997606026467197 0.0689243135304501 0.00997940032043946 0.0676279850461585 0.00189862234792628 0.0135860572241042 436072 3003775 667 665 0 True 496 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 541 524 0.0100434790615679 0.0797965157801806 0.00964370183871214 0.0763866636148623 0.00334734244112019 0.0192701324552391 439019 3477594 667 665 0 True 540 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 585 524 0.00953174133921824 0.0600628143946499 0.00952162966353857 0.0595254444190127 0.00184014328430344 0.0129211771473857 416650 2617584 667 665 0 True 585 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 629 524 0.00925007855422255 0.0514241658162343 0.00914015411612116 0.0501106279087511 0.00191316484862655 0.00750933549823777 404338 2241105 667 665 0 True 630 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 673 523 0.00943062458242154 0.0673631664420837 0.00944533455405508 0.0689250019073777 0.00185755914629042 0.0127437101960981 412230 2935739 667 665 0 True 674 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 276 569 0.00898472713746125 0.0453666324199145 0.0089723048752575 0.0460669871061265 0.00140610456052771 0.00876225266334248 392739 1977113 667 665 0 True 272 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 320 567 0.00930205531246736 0.0555862992340086 0.00932326237888151 0.0570229648279545 0.00143435227480854 0.0107230297213505 406610 2422494 667 665 0 True 317 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 364 569 0.00955885069596124 0.0469390229980995 0.00955214770733196 0.0477607385366598 0.00137425244259723 0.00795513302210138 417835 2045639 667 665 0 True 362 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 409 569 0.00979265459968574 0.0525312824290068 0.0098268101014725 0.0517891203173877 0.00172705196859036 0.00634979710662924 428055 2289354 667 665 0 True 406 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 453 568 0.00992950537777575 0.0943316863915339 0.00999465934233616 0.0889600976577401 0.00193428652360439 0.0202461763591837 434037 4111048 667 665 0 True 451 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 497 567 0.00963008996760489 0.0682543621585435 0.00956740672922866 0.0666208896009766 0.00195663440378988 0.0126056406272062 420949 2974578 667 665 0 True 496 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 541 566 0.00946336170436183 0.0574642373844889 0.00961318379491875 0.0572213321126116 0.0020228341894107 0.00734008913992579 413661 2504336 667 665 0 True 541 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 585 565 0.00940143341009742 0.0393040509261251 0.00946059357595178 0.0410009918364233 0.00168259382770767 0.00833626756092489 410954 1712901 667 665 0 True 585 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 629 567 0.00913608199333613 0.0494101814389487 0.00918593118181125 0.0489662012664988 0.00169429436512196 0.00666813819264899 399355 2153334 667 665 0 True 630 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 674 566 0.00927416813451823 0.0537140516661303 0.00930800335698482 0.0525062943465324 0.00173550082397407 0.00761896302211397 405391 2340900 667 665 0 True 675 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 273 612 0.00873495502191683 0.00877318037598001 0.00869764248111696 0.00885023270008392 0.0013311804726572 0.00144878953638988 381821 382342 667 665 0 False 273 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 317 612 0.00879779839995315 0.00873398878289796 0.00871290150301366 0.00875867856870375 0.00142168567600452 0.0014019165918704 384568 380634 667 665 0 False 317 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 364 611 0.00932115768620611 0.0777507513347342 0.00930800335698482 0.0744335088120851 0.00138507573880277 0.0134428993917802 407445 3388438 667 665 0 True 362 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 408 611 0.00943854005704861 0.0821478048520248 0.00943007553215839 0.0789806973373007 0.00157362879080181 0.0199715724560296 412576 3580065 667 665 0 True 407 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 451 611 0.00942954935898954 0.00938870407880539 0.00950637064164187 0.00935378042267491 0.00184575783271853 0.00191173958944942 412183 409167 667 665 0 False 451 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 496 611 0.00910037084913712 0.00908060951187766 0.00923170824750134 0.00927748531319142 0.00204906298963342 0.00214962208054947 397794 395740 667 665 0 False 496 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 541 611 0.00896514434474226 0.00894203923633758 0.0089723048752575 0.00886549172198062 0.00183984077865685 0.00196673110158698 391883 389701 667 665 0 False 541 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 585 611 0.00899973451132067 0.00900892652780957 0.0089723048752575 0.0089723048752575 0.00165953753411261 0.00180562420143079 393395 392616 667 665 0 False 585 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 630 611 0.00915102073591266 0.00894057069889189 0.00909437705043107 0.0089723048752575 0.00150171571915618 0.00140330824453749 400008 389637 667 665 0 False 630 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 675 610 0.00894052859127772 0.00911727705622491 0.0089723048752575 0.00912489509422446 0.00162858255702162 0.00157731132088209 390807 397338 667 665 0 False 675 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 274 660 0.00871313027395663 0.0397012673592886 0.00871290150301366 0.039810788128481 0.0013214327927842 0.00835718218760007 380867 1730212 667 665 0 True 273 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 317 655 0.00870205776031645 0.00884901656751171 0.00862134737163348 0.00886549172198062 0.00134721585353756 0.00126957008925599 380383 385647 667 665 0 False 317 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 362 655 0.00892579574254987 0.00880904481391164 0.00891126878767071 0.00878919661249714 0.00130895136293677 0.00125782610134207 390163 383905 667 665 0 False 362 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 407 655 0.00915644260726126 0.00896094665595093 0.00921644922560464 0.00900282291905089 0.00141022327644383 0.00139359582001056 400245 390525 667 665 0 False 407 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 452 655 0.00905967249838116 0.00887854793770877 0.00909437705043107 0.00885023270008392 0.00165451701959023 0.00159163393097735 396015 386934 667 665 0 False 452 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 496 655 0.00893471780932605 0.00897120347217322 0.00888075074387732 0.00904859998474098 0.00161253585668693 0.00163932448843769 390553 390972 667 665 0 False 496 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 541 655 0.00908556936912638 0.00880379020336375 0.00920119020370794 0.00885023270008392 0.00177821265125481 0.00184947771332283 397147 383676 667 665 0 False 541 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 586 654 0.00894233588172725 0.00879956815820738 0.0089723048752575 0.00881971465629053 0.00137670187532486 0.00130361521427512 390886 383492 667 665 0 False 586 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 630 654 0.00882001205851641 0.00866659668167902 0.00877393759060044 0.00866712443732357 0.0013546592673526 0.00137218744233907 385539 377697 667 665 0 False 630 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 671 659 0.00901442160585992 0.0408929625505742 0.00903334096284428 0.0411078049897002 0.00138071634121268 0.00768118188367088 394037 1782147 667 665 0 True 675 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B2_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B2_2.csv new file mode 100755 index 0000000..f451671 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B2_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 272 264 0.00733769073348425 0.724788831772725 0.00738536659800107 0.708903639276722 0.00163592051394514 0.173149986208267 320744 31586859 667 665 11 True 271 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 316 264 0.00615672937163828 0.00605939201402453 0.00611886778057527 0.00607309071488518 0.00141082769993841 0.0012446854329358 269122 264073 667 665 0 False 316 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 360 264 0.00566377374370723 0.00587373675663179 0.00570687418936446 0.00592050049591821 0.00120822818952612 0.00126359313498418 247574 255982 667 665 0 True 361 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 404 264 0.00585383664313414 0.00596331754081932 0.00588998245212482 0.0059662775616083 0.00131218028415247 0.00133009696327265 255882 259886 667 665 0 True 405 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 448 263 0.00572798974740142 0.00600760312316612 0.00567635614557107 0.00599679560540169 0.00151413202588595 0.00165342132435304 250381 261816 667 665 0 True 450 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 493 262 0.00610557618878819 0.00630718476208833 0.00605783169298848 0.00625619897764553 0.00159544849499288 0.00145537681824784 266886 274872 667 665 0 True 495 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 536 261 0.00616077861732901 0.00624172011626686 0.00617990386816205 0.00628671702143893 0.00155945299958625 0.00146846731992562 269299 272019 667 665 0 True 539 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 582 262 0.00663916153619231 0.00647028420215106 0.00662241550316625 0.00650034332799268 0.00181384564619412 0.0017646163916781 290210 281980 667 665 0 True 584 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 629 263 0.00799254755776152 0.00718270843049487 0.00755321583886473 0.00727855344472419 0.00348227736109084 0.00182502890199174 349369 313028 667 665 0 False 629 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 669 262 0.00854111740193076 0.744167560122554 0.0085297932402533 0.715266651407645 0.00184605128100216 0.163716944705821 373348 32431399 667 665 12 True 673 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 271 308 0.00622314157638507 0.00577711158188444 0.00617990386816205 0.00579842832074464 0.00153633196106297 0.00145880507150219 272025 251771 667 665 0 False 271 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 316 307 0.00605561261484158 0.00561160282257486 0.00602731364919509 0.00560006103608759 0.00138429240432175 0.00111866764827456 264702 244558 667 665 0 False 316 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 361 308 0.00599899180645429 0.00581566068983399 0.00604257267109178 0.00579842832074464 0.00133023470488833 0.00123358952030624 262227 253451 667 665 0 True 361 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 406 308 0.0059379785959618 0.00615360786952504 0.00601205462729839 0.00619516289005875 0.00145913189888804 0.00133908030296333 259560 268179 667 665 0 True 405 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 449 307 0.0060706657428896 0.0062107202086241 0.00610360875867857 0.00614938582436866 0.00170715447530412 0.0017483700615953 265360 270668 667 665 0 True 450 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 494 306 0.00635397567867474 0.006345894491321 0.00636301213092241 0.00630197604333562 0.00159003543992841 0.00159997986120178 277744 276559 667 665 0 True 495 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 539 306 0.00631696054010074 0.00651970966555781 0.00633249408712902 0.00657663843747616 0.0014329028831821 0.00138928891501687 276126 284134 667 665 0 True 540 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 583 306 0.00664060279313307 0.00670272614472781 0.00657663843747616 0.00671396963454643 0.00180096250786064 0.00184558048028 290273 292110 667 665 0 True 584 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 629 306 0.0067968304700934 0.00685889592371866 0.00685130083161669 0.00692759594110018 0.00188531378090232 0.00189852239038983 297102 298916 667 665 0 False 629 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 674 306 0.00689103834441214 0.00690772479378809 0.00685130083161669 0.00686655985351339 0.00201349730974137 0.0018192552334697 301220 301044 667 665 0 False 674 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 272 352 0.00548826067625377 0.00571107328862325 0.00556954299229419 0.00576791027695125 0.0014162432427187 0.00139689176762624 239902 248893 667 665 0 True 272 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 316 352 0.00578824801378208 0.00580148012512398 0.00575265125505455 0.00573739223315786 0.001303326239215 0.00129068553638283 253015 252833 667 665 0 True 316 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 361 352 0.00617775342129805 0.0059409911824652 0.00613412680247196 0.00593575951781491 0.00129762037366705 0.00138524651820529 270041 258913 667 665 0 True 361 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 405 352 0.00622904386671393 0.00620301038703419 0.00619516289005875 0.00621042191195544 0.00133066847185779 0.0014099532058885 272283 270332 667 665 0 True 406 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 449 351 0.00633139598660272 0.00650851206753437 0.00636301213092241 0.00648508430609598 0.00156016494186662 0.00160898217618005 276757 283646 667 665 0 True 450 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 495 350 0.00661191491688351 0.0066691104047599 0.00656137941557946 0.00665293354695964 0.00165458372661017 0.0016746748339492 289019 290645 667 665 0 False 495 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 538 351 0.00647268492098652 0.00652994353588251 0.00650034332799268 0.00659189745937285 0.00157548341828408 0.00161222741694586 282933 284580 667 665 0 True 540 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 582 350 0.00658114522505284 0.00671061953349843 0.00654612039368277 0.00669871061264973 0.00192542563426749 0.00186835594486457 287674 292454 667 665 0 True 584 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 626 350 0.00662081410656539 0.00663361310118969 0.00656137941557946 0.00677500572213321 0.00197042453257305 0.0020236228543719 289408 289098 667 665 0 True 629 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 670 350 0.00607588172038952 0.00631909368293703 0.00611886778057527 0.00625619897764553 0.00184436490704104 0.0019181966209917 265588 275391 667 665 0 True 674 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 273 396 0.00560278341030904 0.00575324784839187 0.00563057907988098 0.00569161516746777 0.00145472453549412 0.00142739041355657 244908 250731 667 665 0 True 272 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 318 396 0.00601280957141022 0.0692385346520341 0.0059662775616083 0.0706492713817044 0.00136148433785418 0.0109588820503449 262831 3017469 667 665 0 True 316 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 361 396 0.00627294501067159 0.00633747334690583 0.00624093995574884 0.00630197604333562 0.00134518176678535 0.001290436181136 274202 276192 667 665 0 True 361 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 405 395 0.00645532120641442 0.00636987295430152 0.00648508430609598 0.00634775310902571 0.00139956932525531 0.00143078489009621 282174 277604 667 665 0 True 406 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 450 396 0.00643438866513184 0.00646119762670581 0.00651560234988937 0.00656137941557946 0.00146378997068182 0.00162843175111349 281259 281584 667 665 0 True 450 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 494 394 0.00658569776681812 0.00699801690080087 0.00656137941557946 0.0068055237659266 0.0016674523116928 0.00232536465031634 287873 304979 667 665 0 True 495 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 539 394 0.00661328754254139 0.00653423441873165 0.00663767452506294 0.00657663843747616 0.00154555858821842 0.00160448233823825 289079 284767 667 665 0 True 540 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 583 394 0.00641114553732518 0.00646087638413957 0.00646982528419928 0.00653086137178607 0.00186531515859277 0.00179698664904916 280243 281570 667 665 0 True 585 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 627 394 0.00602237219682674 0.00586804617402972 0.00610360875867857 0.00582894636453803 0.00179982248124749 0.0018553084721336 263249 255734 667 665 0 True 629 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 671 393 0.00587952762003068 0.00596588748134929 0.005981536583505 0.00593575951781491 0.00174681682873729 0.00191761584741884 257005 259998 667 665 0 True 674 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 274 440 0.00589439773132431 0.00583108033301381 0.00585946440833143 0.00582894636453803 0.00144151104366721 0.00145340737322696 257655 254123 667 665 0 True 272 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 318 438 0.00594253113772709 0.00594860922046476 0.005981536583505 0.005981536583505 0.00132729396915968 0.00147017853358693 259759 259245 667 665 0 True 317 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 362 440 0.00616690967860085 0.00623701620726111 0.00617990386816205 0.00628671702143893 0.00135834945831013 0.00126026569778009 269567 271814 667 665 0 True 361 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 406 440 0.00630199892042992 0.00630461482155836 0.00625619897764553 0.00630197604333562 0.0015377882453541 0.00160296876350087 275472 274760 667 665 0 True 406 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 451 439 0.00648929369144679 0.00652191247172635 0.00645456626230259 0.00663767452506294 0.00173704629047844 0.0018423411526538 283659 284230 667 665 0 True 451 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 495 438 0.006504438327872 0.006846482193123 0.00653086137178607 0.0068207827878233 0.00178293473832331 0.00200167584572324 284321 298375 667 665 0 True 495 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 539 437 0.0063826178007357 0.00644052337297811 0.00643930724040589 0.00648508430609598 0.00161202705086865 0.00153592813407172 278996 280683 667 665 0 True 540 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 583 437 0.00593008599842903 0.00604585393444701 0.00601205462729839 0.00604257267109178 0.00184835645610499 0.00187089521924357 259215 263483 667 665 0 True 585 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 628 438 0.00581503709120491 0.00567695273890838 0.00582894636453803 0.00564583810177768 0.00183289091072896 0.00172636014002822 254186 247406 667 665 0 True 629 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 671 437 0.00566629022408 0.00565182698104841 0.00567635614557107 0.00566109712367437 0.00182182083719475 0.00180353640214248 247684 246311 667 665 0 True 674 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 275 483 0.00597490222615861 0.00587984036539047 0.00588998245212482 0.00593575951781491 0.00145448696862066 0.00151547369365069 261174 256248 667 665 0 True 272 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 320 483 0.00599979250475472 0.00640337396478149 0.00593575951781491 0.00613412680247196 0.00139137227919794 0.00269484440674325 262262 279064 667 665 0 True 317 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 363 483 0.00615753006993871 0.00609362729322735 0.00622568093385214 0.00611886778057527 0.00148852137621709 0.00141940894153887 269157 265565 667 665 0 True 361 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 408 483 0.00625269878221795 0.00634167244616462 0.00616464484626535 0.00636301213092241 0.00174457659830089 0.00165176409012754 273317 276375 667 665 0 True 406 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 452 483 0.00649826151241157 0.00661417792593179 0.00666819256885634 0.00665293354695964 0.00183553049823966 0.00194374269869154 284051 288251 667 665 0 True 451 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 496 482 0.00624945023482765 0.00642771956212344 0.00611886778057527 0.0063935301747158 0.00177137789323996 0.00187403639068709 273175 280125 667 665 0 True 496 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 540 481 0.00611950833921561 0.00590007864706399 0.00622568093385214 0.00590524147402152 0.00163853071592975 0.00162900137538414 267495 257130 667 665 0 True 540 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 584 481 0.00574386645084416 0.00581917141216511 0.00569161516746777 0.00590524147402152 0.00184579099764418 0.00187472713467765 251075 253604 667 665 0 True 585 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 628 482 0.00571961673088839 0.00589090028802838 0.00572213321126116 0.00585946440833143 0.00170682223203284 0.00162392253736457 250015 256730 667 665 0 True 630 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 673 482 0.00564249804601018 0.00608341636880023 0.00564583810177768 0.005981536583505 0.00177060004385307 0.00197739315993256 246644 265120 667 665 0 True 674 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 275 528 0.00579650664482362 0.0057072183778283 0.00579842832074464 0.00573739223315786 0.00152395243568238 0.00150463511675966 253376 248725 667 665 0 True 272 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 320 527 0.00587010225717995 0.00607875835158966 0.00582894636453803 0.00610360875867857 0.0014506773120074 0.00141408247197034 256593 264917 667 665 0 True 317 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 364 527 0.00613270842262549 0.00612997359500835 0.00604257267109178 0.00610360875867857 0.00141740561664271 0.00148032130258274 268072 267149 667 665 0 True 362 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 408 526 0.00619058747119917 0.00627272002390963 0.00619516289005875 0.00627145799954223 0.00169234493884813 0.00160065715700504 270602 273370 667 665 0 True 406 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 453 527 0.00633601715965089 0.00617497050018041 0.0063935301747158 0.00614938582436866 0.00182354421056522 0.00187264097413812 276959 269110 667 665 0 True 451 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 497 525 0.00628623660245867 0.00614734363948324 0.00622568093385214 0.00616464484626535 0.00185965457037995 0.00173615268577837 274783 267906 667 665 0 True 496 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 541 524 0.00639739640365215 0.00591946793052671 0.00610360875867857 0.0059510185397116 0.00273767013383891 0.00166710263309274 279642 257975 667 665 0 True 540 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 585 524 0.0059032740439119 0.00596776904495159 0.0059662775616083 0.00592050049591821 0.00167102858247451 0.00169657675767808 258043 260080 667 665 0 True 585 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 629 524 0.00595316898657561 0.00584971240185609 0.00602731364919509 0.00576791027695125 0.00169832682705107 0.0018406740737232 260224 254935 667 665 0 True 630 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 673 523 0.00594834191967875 0.00603298128589957 0.00592050049591821 0.005981536583505 0.00182764998847281 0.0018995092611151 260013 262922 667 665 0 True 674 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 276 569 0.00603138577198011 0.0060978952301789 0.00601205462729839 0.00613412680247196 0.00134490690057857 0.00126169689195637 263643 265751 667 665 0 True 272 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 320 567 0.0060739600444685 0.00628166892396934 0.00613412680247196 0.00630197604333562 0.0013837651274922 0.00147211118554314 265504 273760 667 665 0 True 317 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 364 569 0.00601644702940359 0.00613552650222489 0.00599679560540169 0.00613412680247196 0.00127878100459168 0.00132483831847811 262990 267391 667 665 0 True 362 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 409 569 0.00597137915363673 0.00603369260872483 0.00607309071488518 0.00614938582436866 0.0015963297404702 0.00158106182802023 261020 262953 667 665 0 True 406 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 453 568 0.00617230867285515 0.0062182464630333 0.00617990386816205 0.00617990386816205 0.00183869486167268 0.00184985747657357 269803 270996 667 665 0 True 451 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 497 567 0.00618569177301942 0.00629835059151656 0.00608834973678187 0.00633249408712902 0.00199906895470898 0.00209821832343279 270388 274487 667 665 0 True 496 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 541 566 0.00605970761472091 0.00627659788060217 0.00601205462729839 0.00625619897764553 0.00186189073026544 0.00183589194317347 264881 273539 667 665 0 True 541 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 585 565 0.00609306241820724 0.00612010685904507 0.00614938582436866 0.00610360875867857 0.00161227654968179 0.00144795628370404 266339 266719 667 665 0 True 585 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 629 567 0.00596776457273766 0.00604374291186882 0.005981536583505 0.0059662775616083 0.00155022285569189 0.00160739257825937 260862 263391 667 665 0 True 630 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 674 566 0.00592459549579754 0.00600670823316015 0.00590524147402152 0.005981536583505 0.00163973612644599 0.00179056931445248 258975 261777 667 665 0 True 675 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 273 612 0.00628998844592352 0.00634463246695361 0.00624093995574884 0.00633249408712902 0.00138283425519929 0.0014183085608888 274947 276504 667 665 0 False 273 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 317 612 0.00598631789621326 0.00619089495310719 0.0059510185397116 0.00624093995574884 0.00141184983647623 0.00133168912621352 261673 269804 667 665 0 False 317 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 364 611 0.00600290378957923 0.00626113234562717 0.005981536583505 0.00630197604333562 0.00131675747719009 0.00148794563122935 262398 272865 667 665 0 True 362 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 408 611 0.00578808787412199 0.00590459898888902 0.00573739223315786 0.00585946440833143 0.00143283319591823 0.00140474291713543 253008 257327 667 665 0 True 407 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 451 611 0.00581487695154483 0.00599255061434773 0.00581368734264134 0.00607309071488518 0.00182928932396851 0.00194757667891618 254179 261160 667 665 0 False 451 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 496 611 0.00613453859016932 0.00628143946499345 0.00616464484626535 0.00631723506523232 0.00181127252312364 0.00192027629425873 268152 273750 667 665 0 False 496 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 541 611 0.00580121932624898 0.00590558566248535 0.00584420538643473 0.0059662775616083 0.0017686674295643 0.00190722221829025 253582 257370 667 665 0 False 541 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 585 611 0.00602271535324121 0.00601921374734616 0.00604257267109178 0.00607309071488518 0.00157899239842575 0.00170122570159962 263264 262322 667 665 0 False 585 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 630 611 0.00599013837096101 0.00593424508857403 0.00601205462729839 0.00592050049591821 0.00141403243536605 0.00141763362496778 261840 258619 667 665 0 False 630 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 675 610 0.00607519540756058 0.00602377998096638 0.00610360875867857 0.005981536583505 0.0015486952173193 0.00151805682052429 265558 262521 667 665 0 False 675 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 274 660 0.0078731062484322 0.733269773197012 0.00770580605783169 0.727321278706035 0.00187311174603054 0.18659815451603 344148 31956465 667 665 10 True 273 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 317 655 0.00649272525559148 0.0061994308270103 0.00631723506523232 0.00616464484626535 0.00174791848004194 0.00129828838226596 283809 270176 667 665 0 False 317 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 362 655 0.00590832988175173 0.00582270508039382 0.0059510185397116 0.00579842832074464 0.00127678518162923 0.00121029141128126 258264 253758 667 665 0 False 362 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 407 655 0.0057010634074128 0.0056403540322539 0.00566109712367437 0.00567635614557107 0.00132239526362523 0.00135270247358314 249204 245811 667 665 0 False 407 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 452 655 0.00584507471601805 0.00590186842707593 0.00582894636453803 0.0059662775616083 0.00160872432966321 0.00157296520386522 255499 257208 667 665 0 False 452 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 496 655 0.00579913751066788 0.00596616283212036 0.00582894636453803 0.00601205462729839 0.00159999572464512 0.00161870454675694 253491 260010 667 665 0 False 496 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 541 655 0.00581874318048117 0.00599539590564876 0.00579842832074464 0.00601205462729839 0.00166289468469318 0.00178792010778488 254348 261284 667 665 0 False 541 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 586 654 0.00595918566237595 0.00598518498122165 0.0059510185397116 0.0059662775616083 0.00143041436559698 0.00121862656841223 260487 260839 667 665 0 False 586 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 630 654 0.00666681994319846 0.00624472602885102 0.00650034332799268 0.00624093995574884 0.00173450057085726 0.00134168007524894 291419 272150 667 665 0 False 630 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 671 659 0.0077328696603861 0.769834887057424 0.0076752880140383 0.763378347447929 0.00174493102278578 0.164649068612443 338018 33550001 667 665 14 True 675 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B2_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B2_3.csv new file mode 100755 index 0000000..d7c50d7 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B2_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 272 264 0.00110828083326156 0.0747176019701348 0.000946059357595178 0.0709544518196384 0.000790229214309611 0.0207933269966121 48445 3256251 667 665 0 True 271 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 316 264 0.000904445923067306 0.000984792032725439 0.000762951094834821 0.000854505226215 0.000669212896098895 0.000680927812021719 39535 42918 667 665 0 False 316 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 360 264 0.000919430419832428 0.00106420778428103 0.00080872816052491 0.000991836423285267 0.000661372322798604 0.000693473285775136 40190 46379 667 665 0 True 361 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 404 264 0.000944023296202665 0.000927174883879417 0.000793469138628214 0.000793469138628214 0.000710514624698805 0.000691173059956823 41265 40407 667 665 0 True 405 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 448 263 0.000928512626268692 0.000890759744405647 0.000686655985351339 0.000671396963454643 0.000838111566895439 0.00085688460221666 40587 38820 667 665 0 True 450 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 493 262 0.000865348968912202 0.000906684197332425 0.00064087891966125 0.000671396963454643 0.000808022148905213 0.000801771380309525 37826 39514 667 665 0 True 495 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 536 261 0.000926636704536265 0.000953906854570622 0.000762951094834821 0.000778210116731518 0.000803352161281347 0.000824310085695838 40505 41572 667 665 0 True 539 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 582 262 0.000922907738165708 0.000940552342173814 0.000610360875867857 0.00064087891966125 0.000909296791132131 0.00091346951421686 40342 40990 667 665 0 True 584 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 629 263 0.00107703072245063 0.000936284405222257 0.000717174029144732 0.000579842832074464 0.00105378771607438 0.000930098548046603 47079 40804 667 665 0 False 629 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 669 262 0.00111951348656182 0.0764831052224289 0.000778210116731518 0.0723125047684443 0.00101600049977131 0.0199347335385791 48936 3333193 667 665 0 True 673 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 271 308 0.000959167932627872 0.000952644830203226 0.000778210116731518 0.000793469138628214 0.000779729232458418 0.000746374598980512 41927 41517 667 665 0 False 271 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 316 307 0.000946608407858328 0.000881306034598972 0.000854505226215 0.000778210116731518 0.000681144926831434 0.000632095058539668 41378 38408 667 665 0 False 316 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 361 308 0.00095495854727706 0.00088275162614708 0.000854505226215 0.000762951094834821 0.000681381400201504 0.00064029305663173 41743 38471 667 665 0 True 361 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 406 308 0.00095527882659723 0.000900557642676157 0.000778210116731518 0.000686655985351339 0.000765065099871609 0.000796980867438846 41757 39247 667 665 0 True 405 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 449 307 0.000943359860468027 0.000903150529103716 0.000656137941557946 0.000579842832074464 0.000937481618749424 0.000903372449181365 41236 39360 667 665 0 True 450 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 494 306 0.000900808465073941 0.000862949316527758 0.000656137941557946 0.00064087891966125 0.000851545730191077 0.000807845637589155 39376 37608 667 665 0 True 495 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 539 306 0.000962805390621238 0.000882636896659135 0.000762951094834821 0.000701915007248035 0.000833569220744098 0.000781774032831981 42086 38466 667 665 0 True 540 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 583 306 0.000943954664919772 0.000900534696778568 0.000579842832074464 0.000518806744487678 0.000986251058792709 0.00101047270618754 41262 39246 667 665 0 True 584 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 629 306 0.00102320091956768 0.0010818072877318 0.000625619897764553 0.000671396963454643 0.00107896817424971 0.00111550060400037 44726 47146 667 665 0 False 629 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 674 306 0.00101702410410725 0.000987201351972286 0.00064087891966125 0.000595101853971161 0.00101105503590337 0.00100266210761267 44456 43023 667 665 0 False 674 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 272 352 0.000935627402595338 0.000979652151665499 0.000747692072938125 0.000823987182421607 0.000765392350586026 0.000773626786472836 40898 42694 667 665 0 True 272 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 316 352 0.000910622738527738 0.000984126601695358 0.00080872816052491 0.000854505226215 0.000666287287613535 0.000716061811841306 39805 42889 667 665 0 True 316 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 361 352 0.000936771257310232 0.000908565760934724 0.000823987182421607 0.00080872816052491 0.000661153295627412 0.000653128872131735 40948 39596 667 665 0 True 361 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 405 352 0.000942582039261898 0.000867056632196192 0.000762951094834821 0.000701915007248035 0.000766094648485531 0.000704794562663496 41202 37787 667 665 0 True 406 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 449 351 0.000918446704777618 0.000894958843664437 0.000656137941557946 0.000610360875867857 0.000853120615947735 0.000850001917876522 40147 39003 667 665 0 True 450 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 495 350 0.000860018605940792 0.000825363936276948 0.000564583810177768 0.000564583810177768 0.000858418852735954 0.000808591682930101 37593 35970 667 665 0 False 495 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 538 351 0.000930159777058141 0.000862398614985621 0.000732433051041428 0.000610360875867857 0.000847361986910612 0.000828409408789729 40659 37584 667 665 0 True 540 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 582 350 0.000936153575764189 0.000860884185744746 0.000564583810177768 0.000381475547417411 0.000990545827068028 0.00101628709969551 40921 37518 667 665 0 True 584 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 626 350 0.00104557471779102 0.00101354324240448 0.000656137941557946 0.000564583810177768 0.0010941632476906 0.00109949510417471 45704 44171 667 665 0 True 629 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 670 350 0.000922267179525367 0.00102600286479531 0.000579842832074464 0.000701915007248035 0.000945429365560259 0.00103828797758377 40314 44714 667 665 0 True 674 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 273 396 0.000953746061279271 0.000868135089382876 0.000793469138628214 0.000717174029144732 0.000786879290385108 0.000718775626777499 41690 37834 667 665 0 True 272 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 318 396 0.000937137290818999 0.00684304030848465 0.000839246204318303 0.00694285496299687 0.000684928106736648 0.00166426185679142 40964 298225 667 665 0 True 316 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 361 396 0.000916616537233786 0.000873045511466925 0.000793469138628214 0.000686655985351339 0.000707758579977184 0.000727855440591205 40067 38048 667 665 0 True 361 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 405 395 0.000916021732782041 0.000984172493490536 0.000717174029144732 0.000762951094834821 0.000798243202923775 0.000787062160148339 40041 42891 667 665 0 True 406 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 450 396 0.000939813910851853 0.00084351414126986 0.000732433051041428 0.000595101853971161 0.000845103568135714 0.000791825475424581 41081 36761 667 665 0 True 450 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 494 394 0.000895134945688062 0.000910929188386393 0.000610360875867857 0.00064087891966125 0.000871645380085126 0.000881613636845734 39128 39699 667 665 0 True 495 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 539 394 0.000922678967222729 0.000859369756503871 0.000671396963454643 0.000656137941557946 0.000872431772088614 0.000818593478568775 40332 37452 667 665 0 True 540 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 583 394 0.000932241592639249 0.000953929800468211 0.000595101853971161 0.000503547722590982 0.000938464124366127 0.00108082421338567 40750 41573 667 665 0 True 585 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 627 394 0.000861116706467092 0.000869420059647861 0.000473029678797589 0.000457770656900893 0.000934008622199583 0.000965230826788867 37641 37890 667 665 0 True 629 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 671 393 0.000870404806752037 0.000977219886521063 0.000549324788281071 0.000579842832074464 0.000899645351416099 0.00100855680711498 38047 42588 667 665 0 True 674 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 274 440 0.00100066698168426 0.000894775276483725 0.000869764248111696 0.000747692072938125 0.000799797273248945 0.000770193639301219 43741 38995 667 665 0 True 272 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 318 438 0.000978704971158275 0.00100496147670619 0.000869764248111696 0.000869764248111696 0.000774074755353885 0.000800912382405061 42781 43797 667 665 0 True 317 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 362 440 0.000998699551574636 0.000964943831310939 0.000885023270008392 0.000793469138628214 0.000777949468766645 0.000748602671969518 43655 42053 667 665 0 True 361 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 406 440 0.000986620445785347 0.00101847661038612 0.000778210116731518 0.000762951094834821 0.000889532388359204 0.00092497851928627 43127 44386 667 665 0 True 406 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 451 439 0.000929679358077885 0.000946403546059013 0.00064087891966125 0.000595101853971161 0.00095367617630203 0.000960960951022427 40638 41245 667 665 0 True 451 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 495 438 0.00095006284909731 0.000919258549211206 0.000701915007248035 0.000595101853971161 0.000919735199910113 0.00095924546584378 41529 40062 667 665 0 True 495 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 539 437 0.000847161678945375 0.000914072776356088 0.000564583810177768 0.000671396963454643 0.000825852206093468 0.000860537927724024 37031 39836 667 665 0 True 540 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 583 437 0.000838102349603408 0.000882132086912176 0.000488288700694286 0.000457770656900893 0.000902170435266007 0.000992189925914322 36635 38444 667 665 0 True 585 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 628 438 0.000949834078154331 0.000927404342855307 0.000610360875867857 0.000503547722590982 0.000986428525445757 0.000988011567870886 41519 40417 667 665 0 True 629 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 671 437 0.00090581854872518 0.000911571673518885 0.000549324788281071 0.000488288700694286 0.000960605511465299 0.000966932652525929 39595 39727 667 665 0 True 674 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 275 483 0.000924532011860858 0.000955857255865689 0.000778210116731518 0.000823987182421607 0.000784543380181838 0.000784204662630176 40413 41657 667 665 0 True 272 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 320 483 0.000938372653911085 0.00105732401500432 0.00080872816052491 0.000915541313801785 0.000826666804296045 0.000865992217857932 41018 46079 667 665 0 True 317 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 363 483 0.000976760418142954 0.00094298460731825 0.000823987182421607 0.00080872816052491 0.000816737119424385 0.000786297242483708 42696 41096 667 665 0 True 361 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 408 483 0.000974701479656143 0.000983392332972509 0.000717174029144732 0.000701915007248035 0.000894047618054032 0.000903801954167224 42606 42857 667 665 0 True 406 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 452 483 0.00094875885472233 0.000915701935084908 0.000503547722590982 0.000442511635004196 0.00103242712889838 0.00106964635087301 41472 39907 667 665 0 True 451 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 496 482 0.000927734805062564 0.000892847821086247 0.000595101853971161 0.000488288700694286 0.000957902548786461 0.000956814647957661 40553 38911 667 665 0 True 496 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 540 481 0.000859698326620622 0.000880663549466479 0.000534065766384375 0.000564583810177768 0.000880712220641246 0.000896116473921039 37579 38380 667 665 0 True 540 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 584 481 0.000933705726674314 0.000882774572044669 0.000595101853971161 0.0004272526131075 0.000980944101637927 0.00101924013628407 40814 38472 667 665 0 True 585 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 628 482 0.000905521146499307 0.000935320677523518 0.000518806744487678 0.000564583810177768 0.000978651362980723 0.000946077610621837 39582 40762 667 665 0 True 630 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 673 482 0.000829523439241698 0.000929400635945552 0.000442511635004196 0.000488288700694286 0.000937598732810496 0.00100032684988927 36260 40504 667 665 0 True 674 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 275 528 0.00101471351758316 0.000966871286708417 0.000854505226215 0.00080872816052491 0.000809264029917542 0.000819304371737971 44355 42137 667 665 0 True 272 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 320 527 0.00101018385291218 0.000976669184978927 0.000869764248111696 0.000869764248111696 0.000831997106204214 0.000797953855355318 44157 42564 667 665 0 True 317 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 364 527 0.000941506815829897 0.000926830695415582 0.00080872816052491 0.000778210116731518 0.000776296546148376 0.000821599472920995 41155 40392 667 665 0 True 362 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 408 526 0.000979368406892914 0.00100112951180882 0.000778210116731518 0.000701915007248035 0.000843206801108607 0.00094200671201134 42810 43630 667 665 0 True 406 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 453 527 0.000888592096718864 0.00078982074091156 0.000503547722590982 0.000335698481727321 0.000949687554874899 0.000959152101119925 38842 34421 667 665 0 True 451 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 497 525 0.000906298967705435 0.000792184168363229 0.000549324788281071 0.000411993591210803 0.000932821881670437 0.000907947095312449 39616 34524 667 665 0 True 496 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 541 524 0.000875277627837489 0.00083768588328225 0.000534065766384375 0.000534065766384375 0.000901211034290006 0.000851295180490286 38260 36507 667 665 0 True 540 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 585 524 0.000803649445590778 0.00090468790424218 0.000457770656900893 0.000579842832074464 0.000856207896048957 0.000897169406708869 35129 39427 667 665 0 True 585 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 629 524 0.000798021680393495 0.000917422877404085 0.000381475547417411 0.000473029678797589 0.000914569212903096 0.000993207444227922 34883 39982 667 665 0 True 630 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 673 523 0.000920414134887237 0.000919235603313617 0.000564583810177768 0.000488288700694286 0.000967627366043669 0.00101474251408481 40233 40061 667 665 0 True 674 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 276 569 0.000966099692200135 0.000944957954510905 0.000854505226215 0.000839246204318303 0.000726206777836221 0.000707747103924223 42230 41182 667 665 0 True 272 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 320 567 0.00107224940974237 0.00093341616802363 0.000946059357595178 0.000823987182421607 0.000826204848921038 0.000751674860871401 46870 40679 667 665 0 True 317 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 364 569 0.000908632431323821 0.000937890618053488 0.000762951094834821 0.000839246204318303 0.000697972872209867 0.000692969315047769 39718 40874 667 665 0 True 362 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 409 569 0.000995839914787399 0.000985021491701329 0.00080872816052491 0.000762951094834821 0.000857704702439081 0.000843938529870971 43530 42928 667 665 0 True 406 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 453 568 0.000891383102223207 0.000955650742787387 0.000473029678797589 0.000610360875867857 0.000993381909960647 0.000966333410384768 38964 41648 667 665 0 True 451 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 497 567 0.000906893772157181 0.000847346106167226 0.000442511635004196 0.000259403372243839 0.00106169705211827 0.00104503920843485 39642 36928 667 665 0 True 496 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 541 566 0.00088429120299086 0.000860677672666445 0.000411993591210803 0.000457770656900893 0.00099278509883561 0.000935353774039391 38654 37509 667 665 0 True 541 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 585 565 0.00085624388538164 0.00086127426600376 0.000564583810177768 0.000625619897764553 0.000850853703733075 0.000794414682114675 37428 37535 667 665 0 True 585 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 629 567 0.000879875923791366 0.000882889301532614 0.00064087891966125 0.000610360875867857 0.000818318118844564 0.000805179127206207 38461 38477 667 665 0 True 630 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 674 566 0.000918012039985958 0.000850833882600757 0.00064087891966125 0.000518806744487678 0.000857511241141105 0.000831795873897853 40128 37080 667 665 0 True 675 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 273 612 0.000977423853877593 0.000974695837786271 0.000854505226215 0.00080872816052491 0.000723709959992589 0.000763049271426037 42725 42478 667 665 0 False 273 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 317 612 0.000961707290094939 0.000952117074558679 0.000839246204318303 0.000778210116731518 0.000741072195754742 0.000756960077751004 42038 41494 667 665 0 False 317 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 364 611 0.000959877122551107 0.000947390219655341 0.000869764248111696 0.000823987182421607 0.00071666715876631 0.00074520790236439 41958 41288 667 665 0 True 362 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 408 611 0.000957612290215615 0.000883990704616887 0.000778210116731518 0.000717174029144732 0.000824947599128805 0.000734919882493604 41859 38525 667 665 0 True 407 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 451 611 0.000845102740458565 0.000907189007079383 0.000457770656900893 0.000457770656900893 0.000973142610954071 0.00100790183715222 36941 39536 667 665 0 False 451 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 496 611 0.000896118660742872 0.000899226780615994 0.000549324788281071 0.000442511635004196 0.000945871956967188 0.00104069392790086 39171 39189 667 665 0 False 496 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 541 611 0.000794887518474683 0.00092384772872901 0.000396734569314107 0.000442511635004196 0.000887223881653763 0.00107267906185163 34746 40262 667 665 0 False 541 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 585 611 0.000891543241883293 0.000914761153283759 0.000671396963454643 0.000625619897764553 0.000813022449357462 0.000874837656120053 38971 39866 667 665 0 False 585 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 630 611 0.000960952345983108 0.000892113552363399 0.000762951094834821 0.000701915007248035 0.0007795167409541 0.000766265867895445 42005 38879 667 665 0 False 630 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 675 610 0.000877633968550172 0.000923939512319366 0.000671396963454643 0.000625619897764553 0.000777707911179256 0.000827296339277311 38363 40266 667 665 0 False 675 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 274 660 0.00102681550046675 0.0748024100076238 0.000885023270008392 0.0731975280384527 0.000726038631336481 0.020848132762329 44884 3259947 667 665 0 True 273 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 317 655 0.000908243520720757 0.000905651631940919 0.000793469138628214 0.000823987182421607 0.000611999659768077 0.000618328933083943 39701 39469 667 665 0 False 317 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 362 655 0.000940591732057981 0.000979583313972732 0.000823987182421607 0.000915541313801785 0.000672824578085186 0.00062853066762813 41115 42691 667 665 0 False 362 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 407 655 0.000968227261969839 0.000965884613112089 0.000793469138628214 0.000762951094834821 0.000743305539881794 0.000764036455330832 42323 42094 667 665 0 False 407 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 452 655 0.000862123298616199 0.000902439206278456 0.000610360875867857 0.000671396963454643 0.000821163961874703 0.000825876504699777 37685 39329 667 665 0 False 452 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 496 655 0.000809849138145507 0.00085333498543796 0.000503547722590982 0.000564583810177768 0.000850630908766429 0.000832468168904826 35400 37189 667 665 0 False 496 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 541 655 0.000932630503242313 0.000857832381365407 0.000625619897764553 0.000503547722590982 0.000880749212394354 0.000846191430588599 40767 37385 667 665 0 False 541 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 586 654 0.000919087263417959 0.000924214863090434 0.000732433051041428 0.00080872816052491 0.00071165253193125 0.000678789983955547 40175 40278 667 665 0 False 586 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 630 654 0.000935741788066827 0.000887432589255239 0.000778210116731518 0.000701915007248035 0.000702806660261179 0.000741360155373859 40903 38675 667 665 0 False 630 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 671 659 0.00103086474615748 0.0795952114206321 0.000869764248111696 0.0769359884031434 0.000728588791959113 0.020458713115518 45061 3468821 667 665 0 True 675 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B3_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B3_1.csv new file mode 100755 index 0000000..a7dcd35 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B3_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 269 277 0.0101596718235069 0.0414338203026449 0.0101625085831998 0.0411230640115969 0.00150478729192662 0.00945344997133436 444098 1805718 667 665 0 True 269 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 313 275 0.00995858216462837 0.00991466994334084 0.00999465934233616 0.00985732814526589 0.00133137683521682 0.00157478669155787 435308 432089 667 665 0 False 313 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 356 276 0.00986579267015611 0.0605716167277888 0.0097962920576791 0.0629434653238727 0.00163999516977676 0.0136180501173134 431252 2639758 667 665 0 True 358 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 401 276 0.00992124674673421 0.0807948458924835 0.00988784618905928 0.080827038986801 0.00141772131074597 0.0149145226986796 433676 3521102 667 665 0 True 402 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 445 276 0.00968380538501635 0.0721488316809419 0.00965896086060884 0.0697795071335927 0.0016794348664783 0.0186111061059429 423297 3144302 667 665 0 True 447 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 488 274 0.00947091114548013 0.0612696768242419 0.0093842984664683 0.0661631189440757 0.00172178856675223 0.022098383194448 413991 2670180 667 665 0 True 491 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 533 274 0.00942113058828791 0.0785998642750158 0.009399557488365 0.0772869459067674 0.00151932317211226 0.0274663106534587 411815 3425443 667 665 0 True 536 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 577 274 0.00940141053300312 0.064096267218745 0.00941481651026169 0.0633859769588769 0.00178816390417351 0.0195264353233021 410953 2793365 667 665 0 True 580 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 625 275 0.00938521355024021 0.00938168263414315 0.009399557488365 0.00930800335698482 0.00188458301199787 0.00186185629908869 410245 408861 667 665 0 False 625 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 663 273 0.0093560452550104 0.0399670955828574 0.00944533455405508 0.0404821850919356 0.00180997797140882 0.00962017349774741 408970 1741797 667 665 0 True 670 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 269 319 0.00993664303119669 0.00974633883862781 0.00993362325474937 0.00976577401388571 0.00152370278807371 0.0015251044034547 434349 424753 667 665 0 False 269 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 313 319 0.009815943481681 0.00960898469565996 0.0097962920576791 0.00964370183871214 0.00132205646595638 0.00120525556585647 429073 418767 667 665 0 False 313 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 357 320 0.0101654826054585 0.113056479605973 0.0101319905394064 0.115266651407645 0.00147759677466516 0.0376709415255307 444352 4927089 667 665 0 True 358 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 401 320 0.00967547812269192 0.0490837072080522 0.00968947890440223 0.0500038147554742 0.00145265032783028 0.00978352602520767 422933 2139106 667 665 0 True 402 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 446 320 0.00978400705804113 0.0754469143791041 0.00975051499198901 0.0720683604180972 0.00174894808817169 0.0160565399006575 427677 3288035 667 665 0 True 447 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 490 319 0.00958486195217795 0.0433014327992102 0.00961318379491875 0.0439459830624857 0.00165415042981987 0.0111307312598442 418972 1887110 667 665 0 True 491 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 534 319 0.00958630320911872 0.0480048599411094 0.00959792477302205 0.0473945220111391 0.00155015264597327 0.0166873275778227 419035 2092089 667 665 0 True 536 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 578 319 0.00976652895799754 0.0486992486939482 0.00978103303578241 0.0513618677042802 0.00183036999777805 0.0111792712309336 426913 2122351 667 665 0 True 581 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 625 318 0.00925874897296145 0.00950760972011168 0.00926222629129473 0.00953688868543526 0.00188961805024135 0.00208089022912928 404717 414349 667 665 0 False 625 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 670 318 0.00932603050729156 0.00907308325746846 0.00933852140077821 0.00906385900663768 0.00183887068606739 0.001920800117643 407658 395412 667 665 0 False 670 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 269 365 0.00976787870656112 0.0525593911535534 0.00975051499198901 0.0523537041275654 0.00153547497234882 0.013885703268857 426972 2290579 667 665 0 True 269 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 314 365 0.00980473370547503 0.0654252018235105 0.0097962920576791 0.0673380636301213 0.00142634587246599 0.0218997191081059 428583 2851281 667 665 0 True 313 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 357 364 0.00978574571720777 0.0368798627376406 0.00975051499198901 0.0390630960555428 0.00143387515189851 0.00813128378502323 427753 1607253 667 665 0 True 358 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 402 365 0.0096517316988107 0.0335998843526761 0.00965896086060884 0.0345922026398108 0.00152697409585596 0.00624273563009651 421895 1464309 667 665 0 True 402 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 447 365 0.00974010591408347 0.0707869238213409 0.00973525597009232 0.0669871061264973 0.00168791054637563 0.0147498619533772 425758 3084949 667 665 0 True 447 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 490 363 0.00977478758903908 0.0301448746609027 0.00970473792629892 0.031616693369955 0.00174871041368852 0.00614650882734231 427274 1313737 667 665 0 True 491 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 534 363 0.00966207214543335 0.027598201271088 0.00970473792629892 0.028397039749752 0.00164813325447601 0.00438614982606861 422347 1202751 667 665 0 True 536 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 579 362 0.00964621831908491 0.0468434533346412 0.00965896086060884 0.0482185091935607 0.00196299378922946 0.00994618332720187 421654 2041474 667 665 0 True 581 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 623 363 0.00964868904526908 0.0566827918961973 0.00962844281681544 0.0578469520103761 0.00190198959414295 0.0132719180344359 421762 2470280 667 665 0 True 625 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 667 362 0.00953414343411952 0.0615931451425543 0.00947585259784848 0.0623178454261082 0.00194914401282895 0.0202784164248409 416755 2684277 667 665 0 True 670 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 271 409 0.00980079884525579 0.0472407386054975 0.00978103303578241 0.0494392309452964 0.00152687196359406 0.011949056191133 428411 2058788 667 665 0 True 269 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 314 409 0.00986407688808377 0.0348559657325965 0.00988784618905928 0.0345616845960174 0.00147713127310745 0.00639105407698083 431177 1519050 667 665 0 True 313 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 358 409 0.00990928202641641 0.0871255043078054 0.00994888227664607 0.0846875715266651 0.00135845975374048 0.0251867203882562 433153 3796997 667 665 0 True 358 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 402 409 0.00992520448404774 0.06739508418563 0.00993362325474937 0.0659342336156252 0.00148235760858821 0.0214962865463724 433849 2937130 667 665 0 True 402 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 447 409 0.00993323434414631 0.0444377824855111 0.00994888227664607 0.0453040360112917 0.00165922943787247 0.0102512911755567 434200 1936633 667 665 0 True 447 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 491 408 0.0102633508148649 0.0551346780776615 0.00994888227664607 0.0548409246967269 0.00322497881330717 0.0131545871889613 448630 2402812 667 665 0 True 492 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 535 407 0.00984657591094588 0.0411865094184305 0.0098115510795758 0.0429388876173037 0.00168887714151272 0.0070745498190096 430412 1794940 667 665 0 True 536 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 579 408 0.00978704971158275 0.0530625029040902 0.0097962920576791 0.0529335469596399 0.00197090251167582 0.00980834629650386 427810 2312505 667 665 0 True 581 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 623 407 0.00964695038610244 0.0490709951807879 0.00967421988250553 0.0505989166094453 0.00190996171787605 0.0091185760762899 421686 2138552 667 665 0 True 625 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 667 406 0.00949436016713547 0.0993234516825366 0.00946059357595178 0.10092317082475 0.00192083641191855 0.0292478435066129 415016 4328593 667 665 0 True 670 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 270 453 0.00975209351149557 0.0481236049611325 0.00970473792629892 0.0492256046387427 0.00160480173986074 0.0102180040973407 426282 2097264 667 665 0 True 269 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 315 454 0.00989782060217316 0.072230564968154 0.00990310521095598 0.0726634622720684 0.00166296702550494 0.0145260686128124 432652 3147864 667 665 0 True 313 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 358 453 0.00999603196799403 0.0353555667608022 0.00996414129854276 0.0370794232089723 0.00148835493227559 0.0062181260110607 436945 1540823 667 665 0 True 358 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 403 454 0.00979608616383042 0.0557065586832726 0.00975051499198901 0.0557717250324254 0.00167036664473882 0.0115572640111267 428205 2427735 667 665 0 True 403 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 447 454 0.0101340952320818 0.105162976105863 0.0101625085831998 0.107179369802396 0.00199215227146567 0.0230660194682281 442980 4583084 667 665 0 True 447 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 491 452 0.0100766050941112 0.0617475021956356 0.0100404364080262 0.062226291294728 0.00183138053293512 0.0184345015956095 440467 2691004 667 665 0 True 492 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 536 452 0.00989967364681129 0.0547717198695985 0.00993362325474937 0.0544747081712062 0.0017827114548158 0.0102516894759378 432733 2386994 667 665 0 True 536 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 580 451 0.00978576859430207 0.0347134946544663 0.00984206912336919 0.0353093766689555 0.00190442300011155 0.00507786396402007 427754 1512841 667 665 0 True 581 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 624 451 0.00970514971399629 0.0405116705703375 0.00968947890440223 0.041519798580911 0.00183473203528053 0.00622629532366752 424230 1765530 667 665 0 True 625 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 668 451 0.00960600038730921 0.0836430742684131 0.00964370183871214 0.0817425803006027 0.00190866859145569 0.0209080250923615 419896 3645230 667 665 0 True 670 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 271 498 0.00965767974332815 0.0548416130736546 0.00961318379491875 0.0557106889448386 0.00150729180327508 0.0148119594414953 422155 2390040 667 665 0 True 269 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 316 499 0.00978684381773407 0.0577464719248338 0.0098115510795758 0.0567635614557107 0.00167521208800129 0.00671000746766179 427801 2516636 667 665 0 True 314 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 360 498 0.0100531789495502 0.077618605910519 0.0100862134737163 0.075547417410544 0.0015692827583263 0.0201512969542707 439443 3382679 667 665 0 True 358 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 404 498 0.0103134745284716 0.0965186369448455 0.0103761348897536 0.0917067215991455 0.00171719367182412 0.0254537868022104 450821 4206357 667 665 0 True 403 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 448 497 0.0101458083043624 0.101593810573584 0.01025406271458 0.100083924620432 0.00190694412563605 0.0335380742265617 443492 4427537 667 665 0 True 447 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 493 495 0.00990488962431121 0.0432249082307508 0.00988784618905928 0.0457770656900893 0.00167968584409447 0.00786805144918353 432961 1883775 667 665 0 True 492 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 536 495 0.00988446037910319 0.0419504930786568 0.00999465934233616 0.0442511635004196 0.00166795700745894 0.00784074891449839 432068 1828235 667 665 0 True 536 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 580 496 0.0100942433338149 0.127350121699304 0.0100404364080262 0.126863508049134 0.00195375561753983 0.0345314329587783 441238 5550017 667 665 0 True 581 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 624 495 0.00981406755994857 0.0683948139976859 0.00985732814526589 0.069565880827039 0.00190637498633454 0.0227604691416941 428991 2980699 667 665 0 True 625 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 669 495 0.00982342429151641 0.0792239009058467 0.00985732814526589 0.0758220798046845 0.00193867436080483 0.0170004488897098 429400 3452639 667 665 0 True 670 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 271 542 0.00945146561532692 0.0510201573973845 0.00943007553215839 0.0543068589303426 0.00140277557102142 0.0127356070698769 413141 2223498 667 665 0 True 269 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 316 542 0.00991731188651497 0.1229493968384 0.00984206912336919 0.12129396505684 0.00149483415730953 0.0350169391981793 433504 5358230 667 665 0 True 314 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 360 542 0.00983522887217412 0.0608368942498154 0.0098115510795758 0.0629739833676661 0.00154345626845693 0.0136192990976777 429916 2651319 667 665 0 True 358 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 405 542 0.0101057047580581 0.0626381701564509 0.0101625085831998 0.0618600747692073 0.00167518650007724 0.00868951674265319 441739 2729820 667 665 0 True 403 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 448 542 0.0102830022388668 0.0594877672551716 0.0102693217364767 0.0598916609445335 0.00192645832543877 0.00928545166018747 449489 2592523 667 665 0 True 447 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 493 539 0.0101099598975976 0.0667733880363532 0.0100862134737163 0.0662546730754559 0.00187949667102903 0.0155990492775406 441925 2910036 667 665 0 True 492 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 537 540 0.00999550579482518 0.0792310600258944 0.0100404364080262 0.0754253452353704 0.00192284799261008 0.0193281736653618 436922 3452951 667 665 0 True 536 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 581 539 0.00998145925892627 0.0610958387041075 0.00991836423285267 0.0608529793240253 0.00174308264044574 0.0134036707644209 436308 2662604 667 665 0 True 581 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 626 539 0.00978444172283279 0.0534407889717427 0.0098115510795758 0.0501564049744411 0.00184116233868915 0.0109360776041529 427696 2328991 667 665 0 True 626 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 670 539 0.0096375936545346 0.0672462570938677 0.00970473792629892 0.0660715648126955 0.00172172004495079 0.0139767419635486 421277 2930644 667 665 0 True 670 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 269 579 0.0117310994308293 0.0362876979585609 0.00961318379491875 0.0421606775005722 0.00654901012677242 0.0186128268116191 512788 1581446 667 665 0 False 269 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 317 585 0.0095799433769039 0.058413371492361 0.00958266575112535 0.059159227893492 0.0016023309360215 0.0109409400500127 418757 2545700 667 665 0 True 314 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 361 585 0.00979537697390719 0.0481060742953745 0.00985732814526589 0.0485847257190814 0.00142595555141004 0.00824833109194422 428174 2096500 667 665 0 True 358 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 406 585 0.0100190005706691 0.0564882336305401 0.0100709544518196 0.05468833447776 0.00164681725721212 0.00956033917454545 437949 2461801 667 665 0 True 403 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 449 584 0.00989928473620823 0.0921625418547513 0.00996414129854276 0.0851300831616693 0.00198358654414628 0.0197911433797784 432716 4016515 667 665 0 True 447 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 493 582 0.00989127775320397 0.0671999981643282 0.0097962920576791 0.0647135118638895 0.00194534778590679 0.0133203390122679 432366 2928628 667 665 0 True 492 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 538 581 0.00976469879045371 0.0615302963290579 0.0097962920576791 0.0610666056305791 0.00190835559093672 0.0115678904581977 426833 2681538 667 665 0 True 537 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 581 581 0.00964795697825155 0.0396601253649115 0.00968947890440223 0.0407721065079728 0.00174542042022567 0.00910791101531968 421730 1728419 667 665 0 True 581 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 626 581 0.00958051530426135 0.0486724478855642 0.00956740672922866 0.0487830930037385 0.00162805520842291 0.00715512327346826 418782 2121183 667 665 0 True 626 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 670 580 0.00944595223560113 0.0520809691888224 0.00946059357595178 0.0513618677042802 0.00168049232935 0.00832240138415197 412900 2269729 667 665 0 True 670 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 269 623 0.00938686070102966 0.00911433998133351 0.00918593118181125 0.00915541313801785 0.00209416582244797 0.00138217614851438 410317 397210 667 665 0 False 269 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 314 622 0.0094451972914893 0.00925492949586142 0.00926222629129473 0.00926222629129473 0.00211609236749436 0.00137212897415136 412867 403337 667 665 0 False 314 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 361 627 0.0096897305524395 0.0835697391797186 0.00973525597009232 0.0795452811474784 0.0013782591053094 0.0181978989860184 423556 3642034 667 665 0 True 358 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 405 627 0.00969023384851406 0.0846445479686857 0.00970473792629892 0.0784924086366064 0.00156697534516045 0.0215570469322187 423578 3688875 667 665 0 True 403 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 448 622 0.00946530625737715 0.00947798656632426 0.00949111161974517 0.00946059357595178 0.00192240564811378 0.00192726498437963 413746 413058 667 665 0 False 448 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 492 622 0.00947736248607214 0.00941403634974367 0.00947585259784848 0.00946059357595178 0.00198434843899638 0.00197529847342981 414273 410271 667 665 0 False 492 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 537 622 0.00914939646221751 0.00928156968296227 0.00914015411612116 0.00930800335698482 0.0019142032409013 0.00201758752674016 399937 404498 667 665 0 False 537 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 581 622 0.0093831774888477 0.00941353153999671 0.0093690394445716 0.009399557488365 0.00159665542326982 0.0016175616613923 410156 410249 667 665 0 False 581 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 626 622 0.00946601544730038 0.00936337180786712 0.00950637064164187 0.00932326237888151 0.00139106208340582 0.00137357343434792 413777 408063 667 665 0 False 626 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 670 622 0.00926389631917848 0.00940355007454548 0.00929274433508812 0.00935378042267491 0.00157563601114418 0.00151189441459945 404942 409814 667 665 0 False 670 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 269 666 0.00991420060169046 0.0329001721515967 0.00923170824750134 0.0379949645227741 0.00359914560080988 0.0161908315126965 433368 1433815 667 665 0 False 269 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 314 666 0.00910865235727295 0.00918804220438944 0.00917067215991455 0.00914015411612116 0.00143693354454652 0.00136315928774895 398156 400422 667 665 0 False 314 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 359 666 0.0092766159836081 0.00914357305486192 0.00929274433508812 0.00910963607232776 0.00144319463571511 0.00126583938178028 405498 398484 667 665 0 False 359 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 403 666 0.00922209986789622 0.00919494891956373 0.00930800335698482 0.00920119020370794 0.00135933198990185 0.00137268371439245 403115 400723 667 665 0 False 403 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 448 665 0.00919386953353262 0.00917588087866726 0.00923170824750134 0.00927748531319142 0.00164007325654721 0.00159932523258577 401881 399892 667 665 0 False 448 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 492 665 0.0091048547596195 0.00917911625022731 0.00917067215991455 0.00910963607232776 0.00164299440989314 0.00156824870362719 397990 400033 667 665 0 False 492 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 537 665 0.00926318712925524 0.0090725784477215 0.00924696726939803 0.00912489509422446 0.00169687018564273 0.00182188411421344 404911 395390 667 665 0 False 537 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 581 665 0.00928293006163432 0.00935586849935551 0.00924696726939803 0.009399557488365 0.00147995625738882 0.00131961333838208 405774 407736 667 665 0 False 581 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 626 665 0.00941934617493267 0.00935908092501797 0.00941481651026169 0.00933852140077821 0.00134842434496507 0.00141707351755808 411737 407876 667 665 0 False 626 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 665 671 0.00950829231756289 0.0408066630297419 0.00950637064164187 0.0411230640115969 0.00148312257558687 0.00858638989028426 415625 1778386 667 665 0 True 670 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B3_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B3_2.csv new file mode 100755 index 0000000..be47029 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B3_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 269 277 0.00834238408376494 0.728304785768495 0.00817883573662928 0.732021057450217 0.00193229288162972 0.199796289541509 364661 31740087 667 665 14 True 269 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 313 275 0.00699444281063863 0.00668843085052985 0.00688181887541009 0.00665293354695964 0.00150037205321496 0.00132513095092294 305740 291487 667 665 0 False 313 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 356 276 0.00660397656516214 0.00643620954423137 0.00657663843747616 0.0064087891966125 0.00128872486559067 0.00138217662848778 288672 280495 667 665 0 True 358 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 401 276 0.0062946553731603 0.00654013151441203 0.00628671702143893 0.00645456626230259 0.00139311452678019 0.00139386412493303 275151 285024 667 665 0 True 402 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 445 276 0.00639664145954031 0.00642420883979232 0.00645456626230259 0.00636301213092241 0.00164283003280826 0.00173418606828373 279609 279972 667 665 0 True 447 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 488 274 0.00633963174054996 0.00658388934111429 0.0063782711528191 0.00657663843747616 0.00160744879659368 0.0016419043898838 277117 286931 667 665 0 True 491 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 533 274 0.00668217047347235 0.00679868588844508 0.00662241550316625 0.00683604180972 0.0015321079419728 0.00152820083733279 292090 296292 667 665 0 True 536 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 577 274 0.00694193987922496 0.00695168913356864 0.00701915007248035 0.00700389105058366 0.0017190917403282 0.00174477640893665 303445 302960 667 665 0 True 580 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 625 275 0.0095734691592176 0.00769896818035017 0.00796520943007553 0.00775158312352178 0.00890266891678958 0.00178931105638379 418474 335527 667 665 0 False 625 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 663 273 0.00898468138327266 0.723602322354295 0.00888075074387732 0.726085297932403 0.00196639705330891 0.210696525065697 392737 31535150 667 665 12 True 670 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 269 319 0.0068751616409694 0.00651906718042531 0.00679026474402991 0.00656137941557946 0.00151340219566868 0.00143766706653362 300526 284106 667 665 0 False 269 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 313 319 0.00653758723750965 0.00619667731929962 0.00645456626230259 0.00613412680247196 0.00132412412550483 0.00114498156127192 285770 270056 667 665 0 False 313 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 357 320 0.00641521766011021 0.00642817848007522 0.00643930724040589 0.00642404821850919 0.00128416592664484 0.00129488685028665 280421 280145 667 665 0 True 358 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 401 320 0.00629959682552864 0.00627944317190321 0.00634775310902571 0.00622568093385214 0.00143088698126226 0.00132399610982668 275367 273663 667 665 0 True 402 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 446 320 0.00647559031196235 0.00667163445349469 0.00659189745937285 0.00674448767833982 0.00169518381632498 0.00161955517622931 283060 290755 667 665 0 True 447 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 490 319 0.00650416380274042 0.00656768953741644 0.00646982528419928 0.00660715648126955 0.00161912130368196 0.00151361628767548 284309 286225 667 665 0 True 491 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 534 319 0.00661106846439449 0.00667229988452477 0.00669871061264973 0.00663767452506294 0.00147170174289485 0.00150381091060258 288982 290784 667 665 0 True 536 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 578 319 0.00678266954872301 0.0068443941164424 0.00677500572213321 0.00691233691920348 0.00182425029017731 0.00184276105988362 296483 298284 667 665 0 True 581 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 625 318 0.0072469830545931 0.00719762326392773 0.00732433051041428 0.00727855344472419 0.001895514468826 0.00196396027436084 316779 313678 667 665 0 False 625 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 670 318 0.00738118008974455 0.00725026115299693 0.00740062561989776 0.00732433051041428 0.00199219375476635 0.00186687534916794 322645 315972 667 665 0 False 670 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 269 365 0.00593836750656487 0.00635156212802549 0.00592050049591821 0.00636301213092241 0.00151151611757047 0.00150929705331336 259577 276806 667 665 0 True 269 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 314 365 0.00626807218958614 0.00612825265268917 0.00631723506523232 0.00614938582436866 0.00134995449367338 0.00126890949848812 273989 267074 667 665 0 True 313 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 357 364 0.00649418938962654 0.00651764453477479 0.00653086137178607 0.00654612039368277 0.00130178584201205 0.00125796182914589 283873 284044 667 665 0 True 358 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 402 365 0.00668791262414112 0.00680102636999916 0.00663767452506294 0.00683604180972 0.00137568989122479 0.00133056179385822 292341 296394 667 665 0 True 402 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 447 365 0.00665915611660867 0.00667268996478378 0.00672922865644312 0.00669871061264973 0.00168577265364167 0.00172374887226973 291084 290801 667 665 0 True 447 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 490 363 0.00657656980619326 0.00668615920666854 0.00653086137178607 0.00669871061264973 0.00168160589975197 0.0017788386055151 287474 291388 667 665 0 True 491 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 534 363 0.00663298472073188 0.00649586887796282 0.00665293354695964 0.00650034332799268 0.0016922254998765 0.001695293563052 289940 283095 667 665 0 True 536 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 579 362 0.00688687471324992 0.006955131018207 0.00698863202868696 0.00695811398489357 0.00175346181442778 0.00193418869379047 301038 303110 667 665 0 True 581 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 623 363 0.00671785874057707 0.0068182816849861 0.00679026474402991 0.00692759594110018 0.00188210810441035 0.00197502538156625 293650 297146 667 665 0 True 625 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 667 362 0.00620673869977348 0.00638467305824644 0.00617990386816205 0.00646982528419928 0.00186047936901021 0.00194903255550997 271308 278249 667 665 0 True 670 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 271 409 0.00609727180355805 0.00594617695532032 0.00604257267109178 0.00593575951781491 0.00144593257158236 0.0015518323964985 266523 259139 667 665 0 True 269 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 314 409 0.00622401090596839 0.00613102910629744 0.00622568093385214 0.00616464484626535 0.00135868333769223 0.00128902822329883 272063 267195 667 665 0 True 313 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 358 409 0.00649780397052561 0.00669783866854135 0.00654612039368277 0.00672922865644312 0.00138350686653549 0.00133422678990016 284031 291897 667 665 0 True 358 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 402 409 0.00654536544957094 0.00672046332356412 0.00654612039368277 0.00672922865644312 0.00153329273784247 0.0015407962564981 286110 292883 667 665 0 True 402 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 447 409 0.00667782382555575 0.0067292745482383 0.00668345159075303 0.00669871061264973 0.00163468951931179 0.00148164645872159 291900 293267 667 665 0 True 447 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 491 408 0.00674403013645386 0.00667902303251835 0.00668345159075303 0.00685130083161669 0.00182613768193535 0.00174385857192325 294794 291077 667 665 0 True 492 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 535 407 0.00641393654282952 0.00659325126733061 0.00642404821850919 0.00659189745937285 0.00156239506171186 0.00157816077878115 280365 287339 667 665 0 True 536 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 579 408 0.00652566827138045 0.0066901976846442 0.00648508430609598 0.00672922865644312 0.00184529815393718 0.00183768964508181 285249 291564 667 665 0 True 581 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 623 407 0.00623830908990458 0.00623504286006846 0.00619516289005875 0.00633249408712902 0.00173957376543196 0.00190601524422015 272688 271728 667 665 0 True 625 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 667 406 0.00585111426891269 0.00604539501649523 0.00590524147402152 0.00602731364919509 0.00172596198010402 0.0017624752371434 255763 263463 667 665 0 True 670 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 270 453 0.00607974794932586 0.00612763311345427 0.00616464484626535 0.00613412680247196 0.00151925335158061 0.00158244915612425 265757 267047 667 665 0 True 269 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 315 454 0.00633073255086808 0.00623219756876742 0.00636301213092241 0.00619516289005875 0.00144154360909316 0.0014268356602096 276728 271604 667 665 0 True 313 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 358 453 0.00647989120569036 0.0063958247644747 0.00650034332799268 0.0063782711528191 0.00145747336720715 0.00141504776017498 283248 278735 667 665 0 True 358 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 403 454 0.00658691025281591 0.006611653877197 0.00662241550316625 0.00665293354695964 0.00164634152409662 0.001491259461717 287926 288141 667 665 0 True 403 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 447 454 0.00674261175660739 0.00669306592184283 0.00671396963454643 0.00662241550316625 0.00182532875994502 0.00200676088089261 294732 291689 667 665 0 True 447 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 491 452 0.0066490215638347 0.00673861352855703 0.00662241550316625 0.00671396963454643 0.00182038408537992 0.00185534902640954 290641 293674 667 665 0 True 492 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 536 452 0.00645152360876097 0.00653673552156886 0.00650034332799268 0.00657663843747616 0.00174158887143969 0.00164254460552529 282008 284876 667 665 0 True 536 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 580 451 0.00616331797479608 0.00604394942494712 0.00624093995574884 0.00607309071488518 0.00178761484619349 0.0019900771740031 269410 263400 667 665 0 True 581 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 624 451 0.00602115971082895 0.0060866287944627 0.00602731364919509 0.00607309071488518 0.00177444280235462 0.00180797568806776 263196 265260 667 665 0 True 625 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 668 451 0.00603092823009415 0.00616352049728349 0.00602731364919509 0.00608834973678187 0.00177610378989231 0.00188239756437997 263623 268611 667 665 0 True 670 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 271 498 0.00586323912889058 0.00606104411865094 0.00590524147402152 0.00601205462729839 0.00150705357505201 0.00155264651664277 256293 264145 667 665 0 True 269 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 316 499 0.00614497054516916 0.00635426974394099 0.00617990386816205 0.0063782711528191 0.0014829928498148 0.00142499527131112 268608 276924 667 665 0 True 314 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 360 498 0.00633631456187676 0.00643084020419554 0.00634775310902571 0.00646982528419928 0.00148666956432906 0.00145054070734762 276972 280261 667 665 0 True 358 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 404 498 0.00649499008792697 0.00669237754491516 0.00651560234988937 0.00660715648126955 0.00169440205657873 0.00153225432640681 283908 291659 667 665 0 True 403 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 448 497 0.00642098268787328 0.00669196451875856 0.00642404821850919 0.00666819256885634 0.00179560438372695 0.00197190926089487 280673 291641 667 665 0 True 447 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 493 495 0.00647771788173206 0.0063820342800237 0.0063782711528191 0.0063935301747158 0.00167296979298857 0.00170671119728681 283153 278134 667 665 0 True 492 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 536 495 0.00621405936994881 0.00629938315690806 0.00619516289005875 0.00627145799954223 0.00163189285363052 0.00160081391641438 271628 274532 667 665 0 True 536 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 580 496 0.00620628115788753 0.00640881214251009 0.00624093995574884 0.00634775310902571 0.00186167060302225 0.00179279941827155 271288 279301 667 665 0 True 581 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 624 495 0.00611808995936914 0.00614206608303776 0.00613412680247196 0.00621042191195544 0.00173782575422356 0.00173140155655095 267433 267676 667 665 0 True 625 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 669 495 0.00621284688395102 0.00620179425446197 0.00617990386816205 0.00625619897764553 0.00172636642906825 0.00186146801347517 271575 270279 667 665 0 True 670 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 271 542 0.00614707523784457 0.00613339253374911 0.00611886778057527 0.00607309071488518 0.00142900845087647 0.00136414540028813 268700 267298 667 665 0 True 269 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 316 542 0.0064185577158777 0.00640484250222719 0.00645456626230259 0.0063782711528191 0.00145273841912168 0.00144116844018508 280567 279128 667 665 0 True 314 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 360 542 0.00632679769064884 0.00666855970321776 0.00633249408712902 0.00669871061264973 0.00141860349708087 0.00151901384229819 276556 290621 667 665 0 True 358 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 405 542 0.00645722000524114 0.00648591035840918 0.00653086137178607 0.00650034332799268 0.00166661291161457 0.00149403113666008 282257 282661 667 665 0 True 403 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 448 542 0.00645175237970395 0.00637983147385516 0.00651560234988937 0.00642404821850919 0.00187691152108541 0.00191376088904006 282018 278038 667 665 0 True 447 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 493 539 0.00650322584187421 0.00636585742222345 0.00653086137178607 0.00628671702143893 0.0018159921192057 0.00207185734329386 284268 277429 667 665 0 True 492 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 537 540 0.00627781783175704 0.00639931254090823 0.00630197604333562 0.0064087891966125 0.00183355436708393 0.0018235067128052 274415 278887 667 665 0 True 536 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 581 539 0.0063283304559668 0.00647007768907276 0.0063935301747158 0.00642404821850919 0.00165920753339611 0.00146426374619064 276623 281971 667 665 0 True 581 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 626 539 0.00617031836565123 0.00632095230064174 0.00617990386816205 0.00636301213092241 0.00186358521319125 0.00171789513311735 269716 275472 667 665 0 True 626 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 670 539 0.00616800777912715 0.00615569594620564 0.00616464484626535 0.00627145799954223 0.00179406648493658 0.00180172718416953 269615 268270 667 665 0 True 670 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 269 579 0.00630085506571503 0.00630789608491359 0.00628671702143893 0.00627145799954223 0.00130695273276236 0.00132159669028786 275422 274903 667 665 0 False 269 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 317 585 0.00652447866247696 0.00643584240986995 0.00650034332799268 0.00653086137178607 0.00140798653450897 0.00136931902462268 285197 280479 667 665 0 True 314 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 361 585 0.00639634405731444 0.00647982969554809 0.00634775310902571 0.00653086137178607 0.00138856738729549 0.00131480844623279 279596 282396 667 665 0 True 358 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 406 585 0.00651258257344205 0.00648907689227647 0.00656137941557946 0.00648508430609598 0.0015050335114567 0.00136782669500887 284677 282799 667 665 0 True 403 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 449 584 0.00631439830553938 0.00643715032603252 0.0064087891966125 0.00650034332799268 0.00184604478564894 0.00193231910488329 276014 280536 667 665 0 True 447 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 493 582 0.00637376436524242 0.00622026570202113 0.00645456626230259 0.00613412680247196 0.00188724670760805 0.0021291739890714 278609 271084 667 665 0 True 492 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 538 581 0.00643425140256605 0.0063540402849651 0.00645456626230259 0.0063935301747158 0.00190292750551825 0.00193442713273826 281253 276914 667 665 0 True 537 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 581 581 0.00653211961197245 0.00647703029604223 0.00660715648126955 0.00662241550316625 0.00163639563288331 0.00166239688634431 285531 282274 667 665 0 True 581 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 626 581 0.00626999386550716 0.00631767103728651 0.00622568093385214 0.00631723506523232 0.0015367426401242 0.00137081145417814 274073 275329 667 665 0 True 626 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 670 580 0.00626868987113218 0.00624259206037525 0.00628671702143893 0.0063935301747158 0.00162878087875542 0.00157213378624 274016 272057 667 665 0 True 670 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 269 623 0.00668136977517192 0.00651931958529879 0.00659189745937285 0.00645456626230259 0.0014829772469224 0.00149526900634455 292055 284117 667 665 0 False 269 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 314 622 0.00651754690290469 0.00642062927976843 0.00656137941557946 0.0063935301747158 0.00131025771109515 0.00123917838538923 284894 279816 667 665 0 False 314 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 361 627 0.00637367285686523 0.00630697824901003 0.00634775310902571 0.00627145799954223 0.00137642562665768 0.00138228187120333 278605 274863 667 665 0 True 358 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 405 627 0.00615709540514705 0.00626289917974153 0.00621042191195544 0.00619516289005875 0.00144343128484907 0.00129138488398094 269138 272942 667 665 0 True 403 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 448 622 0.00625734283236043 0.00612139182931006 0.00617990386816205 0.00613412680247196 0.00174647590703111 0.00178510186176712 273520 266775 667 665 0 False 448 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 492 622 0.00614407833849155 0.00606834091408425 0.00619516289005875 0.00613412680247196 0.00184449262351535 0.0019297554353105 268569 264463 667 665 0 False 492 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 537 622 0.00635578296912427 0.00624564386475459 0.00643930724040589 0.00627145799954223 0.00183635985021446 0.00179928438976428 277823 272190 667 665 0 False 537 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 581 622 0.00641295282777471 0.0061718728040059 0.00634775310902571 0.00621042191195544 0.00151113775646542 0.00148094252795974 280322 268975 667 665 0 False 581 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 626 622 0.00655328092419801 0.00641721034102767 0.00653086137178607 0.00633249408712902 0.00139388003424118 0.00134651727239986 286456 279667 667 665 0 False 626 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 670 622 0.00652516497530589 0.00622694295821954 0.00653086137178607 0.00627145799954223 0.00147517599226264 0.00146727659921505 285227 271375 667 665 0 False 670 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 269 666 0.0292835957850784 0.566790861337367 0.00819409475852598 0.701731898985275 0.0777477883046611 0.371074191396487 1280040 24701185 667 665 13 False 269 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 314 666 0.00683796348564102 0.00667434206941019 0.0068207827878233 0.00662241550316625 0.00151376168108371 0.00142126586931347 298900 290873 667 665 0 False 314 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 359 666 0.00623959020718526 0.00604782728163967 0.00625619897764553 0.00605783169298848 0.00128762217334005 0.00120405016913784 272744 263569 667 665 0 False 359 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 403 666 0.00599864865003982 0.00608295745084845 0.00604257267109178 0.00611886778057527 0.00129532880086216 0.00133124234199686 262212 265100 667 665 0 False 403 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 448 665 0.00611943970793271 0.00596017395284962 0.00610360875867857 0.00590524147402152 0.00147965324559617 0.00148828798437735 267492 259749 667 665 0 False 448 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 492 665 0.00592793555156503 0.00583521059457983 0.0059510185397116 0.00581368734264134 0.00156954442110877 0.00156479353806108 259121 254303 667 665 0 False 492 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 537 665 0.00604531792240753 0.00615236879105523 0.00607309071488518 0.00611886778057527 0.00164739432956894 0.00164483762720984 264252 268125 667 665 0 False 537 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 581 665 0.00633130447822552 0.00629695089176363 0.00631723506523232 0.00628671702143893 0.00139412141487102 0.00117484990049649 276753 274426 667 665 0 False 581 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 626 665 0.00743043447376792 0.00681761625395602 0.00677500572213321 0.00689707789730678 0.00346658153662391 0.00132042218735546 324798 297117 667 665 0 False 626 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 665 671 0.00811468836421798 0.755987588563994 0.00807202258335241 0.757106889448386 0.00178834262786563 0.183786958936707 354708 32946525 667 665 14 True 670 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B3_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B3_3.csv new file mode 100755 index 0000000..451d9e2 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B3_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 269 277 0.00116734949073872 0.0757012925997759 0.000991836423285267 0.0735484855420768 0.000811923722377111 0.0242289244231813 51027 3299121 667 665 0 True 269 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 313 275 0.0010393292710477 0.000965655154136199 0.000915541313801785 0.000854505226215 0.000729733480043161 0.000620074957409613 45431 42084 667 665 0 False 313 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 356 276 0.00087157153856123 0.000802831064844533 0.000747692072938125 0.000656137941557946 0.000639733399311087 0.000640041852498526 38098 34988 667 665 0 True 358 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 401 276 0.000911560699393951 0.000965333911569953 0.000762951094834821 0.000778210116731518 0.000728259580951845 0.000728660434277839 39846 42070 667 665 0 True 402 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 445 276 0.000952899608790249 0.000900075778826788 0.000701915007248035 0.000610360875867857 0.000860761466318944 0.000903009477188696 41653 39226 667 665 0 True 447 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 488 274 0.000942604916356196 0.000951199238655118 0.000732433051041428 0.000701915007248035 0.000857608184122443 0.000887827040207134 41203 41454 667 665 0 True 491 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 533 274 0.000878869331642259 0.00095092388788405 0.000671396963454643 0.000732433051041428 0.000777996009876528 0.000828652054526321 38417 41442 667 665 0 True 536 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 577 274 0.00102420751171679 0.0010172604778139 0.000762951094834821 0.000671396963454643 0.000937268238570753 0.000988311474736204 44770 44333 667 665 0 True 580 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 625 275 0.00113054024601341 0.00103357501099969 0.00064087891966125 0.000625619897764553 0.00129512982416883 0.0010119772464012 49418 45044 667 665 0 False 625 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 663 273 0.0011382955809804 0.0748595223467228 0.000885023270008392 0.0733958953231098 0.00103719056643416 0.0248391421973135 49757 3262436 667 665 0 True 670 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 269 319 0.000959328072287958 0.000971506358021398 0.000778210116731518 0.000793469138628214 0.000770949926218888 0.000760418610631687 41934 42339 667 665 0 False 269 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 313 319 0.000908563800040927 0.000919006144337727 0.00080872816052491 0.000839246204318303 0.000657227830120416 0.000651126661205804 39715 40051 667 665 0 False 313 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 357 320 0.000877702599833066 0.000977518183189721 0.000762951094834821 0.000854505226215 0.00066027984811932 0.00068992068469547 38366 42601 667 665 0 True 358 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 401 320 0.00092158086669643 0.000906684197332425 0.000686655985351339 0.000778210116731518 0.000758704154417157 0.000687630989885788 40284 39514 667 665 0 True 402 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 446 320 0.000932973659656782 0.00094041466678828 0.000686655985351339 0.000701915007248035 0.000852513715453454 0.000878232728556297 40782 40984 667 665 0 True 447 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 490 319 0.00090570416325369 0.000986696542225328 0.000671396963454643 0.000793469138628214 0.000867616324209007 0.00087163163916815 39590 43001 667 665 0 True 491 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 534 319 0.0009197278220583 0.000958266575112535 0.000747692072938125 0.000778210116731518 0.000779759683954521 0.00081981200911579 40203 41762 667 665 0 True 536 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 578 319 0.000966145446388731 0.000919671575367808 0.000671396963454643 0.000549324788281071 0.000968079883682558 0.000970647833598347 42232 40080 667 665 0 True 581 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 625 318 0.000922861983977112 0.00100821979416383 0.000564583810177768 0.00064087891966125 0.000971569216842964 0.00105718058358091 40340 43939 667 665 0 False 625 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 670 318 0.00100627186978724 0.000993006664062307 0.000625619897764553 0.000534065766384375 0.00101651008816746 0.00104429975565122 43986 43276 667 665 0 False 670 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 269 365 0.000930571564755503 0.000873710942497007 0.000778210116731518 0.000732433051041428 0.000785447087540628 0.000747960471345148 40677 38077 667 665 0 True 269 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 314 365 0.000890216370414015 0.000890645014917702 0.000762951094834821 0.000778210116731518 0.000703032048681241 0.000686064679319696 38913 38815 667 665 0 True 313 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 357 364 0.000839909640052942 0.000854482280317411 0.000717174029144732 0.000686655985351339 0.000684958118850639 0.000695888534320131 36714 37239 667 665 0 True 358 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 402 365 0.000876810393155448 0.000888143912080499 0.000686655985351339 0.000717174029144732 0.000740858121676956 0.000706167118391178 38327 38706 667 665 0 True 402 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 447 365 0.000943268352090835 0.000956637416383715 0.000686655985351339 0.000671396963454643 0.000837198219821446 0.000892053077642618 41232 41691 667 665 0 True 447 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 490 363 0.000948667346345138 0.000912971373271815 0.00064087891966125 0.000564583810177768 0.000887483578367131 0.000895997183120254 41468 39788 667 665 0 True 491 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 534 363 0.00104978410314184 0.00092850574593958 0.000839246204318303 0.00064087891966125 0.00090243920426386 0.000910519400185615 45888 40465 667 665 0 True 536 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 579 362 0.000924394749295071 0.000934792921878971 0.000549324788281071 0.000457770656900893 0.00100080792025615 0.00104289992940851 40407 40739 667 665 0 True 581 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 623 363 0.00099963751244085 0.00102820567096386 0.000686655985351339 0.000686655985351339 0.00105223833685895 0.00103005484748562 43696 44810 667 665 0 True 625 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 667 362 0.00104443086307613 0.00102735667275307 0.000686655985351339 0.000671396963454643 0.00102193334971848 0.00106432499713116 45654 44773 667 665 0 True 670 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 271 409 0.000923616928088943 0.000951658156606898 0.000732433051041428 0.000762951094834821 0.000777133965284952 0.00081701323678401 40373 41474 667 665 0 True 269 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 314 409 0.000965665027408475 0.000995347145616387 0.000869764248111696 0.000885023270008392 0.000730308566731156 0.000708395194156406 42211 43378 667 665 0 True 313 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 358 409 0.000857296231719343 0.000910011352482832 0.000701915007248035 0.000778210116731518 0.000678442969643613 0.000738016225646277 37474 39659 667 665 0 True 358 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 402 409 0.000811839445349424 0.000910470270434612 0.000625619897764553 0.000701915007248035 0.000714422347760815 0.000800535360280441 35487 39679 667 665 0 True 402 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 447 409 0.000930457179284013 0.000949225891462462 0.000671396963454643 0.000717174029144732 0.000808750532863067 0.000880885186241405 40672 41368 667 665 0 True 447 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 491 408 0.000989319942912499 0.000969762469804633 0.000747692072938125 0.000717174029144732 0.000872681775029993 0.000896127539202508 43245 42263 667 665 0 True 492 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 535 407 0.00103475385218812 0.00097194233007559 0.000793469138628214 0.00080872816052491 0.000919560684812769 0.000850229180072482 45231 42358 667 665 0 True 536 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 579 408 0.00103347273490744 0.000927725585421553 0.000701915007248035 0.000518806744487678 0.000986062841586522 0.00101012756139005 45175 40431 667 665 0 True 581 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 623 407 0.000903576593483986 0.000961960864624367 0.000488288700694286 0.000534065766384375 0.000962131427405639 0.00101565833362954 39497 41923 667 665 0 True 625 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 667 406 0.000884245448802264 0.000969991928780523 0.000473029678797589 0.000579842832074464 0.000960469966994465 0.00100900876475555 38652 42273 667 665 0 True 670 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 270 453 0.000900465308659472 0.000913131994554939 0.000747692072938125 0.000656137941557946 0.000760470824654062 0.000839661093145722 39361 39795 667 665 0 True 269 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 315 454 0.00090538388393352 0.000953769179185088 0.000747692072938125 0.000823987182421607 0.000782470961310381 0.000775400071921044 39576 41566 667 665 0 True 313 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 358 453 0.000866012404646841 0.000921392517686985 0.000732433051041428 0.000778210116731518 0.000733797655836085 0.00073484014018009 37855 40155 667 665 0 True 358 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 403 454 0.000852560673199679 0.00084748378155276 0.000595101853971161 0.00064087891966125 0.000798246226737065 0.000795632633524799 37267 36934 667 665 0 True 403 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 447 454 0.000976851926520146 0.000917973578946221 0.00064087891966125 0.000473029678797589 0.00100897304545184 0.00106243314242738 42700 40006 667 665 0 True 447 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 491 452 0.000981358714096831 0.000970014874678112 0.000610360875867857 0.00064087891966125 0.000981160565934007 0.00100021826749927 42897 42274 667 665 0 True 492 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 536 452 0.000949765446871437 0.000957440522799331 0.000686655985351339 0.000610360875867857 0.000899455167432053 0.000933671864491312 41516 41726 667 665 0 True 536 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 580 451 0.000926590950347669 0.000934517571107903 0.000534065766384375 0.000442511635004196 0.000946710990404787 0.00110583975017428 40503 40727 667 665 0 True 581 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 624 451 0.000960197401871278 0.000917881795355865 0.000518806744487678 0.000488288700694286 0.00100311344034587 0.000984318274553097 41972 40002 667 665 0 True 625 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 668 451 0.00101114469087269 0.00095441166431758 0.000625619897764553 0.000457770656900893 0.00102896896857982 0.00106173287624068 44199 41594 667 665 0 True 670 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 271 498 0.000926293548121796 0.00089114982466466 0.000762951094834821 0.000762951094834821 0.000763172699508081 0.000744219364745344 40490 38837 667 665 0 True 269 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 316 499 0.000900099275150706 0.000907533195543218 0.000778210116731518 0.000778210116731518 0.00076814025270103 0.00076716057297044 39345 39551 667 665 0 True 314 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 360 498 0.000878160141719024 0.000856616248793189 0.000747692072938125 0.000701915007248035 0.000748432659640572 0.000754159261449869 38386 37332 667 665 0 True 358 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 404 498 0.000851050784976017 0.000852715446203056 0.000610360875867857 0.000610360875867857 0.000801596576147747 0.000796224228744613 37201 37162 667 665 0 True 403 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 448 497 0.000875941063572128 0.000854505226215 0.000518806744487678 0.0004272526131075 0.000918547899588297 0.00100079691722987 38289 37240 667 665 0 True 447 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 493 495 0.000933042290939675 0.000969487119033565 0.000625619897764553 0.00064087891966125 0.000898611605896953 0.000955512731274866 40785 42251 667 665 0 True 492 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 536 495 0.00092691122966784 0.00089768940547753 0.00064087891966125 0.000671396963454643 0.000913924892066158 0.000818389296973404 40517 39122 667 665 0 True 536 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 580 496 0.000999934914666722 0.000930203742361167 0.000656137941557946 0.000503547722590982 0.000974802119500065 0.00100046782334073 43709 40539 667 665 0 True 581 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 624 495 0.00095930519519366 0.000970267279551591 0.000595101853971161 0.000610360875867857 0.000922291176498573 0.000973177152302562 41933 42285 667 665 0 True 625 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 669 495 0.00102816524903033 0.000901108344218293 0.000671396963454643 0.000579842832074464 0.00101801127418917 0.000953272410741663 44943 39271 667 665 0 True 670 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 271 542 0.000924806536992433 0.000835896103270307 0.000762951094834821 0.000701915007248035 0.000755834026917681 0.000708191071469054 40425 36429 667 665 0 True 269 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 316 542 0.000849563773846654 0.000816415036217231 0.000701915007248035 0.000701915007248035 0.000719535499219426 0.000689795770620719 37136 35580 667 665 0 True 314 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 360 542 0.000940614609152279 0.000906477684254124 0.000839246204318303 0.000717174029144732 0.000752532436585199 0.000763238868381458 41116 39505 667 665 0 True 358 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 405 542 0.000782076345667862 0.000901498424477307 0.000473029678797589 0.000686655985351339 0.000823257372214318 0.000836270849817549 34186 39288 667 665 0 True 403 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 448 542 0.000902066705260325 0.000882453329478423 0.000488288700694286 0.000457770656900893 0.000978010257646144 0.00104644602709405 39431 38458 667 665 0 True 447 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 493 539 0.000872898410030508 0.000923251135391695 0.000473029678797589 0.000473029678797589 0.000936574430378105 0.00104863582800765 38156 40236 667 665 0 True 492 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 537 540 0.000993620836640503 0.000905491010657796 0.00064087891966125 0.000503547722590982 0.000998431935990413 0.000978469235219823 43433 39462 667 665 0 True 536 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 581 539 0.000994124132715057 0.000987752053514422 0.000656137941557946 0.000778210116731518 0.000947442228008375 0.000857173102020188 43455 43047 667 665 0 True 581 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 626 539 0.000967014775972051 0.000943076390908606 0.000701915007248035 0.000595101853971161 0.000944961366176208 0.000956148129642574 42270 41100 667 665 0 True 626 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 670 539 0.000970057429513671 0.000920428789988246 0.000610360875867857 0.000503547722590982 0.000953615745676464 0.000962079258619029 42403 40113 667 665 0 True 670 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 269 579 0.000921191956093366 0.000976485617798215 0.000778210116731518 0.000854505226215 0.000747902263402354 0.000678963492970148 40267 42556 667 665 0 False 269 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 317 585 0.000919750699152598 0.000904366661675934 0.000778210116731518 0.000778210116731518 0.000755124790138634 0.000724188837780235 40204 39413 667 665 0 True 314 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 361 585 0.000884954638725499 0.000917216364325784 0.000732433051041428 0.000793469138628214 0.000758851713114785 0.00072119051614531 38683 39973 667 665 0 True 358 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 406 585 0.000827967796829441 0.0008108391831031 0.000595101853971161 0.000625619897764553 0.000770048554282046 0.000716657871252758 36192 35337 667 665 0 True 403 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 449 584 0.000902981789032241 0.000885872268219186 0.000549324788281071 0.000473029678797589 0.0009611077644946 0.000995985531181953 39471 38607 667 665 0 True 447 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 493 582 0.000885572320271542 0.000968867579798661 0.000488288700694286 0.000488288700694286 0.00101768303666735 0.00115738399453086 38710 42224 667 665 0 True 492 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 538 581 0.000929725112266481 0.00102990366738545 0.000518806744487678 0.000762951094834821 0.000998368093129197 0.000998246076298612 40640 44884 667 665 0 True 537 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 581 581 0.000910302459207567 0.000962901646425517 0.000579842832074464 0.000671396963454643 0.000897127748279835 0.000905533032388593 39791 41964 667 665 0 True 581 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 626 581 0.000972047736717588 0.000934655246493437 0.000793469138628214 0.000686655985351339 0.000773324251044491 0.000800547607267534 42490 40733 667 665 0 True 626 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 670 580 0.00101837385267083 0.00101987631013905 0.000762951094834821 0.000701915007248035 0.000868883557607519 0.000972189981282272 44515 44447 667 665 0 True 670 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 269 623 0.0010045103335263 0.000960882407437683 0.000854505226215 0.000793469138628214 0.000783170492110248 0.000784223779811917 43909 41876 667 665 0 False 269 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 314 622 0.00089993913549062 0.000948468676842025 0.000762951094834821 0.000869764248111696 0.000727384277041276 0.000677573959206994 39338 41335 667 665 0 False 314 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 361 627 0.000888294694492992 0.000820568243680843 0.000747692072938125 0.000656137941557946 0.000710536049711412 0.000660021014584498 38829 35761 667 665 0 True 358 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 405 627 0.00084830553366027 0.000875018858659581 0.000686655985351339 0.000671396963454643 0.000676331949786128 0.000742718076776171 37081 38134 667 665 0 True 403 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 448 622 0.000853292740217211 0.000921140112813505 0.000488288700694286 0.000549324788281071 0.000909888622963124 0.000962835885515631 37299 40144 667 665 0 False 448 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 492 622 0.000942948072770664 0.0009499831060829 0.000534065766384375 0.000610360875867857 0.00102393266815204 0.000996049876841864 41218 41401 667 665 0 False 492 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 537 622 0.000860178745600878 0.000897437000604051 0.000503547722590982 0.0004272526131075 0.000956768285597714 0.00103496134628982 37600 39111 667 665 0 False 537 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 581 622 0.000916181872442126 0.000863339396786771 0.000656137941557946 0.000656137941557946 0.00083175270117895 0.000789135999917152 40048 37625 667 665 0 False 581 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 626 622 0.00098376080899811 0.000874674670195746 0.000823987182421607 0.000671396963454643 0.000817603080539646 0.000735321677190046 43002 38119 667 665 0 False 626 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 670 622 0.00103651538844906 0.00105652090858871 0.000839246204318303 0.000915541313801785 0.000843192075351349 0.000816333810277223 45308 46044 667 665 0 False 670 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 269 666 0.00303828401660923 0.0589555601064919 0.00100709544518196 0.0695201037613489 0.00775555198902356 0.0403536717789018 132809 2569329 667 665 0 False 269 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 314 666 0.000987741423405944 0.00103091328687936 0.000839246204318303 0.000946059357595178 0.000725573297757585 0.000680203567042807 43176 44928 667 665 0 False 314 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 359 666 0.000824010059515905 0.0008288058209153 0.000671396963454643 0.000701915007248035 0.000659946299613635 0.000607746812607674 36019 36120 667 665 0 False 359 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 403 666 0.000946105111783774 0.000896588002393257 0.000793469138628214 0.000732433051041428 0.000721592972499541 0.000721378628011616 41356 39074 667 665 0 False 403 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 448 665 0.000954546759579697 0.0008724718640272 0.000793469138628214 0.00064087891966125 0.000774649211261432 0.000833974213394503 41725 38023 667 665 0 False 448 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 492 665 0.000997487065576848 0.000977380507804187 0.000686655985351339 0.000732433051041428 0.000950946772918677 0.000882028740758097 43602 42595 667 665 0 False 492 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 537 665 0.00101658943931559 0.000935366569318696 0.000747692072938125 0.000701915007248035 0.000936885588875057 0.000842182408649282 44437 40764 667 665 0 False 537 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 581 665 0.000931944190413376 0.00104589695800499 0.000762951094834821 0.000915541313801785 0.000744444702760082 0.000707094893193058 40737 45581 667 665 0 False 581 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 626 665 0.00106190896311972 0.0010352271156261 0.000885023270008392 0.000885023270008392 0.000798918727525202 0.000749966050419708 46418 45116 667 665 0 False 626 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 665 671 0.00113138669850243 0.0783978027008469 0.000976577401388571 0.0760662241550317 0.000826117694576602 0.0227142876360461 49455 3416637 667 665 0 True 670 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B4_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B4_1.csv new file mode 100755 index 0000000..67048ac --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B4_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 243 246 0.0094941313961925 0.0431348685286115 0.00949111161974517 0.0423895628290227 0.00174898912595137 0.00785599890546764 415006 1879851 667 665 0 True 243 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 287 245 0.0094419716211933 0.00944352182814555 0.00944533455405508 0.00946059357595178 0.00144564146264936 0.0014392541925528 412726 411556 667 665 0 False 287 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 330 245 0.00948045089380235 0.061508910752505 0.00949111161974517 0.0600289921416037 0.00135129993792456 0.00799880918135867 414408 2680606 667 665 0 True 332 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 375 245 0.00981175697342448 0.0971571983288503 0.00975051499198901 0.0912336919203479 0.00133745305666472 0.022084881885145 428890 4234186 667 665 0 True 376 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 419 245 0.00990900750128483 0.0722341215822803 0.00990310521095598 0.0693827725642786 0.00153993206333826 0.011353535484655 433141 3148019 667 665 0 True 421 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 463 243 0.00960238580641014 0.0648158735130341 0.00961318379491875 0.0685893034256504 0.00167381125780635 0.0169746725398019 419738 2824726 667 665 0 True 466 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 507 243 0.00954482703715663 0.0773192307846751 0.00961318379491875 0.0767223620965896 0.0017417259659215 0.0204182222559648 417222 3369632 667 665 0 True 510 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 552 244 0.00945613254256369 0.0664572394593717 0.00941481651026169 0.0642710002288853 0.00163955505723141 0.0174719035922569 413345 2896258 667 665 0 True 555 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 600 244 0.0101173263219615 0.00938315117158885 0.00976577401388571 0.00947585259784848 0.00408492794990006 0.0020644858286407 442247 408925 667 665 0 False 600 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 639 244 0.00936386922126028 0.0424978674656428 0.00932326237888151 0.0424811169604028 0.00175493197846686 0.00794815676255789 409312 1852090 667 665 0 True 644 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 243 289 0.00954141835010625 0.00950524629266001 0.00953688868543526 0.009399557488365 0.00150825237847499 0.00167883983505153 417073 414246 667 665 0 False 243 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 287 289 0.00958030941041267 0.0095453786675432 0.00955214770733196 0.00962844281681544 0.00139865012213833 0.00153248609405928 418773 415995 667 665 0 False 287 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 330 290 0.00986194931831406 0.0946529519036777 0.00975051499198901 0.0928664072632944 0.00137705272370707 0.0210715647431098 431084 4125049 667 665 0 True 332 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 375 290 0.00984920677679014 0.0515018835713683 0.00987258716716258 0.0500190737773709 0.00136416473814487 0.00789704082548411 430527 2244492 667 665 0 True 377 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 418 289 0.00992616532200826 0.0858517775326391 0.00993362325474937 0.0862897688258183 0.00151208300666271 0.0220813754286862 433891 3741487 667 665 0 True 421 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 463 288 0.00969393993779032 0.0429325774954668 0.0097962920576791 0.0438391699092088 0.00175763956462658 0.0081658425602512 423740 1871035 667 665 0 True 466 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 507 287 0.0101209409028605 0.0425601885234946 0.00975051499198901 0.0455786984054322 0.00310972488898293 0.00892365958192711 442405 1854806 667 665 0 True 511 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 551 288 0.00969668518910606 0.0515585599384132 0.00961318379491875 0.0520790417334249 0.00199163693863416 0.0109564469999085 423860 2246962 667 665 0 True 555 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 600 288 0.00965241801163964 0.00958865463039609 0.00967421988250553 0.00956740672922866 0.00197263078481244 0.00193775318245528 421925 417881 667 665 0 False 600 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 644 288 0.00940431592397896 0.00957291374465002 0.00943007553215839 0.00953688868543526 0.00185404500458444 0.00185703875853887 411080 417195 667 665 0 False 644 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 243 334 0.00970361694867833 0.0524433078576505 0.00971999694819562 0.050919356069276 0.0014686744059408 0.00906251746343925 424163 2285520 667 665 0 True 243 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 286 335 0.00987535529557263 0.059245435630734 0.00999465934233616 0.0635080491340505 0.00147367696029467 0.0164767781274824 431670 2581962 667 665 0 True 287 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 330 334 0.00974104387494968 0.0373229939118797 0.00970473792629892 0.038956282902266 0.00139644329022685 0.00583599346485439 425799 1626565 667 665 0 True 332 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 374 334 0.0096485060285147 0.0336778774585812 0.00967421988250553 0.0347447928587778 0.00126563206923025 0.00538663219635689 421754 1467708 667 665 0 True 377 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 419 334 0.00960163086229831 0.0681031028016367 0.00964370183871214 0.0658426794842451 0.00170129824376923 0.0105090671731107 419705 2967986 667 665 0 True 421 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 463 332 0.00992323705393813 0.0314280780917733 0.00994888227664607 0.0322728313115129 0.001759997152986 0.00470263618130702 433763 1369660 667 665 0 True 466 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 507 331 0.00969549558020258 0.0285846224625423 0.00975051499198901 0.0291752498664836 0.00166749945727563 0.00369477049280669 423808 1245740 667 665 0 True 511 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 551 331 0.00988777755777639 0.0492114699658278 0.00985732814526589 0.0497901884489204 0.00168339249544217 0.00914788794781588 432213 2144674 667 665 0 True 555 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 596 332 0.00992760657894902 0.0573737617102954 0.0097962920576791 0.057251850156405 0.00194274077598739 0.0119796903325889 433954 2500393 667 665 0 True 600 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 640 333 0.00962178558237475 0.0634573387003788 0.00967421988250553 0.0621194781414511 0.00208247091903116 0.0177744180468432 420586 2765520 667 665 0 True 645 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 242 378 0.0096386688779666 0.0449925913433159 0.00973525597009232 0.0482185091935607 0.00171307706658077 0.0117860442202517 421324 1960812 667 665 0 True 243 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 287 379 0.00957275996929436 0.0338583698890164 0.00958266575112535 0.0334325169756619 0.00137398056985777 0.00522025387866364 418443 1475574 667 665 0 True 288 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 332 378 0.00985314163700937 0.0852443537316626 0.00978103303578241 0.0819562066071565 0.00146390790469222 0.0172310991877147 430699 3715015 667 665 0 True 332 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 375 378 0.00980086747653868 0.0675076797050993 0.0097962920576791 0.0660715648126955 0.00142112646775871 0.0161815398356536 428414 2942037 667 665 0 True 377 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 420 377 0.0099387477238721 0.0455220449842849 0.00994888227664607 0.0459754329747463 0.00168135052438198 0.00861248800064115 434441 1983886 667 665 0 True 421 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 464 377 0.00993261666260026 0.0541745528848443 0.00993362325474937 0.0547188525215534 0.00170629624796636 0.00915773337942602 434173 2360969 667 665 0 True 466 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 508 376 0.010012389090417 0.042324832451924 0.0100404364080262 0.0426489662012665 0.00175865659471283 0.00558531557810408 437660 1844549 667 665 0 True 511 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 552 376 0.0100228667996055 0.0530771882785471 0.0100404364080262 0.0524147402151522 0.00177263426710241 0.00769722442719537 438118 2313145 667 665 0 True 555 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 596 376 0.00991136384199752 0.0438435296297507 0.00997940032043946 0.0439459830624857 0.00214367037759938 0.00832271738045159 433244 1910735 667 665 0 True 600 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 640 376 0.00986673063102232 0.0947838582494231 0.00991836423285267 0.0913862821393149 0.00201187600522655 0.0225745075524312 431293 4130754 667 665 0 True 645 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 243 422 0.00962910625255008 0.0490438042921449 0.00964370183871214 0.0489967193102922 0.00155560763094691 0.00697863821004261 420906 2137367 667 665 0 True 243 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 287 423 0.0096647945196548 0.0652564118008457 0.00967421988250553 0.0594491493095293 0.0014849110235191 0.0233217958036405 422466 2843925 667 665 0 True 288 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 331 423 0.00984188610661481 0.0360664536140076 0.0098115510795758 0.0365148393987945 0.0013383236202121 0.00446871045579032 430207 1571804 667 665 0 True 332 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 376 422 0.0100728074964578 0.059108815756489 0.0100709544518196 0.0545815213244831 0.00144779578806511 0.0152088663174506 440301 2576008 667 665 0 True 377 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 420 421 0.0102287377711922 0.122352229853645 0.0102693217364767 0.122423132677195 0.00164013894660427 0.0293375471124637 447117 5332205 667 665 0 True 422 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 464 421 0.0102113740566201 0.0642743273840357 0.0101930266269932 0.0621805142290379 0.00173481561900687 0.0171159658336563 446358 2801125 667 665 0 True 466 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 509 420 0.010230407799076 0.0556690880325098 0.0101625085831998 0.0542915999084459 0.00181846985181921 0.0101473563055657 447190 2426102 667 665 0 True 511 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 552 420 0.0101525799242745 0.0353696555419219 0.010101472495613 0.0356908522163729 0.00169381826816948 0.00538874190246651 443788 1541437 667 665 0 True 556 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 597 420 0.0099920055993976 0.040790187875273 0.0100404364080262 0.0412451361867704 0.00195432635077554 0.00472871548654306 436769 1777668 667 665 0 True 600 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 641 420 0.00989237585373026 0.0763719323486101 0.0100251773861295 0.0768596932936599 0.00194839622023275 0.0136767990871608 432414 3328348 667 665 0 True 645 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 244 466 0.00967053667032357 0.0584492588761902 0.00956740672922866 0.0587624933241779 0.00151315122731923 0.0154068745106208 422717 2547264 667 665 0 True 243 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 289 467 0.00993252515422307 0.0606493344829228 0.00997940032043946 0.0585946440833143 0.00159410183693758 0.0115655504557143 434169 2643145 667 665 0 True 288 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 333 466 0.00998084157738023 0.0732210705293791 0.010101472495613 0.0699320973525597 0.00160996670119285 0.016169663400456 436281 3191031 667 665 0 True 332 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 377 466 0.0103147785228466 0.0923149485065376 0.0104371709773404 0.0857404440375372 0.00152273932259202 0.0189479028341585 450878 4023157 667 665 0 True 377 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 422 466 0.0104062411458496 0.102785528710768 0.0105287251087205 0.0983443961242084 0.00184864649749078 0.029458107676467 454876 4479473 667 665 0 True 422 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 465 464 0.0101485078014895 0.0484294737759941 0.0102388036926833 0.0476386663614862 0.00203483603687092 0.0096524524504051 443610 2110594 667 665 0 True 466 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 509 464 0.0100611859325544 0.0400766392979473 0.0100251773861295 0.0406195162890059 0.00187913306622451 0.00464347774732349 439793 1746571 667 665 0 True 511 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 554 464 0.010090720261293 0.105057631490032 0.0101625085831998 0.102800030518044 0.00193638348461834 0.0177848893916268 441084 4578493 667 665 0 True 556 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 598 464 0.0100566333907892 0.067273149685842 0.0100709544518196 0.0678721293965057 0.0019218050584262 0.0187279137344268 439594 2931816 667 665 0 True 600 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 643 465 0.0100185430287832 0.0777328764805123 0.0100251773861295 0.0748607614251926 0.00201342158027148 0.0134978118193055 437929 3387659 667 665 0 True 645 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 245 510 0.00950419731768357 0.0498896359690712 0.00949111161974517 0.052323186083772 0.00144026145826167 0.00980857592396027 415446 2174229 667 665 0 True 243 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 289 511 0.00974582518765794 0.126807657734402 0.00970473792629892 0.126955062180514 0.00152142933826688 0.0357110485853569 426008 5526376 667 665 0 True 288 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 333 510 0.00990150381435513 0.0589494106059381 0.00984206912336919 0.0610971236743725 0.00159661729899751 0.0108218189944172 432813 2569061 667 665 0 True 333 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 378 510 0.0103025164003029 0.0621463477875279 0.0102388036926833 0.0613565270466163 0.00164832134807284 0.00747529385176078 450342 2708386 667 665 0 True 377 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 422 510 0.0103843477666065 0.059849142196301 0.0103913939116503 0.0587930113679713 0.00202042407324097 0.00797875348256589 453919 2608272 667 665 0 True 422 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 466 508 0.0103833182973631 0.0664277080891746 0.0104676890211337 0.0650949874113069 0.00193076239768127 0.0112497150780835 453874 2894971 667 665 0 True 467 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 511 508 0.0102708087476061 0.0760902255639098 0.0102998397802701 0.0740520332646677 0.00176717714888963 0.0154037028697806 448956 3316071 667 665 0 True 511 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 555 507 0.0100955473281899 0.0604998190142328 0.0101472495613031 0.0601510643167773 0.00172876285855277 0.0124210918026183 441295 2636629 667 665 0 True 556 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 599 507 0.0101117214338585 0.0502402951760266 0.010101472495613 0.0495155260547799 0.00185348628570349 0.00625609897321316 442002 2189511 667 665 0 True 600 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 643 507 0.0101890688896797 0.0655305923311368 0.00993362325474937 0.0666666666666667 0.00364000312369574 0.0118830638318459 445383 2855874 667 665 0 True 645 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 246 552 0.00958470181251786 0.0437615898294604 0.00953688868543526 0.0442664225223163 0.0014370973825948 0.00758913819252651 418965 1907164 667 665 0 True 243 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 289 553 0.0095811101087131 0.0597186029849171 0.00955214770733196 0.0592050049591821 0.00146070646267255 0.0152843492963535 418808 2602583 667 665 0 True 288 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 335 553 0.0098322319728211 0.0474712072008816 0.00984206912336919 0.0476844434271763 0.00161813804305795 0.00739685281548599 429785 2068832 667 665 0 True 333 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 378 552 0.0102462158712358 0.0533155273168043 0.0102388036926833 0.0513618677042802 0.00153560401963397 0.00669658258550155 447881 2323532 667 665 0 True 377 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 423 552 0.0103416819857409 0.0926054206241169 0.010406652933547 0.0899061570153353 0.00187722240397939 0.016856278883188 452054 4035816 667 665 0 True 422 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 467 551 0.010305673439316 0.0647954746100775 0.0103761348897536 0.0631265735866331 0.0020623781740207 0.0103187345983557 450480 2823837 667 665 0 True 467 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 512 550 0.0100187260455375 0.0568494938421816 0.00999465934233616 0.0561532005798428 0.00206790404997968 0.00624160175375192 437937 2477545 667 665 0 True 511 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 555 549 0.00985298149734929 0.039840709578937 0.00993362325474937 0.0410620279240101 0.00182951257409845 0.00828303877347414 430692 1736289 667 665 0 True 556 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 600 550 0.0099887570520073 0.0506349875604553 0.010101472495613 0.0495002670328832 0.00176604426309215 0.00763040587613285 436627 2206712 667 665 0 True 601 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 644 550 0.0102532391391853 0.0535627923092235 0.00990310521095598 0.0518043793392844 0.00366058134386469 0.00773424944777644 448188 2334308 667 665 0 True 645 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 244 593 0.00938663193008668 0.00933234895432676 0.00921644922560464 0.0093690394445716 0.00263459742515516 0.00129315501150789 410307 406711 667 665 0 False 244 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 288 593 0.00928137441922207 0.00938914005085958 0.00929274433508812 0.00941481651026169 0.00132383597827516 0.00153260282978239 405706 409186 667 665 0 False 288 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 335 595 0.00954988287499647 0.0760581930908755 0.00950637064164187 0.072983901731899 0.00150030120911457 0.0117829202414085 417443 3314675 667 665 0 True 333 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 379 595 0.0104792877079428 0.080978114776527 0.0101625085831998 0.0766765850308995 0.0026229255002954 0.0202588781140127 458069 3529089 667 665 0 True 377 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 422 593 0.0100001498449677 0.00969824423728123 0.00996414129854276 0.00973525597009232 0.00193965963463773 0.00164454384201874 437125 422657 667 665 0 False 422 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 467 593 0.009900725993149 0.00979727873127543 0.00988784618905928 0.0098268101014725 0.00199950570290266 0.00184551078498708 432779 426973 667 665 0 False 467 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 511 592 0.00971020555183612 0.00977219886521064 0.00975051499198901 0.0098115510795758 0.00201250849264637 0.0022681175418599 424451 425880 667 665 0 False 511 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 556 592 0.0098126263030078 0.00984856281238688 0.00973525597009232 0.0098268101014725 0.00188837901364107 0.00183792136478974 428928 429208 667 665 0 False 556 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 601 592 0.00971359136179221 0.00963018670503221 0.00968947890440223 0.00965896086060884 0.00164229003147904 0.00150302286593853 424599 419691 667 665 0 False 601 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 645 592 0.00980974378912627 0.00952752675921894 0.00976577401388571 0.00956740672922866 0.00170763601208712 0.0014857127466184 428802 415217 667 665 0 False 645 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 244 642 0.00911077992704266 0.0412359119359396 0.00915541313801785 0.0416723887998779 0.00126037822132332 0.00814502671945198 398249 1797093 667 665 0 True 244 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 288 637 0.00930763732347605 0.00937828664129998 0.009399557488365 0.00943007553215839 0.00139042212660849 0.00136879884443236 406854 408713 667 665 0 False 288 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 333 636 0.00924175129189811 0.00937277962587861 0.00915541313801785 0.00929274433508812 0.00139861230557144 0.00139564703366717 403974 408473 667 665 0 False 333 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 378 636 0.00965907524608032 0.00948737143843817 0.00953688868543526 0.00952162966353857 0.00226911253415172 0.00124188953087178 422216 413467 667 665 0 False 378 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 422 636 0.00967490619533447 0.009478950294023 0.00961318379491875 0.00947585259784848 0.00183394371338227 0.00160370562001509 422908 413100 667 665 0 False 422 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 467 636 0.00964093371030209 0.00983091741714093 0.00961318379491875 0.0097962920576791 0.0018223550970805 0.0018575477020245 421423 428439 667 665 0 False 467 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 512 636 0.00951524695422946 0.00953955040955559 0.00958266575112535 0.00958266575112535 0.00189711724246264 0.001820709018589 415929 415741 667 665 0 False 512 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 556 636 0.00950234427304544 0.00943129166473061 0.00943007553215839 0.00950637064164187 0.00172628740554193 0.00172704265978926 415365 411023 667 665 0 False 556 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 601 636 0.0095528111430666 0.00937899796412524 0.00955214770733196 0.00944533455405508 0.00144051208398484 0.00132750269568889 417571 408744 667 665 0 False 601 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 641 641 0.00954169287523782 0.0424564501204946 0.00950637064164187 0.0424963759822995 0.00139115381315787 0.00783857744602431 417085 1850285 667 665 0 True 645 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B4_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B4_2.csv new file mode 100755 index 0000000..68631d7 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B4_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 243 246 0.00806861389630202 0.71895853160023 0.00805676356145571 0.686411841000992 0.00195992307037716 0.157407036699241 352694 31332770 667 665 9 True 243 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 287 245 0.00688621127751528 0.00661342071131135 0.00679026474402991 0.00650034332799268 0.0016963014129131 0.00141688104918871 301009 288218 667 665 0 False 287 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 330 245 0.00604609574361366 0.00617985797636687 0.00607309071488518 0.00617990386816205 0.00122125044754054 0.00117338168550972 264286 269323 667 665 0 True 332 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 375 245 0.00608443775365693 0.00611815645775001 0.00604257267109178 0.00616464484626535 0.00126861224270768 0.00125688512055683 265962 266634 667 665 0 True 376 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 419 245 0.00608539859161744 0.00618609926051109 0.00610360875867857 0.00621042191195544 0.00147317078306855 0.00138569566529403 266004 269595 667 665 0 True 421 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 463 243 0.0062750039491584 0.00629913075203458 0.00634775310902571 0.00627145799954223 0.00157120564819608 0.0014690819466299 274292 274521 667 665 0 True 466 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 507 243 0.00651377218234554 0.00631982795165988 0.00654612039368277 0.00631723506523232 0.00151041061285133 0.0015719083410314 284729 275423 667 665 0 True 510 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 552 244 0.0065848513143291 0.00659017651705368 0.00665293354695964 0.00659189745937285 0.00151898837054389 0.00130455730836356 287836 287205 667 665 0 True 555 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 600 244 0.00877350292580878 0.00714411343075014 0.00732433051041428 0.00721751735713741 0.00758360687134495 0.00192631297657927 383506 311346 667 665 0 False 600 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 639 244 0.00876492401544707 0.746004287440965 0.00891126878767071 0.726909285114824 0.00195769877580541 0.163933725415145 383131 32511445 667 665 11 True 644 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 243 289 0.00647064885959401 0.00629775399817924 0.0063782711528191 0.00625619897764553 0.00160766073594404 0.00147863408288953 282844 274461 667 665 0 False 243 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 287 289 0.00610122954087159 0.00616012450444032 0.00604257267109178 0.00611886778057527 0.00130197665762306 0.00130579616490459 266696 268463 667 665 0 False 287 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 330 290 0.00604897825749519 0.00609215875578165 0.00604257267109178 0.00610360875867857 0.00125715078588458 0.001337691359178 264412 265501 667 665 0 True 332 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 375 290 0.00601397630321941 0.00621627311584064 0.005981536583505 0.00621042191195544 0.00132050914135614 0.0011919156554092 262882 270910 667 665 0 True 377 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 418 289 0.00606515236316381 0.00611799583646688 0.00602731364919509 0.00611886778057527 0.00154267550621882 0.00154198463896715 265119 266627 667 665 0 True 421 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 463 288 0.00633013774641633 0.00636755541864503 0.00633249408712902 0.00633249408712902 0.00167359613005478 0.00180669810014924 276702 277503 667 665 0 True 466 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 507 287 0.00653413279627067 0.00657558292618706 0.00646982528419928 0.00660715648126955 0.00180191754079878 0.00154882040134103 285619 286569 667 665 0 True 511 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 551 288 0.00660086528033763 0.00668033094868093 0.00659189745937285 0.00675974670023652 0.00161763561780516 0.00151251467029827 288536 291134 667 665 0 True 555 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 600 288 0.00691517367889642 0.00686752358121213 0.00688181887541009 0.00689707789730678 0.00193572249450359 0.00196332288818215 302275 299292 667 665 0 False 600 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 644 288 0.00730575430984439 0.00739128663957903 0.0072480354009308 0.00746166170748455 0.00200562596040001 0.00203787452418727 319348 322118 667 665 0 False 644 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 243 334 0.00600150828682706 0.00603713449336319 0.00604257267109178 0.00607309071488518 0.00142188581903907 0.00136507243505638 262337 263103 667 665 0 True 243 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 286 335 0.00600400189010553 0.00602068228479186 0.00599679560540169 0.00601205462729839 0.00137914040901014 0.00136379050399763 262446 262386 667 665 0 True 287 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 330 334 0.00604289295041195 0.00592447013620111 0.00605783169298848 0.00592050049591821 0.00122450344097348 0.00127435745677001 264146 258193 667 665 0 True 332 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 374 334 0.00617407020911609 0.00638051985078283 0.00621042191195544 0.00634775310902571 0.00124120133181347 0.00126462063806096 269880 278068 667 665 0 True 377 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 419 334 0.00643210095570205 0.00659715206992074 0.00642404821850919 0.00672922865644312 0.00145983525438026 0.00148901317241115 281159 287509 667 665 0 True 421 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 463 332 0.00674624921460076 0.00686419642606172 0.00675974670023652 0.00679026474402991 0.00165503884807984 0.00151279206938522 294891 299147 667 665 0 True 466 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 507 331 0.00662891259794685 0.00672420350487113 0.00669871061264973 0.00675974670023652 0.00161134490854678 0.00166491830715201 289762 293046 667 665 0 True 511 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 551 331 0.00674302354430475 0.00658606920138524 0.00685130083161669 0.00656137941557946 0.00160489527191171 0.00143317721556777 294750 287026 667 665 0 True 555 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 596 332 0.00666222164724459 0.00693571878884669 0.00666819256885634 0.00686655985351339 0.00201319903412922 0.00203693377642734 291218 302264 667 665 0 True 600 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 640 333 0.00670797583584038 0.00694283201709928 0.00672922865644312 0.00698863202868696 0.00189914233078122 0.00191217107792959 293218 302574 667 665 0 True 645 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 242 378 0.00607773476502765 0.00591081732713565 0.00602731364919509 0.0059510185397116 0.00152175204196316 0.00143771011088648 265669 257598 667 665 0 True 243 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 287 379 0.00608985962500553 0.0062497970722182 0.00610360875867857 0.00616464484626535 0.00138198114104522 0.00154144096094667 266199 272371 667 665 0 True 288 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 332 378 0.00620129395133058 0.00635413206855546 0.00613412680247196 0.00631723506523232 0.00141697678405097 0.00146317140184082 271070 276918 667 665 0 True 332 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 375 378 0.00626695121196554 0.0067418030083219 0.00634775310902571 0.00675974670023652 0.00145798117197356 0.00136964700763997 273940 293813 667 665 0 True 377 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 420 377 0.00668864469115866 0.00670054628445685 0.00668345159075303 0.00665293354695964 0.00161077815054138 0.00139587171481471 292373 292015 667 665 0 True 421 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 464 377 0.00686919071935765 0.0068266339917085 0.0068207827878233 0.00685130083161669 0.00164811428754148 0.00162693628272955 300265 297510 667 665 0 True 466 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 508 376 0.00687813566322812 0.00670589267859509 0.0068055237659266 0.00668345159075303 0.00169918449090455 0.00174252856891107 300656 292248 667 665 0 True 511 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 552 376 0.00655048991869366 0.00672032564817858 0.00657663843747616 0.00675974670023652 0.00173930837112032 0.0015516441650995 286334 292877 667 665 0 True 555 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 596 376 0.00666029997132356 0.0076057160525484 0.00660715648126955 0.00718699931334401 0.00193833756032521 0.00553234267873799 291134 331463 667 665 0 True 600 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 640 376 0.00626267319533184 0.00631886422396114 0.00614938582436866 0.0063782711528191 0.00192948052836192 0.00177767124212373 273753 275381 667 665 0 True 645 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 243 422 0.00599791658302229 0.00620105998573913 0.00604257267109178 0.00627145799954223 0.00147041726769952 0.00152724687822704 262180 270247 667 665 0 True 243 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 287 423 0.00613090113217596 0.00626319747641018 0.00610360875867857 0.00634775310902571 0.00143712823992311 0.00148312942023955 267993 272955 667 665 0 True 288 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 331 423 0.0064098415429502 0.00645603479974828 0.0064087891966125 0.00646982528419928 0.00131295308684997 0.00130611322494513 280186 281359 667 665 0 True 332 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 376 422 0.00651194201480171 0.0063688862807052 0.00650034332799268 0.00642404821850919 0.00135731870651362 0.00130789008329497 284649 277561 667 665 0 True 377 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 420 421 0.00656986681756398 0.00675577705995361 0.00662241550316625 0.00679026474402991 0.00155502956423122 0.0015326215565135 287181 294422 667 665 0 True 422 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 464 421 0.00689721515987257 0.00693633832808159 0.00694285496299687 0.00692759594110018 0.00166768897120434 0.00152673475093962 301490 302291 667 665 0 True 466 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 509 420 0.00672598010905282 0.00677202275544664 0.00672922865644312 0.00677500572213321 0.00172798075775834 0.00174935565728896 294005 295130 667 665 0 True 511 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 552 420 0.00662664776561136 0.00678044389986181 0.00660715648126955 0.0068207827878233 0.00176128141841284 0.00153743214186649 289663 295497 667 665 0 True 556 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 597 420 0.00632604274653701 0.00621069726272651 0.00631723506523232 0.00613412680247196 0.00189826311734328 0.00191101905959429 276523 270667 667 665 0 True 600 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 641 420 0.00598057574554449 0.00593500230319447 0.00601205462729839 0.00601205462729839 0.00179002104504611 0.00185493153391106 261422 258652 667 665 0 True 645 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 244 466 0.00623869800050764 0.00616925697168075 0.00628671702143893 0.00616464484626535 0.00145837196077994 0.00144991539758432 272705 268861 667 665 0 True 243 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 289 467 0.00626498378185593 0.00619378613620341 0.00628671702143893 0.00614938582436866 0.00144915379319152 0.00152301522660211 273854 269930 667 665 0 True 288 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 333 466 0.00642702224076792 0.00625092142120006 0.00650034332799268 0.00616464484626535 0.00146153210164616 0.00153960299388285 280937 272420 667 665 0 True 332 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 377 466 0.00655890868939529 0.00645002297457996 0.00656137941557946 0.00643930724040589 0.0015084763213304 0.00147994368019205 286702 281097 667 665 0 True 377 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 422 466 0.0066087578778704 0.00677557936957294 0.00669871061264973 0.00672922865644312 0.00173100885808808 0.00185866467238633 288881 295285 667 665 0 True 422 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 465 464 0.00684521552453345 0.00676013678049553 0.00668345159075303 0.00686655985351339 0.00194768774005126 0.00180379225598076 299217 294612 667 665 0 True 466 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 509 464 0.00673545122609215 0.00673051362670811 0.0068055237659266 0.00685130083161669 0.00180107082146379 0.00181769882939212 294419 293321 667 665 0 True 511 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 554 464 0.00618775071150623 0.00609876717428729 0.00624093995574884 0.00611886778057527 0.00175074072939552 0.00182991794900217 270478 265789 667 665 0 True 556 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 598 464 0.00599924345449157 0.00604271034647732 0.00601205462729839 0.00605783169298848 0.00177228824277422 0.00178521073065491 262238 263346 667 665 0 True 600 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 643 465 0.00591235625034816 0.00599158688664899 0.00584420538643473 0.00593575951781491 0.00185566152877062 0.00179062955515477 258440 261118 667 665 0 True 645 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 245 510 0.00612991741712115 0.00640890392610044 0.00608834973678187 0.00648508430609598 0.00143626714121329 0.00143560866974047 267950 279305 667 665 0 True 243 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 289 511 0.00622266115740482 0.00639522817113739 0.00628671702143893 0.00636301213092241 0.00149808608987649 0.00164551559494823 272004 278709 667 665 0 True 288 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 333 510 0.00621074219127561 0.00635454509471206 0.00619516289005875 0.0064087891966125 0.00147626739425102 0.00154319492622818 271483 276936 667 665 0 True 333 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 378 510 0.00644045109512078 0.00630406412001622 0.00650034332799268 0.00630197604333562 0.00156077047436426 0.00150483870414418 281524 274736 667 665 0 True 377 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 422 510 0.00644283031292777 0.00653207750435829 0.00648508430609598 0.00657663843747616 0.00179143932801908 0.00170815086895285 281628 284673 667 665 0 True 422 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 466 508 0.00664090019535895 0.00665825699520029 0.00662241550316625 0.00665293354695964 0.00172278791983714 0.00161366809137442 290286 290172 667 665 0 True 467 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 511 508 0.00636619204702982 0.00636140591809118 0.00633249408712902 0.00630197604333562 0.00180093814283908 0.00162847144470793 278278 277235 667 665 0 True 511 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 555 507 0.00609429778129933 0.00620523613910033 0.00613412680247196 0.00630197604333562 0.00171888227421155 0.00161816523657301 266393 270429 667 665 0 True 556 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 599 507 0.00606615895531291 0.00605845123222338 0.00602731364919509 0.00611886778057527 0.0017526098943617 0.00177552351112211 265163 264032 667 665 0 True 600 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 643 507 0.00622627573830388 0.00609537118144411 0.00604257267109178 0.00622568093385214 0.00234185357018023 0.00190236565981042 272162 265641 667 665 0 True 645 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 246 552 0.0063957034986741 0.00629142093044467 0.0064087891966125 0.00630197604333562 0.00145646032617688 0.00138928273874845 279568 274185 667 665 0 True 243 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 289 553 0.00635258017592257 0.00651961788196745 0.0063782711528191 0.00653086137178607 0.00145487432348308 0.00132636361308406 277683 284130 667 665 0 True 288 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 335 553 0.00640094235326832 0.00661504987004017 0.00643930724040589 0.00657663843747616 0.00142396205300893 0.00135639197155308 279797 288289 667 665 0 True 333 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 378 552 0.00643315330203976 0.00641498458896153 0.00645456626230259 0.00646982528419928 0.00155496040658952 0.00135484852183169 281205 279570 667 665 0 True 377 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 423 552 0.00643763721252214 0.0063692993068618 0.00636301213092241 0.0063782711528191 0.00181124819074813 0.00175785241911642 281401 277579 667 665 0 True 422 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 467 551 0.00652749843892428 0.00680426174155921 0.00643930724040589 0.00688181887541009 0.00193138193853094 0.00189001692967283 285329 296535 667 665 0 True 467 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 512 550 0.0065435352820271 0.00668193716151216 0.00643930724040589 0.00674448767833982 0.00196019717519527 0.00199059233230425 286030 291204 667 665 0 True 511 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 555 549 0.00642265271575702 0.00643694381295422 0.0064087891966125 0.00643930724040589 0.00183008981868315 0.00181779569367124 280746 280527 667 665 0 True 556 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 600 550 0.00632386942257871 0.00623678674828522 0.00636301213092241 0.00622568093385214 0.0016598780791383 0.00145209382055506 276428 271804 667 665 0 True 601 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 644 550 0.00630085506571503 0.00637501283536146 0.00621042191195544 0.00642404821850919 0.0022781120995323 0.00182095149101256 275422 277828 667 665 0 True 645 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 244 593 0.00685756915545432 0.00667564998557277 0.00671396963454643 0.00666819256885634 0.00184982234610554 0.00118864297628794 299757 290930 667 665 0 False 244 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 288 593 0.00660427396738802 0.00663918895430382 0.00660715648126955 0.00665293354695964 0.00129975051126162 0.00149689634123546 288685 289341 667 665 0 False 288 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 335 595 0.00644122891632691 0.0067702329754347 0.00645456626230259 0.00671396963454643 0.00144873754053397 0.00153343245826657 281558 295052 667 665 0 True 333 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 379 595 0.00708359484711753 0.00651723150861819 0.00656137941557946 0.00650034332799268 0.00321616859970738 0.00122593531610165 309637 284026 667 665 0 True 377 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 422 593 0.00657192575605079 0.00634534378977887 0.0063935301747158 0.00631723506523232 0.00207009788425593 0.00175224660730707 287271 276535 667 665 0 False 422 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 467 593 0.00649094084223624 0.00654880506370068 0.00646982528419928 0.00646982528419928 0.00193558352172769 0.00177794923043366 283731 285402 667 665 0 False 467 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 511 592 0.00654639491881434 0.00656791899639233 0.00651560234988937 0.00662241550316625 0.00200512378574947 0.00209791346094873 286155 286235 667 665 0 False 511 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 556 592 0.00659727357653286 0.00635681673857337 0.00656137941557946 0.00634775310902571 0.00189900052666051 0.00178927719522618 288379 277035 667 665 0 False 556 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 601 592 0.00647893036772985 0.00643462627729773 0.00645456626230259 0.00636301213092241 0.00152629636974135 0.0015372336420685 283206 280426 667 665 0 False 601 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 645 592 0.00643692802259891 0.00638093287693943 0.00651560234988937 0.00643930724040589 0.00160463270672405 0.001514148521169 281370 278086 667 665 0 False 645 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 244 642 0.00869382200636921 0.738256421552852 0.00840772106507973 0.738048371099413 0.00214665578467967 0.180489876636764 380023 32173787 667 665 11 True 244 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 288 637 0.00694983247675773 0.00674499248808678 0.00679026474402991 0.00671396963454643 0.0016976669804934 0.00125800861370631 303790 293952 667 665 0 False 288 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 333 636 0.00636209704715049 0.00641342426792548 0.00634775310902571 0.0063782711528191 0.00128061778083137 0.00124826120837997 278099 279502 667 665 0 False 333 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 378 636 0.00655410449959273 0.00617848122251153 0.00630197604333562 0.00619516289005875 0.00270485562472203 0.00120752424181419 286492 269263 667 665 0 False 378 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 422 636 0.00632547081917956 0.005950605513555 0.00619516289005875 0.0059662775616083 0.00198118874785252 0.00148604497901558 276498 259332 667 665 0 False 422 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 467 636 0.00620930093433485 0.00612836738217712 0.00613412680247196 0.00619516289005875 0.00158023558587203 0.00178420119530994 271420 267079 667 665 0 False 467 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 512 636 0.00619790814137449 0.00631879538626837 0.00616464484626535 0.00630197604333562 0.00183644844355886 0.00177283830275319 270922 275378 667 665 0 False 512 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 556 636 0.00630074068024354 0.00620975648092536 0.00622568093385214 0.00627145799954223 0.0017385426584246 0.00163510369390064 275417 270626 667 665 0 False 556 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 601 636 0.0071187111868648 0.00663244286041265 0.00686655985351339 0.00657663843747616 0.00208846042420201 0.00130475553889021 311172 289047 667 665 0 False 601 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 641 641 0.00803487018221262 0.774476039033266 0.00799572747386892 0.763469901579309 0.00170012861757452 0.169533160813546 351219 33752266 667 665 14 True 645 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B4_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B4_3.csv new file mode 100755 index 0000000..8d1a348 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B4_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 243 246 0.000989868993175648 0.0731438346380944 0.000732433051041428 0.0686655985351339 0.000875830390152896 0.0186261011502434 43269 3187665 667 665 0 True 243 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 287 245 0.000930960475358567 0.000903334096284428 0.000762951094834821 0.000732433051041428 0.000722383238827017 0.00070254483897326 40694 39368 667 665 0 False 287 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 330 245 0.000921169078999068 0.000965907559009678 0.000854505226215 0.000885023270008392 0.000615493865169677 0.000644799920040972 40266 42095 667 665 0 True 332 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 375 245 0.000918698352814895 0.000891333391845372 0.000762951094834821 0.00080872816052491 0.000652734378821865 0.000583721387363142 40158 38845 667 665 0 True 376 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 419 245 0.000929336201663416 0.000871370460942927 0.000747692072938125 0.000656137941557946 0.000757004551257909 0.00075211030061767 40623 37975 667 665 0 True 421 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 463 243 0.000975982596936826 0.00084819510437802 0.000762951094834821 0.000671396963454643 0.000873848052528872 0.000725028381825528 42662 36965 667 665 0 True 466 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 507 243 0.00100949754008324 0.000954687015088649 0.000778210116731518 0.000778210116731518 0.000874159086641103 0.000807642134637753 44127 41606 667 665 0 True 510 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 552 244 0.00103939790233059 0.00104401539440269 0.000839246204318303 0.000900282291905089 0.000858734148538121 0.000732044288787602 45434 45499 667 665 0 True 555 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 600 244 0.00114115521776763 0.00105099094726975 0.000732433051041428 0.000671396963454643 0.00120937290924498 0.00109041875569808 49882 45803 667 665 0 False 600 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 639 244 0.00120928320458677 0.0758426852207195 0.000869764248111696 0.0734264133669032 0.0010586640794396 0.0192125236376483 52860 3305283 667 665 0 True 644 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 243 289 0.000967884105555371 0.000951635210709309 0.000762951094834821 0.000762951094834821 0.000799447784208863 0.000800112451668466 42308 41473 667 665 0 False 243 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 287 289 0.000866630086192884 0.000896886299061914 0.000701915007248035 0.000747692072938125 0.000686953287773709 0.00072599690653394 37882 39087 667 665 0 False 287 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 330 290 0.000859469555677643 0.000865427473467372 0.000762951094834821 0.000747692072938125 0.000661583343823906 0.000653929895066132 37569 37716 667 665 0 True 332 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 375 290 0.000918217933834639 0.000975521890099476 0.000778210116731518 0.000869764248111696 0.000689891692182558 0.000694149968142138 40137 42514 667 665 0 True 377 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 418 289 0.000908174889437863 0.000961616676160532 0.000747692072938125 0.000778210116731518 0.00073198551263213 0.000804359616678962 39698 41908 667 665 0 True 421 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 463 288 0.000883467627596136 0.00091519712533795 0.000595101853971161 0.000564583810177768 0.000888115164896068 0.000963720265878232 38618 39885 667 665 0 True 466 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 507 287 0.000936496732178658 0.000917468769199263 0.000747692072938125 0.000747692072938125 0.000815975148456393 0.000798059467419301 40936 39984 667 665 0 True 511 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 551 288 0.000918217933834639 0.00101342851291653 0.000701915007248035 0.000823987182421607 0.000821250621016367 0.000827408673848973 40137 44166 667 665 0 True 555 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 600 288 0.0010523234606089 0.0010013819166823 0.000671396963454643 0.000625619897764553 0.00109543144761175 0.00103095838044503 45999 43641 667 665 0 False 600 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 644 288 0.00103088762325178 0.000965425695160309 0.000625619897764553 0.000625619897764553 0.00102469948154454 0.000990035444673858 45062 42074 667 665 0 False 644 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 243 334 0.000910256705018971 0.000917193418428195 0.000732433051041428 0.000747692072938125 0.000783253647963697 0.000760117108075955 39789 39972 667 665 0 True 243 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 286 335 0.00089222955471223 0.000941263664999074 0.000747692072938125 0.000778210116731518 0.000713986356333484 0.000746451570708259 39001 41021 667 665 0 True 287 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 330 334 0.000927986453099841 0.000884449622568667 0.000778210116731518 0.000793469138628214 0.000697247059931407 0.000665939751894055 40564 38545 667 665 0 True 332 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 374 334 0.000931761173658993 0.000959803950250999 0.000778210116731518 0.000839246204318303 0.000687050973227016 0.000660154109293708 40729 41829 667 665 0 True 377 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 419 334 0.000948301312836372 0.000954847636371772 0.000762951094834821 0.000717174029144732 0.00082868637961513 0.000846545346706982 41452 41613 667 665 0 True 421 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 463 332 0.000944778240314496 0.000921599030765286 0.000701915007248035 0.000717174029144732 0.000898192291994846 0.000822479701448794 41298 40164 667 665 0 True 466 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 507 331 0.00104427072341604 0.00094812448837819 0.000839246204318303 0.000762951094834821 0.000859167206561323 0.000863258875038535 45647 41320 667 665 0 True 511 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 551 331 0.00103637812588327 0.00105232180932992 0.000823987182421607 0.000915541313801785 0.000877321121912705 0.000758740176268421 45302 45861 667 665 0 True 555 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 596 332 0.000994284272375142 0.000968752850310716 0.000656137941557946 0.000488288700694286 0.00104785858439734 0.00115963858505799 43462 42219 667 665 0 True 600 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 640 333 0.000927254386082308 0.00101645737139828 0.000503547722590982 0.000671396963454643 0.0010240384699188 0.00099733607714561 40532 44298 667 665 0 True 645 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 242 378 0.000857502125568024 0.000884747919237324 0.000656137941557946 0.000778210116731518 0.000792476723678599 0.000749946919995264 37483 38558 667 665 0 True 243 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 287 379 0.000922656090128431 0.000898492511893146 0.00080872816052491 0.000762951094834821 0.000713470788588079 0.000705996204499781 40331 39157 667 665 0 True 288 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 332 378 0.000867568047059098 0.000913154940452528 0.000762951094834821 0.000793469138628214 0.000682845062842668 0.000705643226040125 37923 39796 667 665 0 True 332 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 375 378 0.000941781340961472 0.00104585106620981 0.000793469138628214 0.000885023270008392 0.000729849237663119 0.00081083043151118 41167 45579 667 665 0 True 377 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 420 377 0.000922221425336771 0.000926234102078267 0.000732433051041428 0.00064087891966125 0.000805190697150615 0.000844079803828806 40312 40366 667 665 0 True 421 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 464 377 0.000992820138340077 0.000911411052235762 0.000656137941557946 0.000534065766384375 0.000972600526281266 0.000901798221347862 43398 39720 667 665 0 True 466 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 508 376 0.000963560334733068 0.000964852047720583 0.000671396963454643 0.000656137941557946 0.000919695065001696 0.000961696609516747 42119 42049 667 665 0 True 511 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 552 376 0.00105435952200142 0.000974810567274217 0.000732433051041428 0.000762951094834821 0.0010205954578997 0.000900588914374222 46088 42483 667 665 0 True 555 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 596 376 0.000957589413121318 0.00105734696090191 0.000488288700694286 0.000488288700694286 0.00108026867663965 0.00125185048581853 41858 46080 667 665 0 True 600 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 640 376 0.00104049600285689 0.00100264394104969 0.000701915007248035 0.000671396963454643 0.00106386463485738 0.000969392460887784 45482 43696 667 665 0 True 645 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 243 422 0.000841899947256859 0.000910516162229791 0.000701915007248035 0.000717174029144732 0.000763785155549562 0.000830050398288389 36801 39681 667 665 0 True 243 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 287 423 0.000865898019175352 0.00100262099515211 0.000747692072938125 0.000854505226215 0.000758340740501865 0.000777650399879406 37850 43695 667 665 0 True 288 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 331 423 0.000908929833549693 0.000961937918726778 0.000778210116731518 0.000869764248111696 0.00072944477835037 0.000673239468943957 39731 41922 667 665 0 True 332 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 376 422 0.000925286955972689 0.000938762562161871 0.000778210116731518 0.000839246204318303 0.000697511258041785 0.000719690473467199 40446 40912 667 665 0 True 377 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 420 421 0.0009653905022769 0.000939290317806418 0.000732433051041428 0.000686655985351339 0.000872136117529557 0.000824909629831334 42199 40935 667 665 0 True 422 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 464 421 0.000966397094426007 0.000942227392697812 0.000686655985351339 0.000717174029144732 0.000919038663326499 0.00084682006687781 42243 41063 667 665 0 True 466 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 509 420 0.000998013238745699 0.00100571869132662 0.000747692072938125 0.000732433051041428 0.000904701016603854 0.000940810650976151 43625 43830 667 665 0 True 511 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 552 420 0.000964704189447963 0.00096515034438924 0.000747692072938125 0.000793469138628214 0.000841036229117372 0.000816669164078168 42169 42062 667 665 0 True 556 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 597 420 0.000960334664437065 0.000967169583377074 0.000534065766384375 0.000549324788281071 0.00102769227493298 0.00103895583608351 41978 42150 667 665 0 True 600 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 641 420 0.000950611899360459 0.000896335597519778 0.000549324788281071 0.000534065766384375 0.00100195571653775 0.000948964863737046 41553 39063 667 665 0 True 645 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 244 466 0.000868025588945056 0.000862559236268745 0.000717174029144732 0.000732433051041428 0.00076710919227459 0.000717892982470847 37943 37591 667 665 0 True 243 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 289 467 0.000853338494405807 0.000897023974447448 0.000701915007248035 0.000747692072938125 0.000762734440970403 0.000781482403256181 37301 39093 667 665 0 True 288 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 333 466 0.000955759245577486 0.000890254934658688 0.000839246204318303 0.000701915007248035 0.000802697518283039 0.00080618513997583 41778 38798 667 665 0 True 332 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 377 466 0.000960746452134427 0.000897115758037804 0.000823987182421607 0.000732433051041428 0.00078439222092169 0.000753797066440043 41996 39097 667 665 0 True 377 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 422 466 0.000918789861192087 0.000954526393805525 0.000610360875867857 0.00064087891966125 0.000931583597087705 0.000984846343148413 40162 41599 667 665 0 True 422 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 465 464 0.000950131480380204 0.00093458640880067 0.000488288700694286 0.000488288700694286 0.00106579035568987 0.00104272190857601 41532 40730 667 665 0 True 466 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 509 464 0.000993071786377354 0.00100608582568805 0.000656137941557946 0.00064087891966125 0.000980868087982258 0.000967116782962734 43409 43846 667 665 0 True 511 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 554 464 0.000922290056619665 0.00100236859027863 0.000549324788281071 0.000656137941557946 0.000997475177308156 0.000978578131974097 40315 43684 667 665 0 True 556 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 598 464 0.000957406396366934 0.000913774479687431 0.000534065766384375 0.000534065766384375 0.00103782527568255 0.000955184105616614 41850 39823 667 665 0 True 600 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 643 465 0.000955690614294592 0.000926463561054157 0.00064087891966125 0.000579842832074464 0.000925740924330446 0.000941673795726612 41775 40376 667 665 0 True 645 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 245 510 0.000843341204197627 0.000942823986035127 0.000671396963454643 0.000747692072938125 0.000723716234141699 0.000795503223343532 36864 41089 667 665 0 True 243 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 289 511 0.000969554133439117 0.000904045419109688 0.000839246204318303 0.000823987182421607 0.000770328904667771 0.000734978861162797 42381 39399 667 665 0 True 288 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 333 510 0.000938006620402319 0.000819558624186927 0.00080872816052491 0.000732433051041428 0.000804197293525155 0.000752034963149681 41002 35717 667 665 0 True 333 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 378 510 0.000924280363823581 0.00093130514544544 0.000732433051041428 0.000823987182421607 0.000853980776073438 0.000753843957618166 40402 40587 667 665 0 True 377 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 422 510 0.000959145055533574 0.000979537422177554 0.000686655985351339 0.000595101853971161 0.000971317854600734 0.000962375308588122 41926 42689 667 665 0 True 422 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 466 508 0.000900877096356834 0.0010197615806511 0.000473029678797589 0.000732433051041428 0.00097011450295598 0.000890114837623523 39379 44442 667 665 0 True 467 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 511 508 0.000887379610721076 0.000982635118352072 0.000534065766384375 0.000686655985351339 0.000897237221157796 0.000915477291358845 38789 42824 667 665 0 True 511 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 555 507 0.000895043437310871 0.00101833893500058 0.000564583810177768 0.000762951094834821 0.000888047813633804 0.00091441722075955 39124 44380 667 665 0 True 556 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 599 507 0.000933476955731335 0.000948308055558902 0.000610360875867857 0.000595101853971161 0.000947765203052316 0.000971510703148173 40804 41328 667 665 0 True 600 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 643 507 0.000948095418987691 0.000900672372164102 0.000518806744487678 0.0004272526131075 0.00101153786324138 0.00101857640769242 41443 39252 667 665 0 True 645 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 246 552 0.000874248158594084 0.000882820463839847 0.000701915007248035 0.000717174029144732 0.000701318060304182 0.00071703564259683 38215 38474 667 665 0 True 243 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 289 553 0.00091135480554527 0.0009518646696852 0.000762951094834821 0.000839246204318303 0.000709167078981227 0.000738492650216352 39837 41483 667 665 0 True 288 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 335 553 0.000930068268680949 0.000954824690474183 0.00080872816052491 0.00080872816052491 0.000723972677067559 0.0007286175754534 40655 41612 667 665 0 True 333 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 378 552 0.000904651816915987 0.000923893620524188 0.000762951094834821 0.000778210116731518 0.000739505178300607 0.000709941274553286 39544 40264 667 665 0 True 377 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 423 552 0.000928832905588863 0.000933806248282643 0.000625619897764553 0.000549324788281071 0.000971687137271047 0.00098462464251027 40601 40696 667 665 0 True 422 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 467 551 0.00088287282314439 0.00093084622749366 0.000442511635004196 0.000473029678797589 0.00103740063491122 0.00104604592255821 38592 40567 667 665 0 True 467 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 512 550 0.000872921287124806 0.000968729904413127 0.000442511635004196 0.000518806744487678 0.000998916156167441 0.00114063783327199 38157 42218 667 665 0 True 511 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 555 549 0.000934277654031762 0.000941699637053265 0.000579842832074464 0.000579842832074464 0.000921494664108703 0.000993117515149994 40839 41040 667 665 0 True 556 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 600 550 0.000905887180008073 0.000922998730518216 0.00064087891966125 0.000686655985351339 0.000823961552792291 0.000804186225120932 39598 40225 667 665 0 True 601 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 644 550 0.000946882932989902 0.000877313448418483 0.000610360875867857 0.000564583810177768 0.000968559317488692 0.00090438284207717 41390 38234 667 665 0 True 645 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 244 593 0.000956193910369146 0.00097006076647329 0.000869764248111696 0.000885023270008392 0.000691516124321389 0.000657662795684112 41797 42276 667 665 0 False 244 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 288 593 0.00089081117486576 0.000846359432570899 0.000762951094834821 0.000701915007248035 0.000703651278886316 0.000705126443540643 38939 36885 667 665 0 False 288 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 335 595 0.000934346285314656 0.000964783210027816 0.000793469138628214 0.000778210116731518 0.00072117221210224 0.000843051542635937 40842 42046 667 665 0 True 333 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 379 595 0.00101935756772564 0.000902944016025415 0.000900282291905089 0.000762951094834821 0.00073304029849347 0.00068546757441471 44558 39351 667 665 0 True 377 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 422 593 0.0010034579871886 0.000843491195372271 0.000717174029144732 0.000503547722590982 0.0010049053719596 0.000887420152105949 43863 36760 667 665 0 False 422 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 467 593 0.000908998464832587 0.00096095124513045 0.000442511635004196 0.000564583810177768 0.00100046689393026 0.000983573715834101 39734 41879 667 665 0 False 467 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 511 592 0.00104493415915068 0.00101017019545889 0.000534065766384375 0.000686655985351339 0.00114967169932922 0.0011725081062167 45676 44024 667 665 0 False 511 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 556 592 0.000922404442091154 0.000958128899727001 0.000488288700694286 0.000625619897764553 0.00101446696559879 0.000943081687432186 40320 41756 667 665 0 False 556 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 601 592 0.00099604580863608 0.000815657821596794 0.000747692072938125 0.000595101853971161 0.000856256234571554 0.000749997123243536 43539 35547 667 665 0 False 601 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 645 592 0.000960311787342767 0.000866437092961288 0.000701915007248035 0.000671396963454643 0.000868380105482025 0.000731458488779403 41977 37760 667 665 0 False 645 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 244 642 0.00103152818189212 0.0754781666916203 0.000885023270008392 0.0739147020675975 0.000736791021633341 0.0213531855050441 45090 3289397 667 665 0 True 244 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 288 637 0.000936748380215935 0.00084842456335391 0.000747692072938125 0.000717174029144732 0.000736451411332151 0.000656069206588831 40947 36975 667 665 0 False 288 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 333 636 0.000895112068593764 0.000945898736312055 0.000793469138628214 0.000839246204318303 0.000676206136851062 0.000667223201897931 39127 41223 667 665 0 False 333 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 378 636 0.000958596005270425 0.000921690814355642 0.000854505226215 0.000778210116731518 0.00072972228668981 0.000670993723092519 41902 40168 667 665 0 False 378 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 422 636 0.000914283073615401 0.000945210359384384 0.000717174029144732 0.000701915007248035 0.000816434148960819 0.000800423250962398 39965 41193 667 665 0 False 422 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 467 636 0.00091016519664178 0.000880227577412288 0.000595101853971161 0.000534065766384375 0.000941422430840685 0.000910802445953358 39785 38361 667 665 0 False 467 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 512 636 0.000890033353659632 0.000990528507122693 0.000549324788281071 0.00064087891966125 0.000956416373359529 0.000965198805484385 38905 43168 667 665 0 False 512 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 556 636 0.000938212514251 0.000934884705469327 0.000610360875867857 0.000671396963454643 0.000931611859011651 0.000852065042369535 41011 40743 667 665 0 False 556 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 601 636 0.00100743860159643 0.000951222184552707 0.00080872816052491 0.000793469138628214 0.000769473082353549 0.000726500184084966 44037 41455 667 665 0 False 601 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 641 641 0.00105943823693555 0.080540788914378 0.000915541313801785 0.0767071030746929 0.000767440898809422 0.0221581552647292 46310 3510030 667 665 0 True 645 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B5_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B5_1.csv new file mode 100755 index 0000000..1cffd87 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B5_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 256 273 0.0099648276113717 0.0417495787993674 0.0100099183642329 0.041519798580911 0.00151684349829429 0.00903946712069862 435581 1819479 667 665 0 True 256 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 301 274 0.00994874501408028 0.00967938270946306 0.00999465934233616 0.00961318379491875 0.00138391523384592 0.00134522670947723 434878 421835 667 665 0 False 301 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 345 275 0.00995231384079075 0.0617326103081003 0.00994888227664607 0.061371786068513 0.0013923462709713 0.00780778782885473 435034 2690355 667 665 0 True 346 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 389 275 0.0102264729388567 0.0941632635032305 0.0102082856488899 0.0922407873655299 0.001512027918661 0.0175061790080109 447018 4103708 667 665 0 True 391 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 433 275 0.009964850488466 0.0722940333208852 0.00997940032043946 0.0698252841992828 0.00167666140454443 0.0117042160488441 435582 3150630 667 665 0 True 435 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 477 274 0.00966813457542229 0.0633259734366817 0.00967421988250553 0.0673075455863279 0.00169436703391472 0.0172263046380111 422612 2759795 667 665 0 True 480 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 521 272 0.0100770397589029 0.0789337500308336 0.00991836423285267 0.0784161135271229 0.00210012184342414 0.0237872672620822 440486 3439994 667 665 0 True 525 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 566 273 0.0095799433769039 0.0685409334735328 0.00959792477302205 0.0669413290608072 0.00162441882449748 0.0171255228589727 418757 2987067 667 665 0 True 570 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 614 273 0.00962087049860284 0.00952376363201435 0.00959792477302205 0.00941481651026169 0.00190550416573958 0.0018640715455603 420546 415053 667 665 0 False 614 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 653 273 0.00944833145340811 0.0419267899664474 0.00949111161974517 0.0414587624933242 0.00188264707024367 0.00866339938302846 413004 1827202 667 665 0 True 659 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 257 317 0.00979315789576029 0.00978617291684235 0.0098268101014725 0.00968947890440223 0.00156520345274721 0.00153092235837052 428077 426489 667 665 0 False 257 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 301 317 0.00992387761257847 0.00989025550830613 0.00996414129854276 0.00994888227664607 0.00144573724172086 0.00128287602159752 433791 431025 667 665 0 False 301 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 344 319 0.0101935070459735 0.139398048795599 0.0101472495613031 0.132631418326085 0.0013623149390861 0.0558732387938516 445577 6075075 667 665 0 True 346 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 388 319 0.0101394255950532 0.0489952507728465 0.0100709544518196 0.0486915388723583 0.00145430464190797 0.00612391142010718 443213 2135251 667 665 0 True 391 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 433 319 0.010079968026973 0.0746210685789778 0.010101472495613 0.0719310292210269 0.00169009046357483 0.0126840675185717 440614 3252044 667 665 0 True 435 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 477 317 0.00986066820103338 0.0443491195372271 0.0098268101014725 0.0441596093690394 0.00177517718537817 0.00933763321631329 431028 1932769 667 665 0 True 480 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 521 317 0.00996466747171162 0.0422216676963638 0.00984206912336919 0.0442511635004196 0.00159964601953597 0.00830824689066471 435574 1840053 667 665 0 True 525 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 566 317 0.00985842624579219 0.0502634016948987 0.00991836423285267 0.0511787594415198 0.00179150987633058 0.00859842971666427 430930 2190518 667 665 0 True 570 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 614 316 0.00975646303650647 0.00970161728422682 0.00976577401388571 0.00978103303578241 0.00205237823731417 0.00212909620023366 426473 422804 667 665 0 False 614 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 659 316 0.009404933605525 0.00938583584160676 0.009399557488365 0.00943007553215839 0.00189974578719064 0.00183099583743354 411107 409042 667 665 0 False 659 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 256 363 0.0100085228614807 0.0514349962798964 0.0100099183642329 0.0501716639963378 0.00153861957951793 0.0110079496508873 437491 2241577 667 665 0 True 257 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 300 364 0.0100461556816007 0.0624281463558186 0.0100556954299229 0.0657511253528649 0.00149696046857181 0.01694953624484 439136 2720667 667 665 0 True 301 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 346 361 0.0101824802865219 0.0282371527353518 0.0100556954299229 0.0332951857785916 0.0017814544760979 0.0138536229299602 445095 1230597 667 665 0 False 346 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 389 363 0.0100613918264031 0.0345121444031227 0.0100556954299229 0.0352788586251621 0.00145144391576836 0.00421698962527123 439802 1504066 667 665 0 True 391 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 433 363 0.0100583491728615 0.0709089271588217 0.0100862134737163 0.0698863202868696 0.00163484225709087 0.0114952142906953 439669 3090266 667 665 0 True 436 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 477 361 0.0101873759847016 0.0336954081243392 0.0102082856488899 0.0341344319829099 0.00170981295713807 0.0060842175052286 445309 1468472 667 665 0 True 480 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 521 361 0.0101234116290447 0.0300188098995486 0.0101167315175097 0.0299839780270085 0.00197614803909323 0.00517290981209438 442513 1308243 667 665 0 True 525 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 566 361 0.00994716649457373 0.0510966819658439 0.00997940032043946 0.0504463263904784 0.001889743778456 0.00826436154706828 434809 2226833 667 665 0 True 570 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 610 361 0.00990793227785283 0.0579535586505747 0.0100099183642329 0.0573281452658885 0.00213356695329137 0.0111882862527914 433094 2525661 667 665 0 True 615 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 654 361 0.00973898493646287 0.064900911009499 0.00991836423285267 0.0647592889295796 0.00188296892365576 0.0173564147042412 425709 2828432 667 665 0 True 659 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 257 407 0.0100295240340461 0.0474872693291939 0.0100862134737163 0.0508278019378958 0.00158629185416407 0.0098902981912568 438409 2069532 667 665 0 True 257 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 300 407 0.0101664663205134 0.0338717244014132 0.0101319905394064 0.0340123598077363 0.0014045141873235 0.00529257220776062 444395 1476156 667 665 0 True 301 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 345 407 0.0102014682747891 0.0861043200815038 0.0102082856488899 0.0824750133516442 0.001378560477955 0.0171309018452494 445925 3752493 667 665 0 True 346 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 389 407 0.0103041635510924 0.0654339442104919 0.01025406271458 0.0632181277180133 0.00156550078423345 0.0147761257737857 450414 2851662 667 665 0 True 391 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 433 406 0.0102918099201715 0.0460784371090234 0.0102235446707866 0.0458228427557794 0.00165360693921764 0.00960847528295098 449874 2008134 667 665 0 True 436 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 478 405 0.0102510429381327 0.0569471286364228 0.0102693217364767 0.056092164492256 0.00171159543489614 0.0109875233654984 448092 2481800 667 665 0 True 480 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 522 405 0.0102485950890428 0.04256480064891 0.0101930266269932 0.043076218814374 0.00209399630314125 0.00444294603043518 447985 1855007 667 665 0 True 525 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 566 404 0.010073516686381 0.0545949676204703 0.0101319905394064 0.0532845044632639 0.00184950658193592 0.00767215630054323 440332 2379291 667 665 0 True 570 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 610 404 0.0100503879440458 0.0447437889757582 0.0100556954299229 0.0452582589456016 0.00195707387295618 0.00787559881835746 439321 1949969 667 665 0 True 615 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 654 405 0.0100035356549237 0.0964992476613828 0.0100709544518196 0.0913710231174182 0.00183625092335067 0.0221599936166676 437273 4205512 667 665 0 True 659 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 257 450 0.00996873959449664 0.0494612360610843 0.0100251773861295 0.0495765621423667 0.00166043240704969 0.00717814958585784 435752 2155559 667 665 0 True 257 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 301 451 0.0100303018552523 0.0777666528417634 0.00997940032043946 0.0730449378194858 0.00158757285486179 0.0284777889026651 438443 3389131 667 665 0 True 302 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 345 450 0.0101317388913691 0.0366856486604472 0.0101625085831998 0.0370641641870756 0.00160402705574774 0.00410597858524603 442877 1598789 667 665 0 True 346 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 389 450 0.0103222135784934 0.0555154881940489 0.0103456168459602 0.0540627145799954 0.00153897693872071 0.0107700935149809 451203 2419408 667 665 0 True 391 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 434 451 0.0103945738277577 0.111881144839668 0.010406652933547 0.112855725947967 0.00186572092993871 0.0228169152309247 454366 4875867 667 665 0 True 436 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 478 449 0.0104170848885468 0.0618108787647764 0.010406652933547 0.0615701533531701 0.00194640568150211 0.0133970672006386 455350 2693766 667 665 0 True 481 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 522 448 0.0103438324326049 0.0531064901897683 0.0102693217364767 0.0520485236896315 0.00175460487764446 0.00799363824600394 452148 2314422 667 665 0 True 525 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 566 448 0.0101720254544277 0.0337691562391903 0.0101777676050965 0.0338597695887694 0.00186297003182533 0.00421255649664134 444638 1471686 667 665 0 True 570 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 610 448 0.00996199085167876 0.0413733349166003 0.0100099183642329 0.0418249790188449 0.00177179978796762 0.00547267155011523 435457 1803082 667 665 0 True 615 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 654 448 0.0098430299613297 0.0766176140740957 0.00991836423285267 0.077256427862974 0.00176257514184837 0.0129820453676234 430257 3339055 667 665 0 True 660 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 258 494 0.00992065194228246 0.0560151121681521 0.00988784618905928 0.0567025253681239 0.0014721916905835 0.0127932017127081 433650 2441182 667 665 0 True 257 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 303 495 0.0101621883038796 0.0570621564210366 0.0101472495613031 0.0563668268863966 0.00153964771557571 0.00629265984931172 444208 2486813 667 665 0 True 302 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 346 494 0.0102504023794923 0.0764926966076211 0.0102388036926833 0.0740215152208743 0.00154174872597015 0.0161420791850013 448064 3333611 667 665 0 True 346 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 391 494 0.0106085204136316 0.0941576876501164 0.0106202792401007 0.0876935988403143 0.00159769801889359 0.0195487909811138 463718 4103465 667 665 0 True 391 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 435 494 0.0105250190194443 0.0994825585364189 0.0105439841306172 0.0962844281681544 0.00191962321367862 0.0266538958666091 460068 4335527 667 665 0 True 436 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 479 493 0.010553409493468 0.0457540509548075 0.0105745021744106 0.0462043183031968 0.0019928000039534 0.00590172689552364 461309 1993997 667 665 0 True 481 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 523 492 0.010243699390863 0.0503984153563125 0.0101167315175097 0.0506599526970321 0.00190211169535404 0.0108639539627575 447771 2196402 667 665 0 True 525 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 567 492 0.0102888130208185 0.105111095431414 0.0102693217364767 0.101121538109407 0.00191036686671586 0.0220055861678307 449743 4580823 667 665 0 True 570 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 612 492 0.010233633469372 0.0677424391833326 0.01025406271458 0.0697947661554894 0.00188976768697988 0.0165795819275638 447331 2952268 667 665 0 True 615 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 656 493 0.0101651852032327 0.0809049862009108 0.0101625085831998 0.0771801327534905 0.00179818927392426 0.0136814140918747 444339 3525902 667 665 0 True 660 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 259 538 0.0098158977274924 0.0509502641933284 0.00976577401388571 0.0526131074998093 0.00146794958174776 0.009398500847971 429071 2220452 667 665 0 True 257 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 302 538 0.0102453465416525 0.126570947854874 0.0102082856488899 0.129945830472267 0.00144109642504597 0.0312550611002835 447843 5516060 667 665 0 True 302 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 347 538 0.010410496285389 0.0631006447223575 0.0104829480430304 0.0631876096742199 0.00153335173896663 0.0131530359920592 455062 2749975 667 665 0 True 347 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 391 538 0.0104705257808267 0.0651243352143233 0.010406652933547 0.0631265735866331 0.00158106150505939 0.00888407974095179 457686 2838169 667 665 0 True 391 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 435 537 0.0105032171485784 0.0623424434283236 0.010406652933547 0.0609597924773022 0.00185154255903618 0.00862056991543049 459115 2716932 667 665 0 True 436 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 480 535 0.0105633381523932 0.0700665144206362 0.0105134660868238 0.0685130083161669 0.00195992870286714 0.0133691498406631 461743 3053553 667 665 0 True 481 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 524 535 0.0106672459146943 0.0789115384019674 0.0107423514152743 0.0761882963302052 0.00189522909894809 0.0150597494256109 466285 3439026 667 665 0 True 526 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 568 535 0.0105235320083149 0.0623591250958708 0.010452429999237 0.0618600747692073 0.00182326903722228 0.0122881347033039 460003 2717659 667 665 0 True 570 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 612 533 0.0102844663729019 0.0513518632929313 0.0103303578240635 0.0503242542153048 0.00177900539181062 0.00644070744425718 449553 2237954 667 665 0 True 615 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 656 534 0.0103975707271107 0.0668409407588553 0.0104371709773404 0.0665598535133898 0.00187667143183684 0.0109584356948461 454497 2912980 667 665 0 True 660 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 259 580 0.00966845485474246 0.0471292903809076 0.00965896086060884 0.0469367513542382 0.00137503642990524 0.00798981406889956 422626 2053931 667 665 0 True 257 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 303 580 0.0100061207665794 0.0576046892236313 0.0100404364080262 0.0571755550469215 0.00139264363981937 0.0104557848359147 437386 2510457 667 665 0 True 302 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 348 579 0.0102649522114658 0.0501457121861647 0.0103456168459602 0.0495918211642634 0.00145194315332722 0.00788155631734532 448700 2185389 667 665 0 True 347 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 392 579 0.0103325311480218 0.0563470704685724 0.0103456168459602 0.0542153047989624 0.00148758624051218 0.00947326514509941 451654 2455649 667 665 0 True 391 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 436 578 0.0106598566132361 0.0959801426202265 0.0107118333714809 0.0891584649423972 0.00212095663432854 0.0193578663208712 465962 4182889 667 665 0 True 436 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 480 577 0.0105141981538414 0.0703170836223082 0.0105745021744106 0.0675974670023651 0.00204541513948101 0.0114443895005727 459595 3064473 667 665 0 True 481 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 524 576 0.0103937960065515 0.0597921216407923 0.0103608758678569 0.0589456015869383 0.00204720105890011 0.00694265890868245 454332 2605787 667 665 0 True 526 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 568 576 0.0102909634676825 0.040790073145785 0.0102388036926833 0.0417334248874647 0.00172587572026066 0.00671121720697487 449837 1777663 667 665 0 True 570 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 612 575 0.0103153733272984 0.0518382474841257 0.0102998397802701 0.0515907530327306 0.00157178839353505 0.00613809247658894 450904 2259151 667 665 0 True 615 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 657 576 0.00999374425856424 0.0567603490300482 0.00997940032043946 0.0554665445944915 0.00186365712402286 0.00864616440599565 436845 2473660 667 665 0 True 660 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 257 622 0.00958776734315378 0.00946713315676465 0.00952162966353857 0.00947585259784848 0.00137337303133199 0.00130780540568539 419099 412585 667 665 0 False 257 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 302 622 0.00943078472208162 0.00950494799599135 0.00943007553215839 0.00950637064164187 0.00141183698526739 0.00135624897908109 412237 414233 667 665 0 False 302 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 347 621 0.0102634423232421 0.0817882885286001 0.0101319905394064 0.0787518120088502 0.00151890106247743 0.0137427254901858 448634 3564397 667 665 0 True 347 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 391 621 0.0102437451450516 0.0838666132027253 0.01025406271458 0.0804760814831769 0.00141785720376676 0.0161647474817578 447773 3654972 667 665 0 True 392 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 436 622 0.0102189006206441 0.00992198968467174 0.0103150988021668 0.0100251773861295 0.00187354761011365 0.00186021196989959 446687 432408 667 665 0 False 436 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 481 622 0.00989301641237061 0.0101602139934409 0.00997940032043946 0.0101167315175097 0.00193858687232972 0.00205200427039031 432442 442790 667 665 0 False 481 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 526 622 0.0100340765758114 0.00983449697716482 0.0100556954299229 0.00985732814526589 0.00200116865448532 0.00200861969538979 438608 428595 667 665 0 False 526 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 571 621 0.00979350105217476 0.00991134278819043 0.00970473792629892 0.00997940032043946 0.00175949137703949 0.00188144366614657 428092 431944 667 665 0 False 571 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 615 621 0.0100778633342976 0.00999321375078805 0.0101472495613031 0.0100404364080262 0.00144034504982913 0.00142502381225485 440522 435512 667 665 0 False 615 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 660 621 0.00990086325571478 0.00988688246136054 0.00994888227664607 0.00990310521095598 0.00162472844294916 0.00147215639047755 432785 430878 667 665 0 False 660 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 258 671 0.00944032447040384 0.0411737973911662 0.00943007553215839 0.0414435034714275 0.00135718566784418 0.00893765322276899 412654 1794386 667 665 0 True 257 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 302 666 0.00943485684486665 0.00961859902674975 0.00947585259784848 0.00961318379491875 0.0013142537282992 0.00121769865046931 412415 419186 667 665 0 False 302 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 347 666 0.0094549429336602 0.00961020082823217 0.00935378042267491 0.00962844281681544 0.00139499071649295 0.00127565562851526 413293 418820 667 665 0 False 347 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 392 665 0.00971967666887545 0.00953268958617647 0.00975051499198901 0.00944533455405508 0.00136215854152796 0.00135093209158115 424865 415442 667 665 0 False 392 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 436 665 0.00983049331365446 0.00969682159163071 0.0097962920576791 0.00967421988250553 0.0015068891020306 0.00150823018478827 429709 422595 667 665 0 False 436 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 481 665 0.00973809272978526 0.00965379803365131 0.00971999694819562 0.00971999694819562 0.00159069128642219 0.00153884623928993 425670 420720 667 665 0 False 481 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 526 665 0.00972299384754865 0.0096763767968789 0.0098268101014725 0.00971999694819562 0.00182256447643034 0.00171428894470911 425010 421704 667 665 0 False 526 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 571 665 0.00996837356098788 0.00978057411783063 0.0100556954299229 0.00978103303578241 0.00166636697767349 0.00146572409890728 435736 426245 667 665 0 False 571 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 615 665 0.0099735666613935 0.00980303815157027 0.0100099183642329 0.00975051499198901 0.00138101033382606 0.00143047424908101 435963 427224 667 665 0 False 615 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 655 670 0.00985039638569363 0.0425986229019562 0.00987258716716258 0.0429083695735103 0.00150135032714244 0.00902420374751562 430579 1856481 667 665 0 True 660 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B5_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B5_2.csv new file mode 100755 index 0000000..29ea8e0 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B5_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 256 273 0.00836263031221858 0.719006029608239 0.00807202258335241 0.715617608911269 0.00228867580098994 0.192299630953816 365546 31334840 667 665 11 True 256 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 301 274 0.00675567457745149 0.00631154448263024 0.00663767452506294 0.00631723506523232 0.00164573899560212 0.00132663951692465 295303 275062 667 665 0 False 301 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 345 275 0.00624864953652723 0.00615895426366328 0.00622568093385214 0.00619516289005875 0.00122908254103975 0.00128171952904176 273140 268412 667 665 0 True 346 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 389 275 0.00626756889351159 0.00624699767271234 0.00625619897764553 0.00622568093385214 0.00136128449983737 0.00124749642031215 273967 272249 667 665 0 True 391 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 433 275 0.00641302145905761 0.00629004417658933 0.0064087891966125 0.00630197604333562 0.00152179338647017 0.00163323040605418 280325 274125 667 665 0 True 435 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 477 274 0.00661127435824317 0.00650378521263103 0.00657663843747616 0.00648508430609598 0.00159621022637666 0.00171662445345341 288991 283440 667 665 0 True 480 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 521 272 0.00665851555796833 0.00661016239385371 0.00666819256885634 0.00669871061264973 0.00152400595767567 0.00159277139091834 291056 288076 667 665 0 True 525 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 566 273 0.00670793008165178 0.00693434203499135 0.00675974670023652 0.00689707789730678 0.00160288831163202 0.00160741359096445 293216 302204 667 665 0 True 570 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 614 273 0.00810023004062171 0.00741879877078827 0.00770580605783169 0.00747692072938125 0.00311512933694379 0.00171905222748785 354076 323317 667 665 0 False 614 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 653 273 0.00876492401544707 0.748174028571084 0.00878919661249714 0.732646677347982 0.00186430657107889 0.164294480079931 383131 32606004 667 665 12 True 659 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 257 317 0.00660283271044725 0.0063316909807134 0.00650034332799268 0.00634775310902571 0.0015847561329125 0.00149456034362196 288622 275940 667 665 0 False 257 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 301 317 0.00615089571259232 0.00610666056305791 0.00617990386816205 0.00610360875867857 0.00129628761290629 0.00120703007752594 268867 266133 667 665 0 False 301 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 344 319 0.00619848006873194 0.00620225317241375 0.00616464484626535 0.00617990386816205 0.0012208961025296 0.00130777255040608 270947 270299 667 665 0 True 346 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 388 319 0.0063642017398259 0.0061133607651539 0.00633249408712902 0.00617990386816205 0.00132650226601899 0.00122730145021107 278191 266425 667 665 0 True 391 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 433 319 0.00655485944370456 0.00662161239675063 0.00657663843747616 0.00668345159075303 0.00163079962256877 0.00163565985866797 286525 288575 667 665 0 True 435 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 477 317 0.00673634343276977 0.00689053831649391 0.00674448767833982 0.00694285496299687 0.00166364774539901 0.00156447240750062 294458 300295 667 665 0 True 480 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 521 317 0.0067686001357298 0.00660848734332971 0.00675974670023652 0.00654612039368277 0.00151540858260968 0.00164176418442996 295868 288003 667 665 0 True 525 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 566 317 0.00670491030520446 0.00689124963931917 0.00660715648126955 0.00691233691920348 0.0016885854780559 0.00150994582045637 293084 300326 667 665 0 True 570 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 614 316 0.00710500780738036 0.0071233015016369 0.00709544518196384 0.0072327763790341 0.00202921468124469 0.00195152601946971 310573 310439 667 665 0 False 614 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 659 316 0.00741956785397642 0.00753045350845642 0.00741588464179446 0.00752269779507134 0.00199313986288045 0.00177249987328274 324323 328183 667 665 0 False 659 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 256 363 0.00606114887166167 0.0063410987987249 0.00616464484626535 0.00631723506523232 0.00139244595311183 0.00156157581890035 264944 276350 667 665 0 True 257 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 300 364 0.0061532749303993 0.00611893661826803 0.00613412680247196 0.00611886778057527 0.0012689924013204 0.00135189878385956 268971 266668 667 665 0 True 301 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 346 361 0.00631348322176746 0.00634564208644752 0.00631723506523232 0.00627145799954223 0.00129415820227875 0.00132315216097788 275974 276548 667 665 0 False 346 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 389 363 0.00640590668273096 0.00658265026264448 0.0063782711528191 0.00654612039368277 0.00128388965484659 0.00132433838235395 280014 286877 667 665 0 True 391 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 433 363 0.00666814681466774 0.00673728266649687 0.00659189745937285 0.00679026474402991 0.0016804061298479 0.00167771162171642 291477 293616 667 665 0 True 436 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 477 361 0.00680712516252746 0.00708477533958494 0.00688181887541009 0.00703440909437705 0.00167504405995678 0.00168621469732863 297552 308760 667 665 0 True 480 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 521 361 0.00697868049266738 0.00674384519320733 0.00703440909437705 0.00679026474402991 0.00169453796277813 0.00159620045556062 305051 293902 667 665 0 True 525 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 566 361 0.0068022980956306 0.00701669486143833 0.0068207827878233 0.00700389105058366 0.00183153164928084 0.00186289419978999 297341 305793 667 665 0 True 570 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 610 361 0.00687237063546505 0.0069956534733492 0.00689707789730678 0.00704966811627375 0.00202675604718309 0.00191954761644917 300404 304876 667 665 0 True 615 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 654 361 0.00660075089486614 0.00633584418817701 0.00663767452506294 0.00630197604333562 0.00193487738784536 0.00191276873258856 288531 276121 667 665 0 True 659 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 257 407 0.00607100889930407 0.00628621221169197 0.00610360875867857 0.00633249408712902 0.0015015143821169 0.00150274422479619 265375 273958 667 665 0 True 257 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 300 407 0.0062283117996964 0.00610078641327512 0.00631723506523232 0.00616464484626535 0.00148355368089224 0.00139475479039875 272251 265877 667 665 0 True 301 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 345 407 0.0063619597845847 0.00669065660259598 0.0063782711528191 0.00662241550316625 0.00135616541134425 0.00128035597097706 278093 291584 667 665 0 True 346 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 389 407 0.00670420111528122 0.00652707529868388 0.00669871061264973 0.00659189745937285 0.00144677075368239 0.00136250656845415 293053 284455 667 665 0 True 391 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 433 406 0.00666823832304493 0.00663432442401495 0.00669871061264973 0.00666819256885634 0.00152152684863252 0.00150198431431035 291481 289129 667 665 0 True 436 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 478 405 0.0067663810575829 0.00702190358019104 0.00674448767833982 0.00701915007248035 0.00166842645138537 0.00167341037021262 295771 306020 667 665 0 True 480 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 522 405 0.00698117409594585 0.00670793486348051 0.00701915007248035 0.00666819256885634 0.00172937501356787 0.00162513072523852 305160 292337 667 665 0 True 525 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 566 404 0.00683290764780119 0.00682027797807634 0.00692759594110018 0.00686655985351339 0.0017208734225196 0.00159871034721459 298679 297233 667 665 0 True 570 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 610 404 0.00647462947400184 0.00644538790326698 0.00656137941557946 0.00643930724040589 0.0018824390732331 0.00191404521204072 283018 280895 667 665 0 True 615 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 654 405 0.00627594191002462 0.00600741955598541 0.00631723506523232 0.005981536583505 0.00180283519702616 0.00174287062044517 274333 261808 667 665 0 True 659 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 257 450 0.00613966305929205 0.00622040337740667 0.00614938582436866 0.00625619897764553 0.00157250696587942 0.00147069714963368 268376 271090 667 665 0 True 257 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 301 451 0.00629657704908132 0.00609447629143814 0.00625619897764553 0.00608834973678187 0.00144705071868919 0.00139878079269211 275235 265602 667 665 0 True 302 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 345 450 0.00641540067686459 0.00647189041498229 0.00634775310902571 0.00643930724040589 0.00126251092972509 0.00148043081923953 280429 282050 667 665 0 True 346 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 389 450 0.00649963413806944 0.00654329804827932 0.00656137941557946 0.00650034332799268 0.0015845303475508 0.00136294595149747 284111 285162 667 665 0 True 391 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 434 451 0.00659059346499787 0.00697185857754939 0.00662241550316625 0.00695811398489357 0.00179507736495098 0.00216602565763782 288087 303839 667 665 0 True 436 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 478 449 0.0067348564216404 0.00691525104819728 0.00671396963454643 0.00698863202868696 0.0017693073442291 0.00186228673507364 294393 301372 667 665 0 True 481 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 522 448 0.0067305326508181 0.00681474801675739 0.00669871061264973 0.00689707789730678 0.00182383015526213 0.001757143177665 294204 296992 667 665 0 True 525 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 566 448 0.00625214973195481 0.00641012005867266 0.00628671702143893 0.0063935301747158 0.00187828562493728 0.00185975326274742 273293 279358 667 665 0 True 570 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 610 448 0.00603879795053263 0.00608738600908313 0.00601205462729839 0.00610360875867857 0.0018023326369372 0.00179056716201619 263967 265293 667 665 0 True 615 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 654 448 0.00610477549048776 0.0061848142902461 0.00610360875867857 0.00633249408712902 0.00186473323844951 0.00196604952284514 266851 269539 667 665 0 True 660 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 258 494 0.00633551386357634 0.00633967615307438 0.00636301213092241 0.00636301213092241 0.00139992028027297 0.00144706252335323 276937 276288 667 665 0 True 257 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 303 495 0.00625754872620911 0.00636335631938624 0.00622568093385214 0.00634775310902571 0.00150513833494315 0.00152702184406032 273529 277320 667 665 0 True 302 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 346 494 0.00646172679281783 0.00643542938371335 0.00654612039368277 0.00646982528419928 0.00146100934681848 0.00146831731242934 282454 280461 667 665 0 True 346 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 391 494 0.00653097575725756 0.00654552380034545 0.00653086137178607 0.00648508430609598 0.00147524709038689 0.00154498366335399 285481 285259 667 665 0 True 391 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 435 494 0.0067087994112351 0.00684515133106284 0.00674448767833982 0.00691233691920348 0.00179296200671814 0.00194912345756326 293254 298317 667 665 0 True 436 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 479 493 0.00676281223087243 0.0066782887637955 0.00677500572213321 0.00671396963454643 0.00175640329750837 0.00174287064370656 295615 291045 667 665 0 True 481 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 523 492 0.00650734371884783 0.00636062575757315 0.00656137941557946 0.00642404821850919 0.00169448834713949 0.00159562091901835 284448 277201 667 665 0 True 525 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 567 492 0.00631007453471708 0.00632072284166585 0.00636301213092241 0.00624093995574884 0.00175263407093235 0.00182633539791874 275825 275462 667 665 0 True 570 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 612 492 0.00622138004012414 0.00642416294799714 0.00624093995574884 0.00643930724040589 0.00183845926381946 0.00168738987465493 271948 279970 667 665 0 True 615 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 656 493 0.00636664958891577 0.00667709557712087 0.0064087891966125 0.00671396963454643 0.00176557187301118 0.00185911291687236 278298 290993 667 665 0 True 660 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 259 538 0.00638183997952958 0.00648150474607209 0.0064087891966125 0.00657663843747616 0.00146511076102131 0.00152190222733699 278962 282469 667 665 0 True 257 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 302 538 0.00633057241120799 0.0065391448408157 0.00634775310902571 0.00657663843747616 0.00139953740572498 0.00145075826905814 276721 284981 667 665 0 True 302 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 347 538 0.00640606682239105 0.00657480276566904 0.0063782711528191 0.00666819256885634 0.0013976877250701 0.00142411925931557 280021 286535 667 665 0 True 347 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 391 538 0.0066675062560274 0.00656167771224812 0.00669871061264973 0.00663767452506294 0.00153181346503481 0.00146785757633894 291449 285963 667 665 0 True 391 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 435 537 0.00674016390751752 0.0064035575319622 0.00675974670023652 0.00636301213092241 0.00192956976690259 0.00208343565180655 294625 279072 667 665 0 True 436 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 480 535 0.00698069367696559 0.00684265022822563 0.00685130083161669 0.00679026474402991 0.00203023734017381 0.00195277537631707 305139 298208 667 665 0 True 481 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 524 535 0.00689808448945589 0.00665382843696561 0.00677500572213321 0.0068055237659266 0.0020427069849437 0.00175212334386937 301528 289979 667 665 0 True 526 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 568 535 0.00656060159437333 0.00681286645315509 0.00665293354695964 0.0068055237659266 0.00167456233397937 0.00185886452669027 286776 296910 667 665 0 True 570 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 612 533 0.00656844843771751 0.00684161766283413 0.00660715648126955 0.00686655985351339 0.0017948941412156 0.00175161584375942 287119 298163 667 665 0 True 615 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 656 534 0.0066044569841424 0.00683484862304537 0.00663767452506294 0.0068055237659266 0.00189218781792206 0.00202894166891719 288693 297868 667 665 0 True 660 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 259 580 0.00662973617334157 0.00664666931691784 0.00666819256885634 0.00665293354695964 0.00129401318373472 0.00120192123458982 289798 289667 667 665 0 True 257 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 303 580 0.00652909983552513 0.00677404199443447 0.00654612039368277 0.00679026474402991 0.00145621231481351 0.0014258857605407 285399 295218 667 665 0 True 302 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 348 579 0.00632702646159182 0.00670286382011334 0.00631723506523232 0.00674448767833982 0.00138903679786299 0.00142461597415428 276566 292116 667 665 0 True 347 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 392 579 0.00656515413613861 0.0066262704139612 0.00653086137178607 0.00665293354695964 0.00144200243520342 0.00133356738456634 286975 288778 667 665 0 True 391 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 436 578 0.00680083396159554 0.00676598798438073 0.00674448767833982 0.00679026474402991 0.00194287937095835 0.00199328601344671 297277 294867 667 665 0 True 436 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 480 577 0.00682043963140883 0.00695040416330366 0.0068055237659266 0.00698863202868696 0.00194630008007274 0.00187304654254355 298134 302904 667 665 0 True 481 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 524 576 0.00695788521395059 0.00677378958956099 0.00695811398489357 0.0068055237659266 0.00204202935046204 0.00199216659960403 304142 295207 667 665 0 True 526 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 568 576 0.00696715043714124 0.00682415583476889 0.00709544518196384 0.00675974670023652 0.00169660372745971 0.00184286439515627 304547 297402 667 665 0 True 570 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 612 575 0.00684015968669362 0.00691063892278189 0.0068207827878233 0.0068207827878233 0.00152101575949605 0.00158987415497875 298996 301171 667 665 0 True 615 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 657 576 0.00665345972012849 0.00656711588997672 0.00659189745937285 0.00662241550316625 0.00162807316081291 0.00155502981256879 290835 286200 667 665 0 True 660 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 257 622 0.0071458891748907 0.00678698348067468 0.00706492713817044 0.00677500572213321 0.00167271719662771 0.00137907894562565 312360 295782 667 665 0 False 257 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 302 622 0.00664208980426244 0.00633338897713499 0.00668345159075303 0.0063782711528191 0.00132600390672618 0.00136257963163171 290338 276014 667 665 0 False 302 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 347 621 0.00654884276790422 0.00673597475033429 0.00653086137178607 0.0068055237659266 0.00134158346498452 0.00150060855987485 286262 293559 667 665 0 True 347 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 391 621 0.00662955315658719 0.00672672755360592 0.00666819256885634 0.00675974670023652 0.00128331689885751 0.00125688088333564 289790 293156 667 665 0 True 392 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 436 622 0.0065936361185395 0.00653648311669538 0.00665293354695964 0.00654612039368277 0.00171346846364678 0.00183050322246748 288220 284865 667 665 0 False 436 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 481 622 0.00667178427266111 0.00675469860276693 0.00660715648126955 0.00669871061264973 0.00192864550193419 0.00186998012562162 291636 294375 667 665 0 False 481 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 526 622 0.00671879670144328 0.0066960488885294 0.00672922865644312 0.00675974670023652 0.00191777014790768 0.00192034004763979 293691 291819 667 665 0 False 526 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 571 621 0.00677290102945781 0.00661904245622066 0.0068055237659266 0.00662241550316625 0.00168579007179235 0.00176354193840075 296056 288463 667 665 0 False 571 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 615 621 0.00678170871076249 0.00680015442589077 0.00674448767833982 0.00683604180972 0.00139661867182012 0.00142648163399716 296441 296356 667 665 0 False 615 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 660 621 0.00688147571899562 0.00688353981772926 0.00692759594110018 0.00688181887541009 0.00147263167361748 0.00149839575249405 300802 299990 667 665 0 False 660 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 258 671 0.0087884874225739 0.732590023926835 0.00840772106507973 0.733089188982986 0.00243577008077475 0.191832508336206 384161 31926841 667 665 12 True 257 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 302 666 0.00731202263368201 0.00681435793649838 0.00708018616006714 0.0068055237659266 0.00175096836300877 0.00124004078488132 319622 296975 667 665 0 False 302 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 347 666 0.00643413701709457 0.00652758010843084 0.0064087891966125 0.00648508430609598 0.00129175122646115 0.00128319883064544 281248 284477 667 665 0 False 347 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 392 665 0.00643253562049371 0.00628160008627657 0.00646982528419928 0.00633249408712902 0.00139872194426988 0.00134323376678354 281178 273757 667 665 0 False 392 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 436 665 0.00641327310709488 0.00627880068677071 0.00645456626230259 0.00634775310902571 0.00148356747329322 0.00149919206457109 280336 273635 667 665 0 False 436 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 481 665 0.0063913339736632 0.00669829758649313 0.00651560234988937 0.00672922865644312 0.0016505513381132 0.001558686348498 279377 291917 667 665 0 False 481 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 526 665 0.00659784550389031 0.00662390698650953 0.00665293354695964 0.00669871061264973 0.00184280343159415 0.00174685020409036 288404 288675 667 665 0 False 526 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 571 665 0.00685381731198946 0.00671988967612439 0.00685130083161669 0.00675974670023652 0.00151834339018123 0.00144555507751124 299593 292858 667 665 0 False 571 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 615 665 0.0073394065155566 0.00711575230133012 0.00706492713817044 0.00712596322575723 0.00203373380578074 0.00141580276116743 320819 310110 667 665 0 False 615 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 655 670 0.00861928843314667 0.768637294770458 0.00857557030594339 0.785351338979171 0.00162369253586417 0.187052943273564 376765 33497809 667 665 15 True 660 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B5_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B5_3.csv new file mode 100755 index 0000000..484c3de --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B5_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 256 273 0.000985888378767815 0.0737847594495509 0.000778210116731518 0.0717021438925765 0.000780709049444405 0.0226783626752867 43095 3215597 667 665 0 True 256 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 301 274 0.00097767550191487 0.000913499128916363 0.000839246204318303 0.000793469138628214 0.000738221093080529 0.000660182123085028 42736 39811 667 665 0 False 301 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 345 275 0.00081231986432968 0.000835919049167896 0.000701915007248035 0.000701915007248035 0.000611471133795273 0.000676567878043692 35508 36430 667 665 0 True 346 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 389 275 0.000837484668057365 0.00091310904865735 0.000686655985351339 0.000793469138628214 0.000661700921793253 0.000653730101832551 36608 39794 667 665 0 True 391 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 433 275 0.000891588996071889 0.000760702396871097 0.000671396963454643 0.000518806744487678 0.000826481143797733 0.000761937488164626 38973 33152 667 665 0 True 435 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 477 274 0.000844622321478309 0.000897046920345037 0.000610360875867857 0.000610360875867857 0.00081870986529258 0.000892023970100875 36920 39094 667 665 0 True 480 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 521 272 0.000963171424130004 0.000927748531319142 0.000732433051041428 0.000686655985351339 0.000827730768290369 0.0008517140522773 42102 40432 667 665 0 True 525 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 566 273 0.000980329244853426 0.00101666388447658 0.000717174029144732 0.000793469138628214 0.000926037341213614 0.000874700218269823 42852 44307 667 665 0 True 570 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 614 273 0.00102217145032428 0.0011263223290545 0.000595101853971161 0.000717174029144732 0.00104201437276842 0.00109044235450103 44681 49086 667 665 0 False 614 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 653 273 0.0010055855569583 0.0769682273892559 0.000625619897764553 0.0733958953231098 0.00096664351992701 0.0206845787559496 43956 3354335 667 665 0 True 659 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 257 317 0.000902432738769091 0.000930731498005715 0.000747692072938125 0.000732433051041428 0.000751365735523326 0.000766755901078181 39447 40562 667 665 0 False 257 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 301 317 0.000825245422607991 0.000894614655200602 0.000701915007248035 0.000854505226215 0.000685734555112102 0.000602620112691561 36073 38988 667 665 0 False 301 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 344 319 0.000906184582233946 0.000830021953487518 0.000732433051041428 0.000686655985351339 0.000720339464562689 0.000638089014312952 39611 36173 667 665 0 True 346 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 388 319 0.000887242348155288 0.000866092904497453 0.000732433051041428 0.000747692072938125 0.000684411861076459 0.000644056018136005 38783 37745 667 665 0 True 391 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 433 319 0.000844485058912521 0.000819581570084516 0.000579842832074464 0.000595101853971161 0.000792217914013379 0.000835425477213402 36914 35718 667 665 0 True 435 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 477 317 0.000797152350810175 0.000966527098244581 0.000518806744487678 0.000778210116731518 0.000806375116890116 0.000854144881775597 34845 42122 667 665 0 True 480 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 521 317 0.000959694105796724 0.000925430995662652 0.000793469138628214 0.000686655985351339 0.00081373149550182 0.000899295205549486 41950 40331 667 665 0 True 525 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 566 317 0.0009740837981101 0.000957715873570399 0.000701915007248035 0.000732433051041428 0.000960903631324127 0.000802557049127866 42579 41738 667 665 0 True 570 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 614 316 0.00100961192555473 0.000920841816144848 0.000564583810177768 0.000473029678797589 0.0010937859852742 0.00106788643556104 44132 40131 667 665 0 False 614 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 659 316 0.00104104505312004 0.00105303313215518 0.000625619897764553 0.000701915007248035 0.00107964403696027 0.00100092441769191 45506 45892 667 665 0 False 659 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 256 363 0.000818542433978708 0.000839452717396604 0.000625619897764553 0.000656137941557946 0.000718786287532263 0.000771314667587095 35780 36584 667 665 0 True 257 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 300 364 0.000920459889075833 0.000880135793821932 0.000823987182421607 0.000762951094834821 0.000693805903975792 0.000684536024098196 40235 38357 667 665 0 True 301 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 346 361 0.000852995337991339 0.000827727363728617 0.000747692072938125 0.000686655985351339 0.000655509443322062 0.000680388146111163 37286 36073 667 665 0 False 346 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 389 363 0.000842677768462987 0.000889360044652717 0.000686655985351339 0.000762951094834821 0.000675039169821995 0.000672034786999995 36835 38759 667 665 0 True 391 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 433 363 0.000882529666729922 0.000926945424903527 0.000579842832074464 0.000610360875867857 0.000820454671066597 0.000905142755304124 38577 40397 667 665 0 True 436 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 477 361 0.000870610700600718 0.000973433813418876 0.000579842832074464 0.000701915007248035 0.000866195312946039 0.00087800142056661 38056 42423 667 665 0 True 480 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 521 361 0.000947477737441648 0.000990826803791351 0.000686655985351339 0.000701915007248035 0.000912871139843201 0.00092502565216342 41416 43181 667 665 0 True 525 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 566 361 0.000999385864403573 0.000986834217610862 0.000701915007248035 0.000595101853971161 0.000962877792168427 0.001028419457803 43685 43007 667 665 0 True 570 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 610 361 0.00094223888284743 0.00103414865843941 0.000534065766384375 0.000579842832074464 0.00104881015440759 0.00114670942703791 41187 45069 667 665 0 True 615 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 654 361 0.00100926876914026 0.000939519776782308 0.000701915007248035 0.000442511635004196 0.00105567114741771 0.00103530601749656 44117 40945 667 665 0 True 659 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 257 407 0.000909822040227311 0.000877634690984729 0.000762951094834821 0.000686655985351339 0.000794650454410028 0.000810108300850992 39770 38248 667 665 0 True 257 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 300 407 0.000953471536147696 0.000797140482242457 0.000793469138628214 0.000671396963454643 0.00077234846421222 0.000673188396088513 41678 34740 667 665 0 True 301 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 345 407 0.000803306289176309 0.000782615729068609 0.000625619897764553 0.00064087891966125 0.000683868418711103 0.000620899739865869 35114 34107 667 665 0 True 346 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 389 407 0.000823758411478628 0.000831100410674202 0.000686655985351339 0.000686655985351339 0.000704415557725862 0.000725419493761788 36008 36220 667 665 0 True 391 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 433 406 0.000917325727157021 0.000892687199803124 0.000610360875867857 0.000610360875867857 0.000868684718193985 0.000849435996810862 40098 38904 667 665 0 True 436 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 478 405 0.000895066314405169 0.000915954339958388 0.000595101853971161 0.00064087891966125 0.000835269700584179 0.00089498927559745 39125 39918 667 665 0 True 480 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 522 405 0.00101841960685942 0.000849021156691224 0.000747692072938125 0.000579842832074464 0.000914038131106196 0.000843893462256308 44517 37001 667 665 0 True 525 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 566 404 0.000955621983011699 0.000893834494682575 0.000701915007248035 0.000625619897764553 0.000910401280809691 0.000848389620640114 41772 38954 667 665 0 True 570 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 610 404 0.000900899973451132 0.000960056355124479 0.000518806744487678 0.000534065766384375 0.000941750479135008 0.00105920969420615 39380 41840 667 665 0 True 615 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 654 405 0.000899664610359046 0.000965517478750665 0.000503547722590982 0.000595101853971161 0.000956125215590463 0.000970288735912756 39326 42078 667 665 0 True 659 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 257 450 0.000921191956093366 0.000831329869650092 0.000732433051041428 0.00064087891966125 0.000805689409032602 0.00077737394530576 40267 36230 667 665 0 True 257 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 301 451 0.000863518801368371 0.000864853826027646 0.000686655985351339 0.000701915007248035 0.000769818832521961 0.00080446285888826 37746 37691 667 665 0 True 302 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 345 450 0.00093082321279278 0.00077768236108697 0.000839246204318303 0.000656137941557946 0.000710659515082567 0.000693015490774757 40688 33892 667 665 0 True 346 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 389 450 0.000873241566444976 0.000837525261999127 0.000671396963454643 0.000701915007248035 0.000785637175147105 0.000710998807201386 38171 36500 667 665 0 True 391 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 434 451 0.000834991064778895 0.000855767250582396 0.000518806744487678 0.000411993591210803 0.000864603827095148 0.00100252936885492 36499 37295 667 665 0 True 436 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 478 449 0.000944595223560113 0.0009460134658 0.000564583810177768 0.000503547722590982 0.000960985852268001 0.00104179773922209 41290 41228 667 665 0 True 481 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 522 448 0.000944457960994325 0.000964048941304968 0.000625619897764553 0.000610360875867857 0.00093393291173076 0.000937693321752011 41284 42014 667 665 0 True 525 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 566 448 0.000901860811411644 0.00101065205930826 0.000549324788281071 0.000686655985351339 0.000938162930097969 0.00104809388689873 39422 44045 667 665 0 True 570 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 610 448 0.000831925534142977 0.000936238513427079 0.0004272526131075 0.000579842832074464 0.000913141884881937 0.0009530814872753 36365 40802 667 665 0 True 615 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 654 448 0.000970514971399629 0.000936559755993325 0.000579842832074464 0.000473029678797589 0.00102788272826439 0.00105064561120973 42423 40816 667 665 0 True 660 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 258 494 0.000907397068231735 0.00089606024674871 0.000778210116731518 0.000732433051041428 0.000792198440438486 0.000753834625713449 39664 39051 667 665 0 True 257 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 303 495 0.00085265218157687 0.000863614747557839 0.000732433051041428 0.000717174029144732 0.000766000730767494 0.000750144898282428 37271 37637 667 665 0 True 302 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 346 494 0.000897285392552065 0.000832959028378912 0.000793469138628214 0.000732433051041428 0.000755964762143246 0.000780388750431624 39222 36301 667 665 0 True 346 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 391 494 0.000808659529242017 0.000809347699759814 0.000579842832074464 0.000595101853971161 0.000746421077337512 0.00079443799006799 35348 35272 667 665 0 True 391 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 435 494 0.000874591315008552 0.000919419170494329 0.000518806744487678 0.000457770656900893 0.000933830790098403 0.00106462259454557 38230 40069 667 665 0 True 436 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 479 493 0.000922107039865281 0.000937638213180009 0.000610360875867857 0.000610360875867857 0.000906366140694376 0.000920718654747189 40307 40863 667 665 0 True 481 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 523 492 0.000909707654755822 0.000915036504054827 0.000610360875867857 0.000625619897764553 0.000869025146661819 0.000864790952494232 39765 39878 667 665 0 True 525 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 567 492 0.000966900390500561 0.00105349205010696 0.000610360875867857 0.000717174029144732 0.000978344976937687 0.0010420584929118 42265 45912 667 665 0 True 570 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 612 492 0.000924120224163496 0.000963085213606229 0.000625619897764553 0.000625619897764553 0.000923581654713226 0.000952554820077661 40395 41972 667 665 0 True 615 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 656 493 0.000963857736958941 0.000986857163508451 0.000549324788281071 0.000579842832074464 0.000977621777060164 0.00106066311611172 42132 43008 667 665 0 True 660 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 259 538 0.000912041118374207 0.000867194307581726 0.000823987182421607 0.00064087891966125 0.000723141758377941 0.000777920795456423 39867 37793 667 665 0 True 257 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 302 538 0.000907602962080416 0.000903402933977195 0.000778210116731518 0.000778210116731518 0.000775421623687583 0.000732161518823653 39673 39371 667 665 0 True 302 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 347 538 0.000907419945326032 0.000798746695073688 0.000762951094834821 0.00064087891966125 0.000769822640353195 0.000687949794945954 39665 34810 667 665 0 True 347 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 391 538 0.000845125617552862 0.000876120261743854 0.000610360875867857 0.000701915007248035 0.000760191697178194 0.000806200294866369 36942 38182 667 665 0 True 391 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 435 537 0.000858897628320196 0.000806892488717789 0.000473029678797589 0.000381475547417411 0.000947154376488647 0.000956907999746565 37544 35165 667 665 0 True 436 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 480 535 0.000940065558889129 0.000956912767154783 0.000564583810177768 0.000549324788281071 0.00100749867471108 0.00105867142526563 41092 41703 667 665 0 True 481 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 524 535 0.000937640586893553 0.000896243813929422 0.000564583810177768 0.000473029678797589 0.000973565305800209 0.000951361916770836 40986 39059 667 665 0 True 526 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 568 535 0.000970263323362352 0.000940299937300335 0.000747692072938125 0.000610360875867857 0.000893897647578356 0.000929500777519436 42412 40979 667 665 0 True 570 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 612 533 0.000925813129141541 0.000980271690900403 0.00064087891966125 0.000671396963454643 0.000926680796326078 0.000939679989037572 40469 42721 667 665 0 True 615 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 656 534 0.00100407566873464 0.000961869081034011 0.000579842832074464 0.000488288700694286 0.00104495058759607 0.00105970486960813 43890 41919 667 665 0 True 660 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 259 580 0.000902913157749347 0.000938326590107679 0.000823987182421607 0.00080872816052491 0.000664384169761809 0.00067549133057261 39468 40893 667 665 0 True 257 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 303 580 0.000900236537716493 0.000917376985608907 0.000823987182421607 0.000793469138628214 0.000708423699318786 0.000754639417849613 39351 39980 667 665 0 True 302 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 348 579 0.000868803410151184 0.000827314337572014 0.000747692072938125 0.000671396963454643 0.000692442476072089 0.000710070138242777 37977 36055 667 665 0 True 347 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 392 579 0.000875460644591872 0.000809623050530882 0.000732433051041428 0.000656137941557946 0.000700162733514099 0.000676550626388193 38268 35284 667 665 0 True 391 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 436 578 0.00087015315871476 0.000897827080863064 0.000457770656900893 0.000442511635004196 0.00099176806535385 0.00103719798101203 38036 39128 667 665 0 True 436 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 480 577 0.000845400142684437 0.000843720654348162 0.000411993591210803 0.000488288700694286 0.00101760025935443 0.000913083534151096 36954 36770 667 665 0 True 481 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 524 576 0.000977400976783295 0.000928758150813059 0.000534065766384375 0.000473029678797589 0.00109054791252093 0.00101546462078925 42724 40476 667 665 0 True 526 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 568 576 0.000926430810687584 0.000937225187023407 0.000625619897764553 0.000595101853971161 0.000887851233087845 0.000941765039536011 40496 40845 667 665 0 True 570 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 612 575 0.000964429664316388 0.00101937150039209 0.000717174029144732 0.000747692072938125 0.000827686296620737 0.000903906590691045 42157 44425 667 665 0 True 615 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 657 576 0.000986231535182283 0.000982359767581003 0.000701915007248035 0.000717174029144732 0.000863038871463564 0.000846404729366246 43110 42812 667 665 0 True 660 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 257 622 0.000929885251926566 0.000948422785046847 0.00080872816052491 0.00080872816052491 0.00068355156193623 0.000699654950626645 40647 41333 667 665 0 False 257 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 302 622 0.000945464553143433 0.000875936694563142 0.000854505226215 0.000747692072938125 0.000688722993656439 0.000690121551351886 41328 38174 667 665 0 False 302 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 347 621 0.000860613410392538 0.000954526393805525 0.000717174029144732 0.000839246204318303 0.000728195229752385 0.000752096244898443 37619 41599 667 665 0 True 347 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 391 621 0.00092766617377967 0.000856891599564257 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.000757764353064738 0.000661181790260223 40550 37344 667 665 0 True 392 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 436 622 0.000874728577574339 0.000871806432997119 0.000534065766384375 0.000503547722590982 0.000915585999645116 0.000918828357593392 38236 37994 667 665 0 False 436 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 481 622 0.000837896455754727 0.000899846319850898 0.000396734569314107 0.0004272526131075 0.000973044324187646 0.00103070884852822 36626 39216 667 665 0 False 481 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 526 622 0.00089298449882406 0.000951428697631008 0.000457770656900893 0.000534065766384375 0.00100413795306708 0.00104104390919955 39034 41464 667 665 0 False 526 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 571 621 0.000872967041313401 0.000943787713733865 0.000579842832074464 0.00064087891966125 0.000872217390131239 0.000916671134596232 38159 41131 667 665 0 False 571 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 615 621 0.000946768547518413 0.000948055650685423 0.000762951094834821 0.000778210116731518 0.000752458788594368 0.000710668068425853 41385 41317 667 665 0 False 615 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 660 621 0.000949376536268373 0.000909300029657573 0.000732433051041428 0.000717174029144732 0.000778984071779066 0.000783154714205674 41499 39628 667 665 0 False 660 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 258 671 0.00107154021981914 0.0758112034492273 0.000900282291905089 0.0736552986953536 0.000721281776462558 0.0231217401491074 46839 3303911 667 665 0 True 257 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 302 666 0.000952785223318759 0.000938670778571515 0.000823987182421607 0.000854505226215 0.000744413790918013 0.000663716767622593 41648 40908 667 665 0 False 302 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 347 666 0.000825702964493949 0.000877106935340182 0.000701915007248035 0.000762951094834821 0.000647725781529575 0.000667403980458162 36093 38225 667 665 0 False 347 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 392 665 0.000764804139472951 0.000909208246067217 0.000595101853971161 0.00080872816052491 0.00062167487683341 0.000641737027001371 33431 39624 667 665 0 False 392 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 436 665 0.000839291958506899 0.000783005809327622 0.000610360875867857 0.000579842832074464 0.000781655360344262 0.000726619320866037 36687 34124 667 665 0 False 436 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 481 665 0.000872806901653316 0.00086664360603959 0.000564583810177768 0.000656137941557946 0.000863344093266954 0.000746528228406666 38152 37769 667 665 0 False 481 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 526 665 0.00091711983330834 0.000944705549637426 0.000518806744487678 0.00064087891966125 0.000932938362788557 0.00088690239665946 40089 41171 667 665 0 False 526 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 571 665 0.00096799849102686 0.0010222626834883 0.000747692072938125 0.00080872816052491 0.000788819863313824 0.000794622209385873 42313 44551 667 665 0 False 571 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 615 665 0.00106440256639819 0.00100686598620607 0.000930800335698482 0.00080872816052491 0.000749737048609821 0.000784507547418071 46527 43880 667 665 0 False 615 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 655 670 0.00114788108349121 0.0805638036496597 0.000991836423285267 0.0785687037460899 0.000832218429862126 0.0240041268506702 50176 3511033 667 665 0 True 660 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B6_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B6_1.csv new file mode 100755 index 0000000..158594a --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B6_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 269 257 0.0100596074130479 0.0418384253148321 0.0101777676050965 0.0418097199969482 0.00152744620264245 0.00899731129215307 439724 1823351 667 665 0 True 269 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 313 257 0.00996654339344404 0.0100462646660139 0.00994888227664607 0.0100862134737163 0.00131364811993243 0.00128677195202873 435656 437824 667 665 0 False 313 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 357 258 0.00998731579506653 0.0655047781963492 0.00993362325474937 0.0633707179369802 0.0013298995941935 0.0126368601317488 436564 2854749 667 665 0 True 358 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 401 258 0.010025520542544 0.0876432325951064 0.00996414129854276 0.0857251850156405 0.00137518339708177 0.0142080527184908 438234 3819560 667 665 0 True 403 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 445 257 0.0100693530552188 0.0730720828163336 0.0100251773861295 0.0713511863889525 0.00160308595350122 0.0125183447134986 440150 3184538 667 665 0 True 448 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 490 256 0.00979974649891809 0.0634003181448701 0.00991836423285267 0.0663309681849393 0.00164843214135462 0.0173422726037896 428365 2763035 667 665 0 True 492 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 533 255 0.00994556509797287 0.078129243915465 0.00996414129854276 0.0762798504615854 0.00165761738841074 0.0249236260741882 434739 3404933 667 665 0 True 537 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 578 255 0.00985554373191065 0.068351652764321 0.00985732814526589 0.0667124437323568 0.00182078844134564 0.0201734665899362 430804 2978818 667 665 0 True 582 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 627 256 0.00996974618664575 0.0097935844417636 0.00991836423285267 0.00985732814526589 0.00191050549186371 0.00180335026424943 435796 426812 667 665 0 False 627 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 667 256 0.0101205519922575 0.0425162012378165 0.0101930266269932 0.0424505989166094 0.00180436081502139 0.00828180087046846 442388 1852889 667 665 0 True 671 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 269 301 0.00976893105289882 0.00953842606057373 0.00971999694819562 0.00958266575112535 0.00149593116417344 0.00143835509448523 427018 415692 667 665 0 False 269 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 314 301 0.0100208536153072 0.00981586490832253 0.010101472495613 0.0097962920576791 0.00133861462097121 0.00125087832460007 438030 427783 667 665 0 False 314 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 357 301 0.0100838342559094 0.09897375620328 0.0100404364080262 0.0944686045624475 0.00138565031010711 0.0228469915338354 440783 4313353 667 665 0 True 358 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 401 302 0.0101340266007989 0.0547862216768747 0.0101930266269932 0.0542763408865492 0.00143972857960964 0.00879162853023053 442977 2387626 667 665 0 True 403 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 445 301 0.0100818668257997 0.0895786043272521 0.00996414129854276 0.074692912184329 0.00182863026493782 0.0482226661193337 440697 3903905 667 665 0 True 448 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 490 300 0.00986423702774385 0.0440289095363724 0.00985732814526589 0.043930724040589 0.00172420289283849 0.00972281377763177 431184 1918814 667 665 0 True 492 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 534 299 0.00981145957119861 0.0417875772057748 0.00978103303578241 0.0442969405661097 0.0015878220962153 0.00871407712290256 428877 1821135 667 665 0 True 537 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 578 299 0.00972034010461009 0.0500397709769962 0.00976577401388571 0.0511940184634165 0.00185394385014362 0.0104730212217731 424894 2180772 667 665 0 True 582 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 627 300 0.0096550031232953 0.00970476087219651 0.00970473792629892 0.00971999694819562 0.0020033530097013 0.00196016251063489 422038 422941 667 665 0 False 627 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 671 300 0.00948635318413121 0.00967353150557786 0.00950637064164187 0.00978103303578241 0.00194026149796385 0.00180706933753989 414666 421580 667 665 0 False 671 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 268 345 0.00966966734074025 0.0516377003391977 0.00967421988250553 0.0516670481422141 0.00146088886130633 0.0128120528283358 422679 2250411 667 665 0 True 269 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 312 345 0.0104525215076142 0.0589972298565136 0.00988784618905928 0.064087891966125 0.00462479155802808 0.0172731365426411 456899 2571145 667 665 0 True 314 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 357 346 0.0101463573546255 0.040655243051552 0.0100862134737163 0.0404821850919356 0.0013516726950923 0.0085837219326224 443516 1771787 667 665 0 True 358 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 400 345 0.0100868082781681 0.0331693504762134 0.0101625085831998 0.0343175402456703 0.00143644962781364 0.005215605749046 440913 1445546 667 665 0 True 403 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 445 345 0.0101918141409954 0.0685157847697752 0.0103303578240635 0.0661326009002823 0.0016905625137708 0.0133307725949952 445503 2985971 667 665 0 True 448 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 489 344 0.0101173034448672 0.0316058399603954 0.0101472495613031 0.0327611200122072 0.00173829109393028 0.00548395696223937 442246 1377407 667 665 0 True 493 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 534 344 0.00988562711091238 0.0291794489657424 0.00996414129854276 0.029205767910277 0.00171581559458355 0.00411370592196626 432119 1271663 667 665 0 True 537 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 578 344 0.0099528857681482 0.0493619721081142 0.00990310521095598 0.0495460440985733 0.0019728105457925 0.00843574287219808 435059 2151233 667 665 0 True 582 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 621 344 0.00993204473524282 0.0572878752156197 0.00993362325474937 0.0576333257038224 0.00200729653995854 0.0141687560123093 434148 2496650 667 665 0 True 627 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 666 344 0.00969261306632104 0.0619756762012608 0.00964370183871214 0.062729839017319 0.00186001799698001 0.0172833912033749 423682 2700948 667 665 0 True 672 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 269 389 0.0101441840306672 0.0460207970142798 0.0100709544518196 0.0497444113832303 0.00144817909653958 0.012055645552389 443421 2005622 667 665 0 True 269 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 314 389 0.00989775197089027 0.032590563155428 0.00991836423285267 0.0327916380560006 0.00134008674938632 0.00343510787438402 432649 1420322 667 665 0 True 314 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 357 390 0.0101702181639782 0.0852215684553568 0.0101472495613031 0.0811169604028382 0.00137378731660524 0.0221816668183351 444559 3714022 667 665 0 True 359 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 401 390 0.0101776303425307 0.0643942196989384 0.01025406271458 0.0644998855573358 0.00149012693965618 0.0151996273916147 444883 2806350 667 665 0 True 403 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 446 389 0.0103103174894585 0.045472573629083 0.0102845807583734 0.0460822461280232 0.00163898941247143 0.0089727090075404 450683 1981730 667 665 0 True 448 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 490 388 0.0104082085759592 0.0539426157520145 0.0104829480430304 0.053681239032578 0.00186624615105932 0.0116038118557767 454962 2350861 667 665 0 True 493 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 534 388 0.0101958176324976 0.0423254290452614 0.0102388036926833 0.0431067368581674 0.0016764398774722 0.00535126915775793 445678 1844575 667 665 0 True 538 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 579 388 0.0102363100894048 0.0493575435498795 0.0102998397802701 0.0496223392080568 0.0019654055988471 0.00590471793319012 447448 2151040 667 665 0 True 582 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 622 388 0.00999946353213872 0.0440321219620349 0.0100404364080262 0.0457007705806058 0.00191247041502416 0.00758076148892677 437095 1918954 667 665 0 True 627 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 667 387 0.00989814088149333 0.0879620887880034 0.00984206912336919 0.0828564888990616 0.00186550016977828 0.0178387365415154 432666 3833456 667 665 0 True 672 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 269 432 0.00995954300258889 0.0492876503458234 0.00994888227664607 0.0501411459525444 0.00152545721435175 0.0105782122375914 435350 2147994 667 665 0 True 269 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 313 433 0.0101483019076408 0.0531174124370207 0.0102082856488899 0.05297932402533 0.00139126634370547 0.00816873958958001 443601 2314898 667 665 0 True 314 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 358 434 0.0102927021268491 0.0362558949445025 0.0102235446707866 0.037247272449836 0.00137797125550879 0.00462430402536747 449913 1580060 667 665 0 True 359 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 402 433 0.0104930597187101 0.0561883766408468 0.0104676890211337 0.0550545510032807 0.00159262899084685 0.0135277879867871 458671 2448733 667 665 0 True 403 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 446 433 0.0105064656959687 0.100003705762461 0.0104676890211337 0.101503013656825 0.00173512808171759 0.0182987793406951 459257 4358239 667 665 0 True 448 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 491 432 0.0103158766233729 0.0619077792902949 0.0103150988021668 0.0623483634699016 0.00184224032352306 0.0140785384086994 450926 2697989 667 665 0 True 493 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 535 431 0.0102357381620474 0.0534270214331893 0.01025406271458 0.0523079270618753 0.00177512714186647 0.0105739462299337 447423 2328391 667 665 0 True 538 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 579 431 0.0101380529693954 0.0340052465794837 0.010101472495613 0.0343633173113603 0.00191253829943241 0.00426512702678458 443153 1481975 667 665 0 True 582 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 623 431 0.0102015826602606 0.0411150100015431 0.0101777676050965 0.0417486839093614 0.00201244404652359 0.00510445032057622 445930 1791824 667 665 0 True 627 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 667 430 0.00994801294706275 0.0775947192311289 0.00991836423285267 0.0772106507972839 0.00190421980744548 0.0140596697534994 434846 3381638 667 665 0 True 672 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 272 477 0.00986888107788633 0.0593662916733353 0.00993362325474937 0.0587930113679713 0.00145077257932435 0.0168445901920272 431387 2587229 667 665 0 True 269 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 316 476 0.010127506628924 0.0572252788069969 0.0101777676050965 0.0572365911345083 0.00163868107464662 0.0072514645066116 442692 2493922 667 665 0 True 314 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 360 477 0.0104504168149388 0.0725200274662394 0.0104371709773404 0.0687876707103075 0.00154403599199919 0.0171471658116034 456807 3160479 667 665 0 True 359 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 404 477 0.0104910694115062 0.0950400950877996 0.0104676890211337 0.090775921263447 0.00164916079897876 0.0198020348073747 458584 4141921 667 665 0 True 404 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 448 476 0.0103984171795997 0.100713055240528 0.0102845807583734 0.0960097657740139 0.00193663214773059 0.0322978859422286 454534 4389153 667 665 0 True 448 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 491 476 0.0103371065668814 0.0498482874616158 0.0103303578240635 0.049912260624094 0.00200210607967019 0.0105925337056079 451854 2172427 667 665 0 True 493 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 536 475 0.0104113884920666 0.0402184908368426 0.010452429999237 0.0410925459678035 0.00185686929739068 0.00557852015811897 455101 1752753 667 665 0 True 538 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 579 474 0.0103408355332519 0.113711653819832 0.0103303578240635 0.111100938429847 0.00197804320916753 0.028546233769088 452017 4955642 667 665 0 True 583 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 623 476 0.0102848781605993 0.0655532169861596 0.0102845807583734 0.0686961165789273 0.00182769910071661 0.0170497139878408 449571 2856860 667 665 0 True 627 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 668 476 0.0102338393632207 0.0831313578062804 0.010101472495613 0.0789349202716106 0.00202915192068473 0.0158827690461991 447340 3622929 667 665 0 True 672 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 272 521 0.00982923507346807 0.0532807413360593 0.00985732814526589 0.0556649118791486 0.00148244923405267 0.0132033455390903 429654 2322016 667 665 0 True 270 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 315 521 0.0102384376591745 0.106798284335237 0.0102388036926833 0.103471427481498 0.0013995733470241 0.0243116507748972 447541 4654352 667 665 0 True 314 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 361 521 0.0103964268723958 0.0624835836443937 0.0103456168459602 0.0636453803311208 0.00150832276167906 0.0135428038342213 454447 2723083 667 665 0 True 359 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 405 520 0.0105143125393129 0.0628911486773698 0.0104982070649271 0.0625009536888685 0.0017303928964245 0.00739464188797284 459600 2740845 667 665 0 True 404 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 449 520 0.0105151132376133 0.061430298107365 0.0105287251087205 0.0606546120393683 0.00190267107399295 0.00864774317221162 459635 2677180 667 665 0 True 449 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 493 518 0.0105287022316262 0.0677712133389092 0.010452429999237 0.067353322652018 0.00183509230944333 0.015271944254678 460229 2953522 667 665 0 True 493 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 537 518 0.0103922861183279 0.0771575998820581 0.0103608758678569 0.0745250629434653 0.00180662695919259 0.0181073449190594 454266 3362588 667 665 0 True 538 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 582 518 0.0103835699454004 0.0622385444040405 0.0103913939116503 0.0619516289005875 0.00180852823275654 0.0154029054275669 453885 2712404 667 665 0 True 583 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 626 518 0.0100750036975104 0.0506099076943905 0.0101167315175097 0.0497444113832303 0.0018406357775033 0.00708150933168084 440397 2205619 667 665 0 True 627 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 670 517 0.0100852755128501 0.0697513066254558 0.0101167315175097 0.0676432440680552 0.00193339849905523 0.0173201323252744 440846 3039816 667 665 0 True 672 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 272 562 0.00963548896185919 0.044833691002512 0.00967421988250553 0.0459143968871595 0.00142128510948505 0.00897215530451462 421185 1953887 667 665 0 True 270 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 316 562 0.00994869925989168 0.061343034858834 0.00994888227664607 0.0587930113679713 0.00145959870148799 0.0163228631847574 434876 2673377 667 665 0 True 314 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 361 562 0.0101527400639346 0.0477010562570308 0.0100862134737163 0.0480964370183871 0.00142514183495145 0.00736850096880734 443795 2078849 667 665 0 True 359 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 405 562 0.0102785183283844 0.0556189053544826 0.01025406271458 0.0532387273975738 0.0016730112285593 0.00863921169473844 449293 2423915 667 665 0 True 404 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 450 561 0.0106363389602978 0.0943021320754392 0.0107881284809644 0.0886854352635996 0.00200205469898521 0.0193098282128662 464934 4109760 667 665 0 True 449 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 493 560 0.010361036007517 0.0652552645059662 0.010452429999237 0.0638895246814679 0.00204125558245611 0.0112584263686751 452900 2843875 667 665 0 True 493 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 538 560 0.0102643802841083 0.0576152672824198 0.0102845807583734 0.0574807354848554 0.00195845866633741 0.0068871271656206 448675 2510918 667 665 0 True 538 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 582 559 0.010245232156181 0.0404755078357372 0.0102082856488899 0.0416571297779812 0.00169044210891567 0.00816331698577484 447838 1763954 667 665 0 True 583 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 626 560 0.0100340536987171 0.0505960713181443 0.0100862134737163 0.050415808346685 0.00164131854888061 0.0077389417060083 438607 2205016 667 665 0 True 628 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 670 559 0.0102445915975407 0.0559091021212909 0.0103761348897536 0.0539406424048219 0.00173059684800441 0.00794090415913335 447810 2436562 667 665 0 True 672 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 270 606 0.00942209142624842 0.00953236834361023 0.00947585259784848 0.00950637064164187 0.00137719816959119 0.00139859890926297 411857 415428 667 665 0 False 270 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 315 606 0.00974436105362288 0.00966031466856659 0.00973525597009232 0.00967421988250553 0.0014192286920591 0.00137477714710683 425944 421004 667 665 0 False 315 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 360 605 0.0100507768546489 0.0775770279440877 0.010101472495613 0.0732585641260395 0.00146377208470316 0.0141918225896757 439338 3380867 667 665 0 True 359 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 404 604 0.010212289140392 0.0879102310594522 0.0101472495613031 0.0797589074540322 0.00160427712049865 0.0269082253470373 446398 3831196 667 665 0 True 404 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 449 605 0.0102227210953919 0.0103096376785406 0.0102845807583734 0.0101930266269932 0.00203048471285287 0.00250909820287015 446854 449302 667 665 0 False 449 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 494 605 0.00990649102091207 0.0100807294041926 0.00999465934233616 0.0100709544518196 0.00198149402869479 0.00206020098002987 433031 439326 667 665 0 False 494 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 538 605 0.00999600909089973 0.00984009577617654 0.0100251773861295 0.00996414129854276 0.00194769597220623 0.00205583574922712 436944 428839 667 665 0 False 538 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 583 605 0.00988812071419086 0.00981054146008188 0.0097962920576791 0.00978103303578241 0.00168251621939863 0.00181328796116287 432228 427551 667 665 0 False 583 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 628 605 0.00968629898829482 0.0099427557219898 0.00973525597009232 0.00993362325474937 0.00147081280369305 0.00149420381586825 423406 433313 667 665 0 False 628 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 672 605 0.00978679806354548 0.00997141514807848 0.00978103303578241 0.0100099183642329 0.00160310338892893 0.00162367999115017 427799 434562 667 665 0 False 672 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 271 654 0.00944098790613849 0.0402363886369621 0.00950637064164187 0.0399481193255512 0.00137467957854306 0.00870058598607126 412683 1753533 667 665 0 True 270 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 315 649 0.00950598173103881 0.00945203475615108 0.00950637064164187 0.0093842984664683 0.00131172732560112 0.00127600597115137 415524 411927 667 665 0 False 315 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 359 649 0.00955466418770473 0.00962231626215918 0.00959792477302205 0.00965896086060884 0.00134144920597542 0.00122359203523766 417652 419348 667 665 0 False 359 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 404 649 0.0100168501238051 0.00971416869020801 0.00993362325474937 0.00975051499198901 0.00189356692264124 0.00138775932583515 437855 423351 667 665 0 False 404 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 449 649 0.00990550730585726 0.00995335672667593 0.00987258716716258 0.00994888227664607 0.00168462500213063 0.00161959945722821 432988 433775 667 665 0 False 449 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 494 649 0.00988782331196498 0.00999993689878163 0.00990310521095598 0.0100251773861295 0.00170270363113738 0.00177241633808278 432215 435805 667 665 0 False 494 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 538 649 0.00983520599507982 0.00967217769762011 0.00985732814526589 0.00961318379491875 0.001861808341401 0.00172357934380797 429915 421521 667 665 0 False 538 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 583 648 0.00989752319994729 0.00971602730791272 0.00991836423285267 0.00970473792629892 0.0014986702544926 0.0013541458806474 432639 423432 667 665 0 False 583 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 628 648 0.00978078138774513 0.00967649152636684 0.00975051499198901 0.00967421988250553 0.00132800837887507 0.00131850508568772 427536 421709 667 665 0 False 628 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 668 653 0.00987084850799594 0.0420819042341491 0.0098115510795758 0.0418554970626383 0.0014085277909902 0.00842771958508571 431473 1833962 667 665 0 True 673 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B6_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B6_2.csv new file mode 100755 index 0000000..3fa9b02 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B6_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 269 257 0.00836080014467474 0.743872774176228 0.00834668497749294 0.752178225375753 0.0019089010408571 0.192197149663188 365466 32418552 667 665 13 True 269 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 313 257 0.00703152658049552 0.00679242165840328 0.00697337300679027 0.0068055237659266 0.00134179921049856 0.001275275445258 307361 296019 667 665 0 False 313 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 357 258 0.0065272696679813 0.00698934335151222 0.00645456626230259 0.00701915007248035 0.00130618308814622 0.0013034837054253 285319 304601 667 665 0 True 358 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 401 258 0.00646573028431996 0.00689269523086728 0.00651560234988937 0.00689707789730678 0.00141152830499155 0.00136399391706885 282629 300389 667 665 0 True 403 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 445 257 0.00652322042229057 0.00704771771497868 0.00653086137178607 0.00695811398489357 0.0014777243543724 0.0017768744266798 285142 307145 667 665 0 True 448 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 490 256 0.0066990537690642 0.00736567901786969 0.00675974670023652 0.00727855344472419 0.00154289862669317 0.00167059912859788 292828 321002 667 665 0 True 492 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 533 255 0.00696701317457545 0.00769961066548266 0.00698863202868696 0.00764476997024491 0.00159550551515008 0.0017415819862325 304541 335555 667 665 0 True 537 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 578 255 0.00731094741025001 0.0077363011557275 0.00729381246662089 0.0076752880140383 0.00181928924640032 0.001898781372511 319575 337154 667 665 0 True 582 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 627 256 0.009259252269036 0.00819721540059809 0.00854505226215 0.00823987182421607 0.00520927009901896 0.00205808206065526 404739 357241 667 665 0 False 627 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 667 256 0.00987411993248054 0.757305256733043 0.00984206912336919 0.749309529259174 0.00208064029763177 0.177049663469761 431616 33003950 667 665 13 True 671 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 269 301 0.00704397171979357 0.00651931958529879 0.00697337300679027 0.00651560234988937 0.00174392557997875 0.00137002556855895 307905 284117 667 665 0 False 269 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 314 301 0.00675370714734187 0.0065627561694348 0.00675974670023652 0.00654612039368277 0.00134113971403152 0.00118860592260441 295217 286010 667 665 0 False 314 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 357 301 0.0064511118210636 0.0063022284482091 0.00643930724040589 0.00631723506523232 0.00121438821440509 0.00132163204675135 281990 274656 667 665 0 True 358 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 401 302 0.00654779042156651 0.00646546556365737 0.00660715648126955 0.0064087891966125 0.00141520815445781 0.00138267863132532 286216 281770 667 665 0 True 403 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 445 301 0.0066218435758088 0.00682075984192571 0.00662241550316625 0.00685130083161669 0.00174319120254347 0.00180080792985405 289453 297254 667 665 0 True 448 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 490 300 0.00676253770574086 0.00683438970509359 0.0068055237659266 0.00688181887541009 0.00168842430241539 0.0016438904806252 295603 297848 667 665 0 True 492 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 534 299 0.00675839695167294 0.00694519544455095 0.00679026474402991 0.00698863202868696 0.00144189320368501 0.00156900047331695 295422 302677 667 665 0 True 537 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 578 299 0.00725963408773983 0.00721678308841456 0.00727855344472419 0.00729381246662089 0.0017120528102143 0.00182668765575849 317332 314513 667 665 0 True 582 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 627 300 0.00732934059406552 0.0076569083500695 0.00735484855420768 0.00756847486076143 0.00185740184233418 0.00193858089171208 320379 333694 667 665 0 False 627 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 671 300 0.00756119994477469 0.00769752258880206 0.00759899290455482 0.00778210116731518 0.00206359031527222 0.00181704280253962 330514 335464 667 665 0 False 671 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 268 345 0.00610678867478598 0.00611407208797916 0.00610360875867857 0.00607309071488518 0.00140652245781619 0.00141371350149849 266939 266456 667 665 0 True 269 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 312 345 0.00663781178762873 0.0064900635658728 0.00614938582436866 0.00654612039368277 0.00404794195318864 0.00125603639461758 290151 282842 667 665 0 True 314 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 357 346 0.00651587687502095 0.00637184630149418 0.00650034332799268 0.0063782711528191 0.0012585596697839 0.00118676274832674 284821 277690 667 665 0 True 358 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 400 345 0.00661017625771687 0.00649710795643262 0.00651560234988937 0.00650034332799268 0.00144796608971345 0.00138859319494291 288943 283149 667 665 0 True 403 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 445 345 0.00693505387384129 0.00712281963778753 0.00692759594110018 0.00698863202868696 0.00168594157587904 0.00169934407393333 303144 310418 667 665 0 True 448 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 489 344 0.00690783013162679 0.00695279053665292 0.00695811398489357 0.00701915007248035 0.00162133589848058 0.00159708423137962 301954 303008 667 665 0 True 493 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 534 344 0.00689355482478491 0.0070366119005456 0.00691233691920348 0.00703440909437705 0.00146541414949065 0.00166922443739404 301330 306661 667 665 0 True 537 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 578 344 0.00711290040491313 0.00732839193428754 0.00718699931334401 0.00729381246662089 0.00182193718368858 0.00186021059857075 310918 319377 667 665 0 True 582 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 621 344 0.00707256808766594 0.00722196886126968 0.00704966811627375 0.00730907148851759 0.0020265277753086 0.00201198282398724 309155 314739 667 665 0 True 627 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 666 344 0.006690360473231 0.00675745211047761 0.00669871061264973 0.00683604180972 0.00192765801209054 0.00195478802580573 292448 294495 667 665 0 True 672 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 269 389 0.00612097247325067 0.00616464484626535 0.00610360875867857 0.00617990386816205 0.00146134395570374 0.00139705886139175 267559 268660 667 665 0 True 269 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 314 389 0.00652685788028394 0.0726063269870717 0.00650034332799268 0.0748607614251926 0.00130410956449056 0.0133222262321004 285301 3164240 667 665 0 True 314 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 357 390 0.00664092307245324 0.00684728529953862 0.00663767452506294 0.00686655985351339 0.00130678450059586 0.00141540995639838 290287 298410 667 665 0 True 359 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 401 390 0.0068794854117917 0.0068694739825072 0.00694285496299687 0.0068207827878233 0.00149650218460132 0.0013140482901141 300715 299377 667 665 0 True 403 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 446 389 0.00703251029555033 0.00702825959382319 0.00706492713817044 0.00703440909437705 0.00162279521094511 0.00157932181814507 307404 306297 667 665 0 True 448 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 490 388 0.00702990230680036 0.00706345860072475 0.00712596322575723 0.00708018616006714 0.00174444502163922 0.00179620423509929 307290 307831 667 665 0 True 493 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 534 388 0.00714005551584473 0.00728399162245279 0.00718699931334401 0.00732433051041428 0.00164482481214474 0.00170292227814483 312105 317442 667 665 0 True 538 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 579 388 0.00707664021045097 0.00735858873551469 0.00712596322575723 0.0072632944228275 0.00184977814360028 0.00210834022029117 309333 320693 667 665 0 True 582 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 622 388 0.00680126862638719 0.00664593504819499 0.00683604180972 0.00668345159075303 0.00199936693401897 0.00188963848049122 297296 289635 667 665 0 True 627 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 667 387 0.00630588802646056 0.00638818378057756 0.00634775310902571 0.0064087891966125 0.00180485930488197 0.00188297073643466 275642 278402 667 665 0 True 672 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 269 432 0.0062652811840818 0.00631452744931682 0.00633249408712902 0.00630197604333562 0.00146517189695811 0.0015571231934446 273867 275192 667 665 0 True 269 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 313 433 0.00656808240420874 0.00663712382352081 0.00666819256885634 0.00669871061264973 0.00139737006341295 0.0014418662207397 287103 289251 667 665 0 True 314 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 358 434 0.00670054078019356 0.00680098047820398 0.00672922865644312 0.00679026474402991 0.00137779116984635 0.00127962606536749 292893 296392 667 665 0 True 359 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 402 433 0.00691455599735038 0.00690673812019176 0.00686655985351339 0.00694285496299687 0.00149210175316255 0.0013881792776272 302248 301001 667 665 0 True 403 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 446 433 0.0069131833716925 0.00718699931334401 0.00697337300679027 0.00715648126955062 0.00167991756106384 0.00172228635662764 302188 313215 667 665 0 True 448 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 491 432 0.00713515981766498 0.00693154263548549 0.00714122224765393 0.00697337300679027 0.00170825204278919 0.00174243812997659 311891 302082 667 665 0 True 493 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 535 431 0.00683460055277923 0.0072139836889087 0.00683604180972 0.00721751735713741 0.0016960205188374 0.00162838024771107 298753 314391 667 665 0 True 538 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 579 431 0.00647998271406755 0.00642113408951539 0.00651560234988937 0.00642404821850919 0.00187591232796519 0.00192957636356155 283252 279838 667 665 0 True 582 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 623 431 0.0064163157606365 0.0062428903570439 0.0064087891966125 0.00614938582436866 0.00192418367402721 0.00161317580760591 280469 272070 667 665 0 True 627 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 667 430 0.00614627453954414 0.00641062486841962 0.00610360875867857 0.00636301213092241 0.00182374499351904 0.00183012423029139 268665 279380 667 665 0 True 672 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 272 477 0.0063228628304296 0.00653049423742464 0.00630197604333562 0.00662241550316625 0.0014026746525339 0.00153231558415235 276384 284604 667 665 0 True 269 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 316 476 0.00633938009251268 0.00636253026707304 0.0063782711528191 0.00628671702143893 0.00151280156626324 0.00150638072934732 277106 277284 667 665 0 True 314 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 360 477 0.00651667757332137 0.00651321597654011 0.00657663843747616 0.00650034332799268 0.00153823568085843 0.0015450929779438 284856 283851 667 665 0 True 359 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 404 477 0.00672767301403087 0.00674058687574969 0.00674448767833982 0.00674448767833982 0.00165182477015579 0.0015174037481251 294079 293760 667 665 0 True 404 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 448 476 0.00704818110514438 0.00710418756894525 0.00703440909437705 0.00717174029144732 0.00194968572296139 0.00203999073814767 308089 309606 667 665 0 True 448 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 491 476 0.00694269482333679 0.00683608770151518 0.00703440909437705 0.00685130083161669 0.00192271727436935 0.0018619984199252 303478 297922 667 665 0 True 493 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 536 475 0.00654321500270693 0.00656383462662149 0.00654612039368277 0.00662241550316625 0.00164907387987433 0.00166241984869696 286016 286057 667 665 0 True 538 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 579 474 0.00637911760530813 0.00661876710544959 0.00628671702143893 0.00663767452506294 0.00177118124972097 0.00204259519084725 278843 288451 667 665 0 True 583 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 623 476 0.00613865646714295 0.00616648051807248 0.00613412680247196 0.00627145799954223 0.00179665992404956 0.00172150109109564 268332 268740 667 665 0 True 627 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 668 476 0.00622844906226218 0.00645667728488078 0.00625619897764553 0.00633249408712902 0.00187154151547849 0.00189899565641443 272257 281387 667 665 0 True 672 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 272 521 0.00647247902713784 0.00659130086603554 0.00646982528419928 0.00659189745937285 0.00142407913248964 0.00153825501835915 282924 287254 667 665 0 True 270 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 315 521 0.00650942553442894 0.00654559263803822 0.00653086137178607 0.00656137941557946 0.00143648215751265 0.00146711644226824 284539 285262 667 665 0 True 314 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 361 521 0.0067011813388339 0.00663710087762322 0.00672922865644312 0.00659189745937285 0.00140983614374834 0.00142266963803219 292921 289250 667 665 0 True 359 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 405 520 0.00671760709253979 0.00686371456221235 0.00674448767833982 0.00689707789730678 0.00160444030947448 0.00161891477129739 293639 299126 667 665 0 True 404 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 449 520 0.00674915460557659 0.00686940514481443 0.00674448767833982 0.00695811398489357 0.0018187221277862 0.00190460641812925 295018 299374 667 665 0 True 449 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 493 518 0.00660981022420811 0.00680559260361937 0.00668345159075303 0.00683604180972 0.0017891620359984 0.00166824593133922 288927 296593 667 665 0 True 493 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 537 518 0.00639735064946355 0.00658976349089708 0.00636301213092241 0.00651560234988937 0.00175017741606972 0.0017076390890946 279640 287187 667 665 0 True 538 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 582 518 0.00645632779856352 0.00661098844616692 0.0063782711528191 0.00663767452506294 0.00166827561164295 0.0017524578671296 282218 288112 667 665 0 True 583 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 626 518 0.00635184810890504 0.00639396614676999 0.0063782711528191 0.0064087891966125 0.00178345272533429 0.0017911663124542 277651 278654 667 665 0 True 627 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 670 517 0.00629975696518873 0.00640826144096795 0.00633249408712902 0.0063782711528191 0.00188083868391822 0.00197442227876807 275374 279277 667 665 0 True 672 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 272 562 0.00663298472073188 0.00673842996137632 0.00663767452506294 0.00677500572213321 0.00128856422200605 0.00129513909360585 289940 293666 667 665 0 True 270 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 316 562 0.00666446360248578 0.00673590591264153 0.00668345159075303 0.00672922865644312 0.00128872149773285 0.00137625299181759 291316 293556 667 665 0 True 314 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 361 562 0.00670076955113654 0.00669894007162562 0.00671396963454643 0.00672922865644312 0.00138493189037765 0.00132298419329205 292903 291945 667 665 0 True 359 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 405 562 0.00674329806943633 0.00649719974002298 0.0068055237659266 0.00642404821850919 0.00146726741386871 0.00148994083479242 294762 283153 667 665 0 True 404 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 450 561 0.00650256240613957 0.00677780512163907 0.00657663843747616 0.00677500572213321 0.00195789755122371 0.0018460185409086 284239 295382 667 665 0 True 449 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 493 560 0.00652113860670946 0.00675348247019471 0.00654612039368277 0.0068055237659266 0.0019302168482563 0.00203835614505755 285051 294322 667 665 0 True 493 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 538 560 0.00673570287412943 0.00672326272306998 0.00672922865644312 0.00674448767833982 0.00193286131776647 0.00190518058095292 294430 293005 667 665 0 True 538 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 582 559 0.00669974008189313 0.00661527932901606 0.00662241550316625 0.00660715648126955 0.00169661924989841 0.00147129543450716 292858 288299 667 665 0 True 583 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 626 560 0.00653895986316752 0.00653595536105083 0.00650034332799268 0.00656137941557946 0.00164829568466601 0.00165940321009732 285830 284842 667 665 0 True 628 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 670 559 0.00658434801825455 0.00668492012819873 0.00671396963454643 0.00660715648126955 0.00169881327953792 0.00177573942497555 287814 291334 667 665 0 True 672 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 270 606 0.00692974638796418 0.00712245250342611 0.00694285496299687 0.00711070420386053 0.00138609047785085 0.00130497502719812 302912 310402 667 665 0 False 270 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 315 606 0.00675295220323004 0.00680524841515554 0.00679026474402991 0.00677500572213321 0.00152721371348481 0.00135753370292042 295184 296578 667 665 0 False 315 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 360 605 0.00656764773941709 0.00675522635841148 0.00659189745937285 0.00675974670023652 0.00136144178470429 0.00154783918040179 287084 294398 667 665 0 True 359 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 404 604 0.0065783770966428 0.00658556439163829 0.00666819256885634 0.00659189745937285 0.00147842656759617 0.00148690329854458 287553 287004 667 665 0 True 404 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 449 605 0.00663005645266174 0.00684026385487638 0.00669871061264973 0.00686655985351339 0.00192918866593497 0.00211500487162602 289812 298104 667 665 0 False 449 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 494 605 0.00660091103452622 0.00674685110579149 0.00665293354695964 0.00665293354695964 0.00190331907276787 0.0019670923062856 288538 294033 667 665 0 False 494 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 538 605 0.00672426432698048 0.00685010764494206 0.00674448767833982 0.0068055237659266 0.00189800561196227 0.00194122882655388 293930 298533 667 665 0 False 538 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 583 605 0.00670733527720004 0.00655874063735672 0.00671396963454643 0.00657663843747616 0.00165303914475738 0.00182660050370346 293190 285835 667 665 0 False 583 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 628 605 0.00667700025016103 0.00657927721569889 0.00666819256885634 0.00662241550316625 0.00151024794010396 0.00142237735992123 291864 286730 667 665 0 False 628 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 672 605 0.00685084328973074 0.00657161328590416 0.00692759594110018 0.00657663843747616 0.00156650923534466 0.00155757214996662 299463 286396 667 665 0 False 672 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 271 654 0.00868538035857329 0.746512584964356 0.00840772106507973 0.745494773785 0.00188468707806695 0.194199719855221 379654 32533597 667 665 14 True 270 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 315 649 0.00717201481657889 0.00679558819227056 0.00709544518196384 0.0068055237659266 0.00152680988687132 0.00134423288863828 313502 296157 667 665 0 False 315 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 359 649 0.00652976327125977 0.00673223456902728 0.00650034332799268 0.00675974670023652 0.00129632491984173 0.0012548180439026 285428 293396 667 665 0 False 359 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 404 649 0.00631430679716219 0.0064785676711807 0.00628671702143893 0.00650034332799268 0.00144145174639524 0.00139059829725336 276010 282341 667 665 0 False 404 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 449 649 0.0064718613455918 0.00652831437715369 0.00648508430609598 0.00659189745937285 0.00157737954342958 0.00168220433729806 282897 284509 667 665 0 False 449 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 494 649 0.00646483807764234 0.00657477981977145 0.00645456626230259 0.00653086137178607 0.00169175373644027 0.00175538522019433 282590 286534 667 665 0 False 494 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 538 649 0.00639417073335614 0.00656617510817557 0.0064087891966125 0.00656137941557946 0.00165204831775675 0.00167341277308178 279501 286159 667 665 0 False 538 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 583 648 0.00672019220419545 0.00666878916219365 0.00679026474402991 0.00660715648126955 0.00144863605329713 0.00128329824747449 293752 290631 667 665 0 False 583 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 628 648 0.00749167645520339 0.00687247989509136 0.00727855344472419 0.00691233691920348 0.0019601989042495 0.00140784851246526 327475 299508 667 665 0 False 628 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 668 653 0.0084753915100129 0.781840639593949 0.00845349813076982 0.782650492103456 0.00157429937641952 0.171078178605876 370475 34073221 667 665 16 True 673 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B6_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B6_3.csv new file mode 100755 index 0000000..4b8df7e --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B6_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 269 257 0.00107394231472041 0.0764697507100321 0.000885023270008392 0.0750743877317464 0.000822916193063261 0.0228268004419693 46944 3332611 667 665 0 True 269 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 313 257 0.000993597959546205 0.000955214770733196 0.000885023270008392 0.000854505226215 0.000640988968357786 0.000671974430237374 43432 41629 667 665 0 False 313 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 357 258 0.000994467289129525 0.000994727606381484 0.000839246204318303 0.000930800335698482 0.000669302827971408 0.000650578323240739 43470 43351 667 665 0 True 358 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 401 258 0.00101485078014895 0.00101567721088026 0.000869764248111696 0.000885023270008392 0.000734425106645309 0.000675807297089224 44361 44264 667 665 0 True 403 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 445 257 0.000943199720807941 0.00103465346818637 0.000732433051041428 0.00080872816052491 0.000832640039158308 0.000930205993138231 41229 45091 667 665 0 True 448 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 490 256 0.000932538994865122 0.00102962831661438 0.000747692072938125 0.000885023270008392 0.00082982375494458 0.000851141104757982 40763 44872 667 665 0 True 492 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 533 255 0.000968684803855797 0.00098688010940604 0.000839246204318303 0.000778210116731518 0.000783905310137055 0.000831821200503526 42343 43009 667 665 0 True 537 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 578 255 0.000939470754437384 0.00103676449076456 0.000656137941557946 0.000762951094834821 0.000916624217617761 0.000943410383279985 41066 45183 667 665 0 True 582 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 627 256 0.00120354105391799 0.00102145957707269 0.000854505226215 0.000671396963454643 0.00116382466419854 0.000949750280139408 52609 44516 667 665 0 False 627 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 667 256 0.00121795362332567 0.0775349681138071 0.000930800335698482 0.0746471351186389 0.00103358823638354 0.0218071677221459 53239 3379034 667 665 0 True 671 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 269 301 0.00097582245727674 0.000976944535749995 0.00080872816052491 0.000823987182421607 0.000726993691056463 0.000749511159099779 42655 42576 667 665 0 False 269 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 314 301 0.000963880614053239 0.000892801929291069 0.000793469138628214 0.000793469138628214 0.000736833489349847 0.000613558667982907 42133 38909 667 665 0 False 314 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 357 301 0.00085320123184002 0.000939542722679897 0.000717174029144732 0.00080872816052491 0.00067699157406502 0.000695790845701827 37295 40946 667 665 0 True 358 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 401 302 0.000850227209581293 0.00100631528466394 0.000732433051041428 0.000839246204318303 0.000666659397170771 0.000764381637740289 37165 43856 667 665 0 True 403 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 445 301 0.000889758828528057 0.000911778186597187 0.000625619897764553 0.000579842832074464 0.000864781584462542 0.000953468434851482 38893 39736 667 665 0 True 448 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 490 300 0.000948347067024968 0.000913407345326007 0.000701915007248035 0.000671396963454643 0.000906352564098926 0.000863374091201592 41454 39807 667 665 0 True 492 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 534 299 0.000932699134525207 0.000883531786665106 0.000732433051041428 0.000671396963454643 0.000840145348101637 0.000833444125444406 40770 38505 667 665 0 True 537 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 578 299 0.000872234974295869 0.000925408049765063 0.000564583810177768 0.000579842832074464 0.000875216692282715 0.000980442938727264 38127 40330 667 665 0 True 582 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 627 300 0.000955164441125741 0.000926188210283089 0.000564583810177768 0.000442511635004196 0.000997305076858539 0.00102364602698344 41752 40364 667 665 0 False 627 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 671 300 0.000989251311629605 0.00102756318583137 0.000656137941557946 0.00064087891966125 0.00096514844686755 0.00102215452930321 43242 44782 667 665 0 False 671 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 268 345 0.000964200893373409 0.000817539385199093 0.000793469138628214 0.000625619897764553 0.000753469144160414 0.00072408630989214 42147 35629 667 665 0 True 269 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 312 345 0.000885366426422861 0.000947482003245697 0.000732433051041428 0.000854505226215 0.000708229197597985 0.000680581912247816 38701 41292 667 665 0 True 314 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 357 346 0.000962942653187025 0.000945967574004822 0.000854505226215 0.000823987182421607 0.000706695814513855 0.000729616758344767 42092 41226 667 665 0 True 358 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 400 345 0.000943565754316708 0.000945669277336165 0.000778210116731518 0.000793469138628214 0.000747784553103024 0.000722738442001461 41245 41213 667 665 0 True 403 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 445 345 0.00105740217554304 0.00102513092068693 0.00080872816052491 0.000747692072938125 0.000896304176345836 0.000927094528301298 46221 44676 667 665 0 True 448 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 489 344 0.000929793743549374 0.000967674393124032 0.000656137941557946 0.000747692072938125 0.000839515715076563 0.000861148386314816 40643 42172 667 665 0 True 493 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 534 344 0.000929702235172183 0.000835207726342636 0.000671396963454643 0.000549324788281071 0.000867360747903781 0.000834555977567209 40639 36399 667 665 0 True 537 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 578 344 0.000928558380457288 0.000851430475938071 0.000701915007248035 0.000457770656900893 0.000964327020705827 0.000949792358754291 40589 37106 667 665 0 True 582 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 621 344 0.000981221451531044 0.000943879497324222 0.000625619897764553 0.000488288700694286 0.00104637129496529 0.00102484883315821 42891 41135 667 665 0 True 627 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 666 344 0.00100274879726536 0.000917927687151043 0.000671396963454643 0.000579842832074464 0.00102069245711939 0.000947111274338887 43832 40004 667 665 0 True 672 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 269 389 0.000945761955369306 0.000848080374890075 0.00080872816052491 0.000732433051041428 0.000747000245218902 0.000712889167832632 41341 36960 667 665 0 True 269 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 314 389 0.000955004301465655 0.00692794012956401 0.000854505226215 0.00711070420386053 0.000708634026649026 0.00183619516572647 41745 301925 667 665 0 True 314 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 357 390 0.00103319820977586 0.000974374595220025 0.000915541313801785 0.000839246204318303 0.000773454680393602 0.000759517578817303 45163 42464 667 665 0 True 359 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 401 390 0.000928169469854224 0.000919120873825672 0.000747692072938125 0.000747692072938125 0.000766697212519897 0.000745650942987056 40572 40056 667 665 0 True 403 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 446 389 0.000993186171848843 0.00101570015677785 0.000701915007248035 0.000747692072938125 0.0009072850677226 0.000885963460199672 43414 44265 667 665 0 True 448 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 490 388 0.000905429638122115 0.000937913563951077 0.000610360875867857 0.000625619897764553 0.000924382015271004 0.000957521254024402 39578 40875 667 665 0 True 493 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 534 388 0.00095397483222225 0.000912787806091103 0.000717174029144732 0.00064087891966125 0.000887291608073969 0.000888236261760372 41700 39780 667 665 0 True 538 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 579 388 0.00100460184190349 0.000909162354272039 0.000732433051041428 0.000549324788281071 0.00100402822253204 0.000988528601515684 43913 39622 667 665 0 True 582 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 622 388 0.000956948854480976 0.000864463745768633 0.000610360875867857 0.000457770656900893 0.000976960929524989 0.000979986581533114 41830 37674 667 665 0 True 627 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 667 387 0.000858623103188621 0.000962075594112312 0.000473029678797589 0.000564583810177768 0.000880693924150647 0.00100018647563347 37532 41928 667 665 0 True 672 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 269 432 0.000963743351487451 0.000923388810777229 0.000793469138628214 0.000732433051041428 0.000854724400382864 0.00084079781390857 42127 40242 667 665 0 True 269 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 313 433 0.000956239664557742 0.00100287340002558 0.000854505226215 0.000854505226215 0.000739944478683803 0.000821785916485543 41799 43706 667 665 0 True 314 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 358 434 0.000987055110577007 0.00102058763296431 0.000915541313801785 0.000930800335698482 0.000704070973404973 0.000726798256011104 43146 44478 667 665 0 True 359 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 402 433 0.00094788952513901 0.00104552982364357 0.000793469138628214 0.000885023270008392 0.000797441219856534 0.000842176290006457 41434 45565 667 665 0 True 403 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 446 433 0.000940431592397896 0.000907395520157684 0.000671396963454643 0.000579842832074464 0.00089729950354055 0.000921813789033721 41108 39545 667 665 0 True 448 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 491 432 0.000933248184788357 0.000908405139651601 0.000671396963454643 0.000595101853971161 0.000911678342395733 0.000922860397033219 40794 39589 667 665 0 True 493 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 535 431 0.000872417991050252 0.000909919568892476 0.000595101853971161 0.000671396963454643 0.000859529102321691 0.00086339654618901 38135 39655 667 665 0 True 538 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 579 431 0.000947363351970158 0.000860379375997788 0.000564583810177768 0.000457770656900893 0.00100502538938232 0.000955616065468007 41411 37496 667 665 0 True 582 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 623 431 0.000935581648406742 0.000885665755140885 0.000595101853971161 0.000534065766384375 0.000970227579266868 0.000879472901755825 40896 38598 667 665 0 True 627 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 667 430 0.000904903464953264 0.000980937121930484 0.000457770656900893 0.000564583810177768 0.000963947071966289 0.00101965127669567 39555 42750 667 665 0 True 672 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 272 477 0.000954661145051187 0.00091565604328973 0.000793469138628214 0.000747692072938125 0.000760720529896094 0.000779953842596809 41730 39905 667 665 0 True 269 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 316 476 0.000943565754316708 0.000957142226130673 0.00080872816052491 0.000839246204318303 0.000789284173700441 0.000757269690675214 41245 41713 667 665 0 True 314 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 360 477 0.000933248184788357 0.000987178406074697 0.000747692072938125 0.000854505226215 0.000833667454329729 0.000821566879126702 40794 43022 667 665 0 True 359 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 404 477 0.000999889160478127 0.000987384919152998 0.000778210116731518 0.000732433051041428 0.00088472744278858 0.000912003372866745 43707 43031 667 665 0 True 404 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 448 476 0.000976508770105677 0.00103295547176479 0.000534065766384375 0.000686655985351339 0.00102765843564934 0.00108334208143549 42685 45017 667 665 0 True 448 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 491 476 0.000844965477892777 0.000922287407692956 0.000442511635004196 0.000488288700694286 0.000954781867404693 0.00102339523945426 36935 40194 667 665 0 True 493 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 536 475 0.000874797208857233 0.000919419170494329 0.000549324788281071 0.000564583810177768 0.000894967734573881 0.000928212324665757 38239 40069 667 665 0 True 538 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 579 474 0.000906619247025606 0.000854941198269191 0.000549324788281071 0.000442511635004196 0.00093360118426055 0.00101644568289866 39630 37259 667 665 0 True 583 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 623 476 0.000906619247025606 0.000871806432997119 0.000488288700694286 0.000473029678797589 0.00096141550492101 0.00091254639059143 39630 37994 667 665 0 True 627 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 668 476 0.000933408324448442 0.000936032000348778 0.000457770656900893 0.000564583810177768 0.00103018354282656 0.00095031546860431 40801 40793 667 665 0 True 672 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 272 521 0.000919865084624088 0.000902921070127826 0.000717174029144732 0.000778210116731518 0.000809462580033375 0.000754879424414619 40209 39350 667 665 0 True 270 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 315 521 0.000935078352332188 0.00100902290057944 0.000732433051041428 0.000839246204318303 0.000805813973666185 0.000873757006933247 40874 43974 667 665 0 True 314 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 361 521 0.000939058966740022 0.00101106508546486 0.000778210116731518 0.000930800335698482 0.000742855576718365 0.000771485130170279 41048 44063 667 665 0 True 359 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 405 520 0.000940157067266321 0.000978803153454706 0.000701915007248035 0.000686655985351339 0.000850083039655182 0.000910625890393359 41096 42657 667 665 0 True 404 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 449 520 0.000940980642661045 0.000948789919408271 0.000595101853971161 0.000488288700694286 0.000979644925794725 0.00107082913795616 41132 41349 667 665 0 True 449 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 493 518 0.000814035646402022 0.000953356153028486 0.0004272526131075 0.000579842832074464 0.000883716596103265 0.000947690059438661 35583 41548 667 665 0 True 493 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 537 518 0.000861757265107433 0.000930157850565989 0.000549324788281071 0.000564583810177768 0.000850212411207239 0.000915227440632438 37669 40537 667 665 0 True 538 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 582 518 0.000857364863002237 0.000899708644465363 0.000534065766384375 0.000579842832074464 0.000874747728165895 0.000896522409162671 37477 39210 667 665 0 True 583 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 626 518 0.000753319838135407 0.000898584295483502 0.000320439459830625 0.000488288700694286 0.000909471972320324 0.000966750092568543 32929 39161 667 665 0 True 627 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 670 517 0.000924143101257794 0.000984746140930261 0.000503547722590982 0.00064087891966125 0.00101750172009052 0.00100829824264428 40396 42916 667 665 0 True 672 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 272 562 0.000992156702605438 0.00101384153907314 0.000869764248111696 0.000885023270008392 0.000721742371073302 0.000733259120587751 43369 44184 667 665 0 True 270 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 316 562 0.000942010111904451 0.000963612969250776 0.000778210116731518 0.000793469138628214 0.000745137386424062 0.000773620442088523 41177 41995 667 665 0 True 314 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 361 562 0.000945144273823262 0.000969257660057675 0.00080872816052491 0.000854505226215 0.000733531662420828 0.000673912122841642 41314 42241 667 665 0 True 359 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 405 562 0.000933934497617293 0.000995576604592277 0.000686655985351339 0.000793469138628214 0.00083582886693145 0.000776134128884603 40824 43388 667 665 0 True 404 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 450 561 0.00106117689610219 0.000943030499113428 0.000671396963454643 0.000534065766384375 0.00110582471747261 0.00103305068670938 46386 41098 667 665 0 True 449 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 493 560 0.000977721256103466 0.000945829898619288 0.000564583810177768 0.000488288700694286 0.00106746171867858 0.00111617775026949 42738 41220 667 665 0 True 493 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 538 560 0.000942147374470238 0.000838718448673756 0.000503547722590982 0.000381475547417411 0.000995252980353114 0.00100078085963061 41183 36552 667 665 0 True 538 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 582 559 0.000927460279930989 0.000928574583632347 0.000656137941557946 0.000717174029144732 0.000884000317643103 0.000779146252711126 40541 40468 667 665 0 True 583 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 626 560 0.000918263688023235 0.00090773970862152 0.00064087891966125 0.000610360875867857 0.000865828262080218 0.000885107961126278 40139 39560 667 665 0 True 628 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 670 559 0.000929015922343246 0.000900236400109911 0.00064087891966125 0.000549324788281071 0.000925408579617433 0.000904065664492403 40609 39233 667 665 0 True 672 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 270 606 0.000986849216728326 0.000877864149960619 0.000823987182421607 0.000747692072938125 0.000735318163520552 0.000701263644620275 43137 38258 667 665 0 False 270 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 315 606 0.000957932569535786 0.000958243629214946 0.000793469138628214 0.00080872816052491 0.000774570463458316 0.000766923929192646 41873 41761 667 665 0 False 315 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 360 605 0.00101418734441431 0.000967789122611977 0.000869764248111696 0.000823987182421607 0.000788786175367301 0.000764287764992963 44332 42177 667 665 0 True 359 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 404 604 0.000989114049063818 0.000928689313120292 0.00080872816052491 0.000778210116731518 0.000832352846089365 0.000736103627884629 43236 40473 667 665 0 True 404 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 449 605 0.000970629356871118 0.00102409835529543 0.000579842832074464 0.000686655985351339 0.00100882476006698 0.00108777538665031 42428 44631 667 665 0 False 449 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 494 605 0.000863724695217052 0.000909139408374449 0.000442511635004196 0.000457770656900893 0.00097118308094378 0.00110840605749035 37755 39621 667 665 0 False 494 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 538 605 0.000859378047300451 0.000922861055132682 0.000442511635004196 0.000488288700694286 0.000975192888456438 0.00100794686063076 37565 40219 667 665 0 False 538 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 583 605 0.000872463745238848 0.000857121058540148 0.000564583810177768 0.000564583810177768 0.000881698094317718 0.000862036085916086 38137 37354 667 665 0 False 583 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 628 605 0.000869215197848546 0.000968844633901072 0.000671396963454643 0.000793469138628214 0.000735160626072625 0.000764852825668407 37995 42223 667 665 0 False 628 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 672 605 0.00091494650935004 0.000927037208493883 0.000671396963454643 0.000625619897764553 0.000804830088868093 0.000863479841395201 39994 40401 667 665 0 False 672 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 271 654 0.00116815018903915 0.0766811053727246 0.00105287251087205 0.074341954680705 0.000791995001913681 0.0236585487307539 51062 3341822 667 665 0 True 270 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 315 649 0.000963057038658515 0.00100525977337484 0.000839246204318303 0.000946059357595178 0.000687994348522101 0.000674089370453331 42097 43810 667 665 0 False 315 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 359 649 0.000956285418746337 0.0010013819166823 0.00080872816052491 0.000900282291905089 0.00068188310624563 0.000700135383309091 41801 43641 667 665 0 False 359 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 404 649 0.000972482401509248 0.00101760466627773 0.000793469138628214 0.000839246204318303 0.000714804028378712 0.000757393680176365 42509 44348 667 665 0 False 404 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 449 649 0.000943657262693899 0.00102634705325915 0.000671396963454643 0.000778210116731518 0.000864369689942438 0.000909314126093094 41249 44729 667 665 0 False 449 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 494 649 0.000947088826838584 0.00091473820738617 0.000610360875867857 0.000610360875867857 0.000935389375134047 0.00091031714679329 41399 39865 667 665 0 False 494 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 538 649 0.000833938718441191 0.000967123691581896 0.000473029678797589 0.000625619897764553 0.000872777661392362 0.000924056092189169 36453 42148 667 665 0 False 538 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 583 648 0.000953448659053398 0.00090702838579626 0.000732433051041428 0.000778210116731518 0.000767464796245107 0.000686637888716681 41677 39529 667 665 0 False 583 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 628 648 0.000978201675083722 0.000966137017985568 0.00080872816052491 0.000823987182421607 0.000724332526426643 0.000745335863639471 42759 42105 667 665 0 False 628 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 668 653 0.00100881122725431 0.0812702389987328 0.000854505226215 0.0770733196002136 0.000750031579755442 0.0226637888931084 44097 3541820 667 665 0 True 673 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B7_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B7_1.csv new file mode 100755 index 0000000..09cb7da --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B7_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 264 271 0.00970791784240633 0.0413247813973019 0.00976577401388571 0.0407873655298695 0.00156172071605024 0.00884822146036898 424351 1800966 667 665 0 True 263 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 307 270 0.00972402331679205 0.00965230655030802 0.0097962920576791 0.00971999694819562 0.00132830495071041 0.00123052183454342 425055 420655 667 665 0 False 307 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 352 271 0.0100460184190349 0.0611940471457885 0.0100709544518196 0.0618142977035172 0.00136446725922408 0.0111287771179267 439130 2666884 667 665 0 True 352 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 397 271 0.00987167208339067 0.081550729650861 0.00984206912336919 0.0813916227969787 0.00142880347014769 0.00994301101726097 431509 3554044 667 665 0 True 397 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 441 270 0.0098506480337309 0.0704940653304123 0.00988784618905928 0.0679026474402991 0.00172176282994257 0.0134749774095477 430590 3072186 667 665 0 True 441 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 485 269 0.00975396943322799 0.0646277171528042 0.00973525597009232 0.0677958342870222 0.00176899613180808 0.0194001344643755 426364 2816526 667 665 0 True 486 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 529 269 0.00969837809408411 0.0770187772016445 0.00962844281681544 0.0759136339360647 0.00161885921504282 0.0248698185742178 423934 3356538 667 665 0 True 531 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 573 269 0.00981079613546397 0.0645371038032252 0.0098115510795758 0.0631570916304265 0.00178522484181191 0.0180534390313529 428848 2812577 667 665 0 True 575 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 620 269 0.00948397396632423 0.00955113808783804 0.00946059357595178 0.00953688868543526 0.00201063817292822 0.00192958964086303 414562 416246 667 665 0 False 620 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 659 269 0.00967474605567438 0.0421061809937983 0.00975051499198901 0.0416113527122911 0.00175396725288731 0.00955861547009363 422901 1835020 667 665 0 True 665 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 263 314 0.00985517769840189 0.00981669096063574 0.00990310521095598 0.00976577401388571 0.00160116899811525 0.00141020454598109 430788 427819 667 665 0 False 263 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 307 314 0.00979388996277782 0.00978323584195095 0.0098268101014725 0.00978103303578241 0.00140305278265569 0.00130664286748929 428109 426361 667 665 0 False 307 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 352 315 0.00985163174878571 0.116752375330636 0.00987258716716258 0.116563668268864 0.00141129693969775 0.0323208474447882 430633 5088159 667 665 0 True 352 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 396 315 0.00980116487876456 0.0491562162444335 0.0098268101014725 0.0499275196459907 0.00142320365174673 0.00762272982583788 428427 2142266 667 665 0 True 397 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 440 314 0.00981605786715248 0.0738582092677333 0.0098268101014725 0.0709849698634318 0.00178527113014595 0.0172004212431954 429078 3218798 667 665 0 True 441 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 485 313 0.0098484975868669 0.0405663735901897 0.00985732814526589 0.0427557793545434 0.00179186759876936 0.0077673250097183 430496 1767914 667 665 0 True 486 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 529 313 0.00960840248221049 0.0437714106736285 0.00958266575112535 0.0452277409018082 0.00155950149923727 0.0105308194269608 420001 1907592 667 665 0 True 531 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 573 313 0.00963208027480881 0.0492457740827234 0.00967421988250553 0.0510261692225528 0.00183457178697447 0.0111697850727711 421036 2146169 667 665 0 True 576 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 620 313 0.00951961647924035 0.00926920184416179 0.00952162966353857 0.00930800335698482 0.00204693451695683 0.00207182254289482 416120 403959 667 665 0 False 620 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 665 313 0.00956411242764976 0.0093214037611768 0.00955214770733196 0.0093690394445716 0.00198273280741916 0.00189747945583659 418065 406234 667 665 0 False 665 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 264 359 0.00979347817508046 0.0503560801752608 0.00978103303578241 0.049759670405127 0.00163433019294245 0.0112623991615162 428091 2194557 667 665 0 True 263 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 309 359 0.00989255887048465 0.0657982332806151 0.00993362325474937 0.06665140764477 0.00134263850676959 0.0216554619456156 432422 2867538 667 665 0 True 307 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 353 360 0.00987215250237092 0.0384629002123069 0.00987258716716258 0.0395819028000305 0.00136864352153755 0.00697472489846289 431530 1676243 667 665 0 True 352 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 397 359 0.00988951621694303 0.0338919856289843 0.00996414129854276 0.0345159075303273 0.00146395752943095 0.00560440546540312 432289 1477039 667 665 0 True 397 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 441 359 0.0100385147321052 0.0675406300140372 0.00999465934233616 0.0650034332799268 0.00173318775311139 0.0134069117765104 438802 2943473 667 665 0 True 442 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 486 358 0.0100008132807023 0.0315308527670745 0.0101472495613031 0.0322117952239261 0.00175791427046701 0.00426146515700636 437154 1374139 667 665 0 True 486 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 530 357 0.00979400434824931 0.0299982274294112 0.00990310521095598 0.029907682917525 0.00168471167200452 0.0048346430295291 428114 1307346 667 665 0 True 531 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 574 357 0.00987105440184463 0.0500193950199371 0.0098115510795758 0.0497444113832303 0.00189764360982416 0.0101606303207307 431482 2179884 667 665 0 True 576 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 618 357 0.00966031060917241 0.056842770694188 0.0098268101014725 0.0572365911345083 0.00205212199691386 0.0131231299724137 422270 2477252 667 665 0 True 620 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 662 358 0.00962951804024744 0.0641271753427974 0.00967421988250553 0.0632791638056001 0.0020067877836072 0.0200984924921134 420924 2794712 667 665 0 True 665 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 266 403 0.00990273917744721 0.0456013460063526 0.00994888227664607 0.048050659952697 0.00153065295705441 0.0111477739380356 432867 1987342 667 665 0 True 263 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 310 404 0.00992984853419022 0.0336574097179318 0.00994888227664607 0.032974746318761 0.0014305837529841 0.00519498939977727 434052 1466816 667 665 0 True 308 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 353 403 0.00989551001564908 0.0837938058696753 0.00990310521095598 0.0819714656290532 0.00140823499418988 0.023310446852651 432551 3651799 667 665 0 True 352 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 397 403 0.0100210137549673 0.0676117164047679 0.0100099183642329 0.0659800106813153 0.00158118573757835 0.0213418781485695 438037 2946571 667 665 0 True 397 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 442 402 0.0102890189146672 0.0451348559083678 0.0102693217364767 0.045990691996643 0.00166714816883295 0.00868810905170959 449752 1967012 667 665 0 True 442 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 486 402 0.0101549820191758 0.055457641586227 0.0101930266269932 0.0545510032806897 0.00178135770597537 0.0123042719343073 443893 2416887 667 665 0 True 486 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 530 401 0.0102313686370365 0.0415535519962644 0.0102082856488899 0.043228809033341 0.00169706512468796 0.00772618687119718 447232 1810936 667 665 0 True 531 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 574 401 0.00991424635587905 0.0525766694144379 0.0100251773861295 0.0532234683756771 0.00181404432097377 0.0100699872688872 433370 2291332 667 665 0 True 576 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 619 401 0.00986661624555083 0.049388336944444 0.0098268101014725 0.0506904707408255 0.00190173594255881 0.0092067637070344 431288 2152382 667 665 0 True 620 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 662 401 0.00976174764528928 0.0909355558729738 0.00978103303578241 0.0882887006942855 0.00198529905456694 0.0210426483636448 426704 3963042 667 665 0 True 665 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 266 447 0.0100198012689695 0.0498502837547061 0.0098268101014725 0.0488288700694286 0.00223124895433969 0.00894609450230993 437984 2172514 667 665 0 True 263 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 309 447 0.00985922694409261 0.054485217392302 0.00976577401388571 0.0548409246967269 0.00155989487006147 0.00863440465601228 430965 2374508 667 665 0 True 308 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 354 447 0.0101079467132993 0.0352362710392369 0.0101625085831998 0.0366826886396582 0.00141224308666551 0.00526914666018165 441837 1535624 667 665 0 True 352 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 398 447 0.0103798409790298 0.0540375888221354 0.0102693217364767 0.054184786755169 0.00162770287319491 0.00939300411200458 453722 2355000 667 665 0 True 397 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 442 447 0.0104109767043693 0.097952090113129 0.0103608758678569 0.097108415350576 0.00185633575556514 0.0216448397442701 455083 4268828 667 665 0 True 442 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 486 445 0.0103041864281867 0.0625296590067524 0.0102693217364767 0.062882429236286 0.00190233599702483 0.0214889625033286 450415 2725091 667 665 0 True 487 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 531 445 0.0101032569089683 0.0541567927601104 0.0100556954299229 0.0537422751201648 0.00176716729306161 0.0108240697634331 441632 2360195 667 665 0 True 531 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 576 446 0.0100478257094845 0.0344112512914238 0.0100862134737163 0.0347142748149844 0.00187958024313835 0.00479055275065444 439209 1499669 667 665 0 True 576 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 620 445 0.00979883141514617 0.0399851769501575 0.00988784618905928 0.0406042572671092 0.00194639010298547 0.00493224559412392 428325 1742585 667 665 0 True 621 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 663 446 0.0095604063383735 0.0798006460417466 0.00953688868543526 0.0803845273517968 0.00194806513257638 0.0153058821673886 417903 3477774 667 665 0 True 665 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 267 491 0.0109401925267625 0.054397059253765 0.0100556954299229 0.0554818036163882 0.00590340721486927 0.0130787101542727 478216 2370666 667 665 0 True 263 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 311 492 0.0100838113788151 0.0572236267023705 0.010101472495613 0.0564431219958801 0.0015895577940683 0.00760941128563846 440782 2493850 667 665 0 True 308 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 355 491 0.0102882410934611 0.0709123460975625 0.0102388036926833 0.0676890211337453 0.00160253678314475 0.0186777145897139 449718 3090415 667 665 0 True 353 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 399 491 0.0104506684629761 0.0934201606098102 0.010406652933547 0.0863660639353017 0.00157417832472822 0.0247666510951081 456818 4071323 667 665 0 True 397 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 444 490 0.0107388969740353 0.0999610952306378 0.0105134660868238 0.0951857785915923 0.00267004081440019 0.0301096906712416 469417 4356382 667 665 0 True 442 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 487 490 0.0102292639443611 0.0483926685562613 0.0102388036926833 0.0484168764782177 0.00181974282634732 0.0110581640823202 447140 2108990 667 665 0 True 487 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 531 488 0.00995734680153629 0.0387706505907708 0.00985732814526589 0.0409857328145266 0.00176980106287871 0.00790196003377466 435254 1689655 667 665 0 True 531 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 576 489 0.010101472495613 0.106223397817042 0.0101777676050965 0.10415808346685 0.00178729524921088 0.0252974417073345 441554 4629298 667 665 0 True 576 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 620 489 0.0100269389223905 0.0685538979056706 0.0100099183642329 0.0689860379949645 0.0017435852638889 0.0212507455552643 438296 2987632 667 665 0 True 621 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 665 490 0.00987453172017791 0.0789027501231908 0.00990310521095598 0.0767833981841764 0.00193240878378828 0.0151145519281845 431634 3438643 667 665 0 True 665 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 268 535 0.00979354680636335 0.0497915193109806 0.00985732814526589 0.052826733806363 0.00147033880502274 0.0108515064745774 428094 2169953 667 665 0 True 263 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 311 535 0.0101909448114121 0.118419578357659 0.0101625085831998 0.113771267261769 0.001425187264457 0.0342995432622273 445465 5160817 667 665 0 True 308 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 356 536 0.0102451406478038 0.0589990655283207 0.01025406271458 0.0612954909590295 0.00149971378349008 0.0107211058459513 447834 2571225 667 665 0 True 353 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 400 535 0.0104646006134035 0.0612513659979658 0.0105287251087205 0.0614023041123064 0.00165314153690162 0.00690812582924668 457427 2669382 667 665 0 True 397 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 444 535 0.0105781167553097 0.0591676949297024 0.0105745021744106 0.0592050049591821 0.00210305031315306 0.00815951456427813 462389 2578574 667 665 0 True 442 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 489 533 0.0104264187430203 0.0650854189720123 0.010452429999237 0.0644846265354391 0.00201240766473644 0.0131962500057837 455758 2836473 667 665 0 True 487 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 533 533 0.0102706714850403 0.0787827201329026 0.0102235446707866 0.0757000076295109 0.00192316937482032 0.0204943869784341 448950 3433412 667 665 0 True 531 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 577 533 0.0100009962974567 0.0600789912524502 0.0100099183642329 0.0605325398641947 0.00168760602236679 0.0135581094313131 437162 2618289 667 665 0 True 576 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 622 533 0.00988926456890575 0.0491309298652904 0.00987258716716258 0.0484168764782177 0.00183244752272939 0.00611726471055527 432278 2141164 667 665 0 True 621 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 665 533 0.00981713309058448 0.0672017191066474 0.00978103303578241 0.0651865415426871 0.00188342358897754 0.0142933906936625 429125 2928703 667 665 0 True 666 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 269 579 0.00966385655878858 0.0452107838834899 0.00965896086060884 0.0458533607995727 0.00137456193250476 0.00854732146921169 422425 1970321 667 665 0 True 263 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 312 579 0.00972930792557486 0.0568691355305178 0.00978103303578241 0.0562142366674296 0.00149488200864035 0.012086375631854 425286 2478401 667 665 0 True 308 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 357 579 0.0101265229138692 0.0474362605988535 0.0101472495613031 0.0479896238651102 0.00146818326168497 0.00702834384540389 442649 2067309 667 665 0 True 353 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 401 579 0.0102529646140537 0.0544685586706524 0.0102693217364767 0.0525673304341192 0.00161592137554832 0.00753448686785698 448176 2373782 667 665 0 True 398 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 445 578 0.0103065427688994 0.0930061018878164 0.0103303578240635 0.0864881361104753 0.00191414916847803 0.0190610397144697 450518 4053278 667 665 0 True 442 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 488 576 0.0104098328496544 0.064264988403717 0.0103456168459602 0.0630960555428397 0.00224704484334569 0.0124615951150388 455033 2800718 667 665 0 True 487 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 533 576 0.00988951621694303 0.0575598529397424 0.00993362325474937 0.0570382238498512 0.00193857927210274 0.00773600487211035 432289 2508503 667 665 0 True 532 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 576 576 0.00982660420762381 0.0401894872222901 0.00985732814526589 0.04101625085832 0.00168810310540239 0.00847099658255802 429539 1751489 667 665 0 True 576 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 621 576 0.00970784921112344 0.0504651420265014 0.00962844281681544 0.0494239719233997 0.00160082335121664 0.00818847510045467 424348 2199310 667 665 0 True 621 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 665 576 0.00972052312136447 0.0564041139699787 0.00962844281681544 0.0548714427405203 0.00169825421213295 0.00827946321374716 424902 2458135 667 665 0 True 666 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 264 619 0.00952805812703627 0.00946520570136718 0.00947585259784848 0.00953688868543526 0.00133666037620257 0.00140895906007616 416489 412501 667 665 0 False 264 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 308 619 0.00951122058563303 0.00951990872121939 0.00950637064164187 0.00949111161974517 0.00141643103523779 0.00138918932772559 415753 414885 667 665 0 False 308 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 357 622 0.0100094379452526 0.0777604803953119 0.00996414129854276 0.0741130693522545 0.00133891433856974 0.0126300928478343 437531 3388862 667 665 0 True 353 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 401 622 0.00998836814140423 0.0857489340196451 0.00997940032043946 0.0808422980086976 0.00143657533912361 0.0221244887399696 436610 3737005 667 665 0 True 398 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 442 618 0.0100523553741554 0.00994885933074848 0.0100404364080262 0.00996414129854276 0.00178921844274696 0.00188514353630151 439407 433579 667 665 0 False 442 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 487 618 0.00989082021131801 0.0105762460626274 0.00993362325474937 0.0102693217364767 0.00209128384595428 0.00252150784084298 432346 460921 667 665 0 False 487 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 532 618 0.009610438543603 0.00963362858967056 0.00967421988250553 0.00961318379491875 0.0019282583402337 0.00201697890329294 420090 419841 667 665 0 False 532 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 576 618 0.00954864751190438 0.00960540513563607 0.00961318379491875 0.00967421988250553 0.00171677713445069 0.00175853538816326 417389 418611 667 665 0 False 576 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 621 618 0.00962485111301067 0.0095247044138155 0.00964370183871214 0.00956740672922866 0.00150767490009758 0.00147450144798566 420720 415094 667 665 0 False 621 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 666 617 0.00972843859599154 0.00937089806227631 0.00968947890440223 0.00935378042267491 0.00152588947688055 0.00158363251502546 425248 408391 667 665 0 False 666 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 263 668 0.00964324429682618 0.0399474309486236 0.00967421988250553 0.0406958113984894 0.00136949475709205 0.0099380097753144 421524 1740940 667 665 0 True 264 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 308 662 0.0094820980445918 0.0094684869647224 0.00944533455405508 0.009399557488365 0.00126880430978304 0.00129272658319539 414480 412644 667 665 0 False 308 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 353 662 0.00977956890174734 0.00964849753130824 0.0098268101014725 0.00965896086060884 0.00129582170356947 0.00122251728349775 427483 420489 667 665 0 False 353 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 398 662 0.00968181507781243 0.00964533099744096 0.00965896086060884 0.00965896086060884 0.00139695411874864 0.00126173513959679 423210 420351 667 665 0 False 398 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 442 662 0.00975161309251531 0.00964494091718194 0.00978103303578241 0.00959792477302205 0.00149457021713941 0.00156525224769415 426261 420334 667 665 0 False 442 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 487 661 0.00962224312426071 0.0095572875883919 0.00970473792629892 0.00946059357595178 0.00174350465599792 0.00160040931294502 420606 416514 667 665 0 False 487 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 532 661 0.00946338458145612 0.00934744735494034 0.00944533455405508 0.0093842984664683 0.00169083659464332 0.001813098948788 413662 407369 667 665 0 False 532 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 577 661 0.00944213176085338 0.00945827604029529 0.00944533455405508 0.00944533455405508 0.00145880598484301 0.00127635411627746 412733 412199 667 665 0 False 577 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 621 661 0.00963459675518158 0.00957612617031248 0.00962844281681544 0.00949111161974517 0.00167871269152638 0.00156333642405086 421146 417335 667 665 0 False 621 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 660 666 0.0101745190577062 0.0406699513719065 0.00958266575112535 0.0406958113984894 0.00510273782767264 0.00994516256917532 444747 1772428 667 665 0 True 666 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B7_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B7_2.csv new file mode 100755 index 0000000..80c0593 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B7_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 264 271 0.00784450988055983 0.749175548163152 0.00775158312352178 0.75542839703975 0.00169394655500334 0.183182883644012 342898 32649651 667 665 14 True 263 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 307 270 0.00661811460943824 0.00630970881082312 0.00657663843747616 0.00630197604333562 0.00146976207943392 0.00120837960648133 289290 274982 667 665 0 False 307 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 352 271 0.0062380574418673 0.00622038043150908 0.00622568093385214 0.00616464484626535 0.00127975755553023 0.00122834819960169 272677 271089 667 665 0 True 352 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 397 271 0.00612550213792165 0.00630713887029315 0.00617990386816205 0.00633249408712902 0.00136265948623466 0.00125412944290839 267757 274870 667 665 0 True 397 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 441 270 0.00638854296815886 0.00643056485342447 0.0064087891966125 0.00651560234988937 0.0015914249465764 0.00165869418986198 279255 280249 667 665 0 True 441 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 485 269 0.0065283448914133 0.00678521664656032 0.00657663843747616 0.00683604180972 0.00166258208676938 0.00151799649200315 285366 295705 667 665 0 True 486 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 529 269 0.0064990393336177 0.00680818549004693 0.00645456626230259 0.00679026474402991 0.00147854306193495 0.00158440821439213 284085 296706 667 665 0 True 531 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 573 269 0.00683196968693497 0.00709131492039781 0.00685130083161669 0.00704966811627375 0.00168993670710267 0.00168673470542939 298638 309045 667 665 0 True 575 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 620 269 0.00815344216195862 0.00749745730772342 0.00788891432059205 0.00755321583886473 0.00301054868751989 0.00187250961798948 356402 326745 667 665 0 False 620 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 659 269 0.00887677012946948 0.761289444715015 0.00892652780956741 0.763546196688792 0.00190921851063123 0.179434159063678 388020 33177584 667 665 15 True 665 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 263 314 0.0064500365976316 0.00620119766112466 0.00645456626230259 0.00608834973678187 0.00156639645415701 0.00143832451226113 281943 270253 667 665 0 False 263 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 307 314 0.00615638621522381 0.00608678941574582 0.00614938582436866 0.00608834973678187 0.00126602859429632 0.00115746035036696 269107 265267 667 665 0 False 307 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 352 315 0.00598954356650926 0.00615193281900104 0.00599679560540169 0.00614938582436866 0.00130341304720094 0.00133298608582705 261814 268106 667 665 0 True 352 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 396 315 0.00619443082304121 0.00623378083570106 0.00619516289005875 0.00624093995574884 0.00135741217020468 0.00124320386012468 270770 271673 667 665 0 True 397 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 440 314 0.00652322042229057 0.00663384256016558 0.00660715648126955 0.00669871061264973 0.00159484951275367 0.00164005761138623 285142 289108 667 665 0 True 441 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 485 313 0.0066109312018287 0.00669088606157187 0.00669871061264973 0.00671396963454643 0.00163820955608522 0.00153477802302434 288976 291594 667 665 0 True 486 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 529 313 0.00663547832401035 0.00665254346670063 0.00671396963454643 0.00671396963454643 0.00141898291012358 0.00157619728762831 290049 289923 667 665 0 True 531 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 573 313 0.00678786264912863 0.00696600737366419 0.00683604180972 0.00701915007248035 0.00166776019369375 0.00177385739602904 296710 303584 667 665 0 True 576 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 620 313 0.00722344252456056 0.00699234926409638 0.00727855344472419 0.00698863202868696 0.00194912592575404 0.00193924094955846 315750 304732 667 665 0 False 620 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 665 313 0.00728852785783808 0.00730748822158394 0.0072480354009308 0.00735484855420768 0.00205290835843323 0.0018485820513711 318595 318466 667 665 0 False 665 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 264 359 0.00591201309393369 0.00598286744556516 0.00592050049591821 0.00593575951781491 0.00146796370294144 0.00144468806352389 258425 260738 667 665 0 True 263 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 309 359 0.00622263828031052 0.00615002830950115 0.00619516289005875 0.00622568093385214 0.00128842720117799 0.00127258969046701 272003 268023 667 665 0 True 307 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 353 360 0.00650370626085447 0.00639919781142029 0.00648508430609598 0.00643930724040589 0.00120536768518731 0.00133572824245141 284289 278882 667 665 0 True 352 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 397 359 0.00653287455608428 0.00662801430217797 0.00656137941557946 0.00662241550316625 0.00140458629534319 0.00134444820307617 285564 288854 667 665 0 True 397 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 441 359 0.00675569745454579 0.006901644130927 0.00674448767833982 0.00700389105058366 0.00156307915091364 0.00169754137199057 295304 300779 667 665 0 True 442 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 486 358 0.00680506622404065 0.00703277993564823 0.00695811398489357 0.00704966811627375 0.0016109382586576 0.00162086554286134 297462 306494 667 665 0 True 486 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 530 357 0.00662683078236574 0.00666718294936242 0.00671396963454643 0.00668345159075303 0.00156310763909304 0.00166117836343635 289671 290561 667 665 0 True 531 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 574 357 0.00691142183543156 0.00672668166181074 0.00698863202868696 0.00674448767833982 0.00178087879181979 0.00196611820511424 302111 293154 667 665 0 True 576 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 618 357 0.00679186614063076 0.00690926216892655 0.0068055237659266 0.00695811398489357 0.00202195661502992 0.00198478355818978 296885 301111 667 665 0 True 620 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 662 358 0.00665764622838501 0.00659625717991477 0.00665293354695964 0.00663767452506294 0.00186525595316912 0.00190254588490404 291018 287470 667 665 0 True 665 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 266 403 0.00621925247035443 0.00612533852369537 0.00625619897764553 0.00610360875867857 0.00148801011701507 0.00144703527070484 271855 266947 667 665 0 True 263 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 310 404 0.00618763632603474 0.00628793315401114 0.00625619897764553 0.00622568093385214 0.00135838343372152 0.00129196239426572 270473 274033 667 665 0 True 308 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 353 403 0.00651482452868324 0.0067340702408344 0.00656137941557946 0.00674448767833982 0.00135238860015687 0.0012783362528487 284775 293476 667 665 0 True 352 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 397 403 0.00667876178642196 0.00682679461299162 0.00671396963454643 0.0068055237659266 0.00140207558711169 0.00135864551669424 291941 297517 667 665 0 True 397 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 442 402 0.00693116476781065 0.00697546108347087 0.00692759594110018 0.00703440909437705 0.00156450373463592 0.00166282068276373 302974 303996 667 665 0 True 442 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 486 402 0.00690583982442288 0.00719743969674702 0.00692759594110018 0.0072480354009308 0.00158946584151277 0.00163655059681048 301867 313670 667 665 0 True 486 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 530 401 0.00673037251115802 0.00686410464247137 0.00675974670023652 0.00691233691920348 0.00153082588993073 0.00162018239744052 294197 299143 667 665 0 True 531 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 574 401 0.00677743069412879 0.00682202186629311 0.00685130083161669 0.00677500572213321 0.0017835083316642 0.00176641911349381 296254 297309 667 665 0 True 576 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 619 401 0.00633544523229344 0.00623520348135158 0.00636301213092241 0.00628671702143893 0.00187571558760064 0.00185952949975116 276934 271735 667 665 0 True 620 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 662 401 0.00617166811421481 0.00629020479787246 0.00605783169298848 0.00628671702143893 0.00177605279828834 0.00177306345692289 269775 274132 667 665 0 True 665 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 266 447 0.00623192638059547 0.00623359726852035 0.00625619897764553 0.00633249408712902 0.00167563150485547 0.00154901923380254 272409 271665 667 665 0 True 263 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 309 447 0.00630913657385086 0.00607820765004753 0.0063782711528191 0.00608834973678187 0.00152595344721935 0.00149702109759418 275784 264893 667 665 0 True 308 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 354 447 0.00640240648730338 0.00631732684882268 0.00646982528419928 0.00627145799954223 0.00143602420077442 0.00133818457790567 279861 275314 667 665 0 True 352 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 398 447 0.00653932589667629 0.00669871061264973 0.00656137941557946 0.00666819256885634 0.0014891934366702 0.00143509360620002 285846 291935 667 665 0 True 397 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 442 447 0.0066044569841424 0.00678140762756055 0.00662241550316625 0.00686655985351339 0.0017808722765283 0.00190619895835314 288693 295539 667 665 0 True 442 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 486 445 0.00675654390703481 0.0067238363705097 0.00672922865644312 0.00675974670023652 0.00174326074475032 0.00183401047364368 295341 293030 667 665 0 True 487 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 531 445 0.00654813357798098 0.00660008914481213 0.00662241550316625 0.00657663843747616 0.00166390312992522 0.00167998357873224 286231 287637 667 665 0 True 531 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 576 446 0.00634839366766605 0.00619263884132396 0.0064087891966125 0.00631723506523232 0.0018493578113807 0.00199505663160511 277500 269880 667 665 0 True 576 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 620 445 0.00590679711643377 0.00601568007911746 0.00576791027695125 0.00605783169298848 0.00182361969233871 0.00178202810140048 258197 262168 667 665 0 True 621 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 663 446 0.00590222169757419 0.00609920314634148 0.0059510185397116 0.00614938582436866 0.00192487032466992 0.00201810879155401 257997 265808 667 665 0 True 665 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 267 491 0.00652994628801415 0.00634027274641169 0.00633249408712902 0.00631723506523232 0.00209043612060748 0.00147105370690793 285436 276314 667 665 0 True 263 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 311 492 0.00627596478711891 0.00628086581755373 0.00630197604333562 0.00630197604333562 0.0015421183338484 0.00155818350625729 274334 273725 667 665 0 True 308 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 355 491 0.00638842858268737 0.00706148525353209 0.00642404821850919 0.00643930724040589 0.00151328021769665 0.00447779359880024 279250 307745 667 665 0 True 353 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 399 491 0.00644578145809219 0.00670217544318567 0.00645456626230259 0.00666819256885634 0.00162878022261787 0.00159757541649427 281757 292086 667 665 0 True 397 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 444 490 0.00680584404524677 0.00681605593291996 0.00662241550316625 0.00686655985351339 0.00203209751669481 0.00198330975509407 297496 297049 667 665 0 True 442 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 487 490 0.00667985988694826 0.00663010237885857 0.00656137941557946 0.00666819256885634 0.00170146847694132 0.0019050324397434 291989 288945 667 665 0 True 487 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 531 488 0.00650965430537192 0.00627866301138518 0.00653086137178607 0.00630197604333562 0.0016973411492339 0.00151933260354628 284549 273629 667 665 0 True 531 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 576 489 0.00618953512486147 0.00618362110357147 0.00628671702143893 0.00619516289005875 0.0017188329864702 0.00186237075467961 270556 269487 667 665 0 True 576 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 620 489 0.00605453739140958 0.00603894721927272 0.00607309071488518 0.00604257267109178 0.0017619665761387 0.00166480196335123 264655 263182 667 665 0 True 621 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 665 490 0.00611854750125509 0.00610783080383495 0.00611886778057527 0.00614938582436866 0.00177064791868733 0.00176250233793605 267453 266184 667 665 0 True 665 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 268 535 0.00618020127038792 0.00624975118042302 0.00616464484626535 0.00622568093385214 0.0014253357087991 0.00148320580658218 270148 272369 667 665 0 True 263 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 311 535 0.00626340526234937 0.00639912897372752 0.00628671702143893 0.00634775310902571 0.00145928301191818 0.0013786599946124 273785 278879 667 665 0 True 308 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 356 536 0.00639105944853163 0.00645330423793519 0.00646982528419928 0.00650034332799268 0.00144444422028832 0.00143561055851872 279365 281240 667 665 0 True 353 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 400 535 0.00652699514284972 0.00665951901956769 0.00650034332799268 0.00668345159075303 0.00152451660187193 0.00148509699568509 285307 290227 667 665 0 True 397 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 444 535 0.00671284865692583 0.00682929571582883 0.00672922865644312 0.00674448767833982 0.00182864396404481 0.00226381112266588 293431 297626 667 665 0 True 442 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 489 533 0.00664517821199265 0.00664584326460463 0.00662241550316625 0.00663767452506294 0.00173582797334807 0.0018986368376062 290473 289631 667 665 0 True 487 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 533 533 0.00656547441545879 0.0064338461167797 0.00656137941557946 0.00650034332799268 0.001746781165056 0.00175624067084353 286989 280392 667 665 0 True 531 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 577 533 0.00650697768533906 0.00621338193274443 0.00665293354695964 0.00628671702143893 0.00165665221755486 0.00167405882684148 284432 270784 667 665 0 True 576 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 622 533 0.00634983492460682 0.00616668703115078 0.00634775310902571 0.00624093995574884 0.00173051167809884 0.00181032678990385 277563 268749 667 665 0 True 621 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 665 533 0.006235884117909 0.00635768868268176 0.00617990386816205 0.00633249408712902 0.001754494147093 0.00194005655511855 272582 277073 667 665 0 True 666 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 269 579 0.00650727508756494 0.00658680347010809 0.00653086137178607 0.00660715648126955 0.0013333993082831 0.00128214019871975 284445 287058 667 665 0 True 263 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 312 579 0.00641542355395889 0.00657289825616915 0.00645456626230259 0.00656137941557946 0.00145605550627937 0.0014072946907025 280430 286452 667 665 0 True 308 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 357 579 0.00634146190809379 0.00658398112470464 0.00636301213092241 0.00650034332799268 0.00128531296877618 0.00129578543372959 277197 286935 667 665 0 True 353 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 401 579 0.00658324991772825 0.00655330245962813 0.00663767452506294 0.00653086137178607 0.00147238430892893 0.00135010026756514 287766 285598 667 665 0 True 398 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 445 578 0.0066902918419481 0.00662365458163605 0.00669871061264973 0.00674448767833982 0.00188536224159039 0.00196568533979204 292445 288664 667 665 0 True 442 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 488 576 0.00662307893890089 0.00675745211047761 0.00669871061264973 0.00679026474402991 0.00193853053782786 0.00187517026060484 289507 294495 667 665 0 True 487 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 533 576 0.00650793852329958 0.00689037769521079 0.00654612039368277 0.00688181887541009 0.00183948011663481 0.00182412154864047 284474 300288 667 665 0 True 532 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 576 576 0.00661925846415314 0.0067451531093699 0.00659189745937285 0.00672922865644312 0.00158545028786797 0.00174778389575824 289340 293959 667 665 0 True 576 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 621 576 0.00644063411187517 0.00642751304904514 0.00645456626230259 0.00650034332799268 0.00154535491991007 0.00157437583772213 281532 280116 667 665 0 True 621 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 665 576 0.00638863447653605 0.00657751038158454 0.0064087891966125 0.00659189745937285 0.00156471500166793 0.00173300524877185 279259 286653 667 665 0 True 666 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 264 619 0.00678088513536777 0.00666016150470018 0.0068207827878233 0.00669871061264973 0.00124109676950186 0.00134423741140325 296405 290255 667 665 0 False 264 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 308 619 0.00684862421158384 0.00654586798880929 0.00683604180972 0.00650034332799268 0.00135295637781463 0.00132152978215849 299366 285274 667 665 0 False 308 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 357 622 0.00653605447219169 0.0064106707602148 0.00656137941557946 0.00653086137178607 0.0013479933059509 0.00142649810719929 285703 279382 667 665 0 True 353 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 401 622 0.00641933553708383 0.00648290444582502 0.00653086137178607 0.00642404821850919 0.00136186926662602 0.00139259461753477 280601 282530 667 665 0 True 398 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 442 618 0.00642359067662324 0.00636957465763287 0.00645456626230259 0.0063782711528191 0.00173521859097794 0.00184920614741638 280787 277591 667 665 0 False 442 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 487 618 0.00650096100953872 0.00713027705450396 0.00645456626230259 0.00706492713817044 0.00189175964975967 0.00241236110059173 284169 310743 667 665 0 False 487 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 532 618 0.0065794065658862 0.00652964523921385 0.00660715648126955 0.00660715648126955 0.00179833744442991 0.00194829433317393 287598 284567 667 665 0 False 532 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 576 618 0.00656366712500925 0.00671564468507042 0.00660715648126955 0.00668345159075303 0.00156530159778047 0.00169926641696681 286910 292673 667 665 0 False 576 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 621 618 0.00674602044365778 0.0066346227206836 0.00665293354695964 0.00666819256885634 0.00169752043967114 0.00138684537225527 294881 289142 667 665 0 False 621 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 666 617 0.00675807667235277 0.00673078897747918 0.0068207827878233 0.00679026474402991 0.00156472634274419 0.00145812950124686 295408 293333 667 665 0 False 666 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 263 668 0.00881417839947044 0.737730822822678 0.00840772106507973 0.768017090104524 0.00229596769508843 0.224100960868472 385284 32150881 667 665 16 True 264 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 308 662 0.00708892521008894 0.00677640542188614 0.00701915007248035 0.0068055237659266 0.00157961315411243 0.00123873664861279 309870 295321 667 665 0 False 308 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 353 662 0.00648016573082193 0.00641452567100975 0.00646982528419928 0.00646982528419928 0.00128675677193327 0.00119358108472333 283260 279550 667 665 0 False 353 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 398 662 0.00622133428593554 0.0061961036718599 0.00619516289005875 0.00614938582436866 0.00133225351537721 0.00124224801929842 271946 270031 667 665 0 False 398 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 442 662 0.00635811643274266 0.00620317100831731 0.0064087891966125 0.00619516289005875 0.00149203606311038 0.00157879939504629 277925 270339 667 665 0 False 442 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 487 661 0.0064641517648134 0.00629438095123366 0.00650034332799268 0.00624093995574884 0.00161817072609347 0.0014767367548508 282560 274314 667 665 0 False 487 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 532 661 0.00644388265926547 0.00651447800090751 0.00643930724040589 0.00654612039368277 0.00167276732598462 0.00172735308133344 281674 283906 667 665 0 False 532 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 577 661 0.00635479925406946 0.00642592978211149 0.00634775310902571 0.0064087891966125 0.00149542567132416 0.00127828227183746 277780 280047 667 665 0 False 577 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 621 661 0.00735750229714623 0.00716373217318875 0.00701915007248035 0.00708018616006714 0.00213974129643996 0.00145182519834766 321610 312201 667 665 0 False 621 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 660 666 0.00866435630891352 0.757071713387382 0.00831616693369955 0.77584496833753 0.00343470076036977 0.215205558713701 378735 32993772 667 665 17 True 666 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B7_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B7_3.csv new file mode 100755 index 0000000..038bb4d --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B7_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 264 271 0.00100636337816443 0.0779435657121747 0.00080872816052491 0.0753643091477836 0.000800333037246994 0.0228541137755837 43990 3396841 667 665 0 True 263 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 307 270 0.00100860533340563 0.000923755945138653 0.000900282291905089 0.00080872816052491 0.00071470207749242 0.000627794934011021 44088 40258 667 665 0 False 307 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 352 271 0.000999980668855318 0.000955467175606675 0.000869764248111696 0.000839246204318303 0.000724298922336832 0.00070062016763755 43711 41640 667 665 0 True 352 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 397 271 0.000886716174986437 0.000932727791095959 0.000747692072938125 0.000793469138628214 0.000684789420212422 0.000660006631474651 38760 40649 667 665 0 True 397 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 441 270 0.000896301677497255 0.00101322199983823 0.00064087891966125 0.000747692072938125 0.000839256105610986 0.000929412917788648 39179 44157 667 665 0 True 441 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 485 269 0.000954775530522676 0.000922448028976079 0.000717174029144732 0.000656137941557946 0.000860642307753753 0.000882893218076216 41735 40201 667 665 0 True 486 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 529 269 0.000923113632014389 0.000995186524333264 0.000717174029144732 0.000793469138628214 0.000805383289863599 0.000856842091548945 40351 43371 667 665 0 True 531 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 573 269 0.00100096438391013 0.000972447139822548 0.000717174029144732 0.000717174029144732 0.000922232872892884 0.000932932291086922 43754 42380 667 665 0 True 575 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 620 269 0.00108684499590443 0.00109488644935754 0.000701915007248035 0.000778210116731518 0.00108937712759863 0.00104112427072822 47508 47716 667 665 0 False 620 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 659 269 0.00109224399015873 0.0797436943239307 0.000701915007248035 0.0768749523155566 0.00104733852996583 0.0235963684866473 47744 3475292 667 665 0 True 665 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 263 314 0.000912521537354463 0.00104988954418548 0.000762951094834821 0.000823987182421607 0.000736632749797384 0.000840488865708243 39888 45755 667 665 0 False 263 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 307 314 0.000952396312715695 0.00094087358474006 0.000839246204318303 0.000885023270008392 0.000685232817054836 0.000623376746843636 41631 41004 667 665 0 False 307 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 352 315 0.000922061285676686 0.000910676783512914 0.000823987182421607 0.000778210116731518 0.000662719662756633 0.000690016072840144 40305 39688 667 665 0 True 352 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 396 315 0.000891749135731974 0.000936949836252338 0.000747692072938125 0.000823987182421607 0.000685998694193912 0.000680829264383714 38980 40833 667 665 0 True 397 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 440 314 0.00100311483077413 0.000970978602376851 0.000762951094834821 0.000671396963454643 0.000908059023031656 0.000913547529235946 43848 42316 667 665 0 True 441 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 485 313 0.000998127624217189 0.00103614495152966 0.000778210116731518 0.00080872816052491 0.000916797856543307 0.000886396553163705 43630 45156 667 665 0 True 486 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 529 313 0.000976783295237252 0.000950051943775667 0.000793469138628214 0.000793469138628214 0.000825818466631539 0.000831929924231142 42697 41404 667 665 0 True 531 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 573 313 0.000890490895545589 0.000958014170239056 0.000671396963454643 0.000701915007248035 0.000874151677064545 0.000899962901869628 38925 41751 667 665 0 True 576 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 620 313 0.000992454104831311 0.00101636558780793 0.000579842832074464 0.000671396963454643 0.00100711691944685 0.00105249459434976 43382 44294 667 665 0 False 620 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 665 313 0.00101912879678266 0.000984126601695358 0.000671396963454643 0.00064087891966125 0.00101038769193304 0.000995732614741324 44548 42889 667 665 0 False 665 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 264 359 0.00091048547596195 0.000875385993021005 0.000747692072938125 0.000701915007248035 0.000729756252073946 0.000756577809125333 39799 38150 667 665 0 True 263 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 309 359 0.000930091145775247 0.000899525077284651 0.00080872816052491 0.000762951094834821 0.000697230848793138 0.000677158096272801 40656 39202 667 665 0 True 307 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 353 360 0.00088808880064431 0.000954572285600704 0.000747692072938125 0.000839246204318303 0.00067054713414471 0.000748208650396155 38820 41601 667 665 0 True 352 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 397 359 0.00094441220680573 0.00103646619409591 0.000793469138628214 0.000869764248111696 0.00070294427584127 0.000767530715217377 41282 45170 667 665 0 True 397 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 441 359 0.000973900781355717 0.000927656747728786 0.000732433051041428 0.000656137941557946 0.000862196225110195 0.000895825155751231 42571 40428 667 665 0 True 442 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 486 358 0.000935901927726912 0.000918386605102823 0.000717174029144732 0.000656137941557946 0.000876590045625944 0.000873454308421425 40910 40024 667 665 0 True 486 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 530 357 0.000983371898395046 0.000993970391761046 0.000762951094834821 0.000701915007248035 0.000865720402177034 0.000944541489027564 42985 43318 667 665 0 True 531 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 574 357 0.0009860485184279 0.00098408070990018 0.000686655985351339 0.000564583810177768 0.00100006689452776 0.00104988417341248 43102 42887 667 665 0 True 576 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 618 357 0.00098865650717786 0.00100659063543501 0.000564583810177768 0.000595101853971161 0.00108504755993955 0.00108223493107179 43216 43868 667 665 0 True 620 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 662 358 0.000861368354504368 0.000950281402751557 0.0004272526131075 0.000503547722590982 0.000969981369081776 0.00104712802888656 37652 41414 667 665 0 True 665 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 266 403 0.000942421899601813 0.000895073573152382 0.00080872816052491 0.000762951094834821 0.000750169455852094 0.000746751756485048 41195 39008 667 665 0 True 263 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 310 404 0.000944984134163177 0.000935481298806641 0.000839246204318303 0.000839246204318303 0.000710835024271307 0.000663332965442957 41307 40769 667 665 0 True 308 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 353 403 0.000968341647441329 0.00107765408026819 0.000885023270008392 0.000976577401388571 0.00066943594956446 0.000715102247959547 42328 46965 667 665 0 True 352 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 397 403 0.000892732850786783 0.000938923183444994 0.000717174029144732 0.000778210116731518 0.000747473011726258 0.000752141705569326 39023 40919 667 665 0 True 397 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 442 402 0.000928192346948522 0.00096352118566042 0.000671396963454643 0.000732433051041428 0.000829117817391314 0.000877833789214585 40573 41991 667 665 0 True 442 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 486 402 0.0010099779590635 0.000957669981775221 0.00080872816052491 0.00064087891966125 0.000908013580590414 0.000906497452476784 44148 41736 667 665 0 True 486 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 530 401 0.000946379636915349 0.00100145075437507 0.000747692072938125 0.000747692072938125 0.000881226542420533 0.000932140013611809 41368 43644 667 665 0 True 531 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 574 401 0.000991859300379565 0.000976072591641613 0.000717174029144732 0.000671396963454643 0.000996760373638105 0.000973689346486829 43356 42538 667 665 0 True 576 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 619 401 0.0009295192184178 0.000852095906968153 0.000518806744487678 0.000335698481727321 0.00101393797964485 0.00102425163754558 40631 37135 667 665 0 True 620 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 662 401 0.00096365184311026 0.00091590844816321 0.000610360875867857 0.000488288700694286 0.000979693081699486 0.000963254559472732 42123 39916 667 665 0 True 665 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 266 447 0.000865554862760883 0.000970404954937125 0.000686655985351339 0.000778210116731518 0.000827589913639619 0.000871045293308277 37835 42291 667 665 0 True 263 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 309 447 0.000921855391828005 0.00106505678249182 0.000732433051041428 0.000976577401388571 0.000797956154696344 0.000791893352629556 40296 46416 667 665 0 True 308 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 354 447 0.00100732421612494 0.000954526393805525 0.000885023270008392 0.000823987182421607 0.000818312306525882 0.000769747286505156 44032 41599 667 665 0 True 352 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 398 447 0.00094994846362582 0.000955788418172921 0.000747692072938125 0.00080872816052491 0.000826201732329357 0.000785128074081203 41524 41654 667 665 0 True 397 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 442 447 0.000906550615742712 0.000954090421751334 0.000549324788281071 0.000518806744487678 0.000927773846713411 0.00107989370743863 39627 41580 667 665 0 True 442 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 486 445 0.000970080306607969 0.000989266482755298 0.000671396963454643 0.000610360875867857 0.000975715032531951 0.0010051200105202 42404 43113 667 665 0 True 487 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 531 445 0.000989731730609861 0.000976990427545173 0.000717174029144732 0.000732433051041428 0.000927119278790777 0.00090335035841931 43263 42578 667 665 0 True 531 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 576 446 0.000920253995227152 0.000936789214969215 0.000579842832074464 0.000518806744487678 0.000949892431162983 0.00101516382011345 40226 40826 667 665 0 True 576 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 620 445 0.00089570687304551 0.000908221572470889 0.000534065766384375 0.000579842832074464 0.000943501049219172 0.000916329926006373 39153 39581 667 665 0 True 621 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 663 446 0.000854253578177723 0.000914829990976526 0.0004272526131075 0.000473029678797589 0.000975880620106452 0.00102485602920361 37341 39869 667 665 0 True 665 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 267 491 0.000957406396366934 0.000926188210283089 0.000839246204318303 0.000762951094834821 0.000798404734701143 0.000791591143478088 41850 40364 667 665 0 True 263 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 311 492 0.00102576315412905 0.000931144524162317 0.000854505226215 0.000778210116731518 0.000841755339056885 0.000810411775921479 44838 40580 667 665 0 True 308 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 355 491 0.000909524638001439 0.0010784801325814 0.000732433051041428 0.000930800335698482 0.000795509022729065 0.000974312656511371 39757 47001 667 665 0 True 353 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 399 491 0.00102569452284615 0.000953057856359828 0.000778210116731518 0.000747692072938125 0.00089909326306361 0.000867186484763982 44835 41535 667 665 0 True 397 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 444 490 0.000965848044162858 0.00101531007651883 0.000579842832074464 0.000686655985351339 0.00100135238274263 0.00108611385951242 42219 44248 667 665 0 True 442 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 487 490 0.000949490921739862 0.000966251747473513 0.000595101853971161 0.000610360875867857 0.000950241100902911 0.000964561481532929 41504 42110 667 665 0 True 487 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 531 488 0.000914832123878551 0.000908267464266067 0.000686655985351339 0.000625619897764553 0.000887365774008214 0.000889559263405768 39989 39583 667 665 0 True 531 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 576 489 0.00092016248684996 0.000907647925031163 0.000625619897764553 0.000488288700694286 0.000898464213495836 0.000979546541851456 40222 39556 667 665 0 True 576 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 620 489 0.000928306732420011 0.000976347942412681 0.000549324788281071 0.000564583810177768 0.000965346871957734 0.000988883098931611 40578 42550 667 665 0 True 621 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 665 490 0.000998493657725955 0.000898538403688324 0.00064087891966125 0.000442511635004196 0.00101102127441126 0.00101329009293219 43646 39159 667 665 0 True 665 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 268 535 0.000990532428910287 0.00099807770742948 0.000854505226215 0.000823987182421607 0.000773212950496123 0.000806557888513996 43298 43497 667 665 0 True 263 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 311 535 0.00103020131042284 0.000972240626744247 0.000854505226215 0.000839246204318303 0.000829239927442974 0.000791555987037655 45032 42371 667 665 0 True 308 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 356 536 0.000928238101137117 0.000934884705469327 0.000793469138628214 0.000793469138628214 0.000767816908529958 0.00076356679572312 40575 40743 667 665 0 True 353 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 400 535 0.000924783659898135 0.00100808211877829 0.00064087891966125 0.000793469138628214 0.000857748700164173 0.000894438415607452 40424 43933 667 665 0 True 397 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 444 535 0.000933042290939675 0.000930823281596071 0.000549324788281071 0.000473029678797589 0.000991087989740105 0.00106256757570819 40785 40566 667 665 0 True 442 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 489 533 0.000989228434535307 0.000916963959452304 0.000579842832074464 0.000473029678797589 0.00105822202710386 0.00105187392728536 43241 39962 667 665 0 True 487 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 533 533 0.00102978952272548 0.00096306226770864 0.000671396963454643 0.000595101853971161 0.00105671971567313 0.000966656565404119 45014 41971 667 665 0 True 531 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 577 533 0.000957223379612551 0.000950855050191283 0.000671396963454643 0.000686655985351339 0.000890439408105838 0.000880551232358912 41842 41439 667 665 0 True 576 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 622 533 0.000879098102585238 0.000913682696097075 0.000564583810177768 0.000518806744487678 0.000927565562140737 0.000966536996274693 38427 39819 667 665 0 True 621 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 665 533 0.000830232629164932 0.0009042289862904 0.0004272526131075 0.000488288700694286 0.000932835346817681 0.000995107089291531 36291 39407 667 665 0 True 666 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 269 579 0.00108190354353608 0.00100273572464005 0.000930800335698482 0.000900282291905089 0.000776064711875589 0.000686321075682398 47292 43700 667 665 0 True 263 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 312 579 0.00101437036116869 0.00096563220823861 0.000900282291905089 0.000839246204318303 0.000758018033357651 0.000743454236862175 44340 42083 667 665 0 True 308 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 357 579 0.000962393602923876 0.000977151048828296 0.000839246204318303 0.000854505226215 0.000724418365236805 0.000735257136916683 42068 42585 667 665 0 True 353 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 401 579 0.00104964684057605 0.0009896795089119 0.000900282291905089 0.000839246204318303 0.000834239110003954 0.000728297979785401 45882 43131 667 665 0 True 398 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 445 578 0.000949788323965735 0.00101049143802514 0.000518806744487678 0.000610360875867857 0.000998276388700668 0.00109233389983242 41517 44038 667 665 0 True 442 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 488 576 0.000959762737079618 0.000992387124827404 0.000534065766384375 0.000549324788281071 0.00107354183729437 0.00107448164048785 41953 43249 667 665 0 True 487 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 533 576 0.000940660363340875 0.00101643442550069 0.000595101853971161 0.000610360875867857 0.001013829386721 0.00106908564020692 41118 44297 667 665 0 True 532 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 576 576 0.000918492458966214 0.00101939444628968 0.00064087891966125 0.000717174029144732 0.000852351667500508 0.00096949658034819 40149 44426 667 665 0 True 576 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 621 576 0.00086264947178505 0.000979468584484787 0.000595101853971161 0.000747692072938125 0.000777044079330665 0.000818204523436946 37708 42686 667 665 0 True 621 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 665 576 0.000891200085468824 0.00103749875948741 0.000610360875867857 0.000778210116731518 0.000875590773950902 0.000925606837861025 38956 45215 667 665 0 True 666 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 264 619 0.000963674720204558 0.000977839425755967 0.00080872816052491 0.000839246204318303 0.000745197130350449 0.000742778960442533 42124 42615 667 665 0 False 264 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 308 619 0.000939264860588703 0.000976393834207859 0.000823987182421607 0.000869764248111696 0.000712462849571146 0.000686151730777781 41057 42552 667 665 0 False 308 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 357 622 0.000947111703932881 0.00105374445498044 0.000854505226215 0.000930800335698482 0.000714384859182904 0.000764798258780875 41400 45923 667 665 0 True 353 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 401 622 0.00101496516562044 0.000890805636200825 0.000854505226215 0.000747692072938125 0.000768606532537718 0.000701622761645452 44366 38822 667 665 0 True 398 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 442 618 0.000958046955007275 0.000896037300851121 0.000595101853971161 0.000488288700694286 0.00098022989486804 0.00101104543755948 41878 39050 667 665 0 False 442 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 487 618 0.000886601789514947 0.00096866106672036 0.000488288700694286 0.000503547722590982 0.000991355687550067 0.00105111701890658 38755 42215 667 665 0 False 487 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 532 618 0.000986185780993687 0.00102391478811471 0.00064087891966125 0.000625619897764553 0.00100107873984356 0.00107171018637378 43108 44623 667 665 0 False 532 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 576 618 0.00098984611608135 0.000970840926991317 0.000686655985351339 0.000671396963454643 0.000946229380411489 0.000943541583805921 43268 42310 667 665 0 False 576 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 621 618 0.000909456006718545 0.000994291634327292 0.000686655985351339 0.000793469138628214 0.000744269229434721 0.000777667500815576 39754 43332 667 665 0 False 621 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 666 617 0.000952830977507355 0.000914164559946444 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.00081245107037572 0.000773748429061093 41650 39840 667 665 0 False 666 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 263 668 0.00120651507617672 0.0766963873405188 0.00109864957656214 0.0762798504615854 0.000739160625995644 0.0272107782941079 52739 3342488 667 665 0 True 264 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 308 662 0.00108741692326188 0.00110941120253139 0.000976577401388571 0.000991836423285267 0.000739479983095306 0.00070489817710138 47533 48349 667 665 0 False 308 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 353 662 0.00108563250990664 0.0010045025587544 0.000976577401388571 0.000869764248111696 0.000709797560450965 0.000694626209329651 47455 43777 667 665 0 False 353 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 398 662 0.000995817037693101 0.000866804227322713 0.00080872816052491 0.000701915007248035 0.000746199746151295 0.000662930250095879 43529 37776 667 665 0 False 398 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 442 662 0.000992774384151481 0.000915403638416251 0.000793469138628214 0.000747692072938125 0.000809090547416499 0.0007601994966249 43396 39894 667 665 0 False 442 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 487 661 0.0009240744699749 0.000990184318658858 0.000656137941557946 0.000747692072938125 0.000870203098827783 0.000867245651552736 40393 43153 667 665 0 False 487 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 532 661 0.000927986453099841 0.000927656747728786 0.000610360875867857 0.000625619897764553 0.000864181441022154 0.000903283159595224 40564 40428 667 665 0 False 532 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 577 661 0.000960952345983108 0.00099059734481546 0.000778210116731518 0.000839246204318303 0.000755927437442252 0.000716428293995463 42005 43171 667 665 0 False 577 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 621 661 0.00107586399064144 0.001108149178164 0.000930800335698482 0.000946059357595178 0.000758492756253942 0.000795018737643168 47028 48294 667 665 0 False 621 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 660 666 0.00106437968930389 0.080091118159326 0.000885023270008392 0.0778973067826352 0.000781999537067642 0.0278083390722142 46526 3490433 667 665 0 True 666 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B8_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B8_1.csv new file mode 100755 index 0000000..174e568 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B8_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 234 240 0.00989885007141657 0.0408121700451633 0.00997940032043946 0.0409552147707332 0.00180846892545482 0.00867600995887253 432697 1778626 667 665 0 True 233 241 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 277 240 0.00978057549389645 0.00978697602325796 0.00976577401388571 0.0098268101014725 0.00155625082163624 0.00145094446588029 427527 426524 667 665 0 False 277 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 321 240 0.00996315758348795 0.0606475217570133 0.00990310521095598 0.0601358052948806 0.00134164415025709 0.00664054347204617 435508 2643066 667 665 0 True 322 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 366 240 0.0100410998437609 0.0867512567181286 0.0100404364080262 0.0846265354390784 0.00124404403010451 0.0139488978732077 438915 3780687 667 665 0 True 367 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 410 241 0.00991925643953029 0.0686083944124445 0.00993362325474937 0.0669871061264973 0.00142431283009237 0.00837261559629927 433589 2990007 667 665 0 True 411 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 454 239 0.0100785038929379 0.0626747918090029 0.0100556954299229 0.0657206073090715 0.00163335660218711 0.0140711070743854 440550 2731416 667 665 0 True 456 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 499 238 0.0100120459340026 0.0761864377125005 0.00996414129854276 0.0750896467536431 0.00165833583333973 0.0190192690728429 437645 3320264 667 665 0 True 501 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 542 238 0.00994721224876232 0.0691918397504404 0.00993362325474937 0.0662394140535592 0.00156366762352994 0.0191198162079169 434811 3015434 667 665 0 True 545 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 590 239 0.0095343493279682 0.00938076479823959 0.00961318379491875 0.0093690394445716 0.00197805547583991 0.00191268053633081 416764 408821 667 665 0 False 590 239 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 630 239 0.00950586734556732 0.0424929111517636 0.00949111161974517 0.0422980086976425 0.00189782820065905 0.00752235317313909 415519 1851874 667 665 0 True 635 239 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 233 284 0.00976909119255891 0.00987141692638554 0.00973525597009232 0.00988784618905928 0.00165504721816677 0.00167980368093934 427025 430204 667 665 0 False 233 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 277 284 0.00988189814454183 0.00999975333160092 0.00988784618905928 0.00985732814526589 0.00144368736285628 0.00175059527205952 431956 435797 667 665 0 False 277 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 321 285 0.00998431889571351 0.0928685182858726 0.00996414129854276 0.0920271610589761 0.00139090283729713 0.0170041372053499 436433 4047282 667 665 0 True 322 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 365 285 0.00991571048991412 0.0484028106429957 0.00985732814526589 0.0480201419089036 0.00138644139082702 0.00662097932374195 433434 2109432 667 665 0 True 367 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 410 285 0.00999589470542824 0.0776529559192098 0.00997940032043946 0.0753337911039902 0.00144491964614613 0.0139881003014352 436939 3384176 667 665 0 True 411 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 454 283 0.0100289978608773 0.0408363550212221 0.00999465934233616 0.0416113527122911 0.00185401243642489 0.00641957835937957 438386 1779680 667 665 0 True 456 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 497 283 0.00983085934716322 0.0439285900721132 0.0098115510795758 0.0451819638361181 0.00173148586638095 0.00937136323188766 429725 1914442 667 665 0 True 501 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 542 282 0.00963445949261579 0.0540104667711852 0.00961318379491875 0.0522468909742886 0.00157730409584188 0.0143290455786741 421140 2353818 667 665 0 True 546 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 590 283 0.00950376265289191 0.00964422959435668 0.00949111161974517 0.00968947890440223 0.00209406241396171 0.00197298126984903 415427 420303 667 665 0 False 590 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 635 283 0.00932481802129377 0.00939418814832917 0.0093690394445716 0.0093690394445716 0.00190043885264368 0.00199447826340398 407605 409406 667 665 0 False 635 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 234 329 0.00986249836857721 0.0526246263403989 0.00985732814526589 0.0505836575875486 0.00152402413125673 0.00941713402187678 431108 2293422 667 665 0 True 233 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 277 329 0.00976536222618835 0.0601323863561398 0.0097962920576791 0.0621805142290379 0.00151880126190093 0.0157400479870133 426862 2620616 667 665 0 True 277 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 322 328 0.0100232557102085 0.0392555203527243 0.0100709544518196 0.0397039749752041 0.00129520944469834 0.00624375451697421 438135 1710786 667 665 0 True 322 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 366 328 0.0100428385029275 0.0343659790354807 0.0100404364080262 0.0344243533989471 0.00131166184470266 0.00495958915166421 438991 1497696 667 665 0 True 367 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 410 329 0.010004244844847 0.0662648381080878 0.0100862134737163 0.0628061341268025 0.001657814945405 0.00944677430660286 437304 2887873 667 665 0 True 412 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 455 327 0.00999010680057088 0.0317534738654831 0.0100251773861295 0.0318608377203021 0.00172071851471204 0.00453836231026262 436686 1383841 667 665 0 True 456 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 498 327 0.00983415364874212 0.0277356471976462 0.00987258716716258 0.0281528953994049 0.00169270943096997 0.00307848182591165 429869 1208741 667 665 0 True 501 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 543 327 0.00963992711815299 0.0502221220251361 0.00961318379491875 0.0500038147554742 0.00167001125922394 0.00718858967343087 421379 2188719 667 665 0 True 546 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 587 327 0.00974447543909437 0.0560416835175602 0.00971999694819562 0.0561684596017395 0.00193271326951681 0.00986971451874713 425949 2442340 667 665 0 True 590 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 631 328 0.00976687211441201 0.0632541757231256 0.00988784618905928 0.0617380025940337 0.00211113054335441 0.0173331185267168 426928 2756666 667 665 0 True 635 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 233 372 0.00987471473693229 0.0434024176944995 0.00993362325474937 0.0468909742885481 0.00153610557917265 0.0102892324852162 431642 1891511 667 665 0 True 233 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 278 374 0.00998502808563674 0.0332681096194365 0.0100251773861295 0.0324406805523766 0.00148503276498148 0.00466436826769785 436464 1449850 667 665 0 True 278 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 322 373 0.0101081754842423 0.0806771563837495 0.010101472495613 0.0772411688410773 0.00141718469074243 0.0153807709258347 441847 3515973 667 665 0 True 322 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 366 372 0.0100602708487825 0.0625687358703465 0.0101472495613031 0.060318913557641 0.00140608011676127 0.0145096947703424 439753 2726794 667 665 0 True 367 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 410 373 0.0101045151491547 0.0425244847068461 0.0101319905394064 0.0433966582742046 0.00156360282169027 0.00782376758863785 441687 1853250 667 665 0 True 412 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 455 371 0.0100384003466337 0.0534189674231355 0.0101319905394064 0.0533760585946441 0.00177120550905652 0.00989796927501552 438797 2328040 667 665 0 True 456 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 499 371 0.00996608585155809 0.0420339931999832 0.00990310521095598 0.0423895628290227 0.00179732690682139 0.00504328370517263 435636 1831874 667 665 0 True 501 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 543 371 0.00977689228171449 0.0519616505213595 0.00984206912336919 0.0510872053101396 0.0017118825748269 0.00640551757188819 427366 2264529 667 665 0 True 546 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 588 371 0.0100149742020727 0.0424797860983427 0.010101472495613 0.042374303807126 0.00190831681882524 0.00649953906603952 437773 1851302 667 665 0 True 590 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 632 371 0.00990058873058321 0.0911736883981526 0.00994888227664607 0.0885328450446326 0.00196585106205249 0.0180575735769304 432773 3973420 667 665 0 True 635 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 234 417 0.00992257361820349 0.0501643213091094 0.00990310521095598 0.0493781948577096 0.00162740609233202 0.0101320536406881 433734 2186200 667 665 0 True 233 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 278 417 0.00992810987502358 0.0562445023063495 0.00985732814526589 0.0551766231784543 0.00171485514804609 0.00833593971263258 433976 2451179 667 665 0 True 278 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 322 417 0.00997576286244609 0.0346709070685411 0.0100556954299229 0.035385671778439 0.00141281472572057 0.00359744010667946 436059 1510985 667 665 0 True 322 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 367 417 0.01025683084299 0.0541691376530133 0.0103150988021668 0.0517128252079042 0.00144395626645591 0.0112178185508734 448345 2360733 667 665 0 True 367 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 411 417 0.0101152445063804 0.0937895207233006 0.0100556954299229 0.0932173647669184 0.00169868566125684 0.0154727107300227 442156 4087420 667 665 0 True 412 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 455 415 0.0102075078276838 0.0585479032899254 0.0102235446707866 0.059510185397116 0.00174633039129517 0.0137630004830492 446189 2551563 667 665 0 True 457 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 499 415 0.0103035916237349 0.0519541013210527 0.0103608758678569 0.0519264515144579 0.00173470816343434 0.00922493551923428 450389 2264200 667 665 0 True 501 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 543 415 0.0100759645354709 0.0337624789829919 0.010101472495613 0.0336919203479057 0.00173774829868145 0.00456114262971376 440439 1471395 667 665 0 True 546 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 587 415 0.00984103965412579 0.0398366711009614 0.00985732814526589 0.0403143358510719 0.00184539332661361 0.00470827098610128 430170 1736113 667 665 0 True 591 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 631 416 0.00983035605108867 0.0803865924825798 0.00990310521095598 0.079163805600061 0.0018899819116252 0.0204553186514552 429703 3503310 667 665 0 True 635 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 236 461 0.00991074616045147 0.0586806682533755 0.00987258716716258 0.0591439688715953 0.00158328680202663 0.0142261944768003 433217 2557349 667 665 0 True 233 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 280 462 0.0100139447328293 0.0581650968804479 0.0100709544518196 0.056092164492256 0.00161598477958391 0.00766304379519867 437728 2534880 667 665 0 True 278 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 324 461 0.0101678160690769 0.0693737318806286 0.0101319905394064 0.0645761806668193 0.00153854287888435 0.0160175123935622 444454 3023361 667 665 0 True 323 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 368 461 0.0102461014857643 0.0911721510230142 0.0102388036926833 0.0853131914244297 0.0015535501491906 0.0182991786687953 447876 3973353 667 665 0 True 367 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 412 461 0.0103885800290516 0.0995571327035832 0.0104982070649271 0.0944228274967575 0.00175325421399421 0.0247777652241419 454104 4338777 667 665 0 True 412 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 455 459 0.0103253934946008 0.0437282494402635 0.0103761348897536 0.0447699702449073 0.00201530483562831 0.00627338085621586 451342 1905711 667 665 0 True 457 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 501 460 0.0103229685226053 0.0430776873518197 0.0103150988021668 0.0442359044785229 0.00182638953376489 0.00595799106224609 451236 1877359 667 665 0 True 501 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 545 459 0.0101311669640117 0.107259060904722 0.0101319905394064 0.108079652094301 0.00184871037256509 0.0185892280143362 442852 4674433 667 665 0 True 546 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 589 459 0.00999623786184271 0.0654904599562536 0.00991836423285267 0.0634164950026703 0.00190867898726167 0.0180482351738589 436954 2854125 667 665 0 True 591 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 633 460 0.00996528515325766 0.0779059803319239 0.00999465934233616 0.0750896467536431 0.00182377733971267 0.011289343932932 435601 3395203 667 665 0 True 635 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 236 505 0.0098636879774807 0.0494616490872409 0.00984206912336919 0.0518501564049744 0.00145022284075079 0.00932219228413297 431160 2155577 667 665 0 True 233 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 280 505 0.00999667252663437 0.0993287980766749 0.0100251773861295 0.0954757000076295 0.00163166879630099 0.0184341851444387 436973 4328826 667 665 0 True 278 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 324 506 0.010123892048025 0.0563156116429779 0.0101319905394064 0.0578927290760662 0.00156699258253155 0.0103870632351985 442534 2454278 667 665 0 True 323 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 368 505 0.0102814923506432 0.0622922148585013 0.0103608758678569 0.0592660410467689 0.00168542852094671 0.00969001419348449 449423 2714743 667 665 0 True 367 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 413 505 0.0103599379069907 0.0574738287696811 0.0103456168459602 0.0563057907988098 0.0018830752703981 0.00713626879415375 452852 2504754 667 665 0 True 412 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 458 503 0.0104202876817485 0.0652093497648906 0.0104371709773404 0.0641641870756084 0.00191000207956427 0.0107504492465397 455490 2841874 667 665 0 True 457 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 501 503 0.010161982410031 0.0751967811494862 0.0102082856488899 0.0727244983596552 0.00181784136003441 0.0151039745019294 444199 3277134 667 665 0 True 501 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 545 502 0.0100512572736291 0.058562106800533 0.0100251773861295 0.0585641260395209 0.00169740664411271 0.0105743406803291 439359 2552182 667 665 0 True 546 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 589 502 0.00999953216342161 0.0532744771060175 0.0100862134737163 0.0505836575875486 0.00188795557579994 0.0100193337138455 437098 2321743 667 665 0 True 591 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 634 503 0.00991225604867514 0.0652839239320549 0.00996414129854276 0.0657511253528649 0.0018630277038755 0.0115793164394451 433283 2845124 667 665 0 True 636 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 237 548 0.00967035365356919 0.0427289326543642 0.00971999694819562 0.0437018387121385 0.00133466670454945 0.00624864228948476 422709 1862160 667 665 0 True 233 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 281 548 0.00987947317254625 0.0533814738264751 0.00988784618905928 0.0528877698939498 0.00144570624378235 0.00931620471245049 431850 2326406 667 665 0 True 278 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 325 549 0.00999921188410144 0.0438364393473957 0.00999465934233616 0.0437170977340352 0.00146243406252749 0.00577712109408314 437084 1910426 667 665 0 True 323 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 369 548 0.0102642201444483 0.0503062875774926 0.0102693217364767 0.0494239719233997 0.00156017611776664 0.00541786180904456 448668 2192387 667 665 0 True 368 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 413 547 0.0105623086831498 0.0905113780101432 0.0104829480430304 0.0863965819790951 0.00175481875795258 0.0151257974986939 461698 3944556 667 665 0 True 412 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 457 546 0.0101930266269932 0.0638370244677842 0.0101319905394064 0.0624399176012818 0.00210093866220861 0.0087011154726398 445556 2782067 667 665 0 True 457 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 502 545 0.00996295168963927 0.0570033460855159 0.0100099183642329 0.0558480201419089 0.00197646931561606 0.00845121465821654 435499 2484250 667 665 0 True 502 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 545 544 0.00992714903706307 0.0382578097796563 0.00990310521095598 0.0397497520408942 0.00179413753523503 0.00752980876005977 433934 1667305 667 665 0 True 546 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 590 545 0.00969458049643066 0.0488179478221762 0.00970473792629892 0.0484473945220111 0.00173332964321286 0.00600736488385423 423768 2127524 667 665 0 True 591 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 634 546 0.00976680348312911 0.0538599646288989 0.00976577401388571 0.0528877698939498 0.00187006694318917 0.00739173755055944 426925 2347259 667 665 0 True 636 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 234 589 0.00947910114523878 0.00934905356777157 0.00947585259784848 0.0093690394445716 0.00133637792170642 0.00124151071332269 414349 407439 667 665 0 False 234 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 278 589 0.00965344748088304 0.00956635121793956 0.00958266575112535 0.00956740672922866 0.00140932219714693 0.00141125939425932 421970 416909 667 665 0 False 278 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 325 591 0.00989239873082456 0.0674199116468213 0.00988784618905928 0.0652018005645838 0.00148631736218149 0.00907985548616972 432415 2938212 667 665 0 True 323 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 369 591 0.0101814736943728 0.0815647037024927 0.0101777676050965 0.0798352025635157 0.00142417090894525 0.0192736286404759 445051 3554653 667 665 0 True 368 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 412 588 0.0100952270488697 0.00991150340947356 0.010101472495613 0.00993362325474937 0.00163014576931511 0.001628938579407 441281 431951 667 665 0 False 412 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 457 588 0.00985204353648307 0.00989307785370958 0.00993362325474937 0.00996414129854276 0.00207414752061814 0.00195344374093745 430651 431148 667 665 0 False 457 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 502 588 0.00988311063053962 0.00971605025381031 0.00994888227664607 0.00962844281681544 0.00205693592962701 0.00204289484808094 432009 423433 667 665 0 False 502 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 546 588 0.00952551876956921 0.00956699370307205 0.00955214770733196 0.00947585259784848 0.00198230984246978 0.00176544480283917 416378 416937 667 665 0 False 546 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 591 588 0.00953924502614795 0.0095359708495317 0.00958266575112535 0.00950637064164187 0.00163689800040854 0.0017330870483092 416978 415585 667 665 0 False 591 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 636 587 0.00967840639076205 0.00967933681766788 0.0097962920576791 0.00961318379491875 0.00156911156859653 0.00168607373973276 423061 421833 667 665 0 False 636 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 234 638 0.00946313293341885 0.0393697909227176 0.00941481651026169 0.039505607690547 0.00128625734587966 0.00831110555885594 413651 1715766 667 665 0 True 234 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 278 632 0.00953853583622471 0.00936860347251741 0.00946059357595178 0.00935378042267491 0.00142983444007143 0.00131627338095092 416947 408291 667 665 0 False 278 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 323 632 0.00961018689556572 0.00947654097477615 0.00961318379491875 0.00949111161974517 0.00131817280752044 0.00125376502431408 420079 412995 667 665 0 False 323 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 368 632 0.00964345019067486 0.0096162126534005 0.00964370183871214 0.00959792477302205 0.0014563583813121 0.0014668292659796 421533 419082 667 665 0 False 368 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 412 632 0.00965070222956729 0.00971010726633475 0.00970473792629892 0.00976577401388571 0.00148230187275432 0.00149807992644447 421850 423174 667 665 0 False 412 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 457 631 0.00973196166851342 0.00978516329734843 0.00971999694819562 0.00975051499198901 0.00189937555585551 0.00182772804620327 425402 426445 667 665 0 False 457 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 502 631 0.00955969714845026 0.00952084950302054 0.00959792477302205 0.00953688868543526 0.00197194098429212 0.00193115705555807 417872 414926 667 665 0 False 502 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 547 631 0.00945183164883569 0.00945811541901217 0.009399557488365 0.00950637064164187 0.00187051966267259 0.00180180056041415 413157 412192 667 665 0 False 547 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 591 631 0.00941657804652263 0.0112980781089827 0.00950637064164187 0.00965896086060884 0.00158050536644957 0.0139544564897639 411616 492379 667 665 0 False 591 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 632 637 0.00954654281922897 0.0416987536362077 0.00953688868543526 0.0416418707560845 0.0014491750008296 0.00792655677311332 417297 1817264 667 665 0 True 636 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B8_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B8_2.csv new file mode 100755 index 0000000..0993467 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B8_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 234 240 0.00782806124975965 0.715115988644075 0.00787365529869535 0.703288319218738 0.0020450081842648 0.199438346127145 342179 31165309 667 665 10 True 233 241 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 277 240 0.00685480102704427 0.00634708767799563 0.00679026474402991 0.00631723506523232 0.00161472731782802 0.00152388227175784 299636 276611 667 665 0 False 277 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 321 240 0.00633185352848867 0.00641266705330504 0.00631723506523232 0.00643930724040589 0.00130559242840217 0.00126382806409856 276777 279469 667 665 0 True 322 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 366 240 0.00611404071367841 0.00626565268745221 0.00613412680247196 0.00628671702143893 0.00121653697140262 0.00116278295981728 267256 273062 667 665 0 True 367 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 410 241 0.00615050680198925 0.00623226640646019 0.00613412680247196 0.00622568093385214 0.00138557871277541 0.00133020661852271 268850 271607 667 665 0 True 411 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 454 239 0.00623750839160415 0.00631103967288328 0.00628671702143893 0.00622568093385214 0.00146030984255655 0.00146817951598851 272653 275040 667 665 0 True 456 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 499 238 0.00657675282294765 0.00655784574735075 0.00651560234988937 0.00653086137178607 0.00156415109363226 0.00157362392418499 287482 285796 667 665 0 True 501 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 542 238 0.00656227162225708 0.00664880328539362 0.00659189745937285 0.00669871061264973 0.00149368475672823 0.00142862767283405 286849 289760 667 665 0 True 545 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 590 239 0.00767036943876425 0.00727375775212809 0.00740062561989776 0.00721751735713741 0.00244486464200089 0.00198971934617252 335286 316996 667 665 0 False 590 239 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 630 239 0.00886695585601569 0.763714367172222 0.00883497367818723 0.740566109712367 0.00197229067668179 0.156419492757931 387591 33283264 667 665 13 True 635 239 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 233 284 0.00676029575049966 0.00652071928505172 0.00675974670023652 0.00643930724040589 0.00164630657895324 0.00147468204987077 295505 284178 667 665 0 False 233 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 277 284 0.00621108534769008 0.00632423356399697 0.00617990386816205 0.00616464484626535 0.00137535994397031 0.00176660418745969 271498 275615 667 665 0 False 277 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 321 285 0.00618738467799746 0.00626679998233166 0.00614938582436866 0.00627145799954223 0.00127225595379478 0.00123877249225076 270462 273112 667 665 0 True 322 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 365 285 0.00624233545850101 0.00614493432023639 0.00619516289005875 0.00621042191195544 0.00131838149114169 0.00133082243715107 272864 267801 667 665 0 True 367 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 410 285 0.00633011486932203 0.00640993649149195 0.00631723506523232 0.0063935301747158 0.00147717325037595 0.00140428938611667 276701 279350 667 665 0 True 411 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 454 283 0.00639186014683205 0.00623194516389394 0.0063782711528191 0.00621042191195544 0.00167505576759396 0.00178279778757715 279400 271593 667 665 0 True 456 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 497 283 0.00649437240638093 0.00634789078441125 0.00653086137178607 0.00636301213092241 0.00165966112989655 0.00163873247990947 283881 276646 667 665 0 True 501 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 542 282 0.0066870890487464 0.00657025947794641 0.00669871061264973 0.00659189745937285 0.00149259627227663 0.00154950623565305 292305 286337 667 665 0 True 546 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 590 283 0.00693757035421406 0.00695914655028507 0.00691233691920348 0.00692759594110018 0.00190820369574522 0.00188588919263858 303254 303285 667 665 0 False 590 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 635 283 0.00750620341008255 0.00720746705399342 0.00738536659800107 0.00721751735713741 0.0019666068245657 0.00181639991064831 328110 314107 667 665 0 False 635 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 234 329 0.00614744127135334 0.0061206805064848 0.00621042191195544 0.00611886778057527 0.00148857814875134 0.00144223315235747 268716 266744 667 665 0 True 233 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 277 329 0.00611669445661697 0.00619534645723946 0.00611886778057527 0.00621042191195544 0.00131497014970423 0.00142991826230797 267372 269998 667 665 0 True 277 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 322 328 0.0062032613814402 0.00615344724824191 0.00614938582436866 0.00617990386816205 0.0012822624141464 0.00118451126333489 271156 268172 667 665 0 True 322 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 366 328 0.00636692411404735 0.00627455569571675 0.00636301213092241 0.00636301213092241 0.00124444907323536 0.00126764898962492 278310 273450 667 665 0 True 367 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 410 329 0.00645614478180914 0.00642076695515396 0.00651560234988937 0.0063935301747158 0.00143758781923231 0.00135842225659383 282210 279822 667 665 0 True 412 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 455 327 0.00663566134076473 0.00655371548578473 0.00665293354695964 0.00657663843747616 0.00164772570488049 0.00155640158942901 290057 285616 667 665 0 True 456 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 498 327 0.00666629377002961 0.00671500219993793 0.00662241550316625 0.00669871061264973 0.00156026317775584 0.00150780412685986 291396 292645 667 665 0 True 501 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 543 327 0.00667565050159745 0.00701492802732397 0.00679026474402991 0.00697337300679027 0.00152030128228946 0.00146066780935645 291805 305716 667 665 0 True 546 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 587 327 0.00686658273060769 0.00737708312897143 0.00683604180972 0.00735484855420768 0.00184319459578122 0.0020194254034343 300151 321499 667 665 0 True 590 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 631 328 0.00698506320197649 0.007222955534866 0.00700389105058366 0.00721751735713741 0.00192062011262601 0.00195489563274151 305330 314782 667 665 0 True 635 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 233 372 0.00599642957189293 0.00613777520018862 0.0059662775616083 0.00614938582436866 0.00159497786662844 0.00145384587192333 262115 267489 667 665 0 True 233 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 278 374 0.0061511473606296 0.00612377820265931 0.00614938582436866 0.00616464484626535 0.00149243149928888 0.00142413115364571 268878 266879 667 665 0 True 278 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 322 373 0.00629543319436642 0.0064919451294751 0.00634775310902571 0.00651560234988937 0.00136758601767389 0.00132825705104614 275185 282924 667 665 0 True 322 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 366 372 0.00670461290297859 0.00683432086740082 0.00671396963454643 0.00686655985351339 0.00132881083422212 0.00129898783907786 293071 297845 667 665 0 True 367 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 410 373 0.00666725460799012 0.00695770095873697 0.00668345159075303 0.00692759594110018 0.00147649116241307 0.0014275388743254 291438 303222 667 665 0 True 412 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 455 371 0.00674183393540126 0.00710473827048739 0.00671396963454643 0.00715648126955062 0.00165494221350079 0.00168236666456663 294698 309630 667 665 0 True 456 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 499 371 0.0067935590456088 0.0068939113634395 0.00692759594110018 0.00692759594110018 0.00171252387875991 0.00183846144109168 296959 300442 667 665 0 True 501 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 543 371 0.00671550239986438 0.0070319997751302 0.00675974670023652 0.00706492713817044 0.0015850632572549 0.00154401855547794 293547 306460 667 665 0 True 546 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 588 371 0.0069110100477342 0.00700859495958941 0.00698863202868696 0.00708018616006714 0.00191049909209643 0.00205809801988722 302093 305440 667 665 0 True 590 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 632 371 0.00672790178497384 0.0067522663376225 0.00688181887541009 0.00671396963454643 0.00187385480467586 0.00185658156079891 294089 294269 667 665 0 True 635 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 234 417 0.00609111786519192 0.0061361460414598 0.00610360875867857 0.00616464484626535 0.00147649619471529 0.00158497125168349 266254 267418 667 665 0 True 233 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 278 417 0.00618216870049754 0.00619032130566746 0.00617990386816205 0.00622568093385214 0.00149051651077849 0.00140596336600557 270234 269779 667 665 0 True 278 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 322 417 0.00654163648320038 0.00667929838328942 0.00651560234988937 0.00666819256885634 0.00137812328945118 0.00130204021291348 285947 291089 667 665 0 True 322 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 367 417 0.00689330317674763 0.00678416113527123 0.00688181887541009 0.00671396963454643 0.00135608733278462 0.00134725881575632 301319 295659 667 665 0 True 367 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 411 417 0.00673176801391019 0.00665580178415827 0.00674448767833982 0.00674448767833982 0.0014620323836929 0.00142759381256239 294258 290065 667 665 0 True 412 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 455 415 0.00674771334863582 0.00676649279412769 0.0068055237659266 0.00675974670023652 0.00160779265586476 0.00152066267924163 294955 294889 667 665 0 True 457 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 499 415 0.00687166144554182 0.00681401374803454 0.0068207827878233 0.00694285496299687 0.00165428804582943 0.00162250068019322 300373 296960 667 665 0 True 501 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 543 415 0.00665897309985428 0.00657085607128373 0.00669871061264973 0.00659189745937285 0.00170676411102178 0.00149399673946187 291076 286363 667 665 0 True 546 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 587 415 0.00639659570535172 0.00645484161307365 0.00646982528419928 0.00651560234988937 0.00184174880356431 0.00194784922613207 279607 281307 667 665 0 True 591 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 631 416 0.00616761886852408 0.00598959059355874 0.00608834973678187 0.0059662775616083 0.0018220088864165 0.00176549519875542 269598 261031 667 665 0 True 635 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 236 461 0.00621383059900583 0.00619355667722752 0.00616464484626535 0.00622568093385214 0.00146570679841956 0.00140431860620402 271618 269920 667 665 0 True 233 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 280 462 0.00629056037328097 0.00633589007997219 0.00627145799954223 0.00633249408712902 0.00148079462109975 0.00152726652352478 274972 276123 667 665 0 True 278 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 324 461 0.00634779886321431 0.00642939461264744 0.00633249408712902 0.0064087891966125 0.0015427145981567 0.00157109105780099 277474 280198 667 665 0 True 323 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 368 461 0.00673204253904176 0.0067115144235044 0.00675974670023652 0.00666819256885634 0.00144939169655145 0.00143999795026922 294270 292493 667 665 0 True 367 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 412 461 0.00674055281812058 0.00682658809991332 0.00669871061264973 0.00679026474402991 0.00171050800558101 0.00171654108878598 294642 297508 667 665 0 True 412 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 455 459 0.00681254703387606 0.00672977935798526 0.00688181887541009 0.0068207827878233 0.00190961514954522 0.00195108275879825 297789 293289 667 665 0 True 457 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 501 460 0.00647602497675401 0.00682899741916017 0.00650034332799268 0.00675974670023652 0.00179804448773749 0.00183404190844757 283079 297613 667 665 0 True 501 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 545 459 0.00622060221891801 0.00644814141097766 0.00622568093385214 0.00650034332799268 0.0016706689389112 0.00178925153402534 271914 281015 667 665 0 True 546 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 589 459 0.00619694730341398 0.00617067961733127 0.00613412680247196 0.00608834973678187 0.0018694173102769 0.0018201255883058 270880 268923 667 665 0 True 591 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 633 460 0.00589769203290321 0.00602667116406259 0.00593575951781491 0.00601205462729839 0.00189286509291819 0.00177009824873706 257799 262647 667 665 0 True 635 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 236 505 0.00629282520561646 0.00616035396341621 0.00627145799954223 0.00619516289005875 0.00140807130208188 0.00144001529042332 275071 268473 667 665 0 True 233 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 280 505 0.00614535945577223 0.00649958611337224 0.00617990386816205 0.00650034332799268 0.00142928688811441 0.00147677766748854 268625 283257 667 665 0 True 278 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 324 506 0.00645738014490123 0.00647085784959079 0.00645456626230259 0.00650034332799268 0.00149979086816871 0.0014346197162497 282264 282005 667 665 0 True 323 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 368 505 0.00647655114992286 0.00652425295328043 0.00653086137178607 0.00657663843747616 0.0014999847504027 0.00148076300929389 283102 284332 667 665 0 True 367 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 413 505 0.006633762541938 0.00669407554133675 0.00663767452506294 0.00668345159075303 0.001756739555406 0.00161981096040008 289974 291733 667 665 0 True 412 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 458 503 0.00667775519427286 0.00653171036999686 0.00668345159075303 0.00659189745937285 0.00192350517027245 0.00177071470737181 291897 284657 667 665 0 True 457 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 501 503 0.00644413430730275 0.00645849001079031 0.00650034332799268 0.00648508430609598 0.00182158652963798 0.00168297454049558 281685 281466 667 665 0 True 501 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 545 502 0.00619587207998198 0.00629456451841437 0.00616464484626535 0.00630197604333562 0.00164950467835088 0.00156946498861298 270833 274322 667 665 0 True 546 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 589 502 0.0062608659048823 0.00618821028308927 0.00634775310902571 0.00610360875867857 0.00179224306367335 0.00184983029646993 273674 269687 667 665 0 True 591 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 634 503 0.00605515507295563 0.00611990034596677 0.00604257267109178 0.00605783169298848 0.00186008402199882 0.00183192053048781 264682 266710 667 665 0 True 636 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 237 548 0.0062576631116806 0.00645883419925414 0.00622568093385214 0.00645456626230259 0.00132258539065297 0.0013316999060207 273534 281481 667 665 0 True 233 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 281 548 0.00648261357991181 0.00614213492073053 0.0063935301747158 0.00611886778057527 0.00139746002113829 0.00136678285428079 283367 267679 667 665 0 True 278 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 325 549 0.00641265542554884 0.00663092843117177 0.00646982528419928 0.00663767452506294 0.00140553558228608 0.0013839834411494 280309 288981 667 665 0 True 323 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 369 548 0.00646685126194056 0.00658404996239741 0.00650034332799268 0.00660715648126955 0.00144360974475814 0.00132452784362251 282678 286938 667 665 0 True 368 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 413 547 0.0063978996997267 0.00656291679071793 0.00646982528419928 0.00659189745937285 0.00165595970349578 0.00157727225187507 279664 286017 667 665 0 True 412 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 457 546 0.0063588027455716 0.00638572856953553 0.00631723506523232 0.00642404821850919 0.0018880550732381 0.00198332493555043 277955 278295 667 665 0 True 457 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 502 545 0.00640059919685385 0.0065416688895505 0.0063782711528191 0.00659189745937285 0.0018902204262355 0.00202831924481454 279782 285091 667 665 0 True 502 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 545 544 0.00634873682408052 0.00640566855454039 0.00634775310902571 0.00643930724040589 0.00185390596220878 0.00190510319382562 277515 279164 667 665 0 True 546 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 590 545 0.006292482049202 0.00643026655675582 0.00636301213092241 0.0064087891966125 0.00159012080849329 0.00150757196636839 275056 280236 667 665 0 True 591 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 634 546 0.00608288211124468 0.00614984474232044 0.00604257267109178 0.00617990386816205 0.00166183103426132 0.00180929856354255 265894 268015 667 665 0 True 636 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 234 589 0.00678143418563092 0.00681802928011262 0.00671396963454643 0.00679026474402991 0.00134120388764153 0.00128031968315795 296429 297135 667 665 0 False 234 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 278 589 0.00662374237463553 0.0066231497718891 0.00659189745937285 0.00660715648126955 0.0013313323247833 0.00132807856664636 289536 288642 667 665 0 False 278 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 325 591 0.00661379083861594 0.00651142619652817 0.00663767452506294 0.00651560234988937 0.00145864389051628 0.00138430143252005 289101 283773 667 665 0 True 323 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 369 591 0.00643727117901338 0.00650282148493229 0.00643930724040589 0.00651560234988937 0.00147175652993331 0.0013123138313665 281385 283398 667 665 0 True 368 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 412 588 0.00641121416860807 0.00639857827218538 0.0063935301747158 0.0063935301747158 0.00156825129959855 0.00151054283037976 280246 278855 667 665 0 False 412 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 457 588 0.00659521463804605 0.00649584593206523 0.00657663843747616 0.00648508430609598 0.001951788086499 0.00181808181629033 288289 283094 667 665 0 False 457 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 502 588 0.00652610293617211 0.00644876095021257 0.00650034332799268 0.00645456626230259 0.00188699460773447 0.00219503564492995 285268 281042 667 665 0 False 502 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 546 588 0.0064370195309761 0.00656622099997074 0.00636301213092241 0.00654612039368277 0.0018577996627974 0.0016998530465743 281374 286161 667 665 0 False 546 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 591 588 0.00665840117249684 0.00654391758751422 0.00674448767833982 0.00657663843747616 0.00158477903209526 0.00161308442967068 291051 285189 667 665 0 False 591 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 636 587 0.00652848215397909 0.00642083579284673 0.00650034332799268 0.0063935301747158 0.00150123713934322 0.00146306835025528 285372 279825 667 665 0 False 636 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 234 638 0.00902869691270181 0.735455025753902 0.00845349813076982 0.729030289158465 0.00287427071655756 0.193709546473452 394661 32051700 667 665 12 True 234 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 278 632 0.00722216140727988 0.00668774247360218 0.00708018616006714 0.00666819256885634 0.00179207336965399 0.00129135921208594 315694 291457 667 665 0 False 278 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 323 632 0.00651194201480171 0.0065468776083032 0.00657663843747616 0.00657663843747616 0.00131473361662266 0.00116753098342218 284649 285318 667 665 0 False 323 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 368 632 0.006273974479915 0.00625601541046482 0.00627145799954223 0.00622568093385214 0.00127738382775142 0.00131501025362456 274247 272642 667 665 0 False 368 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 412 632 0.00623906403401641 0.00613575596120078 0.00633249408712902 0.00616464484626535 0.00139844305416733 0.00140293975805934 272721 267401 667 665 0 False 412 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 457 631 0.00640089659907972 0.0064204916043829 0.00627145799954223 0.00636301213092241 0.00181644133133598 0.00184772015225818 279795 279810 667 665 0 False 457 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 502 631 0.00627189266433389 0.00629649197381185 0.00625619897764553 0.00627145799954223 0.00184552994479822 0.00186241122839409 274156 274406 667 665 0 False 502 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 547 631 0.00646483807764234 0.00630284798744401 0.0063782711528191 0.00627145799954223 0.00178927509078411 0.00189001298168319 282590 274683 667 665 0 False 547 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 591 631 0.00718807453677602 0.0091787032240707 0.00708018616006714 0.00688181887541009 0.00176645688482403 0.0175688849746774 314204 400015 667 665 0 False 591 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 632 637 0.00854516664762149 0.785624922916125 0.00839246204318303 0.77759975585565 0.00180733906270533 0.168581681389231 373525 34238143 667 665 16 True 636 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B8_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B8_3.csv new file mode 100755 index 0000000..56ab0b3 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B8_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 234 240 0.00105101946623392 0.072613738511993 0.000701915007248035 0.0708934157320516 0.000959285645561828 0.0223776803821033 45942 3164563 667 665 0 True 233 241 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 277 240 0.00101780192531338 0.000948675189920326 0.000854505226215 0.000778210116731518 0.000776434134873388 0.000733856812345866 44490 41344 667 665 0 False 277 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 321 240 0.00088548081189435 0.000872816052491035 0.000778210116731518 0.00080872816052491 0.000622662431907117 0.000633924197665691 38706 38038 667 665 0 True 322 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 366 240 0.000894517264142019 0.000890140205170743 0.000747692072938125 0.000823987182421607 0.000662527260386852 0.000591277374404213 39101 38793 667 665 0 True 367 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 410 241 0.000988267596574796 0.000978780207557117 0.000839246204318303 0.00080872816052491 0.000782271309347244 0.000742465352804879 43199 42656 667 665 0 True 411 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 454 239 0.000967746842989583 0.0010122353262419 0.000747692072938125 0.000900282291905089 0.000847378834623577 0.000766318214107349 42302 44114 667 665 0 True 456 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 499 238 0.00105838589059785 0.000998376004098137 0.000900282291905089 0.000839246204318303 0.000895104336351572 0.000815213135635125 46264 43510 667 665 0 True 501 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 542 238 0.000963468826355877 0.000988830510701106 0.000762951094834821 0.000839246204318303 0.000810559223303811 0.000776565766807508 42115 43094 667 665 0 True 545 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 590 239 0.00102377284692513 0.00107903083412353 0.000717174029144732 0.000778210116731518 0.00100983596890624 0.00106617503139812 44751 47025 667 665 0 False 590 239 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 630 239 0.00114337429591453 0.0783975273500758 0.000885023270008392 0.0748455024032959 0.00105015223029337 0.0193730793109289 49979 3416625 667 665 0 True 635 239 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 233 284 0.000966305586048816 0.000994612876893538 0.000762951094834821 0.000823987182421607 0.000802595374160636 0.000784167193643175 42239 43346 667 665 0 False 233 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 277 284 0.00095843586561034 0.000948468676842025 0.00080872816052491 0.000762951094834821 0.000728456942779303 0.000768897166842543 41895 41335 667 665 0 False 277 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 321 285 0.000937366061761978 0.000857970056750941 0.00080872816052491 0.000717174029144732 0.000690414448428118 0.000637660794242077 40974 37391 667 665 0 True 322 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 365 285 0.000865348968912202 0.000819443894698981 0.000686655985351339 0.000686655985351339 0.00069315993703495 0.000642241944361386 37826 35712 667 665 0 True 367 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 410 285 0.000984790278241515 0.000917721174072742 0.000839246204318303 0.000747692072938125 0.000768277000973203 0.000745727014365664 43047 39995 667 665 0 True 411 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 454 283 0.00101857974651951 0.00101854544807888 0.000747692072938125 0.000778210116731518 0.000941116835834122 0.000938533995170721 44524 44389 667 665 0 True 456 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 497 283 0.000993071786377354 0.00100259804925452 0.000778210116731518 0.000747692072938125 0.000884219767038404 0.000867263420897201 43409 43694 667 665 0 True 501 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 542 282 0.000961135362737491 0.000985755760424178 0.000762951094834821 0.000839246204318303 0.000816697369273489 0.00083441835176385 42013 42960 667 665 0 True 546 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 590 283 0.00105930097436976 0.000989335320448065 0.000778210116731518 0.00064087891966125 0.000995396330407473 0.00101281898162845 46304 43116 667 665 0 False 590 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 635 283 0.00101334089192529 0.000912260050446556 0.00064087891966125 0.000549324788281071 0.00104155553971668 0.000961640159993602 44295 39757 667 665 0 False 635 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 234 329 0.000901975196883133 0.000911181593259872 0.000701915007248035 0.000747692072938125 0.000785112786126318 0.000737185055579435 39427 39710 667 665 0 True 233 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 277 329 0.00094429782133424 0.000970473792629892 0.000823987182421607 0.000762951094834821 0.000734190598609228 0.000807776124700707 41277 42294 667 665 0 True 277 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 322 328 0.000869421091697228 0.000903127583206127 0.000686655985351339 0.000778210116731518 0.000687203714653132 0.000636151807357263 38004 39359 667 665 0 True 322 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 366 328 0.000922518827562644 0.000941676691155676 0.00080872816052491 0.000823987182421607 0.000650016238224889 0.000723647084167461 40325 41039 667 665 0 True 367 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 410 329 0.000909433129624247 0.000968225094666169 0.000701915007248035 0.000778210116731518 0.000783722169560678 0.000784354205181768 39753 42196 667 665 0 True 412 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 455 327 0.00102098184142079 0.00105849425578136 0.000793469138628214 0.000885023270008392 0.000905447315704232 0.000832493330225461 44629 46130 667 665 0 True 456 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 498 327 0.0010904138226149 0.00100147370027265 0.000885023270008392 0.000732433051041428 0.000914967242304109 0.000925954362724722 47664 43645 667 665 0 True 501 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 543 327 0.000970354831739543 0.00104117010310165 0.000793469138628214 0.000900282291905089 0.000820267843770713 0.000798008020974421 42416 45375 667 665 0 True 546 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 587 327 0.00104511717590507 0.000965333911569953 0.000686655985351339 0.000579842832074464 0.00106761351952485 0.00105138229200621 45684 42070 667 665 0 True 590 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 631 328 0.000969828658570692 0.000979353854996842 0.000579842832074464 0.000549324788281071 0.00102039395423663 0.00105887288838868 42393 42681 667 665 0 True 635 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 233 372 0.000937205922101892 0.000950717374805749 0.000793469138628214 0.00080872816052491 0.000785620534250095 0.000809171810673105 40967 41433 667 665 0 True 233 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 278 374 0.00089570687304551 0.000897827080863064 0.000747692072938125 0.000778210116731518 0.000713021503933666 0.000698959184142331 39153 39128 667 665 0 True 278 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 322 373 0.000912727431203144 0.000954365772522402 0.000747692072938125 0.000839246204318303 0.000733420941676768 0.00075201772601418 39897 41592 667 665 0 True 322 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 366 372 0.000921809637639409 0.000998146545122247 0.000778210116731518 0.000900282291905089 0.000742429196794821 0.000695197445180048 40294 43500 667 665 0 True 367 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 410 373 0.00104065614251698 0.000986008165297657 0.000839246204318303 0.000778210116731518 0.000869561035591559 0.00080008811594128 45489 42971 667 665 0 True 412 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 455 371 0.000989274188723903 0.000978114776527035 0.000671396963454643 0.000732433051041428 0.000925000020185978 0.000897936664176495 43243 42627 667 665 0 True 456 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 499 371 0.000969325362496138 0.00115110389845064 0.000656137941557946 0.000839246204318303 0.000929902321930822 0.000989800384451348 42371 50166 667 665 0 True 501 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 543 371 0.000958412988516042 0.00107379916947324 0.000701915007248035 0.000839246204318303 0.000878754600739203 0.000928558767226337 41894 46797 667 665 0 True 546 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 588 371 0.00107165460529063 0.00108869105700851 0.000793469138628214 0.000717174029144732 0.00105718470645097 0.00118235308266491 46844 47446 667 665 0 True 590 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 632 371 0.0010197007241401 0.000960744732052149 0.000549324788281071 0.000625619897764553 0.00109077640152342 0.00100087669109051 44573 41870 667 665 0 True 635 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 234 417 0.00100677516586179 0.00101212059675396 0.000854505226215 0.000839246204318303 0.000832342767417313 0.00084642383509021 44008 44109 667 665 0 True 233 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 278 417 0.000936748380215935 0.000959367978196808 0.000823987182421607 0.000793469138628214 0.000768937116024548 0.000796470727567118 40947 41810 667 665 0 True 278 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 322 417 0.000889530057585078 0.000924926185915693 0.000701915007248035 0.00080872816052491 0.000693689446894554 0.000702359680008253 38883 40309 667 665 0 True 322 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 367 417 0.000956514189689316 0.0010061776092784 0.000854505226215 0.000930800335698482 0.000711893069013118 0.000744406539661773 41811 43850 667 665 0 True 367 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 411 417 0.00102553438318607 0.000984906762213384 0.000854505226215 0.000762951094834821 0.00084237392096298 0.000820965712796038 44828 42923 667 665 0 True 412 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 455 415 0.000971201284228565 0.00105780587885369 0.000717174029144732 0.000900282291905089 0.000890310663106228 0.000838691666732615 42453 46100 667 665 0 True 457 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 499 415 0.000973488993658355 0.000906936602205904 0.000671396963454643 0.00064087891966125 0.000913423433814136 0.000839390236673809 42553 39525 667 665 0 True 501 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 543 415 0.000943588631411005 0.00106044465707643 0.000732433051041428 0.000869764248111696 0.000866527641700787 0.000876830504016209 41246 46215 667 665 0 True 546 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 587 415 0.000998974076706211 0.000906362954766178 0.000656137941557946 0.000473029678797589 0.00101573058674747 0.00101247465121924 43667 39500 667 665 0 True 591 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 631 416 0.000883078716993071 0.000960561164871437 0.000534065766384375 0.000610360875867857 0.000941305984885519 0.000934032420892438 38601 41862 667 665 0 True 635 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 236 461 0.00101185388079593 0.000902921070127826 0.000885023270008392 0.000747692072938125 0.000790649175151273 0.000751422040350472 44230 39350 667 665 0 True 233 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 280 462 0.00101736726052172 0.000929997229282866 0.000839246204318303 0.000778210116731518 0.000858332805399462 0.00084344526175286 44471 40530 667 665 0 True 278 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 324 461 0.000947523491630243 0.000917422877404085 0.000823987182421607 0.00080872816052491 0.000812045196764077 0.000787773089547414 41418 39982 667 665 0 True 323 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 368 461 0.000917188464591234 0.000976072591641613 0.000823987182421607 0.000839246204318303 0.000716586096990869 0.000771932324468812 40092 42538 667 665 0 True 367 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 412 461 0.00098561385363624 0.00101310727035029 0.000732433051041428 0.000793469138628214 0.00092393780189503 0.000889922264626027 43083 44152 667 665 0 True 412 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 455 459 0.00105831725931495 0.00104146839977031 0.000747692072938125 0.000671396963454643 0.00105953322424159 0.00111447496006802 46261 45388 667 665 0 True 457 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 501 460 0.00101803069625636 0.000953103748155006 0.000717174029144732 0.000595101853971161 0.00100296901835232 0.000953315607492053 44500 41537 667 665 0 True 501 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 545 459 0.000955164441125741 0.000928368070554046 0.000656137941557946 0.000564583810177768 0.000924305995870146 0.000969251533400543 41752 40459 667 665 0 True 546 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 589 459 0.00100167357383336 0.000964071887202557 0.000656137941557946 0.000518806744487678 0.00103377291854844 0.00104477528399169 43785 42015 667 665 0 True 591 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 633 460 0.00101135058472137 0.00103469935998155 0.000701915007248035 0.000732433051041428 0.000973158105007034 0.00100002287320064 44208 45093 667 665 0 True 635 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 236 505 0.000967197792726434 0.000991859369182856 0.00080872816052491 0.000869764248111696 0.000751577381429761 0.000773402271686712 42278 43226 667 665 0 True 233 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 280 505 0.000926202039744605 0.000882315654092889 0.000778210116731518 0.000701915007248035 0.000779207418888668 0.000832786913204323 40486 38452 667 665 0 True 278 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 324 506 0.000836661092662641 0.000878713148171413 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.000728717024158834 0.000781364023278967 36572 38295 667 665 0 True 323 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 368 505 0.000932767765808101 0.00100145075437507 0.000747692072938125 0.000869764248111696 0.000803162807519907 0.000821629943680843 40773 43644 667 665 0 True 367 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 413 505 0.0010088569814429 0.00101629675011516 0.000732433051041428 0.000717174029144732 0.000918259293437977 0.000961244110947936 44099 44291 667 665 0 True 412 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 458 503 0.00102427614299968 0.00100379123592915 0.000671396963454643 0.000671396963454643 0.00101870681786164 0.000970569110483112 44773 43746 667 665 0 True 457 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 501 503 0.00103242038856973 0.00102357059965088 0.000701915007248035 0.000762951094834821 0.000960485500373477 0.000937582242735008 45129 44608 667 665 0 True 501 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 545 502 0.0010523692147975 0.000934494625210314 0.000762951094834821 0.000717174029144732 0.0009315632693428 0.000805064324569301 46001 40726 667 665 0 True 546 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 589 502 0.00101844248395372 0.000936858052661982 0.000686655985351339 0.000564583810177768 0.00100196678381432 0.000971303746225717 44518 40829 667 665 0 True 591 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 634 503 0.000937754972365042 0.00103552541229476 0.000518806744487678 0.000671396963454643 0.00100936939932936 0.0010185468419731 40991 45129 667 665 0 True 636 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 237 548 0.000868208605699439 0.000965792829521733 0.000717174029144732 0.00080872816052491 0.0006741011709207 0.000742432265575861 37951 42090 667 665 0 True 233 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 281 548 0.00090755720789182 0.00101186819188048 0.000717174029144732 0.000869764248111696 0.000735207456263805 0.000740652460210884 39671 44098 667 665 0 True 278 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 325 549 0.000834556399987235 0.000901360749091773 0.000717174029144732 0.000747692072938125 0.000706305611727352 0.000711729016734153 36480 39282 667 665 0 True 323 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 369 548 0.000900831342168238 0.000966366476961458 0.000778210116731518 0.000839246204318303 0.000697170660040277 0.000738525001401269 39377 42115 667 665 0 True 368 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 413 547 0.000970766619436905 0.00103277190458407 0.000671396963454643 0.000747692072938125 0.000966544530582272 0.000927982574697252 42434 45009 667 665 0 True 412 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 457 546 0.000956605698066508 0.00100725606646509 0.000518806744487678 0.000610360875867857 0.00106243077007032 0.00111565864421602 41815 43897 667 665 0 True 457 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 502 545 0.000945098519634667 0.00102327230298222 0.000503547722590982 0.000686655985351339 0.00102282698419508 0.00111578521702923 41312 44595 667 665 0 True 502 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 545 544 0.00105120248298831 0.000960813569744916 0.000701915007248035 0.00064087891966125 0.0010075987906009 0.00101557705091403 45950 41873 667 665 0 True 546 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 590 545 0.00102569452284615 0.000944636711944659 0.000778210116731518 0.000747692072938125 0.000875239332681207 0.000763170476452354 44835 41168 667 665 0 True 591 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 634 546 0.000905521146499307 0.000917445823301674 0.000534065766384375 0.000564583810177768 0.000923176426371389 0.000946992395937355 39582 39983 667 665 0 True 636 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 234 589 0.000923022123637197 0.00101631969601275 0.000793469138628214 0.000930800335698482 0.00069560506433122 0.000672398271038637 40347 44292 667 665 0 False 234 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 278 589 0.000984058211223983 0.000996127306134414 0.000869764248111696 0.000869764248111696 0.000734163157980135 0.000723197035956094 43015 43412 667 665 0 False 278 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 325 591 0.000933797235051506 0.000927748531319142 0.000793469138628214 0.000762951094834821 0.00073638092823217 0.000764973252814976 40818 40432 667 665 0 True 323 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 369 591 0.00101388994218844 0.000945003846306083 0.000900282291905089 0.000839246204318303 0.000707726782344131 0.000725190031473273 44319 41184 667 665 0 True 368 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 412 588 0.000988931032309435 0.000915564259699374 0.000747692072938125 0.000656137941557946 0.000869939183818497 0.000828702880064447 43228 39901 667 665 0 False 412 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 457 588 0.00109647625260384 0.00105376740087802 0.000747692072938125 0.000686655985351339 0.00107903716902655 0.00102156539096257 47929 45924 667 665 0 False 457 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 502 588 0.000897102375797681 0.00098850926813486 0.000473029678797589 0.000488288700694286 0.000983868358765609 0.00114065521777978 39214 43080 667 665 0 False 502 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 546 588 0.00096408650790192 0.00100778382210963 0.000579842832074464 0.000656137941557946 0.00104167347176718 0.00095851519283155 42142 43920 667 665 0 False 546 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 591 588 0.000981221451531044 0.000929928391590099 0.000717174029144732 0.000671396963454643 0.000882441337582841 0.000879783179693314 42891 40527 667 665 0 False 591 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 636 587 0.000955255949502932 0.00103233593252988 0.000701915007248035 0.000854505226215 0.000803667868379393 0.000817909269909307 41756 44990 667 665 0 False 636 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 234 638 0.00111560150343688 0.0754472585675679 0.000915541313801785 0.0728160524910353 0.000807441442079869 0.0226810060960095 48765 3288050 667 665 0 True 234 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 278 632 0.00100789614348239 0.00105115156855288 0.000885023270008392 0.000946059357595178 0.000718918880205965 0.00074153726882902 44057 45810 667 665 0 False 278 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 323 632 0.000988336227857689 0.000918019470741399 0.000869764248111696 0.000823987182421607 0.000722973748887396 0.000664251041843545 43202 40008 667 665 0 False 323 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 368 632 0.000918995755040768 0.000937110457535461 0.000823987182421607 0.000854505226215 0.000646298793684437 0.000651206392751694 40171 40840 667 665 0 False 368 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 412 632 0.000934163268560272 0.000939932802938911 0.000778210116731518 0.000747692072938125 0.000790743535529797 0.000757599191979298 40834 40963 667 665 0 False 412 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 457 631 0.000996000054447484 0.000914325181229567 0.000686655985351339 0.000656137941557946 0.000977939843400567 0.000920117674427357 43537 39847 667 665 0 False 457 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 502 631 0.00107428547113488 0.00097591197035849 0.000869764248111696 0.000549324788281071 0.000979455052259126 0.00102795858088515 46959 42531 667 665 0 False 502 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 547 631 0.000974541339996058 0.000917376985608907 0.000595101853971161 0.000579842832074464 0.00102175404437246 0.000952015493699888 42599 39980 667 665 0 False 547 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 591 631 0.0010534673153238 0.00127533298799757 0.000839246204318303 0.000946059357595178 0.000839684495380866 0.00195127772457216 46049 55580 667 665 0 False 591 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 632 637 0.00110720560982956 0.0816404940022292 0.000976577401388571 0.0782024872205692 0.00077437014045148 0.0217914675077105 48398 3557956 667 665 0 True 636 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B9_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B9_1.csv new file mode 100755 index 0000000..69aadb4 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B9_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 245 271 0.00971995119400703 0.0418306466555494 0.00978103303578241 0.0411230640115969 0.00158187899347338 0.00703191024190806 424877 1823012 667 665 0 True 244 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 288 270 0.00957289723186015 0.00964617999565175 0.00956740672922866 0.00964370183871214 0.00148571434634742 0.00134827547276857 418449 420388 667 665 0 False 288 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 333 272 0.00967909270359098 0.06034185945523 0.00973525597009232 0.0587014572365911 0.00145028672943035 0.00853224685137293 423091 2629745 667 665 0 True 333 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 377 271 0.00983660149783199 0.0940559914320018 0.0097962920576791 0.0865491721980621 0.0014066779797833 0.0311049100574494 429976 4099033 667 665 0 True 378 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 421 272 0.0100844519374554 0.077626201002621 0.0100556954299229 0.0767986572060731 0.00161578068911203 0.0161232007266172 440810 3383010 667 665 0 True 422 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 465 271 0.00989260462467324 0.0618194605304747 0.00994888227664607 0.0648966201266499 0.00179502612307413 0.0159039696127534 432424 2694140 667 665 0 True 467 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 509 270 0.00971574180865621 0.0789229884048643 0.00971999694819562 0.0765239948119326 0.00167558992918337 0.019747521409279 424693 3439525 667 665 0 True 512 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 554 270 0.00980134789551894 0.0661204166286625 0.0098115510795758 0.0632791638056001 0.00171293058069775 0.015651990235593 428435 2881579 667 665 0 True 556 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 601 269 0.00961505971665117 0.00942080538953242 0.00961318379491875 0.00953688868543526 0.00182864153189914 0.00196026571360821 420292 410566 667 665 0 False 601 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 642 269 0.00973301401485112 0.0418786494733056 0.00970473792629892 0.0414129854276341 0.0017726474509246 0.0079969161943117 425448 1825104 667 665 0 True 646 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 244 314 0.00954677159017196 0.00973658683215248 0.00958266575112535 0.00973525597009232 0.00156365637116952 0.00160002535722101 417307 424328 667 665 0 False 244 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 288 314 0.00979981513020098 0.00950747204472614 0.00984206912336919 0.00950637064164187 0.00141444445084301 0.00133009677366217 428368 414343 667 665 0 False 288 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 332 315 0.00987048247448718 0.092867325099198 0.00984206912336919 0.0899977111467155 0.00140708092859578 0.0190017395347586 431457 4047230 667 665 0 True 333 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 375 315 0.0097767321420544 0.0479430895847997 0.0097962920576791 0.0473334859235523 0.00138940085764581 0.00690558606898005 427359 2089397 667 665 0 True 378 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 421 315 0.0100364100394298 0.0758258199859915 0.0100862134737163 0.0746013580529488 0.00175741547712365 0.0123252518745533 438710 3304548 667 665 0 True 422 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 465 314 0.010071137468574 0.0459164849638401 0.0100556954299229 0.0445258258945602 0.00186720050345878 0.0102838453151642 440228 2001076 667 665 0 True 467 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 510 313 0.010329785896706 0.0428560529270074 0.0098268101014725 0.0437018387121385 0.00306736289802565 0.00809837701290275 451534 1867700 667 665 0 True 512 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 553 313 0.0102750867642398 0.0489203783090136 0.0100556954299229 0.0495002670328832 0.00248209262378157 0.0102263772746831 449143 2131988 667 665 0 True 557 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 601 313 0.0097289190149718 0.00959269310837175 0.00976577401388571 0.00965896086060884 0.00215434036786246 0.00213384728542969 425269 418057 667 665 0 False 601 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 646 313 0.00975637152812928 0.00965145755209723 0.00973525597009232 0.00970473792629892 0.001921529056449 0.00185658024237287 426469 420618 667 665 0 False 646 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 244 360 0.00957742689653113 0.048452373781788 0.00961318379491875 0.0468299382009613 0.00153188817942319 0.00766741871903688 418647 2111592 667 665 0 True 244 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 288 360 0.00968339359731899 0.0584351242032754 0.00964370183871214 0.0608529793240253 0.00146036501970224 0.0130266796877795 423279 2546648 667 665 0 True 288 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 333 357 0.00961421326416215 0.0322670489453205 0.00967421988250553 0.0352635996032654 0.00137691090114466 0.012343788292682 420255 1406223 667 665 0 False 333 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 377 359 0.00974095236657249 0.0337887749816289 0.00971999694819562 0.033829251544976 0.00136023698907362 0.00396267083454898 425795 1472541 667 665 0 True 378 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 421 359 0.00992692026612009 0.0706135905109535 0.00990310521095598 0.0666819256885634 0.00170172083661805 0.0123529230817752 433924 3077395 667 665 0 True 423 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 465 357 0.0101118129422357 0.0334808639818819 0.0100709544518196 0.0334172579537652 0.00194612242218273 0.00582650990012041 442006 1459122 667 665 0 True 467 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 508 357 0.0101871014595701 0.0278081332881299 0.0101319905394064 0.0281071183337148 0.00193151602881895 0.0035308522373106 445297 1211900 667 665 0 True 512 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 553 357 0.00978917728135246 0.0483295443919939 0.0098268101014725 0.0482490272373541 0.0016861415089929 0.00669733356276773 427903 2106239 667 665 0 True 557 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 597 357 0.00989489233410303 0.0555547256789261 0.00985732814526589 0.0547341115434501 0.00209309709824261 0.00979156753944739 432524 2421118 667 665 0 True 601 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 642 358 0.00975326024330476 0.0618324249626125 0.00978103303578241 0.0612497138933394 0.0019697345258994 0.015935448465228 426333 2694705 667 665 0 True 646 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 244 402 0.00977712105265747 0.0461558565674888 0.00976577401388571 0.0478217746242466 0.00160693871421389 0.0109794812666738 427376 2011508 667 665 0 True 244 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 287 403 0.00971770923876583 0.0316426222342306 0.00962844281681544 0.0315098802166781 0.00152759038690759 0.00358225687776938 424779 1379010 667 665 0 True 289 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 332 403 0.00997061551622907 0.0791402401632371 0.00991836423285267 0.074692912184329 0.00134509045159436 0.0157953007112509 435834 3448993 667 665 0 True 333 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 376 403 0.0100571138097694 0.0638500347917172 0.0100404364080262 0.0634622720683604 0.00149184711346244 0.0147435716302148 439615 2782634 667 665 0 True 378 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 421 403 0.0101574984995486 0.0437069097555057 0.0101167315175097 0.0440527962157626 0.00157494950913907 0.00686813869534222 444003 1904781 667 665 0 True 423 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 465 402 0.0101625085831998 0.0523623547309565 0.01025406271458 0.0521400778210117 0.00168795205143347 0.00872329374063979 444222 2281992 667 665 0 True 467 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 508 401 0.0100300730843093 0.0414223473538504 0.0101625085831998 0.0420233463035019 0.00180676980539069 0.00535051090738968 438433 1805218 667 665 0 True 512 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 553 400 0.00998097883994602 0.0532639678849217 0.0100099183642329 0.0517586022735943 0.00180146643881729 0.00878871617862137 436287 2321285 667 665 0 True 557 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 597 401 0.00978252004691177 0.0432324115392624 0.0098115510795758 0.0436102845807584 0.00201522205976098 0.00636137057033578 427612 1884102 667 665 0 True 601 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 641 401 0.00981326686164814 0.0871875959066813 0.00987258716716258 0.0838635843442435 0.00192922049590373 0.0153428257458497 428956 3799703 667 665 0 True 646 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 244 446 0.00978714121995994 0.0461408728963631 0.0098115510795758 0.0462043183031968 0.00156594787911359 0.00638044939012961 427814 2010855 667 665 0 True 244 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 289 447 0.0101642472423665 0.0554653743537145 0.0101625085831998 0.0530708781567102 0.00150371729261079 0.0110689290210979 444298 2417224 667 665 0 True 289 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 333 447 0.0100570909326751 0.0341018029165383 0.010101472495613 0.0345159075303273 0.00151582235472585 0.00334197820497636 439614 1486183 667 665 0 True 333 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 376 446 0.0100944263505693 0.0563654501325412 0.0100099183642329 0.0529640650034333 0.00157458626403128 0.0130065472656672 441246 2456450 667 665 0 True 378 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 421 447 0.010321870422079 0.0934323907732251 0.0102845807583734 0.0918898298619059 0.00177890901214384 0.0184684682004632 451188 4071856 667 665 0 True 423 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 465 446 0.0102763678815204 0.0624468931541488 0.0102235446707866 0.0596780346379797 0.0019056914783216 0.0143213256249143 449199 2721484 667 665 0 True 468 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 509 445 0.0102300417655672 0.0515437827803659 0.0101319905394064 0.0501411459525444 0.00238492392920751 0.00752606610693002 447174 2246318 667 665 0 True 512 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 554 445 0.00995512772338939 0.0333435786766068 0.00994888227664607 0.0334477759975586 0.00196345106546856 0.00354788869600599 435157 1453139 667 665 0 True 557 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 598 445 0.00981514278338057 0.0399819186326999 0.0098268101014725 0.0399938963912413 0.0019892933570985 0.00374102040249967 429038 1742443 667 665 0 True 602 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 642 445 0.00976881666742733 0.0809847002491351 0.0098268101014725 0.0820782787823301 0.00198651904514352 0.0163484549596995 427013 3529376 667 665 0 True 646 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 246 491 0.0099191420540588 0.0532004765862929 0.00987258716716258 0.0530098420691234 0.00153836804490736 0.0116869784869538 433584 2318518 667 665 0 True 244 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 290 491 0.01020046168264 0.0538937180442523 0.0102388036926833 0.0529488059815366 0.00168781996226947 0.00508167292468876 445881 2348730 667 665 0 True 289 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 334 491 0.0103449076560369 0.0688539843543397 0.0103303578240635 0.0653543907835508 0.00161409978568806 0.0139042277328376 452195 3000710 667 665 0 True 334 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 378 491 0.010485373015026 0.0849171452320433 0.0104219119554437 0.07861448081178 0.00166003298755568 0.0164257004615691 458335 3700755 667 665 0 True 378 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 422 491 0.0104432562844236 0.0948161660732284 0.0104676890211337 0.0897840848401617 0.00203137591355682 0.0257646653431632 456494 4132162 667 665 0 True 423 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 466 489 0.0102793647808735 0.04473263726953 0.0102235446707866 0.0450446326390478 0.00200977806173147 0.00621780692758418 449330 1949483 667 665 0 True 468 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 512 489 0.0101479816283207 0.044119935912108 0.0101319905394064 0.044937819485771 0.0017724846698803 0.00619147291595995 443587 1922781 667 665 0 True 512 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 554 488 0.010208217017607 0.0994290028114461 0.0101777676050965 0.0985427634088655 0.00192894294486025 0.016998215725315 446220 4333193 667 665 0 True 557 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 599 489 0.0099386790925892 0.064818168102793 0.00991836423285267 0.0658274204623484 0.00191289948366716 0.015115565587039 434438 2824826 667 665 0 True 602 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 643 490 0.00982260071612168 0.0750368023514956 0.0098115510795758 0.0721599145494774 0.00190853791557069 0.0105521457655359 429364 3270162 667 665 0 True 646 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 246 536 0.00964994728545546 0.047617349622626 0.00976577401388571 0.0497901884489204 0.00151200411877459 0.00776491111839735 421817 2075201 667 665 0 True 244 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 289 535 0.0099398687014927 0.114480915036504 0.0101167315175097 0.0992904554818036 0.00162308866017625 0.0574717641607697 434490 4989167 667 665 0 True 289 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 334 535 0.0100461556816007 0.0573437714221466 0.0100404364080262 0.0585488670176242 0.00155783351923719 0.0105287184180777 439136 2499086 667 665 0 True 334 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 378 534 0.0104489755579981 0.0578118906788601 0.010406652933547 0.0568093385214008 0.00165729276353233 0.00489860692828422 456744 2519487 667 665 0 True 378 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 423 534 0.0106531078704182 0.0558474923862644 0.0106507972838941 0.0553749904631113 0.00177324936479875 0.00574480312784431 465667 2433877 667 665 0 True 423 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 467 532 0.0105752342414282 0.0653564100225386 0.0106813153276875 0.0634622720683604 0.00193876342694623 0.0115506427976077 462263 2848283 667 665 0 True 468 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 512 531 0.0103430317343045 0.0744000078016052 0.0103150988021668 0.0716868848706798 0.00193065949039275 0.0153495078729116 452113 3242410 667 665 0 True 512 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 555 531 0.0102541313458629 0.0601500317513858 0.0102235446707866 0.0593575951781491 0.00184094687282427 0.012536748902906 448227 2621385 667 665 0 True 557 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 599 530 0.0100323836708334 0.0515131729529821 0.0100099183642329 0.0486915388723583 0.00181475472288094 0.00906194558971965 438534 2244984 667 665 0 True 602 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 643 531 0.00995515060048369 0.0654457154559551 0.00990310521095598 0.0643320363164721 0.00197664199699298 0.011097462340669 435158 2852175 667 665 0 True 647 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 246 576 0.00959431019212298 0.0432306905969433 0.00953688868543526 0.0436102845807584 0.00141463004668437 0.00674255080511153 419385 1884027 667 665 0 True 244 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 291 577 0.0099268058806486 0.053440995484821 0.00996414129854276 0.0542305638208591 0.00146447462037303 0.00918275972743426 433919 2329000 667 665 0 True 289 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 335 576 0.00989123199901537 0.0450164780227061 0.00990310521095598 0.0448615243762875 0.00136879281120875 0.00620067714536807 432364 1961853 667 665 0 True 334 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 379 576 0.0101333860421586 0.0528798994510768 0.0101625085831998 0.0506599526970321 0.00149252427467601 0.00754065187626638 442949 2304547 667 665 0 True 379 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 423 575 0.0106813153276875 0.0911636610409062 0.0105897611963073 0.0861676966506447 0.00229461958952713 0.0176107748475725 466900 3972983 667 665 0 True 423 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 467 574 0.010277946401027 0.0639635481470901 0.0103608758678569 0.0612649729152361 0.0021065926226464 0.00956013522639338 449268 2787581 667 665 0 True 468 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 511 573 0.0101985857609076 0.0584902631951818 0.0100709544518196 0.0570840009155413 0.00219940922478954 0.00732410709771118 445799 2549051 667 665 0 True 513 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 555 572 0.0100170560176538 0.0390730545750965 0.0100099183642329 0.0397955291065843 0.00184365504487607 0.00681105700229815 437864 1702834 667 665 0 True 557 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 599 573 0.00972162122189077 0.0504903366220541 0.00964370183871214 0.0480048828870069 0.00174208378112122 0.00873135932865158 424950 2200408 667 665 0 True 602 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 643 573 0.00986858367566045 0.0543065606336739 0.00991836423285267 0.0531166552224002 0.00180957163362939 0.00742970409902455 431374 2366722 667 665 0 True 647 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 245 619 0.00938482463963715 0.00929932980769617 0.00933852140077821 0.00933852140077821 0.00127905661342073 0.00135381761366241 410228 405272 667 665 0 False 245 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 289 619 0.00966769991063063 0.0093767722120591 0.00970473792629892 0.00930800335698482 0.00136999959531313 0.00141071538229626 422593 408647 667 665 0 False 289 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 335 618 0.00967765144665022 0.0700127521825851 0.00968947890440223 0.068055237659266 0.00141533188308176 0.00870002075415887 423028 3051210 667 665 0 True 334 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 379 618 0.00980525987864388 0.0825398584582307 0.0098268101014725 0.0776531624322881 0.00146854441242944 0.0208435681999875 428606 3597151 667 665 0 True 379 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 423 618 0.0100184743975003 0.00999635733875774 0.0100099183642329 0.00999465934233616 0.00174867937494522 0.00178316744638826 437926 435649 667 665 0 False 423 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 468 618 0.0098746232285551 0.0099212324700513 0.00991836423285267 0.0100251773861295 0.00197332734251704 0.00200754434451601 431638 432375 667 665 0 False 468 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 513 618 0.00975426683545387 0.00949136402461865 0.00975051499198901 0.009399557488365 0.00198284942373552 0.00192464045954382 426377 413641 667 665 0 False 513 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 557 618 0.00957406396366934 0.00957988929751708 0.00955214770733196 0.00961318379491875 0.00189580682348766 0.00201058733237658 418500 417499 667 665 0 False 557 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 602 618 0.00951989100437193 0.00942156260415286 0.00947585259784848 0.00933852140077821 0.00159450545952864 0.00150166655654779 416132 410599 667 665 0 False 602 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 647 617 0.00945663583863825 0.00952277695841802 0.0093842984664683 0.00941481651026169 0.00150633788710513 0.0015266328691687 413367 415010 667 665 0 False 647 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 246 668 0.00925991570477064 0.039457650764586 0.00930800335698482 0.0393377584496834 0.00129086917221821 0.00811000800802644 404768 1719595 667 665 0 True 245 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 289 662 0.00946079946980046 0.00925453941560241 0.00952162966353857 0.00921644922560464 0.00127463181655732 0.00126814007764353 413549 403320 667 665 0 False 289 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 334 662 0.00932371992076747 0.00942885939958617 0.00935378042267491 0.00943007553215839 0.00132914589496402 0.00137429125533463 407557 410917 667 665 0 False 334 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 379 662 0.00955475569608192 0.0094294330470259 0.00955214770733196 0.00941481651026169 0.00143551291961453 0.00125820280496128 417656 410942 667 665 0 False 379 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 423 662 0.00952956801525994 0.0095247044138155 0.00953688868543526 0.00959792477302205 0.00149805563398704 0.00150829065609474 416555 415094 667 665 0 False 423 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 468 661 0.00945988438602855 0.00948184147711921 0.009399557488365 0.00952162966353857 0.00172515462704218 0.00150216597015413 413509 413226 667 665 0 False 468 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 513 661 0.00946045631338599 0.00959985222841953 0.00949111161974517 0.00949111161974517 0.00180954798871244 0.0016924008453144 413534 418369 667 665 0 False 513 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 558 661 0.00958312329301131 0.00956570873280707 0.00964370183871214 0.00961318379491875 0.00159702814958264 0.00172547876260114 418896 416881 667 665 0 False 558 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 602 661 0.00960872276153066 0.00921376455558672 0.00968947890440223 0.00923170824750134 0.0013547591500139 0.00130627413503043 420015 401543 667 665 0 False 602 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 643 666 0.00952943075269415 0.0419983123292323 0.00959792477302205 0.0414892805371176 0.00141240643275338 0.0080529109694284 416549 1830319 667 665 0 True 647 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B9_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B9_2.csv new file mode 100755 index 0000000..d50683a --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B9_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 245 271 0.00817130917260527 0.787592969606438 0.00814831769283589 0.77778286411841 0.00173830642205172 0.148876338709334 357183 34323912 667 665 15 True 244 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 288 270 0.00655973226479001 0.00639694911345656 0.00645456626230259 0.0063782711528191 0.0016216811480269 0.00133460512237774 286738 278784 667 665 0 False 288 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 333 272 0.00613392090862328 0.00609048370525765 0.00614938582436866 0.00602731364919509 0.00120433367672133 0.00127569616844074 268125 265428 667 665 0 True 333 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 377 271 0.0061804529184252 0.00651624483502187 0.00616464484626535 0.00648508430609598 0.00121576037085458 0.00129575203636841 270159 283983 667 665 0 True 378 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 421 272 0.00641029908483616 0.00648262909505395 0.0064087891966125 0.00643930724040589 0.00136812808319015 0.00145286906817826 280206 282518 667 665 0 True 422 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 465 271 0.00657961245973488 0.00651743802169649 0.00662241550316625 0.00645456626230259 0.00165854091533725 0.00167882554750026 287607 284035 667 665 0 True 467 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 509 270 0.0065435352820271 0.00671665430456434 0.00656137941557946 0.00668345159075303 0.00156803144019182 0.00158109555855191 286030 292717 667 665 0 True 512 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 554 270 0.00678653577765935 0.00713323707529295 0.00679026474402991 0.00718699931334401 0.00159206602876149 0.00147374671945697 296652 310872 667 665 0 True 556 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 601 269 0.00807794775077556 0.00747854988811007 0.00793469138628214 0.00743114366369116 0.0022484924403613 0.0020170629397808 353102 325921 667 665 0 False 601 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 642 269 0.00935231628863984 0.790678779806004 0.0093690394445716 0.788067444876783 0.00203916360922454 0.165568760140528 408807 34458394 667 665 17 True 646 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 244 314 0.00667224181454706 0.00645752628309157 0.00656137941557946 0.00643930724040589 0.00162586961630429 0.00141584242277087 291656 281424 667 665 0 False 244 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 288 314 0.00609274213888707 0.0061118922277082 0.0059662775616083 0.00614938582436866 0.00124013540715847 0.00132522274447157 266325 266361 667 665 0 False 288 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 332 315 0.00618434202445584 0.00593458927703787 0.00619516289005875 0.005981536583505 0.00125734363392116 0.0012601334550125 270329 258634 667 665 0 True 333 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 375 315 0.0062815467981276 0.00634816613518231 0.00628671702143893 0.00636301213092241 0.00126386416716136 0.00125582554049456 274578 276658 667 665 0 True 378 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 421 315 0.00644399704473696 0.00651780515605792 0.00645456626230259 0.00650034332799268 0.00158503944161371 0.00158466170653667 281679 284051 667 665 0 True 422 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 465 314 0.00662916424598413 0.00669914658470392 0.00668345159075303 0.00674448767833982 0.00162228250351687 0.0016202900876943 289773 291954 667 665 0 True 467 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 510 313 0.00695786233685629 0.00671809989611245 0.00677500572213321 0.00669871061264973 0.00216120568513301 0.00156747277572196 304141 292780 667 665 0 True 512 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 553 313 0.00720678799991169 0.0070942749411868 0.00712596322575723 0.00712596322575723 0.00182433108643109 0.00139746920374156 315022 309174 667 665 0 True 557 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 601 313 0.00732314090151079 0.00714599499435244 0.00738536659800107 0.00729381246662089 0.00196156991741986 0.00204021146726105 320108 311428 667 665 0 False 601 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 646 313 0.00760919608861168 0.00746980750112865 0.00758373388265812 0.00743114366369116 0.00198864201885921 0.00186156413521875 332612 325540 667 665 0 False 646 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 244 360 0.00600418490685991 0.00604287096776044 0.00601205462729839 0.00601205462729839 0.00152535310749741 0.0014322035458083 262454 263353 667 665 0 True 244 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 288 360 0.00594930275763926 0.00579094795813062 0.00592050049591821 0.00584420538643473 0.00136469414609995 0.00137466539047718 260055 252374 667 665 0 True 288 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 333 357 0.00615203956730721 0.00628742834426419 0.00617990386816205 0.00630197604333562 0.00135683256631119 0.0012765995963808 268917 274011 667 665 0 False 333 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 377 359 0.00644212112300453 0.00653909894902053 0.00646982528419928 0.00654612039368277 0.00133818855466171 0.00123360460811577 281597 284979 667 665 0 True 378 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 421 359 0.00674023253880041 0.00701010938883028 0.00669871061264973 0.00691233691920348 0.00143695418225564 0.0017808793186077 294628 305506 667 665 0 True 423 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 465 357 0.00679353616851451 0.00685132377751428 0.0068055237659266 0.00683604180972 0.00160890881820173 0.00160039754831867 296958 298586 667 665 0 True 467 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 508 357 0.00686720041215373 0.00680795603107104 0.0068207827878233 0.0068207827878233 0.00176347956021626 0.00171677690451555 300178 296696 667 665 0 True 512 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 553 357 0.00679731088907366 0.00682539491323869 0.0068207827878233 0.0068055237659266 0.00167512982772767 0.0016467399493405 297123 297456 667 665 0 True 557 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 597 357 0.00692318066190068 0.00695040416330366 0.00695811398489357 0.00701915007248035 0.00197231875604538 0.00211021955897661 302625 302904 667 665 0 True 601 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 642 358 0.00663659930163094 0.00676029740177865 0.00656137941557946 0.00683604180972 0.00188842947921739 0.00181396945329493 290098 294619 667 665 0 True 646 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 244 402 0.00590345706066628 0.00724477708347316 0.0059662775616083 0.00621042191195544 0.00148527928355498 0.00443935336067496 258051 315733 667 665 0 True 244 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 287 403 0.00608054864762629 0.00612398471573762 0.00613412680247196 0.00608834973678187 0.00144939655537588 0.00147166147405259 265792 266888 667 665 0 True 289 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 332 403 0.00640702766035156 0.00654570736752616 0.00643930724040589 0.00651560234988937 0.00127170287811332 0.00128476262184396 280063 285267 667 665 0 True 333 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 376 403 0.00661651321283739 0.00684577087029774 0.00665293354695964 0.00686655985351339 0.00132286966808836 0.00139084489228431 289220 298344 667 665 0 True 378 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 421 403 0.00672437871245197 0.00693996377990066 0.00675974670023652 0.00691233691920348 0.00148491232900469 0.00148415682488073 293935 302449 667 665 0 True 423 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 465 402 0.00690744122102373 0.00701745207605877 0.00686655985351339 0.00708018616006714 0.00166337193853891 0.00151897651824902 301937 305826 667 665 0 True 467 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 508 401 0.00692931172317252 0.00681408258572731 0.00695811398489357 0.00683604180972 0.00168539112445252 0.00170873567200927 302893 296963 667 665 0 True 512 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 553 400 0.00674295491302186 0.00697206509062769 0.00674448767833982 0.00704966811627375 0.00163980396296263 0.0014742728908321 294747 303848 667 665 0 True 557 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 597 401 0.00664327941316593 0.00667737092789194 0.00662241550316625 0.00671396963454643 0.00193482547695286 0.00195473540432811 290390 291005 667 665 0 True 601 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 641 401 0.00619523152134164 0.0061346775040141 0.00617990386816205 0.00619516289005875 0.00180666389021186 0.00177001935424387 270805 267354 667 665 0 True 646 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 244 446 0.00626333663106648 0.00627010419158448 0.00636301213092241 0.00634775310902571 0.00152638940051324 0.00153861538178327 273782 273256 667 665 0 True 244 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 289 447 0.00626390855842392 0.00639426444343865 0.00633249408712902 0.0063935301747158 0.00146795753081856 0.00149075272687266 273807 278667 667 665 0 True 289 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 333 447 0.00658741354889047 0.00644983940739925 0.00657663843747616 0.00643930724040589 0.00139110921238124 0.00143402729082541 287948 281089 667 665 0 True 333 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 376 446 0.00661047365994274 0.00681573469035372 0.00663767452506294 0.00689707789730678 0.0013686189108033 0.00132228524072866 288956 297035 667 665 0 True 378 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 421 447 0.00680808600048797 0.00687465975536231 0.0068055237659266 0.00692759594110018 0.00164452894600505 0.00173190498637955 297594 299603 667 665 0 True 423 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 465 446 0.00681176921266993 0.0069158476415346 0.00688181887541009 0.00691233691920348 0.00169570642391837 0.00188219763837248 297755 301398 667 665 0 True 468 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 509 445 0.00664375983214618 0.0068849165715846 0.00665293354695964 0.00679026474402991 0.00170149923852098 0.0017665824335719 290411 300050 667 665 0 True 512 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 554 445 0.00657208589571088 0.00647572237987966 0.00654612039368277 0.00645456626230259 0.00177200535538411 0.00165127693041084 287278 282217 667 665 0 True 557 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 598 445 0.0061912966611224 0.00621182161170837 0.00616464484626535 0.00617990386816205 0.00181569106558728 0.00183305733886536 270633 270716 667 665 0 True 602 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 642 445 0.00601315272782469 0.00581761109112906 0.00601205462729839 0.0059510185397116 0.00182331429773135 0.00191966014094424 262846 253536 667 665 0 True 646 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 246 491 0.00642146310685353 0.00647097257907873 0.0063782711528191 0.00651560234988937 0.00145881594434934 0.0013044877527788 280694 282010 667 665 0 True 244 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 290 491 0.00630197604333562 0.00650348691596237 0.0063782711528191 0.00646982528419928 0.00142673778476799 0.001616097697056 275471 283427 667 665 0 True 289 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 334 491 0.00644493500560317 0.00654887390139345 0.00648508430609598 0.00651560234988937 0.00148551363405101 0.00157109874457826 281720 285405 667 665 0 True 334 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 378 491 0.00688550208759205 0.00691607710051049 0.00685130083161669 0.00697337300679027 0.00150886592831473 0.00158360354177936 300978 301408 667 665 0 True 378 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 422 491 0.00689330317674763 0.00721552106404716 0.00691233691920348 0.00718699931334401 0.00183731595696413 0.00177709564836446 301319 314458 667 665 0 True 423 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 466 489 0.00688449549544294 0.00711338887387845 0.00689707789730678 0.00709544518196384 0.0019268828954741 0.00178304203558864 300934 310007 667 665 0 True 468 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 512 489 0.0066620386304902 0.00638712826928847 0.00659189745937285 0.00645456626230259 0.0017835149235985 0.00167803530018736 291210 278356 667 665 0 True 512 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 554 488 0.0063826178007357 0.00641514521024466 0.0064087891966125 0.00636301213092241 0.00177669364789076 0.00175434097584318 278996 279577 667 665 0 True 557 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 599 489 0.0061053931720338 0.00595046783816947 0.00605783169298848 0.0059662775616083 0.00177361363400665 0.00185867268538392 266878 259326 667 665 0 True 602 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 643 490 0.00601219188986418 0.00607969913339081 0.00604257267109178 0.00607309071488518 0.00175924298930131 0.00183132538600906 262804 264958 667 665 0 True 646 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 246 536 0.00623460300062832 0.00670743005373356 0.00627145799954223 0.00665293354695964 0.00137100146949672 0.00152567763114829 272526 292315 667 665 0 True 244 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 289 535 0.0064511346981579 0.00622437301768957 0.00646982528419928 0.00617990386816205 0.00142394484987936 0.00155050041974122 281991 271263 667 665 0 True 289 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 334 535 0.00644935028480267 0.00637402616176514 0.00642404821850919 0.00634775310902571 0.00147445052180827 0.00139540899478481 281913 277785 667 665 0 True 334 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 378 534 0.0066305139945477 0.00686603209786884 0.00665293354695964 0.00675974670023652 0.00150486838710443 0.00156929856470903 289832 299227 667 665 0 True 378 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 423 534 0.00682448887709956 0.00695903182079713 0.00689707789730678 0.00703440909437705 0.00185054979881278 0.0018292517381044 298311 303280 667 665 0 True 423 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 467 532 0.00690071535530015 0.00662152061316028 0.00691233691920348 0.00668345159075303 0.00180664477213197 0.0019255456564633 301643 288571 667 665 0 True 468 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 512 531 0.00659418516880264 0.00637143327533758 0.00660715648126955 0.00645456626230259 0.00175648318533697 0.00185857428631577 288244 277672 667 665 0 True 512 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 555 531 0.00655577452747648 0.00665160268489948 0.00663767452506294 0.00672922865644312 0.00167431911872907 0.00182252858420763 286565 289882 667 665 0 True 557 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 599 530 0.00643782022927653 0.00639256644701706 0.00645456626230259 0.0063935301747158 0.00175896762186158 0.00163103474688012 281409 278593 667 665 0 True 602 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 643 531 0.00640487721348756 0.00662799135628038 0.00642404821850919 0.00663767452506294 0.00187420092018005 0.00200761329563174 279969 288853 667 665 0 True 647 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 246 576 0.00643571553660112 0.00673443737519583 0.0063782711528191 0.00671396963454643 0.00128881750279985 0.00119176029183694 281317 293492 667 665 0 True 244 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 291 577 0.00644106877666683 0.00671367133787777 0.00648508430609598 0.00675974670023652 0.00141434618074798 0.00141350091576345 281551 292587 667 665 0 True 289 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 335 576 0.00649565352366161 0.00677202275544664 0.00645456626230259 0.00672922865644312 0.00139702798961022 0.00146366293059209 283937 295130 667 665 0 True 334 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 379 576 0.00644566707262071 0.00664086400482782 0.00648508430609598 0.00662241550316625 0.00131162533830297 0.00126642927919948 281752 289414 667 665 0 True 379 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 423 575 0.00668988005425074 0.00653753862798447 0.00677500572213321 0.00656137941557946 0.00186274498239498 0.00172086694239359 292427 284911 667 665 0 True 423 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 467 574 0.00677598943718802 0.00671552995558248 0.00683604180972 0.00668345159075303 0.0020388922884081 0.00183299178714404 296191 292668 667 665 0 True 468 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 511 573 0.00650915100929737 0.00662030448058806 0.00651560234988937 0.00665293354695964 0.00206531778871488 0.0021364788503313 284527 288518 667 665 0 True 513 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 555 572 0.00660210064342972 0.00650731888085974 0.00662241550316625 0.00662241550316625 0.00187541721014604 0.00177388532348969 288590 283594 667 665 0 True 557 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 599 573 0.00652225958433006 0.00657232460872942 0.00653086137178607 0.00659189745937285 0.00160898472275935 0.00144933579215888 285100 286427 667 665 0 True 602 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 643 573 0.006522945897159 0.0062978457817696 0.00645456626230259 0.00630197604333562 0.0015860346514593 0.00155580791626537 285130 274465 667 665 0 True 647 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 245 619 0.00690252264574968 0.00687686256153086 0.00694285496299687 0.00683604180972 0.00146614869255229 0.00134431633780207 301722 299699 667 665 0 False 245 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 289 619 0.0065185077408652 0.00652324333378651 0.00656137941557946 0.00646982528419928 0.00133713275721452 0.00142425568877046 284936 284288 667 665 0 False 289 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 335 618 0.00651262832763065 0.00653549644309905 0.00646982528419928 0.00645456626230259 0.00140539208148719 0.00142968032733046 284679 284822 667 665 0 True 334 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 379 618 0.00665933913336305 0.00662987291988268 0.00666819256885634 0.00663767452506294 0.00135805853424614 0.00121109327832425 291092 288935 667 665 0 True 379 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 423 618 0.00656737321428551 0.00656174654994089 0.00660715648126955 0.00656137941557946 0.00166753230177745 0.00152907524697854 287072 285966 667 665 0 False 423 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 468 618 0.00670825036097195 0.00655371548578473 0.00666819256885634 0.00662241550316625 0.0018757725580768 0.00194078420130284 293230 285616 667 665 0 False 468 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 513 618 0.00666089477577531 0.00640055161937804 0.00675974670023652 0.00636301213092241 0.00196161996718858 0.00188594983146227 291160 278941 667 665 0 False 513 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 557 618 0.00638195436500107 0.0065483461457489 0.00648508430609598 0.00654612039368277 0.00174811272893764 0.00177338289918417 278967 285382 667 665 0 False 557 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 602 618 0.00655572877328788 0.00659717501581833 0.00656137941557946 0.00657663843747616 0.00144772180901136 0.00138663859325604 286563 287510 667 665 0 False 602 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 647 617 0.00662241550316625 0.00644651225224884 0.00663767452506294 0.00645456626230259 0.00153475715576925 0.0014476769794488 289478 280944 667 665 0 False 647 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 246 668 0.00889427110660737 0.759284936993433 0.00849927519645991 0.75223926146334 0.00246738113210931 0.190982048942356 388785 33090226 667 665 16 True 245 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 289 662 0.00731563721458108 0.00674079338882799 0.00692759594110018 0.0068055237659266 0.00213359307058685 0.00125080151103513 319780 293769 667 665 0 False 289 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 334 662 0.00652775008696155 0.00634486192592949 0.00653086137178607 0.00634775310902571 0.00122247006414522 0.00122929836022841 285340 276514 667 665 0 False 334 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 379 662 0.00631730369651521 0.00642902747828601 0.00634775310902571 0.0064087891966125 0.00128564255457837 0.00127472504846355 276141 280182 667 665 0 False 379 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 423 662 0.00648991137299283 0.00625002653119409 0.00648508430609598 0.00624093995574884 0.00152580064080265 0.00145180667009578 283686 272381 667 665 0 False 423 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 468 661 0.00632510478567079 0.00614633401998932 0.00636301213092241 0.00621042191195544 0.00158867846630578 0.00144300602246867 276482 267862 667 665 0 False 468 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 513 661 0.00642791444744554 0.00659504104734255 0.00636301213092241 0.00656137941557946 0.00158355812608261 0.001579763908085 280976 287417 667 665 0 False 513 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 558 661 0.00650887648416579 0.00640346574837185 0.00651560234988937 0.00636301213092241 0.00157171605937541 0.0015636038377657 284515 279068 667 665 0 False 558 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 602 661 0.00715144830880509 0.00672544258334093 0.00695811398489357 0.00672922865644312 0.00179632902983529 0.0013297146979703 312603 293100 667 665 0 False 602 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 643 666 0.0082264658469575 0.799821343241372 0.00817883573662928 0.804562447547112 0.00166472876769324 0.173739302203026 359594 34856834 667 665 20 True 647 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B9_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B9_3.csv new file mode 100755 index 0000000..2a3f925 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_B9_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 245 271 0.00106369337647496 0.0822908954693899 0.000839246204318303 0.0779430838483253 0.000825466420830908 0.020337553690422 46496 3586301 667 665 0 True 244 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 288 270 0.00101329513773669 0.000923618269753119 0.000869764248111696 0.000778210116731518 0.000752134746952166 0.000676841662727996 44293 40252 667 665 0 False 288 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 333 272 0.000954455251202506 0.000968087419280635 0.000823987182421607 0.000839246204318303 0.000668873418358731 0.000706095703989719 41721 42190 667 665 0 True 333 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 377 271 0.000900762710885345 0.000950556753522626 0.000778210116731518 0.00080872816052491 0.000646901163623844 0.000668230323217726 39374 41426 667 665 0 True 378 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 421 272 0.000970675111059714 0.00107150457971433 0.000732433051041428 0.000915541313801785 0.000821253538450304 0.000809181648937918 42430 46697 667 665 0 True 422 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 465 271 0.000984469998921345 0.000946105249390356 0.000762951094834821 0.000686655985351339 0.000854108574375011 0.000912522391679696 43033 41232 667 665 0 True 467 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 509 270 0.000885206286762776 0.000970565576220248 0.000656137941557946 0.000762951094834821 0.000818298240518244 0.000843115096551044 38694 42298 667 665 0 True 512 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 554 270 0.000911560699393951 0.00099247890841776 0.000686655985351339 0.000762951094834821 0.000831576365467934 0.000824115249044706 39846 43253 667 665 0 True 556 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 601 269 0.00108265848764791 0.000860471159588144 0.000656137941557946 0.000473029678797589 0.00109580571491733 0.000926373541088404 47325 37500 667 665 0 False 601 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 642 269 0.00118581130583712 0.0833003543420235 0.000915541313801785 0.0796520943007553 0.00101185523800721 0.0227766730084312 51834 3630294 667 665 0 True 646 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 244 314 0.000995451004184335 0.00091448580251269 0.000793469138628214 0.000717174029144732 0.000797933138969016 0.000817571094025541 43513 39854 667 665 0 False 244 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 288 314 0.000943565754316708 0.000970014874678112 0.00080872816052491 0.000823987182421607 0.000711781578578431 0.000739465905193718 41245 42274 667 665 0 False 288 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 332 315 0.000940683240435173 0.000931672279806864 0.000793469138628214 0.00080872816052491 0.000689299354139348 0.000722561901495231 41119 40603 667 665 0 True 333 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 375 315 0.000905795671630882 0.000904871471422892 0.000762951094834821 0.00080872816052491 0.000671806526228981 0.000650004828236396 39594 39435 667 665 0 True 378 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 421 315 0.00103026994170573 0.00100645296004947 0.000747692072938125 0.000793469138628214 0.000898722101723456 0.000834529839956748 45035 43862 667 665 0 True 422 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 465 314 0.00103075036068599 0.00100142780847748 0.000747692072938125 0.000793469138628214 0.000944527763365185 0.000864063083350377 45056 43643 667 665 0 True 467 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 510 313 0.000991653406530884 0.00102194144092206 0.000747692072938125 0.00080872816052491 0.000926726216834144 0.000867864610855112 43347 44537 667 665 0 True 512 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 553 313 0.00100624899269294 0.000963245834889352 0.000793469138628214 0.000823987182421607 0.000872909969014175 0.000706963750419798 43985 41979 667 665 0 True 557 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 601 313 0.000897925951192406 0.000990826803791351 0.000457770656900893 0.000549324788281071 0.00104260970949215 0.00112490638545458 39250 43181 667 665 0 False 601 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 646 313 0.00107751114143089 0.00105094505547458 0.000671396963454643 0.000793469138628214 0.00107551589437297 0.000966805073407599 47100 45801 667 665 0 False 646 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 244 360 0.000882918577332986 0.000914554640205458 0.000701915007248035 0.000762951094834821 0.000781831145697947 0.000805927205180772 38594 39857 667 665 0 True 244 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 288 360 0.000945761955369306 0.000888166857978088 0.00080872816052491 0.000732433051041428 0.000727957568799893 0.000722564553874529 41341 38707 667 665 0 True 288 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 333 357 0.00088417681751937 0.000978596640376405 0.000762951094834821 0.000869764248111696 0.000690699918643917 0.00068750022082829 38649 42648 667 665 0 False 333 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 377 359 0.000968639049667201 0.000934769975981382 0.000854505226215 0.000823987182421607 0.000693299755797573 0.000680722801595786 42341 40738 667 665 0 True 378 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 421 359 0.000980741032550788 0.000947527895040875 0.00080872816052491 0.000717174029144732 0.000789231353340513 0.000806469129431169 42870 41294 667 665 0 True 423 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 465 357 0.00090048818575377 0.000915128287645183 0.000625619897764553 0.000595101853971161 0.000834756080339058 0.000913249498877992 39362 39882 667 665 0 True 467 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 508 357 0.000928878659777459 0.00099901848923063 0.000701915007248035 0.000701915007248035 0.000875574172015 0.000914185292804245 40603 43538 667 665 0 True 512 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 553 357 0.00105149988521418 0.000939198534216062 0.000778210116731518 0.000671396963454643 0.000928313837721308 0.000909042642260809 45963 40931 667 665 0 True 557 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 597 357 0.00092494379955822 0.000933026087764616 0.000488288700694286 0.000381475547417411 0.00104868342893927 0.00111078544062542 40431 40662 667 665 0 True 601 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 642 358 0.000971384300982949 0.00100383712772432 0.000534065766384375 0.000549324788281071 0.00104930173122491 0.00106779084301233 42461 43748 667 665 0 True 646 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 244 402 0.000909044219021183 0.00103056909841553 0.000732433051041428 0.000869764248111696 0.00077843528368508 0.000904318387139653 39736 44913 667 665 0 True 244 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 287 403 0.000901517654997175 0.000929630094921442 0.000747692072938125 0.000793469138628214 0.000765273161537766 0.000736423155594675 39407 40514 667 665 0 True 289 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 332 403 0.000974038043921505 0.000889658341321374 0.000839246204318303 0.000778210116731518 0.000729662668629819 0.000653642134959788 42577 38772 667 665 0 True 333 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 376 403 0.000952647960752972 0.000894224574941588 0.000823987182421607 0.000762951094834821 0.000739879734012159 0.000711202320962721 41642 38971 667 665 0 True 378 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 421 403 0.000945190028011858 0.00090888700350097 0.000717174029144732 0.000686655985351339 0.000827345355455077 0.000798609037488959 41316 39610 667 665 0 True 423 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 465 402 0.000966991898877753 0.000818480167000243 0.000686655985351339 0.000534065766384375 0.000899234917961991 0.000786539974924804 42269 35670 667 665 0 True 467 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 508 401 0.00100679804295609 0.00103552541229476 0.000732433051041428 0.000747692072938125 0.000926420835235539 0.000938721251121725 44009 45129 667 665 0 True 512 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 553 400 0.000894494387047721 0.000969165876467318 0.000610360875867857 0.000778210116731518 0.000860890841130864 0.000801933415666611 39100 42237 667 665 0 True 557 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 597 401 0.000948461452496457 0.000843491195372271 0.000595101853971161 0.000289921416037232 0.00102133190798159 0.00103276047694487 41459 36760 667 665 0 True 601 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 641 401 0.000876535868023873 0.000938326590107679 0.000549324788281071 0.000595101853971161 0.00089098214621728 0.0009402938828989 38315 40893 667 665 0 True 646 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 244 446 0.000903759610238369 0.000937867672155899 0.000747692072938125 0.000747692072938125 0.000806868739852602 0.000853442774494719 39505 40873 667 665 0 True 244 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 289 447 0.000981862010171385 0.000954319880727224 0.00080872816052491 0.000839246204318303 0.000859037374158994 0.000766739034027113 42919 41590 667 665 0 True 289 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 333 447 0.000939173352211512 0.00092641766925898 0.000869764248111696 0.000793469138628214 0.000719815646357761 0.000784176382123505 41053 40374 667 665 0 True 333 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 376 446 0.00096017452477698 0.00103545657460199 0.000854505226215 0.000915541313801785 0.000754011485509878 0.000771351398452699 41971 45126 667 665 0 True 378 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 421 447 0.000950520390983268 0.000995874901260934 0.000671396963454643 0.000671396963454643 0.000981469779605848 0.000957789967404557 41549 43401 667 665 0 True 423 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 465 446 0.00102507684130011 0.000944889116818138 0.000732433051041428 0.000564583810177768 0.000990917529649864 0.000998043825031771 44808 41179 667 665 0 True 468 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 509 445 0.000987466898274369 0.00102067941655466 0.000717174029144732 0.000732433051041428 0.000953226374790789 0.000977684806965086 43164 44482 667 665 0 True 512 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 554 445 0.000851416818484784 0.000902553935766402 0.000534065766384375 0.000549324788281071 0.000901894396394143 0.000926104378696987 37217 39334 667 665 0 True 557 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 598 445 0.000888317571587289 0.000907854438109465 0.000473029678797589 0.000595101853971161 0.000984054060470548 0.000940273406554378 38830 39565 667 665 0 True 602 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 642 445 0.00094962818430565 0.000864027773714442 0.000595101853971161 0.0004272526131075 0.000959576419789432 0.000956465459152286 41510 37655 667 665 0 True 646 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 246 491 0.000926156285556009 0.000949960160185311 0.000701915007248035 0.000778210116731518 0.000782675879723228 0.000751352476090181 40484 41400 667 665 0 True 244 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 290 491 0.000961203994020385 0.000927725585421553 0.000778210116731518 0.000747692072938125 0.000831808547624851 0.000825612825059275 42016 40431 667 665 0 True 289 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 334 491 0.00100515089216664 0.000828048606294863 0.000839246204318303 0.000686655985351339 0.000863292273512601 0.000775225676575295 43937 36087 667 665 0 True 334 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 378 491 0.000972642541169333 0.000962465674371325 0.000793469138628214 0.000747692072938125 0.000822456309261352 0.000845590594863137 42516 41945 667 665 0 True 378 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 422 491 0.000931280754678738 0.00100168021335096 0.00064087891966125 0.000625619897764553 0.000973199392952857 0.000979622351750093 40708 43654 667 665 0 True 423 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 466 489 0.00102869142219918 0.000991125100460008 0.000671396963454643 0.000686655985351339 0.00104259713199234 0.000936214221458429 44966 43194 667 665 0 True 468 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 512 489 0.000994901953921185 0.000971276899045508 0.000747692072938125 0.000747692072938125 0.000925708835453051 0.000907030273233544 43489 42329 667 665 0 True 512 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 554 488 0.000892366817278017 0.000953539720209198 0.000564583810177768 0.000625619897764553 0.000913863364774996 0.000953972976558042 39007 41556 667 665 0 True 557 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 599 489 0.000835677377607831 0.000851866447992263 0.000442511635004196 0.000457770656900893 0.000876398292240876 0.000927491772102114 36529 37125 667 665 0 True 602 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 643 490 0.000899962012584918 0.000987201351972286 0.000534065766384375 0.00064087891966125 0.000932232372703603 0.000997040252583249 39339 43023 667 665 0 True 646 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 246 536 0.000941461061641301 0.000945233305281974 0.000778210116731518 0.000717174029144732 0.000752315624824684 0.000801850878387373 41153 41194 667 665 0 True 244 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 289 535 0.00093809812877951 0.000970680305708194 0.000839246204318303 0.000839246204318303 0.000765126906232744 0.00075496999598385 41006 42303 667 665 0 True 289 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 334 535 0.000979116758855637 0.000895693112387285 0.000854505226215 0.000747692072938125 0.00079744956402337 0.00076934544455139 42799 39035 667 665 0 True 334 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 378 534 0.000930365670906822 0.00101891258244031 0.000793469138628214 0.000869764248111696 0.000759047072350864 0.000798539024512774 40668 44405 667 665 0 True 378 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 423 534 0.000966854636311965 0.000882728680249491 0.000671396963454643 0.000503547722590982 0.00100698698075304 0.000965298712128564 42263 38470 667 665 0 True 423 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 467 532 0.00103699580742931 0.000895188302640327 0.000625619897764553 0.000503547722590982 0.00111768676865148 0.000996040185400878 45329 39013 667 665 0 True 468 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 512 531 0.00102551150609177 0.000951497535323775 0.000610360875867857 0.000579842832074464 0.00107033550113046 0.000971095610403145 44827 41467 667 665 0 True 512 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 555 531 0.000951961647924035 0.000890622069020113 0.000595101853971161 0.000473029678797589 0.000965690165545265 0.000945874009158306 41612 38814 667 665 0 True 557 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 599 530 0.000917485866817106 0.000885688701038474 0.000595101853971161 0.000625619897764553 0.000907847479012766 0.000884129458782316 40105 38599 667 665 0 True 602 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 643 531 0.000902547124240581 0.000924513159759091 0.000503547722590982 0.000457770656900893 0.000986989648930244 0.00107053210716084 39452 40291 667 665 0 True 647 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 246 576 0.000955644860105996 0.00104513974338455 0.000869764248111696 0.000930800335698482 0.000664186744017614 0.000700904715437344 41773 45548 667 665 0 True 244 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 291 577 0.000893281901049933 0.00103972451155355 0.000762951094834821 0.000885023270008392 0.000701257135715917 0.000822222127536105 39047 45312 667 665 0 True 289 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 335 576 0.000943588631411005 0.000850971557986291 0.000839246204318303 0.000701915007248035 0.000703017342964619 0.000741871913855004 41246 37086 667 665 0 True 334 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 379 576 0.00096550488774839 0.00089466054699578 0.000854505226215 0.000778210116731518 0.000716697294967881 0.000650110636045808 42204 38990 667 665 0 True 379 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 423 575 0.00102560301446896 0.000923916566421777 0.000732433051041428 0.000579842832074464 0.00102061856287186 0.000932185775065117 44831 40265 667 665 0 True 423 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 467 574 0.000952076033395525 0.00105356088779972 0.000457770656900893 0.000762951094834821 0.00107366413125582 0.000957380674402832 41617 45915 667 665 0 True 468 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 511 573 0.00098430985926126 0.000947436111450519 0.000503547722590982 0.000534065766384375 0.00108255791439989 0.00108786700114628 43026 41290 667 665 0 True 513 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 555 572 0.000971452932265842 0.000891310445947783 0.000595101853971161 0.000534065766384375 0.000977739647855305 0.000923410654794403 42464 38844 667 665 0 True 557 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 599 573 0.000982365306245939 0.000937890618053488 0.000762951094834821 0.000701915007248035 0.000846308396817793 0.000824564328728149 42941 40874 667 665 0 True 602 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 643 573 0.000880127571828643 0.000880457036388178 0.00064087891966125 0.000701915007248035 0.000820460660212411 0.000781896675196495 38472 38371 667 665 0 True 647 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 245 619 0.00097637150753989 0.000890186096965921 0.00080872816052491 0.000747692072938125 0.000735785186145603 0.000679748659814656 42679 38795 667 665 0 False 245 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 289 619 0.000928260978231415 0.000972745436491205 0.000793469138628214 0.00080872816052491 0.000712313339369899 0.000739507112891766 40576 42393 667 665 0 False 289 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 335 618 0.000963994999524728 0.00105177110778778 0.000839246204318303 0.000915541313801785 0.000753866152070124 0.000832052400838981 42138 45837 667 665 0 True 334 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 379 618 0.000890582403922781 0.00104878814110121 0.000762951094834821 0.000885023270008392 0.000673240320880784 0.000736811796209464 38929 45707 667 665 0 True 379 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 423 618 0.000985430836881857 0.00104277631593289 0.000701915007248035 0.000793469138628214 0.000931873713640075 0.000893821398212931 43075 45445 667 665 0 False 423 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 468 618 0.00095223617305561 0.000884977378213214 0.000534065766384375 0.000411993591210803 0.00100551060144251 0.00101320969642444 41624 38568 667 665 0 False 468 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 513 618 0.000940683240435173 0.000987981512490313 0.000488288700694286 0.000610360875867857 0.00106625202985798 0.00103494860561768 41119 43057 667 665 0 False 513 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 557 618 0.000881202795260644 0.00096492088541335 0.000564583810177768 0.000534065766384375 0.0009110002323425 0.00103587792384834 38519 42052 667 665 0 False 557 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 602 618 0.000880219080205834 0.000841678469462739 0.000686655985351339 0.00064087891966125 0.000749468512681724 0.0007152674990309 38476 36681 667 665 0 False 602 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 647 617 0.00100725558484205 0.000984401952466426 0.000793469138628214 0.000854505226215 0.00078998879072373 0.000768242003373846 44029 42901 667 665 0 False 647 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 246 668 0.00116119555237259 0.0792159845711785 0.000976577401388571 0.0759441519798581 0.00080469008533988 0.0237661910638328 50758 3452294 667 665 0 True 245 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 289 662 0.0010153540762235 0.000954824690474183 0.000885023270008392 0.000823987182421607 0.000736859172081304 0.000709085529611851 44383 41612 667 665 0 False 289 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 334 662 0.000985476591070452 0.000980271690900403 0.000839246204318303 0.000854505226215 0.000714437949778792 0.000717269473102546 43077 42721 667 665 0 False 334 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 379 662 0.000946425391103945 0.000911089809669516 0.000823987182421607 0.000778210116731518 0.000672977681855662 0.000655976341052214 41370 39706 667 665 0 False 379 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 423 662 0.000906802263779989 0.000962052648214723 0.000701915007248035 0.000778210116731518 0.000801652404885875 0.000762525664866927 39638 41927 667 665 0 False 423 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 468 661 0.00105657860014831 0.000938028293439022 0.000839246204318303 0.000762951094834821 0.000912744636310878 0.000749697568349954 46185 40880 667 665 0 False 468 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 513 661 0.000876009694855022 0.00107375327767806 0.000579842832074464 0.000778210116731518 0.00082678598787687 0.000933105938463982 38292 46795 667 665 0 False 513 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 558 661 0.000948896117288117 0.000981763174243689 0.000747692072938125 0.000671396963454643 0.000821479372337724 0.000903607621520459 41478 42786 667 665 0 False 558 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 602 661 0.000984264105072664 0.000840600012276055 0.000854505226215 0.000656137941557946 0.000665311829432405 0.000707215886674711 43024 36634 667 665 0 False 602 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 643 666 0.001040427371574 0.0859018454811783 0.000854505226215 0.0814221408407721 0.000767958090286792 0.0253489358913113 45479 3743669 667 665 0 True 647 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C10_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C10_1.csv new file mode 100755 index 0000000..5cfc142 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C10_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 263 251 0.00991463526648212 0.0406583636936241 0.00990310521095598 0.0409246967269398 0.00172909042588352 0.00861611756977089 433387 1771923 667 665 0 True 263 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 308 252 0.00990434057404806 0.00965487649083799 0.00991836423285267 0.00973525597009232 0.00134728535559529 0.00139684435802481 432937 420767 667 665 0 False 308 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 352 252 0.0100144251518095 0.0618640673553878 0.0100556954299229 0.0612649729152361 0.00123773454364854 0.00918262268848531 437749 2696084 667 665 0 True 352 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 396 251 0.0101084042551853 0.0867103212368298 0.0101167315175097 0.0863965819790951 0.00136155535675537 0.012713836296938 441857 3778903 667 665 0 True 397 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 439 251 0.0099626542874134 0.0759703332490071 0.00999465934233616 0.0729076066224155 0.00157757998231963 0.015304473510194 435486 3310846 667 665 0 True 442 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 484 250 0.00986725680419118 0.0636893446709013 0.0097962920576791 0.0675211718928817 0.00152226584439909 0.0184166936482741 431316 2775631 667 665 0 True 487 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 529 250 0.0100193437270836 0.0788287496034662 0.0100251773861295 0.0775158312352178 0.00163353855166051 0.0244377944773947 437964 3435418 667 665 0 True 531 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 573 249 0.010030050207215 0.0659222329111862 0.0101167315175097 0.0640726329442283 0.00169357520390099 0.0175391245434609 438432 2872942 667 665 0 True 576 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 621 251 0.0100524926367212 0.00996985482704243 0.00999465934233616 0.00997940032043946 0.00192488453708102 0.00194876251570145 439413 434494 667 665 0 False 621 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 660 251 0.00993472135527567 0.0425725563622951 0.00988784618905928 0.0422064545662623 0.00176189442248207 0.00781441570783148 434265 1855345 667 665 0 True 666 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 263 295 0.00986126300548513 0.00988277514569211 0.00991836423285267 0.00990310521095598 0.0015344709554603 0.00156544572123437 431054 430699 667 665 0 False 263 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 308 295 0.00983952976590213 0.00972561869310493 0.00984206912336919 0.00973525597009232 0.00142069758093943 0.00132446078064836 430104 423850 667 665 0 False 308 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 352 296 0.00987471473693229 0.105956491136287 0.00985732814526589 0.106523231860838 0.00132417390130003 0.0249348712548017 431642 4617666 667 665 0 True 353 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 396 296 0.0098430299613297 0.0546001992851206 0.00994888227664607 0.0542763408865492 0.00142816636163122 0.00814182398619621 430257 2379519 667 665 0 True 397 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 440 296 0.0099462971649904 0.102470206186099 0.00990310521095598 0.0992141603723201 0.00175137221081649 0.036935103763309 434771 4465731 667 665 0 True 442 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 486 295 0.00981182560470737 0.0439985291679645 0.0097962920576791 0.0443732356755932 0.00172966758883218 0.00760677269895364 428893 1917490 667 665 0 True 487 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 529 293 0.0100148140624126 0.0398917642010726 0.0100251773861295 0.042374303807126 0.00154751387862955 0.00800850739621625 437766 1738514 667 665 0 True 532 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 574 294 0.00980260613570532 0.0496211689672797 0.0098268101014725 0.0511635004196231 0.00184162566713296 0.00814301725169197 428490 2162529 667 665 0 True 576 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 621 294 0.00984319010098979 0.00947514127502322 0.00984206912336919 0.00950637064164187 0.00195764529363457 0.00195198273631295 430264 412934 667 665 0 False 621 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 666 294 0.0094886866477496 0.00969592670162474 0.00950637064164187 0.00968947890440223 0.00193112549828578 0.00186219850991269 414768 422556 667 665 0 False 666 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 265 340 0.0101250359027399 0.0472487926155512 0.0101167315175097 0.0467841611352712 0.00154518577334443 0.00806872237457826 442584 2059139 667 665 0 True 263 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 308 340 0.00992305403718374 0.0616021399344092 0.00993362325474937 0.0633859769588769 0.00137461763135393 0.0177139279976606 433755 2684669 667 665 0 True 308 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 353 340 0.00989992529484857 0.0392242450943105 0.00988784618905928 0.0397344930189975 0.00138217493932701 0.00728765695515866 432744 1709423 667 665 0 True 353 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 397 340 0.00991779230549523 0.0338653454418835 0.00994888227664607 0.0346227206836042 0.00146870633415585 0.00423909230431929 433525 1475878 667 665 0 True 397 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 442 340 0.0100083627218206 0.0708030088955508 0.0100709544518196 0.0688944838635843 0.00163287099250272 0.0107895313227144 437484 3085650 667 665 0 True 442 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 485 339 0.00993064923249064 0.0336005038919111 0.00988784618905928 0.0340123598077363 0.00172937864664195 0.00536941503671813 434087 1464336 667 665 0 True 487 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 528 337 0.00988571861928958 0.0280954847636372 0.0098268101014725 0.0286411841000992 0.0016043231353935 0.00388097813097164 432123 1224423 667 665 0 True 532 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 574 338 0.00997775316965001 0.0497088681878649 0.0100709544518196 0.0500953688868544 0.00186282683873302 0.0073730320960929 436146 2166351 667 665 0 True 576 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 618 336 0.00979583451579314 0.0553947468809355 0.0098268101014725 0.0554512855725948 0.00209837593165977 0.013302546079581 428194 2414146 667 665 0 True 621 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 662 339 0.00972690583067358 0.0593164302378744 0.00964370183871214 0.0595712214847028 0.00181533545655176 0.0150119850848099 425181 2585056 667 665 0 True 666 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 264 383 0.00983351309010178 0.0402465766154916 0.00984206912336919 0.0432745860990311 0.00159204049799309 0.00880228574497437 429841 1753977 667 665 0 True 263 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 309 385 0.0100107648167219 0.0301789263729248 0.0100099183642329 0.0305333028152895 0.00141225520116079 0.00345449596077806 437589 1315221 667 665 0 True 308 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 353 384 0.0100187031684432 0.0790191087698647 0.0100556954299229 0.0762645914396887 0.00141705766180156 0.014379974913044 437936 3443714 667 665 0 True 353 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 398 383 0.00998715565540645 0.0650934729820661 0.0100709544518196 0.0642557412069886 0.0015293110387614 0.0130086671361837 436557 2836824 667 665 0 True 398 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 441 383 0.0100360668830153 0.043139756004798 0.0101167315175097 0.0442206454566262 0.00172907297658437 0.00773313070721621 438695 1880064 667 665 0 True 442 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 486 382 0.0101764178565329 0.0545778499808689 0.0101777676050965 0.053330281528954 0.00168277595924951 0.0115584782207494 444830 2378545 667 665 0 True 487 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 531 381 0.0100457210168091 0.0418713756237699 0.010101472495613 0.0422369726100557 0.00164636847871059 0.00517468297649843 439117 1824787 667 665 0 True 532 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 575 380 0.0101101200372576 0.0507967561384578 0.0101167315175097 0.0498359655146105 0.00194355210904635 0.0098053490022937 441932 2213762 667 665 0 True 577 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 618 381 0.00968574993803167 0.0416913880030816 0.00959792477302205 0.0429694056610971 0.0019685886906938 0.00682040003865567 423382 1816943 667 665 0 True 621 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 663 381 0.00975760689122136 0.0838748966717549 0.00975051499198901 0.0801098649576562 0.00187441703617512 0.0159484448350296 426523 3655333 667 665 0 True 666 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 266 427 0.00992280238914647 0.0430274817278949 0.00991836423285267 0.0436560616464485 0.00154930957648071 0.00664528653614376 433744 1875171 667 665 0 True 263 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 309 427 0.01001522585011 0.0454171363405079 0.0100251773861295 0.0452735179674983 0.0013587545422832 0.00541398341005098 437784 1979314 667 665 0 True 308 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 354 427 0.0100433189219078 0.0334827684913818 0.0100251773861295 0.0339818417639429 0.00144721085498713 0.00297751717150131 439012 1459205 667 665 0 True 353 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 398 427 0.0103075951152371 0.0520050641595979 0.0102693217364767 0.050965133134966 0.00153759638275148 0.00934892141790486 450564 2266421 667 665 0 True 398 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 442 426 0.0102824074344151 0.097094234785866 0.0103456168459602 0.0964675364309148 0.00171696252239733 0.0202589840598241 449463 4231442 667 665 0 True 442 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 487 426 0.0104096955870886 0.0583217944150833 0.010406652933547 0.0585641260395209 0.00173736872968382 0.0116347300965825 455027 2541709 667 665 0 True 487 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 530 425 0.0102642201444483 0.0536383760958817 0.01025406271458 0.0534218356603342 0.00164817669224922 0.00985022789532373 448668 2337602 667 665 0 True 532 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 574 425 0.0102272278829686 0.0321785695642172 0.0102082856488899 0.0329594872968643 0.00179226298218205 0.00447868322501139 447051 1402367 667 665 0 True 577 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 619 425 0.00993149568497967 0.0390757851369096 0.00993362325474937 0.0394293125810636 0.00190457726655403 0.00427947878215156 434124 1702953 667 665 0 True 621 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 663 426 0.00971597057959919 0.0688261739264618 0.00973525597009232 0.0677958342870222 0.00189828452133774 0.0139642076288978 424703 2999498 667 665 0 True 666 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 267 471 0.0098778946530397 0.0529522708120725 0.00996414129854276 0.0539864194705119 0.00154490175499733 0.0128098119778029 431781 2307701 667 665 0 True 264 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 311 471 0.0101637897004805 0.0540236377164013 0.0101777676050965 0.052826733806363 0.00161599360812868 0.00703087231669325 444278 2354392 667 665 0 True 308 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 355 472 0.0103451821811685 0.0663173612676691 0.0103761348897536 0.0637064164187076 0.00162750617781625 0.0144485202414637 452207 2890162 667 665 0 True 353 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 399 471 0.0103930868166283 0.0849769651870578 0.010452429999237 0.0795452811474784 0.00167772707751133 0.0171159799160882 454301 3703362 667 665 0 True 398 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 443 471 0.0104408770666166 0.0900927989463244 0.0103303578240635 0.0870222018768597 0.00194269795247929 0.0259676458416472 456390 3926314 667 665 0 True 443 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 489 471 0.0104829251659361 0.0431442534007254 0.0104676890211337 0.0432440680552377 0.00193977745391735 0.00597104705547014 458228 1880260 667 665 0 True 487 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 531 470 0.0102354178827272 0.0388877664520652 0.0103608758678569 0.0399328603036545 0.001770403382815 0.00541215939355134 447409 1694759 667 665 0 True 532 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 575 469 0.0103693175156528 0.100777946238909 0.0104371709773404 0.101335164415961 0.00193061835614033 0.0210802366171354 453262 4391981 667 665 0 True 577 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 619 469 0.00990623937287479 0.0614059295641255 0.00991836423285267 0.0654764629587243 0.0018998193468978 0.014283732232368 433020 2676118 667 665 0 True 622 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 665 470 0.00969318499367849 0.0838520196118587 0.00970473792629892 0.0795605401693751 0.00195295843001815 0.0160880049358943 423707 3654336 667 665 0 True 666 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 267 515 0.00976858789648435 0.0484192399056694 0.00978103303578241 0.0518196383611811 0.00152136329425472 0.0104492837276751 427003 2110148 667 665 0 True 264 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 311 516 0.0101379157068296 0.098896933338152 0.0101777676050965 0.091783016708629 0.0015630682522497 0.0235937710667495 443147 4310005 667 665 0 True 308 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 356 514 0.0103541500021333 0.0550649913866837 0.0103913939116503 0.0555886167696651 0.00158384580168528 0.0103466597772396 452599 2399775 667 665 0 True 353 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 399 515 0.0103951915093037 0.0572844103850838 0.010406652933547 0.0559090562294957 0.00165810601864153 0.00857741311036695 454393 2496499 667 665 0 True 398 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 443 514 0.0102585008708738 0.0537951195223123 0.0102998397802701 0.0538796063172351 0.001975817627761 0.00574822459523829 448418 2344433 667 665 0 True 443 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 487 513 0.0100896907920496 0.0631521582624449 0.0100404364080262 0.0610666056305791 0.00187264784757132 0.0137333303422337 441039 2752220 667 665 0 True 487 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 532 512 0.0102240250897669 0.0725294582301485 0.0102388036926833 0.069718471046006 0.0017269431447126 0.0174061753936884 446911 3160890 667 665 0 True 532 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 576 512 0.0100182456265573 0.055576616065226 0.00997940032043946 0.05639734493019 0.00175225213339092 0.0121250366514784 437916 2422072 667 665 0 True 577 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 619 510 0.00993511026587873 0.0492042190621897 0.00993362325474937 0.0479591058213169 0.00180031356442412 0.00849744597673375 434282 2144358 667 665 0 True 622 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 664 511 0.00967682787125549 0.0717196975042321 0.00968947890440223 0.0693522545204852 0.00194026827888505 0.0181482235919348 422992 3125600 667 665 0 True 666 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 267 556 0.00953439508215679 0.0394732539749465 0.00955214770733196 0.0406805523765927 0.00136592225677698 0.00763338392984038 416766 1720275 667 665 0 True 264 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 312 557 0.00987293032357705 0.0507895281807173 0.0098115510795758 0.0515754940108339 0.00144819977636995 0.0107769201468281 431564 2213447 667 665 0 True 309 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 355 557 0.0100872886971483 0.0422144856304185 0.0100556954299229 0.0429694056610971 0.00141968232552237 0.00638156879480636 440934 1839740 667 665 0 True 353 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 399 555 0.010120437606786 0.0486812591102384 0.0100556954299229 0.0477912565804532 0.00151842486742124 0.00613887825030296 442383 2121567 667 665 0 True 398 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 444 554 0.0104673687418136 0.0857326424323569 0.0105439841306172 0.080018310826276 0.00199481522786956 0.0196238086353244 457548 3736295 667 665 0 True 443 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 488 553 0.0101444356787045 0.0594076401807907 0.0101167315175097 0.0590981918059052 0.00214553548041981 0.0114547776081451 443432 2589031 667 665 0 True 488 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 531 554 0.0101133457075536 0.0532379242911582 0.0100556954299229 0.0532234683756771 0.00197373488177204 0.00712023585284605 442073 2320150 667 665 0 True 532 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 574 553 0.00991909629987021 0.0359469054875688 0.00994888227664607 0.0381475547417411 0.00173708680650252 0.00748944955531017 433582 1566594 667 665 0 True 577 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 620 552 0.00970457778663884 0.0445404883231195 0.00978103303578241 0.0448310063324941 0.0017908398815981 0.00769553612723279 424205 1941109 667 665 0 True 622 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 663 554 0.0097691369467475 0.0495681868897467 0.00987258716716258 0.0489814602883955 0.00180258715973011 0.0061017320309897 427027 2160220 667 665 0 True 667 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 264 600 0.0092864988883448 0.00947367273757752 0.00923170824750134 0.00949111161974517 0.00130968119184925 0.00127110043082955 405930 412870 667 665 0 False 264 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 309 600 0.00966333038561973 0.00949023967563679 0.00967421988250553 0.00952162966353857 0.00150503077786438 0.0014318088034041 422402 413592 667 665 0 False 309 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 354 598 0.00995771283504505 0.06742277988402 0.00996414129854276 0.0653543907835508 0.00144113945120555 0.00915751582038758 435270 2938337 667 665 0 True 353 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 399 599 0.0100517148155151 0.0733145521161567 0.0100862134737163 0.0706492713817044 0.00151940850495558 0.0174665136065627 439379 3195105 667 665 0 True 398 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 443 600 0.0101087474115998 0.009931466340376 0.0100862134737163 0.0100251773861295 0.00177266091955593 0.00207152472195582 441872 432821 667 665 0 False 443 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 488 600 0.00976872515905014 0.00969315024801647 0.00975051499198901 0.00973525597009232 0.00197565635693984 0.00203823337417026 427009 422435 667 665 0 False 488 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 532 600 0.00972949094232925 0.00978339646323408 0.00976577401388571 0.00975051499198901 0.00195572364023566 0.00204291109012787 425294 426368 667 665 0 False 532 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 577 599 0.0095800120081868 0.00968642710002289 0.00967421988250553 0.00968947890440223 0.00172753525784152 0.00176813530175817 418760 422142 667 665 0 False 577 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 622 599 0.00946221784964693 0.00973142400519495 0.00935378042267491 0.00965896086060884 0.0015071825028764 0.00145830406278399 413611 424103 667 665 0 False 622 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 667 599 0.00958907133752876 0.00941851079977352 0.00961318379491875 0.00941481651026169 0.00158017495272009 0.00165371719479933 419156 410466 667 665 0 False 667 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 264 649 0.0100800366582559 0.036776720927978 0.00947585259784848 0.0373693446250095 0.00407498789413838 0.00900507787730731 440617 1602758 667 665 0 True 264 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 309 644 0.00944137681674155 0.00945113986614511 0.00944533455405508 0.00947585259784848 0.00130895051809018 0.00129388349159665 412700 411888 667 665 0 False 309 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 354 644 0.00957477315359258 0.0095420285664952 0.00959792477302205 0.00956740672922866 0.00133525458811079 0.0012196328485585 418531 415849 667 665 0 False 354 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 398 644 0.00966991898877753 0.0094605476841566 0.00964370183871214 0.00953688868543526 0.00139586471499444 0.00132962963624819 422690 412298 667 665 0 False 398 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 443 643 0.00957941720373505 0.00972984073826131 0.00956740672922866 0.00975051499198901 0.00165120151105456 0.00170803786853756 418734 424034 667 665 0 False 443 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 488 643 0.00958353508070867 0.00949278667026917 0.00955214770733196 0.00955214770733196 0.00178410624634515 0.00171230871180222 418914 413703 667 665 0 False 488 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 533 643 0.0096626211956965 0.00956660362281304 0.00967421988250553 0.00959792477302205 0.00186347992178633 0.00184703275658722 422371 416920 667 665 0 False 533 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 577 643 0.00945775681625884 0.00959762647635339 0.00943007553215839 0.00962844281681544 0.00156230343665077 0.0014377832352836 413416 418272 667 665 0 False 577 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 622 643 0.00938750125967 0.00933712170102528 0.009399557488365 0.00930800335698482 0.00130313585897786 0.00139963504851724 410345 406919 667 665 0 False 622 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 662 648 0.00948768005560049 0.040953493828414 0.00953688868543526 0.0406805523765927 0.0014552104419499 0.00809904984178614 414724 1784785 667 665 0 True 667 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C10_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C10_2.csv new file mode 100755 index 0000000..ab677bb --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C10_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 263 251 0.00834638757526707 0.749739718947173 0.00817883573662928 0.758663309681849 0.00201243732103329 0.187603522787999 364836 32674238 667 665 12 True 263 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 308 252 0.0067294574273861 0.00642813258828004 0.00668345159075303 0.0063782711528191 0.00146193058538113 0.00127060216125236 294157 280143 667 665 0 False 308 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 352 252 0.00632601986944271 0.00651048541472702 0.00630197604333562 0.00643930724040589 0.00123164741902185 0.00132818978550211 276522 283732 667 665 0 True 352 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 396 251 0.00642731964299379 0.00620218433472099 0.00636301213092241 0.00627145799954223 0.00134357052810704 0.00120168528913039 280950 270296 667 665 0 True 397 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 439 251 0.00652564539428615 0.00673255581159353 0.00654612039368277 0.00679026474402991 0.00150991173974443 0.00164226213142 285248 293410 667 665 0 True 442 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 484 250 0.00660496028021695 0.00675561643867049 0.00671396963454643 0.00672922865644312 0.00153830540497462 0.00153076622741548 288715 294415 667 665 0 True 487 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 529 250 0.00674487658894288 0.00676132996717016 0.00677500572213321 0.00674448767833982 0.00151599013006265 0.00156852011057302 294831 294664 667 665 0 True 531 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 573 249 0.006900166305037 0.00716712816603193 0.00697337300679027 0.00720225833524071 0.0016927180059027 0.00161175094026528 301619 312349 667 665 0 True 576 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 621 251 0.00882536529858211 0.00785027342905215 0.0081025406271458 0.00791943236438544 0.00438308285324607 0.00189178759494687 385773 342121 667 665 0 False 621 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 660 251 0.00935661718236785 0.769600334092269 0.0093690394445716 0.76406500343328 0.00196308297755363 0.157252515669268 408995 33539779 667 665 13 True 666 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 263 295 0.00673714413107019 0.00671312063633563 0.00666819256885634 0.00677500572213321 0.0015780472334494 0.0014058399508294 294493 292563 667 665 0 False 263 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 308 295 0.00641279268811463 0.00613770636249585 0.00643930724040589 0.00613412680247196 0.00130216905775702 0.00123231538363212 280315 267486 667 665 0 False 308 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 352 296 0.0061152074454876 0.00647719091732536 0.00617990386816205 0.0063935301747158 0.00122688979299075 0.00135753941161585 267307 282281 667 665 0 True 353 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 396 296 0.00625091436886272 0.0062502100983748 0.00630197604333562 0.00630197604333562 0.00128547963182242 0.00131247818662475 273239 272389 667 665 0 True 397 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 440 296 0.00635706408640495 0.00653269704359319 0.00633249408712902 0.00657663843747616 0.00170192414991824 0.00169761386262716 277879 284700 667 665 0 True 442 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 486 295 0.00666180985954722 0.00666481952191075 0.00669871061264973 0.00669871061264973 0.00158764558242824 0.00167616935472909 291200 290458 667 665 0 True 487 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 529 293 0.00684549004966503 0.00693929834887057 0.00686655985351339 0.00697337300679027 0.00142331920954019 0.00157121111964776 299229 302420 667 665 0 True 532 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 574 294 0.00701892130153737 0.00729915886075913 0.00694285496299687 0.00738536659800107 0.00172356265500808 0.00175950746284776 306810 318103 667 665 0 True 576 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 621 294 0.00733753059382417 0.00739057531675378 0.00735484855420768 0.00743114366369116 0.00193048355447811 0.00187975261229562 320737 322087 667 665 0 False 621 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 666 294 0.00757220382713198 0.00734628973440697 0.00764476997024491 0.00744640268558785 0.00204389793111377 0.00176014357452828 330995 320157 667 665 0 False 666 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 265 340 0.00630021450707468 0.00644818730277284 0.00634775310902571 0.0064087891966125 0.00137780126712612 0.00156442484062075 275394 281017 667 665 0 True 263 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 308 340 0.00640066782813674 0.00629440389713125 0.00636301213092241 0.00630197604333562 0.00127611575771334 0.00121647600865856 279785 274315 667 665 0 True 308 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 353 340 0.00618942073938998 0.00654006267671926 0.00617990386816205 0.00657663843747616 0.00120552028980079 0.00125858654566001 270551 285021 667 665 0 True 353 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 397 340 0.0064642203960963 0.00672553436693129 0.00645456626230259 0.00675974670023652 0.00131074315473189 0.00129322213533502 282563 293104 667 665 0 True 397 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 442 340 0.00653312620412156 0.00687456797177196 0.00656137941557946 0.0068055237659266 0.00162301155945263 0.00172019255376115 285575 299599 667 665 0 True 442 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 485 339 0.00671927712042354 0.00685155323649017 0.00672922865644312 0.00683604180972 0.00169607817486557 0.00153031047705318 293712 298596 667 665 0 True 487 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 528 337 0.00674947488489676 0.00670967875169728 0.00674448767833982 0.00665293354695964 0.00151493170603704 0.00158066655373097 295032 292413 667 665 0 True 532 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 574 338 0.00697442535312797 0.00717369069274239 0.00714122224765393 0.00720225833524071 0.0018333476630493 0.00172977168429789 304865 312635 667 665 0 True 576 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 618 336 0.00704550448511153 0.00692257078952818 0.00718699931334401 0.00700389105058366 0.00193010834721502 0.00204237147267999 307972 301691 667 665 0 True 621 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 662 339 0.00678639851509356 0.0067046306542277 0.00691233691920348 0.00668345159075303 0.00190296037897565 0.00191324258599963 296646 292193 667 665 0 True 666 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 264 383 0.00628012841828113 0.00646925163675956 0.00625619897764553 0.00651560234988937 0.00139461031451269 0.00139365831780223 274516 281935 667 665 0 True 263 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 309 385 0.00659848606253065 0.0672573629083007 0.00659189745937285 0.0689402609292744 0.00135709674113431 0.012867212507465 288432 2931128 667 665 0 True 308 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 353 384 0.00679097393395314 0.00657489454925939 0.00685130083161669 0.00662241550316625 0.00132276428973597 0.00135782944179094 296846 286539 667 665 0 True 353 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 398 383 0.00677914647620113 0.00696424053954984 0.00674448767833982 0.00703440909437705 0.00140116103800726 0.00142568420184799 296329 303507 667 665 0 True 398 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 441 383 0.00665206421737632 0.006741183469087 0.00668345159075303 0.00671396963454643 0.0016194279272547 0.00160619841852046 290774 293786 667 665 0 True 442 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 486 382 0.00695706163855586 0.00693126728471442 0.00694285496299687 0.00695811398489357 0.00171437435559776 0.00183304111243746 304106 302070 667 665 0 True 487 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 531 381 0.00679303287243995 0.00681759330805843 0.00686655985351339 0.00683604180972 0.00162634286635025 0.00169297491073391 296936 297116 667 665 0 True 532 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 575 380 0.00688108680839255 0.00717082245554376 0.00697337300679027 0.00721751735713741 0.00179929062197006 0.001858593231758 300785 312510 667 665 0 True 577 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 618 381 0.00653861670675306 0.00674944399221905 0.00662241550316625 0.00671396963454643 0.0020140458846308 0.001928573116902 285815 294146 667 665 0 True 621 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 663 381 0.00611584800412794 0.00629204046967958 0.00610360875867857 0.00619516289005875 0.00180357078797661 0.00185572902263986 267335 274212 667 665 0 True 666 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 266 427 0.00651063802042673 0.0064313450139425 0.00651560234988937 0.00642404821850919 0.00145824949696934 0.0015332809515318 284592 280283 667 665 0 True 263 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 309 427 0.00644514089945185 0.00680712997875784 0.0063935301747158 0.0068207827878233 0.00139208440517254 0.00138287675700801 281729 296660 667 665 0 True 308 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 354 427 0.00670054078019356 0.00668035389457852 0.0068055237659266 0.00669871061264973 0.00134734245706844 0.00133552931653173 292893 291135 667 665 0 True 353 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 398 427 0.00689991465699972 0.0068161936083055 0.00694285496299687 0.00675974670023652 0.00153070738639225 0.0015136207488688 301608 297055 667 665 0 True 398 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 442 426 0.00688442686416005 0.00692612740365448 0.00694285496299687 0.00695811398489357 0.00163282817611857 0.00165396932000177 300931 301846 667 665 0 True 442 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 487 426 0.00696602945952064 0.0068266339917085 0.00697337300679027 0.0068207827878233 0.00164333888948835 0.00166583499756694 304498 297510 667 665 0 True 487 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 530 425 0.0067425202482302 0.00711862053852874 0.0068055237659266 0.00714122224765393 0.00167160129504286 0.00156842414061613 294728 310235 667 665 0 True 532 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 574 425 0.00644477486594309 0.00656661108022976 0.00643930724040589 0.00660715648126955 0.00170433133518974 0.0018065939103429 281713 286178 667 665 0 True 577 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 619 425 0.00623956733009096 0.00620702591911227 0.00628671702143893 0.00611886778057527 0.00185859596569042 0.00163798867905788 272743 270507 667 665 0 True 621 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 663 426 0.00596028376290225 0.00598158247530018 0.00601205462729839 0.005981536583505 0.00186986095478898 0.00182251043446741 260535 260682 667 665 0 True 666 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 267 471 0.00622261540321622 0.00648416647019242 0.00627145799954223 0.00645456626230259 0.00145299592208437 0.00146032936475356 272002 282585 667 665 0 True 264 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 311 471 0.00654989511424192 0.00671385490505848 0.00665293354695964 0.00668345159075303 0.00151513025632665 0.00148279909472662 286308 292595 667 665 0 True 308 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 355 472 0.00676523720286801 0.00684368279361714 0.00677500572213321 0.00686655985351339 0.00146626875477959 0.00152481189865483 295721 298253 667 665 0 True 353 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 399 471 0.00674565441014901 0.00693324063190707 0.00671396963454643 0.00698863202868696 0.00159135150047272 0.00156982667446644 294865 302156 667 665 0 True 398 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 443 471 0.00670070091985365 0.00679024179813232 0.00663767452506294 0.00683604180972 0.00183935969330633 0.00193683582402077 292900 295924 667 665 0 True 443 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 489 471 0.00678898362674923 0.00688319562926543 0.00685130083161669 0.00695811398489357 0.00178328069984332 0.00190664163626486 296759 299975 667 665 0 True 487 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 531 470 0.006340249422096 0.00643357076600864 0.00631723506523232 0.00650034332799268 0.0017307765307673 0.00163520950281897 277144 280380 667 665 0 True 532 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 575 469 0.00614934007018006 0.00645027537945344 0.00613412680247196 0.00648508430609598 0.00187865096998752 0.00198665907386171 268799 281108 667 665 0 True 577 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 619 469 0.00600841716930503 0.00617067961733127 0.00601205462729839 0.00616464484626535 0.00173977883163015 0.00169815421319335 262639 268923 667 665 0 True 622 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 665 470 0.0058674027600528 0.00601942026042447 0.00588998245212482 0.00608834973678187 0.00181107024067174 0.00185844369074084 256475 262331 667 665 0 True 666 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 267 515 0.00633613154512238 0.00634706473209804 0.00631723506523232 0.00630197604333562 0.00154715108240538 0.00148782269403543 276964 276610 667 665 0 True 264 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 311 516 0.00643912422365151 0.00664281440612288 0.00645456626230259 0.00666819256885634 0.00138263021371775 0.00143447725097925 281466 289499 667 665 0 True 308 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 356 514 0.00661331041963568 0.00672289558870855 0.00663767452506294 0.0068207827878233 0.00143734286706437 0.00148100821250047 289080 292989 667 665 0 True 353 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 399 515 0.0066599339378148 0.00674182595421949 0.00663767452506294 0.00675974670023652 0.00161279969914884 0.00162881489576966 291118 293814 667 665 0 True 398 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 443 514 0.00674135351642101 0.00676986584107327 0.00674448767833982 0.00672922865644312 0.00180409552231049 0.00191938119838945 294677 295036 667 665 0 True 443 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 487 513 0.00654207114799204 0.00639100612598101 0.00662241550316625 0.00636301213092241 0.00168147439179405 0.00165414860952709 285966 278525 667 665 0 True 487 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 532 512 0.00633498769040749 0.00646691115520548 0.00631723506523232 0.00648508430609598 0.0017335357318409 0.00167774428344413 276914 281833 667 665 0 True 532 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 576 512 0.00608876152447924 0.00627070078492179 0.00610360875867857 0.00616464484626535 0.00181082630392294 0.00165391168817828 266151 273282 667 665 0 True 577 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 619 510 0.00615345794715368 0.00610296627354608 0.00614938582436866 0.00605783169298848 0.00167751157837008 0.0017746639990748 268979 265972 667 665 0 True 622 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 664 511 0.00609148389870068 0.00632517434579812 0.00613412680247196 0.00634775310902571 0.00185486927938532 0.00187866101236081 266270 275656 667 665 0 True 666 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 267 556 0.00645385707237935 0.00657663843747616 0.0064087891966125 0.00660715648126955 0.00133759251495078 0.00143158750018705 282110 286615 667 665 0 True 264 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 312 557 0.00654092729327714 0.00652689173150317 0.00659189745937285 0.00651560234988937 0.00134368008877778 0.00136502722205747 285916 284447 667 665 0 True 309 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 355 557 0.00675265480100417 0.00670206071369773 0.00675974670023652 0.00669871061264973 0.00135978958790972 0.00137804290768952 295171 292081 667 665 0 True 353 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 399 555 0.00665135502745308 0.00660945107102845 0.00660715648126955 0.00659189745937285 0.00155231149630908 0.00138199389322984 290743 288045 667 665 0 True 398 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 444 554 0.00647961668055878 0.00690506306966776 0.00642404821850919 0.00689707789730678 0.00185167248081045 0.00206912569497758 283236 300928 667 665 0 True 443 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 488 553 0.00674407589064246 0.00649648841719772 0.00677500572213321 0.00663767452506294 0.00197319770486029 0.00210738481192124 294796 283122 667 665 0 True 488 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 531 554 0.00654911729303579 0.00634327865899585 0.00654612039368277 0.00648508430609598 0.00193242604475614 0.00190108944903943 286274 276445 667 665 0 True 532 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 574 553 0.00625992794401609 0.00661592181414856 0.00625619897764553 0.00660715648126955 0.00164904597420259 0.0016404654824907 273633 288327 667 665 0 True 577 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 620 552 0.00634560266216171 0.00634031863820687 0.0063782711528191 0.00633249408712902 0.00158977851729784 0.00165600246164099 277378 276316 667 665 0 True 622 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 663 554 0.00622600121317231 0.00627329367134935 0.00624093995574884 0.00617990386816205 0.00173716550416395 0.0018532947587521 272150 273395 667 665 0 True 667 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 264 600 0.00672662066769316 0.00676346393564594 0.00665293354695964 0.00679026474402991 0.00134609982406129 0.00134858032264394 294033 294757 667 665 0 False 264 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 309 600 0.00657821695698271 0.00656931869614526 0.00657663843747616 0.00653086137178607 0.00144177966420006 0.00141541725736996 287546 286296 667 665 0 False 309 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 354 598 0.00658732204051327 0.00663051540501517 0.00660715648126955 0.00663767452506294 0.00139567876831062 0.00152041071892358 287944 288963 667 665 0 True 353 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 399 599 0.00648776092612883 0.00659214986424633 0.00650034332799268 0.00656137941557946 0.00144075278886306 0.00131510063368665 283592 287291 667 665 0 True 398 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 443 600 0.00646426615028489 0.00650913160676927 0.00646982528419928 0.00657663843747616 0.00179637693509273 0.00184916765540115 282565 283673 667 665 0 False 443 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 488 600 0.00651393232200563 0.00642441535287062 0.00646982528419928 0.00642404821850919 0.00180086457935665 0.0019629542560851 284736 279981 667 665 0 False 488 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 532 600 0.00655513396883614 0.00662220899008795 0.00660715648126955 0.00669871061264973 0.00190531276336132 0.00199038155065603 286537 288601 667 665 0 False 532 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 577 599 0.00644941891608556 0.00669051892721045 0.00636301213092241 0.00669871061264973 0.00167942959837339 0.00187959296108145 281916 291578 667 665 0 False 577 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 622 599 0.006676153797672 0.00627453274981916 0.00666819256885634 0.0063782711528191 0.00155603625852882 0.00141543469964668 291827 273449 667 665 0 False 622 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 667 599 0.00641109978313658 0.00647136265933775 0.00651560234988937 0.00648508430609598 0.00162786811419545 0.00159451442982468 280241 282027 667 665 0 False 667 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 264 649 0.00894864995975347 0.716673303767544 0.00839246204318303 0.740810254062715 0.00275989282809353 0.221625548324366 391162 31233178 667 665 11 True 264 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 309 644 0.00712969219212779 0.006765414336941 0.00695811398489357 0.0068207827878233 0.00161241173475676 0.0012877014227395 311652 294842 667 665 0 False 309 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 354 644 0.00652326617647917 0.00649513460923997 0.00657663843747616 0.00654612039368277 0.00127920924109937 0.00121116950505146 285144 283063 667 665 0 False 354 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 398 644 0.00640995592842169 0.00614555385947129 0.00642404821850919 0.00616464484626535 0.00133486506509624 0.00133251432916282 280191 267828 667 665 0 False 398 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 443 643 0.00613115278021324 0.00619178984311316 0.00613412680247196 0.00616464484626535 0.00158493952514255 0.00166651241831223 268004 269843 667 665 0 False 443 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 488 643 0.00635859685172291 0.00628419297270413 0.00630197604333562 0.00624093995574884 0.00169980224397303 0.00174801606867909 277946 273870 667 665 0 False 488 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 533 643 0.00631323157373019 0.00650073340825169 0.00630197604333562 0.00656137941557946 0.00179540899239321 0.00165681124789402 275963 283307 667 665 0 False 533 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 577 643 0.00643894120689712 0.00645325834614001 0.00645456626230259 0.00645456626230259 0.00148959338792315 0.00136892051283961 281458 281238 667 665 0 False 577 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 622 643 0.0072295964629267 0.00688753240390975 0.00704966811627375 0.00685130083161669 0.00193372270582646 0.00138729006677114 316019 300164 667 665 0 False 622 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 662 648 0.00822653447824039 0.784768191937844 0.00822461280231937 0.789868009460594 0.00165268512406206 0.180856074118967 359597 34200806 667 665 18 True 667 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C10_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C10_3.csv new file mode 100755 index 0000000..f338b62 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C10_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 263 251 0.00104427072341604 0.0769264658556439 0.000885023270008392 0.0758220798046845 0.000796588379806214 0.0226755470999599 45647 3352515 667 665 0 True 263 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 308 252 0.000984538630204239 0.000891402229538139 0.000869764248111696 0.000762951094834821 0.00068557519224642 0.000620784470924476 43036 38848 667 665 0 False 308 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 352 252 0.00086493718121484 0.000920497627681013 0.000762951094834821 0.000793469138628214 0.00064657944546683 0.000657716864895041 37808 40116 667 665 0 True 352 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 396 251 0.000897171007080575 0.00097425986573208 0.000747692072938125 0.000854505226215 0.00068380549780986 0.000691117638277737 39217 42459 667 665 0 True 397 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 439 251 0.000840710338353368 0.000980937121930484 0.000625619897764553 0.000778210116731518 0.000785816774478659 0.000862569881436783 36749 42750 667 665 0 True 442 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 484 250 0.000831193467125444 0.000965127398491651 0.000656137941557946 0.00080872816052491 0.000726569784279025 0.000823318199920911 36333 42061 667 665 0 True 487 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 529 250 0.000844645198572606 0.000971781708792466 0.000656137941557946 0.000793469138628214 0.00076835940171158 0.000830412333013227 36921 42351 667 665 0 True 531 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 573 249 0.000990806954041862 0.00098896818608664 0.000793469138628214 0.000793469138628214 0.000886377497440477 0.00084646326128778 43310 43100 667 665 0 True 576 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 621 251 0.00111027114046547 0.000993282014833375 0.000717174029144732 0.000595101853971161 0.00112337119053944 0.00101477926254083 48532 43288 667 665 0 False 621 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 660 251 0.00108021063855804 0.0789692014426086 0.000762951094834821 0.0757915617608911 0.00097817535181271 0.0201081501571081 47218 3441539 667 665 0 True 666 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 263 295 0.00088994184528244 0.000982222092195469 0.000717174029144732 0.000747692072938125 0.000719267075807063 0.000810392838615606 38901 42806 667 665 0 False 263 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 308 295 0.000894357124481934 0.000847919753606952 0.000747692072938125 0.000778210116731518 0.000716818963896897 0.000591974801439256 39094 36953 667 665 0 False 308 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 352 296 0.000861963158956114 0.000866001120907097 0.000732433051041428 0.000717174029144732 0.000655860608751581 0.000697178043207916 37678 37741 667 665 0 True 353 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 396 296 0.000928947291060352 0.000843950113324052 0.000778210116731518 0.000717174029144732 0.000747275071430182 0.000624695447760549 40606 36780 667 665 0 True 397 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 440 296 0.000891863521203463 0.000901911450633909 0.000610360875867857 0.000610360875867857 0.000870618702377121 0.000881081529551834 38985 39306 667 665 0 True 442 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 486 295 0.000920253995227152 0.000880594711773712 0.000671396963454643 0.000610360875867857 0.000847559202377471 0.00086714850534543 40226 38377 667 665 0 True 487 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 529 293 0.000867316399021821 0.000945623385540987 0.000656137941557946 0.00080872816052491 0.000791268971047387 0.000768231137081845 37912 41211 667 665 0 True 532 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 574 294 0.000990601060193181 0.000886308240273377 0.000747692072938125 0.000473029678797589 0.000919296063012827 0.000981531418851526 43301 38626 667 665 0 True 576 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 621 294 0.000905749917442286 0.000903976581416921 0.000457770656900893 0.000503547722590982 0.00101320371226437 0.000963746670984964 39592 39396 667 665 0 False 621 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 666 294 0.000983898071563898 0.000967743230816799 0.00064087891966125 0.000534065766384375 0.000975301970631194 0.00104044144672891 43008 42175 667 665 0 False 666 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 265 340 0.000905086481707647 0.00103185406868051 0.000701915007248035 0.000930800335698482 0.000778929041184566 0.000737115838447618 39563 44969 667 665 0 True 263 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 308 340 0.000911766593242632 0.00093224592724659 0.000747692072938125 0.000793469138628214 0.000698223626019492 0.000664973464495254 39855 40628 667 665 0 True 308 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 353 340 0.000877084918287023 0.000942571581161648 0.000732433051041428 0.000869764248111696 0.000685828219358291 0.000661811533890214 38339 41078 667 665 0 True 353 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 397 340 0.000873287320633572 0.000906041712199932 0.000671396963454643 0.000793469138628214 0.000750006883311097 0.000665737878121066 38173 39486 667 665 0 True 397 339 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 442 340 0.000891154331280228 0.000852876067486179 0.000610360875867857 0.000564583810177768 0.000861387682430694 0.000904371457462355 38954 37169 667 665 0 True 442 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 485 339 0.000928901536871756 0.000884931486418036 0.000686655985351339 0.000671396963454643 0.00083200067160881 0.000822607143168008 40604 38566 667 665 0 True 487 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 528 337 0.000973603379129845 0.000913223778145295 0.000762951094834821 0.000686655985351339 0.000866710950007581 0.000879495761081582 42558 39799 667 665 0 True 532 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 574 338 0.000901700671751558 0.000879401525099083 0.000595101853971161 0.000549324788281071 0.000971527853692302 0.000919365813964673 39415 38325 667 665 0 True 576 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 618 336 0.000986940725105518 0.00091193880788031 0.000579842832074464 0.000335698481727321 0.00108005799446266 0.00111016573328197 43141 39743 667 665 0 True 621 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 662 339 0.000965230362616815 0.000903311150386839 0.000595101853971161 0.000503547722590982 0.00096725826973902 0.000942082059799709 42192 39367 667 665 0 True 666 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 264 383 0.000903896872804156 0.000937362862408941 0.000747692072938125 0.000793469138628214 0.000754900856938538 0.000781393534885557 39511 40851 667 665 0 True 263 383 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 309 385 0.000823575394724245 0.00631620249984081 0.000671396963454643 0.00634775310902571 0.000659374916956329 0.00179862694198138 36000 275265 667 665 0 True 308 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 353 384 0.00102773058423867 0.000927794423114321 0.000946059357595178 0.000762951094834821 0.000721823259097526 0.00073534026157864 44924 40434 667 665 0 True 353 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 398 383 0.000863541678462668 0.000966940124401184 0.000671396963454643 0.000793469138628214 0.000731760985298157 0.00077953349548751 37747 42140 667 665 0 True 398 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 441 383 0.000858760365754408 0.000922539812566435 0.000534065766384375 0.000595101853971161 0.00085209321776663 0.000893934254937662 37538 40205 667 665 0 True 442 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 486 382 0.000927094246422223 0.000893582089809096 0.000610360875867857 0.000518806744487678 0.00086894342672134 0.000919792836556759 40525 38943 667 665 0 True 487 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 531 381 0.000906024442573861 0.000927289613367362 0.000595101853971161 0.000595101853971161 0.000898622277935998 0.000950158127181914 39604 40412 667 665 0 True 532 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 575 380 0.000896919359043298 0.000907946221699821 0.000534065766384375 0.000549324788281071 0.000962227151523426 0.00100456861704417 39206 39569 667 665 0 True 577 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 618 381 0.000865715002420968 0.000833142595559625 0.0004272526131075 0.000381475547417411 0.00105384070011895 0.00096524949675598 37842 36309 667 665 0 True 621 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 663 381 0.000766451290262399 0.000893375576730795 0.000396734569314107 0.000488288700694286 0.0008603056974132 0.000949922435604672 33503 38934 667 665 0 True 666 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 266 427 0.00098202214983147 0.000901544316272485 0.00080872816052491 0.000717174029144732 0.000843264218243659 0.000803079643862864 42926 39290 667 665 0 True 263 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 309 427 0.000900236537716493 0.000931580496216508 0.000793469138628214 0.000747692072938125 0.000725727004362063 0.000777657703266867 39351 40599 667 665 0 True 308 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 354 427 0.000877130672475619 0.00101191408367566 0.000762951094834821 0.000930800335698482 0.000686261763837509 0.000678201838035696 38341 44100 667 665 0 True 353 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 398 427 0.000868986426905568 0.000975131809840463 0.000671396963454643 0.000793469138628214 0.00075038375264364 0.000839307536790824 37985 42497 667 665 0 True 398 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 442 426 0.000851165170447507 0.000840898308944712 0.000549324788281071 0.000579842832074464 0.000863960802973247 0.000817899371185338 37206 36647 667 665 0 True 442 426 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 487 426 0.000890902683242952 0.000945715169131343 0.000625619897764553 0.000671396963454643 0.000864776986179124 0.000867825304521953 38943 41215 667 665 0 True 487 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 530 425 0.000978842233724063 0.00092267748795197 0.000762951094834821 0.000686655985351339 0.000888033255066668 0.000841162825769791 42787 40211 667 665 0 True 532 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 574 425 0.000950017094908714 0.000841816144848273 0.000549324788281071 0.000534065766384375 0.0010363420436608 0.000881409258208929 41527 36687 667 665 0 True 577 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 619 425 0.000873127180973487 0.000940712963456937 0.0004272526131075 0.000625619897764553 0.000959430000165492 0.000861633256430393 38166 40997 667 665 0 True 621 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 663 426 0.000859149276357472 0.00089326084724285 0.000442511635004196 0.000488288700694286 0.000968148567848488 0.000939191219205173 37555 38929 667 665 0 True 666 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 267 471 0.000900442431565174 0.00095652268689577 0.000762951094834821 0.000762951094834821 0.000749198558824591 0.000787485345094431 39360 41686 667 665 0 True 264 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 311 471 0.000834121735195575 0.000929171176969661 0.000656137941557946 0.000747692072938125 0.000754261103926141 0.000833024920087276 36461 40494 667 665 0 True 308 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 355 472 0.000911743716148335 0.000931855846987577 0.000762951094834821 0.000823987182421607 0.000752661292798382 0.00078082287186339 39854 40611 667 665 0 True 353 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 399 471 0.000886258633100479 0.000906271171175822 0.000671396963454643 0.000701915007248035 0.00081782238969843 0.000831800726978814 38740 39496 667 665 0 True 398 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 443 471 0.000914214442332507 0.000873917455575308 0.000518806744487678 0.000442511635004196 0.00099293215113311 0.00105767930151035 39962 38086 667 665 0 True 443 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 489 471 0.000863404415896881 0.000918065362536577 0.000457770656900893 0.000595101853971161 0.000954707614628378 0.000989740979887638 37741 40010 667 665 0 True 487 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 531 470 0.000826114752191311 0.000854574063907767 0.000518806744487678 0.000564583810177768 0.000848385758252828 0.000862280266133313 36111 37243 667 665 0 True 532 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 575 469 0.00081938888646773 0.000925912859512021 0.0004272526131075 0.000473029678797589 0.000925258726544829 0.00107179475514523 35817 40352 667 665 0 True 577 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 619 469 0.000961936061037918 0.000808383972061075 0.000595101853971161 0.0004272526131075 0.000982445246027406 0.000892846606004287 42048 35230 667 665 0 True 622 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 665 470 0.000865074443780627 0.000961043028720806 0.000457770656900893 0.000595101853971161 0.000967431996747659 0.000973528687050427 37814 41883 667 665 0 True 666 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 267 515 0.000919064386323661 0.000861526670877239 0.000762951094834821 0.000671396963454643 0.000769478930309372 0.000781838849848131 40174 37546 667 665 0 True 264 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 311 516 0.000894929051839381 0.00084936534515506 0.000732433051041428 0.000686655985351339 0.000754817462625396 0.000760673423247622 39119 37016 667 665 0 True 308 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 356 514 0.000900716956696749 0.000973479705214054 0.000778210116731518 0.000854505226215 0.000768840368634869 0.000781301357029175 39372 42425 667 665 0 True 353 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 399 515 0.000897376900929256 0.000979698043460677 0.000686655985351339 0.000762951094834821 0.000856488496845783 0.000857012114195456 39226 42696 667 665 0 True 398 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 443 514 0.000898223353418278 0.000899364456001528 0.000488288700694286 0.000473029678797589 0.00099201183216189 0.000973104890176954 39263 39195 667 665 0 True 443 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 487 513 0.000783334585854246 0.000872380080436844 0.000457770656900893 0.000625619897764553 0.000823523742980361 0.000839169323099973 34241 38019 667 665 0 True 487 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 532 512 0.000862512209219263 0.000823275859596347 0.000518806744487678 0.000518806744487678 0.000891735190455218 0.00082800683788343 37702 35879 667 665 0 True 532 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 576 512 0.000800675423332051 0.000870452625039366 0.000488288700694286 0.000488288700694286 0.000838230936360432 0.000903049368524161 34999 37935 667 665 0 True 577 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 619 510 0.000837713439000344 0.000903976581416921 0.000488288700694286 0.000595101853971161 0.000911363627112739 0.000952363652134881 36618 39396 667 665 0 True 622 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 664 511 0.000863747572311349 0.000893582089809096 0.000457770656900893 0.000457770656900893 0.00095736199628182 0.000983324884754754 37756 38943 667 665 0 True 666 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 267 556 0.00091059986143344 0.000895417761616217 0.00080872816052491 0.000762951094834821 0.000676376635059776 0.000719605447380839 39804 39023 667 665 0 True 264 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 312 557 0.000906481984459819 0.000919419170494329 0.000717174029144732 0.000778210116731518 0.000752033561607916 0.000757250701654227 39624 40069 667 665 0 True 309 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 355 557 0.000996343210861953 0.000929813662102154 0.000885023270008392 0.000793469138628214 0.000782707902259577 0.000714859402781143 43552 40522 667 665 0 True 353 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 399 555 0.000938349776816787 0.000889704233116552 0.000762951094834821 0.000686655985351339 0.000812438199638207 0.000778236306006976 41017 38774 667 665 0 True 398 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 444 554 0.000871274136335357 0.000901108344218293 0.000396734569314107 0.000396734569314107 0.0010128863662977 0.00106721987216016 38085 39271 667 665 0 True 443 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 488 553 0.000859858466280707 0.000881260142803794 0.0004272526131075 0.000244144350347143 0.000988453097365401 0.00110475907309682 37586 38406 667 665 0 True 488 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 531 554 0.000811153132520487 0.000921667868458053 0.000411993591210803 0.000534065766384375 0.00094946103508858 0.00101077809915913 35457 40167 667 665 0 True 532 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 574 553 0.000837072880360003 0.00089254952441759 0.000610360875867857 0.000625619897764553 0.000830290594613282 0.000846757870487693 36590 38898 667 665 0 True 577 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 620 552 0.000807126763924058 0.00088415132590001 0.000534065766384375 0.000564583810177768 0.000801676230414167 0.000884162346198318 35281 38532 667 665 0 True 622 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 663 554 0.000853498634065892 0.000906730089127603 0.000534065766384375 0.000518806744487678 0.000927258165434702 0.000978277908002236 37308 39516 667 665 0 True 667 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 264 600 0.000952121787584121 0.00100523682747725 0.000823987182421607 0.000885023270008392 0.000695269008771574 0.000729231106914565 41619 43809 667 665 0 False 264 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 309 600 0.000874637069197148 0.000924375484373557 0.000717174029144732 0.000839246204318303 0.000721009069419113 0.000741587214255663 38232 40285 667 665 0 False 309 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 354 598 0.000913184973089102 0.000888327479261211 0.000747692072938125 0.000778210116731518 0.000750292759494986 0.000736518174999748 39917 38714 667 665 0 True 353 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 399 599 0.000895363716631041 0.000958725493064316 0.000686655985351339 0.000823987182421607 0.000761617498052842 0.000710284704426192 39138 41782 667 665 0 True 398 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 443 600 0.000846543997399332 0.000882591004863957 0.000473029678797589 0.000411993591210803 0.000883463973106348 0.00103230126166036 37004 38464 667 665 0 False 443 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 488 600 0.000922404442091154 0.000938005347541433 0.000473029678797589 0.0004272526131075 0.0010307205803273 0.00107696421443503 40320 40879 667 665 0 False 488 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 532 600 0.000939905419229044 0.000921782597945998 0.00064087891966125 0.000473029678797589 0.000977752454271165 0.00104617557679864 41085 40172 667 665 0 False 532 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 577 599 0.000898337738889768 0.000903081691410949 0.000625619897764553 0.000534065766384375 0.000862511098191025 0.000969660102070076 39268 39357 667 665 0 False 577 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 622 599 0.000859538186960537 0.000903930689621743 0.000656137941557946 0.000717174029144732 0.000751828954513245 0.000727429766904694 37572 39394 667 665 0 False 622 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 667 599 0.000949994217814416 0.00101143221982629 0.000701915007248035 0.000732433051041428 0.000859735762019281 0.00092258562018423 41526 44079 667 665 0 False 667 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 264 649 0.00118359222769023 0.0732773338702673 0.00100709544518196 0.0738231479362173 0.000831324703334455 0.0249934781782475 51737 3193483 667 665 0 True 264 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 309 644 0.000921329218659153 0.000933393222126041 0.000793469138628214 0.000869764248111696 0.000690672648296378 0.000658274514317563 40273 40678 667 665 0 False 309 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 354 644 0.000992156702605438 0.000942892823727894 0.000869764248111696 0.000854505226215 0.000693487344956618 0.00063252055721063 43369 41092 667 665 0 False 354 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 398 644 0.000883101594087369 0.000906225279380644 0.000732433051041428 0.000747692072938125 0.000671500271919202 0.0006805422737157 38602 39494 667 665 0 False 398 644 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 443 643 0.000869055058188461 0.000864876771925235 0.000595101853971161 0.000595101853971161 0.000819615286176372 0.00088871003398517 37988 37692 667 665 0 False 443 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 488 643 0.000849151986149292 0.000861847913443485 0.000549324788281071 0.000579842832074464 0.000862827888967145 0.000868969033667533 37118 37560 667 665 0 False 488 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 533 643 0.000858462963528536 0.000920612357168958 0.000503547722590982 0.000564583810177768 0.000891075288042352 0.000948923915841589 37525 40121 667 665 0 False 533 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 577 643 0.000838948802092431 0.000853472660823494 0.000656137941557946 0.000671396963454643 0.000758911917329748 0.000698158778258396 36672 37195 667 665 0 False 577 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 622 643 0.000936748380215935 0.000900832993447225 0.000793469138628214 0.000732433051041428 0.000707628101495036 0.000708355982212274 40947 39259 667 665 0 False 622 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 662 648 0.00098245681462313 0.0819561607153613 0.000839246204318303 0.0786449988555734 0.000738038408230711 0.0240350085559681 42945 3571713 667 665 0 True 667 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C11_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C11_1.csv new file mode 100755 index 0000000..7c0bc85 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C11_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 255 266 0.00968588720059746 0.0376565584251313 0.00973525597009232 0.0380102235446708 0.00152254448976274 0.00845428734710414 423388 1641102 667 665 0 True 256 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 300 265 0.00972541881954422 0.00976377772079546 0.00978103303578241 0.0098115510795758 0.00127921279437876 0.00122348956310892 425116 425513 667 665 0 False 300 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 343 267 0.00984124554797447 0.0588148329165785 0.00993362325474937 0.0588387884336614 0.00119690485154449 0.00801768734814978 430179 2563196 667 665 0 True 345 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 388 266 0.0098702994577328 0.0807403952775048 0.00984206912336919 0.0797436484321355 0.00130763573386859 0.0104347012022358 431449 3518729 667 665 0 True 389 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 433 266 0.00979407297953221 0.0690300711724378 0.0098115510795758 0.0666056305790799 0.00158130523213532 0.0117366554762378 428117 3008384 667 665 0 True 434 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 476 265 0.009610438543603 0.061415612732908 0.00962844281681544 0.0642252231631952 0.00169231692500316 0.0162421716885532 420090 2676540 667 665 0 True 479 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 520 265 0.00957088404756194 0.077469595251576 0.00953688868543526 0.0766765850308995 0.00160286390373311 0.0239259485228715 418361 3376185 667 665 0 True 523 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 565 264 0.00950511240145549 0.062104632145711 0.00956740672922866 0.0614633401998932 0.00172335449851574 0.016063532301672 415486 2706568 667 665 0 True 568 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 612 265 0.00946352184402191 0.00915268257620476 0.00933852140077821 0.00912489509422446 0.00219419595870275 0.00189864553130821 413668 398881 667 665 0 False 612 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 657 265 0.0107618426996161 0.0328663957903456 0.00961318379491875 0.0380560006103609 0.00504000532911721 0.0160815408474666 470420 1432343 667 665 0 False 657 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 256 309 0.00954750365718949 0.00950708196446713 0.00956740672922866 0.00959792477302205 0.00154410820471017 0.00154942214910073 417339 414326 667 665 0 False 256 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 300 309 0.00962647538670582 0.00955171173527777 0.00959792477302205 0.00953688868543526 0.00136258634553288 0.00131791997027248 420791 416271 667 665 0 False 300 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 345 310 0.00984781127403796 0.10070266074892 0.00988784618905928 0.100160219729915 0.00136154551031383 0.0220290981858249 430466 4388700 667 665 0 True 345 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 389 311 0.00974321719890798 0.0477748732095746 0.00976577401388571 0.0480811779964904 0.00136800241013115 0.00617359200711022 425894 2082066 667 665 0 True 389 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 433 311 0.00986959026780956 0.0733997961256999 0.00996414129854276 0.0719615472648203 0.00164072026356918 0.014994204200841 431418 3198820 667 665 0 True 434 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 478 310 0.00984563795007966 0.042814589690064 0.00991836423285267 0.0428931105516136 0.00177074509173262 0.00910545742030396 430371 1865893 667 665 0 True 479 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 521 309 0.00966220940799914 0.0415803069128532 0.00971999694819562 0.0431372549019608 0.00161274560359532 0.00732283409870023 422353 1812102 667 665 0 True 523 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 565 309 0.00951305075317686 0.0488106739726405 0.00950637064164187 0.0508278019378958 0.00180949418708889 0.00908274542366467 415833 2127207 667 665 0 True 568 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 612 309 0.00940749584008637 0.00923269492109766 0.00944533455405508 0.00929274433508812 0.00200342831412024 0.00218604406460176 411219 402368 667 665 0 False 612 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 657 308 0.00927172028542836 0.00949411753232934 0.0093690394445716 0.00950637064164187 0.00195675220077235 0.00182954395527737 405284 413761 667 665 0 False 657 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 257 356 0.00965331021831725 0.0427250318517741 0.00967421988250553 0.0431525139238575 0.00149476628208793 0.00711874829304118 421964 1861990 667 665 0 True 256 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 300 356 0.00970231295430335 0.0522812639288769 0.00975051499198901 0.0567025253681239 0.00130924557908552 0.0144963638005967 424106 2278458 667 665 0 True 300 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 345 356 0.00971333971375493 0.0362249409286549 0.00976577401388571 0.0369878690775921 0.00135822477858397 0.00525765122369295 424588 1578711 667 665 0 True 345 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 388 355 0.00987853521168004 0.0328894793633202 0.0098115510795758 0.0334935530632486 0.00142965625720359 0.00510079439826455 431809 1433349 667 665 0 True 389 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 433 355 0.00975406094160519 0.0667038390207609 0.0097962920576791 0.0641794460975051 0.00170300210693741 0.0112674307405115 426368 2907005 667 665 0 True 434 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 478 353 0.00988386557465145 0.0305366299704399 0.0098268101014725 0.0311894407568475 0.0017689588149815 0.00398062051641366 432042 1330810 667 665 0 True 479 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 521 353 0.00971317957409485 0.0268922018940691 0.00967421988250553 0.0272678721293965 0.00170299020573894 0.00299994840990287 424581 1171983 667 665 0 True 523 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 566 353 0.00961226871114683 0.0473894050759767 0.00967421988250553 0.0486152437628748 0.00178175496719895 0.00872608436061245 420170 2065267 667 665 0 True 568 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 610 352 0.00953144393699236 0.0544135114623363 0.00946059357595178 0.0546425574120699 0.00215114629237553 0.0128203803673585 416637 2371383 667 665 0 True 613 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 655 353 0.00962830555424965 0.0588666906451297 0.00971999694819562 0.0592660410467689 0.00203455805764228 0.0159244396554141 420871 2565456 667 665 0 True 657 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 257 400 0.00962963242571893 0.0362404294095275 0.00965896086060884 0.0384222171358816 0.00156878440781521 0.00723170362277183 420929 1579386 667 665 0 True 256 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 301 400 0.00980866856569427 0.0291934459632716 0.00975051499198901 0.0292362859540703 0.00136499155622927 0.00381893499927045 428755 1272273 667 665 0 True 300 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 345 400 0.00980219434800796 0.0758453469448398 0.0098115510795758 0.0747234302281224 0.00145048712411056 0.0155326645155345 428472 3305399 667 665 0 True 345 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 389 400 0.00975040060651752 0.0613777290559886 0.00976577401388571 0.06152437628748 0.00141172341742957 0.0138568048511299 426208 2674889 667 665 0 True 389 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 434 399 0.0101642472423665 0.041510023628538 0.0102082856488899 0.0424963759822995 0.00158815176654273 0.00705014244227623 444298 1809039 667 665 0 True 434 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 478 397 0.00994265970699704 0.0495151359745209 0.00996414129854276 0.0510109102006561 0.00170142590817171 0.0105258095545462 434612 2157908 667 665 0 True 479 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 522 397 0.0100751409600762 0.0397389445231297 0.0100862134737163 0.0406042572671092 0.00163265459902659 0.00484955017910496 440403 1731854 667 665 0 True 523 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 566 397 0.00973591940582696 0.0484997800062069 0.00976577401388571 0.0486305027847715 0.00170770797768771 0.00720324137522218 425575 2113658 667 665 0 True 568 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 611 397 0.00965415667080628 0.0438118872369755 0.00964370183871214 0.0449225604638743 0.0019667325165434 0.00667677579669215 422001 1909356 667 665 0 True 613 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 654 397 0.00967092558092664 0.0764799386885616 0.00968947890440223 0.0744182497901884 0.00201129910051458 0.0151492223113795 422734 3333055 667 665 0 True 657 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 258 445 0.00973308264613402 0.0385757251907521 0.00962844281681544 0.0386205844205386 0.00154925886804055 0.0046259938476418 425451 1681160 667 665 0 True 256 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 302 444 0.00991637392564876 0.0445194469350304 0.00985732814526589 0.0443121995880064 0.00155112388276123 0.00466539293155863 433463 1940192 667 665 0 True 300 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 346 443 0.00982379032502517 0.0316078591993832 0.00988784618905928 0.0318913557640955 0.00148946874054917 0.00273187154776226 429416 1377495 667 665 0 True 345 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 391 444 0.0100331843691338 0.0484777060527262 0.0100709544518196 0.0479133287556268 0.00149553498023799 0.00668252423130638 438569 2112696 667 665 0 True 390 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 434 444 0.0101824802865219 0.0909267446482996 0.0101777676050965 0.089417868314641 0.00188616262255123 0.0192559769772326 445095 3962658 667 665 0 True 434 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 479 442 0.0100839486413808 0.0564592300159876 0.0100709544518196 0.0571297779812314 0.00183701917143069 0.011725866327765 440788 2460537 667 665 0 True 479 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 523 442 0.00989349683135086 0.0503555524196162 0.0098268101014725 0.0487220569161517 0.00177051580655211 0.00837443257248661 432463 2194534 667 665 0 True 523 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 566 441 0.00967332767582791 0.0317165080244672 0.00968947890440223 0.0317845426108186 0.00188490464812684 0.00393480340361164 422839 1382230 667 665 0 True 568 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 611 441 0.00958396974550033 0.0377762671728532 0.00955214770733196 0.0381933318074311 0.00184353481534066 0.00455716718656525 418933 1646319 667 665 0 True 613 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 655 441 0.00957044938277028 0.0683868747171201 0.00956740672922866 0.0682230869001297 0.00193817726396187 0.0136165380554275 418342 2980353 667 665 0 True 657 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 258 488 0.00958442728738629 0.052109628614911 0.00953688868543526 0.0528572518501564 0.00164373263055776 0.0129072205637349 418953 2270978 667 665 0 True 256 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 303 488 0.00977359798013559 0.0489771235137512 0.0098115510795758 0.048905165178912 0.00153362729107727 0.00576352373546294 427222 2134461 667 665 0 True 300 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 346 488 0.00988530683159222 0.0609162411636783 0.00987258716716258 0.0603036545357443 0.00162411178975154 0.0117110358599464 432105 2654777 667 665 0 True 345 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 391 487 0.01019508556548 0.0829239498379733 0.0101777676050965 0.0785534447241932 0.00166785913096447 0.0188590220227925 445646 3613890 667 665 0 True 390 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 435 487 0.0101645446445923 0.0904927918330961 0.0101930266269932 0.0867933165484092 0.00190244253953417 0.0274364021086995 444311 3943746 667 665 0 True 434 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 479 485 0.0101362685560401 0.042609017393564 0.0101472495613031 0.0433661402304112 0.00189419096217653 0.00713056693566837 443075 1856934 667 665 0 True 479 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 522 486 0.00980455068872064 0.0375057579861762 0.0098268101014725 0.0383459220263981 0.00172707627596316 0.00453265268926078 428575 1634530 667 665 0 True 523 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 567 485 0.0096811058878892 0.0929398800273745 0.0098268101014725 0.0897840848401617 0.0018776777121136 0.0212315958062006 423179 4050392 667 665 0 True 568 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 611 485 0.00957765566747411 0.0622607560329067 0.00964370183871214 0.065644312199588 0.00180122315835548 0.0170072194402873 418657 2713372 667 665 0 True 613 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 656 485 0.00947573821237699 0.0818819536825584 0.00953688868543526 0.0762035553521019 0.00205342097011883 0.0176751125897772 414202 3568479 667 665 0 True 657 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 258 531 0.0098169500738301 0.04492145906079 0.0098268101014725 0.047699702449073 0.00152331998304178 0.00849685196887706 429117 1957712 667 665 0 True 256 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 303 532 0.00975399231032229 0.0904463263904784 0.00968947890440223 0.084596017395285 0.00141335280198445 0.0206070021782298 426365 3941721 667 665 0 True 300 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 347 532 0.00998317504099861 0.0505371462531357 0.00993362325474937 0.0534218356603342 0.00158752661357686 0.00960877116858372 436383 2202448 667 665 0 True 345 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 391 530 0.0102500821001722 0.0544010977317407 0.0102693217364767 0.0539253833829252 0.00165387294168267 0.00646408725064394 448050 2370842 667 665 0 True 390 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 436 531 0.0102557327424637 0.0524132716777065 0.0102998397802701 0.052674143587396 0.00195461633555847 0.0057940069484616 448297 2284211 667 665 0 True 434 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 479 528 0.0100483061284647 0.0607045652584196 0.0100404364080262 0.0595407034409094 0.00193057692443828 0.013553924320086 439230 2645552 667 665 0 True 479 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 523 528 0.00975570809239464 0.0673090829614664 0.0098115510795758 0.067002365148394 0.00189380678480528 0.0136919390973945 426440 2933382 667 665 0 True 523 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 567 527 0.00981990121899453 0.054092383625578 0.0098268101014725 0.0556038757915618 0.0017324415522578 0.0127712330124654 429246 2357388 667 665 0 True 568 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 611 528 0.00963027298435928 0.0476458943192268 0.00958266575112535 0.0463721675440604 0.00187902055841908 0.00716566363990142 420957 2076445 667 665 0 True 613 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 656 528 0.00953112365767219 0.0598281237541095 0.00953688868543526 0.0606546120393683 0.0019221291102117 0.0116258632463756 416623 2607356 667 665 0 True 657 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 258 575 0.00987848945749144 0.0382784610874864 0.00994888227664607 0.0389257648584726 0.00138491328185436 0.00691328065311223 431807 1668205 667 665 0 True 256 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 303 574 0.00970430326150726 0.0485368146849155 0.00976577401388571 0.048905165178912 0.0013872763825548 0.00946974670769911 424193 2115272 667 665 0 True 300 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 346 574 0.00988086867529842 0.0409918134773877 0.00988784618905928 0.0414892805371176 0.00144100415103598 0.00703094167707847 431911 1786455 667 665 0 True 345 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 391 573 0.0101760975772128 0.0454283339385314 0.0102082856488899 0.0448004882887007 0.00148370236480184 0.00454910375209773 444816 1979802 667 665 0 True 390 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 434 572 0.0100062580291452 0.0836542489205389 0.010101472495613 0.0775463492790112 0.00187873882374454 0.0187565663339238 437392 3645717 667 665 0 True 434 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 478 571 0.0100489238100108 0.0573152955632386 0.0100709544518196 0.0573586633096818 0.00206802000779691 0.0104827879452586 439257 2497845 667 665 0 True 479 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 523 571 0.00985028200022214 0.0504732878201455 0.00988784618905928 0.0506599526970321 0.00190048006262558 0.00568800080601158 430574 2199665 667 665 0 True 524 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 566 571 0.00970121485377705 0.0350486424346515 0.00975051499198901 0.0369115739681086 0.00170840762084965 0.00694777060284583 424058 1527447 667 665 0 True 568 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 611 570 0.00964992440836117 0.0434790569924468 0.00965896086060884 0.0441901274128328 0.00159287774530464 0.00636164916921294 421816 1894851 667 665 0 True 613 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 655 570 0.00942911469419788 0.0467815911947413 0.0093690394445716 0.0466163118944076 0.00165296158248187 0.00637598436360361 412164 2038778 667 665 0 True 657 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 256 613 0.00936494444469228 0.00936890176918607 0.0093842984664683 0.00933852140077821 0.00141403032716193 0.00135055536330676 409359 408304 667 665 0 False 256 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 301 613 0.00957534508095003 0.00933425346382665 0.00956740672922866 0.00944533455405508 0.00143701738505774 0.00142471578400896 418556 406794 667 665 0 False 301 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 346 617 0.00961567739819722 0.0624372558771614 0.00961318379491875 0.061173418783856 0.00148557707035614 0.00873041538545304 420319 2721064 667 665 0 True 345 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 391 617 0.00979167088463093 0.0686530471291527 0.00976577401388571 0.06665140764477 0.00142386720312952 0.015327520977372 428012 2991953 667 665 0 True 390 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 434 613 0.00994078378526461 0.00988422073724022 0.00996414129854276 0.00991836423285267 0.00191796907889129 0.00189094889555259 434530 430762 667 665 0 False 434 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 479 613 0.00979873990676898 0.00982329937914138 0.00987258716716258 0.00988784618905928 0.0019480900600305 0.00194628582654158 428321 428107 667 665 0 False 479 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 524 613 0.00946576379926311 0.00958021054008333 0.00946059357595178 0.00959792477302205 0.00192365356072259 0.00203434311624316 413766 417513 667 665 0 False 524 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 568 613 0.00945270097841901 0.00933737410589876 0.00944533455405508 0.0093842984664683 0.00181306910905173 0.00179589704001181 413195 406930 667 665 0 False 568 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 613 613 0.00931914450190789 0.00934093072002506 0.00932326237888151 0.00935378042267491 0.001527924263016 0.00146031076232409 407357 407085 667 665 0 False 613 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 657 613 0.00930637908328967 0.00932539634735729 0.00929274433508812 0.00933852140077821 0.00151396621694785 0.00159843423206288 406799 406408 667 665 0 False 657 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 256 663 0.00906422504014644 0.0363224839393058 0.00910963607232776 0.0364690623331045 0.00124734541244939 0.0064879624266999 396214 1582962 667 665 0 True 256 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 301 656 0.00914237319426805 0.00934671308621749 0.00912489509422446 0.00935378042267491 0.00133183146141061 0.00120348345136506 399630 407337 667 665 0 False 301 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 345 656 0.00917851900325873 0.00934200917721174 0.00912489509422446 0.009399557488365 0.00129898570571031 0.0013867619115427 401210 407132 667 665 0 False 345 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 390 656 0.00921720416971647 0.00928058300936594 0.00927748531319142 0.00927748531319142 0.00143785557006625 0.00129848653584247 402901 404455 667 665 0 False 390 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 434 656 0.00927741668190853 0.00950552164343108 0.00926222629129473 0.00950637064164187 0.00162008235590693 0.00155985820196961 405533 414258 667 665 0 False 434 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 479 656 0.00936011737779542 0.0093803288261854 0.00935378042267491 0.00944533455405508 0.00168539251189187 0.0015571930027499 409148 408802 667 665 0 False 479 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 524 656 0.0093495481602298 0.00946910650395731 0.00949111161974517 0.00944533455405508 0.00170445487097615 0.00169873400982497 408686 412671 667 665 0 False 524 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 568 656 0.00931067997701767 0.00938216449799252 0.00923170824750134 0.009399557488365 0.00161119102169713 0.00147283533291435 406987 408882 667 665 0 False 568 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 613 656 0.00944165134187312 0.00944320058557931 0.00950637064164187 0.0093842984664683 0.00146189814509482 0.00136829217647223 412712 411542 667 665 0 False 613 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 653 661 0.00936299989167696 0.0398347665914615 0.009399557488365 0.0400854505226215 0.00139873652751568 0.00704203399643384 409274 1736030 667 665 0 True 657 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C11_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C11_2.csv new file mode 100755 index 0000000..05dce65 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C11_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 255 266 0.0082438981928125 0.71692488258871 0.00790417334248875 0.725673304341192 0.00217169247183402 0.207341525748479 360356 31244142 667 665 11 True 256 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 300 265 0.00672028371257264 0.00649699322694468 0.00668345159075303 0.00653086137178607 0.00141855818766764 0.00117282354577922 293756 283144 667 665 0 False 300 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 343 267 0.00648828709929768 0.00647879713015659 0.00650034332799268 0.00651560234988937 0.00120828570329363 0.00122002530336659 283615 282351 667 665 0 True 345 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 388 266 0.00655142787955988 0.00647994442503604 0.00656137941557946 0.00648508430609598 0.00124884982850076 0.00123881510237389 286375 282401 667 665 0 True 389 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 433 266 0.0063239838080502 0.00632714769299077 0.00642404821850919 0.00634775310902571 0.00162967643876995 0.00159595218760894 276433 275742 667 665 0 True 434 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 476 265 0.00658613243160978 0.00650353280775755 0.00663767452506294 0.00659189745937285 0.00160937961914994 0.00164090439245476 287892 283429 667 665 0 True 479 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 520 265 0.00667645119989788 0.00676098577870632 0.00671396963454643 0.00671396963454643 0.00154683725922179 0.00160306885487957 291840 294649 667 665 0 True 523 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 565 264 0.00700402831314944 0.00731389012701128 0.00706492713817044 0.00733958953231098 0.00156692595291336 0.00154495564100132 306159 318745 667 665 0 True 568 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 612 265 0.0120254132489718 0.00779630467792278 0.00817883573662928 0.00784313725490196 0.0224358780445478 0.00187601813807312 525653 339769 667 665 0 False 612 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 657 265 0.0469040371093922 0.577066194899012 0.00950637064164187 0.710399023422599 0.119309996257695 0.371993898305161 2050262 25148992 667 665 13 False 657 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 256 309 0.00666460086505157 0.00642404821850919 0.00654612039368277 0.0063782711528191 0.00165888704626786 0.00149754675487447 291322 279965 667 665 0 False 256 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 300 309 0.00626768327898308 0.00613554944812248 0.00630197604333562 0.00613412680247196 0.00121049837527753 0.0012515699797445 273972 267392 667 665 0 False 300 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 345 310 0.00624816911754697 0.00629853415869727 0.00630197604333562 0.00630197604333562 0.00117562208220956 0.00133315676840329 273119 274495 667 665 0 True 345 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 389 311 0.00637165967256701 0.00632253556757538 0.00633249408712902 0.00631723506523232 0.00134911674733065 0.00127992669950724 278517 275541 667 665 0 True 389 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 433 311 0.00651336039464818 0.00670605329987821 0.00651560234988937 0.00677500572213321 0.00155248843657749 0.00171486903039576 284711 292255 667 665 0 True 434 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 478 310 0.00682965910041088 0.00680327506796288 0.00683604180972 0.00685130083161669 0.00161575219094213 0.00158133527468759 298537 296492 667 665 0 True 479 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 521 309 0.00682538108377718 0.00688741767442181 0.00692759594110018 0.00686655985351339 0.00159030801827294 0.00169593499672877 298350 300159 667 665 0 True 523 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 565 309 0.00728674344448284 0.00705898415069489 0.00720225833524071 0.00700389105058366 0.00174559478233101 0.00156134088816179 318517 307636 667 665 0 True 568 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 612 309 0.00732709863882433 0.00748671862765176 0.00729381246662089 0.00744640268558785 0.00201559552640627 0.00192481927956552 320281 326277 667 665 0 False 612 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 657 308 0.00747300874625631 0.0074132917553669 0.00755321583886473 0.00747692072938125 0.00193123503999573 0.00182143271500829 326659 323077 667 665 0 False 657 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 257 356 0.00614844786350244 0.00615936728981988 0.00614938582436866 0.00617990386816205 0.00147584415692399 0.00141227594016628 268760 268430 667 665 0 True 256 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 300 356 0.00634793612578009 0.00620179425446197 0.0063782711528191 0.00622568093385214 0.00143161918254822 0.00129699208002198 277480 270279 667 665 0 True 300 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 345 356 0.0065555000023449 0.00656378873482631 0.00656137941557946 0.00657663843747616 0.00127767375976922 0.00127279761931903 286553 286055 667 665 0 True 345 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 388 355 0.00652264849493312 0.00668778836539736 0.00650034332799268 0.00669871061264973 0.00136177665265835 0.00122729972433665 285117 291459 667 665 0 True 389 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 433 355 0.0067935590456088 0.00675786513663422 0.0068207827878233 0.00669871061264973 0.00157029823936738 0.00171107637187228 296959 294513 667 665 0 True 434 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 478 353 0.00689266261810729 0.00692805485905196 0.00685130083161669 0.00689707789730678 0.00152981204094801 0.00166128736227396 301291 301930 667 665 0 True 479 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 521 353 0.00674069008068637 0.00702697462355821 0.00677500572213321 0.00703440909437705 0.00159954655838253 0.00163332609797487 294648 306241 667 665 0 True 523 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 566 353 0.00710635755594393 0.00711924007776365 0.0072327763790341 0.00717174029144732 0.00181666879233533 0.00175942254409609 310632 310262 667 665 0 True 568 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 610 352 0.00715821992871726 0.00728318851603718 0.00733958953231098 0.00721751735713741 0.00204112085482302 0.00200344935125115 312899 317407 667 665 0 True 613 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 655 353 0.00674341245490782 0.00661257171310056 0.00669871061264973 0.00663767452506294 0.00207824151082159 0.00195479046931056 294767 288181 667 665 0 True 657 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 257 400 0.00613549942812984 0.00610434302740142 0.00608834973678187 0.00602731364919509 0.00145296943708623 0.00164154744088083 268194 266032 667 665 0 True 256 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 301 400 0.00644072562025236 0.00649414793564364 0.00648508430609598 0.00657663843747616 0.00141263028366797 0.00132046766445049 281536 283020 667 665 0 True 300 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 345 400 0.00672703245539052 0.00684324682156295 0.0068055237659266 0.00688181887541009 0.00131402909021458 0.00130179171613329 294051 298234 667 665 0 True 345 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 389 400 0.00679349041432591 0.00717229099298945 0.00683604180972 0.0072327763790341 0.00144505632864674 0.00141085100349449 296956 312574 667 665 0 True 389 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 434 399 0.00699718806195437 0.00682587677708806 0.00704966811627375 0.00686655985351339 0.00155256518717687 0.00157787168140689 305860 297477 667 665 0 True 434 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 478 397 0.0070078259108029 0.00721435082327012 0.00698863202868696 0.0072480354009308 0.00164492610091079 0.00169415597032579 306325 314407 667 665 0 True 479 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 522 397 0.00713312375627247 0.00694131758785841 0.00715648126955062 0.00701915007248035 0.00168396008405593 0.00174620343750812 311802 302508 667 665 0 True 523 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 566 397 0.00691830784081523 0.0070907183270605 0.00695811398489357 0.00715648126955062 0.00176213892857513 0.00164408492691817 302412 309019 667 665 0 True 568 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 611 397 0.00661923558705884 0.00670079868933033 0.00663767452506294 0.00665293354695964 0.00189338483697444 0.00197685170728231 289339 292026 667 665 0 True 613 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 654 397 0.00619982981729552 0.0063091351633834 0.00621042191195544 0.00627145799954223 0.0019107330159319 0.00168755780112841 271006 274957 667 665 0 True 657 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 258 445 0.00625018230184519 0.00613931257532708 0.00621042191195544 0.00610360875867857 0.001452776343405 0.00160752981426816 273207 267556 667 665 0 True 256 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 302 444 0.00647563606615095 0.00662778484320208 0.00651560234988937 0.00671396963454643 0.00151507370324313 0.00143598332243049 283062 288844 667 665 0 True 300 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 346 443 0.00673506231548909 0.00668342864485544 0.0068055237659266 0.00668345159075303 0.00134245274335572 0.00141908903620726 294402 291269 667 665 0 True 345 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 391 444 0.00672781027659665 0.00692874323597963 0.00675974670023652 0.00697337300679027 0.00144886268958208 0.00138992253414881 294085 301960 667 665 0 True 390 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 434 444 0.00688211627763596 0.00705861701633346 0.00685130083161669 0.00704966811627375 0.00174837156986644 0.00176213460583408 300830 307620 667 665 0 True 434 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 479 442 0.00714055881191929 0.00694372690710525 0.00714122224765393 0.00698863202868696 0.00183995344163629 0.00191281118893812 312127 302613 667 665 0 True 479 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 523 442 0.0069654117779746 0.00708759768498839 0.00697337300679027 0.00711070420386053 0.00165813062402753 0.0017278973146468 304471 308883 667 665 0 True 523 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 566 441 0.00648714324458279 0.00633891893845394 0.00648508430609598 0.0063782711528191 0.00177873172710322 0.00181904100044103 283565 276255 667 665 0 True 568 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 611 441 0.00615796473473037 0.00608846446626982 0.00617990386816205 0.00610360875867857 0.00177762316952141 0.00177078213574298 269176 265340 667 665 0 True 613 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 655 441 0.00587790334633553 0.00612497138933394 0.00593575951781491 0.00613412680247196 0.00187293030147691 0.00196468082952364 256934 266931 667 665 0 True 657 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 258 488 0.00633304313739216 0.00643129912214732 0.00634775310902571 0.0064087891966125 0.00141125403540346 0.00143998507033927 276829 280281 667 665 0 True 256 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 303 488 0.00646694277031775 0.0063413053118032 0.00648508430609598 0.0063782711528191 0.00147148956003011 0.0015785687830306 282682 276359 667 665 0 True 300 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 346 488 0.00645035687695177 0.00664386991741198 0.00648508430609598 0.00660715648126955 0.0015794100512714 0.00160855701249688 281957 289545 667 665 0 True 345 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 391 487 0.00669424957926164 0.00676527666155547 0.00660715648126955 0.00672922865644312 0.00159471590678989 0.00154788498883891 292618 294836 667 665 0 True 390 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 435 487 0.00675832832039005 0.00678260081423518 0.00674448767833982 0.0068207827878233 0.00182437882842036 0.00187711984504925 295419 295591 667 665 0 True 434 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 479 485 0.00675787077850409 0.00686995584635656 0.00679026474402991 0.0068207827878233 0.00178765926775631 0.00190837168362073 295399 299398 667 665 0 True 479 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 522 486 0.00652800173499883 0.00651835585760005 0.00656137941557946 0.00653086137178607 0.00183802026810275 0.00169317348248148 285351 284075 667 665 0 True 523 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 567 485 0.00615586004205496 0.00641957376847934 0.00613412680247196 0.00643930724040589 0.001768823862278 0.00187391067732103 269084 279770 667 665 0 True 568 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 611 485 0.00615718691352424 0.00590042283552782 0.00621042191195544 0.00593575951781491 0.00175494960635212 0.0016691916669944 269142 257145 667 665 0 True 613 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 656 485 0.00614277434411657 0.00622164245587647 0.00613412680247196 0.00616464484626535 0.00189694955759446 0.00172780159802847 268512 271144 667 665 0 True 657 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 258 531 0.00648981986461564 0.00652879624100306 0.00653086137178607 0.00656137941557946 0.00150200556633317 0.00148896751601297 283682 284530 667 665 0 True 256 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 303 532 0.00637566316406914 0.00653857119337598 0.00631723506523232 0.00653086137178607 0.00143264861171294 0.00150007510491613 278692 284956 667 665 0 True 300 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 347 532 0.00649812424984578 0.00668868325540333 0.00654612039368277 0.00669871061264973 0.00141756798831935 0.00148428724394272 284045 291498 667 665 0 True 345 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 391 530 0.0065251192211173 0.00667743976558471 0.00653086137178607 0.00669871061264973 0.00155655059892601 0.00161299029287195 285225 291008 667 665 0 True 390 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 436 531 0.00668427516614776 0.00625952613279594 0.00668345159075303 0.00627145799954223 0.00181539668210566 0.00198808866909343 292182 272795 667 665 0 True 434 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 479 528 0.00667091494307779 0.00668370399562651 0.00672922865644312 0.00675974670023652 0.00184314978284935 0.0017997679922507 291598 291281 667 665 0 True 479 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 523 528 0.00646616494911162 0.0063621860786092 0.00645456626230259 0.00634775310902571 0.00180569063748909 0.00165725429083599 282648 277269 667 665 0 True 523 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 567 527 0.00642446000620656 0.00634766132543536 0.00643930724040589 0.00643930724040589 0.00154993243941741 0.00172864425332434 280825 276636 667 665 0 True 568 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 611 528 0.00627308227323738 0.00620002742034762 0.00631723506523232 0.00631723506523232 0.0017318619675518 0.00167182322343247 274208 270202 667 665 0 True 613 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 656 528 0.00612451842286685 0.00606522027201214 0.00616464484626535 0.00604257267109178 0.00182641676490386 0.00189122750909133 267714 264327 667 665 0 True 657 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 258 575 0.00686456954630947 0.00671979789253404 0.00688181887541009 0.00675974670023652 0.00134227956849717 0.00125533411401923 300063 292854 667 665 0 True 256 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 303 574 0.00686987703218658 0.00697449735577213 0.00683604180972 0.00692759594110018 0.00139145208604143 0.00145775706245283 300295 303954 667 665 0 True 300 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 346 574 0.00688236792567324 0.00700579556008355 0.00692759594110018 0.00698863202868696 0.00137105381451086 0.0013967789702396 300841 305318 667 665 0 True 345 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 391 573 0.00651610564596393 0.00671796222072691 0.00651560234988937 0.00672922865644312 0.00137310063037881 0.00126936815463336 284831 292774 667 665 0 True 390 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 434 572 0.00666146670313275 0.00654143943057461 0.00657663843747616 0.00659189745937285 0.00188548031469668 0.00196579361762171 291185 285081 667 665 0 True 434 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 478 571 0.00661026776609406 0.00659740447479422 0.00654612039368277 0.00663767452506294 0.00192750326404759 0.0018732903933933 288947 287520 667 665 0 True 479 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 523 571 0.00648039450176491 0.0064248742708224 0.00648508430609598 0.0063935301747158 0.00190498521361709 0.00189352862713455 283270 280001 667 665 0 True 524 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 566 571 0.00645957634595383 0.00650158240646248 0.00643930724040589 0.00651560234988937 0.00167874331983432 0.00180925310717901 282360 283344 667 665 0 True 568 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 611 570 0.0064174367382571 0.00645025243355585 0.00643930724040589 0.00654612039368277 0.00150092156314843 0.0015419890693045 280518 281107 667 665 0 True 613 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 655 570 0.00631872207636168 0.00624626340398949 0.0063935301747158 0.00619516289005875 0.00151984060730547 0.00155252389660073 276203 272217 667 665 0 True 657 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 256 613 0.00674457918671701 0.00686763831070007 0.0068055237659266 0.0068055237659266 0.00139801913895459 0.00127764634396715 294818 299297 667 665 0 False 256 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 301 613 0.00662717393878021 0.00667037242912729 0.00668345159075303 0.00666819256885634 0.00137223901445929 0.00141339274887555 289686 290700 667 665 0 False 301 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 346 617 0.00651287997566792 0.00663021710834651 0.00648508430609598 0.00659189745937285 0.00144986891126692 0.00147468156858649 284690 288950 667 665 0 True 345 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 391 617 0.00636724439336752 0.00659510988503532 0.0063935301747158 0.00657663843747616 0.00133166826301053 0.00126539714617404 278324 287420 667 665 0 True 390 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 434 613 0.0065022192497251 0.00667760038686783 0.0064087891966125 0.00669871061264973 0.00176356993176168 0.00181903610300743 284224 291015 667 665 0 False 434 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 479 613 0.0067468211419582 0.00677069189338648 0.00675974670023652 0.0068055237659266 0.00195431675668032 0.00195453580557882 294916 295072 667 665 0 False 479 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 524 613 0.0066099246096796 0.00642586094441873 0.00653086137178607 0.0064087891966125 0.00193043194538289 0.00190785042045792 288932 280044 667 665 0 False 524 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 568 613 0.00649238209917701 0.006242270817809 0.00648508430609598 0.00622568093385214 0.00170392994957884 0.00176005138729415 283794 272043 667 665 0 False 568 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 613 613 0.00628859294317135 0.00626689176592201 0.00630197604333562 0.00625619897764553 0.00142131165281106 0.00146096913293379 274886 273116 667 665 0 False 613 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 657 613 0.00647236464166635 0.0064075271722451 0.00651560234988937 0.00642404821850919 0.00150401826164368 0.00156253572419957 282919 279245 667 665 0 False 657 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 256 663 0.00852906117323577 0.733096875858679 0.00833142595559625 0.719615472648203 0.00183029457707141 0.173046382805065 372821 31948930 667 665 10 True 256 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 301 656 0.00696143116356676 0.00664230959637593 0.00692759594110018 0.00665293354695964 0.0015596680251735 0.00138560827009988 304297 289477 667 665 0 False 301 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 345 656 0.0063631265163939 0.006112741225919 0.00645456626230259 0.00611886778057527 0.00126666528041664 0.00121787483274302 278144 266398 667 665 0 False 345 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 390 656 0.00593946560709117 0.00630456892976318 0.0059662775616083 0.00631723506523232 0.00127602638518958 0.0012705921642558 259625 274758 667 665 0 False 390 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 434 656 0.00614437574071742 0.00619360256902269 0.00614938582436866 0.00616464484626535 0.00154834532646905 0.00147317536764249 268582 269922 667 665 0 False 434 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 479 656 0.0062054575824928 0.00618935757796873 0.00616464484626535 0.00621042191195544 0.00168202096488152 0.00156496557678464 271252 269737 667 665 0 False 479 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 524 656 0.00645140922328948 0.00640456715145612 0.00646982528419928 0.0064087891966125 0.00170643723687711 0.0016991153869558 282003 279116 667 665 0 False 524 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 568 656 0.00645541271479161 0.00651105906216675 0.00651560234988937 0.00645456626230259 0.00150325288313202 0.00147426160175651 282178 283757 667 665 0 False 568 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 613 656 0.00771422482853332 0.00698243663633793 0.00701915007248035 0.00695811398489357 0.0030376695737807 0.00140669836117475 337203 304300 667 665 0 False 613 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 653 661 0.00848031008528695 0.779301515404441 0.00839246204318303 0.778347447928588 0.00174280452714167 0.170622216859526 370690 33962564 667 665 15 True 657 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C11_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C11_3.csv new file mode 100755 index 0000000..1d1b568 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C11_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 255 266 0.00121523124910422 0.0734192542468554 0.000991836423285267 0.0732890821698329 0.000922734145814003 0.0231282472111243 53120 3199668 667 665 0 True 256 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 300 265 0.00101219703721039 0.00104110126540889 0.000900282291905089 0.000930800335698482 0.000728646743164506 0.000684023956160387 44245 45372 667 665 0 False 300 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 343 267 0.00104422496922745 0.00103206058175881 0.000946059357595178 0.000915541313801785 0.000696880848649542 0.000771659825711868 45645 44978 667 665 0 True 345 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 388 266 0.00087331019772787 0.000902622773459169 0.000732433051041428 0.000793469138628214 0.000662580524374192 0.000652885263978057 38174 39337 667 665 0 True 389 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 433 266 0.00100920013785737 0.000911158647362283 0.000793469138628214 0.000671396963454643 0.000876228951641731 0.000866046947347532 44114 39709 667 665 0 True 434 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 476 265 0.000987192373142795 0.000944636711944659 0.000762951094834821 0.000717174029144732 0.000898294096690408 0.00082892661349707 43152 41168 667 665 0 True 479 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 520 265 0.000990578183098883 0.000954205151239279 0.00080872816052491 0.000762951094834821 0.000837878175616433 0.000866112307530509 43300 41585 667 665 0 True 523 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 565 264 0.00102594617088343 0.000989014077881818 0.000839246204318303 0.000778210116731518 0.00089902881015104 0.000824566203468455 44846 43102 667 665 0 True 568 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 612 265 0.00140559155075701 0.00107962742746085 0.000747692072938125 0.000701915007248035 0.00246108725692874 0.00108181884141089 61441 47051 667 665 0 False 612 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 657 265 0.00485943798528751 0.060302943212919 0.00112916762035554 0.0711070420386053 0.0119817452980673 0.0410235283797585 212415 2628049 667 665 0 False 657 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 256 309 0.000965642150314177 0.000993373798423732 0.000778210116731518 0.000839246204318303 0.000798376376880672 0.000765176869952132 42210 43292 667 665 0 False 256 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 300 309 0.00100602022174996 0.00102051879527154 0.000885023270008392 0.000869764248111696 0.000692957087032244 0.000723755513744501 43975 44475 667 665 0 False 300 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 345 310 0.000923937207409113 0.000924513159759091 0.000793469138628214 0.000778210116731518 0.000679050717897954 0.000693877104057681 40387 40291 667 665 0 True 345 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 389 311 0.000900854219262536 0.00100252921156175 0.000762951094834821 0.000839246204318303 0.000699071009617645 0.00074307987595851 39378 43691 667 665 0 True 389 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 433 311 0.000897148129986277 0.00088321054409886 0.00064087891966125 0.000579842832074464 0.000825416367312762 0.000904786430285221 39216 38491 667 665 0 True 434 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 478 310 0.00099572552931591 0.00105078443419145 0.000747692072938125 0.000778210116731518 0.000921868354628817 0.000968810981815236 43525 45794 667 665 0 True 479 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 521 309 0.00101045837804375 0.000933668572897109 0.00080872816052491 0.000717174029144732 0.000880915305237906 0.000871760766481439 44169 40690 667 665 0 True 523 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 565 309 0.00108977326397456 0.000991492234821432 0.00080872816052491 0.000793469138628214 0.00103251658635284 0.000825490183281367 47636 43210 667 665 0 True 568 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 612 309 0.000963949245336133 0.0011066806407183 0.000488288700694286 0.000686655985351339 0.00109241746069573 0.00114609845081602 42136 48230 667 665 0 False 612 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 657 308 0.00100652351782452 0.000979789827051034 0.000534065766384375 0.000564583810177768 0.00108724397984355 0.00100401363742777 43997 42700 667 665 0 False 657 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 257 356 0.00097147580936014 0.00095278250558876 0.000778210116731518 0.000793469138628214 0.000842168851749805 0.000799112274494235 42465 41523 667 665 0 True 256 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 300 356 0.000955850753954678 0.000862260939600087 0.000823987182421607 0.000732433051041428 0.000725375629698765 0.000656544759469833 41782 37578 667 665 0 True 300 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 345 356 0.000840275673561709 0.000961249541799108 0.000717174029144732 0.000885023270008392 0.000661157808458893 0.000701891309339114 36730 41892 667 665 0 True 345 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 388 355 0.00094180421805577 0.000877038097647414 0.000762951094834821 0.000732433051041428 0.000736838449250168 0.000693585580759404 41168 38222 667 665 0 True 389 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 433 355 0.000947569245818839 0.000980592933466649 0.000656137941557946 0.000701915007248035 0.000866732861553342 0.000908369197477458 41420 42735 667 665 0 True 434 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 478 353 0.000938555670665468 0.000913269669940473 0.000625619897764553 0.000595101853971161 0.000891460803103285 0.000879986607718609 41026 39801 667 665 0 True 479 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 521 353 0.00112161817923723 0.000990826803791351 0.000854505226215 0.000701915007248035 0.00100620227599421 0.00092853535681795 49028 43181 667 665 0 True 523 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 566 353 0.00096941687087333 0.00104374004363162 0.000686655985351339 0.000686655985351339 0.000972340257842118 0.00106360879427708 42375 45487 667 665 0 True 568 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 610 352 0.00093983678794615 0.000922723379747148 0.0004272526131075 0.000473029678797589 0.0011195340797777 0.00108211043178893 41082 40213 667 665 0 True 613 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 655 353 0.000937000028253211 0.000897872972658242 0.000564583810177768 0.000442511635004196 0.00103985317734136 0.00100091243575562 40958 39130 667 665 0 True 657 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 257 400 0.000968890697704478 0.000912994319169404 0.00080872816052491 0.000732433051041428 0.000804169187479763 0.000782819272007504 42352 39789 667 665 0 True 256 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 301 400 0.00101343240030248 0.000939772181655787 0.000900282291905089 0.000778210116731518 0.000749530942497421 0.00074877538902521 44299 40956 667 665 0 True 300 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 345 400 0.000935078352332188 0.000956912767154783 0.000793469138628214 0.000839246204318303 0.000736596898199535 0.000751331511301926 40874 41703 667 665 0 True 345 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 389 400 0.000931166369207248 0.000955971985353634 0.000778210116731518 0.00080872816052491 0.00074312009412129 0.000775003764999284 40703 41662 667 665 0 True 389 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 434 399 0.00104603225967698 0.00101303843265752 0.00080872816052491 0.000732433051041428 0.000866369800681989 0.000881979708311897 45724 44149 667 665 0 True 434 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 478 397 0.00108222382285625 0.000905513956555385 0.00080872816052491 0.000595101853971161 0.000966560390307748 0.000906455127525937 47306 39463 667 665 0 True 479 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 522 397 0.000950314497134587 0.000953080802257417 0.000701915007248035 0.00064087891966125 0.00090101466822948 0.000934611369525154 41540 41536 667 665 0 True 523 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 566 397 0.000953723184184973 0.000946793626318027 0.000671396963454643 0.000686655985351339 0.000964270755079546 0.000882770212718936 41689 41262 667 665 0 True 568 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 611 397 0.000921763883450813 0.000979032612430596 0.000518806744487678 0.000503547722590982 0.00100476223887877 0.00109081843332746 40292 42667 667 665 0 True 613 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 654 397 0.000903164805786624 0.000850145505673086 0.000488288700694286 0.000442511635004196 0.000972078516663399 0.000946694914663 39479 37050 667 665 0 True 657 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 258 445 0.00099115011045633 0.000952575992510459 0.00080872816052491 0.000778210116731518 0.000833039292511922 0.000830767569593811 43325 41514 667 665 0 True 256 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 302 444 0.00091005081117029 0.000947826191709533 0.000762951094834821 0.00080872816052491 0.000790284512984235 0.000761098507763225 39780 41307 667 665 0 True 300 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 346 443 0.000961775921377832 0.000967605555431265 0.000869764248111696 0.000823987182421607 0.000726894296557321 0.000780343434101662 42041 42169 667 665 0 True 345 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 391 444 0.000927162877705116 0.000956270282022291 0.000793469138628214 0.00080872816052491 0.000771886969108971 0.000782867742520676 40528 41675 667 665 0 True 390 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 434 444 0.000964200893373409 0.00102802210378315 0.000610360875867857 0.000686655985351339 0.000988746581104091 0.00104656448590868 42147 44802 667 665 0 True 434 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 479 442 0.0010208217017607 0.00103352911920451 0.000701915007248035 0.000671396963454643 0.00100501846710185 0.00104931910455024 44622 45042 667 665 0 True 479 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 523 442 0.00100700393680477 0.000998100653327069 0.000701915007248035 0.000732433051041428 0.000965196571789286 0.000960588919677336 44018 43498 667 665 0 True 523 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 566 441 0.00099865379738604 0.00100147370027265 0.000625619897764553 0.000595101853971161 0.00102220829258042 0.00104645298657426 43653 43645 667 665 0 True 568 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 611 441 0.000875117488177404 0.000848906427203279 0.000503547722590982 0.000503547722590982 0.000940006327217165 0.000908811496138314 38253 36996 667 665 0 True 613 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 655 441 0.000938029497496617 0.000885023270008392 0.000564583810177768 0.000457770656900893 0.000968871067346854 0.000964575731067409 41003 38570 667 665 0 True 657 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 258 488 0.00100540254020392 0.00102611759428326 0.00080872816052491 0.000823987182421607 0.00083535949312725 0.000830548561075671 43948 44719 667 665 0 True 256 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 303 488 0.00103903186882183 0.000989266482755298 0.000946059357595178 0.000915541313801785 0.000888637224266616 0.000808880138321081 45418 43113 667 665 0 True 300 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 346 488 0.00106392214741794 0.000934953543162094 0.000885023270008392 0.000732433051041428 0.000922571380977646 0.000846079363231945 46506 40746 667 665 0 True 345 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 391 487 0.000955461843351613 0.00092687658721076 0.000747692072938125 0.000701915007248035 0.000860936398814038 0.0008435527444358 41765 40394 667 665 0 True 390 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 435 487 0.000994124132715057 0.000988532214032449 0.000671396963454643 0.000564583810177768 0.00101612658748029 0.00111100417041247 43455 43081 667 665 0 True 434 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 479 485 0.000936084944481296 0.00102276749323526 0.000579842832074464 0.000625619897764553 0.000949847709595676 0.00103404898288641 40918 44573 667 665 0 True 479 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 522 486 0.000976188490785507 0.00093316376315015 0.000671396963454643 0.000595101853971161 0.000891238328436458 0.00090866519486373 42671 40668 667 665 0 True 523 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 567 485 0.00100473910446928 0.000905789307326453 0.000717174029144732 0.000518806744487678 0.000950079232666225 0.000970040210148491 43919 39475 667 665 0 True 568 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 611 485 0.000962164831980897 0.000942938715523072 0.000595101853971161 0.000564583810177768 0.000970824911848314 0.000953316142668576 42058 41094 667 665 0 True 613 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 656 485 0.000937457570139169 0.000901131290115882 0.000503547722590982 0.000518806744487678 0.0010146412348924 0.000923679039153105 40978 39272 667 665 0 True 657 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 258 531 0.00101409583603712 0.00100893111698909 0.000854505226215 0.000885023270008392 0.000807231264194831 0.0008163070872703 44328 43970 667 665 0 True 256 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 303 532 0.000923067877825793 0.000969418281340798 0.000793469138628214 0.00080872816052491 0.000771955621876237 0.000794508881331527 40349 42248 667 665 0 True 300 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 347 532 0.000901563409185771 0.000909162354272039 0.000793469138628214 0.000732433051041428 0.000736048549896309 0.000791093281080449 39409 39622 667 665 0 True 345 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 391 530 0.000826938327586035 0.00101751288268738 0.000610360875867857 0.00080872816052491 0.000789199442973938 0.000930070868941287 36147 44344 667 665 0 True 390 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 436 531 0.000920963185150387 0.000964645534642282 0.000488288700694286 0.000549324788281071 0.00100664140384617 0.00110062264725206 40257 42040 667 665 0 True 434 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 479 528 0.000975456423767974 0.000969395335443209 0.000595101853971161 0.000610360875867857 0.0010280076447047 0.000980416105247397 42639 42247 667 665 0 True 479 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 523 528 0.00102283488605892 0.00092359532385553 0.000671396963454643 0.000579842832074464 0.00102771437245785 0.0009181846390455 44710 40251 667 665 0 True 523 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 567 527 0.000997807344897018 0.000862628073961512 0.000717174029144732 0.000503547722590982 0.000920587225256627 0.000932451080916256 43616 37594 667 665 0 True 568 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 611 528 0.00094919351951399 0.000966137017985568 0.000579842832074464 0.000625619897764553 0.000984545241979112 0.000948355174317566 41491 42105 667 665 0 True 613 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 656 528 0.000894151230633253 0.000868777574515368 0.0004272526131075 0.0004272526131075 0.000999307976867825 0.00102252487232377 39085 37862 667 665 0 True 657 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 258 575 0.00104795393559801 0.000996563278188605 0.000900282291905089 0.000885023270008392 0.000741443085566012 0.000665204350885668 45808 43431 667 665 0 True 256 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 303 574 0.00107179186785641 0.000976210267027147 0.000900282291905089 0.000854505226215 0.000828992573783623 0.000747632274248955 46850 42544 667 665 0 True 300 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 346 574 0.0010534673153238 0.00100916057596498 0.000885023270008392 0.000854505226215 0.000780439455771851 0.000809107072948516 46049 43980 667 665 0 True 345 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 391 573 0.000882209387409751 0.000932567169812836 0.000701915007248035 0.000869764248111696 0.000765793157233146 0.000660792545320389 38563 40642 667 665 0 True 390 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 434 572 0.000912247012222888 0.00100418131618816 0.000595101853971161 0.000518806744487678 0.00092975075632492 0.00111039007889543 39876 43763 667 665 0 True 434 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 478 571 0.00102006675764887 0.000896633894188435 0.000686655985351339 0.000518806744487678 0.00108505994200966 0.000954025605942691 44589 39076 667 665 0 True 479 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 523 571 0.000977195082934614 0.000954480502010347 0.000518806744487678 0.000473029678797589 0.0010403789258259 0.00106395351178562 42715 41597 667 665 0 True 524 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 566 571 0.000956971731575274 0.0010109962477721 0.000671396963454643 0.00064087891966125 0.000898805872607667 0.00099354205055707 41831 44060 667 665 0 True 568 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 611 570 0.000964544049787878 0.0010024144820738 0.000747692072938125 0.000732433051041428 0.000804980191664749 0.000865158935113192 42162 43686 667 665 0 True 613 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 655 570 0.000868872041434078 0.000878598418683468 0.000564583810177768 0.000625619897764553 0.000823026784502929 0.000857958592930674 37980 38290 667 665 0 True 657 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 256 613 0.00101098455121261 0.001040871806433 0.000854505226215 0.000900282291905089 0.000776309371589768 0.000733513979966631 44192 45362 667 665 0 False 256 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 301 613 0.00101498804271474 0.000957991224341467 0.000885023270008392 0.000823987182421607 0.000791032628098471 0.000753731110721821 44367 41750 667 665 0 False 301 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 346 617 0.000996869384030804 0.000945898736312055 0.000885023270008392 0.000823987182421607 0.000777478251996343 0.000787206877314809 43575 41223 667 665 0 True 345 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 391 617 0.000946745670424115 0.000947849137607122 0.000747692072938125 0.000839246204318303 0.000728191521916284 0.000694530192893944 41384 41308 667 665 0 True 390 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 434 613 0.000979642932024489 0.00102295106041597 0.00064087891966125 0.000671396963454643 0.000978837666261189 0.00100424838651153 42822 44581 667 665 0 False 434 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 479 613 0.00100469335028068 0.000990482615327515 0.000656137941557946 0.000534065766384375 0.00105741912670991 0.00107965828823034 43917 43166 667 665 0 False 479 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 524 613 0.000946539776575434 0.000879699821767741 0.000488288700694286 0.000335698481727321 0.00102458908698396 0.00105677275071334 41375 38338 667 665 0 False 524 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 568 613 0.000995359495807143 0.000974581108298326 0.000671396963454643 0.000595101853971161 0.000933201479443365 0.00103907014144831 43509 42473 667 665 0 False 568 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 613 613 0.000962942653187025 0.000850007830287552 0.000778210116731518 0.000656137941557946 0.00077032658111633 0.00068218976044615 42092 37044 667 665 0 False 613 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 657 613 0.000843821623177882 0.000879906334846042 0.000610360875867857 0.000625619897764553 0.000767686605291929 0.000829724972272622 36885 38347 667 665 0 False 657 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 256 663 0.00119011219956513 0.0750640620778313 0.00103761348897536 0.0720988784618906 0.000794046569875541 0.0203737620504675 52022 3271350 667 665 0 True 256 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 301 656 0.00100528815473243 0.00100358472285084 0.000885023270008392 0.000915541313801785 0.000721281275073371 0.000690814143092997 43943 43737 667 665 0 False 301 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 345 656 0.00101491941143184 0.00100296518361594 0.000885023270008392 0.000885023270008392 0.00071411502960904 0.000697704596438615 44364 43710 667 665 0 False 345 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 390 656 0.000882506789635624 0.000895096519049971 0.000686655985351339 0.000762951094834821 0.000668124807732953 0.000694841256487745 38576 39009 667 665 0 False 390 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 434 656 0.000989022540686626 0.000946816572215616 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.000843202378132627 0.000798779529905742 43232 41263 667 665 0 False 434 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 479 656 0.00101503379690333 0.000970680305708194 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.000906633963175788 0.00085331195994424 44369 42303 667 665 0 False 479 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 524 656 0.000904057012464242 0.000962442728473736 0.000549324788281071 0.000701915007248035 0.000948343605157007 0.000887079166592419 39518 41944 667 665 0 False 524 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 568 656 0.00096637421733171 0.000977426399599365 0.000732433051041428 0.000747692072938125 0.000856421439506519 0.000815516322531648 42242 42597 667 665 0 False 568 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 613 656 0.000985796870390623 0.000965425695160309 0.00080872816052491 0.000762951094834821 0.000750755182851916 0.000719586082723733 43091 42074 667 665 0 False 613 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 653 661 0.00107858636486289 0.0804217226517885 0.000915541313801785 0.0788738841840238 0.000803958439913891 0.0211883769114482 47147 3504841 667 665 0 True 657 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C12_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C12_1.csv new file mode 100755 index 0000000..1f241b5 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C12_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 229 238 0.00942428762730102 0.0367275937612399 0.00941481651026169 0.0364843213550011 0.00187510794433074 0.00647791546910803 411953 1600617 667 665 0 True 229 238 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 273 237 0.00938791304736737 0.00942142492876733 0.00944533455405508 0.00949111161974517 0.00150815856379543 0.00154351378685424 410363 410593 667 665 0 False 273 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 317 239 0.00959403566699141 0.0532550419307596 0.00961318379491875 0.0533760585946441 0.0013610093164074 0.00520191391864212 419373 2320896 667 665 0 True 318 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 361 238 0.00976364644411601 0.0795236890578472 0.00978103303578241 0.0764324406805524 0.00129086948683447 0.0173306138254515 426787 3465704 667 665 0 True 363 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 406 237 0.0098137015264398 0.0657549802636598 0.0098115510795758 0.0632791638056001 0.00152581808573404 0.00978422633570129 428975 2865653 667 665 0 True 407 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 449 237 0.00984220638593498 0.0606447223575074 0.00985732814526589 0.0643472953383688 0.00153445529243967 0.017049850102214 430221 2642944 667 665 0 True 452 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 494 237 0.00999241738709496 0.0755880545951741 0.0100862134737163 0.0736095216296635 0.00162762812548739 0.0176597091978106 436787 3294186 667 665 0 True 497 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 539 237 0.00964793410115725 0.0652935382631447 0.00967421988250553 0.0640726329442283 0.00155046592299758 0.0149717067171552 421729 2845543 667 665 0 True 542 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 586 237 0.00966859211730825 0.00960939772181656 0.00964370183871214 0.00965896086060884 0.00189773954035906 0.00181099885241551 422632 418785 667 665 0 False 586 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 625 236 0.00952627371368104 0.0409914233971287 0.00952162966353857 0.0412909132524605 0.00195521580102044 0.0084633744536262 416411 1786438 667 665 0 True 631 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 229 281 0.00962816829168387 0.00937562491717965 0.00962844281681544 0.00944533455405508 0.00164735039938336 0.00157297328750599 420865 408597 667 665 0 False 229 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 273 281 0.00951643656313294 0.00956398779048789 0.00956740672922866 0.00953688868543526 0.00140262692784771 0.00154536668372602 415981 416806 667 665 0 False 273 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 318 282 0.00970199267498318 0.0853641313170773 0.00975051499198901 0.0844739452201114 0.0013118816476783 0.0156092120719037 424092 3720235 667 665 0 True 318 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 362 284 0.00979336378960897 0.0455410441874886 0.0098268101014725 0.0449530785076677 0.00134093041707689 0.00575295613389127 428086 1984714 667 665 0 True 363 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 405 282 0.00968192946328392 0.0710794610697033 0.00970473792629892 0.0700846875715267 0.0014095932496942 0.011853217481088 423215 3097698 667 665 0 True 408 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 450 282 0.00974026605374356 0.0393124491246427 0.00978103303578241 0.0402990768291753 0.00181624285161962 0.00565087370584583 425765 1713267 667 665 0 True 452 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 494 281 0.00968991356919389 0.0459971856856607 0.00976577401388571 0.0470130464637217 0.00180937518147852 0.0111615201122117 423564 2004593 667 665 0 True 497 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 538 281 0.00969167510545483 0.0516744596671353 0.00970473792629892 0.0508278019378958 0.00160727767491193 0.0117149443985729 423641 2252013 667 665 0 True 542 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 586 280 0.0101435205949326 0.00961157758208752 0.0097962920576791 0.00955214770733196 0.00320467810739058 0.00195094793821606 443392 418880 667 665 0 False 586 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 631 280 0.00920011498027594 0.00946279638212033 0.00921644922560464 0.00943007553215839 0.0019502728156725 0.00191203641105113 402154 412396 667 665 0 False 631 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 230 327 0.00977762434873202 0.0375393048884514 0.00970473792629892 0.0370336461432822 0.00151158854115408 0.00510316140786966 427398 1635992 667 665 0 True 229 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 275 327 0.00960808220289032 0.0503771215633499 0.00965896086060884 0.0524605172808423 0.00147830580087998 0.011303827726019 419987 2195474 667 665 0 True 273 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 318 328 0.00964210044211129 0.0327721799348451 0.00964370183871214 0.0335545891508354 0.00130309166349649 0.00374480489017177 421474 1428237 667 665 0 True 318 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 361 327 0.00977975191850172 0.0304693755446065 0.00978103303578241 0.0313725490196078 0.00131073387209717 0.00386359152735022 427491 1327879 667 665 0 True 363 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 407 327 0.00964512021855861 0.064526617528027 0.00961318379491875 0.0629739833676661 0.00152057169401404 0.0082105701653643 421606 2812120 667 665 0 True 408 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 450 325 0.00969428309420479 0.0311871002752934 0.00968947890440223 0.0313267719539178 0.00167172940494589 0.00387964962731352 423755 1359158 667 665 0 True 452 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 494 325 0.00967435714507132 0.0283999079869507 0.00946059357595178 0.0271763179980163 0.0028055327689824 0.016594977080698 422884 1237690 667 665 0 True 497 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 539 325 0.009801736806122 0.047138652307124 0.00976577401388571 0.0467689021133745 0.00153644335612318 0.00613939782290075 428452 2054339 667 665 0 True 542 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 583 325 0.00969050837364563 0.0564458296117956 0.00978103303578241 0.0549629968719005 0.00184618140495139 0.0121883632142517 423590 2459953 667 665 0 True 587 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 627 325 0.00957841061158594 0.0568142718893824 0.00961318379491875 0.0576791027695125 0.00197298085363841 0.0134942237481707 418690 2476010 667 665 0 True 631 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 231 372 0.00947553231852831 0.0339584828401973 0.00943007553215839 0.0352635996032654 0.00165317110260247 0.00618116402520432 414193 1479937 667 665 0 True 229 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 274 372 0.00963137108488557 0.0273935697563891 0.00973525597009232 0.0271763179980163 0.00156426228454429 0.00332295190275181 421005 1193833 667 665 0 True 274 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 318 372 0.00970119197668275 0.0679461069703327 0.00973525597009232 0.0658274204623484 0.00150720723171937 0.01119023054927 424057 2961144 667 665 0 True 318 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 362 372 0.00988770892649349 0.0561115308298212 0.00994888227664607 0.05468833447776 0.00140191323989434 0.011382983107399 432210 2445384 667 665 0 True 363 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 407 370 0.00970659097093705 0.0397319001325699 0.00968947890440223 0.040161745632105 0.00154070475312087 0.00561646323962471 424293 1731547 667 665 0 True 408 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 451 370 0.00983882057597889 0.0515349715556917 0.00976577401388571 0.0505226214999619 0.00179108594400952 0.00849433506086452 430073 2245934 667 665 0 True 452 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 496 369 0.0104155750003231 0.0391259448690392 0.00976577401388571 0.0395971618219272 0.00584228079422699 0.00417914671633291 455284 1705139 667 665 0 True 497 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 539 369 0.00952032566916359 0.0504646142708568 0.00952162966353857 0.0495307850766766 0.00167990770951845 0.00945704095425883 416151 2199287 667 665 0 True 542 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 584 370 0.00976545373456554 0.0400519495121415 0.00984206912336919 0.0404211490043488 0.00205688815132478 0.00564708016260548 426866 1745495 667 665 0 True 587 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 627 369 0.00969769178125517 0.0829031608547576 0.00959792477302205 0.0841687647821775 0.00205521681656419 0.0184724181069904 423904 3612984 667 665 0 True 631 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 230 416 0.00952309379757363 0.0350826941466736 0.00953688868543526 0.0352025635156786 0.00164311278669489 0.00408641102759459 416272 1528931 667 665 0 True 229 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 275 415 0.00974861619316229 0.0393269738778165 0.00970473792629892 0.0388647287708858 0.00152229944642271 0.00460022466364962 426130 1713900 667 665 0 True 274 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 318 416 0.00969554133439117 0.0304381920697831 0.00970473792629892 0.0307774471656367 0.00143852455739585 0.00313349182096387 423810 1326520 667 665 0 True 318 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 363 415 0.00992142976348859 0.0492789767965347 0.00988784618905928 0.0460517280842298 0.0013890159033646 0.00992556945603188 433684 2147616 667 665 0 True 363 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 408 415 0.00992982565709592 0.0874344249270464 0.00991836423285267 0.0865186541542687 0.00153510996984105 0.0137551923903839 434051 3810460 667 665 0 True 408 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 451 413 0.00982632968249224 0.0523747455156546 0.00984206912336919 0.0530098420691234 0.00165953844520426 0.00956218654990925 429527 2282532 667 665 0 True 453 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 496 413 0.0103811907275934 0.0493846426549321 0.0101319905394064 0.0488136110475319 0.00344016019597528 0.0070555009706929 453781 2152221 667 665 0 True 497 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 539 413 0.00966252968731931 0.0316564127186816 0.00967421988250553 0.0318913557640955 0.00176716913368513 0.00391690060864881 422367 1379611 667 665 0 True 542 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 585 413 0.00974440680781148 0.0370284603704271 0.00975051499198901 0.0370489051651789 0.00186210297336488 0.00363936797296319 425946 1613729 667 665 0 True 587 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 628 414 0.00971674840080532 0.0702825041546416 0.00973525597009232 0.0699473563744564 0.00187246258392182 0.0167838461278887 424737 3062966 667 665 0 True 631 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 232 461 0.00958481619798936 0.0440788168636285 0.00958266575112535 0.0452735179674983 0.00154173730684556 0.00907003414407787 418970 1920989 667 665 0 True 229 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 276 461 0.00967081119545514 0.0431212616113412 0.00962844281681544 0.0436255436026551 0.00156608915929897 0.00426676431961776 422729 1879258 667 665 0 True 274 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 320 461 0.00987592722293008 0.0549257786260111 0.0098268101014725 0.0524910353246357 0.00166978652236167 0.0112622839415212 431695 2393708 667 665 0 True 318 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 364 459 0.0100864651217536 0.0734324251920715 0.0101472495613031 0.0693064774547952 0.00141930596091101 0.0120143426644662 440898 3200242 667 665 0 True 363 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 408 460 0.0101798265435833 0.0821369284965676 0.0101930266269932 0.0786907759212634 0.0016491658578499 0.0204261381450538 444979 3579591 667 665 0 True 408 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 452 458 0.00986419127355526 0.0392633449038022 0.00990310521095598 0.0395819028000305 0.00200476314013014 0.00490324518725597 431182 1711127 667 665 0 True 453 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 496 458 0.00989363409391665 0.0368244942867583 0.0101167315175097 0.0376287479972534 0.00196802665246962 0.0045773326816811 432469 1604840 667 665 0 True 497 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 541 457 0.00988105169205281 0.0896715811042828 0.00988784618905928 0.0882581826504921 0.00174654891101375 0.0157580489458777 431919 3907957 667 665 0 True 542 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 585 456 0.0101018385291218 0.0611333781925631 0.0101625085831998 0.0626840619516289 0.00192679567559653 0.0163787861800477 441570 2664240 667 665 0 True 587 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 628 458 0.00971466658522421 0.0746226977377066 0.00973525597009232 0.0727702754253452 0.00194752460690387 0.0101307898759841 424646 3252115 667 665 0 True 632 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 232 505 0.00971709155721979 0.0434838526850429 0.00978103303578241 0.0454566262302586 0.00149065427528395 0.00727973649856955 424752 1895060 667 665 0 True 229 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 276 504 0.00969583873661704 0.083588921950103 0.00973525597009232 0.0794232089723049 0.00159502782311178 0.0151403842078523 423823 3642870 667 665 0 True 274 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 319 505 0.00981450222474023 0.0469781228075912 0.00984206912336919 0.0483863584344244 0.00154487562806351 0.00806117632158775 429010 2047343 667 665 0 True 319 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 364 503 0.0099267372493657 0.0480310871020536 0.00988784618905928 0.0478217746242466 0.00158249402614691 0.00368514170357481 433916 2093232 667 665 0 True 363 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 408 504 0.0100969657080363 0.0495038695388047 0.0101930266269932 0.0489814602883955 0.00168156041951074 0.00513522475687614 441357 2157417 667 665 0 True 408 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 453 503 0.00973077205960993 0.0555870793945266 0.00970473792629892 0.0547188525215534 0.00190220006575358 0.00867504418782328 425350 2422528 667 665 0 True 453 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 496 502 0.00985858638545227 0.0655693708980623 0.00996414129854276 0.0625467307545586 0.00179636041675539 0.015977059373569 430937 2857564 667 665 0 True 497 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 540 501 0.0097854254378876 0.050813162455234 0.00971999694819562 0.0519874876020447 0.00176670418960646 0.0101352479169021 427739 2214477 667 665 0 True 542 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 585 501 0.0097691827009361 0.0445735763074429 0.00971999694819562 0.0442206454566262 0.00177685984501212 0.00478973607478334 427029 1942551 667 665 0 True 587 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 628 502 0.00958815625375685 0.0640042082776178 0.00956740672922866 0.0638590066376745 0.00170337232924636 0.0126117722683168 419116 2789353 667 665 0 True 632 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 232 547 0.00943700729173065 0.0370543203970099 0.00941481651026169 0.0378118562600137 0.00137271314090736 0.0062601511464714 412509 1614856 667 665 0 True 229 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 277 547 0.00951133497110451 0.0432161428978718 0.00950637064164187 0.0434882124055848 0.00140991758961328 0.00734148289229991 415758 1883393 667 665 0 True 274 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 319 547 0.00967254985462178 0.036628375700065 0.00967421988250553 0.0366979476615549 0.00142866974990831 0.00480599835984562 422805 1596293 667 665 0 True 319 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 365 545 0.0100044278616014 0.0435512677321594 0.00999465934233616 0.0427405203326467 0.00148930206899305 0.00523940474495568 437312 1897998 667 665 0 True 363 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 408 546 0.00991818121609829 0.0756905080279091 0.00991836423285267 0.0717174029144732 0.00166077563122983 0.0123156854400695 433542 3298651 667 665 0 True 408 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 453 543 0.00987283881519986 0.0528792340200467 0.00991836423285267 0.0521095597772183 0.00193430235030776 0.0077657451481891 431560 2304518 667 665 0 True 453 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 497 545 0.00962853432519263 0.0475964000181273 0.00967421988250553 0.0475776302738994 0.00199068109280116 0.00506206051755513 420881 2074288 667 665 0 True 498 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 540 543 0.00959760449370188 0.0346701727998183 0.00958266575112535 0.0355992980849928 0.00183627558080026 0.00652806091579356 419529 1510953 667 665 0 True 542 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 585 542 0.00972255918275698 0.0440403136474741 0.00971999694819562 0.0435950255588617 0.0016953150273517 0.00636032799484187 424991 1919311 667 665 0 True 587 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 627 543 0.00964759094474278 0.0502492899678815 0.00953688868543526 0.0495307850766766 0.00170759114330285 0.00788274949458269 421714 2189903 667 665 0 True 632 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 229 586 0.00926398782755567 0.0093086687880149 0.00929274433508812 0.00935378042267491 0.00132217678294734 0.00123823064412699 404946 405679 667 665 0 False 229 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 274 586 0.00946262963734429 0.00917429761173361 0.00950637064164187 0.00920119020370794 0.0013518114255038 0.00151993819200897 413629 399823 667 665 0 False 274 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 320 590 0.00961686700710071 0.05746774810682 0.00967421988250553 0.0553597314412146 0.00151063983302041 0.00971813709462493 420371 2504489 667 665 0 True 319 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 363 590 0.00991523007093386 0.0627517294036189 0.0098268101014725 0.0612802319371328 0.00139746256255448 0.0117789283015622 433413 2734769 667 665 0 True 364 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 408 585 0.00988553560253519 0.00963188470145379 0.00987258716716258 0.00965896086060884 0.00168102441846219 0.00159811178137865 432115 419765 667 665 0 False 408 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 453 585 0.00963125669941408 0.00958468499011319 0.00967421988250553 0.00962844281681544 0.00193369980493831 0.00183651450342039 421000 417708 667 665 0 False 453 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 498 585 0.00948854938518381 0.00925731586921068 0.00962844281681544 0.00924696726939803 0.0020037202112478 0.00210506926752345 414762 403441 667 665 0 False 498 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 542 585 0.00936608829940717 0.00926736617235467 0.00929274433508812 0.00923170824750134 0.00191167754079702 0.0019465827021342 409409 403879 667 665 0 False 542 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 587 585 0.00950406005511778 0.00937883734284211 0.00952162966353857 0.00946059357595178 0.00173747011650051 0.00172915124006338 415440 408737 667 665 0 False 587 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 632 585 0.0094581914810505 0.00928168441245021 0.00944533455405508 0.00927748531319142 0.00156864160342198 0.00151749559294557 413435 404503 667 665 0 False 632 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 231 636 0.00913496101571553 0.0336544267512452 0.00914015411612116 0.0338445105668727 0.00133147374919159 0.00533490717881107 399306 1466686 667 665 0 True 229 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 274 629 0.00912647361373102 0.00905908625993916 0.00917067215991455 0.00909437705043107 0.00140998362789184 0.00133252167062773 398935 394802 667 665 0 False 274 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 319 629 0.00930049967005511 0.00913288026658544 0.0093842984664683 0.00914015411612116 0.00147867156200181 0.00131919131008726 406542 398018 667 665 0 False 319 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 364 629 0.00946395650881357 0.00946311762468657 0.00944533455405508 0.00947585259784848 0.0013463321736426 0.00137158583939551 413687 412410 667 665 0 False 364 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 408 629 0.00940109025368296 0.0093297790137968 0.009399557488365 0.00933852140077821 0.00145529967651903 0.0013612592321482 410939 406599 667 665 0 False 408 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 453 629 0.00935364316010912 0.00934503803569349 0.0093690394445716 0.00930800335698482 0.00182111175537212 0.0018506778562866 408865 407264 667 665 0 False 453 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 498 629 0.00910959031813917 0.00927957338987203 0.00912489509422446 0.00930800335698482 0.00180453055455606 0.00191923033179435 398197 404411 667 665 0 False 498 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 543 629 0.0092723608440687 0.0092555949268915 0.00933852140077821 0.00923170824750134 0.00186809849962954 0.00183582431987247 405312 403366 667 665 0 False 543 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 587 629 0.00952574754051219 0.00927053270622195 0.00962844281681544 0.00929274433508812 0.00165724353856836 0.00146971983537948 416388 404017 667 665 0 False 587 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 629 634 0.00953206161853841 0.0398361662912144 0.00962844281681544 0.0401770046540017 0.00140975142809278 0.00727023331607557 416664 1736091 667 665 0 True 632 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C12_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C12_2.csv new file mode 100755 index 0000000..b66fbfc --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C12_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 229 238 0.00800723465230077 0.699720025630568 0.00794995040817884 0.682978561074235 0.00222243518015022 0.162316118053424 350011 30494341 667 665 5 True 229 238 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 273 237 0.00650016031123829 0.00644568619993564 0.00654612039368277 0.0064087891966125 0.00168729116039114 0.00148268537309688 284134 280908 667 665 0 False 273 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 317 239 0.00591912787026034 0.00612549914497849 0.00593575951781491 0.00613412680247196 0.00124462458273714 0.0011762852735399 258736 266954 667 665 0 True 318 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 361 238 0.00605055677700175 0.0062708843521025 0.00608834973678187 0.00625619897764553 0.00128843748454163 0.00114017514006766 264481 273290 667 665 0 True 363 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 406 237 0.00628140953556181 0.00617776989968627 0.00627145799954223 0.00624093995574884 0.00134848441460864 0.0012876947252822 274572 269232 667 665 0 True 407 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 449 237 0.00636925757766573 0.00654226548288781 0.00648508430609598 0.00662241550316625 0.00144848088045362 0.00152231699034826 278412 285117 667 665 0 True 452 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 494 237 0.00667716038982111 0.00669618656391494 0.00672922865644312 0.00663767452506294 0.00159170907729077 0.00149194742070333 291871 291825 667 665 0 True 497 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 539 237 0.00699936138591267 0.00688932218392169 0.00704966811627375 0.00689707789730678 0.00157577959255443 0.00152179579690893 305955 300242 667 665 0 True 542 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 586 237 0.00813120562630106 0.00765195203619027 0.00793469138628214 0.00773632410162509 0.00251523406986303 0.00187770222288798 355430 333478 667 665 0 False 586 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 625 236 0.00929022785471535 0.760491340505074 0.00921644922560464 0.762340733958953 0.00198466703472531 0.180940657826409 406093 33142802 667 665 13 True 631 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 229 281 0.00658832863266238 0.00630505079361255 0.00659189745937285 0.00633249408712902 0.0015702227215065 0.00158252509423223 287988 274779 667 665 0 False 229 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 273 281 0.00629868174175673 0.00627861711959 0.00633249408712902 0.00628671702143893 0.00130333759563525 0.00145849211207402 275327 273627 667 665 0 False 273 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 318 282 0.00601555482272597 0.00601561124142469 0.00605783169298848 0.00605783169298848 0.00130381278483201 0.00132415595855496 262951 262165 667 665 0 True 318 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 362 284 0.00614815046127657 0.00600696063803363 0.00624093995574884 0.00599679560540169 0.00124248737940293 0.00133857200958849 268747 261788 667 665 0 True 363 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 405 282 0.00633473604237021 0.00611558651722004 0.00630197604333562 0.00610360875867857 0.00138029885878889 0.0012841572981301 276903 266522 667 665 0 True 408 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 450 282 0.00641478299531855 0.00647670905347599 0.00643930724040589 0.00656137941557946 0.00174023163266369 0.00172296346594112 280402 282260 667 665 0 True 452 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 494 281 0.00670282848962335 0.00653864003106875 0.00672922865644312 0.00662241550316625 0.00157480746386557 0.00160050159449052 292993 284959 667 665 0 True 497 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 538 281 0.00686914496516905 0.00676362455692906 0.00691233691920348 0.0068055237659266 0.00146574682660722 0.0015105053761399 300263 294764 667 665 0 True 542 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 586 280 0.00886533158232054 0.00742464997467347 0.00778210116731518 0.00743114366369116 0.00601619995971506 0.00198735723361705 387520 323572 667 665 0 False 586 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 631 280 0.00789724158291648 0.00755835571992467 0.00788891432059205 0.00758373388265812 0.00203233264541841 0.00180227718107168 345203 329399 667 665 0 False 631 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 230 327 0.00590858152978901 0.0061217130718763 0.00602731364919509 0.00608834973678187 0.00143224572399257 0.00142031893132113 258275 266789 667 665 0 True 229 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 275 327 0.00608979099372264 0.00624807612989902 0.00613412680247196 0.00621042191195544 0.00131523367698993 0.00141372962963764 266196 272296 667 665 0 True 273 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 318 328 0.00612406088098089 0.00629224698275788 0.00601205462729839 0.00634775310902571 0.00127037685192613 0.00119941754413843 267694 274221 667 665 0 True 318 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 361 327 0.00648771517194024 0.00642503489210552 0.00645456626230259 0.00645456626230259 0.00129051100890745 0.00131002822449337 283590 280008 667 665 0 True 363 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 407 327 0.00661514058717952 0.00691908301309465 0.00656137941557946 0.00694285496299687 0.00144005044651556 0.00133758030449674 289160 301539 667 665 0 True 408 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 450 325 0.00669633139484275 0.00687479743074785 0.00668345159075303 0.00686655985351339 0.00173130418290156 0.00175704396303783 292709 299609 667 665 0 True 452 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 494 325 0.00683638496613447 0.0072110466140173 0.00677500572213321 0.00671396963454643 0.00194594115409374 0.0045941608105031 298831 314263 667 665 0 True 497 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 539 325 0.00675514840428264 0.00684896035006261 0.00677500572213321 0.0068055237659266 0.00152391223534297 0.00151259038511252 295280 298483 667 665 0 True 542 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 583 325 0.0070001620842131 0.00716146052932744 0.00698863202868696 0.00717174029144732 0.00182090924871275 0.00200243174886657 305990 312102 667 665 0 True 587 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 627 325 0.00698124272722874 0.00721930713714935 0.00703440909437705 0.00727855344472419 0.00202608966609433 0.00201216183788066 305163 314623 667 665 0 True 631 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 231 372 0.00602115971082895 0.00604645052778433 0.00610360875867857 0.00604257267109178 0.00157816867351925 0.001419516438204 263196 263509 667 665 0 True 229 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 274 372 0.00609486970865677 0.00604606044752531 0.00616464484626535 0.00599679560540169 0.00140261118356132 0.00132720917271354 266418 263492 667 665 0 True 274 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 318 372 0.00610152694309746 0.00634252144437542 0.00613412680247196 0.00633249408712902 0.00135240541904329 0.00132712825574273 266709 276412 667 665 0 True 318 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 362 372 0.00665888159147709 0.0065667258097177 0.00668345159075303 0.00657663843747616 0.00135395480517794 0.0013618985941093 291072 286183 667 665 0 True 363 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 407 370 0.00701876116187729 0.00709181973014477 0.00698863202868696 0.00711070420386053 0.00144529417970878 0.00141676780859146 306803 309067 667 665 0 True 408 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 451 370 0.0071273587285094 0.00725964602511084 0.00712596322575723 0.00735484855420768 0.00172432417818812 0.00171263646069575 311550 316381 667 665 0 True 452 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 496 369 0.00698327878862125 0.00692725175263634 0.00674448767833982 0.00691233691920348 0.0022593595240862 0.0018222376746095 305252 301895 667 665 0 True 497 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 539 369 0.0067001289924962 0.0072260991228357 0.00672922865644312 0.00701915007248035 0.00163059743579653 0.00213782377200982 292875 314919 667 665 0 True 542 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 584 370 0.00691373242195565 0.00707247633847723 0.00695811398489357 0.00711070420386053 0.00176399579924171 0.00200399031356801 302212 308224 667 665 0 True 587 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 627 369 0.00684697706079439 0.00677495983033803 0.00683604180972 0.0068055237659266 0.00191822690281759 0.00197642228258942 299294 295258 667 665 0 True 631 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 230 416 0.00624837501139565 0.00606891456152397 0.00625619897764553 0.00608834973678187 0.00148488482650895 0.00145865085455718 273128 264488 667 665 0 True 229 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 275 415 0.00626454911706426 0.00624151360318856 0.00628671702143893 0.00627145799954223 0.0014070174102846 0.00145219006425479 273835 272010 667 665 0 True 274 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 318 416 0.00633459877980442 0.00669453445928853 0.00633249408712902 0.00674448767833982 0.001272649165691 0.00130026398588812 276897 291753 667 665 0 True 318 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 363 415 0.00651036349529515 0.00670047744676408 0.00659189745937285 0.00671396963454643 0.0012810877435618 0.0013189773949341 284580 292012 667 665 0 True 363 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 408 415 0.00669694907638879 0.00674171122473155 0.00672922865644312 0.00671396963454643 0.00144586933498183 0.0014940155441182 292736 293809 667 665 0 True 408 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 451 413 0.0068534055242921 0.0068759447256273 0.00689707789730678 0.0068207827878233 0.00164780567050799 0.00148014741322293 299575 299659 667 665 0 True 453 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 496 413 0.00698854052030977 0.00688776186288564 0.00692759594110018 0.00698863202868696 0.00194989208954142 0.00166675103344987 305482 300174 667 665 0 True 497 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 539 413 0.00681277580481904 0.00688186476720526 0.00683604180972 0.00692759594110018 0.0015813451275087 0.00152396294619318 297799 299917 667 665 0 True 542 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 585 413 0.00655055854997656 0.00656365105944077 0.00656137941557946 0.00654612039368277 0.00172329829838129 0.00194773386419865 286337 286049 667 665 0 True 587 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 628 414 0.00621122261025587 0.00610663761716032 0.00627145799954223 0.00614938582436866 0.00167718657146765 0.00183436551797759 271504 266132 667 665 0 True 631 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 232 461 0.00625699967594596 0.00618004154354758 0.00627145799954223 0.00619516289005875 0.00143446598771229 0.00153927951541875 273505 269331 667 665 0 True 229 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 276 461 0.00644882411163381 0.00637634369742163 0.00645456626230259 0.00643930724040589 0.00154087664245586 0.00158800351282044 281890 277886 667 665 0 True 274 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 320 461 0.00644161782692998 0.0064969473351495 0.00642404821850919 0.00654612039368277 0.00146593327607865 0.00145460189583157 281575 283142 667 665 0 True 318 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 364 459 0.00666048298807795 0.00672048626946171 0.00662241550316625 0.00669871061264973 0.00134811747184569 0.0014770262789056 291142 292884 667 665 0 True 363 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 408 460 0.00667109795983217 0.00702646981381125 0.00662241550316625 0.00712596322575723 0.00159755259741038 0.00168074793259003 291606 306219 667 665 0 True 408 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 452 458 0.0067316307513444 0.00657301298565709 0.0068207827878233 0.00651560234988937 0.0018643825168898 0.00190164103025442 294252 286457 667 665 0 True 453 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 496 458 0.0067360231534496 0.00694579203788827 0.00674448767833982 0.0068055237659266 0.0017908166682485 0.0018328693715431 294444 302703 667 665 0 True 497 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 541 457 0.00645703698848676 0.00652585916611166 0.00648508430609598 0.00657663843747616 0.00165392991933143 0.00174250253350645 282249 284402 667 665 0 True 542 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 585 456 0.00616615473448902 0.00620094525625118 0.00608834973678187 0.00622568093385214 0.00187808354144878 0.00186257021273333 269534 270242 667 665 0 True 587 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 628 458 0.00620143121389637 0.00627508345136129 0.00622568093385214 0.00631723506523232 0.00172540652043775 0.00177487051909707 271076 273473 667 665 0 True 632 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 232 505 0.00631924824953053 0.00622315688511735 0.00634775310902571 0.00619516289005875 0.00137177992550386 0.00133440391059103 276226 271210 667 665 0 True 229 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 276 504 0.00637591481210642 0.00633196633148447 0.0063935301747158 0.00631723506523232 0.00147765376079544 0.00154609839466483 278703 275952 667 665 0 True 274 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 319 505 0.006258692580924 0.00655096197807405 0.00630197604333562 0.00654612039368277 0.001446782280265 0.00138201429921455 273579 285496 667 665 0 True 319 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 364 503 0.00661646745864879 0.00657528462951841 0.00666819256885634 0.00653086137178607 0.00144631694957019 0.00141215932778336 289218 286556 667 665 0 True 363 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 408 504 0.00678550630841594 0.00669359367748738 0.00677500572213321 0.00671396963454643 0.00172549388898452 0.00165154116487629 296607 291712 667 665 0 True 408 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 453 503 0.00654735575677485 0.00675031593632743 0.00659189745937285 0.00671396963454643 0.00186216928926089 0.00179565690299878 286197 294184 667 665 0 True 453 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 496 502 0.00632231378016645 0.00638992766879433 0.00631723506523232 0.00646982528419928 0.0017698554380168 0.0016888294054564 276360 278478 667 665 0 True 497 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 540 501 0.0061597949022742 0.00619435978364313 0.00617990386816205 0.00622568093385214 0.00166676358657439 0.00159521090205913 269256 269955 667 665 0 True 542 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 585 501 0.00619385889568377 0.0060160013216837 0.00624093995574884 0.0059510185397116 0.00185632491297208 0.00186389079739238 270745 262182 667 665 0 True 587 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 628 502 0.00617843973412699 0.0062048690047389 0.00622568093385214 0.00621042191195544 0.00182754373010981 0.00179135918679659 270071 270413 667 665 0 True 632 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 232 547 0.00640620408495683 0.0064018824814382 0.00645456626230259 0.00648508430609598 0.00139130109782477 0.00132519840152813 280027 278999 667 665 0 True 229 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 277 547 0.00622641300086967 0.00633639488971915 0.00627145799954223 0.00630197604333562 0.00146062202768258 0.00128030630967635 272168 276145 667 665 0 True 274 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 319 547 0.00643827777116248 0.0065203521506903 0.00643930724040589 0.00656137941557946 0.0013675771599033 0.00141082338573803 281429 284162 667 665 0 True 319 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 365 545 0.00647392028407861 0.00665235989951991 0.00645456626230259 0.00663767452506294 0.00137255821301764 0.00140153730120544 282987 289915 667 665 0 True 363 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 408 546 0.00658556050425234 0.00649818641361931 0.00659189745937285 0.00651560234988937 0.00162494332336458 0.00154735729278553 287867 283196 667 665 0 True 408 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 453 543 0.00634393263427796 0.00648620865507784 0.0064087891966125 0.00650034332799268 0.00184587650406306 0.0019291178298044 277305 282674 667 665 0 True 453 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 497 545 0.00633272285807199 0.00629463335610714 0.00624093995574884 0.0064087891966125 0.00183214627990888 0.00214951680560204 276815 274325 667 665 0 True 498 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 540 543 0.00617706710846911 0.00627253645672891 0.00613412680247196 0.00630197604333562 0.00172386694713249 0.00185812523126812 270011 273362 667 665 0 True 542 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 585 542 0.00630861040068201 0.00638166714566228 0.00624093995574884 0.00642404821850919 0.00158203058140879 0.00157040536003286 275761 278118 667 665 0 True 587 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 627 543 0.00633393534406978 0.00633134679224956 0.00624093995574884 0.00645456626230259 0.00177632179037427 0.0017937041316056 276868 275925 667 665 0 True 632 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 229 586 0.00673442175684874 0.00663205278015363 0.00672922865644312 0.00653086137178607 0.00129996744194442 0.00126527403902023 294374 289030 667 665 0 False 229 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 274 586 0.00654282609210387 0.00664733474794792 0.00657663843747616 0.00654612039368277 0.00144231888916798 0.00136237838417077 285999 289696 667 665 0 False 274 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 320 590 0.00649121536736781 0.00731749263293275 0.00651560234988937 0.00666819256885634 0.00141334057062465 0.00398773572841586 283743 318902 667 665 0 True 319 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 363 590 0.00653431581302505 0.00652269263224438 0.00656137941557946 0.00656137941557946 0.00128579783340242 0.0013068284559657 285627 284264 667 665 0 True 364 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 408 585 0.00650519327198383 0.00634782194671848 0.00651560234988937 0.00636301213092241 0.00156917717687405 0.00142499555064167 284354 276643 667 665 0 False 408 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 453 585 0.00649434952928663 0.00647457508500021 0.00654612039368277 0.00651560234988937 0.00197226370506538 0.00183842898869227 283880 282167 667 665 0 False 453 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 498 585 0.00628442931200914 0.0062955511920107 0.00630197604333562 0.00630197604333562 0.00187004856033635 0.00206140260384243 274704 274365 667 665 0 False 498 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 542 585 0.00644662791058122 0.0062541797386577 0.00651560234988937 0.00622568093385214 0.00183641347377741 0.00164467219644098 281794 272562 667 665 0 False 542 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 587 585 0.00636038126507815 0.00637677966947582 0.00634775310902571 0.00643930724040589 0.00164029297233757 0.00162776478162363 278024 277905 667 665 0 False 587 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 632 585 0.00663092578224506 0.00648983410689691 0.00663767452506294 0.00650034332799268 0.00153072330213732 0.00138704078841497 289850 282832 667 665 0 False 632 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 231 636 0.00869624697836479 0.695045487373733 0.00834668497749294 0.6886854352636 0.00215827373747578 0.153731712094524 380129 30290621 667 665 2 True 229 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 274 629 0.00749366676240731 0.00723656245213629 0.0072632944228275 0.00720225833524071 0.00179844882504042 0.00147057758604072 327562 315375 667 665 0 False 274 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 319 629 0.00645468064777408 0.00653090726358125 0.00650034332799268 0.00650034332799268 0.00134489190641638 0.00130449067214164 282146 284622 667 665 0 False 319 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 364 629 0.0062554440335337 0.00633825350742386 0.00627145799954223 0.00634775310902571 0.00124092284745219 0.00124627282021547 273437 276226 667 665 0 False 364 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 408 629 0.00620399344845774 0.00611765164800305 0.00619516289005875 0.00608834973678187 0.00145857720313946 0.0013083642848026 271188 266612 667 665 0 False 408 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 453 629 0.00625841805579243 0.00628332102859575 0.00625619897764553 0.00630197604333562 0.0018266961138022 0.00182095662328226 273567 273832 667 665 0 False 453 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 498 629 0.00599931208577446 0.00617049605015055 0.00605783169298848 0.00610360875867857 0.00176816704271729 0.00179414669195457 262241 268915 667 665 0 False 498 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 543 629 0.00627422612795227 0.00618935757796873 0.00627145799954223 0.00619516289005875 0.00184825874254954 0.00188325850241736 274258 269737 667 665 0 False 543 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 587 629 0.00721893573698388 0.0067250983948771 0.00708018616006714 0.00675974670023652 0.00193075860602515 0.00152748661632392 315553 293085 667 665 0 False 587 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 629 634 0.00868643270491099 0.78303685512706 0.00860608834973678 0.786694132906081 0.00176445332830826 0.165778208507862 379700 34125353 667 665 14 True 632 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C12_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C12_3.csv new file mode 100755 index 0000000..a18a0ab --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C12_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 229 238 0.00111626493917152 0.0700810162279124 0.000839246204318303 0.0682993820096132 0.000985177618513337 0.0170886660377223 48794 3054185 667 665 0 True 229 238 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 273 237 0.000993392065697524 0.000951704048402076 0.000778210116731518 0.000747692072938125 0.000803485275299903 0.000798398008752823 43423 41476 667 665 0 False 273 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 317 239 0.000947569245818839 0.000899157942923227 0.000854505226215 0.000778210116731518 0.000660580865381371 0.000653257616345408 41420 39186 667 665 0 True 318 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 361 238 0.001001261786136 0.000915380692518662 0.000854505226215 0.000839246204318303 0.00069972870761542 0.000553697990918933 43767 39893 667 665 0 True 363 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 406 237 0.000897354023834958 0.000968156256973402 0.000732433051041428 0.00080872816052491 0.000727188151304471 0.000713505866365707 39225 42193 667 665 0 True 407 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 449 237 0.000922221425336771 0.000934953543162094 0.000747692072938125 0.000732433051041428 0.000772661066582169 0.000832842970662808 40312 40746 667 665 0 True 452 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 494 237 0.000971018267474182 0.00104043583437881 0.000823987182421607 0.000930800335698482 0.000864674144792179 0.000836830749365023 42445 45343 667 665 0 True 497 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 539 237 0.000957086117046764 0.00101737520730184 0.00080872816052491 0.000839246204318303 0.000783621402994688 0.000812793478234201 41836 44338 667 665 0 True 542 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 586 237 0.00105392485720976 0.00103866900026445 0.000701915007248035 0.00064087891966125 0.00102189884292534 0.00107430821684407 46069 45266 667 665 0 False 586 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 625 236 0.00114751504998245 0.0782721280197518 0.000823987182421607 0.076752880140383 0.00103487567334599 0.0221439232031492 50160 3411160 667 665 0 True 631 237 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 229 281 0.000962942653187025 0.000901246019603828 0.000717174029144732 0.000656137941557946 0.000832170322042438 0.000805712370701815 42092 39277 667 665 0 False 229 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 273 281 0.000901723548845856 0.000910883296591215 0.000747692072938125 0.000762951094834821 0.000714592069710759 0.000729043324021997 39416 39697 667 665 0 False 273 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 318 282 0.000994215641092248 0.000915082395850005 0.000869764248111696 0.000793469138628214 0.00072941080061484 0.000657615593967902 43459 39880 667 665 0 True 318 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 362 284 0.000812502881084063 0.000904183094495222 0.000686655985351339 0.000778210116731518 0.000612393604693895 0.00068845451102689 35516 39405 667 665 0 True 363 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 405 282 0.000877405197607193 0.000908703436320258 0.000717174029144732 0.000701915007248035 0.000720322635326857 0.000761869222673374 38353 39602 667 665 0 True 408 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 450 282 0.000921672375073621 0.000934976489059683 0.000656137941557946 0.000595101853971161 0.000863124073091343 0.000948598538623542 40288 40747 667 665 0 True 452 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 494 281 0.000900991481828324 0.00102889404789153 0.00064087891966125 0.000793469138628214 0.00085716983979528 0.000919025683176844 39384 44840 667 665 0 True 497 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 538 281 0.000972093490906183 0.00101129454444075 0.000823987182421607 0.000839246204318303 0.000809084059469826 0.000848523816319493 42492 44073 667 665 0 True 542 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 586 280 0.00109704817996129 0.000960308759997958 0.000717174029144732 0.000534065766384375 0.00111944545580658 0.000996468460379502 47954 41851 667 665 0 False 586 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 631 280 0.000961638658812045 0.00100103772821846 0.000610360875867857 0.000656137941557946 0.000964946938807743 0.000994544964331412 42035 43626 667 665 0 False 631 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 230 327 0.000969897289853586 0.000916206744831867 0.000762951094834821 0.000717174029144732 0.000790181702134793 0.000781707745485529 42396 39929 667 665 0 True 229 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 275 327 0.000867819695096375 0.000917491715096852 0.000717174029144732 0.000717174029144732 0.000704701022759495 0.000786794284488011 37934 39985 667 665 0 True 273 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 318 328 0.0009110345262251 0.000919327386903973 0.00080872816052491 0.00080872816052491 0.000656128848007482 0.000618459837422076 39823 40065 667 665 0 True 318 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 361 327 0.000902524247146283 0.000926279993873445 0.000793469138628214 0.000823987182421607 0.000676506565242419 0.000686176411944385 39451 40368 667 665 0 True 363 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 407 327 0.000967723965895285 0.00095721106382344 0.000747692072938125 0.000793469138628214 0.000821907074963684 0.000729657749453553 42301 41716 667 665 0 True 408 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 450 325 0.000963514580544473 0.000882797517942258 0.000686655985351339 0.000625619897764553 0.000935826324572251 0.00084904114830401 42117 38473 667 665 0 True 452 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 494 325 0.000905017850424753 0.000963085213606229 0.000656137941557946 0.000701915007248035 0.000858484085487146 0.000907152117386339 39560 41972 667 665 0 True 497 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 539 325 0.00105079069529094 0.000970473792629892 0.000915541313801785 0.000823987182421607 0.000813051508436271 0.000814907006009905 45932 42294 667 665 0 True 542 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 583 325 0.000984515753109941 0.00101891258244031 0.000686655985351339 0.000564583810177768 0.00101477066229029 0.00110328096751538 43035 44405 667 665 0 True 587 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 627 325 0.00100931452332886 0.0010095277103264 0.000549324788281071 0.000579842832074464 0.00107016123629667 0.00108807980761833 44119 43996 667 665 0 True 631 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 231 372 0.000940271452737811 0.000869167654774382 0.000747692072938125 0.000686655985351339 0.000874885287428257 0.00078987858284087 41101 37879 667 665 0 True 229 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 274 372 0.000909478883812843 0.000860907131642335 0.000793469138628214 0.000717174029144732 0.000725611966742221 0.000744871183652685 39755 37519 667 665 0 True 274 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 318 372 0.00097245952441495 0.000901360749091773 0.000854505226215 0.000762951094834821 0.000710756381155084 0.000700712729466724 42508 39282 667 665 0 True 318 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 362 372 0.000976234244974103 0.000877106935340182 0.00080872816052491 0.000717174029144732 0.000759241170182095 0.000722277932744986 42673 38225 667 665 0 True 363 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 407 370 0.00100583720499558 0.00092290694692786 0.00080872816052491 0.000732433051041428 0.000790400415786961 0.000752738837578976 43967 40221 667 665 0 True 408 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 451 370 0.000930800335698482 0.000938257752414912 0.000625619897764553 0.000610360875867857 0.00088219856873153 0.00089012749708795 40687 40890 667 665 0 True 452 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 496 369 0.000976348630445592 0.000941929096029155 0.000656137941557946 0.000595101853971161 0.000933715572169555 0.000943035525668623 42678 41050 667 665 0 True 497 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 539 369 0.000953700307090675 0.00102329524887981 0.000671396963454643 0.000778210116731518 0.000919175894431927 0.000983411528430995 41688 44596 667 665 0 True 542 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 584 370 0.000991104356267735 0.000962098540009901 0.000671396963454643 0.000595101853971161 0.00103387011048671 0.00108887741614444 43323 41929 667 665 0 True 587 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 627 369 0.000980672401267894 0.000916206744831867 0.000656137941557946 0.000503547722590982 0.00103854950742594 0.000985586165717327 42867 39929 667 665 0 True 631 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 230 416 0.000927643296685372 0.000923480594367585 0.000747692072938125 0.000732433051041428 0.00079710124189411 0.000856945475015098 40549 40246 667 665 0 True 229 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 275 415 0.000979780194590276 0.000954251043034457 0.000869764248111696 0.00080872816052491 0.000815198854255385 0.000764237126069534 42828 41587 667 665 0 True 274 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 318 416 0.000875666538440553 0.000934838813674149 0.000747692072938125 0.000793469138628214 0.000688206117025719 0.000725228800770138 38277 40741 667 665 0 True 318 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 363 415 0.000912430028977271 0.00086896114169608 0.000762951094834821 0.000793469138628214 0.000693582617592302 0.000661100080886774 39884 37870 667 665 0 True 363 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 408 415 0.000981976395642874 0.000916550933295702 0.000762951094834821 0.000686655985351339 0.000830041035741506 0.000827566423699392 42924 39944 667 665 0 True 408 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 451 413 0.000927574665402478 0.000987545540436121 0.000701915007248035 0.000762951094834821 0.000808065790211123 0.000853611592955672 40546 43038 667 665 0 True 453 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 496 413 0.000994947708109781 0.000917354039711318 0.000732433051041428 0.000656137941557946 0.000919913035149932 0.000877936982680934 43491 39979 667 665 0 True 497 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 539 413 0.000944618100654411 0.000991974098670801 0.000701915007248035 0.00080872816052491 0.000861888580822631 0.00085617535552995 41291 43231 667 665 0 True 542 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 585 413 0.000938578547759766 0.000950969779679228 0.000625619897764553 0.000549324788281071 0.00096682753640279 0.00102170152207372 41027 41444 667 665 0 True 587 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 628 414 0.000941872849338663 0.00100996368238059 0.000595101853971161 0.000671396963454643 0.000971571069888139 0.000993749061940663 41171 44015 667 665 0 True 631 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 232 461 0.000864594024800372 0.000971804654690055 0.000671396963454643 0.00080872816052491 0.000769320809009237 0.000842793640035587 37793 42352 667 665 0 True 229 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 276 461 0.000991333127210714 0.00094741316555293 0.000823987182421607 0.000823987182421607 0.000812919406555004 0.000783792663881981 43333 41289 667 665 0 True 274 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 320 461 0.000957795306969999 0.000929400635945552 0.000839246204318303 0.00080872816052491 0.000807386675468805 0.000795905474829924 41867 40504 667 665 0 True 318 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 364 459 0.000928512626268692 0.000941240719101485 0.000778210116731518 0.000839246204318303 0.000792530404141672 0.000752085406456041 40587 41020 667 665 0 True 363 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 408 460 0.000903690978955475 0.000921943219229121 0.00064087891966125 0.000686655985351339 0.000897285973490786 0.000838921758759472 39502 40179 667 665 0 True 408 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 452 458 0.000872509499427444 0.000943627092450742 0.000457770656900893 0.000534065766384375 0.000981011284956109 0.00103090087105561 38139 41124 667 665 0 True 453 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 496 458 0.000958412988516042 0.000948560460432381 0.000579842832074464 0.000488288700694286 0.00100155204616818 0.0010582150166691 41894 41339 667 665 0 True 497 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 541 457 0.000952076033395525 0.000962970484118284 0.000656137941557946 0.000625619897764553 0.000933407728705189 0.000964772126123115 41617 41967 667 665 0 True 542 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 585 456 0.0009566972064437 0.000965081506696473 0.000473029678797589 0.000534065766384375 0.00105753604343298 0.00103820545163906 41819 42059 667 665 0 True 587 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 628 458 0.000875872432289234 0.000926761857722815 0.000457770656900893 0.000503547722590982 0.00096586075601444 0.000964969753066532 38286 40389 667 665 0 True 632 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 232 505 0.00093896745836283 0.00100207029360997 0.000823987182421607 0.000839246204318303 0.000709703206489646 0.000779582034542434 41044 43671 667 665 0 True 229 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 276 504 0.000876467236740979 0.000877634690984729 0.000701915007248035 0.000762951094834821 0.000755694813698739 0.000742784530515755 38312 38248 667 665 0 True 274 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 319 505 0.000962736759338344 0.00086010402522672 0.000823987182421607 0.000732433051041428 0.000795535995968579 0.000740161015147452 42083 37484 667 665 0 True 319 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 364 503 0.0010316883215522 0.000980592933466649 0.000869764248111696 0.000839246204318303 0.000836552247362281 0.000763004544827145 45097 42735 667 665 0 True 363 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 408 504 0.000914443213275486 0.000939772181655787 0.000656137941557946 0.000656137941557946 0.000894927384843343 0.000842451695560106 39972 40956 667 665 0 True 408 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 453 503 0.000892069415052144 0.00098990896788779 0.000518806744487678 0.00064087891966125 0.000952177971100423 0.000986448635249921 38994 43141 667 665 0 True 453 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 496 502 0.000947134581027179 0.000891631688514029 0.000564583810177768 0.000549324788281071 0.000975578106234888 0.000894882812109682 41401 38858 667 665 0 True 497 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 540 501 0.000945624692803518 0.000934356949824779 0.00064087891966125 0.000671396963454643 0.000901062384438419 0.000846080839945832 41335 40720 667 665 0 True 542 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 585 501 0.000951023687057822 0.00093621556752949 0.000595101853971161 0.000534065766384375 0.000985079340333934 0.000969946515488426 41571 40801 667 665 0 True 587 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 628 502 0.000921008939338982 0.00102850396763252 0.000564583810177768 0.000686655985351339 0.000933312743023305 0.00100616605410805 40259 44823 667 665 0 True 632 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 232 547 0.000901700671751558 0.000960675894359382 0.000793469138628214 0.00080872816052491 0.000674399170561346 0.000715891285508707 39415 41867 667 665 0 True 229 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 277 547 0.000991401758493607 0.000906775980922781 0.000869764248111696 0.000762951094834821 0.000785927512735028 0.00076346962565283 43336 39518 667 665 0 True 274 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 319 547 0.000918835615380682 0.000936169675734312 0.00080872816052491 0.000869764248111696 0.000737603827086757 0.000704919890212623 40164 40799 667 665 0 True 319 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 365 545 0.000939745279568959 0.000914095722253677 0.000793469138628214 0.000778210116731518 0.000794805837270499 0.000713604634555499 41078 39837 667 665 0 True 363 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 408 546 0.000934872458483507 0.000950992725576817 0.000656137941557946 0.000778210116731518 0.000885763014686832 0.000791982769314982 40865 41445 667 665 0 True 408 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 453 543 0.000926019022990222 0.000958840222552261 0.000503547722590982 0.000457770656900893 0.000995642996219294 0.00111788081554828 40478 41787 667 665 0 True 453 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 497 545 0.000900899973451132 0.000969074092876962 0.000473029678797589 0.000473029678797589 0.00100663639607483 0.00115005522833329 39380 42233 667 665 0 True 498 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 540 543 0.000971841842868907 0.000947367273757752 0.000579842832074464 0.000488288700694286 0.000994589425946026 0.00103725272253274 42481 41287 667 665 0 True 542 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 585 542 0.000979688686213085 0.000960079301022068 0.000732433051041428 0.000686655985351339 0.000924200196521601 0.000858098867453004 42824 41841 667 665 0 True 587 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 627 543 0.000936817011498828 0.000983943034514645 0.00064087891966125 0.000579842832074464 0.000922099810398168 0.00100597012871505 40950 42881 667 665 0 True 632 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 229 586 0.000999500249875062 0.000958060062034234 0.000869764248111696 0.000854505226215 0.000710214278734656 0.000646340178512464 43690 41753 667 665 0 False 229 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 274 586 0.000954134971882335 0.000901131290115882 0.000869764248111696 0.000778210116731518 0.00070768964681609 0.000692648783185893 41707 39272 667 665 0 False 274 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 320 590 0.000952533575281483 0.0010571633937212 0.000823987182421607 0.000961318379491875 0.000746157248286049 0.000822848962831359 41637 46072 667 665 0 True 319 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 363 590 0.000957406396366934 0.000966871286708417 0.00080872816052491 0.000839246204318303 0.000725512722712467 0.000740074314888002 41850 42137 667 665 0 True 364 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 408 585 0.00092494379955822 0.000987774999412011 0.000717174029144732 0.000778210116731518 0.000788088359239534 0.00082063960603439 40431 43048 667 665 0 False 408 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 453 585 0.000977355222594699 0.000936605647788503 0.000564583810177768 0.000518806744487678 0.00104502614880814 0.00101817761483771 42722 40818 667 665 0 False 453 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 498 585 0.000889964722376738 0.000916298528422223 0.000335698481727321 0.000473029678797589 0.00107332053457934 0.00107325769741794 38902 39933 667 665 0 False 498 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 542 585 0.000926865475479244 0.00101709985653078 0.000579842832074464 0.000656137941557946 0.000965768503713146 0.00100287954992309 40515 44326 667 665 0 False 542 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 587 585 0.000985636730730538 0.000986512975044616 0.000701915007248035 0.000671396963454643 0.000931221384062762 0.000929567222938997 43084 42993 667 665 0 False 587 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 632 585 0.000910531230150546 0.000984447844261604 0.000671396963454643 0.000717174029144732 0.000826382637980043 0.000809692846388415 39801 42903 667 665 0 False 632 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 231 636 0.00104111368440293 0.0697263644347766 0.000915541313801785 0.0688792248416877 0.000766128946201248 0.0156599443155309 45509 3038729 667 665 0 True 229 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 274 629 0.000997189663350975 0.00101322199983823 0.000854505226215 0.000823987182421607 0.000781445413859534 0.000772146049747217 43589 44157 667 665 0 False 274 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 319 629 0.000959213686816468 0.000955421283811497 0.000854505226215 0.00080872816052491 0.000725277918484332 0.000716668230166114 41929 41638 667 665 0 False 319 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 364 629 0.000922427319185452 0.000927656747728786 0.000778210116731518 0.000793469138628214 0.000695685474381496 0.000733628316135464 40321 40428 667 665 0 False 364 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 408 629 0.000853132600557126 0.000939359155499185 0.000671396963454643 0.000778210116731518 0.000727532541045133 0.000685302573065383 37292 40938 667 665 0 False 408 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 453 629 0.000921603743790728 0.000924214863090434 0.000579842832074464 0.000549324788281071 0.000990361111165426 0.00097016865384719 40285 40278 667 665 0 False 453 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 498 629 0.000963262932507196 0.000943374687577263 0.000610360875867857 0.000503547722590982 0.000994818135658594 0.00100225097278377 42106 41113 667 665 0 False 498 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 543 629 0.000970034552419373 0.000893100225959726 0.000656137941557946 0.000411993591210803 0.00098464602219423 0.00102967312948035 42402 38922 667 665 0 False 543 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 587 629 0.000986849216728326 0.00100525977337484 0.000778210116731518 0.000793469138628214 0.000825873812592627 0.000824528862384887 43137 43810 667 665 0 False 587 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 629 634 0.0010708310298959 0.080958518979986 0.000930800335698482 0.0795452811474784 0.000766254516051425 0.0206888079112914 46808 3528235 667 665 0 True 632 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C1_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C1_1.csv new file mode 100755 index 0000000..d9b6b8e --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C1_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 253 282 0.00932822670834416 0.0415373063007714 0.009399557488365 0.0416571297779812 0.00152457867928472 0.00781521255353289 407754 1810228 667 665 0 True 253 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 297 281 0.00936027751745551 0.00924956015582559 0.00947585259784848 0.00924696726939803 0.00138151952253789 0.00129460513757191 409155 403103 667 665 0 False 297 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 341 282 0.00949692240169684 0.0625678868721357 0.00952162966353857 0.062073701075761 0.00140776449290988 0.00810196234997399 415128 2726757 667 665 0 True 342 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 386 283 0.00939919145485623 0.0894009112963227 0.009399557488365 0.0877851529716945 0.00131248357156973 0.0125640625781474 410856 3896161 667 665 0 True 387 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 430 283 0.00941049273943939 0.0741094209545379 0.0093842984664683 0.0720836194399939 0.00166352556299061 0.0113209974253957 411350 3229746 667 665 0 True 431 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 473 282 0.00940511662227938 0.0656828613075375 0.00946059357595178 0.0693064774547952 0.00176422544379327 0.0190453753966563 411115 2862510 667 665 0 True 476 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 518 281 0.00925186296757778 0.0812832263767682 0.00926222629129473 0.0797283894102388 0.00161250116430707 0.0211367609055165 404416 3542386 667 665 0 True 521 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 561 280 0.00908698774897285 0.0692274517834986 0.00909437705043107 0.0669260700389105 0.00185285915407529 0.0185534860061482 397209 3016986 667 665 0 True 565 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 610 280 0.0091179175804636 0.0090947212388949 0.00914015411612116 0.00914015411612116 0.00205048233145367 0.00182013806087133 398561 396355 667 665 0 False 610 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 650 281 0.00928057372092164 0.0410291005609698 0.00927748531319142 0.0409399557488365 0.00200192483985162 0.00833208460334081 405671 1788080 667 665 0 True 655 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 253 325 0.00912242436804029 0.00919985934164778 0.00909437705043107 0.00914015411612116 0.00151188743648691 0.00148036212682463 398758 400937 667 665 0 False 253 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 297 325 0.00934364586990094 0.0094937733438655 0.00944533455405508 0.00944533455405508 0.00142577256849396 0.00133243716784098 408428 413746 667 665 0 False 297 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 341 326 0.00977199658353474 0.141321442769203 0.00968947890440223 0.134447241931792 0.0015330975809599 0.0531414917982398 427152 6158898 667 665 0 True 342 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 385 326 0.00947502902245375 0.0516842346195083 0.00950637064164187 0.050919356069276 0.00136481762435447 0.00661247732041979 414171 2252439 667 665 0 True 387 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 430 326 0.00956958005318696 0.0876062438081929 0.00968947890440223 0.0817120622568093 0.00163604499818415 0.0277933212993553 418304 3817948 667 665 0 True 431 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 474 326 0.00947148307283758 0.0426986211236491 0.00944533455405508 0.0438544289311055 0.00183079419200922 0.00635531633824439 414016 1860839 667 665 0 True 476 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 519 325 0.00960913454922802 0.0440910240811459 0.00959792477302205 0.0467994201571679 0.0016797828077743 0.00900610837105614 420033 1921521 667 665 0 True 521 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 563 325 0.00950287044621429 0.0508274577494319 0.00952162966353857 0.0522621499961852 0.00178110265856567 0.0090589209068753 415388 2215100 667 665 0 True 565 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 610 324 0.009360391902927 0.00912636363167016 0.0093690394445716 0.00918593118181125 0.00219767578117125 0.00208929405115163 409160 397734 667 665 0 False 610 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 655 324 0.00922470785664618 0.00932782861250173 0.00930800335698482 0.00932326237888151 0.00202319660449184 0.00177191894865119 403229 406514 667 665 0 False 655 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 253 371 0.00947278706721256 0.0506005457681742 0.00947585259784848 0.0498359655146105 0.00153719543623257 0.00921214760246107 414073 2205211 667 665 0 True 253 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 296 370 0.00957049513695887 0.0601931012011604 0.00955214770733196 0.0632486457618067 0.00151557065378854 0.0165830659353071 418344 2623262 667 665 0 True 297 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 342 368 0.00977016641599091 0.0286129147542695 0.00965896086060884 0.0329594872968643 0.00163291264400033 0.0143790611001864 427072 1246973 667 665 0 False 342 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 384 371 0.00961297790107006 0.0338467363189388 0.00955214770733196 0.0350804913405051 0.00138590084029646 0.00533782771279214 420201 1475067 667 665 0 True 387 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 429 371 0.0107036433717222 0.0742364264976931 0.00971999694819562 0.0720683604180972 0.00816771789049011 0.0128206292510957 467876 3235281 667 665 0 True 431 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 473 369 0.00963139396197987 0.0350170000418763 0.00968947890440223 0.0345616845960174 0.001743182990884 0.00765794926717904 421006 1526068 667 665 0 True 476 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 517 369 0.00956777276273742 0.028276780300488 0.00953688868543526 0.0287937743190661 0.00175044032111128 0.00371123565389016 418225 1232324 667 665 0 True 521 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 562 368 0.00953279368555594 0.0523683665561248 0.00950637064164187 0.0520485236896315 0.0019150351572052 0.00849958732874686 416696 2282254 667 665 0 True 566 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 606 369 0.00982314976638483 0.0576665054717361 0.00990310521095598 0.0572365911345083 0.00219012848065003 0.0102137054916689 429388 2513151 667 665 0 True 610 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 650 369 0.00956344899191512 0.0618326544215884 0.00956740672922866 0.0614938582436866 0.00198390812607837 0.0159012474059926 418036 2694715 667 665 0 True 655 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 253 414 0.00940676377306883 0.0423737301596862 0.00944533455405508 0.0453955901426719 0.00151871147464662 0.00910190115601213 411187 1846680 667 665 0 True 253 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 297 414 0.00942037564417608 0.0329096717531985 0.00933852140077821 0.0328984512092775 0.0014031965827373 0.00369839390144474 411782 1434229 667 665 0 True 298 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 341 414 0.00971297368024617 0.0842863395614236 0.00965896086060884 0.0801861600671397 0.00141612085138257 0.017010015666935 424572 3673264 667 665 0 True 342 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 386 414 0.00973589652873266 0.0666652669669137 0.00970473792629892 0.0652780956740673 0.00144510218164895 0.0134974432833162 425574 2905324 667 665 0 True 387 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 429 414 0.00986453442996973 0.044313002694422 0.0098268101014725 0.0455634393835355 0.00166981058422107 0.00764027638689459 431197 1931195 667 665 0 True 432 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 473 413 0.00987659065866472 0.054810268977548 0.00985732814526589 0.0561379415579461 0.0017246057232323 0.0100400792746864 431724 2388674 667 665 0 True 476 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 518 413 0.00989843828371921 0.0431151580025826 0.00991836423285267 0.0433356221866178 0.00170282915891247 0.00510303883966346 432679 1878992 667 665 0 True 521 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 562 412 0.0098952583676118 0.0549504913577145 0.00987258716716258 0.0540627145799954 0.00183489690053676 0.00746953126981837 432540 2394785 667 665 0 True 566 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 606 413 0.00959925164449133 0.0421334407201341 0.00947585259784848 0.0430151827267872 0.00202418099315295 0.00628314274571332 419601 1836208 667 665 0 True 610 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 650 413 0.00946718217910958 0.0898498477826519 0.00964370183871214 0.0867933165484092 0.00195424934790238 0.0192262184062002 413828 3915726 667 665 0 True 655 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 254 459 0.00931706268632678 0.0483651334791545 0.00929274433508812 0.0481879911497673 0.00160282944216271 0.00624073746041174 407266 2107790 667 665 0 True 253 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 298 458 0.00954334002602727 0.0603920650791547 0.00952162966353857 0.0591439688715953 0.00147749921334302 0.00943579806909712 417157 2631933 667 665 0 True 298 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 341 458 0.00971729745106847 0.0350450169828325 0.00970473792629892 0.0357213702601663 0.00146057191659836 0.0036596468342483 424761 1527289 667 665 0 True 342 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 386 458 0.00991468102067071 0.0566180385732011 0.00994888227664607 0.053528648813611 0.00158200986456637 0.012695407006268 433389 2467458 667 665 0 True 387 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 430 458 0.0102294469611155 0.0948054962308495 0.01025406271458 0.0950331883726253 0.00187186707423815 0.015377393235682 447148 4131697 667 665 0 True 432 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 474 457 0.0101525341700859 0.0621341405700105 0.0101167315175097 0.0605783169298848 0.00203864596595471 0.0139586708615577 443786 2707854 667 665 0 True 476 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 518 457 0.00984225214012358 0.0529498844387233 0.00987258716716258 0.0523537041275654 0.00185886352477269 0.00758135149062429 430223 2307597 667 665 0 True 521 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 563 455 0.00982383607921377 0.0324001122054392 0.0098268101014725 0.0325780117494469 0.00184166081615568 0.0040043726872269 429418 1412022 667 665 0 True 566 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 606 457 0.00953951955127952 0.0393216504295759 0.00958266575112535 0.0398870832379644 0.00186298864100046 0.00463670209637871 416990 1713668 667 665 0 True 610 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 650 457 0.00938679206974677 0.0748532810625786 0.009399557488365 0.0732890821698329 0.00188562127457769 0.0167115852909665 410314 3262164 667 665 0 True 655 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 254 503 0.00916490713215148 0.0620380202050101 0.00912489509422446 0.0616769665064469 0.00149270288004944 0.0147365045149028 400615 2703665 667 665 0 True 253 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 299 502 0.0094157773482222 0.0573450563924116 0.00946059357595178 0.0566414892805371 0.00152923510022141 0.00508039272084402 411581 2499142 667 665 0 True 298 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 343 503 0.00965875496676015 0.0709656494176618 0.00967421988250553 0.0695963988708324 0.00152058714897717 0.0148305212987173 422202 3092738 667 665 0 True 343 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 387 503 0.010082576015723 0.0909820213155916 0.0101319905394064 0.0880903334096284 0.00166839895692489 0.0186656317384892 440728 3965067 667 665 0 True 387 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 430 501 0.0101818626049758 0.0969016269215038 0.0102235446707866 0.0920881971465629 0.00198068381066634 0.026334592885032 445068 4223048 667 665 0 True 432 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 476 501 0.00992724054544026 0.0423368561022607 0.00999465934233616 0.0431372549019608 0.00197879546325873 0.00469336728220835 433938 1845073 667 665 0 True 477 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 520 500 0.0097952168342471 0.0399137922627581 0.0098115510795758 0.0407415884641794 0.00166380633703608 0.0046330525302705 428167 1739474 667 665 0 True 521 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 563 500 0.00982932658184526 0.128875610862817 0.00993362325474937 0.127214465552758 0.0018565781738044 0.023179690780461 429658 5616499 667 665 0 True 566 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 608 502 0.00967806323434758 0.0598664663489807 0.00971999694819562 0.063080796520943 0.00184694247110569 0.0128940818886286 423046 2609027 667 665 0 True 611 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 652 501 0.00973800122140807 0.0781417953214462 0.0098268101014725 0.075898374914168 0.0018694525588261 0.0126734239351837 425666 3405480 667 665 0 True 655 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 255 546 0.00921509947704106 0.0504657156739411 0.00917067215991455 0.0530251010910201 0.00144185809878399 0.00888167084401847 402809 2199335 667 665 0 True 253 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 298 545 0.00956095538863665 0.110792086648298 0.00961318379491875 0.106263828488594 0.00142516230372862 0.0296308706529006 417927 4828405 667 665 0 True 298 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 342 546 0.0096713144915297 0.0584213337188244 0.00975051499198901 0.060318913557641 0.00143527073285504 0.0108175491409538 422751 2546047 667 665 0 True 343 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 387 546 0.00994483303095534 0.0609730552061087 0.0100251773861295 0.0600442511635004 0.0015108126602004 0.0066967583226912 434707 2657253 667 665 0 True 387 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 431 545 0.0101699893930352 0.057068718947747 0.0101777676050965 0.0562905317769131 0.00204519037941934 0.00534742971994224 444549 2487099 667 665 0 True 432 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 476 544 0.00999401878369582 0.067899802148998 0.00993362325474937 0.0675211718928817 0.00201046582994606 0.00971144859585026 436857 2959126 667 665 0 True 477 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 520 543 0.00983811138605566 0.078883980378963 0.0098115510795758 0.0761120012207217 0.0018315265923438 0.015129094668218 430042 3437825 667 665 0 True 521 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 564 542 0.009614739437331 0.0573732798464461 0.00962844281681544 0.0574044403753719 0.00176766543147622 0.00967059456249749 420278 2500372 667 665 0 True 566 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 608 542 0.00954574212092855 0.0478462349510765 0.00964370183871214 0.0471656366826886 0.00181267204624545 0.0048290205096876 417262 2085176 667 665 0 True 611 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 653 542 0.00954457538911936 0.0626103367826754 0.00959792477302205 0.06323338673991 0.00187128201776019 0.0091929879774383 417211 2728607 667 665 0 True 655 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 255 587 0.00909346196665915 0.043252145011189 0.00901808194094758 0.0440070191500725 0.00138214634522716 0.00691378551663701 397492 1884962 667 665 0 True 254 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 299 586 0.00942460790662119 0.0554907525164479 0.009399557488365 0.0557106889448386 0.00148577540134223 0.00954041961246163 411967 2418330 667 665 0 True 298 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 344 587 0.00941531980633624 0.0464915091574209 0.00946059357595178 0.0462958724345769 0.00136877293331922 0.00580407942724803 411561 2026136 667 665 0 True 343 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 388 587 0.00965779412879964 0.0572111211881845 0.00964370183871214 0.0552834363317311 0.00143216395717408 0.0108431609612414 422160 2493305 667 665 0 True 388 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 433 586 0.00981932929163708 0.101696722924271 0.0098115510795758 0.0997634851606012 0.00178510959874252 0.0215707978336128 429221 4432022 667 665 0 True 432 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 476 584 0.00988693110528737 0.0666925037473519 0.00996414129854276 0.0650797283894102 0.00204078666750806 0.00986277624454499 432176 2906511 667 665 0 True 477 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 521 584 0.00949392550234382 0.0582832682530313 0.00956740672922866 0.0579079880979629 0.00201884985721271 0.00678338396945899 414997 2540030 667 665 0 True 522 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 565 583 0.00947905539105018 0.039623526658257 0.00946059357595178 0.0404058899824521 0.00184083230295748 0.00772174861355097 414347 1726824 667 665 0 True 566 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 610 584 0.00937837329904514 0.046976906675019 0.00930800335698482 0.0467536430914778 0.00157223858172374 0.00590313362495172 409946 2047290 667 665 0 True 611 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 653 583 0.00915561903186653 0.0541426121954004 0.00924696726939803 0.0533150225070573 0.00155565129224486 0.00722691611899766 400209 2359577 667 665 0 True 656 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 254 629 0.00889992174889895 0.00904307002342203 0.00885023270008392 0.00898756389715419 0.00130146517441423 0.0016138313161948 389032 394104 667 665 0 False 254 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 298 629 0.0088950489278135 0.00883995293796404 0.00889600976577401 0.00883497367818723 0.00139286002764941 0.00134772322627066 388819 385252 667 665 0 False 298 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 343 629 0.0092853321565356 0.0735692515793948 0.00930800335698482 0.0720225833524071 0.00145271714966115 0.0107619921849252 405879 3206205 667 665 0 True 343 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 388 629 0.00940191382907768 0.0882859242406772 0.00932326237888151 0.0853437094682231 0.00145090857518359 0.0215961733850759 410975 3847569 667 665 0 True 388 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 432 629 0.00924724179452961 0.00922333299488134 0.00921644922560464 0.00927748531319142 0.00169775542266061 0.00177093869910237 404214 401960 667 665 0 False 432 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 477 629 0.00928670478219348 0.00954310702368189 0.00929274433508812 0.00959792477302205 0.00189519479899646 0.00181765445587106 405939 415896 667 665 0 False 477 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 522 628 0.00916939104263387 0.00898136850480516 0.00920119020370794 0.00907911802853437 0.0019560988407923 0.00183449574426095 400811 391415 667 665 0 False 522 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 566 628 0.00897148129986277 0.00898194215224488 0.0089570458533608 0.0089417868314641 0.00168989968600479 0.00170778658164636 392160 391440 667 665 0 False 566 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 611 628 0.00905862015204346 0.00877093167801628 0.00907911802853437 0.00878919661249714 0.00141839435932872 0.00143688270672932 395969 382244 667 665 0 False 611 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 656 628 0.00888768250344958 0.00896337892109537 0.00891126878767071 0.00898756389715419 0.00153428254623781 0.00137542995833958 388497 390631 667 665 0 False 656 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 255 679 0.00883245719781446 0.0384882554291428 0.00886549172198062 0.038803692683299 0.00135357668030399 0.00878453673327009 386083 1677348 667 665 0 True 254 673 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 299 673 0.00880877940521614 0.00876026183563739 0.00878919661249714 0.00878919661249714 0.00130893869257977 0.0012228037277659 385048 381779 667 665 0 False 299 673 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 343 673 0.00870596974344139 0.00871294739480883 0.00865186541542687 0.00880445563439384 0.00132768456474936 0.00125870404956484 380554 379717 667 665 0 False 343 673 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 388 672 0.0088820547382523 0.00887113641278752 0.0089417868314641 0.00892652780956741 0.0013264457095215 0.00137052286892107 388251 386611 667 665 0 False 388 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 433 672 0.00896864454016983 0.00900665488394825 0.00903334096284428 0.0089723048752575 0.00162425461908627 0.00142030366983321 392036 392517 667 665 0 False 433 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 477 672 0.0090026627793908 0.00912207274882101 0.00903334096284428 0.00915541313801785 0.00164859795763595 0.00151787689683803 393523 397547 667 665 0 False 477 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 522 672 0.00881008339959112 0.00888986026522016 0.00875867856870375 0.00889600976577401 0.00175778645728365 0.00167044329592158 385105 387427 667 665 0 False 522 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 567 672 0.00879750099772728 0.00880298709694814 0.00878919661249714 0.00877393759060044 0.00154892377530793 0.00157872731781919 384555 383641 667 665 0 False 567 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 611 672 0.00887507722449144 0.00876480512336001 0.00888075074387732 0.00880445563439384 0.00138877847864105 0.0015420432174127 387946 381977 667 665 0 False 611 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 652 678 0.00896649409330583 0.0393093514284682 0.00903334096284428 0.0390173189898528 0.00150267458751556 0.00802941219618408 391942 1713132 667 665 0 True 656 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C1_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C1_2.csv new file mode 100755 index 0000000..afe292e --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C1_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 253 282 0.00795587557560199 0.73476247267287 0.00784313725490196 0.735286488136111 0.00186087394072922 0.168344568357807 347766 32021518 667 665 10 True 253 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 297 281 0.00654083578489995 0.00647700735014465 0.0064087891966125 0.00650034332799268 0.00157245821601016 0.00116551402152027 285912 282273 667 665 0 False 297 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 341 282 0.00596483630466753 0.00620480016704613 0.005981536583505 0.00627145799954223 0.00129730885438956 0.00133299216192178 260734 270410 667 665 0 True 342 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 386 283 0.00629056037328097 0.00627242172724097 0.00628671702143893 0.00625619897764553 0.00129059790554538 0.00119710064035967 274972 273357 667 665 0 True 387 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 430 283 0.00617269758345821 0.00652643281355139 0.00614938582436866 0.00645456626230259 0.00157217794541623 0.00162372237458953 269820 284427 667 665 0 True 431 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 473 282 0.00640055344266525 0.00635351252932055 0.00633249408712902 0.0063782711528191 0.00157468357765296 0.00181466410725948 279780 276891 667 665 0 True 476 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 518 281 0.00663845234626907 0.00688819783493983 0.00662241550316625 0.00688181887541009 0.00145427747286547 0.00159130058289066 290179 300193 667 665 0 True 521 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 561 280 0.00684015968669362 0.00683842818306925 0.00674448767833982 0.00694285496299687 0.00169429301833308 0.00145590602087285 298996 298024 667 665 0 True 565 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 610 280 0.00840465553444381 0.00758506474471828 0.0076600289921416 0.00746166170748455 0.00463488283931407 0.0019484609339775 367383 330563 667 665 0 False 610 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 650 281 0.00919107852802827 0.740759681304428 0.00910963607232776 0.72156862745098 0.00217371876711987 0.169807061297718 401759 32282881 667 665 12 True 655 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 253 325 0.00651830184701652 0.00644651225224884 0.00646982528419928 0.00651560234988937 0.00162977931701788 0.00132192699567824 284927 280944 667 665 0 False 253 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 297 325 0.00621767395084788 0.00626663936104854 0.00614938582436866 0.00628671702143893 0.00123673144277558 0.00129179583677464 271786 273105 667 665 0 False 297 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 341 326 0.00607290769813079 0.0063513326690496 0.00605783169298848 0.00633249408712902 0.00128757745674008 0.00129347869160414 265458 276796 667 665 0 True 342 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 385 326 0.00633562824904783 0.00640472777273924 0.00630197604333562 0.0063782711528191 0.00130848382753439 0.00118971554987529 276942 279123 667 665 0 True 387 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 430 326 0.0066153693581225 0.00673714499111133 0.00662241550316625 0.00672922865644312 0.00165995755834576 0.00166381630143573 289170 293610 667 665 0 True 431 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 474 326 0.00683993091575064 0.00673982966112925 0.00688181887541009 0.00666819256885634 0.00165773796869713 0.00154562782944931 298986 293727 667 665 0 True 476 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 519 325 0.00684649664181414 0.00675807164971252 0.00692759594110018 0.0068055237659266 0.00156355698714373 0.00159096667649198 299273 294522 667 665 0 True 521 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 563 325 0.00700437146956391 0.00729493681560275 0.00697337300679027 0.0072480354009308 0.00171825682488779 0.00161412653826663 306174 317919 667 665 0 True 565 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 610 324 0.0073926186368935 0.00724918269581025 0.00738536659800107 0.00729381246662089 0.00206320221595988 0.0020395425117757 323145 315925 667 665 0 False 610 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 655 324 0.0077427525651228 0.00771156547812654 0.00782787823300526 0.00775158312352178 0.00202914454180166 0.00189304855996516 338450 336076 667 665 0 False 655 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 253 371 0.00617084453882008 0.00623986149856215 0.00614938582436866 0.00633249408712902 0.00146834701678905 0.00148675779337391 269739 271938 667 665 0 True 253 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 296 370 0.0060978666080098 0.00629215519916752 0.00611886778057527 0.00634775310902571 0.00132836289566145 0.0012637380897048 266549 274217 667 665 0 True 297 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 342 368 0.00641373064898084 0.00632969468762315 0.0064087891966125 0.00630197604333562 0.00133119663912923 0.0013082750125451 280356 275853 667 665 0 False 342 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 384 371 0.00658318128644536 0.00679659781176448 0.00657663843747616 0.00679026474402991 0.00140847004766223 0.0012658078260399 287763 296201 667 665 0 True 387 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 429 371 0.00754035891186931 0.00698592441277146 0.00689707789730678 0.00703440909437705 0.00585859240655209 0.00172583071929388 329603 304452 667 665 0 True 431 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 473 369 0.00689261686391869 0.00687807869410308 0.0068207827878233 0.00686655985351339 0.0016758648926102 0.00173582977595072 301289 299752 667 665 0 True 476 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 517 369 0.00682259007827283 0.00692929393752176 0.0068055237659266 0.00700389105058366 0.00163785957141595 0.00172694625555005 298228 301984 667 665 0 True 521 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 562 368 0.00701027375989277 0.00713509569299766 0.00700389105058366 0.00712596322575723 0.00174310931990096 0.00171797719331515 306432 310953 667 665 0 True 566 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 606 369 0.00714357858836661 0.00745899998336422 0.00717174029144732 0.00749217975127794 0.00213070545243094 0.00210085234082706 312259 325069 667 665 0 True 610 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 650 369 0.00677180292893151 0.00665809637391717 0.00675974670023652 0.00675974670023652 0.00193146905535612 0.00189567188874818 296008 290165 667 665 0 True 655 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 253 414 0.006167458728864 0.00624261500627283 0.00617990386816205 0.00622568093385214 0.00145917082555156 0.00146578544053245 269591 272058 667 665 0 True 253 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 297 414 0.00624743705052944 0.00616391057754251 0.00625619897764553 0.00619516289005875 0.00145408432649067 0.00142470330991493 273087 268628 667 665 0 True 298 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 341 414 0.00644763450273032 0.00666814667706116 0.00646982528419928 0.00669871061264973 0.00132866911849347 0.00126036056627289 281838 290603 667 665 0 True 342 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 386 414 0.00691139895833727 0.00696910506983871 0.00697337300679027 0.00692759594110018 0.0014535214217354 0.00139636496779066 302110 303719 667 665 0 True 387 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 429 414 0.00721237001092038 0.007402231832729 0.00715648126955062 0.0072327763790341 0.00152844801380313 0.0021658018602526 315266 322595 667 665 0 True 432 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 473 413 0.00725885626653371 0.0070777538949227 0.00727855344472419 0.00708018616006714 0.0018037234635748 0.0014624044131569 317298 308454 667 665 0 True 476 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 518 413 0.00717542350362928 0.00719048708977755 0.00711070420386053 0.0072327763790341 0.00165303388909614 0.00166026991087029 313651 313367 667 665 0 True 521 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 562 412 0.00700784878789719 0.00726657568618273 0.00704966811627375 0.00740062561989776 0.00178457658493012 0.00156885562660713 306326 316683 667 665 0 True 566 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 606 413 0.00632354914325854 0.00638416824849948 0.00631723506523232 0.00631723506523232 0.00184658522656901 0.00183512540778654 276414 278227 667 665 0 True 610 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 650 413 0.0057488536574011 0.00591767815051476 0.00570687418936446 0.00587472343022812 0.00181248910916266 0.00174228949933607 251293 257897 667 665 0 True 655 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 254 459 0.00617400157783319 0.00611622900235253 0.00616464484626535 0.00619516289005875 0.0014327845306913 0.0014479233362892 269877 266550 667 665 0 True 253 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 298 458 0.0062631078601235 0.00623550177802024 0.00630197604333562 0.00622568093385214 0.00146313061643177 0.0015711758726725 273772 271748 667 665 0 True 298 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 341 458 0.0063642246169202 0.00648770013842113 0.00628671702143893 0.00646982528419928 0.00133885651605813 0.00146718806660921 278192 282739 667 665 0 True 342 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 386 458 0.00671019491398727 0.00683549110817786 0.00674448767833982 0.0068055237659266 0.00157820137347378 0.00147330205152546 293315 297896 667 665 0 True 387 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 430 458 0.00683043692161701 0.00694877500457484 0.00688181887541009 0.00697337300679027 0.00181275875743699 0.00198513360089807 298571 302833 667 665 0 True 432 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 474 457 0.00716961272167761 0.00728970515095246 0.00709544518196384 0.00735484855420768 0.0019695618697405 0.00201499894693638 313397 317691 667 665 0 True 476 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 518 457 0.00680058231355826 0.00688808310545189 0.0068055237659266 0.00688181887541009 0.00176199363322095 0.00177017263176992 297266 300188 667 665 0 True 521 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 563 455 0.00639165425298337 0.00616379584805456 0.00648508430609598 0.00619516289005875 0.00174522078866432 0.00186799338184111 279391 268623 667 665 0 True 566 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 606 457 0.00595447298095059 0.00584308103745287 0.0059662775616083 0.00585946440833143 0.00175635179473469 0.00167858725485566 260281 254646 667 665 0 True 610 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 650 457 0.00567125455354264 0.00564877517666907 0.00575265125505455 0.00563057907988098 0.00179180485040872 0.00186883482602686 247901 246178 667 665 0 True 655 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 254 503 0.00614632029373274 0.00628387173013789 0.00610360875867857 0.00630197604333562 0.00143982337438754 0.00142786128967753 268667 273856 667 665 0 True 253 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 299 502 0.0062804715746956 0.00629924548152253 0.00628671702143893 0.00631723506523232 0.00148715906746918 0.00144065404649664 274531 274526 667 665 0 True 298 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 343 503 0.00643123162611873 0.00657243933821737 0.00643930724040589 0.00665293354695964 0.00150225624925079 0.00143438255490813 281121 286432 667 665 0 True 343 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 387 503 0.00663993935739843 0.00657429795592208 0.00668345159075303 0.00660715648126955 0.00152544278344346 0.00153289206218826 290244 286513 667 665 0 True 387 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 430 501 0.00672380678509452 0.00708686341626554 0.00675974670023652 0.00712596322575723 0.00184064059075916 0.00183207779420576 293910 308851 667 665 0 True 432 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 476 501 0.00665570167536968 0.00655619364272434 0.00666819256885634 0.00660715648126955 0.00181011400809708 0.00159680426209502 290933 285724 667 665 0 True 477 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 520 500 0.00627678836251364 0.00602657938047224 0.00633249408712902 0.00604257267109178 0.00167855954191549 0.00152433492115593 274370 262643 667 665 0 True 521 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 563 500 0.00598634077330755 0.0059604263577231 0.00592050049591821 0.00602731364919509 0.00172754597324473 0.0016658293225878 261674 259760 667 665 0 True 566 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 608 502 0.00580595488476865 0.00579175106454624 0.00582894636453803 0.00582894636453803 0.00173905631309194 0.00171965957908062 253789 252409 667 665 0 True 611 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 652 501 0.00576706382446223 0.00588566862337808 0.00567635614557107 0.00590524147402152 0.00182693173037126 0.00188623976709506 252089 256502 667 665 0 True 655 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 255 546 0.00611337727794377 0.00637439329612656 0.00605783169298848 0.00633249408712902 0.00135414442050745 0.00140578155980837 267227 277801 667 665 0 True 253 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 298 545 0.00621483719115494 0.00646044041208538 0.00624093995574884 0.00653086137178607 0.00140240633165582 0.00147826302257174 271662 281551 667 665 0 True 298 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 342 546 0.00645287335732454 0.00649976968055295 0.00650034332799268 0.00642404821850919 0.00127972940408249 0.00137662214150051 282067 283265 667 665 0 True 343 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 387 546 0.00641359338641505 0.00646177127414554 0.0064087891966125 0.00646982528419928 0.00141027203032007 0.00144454685802498 280350 281609 667 665 0 True 387 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 431 545 0.00647110640147996 0.00644807257328489 0.00646982528419928 0.00653086137178607 0.00196455856618388 0.00199175175763552 282864 281012 667 665 0 True 432 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 476 544 0.00619955529216394 0.00620959585964224 0.00619516289005875 0.00614938582436866 0.00182407059617408 0.00197637410105998 270994 270619 667 665 0 True 477 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 520 543 0.00622879221867665 0.0061668476524339 0.00616464484626535 0.00611886778057527 0.00198436715660786 0.00186332966390686 272272 268756 667 665 0 True 521 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 564 542 0.00604074250354795 0.00607384792950561 0.00607309071488518 0.00607309071488518 0.00166495807657784 0.00166216388640532 264052 264703 667 665 0 True 566 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 608 542 0.00606810350832823 0.00619390086569135 0.00611886778057527 0.00605783169298848 0.00162829876715498 0.00159840558673914 265248 269935 667 665 0 True 611 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 653 542 0.00615393836613394 0.00618378172485459 0.00613412680247196 0.00624093995574884 0.00177986706061977 0.00185200279292966 269000 269494 667 665 0 True 655 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 255 587 0.00643651623490155 0.00636223197040438 0.00643930724040589 0.0063782711528191 0.00127205303310924 0.00122404156198313 281352 277271 667 665 0 True 254 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 299 586 0.00636019824832377 0.00637517345664459 0.00631723506523232 0.0063782711528191 0.0013694752467128 0.0013435636446795 278016 277835 667 665 0 True 298 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 344 587 0.00644212112300453 0.00634770721723053 0.00645456626230259 0.0063782711528191 0.00139893577087227 0.00143634296337895 281597 276638 667 665 0 True 343 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 388 587 0.00622035057088073 0.00621599776506958 0.00611886778057527 0.00625619897764553 0.00129164639403271 0.00118831243478464 271903 270898 667 665 0 True 388 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 433 586 0.00602795420783543 0.0061823131874089 0.00601205462729839 0.00616464484626535 0.00179110085917894 0.00182564137712418 263493 269430 667 665 0 True 432 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 476 584 0.00622860920192227 0.00634417354900182 0.00617990386816205 0.00636301213092241 0.00186863105066677 0.00181211959988564 272264 276484 667 665 0 True 477 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 521 584 0.00629392330614276 0.0063143438821361 0.00625619897764553 0.00631723506523232 0.00197923326263935 0.00198663807555914 275119 275184 667 665 0 True 522 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 565 583 0.00660534919082002 0.0360388267533104 0.00657663843747616 0.00743114366369116 0.00174706119074192 0.126090108553149 288732 1570600 667 665 0 True 566 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 610 584 0.00613538504265835 0.00634752365004982 0.00611886778057527 0.0063935301747158 0.0014636412442229 0.00149240287261289 268189 276630 667 665 0 True 611 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 653 583 0.00590023139037028 0.00603075553383344 0.00585946440833143 0.00599679560540169 0.00160987151679316 0.00146411540743154 257910 262825 667 665 0 True 656 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 254 629 0.00654012659497672 0.00689088250495775 0.00653086137178607 0.00686655985351339 0.00133985452374769 0.00163478659868973 285881 300310 667 665 0 False 254 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 298 629 0.00629378604357698 0.00629708856714916 0.00633249408712902 0.00630197604333562 0.00134689201261852 0.00131109213812728 275113 274432 667 665 0 False 298 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 343 629 0.00618928347682419 0.00624321159961015 0.00619516289005875 0.00621042191195544 0.0013795539050528 0.00135181710482234 270545 272084 667 665 0 True 343 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 388 629 0.00595589136079706 0.00592020219924955 0.005981536583505 0.00587472343022812 0.00124561094462735 0.00122905518590791 260343 258007 667 665 0 True 388 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 432 629 0.00589689133460278 0.0059380770534714 0.00592050049591821 0.00593575951781491 0.00162551029298841 0.00165147771541407 257764 258786 667 665 0 False 432 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 477 629 0.00619477397945568 0.0061572333213441 0.00617990386816205 0.00617990386816205 0.00191422141052002 0.0017881363627224 270785 268337 667 665 0 False 477 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 522 628 0.00622773987233895 0.00619055076464336 0.00613412680247196 0.00625619897764553 0.00192897903636735 0.00182182082681941 272226 269789 667 665 0 False 522 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 566 628 0.00630456115499128 0.00625190809479639 0.00634775310902571 0.00621042191195544 0.00177682547800381 0.00160312922324713 275584 272463 667 665 0 False 566 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 611 628 0.00604417406769264 0.0060563172637476 0.00605783169298848 0.00608834973678187 0.00139890312343395 0.00136329569281201 264202 263939 667 665 0 False 611 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 656 628 0.00615750719284441 0.00631214107596756 0.00619516289005875 0.0063935301747158 0.00143957641734629 0.00142252120540251 269156 275088 667 665 0 False 656 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 255 679 0.00841577380227259 0.709912891636278 0.00827038986800946 0.705790798809796 0.00186452684942097 0.202310786891643 367869 30938554 667 665 10 True 254 673 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 299 673 0.00685331401591491 0.00661401730464867 0.00665293354695964 0.00662241550316625 0.00180140544928011 0.00130524126155902 299571 288244 667 665 0 False 299 673 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 343 673 0.00598313798010585 0.00593585130140526 0.0059662775616083 0.005981536583505 0.00128337546200896 0.00137197408002346 261534 258689 667 665 0 False 343 673 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 388 672 0.00573631700972585 0.00590845389968398 0.00576791027695125 0.00587472343022812 0.00128567604678174 0.00121042444817822 250745 257495 667 665 0 False 388 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 433 672 0.00604554669335051 0.00593321252318253 0.00604257267109178 0.0059662775616083 0.00146800413091679 0.00139958715062432 264262 258574 667 665 0 False 433 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 477 672 0.00600386462753974 0.0060985377153114 0.00610360875867857 0.00611886778057527 0.00159259071497908 0.0014778202893166 262440 265779 667 665 0 False 477 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 522 672 0.00593427250668555 0.00600517085802169 0.005981536583505 0.00604257267109178 0.00158104358987705 0.00163667970516262 259398 261710 667 665 0 False 522 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 567 672 0.00613938853416048 0.00600601985623248 0.00613412680247196 0.00607309071488518 0.00148175930787025 0.00152167302018222 268364 261747 667 665 0 False 567 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 611 672 0.00673133334911853 0.00646468540313934 0.00657663843747616 0.00643930724040589 0.00165098031188836 0.00137304558727783 294239 281736 667 665 0 False 611 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 652 678 0.00798488373117172 0.740408104261569 0.00796520943007553 0.72628366521706 0.00172279987079612 0.179168439319686 349034 32267559 667 665 13 True 656 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C1_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C1_3.csv new file mode 100755 index 0000000..d24b45e --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C1_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 253 282 0.000934712318823422 0.0741678412097995 0.000747692072938125 0.0722667277027543 0.000753048573557818 0.0197249602745314 40858 3232292 667 665 0 True 253 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 297 281 0.000892183800523634 0.000835551914806471 0.000762951094834821 0.000747692072938125 0.000671403233813346 0.00059912000667417 38999 36414 667 665 0 False 297 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 341 282 0.000813761121270447 0.000884518460261434 0.000656137941557946 0.000747692072938125 0.000652893191775096 0.000715264603175682 35571 38548 667 665 0 True 342 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 386 283 0.000891588996071889 0.00092850574593958 0.000762951094834821 0.00080872816052491 0.000681820665333875 0.000669217990256629 38973 40465 667 665 0 True 387 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 430 283 0.000897720057343725 0.000895739004182464 0.000656137941557946 0.00064087891966125 0.000810940800429912 0.000814059589050527 39241 39037 667 665 0 True 431 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 473 282 0.000966076815105837 0.00085122396285977 0.000717174029144732 0.000473029678797589 0.000894328546090687 0.000908968242019163 42229 37097 667 665 0 True 476 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 518 281 0.000874088018933998 0.00088952066593584 0.000656137941557946 0.000701915007248035 0.000824741663610218 0.000794189893075607 38208 38766 667 665 0 True 521 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 561 280 0.000869741371017398 0.000873137295057282 0.000564583810177768 0.000610360875867857 0.000879401512705961 0.000818090767980466 38018 38052 667 665 0 True 565 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 610 280 0.00105715052750576 0.000971024494172029 0.000686655985351339 0.000625619897764553 0.00106488992544883 0.00100312352353352 46210 42318 667 665 0 False 610 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 650 281 0.00114904781530041 0.0753764934194034 0.000854505226215 0.0723125047684443 0.00104549346150561 0.0204322406169823 50227 3284966 667 665 0 True 655 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 253 325 0.000971567317737332 0.000929538311331086 0.000793469138628214 0.000778210116731518 0.000771149003941091 0.000731162383656188 42469 40510 667 665 0 False 253 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 297 325 0.000917279972968425 0.000823000508825279 0.00080872816052491 0.000732433051041428 0.000708005555316096 0.000603487805566354 40096 35867 667 665 0 False 297 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 341 326 0.000849998438638314 0.000888556938237101 0.000717174029144732 0.000732433051041428 0.000671123634581296 0.000706915447736607 37155 38724 667 665 0 True 342 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 385 326 0.000918378073494724 0.000891975876977865 0.000778210116731518 0.000823987182421607 0.000708587018617489 0.000607225567284831 40144 38873 667 665 0 True 387 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 430 326 0.000859332293111856 0.000896014354953532 0.000595101853971161 0.000595101853971161 0.000821319005287362 0.000892099500775004 37563 39049 667 665 0 True 431 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 474 326 0.000871731678221315 0.000956637416383715 0.000625619897764553 0.000793469138628214 0.000803635116101405 0.000836343832118439 38105 41691 667 665 0 True 476 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 519 325 0.000872234974295869 0.000928872880301004 0.000656137941557946 0.000701915007248035 0.000793229885744921 0.000866170902750995 38127 40481 667 665 0 True 521 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 563 325 0.000968204384875541 0.000924352538475968 0.000717174029144732 0.000732433051041428 0.000927771913525122 0.000797590519501521 42322 40284 667 665 0 True 565 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 610 324 0.000968844943515882 0.000917606444584797 0.000549324788281071 0.000305180437933928 0.00103807979425991 0.00112503721839037 42350 39990 667 665 0 False 610 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 655 324 0.000952808100413057 0.00102090887553055 0.000595101853971161 0.000610360875867857 0.00102378849157678 0.000987540833205009 41649 44492 667 665 0 False 655 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 253 371 0.000846155086796268 0.000878873769454536 0.000686655985351339 0.000732433051041428 0.000745522666184035 0.00075008655195965 36987 38302 667 665 0 True 253 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 296 370 0.000860796427146921 0.00086150372497965 0.000686655985351339 0.000762951094834821 0.000736160069810048 0.000673370308301572 37627 37545 667 665 0 True 297 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 342 368 0.000810535450974444 0.000809187078476691 0.000701915007248035 0.000686655985351339 0.00065755443149249 0.000646255047945006 35430 35265 667 665 0 False 342 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 384 371 0.000843318327103329 0.00101033081674202 0.000686655985351339 0.000854505226215 0.000696930116632585 0.000731184088760694 36863 44031 667 665 0 True 387 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 429 371 0.0010045103335263 0.000945049738101261 0.000701915007248035 0.000656137941557946 0.00100783172420576 0.000889727945060605 43909 41186 667 665 0 True 431 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 473 369 0.000928238101137117 0.000924811456427748 0.000595101853971161 0.000625619897764553 0.000866958722832216 0.000873150742171126 40575 40304 667 665 0 True 476 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 517 369 0.000890536649734185 0.000931006848776783 0.000579842832074464 0.000656137941557946 0.000900030787496551 0.000912694057652313 38927 40574 667 665 0 True 521 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 562 368 0.000917028324931149 0.000910493216332201 0.000610360875867857 0.000610360875867857 0.000956995723210857 0.000917146734405037 40085 39680 667 665 0 True 566 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 606 369 0.000930868966981375 0.00101650326319346 0.000473029678797589 0.000656137941557946 0.00104771385092721 0.0011008751806041 40690 44300 667 665 0 True 610 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 650 369 0.000949010502759607 0.000920910653837615 0.000488288700694286 0.000503547722590982 0.00101683353008091 0.000983659867098756 41483 40134 667 665 0 True 655 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 253 414 0.000881911985183879 0.000974787621376628 0.000732433051041428 0.00080872816052491 0.000771943762763576 0.000779771986376106 38550 42482 667 665 0 True 253 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 297 414 0.000828219444866718 0.000921300734096629 0.000717174029144732 0.00080872816052491 0.000694336009639491 0.000752127439026979 36203 40151 667 665 0 True 298 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 341 414 0.0008718918178814 0.00081900792264479 0.000747692072938125 0.000686655985351339 0.000667288884155319 0.000629159555798879 38112 35693 667 665 0 True 342 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 386 414 0.000867064750984544 0.000976233212924736 0.000701915007248035 0.000793469138628214 0.000749898121217382 0.000820526698947145 37901 42545 667 665 0 True 387 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 429 414 0.000920322626510046 0.000997641735375289 0.000671396963454643 0.000793469138628214 0.00085287193841474 0.000843032444799368 40229 43478 667 665 0 True 432 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 473 413 0.000925858883330136 0.000925430995662652 0.000656137941557946 0.000717174029144732 0.000881041993856359 0.000801358968950283 40471 40331 667 665 0 True 476 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 518 413 0.000981862010171385 0.000947504949143286 0.000686655985351339 0.000732433051041428 0.000903125418879926 0.000871476667540927 42919 41293 667 665 0 True 521 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 562 412 0.000969668518910607 0.000961501946672587 0.000701915007248035 0.000747692072938125 0.000924583682715619 0.000835449227274592 42386 41903 667 665 0 True 566 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 606 413 0.000855603326741299 0.000908864057603381 0.000366216525520714 0.000473029678797589 0.00101860043403846 0.00101526747470554 37400 39609 667 665 0 True 610 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 650 413 0.00086047614782675 0.000794662325302843 0.000442511635004196 0.000396734569314107 0.000934057411321759 0.000872224219515043 37613 34632 667 665 0 True 655 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 254 459 0.000912796062486038 0.000939129696523295 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.000803363040138704 0.000811870805547501 39900 40928 667 665 0 True 253 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 298 458 0.00089168050444908 0.000883256435894038 0.000732433051041428 0.000747692072938125 0.000792109435410283 0.000762023076577993 38977 38493 667 665 0 True 298 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 341 458 0.000851073662070315 0.000880778278954424 0.000701915007248035 0.000747692072938125 0.000775597128176922 0.000780203975671368 37202 38385 667 665 0 True 342 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 386 458 0.000967312178197923 0.000904183094495222 0.000823987182421607 0.000793469138628214 0.000815084613081709 0.000773190267839123 42283 39405 667 665 0 True 387 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 430 458 0.00092549284982137 0.000896381489314956 0.000564583810177768 0.000503547722590982 0.000970274314144047 0.00100676450772335 40455 39065 667 665 0 True 432 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 474 457 0.00103635524878897 0.000980524095773882 0.000671396963454643 0.000595101853971161 0.00103705158048625 0.00104907468520876 45301 42732 667 665 0 True 476 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 518 457 0.000870633577695016 0.000878116554834098 0.000503547722590982 0.000595101853971161 0.000928408826367841 0.000894447915834253 38057 38269 667 665 0 True 521 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 563 455 0.000829454807958804 0.000824262533192675 0.000457770656900893 0.000411993591210803 0.000925069488291026 0.000929373358116629 36257 35922 667 665 0 True 566 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 606 457 0.000881385812015027 0.000853725065696973 0.000518806744487678 0.000488288700694286 0.00091920710168393 0.00095474636561012 38527 37206 667 665 0 True 610 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 650 457 0.000882529666729922 0.00081129810105488 0.000503547722590982 0.000396734569314107 0.000923542538129877 0.000961991612555248 38577 35357 667 665 0 True 655 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 254 503 0.000757277575448943 0.000982290929888236 0.000610360875867857 0.000823987182421607 0.000696940457923334 0.000802317900531906 33102 42809 667 665 0 True 253 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 299 502 0.00086221480699339 0.000916642716886058 0.000656137941557946 0.000762951094834821 0.000818424679444482 0.000819682192955824 37689 39948 667 665 0 True 298 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 343 503 0.00089298449882406 0.000926830695415582 0.000793469138628214 0.000854505226215 0.000752776711003638 0.000786433711666527 39034 40392 667 665 0 True 343 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 387 503 0.000859812712092111 0.000936651539583681 0.000686655985351339 0.000717174029144732 0.000764337857461294 0.000843322389432001 37584 40820 667 665 0 True 387 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 430 501 0.000872395113955954 0.00101882079884995 0.000503547722590982 0.000701915007248035 0.00093877246110612 0.00101734329120953 38134 44401 667 665 0 True 432 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 476 501 0.000903302068352411 0.00095535244611873 0.000549324788281071 0.000656137941557946 0.000911332908749671 0.000892291868236052 39485 41635 667 665 0 True 477 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 520 500 0.000953517290336292 0.0008565933028956 0.000610360875867857 0.000595101853971161 0.00092531611608771 0.000768551492809617 41680 37331 667 665 0 True 521 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 563 500 0.000929450587134906 0.000870269057858654 0.00064087891966125 0.000610360875867857 0.000922337614951678 0.000830288353820086 40628 37927 667 665 0 True 566 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 608 502 0.000916296257913616 0.000946564167342137 0.000549324788281071 0.000610360875867857 0.000947576399440445 0.000942645226583287 40053 41252 667 665 0 True 611 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 652 501 0.000940660363340875 0.000923526486162763 0.000534065766384375 0.0004272526131075 0.00099113146987148 0.00104726725279221 41118 40248 667 665 0 True 655 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 255 546 0.000871434275995442 0.000833073757866858 0.000732433051041428 0.000671396963454643 0.000690047150315137 0.000716066690484275 38092 36306 667 665 0 True 253 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 298 545 0.000932813519996697 0.000865404527569783 0.000762951094834821 0.000732433051041428 0.000754763925584292 0.000720245306716277 40775 37715 667 665 0 True 298 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 342 546 0.000923342402957368 0.000868158035280465 0.000793469138628214 0.000762951094834821 0.000758743528419827 0.000704444631739132 40361 37835 667 665 0 True 343 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 387 546 0.000783494725514331 0.000956040823046401 0.000564583810177768 0.000778210116731518 0.000743134980952465 0.000802417979633574 34248 41665 667 665 0 True 387 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 431 545 0.000914305950709699 0.000923503540265174 0.000518806744487678 0.000518806744487678 0.000973109946251316 0.00099273354349166 39966 40247 667 665 0 True 432 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 476 544 0.000912475783165867 0.000910401432741845 0.000473029678797589 0.000411993591210803 0.00100118152387091 0.00110638737060651 39886 39676 667 665 0 True 477 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 520 543 0.000901311761148494 0.000903471771669962 0.000503547722590982 0.000488288700694286 0.000955366610680733 0.00101405217604936 39398 39374 667 665 0 True 521 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 564 542 0.000831536623539912 0.000812927259783701 0.000518806744487678 0.0004272526131075 0.000856209653405567 0.000875716584890334 36348 35428 667 665 0 True 566 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 608 542 0.000839406343978388 0.000843261736396381 0.000503547722590982 0.000579842832074464 0.000873437681449526 0.000800680421869351 36692 36750 667 665 0 True 611 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 653 542 0.000993506451169014 0.000870383787346599 0.000656137941557946 0.0004272526131075 0.0010073482764807 0.000965545862689065 43428 37932 667 665 0 True 655 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 255 587 0.000911880978714122 0.000893696819297041 0.000778210116731518 0.000778210116731518 0.00069592489654242 0.000625440820494892 39860 38948 667 665 0 True 254 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 299 586 0.000944183435862751 0.000884770865134913 0.000839246204318303 0.000762951094834821 0.000717757624644187 0.000715915249555244 41272 38559 667 665 0 True 298 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 344 587 0.000874568437914254 0.00080664008384431 0.000732433051041428 0.000625619897764553 0.000708060908539547 0.000728708868536568 38229 35154 667 665 0 True 343 586 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 388 587 0.000866744471664374 0.000853151418257248 0.000717174029144732 0.000762951094834821 0.000709695817331875 0.00060289037220641 37887 37181 667 665 0 True 388 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 433 586 0.000902798772277857 0.000961983810521956 0.000625619897764553 0.000579842832074464 0.000896620492595807 0.00102364901793501 39463 41924 667 665 0 True 432 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 476 584 0.000994490166223823 0.000841747307155506 0.00064087891966125 0.0004272526131075 0.00103496643316584 0.00090697707345414 43471 36684 667 665 0 True 477 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 521 584 0.000883147348275965 0.000907418466055273 0.000396734569314107 0.000473029678797589 0.00105398642056306 0.00102628991469589 38604 39546 667 665 0 True 522 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 565 583 0.000882049247749666 0.0039044050960544 0.000564583810177768 0.000732433051041428 0.00089765606058739 0.0143190493521646 38556 170157 667 665 0 True 566 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 610 584 0.000927162877705116 0.000876785692773935 0.00064087891966125 0.000671396963454643 0.000844422943154159 0.000758237026585506 40528 38211 667 665 0 True 611 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 653 583 0.000835974779833704 0.000902301530892922 0.000564583810177768 0.000701915007248035 0.000846427038799579 0.00081134956236532 36542 39323 667 665 0 True 656 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 254 629 0.000909204358681268 0.00104539214825803 0.000762951094834821 0.000869764248111696 0.000695646032637727 0.000805893744947992 39743 45559 667 665 0 False 254 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 298 629 0.000779903021709562 0.00084025582381222 0.00064087891966125 0.000732433051041428 0.000660550299512265 0.000639005842886575 34091 36619 667 665 0 False 298 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 343 629 0.000848877461017717 0.000868479277846711 0.000732433051041428 0.000686655985351339 0.000675572378580504 0.000721775368682176 37106 37849 667 665 0 True 343 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 388 629 0.000902020951071729 0.000922723379747148 0.000747692072938125 0.000793469138628214 0.000723056174075513 0.000674508226805963 39429 40213 667 665 0 True 388 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 432 629 0.000939150475117214 0.000857901219058174 0.000686655985351339 0.000488288700694286 0.000867952715681359 0.000905236266173348 41052 37388 667 665 0 False 432 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 477 629 0.000939402123154491 0.000873527375316295 0.000595101853971161 0.000518806744487678 0.000960632374207832 0.000962841900703031 41063 38069 667 665 0 False 477 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 522 628 0.000816620758057684 0.000924031295909722 0.000411993591210803 0.000534065766384375 0.000933045873804927 0.000971071741465882 35696 40270 667 665 0 False 522 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 566 628 0.000921123324810472 0.000884495514363845 0.000625619897764553 0.000549324788281071 0.00089733947015231 0.000887388325262722 40264 38547 667 665 0 False 566 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 611 628 0.00092146648122494 0.000910676783512914 0.000778210116731518 0.000747692072938125 0.000717381700894099 0.000703931950744816 40279 39688 667 665 0 False 611 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 656 628 0.000946768547518413 0.00090562868604333 0.000747692072938125 0.000732433051041428 0.000779837748026304 0.000760779010383947 41385 39468 667 665 0 False 656 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 255 679 0.00107419396275769 0.0715177277136536 0.000930800335698482 0.0702525368123903 0.000757515745342758 0.0223005868197505 46955 3116798 667 665 0 True 254 673 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 299 673 0.000879166733868131 0.000895280086230683 0.000717174029144732 0.000793469138628214 0.000705210956367645 0.000672017398602968 38430 39017 667 665 0 False 299 673 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 343 673 0.000809688998485422 0.000824675559349277 0.00064087891966125 0.000671396963454643 0.000672600404298497 0.000692771533610926 35393 35940 667 665 0 False 343 673 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 388 672 0.000781916206007777 0.000856180276738998 0.000671396963454643 0.000762951094834821 0.000599479810726178 0.000633485662177195 34179 37313 667 665 0 False 388 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 433 672 0.000901609163374367 0.000787686772435782 0.000717174029144732 0.000625619897764553 0.000787918960280475 0.000732905322608072 39411 34328 667 665 0 False 433 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 477 672 0.000842586260085796 0.000888304533363622 0.000610360875867857 0.000671396963454643 0.000795003509244959 0.00077798945605838 36831 38713 667 665 0 False 477 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 522 672 0.000878983717113748 0.000937477591896886 0.000518806744487678 0.000671396963454643 0.000909439007855437 0.000884659950035634 38422 40856 667 665 0 False 522 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 567 672 0.000845720422004608 0.000843261736396381 0.000656137941557946 0.000610360875867857 0.000787441651613522 0.000763619662742413 36968 36750 667 665 0 False 567 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 611 672 0.00091277318539174 0.000974351649322436 0.000778210116731518 0.000839246204318303 0.000694023566878855 0.000718603026158224 39899 42463 667 665 0 False 611 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 652 678 0.000951206703812205 0.0756922519161259 0.000778210116731518 0.0723735408560311 0.000772934111356695 0.0220835357908969 41579 3298727 667 665 0 True 656 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C2_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C2_1.csv new file mode 100755 index 0000000..ef5c85b --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C2_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 272 262 0.0094277878227286 0.0410705867438108 0.00950637064164187 0.0412909132524605 0.00148088176234967 0.00901944944349913 412106 1789888 667 665 0 True 272 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 317 263 0.00972480113799818 0.0096354183696825 0.00953688868543526 0.00961318379491875 0.00222005365305142 0.00141718374484036 425089 419919 667 665 0 False 317 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 360 262 0.00974513887482901 0.0639089828026234 0.00976577401388571 0.0633707179369802 0.00132469394897319 0.00957258454366604 425978 2785203 667 665 0 True 361 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 405 262 0.00981303809070516 0.0988991131984229 0.00993362325474937 0.0923781185626001 0.00146104835743158 0.025557024246972 428946 4310100 667 665 0 True 406 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 449 262 0.00943966103466921 0.0730258468326917 0.0093842984664683 0.0691233691920348 0.0016073056493172 0.0127545934168763 412625 3182523 667 665 0 True 451 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 493 261 0.00940923449925301 0.0663928303248393 0.00955214770733196 0.069718471046006 0.00164871460522429 0.0184431146748472 411295 2893451 667 665 0 True 495 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 537 260 0.00913008819463008 0.0797554426234963 0.00912489509422446 0.076554512855726 0.00159808490163619 0.0271753546765565 399093 3475804 667 665 0 True 540 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 582 261 0.00938985760038269 0.0683518592773993 0.0093690394445716 0.0656900892652781 0.00169048112244212 0.01988306382193 410448 2978827 667 665 0 True 585 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 629 261 0.00904697571104583 0.0090529367593853 0.00906385900663768 0.00912489509422446 0.00187052977442486 0.00181133766437924 395460 394534 667 665 0 False 629 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 669 261 0.00899545649468697 0.0412117269598808 0.00900282291905089 0.0412909132524605 0.00175485013576008 0.00764252793093365 393208 1796039 667 665 0 True 674 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 272 306 0.00931308207191895 0.00922165794435735 0.00929274433508812 0.00927748531319142 0.00143750917203802 0.00152558475899044 407092 401887 667 665 0 False 272 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 317 306 0.0096701706368148 0.00952149198815303 0.00943007553215839 0.00956740672922866 0.00244722699096883 0.00127482718909611 422701 414954 667 665 0 False 317 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 361 306 0.00978254292400607 0.107403918356202 0.00984206912336919 0.102616922255283 0.00138647911281172 0.029014149352096 427613 4680746 667 665 0 True 361 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 406 307 0.00967845214495064 0.0563009721603161 0.00971999694819562 0.0556954299229419 0.0014565308161528 0.00845575931812006 423063 2453640 667 665 0 True 406 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 449 306 0.00945162575498701 0.07774774542215 0.00941481651026169 0.0759288929579614 0.00176082054141999 0.0149182861960357 413148 3388307 667 665 0 True 451 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 495 305 0.00943826553191704 0.045155897296457 0.00947585259784848 0.0454566262302586 0.00170315592442593 0.0105321863674772 412564 1967929 667 665 0 True 496 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 537 305 0.00941840821406646 0.0442669502779609 0.0093842984664683 0.0469520103761349 0.00162227319882794 0.00876838422693747 411696 1929188 667 665 0 True 540 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 584 306 0.0093147520998027 0.050890880210368 0.00930800335698482 0.0527962157625696 0.00186563584239402 0.00949675535357665 407165 2217864 667 665 0 True 585 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 630 305 0.00918279701989243 0.00907133936925169 0.00917067215991455 0.00910963607232776 0.00192159873569748 0.00195480443483015 401397 395336 667 665 0 False 630 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 674 304 0.00915539026092356 0.00894119023812679 0.00921644922560464 0.00906385900663768 0.00196761243108071 0.00186249637880919 400199 389664 667 665 0 False 674 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 274 350 0.00946022754244302 0.0508556123657737 0.00958266575112535 0.0505836575875486 0.00152116954269293 0.0116802414410115 413524 2216327 667 665 0 True 272 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 317 350 0.00965241801163964 0.0655252000452034 0.00961318379491875 0.067002365148394 0.00137607901042412 0.0205875521430939 421925 2855639 667 665 0 True 317 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 362 351 0.00954317988636719 0.0393899374208008 0.00955214770733196 0.0402838178072786 0.00134479361426124 0.00657878139877398 417150 1716644 667 665 0 True 362 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 405 350 0.00953423494249671 0.0340919591264726 0.0093690394445716 0.0349584191653315 0.00158968926396736 0.00501709993488139 416759 1485754 667 665 0 True 406 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 450 350 0.00956781851692602 0.0710977948418769 0.00955214770733196 0.0682383459220264 0.00166332368734126 0.0118602951734426 418227 3098497 667 665 0 True 451 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 495 349 0.00968057971472035 0.0330726794096709 0.00970473792629892 0.034027618829633 0.00179974975502242 0.00449572431522884 423156 1441333 667 665 0 True 496 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 538 348 0.00942726164955975 0.0290873211869224 0.00944533455405508 0.0295109483482109 0.00169209659974684 0.00402544034913235 412083 1267648 667 665 0 True 540 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 583 349 0.00941328374494373 0.0517156475533076 0.00943007553215839 0.0506752117189288 0.00193537633604783 0.0104342489626072 411472 2253808 667 665 0 True 585 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 628 349 0.00955294840563239 0.0576974135957885 0.00952162966353857 0.0577859159227894 0.00194662903748343 0.0129951633100466 417577 2514498 667 665 0 True 630 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 671 348 0.0092875054804939 0.0592812082850752 0.00924696726939803 0.0606240939955749 0.00188282943271892 0.0155488288640293 405974 2583521 667 665 0 True 675 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 273 394 0.00931479785399129 0.0439786580206525 0.00929274433508812 0.0469825284199283 0.00151402032149243 0.0115133644794339 407167 1916624 667 665 0 True 272 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 318 395 0.00950913877005191 0.0322895588708553 0.00943007553215839 0.0327306019684138 0.00137069526765966 0.00426235792473928 415662 1407204 667 665 0 True 317 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 362 394 0.00955775259543495 0.0858544392567594 0.00952162966353857 0.0824750133516442 0.00140810289695944 0.0197851800870244 417787 3741603 667 665 0 True 362 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 406 395 0.00955917097528142 0.0664724525894732 0.00958266575112535 0.0661783779659724 0.00156148886690483 0.0161565595344563 417849 2896921 667 665 0 True 407 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 451 394 0.00976877091323873 0.0455089428767616 0.00978103303578241 0.0466926070038911 0.00172036524566744 0.00831284635424238 427011 1983315 667 665 0 True 451 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 495 393 0.00971242462998302 0.0533433606905797 0.00976577401388571 0.0532387273975738 0.00176915201095743 0.0107430133290836 424548 2324745 667 665 0 True 496 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 539 392 0.0096538821456747 0.0421905760051307 0.00964370183871214 0.0428168154421302 0.00175726953002919 0.00562148170087122 421989 1838698 667 665 0 True 541 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 583 393 0.00947621863135724 0.05022570158516 0.00952162966353857 0.0500343327992676 0.00190146781145725 0.0079072593423095 414223 2188875 667 665 0 True 585 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 628 393 0.00939717827055801 0.0424576662530669 0.00943007553215839 0.0432745860990311 0.00191547758654703 0.00661526868793992 410768 1850338 667 665 0 True 630 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 672 392 0.00954418647851629 0.103744827851272 0.00958266575112535 0.0989852750438697 0.00184044425640264 0.0294232153916139 417194 4521280 667 665 0 True 675 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 274 438 0.00944958969359449 0.0463899276687943 0.00941481651026169 0.0474860761425193 0.00156469701906858 0.00998755325906339 413059 2021709 667 665 0 True 273 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 319 438 0.0095929833206537 0.0524928251046476 0.00964370183871214 0.0521095597772183 0.00142439411507122 0.00640661647602462 419327 2287678 667 665 0 True 317 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 363 438 0.00956427256730985 0.0354426234962549 0.00955214770733196 0.0361028458075837 0.0014152081359672 0.00357709316104098 418072 1544617 667 665 0 True 362 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 407 438 0.0098604394300904 0.0521512065813423 0.00988784618905928 0.0529488059815366 0.00157590774746018 0.00806181110509932 431018 2272790 667 665 0 True 407 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 451 438 0.00994263682990274 0.097231634820629 0.00994888227664607 0.0974898908979934 0.00174069797172431 0.0157504049461077 434611 4237430 667 665 0 True 451 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 496 437 0.00992158990314868 0.0606845334898244 0.00996414129854276 0.0609903105210956 0.00188042960670546 0.0123636399142564 433691 2644679 667 665 0 True 496 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 540 436 0.00972482401509248 0.0527402966101452 0.00975051499198901 0.0516517891203174 0.00173723649262592 0.0091801937202494 425090 2298463 667 665 0 True 541 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 583 436 0.00952785223318759 0.0324229204276427 0.00953688868543526 0.032669565880827 0.00187608469535211 0.00407345357001653 416480 1413016 667 665 0 True 586 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 629 437 0.00956491312595019 0.0394351178931536 0.00959792477302205 0.0400854505226215 0.00194535361071701 0.00448479845445187 418100 1718613 667 665 0 True 630 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 672 436 0.0096833249660361 0.0728821596219893 0.00970473792629892 0.0716563668268864 0.00202180587756359 0.0124596970933273 423276 3176261 667 665 0 True 675 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 275 482 0.00950566145171864 0.0617701268506583 0.00952162966353857 0.0613260090028229 0.0015287070383861 0.0166389438210253 415510 2691990 667 665 0 True 273 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 320 482 0.00954985999790217 0.0572432913366043 0.00953688868543526 0.0566109712367437 0.0016041952943499 0.00662543779762498 417442 2494707 667 665 0 True 318 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 364 481 0.00971926488117809 0.069552985232594 0.00973525597009232 0.0672159914549477 0.00156108537982706 0.0171521737284519 424847 3031173 667 665 0 True 362 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 408 482 0.00994908817049475 0.0889969487692681 0.00996414129854276 0.0846112764171817 0.0017492825997034 0.0191402909384434 434893 3878556 667 665 0 True 407 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 452 481 0.0101066198418301 0.0951897252859776 0.0101319905394064 0.0918440527962158 0.00196349069785816 0.0281017406157841 441779 4148442 667 665 0 True 452 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 497 482 0.00983394775489344 0.0413977952434302 0.00985732814526589 0.0420386053253986 0.00186210690425674 0.00463141142274828 429860 1804148 667 665 0 True 496 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 540 481 0.00964992440836117 0.0416615353903183 0.00964370183871214 0.0428015564202335 0.00184793574811322 0.0061489437886575 421816 1815642 667 665 0 True 541 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 585 481 0.00980967515784337 0.113074652756864 0.0098115510795758 0.111879148546578 0.001943322745477 0.0235425313060895 428799 4927881 667 665 0 True 586 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 629 481 0.00960346102984214 0.0628571199112453 0.00968947890440223 0.0652780956740673 0.00188452119929108 0.0144722949753997 419785 2739362 667 665 0 True 630 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 673 481 0.00969993373649636 0.0829108936222451 0.0097962920576791 0.0792095826657511 0.00209060863776927 0.0135567501700094 424002 3613321 667 665 0 True 675 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 275 526 0.00944128530836436 0.053628922386075 0.009399557488365 0.0567940794995041 0.00159401024271182 0.0133439423158475 412696 2337190 667 665 0 True 273 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 320 525 0.00971741183653996 0.103884866664257 0.0097962920576791 0.0984054322117952 0.00158836348034719 0.027923585738096 424766 4527383 667 665 0 True 318 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 365 526 0.00975159021542101 0.0589954859682968 0.0098115510795758 0.0608529793240253 0.00154041817108089 0.0119192997152453 426260 2571069 667 665 0 True 362 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 409 526 0.0100764678315454 0.0590025991965494 0.0101625085831998 0.059159227893492 0.00172858631509525 0.00813591461990373 440461 2571379 667 665 0 True 407 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 453 525 0.00996501062812608 0.0560292927328621 0.010101472495613 0.0558785381857023 0.00203855956342596 0.00668213443915439 435589 2441800 667 665 0 True 452 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 497 523 0.00984378490544153 0.0634308361886635 0.0098115510795758 0.0632791638056001 0.00186380162504963 0.0133859961386188 430290 2764365 667 665 0 True 497 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 541 523 0.00962819116877816 0.0750094967333647 0.00971999694819562 0.0732585641260395 0.00192506027784776 0.0161875943866766 420866 3268972 667 665 0 True 541 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 585 523 0.00948186927364882 0.0561956504903825 0.00944533455405508 0.0570229648279545 0.00168063268309747 0.0107100785429155 414470 2449050 667 665 0 True 586 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 630 523 0.00945448539177424 0.050557063292243 0.00953688868543526 0.0496528572518502 0.00200819789173837 0.00792301862902963 413273 2203316 667 665 0 True 631 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 674 522 0.00952927061303406 0.0685520622338634 0.00955214770733196 0.0666208896009766 0.00195992245006259 0.0158796119991396 416542 2987552 667 665 0 True 675 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 275 568 0.00926279821865218 0.0435441545039068 0.00921644922560464 0.0464026855878538 0.00139427942027869 0.00985270182537632 404894 1897688 667 665 0 True 273 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 320 566 0.00954546759579697 0.0532219310005387 0.00952162966353857 0.0543526359960327 0.00154077193105743 0.01035216735312 417250 2319453 667 665 0 True 318 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 364 567 0.00964868904526908 0.0442850086993634 0.0098115510795758 0.045487144274052 0.00154509261459308 0.00748585556641435 421762 1929975 667 665 0 True 363 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 408 567 0.00996169344945289 0.0515972696676459 0.0100099183642329 0.0509498741130694 0.00167216701878262 0.00751471391802679 435444 2248649 667 665 0 True 407 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 453 566 0.00992611956781966 0.0928906381311484 0.00991836423285267 0.0899366750591287 0.0020427332685641 0.0198070000164388 433889 4048246 667 665 0 True 452 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 497 565 0.00972708884742797 0.0620493325325215 0.00976577401388571 0.0610971236743725 0.00212172158182221 0.0108499459110632 425189 2704158 667 665 0 True 497 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 541 564 0.00955690614294592 0.0542055069006919 0.00950637064164187 0.0547798886091402 0.0021010693506177 0.00815428717221047 417750 2362318 667 665 0 True 541 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 586 566 0.00941465637060161 0.0356379848683278 0.00941481651026169 0.0376897840848402 0.00171241156037362 0.00731636336323934 411532 1553131 667 665 0 False 586 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 629 565 0.00929960746337749 0.0460283462145866 0.00933852140077821 0.046494239719234 0.00167631466332862 0.00642690874852282 406503 2005951 667 665 0 True 631 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 673 565 0.00950675955224493 0.053144809838742 0.00955214770733196 0.0530098420691234 0.00171243822837502 0.00764650912748395 415558 2316092 667 665 0 True 676 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 274 611 0.00900309744418246 0.00894736268457823 0.00903334096284428 0.00900282291905089 0.00141027152301707 0.00146526953633562 393542 389933 667 665 0 False 274 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 318 611 0.00911174076500317 0.00906622243408934 0.00915541313801785 0.00907911802853437 0.00139824251739071 0.00148923876449103 398291 395113 667 665 0 False 318 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 364 609 0.00954077779146591 0.0776864798755873 0.00958266575112535 0.0764171816586557 0.00145936319867376 0.0159787682302168 417045 3385637 667 665 0 True 363 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 408 610 0.00937201346683033 0.0775109208131338 0.00933852140077821 0.0749217975127794 0.0015216854523742 0.020721506520122 409668 3377986 667 665 0 True 408 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 452 610 0.00928606422355314 0.0093801223131071 0.00932326237888151 0.00935378042267491 0.00187595361306138 0.0019481093480029 405911 408793 667 665 0 False 452 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 497 610 0.00935746363485687 0.00918891414849782 0.00946059357595178 0.00924696726939803 0.0018998771592656 0.00196335278062302 409032 400460 667 665 0 False 497 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 542 610 0.00918705215943184 0.00903425879874784 0.00926222629129473 0.00923170824750134 0.00188963948319475 0.00198230123090033 401583 393720 667 665 0 False 542 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 586 609 0.00916177297023267 0.00908214688701612 0.00921644922560464 0.00910963607232776 0.00167908150814301 0.00174164364713557 400478 395807 667 665 0 False 586 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 631 609 0.00912320218924642 0.00923145584262786 0.00918593118181125 0.00926222629129473 0.00149275725111387 0.00146395094631523 398792 402314 667 665 0 False 631 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 676 609 0.00909902110057354 0.00910438146177988 0.00907911802853437 0.00907911802853437 0.00166525481014711 0.00171296671833723 397735 396776 667 665 0 False 676 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 274 659 0.00896020289237391 0.0391042839417151 0.00906385900663768 0.0392767223620966 0.00131932959856393 0.00871583223499851 391667 1704195 667 665 0 True 274 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 318 654 0.00907836308442254 0.00882928309558515 0.00909437705043107 0.00877393759060044 0.0013113542732776 0.00122948481751581 396832 384787 667 665 0 False 318 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 363 654 0.00888617261522592 0.0088390121561629 0.00885023270008392 0.00889600976577401 0.00135089744543085 0.00124306159745032 388431 385211 667 665 0 False 363 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 408 654 0.00917222780232681 0.0091126878767071 0.00920119020370794 0.00915541313801785 0.00139471086226582 0.00133938348607617 400935 397138 667 665 0 False 408 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 453 654 0.00906745071044244 0.00905663104889713 0.00904859998474098 0.00901808194094758 0.00151532214932575 0.00160076732713239 396355 394695 667 665 0 False 453 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 497 653 0.00909773998329286 0.00894057069889189 0.00909437705043107 0.00892652780956741 0.00174814133089735 0.00171674321945746 397679 389637 667 665 0 False 497 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 542 653 0.00888463984990796 0.00896129084441477 0.00881971465629053 0.00901808194094758 0.00168457902025678 0.00179916195893506 388364 390540 667 665 0 False 542 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 587 653 0.00895953945663927 0.00889348571703922 0.00900282291905089 0.00892652780956741 0.00133670014630826 0.00132019285688712 391638 387585 667 665 0 False 587 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 631 653 0.00908648445289829 0.00906014177122825 0.00910963607232776 0.00903334096284428 0.00134019310993073 0.00139386663348297 397187 394848 667 665 0 False 631 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 672 658 0.00929885251926566 0.0402063983488132 0.00935378042267491 0.0401464866102083 0.00142137111279041 0.00747247927108324 406470 1752226 667 665 0 True 676 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C2_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C2_2.csv new file mode 100755 index 0000000..bdf75f9 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C2_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 272 262 0.00796816057523996 0.728279958307304 0.00791943236438544 0.732188906691081 0.00175071734428293 0.194834490201018 348303 31739005 667 665 12 True 272 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 317 263 0.00660743100640112 0.00653005826537045 0.00648508430609598 0.00651560234988937 0.00134971510056378 0.00127732450389527 288823 284585 667 665 0 False 317 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 360 262 0.00616656652218638 0.0064119098386846 0.00614938582436866 0.00646982528419928 0.00122209323824909 0.00114230955973413 269552 279436 667 665 0 True 361 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 405 262 0.00612049205427042 0.00666438354985656 0.00613412680247196 0.00663767452506294 0.00142255553347309 0.00133448114994278 267538 290439 667 665 0 True 406 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 449 262 0.00629762939541902 0.00618368994126424 0.00628671702143893 0.00621042191195544 0.0016018668410766 0.00152501530935286 275281 269490 667 665 0 True 451 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 493 261 0.00631782986968406 0.00629851121279968 0.00628671702143893 0.00633249408712902 0.00155771236356126 0.00163637697422188 276164 274494 667 665 0 True 495 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 537 260 0.00644209824591023 0.0064092022227691 0.00651560234988937 0.0064087891966125 0.00153883944050835 0.00148387315792335 281596 279318 667 665 0 True 540 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 582 261 0.00678308133642037 0.00702022852966704 0.00671396963454643 0.00692759594110018 0.00171283483688279 0.00176418361633035 296501 305947 667 665 0 True 585 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 629 261 0.00834798897186792 0.00753428547335379 0.0076752880140383 0.00756847486076143 0.00430958773244697 0.00177293985893983 364906 328350 667 665 0 False 629 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 669 261 0.00888898649782456 0.736425315979351 0.00891126878767071 0.709620813305867 0.00197390329630729 0.163231386634977 388554 32093986 667 665 11 True 674 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 272 306 0.00642798307872843 0.00623192221799635 0.00643930724040589 0.00619516289005875 0.00153549183393818 0.00138382464691943 280979 271592 667 665 0 False 272 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 317 306 0.00634331495273192 0.00609560064042 0.00627145799954223 0.00604257267109178 0.00145263460078506 0.00119780042051122 277278 265651 667 665 0 False 317 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 361 306 0.00599091619216713 0.00623924195932725 0.00599679560540169 0.00624093995574884 0.00126561029236624 0.00129922949132009 261874 271911 667 665 0 True 361 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 406 307 0.00640274964371785 0.00614321337791721 0.00642404821850919 0.00617990386816205 0.00142438277511386 0.00133419035954939 279876 267726 667 665 0 True 406 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 449 306 0.0064696193903506 0.0063373356715203 0.00650034332799268 0.00636301213092241 0.00186629588813464 0.00174131354118836 282799 276186 667 665 0 True 451 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 495 305 0.00626720286000282 0.00646876977291019 0.00633249408712902 0.00642404821850919 0.00167296807990998 0.00157667106299822 273951 281914 667 665 0 True 496 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 537 305 0.00633777869591183 0.00666794016398286 0.0063782711528191 0.00674448767833982 0.00145656165020017 0.00152065079797029 277036 290594 667 665 0 True 540 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 584 306 0.00690023493631989 0.00694971578637599 0.00686655985351339 0.00701915007248035 0.0017965177163114 0.00197781055890326 301622 302874 667 665 0 True 585 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 630 305 0.00723197568073368 0.00716051974752629 0.00721751735713741 0.00720225833524071 0.00190465838077335 0.001915225648489 316123 312061 667 665 0 False 630 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 674 304 0.00720504934074505 0.00713036883809432 0.00717174029144732 0.00709544518196384 0.00197206869929835 0.00182999797553481 314946 310747 667 665 0 False 674 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 274 350 0.00597799063388882 0.00609846887761863 0.00604257267109178 0.00608834973678187 0.00134445940984645 0.00139314350898372 261309 265776 667 665 0 True 272 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 317 350 0.00592555633375805 0.0059717157393369 0.00592050049591821 0.00590524147402152 0.00129145019209025 0.00128680807998951 259017 260252 667 665 0 True 317 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 362 351 0.00626942193814972 0.00632138827269593 0.00628671702143893 0.0063935301747158 0.00135423792743393 0.00122430404861261 274048 275491 667 665 0 True 362 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 405 350 0.00661761131336369 0.00666800900167562 0.00659189745937285 0.00662241550316625 0.00151539285207269 0.00134563359558504 289268 290597 667 665 0 True 406 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 450 350 0.00646758332895809 0.00656791899639233 0.00646982528419928 0.00663767452506294 0.00170373072007104 0.00167585164245942 282710 286235 667 665 0 True 451 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 495 349 0.00664655083765053 0.00677060010979612 0.00666819256885634 0.00679026474402991 0.00154371468246601 0.00158274229784757 290533 295068 667 665 0 True 496 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 538 348 0.00651336039464818 0.00673184448876827 0.00651560234988937 0.00675974670023652 0.00156519506030209 0.0016168248021187 284711 293379 667 665 0 True 540 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 583 349 0.00684482661393039 0.00695152851228552 0.0068055237659266 0.00703440909437705 0.0019395179279599 0.0020158069836196 299200 302953 667 665 0 True 585 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 628 349 0.00686521010494981 0.00692114814387766 0.00683604180972 0.00695811398489357 0.00186484449692163 0.001850781865846 300091 301629 667 665 0 True 630 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 671 348 0.00650336310444 0.00653572590207494 0.00651560234988937 0.00651560234988937 0.00172715169261228 0.00189682642852302 284274 284832 667 665 0 True 675 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 273 394 0.0059532833720471 0.00614548502177853 0.00602731364919509 0.00621042191195544 0.00138979064899435 0.0014317100937182 260229 267825 667 665 0 True 272 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 318 395 0.00624595003940008 0.0705570288733966 0.00630197604333562 0.0708781567101549 0.00138293835137951 0.0146428262544914 273022 3074930 667 665 0 True 317 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 362 394 0.0065631638289347 0.00647322127704246 0.00659189745937285 0.00643930724040589 0.00126130303569939 0.00130010952880633 286888 282108 667 665 0 True 362 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 406 395 0.00666279357460203 0.00688292027849436 0.00668345159075303 0.00683604180972 0.00141337393620349 0.00174449227400751 291243 299963 667 665 0 True 407 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 451 394 0.00661450002853918 0.00695494745102628 0.00665293354695964 0.00704966811627375 0.00157833456093709 0.00156308830821019 289132 303102 667 665 0 True 451 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 495 393 0.00680762845860201 0.00681796044241985 0.0068055237659266 0.00688181887541009 0.00164236770386086 0.00167122978217886 297574 297132 667 665 0 True 496 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 539 392 0.00672785603078525 0.00694115696657528 0.0068055237659266 0.00666819256885634 0.00161287447762793 0.0025412139910461 294087 302501 667 665 0 True 541 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 583 393 0.00656069310275052 0.00680079691102327 0.00653086137178607 0.00691233691920348 0.00178172372247344 0.00184410954053474 286780 296384 667 665 0 True 585 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 628 393 0.00637580042663493 0.00639805051654084 0.00627145799954223 0.00643930724040589 0.0017944392448652 0.00181394933152612 278698 278832 667 665 0 True 630 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 672 392 0.00607489800533471 0.00621329014915407 0.00605783169298848 0.00622568093385214 0.00168599799500539 0.00189510353777378 265545 270780 667 665 0 True 675 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 274 438 0.00594255401482138 0.00606407297713269 0.005981536583505 0.00613412680247196 0.00149214805870583 0.00152714635350511 259760 264277 667 665 0 True 273 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 319 438 0.00619829705197756 0.00620948113015429 0.00627145799954223 0.00622568093385214 0.00137333063581529 0.00138107512200324 270939 270614 667 665 0 True 317 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 363 438 0.00658089357701557 0.00630023215511886 0.00660715648126955 0.00631723506523232 0.00139261023192119 0.00130741078097154 287663 274569 667 665 0 True 362 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 407 438 0.00661132011243177 0.00681433499060079 0.00659189745937285 0.0068207827878233 0.0015242344920016 0.00155662158887246 288993 296974 667 665 0 True 407 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 451 438 0.00692597166740502 0.00717272696504365 0.00695811398489357 0.00721751735713741 0.00176840093587213 0.00175119742376917 302747 312593 667 665 0 True 451 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 496 437 0.00682265870955573 0.00701121079191455 0.00672922865644312 0.00703440909437705 0.00163987949641435 0.00174743230694539 298231 305554 667 665 0 True 496 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 540 436 0.00641757400082289 0.00662223193598553 0.00645456626230259 0.00663767452506294 0.00164965147500127 0.00165931881004931 280524 288602 667 665 0 True 541 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 583 436 0.00610607948486274 0.00615551237902493 0.00622568093385214 0.00617990386816205 0.00176474714621854 0.00191305151015521 266908 268262 667 665 0 True 586 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 629 437 0.00596344080191536 0.00595393266870541 0.00599679560540169 0.00601205462729839 0.00178114352671415 0.00175753685140699 260673 259477 667 665 0 True 630 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 672 436 0.00591375175310033 0.00613701798556818 0.00588998245212482 0.00608834973678187 0.00174480055328935 0.00174215101942693 258501 267456 667 665 0 True 675 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 275 482 0.00607787202759344 0.00627354607622283 0.00611886778057527 0.00624093995574884 0.0014227825103447 0.00158744593442546 265675 273406 667 665 0 True 273 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 320 482 0.00614968322659453 0.00622558915026178 0.00625619897764553 0.00624093995574884 0.00147118237966385 0.00147108390937153 268814 271316 667 665 0 True 318 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 364 481 0.00640860617985811 0.00648850324483674 0.00642404821850919 0.00648508430609598 0.00150188948963003 0.00157270264504368 280132 282774 667 665 0 True 362 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 408 482 0.00664311927350584 0.0066793442750846 0.00671396963454643 0.00665293354695964 0.0017095515608379 0.00164886166671002 290383 291091 667 665 0 True 407 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 452 481 0.00657306961076569 0.00678344981244597 0.00666819256885634 0.00674448767833982 0.00188288497272302 0.00200595964469215 287321 295628 667 665 0 True 452 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 497 482 0.00642153173813642 0.00646902217778367 0.00646982528419928 0.00636301213092241 0.00171052986382576 0.00179470863686688 280697 281925 667 665 0 True 496 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 540 481 0.00611946258502701 0.00604654231137468 0.00619516289005875 0.00604257267109178 0.00177222059827334 0.00161392854620264 267493 263513 667 665 0 True 541 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 585 481 0.00614835635512525 0.00622669055334606 0.00617990386816205 0.00619516289005875 0.00173423865017842 0.00193794673895866 268756 271364 667 665 0 True 586 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 629 481 0.00613094688636455 0.00605411445757906 0.00617990386816205 0.00614938582436866 0.00168878941976887 0.00162443376678865 267995 263843 667 665 0 True 630 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 673 481 0.00626054562556213 0.00605071846473588 0.00628671702143893 0.00604257267109178 0.0017334592789946 0.00179717994434869 273660 263695 667 665 0 True 675 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 275 526 0.00618010976201073 0.00620567211115452 0.00617990386816205 0.00619516289005875 0.00143612271925526 0.00147530164986958 270144 270448 667 665 0 True 273 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 320 525 0.00619850294582624 0.0060960136665766 0.00613412680247196 0.00611886778057527 0.00144397161684189 0.00154314569081097 270948 265669 667 665 0 True 318 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 365 526 0.00629911640654838 0.00634894629570034 0.00633249408712902 0.00633249408712902 0.00145346751548161 0.00147322989886399 275346 276692 667 665 0 True 362 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 409 526 0.00642498617937541 0.00642551675595489 0.0064087891966125 0.00646982528419928 0.00156545741703269 0.00159792200169791 280848 280029 667 665 0 True 407 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 453 525 0.00643143751996741 0.00633859769588769 0.00636301213092241 0.00634775310902571 0.00182094964280244 0.00198407855915329 281130 276241 667 665 0 True 452 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 497 523 0.00632446422703045 0.00643203339087017 0.00633249408712902 0.00645456626230259 0.00182739057361334 0.00167696225119079 276454 280313 667 665 0 True 497 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 541 523 0.00611623691473101 0.00617235466785526 0.00614938582436866 0.00625619897764553 0.00168207998440377 0.00159949124764758 267352 268996 667 665 0 True 541 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 585 523 0.00621119973316157 0.00625411090096493 0.00625619897764553 0.00630197604333562 0.0017294765031402 0.00174272555969832 271503 272559 667 665 0 True 586 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 630 523 0.00632245104273224 0.00644173950555033 0.00634775310902571 0.00636301213092241 0.00189927273770521 0.00176966760569324 276366 280736 667 665 0 True 631 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 674 522 0.00627344830674615 0.0063235451870693 0.00625619897764553 0.0063782711528191 0.00175833412612975 0.00180869119027386 274224 275585 667 665 0 True 675 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 275 568 0.00639046464407988 0.0063131048036663 0.00643930724040589 0.00624093995574884 0.00138206899222156 0.00125151277690746 279339 275130 667 665 0 True 273 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 320 566 0.00615233696953309 0.00634187895924292 0.00608834973678187 0.00633249408712902 0.00136511505397157 0.00143332262644073 268930 276384 667 665 0 True 318 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 364 567 0.00628605358570429 0.00642714591468371 0.00622568093385214 0.00646982528419928 0.00130390084605086 0.00125528761943734 274775 280100 667 665 0 True 363 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 408 567 0.00627232732912555 0.00633680791587575 0.00624093995574884 0.0063782711528191 0.00145206426541589 0.0014973046141764 274175 276163 667 665 0 True 407 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 453 566 0.00636562011967237 0.00639779811166736 0.0063782711528191 0.00645456626230259 0.00197593413782627 0.00190983640936374 278253 278821 667 665 0 True 452 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 497 565 0.00623743976032126 0.00650796136599223 0.00622568093385214 0.00656137941557946 0.00204644377612375 0.00201434613855112 272650 283622 667 665 0 True 497 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 541 564 0.00624423425732773 0.00629456451841437 0.00619516289005875 0.00633249408712902 0.00182274006969698 0.00174259049906853 272947 274322 667 665 0 True 541 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 586 566 0.00638005556617434 0.00649534112231827 0.00634775310902571 0.00653086137178607 0.00159841155649177 0.00149729498972171 278884 283072 667 665 0 False 586 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 629 565 0.00633464453399302 0.00648329452608404 0.00634775310902571 0.00657663843747616 0.00158030576059471 0.00154538676168424 276899 282547 667 665 0 True 631 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 673 565 0.00620863749860021 0.00618004154354758 0.00628671702143893 0.00610360875867857 0.00160259682269156 0.00165971546485292 271391 269331 667 665 0 True 676 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 274 611 0.00646062869229153 0.0064988288987518 0.00648508430609598 0.00642404821850919 0.00134175830200456 0.00144794441491032 282406 283224 667 665 0 False 274 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 318 611 0.00640890358208399 0.00621680087148519 0.0063935301747158 0.00622568093385214 0.00146103811905096 0.00138266775126756 280145 270933 667 665 0 False 318 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 364 609 0.00600564904089498 0.00621987562176212 0.00599679560540169 0.00622568093385214 0.00131438718478382 0.00128048517789098 262518 271067 667 665 0 True 363 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 408 610 0.00606714267036772 0.00621292301479265 0.00613412680247196 0.00624093995574884 0.00152029117752951 0.00135014298702991 265206 270764 667 665 0 True 408 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 452 610 0.00630913657385086 0.00617554414762014 0.0063782711528191 0.00624093995574884 0.00181357921759942 0.00192912675268573 275784 269135 667 665 0 False 452 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 497 610 0.00634015791371881 0.00630755189644975 0.00625619897764553 0.00631723506523232 0.00185228765839683 0.00197608762819534 277140 274888 667 665 0 False 497 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 542 610 0.00642109707334477 0.00628979177171585 0.0063935301747158 0.00636301213092241 0.00186355152017328 0.00187215473725273 280678 274114 667 665 0 False 542 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 586 609 0.00647856433422108 0.00640741244275716 0.00650034332799268 0.0064087891966125 0.00160924084095491 0.0016019013338191 283190 279240 667 665 0 False 586 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 631 609 0.00637863718632787 0.00629626251483596 0.00643930724040589 0.00634775310902571 0.0014191633992919 0.00143747405314903 278822 274396 667 665 0 False 631 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 676 609 0.00646239022855247 0.00643028950265341 0.00654612039368277 0.00645456626230259 0.00156359346302863 0.0016007753058997 282483 280237 667 665 0 False 676 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 274 659 0.00822939411502763 0.730276893882681 0.00804150453955901 0.715541313801785 0.00194979501323508 0.193393280204197 359722 31826033 667 665 12 True 274 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 318 654 0.00683611044100289 0.00634883156621239 0.00671396963454643 0.00636301213092241 0.00156730430608722 0.0013342845020068 298819 276687 667 665 0 False 318 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 363 654 0.00605790032427137 0.00611056136564804 0.00607309071488518 0.00616464484626535 0.0012734330909936 0.00119309299344184 264802 266303 667 665 0 False 363 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 408 654 0.00619342423089211 0.00599395031410066 0.00611886778057527 0.00599679560540169 0.00139764121597621 0.00138343799879296 270726 261221 667 665 0 False 408 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 453 654 0.00600006702988629 0.00616785727192782 0.00608834973678187 0.00616464484626535 0.00164158949063017 0.00149907417835625 262274 268800 667 665 0 False 453 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 497 653 0.00605970761472091 0.0061267382234483 0.00607309071488518 0.00605783169298848 0.00159105739860823 0.00166774708648437 264881 267008 667 665 0 False 497 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 542 653 0.00608821247421608 0.00612873451653854 0.00614938582436866 0.00610360875867857 0.00170846151275376 0.00166698102462575 266127 267095 667 665 0 False 542 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 587 653 0.00612884219368915 0.00623614426315273 0.00621042191195544 0.00619516289005875 0.00139406620808378 0.00119849584529806 267903 271776 667 665 0 False 587 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 631 653 0.00705259638434388 0.00661323714413064 0.00689707789730678 0.00666819256885634 0.00174013578071331 0.00128233810239829 308282 288210 667 665 0 False 631 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 672 658 0.00799860998775046 0.752965820364599 0.00799572747386892 0.731380178530556 0.0017811009234322 0.169596950559547 349634 32814834 667 665 13 True 676 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C2_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C2_3.csv new file mode 100755 index 0000000..e6ad62f --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C2_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 272 262 0.000926934106762137 0.0745791464240826 0.000732433051041428 0.0733196002136263 0.000744074149971181 0.0225486143991291 40518 3250217 667 665 0 True 272 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 317 263 0.000943291229185133 0.000826786581927467 0.000854505226215 0.000717174029144732 0.000674048861563901 0.000614497090657337 41233 36032 667 665 0 False 317 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 360 262 0.000812228355952488 0.000903678284748263 0.000671396963454643 0.000778210116731518 0.0006541251025003 0.000651204721536095 35504 39383 667 665 0 True 361 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 405 262 0.000880539359526005 0.000915793718675265 0.000732433051041428 0.000717174029144732 0.000696106652242987 0.000740540857319905 38490 39911 667 665 0 True 406 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 449 262 0.000839749500392857 0.000883508840767517 0.00064087891966125 0.000595101853971161 0.000750554697659827 0.000872051894301441 36707 38504 667 665 0 True 451 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 493 261 0.000861871650578922 0.000935825487270476 0.000656137941557946 0.000686655985351339 0.000794437426135734 0.000856899488409134 37674 40784 667 665 0 True 495 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 537 260 0.000976897680708742 0.000889451828243073 0.000793469138628214 0.000686655985351339 0.000817628169531527 0.000810781589692376 42702 38763 667 665 0 True 540 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 582 261 0.00110576435288879 0.00105209235035403 0.000915541313801785 0.000717174029144732 0.000938607869539355 0.00104855335826387 48335 45851 667 665 0 True 585 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 629 261 0.00112537002270208 0.00100073943154981 0.000793469138628214 0.000656137941557946 0.00107200229888741 0.00099313547850234 49192 43613 667 665 0 False 629 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 669 261 0.00109492061019159 0.0751502009773805 0.000762951094834821 0.0715800717174029 0.00102621412172352 0.0193845779287635 47861 3275104 667 665 0 True 674 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 272 306 0.000875803801006341 0.000876992205852236 0.000701915007248035 0.000717174029144732 0.000739947638885688 0.00074671196606187 38283 38220 667 665 0 False 272 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 317 306 0.000818062014998452 0.000850397910546566 0.000656137941557946 0.000778210116731518 0.000661324753660831 0.000613465823967406 35759 37061 667 665 0 False 317 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 361 306 0.000824650618156246 0.000921805543843587 0.000686655985351339 0.00080872816052491 0.000661028379845651 0.000671244388836118 36047 40173 667 665 0 True 361 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 406 307 0.000950977932869226 0.0008526236626127 0.000778210116731518 0.000625619897764553 0.000717678777506022 0.000731168953151177 41569 37158 667 665 0 True 406 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 449 306 0.000863335784613987 0.000899708644465363 0.000549324788281071 0.000595101853971161 0.00087277712410547 0.000921204829928928 37738 39210 667 665 0 True 451 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 495 305 0.000944503715182921 0.000845280975384215 0.000671396963454643 0.000656137941557946 0.000882296115649421 0.000779072132061809 41286 36838 667 665 0 True 496 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 537 305 0.000939173352211512 0.000895096519049971 0.000762951094834821 0.000671396963454643 0.000755275462352542 0.000792292110544016 41053 39009 667 665 0 True 540 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 584 306 0.000954935670182762 0.000958312466907713 0.000625619897764553 0.000473029678797589 0.000952548641671474 0.00109333993969209 41742 41764 667 665 0 True 585 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 630 305 0.000973626256224142 0.00102515386658452 0.000503547722590982 0.000610360875867857 0.00104700110404003 0.00109299441327333 42559 44677 667 665 0 False 630 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 674 304 0.00110468912945679 0.00101574604857302 0.000671396963454643 0.000686655985351339 0.00111896588435719 0.000965762574154065 48288 44267 667 665 0 False 674 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 274 350 0.000850982153693124 0.000864647312949345 0.000656137941557946 0.000686655985351339 0.000752791088455993 0.000757783206561646 37198 37682 667 665 0 True 272 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 317 350 0.000802597099253074 0.000841494902282027 0.000656137941557946 0.000701915007248035 0.000644439034013659 0.000685563543757713 35083 36673 667 665 0 True 317 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 362 351 0.00090190656560024 0.000787549097050247 0.000778210116731518 0.000671396963454643 0.000695233291529299 0.00062676360185066 39424 34322 667 665 0 True 362 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 405 350 0.000932744888713803 0.000862215047804909 0.000747692072938125 0.000671396963454643 0.00075631767928232 0.000723162132290958 40772 37576 667 665 0 True 406 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 450 350 0.0008490604777721 0.000871118056069448 0.000534065766384375 0.000564583810177768 0.000852548030145791 0.000877283116026936 37114 37964 667 665 0 True 451 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 495 349 0.000951526983132375 0.000923664161548297 0.000732433051041428 0.000656137941557946 0.0008573041813415 0.000868231672811421 41593 40254 667 665 0 True 496 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 538 348 0.000966031060917241 0.000897046920345037 0.000747692072938125 0.00064087891966125 0.000865322249727642 0.000869407528033165 42227 39094 667 665 0 True 540 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 583 349 0.000974564217090356 0.00100188672642926 0.00064087891966125 0.000595101853971161 0.00103610222933743 0.00110242271902956 42600 43663 667 665 0 True 585 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 628 349 0.00103205435506097 0.00095675214587166 0.000656137941557946 0.000518806744487678 0.00111258869668927 0.00103741563760607 45113 41696 667 665 0 True 630 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 671 348 0.000916639414328084 0.000899525077284651 0.000549324788281071 0.000488288700694286 0.000950408654237713 0.000983266768754567 40068 39202 667 665 0 True 675 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 273 394 0.000894151230633253 0.000913636804301897 0.000717174029144732 0.000762951094834821 0.000797379475296396 0.000724862083727888 39085 39817 667 665 0 True 272 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 318 395 0.000827441623660589 0.00663661901377385 0.000717174029144732 0.00675974670023652 0.000654489735633741 0.00188175364405768 36169 289229 667 665 0 True 317 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 362 394 0.000832680478254807 0.000985870489912123 0.000701915007248035 0.000854505226215 0.000666415586486724 0.000736391123192148 36398 42965 667 665 0 True 362 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 406 395 0.000905635531970797 0.000922700433849559 0.000717174029144732 0.000701915007248035 0.000767667478882654 0.00081323133644651 39587 40212 667 665 0 True 407 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 451 394 0.000883787906916306 0.00100496147670619 0.000579842832074464 0.000732433051041428 0.000874896178893261 0.000925123474034711 38632 43797 667 665 0 True 451 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 495 393 0.000939241983494405 0.00101652620909105 0.00064087891966125 0.000762951094834821 0.000909361727762744 0.000910270956914109 41056 44301 667 665 0 True 496 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 539 392 0.000997807344897018 0.000946610059137315 0.000778210116731518 0.000701915007248035 0.000919461085670323 0.000876084843384166 43616 41254 667 665 0 True 541 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 583 393 0.00094994846362582 0.000963865374124256 0.000625619897764553 0.000595101853971161 0.000970683539908698 0.00103503773158194 41524 42006 667 665 0 True 585 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 628 393 0.000952830977507355 0.00089511946494756 0.000610360875867857 0.000503547722590982 0.000958645968651695 0.000970346873345543 41650 39010 667 665 0 True 630 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 672 392 0.000927117123516521 0.000814487580819754 0.000549324788281071 0.000366216525520714 0.00093809600263443 0.000959712147184747 40526 35496 667 665 0 True 675 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 274 438 0.000864960058309138 0.000877106935340182 0.000717174029144732 0.000701915007248035 0.000740298637896968 0.000820702775843839 37809 38225 667 665 0 True 273 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 319 438 0.000858874751225898 0.000842871656137368 0.000701915007248035 0.000732433051041428 0.000757714931597737 0.000705048225166956 37543 36733 667 665 0 True 317 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 363 438 0.00090321055997522 0.000914829990976526 0.000823987182421607 0.000778210116731518 0.000729201547511618 0.000681534368597951 39481 39869 667 665 0 True 362 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 407 438 0.000911697961959739 0.000932750736993548 0.000701915007248035 0.000686655985351339 0.000809799800314656 0.000838302625718215 39852 40650 667 665 0 True 407 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 451 438 0.000876535868023873 0.000899846319850898 0.000518806744487678 0.000610360875867857 0.000934060732271546 0.000929734331666166 38315 39216 667 665 0 True 451 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 496 437 0.000926224916838903 0.000866368255268521 0.000595101853971161 0.000488288700694286 0.000922090484514715 0.000970154926057417 40487 37757 667 665 0 True 496 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 540 436 0.000874156650216892 0.000936513864198147 0.00064087891966125 0.000671396963454643 0.000866875679715044 0.00088882132364958 38211 40814 667 665 0 True 541 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 583 436 0.000868757655962589 0.000991446343026254 0.000518806744487678 0.000595101853971161 0.000921632494883668 0.001070899902356 37975 43208 667 665 0 True 586 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 629 437 0.000935307123275167 0.000987224297869875 0.000564583810177768 0.000671396963454643 0.000978392801519651 0.000959070193455892 40884 43024 667 665 0 True 630 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 672 436 0.000980603769985001 0.000881742006653163 0.000610360875867857 0.000457770656900893 0.00100213023808038 0.000956072629832516 42864 38427 667 665 0 True 675 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 275 482 0.000785690926566929 0.000891838201592331 0.000625619897764553 0.000762951094834821 0.000726488691372211 0.000792806598160987 34344 38867 667 665 0 True 273 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 320 482 0.000865554862760883 0.000863729477045785 0.000732433051041428 0.000701915007248035 0.000782297576285292 0.000776215764286033 37835 37642 667 665 0 True 318 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 364 481 0.000902364107486197 0.000925293320277118 0.000793469138628214 0.000778210116731518 0.000766253937539585 0.00080072249624269 39444 40325 667 665 0 True 362 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 408 482 0.00087015315871476 0.000878621364581057 0.000549324788281071 0.000656137941557946 0.00089498394693627 0.00083910162141675 38036 38291 667 665 0 True 407 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 452 481 0.000904102766652838 0.000856639194690778 0.000488288700694286 0.000442511635004196 0.000979740254476204 0.000967656231350743 39520 37333 667 665 0 True 452 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 497 482 0.000855466064175511 0.00086384420653373 0.000564583810177768 0.000457770656900893 0.000858049006569736 0.00093333727212557 37394 37647 667 665 0 True 496 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 540 481 0.000979048127572744 0.000851338692347715 0.000671396963454643 0.000549324788281071 0.000925881045938904 0.000879430410112037 42796 37102 667 665 0 True 541 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 585 481 0.000944984134163177 0.000932957250071849 0.000579842832074464 0.000488288700694286 0.000972024557298207 0.00103841640499907 41307 40659 667 665 0 True 586 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 629 481 0.000909204358681268 0.000887294913869705 0.000503547722590982 0.000518806744487678 0.000974052288203014 0.000893594441195839 39743 38669 667 665 0 True 630 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 673 481 0.000958870530402 0.000939336209601596 0.000625619897764553 0.000488288700694286 0.0010180521753079 0.00100136420142616 41914 40937 667 665 0 True 675 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 275 526 0.000818336540130027 0.000862995208322936 0.000701915007248035 0.000717174029144732 0.000689465273235228 0.000744077348869782 35771 37610 667 665 0 True 273 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 320 525 0.000869443968791525 0.000836309129426909 0.000732433051041428 0.000686655985351339 0.000776559130169385 0.000750609958899401 38005 36447 667 665 0 True 318 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 365 526 0.000857410617190832 0.000915472476109018 0.000701915007248035 0.000762951094834821 0.000753499865101778 0.00076829779633002 37479 39897 667 665 0 True 362 524 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 409 526 0.000932035698790568 0.000858451920600311 0.000595101853971161 0.000579842832074464 0.000923810571490219 0.000847098790870851 40741 37412 667 665 0 True 407 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 453 525 0.000930800335698482 0.000829402414252615 0.000595101853971161 0.000457770656900893 0.000975297590234982 0.000974326871512409 40687 36146 667 665 0 True 452 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 497 523 0.000885778214120223 0.000834014539668007 0.000564583810177768 0.000442511635004196 0.000913528465223665 0.000930612015196495 38719 36347 667 665 0 True 497 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 541 523 0.000918080671268852 0.000887088400791404 0.00064087891966125 0.000579842832074464 0.000948968122965374 0.000866271636998757 40131 38660 667 665 0 True 541 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 585 523 0.000830552908485103 0.00088158138537004 0.000579842832074464 0.000579842832074464 0.000812457701495932 0.000849125954018516 36305 38420 667 665 0 True 586 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 630 523 0.000948735977628032 0.000889107639779237 0.000564583810177768 0.000442511635004196 0.0010037088765491 0.000982101126427971 41471 38748 667 665 0 True 631 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 674 522 0.000929450587134906 0.000967835014407155 0.000564583810177768 0.000595101853971161 0.000974491890030226 0.0010116141176027 40628 42179 667 665 0 True 675 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 275 568 0.000898589386927045 0.000910562054024969 0.000793469138628214 0.000778210116731518 0.000698334009691435 0.000698578974025098 39279 39683 667 665 0 True 273 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 320 566 0.000903942626992752 0.000880365252797822 0.000778210116731518 0.000747692072938125 0.000746332361860819 0.000719829380595469 39513 38367 667 665 0 True 318 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 364 567 0.000910531230150546 0.00089137928364055 0.000762951094834821 0.000762951094834821 0.000700170473682967 0.000668412478855442 39801 38847 667 665 0 True 363 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 408 567 0.000953357150676207 0.000902140909609799 0.000717174029144732 0.000625619897764553 0.000872008011996072 0.000810483161714299 41673 39316 667 665 0 True 407 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 453 566 0.000890856929054356 0.000868892304003313 0.000503547722590982 0.0004272526131075 0.000980422746486714 0.00097241421368881 38941 37867 667 665 0 True 452 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 497 565 0.000879807292508472 0.000977839425755967 0.000488288700694286 0.000503547722590982 0.000995070382653931 0.00109510740178893 38458 42615 667 665 0 True 497 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 541 564 0.000881545951675112 0.000882155032809765 0.000503547722590982 0.0004272526131075 0.000949474308912738 0.000955516044600151 38534 38445 667 665 0 True 541 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 586 566 0.000883467627596136 0.000935940216758422 0.000656137941557946 0.000671396963454643 0.000820009053318711 0.000836184130198339 38618 40789 667 665 0 False 586 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 629 565 0.000892206677617932 0.000929928391590099 0.000656137941557946 0.000656137941557946 0.000812743950159151 0.000858191937307767 39000 40527 667 665 0 True 631 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 673 565 0.000947958156421903 0.00103908202642105 0.000686655985351339 0.000762951094834821 0.000865878839677438 0.00093983457487877 41437 45284 667 665 0 True 676 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 274 611 0.000895821258516999 0.000779059114942311 0.000762951094834821 0.000610360875867857 0.00074417731141727 0.000687869500931993 39158 33952 667 665 0 False 274 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 318 611 0.00086852888501961 0.000900741209856869 0.000747692072938125 0.000732433051041428 0.000709978036626092 0.000728980014770448 37965 39255 667 665 0 False 318 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 364 609 0.000895340839536743 0.000822816941644567 0.000732433051041428 0.000656137941557946 0.00073022256456578 0.000714277016488568 39137 35859 667 665 0 True 363 611 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 408 610 0.000833000757574978 0.00080826924257313 0.000656137941557946 0.000579842832074464 0.000740333384867066 0.000724319618277303 36412 35225 667 665 0 True 408 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 452 610 0.000904811956576072 0.000824790288837222 0.000457770656900893 0.000381475547417411 0.00104312053467141 0.000971691174446045 39551 35945 667 665 0 False 452 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 497 610 0.000801384613255286 0.000889635395423785 0.000320439459830625 0.000366216525520714 0.000975038511392535 0.00107419502564822 35030 38771 667 665 0 False 497 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 542 610 0.000974312569053079 0.000877703528677496 0.000564583810177768 0.000488288700694286 0.00104282082479576 0.000982704094008465 42589 38251 667 665 0 False 542 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 586 609 0.000908152012343565 0.000877680582779907 0.000656137941557946 0.000595101853971161 0.000858357986759268 0.000841792884340515 39697 38250 667 665 0 False 586 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 631 609 0.00088472586778252 0.00087878198586418 0.000686655985351339 0.000686655985351339 0.000760327785931487 0.000723839290764228 38673 38298 667 665 0 False 631 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 676 609 0.000977767010292062 0.000864234286792743 0.000747692072938125 0.000610360875867857 0.000828643483886688 0.000818727183772616 42740 37664 667 665 0 False 676 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 274 659 0.00105433664490712 0.0750039667720457 0.000915541313801785 0.0724040588998245 0.000706023807304399 0.0225791158671872 46087 3268731 667 665 0 True 274 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 318 654 0.000828722740941271 0.000851361638245304 0.000701915007248035 0.000686655985351339 0.000642876125939767 0.000660761465717392 36225 37103 667 665 0 False 318 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 363 654 0.000812800283309936 0.000885803430526419 0.000717174029144732 0.000778210116731518 0.000651393609435974 0.00070288461522043 35529 38604 667 665 0 False 363 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 408 654 0.000811862322443722 0.000807787378723761 0.00064087891966125 0.000610360875867857 0.00070071762845452 0.000692088852988444 35488 35204 667 665 0 False 408 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 453 654 0.000893625057464401 0.000860081079329131 0.000610360875867857 0.00064087891966125 0.000861365337191894 0.000792689081063175 39062 37483 667 665 0 False 453 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 497 653 0.000879853046697068 0.00092896466389136 0.000549324788281071 0.000656137941557946 0.000912636160525658 0.000912420012158951 38460 40485 667 665 0 False 497 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 542 653 0.000875094611083106 0.00086804330579252 0.000564583810177768 0.000564583810177768 0.000842352697930889 0.000872128395791857 38252 37830 667 665 0 False 542 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 587 653 0.000985590976541942 0.000927886206704677 0.000762951094834821 0.000793469138628214 0.000767565920608576 0.000670182534519076 43082 40438 667 665 0 False 587 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 631 653 0.00101288335003933 0.000949317675052819 0.000869764248111696 0.000778210116731518 0.000758141130511364 0.000710690253497639 44275 41372 667 665 0 False 631 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 672 658 0.00102379572401943 0.0770392219963963 0.000854505226215 0.0733501182574197 0.000764409042978245 0.0204225485443077 44752 3357429 667 665 0 True 676 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C3_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C3_1.csv new file mode 100755 index 0000000..b9d886c --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C3_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 271 275 0.00942355556028349 0.0404969851958805 0.0093690394445716 0.0407263294422828 0.00144775142986185 0.00991084630914561 411921 1764890 667 665 0 True 270 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 314 275 0.00939427287958218 0.00926101015872251 0.0093690394445716 0.00927748531319142 0.00124988806115596 0.001324372751639 410641 403602 667 665 0 False 314 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 358 275 0.00929441436297187 0.0630955736789903 0.00930800335698482 0.0655069810025177 0.00126392901587298 0.0130022367358584 406276 2749754 667 665 0 True 359 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 403 275 0.00925655277190885 0.0874742131134657 0.00927748531319142 0.085145342183566 0.0014118721234156 0.0156012115294858 404621 3812194 667 665 0 True 403 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 447 275 0.00953345712129058 0.0727814500774711 0.00947585259784848 0.0698100251773861 0.00162837996512326 0.0178769530976644 416725 3171872 667 665 0 True 448 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 490 274 0.00934112938952817 0.0644846724272343 0.00935378042267491 0.0688792248416877 0.00172500417013131 0.0217755365399129 408318 2810292 667 665 0 True 492 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 535 273 0.00943151678909916 0.0818797967681851 0.00944533455405508 0.0813000686655985 0.0014999741193904 0.0271768165414625 412269 3568385 667 665 0 True 537 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 580 273 0.00945508019622599 0.0644845347518487 0.00941481651026169 0.064286259250782 0.00171627807793218 0.0206501705540201 413299 2810286 667 665 0 True 581 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 626 274 0.00939360944384754 0.00919664691598532 0.0093842984664683 0.00920119020370794 0.00226859262254587 0.00181400399508621 410612 400797 667 665 0 False 626 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 664 273 0.0091331994794546 0.0408382365848244 0.00907911802853437 0.0412451361867704 0.00180560091643557 0.00920314946990266 399229 1779762 667 665 0 True 670 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 270 319 0.00940452181782764 0.00913563377429612 0.00941481651026169 0.00909437705043107 0.00148651190748874 0.00141830219841758 411089 398138 667 665 0 False 270 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 314 319 0.00934893047868375 0.00928223511399235 0.00943007553215839 0.00926222629129473 0.00131901061856416 0.0012375923897034 408659 404527 667 665 0 False 314 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 358 319 0.00970029977000513 0.117021668384741 0.00967421988250553 0.115480277714199 0.00137973097073362 0.0414313634565079 424018 5099895 667 665 0 True 359 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 402 320 0.00956866496941504 0.0527474327842954 0.00953688868543526 0.0518196383611811 0.00140202510283678 0.0109269154148341 418264 2298774 667 665 0 True 403 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 446 319 0.00958049242716705 0.0746630366256681 0.00959792477302205 0.0722056916151675 0.0016646828763458 0.0202626354405748 418781 3253873 667 665 0 True 448 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 490 318 0.00934881609321226 0.0417068764839542 0.00926222629129473 0.0447394522011139 0.00162736631890498 0.00992230770738713 408654 1817618 667 665 0 True 492 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 534 318 0.00937798438844208 0.0454991908702863 0.0093690394445716 0.048355840390631 0.00159439210029528 0.012587168523877 409929 1982890 667 665 0 True 537 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 579 318 0.00942607204065626 0.0496816314074268 0.00950637064164187 0.0525825894560159 0.00177447984311328 0.0122672716769319 412031 2165164 667 665 0 True 581 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 626 318 0.00929002196086667 0.00925472298278312 0.00935378042267491 0.00921644922560464 0.00204238488570383 0.00205936967850672 406084 403328 667 665 0 False 626 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 670 318 0.00908353330773386 0.00920353068526202 0.00910963607232776 0.00921644922560464 0.00190352593474814 0.00195557627691751 397058 401097 667 665 0 False 670 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 270 364 0.0094560867883751 0.0497788990673066 0.00943007553215839 0.0507209887846189 0.00149948598757749 0.012915665326129 413343 2169403 667 665 0 True 270 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 315 364 0.00961249748208981 0.0620883176125253 0.00952162966353857 0.0655374990463111 0.00139125854329158 0.0191479796619338 420180 2705857 667 665 0 True 314 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 358 364 0.00971997407110132 0.0388899922041313 0.00967421988250553 0.0408178835736629 0.00148324773721844 0.00961732973707199 424878 1694856 667 665 0 True 359 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 402 364 0.00969160647417193 0.0328429680289072 0.00964370183871214 0.0347600518806745 0.00143877160950033 0.00691614977297341 423638 1431322 667 665 0 True 403 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 447 363 0.00958605156108144 0.0714598581599341 0.00958266575112535 0.0695201037613489 0.00179532792037483 0.0170357250557897 419024 3114276 667 665 0 True 448 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 491 362 0.00975495314828281 0.0306370871100847 0.00975051499198901 0.0320439459830625 0.0015864962449934 0.00569502019363362 426407 1335188 667 665 0 True 492 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 535 362 0.00962279217452386 0.0284708796481935 0.00958266575112535 0.0289921416037232 0.00162593719349108 0.00403539207508749 420630 1240783 667 665 0 True 537 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 579 361 0.00977535951639653 0.0497956495725466 0.0097962920576791 0.0514839398794537 0.00177018101574832 0.0119851479264406 427299 2170133 667 665 0 True 581 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 624 361 0.00962494262138786 0.0570247087161713 0.00958266575112535 0.0576791027695125 0.00196299041442772 0.0147784847575864 420724 2485181 667 665 0 True 626 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 668 362 0.00938189637156702 0.0608713360420965 0.00941481651026169 0.0619058518348974 0.00183153024624439 0.0180539934235198 410100 2652820 667 665 0 True 671 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 271 407 0.00940484209714781 0.0408386955027762 0.00941481651026169 0.0440985732814527 0.00148794752308029 0.0109763970635467 411103 1779782 667 665 0 True 270 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 315 408 0.00953993133897688 0.0308561974861622 0.00961318379491875 0.0314793621728847 0.00139725192016898 0.00361199165761471 417008 1344737 667 665 0 True 314 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 359 408 0.00970951923900718 0.0865255838153406 0.0098115510795758 0.0835278858625162 0.00145719284387338 0.0244371588737817 424421 3770852 667 665 0 True 359 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 403 407 0.00967861228461073 0.0665323413821806 0.00976577401388571 0.0660410467689021 0.0014501834360717 0.0202647707547335 423070 2899531 667 665 0 True 403 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 448 407 0.00997217115864133 0.0442952884614833 0.0100251773861295 0.04614328221561 0.00159006586962906 0.00966776925073619 435902 1930423 667 665 0 True 448 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 492 407 0.00991333127210714 0.0546043295466866 0.00990310521095598 0.0553749904631113 0.0018369221728015 0.0139818699909191 433330 2379699 667 665 0 True 493 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 536 406 0.00977174493549746 0.0411604887705645 0.00965896086060884 0.0426642252231632 0.00161477411777766 0.00646712908700074 427141 1793806 667 665 0 True 537 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 581 407 0.0097517503550811 0.0516236803957708 0.0098268101014725 0.0520180056458381 0.00184427537498781 0.00945925777913249 426267 2249800 667 665 0 True 582 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 624 405 0.00973662859575019 0.0471329617245219 0.00978103303578241 0.0492713817044327 0.00188797643440212 0.0108421625146796 425606 2054091 667 665 0 True 626 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 668 406 0.00954468977459084 0.0829025642614203 0.00947585259784848 0.0803845273517968 0.00189531646922819 0.0192871406033275 417216 3612958 667 665 0 True 671 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 271 451 0.00949802050222314 0.0456381512260854 0.00953688868543526 0.0467536430914778 0.00151018003924677 0.010725872810639 415176 1988946 667 665 0 True 270 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 315 453 0.00962137379467739 0.0528963287137505 0.00970473792629892 0.0542915999084459 0.00151058087263155 0.0105706793985673 420568 2305263 667 665 0 True 315 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 360 453 0.00976307451675856 0.0357907357085779 0.0097962920576791 0.0366369115739681 0.00148159679567709 0.00616300816765857 426762 1559788 667 665 0 True 359 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 404 452 0.0100710688372911 0.0550669417879788 0.0100404364080262 0.0543068589303426 0.00166316558966832 0.0133752328218411 440225 2399860 667 665 0 True 404 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 448 452 0.0100666764351859 0.0978073473911375 0.0101472495613031 0.0972304875257496 0.00184773715168595 0.0208869197011237 440033 4262520 667 665 0 True 448 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 492 451 0.0102269991120256 0.0625657529036599 0.0102235446707866 0.0618905928130007 0.00181053685813908 0.0194428181579177 447041 2726664 667 665 0 True 493 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 536 451 0.00978121605253679 0.0516614722891 0.0098115510795758 0.0516975661860075 0.00177313126427332 0.0112573906433771 427555 2251447 667 665 0 True 537 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 581 450 0.00975371778519072 0.0331642564869487 0.00970473792629892 0.0334782940413519 0.00185281375149903 0.00509323848447228 426353 1445324 667 665 0 True 582 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 626 451 0.00976099270117745 0.0399322637103172 0.0098268101014725 0.0403448538948653 0.00180838952999403 0.00531209556188896 426671 1740279 667 665 0 True 626 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 669 451 0.00954933382473332 0.0753559568410612 0.00959792477302205 0.0749370565346761 0.00189476068035517 0.0123608222540349 417419 3284071 667 665 0 True 671 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 272 497 0.00948461452496457 0.0597480655174214 0.00964370183871214 0.0617074845502403 0.00152594280471761 0.0171470241150903 414590 2603867 667 665 0 True 270 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 317 497 0.0098191920290713 0.058581817326562 0.0098268101014725 0.0573739223315785 0.00157586305458921 0.00710610159658253 429215 2553041 667 665 0 True 315 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 360 496 0.00991735764070357 0.0722157648642091 0.00993362325474937 0.0683451590753033 0.00157109901373082 0.0213845466214183 433506 3147219 667 665 0 True 359 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 405 497 0.010062306910175 0.0909755505724715 0.0100404364080262 0.086152437628748 0.00170360677387622 0.0243102536424326 439842 3964785 667 665 0 True 404 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 449 496 0.0101086787803169 0.0949763284383997 0.0102082856488899 0.0923476005188067 0.0020090852743063 0.0311186677542851 441869 4139142 667 665 0 True 448 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 493 494 0.01018172534241 0.0426523163023145 0.0101167315175097 0.0449530785076677 0.00178104956594841 0.00937720242211773 445062 1858821 667 665 0 True 493 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 537 494 0.0103133601430001 0.0405130014323977 0.0100556954299229 0.0429694056610971 0.00237032345994492 0.00876266051063565 450816 1765588 667 665 0 True 537 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 582 495 0.00980203420834787 0.104401975412323 0.00968947890440223 0.101075761043717 0.00186434320364509 0.0211957514290448 428465 4549919 667 665 0 True 582 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 627 494 0.00982333278313922 0.0641015218292928 0.0098115510795758 0.0668650339513237 0.00192944800177481 0.018914937335781 429396 2793594 667 665 0 True 626 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 670 495 0.00971720594269128 0.0832180015155765 0.0098115510795758 0.0795605401693751 0.00183537693062472 0.0171625314660726 424757 3626705 667 665 0 True 671 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 273 540 0.0094951379883416 0.0498380765371887 0.00944533455405508 0.0537880521858549 0.00148969203816439 0.0126934124152546 415050 2171982 667 665 0 True 270 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 317 541 0.00979462202979535 0.117407067680646 0.00978103303578241 0.110826276035706 0.00152237057044266 0.036176448640516 428141 5116691 667 665 0 True 315 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 362 542 0.00975781278507004 0.0583361356010764 0.0098115510795758 0.0608224612802319 0.00158847804241936 0.0125904421120023 426532 2542334 667 665 0 True 359 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 406 541 0.0100079509341232 0.0625348447796075 0.0100099183642329 0.0603494316014343 0.00173756245466658 0.00910970359346107 437466 2725317 667 665 0 True 404 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 451 541 0.0101108292271809 0.0580127590663544 0.0101625085831998 0.0578316929884794 0.00196325165859264 0.00784349078984038 441963 2528241 667 665 0 True 448 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 494 538 0.00994810445543994 0.0669814155438952 0.0100251773861295 0.0650186923018235 0.00188690868827733 0.0159577209242328 434850 2919102 667 665 0 True 493 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 538 539 0.00996654339344404 0.0758015202804447 0.00997940032043946 0.0726787212939651 0.00189978862544166 0.0176765926174658 435656 3303489 667 665 0 True 537 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 582 538 0.0095179922055452 0.0590725382924007 0.00953688868543526 0.0596322575722896 0.00168225242522797 0.013151367174663 416049 2574427 667 665 0 True 582 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 628 539 0.00979601753254753 0.0521283524673437 0.0098268101014725 0.050064850843061 0.00171576563583377 0.00946356079862279 428202 2271794 667 665 0 True 627 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 672 539 0.00974623697535531 0.0658079164493977 0.00973525597009232 0.0656290531776913 0.00187482546565211 0.015644019215291 426026 2867960 667 665 0 True 671 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 275 584 0.00936160438892479 0.0439591310618042 0.00930800335698482 0.0445258258945602 0.00153257191577728 0.00808892478177221 409213 1915773 667 665 0 True 270 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 318 583 0.00958282589078544 0.0583502702739912 0.00955214770733196 0.0565804531929503 0.0016481695421935 0.0138551746708664 418883 2542950 667 665 0 True 315 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 362 584 0.00960005234279175 0.0456831022394622 0.00964370183871214 0.0463569085221637 0.00137461636656038 0.007168905386039 419636 1990905 667 665 0 True 359 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 407 583 0.00991545884187684 0.0552823119827493 0.00990310521095598 0.0529488059815366 0.00161287709820606 0.00899950960991265 433423 2409246 667 665 0 True 404 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 450 582 0.00982882328577071 0.0911274065227156 0.00985732814526589 0.0858319981689174 0.00192362352436072 0.0191504172435169 429636 3971403 667 665 0 True 449 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 495 581 0.00973559912650679 0.0638891575471065 0.00968947890440223 0.0631265735866331 0.00199200694489762 0.0123345458466737 425561 2784339 667 665 0 True 493 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 539 580 0.0096701935139091 0.0554814364820268 0.00962844281681544 0.0555275806820783 0.00192017803796251 0.00878394444851192 422702 2417924 667 665 0 True 538 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 582 580 0.00952826402088496 0.0380444588238736 0.00943007553215839 0.0398260471503777 0.00176917245006032 0.00810346315387936 416498 1658007 667 665 0 True 582 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 627 580 0.00982150261559538 0.0485456488554873 0.0098115510795758 0.0488441290913252 0.00161246046074558 0.00765572272413048 429316 2115657 667 665 0 True 627 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 671 580 0.00967698801091558 0.0537471855422488 0.00973525597009232 0.0529640650034333 0.00163269931281037 0.00696500141875479 422999 2342344 667 665 0 True 671 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 271 622 0.00938166760062404 0.0091521777664578 0.00926222629129473 0.00917067215991455 0.00182273626437303 0.00136772207731567 410090 398859 667 665 0 False 271 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 315 622 0.00916092651774365 0.00918283348563673 0.00918593118181125 0.00917067215991455 0.00140901105786257 0.00137392367331466 400441 400195 667 665 0 False 315 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 362 626 0.00938521355024021 0.0741895709748163 0.0093842984664683 0.0710612649729152 0.001296077833907 0.0113867552276187 410245 3233239 667 665 0 True 360 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 406 625 0.00960229429803295 0.0796408049191415 0.00964370183871214 0.0750133516441596 0.00153246276925768 0.018472708060949 419734 3470808 667 665 0 True 404 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 449 622 0.00945620117384659 0.00959145402990195 0.00953688868543526 0.00962844281681544 0.00185715164182908 0.00191463735049961 413348 418003 667 665 0 False 449 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 493 622 0.00944265793402223 0.00942222803518294 0.00941481651026169 0.00944533455405508 0.00195026089378836 0.00196974309188348 412756 410628 667 665 0 False 493 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 538 622 0.00942161100726817 0.00938657011032961 0.00941481651026169 0.00935378042267491 0.00189032171039331 0.00199408381488755 411836 409074 667 665 0 False 538 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 582 621 0.00939747567278389 0.00944189266941673 0.00935378042267491 0.00952162966353857 0.00159586806000746 0.00155616850171734 410781 411485 667 665 0 False 582 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 627 621 0.00963784530257188 0.00963890614611604 0.00950637064164187 0.00971999694819562 0.00176422101892279 0.00162591437320354 421288 420071 667 665 0 False 627 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 671 621 0.00974420091396279 0.0095177976986412 0.00958266575112535 0.00950637064164187 0.00197425272674479 0.00146709745217362 425937 414793 667 665 0 False 671 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 269 672 0.0089570229762665 0.0388437332745918 0.0089417868314641 0.0397497520408942 0.00132891732888646 0.00955874574664397 391528 1692840 667 665 0 True 271 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 315 666 0.00883833661104902 0.00883761245640997 0.00885023270008392 0.00888075074387732 0.00127268280655463 0.00122597611297901 386340 385150 667 665 0 False 315 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 360 665 0.00907721922970764 0.00900555348086398 0.00912489509422446 0.00900282291905089 0.00129872770276468 0.00133027249575449 396782 392469 667 665 0 False 360 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 404 665 0.00919446433798436 0.00897267200961892 0.00915541313801785 0.00901808194094758 0.00137619633738574 0.00136795712727359 401907 391036 667 665 0 False 404 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 449 665 0.00924920922463923 0.00933668572897109 0.00944533455405508 0.00941481651026169 0.00155935533356731 0.00158384356213433 404300 406900 667 665 0 False 449 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 493 665 0.00936663734967032 0.00920527457347879 0.00941481651026169 0.00927748531319142 0.00158135706219991 0.00168805388573474 409433 401173 667 665 0 False 493 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 538 665 0.00904024984532224 0.00910578116153281 0.00914015411612116 0.00914015411612116 0.00171598957273191 0.00172718708031918 395166 396837 667 665 0 False 538 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 582 665 0.00932724299328935 0.00922454912745356 0.0093842984664683 0.00929274433508812 0.00140466311626805 0.00129992565227956 407711 402013 667 665 0 False 582 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 627 665 0.00954725200915221 0.00955880201763278 0.00956740672922866 0.00956740672922866 0.00146503782992652 0.00155452306374055 417328 416580 667 665 0 False 627 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 666 670 0.00951337103249703 0.0401855405279048 0.00953688868543526 0.0406805523765927 0.00152181792260071 0.00864499241065659 415847 1751317 667 665 0 True 671 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C3_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C3_2.csv new file mode 100755 index 0000000..4cfc313 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C3_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 271 275 0.00765170172981717 0.722293534247613 0.00764476997024491 0.746013580529488 0.00164723592117756 0.209340248105667 334470 31478112 667 665 12 True 270 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 314 275 0.00642157749232502 0.00618258853817997 0.00631723506523232 0.00610360875867857 0.0014933918710636 0.00125367757916741 280699 269442 667 665 0 False 314 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 358 275 0.00593294563521627 0.00601501464808737 0.0059510185397116 0.00608834973678187 0.00118398311330531 0.00126290489356939 259340 262139 667 665 0 True 359 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 403 275 0.00593125273023822 0.00592873807315267 0.00602731364919509 0.00593575951781491 0.00136861398011401 0.0013408694200462 259266 258379 667 665 0 True 403 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 447 275 0.00618310666136376 0.00606652818817472 0.00625619897764553 0.00607309071488518 0.00168239638004661 0.00167299422316106 270275 264384 667 665 0 True 448 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 490 274 0.00639190590102065 0.00626622633489193 0.0064087891966125 0.00621042191195544 0.00161497802467306 0.00157839416605213 279402 273087 667 665 0 True 492 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 535 273 0.00641805441980314 0.0065993319301917 0.00636301213092241 0.00659189745937285 0.00147641581194225 0.00155468822014488 280545 287604 667 665 0 True 537 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 580 273 0.00706167859078014 0.00697867350913333 0.00706492713817044 0.00701915007248035 0.00170216156061704 0.00181229013982831 308679 304136 667 665 0 True 581 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 626 274 0.0122022989420831 0.0076894915246459 0.00778210116731518 0.00772106507972839 0.0228485562025523 0.00181117543318173 533385 335114 667 665 0 False 626 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 664 273 0.00873111167007478 0.73953299361932 0.00868238345922026 0.749095902952621 0.00188513995919812 0.197966648500556 381653 32229421 667 665 14 True 670 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 270 319 0.00623393956489368 0.00589530590036547 0.00617990386816205 0.00592050049591821 0.00145001527243273 0.00137914835845618 272497 256922 667 665 0 False 270 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 314 319 0.0060598220001924 0.0058958795478052 0.00607309071488518 0.00590524147402152 0.00122207184783031 0.00116566361605151 264886 256947 667 665 0 False 314 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 358 319 0.00599059591284696 0.00604009451415217 0.00605783169298848 0.00604257267109178 0.00131664861611533 0.00126449007491316 261860 263232 667 665 0 True 359 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 402 320 0.00626393143551822 0.0063147569082927 0.00627145799954223 0.00634775310902571 0.00139286496043284 0.00133145543064691 273808 275202 667 665 0 True 403 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 446 319 0.00637822539863051 0.00658377461162634 0.0063935301747158 0.00663767452506294 0.00157263502672607 0.00169495995411349 278804 286926 667 665 0 True 448 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 490 318 0.00653847944418727 0.00671059658760084 0.00650034332799268 0.00679026474402991 0.00160722104928155 0.00156066354629266 285809 292453 667 665 0 True 492 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 534 318 0.00669280832232087 0.00684164060873172 0.00663767452506294 0.00686655985351339 0.00150371344635941 0.00157498416379718 292555 298164 667 665 0 True 537 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 579 318 0.00697545482237137 0.00688016677078368 0.00704966811627375 0.00700389105058366 0.00174406034339349 0.00185710821852425 304910 299843 667 665 0 True 581 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 626 318 0.00707293412117471 0.00727605234188699 0.00714122224765393 0.00737010757610437 0.00194141919374298 0.00202082654632208 309171 317096 667 665 0 False 626 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 670 318 0.0072643467691652 0.00718348859101289 0.00735484855420768 0.00718699931334401 0.00205968153420446 0.00195229699342211 317538 313062 667 665 0 False 670 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 270 364 0.00582501150431879 0.0058526265308499 0.00576791027695125 0.00585946440833143 0.00137674631294036 0.0014157722488824 254622 255062 667 665 0 True 270 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 315 364 0.00598387004712338 0.00597814059066182 0.00601205462729839 0.00602731364919509 0.00134601811832166 0.00132796738605365 261566 260532 667 665 0 True 314 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 358 364 0.00624990777671361 0.00623095849029761 0.00627145799954223 0.00624093995574884 0.00130133245909708 0.00141063970964902 273195 271550 667 665 0 True 359 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 402 364 0.00652493620436291 0.00652528551867194 0.00654612039368277 0.00650034332799268 0.0014595676727101 0.00134565965431855 285217 284377 667 665 0 True 403 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 447 363 0.00679920968790039 0.00668765069001182 0.00677500572213321 0.00671396963454643 0.00158166887418835 0.00174147706550397 297206 291453 667 665 0 True 448 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 491 362 0.00651724950067882 0.006749948801966 0.00650034332799268 0.00685130083161669 0.00173736508771284 0.00170280613586278 284881 294168 667 665 0 True 492 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 535 362 0.00682041675431453 0.0068870046482652 0.00674448767833982 0.00688181887541009 0.00159121466925546 0.00166543622815828 298133 300141 667 665 0 True 537 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 579 361 0.00693875996311755 0.00711187444463757 0.00685130083161669 0.00708018616006714 0.00184186649205507 0.00193834959477237 303306 309941 667 665 0 True 581 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 624 361 0.00680634734132133 0.00688287438669918 0.00685130083161669 0.0068207827878233 0.0019021458961668 0.00199683181281301 297518 299961 667 665 0 True 626 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 668 362 0.00618736180090317 0.00651562529578696 0.00614938582436866 0.00659189745937285 0.00186815959337479 0.00201766567403124 270461 283956 667 665 0 True 671 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 271 407 0.00597352960050073 0.00601246765345499 0.00593575951781491 0.00604257267109178 0.00146313169954618 0.00142350339012944 261114 262028 667 665 0 True 270 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 315 408 0.00604852071560924 0.00633432975893614 0.00605783169298848 0.00634775310902571 0.00135176591458996 0.00123974939830157 264392 276055 667 665 0 True 314 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 359 408 0.00642908117925473 0.00650619453187787 0.00646982528419928 0.00650034332799268 0.00132257556907219 0.00127320369474967 281027 283545 667 665 0 True 359 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 403 407 0.00660473150927397 0.00651305535525699 0.00663767452506294 0.00651560234988937 0.00146186937296281 0.00150012951644911 288705 283844 667 665 0 True 403 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 448 407 0.00676379594592724 0.00686582558479054 0.0068207827878233 0.00691233691920348 0.00149212715283538 0.00154683266429973 295658 299218 667 665 0 True 448 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 492 407 0.00730813352765137 0.00699675487643347 0.0072632944228275 0.00701915007248035 0.00193138192742085 0.00164930443041449 319452 304924 667 665 0 True 493 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 536 406 0.00687440669685757 0.00699198212973496 0.00698863202868696 0.00698863202868696 0.00159167080626393 0.00147689770025469 300493 304716 667 665 0 True 537 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 581 407 0.00660676757066649 0.00677401904853688 0.00663767452506294 0.0068207827878233 0.00169135831755667 0.00194976916083622 288794 295217 667 665 0 True 582 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 624 405 0.00659228636997592 0.00625583184328411 0.00653086137178607 0.00634775310902571 0.00186639106265793 0.00192333262356316 288161 272634 667 665 0 True 626 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 668 406 0.00590423488187241 0.00597761283501728 0.00592050049591821 0.00588998245212482 0.00171458308157 0.00181179125847386 258085 260509 667 665 0 True 671 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 271 451 0.00606773747481947 0.00609181456731781 0.00608834973678187 0.00605783169298848 0.00147312289938167 0.00153220511226803 265232 265486 667 665 0 True 270 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 315 453 0.00606979641330628 0.00625213755377228 0.00605783169298848 0.00619516289005875 0.00146766169769066 0.00152263324468137 265322 272473 667 665 0 True 315 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 360 453 0.00620273520827135 0.00649710795643262 0.00617990386816205 0.00651560234988937 0.0014727767481277 0.00136729500861335 271133 283149 667 665 0 True 359 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 404 452 0.00664481217848389 0.00668553966743363 0.00656137941557946 0.00666819256885634 0.00155225349838729 0.00157004094963387 290457 291361 667 665 0 True 404 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 448 452 0.00685285647402895 0.0069068528496797 0.0068055237659266 0.0068207827878233 0.00189271204914104 0.00192281805068627 299551 301006 667 665 0 True 448 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 492 451 0.00681552105613478 0.00688975815597589 0.0068055237659266 0.00691233691920348 0.00178504506564813 0.00190161391970481 297919 300261 667 665 0 True 493 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 536 451 0.0065153278247578 0.00671612654891979 0.00648508430609598 0.00666819256885634 0.00174303857392357 0.00171917218587585 284797 292694 667 665 0 True 537 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 581 450 0.00603957577173876 0.00605691385708492 0.00613412680247196 0.00604257267109178 0.00186478473432918 0.00186224958808737 264001 263965 667 665 0 True 582 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 626 451 0.00585385952022844 0.00607192047410814 0.00584420538643473 0.00611886778057527 0.00174432036743166 0.00184523423365483 255883 264619 667 665 0 True 626 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 669 451 0.00582691030314552 0.00606645935048195 0.00587472343022812 0.0059510185397116 0.00179552992781653 0.00197139510330119 254705 264381 667 665 0 True 671 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 272 497 0.006294632496066 0.00617894014046331 0.00625619897764553 0.00621042191195544 0.00146636503782728 0.00144971291093862 275150 269283 667 665 0 True 270 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 317 497 0.00626340526234937 0.0062117757199132 0.00634775310902571 0.00616464484626535 0.00152939452662592 0.00153823371126991 273785 270714 667 665 0 True 315 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 360 496 0.00630643707672371 0.00645626425872417 0.00631723506523232 0.00645456626230259 0.00149711176812037 0.00150367038514137 275666 281369 667 665 0 True 359 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 405 497 0.00648716612167709 0.00661697732543765 0.00653086137178607 0.00659189745937285 0.00160179020779284 0.00157126500897563 283566 288373 667 665 0 True 404 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 449 496 0.00685891890401789 0.00692972990957595 0.00689707789730678 0.00695811398489357 0.0017597192304243 0.00194984869117628 299816 302003 667 665 0 True 448 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 493 494 0.00661893818483297 0.0064451354983935 0.00660715648126955 0.00643930724040589 0.00173047766509531 0.00173255132784964 289326 280884 667 665 0 True 493 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 537 494 0.00654275746082097 0.00632189308244289 0.00648508430609598 0.00631723506523232 0.00181302348222098 0.00154293361851875 285996 275513 667 665 0 True 537 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 582 495 0.0061412873329872 0.00617001418630118 0.00622568093385214 0.00611886778057527 0.00181437534255231 0.00178060730273466 268447 268894 667 665 0 True 582 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 627 494 0.00598135356675061 0.00588222673873973 0.00602731364919509 0.0059510185397116 0.00175354384698578 0.00174401208337902 261456 256352 667 665 0 True 626 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 670 495 0.00617580886828273 0.0060776340026078 0.00622568093385214 0.00621042191195544 0.00182710636655843 0.00193734627037437 269956 264868 667 665 0 True 671 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 273 540 0.00625418579334732 0.00626982884081341 0.00627145799954223 0.00627145799954223 0.00151694334452565 0.00141656946439608 273382 273244 667 665 0 True 270 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 317 541 0.00636660383472718 0.00645401556076045 0.0063935301747158 0.00650034332799268 0.00133486649615342 0.00142928408094754 278296 281271 667 665 0 True 315 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 362 542 0.00648126383134823 0.00661241109181744 0.00646982528419928 0.00660715648126955 0.00145333801059758 0.00138139397304997 283308 288174 667 665 0 True 359 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 406 541 0.00642951584404639 0.00641803639334087 0.00645456626230259 0.00646982528419928 0.00167247882814271 0.00154167318081152 281046 279703 667 665 0 True 404 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 451 541 0.00632638590295148 0.00626852092465084 0.00634775310902571 0.00622568093385214 0.00182955209369703 0.00186820821228903 276538 273187 667 665 0 True 448 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 494 538 0.00622634436958678 0.00642553970185248 0.00628671702143893 0.00646982528419928 0.00173276195117556 0.00184114416601855 272165 280030 667 665 0 True 493 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 538 539 0.00627905319484913 0.00629786872766719 0.00622568093385214 0.00628671702143893 0.00173894791781582 0.00180816123129163 274469 274466 667 665 0 True 537 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 582 538 0.00614668632724151 0.00626007683433808 0.00619516289005875 0.00624093995574884 0.00164933595585817 0.00155217350378442 268683 272819 667 665 0 True 582 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 628 539 0.00626173523446562 0.00631523877214207 0.00621042191195544 0.00633249408712902 0.00168091149850983 0.00178433653274642 273712 275223 667 665 0 True 627 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 672 539 0.00635624051101023 0.00627428034494568 0.00648508430609598 0.00625619897764553 0.00177643002931706 0.00182874813918635 277843 273438 667 665 0 True 671 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 275 584 0.00648567911054772 0.00644265734145389 0.00646982528419928 0.00645456626230259 0.00131575828846439 0.00138016791164668 283501 280776 667 665 0 True 270 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 318 583 0.00650864771322281 0.0065644312199588 0.00656137941557946 0.00654612039368277 0.00145837146339031 0.00140961572216781 284505 286083 667 665 0 True 315 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 362 584 0.00644321922353083 0.00641060192252203 0.00643930724040589 0.00645456626230259 0.00132915873258464 0.0012787420434822 281645 279379 667 665 0 True 359 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 407 583 0.00625711406141745 0.00626916340978333 0.00633249408712902 0.00630197604333562 0.00156317781167107 0.00145937448306109 273510 273215 667 665 0 True 404 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 450 582 0.00617578599118843 0.00626390879923544 0.00621042191195544 0.00627145799954223 0.00196902435548693 0.00190321348848273 269955 272986 667 665 0 True 449 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 495 581 0.00617601476213141 0.0063517456952062 0.00617990386816205 0.00625619897764553 0.00195258910897635 0.00200845097185082 269965 276814 667 665 0 True 493 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 539 580 0.00641244953170016 0.00639146504393279 0.0064087891966125 0.0064087891966125 0.00188604095396458 0.00180530443373969 280300 278545 667 665 0 True 538 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 582 580 0.00650171595365055 0.00649671787617361 0.00654612039368277 0.00653086137178607 0.00153955190805818 0.00165000090515943 284202 283132 667 665 0 True 582 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 627 580 0.00626255880986035 0.00654958522421871 0.00631723506523232 0.00650034332799268 0.00164376151506656 0.00178895882286825 273748 285436 667 665 0 True 627 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 671 580 0.00640606682239105 0.00662342512266016 0.00642404821850919 0.00660715648126955 0.00155385496184503 0.00156589695557433 280021 288654 667 665 0 True 671 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 271 622 0.00652937436065671 0.00656924985845249 0.00657663843747616 0.00659189745937285 0.0013800822382998 0.00134801077514944 285411 286293 667 665 0 False 271 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 315 622 0.00640377911296126 0.00647787929425303 0.00645456626230259 0.00651560234988937 0.00134902428207255 0.00130291253444873 279921 282311 667 665 0 False 315 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 362 626 0.00624553825170271 0.00625206871607951 0.00619516289005875 0.00622568093385214 0.00132371991764056 0.00138109956200232 273004 272470 667 665 0 True 360 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 406 625 0.00605279873224294 0.00595349669665122 0.00605783169298848 0.005981536583505 0.00138436081012452 0.00130523293204397 264579 259458 667 665 0 True 404 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 449 622 0.00607629350808688 0.00591416742818364 0.00610360875867857 0.00588998245212482 0.00176661822455752 0.00178880485805884 265606 257744 667 665 0 False 449 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 493 622 0.00611447537847007 0.00620408884422088 0.00619516289005875 0.00625619897764553 0.00187621900034143 0.00185003967405608 267275 270379 667 665 0 False 493 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 538 622 0.00628172981488198 0.00637856944948776 0.00630197604333562 0.00642404821850919 0.00190062947890664 0.00192660092356747 274586 277983 667 665 0 False 538 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 582 621 0.00648872176408934 0.00647686967475911 0.00656137941557946 0.00657663843747616 0.00148071439815514 0.00151605776666504 283634 282267 667 665 0 False 582 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 627 621 0.00656323246021759 0.00664813785436354 0.00651560234988937 0.00660715648126955 0.00140743265739978 0.00165430624352563 286891 289731 667 665 0 False 627 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 671 621 0.0068751845180637 0.00661314536054028 0.00679026474402991 0.00660715648126955 0.00168577087626924 0.00147683068027537 300527 288206 667 665 0 False 671 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 269 672 0.00795990194419842 0.718611842033557 0.00779736018921187 0.737727931639582 0.00192613715452985 0.213281293271165 347942 31317661 667 665 12 True 271 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 315 666 0.00630362319412507 0.00625211460787469 0.00628671702143893 0.00628671702143893 0.00136692102862421 0.00127564050067587 275543 272472 667 665 0 False 315 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 360 665 0.00584301577753124 0.00579849715843741 0.00584420538643473 0.00584420538643473 0.00128943461917031 0.00113607753217514 255409 252703 667 665 0 False 360 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 404 665 0.00588227287134643 0.00576951648978248 0.00590524147402152 0.00581368734264134 0.00132881064083832 0.00135611271588325 257125 251440 667 665 0 False 404 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 449 665 0.00606531250282389 0.0058505384541693 0.00613412680247196 0.00584420538643473 0.00158595719409652 0.00156492336970569 265126 254971 667 665 0 False 449 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 493 665 0.00612442691448965 0.00613961087199574 0.00613412680247196 0.00611886778057527 0.00168615232418697 0.0015355964521409 267710 267569 667 665 0 False 493 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 538 665 0.00625022805603378 0.00620009625804039 0.00617990386816205 0.00619516289005875 0.00172420487767364 0.00169059440814469 273209 270205 667 665 0 False 538 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 582 665 0.0065153049476635 0.0065512602747427 0.00660715648126955 0.00656137941557946 0.00148040949746047 0.00124984947373764 284796 285509 667 665 0 False 582 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 627 665 0.00750714137094877 0.00685201215444195 0.00715648126955062 0.00679026474402991 0.00243677244716005 0.00142636576329876 328151 298616 667 665 0 False 627 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 666 670 0.00815019361456832 0.732497414284165 0.0080872816052491 0.723552300297551 0.0016142726154319 0.192918081427216 356260 31922805 667 665 14 True 671 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C3_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C3_3.csv new file mode 100755 index 0000000..f7aafb4 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C3_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 271 275 0.00101254019362486 0.0739813828459912 0.00080872816052491 0.0739604791332876 0.000793003778075275 0.0246971256915442 44260 3224166 667 665 0 True 270 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 314 275 0.00091853821315481 0.00101448402420563 0.000778210116731518 0.000930800335698482 0.00069396980141431 0.000664149203137016 40151 44212 667 665 0 False 314 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 358 275 0.000912818939580336 0.000870498516834545 0.000823987182421607 0.000732433051041428 0.000656028539789387 0.000648309232365403 39901 37937 667 665 0 True 359 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 403 275 0.000896072906554276 0.000935068272650039 0.000762951094834821 0.00080872816052491 0.000705738803167483 0.000672065184666862 39169 40751 667 665 0 True 403 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 447 275 0.00091798916289166 0.00098782089120719 0.000701915007248035 0.000732433051041428 0.000836378931577672 0.000919893547849267 40127 43050 667 665 0 True 448 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 490 274 0.000845628913627416 0.000946105249390356 0.000610360875867857 0.00064087891966125 0.000831598548246964 0.000924487046194561 36964 41232 667 665 0 True 492 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 535 273 0.000948164050270585 0.000934471679312725 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.000791970441717008 0.000856301212135758 41446 40725 667 665 0 True 537 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 580 273 0.000924737905709539 0.00103121158354802 0.000701915007248035 0.000656137941557946 0.000867361788156744 0.0010407580394106 40422 44941 667 665 0 True 581 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 626 274 0.00139852252861896 0.00101882079884995 0.000747692072938125 0.00064087891966125 0.00234901700641165 0.0010350776248925 61132 44401 667 665 0 False 626 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 664 273 0.00108336767757115 0.0761461217704366 0.000762951094834821 0.0746471351186389 0.00101261019015195 0.0234883359377846 47356 3318507 667 665 0 True 670 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 270 319 0.00092810083857133 0.000917835903560687 0.000762951094834821 0.000762951094834821 0.000755976272390222 0.000743787622992533 40569 40000 667 665 0 False 270 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 314 319 0.0008153625178713 0.000905605740145741 0.000701915007248035 0.00080872816052491 0.0006176539632773 0.000631781052006697 35641 39467 667 665 0 False 314 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 358 319 0.000868300114076631 0.00092781736901191 0.000762951094834821 0.000823987182421607 0.000645759806073594 0.000689865901957573 37955 40435 667 665 0 True 359 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 402 320 0.000908632431323821 0.000868571061437067 0.000717174029144732 0.000686655985351339 0.000746239662103219 0.000717147893250766 39718 37853 667 665 0 True 403 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 446 319 0.0010001408085154 0.000931098632367139 0.000747692072938125 0.000656137941557946 0.00089116564466389 0.000878481417977256 43718 40578 667 665 0 True 448 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 490 318 0.000936771257310232 0.000947436111450519 0.000717174029144732 0.000717174029144732 0.000882518009279853 0.000861904909754914 40948 41290 667 665 0 True 492 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 534 318 0.000949490921739862 0.000958220683317357 0.000747692072938125 0.000823987182421607 0.000835921038032533 0.000805292093250466 41504 41760 667 665 0 True 537 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 579 318 0.000908723939701012 0.000953402044823664 0.000595101853971161 0.00064087891966125 0.000941038322517571 0.000953050532261931 39722 41550 667 665 0 True 581 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 626 318 0.000989388574195393 0.000933898031872999 0.000549324788281071 0.000564583810177768 0.0010365316180925 0.000999261212036006 43248 40700 667 665 0 False 626 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 670 318 0.00100920013785737 0.000963635915148365 0.00064087891966125 0.000549324788281071 0.00103245015208747 0.00104606795794173 44114 41996 667 665 0 False 670 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 270 364 0.000817947629526962 0.000830825059903134 0.000625619897764553 0.000701915007248035 0.000708888099064734 0.000709004519145044 35754 36208 667 665 0 True 270 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 315 364 0.000949468044645565 0.000910837404796037 0.00080872816052491 0.000793469138628214 0.00071015258298848 0.000701341575641601 41503 39695 667 665 0 True 314 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 358 364 0.000891772012826272 0.000943374687577263 0.000793469138628214 0.000823987182421607 0.000665246184163925 0.000681262252642376 38981 41113 667 665 0 True 359 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 402 364 0.00094125516779262 0.000921392517686985 0.000778210116731518 0.000747692072938125 0.000720982658750606 0.000700915455151191 41144 40155 667 665 0 True 403 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 447 363 0.000913253604371996 0.000892526578520001 0.000625619897764553 0.000595101853971161 0.000836119529938527 0.000911133927992642 39920 38897 667 665 0 True 448 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 491 362 0.000935764665161125 0.000927243721572184 0.000656137941557946 0.00064087891966125 0.000864712886660862 0.000874969442412687 40904 40410 667 665 0 True 492 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 535 362 0.00091190385580842 0.000925063861301227 0.000701915007248035 0.000656137941557946 0.000823922593923926 0.000873374761730098 39861 40315 667 665 0 True 537 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 579 361 0.0010381854163328 0.000967169583377074 0.000732433051041428 0.000549324788281071 0.00102044758384477 0.00107924755899024 45381 42150 667 665 0 True 581 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 624 361 0.000988816646837945 0.000927197829777006 0.000595101853971161 0.000518806744487678 0.00105239544472698 0.00101534856233651 43223 40408 667 665 0 True 626 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 668 362 0.000915930224404849 0.00094975364710701 0.000564583810177768 0.000534065766384375 0.000953792416861118 0.00100659538225569 40037 41391 667 665 0 True 671 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 271 407 0.000910142319547482 0.000874215752243965 0.000747692072938125 0.000717174029144732 0.000807739848397315 0.000739230164209273 39784 38099 667 665 0 True 270 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 315 408 0.000952808100413057 0.000915977285855977 0.000823987182421607 0.00080872816052491 0.000764329915976391 0.000685191356481215 41649 39919 667 665 0 True 314 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 359 408 0.000958024077912978 0.00099456698509836 0.000793469138628214 0.000854505226215 0.000745531012287588 0.000744394806977843 41877 43344 667 665 0 True 359 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 403 407 0.000869924387771781 0.000931144524162317 0.000686655985351339 0.000717174029144732 0.000767674986336329 0.000820091333023004 38026 40580 667 665 0 True 403 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 448 407 0.000894380001576232 0.00107932913079219 0.000625619897764553 0.000839246204318303 0.000840324313228795 0.000900862925367494 39095 47038 667 665 0 True 448 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 492 407 0.00105321566728652 0.000942181500902634 0.000762951094834821 0.000701915007248035 0.00095972467881481 0.00086894808843005 46038 41061 667 665 0 True 493 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 536 406 0.000933980251805889 0.00102375416683159 0.000701915007248035 0.000762951094834821 0.000857286808922442 0.000923388340363971 40826 44616 667 665 0 True 537 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 581 407 0.00100773600382231 0.000925889913614432 0.000656137941557946 0.000473029678797589 0.00100634070779554 0.00103065223198381 44050 40351 667 665 0 True 582 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 624 405 0.000955965139426167 0.00100626939286876 0.000579842832074464 0.000534065766384375 0.000998900161001748 0.00106975258600978 41787 43854 667 665 0 True 626 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 668 406 0.000876490113835277 0.000936697431378859 0.000549324788281071 0.000503547722590982 0.000886261791834586 0.00101591458640356 38313 40822 667 665 0 True 671 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 271 451 0.000868460253736716 0.000945761060926521 0.000686655985351339 0.000778210116731518 0.000778639981727846 0.000816419107523872 37962 41217 667 665 0 True 270 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 315 453 0.000845308634307246 0.000932681899300781 0.000701915007248035 0.000762951094834821 0.000747539554736571 0.000797870023457617 36950 40647 667 665 0 True 315 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 360 453 0.000925286955972689 0.000905422172965029 0.000793469138628214 0.000762951094834821 0.000724609220577787 0.000744324448018078 40446 39459 667 665 0 True 359 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 404 452 0.000967906982649669 0.000908405139651601 0.000762951094834821 0.000701915007248035 0.000874114994065536 0.000830956537832953 42309 39589 667 665 0 True 404 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 448 452 0.000885755337025925 0.000874605832502979 0.00064087891966125 0.000442511635004196 0.000886084538084444 0.000980192585565666 38718 38116 667 665 0 True 448 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 492 451 0.000913985671389528 0.000924880294120515 0.000610360875867857 0.000503547722590982 0.000931435065058275 0.00103387194462297 39952 40307 667 665 0 True 493 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 536 451 0.000857616511039514 0.000826809527825056 0.000579842832074464 0.000518806744487678 0.000846847586250699 0.00087519338146908 37488 36033 667 665 0 True 537 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 581 450 0.000978842233724063 0.000900397021393034 0.000625619897764553 0.000457770656900893 0.00103032039529605 0.00101837227011849 42787 39240 667 665 0 True 582 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 626 451 0.000881179918166346 0.000895807841875231 0.000457770656900893 0.000488288700694286 0.000942958059869864 0.000958287076312628 38518 39040 667 665 0 True 626 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 669 451 0.00098778717759454 0.000895303032128272 0.000579842832074464 0.000457770656900893 0.0009907896891067 0.000979550855882094 43178 39018 667 665 0 True 671 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 272 497 0.000879555644471195 0.000943558254757975 0.000701915007248035 0.00080872816052491 0.000790840818319019 0.000785235870484848 38447 41121 667 665 0 True 270 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 317 497 0.000905292375556328 0.000995324199718798 0.000762951094834821 0.000900282291905089 0.000778679201258337 0.000821838356347645 39572 43377 667 665 0 True 315 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 360 496 0.000976188490785507 0.00103717751692117 0.000854505226215 0.000900282291905089 0.00078230188801437 0.000858433560373918 42671 45201 667 665 0 True 359 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 405 497 0.00101457625501738 0.000915105341747594 0.000793469138628214 0.000701915007248035 0.000902256801942671 0.000818584933051895 44349 39881 667 665 0 True 404 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 449 496 0.00099659485889923 0.000915678989187319 0.000656137941557946 0.000549324788281071 0.00103761300728319 0.000976598186182515 43563 39906 667 665 0 True 448 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 493 494 0.000926522319064775 0.000947550840938464 0.000610360875867857 0.000610360875867857 0.000895082233505287 0.000942585678835162 40500 41295 667 665 0 True 493 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 537 494 0.000945075642540369 0.000875431884816183 0.000671396963454643 0.000625619897764553 0.000897365045306841 0.00083923499353346 41311 38152 667 665 0 True 537 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 582 495 0.000915747207650466 0.000906225279380644 0.000595101853971161 0.000473029678797589 0.000913619695165151 0.000964487906262077 40029 39494 667 665 0 True 582 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 627 494 0.000852697935765466 0.000925545725150597 0.0004272526131075 0.000534065766384375 0.000969637001269044 0.000970704620634827 37273 40336 667 665 0 True 626 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 670 495 0.000881820476806687 0.000898905538049748 0.000488288700694286 0.000442511635004196 0.000965206452308644 0.00102733079173211 38546 39175 667 665 0 True 671 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 273 540 0.000918629721532001 0.000926279993873445 0.000762951094834821 0.000747692072938125 0.000791003749929495 0.000776747322348023 40155 40368 667 665 0 True 270 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 317 541 0.00101924318225415 0.00102698953839164 0.000869764248111696 0.000915541313801785 0.00081317551297888 0.000791630595585744 44553 44757 667 665 0 True 315 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 362 542 0.000921169078999068 0.000943695930143509 0.000747692072938125 0.000793469138628214 0.000757083265922466 0.000777279136697051 40266 41127 667 665 0 True 359 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 406 541 0.000989365697101095 0.00102015166091011 0.000793469138628214 0.00080872816052491 0.00085218178116965 0.000860625869561461 43247 44459 667 665 0 True 404 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 451 541 0.000904445923067306 0.000944705549637426 0.000473029678797589 0.000488288700694286 0.000990251241356201 0.00107238636765843 39535 41171 667 665 0 True 448 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 494 538 0.000869649862640207 0.000952713667895993 0.000473029678797589 0.000564583810177768 0.00096656831086802 0.0010479760656911 38014 41520 667 665 0 True 493 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 538 539 0.000931601033998908 0.000951199238655118 0.000579842832074464 0.000579842832074464 0.000968484547934789 0.00102196526265622 40722 41454 667 665 0 True 537 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 582 538 0.00101048125513805 0.000854826468781246 0.000717174029144732 0.000625619897764553 0.000911690465966428 0.000801611480363787 44170 37254 667 665 0 True 582 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 628 539 0.000905063604613349 0.000918593118181125 0.000534065766384375 0.000503547722590982 0.000974481811494183 0.00100169920159244 39562 40033 667 665 0 True 627 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 672 539 0.000924852291181029 0.000936536810095736 0.00064087891966125 0.000595101853971161 0.000926713550143781 0.000947615071438502 40427 40815 667 665 0 True 671 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 275 584 0.00088559519736584 0.0010015884297606 0.000747692072938125 0.000869764248111696 0.00069891919030849 0.000716157436007828 38711 43650 667 665 0 True 270 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 318 583 0.000980672401267894 0.000996058468441647 0.000823987182421607 0.000869764248111696 0.000752489268408514 0.000781229090022732 42867 43409 667 665 0 True 315 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 362 584 0.000896164414931468 0.000931465766728563 0.000701915007248035 0.000778210116731518 0.000750452403819813 0.000715853359427172 39173 40594 667 665 0 True 359 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 407 583 0.000894036845161763 0.00101028492494684 0.000686655985351339 0.00080872816052491 0.000803253717178114 0.000837761949750021 39080 44029 667 665 0 True 404 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 450 582 0.00100446457933771 0.000895991409055943 0.000610360875867857 0.000457770656900893 0.00105193117381057 0.00100130484771043 43907 39048 667 665 0 True 449 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 495 581 0.000905315252650626 0.000930066066975633 0.000518806744487678 0.000473029678797589 0.00101520795832723 0.00112037807202772 39573 40533 667 665 0 True 493 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 539 580 0.00088689919174082 0.000913315561735651 0.000473029678797589 0.000503547722590982 0.000990120021712858 0.000967422612771058 38768 39803 667 665 0 True 538 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 582 580 0.000945830586652199 0.000841999712028985 0.00064087891966125 0.000503547722590982 0.000906745494627236 0.000865257054986877 41344 36695 667 665 0 True 582 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 627 580 0.000956994608669572 0.000944453144763947 0.000717174029144732 0.000717174029144732 0.000815066274011005 0.000811951400873214 41832 41160 667 665 0 True 627 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 671 580 0.000890490895545589 0.00100057881026668 0.000579842832074464 0.000671396963454643 0.000861516350247282 0.000929298935708569 38925 43606 667 665 0 True 671 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 271 622 0.000957269133801147 0.000941125989613539 0.000778210116731518 0.000747692072938125 0.000750964978376158 0.000757139594065521 41844 41015 667 665 0 False 271 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 315 622 0.000884451342650945 0.000931190415957495 0.000762951094834821 0.000793469138628214 0.000677432798772635 0.00070990768975608 38661 40582 667 665 0 False 315 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 362 626 0.00089776581153232 0.000875936694563142 0.000717174029144732 0.000717174029144732 0.00073194528697193 0.000708444714381658 39243 38174 667 665 0 True 360 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 406 625 0.000908335029097948 0.00089466054699578 0.000732433051041428 0.000762951094834821 0.000758240396447289 0.000662550596678386 39705 38990 667 665 0 True 404 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 449 622 0.000800309389823285 0.000964897939515761 0.000396734569314107 0.000610360875867857 0.000902791005000496 0.000993093486279142 34983 42051 667 665 0 False 449 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 493 622 0.000891017068714441 0.00092173670615082 0.000457770656900893 0.000442511635004196 0.000980116773744644 0.00102868256978419 38948 40170 667 665 0 False 493 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 538 622 0.000949696815588544 0.000950304348649146 0.000534065766384375 0.000488288700694286 0.00100052337016196 0.00106492108971701 41513 41415 667 665 0 False 538 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 582 621 0.00103370150585042 0.000832477164529543 0.000747692072938125 0.000549324788281071 0.00090005429868878 0.000812984708638772 45185 36280 667 665 0 False 582 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 627 621 0.000982822848131896 0.000876877476364291 0.000778210116731518 0.000701915007248035 0.000765102457630259 0.00069640469169223 42961 38215 667 665 0 False 627 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 671 621 0.000920025224284173 0.00101657210088623 0.000747692072938125 0.00080872816052491 0.000779734974632081 0.000782381279073207 40216 44303 667 665 0 False 671 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 269 672 0.000999729020818042 0.0738006150647849 0.000869764248111696 0.072983901731899 0.000742319425265236 0.0252866824476898 43700 3216288 667 665 0 True 271 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 315 666 0.000985568099447644 0.000929653040819031 0.000869764248111696 0.00080872816052491 0.000763250598393277 0.000690466982784734 43081 40515 667 665 0 False 315 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 360 665 0.00100277167435966 0.000917422877404085 0.000854505226215 0.00080872816052491 0.000706206621870775 0.000638551116439021 43833 39982 667 665 0 False 360 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 404 665 0.000958412988516042 0.000831674058113928 0.000778210116731518 0.000656137941557946 0.000728453257828998 0.000646320828826653 41894 36245 667 665 0 False 404 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 449 665 0.00100739284740784 0.000856478573407655 0.000823987182421607 0.000656137941557946 0.000832242743704721 0.000788956456409993 44035 37326 667 665 0 False 449 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 493 665 0.000857959667453982 0.000917858849458276 0.000564583810177768 0.000656137941557946 0.000833640441687078 0.000846015615647553 37503 40001 667 665 0 False 493 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 538 665 0.000811953830820914 0.000797484670706292 0.000442511635004196 0.000457770656900893 0.000847901563074992 0.000846673663360685 35492 34755 667 665 0 False 538 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 582 665 0.000948781731816628 0.00084119660561337 0.00080872816052491 0.000732433051041428 0.000741275944555192 0.000627884960703925 41473 36660 667 665 0 False 582 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 627 665 0.000923845699031922 0.000980822392442539 0.000747692072938125 0.000823987182421607 0.000738066661354996 0.000752779183717782 40383 42745 667 665 0 False 627 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 666 670 0.00101949483029142 0.075465064584097 0.000885023270008392 0.0737315938048371 0.000752356722339925 0.0228712270937015 44564 3288826 667 665 0 True 671 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C4_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C4_1.csv new file mode 100755 index 0000000..3df7af7 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C4_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 244 244 0.0101170060426413 0.0417676831125651 0.0101777676050965 0.0420233463035019 0.00162985456654281 0.0082310321269316 442233 1820268 667 665 0 True 244 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 289 244 0.010045949787752 0.0103180129311606 0.0100556954299229 0.0103456168459602 0.00147671001148189 0.00143764344681832 439127 449667 667 665 0 False 289 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 332 244 0.0111515082467921 0.0633975187453642 0.0105592431525139 0.0625162127107652 0.00659917844108358 0.00770243098895797 487453 2762913 667 665 0 True 333 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 377 244 0.0131205855072006 0.0905975169096924 0.0108339055466545 0.087861448081178 0.0177494474724463 0.0155378798009242 573525 3948310 667 665 0 True 378 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 421 244 0.0102385977988346 0.0763522677143764 0.01025406271458 0.0733043411917296 0.00155615026914739 0.0130993486636777 447548 3327491 667 665 0 True 423 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 465 242 0.0100483747597476 0.068514958717462 0.0100404364080262 0.0707255664911879 0.00153399801818421 0.0189813976316023 439233 2985935 667 665 0 True 467 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 509 242 0.0100514631674778 0.0826268004641955 0.0100404364080262 0.0819104295414664 0.00167769689670754 0.0220718470036149 439368 3600940 667 665 0 True 512 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 554 242 0.00992058331099957 0.0721794415083256 0.00997940032043946 0.0730144197756924 0.00159047137332443 0.0192735417518499 433647 3145636 667 665 0 True 557 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 601 243 0.0100004701242878 0.009537852413134 0.00985732814526589 0.00956740672922866 0.00255417237358304 0.0020178865999529 437139 415667 667 665 0 False 601 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 640 243 0.00974779261776756 0.0428895539374873 0.00973525597009232 0.0430151827267872 0.00186808383025523 0.00762889080732981 426094 1869160 667 665 0 True 646 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 244 288 0.00992065194228246 0.0120498086598965 0.00991836423285267 0.00993362325474937 0.00151466441614713 0.0142127962590489 433650 525140 667 665 0 False 244 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 289 288 0.00991317113244705 0.0100502572521943 0.00991836423285267 0.0101167315175097 0.00138200795073861 0.00142620631833485 433323 437998 667 665 0 False 289 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 333 288 0.0103466691922979 0.109971059486666 0.0103761348897536 0.106981002517739 0.00137994060345395 0.0264282241671451 452272 4792624 667 665 0 True 333 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 377 288 0.0102412515417732 0.0522479464855776 0.0102235446707866 0.0514076447699702 0.00144926037068556 0.00693876994160612 447664 2277006 667 665 0 True 378 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 421 287 0.0103454109521115 0.0908912014529342 0.0102693217364767 0.0881818875410086 0.00161414966978729 0.0205218999022552 452217 3961109 667 665 0 True 423 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 465 286 0.0101010149537271 0.0440635348958342 0.0101930266269932 0.0451972228580148 0.00175882281409003 0.00927791483385728 441534 1920323 667 665 0 True 467 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 509 287 0.00989491521119733 0.047224240505131 0.00988784618905928 0.0501258869306477 0.0015722014382475 0.00917861533294323 432525 2058069 667 665 0 True 512 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 554 287 0.00981704158220729 0.0570086695337566 0.00978103303578241 0.055542839703975 0.00170951404638495 0.0152658457124293 429121 2484482 667 665 0 True 557 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 601 287 0.00957870801381182 0.00974578813708568 0.00961318379491875 0.0097962920576791 0.00200607136519846 0.00199278633701309 418703 424729 667 665 0 False 601 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 646 286 0.00949401701072101 0.00954820101294665 0.00956740672922866 0.00961318379491875 0.00182156971986872 0.00202753125557172 415001 416118 667 665 0 False 646 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 244 332 0.00995059805871841 0.0501926136008366 0.00994888227664607 0.0506446936751354 0.00154196867095278 0.0106304296883683 434959 2187433 667 665 0 True 244 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 288 332 0.0101376183046037 0.0618619563328096 0.0101319905394064 0.064286259250782 0.00133562612941039 0.0173499028449175 443134 2695992 667 665 0 True 289 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 332 332 0.00997825646572456 0.0395141665103477 0.0100709544518196 0.0403143358510719 0.00132730259696542 0.00721091612624768 436168 1722058 667 665 0 True 334 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 377 333 0.0101523282762373 0.0372070023995672 0.010101472495613 0.037094682230869 0.00134623954239783 0.0066479659418049 443777 1621510 667 665 0 True 378 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 421 333 0.010174427549329 0.0768013189301934 0.0102082856488899 0.07690547035935 0.00157142481504222 0.011202203511924 444743 3347061 667 665 0 True 423 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 464 330 0.0102620239433957 0.0318056987283957 0.0103150988021668 0.0336614023041123 0.00166687142402333 0.00589795395769989 448572 1386117 667 665 0 True 468 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 509 330 0.0101596489464126 0.0283170044589615 0.0100709544518196 0.0288700694285496 0.00161482110434824 0.00324838150122047 444097 1234077 667 665 0 True 512 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 554 330 0.0102427614299968 0.0549974845559768 0.0102388036926833 0.0543221179522393 0.00201348973520703 0.0107835232753886 447730 2396833 667 665 0 True 557 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 599 332 0.00994009747243567 0.0654166888955049 0.00994888227664607 0.0603799496452277 0.00211910257602387 0.0201728030210367 434500 2850910 667 665 0 True 602 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 641 330 0.00976492756139669 0.0661401730464867 0.00985732814526589 0.0664682993820096 0.00196735232037431 0.0185813372243257 426843 2882440 667 665 0 True 646 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 244 376 0.0100702223848021 0.0411699654262688 0.0100556954299229 0.0447394522011139 0.00154968410442091 0.0103828595939086 440188 1794219 667 665 0 True 244 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 289 376 0.0100723499545718 0.0320450703320443 0.010101472495613 0.0318455786984054 0.00149293772969338 0.00406194709443156 440281 1396549 667 665 0 True 289 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 333 376 0.010504955807745 0.0816591719628667 0.0102998397802701 0.0785534447241932 0.00228568845469085 0.0174022580455555 459191 3558770 667 665 0 True 334 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 377 377 0.0103763407836022 0.0705051481989478 0.0101930266269932 0.0691691462577249 0.00286070726801344 0.0188383774887707 453569 3072669 667 665 0 True 378 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 422 376 0.0103326684105876 0.0450840766370034 0.0103456168459602 0.0462806134126802 0.00161264018118928 0.00700550258826955 451660 1964799 667 665 0 True 423 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 466 375 0.0104597735465067 0.0572311759026773 0.0105134660868238 0.0588693064774548 0.00182295528196216 0.0108870884506988 457216 2494179 667 665 0 True 468 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 510 374 0.0101999812636598 0.0434826824442658 0.0101777676050965 0.0444800488288701 0.00176628354212578 0.00628269707579063 445860 1895009 667 665 0 True 512 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 555 375 0.0101548218795157 0.0551834151641406 0.0101930266269932 0.0544289311055161 0.00182857861324414 0.00753531604908043 443886 2404936 667 665 0 True 557 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 598 376 0.0100354720785636 0.0431116472802514 0.0100251773861295 0.0440222781719692 0.00222661115372405 0.00752711751805514 438669 1878839 667 665 0 True 602 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 642 375 0.00999831967742382 0.0912168496315176 0.00999465934233616 0.0903028915846494 0.0020526562223955 0.0177944848230653 437045 3975301 667 665 0 True 646 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 245 420 0.00998445615827929 0.0443568064129195 0.00996414129854276 0.0442206454566262 0.0015770434172214 0.0114576650882661 436439 1933104 667 665 0 True 245 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 289 420 0.0100476426927301 0.0572036867173656 0.00997940032043946 0.0567330434119173 0.00157429519929453 0.0104479953204248 439201 2492981 667 665 0 True 289 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 333 421 0.0100507997317432 0.0358181101644016 0.0100404364080262 0.0367589837491417 0.00137204441924984 0.0042149576529613 439339 1560981 667 665 0 True 334 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 378 421 0.0103951457551151 0.0556191807052536 0.0103303578240635 0.053177691309987 0.00137119951159474 0.0125033886427914 454391 2423927 667 665 0 True 379 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 422 421 0.0104890791043023 0.101155245632965 0.0105134660868238 0.0998855573357748 0.00173499113977603 0.0170405573094848 458497 4408424 667 665 0 True 423 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 466 419 0.0104784412554538 0.0621800323651885 0.0104982070649271 0.0612802319371328 0.00181940541506235 0.0159208988346018 458032 2709854 667 665 0 True 468 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 511 419 0.0103968615371875 0.0557815917683887 0.0103761348897536 0.0550545510032807 0.00179030516085687 0.00875016485993751 454466 2431005 667 665 0 True 513 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 554 418 0.0102619781892071 0.0339205303255851 0.0102235446707866 0.0343938353551537 0.00181834655332366 0.00501108401031653 448570 1478283 667 665 0 True 557 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 599 420 0.0100530645640787 0.0394574671974053 0.0100556954299229 0.0396734569314107 0.00210953780888088 0.004572175754095 439438 1719587 667 665 0 True 602 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 643 419 0.0099833123035644 0.0744473222424337 0.00996414129854276 0.0736400396734569 0.00214643168497344 0.0130213268181001 436389 3244472 667 665 0 True 647 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 246 465 0.00990573607680024 0.0669946323809065 0.00988784618905928 0.0667734798199435 0.00148472572420846 0.0195667326265801 432998 2919678 667 665 0 True 245 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 291 465 0.00994652593593338 0.0627256399180602 0.00997940032043946 0.0599374380102235 0.00158287868011867 0.011398237281543 434781 2733632 667 665 0 True 289 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 335 464 0.0103364431311467 0.0880889566557731 0.0103456168459602 0.0908064393072404 0.0015918130610146 0.0204683468832586 451825 3838985 667 665 0 True 334 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 379 464 0.0104434164240837 0.119953764016358 0.0104219119554437 0.116746776531624 0.00148178764540809 0.0315799414734351 456501 5227678 667 665 0 True 379 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 423 464 0.0107279617229609 0.10016474007174 0.010757610437171 0.0963454642557412 0.00191427203989686 0.0269279807199411 468939 4365257 667 665 0 True 423 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 467 463 0.0102592558149856 0.0470576762345323 0.0102388036926833 0.0483863584344244 0.00195913549007911 0.00747962879707964 448451 2050810 667 665 0 True 468 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 510 463 0.0103159223775615 0.0407645114158709 0.0101777676050965 0.0415960936903944 0.00185006959917366 0.00555337558675079 450928 1776549 667 665 0 True 513 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 555 463 0.0101251274111171 0.12123591193594 0.0100251773861295 0.122514686808576 0.0018531641970282 0.0209518460389866 442588 5283555 667 665 0 True 557 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 599 463 0.010094403473475 0.0648784240298618 0.0100709544518196 0.0665903715571832 0.00193267392534401 0.0167127165804724 441245 2827452 667 665 0 True 602 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 644 464 0.00992236772435481 0.0778471929423008 0.00993362325474937 0.0740520332646677 0.00191092935571164 0.0124371098383209 433725 3392641 667 665 0 True 647 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 248 509 0.0097485475618794 0.0559794312974012 0.00975051499198901 0.0584115358205539 0.00157411898200955 0.0113235791099854 426127 2439627 667 665 0 True 245 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 291 508 0.0100967140599991 0.10791377620063 0.0101777676050965 0.106157015335317 0.00159880551728453 0.0252071079636664 441346 4702966 667 665 0 True 290 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 335 509 0.0102539025749199 0.0583120883004031 0.0102082856488899 0.0597390707255665 0.00155760635431639 0.0112665863864222 448217 2541286 667 665 0 True 334 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 380 509 0.0105517394655842 0.0609459102092609 0.0104982070649271 0.0592355230029755 0.00161244524143664 0.00988762165995429 461236 2656070 667 665 0 True 379 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 424 509 0.010474849551649 0.0551587024324372 0.0104982070649271 0.0552834363317311 0.00200798702666364 0.00681141084928773 457875 2403859 667 665 0 True 424 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 468 507 0.0105214273156395 0.0649387258487257 0.0104829480430304 0.0639963378347448 0.00201621938215552 0.0122606610651605 459911 2830080 667 665 0 True 468 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 512 506 0.0104476715636231 0.0752699785627952 0.010452429999237 0.0755626764324407 0.00177343474126506 0.0143124592002875 456687 3280324 667 665 0 True 513 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 557 506 0.0102679491108188 0.0578526655388758 0.01025406271458 0.0579385061417563 0.00192888047424107 0.0116081009262885 448831 2521264 667 665 0 True 558 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 601 507 0.00987302183195424 0.0504946045590057 0.00988784618905928 0.0498207064927138 0.00190617269061949 0.00709323088138541 431568 2200594 667 665 0 True 602 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 645 505 0.0102093151181333 0.065829003729282 0.0101167315175097 0.0651560234988937 0.00223726592355211 0.0130036590735715 446268 2868879 667 665 0 True 647 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 249 551 0.00962867158775842 0.0448465407051619 0.00962844281681544 0.045639734493019 0.00142738599866592 0.00821067830405998 420887 1954447 667 665 0 True 245 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 292 550 0.00987951892673485 0.0542658087195558 0.00978103303578241 0.0546730754558633 0.00150872748177507 0.0114951012474231 431852 2364946 667 665 0 True 290 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 337 551 0.0100359982517325 0.045978186482457 0.00999465934233616 0.0463569085221637 0.00149575872004453 0.00718216539241395 438692 2003765 667 665 0 True 334 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 381 551 0.0102147598665762 0.0496573087559824 0.0101930266269932 0.048905165178912 0.00160062475411255 0.0060102913027447 446506 2164104 667 665 0 True 379 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 425 550 0.0104705029037324 0.0876699875116952 0.0104219119554437 0.0820935378042267 0.00193075644373694 0.0178940694349297 457685 3820726 667 665 0 True 424 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 469 549 0.0107644735654603 0.0649115120141852 0.0106355382619974 0.0641336690318151 0.00216748833654849 0.0115194831552624 470535 2828894 667 665 0 True 468 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 513 547 0.010091177803179 0.0568630548676567 0.0100099183642329 0.0559090562294957 0.00196422084681982 0.00929190790206928 441104 2478136 667 665 0 True 513 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 557 547 0.0101762119626843 0.0387661073030482 0.0100099183642329 0.0399481193255512 0.00202556242096602 0.00849820508294464 444821 1689457 667 665 0 True 558 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 602 549 0.00991335414920143 0.0477980256202419 0.00990310521095598 0.047196154726482 0.00180077328588793 0.00684925816682118 433331 2083075 667 665 0 True 602 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 645 548 0.00969776041253807 0.0534369111150502 0.00968947890440223 0.0523384451056687 0.00190578542443266 0.00720798208087342 423907 2328822 667 665 0 True 647 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 245 592 0.00938361215363936 0.00910695140230985 0.00944533455405508 0.00917067215991455 0.00136422801855038 0.00119033996568491 410175 396888 667 665 0 False 245 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 290 592 0.00947955868712474 0.00940022291939508 0.00944533455405508 0.0093842984664683 0.00139424719646113 0.00155894692566836 414369 409669 667 665 0 False 290 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 336 594 0.00977641186273423 0.0743285083847178 0.0098115510795758 0.0726939803158618 0.00140407652146775 0.0152825013908534 427345 3239294 667 665 0 True 335 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 379 593 0.0100751180829819 0.0760250362688594 0.0100709544518196 0.0733043411917296 0.00140819825600309 0.0195245350926733 440402 3313230 667 665 0 True 379 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 424 592 0.00990333398189896 0.00988052644772839 0.00988784618905928 0.00987258716716258 0.00188842949418301 0.00179829870679052 432893 430601 667 665 0 False 424 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 469 591 0.010131189841106 0.0100378664674963 0.0101930266269932 0.00999465934233616 0.00188800569981478 0.00187662314319856 442853 437458 667 665 0 False 469 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 513 591 0.00986645610589075 0.009801936748486 0.00991836423285267 0.00970473792629892 0.00210699827360474 0.00211094955335334 431281 427176 667 665 0 False 513 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 558 591 0.00965001591673836 0.00961309201132839 0.00968947890440223 0.00961318379491875 0.00188281028191707 0.00188966190690945 421820 418946 667 665 0 False 558 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 603 591 0.00959362387929404 0.0095269990035744 0.00955214770733196 0.00952162966353857 0.00161140339319379 0.00151624879421471 419355 415194 667 665 0 False 603 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 647 591 0.00957520781838424 0.00963651977276678 0.00961318379491875 0.00968947890440223 0.00161933510823403 0.00152639793306617 418550 419967 667 665 0 False 647 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 245 641 0.00922081875061554 0.0398030553609935 0.00926222629129473 0.0406195162890059 0.00132802040305275 0.00873898957037441 403059 1734648 667 665 0 True 245 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 290 636 0.00936922246132599 0.00942633535085138 0.009399557488365 0.00941481651026169 0.00136203145041336 0.00142585159119971 409546 410807 667 665 0 False 290 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 335 635 0.0093332367919954 0.00926286877642722 0.00929274433508812 0.00920119020370794 0.00137483842241233 0.00130083831318436 407973 403683 667 665 0 False 335 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 379 635 0.00952256762440478 0.00955868728814483 0.009399557488365 0.00955214770733196 0.00134713284718964 0.00129826288054187 416249 416575 667 665 0 False 379 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 424 635 0.00970807798206642 0.00974388362758579 0.00973525597009232 0.00975051499198901 0.00174251521004519 0.00152912674314123 424358 424646 667 665 0 False 424 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 469 635 0.00970322803807526 0.00981118394521437 0.00964370183871214 0.00984206912336919 0.00179397375414709 0.00171932196361522 424146 427579 667 665 0 False 469 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 513 635 0.00940980642661045 0.0095242684417613 0.00943007553215839 0.00952162966353857 0.001857651975051 0.00174369574440853 411320 415075 667 665 0 False 513 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 558 635 0.00949019653597326 0.00956309290048192 0.00952162966353857 0.00958266575112535 0.00174648883402443 0.00178750347041146 414834 416767 667 665 0 False 558 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 603 634 0.00925586645907991 0.00942711551136941 0.00929274433508812 0.0093842984664683 0.00150162289683998 0.001306564061826 404591 410841 667 665 0 False 603 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 644 640 0.00943911198440606 0.0414876054865936 0.00935378042267491 0.041870756084535 0.00148043405980498 0.00762560017129768 412601 1808062 667 665 0 True 647 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C4_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C4_2.csv new file mode 100755 index 0000000..e6cad59 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C4_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 244 244 0.00791922647053676 0.696481831725113 0.00779736018921187 0.674799725337606 0.00209977931598374 0.181863752210309 346164 30353218 667 665 7 True 244 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 289 244 0.00687923376375442 0.00692084984720901 0.00683604180972 0.0068207827878233 0.00146156162200925 0.00135066088382418 300704 301616 667 665 0 False 289 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 332 244 0.00707362043400364 0.00679836464587883 0.0068207827878233 0.0068055237659266 0.00303796918070439 0.00116640768974167 309201 296278 667 665 0 True 333 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 377 244 0.00793478289465933 0.00692080395541383 0.00683604180972 0.00698863202868696 0.00909313285012907 0.00120005296760361 346844 301614 667 665 0 True 378 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 421 244 0.00652699514284972 0.00649880595285421 0.00660715648126955 0.00660715648126955 0.00143281985497777 0.00146437127742395 285307 283223 667 665 0 True 423 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 465 242 0.00622023618540924 0.00642801785879209 0.00624093995574884 0.00650034332799268 0.00156074484545585 0.00141567623243806 271898 280138 667 665 0 True 467 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 509 242 0.00641192335853131 0.00680515663156518 0.00648508430609598 0.00675974670023652 0.00160186476901896 0.00174078942100815 280277 296574 667 665 0 True 512 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 554 242 0.00685681421134249 0.00680332095975806 0.00686655985351339 0.00679026474402991 0.00154380328098294 0.00135558145593648 299724 296494 667 665 0 True 557 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 601 243 0.00900646037704425 0.00732059032910727 0.00779736018921187 0.00721751735713741 0.00720880608632865 0.00193777689640088 393689 319037 667 665 0 False 601 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 640 243 0.00892481202749507 0.738711668161018 0.00891126878767071 0.726878767071031 0.00195338897214534 0.166623966011689 390120 32193627 667 665 11 True 646 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 244 288 0.00649286251815726 0.00790192464452502 0.00642404821850919 0.00650034332799268 0.00157004988222764 0.00908314794855123 283815 344372 667 665 0 False 244 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 289 288 0.00619527727553024 0.00617065667143368 0.00614938582436866 0.00619516289005875 0.00129289755146631 0.00126798387000512 270807 268922 667 665 0 False 289 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 333 288 0.00624869529071582 0.00642687056391264 0.00619516289005875 0.00650034332799268 0.00130161557735304 0.00135841942135207 273142 280088 667 665 0 True 333 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 377 288 0.00642535221288417 0.00646379051313337 0.0064087891966125 0.00643930724040589 0.00124722177995212 0.00123067141530641 280864 281697 667 665 0 True 378 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 421 287 0.00652008626037176 0.00648827378586085 0.00648508430609598 0.00650034332799268 0.00150579879020325 0.00158009822887331 285005 282764 667 665 0 True 423 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 465 286 0.00652557676300326 0.00638481073363197 0.00654612039368277 0.0063782711528191 0.00170522510538615 0.00184964970858957 285245 278255 667 665 0 True 467 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 509 287 0.00662250701154344 0.00669341011030667 0.00659189745937285 0.00671396963454643 0.00154112440120385 0.0016021821938953 289482 291704 667 665 0 True 512 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 554 287 0.00689936560673657 0.00687628891409113 0.00679026474402991 0.00700389105058366 0.00154696220929272 0.00156452419474804 301584 299674 667 665 0 True 557 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 601 287 0.00728090978543688 0.00704776360677386 0.00729381246662089 0.00708018616006714 0.00196776962215835 0.00189657853106396 318262 307147 667 665 0 False 601 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 646 286 0.00781149823348797 0.00740438874710236 0.00782787823300526 0.00737010757610437 0.00206212831890737 0.00190004118348758 341455 322689 667 665 0 False 646 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 244 332 0.00596916007548984 0.00596010511515685 0.00592050049591821 0.0059662775616083 0.0014739092187379 0.00142106584097159 260923 259746 667 665 0 True 244 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 288 332 0.00595881962886719 0.00615794464416936 0.00585946440833143 0.00624093995574884 0.00136686030311996 0.00140975572960555 260471 268368 667 665 0 True 289 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 332 332 0.00620852311312872 0.00638049690488524 0.00627145799954223 0.00630197604333562 0.00128664241536767 0.00132800084270547 271386 278067 667 665 0 True 334 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 377 333 0.00651196489189601 0.00637976263616239 0.00653086137178607 0.00636301213092241 0.00118816018725548 0.00136374522070042 284650 278035 667 665 0 True 378 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 421 333 0.00669344888096121 0.00682326094476291 0.00685130083161669 0.00677500572213321 0.00144552966724216 0.00158143500835102 292583 297363 667 665 0 True 423 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 464 330 0.00667050315538042 0.00679290352225264 0.00671396963454643 0.0068207827878233 0.00168930875708935 0.00149597232470865 291580 296040 667 665 0 True 468 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 509 330 0.00670934846149825 0.00703108193922664 0.00666819256885634 0.00703440909437705 0.00161879308854565 0.00160161440922383 293278 306420 667 665 0 True 512 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 554 330 0.00702008803334657 0.00703177031615431 0.00701915007248035 0.00698863202868696 0.00195269385355305 0.00134160870620658 306861 306450 667 665 0 True 557 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 599 332 0.00718077674369499 0.0071506759574606 0.00718699931334401 0.00715648126955062 0.00206069498716873 0.00212369721769599 313885 311632 667 665 0 True 602 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 641 330 0.00715730484494535 0.0071329158327267 0.00715648126955062 0.00712596322575723 0.00189201595522371 0.00182920458886631 312859 310858 667 665 0 True 646 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 244 376 0.00599201429269343 0.00607614251926451 0.00592050049591821 0.00608834973678187 0.001459339378729 0.00151621239386346 261922 264803 667 665 0 True 244 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 289 376 0.00593344893129082 0.00609585304529348 0.005981536583505 0.00607309071488518 0.00136675163563958 0.00135152801316212 259362 265662 667 665 0 True 289 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 333 376 0.00636484229846624 0.00638529259748134 0.00633249408712902 0.00636301213092241 0.00131510432821672 0.00132337335410245 278219 278276 667 665 0 True 334 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 377 377 0.0067207412544586 0.00695499334282146 0.00668345159075303 0.00698863202868696 0.00153715178457851 0.00135190593203995 293776 303104 667 665 0 True 378 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 422 376 0.00698094532500287 0.00713658717634094 0.00697337300679027 0.00721751735713741 0.00152599995644754 0.00159688949534638 305150 311018 667 665 0 True 423 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 466 375 0.00714216020852014 0.00710666572588487 0.00718699931334401 0.00709544518196384 0.00171105085980117 0.00165584549533308 312197 309714 667 665 0 True 468 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 510 374 0.00691730124866612 0.0069835380394222 0.00685130083161669 0.00697337300679027 0.00169037187400137 0.00161646391919334 302368 304348 667 665 0 True 512 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 555 375 0.00697808568821563 0.00689535695498761 0.00708018616006714 0.00686655985351339 0.00186479644406734 0.00152092589163921 305025 300505 667 665 0 True 557 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 598 376 0.00681657340247249 0.00695201037613489 0.00677500572213321 0.00689707789730678 0.00205300598127249 0.00206879228552022 297965 302974 667 665 0 True 602 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 642 375 0.0064609947258003 0.00635521052574214 0.00646982528419928 0.0063935301747158 0.00194691786204271 0.00169951130685867 282422 276965 667 665 0 True 646 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 245 420 0.00601708758804393 0.00609509583067304 0.0059510185397116 0.00610360875867857 0.00157120436577809 0.00159687473702289 263018 265629 667 665 0 True 245 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 289 420 0.00626580735725065 0.00627857122779482 0.00621042191195544 0.00628671702143893 0.00150000349867867 0.00136496072166825 273890 273625 667 665 0 True 289 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 333 421 0.00655254885718047 0.00668833906693949 0.00662241550316625 0.00674448767833982 0.0012389246872044 0.0013242053912556 286424 291483 667 665 0 True 334 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 378 421 0.00691167348346884 0.00689407198472262 0.00692759594110018 0.00689707789730678 0.00136235996007139 0.00137651037095325 302122 300449 667 665 0 True 379 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 422 421 0.00694427334284334 0.00697509394910944 0.00698863202868696 0.00704966811627375 0.00162264006129768 0.00158223186168683 303547 303980 667 665 0 True 423 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 466 419 0.00715906638120628 0.00707380720053739 0.00714122224765393 0.00703440909437705 0.00171170658259543 0.00147986569236633 312936 308282 667 665 0 True 468 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 511 419 0.00705401476419035 0.00705836461145998 0.00703440909437705 0.00706492713817044 0.00178097898060046 0.00173495433632532 308344 307609 667 665 0 True 513 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 554 418 0.00684672541275711 0.00708353626111514 0.00685130083161669 0.00709544518196384 0.00173384509338543 0.00157976004828763 299283 308706 667 665 0 True 557 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 599 420 0.00645317075955041 0.00639229109624599 0.00650034332799268 0.0064087891966125 0.00191809696134088 0.00182993359689132 282080 278581 667 665 0 True 602 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 643 419 0.00629035447943229 0.00613109794399021 0.00624093995574884 0.00617990386816205 0.00180908659734977 0.00179551697546202 274963 267198 667 665 0 True 647 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 246 465 0.00623732537484977 0.00649630485001701 0.00625619897764553 0.00651560234988937 0.00137311096454158 0.00152606709516771 272645 283114 667 665 0 True 245 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 291 465 0.00640785123574628 0.0063655361796572 0.00648508430609598 0.00642404821850919 0.00154216198372362 0.00155566213734921 280099 277415 667 665 0 True 289 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 335 464 0.0064109167663822 0.00645798520104335 0.0063935301747158 0.00651560234988937 0.00150888465572793 0.00149615633527424 280233 281444 667 665 0 True 334 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 379 464 0.00672005494162967 0.00675222044582732 0.00679026474402991 0.00675974670023652 0.00156926986302326 0.00150104134154192 293746 294267 667 665 0 True 379 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 423 464 0.0067457916727148 0.00683145263020219 0.00683604180972 0.00675974670023652 0.00182232531757249 0.00179681133662374 294871 297720 667 665 0 True 423 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 467 463 0.00684221862518043 0.00698177120530784 0.00686655985351339 0.00697337300679027 0.00187568140459597 0.00190808136371095 299086 304271 667 665 0 True 468 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 510 463 0.00649995441738961 0.00677842466087397 0.00656137941557946 0.00683604180972 0.00177684146131674 0.00179798030606352 284125 295409 667 665 0 True 513 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 555 463 0.00629307685365374 0.00672055510715447 0.0064087891966125 0.00675974670023652 0.00190905372082472 0.0019401249607706 275082 292887 667 665 0 True 557 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 599 463 0.006215226101758 0.00619445156723349 0.00628671702143893 0.00630197604333562 0.00180765839535304 0.0018338460541053 271679 269959 667 665 0 True 602 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 644 464 0.00595740124902072 0.00589824297525687 0.005981536583505 0.00602731364919509 0.00185872872119094 0.00179877343773352 260409 257050 667 665 0 True 647 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 248 509 0.00621293839232821 0.00629711151304675 0.00611886778057527 0.00631723506523232 0.00141448435940609 0.00141394122659272 271579 274433 667 665 0 True 245 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 291 508 0.00631481009323674 0.00655623953451952 0.00633249408712902 0.00660715648126955 0.00144207251264098 0.00141949331357135 276032 285726 667 665 0 True 290 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 335 509 0.00643875819014274 0.00659834525659537 0.00643930724040589 0.00656137941557946 0.00148097229349794 0.00150341824356666 281450 287561 667 665 0 True 334 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 380 509 0.00657327550461437 0.00661121790514281 0.00662241550316625 0.00663767452506294 0.00144073124001956 0.00148000954887278 287330 288122 667 665 0 True 379 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 424 509 0.00667642832280358 0.00698831078612072 0.00666819256885634 0.00700389105058366 0.00182545342516892 0.00179868531661105 291839 304556 667 665 0 True 424 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 468 507 0.00670141010977688 0.00659508693913773 0.00675974670023652 0.00659189745937285 0.00178686776763538 0.00163353485757876 292931 287419 667 665 0 True 468 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 512 506 0.00650098388663302 0.00642051455028048 0.00646982528419928 0.00648508430609598 0.00179553203725758 0.00172839756985346 284170 279811 667 665 0 True 513 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 557 506 0.00629104079226123 0.00629048014864352 0.00630197604333562 0.00625619897764553 0.00175389771624221 0.00160808451341863 274993 274144 667 665 0 True 558 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 601 507 0.0064402680783664 0.00618224434971613 0.00643930724040589 0.00624093995574884 0.00182396367391914 0.00177913828550238 281516 269427 667 665 0 True 602 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 645 505 0.00632567671302824 0.00616966999783735 0.00633249408712902 0.00621042191195544 0.00198465762474686 0.0019176806933048 276507 268879 667 665 0 True 647 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 249 551 0.0063924091970952 0.00648109171991549 0.00643930724040589 0.00653086137178607 0.00134713141168047 0.00132934263805907 279424 282451 667 665 0 True 245 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 292 550 0.00624725403377506 0.00632494488682223 0.00625619897764553 0.0063935301747158 0.001361203607509 0.00138795903837255 273079 275646 667 665 0 True 290 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 337 551 0.00638579771684311 0.00666759597551902 0.0063935301747158 0.00677500572213321 0.00139334632140175 0.00132447244495155 279135 290579 667 665 0 True 334 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 381 551 0.00656346123116057 0.00663554055658716 0.00654612039368277 0.00659189745937285 0.00142885074284026 0.00136670832574596 286901 289182 667 665 0 True 379 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 425 550 0.0065402638575425 0.00645929311720592 0.00663767452506294 0.00634775310902571 0.0017508670520904 0.00177922564537096 285887 281501 667 665 0 True 424 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 469 549 0.0065870475153817 0.00643666846218315 0.00669871061264973 0.00630197604333562 0.00188311606605928 0.00200266209823693 287932 280515 667 665 0 True 468 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 513 547 0.0063674731643105 0.00630888275850992 0.00643930724040589 0.00630197604333562 0.00184019307048341 0.00202952925157617 278334 274946 667 665 0 True 513 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 557 547 0.00657862874468008 0.00647895775143971 0.00657663843747616 0.00634775310902571 0.00170200998654579 0.00180380906893548 287564 282358 667 665 0 True 558 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 602 549 0.0064555271002631 0.00641780693436498 0.00642404821850919 0.00634775310902571 0.00159313328607573 0.00154855565005002 282183 279693 667 665 0 True 602 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 645 548 0.00617516830964239 0.00643944491579142 0.00616464484626535 0.00650034332799268 0.00180159383241951 0.00182289500389818 269928 280636 667 665 0 True 647 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 245 592 0.00670781569618029 0.00657255406770531 0.00666819256885634 0.00654612039368277 0.00128638597800594 0.00126828945407378 293211 286437 667 665 0 False 245 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 290 592 0.00652649184677517 0.00639504460395668 0.00651560234988937 0.00633249408712902 0.00134747094644134 0.00149282951946234 285285 278701 667 665 0 False 290 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 336 594 0.00628445218910343 0.00651264232910039 0.00625619897764553 0.00653086137178607 0.00140727231611428 0.0015095340537773 274705 283826 667 665 0 True 335 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 379 593 0.00626647079298529 0.00647257879190996 0.00633249408712902 0.00650034332799268 0.00140219418836751 0.00125556076282082 273919 282080 667 665 0 True 379 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 424 592 0.00645884427893629 0.00621049074964821 0.00643930724040589 0.00613412680247196 0.00176392526402817 0.00167233463605393 282328 270658 667 665 0 False 424 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 469 591 0.00647549880358516 0.00648618570918025 0.00651560234988937 0.00646982528419928 0.00184196739569051 0.00182530956862746 283056 282673 667 665 0 False 469 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 513 591 0.00662031081049084 0.00663340658811139 0.00654612039368277 0.00659189745937285 0.00205684993180241 0.00213620471462928 289386 289089 667 665 0 False 513 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 558 591 0.00661866365970139 0.00663804165942437 0.00660715648126955 0.00662241550316625 0.00188045768287559 0.00177606076940081 289314 289291 667 665 0 False 558 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 603 591 0.0066468482398764 0.00660130527738435 0.00669871061264973 0.00665293354695964 0.00155059630337052 0.0014972707496765 290546 287690 667 665 0 False 603 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 647 591 0.00666812393757344 0.00638965231802326 0.00666819256885634 0.00636301213092241 0.00157037205057635 0.00141689477940235 291476 278466 667 665 0 False 647 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 245 641 0.00860833030497797 0.722462416053868 0.0081177996490425 0.732082093537804 0.00251448634290602 0.1987361308494 376286 31485472 667 665 11 True 245 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 290 636 0.00689616281353487 0.0067430650326893 0.00675974670023652 0.00675974670023652 0.00165626147232469 0.00139443970239164 301444 293868 667 665 0 False 290 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 335 635 0.00613467585273511 0.00631420620675057 0.00604257267109178 0.00630197604333562 0.00130215592873126 0.00128028132161782 268158 275178 667 665 0 False 335 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 379 635 0.00621431101798609 0.00604096645826055 0.00619516289005875 0.00605783169298848 0.00126354804835492 0.00131459652055616 271639 263270 667 665 0 False 379 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 424 635 0.00632235953435505 0.00625789697406712 0.00630197604333562 0.00631723506523232 0.00158737582645118 0.00160017358775396 276362 272724 667 665 0 False 424 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 469 635 0.00622135716302984 0.00634727124517634 0.00619516289005875 0.0064087891966125 0.00172642226649673 0.00173145740612611 271947 276619 667 665 0 False 469 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 513 635 0.00633539947810485 0.00619078022361924 0.00625619897764553 0.00622568093385214 0.00179932189178407 0.0017498603159725 276932 269799 667 665 0 False 513 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 558 635 0.00632247391982654 0.00633956142358643 0.00633249408712902 0.00628671702143893 0.0017671060058674 0.00170332756388233 276367 276283 667 665 0 False 558 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 603 634 0.00726590241157746 0.00675880591843536 0.00706492713817044 0.00671396963454643 0.002073798056696 0.0013736299222474 317606 294554 667 665 0 False 603 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 644 640 0.00843478466763414 0.766157692239296 0.00827038986800946 0.7639734493019 0.00175847161900429 0.169432155580569 368700 33389746 667 665 14 True 647 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C4_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C4_3.csv new file mode 100755 index 0000000..6f473a3 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C4_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 244 244 0.000994398657846632 0.0708513559017709 0.000778210116731518 0.0679942015716793 0.000835030012093835 0.0200352096191459 43467 3087757 667 665 0 True 244 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 289 244 0.000998081870028593 0.000981143635008785 0.000839246204318303 0.000839246204318303 0.000743622475743423 0.00070845639363134 43628 42759 667 665 0 False 289 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 332 244 0.00101590312648665 0.000931190415957495 0.000869764248111696 0.00080872816052491 0.00073730463027916 0.000664865393265716 44407 40582 667 665 0 True 333 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 377 244 0.00110057125248317 0.00108465257903284 0.000915541313801785 0.00103761348897536 0.00107630357613424 0.000645143173473974 48108 47270 667 665 0 True 378 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 421 244 0.000967449440763711 0.000879699821767741 0.00080872816052491 0.000701915007248035 0.000765792701389185 0.000721965933149089 42289 38338 667 665 0 True 423 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 465 242 0.000899916258396323 0.000868112143485287 0.000686655985351339 0.000732433051041428 0.00082586216055257 0.00070781528925224 39337 37833 667 665 0 True 467 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 509 242 0.000974175306487292 0.000904274878085578 0.000793469138628214 0.00064087891966125 0.000838145608269896 0.000833972830145974 42583 39409 667 665 0 True 512 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 554 242 0.00102574027703475 0.000977219886521063 0.000823987182421607 0.000885023270008392 0.000864516416980951 0.000693798310304393 44837 42588 667 665 0 True 557 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 601 243 0.00110285896191296 0.000953516774311609 0.000656137941557946 0.000457770656900893 0.00121555305990655 0.00106460222264927 48208 41555 667 665 0 False 601 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 640 243 0.00101382131090555 0.0761147317825348 0.000701915007248035 0.0728007934691386 0.00094322099877923 0.0200498814045499 44316 3317139 667 665 0 True 646 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 244 288 0.000955530474634507 0.00111501000154311 0.000717174029144732 0.000885023270008392 0.000820035439593294 0.00106731443402424 41768 48593 667 665 0 False 244 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 289 288 0.00102590041669483 0.000912443617627268 0.000869764248111696 0.000762951094834821 0.000745501529183373 0.000695529850209035 44844 39765 667 665 0 False 289 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 333 288 0.00092320514039158 0.000882063249219409 0.000778210116731518 0.000747692072938125 0.000667976638749535 0.000673784820737 40355 38441 667 665 0 True 333 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 377 288 0.00100254290341668 0.000903907743724154 0.000900282291905089 0.000762951094834821 0.000717884480296085 0.000651233593264523 43823 39393 667 665 0 True 378 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 421 287 0.000982845725226194 0.000925866967716843 0.000778210116731518 0.000732433051041428 0.000816133293799746 0.000788794591480918 42962 40350 667 665 0 True 423 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 465 286 0.000919110140512257 0.000891677580309207 0.000686655985351339 0.000549324788281071 0.000862746485279138 0.000920341162325404 40176 38860 667 665 0 True 467 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 509 287 0.000969096591553159 0.000977609966780077 0.000747692072938125 0.000717174029144732 0.000824796102107077 0.000877309893759625 42361 42605 667 665 0 True 512 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 554 287 0.00101814508172785 0.000995393037411565 0.000778210116731518 0.000762951094834821 0.000896723928411579 0.000823843730917829 44505 43380 667 665 0 True 557 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 601 287 0.00102077594757211 0.00101239594752503 0.000656137941557946 0.000671396963454643 0.00105183305642469 0.00101207677158052 44620 44121 667 665 0 False 601 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 646 286 0.00105049329306507 0.0010063841223567 0.000732433051041428 0.000518806744487678 0.000996978672275275 0.00109791212117087 45919 43859 667 665 0 False 646 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 244 332 0.000992065194228246 0.000954595231498293 0.000839246204318303 0.000823987182421607 0.000779582172089814 0.000753649004996517 43365 41602 667 665 0 True 244 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 288 332 0.000907488576608926 0.000880296415105055 0.000747692072938125 0.000778210116731518 0.000710421543207694 0.00065795753263552 39668 38364 667 665 0 True 289 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 332 332 0.000927140000610818 0.000836125562246197 0.000793469138628214 0.000732433051041428 0.000703720874617559 0.000627406339900242 40527 36439 667 665 0 True 334 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 377 333 0.000961226871114683 0.00102276749323526 0.000823987182421607 0.000885023270008392 0.000681731181798303 0.000747192367390456 42017 44573 667 665 0 True 378 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 421 333 0.000976463015917081 0.000945187413486795 0.000732433051041428 0.000656137941557946 0.000871296859658278 0.00084948372375248 42683 41192 667 665 0 True 423 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 464 330 0.00101421022150861 0.000858979676244858 0.000762951094834821 0.00064087891966125 0.000911471582537586 0.000787888624750589 44333 37435 667 665 0 True 468 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 509 330 0.00103226024890965 0.000954801744576594 0.000823987182421607 0.000762951094834821 0.000904614427390285 0.000874567552783849 45122 41611 667 665 0 True 512 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 554 330 0.00103372438294471 0.000879309741508727 0.000747692072938125 0.000717174029144732 0.000905781526595814 0.000725404597881136 45186 38321 667 665 0 True 557 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 599 332 0.00100753010997362 0.000997274601013865 0.000549324788281071 0.000503547722590982 0.00113579435121024 0.00119263680084463 44041 43462 667 665 0 True 602 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 641 330 0.000981175697342448 0.000898331890610022 0.000473029678797589 0.000503547722590982 0.00109350454944892 0.000914907813735 42889 39150 667 665 0 True 646 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 244 376 0.00102606055635492 0.000940506450378636 0.000839246204318303 0.00080872816052491 0.000808328717092426 0.000824605201059201 44851 40988 667 665 0 True 244 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 289 376 0.000955873631048975 0.000958909060245028 0.000869764248111696 0.000839246204318303 0.000716100941986671 0.000723964967206936 41783 41790 667 665 0 True 289 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 333 376 0.00101908304259406 0.000944935008613316 0.000915541313801785 0.000762951094834821 0.000735347974493274 0.000738520301060364 44546 41181 667 665 0 True 334 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 377 377 0.00108018776146374 0.00104139956207754 0.000946059357595178 0.000930800335698482 0.0007695846646756 0.000717889647620445 47217 45385 667 665 0 True 378 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 422 376 0.000918126425457448 0.00101980747244628 0.000671396963454643 0.000747692072938125 0.000816305310340911 0.00090730772413438 40133 44444 667 665 0 True 423 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 466 375 0.000904377291784412 0.000957991224341467 0.000610360875867857 0.00064087891966125 0.000885493104420177 0.000930225454364086 39532 41750 667 665 0 True 468 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 510 374 0.000967380809480817 0.000976210267027147 0.000686655985351339 0.00064087891966125 0.000874647984097579 0.000944858305490161 42286 42544 667 665 0 True 512 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 555 375 0.00101034399257227 0.000939726289860609 0.000732433051041428 0.000701915007248035 0.000955008425033134 0.000847658655931693 44164 40954 667 665 0 True 557 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 598 376 0.000978087289612232 0.000952002345070734 0.000473029678797589 0.000503547722590982 0.00111073268979368 0.0010919862339588 42754 41489 667 665 0 True 602 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 642 375 0.000988381982046285 0.000982612172454482 0.000610360875867857 0.000610360875867857 0.00104720225924473 0.00100187475679001 43204 42823 667 665 0 True 646 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 245 420 0.00101382131090555 0.000987316081460231 0.000869764248111696 0.000823987182421607 0.000817030805982009 0.000844479417377273 44316 43028 667 665 0 True 245 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 289 420 0.000973122960149589 0.000968569283130004 0.000854505226215 0.000839246204318303 0.000773330478642559 0.000778690671549326 42537 42211 667 665 0 True 289 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 333 421 0.000960998100171704 0.000969234714160085 0.000854505226215 0.000854505226215 0.000708361045246052 0.000679163044200579 42007 42240 667 665 0 True 334 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 378 421 0.000952030279206929 0.00101792590884398 0.00080872816052491 0.000900282291905089 0.000706091791282767 0.000795053248259747 41615 44362 667 665 0 True 379 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 422 421 0.000975685194710953 0.000998720192561972 0.000747692072938125 0.000762951094834821 0.000901245274717669 0.000834562950781079 42649 43525 667 665 0 True 423 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 466 419 0.00098202214983147 0.000917193418428195 0.000701915007248035 0.000671396963454643 0.000938949055175409 0.000821792545090393 42926 39972 667 665 0 True 468 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 511 419 0.000987306758614284 0.000925316266174707 0.000762951094834821 0.000625619897764553 0.000863601363694829 0.000901245524488275 43157 40326 667 665 0 True 513 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 554 418 0.00103660689682625 0.00100289634592317 0.000839246204318303 0.00080872816052491 0.000903564039289363 0.000821594922940854 45312 43707 667 665 0 True 557 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 599 420 0.000925950391707328 0.000862008534726608 0.000549324788281071 0.000381475547417411 0.00098109351713146 0.000991167802368698 40475 37567 667 665 0 True 602 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 643 419 0.000917646006477192 0.000844730273842078 0.000488288700694286 0.0004272526131075 0.000965902895016361 0.000942395186013234 40112 36814 667 665 0 True 647 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 246 465 0.00103612647784599 0.000978642532171583 0.000854505226215 0.00080872816052491 0.000865775625021457 0.000818405986698663 45291 42650 667 665 0 True 245 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 291 465 0.00104751927080635 0.000928069773885389 0.000900282291905089 0.000747692072938125 0.000857885556631962 0.000836379057442549 45789 40446 667 665 0 True 289 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 335 464 0.000959877122551107 0.00101163873290459 0.000823987182421607 0.000885023270008392 0.000781323706811906 0.000849939712731786 41958 44088 667 665 0 True 334 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 379 464 0.000978910865006956 0.000988165079671025 0.000823987182421607 0.000839246204318303 0.000795533399340646 0.000802340972335048 42790 43065 667 665 0 True 379 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 423 464 0.000968364524535627 0.000954480502010347 0.00064087891966125 0.00064087891966125 0.00101058090464971 0.000994231811261471 42329 41597 667 665 0 True 423 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 467 463 0.000987261004425688 0.000973502651111643 0.000671396963454643 0.000534065766384375 0.00100871737813979 0.00108824260366333 43155 42426 667 665 0 True 468 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 510 463 0.000997006646596592 0.000959964571534123 0.00064087891966125 0.000656137941557946 0.000977883279395691 0.000895894526623921 43581 41836 667 665 0 True 513 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 555 463 0.000858188438396961 0.000917422877404085 0.000488288700694286 0.000549324788281071 0.000970621586457109 0.000930450982554288 37513 39982 667 665 0 True 557 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 599 463 0.000862374946653476 0.00097543010650912 0.000473029678797589 0.000579842832074464 0.000970187834429217 0.00101498198501946 37696 42510 667 665 0 True 602 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 644 464 0.000940957765566747 0.000934379895722368 0.000579842832074464 0.000518806744487678 0.000956312956951044 0.000973946804888732 41131 40721 667 665 0 True 647 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 248 509 0.0009860485184279 0.000941057151920772 0.00080872816052491 0.000793469138628214 0.00081740043286339 0.000769422509251468 43102 41012 667 665 0 True 245 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 291 508 0.000871983326258592 0.000955765472275332 0.000686655985351339 0.000854505226215 0.000769981523865363 0.000778830968144539 38116 41653 667 665 0 True 290 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 335 509 0.000916616537233786 0.00101459875369357 0.000778210116731518 0.000854505226215 0.000773567173435306 0.000848149795184835 40067 44217 667 665 0 True 334 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 380 509 0.00090048818575377 0.000978894937045062 0.000717174029144732 0.00080872816052491 0.000829027367747043 0.000805186881880678 39362 42661 667 665 0 True 379 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 424 509 0.000972551032792141 0.000970450846732303 0.000701915007248035 0.000610360875867857 0.000965978109288943 0.000994646808673789 42512 42293 667 665 0 True 424 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 468 507 0.000941552570018493 0.00093644502650538 0.000473029678797589 0.000625619897764553 0.00105542465908336 0.000859088872713825 41157 40811 667 665 0 True 468 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 512 506 0.000961753044283535 0.000944567874251892 0.000595101853971161 0.000625619897764553 0.000956101584463781 0.000891618713813065 42040 41165 667 665 0 True 513 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 557 506 0.00100844519374554 0.000897207541628161 0.000732433051041428 0.000686655985351339 0.000965874067258889 0.000822702697902456 44081 39101 667 665 0 True 558 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 601 507 0.00096582516706856 0.000957876494853522 0.00064087891966125 0.000656137941557946 0.000929888145680036 0.000949903528132846 42218 41745 667 665 0 True 602 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 645 505 0.000910096565358886 0.000942732202444771 0.000488288700694286 0.000473029678797589 0.000943749840531526 0.00102429692414831 39782 41085 667 665 0 True 647 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 249 551 0.000921718129262217 0.00106184435682936 0.000762951094834821 0.000900282291905089 0.000755273044677018 0.000759152145635477 40290 46276 667 665 0 True 245 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 292 550 0.000965733658691368 0.000891471067230906 0.000778210116731518 0.000793469138628214 0.000830009210654048 0.000718099874987905 42214 38851 667 665 0 True 290 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 337 551 0.000947180335215775 0.000949019378384161 0.000823987182421607 0.000793469138628214 0.000741931089622116 0.000758846961445079 41403 41359 667 665 0 True 334 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 381 551 0.00100629474688154 0.000934655246493437 0.000900282291905089 0.000793469138628214 0.000774790814469141 0.000712084083294552 43987 40733 667 665 0 True 379 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 425 550 0.000953517290336292 0.000949386512745586 0.000656137941557946 0.000564583810177768 0.000989249286431728 0.000975878625106736 41680 41375 667 665 0 True 424 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 469 549 0.000992156702605438 0.000982772793737606 0.000549324788281071 0.000503547722590982 0.00106954827140558 0.00108632033543849 43369 42830 667 665 0 True 468 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 513 547 0.000983166004546365 0.000922264461795367 0.000488288700694286 0.000473029678797589 0.00105580938898464 0.00104678403822839 42976 40193 667 665 0 True 513 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 557 547 0.000918034917080256 0.000898561349585913 0.000595101853971161 0.000488288700694286 0.000917673870688073 0.000949487359808552 40129 39160 667 665 0 True 558 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 602 549 0.000941781340961472 0.000920887707940026 0.000656137941557946 0.000686655985351339 0.000868459992797268 0.000801780860211748 41167 40133 667 665 0 True 602 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 645 548 0.000918950000852172 0.00101540186010919 0.000625619897764553 0.000701915007248035 0.000902587738693251 0.00102357978712482 40169 44252 667 665 0 True 647 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 245 592 0.00103827692471 0.00101012430366371 0.000961318379491875 0.000946059357595178 0.000728376321522698 0.000636738506418457 45385 44022 667 665 0 False 245 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 290 592 0.00101274608747354 0.000999523298977588 0.000885023270008392 0.000869764248111696 0.000767097859310204 0.000780316318611859 44269 43560 667 665 0 False 290 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 336 594 0.000969462625061925 0.000993282014833375 0.000854505226215 0.000854505226215 0.000738478158059796 0.000774418864977883 42377 43288 667 665 0 True 335 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 379 593 0.000961020977266002 0.000886858941815514 0.000823987182421607 0.000762951094834821 0.000739888014323802 0.000663938371091995 42008 38650 667 665 0 True 379 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 424 592 0.000849472265469463 0.000913384399428418 0.000534065766384375 0.000579842832074464 0.000879204688309219 0.000926645323652815 37132 39806 667 665 0 False 424 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 469 591 0.000948507206685053 0.000918776685361837 0.000549324788281071 0.000488288700694286 0.00102229143960877 0.00103280583243896 41461 40041 667 665 0 False 469 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 513 591 0.000959579720325234 0.00103928853949935 0.000518806744487678 0.000579842832074464 0.00105869015365576 0.00117662895731367 41945 45293 667 665 0 False 513 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 558 591 0.000947935279327606 0.000888717559520224 0.000610360875867857 0.000534065766384375 0.000994524695980326 0.000904328598676686 41436 38731 667 665 0 False 558 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 603 591 0.000944137681674155 0.000899915157543665 0.000701915007248035 0.00064087891966125 0.000878188461991825 0.000800383153420969 41270 39219 667 665 0 False 603 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 647 591 0.000932813519996697 0.000904206040392811 0.000671396963454643 0.000701915007248035 0.00082780651378802 0.000791674024817691 40775 39406 667 665 0 False 647 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 245 641 0.00109453169958852 0.0746801542652695 0.000946059357595178 0.0740062561989776 0.000785686952507712 0.0227240818712058 47844 3254619 667 665 0 True 245 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 290 636 0.000956605698066508 0.00107132101253362 0.00080872816052491 0.000930800335698482 0.000707155282454282 0.000743607538544767 41815 46689 667 665 0 False 290 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 335 635 0.000967906982649669 0.000987201351972286 0.000854505226215 0.000885023270008392 0.000679291410460023 0.000692303872270797 42309 43023 667 665 0 False 335 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 379 635 0.000998036115839997 0.00097939974679202 0.000869764248111696 0.000854505226215 0.000692843532227427 0.000679691322034644 43626 42683 667 665 0 False 379 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 424 635 0.00087102248829808 0.000969441227238387 0.000671396963454643 0.000747692072938125 0.000759008901470934 0.000853172003652989 38074 42249 667 665 0 False 424 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 469 635 0.000910233827924673 0.000951704048402076 0.000595101853971161 0.00064087891966125 0.000940195219290823 0.000955135519517287 39788 41476 667 665 0 False 469 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 513 635 0.000928512626268692 0.00095138280583583 0.000549324788281071 0.000595101853971161 0.000988125858206837 0.000963904157296972 40587 41462 667 665 0 False 513 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 558 635 0.00090581854872518 0.000951405751733419 0.000595101853971161 0.000595101853971161 0.000909101679381213 0.000907238430880755 39595 41463 667 665 0 False 558 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 603 634 0.000993300557320333 0.000960974191028039 0.000823987182421607 0.000793469138628214 0.000807696059886522 0.000744160286382429 43419 41880 667 665 0 False 603 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 644 640 0.00113870736867776 0.0797148972224565 0.00102235446707866 0.0764324406805524 0.000762247138563635 0.0216547171494171 49775 3474037 667 665 0 True 647 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C5_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C5_1.csv new file mode 100755 index 0000000..c9b21d9 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C5_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 259 272 0.0101120417131787 0.0421403244894108 0.0100556954299229 0.0422369726100557 0.00167384879763848 0.0082601488079662 442016 1836508 667 665 0 True 258 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 302 272 0.0100602479716882 0.0101665700070731 0.0100404364080262 0.0102082856488899 0.00132306089307995 0.00134189115721006 439752 443067 667 665 0 False 302 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 346 273 0.0105320194102994 0.0659277628725051 0.0104982070649271 0.0656748302433814 0.0013940494199156 0.0100948906744043 460374 2873183 667 665 0 True 347 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 391 274 0.0103525257284381 0.088445948930463 0.010406652933547 0.085801480125124 0.00135296679969514 0.0118457405154112 452528 3854543 667 665 0 True 392 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 435 273 0.0100818668257997 0.0812106943944893 0.010101472495613 0.0797741664759289 0.00171903856528925 0.0156460874138005 440697 3539225 667 665 0 True 436 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 479 273 0.0100123433362284 0.0668370170103675 0.0100099183642329 0.0702372777904936 0.00169743189646275 0.0188775773208536 437658 2912809 667 665 0 True 481 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 523 271 0.0100354492014693 0.0817574951340356 0.00999465934233616 0.081177996490425 0.00162230275414487 0.0240811183637606 438668 3563055 667 665 0 True 526 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 567 271 0.0100725558484205 0.0724016725264753 0.0100709544518196 0.0715648126955062 0.00166929857384157 0.0203841366982722 440290 3155321 667 665 0 True 570 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 615 271 0.00975117842772365 0.00970636708502775 0.00965896086060884 0.0097962920576791 0.00190273505893161 0.00181409899250474 426242 423011 667 665 0 False 615 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 655 272 0.00986409976517807 0.0426640646018801 0.0098115510795758 0.042221713588159 0.00183168692562769 0.00816853028035168 431178 1859333 667 665 0 True 660 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 258 316 0.00989187255765571 0.010180980030759 0.00991836423285267 0.0100404364080262 0.00152843185042434 0.00220306411911088 432392 443695 667 665 0 False 258 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 302 316 0.0100499990334428 0.0102156053902208 0.0100404364080262 0.0101625085831998 0.00145301309570642 0.00139554930584549 439304 445204 667 665 0 False 302 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 347 318 0.0105267348015166 0.0989331190186498 0.0105745021744106 0.0946059357595178 0.00131425773119538 0.0181315057359319 460143 4311582 667 665 0 True 347 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 391 318 0.0101749765995922 0.0529121613830869 0.0101319905394064 0.0521095597772183 0.00139766198939312 0.00679140855994679 444767 2305953 667 665 0 True 392 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 435 317 0.0103287793045569 0.084859482191402 0.0102845807583734 0.0857099259937438 0.00168684628592051 0.014285835181339 451490 3698242 667 665 0 True 436 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 479 316 0.0100575484745611 0.0465477724983092 0.0100709544518196 0.0464789806973373 0.00177417942839759 0.00984893564841923 439634 2028588 667 665 0 True 481 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 524 316 0.0102296528549641 0.0446698114019312 0.0102235446707866 0.0467841611352712 0.00164243984211067 0.00778028776971884 447157 1946745 667 665 0 True 526 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 567 315 0.0101591685274323 0.0515042240529224 0.0101472495613031 0.0530708781567102 0.00180871809657334 0.00953909971386965 444076 2244594 667 665 0 True 571 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 615 314 0.0098919869431272 0.0100302254835991 0.00991836423285267 0.00987258716716258 0.00211261268997218 0.00244352862591252 432397 437125 667 665 0 False 615 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 660 314 0.00969206401605789 0.00979558073485384 0.00970473792629892 0.0097962920576791 0.00194878108275496 0.00182618396703451 423658 426899 667 665 0 False 660 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 258 361 0.00984515753109941 0.0505470359349966 0.00987258716716258 0.0507515068284123 0.00161907004282742 0.0112882411391102 430350 2202879 667 665 0 True 258 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 302 361 0.0102029324088242 0.0607970831174985 0.01025406271458 0.0646982528419928 0.00135792633580052 0.0167799325337082 445989 2649584 667 665 0 True 303 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 347 359 0.0103496203374623 0.0316283269400326 0.0101625085831998 0.0324101625085832 0.00201174303437999 0.018347992542645 452401 1378387 667 665 0 False 347 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 390 362 0.0100241250397918 0.0369533813935158 0.0100404364080262 0.0368047608148318 0.00140286098773406 0.00676608314307645 438173 1610457 667 665 0 True 392 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 435 361 0.0100274879726536 0.0776727123370339 0.0100556954299229 0.0754558632791638 0.0017025384524872 0.0134583226340376 438320 3385037 667 665 0 True 437 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 479 360 0.0101807416273552 0.0347548661078193 0.0102082856488899 0.0349736781872282 0.00188285356135119 0.00569910543302152 445019 1514644 667 665 0 True 481 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 523 359 0.0103040034114323 0.0305118713469414 0.0102388036926833 0.0308384832532235 0.00206009854952104 0.00456226839624173 450407 1329731 667 665 0 True 526 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 567 359 0.0101436578574984 0.0592801527737861 0.0101930266269932 0.0575417715724422 0.00179930144582877 0.0168185931503817 443398 2583475 667 665 0 True 571 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 611 360 0.0101273922434525 0.0588281644830777 0.0100862134737163 0.0597695887693599 0.00204689086184151 0.0100792761093949 442687 2563777 667 665 0 True 615 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 656 360 0.00999573456576816 0.0685038529030289 0.0100862134737163 0.0667124437323568 0.00189585945244378 0.0191306029316852 436932 2985451 667 665 0 True 660 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 259 406 0.00996880822577953 0.0446503532807758 0.00993362325474937 0.0456702525368124 0.00164252798883053 0.0096083977972021 435755 1945897 667 665 0 True 258 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 303 405 0.0101374581649436 0.0348207208338998 0.0102082856488899 0.0332951857785916 0.00142467706302677 0.0057662755329761 443127 1517514 667 665 0 True 303 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 347 405 0.0105145184331615 0.0851507344694995 0.0105134660868238 0.0807202258335241 0.00150676477673455 0.0165419511625705 459609 3710935 667 665 0 True 347 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 391 406 0.0104631364793685 0.0702426471305295 0.0105134660868238 0.0689402609292744 0.00155496008280393 0.0159712784424232 457363 3061229 667 665 0 True 392 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 435 405 0.0104671170937763 0.0472586822974121 0.0104371709773404 0.0472724498359655 0.00166484817308143 0.00939066097264815 457537 2059570 667 665 0 True 437 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 479 404 0.0103625458957406 0.0576295855225154 0.0103456168459602 0.0578774700541695 0.001698820911148 0.0116008005977815 452966 2511542 667 665 0 True 482 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 524 403 0.0104518809489739 0.0431527892746286 0.010452429999237 0.0438086518654154 0.00168145166996905 0.00516022318758574 456871 1880632 667 665 0 True 526 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 567 403 0.0104993051654534 0.0664240367455604 0.0105287251087205 0.0636758983749142 0.00182237975932109 0.0146355008411416 458944 2894811 667 665 0 True 571 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 612 404 0.0104027638275163 0.0449718023601003 0.0104219119554437 0.0448462653543908 0.00204906499872691 0.00755828549870413 454724 1959906 667 665 0 True 616 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 656 404 0.0102520495302818 0.0882944371686828 0.0102235446707866 0.0872816052491035 0.00195231034729801 0.0131880657494353 448136 3847940 667 665 0 True 660 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 259 449 0.0101071917691875 0.0468331276807262 0.0101472495613031 0.0466315709163043 0.00155116648937018 0.00630822214777994 441804 2041024 667 665 0 True 258 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 303 448 0.0101463344775312 0.0734701253018103 0.0101167315175097 0.0734569314106966 0.00152251211070537 0.0153475165494304 443515 3201885 667 665 0 True 303 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 346 449 0.0103116214838335 0.0358699449470552 0.0103150988021668 0.0365300984206912 0.00157476666971938 0.00437869674997926 450740 1563240 667 665 0 True 348 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 391 449 0.0104050972911347 0.054898817196344 0.0104676890211337 0.0535896849011978 0.00160240885118926 0.0104541538104478 454826 2392533 667 665 0 True 392 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 436 449 0.0105318592706393 0.101101781691583 0.010605020218204 0.100801098649577 0.00198608727408862 0.0151556183470006 460367 4406094 667 665 0 True 437 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 480 448 0.0104842749144997 0.0654139812795894 0.0105592431525139 0.0630960555428397 0.00199180806172964 0.0156159253155678 458287 2850792 667 665 0 True 482 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 524 447 0.0104947068694996 0.0552445430353177 0.0104982070649271 0.0537880521858549 0.00175335531534166 0.00858886602004263 458743 2407600 667 665 0 True 526 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 568 447 0.010464097317329 0.0339897580986111 0.0104676890211337 0.0344548714427405 0.00186071932381864 0.00381257600161705 457405 1481300 667 665 0 True 571 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 612 448 0.0102556412340865 0.0418157318221165 0.0102845807583734 0.0416418707560845 0.00189735400417408 0.0057012807101865 448293 1822362 667 665 0 True 616 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 656 447 0.0101167315175097 0.0825499317072723 0.0101472495613031 0.0809185931181811 0.00198150114948292 0.0159314813756769 442221 3597590 667 665 0 True 661 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 260 493 0.00997917154949648 0.0663613944451424 0.00999465934233616 0.06665140764477 0.00150658579856587 0.0172757930346075 436208 2892081 667 665 0 True 258 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 304 493 0.0109002719972127 0.0620354961562753 0.0105439841306172 0.0605325398641947 0.00280677250656857 0.00880265917389068 476471 2703555 667 665 0 True 303 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 348 493 0.0107041924219854 0.0718981936415771 0.0106660563057908 0.0680857557030594 0.00160420854018744 0.0150711311600355 467900 3133379 667 665 0 True 348 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 393 493 0.010854220406391 0.0894140592956413 0.0109254596780346 0.0845654993514916 0.00167799733510881 0.0180813478644648 474458 3896734 667 665 0 True 393 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 436 492 0.0109326888398328 0.127779209984219 0.0109254596780346 0.120698863202869 0.00187919405717366 0.04147338061618 477888 5568717 667 665 0 True 437 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 480 491 0.0107546821691008 0.043977005916026 0.0107728694590677 0.0452582589456016 0.0019482602492308 0.00620855952723291 470107 1916552 667 665 0 True 482 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 526 492 0.0106273940164274 0.0396460365837918 0.0105592431525139 0.0401770046540017 0.00204669997844515 0.00501982547882043 464543 1727805 667 665 0 True 527 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 568 490 0.01052776427076 0.132787794618154 0.0105287251087205 0.129030289158465 0.00181732252821865 0.0408567408031177 460188 5786995 667 665 0 True 571 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 614 492 0.0112305714846857 0.0662204148503555 0.0103913939116503 0.0672159914549477 0.00516756339963656 0.0169085187511103 490909 2885937 667 665 0 True 616 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 657 492 0.0102259238885936 0.0818521699074879 0.0102693217364767 0.0781261921110857 0.00198250064607257 0.0135300687602189 446994 3567181 667 665 0 True 661 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 261 537 0.0101747249515549 0.0522003337480804 0.0101319905394064 0.0542153047989624 0.00156900696897319 0.00951919220050702 444756 2274931 667 665 0 True 259 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 304 536 0.0104560445801361 0.143426958331971 0.0104371709773404 0.138643472953384 0.00149267058155585 0.0461801467908911 457053 6250658 667 665 0 True 303 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 349 537 0.0104954160594228 0.0602007421850575 0.0105287251087205 0.0610818646524758 0.00139803508319992 0.0112670557094517 458774 2623595 667 665 0 True 348 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 393 537 0.0106916786514044 0.0634386148479461 0.0106507972838941 0.0602731364919509 0.00171400662940307 0.0114347939627776 467353 2764704 667 665 0 True 393 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 437 536 0.0107652056324779 0.0595712903223956 0.0106660563057908 0.0587319752803845 0.0019700281921271 0.00686466270472572 470567 2596163 667 665 0 True 437 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 481 534 0.0105292512818894 0.0691179310143062 0.0105287251087205 0.0674753948271916 0.00200839588022931 0.0118853390584501 460253 3012213 667 665 0 True 482 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 525 533 0.0106834886516458 0.0782514537660241 0.010605020218204 0.0771343556878004 0.00231704357999318 0.0158376201185455 466995 3410259 667 665 0 True 527 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 569 534 0.0103738929345124 0.0595597944277035 0.0104371709773404 0.0594949263752193 0.00174398518528989 0.0105558330315082 453462 2595662 667 665 0 True 571 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 614 534 0.0102681778817618 0.0524149467282305 0.0102845807583734 0.0509956511787594 0.00179382710649114 0.00769616743000499 448841 2284284 667 665 0 True 616 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 658 533 0.00992470118797319 0.070214033596236 0.00990310521095598 0.0701609826810101 0.00189785511879364 0.0125425903402121 433827 3059982 667 665 0 True 661 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 260 578 0.00975273407013591 0.0443965945993388 0.0097962920576791 0.0446784161135271 0.00138905005857582 0.00814766958764252 426310 1934838 667 665 0 True 259 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 305 577 0.0100968741996592 0.0575795864116689 0.010101472495613 0.0567635614557107 0.00151126204304156 0.0108183148387275 441353 2509363 667 665 0 True 303 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 348 577 0.0101815880798443 0.0521363605856023 0.0101930266269932 0.0497291523613336 0.00139882133856458 0.0124162630814633 445056 2272143 667 665 0 True 348 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 393 578 0.0107744708556685 0.0537924348522944 0.0104982070649271 0.0515297169451438 0.00252346839653145 0.0077523127990159 470972 2344316 667 665 0 True 393 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 437 576 0.0103242953940745 0.0944242042506128 0.0102845807583734 0.0882276646066987 0.00197267346313918 0.0189083248853097 451294 4115080 667 665 0 True 438 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 481 575 0.010237476821214 0.0667084511461763 0.01025406271458 0.0641489280537118 0.0019886099988532 0.0107060991289209 447499 2907206 667 665 0 True 482 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 526 575 0.0103366490249954 0.0609525186277665 0.0103913939116503 0.0593881132219425 0.00214022119007406 0.00889645656763379 451834 2656358 667 665 0 True 527 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 570 574 0.0100219288387392 0.0389617669717897 0.010101472495613 0.0398565651941711 0.00175150952768616 0.00710892624333273 438077 1697984 667 665 0 True 572 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 614 575 0.0100128923864916 0.0509371161940099 0.00997940032043946 0.0499732967116808 0.00156267136823868 0.00757172686183976 437682 2219879 667 665 0 True 616 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 658 574 0.0101758916833641 0.0570645657402834 0.0101319905394064 0.0566262302586404 0.00194319717896473 0.00753883205900547 444807 2486918 667 665 0 True 661 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 259 621 0.00948205229040321 0.0093349877325495 0.00946059357595178 0.00941481651026169 0.00138542067382738 0.00142687413987734 414478 406826 667 665 0 False 259 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 304 620 0.00979354680636335 0.00953858668185685 0.00965896086060884 0.00959792477302205 0.0015201262772761 0.00134207299301041 428094 415699 667 665 0 False 304 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 348 620 0.0100893018814465 0.0761501143566171 0.0100556954299229 0.0748455024032959 0.00154518489576071 0.011346662341692 441022 3318681 667 665 0 True 348 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 393 620 0.0106226584579077 0.0832495062329663 0.0102235446707866 0.0813458457312886 0.00288587876221426 0.0172078430666409 464336 3628078 667 665 0 True 393 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 438 620 0.0100198927773467 0.00985069678086266 0.0100099183642329 0.00993362325474937 0.00174437019694043 0.00194111117652829 437988 429301 667 665 0 False 438 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 482 620 0.0098669822790596 0.00977593904651764 0.00990310521095598 0.0098115510795758 0.00197687647426782 0.00192806798373265 431304 426043 667 665 0 False 482 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 527 619 0.0100324523021163 0.00973082741185764 0.00999465934233616 0.00967421988250553 0.00206895459057781 0.00200454503044727 438537 424077 667 665 0 False 527 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 572 619 0.00987416568666914 0.00976251569642807 0.00994888227664607 0.00967421988250553 0.00171828460923539 0.00173420431507887 431618 425458 667 665 0 False 572 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 617 619 0.00969405432326181 0.00964097127689905 0.00970473792629892 0.00965896086060884 0.00142432769587395 0.00140582834030816 423745 420161 667 665 0 False 617 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 661 619 0.00977901985148419 0.00965494532853076 0.00973525597009232 0.00970473792629892 0.00159642988591937 0.00154605907395652 427459 420770 667 665 0 False 661 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 260 670 0.00921393274523187 0.039956173335605 0.00918593118181125 0.0404974441138323 0.00141700284113773 0.00884713425848684 402758 1741321 667 665 0 True 259 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 304 664 0.00946830315673017 0.00939790538373859 0.00950637064164187 0.00946059357595178 0.0013069806882633 0.001347095936755 413877 409568 667 665 0 False 304 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 349 664 0.00929391106689731 0.00948358536533598 0.00932326237888151 0.00943007553215839 0.00135434515247025 0.0012546111296202 406254 413302 667 665 0 False 349 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 393 664 0.00955832452279239 0.00960978780207557 0.00965896086060884 0.00952162966353857 0.00142082266444624 0.00143433842362306 417812 418802 667 665 0 False 393 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 438 663 0.00949223259736577 0.00948438847175159 0.00947585259784848 0.00955214770733196 0.00158280218592674 0.00153986853184478 414923 413337 667 665 0 False 438 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 483 663 0.00952819538960206 0.00932064654655637 0.00946059357595178 0.00935378042267491 0.0020025983156815 0.00159720473816347 416495 406201 667 665 0 False 483 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 527 663 0.00945084793378088 0.00948824338254655 0.00944533455405508 0.00955214770733196 0.00185341648888775 0.00172546919884721 413114 413505 667 665 0 False 527 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 572 663 0.009546314048286 0.00951598497273167 0.00956740672922866 0.00950637064164187 0.001562206970294 0.00144278697392409 417287 414714 667 665 0 False 572 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 617 663 0.00961110197933764 0.00941486240205687 0.00961318379491875 0.00946059357595178 0.0013595742697545 0.00143039151235104 420119 410307 667 665 0 False 617 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 657 669 0.00954457538911936 0.0408668501191179 0.00958266575112535 0.041519798580911 0.0014959054124043 0.00877177244677192 417211 1781009 667 665 0 True 661 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C5_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C5_2.csv new file mode 100755 index 0000000..08a0ea7 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C5_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 259 272 0.00851464860382809 0.740637104319508 0.00848401617456321 0.737178606851301 0.00181604159427094 0.175422115505944 372191 32277539 667 665 12 True 258 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 302 272 0.00738737978229928 0.00717029469989921 0.00735484855420768 0.00718699931334401 0.00147234265331536 0.00123903560612884 322916 312487 667 665 0 False 302 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 346 273 0.00686630820547611 0.00713679368941925 0.00683604180972 0.00704966811627375 0.00134271734086923 0.00201390969539749 300139 311027 667 665 0 True 347 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 391 274 0.00681611586058653 0.00686192478220041 0.00685130083161669 0.00688181887541009 0.00129915513066352 0.00122877139871469 297945 299048 667 665 0 True 392 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 435 273 0.00699663901169122 0.00711281522643872 0.00709544518196384 0.00706492713817044 0.00160057212952212 0.00157390880296821 305836 309982 667 665 0 True 436 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 479 273 0.00700023071549599 0.00710939628769796 0.00703440909437705 0.00711070420386053 0.00164258940935415 0.00170116215569986 305993 309833 667 665 0 True 481 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 523 271 0.00716661582232459 0.00737469675562218 0.00715648126955062 0.00737010757610437 0.00145763132009753 0.00160431662830393 313266 321395 667 665 0 True 526 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 567 271 0.00719429710642504 0.00724794361734044 0.0072480354009308 0.00718699931334401 0.00164042930382153 0.00158466610726843 314476 315871 667 665 0 True 570 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 615 271 0.00845816505800659 0.00787546802460489 0.00813305867093919 0.00787365529869535 0.00294839797864154 0.00187300330317405 369722 343219 667 665 0 False 615 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 655 272 0.00925984707348775 0.764633510991945 0.00926222629129473 0.762478065156023 0.00200281674398044 0.16342955208063 404765 33323321 667 665 13 True 660 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 258 316 0.00709507914845507 0.006896618979355 0.00703440909437705 0.00697337300679027 0.00170061657903598 0.00145607599741814 310139 300560 667 665 0 False 258 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 302 316 0.00694308373393985 0.00675355130788748 0.00691233691920348 0.00671396963454643 0.00131824544356703 0.00129585411357209 303495 294325 667 665 0 False 302 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 347 318 0.00672595723195852 0.00668136351407243 0.00672922865644312 0.00668345159075303 0.00124372250244825 0.00134484400516188 294004 291179 667 665 0 True 347 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 391 318 0.00692727566178001 0.00693957369964164 0.00697337300679027 0.00688181887541009 0.00136019793677655 0.00117315760714514 302804 302432 667 665 0 True 392 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 435 317 0.00697318999003588 0.00728360154219378 0.00700389105058366 0.00735484855420768 0.00170546858468354 0.00174333046376086 304811 317425 667 665 0 True 436 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 479 316 0.00711630909196352 0.00724328560012987 0.00714122224765393 0.00729381246662089 0.00158230252506231 0.00160438959813954 311067 315668 667 665 0 True 481 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 524 316 0.00714321255485784 0.00712802835654024 0.00715648126955062 0.00715648126955062 0.00158195596966533 0.00160710270526446 312243 310645 667 665 0 True 526 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 567 315 0.0073045647009409 0.00739399425549454 0.00730907148851759 0.00741588464179446 0.00177249021887961 0.00153830423061731 319296 322236 667 665 0 True 571 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 615 314 0.00747177338316422 0.00798611314277913 0.00752269779507134 0.00790417334248875 0.00188578213626203 0.00219073007338599 326605 348041 667 665 0 False 615 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 660 314 0.00777253854189865 0.00768049673279101 0.00775158312352178 0.00762951094834821 0.0021495504314577 0.00181490867390249 339752 334722 667 665 0 False 660 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 258 361 0.00652843639979049 0.00660711058947437 0.00650034332799268 0.00671396963454643 0.00151598259890659 0.00153973051757923 285370 287943 667 665 0 True 258 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 302 361 0.00649364033936339 0.00682142527295579 0.00645456626230259 0.00660715648126955 0.00131038800157699 0.00248984246789254 283849 297283 667 665 0 True 303 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 347 359 0.00663742287702567 0.00661066720360067 0.00666819256885634 0.00662241550316625 0.00128749787032485 0.00137218994217028 290134 288098 667 665 0 False 347 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 390 362 0.00690350636080449 0.00669829758649313 0.00695811398489357 0.00671396963454643 0.00133350942439481 0.00124012004051241 301765 291917 667 665 0 True 392 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 435 361 0.0071501900686187 0.00725189031172576 0.0072480354009308 0.00718699931334401 0.0016395846122474 0.00169697098320048 312548 316043 667 665 0 True 437 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 479 360 0.00714781085081172 0.00730746527568635 0.00720225833524071 0.00730907148851759 0.00175893219472784 0.00167914818188029 312444 318465 667 665 0 True 481 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 523 359 0.00721822654706064 0.0072336253772449 0.00709544518196384 0.00721751735713741 0.00208915791827491 0.00167616731139316 315522 315247 667 665 0 True 526 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 567 359 0.00704520708288566 0.00726797538593566 0.00703440909437705 0.00730907148851759 0.00184482234371731 0.00175631070602815 307959 316744 667 665 0 True 571 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 611 360 0.00719379381035049 0.0072752033436762 0.00721751735713741 0.00733958953231098 0.00201462297435958 0.00208462414434073 314454 317059 667 665 0 True 615 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 656 360 0.0068327246310468 0.00689556346806591 0.00683604180972 0.00691233691920348 0.0018515972697946 0.00200285898026141 298671 300514 667 665 0 True 660 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 259 406 0.00646980240710498 0.00691766036744413 0.00648508430609598 0.00691233691920348 0.00151158522527949 0.00158644851213835 282807 301477 667 665 0 True 258 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 303 405 0.00659322433084213 0.00661094255437174 0.00659189745937285 0.00669871061264973 0.00139127890530438 0.00132840433051174 288202 288110 667 665 0 True 303 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 347 405 0.00691551683531089 0.0069544885330745 0.00691233691920348 0.00688181887541009 0.00137269898615313 0.00135697270329856 302290 303082 667 665 0 True 347 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 391 406 0.00719496054215968 0.00727056827236322 0.00720225833524071 0.0072632944228275 0.00143812370338673 0.00141358106391428 314505 316857 667 665 0 True 392 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 435 405 0.00736713355384565 0.00755941123121376 0.00741588464179446 0.00759899290455482 0.00159896855671054 0.00142904585726589 322031 329445 667 665 0 True 437 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 479 404 0.00753230617467645 0.00765665594519602 0.00750743877317464 0.00764476997024491 0.0015925496908373 0.00161114476311241 329251 333683 667 665 0 True 482 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 524 403 0.00743494126134461 0.00740904676431293 0.00750743877317464 0.00750743877317464 0.00164774882856688 0.00168284569749433 324995 322892 667 665 0 True 526 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 567 403 0.00741849263054442 0.00740608674352395 0.00741588464179446 0.00732433051041428 0.00180520812471262 0.00165992270598976 324276 322763 667 665 0 True 571 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 612 404 0.00692782471204315 0.00697156028088073 0.00703440909437705 0.00689707789730678 0.00182752309987962 0.00202588573577195 302828 303826 667 665 0 True 616 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 656 404 0.00642521495031839 0.00634972645621837 0.00645456626230259 0.00634775310902571 0.00183724270433829 0.0017686610227597 280858 276726 667 665 0 True 660 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 259 449 0.00653987494693944 0.00651808050682899 0.00651560234988937 0.00657663843747616 0.00154082914788046 0.001441853754433 285870 284063 667 665 0 True 258 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 303 448 0.00652084120448359 0.00681022767493235 0.00651560234988937 0.00679026474402991 0.00149695791287612 0.0014531300432006 285038 296795 667 665 0 True 303 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 346 449 0.00671449580771528 0.00670178536292666 0.00677500572213321 0.00674448767833982 0.00144083489063243 0.00143460568810618 293503 292069 667 665 0 True 348 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 391 449 0.00707032613242475 0.0070336748256542 0.00708018616006714 0.00701915007248035 0.00148062568187678 0.00142302674674836 309057 306533 667 665 0 True 392 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 436 449 0.00734771090078673 0.0075102381726805 0.00738536659800107 0.00759899290455482 0.00166379336749792 0.0020033624020224 321182 327302 667 665 0 True 437 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 480 448 0.00744169000416249 0.00748364387737483 0.00746166170748455 0.00747692072938125 0.00179108054612756 0.00181294951745465 325290 326143 667 665 0 True 482 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 524 447 0.00721031107243357 0.00715769740212284 0.00717174029144732 0.0072327763790341 0.00171571481724726 0.00171509797203162 315176 311938 667 665 0 True 526 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 568 447 0.0066631138539222 0.00669894007162562 0.00675974670023652 0.00675974670023652 0.00191338742622241 0.00194676879600268 291257 291945 667 665 0 True 571 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 612 448 0.00633304313739216 0.00637443918792174 0.00633249408712902 0.00633249408712902 0.00174224485009113 0.00166813763748058 276829 277803 667 665 0 True 616 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 656 447 0.00613993758442363 0.00621758103200322 0.00614938582436866 0.00622568093385214 0.00184374168757182 0.00186567565513534 268388 270967 667 665 0 True 661 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 260 493 0.00644875548035092 0.00653515225463521 0.0063935301747158 0.00657663843747616 0.0014409912805371 0.00139376940262147 281887 284807 667 665 0 True 258 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 304 493 0.00669978583608173 0.00642531024287659 0.00662241550316625 0.0064087891966125 0.00177345369206043 0.00157623637058643 292860 280020 667 665 0 True 303 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 348 493 0.0069783830904415 0.00670040860907132 0.00698863202868696 0.00665293354695964 0.00145540651344526 0.00155271723829347 305038 292009 667 665 0 True 348 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 393 493 0.00696127102390668 0.0072306883023535 0.00695811398489357 0.0072632944228275 0.00161241934263983 0.00157034510331234 304290 315119 667 665 0 True 393 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 436 492 0.00728026922679654 0.0075127392755177 0.00735484855420768 0.00755321583886473 0.00178977718200137 0.00181761036225038 318234 327411 667 665 0 True 437 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 480 491 0.00718725096138129 0.00754667625805186 0.00717174029144732 0.00746166170748455 0.00190053893546802 0.00209887439106612 314168 328890 667 665 0 True 482 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 526 492 0.00702530401084649 0.00691031768021565 0.00704966811627375 0.00694285496299687 0.00182157448150797 0.00170204100754847 307089 301157 667 665 0 True 527 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 568 490 0.00661305877159841 0.00666697643628412 0.00668345159075303 0.00654612039368277 0.00165963413700244 0.00182343300537138 289069 290552 667 665 0 True 571 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 614 492 0.00695848001840233 0.00641691204435901 0.00657663843747616 0.0063935301747158 0.0026034614403008 0.00170489218785116 304168 279654 667 665 0 True 616 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 657 492 0.00634102724330213 0.00620704886500986 0.00631723506523232 0.00625619897764553 0.00185943493948634 0.00187439162022405 277178 270508 667 665 0 True 661 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 261 537 0.00680682776030158 0.00671208807094413 0.00683604180972 0.00662241550316625 0.0013625652374754 0.00143830977274765 297539 292518 667 665 0 True 259 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 304 536 0.00676381882302154 0.00687188330175404 0.00679026474402991 0.00689707789730678 0.00142516447441972 0.00142010077013774 295659 299482 667 665 0 True 303 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 349 537 0.00695207443199892 0.00678783247888547 0.00698863202868696 0.00672922865644312 0.00143384923973226 0.00139682966290786 303888 295819 667 665 0 True 348 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 393 537 0.00681744273205581 0.00689388841754191 0.0068055237659266 0.00686655985351339 0.00157983510507353 0.00161266934125009 298003 300441 667 665 0 True 393 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 437 536 0.00679172887806497 0.006742858519611 0.00688181887541009 0.00671396963454643 0.00178860179281256 0.00197961003500631 296879 293859 667 665 0 True 437 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 481 534 0.00683194680984067 0.00692966107188319 0.00675974670023652 0.00697337300679027 0.00186613559118477 0.00195073159489031 298637 302000 667 665 0 True 482 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 525 533 0.00663062838001919 0.00671426793121508 0.00654612039368277 0.00666819256885634 0.00201763353116915 0.00192978992468987 289837 292613 667 665 0 True 527 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 569 534 0.00653111301982335 0.00670818726835399 0.00650034332799268 0.00672922865644312 0.00171095969669772 0.00174302227509427 285487 292348 667 665 0 True 571 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 614 534 0.00652223670723576 0.00658115877930119 0.00660715648126955 0.00656137941557946 0.001625059964892 0.00173469757829234 285099 286812 667 665 0 True 616 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 658 533 0.00639865464383853 0.00652260084865402 0.00654612039368277 0.00659189745937285 0.00180138397640653 0.00194030776484536 279697 284260 667 665 0 True 661 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 260 578 0.00681078549761512 0.00685077307597215 0.0068207827878233 0.00688181887541009 0.0014579593687507 0.00118397261906504 297712 298562 667 665 0 True 259 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 305 577 0.00683425739636476 0.0069074953348122 0.00677500572213321 0.00686655985351339 0.00141449583754844 0.0013325291736579 298738 301034 667 665 0 True 303 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 348 577 0.00673096731560976 0.00687087368226012 0.00677500572213321 0.00692759594110018 0.00138862357628051 0.00133914511537928 294223 299438 667 665 0 True 348 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 393 578 0.0070643323337187 0.00674648397143006 0.00666819256885634 0.00674448767833982 0.00319732272858162 0.00120754155199633 308795 294017 667 665 0 True 393 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 437 576 0.00653928014248769 0.0066962554016077 0.00653086137178607 0.00663767452506294 0.00182158449001763 0.00201723498680395 285844 291828 667 665 0 True 438 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 481 575 0.00676795957708946 0.00666045980136884 0.00669871061264973 0.00671396963454643 0.00194185117259101 0.00190216218310294 295840 290268 667 665 0 True 482 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 526 575 0.00669322011001823 0.00670238195626397 0.00669871061264973 0.00669871061264973 0.00205321208704076 0.00186685496733736 292573 292095 667 665 0 True 527 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 570 574 0.00660383930259636 0.00695779274232732 0.00666819256885634 0.00688181887541009 0.00165321858865251 0.00186817582118317 288666 303226 667 665 0 True 572 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 614 575 0.00651400095328852 0.00655954374377234 0.00656137941557946 0.00660715648126955 0.00148824141548581 0.00152440037312522 284739 285870 667 665 0 True 616 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 658 574 0.00655817662237776 0.00632076873346103 0.00651560234988937 0.00628671702143893 0.00177201943937914 0.001596284193246 286670 275464 667 665 0 True 661 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 259 621 0.00712667241568046 0.00692933982931694 0.00709544518196384 0.00689707789730678 0.0014975740232312 0.00137253201119524 311520 301986 667 665 0 False 259 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 304 620 0.00684558155804222 0.00674542846014097 0.0068207827878233 0.00672922865644312 0.00139428345542925 0.00136469866502607 299233 293971 667 665 0 False 304 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 348 620 0.00662312469308948 0.00661711500082318 0.00663767452506294 0.00659189745937285 0.00142862216972895 0.00136842968010149 289509 288379 667 665 0 True 348 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 393 620 0.00715275230318006 0.00674650691732765 0.00650034332799268 0.00674448767833982 0.00420441579130629 0.00123609399014694 312660 294018 667 665 0 True 393 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 438 620 0.00651347478011967 0.00651080665729327 0.00653086137178607 0.00648508430609598 0.00170522869139287 0.00180559004491804 284716 283746 667 665 0 False 438 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 482 620 0.00651038637238945 0.00656931869614526 0.00651560234988937 0.00653086137178607 0.00183278008977629 0.00186448829609095 284581 286296 667 665 0 False 482 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 527 619 0.00679616703435876 0.00653444093180996 0.00672922865644312 0.00660715648126955 0.00192464745788107 0.00200244549360953 297073 284776 667 665 0 False 527 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 572 619 0.006733826952397 0.00661236520002226 0.00674448767833982 0.00656137941557946 0.00167424879513181 0.00166499218746229 294348 288172 667 665 0 False 572 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 617 619 0.0066968575680116 0.00679627656919823 0.00671396963454643 0.0068055237659266 0.00139531469316033 0.00133345910573284 292732 296187 667 665 0 False 617 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 661 619 0.00671994055615818 0.00674283557371341 0.00675974670023652 0.0068207827878233 0.00149746484882988 0.00160913958652152 293741 293858 667 665 0 False 661 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 260 670 0.00864623765022959 0.72930366658234 0.00828564888990616 0.742442969405661 0.00214325163883154 0.199341610810864 377943 31783619 667 665 12 True 259 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 304 664 0.00709388953955158 0.00695352480537577 0.00694285496299687 0.00703440909437705 0.00167238257415174 0.00129559111705805 310087 303040 667 665 0 False 304 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 349 664 0.00641238090041727 0.00620789786322065 0.00650034332799268 0.00625619897764553 0.00126191192886197 0.00129648532592472 280297 270545 667 665 0 False 349 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 393 664 0.00630167864110975 0.00625401911737458 0.00628671702143893 0.00622568093385214 0.00134549833676425 0.00128314305424451 275458 272555 667 665 0 False 393 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 438 663 0.00626766040188878 0.00626372523205473 0.00621042191195544 0.00633249408712902 0.00149517831800875 0.00149482915249481 273971 272978 667 665 0 False 438 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 483 663 0.00660747676058972 0.00644726946686928 0.00663767452506294 0.00651560234988937 0.00160288506643108 0.00153481815005794 288825 280977 667 665 0 False 483 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 527 663 0.00641999897281847 0.00638740362005953 0.00636301213092241 0.00643930724040589 0.00171815195944699 0.00164997812928613 280630 278368 667 665 0 False 527 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 572 663 0.00638179422534098 0.00658349926085527 0.0064087891966125 0.00660715648126955 0.00145158826060785 0.00139867800619285 278960 286914 667 665 0 False 572 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 617 663 0.00722239017822286 0.00692846788520856 0.00706492713817044 0.0068055237659266 0.00178365569155665 0.00147440988496393 315704 301948 667 665 0 False 617 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 657 669 0.00828725028650701 0.757200462818754 0.00814831769283589 0.773876554512856 0.00175090143511543 0.194967747962721 362251 32999383 667 665 15 True 661 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C5_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C5_3.csv new file mode 100755 index 0000000..0025cb9 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C5_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 259 272 0.00102761619876718 0.0758377518527378 0.000854505226215 0.0735179674982834 0.000804751948597852 0.020823730631875 44919 3305068 667 665 0 True 258 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 302 272 0.00101782480240768 0.000846152919492597 0.000885023270008392 0.000762951094834821 0.00071510583517805 0.000613314540981992 44491 36876 667 665 0 False 302 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 346 273 0.000990212149590117 0.000990987425074474 0.000869764248111696 0.000869764248111696 0.000699501163206312 0.000733685624652153 43284 43188 667 665 0 True 347 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 391 274 0.000927254386082308 0.000968729904413127 0.00080872816052491 0.000823987182421607 0.00068830420331189 0.000691244902467044 40532 42218 667 665 0 True 392 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 435 273 0.000873973633462509 0.000908244518368478 0.000625619897764553 0.000625619897764553 0.000841025039173635 0.000856300482284355 38203 39582 667 665 0 True 436 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 479 273 0.000946448268198242 0.000894018061863287 0.000732433051041428 0.000625619897764553 0.000874337590198651 0.000869118287798892 41371 38962 667 665 0 True 481 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 523 271 0.000971727457397417 0.000969510064931154 0.000778210116731518 0.000701915007248035 0.000835172015780556 0.000908853657477567 42476 42252 667 665 0 True 526 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 567 271 0.00103690429905212 0.00102760907762655 0.000747692072938125 0.000762951094834821 0.000954447136629051 0.00091423746785908 45325 44784 667 665 0 True 570 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 615 271 0.00104843435457826 0.000928826988505826 0.000671396963454643 0.000610360875867857 0.00103387603775118 0.000946656295209883 45829 40479 667 665 0 False 615 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 655 272 0.00106421954964381 0.0790930863436917 0.000732433051041428 0.0771648737315938 0.00100175528459732 0.0213723659729452 46519 3446938 667 665 0 True 660 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 258 316 0.000997235417539571 0.00103811829872232 0.000854505226215 0.000885023270008392 0.000730261870307028 0.000798034872477795 43591 45242 667 665 0 False 258 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 302 316 0.000886327264383373 0.00093901496703535 0.000732433051041428 0.000823987182421607 0.000663206958172034 0.000666398910499125 38743 40923 667 665 0 False 302 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 347 318 0.000972001982528992 0.000978573694478816 0.000854505226215 0.000823987182421607 0.000696845845650894 0.000725169463302025 42488 42647 667 665 0 True 347 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 391 318 0.000892160923429336 0.000863454126274716 0.000762951094834821 0.000747692072938125 0.000673918601987463 0.000636189893244392 38998 37630 667 665 0 True 392 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 435 317 0.000883582013067625 0.000861756129853129 0.000625619897764553 0.000579842832074464 0.000829668872698768 0.000863773018413232 38623 37556 667 665 0 True 436 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 479 316 0.000904697571104583 0.000911709348904419 0.00064087891966125 0.000671396963454643 0.000866897912500922 0.000880804434856846 39546 39733 667 665 0 True 481 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 524 316 0.00102315516537909 0.000984103655797769 0.00080872816052491 0.000823987182421607 0.00089147381511496 0.000883304262247707 44724 42888 667 665 0 True 526 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 567 315 0.00102315516537909 0.000989977805580557 0.000778210116731518 0.00080872816052491 0.000937941751927688 0.000832050422735926 44724 43144 667 665 0 True 571 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 615 314 0.000996205948296166 0.00100193261822444 0.000518806744487678 0.000579842832074464 0.00108771139716185 0.00108385807699105 43546 43665 667 665 0 False 615 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 660 314 0.00102546575190317 0.00102586518940978 0.00064087891966125 0.00064087891966125 0.00106305911950327 0.00097948680191527 44825 44708 667 665 0 False 660 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 258 361 0.000950314497134587 0.000937959455746255 0.000778210116731518 0.000778210116731518 0.000752446395449205 0.000767875367712289 41540 40877 667 665 0 True 258 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 302 361 0.0010175960314647 0.000902737502947114 0.000885023270008392 0.000762951094834821 0.00074858004913812 0.000717831050883905 44481 39342 667 665 0 True 303 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 347 359 0.000960128770588384 0.000907143115284205 0.000839246204318303 0.000778210116731518 0.000725829440764185 0.000721533574190094 41969 39534 667 665 0 False 347 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 390 362 0.000877290812135704 0.00091659682509088 0.000686655985351339 0.000778210116731518 0.000726812488096694 0.000691917417084211 38348 39946 667 665 0 True 392 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 435 361 0.00096930248540184 0.000900052832929199 0.000701915007248035 0.000579842832074464 0.000868689040343986 0.000907079893169062 42370 39225 667 665 0 True 437 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 479 360 0.000952190418867014 0.000929148231072072 0.000686655985351339 0.000579842832074464 0.000872445028315273 0.000889238482407495 41622 40493 667 665 0 True 481 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 523 359 0.000962004692320811 0.000872035891973009 0.000686655985351339 0.000564583810177768 0.000944571296221044 0.000892336583762452 42051 38004 667 665 0 True 526 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 567 359 0.000987283881519986 0.000974718783683861 0.000732433051041428 0.000656137941557946 0.00098730036809356 0.000979731158491783 43156 42479 667 665 0 True 571 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 611 360 0.00098691784801122 0.00101978452654869 0.000503547722590982 0.000595101853971161 0.0010977226150782 0.00109449890786945 43140 44443 667 665 0 True 615 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 656 360 0.000931029106641461 0.000981120689111196 0.000579842832074464 0.000595101853971161 0.000992542695697121 0.00103107711782566 40697 42758 667 665 0 True 660 358 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 259 406 0.000984286982166962 0.00091333850763324 0.00080872816052491 0.000717174029144732 0.000798512628116015 0.000811925421391577 43025 39804 667 665 0 True 258 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 303 405 0.000906115950951052 0.000815061228259479 0.000762951094834821 0.000610360875867857 0.000730679785198298 0.000710414744260059 39608 35521 667 665 0 True 303 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 347 405 0.000899687487453344 0.000979285017304075 0.000778210116731518 0.000854505226215 0.000722214100675618 0.000699846094519488 39327 42678 667 665 0 True 347 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 391 406 0.000897193884174873 0.000933370276228452 0.000732433051041428 0.000778210116731518 0.000718544536361176 0.000731621640229138 39218 40677 667 665 0 True 392 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 435 405 0.000941278044886918 0.000901636099862841 0.000717174029144732 0.000656137941557946 0.000850125603419656 0.000832371989399172 41145 39294 667 665 0 True 437 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 479 404 0.000919773576246896 0.000959735112558232 0.000595101853971161 0.000701915007248035 0.000897592092211806 0.000870837783815081 40205 41826 667 665 0 True 482 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 524 403 0.000940523100775087 0.000956385011510236 0.000671396963454643 0.000671396963454643 0.000910800764461361 0.000921861646292464 41112 41680 667 665 0 True 526 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 567 403 0.00099995779176102 0.000939588614475075 0.000717174029144732 0.000701915007248035 0.000982209667502907 0.000872474768845183 43710 40948 667 665 0 True 571 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 612 404 0.00102073019338351 0.000854665847498123 0.000625619897764553 0.000457770656900893 0.00103964410530816 0.000995281138398559 44618 37247 667 665 0 True 616 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 656 404 0.000955347457880124 0.000909758947609353 0.000579842832074464 0.000549324788281071 0.000992351880899886 0.00094397091976162 41760 39648 667 665 0 True 660 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 259 449 0.000882895700238688 0.000906133495790288 0.000732433051041428 0.000747692072938125 0.000791552193491022 0.000789693324939235 38593 39490 667 665 0 True 258 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 303 448 0.000894974806027977 0.000939382101396774 0.000732433051041428 0.00080872816052491 0.000812446486406698 0.000793183512319208 39121 40939 667 665 0 True 303 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 346 449 0.000973054328866695 0.000931741117499631 0.000869764248111696 0.000823987182421607 0.000780927621446129 0.000747840380553697 42534 40606 667 665 0 True 348 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 391 449 0.000964361033033495 0.000887822669514253 0.000762951094834821 0.000701915007248035 0.000808784159934601 0.000740610545604142 42154 38692 667 665 0 True 392 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 436 449 0.000948552960873649 0.000989427104038421 0.000671396963454643 0.000549324788281071 0.000950014580887524 0.00109796774770756 41463 43120 667 665 0 True 437 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 480 448 0.000947958156421903 0.00095955154537752 0.00064087891966125 0.000549324788281071 0.000973517204820139 0.00102182744620547 41437 41818 667 665 0 True 482 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 524 447 0.00099963751244085 0.000973938623165834 0.000747692072938125 0.000732433051041428 0.000922423692238878 0.000914988363471456 43696 42445 667 665 0 True 526 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 568 447 0.000902272599109006 0.000982382713478592 0.000534065766384375 0.000549324788281071 0.00097090809625187 0.00103706546807272 39440 42813 667 665 0 True 571 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 612 448 0.000949056256948203 0.000959299140504041 0.000579842832074464 0.00064087891966125 0.000975848506674883 0.000941173393810509 41485 41807 667 665 0 True 616 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 656 447 0.000978636339875382 0.000921002437427971 0.000595101853971161 0.000488288700694286 0.00100020839669518 0.00100241592124686 42778 40138 667 665 0 True 661 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 260 493 0.000967014775972051 0.000923870674626599 0.000823987182421607 0.000762951094834821 0.00078249094785007 0.000800278427634394 42270 40263 667 665 0 True 258 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 304 493 0.000911331928450973 0.000871416352738105 0.00080872816052491 0.000717174029144732 0.000775965426877208 0.000789098307362932 39836 37977 667 665 0 True 303 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 348 493 0.000904720448198881 0.000863775368840963 0.000732433051041428 0.000793469138628214 0.000771660468899491 0.000703880753888983 39547 37644 667 665 0 True 348 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 393 493 0.000915930224404849 0.000942801040137538 0.000671396963454643 0.000747692072938125 0.000834116365859447 0.000826820311046633 40037 41088 667 665 0 True 393 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 436 492 0.000939150475117214 0.000924650835144625 0.000549324788281071 0.000488288700694286 0.000988923986787058 0.00102366069156367 41052 40297 667 665 0 True 437 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 480 491 0.000964818574919453 0.00098616878658078 0.00064087891966125 0.000671396963454643 0.00094679923527354 0.000976628536621577 42174 42978 667 665 0 True 482 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 526 492 0.000945578938614922 0.000998628408971616 0.000610360875867857 0.000717174029144732 0.000940202094473149 0.000925743627149998 41333 43521 667 665 0 True 527 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 568 490 0.000959899999645405 0.00102079414604261 0.000625619897764553 0.000717174029144732 0.000964871785180772 0.00102200920086801 41959 44487 667 665 0 True 571 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 614 492 0.000907671593363309 0.000885619863345707 0.000503547722590982 0.000503547722590982 0.000954158343729048 0.00094322332085965 39676 38596 667 665 0 True 616 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 657 492 0.000941575447112791 0.0010201746068077 0.000595101853971161 0.000686655985351339 0.000969487001274675 0.00104142519609878 41158 44460 667 665 0 True 661 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 261 537 0.000950039972003012 0.000989335320448065 0.00080872816052491 0.00080872816052491 0.000769599178315382 0.000837303177245108 41528 43116 667 665 0 True 259 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 304 536 0.000944435083900028 0.000968844633901072 0.000823987182421607 0.000823987182421607 0.000766017200062457 0.000782429993400333 41283 42223 667 665 0 True 303 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 349 537 0.00101871700908529 0.000961616676160532 0.000900282291905089 0.000854505226215 0.000780158979902397 0.00076693208921275 44530 41908 667 665 0 True 348 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 393 537 0.000923525419711751 0.000936926890354749 0.000701915007248035 0.000686655985351339 0.000850574887870939 0.000874122869695309 40369 40832 667 665 0 True 393 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 437 536 0.000873264443539274 0.00090796916759741 0.000488288700694286 0.000457770656900893 0.000942309288644707 0.00104571587835137 38172 39570 667 665 0 True 437 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 481 534 0.000940477346586492 0.000919143819723261 0.000579842832074464 0.000488288700694286 0.000998006670834861 0.00102610744101072 41110 40057 667 665 0 True 482 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 525 533 0.000956857346103785 0.000923732999241064 0.000579842832074464 0.000518806744487678 0.000978150363056827 0.000977708149340975 41826 40257 667 665 0 True 527 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 569 534 0.000901883688505942 0.000897597621887174 0.000610360875867857 0.000595101853971161 0.000866530892894667 0.000874357284856184 39423 39118 667 665 0 True 571 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 614 534 0.000843478466763414 0.000882889301532614 0.000503547722590982 0.000595101853971161 0.000890036840932269 0.000903199665567269 36870 38477 667 665 0 True 616 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 658 533 0.000987901563066029 0.000916069069446333 0.000625619897764553 0.0004272526131075 0.00103139442669495 0.00106829873045589 43183 39923 667 665 0 True 661 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 260 578 0.00101281471875644 0.000925017969506049 0.000885023270008392 0.00080872816052491 0.000776335817326183 0.000639357358903674 44272 40313 667 665 0 True 259 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 305 577 0.000983943825752493 0.000912971373271815 0.00080872816052491 0.000793469138628214 0.000839726808404434 0.000672737214186158 43010 39788 667 665 0 True 303 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 348 577 0.00097538779248508 0.000885711646936063 0.000839246204318303 0.000717174029144732 0.000745891706489288 0.000745637147519491 42636 38600 667 665 0 True 348 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 393 578 0.00100762161835082 0.000915724880982497 0.00080872816052491 0.000747692072938125 0.000846453405342016 0.000708662564789367 44045 39908 667 665 0 True 393 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 437 576 0.000890101984942525 0.000804896195627544 0.000534065766384375 0.000244144350347143 0.000931773249646659 0.000996361632554144 38908 35078 667 665 0 True 438 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 481 575 0.000942696424733387 0.000975774294972955 0.000488288700694286 0.000473029678797589 0.00106633197572183 0.00105278141469317 41207 42525 667 665 0 True 482 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 526 575 0.000952419189809993 0.000995002957152552 0.000488288700694286 0.000549324788281071 0.00106957575668637 0.00105939064547754 41632 43363 667 665 0 True 527 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 570 574 0.000931898436224781 0.00102058763296431 0.000671396963454643 0.000732433051041428 0.000878450600478941 0.000982170239294892 40735 44478 667 665 0 True 572 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 614 575 0.000871228382146761 0.000957738819467988 0.000610360875867857 0.000701915007248035 0.00080010824550536 0.000847597098778824 38083 41739 667 665 0 True 616 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 658 574 0.000939585139908874 0.000968293932358936 0.000610360875867857 0.000762951094834821 0.000894750350961176 0.000819792069960279 41071 42199 667 665 0 True 661 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 259 621 0.000976646032671465 0.00103699394974045 0.00080872816052491 0.000900282291905089 0.000739570950726523 0.000770851740824418 42691 45193 667 665 0 False 259 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 304 620 0.000911949609997016 0.000906546521946891 0.00080872816052491 0.000762951094834821 0.000725230444228366 0.000715090719958407 39863 39508 667 665 0 False 304 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 348 620 0.000968593295478605 0.000895899625465587 0.000869764248111696 0.000762951094834821 0.000749428573167102 0.000762633489939957 42339 39044 667 665 0 True 348 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 393 620 0.000973420362375461 0.000889061747984059 0.000793469138628214 0.000793469138628214 0.000796853329610522 0.000676629985964105 42550 38746 667 665 0 True 393 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 438 620 0.000909089973209779 0.000916734500476414 0.000595101853971161 0.000534065766384375 0.000897701580173167 0.000967205992904522 39738 39952 667 665 0 False 438 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 482 620 0.000936130698669891 0.00090211796371221 0.000518806744487678 0.000457770656900893 0.00102011596948398 0.00102987623306358 40920 39315 667 665 0 False 482 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 527 619 0.000975433546673676 0.000884357838978311 0.000579842832074464 0.000411993591210803 0.00104439428283667 0.00104007350033445 42638 38541 667 665 0 False 527 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 572 619 0.000911629330676845 0.000908290410163656 0.000625619897764553 0.000564583810177768 0.000856641392951377 0.000958511758040618 39849 39584 667 665 0 False 572 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 617 619 0.000921832514733707 0.000947344327860163 0.000732433051041428 0.000778210116731518 0.000748103891766971 0.000766261267634092 40295 41286 667 665 0 False 617 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 661 619 0.000975959719842528 0.000820132271626652 0.000823987182421607 0.000625619897764553 0.000745265241741802 0.000746319340688834 42661 35742 667 665 0 False 661 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 260 670 0.00105367320917248 0.0745430984189703 0.000885023270008392 0.0737010757610437 0.000715078483369456 0.0230075246695256 46058 3248646 667 665 0 True 259 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 304 664 0.000946013603406582 0.000906592413742069 0.000839246204318303 0.000778210116731518 0.000656740713935276 0.000652193338480815 41352 39510 667 665 0 False 304 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 349 664 0.000907968995589182 0.000880961846135136 0.000839246204318303 0.000762951094834821 0.000634573790179374 0.000641905715128107 39689 38393 667 665 0 False 349 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 393 664 0.000921695252167919 0.00091776706586792 0.000778210116731518 0.000823987182421607 0.000665058821236071 0.000651599193789417 40289 39997 667 665 0 False 393 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 438 663 0.000861208214844283 0.000922126786409833 0.00064087891966125 0.000732433051041428 0.000767656197793283 0.000796040019031965 37645 40187 667 665 0 False 438 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 483 663 0.000941049273943939 0.00088880934311058 0.000656137941557946 0.000656137941557946 0.000880816329108136 0.00077536119893666 41135 38735 667 665 0 False 483 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 527 663 0.000964612681070772 0.000877221664828127 0.000595101853971161 0.000549324788281071 0.000976254014351132 0.000848741149916838 42165 38230 667 665 0 False 527 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 572 663 0.000940706117529471 0.000973686218292355 0.000762951094834821 0.000778210116731518 0.000792727025352174 0.00078383875478385 41120 42434 667 665 0 False 572 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 617 663 0.000956651452255104 0.00101680155986212 0.000823987182421607 0.000839246204318303 0.000696558137402687 0.000769903218649829 41817 44313 667 665 0 False 617 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 657 669 0.00108215519157336 0.0784084266514306 0.000900282291905089 0.0773632410162509 0.000810696352730563 0.023399610319384 47303 3417100 667 665 0 True 661 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C6_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C6_1.csv new file mode 100755 index 0000000..322deb4 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C6_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 271 256 0.0100563588656576 0.0424380475106283 0.010101472495613 0.0417639429312581 0.00145520174279268 0.00826136858729573 439582 1849483 667 665 0 True 271 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 315 255 0.00985769417877466 0.00986501502095821 0.00988784618905928 0.00990310521095598 0.00139667957349579 0.00127309135509425 430898 429925 667 665 0 False 315 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 359 256 0.0101778591134737 0.0651884001603918 0.0102388036926833 0.0645609216449226 0.00133250609530781 0.00968790440123816 444893 2840961 667 665 0 True 360 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 403 256 0.0102959506742394 0.102347766876564 0.0103303578240635 0.100434882124056 0.00136715422586236 0.021714848988851 450055 4460395 667 665 0 True 405 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 447 255 0.0100486492848792 0.0740923492067316 0.0100862134737163 0.070923933775845 0.00157188166853007 0.012671310690364 439245 3229002 667 665 0 True 449 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 492 255 0.00998829951012134 0.064765576105519 0.0100251773861295 0.0693980315861753 0.00166530815036336 0.0177497298217411 436607 2822534 667 665 0 True 494 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 535 254 0.00993167870173405 0.0792409038159601 0.00985732814526589 0.0768902113374533 0.00150733150628593 0.0253414226673607 434132 3453380 667 665 0 True 539 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 579 253 0.00987720834021076 0.0709531209575782 0.00988784618905928 0.0719920653086137 0.00171564305358924 0.0228284110238173 431751 3092192 667 665 0 True 583 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 628 254 0.00966122569294433 0.00974569635349532 0.00970473792629892 0.00976577401388571 0.0019477194979849 0.00200780961741477 422310 424725 667 665 0 False 628 254 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 667 254 0.00966419971520305 0.0418838352461607 0.00976577401388571 0.0421454184786755 0.00179287721018936 0.00772435954899591 422440 1825330 667 665 0 True 673 254 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 271 299 0.00998861978944151 0.010112027608504 0.0100251773861295 0.0100709544518196 0.00151589651701656 0.00152076373052348 436621 440690 667 665 0 False 271 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 315 299 0.0101362456789458 0.0100519781945135 0.0101167315175097 0.0100404364080262 0.00133710525519839 0.00127054018274972 443074 438073 667 665 0 False 315 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 358 300 0.0102179855368722 0.107972701265638 0.0102235446707866 0.107515068284123 0.00133254205008039 0.0280869768015949 446647 4705534 667 665 0 True 360 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 402 300 0.01031043187493 0.0570891178507037 0.0103303578240635 0.0570077058060578 0.00139895764103108 0.00973568247786298 450688 2487988 667 665 0 True 405 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 446 300 0.0102937315960925 0.0822200844294302 0.0103150988021668 0.081879911497673 0.00183108893022649 0.0188204358085564 449958 3583215 667 665 0 True 449 298 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 490 298 0.0101970301184953 0.043990016239959 0.0102082856488899 0.0453040360112917 0.00172597955819018 0.0113763506278766 445731 1917119 667 665 0 True 494 298 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 535 298 0.0102481604242511 0.0424341467080381 0.0102388036926833 0.0455024032959487 0.00161656842492604 0.00830775009640021 447966 1849313 667 665 0 True 539 298 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 580 298 0.0101768982755132 0.0510694681313033 0.0101319905394064 0.0531929503318837 0.00201211318822338 0.00970669419990318 444851 2225647 667 665 0 True 584 298 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 628 298 0.00998759032019811 0.00963569372045357 0.0100251773861295 0.00955214770733196 0.00197544394434752 0.00195338423399046 436576 419931 667 665 0 False 628 298 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 673 298 0.00960531407448027 0.0097620338325787 0.00950637064164187 0.00970473792629892 0.0019037241136374 0.00185472102772163 419866 425437 667 665 0 False 673 298 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 270 344 0.00998619481744593 0.0501385760120145 0.00999465934233616 0.0506904707408255 0.00150705618898574 0.0118296453871766 436515 2185078 667 665 0 True 271 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 314 344 0.0102544287480888 0.0631701019543595 0.0102235446707866 0.0670328831921874 0.00126398240268116 0.0197261658356875 448240 2753002 667 665 0 True 315 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 358 344 0.010337770002616 0.0408058140315311 0.0102845807583734 0.0419165331502251 0.00126127670641979 0.00888648650829549 451883 1778349 667 665 0 True 360 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 402 344 0.0103715365937997 0.0346371995449829 0.0102388036926833 0.0356908522163729 0.00152721001927807 0.00520301440874113 453359 1509516 667 665 0 True 405 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 447 344 0.0105105835729423 0.075010758757732 0.010452429999237 0.0721141374837873 0.00167755774366731 0.0135639917179824 459437 3269027 667 665 0 True 450 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 492 342 0.0105300062260012 0.0333929123564232 0.0103303578240635 0.034531166552224 0.00188257253207492 0.00491257608471525 460286 1455289 667 665 0 True 494 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 536 342 0.0101705384432984 0.0298491938245706 0.0102845807583734 0.0300755321583886 0.00167550452668715 0.0034735731535476 444573 1300851 667 665 0 True 539 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 579 342 0.0103034086069806 0.0494429022889106 0.0102845807583734 0.0504768444342718 0.00185874836732217 0.00961600065591968 450381 2154760 667 665 0 True 584 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 624 342 0.00991516143965097 0.0587374364040107 0.00987258716716258 0.0584115358205539 0.00196062566887384 0.0146861806738374 433410 2559823 667 665 0 True 628 341 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 667 343 0.00983099660972901 0.0601869287547089 0.0097962920576791 0.0611581597619593 0.00196310732534468 0.0167067547091263 429731 2622993 667 665 0 True 673 341 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 271 388 0.0101400432765993 0.0443736487017498 0.0101625085831998 0.0466926070038911 0.00153217024912299 0.0102053759501407 443240 1933838 667 665 0 True 271 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 316 389 0.0102607657032093 0.032225149736323 0.0102693217364767 0.0327000839246204 0.00134157312476176 0.00352780046148662 448517 1404397 667 665 0 True 316 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 359 388 0.0106789132327862 0.0862249696110269 0.0104829480430304 0.0822613870450904 0.00220421339906934 0.0209006611940162 466795 3757751 667 665 0 True 360 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 403 388 0.0105540042979197 0.0677991614421726 0.0105134660868238 0.0665445944914931 0.00163968049918693 0.0173967954148646 461335 2954740 667 665 0 True 405 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 448 388 0.0105987747714607 0.0463998632424504 0.010605020218204 0.0476691844052796 0.00171024019125702 0.0088693774799124 463292 2022142 667 665 0 True 450 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 491 387 0.0104905661154316 0.0555658314933592 0.0104829480430304 0.0562294956893263 0.00191338566006342 0.0133061779416726 458562 2421602 667 665 0 True 494 385 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 536 386 0.0103092193889322 0.0428341395948099 0.0103150988021668 0.0442511635004196 0.00177007237280211 0.00607232439519236 450635 1866745 667 665 0 True 539 385 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 579 385 0.0103287335503683 0.0496541651680127 0.0103456168459602 0.0509803921568627 0.00198597237241525 0.00889312963100379 451488 2163967 667 665 0 True 584 385 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 624 385 0.0100819354570826 0.0434247440528536 0.0100862134737163 0.0444953078507668 0.00207321471657179 0.00762639593698152 440700 1892484 667 665 0 True 628 385 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 668 386 0.00983342158172459 0.108704675398728 0.00975051499198901 0.109788662546731 0.00192287330276662 0.0275163757784542 429837 4737434 667 665 0 True 673 385 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 271 431 0.0104125323467815 0.0455546511047589 0.0104219119554437 0.0469367513542382 0.00156534407760628 0.00889005095632529 455151 1985307 667 665 0 True 271 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 315 432 0.0105141066454642 0.0522799101209191 0.0105439841306172 0.0522163729304952 0.00148136607817588 0.00864112954687262 459591 2278399 667 665 0 True 316 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 360 433 0.0105286793545319 0.0361303120469978 0.0105439841306172 0.0370336461432822 0.00137246779989618 0.00476797189632393 460228 1574587 667 665 0 True 360 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 404 432 0.0109357543704687 0.0550089804506689 0.0108796826123445 0.0545052262149996 0.00157082095247517 0.00998989502167008 478022 2397334 667 665 0 True 405 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 449 432 0.0108754274728051 0.103178591936467 0.0108491645685512 0.103242542153048 0.00185237202862093 0.0164624223623862 475385 4496603 667 665 0 True 450 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 493 431 0.0106715696855166 0.0631882980511476 0.0107423514152743 0.0627145799954223 0.00177392881701128 0.0159568488588344 466474 2753795 667 665 0 True 495 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 537 430 0.0105181101369663 0.0545331972641606 0.0105745021744106 0.0543526359960327 0.0017076361729907 0.00948447868412287 459766 2376599 667 665 0 True 539 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 581 429 0.0103517250301377 0.0336143632140548 0.010452429999237 0.0341802090486 0.00196549342064739 0.00474594998525011 452493 1464940 667 665 0 True 584 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 625 430 0.0101798722977719 0.0403924666323626 0.0101930266269932 0.0406042572671092 0.00180121755898596 0.00507771861378628 444981 1760335 667 665 0 True 629 428 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 670 430 0.0100540025249449 0.0759053504670351 0.0101167315175097 0.0750591287098497 0.00190024750962532 0.0132498973933515 439479 3308014 667 665 0 True 673 428 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 274 476 0.0100257721905813 0.060347159957573 0.0100099183642329 0.0612039368276493 0.0016242493930504 0.0155837690753187 438245 2629976 667 665 0 True 271 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 317 476 0.0103917828222533 0.0588218773071383 0.0103913939116503 0.0576333257038224 0.00160143711632781 0.00826892234775376 454244 2563503 667 665 0 True 316 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 361 476 0.0106105107208355 0.0716565962858623 0.0105745021744106 0.0678416113527123 0.0015352819824121 0.018401089644465 463805 3122850 667 665 0 True 361 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 406 476 0.01101603009436 0.0944754883317243 0.0110170138094148 0.0918440527962158 0.00177713570396148 0.0193083112041998 481531 4117315 667 665 0 True 405 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 450 475 0.010987845514185 0.100582125948885 0.0109407186999313 0.0953536278324559 0.00196116375469535 0.0318843072096073 480299 4383447 667 665 0 True 450 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 493 475 0.0107454169459102 0.0454591273330958 0.0107423514152743 0.0461127641718166 0.00191897575979969 0.00745506684811152 469702 1981144 667 665 0 True 495 472 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 538 474 0.0104671170937763 0.0413365526427651 0.0104676890211337 0.0428931105516136 0.00166918997577362 0.00610992140837695 457537 1801479 667 665 0 True 539 472 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 582 474 0.0105560174822179 0.104840333839864 0.0105745021744106 0.103685053788052 0.00188239135025049 0.0192504543315798 461423 4569023 667 665 0 True 584 472 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 627 474 0.0101890231354911 0.0639517539557293 0.0101930266269932 0.0680704966811627 0.0019746663733857 0.0157603730233185 445381 2787067 667 665 0 True 629 472 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 671 474 0.0102177110117406 0.0857386313116277 0.0102388036926833 0.0844739452201114 0.00195570299921714 0.013405751258222 446635 3736556 667 665 0 True 673 472 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 273 520 0.00991241618833522 0.0536642361224645 0.00996414129854276 0.056946669718471 0.00155581461846351 0.0118664062687109 433290 2338729 667 665 0 True 271 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 318 520 0.0103832039118916 0.124974303462938 0.0103608758678569 0.11990539406424 0.00157663542057514 0.0378299225085617 453869 5446477 667 665 0 True 316 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 362 520 0.0106953161093978 0.0595187901087119 0.010605020218204 0.0617074845502403 0.00162606009501839 0.0119358656738716 467512 2593875 667 665 0 True 361 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 407 519 0.0108761137856341 0.0613548978878875 0.0108796826123445 0.0607309071488518 0.00170688846049709 0.00834878458645841 475415 2673894 667 665 0 True 405 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 451 519 0.0109372413815981 0.0566099616172498 0.0108796826123445 0.056946669718471 0.00183854986647009 0.0069147240982697 478087 2467106 667 665 0 True 450 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 496 517 0.0107596464985635 0.0669430500031264 0.0108339055466545 0.0645761806668193 0.00193981129740796 0.0153601579967167 470324 2917430 667 665 0 True 495 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 539 516 0.0112644295842466 0.074935220862869 0.0109254596780346 0.0723887998779278 0.00333536928476758 0.01929534867715 492389 3265735 667 665 0 True 539 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 583 516 0.0105819601071517 0.0585491653142928 0.0105134660868238 0.0600747692072938 0.0020989873143006 0.0124283949395918 462557 2551618 667 665 0 True 584 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 628 516 0.0102464675192731 0.0514644129206055 0.0101930266269932 0.0498207064927138 0.00203155160280305 0.00834519669587432 447892 2242859 667 665 0 True 629 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 671 516 0.0100969657080363 0.0705426417956083 0.0101167315175097 0.0695811398489357 0.00191302914101813 0.0176414776499901 441357 3074303 667 665 0 True 674 515 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 275 562 0.00985119708399405 0.0450120494644714 0.00984206912336919 0.0456855115587091 0.00144863403374742 0.0086845853574798 430614 1961660 667 665 0 True 271 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 318 562 0.0102313457599422 0.0559411804861203 0.0102388036926833 0.0554207675288014 0.00145929765523298 0.0126665500388125 447231 2437960 667 665 0 True 316 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 363 561 0.010523463377032 0.0470127022752578 0.0104982070649271 0.046494239719234 0.00145456962069937 0.00852587519371708 460000 2048850 667 665 0 True 361 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 408 561 0.0107888605479819 0.0513642540776294 0.0106507972838941 0.0502479591058213 0.00182733729274007 0.00779027294410949 471601 2238494 667 665 0 True 406 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 451 560 0.0108403111330579 0.0920235814989522 0.0107270923933776 0.0875867856870375 0.00205812319037259 0.0190492582141448 473850 4010459 667 665 0 True 450 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 495 558 0.010629361446537 0.0649661691422422 0.0106813153276875 0.0637521934843976 0.00202580726769741 0.0121497253912206 464629 2831276 667 665 0 True 495 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 539 558 0.0106121121174364 0.0551338061335532 0.0106507972838941 0.0551613641565576 0.00203830954575319 0.00771792370906887 463875 2402774 667 665 0 True 540 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 583 557 0.0102402220725298 0.067693059611721 0.0101930266269932 0.0411993591210803 0.00169875939055939 0.0990396833037793 447619 2950116 667 665 0 True 584 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 628 557 0.0102407482456986 0.048990087945889 0.0102998397802701 0.0484473945220111 0.00177497051043431 0.00995706572931045 447642 2135026 667 665 0 True 629 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 671 558 0.00989836965243631 0.0520646776015342 0.00987258716716258 0.0514991989013504 0.00183655454121952 0.00658494247707234 432676 2269019 667 665 0 True 674 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 272 604 0.00948399684341853 0.00978240978963775 0.00952162966353857 0.00968947890440223 0.00133336954611999 0.00147147022073111 414563 426325 667 665 0 False 272 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 316 604 0.00990342549027615 0.00963369742736333 0.00990310521095598 0.00961318379491875 0.00148649937960476 0.00148775038597154 432897 419844 667 665 0 False 316 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 362 603 0.0100784810158436 0.0805784201864239 0.0100404364080262 0.0757305256733043 0.00141533021241467 0.0179435793391026 440549 3511670 667 665 0 True 361 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 407 603 0.0103692488843699 0.0803817050063933 0.0103303578240635 0.0784466315709163 0.00150514058292868 0.0183635277985487 453259 3503097 667 665 0 True 406 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 450 603 0.0103472411196553 0.0100549611612001 0.0103761348897536 0.0101167315175097 0.00186888024137621 0.00219106787294373 452297 438203 667 665 0 False 450 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 495 603 0.00996894548834532 0.010108172697709 0.0100556954299229 0.0100709544518196 0.00207132443623901 0.00202321118325407 435761 440522 667 665 0 False 495 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 540 603 0.00978085001902802 0.00993596373630345 0.0097962920576791 0.00997940032043946 0.002002878976984 0.00209043000397964 427539 433017 667 665 0 False 540 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 584 603 0.00988777755777639 0.00976836690031327 0.00987258716716258 0.00971999694819562 0.00171200217855909 0.00175761524695514 432213 425713 667 665 0 False 584 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 629 603 0.00974253088607905 0.00983077974175539 0.0097962920576791 0.00978103303578241 0.00146580190406073 0.00158386628942036 425864 428433 667 665 0 False 629 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 674 602 0.00966646454753855 0.00968383421359533 0.00970473792629892 0.00973525597009232 0.00167556519693179 0.00170859235556209 422539 422029 667 665 0 False 674 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 273 653 0.00955294840563239 0.0400788191582183 0.00959792477302205 0.0404821850919356 0.00134065232214072 0.00843856885955321 417577 1746666 667 665 0 True 272 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 316 647 0.00956825318171768 0.00950396132239502 0.00962844281681544 0.00953688868543526 0.00136819869220726 0.00132694654481825 418246 414190 667 665 0 False 316 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 361 647 0.00976993764504793 0.0100007629510948 0.00971999694819562 0.0100404364080262 0.00134793589153743 0.00125915899639278 427062 435841 667 665 0 False 361 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 406 647 0.0100079738112175 0.00993332495808071 0.0100251773861295 0.00997940032043946 0.00145550665699706 0.0014176063696248 437467 432902 667 665 0 False 406 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 450 647 0.00984858909524409 0.00985512533909734 0.00984206912336919 0.00991836423285267 0.00161745213662836 0.00166990642870211 430500 429494 667 665 0 False 450 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 495 646 0.00971606208797638 0.0098786219382285 0.0097962920576791 0.00985732814526589 0.00176603254579989 0.00176147100054107 424707 430518 667 665 0 False 495 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 540 646 0.00971592482541059 0.00970558692450972 0.00965896086060884 0.00971999694819562 0.00181767162454098 0.0017511431117872 424701 422977 667 665 0 False 540 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 585 646 0.0096908972842487 0.00970577049169043 0.0098115510795758 0.00968947890440223 0.00148891065071128 0.0012933442260961 423607 422985 667 665 0 False 585 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 629 646 0.00983236923538688 0.00960382186870243 0.0098115510795758 0.00959792477302205 0.00134404410726765 0.00141448160482087 429791 418542 667 665 0 False 629 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 670 652 0.00956454709244142 0.0410945652067913 0.00958266575112535 0.0417639429312581 0.00137615868950558 0.0080561853813348 418084 1790933 667 665 0 True 674 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C6_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C6_2.csv new file mode 100755 index 0000000..efd4990 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C6_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 271 256 0.00817089738490791 0.749216345969066 0.00819409475852598 0.75371938658732 0.00181407598098318 0.170857658325557 357165 32651429 667 665 13 True 271 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 315 255 0.00683935898839319 0.00648308801300574 0.0068055237659266 0.00654612039368277 0.00150566120418571 0.00130694261360098 298961 282538 667 665 0 False 315 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 359 256 0.00643475469864061 0.00638235552258995 0.00645456626230259 0.0063782711528191 0.00123816045490594 0.00129644624060381 281275 278148 667 665 0 True 360 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 403 256 0.00638167983986949 0.00646046335798296 0.00645456626230259 0.00642404821850919 0.00143001454264599 0.00131974800343691 278955 281552 667 665 0 True 405 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 447 255 0.0066185263971356 0.00645121616125459 0.00656137941557946 0.00654612039368277 0.00152971682923672 0.00165859130542659 289308 281149 667 665 0 True 449 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 492 255 0.00663238991628013 0.00675006353145395 0.00660715648126955 0.00674448767833982 0.00157954638822758 0.00151983334545014 289914 294173 667 665 0 True 494 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 535 254 0.00683196968693497 0.00691073070637225 0.00685130083161669 0.00689707789730678 0.00146288428401112 0.0014779872023434 298638 301175 667 665 0 True 539 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 579 253 0.00720596442451697 0.00706141641583932 0.00715648126955062 0.00708018616006714 0.0017229402333741 0.00169672917484409 314986 307742 667 665 0 True 583 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 628 254 0.00882568557790228 0.00789008456136909 0.00822461280231937 0.00790417334248875 0.00459867287714111 0.00182502033334089 385787 343856 667 665 0 False 628 254 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 667 254 0.0090407073872082 0.753242295484649 0.00912489509422446 0.740306706340124 0.00192487473832649 0.167865225343216 395186 32826883 667 665 12 True 673 254 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 271 299 0.0068316494076148 0.00667702673942811 0.00677500572213321 0.00662241550316625 0.00166088291276262 0.00146837693216392 298624 290990 667 665 0 False 271 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 315 299 0.0063239838080502 0.00629243054993859 0.00631723506523232 0.00630197604333562 0.0012416862469868 0.00118694147360001 276433 274229 667 665 0 False 315 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 358 300 0.00633601715965089 0.00628722183118588 0.00636301213092241 0.00630197604333562 0.00124639140055503 0.00131964766155964 276959 274002 667 665 0 True 360 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 402 300 0.00663788041891162 0.00665355308619454 0.00659189745937285 0.00660715648126955 0.00142836867439579 0.00149460142782692 290154 289967 667 665 0 True 405 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 446 300 0.00677248924176044 0.00673872825804497 0.00679026474402991 0.00672922865644312 0.00163928206638666 0.00165885625061624 296038 293679 667 665 0 True 449 298 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 490 298 0.00687914225537723 0.00682213659578105 0.00686655985351339 0.00688181887541009 0.00171697706003069 0.0016193709284624 300700 297314 667 665 0 True 494 298 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 535 298 0.00686790960207697 0.00696066097952595 0.00686655985351339 0.00698863202868696 0.00156646604607498 0.00160288852875376 300209 303351 667 665 0 True 539 298 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 580 298 0.00714483682855299 0.00717284169453159 0.00711070420386053 0.0072480354009308 0.00172930475740247 0.00194032106612975 312314 312598 667 665 0 True 584 298 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 628 298 0.0075915807260023 0.00747749437682097 0.00761425192645151 0.00749217975127794 0.00191086939384634 0.00186267130312772 331842 325875 667 665 0 False 628 298 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 673 298 0.00764083511002567 0.0077273063638726 0.0076600289921416 0.00782787823300526 0.00201933008979563 0.00196248179821631 333995 336762 667 665 0 False 673 298 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 270 344 0.00637797375059323 0.00665694907903772 0.0064087891966125 0.00668345159075303 0.00140488951377254 0.00140110890537183 278793 290115 667 665 0 True 271 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 314 344 0.0063326313496948 0.00667668255096427 0.00630197604333562 0.00669871061264973 0.00127733000255032 0.00122611105214378 276811 290975 667 665 0 True 315 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 358 344 0.00675649815284621 0.00687397137843464 0.00675974670023652 0.00689707789730678 0.00131434327087346 0.00127049658278183 295339 299573 667 665 0 True 360 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 402 344 0.00686626245128752 0.00709787744710827 0.00689707789730678 0.00709544518196384 0.00140349486815547 0.00137562133149286 300137 309331 667 665 0 True 405 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 447 344 0.00703987671991425 0.00717339239607373 0.00697337300679027 0.00720225833524071 0.00174216192020395 0.00175008861165583 307726 312622 667 665 0 True 450 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 492 342 0.00708531062918987 0.00723667718162424 0.00708018616006714 0.00720225833524071 0.00163715940000026 0.00157271543805702 309712 315380 667 665 0 True 494 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 536 342 0.00695639820282123 0.00723197327261849 0.00697337300679027 0.0072632944228275 0.00155233698664431 0.00158971177307643 304077 315175 667 665 0 True 539 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 579 342 0.00725251931141319 0.00721015172401133 0.00721751735713741 0.00720225833524071 0.00188998666068519 0.00192987513436012 317021 314224 667 665 0 True 584 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 624 342 0.00715682442596509 0.00738740878288649 0.00721751735713741 0.00752269779507134 0.00203916641702781 0.00197363288628706 312838 321949 667 665 0 True 628 341 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 667 343 0.0067175613383512 0.006915434615378 0.00665293354695964 0.00692759594110018 0.00187841274441188 0.00190625880500423 293637 301380 667 665 0 True 673 341 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 271 388 0.006467423189298 0.00688560494851227 0.00654612039368277 0.00674448767833982 0.00134626344458487 0.00162502419040801 282703 300080 667 665 0 True 271 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 316 389 0.00673593164507241 0.0703694002688112 0.00679026474402991 0.0728007934691386 0.00140443467145432 0.0128358268616195 294440 3066753 667 665 0 True 316 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 359 388 0.00699954440266706 0.00689122669342158 0.00697337300679027 0.00692759594110018 0.00168523197559204 0.00141491491311856 305963 300325 667 665 0 True 360 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 403 388 0.00699023342528781 0.00697853583374779 0.00697337300679027 0.00701915007248035 0.00144898994801101 0.00146934003879962 305556 304130 667 665 0 True 405 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 448 388 0.00706918227770985 0.00727125664929089 0.00711070420386053 0.00729381246662089 0.00158479145213805 0.00168377187661373 309007 316887 667 665 0 True 450 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 491 387 0.0071632528894628 0.00724555724399119 0.00717174029144732 0.00720225833524071 0.00163491750374902 0.00172131458313845 313119 315767 667 665 0 True 494 385 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 536 386 0.00721623623985673 0.00699434555718663 0.0072327763790341 0.00695811398489357 0.00167756992730767 0.00172793051107189 315435 304819 667 665 0 True 539 385 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 579 385 0.00702969641295168 0.00705455559246021 0.00714122224765393 0.00715648126955062 0.00184464033919312 0.00196051541989743 307281 307443 667 665 0 True 584 385 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 624 385 0.00676127946555447 0.00652402349430454 0.00672922865644312 0.00650034332799268 0.00188063612644769 0.00194412231562079 295548 284322 667 665 0 True 628 385 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 668 386 0.00619312682866623 0.00612017569673784 0.00621042191195544 0.00613412680247196 0.00175141140334317 0.00192009574424934 270713 266722 667 665 0 True 673 385 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 271 431 0.00668136977517192 0.0067689709510673 0.00666819256885634 0.00683604180972 0.00144227722013539 0.00157531386956841 292055 294997 667 665 0 True 271 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 315 432 0.00681506351424883 0.0068884731857109 0.00679026474402991 0.00689707789730678 0.0014464537511385 0.00142648431845814 297899 300205 667 665 0 True 316 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 360 433 0.00703838970878488 0.00699310647871682 0.00712596322575723 0.00698863202868696 0.00131755156414924 0.00128007811237103 307661 304765 667 665 0 True 360 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 404 432 0.00731746738212491 0.00713732144506379 0.00730907148851759 0.00714122224765393 0.00144263568837499 0.00148704588400496 319860 311050 667 665 0 True 405 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 449 432 0.00749519952772527 0.00747175790242372 0.00750743877317464 0.00746166170748455 0.00173392258987466 0.00171650866929254 327629 325625 667 665 0 True 450 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 493 431 0.00728486752275041 0.00764008900713675 0.00732433051041428 0.00764476997024491 0.00173425654755005 0.00181153405982751 318435 332961 667 665 0 True 495 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 537 430 0.00714447079504423 0.00746324497441819 0.00712596322575723 0.00749217975127794 0.00164726965994271 0.00161411292134866 312298 325254 667 665 0 True 539 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 581 429 0.00660216927471261 0.00691536577768523 0.00662241550316625 0.00694285496299687 0.00175690980099065 0.00187456302662021 288593 301377 667 665 0 True 584 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 625 430 0.00631602257923453 0.00643141385163527 0.00633249408712902 0.00642404821850919 0.00185840233031568 0.00163275963126584 276085 280286 667 665 0 True 629 428 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 670 430 0.00608482666426 0.0061363525545381 0.00613412680247196 0.00610360875867857 0.00184426409541723 0.00186850163466037 265979 267427 667 665 0 True 673 428 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 274 476 0.00665050857496406 0.00682186124500998 0.00666819256885634 0.00674448767833982 0.00145366247159427 0.00155630253885145 290706 297302 667 665 0 True 271 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 317 476 0.00651194201480171 0.00708330680213925 0.00645456626230259 0.00700389105058366 0.00147182347392795 0.00164741870280449 284649 308696 667 665 0 True 316 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 361 476 0.0068055695201152 0.00682606034426878 0.00675974670023652 0.00683604180972 0.00147047407649222 0.00142282841765713 297484 297485 667 665 0 True 361 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 406 476 0.00694752189023364 0.00723130784158841 0.00700389105058366 0.0072632944228275 0.00157939351506991 0.00162109130873079 303689 315146 667 665 0 True 405 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 450 475 0.00714099347671095 0.0072609998330686 0.0072632944228275 0.00727855344472419 0.00188819212785977 0.00189812885607213 312146 316440 667 665 0 True 450 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 493 475 0.00702358822877415 0.00729663481202434 0.00706492713817044 0.0072632944228275 0.00180425618441459 0.00209433596273645 307014 317993 667 665 0 True 495 472 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 538 474 0.00666796379791336 0.00669359367748738 0.00665293354695964 0.00675974670023652 0.00174992814533602 0.00171376370446717 291469 291712 667 665 0 True 539 472 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 582 474 0.00651047788076664 0.00638208017181888 0.00659189745937285 0.0063935301747158 0.00188427672459478 0.00193180514597199 284585 278136 667 665 0 True 584 472 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 627 474 0.00626212414506869 0.0061929600838902 0.00633249408712902 0.00619516289005875 0.00178414661037624 0.0017955339741084 273729 269894 667 665 0 True 629 472 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 671 474 0.00610118378668299 0.00630716181619074 0.00611886778057527 0.00634775310902571 0.001745264116372 0.00189599179311302 266694 274871 667 665 0 True 673 472 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 273 520 0.00673968348853726 0.00694450706762328 0.00674448767833982 0.00698863202868696 0.00143492180365313 0.00161535889717847 294604 302647 667 665 0 True 271 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 318 520 0.00667526159099439 0.0068088738669746 0.00668345159075303 0.00683604180972 0.00149090424563744 0.00146181206369409 291788 296736 667 665 0 True 316 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 362 520 0.00672476762305503 0.00711889588929981 0.00675974670023652 0.00708018616006714 0.00146524257147852 0.00159968880724325 293952 310247 667 665 0 True 361 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 407 519 0.00690616010374305 0.00719796745239156 0.00685130083161669 0.00729381246662089 0.00166874808714192 0.00166861584932643 301881 313693 667 665 0 True 405 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 451 519 0.00694031560552981 0.00693165736497343 0.0068207827878233 0.00698863202868696 0.00189372372307327 0.0018462911003918 303374 302087 667 665 0 True 450 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 496 517 0.00694987823094633 0.00693229985010592 0.00694285496299687 0.00683604180972 0.00171657844293787 0.00195172982714196 303792 302115 667 665 0 True 495 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 539 516 0.00716334439783999 0.0067006610139448 0.00700389105058366 0.00665293354695964 0.00216922830688153 0.00166180266677394 313123 292020 667 665 0 True 539 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 583 516 0.00671982617068669 0.00667305709914521 0.00666819256885634 0.00671396963454643 0.00179853045068997 0.00173187009190727 293736 290817 667 665 0 True 584 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 628 516 0.00630344017737069 0.00647026125625347 0.00627145799954223 0.00634775310902571 0.00177847206524566 0.00209116986476102 275535 281979 667 665 0 True 629 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 671 516 0.00631538202059419 0.00634834970236303 0.0063782711528191 0.0064087891966125 0.00181029394001396 0.00184772869001347 276057 276666 667 665 0 True 674 515 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 275 562 0.00670262259577467 0.00686974933327826 0.00669871061264973 0.00695811398489357 0.00135932475162496 0.00131413477787333 292984 299389 667 665 0 True 271 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 318 562 0.0068294760836565 0.00699156910357836 0.00688181887541009 0.00694285496299687 0.00141355336067274 0.00143134404839012 298529 304698 667 665 0 True 316 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 363 561 0.00686486694853535 0.00744332793531093 0.00691233691920348 0.0072480354009308 0.00130757764048511 0.00198265175595355 300076 324386 667 665 0 True 361 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 408 561 0.00700144320149378 0.00705386721553254 0.00698863202868696 0.00717174029144732 0.00158597074702388 0.00152759610694531 306046 307413 667 665 0 True 406 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 451 560 0.00701166926264494 0.00719867877521682 0.00709544518196384 0.00718699931334401 0.00189491436046093 0.00200243202994664 306493 313724 667 665 0 True 450 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 495 558 0.0068685959149059 0.00701660307784797 0.00679026474402991 0.00701915007248035 0.00193902886773856 0.00201930693183991 300239 305789 667 665 0 True 495 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 539 558 0.00679454276066361 0.00700490067007757 0.0068207827878233 0.00704966811627375 0.00190215511947602 0.00176495780558684 297002 305279 667 665 0 True 540 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 583 557 0.00675604061096026 0.0181065618956983 0.00675974670023652 0.00776684214541848 0.0016152457306212 0.0335486906950475 295319 789098 667 665 0 True 584 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 628 557 0.00660873500077611 0.0066935477856922 0.00665293354695964 0.00668345159075303 0.0016188173522902 0.00158429783986281 288880 291710 667 665 0 True 629 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 671 558 0.00638000981198575 0.00656014033710965 0.0063935301747158 0.00659189745937285 0.00171137856621082 0.0016325464154131 278882 285896 667 665 0 True 674 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 272 604 0.00709871660644843 0.00724879261555124 0.00701915007248035 0.00703440909437705 0.00140155891162332 0.00229735176313346 310298 315908 667 665 0 False 272 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 316 604 0.00694944356615467 0.0067131894740284 0.00692759594110018 0.00668345159075303 0.00139930320244616 0.00140659231012119 303773 292566 667 665 0 False 316 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 362 603 0.00658224332557914 0.00671431382301026 0.00663767452506294 0.00669871061264973 0.00135726075998058 0.00155421999580738 287722 292615 667 665 0 True 361 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 407 603 0.00653928014248769 0.00667707263122329 0.00654612039368277 0.00669871061264973 0.00151603277472228 0.00136613842161804 285844 290992 667 665 0 True 406 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 450 603 0.0066001560904144 0.00657718913901829 0.00650034332799268 0.00659189745937285 0.00176876946016167 0.00189691675638862 288505 286639 667 665 0 False 450 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 495 603 0.0067197117852152 0.0066467381546106 0.00683604180972 0.00656137941557946 0.00206059550165975 0.00197609898315327 293731 289670 667 665 0 False 495 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 540 603 0.0066240626539557 0.00673886593343051 0.00669871061264973 0.00675974670023652 0.00186601318025224 0.00190843733551753 289550 293685 667 665 0 False 540 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 584 603 0.00664780907783691 0.0066062156994684 0.00666819256885634 0.00665293354695964 0.00170611555699482 0.00170780787655733 290588 287904 667 665 0 False 584 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 629 603 0.00658430226406595 0.00639933548680582 0.00654612039368277 0.00643930724040589 0.00137565826791087 0.00147574066472347 287812 278888 667 665 0 False 629 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 674 602 0.00656867720866049 0.00660591740279974 0.00660715648126955 0.00663767452506294 0.00162385039505988 0.0015655327303674 287129 287891 667 665 0 False 674 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 273 653 0.00883769605240868 0.744960042587586 0.00856031128404669 0.747890440222782 0.00194302721563534 0.192668809493337 386312 32465936 667 665 14 True 272 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 316 647 0.00747131584127826 0.00704982873755687 0.0072632944228275 0.00704966811627375 0.00181671905271753 0.0013158296764683 326585 307237 667 665 0 False 316 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 361 647 0.00662820340802361 0.00654398642520699 0.00656137941557946 0.00650034332799268 0.00125608691206722 0.00136107727879511 289731 285192 667 665 0 False 361 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 406 647 0.00659105100688383 0.00640798609019688 0.00657663843747616 0.00645456626230259 0.00133521228673327 0.00141253508077413 288107 279265 667 665 0 False 406 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 450 647 0.00662884396666396 0.00647817759092168 0.00656137941557946 0.00651560234988937 0.00153806421265201 0.00160329065409296 289759 282324 667 665 0 False 450 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 495 646 0.00658405061602868 0.00657923132390372 0.00643930724040589 0.00663767452506294 0.00170219076866537 0.00163312840247112 287801 286728 667 665 0 False 495 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 540 646 0.00643928436331159 0.00659293002476436 0.00648508430609598 0.00650034332799268 0.00165553073584205 0.00168871910858693 281473 287325 667 665 0 False 540 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 585 646 0.00653829642743289 0.00651686437425677 0.00656137941557946 0.00656137941557946 0.00145619272131916 0.0012823161295273 285801 284010 667 665 0 False 585 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 629 646 0.00716849174405702 0.00689643541217429 0.00698863202868696 0.00692759594110018 0.00174983776882619 0.001357996462186 313348 300552 667 665 0 False 629 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 670 652 0.00827839685101372 0.772847201547012 0.00831616693369955 0.776592660410468 0.0015683662856311 0.182160528437867 361864 33681280 667 665 15 True 674 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C6_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C6_3.csv new file mode 100755 index 0000000..c68ef21 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C6_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 271 256 0.00112548440817357 0.077319965053398 0.000946059357595178 0.075043869687953 0.000830875772568357 0.0220743237891811 49197 3369664 667 665 0 True 271 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 315 255 0.000928032207288436 0.000976210267027147 0.00080872816052491 0.000869764248111696 0.000646062779164653 0.000675327878063077 40566 42544 667 665 0 False 315 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 359 256 0.000904102766652838 0.000982130308605113 0.000778210116731518 0.000869764248111696 0.000656848924229576 0.000684998037962581 39520 42802 667 665 0 True 360 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 403 256 0.000921741006356515 0.000967536717738498 0.000778210116731518 0.000839246204318303 0.000671547959618353 0.000690237312407696 40291 42166 667 665 0 True 405 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 447 255 0.000979871702967468 0.00105865487706449 0.000778210116731518 0.000823987182421607 0.00081810475833046 0.000913347832022722 42832 46137 667 665 0 True 449 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 492 255 0.00102207994194709 0.00102189554912688 0.000823987182421607 0.000854505226215 0.000866932266364762 0.000864409096943283 44677 44535 667 665 0 True 494 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 535 254 0.000923571173900347 0.000958954952040206 0.000762951094834821 0.00080872816052491 0.000756834472507799 0.000787816902518574 40371 41792 667 665 0 True 539 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 579 253 0.001020844578855 0.00110330759377271 0.000778210116731518 0.000854505226215 0.000887942674000139 0.000980594179422459 44623 48083 667 665 0 True 583 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 628 254 0.00115826728430246 0.00116094768851632 0.000823987182421607 0.00080872816052491 0.00110434680783581 0.00104811653277496 50630 50595 667 665 0 False 628 254 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 667 254 0.00106966429808671 0.0770896800251946 0.000839246204318303 0.0745555809872587 0.000915061964637772 0.0204241666451581 46757 3359628 667 665 0 True 673 254 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 271 299 0.000863678941028456 0.000904114256802455 0.000671396963454643 0.000732433051041428 0.000735636445410467 0.000739031125725078 37753 39402 667 665 0 False 271 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 315 299 0.000915015140632934 0.000917078688940249 0.000793469138628214 0.000823987182421607 0.000666835217497967 0.000602412942677027 39997 39967 667 665 0 False 315 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 358 300 0.000897468409306448 0.000904412553471112 0.000762951094834821 0.000732433051041428 0.000667610609051264 0.000695214568861816 39230 39415 667 665 0 True 360 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 402 300 0.000957497904744126 0.000954273988932046 0.00080872816052491 0.000793469138628214 0.000711860043737607 0.000731138157458136 41854 41588 667 665 0 True 405 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 446 300 0.00090712254310016 0.000961043028720806 0.000686655985351339 0.000610360875867857 0.000842860482511688 0.000951481218734426 39652 41883 667 665 0 True 449 298 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 490 298 0.000946494022386838 0.000875156534045115 0.000717174029144732 0.000595101853971161 0.000894677689853483 0.000886866903086033 41373 38140 667 665 0 True 494 298 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 535 298 0.000987947317254625 0.00101689334345247 0.000823987182421607 0.000854505226215 0.000822692480760055 0.000820054222201192 43185 44317 667 665 0 True 539 298 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 580 298 0.00103093337744037 0.00104263864054735 0.00080872816052491 0.000671396963454643 0.000948835252050576 0.00105664482232546 45064 45439 667 665 0 True 584 298 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 628 298 0.00107993611342646 0.00108632762955684 0.000762951094834821 0.000717174029144732 0.00103682473948491 0.00108583015024322 47206 47343 667 665 0 False 628 298 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 673 298 0.000950703407737651 0.000946541221444548 0.000579842832074464 0.000488288700694286 0.00100823574571868 0.00102329128134552 41557 41251 667 665 0 False 673 298 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 270 344 0.00093690851987602 0.000934356949824779 0.000778210116731518 0.000762951094834821 0.000745874430749104 0.00075006341713194 40954 40720 667 665 0 True 271 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 314 344 0.000949536675928458 0.000921415463584574 0.00080872816052491 0.00080872816052491 0.000718593525860987 0.000651462317869011 41506 40156 667 665 0 True 315 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 358 344 0.000976943434897337 0.000951245130450296 0.000839246204318303 0.00080872816052491 0.000724399554367999 0.000704830859964663 42704 41456 667 665 0 True 360 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 402 344 0.000976829049425848 0.000958954952040206 0.000778210116731518 0.000793469138628214 0.00073841595402391 0.000698367146585655 42699 41792 667 665 0 True 405 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 447 344 0.0010197236012344 0.000965815775419322 0.000823987182421607 0.000686655985351339 0.000863505952983641 0.000911628369383879 44574 42091 667 665 0 True 450 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 492 342 0.00110359102893049 0.000978413073195692 0.000915541313801785 0.000717174029144732 0.000904538045623595 0.000869970208633919 48240 42640 667 665 0 True 494 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 536 342 0.000994901953921185 0.00100422720798334 0.000793469138628214 0.000762951094834821 0.000861539388947997 0.00087811561017181 43489 43765 667 665 0 True 539 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 579 342 0.000996297456673357 0.00106452902684727 0.000701915007248035 0.000762951094834821 0.00100276165484898 0.00106731072681193 43550 46393 667 665 0 True 584 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 624 342 0.00100515089216664 0.00110528094096537 0.000656137941557946 0.000701915007248035 0.00107162180455203 0.0011423480597983 43937 48169 667 665 0 True 628 341 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 667 343 0.000933019413845378 0.00094929472915523 0.000549324788281071 0.000579842832074464 0.000957646655520967 0.000984313783502227 40784 41371 667 665 0 True 673 341 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 271 388 0.000943474245939516 0.000973387921623698 0.000793469138628214 0.000854505226215 0.000742116552524605 0.000768093823390785 41241 42421 667 665 0 True 271 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 316 389 0.000976646032671465 0.00679386724995138 0.000854505226215 0.00691233691920348 0.000744577097558988 0.00182523642582777 42691 296082 667 665 0 True 316 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 359 388 0.000936176452858487 0.000992042936363569 0.000793469138628214 0.000885023270008392 0.000736877313313637 0.00074516137145312 40922 43234 667 665 0 True 360 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 403 388 0.000978819356629765 0.000942227392697812 0.000823987182421607 0.000793469138628214 0.000749698969167893 0.000706055767024805 42786 41063 667 665 0 True 405 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 448 388 0.00103232888019254 0.00105133513573359 0.000793469138628214 0.000793469138628214 0.000880738232273227 0.000930140548291474 45125 45818 667 665 0 True 450 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 491 387 0.00104099929893145 0.00105714044782361 0.000778210116731518 0.000701915007248035 0.00093660355813721 0.000987428956686708 45504 46071 667 665 0 True 494 385 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 536 386 0.000948667346345138 0.00102806799557833 0.000671396963454643 0.000854505226215 0.000890545163296556 0.000882337246913665 41468 44804 667 665 0 True 539 385 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 579 385 0.00105252935445758 0.00107343203511181 0.000747692072938125 0.000717174029144732 0.00106881054811266 0.00107181696608346 46008 46781 667 665 0 True 584 385 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 624 385 0.00104214315364634 0.000974948242659751 0.000732433051041428 0.000564583810177768 0.00105127059577405 0.00105164908627337 45554 42489 667 665 0 True 628 385 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 668 386 0.000957726675687105 0.000956775091769249 0.000564583810177768 0.000534065766384375 0.000979917828880736 0.00103062028310532 41864 41697 667 665 0 True 673 385 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 271 431 0.00101471351758316 0.00094507268399885 0.000869764248111696 0.000778210116731518 0.000828783502739163 0.000819460401674718 44355 41187 667 665 0 True 271 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 315 432 0.000948873240193819 0.00101384153907314 0.00080872816052491 0.000915541313801785 0.00080256439881183 0.000733230947488293 41477 44184 667 665 0 True 316 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 360 433 0.000957406396366934 0.000959505653582342 0.000854505226215 0.000823987182421607 0.000733766134977122 0.000701491281880896 41850 41816 667 665 0 True 360 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 404 432 0.000950703407737651 0.000962970484118284 0.000778210116731518 0.000778210116731518 0.000795859103099299 0.00082823317503368 41557 41967 667 665 0 True 405 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 449 432 0.000960563435380044 0.00110411070018833 0.000686655985351339 0.000885023270008392 0.000915047295949698 0.000968748506401631 41988 48118 667 665 0 True 450 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 493 431 0.000980626647079298 0.00104718192826998 0.000732433051041428 0.000762951094834821 0.000919291582557875 0.000935402309725253 42865 45637 667 665 0 True 495 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 537 430 0.000934552179163337 0.000973869785473067 0.000701915007248035 0.000793469138628214 0.000892050132939327 0.000853139481135354 40851 42442 667 665 0 True 539 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 581 429 0.00102946924340531 0.0010360531679393 0.000671396963454643 0.000686655985351339 0.00101371704482312 0.0010472995414503 45000 45152 667 665 0 True 584 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 625 430 0.00102251460673875 0.000999133218718575 0.000595101853971161 0.000686655985351339 0.00104257452514122 0.000917215585647093 44696 43543 667 665 0 True 629 428 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 670 430 0.00101674957897568 0.0009838283050267 0.00064087891966125 0.000518806744487678 0.00102602630645078 0.00105533628568026 44444 42876 667 665 0 True 673 428 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 274 476 0.000921443604130642 0.000869420059647861 0.000747692072938125 0.000747692072938125 0.000780901640847342 0.000757584140012117 40278 37890 667 665 0 True 271 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 317 476 0.000854665365875085 0.000959689220763054 0.000732433051041428 0.00080872816052491 0.000769881331327998 0.000804258333703698 37359 41824 667 665 0 True 316 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 361 476 0.000997166786256677 0.000923090514108572 0.000854505226215 0.000747692072938125 0.000824390738742414 0.000817744394861935 43588 40229 667 665 0 True 361 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 406 476 0.000980100473910447 0.001089333542141 0.000701915007248035 0.000885023270008392 0.00094000642687787 0.000906139937934179 42842 47474 667 665 0 True 405 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 450 475 0.000945830586652199 0.00100340115567013 0.000534065766384375 0.000671396963454643 0.00103907219887851 0.00110597770685548 41344 43729 667 665 0 True 450 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 493 475 0.000926751090007754 0.000984424898364015 0.000534065766384375 0.000579842832074464 0.000992724893725793 0.00101955244598527 40510 42902 667 665 0 True 495 472 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 538 474 0.000921535112507834 0.00094275514834236 0.000625619897764553 0.00064087891966125 0.000908426936437197 0.000891769135999255 40282 41086 667 665 0 True 539 472 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 582 474 0.000963331563790089 0.00099059734481546 0.000595101853971161 0.000488288700694286 0.000999981258956579 0.00109670248764246 42109 43171 667 665 0 True 584 472 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 627 474 0.00094354287722241 0.00100303402130871 0.000518806744487678 0.000701915007248035 0.00105017234619501 0.000924103292055197 41244 43713 667 665 0 True 629 472 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 671 474 0.000973168714338185 0.000862467452678389 0.00064087891966125 0.000411993591210803 0.000981779828237213 0.000927888976346078 42539 37587 667 665 0 True 673 472 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 273 520 0.00102134787492955 0.000895876679567998 0.000839246204318303 0.000793469138628214 0.000862639575388988 0.000757711203609628 44645 39043 667 665 0 True 271 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 318 520 0.000999706143723744 0.000970932710581673 0.000854505226215 0.000823987182421607 0.000820163892620591 0.000782794342166264 43699 42314 667 665 0 True 316 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 362 520 0.00104454524854762 0.000957738819467988 0.000915541313801785 0.00080872816052491 0.00081846362569221 0.000826702944128836 45659 41739 667 665 0 True 361 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 407 519 0.00103765924316395 0.000979009666533007 0.000762951094834821 0.000686655985351339 0.000926751847871195 0.000929250404766502 45358 42666 667 665 0 True 405 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 451 519 0.000989434328383988 0.00102471789453033 0.000656137941557946 0.000686655985351339 0.000974366270382346 0.0010551745681881 43250 44658 667 665 0 True 450 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 496 517 0.000940523100775087 0.000984264277080892 0.000595101853971161 0.000625619897764553 0.000929673274838312 0.000948219771261445 41112 42895 667 665 0 True 495 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 539 516 0.00105088220366814 0.00102864164301805 0.000869764248111696 0.000762951094834821 0.00090370901196279 0.00094280118533645 45936 44829 667 665 0 True 539 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 583 516 0.00106037619780176 0.00105140397342636 0.000823987182421607 0.000762951094834821 0.000941269369677084 0.000947481275280537 46351 45821 667 665 0 True 584 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 628 516 0.00092103181643328 0.000990207264556447 0.000534065766384375 0.000610360875867857 0.00097815279914618 0.00101587835324746 40260 43154 667 665 0 True 629 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 671 516 0.000961730167189237 0.000928849934403415 0.000625619897764553 0.000579842832074464 0.000984460613967724 0.000951752818526118 42039 40480 667 665 0 True 674 515 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 275 562 0.000962393602923876 0.000924880294120515 0.000823987182421607 0.000778210116731518 0.000764971598290401 0.000692393197743017 42068 40307 667 665 0 True 271 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 318 562 0.000917623129382894 0.000907166061181794 0.000778210116731518 0.000762951094834821 0.000757137053014623 0.000727625082203342 40111 39535 667 665 0 True 316 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 363 561 0.00104616952224277 0.000919648629470219 0.000915541313801785 0.000778210116731518 0.000802668341256386 0.000692099564420602 45730 40079 667 665 0 True 361 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 408 561 0.00107037348800994 0.00102522270427729 0.000885023270008392 0.000839246204318303 0.00088925676691292 0.000807889226824717 46788 44680 667 665 0 True 406 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 451 560 0.00104118231568583 0.000950350240444324 0.000747692072938125 0.000488288700694286 0.00100873424595827 0.00107575163179561 45512 41417 667 665 0 True 450 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 495 558 0.000965344748088304 0.00104052761796916 0.000457770656900893 0.000564583810177768 0.00110079912152113 0.00117836902680504 42197 45347 667 665 0 True 495 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 539 558 0.000984241227978366 0.000933829194180232 0.000595101853971161 0.000564583810177768 0.00100539916131367 0.000993490466786989 43023 40697 667 665 0 True 540 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 583 557 0.000955736368483188 0.00213929192401925 0.000671396963454643 0.00114442664225223 0.000873992602088365 0.00349749697203279 41777 93232 667 665 0 True 584 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 628 557 0.000969622764722011 0.000971116277762385 0.000717174029144732 0.00064087891966125 0.000876438507340262 0.000904032517446615 42384 42322 667 665 0 True 629 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 671 558 0.00100073561296715 0.00100333231797736 0.000656137941557946 0.00064087891966125 0.000961930624665863 0.000942065289789048 43744 43726 667 665 0 True 674 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 272 604 0.000876284219986596 0.00107373033178047 0.000732433051041428 0.000946059357595178 0.000713446136718921 0.000764645024552785 38304 46794 667 665 0 False 272 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 316 604 0.000907854610117692 0.000948744027613093 0.000793469138628214 0.000854505226215 0.000736995863815486 0.000742920824096287 39684 41347 667 665 0 False 316 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 362 603 0.000935398631652359 0.000885367458472228 0.000793469138628214 0.000732433051041428 0.000756818360757463 0.00073485239583962 40888 38585 667 665 0 True 361 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 407 603 0.000971773211586013 0.000974672891888682 0.000839246204318303 0.000793469138628214 0.000781345785078141 0.000799256574614737 42478 42477 667 665 0 True 406 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 450 603 0.000989754607704159 0.000997779410760823 0.000686655985351339 0.000518806744487678 0.000979422988163117 0.00104621228706029 43264 43484 667 665 0 False 450 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 495 603 0.00103123077966624 0.000984379006568837 0.000732433051041428 0.000488288700694286 0.00104680674815543 0.00113517897382304 45077 42900 667 665 0 False 495 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 540 603 0.000957475027649828 0.00102201027861483 0.000564583810177768 0.000686655985351339 0.00102618019289561 0.00105458767676037 41853 44540 667 665 0 False 540 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 584 603 0.00100757586416222 0.00105808122962476 0.000701915007248035 0.000793469138628214 0.000936599677915572 0.0009700211031715 44043 46112 667 665 0 False 584 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 629 603 0.00103999270678234 0.0010536067795949 0.000823987182421607 0.000839246204318303 0.000840604998699282 0.000843845198882819 45460 45917 667 665 0 False 629 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 674 602 0.000929107430720437 0.000937294024716174 0.000717174029144732 0.00064087891966125 0.000796902029398954 0.000876196226547044 40613 40848 667 665 0 False 674 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 273 653 0.00103381589132191 0.0769878002398994 0.000885023270008392 0.0748149843595026 0.000745430282778158 0.0235205859757443 45190 3355188 667 665 0 True 272 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 316 647 0.00097419818358159 0.000990390831737159 0.000869764248111696 0.000869764248111696 0.000722270843140135 0.000665138249603695 42584 43162 667 665 0 False 316 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 361 647 0.000846200840984863 0.000885275674881872 0.000701915007248035 0.000762951094834821 0.000682468514679512 0.00062300695279079 36989 38581 667 665 0 False 361 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 406 647 0.00102105047270368 0.00096515034438924 0.000839246204318303 0.00080872816052491 0.000766281622973659 0.000695679714229332 44632 42062 667 665 0 False 406 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 450 647 0.000929976760303757 0.000900167562417144 0.000717174029144732 0.000656137941557946 0.000844450838637486 0.00084578409188907 40651 39230 667 665 0 False 450 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 495 646 0.000939882542134746 0.000958587817678782 0.000656137941557946 0.000625619897764553 0.0009147510847802 0.000927712697525268 41084 41776 667 665 0 False 495 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 540 646 0.000943016704053558 0.000902095017814621 0.00064087891966125 0.000595101853971161 0.000885114473870061 0.000864802358316935 41221 39314 667 665 0 False 540 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 585 646 0.000955050055654251 0.0011002098975982 0.000778210116731518 0.00100709544518196 0.000756932053328897 0.000720524614306357 41747 47948 667 665 0 False 585 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 629 646 0.00110640491152913 0.00107015077175658 0.000976577401388571 0.000946059357595178 0.000775863179355567 0.000766944326334083 48363 46638 667 665 0 False 629 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 670 652 0.00113310248057477 0.0797599859112189 0.000946059357595178 0.0780041199359121 0.00080255946818192 0.0223923376972074 49530 3476002 667 665 0 True 674 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C7_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C7_1.csv new file mode 100755 index 0000000..204a468 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C7_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 265 270 0.00992078920484825 0.0409109062424888 0.00996414129854276 0.0412909132524605 0.00171644904640156 0.00888112315036434 433656 1782929 667 665 0 True 264 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 309 270 0.00992927660683277 0.00983346441177331 0.00990310521095598 0.00987258716716258 0.00133861389493517 0.0011690660413371 434027 428550 667 665 0 False 309 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 353 269 0.0101974419061927 0.0647051136653719 0.0101625085831998 0.0650186923018235 0.00135394352581288 0.0140587040551892 445749 2819899 667 665 0 True 353 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 398 269 0.0100658299826969 0.0858917722321368 0.0100404364080262 0.0841535057602808 0.00143418483962776 0.0159483772049519 439996 3743230 667 665 0 True 398 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 442 269 0.010145167745722 0.0727843183146697 0.0102388036926833 0.0711680781261921 0.00170113120732846 0.0162486334258333 443464 3171997 667 665 0 True 443 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 485 268 0.0100676372731464 0.0639683667855838 0.010101472495613 0.0682688639658198 0.00169262435640407 0.0185226822283479 440075 2787791 667 665 0 True 488 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 530 268 0.0100032840068865 0.078973308758277 0.00994888227664607 0.0780346379797055 0.00158657527227463 0.0259507961781715 437262 3441718 667 665 0 True 532 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 574 268 0.0098854212170637 0.0662736722786596 0.00987258716716258 0.0650339513237202 0.00178038785440729 0.0197252675201615 432110 2888258 667 665 0 True 577 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 622 269 0.00991385744527599 0.0100288716756414 0.00987258716716258 0.0100099183642329 0.00200192650855298 0.00180314725838943 433353 437066 667 665 0 False 622 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 660 268 0.00983577792243727 0.0410762314346177 0.00984206912336919 0.0414129854276341 0.00179975164490974 0.00825553266137285 429940 1790134 667 665 0 True 666 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 264 313 0.00997008934306022 0.00972731668952652 0.00996414129854276 0.00970473792629892 0.00144633408598075 0.00148639582035945 435811 423924 667 665 0 False 264 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 309 313 0.0100472309050327 0.010078526598024 0.0100709544518196 0.0100862134737163 0.00131326597508797 0.0012813751102517 439183 439230 667 665 0 False 309 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 353 314 0.0103667324039971 0.100272058034764 0.010406652933547 0.0974288548104067 0.00133417091834748 0.0257007022525295 453149 4369934 667 665 0 True 354 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 398 314 0.0101440696451957 0.052406823880484 0.0101930266269932 0.0517586022735943 0.00143969086490537 0.00746082333776688 443416 2283930 667 665 0 True 398 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 441 314 0.0103234718186798 0.0729235540212399 0.0103456168459602 0.0700541695277333 0.001825311667235 0.0172645903015756 451258 3178065 667 665 0 True 443 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 485 312 0.0100553980276971 0.0431239692272567 0.010101472495613 0.0453955901426719 0.00172390459127536 0.0112291528501918 439540 1879376 667 665 0 True 488 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 530 312 0.0101674957897568 0.0464631021362057 0.0101319905394064 0.0482642862592508 0.00157401495355224 0.0134939112985463 444440 2024898 667 665 0 True 532 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 574 313 0.00997008934306022 0.0515974761807242 0.0100709544518196 0.0525520714122225 0.00176142024677825 0.0101363128440675 435811 2248658 667 665 0 True 577 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 622 312 0.00967705664219847 0.00970157139243164 0.00975051499198901 0.00971999694819562 0.00205812611522135 0.00201894424008655 423002 422802 667 665 0 False 622 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 666 312 0.00982408772725105 0.0097219244035931 0.00991836423285267 0.00968947890440223 0.00193066942704279 0.00191278698655886 429429 423689 667 665 0 False 666 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 265 358 0.00992916222136128 0.0498189396585995 0.00993362325474937 0.0496681162737469 0.00149541565885884 0.0120863201915813 434022 2171148 667 665 0 True 264 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 310 358 0.010147546963529 0.0658807237824477 0.0102388036926833 0.0657816433966583 0.00143701255940229 0.0236237093443874 443568 2871133 667 665 0 True 309 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 354 358 0.0101563546448337 0.0407361732323484 0.0101625085831998 0.0402532997634852 0.00141296141299624 0.0100911319521067 443953 1775314 667 665 0 True 354 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 398 358 0.0101833953702938 0.0346567035579335 0.0102235446707866 0.0355535210193027 0.00150276425506008 0.00535345030701712 445135 1510366 667 665 0 True 398 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 442 358 0.0105133059471637 0.0707648269219627 0.010452429999237 0.0683909361409934 0.00177798826903447 0.0154541308569968 459556 3083986 667 665 0 True 443 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 487 356 0.0101337063214788 0.0318130643615218 0.0101319905394064 0.032974746318761 0.00179988168614238 0.00497056457313879 442963 1386438 667 665 0 True 488 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 531 356 0.0101752282476294 0.0292028767271807 0.0100862134737163 0.0300297550926986 0.00176069156622384 0.00447457636489216 444778 1272684 667 665 0 True 532 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 575 356 0.010142170846369 0.049117162326737 0.0101472495613031 0.0505683985656519 0.00200017322994847 0.00930009373188249 443333 2140564 667 665 0 True 577 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 619 356 0.00994872213698598 0.0568576396358257 0.0100251773861295 0.057099259937438 0.00204556945480205 0.0152306181522514 434877 2477900 667 665 0 True 622 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 663 357 0.0098289605483365 0.0606664521225242 0.00975051499198901 0.0609140154116121 0.00186267827874199 0.0178306838805529 429642 2643891 667 665 0 True 666 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 266 402 0.010060156463311 0.0406415902424865 0.0100099183642329 0.0444647898069734 0.00162371211458886 0.0102577298573654 439748 1771192 667 665 0 True 264 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 310 402 0.00999395015241292 0.032110190789402 0.00999465934233616 0.0321660181582361 0.00144458958444749 0.00540907946927331 436854 1399387 667 665 0 True 309 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 354 402 0.0102338164861264 0.0843322772483968 0.0102082856488899 0.082887006942855 0.0014871712132444 0.0221291540374703 447339 3675266 667 665 0 True 354 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 398 402 0.0104262814804546 0.0695603738116176 0.010406652933547 0.0669565880827039 0.00161028792414772 0.0219374635722274 455752 3031495 667 665 0 True 399 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 443 402 0.0106275312789931 0.0442705757297799 0.010605020218204 0.0453955901426719 0.0018162929428314 0.00775469486909366 464549 1929346 667 665 0 True 443 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 486 401 0.0105226626787316 0.0553966284445378 0.0104676890211337 0.0572671091783017 0.00191167933618493 0.0138374221791378 459965 2414228 667 665 0 True 488 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 531 400 0.0103819227946109 0.0415059851505624 0.0103303578240635 0.0433203631647211 0.00162417310016308 0.00868695865035705 453813 1808863 667 665 0 True 533 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 575 400 0.0103389367344252 0.0517147756091992 0.0102845807583734 0.0526131074998093 0.00222434454976074 0.0105621438539167 451934 2253770 667 665 0 True 577 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 619 400 0.00995876518138276 0.0475227436868665 0.0100404364080262 0.0493781948577096 0.00191789664673397 0.00971208313727222 435316 2071078 667 665 0 True 622 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 664 401 0.00995993191319195 0.0832293367889855 0.00990310521095598 0.0809948882276646 0.00186481299805341 0.0166665538731179 435367 3627199 667 665 0 True 667 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 266 446 0.0100901712110299 0.0446092571781938 0.010101472495613 0.045639734493019 0.00163921970012608 0.010349604527182 441060 1944106 667 665 0 True 265 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 310 447 0.0103242725169802 0.0537236889431177 0.0103456168459602 0.0544899671931029 0.00155147135271727 0.0107511594100469 451293 2341320 667 665 0 True 309 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 355 446 0.0104680093004539 0.0357580836963088 0.0104676890211337 0.0365300984206912 0.00160122534945523 0.00431192030546351 457576 1558365 667 665 0 True 354 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 399 446 0.0106796452998037 0.0527208384889897 0.0106202792401007 0.0540169375143053 0.00162053090871097 0.00972836979403166 466827 2297615 667 665 0 True 399 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 443 446 0.0106950644613605 0.0976273827163468 0.0106660563057908 0.0977035172045472 0.00192818927946992 0.0200925339399796 467501 4254677 667 665 0 True 443 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 487 444 0.0107344816948358 0.0603750851149389 0.0106660563057908 0.0618600747692073 0.0020832144331072 0.0201775367648755 469224 2631193 667 665 0 True 488 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 532 444 0.0106200962233463 0.051763696262859 0.0106355382619974 0.0522163729304952 0.00187734980397203 0.00996413101836635 464224 2255902 667 665 0 True 533 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 576 445 0.0102349145866527 0.0335362783245594 0.01025406271458 0.0337071793698024 0.00185772296612751 0.00473180018633552 447387 1461537 667 665 0 True 577 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 621 444 0.0102026578836926 0.0388518790682359 0.0102693217364767 0.0400396734569314 0.00185014631863553 0.00559422897288824 445977 1693195 667 665 0 True 622 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 664 445 0.00999152518041735 0.0741813563434794 0.00999465934233616 0.0754558632791638 0.00200586503907146 0.0144742442681694 436748 3232881 667 665 0 True 667 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 268 490 0.01022457414003 0.0587785325065926 0.0102082856488899 0.0600900282291905 0.00153386118802841 0.0176923562453001 446935 2561614 667 665 0 True 265 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 312 491 0.0103806416773303 0.056812734514244 0.0103913939116503 0.0565346761272602 0.00161246733551576 0.00809586559221642 453757 2475943 667 665 0 True 309 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 357 491 0.0104193039666937 0.0686138096442755 0.0104676890211337 0.0665140764476997 0.0015184915203787 0.0162027576403005 455447 2990243 667 665 0 True 354 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 400 491 0.0106347146866027 0.0878148679090723 0.0105745021744106 0.0828412298771649 0.00164018686739183 0.0223481994808473 464863 3827040 667 665 0 True 399 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 445 489 0.010876182416917 0.0953850637121529 0.0108949416342412 0.0907148851758602 0.00203459528577232 0.033222242954591 475418 4156955 667 665 0 True 443 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 488 489 0.0106550066692449 0.0433861031613137 0.010757610437171 0.0445258258945602 0.0019312464348993 0.0071138319823929 465750 1890800 667 665 0 True 488 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 532 488 0.0102220119054686 0.0381545761864033 0.0102998397802701 0.0402838178072786 0.00175038434688705 0.00747789687766012 446823 1662806 667 665 0 True 533 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 577 489 0.0105377386838739 0.100985514828499 0.0103761348897536 0.0955062180514229 0.00193555317919233 0.0208370262991099 460624 4401027 667 665 0 True 577 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 621 489 0.0101212154279921 0.0654836450246697 0.0101167315175097 0.0672770275425345 0.00188598364875777 0.0183155377407386 442417 2853828 667 665 0 True 622 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 665 489 0.00987990783733791 0.08574955355888 0.00990310521095598 0.0817120622568093 0.00190440867677004 0.0156727000216496 431869 3737032 667 665 0 True 667 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 269 535 0.0101351475784195 0.0505544704058154 0.0101777676050965 0.0540016784924086 0.00158604950053885 0.0111026324599428 443026 2203203 667 665 0 True 265 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 313 535 0.0108639202943733 0.102334802444426 0.0106965743495842 0.0979476615548943 0.00212485133501134 0.0255191221823411 474882 4459830 667 665 0 True 310 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 357 535 0.0107795495706027 0.0603013140541902 0.010757610437171 0.0616159304188602 0.00153019089885439 0.0129682797081236 471194 2627978 667 665 0 True 354 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 401 534 0.0113272729622829 0.0605007368501363 0.0110780498970016 0.0602273594262608 0.00247005919994441 0.00861697615198349 495136 2636669 667 665 0 True 399 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 446 535 0.0108803002938906 0.0558850089288224 0.0108491645685512 0.0560158693827726 0.00205707128129422 0.00749789361087254 475598 2435512 667 665 0 True 444 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 490 532 0.0106777693780713 0.0654578997275748 0.010757610437171 0.0653086137178607 0.0020202771391097 0.0156324833082464 466745 2852706 667 665 0 True 488 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 534 532 0.0110069936421123 0.0769708432215811 0.0104371709773404 0.0747844663157092 0.00619769723198899 0.0194201826382176 481136 3354449 667 665 0 True 533 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 579 533 0.0102526443347335 0.0587443201732874 0.0103303578240635 0.058655680170901 0.00170527661437708 0.012215084346144 448162 2560123 667 665 0 True 578 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 623 532 0.0102720898648867 0.0536828452454092 0.0103608758678569 0.0495765621423667 0.00181208040470814 0.0119246362288609 449012 2339540 667 665 0 True 622 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 667 533 0.00994430685778649 0.0667567752064987 0.00997940032043946 0.0659189745937285 0.0018567054780579 0.0166401080050652 434684 2909312 667 665 0 True 667 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 269 578 0.00988105169205281 0.0442224811284334 0.00987258716716258 0.0446936751354238 0.00134194158246062 0.00805140026691214 431919 1927250 667 665 0 True 265 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 313 578 0.010033893559057 0.0551746039394664 0.0100556954299229 0.0540169375143053 0.00140124717276952 0.0119756720014842 438600 2404552 667 665 0 True 310 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 358 578 0.0103299917905547 0.0449809348273407 0.0103456168459602 0.0454108491645685 0.00141564623809768 0.00634404973477305 451543 1960304 667 665 0 True 354 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 402 578 0.0105601582362858 0.0528220069514597 0.0105592431525139 0.050415808346685 0.00162408675726679 0.00933199810426301 461604 2302024 667 665 0 True 399 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 446 577 0.0109942511005884 0.0900037229718838 0.0110933089188983 0.0837262531471733 0.00196837691104078 0.0186028808961175 480579 3922432 667 665 0 True 444 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 490 576 0.0106847240147379 0.0628933055917431 0.0106355382619974 0.0623636224917983 0.0021581406440147 0.0105545070807661 467049 2740939 667 665 0 True 488 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 534 575 0.011222152713984 0.0559171102395494 0.0104982070649271 0.0549935149156939 0.00636480626623563 0.00777149716133151 490541 2436911 667 665 0 True 533 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 578 575 0.0101196826626742 0.0385782951312821 0.0101777676050965 0.040009155413138 0.00164558685640624 0.00796808548366375 442350 1681272 667 665 0 True 578 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 623 575 0.0100650750385851 0.0487955755720269 0.00999465934233616 0.0480048828870069 0.0015374248820517 0.00812233457460049 439963 2126549 667 665 0 True 622 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 667 576 0.00987887836809451 0.0521095827231159 0.00987258716716258 0.0513466086823835 0.0016452987097521 0.00679679819093161 431824 2270976 667 665 0 True 667 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 265 618 0.00971487247907289 0.00948847284152244 0.00973525597009232 0.00955214770733196 0.00131438775776335 0.00131574960510208 424655 413515 667 665 0 False 265 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 310 618 0.00999806802938654 0.00987967744951759 0.00999465934233616 0.00993362325474937 0.00139037669607568 0.00132928060197372 437034 430564 667 665 0 False 310 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 358 622 0.0101191564895053 0.0763647732285624 0.0101472495613031 0.0730907148851759 0.00145868304762987 0.0133620557859199 442327 3328036 667 665 0 True 354 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 402 621 0.0103808933253675 0.0795760974879405 0.0103761348897536 0.073334859235523 0.00148053663471406 0.0211849077841404 453768 3467988 667 665 0 True 399 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 444 617 0.010364650588416 0.0104245048418712 0.0103761348897536 0.0104371709773404 0.00195235860544822 0.00201105701516452 453058 454308 667 665 0 False 444 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 488 617 0.0100325209333992 0.0101806128963976 0.00999465934233616 0.0102235446707866 0.00191657189114922 0.00214034524595402 438540 443679 667 665 0 False 488 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 533 617 0.00990088613280908 0.0100130848981001 0.00996414129854276 0.00997940032043946 0.00195430536881969 0.0020369375414977 432786 436378 667 665 0 False 533 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 578 617 0.00972754638931393 0.0104120452194804 0.00976577401388571 0.00988784618905928 0.00175598365525558 0.00402474547262567 425209 453765 667 665 0 False 578 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 623 617 0.00980230873347945 0.00991976393260561 0.0098115510795758 0.00994888227664607 0.00155166972079268 0.001437255262688 428477 432311 667 665 0 False 623 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 667 617 0.0100385147321052 0.00983068795816504 0.00997940032043946 0.00988784618905928 0.00192244714402999 0.0016756530651093 438802 428429 667 665 0 False 667 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 265 666 0.00966724236874467 0.039150129845098 0.00965896086060884 0.0396887159533074 0.00134204859388807 0.00939638938953337 422573 1706193 667 665 0 True 265 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 310 661 0.00957392670110356 0.00968176908281232 0.00958266575112535 0.00970473792629892 0.00120739534100234 0.00128728737792904 418494 421939 667 665 0 False 310 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 355 661 0.00968419429561941 0.00964659302180835 0.00970473792629892 0.00968947890440223 0.0013296363564901 0.00121278161982619 423314 420406 667 665 0 False 355 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 399 661 0.00991294236150407 0.0097081339191421 0.00985732814526589 0.00971999694819562 0.00135167167096009 0.0013868308126464 433313 423088 667 665 0 False 399 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 444 661 0.00998180241534074 0.00981841190295492 0.0100251773861295 0.00985732814526589 0.00152822227600937 0.00165782932832827 436323 427894 667 665 0 False 444 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 489 661 0.00975797292473013 0.0096636188778194 0.00990310521095598 0.00976577401388571 0.00170250964050177 0.00165725460567937 426539 421148 667 665 0 False 489 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 533 661 0.00963683871042277 0.0094992115215941 0.00971999694819562 0.00955214770733196 0.00180073586959974 0.00168934407550639 421244 413983 667 665 0 False 533 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 578 660 0.00972734049546525 0.00955625502300039 0.00970473792629892 0.00965896086060884 0.00151094025375273 0.00129732616446932 425200 416469 667 665 0 False 578 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 623 660 0.00969474063609074 0.00945758766336762 0.00971999694819562 0.00949111161974517 0.00138717751700166 0.00141660576988683 423775 412169 667 665 0 False 623 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 662 665 0.00996240263937612 0.0404977883022961 0.0100099183642329 0.0409857328145266 0.00144314450553828 0.00910112923591643 435475 1764925 667 665 0 True 667 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C7_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C7_2.csv new file mode 100755 index 0000000..85bdca2 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C7_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 265 270 0.0080144638140989 0.741043866246068 0.00798046845197223 0.760296025024796 0.00157728241372701 0.195136626742479 350327 32295266 667 665 15 True 264 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 309 270 0.00697504303467401 0.00658581679651176 0.00698863202868696 0.00662241550316625 0.0013692933228267 0.00120438297558415 304892 287015 667 665 0 False 309 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 353 269 0.00644971631831143 0.006390616045722 0.00648508430609598 0.00643930724040589 0.00121167272360783 0.00131930873163561 281929 278508 667 665 0 True 353 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 398 269 0.00656215723678559 0.00659474275067389 0.00657663843747616 0.00662241550316625 0.00132664440691631 0.00125904794196685 286844 287404 667 665 0 True 398 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 442 269 0.00669521041722215 0.0067679154397782 0.00668345159075303 0.00675974670023652 0.00148870029097823 0.00167442788041539 292660 294951 667 665 0 True 443 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 485 268 0.00683032253614552 0.00703296350282894 0.00685130083161669 0.00700389105058366 0.00155508744179057 0.00161556033667781 298566 306502 667 665 0 True 488 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 530 268 0.00689126711535512 0.00713504980120248 0.00691233691920348 0.00709544518196384 0.00147471982993146 0.00168900606098314 301230 310951 667 665 0 True 532 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 574 268 0.00727045495334274 0.00730670806106592 0.0072327763790341 0.00735484855420768 0.00161279347675492 0.00173844537901102 317805 318432 667 665 0 True 577 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 622 269 0.00957397245529215 0.00785323344984113 0.00843823910887312 0.00791943236438544 0.00782633034215142 0.00184320163732565 418496 342250 667 665 0 False 622 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 660 268 0.00915484121066041 0.754774783146927 0.00917067215991455 0.754787518120088 0.00187158954531768 0.176293677417667 400175 32893670 667 665 13 True 666 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 264 313 0.00676841711897542 0.00675621303200781 0.00675974670023652 0.00677500572213321 0.00140608950319997 0.00139708471730059 295860 294441 667 665 0 False 264 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 309 313 0.0063304580257365 0.00646879271880778 0.00627145799954223 0.00643930724040589 0.00120815200563421 0.00125029333272198 276716 281915 667 665 0 False 309 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 353 314 0.00647680279796014 0.00658744595524058 0.00643930724040589 0.00657663843747616 0.00134486628352756 0.00135557387037136 283113 287086 667 665 0 True 354 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 398 314 0.00660061363230035 0.0066759941740366 0.00662241550316625 0.00663767452506294 0.00141119420255049 0.00136439815665346 288525 290945 667 665 0 True 398 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 441 314 0.00692972351086988 0.00684223720206903 0.00694285496299687 0.00688181887541009 0.00158699107330045 0.00175055711895997 302911 298190 667 665 0 True 443 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 485 312 0.00683146639086042 0.00701605237630584 0.00688181887541009 0.00708018616006714 0.00158796367899057 0.00162506787851001 298616 305765 667 665 0 True 488 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 530 312 0.00695646683410412 0.00698179415120543 0.00691233691920348 0.00689707789730678 0.00147473343523784 0.0015620814503791 304080 304272 667 665 0 True 532 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 574 313 0.00730975780134652 0.00740468704377102 0.00729381246662089 0.00750743877317464 0.001787510730056 0.00164888280267299 319523 322702 667 665 0 True 577 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 622 312 0.00750128483480851 0.00740688984993957 0.00756847486076143 0.00741588464179446 0.00199213345203373 0.00193263184630863 327895 322798 667 665 0 False 622 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 666 312 0.0077785780947933 0.00749860460260287 0.00782787823300526 0.00746166170748455 0.00195961391175882 0.00189056183442053 340016 326795 667 665 0 False 666 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 265 358 0.00645188964226973 0.00653818111311697 0.0064087891966125 0.00659189745937285 0.00130742021123219 0.00145370509816193 282024 284939 667 665 0 True 264 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 310 358 0.00636392721469432 0.00654488131521296 0.00634775310902571 0.00656137941557946 0.00138594601726774 0.00133505261428271 278179 285231 667 665 0 True 309 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 354 358 0.00685759203254861 0.00689689433012607 0.00691233691920348 0.00688181887541009 0.00128055126988551 0.00134120997396571 299758 300572 667 665 0 True 354 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 398 358 0.00715174571103096 0.00708502774445842 0.00721751735713741 0.00704966811627375 0.00126613462768259 0.00135204576261626 312616 308771 667 665 0 True 398 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 442 358 0.00729667210340813 0.00731524393496903 0.00735484855420768 0.00733958953231098 0.00172166990916751 0.00170587979140587 318951 318804 667 665 0 True 443 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 487 356 0.00713326101883826 0.0073052854154154 0.00703440909437705 0.00735484855420768 0.00169540595896819 0.00162488197886255 311808 318370 667 665 0 True 488 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 531 356 0.00710358942753389 0.00767719252353819 0.00709544518196384 0.00756847486076143 0.00169601794001547 0.00185567596413972 310511 334578 667 665 0 True 532 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 575 356 0.00729438439397834 0.00750792063702401 0.00732433051041428 0.00750743877317464 0.00186194848915164 0.00196047251818934 318851 327201 667 665 0 True 577 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 619 356 0.00723385160246611 0.00747818275374864 0.00714122224765393 0.00750743877317464 0.00210709182711982 0.00193855021124381 316205 325905 667 665 0 True 622 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 663 357 0.00678516315200148 0.00678962225889742 0.00660715648126955 0.00672922865644312 0.00189234843558865 0.00190528390554653 296592 295897 667 665 0 True 666 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 266 402 0.00662301030761799 0.00657413733463896 0.00665293354695964 0.00656137941557946 0.0015126647033414 0.00144135132394093 289504 286506 667 665 0 True 264 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 310 402 0.00665913323951437 0.00676734179233848 0.00666819256885634 0.00679026474402991 0.00140433532003865 0.00133004408702655 291083 294926 667 665 0 True 309 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 354 402 0.0070903664670297 0.00717274991094123 0.00706492713817044 0.00717174029144732 0.00127369363887709 0.00127968024684449 309933 312594 667 665 0 True 354 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 398 402 0.00713088180103128 0.00722325383153466 0.00714122224765393 0.00729381246662089 0.0014985825495164 0.00144991947485208 311704 314795 667 665 0 True 399 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 443 402 0.00728484464565611 0.00709060359757255 0.0072632944228275 0.00711070420386053 0.00158668678738006 0.00163411948391803 318434 309014 667 665 0 True 443 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 486 401 0.00717615557064681 0.0070852801493319 0.00720225833524071 0.00717174029144732 0.00175222482015063 0.00171067402842782 313683 308782 667 665 0 True 488 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 531 400 0.00727644875204879 0.00719548929545195 0.00721751735713741 0.00712596322575723 0.0015928332821607 0.00175230592396475 318067 313585 667 665 0 True 533 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 575 400 0.00718132579395814 0.00698420347045228 0.00712596322575723 0.00700389105058366 0.001859805622031 0.00178400580051562 313909 304377 667 665 0 True 577 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 619 400 0.00647492687622771 0.00647799402374097 0.00645456626230259 0.00645456626230259 0.00178934041722928 0.00187090318886377 283031 282316 667 665 0 True 622 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 664 401 0.00627001674260146 0.00635358136701332 0.00627145799954223 0.0063782711528191 0.00184667494902983 0.00177820862459616 274074 276894 667 665 0 True 667 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 266 446 0.00661685636925186 0.00692865145238927 0.00666819256885634 0.00688181887541009 0.00153602677067211 0.00163724439494062 289235 301956 667 665 0 True 265 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 310 447 0.00679133996746191 0.00693436498088894 0.0068055237659266 0.00685130083161669 0.00145112685031001 0.00143569051390754 296862 302205 667 665 0 True 309 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 355 446 0.00706719197050593 0.00698546549481968 0.00704966811627375 0.00703440909437705 0.00135495680977932 0.00145784736611316 308920 304432 667 665 0 True 354 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 399 446 0.00717409663216 0.00706733645741729 0.00720225833524071 0.00706492713817044 0.00156035920347712 0.00143844591010289 313593 308000 667 665 0 True 399 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 443 446 0.00710445875711721 0.00723369421493766 0.00715648126955062 0.00738536659800107 0.00172589543737565 0.00185324915362962 310549 315250 667 665 0 True 443 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 487 444 0.00733183419734399 0.00717894530329027 0.0072632944228275 0.0072632944228275 0.00192076780009325 0.00178273423402048 320488 312864 667 665 0 True 488 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 532 444 0.00710336065659091 0.0071663480055139 0.00708018616006714 0.00718699931334401 0.00172485846050369 0.00167080754423459 310501 312315 667 665 0 True 533 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 576 445 0.00644495788269747 0.00654694644599597 0.00654612039368277 0.00650034332799268 0.0017826054436893 0.00193561457819963 281721 285321 667 665 0 True 577 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 621 444 0.00624649908966323 0.00620039455470904 0.00624093995574884 0.00627145799954223 0.00172494041913261 0.00178006097996292 273046 270218 667 665 0 True 622 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 664 445 0.00629593649044098 0.00643382317088211 0.0063782711528191 0.0063782711528191 0.00190757158848791 0.00188209470024877 275207 280391 667 665 0 True 667 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 268 490 0.00663021659232183 0.0067213352676725 0.00657663843747616 0.00674448767833982 0.00153096571626001 0.00145233230882835 289819 292921 667 665 0 True 265 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 312 491 0.00669610262389977 0.00664485659100831 0.00659189745937285 0.00668345159075303 0.00151337918408456 0.00145359233785249 292699 289588 667 665 0 True 309 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 357 491 0.00675418756632213 0.00680098047820398 0.00675974670023652 0.00675974670023652 0.00151436955668392 0.0015332420294339 295238 296392 667 665 0 True 354 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 400 491 0.00672055823770422 0.00677101313595272 0.00672922865644312 0.00677500572213321 0.0015809385975511 0.00155764875700052 293768 295086 667 665 0 True 399 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 445 489 0.00717228934171047 0.00716375511908634 0.00714122224765393 0.00718699931334401 0.00188854107621103 0.00198707139001613 313514 312202 667 665 0 True 443 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 488 489 0.00700530943043013 0.0070909248401388 0.00697337300679027 0.00700389105058366 0.00175474049380984 0.00215214134557009 306215 309028 667 665 0 True 488 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 532 488 0.00660523480534853 0.00645222578074851 0.00660715648126955 0.00645456626230259 0.00177376641291452 0.00157189392462098 288727 281193 667 665 0 True 533 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 577 489 0.00633324903124085 0.00651718561682301 0.00636301213092241 0.00657663843747616 0.00179267733338624 0.00185246193276369 276838 284024 667 665 0 True 577 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 621 489 0.00637776785674455 0.00614431478100149 0.0063782711528191 0.00614938582436866 0.00177860527836186 0.00181241733704536 278784 267774 667 665 0 True 622 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 665 489 0.00617098180138587 0.00664425999767099 0.00624093995574884 0.00665293354695964 0.00182461700877825 0.00178551403742611 269745 289562 667 665 0 True 667 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 269 535 0.00701683948595627 0.00692594383647377 0.00698863202868696 0.00688181887541009 0.00144100611009328 0.00150340077001725 306719 301838 667 665 0 True 265 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 313 535 0.0072654448696915 0.00703966370492494 0.0072327763790341 0.00700389105058366 0.00167193370426712 0.00137407612946383 317586 306794 667 665 0 True 310 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 357 535 0.00717025328031796 0.007264326988219 0.0072480354009308 0.00730907148851759 0.0014636105010362 0.00147403583316425 313425 316585 667 665 0 True 354 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 401 534 0.00733615796816629 0.00718956925387398 0.0072480354009308 0.00729381246662089 0.00175843880934366 0.00153529887351348 320677 313327 667 665 0 True 399 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 446 535 0.00712278330964982 0.00695253813177944 0.00714122224765393 0.00686655985351339 0.0018436520131241 0.00211418170589173 311350 302997 667 665 0 True 444 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 490 532 0.00692320353899498 0.00713390250632303 0.00698863202868696 0.00717174029144732 0.00187029566942579 0.00191646204365612 302626 310901 667 665 0 True 488 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 534 532 0.00708213071308246 0.00712245250342611 0.00685130083161669 0.0072327763790341 0.00362197009973954 0.00180662743586323 309573 310402 667 665 0 True 533 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 579 533 0.00672664354478746 0.00686933630712166 0.00669871061264973 0.00688181887541009 0.00162480108991453 0.00167646641733168 294034 299371 667 665 0 True 578 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 623 532 0.00650505600941804 0.0065464645821466 0.00642404821850919 0.00659189745937285 0.00176094154475625 0.00176372281373109 284348 285300 667 665 0 True 622 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 667 533 0.00656735033719121 0.0066101853397513 0.00651560234988937 0.00665293354695964 0.00170181894755838 0.00195957499989469 287071 288077 667 665 0 True 667 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 269 578 0.00701853239093431 0.00715843167084569 0.00701915007248035 0.00717174029144732 0.00129365777491412 0.00122024727250012 306793 311970 667 665 0 True 265 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 313 578 0.00701027375989277 0.00697029825651334 0.00694285496299687 0.00695811398489357 0.00142637517183129 0.00138094614035715 306432 303771 667 665 0 True 310 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 358 578 0.00689547650070593 0.00679687316253555 0.00691233691920348 0.00679026474402991 0.00147049765663434 0.00134058660413341 301414 296213 667 665 0 True 354 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 402 578 0.00686555326136428 0.0069486373291893 0.00689707789730678 0.00694285496299687 0.00155011976758241 0.00145638437100276 300106 302827 667 665 0 True 399 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 446 577 0.00702329082654827 0.00685926305808008 0.00700389105058366 0.00692759594110018 0.0017785040612807 0.00186808644152236 307001 298932 667 665 0 True 444 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 490 576 0.00719939869845347 0.00688399873568104 0.00720225833524071 0.00694285496299687 0.00203893965752258 0.00208779947197458 314699 300010 667 665 0 True 488 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 534 575 0.00748270863423861 0.00707362363335668 0.00727855344472419 0.00703440909437705 0.00353743316257625 0.00182324695180753 327083 308274 667 665 0 True 533 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 578 575 0.00710418423198563 0.00716873437886316 0.00701915007248035 0.00721751735713741 0.00158086170821779 0.00174532327020701 310537 312419 667 665 0 True 578 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 623 575 0.00652354070161074 0.00681816695549815 0.00656137941557946 0.0068055237659266 0.00145980515308874 0.0015523156554873 285156 297141 667 665 0 True 622 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 667 576 0.00654419871776174 0.00669141381721642 0.00648508430609598 0.00666819256885634 0.00161817758954086 0.00166112660147528 286059 291617 667 665 0 True 667 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 265 618 0.00717466855951745 0.0072467733765634 0.00715648126955062 0.00721751735713741 0.00146145002847301 0.00134603249209983 313618 315820 667 665 0 False 265 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 310 618 0.00702553278178947 0.0066822584040784 0.00704966811627375 0.00666819256885634 0.00138913115433969 0.00132581666631943 307099 291218 667 665 0 False 310 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 358 622 0.0066501425414553 0.00670226722677603 0.00660715648126955 0.00666819256885634 0.00139327178091254 0.00143996355526832 290690 292090 667 665 0 True 354 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 402 621 0.00659553491736622 0.00650199543261909 0.00656137941557946 0.00645456626230259 0.00133230922313638 0.00131541760525662 288303 283362 667 665 0 True 399 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 444 617 0.00666389167512833 0.00656385757251908 0.00668345159075303 0.00650034332799268 0.00187605212649618 0.00185461261018287 291291 286058 667 665 0 False 444 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 488 617 0.00681655052537819 0.00691274994536008 0.00692759594110018 0.0068207827878233 0.00187490600376609 0.00208672606633407 297964 301263 667 665 0 False 488 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 533 617 0.00688831597019069 0.00692596678237136 0.00689707789730678 0.00692759594110018 0.00192636203249518 0.00199441293637378 301101 301839 667 665 0 False 533 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 578 617 0.00680820038595946 0.00704310558956329 0.00683604180972 0.00692759594110018 0.00170020012769362 0.0019650580169512 297599 306944 667 665 0 False 578 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 623 617 0.00691142183543156 0.00670793486348051 0.00685130083161669 0.00675974670023652 0.00162164814555544 0.0014143077398208 302111 292337 667 665 0 False 623 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 667 617 0.00707135560166815 0.00688620154184959 0.00697337300679027 0.00692759594110018 0.00175870821270764 0.00158028924846804 309102 300106 667 665 0 False 667 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 265 666 0.00881083834370295 0.729835759001532 0.00859082932784009 0.74683756771191 0.00183101669242414 0.216844029280974 385138 31806808 667 665 13 True 265 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 310 661 0.00708380074096621 0.00693741678526828 0.00695811398489357 0.00700389105058366 0.00152830200542094 0.00121828742295407 309646 302338 667 665 0 False 310 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 355 661 0.00650519327198383 0.0065986894450592 0.00654612039368277 0.00663767452506294 0.00120848676620383 0.00125822665683892 284354 287576 667 665 0 False 355 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 399 661 0.00640325293979241 0.00637893658384919 0.00648508430609598 0.00645456626230259 0.0011743858763784 0.00137038500054458 279898 277999 667 665 0 False 399 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 444 661 0.00626990235712997 0.00629252233352895 0.00624093995574884 0.00631723506523232 0.00151229104514053 0.00151111264505158 274069 274233 667 665 0 False 444 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 489 661 0.00635052123743576 0.00636757836454262 0.00634775310902571 0.0063935301747158 0.00156179235569667 0.00160064873522722 277593 277504 667 665 0 False 489 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 533 661 0.00649654573033923 0.00626351871897643 0.00646982528419928 0.00627145799954223 0.00164674094297546 0.00165434694961618 283976 272969 667 665 0 False 533 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 578 660 0.00655790209724618 0.006411496812528 0.00651560234988937 0.00642404821850919 0.00151594531887421 0.00129122508123337 286658 279418 667 665 0 False 578 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 623 660 0.0075155372645561 0.00669671431955949 0.00727855344472419 0.00671396963454643 0.00207604821415694 0.001365605975737 328518 291848 667 665 0 False 623 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 662 665 0.00826787338763669 0.755624492680546 0.00831616693369955 0.763378347447929 0.0015627101475181 0.196782283619178 361404 32930701 667 665 15 True 667 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C7_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C7_3.csv new file mode 100755 index 0000000..d30b757 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C7_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 265 270 0.0010751548007182 0.0766914310266396 0.000946059357595178 0.0758068207827878 0.000788901181789853 0.0234398836977382 46997 3342272 667 665 0 True 264 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 309 270 0.000979231144327127 0.000909139408374449 0.000823987182421607 0.000793469138628214 0.000721042680212412 0.000662284518516728 42804 39621 667 665 0 False 309 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 353 269 0.000959053547156383 0.000985342734267576 0.000885023270008392 0.000823987182421607 0.000633857029356086 0.000736462492441668 41922 42942 667 665 0 True 353 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 398 269 0.00109171781698988 0.00100115245770641 0.000961318379491875 0.000900282291905089 0.000763137144214361 0.000698424569694431 47721 43631 667 665 0 True 398 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 442 269 0.00100871971887711 0.00101290075727199 0.000762951094834821 0.000747692072938125 0.000894728993356297 0.000902931512637556 44093 44143 667 665 0 True 443 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 485 268 0.00098636879774807 0.000991859369182856 0.000732433051041428 0.00080872816052491 0.000897740579800006 0.000856937512249504 43116 43226 667 665 0 True 488 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 530 268 0.000997052400785188 0.0009420438255171 0.000839246204318303 0.000762951094834821 0.000847401789541157 0.000805682298452399 43583 41055 667 665 0 True 532 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 574 268 0.00107675619731906 0.00107999456182227 0.000869764248111696 0.000823987182421607 0.000928853167156308 0.000970500609673615 47067 47067 667 665 0 True 577 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 622 269 0.00117224518891847 0.0010657222135219 0.000854505226215 0.000762951094834821 0.00120720131162004 0.00101252877418904 51241 46445 667 665 0 False 622 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 660 268 0.00125551781216281 0.0781219930118269 0.00103761348897536 0.0755931944762341 0.00099992543514403 0.0221297269943762 54881 3404617 667 665 0 True 666 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 264 313 0.00102802798646454 0.0010579894460344 0.000900282291905089 0.000900282291905089 0.000767322233947467 0.000789443886246597 44937 46108 667 665 0 False 264 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 309 313 0.000941117905226833 0.000967192529274663 0.00080872816052491 0.000869764248111696 0.000667887087016279 0.000618653818592952 41138 42151 667 665 0 False 309 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 353 314 0.000995908546070293 0.000923687107445886 0.000885023270008392 0.000762951094834821 0.000708778520981855 0.000706225945572164 43533 40255 667 665 0 True 354 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 398 314 0.000970835250719799 0.000950625591215393 0.000854505226215 0.000839246204318303 0.000710596526384016 0.00070219714757855 42437 41429 667 665 0 True 398 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 441 314 0.000964040753713324 0.000978550748581226 0.000717174029144732 0.000717174029144732 0.000858228485031883 0.000924478881514304 42140 42646 667 665 0 True 443 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 485 312 0.00103136804223203 0.000962052648214723 0.000793469138628214 0.000747692072938125 0.000905716506630335 0.000866739279544051 45083 41927 667 665 0 True 488 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 530 312 0.00100723270774775 0.000987683215821655 0.000854505226215 0.000778210116731518 0.000800506501387632 0.000851646082937389 44028 43044 667 665 0 True 532 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 574 313 0.00102420751171679 0.00100626939286876 0.000778210116731518 0.000762951094834821 0.00098118647601166 0.000931563453790541 44770 43854 667 665 0 True 577 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 622 312 0.00104653555575154 0.000999225002308931 0.000717174029144732 0.000534065766384375 0.00106645659079118 0.00109276253577669 45746 43547 667 665 0 False 622 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 666 312 0.00114673722877632 0.00111599667513944 0.000869764248111696 0.000778210116731518 0.00104553701375372 0.00106927306259899 50126 48636 667 665 0 False 666 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 265 358 0.00100263441179387 0.00103713162512599 0.000900282291905089 0.000869764248111696 0.000783851300732383 0.000814200499000131 43827 45199 667 665 0 True 264 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 310 358 0.000963034161564217 0.000923710053343475 0.000854505226215 0.000793469138628214 0.000713729218834953 0.000715750561449033 42096 40256 667 665 0 True 309 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 354 358 0.00103244326566403 0.000950097835570845 0.000946059357595178 0.00080872816052491 0.000705358372675184 0.000718959248596549 45130 41406 667 665 0 True 354 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 398 358 0.0010469473434489 0.00100046408077874 0.000885023270008392 0.000823987182421607 0.000750783759771777 0.000716242994174684 45764 43601 667 665 0 True 398 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 442 358 0.000943954664919772 0.000994406363815237 0.000671396963454643 0.000625619897764553 0.0008576274155476 0.00099535997371765 41262 43337 667 665 0 True 443 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 487 356 0.000981358714096831 0.00101060616751308 0.000701915007248035 0.000732433051041428 0.000919304774503266 0.000906941685121612 42897 44043 667 665 0 True 488 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 531 356 0.000992911646717268 0.000994429309712826 0.000717174029144732 0.000747692072938125 0.000915290334482847 0.000901272076903209 43402 43338 667 665 0 True 532 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 575 356 0.000973008574678099 0.00106205086990766 0.000701915007248035 0.000732433051041428 0.000971779210086175 0.0010696840709344 42532 46285 667 665 0 True 577 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 619 356 0.00106193184021402 0.00104100948181853 0.000717174029144732 0.000656137941557946 0.0011196469203793 0.00112842552038128 46419 45368 667 665 0 True 622 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 663 357 0.00100867396468852 0.00100700366159161 0.000701915007248035 0.000656137941557946 0.0010030237330408 0.00102835467382713 44091 43886 667 665 0 True 666 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 266 402 0.000910188073736078 0.00100564985363386 0.000778210116731518 0.000839246204318303 0.000765469802063171 0.000829166668879579 39786 43827 667 665 0 True 264 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 310 402 0.000972139245094779 0.000973227300340574 0.000885023270008392 0.000839246204318303 0.000719593599129319 0.000684050749190445 42494 42414 667 665 0 True 309 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 354 402 0.00102182829390981 0.000973387921623698 0.000900282291905089 0.000885023270008392 0.000742051718778903 0.000689703308632255 44666 42421 667 665 0 True 354 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 398 402 0.00103036145008292 0.00106808564097357 0.000869764248111696 0.000900282291905089 0.000811717235773396 0.000833782522268287 45039 46548 667 665 0 True 399 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 443 402 0.00096353745763877 0.00101918793321138 0.000717174029144732 0.000823987182421607 0.000808156007802861 0.000914692947908173 42118 44417 667 665 0 True 443 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 486 401 0.00097724083712321 0.00094344352527003 0.000747692072938125 0.00064087891966125 0.000883450796320699 0.000888056910107781 42717 41116 667 665 0 True 488 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 531 400 0.000969005083175968 0.00107012782585899 0.000717174029144732 0.000854505226215 0.00088866167824431 0.000928975781405523 42357 46637 667 665 0 True 533 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 575 400 0.000992865892528673 0.00100216207720033 0.000671396963454643 0.000701915007248035 0.00097939186885961 0.000994285519744671 43400 43675 667 665 0 True 577 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 619 400 0.00100430443967762 0.00094952418813112 0.000625619897764553 0.000518806744487678 0.00103224056576124 0.00102567310449172 43900 41381 667 665 0 True 622 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 664 401 0.000954867038899868 0.000981671390653333 0.000595101853971161 0.000610360875867857 0.000963522905550314 0.00100761122878962 41739 42782 667 665 0 True 667 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 266 446 0.00100025519398689 0.00102221679169313 0.000839246204318303 0.000854505226215 0.000859421295887277 0.000865820881613996 43723 44549 667 665 0 True 265 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 310 447 0.00102965226015969 0.00100186378053167 0.000915541313801785 0.000885023270008392 0.000847539444239924 0.000800713848112534 45008 43662 667 665 0 True 309 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 355 446 0.00105390198011546 0.0010412848325896 0.000946059357595178 0.000946059357595178 0.000823048255333496 0.000761810635314077 46068 45380 667 665 0 True 354 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 399 446 0.000967152038537838 0.00104064234745711 0.000762951094834821 0.000930800335698482 0.000842912778505743 0.000796212563966688 42276 45352 667 665 0 True 399 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 443 446 0.00098419547378977 0.000950189619161201 0.000686655985351339 0.000549324788281071 0.000949744386882915 0.00101705087259467 43021 41410 667 665 0 True 443 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 487 444 0.00100206248443643 0.00100399774900745 0.000701915007248035 0.00064087891966125 0.000959610237267462 0.00100330355359202 43802 43755 667 665 0 True 488 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 532 444 0.000940591732057981 0.000941401340384608 0.000610360875867857 0.000686655985351339 0.000939332334644268 0.000883282225137482 41115 41027 667 665 0 True 533 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 576 445 0.000942467653790409 0.000976852752159639 0.000579842832074464 0.000579842832074464 0.00099511177438831 0.00104929098010537 41197 42572 667 665 0 True 577 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 621 444 0.000961890306849322 0.000880801224852013 0.000610360875867857 0.000534065766384375 0.000975588192221416 0.000890335343393121 42046 38386 667 665 0 True 622 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 664 445 0.0010002323168926 0.00109782352424894 0.000564583810177768 0.000762951094834821 0.00107049230217226 0.0010876847316076 43722 47844 667 665 0 True 667 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 268 490 0.00099485619973259 0.00103387330766835 0.000793469138628214 0.000885023270008392 0.000834175228711368 0.00083403718318068 43487 45057 667 665 0 True 265 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 312 491 0.000966923267594859 0.00100929825135051 0.000854505226215 0.000885023270008392 0.000782687875121622 0.000811792158347488 42266 43986 667 665 0 True 309 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 357 491 0.00103459371252803 0.000989082915574585 0.000839246204318303 0.000823987182421607 0.000888817050879087 0.00083596045846442 45224 43105 667 665 0 True 354 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 400 491 0.00103299231592718 0.000994911173562196 0.000778210116731518 0.000823987182421607 0.000918177691849266 0.00085699144379402 45154 43359 667 665 0 True 399 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 445 489 0.00103887172916174 0.000922746325644737 0.000671396963454643 0.000518806744487678 0.00107635336733633 0.00102395646839705 45411 40214 667 665 0 True 443 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 488 489 0.00100720983065345 0.00104470377133036 0.000732433051041428 0.000686655985351339 0.000950492103496933 0.0010614391160189 44027 45529 667 665 0 True 488 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 532 488 0.00097669178686006 0.000921484301277341 0.000701915007248035 0.000701915007248035 0.000930369314426287 0.000855026702396007 42693 40159 667 665 0 True 533 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 577 489 0.000987192373142795 0.000993809770477923 0.000625619897764553 0.000579842832074464 0.000968115395148656 0.00106660041574106 43152 43311 667 665 0 True 577 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 621 489 0.00102722728816411 0.00089885964625457 0.000595101853971161 0.000534065766384375 0.00101344237990094 0.000885894037936671 44902 39173 667 665 0 True 622 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 665 489 0.000959419580665149 0.00095675214587166 0.000579842832074464 0.000564583810177768 0.000981315526544727 0.00098140908574813 41938 41696 667 665 0 True 667 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 269 535 0.00100039245655268 0.00106684656250376 0.000823987182421607 0.000946059357595178 0.000800638260836331 0.00082648943290327 43729 46494 667 665 0 True 265 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 313 535 0.00107046499638713 0.000992019990465979 0.000946059357595178 0.000885023270008392 0.000835485811888694 0.000786296108159845 46792 43233 667 665 0 True 310 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 357 535 0.00103193996958948 0.00104034405078845 0.000930800335698482 0.000961318379491875 0.000765165538658106 0.000821847824521913 45108 45339 667 665 0 True 354 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 401 534 0.00103560030467714 0.000997068087935563 0.000869764248111696 0.000778210116731518 0.000834248147585657 0.000905124626694273 45268 43453 667 665 0 True 399 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 446 535 0.000936016313198402 0.000929469473638319 0.000503547722590982 0.000473029678797589 0.000984346171312964 0.00111152469420308 40915 40507 667 665 0 True 444 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 490 532 0.000983188881640663 0.00098805035018308 0.000625619897764553 0.000625619897764553 0.00101107612688146 0.00103268496075424 42977 43060 667 665 0 True 488 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 534 532 0.0010099550819692 0.000902875178332648 0.000671396963454643 0.000488288700694286 0.00103302009343494 0.000930428763406874 44147 39348 667 665 0 True 533 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 579 533 0.000944778240314496 0.000994635822791128 0.000686655985351339 0.000778210116731518 0.00084738062264296 0.000895324112372309 41298 43347 667 665 0 True 578 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 623 532 0.000998676674480338 0.000937202241125817 0.000686655985351339 0.000549324788281071 0.00100367174709342 0.000973657463306552 43654 40844 667 665 0 True 622 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 667 533 0.00102743318201279 0.000996287927417537 0.000747692072938125 0.000518806744487678 0.000973129045253713 0.00109365280380728 44911 43419 667 665 0 True 667 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 269 578 0.00101816795882215 0.00107519886922617 0.000946059357595178 0.000961318379491875 0.000735129204235166 0.00069425803566177 44506 46858 667 665 0 True 265 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 313 578 0.00104138820953451 0.000922585704361613 0.000991836423285267 0.000823987182421607 0.000759400126300444 0.000694214139005592 45521 40207 667 665 0 True 310 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 358 578 0.00100531103182673 0.00100792149749517 0.000885023270008392 0.000885023270008392 0.000744346370823318 0.000728119920100711 43944 43926 667 665 0 True 354 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 402 578 0.00108782871095924 0.000943282903986907 0.000915541313801785 0.000778210116731518 0.00082066703736711 0.000758559687331578 47551 41109 667 665 0 True 399 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 446 577 0.00100078136715574 0.000910034298380421 0.00064087891966125 0.000488288700694286 0.000984268455667026 0.00100618717482034 43746 39660 667 665 0 True 444 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 490 576 0.00102910320989654 0.000986099948888013 0.000564583810177768 0.000488288700694286 0.00114923043881553 0.0011399807310562 44984 42975 667 665 0 True 488 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 534 575 0.000953334273581909 0.00100567279953144 0.000518806744487678 0.000610360875867857 0.00105498856960455 0.00102660896571152 41672 43828 667 665 0 True 533 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 578 575 0.00097028620045665 0.00103834775769821 0.000747692072938125 0.000778210116731518 0.000841963476492178 0.000969989509777374 42413 45252 667 665 0 True 578 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 623 575 0.000965550641936985 0.000926601236439691 0.000747692072938125 0.00064087891966125 0.000801909817575052 0.000814222495628324 42206 40382 667 665 0 True 622 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 667 576 0.00103628661750608 0.00114025048889103 0.00080872816052491 0.000839246204318303 0.000879536061539017 0.00104869925869208 45298 49693 667 665 0 True 667 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 265 618 0.00102313228828479 0.000962052648214723 0.000885023270008392 0.000793469138628214 0.000762007578651674 0.000718477699365703 44723 41927 667 665 0 False 265 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 310 618 0.000977950027046445 0.000996196143827181 0.000900282291905089 0.000854505226215 0.00072329493613386 0.000775626148754623 42748 43415 667 665 0 False 310 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 358 622 0.000967197792726434 0.00100544334055555 0.000839246204318303 0.000839246204318303 0.000734068837342412 0.000776591243044696 42278 43818 667 665 0 True 354 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 402 621 0.00099659485889923 0.000856776870076312 0.000823987182421607 0.000701915007248035 0.000773653686567499 0.00069072707857127 43563 37339 667 665 0 True 399 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 444 617 0.000887562627475459 0.000855606629299272 0.000534065766384375 0.000442511635004196 0.00090458251767793 0.000928951832293577 38797 37288 667 665 0 False 444 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 488 617 0.00100252002632238 0.000993465582014088 0.000610360875867857 0.000656137941557946 0.00106485213761654 0.00103067640026749 43822 43296 667 665 0 False 488 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 533 617 0.00103381589132191 0.000997687627170467 0.000610360875867857 0.000534065766384375 0.00108179114911065 0.00111185008671058 45190 43480 667 665 0 False 533 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 578 617 0.00093722879919619 0.000974787621376628 0.000701915007248035 0.000762951094834821 0.000827323157954001 0.000887029721216698 40968 42482 667 665 0 False 578 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 623 617 0.0010447511423963 0.000963314672582119 0.000854505226215 0.000778210116731518 0.000798025767147733 0.000768671998741721 45668 41982 667 665 0 False 623 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 667 617 0.00103708731580651 0.00112389006391006 0.000839246204318303 0.000961318379491875 0.000846125891973275 0.000855693172333793 45333 48980 667 665 0 False 667 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 265 666 0.00118011490935695 0.0756556302635738 0.00103761348897536 0.0756389715419242 0.000795947745377397 0.0255641014650819 51585 3297131 667 665 0 True 265 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 310 661 0.00107609276158442 0.000985801652219356 0.00102235446707866 0.000839246204318303 0.000693084210231308 0.000703096969498531 47038 42962 667 665 0 False 310 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 355 661 0.00103319820977586 0.000880434090490589 0.000900282291905089 0.000747692072938125 0.000691130945531953 0.000648568249054058 45163 38370 667 665 0 False 355 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 399 661 0.000956925977386679 0.000969257660057675 0.000823987182421607 0.000823987182421607 0.000670374705184346 0.00072987632981998 41829 42241 667 665 0 False 399 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 444 661 0.000896896481949 0.000992433016622582 0.000717174029144732 0.000778210116731518 0.000767810081366523 0.000838103133923437 39205 43251 667 665 0 False 444 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 489 661 0.000948049664799095 0.000913177886350117 0.00064087891966125 0.000671396963454643 0.000863923955022158 0.000847405743642751 41441 39797 667 665 0 False 489 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 533 661 0.000980352121947724 0.000895968463158354 0.000717174029144732 0.000564583810177768 0.000917239922344543 0.000914846717231321 42853 39047 667 665 0 False 533 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 578 660 0.00104447661726473 0.000913866263277787 0.000915541313801785 0.000747692072938125 0.00078719338917387 0.000719770025199935 45656 39827 667 665 0 False 578 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 623 660 0.00105429089071852 0.00102063352475948 0.000961318379491875 0.000885023270008392 0.000727421607224538 0.000734362873868968 46085 44480 667 665 0 False 623 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 662 665 0.00116693770304136 0.0791716760429341 0.00103761348897536 0.0769512474250401 0.000812750857071211 0.0250538571695265 51009 3450363 667 665 0 True 667 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C8_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C8_1.csv new file mode 100755 index 0000000..814976e --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C8_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 236 241 0.0102795020434393 0.0425925881308903 0.0103150988021668 0.0420233463035019 0.00182986650741413 0.00710107890274273 449336 1856218 667 665 0 True 235 241 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 279 240 0.0103176152825395 0.010318884875269 0.0102998397802701 0.0102388036926833 0.00156481567271243 0.00156824956377714 451002 449705 667 665 0 False 279 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 323 240 0.0103305408408179 0.061526051338004 0.0103608758678569 0.0610971236743725 0.00132464673871498 0.0075339945655391 451567 2681353 667 665 0 True 324 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 368 240 0.0102741945575621 0.0881365693932703 0.01025406271458 0.0843060959792477 0.00134117009865889 0.0175123217419548 449104 3841060 667 665 0 True 369 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 412 240 0.0100311025535527 0.0728311738375465 0.0100099183642329 0.0693522545204852 0.00159204380211783 0.0118732139314254 438478 3174039 667 665 0 True 413 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 456 238 0.0103401949746116 0.0651151568552877 0.010406652933547 0.0689250019073777 0.00167963865762373 0.0187835611241468 451989 2837769 667 665 0 True 458 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 501 238 0.0101947652861599 0.081255599516071 0.0103303578240635 0.0811474784466316 0.00165726038085498 0.0195640774402151 445632 3541182 667 665 0 True 503 239 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 545 239 0.009971301829058 0.0686776910231633 0.00994888227664607 0.0670939192797742 0.00158415540356264 0.0153419785269952 435864 2993027 667 665 0 True 547 239 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 592 239 0.00997473339320269 0.00964964482618769 0.00996414129854276 0.00961318379491875 0.00186952885463784 0.00202735826698261 436014 420539 667 665 0 False 592 239 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 632 239 0.00977192795225184 0.042569320990735 0.00978103303578241 0.0424048218509194 0.00191507941094247 0.00788391667772309 427149 1855204 667 665 0 True 637 239 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 235 284 0.00987585859164718 0.0100562231855675 0.00994888227664607 0.0100556954299229 0.00165494754121313 0.00166159112375864 431692 438258 667 665 0 False 235 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 279 284 0.0101929122415217 0.0102454350570865 0.0101777676050965 0.0102235446707866 0.00142787688299872 0.00139250686470799 445551 446504 667 665 0 False 279 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 324 285 0.0104326184355751 0.117642469644012 0.0104829480430304 0.116731517509728 0.00140680233587116 0.0323179112057641 456029 5126950 667 665 0 True 324 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 369 285 0.010381236481782 0.0519309948021806 0.0103456168459602 0.0508583199816892 0.00139263433487426 0.0072996820715961 453783 2263193 667 665 0 True 369 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 413 284 0.0102566249491414 0.0837065655670419 0.01025406271458 0.0799877927824826 0.00156896944777854 0.0168618421705114 448336 3647997 667 665 0 True 413 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 457 283 0.0101802383312807 0.0441218863134031 0.0101319905394064 0.0451056687266346 0.00180550357721242 0.00714921304292416 444997 1922866 667 665 0 True 458 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 501 284 0.0102856102276168 0.0480098850926813 0.0101930266269932 0.0488441290913252 0.00168736792069009 0.010193356564001 449603 2092308 667 665 0 True 503 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 546 283 0.0101663976892305 0.0527869226740461 0.0101625085831998 0.0538033112077516 0.00160936724252385 0.0101473755963986 444392 2300495 667 665 0 True 548 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 592 282 0.00984067362061702 0.00982141781553908 0.0098268101014725 0.0097962920576791 0.00196684234092424 0.00198349738696621 430154 428025 667 665 0 False 592 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 637 282 0.00968854094353601 0.00957279901516207 0.0098115510795758 0.00958266575112535 0.00187851759500229 0.00192987548848427 423504 417190 667 665 0 False 637 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 236 329 0.00994810445543994 0.0489063124737915 0.00994888227664607 0.0482185091935607 0.00162190070193036 0.0075551606876631 434850 2131375 667 665 0 True 235 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 280 328 0.0100410540895723 0.0583036671559879 0.0101167315175097 0.06152437628748 0.00141686340471557 0.0150249760913154 438913 2540919 667 665 0 True 280 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 325 328 0.0101334317963472 0.0391670639175187 0.010101472495613 0.0393835355153735 0.00133636319958969 0.00637061110117047 442951 1706931 667 665 0 True 324 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 368 328 0.0101563546448337 0.0350108275954248 0.0101167315175097 0.0359655146105135 0.00136141166567917 0.00540768382745212 443953 1525799 667 665 0 True 369 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 412 330 0.0101124763779703 0.0703009756022007 0.0101472495613031 0.0679484245059892 0.00167574721384992 0.0100818228874416 442035 3063771 667 665 0 True 414 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 457 327 0.00995494470663501 0.0335596143024074 0.00996414129854276 0.0341039139391165 0.00176833660928207 0.00461308038779889 435149 1462554 667 665 0 True 458 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 501 327 0.0100542084187936 0.0291742631928872 0.0100099183642329 0.0294956893263142 0.00166149924537352 0.00313951317861717 439488 1271437 667 665 0 True 503 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 546 327 0.0101527171868403 0.0523706840917813 0.0102082856488899 0.0513008316166934 0.0015999049388967 0.00865034983243618 443794 2282355 667 665 0 True 548 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 589 328 0.0100630161000983 0.0603711384205536 0.0100404364080262 0.0588387884336614 0.00202242873058599 0.0141174939447414 439873 2631021 667 665 0 True 592 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 632 328 0.0100602937258768 0.0629848138313281 0.010101472495613 0.0621499961852445 0.00209996413716447 0.0168470020703234 439754 2744927 667 665 0 True 637 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 236 373 0.0102339766257864 0.0417092169655083 0.0103303578240635 0.0433051041428244 0.00160769962409611 0.00937074175739476 447346 1817720 667 665 0 True 235 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 280 372 0.0103246614275833 0.0354173371171118 0.0103456168459602 0.0337834744792859 0.0015698623685829 0.00809430818521507 451310 1543515 667 665 0 True 280 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 324 373 0.0103680821525607 0.0807251592015057 0.0104219119554437 0.0770428015564202 0.00137926417703124 0.0166247479866511 453208 3518065 667 665 0 True 324 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 369 372 0.0102937315960925 0.0652625154096044 0.0103303578240635 0.0638437476157778 0.00151196543048254 0.0130893087556536 449958 2844191 667 665 0 True 369 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 412 373 0.0102536509268826 0.0450729708225703 0.0101625085831998 0.0459296559090562 0.00168503452025605 0.00889038664570976 448206 1964315 667 665 0 True 414 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 458 372 0.0101309839472573 0.0593999303592008 0.0101625085831998 0.0579842832074464 0.00189763301649196 0.0119850848440605 442844 2588695 667 665 0 True 459 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 501 371 0.0101006031660297 0.0423341714322428 0.0100556954299229 0.0431067368581674 0.00176877520515531 0.00590977406914201 441516 1844956 667 665 0 True 503 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 546 371 0.0102065927439119 0.0535503785786279 0.0101930266269932 0.0529640650034333 0.0018028562430078 0.00617207212835953 446149 2333767 667 665 0 True 548 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 590 372 0.0100835368536835 0.0435481700359849 0.0100556954299229 0.0435187304493782 0.00208444987882793 0.00644349491001331 440770 1897863 667 665 0 True 593 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 633 371 0.0101256993384745 0.0843836990048938 0.0100862134737163 0.0822156099794003 0.00188779698439529 0.0158194102679247 442613 3677507 667 665 0 True 637 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 237 417 0.0100092091743096 0.0422956452701908 0.0100404364080262 0.0420996414129854 0.00157847555606083 0.00576025313350255 437521 1843277 667 665 0 True 235 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 281 417 0.0104149344416828 0.0525619610940833 0.0104219119554437 0.0517280842298009 0.00163170571607145 0.00659973375631042 455256 2290691 667 665 0 True 280 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 324 417 0.0107983545421155 0.0343403484678737 0.0103456168459602 0.0349584191653315 0.0035585831002886 0.00377332629563866 472016 1496579 667 665 0 True 325 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 369 417 0.0104259840782287 0.0551526676613713 0.010406652933547 0.0524299992370489 0.00147773684473298 0.0125030127674079 455739 2403596 667 665 0 True 369 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 413 417 0.0105660605266147 0.0941368757210031 0.010605020218204 0.094544899671931 0.00158865608388263 0.0132159637186465 461862 4102558 667 665 0 True 414 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 458 415 0.0106942180088715 0.0630015643365681 0.0106813153276875 0.0612497138933394 0.00180503490837533 0.014922127005478 467464 2745657 667 665 0 True 459 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 502 415 0.0106769229255823 0.0529341435529772 0.0106507972838941 0.0515449759670405 0.00187604112223048 0.00877182320026277 466708 2306911 667 665 0 True 503 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 545 415 0.0106699225347271 0.0341009768642251 0.0104219119554437 0.0342565041580835 0.00248427927638905 0.00452215724018583 466402 1486147 667 665 0 True 548 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 589 416 0.0100910405406132 0.0393538894156885 0.0101625085831998 0.0396887159533074 0.00181297088388117 0.004942484227955 441098 1715073 667 665 0 True 593 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 634 416 0.0100537279998133 0.0777630962276371 0.0101167315175097 0.0766765850308995 0.00186843259712401 0.0150692935220437 439467 3388976 667 665 0 True 638 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 238 462 0.0101446415725532 0.0587077444125305 0.0102235446707866 0.0588998245212482 0.00151112830561842 0.0125572871269948 443441 2558529 667 665 0 True 235 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 282 461 0.0103333776005108 0.0562187799551522 0.0103456168459602 0.0548714427405203 0.00156726654109889 0.00664954687691017 451691 2450058 667 665 0 True 280 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 326 461 0.01036940902403 0.0692618247380869 0.0103608758678569 0.0660257877470054 0.00149617954491284 0.0145864210326806 453266 3018484 667 665 0 True 325 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 371 461 0.010349139918482 0.0870268598940703 0.0102998397802701 0.0816357671473259 0.00156068170023991 0.0185142328383091 452380 3792698 667 665 0 True 370 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 415 461 0.0105569325659898 0.0955822148642377 0.0104982070649271 0.0925612268253605 0.00180252761949848 0.0248251659753228 461463 4165547 667 665 0 True 414 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 458 460 0.0106318779269097 0.0430043293172276 0.0106202792401007 0.0435034714274815 0.00192187491148275 0.00517567679781747 464739 1874162 667 665 0 True 459 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 504 457 0.0118041231158282 0.0363268895516429 0.0109254596780346 0.0398413061722744 0.005037054671015 0.0100129248056226 515980 1583154 667 665 0 False 504 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 546 460 0.0111075155944573 0.0980025251960297 0.0105897611963073 0.0978103303578241 0.00431461031481511 0.014854629248192 485530 4271026 667 665 0 True 548 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 591 460 0.0102555039715208 0.0598146315663271 0.0102388036926833 0.0628213931486992 0.00204702580951412 0.0106585466353218 448287 2606768 667 665 0 True 593 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 635 461 0.0106766484004507 0.0755949613103484 0.0103303578240635 0.0725719081406882 0.00471519948019723 0.0110299197068157 466696 3294487 667 665 0 True 638 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 239 505 0.0101981510961159 0.0573845003903671 0.0102082856488899 0.0585946440833143 0.00157386458346184 0.0126269134246228 445780 2500861 667 665 0 True 236 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 283 505 0.0104101988831631 0.102774790030696 0.0103456168459602 0.0985885404745556 0.00167611410352758 0.0210621706110119 455049 4479005 667 665 0 True 280 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 327 506 0.0105744792973163 0.0558772991072325 0.0105592431525139 0.0577706569008927 0.0016823302289401 0.0099534890703435 462230 2435176 667 665 0 True 325 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 371 505 0.0104360042455312 0.0558982257658337 0.0104676890211337 0.0551003280689708 0.00160408214549525 0.00624265235960068 456177 2436088 667 665 0 True 370 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 415 505 0.0105396146056063 0.0542158784464021 0.0105745021744106 0.0539711604486152 0.0018527438222879 0.00580898174187844 460706 2362770 667 665 0 True 414 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 460 502 0.0103312729078354 0.0637358560053143 0.0103761348897536 0.0609445334554055 0.00195369909465246 0.0135976192514315 451599 2777658 667 665 0 True 459 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 504 503 0.0103822201968368 0.0703899368471534 0.0103456168459602 0.0673380636301213 0.00180856078309833 0.0137355136349134 453826 3067648 667 665 0 True 504 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 548 503 0.0101416217961058 0.0557186282254044 0.0102235446707866 0.0555886167696651 0.00184199198343678 0.0101278594006685 443309 2428261 667 665 0 True 548 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 592 504 0.0102040991406334 0.0479165641271868 0.0102235446707866 0.0473182269016556 0.00198847674448746 0.00536643088727682 446040 2088241 667 665 0 True 593 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 636 503 0.0100647318821706 0.0654969995370665 0.0100556954299229 0.0644846265354391 0.00198136946464471 0.0137375999078544 439948 2854410 667 665 0 True 638 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 239 548 0.00994147009809355 0.0430607303335014 0.00999465934233616 0.0432745860990311 0.00142949313658305 0.00659224529963541 434560 1876620 667 665 0 True 236 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 282 547 0.0103109809251932 0.0521715137007086 0.0102235446707866 0.0520943007553216 0.00178669860735354 0.00945133551314972 450712 2273675 667 665 0 True 280 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 327 548 0.0103192395562347 0.043716776491469 0.0102235446707866 0.0430304417486839 0.00162383077320269 0.00583971005713347 451073 1905211 667 665 0 True 325 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 370 547 0.0109224399015873 0.0498330972774119 0.0107118333714809 0.0478217746242466 0.00196335653352408 0.00713357441073256 477440 2171765 667 665 0 True 370 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 415 547 0.0106784099367117 0.0838405466630642 0.0108186465247578 0.078309300373846 0.00195963371838246 0.0146811755103999 466773 3653836 667 665 0 True 415 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 459 546 0.0103588169293701 0.0595089233727487 0.0104676890211337 0.0585030899519341 0.00207762263155084 0.0086427011312303 452803 2593445 667 665 0 True 459 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 503 545 0.0102560301446896 0.0528612214904393 0.0102845807583734 0.0527199206530861 0.00200558187558272 0.00529948539785797 448310 2303733 667 665 0 True 504 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 547 544 0.0101093879702401 0.0371615006846482 0.0100404364080262 0.0384679942015717 0.00179337812949859 0.00666732570117455 441900 1619527 667 665 0 True 549 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 592 546 0.00993373764022086 0.0474519555928044 0.0100862134737163 0.0472571908140688 0.00165817720550059 0.00667888704474251 434222 2067993 667 665 0 True 593 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 636 546 0.00987755149662523 0.05386671072279 0.00997940032043946 0.0518806744487678 0.00185208238161797 0.00899238646299378 431766 2347553 667 665 0 True 638 543 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 236 589 0.00992870467947532 0.00979376800894431 0.00987258716716258 0.00968947890440223 0.00129080291540675 0.00128193481161481 434002 426820 667 665 0 False 236 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 281 588 0.00982582638641769 0.00994390301686925 0.00984206912336919 0.00990310521095598 0.00142357731571076 0.00135678403948766 429505 433363 667 665 0 False 281 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 326 590 0.00994810445543994 0.0720992685421496 0.00990310521095598 0.0683756771190967 0.00152606052147337 0.0152874135250536 434850 3142142 667 665 0 True 325 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 370 591 0.0102202961233963 0.0716710522013434 0.0102235446707866 0.0684367132066835 0.00145148837566587 0.0170233757929478 446748 3123480 667 665 0 True 370 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 415 588 0.0103349561200174 0.0101439224061527 0.0103456168459602 0.0101625085831998 0.00175444984247491 0.00174015108247307 451760 442080 667 665 0 False 415 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 459 588 0.010217276346949 0.0103361401902559 0.0103761348897536 0.0103303578240635 0.0020440849637114 0.00188174859114705 446616 450457 667 665 0 False 459 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 504 587 0.00991312537825846 0.00987490470281907 0.00990310521095598 0.00985732814526589 0.00207714292300003 0.00214460103937319 433321 430356 667 665 0 False 504 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 549 587 0.00993629987478223 0.00985739698295866 0.00990310521095598 0.00984206912336919 0.00192185864203762 0.00173127951077938 434334 429593 667 665 0 False 549 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 594 587 0.00987091713927884 0.00998394360816209 0.00991836423285267 0.00999465934233616 0.00171367968331667 0.00167280334973813 431476 435108 667 665 0 False 594 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 638 587 0.00975216214277846 0.00983637854076711 0.00985732814526589 0.00988784618905928 0.00163370081610117 0.00158776251733479 426285 428677 667 665 0 False 638 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 236 638 0.00973411211537742 0.0382590259122285 0.0098268101014725 0.0395361257343404 0.00139827084595968 0.00892506433031023 425496 1667358 667 665 0 True 236 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 281 632 0.00975140719866663 0.0100237088486839 0.00973525597009232 0.00999465934233616 0.00143349194631908 0.00136178681638083 426252 436841 667 665 0 False 281 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 326 632 0.00977467320356759 0.00977903674269216 0.00971999694819562 0.00975051499198901 0.0013905459593744 0.00130019766497291 427269 426178 667 665 0 False 326 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 370 632 0.00999276054350943 0.00993309549910482 0.00990310521095598 0.0100556954299229 0.0014870721451934 0.00137221602033742 436802 432892 667 665 0 False 370 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 415 631 0.00987480624530948 0.00997432927707229 0.00993362325474937 0.0100099183642329 0.00156667674616575 0.00149223344033205 431646 434689 667 665 0 False 415 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 460 631 0.00971727457397417 0.00972520566694833 0.0098268101014725 0.00976577401388571 0.00183676351717844 0.00190589159599209 424760 423832 667 665 0 False 460 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 504 631 0.00968526951905142 0.00970622940964221 0.00964370183871214 0.00973525597009232 0.00194800184239364 0.00184332071608086 423361 423005 667 665 0 False 504 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 549 631 0.00971764060748294 0.0097096024565878 0.00971999694819562 0.00973525597009232 0.0017848536424548 0.0019450042300515 424776 423152 667 665 0 False 549 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 594 631 0.00968751147429261 0.00981129867470232 0.00962844281681544 0.00984206912336919 0.00151798342969327 0.00138373027727836 423459 427584 667 665 0 False 594 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 634 637 0.00973443239469759 0.0404542828804674 0.00968947890440223 0.0405584802014191 0.00144655749316646 0.00763847959850766 425510 1763029 667 665 0 True 638 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C8_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C8_2.csv new file mode 100755 index 0000000..425921c --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C8_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 236 241 0.00819805249583951 0.733220783705659 0.00817883573662928 0.706828412298772 0.00188742901470365 0.156551501977163 358352 31954330 667 665 10 True 235 241 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 279 240 0.00703145794921262 0.00660213132969756 0.00689707789730678 0.00656137941557946 0.00167675056326645 0.00148331186843643 307358 287726 667 665 0 False 279 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 323 240 0.0062608887819766 0.00625998505074772 0.00627145799954223 0.00630197604333562 0.00117778380818733 0.00115656233479425 273675 272815 667 665 0 True 324 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 368 240 0.00628678565272182 0.00631888716985873 0.00625619897764553 0.00631723506523232 0.00127722574352256 0.00111824090953475 274807 275382 667 665 0 True 369 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 412 240 0.00629401481451995 0.00646220724619973 0.00628671702143893 0.00645456626230259 0.0014738715885956 0.00153432626756198 275123 281628 667 665 0 True 413 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 456 238 0.00636063291311543 0.00656128763198911 0.00646982528419928 0.00646982528419928 0.00158346637609453 0.00148448516178096 278035 285946 667 665 0 True 458 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 501 238 0.00669113829443713 0.00690026737707166 0.00679026474402991 0.00692759594110018 0.00151257744028166 0.00149289970421198 292482 300719 667 665 0 True 503 239 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 545 239 0.00682002784371147 0.00700168824441511 0.0068207827878233 0.00700389105058366 0.00148081438563894 0.00137347693432244 298116 305139 667 665 0 True 547 239 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 592 239 0.00799225015553564 0.00717607706609164 0.0076600289921416 0.00721751735713741 0.00266275009658165 0.00198771032963921 349356 312739 667 665 0 False 592 239 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 632 239 0.00878720630529322 0.749451105447299 0.00877393759060044 0.732234683756771 0.00198010200713781 0.169280044568444 384105 32661660 667 665 13 True 637 239 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 235 284 0.00662161480486582 0.00656759775382608 0.00656137941557946 0.00654612039368277 0.00153930797720941 0.00144227890752015 289443 286221 667 665 0 False 235 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 279 284 0.00642221805096536 0.0061706107796385 0.0064087891966125 0.00614938582436866 0.00134268218907559 0.00134399652860859 280727 268920 667 665 0 False 279 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 324 285 0.00641782564886017 0.00642129471079851 0.00648508430609598 0.0064087891966125 0.00130027236848101 0.00127308174365786 280535 279845 667 665 0 True 324 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 369 285 0.00619870883967492 0.00645061956791728 0.00622568093385214 0.00653086137178607 0.00129483470125622 0.00124910757991348 270957 281123 667 665 0 True 369 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 413 284 0.00639664145954031 0.00652631808406344 0.00642404821850919 0.00651560234988937 0.00138722276029609 0.00142251888655184 279609 284422 667 665 0 True 413 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 457 283 0.00659313282246494 0.00684340744284607 0.00660715648126955 0.00683604180972 0.00167060850155756 0.00168863224262309 288198 298241 667 665 0 True 458 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 501 284 0.0067359545221667 0.00673356543108745 0.00683604180972 0.00675974670023652 0.00162285111094166 0.00165547984002599 294441 293454 667 665 0 True 503 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 546 283 0.00688813295343631 0.00705317883860487 0.00689707789730678 0.00712596322575723 0.0015729452916929 0.00150386783412907 301093 307383 667 665 0 True 548 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 592 282 0.00715153981718228 0.00707433495618194 0.00703440909437705 0.00711070420386053 0.00185223161938574 0.00196615798360256 312607 308305 667 665 0 False 592 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 637 282 0.00773474558211853 0.00741645828923419 0.00770580605783169 0.00746166170748455 0.00197110056944113 0.00182057731304976 338100 323215 667 665 0 False 637 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 236 329 0.00616185384076101 0.00613373672221295 0.00613412680247196 0.00617990386816205 0.00141827392082966 0.00141111124007925 269346 267313 667 665 0 True 235 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 280 328 0.006151101606441 0.00617077140092162 0.00611886778057527 0.00610360875867857 0.00147232346963259 0.00136711378348038 268876 268927 667 665 0 True 280 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 325 328 0.00620314699596871 0.00610039633301611 0.00617990386816205 0.00610360875867857 0.00123478654755259 0.00117574804323605 271151 265860 667 665 0 True 324 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 368 328 0.00633347780218382 0.00644899040918845 0.0063782711528191 0.00650034332799268 0.00133302211735722 0.00131126510118886 276848 281052 667 665 0 True 369 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 412 330 0.00662751709519468 0.00689338360779495 0.00662241550316625 0.00688181887541009 0.00141698813193809 0.00144312971793672 289701 300419 667 665 0 True 414 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 457 327 0.0067164632378249 0.00687229632791064 0.00668345159075303 0.00688181887541009 0.00169164379704501 0.00161494265955496 293589 299500 667 665 0 True 458 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 501 327 0.00691421284093591 0.00693204744523244 0.00695811398489357 0.00694285496299687 0.00167445952295925 0.001573856316222 302233 302104 667 665 0 True 503 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 546 327 0.00696413066069392 0.00694140937144876 0.00701915007248035 0.00691233691920348 0.00162031982203844 0.00142679152834723 304415 302512 667 665 0 True 548 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 589 328 0.00743231039550035 0.00730881908364411 0.00753795681696803 0.00727855344472419 0.00194321938106269 0.00203712966018689 324880 318524 667 665 0 True 592 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 632 328 0.00725302260748774 0.00751826923683666 0.00737010757610437 0.00758373388265812 0.00197911037249168 0.00189463211852163 317043 327652 667 665 0 True 637 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 236 373 0.00616082437151761 0.00619220286926976 0.00616464484626535 0.00613412680247196 0.00152413175517065 0.0015517139304476 269301 269861 667 665 0 True 235 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 280 372 0.00628738045717357 0.00616567741165686 0.00633249408712902 0.00611886778057527 0.00150660038299944 0.0013838116428965 274833 268705 667 665 0 True 280 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 324 373 0.00652088695867219 0.0065021789997998 0.00659189745937285 0.00648508430609598 0.00141474632105509 0.00130658608952814 285040 283370 667 665 0 True 324 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 369 372 0.00661793159268386 0.00677434029110313 0.00657663843747616 0.0068055237659266 0.001247862876597 0.00133284571728687 289282 295231 667 665 0 True 369 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 412 373 0.00690192784129794 0.00703238985538922 0.00686655985351339 0.00706492713817044 0.00149580388371363 0.00143733113963226 301696 306477 667 665 0 True 414 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 458 372 0.00690858507573862 0.00699925597927068 0.00694285496299687 0.00701915007248035 0.00156590658878961 0.0016483032912678 301987 305033 667 665 0 True 459 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 501 371 0.00687914225537723 0.00679643719048135 0.00688181887541009 0.00683604180972 0.00167316111556062 0.00173832726492707 300700 296194 667 665 0 True 503 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 546 371 0.00692970063377558 0.00721219390889676 0.00709544518196384 0.00715648126955062 0.00171353018916709 0.00161602536438086 302910 314313 667 665 0 True 548 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 590 372 0.00696408490650532 0.00704666220368959 0.00703440909437705 0.00709544518196384 0.00198533363283323 0.00215584931872881 304413 307099 667 665 0 True 593 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 633 371 0.00673565711994083 0.00694666398199665 0.00675974670023652 0.00701915007248035 0.00197067448748969 0.00185081367635527 294428 302741 667 665 0 True 637 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 237 417 0.00607148931828432 0.00624172011626686 0.00605783169298848 0.00622568093385214 0.00154245578926571 0.00158728400136148 265396 272019 667 665 0 True 235 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 281 417 0.00645513818966003 0.00670162474164353 0.00642404821850919 0.00651560234988937 0.00149487470093977 0.00213466188634408 282166 292062 667 665 0 True 280 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 324 417 0.00669527904850504 0.00670573205731197 0.00665293354695964 0.00675974670023652 0.00148247032229596 0.00134433526657069 292663 292241 667 665 0 True 325 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 369 417 0.00678939541444659 0.00717187796683285 0.0068055237659266 0.00718699931334401 0.00140624369043902 0.00131583965748715 296777 312556 667 665 0 True 369 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 413 417 0.00714323543195214 0.0073100811080115 0.00714122224765393 0.00730907148851759 0.00154187877255946 0.00155150351766921 312244 318579 667 665 0 True 414 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 458 415 0.00708803300341132 0.00725719081406882 0.00712596322575723 0.00721751735713741 0.00166035337610744 0.00158857184628067 309831 316274 667 665 0 True 459 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 502 415 0.00712765613073527 0.00720549370680076 0.00717174029144732 0.0072480354009308 0.00170257434205815 0.00168390861257095 311563 314021 667 665 0 True 503 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 545 415 0.00712985233178787 0.00707626241157942 0.00708018616006714 0.00709544518196384 0.00180228077634658 0.00153926303353675 311659 308389 667 665 0 True 548 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 589 416 0.00661463729110496 0.00659804695992671 0.00674448767833982 0.00666819256885634 0.00177510586471355 0.00181211405353801 289138 287548 667 665 0 True 593 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 634 416 0.00608459789331702 0.00614633401998932 0.00607309071488518 0.00616464484626535 0.00182391432622841 0.00192646258638966 265969 267862 667 665 0 True 638 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 238 462 0.00633752704787455 0.00622877863002666 0.00627145799954223 0.00624093995574884 0.00142494192006051 0.00146459163315471 277025 271455 667 665 0 True 235 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 282 461 0.00640169729738015 0.00653760746567724 0.00642404821850919 0.00654612039368277 0.00153801964851711 0.00143927783924393 279830 284914 667 665 0 True 280 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 326 461 0.00665382575363726 0.00699455207026493 0.00666819256885634 0.00685130083161669 0.00145659948284585 0.00186281245082068 290851 304828 667 665 0 True 325 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 371 461 0.0067500925664428 0.0069699540680495 0.00683604180972 0.00703440909437705 0.00139684669536869 0.00146646756918783 295059 303756 667 665 0 True 370 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 415 461 0.00698906669347862 0.0071097175302642 0.00698863202868696 0.00720225833524071 0.00166454457310945 0.0017402946218213 305505 309847 667 665 0 True 414 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 458 460 0.00707856188637199 0.00693071658317228 0.00711070420386053 0.00698863202868696 0.00186903564149864 0.00198669148190802 309417 302046 667 665 0 True 459 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 504 457 0.0075393751968145 0.0071939289744159 0.00708018616006714 0.00714122224765393 0.00299920249616426 0.00182202478487465 329560 313517 667 665 0 False 504 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 546 460 0.00685635666945653 0.00681167326648046 0.00654612039368277 0.00679026474402991 0.00272019690243832 0.00190535531432114 299704 296858 667 665 0 True 548 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 591 460 0.00616125903630927 0.00632386642963554 0.00616464484626535 0.00625619897764553 0.00180446121836024 0.00188079707192997 269320 275599 667 665 0 True 593 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 635 461 0.00629751500994753 0.00621485047019012 0.00622568093385214 0.00624093995574884 0.00222739173564783 0.00184565674733163 275276 270848 667 665 0 True 638 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 239 505 0.00660045349264027 0.00675593768123674 0.00656137941557946 0.00677500572213321 0.00131956649726501 0.00140169274332017 288518 294429 667 665 0 True 236 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 283 505 0.00667558187031456 0.00689611416960804 0.00668345159075303 0.00691233691920348 0.00149082893627857 0.00143297471710415 291802 300538 667 665 0 True 280 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 327 506 0.00668082072490878 0.00684944221391198 0.00671396963454643 0.00689707789730678 0.0015222914778832 0.00145385022499233 292031 298504 667 665 0 True 325 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 371 505 0.00656627511375921 0.00675846172997153 0.00662241550316625 0.0068207827878233 0.0016411308492015 0.0015126342414474 287024 294539 667 665 0 True 370 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 415 505 0.00666997698221157 0.00683044301070828 0.00665293354695964 0.00685130083161669 0.00189645070700646 0.00182865089627207 291557 297676 667 665 0 True 414 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 460 502 0.0068295218378451 0.0069143791040889 0.00689707789730678 0.00689707789730678 0.00190283096051903 0.00162786484752464 298531 301334 667 665 0 True 459 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 504 503 0.00656913475054645 0.00655082430268851 0.00656137941557946 0.00663767452506294 0.0017606529218208 0.00173249340990633 287149 285490 667 665 0 True 504 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 548 503 0.00646685126194056 0.0066183311333954 0.00645456626230259 0.00665293354695964 0.00173178791318558 0.00175058591830647 282678 288432 667 665 0 True 548 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 592 504 0.00618958087905006 0.00625821821663337 0.00622568093385214 0.00634775310902571 0.00172330469606166 0.00180095154568489 270558 272738 667 665 0 True 593 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 636 503 0.00623210939734985 0.0061208870195631 0.00621042191195544 0.00625619897764553 0.00173528670914433 0.00186387885404655 272417 266753 667 665 0 True 638 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 239 548 0.00651134721034996 0.00660043333327597 0.00648508430609598 0.00660715648126955 0.00138311062241723 0.00140301069462456 284623 287652 667 665 0 True 236 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 282 547 0.00665384863073156 0.0067631197471821 0.00665293354695964 0.0068055237659266 0.00140645712925692 0.00138755942935651 290852 294742 667 665 0 True 280 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 327 548 0.00696740208517851 0.00676947576081426 0.00698863202868696 0.00668345159075303 0.0013520076353028 0.0013684745710005 304558 295019 667 665 0 True 325 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 370 547 0.00694711010253628 0.00728536837630813 0.00692759594110018 0.00718699931334401 0.00146350238949573 0.0020815898015839 303671 317502 667 665 0 True 370 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 415 547 0.00679321588919434 0.00691171737996858 0.0068055237659266 0.00691233691920348 0.00175955747909628 0.00169492404616839 296944 301218 667 665 0 True 415 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 459 546 0.00664632206670755 0.00693996377990066 0.00665293354695964 0.00697337300679027 0.00200295390963449 0.00206577029120045 290523 302449 667 665 0 True 459 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 503 545 0.00669720072442607 0.00691490685973345 0.00683604180972 0.00691233691920348 0.00192013367087176 0.00203296605418601 292747 301357 667 665 0 True 504 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 547 544 0.006676153797672 0.00675029299042984 0.00660715648126955 0.0068207827878233 0.00186253843683212 0.00184483587428926 291827 294183 667 665 0 True 549 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 592 546 0.00648245344025172 0.00666075809803749 0.00650034332799268 0.00662241550316625 0.00163653521615347 0.00144570454386044 283360 290281 667 665 0 True 593 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 636 546 0.00648975123333275 0.00646716356007896 0.00659189745937285 0.00643930724040589 0.00178465497202722 0.00198994496728349 283679 281844 667 665 0 True 638 543 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 236 589 0.00692693250536554 0.00713874409071431 0.00692759594110018 0.00708018616006714 0.00123674575298681 0.00130686396097885 302789 311112 667 665 0 False 236 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 281 588 0.00690471884680228 0.00681123729442627 0.00683604180972 0.00675974670023652 0.00138997379997749 0.00141109674950579 301818 296839 667 665 0 False 281 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 326 590 0.00656234025353997 0.00680924100133602 0.00660715648126955 0.00683604180972 0.00142191687250027 0.00144207715407087 286852 296752 667 665 0 True 325 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 370 591 0.00648563335635913 0.00637085962789785 0.00645456626230259 0.00634775310902571 0.00126141653912995 0.00132021331918693 283499 277647 667 665 0 True 370 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 415 588 0.00663561558657613 0.00678790131657824 0.00669871061264973 0.00668345159075303 0.00161839334750015 0.00154140428789451 290055 295822 667 665 0 False 415 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 459 588 0.0067272612263335 0.00673046773491293 0.00677500572213321 0.00677500572213321 0.00194635946857408 0.00180651714013891 294061 293319 667 665 0 False 459 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 504 587 0.00658823712428519 0.0067645882846278 0.00656137941557946 0.00675974670023652 0.00199168841437907 0.00212865640176485 287984 294806 667 665 0 False 504 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 549 587 0.00695520859391774 0.00710086041379484 0.00703440909437705 0.00718699931334401 0.00188641564428204 0.00179461782824644 304025 309461 667 665 0 False 549 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 594 587 0.00665309368661973 0.00676961343619979 0.00672922865644312 0.00675974670023652 0.00161717777130517 0.00151658454854184 290819 295025 667 665 0 False 594 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 638 587 0.00662863807281527 0.00671564468507042 0.00665293354695964 0.00668345159075303 0.00155951868665815 0.00145163070193066 289750 292673 667 665 0 False 638 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 236 638 0.00963933231370124 0.716313626822836 0.00881971465629053 0.727016098268101 0.00341622960355141 0.2158359360586 421353 31217503 667 665 10 True 236 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 281 632 0.00735407073300155 0.00735523863446669 0.00717174029144732 0.00732433051041428 0.00181210614311931 0.00144321324279347 321460 320547 667 665 0 False 281 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 326 632 0.00674078158906356 0.00670215249728808 0.00666819256885634 0.00671396963454643 0.00136493483918988 0.00123219672164766 294652 292085 667 665 0 False 326 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 370 632 0.00672703245539052 0.00648143590837933 0.00675974670023652 0.00650034332799268 0.00134204399649968 0.00124650889159161 294051 282466 667 665 0 False 370 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 415 631 0.00637687565006693 0.00645862768617584 0.0063935301747158 0.00645456626230259 0.00156875675701208 0.00143753349910334 278745 281472 667 665 0 False 415 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 460 631 0.00648046313304781 0.00652193541762394 0.00646982528419928 0.00657663843747616 0.00177569161459392 0.00172584800313679 283273 284231 667 665 0 False 460 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 504 631 0.0066533224575627 0.00648370755224064 0.00660715648126955 0.0064087891966125 0.00176262378395346 0.0017703286518322 290829 282565 667 665 0 False 504 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 549 631 0.00662015067083076 0.00649802579233618 0.00657663843747616 0.00663767452506294 0.00183538117396705 0.00187430038181672 289379 283189 667 665 0 False 549 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 594 631 0.0071218911029722 0.00692729764443152 0.00700389105058366 0.00692759594110018 0.00200686021619424 0.00134733302974825 311311 301897 667 665 0 False 594 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 634 637 0.0082905903422745 0.763981044394002 0.00817883573662928 0.75362783245594 0.00167175468889465 0.177841108099744 362397 33294886 667 665 13 True 638 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C8_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C8_3.csv new file mode 100755 index 0000000..981fdc9 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C8_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 236 241 0.0010480683210695 0.0748084447786897 0.000732433051041428 0.0708476386663615 0.000937149927195397 0.0189636190813691 45813 3260210 667 665 0 True 235 241 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 279 240 0.000996388965050549 0.00082905822578878 0.000839246204318303 0.000595101853971161 0.000774891385315866 0.000756867182950093 43554 36131 667 665 0 False 279 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 323 240 0.000902867403560751 0.000942181500902634 0.000778210116731518 0.000854505226215 0.000717383507972062 0.000640791514724137 39466 41061 667 665 0 True 324 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 368 240 0.000838857293715239 0.00087364210480424 0.000686655985351339 0.000793469138628214 0.000630737266243982 0.000596753153501031 36668 38074 667 665 0 True 369 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 412 240 0.000998104747122891 0.00100112951180882 0.000823987182421607 0.000823987182421607 0.000770685854131068 0.000754164617616569 43629 43630 667 665 0 True 413 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 456 238 0.000964292401750601 0.000943030499113428 0.000793469138628214 0.000747692072938125 0.000822308807172353 0.000795009827460773 42151 41098 667 665 0 True 458 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 501 238 0.00097202485962329 0.00101053732982032 0.000762951094834821 0.000854505226215 0.000851640302305734 0.000817333664468921 42489 44040 667 665 0 True 503 239 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 545 239 0.000922129916959579 0.00102084003783779 0.000762951094834821 0.000900282291905089 0.000773647935787475 0.000772022621563703 40308 44489 667 665 0 True 547 239 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 592 239 0.00104831996910677 0.000978114776527035 0.000701915007248035 0.000579842832074464 0.00104531027281175 0.00105141214725402 45824 42627 667 665 0 False 592 239 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 632 239 0.00114358018976321 0.0772477772595829 0.000854505226215 0.0736705577172503 0.00107201894864653 0.0208668640540863 49988 3366518 667 665 0 True 637 239 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 235 284 0.000991218741739224 0.000937041619842694 0.000732433051041428 0.000747692072938125 0.000874634851614522 0.000826459663707282 43328 40837 667 665 0 False 235 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 279 284 0.000905566900687903 0.000824629667554099 0.000762951094834821 0.000656137941557946 0.000714998378239445 0.000664783829349158 39584 35938 667 665 0 False 279 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 324 285 0.000896736342288915 0.00100151959206783 0.000747692072938125 0.000885023270008392 0.000668442693127294 0.000699880900135588 39198 43647 667 665 0 True 324 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 369 285 0.00099442153494093 0.000924811456427748 0.000839246204318303 0.000839246204318303 0.000734105900325863 0.000623521463509894 43468 40304 667 665 0 True 369 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 413 284 0.000917165587496936 0.00087598258635832 0.000732433051041428 0.000656137941557946 0.000762671357869157 0.000758974893746395 40091 38176 667 665 0 True 413 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 457 283 0.000933385447354144 0.000969808361599811 0.00064087891966125 0.00064087891966125 0.00093174810050064 0.000957571832673044 40800 42265 667 665 0 True 458 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 501 284 0.000939013212551426 0.000942709256547182 0.000717174029144732 0.000701915007248035 0.000849571955990753 0.000825468399524691 41046 41084 667 665 0 True 503 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 546 283 0.000983898071563898 0.00100590225850734 0.000732433051041428 0.000854505226215 0.000872010021995327 0.000780829399800779 43008 43838 667 665 0 True 548 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 592 282 0.00091723421877983 0.000950556753522626 0.000579842832074464 0.000518806744487678 0.000958227324446822 0.00101325811571623 40094 41426 667 665 0 False 592 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 637 282 0.0011110260845773 0.000948376893251669 0.000747692072938125 0.000610360875867857 0.00104493260148766 0.000978598074224938 48565 41331 667 665 0 False 637 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 236 329 0.00094180421805577 0.000855354224425793 0.000762951094834821 0.000686655985351339 0.000749925354569278 0.000751086901065618 41168 37277 667 665 0 True 235 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 280 328 0.000905932934196669 0.000911984699675488 0.000732433051041428 0.000717174029144732 0.000736887576243515 0.000724994478475651 39600 39745 667 665 0 True 280 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 325 328 0.000961066731454598 0.000893169063652494 0.000823987182421607 0.000823987182421607 0.000686966489137057 0.000583249795838666 42010 38925 667 665 0 True 324 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 368 328 0.00096440678722209 0.000859415648299049 0.00080872816052491 0.000747692072938125 0.000698828685616325 0.000627972224428103 42156 37454 667 665 0 True 369 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 412 330 0.000974129552298696 0.000924880294120515 0.000747692072938125 0.000701915007248035 0.000862507793010082 0.000786897468699927 42581 40307 667 665 0 True 414 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 457 327 0.00100201673024783 0.000890071367477976 0.000732433051041428 0.000656137941557946 0.000900420534734565 0.000806264047433744 43800 38790 667 665 0 True 458 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 501 327 0.00105376471754967 0.000906500630151713 0.000793469138628214 0.000671396963454643 0.000943112611648265 0.000822564703194118 46062 39506 667 665 0 True 503 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 546 327 0.000995382372901441 0.000993947445863457 0.000778210116731518 0.000839246204318303 0.000843058846610837 0.00079998620792533 43510 43317 667 665 0 True 548 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 589 328 0.000983257512923557 0.00101831598910299 0.000610360875867857 0.000549324788281071 0.00102080502034573 0.00116019238900225 42980 44379 667 665 0 True 592 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 632 328 0.001039352148142 0.000983300549382153 0.000549324788281071 0.000534065766384375 0.0011330875366945 0.00104196272842937 45432 42853 667 665 0 True 637 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 236 373 0.000857456371379428 0.000895899625465587 0.000701915007248035 0.000701915007248035 0.000746117743882834 0.000792644012280808 37481 39044 667 665 0 True 235 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 280 372 0.000892343940183719 0.000891975876977865 0.000747692072938125 0.000732433051041428 0.000714104723759956 0.000713650241653173 39006 38873 667 665 0 True 280 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 324 373 0.000968822066421584 0.000831995300680174 0.000839246204318303 0.000701915007248035 0.000712312402582334 0.000663445496389587 42349 36259 667 665 0 True 324 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 369 372 0.000940294329832108 0.0010299954509758 0.000823987182421607 0.000915541313801785 0.000726757750051399 0.000723415312197218 41102 44888 667 665 0 True 369 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 412 373 0.000989731730609861 0.000972974895467095 0.000793469138628214 0.000762951094834821 0.000826054396612108 0.00081454135606788 43263 42403 667 665 0 True 414 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 458 372 0.000869329583320036 0.000913131994554939 0.000549324788281071 0.000595101853971161 0.000850735356112614 0.000868131830712391 38000 39795 667 665 0 True 459 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 501 371 0.000901494777902877 0.000912489509422446 0.000579842832074464 0.000518806744487678 0.000861795368361573 0.000974480332764141 39406 39767 667 665 0 True 503 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 546 371 0.000907168297288755 0.000887455535152828 0.000625619897764553 0.000625619897764553 0.000890508051290958 0.000824313693891769 39654 38676 667 665 0 True 548 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 590 372 0.000965436256465496 0.000984447844261604 0.000549324788281071 0.000549324788281071 0.00101710253654074 0.00106941312559079 42201 42903 667 665 0 True 593 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 633 371 0.000923022123637197 0.000884518460261434 0.000488288700694286 0.000411993591210803 0.00101448066414498 0.00102516682630982 40347 38548 667 665 0 True 637 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 237 417 0.000892252431806527 0.000990964479176885 0.000732433051041428 0.000823987182421607 0.000797523488189501 0.000858090342299161 39002 43187 667 665 0 True 235 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 281 417 0.000901998073977431 0.000971414574431042 0.000732433051041428 0.00080872816052491 0.000750623829633269 0.000831874031199627 39428 42335 667 665 0 True 280 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 324 417 0.000979048127572744 0.000947229598372218 0.000854505226215 0.00080872816052491 0.000723038593757787 0.000708949856447763 42796 41281 667 665 0 True 325 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 369 417 0.000952876731695951 0.000999775703851067 0.000823987182421607 0.000900282291905089 0.000702335834692789 0.000729970827376862 41652 43571 667 665 0 True 369 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 413 417 0.000989685976421265 0.00100895406288667 0.000793469138628214 0.000747692072938125 0.000832636932196932 0.000875124744916718 43261 43971 667 665 0 True 414 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 458 415 0.00104754214790064 0.000953975692263389 0.000793469138628214 0.000793469138628214 0.000910101682816273 0.000804037711821016 45790 41575 667 665 0 True 459 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 502 415 0.000957772429875701 0.000946174087083123 0.000686655985351339 0.000671396963454643 0.000903013702278561 0.000927675570007452 41866 41235 667 665 0 True 503 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 545 415 0.000969531256344819 0.000945967574004822 0.000671396963454643 0.000762951094834821 0.000908175721007009 0.000824819183436991 42380 41226 667 665 0 True 548 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 589 416 0.000962736759338344 0.000950992725576817 0.000564583810177768 0.000488288700694286 0.00103663170428244 0.00105194170791634 42083 41445 667 665 0 True 593 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 634 416 0.000973969412638611 0.000902163855507388 0.00064087891966125 0.000473029678797589 0.000974174587397467 0.000982784953970183 42574 39317 667 665 0 True 638 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 238 462 0.000869077935282759 0.00100016578411008 0.000686655985351339 0.000885023270008392 0.00073562665379189 0.000788404624920944 37989 43588 667 665 0 True 235 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 282 461 0.000888866621850439 0.000907647925031163 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.000808802116017578 0.000777428450347292 38854 39556 667 665 0 True 280 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 326 461 0.000996892261125102 0.000946334708366246 0.000885023270008392 0.00080872816052491 0.000804858885811963 0.000811211333639141 43576 41242 667 665 0 True 325 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 371 461 0.000940568854963683 0.000981786120141278 0.000778210116731518 0.000854505226215 0.000783149049360932 0.00077857727983364 41114 42787 667 665 0 True 370 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 415 461 0.00105117960589401 0.000912282996344145 0.000762951094834821 0.000656137941557946 0.00105758142414442 0.00090803200598475 45949 39758 667 665 0 True 414 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 458 460 0.00100139904870179 0.000948147434275779 0.000671396963454643 0.000442511635004196 0.00106899267899103 0.00108191641662706 43773 41321 667 665 0 True 459 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 504 457 0.00100066698168426 0.00094532508887233 0.000701915007248035 0.000610360875867857 0.000975390040700547 0.00095199307436088 43741 41198 667 665 0 False 504 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 546 460 0.000944915502880283 0.00102306578990392 0.000610360875867857 0.000732433051041428 0.000974376979086125 0.000992704555268842 41304 44586 667 665 0 True 548 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 591 460 0.000935627402595338 0.000874055130960842 0.000625619897764553 0.000442511635004196 0.000985484983338793 0.000940229498052438 40898 38092 667 665 0 True 593 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 635 461 0.00088863785090746 0.00097194233007559 0.000457770656900893 0.000549324788281071 0.000967991592406463 0.0010481496356646 38844 42358 667 665 0 True 638 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 239 505 0.00098909117196952 0.000960974191028039 0.000869764248111696 0.000823987182421607 0.000756468187234301 0.000751881696310599 43235 41880 667 665 0 True 236 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 283 505 0.000992980278000162 0.000992777205086417 0.000854505226215 0.000839246204318303 0.000797816689846444 0.000845854362945099 43405 43266 667 665 0 True 280 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 327 506 0.000990852708230458 0.00103903613462588 0.000854505226215 0.000976577401388571 0.0008063019724627 0.00084321007563764 43312 45282 667 665 0 True 325 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 371 505 0.0010099093277806 0.00100427309977851 0.000854505226215 0.000839246204318303 0.000834836250677732 0.000847018753209614 44145 43767 667 665 0 True 370 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 415 505 0.00104026723191391 0.00090211796371221 0.000762951094834821 0.000564583810177768 0.000979952700407422 0.000918012383570059 45472 39315 667 665 0 True 414 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 460 502 0.000919178771795151 0.000996264981519948 0.000488288700694286 0.000701915007248035 0.00102537321785623 0.000944222455128786 40179 43418 667 665 0 True 459 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 504 503 0.000944526592277219 0.000953815070980266 0.000610360875867857 0.000625619897764553 0.000913125406854246 0.00094776104277484 41287 41568 667 665 0 True 504 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 548 503 0.000939058966740022 0.000926050534897555 0.000610360875867857 0.000686655985351339 0.000928570827251394 0.000876133886027534 41048 40358 667 665 0 True 548 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 592 504 0.000877794108210257 0.000911984699675488 0.000534065766384375 0.000564583810177768 0.000941599674020828 0.000935342672384292 38370 39745 667 665 0 True 593 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 636 503 0.000917188464591234 0.000898744916766625 0.000579842832074464 0.000457770656900893 0.00093096481645333 0.0009820401420242 40092 39168 667 665 0 True 638 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 239 548 0.00092766617377967 0.000922264461795367 0.000793469138628214 0.000762951094834821 0.000709896716039065 0.000713267690655395 40550 40193 667 665 0 True 236 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 282 547 0.000987444021180071 0.000925339212072296 0.000854505226215 0.000762951094834821 0.000795824344593596 0.00073140617657032 43163 40327 667 665 0 True 280 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 327 548 0.000950222988757395 0.000957761765365577 0.000793469138628214 0.000839246204318303 0.000764016044158193 0.000773568372205732 41536 41740 667 665 0 True 325 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 370 547 0.000992705752868587 0.000985618085038644 0.000839246204318303 0.000854505226215 0.000784318290899826 0.000741624148064625 43393 42954 667 665 0 True 370 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 415 547 0.00100133041741889 0.000944086010402523 0.000701915007248035 0.000686655985351339 0.000973703669149844 0.000859494684073988 43770 41144 667 665 0 True 415 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 459 546 0.000865646371138075 0.00100071648565222 0.000381475547417411 0.00064087891966125 0.000999442301442169 0.00105634902463124 37839 43612 667 665 0 True 459 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 503 545 0.000874888717234425 0.000955077095347662 0.000457770656900893 0.000473029678797589 0.000958813846869306 0.00109798533835748 38243 41623 667 665 0 True 504 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 547 544 0.000956514189689316 0.000975315377021175 0.000610360875867857 0.000549324788281071 0.000978223144561593 0.00102981436857512 41811 42505 667 665 0 True 549 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 592 546 0.000952853854601653 0.000869947815292408 0.000610360875867857 0.00064087891966125 0.000900047238359664 0.000757032858769679 41651 37913 667 665 0 True 593 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 636 546 0.000882346649975539 0.000893536198013918 0.000518806744487678 0.000564583810177768 0.000939657659966707 0.000935325293486816 38569 38941 667 665 0 True 638 543 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 236 589 0.000972001982528992 0.000914072776356088 0.000839246204318303 0.000778210116731518 0.000701667799087938 0.000630127037747782 42488 39836 667 665 0 False 236 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 281 588 0.000959533966136639 0.000964186616690502 0.000839246204318303 0.000839246204318303 0.000723901893529625 0.000750529755905258 41943 42020 667 665 0 False 281 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 326 590 0.000972551032792141 0.000979743935255855 0.000869764248111696 0.000854505226215 0.000746295396245484 0.000800807754757587 42512 42698 667 665 0 True 325 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 370 591 0.000922999246542899 0.000925109753096405 0.00080872816052491 0.000823987182421607 0.000696190459412863 0.000671886865490433 40346 40317 667 665 0 True 370 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 415 588 0.000856861566927683 0.000989656563014311 0.000610360875867857 0.000671396963454643 0.000858197027707925 0.000897574966648133 37455 43130 667 665 0 False 415 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 459 588 0.000996983769502294 0.00109295899396007 0.000564583810177768 0.000778210116731518 0.00106982980380226 0.00105172434266142 43580 47632 667 665 0 False 459 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 504 587 0.000981518853756917 0.000911020971976749 0.00064087891966125 0.000473029678797589 0.00105725332091206 0.00109021206931441 42904 39703 667 665 0 False 504 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 549 587 0.000887288102343884 0.000935687811884942 0.000503547722590982 0.00064087891966125 0.000980835821961182 0.000904314419286842 38785 40778 667 665 0 False 549 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 594 587 0.000984492876015643 0.000908772274013025 0.000686655985351339 0.00064087891966125 0.000886729226520576 0.000827586106836165 43034 39605 667 665 0 False 594 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 638 587 0.000974541339996058 0.000969234714160085 0.000839246204318303 0.000747692072938125 0.000801311350959007 0.000802249000758431 42599 42240 667 665 0 False 638 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 236 638 0.00108336767757115 0.0732253614122282 0.000946059357595178 0.0739147020675975 0.000777470520801227 0.0240584341826355 47356 3191218 667 665 0 True 236 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 281 632 0.00097463284837325 0.000924949131813282 0.000854505226215 0.000747692072938125 0.000698691425707544 0.000706552521290371 42603 40310 667 665 0 False 281 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 326 632 0.000854756874252277 0.000917032797145071 0.000762951094834821 0.000793469138628214 0.00068171398752234 0.000678967791373659 37363 39965 667 665 0 False 326 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 370 632 0.000957475027649828 0.000950786212498516 0.000854505226215 0.000823987182421607 0.000693235608004302 0.000708925433397129 41853 41436 667 665 0 False 370 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 415 631 0.00093244748648793 0.000906890710410726 0.000732433051041428 0.000762951094834821 0.000810069723427678 0.000732690495141787 40759 39523 667 665 0 False 415 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 460 631 0.0009860485184279 0.000953310261233308 0.000671396963454643 0.000610360875867857 0.000954902281822136 0.000994219024209323 43102 41546 667 665 0 False 460 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 504 631 0.000903485085106794 0.000860218754714665 0.000534065766384375 0.000457770656900893 0.000949677464950562 0.0009542004276889 39493 37489 667 665 0 False 504 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 549 631 0.000920871676773195 0.000872907836081391 0.000656137941557946 0.000457770656900893 0.000934387117812011 0.0009637464448084 40253 38042 667 665 0 False 549 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 594 631 0.00102747893620139 0.000913613858404308 0.000793469138628214 0.000778210116731518 0.000861675863226409 0.00071414325561466 44913 39816 667 665 0 False 594 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 634 637 0.00108185778934749 0.0788492173441156 0.000946059357595178 0.0753795681696803 0.000759534361379696 0.0215117636524154 47290 3436310 667 665 0 True 638 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C9_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C9_1.csv new file mode 100755 index 0000000..a01ea26 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C9_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 248 270 0.0100116112692109 0.0413053691679416 0.0100099183642329 0.0411078049897002 0.00151864016685002 0.00730884466451043 437626 1800120 667 665 0 True 248 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 292 269 0.010149239868507 0.00994055291582125 0.0101472495613031 0.00997940032043946 0.00135131585401488 0.0013120531891093 443642 433217 667 665 0 False 292 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 335 271 0.0101518936114456 0.0613263302453892 0.0100862134737163 0.0610513466086824 0.00132151301427314 0.00857827279467853 443758 2672649 667 665 0 True 337 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 380 271 0.0103677161190519 0.0927774689642394 0.0104219119554437 0.0908369573510338 0.00138019103740536 0.0183890699265132 453192 4043314 667 665 0 True 382 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 424 271 0.0106490815018218 0.0715958584949442 0.0107270923933776 0.0690775921263447 0.00162316816032546 0.0108593187369576 465491 3120203 667 665 0 True 426 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 467 270 0.0106569283451659 0.0647749380317353 0.0108339055466545 0.0688487067978943 0.00168640010361852 0.0178920667829517 465834 2822942 667 665 0 True 471 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 512 269 0.0103722000295343 0.0793776384196931 0.0104371709773404 0.0770275425345235 0.00166012577289573 0.0192203670194523 453388 3459339 667 665 0 True 516 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 555 269 0.0102692988593824 0.0682697129640306 0.0102845807583734 0.0658274204623484 0.00165566715541889 0.015704044066441 448890 2975247 667 665 0 True 561 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 605 269 0.0100870828032997 0.00967685866072827 0.0101472495613031 0.00970473792629892 0.00198307160129473 0.00202829677868731 440925 421725 667 665 0 False 605 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 644 268 0.00999765624168918 0.0420946162614134 0.00993362325474937 0.042069123369192 0.00202064741757398 0.0086975933058703 437016 1834516 667 665 0 True 650 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 248 313 0.00999017543185377 0.00989080620984826 0.0100251773861295 0.0098268101014725 0.00148243077850458 0.00151553604447634 436689 431049 667 665 0 False 248 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 292 313 0.0102828878533953 0.00994371944968854 0.0102235446707866 0.00991836423285267 0.00157823472934251 0.00134388014168871 449484 433355 667 665 0 False 292 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 335 314 0.0104169933801696 0.109411707341138 0.0103761348897536 0.107652399481193 0.0013823716271523 0.0289906248199303 455346 4768247 667 665 0 True 337 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 378 314 0.0104523613679542 0.0497161190915031 0.0104371709773404 0.0495918211642634 0.00142832005272216 0.0064851638293711 456892 2166667 667 665 0 True 382 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 424 314 0.0106482121722384 0.0777479748811259 0.0105745021744106 0.0758678568703746 0.00200179982603445 0.0149840543760045 465453 3388317 667 665 0 True 427 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 467 313 0.010586970190803 0.0436551208646473 0.010605020218204 0.0448310063324941 0.00177896543273378 0.00823153043274021 462776 1902524 667 665 0 True 471 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 512 313 0.0102449805081437 0.0428917337977583 0.0103150988021668 0.0445563439383536 0.00178635268402754 0.00681920589863338 447827 1869255 667 665 0 True 516 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 556 312 0.0101836698954254 0.0488979831129667 0.0102388036926833 0.0505073624780652 0.00170477910038365 0.00894573319690065 445147 2131012 667 665 0 True 561 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 605 312 0.00994124132715057 0.00984886110905554 0.00996414129854276 0.00987258716716258 0.00213447469670835 0.00206241264405126 434550 429221 667 665 0 False 605 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 650 312 0.00967554675397481 0.00975175407045882 0.00967421988250553 0.00975051499198901 0.00193399391622525 0.00190366023961817 422936 424989 667 665 0 False 650 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 247 359 0.0101203918525974 0.0468244541314375 0.0101319905394064 0.0463263904783703 0.00155248641491952 0.00780439148808727 442381 2040646 667 665 0 True 248 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 292 359 0.0101426283882549 0.058434642339426 0.0101472495613031 0.0605325398641947 0.00145163519979389 0.0124295365459934 443353 2546627 667 665 0 True 292 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 337 356 0.0100068070794083 0.0309441720575185 0.00996414129854276 0.0354619668879225 0.00140658428468032 0.0128550504239576 437416 1348571 667 665 0 False 337 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 379 358 0.0103920573473849 0.0344072357593457 0.010406652933547 0.0350041962310216 0.00140558569584549 0.00449445137678775 454256 1499494 667 665 0 True 382 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 423 358 0.0103955804199068 0.0714371646672185 0.010452429999237 0.068909742885481 0.00163125309750184 0.0106985299273249 454410 3113287 667 665 0 True 427 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 468 357 0.010405966620718 0.0346937841284374 0.0103608758678569 0.0348973830777447 0.00170505330675741 0.00595537836440035 454864 1511982 667 665 0 True 471 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 512 356 0.0100028035879062 0.0290650177744659 0.00997940032043946 0.0296482795452811 0.0017584483108091 0.0040093339643417 437241 1266676 667 665 0 True 516 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 556 356 0.0100897365462382 0.0516760199881714 0.0102235446707866 0.0509498741130694 0.00171685404849611 0.00909262131003413 441041 2252081 667 665 0 True 561 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 600 356 0.0100770855130915 0.060925855494768 0.0100099183642329 0.0581216144045167 0.00205555806640286 0.0157505088641958 440488 2655196 667 665 0 True 606 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 644 356 0.00978622613618803 0.0632176229082663 0.00978103303578241 0.0631418326085298 0.00198820558106786 0.0161467971523735 427774 2755073 667 665 0 True 650 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 247 403 0.0100352890618092 0.0414851502755515 0.0100251773861295 0.0432440680552377 0.00152743088355358 0.00816055699675117 438661 1807955 667 665 0 True 248 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 292 403 0.0103254163716951 0.031322068044912 0.0104219119554437 0.0310978866254673 0.00148809591041478 0.00283828230227291 451343 1365040 667 665 0 True 293 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 336 403 0.0104282717876585 0.0797518401175748 0.0105439841306172 0.0768291752498665 0.00145283771523471 0.0125253336691569 455839 3475647 667 665 0 True 337 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 380 403 0.0104563877365506 0.0654579226734724 0.0104371709773404 0.064591439688716 0.00147275415826892 0.0132445732623067 457068 2852707 667 665 0 True 382 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 423 401 0.0105279244104201 0.0435110435736859 0.0105439841306172 0.0447547112230106 0.00162773080780926 0.00668980741750268 460195 1896245 667 665 0 True 427 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 468 401 0.0106174196033135 0.0548456744975279 0.0107118333714809 0.0543221179522393 0.00174575812984677 0.0091452926976337 464107 2390217 667 665 0 True 471 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 512 400 0.0102612003680009 0.0412711568346364 0.0102845807583734 0.0420080872816053 0.00164415051896027 0.00491321543100095 448536 1798629 667 665 0 True 516 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 556 400 0.0101878792807762 0.0534354425776045 0.0101930266269932 0.0524299992370489 0.00163768409564044 0.00702256838349636 445331 2328758 667 665 0 True 561 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 601 400 0.00996196797458446 0.0426995848513479 0.00996414129854276 0.0432440680552377 0.00200201340145045 0.00629858711342998 435456 1860881 667 665 0 True 606 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 645 399 0.0100708858205367 0.0825787976464393 0.0100099183642329 0.0819562066071565 0.00194349222651643 0.0129093462749715 440217 3598848 667 665 0 True 650 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 248 448 0.00994993462298377 0.0430134158926729 0.0100099183642329 0.0429541466392004 0.00159658823881864 0.00489289643551168 434930 1874558 667 665 0 True 248 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 291 446 0.010224802910973 0.0526022770361472 0.0102082856488899 0.0527809567406729 0.00153868299611639 0.00761747139644426 446945 2292448 667 665 0 True 293 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 336 446 0.0105582136832705 0.0339255784230547 0.0105439841306172 0.0345922026398108 0.00153183868216755 0.00358217463258915 461519 1478503 667 665 0 True 337 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 380 446 0.0105671128729524 0.0570274851697796 0.0105439841306172 0.0530251010910201 0.00149037999736307 0.0144680745131592 461908 2485302 667 665 0 True 382 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 425 446 0.0106989535673912 0.0912237104548967 0.0107423514152743 0.0913099870298314 0.0017869233133843 0.0141469727275432 467671 3975600 667 665 0 True 427 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 469 445 0.0105875649952547 0.0610313836777799 0.0105439841306172 0.0596322575722896 0.00194748952636218 0.0120435752898346 462802 2659795 667 665 0 True 472 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 514 445 0.0104966285454206 0.0517882254273817 0.0104982070649271 0.0500038147554742 0.00184867051173372 0.00683886169668622 458827 2256971 667 665 0 True 516 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 557 444 0.0102970258976714 0.0331103336276145 0.0102845807583734 0.0331273365377279 0.00183429787962053 0.00344808311321061 450102 1442974 667 665 0 True 561 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 601 443 0.0102258323802164 0.0393617828044591 0.0101625085831998 0.0398565651941711 0.00179203088398729 0.00534491553038403 446990 1715417 667 665 0 True 606 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 645 444 0.0102304993074532 0.0740765394832928 0.0103150988021668 0.0738689250019074 0.00195618647496698 0.0149468979725447 447194 3228313 667 665 0 True 650 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 250 491 0.0100342367154715 0.0597713785493718 0.0100251773861295 0.0602731364919509 0.00145489047633426 0.0132732995971263 438615 2604883 667 665 0 True 248 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 293 490 0.0104344028489303 0.0554855896894904 0.010452429999237 0.0537880521858549 0.00153784431978417 0.00679161700088499 456107 2418105 667 665 0 True 293 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 337 491 0.0106206223965152 0.0673987784751418 0.0105439841306172 0.0645151445792325 0.00162983688360047 0.0145471468350673 464247 2937291 667 665 0 True 337 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 382 491 0.0108166562175538 0.0969142242192802 0.0107423514152743 0.0923933775844968 0.00177715725454505 0.0235145067799284 472816 4223597 667 665 0 True 382 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 425 489 0.0112157242504863 0.0913987647076033 0.0111238269626917 0.0885481040665293 0.00215186405356427 0.0231308629981542 490260 3983229 667 665 0 True 427 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 471 489 0.010810982698168 0.0418289716050254 0.0108491645685512 0.0422980086976425 0.00209432463729894 0.0042307593596523 472568 1822939 667 665 0 True 472 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 515 490 0.0104689701384144 0.0400303803684079 0.0104982070649271 0.0409094377050431 0.00176788622534678 0.00480920444641003 457618 1744555 667 665 0 True 516 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 557 488 0.0105179499973062 0.107244972123603 0.0106202792401007 0.108369573510338 0.00187873648124272 0.0217514720089665 459759 4673819 667 665 0 True 561 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 602 489 0.0103810992192162 0.0664375059874452 0.0104371709773404 0.0668192568856336 0.00189272305381457 0.0161084754064339 453777 2895398 667 665 0 True 606 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 647 488 0.010105773389341 0.0850514705165294 0.010101472495613 0.0832074464026856 0.00193456493255135 0.0149586043582722 441742 3706609 667 665 0 True 651 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 249 536 0.0101736497281229 0.0506990525065238 0.0101777676050965 0.0526436255436027 0.00164495536311929 0.00971685617869318 444709 2209504 667 665 0 True 248 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 293 535 0.0102896365962132 0.106040633742746 0.0102998397802701 0.103868162050813 0.00157148454091433 0.0207394422260443 449779 4621333 667 665 0 True 293 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 337 534 0.0107249648236079 0.0553752658138824 0.0107118333714809 0.0568856336308843 0.00179360250059049 0.00858429820310551 468808 2413297 667 665 0 True 338 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 381 533 0.0106672001605057 0.0593708808528531 0.0106355382619974 0.0575722896162356 0.00154190501917706 0.00719391979343817 466283 2587429 667 665 0 True 382 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 426 533 0.0107321024770288 0.0556443294090112 0.0107270923933776 0.0550698100251774 0.00183659905001658 0.00541306343910217 469120 2425023 667 665 0 True 427 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 470 531 0.0107943739277077 0.0639083403174909 0.0107728694590677 0.062027924010071 0.0019069214457493 0.0111095207672889 471842 2785175 667 665 0 True 472 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 514 531 0.0103129254782085 0.0750476557610552 0.0102998397802701 0.0724498359655146 0.00192714656116159 0.014913311000053 450797 3270635 667 665 0 True 516 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 558 531 0.0104749868142148 0.0574587533149651 0.0105592431525139 0.0565041580834669 0.00183564154602813 0.0107682746829379 457881 2504097 667 665 0 True 561 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 602 530 0.0102315516537909 0.0497729790257287 0.0101930266269932 0.0483710994125277 0.00180258868371914 0.00581452318580626 447240 2169145 667 665 0 True 606 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 647 530 0.0100269389223905 0.0642948180705827 0.0101167315175097 0.0638284885938811 0.00185727112627268 0.010695159282699 438296 2802018 667 665 0 True 651 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 249 576 0.0098821955467677 0.0415575445824449 0.00991836423285267 0.0422674906538491 0.0013917187485617 0.00604427314552067 431969 1811110 667 665 0 True 248 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 294 576 0.0102016284144492 0.0526785491997331 0.0101472495613031 0.0529640650034333 0.0015806729882879 0.0089600697366465 445932 2295772 667 665 0 True 293 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 338 575 0.0112110573232496 0.0447227934794643 0.010452429999237 0.0443732356755932 0.00448510064673022 0.00563841516702072 490056 1949054 667 665 0 True 338 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 382 575 0.0105349934325582 0.0488539958272885 0.0105592431525139 0.0481879911497673 0.00139438824814078 0.00430281690500301 460504 2129095 667 665 0 True 382 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 426 574 0.0107048101035314 0.0893460476551874 0.010757610437171 0.0836957351033799 0.00179363263472127 0.0165187561462171 467927 3893770 667 665 0 True 427 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 470 573 0.0106322897146071 0.0615475516440449 0.0106355382619974 0.0599984740978103 0.00202212468858311 0.00802350428019323 464757 2682290 667 665 0 True 472 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 514 572 0.0102638083567509 0.0564846770164138 0.0103456168459602 0.0552681773098344 0.00223509651035997 0.00703767098811756 448650 2461646 667 665 0 True 517 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 558 572 0.0101819312362587 0.0379610045943423 0.0102845807583734 0.0387884336614023 0.00184024754617159 0.00595992400902028 445071 1654370 667 665 0 True 561 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 603 572 0.00987549255813842 0.04706673986408 0.00990310521095598 0.0469367513542382 0.00162187084402556 0.00506160448072213 431676 2051205 667 665 0 True 606 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 647 571 0.00993119828275379 0.0534103168197445 0.0100099183642329 0.0521705958648051 0.00170206141480006 0.00634240018439301 434111 2327663 667 665 0 True 651 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 248 618 0.00978517378985033 0.00954193678290485 0.0098268101014725 0.00959792477302205 0.00138563823004485 0.00136074477629072 427728 415845 667 665 0 False 248 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 293 618 0.0100572053181466 0.0100453697760079 0.0100099183642329 0.0100862134737163 0.00159482048008862 0.00146620967198841 439619 437785 667 665 0 False 293 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 338 617 0.0100305992574781 0.070564601019601 0.00996414129854276 0.068909742885481 0.00138342464171264 0.00833287135161773 438456 3075260 667 665 0 True 338 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 382 617 0.0103913939116503 0.077426938827958 0.010406652933547 0.073990997177081 0.00123093539681247 0.015369261567836 454227 3374326 667 665 0 True 383 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 427 617 0.0101690971863576 0.0102006446649928 0.0101472495613031 0.0101777676050965 0.00174072107232167 0.00176142580537705 444510 444552 667 665 0 False 427 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 472 617 0.00999916612991284 0.0100783889226385 0.0100251773861295 0.010101472495613 0.00199483299932813 0.00196029764774724 437082 439224 667 665 0 False 472 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 517 617 0.00987007068678982 0.00969627089008858 0.00984206912336919 0.0098268101014725 0.0019282264278841 0.00203722723382474 431439 422571 667 665 0 False 517 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 561 617 0.00997795906349869 0.00988011342157178 0.00993362325474937 0.00988784618905928 0.00169927579786916 0.00184659036054701 436155 430583 667 665 0 False 561 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 606 617 0.00952698290360427 0.00976985838365655 0.00962844281681544 0.00976577401388571 0.00152768372223079 0.00147734029693391 416442 425778 667 665 0 False 606 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 651 617 0.00959851957747379 0.0098738032997348 0.00964370183871214 0.00990310521095598 0.00155056468020922 0.00156971155750539 419569 430308 667 665 0 False 651 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 250 668 0.00940401852175309 0.0398014262022646 0.00935378042267491 0.0395819028000305 0.00133133088717543 0.00737549406170551 411067 1734577 667 665 0 True 248 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 293 661 0.00943847142576571 0.0093631882406864 0.00947585259784848 0.009399557488365 0.001282975067288 0.00128553496236717 412573 408055 667 665 0 False 293 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 338 661 0.00954446100364787 0.00949898206261821 0.00961318379491875 0.00946059357595178 0.00128395035958867 0.00132652240492445 417206 413973 667 665 0 False 338 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 383 661 0.00967918421196818 0.00969849664215471 0.00967421988250553 0.00968947890440223 0.00146984228308522 0.00125385607506486 423095 422668 667 665 0 False 383 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 427 661 0.00977016641599091 0.00977557191215622 0.0097962920576791 0.00976577401388571 0.0015778875345961 0.00143743277346295 427072 426027 667 665 0 False 427 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 472 661 0.00967632457518094 0.00987004017253021 0.00985732814526589 0.00993362325474937 0.00165372547159782 0.00146445068325487 422970 430144 667 665 0 False 472 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 517 661 0.00981312959908236 0.00956451554613244 0.00984206912336919 0.00952162966353857 0.00177187752189897 0.00179181475568284 428950 416829 667 665 0 False 517 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 562 661 0.00955230784699205 0.009670732106072 0.00953688868543526 0.00970473792629892 0.0016816530154618 0.00165220640681407 417549 421458 667 665 0 False 562 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 606 661 0.00962501125267076 0.00977178583905403 0.00959792477302205 0.0097962920576791 0.00137174326514107 0.00144545950591959 420727 425862 667 665 0 False 606 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 647 665 0.00953224463529279 0.0414591296276856 0.00950637064164187 0.0414892805371176 0.00146642987208676 0.00843610712447467 416672 1806821 667 665 0 True 651 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C9_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C9_2.csv new file mode 100755 index 0000000..a5521f0 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C9_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 248 270 0.00857772075280739 0.761550752596759 0.00843823910887312 0.756420233463035 0.0019275983859776 0.16227924237498 374948 33188972 667 665 12 True 248 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 292 269 0.00714126800184252 0.00681465623316703 0.00703440909437705 0.00677500572213321 0.00162784219746129 0.00132777025083835 312158 296988 667 665 0 False 292 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 335 271 0.00664700837953649 0.00659630307170995 0.00669871061264973 0.00663767452506294 0.00127506056164215 0.00124229284633536 290553 287472 667 665 0 True 337 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 380 271 0.00644100014538393 0.00657744154389177 0.00642404821850919 0.00657663843747616 0.00130958690371898 0.00125288147103734 281548 286650 667 665 0 True 382 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 424 271 0.00690389527140756 0.00687986847411502 0.00688181887541009 0.00700389105058366 0.00152004870855698 0.00150875963440191 301782 299830 667 665 0 True 426 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 467 270 0.00712987520888217 0.00716290612087555 0.00721751735713741 0.00720225833524071 0.00171428072141096 0.00174768636982481 311660 312165 667 665 0 True 471 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 512 269 0.00722046850230184 0.00728410635194074 0.00720225833524071 0.00727855344472419 0.00160492161137511 0.00148300911327747 315620 317447 667 665 0 True 516 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 555 269 0.00725478414374868 0.00745475499231026 0.00729381246662089 0.00749217975127794 0.00158544027846187 0.00158618228997731 317120 324884 667 665 0 True 561 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 605 269 0.00890580116213351 0.00800229000057938 0.00840772106507973 0.00802624551766232 0.00337336154477612 0.00189587949264961 389289 348746 667 665 0 False 605 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 644 268 0.00965099963179317 0.777888988894759 0.00961318379491875 0.781475547417411 0.00259827237485144 0.1745806013533 421863 33901005 667 665 15 True 650 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 248 313 0.00699071384426807 0.0064910961312643 0.00689707789730678 0.0063935301747158 0.00163707664676074 0.00144288813989525 305577 282887 667 665 0 False 248 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 292 313 0.00676892041504997 0.00640048278168527 0.00675974670023652 0.00642404821850919 0.00141305126556735 0.0012336667291071 295882 278938 667 665 0 False 292 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 335 314 0.00655394435993265 0.00665522813671854 0.00653086137178607 0.00665293354695964 0.00131687869482708 0.00125130904578764 286485 290040 667 665 0 True 337 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 378 314 0.00654120181840872 0.00690680695788453 0.00657663843747616 0.00692759594110018 0.00128335819561013 0.00126400530363215 285928 301004 667 665 0 True 382 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 424 314 0.006946858454499 0.00726283550487572 0.00698863202868696 0.0072327763790341 0.00176064165822932 0.0015916875241497 303660 316520 667 665 0 True 427 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 467 313 0.00711630909196352 0.00705795158530338 0.00721751735713741 0.00712596322575723 0.00175202039161321 0.00175468954922951 311067 307591 667 665 0 True 471 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 512 313 0.00706572783647087 0.00736283372656865 0.00700389105058366 0.00740062561989776 0.00167247463305684 0.0015986267511052 308856 320878 667 665 0 True 516 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 556 312 0.00717158015178723 0.00766376917344861 0.00718699931334401 0.007690547035935 0.00169938014043485 0.00139379133724519 313483 333993 667 665 0 True 561 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 605 312 0.00772911781692125 0.00757756143620668 0.00781261921110857 0.00756847486076143 0.00206363868224402 0.00201756564597922 337854 330236 667 665 0 False 605 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 650 312 0.00799963945699387 0.00770608140860276 0.00804150453955901 0.00775158312352178 0.00203350269343838 0.00188630203674244 349679 335837 667 665 0 False 650 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 247 359 0.0063717740580385 0.00652971407690662 0.0064087891966125 0.00662241550316625 0.00139763169191513 0.00152039743385997 278522 284570 667 665 0 True 248 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 292 359 0.00650404941726894 0.00649049953792699 0.00656137941557946 0.00646982528419928 0.00130693954527243 0.00138736508397283 284304 282861 667 665 0 True 292 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 337 356 0.00653191371812377 0.00691550345307076 0.00654612039368277 0.00691233691920348 0.00126382292995337 0.00127349958101055 285522 301383 667 665 0 False 337 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 379 358 0.00662996494428455 0.0069666039670015 0.00666819256885634 0.00694285496299687 0.00125799134925308 0.00132892005331962 289808 303610 667 665 0 True 382 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 423 358 0.00698202054843487 0.00711591292261324 0.00701915007248035 0.00709544518196384 0.00158034099614518 0.00156368226049844 305197 310117 667 665 0 True 427 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 468 357 0.00730177369543656 0.00703211450461815 0.00721751735713741 0.00698863202868696 0.00167651429133988 0.00163822421200454 319174 306465 667 665 0 True 471 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 512 356 0.00713033275076813 0.00728286727347093 0.00720225833524071 0.00735484855420768 0.00172447569048198 0.00176358743759173 311680 317393 667 665 0 True 516 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 556 356 0.00714936649322398 0.00747432784295369 0.00712596322575723 0.00746166170748455 0.00167031806669856 0.00172108749572417 312512 325737 667 665 0 True 561 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 600 356 0.00731401294088593 0.00737657831922447 0.00741588464179446 0.00729381246662089 0.00199513144839149 0.00231242192799582 319709 321477 667 665 0 True 606 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 644 356 0.0068121123690844 0.00690878030507718 0.00677500572213321 0.00691233691920348 0.00197665066855468 0.00193509434493973 297770 301090 667 665 0 True 650 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 247 403 0.00647817542361801 0.00645653960949524 0.00645456626230259 0.00646982528419928 0.00143185706970598 0.00155947296715044 283173 281381 667 665 0 True 248 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 292 403 0.00688740088641877 0.00662333333906981 0.00692759594110018 0.00662241550316625 0.00133105983752826 0.00143542142630275 301061 288650 667 665 0 True 293 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 336 403 0.00723195280363938 0.00720684751475851 0.00732433051041428 0.0072632944228275 0.00130829935984042 0.00126116869388721 316122 314080 667 665 0 True 337 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 380 403 0.00709100702567004 0.00732965395865493 0.00714122224765393 0.00733958953231098 0.001362961698237 0.00136227822603366 309961 319432 667 665 0 True 382 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 423 401 0.0073121598962478 0.0072016617419034 0.00727855344472419 0.00715648126955062 0.00159679821460183 0.00154910206970216 319628 313854 667 665 0 True 427 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 468 401 0.00744599089789049 0.00736338442811079 0.00752269779507134 0.00741588464179446 0.00166884146705817 0.00167394064451087 325478 320902 667 665 0 True 471 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 512 400 0.00714970964963844 0.00707623946568183 0.00718699931334401 0.00712596322575723 0.0016916482805799 0.00165596475986132 312527 308388 667 665 0 True 516 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 556 400 0.0070208201003641 0.00741485207640296 0.00688181887541009 0.00741588464179446 0.00173617688460906 0.00148289484108079 306893 323145 667 665 0 True 561 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 601 400 0.00686088633412751 0.00691614593820326 0.00686655985351339 0.00689707789730678 0.00185255572740804 0.00189804949901753 299902 301411 667 665 0 True 606 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 645 399 0.00637195707479289 0.00645580534077239 0.00642404821850919 0.00659189745937285 0.00184504105335638 0.00178689347818897 278530 281349 667 665 0 True 650 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 248 448 0.00651786718222486 0.00661569235517267 0.00648508430609598 0.00662241550316625 0.00148745914566386 0.00156366663014137 284908 288317 667 665 0 True 248 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 291 446 0.00689698638892959 0.00687741326307299 0.00692759594110018 0.00691233691920348 0.00148983080490736 0.00150713388161216 301480 299723 667 665 0 True 293 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 336 446 0.00717272400650213 0.0073516590744428 0.00715648126955062 0.00737010757610437 0.00144208401979817 0.00143184843238613 313533 320391 667 665 0 True 337 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 380 446 0.00751604056063065 0.00722261134640217 0.00752269779507134 0.00717174029144732 0.00148761657898217 0.00135202139869817 328540 314767 667 665 0 True 382 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 425 446 0.00731620914193853 0.0075862808772905 0.00729381246662089 0.0076600289921416 0.00178473540662531 0.00178881239605305 319805 330616 667 665 0 True 427 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 469 445 0.00736509749245313 0.00741632061384865 0.00735484855420768 0.00741588464179446 0.00179794549035534 0.00177023271414316 321942 323209 667 665 0 True 472 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 514 445 0.00704452077005672 0.00699847581875265 0.00694285496299687 0.00703440909437705 0.00173477028566958 0.00177620887733822 307929 304999 667 665 0 True 516 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 557 444 0.00672099290249588 0.00666282322882051 0.00679026474402991 0.00662241550316625 0.00188751183105254 0.00176608211917479 293787 290371 667 665 0 True 561 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 601 443 0.00627777207756845 0.00623784225957432 0.00627145799954223 0.00614938582436866 0.00182616142300221 0.00177143457804606 274413 271850 667 665 0 True 606 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 645 444 0.00634173643322537 0.00609725274504641 0.0063935301747158 0.00605783169298848 0.00187491434584933 0.00188920730724534 277209 265723 667 665 0 True 650 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 250 491 0.00664721427338517 0.00663345247990656 0.00666819256885634 0.00660715648126955 0.00146080100427648 0.00138856898656188 290562 289091 667 665 0 True 248 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 293 490 0.00681979907276849 0.00665206160285126 0.00674448767833982 0.00659189745937285 0.00145086444128873 0.00155282006831092 298106 289902 667 665 0 True 293 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 337 491 0.00703177822853279 0.00713546282735908 0.00704966811627375 0.00715648126955062 0.00150826325059552 0.00144493831547247 307372 310969 667 665 0 True 337 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 382 491 0.00736754534154301 0.00763270042811309 0.00737010757610437 0.007690547035935 0.00157846755413958 0.0015818633051662 322049 332639 667 665 0 True 382 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 425 489 0.00746626000343843 0.00771750846560209 0.00746166170748455 0.00772106507972839 0.0018145252440678 0.00192386787407979 326364 336335 667 665 0 True 427 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 471 489 0.00720790897753229 0.00728529953861536 0.00717174029144732 0.0072480354009308 0.00186502341962863 0.00171579777196955 315071 317499 667 665 0 True 472 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 515 490 0.00661269273808964 0.00677408788622965 0.00666819256885634 0.00679026474402991 0.00173173747230121 0.00170564244500519 289053 295220 667 665 0 True 516 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 557 488 0.0063706988346065 0.00669962844855329 0.00630197604333562 0.00668345159075303 0.00180427061449267 0.00171471748348442 278475 291975 667 665 0 True 561 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 602 489 0.00637090472845518 0.00653015004896081 0.00643930724040589 0.00650034332799268 0.00183106456907256 0.00178032529366199 278484 284589 667 665 0 True 606 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 647 488 0.00616681817022365 0.00635188337059173 0.00611886778057527 0.00631723506523232 0.00185229620717014 0.00175354663195544 269563 276820 667 665 0 True 651 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 249 536 0.00663682807257392 0.00654130175518907 0.00660715648126955 0.00660715648126955 0.00142843711098396 0.00144885796685274 290108 285075 667 665 0 True 248 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 293 535 0.00660516617406563 0.00676734179233848 0.00663767452506294 0.00674448767833982 0.00145501940781076 0.0015250043102827 288724 294926 667 665 0 True 293 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 337 534 0.00706845021069232 0.00712369158189592 0.00704966811627375 0.00714122224765393 0.00137592134971164 0.00139049953718724 308975 310456 667 665 0 True 338 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 381 533 0.00721799777611766 0.00720898148323429 0.00720225833524071 0.00718699931334401 0.0015464306214475 0.00157306730405873 315512 314173 667 665 0 True 382 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 426 533 0.00704106632881774 0.007236746019317 0.00706492713817044 0.00715648126955062 0.00191568863563107 0.00220915806582147 307778 315383 667 665 0 True 427 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 470 531 0.00682986499425957 0.00703406490591321 0.00679026474402991 0.00703440909437705 0.00194550555055893 0.00186145270789152 298546 306550 667 665 0 True 472 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 514 531 0.00674197119796705 0.00699179856255425 0.0068207827878233 0.00701915007248035 0.00184421880163352 0.00187667279267457 294704 304708 667 665 0 True 516 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 558 531 0.00660784279409849 0.00650534553366708 0.00663767452506294 0.00656137941557946 0.00166067628581566 0.00170898530757097 288841 283508 667 665 0 True 561 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 602 530 0.00641041347030765 0.00642533318877418 0.00645456626230259 0.00643930724040589 0.00161237495973228 0.0015659470626554 280211 280021 667 665 0 True 606 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 647 530 0.00650718357918775 0.00644935754354988 0.00656137941557946 0.00645456626230259 0.00184071438087697 0.00192988252402824 284441 281068 667 665 0 True 651 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 249 576 0.00694500540986087 0.00699932481696344 0.00695811398489357 0.00704966811627375 0.00131531034015047 0.00123438719473622 303579 305036 667 665 0 True 248 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 294 576 0.00699140015709701 0.00694088161580422 0.00701915007248035 0.00691233691920348 0.00152071549313681 0.00130069942756949 305607 302489 667 665 0 True 293 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 338 575 0.00715684730305939 0.00733167319764277 0.00720225833524071 0.00733958953231098 0.0014781198519814 0.00142341686960297 312839 319520 667 665 0 True 338 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 382 575 0.00699458007320441 0.0069325522549794 0.00695811398489357 0.00695811398489357 0.00132678443604037 0.00134153702998748 305746 302126 667 665 0 True 382 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 426 574 0.00687179870810761 0.00697337300679027 0.00677500572213321 0.00701915007248035 0.0017731773786456 0.00178117552426393 300379 303905 667 665 0 True 427 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 470 573 0.00676878315248418 0.00688415935696417 0.00675974670023652 0.00689707789730678 0.0020120950796061 0.00170449729973601 295876 300017 667 665 0 True 472 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 514 572 0.00671003477432719 0.0067771167447114 0.00674448767833982 0.00674448767833982 0.00198697527867539 0.00211337329197182 293308 295352 667 665 0 True 517 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 558 572 0.00692830513102341 0.00668833906693949 0.00694285496299687 0.00660715648126955 0.00165556642959408 0.00172710043829118 302849 291483 667 665 0 True 561 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 603 572 0.00659590095087499 0.00679203157814426 0.00659189745937285 0.00686655985351339 0.00152778073954912 0.00154529219392878 288319 296002 667 665 0 True 606 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 647 571 0.00642368218500043 0.00670811843066123 0.00643930724040589 0.00665293354695964 0.00164064242770173 0.00152030542772142 280791 292345 667 665 0 True 651 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 248 618 0.00739758296635614 0.0071172437846734 0.00737010757610437 0.00715648126955062 0.00135629792304345 0.0013217576199068 323362 310175 667 665 0 False 248 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 293 618 0.00739840654175087 0.00736343031990597 0.00729381246662089 0.00730907148851759 0.00149773943636469 0.00138396922806596 323398 320904 667 665 0 False 293 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 338 617 0.00689776421013572 0.00702263784891389 0.00691233691920348 0.00704966811627375 0.00141181313637888 0.0013569797727584 301514 306052 667 665 0 True 338 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 382 617 0.00673746441039036 0.00686325564426057 0.00677500572213321 0.00689707789730678 0.00130191605011187 0.00130522949276044 294507 299106 667 665 0 True 383 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 427 617 0.00667192153522689 0.00672619979796137 0.00660715648126955 0.00674448767833982 0.00167313802871966 0.00173823376497383 291642 293133 667 665 0 False 427 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 472 617 0.00645493229581135 0.00667682022634981 0.00645456626230259 0.00669871061264973 0.0018244189506228 0.00191591966987704 282157 290981 667 665 0 False 472 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 517 617 0.00669706346186028 0.00654628101496589 0.00660715648126955 0.00657663843747616 0.0019060448387376 0.00192988936502525 292741 285292 667 665 0 False 517 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 561 617 0.00662888972085255 0.00667847233097622 0.00662241550316625 0.00660715648126955 0.00179717800534337 0.00180737055995518 289761 291053 667 665 0 False 561 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 606 617 0.00666075751320952 0.00671922424509431 0.00669871061264973 0.00668345159075303 0.00146468148203005 0.00134287294991029 291154 292829 667 665 0 False 606 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 651 617 0.00670747253976582 0.00680022326358354 0.0068055237659266 0.0068207827878233 0.0015382984716265 0.00148317446827037 293196 296359 667 665 0 False 651 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 250 668 0.0089124355194799 0.764216079223006 0.00863660639353018 0.755489433127337 0.00221006427857392 0.165136416836539 389579 33305129 667 665 13 True 248 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 293 661 0.00735329291179542 0.00689409493062021 0.00718699931334401 0.00695811398489357 0.00186766551087853 0.0012311751133692 321426 300450 667 665 0 False 293 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 338 661 0.00665387150782585 0.00676931513953114 0.00665293354695964 0.00679026474402991 0.00126068426330312 0.00125377938766146 290853 295012 667 665 0 False 338 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 383 661 0.00645948483757663 0.00646124351850099 0.00645456626230259 0.00648508430609598 0.00135223803276211 0.00127202207906808 282356 281586 667 665 0 False 383 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 427 661 0.00648835573058058 0.00653118261435231 0.00646982528419928 0.00651560234988937 0.00151686647629967 0.0014217463856357 283618 284634 667 665 0 False 427 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 472 661 0.00642924131891482 0.00651915896401567 0.00642404821850919 0.00653086137178607 0.00163089450235924 0.00147308075057607 281034 284110 667 665 0 False 472 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 517 661 0.00653712969562369 0.00644837086995355 0.00650034332799268 0.00648508430609598 0.00165062549260238 0.00165473615875252 285750 281025 667 665 0 False 517 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 562 661 0.00661379083861594 0.00652003090812405 0.00662241550316625 0.00653086137178607 0.0015488451716389 0.00165669104192929 289101 284148 667 665 0 False 562 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 606 661 0.00742080321706851 0.00707373836284463 0.00720225833524071 0.00711070420386053 0.00191434806893593 0.00136932177962024 324377 308279 667 665 0 False 606 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 647 665 0.00842359776852247 0.790002633041748 0.00833142595559625 0.791103990234226 0.00153544707652693 0.178484533641522 368211 34428927 667 665 17 True 651 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C9_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C9_3.csv new file mode 100755 index 0000000..90245bc --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_C9_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 248 270 0.00102699851722113 0.0785833661746493 0.000854505226215 0.0754558632791638 0.000836396749528127 0.0199493918242282 44892 3424724 667 665 0 True 248 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 292 269 0.00101855686942521 0.000903127583206127 0.000930800335698482 0.000762951094834821 0.00069195665843904 0.000667894544149054 44523 39359 667 665 0 False 292 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 335 271 0.000873538968670849 0.000966274693371102 0.000732433051041428 0.000793469138628214 0.000661008429324512 0.000722365626827564 38184 42111 667 665 0 True 337 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 380 271 0.000967426563669413 0.000959046735630562 0.000839246204318303 0.000854505226215 0.000713128246714169 0.00067575926842429 42288 41796 667 665 0 True 382 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 424 271 0.00090961614637863 0.000996356765110304 0.000686655985351339 0.00080872816052491 0.000806731812899531 0.000803314647553397 39761 43422 667 665 0 True 426 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 467 270 0.00086983287939459 0.000937018673945105 0.000595101853971161 0.000701915007248035 0.000869768660270576 0.000906841838099902 38022 40836 667 665 0 True 471 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 512 269 0.000942948072770664 0.000965104452594062 0.000732433051041428 0.000778210116731518 0.000810106360561621 0.000864316063628249 41218 42060 667 665 0 True 516 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 555 269 0.00106492873956704 0.001061752573239 0.000869764248111696 0.000885023270008392 0.000861432724762227 0.000835339811305984 46550 46272 667 665 0 True 561 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 605 269 0.00110324787251602 0.000986994838893985 0.000701915007248035 0.000625619897764553 0.00108273004768602 0.000995995569408167 48225 43014 667 665 0 False 605 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 644 268 0.00122230027124227 0.081883766408468 0.000900282291905089 0.0782330052643626 0.00106901485445693 0.0234925345936626 53429 3568558 667 665 0 True 650 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 248 313 0.00103038432717722 0.000987384919152998 0.000869764248111696 0.00080872816052491 0.000807595013276794 0.000771055088667389 45040 43031 667 665 0 False 248 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 292 313 0.00091146919101676 0.0010429598831136 0.000793469138628214 0.000930800335698482 0.000678085483273032 0.000748674439770905 39842 45453 667 665 0 False 292 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 335 314 0.000901266006959898 0.000930295525951523 0.000793469138628214 0.000793469138628214 0.000679272545680214 0.000690050794388753 39396 40543 667 665 0 True 337 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 378 314 0.000866698717475778 0.00094764262452882 0.000747692072938125 0.000869764248111696 0.000701801378330305 0.000649923482974349 37885 41299 667 665 0 True 382 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 424 314 0.0010306588523088 0.00093644502650538 0.000793469138628214 0.000671396963454643 0.000864398963960538 0.000857799601893765 45052 40811 667 665 0 True 427 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 467 313 0.00101132770762707 0.00100815095647106 0.000762951094834821 0.000762951094834821 0.000963810330383504 0.000904517673804074 44207 43936 667 665 0 True 471 313 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 512 313 0.00095408921769374 0.000968316878256525 0.000686655985351339 0.000747692072938125 0.000916455234301843 0.000856947750165165 41705 42200 667 665 0 True 516 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 556 312 0.000997830221991316 0.00101283191957922 0.000778210116731518 0.000854505226215 0.000857170965073449 0.000759541981915682 43617 44140 667 665 0 True 561 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 605 312 0.000943520000128112 0.00094158490756532 0.000488288700694286 0.000488288700694286 0.00105933345752747 0.00108799110544574 41243 41035 667 665 0 False 605 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 650 312 0.000936153575764189 0.00103189996047569 0.000503547722590982 0.00064087891966125 0.000992422063620426 0.00103545800802043 40921 44971 667 665 0 False 650 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 247 359 0.000968181507781243 0.000880135793821932 0.00080872816052491 0.000717174029144732 0.000776866400346134 0.000785207698866702 42321 38357 667 665 0 True 248 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 292 359 0.0010045103335263 0.000938601940878748 0.000854505226215 0.000793469138628214 0.000761165015476335 0.000718532205852102 43909 40905 667 665 0 True 292 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 337 356 0.000994513043318121 0.000950763266600927 0.000900282291905089 0.000854505226215 0.000712383893199349 0.000693334116372927 43472 41435 667 665 0 False 337 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 379 358 0.000922084162770984 0.00090959832632623 0.00080872816052491 0.000778210116731518 0.000677813320414722 0.000683450642950992 40306 39641 667 665 0 True 382 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 423 358 0.000950955055774928 0.00102182671143411 0.000778210116731518 0.00080872816052491 0.000815374987817454 0.000847644767761357 41568 44532 667 665 0 True 427 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 468 357 0.000874820085951531 0.000944040118607345 0.000579842832074464 0.000595101853971161 0.000831912788864763 0.000899870601825143 38240 41142 667 665 0 True 471 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 512 356 0.000941278044886918 0.00104176669643897 0.000610360875867857 0.000823987182421607 0.000946917138574896 0.000920182164199049 41145 45401 667 665 0 True 516 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 556 356 0.00104074765089417 0.000958496034088425 0.000793469138628214 0.000717174029144732 0.000975236537387369 0.000888815904007722 45493 41772 667 665 0 True 561 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 600 356 0.000994147009809355 0.00108545568544846 0.000610360875867857 0.000717174029144732 0.00104680965091884 0.0011339556143793 43456 47305 667 665 0 True 606 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 644 356 0.000945098519634667 0.00093061676851777 0.000518806744487678 0.000457770656900893 0.00100211940396778 0.00105240732199015 41312 40557 667 665 0 True 650 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 247 403 0.00093995117341764 0.00104064234745711 0.00080872816052491 0.000854505226215 0.000785672444955975 0.000858946784860713 41087 45352 667 665 0 True 248 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 292 403 0.00111148362646326 0.000970634413913015 0.00100709544518196 0.000869764248111696 0.000776802610081996 0.000708146123956497 48585 42301 667 665 0 True 293 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 336 403 0.00100430443967762 0.00100333231797736 0.000900282291905089 0.000915541313801785 0.000717248664253349 0.000709988322043463 43900 43726 667 665 0 True 337 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 380 403 0.00101439323826299 0.000957945332546289 0.000915541313801785 0.000778210116731518 0.000781810411281829 0.000757299354201098 44341 41748 667 665 0 True 382 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 423 401 0.001017618908559 0.000971552249816576 0.000762951094834821 0.000747692072938125 0.000894845508445499 0.000823492183828822 44482 42341 667 665 0 True 427 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 468 401 0.00100318346205702 0.000910975080181571 0.000747692072938125 0.000701915007248035 0.000937732191266353 0.000786221194298122 43851 39701 667 665 0 True 471 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 512 400 0.00100499075250656 0.000969555956726332 0.000701915007248035 0.000686655985351339 0.000946207550879683 0.000923334455077505 43930 42254 667 665 0 True 516 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 556 400 0.00100862821049992 0.000968385715949292 0.000778210116731518 0.000747692072938125 0.000900052962452187 0.000848181404700582 44089 42203 667 665 0 True 561 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 601 400 0.000934003128900187 0.00097962920576791 0.000488288700694286 0.000564583810177768 0.00102435811031144 0.00106619353423574 40827 42693 667 665 0 True 606 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 645 399 0.000994650305883909 0.000862329777292854 0.00064087891966125 0.000534065766384375 0.00101855070117711 0.000864486204122859 43478 37581 667 665 0 True 650 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 248 448 0.00101489653433755 0.000946197032980712 0.000885023270008392 0.00080872816052491 0.000782012256930285 0.000751397072234339 44363 41236 667 665 0 True 248 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 291 446 0.000967655334612392 0.000988784618905928 0.000869764248111696 0.000839246204318303 0.000787184718884884 0.000821481504941236 42298 43092 667 665 0 True 293 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 336 446 0.00099387248467778 0.000977724696268022 0.000869764248111696 0.00080872816052491 0.000763064356512378 0.000812617282749614 43444 42610 667 665 0 True 337 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 380 446 0.00105005862827341 0.00085987456625083 0.000946059357595178 0.000717174029144732 0.000771092241341724 0.000685445072274986 45900 37474 667 665 0 True 382 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 425 446 0.000982479691717428 0.00102802210378315 0.000701915007248035 0.000610360875867857 0.000946420931801962 0.00103675185985541 42946 44802 667 665 0 True 427 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 469 445 0.000922198548242473 0.000975682511382599 0.000595101853971161 0.000534065766384375 0.000965578431087097 0.00105344130122733 40311 42521 667 665 0 True 472 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 514 445 0.00104298960613536 0.000974420487015203 0.00080872816052491 0.000701915007248035 0.000946536373065896 0.000935749456767107 45591 42466 667 665 0 True 516 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 557 444 0.000942307514130323 0.00101471348318152 0.00064087891966125 0.000686655985351339 0.000950178171485981 0.00099459725253404 41190 44222 667 665 0 True 561 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 601 443 0.000894517264142019 0.000897758243170297 0.000488288700694286 0.000534065766384375 0.000989514635627292 0.000943136606614287 39101 39125 667 665 0 True 606 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 645 444 0.000948850363099521 0.000881099521520671 0.000518806744487678 0.000442511635004196 0.000999940640858892 0.000995633941242524 41476 38399 667 665 0 True 650 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 250 491 0.00103962667327357 0.000999156164616164 0.000854505226215 0.000900282291905089 0.000830711955698956 0.000707790993682177 45444 43544 667 665 0 True 248 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 293 490 0.00103546304211135 0.000943856551426633 0.000885023270008392 0.000778210116731518 0.000835574458164565 0.000819908470119146 45262 41134 667 665 0 True 293 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 337 491 0.00103813966214421 0.000980822392442539 0.000976577401388571 0.000900282291905089 0.00082449544936146 0.000827476395597187 45379 42745 667 665 0 True 337 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 382 491 0.00105399348849265 0.000954503447907936 0.000946059357595178 0.000778210116731518 0.000839823423739839 0.000816183114924129 46072 41598 667 665 0 True 382 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 425 489 0.000959899999645405 0.00105351499600455 0.000717174029144732 0.000686655985351339 0.000962944407610505 0.00101755673322389 41959 45913 667 665 0 True 427 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 471 489 0.00102551150609177 0.00104653944313748 0.00064087891966125 0.000762951094834821 0.00102907980007293 0.00097250127720639 44827 45609 667 665 0 True 472 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 515 490 0.000897537040589341 0.000940942422432827 0.000579842832074464 0.000610360875867857 0.000890492614925802 0.000909521981025258 39233 41007 667 665 0 True 516 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 557 488 0.000908357906192246 0.00096375064463631 0.000625619897764553 0.00064087891966125 0.000968561141710026 0.000958852375778382 39706 42001 667 665 0 True 561 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 602 489 0.000974449831618867 0.000901498424477307 0.000671396963454643 0.000488288700694286 0.00093459115778084 0.000977113036890817 42595 39288 667 665 0 True 606 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 647 488 0.000895317962442446 0.000919258549211206 0.000473029678797589 0.000564583810177768 0.000945509483689852 0.000942023101323495 39136 40062 667 665 0 True 651 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 249 536 0.000959877122551107 0.000885941105911953 0.000747692072938125 0.000671396963454643 0.000777937797902674 0.000786353034600587 41958 38610 667 665 0 True 248 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 293 535 0.000963949245336133 0.000984287222978481 0.000854505226215 0.000885023270008392 0.000780169735397622 0.00074247763506258 42136 42896 667 665 0 True 293 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 337 534 0.000995977177353186 0.0008962897057246 0.000854505226215 0.000732433051041428 0.000789553628115645 0.00075300355589273 43536 39061 667 665 0 True 338 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 381 533 0.000971247038417161 0.000880066956129165 0.000839246204318303 0.000701915007248035 0.000761426782852872 0.000768022228351238 42455 38354 667 665 0 True 382 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 426 533 0.000963285809601494 0.000943627092450742 0.000610360875867857 0.000564583810177768 0.00102145331190828 0.000999746299692037 42107 41124 667 665 0 True 427 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 470 531 0.000980466507419213 0.000908726382217847 0.000595101853971161 0.000579842832074464 0.00106812837436293 0.000971374966679122 42858 39603 667 665 0 True 472 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 514 531 0.000942055866093046 0.00103635146460796 0.000595101853971161 0.000717174029144732 0.00101085121884383 0.00101553829534332 41179 45165 667 665 0 True 516 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 558 531 0.000986345920653772 0.000929928391590099 0.000671396963454643 0.00064087891966125 0.000940270279131732 0.000930427640127596 43115 40527 667 665 0 True 561 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 602 530 0.000966877513406263 0.00092290694692786 0.000625619897764553 0.000610360875867857 0.000934076022944194 0.00093789014593173 42264 40221 667 665 0 True 606 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 647 530 0.000886304387289075 0.000879768659460508 0.000503547722590982 0.0004272526131075 0.000959534544022677 0.00102689710492453 38742 38341 667 665 0 True 651 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 249 576 0.000982090781114364 0.000932200035451412 0.000854505226215 0.00080872816052491 0.000685984321412147 0.000661830089392492 42929 40626 667 665 0 True 248 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 294 576 0.000994764691355398 0.00109321139883355 0.000885023270008392 0.000991836423285267 0.000728824219912324 0.000784513948723096 43483 47643 667 665 0 True 293 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 338 575 0.00108382521945711 0.000969005255184195 0.000991836423285267 0.00080872816052491 0.000724228183692623 0.000751971933665731 47376 42230 667 665 0 True 338 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 382 575 0.000991927931662459 0.000922998730518216 0.000885023270008392 0.000762951094834821 0.000695572767540043 0.000654521510583358 43359 40225 667 665 0 True 382 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 426 574 0.000962279217452386 0.00105952682117287 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.000942629945462829 0.00103728030387524 42063 46175 667 665 0 True 427 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 470 573 0.000979002373384148 0.0010107897346938 0.000488288700694286 0.000747692072938125 0.00107268989686046 0.000907956492466494 42794 44051 667 665 0 True 472 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 514 572 0.000948598715062245 0.000957945332546289 0.000488288700694286 0.000549324788281071 0.00107626872690337 0.00107607544693192 41465 41748 667 665 0 True 517 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 558 572 0.000924440503483667 0.000986558866839794 0.000579842832074464 0.000595101853971161 0.000964530536786898 0.00100088865346493 40409 42995 667 665 0 True 561 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 603 572 0.000903622347672582 0.000955971985353634 0.000656137941557946 0.000701915007248035 0.000815919958497364 0.000842150377652118 39499 41662 667 665 0 True 606 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 647 571 0.000923777067749028 0.000840324661504987 0.000625619897764553 0.00064087891966125 0.000867620128090902 0.00077429511978579 40380 36622 667 665 0 True 651 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 248 618 0.000986757708351134 0.000939359155499185 0.00080872816052491 0.000793469138628214 0.00075493543096323 0.000682628843707296 43133 40938 667 665 0 False 248 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 293 618 0.00103331259524735 0.00104722782006515 0.000946059357595178 0.000900282291905089 0.000737311788176943 0.000767326036095997 45168 45639 667 665 0 False 293 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 338 617 0.00100906287529158 0.00100363061464602 0.000930800335698482 0.000869764248111696 0.000718467101346905 0.00075910085893478 44108 43739 667 665 0 True 338 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 382 617 0.000906642124119904 0.00100101478232087 0.000778210116731518 0.000915541313801785 0.000678917319252708 0.000694302932062216 39631 43625 667 665 0 True 383 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 427 617 0.00103086474615748 0.000839521555089371 0.00080872816052491 0.000518806744487678 0.000920558341172735 0.000861376078700458 45061 36587 667 665 0 False 427 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 472 617 0.000922107039865281 0.000930479093132236 0.000457770656900893 0.000518806744487678 0.00102350731913689 0.0010147873144808 40307 40551 667 665 0 False 472 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 517 617 0.000975982596936826 0.000941057151920772 0.000518806744487678 0.000488288700694286 0.0010662865335398 0.0010375548631387 42662 41012 667 665 0 False 517 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 561 617 0.000990578183098883 0.00090959832632623 0.000717174029144732 0.000518806744487678 0.000963771715962583 0.000993520832732145 43300 39641 667 665 0 False 561 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 606 617 0.000933957374711591 0.00101815536781987 0.000747692072938125 0.000823987182421607 0.000766397169748899 0.000772870518723789 40825 44372 667 665 0 False 606 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 651 617 0.000886052739251798 0.000895211248537916 0.000686655985351339 0.000701915007248035 0.000747451816447461 0.000779141018273043 38731 39014 667 665 0 False 651 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 250 668 0.00115904510550859 0.0796315577224131 0.00103761348897536 0.0762035553521019 0.000781245912473952 0.0210240301869859 50664 3470405 667 665 0 True 248 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 293 661 0.00105790547161759 0.00101214354265155 0.000961318379491875 0.000900282291905089 0.000739045999660891 0.00067413893173243 46243 44110 667 665 0 False 293 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 338 661 0.00099702952369089 0.000960171084612424 0.000900282291905089 0.000839246204318303 0.000676069403249762 0.000660708862518956 43582 41845 667 665 0 False 338 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 383 661 0.000885366426422861 0.000934953543162094 0.000732433051041428 0.000839246204318303 0.000674581458146302 0.000654792021003959 38701 40746 667 665 0 False 383 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 427 661 0.00104189150560906 0.000936467972402969 0.000823987182421607 0.000778210116731518 0.000844340564629974 0.000706736851455151 45543 40812 667 665 0 False 427 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 472 661 0.000934666564634826 0.000844431977173421 0.000686655985351339 0.00064087891966125 0.000863960426790061 0.000726965188176345 40856 36801 667 665 0 False 472 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 517 661 0.000895981398177085 0.000872655431207912 0.000579842832074464 0.000579842832074464 0.000901232936304342 0.000865726284957427 39165 38031 667 665 0 False 517 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 562 661 0.000942467653790409 0.00107159636330469 0.000671396963454643 0.00080872816052491 0.000891021991493471 0.000889374019937827 41197 46701 667 665 0 False 562 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 606 661 0.00108293301277949 0.000992662475598472 0.000946059357595178 0.000854505226215 0.000742748376684701 0.000729803907434841 47337 43261 667 665 0 False 606 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 647 665 0.001080668180444 0.0828848729743792 0.000930800335698482 0.0804760814831769 0.000773306317826554 0.0233957144559953 47238 3612187 667 665 0 True 651 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D10_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D10_1.csv new file mode 100755 index 0000000..dd93779 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D10_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 265 256 0.010340377991366 0.0404691747680026 0.0103303578240635 0.0406958113984894 0.00157345837260501 0.00805654486752372 451997 1763678 667 665 0 True 264 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 309 256 0.0105119104444116 0.0104023849965954 0.0105287251087205 0.010406652933547 0.00130296982437293 0.00133424701566335 459495 453344 667 665 0 False 309 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 353 257 0.0106035103299804 0.063651231535006 0.0106202792401007 0.0635996032654307 0.00129887348472994 0.00876178693078262 463499 2773970 667 665 0 True 354 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 397 256 0.0106855247130383 0.0854289993695615 0.0107118333714809 0.0843823910887312 0.00141595365436666 0.0136121355011133 467084 3723062 667 665 0 True 399 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 442 256 0.0104298960613536 0.0758369487463222 0.0103456168459602 0.0722667277027543 0.0016887319915384 0.0162328766443452 455910 3305033 667 665 0 True 443 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 486 255 0.0100214941739476 0.0625596034031061 0.0100862134737163 0.0673380636301213 0.00167068315009951 0.0182294585029866 438058 2726396 667 665 0 True 488 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 531 255 0.00997427585131673 0.078124218763893 0.00987258716716258 0.0769207293812467 0.00161541711528085 0.0223861446335468 435994 3404714 667 665 0 True 533 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 576 255 0.00999317233120679 0.0662023793748505 0.0100404364080262 0.064637216754406 0.00174824836644154 0.0173977532294177 436820 2885151 667 665 0 True 578 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 622 255 0.00975623426556349 0.00955914620609661 0.00976577401388571 0.00946059357595178 0.0019313222650669 0.00190352408357651 426463 416595 667 665 0 False 622 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 662 256 0.00986160616189959 0.0421056532381538 0.0098115510795758 0.0420080872816053 0.00180131477419041 0.00741536656519604 431069 1834997 667 665 0 True 667 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 265 300 0.0100955930823785 0.0100189131560877 0.0101319905394064 0.0100862134737163 0.0014302728204546 0.00152955732993837 441297 436632 667 665 0 False 265 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 309 300 0.0101575900079258 0.0102490605089056 0.0102845807583734 0.0102388036926833 0.00135615805852982 0.00128600842118784 444007 446662 667 665 0 False 309 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 354 301 0.0105944052464498 0.111728485783009 0.0106965743495842 0.112092774853132 0.0013859301008555 0.0272051687414777 463101 4869214 667 665 0 True 354 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 398 301 0.010900912555853 0.0554065410722962 0.0109254596780346 0.0549172198062104 0.00144707295716414 0.00723331210124259 476499 2414660 667 665 0 True 399 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 443 300 0.0107611792638814 0.0763399687132686 0.0107270923933776 0.0741283283741512 0.00175003184027387 0.0125616666975674 470391 3326955 667 665 0 True 443 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 487 300 0.0105203978463961 0.0446389721155716 0.0104982070649271 0.0451972228580148 0.00175111820985063 0.00870588495776355 459866 1945401 667 665 0 True 488 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 532 298 0.0100154774981472 0.040855400116221 0.00993362325474937 0.0429388876173037 0.00157023194266664 0.00683463892140336 437795 1780510 667 665 0 True 533 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 577 298 0.00989949063005691 0.0496053821897385 0.00988784618905928 0.0519264515144579 0.00180447741166199 0.0089489385056032 432725 2161841 667 665 0 True 578 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 622 299 0.00976835912554137 0.00990365591249811 0.00975051499198901 0.00984206912336919 0.00182615454738439 0.00183344062965179 426993 431609 667 665 0 False 622 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 667 299 0.00988498655227204 0.0099304337749845 0.00984206912336919 0.00996414129854276 0.00182575017878416 0.00198448425458944 432091 432776 667 665 0 False 667 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 266 344 0.0101511386673338 0.0489233153839049 0.0101625085831998 0.0489967193102922 0.00151293533946277 0.0112937992766487 443725 2132116 667 665 0 True 265 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 310 344 0.0104549464796098 0.0575112764745464 0.010452429999237 0.0617380025940337 0.00143412460700551 0.0136102866817118 457005 2506386 667 665 0 True 309 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 356 345 0.0103157851149957 0.0381131817871527 0.0103608758678569 0.0391088731212329 0.0013806423913758 0.00551093344104154 450922 1661002 667 665 0 True 354 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 398 344 0.0104676890211337 0.0341809662632204 0.0104219119554437 0.0347295338368811 0.00144383018030306 0.00462870123687097 457562 1489633 667 665 0 True 399 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 443 344 0.0108809637296252 0.0692760282486945 0.0108186465247578 0.0675516899366751 0.00175914351008287 0.010734038801591 475627 3019103 667 665 0 True 444 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 487 343 0.0106166417821073 0.0332071653154401 0.0106813153276875 0.0339971007858396 0.00169401543403486 0.00438784999235511 464073 1447194 667 665 0 True 488 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 532 341 0.0105108580980739 0.0302223629570608 0.0105287251087205 0.0303959716182193 0.00157657659823954 0.00429873478974206 459449 1317114 667 665 0 True 533 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 576 343 0.0103475842760698 0.0502129207202029 0.0103913939116503 0.0505683985656519 0.00190947065843923 0.00760551758099035 452312 2188318 667 665 0 True 578 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 621 343 0.010210138693528 0.0567045904989069 0.0103456168459602 0.0573434042877852 0.00212766629901282 0.0107676382764523 446304 2471230 667 665 0 True 623 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 664 344 0.0101027078587051 0.0592486939481916 0.0100556954299229 0.0608987563897154 0.00188652545091696 0.0142395195618243 441608 2582104 667 665 0 True 667 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 265 388 0.0102787699764217 0.0408426880889567 0.0101625085831998 0.0447394522011139 0.00153276467364429 0.0103255302411302 449304 1779956 667 665 0 True 265 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 310 388 0.0102345485531439 0.0310669555555173 0.0102693217364767 0.0315251392385748 0.00145679735442852 0.00370210448687719 447371 1353922 667 665 0 True 310 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 355 389 0.0103581077394468 0.0803707598132433 0.0104219119554437 0.0790112153810941 0.00144531138654556 0.0163835997444521 452772 3502620 667 665 0 True 354 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 399 388 0.0104192353354108 0.0640187100848941 0.0103913939116503 0.064637216754406 0.00146530123566004 0.0137311603890132 455444 2789985 667 665 0 True 399 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 443 388 0.0106919989307246 0.043452692156117 0.010757610437171 0.0451209277485313 0.00169514172852087 0.00777389495402541 467367 1893702 667 665 0 True 444 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 488 387 0.0107482079514145 0.0547856021376398 0.0107270923933776 0.0542000457770657 0.00181136428135348 0.0107930663460717 469824 2387599 667 665 0 True 489 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 533 386 0.0108284379211173 0.0420767872989868 0.0107423514152743 0.0424811169604028 0.00171828780888394 0.00506198202690969 473331 1833739 667 665 0 True 533 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 577 387 0.0105229829580518 0.0498810771492705 0.0105439841306172 0.0499732967116808 0.00188118030867122 0.00638685520441787 459979 2173856 667 665 0 True 578 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 621 387 0.0104513090216165 0.0421624902264817 0.0104219119554437 0.0427862973983368 0.0019794097297508 0.0054596215037802 456846 1837474 667 665 0 True 623 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 665 386 0.0103483620972759 0.0804720200593037 0.0102845807583734 0.076600289921416 0.0018528922961208 0.0135907483744838 452346 3507033 667 665 0 True 667 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 268 432 0.0106219721450788 0.0404248203479631 0.0105439841306172 0.0406958113984894 0.00177770384102762 0.00496087482894933 464306 1761745 667 665 0 True 265 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 311 432 0.0103977766209594 0.0454882686230339 0.0104219119554437 0.0460975051499199 0.00150438676391913 0.00712981803704363 454506 1982414 667 665 0 True 310 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 356 432 0.0105850256377877 0.0339699787348894 0.0105745021744106 0.034332799267567 0.00139809714015074 0.00283693792530351 462691 1480438 667 665 0 True 354 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 400 432 0.010585437425485 0.0505991231225236 0.0105439841306172 0.0515144579232471 0.00161697555493687 0.00706350261131431 462709 2205149 667 665 0 True 399 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 444 432 0.0106480062783898 0.0943868942211331 0.0106965743495842 0.0925459678034638 0.00181802968269731 0.0152169557823615 465444 4113454 667 665 0 True 444 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 488 431 0.0106199818378748 0.0594161760546938 0.0106202792401007 0.0598306248569467 0.00179474077226031 0.0125582484697127 464219 2589403 667 665 0 True 489 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 532 430 0.0104763136856841 0.0527040420919545 0.0104371709773404 0.051773861295491 0.00175405359806082 0.00962040848975117 457939 2296883 667 665 0 True 533 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 576 431 0.0103662748621112 0.0326184653668963 0.0103303578240635 0.0327611200122072 0.00186435312291713 0.00360510968817651 453129 1421538 667 665 0 True 578 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 621 430 0.0104168103634152 0.0386059678837744 0.0105439841306172 0.0390478370336461 0.00186429563419833 0.00405461974610919 455338 1682478 667 665 0 True 623 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 665 431 0.0103341096675283 0.0712707380720054 0.0102845807583734 0.0702525368123903 0.00192577069764576 0.0144855440603427 451723 3106034 667 665 0 True 668 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 268 476 0.0104004532409922 0.0492610331046201 0.0103913939116503 0.0499275196459907 0.00148853438037149 0.0108204573860003 454623 2146834 667 665 0 True 265 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 312 475 0.0104715781271644 0.0523981732770929 0.010452429999237 0.0522011139085985 0.0015603971879608 0.00547101228865584 457732 2283553 667 665 0 True 310 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 356 477 0.0105337580694661 0.0655599630800508 0.0105287251087205 0.0627603570611124 0.00157896951741064 0.0140356391130991 460450 2857154 667 665 0 True 355 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 401 476 0.0107354654098906 0.08505422402424 0.0106813153276875 0.0800030518043793 0.00167791967296224 0.0174521641427791 469267 3706729 667 665 0 True 399 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 445 476 0.0109113445108528 0.0949498947643772 0.0110017547875181 0.0909437705043107 0.00193517755747194 0.0286019092354625 476955 4137990 667 665 0 True 444 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 490 475 0.0108340656863145 0.0430310153961236 0.0107881284809644 0.0441443503471428 0.00196397526852584 0.00562568851781056 473577 1875325 667 665 0 True 489 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 532 474 0.010577293179915 0.0408704296791418 0.0106202792401007 0.0421149004348821 0.00173737588316736 0.0061082095167267 462353 1781165 667 665 0 True 534 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 578 474 0.0105041779865389 0.096263180266987 0.0104829480430304 0.0921950102998398 0.00202974298190201 0.0176839371965437 459157 4195224 667 665 0 True 578 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 622 474 0.0103759289959049 0.0630242578292837 0.0103303578240635 0.0663157091630426 0.00190969477487725 0.0147968493282542 453551 2746646 667 665 0 True 623 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 666 474 0.0102105276041311 0.0761537857002314 0.0102845807583734 0.0719462882429236 0.00194547584538443 0.0133390905951281 446321 3318841 667 665 0 True 668 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 269 520 0.0102814237193603 0.0503431616349182 0.0102693217364767 0.0531013962005035 0.00160501485373022 0.00980410554002727 449420 2193994 667 665 0 True 265 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 313 519 0.0105087076512099 0.0969748243348128 0.0104829480430304 0.0914015411612116 0.0016650244058387 0.0251227535918852 459355 4226238 667 665 0 True 310 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 357 519 0.0107579535935854 0.0550900253609533 0.0107728694590677 0.0561684596017395 0.00155040816895781 0.0105577876761629 470250 2400866 667 665 0 True 355 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 401 519 0.0108784701263468 0.0565005326316478 0.0108949416342412 0.0564736400396735 0.00177154916284705 0.00668323717571651 475518 2462337 667 665 0 True 400 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 445 519 0.0110031045360817 0.0548758024610622 0.0110170138094148 0.0542915999084459 0.00191539849124652 0.00652803004153119 480966 2391530 667 665 0 True 444 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 489 516 0.0108938435337149 0.0595233563423321 0.0108339055466545 0.059510185397116 0.0018265538964457 0.0118845394515544 476190 2594074 667 665 0 True 489 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 534 517 0.0106662393225452 0.0715634818334461 0.0106660563057908 0.0703440909437705 0.00176856560525837 0.0158157345669307 466241 3118792 667 665 0 True 534 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 577 516 0.0103826548616285 0.0569955444803356 0.0103608758678569 0.0578469520103761 0.00181036991989676 0.0120239326396867 453845 2483910 667 665 0 True 578 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 621 515 0.0104179999723187 0.0509852796330492 0.0105287251087205 0.0492713817044327 0.00198823204160567 0.00867617370336403 455390 2221978 667 665 0 True 623 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 666 515 0.0101159994504922 0.0709860253747208 0.0101319905394064 0.0695506218051423 0.00190387152480538 0.0161675899082371 442189 3093626 667 665 0 True 668 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 269 561 0.00995755269538497 0.0423059709241059 0.00988784618905928 0.0438849469748989 0.00141562232250811 0.00797967831351485 435263 1843727 667 665 0 True 265 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 312 560 0.0102576772954791 0.0488697826048298 0.0102388036926833 0.0501106279087511 0.00144766141079134 0.0088933730254958 448382 2129783 667 665 0 True 310 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 357 561 0.0105141295225585 0.0420291286696944 0.0104829480430304 0.0426794842450599 0.00147402923789318 0.00601031399611676 459592 1831662 667 665 0 True 355 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 401 560 0.0107280989855267 0.0463376798599841 0.010757610437171 0.0459296559090562 0.00169379616367379 0.00569666708213561 468945 2019432 667 665 0 True 400 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 445 560 0.0108193328375867 0.0797725373172001 0.0108491645685512 0.0763714045929656 0.00196465801243043 0.0147588409334224 472933 3476549 667 665 0 True 444 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 489 558 0.0108028842067865 0.0586258275581377 0.0108339055466545 0.0585030899519341 0.00204301560752178 0.00968760107473257 472214 2554959 667 665 0 True 489 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 533 558 0.0107653886492323 0.0534696549109097 0.0107728694590677 0.0530861371786069 0.00196247826167138 0.00819285926357054 470575 2330249 667 665 0 True 534 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 577 557 0.0103576730746552 0.0366573793146175 0.0103456168459602 0.0380254825665675 0.00184327902531181 0.00721585731221607 452753 1597557 667 665 0 True 579 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 622 558 0.0101995694759624 0.0478804931761769 0.0101930266269932 0.0472571908140688 0.00172459644074953 0.00723685136310404 445842 2086669 667 665 0 True 623 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 665 558 0.0102745605910709 0.0538238707319913 0.0101930266269932 0.0531624322880903 0.00183907734105676 0.00645902408609303 449120 2345686 667 665 0 True 668 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 266 605 0.00983230060410399 0.00993617024938175 0.00985732814526589 0.00990310521095598 0.00138552558310626 0.00137232143070929 429788 433026 667 665 0 False 266 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 310 605 0.0099452219415584 0.00982380418888833 0.00997940032043946 0.0098268101014725 0.00137236321192293 0.00149623444697092 434724 428129 667 665 0 False 310 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 355 604 0.0101057505122467 0.06498236894594 0.0101167315175097 0.0626993209735256 0.00139754046112291 0.0123165372867541 441741 2831982 667 665 0 True 355 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 400 604 0.0105415591586216 0.067869375888795 0.0103608758678569 0.0669718471046006 0.00193248907808646 0.0151251800803164 460791 2957800 667 665 0 True 400 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 445 604 0.0103481562034272 0.0101493835297789 0.0103150988021668 0.0101167315175097 0.0019782052994765 0.00206948610543667 452337 442318 667 665 0 False 445 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 489 604 0.0103772101131856 0.010337585781804 0.0103761348897536 0.0102693217364767 0.00202289067437738 0.00207294596417377 453607 450520 667 665 0 False 489 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 534 604 0.0102183744474753 0.00997671565042154 0.0101930266269932 0.00999465934233616 0.00186990523113641 0.0020809067859119 446664 434793 667 665 0 False 534 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 579 604 0.010089256127258 0.0101552576795617 0.0101319905394064 0.0101472495613031 0.0017421279685282 0.00187939833357919 441020 442574 667 665 0 False 579 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 623 604 0.0100463386983551 0.0103787277761811 0.0100709544518196 0.0102998397802701 0.00152528234661358 0.00175935208482961 439144 452313 667 665 0 False 623 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 668 603 0.0100729905132122 0.0100725147728557 0.0101167315175097 0.0101167315175097 0.00167897682613954 0.00166970732371576 440309 438968 667 665 0 False 668 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 267 653 0.00976499619267958 0.0377339778835966 0.00971999694819562 0.0383306630045014 0.00138609570545009 0.00777809463349635 426846 1644476 667 665 0 True 266 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 311 648 0.0100727846193635 0.00989759819553461 0.0101319905394064 0.00985732814526589 0.00130604228601169 0.00130904392011262 440300 431345 667 665 0 False 311 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 355 648 0.00987855808877434 0.00962158199343633 0.00994888227664607 0.00962844281681544 0.00137129360086398 0.00118989074394181 431810 419316 667 665 0 False 355 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 400 648 0.00982811409584748 0.0099132931894855 0.00985732814526589 0.00994888227664607 0.00139348303283313 0.00136056391934179 429605 432029 667 665 0 False 400 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 445 648 0.00987320484870863 0.00991694158720216 0.00985732814526589 0.00994888227664607 0.0016341261546723 0.00169211933759964 431576 432188 667 665 0 False 445 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 489 648 0.010064914898925 0.00986932884970495 0.0100099183642329 0.00988784618905928 0.00194485705451138 0.00170562418375218 439956 430113 667 665 0 False 489 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 534 648 0.0100095065765355 0.00988562043699315 0.00997940032043946 0.00991836423285267 0.00179862630764682 0.00179104104577556 437534 430823 667 665 0 False 534 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 579 647 0.00999356124180986 0.00982410248555699 0.00994888227664607 0.00971999694819562 0.00155199176247253 0.00137929813685722 436837 428142 667 665 0 False 579 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 624 647 0.0099355220535761 0.00983883375180914 0.00996414129854276 0.00988784618905928 0.00144137536698786 0.00145031944818459 434300 428784 667 665 0 False 624 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 665 653 0.00998953487321343 0.0406541645943653 0.00994888227664607 0.0404669260700389 0.00143833126743601 0.00769895737342095 436661 1771740 667 665 0 True 668 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D10_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D10_2.csv new file mode 100755 index 0000000..b868322 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D10_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 265 256 0.00884634359405328 0.736031334917748 0.00880445563439384 0.743068589303426 0.00183446176140041 0.189271711451624 386690 32076816 667 665 12 True 264 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 309 256 0.00748055818737461 0.00738194765926031 0.00744640268558785 0.00737010757610437 0.00139794961159388 0.00130881765063024 326989 321711 667 665 0 False 309 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 353 257 0.00721623623985673 0.00734635857209974 0.00715648126955062 0.00743114366369116 0.00133174973463149 0.00126639834017455 315435 320160 667 665 0 True 354 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 397 256 0.00694564596850122 0.00727823220215795 0.00703440909437705 0.00727855344472419 0.00135570031335909 0.00127059959166917 303607 317191 667 665 0 True 399 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 442 256 0.00692990652762426 0.00704572142188844 0.00695811398489357 0.00708018616006714 0.00152707095673724 0.0017311438564263 302919 307058 667 665 0 True 443 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 486 255 0.00692203680718579 0.00685577528164655 0.00694285496299687 0.00689707789730678 0.00153059581015037 0.00157847668289459 302575 298780 667 665 0 True 488 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 531 255 0.00717581241423234 0.00726258310000224 0.00714122224765393 0.00729381246662089 0.00149635173208869 0.00155253297316652 313668 316509 667 665 0 True 533 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 576 255 0.00755266678860158 0.00788696391929698 0.00756847486076143 0.00791943236438544 0.00168294495090532 0.00176001529991566 330141 343720 667 665 0 True 578 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 622 255 0.00871582977108379 0.00815584394724509 0.0085145342183566 0.00822461280231937 0.00259182119878386 0.00191413656589664 380985 355438 667 665 0 False 622 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 662 256 0.00977600007503687 0.762241148763417 0.00984206912336919 0.747768368047608 0.00190051695103067 0.154052483246601 427327 33219060 667 665 12 True 667 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 265 300 0.00704710588171238 0.00653382139257505 0.00700389105058366 0.00654612039368277 0.0016215467092585 0.00150475813142941 308042 284749 667 665 0 False 265 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 309 300 0.00671037793074166 0.0068686249842964 0.00665293354695964 0.0068207827878233 0.00126020424593248 0.00124373747571042 293323 299340 667 665 0 False 309 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 354 301 0.00681897549737377 0.00704067332441885 0.0068055237659266 0.00706492713817044 0.0012953199722081 0.00136027017809451 298070 306838 667 665 0 True 354 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 398 301 0.00712822805809272 0.007098451094548 0.00721751735713741 0.00715648126955062 0.00137828310153408 0.00139549125052642 311588 309356 667 665 0 True 399 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 443 300 0.00702779761412496 0.00713573817813015 0.00708018616006714 0.0072480354009308 0.00169987377428751 0.00174310308562583 307198 310981 667 665 0 True 443 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 487 300 0.00718288143637039 0.00749552985232594 0.00727855344472419 0.00741588464179446 0.00178751197733186 0.00180788906246423 313977 326661 667 665 0 True 488 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 532 298 0.00716844598986842 0.0072752033436762 0.00718699931334401 0.00727855344472419 0.00149196862991848 0.00156305141310392 313346 317059 667 665 0 True 533 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 577 298 0.00749140193007181 0.00732205886655297 0.00753795681696803 0.00727855344472419 0.00168498094133526 0.00194573008548276 327463 319101 667 665 0 True 578 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 622 299 0.00778672234036335 0.00791073586919921 0.00778210116731518 0.00788891432059205 0.00195193217780007 0.00198799582049631 340372 344756 667 665 0 False 622 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 667 299 0.00814703657555521 0.00813124594502966 0.00813305867093919 0.00814831769283589 0.00192276596468429 0.00183487277236777 356122 354366 667 665 0 False 667 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 266 344 0.00659400215204826 0.00651716267092543 0.00657663843747616 0.00659189745937285 0.00144777217653202 0.00146401674369591 288236 284023 667 665 0 True 265 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 310 344 0.00654724137130336 0.00649917308721564 0.00651560234988937 0.00653086137178607 0.001348437052997 0.00129642230319712 286192 283239 667 665 0 True 309 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 356 345 0.00679854625216575 0.00688998761495178 0.00679026474402991 0.00694285496299687 0.00132516837331812 0.00138186802909065 297177 300271 667 665 0 True 354 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 398 344 0.00706918227770985 0.00719574170032543 0.00714122224765393 0.00729381246662089 0.00141283412583969 0.00129855894984323 309007 313596 667 665 0 True 399 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 443 344 0.00739090285482116 0.00713140140348583 0.00737010757610437 0.00715648126955062 0.00161400793719852 0.00174459924760233 323070 310792 667 665 0 True 444 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 487 343 0.0073393150071794 0.00740464115197584 0.00727855344472419 0.00744640268558785 0.00159835159614248 0.00162530544035695 320815 322700 667 665 0 True 488 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 532 341 0.00738712813426201 0.00745321761717179 0.00740062561989776 0.00743114366369116 0.00158547303904401 0.00160876204072652 322905 324817 667 665 0 True 533 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 576 343 0.00759503516724128 0.00767365885530948 0.00764476997024491 0.00764476997024491 0.00181560492682548 0.00195713074158352 331993 334424 667 665 0 True 578 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 621 343 0.00754250935873331 0.0076460319946123 0.00747692072938125 0.00764476997024491 0.00190006598704322 0.00203806922526932 329697 333220 667 665 0 True 623 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 664 344 0.00720422576535033 0.00714886323155107 0.0072480354009308 0.00715648126955062 0.00189803195928279 0.00184495216498701 314910 311553 667 665 0 True 667 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 265 388 0.00664835812810006 0.00691233691920348 0.00668345159075303 0.00695811398489357 0.00145212366742081 0.00140401431781435 290612 301245 667 665 0 True 265 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 310 388 0.00690986619301931 0.0700069698163927 0.00686655985351339 0.0722056916151675 0.00137416711876041 0.0132876548785047 302043 3050958 667 665 0 True 310 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 355 389 0.00691929155587004 0.00708679457857278 0.00700389105058366 0.00706492713817044 0.00130880080610413 0.00146472020577821 302455 308848 667 665 0 True 354 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 399 388 0.00715687018015369 0.00699865938593336 0.00711070420386053 0.00703440909437705 0.00144809225450762 0.001478040408281 312840 305007 667 665 0 True 399 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 443 388 0.00693805077319431 0.00694145526324394 0.00694285496299687 0.00704966811627375 0.00161976330732665 0.00162012854507954 303275 302514 667 665 0 True 444 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 488 387 0.00734851159908716 0.00725613530277972 0.00733958953231098 0.00729381246662089 0.00177832073567249 0.00169863338194071 321217 316228 667 665 0 True 489 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 533 386 0.0077100383202768 0.00765853750879832 0.00770580605783169 0.00770580605783169 0.0016672719249242 0.00170018490570953 337020 333765 667 665 0 True 533 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 577 387 0.00758535815635327 0.00767583871558044 0.00752269779507134 0.007690547035935 0.0019938150343465 0.00182724292093823 331570 334519 667 665 0 True 578 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 621 387 0.00725487565212587 0.0071189188351974 0.0072327763790341 0.00717174029144732 0.00194464968398283 0.00195341680514203 317124 310248 667 665 0 True 623 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 665 386 0.00679593826341579 0.00674795250887576 0.00688181887541009 0.00672922865644312 0.00183295337955425 0.00193275030751435 297063 294081 667 665 0 True 667 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 268 432 0.00704033426180021 0.00709900179609013 0.00701915007248035 0.00718699931334401 0.0015861693357722 0.00157394924569987 307746 309380 667 665 0 True 265 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 311 432 0.00719178062605227 0.00721939892073971 0.00718699931334401 0.00727855344472419 0.00137197727121047 0.00142322374673687 314366 314627 667 665 0 True 310 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 356 432 0.00725647704872672 0.00718759590668133 0.00720225833524071 0.00721751735713741 0.00138549701396162 0.00133427076537064 317194 313241 667 665 0 True 354 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 400 432 0.00709237965132792 0.00721926124535417 0.00711070420386053 0.00727855344472419 0.00158878376837388 0.00153447060411475 310021 314621 667 665 0 True 399 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 444 432 0.00709784727686512 0.00717676544301931 0.00709544518196384 0.00714122224765393 0.00159990069614029 0.00179395539928672 310260 312769 667 665 0 True 444 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 488 431 0.00692560563389626 0.00744043675221471 0.00688181887541009 0.00753795681696803 0.00168255168376962 0.00174698546312362 302731 324260 667 665 0 True 489 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 532 430 0.00711258012559296 0.00746163876158696 0.00715648126955062 0.00740062561989776 0.00178237615352653 0.00160773059889924 310904 325184 667 665 0 True 533 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 576 431 0.00695594066093527 0.00693723321808756 0.00704966811627375 0.00698863202868696 0.00184754641318786 0.00190607779788605 304057 302330 667 665 0 True 578 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 621 430 0.00660072801777184 0.00662679816960575 0.00660715648126955 0.00659189745937285 0.00191811090170098 0.00173398488509477 288530 288801 667 665 0 True 623 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 665 431 0.00655083307510813 0.00661169976899218 0.00657663843747616 0.00669871061264973 0.00198616175408263 0.00182246020070639 286349 288143 667 665 0 True 668 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 268 476 0.00712941766699621 0.00715648126955062 0.00711070420386053 0.00714122224765393 0.00151153739928949 0.0014741852391221 311640 311885 667 665 0 True 265 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 312 475 0.00720196093301484 0.00725264752634619 0.00718699931334401 0.00730907148851759 0.00153512020956904 0.00148865454757341 314811 316076 667 665 0 True 310 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 356 477 0.00736338171038079 0.00739486619960292 0.00741588464179446 0.00737010757610437 0.00151697119145084 0.00156189201455054 321867 322274 667 665 0 True 355 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 401 476 0.00738111145846166 0.00736762941916476 0.00749217975127794 0.00744640268558785 0.00163383904814693 0.00165746031174685 322642 321087 667 665 0 True 399 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 445 476 0.00747170475188133 0.007398881731681 0.00749217975127794 0.00753795681696803 0.00193006473418035 0.00205983778192791 326602 322449 667 665 0 True 444 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 490 475 0.00721154643552566 0.00730826838210197 0.0072480354009308 0.00733958953231098 0.00187358092895086 0.00187996714418 315230 318500 667 665 0 True 489 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 532 474 0.00676571762184827 0.00654664814932731 0.00677500572213321 0.00659189745937285 0.00171009665377771 0.00168727649768238 295742 285308 667 665 0 True 534 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 578 474 0.00660095678871482 0.00640426885478746 0.00668345159075303 0.00646982528419928 0.00188319932302968 0.00192733771093183 288540 279103 667 665 0 True 578 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 622 474 0.00632000319364236 0.00640913338507633 0.00616464484626535 0.0064087891966125 0.00184214603032836 0.00168715244772811 276259 279315 667 665 0 True 623 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 666 474 0.0064652498653397 0.00651211457345584 0.00648508430609598 0.00646982528419928 0.00185770994010137 0.00178920076757919 282608 283803 667 665 0 True 668 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 269 520 0.00694223728145083 0.00697959134503689 0.00691233691920348 0.00695811398489357 0.00143714022876985 0.00152176845853602 303458 304176 667 665 0 True 265 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 313 519 0.00707382632785232 0.00743284166011274 0.00706492713817044 0.00740062561989776 0.00149389991516204 0.00141287693415165 309210 323929 667 665 0 True 310 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 357 519 0.00740398855275956 0.00765422368005158 0.00740062561989776 0.00772106507972839 0.00147571289122593 0.00154721609300111 323642 333577 667 665 0 True 355 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 401 519 0.00749188234905207 0.00753692425157653 0.00749217975127794 0.00753795681696803 0.00162259235608524 0.00167342058167482 327484 328465 667 665 0 True 400 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 445 519 0.00705042306038558 0.00701254165397472 0.00706492713817044 0.00704966811627375 0.00193075183778662 0.00195431137028815 308187 305612 667 665 0 True 444 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 489 516 0.00694029272843551 0.00689505865831895 0.00698863202868696 0.00689707789730678 0.00179467623962437 0.00173057207316655 303373 300492 667 665 0 True 489 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 534 517 0.00657894902400025 0.0072079259719452 0.00657663843747616 0.00709544518196384 0.00166772767000772 0.00212689166828754 287578 314127 667 665 0 True 534 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 577 516 0.00627875579262326 0.00649687849745673 0.00624093995574884 0.00654612039368277 0.0017220764778878 0.00161697857673746 274456 283139 667 665 0 True 578 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 621 515 0.00628749484264505 0.00638866564442693 0.00630197604333562 0.0064087891966125 0.00180451820026055 0.00178692471146972 274838 278423 667 665 0 True 623 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 666 515 0.00659873771056793 0.00666569146601913 0.00651560234988937 0.00665293354695964 0.00184051372564294 0.00196145087105881 288443 290496 667 665 0 True 668 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 269 561 0.00701169213973924 0.00693344714498538 0.00704966811627375 0.00691233691920348 0.00137858957352128 0.00138724179121895 306494 302165 667 665 0 True 265 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 312 560 0.00694111630383023 0.00702367041430539 0.00689707789730678 0.00698863202868696 0.00143503218071008 0.00144522378166325 303409 306097 667 665 0 True 310 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 357 561 0.00720225833524071 0.00735388482650894 0.00721751735713741 0.00737010757610437 0.00127771310567609 0.00129654521666823 314824 320488 667 665 0 True 355 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 401 560 0.00709954018184316 0.00712364569010074 0.00709544518196384 0.00711070420386053 0.00155813786712485 0.00150679292969853 310334 310454 667 665 0 True 400 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 445 560 0.00711420439928811 0.00702713524484133 0.00711070420386053 0.00708018616006714 0.00182777102409509 0.00192973051668457 310975 306248 667 665 0 True 444 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 489 558 0.00703516403848888 0.00703945719184663 0.00703440909437705 0.00694285496299687 0.00203675625795996 0.00216621120194407 307520 306785 667 665 0 True 489 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 533 558 0.00699560954244782 0.00721290523172202 0.00704966811627375 0.0072480354009308 0.00184013289152334 0.00187132280041795 305791 314344 667 665 0 True 534 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 577 557 0.00674162804155258 0.00695269875306256 0.0068055237659266 0.00694285496299687 0.00175198976400481 0.0016719683353241 294689 303004 667 665 0 True 579 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 622 558 0.00665702854683896 0.00679313298122853 0.00660715648126955 0.00679026474402991 0.00158477370164155 0.00172442729667947 290991 296050 667 665 0 True 623 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 665 558 0.00664057991603878 0.00680628098054704 0.00666819256885634 0.0068207827878233 0.00167354291202036 0.001769023506396 290272 296623 667 665 0 True 668 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 266 605 0.00738257559249673 0.00747591110988733 0.00743114366369116 0.00749217975127794 0.0014430528680612 0.00138026293262964 322706 325806 667 665 0 False 266 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 310 605 0.00706307409353231 0.00698066980222357 0.00712596322575723 0.00692759594110018 0.00149986428223699 0.00140390033864777 308740 304223 667 665 0 False 310 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 355 604 0.00690842493607854 0.00707428906438676 0.00691233691920348 0.00701915007248035 0.00135385689421903 0.00142290460582419 301980 308303 667 665 0 True 355 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 400 604 0.00703452347984854 0.00685951546295356 0.00694285496299687 0.00686655985351339 0.0017340871739087 0.00130527622888754 307492 298943 667 665 0 True 400 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 445 604 0.00699757697255744 0.00693730205578033 0.00708018616006714 0.00695811398489357 0.00184771761875658 0.00198353621968197 305877 302333 667 665 0 False 445 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 489 604 0.00688342027201094 0.00685127788571911 0.00685130083161669 0.00688181887541009 0.0020059414190883 0.00199513623617885 300887 298584 667 665 0 False 489 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 534 604 0.00695118222532131 0.00679051714890339 0.00697337300679027 0.00679026474402991 0.00183879724747226 0.00194313317976124 303849 295936 667 665 0 False 534 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 579 604 0.00680760558150771 0.00685862057294759 0.00675974670023652 0.00686655985351339 0.0017308836132906 0.00179327109878168 297573 298904 667 665 0 False 579 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 623 604 0.00675757337627821 0.00700409756366196 0.00666819256885634 0.00692759594110018 0.00161144135309792 0.00160627101343435 295386 305244 667 665 0 False 623 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 668 603 0.00698879216834705 0.00708275610059711 0.00695811398489357 0.00715648126955062 0.00160465153987033 0.00165226721335799 305493 308672 667 665 0 False 668 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 267 653 0.00950634776454757 0.741088312449698 0.00926222629129473 0.742351415274281 0.00208123856294697 0.187967776897979 415540 32297203 667 665 11 True 266 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 311 648 0.00756401382737334 0.00739188323291635 0.00749217975127794 0.00744640268558785 0.00172161662528327 0.00139303872325596 330637 322144 667 665 0 False 311 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 355 648 0.00687024306569535 0.00674710351066497 0.00688181887541009 0.00669871061264973 0.00120332213049324 0.00127551973981128 300311 294044 667 665 0 False 355 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 400 648 0.00652392961221381 0.00662319566368427 0.00657663843747616 0.00660715648126955 0.00127208344856982 0.00134549052532092 285173 288644 667 665 0 False 400 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 445 648 0.00662790600579774 0.00654446828905636 0.00659189745937285 0.00651560234988937 0.00164651802251722 0.00165143091795687 289718 285213 667 665 0 False 445 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 489 648 0.00689094683603495 0.00661486630285946 0.00685130083161669 0.00659189745937285 0.00177087172935006 0.00165072857011669 301216 288281 667 665 0 False 489 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 534 648 0.00688241367986183 0.00668611331487336 0.00686655985351339 0.00663767452506294 0.0018053874199311 0.00170229889147677 300843 291386 667 665 0 False 534 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 579 647 0.0067458145498091 0.00682635864093743 0.00665293354695964 0.00686655985351339 0.00155016749271067 0.00131124934700662 294872 297498 667 665 0 False 579 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 624 647 0.00749433019814195 0.00709136081219299 0.00732433051041428 0.00708018616006714 0.00187803347476382 0.00139799140509314 327591 309047 667 665 0 False 624 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 665 653 0.00871299301139085 0.767487292275091 0.00863660639353018 0.754650186923018 0.00167548574278276 0.174981273888397 380861 33447691 667 665 15 True 668 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D10_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D10_3.csv new file mode 100755 index 0000000..27b5517 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D10_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 265 256 0.00110155496753798 0.0747765729269385 0.000946059357595178 0.0740520332646677 0.000803511722851549 0.0219315870757486 48151 3258821 667 665 0 True 264 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 309 256 0.0011208861122197 0.00101326789163341 0.00103761348897536 0.000885023270008392 0.000724979018007825 0.000671866196009762 48996 44159 667 665 0 False 309 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 353 257 0.00105101946623392 0.00112347703775346 0.000946059357595178 0.00103761348897536 0.000694136254586824 0.000714265355751656 45942 48962 667 665 0 True 354 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 397 256 0.00104090779055425 0.001139470328373 0.000885023270008392 0.00103761348897536 0.000772641807269091 0.000733190314134561 45500 49659 667 665 0 True 399 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 442 256 0.00103958091908498 0.00107340908921422 0.000869764248111696 0.000885023270008392 0.000850130818391623 0.000886582702022604 45442 46780 667 665 0 True 443 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 486 255 0.00103024706461143 0.00110420248377868 0.000839246204318303 0.000976577401388571 0.000871323219640263 0.000864941686679354 45034 48122 667 665 0 True 488 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 531 255 0.0010263122043922 0.0009182259838197 0.000854505226215 0.000717174029144732 0.000839152845801392 0.000828436957856043 44862 40017 667 665 0 True 533 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 576 255 0.00109821491177048 0.00106487321531111 0.000869764248111696 0.000793469138628214 0.000961657746451556 0.000921259107248632 48005 46408 667 665 0 True 578 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 622 255 0.00110425446466513 0.00111792413053692 0.000686655985351339 0.000839246204318303 0.00111964475568868 0.00101494864489623 48269 48720 667 665 0 False 622 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 662 256 0.00116041773116646 0.0772033081100554 0.000869764248111696 0.0741741054398413 0.000989946640547225 0.0186770767331001 50724 3364580 667 665 0 True 667 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 265 300 0.00102477943907424 0.000970175495961235 0.000854505226215 0.000823987182421607 0.000805764712869112 0.000767283815045876 44795 42281 667 665 0 False 265 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 309 300 0.00111141499518037 0.00101886669064513 0.00100709544518196 0.000930800335698482 0.000724533404561331 0.000632072547210273 48582 44403 667 665 0 False 309 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 354 301 0.00106289267817453 0.00103095917867454 0.000946059357595178 0.000869764248111696 0.000713367149785179 0.000766083556159214 46461 44930 667 665 0 True 354 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 398 301 0.0010436759189643 0.000972057059563535 0.000869764248111696 0.000854505226215 0.000756303266455132 0.000678305846225318 45621 42363 667 665 0 True 399 300 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 443 300 0.000984904663713005 0.00102898583148189 0.000732433051041428 0.000762951094834821 0.000904199007411203 0.000912086678659571 43052 44844 667 665 0 True 443 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 487 300 0.00104452237145332 0.000957165172028262 0.000732433051041428 0.000686655985351339 0.000991641115036902 0.000936457315195195 45658 41714 667 665 0 True 488 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 532 298 0.000994169886903653 0.000926784803620404 0.000793469138628214 0.000747692072938125 0.000834806161293726 0.000834756395911694 43457 40390 667 665 0 True 533 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 577 298 0.00109860382237355 0.00104009164591497 0.000839246204318303 0.000701915007248035 0.000994402552266025 0.00102454524419409 48022 45328 667 665 0 True 578 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 622 299 0.0009947418142611 0.00104683773980614 0.000610360875867857 0.000625619897764553 0.00102372375464561 0.0010978600474444 43482 45622 667 665 0 False 622 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 667 299 0.000980054719721851 0.000985273896574809 0.000579842832074464 0.000610360875867857 0.00100744674857694 0.000958119936409484 42840 42939 667 665 0 False 667 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 266 344 0.00085569483511849 0.000972148843153891 0.000686655985351339 0.000839246204318303 0.000712049491298841 0.000763380747412717 37404 42367 667 665 0 True 265 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 310 344 0.000948232681553478 0.00103467641408396 0.000854505226215 0.000961318379491875 0.00066901963798841 0.000697288473013178 41449 45092 667 665 0 True 309 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 356 345 0.00104495703624498 0.00102109244271126 0.000946059357595178 0.000885023270008392 0.000669403831888007 0.000734495386161494 45677 44500 667 665 0 True 354 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 398 344 0.00103184846121229 0.00100860987442284 0.000869764248111696 0.000885023270008392 0.000760449453457768 0.000751743561834637 45104 43956 667 665 0 True 399 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 443 344 0.00108236108542204 0.0010243507601689 0.000854505226215 0.000793469138628214 0.000915677415536914 0.000918158304488604 47312 44642 667 665 0 True 444 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 487 343 0.000961936061037918 0.00110135719247765 0.000701915007248035 0.000885023270008392 0.00090218778049937 0.000938636674900569 42048 47998 667 665 0 True 488 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 532 341 0.00100592871337277 0.00100567279953144 0.000762951094834821 0.000778210116731518 0.000897699310545129 0.000923140856077358 43971 43828 667 665 0 True 533 343 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 576 343 0.001017618908559 0.00104752611673381 0.000762951094834821 0.000732433051041428 0.000978374238030174 0.000995952208028359 44482 45652 667 665 0 True 578 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 621 343 0.00098257120009462 0.00105858603937172 0.000610360875867857 0.000686655985351339 0.00107239175322087 0.00111504600311441 42950 46134 667 665 0 True 623 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 664 344 0.000902478492957687 0.000970909764684084 0.000564583810177768 0.000610360875867857 0.000977755965635304 0.00100553134677345 39449 42313 667 665 0 True 667 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 265 388 0.000989800361892755 0.000977518183189721 0.000823987182421607 0.000823987182421607 0.000813291594416918 0.000765577658645297 43266 42601 667 665 0 True 265 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 310 388 0.00105895781795529 0.00672385931640729 0.000900282291905089 0.00675974670023652 0.00078607173350629 0.00181961677147924 46289 293031 667 665 0 True 310 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 355 389 0.00105662435433691 0.0010333455520238 0.000915541313801785 0.000930800335698482 0.000759918812947791 0.000760690322354919 46187 45034 667 665 0 True 354 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 399 388 0.000961981815226513 0.00100532861106761 0.00080872816052491 0.000839246204318303 0.000728111242167935 0.000782888956337526 42050 43813 667 665 0 True 399 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 443 388 0.000964544049787878 0.000953356153028486 0.000656137941557946 0.000701915007248035 0.000897899959522822 0.000887440747396533 42162 41548 667 665 0 True 444 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 488 387 0.00100592871337277 0.00104353353055332 0.000762951094834821 0.000717174029144732 0.000918027937171242 0.0010169432205745 43971 45478 667 665 0 True 489 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 533 386 0.00104820558363528 0.00100170315924854 0.000839246204318303 0.000762951094834821 0.000889672778952718 0.000909737098741114 45819 43655 667 665 0 True 533 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 577 387 0.00101061851770384 0.00108070588464753 0.000686655985351339 0.00080872816052491 0.00102251927878187 0.00105515156731408 44176 47098 667 665 0 True 578 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 621 387 0.000931623911093206 0.000958840222552261 0.000595101853971161 0.000534065766384375 0.00100978200998215 0.00106257539534288 40723 41787 667 665 0 True 623 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 665 386 0.00103518851697978 0.000891218662357427 0.000793469138628214 0.000488288700694286 0.000934984967102191 0.000954051918442553 45250 38840 667 665 0 True 667 386 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 268 432 0.000977561116443381 0.001104799077116 0.000854505226215 0.000930800335698482 0.000803573717857388 0.000931477368482887 42731 48148 667 665 0 True 265 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 311 432 0.0010403816173854 0.000967353150557786 0.000930800335698482 0.000915541313801785 0.000781030115276912 0.000718501218811332 45477 42158 667 665 0 True 310 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 356 432 0.00106012454976449 0.00103736108410188 0.000930800335698482 0.000991836423285267 0.000805096217665759 0.000733589189763412 46340 45209 667 665 0 True 354 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 400 432 0.00105156851649707 0.00102441959786167 0.000915541313801785 0.000854505226215 0.000826104011081488 0.000857998527393152 45966 44645 667 665 0 True 399 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 444 432 0.00103431918739646 0.00103024785584928 0.000747692072938125 0.00080872816052491 0.000963978955348053 0.000928744793955153 45212 44899 667 665 0 True 444 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 488 431 0.000946265251443859 0.00107549716589482 0.000686655985351339 0.000778210116731518 0.000897960934105259 0.000980437599155832 41363 46871 667 665 0 True 489 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 532 430 0.000987832931783136 0.00100782971390481 0.000701915007248035 0.000778210116731518 0.000945834080958111 0.000871425124845891 43180 43922 667 665 0 True 533 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 576 431 0.00101599463486385 0.000949271783257641 0.000671396963454643 0.000625619897764553 0.00099080274308404 0.000987446074413769 44411 41370 667 665 0 True 578 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 621 430 0.00103148242770352 0.000954939419962128 0.000610360875867857 0.000625619897764553 0.00108814874234199 0.000913220412560129 45088 41617 667 665 0 True 623 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 665 431 0.000945533184426327 0.000980317582695581 0.000564583810177768 0.000564583810177768 0.000969576978686202 0.00101162282814147 41331 42723 667 665 0 True 668 429 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 268 476 0.000986460306125262 0.00100718722877232 0.000823987182421607 0.000854505226215 0.000788270048540079 0.000804902511317494 43120 43894 667 665 0 True 265 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 312 475 0.0010339073996991 0.00105693393474531 0.000930800335698482 0.000930800335698482 0.000820419242419737 0.000893680957100539 45194 46062 667 665 0 True 310 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 356 477 0.00106051346036755 0.00105519004652854 0.000961318379491875 0.000946059357595178 0.000843584498874598 0.000827984448193692 46357 45986 667 665 0 True 355 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 401 476 0.00104493415915068 0.00103206058175881 0.000854505226215 0.00080872816052491 0.000873978170484603 0.000920267050187768 45676 44978 667 665 0 True 399 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 445 476 0.00101201402045601 0.000971873492382823 0.000625619897764553 0.000503547722590982 0.00107668626721683 0.00111555583963178 44237 42355 667 665 0 True 444 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 490 475 0.000998585166103147 0.00107786059334649 0.00064087891966125 0.000778210116731518 0.00102291659869105 0.00105685534578572 43650 46974 667 665 0 True 489 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 532 474 0.00098506480337309 0.000939382101396774 0.000701915007248035 0.00064087891966125 0.000991321668007791 0.000897382288362257 43059 40939 667 665 0 True 534 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 578 474 0.000935307123275167 0.00105312491574553 0.000564583810177768 0.000595101853971161 0.000983456836949469 0.00114451411143159 40884 45896 667 665 0 True 578 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 622 474 0.000940408715303598 0.000901246019603828 0.00064087891966125 0.000595101853971161 0.000974613632509315 0.000875188800291554 41107 39277 667 665 0 True 623 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 666 474 0.000968318770347031 0.000983943034514645 0.000610360875867857 0.000579842832074464 0.000973098464726488 0.000989508221272637 42327 42881 667 665 0 True 668 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 269 520 0.00100586008208988 0.000982589226556893 0.000854505226215 0.00080872816052491 0.000793216048606251 0.000833155071970191 43968 42822 667 665 0 True 265 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 313 519 0.00105625832082814 0.00104367120593886 0.000961318379491875 0.000869764248111696 0.000794347915613885 0.000862643649613855 46171 45484 667 665 0 True 310 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 357 519 0.00106680466129947 0.00104674595621579 0.000976577401388571 0.000900282291905089 0.000802181247949759 0.000809853630990479 46632 45618 667 665 0 True 355 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 401 519 0.00104971547185894 0.00107005898816623 0.000854505226215 0.000778210116731518 0.000876161648384831 0.000942845430871099 45885 46634 667 665 0 True 400 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 445 519 0.00102388723239662 0.00112065469235001 0.00064087891966125 0.000701915007248035 0.00102238097511817 0.00116411963738213 44756 48839 667 665 0 True 444 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 489 516 0.0010078046351052 0.000948262163763724 0.000671396963454643 0.000610360875867857 0.00097459143024923 0.000917190812240787 44053 41326 667 665 0 True 489 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 534 517 0.000927391648648095 0.0010389902428307 0.000625619897764553 0.00080872816052491 0.000931671641782008 0.000896314327537007 40538 45280 667 665 0 True 534 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 577 516 0.000983852317375302 0.00100356177695326 0.000717174029144732 0.000732433051041428 0.00095152235165493 0.000921259992526316 43006 43736 667 665 0 True 578 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 621 515 0.000900007766773514 0.000924031295909722 0.000579842832074464 0.000534065766384375 0.000931074592425081 0.000981799430838228 39341 40270 667 665 0 True 623 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 666 515 0.000969256731213244 0.000970336117244358 0.000595101853971161 0.000625619897764553 0.00100137595784681 0.00100672454786203 42368 42288 667 665 0 True 668 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 269 561 0.00098344052967794 0.000958679601269138 0.000839246204318303 0.000793469138628214 0.000742905727449325 0.000760293257116624 42988 41780 667 665 0 True 265 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 312 560 0.00100615748431575 0.00101948622988003 0.000885023270008392 0.000930800335698482 0.000760398885024706 0.000736861488162231 43981 44430 667 665 0 True 310 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 357 561 0.00101235717687048 0.00113632674040331 0.000900282291905089 0.00105287251087205 0.000731614425180163 0.000739600985046302 44252 49522 667 665 0 True 355 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 401 560 0.00103443357286795 0.00104855868212532 0.000839246204318303 0.000900282291905089 0.000860491949621105 0.000827437322069513 45217 45697 667 665 0 True 400 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 445 560 0.00098245681462313 0.00104025226719809 0.000610360875867857 0.000656137941557946 0.000995652544111174 0.00109443012301521 42945 45335 667 665 0 True 444 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 489 558 0.00105410787396414 0.00101971568885592 0.000686655985351339 0.000686655985351339 0.00112292650876311 0.00112946419012533 46077 44440 667 665 0 True 489 561 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 533 558 0.000978842233724063 0.000916665662783647 0.000610360875867857 0.000595101853971161 0.00106044829316678 0.000944353047737276 42787 39949 667 665 0 True 534 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 577 557 0.00100133041741889 0.00101198292136842 0.000732433051041428 0.000701915007248035 0.000925330475501754 0.000873000798749692 43770 44103 667 665 0 True 579 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 622 558 0.000953746061279271 0.000948078596583012 0.000656137941557946 0.000579842832074464 0.000914421317461545 0.00095978002020496 41690 41318 667 665 0 True 623 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 665 558 0.00100025519398689 0.000931718171602042 0.000686655985351339 0.000625619897764553 0.000985123735404516 0.000898161497497438 43723 40605 667 665 0 True 668 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 266 605 0.00102718153397552 0.00103931148539694 0.000900282291905089 0.000915541313801785 0.000735867584522555 0.00075513834571693 44900 45294 667 665 0 False 266 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 310 605 0.00107138008015905 0.00109605669013458 0.000930800335698482 0.00100709544518196 0.000813578831104554 0.000734458523991978 46832 47767 667 665 0 False 310 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 355 604 0.00103948941070778 0.00105817301321512 0.000946059357595178 0.000930800335698482 0.000746850964445211 0.000836673521641154 45438 46116 667 665 0 True 355 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 400 604 0.000981335837002533 0.00101645737139828 0.000823987182421607 0.000839246204318303 0.000765483307321471 0.000796928123822143 42896 44298 667 665 0 True 400 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 445 604 0.000954272234448123 0.000993282014833375 0.000534065766384375 0.000625619897764553 0.000971165156737775 0.00106450139254129 41713 43288 667 665 0 False 445 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 489 604 0.00101199114336171 0.000980661771159416 0.000488288700694286 0.000503547722590982 0.00113844440753842 0.00107882753481311 44236 42738 667 665 0 False 489 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 534 604 0.000953311396487611 0.000934884705469327 0.000564583810177768 0.000488288700694286 0.00105900615310951 0.00107697276797471 41671 40743 667 665 0 False 534 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 579 604 0.00099430714946944 0.00100349293926049 0.000747692072938125 0.000671396963454643 0.000878197821426647 0.000999152644524626 43463 43733 667 665 0 False 579 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 623 604 0.000966282708954518 0.000957371685106564 0.000762951094834821 0.000762951094834821 0.000786062958964901 0.000768248696467186 42238 41723 667 665 0 False 623 604 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 668 603 0.000989434328383988 0.000976852752159639 0.000747692072938125 0.000701915007248035 0.000879211246340126 0.000853303364752429 43250 42572 667 665 0 False 668 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 267 653 0.00113184424038839 0.0752886794693302 0.00103761348897536 0.0742198825055314 0.000758547465911567 0.0216140103869966 49475 3281139 667 665 0 True 266 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 311 648 0.00103047583555441 0.00112377533442212 0.000930800335698482 0.00102235446707866 0.000700825524598769 0.000705918115316604 45044 48975 667 665 0 False 311 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 355 648 0.0010316883215522 0.000998421895893315 0.000930800335698482 0.000900282291905089 0.000684229631580625 0.000647779931050866 45097 43512 667 665 0 False 355 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 400 648 0.00099833351806587 0.000942961661420661 0.000869764248111696 0.000793469138628214 0.000739407167665245 0.000691705047621218 43639 41095 667 665 0 False 400 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 445 648 0.000997509942671146 0.00103603022204171 0.00080872816052491 0.00080872816052491 0.000838359100429522 0.000925736364218104 43603 45151 667 665 0 False 445 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 489 648 0.00105168290196856 0.00103598433024654 0.000762951094834821 0.000762951094834821 0.00097686259886743 0.000938186396321342 45971 45149 667 665 0 False 489 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 534 648 0.000975616563428059 0.000884036596412065 0.00064087891966125 0.000534065766384375 0.000945169196093801 0.000878203469309834 42646 38527 667 665 0 False 534 648 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 579 647 0.00103708731580651 0.000911296322747817 0.00080872816052491 0.000762951094834821 0.000845680616978322 0.000679532457903907 45333 39715 667 665 0 False 579 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 624 647 0.000973420362375461 0.00101531007651883 0.000778210116731518 0.000854505226215 0.000757693080665009 0.000792867302527098 42550 44248 667 665 0 False 624 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 665 653 0.00116270544059625 0.078898551023932 0.00100709544518196 0.0749217975127794 0.000815109622283413 0.0221936829069415 50824 3438460 667 665 0 True 668 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D11_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D11_1.csv new file mode 100755 index 0000000..69b099f --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D11_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 257 271 0.00972146108223069 0.0387131481714127 0.00970473792629892 0.03930724040589 0.00155804050798638 0.00706887877583538 424943 1687149 667 665 0 True 257 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 301 270 0.00962793952074089 0.00948613235996836 0.00958266575112535 0.00956740672922866 0.00137872891280245 0.00131558475085713 420855 413413 667 665 0 False 301 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 346 272 0.00982697024113258 0.0579273314896305 0.0098268101014725 0.0576485847257191 0.00130385120788363 0.00724553578377866 429555 2524518 667 665 0 True 346 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 390 272 0.0099615790639814 0.0797916283039941 0.00996414129854276 0.0789806973373007 0.00139542202069603 0.0131992711574725 435439 3477381 667 665 0 True 391 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 434 271 0.00998772758276389 0.0695773537758335 0.0100099183642329 0.0661936369878691 0.00168391854462922 0.0137322232333055 436582 3032235 667 665 0 True 435 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 477 270 0.0099485391202316 0.0630502325853544 0.00999465934233616 0.0666971847104601 0.00170465525896976 0.0180456368074461 434869 2747778 667 665 0 True 480 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 522 269 0.00972466387543239 0.0777179387011819 0.00976577401388571 0.0773479819943542 0.0015870464566201 0.0266174032800855 425083 3387008 667 665 0 True 525 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 567 269 0.00981088764384116 0.0638893181683896 0.0097962920576791 0.0638284885938811 0.00182028806513557 0.0186818983291719 428852 2784346 667 665 0 True 569 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 614 270 0.00999767911878348 0.00970244333654002 0.00993362325474937 0.0098268101014725 0.00223334673851406 0.00195964353615928 437017 422840 667 665 0 False 614 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 651 269 0.00997654068365222 0.0411580335595225 0.00999465934233616 0.0414129854276341 0.0017581325988871 0.00815293958086398 436093 1793699 667 665 0 True 659 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 257 314 0.0100710459601968 0.0100578982360915 0.0100251773861295 0.0100556954299229 0.00166728367991746 0.00154620029188651 440224 438331 667 665 0 False 257 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 301 314 0.00985922694409261 0.00990533096302211 0.00993362325474937 0.00988784618905928 0.00141263132584809 0.00146119743680876 430965 431682 667 665 0 False 301 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 346 316 0.00995785009761084 0.0947238776731254 0.00999465934233616 0.0917372396429389 0.00121009536170759 0.0183538750021943 435276 4128140 667 665 0 True 346 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 390 315 0.00994641155046189 0.0486184102967421 0.00994888227664607 0.048905165178912 0.001412848009258 0.00669753034634025 434776 2118828 667 665 0 True 391 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 434 315 0.0110379692277917 0.0716798634260176 0.00996414129854276 0.0698710612649729 0.00636381094246715 0.0145587055004907 482490 3123864 667 665 0 True 435 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 478 314 0.00990212149590117 0.0396145777581973 0.00997940032043946 0.0419012741283284 0.00184343806189043 0.00904872701266307 432840 1726434 667 665 0 True 480 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 522 314 0.00990212149590117 0.0431519861682129 0.00996414129854276 0.045838101777676 0.00172584982333268 0.00972657045779531 432840 1880597 667 665 0 True 525 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 567 313 0.00975456423767974 0.0497810330357824 0.00978103303578241 0.0514076447699702 0.00179590500764118 0.0116071430367829 426390 2169496 667 665 0 True 569 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 614 314 0.00968401127886503 0.0097933779286853 0.00970473792629892 0.0098115510795758 0.00198143925640632 0.00208736300375679 423306 426803 667 665 0 False 614 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 659 314 0.00968126602754928 0.00950084068032292 0.00967421988250553 0.00952162966353857 0.00192058214918754 0.00183679333734651 423186 414054 667 665 0 False 659 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 258 361 0.00997622040433205 0.0435054906664693 0.00997940032043946 0.0440375371938659 0.00151689267577644 0.00789636877800525 436079 1896003 667 665 0 True 257 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 303 361 0.00978039247714207 0.0565075081845148 0.0097962920576791 0.0600289921416037 0.00146786503428445 0.0151280269427463 427519 2462641 667 665 0 True 301 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 347 360 0.0100345341176974 0.0365238112447518 0.00999465934233616 0.0373846036469062 0.00146694955826499 0.00492839923234158 438628 1591736 667 665 0 True 346 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 391 360 0.0101451219915334 0.0332453702349258 0.0101167315175097 0.0337987335011826 0.00139058209618507 0.00427355887566491 443462 1448859 667 665 0 True 391 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 436 360 0.0099170144842891 0.0695183369272345 0.00994888227664607 0.0664835584039063 0.00162691915752243 0.0113146567955582 433491 3029663 667 665 0 True 435 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 479 359 0.00985186051972869 0.0300467350569144 0.00984206912336919 0.03076218814374 0.00168996674797856 0.00394077603425936 430643 1309460 667 665 0 True 480 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 523 357 0.00990189272495819 0.0278699724821323 0.00993362325474937 0.0283665217059586 0.00180304008255616 0.00394098520341127 432830 1214595 667 665 0 True 525 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 568 358 0.0097462827295439 0.0476838238879414 0.0098115510795758 0.0483710994125277 0.00191235485263296 0.00884289761343515 426028 2078098 667 665 0 True 569 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 612 358 0.00962604072191416 0.0541917393621385 0.00968947890440223 0.0552071412222477 0.00205733468446299 0.0114094743489767 420772 2361718 667 665 0 True 614 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 657 358 0.00950909301586332 0.0591935320103876 0.00949111161974517 0.0596475165941863 0.00198540826262053 0.0160591799201678 415660 2579700 667 665 0 True 659 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 259 404 0.00978199387374292 0.037299359637363 0.00971999694819562 0.0396276798657206 0.00163828681687474 0.0080702546941552 427589 1625535 667 665 0 True 257 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 303 405 0.00981967244805155 0.0296519508888954 0.00984206912336919 0.0297856107423514 0.00143950851870116 0.00411571193549729 429236 1292255 667 665 0 True 301 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 347 404 0.0101476613490005 0.076428103905908 0.0101930266269932 0.07519645990692 0.00148864490512062 0.0150941515268322 443573 3330796 667 665 0 True 346 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 392 404 0.0100024375543974 0.0635877631822748 0.00999465934233616 0.0622415503166247 0.00152165104400326 0.0148796040964432 437225 2771204 667 665 0 True 391 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 436 404 0.0101471122987373 0.0440949937214288 0.0101472495613031 0.0444800488288701 0.00169652562849788 0.00770621812797464 443549 1921694 667 665 0 True 435 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 481 403 0.0101261797574548 0.0513431667977451 0.0101319905394064 0.0519264515144579 0.00173272322362225 0.00832140354216293 442634 2237575 667 665 0 True 480 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 524 403 0.0101477071031891 0.0410871307359725 0.0102388036926833 0.0419317921721218 0.00167386792227102 0.00497694450576839 443575 1790609 667 665 0 True 525 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 568 403 0.00974408652849131 0.0497712580834095 0.00985732814526589 0.0504615854123751 0.00182044002724177 0.00754484926815063 425932 2169070 667 665 0 True 569 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 612 402 0.00995348057259994 0.0444232347864397 0.0100404364080262 0.0459601739528496 0.00196564813621587 0.00702440090053584 435085 1935999 667 665 0 True 614 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 656 402 0.00979093881761339 0.0817200703750679 0.0098115510795758 0.0797894254978256 0.00196993597340803 0.0180153923854765 427980 3561424 667 665 0 True 659 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 259 450 0.00986277289370879 0.0379577462768847 0.00993362325474937 0.0381628137636378 0.00156220714517138 0.00610340143276173 431120 1654228 667 665 0 True 257 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 304 449 0.010004016073904 0.0445187815040003 0.00999465934233616 0.0441138323033494 0.00156922696151569 0.00489683330013042 437294 1940163 667 665 0 True 301 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 347 448 0.0100184743975003 0.0321537879948211 0.00997940032043946 0.0328984512092775 0.00144031294021793 0.00346619871477103 437926 1401287 667 665 0 True 346 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 392 448 0.0102033441965216 0.0516177374082953 0.0101167315175097 0.0500343327992676 0.00159216303728005 0.0107096172343007 446007 2249541 667 665 0 True 391 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 436 449 0.0103620883538547 0.0920075652624351 0.0102998397802701 0.0918287937743191 0.00191504808354197 0.0156080633819751 452946 4009761 667 665 0 True 435 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 480 447 0.01032118410925 0.055940583892783 0.01025406271458 0.0573281452658885 0.00181073515806052 0.0121815434743623 451158 2437934 667 665 0 True 480 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 524 445 0.0101879021578705 0.0499120770569133 0.0102388036926833 0.0505073624780652 0.00179097767440149 0.00867556861357239 445332 2175207 667 665 0 True 525 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 568 446 0.00982751929139573 0.0320049379571612 0.00973525597009232 0.0323033493553063 0.00191029485780479 0.00390480026873146 429579 1394800 667 665 0 True 569 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 613 446 0.00977252275670359 0.0369789660693276 0.0097962920576791 0.0372320134279393 0.00192505680609587 0.00353548941529255 427175 1611572 667 665 0 True 614 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 657 446 0.00997473339320269 0.0652009745122706 0.010101472495613 0.0643015182726787 0.00206315190248742 0.0120725613683075 436014 2841509 667 665 0 True 659 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 260 493 0.00989281051852193 0.0474760487852729 0.00990310521095598 0.049256122682536 0.0015524206194211 0.0104553583368891 432433 2069043 667 665 0 True 257 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 304 492 0.0100949982779267 0.0496858534525832 0.0100404364080262 0.0491950865949493 0.00154793695481375 0.00660462562736484 441271 2165348 667 665 0 True 301 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 348 493 0.0102513860945471 0.0627313534465599 0.0101930266269932 0.0611276417181659 0.00158121003757523 0.0124025642186062 448107 2733881 667 665 0 True 346 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 393 492 0.0103854229900385 0.0826510772238447 0.0104676890211337 0.0785839627679866 0.00152564238322618 0.0168711998698068 453966 3601998 667 665 0 True 391 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 436 491 0.0104179542181301 0.0914095951712653 0.0104982070649271 0.0862745098039216 0.00188261692590416 0.0294731943547744 455388 3983701 667 665 0 True 435 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 480 490 0.0102126780509951 0.040426220047716 0.0101930266269932 0.0412603952086671 0.00183419077230338 0.00509590698206082 446415 1761806 667 665 0 True 480 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 523 490 0.0103421395276269 0.0399827676309107 0.0103303578240635 0.0409857328145266 0.00184274553244169 0.00524323701965927 452074 1742480 667 665 0 True 525 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 570 491 0.0102821786634721 0.0968944907473536 0.0102693217364767 0.0930647745479515 0.00177509935388387 0.0166212515037502 449453 4222737 667 665 0 True 569 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 614 490 0.010104309255306 0.0612388604837798 0.0100709544518196 0.0643015182726787 0.00184182024564429 0.0152933677000026 441678 2668837 667 665 0 True 614 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 658 489 0.0099213840093 0.0757055605367275 0.00994888227664607 0.0718242160677501 0.00192031968127997 0.015619142564465 433682 3299307 667 665 0 True 659 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 260 537 0.00981905476650551 0.0471392259545637 0.00971999694819562 0.0505836575875486 0.00154172167826894 0.00952676203543803 429209 2054364 667 665 0 True 257 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 305 536 0.0100318574976645 0.0914310266396135 0.0100709544518196 0.0837109941252766 0.00151176848283344 0.022179005705615 438511 3984635 667 665 0 True 301 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 348 536 0.0100279683916339 0.0513859608967486 0.00999465934233616 0.0534676127260243 0.00159292317545672 0.00938626931408068 438341 2239440 667 665 0 True 346 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 393 535 0.0104204478214086 0.0534214685259727 0.0104982070649271 0.0533913176165408 0.00154344641803307 0.00518115347767432 455497 2328149 667 665 0 True 391 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 438 536 0.0105611190742464 0.0528912576703833 0.0105439841306172 0.0528419928282597 0.00190782121922607 0.00679339467475058 461646 2305042 667 665 0 True 435 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 480 533 0.0102698250325512 0.0591249696683916 0.0102693217364767 0.0589456015869383 0.00184187296548813 0.0111878196132332 448913 2576712 667 665 0 True 480 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 524 533 0.0102452779103696 0.0697327433943063 0.0101930266269932 0.0685435263599603 0.00189598403334336 0.0158637331953891 447840 3039007 667 665 0 True 525 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 568 533 0.0102822701718493 0.0544532996487557 0.0103456168459602 0.0559548332951858 0.00177487232436518 0.0108878350222391 449457 2373117 667 665 0 True 569 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 613 532 0.00996180783492438 0.0479143154292231 0.00993362325474937 0.0471656366826886 0.00174982685973213 0.00552803564319681 435449 2088143 667 665 0 True 614 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 657 532 0.00984602686068273 0.0685910243679696 0.00984206912336919 0.0685893034256504 0.00190006878885574 0.0160914067021526 430388 2989250 667 665 0 True 659 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 260 579 0.00972319974139733 0.0402760391479959 0.00967421988250553 0.0412756542305638 0.00145573957215201 0.0069815114200506 425019 1755261 667 665 0 True 257 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 304 579 0.00989402300451971 0.0477021347142174 0.00971999694819562 0.0476081483176928 0.00211342672441647 0.0100286138988208 432486 2078896 667 665 0 True 302 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 348 578 0.0100319947602303 0.0391991652282457 0.00999465934233616 0.039810788128481 0.00145342491872917 0.00642506046846031 438517 1708330 667 665 0 True 346 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 393 578 0.0102149200062363 0.0451066554002309 0.0102082856488899 0.0437170977340352 0.00148769681494523 0.00626340007514061 446513 1965783 667 665 0 True 391 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 436 577 0.0102207536652823 0.0797738911251578 0.0101930266269932 0.0747692072938125 0.00182781321102334 0.0170242124025168 446768 3476608 667 665 0 True 436 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 480 576 0.0101348044220051 0.0553466981713841 0.0102998397802701 0.0552681773098344 0.00198733387874186 0.00892318233467631 443011 2412052 667 665 0 True 480 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 524 575 0.00994240805895976 0.048689542579268 0.00999465934233616 0.0492408636606394 0.00214554870872754 0.00687341979003878 434601 2121928 667 665 0 True 525 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 569 576 0.00983415364874212 0.0351509352461034 0.00993362325474937 0.0369115739681086 0.00181446022613511 0.00719786186269281 429869 1531905 667 665 0 True 570 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 613 575 0.00975943705876519 0.0454336803326696 0.00976577401388571 0.0459449149309529 0.0016611863023156 0.00628644634983086 426603 1980035 667 665 0 True 614 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 657 574 0.00974900510376535 0.0533448751198206 0.00985732814526589 0.0534676127260243 0.00173435413606751 0.00798504839229837 426147 2324811 667 665 0 True 659 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 257 618 0.00941925466655548 0.00930646598184635 0.00944533455405508 0.00929274433508812 0.00135321141347741 0.00138787730473994 411733 405583 667 665 0 False 257 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 302 618 0.00966641879334995 0.00940263223864193 0.00952162966353857 0.009399557488365 0.00209722685243111 0.00140218655003915 422537 409774 667 665 0 False 302 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 348 621 0.00970295351294369 0.0601733677292338 0.00975051499198901 0.0583199816891737 0.00148625644318957 0.010261831077503 424134 2622402 667 665 0 True 346 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 392 621 0.00991335414920143 0.0651461338170329 0.00985732814526589 0.0637064164187076 0.00148978875956585 0.0141637907925923 433331 2839119 667 665 0 True 391 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 436 618 0.00984007881616527 0.00974643062221817 0.0097962920576791 0.00976577401388571 0.00179849550459846 0.00188609028754607 430128 424757 667 665 0 False 436 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 480 618 0.00986110286582504 0.00954891233577191 0.0100099183642329 0.00949111161974517 0.00196014716172174 0.00198745717240338 431047 416149 667 665 0 False 480 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 525 618 0.00964566926882176 0.00973222711161057 0.00962844281681544 0.00964370183871214 0.00193344150931663 0.00207143878004842 421630 424138 667 665 0 False 525 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 570 618 0.0095354245514002 0.00950244689315415 0.00944533455405508 0.00946059357595178 0.00180154588519033 0.00186984416791406 416811 414124 667 665 0 False 570 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 614 618 0.00967394535737396 0.00965251306338632 0.00973525597009232 0.00958266575112535 0.00149918319542784 0.00138339565438123 422866 420664 667 665 0 False 614 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 659 618 0.00966360491075131 0.00961545543878006 0.00961318379491875 0.00967421988250553 0.00162428122556371 0.00160902426614616 422414 419049 667 665 0 False 659 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 259 667 0.00924303240917879 0.0358851121853615 0.00926222629129473 0.0365148393987945 0.00132362355571484 0.00708577876487864 404030 1563901 667 665 0 True 257 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 302 662 0.00944645553167568 0.0093247538622248 0.00941481651026169 0.00929274433508812 0.0012981430557615 0.0013087926417056 412922 406380 667 665 0 False 302 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 346 662 0.0093484043055149 0.00941247602870761 0.0093842984664683 0.0093842984664683 0.00135305619046277 0.00131097029977546 408636 410203 667 665 0 False 346 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 391 662 0.00952249899312189 0.00950336472905771 0.00952162966353857 0.00949111161974517 0.00137067422949446 0.00130235526481765 416246 414164 667 665 0 False 391 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 436 662 0.0108451381999547 0.00964696015616978 0.00962844281681544 0.00965896086060884 0.0084540199428214 0.00157372219301923 474061 420422 667 665 0 False 436 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 480 662 0.00947175759796916 0.00937571670077001 0.00947585259784848 0.00943007553215839 0.00166502795175318 0.00153774378415335 414028 408601 667 665 0 False 480 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 525 662 0.00930049967005511 0.00942144787466492 0.00930800335698482 0.009399557488365 0.00169998496396725 0.00176342250311191 406542 410594 667 665 0 False 525 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 570 662 0.00944908639751994 0.00956010993379535 0.00950637064164187 0.00953688868543526 0.00156689295084631 0.00150533344213293 413037 416637 667 665 0 False 570 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 614 662 0.00963272083344915 0.00960600172897338 0.00961318379491875 0.00958266575112535 0.00132598540191711 0.00142225631379978 421064 418637 667 665 0 False 614 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 655 666 0.00978091865031092 0.040873320862238 0.0098268101014725 0.0409399557488365 0.00150776020941475 0.00665410969581349 427542 1781291 667 665 0 True 659 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D11_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D11_2.csv new file mode 100755 index 0000000..2267d00 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D11_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 257 271 0.00833357640246025 0.737797480655174 0.00819409475852598 0.74508278019379 0.00193090184131553 0.180471152695052 364276 32153786 667 665 8 True 257 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 301 270 0.00690721245008075 0.00657074134179578 0.00683604180972 0.00656137941557946 0.0015136889638605 0.00135921813640944 301927 286358 667 665 0 False 301 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 346 272 0.00627591903293032 0.00629871772587798 0.00625619897764553 0.0063782711528191 0.00127691891371806 0.00132920398455128 274332 274503 667 665 0 True 346 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 390 272 0.00650889936126009 0.00641982617335281 0.00650034332799268 0.00642404821850919 0.0013318282371394 0.00122625681673619 284516 279781 667 665 0 True 391 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 434 271 0.00660308435848452 0.00654178361903844 0.00659189745937285 0.00656137941557946 0.00153546328535568 0.0016138970120384 288633 285096 667 665 0 True 435 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 477 270 0.00671056094749604 0.00681653779676933 0.00669871061264973 0.00679026474402991 0.00156455262096628 0.00168240341667479 293331 297070 667 665 0 True 480 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 522 269 0.00680161178280166 0.0069244064613353 0.00686655985351339 0.00689707789730678 0.00161820064386129 0.00162190797093937 297311 301771 667 665 0 True 525 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 567 269 0.00707979724946407 0.00724863199426812 0.00703440909437705 0.0072327763790341 0.0016891354645064 0.00154197318968725 309471 315901 667 665 0 True 569 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 614 270 0.0101663061808533 0.00793480611577008 0.00854505226215 0.00787365529869535 0.00934252359893531 0.00192870320396231 444388 345805 667 665 0 False 614 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 651 269 0.00956068086350508 0.74410411471572 0.00950637064164187 0.724177920195315 0.00199860085759987 0.179162518935035 417915 32428634 667 665 12 True 659 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 257 314 0.00709537655068094 0.00667450269069332 0.00711070420386053 0.0068055237659266 0.00153572135741452 0.0014336716390332 310152 290880 667 665 0 False 257 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 301 314 0.00656778500198287 0.00643829762091197 0.00657663843747616 0.00643930724040589 0.00128689766616686 0.00130137036715648 287090 280586 667 665 0 False 301 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 346 316 0.00644692531280709 0.00683920834358728 0.0063782711528191 0.00677500572213321 0.001252359260978 0.0014043705559821 281807 298058 667 665 0 True 346 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 390 315 0.00652598855070062 0.00641661374769035 0.00654612039368277 0.0063935301747158 0.00130251883770665 0.00127611138427052 285263 279641 667 665 0 True 391 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 434 315 0.00756392231899614 0.0070529034878338 0.00662241550316625 0.00668345159075303 0.00538386172599089 0.00377035593730358 330633 307371 667 665 0 True 435 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 478 314 0.0067957323695671 0.00665125849643564 0.00672922865644312 0.00668345159075303 0.00171836927288333 0.00158398178904346 297054 289867 667 665 0 True 480 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 522 314 0.00685594488175917 0.0068249589411845 0.00692759594110018 0.00675974670023652 0.00159404409777583 0.00152104325357533 299686 297437 667 665 0 True 525 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 567 313 0.007051223758686 0.00701274816705302 0.00695811398489357 0.00698863202868696 0.00167944767845296 0.00150408249688944 308222 305621 667 665 0 True 569 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 614 314 0.00758824067023481 0.00717639830865789 0.00762951094834821 0.00732433051041428 0.00206283270256853 0.00203138421222621 331696 312753 667 665 0 False 614 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 659 314 0.00770713292930097 0.00763380183119736 0.00770580605783169 0.00759899290455482 0.00191797570723113 0.00177816997551976 336893 332687 667 665 0 False 659 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 258 361 0.00658425650987736 0.00625108204248318 0.00665293354695964 0.00624093995574884 0.00148211100343189 0.00151966216874805 287810 272427 667 665 0 True 257 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 303 361 0.00639609240927717 0.00634786783851366 0.0063935301747158 0.00631723506523232 0.00135328591438602 0.0013691674193092 279585 276645 667 665 0 True 301 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 347 360 0.00692315778480638 0.00714856493488241 0.00689707789730678 0.00691233691920348 0.00142591637865272 0.00188124069922929 302624 311540 667 665 0 True 346 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 391 360 0.00687340010470846 0.00686348510323646 0.00679026474402991 0.00694285496299687 0.00133043292098064 0.00130050911431567 300449 299116 667 665 0 True 391 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 436 360 0.00677251211885474 0.00692348862543174 0.00685130083161669 0.00698863202868696 0.00159043738528043 0.0016792716392034 296039 301731 667 665 0 True 435 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 479 359 0.00690938577403905 0.00679944310306552 0.00694285496299687 0.0068055237659266 0.00155069852279975 0.00159967392926655 302022 296325 667 665 0 True 480 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 523 357 0.00673561136575223 0.0069296381259856 0.00677500572213321 0.00691233691920348 0.00173297534026991 0.00165693302410985 294426 301999 667 665 0 True 525 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 568 358 0.0071622005431251 0.00714071743790697 0.0072327763790341 0.00718699931334401 0.00182588809732525 0.00173712388269018 313073 311198 667 665 0 True 569 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 612 358 0.00697142845377494 0.00716141463753226 0.00703440909437705 0.00717174029144732 0.00205841640370935 0.00207760182611415 304734 312100 667 665 0 True 614 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 657 358 0.00671682927133366 0.00642317627440081 0.00666819256885634 0.00642404821850919 0.00194402853834148 0.00195347851286001 293605 279927 667 665 0 True 659 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 259 404 0.0062847724684236 0.00641535172332296 0.0064087891966125 0.00642404821850919 0.00150638817884359 0.00150707794262199 274719 279586 667 665 0 True 257 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 303 405 0.00655129061699409 0.00677475331725973 0.00663767452506294 0.0068055237659266 0.00131224069239105 0.00142901283455974 286369 295249 667 665 0 True 301 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 347 404 0.00689771845594712 0.00689081366726498 0.00688181887541009 0.00691233691920348 0.00136214100201036 0.00123232753302557 301512 300307 667 665 0 True 346 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 392 404 0.00699544940278773 0.00707068655846529 0.00694285496299687 0.00708018616006714 0.00139298477007781 0.00150396939455499 305784 308146 667 665 0 True 391 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 436 404 0.0070132020279629 0.00702183474249827 0.00700389105058366 0.00706492713817044 0.0016237465835555 0.00164842243041013 306560 306017 667 665 0 True 435 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 481 403 0.00712184534878361 0.00697548402936845 0.00718699931334401 0.00691233691920348 0.00159650893484494 0.00156128271034868 311309 303997 667 665 0 True 480 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 524 403 0.00688529619374337 0.00703824105927442 0.00691233691920348 0.00708018616006714 0.00156288566070402 0.00171564421134487 300969 306732 667 665 0 True 525 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 568 403 0.00696941526947673 0.00689687138422848 0.00694285496299687 0.00692759594110018 0.00181834670817227 0.00166179684558781 304646 300571 667 665 0 True 569 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 612 402 0.00655131349408839 0.00656229725148302 0.00656137941557946 0.00648508430609598 0.001869280697567 0.00190710737798706 286370 285990 667 665 0 True 614 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 656 402 0.00606117174875597 0.00622391409973779 0.00611886778057527 0.00628671702143893 0.00193489304634215 0.00176310783679629 264945 271243 667 665 0 True 659 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 259 450 0.00653754148332105 0.00650605685649234 0.00654612039368277 0.00656137941557946 0.0015262476139032 0.00161155319018816 285768 283539 667 665 0 True 257 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 304 449 0.00658222044848484 0.00684737708312897 0.00657663843747616 0.00677500572213321 0.00144436280198274 0.00156966162057467 287721 298414 667 665 0 True 301 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 347 448 0.00686559901555288 0.00697929304836823 0.00692759594110018 0.00701915007248035 0.00139228071854662 0.00144335265415455 300108 304163 667 665 0 True 346 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 392 448 0.00684949354116716 0.0068976744906441 0.00688181887541009 0.00689707789730678 0.001488983260296 0.00147459381441354 299404 300606 667 665 0 True 391 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 436 449 0.00700533230752442 0.00704200418647901 0.00715648126955062 0.00698863202868696 0.00177280079607313 0.00199106250979365 306216 306896 667 665 0 True 435 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 480 447 0.00706945680284143 0.00721731084405911 0.00708018616006714 0.0072632944228275 0.00177323868680216 0.00193706429956989 309019 314536 667 665 0 True 480 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 524 445 0.00677779672763755 0.00700412050955955 0.00695811398489357 0.00703440909437705 0.00179033697464914 0.001699846846477 296270 305245 667 665 0 True 525 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 568 446 0.00636818235423373 0.00633079609070743 0.00636301213092241 0.0064087891966125 0.00187029610735685 0.0019277757603242 278365 275901 667 665 0 True 569 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 613 446 0.00607190110598169 0.00616627400499417 0.00607309071488518 0.00611886778057527 0.00185385528349997 0.00178081058936376 265414 268731 667 665 0 True 614 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 657 446 0.0061707072762543 0.00630874508312438 0.00617990386816205 0.00645456626230259 0.00181819384775038 0.00191611782607004 269733 274940 667 665 0 True 659 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 260 493 0.00652129874636955 0.00639040953264369 0.00656137941557946 0.0064087891966125 0.00134688037490533 0.00144088618641562 285058 278499 667 665 0 True 257 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 304 492 0.00661999053117067 0.00663833995609303 0.00668345159075303 0.00665293354695964 0.00152371438941024 0.00152762534110071 289372 289304 667 665 0 True 301 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 348 493 0.00673531396352636 0.00695655366385752 0.00668345159075303 0.00689707789730678 0.00157538441095473 0.00150756342936304 294413 303172 667 665 0 True 346 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 393 492 0.00692880842709796 0.00694453001352087 0.00688181887541009 0.00686655985351339 0.00155534742015445 0.00147385541966344 302871 302648 667 665 0 True 391 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 436 491 0.00711775034890428 0.00700721820573407 0.00704966811627375 0.00700389105058366 0.00182310265424104 0.00179904147769552 311130 305380 667 665 0 True 435 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 480 490 0.00681984482695709 0.00669031241413215 0.0068055237659266 0.00668345159075303 0.00180345568006406 0.00179812702872144 298108 291569 667 665 0 True 480 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 523 490 0.00661127435824317 0.00628476662014386 0.00665293354695964 0.00628671702143893 0.00173527270854175 0.00163242314640086 288991 273895 667 665 0 True 525 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 570 491 0.00611426948462139 0.00636230080809715 0.00608834973678187 0.00645456626230259 0.00179259759702751 0.00184903124002875 267266 277274 667 665 0 True 569 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 614 490 0.00620591512437876 0.00642482837902722 0.00622568093385214 0.0063782711528191 0.00175405010560665 0.00188589868969125 271272 279999 667 665 0 True 614 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 658 489 0.00618139087929141 0.00623690147777317 0.00622568093385214 0.0063782711528191 0.001802866202736 0.00173049165503936 270200 271809 667 665 0 True 659 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 260 537 0.00649579078622739 0.00656131057788669 0.00651560234988937 0.00654612039368277 0.00147436026429729 0.00151733088259534 283943 285947 667 665 0 True 257 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 305 536 0.00660976447001951 0.00655520696912802 0.00659189745937285 0.00656137941557946 0.00139314886025295 0.00142654379644642 288925 285681 667 665 0 True 301 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 348 536 0.00662605296115961 0.00676798427747097 0.00663767452506294 0.00679026474402991 0.00150382010162039 0.00136521871287764 289637 294954 667 665 0 True 346 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 393 535 0.0069795498222507 0.00687502688972374 0.00694285496299687 0.00679026474402991 0.00143445230403856 0.00157914913423004 305089 299619 667 665 0 True 391 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 438 536 0.00681076262052082 0.00660561910613109 0.00688181887541009 0.00665293354695964 0.00170801974823561 0.00201498586529516 297711 287878 667 665 0 True 435 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 480 533 0.00666805530629055 0.00675219749992973 0.00668345159075303 0.00683604180972 0.0018413784904668 0.00193090991581573 291473 294266 667 665 0 True 480 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 524 533 0.00650128128885889 0.00654726768856222 0.00650034332799268 0.00654612039368277 0.00188116378715244 0.00177892001120114 284183 285335 667 665 0 True 525 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 568 533 0.00646703427869494 0.00646890744829572 0.0064087891966125 0.00642404821850919 0.00164567675923403 0.00174059370449875 282686 281920 667 665 0 True 569 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 613 532 0.00634034093047319 0.00622024275612354 0.0063782711528191 0.00624093995574884 0.00165477480732803 0.00170790239387566 277148 271083 667 665 0 True 614 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 657 532 0.00624977051414782 0.0064735425196087 0.00631723506523232 0.00656137941557946 0.00168516327980271 0.00190655293232838 273189 282122 667 665 0 True 659 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 260 579 0.00663508941340728 0.00650486366981771 0.00671396963454643 0.00645456626230259 0.00129639133891172 0.00117618395140771 290032 283487 667 665 0 True 257 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 304 579 0.00679872926892013 0.00680327506796288 0.00679026474402991 0.0068055237659266 0.00134115315058161 0.00144539395512842 297185 296492 667 665 0 True 302 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 348 578 0.0067414450247982 0.00685265463957445 0.00675974670023652 0.0068055237659266 0.00134519549638545 0.00143142506381613 294681 298644 667 665 0 True 346 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 393 578 0.00655964075641282 0.00662471009292515 0.00656137941557946 0.00665293354695964 0.00131598462422984 0.00127662063368642 286734 288710 667 665 0 True 391 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 436 577 0.00669967145061024 0.00664531550896009 0.00675974670023652 0.00663767452506294 0.00180950066787173 0.0020702740541735 292855 289608 667 665 0 True 436 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 480 576 0.00657018709688415 0.00692151527823909 0.00653086137178607 0.00691233691920348 0.00196093866337693 0.00190822291327707 287195 301645 667 665 0 True 480 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 524 575 0.00675132792953489 0.00650591918110681 0.00686655985351339 0.00642404821850919 0.00205322461069391 0.00181544536436481 295113 283533 667 665 0 True 525 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 569 576 0.00648959109367266 0.00673774158444865 0.00642404821850919 0.00677500572213321 0.00163614094190334 0.00179179676792522 283672 293636 667 665 0 True 570 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 613 575 0.00649803274146859 0.00638453538286091 0.00657663843747616 0.00636301213092241 0.00160943741395984 0.00159421474200209 284041 278243 667 665 0 True 614 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 657 574 0.00634491634933277 0.00639334660753509 0.00634775310902571 0.0063782711528191 0.00156445592163144 0.00156265083540667 277348 278627 667 665 0 True 659 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 257 618 0.00687571069123255 0.00683062657788899 0.00686655985351339 0.0068207827878233 0.00138523914730077 0.00125081357936862 300550 297684 667 665 0 False 257 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 302 618 0.00673201966194747 0.00659926309249893 0.00669871061264973 0.00656137941557946 0.00140512914132046 0.00130827854966623 294269 287601 667 665 0 False 302 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 348 621 0.00639943246504466 0.00657042009922953 0.0063935301747158 0.00656137941557946 0.00143875294798191 0.00138865187609677 279731 286344 667 665 0 True 346 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 392 621 0.00645053989370616 0.00646771426162109 0.00643930724040589 0.00646982528419928 0.00138086144858503 0.00132476112817129 281965 281868 667 665 0 True 391 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 436 618 0.00640958989491292 0.00630461482155836 0.00650034332799268 0.00627145799954223 0.00184781220882932 0.0017797321991739 280175 274760 667 665 0 False 436 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 480 618 0.00658306690097387 0.00650839733804642 0.00663767452506294 0.00653086137178607 0.00179214226639323 0.00186640762448506 287758 283641 667 665 0 False 480 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 525 618 0.00649620257392476 0.00665015709335137 0.00646982528419928 0.00663767452506294 0.00185038635930737 0.00199758285864652 283961 289819 667 665 0 False 525 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 570 618 0.00644095439119534 0.00652028331299753 0.00648508430609598 0.00659189745937285 0.00167816879423969 0.00175288481234368 281546 284159 667 665 0 False 570 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 614 618 0.00646371710002174 0.00645741155360362 0.00646982528419928 0.00648508430609598 0.00139333096355644 0.00141741643936748 282541 281419 667 665 0 False 614 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 659 618 0.00675931203544486 0.00648099993632513 0.0068055237659266 0.00643930724040589 0.00153145014642712 0.00154641655753766 295462 282447 667 665 0 False 659 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 259 667 0.00833007620703267 0.720408735273753 0.00831616693369955 0.725627527275502 0.00163116696060494 0.18900055095256 364123 31395971 667 665 8 True 257 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 302 662 0.00718631300051508 0.00678255492244 0.00708018616006714 0.00672922865644312 0.00154193404281466 0.00132878858744425 314127 295589 667 665 0 False 302 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 346 662 0.00630577364098907 0.00624933815426642 0.00634775310902571 0.00628671702143893 0.00130716416053002 0.00120996906654405 275637 272351 667 665 0 False 346 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 391 662 0.00615345794715368 0.00602511084302654 0.00630197604333562 0.00604257267109178 0.00126161347294825 0.00135559049602586 268979 262579 667 665 0 False 391 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 436 662 0.00667706888144392 0.00616372701036179 0.00634775310902571 0.00614938582436866 0.00260078057437625 0.00149168147854163 291867 268620 667 665 0 False 436 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 480 662 0.00599793946011659 0.00632712474709319 0.00599679560540169 0.00631723506523232 0.00161321052781906 0.00145565684207506 262181 275741 667 665 0 False 480 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 525 662 0.00631453556810517 0.00625590068097688 0.00636301213092241 0.00624093995574884 0.00174665747400539 0.00164350327716479 276020 272637 667 665 0 False 525 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 570 662 0.00663586723461341 0.00652836026894887 0.00666819256885634 0.00650034332799268 0.00149873208421932 0.00145169849505471 290066 284511 667 665 0 False 570 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 614 662 0.00743544455741916 0.0069791553729827 0.00715648126955062 0.00704966811627375 0.00210230775201011 0.00139220574539329 325017 304157 667 665 0 False 614 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 655 666 0.00862878242728029 0.785828292406457 0.00862134737163348 0.780529488059815 0.00173593776637037 0.153698442155739 377180 34247006 667 665 14 True 659 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D11_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D11_3.csv new file mode 100755 index 0000000..2cfd752 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D11_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 257 271 0.00109963329161695 0.0739642422604922 0.000930800335698482 0.0743572137026017 0.000833934643882236 0.0192130126236298 48067 3223419 667 665 0 True 257 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 301 270 0.000946677039141221 0.00104045878027639 0.000823987182421607 0.000946059357595178 0.000695867281335978 0.000682234064199915 41381 45344 667 665 0 False 301 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 346 272 0.000984813155335814 0.000937661159077598 0.000869764248111696 0.000793469138628214 0.000706853434307062 0.000736221887872922 43048 40864 667 665 0 True 346 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 390 272 0.00101375267962265 0.00095021256505879 0.000900282291905089 0.000839246204318303 0.000724711373733282 0.000665207916617287 44313 41411 667 665 0 True 391 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 434 271 0.000956674329349402 0.000960997136925628 0.000778210116731518 0.000747692072938125 0.000793787422183456 0.000786708297010899 41818 41881 667 665 0 True 435 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 477 270 0.00104918929869009 0.000972470085720137 0.000823987182421607 0.000762951094834821 0.00092456723539382 0.000901361622369617 45862 42381 667 665 0 True 480 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 522 269 0.00100428156258332 0.00102969715430715 0.000839246204318303 0.000839246204318303 0.000834665212107167 0.00086698920766932 43899 44875 667 665 0 True 525 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 567 269 0.000971567317737332 0.000963635915148365 0.000717174029144732 0.000747692072938125 0.000886851370904193 0.000843275979590809 42469 41996 667 665 0 True 569 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 614 270 0.00122779077387376 0.00103405687484906 0.000762951094834821 0.000717174029144732 0.00139620814173544 0.00101337708881938 53669 45065 667 665 0 False 614 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 651 269 0.00119075275820547 0.0761343046331783 0.000900282291905089 0.072632944228275 0.00105892618053059 0.0213564710824905 52050 3317992 667 665 0 True 659 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 257 314 0.000958390111421744 0.00104479555492072 0.00080872816052491 0.000885023270008392 0.000762119616727539 0.000784827000612916 41893 45533 667 665 0 False 257 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 301 314 0.00088646452694916 0.000947367273757752 0.000762951094834821 0.000854505226215 0.000681834883329069 0.00065510860144351 38749 41287 667 665 0 False 301 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 346 316 0.000952556452375781 0.00107434987101537 0.000854505226215 0.000976577401388571 0.000652382286302541 0.000744669176632655 41638 46821 667 665 0 True 346 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 390 315 0.0010142788527915 0.000982015579117168 0.000885023270008392 0.000854505226215 0.000740671603852005 0.000681676398084859 44336 42797 667 665 0 True 391 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 434 315 0.00110748013496113 0.000999431515387232 0.000823987182421607 0.000686655985351339 0.00104300296394258 0.000954055931644825 48410 43556 667 665 0 True 435 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 478 314 0.00104353865639851 0.000983759467333933 0.00080872816052491 0.00080872816052491 0.000913869077923856 0.000885173924339767 45615 42873 667 665 0 True 480 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 522 314 0.000978659216969679 0.00109206410395409 0.000778210116731518 0.000869764248111696 0.000845489967992163 0.000954733323801121 42779 47593 667 665 0 True 525 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 567 313 0.00103516563988548 0.000934655246493437 0.000793469138628214 0.000732433051041428 0.000957230818657901 0.000817551552314207 45249 40733 667 665 0 True 569 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 614 314 0.00106028468942457 0.000959597437172698 0.000717174029144732 0.000488288700694286 0.00108530918076909 0.00106791492470008 46347 41820 667 665 0 False 614 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 659 314 0.00110224128036691 0.00108201380081011 0.000747692072938125 0.000701915007248035 0.00104994066555501 0.00102577480554697 48181 47155 667 665 0 False 659 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 258 361 0.000973145837243887 0.00102556689274112 0.000823987182421607 0.000854505226215 0.00078681751851095 0.000849225397496432 42538 44695 667 665 0 True 257 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 303 361 0.000869901510677483 0.000926601236439691 0.000762951094834821 0.000839246204318303 0.000632065638084645 0.000673061252796233 38025 40382 667 665 0 True 301 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 347 360 0.000985751116202027 0.00100482380132065 0.000900282291905089 0.000885023270008392 0.000708402984672908 0.000748790155388633 43089 43791 667 665 0 True 346 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 391 360 0.000951687122792461 0.00104474966312554 0.000778210116731518 0.000930800335698482 0.000760748344468601 0.00074554813636221 41600 45531 667 665 0 True 391 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 436 360 0.000939745279568959 0.00100909173827221 0.000671396963454643 0.000747692072938125 0.000875131589116471 0.000935321848967093 41078 43977 667 665 0 True 435 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 479 359 0.0010947604705315 0.00103749875948741 0.000747692072938125 0.000717174029144732 0.000982090353457718 0.000951766582161723 47854 45215 667 665 0 True 480 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 523 357 0.000944938379974581 0.000982703956044838 0.000671396963454643 0.000747692072938125 0.000876056847571716 0.000873161415896436 41305 42827 667 665 0 True 525 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 568 358 0.000992454104831311 0.000956866875359605 0.000732433051041428 0.00064087891966125 0.000955606997115893 0.000999471040910875 43382 41701 667 665 0 True 569 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 612 358 0.000952144664678418 0.00103848543308374 0.000518806744487678 0.000579842832074464 0.00104344287087718 0.00114137640674716 41620 45258 667 665 0 True 614 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 657 358 0.000984927540807303 0.000940712963456937 0.000564583810177768 0.000457770656900893 0.00103423956382615 0.00106387072741231 43053 40997 667 665 0 True 659 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 259 404 0.00101093879702401 0.000985273896574809 0.000839246204318303 0.00080872816052491 0.000836557099634924 0.000831310287822405 44190 42939 667 665 0 True 257 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 303 405 0.000989571590949776 0.000940804747047293 0.000869764248111696 0.00080872816052491 0.000729688927943686 0.000747011614435279 43256 41001 667 665 0 True 301 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 347 404 0.00106225211953419 0.000996769791266906 0.000961318379491875 0.000900282291905089 0.000754148910189165 0.000715840092988185 46433 43440 667 665 0 True 346 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 392 404 0.00103889460625604 0.00103589254665618 0.000900282291905089 0.000885023270008392 0.000790734418357007 0.00082801761791204 45412 45145 667 665 0 True 391 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 436 404 0.00100224550119081 0.000999546244875177 0.000747692072938125 0.000778210116731518 0.000867119249945569 0.000875830845150859 43810 43561 667 665 0 True 435 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 481 403 0.000983920948658196 0.000962236215395435 0.000732433051041428 0.000686655985351339 0.00091796964557581 0.000893685992571298 43009 41935 667 665 0 True 480 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 524 403 0.000977400976783295 0.000929102339276894 0.000732433051041428 0.000656137941557946 0.000905100933372451 0.000917934839217897 42724 40491 667 665 0 True 525 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 568 403 0.000966351340237412 0.000927083100289061 0.000686655985351339 0.000686655985351339 0.000974044309217325 0.000853228015829265 42241 40403 667 665 0 True 569 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 612 402 0.000963377317978685 0.00098945004993601 0.000625619897764553 0.000610360875867857 0.00101364194865558 0.00105429763978245 42111 43121 667 665 0 True 614 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 656 402 0.000980237736476234 0.000899593914977418 0.000549324788281071 0.000579842832074464 0.00104773228131636 0.000908064196448778 42848 39205 667 665 0 True 659 401 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 259 450 0.000970011675325075 0.00101404805215144 0.000823987182421607 0.000869764248111696 0.000802521595682498 0.000860985191797343 42401 44193 667 665 0 True 257 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 304 449 0.000916296257913616 0.00097168992520211 0.00080872816052491 0.000823987182421607 0.000754351947252394 0.000803304652227438 40053 42347 667 665 0 True 301 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 347 448 0.000977423853877593 0.00101618202062721 0.000869764248111696 0.000839246204318303 0.000745700501723846 0.000868387851677516 42725 44286 667 665 0 True 346 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 392 448 0.00100764449544511 0.00103545657460199 0.000823987182421607 0.000930800335698482 0.000809057898221414 0.000817703820916504 44046 45126 667 665 0 True 391 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 436 449 0.00101462200920597 0.00104920116725781 0.000732433051041428 0.000686655985351339 0.000959862169828845 0.00104701708036712 44351 45725 667 665 0 True 435 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 480 447 0.000982937233603386 0.00104025226719809 0.000686655985351339 0.000732433051041428 0.000973645829142283 0.00104328773206077 42966 45335 667 665 0 True 480 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 524 445 0.0010078046351052 0.00102563573043389 0.000747692072938125 0.000747692072938125 0.00095587319932811 0.000949211434238782 44053 44698 667 665 0 True 525 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 568 446 0.000949719692682841 0.000959895733841356 0.000625619897764553 0.000625619897764553 0.000960294287244382 0.00101930139510066 41514 41833 667 665 0 True 569 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 613 446 0.000985133434655984 0.000988991131984229 0.00064087891966125 0.00064087891966125 0.000959278936613137 0.000991794392252078 43062 43101 667 665 0 True 614 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 657 446 0.000952396312715695 0.00085893378444968 0.000503547722590982 0.000366216525520714 0.00104294562108247 0.00106221097866024 41631 37433 667 665 0 True 659 444 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 260 493 0.000963766228581749 0.000962970484118284 0.00080872816052491 0.00080872816052491 0.000791197939906141 0.000747889944471352 42128 41967 667 665 0 True 257 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 304 492 0.000900831342168238 0.000984447844261604 0.000747692072938125 0.000885023270008392 0.000756913535368696 0.000833155767117368 39377 42903 667 665 0 True 301 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 348 493 0.00103413617064208 0.00101345145881412 0.000869764248111696 0.000900282291905089 0.000845709749507916 0.000819577337179268 45204 44167 667 665 0 True 346 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 393 492 0.000930525810566907 0.000953929800468211 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.000796804337185602 0.000848776197570671 40675 41573 667 665 0 True 391 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 436 491 0.000993941115960674 0.00100569574542903 0.000732433051041428 0.00064087891966125 0.000972377449079587 0.0010596979757939 43447 43829 667 665 0 True 435 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 480 490 0.00105683024818559 0.00102471789453033 0.000778210116731518 0.000686655985351339 0.000972292868682466 0.000998731535230694 46196 44658 667 665 0 True 480 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 523 490 0.000992271088076928 0.000984814978623028 0.000717174029144732 0.000671396963454643 0.000965839854617143 0.000924546732282023 43374 42919 667 665 0 True 525 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 570 491 0.000944160558768453 0.000981235418599141 0.000595101853971161 0.000686655985351339 0.000921889938454415 0.000971320659191509 41271 42763 667 665 0 True 569 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 614 490 0.000870176035809058 0.000986237624273547 0.000503547722590982 0.000671396963454643 0.000931243617155671 0.000915434699458771 38037 42981 667 665 0 True 614 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 658 489 0.000939905419229044 0.000940345829095513 0.000549324788281071 0.000534065766384375 0.0010064963919546 0.000999666912279872 41085 40981 667 665 0 True 659 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 260 537 0.00104303536032396 0.000993006664062307 0.000900282291905089 0.00080872816052491 0.000799868887307676 0.000829788873020152 45593 43276 667 665 0 True 257 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 305 536 0.00099115011045633 0.000964071887202557 0.000854505226215 0.000823987182421607 0.000792558955283268 0.000779744482333671 43325 42015 667 665 0 True 301 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 348 536 0.000960357541531363 0.000954273988932046 0.000839246204318303 0.000839246204318303 0.000794438042097097 0.000762037133675811 41979 41588 667 665 0 True 346 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 393 535 0.000855832097684278 0.000978826099352295 0.00064087891966125 0.000793469138628214 0.000757522943710587 0.000833541354863716 37410 42658 667 665 0 True 391 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 438 536 0.00095223617305561 0.00100262099515211 0.000534065766384375 0.000518806744487678 0.000995620766160309 0.00111065571868634 41624 43695 667 665 0 True 435 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 480 533 0.000970583602682522 0.0010126712982961 0.000595101853971161 0.00064087891966125 0.000992762352464527 0.00104592277377189 42426 44133 667 665 0 True 480 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 524 533 0.000948713100533734 0.000943718876041098 0.000534065766384375 0.000473029678797589 0.000989499648398565 0.0010167608037074 41470 41128 667 665 0 True 525 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 568 533 0.00100437307096051 0.000983805359129111 0.000747692072938125 0.00064087891966125 0.000914093530135601 0.000976232755840407 43903 42875 667 665 0 True 569 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 613 532 0.000881706091335198 0.000845349813076982 0.000595101853971161 0.000595101853971161 0.000875135914112453 0.000841735812861181 38541 36841 667 665 0 True 614 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 657 532 0.000968318770347031 0.000929790716204565 0.000564583810177768 0.0004272526131075 0.000974435260151618 0.00106946567365323 42327 40521 667 665 0 True 659 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 260 579 0.00101411871313142 0.0010231116816991 0.000900282291905089 0.000915541313801785 0.000733523119140776 0.000667042249630382 44329 44588 667 665 0 True 257 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 304 579 0.000973900781355717 0.000959620383070287 0.00080872816052491 0.000854505226215 0.000774606813490967 0.00076074872745782 42571 41821 667 665 0 True 302 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 348 578 0.00097811016670653 0.00105147281111912 0.000839246204318303 0.000915541313801785 0.000729697052065957 0.000768570366351189 42755 45824 667 665 0 True 346 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 393 578 0.000994467289129525 0.000971735816997288 0.000854505226215 0.000869764248111696 0.000736390385736757 0.000655470316823769 43470 42349 667 665 0 True 391 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 436 577 0.00101116756796699 0.000945577493745809 0.000625619897764553 0.000518806744487678 0.00102123552297553 0.00107663394970125 44200 41209 667 665 0 True 436 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 480 576 0.00106659876745079 0.000971919384178001 0.000579842832074464 0.000625619897764553 0.00113888386712122 0.000982747036455912 46623 42357 667 665 0 True 480 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 524 575 0.00097495312769342 0.000939886911143733 0.000518806744487678 0.000518806744487678 0.00105471671952796 0.00103816778576076 42617 40961 667 665 0 True 525 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 569 576 0.000949010502759607 0.000938533103185981 0.000610360875867857 0.000595101853971161 0.00095605221891771 0.000971783966753721 41483 40902 667 665 0 True 570 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 613 575 0.000903690978955475 0.000952461263022514 0.000671396963454643 0.000686655985351339 0.000795527544232624 0.00083021806912105 39502 41509 667 665 0 True 614 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 657 574 0.00100213111571932 0.000891654634411618 0.000701915007248035 0.000686655985351339 0.000919013269339448 0.000826217438325584 43805 38859 667 665 0 True 659 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 257 618 0.000895295085348148 0.00100250626566416 0.000762951094834821 0.000839246204318303 0.000705711970827173 0.000725325938523479 39135 43690 667 665 0 False 257 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 302 618 0.00100320633915132 0.00100069353975463 0.000854505226215 0.000885023270008392 0.000750154000483441 0.000728611660055508 43852 43611 667 665 0 False 302 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 348 621 0.00105152276230848 0.00104415306978823 0.000915541313801785 0.000930800335698482 0.000754023413571241 0.000814168787916134 45964 45505 667 665 0 True 346 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 392 621 0.00102539712062028 0.00097871136986435 0.000885023270008392 0.000900282291905089 0.000757758737245455 0.000663749450014684 44822 42653 667 665 0 True 391 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 436 618 0.000927437402836691 0.000972745436491205 0.000595101853971161 0.000625619897764553 0.000932007838586857 0.00096897622218473 40540 42393 667 665 0 False 436 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 480 618 0.00101334089192529 0.00100055586436909 0.000625619897764553 0.000488288700694286 0.0010578819934317 0.00108367392483456 44295 43605 667 665 0 False 480 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 525 618 0.00100929164623456 0.000940506450378636 0.000625619897764553 0.000473029678797589 0.00105464336367684 0.00102763464448181 44118 40988 667 665 0 False 525 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 570 618 0.00101414159022572 0.000836768047378689 0.000762951094834821 0.000488288700694286 0.000942224427014645 0.000885796853557727 44330 36467 667 665 0 False 570 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 614 618 0.000953036871356036 0.00100418131618816 0.00080872816052491 0.00080872816052491 0.000765670346339177 0.000785290181176452 41659 43763 667 665 0 False 614 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 659 618 0.00105683024818559 0.000986903055303629 0.000869764248111696 0.000793469138628214 0.00083794226365715 0.000828096042799127 46196 43010 667 665 0 False 659 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 259 667 0.00106787988473147 0.0726420308037202 0.000961318379491875 0.0726634622720684 0.000695060388354364 0.0201793740378996 46679 3165796 667 665 0 True 257 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 302 662 0.00101631491418402 0.000938739616264282 0.000915541313801785 0.000823987182421607 0.000664743024324581 0.000651585524945158 44425 40911 667 665 0 False 302 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 346 662 0.000949262150796884 0.00105335437472142 0.000823987182421607 0.000915541313801785 0.000684638723189557 0.00073142903842765 41494 45906 667 665 0 False 346 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 391 662 0.000935421508746657 0.000981396039882264 0.000823987182421607 0.000823987182421607 0.000694254341168325 0.000708430751795933 40889 42770 667 665 0 False 391 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 436 662 0.000931212123395844 0.000962809862835161 0.000717174029144732 0.000778210116731518 0.000824926199938758 0.000777814007211133 40705 41960 667 665 0 False 436 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 480 662 0.0010382082934271 0.00102503913709658 0.00080872816052491 0.000823987182421607 0.000892221382189062 0.000838979450291696 45382 44672 667 665 0 False 480 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 525 662 0.000963400195072983 0.000940988314228005 0.000656137941557946 0.000579842832074464 0.000943510771422202 0.00091905248441794 42112 41009 667 665 0 False 525 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 570 662 0.000979231144327127 0.000891539904923673 0.000823987182421607 0.000686655985351339 0.000780939999557733 0.000710161189605334 42804 38854 667 665 0 False 570 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 614 662 0.0010556177621878 0.00100856398262766 0.000915541313801785 0.00080872816052491 0.000742175479044845 0.000768110665490108 46143 43954 667 665 0 False 614 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 655 666 0.00105271237121197 0.0806476020676548 0.000885023270008392 0.0781719691767758 0.000772418587603788 0.0195487849943702 46016 3514685 667 665 0 True 659 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D12_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D12_1.csv new file mode 100755 index 0000000..83c5b96 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D12_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 232 241 0.00940404139884738 0.0369696500349064 0.00929274433508812 0.0368657969024186 0.00183287344823584 0.0065310437027027 411068 1611166 667 665 0 True 231 241 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 276 241 0.00962416480018173 0.00969032790261302 0.00959792477302205 0.00976577401388571 0.00152897932448054 0.00154933665855717 420690 422312 667 665 0 False 276 241 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 319 242 0.0096745859160143 0.0539376364922377 0.00965896086060884 0.0532234683756771 0.0013842708083337 0.00554326061434478 422894 2350644 667 665 0 True 321 241 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 364 242 0.00994563372925577 0.0813356118609639 0.00987258716716258 0.0785687037460899 0.00138066301268229 0.0128625214026397 434742 3544669 667 665 0 True 365 241 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 408 241 0.00992474694216179 0.0693571190507741 0.00988784618905928 0.0679636835278859 0.00141152772806329 0.0108837416605106 433829 3022637 667 665 0 True 410 241 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 452 240 0.0100141963808666 0.0599331471273744 0.0100099183642329 0.0631265735866331 0.00153451564891502 0.0149093768243809 437739 2611933 667 665 0 True 455 241 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 497 240 0.0099745961306369 0.0754428300093332 0.00985732814526589 0.0762035553521019 0.00165595502124975 0.0178520205806012 436008 3287857 667 665 0 True 500 241 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 541 240 0.00976641457252605 0.0651372308087683 0.0097962920576791 0.0642099641412985 0.00151669208048522 0.0161687490857792 426908 2838731 667 665 0 True 544 241 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 589 240 0.00957303449442594 0.0094835394735408 0.00956740672922866 0.00950637064164187 0.00179823865933749 0.00197484996495353 418455 413300 667 665 0 False 589 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 628 240 0.00972265069113418 0.0412203775632719 0.00971999694819562 0.0410009918364233 0.001792867810615 0.00733329864094755 424995 1796416 667 665 0 True 634 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 231 285 0.00968014504992869 0.00956341414304817 0.00970473792629892 0.00962844281681544 0.00172048304779544 0.00161691055736509 423137 416781 667 665 0 False 231 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 276 285 0.00958337494104859 0.00962029702317134 0.00956740672922866 0.00962844281681544 0.0014393425781821 0.00139316348181757 418907 419260 667 665 0 False 276 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 320 285 0.00987611023968446 0.103110947430375 0.00985732814526589 0.104005493247883 0.0013346709238502 0.0205850204997632 431703 4493655 667 665 0 True 321 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 364 286 0.00999891448187556 0.0454005464565511 0.00997940032043946 0.0448767833981842 0.00136806846061319 0.00525579905876435 437071 1978591 667 665 0 True 366 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 407 285 0.0101085643948454 0.0742992753111894 0.0101625085831998 0.0749065384908827 0.00145410555399815 0.0125144402476508 441864 3238020 667 665 0 True 410 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 452 284 0.00958417563934901 0.0409707032516058 0.00961318379491875 0.0415655756466011 0.00179013962173238 0.00800796517180568 418942 1785535 667 665 0 True 455 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 497 284 0.00974669451724127 0.0412827445129188 0.0097962920576791 0.0433051041428244 0.00166125619594538 0.00659687556765255 426046 1799134 667 665 0 True 500 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 541 284 0.00960110468912946 0.0477112671814579 0.00958266575112535 0.0496833752956435 0.00156007560692999 0.0080076023979238 419682 2079294 667 665 0 True 544 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 589 284 0.00954915080797893 0.00948411312098052 0.00953688868543526 0.00952162966353857 0.00180974082456749 0.00201228783838341 417411 413325 667 665 0 False 589 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 634 284 0.00948040513961376 0.00948773857279959 0.00946059357595178 0.00955214770733196 0.00192432435046129 0.00195834233664697 414406 413483 667 665 0 False 634 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 232 330 0.00950639351873617 0.0389684671738857 0.00950637064164187 0.0388647287708858 0.00157699374758654 0.00579416186351677 415542 1698276 667 665 0 True 232 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 276 331 0.00967945873709975 0.0508295687720101 0.00973525597009232 0.0529945830472267 0.00150363824914185 0.0137579181252563 423107 2215192 667 665 0 True 276 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 320 330 0.00967234396077311 0.0349631230743373 0.00962844281681544 0.0357824063477531 0.00127162516597956 0.00470531512222685 422796 1523720 667 665 0 True 321 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 363 330 0.00962283792871246 0.0309980031332623 0.00962844281681544 0.0316929884794385 0.00138178454951865 0.00418149347764542 420632 1350917 667 665 0 True 366 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 409 330 0.00968623035701193 0.0633405211357531 0.00968947890440223 0.0615091172655833 0.00153304164493552 0.00828439840692825 423403 2760429 667 665 0 True 410 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 452 328 0.00958058393554424 0.0329467752696 0.00964370183871214 0.03247119859617 0.00163325100505739 0.00643843280292438 418785 1435846 667 665 0 True 455 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 497 328 0.00983552627439999 0.0286794119654825 0.00993362325474937 0.028702220187686 0.0016888329652721 0.00356251991256524 429929 1249871 667 665 0 True 500 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 541 328 0.00954260795900974 0.0492597710802527 0.00955214770733196 0.048706797894255 0.0015540998763317 0.00903323702708729 417125 2146779 667 665 0 True 544 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 585 327 0.0098278624478102 0.0536720606735424 0.0098268101014725 0.0547798886091402 0.0021053393972902 0.01022682813638 429594 2339070 667 665 0 True 589 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 631 329 0.00941479363316739 0.0594285668393919 0.00943007553215839 0.0587319752803845 0.00197492780643402 0.0140568206693419 411538 2589943 667 665 0 True 634 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 231 375 0.00971727457397417 0.0332531947860037 0.00973525597009232 0.0348516060120546 0.00164858470686469 0.00635604726727546 424760 1449200 667 665 0 True 232 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 275 374 0.00981511990628627 0.0268955519951171 0.00976577401388571 0.0271457999542229 0.00147998579287997 0.00341700619728254 429037 1172129 667 665 0 True 276 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 320 375 0.00954553622707987 0.068966304523038 0.00962844281681544 0.0675669489585718 0.00142830426370541 0.0111872820441667 417253 3005605 667 665 0 True 321 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 364 375 0.00969005083175968 0.0569111953607984 0.00978103303578241 0.0567940794995041 0.00140969717496838 0.0113967862698704 423570 2480234 667 665 0 True 366 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 409 374 0.00959616323676111 0.0406150188930784 0.00958266575112535 0.0414129854276341 0.00160598552822117 0.00591892779022946 419466 1770034 667 665 0 True 411 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 453 373 0.00956161882437129 0.049941401914032 0.00952162966353857 0.0498512245365072 0.00178072642473968 0.0074900300895947 417956 2176485 667 665 0 True 455 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 498 372 0.00955882781886695 0.039530733448407 0.00950637064164187 0.0400396734569314 0.00178449658221709 0.00428135789157975 417834 1722780 667 665 0 True 500 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 541 372 0.00980251462732813 0.0495662823802468 0.00978103303578241 0.0489814602883955 0.00168452870677568 0.00713490286247802 428486 2160137 667 665 0 True 545 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 586 373 0.00968693954693516 0.0406922777302606 0.00971999694819562 0.0410925459678035 0.0018925662902162 0.00607890743374061 423434 1773401 667 665 0 True 589 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 629 374 0.00966074527396407 0.0831350520957922 0.00976577401388571 0.0820630197604334 0.00188572602576442 0.0150446960793796 422289 3623090 667 665 0 True 634 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 232 418 0.00952924773593977 0.0339203008666092 0.00952162966353857 0.0344701304646372 0.00162797544316757 0.00484388568197813 416541 1478273 667 665 0 True 232 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 277 418 0.00962931214639876 0.0381736442272998 0.00968947890440223 0.0375677119096666 0.00152175532433512 0.00494247789324831 420915 1663637 667 665 0 True 277 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 320 419 0.00973086356798712 0.0310108298900146 0.0098115510795758 0.0313878080415045 0.0013595855859383 0.00322225878691397 425354 1351476 667 665 0 True 321 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 364 418 0.00970526409946778 0.0483777078310333 0.00968947890440223 0.0465857938506142 0.00144210362461496 0.00988694958123016 424235 2108338 667 665 0 True 366 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 410 419 0.00982438512947692 0.0835476422803404 0.00990310521095598 0.0837720302128633 0.00161833826823607 0.0116779513944264 429442 3641071 667 665 0 True 411 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 452 416 0.00989333669169078 0.059362849788697 0.00997940032043946 0.057251850156405 0.00167384688410014 0.0161232765726055 432456 2587079 667 665 0 True 455 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 498 416 0.00985206641357737 0.0491288417886098 0.00984206912336919 0.0486152437628748 0.00174503423548862 0.0062873559518187 430652 2141073 667 665 0 True 500 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 541 416 0.00966465725708901 0.0321265741602805 0.00968947890440223 0.0322880903334096 0.00170718135326429 0.0038163927921453 422460 1400101 667 665 0 True 545 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 586 415 0.00959449320887736 0.0359791903654765 0.00952162966353857 0.0365148393987945 0.001793804728597 0.00412780452810236 419393 1568001 667 665 0 True 589 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 629 419 0.0095636091315752 0.0674192462157912 0.00956740672922866 0.0669108110170138 0.00194071784810691 0.0131967202794828 418043 2938183 667 665 0 True 634 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 234 463 0.00935998011522964 0.0403513246379854 0.00935378042267491 0.0413061722743572 0.00158978292434565 0.00753206058343731 409142 1758542 667 665 0 True 232 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 278 464 0.00960268320863601 0.0435372936805277 0.00965896086060884 0.0437018387121385 0.00163883984943887 0.00379615132094871 419751 1897389 667 665 0 True 277 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 321 463 0.00987103152475033 0.0554102124159105 0.00991836423285267 0.0541542687113756 0.00153600183934168 0.00944151717935522 431481 2414820 667 665 0 True 321 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 366 463 0.00994064652269883 0.0721171204504739 0.00993362325474937 0.069062333104448 0.00148259269625109 0.0123103840586474 434524 3142920 667 665 0 True 366 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 410 462 0.00999838830870671 0.0870491633065268 0.00999465934233616 0.0815899900816358 0.00180028452763094 0.0244172318135987 437048 3793670 667 665 0 True 411 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 454 462 0.010044485653717 0.0416294799713865 0.0101625085831998 0.0415350576028077 0.00193167412469477 0.00537454051386363 439063 1814245 667 665 0 True 455 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 500 461 0.00989187255765571 0.0369988831084349 0.00991836423285267 0.0379186694132906 0.00186709409091597 0.00522660494084743 432392 1612440 667 665 0 True 500 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 543 461 0.00985568099447644 0.0911222436957581 0.00985732814526589 0.0896467536430915 0.00180075691831929 0.0136846304545511 430810 3971178 667 665 0 True 545 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 588 460 0.00964653859840508 0.0590401157391074 0.00965896086060884 0.0609903105210956 0.00197376174604726 0.012809667456784 421668 2573014 667 665 0 True 590 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 631 461 0.00948907555835266 0.0691567554730268 0.00950637064164187 0.0671396963454643 0.00178983165233646 0.00898660577701807 414785 3013905 667 665 0 True 634 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 234 506 0.00931864120583334 0.0397811879205911 0.00929274433508812 0.0415960936903944 0.00147125499478604 0.00740890830024785 407335 1733695 667 665 0 True 232 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 278 507 0.00954233343387816 0.0858137332344365 0.00950637064164187 0.0811474784466316 0.00147020141371047 0.0172729813724234 417113 3739829 667 665 0 True 277 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 321 508 0.0096441136264095 0.0473786893418027 0.00955214770733196 0.0488899061570153 0.00153992926492776 0.00876280661943836 421562 2064800 667 665 0 True 321 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 366 506 0.00991381169108739 0.0517252618843974 0.00988784618905928 0.0507362478065156 0.00159152418689707 0.00630018443215275 433351 2254227 667 665 0 True 366 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 410 507 0.00989228434535307 0.0490024098928943 0.00985732814526589 0.0487525749599451 0.00179230850328032 0.00506567890752662 432410 2135563 667 665 0 True 411 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 455 506 0.00997379543233647 0.0569483906607902 0.0100709544518196 0.0561532005798428 0.00192452528042688 0.00915278852634552 435973 2481855 667 665 0 True 456 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 498 505 0.0100025519398689 0.0652284178057871 0.00991836423285267 0.0640115968566415 0.00186884803060421 0.0138026768091316 437230 2842705 667 665 0 True 500 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 542 504 0.00974774686357897 0.0526551214382948 0.00968947890440223 0.0532997634851606 0.00171423143050886 0.0106173972853659 426092 2294751 667 665 0 True 545 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 586 504 0.00962432493984182 0.0473143031531679 0.00971999694819562 0.0459296559090562 0.00191590195033543 0.00620633382959483 420697 2061994 667 665 0 True 590 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 630 505 0.00945029888351773 0.0610669957108381 0.00952162966353857 0.0618600747692073 0.00181814169058515 0.00982709183609718 413090 2661347 667 665 0 True 634 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 234 548 0.00918082958978282 0.0382190312127308 0.00915541313801785 0.0383611810482948 0.00139395846002889 0.00646521692077182 401311 1665615 667 665 0 True 232 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 279 550 0.00937613134380395 0.0442389562829023 0.00935378042267491 0.0448310063324941 0.00138233049351481 0.00738245380043877 409848 1927968 667 665 0 True 277 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 322 549 0.009635397453482 0.0388928833872275 0.00967421988250553 0.0384069581139849 0.00133725736247298 0.0072244622579199 421181 1694982 667 665 0 True 322 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 366 547 0.00974381200335973 0.0435528739449907 0.00970473792629892 0.0418402380407416 0.00138959220388848 0.00621081010438612 425920 1898068 667 665 0 True 366 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 410 550 0.00989898733398236 0.0742695833197092 0.00985732814526589 0.0702220187685969 0.00179114808232714 0.0132964357376813 432703 3236726 667 665 0 True 411 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 455 546 0.00989233009954167 0.0520803496495875 0.00990310521095598 0.0518959334706645 0.00200900692532709 0.00785185640549913 432412 2269702 667 665 0 True 456 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 499 548 0.00986988767003543 0.0468330358971358 0.00985732814526589 0.0467689021133745 0.00199507012795675 0.0048380327775409 431431 2041020 667 665 0 True 500 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 542 546 0.00952737181420734 0.0335790035858701 0.00950637064164187 0.0342565041580835 0.00187820185199666 0.00530326398012007 416459 1463399 667 665 0 True 545 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 587 545 0.00942765056016281 0.0421775427353001 0.00950637064164187 0.042374303807126 0.0017728695266394 0.00435761365920762 412100 1838130 667 665 0 True 590 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 630 547 0.00940998944336484 0.050848728596497 0.00946059357595178 0.0501411459525444 0.00184650492535523 0.00606114575363111 411328 2216027 667 665 0 True 634 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 232 590 0.00903087023666011 0.0090573194258248 0.00901808194094758 0.00910963607232776 0.00137628741023013 0.00128640427384302 394756 394725 667 665 0 False 232 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 277 589 0.00930303902752217 0.00928085836013701 0.00927748531319142 0.00929274433508812 0.00137089941948828 0.00137137097022497 406653 404467 667 665 0 False 277 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 321 592 0.00948383670375844 0.0554402027040593 0.00953688868543526 0.0532845044632639 0.00151464821210267 0.00789459511723656 414556 2416127 667 665 0 True 322 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 365 591 0.00958623457783582 0.0588529689983714 0.00962844281681544 0.0570229648279545 0.0014636938389772 0.0118068964055261 419032 2564858 667 665 0 True 366 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 411 589 0.00947866648044712 0.00948454909303472 0.00955214770733196 0.00950637064164187 0.00172905682654098 0.00157500511913428 414330 413344 667 665 0 False 411 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 456 589 0.00960261457735312 0.00961573078955113 0.00962844281681544 0.00965896086060884 0.00199801124582556 0.00183362446126098 419748 419061 667 665 0 False 456 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 500 589 0.00958877393530289 0.00939329325832319 0.00959792477302205 0.0093690394445716 0.00208642605882054 0.00212226123222114 419143 409367 667 665 0 False 500 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 545 589 0.00933765207119489 0.00932172500374305 0.0093690394445716 0.0093842984664683 0.00196074737933991 0.00178098643502954 408166 406248 667 665 0 False 545 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 590 589 0.00925682729704042 0.00946713315676465 0.00924696726939803 0.00953688868543526 0.00163786946657738 0.00170963324397571 404633 412585 667 665 0 False 590 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 635 588 0.00935901927726912 0.00928856818172692 0.0093690394445716 0.00930800335698482 0.0015736147737161 0.00149935906181356 409100 404803 667 665 0 False 635 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 234 639 0.00900632311447847 0.0346475481447955 0.0089417868314641 0.0347447928587778 0.00131018707208886 0.00545473514753969 393683 1509967 667 665 0 True 232 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 277 633 0.00929221816191927 0.00917583498687208 0.00917067215991455 0.00929274433508812 0.00200352272774516 0.00131327669931617 406180 399890 667 665 0 False 277 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 322 633 0.0093158273232347 0.00933567610947717 0.00904859998474098 0.00932326237888151 0.00217751486432942 0.00137359250385907 407212 406856 667 665 0 False 322 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 366 633 0.00914880165776576 0.00915171884850602 0.00915541313801785 0.00917067215991455 0.00134947532525112 0.00127482472756424 399911 398839 667 665 0 False 366 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 411 633 0.0090874681679531 0.00919754180599129 0.00907911802853437 0.00923170824750134 0.0015258542914165 0.00141220658675156 397230 400836 667 665 0 False 411 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 456 632 0.00938146170677536 0.00934703432878374 0.00927748531319142 0.00926222629129473 0.00182643199932112 0.00173961202745498 410081 407351 667 665 0 False 456 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 501 632 0.00919036933810504 0.009332280116634 0.00927748531319142 0.00927748531319142 0.00187202328654745 0.00183979575068477 401728 406708 667 665 0 False 501 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 545 632 0.00922333523098831 0.00942885939958617 0.00918593118181125 0.00950637064164187 0.00181015933876286 0.00189845401688712 403169 410917 667 665 0 False 545 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 590 632 0.00924127087291786 0.00932252811015867 0.00926222629129473 0.00923170824750134 0.00146941135928257 0.00144614505489853 403953 406283 667 665 0 False 590 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 630 637 0.00949834078154331 0.039269219053585 0.00953688868543526 0.0391851682307164 0.00147071219887487 0.0075730206740494 415190 1711383 667 665 0 True 635 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D12_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D12_2.csv new file mode 100755 index 0000000..909a151 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D12_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 232 241 0.00808437621427327 0.692836141624374 0.00805676356145571 0.675303273060197 0.00196296435430021 0.155308537126899 353383 30194336 667 665 6 True 231 241 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 276 241 0.00697785691727265 0.00687023119712763 0.00695811398489357 0.00691233691920348 0.00165147871473879 0.00136924727276781 305015 299410 667 665 0 False 276 241 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 319 242 0.00648579349601921 0.00661649546158828 0.00653086137178607 0.00665293354695964 0.00126899802510571 0.00119490303238639 283506 288352 667 665 0 True 321 241 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 364 242 0.00648943095401258 0.0064509867022787 0.00656137941557946 0.00642404821850919 0.00124461438395058 0.00119343108606564 283665 281139 667 665 0 True 365 241 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 408 241 0.00657155972254202 0.00708413285445245 0.00656137941557946 0.00695811398489357 0.00151976520559085 0.00162189410803248 287255 308732 667 665 0 True 410 241 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 452 240 0.00668617396497448 0.0066996055026557 0.00669871061264973 0.00669871061264973 0.00152296282837457 0.00144659631555781 292265 291974 667 665 0 True 455 241 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 497 240 0.00684276767544358 0.00682759771940724 0.00679026474402991 0.00686655985351339 0.001606965569611 0.00149839736640579 299110 297552 667 665 0 True 500 241 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 541 240 0.00702004227915797 0.00710187003328876 0.00701915007248035 0.00706492713817044 0.00144764864828557 0.00146648457948276 306859 309505 667 665 0 True 544 241 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 589 240 0.00825952324821796 0.00750264308057854 0.00759899290455482 0.00762951094834821 0.00418463151521517 0.00188416840483457 361039 326971 667 665 0 False 589 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 628 240 0.00906582643674729 0.748911417936005 0.00914015411612116 0.721599145494774 0.0019580861791697 0.155557077421692 396284 32638140 667 665 11 True 634 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 231 285 0.00648867600990075 0.00627127443236152 0.00643930724040589 0.00634775310902571 0.00172671690696235 0.00150965627654771 283632 273307 667 665 0 False 231 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 276 285 0.00621298414651681 0.00631845119780454 0.00625619897764553 0.00634775310902571 0.00141597854826529 0.00137688875645975 271581 275363 667 665 0 False 276 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 320 285 0.00624425713442203 0.00638274560284896 0.00625619897764553 0.0064087891966125 0.00127204916277643 0.0011937063081223 272948 278165 667 665 0 True 321 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 364 286 0.00655042128741077 0.00665378254517043 0.00654612039368277 0.00663767452506294 0.001328776525684 0.00134594541234892 286331 289977 667 665 0 True 366 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 407 285 0.00661562100615977 0.00625537292533233 0.00656137941557946 0.00624093995574884 0.0016250237514674 0.00144363961848377 289181 272614 667 665 0 True 410 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 452 284 0.0064924736075542 0.00647129382164498 0.00660715648126955 0.00648508430609598 0.00162520159184818 0.00175387232083516 283798 282024 667 665 0 True 455 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 497 284 0.00674242873985301 0.0070434956698223 0.00672922865644312 0.00711070420386053 0.00148797272635262 0.00162379754333501 294724 306961 667 665 0 True 500 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 541 284 0.00689167890305248 0.00697139965959761 0.00689707789730678 0.00701915007248035 0.00154979943704391 0.00153949001203029 301248 303819 667 665 0 True 544 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 589 284 0.00724037157434101 0.00727607528778458 0.00718699931334401 0.00729381246662089 0.00180495867607888 0.00199431910283495 316490 317097 667 665 0 False 589 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 634 284 0.00776967890511142 0.00759908468814517 0.00776684214541848 0.00753795681696803 0.00192885028212817 0.00189793230327082 339627 331174 667 665 0 False 634 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 232 330 0.0061314959366277 0.00611634373184047 0.00608834973678187 0.00611886778057527 0.00140401515412332 0.0014000608052014 268019 266555 667 665 0 True 232 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 276 331 0.00606043968173844 0.00592162484490007 0.00610360875867857 0.00601205462729839 0.00134859821050867 0.00137245523374907 264913 258069 667 665 0 True 276 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 320 330 0.00600409339848272 0.00617182691221072 0.0059510185397116 0.00616464484626535 0.00123877757285961 0.00117300351020397 262450 268973 667 665 0 True 321 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 363 330 0.00637733319195289 0.00620188603805233 0.0063782711528191 0.00621042191195544 0.00132488792113544 0.00129308863584286 278765 270283 667 665 0 True 366 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 409 330 0.00630495006559435 0.00642207487131654 0.00634775310902571 0.00651560234988937 0.00145474527949406 0.00136877557996435 275601 279879 667 665 0 True 410 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 452 328 0.00668866756825295 0.00678030622447627 0.00662241550316625 0.00674448767833982 0.00170845212570662 0.00165488028828029 292374 295491 667 665 0 True 455 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 497 328 0.00659741083909865 0.00678294500269901 0.00668345159075303 0.00679026474402991 0.00153414677443643 0.00157237248917551 288385 295606 667 665 0 True 500 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 541 328 0.00686024577548717 0.0069856261161028 0.00692759594110018 0.00694285496299687 0.00143747610707597 0.00146357927517902 299874 304439 667 665 0 True 544 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 585 327 0.00699320744754654 0.00715703197109276 0.00703440909437705 0.00720225833524071 0.00189986355259236 0.00210612435424996 305686 311909 667 665 0 True 589 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 631 329 0.00716387057100884 0.00760417867740994 0.0072480354009308 0.0072480354009308 0.00196763882889016 0.00309149515289905 313146 331396 667 665 0 True 634 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 231 375 0.00585232675491048 0.006062604439687 0.00585946440833143 0.00613412680247196 0.00160495880533571 0.00151468295883417 255816 264213 667 665 0 True 232 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 275 374 0.00596410423765 0.0060640500312351 0.0059662775616083 0.00608834973678187 0.00127755620186175 0.00138579852414151 260702 264276 667 665 0 True 276 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 320 375 0.006276124926779 0.00637664199409028 0.00624093995574884 0.00636301213092241 0.00135838637458009 0.00136000380770264 274341 277899 667 665 0 True 321 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 364 375 0.00644385978217117 0.00663235107682229 0.00642404821850919 0.00665293354695964 0.00127124101945803 0.00143664070125567 281673 289043 667 665 0 True 366 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 409 374 0.00659491723582018 0.00691614593820326 0.00665293354695964 0.00692759594110018 0.00148649094558916 0.00137298897716653 288276 301411 667 665 0 True 411 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 453 373 0.00678790840331722 0.0075444963977809 0.0068055237659266 0.00717174029144732 0.00174039491038509 0.00287052686262579 296712 328795 667 665 0 True 455 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 498 372 0.00682092005038909 0.00686658279941098 0.00688181887541009 0.00691233691920348 0.00164394666965493 0.00169286602478022 298155 299251 667 665 0 True 500 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 541 372 0.00679955284431485 0.00687580705024176 0.00679026474402991 0.00688181887541009 0.00167648247880029 0.00159386218582217 297221 299653 667 665 0 True 545 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 586 373 0.00694562309140692 0.00689388841754191 0.00691233691920348 0.00695811398489357 0.0019328911282638 0.00198950804992497 303606 300441 667 665 0 True 589 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 629 374 0.00681188359814142 0.00681855703575717 0.00674448767833982 0.00674448767833982 0.00200787350254846 0.00184451131431575 297760 297158 667 665 0 True 634 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 232 418 0.00597433029880116 0.005852006991615 0.00601205462729839 0.00593575951781491 0.00149355358586927 0.00146104974134318 261149 255035 667 665 0 True 232 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 277 418 0.00604845208432634 0.00621666319609966 0.00599679560540169 0.00625619897764553 0.00142965470980364 0.00154573788702663 264389 270927 667 665 0 True 277 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 320 419 0.00653786176264122 0.00659361840169203 0.00654612039368277 0.00662241550316625 0.00140073242230854 0.00133950766986306 285782 287355 667 665 0 True 321 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 364 418 0.00669928254000718 0.0066597025867484 0.00668345159075303 0.00663767452506294 0.00126329321642129 0.00125057364645276 292838 290235 667 665 0 True 366 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 410 419 0.00685754627836002 0.00694138642555117 0.0068207827878233 0.00698863202868696 0.00143631599561286 0.00154381529334456 299756 302511 667 665 0 True 411 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 452 416 0.00685933069171525 0.00702417522405235 0.00694285496299687 0.00704966811627375 0.00156169101589419 0.00163478472489075 299834 306119 667 665 0 True 455 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 498 416 0.00702534976503508 0.00697360246576616 0.00703440909437705 0.00698863202868696 0.00171959376732404 0.00168765181029223 307091 303915 667 665 0 True 500 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 541 416 0.00693946915304078 0.00684294852489429 0.00692759594110018 0.00691233691920348 0.0016290376270665 0.00151769171441328 303337 298221 667 665 0 True 545 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 586 415 0.0066545120664662 0.00651711677913025 0.00668345159075303 0.00660715648126955 0.00180356536710271 0.00194485202364968 290881 284021 667 665 0 True 589 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 629 419 0.00609175842383226 0.00616381879395215 0.00601205462729839 0.00617990386816205 0.0018942598066861 0.00178357329184795 266282 268624 667 665 0 True 634 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 234 463 0.00610852733395262 0.00630392644463069 0.00616464484626535 0.00636301213092241 0.00142921216705231 0.00145080884265009 267015 274730 667 665 0 True 232 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 278 464 0.00612527336697868 0.00638740362005953 0.00613412680247196 0.00636301213092241 0.00146642787739943 0.00159307544716838 267747 278368 667 665 0 True 277 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 321 463 0.00641476011822425 0.0065801032680121 0.0063782711528191 0.00656137941557946 0.00152375147043472 0.00157832638331306 280401 286766 667 665 0 True 321 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 366 463 0.00674217709181573 0.00678312856987972 0.00677500572213321 0.00677500572213321 0.00139583854301592 0.00161793178918661 294713 295614 667 665 0 True 366 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 410 462 0.00688266532789911 0.00684831786493012 0.00689707789730678 0.00686655985351339 0.00174050139844152 0.0017339685741699 300854 298455 667 665 0 True 411 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 454 462 0.00697783404017835 0.0069722486578084 0.00708018616006714 0.00691233691920348 0.00198172434416592 0.00195560161441314 305014 303856 667 665 0 True 455 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 500 461 0.00681016781606908 0.00703411079770839 0.00683604180972 0.00701915007248035 0.00181547851495202 0.00187290956459676 297685 306552 667 665 0 True 500 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 543 461 0.00642992763174375 0.00634495370951985 0.00643930724040589 0.0064087891966125 0.00177447009450251 0.00171616194581535 281064 276518 667 665 0 True 545 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 588 460 0.00621296126942251 0.00587215348969815 0.00614938582436866 0.00584420538643473 0.00190886394296665 0.00181559337403769 271580 255913 667 665 0 True 590 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 631 461 0.00599924345449157 0.00598667646456494 0.0059510185397116 0.005981536583505 0.00178313471485738 0.00170693038531065 262238 260904 667 665 0 True 634 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 234 506 0.00638419632024226 0.0062798791439574 0.00631723506523232 0.00621042191195544 0.0014106230491501 0.00136859952519626 279065 273682 667 665 0 True 232 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 278 507 0.006359832214815 0.00638930812955942 0.00631723506523232 0.0064087891966125 0.00139656664943424 0.00150014779357818 278000 278451 667 665 0 True 277 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 321 508 0.0064152634142988 0.00651505164834724 0.0063935301747158 0.00654612039368277 0.00148384774942198 0.00153951847005383 280423 283931 667 665 0 True 321 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 366 506 0.00666359427290246 0.00660343924586013 0.0068055237659266 0.00653086137178607 0.00150123860947347 0.00145537501662342 291278 287783 667 665 0 True 366 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 410 507 0.00664440039078652 0.00671897184022083 0.00662241550316625 0.00669871061264973 0.0017206009255058 0.0016637502770038 290439 292818 667 665 0 True 411 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 455 506 0.0066076826544384 0.00672161061844357 0.00654612039368277 0.00674448767833982 0.00185620418821348 0.00176822558318045 288834 292933 667 665 0 True 456 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 498 505 0.00635905439360887 0.00653269704359319 0.00636301213092241 0.00654612039368277 0.00172511219102052 0.00166812728068254 277966 284700 667 665 0 True 500 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 542 504 0.00605023649768158 0.00616824735218683 0.00607309071488518 0.00619516289005875 0.00169582514924307 0.00160786027476074 264467 268817 667 665 0 True 545 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 586 504 0.00587433451962506 0.00608589452573985 0.0059510185397116 0.00604257267109178 0.00172544992985066 0.00176468031936237 256778 265228 667 665 0 True 590 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 630 505 0.00581489982863913 0.00592139538592418 0.00590524147402152 0.00588998245212482 0.00167821919111455 0.00186018300733297 254180 258059 667 665 0 True 634 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 234 548 0.00633780157300613 0.00632088346294897 0.0063935301747158 0.00630197604333562 0.00132510248548942 0.0012446918939717 277037 275469 667 665 0 True 232 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 279 550 0.00630531609910311 0.00645534642282061 0.00633249408712902 0.00651560234988937 0.00131122871081665 0.00139820075693624 275617 281329 667 665 0 True 277 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 322 549 0.00647774075882636 0.0065170020496423 0.00646982528419928 0.00651560234988937 0.001342238329567 0.00144891327228921 283154 284016 667 665 0 True 322 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 366 547 0.00634201095835694 0.00662177301803375 0.00631723506523232 0.00668345159075303 0.00143204932506772 0.00142740241305005 277221 288582 667 665 0 True 366 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 410 550 0.00626917029011244 0.00638460422055367 0.00630197604333562 0.00643930724040589 0.00161091264589814 0.00160133981638258 274037 278246 667 665 0 True 411 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 455 546 0.00636287486835662 0.00639096023418583 0.00631723506523232 0.00631723506523232 0.00192616965333916 0.00200946711285069 278133 278523 667 665 0 True 456 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 499 548 0.00633610866802808 0.00636080932475386 0.00627145799954223 0.00643930724040589 0.00182681226840457 0.00199652382613109 276963 277209 667 665 0 True 500 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 542 546 0.00616066423185752 0.00628855269324605 0.00613412680247196 0.00630197604333562 0.00179613208151118 0.00182413331414112 269294 274060 667 665 0 True 545 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 587 545 0.00613078674670447 0.00627093024389768 0.00610360875867857 0.00622568093385214 0.00157259640832238 0.00146039776860277 267988 273292 667 665 0 True 590 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 630 547 0.00607148931828432 0.00613151097014681 0.00608834973678187 0.00614938582436866 0.00161500085148286 0.00164060825241389 265396 267216 667 665 0 True 634 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 232 590 0.00665963653558892 0.00669916953060151 0.00666819256885634 0.0068207827878233 0.00132954305879685 0.00129725822940017 291105 291955 667 665 0 False 232 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 277 589 0.00639195165520925 0.00656456889534433 0.00636301213092241 0.00657663843747616 0.00139149352812613 0.0013311652762303 279404 286089 667 665 0 False 277 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 321 592 0.00647609360803691 0.00659155327090902 0.0064087891966125 0.00666819256885634 0.00143298640035905 0.00133655020745969 283082 287265 667 665 0 True 322 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 365 591 0.00640350458782968 0.0065631691955914 0.00643930724040589 0.00654612039368277 0.00139698638539925 0.00140640966278589 279909 286028 667 665 0 True 366 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 411 589 0.00624096283284313 0.00612552209087608 0.00624093995574884 0.00613412680247196 0.00157045740994713 0.00146493416542371 272804 266955 667 665 0 False 411 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 456 589 0.00637996405779715 0.00623814055624298 0.00643930724040589 0.00633249408712902 0.00200387025842678 0.00186701589053759 278880 271863 667 665 0 False 456 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 500 589 0.00632682056774314 0.0064052325824862 0.00631723506523232 0.00634775310902571 0.00189578654547378 0.00204108960058162 276557 279145 667 665 0 False 500 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 545 589 0.00634443593035252 0.00651801166913622 0.0063782711528191 0.00648508430609598 0.00190836270572219 0.00165622617118158 277327 284060 667 665 0 False 545 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 590 589 0.00634997218717261 0.00633214989866518 0.0064087891966125 0.00634775310902571 0.00160617992417245 0.0016564447733714 277569 275960 667 665 0 False 590 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 635 588 0.00629106366935553 0.00633203516917723 0.00633249408712902 0.00634775310902571 0.00159553764920644 0.00141900174041936 274994 275955 667 665 0 False 635 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 234 639 0.00839090640077078 0.704257485095205 0.00817883573662928 0.700251773861295 0.0018061577861602 0.151936078313719 366782 30692087 667 665 1 True 232 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 277 633 0.00696678440363247 0.00675928778228473 0.00686655985351339 0.00671396963454643 0.00162948997680908 0.0014052730434883 304531 294575 667 665 0 False 277 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 322 633 0.00622735096173589 0.00638460422055367 0.00617990386816205 0.00636301213092241 0.00139636854138164 0.00132368290486338 272209 278246 667 665 0 False 322 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 366 633 0.00603607557631118 0.00626643284797023 0.00607309071488518 0.00628671702143893 0.00127161626576972 0.00117681044619072 263848 273096 667 665 0 False 366 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 411 633 0.00597904298022653 0.00596462545698189 0.00602731364919509 0.00599679560540169 0.00144820056274915 0.00136245853158009 261355 259943 667 665 0 False 411 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 456 632 0.00619763361624292 0.00604879100933841 0.00621042191195544 0.00610360875867857 0.00173426406755368 0.00178812309158112 270910 263611 667 665 0 False 456 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 501 632 0.00628715168623059 0.00624656170065815 0.00624093995574884 0.00634775310902571 0.00178490834191711 0.001739971933266 274823 272230 667 665 0 False 501 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 545 632 0.00622860920192227 0.00627971852267428 0.00616464484626535 0.00628671702143893 0.00171670571457714 0.00174217865215912 272264 273675 667 665 0 False 545 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 590 632 0.00688030898718643 0.00671917835329913 0.00672922865644312 0.00675974670023652 0.00186700919826348 0.00138787923002381 300751 292827 667 665 0 False 590 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 630 637 0.0081036616047664 0.76920297998372 0.00805676356145571 0.759243152513924 0.00142377999237091 0.171447384006828 354226 33522462 667 665 14 True 635 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D12_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D12_3.csv new file mode 100755 index 0000000..4f1578b --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D12_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 232 241 0.00105424513652993 0.0700692679283468 0.000747692072938125 0.0680094605935759 0.000914149061493117 0.0167923469544876 46083 3053673 667 665 0 True 231 241 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 276 241 0.00108430563843736 0.000922241515897778 0.000915541313801785 0.000686655985351339 0.000835684502988508 0.000780897521481381 47397 40192 667 665 0 False 276 241 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 319 242 0.000965161731333921 0.000868915249900902 0.000869764248111696 0.000747692072938125 0.0006979529721709 0.000629288305050064 42189 37868 667 665 0 True 321 241 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 364 242 0.000969256731213244 0.000940460558583458 0.000839246204318303 0.000823987182421607 0.000682219121315649 0.000597913870197252 42368 40986 667 665 0 True 365 241 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 408 241 0.000973191591432483 0.00100154253796542 0.000839246204318303 0.000885023270008392 0.000759747790497624 0.000735651297609904 42540 43648 667 665 0 True 410 241 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 452 240 0.000953791815467867 0.00100037229718838 0.000747692072938125 0.000793469138628214 0.000816632998903332 0.000849179503098347 41692 43597 667 665 0 True 455 241 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 497 240 0.00105724203588295 0.00104897170828192 0.000869764248111696 0.000900282291905089 0.000884630388192208 0.000815975069704878 46214 45715 667 665 0 True 500 241 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 541 240 0.00101473639467746 0.000923962458216955 0.000900282291905089 0.000778210116731518 0.000770782622466409 0.000750290619678602 44356 40267 667 665 0 True 544 241 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 589 240 0.00113079189405069 0.00110294045941129 0.000854505226215 0.000732433051041428 0.00106894000435686 0.00107519524845165 49429 48067 667 665 0 False 589 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 628 240 0.00117396097099081 0.0769644413161537 0.000869764248111696 0.0732585641260395 0.00110210877579908 0.0191269031540146 51316 3354170 667 665 0 True 634 240 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 231 285 0.000945350167671943 0.000883164652303682 0.000701915007248035 0.000686655985351339 0.000859831563088378 0.000750057876544355 41323 38489 667 665 0 False 231 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 276 285 0.00095081779320914 0.000924513159759091 0.000793469138628214 0.000762951094834821 0.000720266995712306 0.000726341181173974 41562 40291 667 665 0 False 276 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 320 285 0.000952602206564376 0.000866551822449234 0.000823987182421607 0.000778210116731518 0.000702044640595393 0.000616738220184601 41640 37765 667 665 0 True 321 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 364 286 0.000984881786618707 0.000921530193072519 0.000885023270008392 0.000762951094834821 0.000713570459838916 0.000673985008439003 43051 40161 667 665 0 True 366 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 407 285 0.000934689441729124 0.000926899533108349 0.000762951094834821 0.000778210116731518 0.000731233564497128 0.00073583132859638 40857 40395 667 665 0 True 410 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 452 284 0.000947180335215775 0.000967857960304745 0.000671396963454643 0.000625619897764553 0.000910309894477195 0.000980262739644528 41403 42180 667 665 0 True 455 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 497 284 0.000923342402957368 0.0010182930432054 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.000822262534417011 0.000951818989476166 40361 44378 667 665 0 True 500 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 541 284 0.000963766228581749 0.000964278400280858 0.00080872816052491 0.00080872816052491 0.000808206747575288 0.00077818963970954 42128 42024 667 665 0 True 544 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 589 284 0.00105182016453435 0.00105211529625162 0.000778210116731518 0.000610360875867857 0.00103469673627249 0.00107086374045669 45977 45852 667 665 0 False 589 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 634 284 0.00114600516175879 0.0010469295233965 0.000869764248111696 0.000671396963454643 0.00104688970722143 0.00106617608425316 50094 45626 667 665 0 False 634 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 232 330 0.000882209387409751 0.000836561534300388 0.000701915007248035 0.000610360875867857 0.000762252180962005 0.000778757344841562 38563 36458 667 665 0 True 232 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 276 331 0.000854047684329042 0.000922103840512244 0.000701915007248035 0.000717174029144732 0.000723577893019295 0.00079065791914654 37332 40186 667 665 0 True 276 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 320 330 0.000822980590272499 0.000989105861472175 0.000701915007248035 0.000885023270008392 0.000647105313201328 0.000674765654434412 35974 43106 667 665 0 True 321 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 363 330 0.000949330782079777 0.000990321994044392 0.000854505226215 0.000885023270008392 0.000662264169216949 0.000713422191031684 41497 43159 667 665 0 True 366 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 409 330 0.000963766228581749 0.000961180704106341 0.000747692072938125 0.000747692072938125 0.000766023213777741 0.000743506768566636 42128 41889 667 665 0 True 410 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 452 328 0.000929381955852012 0.000886790104122747 0.000656137941557946 0.000656137941557946 0.000877999392563198 0.000859126181290942 40625 38647 667 665 0 True 455 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 497 328 0.000954272234448123 0.00103325376843344 0.000747692072938125 0.000885023270008392 0.000876278443357905 0.000853284885722421 41713 45030 667 665 0 True 500 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 541 328 0.00097811016670653 0.00102889404789153 0.000793469138628214 0.000915541313801785 0.000808546692405213 0.000804644707162976 42755 44840 667 665 0 True 544 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 585 327 0.000948369944119266 0.000961364271287053 0.000595101853971161 0.000625619897764553 0.00100510381096511 0.00103719734139633 41455 41897 667 665 0 True 589 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 631 329 0.00107163172819633 0.000953287315335719 0.000732433051041428 0.000473029678797589 0.00107559150525566 0.00103695760087833 46843 41545 667 665 0 True 634 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 231 375 0.000873767739613828 0.000947849137607122 0.000686655985351339 0.000762951094834821 0.000797551237186646 0.000833081961367223 38194 41308 667 665 0 True 232 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 275 374 0.0009469058100842 0.00089954802318224 0.000793469138628214 0.000747692072938125 0.000732516201586771 0.000733414874202262 41391 39203 667 665 0 True 276 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 320 375 0.000885069024196988 0.000917927687151043 0.000701915007248035 0.000793469138628214 0.000743901908526738 0.000737021181848097 38688 40004 667 665 0 True 321 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 364 375 0.000956171033274848 0.00087433048173191 0.00080872816052491 0.000778210116731518 0.000714261287448543 0.000694772282888111 41796 38104 667 665 0 True 366 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 409 374 0.000960037262211192 0.000917744119970331 0.000747692072938125 0.000701915007248035 0.000813542258356552 0.000745059228683197 41965 39996 667 665 0 True 411 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 453 373 0.000954363742825314 0.000944292523480824 0.00064087891966125 0.000671396963454643 0.000901933443348357 0.000890561634023256 41717 41153 667 665 0 True 455 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 498 372 0.00102205706485279 0.00102084003783779 0.000686655985351339 0.000717174029144732 0.00101125926369165 0.000972947255070619 44676 44489 667 665 0 True 500 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 541 372 0.000985796870390623 0.000966572990039759 0.000747692072938125 0.000732433051041428 0.000888241807644727 0.000897844225028657 43091 42124 667 665 0 True 545 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 586 373 0.000993071786377354 0.000993213177140608 0.000564583810177768 0.000457770656900893 0.00108013399190425 0.00114832197600741 43409 43285 667 665 0 True 589 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 629 374 0.0010479768126923 0.00096235094488338 0.000656137941557946 0.000656137941557946 0.00110345902152913 0.000943438406015004 45809 41940 667 665 0 True 634 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 232 418 0.00092418885544639 0.000938349536005268 0.000747692072938125 0.000762951094834821 0.000801321949248887 0.000810228908603159 40398 40894 667 665 0 True 232 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 277 418 0.00097332885399827 0.000907946221699821 0.00080872816052491 0.000747692072938125 0.000778360545803289 0.000786022727224446 42546 39569 667 665 0 True 277 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 320 419 0.00103420480192497 0.000894454033917479 0.000915541313801785 0.000778210116731518 0.000733902791654684 0.00066154476610064 45207 38981 667 665 0 True 321 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 364 418 0.00102800510937024 0.000936582701890914 0.000930800335698482 0.000869764248111696 0.000721662519745381 0.000663397117207648 44936 40817 667 665 0 True 366 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 410 419 0.000960288910248469 0.000946793626318027 0.000762951094834821 0.000732433051041428 0.000814281814561727 0.000808403705422411 41976 41262 667 665 0 True 411 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 452 416 0.0009153811741417 0.00098079944654495 0.000656137941557946 0.000762951094834821 0.000837977839566916 0.00085518495113489 40013 42744 667 665 0 True 455 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 498 416 0.00100352661847149 0.00101184524598289 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.000949519925554345 0.000987763736946063 43866 44097 667 665 0 True 500 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 541 416 0.000894791789273594 0.00108329877107509 0.00064087891966125 0.000854505226215 0.000834934367787032 0.00091793373506493 39113 47211 667 665 0 True 545 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 586 415 0.000940317206926406 0.000889337098755128 0.000564583810177768 0.000488288700694286 0.00096777987744314 0.000993321473381594 41103 38758 667 665 0 True 589 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 629 419 0.000909387375435651 0.000886744212327569 0.000518806744487678 0.000518806744487678 0.00098883030721059 0.000930092419031336 39751 38645 667 665 0 True 634 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 234 463 0.00092245019627975 0.000977724696268022 0.000747692072938125 0.000839246204318303 0.000783058473714127 0.000808944870775496 40322 42610 667 665 0 True 232 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 278 464 0.000932927905468186 0.000907762654519109 0.000778210116731518 0.000717174029144732 0.000811398436892997 0.000818973160411882 40780 39561 667 665 0 True 277 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 321 463 0.00100544829439252 0.000930662660312948 0.000854505226215 0.00080872816052491 0.000864516228707572 0.000769633493165632 43950 40559 667 665 0 True 321 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 366 463 0.000871159750863868 0.000993901554068279 0.000717174029144732 0.000885023270008392 0.000755928777818069 0.000821007287580865 38080 43315 667 665 0 True 366 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 410 462 0.000928215224042819 0.000916459149705346 0.00064087891966125 0.000701915007248035 0.00091340244865835 0.000836700478933409 40574 39940 667 665 0 True 411 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 454 462 0.000897674303155129 0.000937821780360721 0.000457770656900893 0.000457770656900893 0.00102807982071205 0.00106607215177952 39239 40871 667 665 0 True 455 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 500 461 0.000975181898636399 0.00101124865264558 0.000549324788281071 0.000671396963454643 0.00104627491065236 0.000987186344996928 42627 44071 667 665 0 True 500 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 543 461 0.000902066705260325 0.000933071979559794 0.000534065766384375 0.000595101853971161 0.000961963783228417 0.000931610473931347 39431 40664 667 665 0 True 545 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 588 460 0.000911880978714122 0.000992433016622582 0.000488288700694286 0.000549324788281071 0.00102404266942135 0.00104030764993845 39860 43251 667 665 0 True 590 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 631 461 0.000970469217211033 0.000897207541628161 0.000656137941557946 0.000488288700694286 0.000949164829668027 0.00096936349217135 42421 39101 667 665 0 True 634 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 234 506 0.000922061285676686 0.000964829101822994 0.000747692072938125 0.000854505226215 0.000754087633065412 0.000754940342058173 40305 42048 667 665 0 True 232 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 278 507 0.000939356368965895 0.000906294117073411 0.000778210116731518 0.000793469138628214 0.000781713035044096 0.000801937926193821 41061 39497 667 665 0 True 277 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 321 508 0.000854596734592191 0.00093784472625831 0.000747692072938125 0.00080872816052491 0.00074475265224494 0.000827817314609016 37356 40872 667 665 0 True 321 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 366 506 0.000916342012102212 0.000999041435128219 0.000747692072938125 0.000869764248111696 0.000808773948686505 0.000802023269516589 40055 43539 667 665 0 True 366 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 410 507 0.00100087287553294 0.000908129788880533 0.000732433051041428 0.000595101853971161 0.000950043589097869 0.00088801110631099 43750 39577 667 665 0 True 411 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 455 506 0.000904606062727391 0.000916413257910168 0.000503547722590982 0.000534065766384375 0.0010077246192226 0.000964208283446691 39542 39938 667 665 0 True 456 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 498 505 0.000910645615622036 0.000954388718419991 0.000549324788281071 0.000595101853971161 0.000920060082522298 0.000939869781811511 39806 41593 667 665 0 True 500 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 542 504 0.000957520781838424 0.000832041192475352 0.00064087891966125 0.000595101853971161 0.000906207288957057 0.000837532008694499 41855 36261 667 665 0 True 545 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 586 504 0.000971521563548736 0.00092102538332556 0.000671396963454643 0.000534065766384375 0.000942491510426756 0.000980112041408921 42467 40139 667 665 0 True 590 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 630 505 0.00100716407646486 0.000945577493745809 0.000671396963454643 0.000549324788281071 0.00101077764277259 0.00101406122078785 44025 41209 667 665 0 True 634 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 234 548 0.000936565363461551 0.000946449437854191 0.000762951094834821 0.00080872816052491 0.000726996433863399 0.000705123234985986 40939 41247 667 665 0 True 232 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 279 550 0.000884062432047881 0.000968523391334826 0.000732433051041428 0.00080872816052491 0.000739725367678854 0.00073011561021461 38644 42209 667 665 0 True 277 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 322 549 0.000914786369689955 0.000929377690047963 0.000793469138628214 0.00080872816052491 0.000701415354636017 0.000711389134332539 39987 40503 667 665 0 True 322 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 366 547 0.000945784832463603 0.000916413257910168 0.000823987182421607 0.000778210116731518 0.000730374504516255 0.000750625927204238 41342 39938 667 665 0 True 366 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 410 550 0.000938692933231256 0.0009002593460075 0.000671396963454643 0.000671396963454643 0.000899641418250158 0.0008358554602217 41032 39234 667 665 0 True 411 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 455 546 0.000899207068473088 0.000977357561906598 0.0004272526131075 0.000579842832074464 0.00102119265579577 0.00107262770350061 39306 42594 667 665 0 True 456 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 499 548 0.000979071004667042 0.00092733550516254 0.000656137941557946 0.000488288700694286 0.000995250880601101 0.00107426615597748 42797 40414 667 665 0 True 500 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 542 546 0.000917577375194298 0.000959367978196808 0.000549324788281071 0.000534065766384375 0.00094738182234646 0.00102315916359897 40109 41810 667 665 0 True 545 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 587 545 0.000946837178801307 0.000948078596583012 0.000656137941557946 0.000747692072938125 0.000890798302111033 0.000776145250852319 41388 41318 667 665 0 True 590 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 630 547 0.00101279184166214 0.000910470270434612 0.000717174029144732 0.000595101853971161 0.000981659700092155 0.000925252061979033 44271 39679 667 665 0 True 634 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 232 590 0.000942604916356196 0.000909460650940696 0.000823987182421607 0.000793469138628214 0.000693073729092572 0.000669920910155762 41203 39635 667 665 0 False 232 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 277 589 0.000924898045369625 0.000875064750454759 0.000823987182421607 0.000793469138628214 0.00068862597935365 0.000678600038696454 40429 38136 667 665 0 False 277 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 321 592 0.000922839106882814 0.000962809862835161 0.000762951094834821 0.000823987182421607 0.000763351438414452 0.0008200443647782 40339 41960 667 665 0 True 322 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 365 591 0.000992728629962885 0.00104034405078845 0.000900282291905089 0.000946059357595178 0.000733064453503806 0.000730954345761001 43394 45339 667 665 0 True 366 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 411 589 0.00104049600285689 0.000883761245640997 0.000823987182421607 0.000671396963454643 0.000897692135497816 0.000775335998733047 45482 38515 667 665 0 False 411 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 456 589 0.000984584384392835 0.000864004827816853 0.000534065766384375 0.000457770656900893 0.00105054365668836 0.000962956933931044 43038 37654 667 665 0 False 456 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 500 589 0.000973374608186866 0.000911250430952639 0.000564583810177768 0.000305180437933928 0.00107674250436731 0.00112840835433443 42548 39713 667 665 0 False 500 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 545 589 0.000958390111421744 0.000933347330330863 0.000549324788281071 0.000564583810177768 0.00101100356057815 0.000951570025983147 41893 40676 667 665 0 False 545 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 590 589 0.000964887206202346 0.000911892916085132 0.000656137941557946 0.000625619897764553 0.000911345479680529 0.000874491537416151 42177 39741 667 665 0 False 590 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 635 588 0.00101924318225415 0.000989105861472175 0.00080872816052491 0.00080872816052491 0.00085696470615102 0.000797030931501589 44553 43106 667 665 0 False 635 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 234 639 0.00114815560862279 0.0706985821156232 0.000946059357595178 0.0700999465934234 0.000792941726923227 0.015751771389997 50188 3081099 667 665 0 True 232 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 277 633 0.00104481977367919 0.000908382193754012 0.000900282291905089 0.000717174029144732 0.0007771806926066 0.000700157850230084 45671 39588 667 665 0 False 277 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 322 633 0.000966099692200135 0.000883738299743408 0.000854505226215 0.000778210116731518 0.00068746802618142 0.000642117698023835 42230 38514 667 665 0 False 322 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 366 633 0.000961203994020385 0.000968500445437237 0.000839246204318303 0.000854505226215 0.000715824949565864 0.000689167963605567 42016 42208 667 665 0 False 366 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 411 633 0.000920185363944258 0.000956178498431935 0.000732433051041428 0.000778210116731518 0.000757467703346464 0.000763153576381605 40223 41671 667 665 0 False 411 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 456 632 0.000885343549328563 0.000986375299659081 0.000549324788281071 0.00064087891966125 0.00092427034194627 0.00101005647072334 38700 42987 667 665 0 False 456 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 501 632 0.000858691734471515 0.00101207470495878 0.000488288700694286 0.000671396963454643 0.000910259924503326 0.00103473690965378 37535 44107 667 665 0 False 501 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 545 632 0.000890673912299973 0.00094344352527003 0.000518806744487678 0.000549324788281071 0.000956024739168393 0.00100050307741397 38933 41116 667 665 0 False 545 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 590 632 0.00101665807059848 0.0009499831060829 0.000839246204318303 0.000793469138628214 0.000801911636491165 0.000746811187511394 44440 41401 667 665 0 False 590 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 630 637 0.000990349412155904 0.07969839912209 0.000823987182421607 0.0766460669871061 0.000748213317575902 0.0216199592853905 43290 3473318 667 665 0 True 635 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D1_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D1_1.csv new file mode 100755 index 0000000..2ee8f03 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D1_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 253 285 0.00928995332958378 0.0400362774640882 0.00929274433508812 0.0398870832379644 0.00160850405031696 0.00753702719675424 406081 1744812 667 665 0 True 253 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 298 285 0.00930132324544983 0.00925855494768048 0.00932326237888151 0.00929274433508812 0.00136837105647031 0.00132336360575834 406578 403495 667 665 0 False 298 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 342 286 0.00965683329083913 0.0632579388503302 0.00967421988250553 0.0624856946669718 0.00141951048218107 0.00786228710147128 422118 2756830 667 665 0 True 342 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 385 286 0.00957381231563207 0.0982654851823998 0.00964370183871214 0.09399557488365 0.00143336406153838 0.0204424296157773 418489 4282486 667 665 0 True 387 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 430 285 0.00925028444807123 0.0898800216379814 0.00918593118181125 0.0871137560082399 0.00171490721436806 0.0250412187500328 404347 3917041 667 665 0 True 432 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 473 286 0.00922800215822508 0.0659801254108033 0.00921644922560464 0.0702067597467002 0.00180974250100913 0.0174959129327794 403373 2875465 667 665 0 True 476 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 518 284 0.00923763341492449 0.0860968626647874 0.00929274433508812 0.0876783398184176 0.00166054908373489 0.0204998981938103 403794 3752168 667 665 0 True 521 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 563 283 0.00940081572855138 0.0695130823166867 0.009399557488365 0.0665445944914931 0.00169057817340624 0.0186054398299121 410927 3029434 667 665 0 True 566 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 610 284 0.00905498269405009 0.00899470007130438 0.00904859998474098 0.0089417868314641 0.00189232425627314 0.00190267395316024 395810 391996 667 665 0 False 610 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 650 284 0.0089526992054442 0.0410730649007504 0.0089570458533608 0.0413824673838407 0.00188162072746938 0.00811207208980923 391339 1789996 667 665 0 True 655 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 253 329 0.00908884079361098 0.00922783039080879 0.00903334096284428 0.00923170824750134 0.0014534257998652 0.00153524789269261 397290 402156 667 665 0 False 253 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 298 329 0.00934815265747762 0.00915243017133128 0.00944533455405508 0.00917067215991455 0.00137919900841261 0.00134906107840994 408625 398870 667 665 0 False 298 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 341 329 0.00964969563741819 0.151362429878771 0.00964370183871214 0.138750286106661 0.00126176987721051 0.0627214296399272 421806 6596492 667 665 0 True 343 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 386 330 0.00961316091782445 0.0520593082614983 0.00962844281681544 0.0507057297627222 0.00138124305331875 0.00700257008265052 420209 2268785 667 665 0 True 387 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 430 329 0.00953531016592871 0.105829715052107 0.00949111161974517 0.102143892576486 0.00162188236369366 0.0278617725057568 416806 4612141 667 665 0 True 432 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 474 327 0.00936414374639185 0.0456729601527279 0.00944533455405508 0.0460669871061265 0.00176649163072332 0.00954895727436206 409324 1990463 667 665 0 True 477 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 519 328 0.00928004754775279 0.0448210478129405 0.00932326237888151 0.0467689021133745 0.00154068051301714 0.00782533542702717 405648 1953336 667 665 0 True 521 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 563 328 0.00928215224042819 0.0507007275570478 0.00927748531319142 0.0520943007553216 0.00182305093866286 0.0087995752270646 405740 2209577 667 665 0 True 566 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 610 328 0.00900982330990605 0.00922452618155597 0.00904859998474098 0.00927748531319142 0.00204568862580625 0.00206876436658745 393836 402012 667 665 0 False 610 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 655 327 0.00878068633341832 0.00899316269616591 0.00885023270008392 0.00900282291905089 0.00189983475082725 0.00180310108717775 383820 391929 667 665 0 False 655 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 254 373 0.00902393847708785 0.0509939072905427 0.00907911802853437 0.0500190737773709 0.00157461242081355 0.0102906932629895 394453 2222354 667 665 0 True 253 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 297 373 0.00927114835807091 0.0608763611936685 0.00929274433508812 0.0644998855573358 0.00145879107074887 0.0163490927830573 405259 2653039 667 665 0 True 298 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 343 372 0.00936528760110675 0.0286790677770187 0.00933852140077821 0.0345006485084306 0.00162441838471652 0.0143435628711771 409374 1249856 667 665 0 False 343 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 385 374 0.00925026157097693 0.0341471440101742 0.00921644922560464 0.0350194552529183 0.00139998075271306 0.00496781967202494 404346 1488159 667 665 0 True 387 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 430 373 0.00947576108947129 0.0739882666152678 0.00953688868543526 0.0713511863889525 0.00166425152305964 0.0108704101710406 414203 3224466 667 665 0 True 432 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 474 372 0.00946466569873681 0.0335741161096837 0.00941481651026169 0.0345464255741207 0.00171356738693505 0.00484838737001964 413718 1463186 667 665 0 True 477 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 518 372 0.00951545284807813 0.0288865904748137 0.00955214770733196 0.0289921416037232 0.00172330347702386 0.00290177659505727 415938 1258900 667 665 0 True 521 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 562 371 0.0094930332956662 0.0525166888381402 0.00961318379491875 0.0522926680399786 0.00179124766954939 0.00904561260544341 414958 2288718 667 665 0 True 566 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 607 372 0.00924790523026425 0.0569398547868871 0.00923170824750134 0.0566567483024338 0.0020489723035491 0.00987206335827008 404243 2481483 667 665 0 True 611 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 651 372 0.00909305017896179 0.0638835358021972 0.00921644922560464 0.0626077668421454 0.00189254474909754 0.0174785888637051 397474 2784094 667 665 0 True 655 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 254 417 0.00899003462333837 0.0424293280695444 0.00907911802853437 0.0439459830624857 0.0015228297353341 0.00865009900349297 392971 1849103 667 665 0 True 254 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 296 417 0.00917103819342332 0.0315364745119838 0.00924696726939803 0.0314793621728847 0.00140908385651031 0.00489215878104292 400883 1374384 667 665 0 True 298 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 341 417 0.00950369402160902 0.0835202448786191 0.00947585259784848 0.0796826123445487 0.00135577585834729 0.0170876021959669 415424 3639877 667 665 0 True 343 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 386 417 0.00957170762295666 0.0659470833182751 0.00950637064164187 0.0642557412069886 0.00153946669669519 0.0140816995044658 418397 2874025 667 665 0 True 388 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 429 417 0.00960666382304385 0.0485352543638795 0.00961318379491875 0.0478370336461433 0.00180994970845879 0.011286861220992 419925 2115204 667 665 0 True 432 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 473 415 0.00978293183460913 0.0543566515281107 0.0097962920576791 0.0544289311055161 0.00172944909317826 0.01025808959385 427630 2368905 667 665 0 True 477 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 517 415 0.0095560825675512 0.0415940056137138 0.00956740672922866 0.042572671091783 0.00181123630269917 0.00597623708608942 417714 1812699 667 665 0 True 521 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 562 415 0.00932612201566875 0.054868276206653 0.00935378042267491 0.0543068589303426 0.00174111106934783 0.00747618861081922 407662 2391202 667 665 0 True 566 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 607 416 0.00922507389015495 0.0430850529849458 0.00923170824750134 0.0441596093690394 0.00192940517238929 0.00668545088800154 403245 1877680 667 665 0 True 611 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 651 416 0.00920407271758948 0.0896521918208201 0.00927748531319142 0.0891584649423972 0.0018335216267729 0.0143336683257671 402327 3907112 667 665 0 True 655 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 253 461 0.00921763883450813 0.0413355659691688 0.00927748531319142 0.0419012741283284 0.00158445306074828 0.00646777009283198 402920 1801436 667 665 0 True 254 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 296 461 0.00940216547711496 0.0584516681954371 0.0093690394445716 0.0578622110322728 0.00154351909131977 0.0116738641318451 410986 2547369 667 665 0 True 298 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 341 461 0.00934790100944035 0.0351250981654181 0.0093842984664683 0.0355840390630961 0.00142120579985759 0.00409609502830046 408614 1530779 667 665 0 True 343 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 385 461 0.00956820742752908 0.0561744025892151 0.00953688868543526 0.0552071412222477 0.00146932002641103 0.01079444663735 418244 2448124 667 665 0 True 388 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 430 461 0.00992916222136128 0.100243972256115 0.00993362325474937 0.100282291905089 0.00185266503407897 0.0159559148249705 434022 4368710 667 665 0 True 432 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 474 459 0.00988178375907034 0.06429798460445 0.00984206912336919 0.0619516289005875 0.0020361890753402 0.0177955749868923 431951 2802156 667 665 0 True 477 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 518 460 0.00958554826500689 0.0529516053810424 0.00955214770733196 0.052124818799115 0.00186668652146101 0.00780146666194109 419002 2307672 667 665 0 True 522 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 563 459 0.00933188704343182 0.0328245424731433 0.009399557488365 0.0329137102311742 0.00187317387684272 0.00352239592030322 407914 1430519 667 665 0 True 566 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 607 461 0.00926028173827941 0.0395265343491482 0.00932326237888151 0.0401464866102083 0.00190272390696988 0.00461815432277413 404784 1722597 667 665 0 True 611 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 651 460 0.00934215885877158 0.0709501379908916 0.0093690394445716 0.0707866025787747 0.0018890053391436 0.0124989616384237 408363 3092062 667 665 0 True 656 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 254 506 0.00910046235751431 0.0605542237374163 0.00920119020370794 0.0606546120393683 0.00149406485337979 0.0130542072220784 397798 2639000 667 665 0 True 254 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 298 505 0.00935874475213755 0.0578647580269052 0.00930800335698482 0.0569771877622644 0.00151778788878409 0.00582200651956927 409088 2521791 667 665 0 True 298 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 343 506 0.00951893016641142 0.0718107468258653 0.00953688868543526 0.0708323796444648 0.00148729378067604 0.0134102781245956 416090 3129568 667 665 0 True 343 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 387 505 0.00968755722848121 0.0903586960075859 0.00965896086060884 0.0852521553368429 0.00166460842655939 0.0175665270655594 423461 3937902 667 665 0 True 388 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 431 505 0.00992307691427804 0.0978239831668895 0.00997940032043946 0.0926832990005341 0.00197970430964334 0.0293515794495181 433756 4263245 667 665 0 True 432 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 476 504 0.00983200320187812 0.0470196778281249 0.00988784618905928 0.047196154726482 0.00191681022582528 0.00758959460433972 429775 2049154 667 665 0 True 477 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 520 503 0.00943897472184027 0.0386978662036185 0.00941481651026169 0.0391241321431296 0.00176773050695889 0.00453041857774836 412595 1686483 667 665 0 True 522 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 564 503 0.00974671739433556 0.108377030927054 0.00971999694819562 0.108400091554131 0.00189729152456545 0.0185687639675694 426047 4723155 667 665 0 True 566 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 609 504 0.00950854396560017 0.061438168550238 0.00949111161974517 0.0639810788128481 0.00188703811153462 0.0137901686651775 415636 2677523 667 665 0 True 611 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 652 504 0.00924127087291786 0.0780421871800123 0.00929274433508812 0.0761577782864118 0.00188880768381013 0.0111429147490557 403953 3401139 667 665 0 True 656 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 255 549 0.00905653833646235 0.0584870507695194 0.00903334096284428 0.0597085526817731 0.00138902613155378 0.0122265206684911 395878 2548911 667 665 0 True 254 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 298 548 0.00925090212961727 0.108271502744043 0.00927748531319142 0.104310673685817 0.00148602281595498 0.0253467285346022 404374 4718556 667 665 0 True 299 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 343 549 0.00962311245384403 0.0586418208487573 0.00961318379491875 0.0600595101853971 0.00143102649915784 0.0108084864369875 420644 2555656 667 665 0 True 343 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 387 548 0.00965072510666159 0.0600121957445686 0.00968947890440223 0.0590218966964218 0.00145571524243287 0.00601153879564897 421851 2615378 667 665 0 True 388 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 431 548 0.00962519426942514 0.0593933907783879 0.00967421988250553 0.0572823682001984 0.00199850403578589 0.0086075162564228 420735 2588410 667 665 0 True 433 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 476 546 0.00960126482878954 0.062773390330943 0.00959792477302205 0.0615548943312734 0.00186574618952147 0.00962085993635126 419689 2735713 667 665 0 True 477 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 520 545 0.0095386044675076 0.0728193567002881 0.00955214770733196 0.0704051270313573 0.00194749296645458 0.0134616722529482 416950 3173524 667 665 0 True 522 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 564 545 0.00948962460861581 0.0576519348267671 0.00950637064164187 0.0574044403753719 0.00177480908660268 0.0102115426741078 414809 2512516 667 665 0 True 567 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 609 545 0.0094288630461606 0.0489889865428047 0.00947585259784848 0.0479743648432136 0.00178092301141656 0.00580474436878353 412153 2134978 667 665 0 True 611 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 653 545 0.00926865475479244 0.0645797602268431 0.00933852140077821 0.0641184100099184 0.00195948797949963 0.0107290974163992 405150 2814436 667 665 0 True 656 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 256 590 0.00880525633269426 0.0469387476473284 0.00881971465629053 0.0465094987411307 0.00130809724132499 0.00772616041734869 384894 2045627 667 665 0 True 254 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 300 589 0.00891634750260484 0.058028912978257 0.00892652780956741 0.057251850156405 0.00141679173241064 0.0119525380329795 389750 2528945 667 665 0 True 299 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 344 589 0.0093082550050221 0.0439481399768591 0.00929274433508812 0.0437933928435187 0.00138471724229675 0.00522945959629398 406881 1915294 667 665 0 True 343 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 388 589 0.00937903673477978 0.0510105660121923 0.0093690394445716 0.0494392309452964 0.00143215903221122 0.00803284831193757 409975 2223080 667 665 0 True 388 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 433 589 0.00944936092265151 0.0873628566724662 0.00943007553215839 0.0838483253223468 0.0018638687686568 0.01621019707773 413049 3807341 667 665 0 True 433 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 477 587 0.00963075340333953 0.0620645915544182 0.00970473792629892 0.0607614251926452 0.0018531542735019 0.00873608573722114 420978 2704823 667 665 0 True 477 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 521 586 0.00939383821479052 0.0520518967365771 0.0093842984664683 0.0516517891203174 0.00199412830710426 0.00550655487057981 410622 2268462 667 665 0 True 522 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 565 586 0.00916884199237072 0.0361361403049854 0.00915541313801785 0.0371709773403525 0.00176605772399839 0.00554928036145208 400787 1574841 667 665 0 True 567 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 610 587 0.00923239456033027 0.0464949280961617 0.00924696726939803 0.0456702525368124 0.00155059751136378 0.00739274827954945 403565 2026285 667 665 0 True 611 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 654 586 0.00902300051622163 0.0505855162052533 0.00904859998474098 0.0500801098649577 0.00158823379052537 0.00688255295575208 394412 2204556 667 665 0 True 656 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 254 633 0.00858595650675463 0.00823310278442731 0.00857557030594339 0.00828564888990616 0.00127865928353281 0.00138474929301398 375308 358805 667 665 0 False 254 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 299 633 0.0084189079641914 0.00855583683401683 0.00837720302128634 0.00859082932784009 0.00128172713159626 0.00128047985593351 368006 372870 667 665 0 False 299 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 344 631 0.00893124049099277 0.0712098855515993 0.00898756389715419 0.0698863202868696 0.00138444161805856 0.0093236811226072 390401 3103382 667 665 0 True 344 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 388 631 0.00905749917442286 0.0735931841505802 0.00900282291905089 0.0701915007248035 0.00129225251890556 0.0157065268563434 395920 3207248 667 665 0 True 388 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 433 633 0.00897795551754908 0.00912340361088117 0.0089417868314641 0.00910963607232776 0.00174787502021131 0.00178589182616188 392443 397605 667 665 0 False 433 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 478 632 0.00904416182844719 0.00885849322321597 0.0089417868314641 0.00886549172198062 0.00185226889028785 0.00189762171715634 395337 386060 667 665 0 False 478 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 522 632 0.00876227027250852 0.00906447854587258 0.00883497367818723 0.00901808194094758 0.00184115440679261 0.0018643504464771 383015 395037 667 665 0 False 522 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 567 632 0.00893695976456725 0.00878912777480437 0.0089417868314641 0.00883497367818723 0.00178758509486914 0.00159800254116449 390651 383037 667 665 0 False 567 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 612 632 0.00881305742184984 0.00868158035280465 0.00881971465629053 0.00865186541542687 0.00131170463504482 0.00137480355649155 385235 378350 667 665 0 False 612 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 656 632 0.00891438007249522 0.00883114171328986 0.00886549172198062 0.00881971465629053 0.00137445843145427 0.00135990566992955 389664 384868 667 665 0 False 656 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 254 682 0.00838013128935646 0.0387610592055786 0.00837720302128634 0.040009155413138 0.00127887636735464 0.00930891852935621 366311 1689237 667 665 0 True 254 677 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 299 677 0.00836297346863304 0.00829367995406231 0.00837720302128634 0.00833142595559625 0.00133872525417548 0.00131340105570285 365561 361445 667 665 0 False 299 677 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 344 676 0.00853011351957347 0.00871122645248966 0.00857557030594339 0.00871290150301366 0.00132212603655536 0.00128949687989291 372867 379642 667 665 0 False 344 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 388 676 0.00856031128404669 0.00852667259818119 0.00857557030594339 0.00860608834973678 0.00132370219221615 0.00139989203650076 374187 371599 667 665 0 False 388 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 433 676 0.00876048585915328 0.00890938722406841 0.00871290150301366 0.00892652780956741 0.00145571379715429 0.00161564104916074 382937 388278 667 665 0 False 433 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 478 676 0.00862670061169919 0.00882733269429009 0.00862134737163348 0.00891126878767071 0.00167567719536369 0.00153990131322327 377089 384702 667 665 0 False 478 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 522 676 0.00859153851776332 0.00869204368210524 0.00863660639353018 0.00869764248111696 0.00182641504731671 0.00167291421944989 375552 378806 667 665 0 False 522 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 567 676 0.00850634421859796 0.00863607863788563 0.00854505226215 0.00869764248111696 0.00152303985109775 0.00159543861122084 371828 376367 667 665 0 False 567 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 612 675 0.00881239398611521 0.00868678907155736 0.00886549172198062 0.00869764248111696 0.00138100565316004 0.00136975311195491 385206 378577 667 665 0 False 612 675 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 652 680 0.0088026712210386 0.0388053906797206 0.00878919661249714 0.0385442893110552 0.00156064171091667 0.0082344744511673 384781 1691169 667 665 0 True 656 675 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D1_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D1_2.csv new file mode 100755 index 0000000..ff8658e --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D1_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 253 285 0.00804328895291425 0.711302449302473 0.00791943236438544 0.697108415350576 0.00177334416738305 0.172384267177964 351587 30999112 667 665 8 True 253 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 298 285 0.00658933522481149 0.00635787224986247 0.00648508430609598 0.00631723506523232 0.00144236369782845 0.0013288310514054 288032 277081 667 665 0 False 298 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 342 286 0.00624649908966323 0.00644286385453219 0.00621042191195544 0.00648508430609598 0.00133964313124451 0.00131538282466341 273046 280785 667 665 0 True 342 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 385 286 0.0061575758241273 0.00636854209224136 0.00617990386816205 0.00636301213092241 0.00135257799510319 0.00129652014401506 269159 277546 667 665 0 True 387 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 430 285 0.00617901166148443 0.00613125856527333 0.00621042191195544 0.00616464484626535 0.00157840181808435 0.00155940792539019 270096 267205 667 665 0 True 432 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 473 286 0.00633112146147114 0.0062358000746889 0.00633249408712902 0.00624093995574884 0.001650551593999 0.00178101359411665 276745 271761 667 665 0 True 476 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 518 284 0.00622259252612192 0.00637019419686777 0.00613412680247196 0.00648508430609598 0.00144854816740406 0.00154014110808515 272001 277618 667 665 0 True 521 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 563 283 0.00666167259698144 0.00655679023606166 0.00683604180972 0.00650034332799268 0.00157128787764976 0.00164684430087753 291194 285750 667 665 0 True 566 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 610 284 0.00770992393480531 0.00756429870740022 0.00744640268558785 0.00755321583886473 0.00269945466053281 0.00195343642449681 337015 329658 667 665 0 False 610 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 650 284 0.00867366728629277 0.735354591560155 0.00863660639353018 0.722026398107881 0.00199763621797885 0.177116144193787 379142 32047323 667 665 12 True 655 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 253 329 0.00630879341743639 0.00617377731350578 0.00636301213092241 0.00616464484626535 0.00156760761784026 0.00135688333858116 275769 269058 667 665 0 False 253 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 298 329 0.00594635161247483 0.00588408535644444 0.0059662775616083 0.00582894636453803 0.00126365315631387 0.00123904982662181 259926 256433 667 665 0 False 298 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 341 329 0.00597650362275946 0.00617425917735515 0.0059662775616083 0.00616464484626535 0.00127664187549499 0.00121257530655734 261244 269079 667 665 0 True 343 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 386 330 0.0060804571392491 0.0062082191057869 0.00605783169298848 0.00621042191195544 0.00124014326345039 0.00119677078985969 265788 270559 667 665 0 True 387 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 430 329 0.00625425442463021 0.00654049864877346 0.00630197604333562 0.00634775310902571 0.00158604033570337 0.00188536340616666 273385 285040 667 665 0 True 432 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 474 327 0.00639986712983632 0.00649832408900484 0.00643930724040589 0.0064087891966125 0.00168694397103122 0.00159207451886215 279750 283202 667 665 0 True 477 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 519 328 0.0064109167663822 0.0064927711817883 0.00648508430609598 0.00657663843747616 0.00164799788073794 0.00156361001576105 280233 282960 667 665 0 True 521 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 563 328 0.00650949416571183 0.00671029829093218 0.00657663843747616 0.00669871061264973 0.00158912221011357 0.00149701352952346 284542 292440 667 665 0 True 566 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 610 328 0.00694409032608896 0.00694019323887655 0.00686655985351339 0.00701915007248035 0.00203664093077805 0.00212746583218206 303539 302459 667 665 0 False 610 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 655 327 0.00701311051958571 0.00682277908091354 0.00698863202868696 0.00675974670023652 0.00216699581377617 0.00174608627218337 306556 297342 667 665 0 False 655 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 254 373 0.00586774591646726 0.00593367144113431 0.00585946440833143 0.00601205462729839 0.00145498196608316 0.00143525688528621 256490 258594 667 665 0 True 253 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 297 373 0.00597863119252916 0.00589665970832322 0.0059510185397116 0.0059662775616083 0.0012822845604297 0.00137504528843445 261337 256981 667 665 0 True 298 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 343 372 0.00629394618323706 0.00614796317871814 0.00624093995574884 0.00616464484626535 0.00124836462042412 0.00136739809029534 275120 267933 667 665 0 False 343 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 385 374 0.0064033215710753 0.00633843707460457 0.00645456626230259 0.00628671702143893 0.00135042713584043 0.00133615555687831 279901 276234 667 665 0 True 387 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 430 373 0.00645504668128284 0.00653515225463521 0.00646982528419928 0.00645456626230259 0.00159746513838354 0.00167570617623113 282162 284807 667 665 0 True 432 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 474 372 0.00669289983069806 0.00677016413774193 0.00665293354695964 0.00683604180972 0.00158062299200046 0.0017350787533311 292559 295049 667 665 0 True 477 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 518 372 0.00662607583825391 0.00663251169810541 0.00656137941557946 0.00672922865644312 0.00165422148729037 0.00173603891767251 289638 289050 667 665 0 True 521 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 562 371 0.0065348648632882 0.00677725442009694 0.00659189745937285 0.00686655985351339 0.00172766288618403 0.00170763473857048 285651 295358 667 665 0 True 566 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 607 372 0.00640075933651394 0.00644802668148972 0.0063935301747158 0.00648508430609598 0.00199083139663606 0.0019504965452108 279789 281010 667 665 0 True 611 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 651 372 0.00604877236364651 0.00595370320972952 0.00611886778057527 0.00602731364919509 0.00198461295100121 0.0018712427339555 264403 259467 667 665 0 True 655 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 254 417 0.00596463041081885 0.00594925170559725 0.0059510185397116 0.00602731364919509 0.00148786414505968 0.00150949880997251 260725 259273 667 665 0 True 254 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 296 417 0.00586818058125892 0.00612019864263543 0.00590524147402152 0.00610360875867857 0.00136803008789476 0.00136339347534992 256509 266723 667 665 0 True 298 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 341 417 0.00617354403594724 0.00633671613228539 0.00613412680247196 0.00636301213092241 0.00136596250060184 0.0012311532866847 269857 276159 667 665 0 True 343 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 386 417 0.00634258288571439 0.0063553023093325 0.00636301213092241 0.00634775310902571 0.00139244018030244 0.00144413311307837 277246 276969 667 665 0 True 388 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 429 417 0.00656277491833163 0.00663572412376788 0.00654612039368277 0.00663767452506294 0.00162443576386726 0.00153907707995763 286871 289190 667 665 0 True 432 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 473 415 0.00671632597525911 0.00690855084610129 0.00669871061264973 0.00689707789730678 0.00164610279189588 0.00154256834091719 293583 301080 667 665 0 True 477 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 517 415 0.00677953538680419 0.00669159738439713 0.00669871061264973 0.00668345159075303 0.00165259364186378 0.0015994307482241 296346 291625 667 665 0 True 521 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 562 415 0.00630355456284218 0.00645509401794713 0.00633249408712902 0.00648508430609598 0.00177389319271894 0.00159702560140564 275540 281318 667 665 0 True 566 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 607 416 0.00582581220261922 0.00580767551747301 0.00584420538643473 0.00576791027695125 0.00190620440906138 0.00168848302170698 254657 253103 667 665 0 True 611 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 651 416 0.00564711921905836 0.00578727661451638 0.00564583810177768 0.00578316929884794 0.00172284101773306 0.00188367045871059 246846 252214 667 665 0 True 655 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 253 461 0.00587435739671936 0.00603867186850165 0.00581368734264134 0.00602731364919509 0.00146134805314422 0.00140331744691472 256779 263170 667 665 0 True 254 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 296 461 0.00587945898874779 0.00607765694850539 0.00587472343022812 0.00607309071488518 0.00136037103661412 0.00148411829073417 257002 264869 667 665 0 True 298 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 341 461 0.0061043637027904 0.00607130093487323 0.00610360875867857 0.00601205462729839 0.0014559732059877 0.00152880287469224 266833 264592 667 665 0 True 343 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 385 461 0.00633652045572544 0.00623249586543608 0.00636301213092241 0.00628671702143893 0.00146022513302788 0.00144631451202244 276981 271617 667 665 0 True 388 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 430 461 0.0065544019018186 0.0066060091863901 0.00657663843747616 0.00671396963454643 0.00183063261152857 0.00183319455863137 286505 287895 667 665 0 True 432 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 474 459 0.00683233572044374 0.00691899122950429 0.00691233691920348 0.00692759594110018 0.00195288764560826 0.00197916463847596 298654 301535 667 665 0 True 477 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 518 460 0.00638710171121809 0.00635114910186889 0.00642404821850919 0.00634775310902571 0.00179925843069882 0.00181808151105323 279192 276788 667 665 0 True 522 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 563 459 0.00580302661669852 0.0058741497827884 0.00576791027695125 0.00584420538643473 0.00179388453033296 0.00180757917667273 253661 256000 667 665 0 True 566 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 607 461 0.00561829408024301 0.0057320687849172 0.0055542839703975 0.00570687418936446 0.00181797178823603 0.00175090717305917 245586 249808 667 665 0 True 611 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 651 460 0.00565578963779726 0.00556369178840899 0.00567635614557107 0.00546272983901732 0.00185666912325792 0.00184886494286421 247225 242470 667 665 0 True 656 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 254 506 0.00607951917838289 0.00603658379182105 0.00599679560540169 0.00605783169298848 0.00142372301357905 0.0014218979384908 265747 263079 667 665 0 True 254 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 298 505 0.00606361959784585 0.00616895867501209 0.00610360875867857 0.00616464484626535 0.00140422745203765 0.00135817796611153 265052 268848 667 665 0 True 298 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 343 506 0.00601226052114707 0.00628224257140907 0.00604257267109178 0.00627145799954223 0.0015023104720896 0.00141105010747518 262807 273785 667 665 0 True 343 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 387 505 0.00632133006511164 0.00633173687250858 0.00625619897764553 0.00633249408712902 0.00153652354318119 0.00147353210705493 276317 275942 667 665 0 True 388 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 431 505 0.0063271866012519 0.00664804607077318 0.00622568093385214 0.00663767452506294 0.00185710733505887 0.0018742674209515 276573 289727 667 665 0 True 432 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 476 504 0.00623737112903836 0.00615115265848301 0.00619516289005875 0.00613412680247196 0.00176615448759695 0.00163685804980413 272647 268072 667 665 0 True 477 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 520 503 0.0059706928408078 0.00577656088034231 0.00602731364919509 0.00566109712367437 0.00169730829446674 0.00155478518492947 260990 251747 667 665 0 True 522 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 564 503 0.0060543543746552 0.0059581317679642 0.00602731364919509 0.00593575951781491 0.00178654678583607 0.00166947501007225 264647 259660 667 665 0 True 566 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 609 504 0.00584855203435133 0.00582541269630932 0.00585946440833143 0.00584420538643473 0.00176481769959063 0.00180869845530006 255651 253876 667 665 0 True 611 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 652 504 0.00555977447302899 0.00564567748049455 0.00561532005798428 0.0055542839703975 0.00185128222450273 0.00186754703849014 243028 246043 667 665 0 True 656 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 255 549 0.00602790845364683 0.00606870804844567 0.00605783169298848 0.00611886778057527 0.00133069921514378 0.0013682041664201 263491 264479 667 665 0 True 254 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 298 548 0.00607089451383258 0.00614507199562192 0.00610360875867857 0.00617990386816205 0.00135594162603748 0.00129741010119207 265370 267807 667 665 0 True 299 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 343 549 0.00612197906539978 0.00627384437289149 0.00613412680247196 0.00624093995574884 0.00138763866047661 0.00137318802352399 267603 273419 667 665 0 True 343 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 387 548 0.00615684375710977 0.00612699062832178 0.00613412680247196 0.00614938582436866 0.00148578965146755 0.00140419729471595 269127 267019 667 665 0 True 388 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 431 548 0.00595271144468965 0.00604502788213381 0.00587472343022812 0.00605783169298848 0.00178896027813643 0.00187360702525682 260204 263447 667 665 0 True 433 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 476 546 0.00593383784189388 0.00613566417761043 0.0059510185397116 0.00614938582436866 0.00185274694198467 0.00196121729158092 259379 267397 667 665 0 True 477 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 520 545 0.0059640813605557 0.00597396443730062 0.00601205462729839 0.00601205462729839 0.00191751729225713 0.00186777268922839 260701 260350 667 665 0 True 522 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 564 545 0.00585186921302452 0.00596324870312655 0.00588998245212482 0.005981536583505 0.00165044670476485 0.00168096246912348 255796 259883 667 665 0 True 567 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 609 545 0.00588705418405469 0.00593883426809184 0.00590524147402152 0.00587472343022812 0.00172565414020725 0.00154316029731705 257334 258819 667 665 0 True 611 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 653 545 0.00584255823564528 0.00579535357046771 0.00592050049591821 0.00584420538643473 0.00181676547745905 0.00184740462971224 255389 252566 667 665 0 True 656 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 256 590 0.00622680191147274 0.00627099908159045 0.00613412680247196 0.00625619897764553 0.00126574177282714 0.00126545896882318 272185 273295 667 665 0 True 254 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 300 589 0.00590897044039207 0.00600769490675648 0.00588998245212482 0.00602731364919509 0.00139704912541146 0.00140412998936817 258292 261820 667 665 0 True 299 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 344 589 0.00614009772408371 0.00605161335474186 0.00611886778057527 0.00608834973678187 0.00135947673464249 0.00148897865540225 268395 263734 667 665 0 True 343 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 388 589 0.00584386223002026 0.00589764638191955 0.00576791027695125 0.00585946440833143 0.00132362448095173 0.00120087895828026 255446 257024 667 665 0 True 388 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 433 589 0.00589897315018389 0.00600604280213007 0.00590524147402152 0.00607309071488518 0.00178021827330334 0.00181929146632817 257855 261748 667 665 0 True 433 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 477 587 0.00603314730824105 0.00598355582249283 0.00607309071488518 0.00604257267109178 0.00184146337756828 0.00188705963105687 263720 260768 667 665 0 True 477 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 521 586 0.00600562616380068 0.00604601455573014 0.00616464484626535 0.0059662775616083 0.00187242313957252 0.00198060809887839 262517 263490 667 665 0 True 522 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 565 586 0.00598384717002909 0.00607976797108358 0.00588998245212482 0.00607309071488518 0.00170513469218845 0.00168191574769098 261565 264961 667 665 0 True 567 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 610 587 0.00584361058198298 0.00605751045042223 0.00582894636453803 0.00604257267109178 0.00146734699844486 0.00150311469170098 255435 263991 667 665 0 True 611 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 654 586 0.00576900837747755 0.00585301661110891 0.00575265125505455 0.00588998245212482 0.0015470257910194 0.00153004773075962 252174 255079 667 665 0 True 656 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 254 633 0.00629309973074804 0.00629392203328188 0.00622568093385214 0.00636301213092241 0.00133913201681232 0.0013520353631042 275083 274294 667 665 0 False 254 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 299 633 0.00601349588423916 0.00604197607775447 0.0059510185397116 0.00610360875867857 0.00127712106905434 0.00124052956936837 262861 263314 667 665 0 False 299 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 344 631 0.00580526857193971 0.00583585307971233 0.00584420538643473 0.00576791027695125 0.00134282160862521 0.00126718697393157 253759 254331 667 665 0 True 344 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 388 631 0.00586454312326556 0.0059940650435886 0.00584420538643473 0.00602731364919509 0.00130895931638294 0.00122302330790094 256350 261226 667 665 0 True 388 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 433 633 0.00579417318120523 0.00582038754473733 0.00579842832074464 0.00579842832074464 0.00161550801900125 0.00164569389641285 253274 253657 667 665 0 False 433 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 478 632 0.00581142251030585 0.00575106798812091 0.00585946440833143 0.00575265125505455 0.0017829965428357 0.00175477602923133 254028 250636 667 665 0 False 478 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 522 632 0.00586554971541467 0.00591756342102682 0.00585946440833143 0.00593575951781491 0.00183623282729162 0.00176298880693131 256394 257892 667 665 0 False 522 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 567 632 0.00587575289947153 0.00580024104665417 0.00585946440833143 0.00582894636453803 0.00162358612258206 0.00153556800886646 256840 252779 667 665 0 False 567 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 612 632 0.00604467736376719 0.00584399887335643 0.00605783169298848 0.00584420538643473 0.00138537839501812 0.00129489977514095 264224 254686 667 665 0 False 612 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 656 632 0.00599425624793463 0.00605991976966908 0.005981536583505 0.00605783169298848 0.00143610882141191 0.00137729197565092 262020 264096 667 665 0 False 656 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 254 682 0.00864561996868355 0.70582331314668 0.00770580605783169 0.715907530327306 0.00339777267362224 0.214353435472451 377916 30760327 667 665 10 True 254 677 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 299 677 0.00658130536471293 0.00622060989048497 0.00645456626230259 0.00621042191195544 0.00171414575369808 0.00136704818646835 287681 271099 667 665 0 False 299 677 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 344 676 0.0058456466433755 0.00585854657242787 0.00587472343022812 0.00588998245212482 0.00137049151236046 0.00130878661538725 255524 255320 667 665 0 False 344 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 388 676 0.00554101525570472 0.00564280924329593 0.0055390249485008 0.00556954299229419 0.0012506079564855 0.00133601059556271 242208 245918 667 665 0 False 388 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 433 676 0.00572682301559223 0.0056280320852486 0.00564583810177768 0.00560006103608759 0.00152333825791195 0.00153670525039831 250330 245274 667 665 0 False 433 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 478 676 0.00580524569484541 0.00566352938881881 0.00581368734264134 0.00570687418936446 0.00165206797258194 0.00146856326749252 253758 246821 667 665 0 False 478 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 522 676 0.00550297064788732 0.00566761375858965 0.00549324788281071 0.00564583810177768 0.00166526602310179 0.00170871035856234 240545 246999 667 665 0 False 522 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 567 676 0.00570122354707288 0.00572881046745956 0.00564583810177768 0.00569161516746777 0.00148420536464281 0.00155183641363351 249211 249666 667 665 0 False 567 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 612 675 0.0065174782716218 0.00611271828002141 0.00627145799954223 0.00610360875867857 0.001843831869146 0.00137452552668066 284891 266397 667 665 0 False 612 675 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 652 680 0.0076230596077562 0.728850370375469 0.00746166170748455 0.718852521553368 0.00174866405185228 0.184659566219035 333218 31763864 667 665 11 True 656 675 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D1_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D1_3.csv new file mode 100755 index 0000000..e1d3f06 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D1_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 253 285 0.00107108267793318 0.0723837517804583 0.000869764248111696 0.070267795834287 0.000825336261038681 0.0189804744124003 46819 3154540 667 665 0 True 253 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 298 285 0.000968044245215456 0.000914394018922334 0.000854505226215 0.00080872816052491 0.00066065667774925 0.000662479648023687 42315 39850 667 665 0 False 298 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 342 286 0.00103566893596004 0.00103164755560221 0.000930800335698482 0.000854505226215 0.000683917261954024 0.000749585135390495 45271 44960 667 665 0 True 342 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 385 286 0.000951435474755184 0.000981005959623251 0.00080872816052491 0.000869764248111696 0.000691564440293909 0.000657882175911857 41589 42753 667 665 0 True 387 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 430 285 0.00097060647977682 0.000902255639097744 0.000747692072938125 0.000701915007248035 0.000870694461025794 0.000811565417899933 42427 39321 667 665 0 True 432 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 473 286 0.00100986357359201 0.000921805543843587 0.000762951094834821 0.000579842832074464 0.000927375606665091 0.000960184971866026 44143 40173 667 665 0 True 476 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 518 284 0.00100759874125652 0.000991629910206966 0.000778210116731518 0.000823987182421607 0.000893393246742557 0.000856740118304208 44044 43216 667 665 0 True 521 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 563 283 0.000946951564272796 0.000933278492638096 0.000717174029144732 0.000656137941557946 0.000917755183470139 0.000846990687112349 41393 40673 667 665 0 True 566 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 610 284 0.00103706443871221 0.00109139867292401 0.000686655985351339 0.000778210116731518 0.00105639072255136 0.00107670736393076 45332 47564 667 665 0 False 610 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 650 284 0.00111063717397424 0.0757484005275262 0.000778210116731518 0.072983901731899 0.00102023312031516 0.021329002070492 48548 3301174 667 665 0 True 655 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 253 329 0.000931784050753291 0.000959276194606452 0.000762951094834821 0.000778210116731518 0.00078657523238015 0.000746639587928877 40730 41806 667 665 0 False 253 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 298 329 0.000973786395884228 0.000940483504481047 0.000793469138628214 0.000793469138628214 0.000737049608608241 0.000697180215181835 42566 40987 667 665 0 False 298 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 341 329 0.000977400976783295 0.00101170757059736 0.000854505226215 0.000885023270008392 0.000650290746528957 0.000744956329798098 42724 44091 667 665 0 True 343 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 386 330 0.00096495583748524 0.00100936708904328 0.00080872816052491 0.000900282291905089 0.000711526975595406 0.000664432289909618 42180 43989 667 665 0 True 387 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 430 329 0.000965527764842687 0.00105780587885369 0.000717174029144732 0.000793469138628214 0.000862143744492223 0.000931021960801701 42205 46100 667 665 0 True 432 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 474 327 0.000972001982528992 0.000902255639097744 0.000717174029144732 0.000671396963454643 0.000882910539430443 0.0008404926756959 42488 39321 667 665 0 True 477 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 519 328 0.000972436647320652 0.000960790623847327 0.000762951094834821 0.000747692072938125 0.000830708067233926 0.000876330810817864 42507 41872 667 665 0 True 521 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 563 328 0.000940042681794832 0.000968569283130004 0.000701915007248035 0.00080872816052491 0.000903609664954337 0.00078052036303808 41091 42211 667 665 0 True 566 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 610 328 0.00108194929772468 0.0011484651202279 0.000625619897764553 0.000717174029144732 0.0011799036089327 0.00125474664164538 47294 50051 667 665 0 False 610 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 655 327 0.000964178016279112 0.000993901554068279 0.000534065766384375 0.00064087891966125 0.00100778560720501 0.000951371191140633 42146 43315 667 665 0 False 655 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 254 373 0.000991195864644926 0.000845900514619118 0.00080872816052491 0.000686655985351339 0.000820545214835119 0.000723951210863096 43327 36865 667 665 0 True 253 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 297 373 0.00103690429905212 0.00102813683327109 0.000946059357595178 0.000900282291905089 0.000741484012819432 0.000764378487113863 45325 44807 667 665 0 True 298 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 343 372 0.000967861228461073 0.000993327906628553 0.000885023270008392 0.000869764248111696 0.000687356776955608 0.000763559984360114 42307 43290 667 665 0 False 343 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 385 374 0.00100858245631133 0.000936582701890914 0.000869764248111696 0.000762951094834821 0.000743980428096945 0.000709039591772528 44087 40817 667 665 0 True 387 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 430 373 0.00101894578002827 0.00107363854819011 0.000793469138628214 0.000778210116731518 0.000871363915820184 0.0009762871972585 44540 46790 667 665 0 True 432 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 474 372 0.000975319161202187 0.00085425282134152 0.000671396963454643 0.000564583810177768 0.00090503544352574 0.000867954433352638 42633 37229 667 665 0 True 477 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 518 372 0.00102178253972121 0.00101572310267543 0.000793469138628214 0.000701915007248035 0.000905186166468387 0.000969722890676216 44664 44266 667 665 0 True 521 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 562 371 0.000951343966377992 0.000895624274694518 0.000671396963454643 0.000610360875867857 0.000955654318841993 0.000865224011256409 41585 39032 667 665 0 True 566 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 607 372 0.000944206312957049 0.000995255362026031 0.000503547722590982 0.000503547722590982 0.00105161022558081 0.00110929960754811 41273 43374 667 665 0 True 611 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 651 372 0.000934529302069039 0.000951910561480378 0.000534065766384375 0.000579842832074464 0.00102634983856718 0.000998642514844214 40850 41485 667 665 0 True 655 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 254 417 0.000916982570742553 0.000918730793566659 0.000747692072938125 0.000717174029144732 0.000793914467964936 0.000802701880485048 40083 40039 667 665 0 True 254 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 296 417 0.000944320698428538 0.000976095537539202 0.000823987182421607 0.000823987182421607 0.000723425411812054 0.000787118230496897 41278 42539 667 665 0 True 298 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 341 417 0.00103887172916174 0.00100663652723018 0.000900282291905089 0.000900282291905089 0.00072546876916851 0.000684365325042076 45411 43870 667 665 0 True 343 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 386 417 0.000942147374470238 0.00105333142882383 0.000823987182421607 0.000915541313801785 0.000762178638561718 0.000814981290304949 41183 45905 667 665 0 True 388 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 429 417 0.00106177170055393 0.00102513092068693 0.000823987182421607 0.000793469138628214 0.000917688124983356 0.000869502138984066 46412 44676 667 665 0 True 432 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 473 415 0.000872898410030508 0.000979445638587198 0.000595101853971161 0.000762951094834821 0.000854301117847444 0.000815846966312087 38156 42685 667 665 0 True 477 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 517 415 0.000896370308780149 0.000904573174754235 0.000610360875867857 0.000671396963454643 0.000850820844373048 0.000891688172204893 39182 39422 667 665 0 True 521 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 562 415 0.000969782904382096 0.000945118575794028 0.00064087891966125 0.00064087891966125 0.000958986400026494 0.000901834948804803 42391 41189 667 665 0 True 566 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 607 416 0.00093505547523789 0.000955926093558456 0.000442511635004196 0.00064087891966125 0.00106797107579999 0.000959662837885027 40873 41660 667 665 0 True 611 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 651 416 0.00088417681751937 0.000884266055387955 0.000457770656900893 0.000488288700694286 0.000962429627093041 0.000964087632443502 38649 38537 667 665 0 True 655 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 253 461 0.00103319820977586 0.000992410070724993 0.000885023270008392 0.000823987182421607 0.000872851222199898 0.000832400234031036 45163 43250 667 665 0 True 254 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 296 461 0.000947683631290329 0.000927404342855307 0.000854505226215 0.000762951094834821 0.000763722907559286 0.000788848648484755 41425 40417 667 665 0 True 298 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 341 461 0.00103797952248412 0.00111322022153117 0.000885023270008392 0.00106813153276875 0.000808427814012028 0.000852197819648747 45372 48515 667 665 0 True 343 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 385 461 0.00102747893620139 0.00102425897657855 0.000885023270008392 0.000915541313801785 0.000801566518082088 0.000823100449871769 44913 44638 667 665 0 True 388 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 430 461 0.000959167932627872 0.00101657210088623 0.00064087891966125 0.000686655985351339 0.000972166234889211 0.00103956551377814 41927 44303 667 665 0 True 432 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 474 459 0.000938990335457128 0.000947160760679451 0.000579842832074464 0.000534065766384375 0.00102500798459063 0.0010760621112184 41045 41278 667 665 0 True 477 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 518 460 0.000984721646958622 0.000947917975299889 0.00064087891966125 0.000686655985351339 0.000989302450205217 0.000907325217226988 43044 41311 667 665 0 True 522 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 563 459 0.000960266033154171 0.000871645811713995 0.000610360875867857 0.000381475547417411 0.00100021973446391 0.00102781792586336 41975 37987 667 665 0 True 566 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 607 461 0.000953929078033654 0.000911640511211652 0.000595101853971161 0.000595101853971161 0.000983173146692198 0.000918524876634392 41698 39730 667 665 0 True 611 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 651 460 0.000933820112145804 0.000896542110598079 0.000534065766384375 0.000503547722590982 0.000940804038858812 0.000991465344583697 40819 39072 667 665 0 True 656 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 254 506 0.000907259805665947 0.000943122282703784 0.000732433051041428 0.000778210116731518 0.000753874731396705 0.000773706519691057 39658 41102 667 665 0 True 254 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 298 505 0.0010480225668809 0.00102015166091011 0.000900282291905089 0.000930800335698482 0.000866576406516397 0.000782836641379045 45811 44459 667 665 0 True 298 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 343 506 0.00102672399208956 0.00096072178615456 0.000961318379491875 0.000854505226215 0.000818086280966619 0.000784361844208324 44880 41869 667 665 0 True 343 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 387 505 0.000960357541531363 0.00106615818557609 0.000778210116731518 0.000869764248111696 0.000837595840932075 0.000863559176484365 41979 46464 667 665 0 True 388 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 431 505 0.00102681550046675 0.00102889404789153 0.000671396963454643 0.000671396963454643 0.00104101994713428 0.00102283721991645 44884 44840 667 665 0 True 432 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 476 504 0.000876329974175192 0.000927450234650485 0.000473029678797589 0.00064087891966125 0.00091796260901232 0.000866182333560401 38306 40419 667 665 0 True 477 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 520 503 0.000987947317254625 0.000936858052661982 0.000701915007248035 0.00064087891966125 0.000929135132303925 0.000886482927559875 43185 40829 667 665 0 True 522 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 564 503 0.000946654162046924 0.000923755945138653 0.000610360875867857 0.000625619897764553 0.000953519423260693 0.000879180327865144 41380 40258 667 665 0 True 566 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 609 504 0.000950131480380204 0.000929240014662429 0.000656137941557946 0.000579842832074464 0.000943282448763121 0.000952225596043902 41532 40497 667 665 0 True 611 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 652 504 0.000900442431565174 0.000895876679567998 0.000473029678797589 0.000442511635004196 0.000951039897787941 0.00102270776693326 39360 39043 667 665 0 True 656 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 255 549 0.000936977151158913 0.000941676691155676 0.000823987182421607 0.000747692072938125 0.000710774867575854 0.000772029581273441 40957 41039 667 665 0 True 254 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 298 548 0.00102997253947986 0.000906500630151713 0.000946059357595178 0.000823987182421607 0.00075859860895933 0.00069306256594016 45022 39506 667 665 0 True 299 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 343 549 0.000963171424130004 0.0010743039792202 0.000854505226215 0.000900282291905089 0.000739142286608454 0.000784377289851071 42102 46819 667 665 0 True 343 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 387 548 0.000941941480621557 0.000976669184978927 0.000762951094834821 0.00080872816052491 0.000770628323271575 0.000782654548162027 41174 42564 667 665 0 True 388 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 431 548 0.000955804999766082 0.000945623385540987 0.000686655985351339 0.000549324788281071 0.000956546086921334 0.00100122197850663 41780 41211 667 665 0 True 433 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 476 546 0.000875689415534851 0.000920864762042437 0.000473029678797589 0.000488288700694286 0.000962364605873335 0.00105969164139489 38278 40132 667 665 0 True 477 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 520 545 0.000906321844799733 0.000969900145190167 0.000473029678797589 0.000671396963454643 0.00100833758272799 0.00104617004025358 39617 42269 667 665 0 True 522 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 564 545 0.000943199720807941 0.00101418572753697 0.000610360875867857 0.00064087891966125 0.000946643571518414 0.00101695553188698 41229 44199 667 665 0 True 567 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 609 545 0.000893076007201252 0.00088064060356889 0.000625619897764553 0.000610360875867857 0.000880688932349904 0.000815329367440066 39038 38379 667 665 0 True 611 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 653 545 0.00081895422167607 0.000869167654774382 0.000518806744487678 0.000503547722590982 0.000865088452212149 0.000946834571253032 35798 37879 667 665 0 True 656 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 256 590 0.00097669178686006 0.0009320164682707 0.000869764248111696 0.000854505226215 0.000681998673240945 0.00064711899231431 42693 40618 667 665 0 True 254 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 300 589 0.00101176237241873 0.00103095917867454 0.000946059357595178 0.000839246204318303 0.000776337011232716 0.000851748405189385 44226 44930 667 665 0 True 299 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 344 589 0.000949468044645565 0.000983116982201441 0.000854505226215 0.000885023270008392 0.000736736485796174 0.000762587282836599 41503 42845 667 665 0 True 343 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 388 589 0.00093070882732129 0.00104729665775792 0.000778210116731518 0.000961318379491875 0.000711026593202244 0.00070668258778526 40683 45642 667 665 0 True 388 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 433 589 0.000990738322758968 0.000910378486844256 0.000717174029144732 0.000503547722590982 0.000989526233965933 0.00101877753219355 43307 39675 667 665 0 True 433 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 477 587 0.000894974806027977 0.00097123100725033 0.000488288700694286 0.00064087891966125 0.00101055457053567 0.000960371369701959 39121 42327 667 665 0 True 477 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 521 586 0.000987329635708582 0.000924467267963913 0.000534065766384375 0.000534065766384375 0.00108560572739501 0.00102689050871629 43158 40289 667 665 0 True 522 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 565 586 0.00102006675764887 0.000898354836507611 0.000686655985351339 0.000564583810177768 0.000965753568505736 0.000924108880783615 44589 39151 667 665 0 True 567 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 610 587 0.000894997683122275 0.000988027404285491 0.00064087891966125 0.000717174029144732 0.000810119444712338 0.000864720357734953 39122 43059 667 665 0 True 611 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 654 586 0.000863861957782839 0.000916757446374003 0.000610360875867857 0.000701915007248035 0.000821213581832141 0.000809979211088703 37761 39953 667 665 0 True 656 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 254 633 0.00096854754129001 0.000911342214542995 0.000869764248111696 0.000762951094834821 0.000696002810008106 0.000717073851246685 42337 39717 667 665 0 False 254 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 299 633 0.000930868966981375 0.000946265870673479 0.000823987182421607 0.000839246204318303 0.000662117788037737 0.000699211883057377 40690 41239 667 665 0 False 299 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 344 631 0.00104200589108055 0.00089371976519463 0.000946059357595178 0.000747692072938125 0.00074082536327242 0.000724721594089508 45548 38949 667 665 0 True 344 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 388 631 0.000979917457156064 0.00101319905394064 0.000854505226215 0.000900282291905089 0.000710850825769648 0.000707756272056649 42834 44156 667 665 0 True 388 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 433 633 0.000971452932265842 0.000951749940197254 0.000732433051041428 0.000671396963454643 0.00085927867494321 0.000883124143271646 42464 41478 667 665 0 False 433 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 478 632 0.000865669248232373 0.000942319176288168 0.000473029678797589 0.000564583810177768 0.000939631001874294 0.000957411101709776 37840 41067 667 665 0 False 478 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 522 632 0.000903347822541007 0.000927771477216731 0.000564583810177768 0.000534065766384375 0.000955284963459281 0.000963298210446091 39487 40433 667 665 0 False 522 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 567 632 0.000942170251564536 0.000947459057348108 0.000671396963454643 0.000686655985351339 0.000907969459310053 0.00084368604882861 41184 41291 667 665 0 False 567 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 612 632 0.00100471622737498 0.00089583078777282 0.000823987182421607 0.000762951094834821 0.000787236561682626 0.000673321505254812 43918 39041 667 665 0 False 612 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 656 632 0.000903324945446709 0.000844317247685476 0.000701915007248035 0.000671396963454643 0.000739904464324604 0.000716676505434419 39486 36796 667 665 0 False 656 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 254 682 0.00109231262144163 0.0723773728209285 0.000976577401388571 0.0724193179217212 0.000764501036778036 0.0239538192468593 47747 3154262 667 665 0 True 254 677 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 299 677 0.00101080153445822 0.000971827600587644 0.000885023270008392 0.000869764248111696 0.000717839505573358 0.000702512484964175 44184 42353 667 665 0 False 299 677 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 344 676 0.000972322261849162 0.00103651208589108 0.000839246204318303 0.000869764248111696 0.000683627785827999 0.000734139227012435 42502 45172 667 665 0 False 344 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 388 676 0.000974381200335973 0.00100989484468782 0.000885023270008392 0.000885023270008392 0.000703229255270461 0.000709157877623429 42592 44012 667 665 0 False 388 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 433 676 0.000916456397573701 0.000956178498431935 0.000732433051041428 0.000839246204318303 0.000785466142814048 0.000745217676482293 40060 41671 667 665 0 False 433 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 478 676 0.000939425000248788 0.000983736521436344 0.000762951094834821 0.000747692072938125 0.000793925210482835 0.000806427835413778 41064 42872 667 665 0 False 478 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 522 676 0.000861208214844283 0.000976783914466872 0.000549324788281071 0.000701915007248035 0.000861194348399827 0.000914135348384497 37645 42569 667 665 0 False 522 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 567 676 0.000888569219624566 0.000986719488122917 0.000656137941557946 0.000762951094834821 0.000793423598817527 0.000837841411256909 38841 43002 667 665 0 False 567 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 612 675 0.000962393602923876 0.00101235005572985 0.000762951094834821 0.000869764248111696 0.000750063488824825 0.000750719751406333 42068 44119 667 665 0 False 612 675 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 652 680 0.000923731313560432 0.0749490342932176 0.000732433051041428 0.0723735408560311 0.000748600267263378 0.0213217563461499 40378 3266337 667 665 0 True 656 675 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D2_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D2_1.csv new file mode 100755 index 0000000..490828b --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D2_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 274 265 0.00946706779363809 0.0409531725858478 0.00944533455405508 0.041214618142977 0.00147489044736776 0.00928769075827161 413823 1784771 667 665 0 True 273 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 318 265 0.0093886908685735 0.00966871286708417 0.009399557488365 0.00965896086060884 0.00131830699433333 0.00144959311735409 410397 421370 667 665 0 False 318 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 362 265 0.00961460217476522 0.0646428843911105 0.00958266575112535 0.0645456626230259 0.00136937709557805 0.0102864348726688 420272 2817187 667 665 0 True 362 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 406 265 0.00958399262259463 0.114775310902571 0.00956740672922866 0.113527122911421 0.00145657266956762 0.0307272431050066 418934 5001997 667 665 0 True 407 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 450 265 0.00951835823905397 0.0740000149148334 0.00953688868543526 0.0713817044327459 0.00166682534047833 0.0138402639368796 416065 3224978 667 665 0 True 452 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 495 265 0.00922894011909129 0.0655345390255222 0.00921644922560464 0.0688334477759976 0.00181895315307024 0.0177512456726548 403414 2856046 667 665 0 True 496 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 539 264 0.00931482073108559 0.0790442345277247 0.009399557488365 0.0772106507972839 0.00157791122069924 0.0239578592383419 407168 3444809 667 665 0 True 541 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 583 263 0.00935293397018588 0.0676223174094541 0.00950637064164187 0.0666208896009766 0.00180922454431529 0.0206897822728631 408834 2947033 667 665 0 True 586 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 631 264 0.0091266337533911 0.0091477951000183 0.00910963607232776 0.00918593118181125 0.00193127789492293 0.00182298761070838 398942 398668 667 665 0 False 631 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 671 264 0.00922850545429963 0.0423578057067595 0.00926222629129473 0.0421454184786755 0.00192409132038925 0.0076363386945416 403395 1845986 667 665 0 True 675 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 273 309 0.00907511453703224 0.00903733354902477 0.00903334096284428 0.00903334096284428 0.00145365309783472 0.00145036065369089 396690 393854 667 665 0 False 273 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 318 309 0.00924330693431037 0.00936690547609582 0.00923170824750134 0.00932326237888151 0.00134401153063911 0.00146729754370667 404042 408217 667 665 0 False 318 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 363 310 0.00963148547035706 0.110784009692347 0.00953688868543526 0.110307469291218 0.00161143907964709 0.0230405205348413 421010 4828053 667 665 0 True 363 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 408 310 0.00958598292979855 0.0571012562305283 0.00953688868543526 0.0564736400396735 0.001509509804005 0.00916589898460715 419021 2488517 667 665 0 True 407 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 450 309 0.00967865803879932 0.0844841102527433 0.00967421988250553 0.0840009155413138 0.00186327871637231 0.0164477882930739 423072 3681883 667 665 0 True 452 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 496 309 0.00933483818859625 0.042759542481748 0.0093690394445716 0.044083314259556 0.00172702397800542 0.00742143871641162 408043 1863494 667 665 0 True 497 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 540 308 0.00951067153536988 0.0433420929297379 0.00950637064164187 0.0466620889600977 0.00154685456773399 0.0088103090962349 415729 1888882 667 665 0 True 541 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 584 308 0.00944062187262972 0.0519784469183946 0.00935378042267491 0.0542000457770657 0.00188334014850983 0.0102203935518184 412667 2265261 667 665 0 True 586 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 631 308 0.00922113902993571 0.00906950369744457 0.00924696726939803 0.00904859998474098 0.00193280325886779 0.00207749914934027 403073 395256 667 665 0 False 631 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 675 307 0.00912171517811705 0.00928599824119695 0.00909437705043107 0.0093842984664683 0.00181679831520242 0.00198180823567598 398727 404691 667 665 0 False 675 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 274 354 0.0091832088075898 0.0520320485351626 0.00909437705043107 0.0516670481422141 0.00145492513189204 0.0118708646875428 401415 2267597 667 665 0 True 273 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 319 354 0.00929057101112982 0.0644862556941679 0.00933852140077821 0.0671854734111543 0.00134891900855696 0.0187051301013016 406108 2810361 667 665 0 True 318 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 363 354 0.00948404259760713 0.0421564325095182 0.00947585259784848 0.0423590447852293 0.00135516490284811 0.0107283398944126 414565 1837210 667 665 0 True 363 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 407 355 0.00950307634006297 0.0343140754151343 0.00955214770733196 0.0356755931944762 0.00155266148640587 0.0056621170330074 415397 1495434 667 665 0 True 408 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 452 354 0.00962471385044489 0.0738489620710049 0.00964370183871214 0.0705424582284276 0.0017679478179332 0.0138230744447435 420714 3218395 667 665 0 True 452 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 497 353 0.00968533815033431 0.0337776232754007 0.00967421988250553 0.0348363469901579 0.00166929389264146 0.00471850029372289 423364 1472055 667 665 0 True 497 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 540 352 0.00957264558382287 0.0295486943497448 0.00955214770733196 0.0298619058518349 0.00165605246201806 0.00325471698686186 418438 1287755 667 665 0 True 542 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 584 352 0.00955226209280345 0.0525816716201123 0.00952162966353857 0.0527199206530861 0.00195980972205463 0.0102153909953258 417547 2291550 667 665 0 True 586 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 628 352 0.0096288774816071 0.0588734367390208 0.00962844281681544 0.0598001068131533 0.0020209617416636 0.012499448358776 420896 2565750 667 665 0 True 631 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 672 352 0.00946450555907672 0.0624335615876496 0.00953688868543526 0.062027924010071 0.00190109615607283 0.0178579968307455 413711 2720903 667 665 0 True 676 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 275 397 0.00914219017751367 0.0442726638064605 0.00912489509422446 0.0480201419089036 0.00154496726094714 0.0113477444157807 399622 1929437 667 665 0 True 274 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 319 397 0.00943876882799159 0.0316591432804947 0.00944533455405508 0.0325780117494469 0.0014428929384225 0.00460923189537214 412586 1379730 667 665 0 True 318 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 363 398 0.0094593582128597 0.0871134577115712 0.0093842984664683 0.0836804760814832 0.00148308658793813 0.0219027405903147 413486 3796472 667 665 0 True 363 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 407 397 0.00981454797892883 0.0688766319552601 0.00978103303578241 0.0691081101701381 0.0015200154558368 0.0181216821001835 429012 3001697 667 665 0 True 408 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 452 397 0.00963514580544473 0.0453721853271311 0.00968947890440223 0.0470893415732052 0.00170385515608241 0.00792352267411363 421170 1977355 667 665 0 True 452 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 496 396 0.00966431410067454 0.0562467051125181 0.00968947890440223 0.0574959945067521 0.00185103182167661 0.0120455763932081 422445 2451275 667 665 0 True 497 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 540 395 0.00973589652873266 0.0421496864156271 0.00975051499198901 0.0434729533836881 0.00165799697471579 0.00680984070087132 425574 1836916 667 665 0 True 542 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 585 396 0.00951510969166367 0.051086012123465 0.00955214770733196 0.0508125429159991 0.00192634628020146 0.00728076305743995 415923 2226368 667 665 0 True 586 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 628 396 0.00954288248414131 0.0429958852269149 0.00958266575112535 0.0445105668726635 0.00191511591893884 0.00763915968738593 417137 1873794 667 665 0 True 631 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 673 395 0.00947372502807877 0.0805694253945691 0.00944533455405508 0.0768902113374533 0.00176035245276031 0.0154782284906969 414114 3511278 667 665 0 True 676 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 276 441 0.00915095210462976 0.0429403102629543 0.00912489509422446 0.0439459830624857 0.00161122390119484 0.0071782916780536 400005 1871372 667 665 0 True 274 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 320 440 0.0106249919215261 0.0521870021815812 0.00953688868543526 0.0519874876020447 0.0067581112130309 0.00912634368346226 464438 2274350 667 665 0 True 319 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 364 441 0.00954393483047902 0.0347081941521233 0.00949111161974517 0.0354619668879225 0.00152814864237424 0.00366150049995296 417183 1512610 667 665 0 True 363 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 408 441 0.00985970736307287 0.0553537884537391 0.00993362325474937 0.0544747081712062 0.00163742942736123 0.0122718303907336 430986 2412361 667 665 0 True 408 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 453 441 0.00998841389559283 0.101858652123557 0.00996414129854276 0.101503013656825 0.00173854262169838 0.0148751470318308 436612 4439079 667 665 0 True 453 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 496 439 0.0098506251566366 0.0612643533760012 0.00988784618905928 0.0623941405355917 0.00181653854629858 0.0153452992970878 430589 2669948 667 665 0 True 497 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 541 439 0.0097626627290612 0.0548732554664299 0.0097962920576791 0.0553749904631113 0.00173403073760395 0.00970337640333547 426744 2391419 667 665 0 True 542 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 587 438 0.00979748166658259 0.0322374257915331 0.00978103303578241 0.0335088120851453 0.00181673316976248 0.00583331840447403 428266 1404932 667 665 0 False 587 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 630 440 0.0095811101087131 0.0387707194284636 0.00958266575112535 0.0394750896467536 0.00188641196629653 0.00465085351929573 418808 1689658 667 665 0 True 631 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 673 439 0.00956493600304448 0.0713710575362646 0.00961318379491875 0.0695963988708324 0.00188661027902653 0.0142263048674175 418101 3110406 667 665 0 True 676 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 277 485 0.00917266246711847 0.0550915168442966 0.00921644922560464 0.0561837186236362 0.0015084500717804 0.0138826553682786 400954 2400931 667 665 0 True 274 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 321 484 0.009691995384775 0.0563511089465481 0.00970473792629892 0.0558175020981155 0.00149246117503738 0.00850641147255307 423655 2455825 667 665 0 True 319 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 365 485 0.00992120099254561 0.0718554224884711 0.00988784618905928 0.0683604180972 0.001630363717221 0.0173430243544575 433674 3131515 667 665 0 True 363 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 409 485 0.00991609940051718 0.091154069655714 0.00994888227664607 0.0860151064316777 0.00175457318702507 0.0204661321735739 433451 3972565 667 665 0 True 408 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 454 485 0.00997594587920048 0.0990830245675989 0.0100404364080262 0.0942854962996872 0.00196038673410812 0.0325346612208173 436067 4318115 667 665 0 True 453 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 498 484 0.00986430565902675 0.0447047809498569 0.00990310521095598 0.045639734493019 0.00186411353675633 0.00733230201674522 431187 1948269 667 665 0 True 497 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 542 482 0.00963892052600388 0.0282168685618831 0.00968947890440223 0.0278171969176776 0.00180616555996086 0.0105145993060218 421335 1229713 667 665 0 False 542 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 586 483 0.00974696904237284 0.100333369473122 0.00965896086060884 0.0958419165331502 0.00195140204021979 0.0184600271389111 426058 4372606 667 665 0 True 587 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 631 484 0.00961949787294496 0.0643119127642866 0.00958266575112535 0.0654154268711376 0.00184824389192254 0.0175907013860089 420486 2802763 667 665 0 True 631 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 675 484 0.00968524664195712 0.078732560400773 0.00962844281681544 0.0744945448996719 0.00190569092082114 0.014642384600323 423360 3431226 667 665 0 True 676 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 277 529 0.00922402154381724 0.0552273795039212 0.00915541313801785 0.0580300602731365 0.00184482203619509 0.012693610339791 403199 2406852 667 665 0 True 274 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 322 529 0.00955951413169588 0.109798368661411 0.00958266575112535 0.100907911802853 0.00145016391630599 0.0284987379775495 417864 4785098 667 665 0 True 319 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 366 529 0.00969181236802061 0.0580374488521602 0.00967421988250553 0.0606240939955749 0.00147572185639376 0.0114936670139205 423647 2529317 667 665 0 True 364 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 411 529 0.00987771163628531 0.0631077120588149 0.00994888227664607 0.0610513466086824 0.00170826809019882 0.0123716496526714 431773 2750283 667 665 0 True 408 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 455 528 0.0100386748717653 0.0566464914862115 0.0101319905394064 0.0566872663462272 0.00197308612310138 0.00777366398829433 438809 2468698 667 665 0 True 453 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 498 526 0.00983609820175744 0.0656014263169941 0.0098268101014725 0.0649271381704433 0.00192677259893701 0.0131775552404083 429954 2858961 667 665 0 True 498 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 543 525 0.00970235870849194 0.074110476465827 0.00971999694819562 0.0727092393377585 0.00176678688403383 0.0181581979533267 424108 3229792 667 665 0 True 542 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 586 525 0.00955379485812141 0.0572398035601707 0.00953688868543526 0.057953765163653 0.00169785744970379 0.0132991269572361 417614 2494555 667 665 0 True 587 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 631 526 0.00970116909958845 0.0486550090033966 0.0098115510795758 0.0476844434271763 0.00195238840507317 0.00705550525123554 424056 2120423 667 665 0 True 632 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 675 525 0.00950410580930638 0.0672119070851769 0.00946059357595178 0.0673228046082246 0.00191408351576391 0.012910680226937 415442 2929147 667 665 0 True 676 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 278 570 0.00889683334116874 0.0459054479870998 0.00891126878767071 0.0463874265659571 0.0013650516356388 0.00935772576616124 388897 2000595 667 665 0 True 274 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 322 568 0.00943899759893457 0.053553384491212 0.00950637064164187 0.0541390096894789 0.00151783912623408 0.0112849647743832 412596 2333898 667 665 0 True 319 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 366 570 0.00959634625351549 0.0446134792233502 0.00953688868543526 0.0452277409018082 0.00132067837543416 0.00699185459666827 419474 1944290 667 665 0 True 364 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 410 569 0.00973786395884228 0.0512793313106525 0.00978103303578241 0.0508888380254826 0.00168586329187355 0.0066628803874652 425660 2234793 667 665 0 True 408 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 455 569 0.0100592185024448 0.0898012713174559 0.0101167315175097 0.0840314335851072 0.00193823777621264 0.0209105424676563 439707 3913609 667 665 0 True 453 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 499 568 0.00962956379443604 0.0598467099311566 0.00975051499198901 0.0588693064774548 0.00204433308361177 0.00947445373801059 420926 2608166 667 665 0 True 498 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 543 567 0.00947981033516201 0.0514365566009324 0.00946059357595178 0.0514076447699702 0.00190703538532261 0.00577368036714564 414380 2241645 667 665 0 True 542 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 587 566 0.00935462687516393 0.0370073271987476 0.00943007553215839 0.0380712596322576 0.00178759727019715 0.00750602155861756 408908 1612808 667 665 0 True 587 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 631 567 0.00930649346876116 0.0459331895772849 0.00927748531319142 0.0459296559090562 0.00178487441049114 0.00631679925375465 406804 2001804 667 665 0 True 632 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 675 567 0.00927549500598751 0.0535666931118136 0.00932326237888151 0.052475776302739 0.00166750870544987 0.00696195837903773 405449 2334478 667 665 0 True 677 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 275 614 0.00877929083066615 0.00859897512148419 0.00878919661249714 0.00865186541542687 0.00135166174322617 0.00137509364603491 383759 374750 667 665 0 False 275 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 319 613 0.00898996599205547 0.00910578116153281 0.00900282291905089 0.00910963607232776 0.00138969446596237 0.00141294654271023 392968 396837 667 665 0 False 319 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 366 613 0.00940436167816756 0.0685530030156646 0.00944533455405508 0.0663157091630426 0.00144790750573414 0.0117151360722353 411082 2987593 667 665 0 True 364 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 409 612 0.00948809184329785 0.0774096376211759 0.00946059357595178 0.0746166170748455 0.00156259666710263 0.0234210786385889 414742 3373572 667 665 0 True 409 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 453 613 0.00952744044549023 0.00944599998508517 0.00959792477302205 0.00943007553215839 0.00193842911075537 0.00193243588537448 416462 411664 667 665 0 False 453 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 498 613 0.00927727941934274 0.00920626124707512 0.00932326237888151 0.00921644922560464 0.00197305434481326 0.00202636060921088 405527 401216 667 665 0 False 498 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 543 612 0.00908797146402766 0.00904995379269873 0.00904859998474098 0.00901808194094758 0.00181220498264903 0.00199919255587449 397252 394404 667 665 0 False 543 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 587 612 0.00954096080822029 0.00917815252252857 0.00947585259784848 0.00924696726939803 0.00173572337527259 0.00164991238590172 417053 399991 667 665 0 False 587 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 632 612 0.00905932934196669 0.00922932187415208 0.00898756389715419 0.00923170824750134 0.00153414760511625 0.00141899067839662 396000 402221 667 665 0 False 632 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 677 612 0.00921887419760022 0.00932135786938162 0.00915541313801785 0.00930800335698482 0.00167986584027335 0.00157504087009764 402974 406232 667 665 0 False 677 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 276 662 0.00875227298230034 0.0391326221252376 0.00869764248111696 0.0390783550774395 0.00132378189268643 0.00790459827614033 382578 1705430 667 665 0 True 275 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 319 657 0.00878754946170769 0.00881260142803794 0.00883497367818723 0.00878919661249714 0.00125317562912503 0.00134328580321653 384120 384060 667 665 0 False 319 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 364 657 0.0088515824486475 0.0090740469851672 0.00878919661249714 0.00904859998474098 0.0013599040611049 0.00133917632067545 386919 395454 667 665 0 False 364 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 409 657 0.00920892266158063 0.00890695495892397 0.00923170824750134 0.0089570458533608 0.00137597745300256 0.00136541023545487 402539 388172 667 665 0 False 409 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 453 656 0.00901632040468665 0.00911844729700195 0.00903334096284428 0.00903334096284428 0.00161377346025682 0.00167433784160073 394120 397389 667 665 0 False 453 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 498 656 0.00901101291880954 0.00884862648725269 0.00904859998474098 0.00891126878767071 0.00167349671227687 0.00167573398842922 393888 385630 667 665 0 False 498 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 543 656 0.00895722887011518 0.00894823462868662 0.00892652780956741 0.0089723048752575 0.00169041043991034 0.00178879691237222 391537 389971 667 665 0 False 543 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 588 656 0.00890632733530237 0.0090038325385448 0.0089417868314641 0.00904859998474098 0.00142782689752946 0.00127942166027131 389312 392394 667 665 0 False 588 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 632 656 0.00901041811435779 0.00909490480607561 0.00909437705043107 0.00917067215991455 0.0013704716060277 0.00132149393289813 393862 396363 667 665 0 False 632 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 673 660 0.00897566780811929 0.0396994775792766 0.0089570458533608 0.0401007095445182 0.00145029149792654 0.00756594104834014 392343 1730134 667 665 0 True 677 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D2_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D2_2.csv new file mode 100755 index 0000000..468ea49 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D2_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 274 265 0.00797978213914329 0.762529234507647 0.00799572747386892 0.771725032425422 0.00172239269829993 0.193685501859499 348811 33231615 667 665 15 True 273 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 318 265 0.00690938577403905 0.00652044393428065 0.00689707789730678 0.00651560234988937 0.00139184246634267 0.00124838958615582 302022 284166 667 665 0 False 318 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 362 265 0.00637456506354285 0.00643439681832184 0.0063935301747158 0.00643930724040589 0.00127022830871193 0.00121564663125177 278644 280416 667 665 0 True 362 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 406 265 0.00606037105045555 0.00620057812188976 0.00607309071488518 0.00617990386816205 0.00137876350504868 0.00129292377171724 264910 270226 667 665 0 True 407 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 450 265 0.00626649367007959 0.00634417354900182 0.00634775310902571 0.00616464484626535 0.00161859399183685 0.00213777936633881 273920 276484 667 665 0 True 452 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 495 265 0.00626839246890631 0.00647202809036783 0.00630197604333562 0.00654612039368277 0.00159171625541024 0.00158238427883888 274003 282056 667 665 0 True 496 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 539 264 0.00661619293351722 0.00669283646286694 0.00665293354695964 0.00671396963454643 0.00143447254802162 0.00150085439935151 289206 291679 667 665 0 True 541 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 583 263 0.00687900499281145 0.00712412755395011 0.00683604180972 0.00712596322575723 0.00171487900510648 0.00181340026859064 300694 310475 667 665 0 True 586 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 631 264 0.00875229585939463 0.00765101125438912 0.00793469138628214 0.00770580605783169 0.00460624737650898 0.00173473755284279 382579 333437 667 665 0 False 631 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 671 264 0.00914214442332507 0.797315123469007 0.00910963607232776 0.785732814526589 0.00197280599531541 0.157146809426755 399620 34747611 667 665 17 True 675 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 273 309 0.00646497534020813 0.00630798786850395 0.00645456626230259 0.00628671702143893 0.00161261019076866 0.00137973744137208 282596 274907 667 665 0 False 273 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 318 309 0.00611783831133186 0.00611891367237044 0.00611886778057527 0.00610360875867857 0.00129356738266238 0.00130995362374472 267422 266667 667 665 0 False 318 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 363 310 0.00611676308789986 0.0060811906167341 0.00611886778057527 0.00607309071488518 0.0013177598894182 0.00134261864245362 267375 265023 667 665 0 True 363 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 408 310 0.00613597984711009 0.00618619104410144 0.00605783169298848 0.00624093995574884 0.00141556603873896 0.00142036752202946 268215 269599 667 665 0 True 407 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 450 309 0.00639515444841095 0.00687374191945875 0.0063782711528191 0.00683604180972 0.00164964793220232 0.00192863083411423 279544 299563 667 665 0 True 452 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 496 309 0.00661390522408743 0.0066367107973642 0.00662241550316625 0.00665293354695964 0.00165260581985254 0.00156673145471842 289106 289233 667 665 0 True 497 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 540 308 0.00667231044582996 0.00671585119814873 0.00662241550316625 0.00665293354695964 0.00145594564031862 0.00145844461105008 291659 292682 667 665 0 True 541 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 584 308 0.00690476460099088 0.00698427230814505 0.00683604180972 0.00694285496299687 0.00185953165175197 0.0019889731264193 301820 304380 667 665 0 True 586 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 631 308 0.00705497560215086 0.00716501714345374 0.00711070420386053 0.0072480354009308 0.00196340519882907 0.00191384786905558 308386 312257 667 665 0 False 631 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 675 307 0.00725464688118289 0.00719464029724116 0.00732433051041428 0.00720225833524071 0.00200615364129962 0.0018849597686027 317114 313548 667 665 0 False 675 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 274 354 0.00583299561022876 0.00586359466989745 0.00587472343022812 0.00582894636453803 0.00137012989698613 0.00137621401801261 254971 255540 667 665 0 True 273 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 319 354 0.00599384446023727 0.0059491369761093 0.005981536583505 0.00604257267109178 0.00125736035806803 0.00127712037315444 262002 259268 667 665 0 True 318 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 363 354 0.00607551568688075 0.00626448244667517 0.00607309071488518 0.00628671702143893 0.00122486906605702 0.00126941043291183 265572 273011 667 665 0 True 363 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 407 355 0.00641585821875055 0.00658964876140913 0.0063935301747158 0.00659189745937285 0.00146230303718867 0.00145153428802082 280449 287182 667 665 0 True 408 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 452 354 0.00672307471807699 0.00688124522797036 0.00674448767833982 0.00694285496299687 0.00156508944318952 0.0016912525215424 293878 299890 667 665 0 True 452 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 497 353 0.00675370714734187 0.00683794631921989 0.00668345159075303 0.00685130083161669 0.00174596646931113 0.00158855587118558 295217 298003 667 665 0 True 497 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 540 352 0.00684967655792154 0.0068328982217503 0.00688181887541009 0.00689707789730678 0.00163338788104654 0.00169262916722978 299412 297783 667 665 0 True 542 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 584 352 0.00683750594375506 0.00704783244446663 0.00689707789730678 0.00704966811627375 0.0019787534382839 0.00198725820148092 298880 307150 667 665 0 True 586 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 628 352 0.00687927951794302 0.00677913598369923 0.00698863202868696 0.00675974670023652 0.00190126190095366 0.00201978429386053 300706 295440 667 665 0 True 631 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 672 352 0.00624283875457556 0.00643524581653263 0.00631723506523232 0.00645456626230259 0.00188546663826898 0.00188831752567351 272886 280453 667 665 0 True 676 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 275 397 0.00597643499147657 0.00602286214506282 0.005981536583505 0.0059510185397116 0.00137226156676559 0.00163043979780001 261241 262481 667 665 0 True 274 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 319 397 0.00620161423065075 0.0729708455161708 0.00617990386816205 0.076249332417792 0.00134093709933933 0.016916188028149 271084 3180126 667 665 0 True 318 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 363 398 0.0064631680497586 0.00666484246780834 0.0064087891966125 0.00668345159075303 0.00141146116912918 0.00132945213334944 282517 290459 667 665 0 True 363 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 407 397 0.00658132824180723 0.00678131584397019 0.00660715648126955 0.0068055237659266 0.00147230751621656 0.00141069516156853 287682 295535 667 665 0 True 408 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 452 397 0.00691171923765744 0.00702635508432331 0.00695811398489357 0.00695811398489357 0.00154379400841216 0.00167307738419164 302124 306214 667 665 0 True 452 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 496 396 0.00702697403873023 0.00706924096691718 0.00709544518196384 0.00711070420386053 0.00181767547933823 0.00165796980022393 307162 308083 667 665 0 True 497 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 540 395 0.00698204342552917 0.00695487861333352 0.00700389105058366 0.00695811398489357 0.00152133063445397 0.00154367595042917 305198 303099 667 665 0 True 542 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 585 396 0.00669084089221125 0.00678400051398811 0.00671396963454643 0.00671396963454643 0.00176928143016814 0.00187721037144409 292469 295652 667 665 0 True 586 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 628 396 0.00629730911609885 0.00618779725693267 0.00642404821850919 0.00616464484626535 0.0018089450080519 0.00189737417390572 275267 269669 667 665 0 True 631 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 673 395 0.00608338540731923 0.00606673470125302 0.00604257267109178 0.00613412680247196 0.00171907192143069 0.00191820287125591 265916 264393 667 665 0 True 676 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 276 441 0.00595685219875757 0.00612299804214129 0.0059510185397116 0.00611886778057527 0.00145956301878474 0.00151051734000058 260385 266845 667 665 0 True 274 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 320 440 0.006689285249799 0.00618082170406561 0.00633249408712902 0.00616464484626535 0.00346516239160883 0.00137386582321107 292401 269365 667 665 0 True 319 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 364 441 0.00642262983866272 0.00650135294748659 0.00642404821850919 0.00656137941557946 0.00135118572619882 0.00131907415110788 280745 283334 667 665 0 True 363 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 408 441 0.00659512312966886 0.00659972201045071 0.00665293354695964 0.00660715648126955 0.00153934335766182 0.00153886140050774 288285 287621 667 665 0 True 408 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 453 441 0.00693969792398376 0.00699622712078893 0.00688181887541009 0.00701915007248035 0.00172795870531957 0.00178622544038248 303347 304901 667 665 0 True 453 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 496 439 0.00695257772807348 0.00706100338968272 0.00704966811627375 0.00711070420386053 0.00175393063114092 0.00172542491353873 303910 307724 667 665 0 True 497 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 541 439 0.00671108712066489 0.00676463417642298 0.00677500572213321 0.0068055237659266 0.00170288846378464 0.00164795681283139 293354 294808 667 665 0 True 542 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 587 438 0.00621664448160447 0.00603011304870095 0.00631723506523232 0.00610360875867857 0.00173255779380167 0.00196564846844432 271741 262797 667 665 0 False 587 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 630 440 0.0057988629855363 0.00588442954490828 0.00585946440833143 0.0059510185397116 0.00181711785907367 0.00179410597449416 253479 256448 667 665 0 True 631 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 673 439 0.00580938644891333 0.00590078996988925 0.00592050049591821 0.00579842832074464 0.0018216347023992 0.00174177226541295 253939 257161 667 665 0 True 676 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 277 485 0.00614142459555299 0.0061894034697639 0.00607309071488518 0.00614938582436866 0.00157386521128346 0.00152937251180853 268453 269739 667 665 0 True 274 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 321 484 0.00625853244126392 0.00619676910288998 0.00619516289005875 0.00613412680247196 0.00149533376894228 0.00156098098078839 273572 270060 667 665 0 True 319 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 365 485 0.00634942313690946 0.00640956935713052 0.00634775310902571 0.00643930724040589 0.0014748895105696 0.00144278106024417 277545 279334 667 665 0 True 363 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 409 485 0.00653735846656667 0.00657078723359096 0.00663767452506294 0.00659189745937285 0.00174579087324148 0.00165582855777684 285760 286360 667 665 0 True 408 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 454 485 0.0067827153029116 0.00685242518059856 0.00685130083161669 0.00685130083161669 0.00192822668790555 0.00183053981829878 296485 298634 667 665 0 True 453 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 498 484 0.00667951673053379 0.00662236961137107 0.00660715648126955 0.00665293354695964 0.00181612623542744 0.00183365534936534 291974 288608 667 665 0 True 497 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 542 482 0.00627186978723959 0.00615009714719392 0.00634775310902571 0.00610360875867857 0.00169236283115972 0.00161411137192563 274155 268026 667 665 0 False 542 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 586 483 0.00594843342805594 0.00586969827865613 0.00593575951781491 0.00584420538643473 0.00181258108876877 0.00189928433321957 260017 255806 667 665 0 True 587 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 631 484 0.00597702979592831 0.00580159485461192 0.0059662775616083 0.00582894636453803 0.00179756759580204 0.00163777023672772 261267 252838 667 665 0 True 631 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 675 484 0.00594699217111517 0.00620730126988334 0.0059662775616083 0.00619516289005875 0.00177308870520078 0.00176042665839829 259954 270519 667 665 0 True 676 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 277 529 0.00633395822116408 0.00618860036334829 0.00621042191195544 0.00627145799954223 0.00156327542635945 0.00141715928179673 276869 269704 667 665 0 True 274 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 322 529 0.00632160459024322 0.00637581594177708 0.00631723506523232 0.00642404821850919 0.00149586592358462 0.00140261582395469 276329 277863 667 665 0 True 319 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 366 529 0.0062793963512636 0.00651108200806434 0.00619516289005875 0.00643930724040589 0.00142412676633067 0.00151426215701514 274484 283758 667 665 0 True 364 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 411 529 0.00639062478373997 0.00655070957320057 0.00642404821850919 0.00653086137178607 0.00168148132459589 0.0016742347008245 279346 285485 667 665 0 True 408 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 455 528 0.00640389349843275 0.00634066282667071 0.00636301213092241 0.0063782711528191 0.00186410265742162 0.00184607731844844 279926 276331 667 665 0 True 453 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 498 526 0.00640757671061471 0.0065763401408075 0.00634775310902571 0.00646982528419928 0.00171523260161595 0.00181313402695958 280087 286602 667 665 0 True 498 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 543 525 0.00611353741760386 0.00612040515571373 0.00611886778057527 0.00608834973678187 0.00163651563829438 0.00166449443304367 267234 266732 667 665 0 True 542 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 586 525 0.00619363012474079 0.00619105557439031 0.00625619897764553 0.00617990386816205 0.00156958463542239 0.00171434307906654 270735 269811 667 665 0 True 587 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 631 526 0.00593180178050137 0.0060375245736222 0.00587472343022812 0.00602731364919509 0.00180678050797233 0.0018122018903606 259290 263120 667 665 0 True 632 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 675 525 0.0061793548178989 0.00610285154405813 0.00619516289005875 0.00619516289005875 0.00165776497131389 0.0016932583695066 270111 265967 667 665 0 True 676 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 278 570 0.00640636422461692 0.00630897454210027 0.0064087891966125 0.0063782711528191 0.00130301645198601 0.00134403752881669 280034 274950 667 665 0 True 274 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 322 568 0.00634047819303898 0.00652714413637665 0.00642404821850919 0.00657663843747616 0.00136823587097962 0.00136546019787429 277154 284458 667 665 0 True 319 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 366 570 0.00648501567481309 0.00639504460395668 0.00651560234988937 0.0063782711528191 0.00136784809003099 0.00129614495468575 283472 278701 667 665 0 True 364 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 410 569 0.0061456339809038 0.0064399038337432 0.00617990386816205 0.00634775310902571 0.0016696631353967 0.00157185434546836 268637 280656 667 665 0 True 408 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 455 569 0.00631497023289683 0.00646337748697677 0.0063935301747158 0.00643930724040589 0.00192843103030924 0.00173957703031179 276039 281679 667 665 0 True 453 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 499 568 0.00636145648851015 0.00637267235380738 0.0063935301747158 0.00643930724040589 0.00192017035778496 0.00205357785069547 278071 277726 667 665 0 True 498 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 543 567 0.00623499191123138 0.00645709031103738 0.00622568093385214 0.00656137941557946 0.00175583533931734 0.0018161898165907 272543 281405 667 665 0 True 542 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 587 566 0.00639453676686491 0.00638003798693346 0.00651560234988937 0.00642404821850919 0.0016748802944322 0.00150392397619277 279517 278047 667 665 0 True 587 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 631 567 0.00610040596547686 0.00619828353213085 0.00613412680247196 0.00621042191195544 0.00162978504554093 0.00152582120989552 266660 270126 667 665 0 True 632 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 675 567 0.00607839820076229 0.00637150211303034 0.00607309071488518 0.0063782711528191 0.00154730790992199 0.00170043896104787 265698 277675 667 665 0 True 677 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 275 614 0.00666494402146603 0.00660346219175772 0.00662241550316625 0.00665293354695964 0.00133945593144624 0.00129866266044181 291337 287784 667 665 0 False 275 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 319 613 0.00643784310637082 0.00624527673039316 0.00643930724040589 0.00622568093385214 0.00139440582455008 0.00130387846959781 281410 272174 667 665 0 False 319 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 366 613 0.0061358425845443 0.00636521493709095 0.00605783169298848 0.00633249408712902 0.00138810225568298 0.00125449334307487 268209 277401 667 665 0 True 364 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 409 612 0.00600962965530281 0.00611577008440075 0.00602731364919509 0.00605783169298848 0.00144138220666082 0.00146776226133753 262692 266530 667 665 0 True 409 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 453 613 0.00615306903655062 0.00611895956416562 0.00614938582436866 0.00613412680247196 0.0017520629429933 0.0019739045530419 268962 266669 667 665 0 False 453 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 498 613 0.00620566347634148 0.00615796759006695 0.00617990386816205 0.00619516289005875 0.00191601014932805 0.00185091006893042 271261 268369 667 665 0 False 498 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 543 612 0.0061369178079763 0.00615124444207337 0.00621042191195544 0.00630197604333562 0.00172935351789995 0.00193406691125936 268256 268076 667 665 0 False 543 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 587 612 0.00634116450586792 0.00608594041753503 0.00636301213092241 0.00610360875867857 0.00163544171028617 0.00163245105998647 277184 265230 667 665 0 False 587 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 632 612 0.00617999537653924 0.00626735068387379 0.00616464484626535 0.00630197604333562 0.00143848648986419 0.00139040265970826 270139 273136 667 665 0 False 632 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 677 612 0.00642731964299379 0.00645128499894736 0.00648508430609598 0.00650034332799268 0.0016182484452279 0.00149089784427408 280950 281152 667 665 0 False 677 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 276 662 0.00826762173959942 0.768055501537088 0.00804150453955901 0.770000762951095 0.00192634735173101 0.182925666830893 361393 33472454 667 665 15 True 275 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 319 657 0.00689373784153929 0.00651844764119041 0.00665293354695964 0.00653086137178607 0.00167277546594607 0.00126333356407207 301338 284079 667 665 0 False 319 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 364 657 0.00620079065525603 0.00614523261690505 0.00622568093385214 0.00614938582436866 0.00122952106389871 0.00117362421749297 271048 267814 667 665 0 False 364 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 409 657 0.00579426468958242 0.00575083852914502 0.00575265125505455 0.00569161516746777 0.00140371243359506 0.00135523084427577 253278 250626 667 665 0 False 409 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 453 656 0.00584546362662111 0.00606606927022294 0.00579842832074464 0.00613412680247196 0.00141682454537408 0.00152638480256073 255516 264364 667 665 0 False 453 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 498 656 0.00608283635705608 0.00589851832602793 0.00605783169298848 0.00588998245212482 0.00162826694922129 0.00157354355130726 265892 257062 667 665 0 False 498 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 543 656 0.00621229783368787 0.00603917667824861 0.00614938582436866 0.00610360875867857 0.00164969284336553 0.00165261554872148 271551 263192 667 665 0 False 543 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 588 656 0.00610020007162818 0.00621441449813593 0.00613412680247196 0.00624093995574884 0.00135674378850125 0.00121491301272932 266651 270829 667 665 0 False 588 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 632 656 0.00678962418538957 0.00649765865797476 0.00662241550316625 0.00653086137178607 0.00173519922018908 0.00133660597294958 296787 283173 667 665 0 False 632 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 673 660 0.00786624312014284 0.789293283563681 0.00782787823300526 0.79145494773785 0.00155196590361328 0.17260266986539 343848 34398013 667 665 16 True 677 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D2_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D2_3.csv new file mode 100755 index 0000000..85a8502 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D2_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 274 265 0.00103786513701263 0.0797745106643927 0.000854505226215 0.0770275425345235 0.000772144642738279 0.0244637815636058 45367 3476635 667 665 0 True 273 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 318 265 0.000960975223077406 0.00092196616512671 0.000823987182421607 0.00080872816052491 0.00065790021365936 0.000656258824689575 42006 40180 667 665 0 False 318 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 362 265 0.000838651399866558 0.00101776528756086 0.000747692072938125 0.000900282291905089 0.000611398895392219 0.000677820253462463 36659 44355 667 665 0 True 362 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 406 265 0.000874133773122594 0.000908152734778122 0.000732433051041428 0.000747692072938125 0.000684232151128655 0.000689185848270149 38210 39578 667 665 0 True 407 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 450 265 0.000882186510315453 0.000945921682209644 0.000625619897764553 0.000686655985351339 0.000843143305034581 0.000890689767308858 38562 41224 667 665 0 True 452 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 495 265 0.000954478128296804 0.00088298108512297 0.000732433051041428 0.000686655985351339 0.00084542852592547 0.000778341951954614 41722 38481 667 665 0 True 496 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 539 264 0.000909776286038716 0.00093387508597541 0.000717174029144732 0.000747692072938125 0.000779580143981637 0.000797688569331443 39768 40699 667 665 0 True 541 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 583 263 0.000971338546794353 0.000878139500731687 0.000671396963454643 0.000503547722590982 0.000905547120546847 0.000968351910897251 42459 38270 667 665 0 True 586 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 631 264 0.000998310640971572 0.000942319176288168 0.000671396963454643 0.000595101853971161 0.000969407156630056 0.00094252223149894 43638 41067 667 665 0 False 631 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 671 264 0.00108210943738476 0.0833748367255975 0.000778210116731518 0.0788281071183337 0.00097754121288497 0.0210134801876141 47301 3633540 667 665 0 True 675 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 273 309 0.000945807709557901 0.000878713148171413 0.000778210116731518 0.000686655985351339 0.000755514759385809 0.000780334499393096 41343 38295 667 665 0 False 273 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 318 309 0.000921100447716174 0.000889612449526196 0.000793469138628214 0.000793469138628214 0.000665024166639723 0.000623766607969166 40263 38770 667 665 0 False 318 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 363 310 0.000861482739975858 0.000877061043545003 0.000732433051041428 0.000778210116731518 0.000689057574404331 0.000677253893489062 37657 38223 667 665 0 True 363 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 408 310 0.000951572737320971 0.000899295618308761 0.000778210116731518 0.000686655985351339 0.000753654840582707 0.000741633981482374 41595 39192 667 665 0 True 407 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 450 309 0.000919773576246896 0.000976416780105448 0.00064087891966125 0.00064087891966125 0.000900432471023168 0.000962634850555036 40205 42553 667 665 0 True 452 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 496 309 0.000931669665281802 0.000952208858149035 0.000656137941557946 0.000732433051041428 0.000925371791792856 0.000859384914558062 40725 41498 667 665 0 True 497 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 540 308 0.000869077935282759 0.000991193938152775 0.000671396963454643 0.000823987182421607 0.000781551443819685 0.000836096669210249 37989 43197 667 665 0 True 541 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 584 308 0.000917714637760085 0.000899387401899117 0.000610360875867857 0.000442511635004196 0.000978499236163435 0.00104103500532687 40115 39196 667 665 0 True 586 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 631 308 0.000971384300982949 0.000958817276654672 0.000518806744487678 0.000518806744487678 0.00104017218942518 0.00106122166537545 42461 41786 667 665 0 False 631 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 675 307 0.000959213686816468 0.000980707662954594 0.000610360875867857 0.000610360875867857 0.000971937217216955 0.000995880121847369 41929 42740 667 665 0 False 675 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 274 354 0.00089776581153232 0.000822610428566266 0.000747692072938125 0.000686655985351339 0.000739619299707485 0.000700261100361082 39243 35850 667 665 0 True 273 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 319 354 0.000944023296202665 0.000857924164955763 0.000823987182421607 0.000717174029144732 0.000718134254566428 0.00065979127413236 41265 37389 667 665 0 True 318 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 363 354 0.000965093100051027 0.000864257232690332 0.000854505226215 0.000762951094834821 0.000728769794551011 0.000659941905994569 42186 37665 667 665 0 True 363 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 407 355 0.00090755720789182 0.000922815163337504 0.000686655985351339 0.000762951094834821 0.000759940566825994 0.000757294588230694 39671 40217 667 665 0 True 408 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 452 354 0.000953791815467867 0.000884862648725269 0.000656137941557946 0.000564583810177768 0.000926379003602533 0.00090389000013215 41692 38563 667 665 0 True 452 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 497 353 0.000944663854843007 0.00088695072540587 0.000671396963454643 0.000610360875867857 0.000880077349845773 0.000842553573398829 41293 38654 667 665 0 True 497 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 540 352 0.000923571173900347 0.000969051146979373 0.000686655985351339 0.000747692072938125 0.0008637826494872 0.00089343964896922 40371 42232 667 665 0 True 542 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 584 352 0.000915587067990381 0.000886078781297487 0.000488288700694286 0.000473029678797589 0.00104362720327124 0.00099962681722619 40022 38616 667 665 0 True 586 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 628 352 0.000897056621609086 0.000947344327860163 0.0004272526131075 0.000503547722590982 0.00103720754188898 0.00103545995551375 39212 41286 667 665 0 True 631 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 672 352 0.000912521537354463 0.000870337895551421 0.000534065766384375 0.000442511635004196 0.000933781001017591 0.000999576945952503 39888 37930 667 665 0 True 676 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 275 397 0.000892641342409592 0.000922838109235093 0.000732433051041428 0.000762951094834821 0.000748927757135461 0.000761620433945281 39019 40218 667 665 0 True 274 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 319 397 0.000933545587014229 0.0069425796122258 0.000823987182421607 0.00712596322575723 0.000683876489470132 0.00212918825765403 40807 302563 667 665 0 True 318 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 363 398 0.000975250529919293 0.000932268873144179 0.000839246204318303 0.000778210116731518 0.000758596355724229 0.000756553999394051 42630 40629 667 665 0 True 363 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 407 397 0.000876215588703703 0.000952048236865912 0.000671396963454643 0.000747692072938125 0.000747492635955833 0.000778537041140881 38301 41491 667 665 0 True 408 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 452 397 0.000983509160960833 0.000919946926138877 0.000747692072938125 0.000671396963454643 0.000885291316484901 0.000858801405174578 42991 40092 667 665 0 True 452 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 496 396 0.000994901953921185 0.00106686950840135 0.000732433051041428 0.000762951094834821 0.00093523432154817 0.000978255035630251 43489 46495 667 665 0 True 497 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 540 395 0.0009262477939332 0.000953815070980266 0.000671396963454643 0.000747692072938125 0.00086896893118776 0.000820056225388669 40488 41568 667 665 0 True 542 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 585 396 0.000897308269646362 0.00084491384102279 0.000579842832074464 0.000381475547417411 0.000917988306860232 0.00097727758414899 39223 36822 667 665 0 True 586 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 628 396 0.000983715054809515 0.000859599215479761 0.000671396963454643 0.000457770656900893 0.000971385523202297 0.000956360002467083 43000 37462 667 665 0 True 631 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 673 395 0.00095788681534719 0.000971162169557563 0.000595101853971161 0.000534065766384375 0.000933738081614079 0.00101446130226031 41871 42324 667 665 0 True 676 394 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 276 441 0.000963880614053239 0.000889589503628607 0.000854505226215 0.000717174029144732 0.000835973012494602 0.00081417708619051 42133 38769 667 665 0 True 274 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 320 440 0.000902249722014708 0.000890300826453866 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.000796838755414489 0.000722077319656135 39439 38800 667 665 0 True 319 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 364 441 0.000978338937649509 0.000967651447226443 0.000839246204318303 0.000854505226215 0.00078009566618663 0.000723131923946072 42765 42171 667 665 0 True 363 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 408 441 0.000940088435983427 0.00107212411894924 0.000686655985351339 0.000869764248111696 0.000887734169646604 0.000907883307492708 41093 46724 667 665 0 True 408 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 453 441 0.000963789105676047 0.000953838016877855 0.000686655985351339 0.000595101853971161 0.000953682968567245 0.000984929164987351 42129 41569 667 665 0 True 453 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 496 439 0.00100743860159643 0.000922998730518216 0.000717174029144732 0.000579842832074464 0.000953131586738112 0.000940923702429728 44037 40225 667 665 0 True 497 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 541 439 0.000908723939701012 0.00103637441050555 0.000595101853971161 0.000762951094834821 0.000906822297609277 0.000965212862325278 39722 45166 667 665 0 True 542 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 587 438 0.000874408298254169 0.000918524280488357 0.000457770656900893 0.000442511635004196 0.000983013470589608 0.00102522784244045 38222 40030 667 665 0 False 587 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 630 440 0.000843501343857712 0.00081012786027784 0.000457770656900893 0.0004272526131075 0.000952227894747612 0.000892819300574238 36871 35306 667 665 0 True 631 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 673 439 0.000900762710885345 0.000895922571363176 0.000518806744487678 0.000442511635004196 0.000992482638299135 0.00100847954221989 39374 39045 667 665 0 True 676 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 277 485 0.000940660363340875 0.000936376188812613 0.000823987182421607 0.000747692072938125 0.000785477008204122 0.000844492179872536 41118 40808 667 665 0 True 274 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 321 484 0.00094342849175092 0.000957807657160755 0.000747692072938125 0.000854505226215 0.000864525706495927 0.000767002176269424 41239 41742 667 665 0 True 319 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 365 485 0.000927368771553797 0.000928666367222703 0.000762951094834821 0.000778210116731518 0.000796563011835786 0.000763556624856006 40537 40472 667 665 0 True 363 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 409 485 0.000934712318823422 0.000999844541543834 0.000625619897764553 0.000747692072938125 0.000931653927561765 0.000906055643738188 40858 43574 667 665 0 True 408 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 454 485 0.000980489384513511 0.000923755945138653 0.000595101853971161 0.000488288700694286 0.00104345612582904 0.00101160106206345 42859 40258 667 665 0 True 453 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 498 484 0.000957314887989743 0.000933485005716397 0.00064087891966125 0.000549324788281071 0.000917089372524082 0.000967854572814125 41846 40682 667 665 0 True 497 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 542 482 0.000894174107727551 0.000953333207130897 0.000549324788281071 0.000701915007248035 0.000910932584663425 0.000892164633099649 39086 41547 667 665 0 False 542 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 586 483 0.000855420309986915 0.00103011018046375 0.000457770656900893 0.000671396963454643 0.000969976786602791 0.00104661917519515 37392 44893 667 665 0 True 587 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 631 484 0.000905841425819478 0.000893742711092219 0.000549324788281071 0.000564583810177768 0.000952600344639584 0.000883229071534993 39596 38950 667 665 0 True 631 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 675 484 0.000795070535229067 0.000912214158651378 0.000396734569314107 0.000518806744487678 0.000921924392389214 0.000957630196734054 34754 39755 667 665 0 True 676 481 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 277 529 0.000885938353780308 0.000844569652558955 0.000717174029144732 0.000732433051041428 0.000740058989192082 0.00074854949134986 38726 36807 667 665 0 True 274 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 322 529 0.000975525055050868 0.000951428697631008 0.00080872816052491 0.000869764248111696 0.000811158938392284 0.000764008548831841 42642 41464 667 665 0 True 319 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 366 529 0.000889987599471036 0.000897712351375119 0.000747692072938125 0.000732433051041428 0.000742291644237083 0.000802819903333566 38903 39123 667 665 0 True 364 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 411 529 0.000966877513406263 0.000998628408971616 0.000671396963454643 0.000732433051041428 0.000927827091013572 0.000935933444462275 42264 43521 667 665 0 True 408 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 455 528 0.000861574248353049 0.000908772274013025 0.000457770656900893 0.000518806744487678 0.000957417883496578 0.000979911795444573 37661 39605 667 665 0 True 453 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 498 526 0.000821196176917263 0.00100934414314569 0.000488288700694286 0.000579842832074464 0.000904735546075854 0.00100685684179556 35896 43988 667 665 0 True 498 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 543 525 0.000871868940787102 0.000925683400536131 0.000549324788281071 0.000595101853971161 0.000912334680016612 0.000906467563433353 38111 40342 667 665 0 True 542 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 586 525 0.000939402123154491 0.000906867764513137 0.000656137941557946 0.000625619897764553 0.000887345018976724 0.000865531124117683 41063 39522 667 665 0 True 587 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 631 526 0.000846315226456353 0.000875110642249937 0.000488288700694286 0.0004272526131075 0.000907792430416514 0.000965147881883562 36994 38138 667 665 0 True 632 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 675 525 0.000811359026369168 0.000844982678715557 0.000457770656900893 0.000457770656900893 0.000895821874874479 0.000967813258836112 35466 36825 667 665 0 True 676 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 278 570 0.000911446313922462 0.000911548727621296 0.000793469138628214 0.000778210116731518 0.000724216736871073 0.000717366229517918 39841 39726 667 665 0 True 274 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 322 568 0.000948507206685053 0.000975590727792243 0.000762951094834821 0.000869764248111696 0.000759944114246175 0.000747006945644327 41461 42517 667 665 0 True 319 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 366 570 0.000939745279568959 0.000905605740145741 0.000793469138628214 0.00080872816052491 0.000713421321873725 0.000654188931019417 41078 39467 667 665 0 True 364 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 410 569 0.000940523100775087 0.000940460558583458 0.000717174029144732 0.000671396963454643 0.000828367138182053 0.000840910732897818 41112 40986 667 665 0 True 408 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 455 569 0.00102761619876718 0.000918960252542549 0.000656137941557946 0.000534065766384375 0.00109690805799355 0.000970774138085669 44919 40049 667 665 0 True 453 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 499 568 0.000960563435380044 0.000949868376594955 0.000488288700694286 0.000473029678797589 0.00113335184302451 0.00113910206042091 41988 41396 667 665 0 True 498 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 543 567 0.000929931006115162 0.000894270466736766 0.000488288700694286 0.000457770656900893 0.000998889314908731 0.000941046605991603 40649 38973 667 665 0 True 542 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 587 566 0.000921626620885026 0.000971253953147919 0.000625619897764553 0.000732433051041428 0.000919664380219046 0.00083396077855133 40286 42328 667 665 0 True 587 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 631 567 0.000920368380698641 0.000823895398831251 0.00064087891966125 0.000625619897764553 0.000868238020631811 0.000772737619550256 40231 35906 667 665 0 True 632 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 675 567 0.000790678133123871 0.000910240811458722 0.000518806744487678 0.000564583810177768 0.000773416887650384 0.000894798586611176 34562 39669 667 665 0 True 677 568 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 275 614 0.00093635946961287 0.000826167042692564 0.00080872816052491 0.000671396963454643 0.000711367846507833 0.00069481612003343 40930 36005 667 665 0 False 275 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 319 613 0.000930731704415588 0.000868754628617779 0.00080872816052491 0.000717174029144732 0.000732673932614869 0.00070210430750512 40684 37861 667 665 0 False 319 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 366 613 0.000845720422004608 0.000847575565143116 0.000686655985351339 0.000732433051041428 0.000687232227662493 0.000685512289224054 36968 36938 667 665 0 True 364 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 409 612 0.000823964305327309 0.000915174179440361 0.000595101853971161 0.000717174029144732 0.000737501615339393 0.000720703070409549 36017 39884 667 665 0 True 409 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 453 613 0.00102667823790096 0.000875661343792073 0.000747692072938125 0.0004272526131075 0.00103357310489893 0.000977048338109874 44878 38162 667 665 0 False 453 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 498 613 0.000923594050994645 0.000949707755311832 0.000457770656900893 0.000488288700694286 0.00105835128461939 0.00106284894178723 40372 41389 667 665 0 False 498 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 543 612 0.000873790616708126 0.000904894417320481 0.000473029678797589 0.000473029678797589 0.000942205121490227 0.00101823461165025 38195 39436 667 665 0 False 543 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 587 612 0.000848854583923419 0.000883554732562695 0.000595101853971161 0.000610360875867857 0.000808271467844845 0.000842981585698126 37105 38506 667 665 0 False 587 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 632 612 0.000870107404526164 0.000828094498090041 0.000671396963454643 0.00064087891966125 0.000721651183799905 0.000710570313987915 38034 36089 667 665 0 False 632 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 677 612 0.000889964722376738 0.000887662048231129 0.000671396963454643 0.000656137941557946 0.000796661123209835 0.000757200546822926 38902 38685 667 665 0 False 677 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 276 662 0.00101844248395372 0.0801438937237807 0.000854505226215 0.0771190966659037 0.000729772847267297 0.0233661305649649 44518 3492733 667 665 0 True 275 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 319 657 0.000935513017123848 0.000942020879619511 0.00080872816052491 0.000778210116731518 0.000663723702647773 0.000696304112877266 40893 41054 667 665 0 False 319 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 364 657 0.000796100004472472 0.00101092741007933 0.000656137941557946 0.000900282291905089 0.000659853771948504 0.000687767722165025 34799 44057 667 665 0 False 364 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 409 657 0.00081373824417615 0.000899433293694295 0.00064087891966125 0.000701915007248035 0.000689226143359058 0.00071284173050964 35570 39198 667 665 0 False 409 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 453 656 0.000936748380215935 0.000788765229622465 0.000732433051041428 0.000625619897764553 0.000833817098484057 0.000741631050852126 40947 34375 667 665 0 False 453 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 498 656 0.000959991508022597 0.000934035707258533 0.000656137941557946 0.00064087891966125 0.000920019791128891 0.000857129138770222 41963 40706 667 665 0 False 498 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 543 656 0.000957177625423955 0.000878483689195523 0.000656137941557946 0.000549324788281071 0.000919376610125277 0.000876460383589523 41840 38285 667 665 0 False 543 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 588 656 0.000925172570501199 0.00086127426600376 0.000747692072938125 0.000732433051041428 0.00073262873638445 0.000626481492475806 40441 37535 667 665 0 False 588 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 632 656 0.000948301312836372 0.000861802021648307 0.000793469138628214 0.000717174029144732 0.00073214741323622 0.000676654956858521 41452 37558 667 665 0 False 632 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 673 660 0.00097463284837325 0.0823146903651897 0.000778210116731518 0.0786449988555734 0.000753208254275893 0.0229000496923801 42603 3587338 667 665 0 True 677 655 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D3_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D3_1.csv new file mode 100755 index 0000000..ffd1f11 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D3_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 272 279 0.00947617287716865 0.0414476337329935 0.00947585259784848 0.041519798580911 0.0014696973205951 0.00924619967223955 414221 1806320 667 665 0 True 272 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 316 277 0.00968600158606895 0.00939189355857026 0.00967421988250553 0.00941481651026169 0.00131059272027439 0.0012664284913586 423393 409306 667 665 0 False 316 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 359 278 0.00979354680636335 0.0620923560905009 0.00975051499198901 0.0638132295719844 0.00139550422380558 0.0157428631907277 428094 2706033 667 665 0 True 361 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 404 278 0.00983884345307319 0.0874085649004636 0.00985732814526589 0.0866712443732357 0.00142678539624167 0.017938555117166 430074 3809333 667 665 0 True 405 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 448 278 0.00985902105024393 0.0737628920091485 0.00987258716716258 0.0731517509727627 0.00178662654705513 0.0212534592747699 430956 3214644 667 665 0 True 450 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 492 277 0.00962837418553255 0.0649580692403933 0.00958266575112535 0.0696879530022126 0.00175205127229403 0.0220702683788291 420874 2830923 667 665 0 True 494 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 537 276 0.00957282860057726 0.0807771316595448 0.00958266575112535 0.0810711833371481 0.00151307217064083 0.0275419950562492 418446 3520330 667 665 0 True 539 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 581 276 0.00949433729004118 0.066040381337872 0.00944533455405508 0.0653696498054475 0.00181647310227035 0.0213247180216992 415015 2878091 667 665 0 True 583 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 628 277 0.0096060690185921 0.00935327561292795 0.00968947890440223 0.00932326237888151 0.0020243487026029 0.00187475142959653 419899 407623 667 665 0 False 628 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 665 275 0.00940411003013028 0.0400683099371225 0.00946059357595178 0.0414587624933242 0.00189682090718211 0.0101895790048712 411071 1746208 667 665 0 True 672 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 272 321 0.00979867127548608 0.00972355356232192 0.0098115510795758 0.00975051499198901 0.00145182287359071 0.001477114478489 428318 423760 667 665 0 False 272 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 316 321 0.00959097013635549 0.00950490210419617 0.00956740672922866 0.00949111161974517 0.00136487969730279 0.00129547139008533 419239 414231 667 665 0 False 316 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 361 322 0.00996965467826856 0.11529515021245 0.00996414129854276 0.113969634546426 0.00144786266622005 0.032590866124209 435792 5024652 667 665 0 True 361 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 404 322 0.00978586010267926 0.0558577950942818 0.00975051499198901 0.0546272983901732 0.00157983181384311 0.0134935074626925 427758 2434326 667 665 0 True 405 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 448 322 0.00997686096297239 0.0762103473377883 0.0100404364080262 0.0728007934691386 0.00173816080410757 0.0214018499407289 436107 3321306 667 665 0 True 450 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 493 320 0.00976069529895158 0.0458029716084673 0.00973525597009232 0.0466163118944076 0.00167419621898927 0.0129371128259033 426658 1996129 667 665 0 True 494 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 537 321 0.00961785072215552 0.0461712073729758 0.00965896086060884 0.0488288700694286 0.00151372226843034 0.0121505438808274 420414 2012177 667 665 0 True 539 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 582 320 0.00980859993441137 0.052523457877929 0.00985732814526589 0.0546272983901732 0.00184734749981728 0.0142987980171641 428752 2289013 667 665 0 True 583 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 628 320 0.00928556092747858 0.00941582612975561 0.00929274433508812 0.00946059357595178 0.00199814805904966 0.00198961409316967 405889 410349 667 665 0 False 628 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 672 320 0.00972333700396311 0.00930201447771408 0.00943007553215839 0.00943007553215839 0.0029485557052396 0.00197902585105956 425025 405389 667 665 0 False 672 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 272 367 0.00956495888013878 0.0514933706433628 0.00958266575112535 0.0520180056458381 0.00141383885055458 0.013507920982723 418102 2244121 667 665 0 True 272 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 318 366 0.00980489384513511 0.0594415771633249 0.00971999694819562 0.0648355840390631 0.00134622138222111 0.0163340503699429 428590 2590510 667 665 0 True 316 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 361 367 0.00984275543619813 0.0394993205146076 0.0098115510795758 0.0412603952086671 0.00141456515545289 0.00839729070510795 430245 1721411 667 665 0 True 361 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 406 367 0.00978268018657186 0.036138228381666 0.00976577401388571 0.0362859540703441 0.00151314754651116 0.00645721533017156 427619 1574932 667 665 0 True 405 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 449 366 0.010076284814791 0.0731775421616527 0.0100709544518196 0.0714579995422293 0.00170951628890532 0.0171229341006571 440453 3189134 667 665 0 True 450 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 493 365 0.00986634172041926 0.0317641666537596 0.0098115510795758 0.0334172579537652 0.00201899293150087 0.0062884545493279 431276 1384307 667 665 0 True 494 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 537 365 0.00980466507419213 0.0298437785927396 0.00978103303578241 0.0303501945525292 0.00168956326505423 0.00426962099191661 428580 1300615 667 665 0 True 539 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 581 365 0.00974545915414918 0.0530312276456763 0.00973525597009232 0.0522163729304952 0.00184491844586982 0.0137483987307854 425992 2311142 667 665 0 True 583 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 626 364 0.00982687873275539 0.0606231991055689 0.0097962920576791 0.0597543297474632 0.00200936210689637 0.018714647134576 429551 2642006 667 665 0 True 628 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 670 364 0.00970638507708837 0.0615266020395461 0.0098115510795758 0.0617532616159304 0.00189049505732211 0.0200205271471734 424284 2681377 667 665 0 True 672 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 274 411 0.00978926878972965 0.0425950892337275 0.0098115510795758 0.0448767833981842 0.00150572243575649 0.0103151820930295 427907 1856327 667 665 0 True 272 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 318 411 0.00987343361965161 0.0339721585951604 0.0098268101014725 0.0328068970778973 0.00140218475271165 0.00654663730328245 431586 1480533 667 665 0 True 316 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 361 411 0.0100534077204932 0.0852500902060599 0.0100556954299229 0.0815136949721523 0.00136731818386234 0.0202853332533195 439453 3715265 667 665 0 True 361 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 405 411 0.0101790258452829 0.0711507310276148 0.0101777676050965 0.069916838330663 0.00153097139370311 0.0227350851921511 444944 3100804 667 665 0 True 405 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 450 410 0.0100820727196484 0.0453637871286135 0.0100251773861295 0.0472266727702754 0.00168451863582122 0.00974614183540996 440706 1976989 667 665 0 True 450 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 494 410 0.0100744546472472 0.0564683165914328 0.0100404364080262 0.0566414892805371 0.00170596589422679 0.0118869519334574 440373 2460933 667 665 0 True 494 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 539 409 0.00985572674866504 0.0424530770735491 0.00978103303578241 0.0438544289311055 0.00167698565561804 0.00642595575479093 430812 1850138 667 665 0 True 539 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 582 409 0.00990035995964023 0.051663537419883 0.00993362325474937 0.0530708781567102 0.0018658771897895 0.010804245117092 432763 2251537 667 665 0 True 583 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 627 408 0.00966069951977548 0.0467601138345979 0.00959792477302205 0.0483863584344244 0.00189673254167219 0.00770755704924463 422287 2037842 667 665 0 True 628 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 671 408 0.00968993644628819 0.0868036880941195 0.00975051499198901 0.0849774929427024 0.00187531665929308 0.0199255666681913 423565 3782972 667 665 0 True 672 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 273 456 0.00962837418553255 0.0433335800017324 0.00961318379491875 0.0438544289311055 0.00160591889150731 0.00936761226339451 420874 1888511 667 665 0 True 272 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 318 456 0.00981775077213053 0.0538296301522862 0.0097962920576791 0.0538185702296483 0.00153205116157108 0.00843082215920025 429152 2345937 667 665 0 True 316 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 361 455 0.010067065345789 0.0349835678690891 0.0100556954299229 0.0367284657053483 0.00153353260223294 0.00626265988309063 440050 1524611 667 665 0 True 361 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 406 456 0.0101471122987373 0.0565687507851799 0.0101930266269932 0.0558785381857023 0.00174747857636585 0.0129429517436445 443549 2465310 667 665 0 True 405 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 451 455 0.0103132000033401 0.104309709958118 0.0103913939116503 0.10609597924773 0.00190223330614971 0.0171410574104542 450809 4545898 667 665 0 True 450 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 494 454 0.0105044067574819 0.0602342202496399 0.010452429999237 0.0617837796597238 0.00222300144776291 0.0160359239954818 459167 2625054 667 665 0 True 494 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 539 454 0.0100198927773467 0.0555427708662822 0.0100251773861295 0.0543678950179294 0.00198909601547229 0.00936472247216407 437988 2420597 667 665 0 True 539 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 583 453 0.0098691098488293 0.032967931387177 0.00996414129854276 0.0336156252384222 0.00196613564678901 0.00468636674040901 431397 1436768 667 665 0 True 584 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 628 453 0.00980800512995962 0.0385825171764385 0.00978103303578241 0.0391393911650263 0.00193267727861486 0.00487409102909897 428726 1681456 667 665 0 True 628 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 671 453 0.0097832749910236 0.0707493154951925 0.00978103303578241 0.0695201037613489 0.00192382378647961 0.0155262041122597 427645 3083310 667 665 0 True 673 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 275 500 0.00959039820899804 0.0593305419648916 0.00958266575112535 0.0601358052948806 0.00161150344272325 0.0160706382319508 419214 2585671 667 665 0 True 272 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 319 500 0.00987535529557263 0.05745033217055 0.00990310521095598 0.0570229648279545 0.0014767874428166 0.00688685891923837 431670 2503730 667 665 0 True 316 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 363 500 0.0100421750671929 0.0695314160888603 0.0100556954299229 0.0671854734111543 0.00150276124325415 0.0174634335462841 438962 3030233 667 665 0 True 361 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 408 500 0.0103439010638878 0.0931085782664489 0.0102998397802701 0.0884412909132525 0.00182325207590305 0.0243703039107357 452151 4057744 667 665 0 True 405 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 452 500 0.0103878022078455 0.100463220307578 0.010406652933547 0.096055542839704 0.00203194843171305 0.0338870903176753 454070 4378265 667 665 0 True 450 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 496 498 0.0102018571853922 0.0444649504282565 0.0101930266269932 0.0459449149309529 0.00177759316794098 0.00715534655452486 445942 1937817 667 665 0 True 495 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 540 497 0.0100579602622584 0.0448592986242213 0.0100556954299229 0.0458991378652628 0.00174733797328729 0.0102022999855351 439652 1955003 667 665 0 True 539 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 584 498 0.0100657155972254 0.105150126403213 0.0101472495613031 0.104280155642023 0.0019476227199595 0.019216118302551 439991 4582524 667 665 0 True 584 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 628 497 0.00993076361796213 0.0676843172247396 0.00987258716716258 0.0667124437323568 0.00185235689989633 0.0201934224334927 434092 2949735 667 665 0 True 628 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 672 497 0.00993742085240282 0.0807516158214258 0.00984206912336919 0.0796520943007553 0.00179041233344982 0.0144508348667332 434383 3519218 667 665 0 True 673 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 275 543 0.00960359829240793 0.0575579484302425 0.00962844281681544 0.0607614251926452 0.00153273763027875 0.0136819973086548 419791 2508420 667 665 0 True 272 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 320 544 0.0098832707701997 0.104760872196513 0.00988784618905928 0.0975814450293736 0.00148469173288096 0.0255176975015578 432016 4565560 667 665 0 True 316 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 364 543 0.0100078823028403 0.0579890559541449 0.00996414129854276 0.0608529793240253 0.00152330745106508 0.0112796261379774 437463 2527208 667 665 0 True 361 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 408 544 0.0102330386649202 0.059176483208479 0.0102998397802701 0.0595559624628061 0.00169991618119077 0.0076141087918629 447305 2578957 667 665 0 True 406 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 452 542 0.0101974190290984 0.0564482159851448 0.0101930266269932 0.0566414892805371 0.00198979417549266 0.00679584430909334 445748 2460057 667 665 0 True 450 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 496 541 0.0101381902319612 0.0647905182961983 0.0101930266269932 0.0642252231631952 0.00195695807115614 0.0142120478763256 443159 2823621 667 665 0 True 495 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 541 541 0.00999683266629446 0.0746755421398541 0.00994888227664607 0.0716411078049897 0.00189510674898926 0.0187121308373783 436980 3254418 667 665 0 True 539 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 585 541 0.00990269342325861 0.0585015984685908 0.00978103303578241 0.0591744869153887 0.00188800628693131 0.0136366814684079 432865 2549545 667 665 0 True 584 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 630 541 0.00970455490954454 0.0510776139249474 0.00964370183871214 0.0495918211642634 0.0017640862817018 0.00934583091881627 424204 2226002 667 665 0 True 628 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 673 540 0.00960398720301099 0.0676194262263578 0.00956740672922866 0.0682230869001297 0.00187902885438269 0.0127407555828942 419808 2946907 667 665 0 True 673 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 276 587 0.009386426036238 0.0462480072922063 0.009399557488365 0.0476081483176928 0.00141560510860865 0.00878005817044139 410298 2015524 667 665 0 True 272 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 320 586 0.00946725081039247 0.055681134628744 0.00953688868543526 0.0552071412222477 0.00146545578848204 0.0107355460837406 413831 2426627 667 665 0 True 317 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 365 586 0.00972793529991699 0.045240200524199 0.00971999694819562 0.0455329213397421 0.00138318814722197 0.00770156077472411 425226 1971603 667 665 0 True 361 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 409 586 0.00982637543668084 0.0486798364645879 0.0097962920576791 0.0484168764782177 0.00162699110835565 0.00599883522101378 429529 2121505 667 665 0 True 406 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 453 585 0.00999111339271998 0.0849049609604235 0.00993362325474937 0.08032349126421 0.00198930554729563 0.0188681179345161 436730 3700224 667 665 0 True 450 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 497 583 0.00972633390331614 0.0614640515227184 0.00964370183871214 0.060318913557641 0.00202173797423981 0.0111010380241347 425156 2678651 667 665 0 True 495 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 541 582 0.00969782904382096 0.0508529506416533 0.00970473792629892 0.0514381628137636 0.00193093985230338 0.0071022495146972 423910 2216211 667 665 0 True 539 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 586 582 0.00936162726601908 0.0354278004464124 0.00947585259784848 0.0372777904936294 0.00165391705524616 0.00730023916659951 409214 1543971 667 665 0 True 584 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 629 583 0.009487565670129 0.0459315604185561 0.00953688868543526 0.0470588235294118 0.00154802355600898 0.00664560462812695 414719 2001733 667 665 0 True 628 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 673 582 0.00947001893880252 0.0541300378435216 0.00953688868543526 0.0531624322880903 0.00163112883793482 0.00788878481287769 413952 2359029 667 665 0 True 673 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 272 624 0.00954635980247459 0.00901312562706836 0.00930800335698482 0.0089723048752575 0.00229450389383653 0.0013979217128581 417289 392799 667 665 0 False 272 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 317 624 0.00931925888737938 0.00903522252644658 0.00927748531319142 0.00903334096284428 0.00155427223896504 0.0013065996908836 407362 393762 667 665 0 False 317 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 365 628 0.00961069019164027 0.071285216933384 0.00950637064164187 0.0676890211337453 0.00149064260940071 0.0110504918496738 420101 3106665 667 665 0 True 361 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 409 628 0.00950900150748613 0.0794622628900014 0.00955214770733196 0.0769817654688335 0.00149522693607326 0.0198110240197916 415656 3463027 667 665 0 True 406 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 450 624 0.0095582101373209 0.00972373712950263 0.00956740672922866 0.0098115510795758 0.00180714868243892 0.00187388799665739 417807 423768 667 665 0 False 450 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 495 624 0.00944711896741032 0.00935561609448203 0.00950637064164187 0.009399557488365 0.00187117233776382 0.00192040428171502 412951 407725 667 665 0 False 495 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 539 624 0.00918933986886163 0.00927039503083642 0.00917067215991455 0.00929274433508812 0.00192885740977124 0.00195383637595812 401683 404011 667 665 0 False 539 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 584 624 0.00926314137506664 0.00916560111654738 0.00923170824750134 0.00915541313801785 0.00160620195194189 0.00145329071801795 404909 399444 667 665 0 False 584 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 628 624 0.00932955357981344 0.00922670604182693 0.00932326237888151 0.00923170824750134 0.00145382245164186 0.00145970452332535 407812 402107 667 665 0 False 628 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 673 624 0.00934817553457192 0.00918760623233524 0.00933852140077821 0.00926222629129473 0.00154890209023447 0.00153566301636153 408626 400403 667 665 0 False 673 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 272 668 0.00968556692127729 0.0331938566948385 0.00918593118181125 0.0387731746395056 0.00296180060004079 0.0154986469076363 423374 1446614 667 665 0 False 272 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 317 668 0.00898545920447879 0.00894538933738558 0.00904859998474098 0.00889600976577401 0.00133968623537765 0.00125160155160558 392771 389847 667 665 0 False 317 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 361 668 0.00922347249355409 0.00897207541628161 0.00920119020370794 0.0089723048752575 0.0016341342497946 0.00128874709575777 403175 391010 667 665 0 False 361 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 406 667 0.00920624604154778 0.00912601944320632 0.00923170824750134 0.00909437705043107 0.00140001950874582 0.00138835392124315 402422 397719 667 665 0 False 406 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 450 667 0.00931456908304831 0.0091787032240707 0.00932326237888151 0.00926222629129473 0.0015722415879295 0.00167315377320026 407157 400015 667 665 0 False 450 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 495 667 0.00915410914364287 0.00917055743042661 0.00920119020370794 0.00924696726939803 0.00167626187910254 0.00164431499525515 400143 399660 667 665 0 False 495 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 539 667 0.00918602269018844 0.00938347241415509 0.00920119020370794 0.009399557488365 0.0017987759839197 0.00180653307524252 401538 408939 667 665 0 False 539 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 584 667 0.00912407151882974 0.00920768389272563 0.00910963607232776 0.00930800335698482 0.00135901692208588 0.00126455072820573 398830 401278 667 665 0 False 584 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 628 667 0.00910361939652742 0.00923850023318768 0.00910963607232776 0.00923170824750134 0.00132219621306799 0.00142686038724222 397936 402621 667 665 0 False 628 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 669 672 0.0091483898700684 0.0396249951957027 0.00917067215991455 0.0402532997634852 0.00147164535277074 0.00798798523059668 399893 1726888 667 665 0 True 673 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D3_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D3_2.csv new file mode 100755 index 0000000..74fddc6 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D3_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 272 279 0.00809000397947055 0.720101788001705 0.00804150453955901 0.731242847333486 0.00179380215030722 0.197923652625307 353629 31382594 667 665 12 True 272 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 316 277 0.00691592862300825 0.00679173328147561 0.00686655985351339 0.0068055237659266 0.00142468351742965 0.00121310516988052 302308 295989 667 665 0 False 316 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 359 278 0.00669338024967832 0.00682918098634088 0.00672922865644312 0.0068055237659266 0.00127415337747717 0.00124058031282003 292580 297621 667 665 0 True 361 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 404 278 0.00671653186910779 0.00686848730891087 0.00674448767833982 0.00683604180972 0.00136272292448791 0.0013847292235318 293592 299334 667 665 0 True 405 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 448 278 0.00683123761991744 0.00685689963062841 0.00683604180972 0.00685130083161669 0.00165124063366155 0.00169116271285544 298606 298829 667 665 0 True 450 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 492 277 0.00696518300703162 0.00692353451722692 0.00701915007248035 0.00689707789730678 0.00177024826604369 0.00158007429077845 304461 301733 667 665 0 True 494 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 537 276 0.00709990621535193 0.00703046239999174 0.00715648126955062 0.00708018616006714 0.00145837751279938 0.00155266399177579 310350 306393 667 665 0 True 539 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 581 276 0.00724323121112824 0.00755225211116599 0.00727855344472419 0.00753795681696803 0.00171243306241243 0.00178587032874103 316615 329133 667 665 0 True 583 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 628 277 0.0102766195295577 0.0079293449921439 0.00804150453955901 0.00791943236438544 0.0118295568618544 0.00185252822854028 449210 345567 667 665 0 False 628 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 665 275 0.00931225849652422 0.709953574712703 0.00921644922560464 0.738551918822004 0.00198242496012 0.229215576777827 407056 30940327 667 665 12 True 672 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 272 321 0.00689854203134185 0.00674451062423741 0.0068055237659266 0.00677500572213321 0.0015564637283873 0.00134253406535332 301548 293931 667 665 0 False 272 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 316 321 0.00666627089293531 0.00664834436744184 0.00668345159075303 0.00663767452506294 0.00126619923280559 0.0011663269733572 291395 289740 667 665 0 False 316 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 361 322 0.00684308795476375 0.00693748562296104 0.00688181887541009 0.00697337300679027 0.00127985487378683 0.00118685118870905 299124 302341 667 665 0 True 361 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 404 322 0.00689650596994934 0.00709078716475327 0.00688181887541009 0.00711070420386053 0.00146786898659182 0.00141062464092146 301459 309022 667 665 0 True 405 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 448 322 0.00696655563268949 0.00718656334128982 0.00700389105058366 0.00718699931334401 0.00162439637747427 0.00163756874138118 304521 313196 667 665 0 True 450 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 493 320 0.00707602252890492 0.00723142257107635 0.00714122224765393 0.00727855344472419 0.00169274240869795 0.00158197926387711 309306 315151 667 665 0 True 494 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 537 321 0.00717725367117311 0.00721125312709561 0.00714122224765393 0.00718699931334401 0.00145734548347684 0.00158037374826743 313731 314272 667 665 0 True 539 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 582 320 0.00732650383437258 0.00735969013859896 0.00738536659800107 0.00730907148851759 0.00179315319213006 0.00190336358452856 320255 320741 667 665 0 True 583 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 628 320 0.00765064938347947 0.007531761424619 0.0076752880140383 0.00759899290455482 0.0019498215518798 0.00202105153516003 334424 328240 667 665 0 False 628 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 672 320 0.00787646918129399 0.00742531540570355 0.00778210116731518 0.00749217975127794 0.00237575120945288 0.00200906961600414 344295 323601 667 665 0 False 672 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 272 367 0.00656604634281623 0.00638820672647515 0.00660715648126955 0.0063782711528191 0.0014197287875388 0.0014085786503774 287014 278403 667 665 0 True 272 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 318 366 0.00675869435389881 0.00697906358939234 0.00675974670023652 0.00701915007248035 0.00137162168936113 0.00131122335329635 295435 304153 667 665 0 True 316 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 361 367 0.0070719275290256 0.00698665868149431 0.00714122224765393 0.00698863202868696 0.00132906161436052 0.00131964336412933 309127 304484 667 665 0 True 361 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 406 367 0.00722172674248822 0.00724271195269015 0.00721751735713741 0.0072327763790341 0.00143458523537619 0.00145104785707188 315675 315643 667 665 0 True 405 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 449 366 0.0072752591431453 0.00736092921706876 0.00730907148851759 0.00737010757610437 0.00164779800176908 0.0016029521941531 318015 320795 667 665 0 True 450 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 493 365 0.00742553877558817 0.00708539487881985 0.00737010757610437 0.00704966811627375 0.00176815017736849 0.00176059365141515 324584 308787 667 665 0 True 494 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 537 365 0.00715044171665598 0.00731352299264986 0.00718699931334401 0.00729381246662089 0.00169438223738453 0.00173138329846397 312559 318729 667 665 0 True 539 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 581 365 0.00731904590163147 0.00759158137963357 0.00732433051041428 0.0076752880140383 0.00192264719876313 0.00189772107383148 319929 330847 667 665 0 True 583 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 626 364 0.00715835719128305 0.00723075714004627 0.00709544518196384 0.00740062561989776 0.00194216809008896 0.00195298344989741 312905 315122 667 665 0 True 628 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 670 364 0.00651402383038282 0.00669944488137258 0.00646982528419928 0.00663767452506294 0.00190156127679326 0.00178141203174082 284740 291967 667 665 0 True 672 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 274 411 0.00645090592721492 0.00654696939189356 0.00643930724040589 0.00665293354695964 0.0014602347025829 0.00151362688946684 281981 285322 667 665 0 True 272 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 318 411 0.00668855318278146 0.00663941841327971 0.00672922865644312 0.00669871061264973 0.00141089573283701 0.00129794412634541 292369 289351 667 665 0 True 316 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 361 411 0.00709679493052741 0.0071126546051556 0.00706492713817044 0.00717174029144732 0.00140041690244098 0.00129914303135723 310214 309975 667 665 0 True 361 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 405 411 0.00703337962513364 0.00717208447991115 0.00701915007248035 0.00715648126955062 0.00145312167358267 0.0015870497663152 307442 312565 667 665 0 True 405 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 450 410 0.00723490394880381 0.00730693752004181 0.0072327763790341 0.00730907148851759 0.00157597373034428 0.0014992322316752 316251 318442 667 665 0 True 450 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 494 410 0.0072980676061603 0.00743665067911252 0.00737010757610437 0.00747692072938125 0.00167133702160021 0.00167236566366441 319012 324095 667 665 0 True 494 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 539 409 0.00711223696917849 0.00729677248740987 0.00717174029144732 0.00729381246662089 0.00160191112143809 0.00153445447890158 310889 317999 667 665 0 True 539 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 582 409 0.00677308404621219 0.00707369247104945 0.00671396963454643 0.00703440909437705 0.00175494649889476 0.00200617189960306 296064 308277 667 665 0 True 583 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 627 408 0.00655300639906643 0.00648067869375889 0.00659189745937285 0.00636301213092241 0.00175689176142767 0.00196341876110389 286444 282433 667 665 0 True 628 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 671 408 0.00619532302971883 0.00631299007417835 0.00616464484626535 0.00622568093385214 0.00169182824299042 0.00183593170550959 270809 275125 667 665 0 True 672 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 273 456 0.00651230804831048 0.00653503752514727 0.00646982528419928 0.00660715648126955 0.00154477742901106 0.00144730646081851 284665 284802 667 665 0 True 272 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 318 456 0.00664373695505189 0.00680701524926989 0.00669871061264973 0.00671396963454643 0.00141293759679192 0.00156322710194817 290410 296655 667 665 0 True 316 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 361 455 0.00695614655478395 0.00678675402169879 0.00700389105058366 0.00674448767833982 0.00139393648102355 0.00146349992100272 304066 295772 667 665 0 True 361 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 406 456 0.00715215749872832 0.007205424869108 0.0072632944228275 0.00718699931334401 0.00157599382185232 0.00153655018094989 312634 314018 667 665 0 True 405 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 451 455 0.00714568328104202 0.00718142346022988 0.00714122224765393 0.00720225833524071 0.00195256938233415 0.00197388186849405 312351 312972 667 665 0 True 450 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 494 454 0.00727061509300282 0.0072616193723035 0.00727855344472419 0.00733958953231098 0.00200805172764029 0.00184876814690549 317812 316467 667 665 0 True 494 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 539 454 0.00681446870979708 0.00688877148237956 0.00683604180972 0.00700389105058366 0.00174934934181452 0.00178351036284498 297873 300218 667 665 0 True 539 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 583 453 0.00655680399671988 0.00642602156570185 0.00656137941557946 0.0063935301747158 0.00183246160000188 0.00186820985365717 286610 280051 667 665 0 True 584 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 628 453 0.00628452082038633 0.00629919958972735 0.00630197604333562 0.00634775310902571 0.00174387034590986 0.00189982957022668 274708 274524 667 665 0 True 628 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 671 453 0.00633604003674519 0.00652622630047309 0.00636301213092241 0.00646982528419928 0.00175822625435539 0.00191251855072218 276960 284418 667 665 0 True 673 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 275 500 0.00654188813123765 0.0065767531669641 0.00650034332799268 0.00654612039368277 0.00142130229141466 0.00152405977951982 285958 286620 667 665 0 True 272 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 319 500 0.00666469237342876 0.00675215160813455 0.00668345159075303 0.0068055237659266 0.00149782182649943 0.00153074255007973 291326 294264 667 665 0 True 316 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 363 500 0.00675533142103702 0.00682633569503984 0.00677500572213321 0.0068207827878233 0.00151867733144991 0.00148472830945399 295288 297497 667 665 0 True 361 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 408 500 0.00694763627570513 0.00708626682292823 0.00691233691920348 0.00715648126955062 0.00163613418867731 0.00169560081097996 303694 308825 667 665 0 True 405 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 452 500 0.00705833853501265 0.00720056033881912 0.00717174029144732 0.00721751735713741 0.00178674590994485 0.00189911923074765 308533 313806 667 665 0 True 450 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 496 498 0.00708036917682152 0.00675988437562205 0.00712596322575723 0.00671396963454643 0.00171931471861248 0.00174458152721997 309496 294601 667 665 0 True 495 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 540 497 0.00667251633967864 0.0064961212828363 0.00665293354695964 0.00650034332799268 0.00170339239256453 0.00162687730037363 291668 283106 667 665 0 True 539 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 584 498 0.00654996374552481 0.00646333159518159 0.00653086137178607 0.00643930724040589 0.0018284971857875 0.00179399342712758 286311 281677 667 665 0 True 584 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 628 497 0.00664057991603878 0.00655355486450161 0.00669871061264973 0.00645456626230259 0.00179065974996682 0.00191972043106283 290272 285609 667 665 0 True 628 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 672 497 0.00678594097320761 0.00669666842776431 0.00674448767833982 0.00668345159075303 0.00187955970763982 0.00182224213494424 296626 291846 667 665 0 True 673 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 275 543 0.00659612972181796 0.00676314269307969 0.00657663843747616 0.00674448767833982 0.00139733901089709 0.00144587441894674 288329 294743 667 665 0 True 272 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 320 544 0.00669292270779236 0.00693792159501523 0.00666819256885634 0.00694285496299687 0.0014277008579966 0.00145045782006547 292560 302360 667 665 0 True 316 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 364 543 0.00679534345896404 0.00691860114924528 0.00688181887541009 0.00691233691920348 0.00150369207792369 0.00132303064925519 297037 301518 667 665 0 True 361 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 408 544 0.00684990532886452 0.00681913068319689 0.0068055237659266 0.00694285496299687 0.00161503097898165 0.00152930656961338 299422 297183 667 665 0 True 406 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 452 542 0.00692745867853439 0.00694108812888252 0.00683604180972 0.00708018616006714 0.00188315938098702 0.00201246869760348 302812 302498 667 665 0 True 450 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 496 541 0.00676745628101491 0.00715021703950882 0.00671396963454643 0.00718699931334401 0.00189193612610204 0.00201466078546731 295818 311612 667 665 0 True 495 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 541 541 0.00686154976986215 0.00692674694288938 0.00679026474402991 0.00704966811627375 0.00182397723734905 0.00197170140903586 299931 301873 667 665 0 True 539 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 585 541 0.00691261144433505 0.00653714854772546 0.00688181887541009 0.00645456626230259 0.00177473032331243 0.00153654832852906 302163 284894 667 665 0 True 584 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 630 541 0.0065620886055027 0.00618793493231821 0.00646982528419928 0.00610360875867857 0.00183928035282561 0.00178866180321791 286841 269675 667 665 0 True 628 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 673 540 0.00642210366549387 0.00634846443185097 0.0063782711528191 0.00648508430609598 0.00172009950189329 0.00177455812100725 280722 276671 667 665 0 True 673 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 276 587 0.00684841831773516 0.00676965932799497 0.00683604180972 0.00679026474402991 0.00128141929503597 0.00137685424686653 299357 295027 667 665 0 True 272 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 320 586 0.00651891952856257 0.00666750419192867 0.00659189745937285 0.00666819256885634 0.00147737974141427 0.00154511959421788 284954 290575 667 665 0 True 317 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 365 586 0.00641903813485795 0.00658650517343944 0.00643930724040589 0.00659189745937285 0.00137390449871862 0.00130290880172021 280588 287045 667 665 0 True 361 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 409 586 0.00652241972399014 0.00648469422583697 0.00645456626230259 0.00651560234988937 0.00151710286487204 0.00150735479834025 285107 282608 667 665 0 True 406 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 453 585 0.00648972835623845 0.0066162430567148 0.00653086137178607 0.00663767452506294 0.0018543300482473 0.00188491648240624 283678 288341 667 665 0 True 450 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 497 583 0.00648773804903454 0.00675199098685143 0.00646982528419928 0.00662241550316625 0.00194100176887318 0.00246362906374686 283591 294257 667 665 0 True 495 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 541 582 0.00646772059152388 0.00652785545920191 0.00650034332799268 0.00653086137178607 0.00176328758562775 0.00169016996450263 282716 284489 667 665 0 True 539 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 586 582 0.00649945112131506 0.0065537843234775 0.00643930724040589 0.00663767452506294 0.0015150886156545 0.00158156427785757 284103 285619 667 665 0 True 584 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 629 583 0.0063196142830393 0.00643643900320726 0.00630197604333562 0.0064087891966125 0.00149832909784793 0.00145580907202006 276242 280505 667 665 0 True 628 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 673 582 0.00638945805193078 0.00638432886978261 0.0063782711528191 0.0063935301747158 0.00159120752636883 0.00170618651083909 279295 278234 667 665 0 True 673 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 272 624 0.00683311354164987 0.00680299971719181 0.00677500572213321 0.00677500572213321 0.00133964638397801 0.0013827761318156 298688 296480 667 665 0 False 272 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 317 624 0.00664776332364832 0.00658388934111429 0.00666819256885634 0.00660715648126955 0.00140041262036999 0.00120963903227868 290586 286931 667 665 0 False 317 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 365 628 0.00630963986992542 0.00641310302535923 0.00630197604333562 0.00642404821850919 0.00138509557807583 0.00121879289451053 275806 279488 667 665 0 True 361 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 409 628 0.00621069643708702 0.00624683705142921 0.00624093995574884 0.00624093995574884 0.00139113498087331 0.0013039464590987 271481 272242 667 665 0 True 406 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 450 624 0.00603090535299986 0.00619518583595634 0.00610360875867857 0.00621042191195544 0.00170550421374539 0.00173547311348814 263622 269991 667 665 0 False 450 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 495 624 0.00613094688636455 0.00637705502024689 0.00622568093385214 0.00645456626230259 0.00183645544079807 0.00196220042367707 267995 277917 667 665 0 False 495 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 539 624 0.00625915012280996 0.00613073080962879 0.00631723506523232 0.00619516289005875 0.00172027117120397 0.00189554870686685 273599 267182 667 665 0 False 539 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 584 624 0.00650558218258689 0.00639564119729399 0.00650034332799268 0.0064087891966125 0.00151409567159207 0.00144845622137277 284371 278727 667 665 0 False 584 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 628 624 0.00652813899756462 0.00643903188963482 0.00660715648126955 0.00648508430609598 0.00140742206728981 0.00128045469444868 285357 280618 667 665 0 False 628 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 673 624 0.0066989851377813 0.00670070690573997 0.00669871061264973 0.00657663843747616 0.00153410284260231 0.00143289093936419 292825 292022 667 665 0 False 673 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 272 668 0.0228801369514373 0.570931264990125 0.00801098649576562 0.701548790722515 0.0598778967537981 0.364133595177477 1000133 24881627 667 665 12 False 272 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 317 668 0.00679216354285663 0.00644749892584517 0.0068207827878233 0.00645456626230259 0.00143570114434517 0.00128171349661478 296898 280987 667 665 0 False 317 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 361 668 0.00618113923125414 0.00604266445468214 0.00621042191195544 0.00607309071488518 0.00131428322647477 0.00118898989466727 270189 263344 667 665 0 False 361 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 406 667 0.00619751923077143 0.00609631196324526 0.00621042191195544 0.00610360875867857 0.00130278307949692 0.00133642436207668 270905 265682 667 665 0 False 406 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 450 667 0.00603959864883306 0.00615374554491057 0.00610360875867857 0.00613412680247196 0.00150219588744357 0.00140659149522851 264002 268185 667 665 0 False 450 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 495 667 0.00607105465349266 0.00626895689670503 0.00605783169298848 0.00622568093385214 0.00150544947254746 0.00157892993441076 265377 273206 667 665 0 False 495 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 539 667 0.00634802763415729 0.00638866564442693 0.00634775310902571 0.00642404821850919 0.00167972708719793 0.00168819617439599 277484 278423 667 665 0 False 539 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 584 667 0.00645813508901306 0.006349244592369 0.00654612039368277 0.0063935301747158 0.00139159959788695 0.00131740343150746 282297 276705 667 665 0 False 584 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 628 667 0.00700601862035336 0.00655972731095305 0.0068055237659266 0.00659189745937285 0.0019146825009258 0.0014053100184745 306246 285878 667 665 0 False 628 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 669 672 0.00788408725369519 0.741956539322671 0.00798046845197223 0.748470283054856 0.00170103369760328 0.184271039648708 344628 32335041 667 665 12 True 673 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D3_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D3_3.csv new file mode 100755 index 0000000..38bf4cd --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D3_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 272 279 0.00107327887898578 0.073767779485335 0.000900282291905089 0.0726939803158618 0.000824555334158074 0.0229867886030106 46915 3214857 667 665 0 True 272 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 316 277 0.000900694079602451 0.00100530566517002 0.000793469138628214 0.000930800335698482 0.000670022805260906 0.000650417580898795 39371 43812 667 665 0 False 316 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 359 278 0.000907968995589182 0.000924673781042214 0.000762951094834821 0.000793469138628214 0.000675322102388774 0.000695901817187869 39689 40298 667 665 0 True 361 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 404 278 0.000934117514371677 0.000881420764086917 0.000762951094834821 0.000717174029144732 0.000740286753805832 0.000704936845693158 40832 38413 667 665 0 True 405 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 448 278 0.000926430810687584 0.00100397480310986 0.000671396963454643 0.000762951094834821 0.000881118114346561 0.000931729591926518 40496 43754 667 665 0 True 450 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 492 277 0.000953059748450334 0.00096469142643746 0.000717174029144732 0.000732433051041428 0.000850020909367938 0.000874422973424624 41660 42042 667 665 0 True 494 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 537 276 0.00100185659058775 0.00102735667275307 0.000854505226215 0.000854505226215 0.000796488532651591 0.000865466680034212 43793 44773 667 665 0 True 539 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 581 276 0.000942902318582069 0.00104543804005321 0.000656137941557946 0.000762951094834821 0.000898736654271523 0.000974007690598644 41216 45561 667 665 0 True 583 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 628 277 0.00124071633215207 0.00102267570964491 0.000778210116731518 0.00064087891966125 0.00148161206728725 0.00101570088742804 54234 44569 667 665 0 False 628 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 665 275 0.00117515057989431 0.073001317668169 0.000900282291905089 0.07348744945449 0.00102275625306638 0.0264664983158872 51368 3181454 667 665 0 True 672 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 272 321 0.000892961621729762 0.000934678192391026 0.000732433051041428 0.000778210116731518 0.000712785596028493 0.000753623951370728 39033 40734 667 665 0 False 272 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 316 321 0.000840344304844602 0.000932613061608014 0.000701915007248035 0.000823987182421607 0.000623487451043293 0.000634935585148697 36733 40644 667 665 0 False 316 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 361 322 0.000952716592035866 0.000928689313120292 0.000778210116731518 0.000778210116731518 0.000695524101701121 0.000706860699464016 41645 40473 667 665 0 True 361 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 404 322 0.000873973633462509 0.000934999434957272 0.000671396963454643 0.000762951094834821 0.000754217243630053 0.000735960291328808 38203 40748 667 665 0 True 405 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 448 322 0.000974381200335973 0.000955604850992209 0.000717174029144732 0.000686655985351339 0.000891136410102636 0.000885917661681319 42592 41646 667 665 0 True 450 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 493 320 0.00100487636703507 0.00100888522519391 0.000762951094834821 0.000854505226215 0.000903640878108509 0.000836074899199567 43925 43968 667 665 0 True 494 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 537 321 0.00110709122435807 0.00105282661907688 0.000991836423285267 0.000854505226215 0.000843391251321056 0.000886566814689722 48393 45883 667 665 0 True 539 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 582 320 0.00104962396348175 0.000998834922049918 0.00080872816052491 0.000625619897764553 0.000971917186372771 0.00108734684898079 45881 43530 667 665 0 True 583 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 628 320 0.000978087289612232 0.000974282811629669 0.000518806744487678 0.000579842832074464 0.00102408968509321 0.0010229539604962 42754 42460 667 665 0 False 628 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 672 320 0.0010763215325274 0.00099153812661661 0.000671396963454643 0.000625619897764553 0.00105242794658343 0.00102314763296822 47048 43212 667 665 0 False 672 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 272 367 0.000956285418746337 0.00103391919946352 0.000778210116731518 0.000915541313801785 0.000806358081626229 0.000777264941368568 41801 45059 667 665 0 True 272 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 318 366 0.000882461035447028 0.000888465154646745 0.000747692072938125 0.000717174029144732 0.000653730417166962 0.000739019069030236 38574 38720 667 665 0 True 316 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 361 367 0.000948598715062245 0.0009301349046684 0.00080872816052491 0.000793469138628214 0.000740810707671955 0.000692502879834544 41465 40536 667 665 0 True 361 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 406 367 0.000939791033757555 0.00094624292477589 0.000747692072938125 0.000778210116731518 0.000792792093034596 0.000723944045678965 41080 41238 667 665 0 True 405 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 449 366 0.000949307904985479 0.000895670166489696 0.00064087891966125 0.000595101853971161 0.000878771870960032 0.000847736058793751 41496 39034 667 665 0 True 450 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 493 365 0.000991218741739224 0.00107044906842524 0.000701915007248035 0.000823987182421607 0.00091745981804756 0.000938287946350981 43328 46651 667 665 0 True 494 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 537 365 0.00102786784680445 0.00105837952629342 0.000793469138628214 0.00080872816052491 0.000933241032374306 0.000936892356232346 44930 46125 667 665 0 True 539 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 581 365 0.00102569452284615 0.000990941533279296 0.000732433051041428 0.000473029678797589 0.000997557330861618 0.00112442658174132 44835 43186 667 665 0 True 583 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 626 364 0.0010218969251927 0.000919602737675041 0.00064087891966125 0.000457770656900893 0.00107837731399193 0.00100573061076766 44669 40077 667 665 0 True 628 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 670 364 0.000994787568449696 0.000967651447226443 0.000656137941557946 0.000595101853971161 0.000993736754167244 0.00100022709780889 43484 42171 667 665 0 True 672 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 274 411 0.000938418408099681 0.000884702027442146 0.000747692072938125 0.000717174029144732 0.000814080469369878 0.000773457661096303 41020 38556 667 665 0 True 272 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 318 411 0.000868139974416545 0.000855767250582396 0.000717174029144732 0.000717174029144732 0.000707804880692139 0.000655480038628309 37948 37295 667 665 0 True 316 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 361 411 0.000976783295237252 0.000904894417320481 0.000854505226215 0.000823987182421607 0.000748205902334787 0.000687178251213165 42697 39436 667 665 0 True 361 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 405 411 0.000899641733264748 0.000926853641313171 0.000686655985351339 0.000701915007248035 0.000750987940098366 0.000803589381844863 39325 40393 667 665 0 True 405 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 450 410 0.000975250529919293 0.00100156548386301 0.000762951094834821 0.000793469138628214 0.000871155018031976 0.000849085439173316 42630 43649 667 665 0 True 450 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 494 410 0.00104834284620107 0.00102012871501253 0.000747692072938125 0.000793469138628214 0.000970202341572651 0.000934443831395868 45825 44458 667 665 0 True 494 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 539 409 0.000996251702484761 0.00102737961865065 0.000717174029144732 0.000823987182421607 0.000907068689287766 0.00086284853185505 43548 44774 667 665 0 True 539 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 582 409 0.00102695276303254 0.00102572751402425 0.000686655985351339 0.000656137941557946 0.000992314163000585 0.00107855295616702 44890 44702 667 665 0 True 583 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 627 408 0.000917257095874127 0.000953608557901965 0.000518806744487678 0.000564583810177768 0.000959047882163842 0.000974719567740852 40095 41559 667 665 0 True 628 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 671 408 0.00101670382478708 0.000876303828924566 0.000671396963454643 0.0004272526131075 0.000981205753305615 0.000976535606180737 44442 38190 667 665 0 True 672 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 273 456 0.000949902709437225 0.00087084270529838 0.00080872816052491 0.000732433051041428 0.000813391287986799 0.000777394587735728 41522 37952 667 665 0 True 272 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 318 456 0.000967929859743966 0.000824078966011963 0.000854505226215 0.000671396963454643 0.000822274233646703 0.000758948462646891 42310 35914 667 665 0 True 316 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 361 455 0.000951778631169652 0.000919327386903973 0.000839246204318303 0.000778210116731518 0.000778468292794368 0.000767670252371477 41604 40065 667 665 0 True 361 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 406 456 0.000957749552781403 0.00091402688456091 0.000717174029144732 0.000686655985351339 0.000914698956614163 0.000847995644048037 41865 39834 667 665 0 True 405 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 451 455 0.000913482375314975 0.000962603349756859 0.000549324788281071 0.000549324788281071 0.000951112375068911 0.00104711067399942 39930 41951 667 665 0 True 450 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 494 454 0.000973946535544313 0.00102536037966282 0.00064087891966125 0.000656137941557946 0.000947824260727172 0.00106886967571678 42573 44686 667 665 0 True 494 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 539 454 0.00107254681196824 0.00100324053438701 0.000778210116731518 0.000686655985351339 0.000970570697901009 0.000948526074821815 46883 43722 667 665 0 True 539 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 583 453 0.00107924980059753 0.00102090887553055 0.000671396963454643 0.000656137941557946 0.00109451787493491 0.00107161968310115 47176 44492 667 665 0 True 584 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 628 453 0.000893945336784572 0.000926050534897555 0.000518806744487678 0.000564583810177768 0.000978971194199735 0.000987378708207801 39076 40358 667 665 0 True 628 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 671 453 0.000941026396849641 0.000948629298125148 0.000518806744487678 0.000503547722590982 0.00102225176020392 0.00102948497710646 41134 41342 667 665 0 True 673 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 275 500 0.000903805364426965 0.000995438929206743 0.000747692072938125 0.000823987182421607 0.000763827343426525 0.000856102557074319 39507 43382 667 665 0 True 272 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 319 500 0.000928375363702905 0.000994222796634525 0.00080872816052491 0.000885023270008392 0.000777206051476026 0.000777721065923562 40581 43329 667 665 0 True 316 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 363 500 0.00089602715236568 0.00098688010940604 0.000747692072938125 0.000854505226215 0.000796498997334073 0.000849934932869103 39167 43009 667 665 0 True 361 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 408 500 0.000878160141719024 0.000900121670621966 0.000564583810177768 0.000610360875867857 0.000903775336258017 0.000864212122857457 38386 39228 667 665 0 True 405 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 452 500 0.000900716956696749 0.000961456054877409 0.000518806744487678 0.000625619897764553 0.000945523523701807 0.000987415831455288 39372 41901 667 665 0 True 450 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 496 498 0.000967746842989583 0.000989495941731188 0.000671396963454643 0.000686655985351339 0.000907403340608212 0.000964817879834263 42302 43123 667 665 0 True 495 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 540 497 0.000901540532091473 0.000973135516750218 0.000625619897764553 0.000747692072938125 0.000878697325116654 0.000882193664571137 39408 42410 667 665 0 True 539 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 584 498 0.00102338393632207 0.000972125897256302 0.000701915007248035 0.000625619897764553 0.000976548798170848 0.000973646937372123 44734 42366 667 665 0 True 584 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 628 497 0.000941529692924195 0.00102871048071082 0.000579842832074464 0.00064087891966125 0.000956408732076302 0.00101737792739469 41156 44832 667 665 0 True 628 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 672 497 0.00108576977247243 0.00101882079884995 0.000823987182421607 0.000579842832074464 0.00101136057994606 0.00106942626309463 47461 44401 667 665 0 True 673 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 275 543 0.000874659946291446 0.00093084622749366 0.000732433051041428 0.000778210116731518 0.000745278224097872 0.000707750433002594 38233 40567 667 665 0 True 272 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 320 544 0.000923388157145964 0.000855239494937848 0.000793469138628214 0.000747692072938125 0.000800250629376719 0.000700793368628162 40363 37272 667 665 0 True 316 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 364 543 0.000947958156421903 0.000901016560627937 0.000778210116731518 0.000762951094834821 0.000795598398671126 0.000746948879347583 41437 39267 667 665 0 True 361 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 408 544 0.000941026396849641 0.0008883504251588 0.000686655985351339 0.00064087891966125 0.000880963814250939 0.000814192123363894 41134 38715 667 665 0 True 406 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 452 542 0.000922999246542899 0.000954709960986238 0.000488288700694286 0.000488288700694286 0.00100804797572839 0.0010878082110273 40346 41607 667 665 0 True 450 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 496 541 0.000911400559733866 0.000968523391334826 0.000534065766384375 0.000564583810177768 0.000980127956795965 0.0010710655180853 39839 42209 667 665 0 True 495 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 541 541 0.000979162513044233 0.000981166580906374 0.000595101853971161 0.00064087891966125 0.000988660371544344 0.000998403482368441 42801 42760 667 665 0 True 539 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 585 541 0.000908701062606714 0.000968064473383046 0.000671396963454643 0.000732433051041428 0.0008453409854286 0.000824436633938857 39721 42189 667 665 0 True 584 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 630 541 0.000990509551815989 0.000989243536857709 0.000717174029144732 0.000549324788281071 0.000958813152011424 0.00104779400795113 43297 43112 667 665 0 True 628 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 673 540 0.000972207876377673 0.000975475998304298 0.000656137941557946 0.000656137941557946 0.000964383979863447 0.000960769986456281 42497 42512 667 665 0 True 673 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 276 587 0.000902455615863389 0.00104032110489086 0.000793469138628214 0.000915541313801785 0.000688220133141387 0.000787768905617055 39448 45338 667 665 0 True 272 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 320 586 0.000926293548121796 0.00093153460442133 0.000717174029144732 0.000778210116731518 0.00080956550686036 0.000742265922768798 40490 40597 667 665 0 True 317 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 365 586 0.00090973053185012 0.000934953543162094 0.000762951094834821 0.000778210116731518 0.000699506610773855 0.000750581591085292 39766 40746 667 665 0 True 361 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 409 586 0.000935650279689636 0.000862582182166334 0.000671396963454643 0.00064087891966125 0.000912608465942888 0.000749811489256608 40899 37592 667 665 0 True 406 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 453 585 0.000904468800161604 0.000888855234905758 0.000518806744487678 0.000473029678797589 0.000977693593152366 0.000968405856401827 39536 38737 667 665 0 True 450 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 497 583 0.000920757291301706 0.000957509360492098 0.000457770656900893 0.000488288700694286 0.0010928038706858 0.00110949448571919 40248 41729 667 665 0 True 495 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 541 582 0.00098419547378977 0.000975338322918764 0.000534065766384375 0.000656137941557946 0.0010542600951731 0.000976314853382312 43021 42506 667 665 0 True 539 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 586 582 0.000905887180008073 0.00095978100435341 0.00064087891966125 0.000656137941557946 0.000853507653509498 0.000939914372602968 39598 41828 667 665 0 True 584 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 629 583 0.000956925977386679 0.000843950113324052 0.000732433051041428 0.000610360875867857 0.000797832983867756 0.000782812413605861 41829 36780 667 665 0 True 628 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 673 582 0.000900945727639728 0.000882453329478423 0.000625619897764553 0.000534065766384375 0.000833303896797378 0.000870373537489538 39382 38458 667 665 0 True 673 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 272 624 0.000959076424250681 0.00097871136986435 0.000839246204318303 0.000793469138628214 0.000724834568281978 0.000772579926704388 41923 42653 667 665 0 False 272 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 317 624 0.000925607235292859 0.000942227392697812 0.00080872816052491 0.000823987182421607 0.000724214997429766 0.000720334104173005 40460 41063 667 665 0 False 317 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 365 628 0.000972207876377673 0.00091473820738617 0.000869764248111696 0.00080872816052491 0.000715616526562884 0.000662512657676459 42497 39865 667 665 0 True 361 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 409 628 0.00086983287939459 0.00086219210190732 0.000656137941557946 0.000656137941557946 0.000793292918471358 0.000700314512072073 38022 37575 667 665 0 True 406 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 450 624 0.000848145394000185 0.000786677152941865 0.000503547722590982 0.000396734569314107 0.000888429765956496 0.000881614828291859 37074 34284 667 665 0 False 450 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 495 624 0.000865737879515266 0.00090562868604333 0.000457770656900893 0.000442511635004196 0.00097765909606988 0.00102581419064352 37843 39468 667 665 0 False 495 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 539 624 0.00091581583893336 0.000932957250071849 0.000549324788281071 0.000503547722590982 0.000954968218874147 0.00100883413212036 40032 40659 667 665 0 False 539 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 584 624 0.000988290473669094 0.000921782597945998 0.000762951094834821 0.000686655985351339 0.000859364025259857 0.000823916375534312 43200 40172 667 665 0 False 584 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 628 624 0.00090787748721199 0.000933943923668177 0.000732433051041428 0.000747692072938125 0.000748349091421684 0.000750883119871669 39685 40702 667 665 0 False 628 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 673 624 0.000985430836881857 0.000902714557049525 0.000823987182421607 0.000701915007248035 0.000793560302740939 0.000752685588948225 43075 39341 667 665 0 False 673 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 272 668 0.00236311233259543 0.0591544551467935 0.000961318379491875 0.0695048447394522 0.00561827325899879 0.0394379175833055 103296 2577997 667 665 0 False 272 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 317 668 0.000957383519272637 0.000863155829606059 0.000839246204318303 0.000747692072938125 0.0007273821134666 0.000672461349719266 41849 37617 667 665 0 False 317 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 361 668 0.000953402904864803 0.000865427473467372 0.000793469138628214 0.000717174029144732 0.0007386474909449 0.00065285119010032 41675 37716 667 665 0 False 361 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 406 667 0.000889392795019291 0.00085964510727494 0.000747692072938125 0.000625619897764553 0.000726138707304127 0.00074640542135467 38877 37464 667 665 0 False 406 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 450 667 0.000907488576608926 0.000817585276994271 0.000656137941557946 0.00064087891966125 0.000804232018789626 0.000756739120449134 39668 35631 667 665 0 False 450 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 495 667 0.000896599079723128 0.00101941739218727 0.00064087891966125 0.000793469138628214 0.000839070892962037 0.000890441963880559 39192 44427 667 665 0 False 495 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 539 667 0.000979437038175808 0.00101253362291056 0.000686655985351339 0.000701915007248035 0.000929034607078029 0.000988517754565152 42813 44127 667 665 0 False 539 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 584 667 0.00100915438366877 0.000974994134454929 0.000823987182421607 0.000839246204318303 0.000784761911945424 0.000654798465784194 44112 42491 667 665 0 False 584 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 628 667 0.000939356368965895 0.000864739096539701 0.000793469138628214 0.000701915007248035 0.00073052516414954 0.000685990200492601 41061 37686 667 665 0 False 628 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 669 672 0.00104870887970984 0.075921320811757 0.000885023270008392 0.0753185320820935 0.000814696341660181 0.0219041519235533 45841 3308710 667 665 0 True 673 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D4_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D4_1.csv new file mode 100755 index 0000000..ee5c468 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D4_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 246 247 0.00991692297591191 0.0418596961618971 0.00997940032043946 0.0424658579385061 0.00176019568938322 0.00781930715357084 433487 1824278 667 665 0 True 246 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 291 247 0.00990511839525419 0.00975760527434402 0.00996414129854276 0.00968947890440223 0.00146824472594749 0.00145610966433696 432971 425244 667 665 0 False 291 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 334 247 0.00995149026539603 0.0629397710343609 0.00993362325474937 0.0623178454261082 0.00143022797732907 0.00857729593372266 434998 2742964 667 665 0 True 336 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 379 247 0.0103690201134269 0.0928652370225174 0.0104219119554437 0.0895094224460212 0.00126693657504151 0.0161366401316733 453249 4047139 667 665 0 True 380 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 423 247 0.010251912267716 0.0715254834270386 0.0102388036926833 0.0688029297322042 0.00160464281917555 0.0114478081131934 448130 3117136 667 665 0 True 425 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 467 245 0.0101287419920161 0.0662767240830389 0.0102082856488899 0.0696879530022126 0.00157728090962189 0.0178020377537117 442746 2888391 667 665 0 True 469 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 511 245 0.010029203754726 0.079556754096273 0.0100404364080262 0.0772869459067674 0.0016290608126594 0.0232863321192128 438395 3467145 667 665 0 True 514 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 555 245 0.00981084188965257 0.0689982452124819 0.00976577401388571 0.0680704966811627 0.0015665502552114 0.0186961305621783 428850 3006997 667 665 0 True 559 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 603 246 0.00964512021855861 0.00957100923515013 0.00975051499198901 0.00956740672922866 0.00190476312803339 0.00212591002447089 421606 417112 667 665 0 False 603 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 642 246 0.00970425750731867 0.0430369583835992 0.0097962920576791 0.0435187304493782 0.00183967116856663 0.00808996086805881 424191 1875584 667 665 0 True 648 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 246 291 0.00978849096852352 0.00970033231396183 0.00970473792629892 0.00971999694819562 0.00159431687741407 0.00157768823335465 427873 422748 667 665 0 False 246 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 291 291 0.00978425870607841 0.00981019727161805 0.00970473792629892 0.00984206912336919 0.00142251918463 0.00132358798289073 427688 427536 667 665 0 False 291 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 334 291 0.00993776400881729 0.110247282201842 0.00999465934233616 0.106218051422904 0.00149341657488746 0.0299388884119406 434398 4804662 667 665 0 True 336 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 378 292 0.0101231599810074 0.0537065483576187 0.0101777676050965 0.0532234683756771 0.00134294945844601 0.00893258936210448 442502 2340573 667 665 0 True 380 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 422 290 0.0103232888019254 0.0896306915147792 0.0103913939116503 0.0923476005188067 0.00163169227198955 0.0204760125590829 451250 3906175 667 665 0 True 425 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 467 290 0.00998358682869598 0.0427840945921682 0.0100251773861295 0.0446173800259403 0.00172568219304367 0.00780000806309859 436401 1864564 667 665 0 True 470 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 511 290 0.0101266372993407 0.046366385177868 0.0100709544518196 0.0482337682154574 0.00177950558702894 0.0092935891409986 442654 2020683 667 665 0 True 514 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 554 290 0.00988013660828089 0.0549505831413049 0.00985732814526589 0.0556038757915618 0.00162502761590722 0.0134255508695413 431879 2394789 667 665 0 True 559 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 603 290 0.00975030909814033 0.00984151842182705 0.00971999694819562 0.0098115510795758 0.00201434954010629 0.00204039870771876 426204 428901 667 665 0 False 603 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 648 290 0.00970096320573977 0.00966889643426488 0.00973525597009232 0.00968947890440223 0.00180074101794577 0.00205014494267345 424047 421378 667 665 0 False 648 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 246 335 0.0099854627504284 0.0528068397131533 0.00999465934233616 0.0516517891203174 0.0015866628169991 0.0116410015716853 436483 2301363 667 665 0 True 247 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 290 336 0.0100236446208116 0.0596589207052881 0.0100862134737163 0.0637674525062943 0.0015293892806645 0.0157359029719961 438152 2599982 667 665 0 True 291 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 335 336 0.0100271676933335 0.0410126024606033 0.0100862134737163 0.0419775692378119 0.00141149920763954 0.00733460624288807 438306 1787361 667 665 0 True 336 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 379 336 0.0101147412103058 0.0363237918554684 0.0101625085831998 0.0369878690775921 0.001321542128245 0.00578709192818103 442134 1583019 667 665 0 True 380 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 423 336 0.0103020131042284 0.0738397378201741 0.0102693217364767 0.0722056916151675 0.00161203436934812 0.0116573844985228 450320 3217993 667 665 0 True 425 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 468 334 0.0104150717042486 0.0345456454136027 0.0104371709773404 0.0350804913405051 0.00166520174731455 0.00495117661831005 455262 1505526 667 665 0 True 470 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 511 334 0.0104893078752453 0.0326233069512876 0.010406652933547 0.0321507591363394 0.00199663525465181 0.00532094301664326 458507 1421749 667 665 0 True 514 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 555 333 0.0105421310859791 0.0531248010160443 0.0104829480430304 0.0536202029449912 0.00175946394594821 0.0114798710041764 460816 2315220 667 665 0 True 559 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 600 334 0.0105198030419444 0.0635014407155449 0.0106202792401007 0.0613565270466163 0.00231275416864936 0.0174826589494128 459840 2767442 667 665 0 True 604 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 644 334 0.00987903850775459 0.0645185176261781 0.00988784618905928 0.0646829938200961 0.00203055904277997 0.0169267145539182 431831 2811767 667 665 0 True 648 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 247 380 0.0100206934756472 0.0440042885882594 0.0100862134737163 0.046341649500267 0.00164787166941714 0.0103237692116291 438023 1917741 667 665 0 True 247 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 291 380 0.0101296799528823 0.0334613370230337 0.0101777676050965 0.0327763790341039 0.00149840270892686 0.00548426441326151 442787 1458271 667 665 0 True 291 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 335 379 0.0101808102586381 0.0838557139013705 0.0102082856488899 0.08032349126421 0.00136483583811104 0.0187151870620622 445022 3654497 667 665 0 True 336 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 379 380 0.0104237878771761 0.0683972003710352 0.0104982070649271 0.0671854734111543 0.001470316666785 0.0171280888575666 455643 2980803 667 665 0 True 381 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 423 380 0.0105064428188744 0.047786575617345 0.0104371709773404 0.0487373159380484 0.00156980896145776 0.0105618649167508 459256 2082576 667 665 0 True 425 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 468 378 0.0105274668685341 0.0561132517721404 0.010452429999237 0.0571908140688182 0.00179789203550485 0.0111644668056739 460175 2445459 667 665 0 True 470 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 513 378 0.0105110639919226 0.0439090172214698 0.0105592431525139 0.0446784161135271 0.00183615987691181 0.00541348661607155 459458 1913589 667 665 0 True 514 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 556 378 0.0102530789995252 0.0562163476900078 0.0101625085831998 0.0566414892805371 0.0018930863374758 0.00831395727169961 448181 2449952 667 665 0 True 559 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 599 377 0.0100872429429597 0.0435784815667 0.00999465934233616 0.0450751506828412 0.00201279628818117 0.00842165733676999 440932 1899184 667 665 0 True 604 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 644 377 0.0102560987759725 0.111521651462141 0.0102693217364767 0.110261692225528 0.00230455042355669 0.0258252530337492 448313 4860200 667 665 0 True 648 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 247 423 0.00988537546287511 0.0403887723428507 0.00988784618905928 0.0410315098802167 0.00174556745127088 0.00609233090367111 432108 1760174 667 665 0 True 247 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 291 424 0.00980553440377545 0.0556777156900032 0.00984206912336919 0.0553597314412146 0.00151572860874088 0.00936442449680515 428618 2426478 667 665 0 True 291 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 335 425 0.0101025705961393 0.0348748272604147 0.010101472495613 0.0358434424353399 0.00146173509325761 0.00455338715905881 441602 1519872 667 665 0 True 336 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 380 424 0.0104216374303121 0.0539413996194423 0.0104371709773404 0.0550087739375906 0.00145984476518668 0.00893751108562025 455549 2350808 667 665 0 True 381 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 423 424 0.010556177621878 0.0995637640679864 0.0105897611963073 0.0994888227664607 0.00177893358415339 0.0180139626585341 461430 4339066 667 665 0 True 425 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 468 422 0.0104675746356623 0.0663180725904943 0.0105745021744106 0.0650339513237202 0.00187358280079062 0.0181824492295738 457557 2890193 667 665 0 True 470 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 512 422 0.0104446746642701 0.0527280435008326 0.010452429999237 0.0523537041275654 0.00176107498495231 0.00918211293711834 456556 2297929 667 665 0 True 515 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 556 421 0.010215125900085 0.0350807666912761 0.0102845807583734 0.0354161898222324 0.00174550090126711 0.00521527559306454 446522 1528847 667 665 0 True 559 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 601 422 0.0101449618518733 0.0406689646983102 0.0102235446707866 0.0409552147707332 0.00207509400121014 0.00484178287466572 443455 1772385 667 665 0 True 604 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 645 422 0.0101203232213145 0.0714373482343992 0.0100251773861295 0.0707103074692912 0.00194398243151296 0.0118305792926682 442378 3113295 667 665 0 True 648 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 248 467 0.00959643776189269 0.0515757923075026 0.00959792477302205 0.0523689631494621 0.00158088505313333 0.0137140972170988 419478 2247713 667 665 0 True 247 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 293 468 0.00996553680129493 0.0543574546345263 0.00997940032043946 0.0537575341420615 0.00159004557642426 0.00604355265043573 435612 2368940 667 665 0 True 292 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 337 467 0.0101748164599321 0.0698155092469099 0.0102082856488899 0.0662851911192493 0.0014894687609289 0.0170419249760775 444760 3042614 667 665 0 True 336 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 381 468 0.0103435807845677 0.0900561543478747 0.0103913939116503 0.0846570534828718 0.00157789133901713 0.0201052405563969 452137 3924717 667 665 0 True 381 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 425 467 0.0105095769807932 0.0971153909034431 0.0105592431525139 0.0905165178912032 0.0019485038452833 0.0279789261602085 459393 4232364 667 665 0 True 425 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 469 467 0.010372863465269 0.0448332779763554 0.010406652933547 0.0454108491645685 0.00186192957950041 0.00639383167510357 453417 1953869 667 665 0 True 470 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 514 466 0.0101583678291319 0.0422752463672342 0.0101167315175097 0.0433813992523079 0.00185130468589947 0.00592787372649671 444041 1842388 667 665 0 True 515 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 558 466 0.0103939790233059 0.0981006418541203 0.0103456168459602 0.0950942244602121 0.0019700130514656 0.0155261763793127 454340 4275302 667 665 0 True 559 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 601 466 0.0100561758489032 0.064175935375174 0.010101472495613 0.0652780956740673 0.00194039114057348 0.016695029022425 439574 2796837 667 665 0 True 604 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 647 467 0.0100123433362284 0.0746754733021613 0.00994888227664607 0.0737773708705272 0.00205493835804121 0.0112129043873948 437658 3254415 667 665 0 True 649 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 249 511 0.00955768396415205 0.0583236759786856 0.00955214770733196 0.0604104676890211 0.00150856722774482 0.0140344148172152 417784 2541791 667 665 0 True 247 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 293 512 0.00982690160984969 0.101384635771163 0.00988784618905928 0.0954146639200427 0.0015448912108443 0.022633247020504 429552 4418421 667 665 0 True 292 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 337 513 0.0099876360743867 0.0567667968272707 0.00994888227664607 0.0593881132219425 0.00154155445456567 0.0114271159400477 436578 2473941 667 665 0 True 336 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 382 512 0.0100486492848792 0.0602353445986218 0.0100709544518196 0.0593423361562524 0.00169965197293979 0.00896491141372926 439245 2625103 667 665 0 True 381 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 425 511 0.0102606513177378 0.0573893190288608 0.0103761348897536 0.0566109712367437 0.00186149956372464 0.00725923803527395 448512 2501071 667 665 0 True 426 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 470 509 0.0102002786658856 0.0609545149208567 0.0102388036926833 0.0614785992217899 0.00196105415512726 0.013274600761353 445873 2656445 667 665 0 True 470 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 514 509 0.0102905745570794 0.0744230454827846 0.0102998397802701 0.0726024261844816 0.00180918673987117 0.0170088384458079 449820 3243414 667 665 0 True 515 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 559 509 0.0102701681889657 0.057544685701436 0.0102845807583734 0.0582131685358969 0.00187695844790573 0.0112444655310497 448928 2507842 667 665 0 True 560 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 603 509 0.00993257090841167 0.0487929138479066 0.00990310521095598 0.0478065156023499 0.00187273149447731 0.00593390938711556 434171 2126433 667 665 0 True 604 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 647 508 0.0098844146249146 0.0647476324136044 0.00984206912336919 0.064438849469749 0.00184080894500204 0.0115318695700588 432066 2821752 667 665 0 True 649 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 251 554 0.00937510187456054 0.0496041660571663 0.009399557488365 0.0499427786678874 0.00130595799717763 0.00846236134370705 409803 2161788 667 665 0 True 247 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 293 553 0.00948335628477819 0.0568483924390973 0.00952162966353857 0.0566262302586404 0.0014342926538433 0.0112566291949043 414535 2477497 667 665 0 True 292 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 339 554 0.00990143518307223 0.0446886040920566 0.0097962920576791 0.0449225604638743 0.00143788393169195 0.00712526102101713 432810 1947564 667 665 0 True 337 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 382 553 0.00992392336676706 0.0522481759445535 0.00996414129854276 0.0493781948577096 0.00150451161792992 0.00828657897658511 433793 2277016 667 665 0 True 381 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 427 553 0.0103278413436907 0.0863290292565931 0.0103913939116503 0.0825665674830243 0.00187401639598004 0.0170044288272268 451449 3762286 667 665 0 True 426 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 471 552 0.0102078281070039 0.0640878231284322 0.0101930266269932 0.0599374380102235 0.00206035788043049 0.0253304560168117 446203 2792997 667 665 0 True 470 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 516 551 0.0101776303425307 0.0521080453479774 0.0101319905394064 0.0521858548867018 0.00198319042842643 0.00571708847198401 444883 2270909 667 665 0 True 515 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 559 550 0.0100501362960086 0.0359066124914025 0.00994888227664607 0.0373235675593194 0.00185073482516606 0.00640783506778181 439310 1564838 667 665 0 True 560 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 603 550 0.00994515331027551 0.0461242371206111 0.00991836423285267 0.0462348363469902 0.00167635007469817 0.00609475824891089 434721 2010130 667 665 0 True 604 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 647 550 0.00984346462612136 0.0546266788509383 0.00987258716716258 0.0532997634851606 0.00187790490604558 0.00782771159176635 430276 2380673 667 665 0 True 649 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 247 595 0.00905582914653911 0.0090721654215649 0.00901808194094758 0.00903334096284428 0.00131127506630482 0.00122413462054485 395847 395372 667 665 0 False 247 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 292 595 0.00939896268391325 0.00923661866958538 0.009399557488365 0.00918593118181125 0.00139347838054181 0.00152602553423875 410846 402539 667 665 0 False 292 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 339 596 0.00965770262042245 0.0686965066591863 0.00968947890440223 0.0663157091630426 0.00137249151376421 0.00993467105448595 422156 2993847 667 665 0 True 337 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 382 596 0.00996645188506685 0.0762522236008882 0.0100251773861295 0.072831311512932 0.00142674729097633 0.0181889922989551 435652 3323131 667 665 0 True 381 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 426 594 0.00993554493067039 0.00960662126820829 0.00997940032043946 0.00961318379491875 0.00179403698879786 0.00182518588457971 434301 418664 667 665 0 False 426 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 471 594 0.00997313199660184 0.0100562461314651 0.00996414129854276 0.0100099183642329 0.00200177450409875 0.00187946365791683 435944 438259 667 665 0 False 471 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 515 594 0.00988969923369741 0.00942977723548973 0.00991836423285267 0.00946059357595178 0.00208338891357809 0.00216806931192309 432297 410957 667 665 0 False 515 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 560 594 0.00976609429320588 0.00976086359180166 0.00973525597009232 0.00968947890440223 0.00201118513699149 0.00218408457830194 426894 425386 667 665 0 False 560 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 604 594 0.00960886002409644 0.00956231273996389 0.00965896086060884 0.00958266575112535 0.00153865905886085 0.00155343709493642 420021 416733 667 665 0 False 604 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 649 594 0.0096919725076807 0.00970850105350352 0.00962844281681544 0.00964370183871214 0.00156722993564399 0.00186204294381409 423654 423104 667 665 0 False 649 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 247 644 0.00906880045900602 0.039489866804801 0.00907911802853437 0.0405737392233158 0.00138732565009679 0.00834316422805565 396414 1720999 667 665 0 True 248 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 292 638 0.00895667981985203 0.00907512544235388 0.00900282291905089 0.00910963607232776 0.00135603165628554 0.00131738241199102 391513 395501 667 665 0 False 292 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 337 638 0.00913523554084711 0.00901851791300178 0.00914015411612116 0.00901808194094758 0.00132703239435565 0.00131172379236 399318 393034 667 665 0 False 337 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 381 638 0.00943513136999822 0.00933069684970035 0.00947585259784848 0.00930800335698482 0.00129791101712992 0.00126629133929389 412427 406639 667 665 0 False 381 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 426 638 0.00955859904792397 0.00938338063056474 0.00952162966353857 0.00944533455405508 0.00160337708031246 0.00159625406165612 417824 408935 667 665 0 False 426 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 471 638 0.00950470061375812 0.00972669715029161 0.00947585259784848 0.00970473792629892 0.0018002831551866 0.00181739990084509 415468 423897 667 665 0 False 471 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 515 638 0.0095995490467172 0.00942179206312875 0.00952162966353857 0.00946059357595178 0.0018364384670393 0.00174506243914932 419614 410609 667 665 0 False 515 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 560 637 0.0096419174253569 0.00953236834361023 0.00958266575112535 0.00958266575112535 0.0018329479602048 0.00170638467847865 421466 415428 667 665 0 False 560 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 605 637 0.00931987656892543 0.00959076565297428 0.0093690394445716 0.00949111161974517 0.0013910904867167 0.00153648435456249 407389 417973 667 665 0 False 605 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 645 642 0.009552765388878 0.0408050797628083 0.00955214770733196 0.0409094377050431 0.00148489719989304 0.00743029067716827 417569 1778317 667 665 0 True 649 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D4_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D4_2.csv new file mode 100755 index 0000000..1b2fdf5 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D4_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 246 247 0.00838463807693315 0.712992942415549 0.00828564888990616 0.709163042648966 0.00200289559876047 0.180071377209841 366508 31072785 667 665 9 True 246 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 291 247 0.00682222404476407 0.00684476125080382 0.0068207827878233 0.00686655985351339 0.00150439056391921 0.0013931747118757 298212 298300 667 665 0 False 291 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 334 247 0.00637040143238063 0.0064789806973373 0.00634775310902571 0.00646982528419928 0.00122613940573038 0.00123141639523104 278462 282359 667 665 0 True 336 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 379 247 0.00648670857979113 0.006609978826673 0.00654612039368277 0.00660715648126955 0.00131175298975517 0.00120956412119074 283546 288068 667 665 0 True 380 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 423 247 0.00688984873550865 0.00684221425617144 0.00694285496299687 0.00686655985351339 0.00154668657728927 0.00151745493150677 301168 298189 667 665 0 True 425 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 467 245 0.00673215692451325 0.00710974047616179 0.00671396963454643 0.00712596322575723 0.00158723602949214 0.00142394038244481 294275 309848 667 665 0 True 469 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 511 245 0.00695159401301867 0.00716302085036349 0.00703440909437705 0.00718699931334401 0.00156379020438166 0.00156349162378697 303867 312170 667 665 0 True 514 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 555 245 0.00733913199042502 0.00754323437341351 0.00735484855420768 0.00755321583886473 0.00149951096515429 0.00122473248074974 320807 328740 667 665 0 True 559 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 603 246 0.00906481984459819 0.00809338521400778 0.00842298008697642 0.00804150453955901 0.00437609010376232 0.00202282832787318 396240 352716 667 665 0 False 603 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 642 246 0.00955322293076396 0.757266638787401 0.00956740672922866 0.761623559929808 0.00185443588738717 0.169454835578956 417589 33002267 667 665 12 True 648 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 246 291 0.00686397474185773 0.00662716530396717 0.00694285496299687 0.00662241550316625 0.00151046208773097 0.00152420560953289 300037 288817 667 665 0 False 246 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 291 291 0.00673233994126764 0.00634472425054396 0.00679026474402991 0.00633249408712902 0.00125390329573372 0.00129994937896059 294283 276508 667 665 0 False 291 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 334 291 0.00630206755171281 0.00654683171650802 0.00630197604333562 0.00653086137178607 0.00129102036690247 0.00120252971919351 275475 285316 667 665 0 True 336 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 378 292 0.00647739760241189 0.00648792959739702 0.00643930724040589 0.0063935301747158 0.00123632158696489 0.00118280846298041 283139 282749 667 665 0 True 380 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 422 290 0.00679394795621187 0.00680233428616173 0.00677500572213321 0.00685130083161669 0.00150740699908584 0.00154428833037474 296976 296451 667 665 0 True 425 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 467 290 0.00678735935305407 0.00696100516798978 0.0068055237659266 0.00703440909437705 0.00172997665253423 0.00176974328462701 296688 303366 667 665 0 True 470 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 511 290 0.00707458127196416 0.00708484417727771 0.00714122224765393 0.00700389105058366 0.00161348388655779 0.00155382349718775 309243 308763 667 665 0 True 514 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 554 290 0.00725812419951617 0.00733991077487722 0.0072480354009308 0.00730907148851759 0.00160062219129433 0.00149349550156098 317266 319879 667 665 0 True 559 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 603 290 0.00772948385043002 0.00756980572282159 0.00781261921110857 0.00756847486076143 0.00196432717082378 0.00191171636389412 337870 329898 667 665 0 False 603 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 648 290 0.00822456704813078 0.00803402417694499 0.00830090791180285 0.0081025406271458 0.00188216980339047 0.00198714665436624 359511 350129 667 665 0 False 648 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 246 335 0.00640398500680994 0.00665945018187492 0.0063935301747158 0.00660715648126955 0.00153798332869729 0.00142639364340576 279930 290224 667 665 0 True 247 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 290 336 0.00646001101074549 0.00695409845281549 0.00642404821850919 0.00688181887541009 0.0012758653003332 0.0016370187768081 282379 303065 667 665 0 True 291 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 335 336 0.00672097002540158 0.00669558997057762 0.00672922865644312 0.00669871061264973 0.00130573744313843 0.00126738001850186 293786 291799 667 665 0 True 336 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 379 336 0.00678893787256063 0.00684336155105089 0.00688181887541009 0.00685130083161669 0.00129856914660305 0.00137145055870852 296757 298239 667 665 0 True 380 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 423 336 0.00711479920373986 0.00711398546721576 0.00712596322575723 0.00715648126955062 0.00152475572665485 0.00168043211961908 311001 310033 667 665 0 True 425 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 468 334 0.0072534343951851 0.00739465968652462 0.0072327763790341 0.00744640268558785 0.001704264678769 0.00154249210622447 317061 322265 667 665 0 True 470 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 511 334 0.00742681989286886 0.00731857109011944 0.00737010757610437 0.00729381246662089 0.00170402388040932 0.00170211998991646 324640 318949 667 665 0 True 514 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 555 333 0.00771603211898285 0.00752265190327616 0.00775158312352178 0.00758373388265812 0.00167472379742708 0.00142806788194513 337282 327843 667 665 0 True 559 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 600 334 0.00797808923416525 0.00797287335987026 0.00798046845197223 0.00805676356145571 0.002092426378084 0.00214274350354892 348737 347464 667 665 0 True 604 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 644 334 0.00769473354419151 0.008139322900981 0.00784313725490196 0.00807202258335241 0.00212472922778457 0.00194483613382811 336351 354718 667 665 0 True 648 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 247 380 0.00664346242992031 0.00661881299724477 0.00674448767833982 0.00672922865644312 0.0015338114681628 0.00143984793870743 290398 288453 667 665 0 True 247 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 291 380 0.0066859680711258 0.00661147031001629 0.00672922865644312 0.00671396963454643 0.00132977140790848 0.00132210406128514 292256 288133 667 665 0 True 291 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 335 379 0.00704317102149314 0.00688934512981928 0.00706492713817044 0.00695811398489357 0.00144614297041656 0.0014187012741767 307870 300243 667 665 0 True 336 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 379 380 0.00707007448438747 0.00722648920309471 0.00709544518196384 0.00733958953231098 0.00136559048184906 0.00147431836910998 309046 314936 667 665 0 True 381 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 423 380 0.00731227428171929 0.00753290871949845 0.00730907148851759 0.00758373388265812 0.00163691223749623 0.00166571308635446 319633 328290 667 665 0 True 425 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 468 378 0.00770976379514523 0.0072325698659558 0.00778210116731518 0.00720225833524071 0.00176293761691656 0.00170988717859495 337008 315201 667 665 0 True 470 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 513 378 0.00768530818134078 0.00742524656801078 0.00761425192645151 0.00747692072938125 0.00171869966188453 0.00178316272532465 335939 323598 667 665 0 True 514 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 556 378 0.00753930656553161 0.0075864873903688 0.00756847486076143 0.00758373388265812 0.00180665778395459 0.00154525347794545 329557 330625 667 665 0 True 559 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 599 377 0.00750961209713294 0.00758866725063976 0.00747692072938125 0.00755321583886473 0.00197382227782391 0.00197716880275238 328259 330720 667 665 0 True 604 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 644 377 0.00673101306979836 0.00697291408883848 0.0068055237659266 0.00709544518196384 0.00194024834092924 0.0018561867265032 294225 303885 667 665 0 True 648 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 247 423 0.006506588774736 0.00637689439896376 0.00651560234988937 0.00634775310902571 0.00159375084612903 0.00160263556993491 284415 277910 667 665 0 True 247 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 291 424 0.00645381131819076 0.00646982528419928 0.00634775310902571 0.0064087891966125 0.00147105123164403 0.00141941998620636 282108 281960 667 665 0 True 291 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 335 425 0.00690826479641845 0.00689999202630059 0.00694285496299687 0.00692759594110018 0.00132010290881281 0.00135655699931117 301973 300707 667 665 0 True 336 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 380 424 0.0070142772513949 0.0069584581733574 0.00701915007248035 0.00694285496299687 0.00137730520575784 0.00143756452557402 306607 303255 667 665 0 True 381 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 423 424 0.00721333084888089 0.00728929212479585 0.00729381246662089 0.0072480354009308 0.0015904230750525 0.00155731741149812 315308 317673 667 665 0 True 425 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 468 422 0.00720358520670999 0.00755206854398528 0.00732433051041428 0.00750743877317464 0.0017192648779791 0.00158907172073285 314882 329125 667 665 0 True 470 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 512 422 0.00737880087193757 0.00767902819534531 0.00744640268558785 0.00775158312352178 0.00171136960831931 0.00164022945829122 322541 334658 667 665 0 True 515 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 556 421 0.00696307831435621 0.0075144143260417 0.00700389105058366 0.00753795681696803 0.00170838309656328 0.00171293328693606 304369 327484 667 665 0 True 559 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 601 422 0.00642333902858596 0.00686823490403739 0.00642404821850919 0.00694285496299687 0.00195176716789005 0.00195754517176203 280776 299323 667 665 0 True 604 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 645 422 0.0065522285778603 0.00647790224015062 0.00654612039368277 0.00653086137178607 0.00187753092484124 0.00181477016810324 286410 282312 667 665 0 True 648 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 248 467 0.00642377369337762 0.00648719532867417 0.00642404821850919 0.0064087891966125 0.00151528986738152 0.00146369387117798 280795 282717 667 665 0 True 247 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 293 468 0.00638961819159086 0.00650295916031782 0.00645456626230259 0.00650034332799268 0.0015177764762811 0.00158012975080474 279302 283404 667 665 0 True 292 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 337 467 0.00664934184315487 0.00653611598233395 0.00668345159075303 0.00656137941557946 0.0014184979272114 0.00155322772033235 290655 284849 667 665 0 True 336 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 381 468 0.00677054468874512 0.00700005908568629 0.00677500572213321 0.00695811398489357 0.00154131103690723 0.00157128757373239 295953 305068 667 665 0 True 381 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 425 467 0.00686921359645195 0.00690733471352907 0.00688181887541009 0.00701915007248035 0.00181380264762349 0.00194717905883184 300266 301027 667 665 0 True 425 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 469 467 0.00694768202989373 0.00704849787549671 0.00698863202868696 0.00711070420386053 0.00189422281466372 0.00189370659790578 303696 307179 667 665 0 True 470 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 514 466 0.00672069550027001 0.0066874900687287 0.00669871061264973 0.00671396963454643 0.00179682693106663 0.00175872823330571 293774 291446 667 665 0 True 515 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 558 466 0.00640366472748977 0.00645727387821809 0.00646982528419928 0.00643930724040589 0.00198215822471227 0.00188268563079348 279916 281413 667 665 0 True 559 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 601 466 0.00606496934640942 0.00603582657720061 0.00605783169298848 0.00608834973678187 0.00188115279943443 0.00179594673327149 265111 263046 667 665 0 True 604 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 647 467 0.00591912787026034 0.00605292127090443 0.00593575951781491 0.00607309071488518 0.0018075225082779 0.0017453832459875 258736 263791 667 665 0 True 649 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 249 511 0.00642921844182052 0.00628648756246304 0.00645456626230259 0.00628671702143893 0.00132449935490508 0.00135643247210255 281033 273970 667 665 0 True 247 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 293 512 0.00656769349360568 0.00632012624832854 0.00656137941557946 0.00634775310902571 0.00149111565346675 0.00152576452256608 287086 275436 667 665 0 True 292 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 337 513 0.00636074729858692 0.0065627561694348 0.0063935301747158 0.00642404821850919 0.00154545943051253 0.00167667959935424 278040 286010 667 665 0 True 336 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 382 512 0.00659491723582018 0.00658349926085527 0.00659189745937285 0.00662241550316625 0.00156259465651292 0.00139809661762497 288276 286914 667 665 0 True 381 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 425 511 0.00661687924634616 0.00681341715469723 0.00663767452506294 0.00692759594110018 0.00176360994290705 0.00183488311827122 289236 296934 667 665 0 True 426 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 470 509 0.0064457585809979 0.00632287975603922 0.0063935301747158 0.00631723506523232 0.00189080197300146 0.00168032280598107 281756 275556 667 665 0 True 470 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 514 509 0.00616800777912715 0.00628602864451126 0.00619516289005875 0.00630197604333562 0.00177024439636872 0.00161826708719625 269615 273950 667 665 0 True 515 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 559 509 0.00617029548855693 0.00621602071096716 0.00621042191195544 0.00627145799954223 0.00179210963131827 0.00157243444754685 269715 270899 667 665 0 True 560 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 603 509 0.0061402578637438 0.00604991535832027 0.00624093995574884 0.00605783169298848 0.00176481260035969 0.00171436158251413 268402 263660 667 665 0 True 604 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 647 508 0.00601564633110316 0.00601510643167773 0.0059662775616083 0.00604257267109178 0.00193675979338501 0.00187639394571558 262955 262143 667 665 0 True 649 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 251 554 0.00643287877690818 0.00661046069052237 0.00642404821850919 0.00660715648126955 0.00141772505583662 0.00148173138993369 281193 288089 667 665 0 True 247 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 293 553 0.0064326500059652 0.00664724296435756 0.0063935301747158 0.00666819256885634 0.00136094331672754 0.00134656005313983 281183 289692 667 665 0 True 292 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 339 554 0.00634878257826912 0.006608303776149 0.00631723506523232 0.00659189745937285 0.00140644451604699 0.00137302897281165 277517 287995 667 665 0 True 337 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 382 553 0.00658954111866017 0.00651808050682899 0.00651560234988937 0.00654612039368277 0.00141983469457968 0.00139188907225078 288041 284063 667 665 0 True 381 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 427 553 0.00646666824518617 0.0066975174259751 0.0064087891966125 0.00674448767833982 0.00179759270846136 0.00178509265579157 282670 291883 667 665 0 True 426 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 471 552 0.00634166780194247 0.00789850570578426 0.00631723506523232 0.00662241550316625 0.00193831679248515 0.00792565785532681 277206 344223 667 665 0 True 470 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 516 551 0.00649457830022961 0.00640979881610641 0.00648508430609598 0.00645456626230259 0.00200757693861248 0.00206486203388002 283890 279344 667 665 0 True 515 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 559 550 0.00661770282174088 0.0065412329174963 0.00657663843747616 0.00651560234988937 0.00178140039213522 0.00183716035304924 289272 285072 667 665 0 True 560 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 603 550 0.00652392961221381 0.00650704353008867 0.00653086137178607 0.00653086137178607 0.00154842426308858 0.00154222462370611 285173 283582 667 665 0 True 604 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 647 550 0.00630311989805052 0.0061823131874089 0.00633249408712902 0.00627145799954223 0.00185490667306784 0.00165969737240088 275521 269430 667 665 0 True 649 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 247 595 0.00673686960593862 0.00674694288938184 0.00677500572213321 0.0068055237659266 0.00127783013595707 0.00118655557091901 294481 294037 667 665 0 False 247 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 292 595 0.00660852910692742 0.00660047922507115 0.00657663843747616 0.00665293354695964 0.00144747259325346 0.00149942788714967 288871 287654 667 665 0 False 292 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 339 596 0.00642656469888196 0.00647409322115084 0.00643930724040589 0.0064087891966125 0.0013406209060868 0.0014640273777562 280917 282146 667 665 0 True 337 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 382 596 0.00629447235640591 0.00638618748748732 0.00627145799954223 0.0064087891966125 0.00128043473846041 0.00127950196812238 275143 278315 667 665 0 True 381 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 426 594 0.00625665651953149 0.00638354870926458 0.00616464484626535 0.00646982528419928 0.00171834083598505 0.00170675949880612 273490 278200 667 665 0 False 426 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 471 594 0.00617374992979592 0.00628894277350506 0.00605783169298848 0.0063935301747158 0.00186759069424089 0.0018404973007643 269866 274077 667 665 0 False 471 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 515 594 0.00636763330397058 0.00639428738933624 0.00631723506523232 0.0063782711528191 0.0019461688010152 0.00197701879273325 278341 278668 667 665 0 False 515 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 560 594 0.00646895595461596 0.00663806460532196 0.00648508430609598 0.00653086137178607 0.00181604706032501 0.00192116352004324 282770 289292 667 665 0 False 560 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 604 594 0.00636724439336752 0.00639297947317366 0.00634775310902571 0.00642404821850919 0.00150903568053185 0.00149033374039027 278324 278611 667 665 0 False 604 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 649 594 0.0065598695273558 0.00646025684490466 0.00653086137178607 0.0063935301747158 0.00150372032547278 0.00162263181273705 286744 281543 667 665 0 False 649 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 247 644 0.0090244417731624 0.727692451545435 0.00837720302128634 0.73321126115816 0.00306714518472961 0.200168974107805 394475 31713401 667 665 10 True 248 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 292 638 0.00701997364787508 0.00684687227338201 0.00691233691920348 0.00675974670023652 0.00165563753819449 0.00148620701012537 306856 298392 667 665 0 False 292 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 337 638 0.00616183096366671 0.00618800377001097 0.00610360875867857 0.00616464484626535 0.00126773513684323 0.00131230197955193 269345 269678 667 665 0 False 337 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 381 638 0.00610731484795483 0.00605383910680799 0.00611886778057527 0.00602731364919509 0.00120974034629656 0.00125947079339516 266962 263831 667 665 0 False 381 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 426 638 0.00611067778081662 0.00614800907051332 0.00616464484626535 0.00611886778057527 0.00155773285321549 0.00153989362081706 267109 267935 667 665 0 False 426 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 471 638 0.00615101009806381 0.00615298833029013 0.00619516289005875 0.00607309071488518 0.00168566418019627 0.00181972724394538 268872 268152 667 665 0 False 471 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 515 638 0.00636015249413517 0.00621625016994305 0.0064087891966125 0.00633249408712902 0.00187255223615093 0.0016732210707318 278014 270909 667 665 0 False 515 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 560 637 0.00658471405176332 0.00633368727380364 0.00669871061264973 0.00630197604333562 0.00180961302117923 0.00154640677399403 287830 276027 667 665 0 False 560 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 605 637 0.00721298769246642 0.0070117385475591 0.00689707789730678 0.00694285496299687 0.00228022572166985 0.00141589634934512 315293 305577 667 665 0 False 605 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 645 642 0.00835956478158266 0.763741328601889 0.00834668497749294 0.758175020981155 0.00175226373077114 0.169643132779151 365412 33284439 667 665 13 True 649 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D4_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D4_3.csv new file mode 100755 index 0000000..c140f83 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D4_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 246 247 0.00110656505118921 0.0717684116448136 0.000823987182421607 0.0705271992065309 0.000935300280377956 0.0196879505948367 48370 3127723 667 665 0 True 246 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 291 247 0.00100826217699116 0.000967238421069841 0.000854505226215 0.000823987182421607 0.000764616810877563 0.000720488862096613 44073 42153 667 665 0 False 291 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 334 247 0.000925447095632774 0.00100757730903133 0.000839246204318303 0.000885023270008392 0.000685669759093471 0.000694470573625947 40453 43911 667 665 0 True 336 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 379 247 0.000962210586169492 0.00085962216137735 0.000854505226215 0.000778210116731518 0.000636715030400115 0.000603776086500055 42060 37463 667 665 0 True 380 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 423 247 0.000970194692079458 0.000883394111279572 0.000839246204318303 0.00064087891966125 0.000784971939495093 0.000789218369883492 42409 38499 667 665 0 True 425 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 467 245 0.000927872067628351 0.000965884613112089 0.000732433051041428 0.000793469138628214 0.000852240545869424 0.000775057544770634 40559 42094 667 665 0 True 469 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 511 245 0.000883673521444817 0.00106813153276875 0.000701915007248035 0.000930800335698482 0.000800840866283159 0.000857545884205099 38627 46550 667 665 0 True 514 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 555 245 0.00096278251352694 0.000922562758464024 0.000747692072938125 0.000762951094834821 0.000799259204028004 0.000716668600439394 42085 40206 667 665 0 True 559 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 603 246 0.00113269069287741 0.000917422877404085 0.000717174029144732 0.000518806744487678 0.00118759997536783 0.000993705439338569 49512 39982 667 665 0 False 603 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 642 246 0.00126926694583585 0.0773613823985461 0.000961318379491875 0.0756389715419242 0.00113785057090054 0.0201366563994066 55482 3371469 667 665 0 True 648 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 246 291 0.000998447903537359 0.00102556689274112 0.000762951094834821 0.000839246204318303 0.000850539467205179 0.000823051930608618 43644 44695 667 665 0 False 246 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 291 291 0.000953013994261738 0.000943558254757975 0.000869764248111696 0.000778210116731518 0.00067267308422991 0.000710393966197619 41658 41121 667 665 0 False 291 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 334 291 0.000918698352814895 0.000989289428652887 0.000854505226215 0.000900282291905089 0.000659157804152652 0.000674300764099693 40158 43114 667 665 0 True 336 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 378 292 0.000879853046697068 0.000878667256376235 0.000762951094834821 0.000778210116731518 0.000672644017090052 0.00062255572554873 38460 38293 667 665 0 True 380 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 422 290 0.000965687904502773 0.000883164652303682 0.000762951094834821 0.000656137941557946 0.000847967250017089 0.000799286032933985 42212 38489 667 665 0 True 425 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 467 290 0.000929633603889289 0.000967376096455375 0.000595101853971161 0.000625619897764553 0.000902659940487103 0.000973767720565354 40636 42159 667 665 0 True 470 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 511 290 0.00092853550336299 0.000938280698312501 0.000732433051041428 0.000701915007248035 0.000829294586256721 0.000858448188479859 40588 40891 667 665 0 True 514 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 554 290 0.000943565754316708 0.000901980288326676 0.000717174029144732 0.000701915007248035 0.000854764022434184 0.000760135892500683 41245 39309 667 665 0 True 559 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 603 290 0.000952693714941568 0.000929492419535908 0.000549324788281071 0.000503547722590982 0.00104083381094425 0.000988317183041408 41644 40508 667 665 0 False 603 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 648 290 0.00107357628121165 0.000986031111195246 0.000747692072938125 0.000564583810177768 0.000992802083942944 0.00106660498977853 46928 42972 667 665 0 False 648 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 246 335 0.000950703407737651 0.000890828582098414 0.000793469138628214 0.000701915007248035 0.000772828448561642 0.000779681704822895 41557 38823 667 665 0 True 247 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 290 336 0.00100871971887711 0.000927312559264951 0.000869764248111696 0.000762951094834821 0.000731655637562775 0.000733699062135571 44093 40413 667 665 0 True 291 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 335 336 0.000908655308418119 0.000893605035706685 0.000778210116731518 0.00080872816052491 0.000676197810459498 0.000656959386803469 39719 38944 667 665 0 True 336 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 379 336 0.000914283073615401 0.000903540609362729 0.000793469138628214 0.000778210116731518 0.000676486663482605 0.000656826138525627 39965 39377 667 665 0 True 380 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 423 336 0.0010512939913655 0.000933301438535685 0.000823987182421607 0.000610360875867857 0.000851649777744113 0.000871539763467326 45954 40674 667 665 0 True 425 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 468 334 0.000873287320633572 0.000942158555005045 0.000625619897764553 0.000747692072938125 0.000834264477844749 0.000799753610088731 38173 41060 667 665 0 True 470 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 511 334 0.00101352390867967 0.000893834494682575 0.000839246204318303 0.000717174029144732 0.000852818953960644 0.000830210544448054 44303 38954 667 665 0 True 514 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 555 333 0.00101187675789022 0.00100562690773627 0.000793469138628214 0.000823987182421607 0.000919702259595971 0.000804331125114763 44231 43826 667 665 0 True 559 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 600 334 0.00107110555502748 0.000936995728047516 0.00064087891966125 0.000320439459830625 0.00117888122061428 0.00115027352288967 46820 40835 667 665 0 True 604 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 644 334 0.00106547778983019 0.000974672891888682 0.000701915007248035 0.000595101853971161 0.00105390658253898 0.000994700813928873 46574 42477 667 665 0 True 648 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 247 380 0.000964383910127793 0.00100897700878426 0.000778210116731518 0.000839246204318303 0.000821628117027506 0.000814544355328073 42155 43972 667 665 0 True 247 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 291 380 0.000919247403078044 0.0010312574753432 0.000793469138628214 0.000946059357595178 0.000700437544925994 0.000713556202182273 40182 44943 667 665 0 True 291 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 335 379 0.000959877122551107 0.000927656747728786 0.000823987182421607 0.000793469138628214 0.00073004972908137 0.000727149048862737 41958 40428 667 665 0 True 336 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 379 380 0.000910233827924673 0.000939519776782308 0.000762951094834821 0.000762951094834821 0.000719956304576002 0.000759203743030985 39788 40945 667 665 0 True 381 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 423 380 0.000961387010774768 0.000989266482755298 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.000832808855506844 0.000866492154681476 42024 43113 667 665 0 True 425 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 468 378 0.000938738687419851 0.00101262540650092 0.00064087891966125 0.000671396963454643 0.000842264189034317 0.000943774900127911 41034 44131 667 665 0 True 470 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 513 378 0.000940408715303598 0.000961341325389464 0.000610360875867857 0.00064087891966125 0.000894268120350059 0.000921781409867293 41107 41896 667 665 0 True 514 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 556 378 0.00100165069673906 0.0010318770145781 0.000717174029144732 0.00080872816052491 0.000979784414995917 0.000870895312040651 43784 44970 667 665 0 True 559 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 599 377 0.00101967784704581 0.000948675189920326 0.000564583810177768 0.000503547722590982 0.00114996315325212 0.00105744071573443 44572 41344 667 665 0 True 604 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 644 377 0.000960563435380044 0.000955214770733196 0.000488288700694286 0.000610360875867857 0.00106161116477816 0.000961878496857993 41988 41629 667 665 0 True 648 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 247 423 0.000896896481949 0.000973915677268245 0.000686655985351339 0.000778210116731518 0.000845523941948285 0.000829616841105091 39205 42444 667 665 0 True 247 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 291 424 0.000898703772398534 0.000907326682464917 0.000747692072938125 0.000793469138628214 0.000768235217544798 0.000763655959122038 39284 39542 667 665 0 True 291 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 335 425 0.00098257120009462 0.000957073388437906 0.000885023270008392 0.000839246204318303 0.00070276469666083 0.000698622413288976 42950 41710 667 665 0 True 336 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 380 424 0.000935444385840954 0.000978573694478816 0.000778210116731518 0.000823987182421607 0.000756831918743216 0.00074824178054908 40890 42647 667 665 0 True 381 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 423 424 0.000935032598143592 0.000952369479432158 0.000717174029144732 0.000656137941557946 0.00082664589025845 0.000840157345683353 40872 41505 667 665 0 True 425 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 468 422 0.000970560725588224 0.00105521299242613 0.000671396963454643 0.000869764248111696 0.000952874562730518 0.000863179078049323 42425 45987 667 665 0 True 470 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 512 422 0.000994650305883909 0.000962029702317134 0.000701915007248035 0.000732433051041428 0.000960985935593159 0.000885508077974862 43478 41926 667 665 0 True 515 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 556 421 0.000906001565479563 0.000963681806943543 0.000671396963454643 0.000747692072938125 0.00088830169711043 0.000850038574781399 39603 41998 667 665 0 True 559 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 601 422 0.00087331019772787 0.000890507339532168 0.000381475547417411 0.000457770656900893 0.00104592712352809 0.000987709242579002 38174 38809 667 665 0 True 604 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 645 422 0.000933568464108527 0.000927473180548074 0.000503547722590982 0.000503547722590982 0.00100087220046234 0.000971827050954332 40808 40420 667 665 0 True 648 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 248 467 0.000910005056981695 0.000939818073450965 0.000747692072938125 0.000778210116731518 0.000771247931122976 0.00076073790708902 39778 40958 667 665 0 True 247 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 293 468 0.000913253604371996 0.000966366476961458 0.000747692072938125 0.000839246204318303 0.000802393156940657 0.000852216836274211 39920 42115 667 665 0 True 292 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 337 467 0.00097637150753989 0.000962557457961681 0.000823987182421607 0.000854505226215 0.000815930405518756 0.000817233727203879 42679 41949 667 665 0 True 336 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 381 468 0.000876718884778256 0.000840577066378466 0.000717174029144732 0.000717174029144732 0.000783500170895803 0.000725719032522224 38323 36633 667 665 0 True 381 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 425 467 0.000928993045248948 0.000889245315164772 0.000625619897764553 0.000579842832074464 0.000989985636537749 0.000955139201830542 40608 38754 667 665 0 True 425 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 469 467 0.000997555696859741 0.000982749847840017 0.00064087891966125 0.000564583810177768 0.00104800256727266 0.00106731601704684 43605 42829 667 665 0 True 470 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 514 466 0.000889095392793418 0.000869121762979204 0.000549324788281071 0.000534065766384375 0.000970782760070178 0.000874922211464196 38864 37877 667 665 0 True 515 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 558 466 0.000940843380095258 0.000827543796547904 0.000579842832074464 0.0004272526131075 0.00101291507339393 0.000932669841435067 41126 36065 667 665 0 True 559 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 601 466 0.000946997318461392 0.000860861239847157 0.000549324788281071 0.000488288700694286 0.00100845337359308 0.000910513373571224 41395 37517 667 665 0 True 604 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 647 467 0.000954363742825314 0.000908588706832313 0.000534065766384375 0.000518806744487678 0.00102491459653259 0.000944423777906814 41717 39597 667 665 0 True 649 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 249 511 0.000961730167189237 0.000945095629896439 0.000854505226215 0.000778210116731518 0.000724741592112381 0.000781468887959529 42039 41188 667 665 0 True 247 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 293 512 0.000943748771071091 0.000910791513000859 0.000793469138628214 0.000793469138628214 0.000828425187094302 0.000773376368381751 41253 39693 667 665 0 True 292 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 337 513 0.000879807292508472 0.000948331001456491 0.000732433051041428 0.000854505226215 0.000776655402569829 0.000751189758510781 38458 41329 667 665 0 True 336 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 382 512 0.000911858101619824 0.000862008534726608 0.000732433051041428 0.000686655985351339 0.000815322925691651 0.000719031024905975 39859 37567 667 665 0 True 381 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 425 511 0.00089950447069896 0.000996402656905482 0.000549324788281071 0.000671396963454643 0.00093156345530185 0.000958108324801815 39319 43424 667 665 0 True 426 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 470 509 0.000945807709557901 0.000920314060500301 0.000564583810177768 0.00064087891966125 0.000987044912704028 0.000846143753777712 41343 40108 667 665 0 True 470 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 514 509 0.000901563409185771 0.000849158832076759 0.000549324788281071 0.000564583810177768 0.00092067413810805 0.000815661945418668 39409 37007 667 665 0 True 515 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 559 509 0.000885412180611457 0.000935527190601819 0.000579842832074464 0.000656137941557946 0.000901599972378989 0.000894176096142718 38703 40771 667 665 0 True 560 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 603 509 0.000888226063210098 0.000849089994383992 0.000503547722590982 0.000488288700694286 0.000974191805114799 0.000888671713049251 38826 37004 667 665 0 True 604 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 647 508 0.000968661926761499 0.000847185484884103 0.000518806744487678 0.0004272526131075 0.00103252000423534 0.000987627506852457 42342 36921 667 665 0 True 649 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 251 554 0.000890010476565334 0.000939221480113651 0.000762951094834821 0.000778210116731518 0.000683644283552717 0.000739844002012565 38904 40932 667 665 0 True 247 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 293 553 0.000913711146257954 0.000877313448418483 0.000762951094834821 0.000778210116731518 0.00075826529545138 0.000685822092050991 39940 38234 667 665 0 True 292 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 339 554 0.000884268325896562 0.000966527098244581 0.000747692072938125 0.000823987182421607 0.000735799534990421 0.000738718951178118 38653 42122 667 665 0 True 337 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 382 553 0.000867842572190673 0.000849250615667115 0.000732433051041428 0.000686655985351339 0.000722802203081247 0.000711148398027368 37935 37011 667 665 0 True 381 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 427 553 0.000936588240555849 0.000932888412379082 0.000625619897764553 0.000564583810177768 0.000969438144043157 0.000959616244174715 40940 40656 667 665 0 True 426 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 471 552 0.000765947994187845 0.00101212059675396 0.000305180437933928 0.000503547722590982 0.000942552157867261 0.00126815700757679 33481 44109 667 665 0 True 470 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 516 551 0.000956559943877912 0.000884334893080722 0.000610360875867857 0.000366216525520714 0.001021327920241 0.00105988021974913 41813 38540 667 665 0 True 515 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 559 550 0.000861803019296028 0.000962213269497846 0.000534065766384375 0.000549324788281071 0.000875790835550382 0.00103801845781294 37671 41934 667 665 0 True 560 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 603 550 0.000879372627716812 0.000896243813929422 0.000610360875867857 0.000671396963454643 0.000869304283293705 0.00079665122714806 38439 39059 667 665 0 True 604 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 647 550 0.000949033379853905 0.000872816052491035 0.000610360875867857 0.000549324788281071 0.00098611254057984 0.000922554711442012 41484 38038 667 665 0 True 649 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 247 595 0.000957497904744126 0.000947091922986684 0.000839246204318303 0.000823987182421607 0.00066908478397203 0.000644935143602678 41854 41275 667 665 0 False 247 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 292 595 0.000898932543341513 0.000870888597093558 0.000778210116731518 0.000701915007248035 0.000698123526918991 0.00072643235155479 39294 37954 667 665 0 False 292 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 339 596 0.000886212878911883 0.000979835718846212 0.000717174029144732 0.000854505226215 0.000726668680839675 0.000809272764325819 38738 42702 667 665 0 True 337 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 382 596 0.000900465308659472 0.000806548300253954 0.000747692072938125 0.000671396963454643 0.000691818218162879 0.000629959649501253 39361 35150 667 665 0 True 381 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 426 594 0.000861322600315773 0.00084491384102279 0.000534065766384375 0.000518806744487678 0.000895778948505838 0.000907863790116688 37650 36822 667 665 0 False 426 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 471 594 0.00085786815907679 0.000943237012191729 0.000457770656900893 0.000473029678797589 0.000970411972633268 0.00101121627634102 37499 41107 667 665 0 False 471 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 515 594 0.000925195447595497 0.000922149732307422 0.000457770656900893 0.000488288700694286 0.00106872633624108 0.00107539271074991 40442 40188 667 665 0 False 515 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 560 594 0.000984401367638451 0.000856845707769079 0.000579842832074464 0.000473029678797589 0.00104250282201216 0.000933025188257008 43030 37342 667 665 0 False 560 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 604 594 0.000913734023352251 0.000883417057177161 0.000671396963454643 0.000625619897764553 0.00081760424683157 0.00078070085189808 39941 38500 667 665 0 False 604 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 649 594 0.000957429273461232 0.000867010740401014 0.000732433051041428 0.000671396963454643 0.000837948625598369 0.000764939369518041 41851 37785 667 665 0 False 649 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 247 644 0.00104379030443579 0.0740459296559091 0.000900282291905089 0.074036774242771 0.000742798030173483 0.0224268866627446 45626 3226979 667 665 0 True 248 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 292 638 0.000935650279689636 0.000886468861556501 0.00080872816052491 0.000747692072938125 0.000651068804965004 0.00070313482659474 40899 38633 667 665 0 False 292 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 337 638 0.000811244640897679 0.000949501242233531 0.000686655985351339 0.000839246204318303 0.000629860348115445 0.000679743326866151 35461 41380 667 665 0 False 337 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 381 638 0.000935421508746657 0.000811229263362113 0.000839246204318303 0.000686655985351339 0.000671722577521855 0.000661094248667533 40889 35354 667 665 0 False 381 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 426 638 0.000967952736838264 0.00082134840419887 0.000762951094834821 0.000564583810177768 0.000857995009619367 0.000740391032426925 42311 35795 667 665 0 False 426 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 471 638 0.000839749500392857 0.000859002622142447 0.000488288700694286 0.000518806744487678 0.00088637184799849 0.000883286030557109 36707 37436 667 665 0 False 471 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 515 638 0.000861482739975858 0.000830549709132066 0.000518806744487678 0.000442511635004196 0.000928083472083959 0.000888215103993512 37657 36196 667 665 0 False 515 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 560 637 0.000901609163374367 0.00084585462282394 0.00064087891966125 0.000564583810177768 0.000843249290537034 0.000828901491909154 39411 36863 667 665 0 False 560 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 605 637 0.000937160167913297 0.000899777482158131 0.00080872816052491 0.000717174029144732 0.000709922598450118 0.000711294888450712 40965 39213 667 665 0 False 605 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 645 642 0.00102500821001722 0.078096752524479 0.000885023270008392 0.0757915617608911 0.000763795667448878 0.0208708889965128 44805 3403517 667 665 0 True 649 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D5_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D5_1.csv new file mode 100755 index 0000000..be0b083 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D5_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 259 277 0.010269962295117 0.0416537796769332 0.0103456168459602 0.0424200808728161 0.00159089952026426 0.00915256308059638 448919 1815304 667 665 0 True 260 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 305 276 0.0103900441630867 0.0109629532746951 0.0104219119554437 0.0103150988021668 0.0013894645183554 0.00461975361213643 454168 477774 667 665 0 False 305 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 347 277 0.0110271941163774 0.0664660047922507 0.0106813153276875 0.0662546730754559 0.00246951475453457 0.0119463115773225 482019 2896640 667 665 0 True 350 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 391 277 0.0110477148699626 0.0869025619668306 0.0108949416342412 0.0854657816433967 0.00170663304362982 0.0141500332374283 482916 3787281 667 665 0 True 394 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 436 277 0.0106803773668213 0.0750857230051554 0.0107118333714809 0.0725413900968948 0.00172526641280946 0.0133774172393609 466859 3272294 667 665 0 True 439 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 480 277 0.0108080086759092 0.0668632441713118 0.0108796826123445 0.0698710612649729 0.00175918136445339 0.0188698195286808 472438 2913952 667 665 0 True 484 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 524 275 0.0106105793521184 0.0821562948341327 0.0106813153276875 0.0828107118333715 0.0016180760928718 0.0221824521235526 463808 3580435 667 665 0 True 528 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 569 275 0.0110092355973535 0.0702102934149289 0.0103913939116503 0.0691233691920348 0.0049557261079735 0.0172776498396173 481234 3059819 667 665 0 True 573 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 618 276 0.0105507099963408 0.0100723082597774 0.0105745021744106 0.0101319905394064 0.00198820335701047 0.00188939690677342 461191 438959 667 665 0 False 618 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 657 274 0.01022995025719 0.0422031962488047 0.0102845807583734 0.0430457007705806 0.00187927877814677 0.00933847302826741 447170 1839248 667 665 0 True 662 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 260 320 0.0102951728530333 0.0102298777385212 0.0103608758678569 0.0102235446707866 0.00142726001480376 0.00152532125527199 450021 445826 667 665 0 False 260 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 305 320 0.0104087347491281 0.0103001380769387 0.0104676890211337 0.0103150988021668 0.0013753293397546 0.00132705898849929 454985 448888 667 665 0 False 305 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 348 321 0.0110053464913229 0.151352976168964 0.0109864957656214 0.139971007858396 0.00134249337729086 0.0601171848509308 481064 6596080 667 665 0 True 350 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 391 321 0.0108362390102728 0.0527634260749149 0.0107270923933776 0.0527962157625696 0.00140295076162185 0.00772578428572281 473672 2299471 667 665 0 True 394 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 436 320 0.0108480664680249 0.0844800947206652 0.0109712367437247 0.0848401617456321 0.00170339844838335 0.014897060921474 474189 3681708 667 665 0 True 439 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 480 319 0.0109450195936593 0.0436677411083213 0.0109102006561379 0.0455024032959487 0.00181839209897111 0.00843401896285333 478427 1903074 667 665 0 True 484 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 525 320 0.0106072850505395 0.0459813989081195 0.0105745021744106 0.047196154726482 0.00167058015423064 0.00858403594702583 463664 2003905 667 665 0 True 528 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 568 319 0.0106152920335438 0.0514772396773577 0.010605020218204 0.0529182879377432 0.00192814920376216 0.00904412235249909 464014 2243418 667 665 0 True 573 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 618 319 0.0105238294105408 0.0100937856199207 0.0104829480430304 0.0100862134737163 0.00202722741031748 0.00221433009469102 460016 439895 667 665 0 False 618 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 662 319 0.0103996982968804 0.0100441536434357 0.0104676890211337 0.0100251773861295 0.00202382626229841 0.00188204069699594 454590 437732 667 665 0 False 662 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 260 366 0.0103556141361684 0.0526975025111417 0.0103150988021668 0.0510414282444495 0.0016077986804945 0.0111419114546772 452663 2296598 667 665 0 True 261 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 303 366 0.0102972089144258 0.0602024401814791 0.0103456168459602 0.0640421149004349 0.00147907832396363 0.0156330195861357 450110 2623669 667 665 0 True 305 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 350 363 0.010671523931328 0.0292026243223073 0.010452429999237 0.0330205233844511 0.00235711939671498 0.0141281502644627 466472 1272673 667 665 0 False 350 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 391 364 0.0104235133520445 0.0367253680091738 0.0104371709773404 0.0372777904936294 0.00147510791108756 0.00576731898288468 455631 1600520 667 665 0 True 395 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 436 365 0.010948679928747 0.0737333835848491 0.0105745021744106 0.0710612649729152 0.00317947114641705 0.0136253262154089 478587 3213358 667 665 0 True 439 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 480 364 0.010446664971474 0.0363701655144958 0.0104982070649271 0.0363317311360342 0.00173227405257721 0.00694595098585121 456643 1585040 667 665 0 True 484 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 524 363 0.0101356051203055 0.0300006138027605 0.0101472495613031 0.0304417486839094 0.00179441337729433 0.00392242465646255 443046 1307450 667 665 0 True 529 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 569 363 0.0102449576310494 0.0547794985288811 0.0101930266269932 0.0550850690470741 0.00187206178712624 0.00949721143427161 447826 2387333 667 665 0 True 573 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 613 363 0.0115772280945817 0.05932303865638 0.0105134660868238 0.0591439688715953 0.00930042706104296 0.0116567232318368 506062 2585344 667 665 0 True 618 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 657 363 0.0100694903177846 0.0667751548704675 0.0100404364080262 0.0653238727397574 0.00207724858568883 0.0186633183148072 440156 2910113 667 665 0 True 663 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 260 410 0.00992266512658068 0.0419518009948194 0.0100099183642329 0.043930724040589 0.00165003593372117 0.0087302760761528 433738 1828292 667 665 0 True 261 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 304 409 0.0102900483839106 0.0317376641420443 0.0102998397802701 0.0320134279392691 0.0015566704440536 0.00328563959456469 449797 1383152 667 665 0 True 305 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 348 409 0.0104647836301579 0.0851991962052075 0.0103913939116503 0.0818646524757763 0.00176594647781774 0.0186400374857244 457435 3713047 667 665 0 True 350 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 392 409 0.010500037232471 0.0683754017683256 0.0104219119554437 0.0684672312504769 0.00175230981129762 0.01605283491238 458976 2979853 667 665 0 True 395 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 436 408 0.0104228041621213 0.0459035434775999 0.010406652933547 0.047699702449073 0.00165743787384976 0.00862683549308186 455600 2000512 667 665 0 True 439 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 481 408 0.0106365906083351 0.0563495945173072 0.0106660563057908 0.056595712214847 0.00175359509975448 0.0103771298989629 464945 2455759 667 665 0 True 484 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 526 407 0.0104009336599725 0.0439731510052311 0.0103456168459602 0.0443732356755932 0.00170328755066876 0.00464712226437392 454644 1916384 667 665 0 True 529 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 569 406 0.0100576628600326 0.054647238375178 0.0100404364080262 0.0532082093537804 0.00177980285527086 0.00761515969342928 439639 2381569 667 665 0 True 573 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 614 407 0.0110746640870455 0.0440632365991656 0.0103303578240635 0.0446631570916304 0.00635736244111583 0.00659915174606116 484094 1920310 667 665 0 True 618 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 657 406 0.0101619137787481 0.0850154913491098 0.0102693217364767 0.0814068818188754 0.00202173011993791 0.0131746492960991 444196 3705041 667 665 0 True 663 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 260 454 0.00984300708423541 0.0418809670089621 0.00985732814526589 0.0424048218509194 0.00164725384149762 0.00625919743392942 430256 1825205 667 665 0 True 261 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 305 453 0.0100897594233325 0.0522246793454224 0.00985732814526589 0.0511482413977264 0.00207473329381553 0.00596096495052761 441042 2275992 667 665 0 True 305 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 348 453 0.0100635422732671 0.0353113729620458 0.010101472495613 0.0357976653696498 0.00147637508824184 0.00370240277400724 439896 1538897 667 665 0 True 350 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 392 452 0.0104191667041279 0.051614960954687 0.0104371709773404 0.0523079270618753 0.00163495633866639 0.00797895419228719 455441 2249420 667 665 0 True 395 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 437 453 0.0104965141599491 0.0937124913450943 0.010452429999237 0.0934462500953689 0.00186825985206345 0.0139027580014759 458822 4084063 667 665 0 True 439 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 481 451 0.0103971131852247 0.0624669708145392 0.0103913939116503 0.062378881513695 0.00186374971813779 0.0138337700177045 454477 2722359 667 665 0 True 484 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 525 451 0.0104320693853119 0.0542447214396715 0.010406652933547 0.053330281528954 0.00177893568032388 0.00781265166997037 456005 2364027 667 665 0 True 529 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 569 450 0.0102749037474854 0.0332298358622581 0.0102693217364767 0.0335545891508354 0.00191257252450045 0.00380517946042746 449135 1448182 667 665 0 True 573 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 613 450 0.0103098828246669 0.0390616504639947 0.0103150988021668 0.0397955291065843 0.00188484365592676 0.00476338154427399 450664 1702337 667 665 0 True 618 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 657 449 0.010194010342048 0.0692722192296947 0.0102388036926833 0.0693064774547952 0.00197744474330253 0.0126818845335341 445599 3018937 667 665 0 True 663 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 261 497 0.00992753794766613 0.0585526301448288 0.00993362325474937 0.0592813000686656 0.00164285188167993 0.0134489913449541 433951 2551769 667 665 0 True 261 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 306 497 0.010141942075426 0.0555247812825724 0.0100099183642329 0.0554665445944915 0.00198967790808129 0.00545234841659074 443323 2419813 667 665 0 True 305 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 350 497 0.0101533348683864 0.0703181161876997 0.0101167315175097 0.0673838406958114 0.00152399715944307 0.0161029826082634 443821 3064518 667 665 0 True 350 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 394 496 0.0104415405023513 0.0898610912724705 0.0103608758678569 0.0851300831616693 0.00163671940938167 0.0166174830473208 456419 3916216 667 665 0 True 395 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 438 496 0.0107918803244292 0.0966152391736953 0.010757610437171 0.0947585259784848 0.0018607172255556 0.0246745958070298 471733 4210567 667 665 0 True 439 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 484 493 0.0108183719996262 0.0422819924611253 0.0107118333714809 0.0448310063324941 0.00222679719218613 0.00924742339991903 472891 1842682 667 665 0 False 484 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 526 495 0.0105606844094547 0.042250969607585 0.0105287251087205 0.0430304417486839 0.00180036905638299 0.00517678971154143 461627 1841330 667 665 0 True 529 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 571 494 0.0104155292461345 0.0981024316341323 0.0104676890211337 0.0958113984893568 0.00185542188059158 0.0153063943675281 455282 4275380 667 665 0 True 573 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 615 494 0.0102659130494263 0.0634109420954538 0.0103303578240635 0.0664225223163195 0.00183285243226056 0.0140019004168626 448742 2763498 667 665 0 True 618 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 659 494 0.01033193634357 0.0798056941392162 0.0102235446707866 0.0769665064469368 0.00205980296849113 0.0128216637384812 451628 3477994 667 665 0 True 663 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 262 541 0.00991847861832416 0.0577057659025109 0.00991836423285267 0.0597695887693599 0.00144678490723065 0.0121051134413161 433555 2514862 667 665 0 True 261 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 305 540 0.0100873802055255 0.111429018873574 0.010101472495613 0.10258640421149 0.00150000368115693 0.0279604122304936 440938 4856163 667 665 0 True 306 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 350 540 0.0102562817927269 0.0585764938783213 0.01025406271458 0.0601052872510872 0.00145296106310286 0.0110320212666065 448321 2552809 667 665 0 True 350 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 394 540 0.0105631322585446 0.0597098605979357 0.0105897611963073 0.0586709391927977 0.00163863444965956 0.00699586231127173 461734 2602202 667 665 0 True 395 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 439 539 0.0106205995194209 0.0568736558723428 0.010605020218204 0.0567330434119173 0.00206672955548541 0.00730283077960152 464246 2478598 667 665 0 True 440 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 483 537 0.0104267847765291 0.0637421431812537 0.010452429999237 0.0627908751049058 0.00189613868992569 0.0108318774486961 455774 2777932 667 665 0 True 484 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 527 537 0.0102904372945137 0.0765721353050743 0.01025406271458 0.0732127870603494 0.00194812857786224 0.0169856476672007 449814 3337073 667 665 0 True 529 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 570 536 0.0101611588346362 0.0585615331530933 0.0101930266269932 0.0585336079957275 0.00175910525890439 0.011276752900891 444163 2552157 667 665 0 True 574 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 615 536 0.0102041220177277 0.0509004715955602 0.0101625085831998 0.0496223392080568 0.00175879531900924 0.00679210499954994 446041 2218282 667 665 0 True 618 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 659 535 0.010079350345427 0.0683381835224362 0.0101319905394064 0.0689707789730678 0.0019599139290622 0.0107646896354643 440587 2978231 667 665 0 True 663 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 262 582 0.00961192555473236 0.0475403661362149 0.00964370183871214 0.046997787441825 0.00128403677743047 0.00788852309933874 420155 2071846 667 665 0 True 261 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 306 581 0.00977197370644044 0.0540527790063394 0.00965896086060884 0.0538796063172351 0.00152887775954607 0.00929344297300717 427151 2355662 667 665 0 True 306 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 351 581 0.00994066939979312 0.0451536944902884 0.00990310521095598 0.0454566262302586 0.00159324091472351 0.00597696788973726 434525 1967833 667 665 0 True 350 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 394 580 0.0102782209261586 0.0485551255111916 0.0103608758678569 0.047501335164416 0.00157957811636516 0.00484112527593391 449280 2116070 667 665 0 True 395 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 439 580 0.0104484265077349 0.0847634077181968 0.0104676890211337 0.0797436484321355 0.00184085870635589 0.015919565637142 456720 3694055 667 665 0 True 440 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 483 578 0.0104059894978123 0.0601499858595906 0.0104676890211337 0.0585488670176242 0.00216770612433781 0.00807204519691912 454865 2621383 667 665 0 True 484 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 528 578 0.0102220805367515 0.052814618372436 0.0102998397802701 0.0524147402151522 0.00215840008916618 0.00582311389036138 446826 2301702 667 665 0 True 529 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 572 577 0.00996189934330157 0.0367293605953543 0.00990310521095598 0.03759822995346 0.0016636726740056 0.00603527525625827 435453 1600694 667 665 0 True 574 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 616 577 0.00996004629866344 0.0470931735381025 0.00999465934233616 0.0470893415732052 0.00162227329754658 0.00616605333235733 435372 2052357 667 665 0 True 618 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 659 576 0.0100529730557015 0.0540251291997446 0.0100862134737163 0.0533455405508507 0.00170302842505185 0.00690611771678997 439434 2354457 667 665 0 True 663 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 261 624 0.00953798678596156 0.00938746500033559 0.00946059357595178 0.00943007553215839 0.00160122391490736 0.00135415691715782 416923 409113 667 665 0 False 261 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 306 624 0.00943243187287107 0.00927796717704079 0.00944533455405508 0.00929274433508812 0.0014086452292806 0.00132271984284188 412309 404341 667 665 0 False 306 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 351 623 0.00978192524246002 0.067252268919036 0.0098115510795758 0.0653543907835508 0.00143544315124 0.00911217969969372 427586 2930906 667 665 0 True 350 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 395 623 0.0101458998127395 0.0709909587427025 0.0100556954299229 0.0679484245059892 0.00141601190195122 0.0152861303376553 443496 3093841 667 665 0 True 395 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 440 624 0.00987039096610999 0.00983991220899583 0.00987258716716258 0.00990310521095598 0.00180500600436373 0.00191350415554057 431453 428831 667 665 0 False 440 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 484 624 0.00980322381725137 0.00984484557697746 0.00978103303578241 0.00990310521095598 0.00201805820346776 0.00190919528608557 428517 429046 667 665 0 False 484 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 529 624 0.00966463437999471 0.00967903852099922 0.00964370183871214 0.00975051499198901 0.00200218569512976 0.00186766390733205 422459 421820 667 665 0 False 529 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 574 624 0.00967650759193532 0.00973973042012218 0.00971999694819562 0.00975051499198901 0.0016531839094933 0.001668846378238 422978 424465 667 665 0 False 574 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 618 624 0.00983408501745923 0.00968608291155905 0.0098268101014725 0.00970473792629892 0.0015601094342023 0.00139277985870603 429866 422127 667 665 0 False 618 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 663 624 0.0101104860707664 0.0100680403228258 0.0101319905394064 0.0100862134737163 0.00151513360623907 0.00149269128500437 441948 438773 667 665 0 False 663 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 261 674 0.00955018027722234 0.0406848203135442 0.00956740672922866 0.0409552147707332 0.00141654147758188 0.00862806645912893 417456 1773076 667 665 0 True 261 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 306 668 0.00930303902752217 0.00923205243596517 0.00929274433508812 0.00924696726939803 0.00127464434918251 0.00126583593071495 406653 402340 667 665 0 False 306 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 350 668 0.00936329729390283 0.00949166232128731 0.00930800335698482 0.00946059357595178 0.00136095005031894 0.0014258474273842 409287 413654 667 665 0 False 350 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 395 668 0.00957767854456841 0.00966976837837326 0.00952162966353857 0.00970473792629892 0.00137220614872533 0.00124153260049522 418658 421416 667 665 0 False 395 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 440 668 0.00958390111421744 0.00967639974277649 0.00962844281681544 0.00971999694819562 0.00156623090792136 0.00151156332264722 418930 421705 667 665 0 False 440 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 484 667 0.00964040753713324 0.00957915502879423 0.00964370183871214 0.00956740672922866 0.00168643059355196 0.00149243524238104 421400 417467 667 665 0 False 484 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 529 667 0.00935863036666606 0.00933524013742298 0.00932326237888151 0.00941481651026169 0.00177676229031622 0.00177007623587598 409083 406837 667 665 0 False 529 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 574 667 0.00970583602682522 0.00969257660057675 0.00973525597009232 0.00971999694819562 0.00151245509612823 0.00147456468112146 424260 422410 667 665 0 False 574 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 619 667 0.00991111219396024 0.00992210441415968 0.00997940032043946 0.00993362325474937 0.00137095263000931 0.00149777949380973 433233 432413 667 665 0 False 619 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 659 672 0.0102511802006985 0.0414522688043065 0.0101930266269932 0.0414587624933242 0.00154613305940472 0.00833070730122802 448098 1806522 667 665 0 True 663 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D5_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D5_2.csv new file mode 100755 index 0000000..4995051 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D5_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 259 277 0.00933472380312476 0.722293075329661 0.00881971465629053 0.730937666895552 0.00255470966849787 0.204942825452932 408038 31478092 667 665 11 True 260 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 305 276 0.00729950886310107 0.00742251600619769 0.00715648126955062 0.00703440909437705 0.00151540415819681 0.00287676498383925 319075 323479 667 665 0 False 305 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 347 277 0.00743972257405287 0.00699253283127709 0.00717174029144732 0.00704966811627375 0.00191561794336766 0.00135407406900775 325204 304740 667 665 0 True 350 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 391 277 0.00708958864582358 0.00709691371940953 0.00706492713817044 0.00708018616006714 0.00150746762578295 0.00119007688694681 309899 309289 667 665 0 True 394 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 436 277 0.00707510744513301 0.00719241454517502 0.00709544518196384 0.00727855344472419 0.00155030768447951 0.00164013886114682 309266 313451 667 665 0 True 439 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 480 277 0.00725174149020706 0.00730762589696948 0.00730907148851759 0.00727855344472419 0.0016920545483577 0.00187197986769293 316987 318472 667 665 0 True 484 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 524 275 0.00747019486365767 0.00752359268507731 0.00746166170748455 0.00756847486076143 0.00150409808822712 0.00156703863764998 326536 327884 667 665 0 True 528 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 569 275 0.00771481963298506 0.00774043141729352 0.00756847486076143 0.00782787823300526 0.0019819509729525 0.00169297251914667 337229 337334 667 665 0 True 573 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 618 276 0.0100275566039365 0.00832330310784974 0.00883497367818723 0.00833142595559625 0.00734018827859397 0.00187155042741118 438323 362736 667 665 0 False 618 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 657 274 0.0101121332215559 0.747259152688313 0.00994888227664607 0.763897154192416 0.00232071229308068 0.198764123222074 442020 32566133 667 665 14 True 662 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 260 320 0.00708409814319208 0.00697676899963344 0.00697337300679027 0.00695811398489357 0.00175865586501806 0.00152745587558759 309659 304053 667 665 0 False 260 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 305 320 0.00693999532620963 0.00676871854619382 0.00692759594110018 0.00674448767833982 0.00131685337022024 0.00123284313267085 303360 294986 667 665 0 False 305 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 348 321 0.00734430221373635 0.00753954008390167 0.00733958953231098 0.00741588464179446 0.00137380556687329 0.00173554804612199 321033 328579 667 665 0 True 350 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 391 321 0.00714719316926568 0.00710845550589681 0.00714122224765393 0.00711070420386053 0.00142994974859233 0.00125161632553272 312417 309792 667 665 0 True 394 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 436 320 0.00725144408798119 0.00717015702451368 0.00730907148851759 0.00712596322575723 0.00170045441977814 0.00180635803204258 316974 312481 667 665 0 True 439 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 480 319 0.00755211773833843 0.00746675569674931 0.00761425192645151 0.00746166170748455 0.00178417460065289 0.00159957964411735 330117 325407 667 665 0 True 484 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 525 320 0.00754635271057536 0.00742047382131226 0.00756847486076143 0.00732433051041428 0.00165682174566455 0.00158271102655035 329865 323390 667 665 0 True 528 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 568 319 0.00804777286339664 0.00777106419057486 0.00802624551766232 0.00776684214541848 0.00189825545519829 0.00158326943175011 351783 338669 667 665 0 True 573 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 618 319 0.00837441201578199 0.00796745812803926 0.00836194399938964 0.00799572747386892 0.00201929396296101 0.00203617112245261 366061 347228 667 665 0 False 618 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 662 319 0.00850144852041821 0.00777395537367107 0.00849927519645991 0.00782787823300526 0.00206398401014131 0.00197266174635208 371614 338795 667 665 0 False 662 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 260 366 0.0066327330726946 0.0061549387315852 0.00675974670023652 0.00614938582436866 0.00154377570888862 0.00147872724012889 289929 268237 667 665 0 True 261 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 303 366 0.0066642348315428 0.00602371114327361 0.00668345159075303 0.00604257267109178 0.00147187405212386 0.00136063216235386 291306 262518 667 665 0 True 305 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 350 363 0.00684784639037771 0.00649306947845696 0.0068055237659266 0.00653086137178607 0.00156758400808646 0.00129648344685753 299332 282973 667 665 0 False 350 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 391 364 0.00689719228277827 0.00676084810332079 0.00691233691920348 0.00672922865644312 0.00138081662679488 0.00136369180283831 301489 294643 667 665 0 True 395 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 436 365 0.00732051003566653 0.00688209422618115 0.00715648126955062 0.0068207827878233 0.00190797539332155 0.00164930848819415 319993 299927 667 665 0 True 439 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 480 364 0.00719388531872768 0.00726345504411062 0.0072632944228275 0.00732433051041428 0.00175351450968491 0.00191245449998857 314458 316547 667 665 0 True 484 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 524 363 0.0070458018873374 0.00711946953673954 0.00698863202868696 0.00709544518196384 0.00176581337492993 0.00165381210214573 307985 310272 667 665 0 True 529 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 569 363 0.00711205395242411 0.00730700635773457 0.00712596322575723 0.00730907148851759 0.00178688326513392 0.00184215038673387 310881 318445 667 665 0 True 573 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 613 363 0.00775826323505677 0.00759711134095252 0.00747692072938125 0.00758373388265812 0.00324386097368856 0.00206811471279931 339128 331088 667 665 0 True 618 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 657 363 0.00693182820354529 0.00701052241498688 0.00700389105058366 0.00704966811627375 0.00211288116716574 0.00196415198252001 303003 305524 667 665 0 True 663 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 260 410 0.00627916758032062 0.00652315155019616 0.00630197604333562 0.00621042191195544 0.00148716698600644 0.00245812655631414 274474 284284 667 665 0 True 261 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 304 409 0.00644006218451772 0.00613183221271306 0.0064087891966125 0.00611886778057527 0.00142147023741987 0.00134602449480765 281507 267230 667 665 0 True 305 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 348 409 0.00659127977782681 0.00674685110579149 0.00653086137178607 0.00674448767833982 0.00144541727516504 0.00129335953400602 288117 294033 667 665 0 True 350 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 392 409 0.00701114308947609 0.00672381342461211 0.00689707789730678 0.00669871061264973 0.00142407037105574 0.00140845649536992 306470 293029 667 665 0 True 395 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 436 408 0.00700588135778757 0.00690107048348727 0.00700389105058366 0.00689707789730678 0.00157867503229999 0.0015894940769398 306240 300754 667 665 0 True 439 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 481 408 0.0072241288373895 0.00701974666581767 0.00718699931334401 0.00701915007248035 0.00166726628156884 0.00158340232261631 315780 305926 667 665 0 True 484 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 526 407 0.00709082400891566 0.00707332533668802 0.00715648126955062 0.00706492713817044 0.00162751930082084 0.00160219484748109 309953 308261 667 665 0 True 529 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 569 406 0.00704493255775408 0.00696896739445317 0.00708018616006714 0.00692759594110018 0.0018227063480997 0.00161742867375758 307947 303713 667 665 0 True 573 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 614 407 0.0069578165826677 0.00646826496316323 0.00683604180972 0.00651560234988937 0.00252638308213177 0.00196466260238798 304139 281892 667 665 0 True 618 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 657 406 0.00629685157421289 0.00635663317139266 0.00621042191195544 0.0063935301747158 0.00191198600191627 0.0018284610736247 275247 277027 667 665 0 True 663 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 260 454 0.0061217960486454 0.00634300330822478 0.00604257267109178 0.00633249408712902 0.00159353598051642 0.00143355310016939 267595 276433 667 665 0 True 261 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 305 453 0.00621540911851238 0.00652322038788893 0.00621042191195544 0.00651560234988937 0.00141374958148889 0.00157796203273703 271687 284287 667 665 0 True 305 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 348 453 0.00657014134269556 0.00673166092158756 0.00659189745937285 0.00675974670023652 0.0013331937440277 0.00151082580883028 287193 293371 667 665 0 True 350 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 392 452 0.00679376493945749 0.0068769772910188 0.00679026474402991 0.00689707789730678 0.00137017115472765 0.00144604331392751 296968 299704 667 665 0 True 395 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 437 453 0.00690702943332637 0.00721834340945061 0.00695811398489357 0.0072480354009308 0.00175950145760524 0.00188451426816055 301919 314581 667 665 0 True 439 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 481 451 0.00713364992944132 0.0070925998906628 0.00708018616006714 0.0072632944228275 0.00177967534602788 0.00186994451818368 311825 309101 667 665 0 True 484 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 525 451 0.00666910765262825 0.00692830726392544 0.00668345159075303 0.00704966811627375 0.00168416399948152 0.00163629190292452 291519 301941 667 665 0 True 529 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 569 450 0.00646454067541647 0.0063018154220525 0.00654612039368277 0.00628671702143893 0.00174882736227226 0.00190292249145637 282577 274638 667 665 0 True 573 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 613 450 0.00623011909014593 0.00619353373132993 0.00619516289005875 0.00624093995574884 0.00179885880940227 0.00166903494012502 272330 269919 667 665 0 True 618 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 657 449 0.00610527878656231 0.00621482752429253 0.00608834973678187 0.00627145799954223 0.00187835113461534 0.0019414013058807 266873 270847 667 665 0 True 663 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 261 497 0.00658956399575447 0.00647049071522936 0.00650034332799268 0.00653086137178607 0.00156567124159663 0.0014534656397231 288042 281989 667 665 0 True 261 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 306 497 0.00646673687646907 0.00648414352429483 0.00653086137178607 0.00654612039368277 0.00151305543104462 0.0014136423146361 282673 282584 667 665 0 True 305 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 350 497 0.00680222946434771 0.00665775218545333 0.00666819256885634 0.00665293354695964 0.00222411389868282 0.00156235210651677 297338 290150 667 665 0 True 350 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 394 496 0.00675043572285727 0.00661259465899815 0.00675974670023652 0.00660715648126955 0.00153639877563214 0.00163188710070679 295074 288182 667 665 0 True 395 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 438 496 0.00689666610960942 0.00712841843679925 0.00691233691920348 0.00718699931334401 0.00179183671030239 0.00208798312934119 301466 310662 667 665 0 True 439 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 484 493 0.00692755018691158 0.00717112075221242 0.00677500572213321 0.00700389105058366 0.00262003031006335 0.00226702601387314 302816 312523 667 665 0 False 484 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 526 495 0.00646872718367298 0.00670155590395077 0.00648508430609598 0.00654612039368277 0.00164949377802302 0.00180951678841366 282760 292059 667 665 0 True 529 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 571 494 0.00635299196361993 0.00611138741796125 0.00645456626230259 0.00614938582436866 0.00177406444134227 0.00181539907495231 277701 266339 667 665 0 True 573 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 615 494 0.00609859867502733 0.00628164597807175 0.00607309071488518 0.00624093995574884 0.00176198343443805 0.00181649610014319 266581 273759 667 665 0 True 618 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 659 494 0.00624796322369829 0.0062324499736409 0.00625619897764553 0.00627145799954223 0.0019134236940749 0.00189374718566168 273110 271615 667 665 0 True 663 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 262 541 0.00638957243740227 0.00650149062287213 0.0063782711528191 0.00642404821850919 0.00142331440914466 0.0015079318718571 279300 283340 667 665 0 True 261 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 305 540 0.00645342240758769 0.00644378169043575 0.00645456626230259 0.0063935301747158 0.00154300514068251 0.00131560200072792 282091 280825 667 665 0 True 306 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 350 540 0.00661934997253033 0.00661179155258253 0.00663767452506294 0.00663767452506294 0.00147144648803006 0.00137864807957311 289344 288147 667 665 0 True 350 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 394 540 0.0064957679091331 0.00667259818119343 0.00656137941557946 0.00665293354695964 0.00147132038510007 0.00150208112526581 283942 290797 667 665 0 True 395 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 439 539 0.0065468753377946 0.00648033450529505 0.00651560234988937 0.00645456626230259 0.00177532951341515 0.00199069831540953 286176 282418 667 665 0 True 440 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 483 537 0.00634336070692052 0.00651236697832932 0.00636301213092241 0.00650034332799268 0.00183584219156355 0.0019831763679287 277280 283814 667 665 0 True 484 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 527 537 0.00651722662358452 0.00632581683093061 0.00659189745937285 0.00642404821850919 0.00183920670066522 0.00189482399561229 284880 275684 667 665 0 True 529 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 570 536 0.00644450034081151 0.00615989504546443 0.00646982528419928 0.00622568093385214 0.00168229710621315 0.00163273738430674 281701 268453 667 665 0 True 574 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 615 536 0.00611481853488454 0.00626094877844646 0.00628671702143893 0.00619516289005875 0.00175398853075216 0.00172621000791206 267290 272857 667 665 0 True 618 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 659 535 0.0065011211491988 0.00641445683331698 0.00650034332799268 0.00633249408712902 0.00184498490486926 0.00196760381521031 284176 279547 667 665 0 True 663 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 262 582 0.0064316205367218 0.00658570206702382 0.00636301213092241 0.00660715648126955 0.0013026688799444 0.00123687157156213 281138 287010 667 665 0 True 261 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 306 581 0.0066913899424744 0.0067259244471903 0.00651560234988937 0.00671396963454643 0.00184050723065208 0.00146701532306068 292493 293121 667 665 0 True 306 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 351 581 0.00643724830191908 0.00658772130601165 0.00636301213092241 0.00660715648126955 0.00141253929537874 0.00146478485575311 281384 287098 667 665 0 True 350 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 394 580 0.00641466860984706 0.006584072908295 0.0064087891966125 0.00663767452506294 0.00138814090902519 0.00127049631092486 280397 286939 667 665 0 True 395 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 439 580 0.00644472911175449 0.00661784926954603 0.0063782711528191 0.00656137941557946 0.00176118103832674 0.00199546161279857 281711 288411 667 665 0 True 440 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 483 578 0.00641654453157948 0.00650949874113069 0.0064087891966125 0.00646982528419928 0.00195309034412838 0.00192374308854084 280479 283689 667 665 0 True 484 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 528 578 0.00653854807547016 0.00643217106625571 0.00666819256885634 0.00645456626230259 0.00191733564952991 0.00186283459703817 285812 280319 667 665 0 True 529 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 572 577 0.00657444223642356 0.00642847677674387 0.00665293354695964 0.00651560234988937 0.00162696382981332 0.00179297029558823 287381 280158 667 665 0 True 574 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 616 577 0.00630346305446499 0.00635472866189277 0.0063782711528191 0.00627145799954223 0.00153522889239259 0.0015160337196526 275536 276944 667 665 0 True 618 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 659 576 0.0064217833861737 0.00640316745170319 0.0063782711528191 0.0063935301747158 0.00163646601126265 0.0015455793177625 280708 279055 667 665 0 True 663 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 261 624 0.00670392659014965 0.00669820580290277 0.00671396963454643 0.00675974670023652 0.00136870442832442 0.00144206534642284 293041 291913 667 665 0 False 261 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 306 624 0.00638437933699664 0.00652312860429857 0.0063782711528191 0.00651560234988937 0.00130093223611656 0.0013185605793435 279073 284283 667 665 0 False 306 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 351 623 0.00643077408423277 0.00638111644412014 0.00646982528419928 0.00643930724040589 0.00134548713704118 0.00134740217069116 281101 278094 667 665 0 True 350 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 395 623 0.00622362199536533 0.00644664992763438 0.00624093995574884 0.00645456626230259 0.00138873852026295 0.00128158737480187 272046 280950 667 665 0 True 395 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 440 624 0.00627591903293032 0.00621923313662963 0.00630197604333562 0.00617990386816205 0.00169814133732629 0.00180542471925528 274332 271039 667 665 0 False 440 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 484 624 0.00621291551523391 0.00631404558546744 0.00624093995574884 0.00631723506523232 0.00177662795510985 0.00185063408005599 271578 275171 667 665 0 False 484 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 529 624 0.00621392210738302 0.00640296093862489 0.00605783169298848 0.00645456626230259 0.00181125348056098 0.00186639385934845 271622 279046 667 665 0 False 529 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 574 624 0.00643777447508793 0.0063421313641164 0.00650034332799268 0.00636301213092241 0.00162992593890542 0.00163135858412611 281407 276395 667 665 0 False 574 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 618 624 0.00677683588967704 0.00674421232756875 0.00675974670023652 0.00677500572213321 0.001558523102377 0.00135393795285482 296228 293918 667 665 0 False 618 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 663 624 0.00705088060227154 0.00705558815785171 0.00711070420386053 0.00703440909437705 0.00157742465185724 0.00152913870695748 308207 307488 667 665 0 False 663 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 261 674 0.0086863869507224 0.73304575239885 0.00830090791180285 0.735439078355077 0.0024260139826327 0.193989105012768 379698 31946702 667 665 13 True 261 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 306 668 0.00680362496709988 0.00653997089312891 0.00666819256885634 0.00653086137178607 0.00158080180459897 0.00125118074958224 297399 285017 667 665 0 False 306 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 350 668 0.00623098841972925 0.00653104493896678 0.00621042191195544 0.00650034332799268 0.00125605109836115 0.00126080857036573 272368 284628 667 665 0 False 350 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 395 668 0.00612598255690191 0.00608947408576373 0.00604257267109178 0.00604257267109178 0.0013199936254238 0.00129706091517361 267778 265384 667 665 0 False 395 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 440 668 0.00601466261604835 0.00610048811660646 0.00608834973678187 0.00614938582436866 0.00147186200235291 0.00149618284627187 262912 265864 667 665 0 False 440 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 484 667 0.00615144476285547 0.00603470222821875 0.00614938582436866 0.0059510185397116 0.00156790832405675 0.00164101557308651 268891 262997 667 665 0 False 484 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 529 667 0.00626898727335806 0.00618506669511958 0.00625619897764553 0.00619516289005875 0.00174789169463752 0.00166350680696787 274029 269550 667 665 0 False 529 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 574 667 0.00658938097900009 0.0063927041224026 0.00656137941557946 0.00643930724040589 0.00137995490010609 0.00138448553613333 288034 278599 667 665 0 False 574 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 619 667 0.0078242407750119 0.00703654306285283 0.00733958953231098 0.00706492713817044 0.00273868690091288 0.00148782520589035 342012 306658 667 665 0 False 619 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 659 672 0.0087982788189334 0.756228153354317 0.00877393759060044 0.762233920805676 0.00190115872812174 0.176517038045237 384589 32957009 667 665 14 True 663 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D5_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D5_3.csv new file mode 100755 index 0000000..e4357b0 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D5_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 259 277 0.00110141770497219 0.0739972155153276 0.000915541313801785 0.0739757381551843 0.000829110772238302 0.0233171390808702 48145 3224856 667 665 0 True 260 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 305 276 0.00108016488436944 0.000940919476535238 0.000976577401388571 0.000823987182421607 0.00071943776956517 0.000694999804638258 47216 41006 667 665 0 False 305 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 347 277 0.000983852317375302 0.000968913471593839 0.000823987182421607 0.000854505226215 0.000713713524328074 0.00069713351851707 43006 42226 667 665 0 True 350 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 391 277 0.000948713100533734 0.000978917882942651 0.000869764248111696 0.000823987182421607 0.000676640255851819 0.000713835038061466 41470 42662 667 665 0 True 394 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 436 277 0.000906870895062883 0.00089606024674871 0.000701915007248035 0.000656137941557946 0.000789401912000884 0.000860467382379165 39641 39051 667 665 0 True 439 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 480 277 0.000909661900567226 0.000951933507377967 0.000686655985351339 0.000595101853971161 0.000827916481699302 0.000937464727144181 39763 41486 667 665 0 True 484 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 524 275 0.00102660960661807 0.000938900237547405 0.000839246204318303 0.000732433051041428 0.000873319213919702 0.000845585083071662 44875 40918 667 665 0 True 528 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 569 275 0.00108743980035617 0.00105773704116092 0.000839246204318303 0.000717174029144732 0.000967164227564753 0.00099702089836634 47534 46097 667 665 0 True 573 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 618 276 0.00113852435192337 0.00102288222272321 0.000732433051041428 0.000671396963454643 0.0011533740069647 0.0010055945349967 49767 44578 667 665 0 False 618 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 657 274 0.00118565116617704 0.0772507602262695 0.000885023270008392 0.0760662241550317 0.00105554617185224 0.0235623008687355 51827 3366648 667 665 0 True 662 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 260 320 0.000988999663592328 0.00102742551044583 0.000823987182421607 0.000854505226215 0.000766835106736615 0.000797723805314161 43231 44776 667 665 0 False 260 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 305 320 0.000884840253254009 0.000921323679994218 0.000732433051041428 0.000823987182421607 0.000668259605814819 0.000657016636051388 38678 40152 667 665 0 False 305 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 348 321 0.00101654368512699 0.00104119304899924 0.000961318379491875 0.000915541313801785 0.000652423539739176 0.000732347334615743 44435 45376 667 665 0 True 350 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 391 321 0.000911583576488249 0.00102451138145203 0.000732433051041428 0.000900282291905089 0.000737158164886262 0.000686269292342822 39847 44649 667 665 0 True 394 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 436 320 0.000967815474272477 0.000956683308178893 0.000701915007248035 0.000656137941557946 0.000890535473467469 0.000909673339780681 42305 41693 667 665 0 True 439 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 480 319 0.000920848799678897 0.000879653929972562 0.000732433051041428 0.000656137941557946 0.000835930024247834 0.00080405635941832 40252 38336 667 665 0 True 484 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 525 320 0.000966282708954518 0.00100562690773627 0.000778210116731518 0.000823987182421607 0.000859117709286058 0.000874054781579784 42238 43826 667 665 0 True 528 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 568 319 0.000996960892407996 0.00108736019494835 0.000732433051041428 0.000854505226215 0.0009663342192282 0.000859523834086307 43579 47388 667 665 0 True 573 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 618 319 0.00106087949387632 0.00116282925211862 0.000625619897764553 0.000762951094834821 0.00113910944897154 0.00116311143494284 46373 50677 667 665 0 False 618 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 662 319 0.001145867899193 0.00109603374423699 0.000869764248111696 0.000732433051041428 0.00107804799332377 0.00101977432829231 50088 47766 667 665 0 False 662 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 260 366 0.000979505669458702 0.000920405844090657 0.00080872816052491 0.000778210116731518 0.000817996909068449 0.000790138615384687 42816 40112 667 665 0 True 261 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 303 366 0.000856106622815852 0.000873986293268075 0.000717174029144732 0.000762951094834821 0.00070697416045617 0.000689791417564093 37422 38089 667 665 0 True 305 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 350 363 0.000952510698187185 0.00087807066303892 0.000839246204318303 0.000778210116731518 0.000704002861930903 0.000709921592144357 41636 38267 667 665 0 False 350 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 391 364 0.000887608381664055 0.000847139593088925 0.000732433051041428 0.000701915007248035 0.000693269388381888 0.000672585981622063 38799 36919 667 665 0 True 395 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 436 365 0.000892458325655209 0.000956316173817469 0.00064087891966125 0.000656137941557946 0.000841008311852987 0.000910702725629068 39011 41677 667 665 0 True 439 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 480 364 0.000964269524656303 0.000928804042608237 0.000686655985351339 0.000579842832074464 0.000911493424038523 0.000917989736028826 42150 40478 667 665 0 True 484 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 524 363 0.000899390085227471 0.000902003234224265 0.000610360875867857 0.000610360875867857 0.000852695349022779 0.000898957366169226 39314 39310 667 665 0 True 529 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 569 363 0.000983715054809515 0.000925637508740953 0.000701915007248035 0.000595101853971161 0.000989365621191479 0.000951877289762242 43000 40340 667 665 0 True 573 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 613 363 0.000979139635949935 0.00100239153617622 0.000549324788281071 0.000579842832074464 0.00112038813157452 0.00107613227268674 42800 43685 667 665 0 True 618 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 657 363 0.00100011793142111 0.00107086209458184 0.000686655985351339 0.000701915007248035 0.000999177183983059 0.00105387844160002 43717 46669 667 665 0 True 663 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 260 410 0.000900785587979643 0.000978160668322213 0.000732433051041428 0.000823987182421607 0.000810878828446995 0.0008456286054455 39375 42629 667 665 0 True 261 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 304 409 0.000913390866937783 0.00083114630246938 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.000763071133544243 0.000671753994836012 39926 36222 667 665 0 True 305 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 348 409 0.000938807318702745 0.000913017265066993 0.000823987182421607 0.000762951094834821 0.000682759213592238 0.000700744240140491 41037 39790 667 665 0 True 350 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 392 409 0.000922404442091154 0.000961456054877409 0.000732433051041428 0.000823987182421607 0.000766682618687276 0.000786060967805015 40320 41901 667 665 0 True 395 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 436 408 0.00090353083929539 0.00096772028491921 0.00064087891966125 0.000732433051041428 0.000823523953971214 0.000822407488832714 39495 42174 667 665 0 True 439 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 481 408 0.000925286955972689 0.000958541925883603 0.000717174029144732 0.000701915007248035 0.000862512667343543 0.000876092406753009 40446 41774 667 665 0 True 484 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 526 407 0.00098419547378977 0.000949891322492544 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.000875504663419335 0.000879488874131666 43021 41397 667 665 0 True 529 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 569 406 0.000912132626751399 0.000957027496642728 0.000625619897764553 0.000671396963454643 0.000949410031582579 0.000931538715479237 39871 41708 667 665 0 True 573 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 614 407 0.00097234513894346 0.000909758947609353 0.000549324788281071 0.000518806744487678 0.00106175457463446 0.000970996808286885 42503 39648 667 665 0 True 618 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 657 406 0.000928421117891501 0.000996035522544058 0.000534065766384375 0.000595101853971161 0.00100987668029973 0.000980598751403603 40583 43408 667 665 0 True 663 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 260 454 0.000990486674721692 0.000985618085038644 0.000823987182421607 0.00080872816052491 0.000845441494277561 0.000821502424071603 43296 42954 667 665 0 True 261 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 305 453 0.000878594806510684 0.000874835291478869 0.000686655985351339 0.000747692072938125 0.000788711533798188 0.000771693769398944 38405 38126 667 665 0 True 305 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 348 453 0.000894768912179296 0.00082648828525881 0.000778210116731518 0.000656137941557946 0.000734316065793448 0.000730033457140961 39112 36019 667 665 0 True 350 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 392 452 0.000948735977628032 0.000910722675308092 0.000762951094834821 0.000747692072938125 0.000775707437586797 0.000775498380021403 41471 39690 667 665 0 True 395 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 437 453 0.000962050446509407 0.000958358358702891 0.000610360875867857 0.000457770656900893 0.000979370572225398 0.0010880809133133 42053 41766 667 665 0 True 439 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 481 451 0.000904491677255902 0.000861824967545896 0.000610360875867857 0.000366216525520714 0.000907549636465274 0.00104872192613772 39537 37559 667 665 0 True 484 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 525 451 0.000945967849217987 0.000928253341066101 0.00064087891966125 0.000610360875867857 0.000902902941018186 0.000935896450101884 41350 40454 667 665 0 True 529 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 569 450 0.000932081452979164 0.00091122748505505 0.000595101853971161 0.000457770656900893 0.00101697139938346 0.00106019304928008 40743 39712 667 665 0 True 573 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 613 450 0.000913711146257954 0.000955949039456045 0.000518806744487678 0.000625619897764553 0.000928972762788842 0.000963376692064612 39940 41661 667 665 0 True 618 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 657 449 0.000995473881278633 0.00103467641408396 0.000579842832074464 0.000656137941557946 0.0010082426495439 0.00105375711304731 43514 45092 667 665 0 True 663 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 261 497 0.00104379030443579 0.000854000416468041 0.000900282291905089 0.000701915007248035 0.000850827725752166 0.000733691430249283 45626 37218 667 665 0 True 261 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 306 497 0.000925813129141541 0.000913866263277787 0.00080872816052491 0.000793469138628214 0.000804704244830532 0.000806269208309447 40469 39827 667 665 0 True 305 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 350 497 0.000933637095391421 0.0009499831060829 0.000762951094834821 0.000839246204318303 0.000820731556849744 0.00080517804760103 40811 41401 667 665 0 True 350 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 394 496 0.00094267354763909 0.000944246631685646 0.000732433051041428 0.000793469138628214 0.000827535903682318 0.00080780473526684 41206 41151 667 665 0 True 395 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 438 496 0.000960037262211192 0.00097637088831027 0.000625619897764553 0.000595101853971161 0.000965107112752519 0.00104426384487021 41965 42551 667 665 0 True 439 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 484 493 0.000958939161684893 0.000965104452594062 0.000610360875867857 0.000579842832074464 0.000943472514388017 0.000966672999760403 41917 42060 667 665 0 False 484 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 526 495 0.00101221991430469 0.000936169675734312 0.000686655985351339 0.000671396963454643 0.00098357289265753 0.000849303963776879 44246 40799 667 665 0 True 529 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 571 494 0.000883147348275965 0.000855216549040259 0.000534065766384375 0.000457770656900893 0.000917857343747849 0.000936445690800996 38604 37271 667 665 0 True 573 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 615 494 0.000923090754920091 0.000918524280488357 0.000579842832074464 0.000564583810177768 0.000945794523997073 0.000952554912385073 40350 40030 667 665 0 True 618 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 659 494 0.00104143396372311 0.00102171198194617 0.00064087891966125 0.000671396963454643 0.000998722140975912 0.00104114667931192 45523 44527 667 665 0 True 663 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 262 541 0.000898658018209938 0.000959023789732973 0.000762951094834821 0.000747692072938125 0.000743059922592858 0.000796948615860248 39282 41795 667 665 0 True 261 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 305 540 0.000908769693889608 0.000854780576986068 0.000793469138628214 0.000717174029144732 0.000760233636305457 0.000697469825362816 39724 37252 667 665 0 True 306 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 350 540 0.000918721229909193 0.000936032000348778 0.000762951094834821 0.00080872816052491 0.000774695487873961 0.000738863099380098 40159 40793 667 665 0 True 350 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 394 540 0.000844988354987075 0.000952162966353857 0.00064087891966125 0.000717174029144732 0.000773887246033219 0.000819441041877447 36936 41496 667 665 0 True 395 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 439 539 0.000889392795019291 0.000840898308944712 0.000488288700694286 0.000335698481727321 0.000959356810886698 0.00104880442579984 38877 36647 667 665 0 True 440 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 483 537 0.000862901119822327 0.00105918263270903 0.000473029678797589 0.000671396963454643 0.000976362023300946 0.0011077907476961 37719 46160 667 665 0 True 484 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 527 537 0.000951504106038077 0.00089980042805572 0.000610360875867857 0.000503547722590982 0.00099858719437955 0.00095792501805536 41592 39214 667 665 0 True 529 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 570 536 0.000974976004787718 0.000847667348733473 0.000717174029144732 0.000518806744487678 0.000905571073967947 0.000872910490640609 42618 36942 667 665 0 True 574 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 615 536 0.000866264052684118 0.000920153439217178 0.000534065766384375 0.000595101853971161 0.0008858633883383 0.000900972591166889 37866 40101 667 665 0 True 618 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 659 535 0.00100634050107013 0.000965242127979597 0.00064087891966125 0.000625619897764553 0.00101399996064631 0.00100720374200914 43989 42066 667 665 0 True 663 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 262 582 0.000959945753834001 0.000970703251605783 0.00080872816052491 0.000869764248111696 0.000704986401154313 0.000667788790614337 41961 42304 667 665 0 True 261 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 306 581 0.000919224525983747 0.000940208153709979 0.000793469138628214 0.000839246204318303 0.000741436127080026 0.000716115837557447 40181 40975 667 665 0 True 306 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 351 581 0.00097115553003997 0.000972424193924959 0.000839246204318303 0.00080872816052491 0.000768900374074551 0.00076314650812786 42451 42379 667 665 0 True 350 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 394 580 0.000902364107486197 0.000974787621376628 0.000701915007248035 0.000869764248111696 0.000804427395941258 0.000700179161404126 39444 42482 667 665 0 True 395 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 439 580 0.00092027687232145 0.000993809770477923 0.000534065766384375 0.000503547722590982 0.000977772491358721 0.00110494372097244 40227 43311 667 665 0 True 440 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 483 578 0.000974861619316229 0.000880112847924343 0.000564583810177768 0.000457770656900893 0.00106699108361587 0.000972748891116528 42613 38356 667 665 0 True 484 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 528 578 0.000934140391465975 0.000895945517260765 0.000503547722590982 0.000488288700694286 0.000995488809056937 0.00096741617651688 40833 39046 667 665 0 True 529 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 572 577 0.000912315643505782 0.000935871379065655 0.000564583810177768 0.000595101853971161 0.000880804855461518 0.000978617375827636 39879 40786 667 665 0 True 574 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 616 577 0.000929221816191927 0.000947550840938464 0.000656137941557946 0.000701915007248035 0.000819105804344514 0.00080679398630623 40618 41295 667 665 0 True 618 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 659 576 0.000952968240073143 0.00103141809662632 0.000625619897764553 0.00080872816052491 0.000879310657883329 0.000855729573136705 41656 44950 667 665 0 True 663 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 261 624 0.00100588295918418 0.000993075501755074 0.00080872816052491 0.00080872816052491 0.000748200749185072 0.000758234814941699 43969 43279 667 665 0 False 261 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 306 624 0.000912018241279909 0.000910745621205681 0.000762951094834821 0.000778210116731518 0.000705547156705969 0.000687358870015316 39866 39691 667 665 0 False 306 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 351 623 0.000896278800402957 0.000921759652048409 0.000778210116731518 0.000823987182421607 0.000738485507269931 0.000740831515363511 39178 40171 667 665 0 True 350 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 395 623 0.000922404442091154 0.000912604238910391 0.000747692072938125 0.000778210116731518 0.000734987273449279 0.000667396989200155 40320 39772 667 665 0 True 395 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 440 624 0.000929908129020864 0.000942158555005045 0.000625619897764553 0.000595101853971161 0.00092169226625625 0.000970005767707468 40648 41060 667 665 0 False 440 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 484 624 0.000870839471543697 0.000882315654092889 0.000442511635004196 0.0004272526131075 0.00100050533027467 0.0010156476882917 38066 38452 667 665 0 False 484 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 529 624 0.000882689806390007 0.00092336586487964 0.000473029678797589 0.000503547722590982 0.000963327177586634 0.00100205492293004 38584 40241 667 665 0 False 529 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 574 624 0.000877313689230002 0.000868846412208135 0.000595101853971161 0.000564583810177768 0.000886617064883491 0.000854274833501429 38349 37865 667 665 0 False 574 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 618 624 0.000930594441849801 0.000991033316869652 0.000762951094834821 0.000793469138628214 0.000721139755470992 0.000745631163072627 40678 43190 667 665 0 False 618 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 663 624 0.00107639016381029 0.000999638028465533 0.000900282291905089 0.00080872816052491 0.000843304483626334 0.000771620855734742 47051 43565 667 665 0 False 663 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 261 674 0.0010415254721003 0.0755981507901133 0.000885023270008392 0.0737926298924239 0.000781311221574607 0.0233490459893224 45527 3294626 667 665 0 True 261 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 306 668 0.00092908455362614 0.000934196328541656 0.000793469138628214 0.000839246204318303 0.000702907610621365 0.000658749128179655 40612 40713 667 665 0 False 306 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 350 668 0.000895363716631041 0.000862146210112142 0.000778210116731518 0.000732433051041428 0.000647009984977548 0.000644925451428503 39138 37573 667 665 0 False 350 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 395 668 0.000964635558165069 0.000879172066123193 0.000793469138628214 0.000762951094834821 0.000708840816240488 0.000689672156177877 42166 38315 667 665 0 False 395 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 440 668 0.00091178947033693 0.000854000416468041 0.000717174029144732 0.000671396963454643 0.000801664260614714 0.000777260718486041 39856 37218 667 665 0 False 440 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 484 667 0.000920437011981535 0.000938372481902857 0.00064087891966125 0.000717174029144732 0.000864625065675009 0.000822482904136338 40234 40895 667 665 0 False 484 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 529 667 0.000921695252167919 0.000906936602205904 0.000595101853971161 0.000579842832074464 0.000910999336710576 0.000882390770484092 40289 39525 667 665 0 False 529 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 574 667 0.000935970559009806 0.00104123894079442 0.000732433051041428 0.000900282291905089 0.000796928669815614 0.000763014528460787 40913 45378 667 665 0 False 574 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 619 667 0.00100940603170605 0.000956889821257194 0.000885023270008392 0.000762951094834821 0.000732960870425258 0.00074415565772006 44123 41702 667 665 0 False 619 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 659 672 0.00106529477307581 0.0785540413175305 0.000915541313801785 0.0766765850308995 0.000794952332290893 0.0225183841825992 46566 3423446 667 665 0 True 663 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D6_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D6_1.csv new file mode 100755 index 0000000..4f41adc --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D6_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 272 260 0.0104169018717924 0.0417926023573468 0.0104676890211337 0.0422827496757458 0.00158372487195282 0.00844873893714762 455342 1821354 667 665 0 True 272 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 317 259 0.010292999529075 0.010196330836246 0.0102235446707866 0.0102082856488899 0.00168183049335562 0.00138325195878107 449926 444364 667 665 0 False 317 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 360 260 0.0105191396062097 0.0667981237139541 0.0105287251087205 0.0666208896009766 0.00138508714060999 0.011754726530264 459811 2911114 667 665 0 True 362 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 404 259 0.0105752342414282 0.0902301989810874 0.0104829480430304 0.0905622949568933 0.00158787051611957 0.0141574238848635 462263 3932302 667 665 0 True 406 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 448 259 0.0103328285502477 0.0824019306678231 0.0103913939116503 0.0783550774395361 0.00176023470477675 0.0203286166707659 451667 3591140 667 665 0 True 451 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 492 258 0.0104204935755972 0.0646946273901738 0.0103913939116503 0.069413290608072 0.00174154134244088 0.0190583931607806 455499 2819442 667 665 0 True 496 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 536 257 0.0102533764017511 0.0810012901330919 0.0102998397802701 0.0814984359502556 0.00160527900121057 0.026589798815735 448194 3530099 667 665 0 True 540 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 580 257 0.0102478172678367 0.067149815486301 0.0102082856488899 0.0677653162432288 0.00173829884547071 0.0192586996245585 447951 2926441 667 665 0 True 585 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 630 259 0.0100964624119618 0.0099676061290787 0.0101930266269932 0.00994888227664607 0.00195418052594332 0.00185676472188392 441335 434396 667 665 0 False 630 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 669 257 0.0100480773575217 0.0413058969235861 0.0101167315175097 0.0427710383764401 0.00188745274569459 0.00894790197153568 439220 1800143 667 665 0 True 675 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 272 303 0.0104181601119788 0.0102328377593102 0.010406652933547 0.0103150988021668 0.00157241988516317 0.00160722759457623 455397 445955 667 665 0 False 272 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 317 303 0.0102236819333524 0.0103779246697655 0.01025406271458 0.010406652933547 0.00135269749624267 0.00129992447160462 446896 452278 667 665 0 False 317 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 360 303 0.0105356568682928 0.122547224091357 0.0105287251087205 0.122453650720989 0.00136293452118902 0.0311523810653957 460533 5340703 667 665 0 True 362 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 404 304 0.0105088906679643 0.0587513416179497 0.0104829480430304 0.0583810177767605 0.0014547696793983 0.010407922800776 459363 2560429 667 665 0 True 407 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 448 303 0.0106912211095185 0.0811913051110266 0.010605020218204 0.0798809796292058 0.00179046041513634 0.0170564358300474 467333 3538380 667 665 0 True 451 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 492 302 0.0105814568110772 0.0432937918153131 0.0106813153276875 0.0445716029602502 0.00176246245538826 0.00823765043653068 462535 1886777 667 665 0 True 496 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 537 301 0.0104492958373182 0.0424932553402274 0.0104371709773404 0.0451056687266346 0.00158227625527069 0.00821892287362221 456758 1851889 667 665 0 True 541 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 581 302 0.0104335792735356 0.0523455583339213 0.0105134660868238 0.0536964980544747 0.00188964305269887 0.00947434371084002 456071 2281260 667 665 0 True 585 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 630 302 0.0104559301946646 0.00981508474780451 0.0103761348897536 0.00984206912336919 0.00243561274067054 0.00201001234412961 457048 427749 667 665 0 False 630 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 675 302 0.0101049498139463 0.00990333466993187 0.010101472495613 0.00993362325474937 0.00203379503586907 0.00187132856349318 441706 431595 667 665 0 False 675 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 271 348 0.0103695462865958 0.0524815357230338 0.0103608758678569 0.0525520714122225 0.00144137863341957 0.0140578913281566 453272 2287186 667 665 0 True 273 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 316 347 0.0103846222917381 0.070633943522115 0.010406652933547 0.0688487067978943 0.00138181961862151 0.0251373163296483 453931 3078282 667 665 0 True 317 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 360 348 0.0105066487127231 0.04082742906706 0.0104676890211337 0.0428931105516136 0.00146661906632229 0.00782091758350269 459265 1779291 667 665 0 True 362 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 404 347 0.0107756833416663 0.0356659788633864 0.0107881284809644 0.0364995803768978 0.00195511002282661 0.00542659833278816 471025 1554351 667 665 0 True 407 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 448 347 0.0130599154531226 0.0849314175803436 0.010955977721828 0.0827038986800946 0.0121030170131976 0.0208846960775535 570873 3701377 667 665 0 True 451 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 496 346 0.0104393671783929 0.0336992400892366 0.0104982070649271 0.0357213702601663 0.00173358939566127 0.00649596247036229 456324 1468639 667 665 0 False 496 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 538 345 0.0103742360909268 0.0298390517378362 0.0103761348897536 0.0303959716182193 0.00163850854272695 0.00343670904646625 453477 1300409 667 665 0 True 541 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 581 345 0.0105235320083149 0.0503756530259042 0.0105287251087205 0.0514229037918669 0.00200118868114588 0.0101133978557701 460003 2195410 667 665 0 True 585 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 625 345 0.0102409541395473 0.0655246722895589 0.0101625085831998 0.0665751125352865 0.00214299326128299 0.0175410989380008 447651 2855616 667 665 0 True 630 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 669 345 0.0102895222107417 0.0597910890754008 0.0102845807583734 0.0621499961852445 0.00190475156508042 0.0153129132277125 449774 2605742 667 665 0 True 675 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 272 392 0.0104866083781181 0.0428639922075732 0.0105439841306172 0.0452429999237049 0.00156514688755229 0.0104997813323709 458389 1868046 667 665 0 True 273 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 317 392 0.0103785827388434 0.0328409258440218 0.0103456168459602 0.0332036316472114 0.00132501693535077 0.00421112546222658 453667 1431233 667 665 0 True 317 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 360 392 0.0109221196222671 0.0845468213908541 0.0106965743495842 0.0830548561837186 0.00232325372644678 0.0213246033824842 477426 3684616 667 665 0 True 362 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 405 391 0.0106904204112181 0.067799528576534 0.0106507972838941 0.0674601358052949 0.00161512900798809 0.0154281914463493 467298 2954756 667 665 0 True 407 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 450 391 0.0108674891210838 0.0483099715413505 0.0109407186999313 0.0491493095292592 0.00179256397085488 0.00936657351938013 475038 2105386 667 665 0 True 451 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 493 389 0.0108522072220928 0.0561279600924949 0.0108339055466545 0.0570687418936446 0.00179706005500087 0.0128700049672822 474370 2446100 667 665 0 True 496 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 538 388 0.0106771059423367 0.0437962151889222 0.0106355382619974 0.045792324711986 0.00171078385946358 0.0088165194418559 466716 1908673 667 665 0 True 541 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 582 389 0.0104567766471536 0.053693354466505 0.010452429999237 0.0542915999084459 0.0019378232642741 0.0108645977261127 457085 2339998 667 665 0 True 585 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 626 389 0.0101780421302281 0.0433355992407203 0.0101472495613031 0.0445258258945602 0.00192784529863107 0.00698243090415929 444901 1888599 667 665 0 True 630 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 671 388 0.0103127882156427 0.103936678501013 0.0103150988021668 0.104798962386511 0.00201715715700969 0.0298767141802454 450791 4529641 667 665 0 True 675 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 272 435 0.00999175395136032 0.0437962840266149 0.00999465934233616 0.0451209277485313 0.00160485165599771 0.00891306938970801 436758 1908676 667 665 0 True 273 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 316 435 0.0102682465130447 0.0501144369277508 0.01025406271458 0.0508735790035859 0.0014461111806313 0.00789536781244111 448844 2184026 667 665 0 True 317 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 362 435 0.0103074807297656 0.0359401593936776 0.0103303578240635 0.0364843213550011 0.001384846552964 0.00365669846759912 450559 1566300 667 665 0 True 362 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 405 435 0.0103877564536569 0.0535156155437805 0.0104371709773404 0.0546578164339666 0.00159733694341751 0.010421322095659 454068 2332252 667 665 0 True 407 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 450 435 0.0107398120578072 0.0991624632650521 0.0107881284809644 0.0991378652628366 0.001886817134144 0.014408120498835 469457 4321577 667 665 0 True 451 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 494 433 0.0109847113522662 0.0611121532372933 0.0109102006561379 0.0630502784771496 0.00202172199534613 0.0154448565563151 480162 2663315 667 665 0 True 496 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 538 433 0.0107858865257232 0.0533348477625742 0.0107881284809644 0.0530556191348135 0.00185384037522612 0.0103807289481645 471471 2324374 667 665 0 True 541 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 582 433 0.0104952559197627 0.033609888764025 0.0104829480430304 0.0341496910048066 0.00199092798828821 0.0044085702254038 458767 1464745 667 665 0 True 585 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 626 433 0.0102608114573979 0.0396446368840389 0.01025406271458 0.0404058899824521 0.00200336367360185 0.00487061854841717 448519 1727744 667 665 0 True 630 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 670 432 0.0100980409314683 0.0678931248927996 0.0101319905394064 0.0677958342870222 0.001937689449747 0.0134564313916566 441404 2958835 667 665 0 True 675 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 275 479 0.00988368255789706 0.0550127206319759 0.00988784618905928 0.0554818036163882 0.00155066366232432 0.0133691925919751 432034 2397497 667 665 0 True 273 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 319 479 0.0101141464058541 0.0567105334863825 0.0101167315175097 0.0567788204776074 0.00156470368124721 0.00695673970795048 442108 2471489 667 665 0 True 317 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 362 479 0.0103886486603345 0.0693847000196761 0.0103608758678569 0.0672617685206378 0.00152692998713106 0.0164342926412392 454107 3023839 667 665 0 True 362 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 407 478 0.0118959060181514 0.0981342805399858 0.0108949416342412 0.0951247425040055 0.0073736934654889 0.0227103801225182 519992 4276768 667 665 0 True 407 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 451 478 0.0111771077153115 0.101866361945147 0.0107118333714809 0.0975356679636835 0.00466204063605123 0.0303002839018355 488572 4439415 667 665 0 True 451 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 495 478 0.0105148387124817 0.0459304360695743 0.0104829480430304 0.0467841611352712 0.00201627895492391 0.00708181914259076 459623 2001684 667 665 0 True 496 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 539 477 0.0107118333714809 0.0444709851993224 0.0106965743495842 0.0457160296025025 0.00188577888749102 0.00837249455775009 468234 1938080 667 665 0 True 541 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 583 477 0.0107041695448911 0.103337079251115 0.010605020218204 0.0975661860074769 0.00208571542030043 0.0194359441773243 467899 4503510 667 665 0 True 586 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 627 477 0.0106180830390481 0.0623330356103121 0.0104982070649271 0.0655527580682078 0.00231611900933161 0.0147075449279129 464136 2716522 667 665 0 True 630 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 672 477 0.0103233574332083 0.0805070354990245 0.0104219119554437 0.0775463492790112 0.00197360722234642 0.0152573361572965 451253 3508559 667 665 0 True 675 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 274 524 0.00985355342470674 0.0562619411885172 0.00984206912336919 0.0590218966964218 0.00144984945874 0.0129143747793737 430717 2451939 667 665 0 True 273 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 319 523 0.0101491483601298 0.105600669102374 0.0101167315175097 0.0985122453650721 0.00150607883991775 0.0265737516806138 443638 4602159 667 665 0 True 318 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 364 523 0.0103743962305869 0.0574906481126139 0.0103456168459602 0.0604257267109178 0.00156311301965911 0.0115242838244828 453484 2505487 667 665 0 True 362 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 408 522 0.0106001473971186 0.0610131875809918 0.0105897611963073 0.0599221789883269 0.00183486820794045 0.00925760721620228 463352 2659002 667 665 0 True 407 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 452 521 0.0108430335072793 0.0572785132894034 0.0107423514152743 0.0569619287403677 0.00219753174985296 0.0073057991346444 473969 2496242 667 665 0 True 452 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 496 520 0.0108663910205575 0.066540693688903 0.010955977721828 0.0644846265354391 0.00194974572422822 0.0148491904102789 474990 2899895 667 665 0 True 496 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 540 519 0.0105249732652557 0.0750933869349501 0.0106202792401007 0.0716868848706798 0.00175081082008491 0.0200613797163167 460066 3272628 667 665 0 True 541 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 584 519 0.0122084071262606 0.0592528701015528 0.0102998397802701 0.0590066376745251 0.018530042870261 0.0137823833145582 533652 2582286 667 665 0 True 586 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 629 519 0.0104138134640622 0.0512899323153386 0.010406652933547 0.0502021820401312 0.00207262392706965 0.00735282903115478 455207 2235255 667 665 0 True 630 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 673 518 0.010318644751783 0.0719400469587794 0.0103303578240635 0.0703898680094606 0.00201986655023338 0.0181188369028541 451047 3135203 667 665 0 True 675 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 276 564 0.00969609038465432 0.0463849713549151 0.00975051499198901 0.0466010528725109 0.00144955708457815 0.00950989107614495 423834 2021493 667 665 0 True 273 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 320 564 0.00991227892576943 0.0569689272391324 0.00993362325474937 0.0560769054703594 0.00150089646050061 0.0134799273700291 433284 2482750 667 665 0 True 318 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 364 563 0.0103210697237785 0.0449317388229099 0.0103303578240635 0.0449835965514611 0.00137639042962716 0.00794897464994211 451153 1958160 667 665 0 True 362 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 409 563 0.0104217746928779 0.0493863406513537 0.0103303578240635 0.0486762798504616 0.00170541782659955 0.00618719377160184 455555 2152295 667 665 0 True 407 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 452 563 0.0105038348301244 0.0852558955181499 0.0104676890211337 0.080872816052491 0.00197964566952692 0.018941361228057 459142 3715518 667 665 0 True 452 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 496 561 0.0108672145959522 0.0611677740930491 0.0108186465247578 0.0609903105210956 0.00203282952696584 0.011549238755872 475026 2665739 667 665 0 True 496 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 541 561 0.0104391841616386 0.053538309036496 0.010452429999237 0.0532997634851606 0.00187535044345175 0.00688786466352203 456316 2333241 667 665 0 True 541 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 584 560 0.0126881169165932 0.0375599561962815 0.0104371709773404 0.0391393911650263 0.0186353237727552 0.0070690066925657 554621 1636892 667 665 0 True 586 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 629 560 0.0103546532982078 0.0486091860459113 0.0103456168459602 0.0481879911497673 0.00178188088843414 0.00773388353572801 452621 2118426 667 665 0 True 630 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 673 560 0.0101707443371471 0.057304946963426 0.0101625085831998 0.0556801709010452 0.00179371904523164 0.00874839628848216 444582 2497394 667 665 0 True 675 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 273 607 0.00976330328770154 0.00963674923174267 0.00978103303578241 0.00956740672922866 0.0013980152107971 0.00167445626851592 426772 419977 667 665 0 False 273 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 318 607 0.00975765264540996 0.00981503885600933 0.00976577401388571 0.00985732814526589 0.00145329896299363 0.00148963089776376 426525 427747 667 665 0 False 318 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 364 606 0.0100677287815236 0.0686635563502485 0.0100862134737163 0.0666056305790799 0.00143318757332626 0.0115199647422077 440079 2992411 667 665 0 True 362 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 408 605 0.0102390782178149 0.07670056349388 0.0101930266269932 0.072831311512932 0.00158402689235227 0.0201283130501266 447569 3342670 667 665 0 True 407 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 452 607 0.0102209366820366 0.010152114091592 0.0101167315175097 0.0100709544518196 0.00200482368714984 0.00202384764343369 446776 442437 667 665 0 False 452 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 496 607 0.010297757964689 0.0100421114585502 0.0102693217364767 0.0101625085831998 0.00211003248145509 0.00205479301885408 450134 437643 667 665 0 False 496 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 541 607 0.0102594617088343 0.00977302491752384 0.0102845807583734 0.0097962920576791 0.00206449379266207 0.00199884068189527 448460 425916 667 665 0 False 541 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 586 607 0.0100427698716446 0.00965740053957278 0.0100099183642329 0.00958266575112535 0.00172902594532264 0.00173691321863014 438988 420877 667 665 0 False 586 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 630 607 0.0099376496233458 0.00957959100084842 0.00990310521095598 0.00953688868543526 0.00156878770253956 0.00145908007684008 434393 417486 667 665 0 False 630 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 675 607 0.00995519635467229 0.00975216709661542 0.00994888227664607 0.0098115510795758 0.00161981545124381 0.00163066835842034 435160 425007 667 665 0 False 675 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 274 657 0.00986425990483815 0.0394427588770507 0.00984206912336919 0.0400396734569314 0.00143163862249626 0.00804378279703647 431185 1718946 667 665 0 True 273 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 318 651 0.00972747775803103 0.00977385096983704 0.00975051499198901 0.00976577401388571 0.00136876724764219 0.00125836988078626 425206 425952 667 665 0 False 318 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 362 651 0.0098626585082373 0.00976804565774702 0.00985732814526589 0.00971999694819562 0.00126408458256904 0.00120613222454387 431115 425699 667 665 0 False 362 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 407 650 0.00984184035242621 0.00993220060909885 0.00975051499198901 0.00993362325474937 0.0014956859355052 0.0014191340910021 430205 432853 667 665 0 False 407 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 452 650 0.0100755069935849 0.0101506455541463 0.0101472495613031 0.0101167315175097 0.00169430952198311 0.00172330162309524 440419 442373 667 665 0 False 452 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 496 650 0.0101386706509414 0.0100332772879785 0.010101472495613 0.0100251773861295 0.0017444569634358 0.00180046342631696 443180 437258 667 665 0 False 496 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 541 650 0.0102299045030014 0.0101999562880651 0.0101777676050965 0.0102235446707866 0.00176265998310108 0.00185331747438624 447168 444522 667 665 0 False 541 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 586 650 0.0104701597473179 0.00994984600434481 0.0103608758678569 0.00999465934233616 0.00191184922404953 0.00128301205861386 457670 433622 667 665 0 False 586 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 631 650 0.00999475085071335 0.00998938178589068 0.0100099183642329 0.00991836423285267 0.00148598973197358 0.00138100539921845 436889 435345 667 665 0 False 631 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 672 654 0.00981079613546397 0.0407624692309855 0.0097962920576791 0.0411993591210803 0.00140812872391183 0.00802546760393361 428848 1776460 667 665 0 True 675 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D6_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D6_2.csv new file mode 100755 index 0000000..1fe92a6 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D6_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 272 260 0.00865296351595317 0.736849838030645 0.00849927519645991 0.748409246967269 0.00191708472809655 0.185621223743805 378237 32112487 667 665 12 True 272 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 317 259 0.00745500447304386 0.00700806720394486 0.00737010757610437 0.00700389105058366 0.00189711574696018 0.00134464659776001 325872 305417 667 665 0 False 317 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 360 260 0.00698792283876373 0.0070739907677181 0.00706492713817044 0.00706492713817044 0.00130290291036883 0.00124051029089638 305455 308290 667 665 0 True 362 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 404 259 0.00682064552525751 0.00713690841890719 0.00685130083161669 0.00712596322575723 0.00145522887443915 0.00137825135182197 298143 311032 667 665 0 True 406 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 448 259 0.00678594097320761 0.00697128493010966 0.00672922865644312 0.00694285496299687 0.00150110850556518 0.00162635374968142 296626 303814 667 665 0 True 451 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 492 258 0.00710642618722683 0.00698080747760911 0.00715648126955062 0.00692759594110018 0.00168471597827674 0.0015894554912327 310635 304229 667 665 0 True 496 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 536 257 0.00701418574301771 0.00749447434103684 0.00698863202868696 0.00752269779507134 0.00151241930433193 0.00152557069585823 306603 326615 667 665 0 True 540 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 580 257 0.00747463301995146 0.00750440991469289 0.00743114366369116 0.00752269779507134 0.00175483546064319 0.00176269092304719 326730 327048 667 665 0 True 585 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 630 259 0.00912546702158191 0.00838163157952102 0.00846875715266651 0.00837720302128634 0.0048123706297414 0.00178154494456705 398891 365278 667 665 0 False 630 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 669 257 0.00938201075703851 0.731308380817 0.00933852140077821 0.745754177157244 0.00204535647597233 0.196224004255695 410105 31870986 667 665 10 True 675 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 272 303 0.00712763325364097 0.00698789775996411 0.00711070420386053 0.00706492713817044 0.00142288868223195 0.0014417537031139 311562 304538 667 665 0 False 272 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 317 303 0.00691451024316178 0.00675667194995959 0.00695811398489357 0.00672922865644312 0.00122414643434901 0.00127028889527714 302246 294461 667 665 0 False 317 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 360 303 0.00701834937417993 0.00688161236233179 0.00700389105058366 0.00685130083161669 0.00137561695788 0.00129475916309875 306785 299906 667 665 0 True 362 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 404 304 0.00698208917971776 0.00687612829280801 0.00694285496299687 0.00686655985351339 0.00142330769371163 0.00136762100735002 305200 299667 667 665 0 True 407 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 448 303 0.00714728467764287 0.00698537371122932 0.00712596322575723 0.00697337300679027 0.00175502489818324 0.00178601798580895 312421 304428 667 665 0 True 451 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 492 302 0.00738378807849451 0.0073706812235441 0.00738536659800107 0.00735484855420768 0.00167608795326967 0.00163578282196909 322759 321220 667 665 0 True 496 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 537 301 0.00721603034600804 0.0074475499804673 0.00721751735713741 0.00747692072938125 0.00149086640976766 0.0015336547576804 315426 324570 667 665 0 True 541 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 581 302 0.00748474469563113 0.00769529683673592 0.00750743877317464 0.00761425192645151 0.00178286696203596 0.00207936716102369 327172 335367 667 665 0 True 585 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 630 302 0.00805987484628022 0.00769979423266337 0.00798046845197223 0.007690547035935 0.00223400346404748 0.00189967915920036 352312 335563 667 665 0 False 630 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 675 302 0.00794688487754292 0.00758341264009188 0.00796520943007553 0.00761425192645151 0.00190522846579125 0.0018613271536265 347373 330491 667 665 0 False 675 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 271 348 0.00674494522022578 0.00686022678577882 0.0068207827878233 0.0068055237659266 0.0014320277340653 0.00146763103677735 294834 298974 667 665 0 True 273 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 316 347 0.00682522094411709 0.00698092220709705 0.0068207827878233 0.00706492713817044 0.00123964930230415 0.00125604253317803 298343 304234 667 665 0 True 317 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 360 348 0.00708780423246834 0.0070990706337829 0.00704966811627375 0.00708018616006714 0.00138232024417847 0.0011796605066838 309821 309383 667 665 0 True 362 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 404 347 0.00819972252372326 0.00722593850155258 0.00749217975127794 0.00714122224765393 0.00648442224340978 0.001359252497232 358425 314912 667 665 0 True 407 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 448 347 0.0180473965351954 0.00756624910869529 0.00772106507972839 0.00761425192645151 0.0489939679135564 0.00181925548410044 788885 329743 667 665 0 True 451 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 496 346 0.0073078361254255 0.0074538371564067 0.00737010757610437 0.00746166170748455 0.00155409081640308 0.00159389726376264 319439 324844 667 665 0 False 496 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 538 345 0.00740435458626832 0.00747373124961637 0.00740062561989776 0.00750743877317464 0.00154861315187127 0.00157811087933822 323658 325711 667 665 0 True 541 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 581 345 0.00753736201251629 0.00772129453870428 0.00750743877317464 0.00764476997024491 0.00193306214416521 0.00194914841378514 329472 336500 667 665 0 True 585 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 625 345 0.00742144377570885 0.00774531889347998 0.00747692072938125 0.00776684214541848 0.00203587349658077 0.00194872614687102 324405 337547 667 665 0 True 630 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 669 345 0.00699862931889514 0.00721639300815555 0.00712596322575723 0.00720225833524071 0.00171158878735569 0.00183666940351499 305923 314496 667 665 0 True 675 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 272 392 0.00662092849203688 0.00696899034035076 0.00657663843747616 0.00688181887541009 0.00146958318313461 0.00168618420370861 289413 303714 667 665 0 True 273 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 317 392 0.00693349823142903 0.0719374540723519 0.00691233691920348 0.0734569314106966 0.00133775204705617 0.015387291494855 303076 3135090 667 665 0 True 317 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 360 392 0.00709020632736962 0.00849431888258068 0.00706492713817044 0.00833142595559625 0.00160690604374365 0.0022775726528207 309926 370189 667 665 0 True 362 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 405 391 0.00762941943997102 0.00816089204471467 0.00758373388265812 0.0081177996490425 0.0014400040953783 0.001592837471442 333496 355658 667 665 0 True 407 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 450 391 0.00788516247712719 0.0081246834183192 0.00790417334248875 0.0080872816052491 0.0016258433841179 0.00161310271885833 344675 354080 667 665 0 True 451 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 493 389 0.00771086189567153 0.00797750843118324 0.00778210116731518 0.00802624551766232 0.00189318734335648 0.00180016862397155 337056 347666 667 665 0 True 496 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 538 388 0.00760944773664896 0.00751214268218039 0.00761425192645151 0.00756847486076143 0.00170171238424562 0.00169213357202389 332623 327385 667 665 0 True 541 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 582 389 0.00738079117914149 0.00730858962466822 0.00747692072938125 0.00735484855420768 0.00192986812040736 0.00195106043471306 322628 318514 667 665 0 True 585 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 626 389 0.00679099681104744 0.00675440030609827 0.00675974670023652 0.00674448767833982 0.0019471760230027 0.00186001629412284 296847 294362 667 665 0 True 630 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 671 388 0.00652264849493312 0.00634378346874281 0.00651560234988937 0.0063782711528191 0.00181743916095169 0.0018951961436073 285117 276467 667 665 0 True 675 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 272 435 0.00643505210086648 0.0065345556612979 0.00653086137178607 0.00650034332799268 0.00155197147253419 0.00147183297795234 281288 284781 667 665 0 True 273 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 316 435 0.00656714444334253 0.00661548584209436 0.00653086137178607 0.00671396963454643 0.00146479494205869 0.0014041401054183 287062 288308 667 665 0 True 317 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 362 435 0.00683126049701174 0.00700689696316782 0.00688181887541009 0.00698863202868696 0.00137432854626767 0.00134848200477971 298607 305366 667 665 0 True 362 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 405 435 0.00698154012945461 0.00715769740212284 0.00701915007248035 0.00720225833524071 0.00164177507793328 0.0015845245603859 305176 311938 667 665 0 True 407 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 450 435 0.00734247204619251 0.00750702574701804 0.00735484855420768 0.0076600289921416 0.00168124000711755 0.00174562399294477 320953 327162 667 665 0 True 451 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 494 433 0.0081079396214001 0.00736804244532136 0.00805676356145571 0.00737010757610437 0.00210250562825825 0.00189171617722984 354413 321105 667 665 0 True 496 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 538 433 0.00772392471651563 0.00751888877607156 0.00778210116731518 0.00738536659800107 0.00187158446378841 0.00218404974481651 337627 327679 667 665 0 True 541 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 582 433 0.00691174211475173 0.00700494656187275 0.00698863202868696 0.00703440909437705 0.00193876041299673 0.00215167715527047 302125 305281 667 665 0 True 585 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 626 433 0.00638222889013264 0.00680940162261915 0.0063935301747158 0.00672922865644312 0.0018827843561976 0.00184829888811892 278979 296759 667 665 0 True 630 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 670 432 0.00614405546139725 0.00683978199102701 0.00614938582436866 0.00683604180972 0.00194505395377976 0.00195675999096961 268568 298083 667 665 0 True 675 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 275 479 0.00641819168236893 0.00627696501496359 0.00646982528419928 0.00634775310902571 0.00148418328090578 0.0015993727244058 280551 273555 667 665 0 True 273 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 319 479 0.00655925184580976 0.0065715444482114 0.00660715648126955 0.00656137941557946 0.00147359203502631 0.00149647202827786 286717 286393 667 665 0 True 317 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 362 479 0.0068794625346974 0.00667861000636175 0.00686655985351339 0.00668345159075303 0.00148340448320513 0.00147607555325136 300714 291059 667 665 0 True 362 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 407 478 0.00751194556075132 0.00718101043407328 0.00714122224765393 0.00711070420386053 0.00323596507706688 0.00171981929013945 328361 312954 667 665 0 True 407 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 451 478 0.0073077903712369 0.00730104042436143 0.00715648126955062 0.00730907148851759 0.00253702296168579 0.00193497211002896 319437 318185 667 665 0 True 451 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 495 478 0.00694326675069423 0.00722763649797416 0.00691233691920348 0.00730907148851759 0.00186483267887447 0.00204513668890734 303503 314986 667 665 0 True 496 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 539 477 0.00679028762112421 0.00688705054006038 0.00669871061264973 0.00692759594110018 0.001820345333342 0.00191766763419254 296816 300143 667 665 0 True 541 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 583 477 0.00662250701154344 0.00747561281321867 0.00674448767833982 0.00741588464179446 0.00198185028657683 0.00224712580114683 289482 325793 667 665 0 True 586 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 627 477 0.0063989520460644 0.0068462756800447 0.0063935301747158 0.0068055237659266 0.00190632343287056 0.00173131125103747 279710 298366 667 665 0 True 630 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 672 477 0.00644118316213832 0.00671571352276319 0.0063782711528191 0.00662241550316625 0.00185193060280993 0.00187945827220465 281556 292676 667 665 0 True 675 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 274 524 0.0064327186372481 0.00643345603652069 0.00643930724040589 0.00650034332799268 0.00144599023227881 0.00153346719595106 281186 280375 667 665 0 True 273 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 319 523 0.00648755503228015 0.00651459273039546 0.00650034332799268 0.00648508430609598 0.00150118676428789 0.00136599608246247 283583 283911 667 665 0 True 318 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 364 523 0.00680696502286737 0.00688009793309091 0.00683604180972 0.00685130083161669 0.0014879677050774 0.00144234542049295 297545 299840 667 665 0 True 362 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 408 522 0.00675258616972127 0.00701756680554671 0.00685130083161669 0.00704966811627375 0.00172008589979305 0.00180423314695029 295168 305831 667 665 0 True 407 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 452 521 0.00680389949223145 0.00668150118945797 0.00672922865644312 0.00669871061264973 0.00196816787542652 0.00184824850577704 297411 291185 667 665 0 True 452 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 496 520 0.0067349250529233 0.00684659692261095 0.00675974670023652 0.00695811398489357 0.00177262563559317 0.00172134441741312 294396 298380 667 665 0 True 496 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 540 519 0.00655380709736686 0.00683962136974388 0.00660715648126955 0.00688181887541009 0.00175550230567205 0.00176612808804686 286479 298076 667 665 0 True 541 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 584 519 0.00748565977940304 0.0070098569839568 0.00656137941557946 0.00697337300679027 0.0100537251028972 0.00174381835114602 327212 305495 667 665 0 True 586 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 629 519 0.00648211028383725 0.00694232720735232 0.00646982528419928 0.00691233691920348 0.00190360327743838 0.00205054992912755 283345 302552 667 665 0 True 630 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 673 518 0.00670587114316497 0.00636872565942207 0.00672922865644312 0.00642404821850919 0.0018464786347224 0.00180908049104589 293126 277554 667 665 0 True 675 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 276 564 0.00689648309285504 0.00650821377086571 0.00694285496299687 0.00650034332799268 0.00141404612973342 0.00128887970258949 301458 283633 667 665 0 True 273 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 320 564 0.00661937284962463 0.00650887920189579 0.00653086137178607 0.00653086137178607 0.00141638813496539 0.00141330411959833 289345 283662 667 665 0 True 318 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 364 563 0.00661278424646683 0.00665442503030293 0.00656137941557946 0.00663767452506294 0.00139001756367266 0.00129483241420035 289057 290005 667 665 0 True 362 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 409 563 0.00670793008165178 0.00674457946193018 0.00675974670023652 0.00672922865644312 0.00165166736750021 0.00152105174607789 293216 293934 667 665 0 True 407 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 452 563 0.0067219079862678 0.00688732589083145 0.00675974670023652 0.00695811398489357 0.00186321453934881 0.00181536023067977 293827 300155 667 665 0 True 452 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 496 561 0.00687873046767987 0.00704854376729188 0.00694285496299687 0.00701915007248035 0.00200005590714569 0.00210540391411269 300682 307181 667 665 0 True 496 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 541 561 0.00716876626918859 0.007310723593144 0.0072480354009308 0.00733958953231098 0.00192754803223778 0.00193851605236752 313360 318607 667 665 0 True 541 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 584 560 0.00853832639642641 0.00728741056119355 0.00721751735713741 0.00730907148851759 0.0105054168327988 0.00155340306684454 373226 317591 667 665 0 True 586 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 629 560 0.00674931474523667 0.0070547850514361 0.0068055237659266 0.00704966811627375 0.00159177450052127 0.00170115846178158 295025 307453 667 665 0 True 630 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 673 560 0.00677237485628895 0.0069758052719347 0.0068207827878233 0.00691233691920348 0.0016562049411318 0.00198222046649196 296033 304011 667 665 0 True 675 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 273 607 0.00724936227240008 0.00714200240817195 0.0072327763790341 0.00709544518196384 0.00141839639942661 0.0014608855874432 316883 311254 667 665 0 False 273 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 318 607 0.00685187275897414 0.00679907596870409 0.00675974670023652 0.0068055237659266 0.00144514557020695 0.00136866806114367 299508 296309 667 665 0 False 318 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 364 606 0.00646440341285068 0.00668287794331331 0.00645456626230259 0.00654612039368277 0.00138945560042685 0.00151638322979533 282571 291245 667 665 0 True 362 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 408 605 0.00638437933699664 0.00680391755309537 0.0064087891966125 0.00671396963454643 0.00155129158937463 0.00135678358041208 279073 296520 667 665 0 True 407 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 452 607 0.0065848284372348 0.00681839641447404 0.00654612039368277 0.0068207827878233 0.00192364652208063 0.00197176398620345 287835 297151 667 665 0 False 452 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 496 607 0.00726315716026171 0.00680543198233625 0.00729381246662089 0.00686655985351339 0.00213661158157115 0.0020524252560399 317486 296586 667 665 0 False 496 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 541 607 0.00747621153945801 0.0065216141750577 0.00759899290455482 0.00645456626230259 0.00214185862844007 0.00206159237598958 326799 284217 667 665 0 False 541 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 586 607 0.00693443619229525 0.00632411883450902 0.00701915007248035 0.00627145799954223 0.00183142679691965 0.00173192106289401 303117 275610 667 665 0 False 586 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 630 607 0.00705259638434388 0.00624431300269442 0.00709544518196384 0.00628671702143893 0.00152157932294477 0.00145349560307401 308282 272132 667 665 0 False 630 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 675 607 0.00699480884414739 0.00665043244412244 0.00708018616006714 0.00666819256885634 0.00164290211093777 0.00155475364154255 305756 289831 667 665 0 False 675 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 274 657 0.00907758526321641 0.733209838512509 0.00872816052491035 0.74032196536202 0.00239227730305182 0.188350755319665 396798 31953853 667 665 10 True 273 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 318 651 0.00736027042555628 0.00711680781261921 0.00732433051041428 0.00715648126955062 0.0016424063317077 0.00132377603021599 321731 310156 667 665 0 False 318 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 362 651 0.00669605686971117 0.00665472332697158 0.00677500572213321 0.00666819256885634 0.00131993568617469 0.00126733673606646 292697 290018 667 665 0 False 362 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 407 650 0.00684780063618912 0.00625305538967584 0.0068055237659266 0.00627145799954223 0.00155046797361903 0.00136887481345077 299330 272513 667 665 0 False 407 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 452 650 0.00668578505437142 0.00716951453938118 0.00665293354695964 0.00717174029144732 0.00166393585921203 0.00170282238290166 292248 312453 667 665 0 False 452 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 496 650 0.00722053713358473 0.00755720842504522 0.00721751735713741 0.00759899290455482 0.00176828885211725 0.00180062879930497 315623 329349 667 665 0 False 496 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 541 650 0.007483966874425 0.00746815539650224 0.00740062561989776 0.00743114366369116 0.00190703919697702 0.00171222646603742 327138 325468 667 665 0 False 541 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 586 650 0.0110964659579114 0.00657964435006032 0.00746166170748455 0.00656137941557946 0.0265634520374285 0.00132416102505129 485047 286746 667 665 0 False 586 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 631 650 0.007939518453179 0.00759295813348891 0.00772106507972839 0.00750743877317464 0.00198641446568646 0.00152015569628119 347051 330907 667 665 0 False 631 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 672 654 0.0088548309960378 0.760338796177902 0.00883497367818723 0.762127107652399 0.00165283075543295 0.179525087525418 387061 33136154 667 665 14 True 675 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D6_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D6_3.csv new file mode 100755 index 0000000..3387d6e --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D6_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 272 260 0.00117400672517941 0.0762935262165485 0.00103761348897536 0.0752727550164034 0.000833563318876727 0.0226480148764245 51318 3324931 667 665 0 True 272 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 317 259 0.00102089033304359 0.0010180865301271 0.000900282291905089 0.000915541313801785 0.000678892054074419 0.000669843704894712 44625 44369 667 665 0 False 317 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 360 260 0.000979254021421425 0.00108029285849093 0.000885023270008392 0.000991836423285267 0.000625692284727342 0.00073344331087234 42805 47080 667 665 0 True 362 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 404 259 0.00085352151116019 0.00103164755560221 0.000717174029144732 0.000854505226215 0.000669642553045143 0.000744414712398104 37309 44960 667 665 0 True 406 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 448 259 0.000903690978955475 0.000969074092876962 0.000686655985351339 0.000778210116731518 0.000816221886794574 0.000856259647736729 39502 42233 667 665 0 True 451 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 492 258 0.00105204893547733 0.00101957801347039 0.00080872816052491 0.000823987182421607 0.000903580450730974 0.00083845816080092 45987 44434 667 665 0 True 496 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 536 257 0.00104719899148617 0.00104908643776987 0.000885023270008392 0.000854505226215 0.000851256588447568 0.000843557939326525 45775 45720 667 665 0 True 540 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 580 257 0.00099529086452425 0.0010730419548528 0.000747692072938125 0.000793469138628214 0.000905830883321023 0.000947217256555008 43506 46764 667 665 0 True 585 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 630 259 0.00113534443581597 0.00114488556020401 0.000823987182421607 0.000900282291905089 0.0010948356209327 0.00100482809773966 49628 49895 667 665 0 False 630 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 669 257 0.00115618546872135 0.0749640179643432 0.000869764248111696 0.0747539482719158 0.000982330115188096 0.0223825949447748 50539 3266990 667 665 0 True 675 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 272 303 0.000950840670303438 0.00103109685406008 0.00080872816052491 0.000885023270008392 0.000762828809538283 0.000815935199546571 41563 44936 667 665 0 False 272 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 317 303 0.000993780976300589 0.000957302847413797 0.000885023270008392 0.000885023270008392 0.000717519820169355 0.000633284434067647 43440 41720 667 665 0 False 317 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 360 303 0.000975708071805251 0.000977632912677666 0.000854505226215 0.000854505226215 0.000681934400227689 0.000704258763362189 42650 42606 667 665 0 True 362 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 404 304 0.000967106284349242 0.00100592520440492 0.000823987182421607 0.000869764248111696 0.000729955999716216 0.000755970011279989 42274 43839 667 665 0 True 407 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 448 303 0.000998058992934295 0.0010072331205675 0.000732433051041428 0.000671396963454643 0.000929333936364843 0.000971049352180683 43627 43896 667 665 0 True 451 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 492 302 0.00106881784559769 0.00094415484809529 0.000854505226215 0.000701915007248035 0.000980078586050663 0.000894539878982705 46720 41147 667 665 0 True 496 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 537 301 0.00102892019314216 0.00105977922604635 0.000839246204318303 0.000900282291905089 0.000858615568075101 0.000856541043773046 44976 46186 667 665 0 True 541 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 581 302 0.00107991323633217 0.00108570809032194 0.000747692072938125 0.000701915007248035 0.00102507124454524 0.00108659124905027 47205 47316 667 665 0 True 585 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 630 302 0.00105545762252772 0.000972929003671917 0.000671396963454643 0.000656137941557946 0.00105587488635894 0.0010057621331553 46136 42401 667 665 0 False 630 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 675 302 0.00113118080465375 0.00105284956497446 0.000762951094834821 0.000671396963454643 0.00112015554919116 0.00103140576957746 49446 45884 667 665 0 False 675 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 271 348 0.000955919385237571 0.000852279474148865 0.000823987182421607 0.000686655985351339 0.000772857645600708 0.000703646496818978 41785 37143 667 665 0 True 273 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 316 347 0.000992271088076928 0.000977013373442762 0.000915541313801785 0.000885023270008392 0.000710129170526415 0.000660060492735527 43374 42579 667 665 0 True 317 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 360 348 0.00102857703672769 0.00096889052569625 0.000900282291905089 0.000839246204318303 0.000722469286781496 0.000706409050648611 44961 42225 667 665 0 True 362 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 404 347 0.000996251702484761 0.00103389625356594 0.000823987182421607 0.000869764248111696 0.00096981762307423 0.000743149393454763 43548 45058 667 665 0 True 407 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 448 347 0.00206987373788501 0.000989886021990201 0.000869764248111696 0.000701915007248035 0.00506730825534738 0.000916493863766512 90478 43140 667 665 0 True 451 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 496 346 0.000993963993054972 0.000967192529274663 0.000747692072938125 0.000701915007248035 0.000888801371396535 0.000864292849119054 43448 42151 667 665 0 False 496 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 538 345 0.00102859991382199 0.00105248243061304 0.000823987182421607 0.000839246204318303 0.000849447341319136 0.000910636985779907 44962 45868 667 665 0 True 541 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 581 345 0.000991630529436586 0.00111514767692865 0.000717174029144732 0.000732433051041428 0.00102738255454175 0.00110514281893442 43346 48599 667 665 0 True 585 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 625 345 0.00106655301326219 0.00107171109279264 0.000686655985351339 0.000686655985351339 0.00108235428445522 0.00115823273222688 46621 46706 667 665 0 True 630 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 669 345 0.000999660389535148 0.00101232710983226 0.000656137941557946 0.00064087891966125 0.000993256539053641 0.00103132816877981 43697 44118 667 665 0 True 675 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 272 392 0.000974815865127633 0.00102150546886787 0.000762951094834821 0.000854505226215 0.000828766520133382 0.000817953037995321 42611 44518 667 665 0 True 273 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 317 392 0.00108217806866766 0.00684618389645434 0.00100709544518196 0.00694285496299687 0.000729550294687044 0.00189398642396999 47304 298362 667 665 0 True 317 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 360 392 0.000977034943274529 0.00110016400580302 0.000823987182421607 0.000915541313801785 0.0007589185073175 0.000849951330238274 42708 47946 667 665 0 True 362 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 405 391 0.000957863938252892 0.00108417071518347 0.000762951094834821 0.000854505226215 0.000777677888787746 0.000850131497722008 41870 47249 667 665 0 True 407 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 450 391 0.00108734829197898 0.00106466670223281 0.000885023270008392 0.00080872816052491 0.000918818716568935 0.000914336762940672 47530 46399 667 665 0 True 451 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 493 389 0.0010284626512562 0.00100406658670021 0.000717174029144732 0.000747692072938125 0.000955249706987745 0.000954080804623564 44956 43758 667 665 0 True 496 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 538 388 0.00103665265101485 0.000975636619587421 0.000854505226215 0.000793469138628214 0.000878002000427092 0.000846474629809188 45314 42519 667 665 0 True 541 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 582 389 0.00106030756651887 0.00100342410156772 0.000717174029144732 0.000701915007248035 0.0010261538215058 0.00105184384987996 46348 43730 667 665 0 True 585 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 626 389 0.00108899544276843 0.00104231739798111 0.000732433051041428 0.000778210116731518 0.00105522622195058 0.00102228062734103 47602 45425 667 665 0 True 630 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 671 388 0.000986506060313858 0.00105817301321512 0.00064087891966125 0.000656137941557946 0.000982723013441274 0.00108482094283611 43122 46116 667 665 0 True 675 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 272 435 0.00101798494206776 0.000901911450633909 0.000854505226215 0.000701915007248035 0.000853926220332739 0.000796285914988691 44498 39306 667 665 0 True 273 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 316 435 0.00098549946816475 0.000979537422177554 0.000885023270008392 0.000869764248111696 0.000717833016015135 0.000757987347848672 43078 42689 667 665 0 True 317 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 362 435 0.000919361788549534 0.000965746937726555 0.000732433051041428 0.000839246204318303 0.00076777144158564 0.000726840383997246 40187 42088 667 665 0 True 362 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 405 435 0.00100915438366877 0.00105337732061901 0.000762951094834821 0.000854505226215 0.00092280454956791 0.000834573986799726 44112 45907 667 665 0 True 407 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 450 435 0.00102260611511594 0.000988142133773436 0.000732433051041428 0.000656137941557946 0.000947819775980498 0.00100173548666089 44700 43064 667 665 0 True 451 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 494 433 0.00105609818116806 0.00101186819188048 0.000762951094834821 0.000732433051041428 0.00099637124110651 0.000997814688584037 46164 44098 667 665 0 True 496 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 538 433 0.000972962820489503 0.00101418572753697 0.000701915007248035 0.000778210116731518 0.000888456570727597 0.000868553395528924 42530 44199 667 665 0 True 541 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 582 433 0.000994833322638292 0.0010216431442534 0.000656137941557946 0.000671396963454643 0.000967753676565843 0.00103179686002109 43486 44524 667 665 0 True 585 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 626 433 0.000907031034722968 0.00100964243981434 0.000534065766384375 0.000686655985351339 0.000964466184653644 0.000969338835355805 39648 44001 667 665 0 True 630 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 670 432 0.00090657349283701 0.0010174669908922 0.000473029678797589 0.000671396963454643 0.000991859761023967 0.00101137666771888 39628 44342 667 665 0 True 675 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 275 479 0.000995931423164591 0.000943397633474852 0.000854505226215 0.000747692072938125 0.000779327144272572 0.000847377795370406 43534 41114 667 665 0 True 273 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 319 479 0.000966145446388731 0.000906890710410726 0.000823987182421607 0.000747692072938125 0.000839118759217448 0.000778546195303309 42232 39523 667 665 0 True 317 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 362 479 0.000949788323965735 0.000988532214032449 0.000823987182421607 0.000854505226215 0.00079771537264966 0.000794093466670169 41517 43081 667 665 0 True 362 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 407 478 0.000971361423888651 0.00105431810242016 0.000671396963454643 0.000793469138628214 0.000979630663730551 0.000951900124455231 42460 45948 667 665 0 True 407 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 451 478 0.0010599415330101 0.000986214678375958 0.00064087891966125 0.000701915007248035 0.00110815201963605 0.00106338342804079 46332 42980 667 665 0 True 451 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 495 478 0.000984035334129685 0.00106569926762431 0.000625619897764553 0.000747692072938125 0.000993136339382438 0.00105123378037379 43014 46444 667 665 0 True 496 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 539 477 0.00102276625477602 0.000953975692263389 0.000762951094834821 0.000656137941557946 0.000932597362095686 0.000919233515263776 44707 41575 667 665 0 True 541 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 583 477 0.000985590976541942 0.000977655858575255 0.000625619897764553 0.000625619897764553 0.0010012094489785 0.00103673200527768 43082 42607 667 665 0 True 586 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 627 477 0.000954661145051187 0.000891425175435728 0.000595101853971161 0.000549324788281071 0.000960425947759684 0.000886174947888048 41730 38849 667 665 0 True 630 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 672 477 0.000903736733144071 0.00105014194905896 0.000564583810177768 0.00064087891966125 0.000948400774855437 0.0010349384812399 39504 45766 667 665 0 True 675 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 274 524 0.000932836397090994 0.000939313263704007 0.000747692072938125 0.000823987182421607 0.000801169755933106 0.000762015710403186 40776 40936 667 665 0 True 273 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 319 523 0.000997395557199656 0.000935137110342806 0.000885023270008392 0.000839246204318303 0.000785576101727726 0.000805155055786727 43598 40754 667 665 0 True 318 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 364 523 0.000940523100775087 0.00092570634643372 0.000732433051041428 0.000778210116731518 0.000794845453557958 0.000787907304392556 41112 40343 667 665 0 True 362 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 408 522 0.000993071786377354 0.00099130866764072 0.000778210116731518 0.000701915007248035 0.00087264892735295 0.000915163049887458 43409 43202 667 665 0 True 407 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 452 521 0.000970354831739543 0.000962052648214723 0.000656137941557946 0.000534065766384375 0.000970287225564394 0.00107337498767441 42416 41927 667 665 0 True 452 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 496 520 0.000958847653307702 0.000935756649577709 0.00064087891966125 0.000595101853971161 0.000957585709208854 0.000910495342641852 41913 40781 667 665 0 True 496 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 540 519 0.000866332683967012 0.000947114868884273 0.000549324788281071 0.000717174029144732 0.000922192739425124 0.000851027339450411 37869 41276 667 665 0 True 541 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 584 519 0.00102267474639883 0.00103116569175284 0.00064087891966125 0.000717174029144732 0.00136040836583249 0.000986787701279429 44703 44939 667 665 0 True 586 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 629 519 0.000985339328504665 0.000918432496898001 0.000686655985351339 0.000518806744487678 0.000986741114322687 0.000980149018734856 43071 40026 667 665 0 True 630 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 673 518 0.00101121332215559 0.000975889024460901 0.000671396963454643 0.00064087891966125 0.00104029328024266 0.00102361086425911 44202 42530 667 665 0 True 675 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 276 564 0.000981495976662619 0.000979330909099253 0.000839246204318303 0.000839246204318303 0.000741465213512701 0.000716882348431894 42903 42680 667 665 0 True 273 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 320 564 0.00100194809896494 0.000985342734267576 0.000885023270008392 0.000869764248111696 0.000773597274851781 0.000732491982678188 43797 42942 667 665 0 True 318 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 364 563 0.000922541704656941 0.00096911998467214 0.000793469138628214 0.000854505226215 0.000714033139370036 0.000698348876559695 40326 42235 667 665 0 True 362 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 409 563 0.00100485348994077 0.000985434517857932 0.000839246204318303 0.000762951094834821 0.000855612332561799 0.000848889190315128 43924 42946 667 665 0 True 407 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 452 563 0.000934643687540528 0.00102453432734962 0.000503547722590982 0.000701915007248035 0.00101526714206923 0.00100204955717867 40855 44650 667 665 0 True 452 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 496 561 0.000952464943998589 0.000927702639523964 0.000534065766384375 0.000488288700694286 0.00104853307675485 0.00108024313717375 41634 40430 667 665 0 True 496 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 541 561 0.000977469608066189 0.00101597550754891 0.000579842832074464 0.000656137941557946 0.00101298686728279 0.000951405410558193 42727 44277 667 665 0 True 541 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 584 560 0.0011534402174056 0.00103912791821623 0.000747692072938125 0.000839246204318303 0.00143854804094261 0.000820871581196357 50419 45286 667 665 0 True 586 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 629 560 0.00107929555478612 0.00108983835188796 0.000839246204318303 0.000854505226215 0.000923043803238323 0.000945373371047798 47178 47496 667 665 0 True 630 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 673 560 0.00105932385146406 0.00109991160092954 0.00080872816052491 0.00080872816052491 0.000924535639593795 0.00100991600524254 46305 47935 667 665 0 True 675 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 273 607 0.000971773211586013 0.000954847636371772 0.000839246204318303 0.00080872816052491 0.000731963415569726 0.000732949251037123 42478 41613 667 665 0 False 273 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 318 607 0.000863678941028456 0.000940529396276225 0.000717174029144732 0.000839246204318303 0.000692945558676918 0.000726145094914997 37753 40989 667 665 0 False 318 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 364 606 0.000940317206926406 0.000980501149876293 0.000823987182421607 0.000854505226215 0.000739311197669265 0.000731994803526911 41103 42731 667 665 0 True 362 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 408 605 0.000845903438758991 0.00103887551334275 0.000625619897764553 0.000854505226215 0.000749520248692493 0.000814075804857243 36976 45275 667 665 0 True 407 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 452 607 0.00101311212098231 0.00100929825135051 0.000701915007248035 0.000656137941557946 0.000995685381768384 0.00104878204779732 44285 43986 667 665 0 False 452 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 496 607 0.000929725112266481 0.000954296934829635 0.000473029678797589 0.000549324788281071 0.00104472102773517 0.00102924620612969 40640 41589 667 665 0 False 496 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 541 607 0.00105250647736329 0.000987637324026477 0.000732433051041428 0.000610360875867857 0.00105955868186838 0.00109948178961801 46007 43042 667 665 0 False 541 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 586 607 0.00100961192555473 0.000932750736993548 0.000762951094834821 0.000625619897764553 0.00091656598863549 0.000905473928705747 44132 40650 667 665 0 False 586 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 630 607 0.00107105980083888 0.000914784099181348 0.000854505226215 0.000732433051041428 0.000833277860332563 0.000762867420877612 46818 39867 667 665 0 False 630 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 675 607 0.00103523427116838 0.00102191849502447 0.000793469138628214 0.000732433051041428 0.000890216474179001 0.000889427115316632 45252 44536 667 665 0 False 675 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 274 657 0.00110915016284488 0.0753460671592004 0.000976577401388571 0.0741283283741512 0.000725126730153442 0.021532949240483 48483 3283640 667 665 0 True 273 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 318 651 0.000959579720325234 0.000980156961412458 0.000839246204318303 0.000839246204318303 0.000666251042586763 0.000694535877764074 41945 42716 667 665 0 False 318 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 362 651 0.000927757682156862 0.000976164375231969 0.00080872816052491 0.000885023270008392 0.000688993472218261 0.000664081568914521 40554 42542 667 665 0 False 362 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 407 650 0.000918332319306129 0.00100732490415785 0.000747692072938125 0.000854505226215 0.000741718928670307 0.000740611545866704 40142 43900 667 665 0 False 407 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 452 650 0.000979254021421425 0.00100704955338679 0.000762951094834821 0.000823987182421607 0.000858351864499003 0.000895106334927499 42805 43888 667 665 0 False 452 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 496 650 0.000870976734109484 0.000989771292502256 0.000579842832074464 0.000686655985351339 0.000916073583147808 0.000909551930623047 38072 43135 667 665 0 False 496 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 541 650 0.00099833351806587 0.00107102271586497 0.00064087891966125 0.000778210116731518 0.000938681707598316 0.000950519247600643 43639 46676 667 665 0 False 541 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 586 650 0.00143331858904606 0.000990207264556447 0.000976577401388571 0.000930800335698482 0.00275737926345756 0.000673041166985799 62653 43154 667 665 0 False 586 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 631 650 0.00102926334955662 0.00102279043913285 0.000869764248111696 0.000900282291905089 0.000746750779530213 0.00072188867217032 44991 44574 667 665 0 False 631 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 672 654 0.00115945689320595 0.0789490090527303 0.000961318379491875 0.0762798504615854 0.00081356125642276 0.0221786220012011 50682 3440659 667 665 0 True 675 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D7_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D7_1.csv new file mode 100755 index 0000000..4af2001 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D7_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 267 275 0.0101102801769177 0.0413851979456538 0.0101319905394064 0.0419470511940185 0.00149170536964416 0.00918281919296804 441939 1803599 667 665 0 True 267 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 311 273 0.0100352890618092 0.0102074366506791 0.0100709544518196 0.0102082856488899 0.00127761353101917 0.00128745936195271 438661 444848 667 665 0 False 311 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 355 274 0.0100491297038594 0.0616938546870725 0.0100556954299229 0.0646677347981994 0.00143199313179313 0.0119508245492376 439266 2688666 667 665 0 True 356 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 400 274 0.0100253832799782 0.0890488523896145 0.00996414129854276 0.086655985351339 0.00145766605769928 0.0159180002629051 438228 3880818 667 665 0 True 400 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 444 274 0.0102258552573107 0.0728588006982437 0.0102235446707866 0.0703288319218738 0.0017918141299628 0.0169251531166516 446991 3175243 667 665 0 True 445 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 488 272 0.0100290207379716 0.0660333828391074 0.0100556954299229 0.0698100251773861 0.00173715183745315 0.0195495008059935 438387 2877786 667 665 0 True 490 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 532 272 0.0101213069363693 0.0797961715917168 0.00999465934233616 0.0797283894102388 0.0017749441429983 0.0291019363978909 442421 3477579 667 665 0 True 534 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 577 272 0.0100753468539248 0.0660879711294717 0.00999465934233616 0.0653086137178607 0.00180544733458647 0.0172792898698284 440412 2880165 667 665 0 True 579 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 624 273 0.010058463558333 0.00989964038042004 0.00997940032043946 0.00988784618905928 0.00194121804214747 0.00188437349231119 439674 431434 667 665 0 False 624 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 662 271 0.0100927791997798 0.0408842201635928 0.0100556954299229 0.0420386053253986 0.00186497269280292 0.0101439456381208 441174 1781766 667 665 0 True 668 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 267 317 0.00998866554363011 0.00999993689878163 0.0100862134737163 0.0100251773861295 0.00151832306904885 0.00145012887877329 436623 435805 667 665 0 False 267 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 311 317 0.0100850238648128 0.0103514680498454 0.0101319905394064 0.0103303578240635 0.00131570190379386 0.00132443943107404 440835 451125 667 665 0 False 311 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 356 318 0.0107148073937396 0.125463808296204 0.010605020218204 0.121934843976501 0.00157408879429283 0.040413756476256 468364 5467810 667 665 0 True 356 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 400 319 0.0102244826316528 0.0530205119115023 0.0101777676050965 0.0525673304341192 0.00142410348009913 0.00998683408991308 446931 2310675 667 665 0 True 400 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 444 318 0.0103333547234165 0.0776220477951574 0.0103608758678569 0.0761882963302052 0.00171280702677089 0.0154483219635203 451690 3382829 667 665 0 True 445 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 489 317 0.0100835826078721 0.0424341696539357 0.0101777676050965 0.0439765011062791 0.00177522783391098 0.00767819561834728 440772 1849314 667 665 0 True 490 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 533 315 0.0101965268224208 0.043503999183126 0.0102082856488899 0.0468146791790646 0.00163650927069866 0.0107240885605174 445709 1895938 667 665 0 True 534 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 576 316 0.0102793190266849 0.0511437210559014 0.0103150988021668 0.0539711604486152 0.00198945502458291 0.0126401987748796 449328 2228883 667 665 0 True 579 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 624 316 0.0100562216030918 0.00996136484493449 0.0100556954299229 0.00997940032043946 0.00198948446033027 0.00198210987850128 439576 434124 667 665 0 False 624 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 668 316 0.010013235542906 0.00974721078273619 0.00994888227664607 0.00968947890440223 0.00244654658811627 0.00203546144448441 437697 424791 667 665 0 False 668 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 268 363 0.0103541042479447 0.0515152151378676 0.0103913939116503 0.0507972838941024 0.0015975573853066 0.0123488470794246 452597 2245073 667 665 0 True 267 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 313 362 0.0102710146414547 0.0611771130733678 0.0102388036926833 0.0638437476157778 0.00147546557808557 0.0169288357007878 448965 2666146 667 665 0 True 311 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 356 363 0.0101393569637703 0.0398582172987975 0.0101472495613031 0.0408941786831464 0.00150055459903274 0.0079620446017161 443210 1737052 667 665 0 True 356 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 401 362 0.0103191938020461 0.0365252797821975 0.0103456168459602 0.0372777904936294 0.00139662100529099 0.0061426986315456 451071 1591800 667 665 0 True 401 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 445 362 0.0104525901388971 0.0726295252895342 0.0104371709773404 0.0708476386663615 0.00169779131654622 0.013498300725777 456902 3165251 667 665 0 True 445 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 490 361 0.0103993322633716 0.0326473313060633 0.0104829480430304 0.0335698481727321 0.00170598846134647 0.00467736193643254 454574 1422796 667 665 0 True 490 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 534 361 0.0103530747787013 0.0302753679804914 0.0102998397802701 0.030411230640116 0.00176912635228949 0.00354988642455491 452552 1319424 667 665 0 True 534 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 578 360 0.0102975749479346 0.050744714842726 0.0101930266269932 0.0516060120546273 0.00202831668998294 0.0101601899948715 450126 2211494 667 665 0 True 579 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 621 360 0.0102034814590873 0.0587633882141839 0.01025406271458 0.059464408331426 0.00201184131474688 0.0168137463669009 446013 2560954 667 665 0 True 624 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 668 360 0.0101244868524767 0.0619242544447638 0.0101319905394064 0.062577248798352 0.00191247268035775 0.0207785731238779 442560 2698707 667 665 0 False 668 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 269 407 0.0102409541395473 0.0414883397553164 0.0101777676050965 0.0439612420843824 0.00155782752008313 0.00956596632606135 447651 1808094 667 665 0 True 267 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 314 408 0.010410496285389 0.0335648000752625 0.0104982070649271 0.0332646677347982 0.00141911913115656 0.00549802037985163 455062 1462780 667 665 0 True 311 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 357 407 0.0105634296607704 0.0863676472022354 0.0105897611963073 0.0835584039063096 0.0014414233336994 0.023594733877132 461747 3763969 667 665 0 True 356 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 401 406 0.0105416049128102 0.0683589036679591 0.010452429999237 0.0676432440680552 0.00160892850168549 0.0186819890257607 460793 2979134 667 665 0 True 401 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 445 406 0.0107174153824896 0.0442159874394157 0.0107118333714809 0.0458991378652628 0.00162018532167183 0.0086338309743408 468478 1926967 667 665 0 True 445 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 490 405 0.0105762408335773 0.0562104276484298 0.0105897611963073 0.056595712214847 0.00178854260458818 0.0104051413647503 462307 2449694 667 665 0 True 490 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 533 404 0.0106881555788826 0.0417803492480343 0.0105745021744106 0.0441901274128328 0.00179260329660329 0.00822433743077412 467199 1820820 667 665 0 True 535 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 579 405 0.0103935901127029 0.054211082753806 0.0103303578240635 0.0535591668574044 0.0018582333976925 0.00832678145964544 454323 2362561 667 665 0 True 579 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 622 404 0.0104307425138426 0.0477604631858887 0.0105134660868238 0.049057755397879 0.00190307139805445 0.00822451192454171 455947 2081438 667 665 0 True 624 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 666 404 0.0102425097819596 0.081606281668924 0.0102388036926833 0.0803387502861067 0.00190828086228429 0.0181119656087626 447719 3556465 667 665 0 True 668 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 269 451 0.0102904830487022 0.0426079389363773 0.0103456168459602 0.0433966582742046 0.00160599879742121 0.00844406107558123 449816 1856887 667 665 0 True 267 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 313 451 0.0105469352757817 0.0518795730456836 0.0104676890211337 0.0520485236896315 0.00169480479422404 0.00937028809160011 461026 2260952 667 665 0 True 311 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 358 451 0.0104996025676793 0.0353684623552472 0.0104219119554437 0.0361638818951705 0.00172615554204928 0.00414395518471186 458957 1541385 667 665 0 True 356 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 401 450 0.0105443044099374 0.0569991699321547 0.0105592431525139 0.0563363088426032 0.00162796889846585 0.0146572701569202 460911 2484068 667 665 0 True 401 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 446 450 0.0109298978343284 0.0948344080618117 0.0108339055466545 0.0949568932631418 0.00193810153538942 0.0154836890196876 477766 4132957 667 665 0 True 445 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 490 449 0.010829261496512 0.061573113373959 0.0109254596780346 0.0628366521705959 0.00192578280103483 0.0152704708625096 473367 2683404 667 665 0 True 490 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 534 448 0.0107442959682896 0.0532689700905961 0.010757610437171 0.0535439078355077 0.00172856796268668 0.0110152014712737 469653 2321503 667 665 0 True 535 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 579 449 0.0106151318938837 0.0331934436686819 0.0105897611963073 0.0335545891508354 0.00192011763879767 0.00428952519948173 464007 1446596 667 665 0 True 579 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 624 449 0.0101815880798443 0.0388742054265901 0.01025406271458 0.0393530174715801 0.00197216601007303 0.00418754403752033 445056 1694168 667 665 0 True 624 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 667 448 0.0102411829104903 0.0687827373423258 0.0102693217364767 0.0691081101701381 0.00204348547877787 0.0144921250376604 447661 2997605 667 665 0 True 669 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 271 495 0.0101916540013353 0.0571007973125765 0.0102388036926833 0.0573281452658885 0.00147180627656847 0.0152131389992981 445496 2488497 667 665 0 True 267 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 315 495 0.0104587440772633 0.0548561837186236 0.010452429999237 0.0550850690470741 0.00149761927089278 0.00588162802488979 457171 2390675 667 665 0 True 312 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 359 495 0.0104653326804211 0.0720273102073104 0.010605020218204 0.0669108110170138 0.00158993466787472 0.0207134468685469 457459 3139006 667 665 0 True 356 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 403 494 0.0108949187571469 0.0897828457616919 0.0109254596780346 0.0834515907530327 0.00173108975821099 0.0220393879771549 476237 3912806 667 665 0 True 401 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 447 494 0.0107904848216771 0.0987601757885214 0.0108033875028611 0.0923170824750134 0.00196600334590577 0.0301044202611785 471672 4304045 667 665 0 True 445 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 491 493 0.0106588957752756 0.0459864928973842 0.0106813153276875 0.0470893415732052 0.00180235374221651 0.00847710149609247 465920 2004127 667 665 0 True 490 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 535 492 0.0104566165074936 0.0394276834223347 0.0105592431525139 0.0410772869459068 0.00185654667309978 0.00659451668646744 457078 1718289 667 665 0 True 535 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 580 493 0.0105023935731837 0.099876723165203 0.0103913939116503 0.0959945067521172 0.00181580013169591 0.017284461777198 459079 4352705 667 665 0 True 579 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 624 493 0.0103241581315087 0.0620475427525096 0.0102998397802701 0.0653391317616541 0.00188599646535324 0.0144857022834344 451288 2704080 667 665 0 True 624 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 668 492 0.0101810390295811 0.0787799207333968 0.0102845807583734 0.0757915617608911 0.00191775140742967 0.0151095308919046 445032 3433290 667 665 0 True 669 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 271 539 0.0100735395634753 0.0564876370372028 0.010101472495613 0.058960860608835 0.00145562125643134 0.0127754029617165 440333 2461775 667 665 0 True 267 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 315 538 0.0103513589966289 0.101960233612183 0.0103913939116503 0.094895857175555 0.00149140951813005 0.0271001204545065 452477 4443506 667 665 0 True 312 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 359 539 0.0107503583982785 0.0570735375862407 0.010757610437171 0.0596169985503929 0.00146624431600613 0.0109155438534841 469918 2487309 667 665 0 True 356 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 404 538 0.0107178958014698 0.0602255696462488 0.0106813153276875 0.0585946440833143 0.00180751469746019 0.00927651426692233 468499 2624677 667 665 0 True 401 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 448 538 0.0107932987042757 0.0560001743888217 0.0108339055466545 0.0560311284046693 0.00199783682309911 0.00718622357973925 471795 2440531 667 665 0 True 446 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 492 537 0.0107240726169303 0.0659952926491096 0.0106813153276875 0.0631723506523232 0.00207095161192457 0.0148208438976453 468769 2876126 667 665 0 True 490 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 536 536 0.0103636211191726 0.0739897351527136 0.0102998397802701 0.0717936980239567 0.00189861006312327 0.0182618235743498 453013 3224530 667 665 0 True 535 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 581 536 0.0103524570971552 0.0583421703721423 0.01025406271458 0.0592050049591821 0.0017287213154979 0.0126235393977435 452525 2542597 667 665 0 True 579 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 626 536 0.0104045482408716 0.0500245578468946 0.0103303578240635 0.049759670405127 0.00187151897061194 0.00694182938475016 454802 2180109 667 665 0 True 624 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 669 535 0.0101900526047345 0.071949615398074 0.0102082856488899 0.0702830548561837 0.00186612920303836 0.016835666410993 445426 3135620 667 665 0 True 669 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 272 583 0.0103268118744473 0.0460935584555346 0.0102845807583734 0.0476691844052796 0.00133750005006362 0.00790784900343007 451404 2008793 667 665 0 True 267 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 316 582 0.010557024074367 0.056250284672542 0.0105439841306172 0.0552681773098344 0.00144588391542523 0.0130063176263911 461467 2451431 667 665 0 True 312 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 360 581 0.0106604742947821 0.043885107596182 0.0106202792401007 0.0448004882887007 0.00136472742130102 0.00732772946544098 465989 1912547 667 665 0 True 356 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 405 581 0.0105844765875245 0.0477185869227888 0.0105745021744106 0.0472571908140688 0.0015708779083873 0.00567770468788341 462667 2079613 667 665 0 True 401 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 449 581 0.0107010811371609 0.0868371202669067 0.0106507972838941 0.0794537270160983 0.00197116228373989 0.0254072780248243 467764 3784429 667 665 0 True 446 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 492 579 0.010605248989147 0.0609407932740985 0.0106660563057908 0.0594338902876326 0.00207427297308215 0.0131197164000422 463575 2655847 667 665 0 True 490 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 537 579 0.0105510989069439 0.0521393435522888 0.0105134660868238 0.0520790417334249 0.00205947061500889 0.00604088453447946 461208 2272273 667 665 0 True 535 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 580 578 0.0103958320679441 0.0377271170602175 0.0103456168459602 0.0388952468146792 0.00177085805441784 0.00803329977212 454421 1644177 667 665 0 True 580 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 625 579 0.0103770042193369 0.0469978562795177 0.0103303578240635 0.0468299382009613 0.00173373373245032 0.00602780409014807 453598 2048203 667 665 0 True 624 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 669 578 0.0101595803151297 0.0527631048323487 0.0101777676050965 0.0520180056458381 0.00178816100253259 0.00700328005312849 444094 2299457 667 665 0 True 669 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 267 621 0.0102115799504688 0.0100652638692176 0.010101472495613 0.0101167315175097 0.00180150762067252 0.00150372903317104 446367 438652 667 665 0 False 267 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 312 621 0.010330472209535 0.0103474984095625 0.0103761348897536 0.0102693217364767 0.00153400194203039 0.00145773478499706 451564 450952 667 665 0 False 312 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 360 625 0.0104578061163971 0.0677904190551912 0.0105134660868238 0.0653849088273442 0.001476586643143 0.00885570625958142 457130 2954359 667 665 0 True 356 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 405 625 0.010655395579848 0.073539261291246 0.0106355382619974 0.0720225833524071 0.00156333912965929 0.019460592352722 465767 3204898 667 665 0 True 401 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 446 621 0.0104235819833274 0.0104756971393923 0.0104982070649271 0.010452429999237 0.0018241896544173 0.00187321398940478 455634 456539 667 665 0 False 446 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 490 621 0.0101572468515113 0.0102603269446218 0.0100862134737163 0.0102235446707866 0.00191808579309962 0.00198132859047808 443992 447153 667 665 0 False 490 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 535 621 0.0100590583627847 0.00995998809107915 0.0100556954299229 0.00996414129854276 0.00182746854100684 0.0019700610364838 439700 434064 667 665 0 False 535 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 580 621 0.010098018054374 0.010118613081112 0.0101930266269932 0.0101625085831998 0.00160766385821644 0.00170265736984515 441403 440977 667 665 0 False 580 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 624 621 0.0100988416297688 0.0102820796555362 0.0100556954299229 0.0101167315175097 0.00163815511018984 0.00204276489777756 441439 448101 667 665 0 False 624 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 669 620 0.0100997567135407 0.00980643414441345 0.0100556954299229 0.00973525597009232 0.00158513464359175 0.00144356469390122 441479 427372 667 665 0 False 669 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 269 671 0.00986792023992581 0.0399000247242047 0.00971999694819562 0.0404211490043488 0.00164282380023247 0.00792830874900075 431345 1738874 667 665 0 True 267 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 312 665 0.0095277607248104 0.00966483501039162 0.00950637064164187 0.00975051499198901 0.00133673633241934 0.00131147646196965 416476 421201 667 665 0 False 312 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 356 665 0.00967705664219847 0.00966472028090368 0.00967421988250553 0.00964370183871214 0.0013433310344346 0.00126783219301297 423002 421196 667 665 0 False 356 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 401 664 0.0101390824386388 0.00987169227715661 0.0101625085831998 0.00984206912336919 0.00151588988649898 0.00133377493679741 443198 430216 667 665 0 False 401 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 446 664 0.010054162664605 0.0102131731250764 0.0100556954299229 0.0102082856488899 0.00168502796919677 0.00151801604648002 439486 445098 667 665 0 False 446 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 490 664 0.00985812884356631 0.0102813224409157 0.00987258716716258 0.01025406271458 0.00168230928850633 0.00163321414468517 430917 448068 667 665 0 False 490 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 535 664 0.0101315787517091 0.0100727671777292 0.0100862134737163 0.0100862134737163 0.00180397522812685 0.00174228561731236 442870 438979 667 665 0 False 535 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 580 664 0.00997837085119605 0.0101512880392788 0.0100404364080262 0.0101167315175097 0.00154773048683175 0.00129861323985436 436173 442401 667 665 0 False 580 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 624 664 0.00988484928970626 0.0101282274122018 0.00999465934233616 0.0101472495613031 0.00132372846752676 0.00144126829431369 432085 441396 667 665 0 False 624 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 665 668 0.00999408741497871 0.0406582489641361 0.00997940032043946 0.04101625085832 0.00145387772992471 0.0082955578379308 436860 1771918 667 665 0 True 669 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D7_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D7_2.csv new file mode 100755 index 0000000..4c90a18 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D7_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 267 275 0.00834256710051932 0.732283971544792 0.00822461280231937 0.752910658426795 0.00176552919811631 0.198022322691849 364669 31913503 667 665 12 True 267 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 311 273 0.00685580761919338 0.00667344717940422 0.00679026474402991 0.00672922865644312 0.0014308422173713 0.00129269030132019 299680 290834 667 665 0 False 311 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 355 274 0.00637369573395952 0.00627056310953626 0.00642404821850919 0.00624093995574884 0.00128966526753738 0.00118386622793745 278606 273276 667 665 0 True 356 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 400 274 0.00652113860670946 0.00657916248621095 0.00646982528419928 0.00654612039368277 0.00127032030690955 0.00138346342460788 285051 286725 667 665 0 True 400 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 444 274 0.00650569656805838 0.00670972464349246 0.00646982528419928 0.00672922865644312 0.00157220277677538 0.0016955390820249 284376 292415 667 665 0 True 445 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 488 272 0.00665862994343982 0.00679407376302968 0.00665293354695964 0.0068055237659266 0.00157759850080236 0.00170249950140533 291061 296091 667 665 0 True 490 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 532 272 0.00694452499088062 0.00698493773917513 0.00691233691920348 0.00698863202868696 0.00144035859140557 0.00156589661261143 303558 304409 667 665 0 True 534 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 577 272 0.00720385973184156 0.0073368360246003 0.00718699931334401 0.0072632944228275 0.00177950055988552 0.00184257632760231 314894 319745 667 665 0 True 579 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 624 273 0.00886585775548939 0.00779942531999488 0.00816357671473259 0.00784313725490196 0.00424329771565871 0.00187442704739824 387543 339905 667 665 0 False 624 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 662 271 0.00934975405407848 0.732322222356073 0.00915541313801785 0.754222934309911 0.00239562553254786 0.22075684963922 408695 31915170 667 665 14 True 668 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 267 317 0.00688184175250438 0.00672390520820247 0.00689707789730678 0.0068055237659266 0.00147861281205544 0.00136004855706523 300818 293033 667 665 0 False 267 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 311 317 0.00657599787883582 0.00646301035261534 0.00659189745937285 0.00646982528419928 0.00126426644694828 0.00114477710322146 287449 281663 667 665 0 False 311 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 356 318 0.00658132824180723 0.00682344451194363 0.00653086137178607 0.0068207827878233 0.00127483708061901 0.00132026313120601 287682 297371 667 665 0 True 356 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 400 319 0.00649935961293787 0.00687915715128976 0.00646982528419928 0.00691233691920348 0.00133650858278418 0.0012951748556459 284099 299799 667 665 0 True 400 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 444 318 0.00682316200563028 0.00691949603925125 0.00686655985351339 0.00692759594110018 0.00168255792159936 0.0015965220826136 298253 301557 667 665 0 True 445 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 489 317 0.00697316711294158 0.00707282052694107 0.00698863202868696 0.00703440909437705 0.00171397195908632 0.00171719544988919 304810 308239 667 665 0 True 490 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 533 315 0.00679596114051008 0.00710258135611402 0.0068207827878233 0.00703440909437705 0.00152332749338307 0.00166185717449321 297064 309536 667 665 0 True 534 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 576 316 0.00723115210533895 0.00713420080299169 0.00721751735713741 0.00709544518196384 0.0018559998693812 0.00174146505781744 316087 310914 667 665 0 True 579 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 624 316 0.00746772413747349 0.00748297844634475 0.00741588464179446 0.00761425192645151 0.00197981586522877 0.00197852887241552 326428 326114 667 665 0 False 624 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 668 316 0.00781053739552746 0.00742806891341423 0.00770580605783169 0.00756847486076143 0.00213920243181245 0.00177958423860823 341413 323721 667 665 0 False 668 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 268 363 0.0064022692247376 0.0062840552973186 0.00645456626230259 0.00628671702143893 0.00137802510825703 0.00158273336059297 279855 273864 667 665 0 True 267 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 313 362 0.00635422732671202 0.00658664284882497 0.00634775310902571 0.00662241550316625 0.00127972601296025 0.00130359579076462 277755 287051 667 665 0 True 311 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 356 363 0.00674313792977624 0.00714305791946105 0.00668345159075303 0.00714122224765393 0.00134211495301154 0.00137322482145039 294755 311300 667 665 0 True 356 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 401 362 0.00722920755232363 0.00694310736787035 0.00727855344472419 0.00701915007248035 0.0014037538608304 0.00140220375699775 316002 302586 667 665 0 True 401 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 445 362 0.00697865761557308 0.00730762589696948 0.00692759594110018 0.00730907148851759 0.00162185429026864 0.00178277344481048 305050 318472 667 665 0 True 445 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 490 361 0.007092539790988 0.00725400133430395 0.00708018616006714 0.00729381246662089 0.00166832925211292 0.00178378021873453 310028 316135 667 665 0 True 490 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 534 361 0.00703472937369722 0.00732733642299844 0.00700389105058366 0.00741588464179446 0.00165136280307693 0.00168143099910013 307501 319331 667 665 0 True 534 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 578 360 0.00727798151736675 0.0073635679952915 0.00715648126955062 0.00730907148851759 0.00198430767788468 0.00199465022514267 318134 320910 667 665 0 True 579 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 621 360 0.00695484256040897 0.00718445231871163 0.00708018616006714 0.0072632944228275 0.00195236773844388 0.00187629169378576 304009 313104 667 665 0 True 624 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 668 360 0.00678838882229748 0.0065867805242105 0.00674448767833982 0.00666819256885634 0.00187301211114174 0.00195793838291688 296733 287057 667 665 0 False 668 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 269 407 0.00631760109874108 0.00652601978739479 0.0063782711528191 0.00645456626230259 0.00139258635366699 0.00150052479678184 276154 284409 667 665 0 True 267 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 314 408 0.00666908477553395 0.00663967081815319 0.00669871061264973 0.00659189745937285 0.00137518035818111 0.00152094189995947 291518 289362 667 665 0 True 311 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 357 407 0.00719868950853024 0.00708801071114499 0.0072632944228275 0.00703440909437705 0.00140744063776605 0.00131865562922956 314668 308901 667 665 0 True 356 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 401 406 0.00712486512523093 0.00738619265031427 0.00717174029144732 0.00749217975127794 0.00142332402536308 0.00146321666022598 311441 321896 667 665 0 True 401 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 445 406 0.00723440065272925 0.00726125223794207 0.00715648126955062 0.00720225833524071 0.00158670194832465 0.00158223347127897 316229 316451 667 665 0 True 445 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 490 405 0.00709903688576861 0.00732850666377548 0.00703440909437705 0.00727855344472419 0.00165320576810109 0.00174355167304184 310312 319382 667 665 0 True 490 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 533 404 0.00711459330989118 0.00732981457993806 0.00704966811627375 0.00737010757610437 0.00152368248895707 0.00159169805051228 310992 319439 667 665 0 True 535 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 579 405 0.007086088450396 0.00709246221527726 0.00711070420386053 0.00711070420386053 0.00174145995683667 0.00187400099321407 309746 309095 667 665 0 True 579 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 622 404 0.00655783346596329 0.00665031771463449 0.00663767452506294 0.00654612039368277 0.00177676880948555 0.00190993324971295 286655 289826 667 665 0 True 624 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 666 404 0.00615062118746075 0.00643132206804491 0.00622568093385214 0.0063935301747158 0.00179075242586604 0.00198156775747936 268855 280282 667 665 0 True 668 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 269 451 0.00655453916438439 0.00654791017369471 0.00656137941557946 0.00656137941557946 0.00151593191737875 0.00162987249302306 286511 285363 667 665 0 True 267 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 313 451 0.0069131604945982 0.00657512400823528 0.00671396963454643 0.00657663843747616 0.00215350215880677 0.00153095196440363 302187 286549 667 665 0 True 311 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 358 451 0.00692103021503668 0.00686892328096506 0.00665293354695964 0.0068207827878233 0.00235790952024188 0.00128696350547803 302531 299353 667 665 0 True 356 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 401 450 0.00713312375627247 0.00709643185556016 0.00712596322575723 0.00711070420386053 0.00157167715865488 0.00154549657070085 311802 309268 667 665 0 True 401 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 446 450 0.00714049018063639 0.00712979519065459 0.0072480354009308 0.00701915007248035 0.00181924075290697 0.00186150089748294 312124 310722 667 665 0 True 445 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 490 449 0.00709512490264367 0.00720946334708366 0.00704966811627375 0.00718699931334401 0.00181943581507375 0.00190551772926562 310141 314194 667 665 0 True 490 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 534 448 0.00694177973956487 0.00692126287336561 0.00691233691920348 0.00701915007248035 0.00174094907419349 0.00172593483158654 303438 301634 667 665 0 True 535 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 579 449 0.0065044612049663 0.00664754126102622 0.00650034332799268 0.00663767452506294 0.00185751764141608 0.00193074723083884 284322 289705 667 665 0 True 579 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 624 449 0.00615064406455504 0.00636468718144641 0.00610360875867857 0.00633249408712902 0.0017757592046799 0.00181759959677903 268856 277378 667 665 0 True 624 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 667 448 0.00621067355999272 0.00691674253154057 0.00611886778057527 0.00645456626230259 0.00184983323247115 0.00381999696426171 271480 301437 667 665 0 True 669 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 271 495 0.0067142212825837 0.00656447711175398 0.00674448767833982 0.00654612039368277 0.00151367144206969 0.00149008662205534 293491 286085 667 665 0 True 267 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 315 495 0.00653351511472462 0.00674340922115313 0.00659189745937285 0.00665293354695964 0.00141778109701106 0.00148382692892268 285592 293883 667 665 0 True 312 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 359 495 0.00680961876580593 0.00702293614558254 0.0068207827878233 0.00703440909437705 0.00149258666756097 0.00147172735637498 297661 306065 667 665 0 True 356 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 403 494 0.00686463817759237 0.00710269608560197 0.00686655985351339 0.00718699931334401 0.00159931201533736 0.00168237909906499 300066 309541 667 665 0 True 401 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 447 494 0.00696063046526634 0.00731095305211989 0.00698863202868696 0.00733958953231098 0.00179598507244457 0.00197694109048424 304262 318617 667 665 0 True 445 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 491 493 0.00686683437864496 0.00657555998028947 0.00692759594110018 0.00662241550316625 0.0017258402718869 0.00173228219276142 300162 286568 667 665 0 True 490 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 535 492 0.00639975274436483 0.00640520963658861 0.0064087891966125 0.0064087891966125 0.00164882579551223 0.00154759833768152 279745 279144 667 665 0 True 535 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 580 493 0.00652143600893534 0.00651970966555781 0.00656137941557946 0.00645456626230259 0.00178776311030763 0.00190920425712554 285064 284134 667 665 0 True 579 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 624 493 0.00618772783441193 0.00631064959262427 0.00622568093385214 0.00628671702143893 0.0018186882537041 0.00180738963661951 270477 275023 667 665 0 True 624 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 668 492 0.00638060461643749 0.00620344635908838 0.00642404821850919 0.00628671702143893 0.00183604598776036 0.00184440312847821 278908 270351 667 665 0 True 669 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 271 539 0.00667555899322026 0.00656241198097097 0.00672922865644312 0.00657663843747616 0.00146182918346692 0.0013602461147681 291801 285995 667 665 0 True 267 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 315 538 0.00667491843457992 0.00682390342989541 0.00663767452506294 0.00683604180972 0.00148544420902069 0.00132167964854103 291773 297391 667 665 0 True 312 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 359 539 0.006793650553986 0.0070090309316436 0.0068207827878233 0.00692759594110018 0.00140819563101382 0.00141393802380478 296963 305459 667 665 0 True 356 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 404 538 0.00680209220178192 0.00674529078475543 0.00674448767833982 0.00672922865644312 0.00154299269939204 0.00153185458091635 297332 293965 667 665 0 True 401 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 448 538 0.00662285016795791 0.00679584059714404 0.00665293354695964 0.00689707789730678 0.00189700961044882 0.00192830262184942 289497 296168 667 665 0 True 446 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 492 537 0.00675864859971022 0.00707789157030824 0.00674448767833982 0.00698863202868696 0.0018584477642017 0.00198112465320407 295433 308460 667 665 0 True 490 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 536 536 0.00688229929439034 0.00676362455692906 0.00694285496299687 0.0068055237659266 0.00178548068421062 0.00206545381864747 300838 294764 667 665 0 True 535 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 581 536 0.00659107388397813 0.006478774184259 0.00672922865644312 0.00653086137178607 0.00168024866456546 0.00158188691463617 288108 282350 667 665 0 True 579 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 626 536 0.00644035958674359 0.00644573209173081 0.00642404821850919 0.00645456626230259 0.00170695567396728 0.00179993697270155 281520 280910 667 665 0 True 624 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 669 535 0.00643612732429848 0.00635615130754329 0.0063935301747158 0.00631723506523232 0.00172010577942176 0.00175281501394994 281335 277006 667 665 0 True 669 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 272 583 0.00699915549206399 0.00693291938934083 0.00700389105058366 0.00692759594110018 0.00138099431391461 0.00132712366951316 305946 302142 667 665 0 True 267 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 316 582 0.00709096127148145 0.00693879353912362 0.00712596322575723 0.00700389105058366 0.00145972335999615 0.00139024262744197 309959 302398 667 665 0 True 312 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 360 581 0.00688859049532226 0.00683058068609381 0.00688181887541009 0.00677500572213321 0.00138340998785129 0.00132642351825999 301113 297682 667 665 0 True 356 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 405 581 0.00678909801222072 0.00680359631052913 0.00685130083161669 0.0068055237659266 0.00148411593594418 0.00141545057940843 296764 296506 667 665 0 True 401 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 449 581 0.00672799329335104 0.00892287941185075 0.00669871061264973 0.00698863202868696 0.00179417048521493 0.0128124948276146 294093 388866 667 665 0 True 446 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 492 579 0.00687008292603527 0.0069331947401119 0.00692759594110018 0.00697337300679027 0.00190810046544267 0.00205857657997166 300304 302154 667 665 0 True 490 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 537 579 0.00686122949054198 0.00696453883621849 0.00691233691920348 0.00711070420386053 0.00180836232114579 0.00174819936595873 299917 303520 667 665 0 True 535 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 580 578 0.00683567577621123 0.00794074910324564 0.00683604180972 0.00711070420386053 0.00169315225550026 0.00496701143750017 298800 346064 667 665 0 True 580 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 625 579 0.00657217740408807 0.00669809107341483 0.00663767452506294 0.00668345159075303 0.00154673145644726 0.00146027353620239 287282 291908 667 665 0 True 624 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 669 578 0.00639513157131665 0.00640094169963705 0.00643930724040589 0.00651560234988937 0.00166221049270385 0.00167010161871703 279543 278958 667 665 0 True 669 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 267 621 0.00743592497639942 0.00732694634273943 0.00740062561989776 0.00730907148851759 0.00144226281006927 0.00152171506640125 325038 319314 667 665 0 False 267 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 312 621 0.0072241059602952 0.00746455289058077 0.00718699931334401 0.00743114366369116 0.00150952346741926 0.00144127006425466 315779 325311 667 665 0 False 312 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 360 625 0.00693903448824912 0.00760920382898193 0.00689707789730678 0.00761425192645151 0.00142878582861057 0.00141927335869226 303318 331615 667 665 0 True 356 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 405 625 0.00713989537618465 0.00699179856255425 0.00717174029144732 0.00698863202868696 0.00145847576400556 0.00137638727565327 312098 304708 667 665 0 True 401 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 446 621 0.00683784910016953 0.00671284528556456 0.00694285496299687 0.00671396963454643 0.00178555334502197 0.00193192755809431 298895 292551 667 665 0 False 446 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 490 621 0.00673085293013827 0.0069319327157445 0.00662241550316625 0.00701915007248035 0.00193188676119502 0.00189263708122335 294218 302099 667 665 0 False 490 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 535 621 0.00664723715047946 0.00679113668813829 0.00662241550316625 0.00689707789730678 0.0019089681343098 0.00189892508983755 290563 295963 667 665 0 False 535 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 580 621 0.00666132944056697 0.00675901243151367 0.00669871061264973 0.0068055237659266 0.0015987528891173 0.00165076698537283 291179 294563 667 665 0 False 580 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 624 621 0.00678918952059791 0.00695926127977302 0.00671396963454643 0.00689707789730678 0.00140734987883632 0.00169025541977851 296768 303290 667 665 0 False 624 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 669 620 0.00682792044124424 0.00676564379591689 0.00689707789730678 0.00672922865644312 0.00151796010485341 0.00154416132765455 298461 294852 667 665 0 False 669 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 269 671 0.00852043650868546 0.747582230926366 0.00845349813076982 0.752208743419547 0.00166615459842508 0.178214396726392 372444 32580213 667 665 12 True 267 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 312 665 0.00694999261641781 0.0069553375312853 0.00679026474402991 0.00698863202868696 0.00159869666276149 0.00131648410802967 303797 303119 667 665 0 False 312 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 356 665 0.00666711734542434 0.0064046130432513 0.00663767452506294 0.00645456626230259 0.0012984928976651 0.00126984935072284 291432 279118 667 665 0 False 356 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 401 664 0.00663746863121426 0.00659231048552946 0.00663767452506294 0.00656137941557946 0.00151455907362821 0.00131604873010504 290136 287298 667 665 0 False 401 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 446 664 0.00661738254242071 0.00686499953247734 0.00663767452506294 0.00688181887541009 0.0017127846246587 0.00169223881131952 289258 299182 667 665 0 False 446 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 490 664 0.00672916002516023 0.00716205712266475 0.00674448767833982 0.00718699931334401 0.00170013591420464 0.00151631512961427 294144 312128 667 665 0 False 490 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 535 664 0.0066914128195687 0.00688392989798828 0.00671396963454643 0.00694285496299687 0.00180536300359889 0.00175652259451576 292494 300007 667 665 0 False 535 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 580 664 0.0067501154435371 0.00685175974956847 0.00677500572213321 0.00692759594110018 0.00144650189389318 0.00135681800094846 295060 298605 667 665 0 False 580 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 624 664 0.00744512156830717 0.00698021088427179 0.00727855344472419 0.00689707789730678 0.00197285657020233 0.00146024554937384 325440 304203 667 665 0 False 624 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 665 668 0.00839587073023342 0.760273079127207 0.00836194399938964 0.767177843900206 0.00170068227366751 0.185139029559001 366999 33133290 667 665 15 True 669 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D7_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D7_3.csv new file mode 100755 index 0000000..346c43e --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D7_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 267 275 0.00101395857347133 0.075371881293988 0.000823987182421607 0.0750286106660563 0.000791261301840622 0.0236553405513432 44322 3284765 667 665 0 True 267 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 311 273 0.000944435083900028 0.00103763643487295 0.00080872816052491 0.000976577401388571 0.000694288687088623 0.000680525005212538 41283 45221 667 665 0 False 311 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 355 274 0.000930365670906822 0.000870154328370709 0.000839246204318303 0.000762951094834821 0.000676951953873978 0.000656034294066427 40668 37922 667 665 0 True 356 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 400 274 0.000911492068111058 0.000974558162400737 0.000762951094834821 0.000869764248111696 0.000675800409824425 0.000713326705063006 39843 42472 667 665 0 True 400 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 444 274 0.000906390476082627 0.000959574491275109 0.000686655985351339 0.000656137941557946 0.000825800552260544 0.000897132086820722 39620 41819 667 665 0 True 445 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 488 272 0.000923525419711751 0.000980386420388348 0.000717174029144732 0.000762951094834821 0.000821436758411358 0.000867256220680548 40369 42726 667 665 0 True 490 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 532 272 0.000863861957782839 0.000974787621376628 0.000686655985351339 0.000732433051041428 0.000722448298247257 0.000897309165700947 37761 42482 667 665 0 True 534 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 577 272 0.00092016248684996 0.00101609023703686 0.000671396963454643 0.000656137941557946 0.000862112482238737 0.000981669039315492 40222 44282 667 665 0 True 579 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 624 273 0.00119601448989399 0.00102717310557235 0.000900282291905089 0.00064087891966125 0.00110937193212851 0.00101024760414578 52280 44765 667 665 0 False 624 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 662 271 0.00118228823331525 0.076233866882817 0.000900282291905089 0.0764934767681392 0.00102331647699669 0.0265460627355942 51680 3322331 667 665 0 True 668 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 267 317 0.00096006013930549 0.000920543519476191 0.000778210116731518 0.000747692072938125 0.000757057258586228 0.000727099874914817 41966 40118 667 665 0 False 267 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 311 317 0.00094082050300096 0.000962052648214723 0.000854505226215 0.000869764248111696 0.000686603462061441 0.00064273116210861 41125 41927 667 665 0 False 311 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 356 318 0.00100222262409651 0.000916780392271592 0.000885023270008392 0.000778210116731518 0.000673496030082002 0.000697447192586082 43809 39954 667 665 0 True 356 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 400 319 0.000956445558406423 0.000919533899982274 0.000823987182421607 0.000778210116731518 0.000744251655144254 0.000710240996938648 41808 40074 667 665 0 True 400 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 444 318 0.000973672010412738 0.00098291046912314 0.000686655985351339 0.000732433051041428 0.000901538844521047 0.000934621906945536 42561 42836 667 665 0 True 445 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 489 317 0.000832291567651743 0.000957188117925851 0.000579842832074464 0.00080872816052491 0.000853160843105425 0.000847394222338401 36381 41715 667 665 0 True 490 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 533 315 0.000915884470216254 0.0010272878350603 0.000778210116731518 0.000839246204318303 0.00078331462919198 0.000880823997700445 40035 44770 667 665 0 True 534 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 576 316 0.000950634776454757 0.000978068884731857 0.000686655985351339 0.000671396963454643 0.00093999075273589 0.000950713080297392 41554 42625 667 665 0 True 579 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 624 316 0.00103919200848191 0.000913063156862171 0.000656137941557946 0.000473029678797589 0.00106630042677773 0.00101357221202383 45425 39792 667 665 0 False 624 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 668 316 0.000983211758734961 0.00100108362001364 0.000518806744487678 0.000534065766384375 0.00101560820603651 0.00105519741886909 42978 43628 667 665 0 False 668 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 268 363 0.000879029471302344 0.000996081414339236 0.000732433051041428 0.000885023270008392 0.000756471111672609 0.000761979298578363 38424 43410 667 665 0 True 267 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 313 362 0.000939127598022916 0.000961983810521956 0.000793469138628214 0.000823987182421607 0.000711868421323355 0.000706936596160493 41051 41924 667 665 0 True 311 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 356 363 0.000928672765928778 0.000994704660483894 0.00080872816052491 0.000869764248111696 0.000672404887349449 0.000755166104504882 40594 43350 667 665 0 True 356 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 401 362 0.000985019049184495 0.0010337585781804 0.000793469138628214 0.000900282291905089 0.000791407711656661 0.000759990736310638 43057 45052 667 665 0 True 401 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 445 362 0.000974312569053079 0.000878644310478646 0.000701915007248035 0.000534065766384375 0.000912544524851137 0.00088175888943414 42589 38292 667 665 0 True 445 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 490 361 0.000898520755644151 0.00096655004414217 0.000579842832074464 0.000671396963454643 0.000898458246859675 0.000918042790859666 39276 42123 667 665 0 True 490 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 534 361 0.000984103965412579 0.000981556661165388 0.000732433051041428 0.000701915007248035 0.000880627984340998 0.000933533878262611 43017 42777 667 665 0 True 534 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 578 360 0.00103626374041178 0.000937500537794475 0.000747692072938125 0.000534065766384375 0.00103290286217956 0.00103311779013782 45297 40857 667 665 0 True 579 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 621 360 0.00104701597473179 0.000991744639694911 0.000595101853971161 0.000595101853971161 0.00115782024431576 0.00108757590992346 45767 43221 667 665 0 True 624 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 668 360 0.000938898827079937 0.000948331001456491 0.000534065766384375 0.000457770656900893 0.00100726252422247 0.00107066409495831 41041 41329 667 665 0 False 668 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 269 407 0.000971521563548736 0.000903793014236209 0.000823987182421607 0.000717174029144732 0.00082434377083736 0.000787252882022321 42467 39388 667 665 0 True 267 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 314 408 0.000919659190775407 0.000920933599735204 0.000762951094834821 0.000869764248111696 0.00074837537131062 0.000674414336398836 40200 40135 667 665 0 True 311 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 357 407 0.000893899582595976 0.00109107743035777 0.000793469138628214 0.000991836423285267 0.000710054898948303 0.000737801892966854 39074 47550 667 665 0 True 356 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 401 406 0.000937640586893553 0.000931855846987577 0.000762951094834821 0.000732433051041428 0.000781851607123662 0.000790245048048794 40986 40611 667 665 0 True 401 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 445 406 0.00104218890783494 0.000995438929206743 0.000747692072938125 0.000778210116731518 0.000901125834659979 0.000857489524094169 45556 43382 667 665 0 True 445 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 490 405 0.0010316883215522 0.00105016489495655 0.000686655985351339 0.00080872816052491 0.000939404626021042 0.000934208532401556 45097 45767 667 665 0 True 490 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 533 404 0.000893602180370103 0.000987407865050587 0.000656137941557946 0.000778210116731518 0.000813811868171965 0.000877866264737592 39061 43032 667 665 0 True 535 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 579 405 0.00100769024963371 0.000964943831310939 0.000701915007248035 0.000595101853971161 0.000964213236134606 0.00104111870580376 44048 42053 667 665 0 True 579 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 622 404 0.000859835589186409 0.000979330909099253 0.000488288700694286 0.000610360875867857 0.000914745532761794 0.00100914325682886 37585 42680 667 665 0 True 624 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 666 404 0.000922724721411325 0.000835987886860663 0.000488288700694286 0.0004272526131075 0.000991921448505218 0.000948307545316801 40334 36433 667 665 0 True 668 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 269 451 0.000914466090369784 0.000826212934487741 0.000762951094834821 0.000625619897764553 0.000796081557099207 0.000751574332590427 39973 36007 667 665 0 True 267 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 313 451 0.00100592871337277 0.000989610671219133 0.000839246204318303 0.000839246204318303 0.000858056277675799 0.000849783941407878 43971 43128 667 665 0 True 311 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 358 451 0.000989891870269946 0.00102568162222907 0.000869764248111696 0.000930800335698482 0.000763621137887637 0.000779815659449077 43270 44700 667 665 0 True 356 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 401 450 0.000956559943877912 0.00101354324240448 0.000762951094834821 0.000854505226215 0.000804016893253582 0.000861678950073625 41813 44171 667 665 0 True 401 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 446 450 0.000930022514492353 0.000968638120822771 0.000549324788281071 0.000549324788281071 0.000964957893058854 0.00107813401462106 40653 42214 667 665 0 True 445 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 490 449 0.000997441311388252 0.00100055586436909 0.000686655985351339 0.00064087891966125 0.000979422350675113 0.0010348260121295 43600 43605 667 665 0 True 490 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 534 448 0.000956193910369146 0.00090936886735034 0.000701915007248035 0.000579842832074464 0.000945659066486531 0.000915153481643083 41797 39631 667 665 0 True 535 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 579 449 0.000894906174745083 0.000945279197077152 0.000518806744487678 0.000625619897764553 0.000936661520945811 0.00102961746031259 39118 41196 667 665 0 True 579 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 624 449 0.000937320307573382 0.0010214366311751 0.000625619897764553 0.000610360875867857 0.000929715896647216 0.00104928894638524 40972 44515 667 665 0 True 624 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 667 448 0.000863312907519689 0.000998697246664383 0.000442511635004196 0.000549324788281071 0.000956872443138534 0.0010874407819947 37737 43524 667 665 0 True 669 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 271 495 0.000881843353900985 0.000945302142974741 0.000686655985351339 0.000747692072938125 0.000782823231377185 0.000816853133724353 38547 41197 667 665 0 True 267 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 315 495 0.000878228773001917 0.00096469142643746 0.000732433051041428 0.000839246204318303 0.000755373807165281 0.000799221060346945 38389 42042 667 665 0 True 312 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 359 495 0.000988381982046285 0.000942204446800223 0.000854505226215 0.000793469138628214 0.000808321842320664 0.0008144196181518 43204 41062 667 665 0 True 356 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 403 494 0.00106552354401879 0.00100716428287473 0.000823987182421607 0.000747692072938125 0.000933585583090675 0.000881835762056432 46576 43893 667 665 0 True 401 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 447 494 0.00103251189694693 0.00094461376604707 0.000625619897764553 0.000518806744487678 0.00104666903912973 0.00105003237299607 45133 41167 667 665 0 True 445 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 491 493 0.000845811930381799 0.00103121158354802 0.000534065766384375 0.000717174029144732 0.00088900626337182 0.000991830588984997 36972 44941 667 665 0 True 490 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 535 492 0.00098865650717786 0.00100140486257989 0.000701915007248035 0.000747692072938125 0.000935225168050669 0.000933098579358008 43216 43642 667 665 0 True 535 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 580 493 0.000950154357474502 0.000832408326836776 0.00064087891966125 0.000457770656900893 0.000925631505276097 0.000892778721545531 41533 36277 667 665 0 True 579 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 624 493 0.000979025250478446 0.000958473088190836 0.00064087891966125 0.000534065766384375 0.00100237897004467 0.00100494333730145 42795 41771 667 665 0 True 624 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 668 492 0.000911423436828164 0.000923480594367585 0.000549324788281071 0.000442511635004196 0.000978214498189121 0.00104175942186506 39840 40246 667 665 0 True 669 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 271 539 0.000975685194710953 0.000829953115794751 0.000823987182421607 0.000671396963454643 0.000772784068845859 0.000753326618655955 42649 36170 667 665 0 True 267 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 315 538 0.000983577792243727 0.000996264981519948 0.000823987182421607 0.000915541313801785 0.000785275019435589 0.000759395139722459 42994 43418 667 665 0 True 312 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 359 539 0.000984172596695473 0.000964347237973625 0.000823987182421607 0.000793469138628214 0.000778766985194502 0.000763852290128782 43020 42027 667 665 0 True 356 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 404 538 0.00102455066813126 0.000991813477387678 0.00080872816052491 0.000793469138628214 0.000887190820255622 0.000873559351254884 44785 43224 667 665 0 True 401 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 448 538 0.000927734805062564 0.00101189113777807 0.000518806744487678 0.000564583810177768 0.000995781051172247 0.00114045935186468 40553 44099 667 665 0 True 446 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 492 537 0.000878983717113748 0.000978252451912569 0.000473029678797589 0.000534065766384375 0.000978122083002286 0.00105793404607666 38422 42633 667 665 0 True 490 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 536 536 0.000875071733988808 0.000930708552108126 0.000488288700694286 0.000473029678797589 0.000958314663952902 0.00102863757198016 38251 40561 667 665 0 True 535 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 581 536 0.000932516117770824 0.000940024586529267 0.000610360875867857 0.000686655985351339 0.000919280672245618 0.000879114955842824 40762 40967 667 665 0 True 579 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 626 536 0.000930228408341034 0.000907395520157684 0.000656137941557946 0.000518806744487678 0.000902292275283732 0.000973812358484097 40662 39545 667 665 0 True 624 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 669 535 0.000880356342771622 0.00097660034728616 0.000549324788281071 0.000595101853971161 0.000902825928672527 0.00101244276629806 38482 42561 667 665 0 True 669 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 272 583 0.00100917726076307 0.000976416780105448 0.000915541313801785 0.000885023270008392 0.00072789902419347 0.000708195269051563 44113 42553 667 665 0 True 267 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 316 582 0.000997532819765443 0.001013290837531 0.000839246204318303 0.000854505226215 0.000775592577412354 0.000783467077375569 43604 44160 667 665 0 True 312 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 360 581 0.00096886782061018 0.000973961569063423 0.000823987182421607 0.000854505226215 0.000757302587657376 0.000686320244853706 42351 42446 667 665 0 True 356 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 405 581 0.00105772245486321 0.00111700629463336 0.000869764248111696 0.000961318379491875 0.000849958279476585 0.000875442853694839 46235 48680 667 665 0 True 401 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 449 581 0.000976005474031124 0.00109679095885743 0.000564583810177768 0.000518806744487678 0.00103310769456774 0.00150091804890592 42663 47799 667 665 0 True 446 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 492 579 0.00101075578026963 0.00100324053438701 0.000549324788281071 0.000488288700694286 0.00109294434309518 0.00110393855247934 44182 43722 667 665 0 True 490 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 537 579 0.000909776286038716 0.000889061747984059 0.000518806744487678 0.000549324788281071 0.000993765337703434 0.000920144433562046 39768 38746 667 665 0 True 535 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 580 578 0.00103953516489638 0.00099621908972477 0.000762951094834821 0.00064087891966125 0.000943763590074624 0.00105428575154415 45440 43416 667 665 0 True 580 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 625 579 0.000861482739975858 0.000946265870673479 0.000595101853971161 0.000686655985351339 0.000786066318589179 0.000834787000115044 37657 41239 667 665 0 True 624 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 669 578 0.000926590950347669 0.000868616953232245 0.000656137941557946 0.000564583810177768 0.000873323033113341 0.000870839874541974 40503 37855 667 665 0 True 669 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 267 621 0.00107620714705591 0.00102001398552458 0.000946059357595178 0.000900282291905089 0.000748485155990019 0.000729669634676498 47043 44453 667 665 0 False 267 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 312 621 0.000984515753109941 0.000927610855933608 0.000854505226215 0.000823987182421607 0.000757024983387861 0.000693762762388147 43035 40426 667 665 0 False 312 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 360 625 0.0010142788527915 0.000914210451741622 0.000900282291905089 0.000778210116731518 0.000767146697455034 0.000719789471954952 44336 39842 667 665 0 True 356 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 405 625 0.000989274188723903 0.000998766084357151 0.000823987182421607 0.000869764248111696 0.000746949878230742 0.000723154051372898 43243 43527 667 665 0 True 401 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 446 621 0.000928421117891501 0.000998628408971616 0.000564583810177768 0.00064087891966125 0.000967066365230825 0.00102339938356522 40583 43521 667 665 0 False 446 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 490 621 0.000926888352573542 0.000970932710581673 0.000549324788281071 0.000534065766384375 0.000993731328500651 0.00105999424265789 40516 42314 667 665 0 False 490 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 535 621 0.000971430055171545 0.000868938195798491 0.000595101853971161 0.000411993591210803 0.00100697015071232 0.00100618485513245 42463 37869 667 665 0 False 535 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 580 621 0.000923022123637197 0.000928138611578156 0.00064087891966125 0.000625619897764553 0.0008200157835173 0.000874777120737565 40347 40449 667 665 0 False 580 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 624 621 0.000953151256827526 0.00101088151828415 0.000732433051041428 0.000854505226215 0.000787023274900722 0.000788303631694828 41664 44055 667 665 0 False 624 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 669 620 0.000968135753592648 0.000918432496898001 0.000747692072938125 0.000701915007248035 0.000814904668675281 0.000784084841655627 42319 40026 667 665 0 False 669 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 269 671 0.00105470267841588 0.0771618448731121 0.000915541313801785 0.0750743877317464 0.000739793566868812 0.0216854031466323 46103 3362773 667 665 0 True 267 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 312 665 0.00101064139479814 0.000958679601269138 0.000915541313801785 0.000869764248111696 0.000667716396237968 0.000684324833126457 44177 41780 667 665 0 False 312 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 356 665 0.00100055259621277 0.000967330204660197 0.000854505226215 0.000854505226215 0.000700076804790782 0.000645842448422143 43736 42157 667 665 0 False 356 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 401 664 0.00102127924364666 0.000958771384859494 0.000869764248111696 0.00080872816052491 0.000739072037469013 0.000731045056058558 44642 41784 667 665 0 False 401 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 446 664 0.000920070978472769 0.000982520388864126 0.000701915007248035 0.000778210116731518 0.000798217157136653 0.00082171455596961 40218 42819 667 665 0 False 446 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 490 664 0.000937709218176446 0.000924031295909722 0.000610360875867857 0.000686655985351339 0.000892501918676165 0.000850055686783455 40989 40270 667 665 0 False 490 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 535 664 0.000909204358681268 0.000875936694563142 0.000610360875867857 0.000518806744487678 0.000914681868658179 0.000899017665476169 39743 38174 667 665 0 False 535 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 580 664 0.00103425055611357 0.000959207356913685 0.000869764248111696 0.000839246204318303 0.000816058686370772 0.000669407964356171 45209 41803 667 665 0 False 580 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 624 664 0.00102363558435934 0.00108623584596648 0.000885023270008392 0.000930800335698482 0.000695736185563137 0.000774076045803833 44745 47339 667 665 0 False 624 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 665 668 0.00105204893547733 0.0785106965169848 0.000869764248111696 0.0764324406805524 0.000785285341639355 0.0220733003389666 45987 3421557 667 665 0 True 669 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D8_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D8_1.csv new file mode 100755 index 0000000..2ed6e59 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D8_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 237 245 0.0105114986567142 0.0413098895097666 0.010452429999237 0.0416723887998779 0.00181153706062858 0.00815174228296895 459477 1800317 667 665 0 True 238 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 282 244 0.0104026951962334 0.0103378152407799 0.0103608758678569 0.0103913939116503 0.00158883595563185 0.00156647340635411 454721 450530 667 665 0 False 282 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 324 244 0.0107694836491116 0.0611970071665775 0.0106813153276875 0.0612649729152361 0.00145415899643388 0.00798411298694761 470754 2667013 667 665 0 True 327 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 369 243 0.0106916786514044 0.0951790783894963 0.0106965743495842 0.0908979934386206 0.00136560636130359 0.0224124553000965 467353 4147978 667 665 0 True 372 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 413 243 0.0103864524592819 0.0693745579329418 0.0103761348897536 0.0677347981994354 0.0015403466001434 0.0115882469718019 454011 3023397 667 665 0 True 417 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 458 242 0.0102299960113786 0.0665174494946453 0.0102388036926833 0.0695201037613489 0.00170696446216879 0.0180932366716594 447172 2898882 667 665 0 True 461 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 502 241 0.0101764407336272 0.0800602100352736 0.0102693217364767 0.0808422980086976 0.00172939563195641 0.0222716154561378 444831 3489086 667 665 0 True 506 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 546 242 0.0101020444229705 0.0690258261813839 0.0101472495613031 0.0674448767833982 0.0015792706719466 0.0156099602850348 441579 3008199 667 665 0 True 551 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 595 243 0.0101449618518733 0.00996953358447618 0.0101625085831998 0.0100556954299229 0.0019089005613355 0.00204129964966328 443455 434480 667 665 0 False 595 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 633 242 0.00991838710994697 0.0421131336007678 0.00993362325474937 0.0428168154421302 0.0018415359319902 0.00921872108492696 433551 1835323 667 665 0 True 640 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 238 288 0.0103215043885702 0.0103792555318257 0.010406652933547 0.0103456168459602 0.00162767690206193 0.00157390312069068 451172 452336 667 665 0 False 238 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 283 287 0.0106665824789597 0.0104886845174277 0.0107118333714809 0.0105134660868238 0.00139579709045407 0.00152408402255921 466256 457105 667 665 0 False 283 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 326 288 0.010823885379352 0.139721264709037 0.0108033875028611 0.138261997405966 0.00138248837427528 0.034446113606467 473132 6089161 667 665 0 True 327 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 370 288 0.0106731482050231 0.052055476296601 0.0107118333714809 0.0516975661860075 0.00135377886382888 0.00648729569604107 466543 2268618 667 665 0 True 372 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 414 288 0.0107237294605158 0.0788816628433065 0.0107728694590677 0.076050965133135 0.00158761901106833 0.0135946917649545 468754 3437724 667 665 0 True 417 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 458 286 0.0105807933753425 0.0471242422834381 0.0106355382619974 0.0469367513542382 0.00180307656080088 0.0113886209160555 462506 2053711 667 665 0 True 461 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 503 287 0.0105349476783696 0.0452495624504154 0.0106355382619974 0.046845197222858 0.00170604724839441 0.00772019478707356 460502 1972011 667 665 0 True 506 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 547 286 0.0101568350638139 0.0541191155962692 0.0101777676050965 0.0546120393682765 0.00175182619450723 0.0118204863934874 443974 2358553 667 665 0 True 551 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 595 287 0.0101471580529259 0.010061110661754 0.0102388036926833 0.010101472495613 0.00199463464878318 0.00199737735790382 443551 438471 667 665 0 False 595 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 640 287 0.01014670051104 0.0099839206622645 0.00996414129854276 0.0100251773861295 0.00233186478061517 0.00199993419880343 443531 435107 667 665 0 False 640 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 238 334 0.0104192582125051 0.0502082397570947 0.0104829480430304 0.0495765621423667 0.00156885404092256 0.00881445711294104 455445 2188114 667 665 0 True 238 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 282 333 0.0106218120054187 0.0623073820968076 0.0105592431525139 0.0638742656595712 0.00181950033391496 0.0162875501161718 464299 2715404 667 665 0 True 283 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 326 332 0.0103650166219248 0.039145494773785 0.0104219119554437 0.0402075226977951 0.00135379742441856 0.00580873845608777 453074 1705991 667 665 0 True 327 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 370 333 0.0104106564250491 0.0353400323881344 0.0104829480430304 0.0359960326543069 0.00136795451912714 0.00524378232129885 455069 1540146 667 665 0 True 372 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 414 332 0.0106258154969208 0.0702217663637235 0.010605020218204 0.0672617685206378 0.0016936342790547 0.0105716095993521 464474 3060319 667 665 0 True 417 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 459 331 0.0101662375495704 0.0345298356901638 0.0101167315175097 0.0346379797055009 0.00174118119990689 0.00529193178932889 444385 1504837 667 665 0 True 461 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 502 330 0.0102456210667841 0.0296181286358492 0.0103608758678569 0.0301823453116655 0.00161309114216511 0.00384485999677369 447855 1290781 667 665 0 True 506 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 547 330 0.0103223508410592 0.0531175271665086 0.0103761348897536 0.0530251010910201 0.00160844595840892 0.00984608296233827 451209 2314903 667 665 0 True 551 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 591 330 0.0102301561510387 0.0596104819154776 0.0103150988021668 0.0588540474555581 0.00194425336097058 0.0129385263425756 447179 2597871 667 665 0 True 595 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 635 330 0.0100318803747588 0.0631035359054537 0.0100709544518196 0.0629129472800793 0.00196411349091563 0.0162037933828329 438512 2750101 667 665 0 True 640 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 238 377 0.0102648607030886 0.0413738167804496 0.0102693217364767 0.0435034714274815 0.00163913428775734 0.00863583761645154 448696 1803103 667 665 0 True 238 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 282 377 0.0103726575714203 0.0319953695178665 0.0103456168459602 0.0319981689173724 0.00148659092194753 0.00426846882936464 453408 1394383 667 665 0 True 283 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 326 376 0.0105786886826671 0.0796295155375277 0.0105592431525139 0.0778515297169451 0.00155542529920061 0.0156475252678918 462414 3470316 667 665 0 True 327 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 371 376 0.0102472453404792 0.0666855511403824 0.0102693217364767 0.0641336690318151 0.00144626435761119 0.0150862850315299 447926 2906208 667 665 0 True 372 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 414 376 0.0103575358120894 0.0470556340496469 0.0103608758678569 0.0470435645075151 0.00170735944454436 0.00963644479072668 452747 2050721 667 665 0 True 417 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 459 375 0.0103539441082846 0.0578302015051362 0.0103608758678569 0.0587014572365911 0.00178974975774647 0.012326311629061 452590 2520285 667 665 0 True 461 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 503 374 0.0102636253399965 0.0431376679281174 0.0102998397802701 0.0442359044785229 0.00188949784587834 0.00594453395302524 448642 1879973 667 665 0 True 506 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 547 374 0.010147775734472 0.0546193591096074 0.0100556954299229 0.0538948653391318 0.00176380569174175 0.00918638665756251 443578 2380354 667 665 0 True 551 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 592 374 0.0102432189718828 0.0424302000136528 0.0102388036926833 0.0428015564202335 0.00195105355115876 0.00632087738443101 447750 1849141 667 665 0 True 596 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 636 374 0.0101148784728716 0.089992158239499 0.0101777676050965 0.0879224841687648 0.00201618481754529 0.0155461575903569 442140 3921928 667 665 0 True 640 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 239 421 0.0101273007350754 0.0406253445469935 0.0100709544518196 0.0408331425955596 0.001555449672236 0.0063699675940607 442683 1770484 667 665 0 True 238 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 283 421 0.0105506184879636 0.056681919952089 0.0105134660868238 0.0556954299229419 0.0019903803253928 0.00986279310617988 461187 2470242 667 665 0 True 283 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 327 421 0.0104607801386558 0.0357320859943404 0.0104371709773404 0.0359502555886168 0.00148462016415568 0.00403984966398357 457260 1557232 667 665 0 True 327 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 371 420 0.0106912668637071 0.0499480791702304 0.0106355382619974 0.0518043793392844 0.00170413714841056 0.00830303533883124 467335 2176776 667 665 0 True 372 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 415 421 0.0104086432407509 0.102635967350282 0.0103761348897536 0.102891584649424 0.00157759889989233 0.017011243633956 454981 4472955 667 665 0 True 417 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 460 418 0.0105305323991701 0.0637098353574483 0.0104982070649271 0.0624704356450752 0.00168624912521701 0.015663287971684 460309 2776524 667 665 0 True 462 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 503 418 0.0105587398564394 0.054410069577698 0.0105745021744106 0.0542153047989624 0.00174462015559703 0.0113541008329466 461542 2371233 667 665 0 True 506 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 547 418 0.010488827456265 0.0337116308739347 0.0104676890211337 0.034332799267567 0.00160286092165553 0.0050778796556389 458486 1469179 667 665 0 True 551 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 592 419 0.0106006278160988 0.040288820012953 0.0105134660868238 0.040665293354696 0.00237289412520524 0.00424196774751422 463373 1755818 667 665 0 True 596 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 636 418 0.0102869828532747 0.0839643168346593 0.0103303578240635 0.0809643701838712 0.00204501591410143 0.0260900960168836 449663 3659230 667 665 0 True 640 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 240 465 0.0101493313768842 0.0506431792458946 0.0102235446707866 0.0506294346532387 0.00157419545230798 0.0131581155389523 443646 2207069 667 665 0 True 238 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 284 466 0.010290002629722 0.0532882216986733 0.0103150988021668 0.052323186083772 0.00156162065853665 0.00664656571102632 449795 2322342 667 665 0 True 283 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 328 465 0.010596647201691 0.0664816080026112 0.0105897611963073 0.0624704356450752 0.00153605957524471 0.0152448068789438 463199 2897320 667 665 0 True 328 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 372 464 0.0107824549615785 0.0866793442750846 0.0106965743495842 0.0814831769283589 0.00148312567879344 0.0178466954290003 471321 3777553 667 665 0 True 372 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 416 464 0.0109949374134173 0.0968158781022136 0.010955977721828 0.092484931715877 0.00190793181858165 0.0269446935649467 480609 4219311 667 665 0 True 417 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 460 464 0.0106421954964381 0.0443007266392119 0.0107270923933776 0.0446784161135271 0.00204075659970849 0.00537408364088134 465190 1930660 667 665 0 True 462 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 504 463 0.0107243700191561 0.0410677643984073 0.0108033875028611 0.0416571297779812 0.0018754205600274 0.00485208068827084 468782 1789765 667 665 0 True 506 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 549 463 0.0105867185427657 0.0991444736813423 0.0104829480430304 0.098115510795758 0.00186719363993491 0.0153147223313194 462765 4320793 667 665 0 True 551 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 592 462 0.0103336292485481 0.061904475081042 0.0103303578240635 0.0645151445792325 0.00190481316915021 0.0143128082599674 451702 2697845 667 665 0 True 596 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 637 463 0.0102573798932532 0.0746805443455285 0.0102388036926833 0.0723887998779278 0.00184743134379782 0.00945911674647238 448369 3254636 667 665 0 True 640 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 241 510 0.0105187735727009 0.0557871905674004 0.0103608758678569 0.0574654764629587 0.00188694245432677 0.0125956013593744 459795 2431249 667 665 0 True 238 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 284 508 0.0103783768449948 0.10120859484486 0.0103913939116503 0.0953841458762493 0.00154532924091302 0.0236737493387007 453658 4410749 667 665 0 True 283 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 328 509 0.0104900399422628 0.0569051146979373 0.0104982070649271 0.0582589456015869 0.0017246367767616 0.0108964103472817 458539 2479969 667 665 0 True 328 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 372 508 0.0105656716160116 0.0578239831668895 0.0106355382619974 0.056900892652781 0.00160377347658183 0.00605843025748559 461845 2520014 667 665 0 True 372 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 417 508 0.010848386747345 0.0550180899720117 0.0109864957656214 0.0549324788281071 0.00193095386338108 0.00560374545809183 474203 2397731 667 665 0 True 417 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 461 506 0.0107216247678404 0.0620384791229619 0.0106355382619974 0.0603952086671244 0.00191459747737857 0.00981089209988033 468662 2703685 667 665 0 True 462 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 505 506 0.0108017861062602 0.0717165309703648 0.0108186465247578 0.0679942015716793 0.00179449761826481 0.0141528970292519 472166 3125462 667 665 0 True 506 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 549 506 0.0105050930703108 0.0572346866250084 0.0105439841306172 0.0569161516746777 0.0018720405904491 0.0103590029490458 459197 2494332 667 665 0 True 551 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 594 506 0.0103876649452797 0.0502165920638171 0.0103608758678569 0.0495460440985733 0.00186837264705675 0.0060566009263384 454064 2188478 667 665 0 True 596 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 638 504 0.0101748393370264 0.0647383622709784 0.01025406271458 0.0644998855573358 0.00189834170003461 0.0118805503153687 444761 2821348 667 665 0 True 641 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 241 551 0.0101778591134737 0.048894449444738 0.0100099183642329 0.0495460440985733 0.00185894052518084 0.00831719038504416 444893 2130858 667 665 0 True 238 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 285 551 0.0101700122701295 0.055954764457493 0.0101777676050965 0.0547951476310369 0.00149906943552331 0.0104145806652233 444550 2438552 667 665 0 True 283 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 329 551 0.0102937087189982 0.0441211061528851 0.0102693217364767 0.0434729533836881 0.0015468226694677 0.00585494136138387 449957 1922832 667 665 0 True 328 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 373 550 0.0105095312266046 0.0495501973060369 0.0105592431525139 0.0485084306095979 0.00153201114470671 0.00570603794447359 459391 2159436 667 665 0 True 372 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 418 550 0.010557481616253 0.0850020450531226 0.0106202792401007 0.080674448767834 0.00180375660954742 0.0158773297970445 461487 3704455 667 665 0 True 417 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 461 549 0.010662693372929 0.0595566508397338 0.0107270923933776 0.0581216144045167 0.00214613855371478 0.00920283853894096 466086 2595525 667 665 0 True 462 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 506 548 0.0104852128753659 0.0510462927747384 0.0104829480430304 0.050965133134966 0.0019363677546575 0.0050764581758391 458328 2224637 667 665 0 True 507 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 550 547 0.010395214386398 0.0363471278333164 0.0103303578240635 0.0376745250629435 0.00220702226501034 0.00621065460678824 454394 1584036 667 665 0 True 551 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 594 548 0.0104396417035245 0.0494380607045194 0.0101930266269932 0.0489967193102922 0.00192027992810012 0.00666382228216326 456336 2154549 667 665 0 True 596 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 638 547 0.0104408084353337 0.0593125523811818 0.010452429999237 0.0584115358205539 0.00199527115868275 0.0091747324455658 456387 2584887 667 665 0 True 641 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 238 592 0.00980349834238294 0.00985225710189871 0.0098268101014725 0.0097962920576791 0.00131059789760187 0.00147432459733635 428529 429369 667 665 0 False 238 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 283 592 0.00995361783516573 0.0101268277124489 0.00993362325474937 0.0100862134737163 0.00140336030381083 0.00138471980256567 435091 441335 667 665 0 False 283 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 330 594 0.0100870599262054 0.0651504705916772 0.0101319905394064 0.063782711528191 0.00144827164048669 0.00847156730944761 440924 2839308 667 665 0 True 328 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 373 593 0.0104831539368791 0.0704004919600443 0.0104829480430304 0.0675669489585718 0.00145650842995163 0.0140918115293062 458238 3068108 667 665 0 True 372 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 417 592 0.0103856746380758 0.010219781543582 0.0102845807583734 0.0102388036926833 0.00176468639659391 0.00171236397847863 453977 445386 667 665 0 False 417 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 462 592 0.0104786013951138 0.0103121617272754 0.0103456168459602 0.0103303578240635 0.00218756466524892 0.00187172850226444 458039 449412 667 665 0 False 462 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 507 592 0.0102257866260278 0.010075681306723 0.0102388036926833 0.0100556954299229 0.00208880165074229 0.00225621408908601 446988 439106 667 665 0 False 507 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 551 592 0.0100268931682019 0.0099506950025556 0.00996414129854276 0.00991836423285267 0.00189552144295497 0.00187477928891421 438294 433659 667 665 0 False 551 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 596 591 0.0100132812970946 0.0100088169611486 0.0100709544518196 0.0100556954299229 0.00169819731354187 0.00168329401371881 437699 436192 667 665 0 False 596 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 641 591 0.0101510929131452 0.0100653556528079 0.0101319905394064 0.00997940032043946 0.00155521801353626 0.00153475981009376 443723 438656 667 665 0 False 641 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 239 642 0.00970835250719799 0.0393142389046546 0.00967421988250553 0.0384222171358816 0.0014586068744435 0.00815419640621438 424370 1713345 667 665 0 True 238 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 283 636 0.00989875856303938 0.00970423311655197 0.00993362325474937 0.00965896086060884 0.00149251754523631 0.00140986494185086 432693 422918 667 665 0 False 283 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 328 635 0.00991948521047327 0.0099333479039783 0.00996414129854276 0.00994888227664607 0.00135066829754316 0.00136576674595451 433599 432903 667 665 0 False 328 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 373 635 0.00998880280619589 0.00976072591641613 0.00997940032043946 0.00975051499198901 0.00135443054801784 0.001430108667938 436629 425380 667 665 0 False 373 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 417 635 0.00999443057139318 0.0101816684076866 0.00997940032043946 0.0102235446707866 0.00161288933011027 0.00149630574158057 436875 443725 667 665 0 False 417 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 462 635 0.0101585966000749 0.0101690940558079 0.0102082856488899 0.0101167315175097 0.00174456191686272 0.00216176170877827 444051 443177 667 665 0 False 462 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 507 635 0.00984705632992613 0.00991710220848528 0.00988784618905928 0.00991836423285267 0.0018934846442116 0.00184820988955203 430433 432195 667 665 0 False 507 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 551 635 0.0098039101300803 0.00966871286708417 0.0097962920576791 0.00973525597009232 0.00188859408942859 0.00169469839556155 428547 421370 667 665 0 False 551 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 596 635 0.0098300357717685 0.00976313523566297 0.0098115510795758 0.00976577401388571 0.00145066604654695 0.00132206754897807 429689 425485 667 665 0 False 596 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 637 639 0.009923534456164 0.0406663718118826 0.00991836423285267 0.0410315098802167 0.00151509606973256 0.00746472322301443 433776 1772272 667 665 0 True 641 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D8_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D8_2.csv new file mode 100755 index 0000000..213a966 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D8_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 237 245 0.00908671322384127 0.691396883144001 0.0089723048752575 0.68383306630045 0.00221434153413362 0.185558576753737 397197 30131612 667 665 7 True 238 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 282 244 0.00748096997507197 0.00727316115879077 0.00740062561989776 0.0072632944228275 0.00162157779892999 0.00131819643715001 327007 316970 667 665 0 False 282 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 324 244 0.00682675370943505 0.00714005200687689 0.00686655985351339 0.00712596322575723 0.00129480853523772 0.00119917134832251 298410 311169 667 665 0 True 327 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 369 243 0.00668427516614776 0.00666013855880259 0.00663767452506294 0.00668345159075303 0.00127420960206666 0.00119524813688189 292182 290254 667 665 0 True 372 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 413 243 0.0064783584403724 0.00647810875322892 0.00653086137178607 0.00650034332799268 0.0014316238772301 0.00140256605291172 283181 282321 667 665 0 True 417 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 458 242 0.00672666642188176 0.00684173239232207 0.00674448767833982 0.00686655985351339 0.00158585115419917 0.00152365614249697 294035 298168 667 665 0 True 461 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 502 241 0.00700309035228323 0.00703181620794949 0.00691233691920348 0.00714122224765393 0.00162500209896895 0.00147930840300657 306118 306452 667 665 0 True 506 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 546 242 0.00723321104382576 0.00721396074301111 0.00727855344472419 0.00721751735713741 0.00149356693411373 0.00135468576599796 316177 314390 667 665 0 True 551 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 595 243 0.00846470790697579 0.00758761173935067 0.00770580605783169 0.00755321583886473 0.00435732132746531 0.00195511784629047 370008 330674 667 665 0 False 595 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 633 242 0.00902455615863389 0.71729672085914 0.00910963607232776 0.704310673685817 0.0020797880424611 0.201739558157802 394480 31260347 667 665 12 True 640 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 238 288 0.00728445573505305 0.0071487943938583 0.00720225833524071 0.00709544518196384 0.00159340966121017 0.00148589803479647 318417 311550 667 665 0 False 238 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 283 287 0.00709750412045065 0.00700148173133681 0.00715648126955062 0.00700389105058366 0.00129653296832608 0.00136608468069973 310245 305130 667 665 0 False 283 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 326 288 0.00689236521588142 0.00703895238209968 0.00689707789730678 0.00700389105058366 0.00134252254306682 0.00137467390520474 301278 306763 667 665 0 True 327 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 370 288 0.00681886111190228 0.00670375871011931 0.00679026474402991 0.00669871061264973 0.00134620548404156 0.00124078895753649 298065 292155 667 665 0 True 372 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 414 288 0.00662417703942718 0.00673902655471363 0.00657663843747616 0.00677500572213321 0.00166847354779851 0.00147813977911025 289555 293692 667 665 0 True 417 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 458 286 0.00680621007875554 0.00697383192474205 0.00686655985351339 0.00703440909437705 0.00167651410559731 0.00182230710804431 297512 303925 667 665 0 True 461 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 503 287 0.00707366618819224 0.00733215506149214 0.00706492713817044 0.0072632944228275 0.00170858464270652 0.00194656234019558 309203 319541 667 665 0 True 506 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 547 286 0.0071403757951649 0.00733701959178101 0.00718699931334401 0.00727855344472419 0.00165367814885027 0.00150850283158947 312119 319753 667 665 0 True 551 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 595 287 0.00769674672848973 0.00732963101275735 0.00772106507972839 0.00744640268558785 0.00190561867424657 0.00190870866328197 336439 319431 667 665 0 False 595 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 640 287 0.00800872166343013 0.00780387682412715 0.00801098649576562 0.00784313725490196 0.00198973466435545 0.00192730047557499 350076 340099 667 665 0 False 640 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 238 334 0.00654568572889111 0.0067432715457676 0.00654612039368277 0.00672922865644312 0.00142606189809831 0.00144045876177822 286124 293877 667 665 0 True 238 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 282 333 0.00661934997253033 0.00671119318093815 0.00660715648126955 0.00669871061264973 0.00138207783247042 0.0013914357682325 289344 292479 667 665 0 True 283 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 326 332 0.00654413008647885 0.00658852441242727 0.00662241550316625 0.00659189745937285 0.00124113806981908 0.00118417669715915 286056 287133 667 665 0 True 327 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 370 333 0.00680927560939146 0.00667909187021112 0.00675974670023652 0.00668345159075303 0.00143240653256823 0.00126382441590322 297646 291080 667 665 0 True 372 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 414 332 0.00696941526947673 0.00661828524160022 0.00677500572213321 0.00663767452506294 0.00261652880497631 0.00144518243042146 304646 288430 667 665 0 True 417 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 459 331 0.00686655985351339 0.00693957369964164 0.00688181887541009 0.00694285496299687 0.0016562678372915 0.00164009360371554 300150 302432 667 665 0 True 461 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 502 330 0.00710077554493525 0.00722366685769126 0.00714122224765393 0.0072327763790341 0.0015917641225221 0.00172207410310945 310388 314813 667 665 0 True 506 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 547 330 0.00720164065369467 0.00717671955122414 0.00718699931334401 0.0072327763790341 0.00164166301925027 0.00146545280076334 314797 312767 667 665 0 True 551 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 591 330 0.00738898117890014 0.00726678219926103 0.00737010757610437 0.00730907148851759 0.00194058400798471 0.00214336214274967 322986 316692 667 665 0 True 595 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 635 330 0.00722618777587631 0.00740482471915655 0.0072480354009308 0.00743114366369116 0.00196012770205115 0.00187727748977776 315870 322708 667 665 0 True 640 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 238 377 0.0066142026263133 0.00659350367220409 0.00668345159075303 0.00666819256885634 0.00150650422783542 0.00155170723514073 289119 287350 667 665 0 True 238 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 282 377 0.0063924320741895 0.00646461656544658 0.00645456626230259 0.00645456626230259 0.00140400413639688 0.00140837635503887 279425 281733 667 665 0 True 283 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 326 376 0.00671438142224379 0.00663554055658716 0.00668345159075303 0.00663767452506294 0.0013196661234924 0.00136747436429743 293498 289182 667 665 0 True 327 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 371 376 0.00671744695287971 0.00696887561086282 0.00674448767833982 0.00700389105058366 0.00139969552588053 0.0013738837439547 293632 303709 667 665 0 True 372 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 414 376 0.00690282004797555 0.00695538342308048 0.00691233691920348 0.00701915007248035 0.00152394431815384 0.00146642340892651 301735 303121 667 665 0 True 417 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 459 375 0.00693864557764606 0.00692410816466664 0.00700389105058366 0.00694285496299687 0.00174212123200831 0.0017086214810544 303301 301758 667 665 0 True 461 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 503 374 0.00707430674683258 0.0073934435539524 0.00712596322575723 0.00735484855420768 0.0017290063183922 0.00185915115370307 309231 322212 667 665 0 True 506 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 547 374 0.00717201481657889 0.00735381598881617 0.00717174029144732 0.00740062561989776 0.00163919517325706 0.00161054153086998 313502 320485 667 665 0 True 551 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 592 374 0.00699494610671318 0.00703672663003354 0.00698863202868696 0.00704966811627375 0.00203216503420103 0.00205623430550392 305762 306666 667 665 0 True 596 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 636 374 0.00674169667283548 0.00665837172468824 0.00663767452506294 0.00665293354695964 0.00186976878423272 0.00180279794783985 294692 290177 667 665 0 True 640 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 239 421 0.00659718206815567 0.00669446562159576 0.00654612039368277 0.00669871061264973 0.00160372759048481 0.0015286863754138 288375 291750 667 665 0 True 238 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 283 421 0.00665744033453633 0.00665224517003197 0.00653086137178607 0.00665293354695964 0.0014678255551949 0.00143410181383234 291009 289910 667 665 0 True 283 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 327 421 0.00687365175274574 0.00712011202187203 0.0068207827878233 0.00709544518196384 0.00136612857611848 0.00141282531988701 300460 310300 667 665 0 True 327 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 371 420 0.00724897336179701 0.0070763083033746 0.00708018616006714 0.00709544518196384 0.00163644640475165 0.00129798253092304 316866 308391 667 665 0 True 372 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 415 421 0.00724053171400109 0.00743926651143767 0.0072632944228275 0.00747692072938125 0.00146981381921803 0.00155002064348024 316497 324209 667 665 0 True 417 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 460 418 0.00721404003880413 0.00745649888052702 0.00714122224765393 0.00743114366369116 0.00170395073611001 0.00156591548991739 315339 324960 667 665 0 True 462 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 503 418 0.00721278179861774 0.00727295464571247 0.00720225833524071 0.00733958953231098 0.00168123591265072 0.00166743617253278 315284 316961 667 665 0 True 506 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 547 418 0.00714362434255521 0.00717683428071208 0.00714122224765393 0.00718699931334401 0.00163847081127539 0.00155273754672821 312261 312772 667 665 0 True 551 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 592 419 0.00669155008213449 0.00683461916406948 0.00659189745937285 0.00688181887541009 0.00213645474410644 0.00194370910592317 292500 297858 667 665 0 True 596 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 636 418 0.0064304538049126 0.00642475954133445 0.00648508430609598 0.00645456626230259 0.00185215476222346 0.00185848603365318 281087 279996 667 665 0 True 640 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 240 465 0.0066370339664226 0.00686949692840478 0.00657663843747616 0.00686655985351339 0.00154689268489016 0.00142026056541069 290117 299378 667 665 0 True 238 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 284 466 0.00675425619760502 0.00699145437409041 0.0068055237659266 0.00703440909437705 0.00142362236281317 0.00153240613942013 295241 304693 667 665 0 True 283 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 328 465 0.00705241336758949 0.00711566051773976 0.00701915007248035 0.00717174029144732 0.00146631598426422 0.00151897076427427 308274 310106 667 665 0 True 328 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 372 464 0.00708073521033029 0.00710620680793309 0.00698863202868696 0.0072480354009308 0.00150596879327274 0.00151481578715523 309512 309694 667 665 0 True 372 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 416 464 0.00720802336300378 0.00730872730005375 0.00729381246662089 0.0072632944228275 0.00175583515451407 0.00179337659634729 315076 318520 667 665 0 True 417 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 460 464 0.00747191064573001 0.00757769911159221 0.00755321583886473 0.0076752880140383 0.00189222729473942 0.00205782233089006 326611 330242 667 665 0 True 462 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 504 463 0.00710191939965014 0.00745840339002691 0.00711070420386053 0.00746166170748455 0.00190790236724879 0.00199303278379621 310438 325043 667 665 0 True 506 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 549 463 0.00678472848720982 0.00657273763488603 0.0068207827878233 0.00657663843747616 0.00184538029636902 0.00184214380297353 296573 286445 667 665 0 True 551 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 592 462 0.00620163710774505 0.00645417618204357 0.00622568093385214 0.00643930724040589 0.00188033323254527 0.00186121436585068 271085 281278 667 665 0 True 596 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 637 463 0.00632002607073666 0.00636429710118739 0.00636301213092241 0.00634775310902571 0.00171796235354907 0.00173345365889812 276260 277361 667 665 0 True 640 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 241 510 0.00685301661368904 0.00650747950214286 0.0068055237659266 0.00650034332799268 0.00155379978520206 0.00141184884563517 299558 283601 667 665 0 True 238 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 284 508 0.00672449309792346 0.00683402257073216 0.00666819256885634 0.0068055237659266 0.00140452445579833 0.00148701713630059 293940 297832 667 665 0 True 283 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 328 509 0.00683622482647438 0.00692192830439569 0.0068207827878233 0.00689707789730678 0.00156404518617696 0.00150072652939756 298824 301663 667 665 0 True 328 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 372 508 0.00699769135802893 0.00721446555275807 0.00700389105058366 0.00718699931334401 0.0016292529429854 0.00152756559486409 305882 314412 667 665 0 True 372 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 417 508 0.00720324205029552 0.00738699575672989 0.0072327763790341 0.00744640268558785 0.00189021842966341 0.00186733915532143 314867 321931 667 665 0 True 417 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 461 506 0.00712594034866293 0.00703787392491299 0.00720225833524071 0.00712596322575723 0.00194208227027303 0.00168101963552868 311488 306716 667 665 0 True 462 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 505 506 0.00698563512933394 0.00662053393956395 0.00701915007248035 0.00659189745937285 0.00178066508840754 0.00170667922781662 305355 288528 667 665 0 True 506 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 549 506 0.00637360422558233 0.00652741948714772 0.00634775310902571 0.00657663843747616 0.00172805306209947 0.00153665098717401 278602 284470 667 665 0 True 551 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 594 506 0.00648293385923198 0.00647549292090377 0.00650034332799268 0.00660715648126955 0.00184967187213438 0.00172431985883648 283381 282207 667 665 0 True 596 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 638 504 0.00632311447846688 0.00660681229280572 0.00645456626230259 0.00659189745937285 0.00177829384372183 0.00193779673713917 276395 287930 667 665 0 True 641 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 241 551 0.006840342703448 0.0067731471044285 0.00674448767833982 0.00677500572213321 0.00154178397810967 0.00133711678368717 299004 295179 667 665 0 True 238 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 285 551 0.00651011184725788 0.00696965577138084 0.00653086137178607 0.00698863202868696 0.00147008513163889 0.00139036283589635 284569 303743 667 665 0 True 283 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 329 551 0.00665535851895522 0.00681330242520928 0.00668345159075303 0.0068207827878233 0.00139901248009463 0.00135807398493486 290918 296929 667 665 0 True 328 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 373 550 0.00694610351038717 0.00707594116901317 0.00691233691920348 0.00704966811627375 0.00154192941517144 0.00132209143981668 303627 308375 667 665 0 True 372 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 418 550 0.0066207454752825 0.00688982699366865 0.00668345159075303 0.00689707789730678 0.00185031307794604 0.00166280607929955 289405 300264 667 665 0 True 417 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 461 549 0.0064359214304498 0.00683778569793676 0.00653086137178607 0.00692759594110018 0.00197871509419875 0.00186833826989855 281326 297996 667 665 0 True 462 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 506 548 0.00652058955644631 0.00652023742120235 0.00643930724040589 0.00646982528419928 0.00191361898927247 0.0019653872321695 285027 284157 667 665 0 True 507 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 550 547 0.00654655505847442 0.00655226989423662 0.00659189745937285 0.00659189745937285 0.00170837104658944 0.00185953100409347 286162 285553 667 665 0 True 551 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 594 548 0.00659025030858341 0.00670279498242057 0.00662241550316625 0.00674448767833982 0.00167775084269123 0.00146412858285539 288072 292113 667 665 0 True 596 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 638 547 0.00669326586420683 0.00655045716832709 0.00677500572213321 0.00657663843747616 0.00186978179622596 0.00181654117729745 292575 285474 667 665 0 True 641 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 238 592 0.00731783341563368 0.00707355479566391 0.00732433051041428 0.00700389105058366 0.00132250267182723 0.00134457801135504 319876 308271 667 665 0 False 238 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 283 592 0.00699778286640612 0.00707511511669997 0.00703440909437705 0.00701915007248035 0.00139098721545124 0.0014412150909556 305886 308339 667 665 0 False 283 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 330 594 0.00682636479883199 0.00666511781857941 0.00686655985351339 0.00669871061264973 0.0013885553733174 0.00151838714428241 298393 290471 667 665 0 True 328 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 373 593 0.0066011626825635 0.00669031241413215 0.00660715648126955 0.00663767452506294 0.00133367596538585 0.00129103762657922 288549 291569 667 665 0 True 372 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 417 592 0.00661587265419705 0.00659208102655357 0.00659189745937285 0.00663767452506294 0.00164501456363444 0.00165402627083484 289192 287288 667 665 0 False 417 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 462 592 0.00671509061216702 0.00681279761546232 0.00675974670023652 0.00683604180972 0.00209013683619641 0.00187589262796347 293529 296907 667 665 0 False 462 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 507 592 0.00665970516687182 0.00674630040424935 0.00666819256885634 0.00691233691920348 0.00194491943820545 0.00206737911933375 291108 294009 667 665 0 False 507 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 551 592 0.00676583200731976 0.00674086222652075 0.00674448767833982 0.00683604180972 0.00185098505243377 0.00174758382814906 295747 293772 667 665 0 False 551 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 596 591 0.00680618720166124 0.00680933278492638 0.00686655985351339 0.00677500572213321 0.00166657624730357 0.00167261512013514 297511 296756 667 665 0 False 596 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 641 591 0.00673931745502849 0.00671387785095607 0.00675974670023652 0.00677500572213321 0.00157150627105156 0.00143681384041196 294588 292596 667 665 0 False 641 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 239 642 0.00907003582209811 0.703192726609382 0.00871290150301366 0.6905317769131 0.00228428097816481 0.173006029601325 396468 30645684 667 665 6 True 238 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 283 636 0.00732714439301292 0.00706290789918261 0.0072480354009308 0.00711070420386053 0.00163472315748817 0.00138675245578743 320283 307807 667 665 0 False 283 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 328 635 0.00660512041987704 0.00667342423350663 0.00660715648126955 0.00669871061264973 0.00132221995141365 0.00133098060328095 288722 290833 667 665 0 False 328 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 373 635 0.00639561199029691 0.00647262468370514 0.0064087891966125 0.00653086137178607 0.00127157803963758 0.001247669920397 279564 282082 667 665 0 False 373 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 417 635 0.00622696205113282 0.00629433505943848 0.00619516289005875 0.00625619897764553 0.00150435903472563 0.00150232092705674 272192 274312 667 665 0 False 417 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 462 635 0.00645950771467093 0.00637799580204804 0.00651560234988937 0.00636301213092241 0.00176565856482238 0.00190502541358006 282357 277958 667 665 0 False 462 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 507 635 0.00645342240758769 0.00645415323614598 0.00653086137178607 0.00646982528419928 0.00177615151785052 0.00177736238958482 282091 281277 667 665 0 False 507 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 551 635 0.00651999475199457 0.00650846617573919 0.00650034332799268 0.00646982528419928 0.00177051257299947 0.0017371851838607 285001 283644 667 665 0 False 551 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 596 635 0.00735878341442691 0.00679290352225264 0.00720225833524071 0.0068055237659266 0.00199834646497033 0.00135806327606835 321666 296040 667 665 0 False 596 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 637 639 0.00839591648442201 0.752397565210807 0.00836194399938964 0.730968184939345 0.0016585057816646 0.173284900714233 367001 32790069 667 665 13 True 641 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D8_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D8_3.csv new file mode 100755 index 0000000..6e9f242 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D8_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 237 245 0.00110331650379891 0.0707173748057486 0.000854505226215 0.0687418936446174 0.000930266997938892 0.0207881938892165 48228 3081918 667 665 0 True 238 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 282 244 0.000985339328504665 0.000951268076347885 0.000839246204318303 0.000717174029144732 0.000740280528897901 0.000781612733698457 43071 41457 667 665 0 False 282 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 324 244 0.00102164527715543 0.00091987808844611 0.000930800335698482 0.000793469138628214 0.000667893753133454 0.000625431904620477 44658 40089 667 665 0 True 327 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 369 243 0.000964429664316388 0.000991216884050364 0.000885023270008392 0.000930800335698482 0.000654462921285901 0.000647244270783591 42157 43198 667 665 0 True 372 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 413 243 0.000909547515095737 0.000958771384859494 0.000732433051041428 0.000762951094834821 0.000722916573646918 0.000778804564613297 39758 41784 667 665 0 True 417 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 458 242 0.000873516091576551 0.000870383787346599 0.000717174029144732 0.000701915007248035 0.000791894705132654 0.000753732625163321 38183 37932 667 665 0 True 461 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 502 241 0.000978865110818361 0.000951933507377967 0.000793469138628214 0.00080872816052491 0.000863068398008637 0.000785228806553582 42788 41486 667 665 0 True 506 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 546 242 0.000963857736958941 0.000995002957152552 0.000793469138628214 0.000854505226215 0.000788588019400743 0.000750021984928115 42132 43363 667 665 0 True 551 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 595 243 0.001143717452329 0.00095372328738991 0.000778210116731518 0.000488288700694286 0.00110465200945899 0.00105017361488285 49994 41564 667 665 0 False 595 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 633 242 0.00111612767660573 0.0740925557198099 0.000778210116731518 0.0718852521553368 0.00106570755130807 0.0236928254065758 48788 3229011 667 665 0 True 640 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 238 288 0.000897514163495044 0.00103086739508419 0.000671396963454643 0.000885023270008392 0.000786808375135219 0.000819232591972705 39232 44926 667 665 0 False 238 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 283 287 0.000856426902136023 0.000955903147660867 0.000732433051041428 0.000854505226215 0.000655992262481103 0.000714796223533532 37436 41659 667 665 0 False 283 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 326 288 0.000937434693044871 0.00103107390816249 0.000823987182421607 0.000900282291905089 0.000645800362568527 0.000747989340496856 40977 44935 667 665 0 True 327 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 370 288 0.000918927123757874 0.000938533103185981 0.000747692072938125 0.000839246204318303 0.000698958421143184 0.000652199496518997 40168 40902 667 665 0 True 372 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 414 288 0.000891154331280228 0.000891998822875454 0.000671396963454643 0.000686655985351339 0.000734641250501966 0.000748030103992811 38954 38874 667 665 0 True 417 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 458 286 0.000880058940545749 0.000907280790669739 0.000595101853971161 0.000549324788281071 0.000833544038314935 0.000972356472770177 38469 39540 667 665 0 True 461 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 503 287 0.00104438510888753 0.000955627796889798 0.000839246204318303 0.000701915007248035 0.000917652083898153 0.000917701704993575 45652 41647 667 665 0 True 506 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 547 286 0.00105577790184789 0.00100273572464005 0.000793469138628214 0.00080872816052491 0.000950090572068933 0.000826766959997342 46150 43700 667 665 0 True 551 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 595 287 0.000939745279568959 0.0010070266074892 0.000518806744487678 0.000579842832074464 0.000977875491694593 0.00106214109572973 41078 43887 667 665 0 False 595 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 640 287 0.00101368404833976 0.000984723195032672 0.000671396963454643 0.000564583810177768 0.00101855401331697 0.00109276404242499 44310 42915 667 665 0 False 640 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 238 334 0.000947500614535946 0.000962259161293024 0.000747692072938125 0.000823987182421607 0.000795204371488482 0.000769733236828222 41417 41936 667 665 0 True 238 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 282 333 0.000891108577091633 0.000953126694052595 0.000762951094834821 0.00080872816052491 0.000699173832507523 0.000712516105041945 38952 41538 667 665 0 True 283 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 326 332 0.000928489749174394 0.000958289521010124 0.000839246204318303 0.000869764248111696 0.000648588887359448 0.000638056861834436 40586 41763 667 665 0 True 327 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 370 333 0.000926179162650307 0.001039196755909 0.000823987182421607 0.000930800335698482 0.000684749921029087 0.000699536035616389 40485 45289 667 665 0 True 372 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 414 332 0.000993689467923397 0.000878873769454536 0.00080872816052491 0.000625619897764553 0.000813551240228191 0.000789033919869398 43436 38302 667 665 0 True 417 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 459 331 0.000915953101499147 0.000898928483947337 0.000610360875867857 0.000701915007248035 0.000880327221880777 0.000808833957011679 40038 39176 667 665 0 True 461 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 502 330 0.000965985306728645 0.00100161137565819 0.000732433051041428 0.00080872816052491 0.000869749118433813 0.000863876632921079 42225 43651 667 665 0 True 506 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 547 330 0.000981816255982789 0.00101365797189242 0.000747692072938125 0.000854505226215 0.00085118535229893 0.00082511691801495 42917 44176 667 665 0 True 551 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 591 330 0.000998127624217189 0.000964347237973625 0.000686655985351339 0.000503547722590982 0.00101272508734521 0.00110383074887588 43630 42027 667 665 0 True 595 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 635 330 0.00101306636679371 0.000930960956981605 0.000686655985351339 0.000473029678797589 0.00100790671273074 0.00105888412148351 44283 40572 667 665 0 True 640 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 238 377 0.000901403269525686 0.000882774572044669 0.000732433051041428 0.000656137941557946 0.000793432050537982 0.000798635786376761 39402 38472 667 665 0 True 238 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 282 377 0.000908083381060671 0.000943374687577263 0.000762951094834821 0.000823987182421607 0.000726869627614201 0.000736062516486041 39694 41113 667 665 0 True 283 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 326 376 0.000964635558165069 0.000886835995917925 0.000839246204318303 0.000747692072938125 0.000720467213854491 0.000727336535392615 42166 38649 667 665 0 True 327 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 371 376 0.000961272625303279 0.000956798037666838 0.000823987182421607 0.000839246204318303 0.000697921539166269 0.000708288633925346 42019 41698 667 665 0 True 372 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 414 376 0.00091885849247498 0.000870200220165887 0.000701915007248035 0.000625619897764553 0.000771377206689019 0.000764709124605714 40165 37924 667 665 0 True 417 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 459 375 0.000926407933593286 0.000896427381110134 0.000610360875867857 0.000595101853971161 0.000906313224776785 0.000875647196253009 40495 39067 667 665 0 True 461 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 503 374 0.0010328092991728 0.00102132190168715 0.000747692072938125 0.000717174029144732 0.000963131745665507 0.000970290777309635 45146 44510 667 665 0 True 506 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 547 374 0.00101288335003933 0.000941561961667731 0.000717174029144732 0.000747692072938125 0.000944872885410732 0.000835404032568554 44275 41034 667 665 0 True 551 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 592 374 0.000948873240193819 0.00102233152118107 0.000534065766384375 0.000549324788281071 0.00102325367373038 0.00113537525168729 41477 44554 667 665 0 True 596 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 636 374 0.00092158086669643 0.00102848102173493 0.000503547722590982 0.000686655985351339 0.00102051829856852 0.00101514851257645 40284 44822 667 665 0 True 640 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 239 421 0.000917874777420171 0.000920704140759314 0.000778210116731518 0.000778210116731518 0.000785692501264015 0.000780724675147238 40122 40125 667 665 0 True 238 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 283 421 0.000837599053528855 0.000889658341321374 0.000671396963454643 0.000717174029144732 0.000734620796382925 0.000760409651609012 36613 38772 667 665 0 True 283 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 327 421 0.0010349139918482 0.000935137110342806 0.000915541313801785 0.000823987182421607 0.000744070618328476 0.000663075295023278 45238 40754 667 665 0 True 327 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 371 420 0.0011415212512764 0.000980317582695581 0.00103761348897536 0.000885023270008392 0.0007935080328247 0.000720898205550681 49898 42723 667 665 0 True 372 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 415 421 0.00101722999795593 0.00104385477311957 0.000854505226215 0.000854505226215 0.000828687047800583 0.00082303368460934 44465 45492 667 665 0 True 417 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 460 418 0.000896164414931468 0.00100000516282696 0.000686655985351339 0.00080872816052491 0.000778403521735331 0.000823400880271674 39173 43581 667 665 0 True 462 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 503 418 0.000941438184547003 0.0010139103767659 0.00064087891966125 0.000762951094834821 0.000917815679493409 0.000955722113279472 41152 44187 667 665 0 True 506 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 547 418 0.00100265728888817 0.000952736613793582 0.000747692072938125 0.000793469138628214 0.00092214794012885 0.000783073546017262 43828 41521 667 665 0 True 551 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 592 419 0.000930480056378311 0.000924788510530159 0.000503547722590982 0.000534065766384375 0.00105023846720582 0.00104326753907848 40673 40303 667 665 0 True 596 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 636 418 0.00094429782133424 0.000954434610215169 0.000503547722590982 0.000610360875867857 0.0010181910844408 0.000936708708650235 41277 41595 667 665 0 True 640 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 240 465 0.000878320281379109 0.000872563647617556 0.000747692072938125 0.000732433051041428 0.000759782050280742 0.000709566074193847 38393 38027 667 665 0 True 238 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 284 466 0.000969577010533415 0.00095978100435341 0.000839246204318303 0.000823987182421607 0.000835883317163115 0.000820145891908697 42382 41828 667 665 0 True 283 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 328 465 0.00104347002511562 0.000932842520583904 0.000885023270008392 0.000793469138628214 0.000879986576695177 0.00078725361368847 45612 40654 667 665 0 True 328 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 372 464 0.00101054988642095 0.00093924442601124 0.000885023270008392 0.00080872816052491 0.000788496002958372 0.000789511771474154 44173 40933 667 665 0 True 372 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 416 464 0.00099028078087301 0.000964278400280858 0.000732433051041428 0.00064087891966125 0.000963974275927195 0.000953258439630631 43287 42024 667 665 0 True 417 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 460 464 0.000963308686695791 0.000956843929462016 0.000488288700694286 0.000473029678797589 0.00104115669475413 0.00110149243579802 42108 41700 667 665 0 True 462 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 504 463 0.0010338387684162 0.000916849229964359 0.00064087891966125 0.000534065766384375 0.00102485307237936 0.000954022143398115 45191 39957 667 665 0 True 506 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 549 463 0.000997990361651401 0.000984333114773659 0.000625619897764553 0.00064087891966125 0.000991168805605167 0.000982917175670384 43624 42898 667 665 0 True 551 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 592 462 0.00092201553148809 0.000932039414168289 0.000488288700694286 0.000488288700694286 0.00101311267657242 0.000985022908179733 40303 40619 667 665 0 True 596 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 637 463 0.000879281119339621 0.000976669184978927 0.000457770656900893 0.000595101853971161 0.00100106775789944 0.000992734256306147 38435 42564 667 665 0 True 640 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 241 510 0.000894517264142019 0.000884977378213214 0.000717174029144732 0.000778210116731518 0.000753057295635396 0.00070357014717416 39101 38568 667 665 0 True 238 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 284 508 0.000960037262211192 0.000919809250753343 0.000793469138628214 0.000732433051041428 0.000797746470674207 0.000832239941111558 41965 40086 667 665 0 True 283 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 328 509 0.000983028741980578 0.000959735112558232 0.000854505226215 0.000778210116731518 0.00080102413729176 0.000840025760930725 42970 41826 667 665 0 True 328 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 372 508 0.000944595223560113 0.000980248745002814 0.000762951094834821 0.000869764248111696 0.00080738914322562 0.000744721586580104 41290 42720 667 665 0 True 372 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 417 508 0.0009545238824854 0.00093038730954188 0.000701915007248035 0.000610360875867857 0.000935448858304996 0.000891212747447823 41724 40547 667 665 0 True 417 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 461 506 0.000982685585566109 0.000943397633474852 0.000579842832074464 0.000671396963454643 0.000999448011343451 0.00088929391208036 42955 41114 667 665 0 True 462 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 505 506 0.000967769720083881 0.000947504949143286 0.000564583810177768 0.000656137941557946 0.000999544171464934 0.000898741270536123 42303 41293 667 665 0 True 506 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 549 506 0.00100290893692545 0.000960652948461793 0.000686655985351339 0.000717174029144732 0.000947740951519859 0.000878397115335254 43839 41866 667 665 0 True 551 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 594 506 0.000963834859864643 0.000894086899556054 0.000595101853971161 0.000503547722590982 0.000966830636527754 0.000939479943552112 42131 38965 667 665 0 True 596 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 638 504 0.000894219861916147 0.000863477072172305 0.000503547722590982 0.000442511635004196 0.000974073387872444 0.00092940600587284 39088 37631 667 665 0 True 641 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 241 551 0.000888386202870183 0.000928826988505826 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.000706792417436308 0.000741788028439708 38833 40479 667 665 0 True 238 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 285 551 0.000987329635708582 0.000930203742361167 0.000839246204318303 0.000793469138628214 0.000755215756183556 0.000756844382696959 43158 40539 667 665 0 True 283 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 329 551 0.000960746452134427 0.000937959455746255 0.000869764248111696 0.000823987182421607 0.000746171081347024 0.000721550328992626 41996 40877 667 665 0 True 328 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 373 550 0.000855649080929894 0.00105115156855288 0.000717174029144732 0.000915541313801785 0.00071525105332942 0.000761510232877367 37402 45810 667 665 0 True 372 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 418 550 0.000929862374832268 0.000960997136925628 0.00064087891966125 0.000656137941557946 0.000980098857528823 0.000913645876406761 40646 41881 667 665 0 True 417 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 461 549 0.00101546846169499 0.000992593637905705 0.000686655985351339 0.000625619897764553 0.00110385246645834 0.00107339046598953 44388 43258 667 665 0 True 462 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 506 548 0.000970309077550948 0.000947757354016765 0.000534065766384375 0.000686655985351339 0.00104710035445398 0.00104952719900859 42414 41304 667 665 0 True 507 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 550 547 0.000993369188603226 0.00102407540939784 0.000595101853971161 0.000671396963454643 0.00102253324615949 0.00103917407753111 43422 44630 667 665 0 True 551 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 594 548 0.000911400559733866 0.000992088828158747 0.000625619897764553 0.000793469138628214 0.000895459539511918 0.000800830371055526 39839 43236 667 665 0 True 596 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 638 547 0.000920231118132854 0.000965448641057898 0.000579842832074464 0.000701915007248035 0.000949747923547661 0.000945849726962445 40225 42075 667 665 0 True 641 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 238 592 0.000939813910851853 0.00107200938946129 0.000823987182421607 0.000991836423285267 0.000684778070764531 0.000702569670432791 41081 46719 667 665 0 False 238 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 283 592 0.000918766984097789 0.000923159351801339 0.000793469138628214 0.000778210116731518 0.000713914715356544 0.000756717444209097 40161 40232 667 665 0 False 283 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 330 594 0.00100897136691439 0.00100248331976657 0.000900282291905089 0.000839246204318303 0.000757343424228003 0.000815072546740183 44104 43689 667 665 0 True 328 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 373 593 0.000936817011498828 0.00100344704746531 0.000854505226215 0.000885023270008392 0.000680515848779428 0.000684298705606001 40950 43731 667 665 0 True 372 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 417 592 0.000876055449043617 0.000945485710155453 0.000595101853971161 0.000656137941557946 0.000871434001532727 0.000890828150935538 38294 41205 667 665 0 False 417 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 462 592 0.000954867038899868 0.00085590492596793 0.000534065766384375 0.000442511635004196 0.00099671130271898 0.000919137408288194 41739 37301 667 665 0 False 462 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 507 592 0.000972436647320652 0.000901819667043553 0.000518806744487678 0.000473029678797589 0.0011193053130437 0.00106990316672676 42507 39302 667 665 0 False 507 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 551 592 0.00098245681462313 0.000988784618905928 0.000579842832074464 0.000625619897764553 0.00102037435967797 0.000978899776481625 42945 43092 667 665 0 False 551 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 596 591 0.00103555455048855 0.00092710604618665 0.000778210116731518 0.000656137941557946 0.000909749550831957 0.000839968693496146 45266 40404 667 665 0 False 596 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 641 591 0.000999157093460594 0.000921071275120738 0.00080872816052491 0.000686655985351339 0.000845767352534183 0.000808823977815509 43675 40141 667 665 0 False 641 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 239 642 0.00112287641942361 0.0720562908759654 0.000991836423285267 0.069718471046006 0.000764580861381286 0.019732248619144 49083 3140269 667 665 0 True 238 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 283 636 0.000981656116322704 0.0009280468279878 0.000885023270008392 0.000778210116731518 0.000705522830321968 0.000699149152923875 42910 40445 667 665 0 False 283 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 328 635 0.000935833296444019 0.000916160853036689 0.000839246204318303 0.000823987182421607 0.000666535511720889 0.000670485262919926 40907 39927 667 665 0 False 328 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 373 635 0.00092201553148809 0.000904389607573523 0.000823987182421607 0.000778210116731518 0.000689825517392077 0.000671867402844053 40303 39414 667 665 0 False 373 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 417 635 0.000936450977990062 0.000849709533618895 0.000717174029144732 0.00064087891966125 0.000813955416388259 0.000705183004893114 40934 37031 667 665 0 False 417 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 462 635 0.000897857319909512 0.000957440522799331 0.000579842832074464 0.00064087891966125 0.00092146734936025 0.000954806468460794 39247 41726 667 665 0 False 462 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 507 635 0.000959350949382256 0.000984195439388125 0.00064087891966125 0.000595101853971161 0.000953939598103306 0.00101301724143247 41935 42892 667 665 0 False 507 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 551 635 0.000953197011016122 0.000974627000093504 0.000579842832074464 0.000701915007248035 0.000974032235302642 0.000915821236838538 41666 42475 667 665 0 False 551 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 596 635 0.00104738200824056 0.000934861759571738 0.000839246204318303 0.00080872816052491 0.000840036681379829 0.000706544263072522 45783 40742 667 665 0 False 596 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 637 639 0.00114996289907232 0.0780922092367563 0.00103761348897536 0.0744335088120851 0.000838657681854807 0.0213431906562884 50267 3403319 667 665 0 True 641 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D9_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D9_1.csv new file mode 100755 index 0000000..5575331 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D9_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 250 273 0.0101929808728046 0.0417053161629182 0.0101625085831998 0.0415960936903944 0.00164117324711786 0.00768740085631804 445554 1817550 667 665 0 True 250 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 295 273 0.0100168272467108 0.00993979570120082 0.00997940032043946 0.0100099183642329 0.00137481941270132 0.0013573929245348 437854 433184 667 665 0 False 295 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 338 275 0.0101900983589231 0.0624542358413773 0.0101625085831998 0.0612039368276493 0.00128867087971478 0.008647866026194 445428 2721804 667 665 0 True 339 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 382 274 0.0101562173822679 0.0885700403446244 0.0102082856488899 0.0868085755703059 0.00133641838985173 0.0129406893922026 443947 3859951 667 665 0 True 384 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 427 275 0.0100820269654598 0.0721604881969171 0.0101319905394064 0.0686961165789273 0.00166124964027396 0.0113288027173495 440704 3144810 667 665 0 True 429 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 470 274 0.00999065585083402 0.0649742231522959 0.0100709544518196 0.0684519722285802 0.00175871778651779 0.0165894576432003 436710 2831627 667 665 0 True 473 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 515 273 0.0100430443967762 0.0797480999362678 0.0101472495613031 0.0782330052643626 0.00165463028679285 0.0189970660827943 439000 3475484 667 665 0 True 518 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 560 272 0.0100498388937827 0.0702462725823485 0.00996414129854276 0.0700083924620432 0.00169569144559272 0.0175762819055826 439297 3061387 667 665 0 True 563 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 608 272 0.0100770626359972 0.0101017707922817 0.00994888227664607 0.0101167315175097 0.00238744638869866 0.00192946295063503 440487 440243 667 665 0 False 608 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 647 273 0.0102098870454908 0.0428293439022138 0.0100556954299229 0.0426337071793698 0.00224397444375875 0.00750817127368338 446293 1866536 667 665 0 True 652 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 250 317 0.0100981781940341 0.010059710962001 0.0101472495613031 0.0101319905394064 0.00150796369903314 0.0014972293265738 441410 438410 667 665 0 False 250 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 295 317 0.0102573798932532 0.0103466723572493 0.0102388036926833 0.0103761348897536 0.00143937142900715 0.00143261493991053 448369 450916 667 665 0 False 295 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 338 318 0.0102608800886808 0.101488098823392 0.0102388036926833 0.0981460288395514 0.00131659160771625 0.0196375861191368 448522 4422930 667 665 0 True 339 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 382 318 0.0103136346681317 0.0499465188491944 0.0103150988021668 0.0494392309452964 0.001336672812759 0.0049168046079998 450828 2176708 667 665 0 True 384 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 427 319 0.0102613147534724 0.0761862311994222 0.0102693217364767 0.0751659418631266 0.00166109871122429 0.012112301198361 448541 3320255 667 665 0 True 429 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 471 316 0.0102044880512365 0.0425764571648852 0.0102388036926833 0.0439917601281758 0.00184231179881311 0.0072340322930934 446057 1855515 667 665 0 True 474 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 515 316 0.010183029336785 0.0437517001475995 0.0102388036926833 0.045639734493019 0.00164867373546182 0.00722831145149266 445119 1906733 667 665 0 True 518 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 559 316 0.0100430901509648 0.0509552893449004 0.0100404364080262 0.0517433432516976 0.00172526128829192 0.00800470330790092 439002 2220671 667 665 0 True 563 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 608 316 0.00989832389824772 0.0100165038368409 0.0100099183642329 0.00996414129854276 0.00216662318003271 0.00206799986051996 432674 436527 667 665 0 False 608 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 652 316 0.00965580382159572 0.00970303992987734 0.00971999694819562 0.00978103303578241 0.00199567004623396 0.00183377676614989 422073 422866 667 665 0 False 652 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 249 362 0.0100457210168091 0.0484495973281797 0.0100709544518196 0.0475318532082094 0.00165008374438561 0.00802580661392445 439117 2111471 667 665 0 True 250 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 293 362 0.00998415875605342 0.0570255118225869 0.00991836423285267 0.0601358052948806 0.0014590814475204 0.012638766469247 436426 2485216 667 665 0 True 295 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 340 360 0.0103534408122101 0.0341779144588411 0.0103608758678569 0.0375219348439765 0.00134060720732468 0.0124661200293279 452568 1489500 667 665 0 False 340 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 381 362 0.0102734396134503 0.0349892355057936 0.0103150988021668 0.0359807736324102 0.00133698898028325 0.00475986971800007 449071 1524858 667 665 0 True 384 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 426 362 0.0105504583483035 0.0722395368141113 0.0105897611963073 0.068207827878233 0.00166403262601085 0.0120286414583643 461180 3148255 667 665 0 True 429 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 470 360 0.0103385249467278 0.0333284343841981 0.010452429999237 0.0340886549172198 0.00171750939530989 0.00444186710562668 451916 1452479 667 665 0 True 474 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 518 360 0.0104158037712661 0.0269741875861547 0.0103913939116503 0.0279850461585412 0.00175514149251613 0.00462162617947512 455294 1175556 667 665 0 False 518 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 559 359 0.010226953357837 0.0517089932430068 0.0102693217364767 0.0509803921568627 0.00178621969944383 0.00855085791834873 447039 2253518 667 665 0 True 563 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 603 361 0.0101059335290011 0.0583182148550594 0.0101319905394064 0.0577401388570993 0.0021257056705696 0.0107542367161121 441749 2541553 667 665 0 True 608 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 648 360 0.0101329285002726 0.0645185635179732 0.0101167315175097 0.0630655374990463 0.00198318378661197 0.0172548651719763 442929 2811769 667 665 0 True 653 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 250 405 0.0100855271608874 0.0395906222411143 0.010101472495613 0.0416571297779812 0.00152124194671597 0.00780926482385952 440857 1725390 667 665 0 True 250 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 293 405 0.0100931909874772 0.0310196411146888 0.010101472495613 0.0309300373846036 0.00144029345891907 0.00317654885468601 441192 1351860 667 665 0 True 295 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 338 406 0.0102726160380556 0.0793146978226064 0.0102845807583734 0.0773479819943542 0.00139088692718616 0.0123466759585531 449035 3456596 667 665 0 True 340 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 381 406 0.0106273482622388 0.0636600657055777 0.0105287251087205 0.0632944228274968 0.00165894573511026 0.0140972495666962 464541 2774355 667 665 0 True 384 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 425 405 0.0106619613059115 0.0452641789871795 0.0106355382619974 0.0455939574273289 0.00169047745623558 0.00805145391953337 466054 1972648 667 665 0 True 429 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 470 405 0.0104110224585579 0.0541007359323004 0.0104219119554437 0.0536964980544747 0.00178371433804841 0.00872801735666947 455085 2357752 667 665 0 True 474 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 514 404 0.0104700453618464 0.0423214135131833 0.010452429999237 0.0426947432669566 0.00176850157260265 0.0050207995067211 457665 1844400 667 665 0 True 519 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 558 403 0.0104993051654534 0.0537740781342232 0.0105134660868238 0.053681239032578 0.00173707777148843 0.00728144382023694 458944 2343516 667 665 0 True 563 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 602 404 0.0102741259262792 0.0424990377064199 0.0102998397802701 0.0428320744640269 0.00199896774528449 0.0057594621779933 449101 1852141 667 665 0 True 608 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 647 404 0.010139791628562 0.0840290242658603 0.0100709544518196 0.081727321278706 0.00192439464701929 0.0127790342199692 443229 3662050 667 665 0 True 653 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 249 450 0.0100054344537505 0.0406463170973898 0.0100251773861295 0.0406195162890059 0.00167009489223172 0.00560105404697368 437356 1771398 667 665 0 True 250 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 295 449 0.0102013538893176 0.0490478886619157 0.0102845807583734 0.0478217746242466 0.00162055701051361 0.00709245558880598 445920 2137545 667 665 0 True 295 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 338 450 0.0102156520732538 0.0340972137370205 0.0102998397802701 0.0342870222018769 0.00154228467350924 0.00292730477644431 446545 1485983 667 665 0 True 340 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 382 449 0.0105992323133466 0.0517941454689597 0.0105439841306172 0.0511024643320363 0.00170227735247483 0.00773050188702446 463312 2257229 667 665 0 True 385 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 427 450 0.0108624561603382 0.0916027766830673 0.0108339055466545 0.0912489509422446 0.00188070133719339 0.0135990266442495 474818 3992120 667 665 0 True 429 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 471 448 0.0107343901864586 0.0621420339587811 0.0106355382619974 0.0596780346379797 0.00217522454611712 0.0136735609626344 469220 2708198 667 665 0 True 474 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 515 448 0.0104646692446864 0.0519412286725053 0.0104829480430304 0.050919356069276 0.00183491033779892 0.00666461355366606 457430 2263639 667 665 0 True 519 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 558 448 0.010231483022508 0.0325971256821385 0.0101930266269932 0.0329289692530709 0.00191709218749573 0.0037977944142475 447237 1420608 667 665 0 True 563 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 603 448 0.0102044651741422 0.0389422859047367 0.0101472495613031 0.0389868009460594 0.00212027664023184 0.00372279706167264 446056 1697135 667 665 0 True 608 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 647 448 0.0101801925770921 0.0716082951714374 0.0101319905394064 0.069214923323415 0.00201383116397712 0.0137030581839671 444995 3120745 667 665 0 True 653 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 252 494 0.0099919827223033 0.0539041584276553 0.00997940032043946 0.0542305638208591 0.00151238192123852 0.011278972818916 436768 2349185 667 665 0 True 251 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 295 493 0.0100861448424334 0.0551049172484886 0.0101930266269932 0.0536659800106813 0.00157151599621388 0.00666828479417706 440884 2401515 667 665 0 True 295 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 340 494 0.0103204749193268 0.0680969762469805 0.0103150988021668 0.064286259250782 0.00155188015710944 0.0153931520290976 451127 2967719 667 665 0 True 340 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 384 494 0.0106734227301547 0.0810498895441855 0.0106813153276875 0.0771801327534905 0.00171714092932328 0.0143282212675943 466555 3532217 667 665 0 True 385 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 428 492 0.0108798198749103 0.0927768723709021 0.0109102006561379 0.0885328450446326 0.0019460772419487 0.0242870633959912 475577 4043288 667 665 0 True 429 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 472 492 0.0106657131493763 0.0459047596101721 0.0106355382619974 0.0457160296025025 0.00204647676247264 0.00769356434713826 466218 2000565 667 665 0 True 474 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 516 492 0.0104088262575053 0.0398415815230454 0.0104371709773404 0.0408331425955596 0.00177658062910351 0.00470930920235553 454989 1736327 667 665 0 True 519 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 560 492 0.0103339724049625 0.102408206370814 0.0104371709773404 0.101960784313725 0.00188052682169801 0.0152320515138491 451717 4463029 667 665 0 True 564 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 605 493 0.0105137177348611 0.0642634510285785 0.0105592431525139 0.0648966201266499 0.0021816460511781 0.0169732742461001 459574 2800651 667 665 0 True 608 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 649 492 0.0101161595901523 0.0769514768840159 0.0101625085831998 0.0744029907682918 0.00191187803178669 0.0109486195543431 442196 3353605 667 665 0 True 653 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 252 537 0.00994684621525356 0.053608936509275 0.00993362325474937 0.055741206988632 0.00140499739538656 0.00941367229714182 434795 2336319 667 665 0 True 251 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 295 536 0.0103575129349951 0.0996253967489105 0.0103303578240635 0.0971389333943694 0.00144143445100399 0.0230476704018266 452746 4341752 667 665 0 True 295 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 340 538 0.0105290453880407 0.0557374438614274 0.0105592431525139 0.0571908140688182 0.00147176798387026 0.00979895498452921 460244 2429081 667 665 0 True 340 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 383 537 0.0107825464699557 0.05694058905561 0.0105897611963073 0.0554818036163882 0.00202971424938481 0.00621253940653158 471325 2481515 667 665 0 True 385 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 428 536 0.0105904475091363 0.0551081985118438 0.0106507972838941 0.054535744258793 0.00199567837260595 0.00562164594868227 462928 2401658 667 665 0 True 430 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 472 535 0.0106285836253308 0.0627900490525926 0.0106202792401007 0.0611886778057526 0.00207711091322703 0.0103592645460279 464595 2736439 667 665 0 True 474 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 517 534 0.0103768669567711 0.0718038860024862 0.0102998397802701 0.0688792248416877 0.00220588642170125 0.0146558638501824 453592 3129269 667 665 0 True 519 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 560 534 0.0103416819857409 0.0592233157854581 0.0103456168459602 0.0586709391927977 0.00190831607532546 0.0175876008864567 452054 2580998 667 665 0 True 564 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 605 534 0.0110029443964216 0.0504690198831939 0.0105592431525139 0.0493629358358129 0.00339545866061024 0.00601298724575322 480959 2199479 667 665 0 True 608 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 649 534 0.010409192291014 0.065979528817466 0.0103913939116503 0.0659342336156252 0.0021664589152913 0.0111428945463864 455005 2875439 667 665 0 True 653 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 252 578 0.00965024468768134 0.0445654075679012 0.00965896086060884 0.0452582589456016 0.00129071605730536 0.00687531772425428 421830 1942195 667 665 0 True 251 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 296 578 0.0100501820501971 0.0526099639118396 0.0100556954299229 0.0516823071641108 0.001458169243586 0.00871072530464414 439312 2292783 667 665 0 True 296 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 340 578 0.0104179084639415 0.0437539717914608 0.0104371709773404 0.0438544289311055 0.00152678831516685 0.0057609980121753 455386 1906832 667 665 0 True 340 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 384 578 0.0110662224392496 0.0474832308512182 0.0106507972838941 0.046646829938201 0.00328480570859731 0.00517467204812931 483725 2069356 667 665 0 True 385 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 428 577 0.0104099701122202 0.0880647946256119 0.0103761348897536 0.0837567711909667 0.0019571620009635 0.0153352077694991 455039 3837932 667 665 0 True 430 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 472 576 0.0104087576262224 0.0595789771980879 0.0104982070649271 0.0584115358205539 0.00207883651138175 0.00777461901209503 454986 2596498 667 665 0 True 474 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 516 574 0.0101363600644173 0.0514572996923529 0.0101167315175097 0.0514839398794537 0.00215063889135563 0.00581552317782068 443079 2242549 667 665 0 True 519 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 560 574 0.0100666535580916 0.0351451069881158 0.0100862134737163 0.0359807736324102 0.00184866608826708 0.00573332135244978 440032 1531651 667 665 0 True 564 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 605 575 0.0102980782440091 0.0481942094880139 0.0102998397802701 0.0473334859235523 0.00180614435781725 0.00724122271574362 450148 2100341 667 665 0 True 609 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 649 575 0.0102985129088008 0.0538851592244516 0.0102235446707866 0.0527351796749828 0.00187678566272096 0.00831168877145427 450167 2348357 667 665 0 True 653 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 251 622 0.00969467200480785 0.00963154051298996 0.00964370183871214 0.00965896086060884 0.00143850733159146 0.00133864076251422 423772 419750 667 665 0 False 251 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 296 622 0.00993915951156946 0.00963665744815231 0.00978103303578241 0.00959792477302205 0.00215527788887483 0.00136755338683038 434459 419973 667 665 0 False 296 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 340 620 0.00994771554483687 0.0645374709375866 0.00994888227664607 0.0626077668421454 0.00149468799498202 0.00866072249739601 434833 2812593 667 665 0 True 340 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 384 620 0.0104885300540391 0.0719068671908657 0.0103761348897536 0.067505912870985 0.00166119121713246 0.0164938313756507 458473 3133757 667 665 0 True 385 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 430 621 0.00995240534916794 0.0101545922485316 0.00991836423285267 0.0101472495613031 0.00172201363756019 0.00185373052121639 435038 442545 667 665 0 False 430 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 475 621 0.00999250889547215 0.00974232330654973 0.010101472495613 0.00965896086060884 0.00191803429354454 0.00192427881534821 436791 424578 667 665 0 False 475 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 519 621 0.00968007641864579 0.00978307522066783 0.00965896086060884 0.00975051499198901 0.00195301429528966 0.00192570242619193 423134 426354 667 665 0 False 519 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 564 621 0.00986634172041926 0.00977070738186735 0.00987258716716258 0.00976577401388571 0.00175168844264612 0.00194403325784212 431276 425815 667 665 0 False 564 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 609 621 0.00989477794863154 0.00963612969250776 0.00993362325474937 0.00967421988250553 0.00158447238346295 0.00150238991038617 432519 419950 667 665 0 False 609 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 653 620 0.00983360459847897 0.00971097921044314 0.00984206912336919 0.00968947890440223 0.00153777527823818 0.00158925442560999 429845 423212 667 665 0 False 653 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 252 671 0.00979709275597953 0.040163810762888 0.00970473792629892 0.0396124208438239 0.00160955035445531 0.00817809051366789 428249 1750370 667 665 0 True 251 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 296 665 0.00981978683352304 0.0095618767679097 0.00985732814526589 0.00956740672922866 0.0013880747345833 0.00127143867741102 429241 416714 667 665 0 False 296 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 341 665 0.00978295471170343 0.0095698160484755 0.0097962920576791 0.00952162966353857 0.00123886957380904 0.00138185954116491 427631 417060 667 665 0 False 341 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 385 665 0.00980075309106719 0.0096462947251397 0.0098115510795758 0.00973525597009232 0.00135320579198005 0.00120775003735413 428409 420393 667 665 0 False 385 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 430 665 0.00969970496555339 0.00965705635110895 0.00973525597009232 0.00965896086060884 0.00161227774684384 0.0014785895118547 423992 420862 667 665 0 False 430 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 475 664 0.00974598532731803 0.00975356679636835 0.00978103303578241 0.00968947890440223 0.00172422455197429 0.00149612811031972 426015 425068 667 665 0 False 475 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 519 664 0.00976641457252605 0.00948390660790222 0.00987258716716258 0.00956740672922866 0.00181313690692009 0.00168224900985928 426908 413316 667 665 0 False 519 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 564 664 0.00973582789744976 0.00961960864624367 0.00975051499198901 0.00959792477302205 0.00152283954074893 0.00167124087081526 425571 419230 667 665 0 False 564 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 609 664 0.00976339479607873 0.0098481038944351 0.00975051499198901 0.00985732814526589 0.00139720036636055 0.00141169401756213 426776 429188 667 665 0 False 609 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 649 670 0.00983104236391761 0.0406789461637614 0.00984206912336919 0.0408331425955596 0.00141355412374804 0.0081286381592972 429733 1772820 667 665 0 True 654 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D9_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D9_2.csv new file mode 100755 index 0000000..377cbf9 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D9_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 250 273 0.00841323444480552 0.77118837377261 0.00839246204318303 0.762996871900511 0.00203851967165878 0.168279169155431 367758 33608987 667 665 13 True 250 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 295 273 0.00691306898622101 0.0066302400542441 0.00683604180972 0.00669871061264973 0.00153444374911781 0.00128639056741934 302183 288951 667 665 0 False 295 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 338 275 0.00637422190712838 0.00665694907903772 0.00636301213092241 0.00656137941557946 0.00125539624829252 0.00149494587908966 278629 290115 667 665 0 True 339 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 382 274 0.0066033131294275 0.00630461482155836 0.00663767452506294 0.00628671702143893 0.00118921953981683 0.00119581825733288 288643 274760 667 665 0 True 384 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 427 275 0.00670410960690403 0.00691208451433 0.00665293354695964 0.00692759594110018 0.00155030525116109 0.00152632075928673 293049 301234 667 665 0 True 429 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 470 274 0.00694301510265696 0.0069643093772426 0.00698863202868696 0.00701915007248035 0.00165296301550542 0.00184177387845339 303492 303510 667 665 0 True 473 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 515 273 0.00697522605142839 0.00712651392729937 0.00689707789730678 0.00718699931334401 0.0015494742264326 0.00157434941941815 304900 310579 667 665 0 True 518 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 560 272 0.00740005369254032 0.00734124163693739 0.00740062561989776 0.00749217975127794 0.00165917657663299 0.00153808807788389 323470 319937 667 665 0 True 563 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 608 272 0.00944995572710326 0.00815687651263659 0.00845349813076982 0.00813305867093919 0.00531031358910749 0.00192611263244556 413075 355483 667 665 0 False 608 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 647 273 0.00983081359297463 0.799607258016866 0.00987258716716258 0.796246280613413 0.00226994928327071 0.154388374834659 429723 34847504 667 665 17 True 652 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 250 317 0.00708149015444212 0.00669972023214365 0.00700389105058366 0.00668345159075303 0.00163974412748497 0.00137094894362416 309545 291979 667 665 0 False 250 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 295 317 0.00670994326595 0.00646438710647069 0.00665293354695964 0.0063935301747158 0.0013378683401499 0.00130797696295868 293304 281723 667 665 0 False 295 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 338 318 0.00660628715168623 0.00665325478952589 0.00665293354695964 0.00665293354695964 0.00121557698083053 0.00127602654001721 288773 289954 667 665 0 True 339 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 382 318 0.00675290644904144 0.0068604791906523 0.00675974670023652 0.0068055237659266 0.00131791109621435 0.00122613950290655 295182 298985 667 665 0 True 384 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 427 319 0.00687054046792122 0.00704528544983424 0.00686655985351339 0.00708018616006714 0.00155418346778719 0.0016612421266658 300324 307039 667 665 0 True 429 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 471 316 0.00698137998979453 0.00681483980034775 0.00703440909437705 0.0068207827878233 0.00163246552967951 0.0016002523964411 305169 296996 667 665 0 True 474 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 515 316 0.0071882346764361 0.00701384957013729 0.0072480354009308 0.00697337300679027 0.00163410988968376 0.00151964126411484 314211 305669 667 665 0 True 518 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 559 316 0.00724028006596381 0.00726905384312234 0.00727855344472419 0.0072480354009308 0.0017357791043694 0.00134571586238413 316486 316791 667 665 0 True 563 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 608 316 0.00769473354419151 0.007618244512632 0.00775158312352178 0.0076600289921416 0.00201417276119068 0.00203896494590728 336351 332009 667 665 0 False 608 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 652 316 0.00800243046249821 0.00758914911448913 0.00802624551766232 0.00758373388265812 0.00203597069977899 0.00182811908490349 349801 330741 667 665 0 False 652 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 249 362 0.00638174847115238 0.00616650346397006 0.00636301213092241 0.00616464484626535 0.00147741871404366 0.00156325694559646 278958 268741 667 665 0 True 250 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 293 362 0.00654133908097451 0.00649164683280644 0.00656137941557946 0.00650034332799268 0.00134008174847441 0.00142219517602538 285934 282911 667 665 0 True 295 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 340 360 0.00665927050208016 0.00678551494322898 0.00671396963454643 0.00677500572213321 0.00124933675460301 0.00136056276265106 291089 295718 667 665 0 False 340 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 381 362 0.00706602523869674 0.00710476121638498 0.00711070420386053 0.00709544518196384 0.00134470832985621 0.00134337919696711 308869 309631 667 665 0 True 384 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 426 362 0.00711335794679909 0.00705976431121291 0.00715648126955062 0.00701915007248035 0.00151538432225992 0.00169965311495331 310938 307670 667 665 0 True 429 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 470 360 0.00711527962272011 0.00736746879788164 0.00714122224765393 0.00732433051041428 0.00167349339352691 0.00165806527897855 311022 321080 667 665 0 True 474 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 518 360 0.00701857814512291 0.00705627653477938 0.00694285496299687 0.00708018616006714 0.00166977021795899 0.00170147385667759 306795 307518 667 665 0 False 518 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 559 359 0.007216487887894 0.00719553518724713 0.00720225833524071 0.0072327763790341 0.00163693967796721 0.00163029897133304 315446 313587 667 665 0 True 563 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 603 361 0.00728868799749816 0.00723178970543778 0.0072632944228275 0.00729381246662089 0.00191569635563191 0.00198582173262093 318602 315167 667 665 0 True 608 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 648 360 0.006818609463865 0.00694303853017758 0.00689707789730678 0.00704966811627375 0.00195381236112147 0.00194919081164411 298054 302583 667 665 0 True 653 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 250 405 0.00634345221529771 0.00647478159807851 0.00636301213092241 0.0064087891966125 0.00150408864220905 0.00154613368106975 277284 282176 667 665 0 True 250 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 293 405 0.00654671519813451 0.00658721649626469 0.00657663843747616 0.00659189745937285 0.00131351345398757 0.00126303511409136 286169 287076 667 665 0 True 295 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 338 406 0.00686333418321739 0.00691566407435389 0.00685130083161669 0.00689707789730678 0.00130176716219819 0.00130086261292895 300009 301390 667 665 0 True 340 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 381 406 0.00720729129598625 0.00718215772895273 0.0072327763790341 0.00712596322575723 0.00137498929089544 0.00137449623977474 315044 313004 667 665 0 True 384 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 425 405 0.00704452077005672 0.00736136518912296 0.00704966811627375 0.00737010757610437 0.00151735252807662 0.00153757084834895 307929 320814 667 665 0 True 429 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 470 405 0.00713483953834481 0.00732120986834218 0.00718699931334401 0.00735484855420768 0.00161206434223637 0.00154085052306539 311877 319064 667 665 0 True 474 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 514 404 0.0072328678874113 0.00695630125898404 0.0072327763790341 0.00697337300679027 0.00167781427526914 0.00167507453906539 316162 303161 667 665 0 True 519 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 558 403 0.00722101755256499 0.00731648301343884 0.00720225833524071 0.00732433051041428 0.00172077250525436 0.00159504879608233 315644 318858 667 665 0 True 563 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 602 404 0.00671740119869111 0.00687571526665141 0.00669871061264973 0.00689707789730678 0.00191808029476811 0.00193383847500158 293630 299649 667 665 0 True 608 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 647 404 0.00635628626519883 0.00645509401794713 0.00633249408712902 0.0064087891966125 0.00179781727639017 0.0017570137739219 277845 281318 667 665 0 True 653 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 249 450 0.00630639132253512 0.00656954815512115 0.00636301213092241 0.00663767452506294 0.00143807597126008 0.00154498461926825 275664 286306 667 665 0 True 250 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 295 449 0.00659512312966886 0.0065865740111322 0.00665293354695964 0.00659189745937285 0.00141925533985247 0.00154071677651041 288285 287048 667 665 0 True 295 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 338 450 0.00675048147704587 0.00673787925983418 0.00675974670023652 0.0068055237659266 0.0013858517486896 0.00146529977178414 295076 293642 667 665 0 True 340 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 382 449 0.00699757697255744 0.00715498978620734 0.00698863202868696 0.00718699931334401 0.00161411451730225 0.00139608042696807 305877 311820 667 665 0 True 385 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 427 450 0.00706739786435462 0.00716834429860414 0.00701915007248035 0.00714122224765393 0.00173181309454577 0.00185897575313578 308929 312402 667 665 0 True 429 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 471 448 0.00725197026115004 0.00704016851467189 0.00721751735713741 0.00706492713817044 0.00188782398429531 0.00194930921595914 316997 306816 667 665 0 True 474 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 515 448 0.00710573987439789 0.00728782358735016 0.00708018616006714 0.00735484855420768 0.00178362471222697 0.00182556659271479 310605 317609 667 665 0 True 519 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 558 448 0.00666915340681685 0.00685031415802037 0.00666819256885634 0.00679026474402991 0.00186259418682067 0.00177514448479135 291521 298542 667 665 0 True 563 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 603 448 0.00632448710412475 0.00619874245008263 0.0063782711528191 0.00624093995574884 0.00172413841617314 0.0018120357418533 276455 270146 667 665 0 True 608 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 647 448 0.0061988918564293 0.00623653434341175 0.00628671702143893 0.00617990386816205 0.00185966553539935 0.00194353007366052 270965 271793 667 665 0 True 653 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 252 494 0.00648586212730211 0.00648285855402984 0.00650034332799268 0.00650034332799268 0.00144556946162287 0.00138906863412753 283509 282528 667 665 0 True 251 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 295 493 0.00655840539332074 0.00654093462082765 0.00662241550316625 0.00656137941557946 0.0014882289848026 0.00141501908610666 286680 285059 667 665 0 True 295 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 340 494 0.00666242754109327 0.00681103078134797 0.00672922865644312 0.00677500572213321 0.00156219124800073 0.0015170172997125 291227 296830 667 665 0 True 340 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 384 494 0.00684981382048733 0.006770439488513 0.00685130083161669 0.0068207827878233 0.00169959702047233 0.00152787259530746 299418 295061 667 665 0 True 385 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 428 492 0.00711411289091092 0.0072198348927939 0.00709544518196384 0.0072480354009308 0.00179505379413754 0.00177812224935863 310971 314646 667 665 0 True 429 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 472 492 0.00707400934460671 0.00715905121008059 0.00714122224765393 0.00718699931334401 0.00191367225102412 0.00174504238574542 309218 311997 667 665 0 True 474 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 516 492 0.00685022560818469 0.00661153914770905 0.00689707789730678 0.00653086137178607 0.00171519707699555 0.00182768540899297 299436 288136 667 665 0 True 519 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 560 492 0.00649549338400152 0.00641629250512411 0.00657663843747616 0.00653086137178607 0.00172320744942477 0.0017944330538633 283930 279627 667 665 0 True 564 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 605 493 0.00641400517411242 0.00620358403447392 0.00631723506523232 0.00622568093385214 0.00181099097919536 0.00178857847708494 280368 270357 667 665 0 True 608 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 649 492 0.00619305819738334 0.00645534642282061 0.00616464484626535 0.00643930724040589 0.00179743675035846 0.00191494563243236 270710 281329 667 665 0 True 653 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 252 537 0.00655721578441724 0.0063550957962542 0.00653086137178607 0.00636301213092241 0.00143777435451925 0.00153801634772095 286628 276960 667 665 0 True 251 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 295 536 0.0068251751899285 0.00675102725915269 0.00688181887541009 0.00672922865644312 0.0015160520895331 0.0015584596039523 298341 294215 667 665 0 True 295 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 340 538 0.00689058080252618 0.00678436764834953 0.00691233691920348 0.0068207827878233 0.0013945093654433 0.00140893289628642 301200 295668 667 665 0 True 340 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 383 537 0.00693608334308469 0.00682275613501596 0.00689707789730678 0.00683604180972 0.00181964463958292 0.0015286746191902 303189 297341 667 665 0 True 385 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 428 536 0.00695166264430156 0.00692369513851004 0.00703440909437705 0.00697337300679027 0.0017772229701666 0.00190241363640998 303870 301740 667 665 0 True 430 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 472 535 0.00668994868553364 0.00686015794808605 0.00663767452506294 0.00691233691920348 0.00187725805435604 0.00185665923539731 292430 298971 667 665 0 True 474 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 517 534 0.00663085715096217 0.00681784571293191 0.00665293354695964 0.00677500572213321 0.00194107451845908 0.00184539648816134 289847 297127 667 665 0 True 519 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 560 534 0.0066468024856878 0.00832892485275904 0.00671396963454643 0.00698863202868696 0.00173954498349063 0.00883938191866361 290544 362981 667 665 0 True 564 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 605 534 0.0066522243570364 0.00658421058368053 0.00656137941557946 0.00657663843747616 0.0019904511484888 0.00156726267462147 290781 286945 667 665 0 True 608 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 649 534 0.00644308196096504 0.00624224787191141 0.00645456626230259 0.00628671702143893 0.00181341214123925 0.00201050889031349 281639 272042 667 665 0 True 653 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 252 578 0.00656661827017368 0.00681130613211904 0.00659189745937285 0.00677500572213321 0.00127199988875285 0.00123106475416681 287039 296842 667 665 0 True 251 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 296 578 0.006757710638844 0.00673730561239446 0.00674448767833982 0.00671396963454643 0.00143375472818889 0.00140596904732788 295392 293617 667 665 0 True 296 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 340 578 0.0069697355487969 0.00679285763045747 0.00700389105058366 0.00685130083161669 0.00131827712050906 0.00147094250381247 304660 296038 667 665 0 True 340 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 384 578 0.00715044171665598 0.00681954370935349 0.00688181887541009 0.00686655985351339 0.00239397924141252 0.00123623408950999 312559 297201 667 665 0 True 385 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 428 577 0.00673979787400875 0.00689420966010816 0.00677500572213321 0.00701915007248035 0.00167838363430374 0.00192017902132207 294609 300455 667 665 0 True 430 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 472 576 0.00669770402050062 0.00673060541029846 0.00668345159075303 0.00685130083161669 0.00189737913942675 0.00184739037613176 292769 293325 667 665 0 True 474 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 516 574 0.00650324871896851 0.00657388492976548 0.00650034332799268 0.00657663843747616 0.00192850293980148 0.00195710452587224 284269 286495 667 665 0 True 519 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 560 574 0.00666512703822042 0.00682259551373283 0.00669871061264973 0.00686655985351339 0.00183480143869311 0.00187188920648098 291345 297334 667 665 0 True 564 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 605 575 0.00653326346668735 0.00654825436215854 0.00656137941557946 0.00653086137178607 0.00165679850632202 0.0014920208963306 285581 285378 667 665 0 True 609 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 649 575 0.00671358072394336 0.0066076842369141 0.00669871061264973 0.00654612039368277 0.00161783467329546 0.00149828167724436 293463 287968 667 665 0 True 653 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 251 622 0.00699526638603335 0.00691722439538994 0.00701915007248035 0.00697337300679027 0.00137451857759107 0.00138011169706931 305776 301458 667 665 0 False 251 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 296 622 0.0068207827878233 0.00666055158495919 0.00675974670023652 0.00662241550316625 0.00165466504254582 0.00136588831632265 298149 290272 667 665 0 False 296 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 340 620 0.00647327972543826 0.00669630129340288 0.00645456626230259 0.00668345159075303 0.00138541940416348 0.00154349713084827 282959 291830 667 665 0 True 340 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 384 620 0.00660180324120384 0.00654182951083362 0.00651560234988937 0.00654612039368277 0.00142897745117191 0.00123694432617324 288577 285098 667 665 0 True 385 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 430 621 0.00639387333113027 0.00649894362823975 0.00643930724040589 0.00656137941557946 0.00168851888566348 0.00164137199138935 279488 283229 667 665 0 False 430 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 475 621 0.00648972835623845 0.00642670994262952 0.00646982528419928 0.0064087891966125 0.00189848841678945 0.00195817366430921 283678 280081 667 665 0 False 475 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 519 621 0.00653541391355135 0.006516795536564 0.00653086137178607 0.00653086137178607 0.00196968235232505 0.00189584393535096 285675 284007 667 665 0 False 519 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 564 621 0.00648000559116185 0.00655029654704397 0.00650034332799268 0.00663767452506294 0.00165224431953286 0.00179017787694375 283253 285467 667 665 0 False 564 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 609 621 0.00650388927760885 0.00643329541523757 0.0064087891966125 0.00646982528419928 0.00140968416416949 0.00136420062323522 284297 280368 667 665 0 False 609 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 653 620 0.00667441513850536 0.00663517342222574 0.00675974670023652 0.00663767452506294 0.00152159465313603 0.00144458483858084 291751 289166 667 665 0 False 653 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 252 671 0.00912468920037578 0.759511367110842 0.00883497367818723 0.744075684748608 0.00209663589163387 0.178092731207787 398857 33100094 667 665 14 True 251 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 296 665 0.00741291061953573 0.00682947928300954 0.0072327763790341 0.00685130083161669 0.00176696675964052 0.00139154950385104 324032 297634 667 665 0 False 296 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 341 665 0.00645969073142532 0.0063908225588003 0.00645456626230259 0.00634775310902571 0.00134013088470034 0.00122609633504007 282365 278517 667 665 0 False 341 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 385 665 0.00625075422920263 0.00623545588622506 0.00619516289005875 0.00621042191195544 0.00126649138599515 0.00127794137711891 273232 271746 667 665 0 False 385 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 430 665 0.00620241492895118 0.00623983855266456 0.00624093995574884 0.00622568093385214 0.00157189927560916 0.001430628751241 271119 271937 667 665 0 False 430 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 475 664 0.0063403180533789 0.00629701972945639 0.0064087891966125 0.00622568093385214 0.00164134240597726 0.00144350595043142 277147 274429 667 665 0 False 475 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 519 664 0.00645575587120608 0.00633008476788217 0.00646982528419928 0.00643930724040589 0.00163834504893419 0.00161656079576568 282193 275870 667 665 0 False 519 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 564 664 0.00641839757621761 0.00639114380136654 0.0063935301747158 0.0063935301747158 0.00157703387216562 0.00161879980122287 280560 278531 667 665 0 False 564 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 609 664 0.00722698847417674 0.0068358352966417 0.00703440909437705 0.00689707789730678 0.00189011064901897 0.00134134532173874 315905 297911 667 665 0 False 609 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 649 670 0.00853558114511067 0.775830627151536 0.00849927519645991 0.781094071869993 0.00189647704336504 0.196516988074738 373106 33811300 667 665 17 True 654 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D9_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D9_3.csv new file mode 100755 index 0000000..5e110ee --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_D9_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 250 273 0.00104170848885468 0.07869889876901 0.000839246204318303 0.0757763027389944 0.000825201942426453 0.0204117170078624 45535 3429759 667 665 0 True 250 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 295 273 0.000972642541169333 0.000860058133431542 0.000869764248111696 0.000747692072938125 0.000674402123391095 0.000617458063101038 42516 37482 667 665 0 False 295 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 338 275 0.000948804608910926 0.000936880998559571 0.000869764248111696 0.000839246204318303 0.000653807631447229 0.000683798220025788 41474 40830 667 665 0 True 339 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 382 274 0.000994879076826887 0.000888648721827457 0.000900282291905089 0.00080872816052491 0.00069694964638174 0.000623323179815419 43488 38728 667 665 0 True 384 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 427 275 0.000965207485522517 0.000974099244448957 0.000747692072938125 0.000717174029144732 0.000796697189255225 0.000837829760315205 42191 42452 667 665 0 True 429 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 470 274 0.00094093488847245 0.0010544557778057 0.000701915007248035 0.000778210116731518 0.000851465494462819 0.000971171198458472 41130 45954 667 665 0 True 473 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 515 273 0.00101766466274759 0.00100289634592317 0.000823987182421607 0.000762951094834821 0.000839707153921446 0.000908740637323858 44484 43707 667 665 0 True 518 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 560 272 0.00108021063855804 0.00105505237114301 0.00080872816052491 0.000839246204318303 0.000939937646229802 0.000844659917994852 47218 45980 667 665 0 True 563 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 608 272 0.00118212809365516 0.00109422101832746 0.000839246204318303 0.000793469138628214 0.00116669200864973 0.00107040452562113 51673 47687 667 665 0 False 608 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 647 273 0.00117295437884171 0.0830891603006142 0.000915541313801785 0.0796978713664454 0.00103472723878162 0.0209149346726078 51272 3621090 667 665 0 True 652 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 250 317 0.000974266814864484 0.00098056998756906 0.000778210116731518 0.000793469138628214 0.000822179966130546 0.000762264352852405 42587 42734 667 665 0 False 250 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 295 317 0.000942787933110579 0.00096820214876858 0.000793469138628214 0.000839246204318303 0.000729238145930559 0.000704710501487582 41211 42195 667 665 0 False 295 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 338 318 0.00090625321351684 0.000981281310394319 0.00080872816052491 0.000839246204318303 0.000670162250892026 0.000736435687333511 39614 42765 667 665 0 True 339 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 382 318 0.00101906016549976 0.000953769179185088 0.000869764248111696 0.000823987182421607 0.000751461008734838 0.000663329484881888 44545 41566 667 665 0 True 384 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 427 319 0.0010588434324838 0.00093153460442133 0.00080872816052491 0.000656137941557946 0.000890307656880366 0.000875236229207506 46284 40597 667 665 0 True 429 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 471 316 0.000932676257430909 0.000926463561054157 0.000671396963454643 0.000717174029144732 0.000873871807604006 0.000841310108169226 40769 40376 667 665 0 True 474 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 515 316 0.000994673182978206 0.00098688010940604 0.000747692072938125 0.000762951094834821 0.000922335186350816 0.000882156688768488 43479 43009 667 665 0 True 518 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 559 316 0.0011317527320112 0.0010607200078475 0.000900282291905089 0.000915541313801785 0.000990423875381788 0.00080208053965892 49471 46227 667 665 0 True 563 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 608 316 0.00109425717445695 0.00107405157434672 0.000747692072938125 0.000595101853971161 0.00109921766043343 0.0011565565591414 47832 46808 667 665 0 False 608 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 652 316 0.00105749368392023 0.00110066881554998 0.000747692072938125 0.000747692072938125 0.00103092440302547 0.00102640808669069 46225 47968 667 665 0 False 652 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 249 362 0.000957726675687105 0.000941217773203895 0.000793469138628214 0.000717174029144732 0.000788527264797678 0.000822570127926361 41864 41019 667 665 0 True 250 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 293 362 0.000962004692320811 0.000916413257910168 0.000823987182421607 0.000778210116731518 0.000737452304990046 0.000706514514207369 42051 39938 667 665 0 True 295 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 340 360 0.000945350167671943 0.000963360564377297 0.00080872816052491 0.000869764248111696 0.000684924945600075 0.000735613495611284 41323 41984 667 665 0 False 340 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 381 362 0.00106481435409555 0.000954870582269361 0.000900282291905089 0.000839246204318303 0.000741603093668843 0.000704725307315781 46545 41614 667 665 0 True 384 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 426 362 0.000994284272375142 0.000939152642420884 0.000747692072938125 0.000701915007248035 0.000859724431339355 0.000835043624579774 43462 40929 667 665 0 True 429 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 470 360 0.00104653555575154 0.000943764767836276 0.000747692072938125 0.000686655985351339 0.000959237027672403 0.00086775516048685 45746 41130 667 665 0 True 474 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 518 360 0.0010175502772761 0.00104966008520959 0.000747692072938125 0.000686655985351339 0.000922209322166705 0.000984804796224748 44479 45745 667 665 0 False 518 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 559 359 0.00104349290220992 0.0010565438544863 0.00080872816052491 0.000732433051041428 0.000939178210648915 0.00100392871359562 45613 46045 667 665 0 True 563 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 603 361 0.000944801117408794 0.00110236681197156 0.000503547722590982 0.000778210116731518 0.00105964250114994 0.00116200880361862 41299 48042 667 665 0 True 608 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 648 360 0.00106154292961096 0.0010770115951357 0.000686655985351339 0.000671396963454643 0.00105235759168144 0.00108824305168114 46402 46937 667 665 0 True 653 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 250 405 0.000846338103550651 0.000880434090490589 0.000701915007248035 0.000717174029144732 0.000727919007164262 0.000754985339968547 36995 38370 667 665 0 True 250 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 293 405 0.000897628548966533 0.000956155552534346 0.000778210116731518 0.000839246204318303 0.000707076159009395 0.000726635115700851 39237 41670 667 665 0 True 295 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 338 406 0.00101123619924988 0.00101441518651286 0.000885023270008392 0.000885023270008392 0.000759980872560765 0.000680006955257748 44203 44209 667 665 0 True 340 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 381 406 0.00103905474591612 0.000900764155754458 0.000854505226215 0.000793469138628214 0.000826883046863525 0.000683742645656529 45419 39256 667 665 0 True 384 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 425 405 0.00101219703721039 0.000892251227748933 0.000793469138628214 0.000686655985351339 0.00085607177888977 0.000760033634061396 44245 38885 667 665 0 True 429 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 470 405 0.000963560334733068 0.000962213269497846 0.000686655985351339 0.000747692072938125 0.000894778962672843 0.000829307627665964 42119 41934 667 665 0 True 474 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 514 404 0.0010458492429226 0.000948147434275779 0.000823987182421607 0.000686655985351339 0.000920912673957384 0.000911998985253949 45716 41321 667 665 0 True 519 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 558 403 0.00107133432597046 0.000939427993191952 0.000747692072938125 0.000762951094834821 0.00100252396880507 0.00081642053534623 46830 40941 667 665 0 True 563 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 602 404 0.000978476200215296 0.000917331093813729 0.00064087891966125 0.000442511635004196 0.00100336488504463 0.0010303949847173 42771 39978 667 665 0 True 608 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 647 404 0.00100785038929379 0.00101216648854914 0.000656137941557946 0.000778210116731518 0.00102976782905116 0.000951192263639061 44055 44111 667 665 0 True 653 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 249 450 0.000958275725950254 0.00091659682509088 0.000793469138628214 0.000732433051041428 0.000822987287267546 0.000821675075163824 41888 39946 667 665 0 True 250 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 295 449 0.000968844943515882 0.00101478232087428 0.00080872816052491 0.000869764248111696 0.000850671806138696 0.000839016138199956 42350 44225 667 665 0 True 295 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 338 450 0.000946814301707009 0.00103703984153563 0.000778210116731518 0.000900282291905089 0.000807657487356438 0.000825501931843668 41387 45195 667 665 0 True 340 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 382 449 0.0010197236012344 0.00100718722877232 0.000900282291905089 0.000885023270008392 0.000790328137788119 0.00077577290492472 44574 43894 667 665 0 True 385 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 427 450 0.00108025639274663 0.000976875698057228 0.000732433051041428 0.000534065766384375 0.00104471520909083 0.00102363277256509 47220 42573 667 665 0 True 429 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 471 448 0.00100471622737498 0.0010063841223567 0.000686655985351339 0.000671396963454643 0.000991768631581669 0.00102015109395909 43918 43859 667 665 0 True 474 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 515 448 0.000984172596695473 0.00114874047099897 0.000686655985351339 0.000946059357595178 0.000941439588236254 0.00102281120265833 43020 50063 667 665 0 True 519 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 558 448 0.00101295198132223 0.000976095537539202 0.000686655985351339 0.000595101853971161 0.00100327878605816 0.00101296402766116 44278 42539 667 665 0 True 563 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 603 448 0.000992957400905864 0.000972355356232192 0.000656137941557946 0.000579842832074464 0.00102062499834702 0.000999853458882087 43404 42376 667 665 0 True 608 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 647 448 0.00100185659058775 0.000912879589681459 0.000656137941557946 0.000473029678797589 0.00101501726399603 0.00102499373688901 43793 39784 667 665 0 True 653 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 252 494 0.000930457179284013 0.000905972874507165 0.000778210116731518 0.000732433051041428 0.000733825957409614 0.00073495741355396 40672 39483 667 665 0 True 251 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 295 493 0.000859126399263175 0.00089697808265227 0.000701915007248035 0.000732433051041428 0.000779549253785129 0.000786116838309192 37554 39091 667 665 0 True 295 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 340 494 0.000925721620764349 0.000982635118352072 0.000823987182421607 0.000854505226215 0.00080229942044067 0.000843355598312877 40465 42824 667 665 0 True 340 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 384 494 0.000967174915632136 0.00100140486257989 0.00080872816052491 0.000793469138628214 0.000823247951420932 0.000830535061943462 42277 43642 667 665 0 True 385 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 428 492 0.000936222207047083 0.00100177199694131 0.000625619897764553 0.00064087891966125 0.000975800126713895 0.00101404822531135 40924 43658 667 665 0 True 429 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 472 492 0.00106138278995087 0.000978068884731857 0.000778210116731518 0.000625619897764553 0.00100671383281601 0.000961294276275557 46395 42625 667 665 0 True 474 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 516 492 0.000971132652945672 0.000993809770477923 0.000625619897764553 0.000717174029144732 0.000952959510644505 0.00090453007231907 42450 43311 667 665 0 True 519 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 560 492 0.000932584749053718 0.0010151724011333 0.000579842832074464 0.000671396963454643 0.000968285151887693 0.00103097568600394 40765 44242 667 665 0 True 564 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 605 493 0.000924440503483667 0.000926670074132459 0.000564583810177768 0.000595101853971161 0.000929357046937941 0.000963484559014451 40409 40385 667 665 0 True 608 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 649 492 0.000969256731213244 0.00107180287638299 0.00064087891966125 0.000717174029144732 0.000987505215232896 0.00108174503814864 42368 46710 667 665 0 True 653 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 252 537 0.000865509108572287 0.000963016375913462 0.000732433051041428 0.000747692072938125 0.000716718565099671 0.000849714494753964 37833 41969 667 665 0 True 251 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 295 536 0.00102500821001722 0.000962190323600257 0.000930800335698482 0.00080872816052491 0.000797050084065509 0.000840054517888421 44805 41933 667 665 0 True 295 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 340 538 0.000963468826355877 0.000959826896148588 0.000900282291905089 0.000839246204318303 0.000744231901855238 0.000775266946928845 42115 41830 667 665 0 True 340 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 383 537 0.000999660389535148 0.000953218477642951 0.000823987182421607 0.000747692072938125 0.000836941112556071 0.000831733597247499 43697 41542 667 665 0 True 385 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 428 536 0.000956399804217827 0.000935228893933162 0.000625619897764553 0.000534065766384375 0.000992020249598189 0.000987478777122832 41806 40758 667 665 0 True 430 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 472 535 0.000965138854239623 0.0009917675855925 0.000534065766384375 0.000610360875867857 0.00103081170091328 0.00104834242121396 42188 43222 667 665 0 True 474 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 517 534 0.00101141921600427 0.00108882873239404 0.000701915007248035 0.000793469138628214 0.000999227127390485 0.00104770290113349 44211 47452 667 665 0 True 519 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 560 534 0.000972482401509248 0.00111120098254333 0.000701915007248035 0.000686655985351339 0.000900583901563157 0.00124815327190447 42509 48427 667 665 0 True 564 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 605 534 0.000979574300741595 0.000853013742871713 0.000671396963454643 0.000625619897764553 0.000919750416915992 0.000798361531683375 42819 37175 667 665 0 True 608 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 649 534 0.00102807374065313 0.00100732490415785 0.000686655985351339 0.000518806744487678 0.00100968421348585 0.0011544515243929 44939 43900 667 665 0 True 653 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 252 578 0.000894242739010444 0.000993580311502033 0.000778210116731518 0.000854505226215 0.000666838699055692 0.000661309289175225 39089 43301 667 665 0 True 251 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 296 578 0.000909456006718545 0.00103779705615607 0.000762951094834821 0.000915541313801785 0.000736494845165919 0.000820784659935827 39754 45228 667 665 0 True 296 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 340 578 0.00095310550263893 0.000935848433168066 0.000823987182421607 0.000793469138628214 0.000727459886588297 0.000771991275153603 41662 40785 667 665 0 True 340 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 384 578 0.0010240931262453 0.00110603815558581 0.000854505226215 0.00102235446707866 0.000792051987808444 0.000731752026261883 44765 48202 667 665 0 True 385 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 428 577 0.000957429273461232 0.000944292523480824 0.000625619897764553 0.000473029678797589 0.000975233282058335 0.00102803016569908 41851 41153 667 665 0 True 430 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 472 576 0.0010045103335263 0.000988830510701106 0.000579842832074464 0.000686655985351339 0.00109921879169814 0.000945660161680451 43909 43094 667 665 0 True 474 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 516 574 0.00102988103110267 0.000952530100715281 0.000610360875867857 0.000488288700694286 0.00110652549680445 0.0010884931169853 45018 41512 667 665 0 True 519 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 560 574 0.000971933351246098 0.000939886911143733 0.000625619897764553 0.00064087891966125 0.000941408528134319 0.000920316177278087 42485 40961 667 665 0 True 564 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 605 575 0.000954867038899868 0.000951635210709309 0.000717174029144732 0.000717174029144732 0.00084921913187727 0.000827377941817042 41739 41473 667 665 0 True 609 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 649 575 0.00101061851770384 0.00104830627725184 0.000717174029144732 0.000839246204318303 0.000916895483486314 0.000840934669269684 44176 45686 667 665 0 True 653 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 251 622 0.00100393840616885 0.000966527098244581 0.000869764248111696 0.000839246204318303 0.000697051558357595 0.000712386403708779 43884 42122 667 665 0 False 251 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 296 622 0.000966580111180391 0.000976393834207859 0.000839246204318303 0.000869764248111696 0.000727742211483531 0.000710266984096211 42251 42552 667 665 0 False 296 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 340 620 0.000978590585686786 0.00094741316555293 0.000885023270008392 0.000823987182421607 0.000718357159417657 0.000735474659519864 42776 41289 667 665 0 True 340 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 384 620 0.000966465725708901 0.00099504884894773 0.000823987182421607 0.000869764248111696 0.000733716642057122 0.000714545452710185 42246 43365 667 665 0 True 385 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 430 621 0.000980374999042022 0.000948055650685423 0.000656137941557946 0.00064087891966125 0.000942888645289486 0.00092536672745135 42854 41317 667 665 0 False 430 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 475 621 0.000920093855567067 0.000915541313801785 0.000518806744487678 0.000488288700694286 0.00101093591602806 0.00100009941684272 40219 39900 667 665 0 False 475 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 519 621 0.000952510698187185 0.000988440430442093 0.000503547722590982 0.00064087891966125 0.00104796100925479 0.00102572914685593 41636 43077 667 665 0 False 519 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 564 621 0.00101546846169499 0.00093153460442133 0.000717174029144732 0.000579842832074464 0.000962729217962167 0.000926407578442353 44388 40597 667 665 0 False 564 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 609 621 0.000972665418263631 0.000906890710410726 0.000762951094834821 0.000732433051041428 0.000794267930337097 0.000718764874103506 42517 39523 667 665 0 False 609 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 653 620 0.00101729862923883 0.000925017969506049 0.000823987182421607 0.000762951094834821 0.000814030088643633 0.000761854067091205 44468 40313 667 665 0 False 653 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 252 671 0.00103296943883288 0.0780617370847581 0.000869764248111696 0.0737163347829404 0.000717705412572586 0.022370251937459 45153 3401991 667 665 0 True 251 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 296 665 0.000969782904382096 0.000989358266345654 0.000823987182421607 0.000900282291905089 0.000717503907326894 0.000665895690808453 42391 43117 667 665 0 False 296 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 341 665 0.000979940334250362 0.000985893435809712 0.000839246204318303 0.000854505226215 0.000677398927094007 0.000690875044234709 42835 42966 667 665 0 False 341 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 385 665 0.00106444832058679 0.000932406548529713 0.000946059357595178 0.000823987182421607 0.000750678139510751 0.000639876884298607 46529 40635 667 665 0 False 385 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 430 665 0.000891543241883293 0.000918661955873892 0.000701915007248035 0.000732433051041428 0.000790579432178816 0.000747533585793698 38971 40036 667 665 0 False 430 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 475 664 0.000949719692682841 0.00093224592724659 0.000701915007248035 0.000732433051041428 0.000836992200170625 0.000773898749798711 41514 40628 667 665 0 False 475 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 519 664 0.000968295893252733 0.000894385196224712 0.00064087891966125 0.000610360875867857 0.000932883669947594 0.000819716181643601 42326 38978 667 665 0 False 519 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 564 664 0.000988587875894966 0.00102145957707269 0.000823987182421607 0.000778210116731518 0.000802733460465143 0.000850722810523205 43213 44516 667 665 0 False 564 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 609 664 0.00097996321134466 0.000998054761531891 0.000854505226215 0.000839246204318303 0.000707317371866407 0.000769986125979861 42836 43496 667 665 0 False 609 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 649 670 0.00117679773068375 0.0810681315327687 0.00103761348897536 0.0780193789578088 0.000819368563050014 0.0253454359935723 51440 3533012 667 665 0 True 654 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E10_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E10_1.csv new file mode 100755 index 0000000..9f6388e --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E10_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 269 259 0.0103360084663551 0.0407093724239645 0.0103608758678569 0.0408941786831464 0.00150239489360414 0.00802795741675527 451806 1774146 667 665 0 True 268 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 312 258 0.0101769440297018 0.0103122764567633 0.0101777676050965 0.0102082856488899 0.00129958047246487 0.00162592158027091 444853 449417 667 665 0 False 312 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 356 260 0.0103527544993811 0.0612127021605283 0.0102998397802701 0.061173418783856 0.00140500297728705 0.00822433407444704 452538 2667697 667 665 0 True 357 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 400 260 0.0102872573784062 0.0836048464030298 0.0103913939116503 0.0831006332494087 0.00145756231099188 0.0114231440122194 449675 3643564 667 665 0 True 402 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 446 260 0.0101895721857542 0.0686250531340941 0.0101625085831998 0.0651712825207904 0.00162571703833757 0.012402646092454 445405 2990733 667 665 0 True 446 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 489 259 0.0100818668257997 0.0603545026448015 0.0100709544518196 0.0658274204623484 0.00160462423250258 0.0155643614203673 440697 2630296 667 665 0 True 491 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 534 258 0.0102640600047882 0.0758763468524825 0.0102693217364767 0.0755016403448539 0.00162520353625589 0.0230276208274823 448661 3306750 667 665 0 True 536 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 578 257 0.0104365075416057 0.064856189455098 0.010452429999237 0.0639505607690547 0.00180588067589182 0.0159399300115941 456199 2826483 667 665 0 True 580 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 625 257 0.0102386664301175 0.0103173016083353 0.0101930266269932 0.0102998397802701 0.00185992744877621 0.00178540627992848 447551 449636 667 665 0 False 625 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 665 259 0.0103666180185256 0.0424628979177172 0.0101472495613031 0.0419775692378119 0.00260796844967073 0.00734202880960094 453144 1850566 667 665 0 True 670 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 268 302 0.0100729218819293 0.0100890587650174 0.0101319905394064 0.0100862134737163 0.00146323411712593 0.00150591469285599 440306 439689 667 665 0 False 268 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 312 302 0.0100944263505693 0.010104822596661 0.010101472495613 0.0101625085831998 0.00126310719485211 0.00125696289396348 441246 440376 667 665 0 False 312 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 356 304 0.0102428758154683 0.0933661918586808 0.0101930266269932 0.0918745708400092 0.00138808665506851 0.0214287118893177 447735 4068971 667 665 0 True 357 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 401 304 0.0101929808728046 0.0519860649563942 0.0102235446707866 0.0523842221713588 0.00145019490160558 0.00688676591229209 445554 2265593 667 665 0 True 402 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 445 304 0.0102283717376835 0.0714071055413769 0.0101472495613031 0.069413290608072 0.00188819013136036 0.0143394526976623 447101 3111977 667 665 0 True 446 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 490 301 0.0101209409028605 0.0424532606407298 0.0101319905394064 0.043930724040589 0.00182863860376089 0.00881778952685439 442405 1850146 667 665 0 True 491 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 533 301 0.010024445319112 0.0410933261283215 0.0100556954299229 0.0434882124055848 0.00153722238993965 0.00791747861094706 438187 1790879 667 665 0 True 536 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 579 302 0.00989878144013367 0.0491676433014328 0.0098268101014725 0.0505378805218586 0.00179106077021553 0.00738167036421577 432694 2142764 667 665 0 True 581 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 625 301 0.00999433906301599 0.0101451155928273 0.0101167315175097 0.0101167315175097 0.0019096932053635 0.0019533103979084 436871 442132 667 665 0 False 625 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 670 301 0.00999074735921122 0.00975072150506731 0.00987258716716258 0.00971999694819562 0.0022032448060781 0.00185979957014387 436714 424944 667 665 0 False 670 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 269 348 0.00983667012911489 0.04596930642009 0.0098268101014725 0.0465247577630274 0.00145541891413354 0.0094746236895699 429979 2003378 667 665 0 True 268 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 313 348 0.00989315367493639 0.0566667756596802 0.00993362325474937 0.0609903105210956 0.00137543247695209 0.0124358852777812 432448 2469582 667 665 0 True 312 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 357 348 0.0100836969933436 0.0371198997723193 0.0101319905394064 0.0382848859388113 0.00136020899190278 0.00561038036330163 440777 1617714 667 665 0 True 357 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 402 347 0.0102981926294806 0.0335032132861336 0.0103150988021668 0.0338139925230793 0.00159182691061923 0.00389860430604737 450153 1460096 667 665 0 True 402 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 447 347 0.0101962065431006 0.0658352909052214 0.0101777676050965 0.0639200427252613 0.00170591618298844 0.00784571030195428 445695 2869153 667 665 0 True 447 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 490 346 0.0101548905107986 0.0318382589570745 0.0101319905394064 0.0324406805523766 0.00171611177707007 0.00411266005613562 443889 1387536 667 665 0 True 491 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 533 345 0.00992952825487005 0.0272133985685202 0.00988784618905928 0.0280766002899214 0.00178080776974202 0.00433563287394391 434038 1185981 667 665 0 True 536 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 579 346 0.00989763758541878 0.0500432587534297 0.00993362325474937 0.0495155260547799 0.00203274621215678 0.00864929113506087 432644 2180924 667 665 0 True 581 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 624 345 0.0099267830035543 0.0577216444636425 0.00999465934233616 0.0568245975432975 0.00216322442420289 0.0131711346435918 433918 2515554 667 665 0 True 625 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 667 347 0.0102097726600193 0.0574911299764632 0.00991836423285267 0.0581368734264134 0.00302277371225927 0.0135787513793252 446288 2505508 667 665 0 True 670 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 270 392 0.00992735493091175 0.0406593503672204 0.00993362325474937 0.0433203631647211 0.00151122681865203 0.00774979214574289 433943 1771966 667 665 0 True 268 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 313 392 0.00995535649433237 0.0304055630034115 0.00997940032043946 0.0308690012970169 0.00136810071229825 0.00324914272003586 435167 1325098 667 665 0 True 313 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 358 392 0.0100365701790899 0.0776694999113715 0.0100099183642329 0.0762035553521019 0.00139777968386496 0.0161868186220963 438717 3384897 667 665 0 True 357 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 402 392 0.0101491941143184 0.06044883322979 0.0100862134737163 0.0611886778057526 0.00169536845749482 0.0120856872257163 443640 2634407 667 665 0 True 402 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 446 392 0.0105269864495539 0.0423386688281702 0.0104676890211337 0.0435950255588617 0.0017651244086596 0.0070349388016216 460154 1845152 667 665 0 True 447 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 491 390 0.0101791402307544 0.0511506736628708 0.0101319905394064 0.0519264515144579 0.00180857493922651 0.00885140616853528 444949 2229186 667 665 0 True 491 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 536 390 0.010281629613209 0.0414520852371258 0.0102845807583734 0.042069123369192 0.00167414012334182 0.0055270504495651 449429 1806514 667 665 0 True 536 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 579 390 0.0101357881370599 0.0485451899375355 0.010101472495613 0.0493476768139162 0.00197251516455096 0.00754713875158909 443054 2115637 667 665 0 True 581 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 623 389 0.0100624670498351 0.0409041372027 0.0100862134737163 0.042221713588159 0.00208531703755794 0.00652376500262477 439849 1782634 667 665 0 True 625 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 668 390 0.0100160494255047 0.0813502283977281 0.00997940032043946 0.0782330052643626 0.00187770421840643 0.0137689290465385 437820 3545306 667 665 0 True 670 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 271 435 0.00985000747509056 0.0399905921819885 0.00987258716716258 0.0404974441138323 0.00149872961919472 0.00538160670609283 430562 1742821 667 665 0 True 268 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 315 436 0.00989889582560517 0.0449579659838541 0.00990310521095598 0.044632639047837 0.00151188544257928 0.00450270852387157 432699 1959303 667 665 0 True 313 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 359 435 0.0101506353712592 0.0332843782608272 0.0102235446707866 0.0341496910048066 0.0014525696660145 0.00391084118524835 443703 1450559 667 665 0 True 357 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 402 435 0.0104487010328665 0.0544004552466082 0.0104982070649271 0.0516823071641108 0.00163301572859505 0.0141164146859413 456732 2370814 667 665 0 True 402 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 448 434 0.0107900272797911 0.104424668905039 0.0105897611963073 0.103562981612879 0.00198001518166486 0.0198335031724064 471652 4550908 667 665 0 True 447 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 491 433 0.010390455950784 0.0548080432254819 0.0103608758678569 0.0566720073243305 0.00201982572000801 0.0120359803287342 454186 2388577 667 665 0 True 492 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 536 433 0.010228646262815 0.0498734132194758 0.0102082856488899 0.0491187914854658 0.00172076343111482 0.00687114319084763 447113 2173522 667 665 0 True 536 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 580 433 0.0101311669640117 0.0318516823071641 0.0101930266269932 0.0320439459830625 0.00193039876327332 0.00366095750907353 442852 1388121 667 665 0 True 581 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 624 432 0.00990319671933317 0.0375518104026374 0.00996414129854276 0.0382696269169146 0.00192595035379199 0.00438335368889413 432887 1636537 667 665 0 True 626 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 668 434 0.00993897649481508 0.0692896122200672 0.00988784618905928 0.0707408255130846 0.00190323806425948 0.0132487780990377 434451 3019695 667 665 0 True 670 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 271 479 0.00977176781259176 0.0476681518398881 0.00973525597009232 0.049256122682536 0.00155521502826746 0.00985241959048574 427142 2077415 667 665 0 True 268 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 316 479 0.010113139813705 0.0501250838242321 0.0101472495613031 0.0500953688868544 0.00168096277739533 0.00427886536078691 442064 2184490 667 665 0 True 313 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 360 480 0.0103358940808836 0.066851449979951 0.0103608758678569 0.0624246585793851 0.00164778309677655 0.0162852685720739 451801 2913438 667 665 0 True 358 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 404 479 0.0109180474994821 0.0833160952277696 0.0104829480430304 0.0790569924467842 0.00307239707175989 0.0173355351139135 477248 3630980 667 665 0 True 402 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 448 479 0.0110450840041183 0.0898205229255331 0.0106355382619974 0.0868238345922026 0.00298678244387928 0.0250290337003464 482801 3914448 667 665 0 True 447 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 493 478 0.0104819414508813 0.0413252862070489 0.010406652933547 0.0418097199969482 0.00211597302413182 0.00460035701042559 458185 1800988 667 665 0 True 492 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 537 477 0.0102554353402379 0.0378006816078879 0.0102845807583734 0.0386663614862287 0.00182895349615181 0.00535673592090099 448284 1647383 667 665 0 True 536 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 581 477 0.0102845121270905 0.0963543672640057 0.01025406271458 0.0928206301976043 0.00201489415041611 0.0176869320336362 449555 4199198 667 665 0 True 581 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 626 477 0.0100986586130144 0.0597139908595017 0.0101625085831998 0.061875333791104 0.00199889373826032 0.0157624729211948 441431 2602382 667 665 0 True 626 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 670 478 0.0102042592802935 0.0685597261636582 0.0101319905394064 0.0668650339513237 0.00202960080596204 0.0103247765904455 446047 2987886 667 665 0 True 670 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 271 523 0.00974861619316229 0.0448496154554388 0.00967421988250553 0.0479438467994202 0.00146536462729653 0.00894201162689265 426130 1954581 667 665 0 True 268 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 315 523 0.0103035001153577 0.0951315115437942 0.0101319905394064 0.0893415732051576 0.00183582269057929 0.0221231247263894 450385 4145905 667 665 0 True 313 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 361 522 0.0110654217409492 0.0545812000819169 0.0103608758678569 0.056244754711223 0.00662551286379802 0.00999721695203303 483690 2378691 667 665 0 True 358 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 404 522 0.0111626036375266 0.0560191047543326 0.0104371709773404 0.0558175020981155 0.00664543680236647 0.00556187775153371 487938 2441356 667 665 0 True 402 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 449 522 0.0104213171509919 0.0544507756000209 0.0103761348897536 0.0545662623025864 0.00196223048837854 0.00617431200478 455535 2373007 667 665 0 True 447 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 492 520 0.0104451550832503 0.0638623796846201 0.0104982070649271 0.061020828564889 0.00187489880779972 0.0164132346119467 456577 2783172 667 665 0 True 492 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 537 520 0.0104302163406738 0.0718882351220234 0.0104219119554437 0.0696574349584192 0.00194019891432908 0.0153510694092524 455924 3132945 667 665 0 True 536 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 581 519 0.0102567393346129 0.0575003771731916 0.0103608758678569 0.0574349584191653 0.00180832495537757 0.0131033918918353 448341 2505911 667 665 0 True 581 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 624 517 0.00994181325450802 0.0476005532255909 0.00997940032043946 0.046997787441825 0.00195551345919241 0.00685864829867269 434575 2074469 667 665 0 True 626 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 669 519 0.0100523782512497 0.0620535545776779 0.00993362325474937 0.0624399176012818 0.00198574737225693 0.0120172011778122 439408 2704342 667 665 0 True 671 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 272 564 0.00943918061568895 0.0410102619790492 0.00941481651026169 0.0415655756466011 0.00133263767011406 0.00793231786423408 412604 1787259 667 665 0 True 268 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 316 564 0.00989235297663597 0.0513532629926843 0.00987258716716258 0.0512397955291066 0.00147552579231699 0.0104917643201628 432413 2238015 667 665 0 True 313 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 360 564 0.0102466734131218 0.0424494057299348 0.0101625085831998 0.04272526131075 0.00138179156977352 0.00649915757229199 447901 1849978 667 665 0 True 358 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 404 563 0.0102434248657315 0.0451427492971385 0.0101472495613031 0.0451972228580148 0.00165497902075841 0.004736560904357 447759 1967356 667 665 0 True 403 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 448 562 0.0102297443633413 0.0798718242160677 0.0102693217364767 0.0756237125200275 0.00196656682038623 0.0166849461146422 447161 3480876 667 665 0 True 447 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 492 561 0.0103005489701933 0.0577997752449331 0.0104219119554437 0.0571145189593347 0.00215219162981428 0.00940335116602142 450256 2518959 667 665 0 True 492 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 537 561 0.0100887299540891 0.0511393613353595 0.0101167315175097 0.0511482413977264 0.00197704782719679 0.00545844188113439 440997 2228693 667 665 0 True 537 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 582 560 0.00981038434776661 0.0351508893543082 0.00985732814526589 0.0368963149462119 0.0017838715601091 0.00635222002138984 428830 1531903 667 665 0 True 581 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 626 560 0.00980743320260218 0.0459664381828914 0.0097962920576791 0.0458991378652628 0.00169761761877514 0.00628346908525726 428701 2003253 667 665 0 True 626 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 668 560 0.00993689467923397 0.0544768880314772 0.00993362325474937 0.0538185702296483 0.00171786732218022 0.00745249814367575 434360 2374145 667 665 0 True 671 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 269 607 0.00935188162384818 0.00947514127502322 0.00941481651026169 0.00949111161974517 0.00141471963198233 0.00138613034867675 408788 412934 667 665 0 False 269 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 313 607 0.00931893860805921 0.00955054149450073 0.00930800335698482 0.00950637064164187 0.00152761648777071 0.00137685618832896 407348 416220 667 665 0 False 313 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 359 606 0.00976815323169269 0.0639267888191525 0.0097962920576791 0.0618295567254139 0.00142813757138617 0.00861554605780432 426984 2785979 667 665 0 True 358 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 404 607 0.00990903037837913 0.0721909603489153 0.00987258716716258 0.0698558022430762 0.00145762744702804 0.0161714818263282 433142 3146138 667 665 0 True 403 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 447 606 0.00995144451120743 0.0100219190686719 0.00999465934233616 0.0100251773861295 0.00184244940449566 0.0020008659794244 434996 436763 667 665 0 False 447 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 492 606 0.00988963060241452 0.0098556301488443 0.00993362325474937 0.00990310521095598 0.00188847802013623 0.00200267369424972 432294 429516 667 665 0 False 492 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 537 606 0.00963418496748421 0.00945717463721102 0.00973525597009232 0.00946059357595178 0.00194506695991641 0.00205781132479116 421128 412151 667 665 0 False 537 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 581 606 0.00962411904599314 0.00956547927383118 0.00959792477302205 0.00952162966353857 0.00162765470318632 0.00177573208499865 420688 416871 667 665 0 False 581 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 626 606 0.00961663823615773 0.00967759292945112 0.00959792477302205 0.00971999694819562 0.00147335450595894 0.00146264422280452 420361 421757 667 665 0 False 626 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 671 605 0.00967826912819626 0.00971348031328034 0.00967421988250553 0.00975051499198901 0.00163892365366704 0.00169512429080313 423055 423321 667 665 0 False 671 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 270 656 0.00923834260484772 0.0373221678595665 0.00932326237888151 0.0382391088731212 0.00135250367228294 0.00915435751624216 403825 1626529 667 665 0 True 269 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 313 650 0.00921894282888311 0.00936002170681912 0.00920119020370794 0.0093690394445716 0.00132426130964069 0.00133842641858654 402977 407917 667 665 0 False 313 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 358 650 0.0094788723742958 0.00944673425380802 0.00949111161974517 0.00946059357595178 0.00127039390668557 0.00125425318929902 414339 411696 667 665 0 False 358 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 403 650 0.00957102131012772 0.00946919828754766 0.00953688868543526 0.00946059357595178 0.00144279411358392 0.00144321166202405 418367 412675 667 665 0 False 403 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 447 650 0.00957356066759479 0.00961171525747305 0.00962844281681544 0.00964370183871214 0.0016605568707139 0.00164732068510974 418478 418886 667 665 0 False 447 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 492 649 0.00963038736983076 0.00951609970221961 0.00968947890440223 0.00955214770733196 0.00175976916220014 0.00169645138129812 420962 414719 667 665 0 False 492 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 537 649 0.00924799673864144 0.00927108340776409 0.00926222629129473 0.0093690394445716 0.00183073771949323 0.00181458573907694 404247 404041 667 665 0 False 537 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 582 649 0.00959506513623481 0.00952126252917714 0.00961318379491875 0.00955214770733196 0.00138847452511605 0.00130291117463277 419418 414944 667 665 0 False 582 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 626 649 0.00955544200891086 0.00966623471014455 0.00955214770733196 0.00970473792629892 0.00142927679534541 0.00150664237362673 417686 421262 667 665 0 False 626 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 667 655 0.00971379725564089 0.0408262129344877 0.00976577401388571 0.0409399557488365 0.00150057766951835 0.0074226275958074 424608 1779238 667 665 0 True 671 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E10_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E10_2.csv new file mode 100755 index 0000000..a9596b8 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E10_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 269 259 0.00843620304748061 0.73447172520452 0.00836194399938964 0.728892957961395 0.00171269348752952 0.184157425818191 368762 32008847 667 665 12 True 268 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 312 258 0.00738403972653179 0.00726077037409271 0.00738536659800107 0.00721751735713741 0.00135065816055384 0.00138257785461772 322770 316430 667 665 0 False 312 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 356 260 0.0067229145784169 0.00705297232552657 0.00669871061264973 0.00706492713817044 0.00129842596979757 0.00128367823136395 293871 307374 667 665 0 True 357 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 400 260 0.006650119664361 0.00671016061554665 0.00669871061264973 0.00675974670023652 0.00140289501440913 0.00125668690258933 290689 292434 667 665 0 True 402 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 446 260 0.00667331703797906 0.00673076603158159 0.00663767452506294 0.0068055237659266 0.00149693673819262 0.00161584088617021 291703 293332 667 665 0 True 446 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 489 259 0.0068077199669792 0.00694117991247287 0.00675974670023652 0.00698863202868696 0.00158397140048032 0.00155710519622946 297578 302502 667 665 0 True 491 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 534 258 0.00715725909075675 0.00712548136190786 0.0072327763790341 0.0072327763790341 0.00154634167154219 0.00163081179716629 312857 310534 667 665 0 True 536 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 578 257 0.00739753721216755 0.00738066268899532 0.00741588464179446 0.00738536659800107 0.00164077668745567 0.00175658603414493 323360 321655 667 665 0 True 580 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 625 257 0.00862198793027382 0.00816219996087724 0.00833142595559625 0.00819409475852598 0.00288831155806035 0.00193900676534608 376883 355715 667 665 0 False 625 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 665 259 0.00953279368555594 0.748796849069343 0.00929274433508812 0.721110856794079 0.00235810711468009 0.159506563292825 416696 32633147 667 665 12 True 670 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 268 302 0.00682524382121139 0.00692596678237136 0.00675974670023652 0.00701915007248035 0.00162040779387883 0.00143858476855708 298344 301839 667 665 0 False 268 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 312 302 0.00677168854346002 0.00672564909641924 0.00675974670023652 0.00675974670023652 0.00131444043617155 0.0011482870358303 296003 293109 667 665 0 False 312 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 356 304 0.00642098268787328 0.00652471187123221 0.00642404821850919 0.00651560234988937 0.00138888848024878 0.00138758737392463 280673 284352 667 665 0 True 357 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 401 304 0.00664888430126891 0.00671509398352829 0.00663767452506294 0.00674448767833982 0.00145850030567816 0.00137622141023521 290635 292649 667 665 0 True 402 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 445 304 0.00677662999582836 0.00677034770492264 0.00683604180972 0.00672922865644312 0.00171362941185995 0.00177426899172063 296219 295057 667 665 0 True 446 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 490 301 0.00691899415364417 0.00710466943279462 0.00698863202868696 0.00712596322575723 0.00166830176012876 0.00165194654647005 302442 309627 667 665 0 True 491 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 533 301 0.0070164963295418 0.00703704787259979 0.00706492713817044 0.00704966811627375 0.00161760499656258 0.00153153889171079 306704 306680 667 665 0 True 536 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 579 302 0.00732231732611607 0.00721265282684854 0.0072480354009308 0.00733958953231098 0.00176077462328599 0.00194180667706338 320072 314333 667 665 0 True 581 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 625 301 0.00767160480185634 0.0076698498363097 0.00761425192645151 0.00770580605783169 0.00190673168266065 0.00191679841049903 335340 334258 667 665 0 False 625 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 670 301 0.00792551767146868 0.00774522710988962 0.00796520943007553 0.00782787823300526 0.00205584908943231 0.00191621718127883 346439 337543 667 665 0 False 670 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 269 348 0.00614769291939061 0.00627457864161434 0.00610360875867857 0.00631723506523232 0.00147796375835741 0.00152092677162867 268727 273451 667 665 0 True 268 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 313 348 0.00621808573854524 0.00643754040629154 0.00625619897764553 0.00646982528419928 0.00136531356428186 0.001304370970082 271804 280553 667 665 0 True 312 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 357 348 0.00641553793943038 0.00662255317855178 0.0064087891966125 0.00663767452506294 0.00131779475284836 0.00131992418779633 280435 288616 667 665 0 True 357 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 402 347 0.00676830273350393 0.00681176505007082 0.00677500572213321 0.00686655985351339 0.00148601772364011 0.00132438966759925 295855 296862 667 665 0 True 402 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 447 347 0.00698721364884049 0.00697702140450692 0.00695811398489357 0.00698863202868696 0.00170581142993773 0.00168908346493825 305424 304064 667 665 0 True 447 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 490 346 0.00711672087966088 0.00725177558223781 0.00704966811627375 0.00729381246662089 0.00174629551247915 0.00155977515990674 311085 316038 667 665 0 True 491 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 533 345 0.00713749328128337 0.00719014290131371 0.00717174029144732 0.00721751735713741 0.00157456114452266 0.00163470311077713 311993 313352 667 665 0 True 536 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 579 346 0.00738410835781468 0.00747334116935736 0.00732433051041428 0.00756847486076143 0.00186040959993648 0.00205429935310373 322773 325694 667 665 0 True 581 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 624 345 0.0073925957597992 0.00759291224169373 0.00735484855420768 0.00761425192645151 0.00194208688007271 0.00204192814078414 323144 330905 667 665 0 True 625 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 667 347 0.00736171168249704 0.00730094864077107 0.00712596322575723 0.00732433051041428 0.00291079507929311 0.00191006845354147 321794 318181 667 665 0 True 670 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 270 392 0.00637328394626216 0.0061008323050703 0.00636301213092241 0.00608834973678187 0.00145138988547654 0.00145518187316745 278588 265879 667 665 0 True 268 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 313 392 0.00648588500439641 0.0673016484906475 0.00646982528419928 0.0694895857175555 0.00141587992888309 0.0124244490438213 283510 2933058 667 665 0 True 313 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 358 392 0.0068893225623398 0.00706706110664622 0.0068207827878233 0.00701915007248035 0.00131791635916068 0.00139233770940914 301145 307988 667 665 0 True 357 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 402 392 0.00709356926023141 0.00697878823862127 0.00712596322575723 0.00694285496299687 0.00145129309504551 0.00147480218715104 310073 304141 667 665 0 True 402 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 446 392 0.00719644755328905 0.00725381776712323 0.00711070420386053 0.00729381246662089 0.00159326211260745 0.00168286962885423 314570 316127 667 665 0 True 447 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 491 390 0.00699073672136237 0.00726283550487572 0.00700389105058366 0.00720225833524071 0.00171017753234557 0.00172497521053597 305578 316520 667 665 0 True 491 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 536 390 0.00724204160222475 0.00736056208270734 0.00730907148851759 0.00738536659800107 0.00163809820366604 0.00173034337511805 316563 320779 667 665 0 True 536 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 579 390 0.00717366196736834 0.00717903708688063 0.00712596322575723 0.00720225833524071 0.001877909925045 0.00199917505687792 313574 312868 667 665 0 True 581 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 623 389 0.00681300457576202 0.00657611068183161 0.0068207827878233 0.00672922865644312 0.00198664382451899 0.00189971357240387 297809 286592 667 665 0 True 625 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 668 390 0.00638200011918966 0.0063880919969872 0.0063935301747158 0.00636301213092241 0.00184538398211257 0.00201552066466318 278969 278398 667 665 0 True 670 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 271 435 0.00636751891849909 0.00635367315060368 0.00631723506523232 0.0063935301747158 0.00152224901336974 0.00154001609298143 278336 276898 667 665 0 True 268 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 315 436 0.00666986259674008 0.00684581676209292 0.00665293354695964 0.00686655985351339 0.00147976352861972 0.0014745325671343 291552 298346 667 665 0 True 313 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 359 435 0.00692114460050817 0.00694629684763522 0.00691233691920348 0.00697337300679027 0.00136198594054538 0.00128577719912358 302536 302725 667 665 0 True 357 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 402 435 0.00722778917247716 0.00736687220454432 0.00727855344472419 0.00735484855420768 0.00154244697378289 0.00143576720733767 315940 321054 667 665 0 True 402 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 448 434 0.00734816844267269 0.00750842544677097 0.00741588464179446 0.00755321583886473 0.00173667476320697 0.00178129643445752 321202 327223 667 665 0 True 447 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 491 433 0.00718450571006554 0.00722352918230573 0.00720225833524071 0.00730907148851759 0.001730146785522 0.00178703211931007 314048 314807 667 665 0 True 492 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 536 433 0.00697877200104457 0.00728474883707323 0.00701915007248035 0.00730907148851759 0.001718643005929 0.00157688907195716 305055 317475 667 665 0 True 536 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 580 433 0.00671579980209026 0.00653015004896081 0.00675974670023652 0.00653086137178607 0.00188391335951892 0.00193043053968709 293560 284589 667 665 0 True 581 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 624 432 0.00619207448232853 0.00632251262167779 0.00613412680247196 0.0064087891966125 0.00175326609638688 0.00174398861878259 270667 275540 667 665 0 True 626 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 668 434 0.00608718300497268 0.00632859328453888 0.00614938582436866 0.00628671702143893 0.00185571035486837 0.00189156927929626 266082 275805 667 665 0 True 670 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 271 479 0.00628536727287535 0.00645341896742314 0.00624093995574884 0.00648508430609598 0.0014048305036395 0.00146525090212044 274745 281245 667 665 0 True 268 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 316 479 0.00663758301668575 0.00667711852301846 0.00669871061264973 0.00671396963454643 0.0015603711591519 0.00149147183922774 290141 290994 667 665 0 True 313 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 360 480 0.00683576728458842 0.00677447796648866 0.00691233691920348 0.00675974670023652 0.00160268383024023 0.00151366474022682 298804 295237 667 665 0 True 358 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 404 479 0.00738406260362609 0.00728998050172352 0.00727855344472419 0.00721751735713741 0.00192819875331315 0.00160412971484672 322771 317703 667 665 0 True 402 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 448 479 0.00748565977940304 0.00736320086093008 0.00749217975127794 0.00733958953231098 0.00204836320592965 0.00198449967598663 327212 320894 667 665 0 True 447 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 493 478 0.00706133543436567 0.00721797627508919 0.00692759594110018 0.0072480354009308 0.00190246390888668 0.00176572064012178 308664 314565 667 665 0 True 492 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 537 477 0.0065479505612266 0.00638671524313186 0.00660715648126955 0.00633249408712902 0.00168906001403436 0.00171101748605725 286223 278338 667 665 0 True 536 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 581 477 0.00649229059079982 0.00609069021833595 0.00645456626230259 0.00617990386816205 0.00183460500377662 0.00185665946254608 283790 265437 667 665 0 True 581 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 626 477 0.00614821909255947 0.00616051458469933 0.00619516289005875 0.00617990386816205 0.00177824998196736 0.00161930428026207 268750 268480 667 665 0 True 626 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 670 478 0.00619312682866623 0.00623362021441794 0.00624093995574884 0.00624093995574884 0.00183908614332609 0.00188891004331914 270713 271666 667 665 0 True 670 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 271 523 0.00631380350108763 0.00652214193070224 0.00633249408712902 0.00657663843747616 0.00150752719813078 0.00156417181262258 275988 284240 667 665 0 True 268 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 315 523 0.00658402773893438 0.00647466686859057 0.00659189745937285 0.00643930724040589 0.00148284612736766 0.00164328716638317 287800 282171 667 665 0 True 313 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 361 522 0.00682483203351403 0.00667115258964532 0.00651560234988937 0.00666819256885634 0.00295263866503079 0.00164269131214253 298326 290734 667 665 0 True 358 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 404 522 0.00727708931068913 0.00703057712947968 0.00700389105058366 0.00708018616006714 0.00297821732248693 0.00173094538758304 318095 306398 667 665 0 True 402 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 449 522 0.00697977859319368 0.00671266171838385 0.00700389105058366 0.00671396963454643 0.0019180300808012 0.00188656377092357 305099 292543 667 665 0 True 447 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 492 520 0.00654165936029468 0.00662140588367233 0.00650034332799268 0.00668345159075303 0.00186773568646046 0.00170197484215759 285948 288566 667 665 0 True 492 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 537 520 0.00649599668007608 0.00661500397824499 0.00656137941557946 0.00659189745937285 0.00182398535039542 0.00165750463629466 283952 288287 667 665 0 True 536 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 581 519 0.00617187400806349 0.0061881643912941 0.00621042191195544 0.00621042191195544 0.00162636940037126 0.00165929108412752 269784 269685 667 665 0 True 581 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 624 517 0.00605659632989639 0.00616372701036179 0.00611886778057527 0.00613412680247196 0.00183729956456563 0.00181846476248387 264745 268620 667 665 0 True 626 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 669 519 0.00617901166148443 0.00631620249984081 0.00619516289005875 0.00633249408712902 0.00175965058879783 0.00174060782170414 270096 275265 667 665 0 True 671 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 272 564 0.00644331073190802 0.00660984115128747 0.00645456626230259 0.00657663843747616 0.00137559664671697 0.00128311590149079 281649 288062 667 665 0 True 268 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 316 564 0.00667567337869175 0.00674150471165325 0.00662241550316625 0.00675974670023652 0.00140700021981013 0.00138896953671949 291806 293800 667 665 0 True 313 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 360 564 0.00655435614763001 0.00669657664417395 0.00651560234988937 0.00671396963454643 0.00132277460013126 0.00131787846355689 286503 291842 667 665 0 True 358 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 404 563 0.00667956248472239 0.00668664107051791 0.00674448767833982 0.00671396963454643 0.00156146505503228 0.00144331675661965 291976 291409 667 665 0 True 403 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 448 562 0.00660566947014019 0.00682576204760012 0.00653086137178607 0.00677500572213321 0.00195689954133213 0.00197382758739175 288746 297472 667 665 0 True 447 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 492 561 0.00667359156311064 0.00662890919218394 0.00656137941557946 0.00679026474402991 0.00187722341294058 0.00205761776840817 291715 288893 667 665 0 True 492 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 537 561 0.00643509785505508 0.00665522813671854 0.00653086137178607 0.00671396963454643 0.00181405777363861 0.00179027535121084 281290 290040 667 665 0 True 537 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 582 560 0.006563186706029 0.00664825258385148 0.00656137941557946 0.00668345159075303 0.00157381410884367 0.001548888060876 286889 289736 667 665 0 True 581 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 626 560 0.00649485282536118 0.00644545674095975 0.00653086137178607 0.00643930724040589 0.00161957922184328 0.00160729552351213 283902 280898 667 665 0 True 626 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 668 560 0.0064282804809543 0.00649286296537866 0.00650034332799268 0.0063935301747158 0.00170925347242968 0.00171846873964485 280992 282964 667 665 0 True 671 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 269 607 0.00672957181285759 0.00687149322149503 0.00672922865644312 0.00689707789730678 0.00135135111661777 0.00143383894599665 294162 299465 667 665 0 False 269 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 313 607 0.00672469899177214 0.00659123202834277 0.00685130083161669 0.00660715648126955 0.0014782560672713 0.00141035067718266 293949 287251 667 665 0 False 313 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 359 606 0.0064359671846384 0.00651594653835321 0.0063935301747158 0.00659189745937285 0.00128959083097454 0.00137541789358759 281328 283970 667 665 0 True 358 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 404 607 0.00645742589908982 0.00647565354218689 0.00643930724040589 0.00646982528419928 0.00135704940126346 0.00141095173856388 282266 282214 667 665 0 True 403 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 447 606 0.00648281947376049 0.00651681848246159 0.00646982528419928 0.00657663843747616 0.00175117013432867 0.00202463849039294 283376 284008 667 665 0 False 447 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 492 606 0.00632098690869717 0.00664554496793598 0.0064087891966125 0.00662241550316625 0.0019273402081402 0.00195760536690037 276302 289618 667 665 0 False 492 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 537 606 0.0064924278533656 0.00645153740382084 0.00656137941557946 0.00650034332799268 0.00184717879121737 0.00198427656703795 283796 281163 667 665 0 False 537 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 581 606 0.00656540578417589 0.00635438447342894 0.00660715648126955 0.00634775310902571 0.00167012427532504 0.00184629010627497 286986 276929 667 665 0 False 581 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 626 606 0.00659418516880264 0.00637664199409028 0.00656137941557946 0.00633249408712902 0.00136787080579243 0.00138317660240221 288244 277899 667 665 0 False 626 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 671 605 0.00654758452771783 0.00654433061367082 0.00657663843747616 0.00656137941557946 0.00152307079393388 0.00164406455296125 286207 285207 667 665 0 False 671 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 270 656 0.00852778005595508 0.711762376873748 0.00816357671473259 0.725307087815671 0.0021024433565767 0.226296020520695 372765 31019156 667 665 12 True 269 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 313 650 0.00711292328200743 0.00661438443901009 0.00686655985351339 0.00656137941557946 0.00195762777327692 0.00122091904032048 310919 288260 667 665 0 False 313 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 358 650 0.00613106127183604 0.006316638471895 0.00608834973678187 0.00633249408712902 0.0011959462417412 0.00127779504628279 268000 275284 667 665 0 False 358 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 403 650 0.00608256183192451 0.00619000006310122 0.00602731364919509 0.00611886778057527 0.0013174763733 0.00135834732980533 265880 269765 667 665 0 False 403 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 447 650 0.00615187942764713 0.00638770191672819 0.00608834973678187 0.00646982528419928 0.00163837437150401 0.00161494883513844 268910 278381 667 665 0 False 447 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 492 649 0.0063555084439927 0.00633756513049619 0.0064087891966125 0.00642404821850919 0.00164491348012617 0.0016402790357237 277811 276196 667 665 0 False 492 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 537 649 0.00639035025860839 0.00649479042077613 0.00642404821850919 0.00653086137178607 0.00173229795645758 0.00172021800584915 279334 283048 667 665 0 False 537 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 582 649 0.00645962210014242 0.00629389908738429 0.00650034332799268 0.00627145799954223 0.00138990034193195 0.00129335934877988 282362 274293 667 665 0 False 582 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 626 649 0.00690652613725181 0.00684421054926169 0.00675974670023652 0.00685130083161669 0.00169174821929968 0.00142855440854425 301897 298276 667 665 0 False 626 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 667 655 0.00817705132327405 0.769177739496372 0.00825513084611276 0.760021362630655 0.00151902067070359 0.176262137357812 357434 33521362 667 665 14 True 671 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E10_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E10_3.csv new file mode 100755 index 0000000..9e9bcc6 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E10_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 269 259 0.00105834013640925 0.0749641785856263 0.000823987182421607 0.0731212329289693 0.000819098878818364 0.0210674562841236 46262 3266997 667 665 0 True 268 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 312 258 0.00109668214645252 0.00109591901474905 0.000976577401388571 0.00103761348897536 0.000735542717846234 0.000663801067464494 47938 47761 667 665 0 False 312 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 356 260 0.000933728603768612 0.000937867672155899 0.000823987182421607 0.000823987182421607 0.000669424409394171 0.000680909319960981 40815 40873 667 665 0 True 357 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 400 260 0.000906367598988329 0.000958932006142617 0.000747692072938125 0.00080872816052491 0.000701971182947854 0.000691911070736233 39619 41791 667 665 0 True 402 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 446 260 0.00100986357359201 0.000920084601524411 0.000823987182421607 0.000656137941557946 0.00082350557405021 0.000874005749984669 44143 40098 667 665 0 True 446 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 489 259 0.000996960892407996 0.00101859133987406 0.000793469138628214 0.000839246204318303 0.000852856233842018 0.000869010441561095 43579 44391 667 665 0 True 491 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 534 258 0.00101496516562044 0.00104041288848122 0.000823987182421607 0.00080872816052491 0.000832763919717964 0.000886183970490416 44366 45342 667 665 0 True 536 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 578 257 0.000955759245577486 0.00101535596831401 0.000686655985351339 0.000732433051041428 0.000890698016274118 0.000942446829515143 41778 44250 667 665 0 True 580 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 625 257 0.00108087407429268 0.00112070058414519 0.000778210116731518 0.000762951094834821 0.00104430162760925 0.00101550240288072 47247 48841 667 665 0 False 625 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 665 259 0.0011882134007384 0.0768404875773779 0.000930800335698482 0.0728007934691386 0.00103115409563908 0.0198461959740537 51939 3348768 667 665 0 True 670 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 268 302 0.000965161731333921 0.00101540186010919 0.000793469138628214 0.000869764248111696 0.000740171735496457 0.000814600030322148 42189 44252 667 665 0 False 268 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 312 302 0.000975113267353506 0.00096306226770864 0.000869764248111696 0.000885023270008392 0.000670985532992412 0.000648078812446287 42624 41971 667 665 0 False 312 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 356 304 0.000930319916718226 0.00100383712772432 0.000762951094834821 0.00080872816052491 0.000738208276580979 0.00077037098085323 40666 43748 667 665 0 True 357 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 401 304 0.000905910057102371 0.000924903240018104 0.000762951094834821 0.000778210116731518 0.000718898512381036 0.000687704240596536 39599 40308 667 665 0 True 402 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 445 304 0.000939127598022916 0.000942158555005045 0.000656137941557946 0.000610360875867857 0.000911392178969092 0.000938524664631797 41051 41060 667 665 0 True 446 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 490 301 0.00092723150898801 0.000954342826624813 0.000686655985351339 0.000701915007248035 0.000851349614636953 0.000875669482025936 40531 41591 667 665 0 True 491 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 533 301 0.00101064139479814 0.000984654357339905 0.00080872816052491 0.000839246204318303 0.000842896517074226 0.000804487785470697 44177 42912 667 665 0 True 536 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 579 302 0.000989594468044073 0.00106627291506404 0.000747692072938125 0.000717174029144732 0.000934257096686959 0.00108124834945659 43257 46469 667 665 0 True 581 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 625 301 0.000983920948658196 0.00100071648565222 0.00064087891966125 0.000701915007248035 0.000992990080500754 0.000974410515068073 43009 43612 667 665 0 False 625 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 670 301 0.000996663490182123 0.00110805739457364 0.000686655985351339 0.000747692072938125 0.000996162944461771 0.00102383293206492 43566 48290 667 665 0 False 670 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 269 348 0.000903324945446709 0.000892274173646522 0.000747692072938125 0.000671396963454643 0.000724955170412447 0.000761421327838385 39486 38886 667 665 0 True 268 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 313 348 0.00099517647905276 0.00094367298424592 0.000915541313801785 0.000823987182421607 0.000660658693853659 0.000682104428734515 43501 41126 667 665 0 True 312 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 357 348 0.00104127382406302 0.000955513067401853 0.000946059357595178 0.000839246204318303 0.000707428520509227 0.000692474315302714 45516 41642 667 665 0 True 357 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 402 347 0.000952762346224462 0.00081223888285603 0.000793469138628214 0.000671396963454643 0.00073899188023397 0.000672580710086939 41647 35398 667 665 0 True 402 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 447 347 0.000981221451531044 0.000939427993191952 0.000747692072938125 0.00064087891966125 0.000886005496801499 0.000880924146532996 42891 40941 667 665 0 True 447 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 490 346 0.000982639831377513 0.00102322641118704 0.000762951094834821 0.000778210116731518 0.000866534732343847 0.000887476234631326 42953 44593 667 665 0 True 491 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 533 345 0.000938807318702745 0.00104516268928214 0.000701915007248035 0.000778210116731518 0.000850941292762914 0.000923962778753999 41037 45549 667 665 0 True 536 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 579 346 0.00108551812443515 0.00108084356003307 0.00080872816052491 0.00080872816052491 0.00106180624828843 0.00105608692550947 47450 47104 667 665 0 True 581 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 624 345 0.000887471119098267 0.000988394538646915 0.000457770656900893 0.000564583810177768 0.00102663663335073 0.00106688290103255 38793 43075 667 665 0 True 625 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 667 347 0.00105047041597077 0.00112278866082579 0.000671396963454643 0.000778210116731518 0.00104625606791845 0.00109326541545456 45918 48932 667 665 0 True 670 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 270 392 0.000947752262573222 0.000890163151068332 0.000793469138628214 0.000732433051041428 0.000764382268136628 0.000776055516890922 41428 38794 667 665 0 True 268 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 313 392 0.00104273795809809 0.00652083401453967 0.000961318379491875 0.00650034332799268 0.00072879915454701 0.0017514654818243 45580 284183 667 665 0 True 313 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 358 392 0.000995862791881697 0.000976164375231969 0.000885023270008392 0.00080872816052491 0.000769948125082625 0.000781553600621087 43531 42542 667 665 0 True 357 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 402 392 0.00101308924388801 0.00103860016257168 0.000839246204318303 0.000839246204318303 0.000799881171865561 0.00082305229076504 44284 45263 667 665 0 True 402 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 446 392 0.000989891870269946 0.000964760264130227 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.000876479276511395 0.000846938951678233 43270 42045 667 665 0 True 447 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 491 390 0.000999111339271998 0.000950327294546735 0.000732433051041428 0.000686655985351339 0.00093615568200196 0.000891814906777227 43673 41416 667 665 0 True 491 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 536 390 0.000963262932507196 0.000961387217184642 0.000701915007248035 0.000762951094834821 0.00089597130305109 0.000835989910755282 42106 41898 667 665 0 True 536 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 579 390 0.000987169496048497 0.00111996631542234 0.000625619897764553 0.000839246204318303 0.00105083590661284 0.00107024753886826 43151 48809 667 665 0 True 581 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 623 389 0.000963400195072983 0.00103249655381301 0.00064087891966125 0.000595101853971161 0.00101139488845665 0.00108882499495101 42112 44997 667 665 0 True 625 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 668 390 0.00101748164599321 0.000991790531490089 0.000686655985351339 0.000625619897764553 0.00098984763829416 0.00101144611485939 44476 43223 667 665 0 True 670 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 271 435 0.000950886424492034 0.000967536717738498 0.000762951094834821 0.000747692072938125 0.000835382572826517 0.000898084496252057 41565 42166 667 665 0 True 268 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 315 436 0.000973283099809674 0.0010038830195195 0.000854505226215 0.000869764248111696 0.000739699779510366 0.000778305387286824 42544 43750 667 665 0 True 313 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 359 435 0.000998287763877274 0.00100273572464005 0.000869764248111696 0.000885023270008392 0.000760740888364144 0.000697183607555935 43637 43700 667 665 0 True 357 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 402 435 0.000950589022266162 0.00100197851001961 0.000793469138628214 0.000823987182421607 0.000795963051269797 0.000830344215990581 41552 43667 667 665 0 True 402 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 448 434 0.00104433935469894 0.00105344615831178 0.000823987182421607 0.000747692072938125 0.000956021978449489 0.000997463924446962 45650 45910 667 665 0 True 447 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 491 433 0.0010121512830218 0.000894867060074081 0.000762951094834821 0.000595101853971161 0.000936230515078236 0.000906749108310906 44243 38999 667 665 0 True 492 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 536 433 0.00105074494110235 0.000998008869736713 0.000793469138628214 0.000762951094834821 0.000958111878676263 0.000882840358926729 45930 43494 667 665 0 True 536 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 580 433 0.00104232617040072 0.00104897170828192 0.000671396963454643 0.000717174029144732 0.0010493317772683 0.00103556160551204 45562 45715 667 665 0 True 581 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 624 432 0.000955347457880124 0.00093527478572834 0.000503547722590982 0.000610360875867857 0.00101109081550817 0.000901513687154603 41760 40760 667 665 0 True 626 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 668 434 0.000942421899601813 0.000934150436746478 0.000503547722590982 0.000549324788281071 0.00100416831278323 0.000965946488847161 41195 40711 667 665 0 True 670 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 271 479 0.0009740837981101 0.000911433998133351 0.00080872816052491 0.000747692072938125 0.000818455059659016 0.000807399197741416 42579 39721 667 665 0 True 268 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 316 479 0.000953311396487611 0.000991561072514199 0.000854505226215 0.000885023270008392 0.000813881820810904 0.000850144166696847 41671 43213 667 665 0 True 313 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 360 480 0.00103923776267051 0.00099036788583957 0.000885023270008392 0.000839246204318303 0.000872716091918365 0.000833263712644355 45427 43161 667 665 0 True 358 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 404 479 0.000988931032309435 0.000939359155499185 0.00080872816052491 0.000747692072938125 0.000862708714314624 0.000840286215501535 43228 40938 667 665 0 True 402 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 448 479 0.00107819745425982 0.000998330112302959 0.000717174029144732 0.000610360875867857 0.00107826795010219 0.00109674063048796 47130 43508 667 665 0 True 447 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 493 478 0.00101828234429363 0.00103169344739739 0.000686655985351339 0.000671396963454643 0.00099794296649066 0.00102289696002101 44511 44962 667 665 0 True 492 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 537 477 0.000959785614173916 0.000947711462221587 0.000656137941557946 0.000625619897764553 0.000913806400276294 0.000893086089378026 41954 41302 667 665 0 True 536 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 581 477 0.000973168714338185 0.000940322883197924 0.000579842832074464 0.000457770656900893 0.00101041196629452 0.00106477090268418 42539 40980 667 665 0 True 581 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 626 477 0.000961821675566428 0.000896633894188435 0.000595101853971161 0.000564583810177768 0.00100128231844038 0.000884608758842905 42043 39076 667 665 0 True 626 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 670 478 0.000942284637036025 0.000899066159332871 0.000549324788281071 0.000442511635004196 0.000986232453768036 0.000949496253234426 41189 39182 667 665 0 True 670 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 271 523 0.000925858883330136 0.000960239922305191 0.000701915007248035 0.00080872816052491 0.000818716654753754 0.000827918058345937 40471 41848 667 665 0 True 268 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 315 523 0.00102544287480888 0.000953379098926075 0.000915541313801785 0.00080872816052491 0.000785946437830414 0.000826175604421875 44824 41549 667 665 0 True 313 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 361 522 0.000981015557682363 0.000945531601950631 0.000839246204318303 0.000823987182421607 0.000785334575511381 0.000785444759790865 42882 41207 667 665 0 True 358 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 404 522 0.000957863938252892 0.000951887615582789 0.000701915007248035 0.000701915007248035 0.000890262554631916 0.000885792213689433 41870 41484 667 665 0 True 402 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 449 522 0.000956445558406423 0.000993763878682745 0.000625619897764553 0.000686655985351339 0.00097648284658633 0.001030964769328 41808 43309 667 665 0 True 447 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 492 520 0.00100094150681583 0.000998398949995726 0.000747692072938125 0.000701915007248035 0.00092737475280801 0.00094617907551423 43753 43511 667 665 0 True 492 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 537 520 0.000919270280172342 0.000951015671474406 0.000671396963454643 0.000671396963454643 0.000922896715788602 0.000897630047530301 40183 41446 667 665 0 True 536 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 581 519 0.000933659972485719 0.000917812957663098 0.000595101853971161 0.000625619897764553 0.000920161424385716 0.000841406442395462 40812 39999 667 665 0 True 581 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 624 517 0.000973260222715376 0.00101248773111538 0.000610360875867857 0.000656137941557946 0.000976739221665697 0.00104926231146318 42543 44125 667 665 0 True 626 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 669 519 0.00102089033304359 0.000885757538731241 0.000732433051041428 0.000473029678797589 0.00103806888865235 0.000966790056713804 44625 38602 667 665 0 True 671 518 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 272 564 0.000839978271335836 0.00100865576621802 0.000701915007248035 0.000930800335698482 0.000700170316712744 0.000677719826806971 36717 43958 667 665 0 True 268 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 316 564 0.000976668909765763 0.000954939419962128 0.000915541313801785 0.000869764248111696 0.000716265421792011 0.000716511412519799 42692 41617 667 665 0 True 313 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 360 564 0.0010774196330537 0.000930685606210537 0.000961318379491875 0.000839246204318303 0.000763999259768592 0.000665607618850404 47096 40560 667 665 0 True 358 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 404 563 0.000971521563548736 0.000909185300169628 0.000778210116731518 0.000747692072938125 0.00084548525921768 0.000748539330966936 42467 39623 667 665 0 True 403 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 448 562 0.000917051202025446 0.00100691187800125 0.000473029678797589 0.000579842832074464 0.0010010159598307 0.00109102642847008 40086 43882 667 665 0 True 447 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 492 561 0.000954501005391102 0.00101283191957922 0.000518806744487678 0.000534065766384375 0.0010506440887709 0.00112064485623651 41723 44140 667 665 0 True 492 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 537 561 0.00100606597593856 0.000943695930143509 0.000595101853971161 0.000534065766384375 0.00106459049260945 0.00100714499434541 43977 41127 667 665 0 True 537 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 582 560 0.000973420362375461 0.0010182930432054 0.000701915007248035 0.000747692072938125 0.000868968091610903 0.0009022307575027 42550 44378 667 665 0 True 581 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 626 560 0.000890353632979802 0.000970359063141947 0.00064087891966125 0.00064087891966125 0.00086077173513213 0.000933971166661853 38919 42289 667 665 0 True 626 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 668 560 0.000956056647803359 0.000922126786409833 0.000610360875867857 0.000610360875867857 0.000939335926111623 0.000874816218840218 41791 40187 667 665 0 True 671 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 269 607 0.00095658282097221 0.000964829101822994 0.000823987182421607 0.000839246204318303 0.000721848056997008 0.000695476538902313 41814 42048 667 665 0 False 269 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 313 607 0.000979894580061766 0.000960607056666615 0.00080872816052491 0.000839246204318303 0.000789312100964215 0.000745318451792518 42833 41864 667 665 0 False 313 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 359 606 0.000993826730489185 0.000904940309115659 0.000839246204318303 0.00080872816052491 0.000774886885789706 0.000754881724704153 43442 39438 667 665 0 True 358 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 404 607 0.000856792935644789 0.000861572562672417 0.00064087891966125 0.000686655985351339 0.00076262090863085 0.000715243082643828 37452 37548 667 665 0 True 403 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 447 606 0.000906756509591393 0.000974007460858601 0.000518806744487678 0.000503547722590982 0.00095211878880509 0.00107080681064693 39636 42448 667 665 0 False 447 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 492 606 0.00091364251497506 0.000899823373953309 0.000442511635004196 0.000457770656900893 0.00102331070439612 0.00103415494080741 39937 39215 667 665 0 False 492 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 537 606 0.000992225333888332 0.000958656655371549 0.000610360875867857 0.000473029678797589 0.00105334578905842 0.00106525610879685 43372 41779 667 665 0 False 537 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 581 606 0.000886304387289075 0.000998398949995726 0.000610360875867857 0.000671396963454643 0.000833224207136325 0.00097269523410981 38742 43511 667 665 0 False 581 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 626 606 0.000909661900567226 0.000958771384859494 0.000701915007248035 0.000778210116731518 0.000765870568860602 0.000731277787333039 39763 41784 667 665 0 False 626 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 671 605 0.00094212449737594 0.000911778186597187 0.000717174029144732 0.000610360875867857 0.000804460171912295 0.000826879144898593 41182 39736 667 665 0 False 671 605 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 270 656 0.0011578326195108 0.0726635540556587 0.00105287251087205 0.0728465705348287 0.000742688630266825 0.0246050427580313 50611 3166734 667 665 0 True 269 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 313 650 0.00104534594684805 0.000999821595646245 0.000961318379491875 0.000885023270008392 0.000697782158224855 0.00070507589273389 45694 43573 667 665 0 False 313 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 358 650 0.000917211341685532 0.00096049232717867 0.000778210116731518 0.000869764248111696 0.000685809522178505 0.000641415206184589 40093 41859 667 665 0 False 358 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 403 650 0.000920208241038556 0.00084445492307101 0.000778210116731518 0.000671396963454643 0.000692969660454797 0.000707982295473148 40224 36802 667 665 0 False 403 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 447 650 0.00095626254165204 0.000856249114431765 0.000732433051041428 0.000671396963454643 0.000873656040574862 0.000790081205996926 41800 37316 667 665 0 False 447 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 492 649 0.000920825922584599 0.000958771384859494 0.000595101853971161 0.000686655985351339 0.000931350348281489 0.000929924871310081 40251 41784 667 665 0 False 492 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 537 649 0.00101391281928274 0.000905307443477084 0.000732433051041428 0.000534065766384375 0.000945270665831157 0.000901701073525208 44320 39454 667 665 0 False 537 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 582 649 0.000982914356509088 0.000929951337487688 0.00080872816052491 0.000778210116731518 0.000783047039404624 0.000699641412407009 42965 40528 667 665 0 False 582 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 626 649 0.000958184217573063 0.000911250430952639 0.00080872816052491 0.000732433051041428 0.000719012514690501 0.000738147808185929 41884 39713 667 665 0 False 626 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 667 655 0.00108476318032332 0.0793567347069895 0.000946059357595178 0.0767071030746929 0.000773111921667251 0.021643258892952 47417 3458428 667 665 0 True 671 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E11_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E11_1.csv new file mode 100755 index 0000000..c21fa64 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E11_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 261 274 0.00967799460306468 0.03873820509158 0.00970473792629892 0.0398260471503777 0.00164617479603472 0.00812368368717143 423043 1688241 667 665 0 True 262 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 306 273 0.00998237434269819 0.00969941447805827 0.00987258716716258 0.00971999694819562 0.00134773521268553 0.00124008694293951 436348 422708 667 665 0 False 306 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 350 275 0.00976106133246034 0.0576415403351593 0.00973525597009232 0.0585946440833143 0.00136222730655346 0.00841720724191117 426674 2512063 667 665 0 True 351 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 394 275 0.009949568589475 0.0787942160275947 0.00994888227664607 0.0786907759212634 0.00137553238680528 0.010537892036421 434914 3433913 667 665 0 True 395 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 439 274 0.00982765655396152 0.0686793660736873 0.00973525597009232 0.0671091783016709 0.0016487779331339 0.0141881384725198 429585 2993100 667 665 0 True 440 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 482 273 0.00989933049039683 0.0600251831226039 0.00987258716716258 0.064637216754406 0.00166701149609943 0.016661834218655 432718 2615944 667 665 0 True 485 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 527 273 0.00977693803590308 0.0766424415352871 0.0098115510795758 0.0757305256733043 0.001630913254308 0.0249435950153768 427368 3340137 667 665 0 True 529 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 571 273 0.00987601873130727 0.0622419174509861 0.00994888227664607 0.0626535439078355 0.00169736764022397 0.0182839045197559 431699 2712551 667 665 0 True 574 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 618 273 0.00962270066614667 0.00930901297647873 0.00958266575112535 0.00935378042267491 0.00203722368908789 0.00187558138495996 420626 405694 667 665 0 False 618 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 663 273 0.0107900272797911 0.0339929934701712 0.0100099183642329 0.0394445716029602 0.00406187931840537 0.0156518101332465 471652 1481441 667 665 0 False 663 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 262 317 0.0096202299399625 0.00959335853940184 0.00959792477302205 0.00967421988250553 0.00155432801502023 0.00149245373509478 420518 418086 667 665 0 False 262 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 306 317 0.00980967515784337 0.0096882857177276 0.00984206912336919 0.00971999694819562 0.00136026494565425 0.00126795807312458 428799 422223 667 665 0 False 306 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 351 319 0.009990884621777 0.0943559631511831 0.00991836423285267 0.0886091401541161 0.00141398307791504 0.0260183618182554 436720 4112106 667 665 0 True 351 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 395 320 0.0100354949556579 0.0464801968299095 0.0100251773861295 0.0472419317921721 0.00139772597254288 0.00806636028635935 438670 2025643 667 665 0 True 395 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 439 319 0.00986009627367593 0.0683324929398341 0.00988784618905928 0.0668802929732204 0.00171021792107891 0.0145697585531688 431003 2977983 667 665 0 True 440 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 485 316 0.00972079764649605 0.0393029495230408 0.00961318379491875 0.0413519493400473 0.00175262919545132 0.0102327884491158 424914 1712853 667 665 0 False 485 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 527 317 0.00955342882461264 0.0395984467921922 0.00959792477302205 0.0420080872816053 0.00165833680852603 0.00781335723831021 417598 1725731 667 665 0 True 529 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 572 317 0.0095549387128363 0.0489438519622471 0.00958266575112535 0.0505683985656519 0.00188794602614518 0.0102104268085505 417664 2133011 667 665 0 True 574 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 619 316 0.00946960715110515 0.00950520040086483 0.00947585259784848 0.00953688868543526 0.00196873906595952 0.00209190398480786 413934 414244 667 665 0 False 619 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 663 316 0.00939836787946151 0.00953542014798957 0.00946059357595178 0.00944533455405508 0.00194247613961156 0.00222373237017982 410820 415561 667 665 0 False 663 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 263 365 0.0096039414488224 0.0433220611611427 0.00964370183871214 0.0438544289311055 0.00147278345085511 0.00795934573266436 419806 1888009 667 665 0 True 262 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 307 364 0.00967913845777958 0.0552420878242757 0.00962844281681544 0.0591744869153887 0.00151192151390039 0.0156024083338267 423093 2407493 667 665 0 True 306 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 351 364 0.010062993223004 0.0351264519733759 0.00997940032043946 0.0365606164644846 0.00160983891917111 0.00567995978688967 439872 1530838 667 665 0 True 351 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 395 363 0.0100885469373347 0.0321310486103104 0.0101319905394064 0.0333714808880751 0.00135071365519216 0.00509674789914045 440989 1400296 667 665 0 True 396 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 440 363 0.0100563359885633 0.0656948849578742 0.0101777676050965 0.0643320363164721 0.00169015940345175 0.0114675030783452 439581 2863034 667 665 0 True 440 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 484 362 0.00990029132835734 0.0299826701108459 0.00990310521095598 0.0307164110780499 0.00167565244753416 0.00420410646973257 432760 1306668 667 665 0 True 485 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 527 361 0.00975907102525642 0.0284805857628737 0.00973525597009232 0.0288700694285496 0.00173219440121025 0.00433133055303571 426587 1241206 667 665 0 True 529 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 572 362 0.00966827183798808 0.048568388239998 0.00962844281681544 0.0489204242008087 0.00188271098181919 0.0107182926174284 422618 2116648 667 665 0 True 574 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 617 362 0.009527806478999 0.0544904720028499 0.00952162966353857 0.0550545510032807 0.00210162632497416 0.0118425358320453 416478 2374737 667 665 0 True 619 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 661 361 0.0094538905873225 0.0603691191815657 0.0093690394445716 0.0602883955138476 0.00188808567682202 0.0178126491283585 413247 2630933 667 665 0 True 663 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 264 408 0.00964484569342703 0.0373276748749879 0.00967421988250553 0.0395361257343404 0.00162054892152525 0.00750958341432862 421594 1626769 667 665 0 True 262 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 308 408 0.00976236532683532 0.0289889521239583 0.00975051499198901 0.0290836957351034 0.00148609212098115 0.0033229804301941 426731 1263361 667 665 0 True 306 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 352 408 0.0098680346253973 0.0738211745890246 0.00987258716716258 0.0734264133669032 0.00135052332798887 0.0149272795197365 431350 3217184 667 665 0 True 351 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 395 407 0.00978686669482837 0.0611415239862072 0.0097962920576791 0.0610818646524758 0.00153219636726815 0.0171865829485256 427802 2664595 667 665 0 True 396 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 440 407 0.0101559886113249 0.040588745840339 0.0101930266269932 0.0419012741283284 0.00172188620263681 0.00688015287836302 443937 1768889 667 665 0 True 440 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 484 406 0.010290620311268 0.0497634335323316 0.0103608758678569 0.0516060120546273 0.00164819586676921 0.0113152019630876 449822 2168729 667 665 0 True 485 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 528 406 0.00977915711404998 0.0393749766955728 0.0097962920576791 0.0406500343327993 0.00159457229455258 0.00535090549330804 427465 1715992 667 665 0 True 529 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 573 406 0.00983772247545259 0.0498836929815957 0.00975051499198901 0.0493934538796063 0.001789875998414 0.00766949541347979 430025 2173970 667 665 0 True 574 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 617 406 0.00965779412879964 0.0451553465949148 0.00970473792629892 0.0462958724345769 0.00192376440525857 0.0076978854603059 422160 1967905 667 665 0 True 619 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 661 405 0.00972473250671528 0.0807737815584968 0.00971999694819562 0.079468986037995 0.00185086820050293 0.0161763928062534 425086 3520184 667 665 0 True 663 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 265 453 0.00994215641092249 0.0371293305362284 0.00993362325474937 0.0374914168001831 0.00157069650026427 0.00503418003425215 434590 1618125 667 665 0 True 262 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 308 453 0.0100249943693752 0.042067448318668 0.0100709544518196 0.0420538643472953 0.00148249523953245 0.00556945315638357 438211 1833332 667 665 0 True 307 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 351 452 0.00986364222329211 0.0313630953098012 0.00985732814526589 0.0322423132677195 0.00147972729127574 0.00423211110042069 431158 1366828 667 665 0 True 351 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 395 450 0.0102020859563352 0.0493715634933064 0.0101625085831998 0.0494392309452964 0.00154464002767278 0.0103730198102064 445952 2151651 667 665 0 True 396 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 440 451 0.0101893891689998 0.0893161262047313 0.0102998397802701 0.0896162355992981 0.00189377114942603 0.0144652743978699 445397 3892466 667 665 0 True 440 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 485 451 0.0101844248395372 0.0565774472803662 0.0102388036926833 0.0567025253681239 0.00186860457979811 0.0128508234010037 445180 2465689 667 665 0 True 485 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 528 449 0.0101795520184518 0.0473262809117094 0.0101319905394064 0.047501335164416 0.00182130620422523 0.00857537223677761 444967 2062516 667 665 0 True 530 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 572 448 0.00984328160936698 0.0310616779990718 0.0097962920576791 0.0321965362020294 0.00194604843755984 0.00553869707519444 430268 1353692 667 665 0 True 574 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 617 449 0.00976753555014665 0.0370531042644377 0.0098115510795758 0.0377050431067369 0.00197309886143477 0.00517638159252621 426957 1614803 667 665 0 True 619 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 661 449 0.00959122178439276 0.0636082768147193 0.00958266575112535 0.0636606393530175 0.00202598023145099 0.0113307168189505 419250 2772098 667 665 0 True 663 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 265 496 0.00944419069934019 0.0468467345979965 0.00947585259784848 0.0474250400549325 0.0016590049054876 0.0113240391737169 412823 2041617 667 665 0 True 262 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 309 496 0.00975424395835957 0.047261757047689 0.00975051499198901 0.047501335164416 0.00159001195813666 0.00431541146908672 426376 2059704 667 665 0 True 307 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 353 496 0.0100035127778294 0.0594528435990411 0.0101167315175097 0.0580453192950332 0.00151923409848301 0.0118914105327773 437272 2591001 667 665 0 True 351 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 397 495 0.0102344570447667 0.079666068352387 0.0102845807583734 0.0756084534981308 0.00162996765955902 0.0169384765305907 447367 3471909 667 665 0 True 396 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 442 496 0.0100338020506799 0.0864256085395452 0.0100862134737163 0.0838025482566567 0.00185283346797497 0.025478407776399 438596 3766495 667 665 0 True 440 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 486 495 0.0101522596449544 0.0408785754727859 0.0101319905394064 0.0417334248874647 0.00173030777667093 0.00582067813502746 443774 1781520 667 665 0 True 485 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 527 493 0.00996034370088931 0.0385182457172916 0.00997940032043946 0.0399023422598611 0.00169220844951191 0.00655892277930406 435385 1678655 667 665 0 True 530 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 574 493 0.0100764678315454 0.0932726414342104 0.0101167315175097 0.0882581826504921 0.00184844447560158 0.0196080778559689 440461 4064894 667 665 0 True 574 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 619 490 0.00992648560132843 0.0505081655844808 0.00994888227664607 0.0590524147402152 0.00181814184948118 0.0192998736566795 433905 2201185 667 665 0 False 619 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 662 494 0.00990884736162475 0.0688295240275098 0.00985732814526589 0.0668192568856336 0.00185741569835737 0.0111714766426648 433134 2999644 667 665 0 True 664 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 265 540 0.00947038497231128 0.0426050477532811 0.00946059357595178 0.0451819638361181 0.00148573569435807 0.00788712536151405 413968 1856761 667 665 0 True 262 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 309 540 0.0104822388531072 0.0911534960082743 0.0102082856488899 0.0872663462272068 0.00291767293495394 0.0205746602269266 458198 3972540 667 665 0 True 307 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 352 539 0.0104705715350153 0.0501904796323608 0.0103456168459602 0.0529945830472267 0.00178358633172412 0.00911599005972146 457688 2187340 667 665 0 True 351 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 397 538 0.0102201817379248 0.0544536208913219 0.0101777676050965 0.054032196536202 0.00162923127152463 0.007047745340061 446743 2373131 667 665 0 True 396 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 442 539 0.010264197267354 0.0511700170545384 0.0102998397802701 0.0515297169451438 0.00196524410501728 0.00624470199711896 448667 2230029 667 665 0 True 441 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 485 537 0.0101479129970378 0.0576838984621086 0.0100709544518196 0.0573434042877852 0.00189965864404425 0.0111993198328919 443584 2513909 667 665 0 True 485 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 529 537 0.00983486283866536 0.0698326727783065 0.00985732814526589 0.0674143587396048 0.00194339642156427 0.0172821907736111 429900 3043362 667 665 0 True 530 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 573 536 0.00987922152450898 0.0540207924251003 0.00984206912336919 0.0555123216601816 0.00182989453138825 0.0118119946947885 431839 2354268 667 665 0 True 574 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 618 535 0.00983586943081446 0.0459766032155234 0.00970473792629892 0.0459143968871595 0.0018071530459301 0.00714952175815898 429944 2003696 667 665 0 True 619 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 662 535 0.00976019200287702 0.0591469059464867 0.00975051499198901 0.061173418783856 0.00187260808376301 0.010140205561519 426636 2577668 667 665 0 True 664 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 265 583 0.00970052854094811 0.0405496689767449 0.00958266575112535 0.0414587624933242 0.00133605730340052 0.00716476320631095 424028 1767186 667 665 0 True 262 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 308 582 0.0101652767116099 0.0480613297950759 0.00976577401388571 0.0487525749599451 0.00299887697838516 0.00942812117549649 444343 2094550 667 665 0 True 307 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 353 582 0.0103633008398524 0.0401879039553565 0.0100862134737163 0.0410467689021134 0.00216201107198328 0.00672652842614115 452999 1751420 667 665 0 True 351 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 397 581 0.0100001498449677 0.0457914527678776 0.00994888227664607 0.0444953078507668 0.00141934443041009 0.00634098409584919 437125 1995627 667 665 0 True 396 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 441 580 0.0101551650359302 0.0738133729838444 0.0101777676050965 0.0701762417029068 0.00195493541220337 0.0153993959797079 443901 3216844 667 665 0 True 441 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 484 579 0.0099158935066685 0.0551031733602718 0.00988784618905928 0.0555123216601816 0.0020076403804028 0.0100976233483788 433442 2401439 667 665 0 True 485 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 529 578 0.00959595734291243 0.0514258638126559 0.00958266575112535 0.0511940184634165 0.00202050727526611 0.00887893830565801 419457 2241179 667 665 0 True 530 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 573 578 0.00955633421558848 0.0348338688332183 0.00959792477302205 0.0365606164644846 0.00168177297998184 0.00682931900430317 417725 1518087 667 665 0 True 575 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 617 578 0.00947441134090771 0.0448669396081185 0.00956740672922866 0.0454718852521553 0.00151265801817704 0.00609289211347971 414144 1955336 667 665 0 True 619 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 661 578 0.00987217537946522 0.053358642658374 0.00987258716716258 0.0523537041275654 0.00167967531100036 0.00778446056379737 431531 2325411 667 665 0 True 664 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 262 621 0.00951488092072069 0.00933071979559794 0.00949111161974517 0.0093842984664683 0.00140344459789708 0.00139288733714077 415913 406640 667 665 0 False 262 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 307 621 0.00953853583622471 0.00973431518829117 0.00955214770733196 0.00962844281681544 0.00142594559104876 0.00146542703050947 416947 424229 667 665 0 False 307 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 351 624 0.00972990273002661 0.0631358437292591 0.00967421988250553 0.0611581597619593 0.00135209787640429 0.00997498851502317 425312 2751509 667 665 0 True 352 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 397 624 0.00976618580158307 0.0691196978484206 0.00976577401388571 0.06665140764477 0.00140870054274325 0.0172550652060697 426898 3012290 667 665 0 True 396 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 441 621 0.00970485231177041 0.0097505379378866 0.00967421988250553 0.00975051499198901 0.00184435878201911 0.00195525582157328 424217 424936 667 665 0 False 441 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 485 620 0.00965864058128866 0.00946832634343928 0.00967421988250553 0.00950637064164187 0.00191298542750892 0.00194300356535619 422197 412637 667 665 0 False 485 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 530 620 0.00939816198561282 0.00939726289860609 0.00946059357595178 0.00932326237888151 0.00185388404386617 0.00190799166705284 410811 409540 667 665 0 False 530 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 575 620 0.00937809877391357 0.00949833957748572 0.00929274433508812 0.00947585259784848 0.00157853209620061 0.00169803284935934 409934 413945 667 665 0 False 575 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 619 620 0.00929102855301578 0.00918515102129322 0.00929274433508812 0.00923170824750134 0.0014417335040586 0.00139465688491057 406128 400296 667 665 0 False 619 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 664 620 0.00938084402522932 0.00946373716392148 0.00949111161974517 0.00941481651026169 0.00158499019855016 0.00159646453022958 410054 412437 667 665 0 False 664 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 262 664 0.0105425657507708 0.0299242957473794 0.00953688868543526 0.0351415274280919 0.00442478455019214 0.0141848894061611 460835 1304124 667 665 0 False 262 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 307 664 0.00926913517377269 0.00943370098397745 0.00920119020370794 0.00943007553215839 0.00128110421330096 0.00128429501023949 405171 411128 667 665 0 False 307 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 352 664 0.00939100145509758 0.00943776240785071 0.0093690394445716 0.0093842984664683 0.00126551158796669 0.00126455317517839 410498 411305 667 665 0 False 352 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 396 664 0.00950547843496425 0.00939136580292572 0.00950637064164187 0.009399557488365 0.0014119535804596 0.0012836185684287 415502 409283 667 665 0 False 396 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 441 664 0.00933293938976952 0.00939994756862401 0.0093690394445716 0.0093690394445716 0.00154637919857375 0.00155773665489934 407960 409657 667 665 0 False 441 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 486 664 0.0092799560393756 0.0093044926346537 0.00932326237888151 0.00935378042267491 0.00171483851587344 0.00157368950054577 405644 405497 667 665 0 False 486 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 530 664 0.00928855782683161 0.00940740498534044 0.0093690394445716 0.00944533455405508 0.00192382915658707 0.00167436982073724 406020 409982 667 665 0 False 530 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 575 664 0.009235368582589 0.00944859287151273 0.00929274433508812 0.00944533455405508 0.00148590088933155 0.00130743225397328 403695 411777 667 665 0 False 575 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 619 664 0.00909762559782137 0.00934698843698856 0.00907911802853437 0.0093690394445716 0.00145896117658471 0.00148003514099058 397674 407349 667 665 0 False 619 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 658 669 0.00951659670279303 0.0408357584278848 0.00953688868543526 0.0412756542305638 0.00145194232752257 0.00719385592716109 415988 1779654 667 665 0 True 664 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E11_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E11_2.csv new file mode 100755 index 0000000..0a385bb --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E11_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 261 274 0.00835187807789856 0.740592176252029 0.00819409475852598 0.766948958571756 0.00196952320587044 0.197292074583112 365076 32275581 667 665 8 True 262 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 306 273 0.00698536060420236 0.0063594784626937 0.00691233691920348 0.00631723506523232 0.00149733750090734 0.00130982028718344 305343 277151 667 665 0 False 306 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 350 275 0.00626674531811686 0.00648770013842113 0.00625619897764553 0.0063935301747158 0.00119150909493649 0.00137873694207543 273931 282739 667 665 0 True 351 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 394 275 0.0064664165971489 0.00654990646678495 0.00650034332799268 0.00653086137178607 0.0013648718032201 0.00125346944583368 282659 285450 667 665 0 True 395 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 439 274 0.00653728983528378 0.00645261586100752 0.00648508430609598 0.00642404821850919 0.00153501445155451 0.00174390004744882 285757 281210 667 665 0 True 440 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 482 273 0.00683142063667182 0.00667711852301846 0.00685130083161669 0.00675974670023652 0.00165252346894423 0.00166155627491176 298614 290994 667 665 0 True 485 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 527 273 0.00698048778311691 0.00710209949226465 0.00703440909437705 0.00720225833524071 0.00159028031223328 0.00168980163293551 305130 309515 667 665 0 True 529 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 571 273 0.00721795202192907 0.0074450488776301 0.00727855344472419 0.00747692072938125 0.00175682512770916 0.00170247947054695 315510 324461 667 665 0 True 574 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 618 273 0.0110866288073633 0.00814873071899249 0.00845349813076982 0.00820935378042268 0.0149607626078486 0.001928428205005 484617 355128 667 665 0 False 618 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 663 273 0.0376687371580861 0.581316601184811 0.00975051499198901 0.701258869306477 0.0937586812511607 0.365638489186492 1646570 25334228 667 665 13 False 663 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 262 317 0.00668834728893278 0.00654536317906233 0.00668345159075303 0.00651560234988937 0.00155591049995485 0.00135508767488206 292360 285252 667 665 0 False 262 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 306 317 0.00643468606735772 0.00622306510152699 0.00648508430609598 0.00625619897764553 0.00129689840959912 0.00124505942491352 281272 271206 667 665 0 False 306 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 351 319 0.00640624983914543 0.00637840882820464 0.00645456626230259 0.00645456626230259 0.00129901767302083 0.00131098573561581 280029 277976 667 665 0 True 351 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 395 320 0.00655867991845231 0.00665738505109191 0.00654612039368277 0.00662241550316625 0.00138018878119369 0.00126773430816702 286692 290134 667 665 0 True 395 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 439 319 0.00679765404548813 0.00682085162551607 0.00685130083161669 0.00685130083161669 0.00154565099292104 0.00172901376215926 297138 297258 667 665 0 True 440 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 485 316 0.00709718384113048 0.00728747939888632 0.00709544518196384 0.00700389105058366 0.00172007526753404 0.00318890800040838 310231 317594 667 665 0 False 485 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 527 317 0.00698188328586908 0.00697695256681415 0.00704966811627375 0.00704966811627375 0.00161636848691644 0.00158272004742976 305191 304061 667 665 0 True 529 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 572 317 0.00725030023326629 0.00737019935969473 0.0072632944228275 0.00743114366369116 0.00171463227048814 0.00177229914309834 316924 321199 667 665 0 True 574 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 619 316 0.00776002477131771 0.00762182407265589 0.00773632410162509 0.00746166170748455 0.00194469006366477 0.00203549941000352 339205 332165 667 665 0 False 619 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 663 316 0.00764451832220763 0.00740945979046954 0.00762951094834821 0.00746166170748455 0.00199804189270976 0.00187869065750753 334156 322910 667 665 0 False 663 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 263 365 0.00634052394722758 0.00636471012734399 0.0064087891966125 0.0064087891966125 0.00143971465804804 0.00139234371595031 277156 277379 667 665 0 True 262 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 307 364 0.00632739249510058 0.00639240582573394 0.00628671702143893 0.0063935301747158 0.00136687457653619 0.00134801146414308 276582 278586 667 665 0 True 306 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 351 364 0.0066185721513242 0.00651642840220258 0.00663767452506294 0.00645456626230259 0.00130444152383529 0.00142599953390966 289310 283991 667 665 0 True 351 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 395 363 0.00685459513319559 0.00694033091426208 0.0068055237659266 0.00698863202868696 0.00141838261164336 0.00127835374833768 299627 302465 667 665 0 True 396 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 440 363 0.00699574680501361 0.00722114280895647 0.00700389105058366 0.00717174029144732 0.00167885860923612 0.00173197279571687 305797 314703 667 665 0 True 440 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 484 362 0.00690986619301931 0.00711504097850486 0.00686655985351339 0.00717174029144732 0.00168584527687377 0.00174586504688395 302043 310079 667 665 0 True 485 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 527 361 0.00712578020900285 0.00696128051876085 0.00709544518196384 0.00701915007248035 0.00161003379156867 0.00172261885010479 311481 303378 667 665 0 True 529 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 572 362 0.00720168640788326 0.0072096010224692 0.00727855344472419 0.00718699931334401 0.00186907454747271 0.00178736783605589 314799 314200 667 665 0 True 574 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 617 362 0.00709681780762171 0.00716501714345374 0.00703440909437705 0.00721751735713741 0.00209665601462255 0.00195676525675049 310215 312257 667 665 0 True 619 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 661 361 0.00651384081362843 0.00652714413637665 0.00651560234988937 0.00654612039368277 0.00198981096285873 0.00195124995018294 284732 284458 667 665 0 True 663 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 264 408 0.00634830215928886 0.00644928870585711 0.00645456626230259 0.00646982528419928 0.00143893647634865 0.00159399790362522 277496 281065 667 665 0 True 262 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 308 408 0.00641896950357506 0.00660571088972144 0.00642404821850919 0.00657663843747616 0.00134450213769348 0.00131798566545945 280585 287882 667 665 0 True 306 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 352 408 0.00666105491543539 0.00708892854704856 0.00668345159075303 0.00712596322575723 0.00135730590349599 0.00127281636532285 291167 308941 667 665 0 True 351 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 395 407 0.00701773169263388 0.0069641028641643 0.00701915007248035 0.00695811398489357 0.00149245069382328 0.00141184425864599 306758 303501 667 665 0 True 396 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 440 407 0.00693363549399482 0.00715363597824958 0.00691233691920348 0.00718699931334401 0.00161322948954126 0.0015608026777671 303082 311761 667 665 0 True 440 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 484 406 0.00725938243970256 0.00716728878731505 0.00717174029144732 0.00720225833524071 0.00160031658716524 0.00169445892644859 317321 312356 667 665 0 True 485 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 528 406 0.00696774524159298 0.0071419106245816 0.00697337300679027 0.00721751735713741 0.00153989228695952 0.00169149023051565 304573 311250 667 665 0 True 529 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 573 406 0.00695420200176863 0.0072979656740845 0.00698863202868696 0.00730907148851759 0.00176202801714368 0.00169867049624546 303981 318051 667 665 0 True 574 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 617 406 0.00634745570679984 0.0065508472485861 0.00627145799954223 0.00653086137178607 0.00185304040303793 0.00192244755405275 277459 285491 667 665 0 True 619 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 661 405 0.00630490431140575 0.00620888453681698 0.00627145799954223 0.00617990386816205 0.00184133540778026 0.00182433099391449 275599 270588 667 665 0 True 663 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 265 453 0.00650832743390264 0.00671738857328719 0.00646982528419928 0.00663767452506294 0.00152312769435705 0.00163529553419175 284491 292749 667 665 0 True 262 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 308 453 0.00672973195251768 0.00663271821118372 0.00677500572213321 0.00671396963454643 0.00146597751610364 0.00152411570530713 294169 289059 667 665 0 True 307 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 351 452 0.00680591267652967 0.0069432220973583 0.00674448767833982 0.00694285496299687 0.00141821274122214 0.0014001270520406 297499 302591 667 665 0 True 351 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 395 450 0.0069588689290054 0.0069879207058617 0.00692759594110018 0.00708018616006714 0.00152428270347338 0.00143188481930466 304185 304539 667 665 0 True 396 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 440 451 0.00709173909268758 0.00716251604061653 0.00711070420386053 0.00715648126955062 0.00184976905438721 0.00190829938755431 309993 312148 667 665 0 True 440 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 485 451 0.00715597797347607 0.00734147109591328 0.00727855344472419 0.00738536659800107 0.0018286107356981 0.00185484135538051 312801 319947 667 665 0 True 485 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 528 449 0.00696527451540881 0.00691440204998649 0.00694285496299687 0.00692759594110018 0.00172128812913832 0.00172173552443997 304465 301335 667 665 0 True 530 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 572 448 0.00637145377871833 0.00622474015205099 0.00645456626230259 0.00628671702143893 0.0017769599529041 0.0019182651913505 278508 271279 667 665 0 True 574 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 617 449 0.0060934970829989 0.00625014126068203 0.00604257267109178 0.00631723506523232 0.0017934106927557 0.00183730370588137 266358 272386 667 665 0 True 619 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 661 449 0.00606494646931513 0.00619959144829343 0.00605783169298848 0.00621042191195544 0.00182135882649874 0.00192270076845577 265110 270183 667 665 0 True 663 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 265 496 0.0064413433017984 0.00650722709726938 0.00645456626230259 0.00653086137178607 0.00145959430331941 0.00150079528430454 281563 283590 667 665 0 True 262 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 309 496 0.00660761402315551 0.0067113079104261 0.00657663843747616 0.00668345159075303 0.00155832251253148 0.00153245772086477 288831 292484 667 665 0 True 307 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 353 496 0.00694980959966343 0.0069246129744136 0.00698863202868696 0.00688181887541009 0.00147784490866583 0.00152442428435874 303789 301780 667 665 0 True 351 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 397 495 0.0066425244690541 0.00688397578978345 0.00668345159075303 0.00688181887541009 0.00167145737364134 0.00166242500133426 290357 300009 667 665 0 True 396 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 442 496 0.00675887737065319 0.00706515659714633 0.00665293354695964 0.00709544518196384 0.00188977769989469 0.00197357547378963 295443 307905 667 665 0 True 440 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 486 495 0.00664332516735452 0.00671245520530555 0.00672922865644312 0.00677500572213321 0.00177103860844934 0.00168792518808149 290392 292534 667 665 0 True 485 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 527 493 0.00631478721614244 0.00637443918792174 0.0063935301747158 0.00628671702143893 0.00173371802731333 0.00165290832068695 276031 277803 667 665 0 True 530 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 574 493 0.00636326377895968 0.00625193104069398 0.00636301213092241 0.00628671702143893 0.00173295101899891 0.00193135464398778 278150 272464 667 665 0 True 574 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 619 490 0.00617308649406128 0.00604750603907342 0.00614938582436866 0.00608834973678187 0.00181622341682797 0.00170684863552559 269837 263555 667 665 0 False 619 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 662 494 0.00633368369603251 0.00625697913816356 0.00630197604333562 0.00633249408712902 0.00184146303964312 0.00187429109763894 276857 272684 667 665 0 True 664 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 265 540 0.00652921422099662 0.00640218077810686 0.00645456626230259 0.0064087891966125 0.00148607902678108 0.00138377360301183 285404 279012 667 665 0 True 262 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 309 540 0.00692313490771209 0.00646133530209135 0.00671396963454643 0.00645456626230259 0.00219858211930113 0.00143566880868685 302623 281590 667 665 0 True 307 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 352 539 0.00691158197509165 0.00654823141626095 0.00685130083161669 0.00656137941557946 0.00184167130801677 0.00150086557645636 302118 285377 667 665 0 True 351 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 397 538 0.00691386968452144 0.00694439233813534 0.00691233691920348 0.00692759594110018 0.00154630442316747 0.00158439898645723 302218 302642 667 665 0 True 396 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 442 539 0.00659262952639039 0.00675924189048956 0.00665293354695964 0.00677500572213321 0.00189330430567102 0.00202317825781296 288176 294573 667 665 0 True 441 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 485 537 0.00630607104321495 0.00655653783118818 0.00636301213092241 0.00663767452506294 0.00186622837137171 0.00189371019982869 275650 285739 667 665 0 True 485 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 529 537 0.00617219428738366 0.00616953232245182 0.00617990386816205 0.00621042191195544 0.00181685832943256 0.00181518503596574 269798 268873 667 665 0 True 530 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 573 536 0.00631185894807231 0.00632797374530398 0.00636301213092241 0.00634775310902571 0.00171703639837839 0.00162140907841174 275903 275778 667 665 0 True 574 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 618 535 0.00614485615969768 0.00632129648910557 0.00625619897764553 0.00625619897764553 0.00183661103663059 0.00176039679497648 268603 275487 667 665 0 True 619 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 662 535 0.00637605207467221 0.00604199902365206 0.00636301213092241 0.005981536583505 0.00179533178320955 0.00186103126839884 278709 263315 667 665 0 True 664 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 265 583 0.00682355091623335 0.00702555197790769 0.00677500572213321 0.00700389105058366 0.0013386529032736 0.00132128775019149 298270 306179 667 665 0 True 262 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 308 582 0.00664881566998602 0.0065744585772052 0.00662241550316625 0.00651560234988937 0.00158717334665873 0.00143407456454222 290632 286520 667 665 0 True 307 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 353 582 0.00707542772445318 0.00650128410979383 0.00662241550316625 0.00654612039368277 0.00263232837520203 0.00132454586624525 309280 283331 667 665 0 True 351 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 397 581 0.00642111995043906 0.00647455213910262 0.0063935301747158 0.00642404821850919 0.0015042044994533 0.00135587458823053 280679 282166 667 665 0 True 396 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 441 580 0.00655728441570014 0.00661043774462478 0.00654612039368277 0.00663767452506294 0.00173171739134016 0.00193914721551478 286631 288088 667 665 0 True 441 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 484 579 0.00663550120110464 0.00674857204811066 0.00659189745937285 0.00679026474402991 0.00179239243555953 0.00201755281846002 290050 294108 667 665 0 True 485 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 529 578 0.00633077830505667 0.00636207134912126 0.00634775310902571 0.0063782711528191 0.00190037286259813 0.00188826603228649 276730 277264 667 665 0 True 530 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 573 578 0.00638634676710626 0.00643737978500841 0.00654612039368277 0.00643930724040589 0.00164582486528182 0.00180081671721327 279159 280546 667 665 0 True 575 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 617 578 0.0062858705689499 0.00630080580255858 0.00636301213092241 0.00624093995574884 0.00151898413882341 0.00160341843937284 274767 274594 667 665 0 True 619 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 661 578 0.0062978352892677 0.00646197778722384 0.00633249408712902 0.00653086137178607 0.00168152627693151 0.00161972638428977 275290 281618 667 665 0 True 664 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 262 621 0.00684166957491728 0.00679607005611993 0.0068055237659266 0.0068207827878233 0.00140365137173567 0.00136712799078978 299062 296178 667 665 0 False 262 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 307 621 0.006566412376325 0.00668579207230711 0.00650034332799268 0.00666819256885634 0.00145364257370503 0.00133293222252273 287030 291372 667 665 0 False 307 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 351 624 0.00641949567674391 0.00661722973031113 0.00646982528419928 0.00663767452506294 0.00132882389366822 0.00135141078035444 280608 288384 667 665 0 True 352 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 397 624 0.00622332459313946 0.00618637461128215 0.00628671702143893 0.00622568093385214 0.00129671351510038 0.00133280902875368 272033 269607 667 665 0 True 396 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 441 621 0.00608896741832792 0.00607132388077082 0.00611886778057527 0.00607309071488518 0.0017284108131 0.00177595672287752 266160 264593 667 665 0 False 441 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 485 620 0.00634711255038537 0.00640869741302214 0.00636301213092241 0.00642404821850919 0.00191752263007888 0.00196730152160901 277444 279296 667 665 0 False 485 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 530 620 0.00643514360924367 0.00642313038260563 0.00656137941557946 0.00634775310902571 0.00188958396390818 0.00197698374693621 281292 279925 667 665 0 False 530 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 575 620 0.00647238751876065 0.00647349662781353 0.00648508430609598 0.00648508430609598 0.00154950689661264 0.00167484333015998 282920 282120 667 665 0 False 575 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 619 620 0.00627166389339091 0.00620262030677518 0.00625619897764553 0.00624093995574884 0.00139069641766335 0.00141893323820014 274146 270315 667 665 0 False 619 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 664 620 0.00644836656974786 0.00646847147624153 0.00648508430609598 0.00648508430609598 0.00150539286624434 0.00151340767768059 281870 281901 667 665 0 False 664 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 262 664 0.0401056967510751 0.544901461711041 0.00837720302128634 0.681315327687495 0.109007319924684 0.366429708546567 1753094 23747228 667 665 10 False 262 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 307 664 0.0066500967872667 0.00651791988554586 0.00657663843747616 0.00643930724040589 0.00145428739608816 0.001310028684279 290688 284056 667 665 0 False 307 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 352 664 0.0063109438643004 0.00632042454499719 0.0063782711528191 0.00636301213092241 0.00122522646440941 0.0012926079322256 275863 275449 667 665 0 False 352 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 396 664 0.00620314699596871 0.00613582479889355 0.00619516289005875 0.00607309071488518 0.0012968943135751 0.00133545986289475 271151 267404 667 665 0 False 396 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 441 664 0.00600148540973276 0.00605982798607872 0.00607309071488518 0.00613412680247196 0.00158866697534841 0.00144692580194186 262336 264092 667 665 0 False 441 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 486 664 0.00619276079515747 0.00633201222327965 0.00621042191195544 0.0063935301747158 0.00167985579463969 0.00163547609562119 270697 275954 667 665 0 False 486 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 530 664 0.00642111995043906 0.00609787228428131 0.00642404821850919 0.00608834973678187 0.00170699070631511 0.0016318228912388 280679 265750 667 665 0 False 530 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 575 664 0.00638559182299443 0.0063296029040328 0.00642404821850919 0.00633249408712902 0.00137391966498201 0.00133743241276927 279126 275849 667 665 0 False 575 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 619 664 0.00759551558622154 0.00679875472613784 0.00694285496299687 0.00686655985351339 0.00363019313678708 0.0014583766986494 332014 296295 667 665 0 False 619 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 658 669 0.00811683881108199 0.78515111307681 0.0080872816052491 0.779842832074464 0.00166165835640075 0.166080875385831 354802 34217494 667 665 15 True 664 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E11_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E11_3.csv new file mode 100755 index 0000000..52427d1 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E11_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 261 274 0.00107812882297693 0.0745615239747343 0.000854505226215 0.0764629587243458 0.000868745357667731 0.0208364810736123 47127 3249449 667 665 0 True 262 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 306 273 0.000966397094426007 0.000915265963030717 0.000854505226215 0.000778210116731518 0.000685663192521154 0.00064014635843069 42243 39888 667 665 0 False 306 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 350 275 0.000983280390017854 0.000936949836252338 0.000839246204318303 0.000793469138628214 0.000743226408909775 0.000729055561578011 42981 40833 667 665 0 True 351 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 394 275 0.000873767739613828 0.000990459669429926 0.000747692072938125 0.000839246204318303 0.000680678385262211 0.00069357818462041 38194 43165 667 665 0 True 395 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 439 274 0.000851256678824698 0.000990620290713049 0.000625619897764553 0.000701915007248035 0.00079864792753381 0.000928746061563856 37210 43172 667 665 0 True 440 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 482 273 0.000971864719963205 0.000942020879619511 0.000747692072938125 0.00064087891966125 0.000880297255797114 0.000893372476135513 42482 41054 667 665 0 True 485 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 527 273 0.000968524664195712 0.00102201027861483 0.000732433051041428 0.000854505226215 0.000832214533342919 0.00087407056864514 42336 44540 667 665 0 True 529 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 571 273 0.00102395586367951 0.00102219384579554 0.000762951094834821 0.000717174029144732 0.000908895159099497 0.000944792214899494 44759 44548 667 665 0 True 574 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 618 273 0.00131200135798432 0.00113662503707197 0.000701915007248035 0.000823987182421607 0.0018369191652664 0.00104857871973757 57350 49535 667 665 0 False 618 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 663 273 0.00402691764669279 0.0606356128361646 0.00117494468604562 0.0709849698634318 0.00944982284687277 0.0397589699821115 176024 2642547 667 665 0 False 663 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 262 317 0.00097680617233155 0.0010164114796031 0.000778210116731518 0.000854505226215 0.000811908911397657 0.000789616374924093 42698 44296 667 665 0 False 262 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 306 317 0.000887837152607034 0.000896679785983613 0.000778210116731518 0.000793469138628214 0.00065355714937298 0.000635105495325495 38809 39078 667 665 0 False 306 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 351 319 0.000903690978955475 0.000977449345496954 0.000762951094834821 0.000839246204318303 0.000673294566384496 0.000720844482020811 39502 42598 667 665 0 True 351 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 395 320 0.000891451733506101 0.00093830364421009 0.000717174029144732 0.000762951094834821 0.000721730499772684 0.000726501950966965 38967 40892 667 665 0 True 395 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 439 319 0.000868574639208205 0.000905376281169851 0.000595101853971161 0.000625619897764553 0.000828102397411802 0.000886762262778078 37967 39457 667 665 0 True 440 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 485 316 0.000983554915149429 0.0009658616672145 0.000717174029144732 0.000732433051041428 0.000896256720097114 0.000924427404096239 42993 42093 667 665 0 False 485 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 527 317 0.000910325336301865 0.00106606640198574 0.000732433051041428 0.000885023270008392 0.00079382806570173 0.000907529079010499 39792 46460 667 665 0 True 529 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 572 317 0.00104175424304328 0.00101134043623593 0.000762951094834821 0.000778210116731518 0.0010077406296069 0.000919084481379062 45537 44075 667 665 0 True 574 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 619 316 0.000978727848252573 0.00097077208929855 0.000564583810177768 0.000564583810177768 0.00106236215845725 0.00106651339916115 42782 42307 667 665 0 False 619 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 663 316 0.00102418463462249 0.00107549716589482 0.00064087891966125 0.000701915007248035 0.00102574139417842 0.00106734715904885 44769 46871 667 665 0 False 663 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 263 365 0.000951343966377992 0.00095044202403468 0.000823987182421607 0.000762951094834821 0.000768830956326059 0.000852399423089836 41585 41421 667 665 0 True 262 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 307 364 0.00096799849102686 0.000913613858404308 0.000839246204318303 0.000747692072938125 0.000752293755506902 0.000735974266038006 42313 39816 667 665 0 True 306 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 351 364 0.000961638658812045 0.000969005255184195 0.00080872816052491 0.000869764248111696 0.000740355650602804 0.000728975413950023 42035 42230 667 665 0 True 351 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 395 363 0.000950291620040289 0.0010128778113744 0.000823987182421607 0.000854505226215 0.000702601404249657 0.0007539250560228 41539 44142 667 665 0 True 396 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 440 363 0.000874705700480042 0.00102162019835581 0.000579842832074464 0.000671396963454643 0.000836925973890297 0.000979604161564313 38235 44523 667 665 0 True 440 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 484 362 0.000919201648889449 0.00102088592963296 0.000625619897764553 0.000686655985351339 0.000871466848760712 0.000957799914496919 40180 44491 667 665 0 True 485 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 527 361 0.000941781340961472 0.00105840247219101 0.000717174029144732 0.000762951094834821 0.000862912981028079 0.000967399957793701 41167 46126 667 665 0 True 529 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 572 362 0.000970080306607969 0.000917675282277564 0.000747692072938125 0.000518806744487678 0.00095502072630541 0.000990148108803559 42404 39993 667 665 0 True 574 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 617 362 0.000983097373263471 0.000926555344644513 0.000595101853971161 0.000503547722590982 0.00107284349855294 0.00101588595541912 42973 40380 667 665 0 True 619 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 661 361 0.000926728212913456 0.00103619084332484 0.000534065766384375 0.000625619897764553 0.000962816115932112 0.00112228617240747 40509 45158 667 665 0 True 663 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 264 408 0.000919910838812683 0.000919923980241288 0.000747692072938125 0.000747692072938125 0.000778760162629153 0.000781313131214624 40211 40091 667 665 0 True 262 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 308 408 0.000966786005029072 0.000963980103612201 0.000869764248111696 0.000854505226215 0.000718107576372563 0.000713632290592883 42260 42011 667 665 0 True 306 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 352 408 0.000951984525018333 0.000923274081289284 0.000823987182421607 0.000778210116731518 0.000729095980703505 0.000686401294628803 41613 40237 667 665 0 True 351 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 395 407 0.000962050446509407 0.000952392425329747 0.000762951094834821 0.000793469138628214 0.000790885642614815 0.000749773611175096 42053 41506 667 665 0 True 396 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 440 407 0.000888020169361417 0.000990872695586529 0.000671396963454643 0.000747692072938125 0.000801550512813828 0.000885642068199347 38817 43183 667 665 0 True 440 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 484 406 0.00108531223058647 0.000888648721827457 0.000793469138628214 0.000579842832074464 0.00098439109495608 0.000883783017910788 47441 38728 667 665 0 True 485 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 528 406 0.000949147765325394 0.000906454738356534 0.000701915007248035 0.00064087891966125 0.000919494268559037 0.000915053236604129 41489 39504 667 665 0 True 529 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 573 406 0.000908152012343565 0.000968110365178224 0.000579842832074464 0.000610360875867857 0.000960123958749742 0.00100320943870286 39697 42191 667 665 0 True 574 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 617 406 0.000984172596695473 0.000980776500647361 0.00064087891966125 0.000595101853971161 0.00101588534760334 0.00102421407179166 43020 42743 667 665 0 True 619 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 661 405 0.000969050837364563 0.00101026197904925 0.000549324788281071 0.000595101853971161 0.00100814598182505 0.00106530304325199 42359 44028 667 665 0 True 663 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 265 453 0.000948003910610499 0.000912443617627268 0.000778210116731518 0.000671396963454643 0.000796644935954543 0.000804317141452928 41439 39765 667 665 0 True 262 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 308 453 0.000977103574557422 0.000898010648043776 0.000854505226215 0.000762951094834821 0.000782581094297452 0.000796070175096866 42711 39136 667 665 0 True 307 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 351 452 0.00100553980276971 0.000941263664999074 0.000823987182421607 0.000823987182421607 0.0008031867459327 0.000758407428753328 43954 41021 667 665 0 True 351 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 395 450 0.000934712318823422 0.00092827628696369 0.000747692072938125 0.000732433051041428 0.000840096418978861 0.000831379949479013 40858 40455 667 665 0 True 396 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 440 451 0.000948049664799095 0.000947688516323998 0.000579842832074464 0.000442511635004196 0.00100826421149484 0.00107439533033594 41441 41301 667 665 0 True 440 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 485 451 0.000967769720083881 0.000976026699846435 0.000625619897764553 0.00064087891966125 0.000958136424315562 0.00103977138774215 42303 42536 667 665 0 True 485 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 528 449 0.000934392039503251 0.00101000957417577 0.000610360875867857 0.000762951094834821 0.000942803740883123 0.00093253128178815 40844 44017 667 665 0 True 530 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 572 448 0.000946699916235519 0.000993855662273101 0.000595101853971161 0.000671396963454643 0.000965065068614584 0.00104606573122085 41382 43313 667 665 0 True 574 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 617 449 0.000964749943636559 0.000956362065612647 0.000579842832074464 0.000564583810177768 0.000975081428148669 0.000986622266620546 42171 41679 667 665 0 True 619 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 661 449 0.000966191200577326 0.000936628593686092 0.000457770656900893 0.000442511635004196 0.00103251873045071 0.00104830735156891 42234 40819 667 665 0 True 663 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 265 496 0.000922404442091154 0.000926601236439691 0.000747692072938125 0.000762951094834821 0.000813993056525861 0.00077682890686565 40320 40382 667 665 0 True 262 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 309 496 0.000930205531246736 0.000988210971466203 0.000793469138628214 0.000839246204318303 0.000789726282258102 0.000852679170512512 40661 43067 667 665 0 True 307 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 353 496 0.000912956202146123 0.00101973863475351 0.000732433051041428 0.000869764248111696 0.00080595156566235 0.000875750532543025 39907 44441 667 665 0 True 351 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 397 495 0.000925607235292859 0.000937316970613763 0.000732433051041428 0.000701915007248035 0.000825877404432163 0.000875422279867694 40460 40849 667 665 0 True 396 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 442 496 0.000950909301586332 0.000987912674797546 0.00064087891966125 0.000579842832074464 0.00096507732955335 0.00107788246924911 41566 43054 667 665 0 True 440 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 486 495 0.00107158597400773 0.00091682628406677 0.000717174029144732 0.000534065766384375 0.000997615204123109 0.000942682371641223 46841 39956 667 665 0 True 485 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 527 493 0.000985041926278792 0.000958771384859494 0.000717174029144732 0.000701915007248035 0.000927588579667536 0.000842927719709183 43058 41784 667 665 0 True 530 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 574 493 0.000962004692320811 0.000964416075666392 0.000610360875867857 0.00064087891966125 0.000944155442158943 0.000998880264602427 42051 42030 667 665 0 True 574 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 619 490 0.000918149302551745 0.000937775888565543 0.000564583810177768 0.000595101853971161 0.000952420041546165 0.000936338278507467 40134 40869 667 665 0 False 619 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 662 494 0.000962622373866855 0.0009738009477803 0.000625619897764553 0.000549324788281071 0.000988175513820571 0.0010361352910971 42078 42439 667 665 0 True 664 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 265 540 0.00100727846193635 0.000901108344218293 0.000839246204318303 0.000717174029144732 0.000818259419436269 0.000785941162537906 44030 39271 667 665 0 True 262 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 309 540 0.000915083771915827 0.000787273746279179 0.000793469138628214 0.000656137941557946 0.000768647138275439 0.000662678376485221 40000 34310 667 665 0 True 307 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 352 539 0.000987146618954199 0.000906523576049302 0.000869764248111696 0.000778210116731518 0.000782658212270931 0.000761400842902666 43150 39507 667 665 0 True 351 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 397 538 0.00091364251497506 0.000902140909609799 0.000701915007248035 0.000732433051041428 0.00083034255908723 0.000804652599818296 39937 39316 667 665 0 True 396 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 442 539 0.000921191956093366 0.000844202518197531 0.000518806744487678 0.000259403372243839 0.00100348157827913 0.00104302000752775 40267 36791 667 665 0 True 441 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 485 537 0.000883559135973327 0.000965333911569953 0.000473029678797589 0.00064087891966125 0.000965617803597562 0.00101072772271572 38622 42070 667 665 0 True 485 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 529 537 0.000980603769985001 0.000956775091769249 0.000610360875867857 0.000534065766384375 0.00100720454901185 0.00101370046475135 42864 41697 667 665 0 True 530 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 573 536 0.000971864719963205 0.000982520388864126 0.00064087891966125 0.000656137941557946 0.000939236638655335 0.000956519290086639 42482 42819 667 665 0 True 574 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 618 535 0.000863427292991179 0.000875730181484841 0.000534065766384375 0.000549324788281071 0.00088156244945953 0.000900546587102131 37742 38165 667 665 0 True 619 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 662 535 0.00101393569637703 0.00097543010650912 0.000686655985351339 0.000579842832074464 0.000986670337616826 0.0010360307426961 44321 42510 667 665 0 True 664 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 265 583 0.00096234784873528 0.00100737079595303 0.000869764248111696 0.000869764248111696 0.000721782092935439 0.000711413143460777 42066 43902 667 665 0 True 262 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 308 582 0.000941941480621557 0.000975085918045285 0.000793469138628214 0.000823987182421607 0.000807550735385545 0.000769387039220244 41174 42495 667 665 0 True 307 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 353 582 0.00101910591968836 0.000938969075240172 0.000915541313801785 0.000854505226215 0.000783367014721896 0.000725169898209915 44547 40921 667 665 0 True 351 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 397 581 0.000964269524656303 0.000845739893335995 0.000839246204318303 0.000701915007248035 0.000764007754077637 0.000637970913147913 42150 36858 667 665 0 True 396 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 441 580 0.000812091093386701 0.000907372574260095 0.0004272526131075 0.000442511635004196 0.000934302493938357 0.00105404350042757 35498 39544 667 665 0 True 441 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 484 579 0.000901266006959898 0.000927702639523964 0.000488288700694286 0.000534065766384375 0.00102436145221071 0.00100285326953134 39396 40430 667 665 0 True 485 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 529 578 0.00100354949556579 0.000991377505333487 0.000656137941557946 0.000595101853971161 0.00106057809456647 0.00102269353041387 43867 43205 667 665 0 True 530 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 573 578 0.000974976004787718 0.000979147341918541 0.00064087891966125 0.000579842832074464 0.000932259136258145 0.000963581920074336 42618 42672 667 665 0 True 575 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 617 578 0.000923960084503411 0.000922080894614655 0.000686655985351339 0.000656137941557946 0.000807304203196486 0.000817164155334388 40388 40185 667 665 0 True 619 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 661 578 0.000975799580182443 0.00097217178905148 0.000686655985351339 0.000747692072938125 0.000874863587842368 0.000845977313134146 42654 42368 667 665 0 True 664 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 262 621 0.000913459498220677 0.001011615787007 0.000793469138628214 0.000839246204318303 0.00070720124080369 0.000768535568797574 39929 44087 667 665 0 False 262 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 307 621 0.00093462081044623 0.00107496941025028 0.000762951094834821 0.000961318379491875 0.000761028182424621 0.000734006610969151 40854 46848 667 665 0 False 307 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 351 624 0.000909890671510205 0.000943764767836276 0.000823987182421607 0.000839246204318303 0.000719082586625026 0.000727909968188033 39773 41130 667 665 0 True 352 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 397 624 0.000879303996433919 0.000873687996599418 0.000732433051041428 0.000747692072938125 0.000685725858246206 0.000654647441035053 38436 38076 667 665 0 True 396 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 441 621 0.000868894918528376 0.000841930874336218 0.000595101853971161 0.000457770656900893 0.000883260735033055 0.000935714976534324 37981 36692 667 665 0 False 441 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 485 620 0.000935741788066827 0.000997182817423509 0.000549324788281071 0.000579842832074464 0.00101305532649365 0.00106029352586183 40903 43458 667 665 0 False 485 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 530 620 0.000981747624699896 0.00096423250848568 0.00064087891966125 0.000488288700694286 0.000982830961662971 0.00108125897271231 42914 42022 667 665 0 False 530 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 575 620 0.00094745486034735 0.000940093424222034 0.000701915007248035 0.000656137941557946 0.000873542885759346 0.00090814279351127 41415 40970 667 665 0 False 575 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 619 620 0.000887105085589501 0.000946036411697589 0.000701915007248035 0.000732433051041428 0.000729799017995321 0.000744563009874103 38777 41229 667 665 0 False 619 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 664 620 0.000934643687540528 0.000906592413742069 0.000732433051041428 0.000656137941557946 0.000790871346233379 0.000787504900120681 40855 39510 667 665 0 False 664 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 262 664 0.0041409599617678 0.0557422166081259 0.00111390859845884 0.068207827878233 0.0106748192771962 0.0384513809977139 181009 2429289 667 665 0 False 262 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 307 664 0.00103207723215527 0.00100392891131468 0.000900282291905089 0.000915541313801785 0.000695674693895384 0.000682326560669934 45114 43752 667 665 0 False 307 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 352 664 0.000973900781355717 0.000900098724724377 0.000869764248111696 0.000747692072938125 0.000696230524300108 0.000663225405683313 42571 39227 667 665 0 False 352 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 396 664 0.000905955811290967 0.000842389792287999 0.000778210116731518 0.000686655985351339 0.000668579193108553 0.000664584173711473 39601 36712 667 665 0 False 396 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 441 664 0.000931669665281802 0.00094578400682411 0.000701915007248035 0.000762951094834821 0.000799375367720171 0.000815064714935455 40725 41218 667 665 0 False 441 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 486 664 0.00095626254165204 0.000917216364325784 0.000671396963454643 0.000701915007248035 0.000899894611346294 0.000833996868418746 41800 39973 667 665 0 False 486 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 530 664 0.000994490166223823 0.00100363061464602 0.000717174029144732 0.00064087891966125 0.00094266076933566 0.000923305164681671 43471 43739 667 665 0 False 530 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 575 664 0.000997258294633869 0.000989381212243243 0.000823987182421607 0.00080872816052491 0.000803240141980657 0.000770630479340096 43592 43118 667 665 0 False 575 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 619 664 0.00103342698071884 0.000933186709047739 0.000854505226215 0.000762951094834821 0.000805036043844695 0.000733512561598167 45173 40669 667 665 0 False 619 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 658 669 0.00103040720427152 0.0814133525619955 0.000839246204318303 0.0781567101548791 0.000813913537029229 0.0213396621535482 45041 3548057 667 665 0 True 664 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E12_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E12_1.csv new file mode 100755 index 0000000..386e07a --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E12_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 234 247 0.00956578245553351 0.0373227415070062 0.00958266575112535 0.0372625314717327 0.00180306415300351 0.00666028506771251 418138 1626554 667 665 0 True 233 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 277 246 0.00949749432905429 0.00927073921930025 0.00950637064164187 0.00921644922560464 0.00147338808820283 0.0014950891005508 415153 404026 667 665 0 False 277 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 322 247 0.00948930432929564 0.0544096106597462 0.00950637064164187 0.0533760585946441 0.00141166019809964 0.00670431231956735 414795 2371213 667 665 0 True 322 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 366 247 0.00956070374059937 0.0781990453359308 0.00961318379491875 0.0760814831769284 0.00135964740620017 0.0121297651746873 417916 3407975 667 665 0 True 367 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 411 247 0.00959373826476554 0.0649978803727102 0.00959792477302205 0.0630502784771496 0.00137835635703811 0.00884451589966609 419360 2832658 667 665 0 True 411 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 454 246 0.00953377740061075 0.0581868266454647 0.00947585259784848 0.0617837796597238 0.00164200622178807 0.0137654790510665 416739 2535827 667 665 0 True 456 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 499 246 0.00964278675494022 0.0725902648587594 0.00970473792629892 0.072480354009308 0.00169654658071092 0.0169157097667876 421504 3163540 667 665 0 True 501 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 543 246 0.00948486617300185 0.0656466297352445 0.00946059357595178 0.0628976882581826 0.00152577330181109 0.016666635050747 414601 2860931 667 665 0 True 545 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 590 245 0.00948198365912032 0.00944386601660939 0.00952162966353857 0.00953688868543526 0.00184308752303232 0.0019550229101728 414475 411571 667 665 0 False 590 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 630 246 0.00937757260074472 0.0418262180973147 0.00946059357595178 0.0418402380407416 0.00185258235470689 0.0073614417261185 409911 1822819 667 665 0 True 635 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 233 290 0.00943284366056843 0.00933572200127235 0.00952162966353857 0.00918593118181125 0.00154165424161716 0.00147830046491568 412327 406858 667 665 0 False 233 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 277 290 0.00940884558864994 0.00936346359145747 0.00943007553215839 0.0093842984664683 0.00141752883040581 0.00143750893734878 411278 408067 667 665 0 False 277 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 323 290 0.00979327228123178 0.0976363775082017 0.00975051499198901 0.0966811627374685 0.00137138766001685 0.0229538146721403 428082 4255069 667 665 0 True 322 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 367 292 0.00959591158872383 0.0447369052064815 0.00965896086060884 0.044281681544213 0.00151598412274747 0.00515060700499602 419455 1949669 667 665 0 True 367 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 412 292 0.00952652536171832 0.0718504432286943 0.00947585259784848 0.0712443732356756 0.00150685240732201 0.0111202016663383 416422 3131298 667 665 0 True 411 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 455 290 0.00944352726360555 0.0390191087698647 0.00950637064164187 0.0395513847562371 0.00183689083618661 0.0063015929477402 412794 1700483 667 665 0 True 456 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 500 290 0.00956029195290201 0.0395938117208792 0.00947585259784848 0.0414587624933242 0.0015945845618434 0.00616490059530622 417898 1725529 667 665 0 True 501 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 545 289 0.00948381382666415 0.0495306244553935 0.00944533455405508 0.0489662012664988 0.00153081063235569 0.0132120201468739 414555 2158583 667 665 0 True 545 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 590 289 0.00949767734580867 0.00932060065476119 0.00953688868543526 0.0093690394445716 0.00193955649648922 0.00211093949918669 415161 406199 667 665 0 False 590 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 635 289 0.00959984644894307 0.00921869792356836 0.00950637064164187 0.00923170824750134 0.00218199137057912 0.00203286809083454 419627 401758 667 665 0 False 635 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 235 336 0.00931676528410091 0.039575455002808 0.00933852140077821 0.0392919813839933 0.00165169712213963 0.00542826799613663 407253 1724729 667 665 0 True 233 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 279 335 0.00934575056257634 0.0490048651039363 0.00935378042267491 0.0527046616311894 0.00146694504727671 0.0111160236354263 408520 2135670 667 665 0 True 277 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 322 336 0.00997294897984745 0.0331651513769546 0.00975051499198901 0.0340886549172198 0.00255983491507458 0.00485610662020433 435936 1445363 667 665 0 True 322 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 366 336 0.0102832767639984 0.0309334104315492 0.00976577401388571 0.0312199588006409 0.00381325417274291 0.00388523469396082 449501 1348102 667 665 0 True 367 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 411 336 0.00953039159065466 0.0648222524725639 0.00950637064164187 0.0637064164187076 0.0015902446508734 0.0105732742888267 416591 2825004 667 665 0 True 411 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 454 334 0.00953714033347254 0.0302273881086328 0.00952162966353857 0.0307164110780499 0.0017618992045986 0.00520386043482881 416886 1317333 667 665 0 True 456 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 499 334 0.00952693714941568 0.0268697837521246 0.00949111161974517 0.0271610589761196 0.00160698738957566 0.00291354407163584 416440 1171006 667 665 0 True 501 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 544 334 0.00955109536099426 0.046767984277471 0.00955214770733196 0.047348744945449 0.00165755961649691 0.00660370173277989 417496 2038185 667 665 0 True 546 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 588 335 0.0094049793597136 0.0539187979103171 0.00933852140077821 0.0544747081712062 0.00201737459787082 0.0102295208635922 411109 2349823 667 665 0 True 590 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 632 334 0.00911855813910394 0.0592397221022343 0.00909437705043107 0.0587167162584878 0.00207164917656672 0.015208965977493 398589 2581713 667 665 0 True 635 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 235 380 0.00971411753496106 0.0348643180393189 0.00975051499198901 0.0363775082017243 0.00160247277843564 0.00643294009871625 424622 1519414 667 665 0 True 233 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 278 380 0.00939958036545929 0.0274345740753807 0.0093690394445716 0.0273136491950866 0.00147751199819101 0.00316643292700458 410873 1195620 667 665 0 True 278 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 323 381 0.0094767219274318 0.067312065928153 0.0093842984664683 0.0669413290608072 0.0014625713329133 0.0100022678569891 414245 2933512 667 665 0 True 322 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 366 380 0.00972804968538848 0.0544548140779965 0.00968947890440223 0.0553139543755245 0.00147399353632603 0.0103003801273774 425231 2373183 667 665 0 True 367 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 411 379 0.0100071731129171 0.0396451416937859 0.0100556954299229 0.040360112916762 0.00167330923386974 0.00569963747565039 437432 1727766 667 665 0 True 412 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 456 379 0.00976620867867737 0.0494403552942783 0.00984206912336919 0.0491645685511559 0.00192812473618129 0.00740163527435446 426899 2154649 667 665 0 True 456 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 500 378 0.00976364644411601 0.0384123274540207 0.0098268101014725 0.0392156862745098 0.00177313167071171 0.00459272997623905 426787 1674039 667 665 0 True 501 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 544 378 0.00971546728352464 0.050306654711854 0.00975051499198901 0.0492256046387427 0.00174841793826093 0.00703917722258134 424681 2192403 667 665 0 True 546 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 589 380 0.00951700849049039 0.0399880451873561 0.00956740672922866 0.0405432211795224 0.00200170295057157 0.00592923269442785 416006 1742710 667 665 0 True 590 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 632 380 0.00944727910707041 0.0846774064940332 0.00946059357595178 0.0828259708552682 0.00194296670547643 0.0151222261664563 412958 3690307 667 665 0 True 635 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 235 423 0.0096746087931086 0.0328172227318124 0.00968947890440223 0.0332494087129015 0.00157757975009493 0.00414856080346116 422895 1430200 667 665 0 True 233 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 280 423 0.00979366119183484 0.0388400619309776 0.0097962920576791 0.0384069581139849 0.00167974323357468 0.00413393010062344 428099 1692680 667 665 0 True 278 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 322 423 0.00949429153585258 0.0290987482439218 0.00949111161974517 0.0295719844357977 0.00146586473207038 0.00324756447485601 415013 1268146 667 665 0 True 322 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 367 424 0.00981246616334771 0.0447872714516894 0.0098115510795758 0.0450751506828412 0.00142007125552054 0.00700760320519817 428921 1951864 667 665 0 True 367 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 412 424 0.010028517441897 0.0818381958558562 0.0100556954299229 0.0812237735561151 0.00166668812723314 0.0132344182243173 438365 3566572 667 665 0 True 412 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 455 423 0.0101588711252065 0.055732166304982 0.0100862134737163 0.0546272983901732 0.0020386314196272 0.011377043851091 444063 2428851 667 665 0 True 456 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 500 422 0.00984909239131865 0.0471695145393812 0.0097962920576791 0.0469367513542382 0.00165779135188154 0.00652139893195924 430522 2055684 667 665 0 True 501 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 543 421 0.0096528069222427 0.0310891671843835 0.00970473792629892 0.0314183260852979 0.00173231996966981 0.00427300333226703 421942 1354890 667 665 0 True 546 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 588 422 0.00969110317809738 0.0372936920006585 0.00956740672922866 0.0371709773403525 0.00198989581283788 0.00458050491514277 423616 1625288 667 665 0 True 590 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 631 425 0.00937640586893553 0.0666132256711818 0.00941481651026169 0.0668192568856336 0.00200133021519518 0.0119995571819992 409860 2903056 667 665 0 True 635 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 236 467 0.00972658555135341 0.0406692171031837 0.00973525597009232 0.0416418707560845 0.00155176829447867 0.00903102822862108 425167 1772396 667 665 0 True 233 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 280 469 0.00970876429489535 0.0422807763285531 0.00965896086060884 0.0421911955443656 0.00156599440633541 0.00388881194432065 424388 1842629 667 665 0 True 278 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 324 469 0.00984929828516733 0.0540291906236179 0.0098115510795758 0.0527809567406729 0.00155933391975907 0.00910678595727086 430531 2354634 667 665 0 True 323 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 369 468 0.00981871161009104 0.0726340915231544 0.00985732814526589 0.0701304646372168 0.00167104333180432 0.0110572705701398 429194 3165450 667 665 0 True 367 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 413 467 0.0100155461294301 0.0837982803197052 0.0100404364080262 0.0797131303883421 0.00185138061636732 0.0208767823126744 437798 3651994 667 665 0 True 412 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 457 467 0.00984227501721787 0.0395433995838761 0.00985732814526589 0.0399176012817578 0.00202123950975324 0.00477738418849188 430224 1723332 667 665 0 True 457 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 500 466 0.0100198927773467 0.0386396983532303 0.0100404364080262 0.0390173189898528 0.00198180422754766 0.00602554163307594 437988 1683948 667 665 0 True 501 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 545 467 0.0100358381120724 0.0955789336008825 0.0100404364080262 0.0941023880369268 0.00180332153106268 0.0150977723507881 438685 4165404 667 665 0 True 546 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 590 467 0.00976993764504793 0.0616773106949108 0.00968947890440223 0.0606393530174716 0.00200475959416272 0.0184169625952291 427062 2687945 667 665 0 True 591 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 634 468 0.00944643265458139 0.0673026581101415 0.009399557488365 0.0660868238345922 0.00186076008084297 0.0102974355816534 412921 2933102 667 665 0 True 635 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 237 512 0.00953071186997483 0.0377907230883342 0.00955214770733196 0.0396429388876173 0.0014123933383409 0.00626971265276403 416605 1646949 667 665 0 True 233 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 281 511 0.00958314617010561 0.0806976700161941 0.00962844281681544 0.0778973067826352 0.00159372687034269 0.0169360830609999 418897 3516867 667 665 0 True 278 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 323 513 0.00963709035846005 0.0458222691083396 0.00965896086060884 0.0473945220111391 0.00157195561980022 0.00740477234453417 421255 1996970 667 665 0 True 323 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 369 513 0.00995238247207365 0.0479574078248953 0.00997940032043946 0.0484016174563211 0.00159373186052526 0.00525951463960673 435037 2090021 667 665 0 True 367 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 413 511 0.00981566895654942 0.0470007015708188 0.00988784618905928 0.0470283054856184 0.00169427468120181 0.00398378303437074 429061 2048327 667 665 0 True 412 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 457 512 0.00991129521071463 0.0553533065898897 0.00991836423285267 0.0542915999084459 0.00189492938942509 0.00866266993231719 433241 2412340 667 665 0 True 457 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 500 511 0.0098300128946742 0.065517627898999 0.00991836423285267 0.0626840619516289 0.00184991775339438 0.014277863483036 429688 2855309 667 665 0 True 501 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 544 510 0.00980688415233903 0.0516929999523873 0.00987258716716258 0.0527351796749828 0.00174715109979373 0.00988763630002693 428677 2252821 667 665 0 True 546 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 589 510 0.00949166067000832 0.0444394345901375 0.00956740672922866 0.0440070191500725 0.00183686342212216 0.00519917934070236 414898 1936705 667 665 0 True 591 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 633 511 0.00933220732275199 0.0586983595404166 0.00935378042267491 0.0586861982146944 0.00194013399313547 0.0116444246515258 407928 2558120 667 665 0 True 635 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 237 554 0.00928519489396982 0.0342236685786336 0.00921644922560464 0.0346990157930877 0.00135837778161464 0.00502760068046759 405873 1491494 667 665 0 True 234 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 280 553 0.00940829653838679 0.0431650882757363 0.0093842984664683 0.0434119172961013 0.00138114678810705 0.00784398456486098 411254 1881168 667 665 0 True 278 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 324 555 0.00969952194879901 0.0359748306449346 0.00967421988250553 0.0364080262455177 0.00149630338981361 0.00469747897747116 423984 1567811 667 665 0 True 323 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 369 552 0.00988041113341247 0.0407824092159903 0.00987258716716258 0.0405279621576257 0.00144129665049854 0.00333617544760198 431891 1777329 667 665 0 True 368 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 413 555 0.00989541850727189 0.0721537421030259 0.00990310521095598 0.0691996643015183 0.00176632714962012 0.0113663355253203 432547 3144516 667 665 0 True 412 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 457 552 0.0096963420326916 0.0524337853101511 0.00962844281681544 0.0516823071641108 0.00186249163984543 0.00670470107483194 423845 2285105 667 665 0 True 457 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 501 553 0.00971331683666063 0.0468445547377255 0.00975051499198901 0.0468604562447547 0.00201438777695202 0.00494416504109727 424587 2041522 667 665 0 True 502 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 544 551 0.00936192466824496 0.0342375737925725 0.00944533455405508 0.0354772259098192 0.00185767310573405 0.00568684135701801 409227 1492100 667 665 0 True 546 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 589 551 0.00949182080966841 0.0443372565081736 0.00949111161974517 0.0435034714274815 0.00174664512626218 0.00593481806620685 414905 1932252 667 665 0 True 591 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 632 553 0.00935899640017483 0.0501823797305119 0.00933852140077821 0.0492713817044327 0.00183633872793293 0.00726510771890762 409099 2186987 667 665 0 True 636 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 234 594 0.00926083078854256 0.00927516777753493 0.00920119020370794 0.00929274433508812 0.00136626444549396 0.00130756534199003 404808 404219 667 665 0 False 234 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 278 594 0.00925476835855361 0.00918285643153432 0.00921644922560464 0.00923170824750134 0.00143116956891424 0.00143665092958412 404543 400196 667 665 0 False 278 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 323 598 0.00957271421510577 0.0586429681436367 0.00958266575112535 0.0563210498207065 0.0014827576939394 0.0127381453477383 418441 2555706 667 665 0 True 323 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 367 598 0.00965248664292253 0.0601456261390487 0.00962844281681544 0.0583352407110704 0.00149955979664384 0.0125849813668105 421928 2621193 667 665 0 True 368 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 412 594 0.00973713189182474 0.009525736979207 0.0098115510795758 0.00949111161974517 0.00162532222960079 0.00159355088032334 425628 415139 667 665 0 False 412 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 457 594 0.00953270217717875 0.00952612705946601 0.00950637064164187 0.00961318379491875 0.00205665436467912 0.00189455757206502 416692 415156 667 665 0 False 457 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 502 593 0.00933266486463795 0.00939299496165454 0.009399557488365 0.00933852140077821 0.00191228640394541 0.00213100435888934 407948 409354 667 665 0 False 502 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 546 593 0.00909545227386307 0.00905750299300552 0.00904859998474098 0.00910963607232776 0.00193910002876407 0.00188716235109152 397579 394733 667 665 0 False 546 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 591 593 0.00922267179525367 0.00922916125286895 0.00924696726939803 0.00920119020370794 0.00167809628446505 0.00170849864869701 403140 402214 667 665 0 False 591 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 636 593 0.00938589986306915 0.00928799453428719 0.0093842984664683 0.00930800335698482 0.0016258716156011 0.00151809190449209 410275 404778 667 665 0 False 636 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 235 644 0.00919535654466198 0.0357934203785958 0.00917067215991455 0.0365606164644846 0.00138494344150348 0.00701730826128113 401946 1559905 667 665 0 True 234 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 279 638 0.00917215917104391 0.00905924688122228 0.00914015411612116 0.0089723048752575 0.00130454307541105 0.00151326706396833 400932 394809 667 665 0 False 279 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 323 638 0.00923939495118543 0.00931821428141193 0.00923170824750134 0.00932326237888151 0.00162179743911035 0.001371230630636 403871 406095 667 665 0 False 323 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 368 637 0.00938523642733451 0.00934428082107305 0.00941481651026169 0.0093690394445716 0.001438429764346 0.00127166510448086 410246 407231 667 665 0 False 368 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 413 637 0.0095572035451718 0.0093128449413761 0.00956740672922866 0.00932326237888151 0.00147859330833396 0.00153130442257524 417763 405861 667 665 0 False 413 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 457 637 0.00926238643095481 0.00939854786887108 0.00932326237888151 0.00933852140077821 0.00174638522749752 0.00186208784015748 404876 409596 667 665 0 False 457 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 502 637 0.00921331506368583 0.0091879045290039 0.00926222629129473 0.00920119020370794 0.00186337588075191 0.00183948153425352 402731 400416 667 665 0 False 502 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 547 637 0.00882241415341768 0.00912604238910391 0.00891126878767071 0.00914015411612116 0.00184854071220468 0.00176905169826683 385644 397720 667 665 0 False 547 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 591 637 0.0090342560466162 0.00892806518470587 0.00903334096284428 0.0089723048752575 0.00145740173417967 0.00136953578004402 394904 389092 667 665 0 False 591 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 632 643 0.00929107430720437 0.0405646985396657 0.00924696726939803 0.0402838178072786 0.0013328572298389 0.00750497981461206 406130 1767841 667 665 0 True 636 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E12_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E12_2.csv new file mode 100755 index 0000000..c86f1a0 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E12_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 234 247 0.00813397375471111 0.686745038379882 0.00813305867093919 0.661631189440757 0.00203428383054265 0.159157338782846 355551 29928881 667 665 5 True 233 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 277 246 0.00687987432239477 0.00663939546738212 0.00675974670023652 0.00659189745937285 0.00179356008470273 0.0014636978503518 300732 289350 667 665 0 False 277 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 322 247 0.00622419392272278 0.00627992503575258 0.00616464484626535 0.00627145799954223 0.00127299382019113 0.00120078536288796 272071 273684 667 665 0 True 322 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 366 247 0.0062108565767471 0.00620418062781123 0.00625619897764553 0.00621042191195544 0.0011731255081908 0.00115098137293023 271488 270383 667 665 0 True 367 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 411 247 0.00625729707817183 0.0063402498005141 0.00628671702143893 0.00634775310902571 0.00148494922858756 0.00144338471115418 273518 276313 667 665 0 True 411 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 454 246 0.00634992643298401 0.00631177394160613 0.00630197604333562 0.00630197604333562 0.00162201317761372 0.00147528221909399 277567 275072 667 665 0 True 456 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 499 246 0.00673071566757249 0.0067675024136216 0.00675974670023652 0.00675974670023652 0.0015143979319982 0.00155355094920179 294212 294933 667 665 0 True 501 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 543 246 0.00711024666197457 0.00720680162296334 0.00718699931334401 0.00718699931334401 0.00149682300650512 0.00148328450655992 310802 314078 667 665 0 True 545 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 590 245 0.00830342439217562 0.00774428632808848 0.00802624551766232 0.00772106507972839 0.0026181191345271 0.00197966773899041 362958 337502 667 665 0 False 590 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 630 246 0.00913775202121988 0.753993796576587 0.00924696726939803 0.744625009536889 0.00201452452781777 0.154700933880767 399428 32859634 667 665 10 True 635 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 233 290 0.00672131318181605 0.00639109790957136 0.00668345159075303 0.00636301213092241 0.00168010306881527 0.00151538461252229 293801 278529 667 665 0 False 233 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 277 290 0.0062620097595972 0.00640043688989009 0.00631723506523232 0.00642404821850919 0.00128652311412643 0.0013938656566562 273724 278936 667 665 0 False 277 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 323 290 0.00616661227637497 0.00636851914634377 0.00621042191195544 0.00633249408712902 0.00127442393758609 0.00127981106555169 269554 277545 667 665 0 True 322 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 367 292 0.00614394107592576 0.00602616635431564 0.00611886778057527 0.00602731364919509 0.0012163522815844 0.0012417656416659 268563 262625 667 665 0 True 367 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 412 292 0.00628673989853322 0.0064294634503402 0.00622568093385214 0.00643930724040589 0.00143955155487447 0.00140532322856854 274805 280201 667 665 0 True 411 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 455 290 0.00656778500198287 0.00649970084286018 0.00660715648126955 0.00654612039368277 0.0016000329124139 0.00186498125859707 287090 283262 667 665 0 True 456 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 500 290 0.0066968804451059 0.00678457416142783 0.00669871061264973 0.00685130083161669 0.00166483080555149 0.00162981907261711 292733 295677 667 665 0 True 501 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 545 289 0.0069175300196091 0.00694235015324991 0.00695811398489357 0.00697337300679027 0.00152787997619715 0.00143369703700206 302378 302553 667 665 0 True 545 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 590 289 0.00739824640209078 0.00719920653086137 0.00740062561989776 0.00715648126955062 0.00178754814063348 0.00189844273195373 323391 313747 667 665 0 False 590 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 635 289 0.00795983331291553 0.00769176316850721 0.00798046845197223 0.00782787823300526 0.00195183948136672 0.00204969570713682 347939 335213 667 665 0 False 635 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 235 336 0.00615734705318433 0.00617414444786721 0.00617990386816205 0.00621042191195544 0.00144078888475142 0.00140854598775531 269149 269074 667 665 0 True 233 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 279 335 0.00615409850579402 0.00624793845451349 0.00616464484626535 0.00624093995574884 0.00131784771166157 0.00140477535559743 269007 272290 667 665 0 True 277 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 322 336 0.00665092036266143 0.00642900453238842 0.00663767452506294 0.0064087891966125 0.00150133812421764 0.00114719772791415 290724 280181 667 665 0 True 322 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 366 336 0.00667107508273787 0.00657558292618706 0.00646982528419928 0.00662241550316625 0.00172484628531605 0.00131361710822528 291605 286569 667 665 0 True 367 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 411 336 0.00683331943549855 0.00684896035006261 0.0068207827878233 0.00688181887541009 0.00148997370284448 0.00139218610978198 298697 298483 667 665 0 True 411 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 454 334 0.00673666371208994 0.00668836201283708 0.00675974670023652 0.00668345159075303 0.00171111514021165 0.00163909621615909 294472 291484 667 665 0 True 456 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 499 334 0.0068968948805524 0.00680685462798677 0.00698863202868696 0.0068055237659266 0.00161965188488613 0.00158076938887897 301476 296648 667 665 0 True 501 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 544 334 0.00694514267242666 0.00699306058692164 0.00697337300679027 0.00701915007248035 0.0015608416811535 0.00144692112783485 303585 304763 667 665 0 True 546 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 588 335 0.00728628590259688 0.00719665953622899 0.00735484855420768 0.00729381246662089 0.0019344573582487 0.00205632019307749 318497 313636 667 665 0 True 590 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 632 334 0.0071523862696713 0.0072432397083347 0.00718699931334401 0.0072480354009308 0.00196484157586544 0.00186408237593991 312644 315666 667 665 0 True 635 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 235 380 0.0062152947330409 0.00621404736377451 0.00617990386816205 0.00624093995574884 0.00154861065134075 0.00155811488450541 271682 270813 667 665 0 True 233 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 278 380 0.00622847193935648 0.00626021450972361 0.00625619897764553 0.00627145799954223 0.00139466213217929 0.0014132678306252 272258 272825 667 665 0 True 278 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 323 381 0.0065294658690339 0.00654722179676704 0.00648508430609598 0.00657663843747616 0.00147577945751263 0.0013334551355261 285415 285333 667 665 0 True 322 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 366 380 0.00666803242919625 0.00675462976507416 0.00665293354695964 0.00677500572213321 0.0013690809340136 0.00129879640668728 291472 294372 667 665 0 True 367 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 411 379 0.00703404306086828 0.00711671602902886 0.00701915007248035 0.00715648126955062 0.0015507846896697 0.00148761136631115 307471 310152 667 665 0 True 412 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 456 379 0.00700869524038622 0.00712293436727548 0.00701915007248035 0.00711070420386053 0.00164366400890933 0.00167032819875535 306363 310423 667 665 0 True 456 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 500 378 0.0068718673393905 0.0067921692535298 0.00683604180972 0.00674448767833982 0.00171635937112014 0.00186479931252943 300382 296008 667 665 0 True 501 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 544 378 0.00697550057655997 0.00701499686501674 0.00698863202868696 0.00703440909437705 0.00168252599656981 0.00160948981653482 304912 305719 667 665 0 True 546 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 589 380 0.00686177854080513 0.00702665338099196 0.0068207827878233 0.00711070420386053 0.00196140312259579 0.00205922821784809 299941 306227 667 665 0 True 590 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 632 380 0.00652564539428615 0.00653047129152705 0.00648508430609598 0.00643930724040589 0.00193665182808316 0.00176070651262464 285248 284603 667 665 0 True 635 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 235 423 0.00635365539935457 0.00650585034341404 0.00631723506523232 0.00651560234988937 0.0015035648651442 0.00157802162357761 277730 283530 667 665 0 True 233 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 280 423 0.00656414754398951 0.00645435974922429 0.00660715648126955 0.00657663843747616 0.001502165722528 0.00152412914865023 286931 281286 667 665 0 True 278 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 322 423 0.00653042670699441 0.00658957992371636 0.00650034332799268 0.00662241550316625 0.00137937125928491 0.00130362876221542 285457 287179 667 665 0 True 322 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 367 424 0.00672691806991904 0.00669260700389105 0.00679026474402991 0.00666819256885634 0.00137139298373252 0.0012091885268765 294046 291669 667 665 0 True 367 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 412 424 0.00717620132483541 0.00717474620403148 0.00720225833524071 0.00711070420386053 0.0015137831929514 0.00156100504404614 313685 312681 667 665 0 True 412 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 455 423 0.00702162079866453 0.00712678927807043 0.00712596322575723 0.00712596322575723 0.00161379859596338 0.00175299133687072 306928 310591 667 665 0 True 456 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 500 422 0.00711198532114121 0.00708775830627152 0.00718699931334401 0.00704966811627375 0.00170708148844349 0.00164353496600007 310878 308890 667 665 0 True 501 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 543 421 0.00694708722544198 0.00702871851177497 0.00695811398489357 0.00703440909437705 0.00160648968566008 0.00146695000904385 303670 306317 667 665 0 True 546 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 588 422 0.00636925757766573 0.00642657226724398 0.00631723506523232 0.00646982528419928 0.00188165684689757 0.00187342911294315 278412 280075 667 665 0 True 590 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 631 425 0.00598222289633393 0.00596558918468063 0.00605783169298848 0.0059662775616083 0.00172522393919075 0.00178876563201411 261494 259985 667 665 0 True 635 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 236 467 0.00651946857882572 0.00658329274777697 0.00653086137178607 0.00665293354695964 0.00148691973045086 0.00145808705716956 284978 286905 667 665 0 True 233 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 280 469 0.00666656829516119 0.00672076162023277 0.00672922865644312 0.00675974670023652 0.00145918292166205 0.00147504290067364 291408 292896 667 665 0 True 278 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 324 469 0.00667064041794621 0.00676084810332079 0.00665293354695964 0.00668345159075303 0.00145153672317249 0.00153727248913295 291586 294643 667 665 0 True 323 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 369 468 0.00670891379670659 0.00674354689653867 0.00672922865644312 0.00677500572213321 0.0014568071361854 0.00147064763231002 293259 293889 667 665 0 True 367 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 413 467 0.00676610653245133 0.00667037242912729 0.00675974670023652 0.00659189745937285 0.00172704479658788 0.00170953642960717 295759 290700 667 665 0 True 412 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 457 467 0.00694914616392879 0.00692665515929903 0.00703440909437705 0.00683604180972 0.00193441431024066 0.00202421663039171 303760 301869 667 665 0 True 457 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 500 466 0.00681952454763692 0.00699283112794575 0.00674448767833982 0.00697337300679027 0.00189896709435515 0.00187681955065834 298094 304753 667 665 0 True 501 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 545 467 0.00647039721155673 0.00643464922319532 0.0064087891966125 0.00648508430609598 0.00168242931355206 0.00170853969261598 282833 280427 667 665 0 True 546 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 590 467 0.00610587359101406 0.00616299274163894 0.00619516289005875 0.00619516289005875 0.00184570337278338 0.00190322029282738 266899 268588 667 665 0 True 591 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 634 468 0.00613108414893034 0.00599791995438356 0.00619516289005875 0.00599679560540169 0.00192910214662047 0.00175866253187099 268001 261394 667 665 0 True 635 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 237 512 0.00659315569955924 0.00675295471455017 0.00662241550316625 0.00674448767833982 0.00150745057293728 0.00144110001578743 288199 294299 667 665 0 True 233 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 281 511 0.00639867752093283 0.00664104757200853 0.0063782711528191 0.00666819256885634 0.00145291567893308 0.00158881922315327 279698 289422 667 665 0 True 278 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 323 513 0.00658519447074357 0.00655137500423065 0.00653086137178607 0.00659189745937285 0.00145791526485846 0.00156684305560367 287851 285514 667 665 0 True 323 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 369 513 0.00678866334742906 0.00676220191127854 0.00674448767833982 0.00674448767833982 0.00158093407183167 0.00146635990514845 296745 294702 667 665 0 True 367 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 413 511 0.00673400996915138 0.00695308883332157 0.00677500572213321 0.00694285496299687 0.00175937112562472 0.00172394169028436 294356 303021 667 665 0 True 412 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 457 512 0.00666961094870281 0.00655630837221229 0.00671396963454643 0.00650034332799268 0.0018544882694743 0.00179851516114978 291541 285729 667 665 0 True 457 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 500 511 0.00645859263089902 0.00647758099758437 0.00657663843747616 0.00654612039368277 0.00165973397616518 0.00170378906630685 282317 282298 667 665 0 True 501 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 544 510 0.00608388870339378 0.00630771251773288 0.00610360875867857 0.00636301213092241 0.00161223190509568 0.00167846132865599 265938 274895 667 665 0 True 546 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 589 510 0.00606503797769232 0.00629552824611311 0.00605783169298848 0.0063935301747158 0.00175682808616987 0.00176048931523482 265114 274364 667 665 0 True 591 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 633 511 0.00590370870870356 0.00629880950946834 0.00588998245212482 0.00625619897764553 0.00180622400061223 0.00190550556770433 258062 274507 667 665 0 True 635 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 237 554 0.00670564237222199 0.0067386823662498 0.00677500572213321 0.00668345159075303 0.00140066858957251 0.0013753036002975 293116 293677 667 665 0 True 234 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 280 553 0.00661013050352828 0.00672057805305206 0.00663767452506294 0.00675974670023652 0.00134280129210053 0.00130355350482462 288941 292888 667 665 0 True 278 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 324 555 0.00671035505364736 0.00674109168549664 0.00669871061264973 0.00671396963454643 0.00143886944955859 0.00129550263620285 293322 293782 667 665 0 True 323 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 369 552 0.00668997156262793 0.00671374017557054 0.00669871061264973 0.00666819256885634 0.00144843532627625 0.00135269635796628 292431 292590 667 665 0 True 368 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 413 555 0.00661143449790326 0.00658285677572278 0.00662241550316625 0.00662241550316625 0.00161888513851267 0.00171187388991404 288998 286886 667 665 0 True 412 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 457 552 0.00643802612312521 0.00659896479583027 0.00643930724040589 0.00657663843747616 0.00196243864883855 0.00194076409485477 281418 287588 667 665 0 True 457 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 501 553 0.00650041195927557 0.00636064870347074 0.00651560234988937 0.0063782711528191 0.00200255294790363 0.00203754179473538 284145 277202 667 665 0 True 502 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 544 551 0.0063707445887951 0.00645741155360362 0.0063935301747158 0.00646982528419928 0.00179739241233098 0.00173762222548778 278477 281419 667 665 0 True 546 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 589 551 0.00622808302875342 0.00639474630728802 0.00625619897764553 0.0063782711528191 0.00161080661877028 0.00142364078729233 272241 278688 667 665 0 True 591 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 632 553 0.00625898998314988 0.00654628101496589 0.00630197604333562 0.00660715648126955 0.00176083541662102 0.00179355056916003 273592 285292 667 665 0 True 636 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 234 594 0.00697659867708627 0.00708124167135623 0.00691233691920348 0.00709544518196384 0.0013677792092661 0.00127911645120449 304960 308606 667 665 0 False 234 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 278 594 0.0069044443216707 0.00688675224339173 0.00688181887541009 0.00686655985351339 0.0014272183061827 0.00140247523965002 301806 300130 667 665 0 False 278 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 323 598 0.00672474474596073 0.00668349748254821 0.00674448767833982 0.00662241550316625 0.00140127993665306 0.00149118030768731 293951 291272 667 665 0 True 323 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 367 598 0.00647048871993392 0.00657643192439786 0.00654612039368277 0.00656137941557946 0.00125308641931995 0.00134263601832396 282837 286606 667 665 0 True 368 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 412 594 0.00638236615269843 0.0065316415323041 0.0064087891966125 0.00653086137178607 0.00159395909890632 0.00148598145029016 278985 284654 667 665 0 False 412 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 457 594 0.00647607073094261 0.00655403672835098 0.00645456626230259 0.00653086137178607 0.0018819354749973 0.00183747509707615 283081 285630 667 665 0 False 457 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 502 593 0.00638421919733656 0.006580722807247 0.00653086137178607 0.00660715648126955 0.00190082690112097 0.00212319295602798 279066 286793 667 665 0 False 502 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 546 593 0.00639476553780789 0.00628033806190918 0.00643930724040589 0.00625619897764553 0.0019259131652797 0.00184036250598872 279527 273702 667 665 0 False 546 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 591 593 0.00652676637190674 0.00673397845724405 0.00651560234988937 0.00672922865644312 0.00161365760380131 0.00159797203901102 285297 293472 667 665 0 False 591 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 636 593 0.00659523751514035 0.00643676024577351 0.00665293354695964 0.0064087891966125 0.00149288168386309 0.00150676653374758 288290 280519 667 665 0 False 636 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 235 644 0.00927675324617389 0.697720152980299 0.00883497367818723 0.68882276646067 0.00235295828117324 0.187210178048304 405504 30407185 667 665 6 True 234 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 279 638 0.007341511208232 0.00704826841652082 0.00714122224765393 0.00703440909437705 0.00188619177570652 0.00132788622147528 320911 307169 667 665 0 False 279 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 323 638 0.0065925380180132 0.0064217306828527 0.00663767452506294 0.00642404821850919 0.00145418008105021 0.00122235722357447 288172 279864 667 665 0 False 323 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 368 637 0.00631675464625206 0.00633891893845394 0.00630197604333562 0.00636301213092241 0.00126570963411695 0.00126621750614619 276117 276255 667 665 0 False 368 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 413 637 0.00615318342202211 0.00625996210485013 0.00617990386816205 0.00621042191195544 0.00146512257554554 0.00147510097325183 268967 272814 667 665 0 False 413 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 457 637 0.00633743553949736 0.0064994484379867 0.00634775310902571 0.00651560234988937 0.00170683268222878 0.00171833818681069 277021 283251 667 665 0 False 457 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 502 637 0.00635756738247951 0.00612116237033417 0.00633249408712902 0.00611886778057527 0.00170187414595004 0.00175877556879105 277901 266765 667 665 0 False 502 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 547 637 0.00617651805820596 0.00617894014046331 0.00619516289005875 0.00624093995574884 0.00167436062405729 0.00164766747178877 269987 269283 667 665 0 False 547 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 591 637 0.00699114850905973 0.00634463246695361 0.00695811398489357 0.0063782711528191 0.00172685819587035 0.0013193306846318 305596 276504 667 665 0 False 591 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 632 643 0.00828791372224165 0.777984604450013 0.00825513084611276 0.766445410849165 0.00161838627800155 0.1646853941872 362280 33905172 667 665 14 True 636 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E12_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E12_3.csv new file mode 100755 index 0000000..8d2109c --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E12_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 234 247 0.0010284855283505 0.0681207023050875 0.000793469138628214 0.0655832761120012 0.000912867713714672 0.0168794295260391 44957 2968753 667 665 0 True 233 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 277 246 0.000925698743670051 0.0010454609859508 0.000732433051041428 0.000854505226215 0.000741608969440065 0.000794508990675603 40464 45562 667 665 0 False 277 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 322 247 0.000953768938373569 0.000984424898364015 0.000854505226215 0.000900282291905089 0.000679999462837079 0.00061908059165603 41691 42902 667 665 0 True 322 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 366 247 0.00100519664635524 0.000980065177822102 0.000885023270008392 0.000869764248111696 0.000741245075669882 0.000665718680189292 43939 42712 667 665 0 True 367 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 411 247 0.00101608614324104 0.00102552100094594 0.000823987182421607 0.000869764248111696 0.000780910411054796 0.000737961594338079 44415 44693 667 665 0 True 411 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 454 246 0.000992088071322544 0.00093924442601124 0.000823987182421607 0.000762951094834821 0.000810465777122535 0.000827816697662534 43366 40933 667 665 0 True 456 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 499 246 0.00094082050300096 0.000937592321384831 0.000686655985351339 0.000778210116731518 0.000850892891566351 0.0007651535321734 41125 40861 667 665 0 True 501 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 543 246 0.000986162903899389 0.000987958566592724 0.000793469138628214 0.000839246204318303 0.000844788450347513 0.000770911728258313 43107 43056 667 665 0 True 545 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 590 245 0.00109009354329473 0.00101824715141023 0.000778210116731518 0.000671396963454643 0.00105492171192602 0.00104629907777103 47650 44376 667 665 0 False 590 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 630 246 0.00110105167146342 0.0760673943958087 0.000823987182421607 0.0733653772793164 0.00102140026389973 0.0183454647367928 48129 3315076 667 665 0 True 635 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 233 290 0.000962576619678259 0.000968821688003483 0.000793469138628214 0.000732433051041428 0.000833398717797232 0.000834387888638535 42076 42222 667 665 0 False 233 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 277 290 0.000940340084020704 0.000915357746621073 0.000778210116731518 0.000747692072938125 0.000709183693258045 0.000732825393411694 41104 39892 667 665 0 False 277 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 323 290 0.000993895361772078 0.000986558866839794 0.000885023270008392 0.000854505226215 0.00069334692769847 0.000697769624315022 43445 42995 667 665 0 True 322 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 367 292 0.000989731730609861 0.00101452991600081 0.00080872816052491 0.000930800335698482 0.00076097132994852 0.000707189244645764 43263 44214 667 665 0 True 367 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 412 292 0.000889873213999546 0.000932406548529713 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.00071147779523167 0.000779635423539736 38898 40635 667 665 0 True 411 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 455 290 0.000950131480380204 0.000912076483265844 0.000686655985351339 0.000595101853971161 0.000904841802272988 0.000932691584940402 41532 39749 667 665 0 True 456 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 500 290 0.000936633994744445 0.000984654357339905 0.000717174029144732 0.000717174029144732 0.000836498224201529 0.000891881981446223 40942 42912 667 665 0 True 501 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 545 289 0.000953677429996377 0.000940690017559348 0.000762951094834821 0.000732433051041428 0.000823046301266265 0.000825531960715198 41687 40996 667 665 0 True 545 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 590 289 0.00105982714753861 0.000904206040392811 0.000686655985351339 0.000457770656900893 0.00102016829679742 0.00107021185181771 46327 39406 667 665 0 False 590 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 635 289 0.00105662435433691 0.00105326259113107 0.000701915007248035 0.000762951094834821 0.00101319205231316 0.00103617002575272 46187 45902 667 665 0 False 635 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 235 336 0.000958641759459021 0.000864188394997565 0.000762951094834821 0.000686655985351339 0.000843463187927718 0.000751055961658312 41904 37662 667 665 0 True 233 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 279 335 0.000993094663471652 0.000948491622739614 0.000839246204318303 0.000747692072938125 0.000762000752324965 0.000789002215630995 43410 41336 667 665 0 True 277 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 322 336 0.00094212449737594 0.000900328183700267 0.00080872816052491 0.000793469138628214 0.000725914009577522 0.000629297500118389 41182 39237 667 665 0 True 322 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 366 336 0.00104639829318575 0.000969968982882934 0.000946059357595178 0.000854505226215 0.000702947925506292 0.000712052543534296 45740 42272 667 665 0 True 367 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 411 336 0.00102505396420581 0.00100142780847748 0.000823987182421607 0.000793469138628214 0.000848002821324987 0.000784398508486525 44807 43643 667 665 0 True 411 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 454 334 0.000947569245818839 0.00101381859317555 0.000656137941557946 0.000732433051041428 0.000901144707690491 0.00089753683003482 41420 44183 667 665 0 True 456 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 499 334 0.000836523830096854 0.000960171084612424 0.00064087891966125 0.000732433051041428 0.000801158567699945 0.000839237284700187 36566 41845 667 665 0 True 501 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 544 334 0.000883330365030348 0.00102051879527154 0.000671396963454643 0.000854505226215 0.000802677365259564 0.000829186376892621 38612 44475 667 665 0 True 546 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 588 335 0.000908678185512417 0.000930502039029825 0.000549324788281071 0.000488288700694286 0.000991285119944394 0.00108938285822274 39720 40552 667 665 0 True 590 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 632 334 0.000990646814381777 0.000995760171772989 0.000503547722590982 0.000564583810177768 0.00106134619558448 0.00104516105784463 43303 43396 667 665 0 True 635 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 235 380 0.000900511062848068 0.000964943831310939 0.000732433051041428 0.000793469138628214 0.000782260674405175 0.000792024097842615 39363 42053 667 665 0 True 233 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 278 380 0.00090831215200365 0.000936858052661982 0.000778210116731518 0.000778210116731518 0.000710865619016956 0.000771022799475121 39704 40829 667 665 0 True 278 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 323 381 0.000931784050753291 0.000922402137180901 0.000778210116731518 0.000793469138628214 0.00076985532737229 0.000687861260290421 40730 40199 667 665 0 True 322 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 366 380 0.000940591732057981 0.000976003753948846 0.000823987182421607 0.000854505226215 0.00071967989190476 0.000728951835192445 41115 42535 667 665 0 True 367 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 411 379 0.0010023827637566 0.000928230395168512 0.000823987182421607 0.000732433051041428 0.000783578790050959 0.000760003999665345 43816 40453 667 665 0 True 412 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 456 379 0.000914809246784253 0.000903471771669962 0.00064087891966125 0.000579842832074464 0.000832556372177354 0.000878273980255517 39988 39374 667 665 0 True 456 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 500 378 0.00091940754273813 0.0010176735039705 0.000610360875867857 0.000671396963454643 0.000940861605496654 0.000967962553239093 40189 44351 667 665 0 True 501 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 544 378 0.000928832905588863 0.000971781708792466 0.00064087891966125 0.000778210116731518 0.000906552416661903 0.000845329085778197 40601 42351 667 665 0 True 546 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 589 380 0.000928627011740182 0.000979445638587198 0.000503547722590982 0.000457770656900893 0.00102039035212405 0.00113768247567414 40592 42685 667 665 0 True 590 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 632 380 0.000864159360008712 0.000876418558412511 0.000488288700694286 0.000549324788281071 0.000962874216763536 0.000962345758243053 37774 38195 667 665 0 True 635 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 235 423 0.00102450491394266 0.000968913471593839 0.00080872816052491 0.000747692072938125 0.000865976010537582 0.00085690834860318 44783 42226 667 665 0 True 233 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 280 423 0.000983554915149429 0.000938349536005268 0.000823987182421607 0.00080872816052491 0.000803997006992528 0.000765978131774995 42993 40894 667 665 0 True 278 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 322 423 0.00100876547306571 0.0010013819166823 0.000839246204318303 0.000854505226215 0.000795075730183269 0.000755956273185718 44095 43641 667 665 0 True 322 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 367 424 0.00101990661798879 0.000935068272650039 0.000885023270008392 0.000823987182421607 0.000752788165016573 0.000698004803716172 44582 40751 667 665 0 True 367 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 412 424 0.00101558284716648 0.00101276308188645 0.000839246204318303 0.000762951094834821 0.00082957621702559 0.000858083697111865 44393 44137 667 665 0 True 412 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 455 423 0.000970789496531203 0.00101400216035626 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.000848785815138708 0.000898316474233954 42435 44191 667 665 0 True 456 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 500 422 0.000930502933472609 0.000907900329904643 0.000625619897764553 0.000671396963454643 0.000915823182295749 0.000882538112698799 40674 39567 667 665 0 True 501 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 543 421 0.000989136926158116 0.000931029794674372 0.000762951094834821 0.000732433051041428 0.000921384375555338 0.000826516241398973 43237 40575 667 665 0 True 546 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 588 422 0.000811359026369168 0.000913935100970554 0.000442511635004196 0.000457770656900893 0.000910347430666103 0.00103473360067022 35466 39830 667 665 0 True 590 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 631 425 0.00088504614710269 0.000890736798508058 0.000534065766384375 0.000549324788281071 0.000914196869015025 0.000920064587022516 38687 38819 667 665 0 True 635 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 236 467 0.0010360578465631 0.000863798314738552 0.000900282291905089 0.000732433051041428 0.000818897635371156 0.000734395247816836 45288 37645 667 665 0 True 233 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 280 469 0.000945212905106156 0.000926601236439691 0.000747692072938125 0.000778210116731518 0.000835329646889732 0.000831262617653072 41317 40382 667 665 0 True 278 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 324 469 0.00102322379666198 0.000957348739208975 0.000885023270008392 0.000823987182421607 0.000852089060190698 0.000809685908040396 44727 41722 667 665 0 True 323 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 369 468 0.000957749552781403 0.000954365772522402 0.000854505226215 0.000823987182421607 0.000772681701076145 0.000788457491303482 41865 41592 667 665 0 True 367 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 413 467 0.00100004930013821 0.00103552541229476 0.000747692072938125 0.000793469138628214 0.000958773251695733 0.0009478878123318 43714 45129 667 665 0 True 412 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 457 467 0.000938235391345298 0.000856501519305244 0.000457770656900893 0.000473029678797589 0.0010575449256378 0.000957499337521565 41012 37327 667 665 0 True 457 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 500 466 0.000910668492716333 0.00105390507626356 0.000503547722590982 0.000656137941557946 0.000980578946657188 0.00103750212029601 39807 45930 667 665 0 True 501 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 545 467 0.00095267083784727 0.000877336394316072 0.000595101853971161 0.000473029678797589 0.000958298722921414 0.000989713463267667 41643 38235 667 665 0 True 546 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 590 467 0.000920986062244685 0.000908060951187766 0.000518806744487678 0.000534065766384375 0.00100735106019196 0.00096908193154811 40258 39574 667 665 0 True 591 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 634 468 0.000990646814381777 0.000915013558157238 0.000595101853971161 0.000549324788281071 0.00103740790210861 0.000904629804914313 43303 39877 667 665 0 True 635 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 237 512 0.00090657349283701 0.00093924442601124 0.000717174029144732 0.00080872816052491 0.000763443164104627 0.000749375847039997 39628 40933 667 665 0 True 233 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 281 511 0.00093473519591772 0.000989243536857709 0.000778210116731518 0.000854505226215 0.000775194060630237 0.000815768059609128 40859 43112 667 665 0 True 278 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 323 513 0.000879189610962429 0.00101932560859691 0.000732433051041428 0.000854505226215 0.000730156461819004 0.000838018493166929 38431 44423 667 665 0 True 323 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 369 513 0.00101986086380019 0.00093947388498713 0.000854505226215 0.000793469138628214 0.000834147883039112 0.000752227257844836 44580 40943 667 665 0 True 367 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 413 511 0.000993094663471652 0.00104826038545666 0.000732433051041428 0.000762951094834821 0.000929901218815997 0.000957221866199986 43410 45684 667 665 0 True 412 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 457 512 0.00102690700884394 0.000967559663636087 0.000686655985351339 0.000579842832074464 0.00105999249370724 0.00101573174635714 44888 42167 667 665 0 True 457 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 500 511 0.000894334247387636 0.00105064675880592 0.000595101853971161 0.000732433051041428 0.000884723973334897 0.000972175645674701 39093 45788 667 665 0 True 501 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 544 510 0.00094994846362582 0.000925844021819254 0.000610360875867857 0.000686655985351339 0.000952312306811 0.000842437302181771 41524 40349 667 665 0 True 546 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 589 510 0.00082547419355097 0.000931924684680344 0.000457770656900893 0.000595101853971161 0.000870818296782416 0.000929094077730989 36083 40614 667 665 0 True 591 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 633 511 0.000911766593242632 0.000969464173135976 0.000503547722590982 0.000625619897764553 0.000978315261857341 0.000996853560873661 39855 42250 667 665 0 True 635 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 237 554 0.000991172987550629 0.000867423766557616 0.000823987182421607 0.000717174029144732 0.000758888226416628 0.000679344060275456 43326 37803 667 665 0 True 234 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 280 553 0.000952259050149908 0.000946793626318027 0.000839246204318303 0.000823987182421607 0.000765580379823404 0.00071688091111187 41625 41262 667 665 0 True 278 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 324 555 0.000974426954524569 0.000957256955618619 0.000854505226215 0.000839246204318303 0.000789451682687389 0.000730719638785596 42594 41718 667 665 0 True 323 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 369 552 0.00115360035706569 0.000955191824835607 0.000991836423285267 0.000869764248111696 0.000873928130496124 0.000736991742317442 50426 41628 667 665 0 True 368 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 413 555 0.00102473368488564 0.00100663652723018 0.000793469138628214 0.000717174029144732 0.000933816123679912 0.000873208250667997 44793 43870 667 665 0 True 412 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 457 552 0.000992408350642715 0.000895050627254793 0.000473029678797589 0.000457770656900893 0.00112347201743899 0.00102241864997452 43380 39007 667 665 0 True 457 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 501 553 0.000908014749777778 0.000976439726003037 0.000396734569314107 0.000534065766384375 0.00105264996942302 0.0011439230901955 39691 42554 667 665 0 True 502 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 544 551 0.000991927931662459 0.00092453610565668 0.000564583810177768 0.000442511635004196 0.0010443838751313 0.00101806622232165 43359 40292 667 665 0 True 546 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 589 551 0.00092450913476656 0.000871691703509174 0.000656137941557946 0.000686655985351339 0.000858933871151544 0.000753734363833412 40412 37989 667 665 0 True 591 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 632 553 0.00092059715164162 0.000919946926138877 0.000625619897764553 0.000610360875867857 0.000943483242578416 0.000883308691062313 40241 40092 667 665 0 True 636 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 234 594 0.00104431647760464 0.00095069442890816 0.000885023270008392 0.000854505226215 0.000763578650747284 0.000669904509851686 45649 41432 667 665 0 False 234 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 278 594 0.00104623815352566 0.000999821595646245 0.000961318379491875 0.000885023270008392 0.00071999136161721 0.000764647638372904 45733 43573 667 665 0 False 278 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 323 598 0.000978361814743807 0.00103488292716226 0.000854505226215 0.000930800335698482 0.000783688486201754 0.000791991659039427 42766 45101 667 665 0 True 323 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 367 598 0.0010513168684598 0.00102221679169313 0.000976577401388571 0.000885023270008392 0.000751410873190214 0.0007949217726142 45955 44549 667 665 0 True 368 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 412 594 0.000961341256586172 0.00101879785295236 0.000732433051041428 0.000793469138628214 0.000889508633180963 0.000870429399077658 42022 44400 667 665 0 False 412 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 457 594 0.00097941416108151 0.000958289521010124 0.000595101853971161 0.000595101853971161 0.00103189442588271 0.00101061978267498 42812 41763 667 665 0 False 457 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 502 593 0.000956125279086252 0.000961341325389464 0.000442511635004196 0.000488288700694286 0.00108822499907317 0.00113931757721165 41794 41896 667 665 0 False 502 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 546 593 0.00092864988883448 0.000928689313120292 0.000473029678797589 0.000564583810177768 0.00102713072671769 0.000961055790144697 40593 40473 667 665 0 False 546 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 591 593 0.000926156285556009 0.000921644922560464 0.00064087891966125 0.000686655985351339 0.000908954796711079 0.000852409170101159 40484 40166 667 665 0 False 591 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 636 593 0.000890239247508313 0.000973204354442985 0.000701915007248035 0.000778210116731518 0.0007640210070662 0.000778975392249762 38914 42413 667 665 0 False 636 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 235 644 0.00101588024939236 0.0699626612881483 0.000839246204318303 0.0686350804913405 0.000745928907508599 0.0199640188872931 44406 3049027 667 665 0 True 234 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 279 638 0.000967815474272477 0.000994291634327292 0.000854505226215 0.000839246204318303 0.000703117282030694 0.000698989740407733 42305 43332 667 665 0 False 279 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 323 638 0.000959991508022597 0.000944912062715727 0.000823987182421607 0.000885023270008392 0.000732803031895338 0.000635672611618874 41963 41180 667 665 0 False 323 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 368 637 0.00106417379545521 0.000954228097136868 0.000976577401388571 0.000854505226215 0.00073945840229479 0.000688204977938254 46517 41586 667 665 0 False 368 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 413 637 0.000922038408582388 0.000876831584569113 0.000778210116731518 0.000732433051041428 0.000766840143536227 0.000712172040457145 40304 38213 667 665 0 False 413 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 457 637 0.00101167086404154 0.000986191732478369 0.000747692072938125 0.000717174029144732 0.000948774152331908 0.00095500060917551 44222 42979 667 665 0 False 457 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 502 637 0.00100329784752851 0.000835620752499238 0.000701915007248035 0.000442511635004196 0.000965062511634173 0.000910353551382369 43856 36417 667 665 0 False 502 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 547 637 0.000854162069800531 0.000983277603484564 0.000534065766384375 0.000656137941557946 0.000869183229238396 0.000943021510652535 37337 42852 667 665 0 False 547 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 591 637 0.00100821642280256 0.000859851620353241 0.000778210116731518 0.000717174029144732 0.000842837793247042 0.000661931645378219 44071 37473 667 665 0 False 591 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 632 643 0.00112820678239502 0.0796576701538695 0.000991836423285267 0.0762340733958953 0.00079642256440167 0.0206543817637675 49316 3471543 667 665 0 True 636 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E1_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E1_1.csv new file mode 100755 index 0000000..e3c6ec2 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E1_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 256 287 0.00909842629612179 0.0404715840872495 0.00909437705043107 0.0405889982452125 0.00152661236161646 0.00761888889739685 397709 1763783 667 665 0 True 256 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 301 287 0.00911654495480573 0.00897638924502834 0.00904859998474098 0.0089570458533608 0.00137536902064829 0.00135280927289388 398501 391198 667 665 0 False 301 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 344 288 0.00900797026526792 0.0621372841579802 0.0089570458533608 0.0619058518348974 0.00136025021274138 0.00888067249234801 393755 2707991 667 665 0 True 345 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 388 288 0.00920636042701927 0.0944499954395028 0.00914015411612116 0.0909590295262074 0.00133378803158166 0.0170131848113462 402427 4116204 667 665 0 True 390 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 433 287 0.00913349688168047 0.0758536763056646 0.00920119020370794 0.0748149843595026 0.001662829005086 0.0115949367816538 399242 3305762 667 665 0 True 435 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 476 288 0.00904924054338132 0.0644204927516778 0.00904859998474098 0.0659189745937285 0.00169672447422201 0.0176658098494242 395559 2807495 667 665 0 True 479 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 522 286 0.00904901177243834 0.0771285962675056 0.00907911802853437 0.0751354238193332 0.00156842940409564 0.0206001596363382 395549 3361324 667 665 0 True 524 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 566 285 0.00911965623963024 0.0684067688103298 0.00915541313801785 0.0684061951628901 0.00179732517919748 0.0184329308001492 398637 2981220 667 665 0 True 569 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 613 286 0.00925344148708434 0.00915665221648766 0.00926222629129473 0.00926222629129473 0.00202498878557154 0.00183933275034073 404485 399054 667 665 0 False 613 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 653 286 0.00925776525790664 0.0400877451123804 0.00926222629129473 0.0396276798657206 0.00179336659400736 0.00804713624175166 404674 1747055 667 665 0 True 658 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 256 331 0.00895743476396386 0.00892363662647119 0.0089417868314641 0.0089417868314641 0.00152410397039831 0.00146151864492267 391546 388899 667 665 0 False 256 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 301 330 0.00916200174117565 0.00907289969028775 0.00917067215991455 0.00906385900663768 0.00131007246488864 0.00130471162711259 400488 395404 667 665 0 False 301 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 344 332 0.00927597542496776 0.134802880398524 0.00924696726939803 0.12156862745098 0.00131415730188669 0.0633413741318941 405470 5874814 667 665 0 True 345 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 388 332 0.00926812858162358 0.0496778912261198 0.00923170824750134 0.0492256046387427 0.00133187619054069 0.00678010299041426 405127 2165001 667 665 0 True 390 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 433 332 0.00920700098565961 0.0854877867591845 0.00915541313801785 0.0829480430304417 0.00154179125322483 0.0206603153283319 402455 3725624 667 665 0 True 435 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 476 330 0.00919883386299526 0.0413972674877856 0.00910963607232776 0.04272526131075 0.00163268392346234 0.00756427319344686 402098 1804125 667 665 0 True 479 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 521 330 0.00910567833501423 0.04345152191534 0.00915541313801785 0.0449225604638743 0.00162167295749966 0.00852276523029383 398026 1893651 667 665 0 True 524 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 565 330 0.0090440245658814 0.0482863602127314 0.00906385900663768 0.0500190737773709 0.00180444640637371 0.00755906091868708 395331 2104357 667 665 0 True 569 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 613 329 0.00918657174045159 0.00910050360508733 0.00921644922560464 0.00907911802853437 0.00202743829603002 0.00218009277610034 401562 396607 667 665 0 False 613 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 658 329 0.00890085970976517 0.00896145146569789 0.00901808194094758 0.00901808194094758 0.0019787298654296 0.00187390626270233 389073 390547 667 665 0 False 658 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 257 376 0.00927087383293933 0.0512401856093656 0.00926222629129473 0.0496528572518502 0.00157479553337625 0.00931346946910144 405247 2233087 667 665 0 True 256 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 300 375 0.00930379397163401 0.059743843472265 0.0093690394445716 0.0637979705500877 0.00137889828316316 0.0153118311216765 406686 2603683 667 665 0 True 301 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 346 374 0.00948836636842943 0.0279987907511971 0.00946059357595178 0.0325780117494469 0.0014927704192601 0.0134075236658285 414754 1220209 667 665 0 False 346 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 388 376 0.00928171757563654 0.0335328134940234 0.00921644922560464 0.0346990157930877 0.0014505231614142 0.00486235713131468 405721 1461386 667 665 0 True 390 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 432 375 0.00933396885901293 0.0685893493174456 0.00929274433508812 0.0664072632944228 0.0016324590382447 0.0107222322618335 408005 2989177 667 665 0 True 435 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 477 375 0.0380333537362337 0.0317254569245269 0.00970473792629892 0.0322117952239261 0.13454728343792 0.00432837916901482 1652538 1382620 663 665 0 True 480 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 520 374 0.0399530445603716 0.0280775410717226 0.00962844281681544 0.0287327382314794 0.133753728396274 0.00385599336178818 1735948 1223641 663 665 0 True 524 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 565 373 0.00926272958736928 0.049954412237965 0.00926222629129473 0.050919356069276 0.00175323280572295 0.00757273864656977 404891 2177052 667 665 0 True 569 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 609 373 0.0091244375523385 0.0544747540630014 0.00923170824750134 0.054886701762417 0.00205879974069292 0.00985302499218411 398846 2374052 667 665 0 True 614 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 654 374 0.00910249841890682 0.0600748609908842 0.00912489509422446 0.0600289921416037 0.00192890105607306 0.0145792269573309 397887 2618109 667 665 0 True 658 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 255 419 0.00924115648744636 0.0419354405698384 0.00935378042267491 0.0452429999237049 0.00155607561180932 0.0104115484598822 403948 1827579 667 665 0 True 256 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 300 419 0.0092690436653955 0.0331961512845974 0.00924696726939803 0.0319218738078889 0.00147322182443704 0.00617945646890295 405167 1446714 667 665 0 True 301 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 345 420 0.00942044427545897 0.0817971915368646 0.0093842984664683 0.0790264744029908 0.00136268655854094 0.0159369232009363 411785 3564785 667 665 0 True 346 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 388 420 0.00940401852175309 0.066619076875067 0.00944533455405508 0.0646982528419928 0.00145201788544198 0.0153108023193241 411067 2903311 667 665 0 True 390 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 433 419 0.00956843619847206 0.0441152090572047 0.00950637064164187 0.0453192950331884 0.00159678578503303 0.00722372535071386 418254 1922575 667 665 0 True 435 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 478 418 0.00955683751166303 0.0530810431893421 0.00946059357595178 0.0525062943465324 0.00174573617606128 0.00810287709276785 417747 2313313 667 665 0 True 480 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 521 417 0.00931456908304831 0.0424809104473245 0.0093690394445716 0.0430914778362707 0.00168325485142174 0.00514001427830466 407157 1851351 667 665 0 True 524 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 566 417 0.00945782544754174 0.0552103077561149 0.00950637064164187 0.0532082093537804 0.00185924781765675 0.00782523440934788 413419 2406108 667 665 0 True 569 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 609 417 0.00931621623383776 0.0421410587581336 0.00933852140077821 0.0425879301136797 0.00190770995449357 0.00628903913273585 407229 1836540 667 665 0 True 614 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 654 418 0.00935407782490078 0.0910269493830709 0.00930800335698482 0.0904859998474098 0.00183362334383556 0.0184033277733038 408884 3967025 667 665 0 True 658 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 257 463 0.00902437314187951 0.0408949129518693 0.00909437705043107 0.0410620279240101 0.00154882800938442 0.00529774123372318 394472 1782232 667 665 0 True 257 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 301 463 0.00919322897489228 0.0630125783674109 0.00918593118181125 0.0607003891050584 0.00156942362492345 0.0125537466672498 401853 2746137 667 665 0 True 301 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 345 464 0.00939836787946151 0.0348461448884284 0.0093842984664683 0.0354467078660258 0.0014646406436016 0.00375537993016089 410820 1518622 667 665 0 True 346 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 389 463 0.00965122840273615 0.0528626670819874 0.00959792477302205 0.0527046616311894 0.00165687311751489 0.0080584808494637 421873 2303796 667 665 0 True 391 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 433 463 0.00980519124736098 0.0939279992152503 0.00976577401388571 0.0928511482413977 0.00191604740685868 0.0149792464017035 428603 4093455 667 665 0 True 435 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 477 462 0.00963175999548864 0.0653918155425185 0.00962844281681544 0.0634775310902571 0.00192878571944338 0.0167439531067718 421022 2849826 667 665 0 True 480 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 522 462 0.00951627642347286 0.0511444553246242 0.00953688868543526 0.0502479591058213 0.00177643133268963 0.00616844939875756 415974 2228915 667 665 0 True 525 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 566 461 0.00953798678596156 0.0322283621619854 0.00959792477302205 0.0324254215304799 0.00196894946114241 0.00364901113347124 416923 1404537 667 665 0 True 569 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 610 461 0.00929343064791706 0.0389972413294624 0.00935378042267491 0.0392462043183032 0.00185257389793814 0.00431124633816066 406233 1699530 667 665 0 True 614 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 654 462 0.00928007042484709 0.0683496564712307 0.0093842984664683 0.0677500572213321 0.00189571713109759 0.0108964990838869 405649 2978731 667 665 0 True 659 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 258 507 0.00917952559540784 0.0528736811128301 0.00920119020370794 0.0530556191348135 0.00154739467044936 0.0114413981790882 401254 2304276 667 665 0 True 257 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 302 508 0.00938871374566779 0.0589674001896478 0.00930800335698482 0.0571145189593347 0.00158918932159329 0.00872421082794621 410398 2569845 667 665 0 True 301 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 346 508 0.00957751840490833 0.0698594965325881 0.00952162966353857 0.0682841229877165 0.00162463535399226 0.0140774463365407 418651 3044531 667 665 0 True 346 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 390 507 0.00981029283938941 0.0860881432237036 0.00984206912336919 0.0802166781109331 0.00161582415188594 0.0158221474431352 428826 3751788 667 665 0 True 391 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 435 507 0.00977519937673644 0.0943562614478517 0.0097962920576791 0.0900129701686122 0.00194562745208134 0.0253250793426618 427292 4112119 667 665 0 True 435 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 479 506 0.00957182200842815 0.0417673618699989 0.00964370183871214 0.0421149004348821 0.00184723648993457 0.00413689624734677 418402 1820254 667 665 0 True 480 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 524 505 0.00940022092409964 0.0408335326758186 0.00933852140077821 0.0414129854276341 0.00175211988515271 0.00471934189128724 410901 1779557 667 665 0 True 525 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 566 505 0.00958236834889948 0.0995847595642804 0.00958266575112535 0.0989852750438697 0.0018312775249871 0.0141173632894894 418863 4339981 667 665 0 True 569 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 611 505 0.00916849883595625 0.062408412883892 0.00920119020370794 0.0637369344625009 0.00192837067441836 0.0153585998884451 400772 2719807 667 665 0 True 614 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 655 506 0.0092951006758008 0.07174750793211 0.00924696726939803 0.0695963988708324 0.001971536119562 0.00933670845226187 406306 3126812 667 665 0 True 659 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 258 551 0.00904855423055238 0.0540745087713562 0.00901808194094758 0.0560006103608759 0.00141214780285207 0.010833138330073 395529 2356609 667 665 0 True 257 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 302 550 0.00946095960946055 0.102997961830647 0.00944533455405508 0.0999313344014649 0.00146605732563338 0.020400658637336 413556 4488731 667 665 0 True 301 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 347 551 0.00947470874313358 0.0578707927979711 0.00947585259784848 0.059311818112459 0.00145498445162908 0.00986788037461929 414157 2522054 667 665 0 True 346 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 391 551 0.00985671046371984 0.0578860747657654 0.00978103303578241 0.0574044403753719 0.00152800153845582 0.00579583477983475 430855 2522720 667 665 0 True 391 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 435 550 0.0100479629720503 0.0545334955608293 0.00997940032043946 0.0544747081712062 0.00206702436022857 0.00500020738996377 439215 2376612 667 665 0 True 435 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 479 548 0.00944766801767347 0.0649442099182495 0.00956740672922866 0.0628213931486992 0.00197861870039547 0.0114751893019304 412975 2830319 667 665 0 True 480 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 523 548 0.00939587427618303 0.0721410530216592 0.00935378042267491 0.0689555199511711 0.00192848224272405 0.0128023136681342 410711 3143963 667 665 0 True 525 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 568 547 0.0093615128805476 0.0557536666110229 0.00933852140077821 0.0565804531929503 0.00175137409075101 0.00941156351824706 409209 2429788 667 665 0 True 569 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 611 546 0.00918357484109856 0.0469019883193908 0.00920119020370794 0.0465552758068208 0.00167893170516922 0.0043799906968735 401431 2044025 667 665 0 True 614 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 656 547 0.00921390986813757 0.0648321651003223 0.00932326237888151 0.0643015182726787 0.00180071274836308 0.0108737194958277 402757 2825436 667 665 0 True 659 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 259 592 0.00895260769706701 0.0474502575963828 0.00891126878767071 0.0477912565804532 0.00131377900156972 0.00695974578926434 391335 2067919 667 665 0 True 257 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 303 592 0.00915118087557274 0.0570548596256033 0.00915541313801785 0.0567940794995041 0.00147369645983049 0.00940417184456674 400015 2486495 667 665 0 True 302 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 347 591 0.0091766659586206 0.0456813583512455 0.00921644922560464 0.0454566262302586 0.00149732919469993 0.00537145606188034 401129 1990829 667 665 0 True 346 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 391 591 0.00944689019646734 0.0526515648241685 0.00944533455405508 0.0504921034561685 0.0014459848513095 0.00757269526603101 412941 2294596 667 665 0 True 391 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 436 590 0.00966763127934774 0.0900929825135051 0.00964370183871214 0.0857557030594339 0.00190488164459798 0.0152604636631457 422590 3926322 667 665 0 True 436 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 480 589 0.00935341438916614 0.0610864079401984 0.0093842984664683 0.060013733119707 0.00204130044644728 0.00750651218318931 408855 2662193 667 665 0 True 480 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 524 588 0.00928048221254445 0.0553425449639204 0.00933852140077821 0.0547951476310369 0.0020428023552591 0.00625030855004737 405667 2411871 667 665 0 True 525 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 569 588 0.00893407725068571 0.0361238183579801 0.0089417868314641 0.0369726100556954 0.00178558512271871 0.00528924086431093 390525 1574304 667 665 0 True 570 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 613 588 0.00933268774173225 0.0454236988672184 0.00932326237888151 0.0452429999237049 0.00150644279110442 0.00478816114194052 407949 1979600 667 665 0 True 614 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 658 588 0.00915829565189939 0.053374108193349 0.00920119020370794 0.052475776302739 0.00160988291198849 0.00855704860507503 400326 2326085 667 665 0 True 659 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 257 635 0.00873921016145624 0.00872728858080197 0.00869764248111696 0.00869764248111696 0.00136771847211944 0.00155212046758879 382007 380342 667 665 0 False 257 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 302 635 0.00888658440292328 0.0088546612583186 0.00891126878767071 0.00889600976577401 0.00139863245350459 0.00125981081208337 388449 385893 667 665 0 False 302 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 348 634 0.00925511151496808 0.0739558670078722 0.00918593118181125 0.0693217364766918 0.00137468137056845 0.0144597115118941 404558 3223054 667 665 0 True 346 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 392 633 0.00933948223873872 0.0761152365922818 0.0093690394445716 0.072983901731899 0.00143967987154963 0.0150648141509989 408246 3317161 667 665 0 True 391 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 436 634 0.00910469461995942 0.00900954606704447 0.00909437705043107 0.0089417868314641 0.00174405408516824 0.00176502731798696 397983 392643 667 665 0 False 436 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 480 634 0.00902375546033346 0.00894102961684367 0.00906385900663768 0.00889600976577401 0.00175372597738011 0.00172417000834318 394445 389657 667 665 0 False 480 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 525 634 0.00887802836965587 0.00870968907735119 0.00885023270008392 0.00872816052491035 0.00177502711105408 0.00178075249953157 388075 379575 667 665 0 False 525 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 570 634 0.00902837663338164 0.00874442916630097 0.00909437705043107 0.00877393759060044 0.00178490442485704 0.00156301009956241 394647 381089 667 665 0 False 570 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 614 634 0.00888910088329605 0.00882806696301293 0.00883497367818723 0.00885023270008392 0.00144689592852385 0.0013584542825932 388559 384734 667 665 0 False 614 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 659 634 0.00898939406469802 0.00886326596991449 0.00901808194094758 0.00878919661249714 0.00148586386227659 0.00152715897548187 392943 386268 667 665 0 False 659 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 257 684 0.00875584180901081 0.038940817367291 0.00878919661249714 0.0401464866102083 0.0014111476449712 0.00924717474338795 382734 1697071 667 665 0 True 257 679 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 302 678 0.0087428704965439 0.00860494105485733 0.00881971465629053 0.00869764248111696 0.00134009837111328 0.00124613486648037 382167 375010 667 665 0 False 302 678 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 347 678 0.00875547577550204 0.00865539908365558 0.00881971465629053 0.00862134737163348 0.00128266614865267 0.00130760533029929 382718 377209 667 665 0 False 347 678 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 391 678 0.00878892208736556 0.00859376640273148 0.00881971465629053 0.00860608834973678 0.00137254992459538 0.0013482563728196 384180 374523 667 665 0 False 391 678 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 436 678 0.00888134554832906 0.00866505930654056 0.00886549172198062 0.00874341954680705 0.00175747699563921 0.00152803923014915 388220 377630 667 665 0 False 436 678 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 481 678 0.00860876496976964 0.00871375050122445 0.00859082932784009 0.00880445563439384 0.00168104692564003 0.00156060481489457 376305 379752 667 665 0 False 481 678 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 525 678 0.00858204452362969 0.00876000943076391 0.00862134737163348 0.00883497367818723 0.00176436418823029 0.00169726759276567 375137 381768 667 665 0 False 525 678 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 570 678 0.00873113454716908 0.00857956289212388 0.00877393759060044 0.00860608834973678 0.00158009853730069 0.00145959801182653 381654 373904 667 665 0 False 570 678 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 615 677 0.00890557239119053 0.00885183891291516 0.00888075074387732 0.00886549172198062 0.00131272430993401 0.00147542126671805 389279 385770 667 665 0 False 615 677 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 655 683 0.00887123387264939 0.0395252034870881 0.00886549172198062 0.0397192339971008 0.00150436474856909 0.00790622972917245 387778 1722539 667 665 0 True 659 677 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E1_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E1_2.csv new file mode 100755 index 0000000..5564682 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E1_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 256 287 0.0079481659948236 0.718305238949973 0.00782787823300526 0.704966811627375 0.00197073827937839 0.17140861215205 347429 31304299 667 665 9 True 256 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 301 287 0.00642917268763192 0.00641906895873238 0.00633249408712902 0.0063782711528191 0.00151691807505316 0.00127508729006072 281031 279748 667 665 0 False 301 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 344 288 0.00602884641451305 0.0061944286213359 0.00599679560540169 0.00616464484626535 0.00123610380530446 0.00131011698745906 263532 269958 667 665 0 True 345 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 388 288 0.00596778744983196 0.00594668176506728 0.00593575951781491 0.00592050049591821 0.00132865415773114 0.00121878117827822 260863 259161 667 665 0 True 390 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 433 287 0.00620413071102352 0.00622494666512929 0.00628671702143893 0.00619516289005875 0.0016659299234231 0.0018077508273586 271194 271288 667 665 0 True 435 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 476 288 0.00623039361527751 0.00648272087864431 0.00625619897764553 0.00653086137178607 0.00168810801656957 0.00177761960085797 272342 282522 667 665 0 True 479 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 522 286 0.00653070123212598 0.00665291060106205 0.00654612039368277 0.00660715648126955 0.00145984394528583 0.0017385301636904 285469 289939 667 665 0 True 524 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 566 285 0.00690021205922559 0.00689918891988497 0.00695811398489357 0.00689707789730678 0.00179688292565055 0.00162882967501028 301621 300672 667 665 0 True 569 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 613 286 0.00867419345946162 0.00736574785556246 0.00801098649576562 0.00732433051041428 0.00519624749198499 0.00182211307005088 379165 321005 667 665 0 False 613 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 653 286 0.00863557692428677 0.71907273333253 0.00874341954680705 0.691783016708629 0.00200976797898505 0.173498286803684 377477 31337747 667 665 10 True 658 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 256 331 0.00629813269149358 0.00620562621935934 0.00628671702143893 0.00614938582436866 0.00152683799739807 0.00144003169034235 275303 270446 667 665 0 False 256 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 301 330 0.00624665922932331 0.00610597218613024 0.00622568093385214 0.00611886778057527 0.00131139938396795 0.00125429640773704 273053 266103 667 665 0 False 301 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 344 332 0.00594445281364811 0.00614835325897715 0.0059662775616083 0.00611886778057527 0.00129653588316807 0.00129835175440781 259843 267950 667 665 0 True 345 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 388 332 0.00626063713393933 0.00606219141353039 0.00625619897764553 0.00607309071488518 0.0013229371371924 0.00119131514047808 273664 264195 667 665 0 True 390 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 433 332 0.00664957061409785 0.00658283382982519 0.00665293354695964 0.00654612039368277 0.0016331180587117 0.00176009330537651 290665 286885 667 665 0 True 435 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 476 330 0.00646618782620592 0.00652629513816585 0.00643930724040589 0.00653086137178607 0.00160900089206554 0.00150906747513667 282649 284421 667 665 0 True 479 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 521 330 0.00631762397583538 0.00646977939240411 0.00622568093385214 0.00653086137178607 0.00155476396641326 0.00172413148821766 276155 281958 667 665 0 True 524 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 565 330 0.00670271410415186 0.00687913420539217 0.00671396963454643 0.00689707789730678 0.00179551028777245 0.00148972340409355 292988 299798 667 665 0 True 569 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 613 329 0.00724716607134748 0.00715267225055084 0.00718699931334401 0.00704966811627375 0.00193894701663079 0.00213397926575125 316787 311719 667 665 0 False 613 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 658 329 0.00704205004387255 0.00696169354491745 0.00703440909437705 0.00704966811627375 0.00198606828176629 0.00181473444844941 307821 303396 667 665 0 False 658 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 257 376 0.00598901739334041 0.00614039103251376 0.0059510185397116 0.00614938582436866 0.00146255759121051 0.00152188422738295 261791 267603 667 665 0 True 256 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 300 375 0.00612563940048744 0.00612373231086414 0.00613412680247196 0.00608834973678187 0.00137645507267057 0.00129793672154444 267763 266877 667 665 0 True 301 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 346 374 0.00633171626592289 0.00608337047700506 0.0063782711528191 0.00610360875867857 0.00134700713585326 0.00142561400975688 276771 265118 667 665 0 False 346 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 388 376 0.00670921119893246 0.00671626422430533 0.00666819256885634 0.00668345159075303 0.00139082948024826 0.00128765678953971 293272 292700 667 665 0 True 390 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 432 375 0.00670825036097195 0.00664251610945423 0.00671396963454643 0.00653086137178607 0.0015634275363053 0.00161465038028035 293230 289486 667 665 0 True 435 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 477 375 0.027667786614818 0.0068074053295289 0.00709544518196384 0.0068055237659266 0.09903572362194 0.00168164054229058 1209410 296672 667 665 0 True 480 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 520 374 0.0290557170487771 0.00658347631495769 0.00695811398489357 0.00665293354695964 0.0997876256407049 0.00167206929171457 1270079 286913 667 665 0 True 524 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 565 373 0.00671989480196958 0.00682713880145546 0.00668345159075303 0.00686655985351339 0.0018563100851485 0.00164547366117774 293739 297532 667 665 0 True 569 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 609 373 0.00659645000113814 0.00663801871352678 0.00666819256885634 0.00666819256885634 0.00192507250070265 0.00192481089747458 288343 289290 667 665 0 True 614 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 654 374 0.00601061337035762 0.00624862683144116 0.00601205462729839 0.00624093995574884 0.00200022828675602 0.00169579230735551 262735 272320 667 665 0 True 658 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 255 419 0.00621570652073826 0.00611510465337067 0.00627145799954223 0.00619516289005875 0.00142854415183257 0.00157267703560441 271700 266501 667 665 0 True 256 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 300 419 0.00619644400733943 0.00614589804793513 0.00622568093385214 0.00616464484626535 0.00137764280400578 0.00131590023301286 270858 267843 667 665 0 True 301 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 345 420 0.00645641930694072 0.00668092754201824 0.00650034332799268 0.00660715648126955 0.00134549761249782 0.00130525376763167 282222 291160 667 665 0 True 346 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 388 420 0.00663556983238754 0.00654807079497783 0.00666819256885634 0.00654612039368277 0.00138374967276343 0.00138652239662461 290053 285370 667 665 0 True 390 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 433 419 0.00672609449452431 0.00680648749362534 0.00675974670023652 0.00674448767833982 0.00160928245036837 0.00152804605017865 294010 296632 667 665 0 True 435 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 478 418 0.00667468966363694 0.0067275994977143 0.00672922865644312 0.00675974670023652 0.00165643044200217 0.00161322434730557 291763 293194 667 665 0 True 480 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 521 417 0.00660182611829814 0.00670894448297443 0.00659189745937285 0.00675974670023652 0.00164169807248135 0.00164041834616504 288578 292381 667 665 0 True 524 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 566 417 0.00645692260301527 0.00666339687626023 0.00653086137178607 0.00662241550316625 0.00169842243777712 0.00163004933142389 282244 290396 667 665 0 True 569 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 609 417 0.00587740005026098 0.00598346403890247 0.00592050049591821 0.00602731364919509 0.0019165605949611 0.00167347010960747 256912 260764 667 665 0 True 614 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 654 418 0.00596456177953596 0.00573346848467013 0.0059510185397116 0.00569161516746777 0.00196517374475432 0.00193773136099981 260722 249869 667 665 0 True 658 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 257 463 0.00623279571017879 0.00612855094935783 0.00622568093385214 0.00610360875867857 0.00141694102158227 0.00143675562603932 272447 267087 667 665 0 True 257 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 301 463 0.00621916096197724 0.00627584066598173 0.00627145799954223 0.00622568093385214 0.00145545641725695 0.00161495936735217 271851 273506 667 665 0 True 301 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 345 464 0.00643683651422172 0.00637111203277133 0.00648508430609598 0.00630197604333562 0.00149638206107263 0.00151335213480748 281366 277658 667 665 0 True 346 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 389 463 0.0064729136919295 0.00640011564732385 0.00643930724040589 0.00646982528419928 0.00151430215376361 0.00147568519158316 282943 278922 667 665 0 True 391 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 433 463 0.0066261673466311 0.00661640367799792 0.00679026474402991 0.00657663843747616 0.0018313786405369 0.00191362089865198 289642 288348 667 665 0 True 435 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 477 462 0.00679527482768115 0.00688002909539814 0.00691233691920348 0.00701915007248035 0.00194949345720547 0.00189542862035285 297034 299837 667 665 0 True 480 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 522 462 0.00652020064584325 0.0066444435648517 0.00654612039368277 0.00662241550316625 0.00169932503658129 0.00173279070271337 285010 289570 667 665 0 True 525 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 566 461 0.00616391277924782 0.00620610808320871 0.00616464484626535 0.00621042191195544 0.00184093070550675 0.00199922242396176 269436 270467 667 665 0 True 569 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 610 461 0.00598238303599402 0.00599899841157024 0.00607309071488518 0.00590524147402152 0.0017236087410154 0.00177499022761556 261501 261441 667 665 0 True 614 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 654 462 0.00575841628281762 0.00590705419993105 0.00572213321126116 0.00587472343022812 0.00181656953332977 0.00189707221037118 251711 257434 667 665 0 True 659 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 258 507 0.00619992132567271 0.00606898339921674 0.00619516289005875 0.00608834973678187 0.00143786768097108 0.00148548073182162 271010 264491 667 665 0 True 257 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 302 508 0.0063326084726005 0.00634284268694166 0.00631723506523232 0.00645456626230259 0.00148141133829846 0.00160171297286821 276810 276426 667 665 0 True 301 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 346 508 0.00624544674332552 0.00641649901820241 0.00634775310902571 0.00645456626230259 0.00153104257224399 0.001459454526208 273000 279636 667 665 0 True 346 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 390 507 0.00648126383134823 0.00650573561392609 0.00654612039368277 0.00646982528419928 0.00146304137370547 0.00154035277627895 283308 283525 667 665 0 True 391 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 435 507 0.00658604092323259 0.00677188508006111 0.00654612039368277 0.0068207827878233 0.00180267112150525 0.00194595698102871 287888 295124 667 665 0 True 435 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 479 506 0.00640414514647002 0.00629217814506511 0.00643930724040589 0.00631723506523232 0.00171787269450505 0.00165937946543236 279937 274218 667 665 0 True 480 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 524 505 0.00595776728252948 0.00614185956995946 0.0059662775616083 0.00619516289005875 0.00160136757478603 0.00152050612431556 260425 267667 667 665 0 True 525 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 566 505 0.00599304376193684 0.00600668528726256 0.00592050049591821 0.00599679560540169 0.00170466887827535 0.00173161526281368 261967 261776 667 665 0 True 569 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 611 505 0.00578653223170973 0.00577107681081853 0.00573739223315786 0.00584420538643473 0.00174391702845507 0.00181643652046918 252940 251508 667 665 0 True 614 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 655 506 0.00577319488573406 0.00597176163113208 0.00575265125505455 0.00601205462729839 0.00194937562162114 0.00188736767786645 252357 260254 667 665 0 True 659 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 258 551 0.00617738738778928 0.00625195398659156 0.00611886778057527 0.00613412680247196 0.00138726900977747 0.00138495957105905 270025 272465 667 665 0 True 257 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 302 550 0.00630753517725001 0.00633065841532189 0.00625619897764553 0.00636301213092241 0.00137500186226807 0.00137701711713608 275714 275895 667 665 0 True 301 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 347 551 0.00646653098262039 0.00657489454925939 0.00645456626230259 0.00656137941557946 0.0013817625582968 0.00136831179287893 282664 286539 667 665 0 True 346 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 391 551 0.0064011253700227 0.00642322216619599 0.00645456626230259 0.00643930724040589 0.00141003968908954 0.00129936238257845 279805 279929 667 665 0 True 391 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 435 550 0.00639671009082321 0.0063059915754137 0.00636301213092241 0.00627145799954223 0.00179137166986836 0.00183859090189201 279612 274820 667 665 0 True 435 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 479 548 0.00624844364267855 0.00631746452420821 0.00630197604333562 0.00636301213092241 0.00187376275125328 0.00199293371401692 273131 275320 667 665 0 True 480 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 523 548 0.00604463160957859 0.00620920577938323 0.0059510185397116 0.00625619897764553 0.001911936439513 0.00182383792636808 264222 270602 667 665 0 True 525 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 568 547 0.00587376259226761 0.00609663320581151 0.00584420538643473 0.00624093995574884 0.00169538422832324 0.00171334082182301 256753 265696 667 665 0 True 569 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 611 546 0.00603701353717739 0.00608720244190242 0.0059510185397116 0.00610360875867857 0.00165887951551642 0.00163107090667947 263889 265285 667 665 0 True 614 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 656 547 0.00593273974136759 0.00637616013024091 0.00599679560540169 0.00631723506523232 0.00181029535864192 0.00209993645983731 259331 277878 667 665 0 True 659 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 259 592 0.00635905439360887 0.00641548939870849 0.00636301213092241 0.00645456626230259 0.0011923703859328 0.00127960071921536 277966 279592 667 665 0 True 257 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 303 592 0.00647577332871674 0.00659549996529433 0.00645456626230259 0.00660715648126955 0.00135923788313502 0.00137526378106311 283068 287437 667 665 0 True 302 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 347 591 0.00632279419914671 0.00644765954712829 0.00642404821850919 0.00648508430609598 0.00134170298345239 0.00143429713188211 276381 280994 667 665 0 True 346 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 391 591 0.00632807880792952 0.0062290998725929 0.0063782711528191 0.00625619897764553 0.0013077596155075 0.00126980598162448 276612 271469 667 665 0 True 391 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 436 590 0.00620133970551918 0.00621673203379242 0.00625619897764553 0.00619516289005875 0.00167971658396229 0.0018277960511406 271072 270930 667 665 0 True 436 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 480 589 0.00621863478880839 0.00627400499417461 0.00633249408712902 0.00622568093385214 0.00195403160073425 0.00177108972422713 271828 273426 667 665 0 True 480 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 524 588 0.00621316716327119 0.00660226900508309 0.00613412680247196 0.00646982528419928 0.00201846095013196 0.00216913314269076 271589 287732 667 665 0 True 525 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 569 588 0.00617985811397345 0.00615443392183824 0.00622568093385214 0.00610360875867857 0.00162102940173583 0.00184117921145622 270133 268215 667 665 0 True 570 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 613 588 0.00620033311337007 0.00640399350401639 0.00613412680247196 0.00643930724040589 0.00153581050940329 0.00149357352151489 271028 279091 667 665 0 True 614 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 658 588 0.00591494136200382 0.00613945025071261 0.0059510185397116 0.00604257267109178 0.00159628425776355 0.00161712260366297 258553 267562 667 665 0 True 659 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 257 635 0.00655721578441724 0.0065980699058243 0.00663767452506294 0.00650034332799268 0.00134947229322506 0.0014377006108139 286628 287549 667 665 0 False 257 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 302 635 0.00658645271092995 0.00652725886586459 0.00663767452506294 0.00646982528419928 0.00138031194334253 0.00129327031503788 287906 284463 667 665 0 False 302 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 348 634 0.00608123496045523 0.00630371993155239 0.00611886778057527 0.00625619897764553 0.00130630253781436 0.00133415061754146 265822 274721 667 665 0 True 346 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 392 633 0.00616773325399557 0.00599220642588389 0.00617990386816205 0.0059662775616083 0.00143016514635961 0.00125596888566003 269603 261145 667 665 0 True 391 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 436 634 0.00597954627630108 0.00597199109010797 0.00601205462729839 0.0059662775616083 0.00153596258814183 0.00164587515298747 261377 260264 667 665 0 False 436 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 480 634 0.0061119131439087 0.0059873877873902 0.00617990386816205 0.00601205462729839 0.00173047303386274 0.00180521438212236 267163 260935 667 665 0 False 480 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 525 634 0.00596396697508421 0.00611136447206366 0.005981536583505 0.00610360875867857 0.00183662856873646 0.00175788459669313 260696 266338 667 665 0 False 525 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 570 634 0.00611756378620028 0.00623061430183378 0.00614938582436866 0.00630197604333562 0.00159377306308667 0.00149436405049307 267410 271535 667 665 0 False 570 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 614 634 0.00618013263910503 0.00617829765533082 0.00621042191195544 0.00616464484626535 0.00143539513673119 0.00136153672496673 270145 269255 667 665 0 False 614 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 659 634 0.00620234629766829 0.00639047837033646 0.00621042191195544 0.00634775310902571 0.00140036859290988 0.00155061584104902 271116 278502 667 665 0 False 659 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 257 684 0.00863797901918805 0.703073912751666 0.00796520943007553 0.718333714808881 0.00286489445464411 0.211898918000022 377582 30640506 667 665 10 True 257 679 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 302 678 0.00678077074989628 0.00664740358564069 0.00665293354695964 0.00665293354695964 0.00173895856169077 0.00135019103038381 296400 289699 667 665 0 False 302 678 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 347 678 0.00595806468475536 0.00613821117224281 0.005981536583505 0.00614938582436866 0.00124322272061391 0.00136662126585904 260438 267508 667 665 0 False 347 678 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 391 678 0.00579275480135876 0.00565930734366243 0.00581368734264134 0.00564583810177768 0.0013639671392316 0.00128533906859217 253212 246637 667 665 0 False 391 678 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 436 678 0.00602147999014912 0.00580033283024453 0.00605783169298848 0.00575265125505455 0.00152623930489388 0.00146482291542671 263210 252783 667 665 0 False 436 678 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 481 678 0.00594294292542445 0.00580535798181652 0.005981536583505 0.00585946440833143 0.00155349664113163 0.00156886796839551 259777 253002 667 665 0 False 481 678 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 525 678 0.00585848069327662 0.00596705772212633 0.00592050049591821 0.0059662775616083 0.00170241117371228 0.00173987006084872 256085 260049 667 665 0 False 525 678 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 570 678 0.00596897705873545 0.00607162217743948 0.00604257267109178 0.00610360875867857 0.00146248412841508 0.00147023038157873 260915 264606 667 665 0 False 570 678 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 615 677 0.00687927951794302 0.00633240230353866 0.00669871061264973 0.00636301213092241 0.0021517308533224 0.00144703570151171 300706 275971 667 665 0 False 615 677 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 655 683 0.00788600892961622 0.727198380478548 0.00793469138628214 0.720607309071489 0.00176773728888495 0.178234080381473 344712 31691869 667 665 10 True 659 677 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E1_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E1_3.csv new file mode 100755 index 0000000..52f851a --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E1_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 256 287 0.00108039365531242 0.0727873012813563 0.000885023270008392 0.0710307469291218 0.000851432387638264 0.0193498456214251 47226 3172127 667 665 0 True 256 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 301 287 0.000950886424492034 0.000918478388693179 0.000793469138628214 0.000793469138628214 0.000704964526854113 0.000660314241236405 41565 40028 667 665 0 False 301 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 344 288 0.000930640196038397 0.000959436815889575 0.00080872816052491 0.000854505226215 0.000641347436485093 0.00070375771017574 40680 41813 667 665 0 True 345 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 388 288 0.000943336983373729 0.000973594434701999 0.000778210116731518 0.000854505226215 0.000711833214949427 0.000690049605621401 41235 42430 667 665 0 True 390 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 433 287 0.00093157815690461 0.000973823893677889 0.000671396963454643 0.000717174029144732 0.000827633996528953 0.000864275610839958 40721 42440 667 665 0 True 435 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 476 288 0.000959373826476553 0.000840508228685699 0.000747692072938125 0.000503547722590982 0.000857765155942809 0.000874205510275745 41936 36630 667 665 0 True 479 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 522 286 0.000839818131675751 0.000920176385114767 0.000656137941557946 0.000686655985351339 0.000772553508894477 0.000827438123831258 36710 40102 667 665 0 True 524 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 566 285 0.00100597446756137 0.000969578902623921 0.000747692072938125 0.000732433051041428 0.000954881876640267 0.000862980044130026 43973 42255 667 665 0 True 569 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 613 286 0.00110896714609049 0.00106340467786541 0.000671396963454643 0.000717174029144732 0.00112735857950216 0.00101757898970756 48475 46344 667 665 0 False 613 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 653 286 0.00104546033231953 0.0731552387491962 0.000671396963454643 0.0690928511482414 0.00103501749543529 0.0203633567041266 45699 3188162 667 665 0 True 658 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 256 331 0.00102910320989654 0.000945646331438576 0.000885023270008392 0.000732433051041428 0.000823672886046041 0.000789350585386413 44984 41212 667 665 0 False 256 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 301 330 0.000952396312715695 0.000896656840086024 0.000839246204318303 0.000778210116731518 0.000688725268796935 0.000665074401159493 41631 39077 667 665 0 False 301 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 344 332 0.000865646371138075 0.000908588706832313 0.000762951094834821 0.000747692072938125 0.000624633850086339 0.000710933899219038 37839 39597 667 665 0 True 345 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 388 332 0.000899390085227471 0.000997091033833153 0.000717174029144732 0.000854505226215 0.000711381156874192 0.000689740416135212 39314 43454 667 665 0 True 390 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 433 332 0.00101375267962265 0.000998398949995726 0.000778210116731518 0.000732433051041428 0.000873967299317499 0.000893795568747472 44313 43511 667 665 0 True 435 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 476 330 0.000956537066783614 0.000957325793311386 0.000671396963454643 0.000793469138628214 0.000918545392594927 0.000815098798628128 41812 41721 667 665 0 True 479 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 521 330 0.0009610438543603 0.000893513252116329 0.000793469138628214 0.000671396963454643 0.000823904944506898 0.000848437053959835 42009 38940 667 665 0 True 524 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 565 330 0.000974404077430271 0.000991354559435898 0.000732433051041428 0.000778210116731518 0.000946976113183037 0.00083914968766441 42593 43204 667 665 0 True 569 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 613 329 0.00102400161786811 0.00106191319452213 0.000579842832074464 0.000686655985351339 0.00112863795753756 0.00114744045138066 44761 46279 667 665 0 False 613 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 658 329 0.000963400195072983 0.000957991224341467 0.000534065766384375 0.000579842832074464 0.00102363027856738 0.00100892725787521 42112 41750 667 665 0 False 658 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 257 376 0.000985156311750282 0.000968638120822771 0.000793469138628214 0.000778210116731518 0.000832373060284367 0.000810308363148148 43063 42214 667 665 0 True 256 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 300 375 0.000925332710161285 0.000915151233542772 0.000823987182421607 0.000793469138628214 0.000704254855972422 0.00071377328475074 40448 39883 667 665 0 True 301 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 346 374 0.000907808855929097 0.000970427900834714 0.00080872816052491 0.000854505226215 0.000688139796874337 0.000761060303145704 39682 42292 667 665 0 False 346 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 388 376 0.00100796477476528 0.000938739616264282 0.000839246204318303 0.000823987182421607 0.00078242264223331 0.000703517887452914 44060 40911 667 665 0 True 390 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 432 375 0.000957772429875701 0.00094741316555293 0.000686655985351339 0.00064087891966125 0.000860504312047378 0.000912431407142802 41866 41289 667 665 0 True 435 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 477 375 0.00304057172603902 0.000989977805580557 0.000930800335698482 0.00064087891966125 0.00969545282212551 0.000946447717480521 132909 43144 667 665 0 True 480 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 520 374 0.00313768499133359 0.000926532398746924 0.000747692072938125 0.000595101853971161 0.00983151007457577 0.000949879534080217 137154 40379 667 665 0 True 524 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 565 373 0.000998836814140423 0.000961869081034011 0.000686655985351339 0.000610360875867857 0.0010206069076359 0.000967203676079352 43661 41919 667 665 0 True 569 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 609 373 0.000967266424009327 0.000961547838467765 0.000518806744487678 0.000488288700694286 0.00104275895231362 0.00107923955085267 42281 41905 667 665 0 True 614 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 654 374 0.00092864988883448 0.00102593402710255 0.000549324788281071 0.000717174029144732 0.000997748502411066 0.00100973552673919 40593 44711 667 665 0 True 658 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 255 419 0.000869123689471355 0.000891516959026084 0.000671396963454643 0.000671396963454643 0.000785500190354341 0.000829294930521904 37991 38853 667 665 0 True 256 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 300 419 0.000955072932748549 0.00084282576434219 0.000793469138628214 0.000686655985351339 0.000757162105808251 0.000708538417935359 41748 36731 667 665 0 True 301 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 345 420 0.000883055839898773 0.000961410163082231 0.000732433051041428 0.000854505226215 0.000700454055436606 0.000695374377381706 38600 41899 667 665 0 True 346 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 388 420 0.000899641733264748 0.000990964479176885 0.000701915007248035 0.000869764248111696 0.00077087185420464 0.000814867955228702 39325 43187 667 665 0 True 390 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 433 419 0.000960746452134427 0.00097543010650912 0.000717174029144732 0.000747692072938125 0.000861541614116708 0.000839924553129924 41996 42510 667 665 0 True 435 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 478 418 0.000981244328625342 0.000980294636797992 0.000762951094834821 0.000732433051041428 0.000913518957880784 0.000854368059245426 42892 42722 667 665 0 True 480 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 521 417 0.000972917066300908 0.000966251747473513 0.000717174029144732 0.000717174029144732 0.000888668921491452 0.000867131244293815 42528 42110 667 665 0 True 524 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 566 417 0.000969691396004905 0.000952897235076705 0.000717174029144732 0.000656137941557946 0.000944866259681881 0.000917695018130608 42387 41528 667 665 0 True 569 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 609 417 0.00108142312455583 0.000898171269326899 0.00080872816052491 0.000595101853971161 0.0010442847554449 0.000894815512838956 47271 39143 667 665 0 True 614 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 654 418 0.000888706482190354 0.00100094594462811 0.000488288700694286 0.000595101853971161 0.000940164928033745 0.00102615726869161 38847 43622 667 665 0 True 658 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 257 463 0.0008903765100741 0.000875546614304128 0.000701915007248035 0.000717174029144732 0.000796615957712494 0.000739424593374706 38920 38157 667 665 0 True 257 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 301 463 0.000912681677014548 0.000955971985353634 0.000762951094834821 0.000839246204318303 0.000804211039989335 0.00080002386661752 39895 41662 667 665 0 True 301 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 345 464 0.000958504496893233 0.000946655950932493 0.000793469138628214 0.000747692072938125 0.000816894052458576 0.000817925222715491 41898 41256 667 665 0 True 346 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 389 463 0.00100151343417328 0.000988233917363792 0.00080872816052491 0.000885023270008392 0.000842144457202788 0.000791096855090015 43778 43068 667 665 0 True 391 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 433 463 0.00101025248419507 0.000996310873315126 0.000717174029144732 0.000549324788281071 0.000970413203897361 0.00110669133574806 44160 43420 667 665 0 True 435 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 477 462 0.000991172987550629 0.000974007460858601 0.000595101853971161 0.000564583810177768 0.00103478629086425 0.00107542557232122 43326 42448 667 665 0 True 480 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 522 462 0.000933065168033973 0.000958083007931823 0.000579842832074464 0.00064087891966125 0.000945697000972546 0.000940770553115396 40786 41754 667 665 0 True 525 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 566 461 0.00087287553293621 0.000953287315335719 0.000473029678797589 0.000503547722590982 0.000958830138494992 0.00109244619818259 38155 41545 667 665 0 True 569 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 610 461 0.000874316789876977 0.000920314060500301 0.000488288700694286 0.000518806744487678 0.000919180998350538 0.000955041660387491 38218 40108 667 665 0 True 614 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 654 462 0.000912567291543059 0.000941080097818361 0.000442511635004196 0.000503547722590982 0.000985939066194082 0.00102534559099039 39890 41013 667 665 0 True 659 460 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 258 507 0.00080046952948337 0.000943099336806195 0.000625619897764553 0.000778210116731518 0.000758597427839989 0.000821036746575929 34990 41101 667 665 0 True 257 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 302 508 0.000857158969153555 0.000844041896914408 0.000701915007248035 0.000671396963454643 0.000753609424801986 0.000819573854604164 37468 36784 667 665 0 True 301 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 346 508 0.000879029471302344 0.000966641827732526 0.000732433051041428 0.000854505226215 0.000767825522147855 0.000826154644294722 38424 42127 667 665 0 True 346 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 390 507 0.00096006013930549 0.000915082395850005 0.000732433051041428 0.000717174029144732 0.000858814549202871 0.000789633063355297 41966 39880 667 665 0 True 391 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 435 507 0.000933110922222569 0.00100085416103775 0.000579842832074464 0.000534065766384375 0.000981356262767012 0.00107924358932265 40788 43618 667 665 0 True 435 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 479 506 0.000915884470216254 0.000993511473809266 0.000595101853971161 0.000701915007248035 0.000916062508248263 0.000884036241148726 40035 43298 667 665 0 True 480 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 524 505 0.000918149302551745 0.00087504180455717 0.000625619897764553 0.000625619897764553 0.000864617228156814 0.000821851391635806 40134 38135 667 665 0 True 525 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 566 505 0.00093462081044623 0.000864280178587921 0.000579842832074464 0.000549324788281071 0.00094352161233425 0.000860902668008771 40854 37666 667 665 0 True 569 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 611 505 0.00100224550119081 0.000941217773203895 0.000610360875867857 0.000549324788281071 0.00104095231395827 0.00102322621951239 43810 41019 667 665 0 True 614 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 655 506 0.000900328046093685 0.000879745713562919 0.000473029678797589 0.000411993591210803 0.000991931269647504 0.00101865235316867 39355 38340 667 665 0 True 659 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 258 551 0.000927185754799414 0.000924008350012133 0.00080872816052491 0.000762951094834821 0.000719357068745259 0.000751754925588213 40529 40269 667 665 0 True 257 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 302 550 0.00098996050155284 0.000909896622994887 0.000869764248111696 0.000762951094834821 0.00076129618265012 0.000773522684896546 43273 39654 667 665 0 True 301 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 347 551 0.000916547905950893 0.00100129013309194 0.000778210116731518 0.000900282291905089 0.000708449594175302 0.000729252619691566 40064 43637 667 665 0 True 346 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 391 551 0.00104745063952345 0.000916527987398113 0.000900282291905089 0.000778210116731518 0.000830901957368137 0.000744179472878557 45786 39943 667 665 0 True 391 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 435 550 0.000981221451531044 0.00091099802607916 0.000656137941557946 0.000457770656900893 0.00100536729944955 0.00101602475864614 42891 39702 667 665 0 True 435 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 479 548 0.000868872041434078 0.000909781893506942 0.000457770656900893 0.000442511635004196 0.000954471121811403 0.00105569427774028 37980 39649 667 665 0 True 480 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 523 548 0.000932767765808101 0.000900695318061691 0.000534065766384375 0.000442511635004196 0.00102378685215467 0.00105603206143149 40773 39253 667 665 0 True 525 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 568 547 0.000900099275150706 0.000954709960986238 0.000579842832074464 0.000625619897764553 0.000911453948297437 0.00090931620536398 39345 41607 667 665 0 True 569 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 611 546 0.000940134190172023 0.000883072868713326 0.000656137941557946 0.000595101853971161 0.000884068312324817 0.000846938118643698 41095 38485 667 665 0 True 614 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 656 547 0.000964063630807622 0.000935205948035573 0.000564583810177768 0.000549324788281071 0.000990112704499718 0.000976269835875084 42141 40757 667 665 0 True 659 547 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 259 592 0.000950634776454757 0.00103029374764446 0.000823987182421607 0.000930800335698482 0.000670468246800444 0.000698457116833537 41554 44901 667 665 0 True 257 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 303 592 0.00103010980204565 0.000948652244022737 0.000930800335698482 0.000823987182421607 0.000788325070376835 0.000762740376159021 45028 41343 667 665 0 True 302 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 347 591 0.000986300166465177 0.000983897142719467 0.000854505226215 0.000823987182421607 0.000754366947525552 0.000796533553467498 43113 42879 667 665 0 True 346 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 391 591 0.000997395557199656 0.000896633894188435 0.000869764248111696 0.000793469138628214 0.000731562362910281 0.000614511154361757 43598 39076 667 665 0 True 391 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 436 590 0.000983989579941089 0.000906775980922781 0.00064087891966125 0.000457770656900893 0.000958140038702879 0.00100756165447855 43012 39518 667 665 0 True 436 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 480 589 0.000923365280051666 0.000867377874762438 0.000534065766384375 0.0004272526131075 0.000986060143736299 0.000991954099695123 40362 37801 667 665 0 True 480 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 524 588 0.000870793717355101 0.000933278492638096 0.000350957503624018 0.000442511635004196 0.00103123099307479 0.00108959973838535 38064 40673 667 665 0 True 525 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 569 588 0.000869009303999865 0.000999339731796876 0.000549324788281071 0.000610360875867857 0.000885392257283102 0.00103375210266199 37986 43552 667 665 0 True 570 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 613 588 0.00093331681607125 0.000939221480113651 0.000717174029144732 0.000717174029144732 0.000780195840319304 0.000787458477536416 40797 40932 667 665 0 True 614 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 658 588 0.000950977932869226 0.000922746325644737 0.000701915007248035 0.000701915007248035 0.000828979115146992 0.00081822155669188 41569 40214 667 665 0 True 659 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 257 635 0.00096397212243043 0.000905697523736097 0.000869764248111696 0.000717174029144732 0.000697871477995173 0.000726870071695441 42137 39471 667 665 0 False 257 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 302 635 0.000885183409668478 0.000994429309712826 0.000747692072938125 0.000869764248111696 0.000680383395073402 0.000675639449508627 38693 43338 667 665 0 False 302 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 348 634 0.000824010059515905 0.00094952418813112 0.000747692072938125 0.000839246204318303 0.000645039124442923 0.000697704956400722 36019 41381 667 665 0 True 346 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 392 633 0.000888912376039035 0.000963245834889352 0.000732433051041428 0.00080872816052491 0.000709384095140919 0.000698482034064047 38856 41979 667 665 0 True 391 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 436 634 0.000910897263659313 0.000900580588573746 0.00064087891966125 0.000595101853971161 0.000874477846715051 0.000874411409487386 39817 39248 667 665 0 False 436 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 480 634 0.000912018241279909 0.000986994838893985 0.000595101853971161 0.00064087891966125 0.000928631130419586 0.000977274501920738 39866 43014 667 665 0 False 480 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 525 634 0.00090929586705846 0.00094647238375178 0.000549324788281071 0.000534065766384375 0.000954617503241492 0.000972662569708641 39747 41248 667 665 0 False 525 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 570 634 0.000948530083779351 0.00089489000597167 0.000671396963454643 0.000656137941557946 0.000919441655098124 0.000795400851688347 41462 39000 667 665 0 False 570 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 614 634 0.000929931006115162 0.0008425963053663 0.000747692072938125 0.000686655985351339 0.000742807694849379 0.000686039469952052 40649 36721 667 665 0 False 614 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 659 634 0.000953174133921824 0.000871186893762215 0.000778210116731518 0.000717174029144732 0.00076410596951726 0.000688430525670949 41665 37967 667 665 0 False 659 634 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 257 684 0.00105278100249486 0.0712092201205692 0.000885023270008392 0.0715342946517128 0.000786645737528338 0.0236776588129058 46019 3103353 667 665 0 True 257 679 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 302 678 0.000944869748691688 0.000973846839575478 0.000793469138628214 0.000839246204318303 0.000727316434004301 0.000711748700943612 41302 42441 667 665 0 False 302 678 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 347 678 0.000936931396970318 0.000961869081034011 0.000793469138628214 0.00080872816052491 0.000678466286048783 0.00073106197746202 40955 41919 667 665 0 False 347 678 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 391 678 0.000947523491630243 0.000969647740316688 0.000793469138628214 0.000839246204318303 0.00074289933497987 0.000687460622002347 41418 42258 667 665 0 False 391 678 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 436 678 0.000921191956093366 0.00092336586487964 0.000732433051041428 0.000762951094834821 0.000768541797918889 0.000783126859685959 40267 40241 667 665 0 False 436 678 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 481 678 0.000901609163374367 0.000926440615156569 0.000656137941557946 0.000671396963454643 0.000826138835476231 0.000812739096284419 39411 40375 667 665 0 False 481 678 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 525 678 0.000898360615984066 0.000882958139225381 0.000579842832074464 0.000549324788281071 0.000914056037848707 0.000882354717705769 39269 38480 667 665 0 False 525 678 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 570 678 0.000910210950830376 0.00089069090671288 0.000717174029144732 0.000671396963454643 0.000789627840790774 0.000777033645492211 39787 38817 667 665 0 False 570 678 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 615 677 0.000972276507660567 0.000966641827732526 0.000823987182421607 0.000762951094834821 0.000746212003177 0.000748078321598267 42500 42127 667 665 0 False 615 677 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 655 683 0.0011208174809368 0.0738878553674183 0.000946059357595178 0.0715800717174029 0.000849624854034832 0.0201944343390538 48993 3220090 667 665 0 True 659 677 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E2_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E2_1.csv new file mode 100755 index 0000000..4cbebbd --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E2_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 277 268 0.00950845245722298 0.0413385259899577 0.00961318379491875 0.0418554970626383 0.00139738408960988 0.00889462490210721 415632 1801565 667 665 0 True 277 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 322 268 0.00953627100388922 0.00948069418223976 0.00952162966353857 0.00944533455405508 0.00134263220562633 0.0013245807031658 416848 413176 667 665 0 False 322 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 365 268 0.00973063479704414 0.0627140751856753 0.00971999694819562 0.0630197604333562 0.00131478926819887 0.0101505151561433 425344 2733128 667 665 0 True 366 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 410 268 0.00976517920943397 0.0873979409498798 0.00968947890440223 0.0869764248111696 0.00147962032515465 0.0131422036667969 426854 3808870 667 665 0 True 411 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 454 268 0.00976838200263567 0.0725769791840554 0.0098115510795758 0.0719920653086137 0.00173159115172738 0.0122427539552261 426994 3162961 667 665 0 True 456 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 498 268 0.00971382013273519 0.062404787432073 0.0097962920576791 0.0662241550316625 0.00164469933710015 0.0170241152910218 424609 2719649 667 665 0 True 500 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 543 267 0.00942273198488876 0.0773324476216864 0.00943007553215839 0.0758373388265812 0.00165466615179025 0.0246265057464054 411885 3370208 667 665 0 True 545 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 587 267 0.00944586072722394 0.0666552625555649 0.00947585259784848 0.0657053482871748 0.00160870397252335 0.0180276581262062 412896 2904888 667 665 0 True 590 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 634 267 0.00939450165052516 0.00924533811066921 0.009399557488365 0.00920119020370794 0.00187793412329542 0.00165031164005577 410651 402919 667 665 0 False 634 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 674 267 0.00926064777178817 0.0416869823907445 0.00932326237888151 0.0417029068436713 0.00182348481044683 0.00769966562312342 404800 1816751 667 665 0 True 679 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 277 312 0.00935133257358503 0.00954186794521208 0.00935378042267491 0.00955214770733196 0.00142448966430441 0.00150756797482499 408764 415842 667 665 0 False 277 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 322 312 0.00960659519176095 0.00966944713580702 0.00965896086060884 0.00962844281681544 0.00135399463782467 0.00137138838722319 419922 421402 667 665 0 False 322 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 367 313 0.00992845303143805 0.120246920803955 0.00993362325474937 0.118532082093538 0.00127743377741015 0.0320854672026073 433991 5240454 667 665 0 True 367 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 411 313 0.00994439836616368 0.0556937089806228 0.0100099183642329 0.0557869840543221 0.00152004337421932 0.0085297559180197 434688 2427175 667 665 0 True 411 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 455 312 0.00988725138460754 0.0957887049966413 0.00987258716716258 0.0953383688105592 0.00181466688537475 0.026938238073565 432190 4174546 667 665 0 True 456 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 499 311 0.00994570236053866 0.0437531916309428 0.00999465934233616 0.0441596093690394 0.00163813538396042 0.010013709179756 434745 1906798 667 665 0 True 501 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 543 311 0.00990809241751292 0.0414346922467533 0.00967421988250553 0.044281681544213 0.00263211536377425 0.00792699743247151 433101 1805756 667 665 0 True 545 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 588 311 0.0119662073289288 0.0490196422619836 0.00970473792629892 0.050919356069276 0.0138509352934067 0.00940785908719444 523065 2136314 667 665 0 True 590 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 635 311 0.00915939375242569 0.00922537517976677 0.00921644922560464 0.00926222629129473 0.00201960968481732 0.00193059357943442 400374 402049 667 665 0 False 635 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 679 311 0.00904711297361161 0.00923246546212177 0.00907911802853437 0.00920119020370794 0.00194304885511652 0.00203048897141633 395466 402358 667 665 0 False 679 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 278 356 0.0097680846004098 0.051413518919753 0.00978103303578241 0.0523079270618753 0.00150501308050724 0.0123260767552223 426981 2240641 667 665 0 True 277 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 321 357 0.00978988647127569 0.0597571520928666 0.0098115510795758 0.064591439688716 0.00142414539313081 0.0174327599532129 427934 2604263 667 665 0 True 322 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 367 358 0.00984559219589107 0.0404676144469666 0.00985732814526589 0.0408331425955596 0.00148754669620893 0.00820103984262894 430369 1763610 667 665 0 True 367 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 410 357 0.009877917530134 0.0337852642592978 0.00991836423285267 0.0350194552529183 0.00153989957916861 0.00566845345762777 431782 1472388 667 665 0 True 411 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 456 357 0.00995144451120743 0.0881887713102853 0.00991836423285267 0.0854200045777066 0.00177367172584699 0.021323936894349 434996 3843335 667 665 0 True 456 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 500 356 0.00986801174830301 0.0330661168829604 0.00990310521095598 0.0340581368734264 0.00170574633110484 0.00518423757248342 431349 1441047 667 665 0 True 501 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 545 355 0.00973955686382032 0.0276954689309678 0.00975051499198901 0.0282902265964752 0.00168864296023804 0.00380113298375522 425734 1206990 667 665 0 False 545 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 587 355 0.00966392519007148 0.0487883705601839 0.00958266575112535 0.0498207064927138 0.0019248600350711 0.00994037046648821 422428 2126235 667 665 0 True 590 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 632 356 0.0094365039956561 0.0573150890501603 0.00943007553215839 0.0575265125505455 0.0020463986328308 0.012679273782514 412487 2497836 667 665 0 True 635 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 676 355 0.00924600643143752 0.0606682648484337 0.00926222629129473 0.0622415503166247 0.00191317699018383 0.0154357753168379 404160 2643970 667 665 0 True 679 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 278 401 0.00976950298025627 0.0434210038715466 0.0098268101014725 0.0473334859235523 0.00152367521427973 0.0110388054189368 427043 1892321 667 665 0 True 278 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 323 400 0.00975056074617761 0.0313727784785837 0.00971999694819562 0.0320897230487526 0.00139252824395779 0.00356714470134052 426215 1367250 667 665 0 True 322 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 367 401 0.0100519893406467 0.08485702698036 0.0100709544518196 0.081727321278706 0.00150239688268962 0.0218033351869753 439391 3698135 667 665 0 True 367 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 411 400 0.0100297070508005 0.0686253743766604 0.0100404364080262 0.0679942015716793 0.00163061809316528 0.0158913849244417 438417 2990747 667 665 0 True 412 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 455 400 0.00986407688808377 0.0447064330544833 0.00993362325474937 0.045990691996643 0.00168528817748942 0.00950621061077716 431177 1948341 667 665 0 True 456 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 499 399 0.00997935456625086 0.0553068411472719 0.0100251773861295 0.0564431219958801 0.00175199020432398 0.0131808200018753 436216 2410315 667 665 0 True 501 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 544 398 0.00982660420762381 0.0413931372262196 0.0097962920576791 0.0430914778362707 0.00173251384956784 0.00657383042207016 429539 1803945 667 665 0 True 546 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 588 398 0.00954169287523782 0.0496296589493877 0.00953688868543526 0.0511329823758297 0.00194443703656751 0.0092440658237391 417085 2162899 667 665 0 True 590 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 632 398 0.00941092740423105 0.0415997879799063 0.00956740672922866 0.0427100022888533 0.00196587972324491 0.0070469028421217 411369 1812951 667 665 0 True 635 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 677 398 0.00962816829168387 0.0811566797515648 0.00962844281681544 0.0768902113374533 0.00174671969440819 0.0170366546961206 420865 3536871 667 665 0 True 680 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 280 444 0.00963677007913988 0.0445939981562971 0.00962844281681544 0.0456855115587091 0.00156742906970594 0.00833901375875264 421241 1943441 667 665 0 True 278 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 323 443 0.00973360881930287 0.0501809111930662 0.0098268101014725 0.0508125429159991 0.0014224609058559 0.00783678171919035 425474 2186923 667 665 0 True 322 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 368 444 0.0100273735871821 0.0340789258566421 0.0100404364080262 0.0346684977492943 0.00154608067644097 0.00352373132335145 438315 1485186 667 665 0 True 367 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 411 444 0.0101294283048451 0.0557739507844916 0.0101777676050965 0.05468833447776 0.00170590607017365 0.0144001338823781 442776 2430672 667 665 0 True 412 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 457 444 0.010137183639812 0.0960771119834377 0.0100556954299229 0.0953688868543526 0.00196509089249542 0.0146468840314769 443115 4187115 667 665 0 True 456 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 501 442 0.0101747249515549 0.0594663357868234 0.0102082856488899 0.0605020218204013 0.00186338970808106 0.0141823189060523 444756 2591589 667 665 0 True 501 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 545 442 0.00992959688615294 0.052823773785574 0.00999465934233616 0.0518806744487678 0.00192621800641819 0.00961476321661665 434041 2302101 667 665 0 True 546 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 589 442 0.00964123111252796 0.0323360243134731 0.00965896086060884 0.0324559395742733 0.00202275855568105 0.00415508259576383 421436 1409229 667 665 0 True 590 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 633 443 0.00957980611433812 0.0380111872723695 0.00953688868543526 0.0385442893110552 0.00182524304791528 0.00452062402491021 418751 1656557 667 665 0 True 635 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 677 442 0.00959904575064265 0.0665280046075362 0.00959792477302205 0.0657358663309682 0.00192536766999768 0.00999646251600934 419592 2899342 667 665 0 True 680 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 281 488 0.00943856293414291 0.0548979223063381 0.00947585259784848 0.0560006103608759 0.00151417016939014 0.0135199769833437 412577 2392494 667 665 0 True 278 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 325 487 0.00963368167140966 0.0573312200161654 0.00959792477302205 0.0568703746089876 0.00162319760326384 0.00879363677695367 421106 2498539 667 665 0 True 323 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 369 488 0.00997317775079043 0.0701925562360926 0.00993362325474937 0.0669565880827039 0.00158288330971935 0.0167856544677874 435946 3059046 667 665 0 True 367 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 413 488 0.0102207994194709 0.0851450209409998 0.0102388036926833 0.0812237735561151 0.00177272058903543 0.0172218470590119 446770 3710686 667 665 0 True 412 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 458 488 0.0103154877127698 0.0945849173173263 0.0103303578240635 0.0906538490882734 0.00195310320054988 0.0297261288115237 450909 4122084 667 665 0 True 457 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 502 487 0.0103862694425275 0.0429993730033484 0.01025406271458 0.0440985732814527 0.00221196942752891 0.00621604613161616 454003 1873946 667 665 0 True 501 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 545 486 0.00975740099737268 0.0410073937418506 0.00978103303578241 0.0426642252231632 0.00177033082093808 0.00705243017051421 426514 1787134 667 665 0 True 546 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 590 486 0.00976350918155022 0.0986253915860836 0.00978103303578241 0.0935530632486458 0.00194945990153679 0.0196814579073675 426781 4298171 667 665 0 True 591 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 633 486 0.00962622373866855 0.065729120237077 0.00975051499198901 0.0658274204623484 0.00187965325970658 0.0208134591029101 420780 2864526 667 665 0 True 635 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 678 486 0.00968051108343745 0.0732419742420827 0.00964370183871214 0.0702220187685969 0.00184280769078011 0.0113788002524482 423153 3191942 667 665 0 True 680 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 281 532 0.00941861410791514 0.0547160760679451 0.009399557488365 0.0573434042877852 0.00156752319873809 0.012878418011637 411705 2384569 667 665 0 True 278 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 325 531 0.00977632035435704 0.100660738594025 0.00978103303578241 0.0950331883726253 0.00147489724623351 0.0260630218100296 427341 4386873 667 665 0 True 323 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 370 532 0.00989782060217316 0.0575942947320235 0.00994888227664607 0.0601510643167773 0.00151397584988644 0.0116664555525264 432652 2510004 667 665 0 True 367 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 414 531 0.0100245368274892 0.0584052027528193 0.010101472495613 0.0584267948424506 0.00174687687347463 0.0070903194486978 438191 2545344 667 665 0 True 412 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 459 531 0.010381007710839 0.0548641229991894 0.010452429999237 0.0553444724193179 0.00199984656662306 0.00779263592149761 453773 2391021 667 665 0 True 457 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 502 529 0.0100811118816879 0.061608404164451 0.0100862134737163 0.0608377203021286 0.00186001908392899 0.0122476016135001 440664 2684942 667 665 0 True 501 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 547 528 0.00972914778591478 0.0711887294340222 0.00973525597009232 0.0699626153963531 0.0018402816698347 0.0178010658850035 425279 3102460 667 665 0 True 546 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 591 528 0.00954372893663033 0.0577647368593147 0.00946059357595178 0.0577706569008927 0.00178365314583712 0.0133342293080174 417174 2517432 667 665 0 True 591 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 634 528 0.00937327170701671 0.0498061358477448 0.00933852140077821 0.0487983520256352 0.0019398907074195 0.00757031754006383 409723 2170590 667 665 0 True 635 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 679 528 0.00962089337569714 0.0648178239143292 0.00959792477302205 0.065445944914931 0.00187549026293647 0.0136493878985438 420547 2824811 667 665 0 True 680 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 282 573 0.00923497967198593 0.0468780328023079 0.00923170824750134 0.0473792629892424 0.00132846062360257 0.0105162468461227 403678 2042981 667 665 0 True 278 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 326 571 0.0096223117555436 0.0554618636313833 0.00964370183871214 0.0559090562294957 0.00148717773496356 0.0126143232742575 420609 2417071 667 665 0 True 323 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 370 573 0.00982006135865462 0.0451992650429002 0.00987258716716258 0.0457007705806058 0.00133624792934947 0.00851636556231225 429253 1969819 667 665 0 True 368 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 415 572 0.00989971940099989 0.0504262946218832 0.0100251773861295 0.0495002670328832 0.00174869623025223 0.00778837323916016 432735 2197617 667 665 0 True 412 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 459 571 0.00996201372877306 0.0881116960402838 0.0100709544518196 0.0821698329137102 0.00202916444736638 0.0237814383265701 435458 3839976 667 665 0 True 457 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 503 570 0.00984993884380767 0.0600278219008267 0.00973525597009232 0.0596932936598764 0.0020194433977477 0.011942143112473 430559 2616059 667 665 0 True 502 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 547 570 0.00950149782055642 0.0542189761425766 0.00950637064164187 0.054032196536202 0.00187372533026735 0.00830367739723112 415328 2362905 667 665 0 True 546 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 591 572 0.00937574243320089 0.0352082082064855 0.00941481651026169 0.0379034103913939 0.0017100337215041 0.00940976631448876 409831 1534401 667 665 0 False 591 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 635 570 0.00942378433122647 0.0480857901219058 0.00933852140077821 0.0480964370183871 0.00174090415189563 0.00833980779765823 411931 2095616 667 665 0 True 636 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 679 569 0.00953423494249671 0.0569808361599811 0.00955214770733196 0.0558022430762188 0.00176832299909505 0.00872197254628465 416759 2483269 667 665 0 True 680 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 278 617 0.00904537431444498 0.00912542284986901 0.00903334096284428 0.00912489509422446 0.00138996883283603 0.00141522061272595 395390 397693 667 665 0 False 278 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 323 616 0.00905898618555222 0.00915935983240316 0.00901808194094758 0.00910963607232776 0.00143696521722414 0.00143074560701597 395985 399172 667 665 0 False 323 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 369 616 0.00955974290263886 0.0711022463460092 0.00965896086060884 0.0693217364766918 0.00146902558490885 0.0142932501724046 417874 3098691 667 665 0 True 368 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 414 615 0.0097213466967592 0.0747060142918523 0.00968947890440223 0.0722362096589609 0.00158670330562519 0.0205949860859464 424938 3255746 667 665 0 True 412 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 457 616 0.00953350287547917 0.00952812335255626 0.00958266575112535 0.00946059357595178 0.00192321451493389 0.00229383008332343 416727 415243 667 665 0 False 457 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 502 616 0.00938589986306915 0.00947975340043861 0.00943007553215839 0.00947585259784848 0.00199340960814744 0.00204002144570715 410275 413135 667 665 0 False 502 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 546 616 0.00926188313488026 0.00919990523344296 0.00921644922560464 0.00923170824750134 0.00176282499756665 0.00196037115781174 404854 400939 667 665 0 False 546 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 591 615 0.00919679780160275 0.00922590293541131 0.00926222629129473 0.00927748531319142 0.00161920813890421 0.00160552185144893 402009 402072 667 665 0 False 591 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 636 615 0.00932420033974773 0.00933923272360347 0.00935378042267491 0.00933852140077821 0.00149906498488118 0.00148817857998614 407578 407011 667 665 0 False 636 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 681 615 0.00927247522954018 0.00936197210811419 0.00935378042267491 0.00929274433508812 0.00160092680015789 0.00176665058770564 405317 408002 667 665 0 False 681 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 279 665 0.00893046266978664 0.0400426105318228 0.00901808194094758 0.0408026245517662 0.00131794588456306 0.00892918494838107 390367 1745088 667 665 0 True 279 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 323 660 0.00892936456926035 0.00874991323582474 0.0089723048752575 0.00871290150301366 0.00128292280901616 0.00118890958611987 390319 381328 667 665 0 False 323 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 368 660 0.00903974654924769 0.00890892830611663 0.00910963607232776 0.00883497367818723 0.00128647144829626 0.00126594707716037 395144 388258 667 665 0 False 368 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 413 660 0.00904665543172566 0.00897728413503431 0.00904859998474098 0.00892652780956741 0.00142799388523058 0.00134211061580169 395446 391237 667 665 0 False 413 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 457 659 0.00929354503338855 0.00920047888088268 0.00926222629129473 0.00918593118181125 0.00162357227601959 0.00163885806554264 406238 400964 667 665 0 False 457 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 502 659 0.00925524877753387 0.0091022474933041 0.00930800335698482 0.00912489509422446 0.00174278738932696 0.00163391999608486 404564 396683 667 665 0 False 502 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 547 659 0.00915751783069326 0.00930419433798504 0.00918593118181125 0.00932326237888151 0.00169237147340906 0.0018464168917758 400292 405484 667 665 0 False 547 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 591 659 0.00896265074146378 0.00923854612498286 0.0089417868314641 0.00924696726939803 0.00140433011412419 0.00125729551497429 391774 402623 667 665 0 False 591 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 636 659 0.00917973148925652 0.00916929540605921 0.00915541313801785 0.00915541313801785 0.00135889013295912 0.00134647256329502 401263 399605 667 665 0 False 636 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 677 664 0.00943963815757491 0.0407694447838525 0.00941481651026169 0.0411688410772869 0.00151320981294312 0.00764633862090724 412624 1776764 667 665 0 True 681 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E2_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E2_2.csv new file mode 100755 index 0000000..aceaeb1 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E2_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 277 268 0.00788831951614031 0.737765264614959 0.00770580605783169 0.754741741054398 0.00194644825216034 0.202952066068588 344813 32152382 667 665 13 True 277 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 322 268 0.00663641628487656 0.00654274734673718 0.00663767452506294 0.00654612039368277 0.00139229163883983 0.00133373815736933 290090 285138 667 665 0 False 322 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 365 268 0.00619481973364428 0.00629844237510691 0.00621042191195544 0.00627145799954223 0.00133080252660545 0.00131578515989829 270787 274491 667 665 0 True 366 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 410 268 0.00635235140497959 0.00630888275850992 0.00630197604333562 0.00625619897764553 0.00139933198864665 0.00127093064636223 277673 274946 667 665 0 True 411 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 454 268 0.00646504397149102 0.00652069633915413 0.0063782711528191 0.00654612039368277 0.00173534614221061 0.00171474364997923 282599 284177 667 665 0 True 456 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 498 268 0.00658217469429625 0.00657656959978339 0.00663767452506294 0.00657663843747616 0.00168545508583398 0.00155596473421275 287719 286612 667 665 0 True 500 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 543 267 0.00681602435220934 0.00681704260651629 0.00686655985351339 0.0068207827878233 0.00153679957343866 0.00146899521061886 297941 297092 667 665 0 True 545 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 587 267 0.00688799569087052 0.00700249135083073 0.00689707789730678 0.00706492713817044 0.00171509419470341 0.00190658772102772 301087 305174 667 665 0 True 590 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 634 267 0.00867286658799234 0.00752712635330602 0.00784313725490196 0.00744640268558785 0.00493809350227016 0.00186111996673814 379107 328038 667 665 0 False 634 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 674 267 0.00899495319861241 0.743558576000542 0.0089570458533608 0.720408941786831 0.00197075968628661 0.167601917063912 393186 32404859 667 665 12 True 679 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 277 312 0.00644276168164487 0.00622212431972584 0.0063935301747158 0.00627145799954223 0.00140486442598634 0.00137672855534432 281625 271165 667 665 0 False 277 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 322 312 0.00618125361672563 0.00626163715537413 0.00616464484626535 0.00624093995574884 0.00128225828443039 0.00124935072459049 270194 272887 667 665 0 False 322 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 367 313 0.0062598364356389 0.00657819875851221 0.00633249408712902 0.00660715648126955 0.00127715442206425 0.00120075952810867 273629 286683 667 665 0 True 367 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 411 313 0.00647158682046022 0.0065602550665976 0.00648508430609598 0.00662241550316625 0.00148253034839794 0.00154130028804098 282885 285901 667 665 0 True 411 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 455 312 0.00667539885356017 0.00692823842623267 0.00666819256885634 0.00688181887541009 0.00172977197248231 0.00190442220201726 291794 301938 667 665 0 True 456 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 499 311 0.00655902307486678 0.00670559438192643 0.00656137941557946 0.00666819256885634 0.00161604262122049 0.00163961452207678 286707 292235 667 665 0 True 501 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 543 311 0.00680106273253852 0.00676578147130243 0.0068055237659266 0.00672922865644312 0.00157207444534943 0.0014262012182264 297287 294858 667 665 0 True 545 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 588 311 0.00786379527105296 0.00712577965857652 0.0072327763790341 0.00720225833524071 0.00522879415628039 0.00192062848164609 343741 310547 667 665 0 True 590 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 635 311 0.00733197145990978 0.00723390072801597 0.0072480354009308 0.00730907148851759 0.00190767600816385 0.00175485120574473 320494 315259 667 665 0 False 635 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 679 311 0.00726679461825507 0.00738371449337466 0.00721751735713741 0.00747692072938125 0.00201166085419915 0.00194993238733417 317645 321788 667 665 0 False 679 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 278 356 0.00609091197134324 0.00602809380971311 0.00599679560540169 0.00604257267109178 0.00129589757981251 0.00147201712065272 266245 262709 667 665 0 True 277 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 321 357 0.00631481009323674 0.00632092935474415 0.00628671702143893 0.00631723506523232 0.00139259206122971 0.00127723580632726 276032 275471 667 665 0 True 322 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 367 358 0.00662808902255213 0.0065472906344598 0.00665293354695964 0.00651560234988937 0.00131827853622498 0.0013625228900252 289726 285336 667 665 0 True 367 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 410 357 0.00680039929680388 0.0070480848493401 0.0068207827878233 0.00706492713817044 0.00153364028029726 0.00143970566421414 297258 307161 667 665 0 True 411 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 456 357 0.00707904230535225 0.00715980842470103 0.00706492713817044 0.00712596322575723 0.00169847311711565 0.00167812871675242 309438 312030 667 665 0 True 456 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 500 356 0.00696289529760183 0.00698424936224746 0.00694285496299687 0.00694285496299687 0.00162495380123131 0.00160731449146098 304361 304379 667 665 0 True 501 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 545 355 0.00689732954534406 0.00686077748732096 0.00685130083161669 0.0068207827878233 0.00162841625303724 0.00159819923353521 301495 298998 667 665 0 False 545 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 587 355 0.00691576848334816 0.00708121872545864 0.00692759594110018 0.00711070420386053 0.00190722392972415 0.00202850502477901 302301 308605 667 665 0 True 590 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 632 356 0.006920824321188 0.00695015175843018 0.00685130083161669 0.00697337300679027 0.0019948119848243 0.00196395094085434 302522 302893 667 665 0 True 635 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 676 355 0.00633100707599965 0.00643189571548464 0.00628671702143893 0.0063935301747158 0.00177062672101525 0.00192897904425109 276740 280307 667 665 0 True 679 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 278 401 0.00616713844954382 0.00607490344079471 0.00621042191195544 0.00608834973678187 0.00137209935444616 0.00133887274694864 269577 264749 667 665 0 True 278 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 323 400 0.0065261944445493 0.0696591100089432 0.00657663843747616 0.0729228656443122 0.00128886592556687 0.013687097550179 285272 3035798 667 665 0 True 322 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 367 401 0.00668196457962367 0.00679799751151741 0.00671396963454643 0.00688181887541009 0.00140074426608683 0.0014275980697569 292081 296262 667 665 0 True 367 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 411 400 0.00689829038330457 0.00699703022720454 0.00688181887541009 0.00706492713817044 0.00152596450429877 0.00143061749647308 301537 304936 667 665 0 True 412 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 455 400 0.00697259518558414 0.00726806716952601 0.00689707789730678 0.0072632944228275 0.00163764862252963 0.00159239717599065 304785 316748 667 665 0 True 456 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 499 399 0.00696504574446583 0.00722132637613718 0.00692759594110018 0.0072327763790341 0.00168709620287041 0.0016591336029042 304455 314711 667 665 0 True 501 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 544 398 0.00702159792157023 0.0067886126394035 0.00704966811627375 0.00685130083161669 0.00170029265782376 0.00146325113581709 306927 295853 667 665 0 True 546 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 588 398 0.00673881415895394 0.00677434029110313 0.00675974670023652 0.00674448767833982 0.00180127632694631 0.00201193290745774 294566 295231 667 665 0 True 590 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 632 398 0.00626768327898308 0.00640018448501662 0.00634775310902571 0.00643930724040589 0.00184940437359303 0.00191206364010086 273972 278925 667 665 0 True 635 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 677 398 0.00604721672123426 0.00601623078065959 0.00611886778057527 0.00604257267109178 0.00169556930943057 0.00189659935051134 264335 262192 667 665 0 True 680 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 280 444 0.0060869542340297 0.00619947671880548 0.00607309071488518 0.00625619897764553 0.00149015756637286 0.00155544437270297 266072 270178 667 665 0 True 278 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 323 443 0.00632144445058313 0.00639511344164944 0.00624093995574884 0.00643930724040589 0.00141441666081751 0.00145338470957925 276322 278704 667 665 0 True 322 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 368 444 0.00664412586565495 0.0065729900397595 0.00665293354695964 0.00662241550316625 0.00147899142147342 0.00133601599227973 290427 286456 667 665 0 True 367 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 411 444 0.00686855016071731 0.00695598001641779 0.0068207827878233 0.00700389105058366 0.00164195428216178 0.00163760226001793 300237 303147 667 665 0 True 412 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 457 444 0.00695525434810633 0.00707929127006117 0.00694285496299687 0.00706492713817044 0.00172587645623368 0.00184764376947932 304027 308521 667 665 0 True 456 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 501 442 0.00689373784153929 0.00701127962960732 0.00686655985351339 0.00698863202868696 0.00178079493787434 0.00188229941674805 301338 305557 667 665 0 True 501 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 545 442 0.00667979125566537 0.00691070776047466 0.00669871061264973 0.00691233691920348 0.00166218455255215 0.00172397952137849 291986 301174 667 665 0 True 546 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 589 442 0.00626285621208622 0.00611067609513599 0.00627145799954223 0.00613412680247196 0.001779602504625 0.00192821266220405 273761 266308 667 665 0 True 590 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 633 443 0.00593306002068776 0.00599165572434175 0.0059662775616083 0.00604257267109178 0.00178082170330226 0.00179620138004949 259345 261121 667 665 0 True 635 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 677 442 0.00603726518521467 0.00611216757847927 0.00608834973678187 0.00611886778057527 0.00179205487275982 0.0018304124640533 263900 266373 667 665 0 True 680 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 281 488 0.00616555993003727 0.00622418945050885 0.00621042191195544 0.00624093995574884 0.0015173330304548 0.00151263439912658 269508 271255 667 665 0 True 278 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 325 487 0.00610839007138683 0.0062355935616106 0.00616464484626535 0.00625619897764553 0.00155039948342072 0.00151937265854796 267009 271752 667 665 0 True 323 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 369 488 0.00642258408447413 0.00652875034920788 0.00646982528419928 0.00657663843747616 0.0014366290693831 0.00149714751367795 280743 284528 667 665 0 True 367 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 413 488 0.00658642983383566 0.0066833139153675 0.00656137941557946 0.00668345159075303 0.00172902260996187 0.00173145210891715 287905 291264 667 665 0 True 412 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 458 488 0.00681945591635402 0.00724454762449727 0.00683604180972 0.0072327763790341 0.00183487790833866 0.00208741722559471 298091 315723 667 665 0 True 457 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 502 487 0.0067120479586254 0.00666013855880259 0.00662241550316625 0.00666819256885634 0.0017568723147274 0.00183803729919564 293396 290254 667 665 0 True 501 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 545 486 0.0064272052575223 0.00643285944318338 0.00642404821850919 0.00645456626230259 0.00169024538546557 0.00164477458274428 280945 280349 667 665 0 True 546 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 590 486 0.00613655177446754 0.00610319573252197 0.00622568093385214 0.00601205462729839 0.00178046765343727 0.00188712300780126 268240 265982 667 665 0 True 591 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 633 486 0.0060728619439422 0.00617407561017444 0.00621042191195544 0.00619516289005875 0.00185251371208902 0.0017160172245538 265456 269071 667 665 0 True 635 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 678 486 0.00618740755509176 0.00610122238532931 0.00619516289005875 0.00616464484626535 0.00177125454174385 0.0017334791544042 270463 265896 667 665 0 True 680 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 281 532 0.00619294381191185 0.00626897984260262 0.00619516289005875 0.00625619897764553 0.00151044718542819 0.00147171194002131 270705 273207 667 665 0 True 278 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 325 531 0.0063272552325348 0.00631030540416044 0.00634775310902571 0.00624093995574884 0.00144007929151783 0.00151396572469482 276576 275008 667 665 0 True 323 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 370 532 0.00636360693537415 0.00671713616841371 0.00628671702143893 0.00671396963454643 0.00148941988708691 0.00145462816878595 278165 292738 667 665 0 True 367 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 414 531 0.00657318399623718 0.00656803372588028 0.00662241550316625 0.00656137941557946 0.00164241589898586 0.00176301642932528 287326 286240 667 665 0 True 412 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 459 531 0.00659345310178511 0.0065485526588272 0.00669871061264973 0.00660715648126955 0.00186680572195592 0.00195518527528023 288212 285391 667 665 0 True 457 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 502 529 0.00658007000162084 0.00667303415324762 0.00668345159075303 0.00665293354695964 0.00182732390146447 0.00189850061027739 287627 290816 667 665 0 True 501 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 547 528 0.00647325684834397 0.006480449234783 0.00656137941557946 0.00656137941557946 0.00167468219515754 0.00174254674949972 282958 282423 667 665 0 True 546 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 591 528 0.00629746925575894 0.00629160449762539 0.00633249408712902 0.00630197604333562 0.00157602808418839 0.00162570067930771 275274 274193 667 665 0 True 591 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 634 528 0.00619745059948854 0.00609817058094997 0.00622568093385214 0.00601205462729839 0.00176098065923535 0.00187732727760334 270902 265763 667 665 0 True 635 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 679 528 0.00636118196337858 0.00636269088835616 0.00636301213092241 0.00645456626230259 0.00171957118427283 0.00181570701224439 278059 277291 667 665 0 True 680 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 282 573 0.00627532422847857 0.0064463975227609 0.00627145799954223 0.00646982528419928 0.00135314287099903 0.0013776344751254 274306 280939 667 665 0 True 278 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 326 571 0.00632409819352169 0.00663063013450312 0.00628671702143893 0.00656137941557946 0.00136417459138549 0.00137011945221987 276438 288968 667 665 0 True 323 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 370 573 0.00633279148935489 0.00637313127175916 0.00633249408712902 0.00633249408712902 0.00135457757717444 0.00131387745626722 276818 277746 667 665 0 True 368 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 415 572 0.00642201215711668 0.00642235022208761 0.00654612039368277 0.00634775310902571 0.00162595904855203 0.00156274985253718 280718 279891 667 665 0 True 412 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 459 571 0.00662898122922974 0.00668308445639161 0.00674448767833982 0.00674448767833982 0.0019270212121826 0.00179199759672979 289765 291254 667 665 0 True 457 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 503 570 0.00664385134052338 0.00653799754593625 0.00663767452506294 0.00651560234988937 0.00202418821457193 0.00215249849493788 290415 284931 667 665 0 True 502 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 547 570 0.00658059617478969 0.0065905436514151 0.00659189745937285 0.00662241550316625 0.00182687967885926 0.00177110922586047 287650 287221 667 665 0 True 546 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 591 572 0.00635800204727117 0.00665231400772474 0.00631723506523232 0.00666819256885634 0.00164034659302691 0.00146910208874837 277920 289913 667 665 0 False 591 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 635 570 0.00629074339003536 0.00637595361716261 0.00628671702143893 0.00643930724040589 0.00154017452592524 0.00155848328384364 274980 277869 667 665 0 True 636 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 679 569 0.0063054304845746 0.00641643018050964 0.00624093995574884 0.0064087891966125 0.00156826884665288 0.00171888719039854 275622 279633 667 665 0 True 680 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 278 617 0.00661237245876947 0.00665378254517043 0.00663767452506294 0.00660715648126955 0.00141499613662411 0.00145685122826547 289039 289977 667 665 0 False 278 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 323 616 0.00662470321259604 0.00642689350981023 0.00663767452506294 0.0063782711528191 0.00136303871568063 0.00127819530159428 289578 280089 667 665 0 False 323 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 369 616 0.00613877085261443 0.00627363785981319 0.00611886778057527 0.00622568093385214 0.00131306001627398 0.00134181516606726 268337 273410 667 665 0 True 368 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 414 615 0.00615199381311862 0.0062504166114531 0.00616464484626535 0.00619516289005875 0.00151900017602388 0.00146093858297264 268915 272398 667 665 0 True 412 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 457 616 0.00638435645990234 0.00649850765618555 0.00634775310902571 0.00636301213092241 0.00182590966496639 0.00230361757741752 279072 283210 667 665 0 False 457 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 502 616 0.00639202028649214 0.00642104230592503 0.00630197604333562 0.00630197604333562 0.00194224174099397 0.00178439790860098 279407 279834 667 665 0 False 502 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 546 616 0.00630508732816014 0.00634665170594144 0.00628671702143893 0.00636301213092241 0.00176761084684894 0.00185377080127922 275607 276592 667 665 0 False 546 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 591 615 0.00637467944901433 0.00640729771326921 0.00636301213092241 0.0064087891966125 0.00160190652069194 0.00152496762070818 278649 279235 667 665 0 False 591 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 636 615 0.00626990235712997 0.00646181716594072 0.00625619897764553 0.00651560234988937 0.00143442655225475 0.00138542672436258 274069 281611 667 665 0 False 636 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 681 615 0.00657501416378101 0.00663354426349692 0.00651560234988937 0.00665293354695964 0.00154464099366032 0.00159178627676806 287406 289095 667 665 0 False 681 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 279 665 0.00847031279507877 0.739818302909941 0.00816357671473259 0.747493705653468 0.00224198470553042 0.205881951224496 370253 32241855 667 665 13 True 279 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 323 660 0.00674602044365778 0.00648923751355959 0.00659189745937285 0.00642404821850919 0.00166380115281891 0.00124286248597386 294881 282806 667 665 0 False 323 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 368 660 0.00612904808753783 0.00621459806531664 0.00610360875867857 0.00624093995574884 0.00123314430529846 0.00122182383180307 267912 270837 667 665 0 False 368 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 413 660 0.00622318733057367 0.00595441453255478 0.00622568093385214 0.00607309071488518 0.00137417838180428 0.00134964808621279 272027 259498 667 665 0 False 413 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 457 659 0.00623547233021164 0.00637030892635572 0.00621042191195544 0.0064087891966125 0.00154434196337575 0.00152750548746946 272564 277623 667 665 0 False 457 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 502 659 0.00630728352921273 0.00620264325267277 0.00631723506523232 0.00622568093385214 0.0016125565795833 0.00169255380868706 275703 270316 667 665 0 False 502 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 547 659 0.00623332188334764 0.00636810612018717 0.00624093995574884 0.0063935301747158 0.00156485436473935 0.00169659834876749 272470 277527 667 665 0 False 547 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 591 659 0.00637294078984769 0.00630046161409475 0.0063782711528191 0.00628671702143893 0.00128694583380105 0.00120245137851662 278573 274579 667 665 0 False 591 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 636 659 0.00717826026332222 0.00695526869359253 0.00698863202868696 0.00692759594110018 0.00192962727595039 0.00125429582593766 313775 303116 667 665 0 False 636 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 677 664 0.0082416791146656 0.754548605434392 0.00814831769283589 0.740077821011673 0.00187052960654895 0.174930137312134 360259 32883813 667 665 14 True 681 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E2_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E2_3.csv new file mode 100755 index 0000000..883c230 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E2_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 277 268 0.00103397603098199 0.0757240549301842 0.000900282291905089 0.0748760204470893 0.000778536181015502 0.0235796244522741 45197 3300113 667 665 0 True 277 269 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 322 268 0.00090700815762867 0.000912902535579048 0.000747692072938125 0.000823987182421607 0.000698016669942895 0.000665606606333885 39647 39785 667 665 0 False 322 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 365 268 0.000902158213637516 0.00100709544518196 0.000793469138628214 0.000869764248111696 0.000635680510170133 0.000686108379860002 39435 43890 667 665 0 True 366 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 410 268 0.00101983798670589 0.000981281310394319 0.000839246204318303 0.00080872816052491 0.000779669486508701 0.000775069370330703 44579 42765 667 665 0 True 411 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 454 268 0.000983623546432323 0.000957142226130673 0.000732433051041428 0.000686655985351339 0.000888870443130689 0.00090420472731773 42996 41713 667 665 0 True 456 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 498 268 0.00097028620045665 0.000957991224341467 0.00080872816052491 0.000762951094834821 0.000863580828394505 0.00083018842855417 42413 41750 667 665 0 True 500 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 543 267 0.000918675475720597 0.000897895918555831 0.000793469138628214 0.000686655985351339 0.000755438527754963 0.000801564312753067 40157 39131 667 665 0 True 545 268 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 587 267 0.00090787748721199 0.000934196328541656 0.000579842832074464 0.000549324788281071 0.000897846997557405 0.00102361914454595 39685 40713 667 665 0 True 590 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 634 267 0.00106158868379955 0.00100324053438701 0.000747692072938125 0.000671396963454643 0.00104096451213563 0.000989119182523082 46404 43722 667 665 0 False 634 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 674 267 0.0011458221450044 0.0760100755436313 0.000915541313801785 0.0717631799801633 0.000965496610458859 0.0207871760306056 50086 3312578 667 665 0 True 679 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 277 312 0.000866058158835437 0.000904114256802455 0.000701915007248035 0.000747692072938125 0.000728776134296101 0.000730809038172652 37857 39402 667 665 0 False 277 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 322 312 0.000997166786256677 0.000910447324537023 0.000885023270008392 0.000778210116731518 0.000693874808218797 0.00065807504801927 43588 39678 667 665 0 False 322 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 367 313 0.000913367989843485 0.000995209470230853 0.00080872816052491 0.000900282291905089 0.000691223955013333 0.000694080782475243 39925 43372 667 665 0 True 367 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 411 313 0.000965756535785666 0.000958335412805302 0.000778210116731518 0.000762951094834821 0.000745479191786013 0.000793492654838746 42215 41765 667 665 0 True 411 312 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 455 312 0.00094267354763909 0.000997962977941535 0.00064087891966125 0.000747692072938125 0.000931975356753273 0.000914283358298203 41206 43492 667 665 0 True 456 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 499 311 0.00089918419137879 0.0010080591728807 0.000686655985351339 0.000823987182421607 0.000848436884012229 0.000846412763228291 39305 43932 667 665 0 True 501 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 543 311 0.000996823629842209 0.000958771384859494 0.000793469138628214 0.000793469138628214 0.000823400377159494 0.000789845223333538 43573 41784 667 665 0 True 545 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 588 311 0.0010501730137449 0.000908152734778122 0.000671396963454643 0.000473029678797589 0.00106367839476578 0.001047432431037 45905 39578 667 665 0 True 590 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 635 311 0.000968730558044393 0.000943650038348331 0.000549324788281071 0.000579842832074464 0.00104078932119034 0.00098307464960348 42345 41125 667 665 0 False 635 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 679 311 0.000955530474634507 0.00104208793900521 0.000564583810177768 0.000686655985351339 0.00100168521765024 0.00105809998098226 41768 45415 667 665 0 False 679 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 278 356 0.00085972120371492 0.000865565148852906 0.000671396963454643 0.000717174029144732 0.000709533525536681 0.000749462813788255 37580 37722 667 665 0 True 277 356 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 321 357 0.000849289248715079 0.000953746233287499 0.000717174029144732 0.00080872816052491 0.000676433407439268 0.00076178460671431 37124 41565 667 665 0 True 322 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 367 358 0.000864182237103009 0.00102409835529543 0.000747692072938125 0.000869764248111696 0.00065788590797748 0.000738083508617942 37775 44631 667 665 0 True 367 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 410 357 0.000973443239469759 0.000895417761616217 0.000778210116731518 0.000701915007248035 0.00079030995931322 0.000749282408979406 42551 39023 667 665 0 True 411 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 456 357 0.00101906016549976 0.000946334708366246 0.000701915007248035 0.000610360875867857 0.000940580092015772 0.000919115766894243 44545 41242 667 665 0 True 456 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 500 356 0.00106385351613504 0.000995714279977811 0.000778210116731518 0.000717174029144732 0.000971244015704639 0.000901882619813911 46503 43394 667 665 0 True 501 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 545 355 0.000970080306607969 0.000995232416128442 0.000686655985351339 0.000747692072938125 0.000906209290094569 0.000877439013518951 42404 43373 667 665 0 False 545 355 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 587 355 0.000953471536147696 0.000974305757527258 0.000534065766384375 0.000534065766384375 0.00104308462446856 0.00114110648989328 41678 42461 667 665 0 True 590 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 632 356 0.000897925951192406 0.00092242508307849 0.000457770656900893 0.000488288700694286 0.000999815900268518 0.00100314947930423 39250 40200 667 665 0 True 635 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 676 355 0.000966122569294433 0.000907143115284205 0.000579842832074464 0.000457770656900893 0.00099023952783564 0.000977297881033847 42231 39534 667 665 0 True 679 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 278 401 0.00093157815690461 0.000922769271542326 0.000762951094834821 0.000778210116731518 0.00078968147698612 0.000780781834492635 40721 40215 667 665 0 True 278 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 323 400 0.000918766984097789 0.00666640278884439 0.00080872816052491 0.00677500572213321 0.00071164130202348 0.00171963689637242 40161 290527 667 665 0 True 322 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 367 401 0.000938349776816787 0.000973181408545396 0.000793469138628214 0.000869764248111696 0.000741869293624529 0.000736829546272186 41017 42412 667 665 0 True 367 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 411 400 0.000961066731454598 0.000903081691410949 0.000778210116731518 0.000701915007248035 0.000812017890216915 0.000762967986969059 42010 39357 667 665 0 True 412 399 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 455 400 0.00101555997007219 0.000966871286708417 0.000823987182421607 0.000701915007248035 0.000856906551868522 0.000862888512149935 44392 42137 667 665 0 True 456 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 499 399 0.000995634020938718 0.000984814978623028 0.000656137941557946 0.000656137941557946 0.000980164071365349 0.000939100251218511 43521 42919 667 665 0 True 501 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 544 398 0.00100199385315353 0.000909254137862395 0.000747692072938125 0.000732433051041428 0.000922009922459111 0.000784875944842534 43799 39626 667 665 0 True 546 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 588 398 0.000968524664195712 0.000910562054024969 0.000564583810177768 0.000457770656900893 0.00103053889241271 0.00104841008514676 42336 39683 667 665 0 True 590 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 632 398 0.00100746147869073 0.000960194030510013 0.00064087891966125 0.000549324788281071 0.00100996271895252 0.00100153402942139 44038 41846 667 665 0 True 635 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 677 398 0.000932333101016441 0.000931029794674372 0.000564583810177768 0.000595101853971161 0.000926204055883112 0.000954908003298771 40754 40575 667 665 0 True 680 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 280 444 0.000895523856291127 0.000904802633730125 0.000701915007248035 0.000717174029144732 0.000780054278313364 0.000820710588489043 39145 39432 667 665 0 True 278 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 323 443 0.000939813910851853 0.000918363659205234 0.000854505226215 0.000778210116731518 0.000750421664826494 0.000759031562112549 41081 40023 667 665 0 True 322 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 368 444 0.000960586312474342 0.000961180704106341 0.000823987182421607 0.00080872816052491 0.000759951608469816 0.000764935616162966 41989 41889 667 665 0 True 367 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 411 444 0.000924875168275327 0.000990735020200994 0.000671396963454643 0.000762951094834821 0.000874632960142545 0.000916590971702731 40428 43177 667 665 0 True 412 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 457 444 0.000982045026925768 0.00095232358763698 0.000686655985351339 0.000579842832074464 0.000991533759134283 0.00100559431247305 42927 41503 667 665 0 True 456 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 501 442 0.000987398266991476 0.000949593025823887 0.00064087891966125 0.000625619897764553 0.00100144063849278 0.000934929963429274 43161 41384 667 665 0 True 501 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 545 442 0.000947706508384627 0.000868020359894931 0.00064087891966125 0.000579842832074464 0.000942294159899855 0.000871775187268016 41426 37829 667 665 0 True 546 442 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 589 442 0.000969096591553159 0.000888212749773266 0.000534065766384375 0.000442511635004196 0.00102953412232548 0.00101528787090323 42361 38709 667 665 0 True 590 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 633 443 0.000918057794174554 0.000915862556368032 0.000488288700694286 0.000488288700694286 0.000974996862776 0.00100278031692643 40130 39914 667 665 0 True 635 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 677 442 0.000990372289250202 0.000937202241125817 0.000671396963454643 0.000534065766384375 0.000982610447243114 0.000972468242997303 43291 40844 667 665 0 True 680 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 281 488 0.000936588240555849 0.000867079578093781 0.000793469138628214 0.000701915007248035 0.000797711405351765 0.000778974922494884 40940 37788 667 665 0 True 278 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 325 487 0.000943771648165389 0.000931970576475522 0.000823987182421607 0.000854505226215 0.000811498452040279 0.000771695024800255 41254 40616 667 665 0 True 323 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 369 488 0.00100075849006145 0.000990184318658858 0.00080872816052491 0.000839246204318303 0.000858912401053641 0.000861294457973549 43745 43153 667 665 0 True 367 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 413 488 0.00106165731508244 0.000962649241552038 0.00080872816052491 0.000701915007248035 0.000966492819788622 0.000868884601305184 46407 41953 667 665 0 True 412 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 458 488 0.000930777458604184 0.000946633005034904 0.000564583810177768 0.000549324788281071 0.00100256999739623 0.00103899237373618 40686 41255 667 665 0 True 457 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 502 487 0.00101887714874538 0.000928436908246813 0.000732433051041428 0.000518806744487678 0.000959240921078906 0.00100246800321434 44537 40462 667 665 0 True 501 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 545 486 0.000985545222353346 0.000906225279380644 0.000686655985351339 0.000579842832074464 0.000945759992821251 0.000928773082306745 43080 39494 667 665 0 True 546 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 590 486 0.000934758073012018 0.000802991686127656 0.000595101853971161 0.000350957503624018 0.000948850328901916 0.000941775060843572 40860 34995 667 665 0 True 591 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 633 486 0.000908449414569438 0.00094812448837819 0.000503547722590982 0.000579842832074464 0.000973171339561749 0.000957089000983151 39710 41320 667 665 0 True 635 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 678 486 0.00105687600237418 0.000934655246493437 0.000747692072938125 0.000595101853971161 0.00103352879885273 0.000977036490707068 46198 40733 667 665 0 True 680 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 281 532 0.000944137681674155 0.000869970761189997 0.000762951094834821 0.000717174029144732 0.000803080333549936 0.000727774290478024 41270 37914 667 665 0 True 278 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 325 531 0.000904148520841433 0.0010118223000853 0.000793469138628214 0.000869764248111696 0.000754552020012498 0.000845260921311349 39522 44096 667 665 0 True 323 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 370 532 0.000964361033033495 0.000872403026334433 0.00080872816052491 0.000686655985351339 0.000794060308836611 0.000800535700970333 42154 38020 667 665 0 True 367 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 414 531 0.000912201258034292 0.000993603257399622 0.000579842832074464 0.000686655985351339 0.000911842631512902 0.000971384649993919 39874 43302 667 665 0 True 412 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 459 531 0.000971796088680311 0.000994039229453813 0.000625619897764553 0.000488288700694286 0.00102243923024062 0.00110695806052799 42479 43321 667 665 0 True 457 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 502 529 0.000944366452617134 0.000935389515216285 0.000534065766384375 0.000503547722590982 0.00101401621362502 0.00096482940087051 41280 40765 667 665 0 True 501 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 547 528 0.000946105111783774 0.000915633097392141 0.000656137941557946 0.000625619897764553 0.000950916388802939 0.000921813501734166 41356 39904 667 665 0 True 546 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 591 528 0.000875460644591872 0.00095326436943813 0.000595101853971161 0.00064087891966125 0.000850446349936126 0.000925984801477317 38268 41544 667 665 0 True 591 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 634 528 0.000894906174745083 0.000937202241125817 0.000488288700694286 0.000457770656900893 0.00100430476798211 0.00103987590841227 39118 40844 667 665 0 True 635 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 679 528 0.000914100056861018 0.000891952931080276 0.00064087891966125 0.000534065766384375 0.000939048681800194 0.000918777629477789 39957 38872 667 665 0 True 680 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 282 573 0.000966557234086093 0.000917354039711318 0.000839246204318303 0.000793469138628214 0.000721666110282495 0.000682145974813756 42250 39979 667 665 0 True 278 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 326 571 0.000890765420677164 0.000973066679057451 0.000793469138628214 0.000869764248111696 0.00069174117404085 0.000738221180788336 38937 42407 667 665 0 True 323 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 370 573 0.000964155139184814 0.00090562868604333 0.000854505226215 0.000778210116731518 0.000702617119038768 0.000665247819847428 42145 39468 667 665 0 True 368 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 415 572 0.00103681279067493 0.00102074825424743 0.000823987182421607 0.000701915007248035 0.000914076611217273 0.000930823212021907 45321 44485 667 665 0 True 412 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 459 571 0.000899962012584918 0.000962029702317134 0.0004272526131075 0.000564583810177768 0.00104511791253482 0.00097048554599716 39339 41926 667 665 0 True 457 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 503 570 0.000919636313681109 0.000970221387756413 0.000473029678797589 0.000503547722590982 0.00106191061367186 0.00111771341675598 40199 42283 667 665 0 True 502 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 547 570 0.000923822821937624 0.000856524465202833 0.000503547722590982 0.000518806744487678 0.000968835981163414 0.000876287689139877 40382 37328 667 665 0 True 546 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 591 572 0.000954889915994166 0.000932727791095959 0.000686655985351339 0.000671396963454643 0.000893259476271168 0.000837037234707632 41740 40649 667 665 0 False 591 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 635 570 0.00092897016815465 0.000957761765365577 0.000610360875867857 0.000747692072938125 0.000883088119718577 0.000809834407569705 40607 41740 667 665 0 True 636 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 679 569 0.000996571981804932 0.000897023974447448 0.000778210116731518 0.000625619897764553 0.000864258276250141 0.000883053998141798 43562 39093 667 665 0 True 680 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 278 617 0.000894471509953423 0.00105291840266723 0.000732433051041428 0.000915541313801785 0.000724241394284954 0.000789458472159204 39099 45887 667 665 0 False 278 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 323 616 0.000978338937649509 0.00083511594275228 0.000900282291905089 0.000701915007248035 0.000731548916083873 0.000704320523348795 42765 36395 667 665 0 False 323 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 369 616 0.000835105450250384 0.000918386605102823 0.000732433051041428 0.000823987182421607 0.000656349888359644 0.000662852844609052 36504 40024 667 665 0 True 368 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 414 615 0.00100279455145396 0.00090516976809155 0.000778210116731518 0.000671396963454643 0.000860970308515742 0.000775592531267483 43834 39448 667 665 0 True 412 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 457 616 0.000974152429392994 0.000960538218973848 0.000610360875867857 0.000549324788281071 0.00101611561931724 0.00103279145115936 42582 41861 667 665 0 False 457 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 502 616 0.00102075307047781 0.00103754465128259 0.000564583810177768 0.000625619897764553 0.00111650504547812 0.00110513638293254 44619 45217 667 665 0 False 502 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 546 616 0.000905612654876499 0.000940712963456937 0.000503547722590982 0.000473029678797589 0.000944462814135423 0.00104329952003565 39586 40997 667 665 0 False 546 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 591 615 0.000863450170085477 0.000889773070809319 0.000610360875867857 0.000610360875867857 0.000797348276972924 0.00081051803050675 37743 38777 667 665 0 False 591 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 636 615 0.000915404051235998 0.000984241331183303 0.000732433051041428 0.00080872816052491 0.000750619499789465 0.000791955526461384 40014 42894 667 665 0 False 636 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 681 615 0.000868620393396801 0.00102120717219921 0.000625619897764553 0.00080872816052491 0.000797480145429434 0.000817820607139936 37969 44505 667 665 0 False 681 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 279 665 0.00105898069504959 0.0761058976119631 0.000915541313801785 0.0741283283741512 0.000753229562028331 0.0246874887498993 46290 3316754 667 665 0 True 279 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 323 660 0.00099442153494093 0.000957004550745139 0.000854505226215 0.000823987182421607 0.00072889616180692 0.000686335649926478 43468 41707 667 665 0 False 323 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 368 660 0.000897903074098108 0.000944751441432604 0.000778210116731518 0.000854505226215 0.000668733722760615 0.000653533245322372 39249 41173 667 665 0 False 368 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 413 660 0.000959831368362511 0.000855859034172752 0.000793469138628214 0.000717174029144732 0.000753619809880574 0.00069728706779284 41956 37299 667 665 0 False 413 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 457 659 0.00094354287722241 0.000951038617371995 0.000717174029144732 0.000793469138628214 0.000822912499260525 0.000765739019243169 41244 41447 667 665 0 False 457 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 502 659 0.00097495312769342 0.0010350206025478 0.000671396963454643 0.000732433051041428 0.000919881381329949 0.000955564466439023 42617 45107 667 665 0 False 502 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 547 659 0.000926019022990222 0.000916872175861948 0.000656137941557946 0.000579842832074464 0.0008552013686351 0.000890712762593955 40478 39958 667 665 0 False 547 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 591 659 0.000984447121827047 0.000974168082141724 0.000793469138628214 0.000869764248111696 0.000753463210843718 0.000700256058969342 43032 42455 667 665 0 False 591 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 636 659 0.000899984889679216 0.000907189007079383 0.000717174029144732 0.000762951094834821 0.000737051754455632 0.000675029992884145 39340 39536 667 665 0 False 636 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 677 664 0.00101240293105908 0.0773839841076713 0.000823987182421607 0.0739147020675975 0.000807445228047328 0.0215935932263128 44254 3372454 667 665 0 True 681 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E3_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E3_1.csv new file mode 100755 index 0000000..8217046 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E3_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 274 282 0.00945665871573254 0.0411382541958008 0.00947585259784848 0.0419623102159152 0.00146690332604274 0.00937211352210726 413368 1792837 667 665 0 True 275 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 319 281 0.00938578547759766 0.00937413343383637 0.0093690394445716 0.0093842984664683 0.00131247812573999 0.00127963220021294 410270 408532 667 665 0 False 319 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 362 282 0.0096212594092059 0.0607173231774791 0.00964370183871214 0.0628671702143893 0.00130469793557195 0.0132527472617618 420563 2646108 667 665 0 True 364 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 407 282 0.00941440472256433 0.0858490010790308 0.00933852140077821 0.0844892042420081 0.00146247295640781 0.0150845735866683 411521 3741366 667 665 0 True 408 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 451 282 0.0094592895815768 0.0717675626466028 0.00941481651026169 0.0693369954985885 0.00194696246337786 0.0160898492262932 413483 3127686 667 665 0 True 453 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 497 281 0.00947004181589681 0.0624051545664344 0.00950637064164187 0.067154955367361 0.00181095543546283 0.0190281632859897 413953 2719665 667 665 0 False 497 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 539 280 0.00970357119448973 0.0787363694197728 0.00943007553215839 0.0789044022278172 0.00284153625770098 0.0279639800005818 424161 3431392 667 665 0 True 542 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 584 280 0.0092843255643865 0.0640527847428138 0.00933852140077821 0.0624093995574884 0.00177183862168654 0.0171092219605942 405835 2791470 667 665 0 True 586 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 631 281 0.00937592544995527 0.00903143645334439 0.00921644922560464 0.00904859998474098 0.00237527324268358 0.00193449188785749 409839 393597 667 665 0 False 631 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 676 281 0.0109780083636369 0.0325236070262633 0.00953688868543526 0.0377203021286336 0.00548076468625283 0.0166150750228977 479869 1417404 667 665 0 False 676 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 275 325 0.00948880103322109 0.0099302272619062 0.00949111161974517 0.00967421988250553 0.00145189355303034 0.00288474272242065 414773 432767 667 665 0 False 275 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 319 325 0.00949092860299079 0.00944278755942271 0.00949111161974517 0.00946059357595178 0.00130749943157599 0.00124575412058181 414866 411524 667 665 0 False 319 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 363 326 0.00978153633185696 0.106861385553607 0.0098268101014725 0.109529259174487 0.00130631152781987 0.0222124548964375 427569 4657102 667 665 0 True 364 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 407 326 0.00963384181106975 0.0502692528987839 0.00967421988250553 0.0505226214999619 0.00157013523678029 0.00818241466315652 421113 2190773 667 665 0 True 408 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 451 326 0.00970320516098097 0.0746200360135863 0.00968947890440223 0.0715190356298161 0.00182140868420384 0.0165017051894065 424145 3251999 667 665 0 True 453 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 496 325 0.00945034463770632 0.0408770380976474 0.0093842984664683 0.0427100022888533 0.00170915844187272 0.00717801671158084 413092 1781453 667 665 0 True 497 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 540 325 0.00949882120052357 0.0462330924587734 0.00949111161974517 0.0480201419089036 0.00150495915500273 0.0113335563106529 415211 2014874 667 665 0 True 542 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 584 324 0.00948584988805666 0.0485553549701675 0.00950637064164187 0.050919356069276 0.00181793242684888 0.0102828504485723 414644 2116080 667 665 0 True 587 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 631 324 0.0091537888643227 0.00916259520396322 0.00920119020370794 0.00918593118181125 0.00193428814946362 0.00194017120907165 400129 399313 667 665 0 False 631 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 676 324 0.00917913668480477 0.00919107106287119 0.00921644922560464 0.00917067215991455 0.00198133190868325 0.00196044092529615 401237 400554 667 665 0 False 676 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 275 371 0.00970659097093705 0.0512164595512586 0.00965896086060884 0.0508888380254826 0.00155370975956303 0.0117296490242553 424293 2232053 667 665 0 True 275 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 319 370 0.00976119859502613 0.0615418381155452 0.00976577401388571 0.0651102464332036 0.00152112048008464 0.0187966906397944 426680 2682041 667 665 0 True 319 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 363 371 0.00964377046999503 0.0396845397999462 0.00968947890440223 0.0410315098802167 0.00142497518184136 0.00915308758551052 421547 1729483 667 665 0 True 364 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 408 371 0.00968767161395269 0.0339346649984999 0.00967421988250553 0.034882124055848 0.00175132215976882 0.00469358155329205 423466 1478899 667 665 0 True 408 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 453 370 0.00992282526624076 0.072785029637495 0.00990310521095598 0.0717174029144732 0.00172868910980822 0.0126824020259393 433745 3172028 667 665 0 True 453 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 496 369 0.00951549860226673 0.0309549795752829 0.00946059357595178 0.0321355001144427 0.00179996408769818 0.00505172459952417 415940 1349042 667 665 0 True 497 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 540 368 0.00954606240024872 0.030858606805409 0.00956740672922866 0.0300297550926986 0.00171586533989464 0.00654957584563626 417276 1344842 667 665 0 True 542 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 584 368 0.00934545316035047 0.0503051861744083 0.00932326237888151 0.0506904707408255 0.00206543378302573 0.0121682816672749 408507 2192339 667 665 0 True 587 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 629 369 0.00933804098179795 0.0572264031559788 0.00944533455405508 0.0575265125505455 0.00211005132110078 0.0128961008892995 408183 2493971 667 665 0 True 631 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 672 367 0.00914518707686669 0.0608316625851651 0.00918593118181125 0.0616922255283436 0.00199366410701048 0.0187073686415323 399753 2651091 667 665 0 True 676 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 276 415 0.0095332054732533 0.0421842888291913 0.00952162966353857 0.0451056687266346 0.00163095897016453 0.00918702102362384 416714 1838424 667 665 0 True 275 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 321 415 0.00948491192719044 0.0352037337564557 0.00952162966353857 0.0332188906691081 0.00135582740656948 0.00804718841297787 414603 1534206 667 665 0 True 319 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 364 414 0.0097289418920661 0.0836241668487997 0.00973525597009232 0.0827954528114748 0.00145817090393419 0.0188630559117932 425270 3644406 667 665 0 True 364 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 408 414 0.00984250378816085 0.0685778534227535 0.00993362325474937 0.0664377813382162 0.00161124670063516 0.0204661211490786 430234 2988676 667 665 0 True 408 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 453 414 0.00968032806668307 0.0445521218931972 0.00984206912336919 0.0455176623178454 0.0016927240321987 0.00822088706209747 423145 1941616 667 665 0 True 453 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 496 413 0.00982960110697684 0.0534005877591667 0.00985732814526589 0.0554207675288014 0.0018611516716343 0.0114253405781945 429670 2327239 667 665 0 True 498 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 542 413 0.00970267898781211 0.0420044618297862 0.00965896086060884 0.0425879301136797 0.00167305589482627 0.00620938698998987 424122 1830587 667 665 0 True 542 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 585 412 0.0096647487654662 0.0502719146229043 0.00961318379491875 0.0508278019378958 0.00196032816836044 0.00921256300855599 422464 2190889 667 665 0 True 587 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 630 413 0.00954377469081893 0.0471659349793573 0.00959792477302205 0.0479743648432136 0.00187146374544757 0.0069782379926893 417176 2055528 667 665 0 True 631 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 673 412 0.00954764091975528 0.0823172603057197 0.00958266575112535 0.0810101472495613 0.00173923677030616 0.0141789629452158 417345 3587450 667 665 0 True 676 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 276 459 0.00945434812920846 0.0412197809699346 0.00946059357595178 0.0417639429312581 0.00155404360410299 0.007067183253523 413267 1796390 667 665 0 True 275 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 320 459 0.00964475418504984 0.0526063843518157 0.00962844281681544 0.0521553368429084 0.00154663359822269 0.00797628007545041 421590 2292627 667 665 0 True 319 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 365 459 0.00979011524221867 0.0353131397961601 0.00978103303578241 0.0361028458075837 0.00155455448673882 0.00420246302855277 427944 1538974 667 665 0 True 364 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 409 459 0.00994483303095534 0.0556055737879834 0.00984206912336919 0.0547341115434501 0.00197551252280488 0.0124216894637193 434707 2423334 667 665 0 True 409 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 453 459 0.0100235531124344 0.099715482342845 0.0100404364080262 0.097962920576791 0.00200699770970267 0.0189355921442069 438148 4345678 667 665 0 True 453 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 497 457 0.00978711834286565 0.0636593773286501 0.0098268101014725 0.061875333791104 0.00192438931874028 0.0200497636748766 427813 2774325 667 665 0 True 498 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 542 457 0.00992509009857626 0.0513864198147004 0.00976577401388571 0.0504615854123751 0.00204436783305276 0.0105969358780189 433844 2239460 667 665 0 True 542 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 586 457 0.00948488905009615 0.0328455150235396 0.00943007553215839 0.0332646677347982 0.00197144174248282 0.00443387047678458 414602 1431433 667 665 0 True 587 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 630 456 0.00949138614487675 0.0376188812612901 0.00950637064164187 0.0386053253986419 0.00187198451930032 0.00534078392886881 414886 1639460 667 665 0 True 631 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 674 457 0.0094646885758311 0.0671043367172796 0.00944533455405508 0.0666819256885634 0.00187138500957702 0.0104332127983425 413719 2924459 667 665 0 True 676 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 278 504 0.00938340625979068 0.055434971039409 0.00941481651026169 0.0565651941710536 0.00155902007582722 0.0130139674703742 410166 2415899 667 665 0 True 275 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 322 503 0.0096680888212337 0.0558571296632517 0.00967421988250553 0.0555275806820783 0.0015366068462536 0.00681567053296366 422610 2434297 667 665 0 True 320 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 366 503 0.00984707920702043 0.0705133169384895 0.00991836423285267 0.0671396963454643 0.00157530410365822 0.0172816901745881 430434 3073025 667 665 0 True 364 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 410 503 0.0100802883062932 0.0868092639472336 0.0100251773861295 0.0833600366216525 0.00175694612918552 0.0193748646292159 440628 3783215 667 665 0 True 409 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 455 503 0.0101876505098332 0.0966232014001587 0.0100404364080262 0.0919050888838026 0.00238648629589005 0.0311671886628299 445321 4210914 667 665 0 True 453 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 499 502 0.0100425868548902 0.0458883303474984 0.0100404364080262 0.0467536430914778 0.00200300087604046 0.00781851062127351 438980 1999849 667 665 0 True 498 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 542 500 0.00986316180431185 0.0400331338761185 0.0097962920576791 0.0417944609750515 0.00185439351587938 0.00765462192750061 431137 1744675 667 665 0 True 542 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 587 501 0.00972173560736226 0.0965224230179477 0.00968947890440223 0.0927443350881209 0.00188702977506652 0.0165677663129451 424955 4206522 667 665 0 True 587 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 631 501 0.0097310923389301 0.0669929343844849 0.00971999694819562 0.0654612039368277 0.00183542777452212 0.0207368866398858 425364 2919604 667 665 0 True 631 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 675 500 0.00945594952580931 0.0719043201962333 0.00941481651026169 0.0700236514839399 0.00183015827572536 0.0135588356686352 413337 3133646 667 665 0 True 676 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 278 547 0.00924936936429931 0.0536314693807074 0.00930800335698482 0.0566262302586404 0.00147654979403229 0.0113129843796978 404307 2337301 667 665 0 True 275 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 322 547 0.0096060461414978 0.102223629570608 0.00962844281681544 0.0950179293507286 0.00151952652780907 0.0249889880546469 419898 4454985 667 665 0 True 320 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 366 547 0.00969297909982981 0.0564379591689225 0.0097962920576791 0.0596475165941863 0.00153008113440481 0.0115615474051245 423698 2459610 667 665 0 True 364 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 411 547 0.00997441311388252 0.0584198422354811 0.00996414129854276 0.0581826504921035 0.00179769167694337 0.0073208564649855 436000 2545982 667 665 0 True 409 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 456 547 0.00986576979306181 0.0543664264804837 0.0098268101014725 0.0551308461127642 0.00202357022616858 0.00729542800149672 431251 2369331 667 665 0 True 453 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 499 545 0.00996103001371825 0.0620495160997022 0.0100862134737163 0.0614633401998932 0.00197776724449557 0.0122349524602063 435415 2704166 667 665 0 True 498 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 544 545 0.00966827183798808 0.0755369540812434 0.00965896086060884 0.0715953307392996 0.00182614888861486 0.0208078349345093 422618 3291959 667 665 0 True 542 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 588 545 0.00949220972027147 0.0572104328112568 0.00946059357595178 0.0573434042877852 0.00171404524428254 0.0125089208848592 414922 2493275 667 665 0 True 587 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 632 544 0.00964937535809802 0.0492741811039386 0.00958266575112535 0.0489204242008087 0.00177230931367541 0.00669622605248326 421792 2147407 667 665 0 True 632 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 676 543 0.0095146979039663 0.0673819132404139 0.00949111161974517 0.066849774929427 0.00184236662119923 0.0169841003790514 415905 2936556 667 665 0 True 676 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 279 590 0.00967094845802093 0.0468587582483331 0.00927748531319142 0.0475928892957961 0.00325125816272979 0.00914635929198135 422735 2042141 667 665 0 True 275 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 323 590 0.00956054360093929 0.0591564743857813 0.00956740672922866 0.057755397878996 0.0014247735637697 0.0153419764386093 417909 2578085 667 665 0 True 320 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 367 590 0.00984426532442179 0.0460044595351964 0.00988784618905928 0.0466315709163043 0.00139613767549618 0.0082480625543981 430311 2004910 667 665 0 True 364 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 412 590 0.00993952554507823 0.0496942057593056 0.00994888227664607 0.0491035324635691 0.00169575716220624 0.00737139737391961 434475 2165712 667 665 0 True 409 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 455 588 0.0098571680056058 0.0860551699688682 0.00994888227664607 0.0808117799649043 0.00208210720693107 0.0190550770425041 430875 3750351 667 665 0 True 453 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 500 586 0.00971226449032293 0.0607018117507089 0.00971999694819562 0.0610666056305791 0.00212872669837414 0.0112353948060577 424541 2645432 667 665 0 True 498 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 544 586 0.00955404650615869 0.0550556753522626 0.00958266575112535 0.0542305638208591 0.00190109904914123 0.00791933510655069 417625 2399369 667 665 0 True 543 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 587 584 0.00957033499729879 0.047437407893733 0.00964370183871214 0.0392614633401999 0.0018288692117026 0.0463817127539642 418337 2067359 667 665 0 False 587 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 632 586 0.00934252489228034 0.0497359672929176 0.00926222629129473 0.0488441290913252 0.00164931415163096 0.00879057119442807 408379 2167532 667 665 0 True 632 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 676 585 0.00940738145461488 0.0565375443644589 0.00935378042267491 0.0558480201419089 0.00161308960364005 0.0093236109641833 411214 2463950 667 665 0 True 676 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 275 629 0.00948843499971232 0.00918485272462456 0.00901808194094758 0.0089723048752575 0.00336570694586561 0.00209100453611979 414757 400283 667 665 0 False 275 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 320 628 0.00896695163519179 0.00904410258881353 0.00901808194094758 0.00910963607232776 0.00144999364034653 0.00133385388741816 391962 394149 667 665 0 False 320 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 367 632 0.00936313715424275 0.0707011979479484 0.00927748531319142 0.0679484245059892 0.00136877254178445 0.0125745553343059 409280 3081213 667 665 0 True 364 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 412 631 0.009484339999833 0.0747925891634557 0.00955214770733196 0.071122301060502 0.00156061573749549 0.019960037589529 414578 3259519 667 665 0 True 409 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 454 628 0.00951266184257379 0.00924074893115141 0.00955214770733196 0.00927748531319142 0.00197093388970476 0.00188148064041718 415816 402719 667 665 0 False 454 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 498 628 0.00934588782514213 0.00935059094291003 0.0093842984664683 0.00946059357595178 0.00190248358864887 0.00200445742846421 408526 407506 667 665 0 False 498 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 543 628 0.00934064897054791 0.00922126786409833 0.00932326237888151 0.00927748531319142 0.00181146201436315 0.00197040596878273 408297 401870 667 665 0 False 543 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 587 628 0.00930644771457256 0.0106213576972874 0.00935378042267491 0.00932326237888151 0.00164375311966999 0.00639866669669768 406802 462887 667 665 0 False 587 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 632 628 0.00928556092747858 0.00928127138629361 0.00933852140077821 0.00933852140077821 0.00150592324911673 0.00155399891437174 405889 404485 667 665 0 False 632 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 676 628 0.00944396192839721 0.009510271444232 0.00943007553215839 0.009399557488365 0.00160242884248595 0.00158095051682219 412813 414465 667 665 0 False 676 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 275 678 0.00900920562836 0.0401249174664746 0.00910963607232776 0.0405737392233158 0.00137093327246516 0.00808824586595569 393809 1748675 667 665 0 True 275 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 320 672 0.00889266971000652 0.00882171094938078 0.00888075074387732 0.00881971465629053 0.00136771193830552 0.00134812629383839 388715 384457 667 665 0 False 320 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 365 672 0.00874545560819956 0.00886572118095651 0.00878919661249714 0.00888075074387732 0.00132507690807847 0.00123765226472519 382280 386375 667 665 0 False 365 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 409 672 0.00938304022628191 0.0089443108801989 0.00921644922560464 0.00891126878767071 0.00205488105088324 0.00139575901417468 410150 389800 667 665 0 False 409 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 454 671 0.00921347520334591 0.00895525607334886 0.00920119020370794 0.00892652780956741 0.00158299132250773 0.00162417620900002 402738 390277 667 665 0 False 454 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 498 671 0.00914985400410346 0.0089275833208565 0.00909437705043107 0.00900282291905089 0.00172867502277137 0.00162722287334399 399957 389071 667 665 0 False 498 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 543 671 0.00892053401086136 0.00902230398610396 0.00889600976577401 0.00907911802853437 0.00184725802647763 0.00182490905637551 389933 393199 667 665 0 False 543 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 587 671 0.00908007886649488 0.00899102872769013 0.00901808194094758 0.00904859998474098 0.00142722965551321 0.0011655123744597 396907 391836 667 665 0 False 587 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 632 671 0.00923603201832364 0.00920297998371989 0.00924696726939803 0.00914015411612116 0.00135082207317157 0.00132606474264011 403724 401073 667 665 0 False 632 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 672 676 0.00922088738189843 0.0405919123742063 0.00929274433508812 0.0410467689021134 0.00153603803190531 0.00793385718725663 403062 1769027 667 665 0 True 676 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E3_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E3_2.csv new file mode 100755 index 0000000..3e039a4 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E3_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 274 282 0.00827885439289968 0.740903873324878 0.00787365529869535 0.762905317769131 0.00226337268872567 0.210424852750199 361884 32289165 667 665 12 True 275 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 319 281 0.00672453885211205 0.00649173861639679 0.00668345159075303 0.00648508430609598 0.00152949720730811 0.00125203642690813 293942 282915 667 665 0 False 319 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 362 282 0.00617590037665992 0.00625408795506734 0.00617990386816205 0.00631723506523232 0.00130405094158299 0.00120347907643848 269960 272558 667 665 0 True 364 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 407 282 0.0062054118283042 0.00628664818374616 0.00621042191195544 0.0063935301747158 0.00138195381313357 0.0013680415085315 271250 273977 667 665 0 True 408 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 451 282 0.0063272323554405 0.00641101494867863 0.00634775310902571 0.00636301213092241 0.00162145602078622 0.00162962585906932 276575 279397 667 665 0 True 453 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 497 281 0.00650173883074485 0.00676217896538095 0.00645456626230259 0.00674448767833982 0.00164036322689601 0.00204176418242504 284203 294701 667 665 0 False 497 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 539 280 0.00788099884596498 0.00689017118213249 0.00691233691920348 0.0068207827878233 0.00691870547122052 0.00165077422842119 344493 300279 667 665 0 True 542 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 584 280 0.00712651227602038 0.00705487683502645 0.00714122224765393 0.00700389105058366 0.00181084246053654 0.00189766898826863 311513 307457 667 665 0 True 586 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 631 281 0.01417908578327 0.00759438077913943 0.00782787823300526 0.00752269779507134 0.0297618413964727 0.00192325112342818 619794 330969 667 665 0 False 631 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 676 281 0.0510465069593837 0.542692574879634 0.00903334096284428 0.656427862973983 0.124334473959464 0.377577049852543 2231337 23650963 667 665 13 False 676 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 275 325 0.00680643884969852 0.00659003884166814 0.00675974670023652 0.00663767452506294 0.00150226152655632 0.0015845420564394 297522 287199 667 665 0 False 275 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 319 325 0.00642855500608588 0.00617662260480682 0.00648508430609598 0.00616464484626535 0.00129068001152681 0.00118893781113011 281004 269182 667 665 0 False 319 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 363 326 0.00643184930766478 0.00653159564050892 0.00645456626230259 0.00657663843747616 0.0012993653787138 0.0013110902265839 281148 284652 667 665 0 True 364 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 407 326 0.0064402909554607 0.00652177479634082 0.0063782711528191 0.00648508430609598 0.00143615837140429 0.00140903211088283 281517 284224 667 665 0 True 408 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 451 326 0.00661477455367075 0.00689632068268635 0.00665293354695964 0.00688181887541009 0.00159295068505414 0.00165162778104087 289144 300547 667 665 0 True 453 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 496 325 0.00668452681418503 0.0067127764478718 0.00668345159075303 0.00677500572213321 0.00155558675566442 0.00160977479317698 292193 292548 667 665 0 True 497 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 540 325 0.00701173789392784 0.00694955516509286 0.00709544518196384 0.00700389105058366 0.00158770278359635 0.00162575656843763 306496 302867 667 665 0 True 542 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 584 324 0.00706163283659155 0.00698197771838615 0.00697337300679027 0.00689707789730678 0.00188837746299448 0.00195988317069825 308677 304280 667 665 0 True 587 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 631 324 0.00707133272457385 0.00710246662662608 0.00694285496299687 0.00695811398489357 0.00194107897831449 0.00202245109380498 309101 309531 667 665 0 False 631 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 676 324 0.00719404545838777 0.00685439852779121 0.00715648126955062 0.00688181887541009 0.00203173949297409 0.00197059324275261 314465 298720 667 665 0 False 676 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 275 371 0.0060238820850504 0.00623745217931531 0.00605783169298848 0.00630197604333562 0.0014681144159752 0.00146515256999348 263315 271833 667 665 0 True 275 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 319 370 0.00647478961366193 0.00638891804930041 0.00653086137178607 0.00643930724040589 0.00131070152690407 0.00136649570693599 283025 278434 667 665 0 True 319 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 363 371 0.00670465865716718 0.00684228309386421 0.00675974670023652 0.00683604180972 0.0013466334338985 0.00136710007476958 293073 298192 667 665 0 True 364 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 408 371 0.00693633499112197 0.0068391624517921 0.00685130083161669 0.00679026474402991 0.00161588040316166 0.00150717890630801 303200 298056 667 665 0 True 408 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 453 370 0.0069686374482706 0.00704875028037019 0.00701915007248035 0.00704966811627375 0.00172521868925959 0.00169912141495305 304612 307190 667 665 0 True 453 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 496 369 0.00681222675455589 0.00692888091136516 0.00685130083161669 0.00701915007248035 0.00170053228106161 0.00184993991756103 297775 301966 667 665 0 True 497 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 540 368 0.0068045171737775 0.00691171737996858 0.00679026474402991 0.00694285496299687 0.00172078033510189 0.00162957655493954 297438 301218 667 665 0 True 542 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 584 368 0.00697712485025512 0.00697982080401278 0.00694285496299687 0.00706492713817044 0.00190242772728134 0.00207619893610004 304983 304186 667 665 0 True 587 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 629 369 0.00652633170711509 0.0065848989606082 0.00654612039368277 0.00654612039368277 0.00190201056051883 0.00186318957158106 285278 286975 667 665 0 True 631 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 672 367 0.00622222649261316 0.0061309143768095 0.00621042191195544 0.00614938582436866 0.00173126436378166 0.00197634703767868 271985 267190 667 665 0 True 676 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 276 415 0.00623332188334764 0.00623091259850244 0.00631723506523232 0.00627145799954223 0.00142388361988574 0.00147555856743396 272470 271548 667 665 0 True 275 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 321 415 0.00654289472338676 0.00643458038550255 0.00654612039368277 0.00642404821850919 0.00127767474572553 0.00128808623660849 286002 280424 667 665 0 True 319 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 364 414 0.00662351360369255 0.00675387255045373 0.00659189745937285 0.00674448767833982 0.00128857838386638 0.00141276909142648 289526 294339 667 665 0 True 364 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 408 414 0.00683563002202263 0.00682959401249748 0.00685130083161669 0.00685130083161669 0.00156650857951787 0.00154772127923909 298798 297639 667 665 0 True 408 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 453 414 0.00703523266977177 0.00696075276311631 0.00701915007248035 0.00695811398489357 0.00163108095681148 0.00156655844602219 307523 303355 667 665 0 True 453 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 496 413 0.00696630398465221 0.00706933275050753 0.00698863202868696 0.00704966811627375 0.00166731360662367 0.00181101900812925 304510 308087 667 665 0 True 498 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 542 413 0.00688307711559647 0.00743534276294995 0.00683604180972 0.00717174029144732 0.00165892896577444 0.00264666190149827 300872 324038 667 665 0 True 542 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 585 412 0.00656604634281623 0.00648646105995132 0.00648508430609598 0.00657663843747616 0.00198797238975499 0.00204436784974221 287014 282685 667 665 0 True 587 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 630 413 0.00592274245115941 0.00602490432994824 0.00593575951781491 0.0059662775616083 0.0019277024096258 0.00192845697425968 258894 262570 667 665 0 True 631 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 673 412 0.00566583268219404 0.00619456629672143 0.00566109712367437 0.00579842832074464 0.00173135448617394 0.00337100328572797 247664 269964 667 665 0 True 676 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 276 459 0.00632906252298433 0.00626413825821133 0.00636301213092241 0.00624093995574884 0.00138383077053325 0.00142729584821938 276655 272996 667 665 0 True 275 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 320 459 0.00640856042566952 0.00647629602731939 0.00645456626230259 0.0063935301747158 0.00139921665963058 0.00150711434943859 280130 282242 667 665 0 True 319 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 365 459 0.00648558760217053 0.00672415761307595 0.00645456626230259 0.0068207827878233 0.00145704020911269 0.0014508761037068 283497 293044 667 665 0 True 364 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 409 459 0.00670573388059918 0.00665355308619454 0.00660715648126955 0.00662241550316625 0.00186990899028975 0.00158257320465886 293120 289967 667 665 0 True 409 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 453 459 0.00656034994633606 0.00688248430644017 0.00656137941557946 0.00689707789730678 0.00193158628934948 0.00208519930782156 286765 299944 667 665 0 True 453 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 497 457 0.00672545393588397 0.00712050210213104 0.00674448767833982 0.00712596322575723 0.00186702478375254 0.00202191621514027 293982 310317 667 665 0 True 498 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 542 457 0.00646289352462702 0.00647381787037977 0.00648508430609598 0.00648508430609598 0.00188752807435637 0.00175211372782195 282505 282134 667 665 0 True 542 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 586 457 0.00604307596716634 0.00601389029910551 0.00610360875867857 0.0059662775616083 0.00189481143253626 0.00194266927710198 264154 262090 667 665 0 True 587 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 630 456 0.00591224186487667 0.00571313841940626 0.00585946440833143 0.00573739223315786 0.00173197828395332 0.00176453558678855 258435 248983 667 665 0 True 631 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 674 457 0.00581856016372679 0.00580680357336463 0.00587472343022812 0.00572213321126116 0.00174904951143991 0.00188812233991854 254340 253065 667 665 0 True 676 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 278 504 0.00635601174006725 0.00649940254619153 0.0064087891966125 0.00654612039368277 0.0014106910002822 0.00144617144653927 277833 283249 667 665 0 True 275 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 322 503 0.00649595092588748 0.00665045539002003 0.00653086137178607 0.00657663843747616 0.00155545760986879 0.00147607963423543 283950 289832 667 665 0 True 320 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 366 503 0.00651622003143541 0.00659628012581236 0.00653086137178607 0.00653086137178607 0.00153258572634493 0.0016993308219806 284836 287471 667 665 0 True 364 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 410 503 0.00648986561880424 0.00656599154099485 0.00656137941557946 0.00659189745937285 0.00177325505454883 0.0016690717381601 283684 286151 667 665 0 True 409 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 455 503 0.00664966212247504 0.00711272344284837 0.00656137941557946 0.00704966811627375 0.00202476996403377 0.00209914291045381 290669 309978 667 665 0 True 453 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 499 502 0.00648217891512015 0.00627701090675877 0.00648508430609598 0.00625619897764553 0.0018747506368833 0.00180301578646281 283348 273557 667 665 0 True 498 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 542 500 0.00627994540152675 0.00612774784294221 0.00636301213092241 0.00611886778057527 0.00163607072739901 0.00149382368773297 274508 267052 667 665 0 True 542 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 587 501 0.00593742954569865 0.00619582832108883 0.0059662775616083 0.00614938582436866 0.00177785947657281 0.00175195038217917 259536 270019 667 665 0 True 587 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 631 501 0.00593294563521627 0.00585675679241592 0.00593575951781491 0.0059662775616083 0.00173473660174442 0.00175762095060071 259340 255242 667 665 0 True 631 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 675 500 0.00595012633303399 0.00587451691714982 0.00604257267109178 0.00593575951781491 0.00177354118724235 0.00187343482007551 260091 256016 667 665 0 True 676 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 278 547 0.0062119318001791 0.00648747067944524 0.00614938582436866 0.00645456626230259 0.00137951436615949 0.00145154516405953 271535 282729 667 665 0 True 275 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 322 547 0.00645314788245612 0.00670800370117328 0.00645456626230259 0.00668345159075303 0.00140713661448646 0.00139447060216194 282079 292340 667 665 0 True 320 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 366 547 0.00648581637311351 0.00681988789781733 0.00654612039368277 0.00657663843747616 0.00142492759215544 0.00178009863557704 283507 297216 667 665 0 True 364 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 411 547 0.00684699993788869 0.00650415234699245 0.00654612039368277 0.00648508430609598 0.00323064448984813 0.0016041973223587 299295 283456 667 665 0 True 409 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 456 547 0.00627166389339091 0.00655130616653788 0.00622568093385214 0.00656137941557946 0.00189034868336898 0.00214792162955223 274146 285511 667 665 0 True 453 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 499 545 0.00650162444527336 0.00637423267484344 0.00648508430609598 0.0064087891966125 0.00191651003423454 0.00205438968486957 284198 277794 667 665 0 True 498 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 544 545 0.00635976358353211 0.00679267406327675 0.00648508430609598 0.00689707789730678 0.00182735250888606 0.00193545506072732 277997 296030 667 665 0 True 542 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 588 545 0.00653868533803595 0.00659942371378205 0.00656137941557946 0.00660715648126955 0.00167025940708261 0.00145721159905932 285818 287608 667 665 0 True 587 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 632 544 0.00600057032596085 0.0064275818867379 0.00604257267109178 0.00628671702143893 0.00170411019878786 0.00221454798223379 262296 280119 667 665 0 True 632 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 676 543 0.00593507320498597 0.00626227964050662 0.00599679560540169 0.00614938582436866 0.00165583810176339 0.00202015350851607 259433 272915 667 665 0 True 676 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 279 590 0.00956104689701384 0.00659543112760156 0.00663767452506294 0.00662241550316625 0.017584644928884 0.00132240242219324 417931 287434 667 665 0 True 275 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 323 590 0.00648311687598636 0.00659421499502934 0.00648508430609598 0.00656137941557946 0.00142710828083759 0.00141332167885295 283389 287381 667 665 0 True 320 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 367 590 0.00647497263041631 0.0064796002365722 0.00648508430609598 0.00650034332799268 0.00141442824311379 0.00133402645091693 283033 282386 667 665 0 True 364 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 412 590 0.00631384925527623 0.00632673466683417 0.0064087891966125 0.00631723506523232 0.00158274591901998 0.00155427063753192 275990 275724 667 665 0 True 409 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 455 588 0.00637145377871833 0.00630768957183529 0.0064087891966125 0.00633249408712902 0.00192333881784608 0.00185327146327585 278508 274894 667 665 0 True 453 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 500 586 0.00659775399551312 0.00645571355718204 0.00656137941557946 0.00646982528419928 0.0020780654756634 0.00217142850634239 288400 281345 667 665 0 True 498 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 544 586 0.0066392072903809 0.0069135530517757 0.00672922865644312 0.00686655985351339 0.00182323558174498 0.00189584290500862 290212 301298 667 665 0 True 543 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 587 584 0.00710708962296147 0.0768567103269733 0.00703440909437705 0.00784313725490196 0.00240135677368076 0.225841893210925 310664 3349475 667 665 3 False 587 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 632 586 0.0060586552683832 0.00623740628752013 0.00613412680247196 0.00619516289005875 0.0014896323407016 0.00145701625623887 264835 271831 667 665 0 True 632 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 676 585 0.0060304249340196 0.00611696327107538 0.00602731364919509 0.00611886778057527 0.00156607027446517 0.00175950082420588 263601 266582 667 665 0 True 676 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 275 629 0.00989486945700874 0.00683555994587063 0.00688181887541009 0.0068055237659266 0.0181349880023317 0.00157796914283596 432523 297899 667 665 0 False 275 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 320 628 0.00649295402653446 0.00646346927056712 0.00642404821850919 0.00646982528419928 0.00132708696229055 0.0013660066593747 283819 281683 667 665 0 False 320 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 367 632 0.00621225207949927 0.00637884480025883 0.00621042191195544 0.00636301213092241 0.00142793671026844 0.00121529100650041 271549 277995 667 665 0 True 364 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 412 631 0.00597000652797886 0.00617517701325871 0.00602731364919509 0.00616464484626535 0.00144771911252878 0.00153542897880232 260960 269119 667 665 0 True 409 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 454 628 0.00609528149635414 0.00607061255794556 0.00614938582436866 0.00613412680247196 0.0018422946193609 0.00183519931839114 266436 264562 667 665 0 False 454 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 498 628 0.00606684526814185 0.00618933463207114 0.00605783169298848 0.00624093995574884 0.00181866086540542 0.00190326212479293 265193 269736 667 665 0 False 498 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 543 628 0.00653660352245484 0.00637829409871669 0.00657663843747616 0.00646982528419928 0.00184676563492079 0.00187762645185553 285727 277971 667 665 0 False 543 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 587 628 0.00662390251429561 0.00764199351663664 0.00654612039368277 0.00675974670023652 0.00164353772080229 0.00415889002043414 289543 333044 667 665 0 False 587 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 632 628 0.00619324121413772 0.00628639577887268 0.00625619897764553 0.00627145799954223 0.00142052076725801 0.00137818591625768 270718 273966 667 665 0 False 632 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 676 628 0.00627667397704215 0.00647122498395221 0.00630197604333562 0.0064087891966125 0.00143359438407211 0.00150624580405849 274365 282021 667 665 0 False 676 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 275 678 0.00819459805460053 0.748766101566574 0.0080872816052491 0.758968490119783 0.00180521612641814 0.18727888745194 358201 32631807 667 665 12 True 275 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 320 672 0.00694301510265696 0.00664705939717685 0.00689707789730678 0.00663767452506294 0.00142958865362943 0.00121933179420225 303492 289684 667 665 0 False 320 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 365 672 0.00604623300617945 0.00609362729322735 0.00607309071488518 0.00611886778057527 0.00128820652330868 0.00127342439576116 264292 265565 667 665 0 False 365 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 409 672 0.00619589495707628 0.0057586171884277 0.00613412680247196 0.00573739223315786 0.00154905167011365 0.00134105286629125 270834 250965 667 665 0 False 409 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 454 671 0.00593788708758461 0.00580120477435291 0.0059510185397116 0.00585946440833143 0.0014720336464578 0.00149113956776717 259556 252821 667 665 0 False 454 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 498 671 0.00615274875723045 0.00590645760659373 0.00611886778057527 0.0059510185397116 0.00178558217761122 0.00158706014794017 268948 257408 667 665 0 False 498 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 543 671 0.00616880847742757 0.00590519558222634 0.00624093995574884 0.00592050049591821 0.00166098690664561 0.00169402603490285 269650 257353 667 665 0 False 543 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 587 671 0.0060706428657953 0.00618853152565552 0.00611886778057527 0.00614938582436866 0.00139809078274728 0.00135491248515555 265359 269701 667 665 0 False 587 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 632 671 0.00768867111420257 0.00664045097867122 0.00686655985351339 0.00669871061264973 0.00472638665423897 0.00134312777213724 336086 289396 667 665 0 False 632 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 672 676 0.0080504037292409 0.751583513602041 0.00790417334248875 0.74346532387274 0.00192349447067935 0.173596642250678 351898 32754592 667 665 12 True 676 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E3_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E3_3.csv new file mode 100755 index 0000000..1d3c8ec --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E3_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 274 282 0.00111736303969782 0.0774060810070496 0.000976577401388571 0.0777294575417716 0.00077018685281318 0.0253797622437047 48842 3373417 667 665 0 True 275 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 319 281 0.00101302061260512 0.000969991928780523 0.000930800335698482 0.000900282291905089 0.000681250823341805 0.000622980627662713 44281 42273 667 665 0 False 319 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 362 282 0.000927872067628351 0.000862146210112142 0.000823987182421607 0.000762951094834821 0.000673452090117787 0.00063233422886999 40559 37573 667 665 0 True 364 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 407 282 0.000915884470216254 0.000933691518794698 0.000762951094834821 0.000747692072938125 0.000755915210557259 0.000746091904066417 40035 40691 667 665 0 True 408 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 451 282 0.000936313715424275 0.00096749082594332 0.000671396963454643 0.000686655985351339 0.000895606892874831 0.000932202212219641 40928 42164 667 665 0 True 453 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 497 281 0.000952556452375781 0.000942938715523072 0.000778210116731518 0.000747692072938125 0.000864795776772741 0.000849253775364219 41638 41094 667 665 0 False 497 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 539 280 0.000990052009930032 0.000914554640205458 0.000762951094834821 0.000717174029144732 0.00095226945594206 0.000799263053443305 43277 39857 667 665 0 True 542 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 584 280 0.000933362570259846 0.000964140724895324 0.000610360875867857 0.000625619897764553 0.000886742744716179 0.00104809879388167 40799 42018 667 665 0 True 586 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 631 281 0.00168633925198078 0.00100202440181479 0.000869764248111696 0.000625619897764553 0.00297525172214895 0.00100211212272311 73713 43669 667 665 0 False 631 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 676 281 0.00529204383846072 0.0570963917002394 0.00106813153276875 0.066147859922179 0.0124449294290137 0.0414266745591039 231325 2488305 667 665 0 False 676 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 275 325 0.000966511479897497 0.000968752850310716 0.000823987182421607 0.000762951094834821 0.000780739698684205 0.000779937048318766 42248 42219 667 665 0 False 275 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 319 325 0.000915426928330296 0.000927519072343252 0.000778210116731518 0.000839246204318303 0.000666062819053426 0.000649580332849062 40015 40422 667 665 0 False 319 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 363 326 0.00084427916506384 0.000975384214713942 0.000747692072938125 0.000839246204318303 0.000601930043099148 0.000705977131050248 36905 42508 667 665 0 True 364 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 407 326 0.000916547905950893 0.000963131105401407 0.000732433051041428 0.000823987182421607 0.00078698317174623 0.000731946152945953 40064 41974 667 665 0 True 408 325 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 451 326 0.000880607990808899 0.00102093182142814 0.000595101853971161 0.000793469138628214 0.000870209666358288 0.000930031748262613 38493 44493 667 665 0 True 453 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 496 325 0.000975525055050868 0.00107290427946727 0.000747692072938125 0.000885023270008392 0.000850494123646701 0.000893917770851557 42642 46758 667 665 0 True 497 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 540 325 0.000914603352935572 0.00101992220193422 0.000717174029144732 0.000854505226215 0.000807336527875476 0.000827449646843403 39979 44449 667 665 0 True 542 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 584 324 0.000972642541169333 0.000992501854315349 0.000717174029144732 0.000534065766384375 0.000966212268789703 0.00113505490877581 42516 43254 667 665 0 True 587 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 631 324 0.000960700697945831 0.000981946741424401 0.000579842832074464 0.000610360875867857 0.00100211148812393 0.00105050686811799 41994 42794 667 665 0 False 631 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 676 324 0.000955118686937145 0.00100161137565819 0.000564583810177768 0.000671396963454643 0.000977498287405739 0.000998351097125736 41750 43651 667 665 0 False 676 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 275 371 0.00103402178517059 0.000987958566592724 0.000869764248111696 0.000854505226215 0.000801895965091467 0.000765239053303792 45199 43056 667 665 0 True 275 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 319 370 0.000908723939701012 0.000956407957407825 0.000778210116731518 0.000839246204318303 0.000705195392149284 0.000695539802381288 39722 41681 667 665 0 True 319 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 363 371 0.000986071395522198 0.000903127583206127 0.000869764248111696 0.000793469138628214 0.000716424483586033 0.000708666758093193 43103 39359 667 665 0 True 364 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 408 371 0.000989983378647138 0.000988922294291462 0.000823987182421607 0.000793469138628214 0.000826808766325455 0.000785439531129646 43274 43098 667 665 0 True 408 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 453 370 0.00102169103134402 0.000930433201337058 0.000732433051041428 0.00064087891966125 0.000922085886526019 0.00085948098348396 44660 40549 667 665 0 True 453 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 496 369 0.000991172987550629 0.00102072530834984 0.00064087891966125 0.000656137941557946 0.000975543763958972 0.000990089658916856 43326 44484 667 665 0 True 497 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 540 368 0.00101366117124546 0.000907303736567328 0.000762951094834821 0.00064087891966125 0.000909402158150716 0.000930294672759691 44309 39541 667 665 0 True 542 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 584 368 0.000951481228943779 0.000982635118352072 0.000595101853971161 0.000549324788281071 0.00100958368491814 0.00108902032625802 41591 42824 667 665 0 True 587 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 629 369 0.000987146618954199 0.00102104655091609 0.000595101853971161 0.000671396963454643 0.00104069798394114 0.00103539280352472 43150 44498 667 665 0 True 631 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 672 367 0.000895020560216573 0.000911778186597187 0.000534065766384375 0.0004272526131075 0.000957070137506885 0.00105159583767752 39123 39736 667 665 0 True 676 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 276 415 0.000866561454909991 0.00100649885184465 0.000671396963454643 0.000823987182421607 0.000765457650340474 0.000813579865873445 37879 43864 667 665 0 True 275 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 321 415 0.000950291620040289 0.00102152841476546 0.000854505226215 0.000946059357595178 0.000713737318570188 0.000703888088149744 41539 44519 667 665 0 True 319 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 364 414 0.000978956619195552 0.000951107455064762 0.000885023270008392 0.000869764248111696 0.000701011721781675 0.000700639657450862 42792 41450 667 665 0 True 364 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 408 414 0.000932699134525207 0.000978986720635418 0.000717174029144732 0.00080872816052491 0.000820876948302942 0.00078034731913635 40770 42665 667 665 0 True 408 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 453 414 0.000930617318944099 0.00105241359292027 0.000625619897764553 0.000823987182421607 0.000901482520699012 0.000880429168800076 40679 45865 667 665 0 True 453 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 496 413 0.000949490921739862 0.000997251655116275 0.000625619897764553 0.000732433051041428 0.000955727603827714 0.000907838140953325 41504 43461 667 665 0 True 498 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 542 413 0.000983051619074876 0.000897437000604051 0.000778210116731518 0.00064087891966125 0.000857872335925368 0.000856081482778904 42971 39111 667 665 0 True 542 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 585 412 0.000894700280896402 0.000870475570936955 0.000549324788281071 0.0004272526131075 0.000955488785248757 0.00103621547183892 39109 37936 667 665 0 True 587 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 630 413 0.000962393602923876 0.000835941995065485 0.00064087891966125 0.0004272526131075 0.000941189813120492 0.000916593699650495 42068 36431 667 665 0 True 631 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 673 412 0.00087504885689451 0.000988807564803517 0.000579842832074464 0.000610360875867857 0.000864608039502379 0.00100499610609361 38250 43093 667 665 0 True 676 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 276 459 0.000950863547397736 0.000939818073450965 0.000747692072938125 0.000747692072938125 0.000867963297379901 0.000845251509841613 41564 40958 667 665 0 True 275 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 320 459 0.00103907762301042 0.00092267748795197 0.000900282291905089 0.000747692072938125 0.000855476513402238 0.000768800425310698 45420 40211 667 665 0 True 319 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 365 459 0.000900007766773514 0.000885298620779461 0.000747692072938125 0.000778210116731518 0.000799497184814109 0.00072553925502033 39341 38582 667 665 0 True 364 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 409 459 0.000968341647441329 0.00101673272216935 0.000732433051041428 0.000762951094834821 0.000897125670297492 0.000926565220760777 42328 44310 667 665 0 True 409 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 453 459 0.000959167932627872 0.000987522594538532 0.000518806744487678 0.000518806744487678 0.00104278039429469 0.00111179145425842 41927 43037 667 665 0 True 453 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 497 457 0.00102816524903033 0.000996976304345207 0.000671396963454643 0.000625619897764553 0.00104135208304053 0.00101599400189738 44943 43449 667 665 0 True 498 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 542 457 0.00093734318466768 0.000961914972829189 0.000579842832074464 0.000625619897764553 0.000952365584398878 0.000939480056759281 40973 41921 667 665 0 True 542 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 586 457 0.000893053130106954 0.000898538403688324 0.000473029678797589 0.000473029678797589 0.000958327228612767 0.000993585884349201 39037 39159 667 665 0 True 587 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 630 456 0.000903599470578284 0.000882820463839847 0.000549324788281071 0.000488288700694286 0.000955859672158058 0.00095575541173563 39498 38474 667 665 0 True 631 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 674 457 0.000876078326137915 0.000881994411526642 0.000473029678797589 0.000473029678797589 0.000963403524610138 0.000978432786342935 38295 38438 667 665 0 True 676 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 278 504 0.000978453323120998 0.000932406548529713 0.000854505226215 0.000778210116731518 0.000797940870637881 0.000769725540177881 42770 40635 667 665 0 True 275 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 322 503 0.000973008574678099 0.000870292003756243 0.000915541313801785 0.000686655985351339 0.000777788012774935 0.000770124723264276 42532 37928 667 665 0 True 320 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 366 503 0.00101764178565329 0.000917491715096852 0.000854505226215 0.000793469138628214 0.000826695864268714 0.000748890652445236 44483 39985 667 665 0 True 364 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 410 503 0.00100627186978724 0.000960859461540094 0.000732433051041428 0.000701915007248035 0.000979492749179701 0.000882777141466143 43986 41875 667 665 0 True 409 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 455 503 0.00103477672928242 0.00101381859317555 0.000656137941557946 0.000701915007248035 0.00107887046278306 0.000991293145763004 45232 44183 667 665 0 True 453 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 499 502 0.000998470780631657 0.000897184595730572 0.000671396963454643 0.000595101853971161 0.000959180245758667 0.000893262373569009 43645 39100 667 665 0 True 498 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 542 500 0.000890285001696908 0.00100714133697714 0.000595101853971161 0.000732433051041428 0.000893773239109015 0.000893143677200342 38916 43892 667 665 0 True 542 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 587 501 0.000913825531729443 0.000837410532511182 0.000534065766384375 0.000396734569314107 0.000995500472903741 0.000939080338111623 39945 36495 667 665 0 True 587 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 631 501 0.000918217933834639 0.00081760822289186 0.000579842832074464 0.000411993591210803 0.00095796293134536 0.000923597696769893 40137 35632 667 665 0 True 631 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 675 500 0.000967174915632136 0.000873894509677719 0.000671396963454643 0.000503547722590982 0.000972906547019553 0.000942167812114793 42277 38085 667 665 0 True 676 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 278 547 0.000933110922222569 0.00098499854580374 0.000793469138628214 0.000885023270008392 0.000754745267056354 0.000750976765409978 40788 42927 667 665 0 True 275 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 322 547 0.00098071815545649 0.000917376985608907 0.000854505226215 0.000762951094834821 0.000793879474668389 0.000750818209004209 42869 39980 667 665 0 True 320 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 366 547 0.00090396550408705 0.000942823986035127 0.000747692072938125 0.000823987182421607 0.00073692135341285 0.00071684150597476 39514 41089 667 665 0 True 364 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 411 547 0.000856266762475938 0.00093224592724659 0.000610360875867857 0.000701915007248035 0.000869450958301135 0.000858106909024023 37429 40628 667 665 0 True 409 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 456 547 0.000919521928209619 0.000983988926309823 0.000534065766384375 0.000518806744487678 0.00101158022070767 0.00108001209688542 40194 42883 667 665 0 True 453 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 499 545 0.000977012066180231 0.000972515977515315 0.000564583810177768 0.000534065766384375 0.00104001523639998 0.00110119011045499 42707 42383 667 665 0 True 498 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 544 545 0.000978636339875382 0.000931924684680344 0.00064087891966125 0.000473029678797589 0.000963412956878162 0.00102949692363748 42778 40614 667 665 0 True 542 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 588 545 0.000881706091335198 0.000929262960560018 0.000564583810177768 0.000732433051041428 0.000865168757800405 0.000802497783038305 38541 40498 667 665 0 True 587 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 632 544 0.000862077544427603 0.000887868561309431 0.000534065766384375 0.000457770656900893 0.000906435316272471 0.000967456999690037 37683 38694 667 665 0 True 632 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 676 543 0.00088852346543597 0.00091379742558502 0.000564583810177768 0.000503547722590982 0.000927431852274953 0.0009769454190718 38839 39824 667 665 0 True 676 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 279 590 0.00120713275772276 0.000941676691155676 0.000869764248111696 0.000839246204318303 0.00184882564203028 0.000736431963867881 52766 41039 667 665 0 True 275 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 323 590 0.00092897016815465 0.000918845523054604 0.000793469138628214 0.000839246204318303 0.00075036564152308 0.00070080245117574 40607 40044 667 665 0 True 320 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 367 590 0.000954706899239783 0.000898400728302789 0.000823987182421607 0.000762951094834821 0.000727116223960034 0.000683716414260233 41732 39153 667 665 0 True 364 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 412 590 0.00102960650597109 0.000925132698993994 0.000762951094834821 0.000701915007248035 0.000943503696805698 0.000796809397446889 45006 40318 667 665 0 True 409 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 455 588 0.00102933198083952 0.000914462856615101 0.000717174029144732 0.000534065766384375 0.0010443273117061 0.000974342580995368 44994 39853 667 665 0 True 453 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 500 586 0.000976851926520146 0.000956362065612647 0.000534065766384375 0.000488288700694286 0.00107989418791181 0.00109644357417484 42700 41679 667 665 0 True 498 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 544 586 0.000949262150796884 0.000894201629043999 0.000595101853971161 0.000488288700694286 0.000996990722371899 0.000947588723555286 41494 38970 667 665 0 True 543 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 587 584 0.000917623129382894 0.0112450730855521 0.000625619897764553 0.000900282291905089 0.000832214606292769 0.0392272583441683 40111 490069 667 665 0 False 587 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 632 586 0.000920139609755662 0.000906110549892699 0.000717174029144732 0.000701915007248035 0.000787546599159117 0.000759710443322846 40221 39489 667 665 0 True 632 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 676 585 0.000925858883330136 0.000893880386477753 0.00064087891966125 0.000579842832074464 0.000891525675757833 0.00088775593223246 40471 38956 667 665 0 True 676 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 275 629 0.0012796073924585 0.000961639622058121 0.000900282291905089 0.000839246204318303 0.00193007745708936 0.000723309176996608 55934 41909 667 665 0 False 275 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 320 628 0.000979254021421425 0.00083325732504757 0.000900282291905089 0.000701915007248035 0.000708844509378723 0.000633954067342919 42805 36314 667 665 0 False 320 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 367 632 0.000906001565479563 0.000886904833610692 0.000778210116731518 0.000747692072938125 0.000674221619261406 0.000670705072019526 39603 38652 667 665 0 True 364 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 412 631 0.000959831368362511 0.000839590392782138 0.000732433051041428 0.000671396963454643 0.000859920288696493 0.000690741879994039 41956 36590 667 665 0 True 409 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 454 628 0.000982342429151641 0.000896886299061914 0.000610360875867857 0.000534065766384375 0.00102277671692377 0.000962933445030057 42940 39087 667 665 0 False 454 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 498 628 0.00090179218012875 0.000886744212327569 0.000534065766384375 0.000503547722590982 0.000968867316353537 0.000942221187511664 39419 38645 667 665 0 False 498 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 543 628 0.000918149302551745 0.000910883296591215 0.000564583810177768 0.000473029678797589 0.000954167477404923 0.000992086684076814 40134 39697 667 665 0 False 543 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 587 628 0.000872372236861656 0.000910355540946667 0.00064087891966125 0.000656137941557946 0.000808824738341604 0.000874448337080267 38133 39674 667 665 0 False 587 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 632 628 0.000951984525018333 0.000871232785557393 0.000778210116731518 0.000686655985351339 0.00075288104071844 0.000694284384456969 41613 37969 667 665 0 False 632 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 676 628 0.000889118269887716 0.000966986016196362 0.000656137941557946 0.000839246204318303 0.000781140484908712 0.00073085986802935 38865 42142 667 665 0 False 676 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 275 678 0.00109089424159516 0.0774787965565091 0.000961318379491875 0.0767223620965896 0.000713748327052655 0.0218503633333046 47685 3376586 667 665 0 True 275 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 320 672 0.000902364107486197 0.000980455258081115 0.000747692072938125 0.000869764248111696 0.00070442465982412 0.000736873972433161 39444 42729 667 665 0 False 320 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 365 672 0.000858119807114067 0.000929515365433497 0.000732433051041428 0.000793469138628214 0.00064919325756442 0.000659688228172991 37510 40509 667 665 0 False 365 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 409 672 0.000844141902498053 0.00086967246452134 0.000671396963454643 0.000686655985351339 0.000694835985112355 0.000720345991929677 36899 37901 667 665 0 False 409 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 454 671 0.000971818965774609 0.000936238513427079 0.000732433051041428 0.000717174029144732 0.000867710940367085 0.000841288727158728 42480 40802 667 665 0 False 454 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 498 671 0.000881225672354942 0.000989863076092612 0.000610360875867857 0.00064087891966125 0.00086690869060251 0.000947241235780077 38520 43139 667 665 0 False 498 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 543 671 0.000912063995468505 0.000937890618053488 0.000595101853971161 0.000549324788281071 0.000907018697695131 0.000965144627264069 39868 40874 667 665 0 False 543 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 587 671 0.000919499051115321 0.000902691611151936 0.000717174029144732 0.000793469138628214 0.000720027291368675 0.000650490672377856 40193 39340 667 665 0 False 587 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 632 671 0.00109222111306443 0.00103249655381301 0.000839246204318303 0.000854505226215 0.000910427847416492 0.00078613674751688 47743 44997 667 665 0 False 632 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 672 676 0.00107199776170509 0.0779312208192718 0.000869764248111696 0.074891279468986 0.000842832984584435 0.0212280699250294 46859 3396303 667 665 0 True 676 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E4_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E4_1.csv new file mode 100755 index 0000000..183d019 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E4_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 248 251 0.0100245597045835 0.0417923499524733 0.0100099183642329 0.0424963759822995 0.00165401871021321 0.00843702123432161 438192 1821343 667 665 0 True 248 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 292 251 0.0100470021340897 0.00981811360628626 0.0101167315175097 0.0097962920576791 0.00147420610573895 0.00136014663033452 439173 427881 667 665 0 False 292 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 336 251 0.00995871942719416 0.063952442332657 0.0100099183642329 0.0638895246814679 0.00132445525625559 0.00900901108772316 435314 2787097 667 665 0 True 337 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 380 251 0.00994041775175585 0.0993282932669279 0.00994888227664607 0.0963912413214313 0.00143051549701953 0.0203918319327161 434514 4328804 667 665 0 True 381 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 425 252 0.00995375509773152 0.0712161727275387 0.00997940032043946 0.0695048447394522 0.00160212757484442 0.0114058319930288 435097 3103656 667 665 0 True 426 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 470 250 0.00974369761788824 0.0654635214724841 0.0098268101014725 0.0675974670023651 0.00164049510276569 0.0186412910597903 425915 2852951 667 665 0 True 471 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 513 250 0.00990061160767751 0.0806830305335323 0.00997940032043946 0.0802471961547265 0.00167229950871768 0.021753926316206 432774 3516229 667 665 0 True 515 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 557 250 0.00961997829192522 0.0690832827089468 0.00956740672922866 0.0672770275425345 0.00153657622640919 0.0174693736043057 420507 3010703 667 665 0 True 560 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 605 250 0.00968357661407337 0.00962259161293024 0.00965896086060884 0.00968947890440223 0.00202270641003345 0.00215518609775429 423287 419360 667 665 0 False 605 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 644 250 0.00980274339827111 0.042488253134553 0.0098268101014725 0.0431830319676509 0.00190774243389664 0.00771509882642434 428496 1851671 667 665 0 True 649 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 248 295 0.00984808579916954 0.00960070122663032 0.00990310521095598 0.00962844281681544 0.00158845308460457 0.00160887223150338 430478 418406 667 665 0 False 248 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 292 295 0.00984273255910383 0.00971265426096713 0.0098115510795758 0.00964370183871214 0.00152997319866768 0.00149715157625958 430244 423285 667 665 0 False 292 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 336 296 0.0103256680197324 0.106636882891596 0.0101472495613031 0.109849698634318 0.00176400317792814 0.0255986472374118 451354 4647318 667 665 0 True 337 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 381 296 0.010017147526031 0.0500447272908754 0.0100404364080262 0.0495002670328832 0.00134191993126111 0.00613665810356125 437868 2180988 667 665 0 True 382 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 425 295 0.00985908968152683 0.0805158467236987 0.0098115510795758 0.0805523765926604 0.00185231417116301 0.0139893009212871 430959 3508943 667 665 0 True 426 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 469 295 0.00974900510376535 0.0426959364536312 0.00971999694819562 0.0439765011062791 0.00179151366852162 0.00795928784526289 426147 1860722 667 665 0 True 471 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 513 294 0.0098941373899912 0.044013352217807 0.00991836423285267 0.0462500953688869 0.00167928289846431 0.00952751257624562 432491 1918136 667 665 0 True 515 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 557 294 0.00977721256103466 0.0527403425019404 0.00973525597009232 0.053528648813611 0.00178789468039323 0.0129457277324455 427380 2298465 667 665 0 True 560 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 605 294 0.0095418758919922 0.00945354918539195 0.00953688868543526 0.00959792477302205 0.00215559601161514 0.00194742203995031 417093 411993 667 665 0 False 605 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 649 294 0.00952002826693771 0.00941502302333999 0.00950637064164187 0.00932326237888151 0.00187010490082262 0.00204713555360936 416138 410314 667 665 0 False 649 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 248 340 0.00996947166151417 0.0526895861764735 0.0100251773861295 0.0540779736018921 0.0016112149766776 0.0117346987675833 435784 2296253 667 665 0 True 248 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 293 340 0.00999429330882739 0.059447267745927 0.0100404364080262 0.0632181277180133 0.00137905350903589 0.0144326681807997 436869 2590758 667 665 0 True 292 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 337 341 0.00988727426170183 0.0398725814306882 0.00991836423285267 0.0404821850919356 0.00139550067823024 0.00768218069420261 432191 1737678 667 665 0 True 337 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 380 340 0.00984399079929021 0.0343875940710095 0.0098268101014725 0.035385671778439 0.00138006133944075 0.00595137786002749 430299 1498638 667 665 0 True 382 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 426 341 0.0100962107639245 0.0709763651518359 0.0100404364080262 0.0695811398489357 0.00179148572834845 0.0108606328200809 441324 3093205 667 665 0 True 426 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 470 339 0.00981738473862176 0.0325334278704314 0.00978103303578241 0.0332494087129015 0.00163364967025592 0.00477231162479802 429136 1417832 667 665 0 True 471 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 516 338 0.00989340532297367 0.0286761536480248 0.00990310521095598 0.0292668039978637 0.00169889647246575 0.0039535639871019 432459 1249729 667 665 0 False 516 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 557 338 0.0098810974462414 0.0542735414870433 0.00994888227664607 0.0549477378500038 0.00179792135982138 0.0133312061253932 431921 2365283 667 665 0 True 560 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 602 338 0.00980882870535435 0.0597099064897309 0.00976577401388571 0.0587319752803845 0.00200520926328152 0.0153465794747999 428762 2602204 667 665 0 True 605 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 645 338 0.00966275845826229 0.061032829269328 0.00959792477302205 0.0612344548714427 0.00204647164719898 0.01621941357088 422377 2659858 667 665 0 True 650 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 249 384 0.00987807766979408 0.0436023682460902 0.00993362325474937 0.0461738002594034 0.00157548763577563 0.0110964032326651 431789 1900225 667 665 0 True 248 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 293 385 0.00997393269490226 0.0344903228545156 0.0100251773861295 0.0331883726253147 0.00143811944661254 0.00650163408133457 435979 1503115 667 665 0 True 293 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 338 384 0.00997741001323554 0.0912836910311944 0.00997940032043946 0.0854352635996033 0.00141686706896351 0.0264161893899989 436131 3978214 667 665 0 True 337 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 381 384 0.00986657049136224 0.067746041689254 0.00997940032043946 0.0675974670023651 0.0015124004812299 0.0168362735857609 431286 2952425 667 665 0 True 382 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 425 383 0.0103516335217605 0.0452566068409752 0.01025406271458 0.0467536430914778 0.00192165636155276 0.00971266051943246 452489 1972318 667 665 0 True 426 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 469 382 0.00998720140959504 0.0543357478154071 0.00990310521095598 0.055390249485008 0.00194870018753935 0.0124258316864843 436559 2367994 667 665 0 True 471 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 514 383 0.010111149506501 0.0422811664088121 0.0101167315175097 0.0428320744640269 0.00180488015269926 0.00533641071671739 441977 1842646 667 665 0 True 516 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 558 382 0.00990424906567087 0.0576744218064043 0.00996414129854276 0.0559243152513924 0.00181455312223332 0.0106163766559264 432933 2513496 667 665 0 True 560 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 602 382 0.00970590465810812 0.042133165369363 0.00971999694819562 0.0431677729457542 0.00209893196857413 0.00705368392487002 424263 1836196 667 665 0 True 605 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 646 383 0.00977343784047551 0.0879754203545026 0.00973525597009232 0.0854352635996033 0.00193772858593778 0.0166959052172227 427215 3834037 667 665 0 True 650 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 249 427 0.00982047314635198 0.0421202238831228 0.00990310521095598 0.0425268940260929 0.00153608375505075 0.00854566753960326 429271 1835632 667 665 0 True 248 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 293 428 0.0098854212170637 0.0563988593594308 0.00987258716716258 0.0562142366674296 0.00152456273749734 0.00922183760854508 432110 2457906 667 665 0 True 293 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 337 428 0.00989397725033112 0.0347598224216986 0.00990310521095598 0.0355687800411994 0.00140014274537404 0.00446026571637954 432484 1514860 667 665 0 True 337 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 382 429 0.0100136473306034 0.0520976967481648 0.00990310521095598 0.0535896849011978 0.00146206946803645 0.0101727821371031 437715 2270458 667 665 0 True 382 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 426 428 0.0103462345275062 0.0989019355438264 0.010406652933547 0.0979781795986877 0.00176127569235946 0.0147411788635133 452253 4310223 667 665 0 True 427 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 471 427 0.0102795249205336 0.0618505063299127 0.01025406271458 0.061722743572137 0.00196869992496169 0.0151894551841081 449337 2695493 667 665 0 True 471 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 515 427 0.0101926377163901 0.0541720976738023 0.0101167315175097 0.0531929503318837 0.00169462152248037 0.00916779694590611 445539 2360862 667 665 0 True 516 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 558 426 0.00997297185694175 0.0335874017843877 0.00997940032043946 0.0340733958953231 0.00178449173571882 0.00433287261381308 435937 1463765 667 665 0 True 561 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 603 426 0.0102206392798108 0.039584610415946 0.0101472495613031 0.0400854505226215 0.00263205608468153 0.00457422033566914 446763 1725128 667 665 0 True 605 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 647 427 0.0099790114098364 0.0696100516798978 0.00996414129854276 0.0690012970168612 0.0021324537841248 0.00966970827201821 436201 3033660 667 665 0 True 650 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 251 472 0.00999754185621769 0.0528952043647686 0.00985732814526589 0.0528419928282597 0.00179538907409829 0.0135220709443102 437011 2305214 667 665 0 True 248 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 295 472 0.00999948640923301 0.0554309096155357 0.00999465934233616 0.054337376974136 0.00154364819337036 0.00751322278732961 437096 2415722 667 665 0 True 293 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 339 472 0.0100698792283876 0.0697075029069584 0.0100099183642329 0.068207827878233 0.00152857825760765 0.0160329477129652 440173 3037907 667 665 0 True 337 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 383 473 0.0104734082947082 0.0885263972474101 0.0103761348897536 0.0846723125047684 0.00169573864461693 0.018857399084769 457812 3858049 667 665 0 True 382 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 428 472 0.0103164485507304 0.0963975284973707 0.010452429999237 0.0915236133363851 0.00192080006578141 0.0289588812448442 450951 4201079 667 665 0 True 427 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 472 471 0.0101899153421687 0.0430683254256034 0.0102388036926833 0.0438849469748989 0.00194887336876891 0.00558986092497843 445420 1876951 667 665 0 True 471 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 516 470 0.0101977621855129 0.041536434356663 0.0101777676050965 0.042572671091783 0.00180652010741792 0.00593714075873131 445763 1810190 667 665 0 True 516 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 560 471 0.0102015597831663 0.0979618650655019 0.0102388036926833 0.0940108339055467 0.00194803079817071 0.0145790039309036 445929 4269254 667 665 0 True 561 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 604 471 0.00983362747557327 0.0625620586141481 0.0097962920576791 0.0638437476157778 0.00193121585267765 0.0152304814974642 429846 2726503 667 665 0 True 605 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 648 471 0.00984007881616527 0.0746489478445484 0.0098115510795758 0.0717479209582666 0.00203369104388386 0.0112897709692093 430128 3253259 667 665 0 True 650 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 251 515 0.00977426141587023 0.0492611707800056 0.00975051499198901 0.052323186083772 0.00156183656522155 0.0106226186269041 427251 2146840 667 665 0 True 248 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 295 516 0.0100354720785636 0.10049642302139 0.0100862134737163 0.0958419165331502 0.0016269484048708 0.0226332000792697 438669 4379712 667 665 0 True 293 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 339 517 0.00997047825366328 0.0559813358069011 0.00997940032043946 0.0582742046234836 0.00149402186717569 0.0116227665392457 435828 2439710 667 665 0 True 338 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 384 516 0.0102711976582091 0.0585902614168748 0.0102235446707866 0.0580758373388266 0.0017041038214886 0.00729147679891766 448973 2553409 667 665 0 True 382 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 428 516 0.010423398966573 0.0555685391092747 0.0103761348897536 0.0551766231784543 0.00189890497816138 0.00685202317240741 455626 2421720 667 665 0 True 427 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 473 514 0.0103397374327256 0.0627814213950991 0.0103608758678569 0.0614175631342031 0.0019700582470262 0.0119859093885842 451969 2736063 667 665 0 True 471 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 517 514 0.0101878335265876 0.0729948928168441 0.0102082856488899 0.069718471046006 0.00179516444642964 0.015854268039468 445329 3181174 667 665 0 True 516 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 561 513 0.0101307551763143 0.0565961711327988 0.0100251773861295 0.0579995422293431 0.00181868143846665 0.0107529098364733 442834 2466505 667 665 0 True 561 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 605 512 0.0097875758847516 0.0499219896846717 0.00984206912336919 0.0481727321278706 0.00188642457745394 0.00841539845252074 427833 2175639 667 665 0 True 605 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 650 513 0.0101049726910406 0.0613869074150242 0.010101472495613 0.0621652552071412 0.00206469207371351 0.0120895191331555 441707 2675289 667 665 0 True 650 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 253 558 0.00980278915245971 0.0466960029967342 0.0098115510795758 0.0468909742885481 0.00138588373720701 0.00808068328975536 428498 2035048 667 665 0 True 248 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 296 559 0.00987670504413621 0.0553729023864307 0.00987258716716258 0.055191882200351 0.00138484537763178 0.01171315047176 431729 2413194 667 665 0 True 293 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 341 559 0.010022066101305 0.0455339997969288 0.00999465934233616 0.0452582589456016 0.00145587141322552 0.00720907572032341 438083 1984407 667 665 0 True 338 555 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 384 558 0.0101333860421586 0.0483811726615692 0.0101319905394064 0.0477912565804532 0.00147336002709567 0.00517401129098131 442949 2108489 667 665 0 True 382 555 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 429 557 0.010340995672912 0.0847409436844572 0.0103456168459602 0.0799267566948959 0.00188408108405264 0.0160269497328068 452024 3693076 667 665 0 True 427 555 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 473 556 0.0101418505670488 0.0607604385190488 0.0102082856488899 0.0598458838788434 0.00202223436939841 0.0089078317059412 443319 2647987 667 665 0 True 472 555 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 518 555 0.0098789469993774 0.0539765986263438 0.00985732814526589 0.0529640650034333 0.00198303624487549 0.00699291940542991 431827 2352342 667 665 0 True 516 555 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 561 555 0.00991774655130663 0.0377839311026479 0.00990310521095598 0.0390936140993362 0.00174471265829605 0.00693578238009839 433523 1646653 667 665 0 True 561 555 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 606 555 0.00966753977097055 0.0467736289682779 0.00967421988250553 0.0465247577630274 0.00168734084032997 0.00669951040940742 422586 2038431 667 665 0 True 606 555 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 650 555 0.00992053755681097 0.0539849509330662 0.00996414129854276 0.0529640650034333 0.00192277669173966 0.00671686128592625 433645 2352706 667 665 0 True 650 555 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 249 599 0.00939395260026201 0.00965207709133213 0.00943007553215839 0.00965896086060884 0.00138749736622527 0.00116034859022609 410627 420645 667 665 0 False 249 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 293 599 0.00948184639655453 0.0104398327014607 0.00949111161974517 0.00965896086060884 0.00144233851437799 0.00414691666142045 414469 454976 667 665 0 False 293 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 342 601 0.00989971940099989 0.073810045828694 0.00978103303578241 0.0696269169146258 0.00187142102928156 0.0160300121209746 432735 3216699 667 665 0 True 338 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 385 600 0.00990903037837913 0.0730527164787684 0.00991836423285267 0.0705119401846342 0.00141229344952397 0.0160589777011118 433142 3183694 667 665 0 True 382 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 427 599 0.00981637814647266 0.00970788151426862 0.00985732814526589 0.00964370183871214 0.00180661647992255 0.00189184286096094 429092 423077 667 665 0 False 427 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 472 599 0.00965459133559794 0.00963837839047149 0.00970473792629892 0.00978103303578241 0.00192916835954523 0.00198038506914536 422020 420048 667 665 0 False 472 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 516 598 0.00951291349061107 0.00976341058643404 0.00953688868543526 0.0097962920576791 0.00200259028491171 0.00230363176361929 415827 425497 667 665 0 False 516 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 561 598 0.00960641217500657 0.00966295344678932 0.00967421988250553 0.00976577401388571 0.00183433292682461 0.00185108001031145 419914 421119 667 665 0 False 561 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 606 598 0.00951128921691592 0.00968626647873977 0.00949111161974517 0.00965896086060884 0.00154386656736774 0.00155469501979073 415756 422135 667 665 0 False 606 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 650 598 0.00962656689508302 0.00969668391624518 0.00962844281681544 0.00975051499198901 0.00152275172623454 0.00158571877868245 420795 422589 667 665 0 False 650 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 249 648 0.00950399142383489 0.0401899002484467 0.00953688868543526 0.0415808346684977 0.0014002508790766 0.0090309497971467 415437 1751507 667 665 0 True 249 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 293 643 0.00938960595234541 0.0092530938240543 0.0093842984664683 0.00923170824750134 0.00134111235701488 0.00124661602056785 410437 403257 667 665 0 False 293 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 338 642 0.00927952137458394 0.00985540068986841 0.00930800335698482 0.00943007553215839 0.00132041683929196 0.00328298010361483 405625 429506 667 665 0 False 338 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 383 642 0.00950863547397736 0.00966439903833743 0.00956740672922866 0.00964370183871214 0.00135315939778152 0.00129231624945976 415640 421182 667 665 0 False 383 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 427 642 0.00962050446509407 0.00956655773101786 0.00962844281681544 0.00959792477302205 0.0015661015036614 0.0015032993109214 420530 416918 667 665 0 False 427 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 472 642 0.00957216516484262 0.00952598938408048 0.00964370183871214 0.00956740672922866 0.0017386421980746 0.00176581882427226 418417 415150 667 665 0 False 472 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 517 642 0.0094865362008856 0.00930820987006312 0.00947585259784848 0.00935378042267491 0.0018083862984673 0.0018081960919408 414674 405659 667 665 0 False 517 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 561 642 0.00954118957916327 0.00947573786836053 0.00956740672922866 0.00953688868543526 0.00161051538919864 0.00168210614394683 417063 412960 667 665 0 False 561 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 606 642 0.00964587516267044 0.00937826369540239 0.00970473792629892 0.00943007553215839 0.00141550220497106 0.00144838221628136 421639 408712 667 665 0 False 606 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 647 648 0.00954818997001842 0.0414019713967914 0.00943007553215839 0.0419928282597086 0.00141489104589523 0.00761992325729246 417369 1804330 667 665 0 True 650 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E4_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E4_2.csv new file mode 100755 index 0000000..95a2b72 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E4_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 248 251 0.00850019028023182 0.720923985404115 0.00834668497749294 0.715419241626612 0.00232024332358827 0.18822284255938 371559 31418426 667 665 9 True 248 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 292 251 0.00675185410270374 0.006672231046832 0.00659189745937285 0.00660715648126955 0.00167894869803314 0.0013171496953438 295136 290781 667 665 0 False 292 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 336 251 0.00629266506595638 0.00643189571548464 0.0063782711528191 0.00643930724040589 0.0012509697958553 0.00126499802874388 275064 280307 667 665 0 True 337 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 380 251 0.00622387364340261 0.0062218030771596 0.00627145799954223 0.00616464484626535 0.00131840323236257 0.00122601394485372 272057 271151 667 665 0 True 381 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 425 252 0.00615476194152866 0.0064069076330102 0.00614938582436866 0.00643930724040589 0.00146347949948784 0.0015040431485969 269036 279218 667 665 0 True 426 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 470 250 0.0066120979336379 0.0066534383567066 0.00662241550316625 0.00675974670023652 0.00157866026105126 0.00148960363393231 289027 289962 667 665 0 True 471 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 513 250 0.00648842436186347 0.00658588563420453 0.00656137941557946 0.00659189745937285 0.00154714780452398 0.00153558182203279 283621 287018 667 665 0 True 515 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 557 250 0.00688236792567324 0.00704973695396651 0.00692759594110018 0.00694285496299687 0.00156327556897793 0.00151708949348096 300841 307233 667 665 0 True 560 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 605 250 0.00953473823857126 0.00767813330533934 0.00787365529869535 0.00775158312352178 0.00863704239635007 0.00215846802903798 416781 334619 667 665 0 False 605 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 644 250 0.00925618673840008 0.743912998334701 0.00921644922560464 0.73334859235523 0.00195103157555436 0.168080017079539 404605 32420305 667 665 12 True 649 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 248 295 0.00668830153474419 0.00647175273959676 0.00668345159075303 0.00654612039368277 0.00165015351550287 0.00154147360641583 292358 282044 667 665 0 False 248 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 292 295 0.00638986983962814 0.00605076435653106 0.00634775310902571 0.00604257267109178 0.00144841488828938 0.00134126289482266 279313 263697 667 665 0 False 292 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 336 296 0.00646918472555894 0.00629433505943848 0.00636301213092241 0.00630197604333562 0.00161028646289717 0.00135504489720895 282780 274312 667 665 0 True 337 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 381 296 0.00617219428738366 0.00602203609274961 0.00611886778057527 0.00604257267109178 0.00129868147851057 0.00115245941392912 269798 262445 667 665 0 True 382 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 425 295 0.00633297450610927 0.00643274471369543 0.00625619897764553 0.0063782711528191 0.00159746011235803 0.00152802997053125 276826 280344 667 665 0 True 426 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 469 295 0.00653539103645705 0.00696694815546534 0.00650034332799268 0.00677500572213321 0.00166144299603412 0.00257431942281267 285674 303625 667 665 0 True 471 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 513 294 0.00667489555748562 0.00658939635653565 0.00675974670023652 0.00656137941557946 0.00159517709359745 0.00156637628208871 291772 287171 667 665 0 True 515 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 557 294 0.00695628381734974 0.00683595002612964 0.00697337300679027 0.00691233691920348 0.00166317791461169 0.00140798331039867 304072 297916 667 665 0 True 560 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 605 294 0.00731684970057887 0.00726295023436366 0.00733958953231098 0.0072632944228275 0.00207054709377754 0.00191948208397132 319833 316525 667 665 0 False 605 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 649 294 0.00773312130842338 0.00771842630150565 0.00775158312352178 0.00775158312352178 0.00193286381805782 0.00199281962535432 338029 336375 667 665 0 False 649 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 248 340 0.00610026870291108 0.00608151185930034 0.00605783169298848 0.00607309071488518 0.00142507060287226 0.00142253382854486 266654 265037 667 665 0 True 248 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 293 340 0.00611076928919381 0.00599847065592569 0.00616464484626535 0.0059510185397116 0.00131361884215978 0.00126215986107134 267113 261418 667 665 0 True 292 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 337 341 0.00628303380925696 0.00620668173064843 0.00631723506523232 0.00621042191195544 0.00128505934627805 0.00125869446003155 274643 270492 667 665 0 True 337 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 380 340 0.00636557436548377 0.00635484339138072 0.00642404821850919 0.0063782711528191 0.00134436726037314 0.00116393275391942 278251 276949 667 665 0 True 382 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 426 341 0.00672083276283579 0.00684859321570119 0.00669871061264973 0.00685130083161669 0.00171774485792556 0.0017053083693103 293780 298467 667 665 0 True 426 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 470 339 0.00676002122536809 0.00691974844412473 0.0068055237659266 0.00701915007248035 0.00170344120074566 0.00150148259113283 295493 301568 667 665 0 True 471 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 516 338 0.00675537717522562 0.00687539402408516 0.00671396963454643 0.00689707789730678 0.00165816955758435 0.0017036569132382 295290 299635 667 665 0 False 516 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 557 338 0.00706332574156959 0.00703261931436511 0.00706492713817044 0.00701915007248035 0.00174818207177503 0.00151067559891633 308751 306487 667 665 0 True 560 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 602 338 0.00690332334405011 0.00712708757473909 0.0068055237659266 0.00704966811627375 0.00198567650711351 0.00205303362555219 301757 310604 667 665 0 True 605 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 645 338 0.00687532178062948 0.0070821595072598 0.00689707789730678 0.00717174029144732 0.00183973385578562 0.00184125087079394 300533 308646 667 665 0 True 650 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 249 384 0.00610154982019176 0.00596207846234951 0.00604257267109178 0.0059662775616083 0.00146792556100289 0.00149987020501449 266710 259832 667 665 0 True 248 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 293 385 0.00602811434749551 0.00600836033778656 0.00605783169298848 0.00599679560540169 0.00135244446919797 0.00132042784316897 263500 261849 667 665 0 True 293 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 338 384 0.00643532662599806 0.00643508519524951 0.00645456626230259 0.00646982528419928 0.00138633951357737 0.00146314116703171 281300 280446 667 665 0 True 337 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 381 384 0.00670598552863646 0.00687603650921765 0.00675974670023652 0.00685130083161669 0.00136304068542825 0.00137779192571159 293131 299663 667 665 0 True 382 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 425 383 0.0069838507159787 0.00697396960012758 0.00703440909437705 0.00703440909437705 0.00174839640401944 0.00171447890805294 305277 303931 667 665 0 True 426 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 469 382 0.00691821633243804 0.00714466413229228 0.00685130083161669 0.00709544518196384 0.00179270991170831 0.00166256857705027 302408 311370 667 665 0 True 471 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 514 383 0.00690590845570577 0.0069895957563857 0.00683604180972 0.00703440909437705 0.00170817448007341 0.00174444177658209 301870 304612 667 665 0 True 516 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 558 382 0.00684780063618912 0.00702128404095613 0.00689707789730678 0.00695811398489357 0.00181250983428186 0.0015201463689002 299330 305993 667 665 0 True 560 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 602 382 0.00668548765214555 0.00677149499980209 0.00666819256885634 0.00679026474402991 0.0020765590675181 0.00196704947601819 292235 295107 667 665 0 True 605 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 646 383 0.00622812878294201 0.00647661726988563 0.00627145799954223 0.00642404821850919 0.00188712564333557 0.00177840150506728 272243 282256 667 665 0 True 650 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 249 427 0.00610479836758206 0.00620594746192559 0.00608834973678187 0.00625619897764553 0.00143921213866269 0.00152982431868296 266852 270460 667 665 0 True 248 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 293 428 0.0060902485356086 0.00633465100150238 0.00602731364919509 0.00628671702143893 0.00135642251326731 0.0014278715683587 266216 276069 667 665 0 True 293 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 337 428 0.00627216718946546 0.00654513372008644 0.00625619897764553 0.00654612039368277 0.00136989949626751 0.00140109207127782 274168 285242 667 665 0 True 337 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 382 429 0.00674892583463361 0.00664334216176743 0.00672922865644312 0.00662241550316625 0.00134436211654958 0.00134034107220653 295008 289522 667 665 0 True 382 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 426 428 0.00695738191787604 0.00696630567033285 0.00694285496299687 0.00688181887541009 0.00170676911751898 0.00164788378420586 304120 303597 667 665 0 True 427 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 471 427 0.00705257350724958 0.00711591292261324 0.00712596322575723 0.00711070420386053 0.00162827068993069 0.00157260467308384 308281 310117 667 665 0 True 471 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 515 427 0.00683604180972 0.0070090309316436 0.00689707789730678 0.00689707789730678 0.0016907862513146 0.00166883302702843 298816 305459 667 665 0 True 516 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 558 426 0.00667558187031456 0.00688838140212055 0.00671396963454643 0.00688181887541009 0.00164343490895816 0.00160954999445177 291802 300201 667 665 0 True 561 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 603 426 0.00637092760554948 0.00605539942784404 0.00614938582436866 0.00610360875867857 0.00243815460153851 0.00171738476369923 278485 263899 667 665 0 True 605 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 647 427 0.00604458585539 0.00595579128641012 0.00601205462729839 0.00610360875867857 0.00193567267060498 0.00184378073661528 264220 259558 667 665 0 True 650 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 251 472 0.00639799120810389 0.00648795254329461 0.0064087891966125 0.00648508430609598 0.00158401898158106 0.0015745747334703 279668 282750 667 665 0 True 248 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 295 472 0.0063978539455381 0.00632879979761718 0.00631723506523232 0.00634775310902571 0.00163811251977993 0.00157163013489425 279662 275814 667 665 0 True 293 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 339 472 0.00629861311047383 0.00648139001658415 0.00624093995574884 0.00645456626230259 0.00147939164914288 0.00151876054900633 275324 282464 667 665 0 True 337 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 383 473 0.00665519837929513 0.00670591562449268 0.00663767452506294 0.00665293354695964 0.00142066561079239 0.00149884891195249 290911 292249 667 665 0 True 382 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 428 472 0.00674318368396484 0.00678491834989167 0.00668345159075303 0.00683604180972 0.00189560077459257 0.0019453625142369 294757 295692 667 665 0 True 427 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 472 471 0.00692867116453218 0.00695593412462261 0.00698863202868696 0.00697337300679027 0.00189026639554115 0.00190238316614539 302865 303145 667 665 0 True 471 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 516 470 0.0064892021830696 0.00659554585708951 0.00653086137178607 0.00663767452506294 0.00175552146316489 0.00170371393097872 283655 287439 667 665 0 True 516 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 560 471 0.00620914079467476 0.0062167779255876 0.00613412680247196 0.00627145799954223 0.00176948273676428 0.00186602900489315 271413 270932 667 665 0 True 561 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 604 471 0.00595472462898786 0.00597885191348708 0.00587472343022812 0.00601205462729839 0.00177980910629917 0.00166892889194637 260292 260563 667 665 0 True 605 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 648 471 0.00608068591019208 0.00619674615699239 0.00611886778057527 0.00624093995574884 0.00183100453370211 0.00175210247397444 265798 270059 667 665 0 True 650 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 251 515 0.00632874224366416 0.00638375522234288 0.0064087891966125 0.00643930724040589 0.00147961757538461 0.00150174455693685 276641 278209 667 665 0 True 248 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 295 516 0.00636248595775356 0.00628731361477624 0.00630197604333562 0.00625619897764553 0.00149544369597259 0.00159428107412852 278116 274006 667 665 0 True 293 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 339 517 0.00644578145809219 0.00631652374240706 0.00636301213092241 0.0063935301747158 0.00157764351638639 0.00154024657509526 281757 275279 667 665 0 True 338 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 384 516 0.00670502469067595 0.00674843437272513 0.00668345159075303 0.00683604180972 0.00152720194647999 0.00149923124132124 293089 294102 667 665 0 True 382 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 428 516 0.00640039330300517 0.00681529871829953 0.00645456626230259 0.00677500572213321 0.00174468836445711 0.00183376161906508 279773 297016 667 665 0 True 427 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 473 514 0.00653998933241093 0.00627542763982513 0.00650034332799268 0.00621042191195544 0.0018939249883057 0.00164225068360769 285875 273488 667 665 0 True 471 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 517 514 0.00636145648851015 0.00645672317667595 0.00631723506523232 0.00650034332799268 0.00167800079809173 0.00162989374537138 278071 281389 667 665 0 True 516 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 561 513 0.00619184571138555 0.00630383466104033 0.00616464484626535 0.00633249408712902 0.00168162816261768 0.0016782340527653 270657 274726 667 665 0 True 561 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 605 512 0.00613055797576149 0.00616648051807248 0.00607309071488518 0.00611886778057527 0.00165203507850371 0.00182474992689253 267978 268740 667 665 0 True 605 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 650 513 0.00636390433760003 0.00597316133088501 0.00643930724040589 0.00587472343022812 0.00187342309688546 0.00196756336752429 278178 260315 667 665 0 True 650 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 253 558 0.00654987223714762 0.00638678408082463 0.00653086137178607 0.0063935301747158 0.00134128861214571 0.00136650208367753 286307 278341 667 665 0 True 248 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 296 559 0.00657050737620432 0.00654866738831515 0.00659189745937285 0.00657663843747616 0.00137515365324347 0.00136045929464207 287209 285396 667 665 0 True 293 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 341 559 0.00631046344532014 0.00636686704171736 0.00627145799954223 0.00643930724040589 0.00129918133321443 0.00135324598475333 275842 277473 667 665 0 True 338 555 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 384 558 0.0064968202554708 0.00660490778330583 0.00650034332799268 0.00662241550316625 0.00147616745438329 0.0012683489729827 283988 287847 667 665 0 True 382 555 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 429 557 0.00627971663058377 0.00654953933242353 0.00634775310902571 0.00659189745937285 0.00191099078253928 0.00194525022441182 274498 285434 667 665 0 True 427 555 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 473 556 0.0062152489788523 0.00673271643287665 0.00613412680247196 0.00683604180972 0.00201267265275583 0.00194593134749244 271680 293417 667 665 0 True 472 555 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 518 555 0.00623750839160415 0.00641918368822032 0.00622568093385214 0.0064087891966125 0.00186081014371315 0.00199715964335937 272653 279753 667 665 0 True 516 555 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 561 555 0.00631208771901529 0.00654717590497186 0.00628671702143893 0.00646982528419928 0.00170820559179791 0.00193609539158775 275913 285331 667 665 0 True 561 555 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 606 555 0.00626644791589099 0.00627749277060814 0.00630197604333562 0.00634775310902571 0.00153801955459908 0.00164637789415568 273918 273578 667 665 0 True 606 555 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 650 555 0.00633167051173429 0.00653315596154497 0.0063935301747158 0.00653086137178607 0.00177616191520551 0.00171487096467624 276769 284720 667 665 0 True 650 555 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 249 599 0.00678557493969884 0.00688861086109644 0.00675974670023652 0.00685130083161669 0.00135596554401099 0.00134220192870624 296610 300211 667 665 0 False 249 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 293 599 0.00656899748798066 0.00726219301974322 0.00665293354695964 0.00674448767833982 0.00138099835718619 0.00292785748235247 287143 316492 667 665 0 False 293 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 342 601 0.0065619970971255 0.00635982265115753 0.00659189745937285 0.00634775310902571 0.00151961036002648 0.00151280351433416 286837 277166 667 665 0 True 338 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 385 600 0.00652095558995508 0.00703688725131666 0.00650034332799268 0.00666819256885634 0.00136366435368747 0.0023361202678252 285043 306673 667 665 0 True 382 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 427 599 0.0063239838080502 0.00627999387344534 0.0063782711528191 0.00625619897764553 0.00182223091493535 0.00176728275488555 276433 273687 667 665 0 False 427 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 472 599 0.00643038517362971 0.00636822084967511 0.00656137941557946 0.00645456626230259 0.00201445499638309 0.00187915330253862 281084 277532 667 665 0 False 472 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 516 598 0.00636749604140479 0.0063945856860049 0.00636301213092241 0.00645456626230259 0.00202204602203389 0.00202654818525814 278335 278681 667 665 0 False 516 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 561 598 0.006334873304936 0.00639077666700512 0.00636301213092241 0.00642404821850919 0.00180792042095919 0.0016756403497495 276909 278515 667 665 0 False 561 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 606 598 0.00650251665195098 0.00664554496793598 0.00656137941557946 0.00660715648126955 0.00149519428536943 0.00159713893129686 284237 289618 667 665 0 False 606 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 650 598 0.0066370339664226 0.0063795331771865 0.00674448767833982 0.0063782711528191 0.00160845707932068 0.00154543791941935 290117 278025 667 665 0 False 650 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 249 648 0.00891161194408518 0.732366094912263 0.00827038986800946 0.738857099259937 0.00284273720210283 0.212735137905979 389543 31917082 667 665 13 True 249 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 293 643 0.00708416677447497 0.00658760657652371 0.00689707789730678 0.00654612039368277 0.00185026247818003 0.00143876279413711 309662 287093 667 665 0 False 293 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 338 642 0.00619390464987236 0.00648008210042157 0.00622568093385214 0.0064087891966125 0.00127321397335224 0.00171202216598533 270747 282407 667 665 0 False 338 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 383 642 0.00603140864907441 0.00630293977103436 0.005981536583505 0.00631723506523232 0.00117627288096588 0.00124359664329208 263644 274687 667 665 0 False 383 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 427 642 0.00600292666667353 0.00608773019754697 0.00592050049591821 0.00608834973678187 0.00155787721691997 0.00145876987436703 262399 265308 667 665 0 False 427 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 472 642 0.00629934517749136 0.00640341985657667 0.00633249408712902 0.0063935301747158 0.00171993724180075 0.00162712075428524 275356 279066 667 665 0 False 472 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 517 642 0.00621394498447732 0.00623717682854424 0.00621042191195544 0.00628671702143893 0.00174310092350388 0.00175332361318046 271623 271821 667 665 0 False 517 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 561 642 0.00639423936463904 0.00631436682803369 0.0064087891966125 0.00633249408712902 0.00154539113015058 0.00151612615275418 279504 275185 667 665 0 False 561 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 606 642 0.00709704657856469 0.00681568879855854 0.00694285496299687 0.00679026474402991 0.0018868913337795 0.00131811010085592 310225 297033 667 665 0 False 606 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 647 648 0.00865005812497734 0.763888067616971 0.00836194399938964 0.753536278324559 0.00211098925241765 0.177182808794202 378110 33290834 667 665 14 True 650 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E4_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E4_3.csv new file mode 100755 index 0000000..8531d34 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E4_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 248 251 0.00104598650548839 0.0730806875279295 0.000762951094834821 0.0719157701991302 0.000912060651807604 0.0213037568773634 45722 3184913 667 665 0 True 248 252 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 292 251 0.000911835224525526 0.000973066679057451 0.000717174029144732 0.000869764248111696 0.000741861746541437 0.000645501092138387 39858 42407 667 665 0 False 292 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 336 251 0.000860293131072367 0.000946633005034904 0.000701915007248035 0.000854505226215 0.00065144251835177 0.000664033732431993 37605 41255 667 665 0 True 337 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 380 251 0.000850776259844443 0.000979468584484787 0.000747692072938125 0.000854505226215 0.000596252856692835 0.000671832826966634 37189 42686 667 665 0 True 381 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 425 252 0.000854047684329042 0.00101464464548875 0.000671396963454643 0.000778210116731518 0.000773690293430462 0.000844255411976696 37332 44219 667 665 0 True 426 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 470 250 0.000958573128176127 0.000958725493064316 0.000747692072938125 0.000793469138628214 0.000845889913843388 0.000793219738971968 41901 41782 667 665 0 True 471 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 513 250 0.000977995781235041 0.000996884520754851 0.00080872816052491 0.000839246204318303 0.000841358478803196 0.000822611238232826 42750 43445 667 665 0 True 515 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 557 250 0.00107057938185862 0.00109860368476696 0.000854505226215 0.00102235446707866 0.000854122323930112 0.000753559356248031 46797 47878 667 665 0 True 560 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 605 250 0.00117112421129788 0.00111679978155505 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.00132368995405432 0.00113791705960076 51192 48671 667 665 0 False 605 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 644 250 0.00112820678239502 0.0757863300962408 0.000839246204318303 0.0730144197756924 0.000956849200760258 0.0200270402854109 49316 3302827 667 665 0 True 649 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 248 295 0.000863404415896881 0.000922126786409833 0.000686655985351339 0.000732433051041428 0.000715675018482465 0.000794731733081875 37741 40187 667 665 0 False 248 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 292 295 0.000900579694130962 0.000939175588318473 0.000823987182421607 0.00080872816052491 0.00065724036880229 0.000703531993192992 39366 40930 667 665 0 False 292 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 336 296 0.000863770449405647 0.000962855754630339 0.000747692072938125 0.000854505226215 0.000652985054680569 0.000696470240092941 37757 41962 667 665 0 True 337 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 381 296 0.000898932543341513 0.000913613858404308 0.000762951094834821 0.000823987182421607 0.000683955953733884 0.000658732738275867 39294 39816 667 665 0 True 382 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 425 295 0.000879670029942685 0.00100034935129079 0.000579842832074464 0.000732433051041428 0.000851548538301561 0.000860203854656096 38452 43596 667 665 0 True 426 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 469 295 0.000903050420315134 0.00108658003443032 0.000701915007248035 0.000747692072938125 0.000841088087229826 0.00109256031624444 39474 47354 667 665 0 True 471 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 513 294 0.00101034399257227 0.000967628501328854 0.000793469138628214 0.000778210116731518 0.000875646002485835 0.000858036775593566 44164 42170 667 665 0 True 515 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 557 294 0.00103354136619033 0.00105262010599857 0.000793469138628214 0.000854505226215 0.000951335617866081 0.0008009602122362 45178 45874 667 665 0 True 560 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 605 294 0.000985041926278792 0.00095418220534169 0.000656137941557946 0.000503547722590982 0.00102157425723572 0.00103399379627437 43058 41584 667 665 0 False 605 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 649 294 0.00108357357141983 0.00104061940155952 0.000701915007248035 0.000595101853971161 0.00103561417446703 0.00107448523475617 47365 45351 667 665 0 False 649 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 248 340 0.000935284246180869 0.000918639009976303 0.000747692072938125 0.000747692072938125 0.000798555397737805 0.000770470490318555 40883 40035 667 665 0 True 248 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 293 340 0.000886441649854862 0.000849640695926128 0.000778210116731518 0.000717174029144732 0.000682609876264196 0.000693227202829642 38748 37028 667 665 0 True 292 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 337 341 0.000858074052925471 0.000921186004608684 0.000686655985351339 0.000823987182421607 0.000702749901194722 0.000654486426205541 37508 40146 667 665 0 True 337 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 380 340 0.000822408662915052 0.00096540274926272 0.000686655985351339 0.000839246204318303 0.000643926815967499 0.000682817204814447 35949 42073 667 665 0 True 382 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 426 341 0.000954295111542421 0.000876648017388401 0.000686655985351339 0.000610360875867857 0.000883745904373705 0.000834406028330942 41714 38205 667 665 0 True 426 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 470 339 0.000897720057343725 0.000891516959026084 0.000610360875867857 0.000671396963454643 0.000879469031003753 0.000826938638009394 39241 38853 667 665 0 True 471 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 516 338 0.000973100083055291 0.000930456147234647 0.000732433051041428 0.000656137941557946 0.000870109014113579 0.00090529768557308 42536 40550 667 665 0 False 516 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 557 338 0.000944549469371517 0.00109376210037568 0.000717174029144732 0.000915541313801785 0.000904175092888874 0.00087048649763029 41288 47667 667 665 0 True 560 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 602 338 0.00100370963522588 0.00104452020414965 0.000549324788281071 0.000534065766384375 0.00113123196165074 0.00121364346764279 43874 45521 667 665 0 True 605 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 645 338 0.00101963209285721 0.00102910056096983 0.000656137941557946 0.000625619897764553 0.00105530772466824 0.00104242636799749 44570 44849 667 665 0 True 650 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 249 384 0.000820738635031306 0.000949730701209421 0.000625619897764553 0.000793469138628214 0.000754085444777269 0.000749582603207204 35876 41390 667 665 0 True 248 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 293 385 0.000868254359888035 0.000897597621887174 0.000717174029144732 0.000732433051041428 0.000717900488223217 0.000729096483137827 37953 39118 667 665 0 True 293 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 338 384 0.000932950782562484 0.000847713240528651 0.00080872816052491 0.000671396963454643 0.000735127295545043 0.000721080607068204 40781 36944 667 665 0 True 337 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 381 384 0.000957818184064297 0.000918409551000412 0.00080872816052491 0.000762951094834821 0.000752365150538337 0.000728547638301001 41868 40025 667 665 0 True 382 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 425 383 0.000915609945084679 0.00100069353975463 0.000610360875867857 0.000778210116731518 0.000859478976161226 0.000871288401401203 40023 43611 667 665 0 True 426 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 469 382 0.00100581432790128 0.000957188117925851 0.000701915007248035 0.00064087891966125 0.000925067212261275 0.000922351051048259 43966 41715 667 665 0 True 471 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 514 383 0.0010132036293595 0.00100353883105567 0.000701915007248035 0.000656137941557946 0.000960899077993395 0.00099216288477046 44289 43735 667 665 0 True 516 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 558 382 0.000982228043680151 0.00109217883344204 0.000701915007248035 0.000900282291905089 0.00094926033910836 0.000877593697812438 42935 47598 667 665 0 True 560 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 602 382 0.00100149055707898 0.00103995397052944 0.000518806744487678 0.000564583810177768 0.00110146921536231 0.00112381635306722 43777 45322 667 665 0 True 605 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 646 383 0.000966580111180391 0.00105264305189616 0.000503547722590982 0.000747692072938125 0.00105522815425123 0.00100087490513888 42251 45875 667 665 0 True 650 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 249 427 0.000896850727760405 0.00087947036279185 0.000732433051041428 0.000686655985351339 0.000743695470289164 0.000805556475301199 39203 38328 667 665 0 True 248 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 293 428 0.000885618074460138 0.000955145933040429 0.000793469138628214 0.000839246204318303 0.000735788532788126 0.000807058570495427 38712 41626 667 665 0 True 293 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 337 428 0.000915609945084679 0.000944980900408494 0.000793469138628214 0.000839246204318303 0.000711292889015618 0.000713393290630118 40023 41183 667 665 0 True 337 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 382 429 0.000955095809842847 0.000958105953829412 0.000762951094834821 0.000869764248111696 0.000765188187104916 0.000703549378008812 41749 41755 667 665 0 True 382 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 426 428 0.000925607235292859 0.000955077095347662 0.000610360875867857 0.000701915007248035 0.00089262716511208 0.000836849681070833 40460 41623 667 665 0 True 427 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 471 427 0.000952190418867014 0.000949317675052819 0.00064087891966125 0.000717174029144732 0.000949355723722367 0.000854042019305391 41622 41372 667 665 0 True 471 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 515 427 0.000943886033636878 0.00103926559360177 0.000625619897764553 0.000762951094834821 0.000928946658370955 0.00097235918992661 41259 45292 667 665 0 True 516 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 558 426 0.00098419547378977 0.000972011167768357 0.000732433051041428 0.000747692072938125 0.000928275132536266 0.000839567479181516 43021 42361 667 665 0 True 561 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 603 426 0.000951870139546844 0.00101074384289862 0.000518806744487678 0.000701915007248035 0.00101845592604644 0.000996651139018564 41608 44049 667 665 0 True 605 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 647 427 0.00094386315654258 0.000930456147234647 0.000488288700694286 0.000488288700694286 0.00102092436257074 0.00100540239864376 41258 40550 667 665 0 True 650 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 251 472 0.000877862739493151 0.000914784099181348 0.000747692072938125 0.000762951094834821 0.000723369623055997 0.000727596378339388 38373 39867 667 665 0 True 248 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 295 472 0.000853361371500105 0.000927197829777006 0.000732433051041428 0.00080872816052491 0.000751032894201834 0.00077774947284285 37302 40408 667 665 0 True 293 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 339 472 0.000976348630445592 0.000873343808135583 0.000839246204318303 0.000762951094834821 0.000838057177755408 0.000754813162186201 42678 38061 667 665 0 True 337 469 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 383 473 0.000868117097322248 0.000954296934829635 0.000717174029144732 0.000793469138628214 0.000744087766438681 0.000809112995915964 37947 41589 667 665 0 True 382 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 428 472 0.000959762737079618 0.00098268101014725 0.000610360875867857 0.000671396963454643 0.00100350167375303 0.00102189383571841 41953 42826 667 665 0 True 427 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 472 471 0.000998905445423317 0.000991698747899733 0.000518806744487678 0.000564583810177768 0.00106741488799233 0.00107512255076767 43664 43219 667 665 0 True 471 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 516 470 0.000992316842265523 0.000955306554323552 0.000671396963454643 0.000625619897764553 0.000937730177030844 0.0009566123806404 43376 41633 667 665 0 True 516 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 560 471 0.00101450762373448 0.000957279901516208 0.000595101853971161 0.000625619897764553 0.00106326636057045 0.000978056546086388 44346 41719 667 665 0 True 561 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 604 471 0.000940454469492194 0.000918409551000412 0.000534065766384375 0.000488288700694286 0.00102882392335568 0.000934567969649261 41109 40025 667 665 0 True 605 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 648 471 0.00101734438342742 0.000959689220763054 0.000610360875867857 0.000671396963454643 0.00105722311634579 0.000907360388086941 44470 41824 667 665 0 True 650 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 251 515 0.000875003102705914 0.000928000936192622 0.000717174029144732 0.000778210116731518 0.000721539849130338 0.000777215297678223 38248 40443 667 665 0 True 248 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 295 516 0.000864548270611776 0.000936766269071626 0.000686655985351339 0.000793469138628214 0.000765654965994131 0.000795306730314813 37791 40825 667 665 0 True 293 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 339 517 0.00100203960734213 0.000868135089382876 0.000869764248111696 0.000732433051041428 0.000816539176786922 0.000812399487612663 43801 37834 667 665 0 True 338 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 384 516 0.000876307097080894 0.000892985496471781 0.000686655985351339 0.000671396963454643 0.000860052759639208 0.00082354853000654 38305 38917 667 665 0 True 382 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 428 516 0.000977995781235041 0.000905835199121631 0.000610360875867857 0.000488288700694286 0.00103421171330753 0.000968583159778383 42750 39477 667 665 0 True 427 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 473 514 0.000949811201060033 0.000924031295909722 0.000579842832074464 0.000610360875867857 0.000996235379280539 0.000867769922694557 41518 40270 667 665 0 True 471 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 517 514 0.000975616563428059 0.00102508502889175 0.000671396963454643 0.000686655985351339 0.000945755883991116 0.000963844700416847 42646 44674 667 665 0 True 516 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 561 513 0.000997372680105358 0.00100693482389884 0.00064087891966125 0.000747692072938125 0.000975074613722803 0.000899379156301376 43597 43883 667 665 0 True 561 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 605 512 0.000904057012464242 0.000915449530211429 0.000518806744487678 0.000610360875867857 0.000963395623663284 0.000939084737679166 39518 39896 667 665 0 True 605 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 650 513 0.00095397483222225 0.00099293782636954 0.000503547722590982 0.000595101853971161 0.00105420608320717 0.00105396661723255 41700 43273 667 665 0 True 650 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 253 558 0.000913345112749187 0.000916000231753566 0.000778210116731518 0.000762951094834821 0.000677899017031116 0.000669126538846302 39924 39920 667 665 0 True 248 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 296 559 0.000929267570380523 0.000895945517260765 0.000793469138628214 0.000778210116731518 0.000725855489054858 0.000722019331861526 40620 39046 667 665 0 True 293 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 341 559 0.000990486674721692 0.000920543519476191 0.000900282291905089 0.00080872816052491 0.00073897806080292 0.000720288770432632 43296 40118 667 665 0 True 338 555 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 384 558 0.000951023687057822 0.000977242832418653 0.00080872816052491 0.000885023270008392 0.000775963438552137 0.000692949689280085 41571 42589 667 665 0 True 382 555 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 429 557 0.000952922485884547 0.000984975599906151 0.00064087891966125 0.000534065766384375 0.000975789444355242 0.00106386335529205 41654 42926 667 665 0 True 427 555 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 473 556 0.0010153769533178 0.000915036504054827 0.000610360875867857 0.000534065766384375 0.00111342784574652 0.000998925775343768 44384 39878 667 665 0 True 472 555 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 518 555 0.000983394775489344 0.000908106842982944 0.000671396963454643 0.000473029678797589 0.0010029901473483 0.00105540069754302 42986 39576 667 665 0 True 516 555 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 561 555 0.00103358712037893 0.0010093211972481 0.000747692072938125 0.000686655985351339 0.000941610660326609 0.000999228495009148 45180 43987 667 665 0 True 561 555 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 606 555 0.000894563018330615 0.000912282996344145 0.000625619897764553 0.00064087891966125 0.000837380957932661 0.000843082475854002 39103 39758 667 665 0 True 606 555 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 650 555 0.000961661535906343 0.00101189113777807 0.000610360875867857 0.000701915007248035 0.000986704955648913 0.000979553558994775 42036 44099 667 665 0 True 650 555 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 249 599 0.000929153184909033 0.000941286610896663 0.000823987182421607 0.00080872816052491 0.000673308697808793 0.000678780648752739 40615 41022 667 665 0 False 249 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 293 599 0.000965093100051027 0.000974282811629669 0.000839246204318303 0.000869764248111696 0.00075974710645727 0.000788985764772537 42186 42460 667 665 0 False 293 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 342 601 0.000927597542496776 0.000939083804728117 0.00080872816052491 0.00080872816052491 0.000717604576951957 0.000797688136998678 40547 40926 667 665 0 True 338 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 385 600 0.000958618882364723 0.000900580588573746 0.000885023270008392 0.000762951094834821 0.000701354076584888 0.000692507180112921 41903 39248 667 665 0 True 382 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 427 599 0.000899824750019131 0.0009877979453096 0.000625619897764553 0.000595101853971161 0.000912260464952069 0.00102263019498678 39333 43049 667 665 0 False 427 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 472 599 0.00090700815762867 0.000846267648980542 0.000442511635004196 0.000411993591210803 0.00103668022392313 0.00098319124468186 39647 36881 667 665 0 False 472 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 516 598 0.00095539321206872 0.000983874196821878 0.000473029678797589 0.000503547722590982 0.00110282757332223 0.00111823084760683 41762 42878 667 665 0 False 516 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 561 598 0.000979345529798616 0.000925660454638542 0.000671396963454643 0.000610360875867857 0.00097228908459824 0.000944022854090433 42809 40341 667 665 0 False 561 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 606 598 0.000962759636432642 0.000989174699164941 0.000732433051041428 0.000778210116731518 0.000826078006177733 0.000760612482287842 42084 43109 667 665 0 False 606 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 650 598 0.000926956983856435 0.00101257951470574 0.000717174029144732 0.000823987182421607 0.000779438832069268 0.000862679348223962 40519 44129 667 665 0 False 650 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 249 648 0.0010795014486348 0.0748830418917516 0.000915541313801785 0.0740520332646677 0.00073786354708858 0.0244323732638478 47187 3263461 667 665 0 True 249 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 293 643 0.000896759219383213 0.000890828582098414 0.000762951094834821 0.000747692072938125 0.000670259539719498 0.000675134757208049 39199 38823 667 665 0 False 293 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 338 642 0.000921832514733707 0.000904137202700044 0.000793469138628214 0.000793469138628214 0.000698648819402761 0.000667197129109173 40295 39403 667 665 0 False 338 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 383 642 0.000856747181456193 0.000923641215650708 0.000747692072938125 0.00080872816052491 0.000624926114263892 0.000650236348666901 37450 40253 667 665 0 False 383 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 427 642 0.0008740651418397 0.000819512732391748 0.000625619897764553 0.000625619897764553 0.00081269645147506 0.000737283865223165 38207 35715 667 665 0 False 427 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 472 642 0.000962141954886599 0.000832752515300611 0.00064087891966125 0.000564583810177768 0.000954710160420688 0.000828238746993027 42057 36292 667 665 0 False 472 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 517 642 0.000940889134283854 0.000930754443903304 0.000625619897764553 0.000610360875867857 0.000939356873464161 0.000928742144216524 41128 40563 667 665 0 False 517 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 561 642 0.00095919080972217 0.00104603463339053 0.000732433051041428 0.000762951094834821 0.000838807064049766 0.000893474573829768 41928 45587 667 665 0 False 561 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 606 642 0.00107327887898578 0.000914554640205458 0.000915541313801785 0.000762951094834821 0.000757704518378977 0.0006546948237743 46915 39857 667 665 0 False 606 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 647 648 0.00112353985515825 0.0788749626412105 0.000976577401388571 0.0758220798046845 0.000787158400937902 0.0219382898319011 49112 3437432 667 665 0 True 650 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E5_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E5_1.csv new file mode 100755 index 0000000..fb3b256 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E5_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 262 281 0.0101135744784966 0.0425991506576007 0.0101167315175097 0.0432898451209277 0.00161166316184636 0.00855169132024016 442083 1856504 667 665 0 True 263 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 307 280 0.00978080426483943 0.00981083975675054 0.0097962920576791 0.00976577401388571 0.00127613788681233 0.00127307915964141 427537 427564 667 665 0 False 307 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 350 282 0.0099713704603409 0.0657010115125305 0.00994888227664607 0.066300450141146 0.00147060514750923 0.0111778655914131 435867 2863301 667 665 0 True 352 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 394 282 0.0102499677147007 0.107256766314963 0.0101930266269932 0.105073624780652 0.00158183562665127 0.0281247449509597 448045 4674333 667 665 0 True 397 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 438 282 0.0101018614062161 0.0748581914846627 0.010101472495613 0.075547417410544 0.0017894510417242 0.0136158823299119 441571 3262378 667 665 0 True 441 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 482 282 0.00999333247086688 0.0649351692345994 0.0100556954299229 0.0679789425497826 0.00174044885075823 0.0183458909172413 436827 2829925 667 665 0 True 486 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 526 280 0.00972928504848057 0.0770979405483266 0.00976577401388571 0.0759288929579614 0.00159717737631565 0.0223601471713975 425285 3359988 667 665 0 True 531 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 571 280 0.0102353721285386 0.0686037822870291 0.0100709544518196 0.0665598535133898 0.00241788888244023 0.0182688009418653 447407 2989806 667 665 0 True 575 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 620 280 0.0100683007088811 0.010163059284742 0.0100709544518196 0.0100862134737163 0.00204608210822285 0.00193839764691072 440104 442914 667 665 0 False 620 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 659 279 0.0100022316605488 0.041788793338347 0.00997940032043946 0.0424505989166094 0.00187265412768175 0.00938743149974094 437216 1821188 667 665 0 True 665 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 263 324 0.0099115239816576 0.0101366944484122 0.00990310521095598 0.0100862134737163 0.00154656612668679 0.00161220811131073 433251 441765 667 665 0 False 263 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 307 324 0.0100219517158335 0.00978580578248092 0.00988784618905928 0.0097962920576791 0.00171375853328131 0.00137701540913955 438078 426473 667 665 0 False 307 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 351 325 0.00992227621597762 0.108898132261301 0.00991836423285267 0.104600595101854 0.0013298206677096 0.0260630087090391 433721 4745865 667 665 0 True 352 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 394 325 0.0100386291175767 0.0509362901416967 0.00997940032043946 0.0505989166094453 0.00151410019799552 0.00798625981651655 438807 2219843 667 665 0 True 397 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 439 326 0.0102380487485715 0.0933993027889018 0.0103303578240635 0.0893415732051576 0.00177674252028529 0.0220547677747982 447524 4070414 667 665 0 True 441 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 483 325 0.0100208536153072 0.0427083272383293 0.0100862134737163 0.0438696879530022 0.00169834827475037 0.00693498616276056 438030 1861262 667 665 0 True 486 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 528 324 0.00991472677485931 0.0434442021740091 0.00994888227664607 0.0452429999237049 0.00162088286334616 0.00893510794403432 433391 1893332 667 665 0 True 531 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 571 324 0.00996091562824676 0.0492566045463854 0.00997940032043946 0.0506294346532387 0.0018931057882273 0.00792809417666608 435410 2146641 667 665 0 True 575 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 620 323 0.0099419733941681 0.00991065441126276 0.0100404364080262 0.00988784618905928 0.00211385221457388 0.00210981317674764 434582 431914 667 665 0 False 620 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 665 323 0.0101157935566435 0.00989808005938398 0.0100404364080262 0.00994888227664607 0.00219846863033067 0.0019750648918896 442180 431366 667 665 0 False 665 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 263 371 0.0100013165767768 0.0530306539982366 0.00997940032043946 0.0522468909742886 0.00169425784977518 0.00952727602524895 437176 2311117 667 665 0 True 263 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 306 371 0.0101868269344385 0.0616057653862282 0.01025406271458 0.0637216754406043 0.00144404037552187 0.0172899044899081 445285 2684827 667 665 0 True 307 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 352 367 0.0103276812040306 0.0306767146752209 0.0102998397802701 0.0334477759975586 0.00167035887027939 0.0159241865044934 451442 1336915 667 665 0 False 352 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 394 370 0.010148393416018 0.0351509352461034 0.0101625085831998 0.0361638818951705 0.00151606953375451 0.00594904772612204 443605 1531905 667 665 0 True 397 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 439 370 0.0102802798646454 0.0750502257015852 0.0102845807583734 0.0741588464179446 0.00171922955387833 0.0163508492071989 449370 3270747 667 665 0 True 441 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 483 369 0.0101816338340329 0.0339761282354433 0.0100404364080262 0.0348973830777447 0.00178888850642263 0.00482835451878468 445058 1480706 667 665 0 True 486 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 527 368 0.00992287102042936 0.0293516120353527 0.00990310521095598 0.0297398336766613 0.0016856746767998 0.00360283609445017 433747 1279166 667 665 0 True 531 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 571 368 0.0098995592613398 0.0593945839650626 0.00994888227664607 0.0585488670176242 0.00183486059795941 0.0142381939928765 432728 2588462 667 665 0 True 576 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 616 368 0.00996716107499009 0.0594090857723388 0.00987258716716258 0.0585641260395209 0.00210593332472247 0.0127370489214011 435683 2589094 667 665 0 True 620 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 660 367 0.0101989060402278 0.0645312755452375 0.0101777676050965 0.0637064164187076 0.00197078301349428 0.0171956489570723 445813 2812323 667 665 0 True 665 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 263 415 0.0100698563512933 0.0441479757989618 0.00997940032043946 0.0463721675440604 0.00159258596900313 0.00933991399407672 440172 1924003 667 665 0 True 263 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 307 414 0.0100406423018749 0.032703847051825 0.0100556954299229 0.0324101625085832 0.00145266551681233 0.0045789440864298 438895 1425259 667 665 0 True 307 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 351 414 0.0102799367082309 0.0838064720051445 0.0102082856488899 0.080872816052491 0.00144104359897819 0.0161990493689044 449355 3652351 667 665 0 True 352 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 395 414 0.0101446873267418 0.0676446437678082 0.0101319905394064 0.0668650339513237 0.0015662954934371 0.0154435119690183 443443 2948006 667 665 0 True 397 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 439 413 0.0102933884396781 0.0458918410698295 0.0102845807583734 0.0465094987411307 0.00176198677067269 0.00884753135655586 449943 2000002 667 665 0 True 442 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 484 412 0.0102066384981005 0.0558965048235145 0.0101472495613031 0.0554512855725948 0.00173218230326747 0.0103076644876524 446151 2436013 667 665 0 True 486 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 527 411 0.0102616121556983 0.0429296174746778 0.0102693217364767 0.0437170977340352 0.00175948969525402 0.0053836073376775 448554 1870906 667 665 0 True 531 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 571 411 0.00998155076730346 0.0580733132900918 0.0100099183642329 0.0581673914702068 0.00191477828135582 0.00940889354204566 436312 2530880 667 665 0 True 576 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 616 411 0.0100869912949225 0.04322662917307 0.0101167315175097 0.0440375371938659 0.00192667887483865 0.00618743206488787 440921 1883850 667 665 0 True 620 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 660 411 0.0103240666231316 0.0902872424824937 0.0102998397802701 0.088715953307393 0.00181335164092958 0.0146485294466134 451284 3934788 667 665 0 True 665 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 263 458 0.0108350951555579 0.0423496140213202 0.00997940032043946 0.0429083695735103 0.00567238465625169 0.00559145746783158 473622 1845629 667 665 0 True 263 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 307 458 0.0100788012951638 0.0532320960331706 0.010101472495613 0.0523537041275654 0.0015792413343228 0.00724898434259872 440563 2319896 667 665 0 True 308 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 351 457 0.0103252791091293 0.0344456471919097 0.0103456168459602 0.0349279011215381 0.00142868820977944 0.0033316845038073 451337 1501168 667 665 0 True 352 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 395 457 0.0103772787444685 0.0562961305759248 0.0103150988021668 0.05468833447776 0.00161269392297573 0.0122058122938446 453610 2453429 667 665 0 True 397 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 440 458 0.0105576188788188 0.0938586567127363 0.0105897611963073 0.0935072861829557 0.00189930337464405 0.0120183919719915 461493 4090433 667 665 0 True 442 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 484 456 0.0102774659820467 0.0612784192112233 0.0102693217364767 0.0612802319371328 0.00186126573476374 0.012728413872192 449247 2670561 667 665 0 True 486 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 528 456 0.009983358057753 0.0528477063567594 0.00990310521095598 0.0519111924925612 0.00177404651072568 0.0078525097362053 436391 2303144 667 665 0 True 531 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 572 455 0.0100559699550545 0.0326291122633776 0.0101319905394064 0.0327306019684138 0.00196640678035937 0.00383131625166472 439565 1422002 667 665 0 True 576 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 616 455 0.010064068446436 0.0389468062465617 0.00999465934233616 0.0394598306248569 0.00187893293955452 0.0045137143190478 439919 1697332 667 665 0 True 620 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 661 455 0.0102058149227057 0.0697609209565456 0.0101777676050965 0.0683146410315099 0.00199458866744856 0.0107009584479158 446115 3040235 667 665 0 True 665 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 265 502 0.00993641426025371 0.0549017313253378 0.00997940032043946 0.0554665445944915 0.00151838498330004 0.012454101096367 434339 2392660 667 665 0 True 263 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 309 502 0.0100954329427184 0.0569887754405469 0.0101167315175097 0.055893797207599 0.0015753371670569 0.00793996492886889 441290 2483615 667 665 0 True 308 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 352 501 0.0101724829963137 0.0699264526617528 0.0101625085831998 0.0676432440680552 0.00159037129725742 0.0157649278946253 444658 3047449 667 665 0 True 352 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 397 502 0.0105330717566371 0.0836446804812443 0.0105287251087205 0.0795910582131685 0.00170966639637662 0.0169182956229752 460420 3645300 667 665 0 True 397 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 440 500 0.0105032857798613 0.0951088868887715 0.0105134660868238 0.091630426489662 0.0018612244843538 0.0257819083852632 459118 4144919 667 665 0 True 442 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 485 500 0.0104437824575924 0.046612158686944 0.010452429999237 0.0464179446097505 0.00186893649498851 0.00836848055924326 456517 2031394 667 665 0 True 486 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 530 500 0.0100069900961627 0.0388840492166557 0.0100556954299229 0.0397650110627909 0.00180110399881867 0.00485364856538229 437424 1694597 667 665 0 True 531 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 574 499 0.0101545931085727 0.103557681110536 0.0101625085831998 0.104280155642023 0.00179975347750822 0.0159435635327528 443876 4513124 667 665 0 True 576 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 617 499 0.0102232930227493 0.0623451739901367 0.0102082856488899 0.0649881742580301 0.00183636978526644 0.0132961268101391 446879 2717051 667 665 0 True 620 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 661 499 0.0105832412244324 0.0742822265092807 0.0104219119554437 0.0724650949874113 0.00262159984039725 0.00869133518714824 462613 3237277 667 665 0 True 665 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 265 546 0.00978595161105645 0.0537017756109202 0.0098115510795758 0.0565804531929503 0.00142628699158778 0.00984710514341701 427762 2340365 667 665 0 True 263 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 308 545 0.0100617121057233 0.108224119465521 0.00996414129854276 0.104081788357366 0.00163687008507484 0.0228166061130252 439816 4716491 667 665 0 True 308 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 352 545 0.0102718839710381 0.0566003243402624 0.0102388036926833 0.0588998245212482 0.00150382452322465 0.00948442817831304 449003 2466686 667 665 0 True 352 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 397 545 0.0105217475949597 0.0588751117895448 0.0105897611963073 0.0582284275577935 0.00170722976158774 0.00742838671733773 459925 2565823 667 665 0 True 397 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 441 543 0.010504566897142 0.0557076830322545 0.0103913939116503 0.055390249485008 0.00195707251980858 0.00612929962042229 459174 2427784 667 665 0 True 442 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 485 542 0.0104541229042151 0.0633089934724658 0.0104219119554437 0.061875333791104 0.00186789826467386 0.0111235101481478 456969 2759055 667 665 0 True 486 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 530 542 0.0104603225967698 0.0735179674982834 0.0102388036926833 0.0703898680094606 0.00254253201820045 0.0164267009169082 457240 3203970 667 665 0 True 531 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 574 541 0.00995981752772046 0.0586887452093268 0.010101472495613 0.0587930113679713 0.00172702350374404 0.0120761468884055 435362 2557701 667 665 0 True 576 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 618 541 0.0102145997269161 0.0477992646987118 0.0102235446707866 0.0471503776607919 0.00182865774604713 0.00582823349163881 446499 2083129 667 665 0 True 621 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 662 540 0.0102764822669919 0.064775626408663 0.0102388036926833 0.0648050659952697 0.00193220156728446 0.0112471226243781 449204 2822972 667 665 0 True 665 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 266 587 0.00960778480066444 0.0480037585380251 0.00961318379491875 0.0463874265659571 0.00146013200866427 0.0148945631370169 419974 2092041 667 665 0 True 263 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 309 586 0.00991189001516637 0.0571420081446464 0.00997940032043946 0.0567940794995041 0.00152032909524876 0.0119519759584528 433267 2490293 667 665 0 True 308 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 354 586 0.0101378470755467 0.046596693151969 0.0101319905394064 0.047348744945449 0.00146563130130331 0.00732854043953414 443144 2030720 667 665 0 True 352 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 398 585 0.0103797952248412 0.0485401188941684 0.0103761348897536 0.0480354009308003 0.00151193605067228 0.00489855546692728 453720 2115416 667 665 0 True 397 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 442 585 0.0104723788254648 0.0831189670215823 0.0105439841306172 0.0786907759212634 0.00187177847043063 0.0166194654295649 457767 3622389 667 665 0 True 442 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 486 583 0.0101408439748997 0.0609581633185734 0.0101167315175097 0.0594338902876326 0.00197229249968461 0.00878300560119069 443275 2656604 667 665 0 True 487 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 530 582 0.00991234755705233 0.0545050426478189 0.00990310521095598 0.0536202029449912 0.00192875167760451 0.00644621036154058 433287 2375372 667 665 0 True 531 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 576 585 0.0101699893930352 0.0354593051638022 0.010101472495613 0.0385900663767453 0.00186181205562212 0.00992833845497899 444549 1545344 667 665 0 False 576 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 618 582 0.010145167745722 0.0494331043906401 0.0102235446707866 0.049210345616846 0.00156294699605539 0.00712864161414531 443464 2154333 667 665 0 True 621 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 662 581 0.0101608614324104 0.0582926990169404 0.0101930266269932 0.0570077058060578 0.00176432692264216 0.00884526963601864 444150 2540441 667 665 0 True 665 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 263 629 0.00955816438313231 0.00951224479142466 0.00962844281681544 0.00958266575112535 0.00135472066725681 0.00145882166297239 417805 414551 667 665 0 False 263 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 308 629 0.00957086117046764 0.00931867319936371 0.00953688868543526 0.00935378042267491 0.00133873735997324 0.00141390945979897 418360 406115 667 665 0 False 308 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 353 628 0.010151230175711 0.0713515994151091 0.0100862134737163 0.0686655985351339 0.00158869055410629 0.01200006101919 443729 3109558 667 665 0 True 353 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 397 627 0.0100899881942755 0.073494149656586 0.0100709544518196 0.0700541695277333 0.00145346878943645 0.0148567794065926 441052 3202932 667 665 0 True 397 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 442 628 0.00985307300572648 0.00990627174482326 0.00991836423285267 0.00984206912336919 0.00168968732674566 0.00177488658703731 430696 431723 667 665 0 False 442 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 487 628 0.00984170308986042 0.00979016550302284 0.00987258716716258 0.0098115510795758 0.001887239937787 0.0019600852363946 430199 426663 667 665 0 False 487 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 531 628 0.00969002795466538 0.00951564078426783 0.00971999694819562 0.00956740672922866 0.00184891835871581 0.00193593223997518 423569 414699 667 665 0 False 531 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 576 628 0.00987617887096735 0.00997313609039766 0.00984206912336919 0.0100404364080262 0.00167956562985036 0.00164394870268622 431706 434637 667 665 0 False 576 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 621 628 0.0100103759061188 0.0100061781829258 0.0100099183642329 0.0100404364080262 0.00166857766297662 0.00146732177009074 437572 436077 667 665 0 False 621 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 665 628 0.00992312266846664 0.00970051588114255 0.00996414129854276 0.00971999694819562 0.0015304722674536 0.00152404164474876 433758 422756 667 665 0 False 665 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 265 679 0.00957413259495224 0.0409112963227478 0.00962844281681544 0.0405279621576257 0.00146917999530061 0.00783553318959081 418503 1782946 667 665 0 True 263 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 308 672 0.00924662411298356 0.00925878440665638 0.00920119020370794 0.00930800335698482 0.00141280305907167 0.00130701367890043 404187 403505 667 665 0 False 308 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 353 672 0.00935535894218146 0.00934267460824182 0.00935378042267491 0.00933852140077821 0.00130777652652178 0.00130815726630964 408940 407161 667 665 0 False 353 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 397 672 0.00949390262524952 0.00940797863278017 0.00949111161974517 0.00941481651026169 0.00141132336123201 0.00133323375657129 414996 410007 667 665 0 False 397 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 442 672 0.00940921162215871 0.00924318119629584 0.0093690394445716 0.00921644922560464 0.00156565681665235 0.00151344704133432 411294 402825 667 665 0 False 442 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 487 672 0.00956683480187121 0.0094411354547963 0.00961318379491875 0.00949111161974517 0.0017110867237592 0.00165704581421612 418184 411452 667 665 0 False 487 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 531 672 0.00961746181155245 0.00962855754630339 0.00959792477302205 0.00967421988250553 0.0018636830636442 0.00170011574179454 420397 419620 667 665 0 False 531 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 576 672 0.00975456423767974 0.00982433194453288 0.00975051499198901 0.00988784618905928 0.00156224501504289 0.0014342192210708 426390 428152 667 665 0 False 576 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 621 672 0.00990299082548449 0.00974858753659154 0.00991836423285267 0.00971999694819562 0.00135191262807643 0.00145787546904306 432878 424851 667 665 0 False 621 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 663 676 0.0099963522473142 0.0411992902833876 0.00996414129854276 0.0416876478217746 0.00153078273803293 0.00940213365021077 436959 1795497 667 665 0 True 665 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E5_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E5_2.csv new file mode 100755 index 0000000..ba2209a --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E5_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 262 281 0.00881877669542432 0.753966697471534 0.00836194399938964 0.771313038834211 0.00268742704154998 0.189284298375278 385485 32858453 667 665 13 True 263 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 307 280 0.00691327488006969 0.00671263877248626 0.00677500572213321 0.00668345159075303 0.00152855688102671 0.00128413339856631 302192 292542 667 665 0 False 307 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 350 282 0.0063239609309559 0.00641406675305797 0.00628671702143893 0.00643930724040589 0.00128144520351186 0.00144022268222744 276432 279530 667 665 0 True 352 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 394 282 0.00639236344290661 0.00657597300644608 0.00630197604333562 0.00660715648126955 0.00128909415854034 0.00131471678217861 279422 286586 667 665 0 True 397 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 438 282 0.00656375863338644 0.00659722090761351 0.00651560234988937 0.00657663843747616 0.00156456512329796 0.00165525518955194 286914 287512 667 665 0 True 441 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 482 282 0.00667958536181669 0.00670235901036638 0.00668345159075303 0.00679026474402991 0.0016782838168784 0.00170548718462627 291977 292094 667 665 0 True 486 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 526 280 0.00687463546780055 0.00698122050376571 0.0068207827878233 0.00694285496299687 0.00151448293138234 0.00163576613212858 300503 304247 667 665 0 True 531 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 571 280 0.00801926800390146 0.00797379119577383 0.00778210116731518 0.00804150453955901 0.00224550816207241 0.00179561602097943 350537 347504 667 665 0 True 575 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 620 280 0.00982644406796373 0.00866723916681151 0.00881971465629053 0.00872816052491035 0.00545157774572046 0.0019776220482945 429532 377725 667 665 0 False 620 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 659 279 0.0101881995600964 0.746609646111158 0.0101625085831998 0.759395742732891 0.00217190324997102 0.201767907632248 445345 32537827 667 665 15 True 665 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 263 324 0.00689202205946695 0.00677638247598855 0.00683604180972 0.00683604180972 0.00154039733219969 0.00145126977503471 301263 295320 667 665 0 False 263 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 307 324 0.00639945534213896 0.00629851121279968 0.00634775310902571 0.00631723506523232 0.00129386830426236 0.00134114063667103 279732 274494 667 665 0 False 307 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 351 325 0.00636099894662419 0.00642728359006925 0.00634775310902571 0.00642404821850919 0.00127679156753319 0.00120237998650215 278051 280106 667 665 0 True 352 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 394 325 0.00650240226647949 0.00663315418323791 0.00645456626230259 0.00666819256885634 0.00139043194810201 0.00124630265307573 284232 289078 667 665 0 True 397 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 439 326 0.00682906429595914 0.00697848994195262 0.00685130083161669 0.00706492713817044 0.0016180268023952 0.00165116693689166 298511 304128 667 665 0 True 441 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 483 325 0.00689813024364449 0.00707724908517575 0.00688181887541009 0.00708018616006714 0.00158580620823758 0.00158485825432655 301530 308432 667 665 0 True 486 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 528 324 0.00696676152653817 0.00703626771208176 0.00692759594110018 0.00700389105058366 0.00157792459629807 0.00167305388237504 304530 306646 667 665 0 True 531 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 571 324 0.00748270863423861 0.00708601441805475 0.00741588464179446 0.00711070420386053 0.00181427576566367 0.00165700549185876 327083 308814 667 665 0 True 575 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 620 323 0.00809210867214596 0.00801341876091006 0.00814831769283589 0.00799572747386892 0.00196889731009249 0.00193723024494054 353721 349231 667 665 0 False 620 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 665 323 0.00821479852886558 0.00811311868593434 0.00817883573662928 0.00813305867093919 0.00220945181540229 0.00183925639653699 359084 353576 667 665 0 False 665 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 263 371 0.00628520713321526 0.00632753777324979 0.00627145799954223 0.00636301213092241 0.00146854011589285 0.0014866033162543 274738 275759 667 665 0 True 263 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 306 371 0.00645136346910088 0.00647574532577725 0.00645456626230259 0.00648508430609598 0.0012919202758748 0.00141361475141341 282001 282218 667 665 0 True 307 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 352 367 0.00673934033212279 0.0068686249842964 0.00686655985351339 0.00672922865644312 0.00131790316780198 0.00168959859140562 294589 299340 667 665 0 False 352 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 394 370 0.00685891890401789 0.007039939055696 0.00683604180972 0.00708018616006714 0.00141959590100641 0.00130976673304998 299816 306806 667 665 0 True 397 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 439 370 0.00707636568531939 0.00717933538354928 0.00712596322575723 0.00727855344472419 0.00154042106033631 0.00171334237677383 309321 312881 667 665 0 True 441 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 483 369 0.00711473057245696 0.00724172527909382 0.00712596322575723 0.00721751735713741 0.00162542205927099 0.00170014069358933 310998 315600 667 665 0 True 486 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 527 368 0.00702413727903729 0.00713470561273864 0.00708018616006714 0.00711070420386053 0.00160045723205651 0.00163780351752785 307038 310936 667 665 0 True 531 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 571 368 0.00713984962199605 0.00734954805186461 0.00718699931334401 0.00738536659800107 0.00184282009680657 0.00182424064449249 312096 320299 667 665 0 True 576 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 616 368 0.00743894475284674 0.00752545130278202 0.00746166170748455 0.00758373388265812 0.00214367241716641 0.00194703374587478 325170 327965 667 665 0 True 620 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 660 367 0.00722563872561316 0.00715494389441216 0.00717174029144732 0.00708018616006714 0.00196544404015707 0.00204794160044385 315846 311818 667 665 0 True 665 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 263 415 0.00634702104200818 0.00643194160727982 0.0064087891966125 0.00646982528419928 0.00148732609283017 0.00154951688614576 277440 280309 667 665 0 True 263 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 307 414 0.00648677721107402 0.00642058338797325 0.00646982528419928 0.00646982528419928 0.00128457187246318 0.00134393405122558 283549 279814 667 665 0 True 307 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 351 414 0.00678541480003875 0.00702878734946774 0.00677500572213321 0.00704966811627375 0.00131144867099003 0.00130274523935715 296603 306320 667 665 0 True 352 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 395 414 0.00681787739684747 0.00682943339121436 0.00679026474402991 0.00677500572213321 0.00145510687443826 0.00152487883489348 298022 297632 667 665 0 True 397 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 439 413 0.00704326252987034 0.00713369599324473 0.00715648126955062 0.00711070420386053 0.00161722261883181 0.00154967778177355 307874 310892 667 665 0 True 442 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 484 412 0.00721884422860669 0.00725622708637008 0.00720225833524071 0.0072632944228275 0.00163604302315565 0.00156124033322257 315549 316232 667 665 0 True 486 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 527 411 0.00703292208324769 0.00719592526750614 0.00701915007248035 0.0072327763790341 0.00153550604497504 0.00157741422756684 307422 313604 667 665 0 True 531 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 571 411 0.00696488560480575 0.00704218775365973 0.00698863202868696 0.00700389105058366 0.00189596946185459 0.00172657523265903 304448 306904 667 665 0 True 576 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 616 411 0.00679731088907366 0.00692397048928111 0.0068055237659266 0.00689707789730678 0.00206151410251958 0.00196835276452881 297123 301752 667 665 0 True 620 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 660 411 0.00670692348950267 0.00662039626417841 0.00671396963454643 0.00660715648126955 0.00182435869311814 0.00182693374091719 293172 288522 667 665 0 True 665 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 263 458 0.00654024098044821 0.00641404380716038 0.00634775310902571 0.00651560234988937 0.00233677883477214 0.0014728358258839 285886 279529 667 665 0 True 263 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 307 458 0.0064098415429502 0.00639906013603475 0.00648508430609598 0.0064087891966125 0.00147604901921108 0.00156583195099451 280186 278876 667 665 0 True 308 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 351 457 0.00670200491422863 0.0066958423754511 0.00669871061264973 0.00672922865644312 0.00144018528318947 0.00140579792988323 292957 291810 667 665 0 True 352 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 395 457 0.00683874130684715 0.00693762329834658 0.0068207827878233 0.00694285496299687 0.0015552947135624 0.00144830616796215 298934 302347 667 665 0 True 397 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 440 458 0.00704211867515544 0.0069018506440053 0.00706492713817044 0.00686655985351339 0.00174962319616722 0.00194700502666265 307824 300788 667 665 0 True 442 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 484 456 0.00701370532403745 0.00731200856340898 0.00701915007248035 0.00738536659800107 0.00173119966429873 0.00189049324040678 306582 318663 667 665 0 True 486 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 528 456 0.0068696940154322 0.00729869994280735 0.00691233691920348 0.00695811398489357 0.00174138805829212 0.00305929681414335 300287 318083 667 665 0 True 531 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 572 455 0.00641990746444127 0.00631308185776871 0.00643930724040589 0.0063782711528191 0.00173370232686406 0.00191117808127759 280626 275129 667 665 0 True 576 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 616 455 0.00633212805362025 0.00624947582965195 0.00630197604333562 0.00619516289005875 0.00169176476200543 0.00183886976856538 276789 272357 667 665 0 True 620 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 661 455 0.00662124877135705 0.00687202097713958 0.00665293354695964 0.00689707789730678 0.00179297326751133 0.00192840744387093 289427 299488 667 665 0 True 665 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 265 502 0.00644541542458343 0.00632820320427987 0.00650034332799268 0.00624093995574884 0.00150482338453992 0.00159371715396787 281741 275788 667 665 0 True 263 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 309 502 0.00637978104104277 0.00664389286330957 0.00645456626230259 0.00668345159075303 0.00148581018613153 0.00153976514634574 278872 289546 667 665 0 True 308 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 352 501 0.00649762095377123 0.00652087990633485 0.00645456626230259 0.00656137941557946 0.00148163504028519 0.00152907419778926 284023 284185 667 665 0 True 352 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 397 502 0.00661269273808964 0.00684519722285801 0.00660715648126955 0.00683604180972 0.00158891967025722 0.00146195357123017 289053 298319 667 665 0 True 397 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 440 500 0.00676338415822988 0.00699638774207205 0.00668345159075303 0.00706492713817044 0.00177891003803151 0.00195384863200896 295640 304908 667 665 0 True 442 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 485 500 0.00682501505026841 0.00662273674573249 0.00683604180972 0.00651560234988937 0.00179169177677355 0.00172738412593666 298334 288624 667 665 0 True 486 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 530 500 0.00656707581205964 0.00635679379267578 0.00665293354695964 0.00628671702143893 0.00165245895658349 0.00166539642699496 287059 277034 667 665 0 True 531 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 574 499 0.00623458012353402 0.00634210841821881 0.00621042191195544 0.00628671702143893 0.0017322258229566 0.00169346592627394 272525 276394 667 665 0 True 576 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 617 499 0.00665531276476662 0.00651661196938329 0.00669871061264973 0.00651560234988937 0.00178835722029596 0.00170601452272799 290916 283999 667 665 0 True 620 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 661 499 0.00731783341563368 0.00678907155735528 0.00706492713817044 0.00683604180972 0.00344274856521142 0.00188836777802421 319876 295873 667 665 0 True 665 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 265 546 0.00654113318712582 0.00651691026605195 0.00651560234988937 0.00648508430609598 0.00139898498208334 0.0014847596947572 285925 284012 667 665 0 True 263 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 308 545 0.00657265782306832 0.00671640189969086 0.00656137941557946 0.00668345159075303 0.00140827116802124 0.00142803001477738 287303 292706 667 665 0 True 308 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 352 545 0.00653136466786062 0.00646870093521742 0.00657663843747616 0.00643930724040589 0.00155591991559231 0.00128027169383488 285498 281911 667 665 0 True 352 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 397 545 0.00661010762643398 0.00674914569555039 0.00659189745937285 0.00669871061264973 0.00153922257995393 0.00145686469779052 288940 294133 667 665 0 True 397 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 441 543 0.00655838251622644 0.00667971140944602 0.00653086137178607 0.00679026474402991 0.00184530056838334 0.00199187502557964 286679 291107 667 665 0 True 442 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 485 542 0.00660377067131346 0.00675173858197795 0.00659189745937285 0.00679026474402991 0.00184314726307985 0.00201119525221381 288663 294246 667 665 0 True 486 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 530 542 0.00674869706369063 0.00648150474607209 0.00662241550316625 0.00653086137178607 0.00211017861352685 0.00182064475279029 294998 282469 667 665 0 True 531 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 574 541 0.00640698190616296 0.00642363519235259 0.00645456626230259 0.00650034332799268 0.00160387871594413 0.00159117359142897 280061 279947 667 665 0 True 576 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 618 541 0.00676475678388775 0.00677652015137409 0.00674448767833982 0.00683604180972 0.00174743314445009 0.00169579759393662 295700 295326 667 665 0 True 621 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 662 540 0.00689023764611171 0.00715751383494213 0.00692759594110018 0.00714122224765393 0.00184975266539755 0.00197950979500007 301185 311930 667 665 0 True 665 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 266 587 0.00669527904850504 0.00675116493453822 0.00668345159075303 0.00672922865644312 0.00127307493244651 0.00133015509601802 292663 294221 667 665 0 True 263 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 309 586 0.0065598924044501 0.00668072102893994 0.00659189745937285 0.00660715648126955 0.00143244808208565 0.00137245910072825 286745 291151 667 665 0 True 308 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 354 586 0.00663257293303451 0.0067188341648353 0.00666819256885634 0.00674448767833982 0.00142055406771659 0.00143680975123886 289922 292812 667 665 0 True 352 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 398 585 0.00669585097586249 0.00671403847223919 0.00677500572213321 0.00672922865644312 0.00152308818010393 0.00129626104426199 292688 292603 667 665 0 True 397 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 442 585 0.00679177463225357 0.00662009796750976 0.00686655985351339 0.00671396963454643 0.00181945574597328 0.00197166471374798 296881 288509 667 665 0 True 442 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 486 583 0.00665167530677326 0.00686825784993498 0.0068207827878233 0.00686655985351339 0.00200066920201081 0.00197645592139775 290757 299324 667 665 0 True 487 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 530 582 0.00641007031389318 0.0067796178475486 0.00642404821850919 0.00679026474402991 0.00196435438995618 0.00184836558644764 280196 295461 667 665 0 True 531 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 576 585 0.0068914043779209 0.00670949518451657 0.00683604180972 0.00674448767833982 0.00162803387784853 0.00183876712881559 301236 292405 667 665 0 False 576 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 618 582 0.00715847157675454 0.00722144110562513 0.00715648126955062 0.00721751735713741 0.00150647385840732 0.0015835177513441 312910 314716 667 665 0 True 621 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 662 581 0.00683315929583846 0.00695728793258036 0.00677500572213321 0.00695811398489357 0.00163157635031662 0.00163156131950474 298690 303204 667 665 0 True 665 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 263 629 0.00681122016240678 0.00684581676209292 0.0068055237659266 0.00695811398489357 0.00140418258146431 0.00137978823544976 297731 298346 667 665 0 False 263 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 308 629 0.00650736659594213 0.006513445435516 0.00646982528419928 0.00654612039368277 0.00128334785931227 0.00130771837290169 284449 283861 667 665 0 False 308 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 353 628 0.00655710139894576 0.0066248018765155 0.00643930724040589 0.00660715648126955 0.00136054062007543 0.00129623818592229 286623 288714 667 665 0 True 353 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 397 627 0.00649455542313531 0.00661470568157634 0.00645456626230259 0.00660715648126955 0.00140884197246819 0.00122801885586972 283889 288274 667 665 0 True 397 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 442 628 0.00653749572913246 0.00633579829638183 0.00663767452506294 0.00631723506523232 0.00168440921815833 0.00179289372759247 285766 276119 667 665 0 False 442 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 487 628 0.0065109354226526 0.00664978995898994 0.00659189745937285 0.00660715648126955 0.00180580237374321 0.0017891367281244 284605 289803 667 665 0 False 487 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 531 628 0.00675693281763787 0.00688473300440389 0.00674448767833982 0.00692759594110018 0.00180398575523256 0.00183357560334989 295358 300042 667 665 0 False 531 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 576 628 0.0071241559353077 0.00710932745000519 0.00708018616006714 0.00717174029144732 0.00168392044019576 0.00153566798676465 311410 309830 667 665 0 False 576 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 621 628 0.00727667752299177 0.00718509480384413 0.0072632944228275 0.00717174029144732 0.00145966805891856 0.0013349029894695 318077 313132 667 665 0 False 621 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 665 628 0.00719006484397993 0.00702256901122112 0.0072327763790341 0.00701915007248035 0.0015820159261805 0.00132618867168855 314291 306049 667 665 0 False 665 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 265 679 0.00890834051960058 0.746733439228651 0.00857557030594339 0.735973144121462 0.00220399063716263 0.177858131831432 389400 32543222 667 665 13 True 263 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 308 672 0.00694727024219637 0.00672720941745529 0.00675974670023652 0.00672922865644312 0.00175556975575446 0.0012744866331293 303678 293177 667 665 0 False 308 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 353 672 0.0060826304632074 0.00615053311924811 0.00613412680247196 0.00616464484626535 0.00138731460960536 0.00122804850921169 265883 268045 667 665 0 False 353 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 397 672 0.00661340192801288 0.00597313838498742 0.0063782711528191 0.0059662775616083 0.00200646573804035 0.00120755763629052 289084 260314 667 665 0 False 397 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 442 672 0.00629778953507911 0.00598747957098055 0.00627145799954223 0.0059510185397116 0.00165374504794294 0.0014493069561856 275288 260939 667 665 0 False 442 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 487 672 0.00637760771708447 0.00652739654125013 0.00630197604333562 0.00663767452506294 0.00166544980636521 0.00153539985002141 278777 284469 667 665 0 False 487 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 531 672 0.00689641446157214 0.0070012981641561 0.00689707789730678 0.00692759594110018 0.0018273618665467 0.00181592086271146 301455 305122 667 665 0 False 531 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 576 672 0.00694992398513492 0.00695244634818908 0.00694285496299687 0.00692759594110018 0.0014936643226141 0.00135282983615268 303794 302993 667 665 0 False 576 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 621 672 0.00762580485907195 0.00735796919627978 0.00744640268558785 0.00743114366369116 0.00197598061284823 0.00147111630336124 333338 320666 667 665 0 False 621 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 663 676 0.00904709009651732 0.760382095086652 0.0089723048752575 0.76923781185626 0.00181286413436265 0.198638011336983 395465 33138041 667 665 16 True 665 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E5_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E5_3.csv new file mode 100755 index 0000000..0c8497f --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E5_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 262 281 0.00101505667399763 0.0780125410803273 0.000885023270008392 0.0773022049286641 0.000765438911298997 0.0224699525003431 44370 3399847 667 665 0 True 263 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 307 280 0.00101588024939236 0.000882223870502532 0.000915541313801785 0.000778210116731518 0.000726232594234965 0.000645067504923362 44406 38448 667 665 0 False 307 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 350 282 0.00093995117341764 0.000920750032554492 0.000823987182421607 0.00080872816052491 0.000670456815729173 0.000654265047895314 41087 40127 667 665 0 True 352 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 394 282 0.000875025979800212 0.000939680398065431 0.000778210116731518 0.000793469138628214 0.000630619957772867 0.000690964654242674 38249 40952 667 665 0 True 397 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 438 282 0.00100753010997362 0.000974787621376628 0.00080872816052491 0.000762951094834821 0.000863355006057387 0.000871617238961093 44041 42482 667 665 0 True 441 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 482 282 0.00109496636438018 0.000984470790159193 0.000885023270008392 0.000701915007248035 0.000932731472760245 0.000931875360486254 47863 42904 667 665 0 True 486 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 526 280 0.00104811407525809 0.000977242832418653 0.000854505226215 0.000778210116731518 0.000878716924656175 0.000845908020785516 45815 42589 667 665 0 True 531 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 571 280 0.00109235837563022 0.00090888700350097 0.000854505226215 0.000579842832074464 0.000981064874340839 0.000922913507316997 47749 39610 667 665 0 True 575 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 620 280 0.00119887412668122 0.00111452813769374 0.000885023270008392 0.000762951094834821 0.00118521214171183 0.0010635900474698 52405 48572 667 665 0 False 620 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 659 279 0.00128189510188829 0.0780982210619247 0.00108339055466545 0.075898374914168 0.00110367579754452 0.0249462354081688 56034 3403581 667 665 0 True 665 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 263 324 0.000987924440160327 0.000971529303918987 0.000823987182421607 0.00080872816052491 0.000787027097910444 0.000757227390069567 43184 42340 667 665 0 False 263 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 307 324 0.000925355587255583 0.000965356857467542 0.000793469138628214 0.000885023270008392 0.000664064611105156 0.000646714324999193 40449 42071 667 665 0 False 307 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 351 325 0.000958984915873489 0.000927542018240841 0.00080872816052491 0.000793469138628214 0.000718341125967343 0.000695514265731096 41919 40423 667 665 0 True 352 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 394 325 0.000934437793691847 0.000977151048828296 0.00080872816052491 0.000885023270008392 0.00072540444022573 0.000675196291240466 40846 42585 667 665 0 True 397 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 439 326 0.00098561385363624 0.000950419078137091 0.000778210116731518 0.000625619897764553 0.000858604097045266 0.000935161634103817 43083 41420 667 665 0 True 441 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 483 325 0.00100483061284647 0.000906707143230014 0.000747692072938125 0.000732433051041428 0.000883156088629145 0.000792571116066905 43923 39515 667 665 0 True 486 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 528 324 0.00103514276279118 0.00099341969021891 0.000854505226215 0.000762951094834821 0.000871154528406493 0.000897976746270758 45248 43294 667 665 0 True 531 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 571 324 0.000980329244853426 0.000973732110087533 0.000717174029144732 0.000732433051041428 0.00100199683533522 0.000862535208085921 42852 42436 667 665 0 True 575 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 620 323 0.00111788921286667 0.00107866369976211 0.000686655985351339 0.000717174029144732 0.00115457954487749 0.00112169543175356 48865 47009 667 665 0 False 620 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 665 323 0.0010643339351153 0.0010901825403518 0.000701915007248035 0.000762951094834821 0.00105431008203575 0.00104481213063393 46524 47511 667 665 0 False 665 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 263 371 0.000857913913265386 0.000923687107445886 0.000717174029144732 0.000732433051041428 0.000711970990416584 0.000800165680900444 37501 40255 667 665 0 True 263 368 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 306 371 0.000893647934558699 0.000914325181229567 0.000778210116731518 0.000793469138628214 0.000672083422682016 0.000666283705615699 39063 39847 667 665 0 True 307 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 352 367 0.000895729750139808 0.00087178348709953 0.000778210116731518 0.000701915007248035 0.000687287770562786 0.00074829014916254 39154 37993 667 665 0 False 352 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 394 370 0.000951549860226673 0.000853289093642782 0.000778210116731518 0.000656137941557946 0.000716636615979725 0.00070076247025574 41594 37187 667 665 0 True 397 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 439 370 0.00105268949411767 0.000992180611749103 0.000793469138628214 0.000671396963454643 0.000885494078452815 0.000914573376639719 46015 43240 667 665 0 True 441 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 483 369 0.00105431376781282 0.000935297731625929 0.000762951094834821 0.000579842832074464 0.000942906853360091 0.00092478510447887 46086 40761 667 665 0 True 486 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 527 368 0.00094875885472233 0.000972263572641836 0.000656137941557946 0.000656137941557946 0.000893815114152789 0.000939823586657564 41472 42372 667 665 0 True 531 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 571 368 0.00102015826602606 0.000983254657586975 0.000778210116731518 0.000671396963454643 0.000941374962992814 0.000966857271132566 44593 42851 667 665 0 True 576 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 616 368 0.00108860653216537 0.00108430839056901 0.000686655985351339 0.000717174029144732 0.00113593689008084 0.00111045043773676 47585 47255 667 665 0 True 620 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 660 367 0.00102681550046675 0.000930318471849112 0.000671396963454643 0.000488288700694286 0.00101233936337112 0.00100764119009706 44884 40544 667 665 0 True 665 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 263 415 0.000920528520358727 0.000949202945564873 0.000793469138628214 0.000793469138628214 0.000784317604266393 0.000812122609398739 40238 41367 667 665 0 True 263 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 307 414 0.000948804608910926 0.000938900237547405 0.000854505226215 0.000823987182421607 0.000682912598411694 0.000742102023767589 41474 40918 667 665 0 True 307 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 351 414 0.000917577375194298 0.000969739523907044 0.000778210116731518 0.000823987182421607 0.000713389352607734 0.000732290691410707 40109 42262 667 665 0 True 352 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 395 414 0.000865737879515266 0.000895211248537916 0.000671396963454643 0.000732433051041428 0.000757737794451647 0.000756334997956054 37843 39014 667 665 0 True 397 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 439 413 0.000995428127090037 0.00107526770691893 0.000732433051041428 0.000885023270008392 0.000871159643927864 0.000887275739071456 43512 46861 667 665 0 True 442 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 484 412 0.00110265306806427 0.000969234714160085 0.000839246204318303 0.000732433051041428 0.00094707556682846 0.00084230349886768 48199 42240 667 665 0 True 486 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 527 411 0.00102972089144258 0.000967812068509566 0.000793469138628214 0.000762951094834821 0.000897782416699259 0.000888048257525028 45011 42178 667 665 0 True 531 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 571 411 0.000958069832101573 0.000983048144508674 0.000686655985351339 0.000671396963454643 0.000988550187237631 0.00095996788704496 41879 42842 667 665 0 True 576 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 616 411 0.000946814301707009 0.00101466759138634 0.000595101853971161 0.000701915007248035 0.000996313461580602 0.000990242563304011 41387 44220 667 665 0 True 620 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 660 411 0.000969508379250521 0.00102992661328304 0.000656137941557946 0.000625619897764553 0.000960136914001401 0.00102966268375087 42379 44885 667 665 0 True 665 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 263 458 0.00105049329306507 0.000889199423369594 0.000946059357595178 0.000762951094834821 0.000830634504277712 0.000753268017617761 45919 38752 667 665 0 True 263 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 307 458 0.000954684022145485 0.000963567077455598 0.000793469138628214 0.000839246204318303 0.000848880994364199 0.000808968528084648 41731 41993 667 665 0 True 308 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 351 457 0.000939653771191767 0.000948032704787834 0.000762951094834821 0.000793469138628214 0.000802577913055988 0.000816062672934006 41074 41316 667 665 0 True 352 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 395 457 0.000912887570863229 0.000909621272223819 0.000686655985351339 0.000732433051041428 0.000807859405897384 0.000790025053366586 39904 39642 667 665 0 True 397 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 440 458 0.00101441611535729 0.00105755347398021 0.000671396963454643 0.000747692072938125 0.000990488129901649 0.00109625316721844 44342 46089 667 665 0 True 442 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 484 456 0.00105985002463291 0.000976783914466872 0.000747692072938125 0.000534065766384375 0.000994693797615804 0.00104729249257805 46328 42569 667 665 0 True 486 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 528 456 0.00108242971670493 0.00105780587885369 0.000885023270008392 0.000747692072938125 0.000953969685685068 0.0010062846225214 47315 46100 667 665 0 True 531 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 572 455 0.00099952312696936 0.000935802541372887 0.000610360875867857 0.000457770656900893 0.000986414114747328 0.0010885047162719 43691 40783 667 665 0 True 576 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 616 455 0.000968181507781243 0.000937018673945105 0.000579842832074464 0.000503547722590982 0.000982090423801254 0.00097098491903938 42321 40836 667 665 0 True 620 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 661 455 0.0010708081528016 0.00102350176195811 0.000717174029144732 0.000656137941557946 0.00103702498996255 0.00108429173396764 46807 44605 667 665 0 True 665 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 265 502 0.000917829023231575 0.000994222796634525 0.000747692072938125 0.000839246204318303 0.000775963124925092 0.000818067919608446 40120 43329 667 665 0 True 263 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 309 502 0.000977698379009168 0.000924283700783201 0.000793469138628214 0.00080872816052491 0.000841808769318922 0.00080818110825892 42737 40281 667 665 0 True 308 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 352 501 0.000882346649975539 0.000890805636200825 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.000813276003302142 0.0008118483048445 38569 38822 667 665 0 True 352 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 397 502 0.000955233072408634 0.000934632300595848 0.000762951094834821 0.000747692072938125 0.000825795859869473 0.000808932929260106 41755 40732 667 665 0 True 397 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 440 500 0.00109020792876622 0.00101744404499461 0.000747692072938125 0.000625619897764553 0.00106562532542893 0.00108883832618572 47655 44341 667 665 0 True 442 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 485 500 0.00102811949484173 0.000947527895040875 0.000671396963454643 0.000610360875867857 0.000969090554035811 0.000912505095731824 44941 41294 667 665 0 True 486 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 530 500 0.000957818184064297 0.000949157053769695 0.000671396963454643 0.000686655985351339 0.00092179474475441 0.00085818699358412 41868 41365 667 665 0 True 531 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 574 499 0.000957658044404211 0.000957096334335495 0.000610360875867857 0.000595101853971161 0.000948052660440032 0.000951929560449734 41861 41711 667 665 0 True 576 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 617 499 0.000897262515457767 0.000909988406585243 0.000579842832074464 0.000534065766384375 0.000887121900333387 0.000976842665441973 39221 39658 667 665 0 True 620 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 661 499 0.00102610631054352 0.00102086298373537 0.000625619897764553 0.000656137941557946 0.00102237609358501 0.00105816067193624 44853 44490 667 665 0 True 665 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 265 546 0.000888065923550013 0.00101404805215144 0.000732433051041428 0.000885023270008392 0.000731498421029633 0.000769786561994729 38819 44193 667 665 0 True 263 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 308 545 0.000882918577332986 0.000997802356658412 0.000747692072938125 0.000885023270008392 0.000730936243816074 0.000717386697750714 38594 43485 667 665 0 True 308 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 352 545 0.000948095418987691 0.000849434182847827 0.000823987182421607 0.000701915007248035 0.000759846562077477 0.000693726830132224 41443 37019 667 665 0 True 352 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 397 545 0.000976348630445592 0.000969211768262496 0.000747692072938125 0.000793469138628214 0.000839166931458204 0.000812908457505546 42678 42239 667 665 0 True 397 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 441 543 0.00100386977488596 0.000959413869991986 0.00064087891966125 0.000488288700694286 0.00105323453557721 0.00109522892039909 43881 41812 667 665 0 True 442 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 485 542 0.00108268136474221 0.00101762761217532 0.000778210116731518 0.000579842832074464 0.00108128810081137 0.00112041053007429 47326 44349 667 665 0 True 486 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 530 542 0.0010067522887675 0.000953149639950184 0.000610360875867857 0.000503547722590982 0.00103194004617104 0.00102099023141135 44007 41539 667 665 0 True 531 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 574 541 0.00100730133903064 0.000963383510274886 0.000717174029144732 0.000671396963454643 0.00092598252958124 0.000945212537662955 44031 41985 667 665 0 True 576 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 618 541 0.000911835224525526 0.00093061676851777 0.000625619897764553 0.000595101853971161 0.000903845937105902 0.000890344941805945 39858 40557 667 665 0 True 621 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 662 540 0.00105614393535665 0.00098710956838193 0.000701915007248035 0.000579842832074464 0.00102164286844424 0.00103376192186268 46166 43019 667 665 0 True 665 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 266 587 0.00100798765185958 0.000950281402751557 0.000839246204318303 0.000854505226215 0.000742968138139979 0.00069187649581449 44061 41414 667 665 0 True 263 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 309 586 0.000894746035084998 0.0010199680937294 0.000762951094834821 0.000839246204318303 0.000710172363735889 0.000815764183198599 39111 44451 667 665 0 True 308 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 354 586 0.000925309833066987 0.000932452440324891 0.000778210116731518 0.000823987182421607 0.000718749028753628 0.00074404160183673 40447 40637 667 665 0 True 352 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 398 585 0.000963674720204558 0.000967467880045731 0.000762951094834821 0.000869764248111696 0.000783958866534331 0.000698278136675215 42124 42163 667 665 0 True 397 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 442 585 0.00103800239957842 0.00107347792690699 0.00064087891966125 0.000732433051041428 0.00106917300587212 0.00106856436243902 45373 46783 667 665 0 True 442 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 486 583 0.00100281742854826 0.000974168082141724 0.000579842832074464 0.000656137941557946 0.00111668417038279 0.00103994332732906 43835 42455 667 665 0 True 487 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 530 582 0.000951412597660886 0.00102168903604858 0.000488288700694286 0.000595101853971161 0.00110681556839829 0.00111244487277369 41588 44526 667 665 0 True 531 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 576 585 0.000962576619678259 0.000944269577583235 0.000686655985351339 0.000534065766384375 0.000883677717868737 0.000983362461411524 42076 41152 667 665 0 False 576 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 618 582 0.00103232888019254 0.00100727901236268 0.000854505226215 0.000778210116731518 0.000833738879053418 0.000844127599707729 45125 43898 667 665 0 True 621 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 662 581 0.00105751656101453 0.00105555718088997 0.00080872816052491 0.000823987182421607 0.00091394294819616 0.000901822125570932 46226 46002 667 665 0 True 665 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 263 629 0.00102928622665092 0.00102643883684951 0.000869764248111696 0.000839246204318303 0.00075096621610253 0.000757624276768473 44992 44733 667 665 0 False 263 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 308 629 0.000899024051718705 0.00087807066303892 0.000747692072938125 0.000747692072938125 0.000682479516807735 0.000644072174137429 39298 38267 667 665 0 False 308 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 353 628 0.000977423853877593 0.000964645534642282 0.000869764248111696 0.00080872816052491 0.000690057757817662 0.000748513549211568 42725 42040 667 665 0 True 353 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 397 627 0.000874454052442765 0.000938808453957049 0.000732433051041428 0.000778210116731518 0.000695031553422637 0.000710324642301468 38224 40914 667 665 0 True 397 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 442 628 0.00096191318394362 0.000940437612685869 0.000686655985351339 0.000610360875867857 0.00090800181427991 0.000946438395420773 42047 40985 667 665 0 False 442 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 487 628 0.000894128353538955 0.000991561072514199 0.000534065766384375 0.000595101853971161 0.000961137072814152 0.00107010466101198 39084 43213 667 665 0 False 487 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 531 628 0.000987421144085774 0.000936467972402969 0.000610360875867857 0.000518806744487678 0.00101942475921013 0.000991559667234284 43162 40812 667 665 0 False 531 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 576 628 0.00102773058423867 0.00101877490705477 0.000823987182421607 0.000793469138628214 0.000898979527079939 0.000864184264214349 44924 44399 667 665 0 False 576 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 621 628 0.00111793496705527 0.00100445666695923 0.000991836423285267 0.000900282291905089 0.000788199047267538 0.000695555905567944 48867 43775 667 665 0 False 621 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 665 628 0.00103537153373416 0.000984264277080892 0.000869764248111696 0.000839246204318303 0.000827039350048477 0.000734270300377314 45258 42895 667 665 0 False 665 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 265 679 0.00112825253658362 0.0778197037569892 0.00100709544518196 0.0733806363012131 0.000745140565339634 0.0228498970842193 49318 3391443 667 665 0 True 263 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 308 672 0.000992019440039651 0.000875087696352348 0.000869764248111696 0.000778210116731518 0.000692618533908056 0.000634003910125975 43363 38137 667 665 0 False 308 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 353 672 0.000969005083175968 0.000890025475682798 0.000823987182421607 0.000778210116731518 0.000719907679705019 0.00066425106165963 42357 38788 667 665 0 False 353 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 397 672 0.00094267354763909 0.000921484301277341 0.000823987182421607 0.000762951094834821 0.000687492310091648 0.000711180888501403 41206 40159 667 665 0 False 397 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 442 672 0.00103562318177144 0.000878460743297934 0.000793469138628214 0.000701915007248035 0.000841914143915539 0.000780136985978827 45269 38284 667 665 0 False 442 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 487 672 0.000985385082693261 0.000987499648640943 0.000717174029144732 0.000762951094834821 0.000886154327136137 0.000854473118607716 43073 43036 667 665 0 False 487 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 531 672 0.00101510242818623 0.0010579894460344 0.000717174029144732 0.000732433051041428 0.000939442140642787 0.000985844486443837 44372 46108 667 665 0 False 531 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 576 672 0.00106623273394202 0.000998949651537863 0.000900282291905089 0.000823987182421607 0.000854112685968009 0.000748992884288283 46607 43535 667 665 0 False 576 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 621 672 0.00105369608626678 0.00103107390816249 0.000900282291905089 0.000854505226215 0.000707282551642823 0.000797463333806113 46059 44935 667 665 0 False 621 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 663 676 0.00114158988255929 0.0798088147812883 0.000961318379491875 0.0775463492790112 0.000840241380888606 0.0249384942446028 49901 3478130 667 665 0 True 665 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E6_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E6_1.csv new file mode 100755 index 0000000..bda4e95 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E6_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 276 262 0.0104674602501908 0.0421256391149538 0.0104676890211337 0.0424048218509194 0.00155004193226373 0.00870193618161275 457552 1835868 667 665 0 True 275 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 320 262 0.0101133457075536 0.0103737026246091 0.010101472495613 0.0103456168459602 0.00131412219698922 0.00141532883559528 442073 452094 667 665 0 False 320 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 363 262 0.0104961023722517 0.0638886068455644 0.010452429999237 0.0648661020828565 0.00158702992710674 0.0102189765191902 458804 2784315 667 665 0 True 364 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 407 262 0.0104380403069237 0.096401589921244 0.0104371709773404 0.095551995117113 0.0014126218320886 0.0161426758060511 456266 4201256 667 665 0 True 409 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 452 262 0.0102721813732639 0.0736154875630367 0.0101777676050965 0.0711833371480888 0.0017535458048776 0.0144907061977528 449016 3208220 667 665 0 True 454 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 496 261 0.0105926208330946 0.0632328589842654 0.0105897611963073 0.0667124437323568 0.00173436159378715 0.0174449443027329 463023 2755737 667 665 0 True 499 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 539 260 0.0103389367344252 0.0773900647705324 0.0103456168459602 0.0765087357900359 0.00163555958512461 0.0246436354731199 451934 3372719 667 665 0 True 543 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 584 260 0.0100834453453063 0.0668377053872952 0.0100862134737163 0.0662851911192493 0.0019151671348848 0.0199241222432883 440766 2912839 667 665 0 True 588 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 633 261 0.0101265915451521 0.0101610859375493 0.0101625085831998 0.0101472495613031 0.00203121339127518 0.00188532435850463 442652 442828 667 665 0 False 633 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 673 261 0.0102995423780442 0.0415834505008229 0.0102998397802701 0.0416113527122911 0.00204986827317781 0.00863160988693626 450212 1812239 667 665 0 True 677 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 275 306 0.0107899815256025 0.0238047166439789 0.0106965743495842 0.0108644235904479 0.00195380643777419 0.0776897200825092 471650 1037428 667 665 0 False 275 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 320 306 0.0105087534053985 0.0104052302878964 0.0105287251087205 0.0103456168459602 0.00138062743921969 0.00127590889082247 459357 453468 667 665 0 False 320 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 363 306 0.0105301663656613 0.10953465146042 0.0105745021744106 0.109697108415351 0.00138856823345254 0.0257424274727435 460293 4773605 667 665 0 True 365 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 407 307 0.0103079382716515 0.0555026843831942 0.0103456168459602 0.0559090562294957 0.0015412471817351 0.00966802773348184 450579 2418850 667 665 0 True 409 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 451 306 0.0103497118458395 0.0783680877634691 0.0103913939116503 0.07690547035935 0.00185841286565337 0.0187622349679199 452405 3415342 667 665 0 True 454 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 495 304 0.0103343384384713 0.041818049357773 0.0102998397802701 0.0438696879530022 0.00166689301271693 0.00932249893368891 451733 1822463 667 665 0 True 499 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 543 305 0.0102500134688893 0.0395145795365043 0.0103150988021668 0.0438239108873121 0.00154871400684145 0.0101974353581631 448047 1722076 667 665 0 False 543 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 583 304 0.0101247842547026 0.0501549823287906 0.0101930266269932 0.0529030289158465 0.00176751150429318 0.0108498443270488 442573 2185793 667 665 0 True 588 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 633 305 0.0102204791401507 0.00976267631771119 0.0102388036926833 0.00971999694819562 0.00232667156051679 0.00208100413670418 446756 425465 667 665 0 False 633 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 677 305 0.00991230180286373 0.0100509226832244 0.00994888227664607 0.0101319905394064 0.00186131747222682 0.00198746191470418 433285 438027 667 665 0 False 677 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 275 351 0.0107368151584542 0.0510578804530209 0.0106813153276875 0.0507972838941024 0.00183322535777852 0.0106861965737939 469326 2225142 667 665 0 True 275 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 318 351 0.0101898695879801 0.0624921883559895 0.0101472495613031 0.0662088960097658 0.00143059903613745 0.0218609867812626 445418 2723458 667 665 0 True 320 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 362 350 0.0100724185858547 0.0384171002007192 0.0100709544518196 0.0401007095445182 0.0014511032958634 0.00909110848637381 440284 1674247 667 665 0 True 365 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 407 350 0.0102089262075302 0.0342710059653597 0.0101472495613031 0.0355077439536126 0.00163642980270857 0.0052112991507895 446251 1493557 667 665 0 True 409 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 452 350 0.0102201131066419 0.0716916805632759 0.01025406271458 0.0693675135423819 0.00178731929861524 0.013285940255845 446740 3124379 667 665 0 True 454 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 499 349 0.0105421082088848 0.0336965783651163 0.0104982070649271 0.0350041962310216 0.00191644160314553 0.00699676414888047 460815 1468523 667 665 0 False 499 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 541 348 0.0103612419013656 0.0313911810884501 0.0103150988021668 0.0310521095597772 0.00175397197068158 0.0055913056621353 452909 1368052 667 665 0 True 544 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 584 348 0.0100885240602404 0.0514402508904442 0.010101472495613 0.0513923857480735 0.00192142404541076 0.0112919119321669 440988 2241806 667 665 0 True 588 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 628 348 0.0100577314913155 0.0574805289717771 0.0100404364080262 0.0587624933241779 0.00218331192896754 0.0130237977719235 439642 2505046 667 665 0 True 633 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 673 349 0.0100025061856803 0.0610446234606888 0.0100556954299229 0.0604257267109178 0.00196608373601026 0.0172986874202647 437228 2660372 667 665 0 True 678 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 275 393 0.0103285276565196 0.0426412104878814 0.0103303578240635 0.0464637216754406 0.00156419945999367 0.0115052506565929 451479 1858337 667 665 0 True 275 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 320 395 0.0101612503430134 0.0322648231932544 0.0101625085831998 0.0333562218661784 0.00148481333652871 0.0045120329455932 444167 1406126 667 665 0 True 320 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 363 394 0.010167358527191 0.0837951826235307 0.0101930266269932 0.0818036163881895 0.00146237331102457 0.0220482203139291 444434 3651859 667 665 0 True 365 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 408 394 0.0103278870978793 0.0654718278874114 0.0102998397802701 0.0652475776302739 0.0015146231047516 0.0160074601602752 451451 2853313 667 665 0 True 410 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 453 394 0.0101909676885064 0.0449057411209415 0.0102693217364767 0.04614328221561 0.00178138094093244 0.0080031838452455 445466 1957027 667 665 0 True 454 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 497 393 0.0103681736609379 0.0536522813098207 0.0103150988021668 0.0544899671931029 0.00187484388597046 0.00990170166485424 453212 2338208 667 665 0 True 499 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 541 391 0.0104680550546425 0.0414445130909214 0.0105134660868238 0.0435034714274815 0.0017464976300668 0.00769967965976864 457578 1806184 667 665 0 True 544 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 584 392 0.0102658444181434 0.0499512915958929 0.0103608758678569 0.0513008316166934 0.00207796448249244 0.00925752861951021 448739 2176916 667 665 0 True 588 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 629 392 0.0102626873791303 0.042925418375419 0.0102845807583734 0.0439002059967956 0.00196470698619997 0.00738697374654418 448601 1870723 667 665 0 True 633 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 673 392 0.0102211425758853 0.0895735791756801 0.0102693217364767 0.0884718089570459 0.00195521412751865 0.0164626968035979 446785 3903686 667 665 0 True 678 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 275 437 0.0100847950938699 0.0425364165735924 0.010101472495613 0.0450293736171511 0.00165689287114547 0.009811199623048 440825 1853770 667 665 0 True 276 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 320 438 0.0100919785014794 0.0504402916194125 0.0100556954299229 0.050064850843061 0.00149174351577762 0.00776854009117812 441139 2198227 667 665 0 True 320 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 365 438 0.0101984027441532 0.0349386398016098 0.0101472495613031 0.0356755931944762 0.00165392081103906 0.00410987692584044 445791 1522653 667 665 0 True 365 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 408 438 0.0101637897004805 0.0520546272983902 0.0102693217364767 0.0531471732661936 0.0016884439035856 0.00987282911751641 444278 2268581 667 665 0 True 410 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 452 438 0.0103552481026596 0.098512474824048 0.0103608758678569 0.100907911802853 0.00181393249921106 0.0172776090411431 452647 4293250 667 665 0 True 454 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 497 436 0.0103105691374958 0.0593538320509445 0.0102693217364767 0.0609445334554055 0.00184528561907344 0.0138484781958737 450694 2586686 667 665 0 True 499 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 541 436 0.0103557285216398 0.0549535431620938 0.0103456168459602 0.0541084916456855 0.00165488096523947 0.0124721134351189 452668 2394918 667 665 0 True 544 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 585 435 0.0104306738825597 0.0327638046822251 0.0103456168459602 0.0332799267566949 0.00194331422709847 0.00471734996053273 455944 1427872 667 665 0 True 588 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 629 435 0.0101453278853821 0.0386634932490301 0.0101625085831998 0.0397192339971008 0.00194366702396213 0.00567076623686211 443471 1684985 667 665 0 True 633 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 673 436 0.00999955504051591 0.0694365348023297 0.0100404364080262 0.0689402609292744 0.00187579294000899 0.0112231445614462 437099 3026098 667 665 0 True 678 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 277 481 0.00980379574460881 0.0525378220098197 0.00988784618905928 0.054337376974136 0.00168288661915147 0.0137284532622452 428542 2289639 667 665 0 True 276 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 322 482 0.0100409854582894 0.0554549798621066 0.00997940032043946 0.0551155870908675 0.00155387061658412 0.00668431064516974 438910 2416771 667 665 0 True 320 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 365 481 0.0102354407598215 0.0678588207759041 0.0102845807583734 0.0653543907835508 0.00154774183604008 0.0173349034479008 447410 2957340 667 665 0 True 365 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 411 482 0.010607856977897 0.0874395648081063 0.0105287251087205 0.0831158922713054 0.00177901539769337 0.0195782241179476 463689 3810684 667 665 0 True 410 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 454 481 0.0105407355832269 0.0964773572750829 0.0105134660868238 0.0911726558327611 0.00204416576740101 0.0322770394532933 460755 4204558 667 665 0 True 455 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 498 481 0.010264357407014 0.0402337269128417 0.01025406271458 0.0409399557488365 0.00176888775160473 0.0046533383763355 448674 1753417 667 665 0 True 499 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 541 480 0.0102502651169265 0.0401565598592499 0.01025406271458 0.0417792019531548 0.00174750402009472 0.00670032672343357 448058 1750054 667 665 0 True 544 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 586 480 0.0104653326804211 0.101302787754463 0.0105287251087205 0.0976577401388571 0.00188084594091492 0.018265596339448 457459 4414854 667 665 0 True 589 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 630 479 0.0103176839138224 0.0650473517279121 0.0102998397802701 0.0658884565499352 0.00194161333266009 0.0210370576280711 451005 2834814 667 665 0 True 633 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 675 480 0.0101485535556781 0.0723290258147084 0.0101472495613031 0.0704051270313573 0.0019258756904375 0.00933271402896916 443612 3152155 667 665 0 True 678 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 277 526 0.0101265915451521 0.0524738029555463 0.0101472495613031 0.0553597314412146 0.00160561535814435 0.0123759564085506 442652 2286849 667 665 0 True 276 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 322 526 0.0101257222155688 0.0997755776486306 0.0100404364080262 0.0926985580224308 0.00159992676650656 0.0261076792256465 442614 4348297 667 665 0 True 321 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 366 525 0.0102107106208855 0.0563463361998496 0.0102235446707866 0.0591897459372854 0.00153650061866554 0.0112255091301364 446329 2455617 667 665 0 True 365 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 411 525 0.0102997482718929 0.0595660357118477 0.0103303578240635 0.0596322575722896 0.00170189557016383 0.00830905812331443 450221 2595934 667 665 0 True 410 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 455 524 0.0104258696927572 0.0549849790417908 0.0104829480430304 0.0552986953536278 0.00187661241178386 0.00657957684982381 455734 2396288 667 665 0 True 455 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 499 522 0.0103725203088545 0.0621250769404629 0.0103456168459602 0.062378881513695 0.00188732732989513 0.0136080962263285 453402 2707459 667 665 0 True 499 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 544 522 0.0102410914021131 0.0731000079736994 0.0102235446707866 0.0710612649729152 0.00175338867352522 0.0191678436242517 447657 3185755 667 665 0 True 544 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 588 521 0.0103913481574617 0.0576261206919794 0.0104219119554437 0.0585183489738308 0.00175339554077224 0.0142466473981972 454225 2511391 667 665 0 True 589 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 632 520 0.010265890172332 0.0497280968500445 0.0101777676050965 0.0491950865949493 0.00191297817944483 0.00977086031144193 448741 2167189 667 665 0 True 633 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 676 521 0.00996471322590021 0.0652126080823482 0.00993362325474937 0.0648966201266499 0.0019658022469731 0.0137524666217831 435576 2842016 667 665 0 True 678 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 279 566 0.010015614760713 0.0456892058482209 0.00997940032043946 0.0472419317921721 0.00149352878829674 0.00933041104120393 437801 1991171 667 665 0 True 276 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 323 566 0.00999003816928798 0.0560422801108975 0.00999465934233616 0.0556191348134585 0.0014603075187495 0.0131342960905245 436683 2442366 667 665 0 True 321 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 367 566 0.0100755298706792 0.0431835138315002 0.0100709544518196 0.0440680552376593 0.00144839734397549 0.0074583797537235 440420 1881971 667 665 0 True 365 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 411 565 0.0101303205115227 0.0501283421416898 0.0101167315175097 0.049256122682536 0.00170525151441173 0.0074394061140264 442815 2184632 667 665 0 True 410 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 455 565 0.0103986230734484 0.0794520519655743 0.0103608758678569 0.0776379034103914 0.0020319469066624 0.0204867753736804 454543 3462582 667 665 0 True 455 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 499 563 0.0101023647022907 0.060925465414509 0.0102082856488899 0.0604867627985046 0.00219196379963854 0.0131163586542977 441593 2655179 667 665 0 True 499 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 544 563 0.0100923445349882 0.0530367346610977 0.0101472495613031 0.0532082093537804 0.00195833284632861 0.00776302000209808 441155 2311382 667 665 0 True 544 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 588 562 0.0103733210071549 0.0365525395085333 0.0103608758678569 0.0391699092088197 0.00180256815374536 0.00757337582407192 453437 1592988 667 665 0 True 589 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 632 563 0.0101714992812589 0.0477550479540577 0.010101472495613 0.0482795452811475 0.00175206626077938 0.00739515666839622 444615 2081202 667 665 0 True 634 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 676 563 0.0101312127182003 0.0570946937038178 0.0101319905394064 0.0551155870908675 0.00170302929597445 0.010445628170499 442854 2488231 667 665 0 True 678 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 276 610 0.00981740761571606 0.00974654535170611 0.00985732814526589 0.00968947890440223 0.00140720973511227 0.00139529437870077 429137 424762 667 665 0 False 276 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 321 610 0.00984328160936698 0.0109623107895626 0.00987258716716258 0.0103303578240635 0.00152947630038574 0.00322631628594604 430268 477746 667 665 0 False 321 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 367 608 0.0100126636155486 0.0699769565823462 0.00999465934233616 0.0678416113527123 0.00143417603300804 0.012547555147713 437672 3049650 667 665 0 True 366 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 411 608 0.0101320134165007 0.0734852237024238 0.0101167315175097 0.0712443732356756 0.00162547160878 0.018942280465335 442889 3202543 667 665 0 True 410 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 455 610 0.00993968568473831 0.00996331524622956 0.0100251773861295 0.0100862134737163 0.00196364577617914 0.00197245056931402 434482 434209 667 665 0 False 455 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 500 610 0.0101435663491212 0.00992754259188828 0.0100862134737163 0.00991836423285267 0.00229284019795671 0.00204825369100524 443394 432650 667 665 0 False 500 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 544 610 0.00983367322976187 0.00999927146775155 0.00991836423285267 0.00996414129854276 0.0019313075133415 0.00202724066284762 429848 435776 667 665 0 False 544 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 589 609 0.010377164358997 0.00984479968518229 0.00991836423285267 0.00985732814526589 0.00370579468665769 0.00167145262422871 453605 429044 667 665 0 False 589 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 634 609 0.00985240956999184 0.00970560987040731 0.00990310521095598 0.00967421988250553 0.00148471003307169 0.00148211639071893 430667 422978 667 665 0 False 634 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 678 609 0.00980713580037631 0.0100186607512143 0.00970473792629892 0.00996414129854276 0.00159795704591714 0.00207796776909523 428688 436621 667 665 0 False 678 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 277 659 0.0101101200372576 0.0400550701542136 0.0100404364080262 0.0405584802014191 0.00213862331355731 0.00880707244874635 441932 1745631 667 665 0 True 276 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 321 654 0.0100365473019956 0.00979438754817921 0.00970473792629892 0.00971999694819562 0.002776611907007 0.00129449571269781 438716 426847 667 665 0 False 321 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 366 654 0.00967838351366775 0.00982398775606905 0.00965896086060884 0.00973525597009232 0.00137728484805275 0.00124327322977941 423060 428137 667 665 0 False 366 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 410 654 0.00987100864765603 0.00981832011936456 0.0098268101014725 0.00976577401388571 0.00140426857226066 0.00148058646987379 431480 427890 667 665 0 False 410 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 455 653 0.0099300773051332 0.010059825691489 0.0100099183642329 0.00997940032043946 0.00161219390407415 0.00162186278003649 434062 438415 667 665 0 False 455 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 500 653 0.00991943945628468 0.00996104360236825 0.00996414129854276 0.0100099183642329 0.00168676410930519 0.00174475568805049 433597 434110 667 665 0 False 500 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 544 653 0.0100059606269193 0.00977513594010203 0.0100404364080262 0.0098115510795758 0.00185789559509919 0.00184248182029188 437379 426008 667 665 0 False 544 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 589 653 0.00971208147356855 0.00990675360867263 0.0098115510795758 0.00991836423285267 0.00139253708320308 0.00127534851168217 424533 431744 667 665 0 False 589 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 634 653 0.00982973836954263 0.00970414133296161 0.0098268101014725 0.00973525597009232 0.00142403349012011 0.00133057031342855 429676 422914 667 665 0 False 634 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 674 658 0.0100495872457454 0.0411641142223836 0.0100709544518196 0.0414282444495308 0.00149815975027443 0.00894298937772061 439286 1793964 667 665 0 True 679 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E6_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E6_2.csv new file mode 100755 index 0000000..b64c94c --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E6_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 276 262 0.00859977427171056 0.736415954053135 0.00857557030594339 0.74683756771191 0.00168536287546698 0.189157044181739 375912 32093578 667 665 12 True 275 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 320 262 0.00726331729992179 0.00727020113800179 0.00720225833524071 0.0072480354009308 0.001333756830543 0.00140200497324641 317493 316841 667 665 0 False 320 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 363 262 0.0070055610784674 0.00709576642453008 0.00701915007248035 0.00704966811627375 0.00130796084707858 0.0012883147543989 306226 309239 667 665 0 True 364 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 407 262 0.0070686332274467 0.00737866639590508 0.00704966811627375 0.00730907148851759 0.001422332113515 0.00162174150401981 308983 321568 667 665 0 True 409 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 452 262 0.00740206687683853 0.0072795860101157 0.00738536659800107 0.00729381246662089 0.00167315554211664 0.00180724131837179 323558 317250 667 665 0 True 454 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 496 261 0.007635024328074 0.00730397749925282 0.00762951094834821 0.0072480354009308 0.00171107997697698 0.00152715611391202 333741 318313 667 665 0 True 499 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 539 260 0.00758080561458799 0.00737605056357993 0.00758373388265812 0.00729381246662089 0.00160155208270517 0.00159278028639328 331371 321454 667 665 0 True 543 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 584 260 0.00748600293581751 0.0077283618751617 0.00752269779507134 0.00773632410162509 0.00180249866657059 0.00194702094096927 327227 336808 667 665 0 True 588 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 633 261 0.0100104216603074 0.00837841915385855 0.00877393759060044 0.00836194399938964 0.00720267818734145 0.00190464482970784 437574 365138 667 665 0 False 633 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 673 261 0.01028094330038 0.728309765028272 0.00991836423285267 0.71441214618143 0.0035080889586489 0.188785754861636 449399 31740304 667 665 12 True 677 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 275 306 0.00727864495310138 0.0101019314135648 0.00715648126955062 0.00718699931334401 0.00143037386053288 0.0187444917998338 318163 440250 667 665 0 False 275 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 320 306 0.00698902093929003 0.00694547079532202 0.00700389105058366 0.00688181887541009 0.00137678167345365 0.0012399501952333 305503 302689 667 665 0 False 320 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 363 306 0.0070252125024693 0.00712164939701049 0.00697337300679027 0.00714122224765393 0.00134082319384436 0.00126004256077116 307085 310367 667 665 0 True 365 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 407 307 0.00717292990035081 0.00743052412445625 0.00708018616006714 0.00746166170748455 0.00143964260199122 0.00147616353606827 313542 323828 667 665 0 True 409 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 451 306 0.0075915807260023 0.0077206291076742 0.00761425192645151 0.00772106507972839 0.00165186233883655 0.0017561088497202 331842 336471 667 665 0 True 454 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 495 304 0.00740048835733198 0.00746095038465929 0.00735484855420768 0.00746166170748455 0.00162432772479331 0.00164632265998221 323489 325154 667 665 0 True 499 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 543 305 0.00757234108969777 0.00729020996069941 0.00755321583886473 0.0072480354009308 0.00149124117534141 0.00147967523722226 331001 317713 667 665 0 False 543 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 583 304 0.00768027522059524 0.00762377447395096 0.00770580605783169 0.00762951094834821 0.00170891329857687 0.00191290949904405 335719 332250 667 665 0 True 588 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 633 305 0.00802565071321057 0.007695962267766 0.0080872816052491 0.00785839627679866 0.00193498135204914 0.00197618720706443 350816 335396 667 665 0 False 633 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 677 305 0.00795027068749901 0.00807534973850282 0.00796520943007553 0.00817883573662928 0.00204756944727385 0.00188974541512881 347521 351930 667 665 0 False 677 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 275 351 0.00705465532283069 0.00689420966010816 0.00706492713817044 0.00685130083161669 0.00154487525507489 0.00154033885925716 308372 300455 667 665 0 True 275 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 318 351 0.00662635036338549 0.00662530668626246 0.00665293354695964 0.00657663843747616 0.00123539354663094 0.00129219453911221 289650 288736 667 665 0 True 320 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 362 350 0.00663856673174056 0.00655991087813376 0.00657663843747616 0.00659189745937285 0.0013822278100638 0.00133627264811704 290184 285886 667 665 0 True 365 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 407 350 0.00719413696676496 0.00703631360387694 0.00715648126955062 0.00701915007248035 0.00147647314388694 0.00138914271196077 314469 306648 667 665 0 True 409 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 452 350 0.0074774240254558 0.00778965036762196 0.00746166170748455 0.00773632410162509 0.00169078473117615 0.00194116590460214 326852 339479 667 665 0 True 454 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 499 349 0.00777592435185474 0.00761000693539755 0.0076600289921416 0.00759899290455482 0.00181953567678623 0.00165603242049307 339900 331650 667 665 0 False 499 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 541 348 0.00762726899310702 0.00768001486894164 0.00755321583886473 0.00773632410162509 0.00174263155507721 0.00169984605725382 333402 334701 667 665 0 True 544 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 584 348 0.00747863651145359 0.00772170756486088 0.00752269779507134 0.00779736018921187 0.00190801979516491 0.00215457464105324 326905 336518 667 665 0 True 588 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 628 348 0.00733318394590757 0.00744800889841908 0.00727855344472419 0.00756847486076143 0.00198509761824134 0.00188616289668789 320547 324590 667 665 0 True 633 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 673 349 0.00708187906504518 0.00684703289466514 0.00697337300679027 0.00685130083161669 0.00184659978245882 0.00189134598160558 309562 298399 667 665 0 True 678 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 275 393 0.00673689248303292 0.00663184626707533 0.00675974670023652 0.00668345159075303 0.00139799002023753 0.00146285994808649 294482 289021 667 665 0 True 275 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 320 395 0.00671367223232055 0.070516804714923 0.00668345159075303 0.0730144197756924 0.0013798801323172 0.0158717336308588 293467 3073177 667 665 0 True 320 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 363 394 0.0066707319263234 0.00685320534111658 0.00668345159075303 0.0068207827878233 0.00131131369855113 0.00130716964346847 291590 298668 667 665 0 True 365 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 408 394 0.00702162079866453 0.007070870125646 0.00701915007248035 0.00709544518196384 0.00153867596855093 0.00138656835432435 306928 308154 667 665 0 True 410 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 453 394 0.00732577176735505 0.00737412310818245 0.00733958953231098 0.00738536659800107 0.00154519634664802 0.00165008838137459 320223 321370 667 665 0 True 454 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 497 393 0.00760828100483976 0.00766688981552072 0.00762951094834821 0.00759899290455482 0.0017527956696124 0.00176270728690347 332572 334129 667 665 0 True 499 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 541 391 0.00775425974355464 0.00771955065048751 0.00781261921110857 0.00773632410162509 0.00166515452787612 0.00152128462065486 338953 336424 667 665 0 True 544 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 584 392 0.00738456589970064 0.00747063355344186 0.00737010757610437 0.00746166170748455 0.00183614207182946 0.00205296947575483 322793 325576 667 665 0 True 588 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 629 392 0.00700045948643897 0.00677333067160921 0.00694285496299687 0.00686655985351339 0.00196098935270377 0.00182284958157241 306003 295187 667 665 0 True 633 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 673 392 0.00645250732381578 0.00654882800959827 0.00645456626230259 0.00653086137178607 0.00176428672070066 0.00184644007355626 282051 285403 667 665 0 True 678 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 275 437 0.00666245041818756 0.00664666931691784 0.00660715648126955 0.00662241550316625 0.00150953698405436 0.00159779064501863 291228 289667 667 665 0 True 276 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 320 438 0.00663323636876915 0.00679682727074037 0.00656137941557946 0.00685130083161669 0.00146831024782697 0.00134569176103625 289951 296211 667 665 0 True 320 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 365 438 0.00669530192559934 0.00697227160370599 0.00671396963454643 0.00698863202868696 0.00128925454327184 0.00139121450834903 292664 303857 667 665 0 True 365 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 408 438 0.0069696897946083 0.00688057979694028 0.00698863202868696 0.0068207827878233 0.00158245354425412 0.0016165373165173 304658 299861 667 665 0 True 410 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 452 438 0.00712044984603144 0.00723149140876912 0.00706492713817044 0.0072632944228275 0.00180627150986571 0.00163868070263196 311248 315154 667 665 0 True 454 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 497 436 0.00729319478507485 0.00735790035858701 0.00733958953231098 0.00744640268558785 0.00166864738124861 0.00178145172796787 318799 320663 667 665 0 True 499 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 541 436 0.00710498493028606 0.00716520071063445 0.00714122224765393 0.0072327763790341 0.0017267753571783 0.00162210169902793 310572 312265 667 665 0 True 544 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 585 435 0.00694031560552981 0.00680201304359548 0.00689707789730678 0.00672922865644312 0.00180166356335304 0.00194355864862934 303374 296437 667 665 0 True 588 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 629 435 0.00658093933120416 0.00639474630728802 0.00657663843747616 0.0063782711528191 0.00182808642350406 0.0017535298093897 287665 278688 667 665 0 True 633 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 673 436 0.00631332308210738 0.00636881744301243 0.00631723506523232 0.00648508430609598 0.00172444763926317 0.0018215410276978 275967 277558 667 665 0 True 678 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 277 481 0.0066479005862141 0.00646319391979606 0.00668345159075303 0.0063935301747158 0.0014496377154562 0.00145369394997945 290592 281671 667 665 0 True 276 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 322 482 0.00655003237680771 0.00652939283434037 0.00656137941557946 0.00656137941557946 0.00154865056978866 0.00149560256557457 286314 284556 667 665 0 True 320 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 365 481 0.00673073854466678 0.00673432264570788 0.00671396963454643 0.00677500572213321 0.00151117785056244 0.0015168227787259 294213 293487 667 665 0 True 365 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 411 482 0.00684706856917158 0.00696614504904972 0.00689707789730678 0.00697337300679027 0.0017089413793831 0.00164839241469935 299298 303590 667 665 0 True 410 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 454 481 0.00693418454425797 0.00711405430490853 0.00697337300679027 0.00708018616006714 0.00190424087184453 0.00195124271968893 303106 310036 667 665 0 True 455 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 498 481 0.00663934455294669 0.00690391577478831 0.00659189745937285 0.00694285496299687 0.00184109989284039 0.00187335665808384 290218 300878 667 665 0 True 499 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 541 480 0.00654060701395697 0.00656941047973562 0.0064087891966125 0.00650034332799268 0.00182163689768148 0.0016017963283649 285902 286300 667 665 0 True 544 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 586 480 0.00662824916221221 0.00689239693419862 0.00659189745937285 0.00688181887541009 0.00178141069304565 0.00192713739355146 289733 300376 667 665 0 True 589 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 630 479 0.0067588544935589 0.00665474627286917 0.00669871061264973 0.00674448767833982 0.00179817046681252 0.00173879504052966 295442 290019 667 665 0 True 633 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 675 480 0.00648188151289427 0.00645316656254966 0.00654612039368277 0.00651560234988937 0.00192345422477678 0.00179657549361091 283335 281234 667 665 0 True 678 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 277 526 0.00669395217703577 0.00666484246780834 0.00672922865644312 0.00671396963454643 0.00151053133582485 0.00149424460543565 292605 290459 667 665 0 True 276 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 322 526 0.00658940385609438 0.00665621481031487 0.00653086137178607 0.00666819256885634 0.00143938861283732 0.00142248802123452 288035 290083 667 665 0 True 321 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 366 525 0.0066620615075845 0.0066574079969895 0.00665293354695964 0.00666819256885634 0.00143224551387998 0.00154104929735569 291211 290135 667 665 0 True 365 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 411 525 0.00669431821054453 0.00695102370253856 0.00672922865644312 0.00697337300679027 0.00169079479173721 0.00171655400788763 292621 302931 667 665 0 True 410 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 455 524 0.00656883734832058 0.00646672758802477 0.00659189745937285 0.00642404821850919 0.00187522128190841 0.00188853424196566 287136 281825 667 665 0 True 455 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 499 522 0.00650416380274042 0.00661043774462478 0.00646982528419928 0.00662241550316625 0.00180223027273918 0.00167372480715654 284309 288088 667 665 0 True 499 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 544 522 0.00635086439385022 0.00662581149600942 0.00631723506523232 0.00668345159075303 0.00170369636624404 0.00171910826999741 277608 288758 667 665 0 True 544 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 588 521 0.00648643405465955 0.00666098755701339 0.00648508430609598 0.00669871061264973 0.00171227709850594 0.00173680301872096 283534 290291 667 665 0 True 589 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 632 520 0.00666707159123574 0.0066323281309247 0.00653086137178607 0.00657663843747616 0.00185616160979354 0.00208014838267059 291430 289042 667 665 0 True 633 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 676 521 0.00649693464094229 0.0068203697616667 0.00653086137178607 0.00679026474402991 0.00182776126564867 0.00190938036860837 283993 297237 667 665 0 True 678 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 279 566 0.00696003566081459 0.00714032735764795 0.00700389105058366 0.00709544518196384 0.00138916396361975 0.00151268070040215 304236 311181 667 665 0 True 276 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 323 566 0.00693942339885219 0.00687250284098895 0.00694285496299687 0.00689707789730678 0.00158003044744376 0.00136747002850427 303335 299509 667 665 0 True 321 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 367 566 0.00675727597405234 0.00666509487268182 0.00671396963454643 0.00669871061264973 0.00131708993190306 0.00121395829714904 295373 290470 667 665 0 True 365 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 411 565 0.00643944450297168 0.00667470920377162 0.0063935301747158 0.00672922865644312 0.001491943247542 0.0015891295001044 281480 290889 667 665 0 True 410 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 455 565 0.00638209162756685 0.00652507900559364 0.0063935301747158 0.00651560234988937 0.00194043493282586 0.00188798416813565 278973 284368 667 665 0 True 455 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 499 563 0.00640865193404671 0.00654657931163455 0.00645456626230259 0.00665293354695964 0.00195930388244256 0.00198072841463474 280134 285305 667 665 0 True 499 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 544 563 0.00661985326860488 0.00693512219550937 0.00665293354695964 0.00700389105058366 0.00189030808560517 0.00179356026100824 289366 302238 667 665 0 True 544 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 588 562 0.00691439585769029 0.00718605853154286 0.00689707789730678 0.00712596322575723 0.00160609635190697 0.0015235011317184 302241 313174 667 665 0 True 589 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 632 563 0.00702665375941006 0.00690212599477637 0.00704966811627375 0.00692759594110018 0.00168599106525523 0.00165041472576129 307148 300800 667 665 0 True 634 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 676 563 0.00669818443948088 0.00683032828122033 0.00671396963454643 0.00683604180972 0.00168345980793036 0.0018262106373168 292790 297671 667 665 0 True 678 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 276 610 0.00740069425118066 0.00728305084065164 0.00744640268558785 0.00729381246662089 0.00138235285051759 0.0014171238561684 323498 317401 667 665 0 False 276 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 321 610 0.00696735633098992 0.00764660564205203 0.00697337300679027 0.00743114366369116 0.00140052925858716 0.00180699471341228 304556 333245 667 665 0 False 321 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 367 608 0.00673858538801096 0.00660715648126955 0.00671396963454643 0.00659189745937285 0.00140043764440123 0.00136143891967737 294556 287945 667 665 0 True 366 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 411 608 0.00643738556448487 0.00646757658623556 0.00642404821850919 0.00654612039368277 0.00144488386498662 0.00152111568963111 281390 281862 667 665 0 True 410 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 455 610 0.00667368307148783 0.00651482218937135 0.00679026474402991 0.00642404821850919 0.00195281265687171 0.00186841050737675 291719 283921 667 665 0 False 455 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 500 610 0.00687019731150676 0.00660736299434785 0.00671396963454643 0.00656137941557946 0.00237563503794454 0.00195041504824908 300309 287954 667 665 0 False 500 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 544 610 0.00683611044100289 0.00706694637715828 0.0068207827878233 0.00706492713817044 0.00184880430378777 0.00192345793337825 298819 307983 667 665 0 False 544 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 589 609 0.00733917774461362 0.00683817577819578 0.00709544518196384 0.00685130083161669 0.00246189585685335 0.00172595781040654 320809 298013 667 665 0 False 589 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 634 609 0.00668013441207984 0.00691896828360671 0.00675974670023652 0.00694285496299687 0.00153066457238763 0.00150160795980259 292001 301534 667 665 0 False 634 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 678 609 0.00688884214335954 0.00715510451569528 0.00685130083161669 0.00703440909437705 0.00159493694753026 0.00187332863455084 301124 311825 667 665 0 False 678 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 277 659 0.00918064657302843 0.733879491587747 0.00892652780956741 0.732021057450217 0.00241636212345526 0.20067414994137 401303 31983037 667 665 13 True 276 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 321 654 0.00769134773423542 0.00725062828735836 0.00746166170748455 0.00718699931334401 0.00261872128476351 0.00134841353419559 336203 315988 667 665 0 False 321 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 366 654 0.00693942339885219 0.00709881822890942 0.00695811398489357 0.00704966811627375 0.00137028431531224 0.00130619507332849 303335 309372 667 665 0 False 366 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 410 654 0.00677180292893151 0.00666853675732017 0.00675974670023652 0.00666819256885634 0.00140841939312991 0.00140771330740607 296008 290620 667 665 0 False 410 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 455 653 0.00691254281305216 0.00687034592661558 0.0068207827878233 0.00685130083161669 0.00172409008008625 0.00166854761472248 302160 299415 667 665 0 False 455 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 500 653 0.00689625432191206 0.00703413374360598 0.00689707789730678 0.00694285496299687 0.00180174469944104 0.00172082870355611 301448 306553 667 665 0 False 500 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 544 653 0.00701958473727201 0.00689861527244525 0.00695811398489357 0.00688181887541009 0.00178053150031521 0.00168809618746245 306839 300647 667 665 0 False 544 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 589 653 0.00659505449838596 0.00698459355071129 0.00662241550316625 0.00698863202868696 0.00139126014882016 0.00116635662827643 288282 304394 667 665 0 False 589 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 634 653 0.00749014368988543 0.00733142079276929 0.0072327763790341 0.00730907148851759 0.00200794886732337 0.00136252010582331 327408 319509 667 665 0 False 634 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 674 658 0.00862882818146889 0.75085098876741 0.00860608834973678 0.746761272602426 0.00174653311464923 0.190265347813694 377182 32722668 667 665 14 True 679 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E6_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E6_3.csv new file mode 100755 index 0000000..14fb3a5 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E6_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 276 262 0.00111740879388642 0.0760504373774904 0.000976577401388571 0.0743572137026017 0.000761859970340862 0.0226410644524511 48844 3314337 667 665 0 True 275 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 320 262 0.00102320091956768 0.000969693632111866 0.000915541313801785 0.000869764248111696 0.000671251612537479 0.000686968402132454 44726 42260 667 665 0 False 320 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 363 262 0.000994627428789611 0.0010352271156261 0.000854505226215 0.000930800335698482 0.000721565322608303 0.000699410367401796 43477 45116 667 665 0 True 364 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 407 262 0.00102418463462249 0.00103407982074665 0.000869764248111696 0.000869764248111696 0.000775873460161675 0.000763743312125933 44769 45066 667 665 0 True 409 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 452 262 0.00101851111523661 0.00100050997257392 0.000793469138628214 0.000747692072938125 0.000887973773623777 0.000903066135442772 44521 43603 667 665 0 True 454 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 496 261 0.00103864295821876 0.00107352381870217 0.000823987182421607 0.000854505226215 0.000893438315134582 0.000857532401144546 45401 46785 667 665 0 True 499 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 539 260 0.000965047345862432 0.00106863634251571 0.000793469138628214 0.000869764248111696 0.000821543582761234 0.000860137353185062 42184 46572 667 665 0 True 543 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 584 260 0.00104619239933707 0.00114958946920976 0.000732433051041428 0.000839246204318303 0.000963626769655989 0.00106216711871135 45731 50100 667 665 0 True 588 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 633 261 0.00116577097123217 0.0010333455520238 0.000747692072938125 0.000732433051041428 0.00126975103339769 0.000967813975316239 50958 45034 667 665 0 False 633 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 673 261 0.00128489200124131 0.0746913289173953 0.00100709544518196 0.0711985961699855 0.00110738958550647 0.0223657854595197 56165 3255106 667 665 0 True 677 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 275 306 0.00101025248419507 0.00130105533919486 0.000854505226215 0.000930800335698482 0.000766588449396869 0.00192990428663564 44160 56701 667 665 0 False 275 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 320 306 0.000961455642057662 0.000941080097818361 0.000869764248111696 0.000823987182421607 0.000659394089865253 0.000648360463838497 42027 41013 667 665 0 False 320 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 363 306 0.000967174915632136 0.000949593025823887 0.000869764248111696 0.000854505226215 0.000683278836496273 0.000669761206440848 42277 41384 667 665 0 True 365 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 407 307 0.000996137317013272 0.00099690746665244 0.000869764248111696 0.000762951094834821 0.000771814134552225 0.000813174058467977 43543 43446 667 665 0 True 409 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 451 306 0.000997281171728167 0.00101730636960908 0.000747692072938125 0.000717174029144732 0.000921638172365337 0.000954523177711839 43593 44335 667 665 0 True 454 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 495 304 0.000897376900929256 0.000997825302556001 0.000656137941557946 0.000747692072938125 0.000873144256807724 0.000920054083169048 39226 43486 667 665 0 True 499 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 543 305 0.00104347002511562 0.00104078002284264 0.000930800335698482 0.000900282291905089 0.000792843675452209 0.000840456949962332 45612 45358 667 665 0 False 543 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 583 304 0.00103354136619033 0.00103022490995169 0.000732433051041428 0.000656137941557946 0.000999196567781433 0.00107316907615289 45178 44898 667 665 0 True 588 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 633 305 0.000985293574316069 0.0010527807272817 0.000595101853971161 0.00064087891966125 0.000990287378884706 0.00111233254244753 43069 45881 667 665 0 False 633 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 677 305 0.00104024435481961 0.0010525742142034 0.00064087891966125 0.000656137941557946 0.00097929762642097 0.00105576698915381 45471 45872 667 665 0 False 677 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 275 351 0.000935833296444019 0.00103089034098177 0.000793469138628214 0.000854505226215 0.000729421724662446 0.000772409031577555 40907 44927 667 665 0 True 275 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 318 351 0.000929153184909033 0.000943420579372441 0.000793469138628214 0.000823987182421607 0.000697898089093826 0.000699865118393643 40615 41115 667 665 0 True 320 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 362 350 0.000981312959908235 0.000920107547422 0.000869764248111696 0.00080872816052491 0.000727411654662911 0.000669006713310933 42895 40099 667 665 0 True 365 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 407 350 0.000952899608790249 0.00101033081674202 0.000717174029144732 0.00080872816052491 0.000802194739942576 0.000817057083155651 41653 44031 667 665 0 True 409 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 452 350 0.00112717731315162 0.00103832481180062 0.000854505226215 0.000762951094834821 0.000988891226803727 0.000941716604228728 49271 45251 667 665 0 True 454 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 499 349 0.00102681550046675 0.00093107568646955 0.000778210116731518 0.000671396963454643 0.000907610552091119 0.000831441430020794 44884 40577 667 665 0 False 499 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 541 348 0.00101727575214453 0.00096655004414217 0.00080872816052491 0.000701915007248035 0.000880480786510579 0.000865718944846443 44467 42123 667 665 0 True 544 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 584 348 0.00104955533219886 0.00104649355134231 0.000686655985351339 0.000610360875867857 0.00110361088212413 0.00119564705704071 45878 45607 667 665 0 True 588 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 628 348 0.000982548323000322 0.00103180817688534 0.000625619897764553 0.000671396963454643 0.00102861317178659 0.00105789296664706 42949 44967 667 665 0 True 633 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 673 349 0.00106188608602542 0.000963245834889352 0.000717174029144732 0.000564583810177768 0.000983269127584476 0.00101115726348901 46417 41979 667 665 0 True 678 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 275 393 0.000964864329108048 0.00101439224061527 0.00080872816052491 0.000854505226215 0.000758035208399938 0.000801406651899374 42176 44208 667 665 0 True 275 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 320 395 0.000965138854239623 0.00679834169998124 0.000839246204318303 0.00695811398489357 0.000709283828227773 0.00204632766401717 42188 296277 667 665 0 True 320 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 363 394 0.000995908546070293 0.000978642532171583 0.000823987182421607 0.000854505226215 0.000741918173555412 0.000716250428258757 43533 42650 667 665 0 True 365 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 408 394 0.000966580111180391 0.00103541068280681 0.000778210116731518 0.000762951094834821 0.000760875765276781 0.000879458832294964 42251 45124 667 665 0 True 410 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 453 394 0.00106229787372279 0.00103102801636731 0.000823987182421607 0.000793469138628214 0.000920099193578173 0.00088902326216798 46435 44933 667 665 0 True 454 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 497 393 0.00105898069504959 0.000998353058200548 0.000793469138628214 0.000732433051041428 0.000987852227189274 0.000956384316196436 46290 43509 667 665 0 True 499 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 541 391 0.0010078046351052 0.00101310727035029 0.00080872816052491 0.000854505226215 0.000854719173637332 0.000875221490664382 44053 44152 667 665 0 True 544 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 584 392 0.00107165460529063 0.000967123691581896 0.000762951094834821 0.000488288700694286 0.00105122364520773 0.00111128397619649 46844 42148 667 665 0 True 588 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 629 392 0.000961524273340556 0.000944223685788057 0.000579842832074464 0.000564583810177768 0.0010257748257788 0.00104179847557513 42030 41150 667 665 0 True 633 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 673 392 0.000959533966136639 0.0010103537626396 0.000595101853971161 0.000564583810177768 0.000966892920571319 0.00108099453139101 41943 44032 667 665 0 True 678 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 275 437 0.00101590312648665 0.000889405936447895 0.000915541313801785 0.000656137941557946 0.000839274441168302 0.000821229088724232 44407 38761 667 665 0 True 276 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 320 438 0.000980695278362192 0.00091659682509088 0.000885023270008392 0.000762951094834821 0.000793633973911604 0.000759029386773564 42868 39946 667 665 0 True 320 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 365 438 0.000943657262693899 0.000895876679567998 0.000839246204318303 0.000747692072938125 0.000762220158007255 0.000710287851119177 41249 39043 667 665 0 True 365 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 408 438 0.000972230753471971 0.00095466406919106 0.000747692072938125 0.000732433051041428 0.00087578873144312 0.000829830739225237 42498 41605 667 665 0 True 410 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 452 438 0.00103958091908498 0.00102983482969268 0.000793469138628214 0.000762951094834821 0.000970412747634108 0.00093846229428375 45442 44881 667 665 0 True 454 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 497 436 0.00107680195150765 0.000954526393805525 0.000869764248111696 0.000610360875867857 0.000978113542215835 0.000966595518961956 47069 41599 667 665 0 True 499 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 541 436 0.000951595614415269 0.00102490146171104 0.000701915007248035 0.000793469138628214 0.000881692367999069 0.000926993211768114 41596 44666 667 665 0 True 544 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 585 435 0.00101517105946912 0.000957371685106564 0.000671396963454643 0.000610360875867857 0.00103826564790721 0.00101942046191372 44375 41723 667 665 0 True 588 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 629 435 0.000923708436466134 0.000997251655116275 0.000595101853971161 0.000701915007248035 0.000947337751829257 0.000932193584754737 40377 43461 667 665 0 True 633 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 673 436 0.000984332736355558 0.000992570692008116 0.00064087891966125 0.000625619897764553 0.000996901799677006 0.00101535520500612 43027 43257 667 665 0 True 678 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 277 481 0.000972505278603546 0.00097939974679202 0.000823987182421607 0.000854505226215 0.000788874808987141 0.000784512546051164 42510 42683 667 665 0 True 276 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 322 482 0.000935238491992273 0.00106526329557012 0.000747692072938125 0.000930800335698482 0.000814951512694389 0.000875619594996381 40881 46425 667 665 0 True 320 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 365 481 0.000988038825631817 0.000936835106764393 0.000854505226215 0.000762951094834821 0.000803052353947716 0.000779383069856744 43189 40828 667 665 0 True 365 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 411 482 0.00102246885255015 0.00103040847713241 0.000747692072938125 0.000762951094834821 0.000960362869913863 0.000934697631477435 44694 44906 667 665 0 True 410 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 454 481 0.00100812491442537 0.00094227328449299 0.000579842832074464 0.000610360875867857 0.00107030818890011 0.00103205752743688 44067 41065 667 665 0 True 455 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 498 481 0.000880241957300132 0.000957853548955933 0.000564583810177768 0.000488288700694286 0.000931083914323456 0.00103936041360835 38477 41744 667 665 0 True 499 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 541 480 0.000869855756488888 0.000928092719782978 0.000595101853971161 0.000549324788281071 0.000853399460503043 0.000952521550135137 38023 40447 667 665 0 True 544 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 586 480 0.000974792988033335 0.000995920793056113 0.000610360875867857 0.000656137941557946 0.000989098634578107 0.0010489206204802 42610 43403 667 665 0 True 589 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 630 479 0.000918561090249108 0.00099433752612247 0.000534065766384375 0.000671396963454643 0.000967287270503724 0.000953345698416398 40152 43334 667 665 0 True 633 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 675 480 0.000944137681674155 0.00102283633092803 0.000671396963454643 0.000625619897764553 0.00097548824134427 0.0010524439899797 41270 44576 667 665 0 True 678 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 277 526 0.00101617765161823 0.000895486599308984 0.000854505226215 0.000686655985351339 0.000813560152524511 0.000812763996423972 44419 39026 667 665 0 True 276 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 322 526 0.000994238518186547 0.000857878273160585 0.000885023270008392 0.000778210116731518 0.000806234916222387 0.000695567833782212 43460 37387 667 665 0 True 321 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 366 525 0.00108755418582766 0.000985870489912123 0.000946059357595178 0.000823987182421607 0.00082934342063579 0.000829648616025327 47539 42965 667 665 0 True 365 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 411 525 0.000987192373142795 0.00096049232717867 0.000747692072938125 0.000701915007248035 0.000907426922625522 0.000926206412083595 43152 41859 667 665 0 True 410 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 455 524 0.00089744553221215 0.000922631596156792 0.000473029678797589 0.000488288700694286 0.00102096586567272 0.00103300554380382 39229 40209 667 665 0 True 455 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 499 522 0.000867705309624885 0.000957004550745139 0.000534065766384375 0.000564583810177768 0.000911712806806727 0.00099067783502701 37929 41707 667 665 0 True 499 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 544 522 0.00098300586488628 0.00105376740087802 0.000701915007248035 0.000732433051041428 0.00093841494250908 0.000982855282465197 42969 45924 667 665 0 True 544 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 588 521 0.000947317597781562 0.000963268780786941 0.000671396963454643 0.00064087891966125 0.000917828922873429 0.00094450518692266 41409 41980 667 665 0 True 589 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 632 520 0.0009925684903028 0.000989886021990201 0.000610360875867857 0.000503547722590982 0.00104206203659123 0.00108897932341292 43387 43140 667 665 0 True 633 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 676 521 0.000944823994503092 0.000978871991147473 0.000595101853971161 0.000610360875867857 0.00101450112778685 0.000992131492302873 41300 42660 667 665 0 True 678 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 279 566 0.00100933740042316 0.000998284220507781 0.000900282291905089 0.000885023270008392 0.000713930950844964 0.000726970743254737 44120 43506 667 665 0 True 276 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 323 566 0.00102150801458964 0.000975957862153668 0.000915541313801785 0.000839246204318303 0.000754799666596788 0.000748769964774581 44652 42533 667 665 0 True 321 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 367 566 0.00100638625525873 0.000932544223915247 0.000885023270008392 0.00080872816052491 0.000735510124023686 0.000673921302821782 43991 40641 667 665 0 True 365 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 411 565 0.000885000392914095 0.000908496923241957 0.000656137941557946 0.000686655985351339 0.000830074364612376 0.000825576834883227 38685 39593 667 665 0 True 410 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 455 565 0.000971796088680311 0.000985388626062754 0.000534065766384375 0.000595101853971161 0.00105487955677221 0.00101685376065926 42479 42944 667 665 0 True 455 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 499 563 0.000968593295478605 0.00093036436364429 0.000518806744487678 0.000473029678797589 0.00105874374160866 0.00112895650722191 42339 40546 667 665 0 True 499 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 544 563 0.000988176088197604 0.00103802651513196 0.000579842832074464 0.000625619897764553 0.00103299644609726 0.00101806529141362 43195 45238 667 665 0 True 544 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 588 562 0.000957383519272637 0.00105181699958296 0.00064087891966125 0.000854505226215 0.000900354923008498 0.000840102654334852 41849 45839 667 665 0 True 589 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 632 563 0.000894334247387636 0.000903150529103716 0.000564583810177768 0.000610360875867857 0.000889992708770146 0.000873035836842013 39093 39360 667 665 0 True 634 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 676 563 0.000937160167913297 0.00104582812031222 0.000671396963454643 0.000671396963454643 0.000876289668688623 0.000997593655916807 40965 45578 667 665 0 True 678 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 276 610 0.00101013809872358 0.00101303843265752 0.000869764248111696 0.000869764248111696 0.000764380142185243 0.000777779678047037 44155 44149 667 665 0 False 276 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 321 610 0.00101510242818623 0.00099130866764072 0.000885023270008392 0.000854505226215 0.000768029458149052 0.000769755919336705 44372 43202 667 665 0 False 321 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 367 608 0.000937892234930829 0.000911135701464694 0.000839246204318303 0.000778210116731518 0.000711361332489158 0.000714954500678845 40997 39708 667 665 0 True 366 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 411 608 0.00095930519519366 0.00100411247849539 0.000793469138628214 0.000762951094834821 0.00080915179158707 0.000785667255336114 41933 43760 667 665 0 True 410 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 455 610 0.000997121032068081 0.00102568162222907 0.000625619897764553 0.000549324788281071 0.00102042756051883 0.00110700538480662 43586 44700 667 665 0 False 455 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 500 610 0.000962965530281323 0.000916482095602935 0.000549324788281071 0.000350957503624018 0.0010120952371652 0.00109773079433175 42093 39941 667 665 0 False 500 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 544 610 0.0010164521767498 0.000977128102930707 0.00064087891966125 0.000518806744487678 0.00104882796374254 0.00106813368539246 44431 42584 667 665 0 False 544 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 589 609 0.000990532428910287 0.00101886669064513 0.000793469138628214 0.000747692072938125 0.000865972256848182 0.000915307858699083 43298 44403 667 665 0 False 589 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 634 609 0.000908975587738289 0.000977839425755967 0.000701915007248035 0.00080872816052491 0.000771170825827227 0.000756827142397345 39733 42615 667 665 0 False 634 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 678 609 0.000932378855205037 0.00110330759377271 0.000671396963454643 0.000854505226215 0.000817772070545876 0.00091150330659698 40756 48083 667 665 0 False 678 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 277 659 0.00110157784463227 0.0754989327289384 0.00102235446707866 0.0738841840238041 0.000719987367292747 0.0235384414976364 48152 3290302 667 665 0 True 276 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 321 654 0.000985819747484921 0.0010402293213005 0.000869764248111696 0.000991836423285267 0.000704020842513466 0.000688546027344452 43092 45334 667 665 0 False 321 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 366 654 0.000982685585566109 0.000960652948461793 0.000915541313801785 0.000839246204318303 0.000704716366930588 0.000665922841612003 42955 41866 667 665 0 False 366 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 410 654 0.00101958633866861 0.000997228709218687 0.000885023270008392 0.000839246204318303 0.000761369804102236 0.000735819293173046 44568 43460 667 665 0 False 410 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 455 653 0.000994879076826887 0.00104142250797513 0.000747692072938125 0.000793469138628214 0.000883331603919052 0.000898172601481144 43488 45386 667 665 0 False 455 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 500 653 0.000918698352814895 0.000982933415020729 0.000610360875867857 0.000656137941557946 0.000883484324672282 0.000975025099935584 40158 42837 667 665 0 False 500 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 544 653 0.00108071393463259 0.00100539744876038 0.000885023270008392 0.000717174029144732 0.000896787620228293 0.000933118138810682 47240 43816 667 665 0 False 544 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 589 653 0.00107179186785641 0.000919258549211206 0.000900282291905089 0.00080872816052491 0.000788446594777674 0.00065799966394506 46850 40062 667 665 0 False 589 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 634 653 0.00103134516513773 0.000970496738527481 0.000885023270008392 0.000778210116731518 0.000766604385847777 0.000708813610606317 45082 42295 667 665 0 False 634 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 674 658 0.0010805995491611 0.0784327951946701 0.000961318379491875 0.0746776531624323 0.00079073141347267 0.0243642284135035 47235 3418162 667 665 0 True 679 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E7_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E7_1.csv new file mode 100755 index 0000000..e8af75a --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E7_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 269 276 0.00991790669096672 0.0413363920214819 0.00994888227664607 0.0421606775005722 0.00147040017455419 0.00994989935340574 433530 1801472 667 665 0 True 270 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 315 275 0.00977176781259176 0.00987625851077683 0.0097962920576791 0.00991836423285267 0.00131344729070906 0.00127789540224108 427142 430415 667 665 0 False 315 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 357 275 0.0102092464868504 0.0607898092679628 0.0101625085831998 0.0625314717326619 0.00215086393407347 0.0134260375452363 446265 2649267 667 665 0 True 359 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 402 275 0.0101035085570055 0.0823159982813523 0.0101319905394064 0.0820935378042267 0.00161857509069675 0.0121745901388287 441643 3587395 667 665 0 True 404 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 446 275 0.0100415573856468 0.0708454129142954 0.00999465934233616 0.0692607003891051 0.00185207682128292 0.0157105947902815 438935 3087498 667 665 0 True 449 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 490 274 0.00983449680515659 0.0627191691749401 0.00973525597009232 0.0666666666666667 0.00173004565351421 0.0196342342910078 429884 2733350 667 665 0 True 493 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 534 274 0.00983168292255795 0.0779852813539915 0.00984206912336919 0.0771953917753872 0.00168735333731773 0.0263625297510323 429761 3398659 667 665 0 True 538 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 579 274 0.00987926727869757 0.0644287303289122 0.00991836423285267 0.063935301747158 0.00183196986927165 0.0164640718455823 431841 2807854 667 665 0 True 583 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 627 274 0.0100016826102856 0.00973114865442388 0.00999465934233616 0.00971999694819562 0.00207626659058212 0.00202646387048628 437192 424091 667 665 0 False 627 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 665 272 0.0100027578337176 0.0409188455230546 0.00994888227664607 0.0417029068436713 0.00206928490283583 0.00952814692188395 437239 1783275 667 665 0 True 672 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 270 319 0.00976847351101286 0.0100038835931669 0.0097962920576791 0.0100099183642329 0.00148085254584159 0.0014992671447462 426998 435977 667 665 0 False 270 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 315 319 0.00992964264034154 0.00999677036491435 0.00993362325474937 0.00997940032043946 0.00139663520801395 0.00126855181652173 434043 435667 667 665 0 False 315 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 359 320 0.0102005989452058 0.113661723546679 0.0102235446707866 0.106645304036011 0.00144385831546511 0.0351012412538167 445887 4953466 667 665 0 True 359 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 403 319 0.0103060852270134 0.0514984875785252 0.0103150988021668 0.0512092774853132 0.00165096931193733 0.00876459025024275 450498 2244344 667 665 0 True 404 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 447 319 0.010197922325173 0.0758126260948779 0.0102693217364767 0.0736400396734569 0.00184197360708451 0.0168874001750439 445770 3303973 667 665 0 True 449 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 494 318 0.0101444128016102 0.0407193538894157 0.0101319905394064 0.043228809033341 0.00164995278177068 0.00873676811318748 443431 1774581 667 665 0 False 494 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 536 318 0.00987357088221739 0.0443300285504331 0.0098115510795758 0.0456855115587091 0.00152805229163386 0.0105449776334866 431592 1931937 667 665 0 True 538 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 579 318 0.010079350345427 0.0505860898526931 0.0100251773861295 0.0514381628137636 0.00197736396414756 0.0135188941406218 440587 2204581 667 665 0 True 583 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 628 318 0.00984188610661481 0.00984376711979078 0.00990310521095598 0.00987258716716258 0.00221669056595768 0.00207734988632386 430207 428999 667 665 0 False 628 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 672 318 0.00976426412566205 0.00964209562588091 0.0098115510795758 0.00970473792629892 0.00196153641812597 0.00191265548416336 426814 420210 667 665 0 False 672 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 271 364 0.00992060618809387 0.0509741738186161 0.00991836423285267 0.0501106279087511 0.0014753314024618 0.011827480572151 433648 2221494 667 665 0 True 270 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 315 364 0.00985085392757958 0.0618941264812294 0.00987258716716258 0.0649729152361334 0.00131032361684208 0.0180972609359795 430599 2697394 667 665 0 True 315 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 358 364 0.0102160181067626 0.0394854382465663 0.01025406271458 0.0411841000991836 0.00137840725218033 0.00870530358301552 446561 1720806 667 665 0 True 360 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 403 364 0.0101991348111707 0.0338243640687895 0.0101472495613031 0.0350804913405051 0.00156587966391599 0.00540672701901131 445823 1474092 667 665 0 True 404 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 448 363 0.010164521767498 0.0728194484838785 0.0101472495613031 0.0705577172503243 0.00175989851546164 0.0154516776109675 444310 3173528 667 665 0 True 449 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 493 362 0.0104123722071214 0.0317129743562385 0.0103303578240635 0.0328374151216907 0.00244607702971708 0.00512511843891722 455144 1382076 667 665 0 True 494 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 536 363 0.0101249901485513 0.0300402413678967 0.0101625085831998 0.0301518272678721 0.00171504686310855 0.00412874065792196 442582 1309177 667 665 0 True 538 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 581 362 0.0102298358717185 0.0501270801173224 0.0101472495613031 0.0506752117189288 0.00202632285489992 0.0091601307833695 447165 2184577 667 665 0 True 583 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 624 361 0.0100403448996491 0.0579797399197238 0.00993362325474937 0.0599526970321202 0.00245290191512077 0.0139417632659376 438882 2526802 667 665 0 True 628 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 668 361 0.0100071273587285 0.0625481534002091 0.00996414129854276 0.0632791638056001 0.00197181112835161 0.0191384544852752 437430 2725897 667 665 0 True 672 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 271 409 0.0100144480289038 0.0415918945911357 0.00997940032043946 0.044785229266804 0.00165683629989929 0.0112753191350255 437750 1812607 667 665 0 True 270 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 316 408 0.0101391053157331 0.032661695437954 0.0101167315175097 0.0324864576180667 0.00140553630391435 0.00543017857848856 443199 1423422 667 665 0 True 315 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 359 408 0.0101267516848122 0.0828378338843217 0.0101319905394064 0.0800793469138628 0.00147505060839502 0.0211081080068359 442659 3610137 667 665 0 True 360 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 404 408 0.0102583864854023 0.0642323134455502 0.0102693217364767 0.0629129472800793 0.00152295545644359 0.0146146934928902 448413 2799294 667 665 0 True 404 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 448 407 0.0101624857061055 0.0433863785120847 0.0102388036926833 0.0452582589456016 0.00165060873829772 0.00760753904403789 444221 1890812 667 665 0 True 449 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 492 406 0.0101047667971919 0.0537638213180009 0.0101472495613031 0.0550698100251774 0.00176984092132722 0.0102794950969477 441698 2343069 667 665 0 True 494 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 537 406 0.0102812178255116 0.0416639906013603 0.0103456168459602 0.0429694056610971 0.00159808870873651 0.00567220285470546 449411 1815749 667 665 0 True 538 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 581 406 0.0100284716877084 0.0518401061018305 0.010101472495613 0.0517586022735943 0.00189325843638868 0.00938401856922004 438363 2259232 667 665 0 True 583 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 625 406 0.0100133270512832 0.0473478271095454 0.0101472495613031 0.0484168764782177 0.00196567293547834 0.007651279221744 437701 2063455 667 665 0 True 628 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 669 405 0.00989681401002406 0.0877983698087058 0.00985732814526589 0.0869459067673762 0.00182092731253457 0.0170228929695521 432608 3826321 667 665 0 True 672 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 271 452 0.00998976364415641 0.0416274836782962 0.0100404364080262 0.0426642252231632 0.00173890602155968 0.00830554758805361 436671 1814158 667 665 0 True 270 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 316 452 0.0101177381096588 0.0514247165177765 0.0101472495613031 0.0513771267261769 0.00148108094788284 0.00653265180745723 442265 2241129 667 665 0 True 315 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 360 452 0.0101986315150962 0.0348676910862645 0.0101472495613031 0.0357824063477531 0.00155690786616554 0.00460712080006789 445801 1519561 667 665 0 True 360 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 404 452 0.0104250232402682 0.0517890744255925 0.0104676890211337 0.0524910353246357 0.00179989697912249 0.00900831122704985 455697 2257008 667 665 0 True 404 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 449 452 0.0106669485124684 0.0943245961091789 0.0107423514152743 0.0939650568398566 0.00200644429134741 0.013661085007464 466272 4110739 667 665 0 True 449 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 493 451 0.0106051803578641 0.0595108508281461 0.0104982070649271 0.0603952086671244 0.00223747366580927 0.0142017040962811 463572 2593529 667 665 0 True 494 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 537 450 0.0102395128826065 0.0519705305837264 0.0102693217364767 0.0508583199816892 0.00178228073577217 0.00908509076621972 447588 2264916 667 665 0 True 538 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 582 450 0.0102036644758417 0.0327512532762439 0.0101625085831998 0.033173113603418 0.00196647805807402 0.00405776099420902 446021 1427325 667 665 0 True 583 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 626 450 0.0100618722453834 0.0378651136883178 0.0101472495613031 0.0382391088731212 0.00188856155367798 0.00432299147378895 439823 1650191 667 665 0 True 628 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 669 450 0.00985250107836903 0.0658534870020095 0.00991836423285267 0.065995269703212 0.00191774885086616 0.0115266793567099 430671 2869946 667 665 0 True 672 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 273 497 0.0100416946482126 0.0524045751825203 0.0100251773861295 0.0536202029449912 0.00160957044856948 0.0127396765146467 438941 2283832 667 665 0 True 271 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 318 496 0.0102948754508074 0.0536747223976627 0.0102998397802701 0.0538185702296483 0.00171603403557955 0.0053734645527859 450008 2339186 667 665 0 True 315 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 361 496 0.0104809348587322 0.0675423509563563 0.0103608758678569 0.0654154268711376 0.00162626122940515 0.0152444549214162 458141 2943548 667 665 0 True 360 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 406 495 0.0104783726241709 0.0863315762512255 0.010452429999237 0.0831464103150988 0.00181413520537511 0.0191254370483022 458029 3762397 667 665 0 True 405 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 450 496 0.0102808060378142 0.0945072225080899 0.0102845807583734 0.0898451209277485 0.00195878305398771 0.0300525113520737 449393 4118698 667 665 0 True 449 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 494 495 0.0102245055087471 0.0442625217197262 0.0103150988021668 0.0446173800259403 0.00180132899685077 0.00736964112638603 446932 1928995 667 665 0 True 494 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 537 494 0.0101246241150425 0.0393258495288347 0.0101777676050965 0.0404516670481422 0.00184078450891484 0.00582449538190341 442566 1713851 667 665 0 True 539 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 582 494 0.0101467462652286 0.0958711954984738 0.0100709544518196 0.0921492332341497 0.00191320964321555 0.0173784876370534 443533 4178141 667 665 0 True 583 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 626 494 0.010044485653717 0.0630445878945475 0.0101319905394064 0.0653543907835508 0.0018289267202867 0.0151275254787756 439063 2747532 667 665 0 True 628 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 671 493 0.00992376322710698 0.0739771378549372 0.00999465934233616 0.072129396505684 0.00183426040562487 0.0138376725984865 433786 3223981 667 665 0 True 673 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 273 541 0.00985192915101159 0.0513341949517878 0.00987258716716258 0.0545510032806897 0.00145194293597231 0.0112552873747664 430646 2237184 667 665 0 True 271 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 317 540 0.0101009920766328 0.0989773587092015 0.0100862134737163 0.0932784008545052 0.00147307508235299 0.0247126697369067 441533 4313510 667 665 0 True 315 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 361 540 0.0107312560245398 0.0570395547119114 0.0104676890211337 0.0596322575722896 0.00258572858011673 0.0115619484828619 469083 2485828 667 665 0 True 360 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 407 540 0.0108280490105142 0.0596035522544058 0.0106202792401007 0.0584267948424506 0.00254296743171033 0.0102211075536348 473314 2597569 667 665 0 True 405 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 451 540 0.0104665451664188 0.0565126021737796 0.0104676890211337 0.0559548332951858 0.00195099746771792 0.01040692229799 457512 2462863 667 665 0 True 449 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 495 538 0.00996679504148132 0.0633644537069384 0.00991836423285267 0.0619516289005875 0.00194544231134709 0.0129236088689345 435667 2761472 667 665 0 True 494 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 539 538 0.0100978121605254 0.0721121641365946 0.0100862134737163 0.0698405432211795 0.00197410223409132 0.0162539097934657 441394 3142704 667 665 0 True 539 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 584 537 0.010053476351776 0.0575657270895251 0.010101472495613 0.0582284275577935 0.00175980672534368 0.0136300455539771 439456 2508759 667 665 0 True 583 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 628 537 0.0100327954585307 0.0487858465114491 0.00997940032043946 0.0483253223468376 0.00182381069170302 0.00753542687070205 438552 2126125 667 665 0 True 628 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 672 536 0.00999758761040629 0.0662727314968584 0.00988784618905928 0.065796902418555 0.00179952157442048 0.0149489483308154 437013 2888217 667 665 0 True 673 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 274 584 0.00981406755994857 0.0494996245477507 0.00978103303578241 0.0497291523613336 0.0013873699107734 0.0144231116135618 428991 2157232 667 665 0 True 271 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 319 583 0.010150543862882 0.0563333717677118 0.0102082856488899 0.0565346761272602 0.00149074748707105 0.0129451391476143 443699 2455052 667 665 0 True 315 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 363 583 0.0104509887422963 0.0448708404107086 0.010452429999237 0.0450446326390478 0.00140892968551887 0.00845972544379707 456832 1955506 667 665 0 True 360 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 407 582 0.0105272609746855 0.0507717451100858 0.0103761348897536 0.0489967193102922 0.00227020953051563 0.00795926299629239 460166 2212672 667 665 0 True 405 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 451 582 0.0103873217888652 0.0837979361312414 0.0103913939116503 0.0793621728847181 0.00201564864742613 0.0181515450948756 454049 3651979 667 665 0 True 449 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 495 580 0.0101439552597242 0.0589998456888387 0.0102693217364767 0.0580910963607233 0.00216901135719738 0.011220325691784 443411 2571259 667 665 0 True 494 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 539 579 0.0100083855989149 0.0519583004203115 0.0100251773861295 0.0521705958648051 0.00215527935239764 0.00722294287022573 437485 2264383 667 665 0 True 539 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 583 579 0.00994755540517679 0.0367867253393268 0.00994888227664607 0.0387273975738155 0.00172067787211138 0.00722258880137217 434826 1603194 667 665 0 True 583 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 628 580 0.009907177333741 0.0483959498196166 0.00984206912336919 0.0478980697337301 0.00163952594188032 0.00795467031833632 433061 2109133 667 665 0 True 628 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 671 579 0.0100595159046707 0.0531862730756853 0.0100862134737163 0.05297932402533 0.00187601827741878 0.00870668554187714 439720 2317899 667 665 0 True 673 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 271 623 0.00958085846067582 0.0099680421011329 0.00952162966353857 0.00978103303578241 0.00150591414644542 0.00187208381226284 418797 434415 667 665 0 False 271 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 315 623 0.00979377557730634 0.00943358625448951 0.00976577401388571 0.00941481651026169 0.00143572876370399 0.00125027426796917 428104 411123 667 665 0 False 315 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 363 626 0.010124280958628 0.0701987975202368 0.00994888227664607 0.068207827878233 0.00175530324438539 0.0106783873237714 442551 3059318 667 665 0 True 360 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 407 626 0.0101751824934409 0.0772267358714938 0.0100251773861295 0.0727092393377585 0.00187614505314097 0.0217544935038238 444776 3365601 667 665 0 True 405 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 449 623 0.0102917870430772 0.0120356051492889 0.0102388036926833 0.0106813153276875 0.00213899792499967 0.00588575108649286 449873 524521 667 665 0 False 449 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 494 623 0.00974559641671497 0.00996067646800682 0.00985732814526589 0.00988784618905928 0.00197706405703096 0.00217072878968957 425998 434094 667 665 0 False 494 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 539 623 0.00975271119304161 0.00992889639984603 0.00962844281681544 0.00984206912336919 0.00234939896250226 0.002214258460467 426309 432709 667 665 0 False 539 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 583 623 0.00986121725129653 0.00962353239473139 0.0097962920576791 0.00962844281681544 0.00164987404631526 0.0016253703021705 431052 419401 667 665 0 False 583 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 628 622 0.00974687753399565 0.00971205766762982 0.00976577401388571 0.00965896086060884 0.00147000622898652 0.0015023637777203 426054 423259 667 665 0 False 628 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 673 622 0.00987057398286437 0.00992006222927426 0.00984206912336919 0.00990310521095598 0.00171320818596613 0.00158352225500369 431461 432324 667 665 0 False 673 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 271 673 0.00957195927099394 0.0403147488772286 0.00956740672922866 0.0407721065079728 0.0014272115893167 0.00876976324787884 418408 1756948 667 665 0 True 271 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 316 667 0.00957081541627904 0.00959898028431114 0.00958266575112535 0.00962844281681544 0.00131871908232005 0.00136954198846802 418358 418331 667 665 0 False 316 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 360 666 0.00966518343025786 0.00946986371857774 0.00970473792629892 0.00952162966353857 0.00136315755279371 0.00130274091567339 422483 412704 667 665 0 False 360 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 405 666 0.00970739166923748 0.00992641824290642 0.00970473792629892 0.00988784618905928 0.0013801008497702 0.00148986198636822 424328 432601 667 665 0 False 405 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 450 666 0.00970572164135373 0.00963631325968847 0.00967421988250553 0.00962844281681544 0.00153648211067517 0.0016542915095199 424255 419958 667 665 0 False 450 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 494 666 0.00950252728979982 0.00968819393413724 0.00944533455405508 0.00967421988250553 0.00161426783269608 0.00177874965723365 415373 422219 667 665 0 False 494 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 539 666 0.00953663703739799 0.00952417665817095 0.00961318379491875 0.00961318379491875 0.00168686625136325 0.00182685536560277 416864 415071 667 665 0 False 539 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 584 666 0.00974118113751547 0.00964767147899504 0.00968947890440223 0.00962844281681544 0.00166620427597114 0.00130211473369539 425805 420453 667 665 0 False 584 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 628 666 0.00970725440667169 0.00977171700136127 0.00976577401388571 0.0097962920576791 0.00150849198174606 0.00152869079503889 424322 425859 667 665 0 False 628 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 668 669 0.00972098066325043 0.0398516777179846 0.00968947890440223 0.0410467689021134 0.00169842584278286 0.00929069935886775 424922 1736767 667 665 0 True 673 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E7_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E7_2.csv new file mode 100755 index 0000000..1468945 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E7_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 269 276 0.0086928382913144 0.731783934544533 0.00845349813076982 0.763225757228962 0.00236108775760117 0.220819592601679 379980 31891711 667 665 13 True 270 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 315 275 0.00705897909365299 0.00708420169214522 0.00706492713817044 0.00712596322575723 0.00137585236568577 0.00137410349683421 308561 308735 667 665 0 False 315 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 357 275 0.00669312860164104 0.00666335098446505 0.00657663843747616 0.00671396963454643 0.00150914521639513 0.0012449015950488 292569 290394 667 665 0 True 359 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 402 275 0.00663765164796865 0.0067672959005433 0.00656137941557946 0.00679026474402991 0.00141655085270636 0.0013019434683529 290144 294924 667 665 0 True 404 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 446 275 0.00700167197243676 0.00691442499588408 0.00701915007248035 0.00686655985351339 0.00158679956710244 0.00176414777971869 306056 301336 667 665 0 True 449 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 490 274 0.00720946461994455 0.00755255040783465 0.00717174029144732 0.00764476997024491 0.00167000833844547 0.00171610605529559 315139 329146 667 665 0 True 493 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 534 274 0.00756511192789963 0.00744094156196167 0.00752269779507134 0.00746166170748455 0.00165261934651788 0.00153220009729909 330685 324282 667 665 0 True 538 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 579 274 0.00741844687635583 0.0075821047239293 0.00750743877317464 0.00762951094834821 0.00182169719063107 0.0019047875360452 324274 330434 667 665 0 True 583 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 627 274 0.00970318228388667 0.00816075436932914 0.00880445563439384 0.00805676356145571 0.00609402886579004 0.00229417866421871 424144 355652 667 665 0 False 627 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 665 272 0.0102838029371673 0.721589485271889 0.00990310521095598 0.735866330968185 0.00258620320356262 0.217128402347022 449524 31447429 667 665 12 True 672 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 270 319 0.00703271618939901 0.00696446999852573 0.00695811398489357 0.00703440909437705 0.00160606091659749 0.00141527744207367 307413 303517 667 665 0 False 270 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 315 319 0.00673007510893214 0.00656594564919968 0.00669871061264973 0.00653086137178607 0.00129691403772878 0.00115325740563167 294184 286149 667 665 0 False 315 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 359 320 0.00663401418997528 0.00710687223896317 0.00665293354695964 0.00712596322575723 0.00131199276438612 0.00135090545054246 289985 309723 667 665 0 True 359 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 403 319 0.00701077705596732 0.00708743706370527 0.00698863202868696 0.00708018616006714 0.00148006547327971 0.00132685332136271 306454 308876 667 665 0 True 404 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 447 319 0.00721051696628225 0.00744465879737109 0.00721751735713741 0.00750743877317464 0.00170528003086312 0.0016564596385696 315185 324444 667 665 0 True 449 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 494 318 0.00731810794076525 0.00752019669223413 0.00735484855420768 0.00756847486076143 0.0016557578229879 0.00162645133465267 319888 327736 667 665 0 False 494 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 536 318 0.00731023822032678 0.00728263781449504 0.00737010757610437 0.0072632944228275 0.00150819172363742 0.0015711582475479 319544 317383 667 665 0 True 538 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 579 318 0.00759336513935754 0.00759963538968731 0.00755321583886473 0.00756847486076143 0.00177087083770904 0.00194228268024059 331920 331198 667 665 0 True 583 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 628 318 0.00798239012789325 0.00773969714857067 0.00787365529869535 0.00776684214541848 0.0023904780955141 0.00189098833883218 348925 337302 667 665 0 False 628 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 672 318 0.00777514653064861 0.00728057268371203 0.00776684214541848 0.00732433051041428 0.00236097180956629 0.00190801491669944 339866 317293 667 665 0 False 672 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 271 364 0.00644326497771943 0.00641051013893167 0.0064087891966125 0.0063935301747158 0.00139508137498403 0.00136578478838793 281647 279375 667 665 0 True 270 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 315 364 0.00672538530460108 0.00659628012581236 0.00674448767833982 0.00666819256885634 0.00127807200823123 0.00136098082700873 293979 287471 667 665 0 True 315 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 358 364 0.00706055761315955 0.00730836016569233 0.00712596322575723 0.00737010757610437 0.00135247946129617 0.00134959704257409 308630 318504 667 665 0 True 360 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 403 364 0.00738559536894405 0.00741797271847506 0.00738536659800107 0.00746166170748455 0.00141597862921012 0.00142799292310739 322838 323281 667 665 0 True 404 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 448 363 0.00757037365958815 0.00758343558598946 0.00758373388265812 0.00761425192645151 0.00161833282355973 0.00176288924362156 330915 330492 667 665 0 True 449 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 493 362 0.00758089712296518 0.00734670276056357 0.00764476997024491 0.00743114366369116 0.00179015634101734 0.00175121854407269 331375 320175 667 665 0 True 494 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 536 363 0.00767322907555149 0.00732224243373368 0.007690547035935 0.00727855344472419 0.00161829153546156 0.00181012828990913 335411 319109 667 665 0 True 538 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 581 362 0.0075753151119565 0.00762244361189079 0.00761425192645151 0.007690547035935 0.00198736590429782 0.00213588404332219 331131 332192 667 665 0 True 583 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 624 361 0.00734828282814418 0.00709565169504214 0.00727855344472419 0.00704966811627375 0.00225268057252217 0.00189669983947624 321207 309234 667 665 0 True 628 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 668 361 0.00653831930452718 0.00654756598523087 0.00653086137178607 0.00654612039368277 0.00191918145205772 0.00184151994187763 285802 285348 667 665 0 True 672 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 271 409 0.0065935446101623 0.00658232902007823 0.00659189745937285 0.00666819256885634 0.00147261526579048 0.00152984305086021 288216 286863 667 665 0 True 270 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 316 408 0.00699522063184476 0.00698658984380154 0.00694285496299687 0.00700389105058366 0.00137308923728681 0.00138956816190168 305774 304481 667 665 0 True 315 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 359 408 0.0072240830832009 0.00716081804419495 0.00720225833524071 0.00720225833524071 0.00133791921273052 0.00131752310922732 315778 312074 667 665 0 True 360 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 404 408 0.00753232905177075 0.00758788709012173 0.00753795681696803 0.00755321583886473 0.0015114429924443 0.00142344044907884 329252 330686 667 665 0 True 404 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 448 407 0.00760343106084861 0.00758212766982689 0.0076752880140383 0.00756847486076143 0.00158057421629994 0.00156196827252278 332360 330435 667 665 0 True 449 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 492 406 0.00737095402859339 0.00761250803823475 0.00747692072938125 0.00755321583886473 0.00164534404213145 0.00166876848584207 322198 331759 667 665 0 True 494 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 537 406 0.00756737676023513 0.00738662862236846 0.00755321583886473 0.00735484855420768 0.00165489145374447 0.00160724764796928 330784 321915 667 665 0 True 538 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 581 406 0.00713982674490175 0.00678248608474723 0.00717174029144732 0.00686655985351339 0.00194062923493236 0.00194785231815339 312095 295586 667 665 0 True 583 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 625 406 0.00661450002853918 0.00644715473738133 0.00663767452506294 0.00642404821850919 0.00180220057218786 0.00185869877363137 289132 280972 667 665 0 True 628 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 669 405 0.00623291009565028 0.00667597122813901 0.00621042191195544 0.00669871061264973 0.00174003957277852 0.00210630497571655 272452 290944 667 665 0 True 672 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 271 452 0.00688202476925877 0.00692213481747399 0.00689707789730678 0.00689707789730678 0.00150060000026103 0.00168681644242022 300826 301672 667 665 0 True 270 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 316 452 0.00674203982924994 0.00698115166607294 0.00674448767833982 0.00704966811627375 0.00154484396876752 0.0015402182313686 294707 304244 667 665 0 True 315 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 360 452 0.00713259758310362 0.00720902737502947 0.00708018616006714 0.00720225833524071 0.00144910187952174 0.00141701710505436 311779 314175 667 665 0 True 360 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 404 452 0.00720081707829994 0.00714884028565348 0.00715648126955062 0.00720225833524071 0.0017105248833281 0.00149355558026521 314761 311552 667 665 0 True 404 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 449 452 0.00716146847610756 0.00713516453069042 0.00721751735713741 0.00721751735713741 0.00179892626014659 0.00191178708184338 313041 310956 667 665 0 True 449 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 493 451 0.00726944836119363 0.00748811832740469 0.00721751735713741 0.00743114366369116 0.001931817469825 0.00182061172137507 317761 326338 667 665 0 True 494 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 537 450 0.00687140979750454 0.00705141200449051 0.00694285496299687 0.00704966811627375 0.00175592479940237 0.00159276678779632 300362 307306 667 665 0 True 538 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 582 450 0.00647188422268609 0.00636682114992218 0.00653086137178607 0.00642404821850919 0.00181277405206941 0.00199903482129148 282898 277471 667 665 0 True 583 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 626 450 0.00624961037448774 0.00609805585146203 0.00628671702143893 0.00611886778057527 0.00187326386102429 0.00192384740528291 273182 265758 667 665 0 True 628 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 669 450 0.00613554518231843 0.00646305624441052 0.00627145799954223 0.00651560234988937 0.00179522069140022 0.00192586651633491 268196 281665 667 665 0 True 672 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 273 497 0.00690249976865538 0.00695857290284535 0.00689707789730678 0.00697337300679027 0.00147820453553 0.00150780661660186 301721 303260 667 665 0 True 271 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 318 496 0.0068969177576467 0.00713176853784725 0.0068055237659266 0.00718699931334401 0.00159398625112707 0.00157399194231808 301477 310808 667 665 0 True 315 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 361 496 0.00680213795597052 0.00674728707784568 0.00672922865644312 0.00675974670023652 0.00146291872480064 0.00143817389781224 297334 294052 667 665 0 True 360 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 406 495 0.00703317373128496 0.00670054628445685 0.00692759594110018 0.00657663843747616 0.00185016069177713 0.0015861932847224 307433 292015 667 665 0 True 405 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 450 496 0.00682581574856884 0.00712522895703438 0.0068055237659266 0.00706492713817044 0.0017954963236229 0.00191330339342983 298369 310523 667 665 0 True 449 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 494 495 0.00669267105975508 0.00659297591655954 0.00660715648126955 0.00648508430609598 0.00177812536298092 0.00188470577767825 292549 287327 667 665 0 True 494 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 537 494 0.00655417313087562 0.00653235285512935 0.00654612039368277 0.00654612039368277 0.0017559052788047 0.00162814825947802 286495 284685 667 665 0 True 539 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 582 494 0.00623009621305163 0.00646544261775978 0.00624093995574884 0.00645456626230259 0.00173888251521266 0.00187409025739608 272329 281769 667 665 0 True 583 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 626 494 0.00621659872741588 0.00619757220930559 0.00627145799954223 0.00624093995574884 0.00183768627077737 0.0017318537166783 271739 270095 667 665 0 True 628 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 671 493 0.00630943397607674 0.00639610011524577 0.0063935301747158 0.00646982528419928 0.0017584620754021 0.00195197695889265 275797 278747 667 665 0 True 673 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 273 541 0.00692981501924707 0.00703668073823836 0.00689707789730678 0.00697337300679027 0.00148237832319034 0.00142690259490207 302915 306664 667 665 0 True 271 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 317 540 0.00703299071453058 0.00710976342205938 0.00706492713817044 0.00714122224765393 0.00139499656015963 0.00153494915020735 307425 309849 667 665 0 True 315 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 361 540 0.00722200126761979 0.00697282230524813 0.00709544518196384 0.00700389105058366 0.00181003217531004 0.00141236700862915 315687 303881 667 665 0 True 360 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 407 540 0.00687285105444531 0.00668843085052985 0.00675974670023652 0.00671396963454643 0.00191508333967585 0.00172957128719369 300425 291487 667 665 0 True 405 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 451 540 0.00665975092106041 0.00648081636914442 0.00672922865644312 0.00650034332799268 0.00193397657967754 0.00193278991382938 291110 282439 667 665 0 True 449 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 495 538 0.00644587296646939 0.00678682285939156 0.00643930724040589 0.0068055237659266 0.00183627708281537 0.00196899069298654 281761 295775 667 665 0 True 494 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 539 538 0.00663097153643366 0.00653758451977965 0.00666819256885634 0.00653086137178607 0.00168979084442075 0.00184650936537258 289852 284913 667 665 0 True 539 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 584 537 0.00665856131215692 0.00649752098258923 0.00665293354695964 0.00650034332799268 0.00162794247699509 0.00163461052305936 291058 283167 667 665 0 True 583 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 628 537 0.00633286012063778 0.00658444004265642 0.00642404821850919 0.00651560234988937 0.00170040739812764 0.00192112539297555 276821 286955 667 665 0 True 628 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 672 536 0.00631082947882891 0.00653386728437023 0.00625619897764553 0.00646982528419928 0.00176186687374485 0.00195822618129458 275858 284751 667 665 0 True 673 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 274 584 0.00689501895881997 0.00881962287270018 0.00686655985351339 0.00721751735713741 0.00135615164383911 0.0108260326953001 301394 384366 667 665 0 True 271 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 319 583 0.00702640211137279 0.00724142698242516 0.00697337300679027 0.00717174029144732 0.0014168223127765 0.00159683979208203 307137 315587 667 665 0 True 315 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 363 583 0.00701315627377431 0.00706240308943565 0.00700389105058366 0.00708018616006714 0.00135229113194422 0.00126692764021731 306558 307785 667 665 0 True 360 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 407 582 0.00694550870593543 0.00698443292942817 0.00688181887541009 0.00694285496299687 0.00179364860627934 0.00143492118120426 303601 304387 667 665 0 True 405 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 451 582 0.00665085173137853 0.00659706028633038 0.00659189745937285 0.00671396963454643 0.00198860189132809 0.0018689207731899 290721 287505 667 665 0 True 449 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 495 580 0.00677795686729764 0.00700189475749341 0.00686655985351339 0.00695811398489357 0.0019859757656126 0.002117875532617 296277 305148 667 665 0 True 494 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 539 579 0.00675395879537915 0.00709060359757255 0.00674448767833982 0.00711070420386053 0.00189498973718716 0.00174653182276928 295228 309014 667 665 0 True 539 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 583 579 0.00676528295705661 0.00717357596325444 0.00672922865644312 0.00695811398489357 0.0016538686769347 0.0024288697852212 295723 312630 667 665 0 True 583 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 628 580 0.00655360120351818 0.00644609922609224 0.00650034332799268 0.00650034332799268 0.00151200728454557 0.00147931105958485 286470 280926 667 665 0 True 628 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 671 579 0.00654559422051391 0.0066051831340769 0.00654612039368277 0.00665293354695964 0.00164974471605683 0.00170407106084994 286120 287859 667 665 0 True 673 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 271 623 0.00722399157482371 0.0075018858659581 0.00720225833524071 0.00733958953231098 0.00150119425357753 0.0018083296044569 315774 326938 667 665 0 False 271 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 315 623 0.00689570527164891 0.00677821814779567 0.00689707789730678 0.00668345159075303 0.0014507651140126 0.00136340985774597 301424 295400 667 665 0 False 315 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 363 626 0.00673796770646492 0.00683909361409934 0.00665293354695964 0.0068055237659266 0.00151860194366006 0.00141831401828418 294529 298053 667 665 0 True 360 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 407 626 0.006884884406046 0.00679120552583106 0.00674448767833982 0.00683604180972 0.00151305213222065 0.00142709572094707 300951 295966 667 665 0 True 405 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 449 623 0.0070393505467454 0.00845118059511333 0.00700389105058366 0.00730907148851759 0.00193714583008327 0.00515478190131001 307703 368309 667 665 0 False 449 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 494 623 0.006941482337339 0.00714516894203924 0.00698863202868696 0.00718699931334401 0.0018294391815219 0.00206144450637578 303425 311392 667 665 0 False 494 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 539 623 0.00685967384812972 0.00702933805100988 0.00689707789730678 0.00691233691920348 0.00197171140849338 0.00221899112567181 299849 306344 667 665 0 False 539 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 583 623 0.00677152840379993 0.00667330950401869 0.00674448767833982 0.00674448767833982 0.00166194887301956 0.00153248039183938 295996 290828 667 665 0 False 583 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 628 622 0.00652566827138045 0.00646172538235036 0.00653086137178607 0.00648508430609598 0.00142683439556196 0.00139698337464067 285249 281607 667 665 0 False 628 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 673 622 0.0067675249122978 0.00655559704938703 0.00679026474402991 0.00663767452506294 0.00158215069821849 0.0015117897384207 295821 285698 667 665 0 False 673 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 271 673 0.00886192289527015 0.741004078059649 0.00866712443732357 0.75030136568246 0.00204309712951255 0.195117717999772 387371 32293532 667 665 15 True 271 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 316 667 0.00711829939916743 0.00709230159399414 0.00709544518196384 0.00714122224765393 0.00143795648751685 0.00135866355603839 311154 309088 667 665 0 False 316 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 360 666 0.00676800533127806 0.00638595802851142 0.00672922865644312 0.00646982528419928 0.00131712426790027 0.00129604564865048 295842 278305 667 665 0 False 360 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 405 666 0.00650526190326672 0.00658868503371039 0.00654612039368277 0.00654612039368277 0.00135346988624614 0.00137749787389537 284357 287140 667 665 0 False 405 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 450 666 0.00656105913625929 0.00660226900508309 0.00662241550316625 0.00666819256885634 0.00146625376346717 0.00152615099193876 286796 287732 667 665 0 False 450 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 494 666 0.00651471014321175 0.00672223015767847 0.00654612039368277 0.00674448767833982 0.00164449556919204 0.00175413075473838 284770 292960 667 665 0 False 494 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 539 666 0.00648581637311351 0.00664400759279751 0.00646982528419928 0.00665293354695964 0.00166702723098095 0.00175360016001142 283507 289551 667 665 0 False 539 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 584 666 0.00673638918695836 0.00652007679991923 0.00668345159075303 0.00651560234988937 0.00151503739607197 0.00123499467259625 294460 284150 667 665 0 False 584 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 628 666 0.00754978427472004 0.00703925067876833 0.00721751735713741 0.00717174029144732 0.00233103851998583 0.00150358379514256 330015 306776 667 665 0 False 628 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 668 669 0.00839893626086934 0.736829462073586 0.00828564888990616 0.750988021667811 0.00212584582190304 0.206787979298002 367133 32111599 667 665 14 True 673 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E7_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E7_3.csv new file mode 100755 index 0000000..2954457 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E7_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 269 276 0.00111036264884267 0.0759287782284735 0.000946059357595178 0.0772411688410773 0.000762944913535517 0.0262553208200617 48536 3309035 667 665 0 True 270 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 315 275 0.00104822846072958 0.00101338262112135 0.000961318379491875 0.000915541313801785 0.000693555677163468 0.000687570179689575 45820 44164 667 665 0 False 315 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 357 275 0.000935146983615082 0.00100108362001364 0.00080872816052491 0.000885023270008392 0.000717496396453524 0.000711502955875302 40877 43628 667 665 0 True 359 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 402 275 0.00105316991309793 0.00105750758218503 0.000869764248111696 0.000930800335698482 0.000780882986906461 0.000713473031612394 46036 46087 667 665 0 True 404 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 446 275 0.00103514276279118 0.000945921682209644 0.000839246204318303 0.000717174029144732 0.000890775229330836 0.000898099190828033 45248 41224 667 665 0 True 449 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 490 274 0.00105303265053214 0.00102809094147591 0.000762951094834821 0.000778210116731518 0.000951385231998255 0.000915637684375065 46030 44805 667 665 0 True 493 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 534 274 0.00115357747997139 0.00107799826873203 0.000991836423285267 0.000915541313801785 0.000842315920596494 0.000879932432896859 50425 46980 667 665 0 True 538 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 579 274 0.00100839943955694 0.00107109155355773 0.000778210116731518 0.000686655985351339 0.000902057806118996 0.00103036799118111 44079 46679 667 665 0 True 583 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 627 274 0.00126782568889508 0.0010966532834719 0.00103761348897536 0.000717174029144732 0.00114877903847143 0.00104019230827246 55419 47793 667 665 0 False 627 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 665 272 0.00125213200220672 0.0736974273633271 0.00105287251087205 0.073990997177081 0.00108328127391622 0.0244387837135567 54733 3211791 667 665 0 True 672 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 270 319 0.000896438940063042 0.00100163432155578 0.000762951094834821 0.00080872816052491 0.000696763599296498 0.000779152087858528 39185 43652 667 665 0 False 270 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 315 319 0.000982365306245939 0.000887524372845595 0.000854505226215 0.00080872816052491 0.000707800834602486 0.000601366683750905 42941 38679 667 665 0 False 315 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 359 320 0.00106364762228636 0.00111078795638673 0.000976577401388571 0.00100709544518196 0.000719773753866853 0.000704935915060647 46494 48409 667 665 0 True 359 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 403 319 0.00105733354426014 0.00102423603068096 0.000915541313801785 0.000854505226215 0.000815314759310675 0.000734079931283217 46218 44637 667 665 0 True 404 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 447 319 0.0010555948850935 0.00102903172327706 0.000762951094834821 0.000778210116731518 0.00092481821088634 0.000889755997470431 46142 44846 667 665 0 True 449 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 494 318 0.00119272018831509 0.00108270217773778 0.00100709544518196 0.000900282291905089 0.000987282022979619 0.000880663621209773 52136 47185 667 665 0 False 494 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 536 318 0.00109093999578375 0.00118006162120798 0.000930800335698482 0.00103761348897536 0.000858941006202629 0.000881558426034238 47687 51428 667 665 0 True 538 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 579 318 0.001066461504885 0.00105367561728767 0.000778210116731518 0.000732433051041428 0.00103804352464284 0.00105914204413806 46617 45920 667 665 0 True 583 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 628 318 0.00104429360051034 0.000977196940623475 0.000656137941557946 0.000579842832074464 0.00111430232325485 0.00104804361411785 45648 42587 667 665 0 False 628 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 672 318 0.00109649912969814 0.00106794796558804 0.000762951094834821 0.000717174029144732 0.00104834200974527 0.00104478962025508 47930 46542 667 665 0 False 672 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 271 364 0.000993094663471652 0.000907464357850451 0.00080872816052491 0.000732433051041428 0.000792572127713217 0.000770525494626439 43410 39548 667 665 0 True 270 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 315 364 0.000943016704053558 0.00095301196456465 0.00080872816052491 0.000839246204318303 0.000717649782991169 0.000672769951417479 41221 41533 667 665 0 True 315 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 358 364 0.00101087016574112 0.000951520481221364 0.000885023270008392 0.000823987182421607 0.000763230186182906 0.000746121631631996 44187 41468 667 665 0 True 360 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 403 364 0.00112472946406174 0.000981671390653333 0.000961318379491875 0.00080872816052491 0.000839498765668337 0.000730972591722913 49164 42782 667 665 0 True 404 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 448 363 0.000997075277879486 0.00107671329846704 0.000717174029144732 0.000778210116731518 0.000884546346929974 0.000964802874777075 43584 46924 667 665 0 True 449 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 493 362 0.00106625561103632 0.00107152752561192 0.000823987182421607 0.000732433051041428 0.000949488750000883 0.00100085132870047 46608 46698 667 665 0 True 494 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 536 363 0.00106186320893113 0.00101491999625982 0.00080872816052491 0.000732433051041428 0.000917691797735417 0.000940958676126186 46416 44231 667 665 0 True 538 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 581 362 0.0010741482085691 0.00103506649434298 0.000747692072938125 0.000671396963454643 0.00104728467325678 0.00109710641250393 46953 45109 667 665 0 True 583 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 624 361 0.00102571739994045 0.00101397921445867 0.000625619897764553 0.000610360875867857 0.00106231777318439 0.00105003297821786 44836 44190 667 665 0 True 628 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 668 361 0.00100553980276971 0.000969716578009455 0.000610360875867857 0.000473029678797589 0.00102137199871866 0.00105038969100813 43954 42261 667 665 0 True 672 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 271 409 0.00100846807083984 0.000973732110087533 0.000915541313801785 0.000823987182421607 0.000777283177542416 0.000780451958825178 44082 42436 667 665 0 True 270 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 316 408 0.00102361270726504 0.000984149547592947 0.000915541313801785 0.000900282291905089 0.000745375438163783 0.000698313297152837 44744 42890 667 665 0 True 315 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 359 408 0.00103246614275833 0.000976324996515092 0.000915541313801785 0.000900282291905089 0.00070508208405297 0.000695234094342879 45131 42549 667 665 0 True 360 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 404 408 0.00111921608433595 0.00106985247508793 0.000946059357595178 0.000915541313801785 0.000833990540638526 0.000817039821344225 48923 46625 667 665 0 True 404 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 448 407 0.00104669569541162 0.00100792149749517 0.000793469138628214 0.000793469138628214 0.00093364394739544 0.000831414113496136 45753 43926 667 665 0 True 449 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 492 406 0.00105051617015937 0.00116367825032942 0.000793469138628214 0.000885023270008392 0.0009070298074325 0.000998646941984063 45920 50714 667 665 0 True 494 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 537 406 0.0010947833476258 0.00114171902633673 0.000885023270008392 0.000991836423285267 0.000898560827526171 0.000869837925808859 47855 49757 667 665 0 True 538 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 581 406 0.00106389927032364 0.00101813242192228 0.000732433051041428 0.000717174029144732 0.00104352981120321 0.00106144796778144 46505 44371 667 665 0 True 583 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 625 406 0.000984081088318281 0.000895073573152382 0.00064087891966125 0.000488288700694286 0.00100810234934332 0.000987201556508251 43016 39008 667 665 0 True 628 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 669 405 0.000928947291060352 0.000914210451741622 0.000534065766384375 0.000457770656900893 0.000962007742976036 0.00101580761321434 40606 39842 667 665 0 True 672 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 271 452 0.000926956983856435 0.0010053515569652 0.000778210116731518 0.000839246204318303 0.000791341286127176 0.000843861972892462 40519 43814 667 665 0 True 270 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 316 452 0.000989319942912499 0.000963658861045954 0.000854505226215 0.000839246204318303 0.000823390013474613 0.000785385948752943 43245 41997 667 665 0 True 315 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 360 452 0.00103589770690301 0.00104403834030028 0.000915541313801785 0.000976577401388571 0.000773090239870744 0.000753404177189039 45281 45500 667 665 0 True 360 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 404 452 0.00112983105609017 0.00103261128330095 0.000930800335698482 0.000839246204318303 0.000955327106581554 0.000884749961025897 49387 45002 667 665 0 True 404 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 449 452 0.0010697329293696 0.00102361649144606 0.000701915007248035 0.000701915007248035 0.00108279230711636 0.0010564488984555 46760 44610 667 665 0 True 449 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 493 451 0.00105850027606934 0.0010776311343706 0.000732433051041428 0.000747692072938125 0.00101880273575802 0.00107662580719855 46269 46964 667 665 0 True 494 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 537 450 0.000968844943515882 0.000968041527485457 0.000732433051041428 0.00064087891966125 0.000873939474645756 0.000943433200787392 42350 42188 667 665 0 True 538 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 582 450 0.000962073323603705 0.00101719164012113 0.000579842832074464 0.000671396963454643 0.000974854624847585 0.00105232962929838 42054 44330 667 665 0 True 583 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 626 450 0.000961661535906343 0.000935710757782531 0.000625619897764553 0.000595101853971161 0.00092326306827494 0.000953500305083384 42036 40779 667 665 0 True 628 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 669 450 0.000980237736476234 0.00102313462759669 0.000534065766384375 0.00064087891966125 0.00101654229324522 0.00108685264279354 42848 44589 667 665 0 True 672 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 273 497 0.000896667711006021 0.00100877049570596 0.000778210116731518 0.000854505226215 0.00073360137055506 0.000859377783119284 39195 43963 667 665 0 True 271 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 318 496 0.000942353268318919 0.000996242035622359 0.000732433051041428 0.00080872816052491 0.000840259184203226 0.000831123171273876 41192 43417 667 665 0 True 315 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 361 496 0.000993254803131737 0.0010120288131636 0.000854505226215 0.000885023270008392 0.00080755134328896 0.000837846273309102 43417 44105 667 665 0 True 360 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 406 495 0.00104287522066387 0.00102614054018085 0.000839246204318303 0.000793469138628214 0.000902050561885667 0.000895423915409263 45586 44720 667 665 0 True 405 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 450 496 0.00109325058230784 0.00104552982364357 0.00080872816052491 0.000717174029144732 0.00105060947337369 0.00105295980392933 47788 45565 667 665 0 True 449 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 494 495 0.00100256578051098 0.000994153958941758 0.000686655985351339 0.000579842832074464 0.000944650116464322 0.00103297575699909 43824 43326 667 665 0 True 494 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 537 494 0.00106838318080603 0.00101827009730782 0.000854505226215 0.000732433051041428 0.000912509428840142 0.000920036157383732 46701 44377 667 665 0 True 539 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 582 494 0.000971613071925928 0.00104243212746905 0.000610360875867857 0.00064087891966125 0.000985430457942567 0.00107183965747062 42471 45430 667 665 0 True 583 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 626 494 0.000939585139908874 0.000996746845369317 0.000518806744487678 0.000671396963454643 0.000943065271050041 0.000982954743273523 41071 43439 667 665 0 True 628 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 671 493 0.000978270306366615 0.00106319816478711 0.000671396963454643 0.000701915007248035 0.000982528721818648 0.00104400976596294 42762 46335 667 665 0 True 673 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 273 541 0.000924463380577965 0.000951658156606898 0.000793469138628214 0.000793469138628214 0.000721139050049376 0.00074673744619407 40410 41474 667 665 0 True 271 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 317 540 0.000965687904502773 0.00097425986573208 0.000854505226215 0.00080872816052491 0.000783653168507624 0.000776766934864947 42212 42459 667 665 0 True 315 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 361 540 0.000992545613208502 0.0010847443626232 0.000869764248111696 0.000961318379491875 0.000804619390822138 0.000815397134823914 43386 47274 667 665 0 True 360 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 407 540 0.00101670382478708 0.000995530712797099 0.000778210116731518 0.000732433051041428 0.000895674634594369 0.00089596101321787 44442 43386 667 665 0 True 405 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 451 540 0.000975913965653932 0.00100782971390481 0.000717174029144732 0.000671396963454643 0.000967814719633604 0.00109889374160866 42659 43922 667 665 0 True 449 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 495 538 0.00108240683961064 0.000894132791351232 0.000762951094834821 0.000442511635004196 0.0010397526854829 0.00102396574496323 47314 38967 667 665 0 True 494 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 539 538 0.000998539411914551 0.000999202056411342 0.000717174029144732 0.000564583810177768 0.000983499337399892 0.00103684891505687 43648 43546 667 665 0 True 539 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 584 537 0.00100142192579609 0.00101255656880815 0.000747692072938125 0.000747692072938125 0.000924340604346972 0.000888518943133015 43774 44128 667 665 0 True 583 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 628 537 0.00100855957921703 0.000978573694478816 0.000747692072938125 0.000656137941557946 0.000952947931877281 0.000984466107802976 44086 42647 667 665 0 True 628 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 672 536 0.000946242374349561 0.000992088828158747 0.000686655985351339 0.000671396963454643 0.000903530196628087 0.000987534413441824 41362 43236 667 665 0 True 673 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 274 584 0.000964017876619026 0.00116374708802218 0.000839246204318303 0.000991836423285267 0.000748254013707211 0.00119500909916015 42139 50717 667 665 0 True 271 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 319 583 0.000956880223198083 0.00103472230587914 0.000885023270008392 0.000930800335698482 0.000723470825625606 0.000783420989473466 41827 45094 667 665 0 True 315 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 363 583 0.00111150650355756 0.00100964243981434 0.00100709544518196 0.000930800335698482 0.000789315416258278 0.000686725194895126 48586 44001 667 665 0 True 360 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 407 582 0.00104230329330643 0.00105505237114301 0.000869764248111696 0.000885023270008392 0.00084173092879508 0.000847987794687519 45561 45980 667 665 0 True 405 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 451 582 0.00106989306902969 0.00101723753191631 0.000717174029144732 0.000579842832074464 0.00107551202140257 0.00106224414393244 46767 44332 667 665 0 True 449 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 495 580 0.00110807493941288 0.00101420867343456 0.000854505226215 0.000549324788281071 0.00109046235568587 0.00117115256625223 48436 44200 667 665 0 True 494 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 539 579 0.000986414551936666 0.000999225002308931 0.000595101853971161 0.000656137941557946 0.0010362929748724 0.000993093958665742 43118 43547 667 665 0 True 539 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 583 579 0.00101075578026963 0.00103004134277098 0.000747692072938125 0.000732433051041428 0.000896569831448383 0.000929747471573571 44182 44890 667 665 0 True 583 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 628 580 0.00100686667423898 0.00089417868314641 0.000823987182421607 0.00064087891966125 0.000832086087039816 0.000794807168350841 44012 38969 667 665 0 True 628 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 671 579 0.0010208217017607 0.000941034206023183 0.000732433051041428 0.000610360875867857 0.000921767547344293 0.000918723519036721 44622 41011 667 665 0 True 673 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 271 623 0.000981793378888491 0.00108729135725558 0.000839246204318303 0.000946059357595178 0.000713726650159904 0.000768741897718063 42916 47385 667 665 0 False 271 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 315 623 0.000961203994020385 0.000959758058455821 0.00080872816052491 0.000839246204318303 0.000723138152008173 0.000703540549449831 42016 41827 667 665 0 False 315 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 363 626 0.000941232290698322 0.00103309314715032 0.00080872816052491 0.000946059357595178 0.000743656506506369 0.000759642612584465 41143 45023 667 665 0 True 360 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 407 626 0.00101221991430469 0.00104181258823415 0.000839246204318303 0.000915541313801785 0.000821630176384277 0.000751863995578469 44246 45403 667 665 0 True 405 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 449 623 0.000978865110818361 0.00108568514442435 0.000701915007248035 0.000656137941557946 0.000911057290726219 0.00114515944682661 42788 47315 667 665 0 False 449 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 494 623 0.00107446848788927 0.00107616259692491 0.000747692072938125 0.000717174029144732 0.00106575980722556 0.00109060014539516 46967 46900 667 665 0 False 494 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 539 623 0.000983394775489344 0.00108341350056304 0.000579842832074464 0.000747692072938125 0.00104790006357046 0.00108403220318037 42986 47216 667 665 0 False 539 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 583 623 0.0010067065345789 0.000989725400707078 0.000762951094834821 0.000732433051041428 0.000888760628650824 0.000864555283323001 44005 43133 667 665 0 False 583 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 628 622 0.000965596396125581 0.00100530566517002 0.00080872816052491 0.000839246204318303 0.000780439363229268 0.000755389862490377 42208 43812 667 665 0 False 628 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 673 622 0.000990967093701947 0.00104013753771015 0.00080872816052491 0.000823987182421607 0.000795542928601281 0.000816644456509393 43317 45330 667 665 0 False 673 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 271 673 0.0011698202169229 0.0770697170942922 0.000991836423285267 0.0758678568703746 0.000800759130270329 0.0239457948805571 51135 3358758 667 665 0 True 271 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 316 667 0.00100368675813158 0.000939198534216062 0.000869764248111696 0.00080872816052491 0.00070719263475649 0.000706588037531716 43873 40931 667 665 0 False 316 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 360 666 0.00092810083857133 0.000994360472020059 0.000747692072938125 0.000885023270008392 0.000750542570128293 0.000682629874939688 40569 43335 667 665 0 False 360 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 405 666 0.00103251189694693 0.00104465787953518 0.000854505226215 0.000885023270008392 0.000771360680855586 0.000756546925853345 45133 45527 667 665 0 False 405 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 450 666 0.00105397061139835 0.00102279043913285 0.000854505226215 0.000839246204318303 0.000852244049920331 0.00086915324130673 46071 44574 667 665 0 False 450 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 494 666 0.000993140417660248 0.00116638586624492 0.00080872816052491 0.000915541313801785 0.000837384674787657 0.000947887671244828 43412 50832 667 665 0 False 494 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 539 666 0.000984515753109941 0.000988807564803517 0.000610360875867857 0.000656137941557946 0.000936092677866633 0.000935474602547385 43035 43093 667 665 0 False 539 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 584 666 0.00110439172723091 0.000937408754204119 0.000961318379491875 0.000854505226215 0.000782652090991791 0.000660116934652616 48275 40853 667 665 0 False 584 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 628 666 0.00109970192289985 0.000995576604592277 0.000961318379491875 0.000854505226215 0.000766684385334676 0.000757186196890289 48070 43388 667 665 0 False 628 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 668 669 0.00115007728454381 0.0761589944189841 0.00105287251087205 0.0744640268558785 0.000803195104693221 0.0247925678086752 50272 3319068 667 665 0 True 673 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E8_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E8_1.csv new file mode 100755 index 0000000..a982ea4 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E8_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 241 248 0.0099594286171174 0.0424026419906484 0.0100099183642329 0.0421911955443656 0.0017924936003819 0.00735979314760331 435345 1847940 667 665 0 True 241 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 286 248 0.0100718466584973 0.00972832630902043 0.0100862134737163 0.00967421988250553 0.00156250337777175 0.0014048767616737 440259 423968 667 665 0 False 286 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 329 248 0.0100692615468416 0.0605098693173768 0.0100099183642329 0.0598306248569467 0.00130149020330245 0.00657277891009607 440146 2637067 667 665 0 True 330 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 374 247 0.010132036293595 0.0883498285654626 0.0101625085831998 0.0851148241397726 0.00139976518524741 0.016928643702867 442890 3850354 667 665 0 True 375 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 417 247 0.0102080797550412 0.0725739732714712 0.0101625085831998 0.071473258564126 0.00159354183407354 0.00948562145835065 446214 3162830 667 665 0 True 420 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 461 246 0.010156995203474 0.0653612286610323 0.010101472495613 0.0677195391775387 0.00177360822573566 0.0173166927398472 443981 2848493 667 665 0 True 464 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 506 245 0.00992010289201931 0.081113174329736 0.00996414129854276 0.0816510261692226 0.0016863954484762 0.0194858234937425 433626 3534975 667 665 0 True 509 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 550 245 0.0100560157092431 0.0665676551185701 0.00985732814526589 0.0646524757763027 0.00214143778234085 0.0165951062743347 439567 2901070 667 665 0 True 554 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 598 247 0.0098191005206941 0.00957415282311983 0.00991836423285267 0.00955214770733196 0.00189551759074517 0.00206958795632005 429211 417249 667 665 0 False 598 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 637 246 0.00966166035773599 0.0421081772868885 0.00967421988250553 0.0426794842450599 0.00179646347142725 0.00805524429339998 422329 1835107 667 665 0 True 643 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 241 291 0.00964791122406295 0.00989934208375138 0.00968947890440223 0.00996414129854276 0.00159155441286372 0.00163906763676409 421728 431421 667 665 0 False 241 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 286 291 0.00982173138653836 0.0100253838992079 0.00985732814526589 0.00997940032043946 0.00146696334908785 0.00141954465868449 429326 436914 667 665 0 False 286 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 328 291 0.0101796892810175 0.103219252066995 0.0101167315175097 0.103044174868391 0.00142050037049821 0.0271678019370658 444973 4498375 667 665 0 True 330 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 373 292 0.0100957532220386 0.0488333215735608 0.0100709544518196 0.0485084306095979 0.00132643204665292 0.00558740875584201 441304 2128194 667 665 0 True 375 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 417 292 0.0101179897576961 0.0832462020237134 0.0101319905394064 0.0810711833371481 0.00155092704202655 0.0193603857432589 442276 3627934 667 665 0 True 420 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 461 290 0.0100281742854826 0.0423382558020136 0.00999465934233616 0.0429541466392004 0.00176796559874477 0.00830011150880911 438350 1845134 667 665 0 True 464 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 505 291 0.0098257348780405 0.0425231997365811 0.0098268101014725 0.044937819485771 0.00169529860542045 0.00749346454177473 429501 1853194 667 665 0 True 509 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 549 290 0.0100718009043087 0.050447129496894 0.0100556954299229 0.0521553368429084 0.00163578610485011 0.00923974109168458 440257 2198525 667 665 0 True 554 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 599 290 0.00963473401774736 0.0099686616403678 0.00959792477302205 0.00985732814526589 0.00193037431092088 0.00218257886332939 421152 434442 667 665 0 False 599 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 643 290 0.0095267541326613 0.00946929007113802 0.00952162966353857 0.00953688868543526 0.00186765632489016 0.00209482079241806 416432 412679 667 665 0 False 643 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 241 336 0.00987757437371953 0.0493657122894212 0.00990310521095598 0.0492408636606394 0.00161816004323705 0.00763310083807492 431767 2151396 667 665 0 True 241 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 285 337 0.0101170289197356 0.0602123987010327 0.0101930266269932 0.062226291294728 0.00151485381915932 0.0146647508916419 442234 2624103 667 665 0 True 286 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 329 336 0.00990424906567087 0.03799842935331 0.00996414129854276 0.0388952468146792 0.00139841888217052 0.00588764788974154 432933 1656001 667 665 0 True 331 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 373 336 0.0100395670784429 0.0350707163881322 0.0100404364080262 0.0354772259098192 0.00136497795558132 0.00594718890518803 438848 1528409 667 665 0 True 375 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 418 336 0.0102846951438449 0.068445111405201 0.01025406271458 0.065796902418555 0.00161163949994701 0.00930940457934357 449563 2982891 667 665 0 True 420 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 461 334 0.0103003430763446 0.0328104995838188 0.0103761348897536 0.0339208056763561 0.0017665756078238 0.0062127369564583 450247 1429907 667 665 0 True 465 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 506 334 0.00998372409126176 0.0292650830555446 0.00999465934233616 0.0294193942168307 0.00172873226816572 0.00352587399664115 436407 1275395 667 665 0 True 509 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 550 334 0.0101406609581453 0.0516265486329695 0.0100709544518196 0.0520180056458381 0.00166436412212706 0.00858045933738077 443267 2249925 667 665 0 True 554 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 594 334 0.00999873146512118 0.057057108323567 0.0100404364080262 0.0577096208133059 0.00211112772838251 0.010724098620612 437063 2486593 667 665 0 True 599 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 638 335 0.00967577552491779 0.062768640530142 0.00971999694819562 0.0612344548714427 0.00200699541598311 0.0172323650106341 422946 2735506 667 665 0 True 643 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 241 380 0.0099071544566467 0.0432690561377121 0.00990310521095598 0.0445105668726635 0.00161405160756551 0.00921629862596838 433060 1885699 667 665 0 True 241 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 285 380 0.0100414887543639 0.0316935850727758 0.0100556954299229 0.0314335851071946 0.00155490386796007 0.00402755542564864 438932 1381231 667 665 0 True 286 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 329 380 0.010354355895982 0.0786226954431168 0.0102693217364767 0.0762798504615854 0.00155041633763911 0.014172185460496 452608 3426438 667 665 0 True 331 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 374 380 0.0101219474950096 0.0659597723996418 0.010101472495613 0.0631570916304265 0.00151304255566312 0.0150842044172238 442449 2874578 667 665 0 True 375 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 417 380 0.0101514589466539 0.0451336627216932 0.00996414129854276 0.0460822461280232 0.00169725524022341 0.0093430379472144 443739 1966960 667 665 0 True 420 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 463 379 0.0105077696903437 0.0566531457965123 0.010452429999237 0.0542458228427558 0.00216720462002219 0.0117773156917222 459314 2468988 667 665 0 True 465 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 506 379 0.0101655512367414 0.0424518609409768 0.0100556954299229 0.0429694056610971 0.00192750382637161 0.00471130425468109 444355 1850085 667 665 0 True 509 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 550 378 0.0100621238934207 0.0529435284250911 0.0100099183642329 0.0529030289158465 0.00180246825238609 0.00741233138909028 439834 2307320 667 665 0 True 554 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 596 378 0.00990955655154798 0.0421465198817598 0.00987258716716258 0.0425268940260929 0.00201972913233833 0.00645128415187714 433165 1836778 667 665 0 True 599 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 639 379 0.00996830492970498 0.0963817417198294 0.00991836423285267 0.0877393759060044 0.00207508553371441 0.0266576711470882 435733 4200391 667 665 0 True 644 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 242 424 0.00996608585155809 0.0412915786834906 0.00996414129854276 0.0416571297779812 0.00165702221927643 0.00546420246383259 435636 1799519 667 665 0 True 241 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 286 424 0.0102194039167187 0.0610020588206612 0.0102388036926833 0.0568398565651942 0.00162732614989261 0.0197745660831215 446709 2658517 667 665 0 True 286 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 329 424 0.0102862050320685 0.0356641890833745 0.0102388036926833 0.0362706950484474 0.0014115753520303 0.00491895274371283 449629 1554273 667 665 0 True 331 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 374 424 0.0102844434958076 0.0514396542971069 0.0102388036926833 0.0511940184634165 0.00144690397264268 0.0085753494722433 449552 2241780 667 665 0 True 375 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 418 424 0.0104051887995119 0.0943913916170605 0.0103761348897536 0.0944380865186542 0.00159068721682928 0.0123363114605796 454830 4113650 667 665 0 True 420 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 463 423 0.010648944239256 0.0618000483011144 0.0105897611963073 0.0614938582436866 0.00165064195884163 0.0130426843215765 465485 2693294 667 665 0 True 465 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 507 423 0.0104735913114626 0.0530012373575275 0.0104219119554437 0.051972228580148 0.00174977157894464 0.00736452249342196 457820 2309835 667 665 0 True 510 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 550 422 0.0101228854558759 0.0336593371733293 0.0101625085831998 0.0340733958953231 0.00182732067735901 0.00463232717491193 442490 1466900 667 665 0 True 554 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 595 423 0.0101286962378275 0.0391362016852614 0.0100862134737163 0.0389715419241627 0.00187478565116279 0.00379489300856613 442744 1705586 667 665 0 True 599 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 639 423 0.0100296841737062 0.0806847514758515 0.00996414129854276 0.0789349202716106 0.00202684574109006 0.0178311497719203 438416 3516304 667 665 0 True 644 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 242 465 0.0103494144436136 0.0706416992355001 0.0101472495613031 0.065445944914931 0.002503220384474 0.0347830450816381 452392 3078620 667 665 0 False 242 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 286 465 0.0106168934301446 0.0254523468203583 0.0102845807583734 0.0237888151369497 0.00286072632128043 0.00954612505341554 464084 1109233 667 665 0 False 286 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 331 468 0.0103611046387998 0.0725200045203418 0.0103608758678569 0.0646982528419928 0.00149015738233768 0.0293739425090456 452903 3160478 667 665 0 True 331 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 375 468 0.0105381047173827 0.0857037994390875 0.0105287251087205 0.078812848096437 0.00162652604541059 0.0197968436627219 460640 3735038 667 665 0 True 376 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 419 468 0.0107112156899348 0.0938306397717801 0.0106965743495842 0.0895551995117113 0.00198234006388276 0.0259802901474344 468207 4089212 667 665 0 True 420 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 463 467 0.0106649124510759 0.0406498507656186 0.0106965743495842 0.0408941786831464 0.00206305111229464 0.00413544415212359 466183 1771552 667 665 0 True 465 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 507 466 0.0104045939950601 0.0417525847119515 0.010452429999237 0.0426642252231632 0.00192382326524649 0.00609457816044735 454804 1819610 667 665 0 True 510 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 552 467 0.0101700809014124 0.0949269488667882 0.0101777676050965 0.0928206301976043 0.00198298788847262 0.0141220745416096 444553 4136990 667 665 0 True 554 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 596 466 0.0101597175776955 0.063621585435321 0.0100862134737163 0.0641031509880217 0.00205966092978368 0.0156659044992068 444100 2772678 667 665 0 True 599 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 640 467 0.010026824536919 0.0713887488233057 0.010101472495613 0.069214923323415 0.00196381309848357 0.00849549599231202 438291 3111177 667 665 0 True 644 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 243 512 0.00983319281078161 0.045685350937426 0.00978103303578241 0.0480964370183871 0.00151663286743786 0.00785968274410595 429827 1991003 667 665 0 True 242 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 287 512 0.0100409168270065 0.095391534455273 0.0101167315175097 0.0902265964751659 0.00162659111235574 0.0204020852229271 438907 4157237 667 665 0 True 286 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 332 513 0.0101774930799649 0.0553440364472637 0.0102082856488899 0.0574044403753719 0.00155650610812953 0.0109442965461605 444877 2411936 667 665 0 True 331 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 376 512 0.0103816711465737 0.0577138658043598 0.0103150988021668 0.0563057907988098 0.00166518405754693 0.00902681742845526 453802 2515215 667 665 0 True 376 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 420 512 0.0104774575403989 0.0560684154882514 0.0105592431525139 0.0552986953536278 0.00196286003620656 0.00809447169109597 457989 2443505 667 665 0 True 420 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 464 509 0.0104584466750374 0.0613661872695013 0.010406652933547 0.0599679560540169 0.00206870629074748 0.0114344500337959 457158 2674386 667 665 0 True 465 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 508 510 0.0101939417107651 0.069919018190934 0.0101472495613031 0.0668955519951171 0.00179738162181776 0.0137859619475232 445596 3047125 667 665 0 True 510 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 553 509 0.0101280785562815 0.0541158802247092 0.0100862134737163 0.0553139543755245 0.00190532447975288 0.00967709160376822 442717 2358412 667 665 0 True 555 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 597 509 0.0101522825220487 0.0471833968074225 0.0101777676050965 0.0466163118944076 0.00173047182259665 0.00593874215199142 443775 2056289 667 665 0 True 599 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 641 509 0.00992801836664639 0.0651750685938926 0.00993362325474937 0.0627756160830091 0.00191138854240004 0.0160403657223613 433972 2840380 667 665 0 True 644 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 244 554 0.00975293996398459 0.0443101115113258 0.00975051499198901 0.0446021210040436 0.00150400324781963 0.00716313399324544 426319 1931069 667 665 0 True 242 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 287 555 0.0101292452880907 0.0533096302211239 0.0100556954299229 0.0527046616311894 0.00188302335724862 0.00947954230691091 442768 2323275 667 665 0 True 286 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 332 555 0.00992662286389421 0.0439143406697104 0.00991836423285267 0.0443274586099031 0.00144255807863194 0.00647459652566469 433911 1913821 667 665 0 True 331 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 375 554 0.0104940205566706 0.0466652554939649 0.0104829480430304 0.0460364690623331 0.00140619589855759 0.00476351812660594 458713 2033708 667 665 0 True 376 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 420 553 0.0105194370084356 0.0849542946402399 0.0104829480430304 0.0812237735561151 0.00188315409083517 0.0154038420388682 459824 3702374 667 665 0 True 421 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 465 553 0.010279021624459 0.059302662699321 0.0103150988021668 0.0579079880979629 0.00219576827494353 0.00881039412572394 449315 2584456 667 665 0 True 465 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 509 551 0.0102752011497113 0.051509272150392 0.0101625085831998 0.0510414282444495 0.0021034519173578 0.00654917523454316 449148 2244814 667 665 0 True 510 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 553 551 0.0099996694259874 0.0369688010366957 0.010101472495613 0.0381475547417411 0.00186578913350559 0.00633311894669529 437104 1611129 667 665 0 True 555 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 597 551 0.0106459473399029 0.0467080266470709 0.00985732814526589 0.0453803311207752 0.00609731060843636 0.00921729816432245 465354 2035572 667 665 0 True 599 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 641 551 0.00999836543161241 0.0529924949705461 0.00976577401388571 0.0515297169451438 0.00289676338829644 0.00679334785792592 437047 2309454 667 665 0 True 644 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 242 596 0.00955397787487579 0.00918907476978094 0.00958266575112535 0.00923170824750134 0.00132354268751152 0.00123203397817797 417622 400467 667 665 0 False 242 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 287 596 0.00973161851209895 0.00977584726292729 0.00962844281681544 0.00967421988250553 0.00196611431757234 0.00149157838463688 425387 426039 667 665 0 False 287 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 332 597 0.00978727848252573 0.0699177791124641 0.0097962920576791 0.066300450141146 0.00150586240836329 0.0104620018519159 427820 3047071 667 665 0 True 331 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 376 596 0.0103293283548201 0.0693088638281444 0.010406652933547 0.0665903715571832 0.00145100419305551 0.0140494238464074 451514 3020534 667 665 0 True 376 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 421 595 0.0101881766830021 0.0100429834026586 0.0101777676050965 0.0101167315175097 0.00182561337474487 0.0017268777975929 445344 437681 667 665 0 False 421 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 465 595 0.0102210510675081 0.00992559219059322 0.0101930266269932 0.00991836423285267 0.00218861133575383 0.00184513638689152 446781 432565 667 665 0 False 465 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 510 595 0.00966516055316356 0.00987733696796351 0.00967421988250553 0.00988784618905928 0.00200181212334456 0.00220584077853187 422482 430462 667 665 0 False 510 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 555 595 0.00965189183847079 0.00967529833969222 0.00956740672922866 0.00956740672922866 0.00201111068642955 0.00183438573898682 421902 421657 667 665 0 False 555 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 599 595 0.00974662588595837 0.0111838075389894 0.00971999694819562 0.00978103303578241 0.00162125061987637 0.00875778125055806 426043 487399 667 665 0 False 599 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 644 595 0.00964672161515946 0.00966288460909656 0.00964370183871214 0.00968947890440223 0.00156955923746714 0.00161681122095172 421676 421116 667 665 0 False 644 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 242 644 0.00928391377668913 0.0391394600027191 0.00926222629129473 0.0402990768291753 0.00139758342878447 0.00817676291544153 405817 1705728 667 665 0 True 242 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 287 639 0.00948193790493172 0.00951687986273764 0.00943007553215839 0.00952162966353857 0.00137037597850754 0.00130445800299712 414473 414753 667 665 0 False 287 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 331 639 0.00966639591625565 0.00933852140077821 0.00962844281681544 0.00929274433508812 0.00143200984644912 0.0013199127884585 422536 406980 667 665 0 False 331 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 376 639 0.00959314346031379 0.0098102890552084 0.00956740672922866 0.0098115510795758 0.00141407606515867 0.00135116919414202 419334 427540 667 665 0 False 376 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 421 639 0.00973289962937963 0.00969090155005275 0.00971999694819562 0.00970473792629892 0.00159392122535632 0.00152157444736557 425443 422337 667 665 0 False 421 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 466 639 0.00991859300379565 0.0097373899385681 0.00990310521095598 0.00970473792629892 0.00175288777551071 0.00182218208001414 433560 424363 667 665 0 False 466 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 510 639 0.00992104085288553 0.0100694629684764 0.00990310521095598 0.0098115510795758 0.00191752569324001 0.00300358156997935 433667 438835 667 665 0 False 510 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 555 639 0.00957797594679428 0.00963872257893532 0.00956740672922866 0.00968947890440223 0.00173077323204252 0.00173006557157437 418671 420063 667 665 0 False 555 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 600 638 0.00961606630880028 0.00967789122611977 0.00958266575112535 0.00970473792629892 0.0014788438292185 0.00133141059935387 420336 421770 667 665 0 False 600 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 640 644 0.00967639320646383 0.0416073371802131 0.00970473792629892 0.041519798580911 0.00141959500587704 0.00785887865933185 422973 1813280 667 665 0 True 644 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E8_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E8_2.csv new file mode 100755 index 0000000..e3668d1 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E8_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 241 248 0.00812033900650956 0.715666644294417 0.00805676356145571 0.698771648737316 0.002035330226251 0.163094547546365 354955 31189307 667 665 8 True 241 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 286 248 0.00675464510820808 0.00657544525080153 0.00671396963454643 0.00662241550316625 0.00162742402486906 0.00137687364607169 295258 286563 667 665 0 False 286 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 329 248 0.00604209225211153 0.006166228113199 0.00602731364919509 0.00616464484626535 0.00128201359317907 0.00119940822905453 264111 268729 667 665 0 True 330 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 374 247 0.00641178609596552 0.00624633224168226 0.00643930724040589 0.00619516289005875 0.00134707231205209 0.00113425263352025 280271 272220 667 665 0 True 375 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 417 247 0.00668866756825295 0.00680001675050524 0.00666819256885634 0.00674448767833982 0.00151227200102974 0.00142726633787418 292374 296350 667 665 0 True 420 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 461 246 0.00667869315513907 0.00657773984056043 0.00666819256885634 0.00657663843747616 0.00158555637602997 0.00150272689722291 291938 286663 667 665 0 True 464 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 506 245 0.00661923558705884 0.00672622274385896 0.00665293354695964 0.00674448767833982 0.00158522333194942 0.00152007579482709 289339 293134 667 665 0 True 509 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 550 245 0.00701670222339048 0.00707240750078446 0.00700389105058366 0.00706492713817044 0.0014684569596106 0.00133525671250832 306713 308221 667 665 0 True 554 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 598 247 0.00886732188952445 0.0076826077553692 0.0081177996490425 0.00773632410162509 0.00486446057120297 0.00197977615737666 387607 334814 667 665 0 False 598 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 637 246 0.00919210799727168 0.734175837855109 0.00921644922560464 0.723552300297551 0.00191444626277645 0.174233275432721 401804 31995952 667 665 11 True 643 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 241 291 0.00650800715458247 0.0064313450139425 0.00650034332799268 0.00643930724040589 0.00154304795450732 0.00145988002177956 284477 280283 667 665 0 False 241 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 286 291 0.00649132975283931 0.00635018537417015 0.00650034332799268 0.00633249408712902 0.00132804076875288 0.00133151915232671 283748 276746 667 665 0 False 286 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 328 291 0.0060685152960256 0.0061793761125175 0.00608834973678187 0.00624093995574884 0.00130096442352027 0.00132785442174835 265266 269302 667 665 0 True 330 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 373 292 0.00621902369941145 0.00646782899110904 0.00621042191195544 0.00651560234988937 0.0012180089516014 0.00123961937054424 271845 281873 667 665 0 True 375 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 417 292 0.00640261238115207 0.00643861886347822 0.00636301213092241 0.00648508430609598 0.00156151312351082 0.00141013627840756 279870 280600 667 665 0 True 420 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 461 290 0.00665480946869207 0.00663689436454492 0.00663767452506294 0.00656137941557946 0.00174966022514068 0.00184893113296761 290894 289241 667 665 0 True 464 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 505 291 0.00667114371402076 0.00683023649762998 0.00660715648126955 0.00689707789730678 0.00160532808094933 0.00154518418656146 291608 297667 667 665 0 True 509 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 549 290 0.00713303224789528 0.00720212065985518 0.00704966811627375 0.00720225833524071 0.00157916675617095 0.00141084465180171 311798 313874 667 665 0 True 554 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 599 290 0.00735898930827559 0.00767391126018296 0.00740062561989776 0.0076752880140383 0.00193992437519314 0.00205078660795203 321675 334435 667 665 0 False 599 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 643 290 0.00790103918056993 0.00756326614200872 0.00787365529869535 0.00762951094834821 0.00183096031309439 0.0018848235402325 345369 329613 667 665 0 False 643 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 241 336 0.00621190892308481 0.00630773546363047 0.00619516289005875 0.00631723506523232 0.00148246471788115 0.00146495289495715 271534 274896 667 665 0 True 241 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 285 337 0.00631249950671265 0.00615308011388049 0.00636301213092241 0.00613412680247196 0.0012768873063543 0.0013846835363619 275931 268156 667 665 0 True 286 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 329 336 0.00639975274436483 0.00631757925369615 0.00636301213092241 0.00636301213092241 0.00124165258782532 0.00126821826931942 279745 275325 667 665 0 True 331 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 373 336 0.00653564268449433 0.00658336158546974 0.00648508430609598 0.00659189745937285 0.00125756710116568 0.00127771077370743 285685 286908 667 665 0 True 375 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 418 336 0.00681595572092644 0.0069296381259856 0.00679026474402991 0.00697337300679027 0.0015270319287237 0.00154598231561392 297938 301999 667 665 0 True 420 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 461 334 0.0070056297097503 0.00699062832177721 0.00700389105058366 0.00700389105058366 0.00157973934850209 0.0015751994708221 306229 304657 667 665 0 True 465 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 506 334 0.00690366650046458 0.00690325034375823 0.00695811398489357 0.00691233691920348 0.00163422545710689 0.00158522989459864 301772 300849 667 665 0 True 509 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 550 334 0.00704989688721673 0.00721111545171007 0.00704966811627375 0.00721751735713741 0.00170271683942584 0.00144511636864456 308164 314266 667 665 0 True 554 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 594 334 0.00733448794028255 0.00769270395030836 0.00738536659800107 0.00762951094834821 0.00202579173658495 0.00216511905257518 320604 335254 667 665 0 True 599 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 638 335 0.00736624134716803 0.00722350623640814 0.00743114366369116 0.00720225833524071 0.00188605488734586 0.0018156571499252 321992 314806 667 665 0 True 643 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 241 380 0.0060564819444249 0.00633091082019537 0.00607309071488518 0.00636301213092241 0.001530469603919 0.00160233833816562 264740 275906 667 665 0 True 241 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 285 380 0.00616350099155046 0.00629525289534204 0.00617990386816205 0.00634775310902571 0.00139010407454616 0.00133107084077299 269418 274352 667 665 0 True 286 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 329 380 0.00666901614425106 0.00661078193308862 0.00665293354695964 0.00663767452506294 0.0014533515657922 0.00139314877584115 291515 288103 667 665 0 True 331 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 374 380 0.00681433144723129 0.00673875120394256 0.00683604180972 0.00677500572213321 0.00141824353413277 0.00130338733179352 297867 293680 667 665 0 True 375 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 417 380 0.00722108618384788 0.0073019353143674 0.00727855344472419 0.00733958953231098 0.00154198032391362 0.00155862884619017 315647 318224 667 665 0 True 420 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 463 379 0.00748364659510483 0.0073627419429783 0.00738536659800107 0.00744640268558785 0.00203939834285844 0.00166331812137383 327124 320874 667 665 0 True 465 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 506 379 0.00706012294836789 0.00708500479856083 0.00703440909437705 0.00711070420386053 0.00174865877262988 0.00176493465406637 308611 308770 667 665 0 True 509 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 550 378 0.00705438079769911 0.00714959750027392 0.00709544518196384 0.00718699931334401 0.00158161398223775 0.00152620925079528 308360 311585 667 665 0 True 554 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 596 378 0.00703081739057228 0.00689914302808979 0.00704966811627375 0.00688181887541009 0.00196386303138893 0.00200689355002385 307330 300670 667 665 0 True 599 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 639 379 0.00640689039778577 0.00668010148970504 0.00646982528419928 0.00660715648126955 0.00186190542482177 0.0017624932848676 280057 291124 667 665 0 True 644 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 242 424 0.0062282889226021 0.00626748835925933 0.00624093995574884 0.00630197604333562 0.00148103656816911 0.00157223041652971 272250 273142 667 665 0 True 241 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 286 424 0.00654456475127051 0.00664887212308638 0.00653086137178607 0.00656137941557946 0.00143965025476035 0.00144703738471368 286075 289763 667 665 0 True 286 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 329 424 0.00676226318060928 0.00693337830729261 0.00683604180972 0.00697337300679027 0.00131248307192766 0.00130295509657712 295591 302162 667 665 0 True 331 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 374 424 0.00696927800691094 0.00725537808815929 0.00701915007248035 0.0072632944228275 0.00139607901370549 0.00166731307041018 304640 316195 667 665 0 True 375 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 418 424 0.00701777744682248 0.00708342153162719 0.00711070420386053 0.00708018616006714 0.00155481987596474 0.00158611985784496 306760 308701 667 665 0 True 420 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 463 423 0.00713371856072422 0.00736304023964695 0.00712596322575723 0.00741588464179446 0.00165745598510375 0.00164381690620608 311828 320887 667 665 0 True 465 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 507 423 0.00721195822322302 0.0074818311514653 0.00721751735713741 0.00743114366369116 0.00163823558323049 0.00175111473863899 315248 326064 667 665 0 True 510 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 550 422 0.00697721635863231 0.00716678397756809 0.00695811398489357 0.0072480354009308 0.00165757465933209 0.00153431275708321 304987 312334 667 665 0 True 554 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 595 423 0.0065196515955801 0.0065577539637604 0.00654612039368277 0.00656137941557946 0.00186988997949285 0.0018865654733496 284986 285792 667 665 0 True 599 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 639 423 0.00627157238501372 0.00625323895685655 0.00614938582436866 0.00634775310902571 0.00180259532811043 0.00175666637746908 274142 272521 667 665 0 True 644 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 242 465 0.00633137310950842 0.00644619100968259 0.00634775310902571 0.00636301213092241 0.00148477206803533 0.00147287511206001 276756 280930 667 665 0 False 242 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 286 465 0.00648062327270789 0.00653698792644234 0.00643930724040589 0.00654612039368277 0.00146831719193402 0.00155108943313543 283280 284887 667 665 0 False 286 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 331 468 0.0066055550846687 0.00664384697151439 0.00659189745937285 0.00657663843747616 0.00142978517459357 0.00154895234548911 288741 289544 667 665 0 True 331 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 375 468 0.007008832502952 0.00720914210451742 0.00700389105058366 0.00720225833524071 0.0015625124629454 0.00157405243774796 306369 314180 667 665 0 True 376 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 419 468 0.00709835057293967 0.00717458558274836 0.00714122224765393 0.00714122224765393 0.00181190314351986 0.00172433301889463 310282 312674 667 665 0 True 420 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 463 467 0.00725444098733421 0.00729720845946406 0.00729381246662089 0.00732433051041428 0.00190368871173787 0.00195532566413724 317105 318018 667 665 0 True 465 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 507 466 0.00704882166378472 0.00694721468353878 0.00708018616006714 0.00706492713817044 0.00185299257195579 0.00184229577223012 308117 302765 667 665 0 True 510 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 552 467 0.00661674198378037 0.00670045450086649 0.00663767452506294 0.00679026474402991 0.00187027934333871 0.00179875321359052 289230 292011 667 665 0 True 554 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 596 466 0.00635125330445329 0.00632859328453888 0.00636301213092241 0.00628671702143893 0.00185788373679364 0.00183177207378734 277625 275805 667 665 0 True 599 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 640 467 0.00643347358135993 0.00626569857924739 0.00646982528419928 0.00631723506523232 0.00171630712136995 0.00181495041635153 281219 273064 667 665 0 True 644 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 243 512 0.00648723475295998 0.00674026563318344 0.00648508430609598 0.00677500572213321 0.00145312080738911 0.00141622507533341 283569 293746 667 665 0 True 242 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 287 512 0.00655396723702694 0.00659712912402315 0.00657663843747616 0.00654612039368277 0.00155974738197286 0.00146970564716776 286486 287508 667 665 0 True 286 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 332 513 0.00660464000089678 0.00688236957695222 0.00660715648126955 0.00683604180972 0.00160679410560019 0.00151305752647893 288701 299939 667 665 0 True 331 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 376 512 0.00694937493487177 0.00710622975383067 0.00686655985351339 0.00708018616006714 0.00163071356987542 0.00143561096928181 303770 309695 667 665 0 True 376 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 420 512 0.00714458518051572 0.007291907957121 0.00712596322575723 0.0072327763790341 0.001784584455673 0.00182874109258437 312303 317787 667 665 0 True 420 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 464 509 0.00682156060902943 0.00682693228837716 0.00677500572213321 0.00686655985351339 0.00197592863916188 0.00166824120981484 298183 297523 667 665 0 True 465 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 508 510 0.00667224181454706 0.0066914597090116 0.00665293354695964 0.00675974670023652 0.00165305879634991 0.0015992992162071 291656 291619 667 665 0 True 510 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 553 509 0.00671541089148719 0.00656865326511518 0.00677500572213321 0.00657663843747616 0.00179036479477403 0.00166019468854175 293543 286267 667 665 0 True 555 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 597 509 0.00676487116935924 0.00658974054499949 0.00688181887541009 0.00660715648126955 0.00188343489801083 0.0018097679111384 295705 287186 667 665 0 True 599 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 641 509 0.00637591481210642 0.00625117382607354 0.0064087891966125 0.00617990386816205 0.00183495611177232 0.00196869643720622 278703 272431 667 665 0 True 644 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 244 554 0.00647680279796014 0.0066774627114823 0.00646982528419928 0.00672922865644312 0.00137061790569094 0.00136047860834411 283113 291009 667 665 0 True 242 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 287 555 0.00683462342987353 0.00671727384379924 0.00675974670023652 0.00672922865644312 0.00157016966795308 0.00135860815414495 298754 292744 667 665 0 True 286 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 332 555 0.00653653489117195 0.00679636835278859 0.00662241550316625 0.00679026474402991 0.00138826510851145 0.00141731450508425 285724 296191 667 665 0 True 331 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 375 554 0.00683343382097004 0.00696843963880863 0.00683604180972 0.00694285496299687 0.00150457310812431 0.00131039931305341 298702 303690 667 665 0 True 376 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 420 553 0.00690066960111155 0.00731457850393895 0.00695811398489357 0.00700389105058366 0.00180185997387576 0.00229772177856916 301641 318775 667 665 0 True 421 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 465 553 0.00670911969055527 0.00682498188708209 0.00672922865644312 0.00683604180972 0.00196357421280964 0.00188434245538857 293268 297438 667 665 0 True 465 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 509 551 0.00666766639568748 0.00669026652233697 0.00659189745937285 0.00662241550316625 0.00193887845481556 0.00192649275232801 291456 291567 667 665 0 True 510 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 553 551 0.0073306217113462 0.00753609819926332 0.00741588464179446 0.00752269779507134 0.00191590123928125 0.0019634287981121 320435 328429 667 665 0 True 555 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 597 551 0.00829395327513629 0.0406714199093522 0.00776684214541848 0.00891126878767071 0.00527536820937559 0.132427322462958 362544 1772492 667 665 0 True 599 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 641 551 0.00719635604491185 0.00673436853750306 0.00694285496299687 0.00679026474402991 0.00289842661201508 0.00181339082417877 314566 293489 667 665 0 True 644 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 242 596 0.00687918800956583 0.00708371982829585 0.00688181887541009 0.00709544518196384 0.00129960855755345 0.00119357702507574 300702 308714 667 665 0 False 242 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 287 596 0.00691402982418152 0.00677945722626548 0.00686655985351339 0.00669871061264973 0.00146802447728594 0.00148703562557974 302225 295454 667 665 0 False 287 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 332 597 0.0067273069805221 0.00670206071369773 0.00674448767833982 0.00677500572213321 0.00137524238391517 0.00151873817799293 294063 292081 667 665 0 True 331 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 376 596 0.00688653155683545 0.0067069252439866 0.00694285496299687 0.00669871061264973 0.00137638275860377 0.00131236196371917 301023 292293 667 665 0 True 376 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 421 595 0.00693134778456503 0.00661725267620872 0.00695811398489357 0.00651560234988937 0.00177285914215304 0.00173986569498813 302982 288385 667 665 0 False 421 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 465 595 0.00700581272650468 0.00691938130976331 0.00703440909437705 0.00695811398489357 0.00205342406911659 0.00188533689907471 306237 301552 667 665 0 False 465 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 510 595 0.0067272612263335 0.00689065304598186 0.00675974670023652 0.00683604180972 0.00200939284997242 0.00205946351841441 294061 300300 667 665 0 False 510 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 555 595 0.00737143444757365 0.0073715072758573 0.0072632944228275 0.00738536659800107 0.00213800387151137 0.00176287421441034 322219 321256 667 665 0 False 555 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 599 595 0.00771109066661451 0.00793911994451682 0.00784313725490196 0.00741588464179446 0.00159249570896896 0.00341864330618964 337066 345993 667 665 0 False 599 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 644 595 0.00712683255534055 0.00709303586271699 0.00720225833524071 0.00708018616006714 0.00158616728973189 0.00162263903146382 311527 309120 667 665 0 False 644 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 242 644 0.0089744553221215 0.716424478454089 0.00871290150301366 0.708369573510338 0.00218992789121723 0.196164511070343 392290 31222334 667 665 10 True 242 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 287 639 0.00724702880878169 0.00688787659237359 0.00714122224765393 0.00694285496299687 0.00151414601466816 0.00131282476146575 316781 300179 667 665 0 False 287 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 331 639 0.00665220147994211 0.00648088520683719 0.00671396963454643 0.00650034332799268 0.00129000281580377 0.00130437748705529 290780 282442 667 665 0 False 331 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 376 639 0.00669916815453569 0.00656993823538017 0.00665293354695964 0.00662241550316625 0.00134328743556636 0.00124956163053289 292833 286323 667 665 0 False 376 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 421 639 0.00645319363664471 0.00626739657566897 0.00634775310902571 0.00636301213092241 0.00160434190986661 0.00156178010707378 282081 273138 667 665 0 False 421 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 466 639 0.00678875485580625 0.00678888799017457 0.00683604180972 0.00669871061264973 0.00176431161264056 0.00189821699201459 296749 295865 667 665 0 False 466 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 510 639 0.00694562309140692 0.00703456971566017 0.00698863202868696 0.00698863202868696 0.00178576031328939 0.00217679075368096 303606 306572 667 665 0 False 510 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 555 639 0.0069512051024156 0.00709994257789128 0.00698863202868696 0.00709544518196384 0.00172117142660297 0.00169209512912649 303850 309421 667 665 0 False 555 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 600 638 0.00796459174852949 0.00751312935577672 0.007690547035935 0.00749217975127794 0.00219728707168538 0.00144254870733565 348147 327428 667 665 0 False 600 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 640 644 0.00864214265035027 0.75838768356001 0.00845349813076982 0.744579232471199 0.00186990474329398 0.174441249328542 377764 33051123 667 665 14 True 644 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E8_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E8_3.csv new file mode 100755 index 0000000..006cf72 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E8_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 241 248 0.00101169374113584 0.0715996675139439 0.000747692072938125 0.069565880827039 0.000882769062144906 0.0179902085835415 44223 3120369 667 665 0 True 241 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 286 248 0.00088417681751937 0.00101735226140425 0.000701915007248035 0.000839246204318303 0.000728420701715362 0.00075298869105429 38649 44337 667 665 0 False 286 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 329 248 0.000922953492354304 0.000966137017985568 0.000778210116731518 0.000854505226215 0.000651416684078126 0.000663081737110802 40344 42105 667 665 0 True 330 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 374 247 0.00103356424328463 0.000999385623592054 0.000930800335698482 0.000900282291905089 0.000683586397370586 0.000651742482032945 45179 43554 667 665 0 True 375 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 417 247 0.00100366388103728 0.000998513679483671 0.000793469138628214 0.00080872816052491 0.000815200920865689 0.000754447606767917 43872 43516 667 665 0 True 420 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 461 246 0.00104516293009366 0.000921415463584574 0.000854505226215 0.000778210116731518 0.000907391821319458 0.00077164973354115 45686 40156 667 665 0 True 464 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 506 245 0.00106932114167224 0.00108791089649048 0.000869764248111696 0.000976577401388571 0.000910659662116269 0.000865088761119823 46742 47412 667 665 0 True 509 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 550 245 0.000969920166947883 0.00105248243061304 0.00080872816052491 0.000946059357595178 0.000798002579630752 0.000710826927009876 42397 45868 667 665 0 True 554 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 598 247 0.00120470778572719 0.00109594196064664 0.000976577401388571 0.00080872816052491 0.00107748414515 0.00106990297234175 52660 47762 667 665 0 False 598 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 637 246 0.00121360697540907 0.0745866038407991 0.000930800335698482 0.0724193179217212 0.0010448874663166 0.0203486720538934 53049 3250542 667 665 0 True 643 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 241 291 0.000981061311870959 0.000907808546314287 0.000778210116731518 0.000747692072938125 0.000811519400456073 0.000769913743347227 42884 39563 667 665 0 False 241 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 286 291 0.00100435019386622 0.000958977897937795 0.000854505226215 0.000823987182421607 0.000742532858842852 0.000738609181131077 43902 41793 667 665 0 False 286 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 328 291 0.00101555997007219 0.000929056447481716 0.000885023270008392 0.000778210116731518 0.000731507075957308 0.000684451249521549 44392 40489 667 665 0 True 330 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 373 292 0.00100270304307677 0.000937913563951077 0.000900282291905089 0.000854505226215 0.000697347287844357 0.000646250196294042 43830 40875 667 665 0 True 375 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 417 292 0.000972093490906183 0.000949432404540764 0.000762951094834821 0.000701915007248035 0.000799022565857349 0.000814669994371123 42492 41377 667 665 0 True 420 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 461 290 0.00101956346157432 0.00101257951470574 0.000747692072938125 0.00064087891966125 0.000950544753573407 0.00102013179627578 44567 44129 667 665 0 True 464 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 505 291 0.00102393298658521 0.00105661269217906 0.000823987182421607 0.00080872816052491 0.000887534582440184 0.000894318392899076 44758 46048 667 665 0 True 509 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 549 290 0.00100567706533549 0.00104658533493266 0.000778210116731518 0.000854505226215 0.00086854674331106 0.000834132904941661 43960 45611 667 665 0 True 554 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 599 290 0.00103246614275833 0.00106062822425714 0.000701915007248035 0.000656137941557946 0.00105781233820798 0.00107339158191077 45131 46223 667 665 0 False 599 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 643 290 0.00108940723046579 0.00107976510284638 0.000717174029144732 0.000762951094834821 0.00102988171205909 0.00106329447797783 47620 47057 667 665 0 False 643 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 241 336 0.000892572711126698 0.000953746233287499 0.000701915007248035 0.000793469138628214 0.000759963153368858 0.000787741610607166 39016 41565 667 665 0 True 241 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 285 337 0.000933682849580017 0.000936789214969215 0.00080872816052491 0.000793469138628214 0.000709137397695041 0.000738840526701765 40813 40826 667 665 0 True 286 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 329 336 0.000985888378767815 0.000940208153709979 0.000885023270008392 0.000839246204318303 0.000683882676018197 0.000674848027169812 43095 40975 667 665 0 True 331 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 373 336 0.000918309442211831 0.00100879344160355 0.00080872816052491 0.000930800335698482 0.000689393251463503 0.000705331558384204 40141 43964 667 665 0 True 375 335 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 418 336 0.00101807645044495 0.000967284312865019 0.00080872816052491 0.000732433051041428 0.000869378376986743 0.000852612212435351 44502 42155 667 665 0 True 420 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 461 334 0.00105511446611325 0.00110447783454975 0.00080872816052491 0.000900282291905089 0.000918846350418964 0.000860610581028317 46121 48134 667 665 0 True 465 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 506 334 0.0010207988246664 0.000996953358447618 0.000778210116731518 0.000762951094834821 0.000879750776691859 0.000887821848746731 44621 43448 667 665 0 True 509 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 550 334 0.0010273645507299 0.00100135897078471 0.000762951094834821 0.000854505226215 0.000881648992910289 0.000787874447493497 44908 43640 667 665 0 True 554 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 594 334 0.00101588024939236 0.00103853132487892 0.00064087891966125 0.000534065766384375 0.00108857157702905 0.0011632662774133 44406 45260 667 665 0 True 599 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 638 335 0.00107183762204501 0.00108322993338232 0.000701915007248035 0.000762951094834821 0.00107459155134807 0.00104331488437443 46852 47208 667 665 0 True 643 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 241 380 0.000926819721290648 0.000934540517005492 0.000747692072938125 0.000747692072938125 0.000812449344626506 0.000824004401569126 40513 40728 667 665 0 True 241 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 285 380 0.000919682067869704 0.000965655154136199 0.000762951094834821 0.000839246204318303 0.000736978135255218 0.000696601195945606 40201 42084 667 665 0 True 286 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 329 380 0.00101533119912921 0.000969464173135976 0.000930800335698482 0.000854505226215 0.000723256589017678 0.000753767832276383 44382 42250 667 665 0 True 331 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 374 380 0.000924829414086731 0.00101836188089817 0.000732433051041428 0.000869764248111696 0.000745125402506843 0.000755395800294419 40426 44381 667 665 0 True 375 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 417 380 0.00108867516344826 0.00104927000495058 0.000869764248111696 0.00080872816052491 0.000876781682460295 0.000851221738285586 47588 45728 667 665 0 True 420 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 463 379 0.0011099508611453 0.00110181611042943 0.000823987182421607 0.000717174029144732 0.000985551553361753 0.00106974134497936 48518 48018 667 665 0 True 465 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 506 379 0.0010469702205432 0.000985549247345877 0.000793469138628214 0.00064087891966125 0.000924196029215037 0.000944337422560848 45765 42951 667 665 0 True 509 378 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 550 378 0.00107897527546595 0.00106985247508793 0.00080872816052491 0.000823987182421607 0.000971089558442002 0.000872643327677351 47164 46625 667 665 0 True 554 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 596 378 0.00106312144911751 0.00101827009730782 0.000579842832074464 0.000549324788281071 0.00116680494093404 0.00110385050316446 46471 44377 667 665 0 True 599 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 639 379 0.000982525445906024 0.000977885317551145 0.000579842832074464 0.000671396963454643 0.00105347570498246 0.000934149510985493 42948 42617 667 665 0 True 644 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 242 424 0.000977103574557422 0.000931351037240618 0.000793469138628214 0.000778210116731518 0.000847024394444764 0.000810043262279597 42711 40589 667 665 0 True 241 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 286 424 0.000922107039865281 0.000988922294291462 0.00080872816052491 0.000854505226215 0.00074855728552807 0.000788768237114669 40307 43098 667 665 0 True 286 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 329 424 0.000923228017485878 0.000999316785899287 0.000762951094834821 0.000930800335698482 0.000746422890537983 0.000679281650958675 40356 43551 667 665 0 True 331 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 374 424 0.0010404044944797 0.00102813683327109 0.000961318379491875 0.000900282291905089 0.000701655275615909 0.000758761719780687 45478 44807 667 665 0 True 375 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 418 424 0.00106341885134338 0.00113465168987931 0.000839246204318303 0.000885023270008392 0.000866463961622655 0.000935566167312049 46484 49449 667 665 0 True 420 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 463 423 0.00111491519060795 0.00106581399711226 0.000946059357595178 0.000885023270008392 0.000935338084395185 0.000873413175710597 48735 46449 667 665 0 True 465 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 507 423 0.00101009234453499 0.00112850218932545 0.000732433051041428 0.000930800335698482 0.000951816695113249 0.000970804455833069 44153 49181 667 665 0 True 510 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 550 422 0.00100421293130043 0.00103958683616801 0.000747692072938125 0.000823987182421607 0.000919875452909257 0.000852868123213846 43896 45306 667 665 0 True 554 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 595 423 0.000976989189085933 0.00100801328108552 0.000579842832074464 0.00064087891966125 0.0010083078105008 0.00108788293390373 42706 43930 667 665 0 True 599 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 639 423 0.000965070222956729 0.00102315757349428 0.000595101853971161 0.000686655985351339 0.000980730001107983 0.0010254430726531 42185 44590 667 665 0 True 644 421 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 242 465 0.00088298720861588 0.000913590912506719 0.000747692072938125 0.000747692072938125 0.000737122883417722 0.000774469750508506 38597 39815 667 665 0 False 242 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 286 465 0.00100906287529158 0.000987178406074697 0.000869764248111696 0.000854505226215 0.000833311263860726 0.000849194166610193 44108 43022 667 665 0 False 286 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 331 468 0.000968936451893074 0.00105899906552832 0.000839246204318303 0.000946059357595178 0.000772164971118382 0.000874466075667369 42354 46152 667 665 0 True 331 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 375 468 0.00104230329330643 0.00102421308478337 0.000885023270008392 0.000869764248111696 0.000820210158708247 0.000856605704506898 45561 44636 667 665 0 True 376 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 419 468 0.0010719062533279 0.00105163343240225 0.000762951094834821 0.000762951094834821 0.00104238420154954 0.000970821024434447 46855 45831 667 665 0 True 420 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 463 467 0.000988748015555052 0.00104073413104746 0.000564583810177768 0.000732433051041428 0.00106744854363422 0.00106658454516973 43220 45356 667 665 0 True 465 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 507 466 0.00111534985539961 0.00104178964233656 0.000823987182421607 0.000732433051041428 0.00102120109253927 0.00100483520451452 48754 45402 667 665 0 True 510 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 552 467 0.0011099508611453 0.00106351940735336 0.000717174029144732 0.000732433051041428 0.00106997451131086 0.00105372237101519 48518 46349 667 665 0 True 554 465 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 596 466 0.000958939161684893 0.0009023474226881 0.000595101853971161 0.000579842832074464 0.00102137007051721 0.000903429483303664 41917 39325 667 665 0 True 599 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 640 467 0.001024070249151 0.00102100065912091 0.00064087891966125 0.00064087891966125 0.00100969394063956 0.00101545715182871 44764 44496 667 665 0 True 644 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 243 512 0.000908037626872076 0.000896473272905312 0.000732433051041428 0.000762951094834821 0.000773216692201506 0.000702215375215212 39692 39069 667 665 0 True 242 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 287 512 0.000954226480259527 0.000933278492638096 0.00080872816052491 0.000793469138628214 0.000816640095305378 0.000781514836319688 41711 40673 667 665 0 True 286 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 332 513 0.000991104356267735 0.00105264305189616 0.000839246204318303 0.000854505226215 0.000829718817280887 0.00087555048431481 43323 45875 667 665 0 True 331 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 376 512 0.00100762161835082 0.00104215677669798 0.000778210116731518 0.000885023270008392 0.000909417646465165 0.000851144633852464 44045 45418 667 665 0 True 376 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 420 512 0.00100769024963371 0.00107003604226864 0.000686655985351339 0.000793469138628214 0.00104249551301903 0.00099868483627505 44048 46633 667 665 0 True 420 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 464 509 0.00100551692567541 0.0010891270290627 0.000564583810177768 0.000717174029144732 0.00106909256948171 0.000985922582105426 43953 47465 667 665 0 True 465 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 508 510 0.00104019860063102 0.00100835746954936 0.000778210116731518 0.000732433051041428 0.000923690065541025 0.000911053656998843 45469 43945 667 665 0 True 510 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 553 509 0.00103896323753893 0.00103644324819832 0.000778210116731518 0.00080872816052491 0.000951719227173192 0.000883279461667716 45415 45169 667 665 0 True 555 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 597 509 0.00103905474591612 0.000963131105401407 0.000747692072938125 0.000671396963454643 0.000998839551622739 0.000902988294148743 45419 41974 667 665 0 True 599 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 641 509 0.00108425988424877 0.000914692315590992 0.000717174029144732 0.000503547722590982 0.00106803018816596 0.000979683591995974 47395 39863 667 665 0 True 644 508 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 244 554 0.000926133408461711 0.000978596640376405 0.000778210116731518 0.000854505226215 0.000720242876562929 0.000697167697541075 40483 42648 667 665 0 True 242 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 287 555 0.000940294329832108 0.000975338322918764 0.00080872816052491 0.000839246204318303 0.000747762519772342 0.000755726473943647 41102 42506 667 665 0 True 286 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 332 555 0.00101471351758316 0.00103791178564401 0.000900282291905089 0.000915541313801785 0.000748078024204789 0.000774013140502733 44355 45233 667 665 0 True 331 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 375 554 0.000950428882606076 0.00111271541178421 0.000823987182421607 0.000991836423285267 0.000773156103181433 0.000756981063323012 41545 48493 667 665 0 True 376 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 420 553 0.00104982985733043 0.0010832758251775 0.000839246204318303 0.000762951094834821 0.000964387269101308 0.00100767917303875 45890 47210 667 665 0 True 421 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 465 553 0.00106298418655172 0.000958794330757083 0.000564583810177768 0.000564583810177768 0.00115286101705764 0.00101337241273292 46465 41785 667 665 0 True 465 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 509 551 0.00108117147651855 0.0010866259262255 0.000854505226215 0.000717174029144732 0.00103766242016903 0.0011590365217252 47260 47356 667 665 0 True 510 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 553 551 0.00117444138997107 0.0010095277103264 0.000915541313801785 0.000625619897764553 0.00105042816937158 0.00100480992684544 51337 43996 667 665 0 True 555 552 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 597 551 0.00112610208971962 0.0045514335162695 0.000854505226215 0.00109864957656214 0.0010381898114216 0.0148862585624148 49224 198355 667 665 0 True 599 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 641 551 0.00111146074936896 0.0010588384442452 0.000900282291905089 0.000732433051041428 0.00101323721302199 0.0010005824947798 48584 46145 667 665 0 True 644 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 242 596 0.000941438184547003 0.00109942973708017 0.000823987182421607 0.000991836423285267 0.000654746769612447 0.000731198731529246 41152 47914 667 665 0 False 242 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 287 596 0.000990463797627394 0.00096843160774447 0.000885023270008392 0.000854505226215 0.000724196887335652 0.000763791252616419 43295 42205 667 665 0 False 287 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 332 597 0.000912361397694378 0.000976577401388571 0.000747692072938125 0.000823987182421607 0.000751634521796948 0.00081507249377046 39881 42560 667 665 0 True 331 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 376 596 0.000938189637156702 0.000944728495535015 0.000793469138628214 0.000823987182421607 0.000720026917033956 0.000730627407186971 41010 41172 667 665 0 True 376 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 421 595 0.00101265457909635 0.00101434634882009 0.000793469138628214 0.000701915007248035 0.000935343192445046 0.000947717381735782 44265 44206 667 665 0 False 421 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 465 595 0.000980054719721851 0.00103678743666215 0.00064087891966125 0.000701915007248035 0.00102795636151292 0.00100293504377122 42840 45184 667 665 0 False 465 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 510 595 0.0010719520075165 0.00104676890211337 0.000686655985351339 0.000701915007248035 0.00116504116559745 0.00119587776496366 46857 45619 667 665 0 False 510 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 555 595 0.00100432731677192 0.00107907672591871 0.000610360875867857 0.000732433051041428 0.00103803276991 0.00100997397083806 43901 47027 667 665 0 False 555 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 599 595 0.00109782600116742 0.00102669124172298 0.000900282291905089 0.000747692072938125 0.000904375172589394 0.00092809184187378 47988 44744 667 665 0 False 599 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 644 595 0.00109899273297661 0.00101822420551264 0.000900282291905089 0.000823987182421607 0.000860874951515554 0.00082706791806499 48039 44375 667 665 0 False 644 595 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 242 644 0.0010654549127359 0.0721542469127729 0.000915541313801785 0.071122301060502 0.000770348113783343 0.0210725510454487 46573 3144538 667 665 0 True 242 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 287 639 0.000902913157749347 0.000969487119033565 0.000747692072938125 0.000839246204318303 0.000660646311152175 0.000674010166378213 39468 42251 667 665 0 False 287 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 331 639 0.00098691784801122 0.00101845366448853 0.000869764248111696 0.000915541313801785 0.000677192531449912 0.000681669208720255 43140 44385 667 665 0 False 331 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 376 639 0.00107071664442441 0.00101448402420563 0.000976577401388571 0.000869764248111696 0.000733963706056177 0.000701834214135924 46803 44212 667 665 0 False 376 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 421 639 0.00100684379714469 0.00104158312925826 0.000823987182421607 0.000793469138628214 0.000851325279676931 0.000834676078667129 44011 45393 667 665 0 False 421 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 466 639 0.00100929164623456 0.00106340467786541 0.000747692072938125 0.000778210116731518 0.000911065179108544 0.000945392615839449 44118 46344 667 665 0 False 466 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 510 639 0.000983394775489344 0.0010550753170406 0.00064087891966125 0.000717174029144732 0.00100382057836107 0.00100041622932546 42986 45981 667 665 0 False 510 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 555 639 0.00093908184383432 0.00101485115856705 0.000656137941557946 0.000701915007248035 0.00090245696999985 0.000923714909725966 41049 44228 667 665 0 False 555 639 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 600 638 0.00104845723167256 0.00109103153856259 0.000885023270008392 0.000946059357595178 0.000781130249304091 0.000784694617405995 45830 47548 667 665 0 False 600 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 640 644 0.00110915016284488 0.0782104494470326 0.00102235446707866 0.0741130693522545 0.000798679259224532 0.0221181559706961 48483 3408472 667 665 0 True 644 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E9_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E9_1.csv new file mode 100755 index 0000000..269cc15 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E9_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 252 278 0.0100862821049992 0.0410243507601689 0.0101472495613031 0.0416571297779812 0.00168332924695097 0.00837071318430178 440890 1787873 667 665 0 True 253 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 297 276 0.00999168532007743 0.0098710956838193 0.0100099183642329 0.00988784618905928 0.00144121333382411 0.00127264139050318 436755 430190 667 665 0 False 297 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 340 279 0.0100339621903399 0.0614132722513539 0.0101167315175097 0.061020828564889 0.00139413205420982 0.00966683066056447 438603 2676438 667 665 0 True 342 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 385 279 0.0101801468229035 0.0889632412457098 0.0101319905394064 0.0871137560082399 0.00143218817099351 0.0143215779504272 444993 3877087 667 665 0 True 387 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 429 279 0.010057777245504 0.0692966795565246 0.0100709544518196 0.0675974670023651 0.00170045471432109 0.0102730234021961 439644 3020003 667 665 0 True 431 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 472 278 0.0100771083901858 0.0609006608992153 0.0100709544518196 0.0650644693675135 0.00174808940237815 0.0170051262169234 440489 2654098 667 665 0 True 476 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 517 277 0.00974365186369964 0.0764829675470434 0.00976577401388571 0.0755626764324407 0.00176831956826723 0.01898459087758 425913 3333187 667 665 0 True 521 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 562 276 0.00972738624965384 0.0679618937478739 0.00971999694819562 0.0663767452506294 0.00171110840210558 0.0147578410404909 425202 2961832 667 665 0 True 565 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 610 276 0.00964184879407401 0.00974831218582047 0.00965896086060884 0.00970473792629892 0.00198331409807321 0.00185458256226759 421463 424839 667 665 0 False 610 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 649 276 0.00951570449611541 0.0421001232768348 0.00955214770733196 0.0421606775005722 0.00188410791275913 0.0079529218825106 415949 1834756 667 665 0 True 655 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 253 320 0.0100411227208552 0.00999764230902273 0.0100556954299229 0.0100099183642329 0.00146321619323462 0.00149990334702292 438916 435705 667 665 0 False 253 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 297 320 0.0100931223561943 0.0100717116664401 0.0101472495613031 0.0100862134737163 0.00136342029250799 0.00135799137536902 441189 438933 667 665 0 False 297 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 340 322 0.0104389553906956 0.127567763537936 0.0104219119554437 0.121110856794079 0.00134508291917709 0.050439029068479 456306 5559502 667 665 0 True 342 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 383 322 0.0105369608626678 0.0490797834595645 0.0104676890211337 0.0487373159380484 0.00143489453386505 0.00672676844643745 460590 2138935 667 665 0 True 387 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 430 323 0.0103336063714538 0.0764803517147182 0.0103913939116503 0.074189364461738 0.0016247540286087 0.0129237390889543 451701 3333073 667 665 0 True 431 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 473 321 0.0100326124417764 0.0420991136573409 0.0100251773861295 0.0429541466392004 0.00174471893425695 0.00748383137362729 438544 1834712 667 665 0 True 476 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 517 321 0.010005708978882 0.0425705141774096 0.0098268101014725 0.0445258258945602 0.00189483464240051 0.00834803426576093 437368 1855256 667 665 0 True 521 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 562 320 0.00995624870100999 0.0485773371400577 0.00996414129854276 0.0503700312809949 0.00169353826357755 0.00781990132093279 435206 2117038 667 665 0 True 565 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 610 319 0.009756119880092 0.00957791595032443 0.00967421988250553 0.00962844281681544 0.00212500902123736 0.00209330456637292 426458 417413 667 665 0 False 610 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 655 319 0.0096474308050827 0.00954615882806123 0.00959792477302205 0.00958266575112535 0.0019753389149946 0.00175571065437854 421707 416029 667 665 0 False 655 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 253 367 0.0103537610915302 0.0519140836756574 0.0103761348897536 0.0493171587701228 0.00155853403114568 0.0109335402495298 452582 2262456 667 665 0 True 253 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 297 368 0.0101447102038361 0.05728987150871 0.0101777676050965 0.0604715037766079 0.00144718942689662 0.0123007252855715 443444 2496737 667 665 0 True 297 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 342 363 0.0103237692209057 0.0314800046580172 0.0103608758678569 0.0350957503624018 0.00151204064069391 0.0130449169398974 451271 1371923 667 665 0 False 342 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 384 366 0.0100792359599555 0.0341421418044998 0.0100709544518196 0.0345616845960174 0.00153162942083019 0.00470334585866893 440582 1487941 667 665 0 True 387 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 429 366 0.0103904330736898 0.0687674094827364 0.0103761348897536 0.0655680170901045 0.00159795990777642 0.0106576050517712 454185 2996937 667 665 0 True 431 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 473 364 0.0103785369846548 0.0327161689988303 0.0103761348897536 0.0339665827420462 0.0017408691463254 0.00610098438992054 453665 1425796 667 665 0 True 476 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 517 365 0.0102346858157097 0.0280577387621032 0.0102998397802701 0.0285343709468223 0.00174091676492384 0.00333928126448425 447377 1222778 667 665 0 True 521 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 562 364 0.0101283988356017 0.0512511537484132 0.0100556954299229 0.0515907530327306 0.00179761898242471 0.0080951548514076 442731 2233565 667 665 0 True 565 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 606 364 0.00990479811593402 0.0564384869245671 0.00997940032043946 0.0567635614557107 0.00207019159125895 0.0100506095146209 432957 2459633 667 665 0 True 610 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 650 364 0.00988386557465145 0.06151600103486 0.00991836423285267 0.0618448157473106 0.00200111758475682 0.0148730795087622 432042 2680915 667 665 0 True 655 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 254 411 0.0104077739111676 0.0413037629551104 0.010406652933547 0.0429846646829938 0.00162287681456075 0.00734911690211547 454943 1800050 667 665 0 True 253 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 297 411 0.0103261484387127 0.0307575301265294 0.0103913939116503 0.0309300373846036 0.00161865058691002 0.00319433566579737 451375 1340437 667 665 0 True 297 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 341 410 0.0107663266100985 0.0782366307161816 0.0106507972838941 0.0764934767681392 0.00222480818761636 0.0116771167504749 470616 3409613 667 665 0 True 342 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 385 411 0.0103577417059381 0.062806271802188 0.0103913939116503 0.062027924010071 0.00144895118524751 0.0131568809893039 452756 2737146 667 665 0 True 387 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 429 410 0.0104721043003332 0.0418239005616582 0.010452429999237 0.0428473334859236 0.00172860299907158 0.00519175022572955 457755 1822718 667 665 0 True 431 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 473 409 0.0104362330164741 0.052956263398253 0.0104219119554437 0.0531319142442969 0.00185259668182866 0.00818120207882332 456187 2307875 667 665 0 True 476 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 518 409 0.0103066800314652 0.0425173485326959 0.0103150988021668 0.0426489662012665 0.00172577505760455 0.00481628142619027 450524 1852939 667 665 0 True 521 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 562 408 0.0102006675764887 0.0520782386270093 0.0101472495613031 0.0515449759670405 0.0017977332317346 0.00606638857758746 445890 2269610 667 665 0 True 565 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 606 408 0.0100526985305699 0.0424795336934692 0.00999465934233616 0.043076218814374 0.00199178460448887 0.00605521751723255 439422 1851291 667 665 0 True 610 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 650 408 0.0100974461270166 0.0822445447562601 0.0100251773861295 0.0803540093080034 0.00193440311635168 0.0123581147491128 441378 3584281 667 665 0 True 655 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 252 455 0.0101581848123775 0.0428944643595714 0.0102235446707866 0.0423895628290227 0.00168306798048694 0.0085741278546127 444033 1869374 667 665 0 True 253 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 297 455 0.0102242996148984 0.0507260368820885 0.01025406271458 0.0498054474708171 0.00156125005268192 0.00770875406943363 446923 2210680 667 665 0 True 298 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 341 454 0.010751159096579 0.0330059986312772 0.0108033875028611 0.0333562218661784 0.00163138041839038 0.00301214714142609 469953 1438427 667 665 0 True 342 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 386 454 0.010673216836306 0.0538045502862214 0.0106507972838941 0.0529640650034333 0.00162609032756038 0.00944204446262671 466546 2344844 667 665 0 True 387 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 430 454 0.0108139567204267 0.0906955647300903 0.0108949416342412 0.0905165178912032 0.00198204015742759 0.0120557589120924 472698 3952583 667 665 0 True 432 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 473 453 0.0107520741803509 0.0582411395850579 0.0106965743495842 0.0582131685358969 0.00225137390911609 0.0110451611429747 469993 2538194 667 665 0 True 476 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 518 453 0.010121512830218 0.0501237988539671 0.0100404364080262 0.0490272373540856 0.00191237345551989 0.00619253210278486 442430 2184434 667 665 0 True 521 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 562 452 0.0100700164909534 0.032184558443488 0.0100099183642329 0.0324559395742733 0.00197247107945398 0.00363166650566267 440179 1402628 667 665 0 True 566 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 605 452 0.0101107834729923 0.0385651012401684 0.0100251773861295 0.0388647287708858 0.00190443508802658 0.00441061737265298 441961 1680697 667 665 0 True 610 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 650 452 0.00991225604867514 0.0683102354191728 0.00988784618905928 0.0676585030899519 0.00188089614698954 0.0123485955991507 433283 2977013 667 665 0 True 655 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 254 499 0.0101101657914462 0.050808642113409 0.0100404364080262 0.052628366521706 0.00162280110892695 0.0101286973809467 441934 2214280 667 665 0 True 253 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 298 498 0.0105415820357159 0.0520286984341146 0.0104219119554437 0.0512397955291066 0.00205400428633382 0.00643035716226451 460792 2267451 667 665 0 True 298 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 342 498 0.0106373226753526 0.0645224184287682 0.0105745021744106 0.0619211108567941 0.00161536850471969 0.0115704323823033 464977 2811937 667 665 0 True 342 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 386 498 0.0108151692064245 0.0834799977742479 0.010757610437171 0.0797283894102388 0.00176885311313162 0.0137953279561964 472751 3638123 667 665 0 True 387 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 431 498 0.0111762155086339 0.0894021503747926 0.0112458991378653 0.0859235523002976 0.00208639440845168 0.0230879431541411 488533 3896215 667 665 0 True 432 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 475 496 0.0106159325921841 0.0425936436421794 0.0105897611963073 0.0433356221866178 0.00197909583205216 0.00521094185120742 464042 1856264 667 665 0 True 476 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 519 496 0.0106714324229508 0.0401108975230477 0.010605020218204 0.0406195162890059 0.00214229395876361 0.00431649838644866 466468 1748064 667 665 0 True 521 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 563 496 0.0103024706461143 0.102540145281951 0.0103303578240635 0.101823453116655 0.00192806795104483 0.0172066956460238 450340 4468779 667 665 0 True 566 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 608 496 0.0100751638371705 0.0597862015992143 0.0100862134737163 0.0624551766231785 0.00183738711452055 0.0136170881622236 440404 2605529 667 665 0 True 610 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 651 496 0.0100438222179823 0.0724316857605217 0.0100099183642329 0.0707255664911879 0.00185606153308488 0.00911697037090877 439034 3156629 667 665 0 True 655 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 254 543 0.00995203931565918 0.050526912382811 0.00991836423285267 0.0531166552224002 0.00145914368793497 0.00886768184502188 435022 2202002 667 665 0 True 253 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 298 542 0.0101659859015331 0.113641875345264 0.0101319905394064 0.0975661860074769 0.00151516057383508 0.04914897878585 444374 4952601 667 665 0 True 298 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 342 542 0.0103222135784934 0.0571137158529191 0.0103456168459602 0.0578927290760662 0.00147096729865933 0.0107389704237991 451203 2489060 667 665 0 True 342 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 386 542 0.0106207825361753 0.0566121414775208 0.0106202792401007 0.055741206988632 0.00162507622191065 0.00598786031120489 464254 2467201 667 665 0 True 387 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 431 541 0.0110997831365846 0.0540494059593938 0.0110017547875181 0.0538490882734417 0.0020470029477026 0.00627038863890589 485192 2355515 667 665 0 True 432 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 475 539 0.0105248588797842 0.0615698550565014 0.0106355382619974 0.0601510643167773 0.00208176492608032 0.0100271572390361 460061 2683262 667 665 0 True 476 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 519 539 0.0105404153039068 0.0717107027123772 0.0105897611963073 0.0688181887541009 0.00211049904530345 0.013060143935331 460741 3125208 667 665 0 True 521 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 564 539 0.0105991636820638 0.057013947090202 0.010406652933547 0.0576485847257191 0.00226604000566118 0.0109791602340214 463309 2484712 667 665 0 True 566 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 608 538 0.0102777862613669 0.0471554257582615 0.0102388036926833 0.046494239719234 0.00198276061088527 0.00474894978549905 449261 2055070 667 665 0 True 610 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 652 537 0.00992101797579123 0.0632428404497166 0.00996414129854276 0.063431754024567 0.00200821194625991 0.0100020526792041 433666 2756172 667 665 0 True 655 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 254 584 0.00947493751407656 0.0444630000269614 0.00947585259784848 0.0448767833981842 0.00146127877545209 0.0072094479174456 414167 1937732 667 665 0 True 253 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 299 583 0.0099387706009664 0.0550789424924178 0.00993362325474937 0.0548714427405203 0.00141975527996909 0.0112774269856847 434442 2400383 667 665 0 True 298 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 343 583 0.0100503650669515 0.04380660968053 0.0100404364080262 0.0437170977340352 0.00141437376161095 0.00593598584878769 439320 1909126 667 665 0 True 343 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 386 582 0.0102896594733075 0.0500320152636111 0.0102235446707866 0.0482185091935607 0.00160377799234765 0.00679258602504161 449780 2180434 667 665 0 True 387 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 432 582 0.0107435867783664 0.0828765206676568 0.0107728694590677 0.0786602578774701 0.00192249618936883 0.016878404618612 469622 3611823 667 665 0 True 432 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 475 580 0.0105403237955296 0.0597810158263592 0.0105592431525139 0.0590676737621118 0.00196037184788982 0.00741958926792032 460737 2605303 667 665 0 True 477 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 519 579 0.0101911964594494 0.0532245238869662 0.0100862134737163 0.0524299992370489 0.00216572257610633 0.00560860451748461 445476 2319566 667 665 0 True 521 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 564 579 0.0101329513773669 0.0368272707403666 0.0101319905394064 0.0377508201724269 0.00188620750069261 0.00589827565260612 442930 1604961 667 665 0 True 566 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 607 578 0.0101016326352731 0.048199119910098 0.0100862134737163 0.0472266727702754 0.00160988060577807 0.00671387965677403 441561 2100555 667 665 0 True 611 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 652 578 0.00996615448284098 0.0531652087416986 0.00999465934233616 0.0515907530327306 0.00167710489985092 0.00675518814891553 435639 2316981 667 665 0 True 655 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 253 624 0.00931669665281802 0.00938930067214271 0.00930800335698482 0.0093690394445716 0.00132597920675056 0.0014830679709247 407250 409193 667 665 0 False 253 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 298 624 0.00966202639124475 0.00966832278682516 0.00970473792629892 0.00964370183871214 0.00139009413364661 0.00156631084729797 422345 421353 667 665 0 False 298 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 343 625 0.00996690942695281 0.0674562579486023 0.0100099183642329 0.0652323186083772 0.00149471017596885 0.0100439970994158 435672 2939796 667 665 0 True 343 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 387 624 0.0100308051513268 0.0723927924641083 0.0100251773861295 0.0695811398489357 0.00144695334900282 0.014005340905765 438465 3154934 667 665 0 True 387 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 432 624 0.00999507113003352 0.00985035259239883 0.00997940032043946 0.0098115510795758 0.00176702690099789 0.00181610934917394 436903 429286 667 665 0 False 432 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 477 624 0.0100183828891231 0.00973032260211068 0.00999465934233616 0.00978103303578241 0.00192124263475165 0.00195832257877769 437922 424055 667 665 0 False 477 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 521 624 0.00974648862339258 0.0100474807985861 0.00970473792629892 0.00997940032043946 0.00195588952127863 0.00226613139472389 426037 437877 667 665 0 False 521 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 566 624 0.00998031540421137 0.00968250335153517 0.0100251773861295 0.00964370183871214 0.00175851398005596 0.00183432116128647 436258 421971 667 665 0 False 566 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 611 624 0.00973040602610116 0.0099066159332871 0.00971999694819562 0.00999465934233616 0.00156919653093703 0.00143048670487323 425334 431738 667 665 0 False 611 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 655 623 0.00978945180648403 0.00989346793396859 0.0097962920576791 0.00991836423285267 0.0016283802543833 0.00156529263691955 427915 431165 667 665 0 False 655 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 253 668 0.0112586416793892 0.0311642920530899 0.00971999694819562 0.0370336461432822 0.00570535308374719 0.015782646362836 492136 1358164 667 665 0 False 253 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 298 668 0.00937048070151237 0.00928030765859487 0.0093690394445716 0.00923170824750134 0.00135558873285852 0.00125377222973518 409601 404443 667 665 0 False 298 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 343 668 0.00942705575571107 0.00934428082107305 0.00946059357595178 0.00932326237888151 0.0013359066206706 0.00130651211111681 412074 407231 667 665 0 False 343 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 387 668 0.00962473672753918 0.00952387836150229 0.00958266575112535 0.00949111161974517 0.00135315067144892 0.00136771829549267 420715 415058 667 665 0 False 387 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 432 667 0.0095484416180557 0.00937617561872179 0.00955214770733196 0.0093690394445716 0.00155911970575005 0.00144767284603873 417380 408621 667 665 0 False 432 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 477 667 0.00950998522254094 0.00937869966745658 0.00952162966353857 0.009399557488365 0.00163873690445809 0.00161832375425029 415699 408731 667 665 0 False 477 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 521 667 0.00939445589633657 0.00937741469719159 0.00946059357595178 0.00935378042267491 0.00176671206472765 0.00175568653372846 410649 408675 667 665 0 False 521 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 566 667 0.00956964868446985 0.00958567166370951 0.00959792477302205 0.00965896086060884 0.00171298212165613 0.00154155285440801 418307 417751 667 665 0 False 566 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 611 667 0.0108233134519945 0.00938140728337208 0.00987258716716258 0.0093690394445716 0.00703057265142615 0.00146173639530133 473107 408849 667 665 0 False 611 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 652 673 0.0097245494899609 0.0412327454020724 0.00973525597009232 0.0412298771648737 0.00150693537376652 0.00735093617838415 425078 1796955 667 665 0 True 655 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E9_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E9_2.csv new file mode 100755 index 0000000..1d58f12 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E9_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 252 278 0.00914708587569342 0.734380033397754 0.00889600976577401 0.736415655756466 0.00219642769309414 0.189149691763238 399836 32004851 667 665 11 True 253 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 297 276 0.00730747009191673 0.00701745207605877 0.0072480354009308 0.00701915007248035 0.00167061738478641 0.00128452907976933 319423 305826 667 665 0 False 297 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 340 279 0.00680966451999452 0.00672273496742543 0.0068207827878233 0.00672922865644312 0.00124093642272484 0.00132858914914667 297663 292982 667 665 0 True 342 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 385 279 0.00638902338713912 0.00657207220385594 0.00643930724040589 0.00650034332799268 0.00134929333616097 0.00129748655288357 279276 286416 667 665 0 True 387 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 429 279 0.00668281103211269 0.00679439500559593 0.00669871061264973 0.00686655985351339 0.00160122852349812 0.00168583813782563 292118 296105 667 665 0 True 431 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 472 278 0.00701045677664715 0.00680882797517942 0.00698863202868696 0.0068055237659266 0.00178625915578305 0.00178326042272211 306440 296734 667 665 0 True 476 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 517 277 0.00697049049290873 0.00708103515827793 0.00697337300679027 0.00708018616006714 0.00160120709016999 0.00160276952680454 304693 308597 667 665 0 True 521 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 562 276 0.00735516883352785 0.00740840427918044 0.00727855344472419 0.00738536659800107 0.00165773849877109 0.00161608203412908 321508 322864 667 665 0 True 565 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 610 276 0.00903809939845824 0.0080258554374033 0.00846875715266651 0.00802624551766232 0.00405959154553644 0.00191461139636866 395072 349773 667 665 0 False 610 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 649 276 0.00936485293631509 0.766296583757402 0.0093690394445716 0.750637064164187 0.00200107294266018 0.165522813053512 409355 33395799 667 665 14 True 655 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 253 320 0.00728589699199382 0.00680238017795691 0.0072480354009308 0.00679026474402991 0.0015854790283304 0.00141438470413119 318480 296453 667 665 0 False 253 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 297 320 0.00700368515673498 0.00674671343040595 0.00694285496299687 0.00671396963454643 0.0013624400485086 0.00116196063962165 306144 294027 667 665 0 False 297 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 340 322 0.0069458061081613 0.00725365714584011 0.00689707789730678 0.00738536659800107 0.00124952200444761 0.00132554499821324 303614 316120 667 665 0 True 342 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 383 322 0.00699224660958603 0.00722357507410091 0.00700389105058366 0.00720225833524071 0.00136605481009456 0.00133562416524914 305644 314809 667 665 0 True 387 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 430 323 0.00707618266856501 0.00728761707427185 0.00712596322575723 0.00729381246662089 0.00171333519416846 0.00161001386005758 309313 317600 667 665 0 True 431 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 473 321 0.00729408699175246 0.00755817215274396 0.00732433051041428 0.00762951094834821 0.00174571835830632 0.00158015516448759 318838 329391 667 665 0 True 476 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 517 321 0.00721955341852992 0.0070242670076427 0.00717174029144732 0.00709544518196384 0.00176646591948725 0.00170419406403543 315580 306123 667 665 0 True 521 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 562 320 0.0072882533327065 0.00714936804129803 0.00732433051041428 0.00708018616006714 0.00179313537942578 0.00150002039937354 318583 311575 667 665 0 True 565 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 610 319 0.00792366462683055 0.00783675829537221 0.00799572747386892 0.00775158312352178 0.00207425242781775 0.00203688377498168 346358 341532 667 665 0 False 610 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 655 319 0.00779349396027553 0.00790341612786831 0.00775158312352178 0.00782787823300526 0.0021530785605584 0.00184509251143091 340668 344437 667 665 0 False 655 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 253 367 0.00687767812134217 0.00699205096742772 0.00691233691920348 0.00688181887541009 0.00156124317899119 0.00151511131296733 300636 304719 667 665 0 True 253 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 297 368 0.00670852488610353 0.00670155590395077 0.00675974670023652 0.00672922865644312 0.00146529273070655 0.00133278386993488 293242 292059 667 665 0 True 297 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 342 363 0.00698190616296338 0.00683468800176225 0.00697337300679027 0.00679026474402991 0.00129948515945604 0.00147172708340976 305192 297861 667 665 0 False 342 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 384 366 0.00729456741073272 0.00717979430150106 0.00732433051041428 0.00721751735713741 0.00128103555946079 0.00133088772648443 318859 312901 667 665 0 True 387 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 429 366 0.00752164544873363 0.00795385121076897 0.00758373388265812 0.0080872816052491 0.00165279806082701 0.00166136335435951 328785 346635 667 665 0 True 431 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 473 364 0.0074730773775392 0.00753036172486607 0.00746166170748455 0.00741588464179446 0.00173216753702177 0.0016739239469815 326662 328179 667 665 0 True 476 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 517 365 0.00733492260507421 0.00735000696981639 0.00749217975127794 0.00735484855420768 0.00170015178795331 0.00158406612278091 320623 320319 667 665 0 True 521 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 562 364 0.00743363726696963 0.00762278780035463 0.00746166170748455 0.00755321583886473 0.00177563149289428 0.0018463961597815 324938 332207 667 665 0 True 565 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 606 364 0.00741844687635583 0.00753935651672096 0.00741588464179446 0.00750743877317464 0.0019994098023189 0.0020690440896403 324274 328571 667 665 0 True 610 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 650 364 0.00705756071380652 0.00694689344097254 0.00708018616006714 0.00708018616006714 0.00196734394567879 0.00187333805756259 308499 302751 667 665 0 True 655 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 254 411 0.00710622029337815 0.00667381431376565 0.00714122224765393 0.00665293354695964 0.00158880654461419 0.00146642472590853 310626 290850 667 665 0 True 253 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 297 411 0.00698675610695453 0.00742159817029413 0.00698863202868696 0.00741588464179446 0.00141643366011409 0.00134378046826784 305404 323439 667 665 0 True 297 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 341 410 0.00735434525813312 0.00747506211167654 0.00732433051041428 0.00746166170748455 0.0015017625050636 0.0012771008043528 321472 325769 667 665 0 True 342 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 385 411 0.00723666548506475 0.00719480091852428 0.0072327763790341 0.0072632944228275 0.00147768324065941 0.00146169855351249 316328 313555 667 665 0 True 387 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 429 410 0.0073110846728158 0.0071412681394491 0.0072632944228275 0.00711070420386053 0.00153983029872894 0.00155489380705127 319581 311222 667 665 0 True 431 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 473 409 0.0075057229911023 0.00757294931079128 0.00747692072938125 0.00747692072938125 0.00164116735233882 0.00160189556710403 328089 330035 667 665 0 True 476 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 518 409 0.00763493281969681 0.00753534098464288 0.0076752880140383 0.00758373388265812 0.00169589267033788 0.0017607383189773 333737 328396 667 665 0 True 521 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 562 408 0.00748124450020355 0.00728617148272375 0.00756847486076143 0.00737010757610437 0.00181734443452187 0.00156646849840445 327019 317537 667 665 0 True 565 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 606 408 0.00697554633074856 0.0069106159768843 0.00700389105058366 0.0068207827878233 0.00196886160343928 0.0019428307735296 304914 301170 667 665 0 True 610 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 650 408 0.00639833436451836 0.00665428735491739 0.00633249408712902 0.00665293354695964 0.00182357459410112 0.00183507447325122 279683 289999 667 665 0 True 655 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 252 455 0.00682352803913905 0.00674205541319538 0.00688181887541009 0.00674448767833982 0.00155131682488882 0.00146816338602195 298269 293824 667 665 0 True 253 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 297 455 0.00687644275825008 0.00734684043594911 0.00691233691920348 0.00735484855420768 0.0015436875359712 0.00158022939229272 300582 320181 667 665 0 True 298 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 341 454 0.00745598818809867 0.00692555375621475 0.00741588464179446 0.0068207827878233 0.00153474462204147 0.00147140389177276 325915 301821 667 665 0 True 342 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 386 454 0.00746886799218839 0.00981265248266007 0.00753795681696803 0.00814831769283589 0.00153657366882416 0.00817965533790858 326478 427643 667 665 0 True 387 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 430 454 0.00758222399443446 0.00755337646014785 0.0076600289921416 0.00762951094834821 0.00181959483967593 0.00185561014004016 331433 329182 667 665 0 True 432 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 473 453 0.00746152444491876 0.00748481411815187 0.00744640268558785 0.00749217975127794 0.0017897521558942 0.00202982676373677 326157 326194 667 665 0 True 476 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 518 453 0.00716480853187506 0.0071189188351974 0.00717174029144732 0.00709544518196384 0.00166734475036923 0.001790856925183 313187 310248 667 665 0 True 521 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 562 452 0.00661708514019484 0.00679662075766207 0.00660715648126955 0.0068055237659266 0.00192892255123088 0.00184753811018797 289245 296202 667 665 0 True 566 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 605 452 0.00632965732743608 0.00650353280775755 0.00634775310902571 0.00660715648126955 0.0018617663305228 0.00178983554662584 276681 283429 667 665 0 True 610 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 650 452 0.00621472280568345 0.00625899837715139 0.00628671702143893 0.00627145799954223 0.0017637374895673 0.00191334705255896 271657 272772 667 665 0 True 655 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 254 499 0.00702212409473908 0.00682135643526303 0.00691233691920348 0.00683604180972 0.00161786812783299 0.00138665293655482 306950 297280 667 665 0 True 253 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 298 498 0.00698135711270023 0.00715168557695452 0.00672922865644312 0.00717174029144732 0.00191336336917517 0.00151274395851432 305168 311676 667 665 0 True 298 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 342 498 0.00727779850061236 0.00690921627713137 0.00720225833524071 0.00689707789730678 0.00151710890570434 0.00154602524378642 318126 301109 667 665 0 True 342 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 386 498 0.00720706252504327 0.00733651478203405 0.00712596322575723 0.00737010757610437 0.00159695716151934 0.00155843535577883 315034 319731 667 665 0 True 387 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 431 498 0.00767716393577073 0.0073063179808069 0.0076752880140383 0.0072480354009308 0.00201332882167016 0.00187230615698281 335583 318415 667 665 0 True 432 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 475 496 0.00735015874987661 0.0078842104115863 0.00737010757610437 0.00779736018921187 0.00184070177214946 0.00194692975360991 321289 343600 667 665 0 True 476 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 519 496 0.00734761939240954 0.0070077689072762 0.00730907148851759 0.00700389105058366 0.0020470685477535 0.00161424721153094 321178 305404 667 665 0 True 521 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 563 496 0.00653616885766318 0.0067449465962916 0.00654612039368277 0.00679026474402991 0.00186825831189097 0.00197315563714182 285708 293950 667 665 0 True 566 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 608 496 0.00618839127014657 0.00617868773558983 0.00625619897764553 0.00621042191195544 0.00177678822664194 0.00182912992077902 270506 269272 667 665 0 True 610 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 651 496 0.00609162116126647 0.00630078285666099 0.00605783169298848 0.00630197604333562 0.00177740303575176 0.00187373149450649 266276 274593 667 665 0 True 655 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 254 543 0.00676503130901933 0.00675417084712238 0.00679026474402991 0.0068055237659266 0.00138271265686586 0.00155671245178899 295712 294352 667 665 0 True 253 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 298 542 0.00683215270368935 0.00682702407196751 0.00688181887541009 0.00685130083161669 0.00145398200446349 0.00140281912640151 298646 297527 667 665 0 True 298 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 342 542 0.00679353616851451 0.00728913150351273 0.00679026474402991 0.0072327763790341 0.00155298266863589 0.00159220284519287 296958 317666 667 665 0 True 342 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 386 542 0.00721454333487868 0.00736457761478542 0.00714122224765393 0.00733958953231098 0.00168609520313702 0.00157964077186738 315361 320954 667 665 0 True 387 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 431 541 0.00722669107195086 0.00699806279259605 0.00720225833524071 0.00697337300679027 0.00192757259456628 0.00212017023246156 315892 304981 667 665 0 True 432 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 475 539 0.00698488018522211 0.00747143665985747 0.00692759594110018 0.00753795681696803 0.00195172532597725 0.00207036359078572 305322 325611 667 665 0 True 476 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 519 539 0.00726059492570034 0.006991477319988 0.00721751735713741 0.00700389105058366 0.00203978058882707 0.00191829023420887 317374 304694 667 665 0 True 521 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 564 539 0.00703530130105467 0.00685770273704403 0.00698863202868696 0.00691233691920348 0.00179684736003261 0.00183705182888693 307526 298864 667 665 0 True 566 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 608 538 0.0066229645534294 0.00655706558683273 0.00668345159075303 0.00653086137178607 0.00187803313868144 0.00162041783568204 289502 285762 667 665 0 True 610 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 652 537 0.00635832232659134 0.00640608158069699 0.00627145799954223 0.00648508430609598 0.00198019864457089 0.00197286865343513 277934 279182 667 665 0 True 655 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 254 584 0.00685347415557499 0.00705588645452037 0.00683604180972 0.00706492713817044 0.00122762107015098 0.00114928903655079 299578 307501 667 665 0 True 253 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 299 583 0.00701633618988171 0.00716478768447785 0.00697337300679027 0.00708018616006714 0.00140494660894454 0.00150369427271765 306697 312247 667 665 0 True 298 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 343 583 0.00688213915473026 0.0068368678620332 0.00691233691920348 0.0068207827878233 0.00144911799450861 0.00151377736824952 300831 297956 667 665 0 True 343 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 386 582 0.00697017021358856 0.00672906803516 0.00686655985351339 0.00669871061264973 0.00172267843954401 0.00134444435578547 304679 293258 667 665 0 True 387 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 432 582 0.00706934241736994 0.00758322907291116 0.00711070420386053 0.00759899290455482 0.00184312567140453 0.00202802938081555 309014 330483 667 665 0 True 432 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 475 580 0.00728543945010786 0.00697422200500106 0.00733958953231098 0.00704966811627375 0.00200640692406767 0.0018416940860201 318460 303942 667 665 0 True 477 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 519 579 0.00709276856193098 0.00745314877947902 0.00720225833524071 0.00749217975127794 0.00196933963952056 0.00201707115046706 310038 324814 667 665 0 True 521 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 564 579 0.00714252624202891 0.00703486801232883 0.00718699931334401 0.00709544518196384 0.00174223693496829 0.00178818074057863 312213 306585 667 665 0 True 566 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 607 578 0.0069491004097402 0.00722300142666118 0.00697337300679027 0.00720225833524071 0.00150121126767396 0.00163037276308462 303758 314784 667 665 0 True 611 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 652 578 0.00658508008527208 0.00662594917139496 0.00666819256885634 0.00666819256885634 0.00168082579565758 0.00153654938049603 287846 288764 667 665 0 True 655 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 253 624 0.0072089155696814 0.00710427935253561 0.00721751735713741 0.00706492713817044 0.00139008571635534 0.00145509105454528 315115 309610 667 665 0 False 253 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 298 624 0.00703811518365331 0.00706508775945357 0.00711070420386053 0.00697337300679027 0.00146270317434351 0.00161590553096249 307649 307902 667 665 0 False 298 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 343 625 0.00683116898863455 0.00686651396171821 0.00686655985351339 0.00688181887541009 0.00143469713250242 0.00145870987930253 298603 299248 667 665 0 True 343 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 387 624 0.00648092067493376 0.0066323281309247 0.00653086137178607 0.00665293354695964 0.00135863212202111 0.0013595464935994 283293 289042 667 665 0 True 387 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 432 624 0.00665350547431709 0.0065853349326624 0.00668345159075303 0.00656137941557946 0.00172732067070153 0.00178079127971337 290837 286994 667 665 0 False 432 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 477 624 0.00704518420579136 0.00665086841617663 0.00698863202868696 0.00677500572213321 0.00197637362630213 0.00195052714790455 307958 289850 667 665 0 False 477 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 521 624 0.00683217558078365 0.00719585642981338 0.00688181887541009 0.00720225833524071 0.00197214892840997 0.00202974067856863 298647 313601 667 665 0 False 521 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 566 624 0.00713618928690839 0.00669471802646924 0.00709544518196384 0.00665293354695964 0.00169826091618367 0.00181231252313018 311936 291761 667 665 0 False 566 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 611 624 0.00688966571875426 0.00692534724313645 0.00692759594110018 0.0068055237659266 0.00142477546837219 0.00137627180499096 301160 301812 667 665 0 False 611 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 655 623 0.00709636026573575 0.0069221118715764 0.00711070420386053 0.00698863202868696 0.00152670491891717 0.00147387515110464 310195 301671 667 665 0 False 655 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 253 668 0.0568415723472665 0.540654543201676 0.00846875715266651 0.677515831235218 0.141783751379713 0.377878406030141 2484650 23562144 667 665 12 False 253 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 298 668 0.00737694782729944 0.00677631363829579 0.00711070420386053 0.00679026474402991 0.00193240289450024 0.0012513254359624 322460 295317 667 665 0 False 298 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 343 668 0.00644063411187517 0.00629077844531218 0.00646982528419928 0.00628671702143893 0.0013391062954368 0.00133305587689354 281532 274157 667 665 0 False 343 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 387 668 0.0063913339736632 0.00648251436556601 0.00636301213092241 0.00646982528419928 0.00134367235175635 0.00128929649853756 279377 282513 667 665 0 False 387 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 432 667 0.00637815676734762 0.00621186750350355 0.00634775310902571 0.00619516289005875 0.00151332756599787 0.00144945611628654 278801 270718 667 665 0 False 432 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 477 667 0.00648412346813547 0.00651812639862416 0.00646982528419928 0.00648508430609598 0.00175255711128357 0.00146519087058133 283433 284065 667 665 0 False 477 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 521 667 0.00657249768340824 0.00656268733174204 0.00659189745937285 0.00654612039368277 0.00187880425104452 0.00161368686565143 287296 286007 667 665 0 False 521 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 566 667 0.00667862452385618 0.00685430674420085 0.00672922865644312 0.0068207827878233 0.00160219569251295 0.00188649761345823 291935 298716 667 665 0 False 566 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 611 667 0.0107410931750879 0.00698759946329546 0.00752269779507134 0.00692759594110018 0.0175522471700641 0.00145180374813007 469513 304525 667 665 0 False 611 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 652 673 0.00879235365151025 0.774274642890128 0.00883497367818723 0.760540169375143 0.00179151269221067 0.166439448630971 384330 33743489 667 665 15 True 655 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E9_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E9_3.csv new file mode 100755 index 0000000..d617bcf --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_E9_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 252 278 0.001101326196595 0.0749740453215896 0.000930800335698482 0.0728770885786221 0.00080182509863378 0.0221297706923402 48141 3267427 667 665 0 True 253 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 297 276 0.000933934497617293 0.000917629390482386 0.00080872816052491 0.00080872816052491 0.000674456785268396 0.000661392734405644 40824 39991 667 665 0 False 297 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 340 279 0.000995153601958462 0.000883761245640997 0.000854505226215 0.000762951094834821 0.000722270769230367 0.000673627991798157 43500 38515 667 665 0 True 342 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 385 279 0.000984035334129685 0.000958266575112535 0.000869764248111696 0.000854505226215 0.000699687587158518 0.000707502639823018 43014 41762 667 665 0 True 387 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 429 279 0.000956125279086252 0.00088623940258061 0.000747692072938125 0.00064087891966125 0.000814820892979282 0.000822177307853981 41794 38623 667 665 0 True 431 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 472 278 0.000984561507298537 0.000948698135817915 0.000717174029144732 0.000656137941557946 0.000896012644302591 0.000948537066585116 43037 41345 667 665 0 True 476 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 517 277 0.000942010111904451 0.000953424990721253 0.000747692072938125 0.000732433051041428 0.000849462293186208 0.0008486903835242 41177 41551 667 665 0 True 521 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 562 276 0.000986185780993687 0.00101264835239851 0.000732433051041428 0.000778210116731518 0.000891146859223674 0.000861358223967745 43108 44132 667 665 0 True 565 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 610 276 0.00119054686435679 0.00106097241272098 0.000915541313801785 0.000701915007248035 0.00114286744602437 0.00102294414666772 52041 46238 667 665 0 False 610 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 649 276 0.00124291253320467 0.0788686984111687 0.000976577401388571 0.0747539482719158 0.00109249929167455 0.0214973050141695 54330 3437159 667 665 0 True 655 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 253 320 0.000993117540565949 0.000951841723787611 0.000823987182421607 0.000793469138628214 0.000768046946955472 0.000733155133604659 43411 41482 667 665 0 False 253 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 297 320 0.000923159386202985 0.000909942514790065 0.00080872816052491 0.00080872816052491 0.000677399480278587 0.000652998977745139 40353 39656 667 665 0 False 297 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 340 322 0.000992088071322544 0.000937041619842694 0.000885023270008392 0.00080872816052491 0.000698777018489041 0.000690930946404916 43366 40837 667 665 0 True 342 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 383 322 0.000978956619195552 0.00101131749033834 0.000839246204318303 0.000930800335698482 0.000671871958947142 0.000688789720683672 42792 44074 667 665 0 True 387 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 430 323 0.000957932569535786 0.00100064764795945 0.000671396963454643 0.000701915007248035 0.000899620194797111 0.00091747099239603 41873 43609 667 665 0 True 431 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 473 321 0.000939470754437384 0.000936858052661982 0.000717174029144732 0.000717174029144732 0.000838535600100874 0.00087317452737726 41066 40829 667 665 0 True 476 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 517 321 0.000911446313922462 0.000995760171772989 0.000717174029144732 0.000762951094834821 0.000817668142620079 0.000860770463996629 39841 43396 667 665 0 True 521 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 562 320 0.00100480773575217 0.00101319905394064 0.000732433051041428 0.000823987182421607 0.00094919919562551 0.00079575681216711 43922 44156 667 665 0 True 565 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 610 319 0.00104536882394234 0.00106634175275681 0.000595101853971161 0.000656137941557946 0.00111187816147907 0.00116366912197631 45695 46472 667 665 0 False 610 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 655 319 0.00113038010635332 0.00105929736219698 0.000747692072938125 0.000762951094834821 0.00108878606805611 0.000964303831867064 49411 46165 667 665 0 False 655 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 253 367 0.000938395531005383 0.000950946833781639 0.000793469138628214 0.000778210116731518 0.000755252717602873 0.0007980005409498 41019 41443 667 665 0 True 253 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 297 368 0.000893442040710018 0.000866253525780576 0.000778210116731518 0.000732433051041428 0.000703774780083066 0.000677522638803836 39054 37752 667 665 0 True 297 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 342 363 0.000973855027167121 0.000934861759571738 0.000854505226215 0.000793469138628214 0.000740259000422638 0.00073552372167898 42569 40742 667 665 0 False 342 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 384 366 0.00103404466226488 0.000925224482584351 0.000930800335698482 0.000793469138628214 0.00074800353672023 0.000706796534072994 45200 40322 667 665 0 True 387 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 429 366 0.000986140026805092 0.00104789325109524 0.000717174029144732 0.000747692072938125 0.000898676952384736 0.000945282984624268 43106 45668 667 665 0 True 431 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 473 364 0.000940065558889129 0.00096866106672036 0.000671396963454643 0.000595101853971161 0.00085737945124534 0.000949232416111121 41092 42215 667 665 0 True 476 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 517 365 0.000939791033757555 0.000987545540436121 0.000701915007248035 0.000671396963454643 0.000865076347682265 0.000922264712131862 41080 43038 667 665 0 True 521 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 562 364 0.00101793918787917 0.00103079855739142 0.000717174029144732 0.000793469138628214 0.00100043510463901 0.000914034125329858 44496 44923 667 665 0 True 565 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 606 364 0.000987489775368667 0.00102033522809083 0.000579842832074464 0.000503547722590982 0.0010340158640561 0.00116186564246878 43165 44467 667 665 0 True 610 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 650 364 0.000960746452134427 0.00101953212167521 0.000610360875867857 0.000656137941557946 0.000971036518044302 0.00104754911465209 41996 44432 667 665 0 True 655 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 254 411 0.000989022540686626 0.000976760968569283 0.000854505226215 0.00080872816052491 0.000798086624944714 0.000832108653944632 43232 42568 667 665 0 True 253 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 297 411 0.000932973659656782 0.000984011872207413 0.000762951094834821 0.000900282291905089 0.000749664946713865 0.000744421249108005 40782 42884 667 665 0 True 297 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 341 410 0.00102681550046675 0.00103873783795722 0.000930800335698482 0.000915541313801785 0.000762122492011395 0.000700772116704831 44884 45269 667 665 0 True 342 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 385 411 0.00102610631054352 0.000977242832418653 0.000930800335698482 0.000854505226215 0.000784360091664079 0.000764740551257766 44853 42589 667 665 0 True 387 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 429 410 0.00100082712134434 0.000998903759742685 0.000778210116731518 0.000762951094834821 0.000887114731768851 0.000837543214928446 43748 43533 667 665 0 True 431 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 473 409 0.00104774804174932 0.000932154143656234 0.000823987182421607 0.000747692072938125 0.000934241622431605 0.000786965512703633 45799 40624 667 665 0 True 476 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 518 409 0.00105257510864618 0.00108593754929783 0.000823987182421607 0.000854505226215 0.000921033406350185 0.000955741551292286 46010 47326 667 665 0 True 521 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 562 408 0.0010100008361578 0.0010061776092784 0.000732433051041428 0.000793469138628214 0.0009373363295545 0.000867930385585955 44149 43850 667 665 0 True 565 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 606 408 0.00101883139455678 0.000953585612004376 0.000595101853971161 0.00064087891966125 0.00109178924774598 0.000998962744080274 44535 41558 667 665 0 True 610 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 650 408 0.000953814692562165 0.000963911265919434 0.000549324788281071 0.00064087891966125 0.000993338083655524 0.000962145678120405 41693 42008 667 665 0 True 655 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 252 455 0.00090918148158697 0.000913820371482609 0.000762951094834821 0.000701915007248035 0.00077732618476084 0.000814390594754821 39742 39825 667 665 0 True 253 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 297 455 0.000976188490785507 0.00093224592724659 0.000839246204318303 0.000762951094834821 0.000823308759698645 0.000808887906983824 42671 40628 667 665 0 True 298 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 341 454 0.000977698379009168 0.00101751288268738 0.000854505226215 0.000885023270008392 0.00074396980856928 0.000820710889368702 42737 44344 667 665 0 True 342 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 386 454 0.000963583211827366 0.00109851190117661 0.000823987182421607 0.000930800335698482 0.000790875897095298 0.00103559091984769 42120 47874 667 665 0 True 387 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 430 454 0.000998379272254466 0.0010356401417827 0.000686655985351339 0.000732433051041428 0.000983137779334487 0.00107887889718692 43641 45134 667 665 0 True 432 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 473 453 0.000937617709799255 0.000972745436491205 0.000534065766384375 0.000625619897764553 0.00100922887668769 0.00102300874007508 40985 42393 667 665 0 True 476 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 518 453 0.000903690978955475 0.000930180796463578 0.000610360875867857 0.000625619897764553 0.000856203738281668 0.000922134388095662 39502 40538 667 665 0 True 521 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 562 452 0.000926407933593286 0.000939863965246143 0.000534065766384375 0.000503547722590982 0.00100848664760417 0.00100456132022302 40495 40960 667 665 0 True 566 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 605 452 0.000923616928088943 0.000949340620950408 0.000518806744487678 0.000518806744487678 0.00100157389271792 0.000995247598564961 40373 41373 667 665 0 True 610 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 650 452 0.000914740615501359 0.00103798062333678 0.000503547722590982 0.000564583810177768 0.000985452909910436 0.00113338637604079 39985 45236 667 665 0 True 655 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 254 499 0.000995451004184335 0.000925752238228898 0.000839246204318303 0.000762951094834821 0.000805590842556181 0.000774290041591494 43513 40345 667 665 0 True 253 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 298 498 0.0010002323168926 0.000981189526803963 0.000854505226215 0.000839246204318303 0.000861025459762924 0.000808254653801316 43722 42761 667 665 0 True 298 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 342 498 0.000971750334491715 0.000981074797316018 0.000900282291905089 0.000793469138628214 0.000760365319311569 0.000875733295543933 42477 42756 667 665 0 True 342 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 386 498 0.000998608043197445 0.0010416978587462 0.000793469138628214 0.000839246204318303 0.000882125884703639 0.000869761702902157 43651 45398 667 665 0 True 387 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 431 498 0.00104660418703443 0.000973846839575478 0.000686655985351339 0.000625619897764553 0.00105321767334112 0.000992362751707541 45749 42441 667 665 0 True 432 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 475 496 0.00104511717590507 0.000950327294546735 0.000671396963454643 0.00064087891966125 0.00103163454348138 0.000922625599296674 45684 41416 667 665 0 True 476 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 519 496 0.00100098726100443 0.000932108251861056 0.000686655985351339 0.000610360875867857 0.000932038460647705 0.000876892370506088 43755 40622 667 665 0 True 521 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 563 496 0.000959373826476553 0.000901246019603828 0.000610360875867857 0.000595101853971161 0.000968969041238806 0.000919921408976191 41936 39277 667 665 0 True 566 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 608 496 0.000891932152486357 0.000888533992339512 0.000534065766384375 0.000579842832074464 0.000929220149042883 0.000922413023845972 38988 38723 667 665 0 True 610 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 651 496 0.000931669665281802 0.000938120077029378 0.000534065766384375 0.000503547722590982 0.000952841689310121 0.00101080480221915 40725 40884 667 665 0 True 655 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 254 543 0.000943268352090835 0.000970588522117837 0.00080872816052491 0.000793469138628214 0.00075462314798658 0.00080657304227589 41232 42299 667 665 0 True 253 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 298 542 0.00093635946961287 0.00091379742558502 0.000823987182421607 0.000793469138628214 0.000779380783595135 0.000717682153079528 40930 39824 667 665 0 True 298 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 342 542 0.000937114413724701 0.00102448843555444 0.00080872816052491 0.000900282291905089 0.000763752240261192 0.000777487884302798 40963 44648 667 665 0 True 342 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 386 542 0.000959808491268213 0.000882682788454313 0.000839246204318303 0.000701915007248035 0.000763203952180087 0.000770019727715899 41955 38468 667 665 0 True 387 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 431 541 0.001018694131991 0.00102022049860288 0.000595101853971161 0.00064087891966125 0.00107459268272491 0.0010791162858493 44529 44462 667 665 0 True 432 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 475 539 0.00099778446780272 0.000945898736312055 0.000610360875867857 0.000488288700694286 0.00102690263707125 0.00108713620678606 43615 41223 667 665 0 True 476 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 519 539 0.000972688295357929 0.000901337803194184 0.000610360875867857 0.000503547722590982 0.000993170786312016 0.000987615247909224 42518 39281 667 665 0 True 521 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 564 539 0.000964223770467707 0.000900764155754458 0.000701915007248035 0.000595101853971161 0.000878016206741391 0.000892729673239256 42148 39256 667 665 0 True 566 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 608 538 0.000934872458483507 0.000929859553897332 0.00064087891966125 0.000671396963454643 0.000874626987109278 0.000861388412981108 40865 40524 667 665 0 True 610 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 652 537 0.00103688142195782 0.000945256251179563 0.000747692072938125 0.000534065766384375 0.000990982469882076 0.00103637555459918 45324 41195 667 665 0 True 655 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 254 584 0.000942421899601813 0.000987637324026477 0.00080872816052491 0.000839246204318303 0.000692877340028978 0.000688650818899903 41195 43042 667 665 0 True 253 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 299 583 0.000987878685971731 0.000960423489485903 0.000854505226215 0.000839246204318303 0.000748090011893495 0.000782816642187165 43182 41856 667 665 0 True 298 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 343 583 0.00100537966310962 0.000954618177395882 0.000885023270008392 0.000823987182421607 0.000752633436646338 0.000742285574598168 43947 41603 667 665 0 True 343 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 386 582 0.00101688684154146 0.000976577401388571 0.000869764248111696 0.000823987182421607 0.000744875771940024 0.000689896712154471 44450 42560 667 665 0 True 387 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 432 582 0.00107293572257131 0.000992800150984006 0.000717174029144732 0.000579842832074464 0.00103122793277675 0.00108193305066995 46900 43267 667 665 0 True 432 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 475 580 0.00100515089216664 0.000991033316869652 0.000610360875867857 0.00064087891966125 0.0010884390068783 0.000960209445361976 43937 43190 667 665 0 True 477 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 519 579 0.000887265225249586 0.000969762469804633 0.000488288700694286 0.000473029678797589 0.0010252156659638 0.00110737679763775 38784 42263 667 665 0 True 521 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 564 579 0.00101157935566435 0.000969877199292578 0.000732433051041428 0.000595101853971161 0.000955342209720034 0.000981898504203071 44218 42268 667 665 0 True 566 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 607 578 0.000929770866455076 0.000978803153454706 0.000701915007248035 0.000686655985351339 0.000823552395297633 0.000863401435690885 40642 42657 667 665 0 True 611 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 652 578 0.00101986086380019 0.000927519072343252 0.000778210116731518 0.000732433051041428 0.000879650405232065 0.000799375635702031 44580 40422 667 665 0 True 655 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 253 624 0.000973374608186866 0.000961869081034011 0.000839246204318303 0.000778210116731518 0.000734525369547056 0.000768502422857876 42548 41919 667 665 0 False 253 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 298 624 0.000921191956093366 0.000980409366285937 0.000762951094834821 0.000839246204318303 0.000731904669389085 0.000741641733965854 40267 42727 667 665 0 False 298 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 343 625 0.00101665807059848 0.000915311854825895 0.000961318379491875 0.000793469138628214 0.000711935768531377 0.000715799583115569 44440 39890 667 665 0 True 343 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 387 624 0.000975685194710953 0.000934930597264505 0.000839246204318303 0.000839246204318303 0.00070245706456271 0.000687323202779352 42649 40745 667 665 0 True 387 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 432 624 0.00090005352096211 0.000894293412634355 0.000656137941557946 0.000549324788281071 0.000881650726268944 0.000902345750684783 39343 38974 667 665 0 False 432 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 477 624 0.000964361033033495 0.000916757446374003 0.000656137941557946 0.000549324788281071 0.000981738362722191 0.000952507529317043 42154 39953 667 665 0 False 477 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 521 624 0.0008947231579907 0.000958174791522179 0.000503547722590982 0.000549324788281071 0.00097270070232799 0.00100951693775518 39110 41758 667 665 0 False 521 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 566 624 0.00097724083712321 0.00087924090381596 0.000686655985351339 0.000610360875867857 0.000913630175856514 0.000907189250838886 42717 38318 667 665 0 False 566 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 611 624 0.000959076424250681 0.00098265806424966 0.00080872816052491 0.000793469138628214 0.000746515685323051 0.000709278283128506 41923 42825 667 665 0 False 611 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 655 623 0.00103910050010472 0.00106852161302776 0.000854505226215 0.000900282291905089 0.000783660821344031 0.000852334607571175 45421 46567 667 665 0 False 655 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 253 668 0.0058096838511392 0.0558828979062442 0.00115968566414893 0.0676279850461585 0.0140409892276718 0.0404470613024345 253952 2435420 667 665 0 False 253 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 298 668 0.000962645250961153 0.000887455535152828 0.000778210116731518 0.000778210116731518 0.000740172978543984 0.000656395659757667 42079 38676 667 665 0 False 298 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 343 668 0.000973191591432483 0.000924421376168735 0.000823987182421607 0.000793469138628214 0.00071458476919101 0.000646023226230785 42540 40287 667 665 0 False 343 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 387 668 0.000933362570259846 0.000985021491701329 0.00080872816052491 0.000854505226215 0.00070945852546692 0.000689922177418786 40799 42928 667 665 0 False 387 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 432 667 0.000910142319547482 0.000935366569318696 0.000717174029144732 0.000747692072938125 0.000801863849251775 0.000769717993254306 39784 40764 667 665 0 False 432 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 477 667 0.000962530865489663 0.000869718356316518 0.000717174029144732 0.000671396963454643 0.000877962923382938 0.000741055369203663 42074 37903 667 665 0 False 477 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 521 667 0.000981473099568321 0.000942801040137538 0.000595101853971161 0.000610360875867857 0.000965306036462391 0.000888112740777138 42902 41088 667 665 0 False 521 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 566 667 0.000936496732178658 0.000890828582098414 0.000701915007248035 0.000656137941557946 0.000825395471683153 0.000757222194631881 40936 38823 667 665 0 False 566 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 611 667 0.00137591995945264 0.00099481938997184 0.000976577401388571 0.000793469138628214 0.00187773844374329 0.00078242783802877 60144 43355 667 665 0 False 611 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 652 673 0.00118299742323848 0.0803052033838315 0.00105287251087205 0.0762951094834821 0.000805903569234566 0.0217646235106797 51711 3499763 667 665 0 True 655 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F10_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F10_1.csv new file mode 100755 index 0000000..33077e5 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F10_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 270 260 0.00980269764408251 0.0382378239028562 0.00976577401388571 0.0387731746395056 0.00142558497235804 0.00810466408212317 428494 1666434 667 665 0 True 270 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 315 260 0.00963500854287894 0.00977731580037299 0.00961318379491875 0.0098115510795758 0.0012942115864161 0.00138233101052368 421164 426103 667 665 0 False 315 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 358 261 0.00953023145099458 0.0518343466815356 0.00956740672922866 0.0524605172808423 0.0012772690704395 0.00745206871051114 416584 2258981 667 665 0 True 359 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 403 261 0.00963590074955656 0.0735880213236226 0.00967421988250553 0.0732585641260395 0.00142657735267474 0.00905875629446588 421203 3207023 667 665 0 True 404 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 448 261 0.00964264949237443 0.0612995753288004 0.00965896086060884 0.0595254444190127 0.00159783510754365 0.0102372414290116 421498 2671483 667 665 0 True 449 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 492 260 0.00967543236850332 0.0522860366755754 0.00976577401388571 0.0558327611200122 0.00167537019097818 0.013100328421847 422931 2278666 667 665 0 True 494 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 536 260 0.0098973859373815 0.0686237222720339 0.00991836423285267 0.0676585030899519 0.00161019838955186 0.02182581321367 432633 2990675 667 665 0 True 538 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 579 259 0.00964800273244014 0.0575177931094617 0.00962844281681544 0.0575570305943389 0.00171838772355429 0.0155957778841553 421732 2506670 667 665 0 True 583 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 628 259 0.0094603876821031 0.00948594879278765 0.00941481651026169 0.00949111161974517 0.00187389447695416 0.00175583532123672 413531 413405 667 665 0 False 628 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 667 260 0.00946503173224557 0.0402978836425006 0.00941481651026169 0.0405584802014191 0.00180721917352744 0.00743803768540346 413734 1756213 667 665 0 True 672 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 270 304 0.00926865475479244 0.00945396221154855 0.00935378042267491 0.00949111161974517 0.00151257881081231 0.00159475410618851 405150 412011 667 665 0 False 270 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 315 304 0.00950017094908714 0.00949441582899799 0.00950637064164187 0.00947585259784848 0.00135932163568889 0.00124088512243646 415270 413774 667 665 0 False 315 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 359 305 0.00977085272881984 0.0837611768033038 0.0098115510795758 0.0808117799649043 0.00131250890432997 0.0209475138626655 427102 3650377 667 665 0 True 360 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 404 305 0.00971665689242813 0.0473303423355826 0.00971999694819562 0.0474250400549325 0.00145946047519175 0.00644075513710509 424733 2062693 667 665 0 True 404 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 447 304 0.00970512683690199 0.0656544542863224 0.00971999694819562 0.0646982528419928 0.00180014698641231 0.0121307268209433 424229 2861272 667 665 0 True 449 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 491 303 0.00962629236995144 0.0381010892991233 0.00967421988250553 0.0390325780117494 0.001783448790111 0.00881687427979078 420783 1660475 667 665 0 True 494 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 538 303 0.00972557895920431 0.0361301743716122 0.00976577401388571 0.038803692683299 0.00158533813513513 0.00824487667303819 425123 1574581 667 665 0 False 538 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 581 303 0.00965074798375589 0.0441781037624962 0.00968947890440223 0.0456702525368124 0.0018186609146146 0.00676683068356218 421852 1925316 667 665 0 True 583 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 628 303 0.00945553773811195 0.00931445115420733 0.00956740672922866 0.00929274433508812 0.00194903810784186 0.00193609190523147 413319 405931 667 665 0 False 628 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 672 303 0.00935782966836563 0.0092631211813007 0.00935378042267491 0.00929274433508812 0.0020356923831593 0.00190414492296535 409048 403694 667 665 0 False 672 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 271 348 0.00935320849531746 0.0448154031221336 0.00943007553215839 0.0459601739528496 0.00152469495258756 0.0120048701606172 408846 1953090 667 665 0 True 270 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 316 349 0.00947157458121477 0.0536543234947061 0.00943007553215839 0.0582131685358969 0.00140948376561985 0.0143301164263675 414020 2338297 667 665 0 True 315 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 359 349 0.00988407146850013 0.0341725910106004 0.0098115510795758 0.0359349965667201 0.00138432257522928 0.0068598703197571 432051 1489268 667 665 0 True 360 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 404 349 0.00979558286775587 0.0305073968969115 0.00975051499198901 0.0312809948882277 0.00132999921019314 0.00447417195953605 428183 1329536 667 665 0 True 404 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 449 349 0.00994590825438734 0.0597508878628248 0.00993362325474937 0.0596017395284962 0.0016980199118327 0.0102153455564419 434754 2603990 667 665 0 True 449 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 491 346 0.0097071628982945 0.0276347770318449 0.00967421988250553 0.0290836957351034 0.00169026745341515 0.00499175110359459 424318 1204345 667 665 0 True 494 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 536 347 0.00957367505306628 0.0269833659451903 0.00967421988250553 0.0272068360418097 0.00168552687476496 0.00352029048661361 418483 1175956 667 665 0 True 538 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 581 346 0.00952577041760649 0.0446728632063106 0.00955214770733196 0.0461890592813001 0.0020096062575176 0.00946298819421708 416389 1946878 667 665 0 True 583 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 625 347 0.00963203452062021 0.0549124470595119 0.00973525597009232 0.0554055085069047 0.00209423823678835 0.0125593242141179 421034 2393127 667 665 0 True 628 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 669 347 0.00957115857269351 0.0587851409250983 0.00958266575112535 0.0594338902876326 0.00189411181713066 0.0161531656459896 418373 2561902 667 665 0 True 673 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 272 392 0.00985979887145006 0.04070113484673 0.0098268101014725 0.0438086518654154 0.00144910411981179 0.0100577918546841 430990 1773787 667 665 0 True 271 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 316 391 0.00999367562728135 0.029529924605517 0.00999465934233616 0.0301976043335622 0.00148124888579941 0.00419504298748975 436842 1286937 667 665 0 True 315 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 360 392 0.0102052658724426 0.0738536659800107 0.0102388036926833 0.0735790035858701 0.00145188948622251 0.0156494701749814 446091 3218600 667 665 0 True 360 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 404 392 0.010376935588054 0.0573647669184405 0.0103761348897536 0.0577401388570993 0.00149239349593543 0.0136040588867878 453595 2500001 667 665 0 True 405 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 448 392 0.0101738556219716 0.0397362598531118 0.0101777676050965 0.0409246967269398 0.00160781892344964 0.00757235829228383 444718 1731737 667 665 0 True 449 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 493 391 0.0098506709108252 0.0505404963541837 0.00976577401388571 0.0501258869306477 0.00178586635781138 0.0126080213605357 430591 2202594 667 665 0 True 494 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 538 390 0.00981855147043095 0.0385834579582396 0.00984206912336919 0.0396429388876173 0.00159307064605308 0.00588622767717951 429187 1681497 667 665 0 True 539 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 581 390 0.00986727968128547 0.0458224297296227 0.0098268101014725 0.0471198596169986 0.00185998951154336 0.00822354518499222 431317 1996977 667 665 0 True 583 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 625 391 0.00975195624892978 0.0403147029854334 0.00973525597009232 0.0413824673838407 0.00227834528143322 0.00664855200635776 426276 1756946 667 665 0 True 628 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 670 390 0.00956575957843921 0.0902387807467857 0.00964370183871214 0.0856031128404669 0.00185513568862427 0.0237381162338258 418137 3932676 667 665 0 True 673 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 273 435 0.00999234875581207 0.0401122742769031 0.00996414129854276 0.0410925459678035 0.00160647860553451 0.0072041175885307 436784 1748124 667 665 0 True 271 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 317 435 0.00998406724767623 0.0448182713593322 0.00997940032043946 0.0449073014419776 0.00153368726347888 0.00682572152375594 436422 1953215 667 665 0 True 315 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 361 436 0.010231871933111 0.0318337845070447 0.0102235446707866 0.0323949034866865 0.00148134940955345 0.0034363891520916 447254 1387341 667 665 0 True 360 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 405 437 0.0105096456120761 0.0453722541648238 0.0105592431525139 0.046997787441825 0.00166981110168671 0.0076275304988539 459396 1977358 667 665 0 True 405 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 449 436 0.0105649624260884 0.0853218649737183 0.0106660563057908 0.0841992828259709 0.0018467945317668 0.0149273318292125 461814 3718393 667 665 0 True 449 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 493 434 0.0101663976892305 0.054212872533818 0.0101625085831998 0.0557869840543221 0.00175895511952647 0.0145044427324507 444392 2362639 667 665 0 True 494 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 538 434 0.0099735437842992 0.0488866478395577 0.00999465934233616 0.0479591058213169 0.0016677942352465 0.00923177876657831 435962 2130518 667 665 0 True 539 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 582 434 0.0095277836019047 0.0307410320261629 0.00946059357595178 0.0308842603189136 0.0019269910506897 0.00407034428946537 416477 1339718 667 665 0 True 583 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 625 434 0.00975181898636399 0.0368127000953976 0.00967421988250553 0.03759822995346 0.00204064695780004 0.00583646776559171 426270 1604326 667 665 0 True 628 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 670 434 0.00973941960125453 0.0696399731303539 0.0097962920576791 0.0695963988708324 0.00188092344934695 0.0113267329166338 425728 3034964 667 665 0 True 673 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 273 480 0.00979727577273391 0.0460999144691667 0.0097962920576791 0.0475318532082094 0.00150269909032392 0.0111903684825629 428257 2009070 667 665 0 True 271 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 318 479 0.010065761351414 0.0488386220759039 0.0100556954299229 0.0493171587701228 0.00167413779779664 0.00682845329703133 439993 2128425 667 665 0 True 316 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 362 480 0.010280714529437 0.0617569329595447 0.0103150988021668 0.0599221789883269 0.00155268613506592 0.0146027928246795 449389 2691415 667 665 0 True 360 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 406 480 0.010485830556912 0.0796482852817555 0.0105134660868238 0.0761425192645151 0.00183557515332923 0.0168386656501521 458355 3471134 667 665 0 True 405 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 450 479 0.0103948712299835 0.0855586895827346 0.0103608758678569 0.0823071641107805 0.00207359460711482 0.0279122418989199 454379 3728714 667 665 0 True 450 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 495 478 0.010163675315009 0.0375311361489097 0.0102388036926833 0.038651102464332 0.0018030925796121 0.00546336777444223 444273 1635636 667 665 0 True 494 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 537 478 0.00994828747219432 0.0383877065059077 0.0100556954299229 0.0400244144350347 0.00183881448806119 0.00742629072906784 434858 1672966 667 665 0 True 539 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 583 478 0.00978972633161561 0.102637780076192 0.00976577401388571 0.102800030518044 0.00192477507825226 0.0173184536126925 427927 4473034 667 665 0 True 584 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 628 479 0.00979887716933477 0.0565580121051083 0.0097962920576791 0.0608072022583352 0.00184431893014616 0.0140698561870094 428327 2464842 667 665 0 True 628 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 671 478 0.0097288961378775 0.0671902461578529 0.00967421988250553 0.066300450141146 0.00194666122349288 0.010101848997871 425268 2928203 667 665 0 True 673 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 275 524 0.00967012488262621 0.0428136718541605 0.00970473792629892 0.0460059510185397 0.00148159347802941 0.00863652581445801 422699 1865853 667 665 0 True 271 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 318 523 0.0100986357359201 0.0969665179198855 0.0102388036926833 0.0930189974822614 0.00154341057959222 0.0256945413938823 441430 4225876 667 665 0 True 316 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 363 524 0.00993028319898188 0.0520753703898106 0.00996414129854276 0.0543526359960327 0.00156060269679775 0.0095017129659389 434071 2269485 667 665 0 True 360 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 407 523 0.00996775587944183 0.0535766057395721 0.00996414129854276 0.0540627145799954 0.00183116637231694 0.00607485594996198 435709 2334910 667 665 0 True 405 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 451 523 0.0100068985877855 0.0531645203647709 0.00999465934233616 0.0533150225070573 0.00191594480868661 0.00736002865983396 437420 2316951 667 665 0 True 450 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 494 521 0.0100970800935078 0.0594387318720238 0.0100709544518196 0.0592202639810788 0.00189699583422699 0.0105469983963962 441362 2590386 667 665 0 True 494 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 539 521 0.0101702181639782 0.0679041389236424 0.0101625085831998 0.0672312504768444 0.00185566761817766 0.0149451493052765 444559 2959315 667 665 0 True 539 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 583 520 0.00970466929501603 0.0530401535998385 0.00968947890440223 0.0542763408865492 0.00183734890226038 0.0118891939631662 424209 2311531 667 665 0 True 584 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 627 520 0.00979240295164846 0.0468783769907717 0.0098268101014725 0.0455939574273289 0.00190604139962229 0.00800825050092892 428044 2042996 667 665 0 True 628 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 671 519 0.00942085606315634 0.0577675362588205 0.0093842984664683 0.0576638437476158 0.00191193330389085 0.0114373012355067 411803 2517554 667 665 0 True 673 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 274 565 0.00943023567181847 0.0389196612497139 0.00944533455405508 0.0402838178072786 0.00131338640559461 0.00830588212965744 412213 1696149 667 665 0 True 271 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 318 563 0.00983447392806229 0.0499845860932946 0.00993362325474937 0.0505378805218586 0.00156776614857615 0.010289739397698 429883 2178367 667 665 0 True 316 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 362 566 0.009943117248883 0.0412159490050372 0.00997940032043946 0.0418860151064317 0.00138054379794168 0.00681283019435171 434632 1796223 667 665 0 True 360 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 407 565 0.00988061702726115 0.0465740455510486 0.0098268101014725 0.0462653543907836 0.00171880729705654 0.00603612954510159 431900 2029733 667 665 0 True 405 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 451 564 0.00988164649650455 0.0843929232557246 0.00990310521095598 0.0781719691767758 0.00201407241936807 0.021067547085957 431945 3677909 667 665 0 True 450 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 495 561 0.00968915862508206 0.0569455683153868 0.00970473792629892 0.0563363088426032 0.00196695275784703 0.0100779972930074 423531 2481732 667 665 0 True 495 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 539 561 0.00979924320284353 0.0527761610480768 0.00971999694819562 0.0522621499961852 0.0019136377147012 0.00844487090278635 428343 2300026 667 665 0 True 539 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 583 561 0.00959918301320843 0.0351713800408552 0.00958266575112535 0.0365300984206912 0.00176293547203707 0.00546558296544559 419598 1532796 667 665 0 True 584 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 627 561 0.00961554013563143 0.0439836602263269 0.00958266575112535 0.0441290913252461 0.0016701829591151 0.0058684194804979 420313 1916842 667 665 0 True 629 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 670 561 0.00945954122961408 0.0497467059729892 0.00953688868543526 0.0488136110475319 0.00175266202577756 0.00585204103922963 413494 2168000 667 665 0 True 673 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 271 609 0.00901327775114503 0.00901218484526721 0.00898756389715419 0.00901808194094758 0.00131033200290912 0.00137594410621265 393987 392758 667 665 0 False 271 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 316 608 0.00935558771312444 0.0093094948403281 0.00944533455405508 0.00927748531319142 0.00145675008938166 0.00134170729188856 408950 405715 667 665 0 False 316 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 361 607 0.00959394415861422 0.0648822789406567 0.00958266575112535 0.0635690852216373 0.00146583598531163 0.00885182349102444 419369 2827620 667 665 0 True 361 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 406 606 0.00956015469033622 0.0708357526914104 0.00955214770733196 0.067353322652018 0.00150118488411541 0.0159411966706839 417892 3087077 667 665 0 True 405 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 450 608 0.00953830706528173 0.009596364451986 0.00956740672922866 0.00950637064164187 0.00198488779699013 0.00197238391235337 416937 418217 667 665 0 False 450 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 495 608 0.00939720114765231 0.00957993518931226 0.00941481651026169 0.00958266575112535 0.00195889736689377 0.00209916820935539 410769 417501 667 665 0 False 495 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 539 608 0.00935156134452801 0.00939242131421481 0.00941481651026169 0.00944533455405508 0.00192198545885675 0.00205135377912521 408774 409329 667 665 0 False 539 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 584 608 0.00963951533045562 0.00969808361599811 0.00955214770733196 0.00976577401388571 0.00185748375437408 0.00172826135204457 421361 422650 667 665 0 False 584 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 629 607 0.00942131360504229 0.00947328265731851 0.00944533455405508 0.00952162966353857 0.00149467117659693 0.00150610745682349 411823 412853 667 665 0 False 629 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 673 607 0.00921498509156957 0.00939019556214868 0.00930800335698482 0.009399557488365 0.00163524641624726 0.0016746434812704 402804 409232 667 665 0 False 673 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 272 657 0.0090331121919013 0.0364853539203926 0.00898756389715419 0.0372320134279393 0.00133003783058184 0.00831902493210389 394854 1590060 667 665 0 True 271 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 316 652 0.00909817464808452 0.00901372222040567 0.00917067215991455 0.00900282291905089 0.00129156437785021 0.00132009365163367 397698 392825 667 665 0 False 316 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 361 652 0.00921100447716174 0.00918138789408862 0.00917067215991455 0.00915541313801785 0.00120041515827862 0.00120563031714846 402630 400132 667 665 0 False 361 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 405 652 0.00930049967005511 0.00901796721145964 0.0093690394445716 0.00903334096284428 0.00143719643455556 0.00138285932860017 406542 393010 667 665 0 False 405 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 450 652 0.00931161793788388 0.00936428964377068 0.00926222629129473 0.009399557488365 0.00155568424380711 0.00156374731235281 407028 408103 667 665 0 False 450 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 495 651 0.00925522590043957 0.00924804572658472 0.00926222629129473 0.00927748531319142 0.00167259844781226 0.00172936959485765 404563 403037 667 665 0 False 495 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 540 651 0.00947683631290329 0.00917480242148057 0.00952162966353857 0.00915541313801785 0.00166163828020207 0.00178472302136748 414250 399845 667 665 0 False 540 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 584 651 0.00947695069837478 0.00936871820200536 0.00953688868543526 0.009399557488365 0.00137474060698092 0.00130339749817405 414255 408296 667 665 0 False 584 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 629 651 0.00951190689846196 0.00935511128473507 0.00949111161974517 0.00933852140077821 0.0014391546835179 0.0014062398768288 415783 407703 667 665 0 False 629 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 669 656 0.00952535862990912 0.0391346413642254 0.00944533455405508 0.039154650186923 0.00136052838053693 0.00763916723039017 416371 1705518 667 665 0 True 674 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F10_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F10_2.csv new file mode 100755 index 0000000..1e00754 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F10_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 270 260 0.00785398099759916 0.705149736322954 0.00785839627679866 0.702784771496147 0.00190450533662463 0.196722506221043 343312 30730972 667 665 9 True 270 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 315 260 0.00681659627956679 0.0066095658005164 0.0068207827878233 0.00659189745937285 0.00133992274450421 0.00135459757000031 297966 288050 667 665 0 False 315 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 358 261 0.0062500450392794 0.0064035575319622 0.00627145799954223 0.0064087891966125 0.00124343760845939 0.00130233249807993 273201 279072 667 665 0 True 359 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 403 261 0.0064761622393198 0.0066262704139612 0.00650034332799268 0.00662241550316625 0.00141555923256835 0.00132761383627616 283085 288778 667 665 0 True 404 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 448 261 0.00660733949802393 0.00654628101496589 0.00666819256885634 0.00650034332799268 0.00152447970424469 0.00162011120421946 288819 285292 667 665 0 True 449 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 492 260 0.00657606651011871 0.00691922068848018 0.00662241550316625 0.00691233691920348 0.00160171147538732 0.00159867830472416 287452 301545 667 665 0 True 494 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 536 260 0.00693379563365491 0.00705618475118903 0.00695811398489357 0.00701915007248035 0.00148830102069545 0.00155341825478075 303089 307514 667 665 0 True 538 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 579 259 0.00722911604394644 0.00740395277504817 0.00727855344472419 0.00740062561989776 0.00175257605998084 0.0017715491931221 315998 322670 667 665 0 True 583 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 628 259 0.00921672375073621 0.00787847393718905 0.00814831769283589 0.00784313725490196 0.00662038819227292 0.00178303823284189 402880 343350 667 665 0 False 628 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 667 260 0.00916426657351114 0.742592897900508 0.00910963607232776 0.727138170443275 0.00195802980240953 0.164770447967302 400587 32362774 667 665 11 True 672 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 270 304 0.00626262744114324 0.0062138637965938 0.00624093995574884 0.00617990386816205 0.00147376478838406 0.00137950667032359 273751 270805 667 665 0 False 270 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 315 304 0.00616247152230705 0.00604528028700729 0.00613412680247196 0.00607309071488518 0.00121198164936194 0.00113790766490131 269373 263458 667 665 0 False 315 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 359 305 0.00648057751851929 0.00652416116969008 0.00650034332799268 0.00648508430609598 0.00131131506790476 0.00137009856241283 283278 284328 667 665 0 True 360 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 404 305 0.0065827237445594 0.00651427148782921 0.00651560234988937 0.00643930724040589 0.00143885796761587 0.00144103206933711 287743 283897 667 665 0 True 404 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 447 304 0.00673904292989692 0.00672599328488307 0.00672922865644312 0.00677500572213321 0.00170329357398305 0.0017268316330159 294576 293124 667 665 0 True 449 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 491 303 0.0066511491336044 0.00674955872170699 0.00666819256885634 0.00672922865644312 0.00169581631133857 0.00157092348026173 290734 294151 667 665 0 True 494 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 538 303 0.0069991097378754 0.0069873011666268 0.00695811398489357 0.00706492713817044 0.00157186009740855 0.00150335334484056 305944 304512 667 665 0 False 538 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 581 303 0.00721662515045979 0.00717447085326041 0.00714122224765393 0.0072327763790341 0.00172378187219711 0.00194805610394621 315452 312669 667 665 0 True 583 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 628 303 0.00739614170941538 0.00736079154168323 0.00735484855420768 0.00743114366369116 0.00187853747158018 0.00182243321523315 323299 320789 667 665 0 False 628 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 672 303 0.00756730812895223 0.00753205972128766 0.00761425192645151 0.00753795681696803 0.00205443155466469 0.00185473222524959 330781 328253 667 665 0 False 672 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 271 348 0.00593086381963516 0.0059244930820987 0.00593575951781491 0.0059510185397116 0.00144780400720448 0.00137098385340919 259249 258194 667 665 0 True 270 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 316 349 0.00613010043387553 0.00601083849472617 0.00610360875867857 0.00605783169298848 0.00128803686864658 0.0012621074008614 267958 261957 667 665 0 True 315 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 359 349 0.00663982497192695 0.00656335276277212 0.00668345159075303 0.00650034332799268 0.00132948456771083 0.00126828538530692 290239 286036 667 665 0 True 360 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 404 349 0.00691400694708723 0.00712860200397997 0.00691233691920348 0.00711070420386053 0.00148309969620735 0.00146351251879565 302224 310670 667 665 0 True 404 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 449 349 0.00683128337410603 0.00703601530720828 0.00677500572213321 0.00709544518196384 0.00173368674762747 0.00171490359842228 298608 306635 667 665 0 True 449 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 491 346 0.00672202237173928 0.00690976697867351 0.00679026474402991 0.00689707789730678 0.00159553375040674 0.00163581739815985 293832 301133 667 665 0 True 494 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 536 347 0.00688092666873247 0.00703151791128083 0.00686655985351339 0.00712596322575723 0.00157017728052087 0.00162667746298881 300778 306439 667 665 0 True 538 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 581 346 0.00718265266542741 0.00724642918809957 0.00718699931334401 0.00729381246662089 0.00196805209190093 0.00189337593916923 313967 315805 667 665 0 True 583 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 625 347 0.00700066538028765 0.00716646273500184 0.00701915007248035 0.00711070420386053 0.00192846079747884 0.0020282219741673 306012 312320 667 665 0 True 628 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 669 347 0.00678406505147518 0.006829341607624 0.00679026474402991 0.00677500572213321 0.00179016550077343 0.00184101343192833 296544 297628 667 665 0 True 673 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 272 392 0.00648066902689648 0.00647136265933775 0.00642404821850919 0.00642404821850919 0.00153714730085936 0.00154469437959287 283282 282027 667 665 0 True 271 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 316 391 0.00721202685450591 0.0663345477449632 0.00718699931334401 0.068909742885481 0.00155629144839327 0.0147109612850331 315251 2890911 667 665 0 True 315 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 360 392 0.00723019126737844 0.00699466679975287 0.00712596322575723 0.00697337300679027 0.00155676826909965 0.00133623663880704 316045 304833 667 665 0 True 360 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 404 392 0.00728294584682939 0.00717017997041126 0.00718699931334401 0.00714122224765393 0.00154259791784837 0.00142588228585504 318351 312482 667 665 0 True 405 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 448 392 0.00732931771697122 0.00727368891443532 0.00735484855420768 0.00737010757610437 0.00158783954927856 0.00164388240941183 320378 316993 667 665 0 True 449 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 493 391 0.00707144711004534 0.00694648041481594 0.00709544518196384 0.00700389105058366 0.00165850687698003 0.0016647880825379 309106 302733 667 665 0 True 494 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 538 390 0.00696543465506889 0.00697596589321782 0.00701915007248035 0.00706492713817044 0.00169499411563216 0.00157831452447043 304472 304018 667 665 0 True 539 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 581 390 0.00694418183446615 0.00707596411491076 0.00685130083161669 0.00704966811627375 0.00190615497226628 0.00191444922843248 303543 308376 667 665 0 True 583 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 625 391 0.00655909170614967 0.00656342160046488 0.00657663843747616 0.00657663843747616 0.00194355940358272 0.00200619585537884 286710 286039 667 665 0 True 628 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 670 390 0.00613776426046533 0.00617368552991543 0.00613412680247196 0.00608834973678187 0.00179258714639569 0.00199355438110381 268293 269054 667 665 0 True 673 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 273 435 0.00651443561808018 0.00713362715555196 0.00650034332799268 0.00715648126955062 0.00156703679998017 0.00173111197410337 284758 310889 667 665 0 True 271 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 317 435 0.00685251331761448 0.00702633213842572 0.00683604180972 0.00709544518196384 0.00160517680730784 0.00152806212758946 299536 306213 667 665 0 True 315 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 361 436 0.00716675308489038 0.00700636920752327 0.00715648126955062 0.00701915007248035 0.00148896932333494 0.00136557993134712 313272 305343 667 665 0 True 360 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 405 437 0.00745212195916233 0.00761849691750548 0.00746166170748455 0.00759899290455482 0.00173074038657302 0.00165172870434239 325746 332020 667 665 0 True 405 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 449 436 0.0072295964629267 0.00773620937213714 0.00721751735713741 0.00782787823300526 0.00176847442539253 0.00186464950542618 316019 337150 667 665 0 True 449 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 493 434 0.006945783231067 0.00707773094902512 0.00695811398489357 0.00698863202868696 0.00163946152683759 0.00171705268837778 303613 308453 667 665 0 True 494 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 538 434 0.00662124877135705 0.00701630478117932 0.00663767452506294 0.00703440909437705 0.0017156577314393 0.00163114009540457 289427 305776 667 665 0 True 539 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 582 434 0.00633844213164647 0.00678501013348202 0.0063782711528191 0.00646982528419928 0.00176193722818621 0.00296441460971424 277065 295696 667 665 0 True 583 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 625 434 0.00608297361962187 0.00618873803873382 0.00605783169298848 0.00617990386816205 0.00189447508339058 0.00167624221334026 265898 269710 667 665 0 True 628 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 670 434 0.00585337910124819 0.00618148713509569 0.00581368734264134 0.00619516289005875 0.00181272533780036 0.0018281372408823 255862 269394 667 665 0 True 673 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 273 480 0.00650450695915489 0.00631418326085298 0.00656137941557946 0.00636301213092241 0.00147070722008816 0.0015658237602092 284324 275177 667 665 0 True 271 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 318 479 0.0066110227102059 0.00680600562977597 0.00665293354695964 0.0068055237659266 0.00166292684529589 0.00141144862136815 288980 296611 667 665 0 True 316 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 362 480 0.00674933762233097 0.00693959664553923 0.00671396963454643 0.00691233691920348 0.00152753755376954 0.0014929934824639 295026 302433 667 665 0 True 360 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 406 480 0.0069348937341812 0.00686802839095909 0.00698863202868696 0.00692759594110018 0.00171681155179789 0.00160524345872284 303137 299314 667 665 0 True 405 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 450 479 0.00729557400288183 0.00699526339309019 0.00718699931334401 0.00697337300679027 0.00195677729411619 0.00193834944265947 318903 304859 667 665 0 True 450 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 495 478 0.00680916122391997 0.00700313383596322 0.00679026474402991 0.00698863202868696 0.00184049666817437 0.00190361000401919 297641 305202 667 665 0 True 494 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 537 478 0.00642381944756621 0.00606464662457242 0.00636301213092241 0.00608834973678187 0.00178784944707817 0.00160132570307847 280797 264302 667 665 0 True 539 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 583 478 0.00602047339800002 0.00615624664774777 0.00604257267109178 0.00611886778057527 0.00184519232900189 0.0020351994252515 263166 268294 667 665 0 True 584 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 628 479 0.00590695725609386 0.00612641698088205 0.00588998245212482 0.00616464484626535 0.00182101539412791 0.00174928797006976 258204 266994 667 665 0 True 628 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 671 478 0.00599260909714518 0.0061986047746971 0.00588998245212482 0.00614938582436866 0.00186823771049133 0.00181029904303821 261948 270140 667 665 0 True 673 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 275 524 0.00631012028890567 0.00642921104546672 0.00633249408712902 0.0063935301747158 0.00151781590055146 0.00148504839637011 275827 280190 667 665 0 True 271 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 318 523 0.00640602106820245 0.00655013592576084 0.00642404821850919 0.00653086137178607 0.0014813088409181 0.00147574709459205 280019 285460 667 665 0 True 316 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 363 524 0.00678319572189186 0.00665816521160994 0.00675974670023652 0.00660715648126955 0.00157779739234218 0.00150090669924871 296506 290168 667 665 0 True 360 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 407 523 0.00678104527502786 0.00694191418119572 0.00674448767833982 0.00692759594110018 0.00165173985941306 0.00174238819067377 296412 302534 667 665 0 True 405 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 451 523 0.00651466438902316 0.00654926398165246 0.00654612039368277 0.00656137941557946 0.00179205323409214 0.00192283094940826 284768 285422 667 665 0 True 450 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 494 521 0.00642224092805966 0.00651158681781129 0.0064087891966125 0.00659189745937285 0.0018033220357566 0.00186721366723708 280728 283780 667 665 0 True 494 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 539 521 0.00633462165689872 0.00630064518127546 0.00633249408712902 0.00633249408712902 0.00172951341634345 0.00166075969948406 276898 274587 667 665 0 True 539 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 583 520 0.00600516862191472 0.00619158333003486 0.00602731364919509 0.00608834973678187 0.00176471635246638 0.00169828785815872 262497 269834 667 665 0 True 584 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 627 520 0.00607684255835003 0.00595533236845834 0.00613412680247196 0.0059662775616083 0.00184773328850975 0.00180315665951151 265630 259538 667 665 0 True 628 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 671 519 0.00621296126942251 0.00634660581414626 0.00622568093385214 0.0063935301747158 0.00178623326351026 0.00182880404376178 271580 276590 667 665 0 True 673 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 274 565 0.00623524355926866 0.0064608075464468 0.00627145799954223 0.00653086137178607 0.00143290194048295 0.00132253697245083 272554 281567 667 665 0 True 271 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 318 563 0.00642972173789507 0.00653301828615944 0.00648508430609598 0.00657663843747616 0.00145832626410451 0.0014352695908439 281055 284714 667 665 0 True 316 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 362 566 0.00663712547479979 0.00660318684098665 0.00663767452506294 0.00662241550316625 0.00139772735683875 0.00130949140511339 290121 287772 667 665 0 True 360 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 407 565 0.00650956279699473 0.00634853326954374 0.00653086137178607 0.0063782711528191 0.00162890630092242 0.00145060877681048 284545 276674 667 665 0 True 405 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 451 564 0.00640849179438662 0.00659921720070375 0.00654612039368277 0.00662241550316625 0.00198336668753083 0.00194011619349682 280127 287599 667 665 0 True 450 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 495 561 0.00630796984204167 0.00615934434392229 0.00630197604333562 0.00619516289005875 0.00195908856896081 0.00206373730236078 275733 268429 667 665 0 True 495 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 539 561 0.00624153476020058 0.00652397760250936 0.00624093995574884 0.00672922865644312 0.00182280519081534 0.00186751195416685 272829 284320 667 665 0 True 539 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 583 561 0.00628307956344556 0.00629022774377005 0.00627145799954223 0.00630197604333562 0.0016091152237124 0.00151658106745395 274645 274133 667 665 0 True 584 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 627 561 0.00610672004350308 0.00610317278662438 0.00611886778057527 0.00608834973678187 0.00159079018232412 0.0016173113286397 266936 265981 667 665 0 True 629 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 670 561 0.00639080780049435 0.00611331487335872 0.0064087891966125 0.00611886778057527 0.00168625017333678 0.0016736325173526 279354 266423 667 665 0 True 673 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 271 609 0.00664755742979963 0.00690051978194514 0.00660715648126955 0.00688181887541009 0.0014187612415895 0.00134848057300038 290577 300730 667 665 0 False 271 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 316 608 0.00647494975332201 0.00647976085785533 0.00648508430609598 0.00653086137178607 0.00147484853571357 0.00133285902618052 283032 282393 667 665 0 False 316 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 361 607 0.00634267439409158 0.00627189397159642 0.00625619897764553 0.00627145799954223 0.00134210277122168 0.00137996196652701 277250 273334 667 665 0 True 361 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 406 606 0.00626571584887346 0.00609610545016696 0.00624093995574884 0.00601205462729839 0.00147037918122041 0.00136356568881617 273886 265673 667 665 0 True 405 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 450 608 0.00624144325182339 0.00619314365107091 0.00622568093385214 0.00617990386816205 0.00199920622409327 0.00192972584150741 272825 269902 667 665 0 False 450 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 495 608 0.00605426286627801 0.00628811672119186 0.00602731364919509 0.00621042191195544 0.00190697126062151 0.00196944028852705 264643 274041 667 665 0 False 495 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 539 608 0.00623794305639581 0.00640445242196817 0.00619516289005875 0.00642404821850919 0.00185838697272219 0.00201760426713922 272672 279111 667 665 0 False 539 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 584 608 0.00624311327970714 0.00648033450529505 0.00628671702143893 0.00645456626230259 0.00160299000889728 0.0016679413230315 272898 282418 667 665 0 False 584 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 629 607 0.00641304433615191 0.00628788726221597 0.00648508430609598 0.0063935301747158 0.00140656217962437 0.00135350877319232 280326 274031 667 665 0 False 629 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 673 607 0.0065392115112048 0.00651307830115458 0.00659189745937285 0.00656137941557946 0.00163067910888457 0.00166686800372095 285841 283845 667 665 0 False 673 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 272 657 0.00823852207565249 0.709734579066113 0.00805676356145571 0.713450827801938 0.00196106442962141 0.208442600200644 360121 30930783 667 665 9 True 271 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 316 652 0.00696140828647247 0.00664510899588179 0.00689707789730678 0.00662241550316625 0.00157843501321629 0.0013065638160105 304296 289599 667 665 0 False 316 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 361 652 0.00617757040454367 0.00615044133565775 0.00619516289005875 0.00614938582436866 0.00129956547645429 0.00109869241094472 270033 268041 667 665 0 False 361 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 405 652 0.00601910077234214 0.00604771255215172 0.0059510185397116 0.00607309071488518 0.00134463943489436 0.00134476772005241 263106 263564 667 665 0 False 405 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 450 652 0.00615345794715368 0.00609950144301013 0.00613412680247196 0.00605783169298848 0.00154777069341896 0.00166209620959726 268979 265821 667 665 0 False 450 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 495 651 0.00612113261291076 0.00613385145170089 0.00607309071488518 0.00614938582436866 0.0017038738013953 0.00168406441419019 267566 267318 667 665 0 False 495 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 540 651 0.00605776306170559 0.00604658820316986 0.00607309071488518 0.00599679560540169 0.0017316067220119 0.001679176364444 264796 263515 667 665 0 False 540 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 584 651 0.00639204316358644 0.00636631634017523 0.0064087891966125 0.00636301213092241 0.00136331779862894 0.00125520940959555 279408 277449 667 665 0 False 584 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 629 651 0.00705353434521009 0.00664855088052014 0.00691233691920348 0.00666819256885634 0.00193554027650132 0.00137766049036017 308323 289749 667 665 0 False 629 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 669 656 0.00813445417369136 0.753648346088384 0.00814831769283589 0.741313801785306 0.00174751647856968 0.179621250881531 355572 32844579 667 665 14 True 674 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F10_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F10_3.csv new file mode 100755 index 0000000..0e654c2 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F10_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 270 260 0.00104635253899715 0.0723406593847861 0.000900282291905089 0.0710307469291218 0.000796521149731504 0.0222918412442285 45738 3152662 667 665 0 True 270 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 315 260 0.000895661118856914 0.00105326259113107 0.000778210116731518 0.000930800335698482 0.00065413281935955 0.000720398141808282 39151 45902 667 665 0 False 315 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 358 261 0.000926499441970477 0.000910355540946667 0.000762951094834821 0.000778210116731518 0.000702887855505981 0.000670312204815569 40499 39674 667 665 0 True 359 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 403 261 0.000950589022266162 0.00088740964335765 0.00080872816052491 0.000793469138628214 0.000750535151401977 0.000660130847971173 41552 38674 667 665 0 True 404 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 448 261 0.000966969021783455 0.00115773526285386 0.000732433051041428 0.00100709544518196 0.000860026410211924 0.000859932750753157 42268 50455 667 665 0 True 449 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 492 260 0.000979894580061766 0.000942938715523072 0.000747692072938125 0.000762951094834821 0.000880200313843755 0.000800088379169352 42833 41094 667 665 0 True 494 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 536 260 0.00098115282024815 0.000980271690900403 0.000869764248111696 0.00080872816052491 0.000801343349176964 0.000788770739622468 42888 42721 667 665 0 True 538 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 579 259 0.00108792021933643 0.000975889024460901 0.000823987182421607 0.000732433051041428 0.00096510492897531 0.000907195067385492 47555 42530 667 665 0 True 583 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 628 259 0.00120399859580395 0.000992318287134637 0.000823987182421607 0.000595101853971161 0.00117362076155765 0.000957917342297499 52629 43246 667 665 0 False 628 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 667 260 0.0010708310298959 0.0762644996560984 0.000732433051041428 0.0733958953231098 0.000979760195891419 0.0195722645110766 46808 3323666 667 665 0 True 672 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 270 304 0.000869146566565653 0.000933622681101931 0.000732433051041428 0.000747692072938125 0.000716040694863007 0.000762683556039423 37992 40688 667 665 0 False 270 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 315 304 0.000922953492354304 0.000986191732478369 0.000823987182421607 0.000900282291905089 0.000677254107764919 0.000650540345644714 40344 42979 667 665 0 False 315 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 359 305 0.000922747598505622 0.000944407252968769 0.000778210116731518 0.00080872816052491 0.000721544169240211 0.000719648212262108 40335 41158 667 665 0 True 360 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 404 305 0.000932104330073462 0.0009399557488365 0.000747692072938125 0.000778210116731518 0.000768833937209307 0.000724229266616298 40744 40964 667 665 0 True 404 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 447 304 0.000948621592156543 0.00100360766874843 0.000671396963454643 0.000747692072938125 0.000900847875142739 0.000943050001640576 41466 43738 667 665 0 True 449 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 491 303 0.000947043072649988 0.000952828397383938 0.000778210116731518 0.000671396963454643 0.000855628371899499 0.000900310902911522 41397 41525 667 665 0 True 494 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 538 303 0.000976463015917081 0.000958656655371549 0.000778210116731518 0.000793469138628214 0.000844897361982369 0.000797350687561953 42683 41779 667 665 0 False 538 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 581 303 0.00102944636631101 0.00101847661038612 0.000732433051041428 0.000671396963454643 0.000978476127739871 0.00106269559324505 44999 44386 667 665 0 True 583 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 628 303 0.00109681940901831 0.00100982600699506 0.000762951094834821 0.000625619897764553 0.00108711913108546 0.00106053329633095 47944 44009 667 665 0 False 628 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 672 303 0.00106767399088279 0.000943902443221811 0.000656137941557946 0.000610360875867857 0.00106225316723985 0.000971511992456139 46670 41136 667 665 0 False 672 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 271 348 0.000918034917080256 0.000877772366370263 0.000778210116731518 0.000732433051041428 0.000730899917315444 0.000715753110337723 40129 38254 667 665 0 True 270 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 316 349 0.000925126816312604 0.000918317767410056 0.000793469138628214 0.000778210116731518 0.000712187690095849 0.000702324667378531 40439 40021 667 665 0 True 315 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 359 349 0.000979803071684574 0.00100624644697117 0.000839246204318303 0.000839246204318303 0.00077653788699846 0.00071875115375385 42829 43853 667 665 0 True 360 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 404 349 0.000857822404888195 0.000931580496216508 0.000625619897764553 0.000778210116731518 0.0007468718943781 0.000698879650989454 37497 40599 667 665 0 True 404 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 449 349 0.00096440678722209 0.00101501177985017 0.000701915007248035 0.000732433051041428 0.000887275705803701 0.000910141135752771 42156 44235 667 665 0 True 449 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 491 346 0.00101093879702401 0.00092664712823487 0.000778210116731518 0.000686655985351339 0.000899923299107579 0.000864479236577423 44190 40384 667 665 0 True 494 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 536 347 0.000974404077430271 0.000938670778571515 0.000732433051041428 0.000671396963454643 0.000861139863736161 0.000928954762557677 42593 40908 667 665 0 True 538 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 581 346 0.000988725138460753 0.00105977922604635 0.000701915007248035 0.000686655985351339 0.00100195652511958 0.00108463340566552 43219 46186 667 665 0 True 583 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 625 347 0.00112157242504863 0.00104495617620384 0.000747692072938125 0.000610360875867857 0.00113687573929149 0.00111941317395044 49026 45540 667 665 0 True 628 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 669 347 0.000952533575281483 0.000918294821512467 0.000518806744487678 0.000503547722590982 0.00100843406600516 0.00100440341298097 41637 40020 667 665 0 True 673 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 272 392 0.000977881395763551 0.000930089012873222 0.000869764248111696 0.000793469138628214 0.000802843552437833 0.000757786287336291 42745 40534 667 665 0 True 271 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 316 391 0.000888546342530268 0.00644302447581531 0.000717174029144732 0.00662241550316625 0.000736216217970696 0.00187872927581863 38840 280792 667 665 0 True 315 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 360 392 0.000946173743066668 0.000989404158140832 0.000823987182421607 0.000869764248111696 0.000756939782725055 0.000744882267020749 41359 43119 667 665 0 True 360 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 404 392 0.000949445167551267 0.000989725400707078 0.000717174029144732 0.00080872816052491 0.000825523844475834 0.000775946941146739 41502 43133 667 665 0 True 405 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 448 392 0.00105751656101453 0.00109892492733321 0.000854505226215 0.000900282291905089 0.000865237698254838 0.000943396065200644 46226 47892 667 665 0 True 449 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 493 391 0.000995839914787399 0.000913705641994664 0.000671396963454643 0.000579842832074464 0.000964351180756335 0.000958063178325295 43530 39820 667 665 0 True 494 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 538 390 0.000935444385840954 0.000959276194606452 0.000671396963454643 0.000747692072938125 0.000891123293909646 0.000888616717980706 40890 41806 667 665 0 True 539 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 581 390 0.000931875559130483 0.000992960772267129 0.000625619897764553 0.000564583810177768 0.000954898745612882 0.00106758878823414 40734 43274 667 665 0 True 583 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 625 391 0.00107510904652961 0.000959161465118507 0.000778210116731518 0.000564583810177768 0.000990264494807995 0.00102184845549626 46995 41801 667 665 0 True 628 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 670 390 0.000953471536147696 0.000897804134965475 0.000564583810177768 0.000442511635004196 0.000966727865904164 0.00100002037231219 41678 39127 667 665 0 True 673 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 273 435 0.000938281145533894 0.000961272487696697 0.000778210116731518 0.000823987182421607 0.000799600419167203 0.000814757555688158 41014 41893 667 665 0 True 271 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 317 435 0.00103553167339425 0.000933255546740507 0.000885023270008392 0.000793469138628214 0.000801995764847938 0.000758449547614244 45265 40672 667 665 0 True 315 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 361 436 0.000934163268560272 0.000933530897511575 0.00080872816052491 0.000762951094834821 0.000741512975975793 0.000725617410175453 40834 40684 667 665 0 True 360 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 405 437 0.000928238101137117 0.000990987425074474 0.000686655985351339 0.000762951094834821 0.000884677914974116 0.000854180017141639 40575 43188 667 665 0 True 405 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 449 436 0.000967540949140902 0.00103130336713838 0.000671396963454643 0.000823987182421607 0.000928846997368615 0.00092775941512016 42293 44945 667 665 0 True 449 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 493 434 0.00100766737253941 0.000907372574260095 0.000732433051041428 0.000610360875867857 0.000918757914046446 0.000878217263915386 44047 39544 667 665 0 True 494 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 538 434 0.000930365670906822 0.000945279197077152 0.000671396963454643 0.000732433051041428 0.000889349180829494 0.000825307269383343 40668 41196 667 665 0 True 539 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 582 434 0.000949536675928458 0.00105039435393244 0.000503547722590982 0.000610360875867857 0.0010112628217343 0.00112363689876516 41506 45777 667 665 0 True 583 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 625 434 0.000888477711247375 0.000959138519220918 0.000488288700694286 0.000595101853971161 0.000942634289447994 0.000946338632450436 38837 41800 667 665 0 True 628 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 670 434 0.000904994973330455 0.000999752757953478 0.000518806744487678 0.00064087891966125 0.000976340447768151 0.00100916054726956 39559 43570 667 665 0 True 673 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 273 480 0.000943840279448282 0.000975475998304298 0.000778210116731518 0.000778210116731518 0.000787242572192018 0.000852828230038171 41257 42512 667 665 0 True 271 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 318 479 0.000995199356147058 0.000928643421325114 0.000854505226215 0.000778210116731518 0.000810354597795342 0.000806374233410252 43502 40471 667 665 0 True 316 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 362 480 0.000930297039623928 0.000975820186768133 0.000823987182421607 0.00080872816052491 0.000787125584049699 0.000833173685915565 40665 42527 667 665 0 True 360 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 406 480 0.000920940308056089 0.000962534512064092 0.000686655985351339 0.000747692072938125 0.000886595757509185 0.000860309423537476 40256 41948 667 665 0 True 405 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 450 479 0.000986711954162539 0.000943535308860386 0.000671396963454643 0.000625619897764553 0.000991611458498683 0.00103091287727703 43131 41120 667 665 0 True 450 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 495 478 0.00103463946671663 0.000979720989358266 0.000732433051041428 0.000534065766384375 0.00100884206341696 0.00107760238565619 45226 42697 667 665 0 True 494 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 537 478 0.000993277680226035 0.000931052740571961 0.000625619897764553 0.000656137941557946 0.00101746621222172 0.000888040421866863 43418 40576 667 665 0 True 539 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 583 478 0.000867796818002077 0.000917698228175153 0.000503547722590982 0.000488288700694286 0.000952226937862463 0.00100055176483048 37933 39994 667 665 0 True 584 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 628 479 0.000942604916356196 0.000899295618308761 0.000534065766384375 0.000579842832074464 0.00100028185340216 0.000879714007075634 41203 39192 667 665 0 True 628 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 671 478 0.000903805364426965 0.000959895733841356 0.000503547722590982 0.000549324788281071 0.00099346981279637 0.00100770128141633 39507 41833 667 665 0 True 673 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 275 524 0.000978887987912658 0.000870337895551421 0.000823987182421607 0.000686655985351339 0.00079005789359194 0.000792643552619299 42789 37930 667 665 0 True 271 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 318 523 0.000966877513406263 0.000825845800126317 0.000854505226215 0.000686655985351339 0.000774508111940028 0.000738955809302469 42264 35991 667 665 0 True 316 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 363 524 0.000869238074942844 0.00089723048752575 0.000717174029144732 0.000762951094834821 0.000738275863774876 0.000784347429343226 37996 39102 667 665 0 True 360 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 407 523 0.000973511870752653 0.000952162966353857 0.000686655985351339 0.000701915007248035 0.000923069541628433 0.000877060351679964 42554 41496 667 665 0 True 405 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 451 523 0.000972436647320652 0.000922241515897778 0.000564583810177768 0.000473029678797589 0.00101306770249112 0.00100900991796233 42507 40192 667 665 0 True 450 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 494 521 0.000916479274667999 0.00089371976519463 0.000579842832074464 0.000503547722590982 0.000942049300829103 0.00092820420466587 40061 38949 667 665 0 True 494 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 539 521 0.000873172935162083 0.000912925481476637 0.000503547722590982 0.000671396963454643 0.000954465086366757 0.000844541154391745 38168 39786 667 665 0 True 539 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 583 520 0.000892298185995123 0.0010124418393202 0.000549324788281071 0.000701915007248035 0.000917628830815486 0.000946049987185501 39004 44123 667 665 0 True 584 521 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 627 520 0.000913505252409273 0.000956316173817469 0.000534065766384375 0.000518806744487678 0.000997394786373827 0.000994463168869116 39931 41677 667 665 0 True 628 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 671 519 0.00090048818575377 0.000916344420217401 0.000564583810177768 0.000473029678797589 0.000979698155074864 0.00101429577844714 39362 39935 667 665 0 True 673 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 274 565 0.000912590168637357 0.000911181593259872 0.00080872816052491 0.000793469138628214 0.000695083800137829 0.000683209201332063 39891 39710 667 665 0 True 271 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 318 563 0.000876261342892298 0.000921576084867697 0.000747692072938125 0.000778210116731518 0.00074407952090573 0.000740282227243292 38303 40163 667 665 0 True 316 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 362 566 0.000905635531970797 0.00099293782636954 0.000793469138628214 0.000854505226215 0.000698792277042191 0.000735182958586392 39587 43273 667 665 0 True 360 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 407 565 0.000880516482431707 0.00096797268979269 0.000656137941557946 0.000717174029144732 0.0008209624507218 0.000840708156198588 38489 42185 667 665 0 True 405 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 451 564 0.000936565363461551 0.000979698043460677 0.000549324788281071 0.000488288700694286 0.000983799658646458 0.00106142307898678 40939 42696 667 665 0 True 450 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 495 561 0.000961272625303279 0.000944430198866358 0.000488288700694286 0.000473029678797589 0.00110912594894832 0.00110460723145912 42019 41159 667 665 0 True 495 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 539 561 0.000911972487091314 0.000930524984927414 0.000488288700694286 0.000549324788281071 0.00100985139957523 0.000998029212422914 39864 40553 667 665 0 True 539 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 583 561 0.000918492458966214 0.000888717559520224 0.000625619897764553 0.000656137941557946 0.000905959826515117 0.000762754657493772 40149 38731 667 665 0 True 584 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 627 561 0.0009262477939332 0.000995209470230853 0.00064087891966125 0.000701915007248035 0.000888683850085756 0.0008936736339071 40488 43372 667 665 0 True 629 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 670 561 0.000894425755764828 0.00101104213956727 0.000595101853971161 0.000656137941557946 0.000903907554527737 0.00097670494227444 39097 44062 667 665 0 True 673 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 271 609 0.000949147765325394 0.000984470790159193 0.000839246204318303 0.000839246204318303 0.000744330143444651 0.00072338767571669 41489 42904 667 665 0 False 271 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 316 608 0.000990555306004585 0.000954870582269361 0.000869764248111696 0.000839246204318303 0.00077688352719228 0.000732448888715299 43299 41614 667 665 0 False 316 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 361 607 0.000897125252891979 0.000959230302811274 0.000747692072938125 0.00080872816052491 0.000729379611827649 0.000785639170225009 39215 41804 667 665 0 True 361 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 406 606 0.000914054302672422 0.000852095906968153 0.000701915007248035 0.000686655985351339 0.000773635982876655 0.00070287817912728 39955 37135 667 665 0 True 405 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 450 608 0.00101496516562044 0.000914049830458499 0.000656137941557946 0.000457770656900893 0.00103798493719969 0.00102524219629304 44366 39835 667 665 0 False 450 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 495 608 0.000864571147706074 0.000990230210454036 0.000396734569314107 0.000564583810177768 0.00100442008011887 0.00111092314475931 37792 43155 667 665 0 False 495 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 539 608 0.000972276507660567 0.00094858340632997 0.000625619897764553 0.000534065766384375 0.000999195958622471 0.00107029409308526 42500 41340 667 665 0 False 539 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 584 608 0.00102425326590539 0.00101280897368163 0.000778210116731518 0.000732433051041428 0.000905924110874378 0.000951626558861007 44772 44139 667 665 0 False 584 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 629 607 0.000989114049063818 0.000931259253650262 0.000793469138628214 0.000732433051041428 0.000784869977752701 0.000746869876419657 43236 40585 667 665 0 False 629 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 673 607 0.000976897680708742 0.000983943034514645 0.000778210116731518 0.000717174029144732 0.00081840867900484 0.000869286490213979 42702 42881 667 665 0 False 673 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 272 657 0.00110654217409492 0.0726724800098208 0.000976577401388571 0.0721141374837873 0.000772032002752373 0.0229918827321994 48369 3167123 667 665 0 True 271 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 316 652 0.00106145142123376 0.000969418281340798 0.00100709544518196 0.000900282291905089 0.000681895579926684 0.000662705122024272 46398 42248 667 665 0 False 316 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 361 652 0.000947866648044712 0.000856088493148642 0.00080872816052491 0.000793469138628214 0.000683953876984487 0.000592813112345312 41433 37309 667 665 0 False 361 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 405 652 0.00088330748793605 0.000859048513937625 0.000793469138628214 0.000671396963454643 0.000649213151166693 0.000721141979951075 38611 37438 667 665 0 False 405 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 450 652 0.000981358714096831 0.000969877199292578 0.000747692072938125 0.000778210116731518 0.000870621618489656 0.000883087720966806 42897 42268 667 665 0 False 450 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 495 651 0.000860979443901304 0.000918180092024522 0.000534065766384375 0.00064087891966125 0.000884373188958559 0.00086958873711554 37635 40015 667 665 0 False 495 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 540 651 0.000946654162046924 0.000995599550489866 0.000549324788281071 0.000671396963454643 0.000941636875537701 0.000941686115985402 41380 43389 667 665 0 False 540 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 584 651 0.000981358714096831 0.00100131307898953 0.000793469138628214 0.000869764248111696 0.000781932537869732 0.000667649060524941 42897 43638 667 665 0 False 584 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 629 651 0.00107240954940246 0.00088226976229771 0.000915541313801785 0.000717174029144732 0.000765202213717312 0.000697522172876486 46877 38450 667 665 0 False 629 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 669 656 0.00115144991020169 0.0783893356646365 0.000991836423285267 0.0756694895857176 0.00079798850585137 0.0219022755140661 50332 3416268 667 665 0 True 674 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F11_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F11_1.csv new file mode 100755 index 0000000..b8ee828 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F11_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 264 275 0.00956532491364755 0.0374175310099465 0.00953688868543526 0.0377355611505302 0.00141375795636024 0.00758568235820223 418118 1630685 667 665 0 True 264 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 308 274 0.00949262150796884 0.00927285024187844 0.00950637064164187 0.00918593118181125 0.00133469878187999 0.00125242775082075 414940 404118 667 665 0 False 308 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 351 276 0.0096527840451484 0.0509953758279884 0.00964370183871214 0.0528114747844663 0.00133064330074781 0.00834378802256716 421941 2222418 667 665 0 True 353 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 395 276 0.0096180566160042 0.0677434488028265 0.00968947890440223 0.0688029297322042 0.00136730873412919 0.0119826356902089 420423 2952312 667 665 0 True 397 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 441 275 0.00951918181444869 0.0563319950138565 0.00956740672922866 0.056092164492256 0.00174323603618303 0.011400409921032 416101 2454992 667 665 0 True 442 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 487 274 0.00955384061231 0.0497594180002535 0.00950637064164187 0.0555886167696651 0.00172922918012107 0.0154304193524967 417616 2168554 667 665 0 False 487 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 529 274 0.00954995150627936 0.0659495385293171 0.00949111161974517 0.066346227206836 0.00149664117875611 0.0212101144243682 417446 2874132 667 665 0 True 531 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 573 274 0.00936444114861773 0.0551664122540272 0.00927748531319142 0.0556343938353552 0.00178955480662501 0.0147507758790533 409337 2404195 667 665 0 True 576 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 620 274 0.0092690894195841 0.00927108340776409 0.00926222629129473 0.00932326237888151 0.00198354060089579 0.00180979434185747 405169 404041 667 665 0 False 620 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 658 272 0.00948170913398874 0.0396539988102552 0.00961318379491875 0.0395666437781338 0.00182162212508445 0.00912749326359524 414463 1728152 667 665 0 True 665 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 264 318 0.0095071713399423 0.00951944980326761 0.00958266575112535 0.00958266575112535 0.00153634884731207 0.00148515431954601 415576 414865 667 665 0 False 264 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 308 318 0.00947788865924099 0.00943638565399537 0.00944533455405508 0.0093690394445716 0.00137728570798131 0.00124936988561375 414296 411245 667 665 0 False 308 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 352 320 0.0097126076467374 0.0857371857200796 0.00965896086060884 0.0830701152056153 0.00136675047078552 0.0211918973259887 424556 3736493 667 665 0 True 353 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 397 321 0.00955239935536924 0.0437150784950474 0.00950637064164187 0.0437170977340352 0.00141960082752587 0.00707751439630978 417553 1905137 667 665 0 True 397 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 441 320 0.00957154748329658 0.0612095356266611 0.00955214770733196 0.0603036545357443 0.00161819576018401 0.0132781952030371 418390 2667559 667 665 0 True 442 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 485 318 0.00964141412928235 0.0352800977036319 0.00956740672922866 0.0373083085374228 0.00163044958069716 0.00717581631683032 421444 1537534 667 665 0 True 487 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 529 318 0.00953229038948139 0.0388276711462795 0.00956740672922866 0.0400396734569314 0.00154583638534879 0.00926312986682026 416674 1692140 667 665 0 True 531 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 574 319 0.00942586614680758 0.0452856334014253 0.00949111161974517 0.0464484626535439 0.00186327905989095 0.00939976978722184 412022 1973583 667 665 0 True 576 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 620 318 0.00932204989288372 0.00939267371908829 0.0093690394445716 0.0093690394445716 0.00206437900299433 0.00202738611828899 407484 409340 667 665 0 False 620 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 665 317 0.00924149964386083 0.0093809483654203 0.00921644922560464 0.00933852140077821 0.00191024111420705 0.00192100180107545 403963 408829 667 665 0 False 665 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 265 365 0.00972203300958813 0.0444649504282565 0.00967421988250553 0.0449073014419776 0.00148568115580434 0.00929580113630662 424968 1937817 667 665 0 True 264 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 310 365 0.00966774566481923 0.0537432388478635 0.00965896086060884 0.0569771877622644 0.00134752050727653 0.0140546641433752 422595 2342172 667 665 0 True 308 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 353 364 0.00967707951929277 0.0332335989894627 0.00967421988250553 0.0347905699244678 0.00144065890967327 0.00634646699173122 423003 1448346 667 665 0 True 353 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 398 365 0.00961899457687041 0.0305136840728509 0.00968947890440223 0.0315861753261616 0.0014306251238718 0.00566881537446277 420464 1329810 667 665 0 True 397 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 442 363 0.00979057278410463 0.059740608100705 0.00990310521095598 0.0594491493095293 0.00163442630488829 0.0105189092705112 427964 2603542 667 665 0 True 442 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 486 363 0.00973200742270202 0.0276341345467124 0.00970473792629892 0.0283207446402686 0.00187540473845499 0.00419590555245107 425404 1204317 667 665 0 True 487 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 530 363 0.00972928504848057 0.0257066332574398 0.00976577401388571 0.0260013733119707 0.00171500485719615 0.00301413728119072 425285 1120315 667 665 0 True 531 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 574 363 0.00962048158799977 0.0454053421491472 0.00955214770733196 0.0464332036316472 0.00194484618875271 0.00933341389289852 420529 1978800 667 665 0 True 576 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 619 363 0.00943988980561219 0.0536868837233849 0.00944533455405508 0.0544899671931029 0.00203749256789485 0.0131494873677429 412635 2339716 667 665 0 True 621 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 663 361 0.00926286684993507 0.0591909391239601 0.00926222629129473 0.0599526970321202 0.00177454886609881 0.0183743585317396 404897 2579587 667 665 0 True 665 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 266 409 0.00949140902197105 0.0359260247207628 0.00952162966353857 0.037949187457084 0.00154776666178388 0.00707908583617897 414887 1565684 667 665 0 True 264 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 310 408 0.00960471927002852 0.0288090562868604 0.00962844281681544 0.0286259250782025 0.00140211725979362 0.00378402050208991 419840 1255521 667 665 0 True 308 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 353 409 0.00983966702846791 0.0714288811981889 0.00993362325474937 0.0725413900968948 0.00145645541294103 0.0176079136448085 430110 3112926 667 665 0 True 353 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 398 408 0.0098082567779969 0.0546362243443353 0.00984206912336919 0.0554818036163882 0.00157369225125755 0.013261605934648 428737 2381089 667 665 0 True 397 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 442 408 0.0100315143412501 0.0376722534190822 0.0100709544518196 0.039154650186923 0.00168865463526816 0.00662344297304902 438496 1641786 667 665 0 True 442 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 486 407 0.010067522887675 0.0465587176914591 0.010101472495613 0.0483100633249409 0.00170666519389032 0.0105611577041015 440070 2029065 667 665 0 True 487 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 531 407 0.00976881666742733 0.0386673252139275 0.00978103303578241 0.0391393911650263 0.00168635540813549 0.00681242845366204 427013 1685152 667 665 0 True 531 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 575 406 0.00979679535375366 0.0471823871879286 0.00984206912336919 0.0478828107118334 0.00178064273996927 0.00798620728642536 428236 2056245 667 665 0 True 576 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 618 406 0.00950925315552341 0.0429996483541194 0.00956740672922866 0.0443121995880064 0.00185465334172822 0.00859201120039474 415667 1873958 667 665 0 True 621 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 663 406 0.0095517587967289 0.0781855990399436 0.00955214770733196 0.0759899290455482 0.00190692266349951 0.0170528343444112 417525 3407389 667 665 0 True 665 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 266 453 0.00944400768258581 0.0361162462117757 0.00953688868543526 0.0368505378805219 0.00153781570767084 0.00595482090560339 412815 1573974 667 665 0 True 264 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 310 453 0.00965049633571861 0.0409332096549453 0.00965896086060884 0.041367208361944 0.00159967553912761 0.00644685940749415 421841 1783901 667 665 0 True 308 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 354 452 0.00976684923731771 0.0315737615955659 0.00975051499198901 0.0321965362020294 0.00145987870874924 0.00425527955838093 426927 1376009 667 665 0 True 353 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 399 453 0.00990109202665776 0.046623379230865 0.00984206912336919 0.0464484626535439 0.00157590045083961 0.00764230044502739 432795 2031883 667 665 0 True 398 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 443 453 0.0100747978036617 0.0922786939883469 0.0101472495613031 0.09228656443122 0.00181585846748376 0.0153387872328844 440388 4021577 667 665 0 True 442 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 487 451 0.0101017698978389 0.0526790540094801 0.0100556954299229 0.0542153047989624 0.00176740569189953 0.0113874998877946 441567 2295794 667 665 0 True 487 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 531 451 0.0101071917691875 0.0471158211390229 0.0100556954299229 0.0467994201571679 0.00188740110240846 0.00813818717162329 441804 2053344 667 665 0 True 531 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 575 450 0.00971533002095885 0.03051473958414 0.0098115510795758 0.0307774471656367 0.00184203465526998 0.00396862766826984 424675 1329856 667 665 0 True 576 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 619 450 0.00967989340189141 0.0356515458938029 0.00967421988250553 0.0362249179827573 0.00192238144365473 0.00468166479431866 423126 1553722 667 665 0 True 621 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 663 449 0.00951160949623609 0.0632712704168294 0.00958266575112535 0.0634012359807736 0.00202635858058068 0.01094590252547 415770 2757411 667 665 0 True 665 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 267 498 0.00934870170774077 0.0450337792294882 0.00941481651026169 0.0453192950331884 0.00159653918379541 0.0117781167906902 408649 1962607 667 665 0 True 264 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 311 497 0.00965184608428219 0.0457590761063795 0.00959792477302205 0.0460364690623331 0.00141512712033646 0.00435195310162004 421900 1994216 667 665 0 True 308 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 355 497 0.00974998881882016 0.0584899878444108 0.00973525597009232 0.0568551155870909 0.00143056277057584 0.0115581707386563 426190 2549039 667 665 0 True 353 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 399 496 0.0101986772692848 0.0782942478650276 0.0101930266269932 0.0753490501258869 0.00162636588473088 0.0177935557272966 445803 3412124 667 665 0 True 398 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 444 496 0.0101019529145933 0.0869158935333298 0.0101319905394064 0.0833295185778592 0.00193934778278256 0.0273419965583434 441575 3787862 667 665 0 True 442 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 488 495 0.0100983383336942 0.0429184428225519 0.0101167315175097 0.0431067368581674 0.00178054879245758 0.00825986025245449 441417 1870419 667 665 0 True 487 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 531 491 0.0102073248109294 0.036437878858281 0.0102082856488899 0.0400244144350347 0.00195542290749122 0.0101850563678108 446181 1587991 667 665 0 False 531 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 576 495 0.00984133705635166 0.0931963463247269 0.0098268101014725 0.0883802548256657 0.00186609457771525 0.0165526344132003 430183 4061569 667 665 0 True 576 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 620 494 0.00961247460499551 0.0548826403385438 0.00962844281681544 0.058609903105211 0.00184119417622301 0.0149666669287504 420179 2391828 667 665 0 True 621 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 664 494 0.00955198756767187 0.0647698899342657 0.00970473792629892 0.064087891966125 0.00187343653214826 0.0111796504565338 417535 2822722 667 665 0 True 665 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 268 540 0.00937533064550353 0.0415886592195756 0.00941481651026169 0.0441290913252461 0.00151191273119243 0.00861673212528606 409813 1812466 667 665 0 True 264 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 311 541 0.0095005598596902 0.0926265537957964 0.00947585259784848 0.0867780575265125 0.00144703392567988 0.0222306196943128 415287 4036737 667 665 0 True 308 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 355 541 0.00973688024378747 0.0494340910642365 0.00975051499198901 0.0522621499961852 0.00146372531125493 0.00900082979952554 425617 2154376 667 665 0 True 353 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 399 540 0.0100551006254712 0.0533837913621316 0.00996414129854276 0.0531319142442969 0.00168588653165294 0.00660649809779724 439527 2326507 667 665 0 True 398 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 444 539 0.00999969230308169 0.0517771884506414 0.0100862134737163 0.0514991989013504 0.00194472045148687 0.00741615227733518 437105 2256490 667 665 0 True 442 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 487 537 0.0100754841164906 0.0589857339618215 0.0101167315175097 0.0580758373388266 0.00194648952187965 0.0120507054243364 440418 2570644 667 665 0 True 487 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 532 537 0.00986869806113194 0.0683817807278553 0.00991836423285267 0.0667734798199435 0.00203891646709529 0.015983104222195 431379 2980131 667 665 0 True 531 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 576 537 0.00967570689363489 0.0538288270458706 0.00970473792629892 0.0551003280689708 0.0017174253237333 0.0119576890722694 422943 2345902 667 665 0 True 576 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 620 537 0.00954221904840667 0.045163377659071 0.00950637064164187 0.0444190127412833 0.00186025996659957 0.00658909048772763 417108 1968255 667 665 0 True 621 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 664 535 0.00950035396584152 0.0562205467892666 0.00958266575112535 0.057755397878996 0.00184171489662642 0.0102883639445269 415278 2450135 667 665 0 True 665 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 267 583 0.00913596760786464 0.0383728834560652 0.00918593118181125 0.0395513847562371 0.00136566124927749 0.00722519500396459 399350 1672320 667 665 0 True 264 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 310 582 0.00937144153947288 0.0490744600113238 0.009399557488365 0.0492408636606394 0.00146587550048999 0.0106452139026214 409643 2138703 667 665 0 True 308 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 355 582 0.00954077779146591 0.0394378484549667 0.00953688868543526 0.0398565651941711 0.00149320160407237 0.00619701970082399 417045 1718732 667 665 0 True 353 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 399 582 0.00987100864765603 0.0440533928090999 0.00988784618905928 0.0441596093690394 0.00152514452519651 0.00484455518531445 431480 1919881 667 665 0 True 398 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 443 581 0.0100709773289139 0.080606666586356 0.00988784618905928 0.0770580605783169 0.00199675124275991 0.0154954035314922 440221 3512901 667 665 0 True 442 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 487 579 0.00992575353431089 0.0565629225271923 0.00987258716716258 0.0567025253681239 0.00206461029867753 0.0113560296515862 433873 2465056 667 665 0 True 487 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 531 579 0.00963194301224302 0.0506885203395304 0.00965896086060884 0.0507515068284123 0.00207272748779463 0.00672813692422875 421030 2209045 667 665 0 True 532 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 575 579 0.00947461723475639 0.0349588092455905 0.00956740672922866 0.0364385442893111 0.00174347589782414 0.0071666665395323 414153 1523532 667 665 0 True 576 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 619 578 0.009421290727948 0.044016817048343 0.00943007553215839 0.0447699702449073 0.00161445155096002 0.00603403548361599 411822 1918287 667 665 0 True 621 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 663 578 0.00932422321684202 0.0500789625700782 0.0093842984664683 0.0498664835584039 0.00176076044459 0.00748391048769238 407579 2182480 667 665 0 True 665 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 264 622 0.00890024202821912 0.00905032092706015 0.00898756389715419 0.00909437705043107 0.00144334481854279 0.00137464251217597 389046 394420 667 665 0 False 264 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 309 622 0.00927480869315857 0.00911606092365269 0.00932326237888151 0.00910963607232776 0.0013816220309694 0.00126479346714757 405419 397285 667 665 0 False 309 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 354 624 0.00930196380409017 0.0619442632674614 0.00932326237888151 0.0601968413824674 0.0015123968124366 0.0084166125640423 406606 2699579 667 665 0 True 353 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 399 624 0.00948516357522772 0.071345518752248 0.00950637064164187 0.0672312504768444 0.00138168092171113 0.0199541601817974 414614 3109293 667 665 0 True 398 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 442 622 0.00966010471532373 0.00931633271780963 0.00959792477302205 0.00930800335698482 0.00194029308316832 0.00187643951724157 422261 406013 667 665 0 False 442 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 487 622 0.00943176843713643 0.00937339916511352 0.0093690394445716 0.009399557488365 0.00189235483174669 0.00194574065318893 412280 408500 667 665 0 False 487 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 532 622 0.00924488545381692 0.00922950544133279 0.00926222629129473 0.00924696726939803 0.00196928593904664 0.00194868564968267 404111 402229 667 665 0 False 532 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 576 622 0.00919805604178913 0.00914834580156044 0.00923170824750134 0.00917067215991455 0.00158842117064845 0.00175265128635579 402064 398692 667 665 0 False 576 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 621 622 0.00926531469902494 0.0091406818717657 0.00924696726939803 0.00909437705043107 0.001386396050309 0.00153148689152115 405004 398358 667 665 0 False 621 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 665 622 0.00919391528772121 0.00920740854195457 0.00918593118181125 0.00924696726939803 0.00158081701039647 0.00156672756785513 401883 401266 667 665 0 False 665 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 265 672 0.00897065772446805 0.0367712827502494 0.00892652780956741 0.0368352788586252 0.00132154299672376 0.00653905756363843 392124 1602521 667 665 0 True 264 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 309 665 0.00894755185922717 0.0089290518583022 0.0089417868314641 0.00901808194094758 0.00134999090640988 0.00121454915984305 391114 389135 667 665 0 False 309 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 353 665 0.00893833239022512 0.00889210896318388 0.0089723048752575 0.00888075074387732 0.00131106906897577 0.00126003195850912 390711 387525 667 665 0 False 353 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 398 665 0.00903823666102403 0.00923228189494106 0.00903334096284428 0.00929274433508812 0.00135861554971312 0.00139594040200949 395078 402350 667 665 0 False 398 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 442 665 0.00932140933424338 0.00921078158890015 0.00930800335698482 0.00918593118181125 0.00158430182979831 0.00153719763587714 407456 401413 667 665 0 False 442 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 487 665 0.00916424369641684 0.00909531783223222 0.00909437705043107 0.00910963607232776 0.00171858756683516 0.00158546403254974 400586 396381 667 665 0 False 487 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 532 665 0.00922603472811546 0.00911486773697806 0.00926222629129473 0.00912489509422446 0.00178013143764656 0.00170717951875911 403287 397233 667 665 0 False 532 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 576 665 0.00912974503821561 0.00909990701175002 0.00915541313801785 0.00910963607232776 0.00144504804570976 0.00134708624907951 399078 396581 667 665 0 False 576 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 621 665 0.00918066945012273 0.00900709085600245 0.00912489509422446 0.0089570458533608 0.00128538481270164 0.00147115650047968 401304 392536 667 665 0 False 621 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 661 669 0.00922376989577997 0.0381192624500138 0.00927748531319142 0.0383154039826047 0.00142800834582791 0.0085213512497012 403188 1661267 667 665 0 True 665 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F11_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F11_2.csv new file mode 100755 index 0000000..6271638 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F11_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 264 275 0.00805987484628022 0.724484982196852 0.00802624551766232 0.718806744487678 0.00181716605928751 0.185384797758349 352312 31573617 667 665 10 True 264 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 308 274 0.00685942220009245 0.00639587065626988 0.00679026474402991 0.0063782711528191 0.00146982039231628 0.00123717838780149 299838 278737 667 665 0 False 308 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 351 276 0.0061195769704985 0.00628205900422836 0.00611886778057527 0.00630197604333562 0.0012832450170554 0.00136102364674183 267498 273777 667 665 0 True 353 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 395 276 0.00616791627074995 0.00619679204878757 0.00617990386816205 0.00622568093385214 0.00130801280042805 0.00131454708499354 269611 270061 667 665 0 True 397 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 441 275 0.00635674380708478 0.00623752101700807 0.00627145799954223 0.00617990386816205 0.00154899927232486 0.0017354649039064 277865 271836 667 665 0 True 442 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 487 274 0.0064935717080805 0.00663891360353275 0.00662241550316625 0.00662241550316625 0.00171599622274365 0.00168305469634865 283846 289329 667 665 0 False 487 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 529 274 0.00651182762933022 0.00670453887063734 0.00653086137178607 0.00668345159075303 0.00155180322288566 0.00157238462588882 284644 292189 667 665 0 True 531 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 573 274 0.00682270446374432 0.00694806368174958 0.00692759594110018 0.00701915007248035 0.00171097281586291 0.00172815579624752 298233 302802 667 665 0 True 576 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 620 274 0.00938509916476873 0.00771028050786155 0.00785839627679866 0.007690547035935 0.0082368798713917 0.00186328754211633 410240 336020 667 665 0 False 620 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 658 272 0.00900954878477447 0.739398163525086 0.00891126878767071 0.744441901274128 0.00192599298690967 0.200217253862632 393824 32223545 667 665 13 True 665 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 264 318 0.00663513516759588 0.00637687145306618 0.00657663843747616 0.00634775310902571 0.00164640192944934 0.00130636405749119 290034 277909 667 665 0 False 264 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 308 318 0.00623027922980602 0.00628632694117991 0.00625619897764553 0.00630197604333562 0.00131738434778929 0.00120315395738819 272337 273963 667 665 0 False 308 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 352 320 0.00624595003940008 0.00625473044019984 0.00627145799954223 0.00622568093385214 0.00135828094161235 0.00131916927414831 273022 272586 667 665 0 True 353 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 397 321 0.00629774378089051 0.00655128322064029 0.00633249408712902 0.00656137941557946 0.00134183530590408 0.00134509474242145 275286 285510 667 665 0 True 397 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 441 320 0.00666064312773803 0.00669529167390897 0.00666819256885634 0.00663767452506294 0.00152323246868872 0.00171506090254275 291149 291786 667 665 0 True 442 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 485 318 0.00663506653631298 0.00664368635023127 0.00666819256885634 0.00663767452506294 0.001585225807412 0.00156791359702223 290031 289537 667 665 0 True 487 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 529 318 0.00657787380056824 0.0066016265199506 0.00657663843747616 0.00657663843747616 0.00149597015483744 0.00158039819987926 287531 287704 667 665 0 True 531 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 574 319 0.00695404186210854 0.00697314354781437 0.00700389105058366 0.00692759594110018 0.0017359739479664 0.00168728289375406 303974 303895 667 665 0 True 576 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 620 318 0.00732407886237701 0.00720154701241545 0.00733958953231098 0.00715648126955062 0.00192530542805531 0.00195471804362988 320149 313849 667 665 0 False 620 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 665 317 0.00750942908037856 0.00735266869393672 0.00758373388265812 0.00746166170748455 0.00203062031885537 0.0018355590087938 328251 320435 667 665 0 False 665 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 265 365 0.00618980964999304 0.00614979885052526 0.00621042191195544 0.00619516289005875 0.00140351789483559 0.00148070605129231 270568 268013 667 665 0 True 264 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 310 365 0.00615126174610109 0.00642719180647889 0.00611886778057527 0.00646982528419928 0.0012772805323345 0.00126235011871833 268883 280102 667 665 0 True 308 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 353 364 0.00645287335732454 0.00650206427031185 0.00648508430609598 0.00651560234988937 0.0013156546552936 0.00131634547684249 282067 283365 667 665 0 True 353 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 398 365 0.00671724105903102 0.00695003702894223 0.00666819256885634 0.00689707789730678 0.00145786953735442 0.00137667219726578 293623 302888 667 665 0 True 397 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 442 363 0.0069718631185666 0.00676100872460391 0.00697337300679027 0.0068055237659266 0.00163008347506121 0.00172646696631343 304753 294650 667 665 0 True 442 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 486 363 0.00687365175274574 0.00701703904990217 0.00685130083161669 0.00703440909437705 0.00176817001032007 0.00162117526346788 300460 305808 667 665 0 True 487 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 530 363 0.00676837136478682 0.00694462179711123 0.00679026474402991 0.00695811398489357 0.00166805168135214 0.00162807206981194 295858 302652 667 665 0 True 531 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 574 363 0.00688847610985077 0.00710042444174065 0.00688181887541009 0.00703440909437705 0.00188393908190775 0.00186335860582054 301108 309442 667 665 0 True 576 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 619 363 0.00674421315320824 0.0069227314108113 0.00677500572213321 0.00708018616006714 0.00200056654419169 0.0018802924145315 294802 301698 667 665 0 True 621 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 663 361 0.00637214009154727 0.00624809907579661 0.00648508430609598 0.00617990386816205 0.00183576399964838 0.00193805627067468 278538 272297 667 665 0 True 665 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 266 409 0.00614826484674806 0.00617763222430074 0.00621042191195544 0.00619516289005875 0.00149639359547348 0.00149666368237284 268752 269226 667 665 0 True 264 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 310 408 0.00640679888940858 0.00646374462133819 0.00642404821850919 0.00645456626230259 0.00135267061943739 0.00129866365495633 280053 281695 667 665 0 True 308 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 353 409 0.0066468024856878 0.0068924428259938 0.00668345159075303 0.00694285496299687 0.00132703431737468 0.00128397056915563 290544 300378 667 665 0 True 353 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 398 408 0.00685061451878776 0.00688562789440986 0.00689707789730678 0.00686655985351339 0.00143235352303157 0.00149686161908922 299453 300081 667 665 0 True 397 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 442 408 0.00705042306038558 0.00679567997586092 0.00708018616006714 0.00677500572213321 0.00166108578954609 0.00155207539749121 308187 296161 667 665 0 True 442 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 486 407 0.00697547769946567 0.00707043415359181 0.00704966811627375 0.00711070420386053 0.00161429568791294 0.00168185305720094 304911 308135 667 665 0 True 487 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 531 407 0.00689854203134185 0.00740177291477722 0.00698863202868696 0.0072632944228275 0.00160680127495872 0.00209068540531142 301548 322575 667 665 0 True 531 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 575 406 0.00673030387987512 0.00684992407776135 0.00674448767833982 0.00685130083161669 0.00183894079448117 0.00180124627718471 294194 298525 667 665 0 True 576 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 618 406 0.0062467736147948 0.00613607720376703 0.00627145799954223 0.00610360875867857 0.001815677350902 0.00190294744211065 273058 267415 667 665 0 True 621 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 663 406 0.00612639434459927 0.00585230528828365 0.00616464484626535 0.00582894636453803 0.00172172740480015 0.00184304707540809 267796 255048 667 665 0 True 665 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 266 453 0.00625828079322664 0.00632271913475609 0.00633249408712902 0.00634775310902571 0.00149906336703388 0.0015270003412656 273561 275549 667 665 0 True 264 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 310 453 0.00643322193332265 0.0062566808414949 0.00645456626230259 0.00616464484626535 0.00145223711570842 0.00150287575227435 281208 272671 667 665 0 True 308 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 354 452 0.00670834186934914 0.0065880425485779 0.00666819256885634 0.00660715648126955 0.00137458401798472 0.00139914516974166 293234 287112 667 665 0 True 353 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 399 453 0.0067946800232294 0.00685800103371269 0.00674448767833982 0.00688181887541009 0.00158875455403984 0.00149637514858552 297008 298877 667 665 0 True 398 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 443 453 0.00683826088786689 0.00694872911277966 0.00688181887541009 0.00704966811627375 0.00187742185494482 0.00192126146634278 298913 302831 667 665 0 True 442 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 487 451 0.00688195613797587 0.00673292294595495 0.00689707789730678 0.00677500572213321 0.00178742316940876 0.0019368286854246 300823 293426 667 665 0 True 487 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 531 451 0.00676395608558733 0.00667672844275945 0.00665293354695964 0.00675974670023652 0.00173925367258763 0.00164833677496732 295665 290977 667 665 0 True 531 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 575 450 0.0063370466288943 0.0061538832202961 0.0063782711528191 0.00622568093385214 0.00186562827375707 0.00196075145542294 277004 268191 667 665 0 True 576 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 619 450 0.0059771899355884 0.00604438539700131 0.0059510185397116 0.00608834973678187 0.00177472679192547 0.00188822163569322 261274 263419 667 665 0 True 621 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 663 449 0.00595099566261731 0.00590907343891888 0.00592050049591821 0.00593575951781491 0.00168807644174093 0.00186169142412702 260129 257522 667 665 0 True 665 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 267 498 0.00617436761134196 0.00625530408763956 0.00624093995574884 0.00625619897764553 0.00153217115602235 0.00150231189163456 269893 272611 667 665 0 True 264 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 311 497 0.00646435765866209 0.00630378876924515 0.00654612039368277 0.00630197604333562 0.0014634123708516 0.00150405079891759 282569 274724 667 665 0 True 308 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 355 497 0.00655042128741077 0.00659114024475242 0.00653086137178607 0.00662241550316625 0.00138791368752633 0.00144663052119418 286331 287247 667 665 0 True 353 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 399 496 0.00672440158954627 0.00676006794280276 0.00668345159075303 0.00672922865644312 0.00153048858881118 0.00164850561540332 293936 294609 667 665 0 True 398 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 444 496 0.00659612972181796 0.00687229632791064 0.00662241550316625 0.00691233691920348 0.00181407167164925 0.00200650133224729 288329 299500 667 665 0 True 442 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 488 495 0.00653227975163254 0.00648267498684913 0.00654612039368277 0.00651560234988937 0.00179176800861524 0.0017718117443497 285538 282520 667 665 0 True 487 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 531 491 0.00643070545294988 0.00618024805662589 0.00646982528419928 0.00621042191195544 0.00171370015857546 0.00156877532693341 281098 269340 667 665 0 False 531 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 576 495 0.00609390887069626 0.00604424772161578 0.00602731364919509 0.00593575951781491 0.00177203085097762 0.00188199906588392 266376 263413 667 665 0 True 576 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 620 494 0.00590199292663121 0.00594399709504937 0.00593575951781491 0.0059510185397116 0.00164919823413081 0.00171727691959394 257987 259044 667 665 0 True 621 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 664 494 0.00602150286724342 0.0060644860032893 0.00607309071488518 0.00602731364919509 0.00172232689159794 0.00191382039303064 263211 264295 667 665 0 True 665 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 268 540 0.00629849872500234 0.00647028420215106 0.00633249408712902 0.00646982528419928 0.00143604790961879 0.00144507923204765 275319 281980 667 665 0 True 264 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 311 541 0.00627713151892811 0.00639314009445679 0.00619516289005875 0.0063935301747158 0.00146179757083465 0.00139323197488325 274385 278618 667 665 0 True 308 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 355 541 0.00628877595992574 0.0065247348171298 0.00628671702143893 0.00648508430609598 0.00144671021591142 0.00136944291559309 274894 284353 667 665 0 True 353 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 399 540 0.00652473031051423 0.00659747331248699 0.00654612039368277 0.00663767452506294 0.0016107535067386 0.00161753210616593 285208 287523 667 665 0 True 398 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 444 539 0.00652811612047032 0.00644979351560407 0.00651560234988937 0.0063935301747158 0.00176307822744454 0.00195966497471087 285356 281087 667 665 0 True 442 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 487 537 0.00641862634716059 0.00659728974530627 0.00642404821850919 0.00657663843747616 0.00180944717461542 0.00220962524517032 280570 287515 667 665 0 True 487 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 532 537 0.00624208381046373 0.00643822878321921 0.00636301213092241 0.00646982528419928 0.00180193961695489 0.00180006492377889 272853 280583 667 665 0 True 531 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 576 537 0.00617583174537703 0.00631406853136503 0.00622568093385214 0.00627145799954223 0.00164862205097316 0.00156439413140421 269957 275172 667 665 0 True 576 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 620 537 0.00611044900987364 0.00617047310425296 0.00607309071488518 0.00622568093385214 0.00170762694813421 0.0017126158120985 267099 268914 667 665 0 True 621 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 664 535 0.00626406869808401 0.00614438361869425 0.00636301213092241 0.00607309071488518 0.00183831301188926 0.00191670652780913 273814 267777 667 665 0 True 665 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 267 583 0.00633885391934383 0.00646750774854279 0.0063782711528191 0.00651560234988937 0.00130382620224117 0.00121643937082417 277083 281859 667 665 0 True 264 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 310 582 0.00633322615414655 0.00649013240356556 0.00634775310902571 0.00646982528419928 0.00144037670199316 0.00137415729466064 276837 282845 667 665 0 True 308 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 355 582 0.0063967787221061 0.00647478159807851 0.0064087891966125 0.00646982528419928 0.00130701661644277 0.00126828441388222 279615 282176 667 665 0 True 353 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 399 582 0.00632499040019931 0.0064014694552816 0.00630197604333562 0.0064087891966125 0.00138305441077295 0.00130994319714687 276477 278981 667 665 0 True 398 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 443 581 0.00637477095739153 0.00634963467262801 0.00634775310902571 0.00650034332799268 0.00181834515076302 0.00195459429668111 278653 276722 667 665 0 True 442 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 487 579 0.00635843671206283 0.00634309509181514 0.00642404821850919 0.00625619897764553 0.00194537019509451 0.00195177299169985 277939 276437 667 665 0 True 487 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 531 579 0.00652088695867219 0.00655958963556752 0.00654612039368277 0.00656137941557946 0.0018369648888984 0.00181479324032341 285040 285872 667 665 0 True 532 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 575 579 0.00625564992738238 0.00633563767509871 0.00624093995574884 0.0064087891966125 0.00169904036780914 0.00175972548873937 273446 276112 667 665 0 True 576 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 619 578 0.00609541875891992 0.00635991443474789 0.00607309071488518 0.0064087891966125 0.00150394205239164 0.00147807022824614 266442 277170 667 665 0 True 621 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 663 578 0.00606215546381078 0.00618926579437837 0.00604257267109178 0.00610360875867857 0.0016420735253278 0.00170203641225423 264988 269733 667 665 0 True 665 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 264 622 0.00646056006100863 0.00639793578705289 0.00648508430609598 0.0063935301747158 0.00134947523527552 0.00139435562762709 282403 278827 667 665 0 False 264 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 309 622 0.00623096554263495 0.00609773460889578 0.00619516289005875 0.00614938582436866 0.00137274005116092 0.00124146463916059 272367 265744 667 665 0 False 309 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 354 624 0.00625263015093506 0.00621879716457544 0.00621042191195544 0.00624093995574884 0.00128467428055344 0.00138101201777685 273314 271020 667 665 0 True 353 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 399 624 0.00602912093964462 0.00614605866921825 0.00601205462729839 0.00610360875867857 0.00133583734189581 0.00128202734107762 263544 267850 667 665 0 True 398 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 442 622 0.00615851378499352 0.00611370495361774 0.00608834973678187 0.005981536583505 0.00174809856879452 0.00178161646982724 269200 266440 667 665 0 False 442 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 487 622 0.00636223430971628 0.00627012713748207 0.00643930724040589 0.00631723506523232 0.00186098778943082 0.00183798521843571 278105 273257 667 665 0 False 487 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 532 622 0.00616347811445616 0.00633045190224359 0.00621042191195544 0.00634775310902571 0.00186409926417922 0.0018676089218373 269417 275886 667 665 0 False 532 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 576 622 0.0062956848424037 0.00616489725113883 0.00624093995574884 0.00619516289005875 0.00163868951199739 0.00157556387543665 275196 268671 667 665 0 False 576 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 621 622 0.00608818959712179 0.00616648051807248 0.00616464484626535 0.00613412680247196 0.00135352136917024 0.00133858933689995 266126 268740 667 665 0 False 621 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 665 622 0.00636518545488071 0.00632992414659905 0.00642404821850919 0.00630197604333562 0.00149057238606624 0.00145349013867366 278234 275863 667 665 0 False 665 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 265 672 0.00800755493162094 0.738638631368992 0.00790417334248875 0.717021438925765 0.00161206802022544 0.162194064641766 350025 32190444 667 665 9 True 264 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 309 665 0.00655197692982303 0.00627886952446348 0.00653086137178607 0.00631723506523232 0.00156375521539524 0.0013305462527235 286399 273638 667 665 0 False 309 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 353 665 0.00607471498858033 0.00603701976387524 0.00605783169298848 0.00605783169298848 0.00127309675551709 0.00119342177543222 265537 263098 667 665 0 False 353 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 398 665 0.00597316356699197 0.00607146155615636 0.00602731364919509 0.00617990386816205 0.00125819312981705 0.00124167050074016 261098 264599 667 665 0 False 398 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 442 665 0.00596236557848336 0.0059403716432303 0.00590524147402152 0.00588998245212482 0.0014659748831887 0.00152290046614341 260626 258886 667 665 0 False 442 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 487 665 0.00609450367514801 0.00599461574513074 0.00619516289005875 0.00604257267109178 0.00160531377924842 0.00155276613223706 266402 261250 667 665 0 False 487 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 532 665 0.00633713813727149 0.00614202019124258 0.00636301213092241 0.00607309071488518 0.00169720896036839 0.00168954079783024 277008 267674 667 665 0 False 532 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 576 665 0.00612271113241731 0.00613336958785152 0.00614938582436866 0.00610360875867857 0.00141495094287108 0.00141613239524537 267635 267297 667 665 0 False 576 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 621 665 0.00723801523362832 0.00651160976370888 0.00674448767833982 0.00653086137178607 0.00297142045766694 0.00136836977005143 316387 283781 667 665 0 False 621 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 661 669 0.00793629278288299 0.737137740207695 0.00793469138628214 0.734554055085069 0.00163069167390822 0.199579909462793 346910 32125034 667 665 14 True 665 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F11_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F11_3.csv new file mode 100755 index 0000000..38efcec --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F11_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 264 275 0.0010469702205432 0.0745148979108334 0.000854505226215 0.0737926298924239 0.000782624360743482 0.0211797291352068 45765 3247417 667 665 0 True 264 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 308 274 0.000999042707989105 0.000944315469378413 0.000900282291905089 0.000823987182421607 0.000680232872952205 0.000645467872411877 43670 41154 667 665 0 False 308 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 351 276 0.000936771257310232 0.000940552342173814 0.000823987182421607 0.00080872816052491 0.00066615764965282 0.000698298040202132 40948 40990 667 665 0 True 353 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 395 276 0.00103484536056531 0.00103212941945158 0.000915541313801785 0.000915541313801785 0.000737581142656408 0.000717254116537507 45235 44981 667 665 0 True 397 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 441 275 0.00100988645068631 0.00105245948471545 0.000747692072938125 0.00080872816052491 0.000889653175465566 0.000914999537155223 44144 45867 667 665 0 True 442 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 487 274 0.001064311058021 0.000893880386477753 0.000839246204318303 0.000610360875867857 0.000906196599400474 0.000870724817848871 46523 38956 667 665 0 False 487 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 529 274 0.000969393993779032 0.000997664681272878 0.000747692072938125 0.000823987182421607 0.000823015642215143 0.000874598032933907 42374 43479 667 665 0 True 531 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 573 274 0.00101080153445822 0.000974122190346546 0.000701915007248035 0.000656137941557946 0.000951549547821237 0.000928713075395754 44184 42453 667 665 0 True 576 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 620 274 0.00123126809220704 0.00106480437761834 0.00080872816052491 0.000717174029144732 0.00127590323517379 0.0010146399204982 53821 46405 667 665 0 False 620 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 658 272 0.00123481404182322 0.0769967720858567 0.00105287251087205 0.0757152666514076 0.00100311895613475 0.024222905571731 53976 3355579 667 665 0 True 665 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 264 318 0.000987993071443221 0.000985296842472397 0.000793469138628214 0.000823987182421607 0.000802689954356935 0.000765972789477887 43187 42940 667 665 0 False 264 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 308 318 0.000914557598746976 0.000871990000177831 0.00080872816052491 0.000762951094834821 0.000676159365163049 0.000631744415523243 39977 38002 667 665 0 False 308 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 352 320 0.000919750699152598 0.000981923795526812 0.00080872816052491 0.000823987182421607 0.000651344504005417 0.000743466130984351 40204 42793 667 665 0 True 353 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 397 321 0.000973420362375461 0.000995140632538086 0.00080872816052491 0.000854505226215 0.000738267646196712 0.000696988498073049 42550 43369 667 665 0 True 397 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 441 320 0.00101718424376734 0.00105957271296805 0.000778210116731518 0.000793469138628214 0.000885732850798547 0.000905930805470351 44463 46177 667 665 0 True 442 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 485 318 0.00104138820953451 0.000974305757527258 0.000793469138628214 0.000793469138628214 0.000963486205783446 0.000852311951337493 45521 42461 667 665 0 True 487 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 529 318 0.00106163443798815 0.000982336821683414 0.000854505226215 0.000823987182421607 0.000865764821328435 0.000832849807759446 46406 42811 667 665 0 True 531 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 574 319 0.00100096438391013 0.000983002252713496 0.000747692072938125 0.000686655985351339 0.000970723393845418 0.000919739222630096 43754 42840 667 665 0 True 576 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 620 318 0.000978704971158275 0.000984677303237494 0.000564583810177768 0.000534065766384375 0.00105419110220167 0.00106964253606782 42781 42913 667 665 0 False 620 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 665 317 0.00109885547041082 0.00102267570964491 0.000686655985351339 0.000656137941557946 0.00106651303954941 0.000987740898196202 48033 44569 667 665 0 False 665 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 265 365 0.000997624328142635 0.000974558162400737 0.00080872816052491 0.00080872816052491 0.000822827903587041 0.000765984559391625 43608 42472 667 665 0 True 264 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 310 365 0.000948369944119266 0.000966435314654225 0.000823987182421607 0.000839246204318303 0.000709711515144325 0.000736929603894562 41455 42118 667 665 0 True 308 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 353 364 0.00104870887970984 0.000977265778316241 0.000900282291905089 0.000854505226215 0.000760016804133317 0.0007911408280628 45841 42590 667 665 0 True 353 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 398 365 0.00101469064048887 0.00102155136066304 0.000854505226215 0.000885023270008392 0.000743409670388678 0.000770813870708527 44354 44520 667 665 0 True 397 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 442 363 0.00111315365434701 0.000978114776527035 0.000869764248111696 0.000701915007248035 0.000944081995621225 0.000877692603348464 48658 42627 667 665 0 True 442 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 486 363 0.00106957278970952 0.000959803950250999 0.00080872816052491 0.000625619897764553 0.000951564661416666 0.000900519585311283 46753 41829 667 665 0 True 487 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 530 363 0.000971727457397417 0.000996976304345207 0.000717174029144732 0.000747692072938125 0.000887577601506198 0.000932184626791791 42476 43449 667 665 0 True 531 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 574 363 0.000934872458483507 0.00100982600699506 0.000595101853971161 0.000625619897764553 0.000982558336105768 0.0010781511826722 40865 44009 667 665 0 True 576 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 619 363 0.00099876818285753 0.00107056379791319 0.000564583810177768 0.000717174029144732 0.00107996393961285 0.00110379416041442 43658 46656 667 665 0 True 621 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 663 361 0.00107105980083888 0.00104470377133036 0.000656137941557946 0.000701915007248035 0.00105649089305449 0.00104853585372904 46818 45529 667 665 0 True 665 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 266 409 0.000942925195676366 0.00100317169669424 0.000823987182421607 0.000793469138628214 0.000774882202526533 0.000857870219319557 41217 43719 667 665 0 True 264 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 310 408 0.000905361006839222 0.000944889116818138 0.000793469138628214 0.000823987182421607 0.000697177413245787 0.000687855795051056 39575 41179 667 665 0 True 308 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 353 409 0.00106083373968772 0.000920405844090657 0.000976577401388571 0.000839246204318303 0.000738996637973471 0.000659640227937266 46371 40112 667 665 0 True 353 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 398 408 0.00106055921455615 0.000997802356658412 0.000930800335698482 0.000762951094834821 0.000773454587015302 0.000816055693900632 46359 43485 667 665 0 True 397 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 442 408 0.00102137075202385 0.00100482380132065 0.000823987182421607 0.000839246204318303 0.000824649129592063 0.000830007663321988 44646 43791 667 665 0 True 442 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 486 407 0.00106135991285657 0.00097705926523794 0.000885023270008392 0.000701915007248035 0.000882103327908208 0.000888593716448106 46394 42581 667 665 0 True 487 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 531 407 0.000980878295116575 0.00101177640829012 0.000762951094834821 0.000839246204318303 0.000860107074032757 0.000871747897070288 42876 44094 667 665 0 True 531 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 575 406 0.000957475027649828 0.00102301989810874 0.000732433051041428 0.000778210116731518 0.000904634836542314 0.000949709546840937 41853 44584 667 665 0 True 576 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 618 406 0.001003412233 0.000983346441177331 0.000671396963454643 0.000564583810177768 0.000983133655304578 0.00104400618529016 43861 42855 667 665 0 True 621 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 663 406 0.000997212540445273 0.000955926093558456 0.000595101853971161 0.000518806744487678 0.00101914342224217 0.00102325015566783 43590 41660 667 665 0 True 665 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 266 453 0.00101883139455678 0.00101581488626579 0.000885023270008392 0.00080872816052491 0.000780834637929859 0.000849687935474146 44535 44270 667 665 0 True 264 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 310 453 0.000981541730851214 0.000958679601269138 0.000869764248111696 0.000823987182421607 0.000787319171752859 0.000813293223673036 42905 41780 667 665 0 True 308 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 354 452 0.000913001956334719 0.00102448843555444 0.000778210116731518 0.000915541313801785 0.000736643803332881 0.000817207673399344 39909 44648 667 665 0 True 353 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 399 453 0.00110855535839313 0.000961157758208751 0.000869764248111696 0.000778210116731518 0.000942173693343318 0.000846253813575626 48457 41888 667 665 0 True 398 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 443 453 0.00113054024601341 0.000963154051298996 0.000839246204318303 0.000534065766384375 0.00105791719208722 0.00102012961203786 49418 41975 667 665 0 True 442 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 487 451 0.000964978714579538 0.00109052672881563 0.000656137941557946 0.000732433051041428 0.00094858457408224 0.00108145013987745 42181 47526 667 665 0 True 487 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 531 451 0.00096147851915196 0.000970359063141947 0.000671396963454643 0.000671396963454643 0.000970472103201181 0.000939979991163805 42028 42289 667 665 0 True 531 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 575 450 0.000919933715906981 0.000895325978025861 0.000564583810177768 0.000442511635004196 0.000939389446597073 0.00106440810925005 40212 39019 667 665 0 True 576 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 619 450 0.00103001829366846 0.00105739285269709 0.000717174029144732 0.000762951094834821 0.00103229485245713 0.001000996075914 45024 46082 667 665 0 True 621 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 663 449 0.000957543658932722 0.000987040730689163 0.000534065766384375 0.000518806744487678 0.000985984654013117 0.00107743415267937 41856 43016 667 665 0 True 665 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 267 498 0.00102461929941415 0.000891471067230906 0.000900282291905089 0.000747692072938125 0.000822562552006991 0.000742717162292226 44788 38851 667 665 0 True 264 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 311 497 0.000877679722738768 0.0010210236050185 0.000732433051041428 0.000961318379491875 0.000787357770182964 0.00082577013436216 38365 44497 667 665 0 True 308 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 355 497 0.000974976004787718 0.000916069069446333 0.000869764248111696 0.00080872816052491 0.000788302032379556 0.000773504399143118 42618 39923 667 665 0 True 353 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 399 496 0.00103248901985263 0.00110571691301956 0.00080872816052491 0.000930800335698482 0.000883092145575231 0.000881021110036971 45132 48188 667 665 0 True 398 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 444 496 0.00102013538893176 0.00109940679118258 0.000762951094834821 0.000717174029144732 0.000985639880547327 0.00107030841466839 44592 47913 667 665 0 True 442 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 488 495 0.00102832538869041 0.000959872787943767 0.000717174029144732 0.000610360875867857 0.00094095856566123 0.000958133098076304 44950 41832 667 665 0 True 487 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 531 491 0.000941026396849641 0.000954572285600704 0.000656137941557946 0.00064087891966125 0.000903464810153679 0.000892916672930773 41134 41601 667 665 0 False 531 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 576 495 0.000962210586169492 0.000940552342173814 0.000686655985351339 0.00064087891966125 0.00093600732195114 0.000973719571844086 42060 40990 667 665 0 True 576 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 620 494 0.000989685976421265 0.000919074982030494 0.000671396963454643 0.000579842832074464 0.000941184817987462 0.000917690797722516 43261 40054 667 665 0 True 621 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 664 494 0.00102336105922777 0.000862651019859101 0.00064087891966125 0.000442511635004196 0.000987814941470776 0.000967531298778007 44733 37595 667 665 0 True 665 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 268 540 0.00092233581080826 0.000976485617798215 0.000747692072938125 0.000732433051041428 0.000781093513387112 0.000850628815748458 40317 42556 667 665 0 True 264 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 311 541 0.000980352121947724 0.000911571673518885 0.000854505226215 0.000762951094834821 0.000790089811018847 0.000756239729523906 42853 39727 667 665 0 True 308 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 355 541 0.000904240029218625 0.0009499831060829 0.000778210116731518 0.000793469138628214 0.00074206299063348 0.000772016176700597 39526 41401 667 665 0 True 353 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 399 540 0.00098648318321956 0.000990092535068502 0.000762951094834821 0.000778210116731518 0.000879729912797989 0.000804161222407845 43121 43149 667 665 0 True 398 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 444 539 0.00102283488605892 0.00102141368527751 0.000595101853971161 0.000610360875867857 0.00106520716041077 0.00110286552001395 44710 44514 667 665 0 True 442 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 487 537 0.00100743860159643 0.00106218854529319 0.000564583810177768 0.000701915007248035 0.00108040236849236 0.0011392661200495 44037 46291 667 665 0 True 487 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 532 537 0.000946951564272796 0.000892297119544111 0.000595101853971161 0.000442511635004196 0.000931283202099754 0.00102278365170826 41393 38887 667 665 0 True 531 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 576 537 0.000945899217935093 0.000989564779423955 0.000686655985351339 0.000656137941557946 0.00088692612243052 0.000924886571814884 41347 43126 667 665 0 True 576 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 620 537 0.000986323043559475 0.000963475293865242 0.000732433051041428 0.000595101853971161 0.000943851710717679 0.000969815193769007 43114 41989 667 665 0 True 621 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 664 535 0.000993460696980418 0.00105071559649869 0.000686655985351339 0.000656137941557946 0.000957036718068671 0.00113277347168698 43426 45791 667 665 0 True 665 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 267 583 0.00103681279067493 0.00100812801057347 0.000930800335698482 0.000900282291905089 0.000712066458000981 0.000710898195710271 45321 43935 667 665 0 True 264 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 310 582 0.000989777484798457 0.000979262071406486 0.000854505226215 0.000885023270008392 0.000756777176350344 0.000778266223061036 43265 42677 667 665 0 True 308 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 355 582 0.00104902915903001 0.000981946741424401 0.000915541313801785 0.000823987182421607 0.000787822532385952 0.000777272067515482 45855 42794 667 665 0 True 353 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 399 582 0.00101096167411831 0.000949868376594955 0.000823987182421607 0.000793469138628214 0.000828150922913577 0.000744506004711079 44191 41396 667 665 0 True 398 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 443 581 0.00096092946888881 0.00105672742166701 0.000610360875867857 0.000686655985351339 0.000942769402709691 0.00112990282150847 42004 46053 667 665 0 True 442 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 487 579 0.00105982714753861 0.00103839364949338 0.000610360875867857 0.000701915007248035 0.00113489854270513 0.00106449238514024 46327 45254 667 665 0 True 487 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 531 579 0.000996000054447484 0.00104640176775195 0.000503547722590982 0.000610360875867857 0.00111145575146791 0.00108593575778446 43537 45603 667 665 0 True 532 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 575 579 0.000935215614897976 0.00093481586777656 0.00064087891966125 0.000564583810177768 0.000902102506613573 0.000949209349726812 40880 40740 667 665 0 True 576 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 619 578 0.000997875976179912 0.000960905353335272 0.000778210116731518 0.000686655985351339 0.000826581662102804 0.000848450956465967 43619 41877 667 665 0 True 621 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 663 578 0.000953197011016122 0.00098593932760489 0.000656137941557946 0.000717174029144732 0.00090033096392849 0.00089287190272013 41666 42968 667 665 0 True 665 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 264 622 0.00098549946816475 0.000989404158140832 0.000839246204318303 0.000823987182421607 0.000748574179843918 0.000746849179884666 43078 43119 667 665 0 False 264 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 309 622 0.000967952736838264 0.000928895826198593 0.000885023270008392 0.000823987182421607 0.000689057164256799 0.000700951776054238 42311 40482 667 665 0 False 309 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 354 624 0.000963194301224302 0.00102731078095789 0.000839246204318303 0.000915541313801785 0.000758366458140986 0.00075239171115368 42103 44771 667 665 0 True 353 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 399 624 0.000977583993537678 0.00101296959496475 0.000793469138628214 0.000930800335698482 0.000763575634954612 0.000712340677999041 42732 44146 667 665 0 True 398 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 442 622 0.00099300315509446 0.00105032551623967 0.00064087891966125 0.000747692072938125 0.00098418746669443 0.00101747271156751 43406 45774 667 665 0 False 442 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 487 622 0.000935284246180869 0.000949730701209421 0.000564583810177768 0.000610360875867857 0.000992659552378577 0.00100036151839532 40883 41390 667 665 0 False 487 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 532 622 0.000958161340478765 0.000963016375913462 0.000534065766384375 0.000579842832074464 0.00101768720634075 0.00105578970932153 41883 41969 667 665 0 False 532 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 576 622 0.000987169496048497 0.000970129604166057 0.000732433051041428 0.000701915007248035 0.000875268360950811 0.000890336753800357 43151 42279 667 665 0 False 576 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 621 622 0.000929359078757714 0.000959413869991986 0.000747692072938125 0.000839246204318303 0.000729172731262043 0.000745111977226484 40624 41812 667 665 0 False 621 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 665 622 0.0010328092991728 0.00101058322161549 0.000839246204318303 0.00080872816052491 0.000837598451499841 0.000828655190152096 45146 44042 667 665 0 False 665 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 265 672 0.0011502603012982 0.0755071473602753 0.00103761348897536 0.0734721904325933 0.000771887514921803 0.0184818524489671 50280 3290660 667 665 0 True 264 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 309 665 0.00101674957897568 0.00103660386948144 0.000930800335698482 0.000930800335698482 0.000738864024519815 0.000705876731700114 44444 45176 667 665 0 False 309 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 353 665 0.000953517290336292 0.000997228709218687 0.00080872816052491 0.000854505226215 0.000682238101769732 0.00071033896495202 41680 43460 667 665 0 False 353 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 398 665 0.00107131144887616 0.000982222092195469 0.000900282291905089 0.00080872816052491 0.000773586204042432 0.000760654654865999 46829 42806 667 665 0 False 398 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 442 665 0.00103688142195782 0.00102299695221115 0.000839246204318303 0.000839246204318303 0.000851434682248693 0.000871071146390225 45324 44583 667 665 0 False 442 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 487 665 0.000965138854239623 0.00104745727904105 0.000717174029144732 0.000839246204318303 0.000833492270927107 0.000916014306700397 42188 45649 667 665 0 False 487 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 532 665 0.000988427736234881 0.00101611318293445 0.000686655985351339 0.000625619897764553 0.000947368666152172 0.000960225778956853 43206 44283 667 665 0 False 532 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 576 665 0.00102018114312036 0.000990803857893762 0.000854505226215 0.000900282291905089 0.000788270328721332 0.000720169038945455 44594 43180 667 665 0 False 576 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 621 665 0.00103429631030216 0.000980042231924513 0.000900282291905089 0.000793469138628214 0.000748391243138876 0.000752137785447263 45211 42711 667 665 0 False 621 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 661 669 0.00109492061019159 0.077143648776324 0.000946059357595178 0.0740672922865644 0.000799526740055662 0.0243747879147425 47861 3361980 667 665 0 True 665 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F12_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F12_1.csv new file mode 100755 index 0000000..d05c922 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F12_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 236 246 0.00937526201422063 0.0356930320766439 0.0093842984664683 0.0361333638513771 0.00166647772881595 0.00666282890655887 409810 1555530 667 665 0 True 236 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 280 246 0.00928867221230309 0.00920493038501495 0.00935378042267491 0.00921644922560464 0.00139966374421314 0.00148800534734652 406025 401158 667 665 0 False 280 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 324 246 0.00919217662855457 0.0488767352117992 0.00917067215991455 0.0486305027847715 0.00131933407200028 0.00607477500272439 401807 2130086 667 665 0 True 325 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 369 246 0.00937219648358471 0.0668778377621784 0.00933852140077821 0.0662851911192493 0.00134679372926069 0.00907800928415999 409676 2914588 667 665 0 True 370 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 413 246 0.00914736040082499 0.0553880925706346 0.00920119020370794 0.0540169375143053 0.00148608607486368 0.00789695663546738 399848 2413856 667 665 0 True 414 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 456 245 0.00926341590019822 0.0517408421488604 0.00918593118181125 0.0544289311055161 0.0016829653622345 0.0121304524283105 404921 2254906 667 665 0 True 459 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 501 244 0.00959396703570851 0.0634226215573266 0.00961318379491875 0.0649881742580301 0.00161893382257696 0.015910205622049 419370 2764007 667 665 0 True 504 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 545 244 0.00950241290432833 0.0570030707347449 0.00947585259784848 0.0557106889448386 0.00162286076028724 0.0147623352014944 415368 2484238 667 665 0 True 548 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 593 245 0.00918574816505686 0.00945412283283168 0.00920119020370794 0.00935378042267491 0.00188370465798666 0.0019983612412207 401526 412018 667 665 0 False 593 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 632 245 0.0093016892789586 0.0398774230150795 0.00927748531319142 0.039658197909514 0.00191678746554104 0.0077242770747335 406594 1737889 667 665 0 True 638 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 236 290 0.00930029377620642 0.00947794067452908 0.00933852140077821 0.00946059357595178 0.00169348180268441 0.00173002108345467 406533 413056 667 665 0 False 236 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 281 290 0.00910659341878614 0.00897620567784763 0.00906385900663768 0.00898756389715419 0.00143196399708269 0.00146827301702938 398066 391190 667 665 0 False 281 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 323 289 0.00916040034457479 0.0830351227117921 0.00910963607232776 0.0855420767528801 0.00143327203572361 0.0187941747185905 400418 3618735 667 665 0 True 325 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 368 290 0.00926284397284077 0.0397379349036358 0.00926222629129473 0.0397344930189975 0.00137864695649985 0.00558475324345733 404896 1731810 667 665 0 True 370 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 412 290 0.00929073115078991 0.0631464217880476 0.00932326237888151 0.0624856946669718 0.0014934507608264 0.00956890049026922 406115 2751970 667 665 0 True 415 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 456 288 0.0093821022654157 0.0339450594901077 0.0093690394445716 0.0349889372091249 0.00181615069782776 0.00601081067156639 410109 1479352 667 665 0 True 459 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 500 288 0.00940786187359513 0.0358554201938814 0.00941481651026169 0.0373693446250095 0.00168842737886814 0.00775335518101317 411235 1562607 667 665 0 True 504 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 546 288 0.00944387042002002 0.0430953098011681 0.00943007553215839 0.0447547112230106 0.0015959143531055 0.0072525006029747 412809 1878127 667 665 0 True 548 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 593 289 0.00923729025851002 0.00953766884595329 0.00924696726939803 0.00935378042267491 0.00198539445789773 0.00231076470718235 403779 415659 667 665 0 False 593 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 638 289 0.00922418168347733 0.00929492419535908 0.00930800335698482 0.00927748531319142 0.00198576804913765 0.00192068877892413 403206 405080 667 665 0 False 638 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 236 335 0.00938191924866132 0.0402182843237643 0.00943007553215839 0.0399328603036545 0.00154252992066151 0.0063581169178236 410101 1752744 667 665 0 True 236 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 280 335 0.0093722879919619 0.0478271898560776 0.00927748531319142 0.0508278019378958 0.00142121142378634 0.0107304993221734 409680 2084346 667 665 0 True 281 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 324 334 0.00939779595210406 0.0315143317208104 0.0093842984664683 0.0323033493553063 0.00126346923111611 0.00454301559316571 410795 1373419 667 665 0 True 325 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 368 335 0.00933961950130451 0.0294992229945429 0.0093842984664683 0.0298161287861448 0.00136118908622774 0.00467582455007829 408252 1285599 667 665 0 True 370 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 413 335 0.00940987505789335 0.0579652381124475 0.009399557488365 0.0565194171053635 0.0016173684847563 0.00937853961218018 411323 2526170 667 665 0 True 415 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 457 333 0.00930836939049358 0.0294028961164642 0.00933852140077821 0.0292210269321736 0.00179213476701651 0.0055244903741058 406886 1281401 667 665 0 True 459 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 504 333 0.0095615273159941 0.0255471592691961 0.0093690394445716 0.0260929274433509 0.00225590122643363 0.00431976069930162 417952 1113365 667 665 0 False 504 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 545 333 0.00961549438144283 0.0449821509599129 0.00959792477302205 0.0442969405661097 0.00176331296507726 0.00776630481486479 420311 1960357 667 665 0 True 549 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 590 332 0.00939486768403393 0.0516172325985483 0.00935378042267491 0.0520637827115282 0.00201817017313969 0.0113846408884201 410667 2249519 667 665 0 True 593 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 634 332 0.00925723908473779 0.0585941392735673 0.00923170824750134 0.058304722667277 0.00199359208124689 0.0152935716497433 404651 2553578 667 665 0 True 638 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 237 378 0.00919553956141636 0.0352840902898124 0.00920119020370794 0.0370794232089723 0.0016228847874599 0.00699312241659771 401954 1537708 667 665 0 True 236 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 280 380 0.00918188193612052 0.027925317987117 0.00920119020370794 0.0273746852826734 0.00158605990900078 0.00479513753818229 401357 1217007 667 665 0 True 281 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 324 379 0.00945480567109441 0.0670796469314738 0.00941481651026169 0.065293354695964 0.00140021488602079 0.0123711276875326 413287 2923383 667 665 0 True 326 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 369 379 0.00930454891574584 0.0542913475035724 0.00929274433508812 0.0525978484779126 0.00139599647816347 0.0131741668846987 406719 2366059 667 665 0 True 370 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 412 377 0.00947514340792524 0.0361426798857983 0.00952162966353857 0.0371709773403525 0.00166877620748081 0.00558058427354685 414176 1575126 667 665 0 True 415 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 457 378 0.00951559011064392 0.0460295852930564 0.00956740672922866 0.0463111314564736 0.00178748952711171 0.00946101234155837 415944 2006005 667 665 0 True 459 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 502 377 0.00955772971834065 0.0377348268818074 0.00955214770733196 0.0381475547417411 0.00182549043202216 0.00466974248164898 417786 1644513 667 665 0 True 504 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 545 377 0.00950815505499711 0.0469517120794662 0.00947585259784848 0.0462653543907836 0.00175170972757623 0.00697338364488851 415619 2046192 667 665 0 True 549 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 591 377 0.00965653588861326 0.039425549453859 0.00959792477302205 0.0396887159533074 0.00199763148118742 0.00615416925271575 422105 1718196 667 665 0 True 593 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 633 378 0.00941813368893489 0.079376972988663 0.0093690394445716 0.0770885786221103 0.00191491799140584 0.0137228169000012 411684 3459310 667 665 0 True 638 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 237 422 0.00915250774704202 0.032912884178861 0.00914015411612116 0.0333867399099718 0.00163375002386905 0.00455269913349975 400073 1434369 667 665 0 True 236 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 281 423 0.00932637366370603 0.0381562512369273 0.00932326237888151 0.0379644464789807 0.00166925210864153 0.00559126560013223 407673 1662879 667 665 0 True 281 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 325 422 0.00955628846139988 0.0289364519102747 0.00950637064164187 0.0295109483482109 0.00140753815440268 0.00300029121137364 417723 1261073 667 665 0 True 326 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 368 422 0.00945421086664267 0.0427792300618794 0.00952162966353857 0.0431677729457542 0.00143577817335206 0.00726812888712756 413261 1864352 667 665 0 True 370 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 414 423 0.00987011644097841 0.0850444949636623 0.00990310521095598 0.0824597543297475 0.00154034619921637 0.0188368717696179 431441 3706305 667 665 0 True 415 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 458 422 0.00977467320356759 0.0537597598941276 0.00971999694819562 0.0522774090180819 0.00181790376187452 0.0120305433456792 427269 2342892 667 665 0 True 460 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 501 421 0.00970446340116735 0.0451769386845461 0.00967421988250553 0.0449683375295644 0.00172183070990932 0.00744579517941028 424200 1968846 667 665 0 True 504 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 545 420 0.0096071442420241 0.0297235879811683 0.00959792477302205 0.0301213092240787 0.0017198629901482 0.0036563994900059 419946 1295377 667 665 0 True 549 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 590 419 0.00958337494104859 0.0360949753647107 0.00956740672922866 0.0365300984206912 0.00184979725838795 0.00518677712042415 418907 1573047 667 665 0 True 593 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 632 423 0.00967547812269192 0.0636689457679447 0.00978103303578241 0.0633707179369802 0.00186157239966612 0.0120766955301746 422933 2774742 667 665 0 True 638 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 239 466 0.00939775019791546 0.0393916124713248 0.00943007553215839 0.0400396734569314 0.00164620485055821 0.00821249224066958 410793 1716717 667 665 0 True 236 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 282 468 0.00943220310192809 0.0418164431449418 0.00946059357595178 0.0413214312962539 0.00171983259750278 0.00465198150842418 412299 1822393 667 665 0 True 281 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 326 468 0.0093853736899003 0.0528234295971102 0.009399557488365 0.050919356069276 0.00153671263567488 0.0111031882965675 410252 2302086 667 665 0 True 326 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 370 467 0.00969451186514777 0.0704922755504004 0.00967421988250553 0.0677347981994354 0.00161087737014241 0.0118785011262103 423765 3072108 667 665 0 True 370 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 415 466 0.00996114439918974 0.0807663929794732 0.00996414129854276 0.077256427862974 0.00188147577300134 0.0213142451497565 435420 3519862 667 665 0 True 415 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 459 465 0.00977076122044265 0.037021874897819 0.00976577401388571 0.0375371938658732 0.00201777340723107 0.00462611402578511 427098 1613442 667 665 0 True 460 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 502 465 0.00959586583453524 0.0362953618883556 0.00946059357595178 0.0366979476615549 0.00186028701168688 0.00447582814122224 419453 1581780 667 665 0 True 504 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 547 465 0.00972841571889725 0.0923259854832779 0.00971999694819562 0.0901350423437858 0.00191562238954351 0.0159371313146986 425247 4023638 667 665 0 True 549 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 591 464 0.00948388245794704 0.0586437024123596 0.00947585259784848 0.0592660410467689 0.00186699356919423 0.0148410189342055 414558 2555738 667 665 0 True 594 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 636 466 0.00953599647875765 0.066798972712165 0.00967421988250553 0.0655222400244144 0.00201499201164082 0.0103259346549102 416836 2911151 667 665 0 True 638 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 238 511 0.00927030190558188 0.0371906419745863 0.0093690394445716 0.0387426565957122 0.00145585222028623 0.00591516845377453 405222 1620797 667 665 0 True 237 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 283 511 0.00940541402450526 0.0933350772215501 0.009399557488365 0.09057755397879 0.00153473733841693 0.0211210227994162 411128 4067615 667 665 0 True 281 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 326 512 0.00945610966546939 0.0443139664221208 0.00949111161974517 0.0462043183031968 0.00154249423430672 0.00764949566415956 413344 1931237 667 665 0 True 326 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 370 509 0.00971521563548736 0.048992657886419 0.00956740672922866 0.0481727321278706 0.00165924889281974 0.00627155739995637 424670 2135138 667 665 0 True 371 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 416 509 0.00992767521023192 0.046284812511939 0.00991836423285267 0.046494239719234 0.00187796041444643 0.00450143120231139 433957 2017128 667 665 0 True 415 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 459 510 0.00963734200649732 0.0534906733531012 0.00967421988250553 0.0534370946822309 0.00198475957443925 0.00775693214757346 421266 2331165 667 665 0 True 460 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 503 510 0.00957793019260569 0.0625011372560493 0.00949111161974517 0.0609597924773022 0.00186681822165791 0.0120831342784359 418669 2723848 667 665 0 True 504 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 547 509 0.00944698170484453 0.0499286669408701 0.00962844281681544 0.0507820248722057 0.00186780598213394 0.00910251285709906 412945 2175930 667 665 0 True 549 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 591 507 0.00920391257792939 0.0431483148245987 0.00920119020370794 0.043076218814374 0.0017951205009685 0.00467908091509164 402320 1880437 667 665 0 True 594 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 635 507 0.0092364666831153 0.0546720199445742 0.00924696726939803 0.0552681773098344 0.00181842551404443 0.00875830932421209 403743 2382649 667 665 0 True 638 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 239 552 0.00911553836265662 0.0329979905130186 0.00907911802853437 0.033524071107042 0.00139175796141926 0.00518037026636304 398457 1438078 667 665 0 True 237 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 282 552 0.00923255469999036 0.042181237024812 0.00926222629129473 0.0424963759822995 0.00147860147379212 0.0068735416155136 403572 1838291 667 665 0 True 281 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 327 553 0.00964244359852575 0.0348705822693607 0.00965896086060884 0.035385671778439 0.00146392622695555 0.00424106788369335 421489 1519687 667 665 0 True 326 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 371 551 0.00967735404442434 0.0412812071377804 0.00971999694819562 0.0408484016174563 0.00143550055951954 0.00433479061695299 423015 1799067 667 665 0 True 371 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 415 553 0.00962835130843825 0.0762457758036657 0.00964370183871214 0.0724193179217212 0.00190583308859355 0.0145856796211373 420873 3322850 667 665 0 True 415 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 459 550 0.00968584144640886 0.0528112223795928 0.00962844281681544 0.0520180056458381 0.00207610058951666 0.00743443592555644 423386 2301554 667 665 0 True 460 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 503 551 0.00945977000055706 0.0471937683531328 0.00946059357595178 0.0469825284199283 0.00207146601197556 0.00489098391477822 413504 2056741 667 665 0 True 505 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 546 549 0.00924660123588926 0.0339725257295218 0.00927748531319142 0.0349584191653315 0.00187899893470705 0.00599900772860271 404186 1480549 667 665 0 True 549 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 592 548 0.00923854849869641 0.0421841052620106 0.00926222629129473 0.0424048218509194 0.00164824536892813 0.00452610122224003 403834 1838416 667 665 0 True 594 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 634 550 0.00924017277239156 0.0476232237724088 0.00926222629129473 0.0467994201571679 0.0019206111374018 0.00562574035701107 403905 2075457 667 665 0 True 638 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 237 594 0.00913475512186685 0.00928962369301601 0.00915541313801785 0.00926222629129473 0.00132770942969713 0.00125262308636316 399297 404849 667 665 0 False 237 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 282 594 0.00917648294186621 0.00913462415480221 0.00917067215991455 0.00917067215991455 0.00133374508881239 0.00147777244224626 401121 398094 667 665 0 False 282 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 325 595 0.00944000419108368 0.0579792121640792 0.00949111161974517 0.057251850156405 0.00143656100082992 0.00731706490194129 412640 2526779 667 665 0 True 326 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 370 595 0.00951430899336324 0.0602377539178686 0.00953688868543526 0.0590066376745251 0.00139310500483191 0.0127087568802228 415888 2625208 667 665 0 True 371 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 415 594 0.00946176030776097 0.00938090247362513 0.00952162966353857 0.00932326237888151 0.00167435936688456 0.00158878953390438 413591 408827 667 665 0 False 415 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 460 593 0.00945524033588607 0.00942617472956826 0.0093842984664683 0.00946059357595178 0.00201058051805865 0.00191070286962454 413306 410800 667 665 0 False 460 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 505 593 0.00925749073277506 0.00925375925508438 0.00920119020370794 0.00929274433508812 0.00204419983482577 0.00206263774431766 404662 403286 667 665 0 False 505 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 549 593 0.00913560157435588 0.00918813398797979 0.00915541313801785 0.00923170824750134 0.00193158951201463 0.0017949280019591 399334 400426 667 665 0 False 549 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 594 593 0.00904770777806336 0.00914784099181348 0.00900282291905089 0.00912489509422446 0.00167395815021928 0.00155278561573585 395492 398670 667 665 0 False 594 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 639 593 0.0089450582559487 0.0089219386300496 0.00900282291905089 0.0089417868314641 0.0014537420982288 0.00158438126318173 391005 388825 667 665 0 False 639 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 237 642 0.00914248757973954 0.0335486002715647 0.00912489509422446 0.0342107270923934 0.00136086333249612 0.00691685739271688 399635 1462074 667 665 0 True 237 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 282 637 0.00909334758118766 0.00901034917346009 0.00906385900663768 0.00900282291905089 0.00125421251336214 0.00144408292332832 397487 392678 667 665 0 False 282 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 326 637 0.00920654344377365 0.00924935364274729 0.00921644922560464 0.00918593118181125 0.00144555468757007 0.00138813882829363 402435 403094 667 665 0 False 326 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 371 637 0.00912164654683416 0.00908306472291968 0.00910963607232776 0.00912489509422446 0.00130539976346533 0.00125044196314293 398724 395847 667 665 0 False 371 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 416 637 0.00916408355675676 0.00899456239591884 0.00907911802853437 0.00906385900663768 0.00147729327855817 0.0015894124219384 400579 391990 667 665 0 False 416 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 460 637 0.00931177807754397 0.00922252988846573 0.00927748531319142 0.00924696726939803 0.00167772836678659 0.00176498779140646 407035 401925 667 665 0 False 460 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 505 637 0.00898102104818499 0.00895610507155965 0.00901808194094758 0.00906385900663768 0.00185224832833242 0.00185079285819971 392577 390314 667 665 0 False 505 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 549 637 0.00902261160561857 0.00899559496131035 0.00907911802853437 0.00901808194094758 0.00181203437953079 0.00178730003387176 394395 392035 667 665 0 False 549 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 594 637 0.0090298407674167 0.0089814832342931 0.00910963607232776 0.00900282291905089 0.00144274975540836 0.00137314692859921 394711 391420 667 665 0 False 594 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 634 642 0.00905020138134183 0.0379354199185306 0.00907911802853437 0.038101777676051 0.00140326029078077 0.00756628322517789 395601 1653255 667 665 0 True 639 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F12_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F12_2.csv new file mode 100755 index 0000000..8be087c --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F12_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 236 246 0.00760002237379822 0.677966809906432 0.0076752880140383 0.676600289921416 0.00197127696226297 0.174653174435407 332211 29546319 667 665 1 True 236 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 280 246 0.00625141766493727 0.00620470838345578 0.00611886778057527 0.00617990386816205 0.00157149895033114 0.00126995902693331 273261 270406 667 665 0 False 280 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 324 246 0.00596165638856013 0.00585046961647653 0.0059662775616083 0.00587472343022812 0.00130426557680537 0.00117968610102219 260595 254968 667 665 0 True 325 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 369 246 0.00592647141752996 0.00599564831052224 0.00592050049591821 0.005981536583505 0.00122591479728276 0.00115618357854544 259057 261295 667 665 0 True 370 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 413 246 0.00591709180886782 0.00594727835840459 0.00590524147402152 0.005981536583505 0.00140749398729136 0.00134903466503844 258647 259187 667 665 0 True 414 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 456 245 0.00602331015769295 0.00597458397653552 0.00605783169298848 0.00605783169298848 0.00148274519045753 0.00148498050080657 263290 260377 667 665 0 True 459 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 501 244 0.00644301332968215 0.00644481425582725 0.00646982528419928 0.00645456626230259 0.00157436819582549 0.00154220982124959 281636 280870 667 665 0 True 504 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 545 244 0.00674457918671701 0.00675157796069482 0.00679026474402991 0.0068055237659266 0.00140009732598095 0.00137063353816094 294818 294239 667 665 0 True 548 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 593 245 0.00841810726589097 0.00736150286450849 0.00753795681696803 0.00732433051041428 0.00558762940052969 0.00201230510063872 367971 320820 667 665 0 False 593 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 632 245 0.00870690770430761 0.732244183358373 0.00865186541542687 0.712062256809339 0.0018999544152461 0.166160919490601 380595 31911769 667 665 10 True 638 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 236 290 0.00644070274315806 0.00612563682036403 0.0063782711528191 0.00616464484626535 0.00158139447315485 0.00158718869159999 281535 266960 667 665 0 False 236 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 281 290 0.00589007396050201 0.00564113419277193 0.00590524147402152 0.00560006103608759 0.00129754790157975 0.00136358130075265 257466 245845 667 665 0 False 281 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 323 289 0.00584061368262996 0.00574705245604283 0.00582894636453803 0.00572213321126116 0.00125399429672939 0.00125455758112214 255304 250461 667 665 0 True 325 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 368 290 0.00574738952336603 0.00578819445041994 0.00579842832074464 0.00581368734264134 0.00124852489474888 0.00122529474741366 251229 252254 667 665 0 True 370 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 412 290 0.0059478386236042 0.0061869023669267 0.00593575951781491 0.00616464484626535 0.00140870258944942 0.001515546109988 259991 269630 667 665 0 True 415 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 456 288 0.00614739551716474 0.00617985797636687 0.00613412680247196 0.00619516289005875 0.00159504068308956 0.00179946323222265 268714 269323 667 665 0 True 459 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 500 288 0.0064141424366782 0.00678675402169879 0.00645456626230259 0.0068207827878233 0.00160761946317172 0.00165987070788946 280374 295772 667 665 0 True 504 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 546 288 0.00651624290852971 0.00673989849882202 0.00646982528419928 0.00675974670023652 0.0015713653663387 0.00147755186430304 284837 293730 667 665 0 True 548 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 593 289 0.00714826839269768 0.00695942190105614 0.0072480354009308 0.00698863202868696 0.00189677877614092 0.00208204573275158 312464 303297 667 665 0 False 593 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 638 289 0.00750187963926025 0.00742022141643879 0.00758373388265812 0.00743114366369116 0.00193236184259006 0.00194140966678566 327921 323379 667 665 0 False 638 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 236 335 0.00581178854381461 0.00566242798573454 0.00584420538643473 0.00560006103608759 0.00142561364785056 0.00143478090655844 254044 246773 667 665 0 True 236 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 280 335 0.00588771761978933 0.00584402181925402 0.0059510185397116 0.00590524147402152 0.00126932901166226 0.00131545562777882 257363 254687 667 665 0 True 281 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 324 334 0.00574807583619497 0.00591618666717148 0.00578316929884794 0.00585946440833143 0.00126803052283897 0.00127585299505024 251259 257832 667 665 0 True 325 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 368 335 0.00622327883895086 0.00620709475680504 0.00624093995574884 0.00619516289005875 0.00125023593523278 0.00129206193263427 272031 270510 667 665 0 True 370 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 413 335 0.00638730760506677 0.00651574002527491 0.00628671702143893 0.00645456626230259 0.00151800690518348 0.00144696407446853 279201 283961 667 665 0 True 415 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 457 333 0.00650368338376017 0.00652806197228021 0.00653086137178607 0.00654612039368277 0.00157640050882466 0.00150653683241434 284288 284498 667 665 0 True 459 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 504 333 0.00662005916245356 0.00653127439794267 0.00657663843747616 0.00665293354695964 0.00185104456898282 0.00165466729800705 289375 284638 667 665 0 False 504 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 545 333 0.00668283390920699 0.00673216573133452 0.00669871061264973 0.00669871061264973 0.00159206304026524 0.00146260937508483 292119 293393 667 665 0 True 549 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 590 332 0.0069696897946083 0.0074082895496925 0.00695811398489357 0.00735484855420768 0.00201711444897274 0.00248282509714602 304658 322859 667 665 0 True 593 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 634 332 0.00684969943501584 0.00701710788759493 0.00694285496299687 0.00698863202868696 0.00185673919045035 0.00185807599408684 299413 305811 667 665 0 True 638 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 237 378 0.00577541396388096 0.00588456722029381 0.00578316929884794 0.00590524147402152 0.00140741920695359 0.00136719092789538 252454 256454 667 665 0 True 236 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 280 380 0.00585180058174163 0.00585276420623543 0.00584420538643473 0.00587472343022812 0.00134256497352959 0.00147594576486718 255793 255068 667 665 0 True 281 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 324 379 0.00615160490251555 0.0062742344531505 0.00607309071488518 0.00630197604333562 0.00126296003682401 0.0012654453538283 268898 273436 667 665 0 True 326 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 369 379 0.00670964586372412 0.0539722847975971 0.00657663843747616 0.00733958953231098 0.0014613955684325 0.18491172887483 293291 2352154 667 665 1 True 370 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 412 377 0.00697502015757971 0.00666316741728434 0.00700389105058366 0.00679026474402991 0.00159774546603848 0.00147098476343942 304891 290386 667 665 0 True 415 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 457 378 0.00658084782282697 0.00687619713050078 0.00660715648126955 0.00691233691920348 0.00163055686717358 0.00169991614522426 287661 299670 667 665 0 True 459 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 502 377 0.00656126503010797 0.00681192567135394 0.00651560234988937 0.00686655985351339 0.00159899631546489 0.00176533635864402 286805 296869 667 665 0 True 504 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 545 377 0.00669607974680547 0.00701995317889597 0.00669871061264973 0.00700389105058366 0.00162363161828948 0.00185604654664723 292698 305935 667 665 0 True 549 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 591 377 0.0067152965060157 0.00679515222021637 0.00677500572213321 0.00674448767833982 0.00198610274966791 0.00198891407070901 293538 296138 667 665 0 True 593 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 633 378 0.00625635911730562 0.00653740095259894 0.00611886778057527 0.00666819256885634 0.00197981156400892 0.0018566738420559 273477 284905 667 665 0 True 638 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 237 422 0.00595881962886719 0.00594677354865764 0.00599679560540169 0.00593575951781491 0.00152474218497929 0.00149912474530408 260471 259165 667 665 0 True 236 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 281 423 0.0060271763866293 0.00586859687557185 0.00604257267109178 0.005981536583505 0.00147335132285064 0.00144178227895805 263459 255758 667 665 0 True 281 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 325 422 0.00622160881106711 0.0064158794789675 0.00625619897764553 0.0064087891966125 0.00132091738335538 0.00144394122291072 271958 279609 667 665 0 True 326 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 368 422 0.00645019673729169 0.00649983851824572 0.00643930724040589 0.00657663843747616 0.00134531691568021 0.00130946590725678 281950 283268 667 665 0 True 370 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 414 423 0.00667656558536937 0.00665499867774265 0.00677500572213321 0.00665293354695964 0.00156994921312495 0.00146382645364125 291845 290030 667 665 0 True 415 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 458 422 0.00680611857037835 0.00691300235023356 0.00683604180972 0.00698863202868696 0.0015897563653357 0.00152127268540374 297508 301274 667 665 0 True 460 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 501 421 0.00672879399165146 0.00662945989372607 0.00665293354695964 0.00660715648126955 0.00156956641918588 0.00168785339621641 294128 288917 667 665 0 True 504 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 545 420 0.00650718357918775 0.00661787221544362 0.00650034332799268 0.00666819256885634 0.00163573040757143 0.00146901308660414 284441 288412 667 665 0 True 549 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 590 419 0.00624485193887378 0.00641193278458219 0.00625619897764553 0.00643930724040589 0.0019030406311926 0.0019579298489583 272974 279437 667 665 0 True 593 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 632 423 0.00601374753227643 0.00588078114719162 0.005981536583505 0.00587472343022812 0.00181740209180864 0.00177907617862208 262872 256289 667 665 0 True 638 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 239 466 0.00598320661138874 0.00602504200533377 0.00602731364919509 0.00601205462729839 0.00156728069944467 0.00141277414871799 261537 262576 667 665 0 True 236 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 282 468 0.00607908451359122 0.00618229024151131 0.00604257267109178 0.00619516289005875 0.00154744076151236 0.00147162501483741 265728 269429 667 665 0 True 281 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 326 468 0.00628829554094548 0.00621345077043719 0.00625619897764553 0.00621042191195544 0.0015467939568114 0.00149993150058592 274873 270787 667 665 0 True 326 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 370 467 0.00643063682166699 0.00647404732935566 0.00646982528419928 0.00657663843747616 0.0014622586101163 0.00147370528501621 281095 282144 667 665 0 True 370 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 415 466 0.00666162684279284 0.00649187629178233 0.00662241550316625 0.00651560234988937 0.00172941668012661 0.00171927681805991 291192 282921 667 665 0 True 415 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 459 465 0.00659562642574341 0.00668570028871676 0.00665293354695964 0.00668345159075303 0.00194601044252416 0.00207774861375382 288307 291368 667 665 0 True 460 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 502 465 0.0065175011487161 0.00671071131708879 0.00651560234988937 0.00671396963454643 0.00186782228332696 0.00184001297055075 284892 292458 667 665 0 True 504 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 547 465 0.00605517795004992 0.0060726317969334 0.00611886778057527 0.00611886778057527 0.00185065742932859 0.00175284645856495 264683 264650 667 665 0 True 549 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 591 464 0.00586447449198267 0.00590553977069017 0.00578316929884794 0.005981536583505 0.00184187484369441 0.00192871934107692 256347 257368 667 665 0 True 594 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 636 466 0.00571794670300464 0.00573282599953764 0.00566109712367437 0.00563057907988098 0.00189336720737044 0.00180120534576334 249942 249841 667 665 0 True 638 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 238 511 0.00598645515877905 0.00608763841395661 0.00601205462729839 0.00616464484626535 0.00150538298821328 0.0015413016698282 261679 265304 667 665 0 True 237 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 283 511 0.00624652196675752 0.00633224168225554 0.00628671702143893 0.0063935301747158 0.0015176303736964 0.00154302844649854 273047 275964 667 665 0 True 281 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 326 512 0.00623380230232789 0.0063235451870693 0.00628671702143893 0.00630197604333562 0.00147019725622097 0.00148632789601558 272491 275585 667 665 0 True 326 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 370 509 0.00649565352366161 0.00630759778824493 0.00653086137178607 0.00636301213092241 0.00151809163354791 0.0014436576490552 283937 274890 667 665 0 True 371 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 416 509 0.00637369573395952 0.00664607272358052 0.00645456626230259 0.00660715648126955 0.00182374152518742 0.00169752127332096 278606 289641 667 665 0 True 415 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 459 510 0.00641290707358612 0.00636477896503676 0.0063782711528191 0.00645456626230259 0.00184117141183408 0.00171139885320304 280320 277382 667 665 0 True 460 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 503 510 0.00623242967667002 0.00604268740057973 0.00621042191195544 0.00604257267109178 0.00173358157717481 0.00166113682727586 272431 263345 667 665 0 True 504 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 547 509 0.00588085449149996 0.00600716715111193 0.00585946440833143 0.00599679560540169 0.00168001515746636 0.00155719129187437 257063 261797 667 665 0 True 549 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 591 507 0.00577516231584368 0.00592242795131569 0.00575265125505455 0.00590524147402152 0.00178769562949562 0.00167894181578952 252443 258104 667 665 0 True 594 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 635 507 0.00580487966133665 0.00582417361783952 0.00584420538643473 0.00592050049591821 0.00186893621411671 0.00188470756698775 253742 253822 667 665 0 True 638 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 239 552 0.0061946138397956 0.00631546823111796 0.00624093995574884 0.00630197604333562 0.00130821385143329 0.00128073088366959 270778 275233 667 665 0 True 237 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 282 552 0.00634601444985907 0.00620849445655797 0.00642404821850919 0.00627145799954223 0.00143548310893463 0.00137476487440983 277396 270571 667 665 0 True 281 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 327 553 0.0062173994257163 0.00632925871556896 0.00625619897764553 0.00630197604333562 0.00137684112511842 0.00144683402511701 271774 275834 667 665 0 True 326 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 371 551 0.00630096945118651 0.00644380463633334 0.00625619897764553 0.0064087891966125 0.00141380098271515 0.00131069943774955 275427 280826 667 665 0 True 371 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 415 553 0.00644543830167773 0.0062917880648061 0.00646982528419928 0.00625619897764553 0.00173540797833033 0.00160807819916928 281742 274201 667 665 0 True 415 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 459 550 0.00613941141125478 0.0064672782895669 0.00614938582436866 0.00636301213092241 0.00194846929754939 0.0018259601020788 268365 281849 667 665 0 True 460 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 503 551 0.00612081233359059 0.00591804528487619 0.00619516289005875 0.00593575951781491 0.00191400015573306 0.0020080070202259 267552 257913 667 665 0 True 505 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 546 549 0.00601772814668427 0.00614621929050137 0.005981536583505 0.00616464484626535 0.00177927349365887 0.00185367511701946 263046 267857 667 665 0 True 549 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 592 548 0.00615059831036645 0.00597669499911371 0.00611886778057527 0.00593575951781491 0.00162987716284694 0.00143691205182495 268854 260469 667 665 0 True 594 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 634 550 0.00599858001875693 0.00599867716900399 0.00604257267109178 0.0059510185397116 0.00170461739605304 0.00174033542987559 262209 261427 667 665 0 True 638 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 237 594 0.00661891530773867 0.00658253553315654 0.00662241550316625 0.00657663843747616 0.00128222699317514 0.00119822534367907 289325 286872 667 665 0 False 237 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 282 594 0.00657910916366033 0.00652558381534059 0.00657663843747616 0.00646982528419928 0.00131234591079211 0.00141723308500747 287585 284390 667 665 0 False 282 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 325 595 0.0062652583069875 0.00631569769009385 0.00628671702143893 0.00627145799954223 0.00140661315032642 0.00147432610474888 273866 275243 667 665 0 True 326 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 370 595 0.00607320510035666 0.00624766310374242 0.00610360875867857 0.00622568093385214 0.00137632754186806 0.00132716572853255 265471 272278 667 665 0 True 371 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 415 594 0.00616819079588153 0.00616659524756042 0.00614938582436866 0.00616464484626535 0.0015919715029749 0.00151735547499872 269623 268745 667 665 0 False 415 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 460 593 0.0062075851522625 0.00640332807298631 0.00625619897764553 0.0064087891966125 0.00191626591288191 0.00181074525088977 271345 279062 667 665 0 False 460 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 505 593 0.00634274302537447 0.00608405885393273 0.00634775310902571 0.00610360875867857 0.0019696888624395 0.00214908546567868 277253 265148 667 665 0 False 505 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 549 593 0.00609164403836077 0.00599723157745588 0.00607309071488518 0.00593575951781491 0.00182784025660025 0.00174123857999049 266277 261364 667 665 0 False 549 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 594 593 0.00597140203073103 0.00611895956416562 0.00593575951781491 0.00607309071488518 0.00167917658273637 0.00161976009109209 261021 266669 667 665 0 False 594 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 639 593 0.00615890269559658 0.00603929140773655 0.00613412680247196 0.00604257267109178 0.00149672168796978 0.0013727678219925 269217 263197 667 665 0 False 639 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 237 642 0.00839760938940006 0.679181496887102 0.00814831769283589 0.68374151216907 0.00212352956202762 0.189550779398577 367075 29599256 667 665 2 True 237 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 282 637 0.00686013139001568 0.00652957640152108 0.00679026474402991 0.00654612039368277 0.00167929214875099 0.00136436031991099 299869 284564 667 665 0 False 282 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 326 637 0.00634546539959592 0.00618593863922796 0.0063935301747158 0.00614938582436866 0.00137087174086319 0.00131638862537053 277372 269588 667 665 0 False 326 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 371 637 0.00604586697267068 0.00594633757660345 0.00611886778057527 0.00601205462729839 0.00137010274752882 0.00118235821485703 264276 259146 667 665 0 False 371 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 416 637 0.00593081806544656 0.00600769490675648 0.00587472343022812 0.00601205462729839 0.00145735603832513 0.00141873502268646 259247 261820 667 665 0 False 416 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 460 637 0.00597460482393273 0.00613378261400813 0.00601205462729839 0.00613412680247196 0.00168704447383533 0.00173096800210167 261161 267315 667 665 0 False 460 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 505 637 0.00596728415375741 0.0058912674223898 0.005981536583505 0.00592050049591821 0.00179221457682225 0.00177886283756102 260841 256746 667 665 0 False 505 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 549 637 0.00605183789428243 0.00596276683927718 0.00602731364919509 0.00602731364919509 0.00172062189085026 0.00176029037462064 264537 259862 667 665 0 False 549 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 594 637 0.00668411502648767 0.00655835055709771 0.00656137941557946 0.00654612039368277 0.00204715683220471 0.00129545597869804 292175 285818 667 665 0 False 594 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 634 642 0.00778830085986991 0.745135670487732 0.0076600289921416 0.733730067902647 0.00174588363226648 0.186243446569126 340441 32473590 667 665 12 True 639 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F12_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F12_3.csv new file mode 100755 index 0000000..dee5950 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F12_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 236 246 0.00101784767950197 0.067530533819098 0.000732433051041428 0.0670176241702907 0.000932841250662407 0.0180888610034198 44492 2943033 667 665 0 True 236 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 280 246 0.000944984134163177 0.000807190785386446 0.000793469138628214 0.000625619897764553 0.000716490965733823 0.000695298411255592 41307 35178 667 665 0 False 280 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 324 246 0.000961181116926087 0.000932636007505603 0.000839246204318303 0.000854505226215 0.000684031528889057 0.000643549387315116 42015 40645 667 665 0 True 325 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 369 246 0.000883536258879029 0.000908909949398559 0.000762951094834821 0.000823987182421607 0.000631876373788437 0.000594916023349066 38621 39611 667 665 0 True 370 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 413 246 0.00101345527739678 0.000904527282959057 0.000869764248111696 0.000732433051041428 0.000740529716210818 0.000722030060862488 44300 39420 667 665 0 True 414 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 456 245 0.000913848408823741 0.00104032110489086 0.000717174029144732 0.000854505226215 0.000804769538120054 0.000858657168989036 39946 45338 667 665 0 True 459 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 501 244 0.000983074496169173 0.00103407982074665 0.000732433051041428 0.000885023270008392 0.000878049256559368 0.000813359352705125 42972 45066 667 665 0 True 504 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 545 244 0.000966831759217667 0.000990528507122693 0.000823987182421607 0.000869764248111696 0.000799765695461372 0.000792978322847062 42262 43168 667 665 0 True 548 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 593 245 0.00112969379352439 0.00102031228219324 0.00080872816052491 0.000564583810177768 0.0011503446231407 0.00109583910715908 49381 44466 667 665 0 False 593 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 632 245 0.00100396128326315 0.0745225618406281 0.000717174029144732 0.0713817044327459 0.00097726934216572 0.0198108337028361 43885 3247751 667 665 0 True 638 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 236 290 0.00100268016598247 0.000948904648896216 0.00080872816052491 0.000747692072938125 0.000806390921258772 0.000803907684588966 43829 41354 667 665 0 False 236 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 281 290 0.000933728603768612 0.000854826468781246 0.000747692072938125 0.000686655985351339 0.000726600820687003 0.000715336174621873 40815 37254 667 665 0 False 281 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 323 289 0.000905841425819478 0.000893513252116329 0.000762951094834821 0.00080872816052491 0.000695543783043874 0.000651383491423711 39596 38940 667 665 0 True 325 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 368 290 0.000869421091697228 0.000907946221699821 0.000747692072938125 0.000793469138628214 0.00067905421235664 0.000689850081909389 38004 39569 667 665 0 True 370 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 412 290 0.000926202039744605 0.000891471067230906 0.000747692072938125 0.000671396963454643 0.000766667447742329 0.000775285376511733 40486 38851 667 665 0 True 415 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 456 288 0.000866858857135863 0.000854206929546342 0.000610360875867857 0.000564583810177768 0.0008660010161846 0.00089998156210918 37892 37227 667 665 0 True 459 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 500 288 0.000996503350522038 0.000945692223233754 0.000778210116731518 0.000747692072938125 0.00089600469991632 0.000848256586788779 43559 41214 667 665 0 True 504 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 546 288 0.00100659214910741 0.000973961569063423 0.000793469138628214 0.000778210116731518 0.000916771517915909 0.000824308884237819 44000 42446 667 665 0 True 548 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 593 289 0.000894174107727551 0.000895142410845149 0.000518806744487678 0.000457770656900893 0.000961879815517497 0.000978842572515606 39086 39011 667 665 0 False 593 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 638 289 0.000957680921498509 0.000945898736312055 0.000595101853971161 0.000488288700694286 0.000975979035220601 0.00106469015650059 41862 41223 667 665 0 False 638 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 236 335 0.000910027934075992 0.000850306126956209 0.000747692072938125 0.000656137941557946 0.000776406325448961 0.000755792034698005 39779 37057 667 665 0 True 236 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 280 335 0.00094788952513901 0.000892457740827234 0.000793469138628214 0.000747692072938125 0.000720733391625202 0.000714301783589497 41434 38894 667 665 0 True 281 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 324 334 0.000865898019175352 0.000916344420217401 0.000732433051041428 0.000793469138628214 0.000684731403832157 0.000662133621227504 37850 39935 667 665 0 True 325 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 368 335 0.000865943773363947 0.000963544131558009 0.000717174029144732 0.000885023270008392 0.000660286908881245 0.000655803767159732 37852 41992 667 665 0 True 370 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 413 335 0.000940889134283854 0.000854413442624644 0.000762951094834821 0.000656137941557946 0.000782264595622018 0.000713982078244883 41128 37236 667 665 0 True 415 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 457 333 0.00101066427189244 0.000991354559435898 0.000762951094834821 0.000793469138628214 0.000924938942173252 0.000830983669180569 44178 43204 667 665 0 True 459 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 504 333 0.00103594346109161 0.000939680398065431 0.000885023270008392 0.000717174029144732 0.000876311753412752 0.000865144439340601 45283 40952 667 665 0 False 504 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 545 333 0.000999683266629446 0.000906753035025192 0.000762951094834821 0.000701915007248035 0.00085229198629731 0.000773194767631685 43698 39517 667 665 0 True 549 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 590 332 0.000942856564393473 0.000962442728473736 0.000518806744487678 0.000488288700694286 0.00102217205116719 0.00114385811424484 41214 41944 667 665 0 True 593 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 634 332 0.000903805364426965 0.000947527895040875 0.000549324788281071 0.000625619897764553 0.000983608679613958 0.000991342935584893 39507 41294 667 665 0 True 638 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 237 378 0.000898246230512576 0.000838879069956879 0.000732433051041428 0.000717174029144732 0.000779040902277428 0.000733485324228399 39264 36559 667 665 0 True 236 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 280 380 0.000808179110261761 0.00088903880208647 0.000701915007248035 0.000762951094834821 0.000655195616136579 0.000692619465253699 35327 38745 667 665 0 True 281 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 324 379 0.000899687487453344 0.000970611468015426 0.000778210116731518 0.000854505226215 0.000707954682120326 0.000723368870136937 39327 42300 667 665 0 True 326 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 369 379 0.000977812764480657 0.00824709978195661 0.000854505226215 0.00100709544518196 0.000733191802995707 0.0336473133714728 42742 359415 667 665 0 True 370 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 412 377 0.000972573909886439 0.000899616860875007 0.000778210116731518 0.000671396963454643 0.000798129656738137 0.000794286327661188 42513 39206 667 665 0 True 415 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 457 378 0.000953791815467867 0.000960148138714835 0.000671396963454643 0.000671396963454643 0.000912305104400852 0.000881251132522832 41692 41844 667 665 0 True 459 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 502 377 0.00102809661774743 0.00098990896788779 0.000732433051041428 0.000656137941557946 0.000963890526251458 0.000968481839227783 44940 43141 667 665 0 True 504 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 545 377 0.000992454104831311 0.0010070266074892 0.000732433051041428 0.000793469138628214 0.000922267996685688 0.000865095711583711 43382 43887 667 665 0 True 549 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 591 377 0.000966831759217667 0.000972974895467095 0.000579842832074464 0.000457770656900893 0.00104434342145159 0.0011472014046113 42262 42403 667 665 0 True 593 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 633 378 0.000961272625303279 0.000943237012191729 0.000579842832074464 0.000610360875867857 0.00102164280902041 0.00102224439783781 42019 41107 667 665 0 True 638 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 237 422 0.000869215197848546 0.000896496218802901 0.000671396963454643 0.000686655985351339 0.00078561801876598 0.000813415253153184 37995 39070 667 665 0 True 236 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 281 423 0.000939127598022916 0.000866230579882987 0.00080872816052491 0.000747692072938125 0.000763675349937799 0.000740726060245817 41051 37751 667 665 0 True 281 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 325 422 0.000989159803252414 0.000910103136073188 0.000885023270008392 0.000823987182421607 0.000752712723838727 0.000656727209179576 43238 39663 667 665 0 True 326 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 368 422 0.000979711563307383 0.000938716670366693 0.00080872816052491 0.00080872816052491 0.000784296710037174 0.0007107208810201 42825 40910 667 665 0 True 370 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 414 423 0.000988176088197604 0.000971276899045508 0.000778210116731518 0.000747692072938125 0.000833257371000337 0.000804873100909014 43195 42329 667 665 0 True 415 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 458 422 0.000923960084503411 0.00102625526966879 0.000625619897764553 0.000793469138628214 0.000904500400852758 0.000892750892096338 40388 44725 667 665 0 True 460 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 501 421 0.000954386619919612 0.000973410867521287 0.000686655985351339 0.000686655985351339 0.000892923081847171 0.000919129400590734 41718 42422 667 665 0 True 504 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 545 420 0.000954180726070931 0.000929928391590099 0.000747692072938125 0.000762951094834821 0.000856518501557201 0.000775565682120736 41709 40527 667 665 0 True 549 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 590 419 0.000896438940063042 0.000889910746194853 0.000534065766384375 0.0004272526131075 0.000961359536529275 0.00101273802263081 39185 38783 667 665 0 True 593 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 632 423 0.000870336175469143 0.000850673261317634 0.000442511635004196 0.000442511635004196 0.000942137411829902 0.000939140492156221 38044 37073 667 665 0 True 638 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 239 466 0.000949147765325394 0.000912443617627268 0.000778210116731518 0.000823987182421607 0.000805909078806032 0.00070184307166096 41489 39765 667 665 0 True 236 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 282 468 0.000988770892649349 0.000903150529103716 0.000839246204318303 0.000778210116731518 0.000830772189931232 0.000811697990376107 43221 39360 667 665 0 True 281 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 326 468 0.000889530057585078 0.000914829990976526 0.000778210116731518 0.000747692072938125 0.000785522408410365 0.000816218119513471 38883 39869 667 665 0 True 326 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 370 467 0.000842700645557285 0.000917491715096852 0.000671396963454643 0.00080872816052491 0.000751629130343957 0.000779160022507672 36836 39985 667 665 0 True 370 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 415 466 0.000955507597540209 0.000883554732562695 0.000656137941557946 0.000625619897764553 0.000972849052336236 0.000865918313574987 41767 38506 667 665 0 True 415 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 459 465 0.000949651061399948 0.000943191120396551 0.000503547722590982 0.000534065766384375 0.00105711661727624 0.00102838830019769 41511 41105 667 665 0 True 460 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 502 465 0.00100153631126758 0.00106955417841927 0.000625619897764553 0.000732433051041428 0.00102237657068219 0.00102334976940332 43779 46612 667 665 0 True 504 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 547 465 0.00104102217602574 0.000848034483094897 0.000747692072938125 0.000549324788281071 0.000983936067934876 0.000894853690704282 45505 36958 667 665 0 True 549 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 591 464 0.000918675475720597 0.000904779687832536 0.000534065766384375 0.000457770656900893 0.00101722873409408 0.00100644270648411 40157 39431 667 665 0 True 594 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 636 466 0.000947431983253052 0.00089723048752575 0.000534065766384375 0.000534065766384375 0.000997090854065028 0.000921880050028324 41414 39102 667 665 0 True 638 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 238 511 0.000895249331159552 0.000939932802938911 0.000686655985351339 0.000793469138628214 0.000763864587691245 0.000760641490073713 39133 40963 667 665 0 True 237 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 283 511 0.00085569483511849 0.000918432496898001 0.000717174029144732 0.000747692072938125 0.000758107266703432 0.000821429446110995 37404 40026 667 665 0 True 281 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 326 512 0.000998699551574636 0.000920864762042437 0.000946059357595178 0.000854505226215 0.000797097654984632 0.000740777280030343 43655 40132 667 665 0 True 326 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 370 509 0.000919270280172342 0.000972102951358713 0.000747692072938125 0.000839246204318303 0.000804443578182586 0.000758826162082669 40183 42365 667 665 0 True 371 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 416 509 0.000945876340840795 0.00102460316504238 0.000656137941557946 0.000701915007248035 0.00096024126425846 0.000973329378642319 41346 44653 667 665 0 True 415 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 459 510 0.000909341621247056 0.000897069866242626 0.000579842832074464 0.000610360875867857 0.000946699864269763 0.000840585911022429 39749 39095 667 665 0 True 460 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 503 510 0.00091723421877983 0.00101882079884995 0.000564583810177768 0.000686655985351339 0.000961115149515187 0.000973275558347419 40094 44401 667 665 0 True 504 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 547 509 0.00094484687159739 0.000919258549211206 0.00064087891966125 0.000686655985351339 0.000924660233971044 0.000861461588020649 41301 40062 667 665 0 True 549 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 591 507 0.000864296622574499 0.00087318318685246 0.000534065766384375 0.000488288700694286 0.000924225331341135 0.000932324165814513 37780 38054 667 665 0 True 594 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 635 507 0.000882666929295709 0.000910355540946667 0.000503547722590982 0.0004272526131075 0.000940367441630971 0.00104024171638451 38583 39674 667 665 0 True 638 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 239 552 0.000951435474755184 0.000992226503544281 0.000793469138628214 0.000823987182421607 0.000719719384370461 0.000748783680022542 41589 43242 667 665 0 True 237 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 282 552 0.000885686705743031 0.000876326774822155 0.000762951094834821 0.000747692072938125 0.000722420643421039 0.000717360012895849 38715 38191 667 665 0 True 281 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 327 553 0.000917440112628511 0.000962006756419545 0.000793469138628214 0.000793469138628214 0.00071194033511028 0.00076363793422033 40103 41925 667 665 0 True 326 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 371 551 0.000929542095512097 0.000895050627254793 0.000778210116731518 0.000747692072938125 0.000752211223645831 0.0007426123975129 40632 39007 667 665 0 True 371 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 415 553 0.000937045782441807 0.00093947388498713 0.000686655985351339 0.000595101853971161 0.000925612328061556 0.000918748721038325 40960 40943 667 665 0 True 415 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 459 550 0.000978018658329339 0.0010063841223567 0.000549324788281071 0.000656137941557946 0.00107751098357407 0.00107490785110188 42751 43859 667 665 0 True 460 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 503 551 0.000974930250599123 0.000902324476790511 0.000549324788281071 0.000473029678797589 0.00105741710585861 0.00104401741242332 42616 39324 667 665 0 True 505 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 546 549 0.000988953909403733 0.000895211248537916 0.000610360875867857 0.000488288700694286 0.000991688097863034 0.000994621772319618 43229 39014 667 665 0 True 549 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 592 548 0.000958458742704638 0.000854987090064369 0.000686655985351339 0.000625619897764553 0.000875994320251686 0.000735919779340639 41896 37261 667 665 0 True 594 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 634 550 0.000787887127619527 0.000871416352738105 0.0004272526131075 0.000518806744487678 0.00086119038608346 0.000906146521807883 34440 37977 667 665 0 True 638 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 237 594 0.000987329635708582 0.000977426399599365 0.000930800335698482 0.000900282291905089 0.000668177303587425 0.000676102878130562 43158 42597 667 665 0 False 237 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 282 594 0.000935284246180869 0.000922218570000189 0.000747692072938125 0.000778210116731518 0.000750753066412871 0.000741752811340004 40883 40191 667 665 0 False 282 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 325 595 0.000967518072046604 0.000913017265066993 0.000839246204318303 0.000747692072938125 0.000764310360454146 0.000766351854374875 42292 39790 667 665 0 True 326 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 370 595 0.00105634982920533 0.000948331001456491 0.000915541313801785 0.00080872816052491 0.000776837258307579 0.000715087619434083 46175 41329 667 665 0 True 371 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 415 594 0.000935192737803678 0.00098196968732199 0.000701915007248035 0.000732433051041428 0.00089417544514047 0.000860136678007538 40879 42795 667 665 0 False 415 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 460 593 0.000981541730851214 0.000987178406074697 0.000595101853971161 0.000625619897764553 0.00101787395295962 0.00102181047573774 42905 43022 667 665 0 False 460 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 505 593 0.000908540922946629 0.000960102246919657 0.000457770656900893 0.000488288700694286 0.00104041276537308 0.0011192027710921 39714 41842 667 665 0 False 505 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 549 593 0.000894563018330615 0.000805791085633516 0.000503547722590982 0.0004272526131075 0.000979599703288611 0.000878117176913597 39103 35117 667 665 0 False 549 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 594 593 0.000873127180973487 0.000888556938237101 0.000595101853971161 0.000625619897764553 0.000819664060642179 0.000823485265842398 38166 38724 667 665 0 False 594 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 639 593 0.000948255558647776 0.000877221664828127 0.000701915007248035 0.000717174029144732 0.000854778111056605 0.000743514354937413 41450 38230 667 665 0 False 639 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 237 642 0.00106671315292228 0.0681722158451749 0.000885023270008392 0.0686045624475471 0.000790221917819507 0.0193872941925696 46628 2970998 667 665 0 True 237 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 282 637 0.000918217933834639 0.000936697431378859 0.000762951094834821 0.000793469138628214 0.00070259762540759 0.000717919305022753 40137 40822 667 665 0 False 282 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 326 637 0.000963766228581749 0.00091636736611499 0.000839246204318303 0.000839246204318303 0.000725707725477271 0.000641142757141478 42128 39936 667 665 0 False 326 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 371 637 0.000920505643264429 0.000872494809924789 0.00080872816052491 0.000793469138628214 0.000670234008303634 0.000614379728343319 40237 38024 667 665 0 False 371 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 416 637 0.000915541313801785 0.000919419170494329 0.000701915007248035 0.000701915007248035 0.00076493790002973 0.000775140346393247 40020 40069 667 665 0 False 416 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 460 637 0.000901746425940154 0.000956660362281304 0.000610360875867857 0.000686655985351339 0.000902646551666417 0.00090609644865178 39417 41692 667 665 0 False 460 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 505 637 0.00099778446780272 0.00097100154827444 0.000686655985351339 0.000595101853971161 0.000981788527968731 0.000974198924171902 43615 42317 667 665 0 False 505 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 549 637 0.000934689441729124 0.000990000751478146 0.000625619897764553 0.00064087891966125 0.000921360799732696 0.00090504465462803 40857 43145 667 665 0 False 549 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 594 637 0.000927917821816947 0.000884311947183133 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.000788729587207097 0.000677084202298983 40561 38539 667 665 0 False 594 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 634 642 0.000988702261366456 0.0763640160139419 0.000854505226215 0.0733958953231098 0.000746842303732576 0.0218655933144745 43218 3328003 667 665 0 True 639 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F1_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F1_1.csv new file mode 100755 index 0000000..b5a5902 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F1_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 258 286 0.00890024202821912 0.0392300733522981 0.00881971465629053 0.0385137712672618 0.00149604016468426 0.00792482159699976 389046 1709677 667 665 0 True 257 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 301 285 0.00905495981695579 0.00879750302742436 0.0089570458533608 0.00878919661249714 0.00178529589601523 0.0012921147141138 395809 383402 667 665 0 False 301 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 345 288 0.0088896728106535 0.0584210583680533 0.00889600976577401 0.059311818112459 0.00137224675136241 0.00841819400905311 388584 2546035 667 665 0 True 346 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 391 287 0.00931539265844304 0.0780398237525606 0.00929274433508812 0.0768444342717632 0.00137454482121099 0.00927076866302246 407193 3401036 667 665 0 True 390 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 434 287 0.00904082177267969 0.0635922605782022 0.00901808194094758 0.0620889600976577 0.00164548170286274 0.00886076496984565 395191 2771400 667 665 0 True 435 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 477 287 0.00942678123057949 0.0576662989586578 0.00926222629129473 0.0603952086671244 0.00199980309607775 0.0146432724498925 412062 2513142 667 665 0 True 480 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 522 285 0.0092092658179951 0.0730057921181989 0.00906385900663768 0.0723430228122377 0.00208360345800039 0.0190700636233649 402554 3181649 667 665 0 True 524 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 567 285 0.00896875892564132 0.0603757964377641 0.0089570458533608 0.0593881132219425 0.00162137014940264 0.0146131390015578 392041 2631224 667 665 0 True 569 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 614 284 0.00875693990953711 0.00885188480471033 0.00875867856870375 0.00883497367818723 0.00196539495560369 0.00190398140092785 382782 385772 667 665 0 False 614 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 654 285 0.0088440330075292 0.0394653146943807 0.0089417868314641 0.0394445716029602 0.00180706380063625 0.0079069570823389 386589 1719929 667 665 0 True 658 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 257 329 0.00881694652788049 0.00884227047362053 0.00881971465629053 0.00885023270008392 0.00147500666888582 0.00144795656405948 385405 385353 667 665 0 False 257 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 301 329 0.0089440287867053 0.00893722059784389 0.0089417868314641 0.00888075074387732 0.00141600103264117 0.00124617493404832 390960 389491 667 665 0 False 301 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 345 331 0.00915047168564951 0.0977883481879338 0.00921644922560464 0.093339436942092 0.00143515145827471 0.0208654360729428 399984 4261692 667 665 0 True 346 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 388 331 0.00928082536895892 0.0466333836422138 0.00933852140077821 0.0469520103761349 0.00136555609208314 0.00773627405983318 405682 2032319 667 665 0 True 391 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 434 331 0.0093146605914255 0.0770111132718498 0.0093690394445716 0.0724040588998245 0.00165246318126292 0.0200578601256935 407161 3356204 667 665 0 True 435 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 479 330 0.00930200955827877 0.0418694252224748 0.00923170824750134 0.0416418707560845 0.00168707444894921 0.00879921938917329 406608 1824702 667 665 0 True 480 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 522 330 0.00899785858958825 0.0387132170091055 0.00891126878767071 0.0404516670481422 0.00160500538763246 0.00616494846521538 393313 1687152 667 665 0 True 524 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 566 329 0.00881960027081904 0.0460314898025563 0.00880445563439384 0.0473029678797589 0.00173266134152692 0.00800127806453008 385521 2006088 667 665 0 True 569 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 614 328 0.00998715565540645 0.00888628070519627 0.00886549172198062 0.0089417868314641 0.00908294630304773 0.00218637505977682 436557 387271 667 665 0 False 614 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 658 328 0.00845436746035314 0.00861717121827228 0.00843823910887312 0.00857557030594339 0.00190447808818508 0.00183827410912484 369556 375543 667 665 0 False 658 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 258 376 0.00893549563053218 0.0519569236664561 0.00900282291905089 0.050965133134966 0.00149661825495894 0.00953384107496104 390587 2264323 667 665 0 True 257 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 301 375 0.00934634536702809 0.0603137277847858 0.00933852140077821 0.0628213931486992 0.0014661281645135 0.016074068940732 408546 2628519 667 665 0 True 301 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 346 372 0.00931633061930925 0.0267827499625695 0.00917067215991455 0.0307316700999466 0.00177146290909806 0.0134717053440038 407234 1167213 667 665 0 False 346 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 389 375 0.00935439810422095 0.0322966032614152 0.00932326237888151 0.0330205233844511 0.00134930149748108 0.00413122563336933 408898 1407511 667 665 0 True 391 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 433 375 0.00943439930298069 0.0692362171163776 0.00952162966353857 0.0686808575570306 0.00160514838954086 0.00923846813690933 412395 3017368 667 665 0 True 435 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 479 374 0.00950511240145549 0.0327770674110316 0.00956740672922866 0.0325780117494469 0.00168658557917065 0.00594774610350978 415486 1428450 667 665 0 True 480 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 525 372 0.00921436741002353 0.0255754515609234 0.00924696726939803 0.0266575112535286 0.00171908168705895 0.00474458917788391 402777 1114598 667 665 0 False 525 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 566 373 0.00921079858331306 0.0478432978761851 0.00924696726939803 0.0478370336461433 0.00179192067665481 0.0075981471059411 402621 2085048 667 665 0 True 569 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 611 373 0.00902064417550895 0.0547832846019833 0.00910963607232776 0.0547035934996567 0.00204763657398011 0.0103653567170132 394309 2387498 667 665 0 True 614 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 655 373 0.00902171939894095 0.0616526438550026 0.00910963607232776 0.0609140154116121 0.00199233640957711 0.0165247549578352 394356 2686870 667 665 0 True 659 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 257 418 0.00901872249958793 0.0438884118054348 0.00907911802853437 0.0462195773250935 0.00159916985002617 0.0110895376658288 394225 1912691 667 665 0 True 257 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 301 419 0.0091821107070635 0.0308949301612925 0.00924696726939803 0.0309910734721904 0.00143609772009586 0.00432570371210121 401367 1346425 667 665 0 True 302 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 345 418 0.00941294058852927 0.0790136476462385 0.00944533455405508 0.0752117189288167 0.00138909693029087 0.0172383444757566 411457 3443476 667 665 0 True 346 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 390 419 0.00932598475310296 0.062706388309983 0.00929274433508812 0.0613260090028229 0.00154243373638286 0.0137746122415103 407656 2732793 667 665 0 True 391 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 434 418 0.00955759245577486 0.0422157476547858 0.00947585259784848 0.0432593270771344 0.0020635864826096 0.00686521999713588 417780 1839795 667 665 0 True 435 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 478 417 0.00943602357667584 0.051259758460009 0.00952162966353857 0.0518806744487678 0.0017145508676345 0.0100940960203621 412466 2233940 667 665 0 True 480 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 522 417 0.00907948406204314 0.0399116353483847 0.00915541313801785 0.0404058899824521 0.0016559520418616 0.00419279629823956 396881 1739380 667 665 0 True 525 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 566 416 0.00915975978593445 0.0509529029715511 0.00915541313801785 0.0504005493247883 0.0017422118640172 0.00763972737280738 400390 2220567 667 665 0 True 569 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 611 416 0.00893194968091601 0.0412407994121261 0.00900282291905089 0.0413519493400473 0.00193520538537592 0.00666419847890803 390432 1797306 667 665 0 True 614 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 655 417 0.00899113272386466 0.0843096984851692 0.00906385900663768 0.0823224231326772 0.00182570504946797 0.0140711935846374 393019 3674282 667 665 0 True 659 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 258 462 0.00896171278059757 0.0409833693870749 0.0089570458533608 0.0412756542305638 0.00170032486733344 0.00586642289382505 391733 1786087 667 665 0 True 257 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 302 463 0.00931333371995623 0.0577265089939314 0.00935378042267491 0.0560311284046693 0.0015860682260199 0.010818219515824 407103 2515766 667 665 0 True 302 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 345 462 0.00926488003423328 0.0334020218777661 0.00923170824750134 0.0341039139391165 0.00152363130099431 0.00416506741674845 404985 1455686 667 665 0 True 346 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 390 462 0.00975577672367753 0.052195331542406 0.00958266575112535 0.0520943007553216 0.00179986249718526 0.00906381505596782 426443 2274713 667 665 0 True 391 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 435 462 0.00972125518838201 0.0940160196784018 0.00968947890440223 0.0932631418326085 0.00208869208882191 0.0132112943736695 424934 4097291 667 665 0 True 436 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 478 461 0.00952661687009551 0.0582109886756259 0.00961318379491875 0.0578316929884794 0.00184711777137847 0.0117177461682788 416426 2536880 667 665 0 True 480 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 523 461 0.00936023176326691 0.0489288223993263 0.00932326237888151 0.0479285877775235 0.00178643046468228 0.00688850203336854 409153 2132356 667 665 0 True 525 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 566 460 0.00934559042291626 0.0310319401157965 0.00935378042267491 0.0313572899977111 0.00196975840116125 0.00388987702248902 408513 1352396 667 665 0 True 570 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 611 460 0.0091451413226781 0.0369791725824059 0.00914015411612116 0.0373998626688029 0.00181485921943004 0.00411462659213227 399751 1611581 667 665 0 True 614 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 655 461 0.00875009965834203 0.0668588385589747 0.00885023270008392 0.0656900892652781 0.00196714801003371 0.0113805749815022 382483 2913760 667 665 0 True 659 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 259 506 0.00892124320078459 0.0509997126026327 0.00889600976577401 0.0505073624780652 0.00156470336248813 0.0116491992077701 389964 2222607 667 665 0 True 257 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 303 507 0.00910309322335857 0.0531951760839499 0.00912489509422446 0.0531319142442969 0.00152394532851153 0.00588845875596153 397913 2318287 667 665 0 True 302 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 348 506 0.00939887117553606 0.0687943479665059 0.00933852140077821 0.0666361486228733 0.00151087973661092 0.0139626867083534 410842 2998111 667 665 0 True 346 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 391 507 0.00969034823398555 0.0893566716057711 0.00962844281681544 0.0858777752346075 0.00163914491948712 0.0168305001914583 423583 3894233 667 665 0 True 391 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 435 506 0.00987299895485995 0.0933830112016136 0.00991836423285267 0.0880445563439384 0.00191472019320075 0.0245515453650564 431567 4069704 667 665 0 True 436 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 480 505 0.0095864633487788 0.0424880466214747 0.00956740672922866 0.0432593270771344 0.00180294345995566 0.0046881623631408 419042 1851662 667 665 0 True 480 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 525 505 0.00943195145389081 0.0379719038956971 0.009399557488365 0.0385290302891585 0.00178798866342672 0.00456778104554746 412288 1654845 667 665 0 True 525 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 568 504 0.00938663193008668 0.126359340787308 0.009399557488365 0.125856412603952 0.00183710507045784 0.0257897515157719 410307 5506838 667 665 0 True 570 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 612 504 0.00905788808502592 0.0610379462044904 0.00910963607232776 0.061219195849546 0.00188061075211061 0.0151136977204074 395937 2660081 667 665 0 True 614 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 656 505 0.00901110442718673 0.0705517972087463 0.00901808194094758 0.0693217364766918 0.00188344590353738 0.0098559193210569 393892 3074702 667 665 0 True 659 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 260 550 0.00885842269984257 0.0506667217368209 0.00888075074387732 0.0518196383611811 0.00149595617976326 0.0097835853736534 387218 2208095 667 665 0 True 257 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 303 550 0.0092081448403745 0.110263160762974 0.00923170824750134 0.108827344167239 0.00148647351689904 0.0213460554992179 402505 4805354 667 665 0 True 302 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 347 550 0.00974278253411632 0.0573843856608791 0.00959792477302205 0.0587014572365911 0.00186762043294171 0.010374893059629 425875 2500856 667 665 0 True 347 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 392 550 0.00972221602634252 0.0591517704767756 0.00964370183871214 0.0579995422293431 0.00176305075360647 0.00715688164140169 424976 2577880 667 665 0 True 391 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 436 549 0.00968561267546588 0.0563018441044245 0.00970473792629892 0.0561684596017395 0.00201409488919481 0.00529832693279671 423376 2453678 667 665 0 True 436 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 480 547 0.00959122178439276 0.0630527336881916 0.00964370183871214 0.0620889600976577 0.00197644709194557 0.00894388076719652 419250 2747887 667 665 0 True 480 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 525 547 0.00933877304881549 0.0753454017281703 0.00927748531319142 0.0735027084763867 0.00197153981341655 0.0134080005558625 408215 3283611 667 665 0 True 525 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 569 546 0.00915934799823709 0.0567998848115941 0.00921644922560464 0.0569771877622644 0.00178779924657384 0.0106981003187995 400372 2475383 667 665 0 True 570 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 613 545 0.00899008037752696 0.049691222792619 0.00901808194094758 0.0483100633249409 0.00176913909839431 0.0073830171644479 392973 2165582 667 665 0 True 614 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 657 546 0.00906813702327138 0.0623015079470248 0.00906385900663768 0.0622415503166247 0.00187581873608447 0.0109628489129496 396385 2715148 667 665 0 True 659 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 260 591 0.00856497821128346 0.0445001264892605 0.0085145342183566 0.0447089341573205 0.00134688161406428 0.0071994751135698 374391 1939350 667 665 0 True 257 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 304 591 0.00899932272362331 0.0569177578875089 0.00901808194094758 0.0561226825360494 0.00143614617866715 0.0120216458508785 393377 2480520 667 665 0 True 302 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 349 591 0.00932381142914466 0.0449105597594352 0.00930800335698482 0.0453192950331884 0.0015792933365092 0.00714423830197552 407561 1957237 667 665 0 True 347 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 393 590 0.00936496732178658 0.0534484529015374 0.009399557488365 0.051621271076524 0.00146251651526656 0.0082090422251223 409360 2329325 667 665 0 True 391 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 438 589 0.00942266335360587 0.0881605478562508 0.00932326237888151 0.0832684824902724 0.00189021532584931 0.0165922241287986 411882 3842105 667 665 0 True 436 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 481 588 0.00915401763526568 0.0638440918042417 0.00912489509422446 0.0612344548714427 0.0020119295912351 0.00968509806005875 400139 2782375 667 665 0 True 481 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 525 587 0.00890200356448006 0.0564631078726801 0.0089570458533608 0.0557259479667353 0.00198816952965696 0.00682707509978605 389123 2460706 667 665 0 True 525 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 570 587 0.00891943591033506 0.0370145551564882 0.00891126878767071 0.03759822995346 0.00179136834628933 0.00690486827643468 389885 1613123 667 665 0 True 570 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 614 586 0.00899195629925939 0.0457211694835624 0.00901808194094758 0.045639734493019 0.0015752721532196 0.00574137356839655 393055 1992564 667 665 0 True 615 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 658 586 0.00869018454837585 0.0517727140006115 0.00874341954680705 0.050919356069276 0.00173183447627787 0.00640198491875118 379864 2256295 667 665 0 True 659 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 258 633 0.00835723131796427 0.00832387675528946 0.00837720302128634 0.00830090791180285 0.00129634886346111 0.00138261893389407 365310 362761 667 665 0 False 258 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 302 633 0.00846628642648234 0.00828672734709284 0.00845349813076982 0.00831616693369955 0.00128533671849445 0.00126120836984114 370077 361142 667 665 0 False 302 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 349 632 0.0091364251497506 0.0837115448268187 0.00907911802853437 0.079667353322652 0.00141035684124449 0.0216184838109437 399370 3648214 667 665 0 True 347 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 393 632 0.0092342476049684 0.0861631533629221 0.00920119020370794 0.0789501792935073 0.00146796654299342 0.0323924613915191 403646 3755057 667 665 0 True 391 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 436 633 0.00885499113569789 0.00888795575572027 0.0089723048752575 0.00891126878767071 0.00169063956821692 0.00179157611045637 387068 387344 667 665 0 False 436 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 481 633 0.00869260952037142 0.00885055394265017 0.00862134737163348 0.00881971465629053 0.00181011192403417 0.00184117697577453 379970 385714 667 665 0 False 481 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 525 632 0.00873026521758576 0.00860131560303827 0.00871290150301366 0.00869764248111696 0.00183490457653954 0.00193758046968419 381616 374852 667 665 0 False 525 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 570 632 0.00851107977711762 0.00839574330653826 0.0085145342183566 0.00837720302128634 0.00166036727338163 0.00160480873596098 372035 365893 667 665 0 False 570 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 615 632 0.00856834114414525 0.00869220430338836 0.00857557030594339 0.00874341954680705 0.00136698819952911 0.00137771721463352 374538 378813 667 665 0 False 615 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 659 632 0.00839694595366542 0.008569283130004 0.00834668497749294 0.00865186541542687 0.00145502501614551 0.00146613201372687 367046 373456 667 665 0 False 659 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 260 683 0.00849595801778671 0.0385221694657794 0.0085145342183566 0.0387273975738155 0.00143188708270709 0.00711042827070061 371374 1678826 667 665 0 True 258 677 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 302 677 0.00834442014515745 0.00834471163030029 0.00842298008697642 0.00834668497749294 0.0013642937346537 0.00138926724849947 364750 363669 667 665 0 False 302 677 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 347 676 0.00855923606061469 0.00855714475017941 0.00856031128404669 0.00857557030594339 0.00132057209141906 0.00134087858131204 374140 372927 667 665 0 False 347 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 392 676 0.0089320869434818 0.00872900952312115 0.00872816052491035 0.00875867856870375 0.00252198943412546 0.00132118956605357 390438 380417 667 665 0 False 392 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 436 676 0.00855527832330116 0.0085160027558023 0.00857557030594339 0.00849927519645991 0.00153113840120503 0.00163077009195932 373967 371134 667 665 0 False 436 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 481 676 0.00848783664931096 0.00839411414780944 0.00856031128404669 0.00837720302128634 0.0016620003146936 0.00154946267164379 371019 365822 667 665 0 False 481 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 526 676 0.00832922975454365 0.00850051427492971 0.00836194399938964 0.00848401617456321 0.00185499078733535 0.00177321869915051 364086 370459 667 665 0 False 526 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 570 676 0.00843217667888418 0.00839347166267695 0.00840772106507973 0.00843823910887312 0.00150868703220419 0.00157534010759539 368586 365794 667 665 0 False 570 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 615 676 0.00851055360394877 0.00849957349312857 0.00849927519645991 0.00846875715266651 0.00137059461113448 0.00132118874511186 372012 370418 667 665 0 False 615 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 656 682 0.00841419528276603 0.0382774514679925 0.00848401617456321 0.0384679942015717 0.00156295864831466 0.00815343908033406 367800 1668161 667 665 0 True 659 675 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F1_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F1_2.csv new file mode 100755 index 0000000..8499f4d --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F1_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 258 286 0.00756522631337112 0.693841768532111 0.00752269779507134 0.657328145265888 0.00171890086856846 0.175701288635971 330690 30238162 667 665 8 True 257 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 301 285 0.00640975003457301 0.00617726508993931 0.00624093995574884 0.00617990386816205 0.00171719874513756 0.00134152519026625 280182 269210 667 665 0 False 301 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 345 288 0.0057770839917647 0.0056675219749993 0.00581368734264134 0.00569161516746777 0.00115297256464301 0.00130819799840664 252527 246995 667 665 0 True 346 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 391 287 0.00575770709289439 0.00602547797738797 0.00563057907988098 0.00605783169298848 0.00124497837179411 0.00126019753841873 251680 262595 667 665 0 True 390 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 434 287 0.00614952308693445 0.00622347812768359 0.00616464484626535 0.00624093995574884 0.00151712346832002 0.00166026220121011 268807 271224 667 665 0 True 435 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 477 287 0.00689668898670372 0.0062080125927086 0.00671396963454643 0.00628671702143893 0.00254248849570014 0.00174489242656629 301467 270550 667 665 0 True 480 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 522 285 0.00650153293689617 0.00651743802169649 0.00656137941557946 0.00654612039368277 0.001577884350418 0.00165683109266293 284194 284035 667 665 0 True 524 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 567 285 0.00658359307414272 0.00677922776728959 0.00665293354695964 0.00668345159075303 0.00181426445304695 0.00161161286308121 287781 295444 667 665 0 True 569 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 614 284 0.00904381867203272 0.0073059049546503 0.00779736018921187 0.00732433051041428 0.00754066137478026 0.00185075643041577 395322 318397 667 665 0 False 614 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 654 285 0.00862811899154566 0.717035642436373 0.00860608834973678 0.712626840619516 0.00202882659991413 0.173980164505278 377151 31248969 667 665 8 True 658 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 257 329 0.00630019162998039 0.00615812821135007 0.00630197604333562 0.00617990386816205 0.0016428719571294 0.00148097526340541 275393 268376 667 665 0 False 257 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 301 329 0.00591597083124723 0.00596765431546364 0.00588998245212482 0.00601205462729839 0.0012841736203451 0.00125545677541681 258598 260075 667 665 0 False 301 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 345 331 0.00589375717268397 0.00603364671692966 0.00588998245212482 0.00608834973678187 0.00126894969504209 0.00124648732834132 257627 262951 667 665 0 True 346 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 388 331 0.00613412680247196 0.00611728451364162 0.00613412680247196 0.00607309071488518 0.00125437644267119 0.00123288526912441 268134 266596 667 665 0 True 391 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 434 331 0.00640300129175513 0.00640491133991995 0.00642404821850919 0.00636301213092241 0.00163009734818616 0.00174717983080127 279887 279131 667 665 0 True 435 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 479 330 0.00656524564451581 0.00656489013791058 0.00666819256885634 0.00654612039368277 0.00151503371639193 0.00158459273057127 286979 286103 667 665 0 True 480 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 522 330 0.00644877835744522 0.00652900275408136 0.00654612039368277 0.00654612039368277 0.00150230561056404 0.00159374667180479 281888 284539 667 665 0 True 524 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 566 329 0.00652775008696155 0.00681841936037163 0.00648508430609598 0.00674448767833982 0.00178751362221216 0.00146977678388175 285340 297152 667 665 0 True 569 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 614 328 0.00730817928183997 0.00688900094135545 0.00695811398489357 0.00689707789730678 0.00345504553047893 0.0020912029511274 319454 300228 667 665 0 False 614 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 658 328 0.0070012144305508 0.00688181887541009 0.00697337300679027 0.00688181887541009 0.00199346597988509 0.00177512651408244 306036 299915 667 665 0 False 658 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 258 376 0.00569655661983611 0.00581552301444846 0.00564583810177768 0.00584420538643473 0.00144451618102753 0.00137615538612729 249007 253445 667 665 0 True 257 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 301 375 0.00604417406769264 0.00602235733531586 0.00602731364919509 0.00601205462729839 0.00136205179364257 0.00132543974719732 264202 262459 667 665 0 True 301 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 346 372 0.00602093093988597 0.00616147831239807 0.00604257267109178 0.00627145799954223 0.00138678534272039 0.00140976784708091 263186 268522 667 665 0 False 346 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 389 375 0.00634196520416834 0.00647783340245785 0.00634775310902571 0.00650034332799268 0.00138119175264565 0.00133617962730262 277219 282309 667 665 0 True 391 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 433 375 0.00663884125687214 0.00670577794910715 0.00669871061264973 0.00672922865644312 0.0016263394375394 0.00164020238008391 290196 292243 667 665 0 True 435 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 479 374 0.00673460477360313 0.00665187803567054 0.00666819256885634 0.00663767452506294 0.00174274559318116 0.00175422074453147 294382 289894 667 665 0 True 480 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 525 372 0.00658084782282697 0.00663361310118969 0.00665293354695964 0.00668345159075303 0.00166300903350957 0.00165011054883959 287661 289098 667 665 0 False 525 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 566 373 0.00668075209362588 0.00665626070211005 0.00672922865644312 0.00663767452506294 0.00176955018779958 0.00160318829734973 292028 290085 667 665 0 True 569 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 611 373 0.00649668299290501 0.00661133263463075 0.00645456626230259 0.00668345159075303 0.00193682337877995 0.00200830450521367 283982 288127 667 665 0 True 614 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 655 373 0.00587680524580923 0.00605126916627802 0.00593575951781491 0.00599679560540169 0.00175339002506794 0.00189294708417666 256886 263719 667 665 0 True 659 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 257 418 0.00574485016589897 0.00589413565958843 0.00575265125505455 0.00587472343022812 0.00158180227061686 0.00156293714259447 251118 256871 667 665 0 True 257 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 301 419 0.00603198057643186 0.00610943701666618 0.00607309071488518 0.00608834973678187 0.00129748166837237 0.0013537030178171 263669 266254 667 665 0 True 302 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 345 418 0.00610502713852504 0.00603869481439924 0.00613412680247196 0.00605783169298848 0.00122526302063161 0.00123815066285865 266862 263171 667 665 0 True 346 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 390 419 0.00656325533731189 0.00632595450631615 0.00650034332799268 0.00636301213092241 0.00198569818812607 0.00147786664315123 286892 275690 667 665 0 True 391 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 434 418 0.00721536691027341 0.00640897276379321 0.00663767452506294 0.0063782711528191 0.00485166622406092 0.00152206239952758 315397 279308 667 665 0 True 435 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 478 417 0.00674480795765999 0.00667090018477184 0.00674448767833982 0.00675974670023652 0.00161264689162734 0.00151188174563213 294828 290723 667 665 0 True 480 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 522 417 0.00654330651108412 0.00642661815903916 0.00650034332799268 0.00653086137178607 0.00163365167957347 0.00159560066538493 286020 280077 667 665 0 True 525 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 566 416 0.0063881083033672 0.00650323451108889 0.00643930724040589 0.00657663843747616 0.00175382480360003 0.00168671071403508 279236 283416 667 665 0 True 569 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 611 416 0.00594401814885645 0.00578945647478733 0.00590524147402152 0.00584420538643473 0.00185909503244487 0.00169291339859604 259824 252309 667 665 0 True 614 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 655 417 0.00565768843662399 0.00577617080008329 0.00563057907988098 0.00575265125505455 0.001719331551307 0.00189689035939296 247308 251730 667 665 0 True 659 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 258 462 0.00587380834645621 0.00611719273005127 0.00587472343022812 0.00611886778057527 0.00147572767544265 0.00149649742541557 256755 266592 667 665 0 True 257 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 302 463 0.00598764476768254 0.0060492269813926 0.0059510185397116 0.00605783169298848 0.00153611172482759 0.0014408387217986 261731 263630 667 665 0 True 302 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 345 462 0.00595943731041323 0.00606733129459033 0.00593575951781491 0.00602731364919509 0.00142329538132799 0.00152387612860504 260498 264419 667 665 0 True 346 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 390 462 0.006292482049202 0.00626491841872936 0.00633249408712902 0.00625619897764553 0.0015292697328851 0.00142559026827079 275056 273030 667 665 0 True 391 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 435 462 0.00639522307969385 0.006506355153161 0.00631723506523232 0.00646982528419928 0.00187435817270109 0.00198036754061698 279547 283552 667 665 0 True 436 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 478 461 0.00678397354309799 0.00657138382692827 0.00692759594110018 0.00659189745937285 0.00180908317439674 0.00193663236371832 296540 286386 667 665 0 True 480 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 523 461 0.00633471316527591 0.00619644786032373 0.00636301213092241 0.00624093995574884 0.00175413847374802 0.00176116708079682 276902 270046 667 665 0 True 525 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 566 460 0.00581647834814568 0.00587151100456566 0.005981536583505 0.00588998245212482 0.00187791441089154 0.00183044505340203 254249 255885 667 665 0 True 570 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 611 460 0.00572744069713827 0.0055599286612044 0.00578316929884794 0.00550850690470741 0.0017474259737349 0.00174004339424454 250357 242306 667 665 0 True 614 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 655 461 0.00553742355189995 0.00563849541454919 0.00558480201419089 0.00561532005798428 0.00177853141940724 0.00188939822710133 242051 245730 667 665 0 True 659 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 259 506 0.00587643921230046 0.00603373850052001 0.00587472343022812 0.00604257267109178 0.00142044030223487 0.00151070239776848 256870 262955 667 665 0 True 257 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 303 507 0.00588181532946047 0.00601159570934661 0.00590524147402152 0.00601205462729839 0.00147766543430255 0.00145921689995412 257105 261990 667 665 0 True 302 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 348 506 0.00601857459917329 0.00594567214557336 0.00599679560540169 0.005981536583505 0.00144352469224171 0.00141375313382244 263083 259117 667 665 0 True 346 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 391 507 0.00614268283573937 0.00613825706403798 0.00611886778057527 0.00617990386816205 0.00156568416085607 0.00152187759596756 268508 267510 667 665 0 True 391 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 435 506 0.00624723115668076 0.00650959052472105 0.00624093995574884 0.00657663843747616 0.00183382255176784 0.0018397968954076 273078 283693 667 665 0 True 436 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 480 505 0.0061314959366277 0.00608734011728796 0.00613412680247196 0.00610360875867857 0.00174685672506924 0.00162035735919322 268019 265291 667 665 0 True 480 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 525 505 0.00596177077403162 0.00595719098616305 0.005981536583505 0.0059510185397116 0.00165588871492649 0.00161064112222737 260600 259619 667 665 0 True 525 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 568 504 0.00582896924163233 0.00584057993461566 0.00588998245212482 0.00585946440833143 0.00167599038923557 0.00166994210591443 254795 254537 667 665 0 True 570 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 612 504 0.00569806650805977 0.0057402145785613 0.00573739223315786 0.00587472343022812 0.00177091632383198 0.0017596255507799 249073 250163 667 665 0 True 614 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 656 505 0.00553129249062811 0.00579335727737747 0.00563057907988098 0.00575265125505455 0.0018546526379505 0.00185980076342123 241783 252479 667 665 0 True 659 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 260 550 0.00577742714817917 0.00602348168429772 0.00579842832074464 0.005981536583505 0.00139939661275526 0.00137555387498284 252542 262508 667 665 0 True 257 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 303 550 0.0059738956340095 0.00622295037203905 0.00593575951781491 0.00621042191195544 0.00153611338712796 0.00135356834909736 261130 271201 667 665 0 True 302 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 347 550 0.00618759057184614 0.00626223374871144 0.00616464484626535 0.00622568093385214 0.00139024576002774 0.00135287354006674 270471 272913 667 665 0 True 347 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 392 550 0.00603072233624547 0.00602114120274364 0.00601205462729839 0.00601205462729839 0.00148618349402175 0.00139489309577462 263614 262406 667 665 0 True 391 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 436 549 0.00602111395664036 0.00602947056356845 0.00611886778057527 0.00605783169298848 0.00178127776788691 0.00197906673277484 263194 262769 667 665 0 True 436 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 480 547 0.00604643890002813 0.00612166718008113 0.00613412680247196 0.00610360875867857 0.00186439203874203 0.00190526743950436 264301 266787 667 665 0 True 480 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 525 547 0.00602404222471049 0.00609755104171507 0.005981536583505 0.00614938582436866 0.00181749030623535 0.00188432095257782 263322 265736 667 665 0 True 525 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 569 546 0.00590139812217947 0.00603472517411634 0.00593575951781491 0.00611886778057527 0.00176308508544762 0.00165518020692957 257961 262998 667 665 0 True 570 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 613 545 0.00586689946397824 0.00601368378602721 0.00588998245212482 0.00610360875867857 0.00158035809965569 0.00166647868813868 256453 262081 667 665 0 True 614 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 657 546 0.00561392455523211 0.00585501290419916 0.00567635614557107 0.00584420538643473 0.00181284833989203 0.00193178800384012 245395 255166 667 665 0 True 659 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 260 591 0.00590302239587462 0.00607430684745739 0.00587472343022812 0.00608834973678187 0.00126788775572031 0.00128148720977374 258032 264723 667 665 0 True 257 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 304 591 0.00604588984976498 0.00622992592490611 0.00599679560540169 0.00622568093385214 0.00139370513641512 0.00138366837292044 264277 271505 667 665 0 True 302 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 349 591 0.00601006432009447 0.00621815467944294 0.00604257267109178 0.00627145799954223 0.00146318863811411 0.00142657006242287 262711 270992 667 665 0 True 347 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 393 590 0.00588755748012924 0.00587180930123432 0.0059510185397116 0.00582894636453803 0.00131401832724569 0.00127739050708392 257356 255898 667 665 0 True 391 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 438 589 0.00590823837337454 0.00610553621407605 0.00588998245212482 0.00616464484626535 0.00179937761501695 0.00185970171879532 258260 266084 667 665 0 True 436 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 481 588 0.00606544976538968 0.00616173071727155 0.00613412680247196 0.00607309071488518 0.00194517950294246 0.00190064267481876 265132 268533 667 665 0 True 481 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 525 587 0.00600848580058792 0.00621028423656991 0.00602731364919509 0.00613412680247196 0.00182599240644472 0.00199613497408852 262642 270649 667 665 0 True 525 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 570 587 0.00599137373405309 0.00611517349106343 0.00602731364919509 0.00605783169298848 0.00177499554828515 0.00183076040261927 261894 266504 667 665 0 True 570 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 614 586 0.0059184186803371 0.00610443481099177 0.0059510185397116 0.00613412680247196 0.00146121343613124 0.00141002396997189 258705 266036 667 665 0 True 615 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 658 586 0.00586946169853961 0.00586074937859641 0.00582894636453803 0.00585946440833143 0.00157887259789174 0.00161238113432789 256565 255416 667 665 0 True 659 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 258 633 0.00618187129827167 0.0061469994510194 0.00619516289005875 0.00605783169298848 0.00130377490015676 0.00138337458064567 270221 267891 667 665 0 False 258 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 302 633 0.00609587630080588 0.00599640552514268 0.00610360875867857 0.00605783169298848 0.00131017252663468 0.00122376582621478 266462 261328 667 665 0 False 302 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 349 632 0.00590137524508517 0.00594837976148887 0.00588998245212482 0.005981536583505 0.00128398834618305 0.00124477404907882 257960 259235 667 665 0 True 347 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 393 632 0.00572677726140363 0.00582830387940554 0.00569161516746777 0.00582894636453803 0.0012034296187548 0.00130101621492247 250328 254002 667 665 0 True 391 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 436 633 0.00572313980341027 0.00581393974751482 0.00572213321126116 0.00588998245212482 0.00164798761417046 0.00168236650558272 250169 253376 667 665 0 False 436 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 481 633 0.0059184644345257 0.00582346229501426 0.0059662775616083 0.00588998245212482 0.00182345525833649 0.00174653513584132 258707 253791 667 665 0 False 481 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 525 632 0.00594985180790241 0.00592396532645415 0.0059662775616083 0.00605783169298848 0.00185573800718152 0.00176293531784914 260079 258171 667 665 0 False 525 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 570 632 0.00602516320233108 0.00585760579062672 0.00605783169298848 0.00587472343022812 0.00162176945844663 0.00157567257550536 263371 255279 667 665 0 False 570 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 615 632 0.00604838345304345 0.00607820765004753 0.00602731364919509 0.00605783169298848 0.00142253146436562 0.00124940869097972 264386 264893 667 665 0 False 615 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 659 632 0.00586127169878096 0.00598353287659524 0.00584420538643473 0.005981536583505 0.00136744489002374 0.00137283022862239 256207 260767 667 665 0 False 659 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 260 683 0.00774245516289692 0.706515659714633 0.00758373388265812 0.69413290608072 0.00167941226477365 0.174994601339648 338437 30790500 667 665 8 True 258 677 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 302 677 0.00646987103838788 0.00624752542835688 0.00634775310902571 0.00621042191195544 0.00187201568027256 0.00136046143907446 282810 272272 667 665 0 False 302 677 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 347 676 0.00566672488887165 0.00582043343653251 0.00560006103608759 0.00584420538643473 0.00129377263637204 0.00132256229155934 247703 253659 667 665 0 False 347 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 392 676 0.00586763153099577 0.00553973627132606 0.00563057907988098 0.0055390249485008 0.00215181565045897 0.00125976447687335 256485 241426 667 665 0 False 392 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 436 676 0.00558340651143872 0.0055066482870027 0.00561532005798428 0.00552376592660411 0.0014672254781496 0.00149993865938303 244061 239984 667 665 0 False 436 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 481 676 0.00564851472181053 0.00568101416278164 0.00563057907988098 0.00567635614557107 0.0015631365954942 0.00154125231448985 246907 247583 667 665 0 False 481 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 526 676 0.00593749817698155 0.00580779024696096 0.00590524147402152 0.00575265125505455 0.00171115478867229 0.00167435952858849 259539 253108 667 665 0 False 526 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 570 676 0.00577479628233491 0.00586102472936748 0.00572213321126116 0.00581368734264134 0.00143855118391347 0.00147894779692105 252427 255428 667 665 0 False 570 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 615 676 0.00622321020766797 0.00607171396102984 0.00613412680247196 0.00605783169298848 0.00158552878666085 0.00130936019411538 272028 264610 667 665 0 False 615 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 656 682 0.00757442290527888 0.704439491954882 0.00746166170748455 0.691691462577249 0.00192361193384535 0.189711763899846 331092 30700019 667 665 10 True 659 675 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F1_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F1_3.csv new file mode 100755 index 0000000..966dc16 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F1_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 258 286 0.000958870530402 0.0703355091780722 0.000793469138628214 0.0657358663309682 0.000769340867105701 0.0194914365592002 41914 3065276 667 665 0 True 257 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 301 285 0.000867407907399013 0.000863545909865072 0.000747692072938125 0.000747692072938125 0.000659396511441146 0.000623726953119444 37916 37634 667 665 0 False 301 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 345 288 0.000839429221072686 0.000824469046270976 0.000717174029144732 0.000671396963454643 0.000620349048326523 0.000699158665747146 36693 35931 667 665 0 True 346 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 391 287 0.000897216761269171 0.000962993430015873 0.000717174029144732 0.000823987182421607 0.000716754350044041 0.000713204138599279 39219 41968 667 665 0 True 390 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 434 287 0.000942467653790409 0.000932360656734535 0.000671396963454643 0.000671396963454643 0.000868007167030136 0.000878938911415341 41197 40633 667 665 0 True 435 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 477 287 0.000979048127572744 0.000930203742361167 0.000717174029144732 0.000610360875867857 0.000924920259859742 0.000958565297193371 42796 40539 667 665 0 True 480 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 522 285 0.000973603379129845 0.000918799631259426 0.000747692072938125 0.000701915007248035 0.000847391614401506 0.000811206563130265 42558 40042 667 665 0 True 524 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 567 285 0.000997601451048337 0.000975797240870544 0.000732433051041428 0.000671396963454643 0.000978290392764923 0.0009046700677005 43607 42526 667 665 0 True 569 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 614 284 0.00116803580356766 0.000984493736056782 0.000671396963454643 0.000625619897764553 0.00123831292135967 0.00100917511921842 51057 42905 667 665 0 False 614 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 654 285 0.00122271205893963 0.072847557208425 0.000885023270008392 0.0715800717174029 0.00109846267580238 0.0197914247239897 53447 3174753 667 665 0 True 658 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 257 329 0.000853818913386063 0.000911135701464694 0.000686655985351339 0.000732433051041428 0.000730114182768696 0.000773080678092363 37322 39708 667 665 0 False 257 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 301 329 0.000906001565479563 0.000902255639097744 0.000762951094834821 0.000778210116731518 0.000702634346280673 0.000659548517414382 39603 39321 667 665 0 False 301 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 345 331 0.000917440112628511 0.000806685975639488 0.000778210116731518 0.000701915007248035 0.000701856984476578 0.000623936450902764 40103 35156 667 665 0 True 346 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 388 331 0.000884886007442605 0.000911020971976749 0.000747692072938125 0.00080872816052491 0.000707639273798028 0.000677081380310129 38680 39703 667 665 0 True 391 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 434 331 0.00102541999771458 0.000988256863261381 0.000762951094834821 0.000701915007248035 0.000902156278639929 0.000925859951420507 44823 43069 667 665 0 True 435 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 479 330 0.0010164750538441 0.000963016375913462 0.000762951094834821 0.000762951094834821 0.000853875051814687 0.000865005609278644 44432 41969 667 665 0 True 480 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 522 330 0.00102285776315321 0.000918065362536577 0.00080872816052491 0.000686655985351339 0.000860556296034244 0.000876030622604815 44711 40010 667 665 0 True 524 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 566 329 0.00096147851915196 0.000986948947098807 0.000701915007248035 0.000747692072938125 0.00092108536352886 0.000846825382862391 42028 43012 667 665 0 True 569 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 614 328 0.00100359524975439 0.00101570015677785 0.000549324788281071 0.000701915007248035 0.0011365565361619 0.00109765217776767 43869 44265 667 665 0 False 614 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 658 328 0.00106140566704517 0.00107538243640688 0.00064087891966125 0.000701915007248035 0.00105538754744742 0.00100189657336243 46396 46866 667 665 0 False 658 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 258 376 0.000903416453823901 0.000902416260380867 0.000732433051041428 0.000701915007248035 0.000776453744313733 0.00078726359945896 39490 39328 667 665 0 True 257 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 301 375 0.000908540922946629 0.000913659750199486 0.000747692072938125 0.000762951094834821 0.000753432407829993 0.000715456617747459 39714 39818 667 665 0 True 301 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 346 372 0.000927185754799414 0.000905582794248152 0.000778210116731518 0.000747692072938125 0.000719990551850584 0.000744377651095836 40529 39466 667 665 0 False 346 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 389 375 0.000962919776092727 0.0009042289862904 0.000823987182421607 0.000778210116731518 0.000725961857987184 0.000675392656219068 42091 39407 667 665 0 True 391 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 433 375 0.00102525985805449 0.00100718722877232 0.000747692072938125 0.000732433051041428 0.000888158744517418 0.000916475113453549 44816 43894 667 665 0 True 435 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 479 374 0.000936245084141381 0.000952943126871883 0.000625619897764553 0.000610360875867857 0.000902138478555871 0.000953917641377635 40925 41530 667 665 0 True 480 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 525 372 0.000942330391224621 0.000910378486844256 0.00064087891966125 0.00064087891966125 0.000896449425166328 0.000858208469555751 41191 39675 667 665 0 False 525 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 566 373 0.000870176035809058 0.000975315377021175 0.000534065766384375 0.000686655985351339 0.000956797423261756 0.000956111851357293 38037 42505 667 665 0 True 569 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 611 373 0.00102061580791202 0.00093433400392719 0.000579842832074464 0.000518806744487678 0.00110336506081933 0.00101726068872794 44613 40719 667 665 0 True 614 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 655 373 0.00102498533292292 0.0009798586647438 0.000656137941557946 0.000610360875867857 0.00105045241177544 0.00103280636567929 44804 42703 667 665 0 True 659 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 257 418 0.000878937962925152 0.000983048144508674 0.000701915007248035 0.000823987182421607 0.000769950020184205 0.000835039359711272 38420 42842 667 665 0 True 257 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 301 419 0.000899458716510365 0.000936628593686092 0.000762951094834821 0.000885023270008392 0.000728168368895321 0.000726190255198332 39317 40819 667 665 0 True 302 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 345 418 0.000925538604009966 0.000880112847924343 0.00080872816052491 0.000778210116731518 0.000676455759472934 0.000648704084745093 40457 38356 667 665 0 True 346 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 390 419 0.000951526983132375 0.00100562690773627 0.000793469138628214 0.000885023270008392 0.000798830084721909 0.00074507466582357 41593 43826 667 665 0 True 391 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 434 418 0.000982319552057343 0.000974191028039313 0.000701915007248035 0.000717174029144732 0.00101815824528884 0.000880761238688409 42939 42456 667 665 0 True 435 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 478 417 0.00092592751461303 0.000965517478750665 0.000701915007248035 0.000732433051041428 0.000866245290919482 0.000818629027115935 40474 42078 667 665 0 True 480 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 522 417 0.000944526592277219 0.00094555454784822 0.000686655985351339 0.000701915007248035 0.000867884141049489 0.000902438621385126 41287 41208 667 665 0 True 525 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 566 416 0.000893647934558699 0.000915587205596963 0.000549324788281071 0.000656137941557946 0.000965058754514718 0.000868543836360304 39063 39902 667 665 0 True 569 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 611 416 0.000982159412397258 0.00096049232717867 0.000671396963454643 0.000625619897764553 0.00100036594186403 0.000956688009563982 42932 41859 667 665 0 True 614 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 655 417 0.000997418434293954 0.000925293320277118 0.000625619897764553 0.000457770656900893 0.00100378717261795 0.00100508661147253 43599 40325 667 665 0 True 659 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 258 462 0.0009447324861259 0.000939359155499185 0.000793469138628214 0.000732433051041428 0.000798449285778967 0.000826481913143387 41296 40938 667 665 0 True 257 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 302 463 0.000953265642299015 0.000835483077113704 0.000793469138628214 0.000671396963454643 0.000854142840925875 0.000772420738181513 41669 36411 667 665 0 True 302 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 345 462 0.000938143882968106 0.000873481483521117 0.000762951094834821 0.000732433051041428 0.000811476407314943 0.000782797816854643 41008 38067 667 665 0 True 346 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 390 462 0.000858554471905727 0.0010172604778139 0.000686655985351339 0.000885023270008392 0.000771552446129536 0.000817134382753896 37529 44333 667 665 0 True 391 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 435 462 0.000977629747726274 0.000933209654945329 0.000671396963454643 0.000473029678797589 0.00101955344897859 0.00102207041580725 42734 40670 667 665 0 True 436 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 478 461 0.00100682092005039 0.000955168878938018 0.000671396963454643 0.000473029678797589 0.0010079750984815 0.00107954319306245 44010 41627 667 665 0 True 480 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 523 461 0.000975570809239464 0.000891080986971893 0.000732433051041428 0.000595101853971161 0.000916629825630592 0.000890251989384215 42644 38834 667 665 0 True 525 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 566 460 0.000907717347551905 0.000954113367648923 0.000610360875867857 0.000549324788281071 0.000950455684689337 0.00103408355748029 39678 41581 667 665 0 True 570 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 611 460 0.000942787933110579 0.000978436019093281 0.000518806744487678 0.00064087891966125 0.00101232183752243 0.000965562766361849 41211 42641 667 665 0 True 614 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 655 461 0.000933293938976952 0.00103336849792139 0.000564583810177768 0.000686655985351339 0.000959472311414839 0.00102570055370319 40796 45035 667 665 0 True 659 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 259 506 0.000936450977990062 0.000940575288071403 0.000778210116731518 0.000778210116731518 0.000750216089326809 0.00077788297979324 40934 40991 667 665 0 True 257 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 303 507 0.000897079498703384 0.000912512455320035 0.000747692072938125 0.000762951094834821 0.000777252640467733 0.000812463352535491 39213 39768 667 665 0 True 302 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 348 506 0.000898841034964322 0.000896679785983613 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.000762723902780249 0.000808785076001787 39290 39078 667 665 0 True 346 503 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 391 507 0.000937251676290488 0.00091799652484381 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.000819645783806949 0.000787196837985877 40969 40007 667 665 0 True 391 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 435 506 0.000940614609152279 0.000938418373698035 0.000549324788281071 0.000549324788281071 0.000983819579488454 0.000978862550258193 41116 40897 667 665 0 True 436 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 480 505 0.000850158578298399 0.000925385103867474 0.000503547722590982 0.000671396963454643 0.0008956053250218 0.00083550042704697 37162 40329 667 665 0 True 480 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 525 505 0.000916525028856595 0.000918432496898001 0.000610360875867857 0.00064087891966125 0.000916053660801304 0.000833019184204896 40063 40026 667 665 0 True 525 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 568 504 0.000969782904382096 0.000894476979815068 0.00064087891966125 0.000656137941557946 0.000962585906724619 0.00086980324436704 42391 38982 667 665 0 True 570 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 612 504 0.000943725893976793 0.000901223073706239 0.000564583810177768 0.000564583810177768 0.000963940839042334 0.000943879293441239 41252 39276 667 665 0 True 614 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 656 505 0.000983234635829259 0.000941194827306306 0.000625619897764553 0.000488288700694286 0.00101409405605229 0.00100633871373482 42979 41018 667 665 0 True 659 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 260 550 0.000923868576126219 0.00084236684639041 0.000732433051041428 0.000686655985351339 0.000736620304957694 0.00066727390755593 40384 36711 667 665 0 True 257 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 303 550 0.000823827042761522 0.000954228097136868 0.000671396963454643 0.000793469138628214 0.000706949538932028 0.000742941326038218 36011 41586 667 665 0 True 302 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 347 550 0.000878251650096215 0.000894499925712657 0.000717174029144732 0.000717174029144732 0.000716513609352735 0.000762981039851199 38390 38983 667 665 0 True 347 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 392 550 0.000993209048943141 0.000966986016196362 0.000839246204318303 0.000823987182421607 0.000804263349635277 0.000773279181555906 43415 42142 667 665 0 True 391 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 436 549 0.000854528103309298 0.00101166167880218 0.000503547722590982 0.000564583810177768 0.000884047497046069 0.00108725705989772 37353 44089 667 665 0 True 436 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 480 547 0.000834464891610043 0.000914715261488581 0.000411993591210803 0.000473029678797589 0.000967738209013891 0.00106556441612506 36476 39864 667 665 0 True 480 546 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 525 547 0.000913230727277698 0.000898171269326899 0.000488288700694286 0.000457770656900893 0.000974216008469919 0.0010065677724454 39919 39143 667 665 0 True 525 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 569 546 0.00098952583676118 0.000890851527996003 0.000701915007248035 0.000595101853971161 0.000934899194323108 0.000879814848978402 43254 38824 667 665 0 True 570 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 613 545 0.000891428856411803 0.000892710145700713 0.000610360875867857 0.000610360875867857 0.000857305626330945 0.000822158881702884 38966 38905 667 665 0 True 614 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 657 546 0.00101796206497346 0.000936054946246367 0.000671396963454643 0.000564583810177768 0.00101116122084735 0.00100360512170755 44497 40794 667 665 0 True 659 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 260 591 0.000923548296806049 0.000946655950932493 0.00080872816052491 0.000839246204318303 0.000688989890681252 0.000657873659684723 40370 41256 667 665 0 True 257 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 304 591 0.000870107404526164 0.000905009146808426 0.000762951094834821 0.000778210116731518 0.000704353811026415 0.000757870058900699 38034 39441 667 665 0 True 302 590 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 349 591 0.000887905783889927 0.000833785080692117 0.000717174029144732 0.000671396963454643 0.000735463762129093 0.000714839958168259 38812 36337 667 665 0 True 347 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 393 590 0.000937457570139169 0.000912925481476637 0.000778210116731518 0.00080872816052491 0.000753211932765474 0.000645174652084815 40978 39786 667 665 0 True 391 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 438 589 0.000954157848976633 0.000914508748410279 0.000625619897764553 0.000442511635004196 0.000928286295707518 0.00100826083185681 41708 39855 667 665 0 True 436 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 481 588 0.000904445923067306 0.000869833085804463 0.000503547722590982 0.000442511635004196 0.000991026479046813 0.000963692712712154 39535 37908 667 665 0 True 481 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 525 587 0.000912704554108846 0.000914692315590992 0.000503547722590982 0.000473029678797589 0.00102505040067875 0.00106042157463748 39896 39863 667 665 0 True 525 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 570 587 0.000965321870994006 0.0010126712982961 0.000732433051041428 0.000717174029144732 0.000876982339498554 0.00097557806313103 42196 44133 667 665 0 True 570 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 614 586 0.000979871702967468 0.000909047624784093 0.000747692072938125 0.000686655985351339 0.000849263964848204 0.000789666577177966 42832 39617 667 665 0 True 615 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 658 586 0.0010480683210695 0.00101843071859094 0.000839246204318303 0.000793469138628214 0.000902864260027118 0.000863197062247306 45813 44384 667 665 0 True 659 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 258 633 0.000987055110577007 0.000934219274439245 0.000839246204318303 0.000747692072938125 0.000705517239303988 0.000736252099059346 43146 40714 667 665 0 False 258 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 302 633 0.000974335446147377 0.000942846931932716 0.000854505226215 0.000854505226215 0.000714576572130109 0.000674719165378743 42590 41090 667 665 0 False 302 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 349 632 0.000881454443297921 0.000955719580480154 0.000747692072938125 0.000854505226215 0.000675638061638412 0.000657929404117512 38530 41651 667 665 0 True 347 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 393 632 0.000881591705863708 0.000920314060500301 0.000747692072938125 0.00080872816052491 0.000669762450585515 0.000663053026341673 38536 40108 667 665 0 True 391 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 436 633 0.000893053130106954 0.00095326436943813 0.000656137941557946 0.00064087891966125 0.000808633903746269 0.000969153385358806 39037 41544 667 665 0 False 436 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 481 633 0.0008816832142409 0.00091496766636206 0.000534065766384375 0.000595101853971161 0.000910234086088288 0.000922523145892459 38540 39875 667 665 0 False 481 633 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 525 632 0.000869489722980121 0.000930226688258756 0.000442511635004196 0.000503547722590982 0.000976835053579794 0.000976051307468578 38007 40540 667 665 0 False 525 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 570 632 0.000913734023352251 0.000918157146126933 0.000656137941557946 0.000656137941557946 0.000880790280565634 0.00084127206331205 39941 40014 667 665 0 False 570 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 615 632 0.00101411871313142 0.000998444841790904 0.000854505226215 0.000793469138628214 0.000765085675184519 0.000788555254554402 44329 43513 667 665 0 False 615 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 659 632 0.000956628575160806 0.00105640617910076 0.00080872816052491 0.000885023270008392 0.000754023462851755 0.000774651063920085 41816 46039 667 665 0 False 659 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 260 683 0.000963697597298856 0.07158190738921 0.000823987182421607 0.0694590676737621 0.000695859224047247 0.0194113598536466 42125 3119595 667 665 0 True 258 677 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 302 677 0.00098778717759454 0.000978160668322213 0.000885023270008392 0.000823987182421607 0.000701438412547065 0.000722984326131526 43178 42629 667 665 0 False 302 677 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 347 676 0.000929679358077885 0.000918478388693179 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.000732282761780652 0.000739830491105348 40638 40028 667 665 0 False 347 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 392 676 0.000975021758976314 0.000935940216758422 0.000823987182421607 0.00080872816052491 0.000725206622942658 0.000698184503240468 42620 40789 667 665 0 False 392 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 436 676 0.000850890645315932 0.000839131474830358 0.000625619897764553 0.00064087891966125 0.000781862681386761 0.00077968669320219 37194 36570 667 665 0 False 436 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 481 676 0.000908975587738289 0.000893077280062137 0.000625619897764553 0.000610360875867857 0.00086440584199093 0.000810250408072684 39733 38921 667 665 0 False 481 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 526 676 0.000886098493440394 0.000957876494853522 0.000503547722590982 0.000671396963454643 0.000936297983936032 0.000896553282206655 38733 41745 667 665 0 False 526 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 570 676 0.00092462352023805 0.000849640695926128 0.000732433051041428 0.000656137941557946 0.000804730262757262 0.000714000330225142 40417 37028 667 665 0 False 570 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 615 676 0.000933019413845378 0.00101765055807291 0.000778210116731518 0.000823987182421607 0.000693511301878367 0.000776543811391628 40784 44350 667 665 0 False 615 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 656 682 0.00104314974579545 0.0723514898484481 0.000869764248111696 0.0693827725642786 0.000811942951688029 0.022578482283807 45598 3153134 667 665 0 True 659 675 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F2_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F2_1.csv new file mode 100755 index 0000000..9cfab43 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F2_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 279 267 0.00955830164569809 0.040853725065697 0.00953688868543526 0.0406805523765927 0.00159125381691463 0.00827176106937455 417811 1780437 667 665 0 True 279 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 324 267 0.00943959240338631 0.00946155730365052 0.00944533455405508 0.00946059357595178 0.00134631972057812 0.00129585667655226 412622 412342 667 665 0 False 324 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 367 267 0.00964342731358056 0.0589689146188887 0.00970473792629892 0.0600442511635004 0.00127620380061096 0.0102193834199241 421532 2569911 667 665 0 True 368 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 412 267 0.0096027975941075 0.0772148498965427 0.00967421988250553 0.0755931944762341 0.00151223194147951 0.00973369524774836 419756 3365083 667 665 0 True 413 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 456 267 0.00970226720011475 0.0650449883004605 0.00968947890440223 0.0636911573968109 0.00166605154689043 0.0112679302482172 424104 2834711 667 665 0 True 458 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 500 266 0.00958122449418459 0.0557445800355776 0.00952162966353857 0.0590371557183185 0.00170916742390768 0.0150066184186716 418813 2429392 667 665 0 True 502 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 543 265 0.00957106706431632 0.0696663379666837 0.00949111161974517 0.069565880827039 0.00168612076736474 0.0211332338062957 418369 3036113 667 665 0 True 547 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 589 265 0.00946942413435077 0.059675005779498 0.00955214770733196 0.0596017395284962 0.0018642082045028 0.01739233515586 413926 2600683 667 665 0 True 592 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 636 266 0.0094201468732331 0.00938519335647427 0.0093842984664683 0.00943007553215839 0.00198787317494717 0.00178108733062424 411772 409014 667 665 0 False 636 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 675 266 0.00941053849362799 0.0405964097701337 0.00949111161974517 0.0404821850919356 0.0018987376738894 0.007748475321422 411352 1769223 667 665 0 True 681 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 279 311 0.00946892083827621 0.00944758325201881 0.00947585259784848 0.00943007553215839 0.00149692747808582 0.00137068285730326 413904 411733 667 665 0 False 279 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 324 310 0.00958179642154203 0.00934806689417524 0.00959792477302205 0.0093690394445716 0.00137460669134617 0.00133864706230621 418838 407396 667 665 0 False 324 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 368 311 0.00954450675783646 0.103735810113519 0.00947585259784848 0.103730830853742 0.00139051214615156 0.0238536269952693 417208 4520887 667 665 0 True 368 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 412 311 0.0094451972914893 0.051409503387675 0.00943007553215839 0.0517891203173877 0.00155343122364354 0.00764672328527249 412867 2240466 667 665 0 True 413 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 457 311 0.00978823932048624 0.0686877183804097 0.00988784618905928 0.0654612039368277 0.00180507215001915 0.0138645685343822 427862 2993464 667 665 0 True 458 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 502 310 0.00953528728883441 0.0375213611965368 0.00962844281681544 0.0394750896467536 0.00170466693056167 0.00708791520488175 416805 1635210 667 665 0 False 502 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 544 310 0.00956816167334049 0.0378790877399496 0.00964370183871214 0.0401312275883116 0.00150315052033683 0.00651977537680395 418242 1650800 667 665 0 True 547 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 589 310 0.00978286320332624 0.0472556304930328 0.00987258716716258 0.0491798275730526 0.00190624447224785 0.00921263187594419 427627 2059437 667 665 0 True 592 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 636 309 0.00929352215629425 0.00937358273229423 0.00927748531319142 0.0093690394445716 0.00193607766412596 0.00198980554631058 406237 408508 667 665 0 False 636 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 681 309 0.00922614911358695 0.00912526222858588 0.00917067215991455 0.00924696726939803 0.00188055948282158 0.00193093379533335 403292 397686 667 665 0 False 681 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 279 355 0.00952178980319865 0.0507879219678861 0.00955214770733196 0.0504768444342718 0.00150752657982889 0.0128919709801387 416215 2213377 667 665 0 True 279 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 324 355 0.00961608918589458 0.0619962816172957 0.00959792477302205 0.0653696498054475 0.00141886145483983 0.0186047538928566 420337 2701846 667 665 0 True 324 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 368 356 0.00959156494080723 0.0359638854517846 0.00965896086060884 0.0378271152819104 0.00143529691653699 0.0070808517927175 419265 1567334 667 665 0 True 369 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 412 355 0.00983948401171353 0.0317504220611038 0.00990310521095598 0.0327458609903105 0.00159693967111289 0.00483735028573542 430102 1383708 667 665 0 True 413 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 457 355 0.00984165733567183 0.0685987341895595 0.00984206912336919 0.0668345159075303 0.00172340038267631 0.0124977433566348 430197 2989586 667 665 0 True 458 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 503 353 0.00966268982697939 0.0297358181445832 0.00967421988250553 0.0312504768444343 0.00179176128025899 0.00564495538928281 422374 1295910 667 665 0 False 503 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 544 353 0.00970739166923748 0.0283075048573597 0.00970473792629892 0.0288242923628595 0.00172994850415532 0.00476635408622238 424328 1233663 667 665 0 True 547 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 589 354 0.00978666080097969 0.047995612744381 0.0098115510795758 0.049256122682536 0.00201489105657471 0.00930729589232279 427793 2091686 667 665 0 True 592 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 633 354 0.00942305226420893 0.0567031449073588 0.00944533455405508 0.0575417715724422 0.00208436523965791 0.0134211013963582 411899 2471167 667 665 0 True 636 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 677 354 0.00926872338607533 0.0599279384086217 0.00926222629129473 0.0612497138933394 0.00178231731441996 0.0155327615617987 405153 2611706 667 665 0 True 681 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 281 399 0.00936945123226897 0.0447357349657045 0.009399557488365 0.0478065156023499 0.00150911014616881 0.0107592286283565 409556 1949618 667 665 0 True 279 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 325 399 0.00974863907025659 0.0317105191451965 0.00973525597009232 0.0320439459830625 0.00182402937226058 0.00402540059053967 426131 1381969 667 665 0 True 324 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 369 399 0.0110826024387669 0.0805810589646467 0.0097962920576791 0.0786755168993667 0.0104130119571736 0.0192936522307571 484441 3511785 667 665 0 True 369 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 413 399 0.00984536342494809 0.0638773863016433 0.00985732814526589 0.0634012359807736 0.0015644376205862 0.0165963474532655 430359 2783826 667 665 0 True 413 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 458 399 0.00972262781403988 0.0422473900475611 0.00965896086060884 0.0437018387121385 0.00172979022951854 0.00810094365678516 424994 1841174 667 665 0 True 458 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 501 397 0.00976531647199975 0.0523417722608191 0.00973525597009232 0.0535744258793011 0.0016800836298215 0.0120323551771576 426860 2281095 667 665 0 True 503 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 546 397 0.00966920979885429 0.0398250834226789 0.00970473792629892 0.0413366903181506 0.00182556083583394 0.00567678652975447 422659 1735608 667 665 0 True 547 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 590 397 0.00951101469178435 0.0475955739658141 0.00953688868543526 0.0483710994125277 0.00193145627766559 0.00880707333269944 415744 2074252 667 665 0 True 592 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 634 397 0.00927025615139329 0.0419032933673162 0.00930800335698482 0.0431830319676509 0.00189534203575668 0.0071359032501286 405220 1826178 667 665 0 True 637 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 678 397 0.00912496372550735 0.0823467687300191 0.00917067215991455 0.0791180285343709 0.00175825107254872 0.018623170494798 398869 3588736 667 665 0 True 681 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 281 442 0.0091614069367239 0.0431933576215659 0.00910963607232776 0.0441901274128328 0.00156951600174559 0.00844018950237046 400462 1882400 667 665 0 True 280 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 324 442 0.0095342806966853 0.0496166256795571 0.00949111161974517 0.0505531395437552 0.00174645434644649 0.00850790256937376 416761 2162331 667 665 0 True 324 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 369 443 0.0134240730401565 0.0337914367057493 0.00975051499198901 0.0346990157930877 0.0231331032560713 0.00405450632363357 586791 1472657 667 665 0 True 369 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 414 443 0.00969668518910606 0.0504030045358303 0.00971999694819562 0.051468680857557 0.00164335011822203 0.00874857318191976 423860 2196602 667 665 0 True 414 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 458 442 0.00992595942815958 0.0945390025762507 0.00997940032043946 0.0936293583581292 0.00181707158821163 0.0140454789247938 433882 4120083 667 665 0 True 458 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 502 441 0.0099995779176102 0.0555859320996471 0.0100862134737163 0.0580148012512398 0.0017842813418928 0.0132980613889716 437100 2422478 667 665 0 True 503 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 546 440 0.00960076153271499 0.0461972968585345 0.00958266575112535 0.0473334859235523 0.00181545445371858 0.00880525493046456 419667 2013314 667 665 0 True 547 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 591 441 0.00951275335095098 0.031887867987662 0.00943007553215839 0.0321965362020294 0.00187755845815473 0.00447127565835553 415820 1389698 667 665 0 True 592 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 635 441 0.00965212060941376 0.0380323892817418 0.00959792477302205 0.0383306630045014 0.00191674550251243 0.0053628843644396 421912 1657481 667 665 0 True 637 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 678 441 0.00923783930877317 0.0727901236267597 0.00933852140077821 0.0706645304036011 0.00195108192435783 0.0158283780530915 403803 3172250 667 665 0 True 681 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 282 486 0.0090548683085786 0.0524089349030622 0.00904859998474098 0.052628366521706 0.00149527295933041 0.0155917166321954 395805 2284022 667 665 0 True 280 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 326 486 0.00951067153536988 0.0537338539757496 0.00944533455405508 0.0539559014267186 0.00156213786539641 0.0076299096564053 415729 2341763 667 665 0 True 324 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 371 486 0.00978581434849067 0.067526793637791 0.00978103303578241 0.0649576562142367 0.00152356046769944 0.01695121605061 427756 2942870 667 665 0 True 369 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 415 486 0.00975003457300876 0.0886450275379453 0.0097962920576791 0.0849317158770123 0.00176589997634699 0.0202503196531096 426192 3863219 667 665 0 True 414 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 459 486 0.00998029252711708 0.0925079464511588 0.00994888227664607 0.0885938811322194 0.00204405672365604 0.0286130458642477 436257 4031568 667 665 0 True 458 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 503 486 0.00965134278820763 0.04258221658518 0.00962844281681544 0.0434729533836881 0.00179160868422743 0.00676502910148871 421878 1855766 667 665 0 True 503 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 547 485 0.0097647674217366 0.0387983003973656 0.0098115510795758 0.0400549324788281 0.00185419166627999 0.00560316340478875 426836 1690860 667 665 0 True 548 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 591 485 0.00953075762416343 0.0996185359255314 0.00953688868543526 0.095551995117113 0.00191452135053849 0.0185065403220509 416607 4341453 667 665 0 True 592 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 635 485 0.00947164321249767 0.0617562904744122 0.00944533455405508 0.0621957732509346 0.00189219280982338 0.0178813557006075 414023 2691387 667 665 0 True 637 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 680 485 0.00924930073301642 0.0706755444344439 0.00926222629129473 0.0688029297322042 0.00183823000957195 0.0114931685890528 404304 3080095 667 665 0 True 682 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 282 530 0.00904059300173671 0.0497345905390622 0.00900282291905089 0.0532692454413672 0.00142727135536882 0.0123563972580389 395181 2167472 667 665 0 True 280 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 327 529 0.00948127446919708 0.111147885736314 0.00949111161974517 0.110749980926223 0.00154549291430889 0.0328369402228841 414444 4843911 667 665 0 True 325 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 371 530 0.00978926878972965 0.0583411607526484 0.00973525597009232 0.0600289921416037 0.00144183315151639 0.0128812953361728 427907 2542553 667 665 0 True 369 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 416 529 0.00977002915342512 0.0591930960383334 0.00971999694819562 0.0591287098496986 0.00180120097143077 0.00833503205061345 427066 2579681 667 665 0 True 414 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 460 529 0.00991751778036365 0.0547535926105031 0.00987258716716258 0.0552071412222477 0.00198017492981198 0.0068273650866319 433513 2386204 667 665 0 True 458 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 504 526 0.00964809424081733 0.063883489910402 0.00965896086060884 0.0636911573968109 0.00189387710348202 0.0147479000125997 421736 2784092 667 665 0 True 503 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 548 527 0.00979883141514617 0.0732613176337502 0.00976577401388571 0.0708628976882582 0.00176746788515669 0.0186733619126099 428325 3192785 667 665 0 True 548 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 592 526 0.00946731944167536 0.056297071357726 0.00952162966353857 0.0578164339665827 0.00179449817822867 0.01405295872214 413834 2453470 667 665 0 True 592 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 636 526 0.0096223117555436 0.0476119802825902 0.00965896086060884 0.0466163118944076 0.0018958352052756 0.00732797898087891 420609 2074967 667 665 0 True 637 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 681 526 0.00928723095536233 0.0618764122482907 0.0093690394445716 0.0614633401998932 0.00186586909929443 0.0154380227927161 405962 2696622 667 665 0 True 682 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 283 571 0.00890410825715547 0.0442832648111467 0.00888075074387732 0.04614328221561 0.00134556960080697 0.0099368330618117 389215 1929899 667 665 0 True 280 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 328 570 0.00934058033926502 0.053957943611604 0.0093690394445716 0.0548714427405203 0.00149670924624392 0.0113991665645893 408294 2351529 667 665 0 True 325 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 371 571 0.00965221211779096 0.044328192878626 0.00958266575112535 0.0453803311207752 0.00131823652978628 0.0083308857946015 421916 1931857 667 665 0 True 369 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 416 570 0.00959755873951328 0.0498602881660549 0.00961318379491875 0.0489662012664988 0.00174679182202138 0.00755229185943136 419527 2172950 667 665 0 True 414 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 461 570 0.00967744555280154 0.0871759393907061 0.00968947890440223 0.0839856565194171 0.00200447442882172 0.0204932524281232 423019 3799195 667 665 0 True 459 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 504 568 0.00952361997074249 0.0606670946076567 0.00952162966353857 0.0596932936598764 0.00216118588516764 0.0127957424103119 416295 2643919 667 665 0 True 503 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 548 568 0.00946185181613817 0.0529386409489047 0.00947585259784848 0.0536202029449912 0.0019135748171779 0.0079533178728291 413595 2307107 667 665 0 True 548 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 593 570 0.00947713371512916 0.0352752561192407 0.00946059357595178 0.0378118562600137 0.00169747735998229 0.00986573295367656 414263 1537323 667 665 0 False 593 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 636 568 0.00960000658860316 0.0464143191579314 0.00967421988250553 0.0466010528725109 0.00162323074414788 0.00916423064232704 419634 2022772 667 665 0 True 637 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 681 567 0.00938013483530608 0.0523802984228711 0.00930800335698482 0.0521705958648051 0.00167637664295893 0.00873379587545282 410023 2282774 667 665 0 True 682 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 280 615 0.00875218147392314 0.00892326949210977 0.00871290150301366 0.0089417868314641 0.00137120554520212 0.0013573430747903 382574 388883 667 665 0 False 280 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 325 615 0.008901614653877 0.00890472920685784 0.00889600976577401 0.00883497367818723 0.00143484068393983 0.00141842738117088 389106 388075 667 665 0 False 325 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 371 613 0.00938747838257571 0.0734670276056358 0.00935378042267491 0.0710002288853284 0.00133623663133532 0.0171754158998763 410344 3201750 667 665 0 True 369 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 415 613 0.00955910234399852 0.0762129402242158 0.00930800335698482 0.0750743877317464 0.00231210968613057 0.0212627859699075 417846 3321419 667 665 0 True 414 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 459 614 0.00925989282767634 0.00928251046476342 0.00933852140077821 0.0093690394445716 0.00188249827619751 0.00195780539011548 404767 404539 667 665 0 False 459 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 503 614 0.00894249602138734 0.00906771391743263 0.00898756389715419 0.00906385900663768 0.00194083933682541 0.00201892205873464 390893 395178 667 665 0 False 503 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 548 614 0.00912313355796352 0.00909387224068411 0.00904859998474098 0.00906385900663768 0.00190028960672591 0.00199843928303191 398789 396318 667 665 0 False 548 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 593 614 0.00920640618120786 0.00902333655149547 0.00926222629129473 0.00904859998474098 0.00157092402573396 0.0015613648844998 402429 393244 667 665 0 False 593 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 637 614 0.00904800518028923 0.00893742711092219 0.00901808194094758 0.0089417868314641 0.00141123447560542 0.00152717374764762 395505 389500 667 665 0 False 637 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 682 614 0.00909961590502529 0.00910383076023774 0.00914015411612116 0.00912489509422446 0.00152748679273951 0.00156155779309261 397761 396752 667 665 0 False 682 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 281 664 0.00886565186164071 0.0400482552226297 0.00888075074387732 0.040360112916762 0.0013350075583212 0.00874164706005734 387534 1745334 667 665 0 True 280 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 325 658 0.00911537822299653 0.00892673432264571 0.0089570458533608 0.00885023270008392 0.00275815321933333 0.00151135778410744 398450 389034 667 665 0 False 325 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 370 658 0.00883485929271574 0.00901193244039373 0.00889600976577401 0.00903334096284428 0.00128461741316544 0.00125174198520447 386188 392747 667 665 0 False 370 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 414 658 0.00889381356472142 0.00906938896795663 0.00892652780956741 0.00909437705043107 0.00142926083088022 0.00145533064422535 388765 395251 667 665 0 False 414 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 459 658 0.00890513772639887 0.0089202635795256 0.00892652780956741 0.00886549172198062 0.00164172642821401 0.00159292545180481 389260 388752 667 665 0 False 459 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 504 658 0.00879141569064404 0.00877905452576279 0.00885023270008392 0.00881971465629053 0.00168509971203341 0.00179789662638617 384289 382598 667 665 0 False 504 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 548 658 0.00893474068642035 0.00886466566966742 0.00886549172198062 0.00889600976577401 0.00159159000311559 0.00165497034218187 390554 386329 667 665 0 False 548 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 593 657 0.00907465699514628 0.00908900771039524 0.00912489509422446 0.00906385900663768 0.00144930398611996 0.00132038987610239 396670 396106 667 665 0 False 593 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 638 657 0.0091027500669441 0.00902248755328468 0.00923170824750134 0.00906385900663768 0.00144308183365895 0.00129360092421318 397898 393207 667 665 0 False 638 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 678 663 0.00911631618386275 0.0392676128407538 0.00914015411612116 0.0396887159533074 0.00151652351831583 0.00870697886565482 398491 1711313 667 665 0 True 682 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F2_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F2_2.csv new file mode 100755 index 0000000..fb24cfa --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F2_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 279 267 0.00814401679910788 0.751143801366543 0.00817883573662928 0.747386892500191 0.00170318330306016 0.182428087463261 355990 32735429 667 665 14 True 279 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 324 267 0.00660420533610512 0.00645312067075448 0.00657663843747616 0.00651560234988937 0.00144188742594493 0.00122726145932268 288682 281232 667 665 0 False 324 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 367 267 0.00608363705535651 0.00628694648041482 0.00611886778057527 0.00628671702143893 0.00123107893901275 0.00119098682466848 265927 273990 667 665 0 True 368 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 412 267 0.00616976931538808 0.006264826635139 0.00617990386816205 0.00627145799954223 0.00156344790787722 0.00134915279818991 269692 273026 667 665 0 True 413 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 456 267 0.00637987254941996 0.00648161947556004 0.0063935301747158 0.00657663843747616 0.00164225200384922 0.0016463244845103 278876 282474 667 665 0 True 458 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 500 266 0.00674620346041216 0.00681178799596841 0.00672922865644312 0.00679026474402991 0.00158742308395503 0.00156882914387235 294889 296863 667 665 0 True 502 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 543 265 0.00675281494066425 0.00665208454874885 0.00683604180972 0.00671396963454643 0.00159343147597627 0.00146019045752667 295178 289903 667 665 0 True 547 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 589 265 0.00697204613532099 0.00717414961069416 0.00692759594110018 0.00718699931334401 0.0017760208842163 0.00189811884518793 304761 312655 667 665 0 True 592 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 636 266 0.00954942533311051 0.00781502853035541 0.00830090791180285 0.00781261921110857 0.00730593595600456 0.0017982175576507 417423 340585 667 665 0 False 636 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 675 266 0.00917099243923472 0.750976984691071 0.00915541313801785 0.734126802471961 0.00196286608847869 0.168589932757891 400881 32728159 667 665 12 True 681 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 279 311 0.00666997698221157 0.00636482485683194 0.00665293354695964 0.0064087891966125 0.00145181531094066 0.00142419095468211 291557 277384 667 665 0 False 279 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 324 310 0.0061717367454977 0.00628290800243915 0.00619516289005875 0.00634775310902571 0.00121295657808107 0.00114410651175222 269778 273814 667 665 0 False 324 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 368 311 0.00611360604888675 0.00632230610859949 0.00610360875867857 0.00630197604333562 0.00126895334097741 0.00129558918548882 267237 275531 667 665 0 True 368 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 412 311 0.00645776905550429 0.00658925868115012 0.00654612039368277 0.00665293354695964 0.00143752841728849 0.00153305065892642 282281 287165 667 665 0 True 413 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 457 311 0.0066131502799756 0.00679799751151741 0.00662241550316625 0.00686655985351339 0.00176485045590413 0.00169734652614082 289073 296262 667 665 0 True 458 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 502 310 0.00682698248037803 0.00695113843202651 0.00689707789730678 0.00698863202868696 0.00168671146001931 0.00158806476685711 298420 302936 667 665 0 False 502 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 544 310 0.00683764320632085 0.00685474271625505 0.00685130083161669 0.00686655985351339 0.00158373628508989 0.00136964646446006 298886 298735 667 665 0 True 547 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 589 310 0.00711509660596573 0.00719840342444576 0.00718699931334401 0.00714122224765393 0.00184950540589747 0.00206097635632562 311014 313712 667 665 0 True 592 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 636 309 0.00748209095269257 0.00747228565806827 0.00741588464179446 0.00756847486076143 0.00194676390969504 0.00192677864321166 327056 325648 667 665 0 False 636 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 681 309 0.00741279623406424 0.00738171820028441 0.00741588464179446 0.00741588464179446 0.00196479349166281 0.00190743776109246 324027 321701 667 665 0 False 681 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 279 355 0.00594596270187177 0.00593039017777908 0.00599679560540169 0.0059510185397116 0.00137595805204124 0.00142340895457627 259909 258451 667 665 0 True 279 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 324 355 0.00610205311626631 0.00621519465865396 0.00610360875867857 0.00614938582436866 0.00136262223174489 0.00131550819987546 266732 270863 667 665 0 True 324 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 368 356 0.00644095439119534 0.00667542052659688 0.00648508430609598 0.00669871061264973 0.00131648599358763 0.00126735233692422 281546 290920 667 665 0 True 369 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 412 355 0.00688074365197809 0.0068372808881898 0.00683604180972 0.00692759594110018 0.0014976978083839 0.00145739172177728 300770 297974 667 665 0 True 413 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 457 355 0.00679417672715485 0.00692624213314242 0.00683604180972 0.00695811398489357 0.00162725528165971 0.00169722023004784 296986 301851 667 665 0 True 458 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 503 353 0.00700025359259029 0.0069267010510942 0.00704966811627375 0.00688181887541009 0.00168805535897307 0.00159127692184356 305994 301871 667 665 0 False 503 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 544 353 0.00687461259070625 0.00702864967408221 0.00688181887541009 0.00709544518196384 0.00159658336409908 0.00164208269997901 300502 306314 667 665 0 True 547 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 589 354 0.00710516794704044 0.0071208003987997 0.00720225833524071 0.00712596322575723 0.00192357523502868 0.00201728940803873 310580 310330 667 665 0 True 592 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 633 354 0.00690071535530015 0.00715248868337013 0.00697337300679027 0.00715648126955062 0.00187141505433797 0.00194547186064396 301643 311711 667 665 0 True 636 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 677 354 0.00632197062375198 0.00652560676123818 0.00631723506523232 0.00646982528419928 0.00185506649046993 0.00193610744693514 276345 284391 667 665 0 True 681 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 281 399 0.00606174367611342 0.00589842654243758 0.00601205462729839 0.00587472343022812 0.00144626584200616 0.00134463724523883 264970 257058 667 665 0 True 279 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 325 399 0.0065490486617529 0.0733091139384281 0.00650034332799268 0.0744335088120851 0.00178645886330324 0.0140913903788646 286271 3194868 667 665 0 True 324 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 369 399 0.00772898055435546 0.00669038125182492 0.00672922865644312 0.00668345159075303 0.00850513520614571 0.00132659799290001 337848 291572 667 665 0 True 369 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 413 399 0.00688760678026745 0.0068623607542546 0.00679026474402991 0.00686655985351339 0.00152619533541883 0.00143297389774075 301070 299067 667 665 0 True 413 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 458 399 0.00700803180465158 0.00688331035875337 0.00701915007248035 0.00689707789730678 0.00163084443021402 0.00154527617039677 306334 299980 667 665 0 True 458 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 501 397 0.00691036948909386 0.00716084099009253 0.00691233691920348 0.00715648126955062 0.00175936709786619 0.00174944323311793 302065 312075 667 665 0 True 503 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 546 397 0.00697920666583623 0.00708385750368138 0.00703440909437705 0.00704966811627375 0.00161289492068522 0.00159056240431828 305074 308720 667 665 0 True 547 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 590 397 0.00666036860260646 0.00689209863752997 0.00665293354695964 0.00695811398489357 0.00192049152832344 0.00199395615389683 291137 300363 667 665 0 True 592 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 634 397 0.00640279539790645 0.00625844767560926 0.00642404821850919 0.00630197604333562 0.00186451251264063 0.00188390230244475 279878 272748 667 665 0 True 637 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 678 397 0.00599514845461225 0.00596843447598167 0.0059662775616083 0.005981536583505 0.00170030193693872 0.00182320390744493 262059 260109 667 665 0 True 681 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 281 442 0.00604154320184838 0.00621340487864202 0.00605783169298848 0.00624093995574884 0.00144304685414603 0.00148289633232516 264087 270785 667 665 0 True 280 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 324 442 0.00636239444937636 0.00636544439606684 0.00633249408712902 0.0063935301747158 0.00168215373217126 0.00135632447441969 278112 277411 667 665 0 True 324 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 369 443 0.00958271150531395 0.0067305365726057 0.00677500572213321 0.00665293354695964 0.0175757176920944 0.00137792147390742 418878 293322 667 665 0 True 369 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 414 443 0.00673675522046713 0.00669765510136063 0.00665293354695964 0.00669871061264973 0.00160399722959182 0.00161264273077629 294476 291889 667 665 0 True 414 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 458 442 0.00708089534999037 0.00718647155769947 0.00718699931334401 0.0072327763790341 0.00185110269654762 0.0018113831783043 309519 313192 667 665 0 True 458 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 502 441 0.00696843155442192 0.00706712994433899 0.00703440909437705 0.00703440909437705 0.00180311416130143 0.00183814134371836 304603 307991 667 665 0 True 503 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 546 440 0.00674842253855906 0.00682353629553398 0.00675974670023652 0.0068055237659266 0.00173392659312996 0.00163823162653022 294986 297375 667 665 0 True 547 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 591 441 0.00633604003674519 0.00625333074044691 0.0063782711528191 0.00627145799954223 0.0019498800056273 0.00188449043549426 276960 272525 667 665 0 True 592 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 635 441 0.00601399918031371 0.00608444893419174 0.00602731364919509 0.00599679560540169 0.00171863301977038 0.00179950220020812 262883 265165 667 665 0 True 637 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 678 441 0.00592795842865933 0.00601574891681022 0.0059662775616083 0.0059662775616083 0.00186468508617756 0.00185449664816844 259122 262171 667 665 0 True 681 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 282 486 0.00610582783682547 0.00607894191877037 0.00605783169298848 0.00607309071488518 0.00154094373851836 0.00151513252752402 266897 264925 667 665 0 True 280 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 326 486 0.00610903063002717 0.00635399439316992 0.00604257267109178 0.00634775310902571 0.00150365779799571 0.00149720778835813 267037 276912 667 665 0 True 324 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 371 486 0.00643708816225899 0.0065061486400827 0.00648508430609598 0.00654612039368277 0.00147971043548176 0.00151386649526251 281377 283543 667 665 0 True 369 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 415 486 0.00650887648416579 0.00653283471897872 0.00643930724040589 0.00650034332799268 0.00169132383372401 0.00164476230155175 284515 284706 667 665 0 True 414 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 459 486 0.00678328723026905 0.0069591006584899 0.0068207827878233 0.00700389105058366 0.00197563228089319 0.00191867872607869 296510 303283 667 665 0 True 458 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 503 486 0.00668615108788018 0.00682587677708806 0.00669871061264973 0.0068055237659266 0.00181592012183699 0.0021317802972485 292264 297477 667 665 0 True 503 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 547 485 0.00622547504000346 0.0061066835089555 0.00621042191195544 0.00610360875867857 0.00169111293237157 0.00167429567654547 272127 266134 667 665 0 True 548 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 591 485 0.00605945596668363 0.00608862508755294 0.00605783169298848 0.00608834973678187 0.00182642401921309 0.00174452952967314 264870 265347 667 665 0 True 592 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 635 485 0.00588396577632447 0.00604450012648926 0.00585946440833143 0.00599679560540169 0.00190678506405832 0.00163147798184397 257199 263424 667 665 0 True 637 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 680 485 0.00588394289923017 0.00609069021833595 0.005981536583505 0.00608834973678187 0.0017865069391919 0.00185015501330638 257198 265437 667 665 0 True 682 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 282 530 0.00607478361986322 0.006097275690944 0.00604257267109178 0.00610360875867857 0.00145027527328332 0.00141247463416796 265540 265724 667 665 0 True 280 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 327 529 0.0061293912439523 0.00644614511788742 0.00616464484626535 0.00651560234988937 0.00140799130241384 0.00143943941432608 267927 280928 667 665 0 True 325 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 371 530 0.00641727659859702 0.00650768601522116 0.00642404821850919 0.00642404821850919 0.00147535636967485 0.00148173034986147 280511 283610 667 665 0 True 369 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 416 529 0.00647694006052593 0.00661596770594373 0.00653086137178607 0.00662241550316625 0.0017157438869966 0.00172658598811192 283119 288329 667 665 0 True 414 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 460 529 0.00650141855142468 0.00630505079361255 0.00643930724040589 0.0063782711528191 0.00191447607379744 0.00182430150932332 284189 274779 667 665 0 True 458 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 504 526 0.00642059377727021 0.00675949429536304 0.0063782711528191 0.00669871061264973 0.00184649779472025 0.00187494094083868 280656 294584 667 665 0 True 503 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 548 527 0.00639453676686491 0.00647659432398804 0.0063935301747158 0.00650034332799268 0.00170001724303297 0.00174765552016407 279517 282255 667 665 0 True 548 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 592 526 0.00619294381191185 0.00619582832108883 0.00624093995574884 0.00614938582436866 0.00167324169069697 0.00165188494690197 270705 270019 667 665 0 True 592 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 636 526 0.00630572788680048 0.0065445830185443 0.00628671702143893 0.00656137941557946 0.00185381646775984 0.00192667956838009 275635 285218 667 665 0 True 637 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 681 526 0.00623087403425776 0.00630378876924515 0.00628671702143893 0.00627145799954223 0.00173022915971329 0.00170218471876673 272363 274724 667 665 0 True 682 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 283 571 0.00629147545705289 0.00627728625752984 0.00625619897764553 0.00621042191195544 0.00136683303626118 0.00124986802387663 275012 273569 667 665 0 True 280 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 328 570 0.006444614726283 0.00650199543261909 0.00646982528419928 0.00651560234988937 0.0014897976881569 0.00144335778485443 281706 283362 667 665 0 True 325 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 371 571 0.00644381402798258 0.00638722005287882 0.00645456626230259 0.0063782711528191 0.00135043766366367 0.00126271071158982 281671 278360 667 665 0 True 369 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 416 570 0.00628388026174599 0.00634885451210998 0.00622568093385214 0.0063935301747158 0.00165351728714599 0.00160343868685616 274680 276688 667 665 0 True 414 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 461 570 0.0064598279939911 0.00639031774905334 0.00654612039368277 0.00631723506523232 0.00191166481671033 0.00169702514007404 282371 278495 667 665 0 True 459 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 504 568 0.00630430950695401 0.00645009181227273 0.00636301213092241 0.0064087891966125 0.00195516377270017 0.00213564391348823 275573 281100 667 665 0 True 503 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 548 568 0.00651807307607354 0.00655745566709174 0.00654612039368277 0.00657663843747616 0.00178794908777291 0.00173796556377246 284917 285779 667 665 0 True 548 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 593 570 0.00658894631420843 0.00655823582760977 0.00657663843747616 0.00653086137178607 0.00155449917197452 0.00145882950243958 288015 285813 667 665 0 False 593 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 636 568 0.00634171355613107 0.00647108730856668 0.00628671702143893 0.00646982528419928 0.0015907703490876 0.00150346950068483 277208 282015 667 665 0 True 637 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 681 567 0.00622192909038728 0.00621331309505166 0.00622568093385214 0.00625619897764553 0.00166972439276764 0.00166030880556162 271972 270781 667 665 0 True 682 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 280 615 0.00631988880817087 0.00645302888716412 0.00622568093385214 0.00646982528419928 0.0013556776720118 0.00139747536229045 276254 281228 667 665 0 False 280 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 325 615 0.00642645031341047 0.00627531291033718 0.00646982528419928 0.00624093995574884 0.00141363299633554 0.00137343071796905 280912 273483 667 665 0 False 325 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 371 613 0.00644822930718207 0.0062529177142903 0.00646982528419928 0.00624093995574884 0.00132032917564719 0.00134862000836506 281864 272507 667 665 0 True 369 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 415 613 0.0061793548178989 0.00630750600465458 0.00611886778057527 0.00630197604333562 0.00164787238242545 0.00147135684337476 270111 274886 667 665 0 True 414 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 459 614 0.00612708065742821 0.00623031600516512 0.00613412680247196 0.00613412680247196 0.00188044692509682 0.00183026180660463 267826 271522 667 665 0 False 459 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 503 614 0.00624258710653829 0.00639571003498676 0.00630197604333562 0.0063782711528191 0.00190157618001416 0.00198067573934435 272875 278730 667 665 0 False 503 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 548 614 0.0064358985533555 0.0064491051386764 0.00642404821850919 0.0063782711528191 0.00172172446445109 0.00192493751340842 281325 281057 667 665 0 False 548 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 593 614 0.00619431643756973 0.00616101939444629 0.00616464484626535 0.00621042191195544 0.00153049619494411 0.00155326697922468 270765 268502 667 665 0 False 593 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 637 614 0.0063891835267992 0.00643944491579142 0.00634775310902571 0.00646982528419928 0.00141504224617618 0.0014862957014306 279283 280636 667 665 0 False 637 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 682 614 0.0065119877689903 0.00641583358717233 0.00650034332799268 0.0064087891966125 0.0015589345229456 0.00160004924560129 284651 279607 667 665 0 False 682 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 281 664 0.0083536624912538 0.742473074423298 0.00796520943007553 0.736446173800259 0.00237346167575119 0.189828136625163 365154 32357552 667 665 13 True 280 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 325 658 0.00679072228591587 0.00642680172621988 0.00669871061264973 0.0064087891966125 0.00190253229008202 0.00135678147906244 296835 280085 667 665 0 False 325 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 370 658 0.00605986775438099 0.00605969031069319 0.00605783169298848 0.00611886778057527 0.00131833749749748 0.00112897459999627 264888 264086 667 665 0 False 370 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 414 658 0.00597874557800065 0.00603454160693563 0.005981536583505 0.00601205462729839 0.00140826560018969 0.001384226765444 261342 262990 667 665 0 False 414 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 459 658 0.00603438267133314 0.00607765694850539 0.00605783169298848 0.00599679560540169 0.00159458323291333 0.00148304116477523 263774 264869 667 665 0 False 459 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 504 658 0.00595916278528166 0.00610149773610038 0.00602731364919509 0.00617990386816205 0.00160072518896302 0.00170904069897133 260486 265908 667 665 0 False 504 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 548 658 0.00613762699789954 0.00612781668063498 0.00613412680247196 0.00627145799954223 0.0016122697864137 0.00173812131114626 268287 267055 667 665 0 False 548 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 593 657 0.00642107419625047 0.00629614778534801 0.00642404821850919 0.00630197604333562 0.00143713327640898 0.0011253025260501 280677 274391 667 665 0 False 593 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 638 657 0.00727221648960368 0.00690942279020967 0.00708018616006714 0.00689707789730678 0.00214914049395668 0.00131553745082477 317882 301118 667 665 0 False 638 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 678 663 0.00847228022518839 0.744286098629499 0.0081025406271458 0.749080643930724 0.00241948140166203 0.200070504529493 370339 32436565 667 665 14 True 682 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F2_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F2_3.csv new file mode 100755 index 0000000..d60dc5e --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F2_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 279 267 0.00105001287408482 0.0778584134862218 0.000930800335698482 0.0751201647974365 0.000758823326919159 0.0223802724560815 45898 3393130 667 665 0 True 279 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 324 267 0.000884405588462349 0.00104073413104746 0.000762951094834821 0.000946059357595178 0.000640143136801556 0.000682156900259808 38659 45356 667 665 0 False 324 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 367 267 0.00090048818575377 0.000936100838041545 0.00080872816052491 0.000823987182421607 0.000636462278327136 0.000668851599491201 39362 40796 667 665 0 True 368 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 412 267 0.000878137264624726 0.000931442820830974 0.000686655985351339 0.000778210116731518 0.00073702580433674 0.000748074520948111 38385 40593 667 665 0 True 413 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 456 267 0.000923502542617453 0.000979927502436568 0.000701915007248035 0.000747692072938125 0.000884812703664855 0.000891827071578858 40368 42706 667 665 0 True 458 267 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 500 266 0.00103827692471 0.000980065177822102 0.000900282291905089 0.000762951094834821 0.000861910186272034 0.000871837426378512 45385 42712 667 665 0 True 502 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 543 265 0.000945761955369306 0.000918845523054604 0.000778210116731518 0.000701915007248035 0.000793106706135375 0.000820359015752816 41341 40044 667 665 0 True 547 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 589 265 0.000933454078637038 0.000988210971466203 0.000625619897764553 0.000610360875867857 0.000923241736497812 0.00102453020735788 40803 43067 667 665 0 True 592 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 636 266 0.00109105438125524 0.000999729812055889 0.000686655985351339 0.000656137941557946 0.00115254086331669 0.000962529933595045 47692 43569 667 665 0 False 636 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 675 266 0.00114611954723028 0.0777340926130846 0.000885023270008392 0.0742809185931182 0.000978357652394057 0.0210624567882496 50099 3387712 667 665 0 True 681 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 279 311 0.000856815812739087 0.000978413073195692 0.000701915007248035 0.000823987182421607 0.000704992121099488 0.00072949735324903 37453 42640 667 665 0 False 279 311 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 324 310 0.00088678480626933 0.000987729107616833 0.000778210116731518 0.000869764248111696 0.000623529319395702 0.000660305612848281 38763 43046 667 665 0 False 324 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 368 311 0.000927597542496776 0.000955994931251223 0.00080872816052491 0.000854505226215 0.000661088810462961 0.000659630845218677 40547 41663 667 665 0 True 368 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 412 311 0.000898703772398534 0.000951405751733419 0.000732433051041428 0.000778210116731518 0.000753056153083733 0.000745619001963722 39284 41463 667 665 0 True 413 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 457 311 0.000978384691838105 0.000958656655371549 0.000793469138628214 0.000717174029144732 0.000877789322907695 0.000904254208841121 42767 41779 667 665 0 True 458 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 502 310 0.000977515362254785 0.00103196879816846 0.000747692072938125 0.000854505226215 0.000894781864970929 0.00084953630885601 42729 44974 667 665 0 False 502 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 544 310 0.000940614609152279 0.000979216179611308 0.000747692072938125 0.000854505226215 0.000784366188937937 0.000751953511756494 41116 42675 667 665 0 True 547 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 589 310 0.00100290893692545 0.00098662770453256 0.000717174029144732 0.000656137941557946 0.00101781194356995 0.00107114131996379 43839 42998 667 665 0 True 592 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 636 309 0.00103470809799952 0.00105197762086608 0.000671396963454643 0.000762951094834821 0.00103143760816401 0.00100453279806434 45229 45846 667 665 0 False 636 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 681 309 0.00098909117196952 0.00113075088728918 0.00064087891966125 0.000915541313801785 0.000953860094774296 0.0010595860338482 43235 49279 667 665 0 False 681 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 279 355 0.000908037626872076 0.000897804134965475 0.000747692072938125 0.000732433051041428 0.000723999736237159 0.000773407582407211 39692 39127 667 665 0 True 279 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 324 355 0.00091407717976672 0.000874628778400568 0.000747692072938125 0.000747692072938125 0.000725291045735245 0.000662844798939631 39956 38117 667 665 0 True 324 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 368 356 0.000973260222715376 0.000973686218292355 0.000823987182421607 0.000885023270008392 0.00068959941825687 0.000693753723527163 42543 42434 667 665 0 True 369 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 412 355 0.000960586312474342 0.00100197851001961 0.000717174029144732 0.000839246204318303 0.000811244495419965 0.000775517463335931 41989 43667 667 665 0 True 413 354 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 457 355 0.000927643296685372 0.00108304636620161 0.00064087891966125 0.000885023270008392 0.000873452573171454 0.000907934635017515 40549 47200 667 665 0 True 458 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 503 353 0.000983532038055131 0.000971758762894877 0.000717174029144732 0.000686655985351339 0.000890156801730362 0.000884148457360407 42992 42350 667 665 0 False 503 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 544 353 0.000990257903778713 0.000878116554834098 0.000762951094834821 0.000579842832074464 0.000877796922380495 0.00085624258654621 43286 38269 667 665 0 True 547 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 589 354 0.0010164521767498 0.00108293163671367 0.000610360875867857 0.000671396963454643 0.00110234313478252 0.00121186742974969 44431 47195 667 665 0 True 592 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 633 354 0.00100263441179387 0.000966572990039759 0.000610360875867857 0.000488288700694286 0.00104490550679498 0.00106620432872625 43827 42124 667 665 0 True 636 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 677 354 0.00100926876914026 0.00108134836978002 0.000625619897764553 0.000671396963454643 0.000993111875687773 0.00109243615025632 44117 47126 667 665 0 True 681 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 281 399 0.000849243494526484 0.000916023177651155 0.000656137941557946 0.000778210116731518 0.00075714307090346 0.000743111182876289 37122 39921 667 665 0 True 279 398 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 325 399 0.000978155920895126 0.00722137226793236 0.00080872816052491 0.00729381246662089 0.000760885209961062 0.00186705357917354 42757 314713 667 665 0 True 324 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 369 399 0.00109823778886478 0.000951405751733419 0.000930800335698482 0.000778210116731518 0.000986869602890093 0.000764194978947567 48006 41463 667 665 0 True 369 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 413 399 0.000941666955489982 0.000938372481902857 0.000747692072938125 0.000701915007248035 0.000770475495724263 0.000785476863007823 41162 40895 667 665 0 True 413 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 458 399 0.000931440894338823 0.000995232416128442 0.000686655985351339 0.000793469138628214 0.000858635757056735 0.000862806366291283 40715 43373 667 665 0 True 458 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 501 397 0.00104461387983051 0.00100314875079665 0.00080872816052491 0.000686655985351339 0.000943354076821719 0.00095329508388085 45662 43718 667 665 0 True 503 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 546 397 0.000997326925916762 0.000954021584058567 0.000747692072938125 0.000778210116731518 0.00091032873117998 0.000837396172261243 43595 41577 667 665 0 True 547 397 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 590 397 0.000917577375194298 0.00101198292136842 0.000518806744487678 0.000610360875867857 0.0009720366663807 0.00108559850789833 40109 44103 667 665 0 True 592 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 634 397 0.000945990726312284 0.000935137110342806 0.000610360875867857 0.000579842832074464 0.000938476015673497 0.00098920090091557 41351 40754 667 665 0 True 637 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 678 397 0.000971818965774609 0.000987889728899956 0.000656137941557946 0.000579842832074464 0.00094786181978558 0.00101319268034885 42480 43053 667 665 0 True 681 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 281 442 0.00091407717976672 0.00102258392605455 0.000732433051041428 0.000869764248111696 0.000816854639265979 0.000856860868690364 39956 44565 667 665 0 True 280 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 324 442 0.00104614664514847 0.00103536479101163 0.000915541313801785 0.000930800335698482 0.000836003331577524 0.000805063354028757 45729 45122 667 665 0 True 324 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 369 443 0.00129907579970601 0.000925063861301227 0.000930800335698482 0.000823987182421607 0.0018714348975653 0.000713672582644604 56785 40315 667 665 0 True 369 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 414 443 0.000981404468285427 0.00101466759138634 0.000732433051041428 0.000778210116731518 0.000889154431913856 0.000933390978752611 42899 44220 667 665 0 True 414 441 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 458 442 0.000991470389776501 0.00100163432155578 0.000732433051041428 0.000778210116731518 0.000985718276520311 0.000970933399272877 43339 43652 667 665 0 True 458 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 502 441 0.000925652989481455 0.000993304960730965 0.00064087891966125 0.000701915007248035 0.000902084308632899 0.000996312570739361 40462 43289 667 665 0 True 503 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 546 440 0.000979574300741595 0.000911433998133351 0.000732433051041428 0.000625619897764553 0.000903126244667464 0.000856220925981616 42819 39721 667 665 0 True 547 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 591 441 0.000946196620160966 0.00100000516282696 0.000534065766384375 0.000610360875867857 0.00101230866553589 0.00103365712933427 41360 43581 667 665 0 True 592 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 635 441 0.00091853821315481 0.000925958751307199 0.000549324788281071 0.000488288700694286 0.000920499703228794 0.000979158639503072 40151 40354 667 665 0 True 637 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 678 441 0.000932905028373888 0.000997917086146357 0.000564583810177768 0.000579842832074464 0.000947816183529601 0.00101066752272964 40779 43490 667 665 0 True 681 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 282 486 0.000919887961718386 0.000889773070809319 0.000778210116731518 0.000732433051041428 0.000736055326806549 0.000840426788415333 40210 38777 667 665 0 True 280 485 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 326 486 0.000940042681794832 0.000931809955192399 0.000793469138628214 0.000854505226215 0.000821682544608402 0.000778125547217807 41091 40609 667 665 0 True 324 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 371 486 0.00102285776315321 0.000939542722679897 0.000885023270008392 0.000747692072938125 0.00084109020907687 0.000829099457965419 44711 40946 667 665 0 True 369 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 415 486 0.000917623129382894 0.00101588372395856 0.00064087891966125 0.000793469138628214 0.000914027616729239 0.000922481842747464 40111 44273 667 665 0 True 414 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 459 486 0.000876993409909831 0.000968936417491428 0.000488288700694286 0.000610360875867857 0.000953844336081517 0.00101060461678955 38335 42227 667 665 0 True 458 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 503 486 0.000874911594328723 0.00102898583148189 0.000549324788281071 0.000778210116731518 0.000873828900188144 0.000969614926552337 38244 44844 667 665 0 True 503 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 547 485 0.000960334664437065 0.00094858340632997 0.00064087891966125 0.00064087891966125 0.000976868009467229 0.000937653385942884 41978 41340 667 665 0 True 548 484 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 591 485 0.0010263122043922 0.00099107920866483 0.000747692072938125 0.000488288700694286 0.000997423311255194 0.00106112469837602 44862 43192 667 665 0 True 592 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 635 485 0.00100821642280256 0.000938418373698035 0.000656137941557946 0.000534065766384375 0.00102752737843868 0.000925108761943739 44071 40897 667 665 0 True 637 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 680 485 0.00101151072438146 0.00105493764165506 0.000671396963454643 0.000656137941557946 0.00104026102058718 0.00102292740936158 44215 45975 667 665 0 True 682 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 282 530 0.000874271035688382 0.0010034699933629 0.000732433051041428 0.000869764248111696 0.000756139185967128 0.000795402723675846 38216 43732 667 665 0 True 280 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 327 529 0.000930548687661205 0.000827130770391302 0.00080872816052491 0.000686655985351339 0.000809809097070653 0.000723879445272946 40676 36047 667 665 0 True 325 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 371 530 0.000961775921377832 0.000976531509593393 0.000778210116731518 0.000823987182421607 0.000787454169253479 0.000865507834524268 42041 42558 667 665 0 True 369 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 416 529 0.000933408324448442 0.000920199331012356 0.000717174029144732 0.000564583810177768 0.00090596299859027 0.000948669559434117 40801 40103 667 665 0 True 414 528 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 460 529 0.000921969777299494 0.000902301530892922 0.000564583810177768 0.000473029678797589 0.000979114289084205 0.000991661199090997 40301 39323 667 665 0 True 458 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 504 526 0.000917462989722809 0.000993052555857485 0.000610360875867857 0.000625619897764553 0.000940287315618259 0.00101929427709683 40104 43278 667 665 0 True 503 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 548 527 0.000971247038417161 0.000992891934574362 0.000625619897764553 0.000656137941557946 0.000954834753966647 0.000962042508391745 42455 43271 667 665 0 True 548 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 592 526 0.000925721620764349 0.000944636711944659 0.000671396963454643 0.000686655985351339 0.00087441455169529 0.000892153709288679 40465 41168 667 665 0 True 592 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 636 526 0.00101384418799984 0.000973319083930931 0.000656137941557946 0.000518806744487678 0.0010163466916062 0.00103249738425457 44317 42418 667 665 0 True 637 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 681 526 0.00110462049817389 0.00099084974968894 0.000869764248111696 0.000656137941557946 0.000985986899828746 0.000982435811111317 48285 43182 667 665 0 True 682 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 283 571 0.000969805781476394 0.00101147811162147 0.000839246204318303 0.000930800335698482 0.000717360341719381 0.000729830795237386 42392 44081 667 665 0 True 280 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 328 570 0.00105140837683699 0.000999179110513753 0.000961318379491875 0.000854505226215 0.000755228015182018 0.000777377548525491 45959 43545 667 665 0 True 325 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 371 571 0.000898246230512576 0.00102203322451241 0.000778210116731518 0.000885023270008392 0.000678555499037434 0.000692724796657551 39264 44541 667 665 0 True 369 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 416 570 0.000967723965895285 0.000935228893933162 0.000732433051041428 0.000717174029144732 0.000921608890199769 0.000860116127382409 42301 40758 667 665 0 True 414 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 461 570 0.000999477372780765 0.000917514660994441 0.000595101853971161 0.000564583810177768 0.00106865214569172 0.000907293909894736 43689 39986 667 665 0 True 459 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 504 568 0.00086548623147799 0.000968752850310716 0.000457770656900893 0.000381475547417411 0.00105343493371974 0.00119715077006918 37832 42219 667 665 0 True 503 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 548 568 0.000974449831618867 0.000997435222296988 0.000518806744487678 0.000625619897764553 0.00105709250888963 0.00094456048265064 42595 43469 667 665 0 True 548 571 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 593 570 0.000881019778506261 0.0010550753170406 0.000579842832074464 0.00080872816052491 0.000875607993008783 0.000869198294903786 38511 45981 667 665 0 False 593 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 636 568 0.000965184608428219 0.000964117778997735 0.000717174029144732 0.000762951094834821 0.000873260862618215 0.000819017500361887 42190 42017 667 665 0 True 637 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 681 567 0.00101558284716648 0.00102162019835581 0.00080872816052491 0.000747692072938125 0.000854754926240649 0.000920876457903603 44393 44523 667 665 0 True 682 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 280 615 0.000908609554229523 0.00096563220823861 0.00080872816052491 0.000793469138628214 0.000676480700963846 0.000764783384988833 39717 42083 667 665 0 False 280 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 325 615 0.000922107039865281 0.000993809770477923 0.000778210116731518 0.000915541313801785 0.000747350824813186 0.000706171256427716 40307 43311 667 665 0 False 325 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 371 613 0.00089744553221215 0.000932796628788726 0.000732433051041428 0.00080872816052491 0.000750132193032689 0.000695309834267035 39229 40652 667 665 0 True 369 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 415 613 0.0009197278220583 0.000924260754885612 0.000686655985351339 0.000656137941557946 0.000825686552061386 0.000835068383590115 40203 40280 667 665 0 True 414 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 459 614 0.000900419554470876 0.000967697339021621 0.000457770656900893 0.00064087891966125 0.000976302828011178 0.00100515774406371 39359 42173 667 665 0 False 459 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 503 614 0.000973946535544313 0.00100622350107358 0.000473029678797589 0.000518806744487678 0.00109840857368608 0.00111074335558492 42573 43852 667 665 0 False 503 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 548 614 0.000891108577091633 0.000899387401899117 0.000503547722590982 0.000473029678797589 0.000954323939185389 0.00102245030670717 38952 39196 667 665 0 False 548 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 593 614 0.000935650279689636 0.00097448932470797 0.000686655985351339 0.000762951094834821 0.000822816360431956 0.000794289592324188 40899 42469 667 665 0 False 593 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 637 614 0.000948484329590755 0.000955742526377743 0.000717174029144732 0.000762951094834821 0.000787687258494474 0.000782368233562731 41460 41652 667 665 0 False 637 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 682 614 0.0010523234606089 0.00110844747483265 0.000839246204318303 0.000915541313801785 0.000839768915502825 0.000889545277121494 45999 48307 667 665 0 False 682 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 281 664 0.00107659605765897 0.0769518899101726 0.000915541313801785 0.074341954680705 0.000736574192706069 0.0233058387588213 47060 3353623 667 665 0 True 280 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 325 658 0.000945967849217987 0.00100101478232087 0.000823987182421607 0.000900282291905089 0.000675058745221587 0.000654892451052747 41350 43625 667 665 0 False 325 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 370 658 0.000884634359405328 0.000830136682975463 0.000747692072938125 0.000717174029144732 0.000662176723451779 0.000613577444477946 38669 36178 667 665 0 False 370 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 414 658 0.000874568437914254 0.000928230395168512 0.000686655985351339 0.000778210116731518 0.000749781446703419 0.000714671032933262 38229 40453 667 665 0 False 414 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 459 658 0.000957703798592807 0.000868433386051533 0.000686655985351339 0.000656137941557946 0.00086038698226667 0.000785489054539742 41863 37847 667 665 0 False 459 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 504 658 0.000923960084503411 0.000910011352482832 0.000656137941557946 0.000610360875867857 0.000860139938845863 0.000843503065858234 40388 39659 667 665 0 False 504 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 548 658 0.000905589777782201 0.000869305330159916 0.000595101853971161 0.000457770656900893 0.000853070384394967 0.00091023680261319 39585 37885 667 665 0 False 548 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 593 657 0.000979322652704319 0.00096375064463631 0.000778210116731518 0.000854505226215 0.000734969544148575 0.000660137575614331 42808 42001 667 665 0 False 593 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 638 657 0.00107714510792212 0.000963590023353187 0.000946059357595178 0.000823987182421607 0.000784230478351435 0.00070813923529641 47084 41994 667 665 0 False 638 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 678 663 0.00111418312359041 0.0772176263501509 0.000961318379491875 0.0757610437170977 0.000821431955079369 0.0239910049519486 48703 3365204 667 665 0 True 682 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F3_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F3_1.csv new file mode 100755 index 0000000..a040135 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F3_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 277 280 0.00944146832511874 0.0405301420178967 0.00944533455405508 0.0409399557488365 0.00157005027056945 0.0084464992908758 412704 1766335 667 665 0 True 277 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 321 280 0.00917403509277634 0.0093700949558607 0.00915541313801785 0.00933852140077821 0.00139207175309295 0.00149556569052987 401014 408356 667 665 0 False 321 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 365 280 0.00949699103297973 0.0569008238150882 0.00946059357595178 0.0581368734264134 0.00136868044273612 0.00891368985972336 415131 2479782 667 665 0 True 366 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 410 281 0.00956333460644363 0.0782510177939699 0.00953688868543526 0.07690547035935 0.00144404347029584 0.00981320064292335 418031 3410240 667 665 0 True 410 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 454 281 0.0094647343300197 0.0669498419888127 0.00946059357595178 0.0641031509880217 0.00178775885084058 0.013511837584911 413721 2917726 667 665 0 True 455 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 497 280 0.00942218293462561 0.0587636865108526 0.00941481651026169 0.0617074845502403 0.0017324445031165 0.0161663838082092 411861 2560967 667 665 0 True 499 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 542 279 0.00950561569753004 0.0701845710637317 0.00955214770733196 0.0708171206225681 0.00158031598963582 0.021716107964571 415508 3058698 667 665 0 True 544 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 586 279 0.00946221784964693 0.0594987124483215 0.0093842984664683 0.0584267948424506 0.0018117548489815 0.0172435811637596 413611 2593000 667 665 0 True 588 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 633 279 0.011405924412479 0.00913772185097672 0.00970473792629892 0.00912489509422446 0.0123040632175683 0.00198530954681849 498574 398229 667 665 0 False 633 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 671 279 0.0123618209206223 0.0403533897687685 0.00958266575112535 0.0404364080262455 0.0179219411211948 0.00777024543730371 540358 1758632 667 665 0 True 677 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 277 324 0.00936320578552564 0.0095182107247978 0.00933852140077821 0.00956740672922866 0.00145458363863519 0.00143273405544447 409283 414811 667 665 0 False 277 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 321 324 0.00926069352597677 0.00949352093899202 0.00924696726939803 0.00950637064164187 0.00140726784663973 0.00132015899098042 404802 413735 667 665 0 False 321 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 365 325 0.00962059597347126 0.120319177435463 0.00961318379491875 0.122758831158923 0.00138274517560319 0.0368832551610883 420534 5243603 667 665 0 True 366 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 409 325 0.0095941500524629 0.0496401681704834 0.00952162966353857 0.0487525749599451 0.00151757050373033 0.00914014477182751 419378 2163357 667 665 0 True 410 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 453 325 0.00949211821189428 0.0695202873285296 0.00949111161974517 0.0695353627832456 0.00177992133525142 0.0143038227247561 414918 3029748 667 665 0 True 455 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 498 324 0.00956996896379002 0.0389480912168267 0.00956740672922866 0.0405279621576257 0.00172845941441646 0.00654051165951271 418321 1697388 667 665 0 True 499 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 542 324 0.00948491192719044 0.0408415178481796 0.00946059357595178 0.0428778515297169 0.00160615101811149 0.00825488894915687 414603 1779905 667 665 0 True 544 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 586 323 0.00950001080942706 0.0485525555706616 0.00955214770733196 0.0503547722590982 0.00184313750653616 0.0109437637633035 415263 2115958 667 665 0 True 588 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 633 323 0.00984913814550724 0.00921043740043632 0.00950637064164187 0.00930800335698482 0.00431394751530388 0.00206944725800976 430524 401398 667 665 0 False 633 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 677 323 0.00961338968876743 0.00906532754408337 0.00914015411612116 0.00909437705043107 0.00488054600744693 0.00207698950702723 420219 395074 667 665 0 False 677 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 277 369 0.00959062697994102 0.0513164348270539 0.00947585259784848 0.0513160906385901 0.00161953749209865 0.0128931569959488 419224 2236410 667 665 0 True 277 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 322 369 0.00931900723934211 0.0637803022089442 0.00932326237888151 0.0657206073090715 0.00148072088539867 0.0197209490371087 407351 2779595 667 665 0 True 321 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 366 369 0.00929848648575689 0.0380650183481134 0.0093690394445716 0.0396429388876173 0.00138974069419478 0.00747052172257578 406454 1658903 667 665 0 True 366 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 410 370 0.00953878748426199 0.032320398157215 0.00952162966353857 0.0332188906691081 0.00156277993205622 0.00506390257423962 416958 1408548 667 665 0 True 410 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 454 369 0.00962103063826292 0.0676777088062339 0.00964370183871214 0.0662394140535592 0.00185246648584708 0.0132143006882373 420553 2949447 667 665 0 True 455 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 499 368 0.00954578787511715 0.0293000296575726 0.00950637064164187 0.0296940566109712 0.00181321904841679 0.00395715968846172 417264 1276918 667 665 0 True 499 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 544 366 0.00938452723741128 0.0271885711073289 0.00944533455405508 0.0282749675745785 0.00166778880422206 0.00533289103196301 410215 1184899 667 665 0 False 544 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 586 367 0.00943897472184027 0.0494023339419733 0.00953688868543526 0.0495002670328832 0.0019643326057816 0.0117200284021545 412595 2152992 667 665 0 True 588 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 631 367 0.00946494022386838 0.058060853667701 0.00950637064164187 0.0585336079957275 0.00196680652937516 0.0148449274255324 413730 2530337 667 665 0 True 633 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 674 368 0.00920244844389433 0.0629945658378035 0.00914015411612116 0.0629129472800793 0.0018686823324266 0.0189021430305113 402256 2745352 667 665 0 True 678 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 277 411 0.00961670686744062 0.0420819501259443 0.00961318379491875 0.0461127641718166 0.00163843778476183 0.0147437116484036 420364 1833964 667 665 0 False 277 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 322 413 0.00957202790227683 0.0312520142195727 0.00962844281681544 0.0316472114137484 0.00138068488988387 0.00444231924656704 418411 1361987 667 665 0 True 321 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 366 413 0.00958412988516042 0.0829804426378374 0.00953688868543526 0.0812848096437018 0.00150099064643851 0.0200970268377273 418940 3616352 667 665 0 True 366 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 410 413 0.00991523007093386 0.0622813385030441 0.0098115510795758 0.062729839017319 0.00189299585403422 0.0151334542848925 433413 2714269 667 665 0 True 410 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 455 413 0.00973228194783359 0.0427602538045732 0.00965896086060884 0.0440375371938659 0.00171326608042539 0.00828376497430659 425416 1863525 667 665 0 True 455 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 499 411 0.00976792446074971 0.0514213205249333 0.0097962920576791 0.052826733806363 0.00177504077745542 0.0108278274422277 426974 2240981 667 665 0 True 500 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 543 411 0.00990804666332432 0.0392165352727206 0.00973525597009232 0.0409246967269398 0.00207131669795464 0.00640592553548216 433099 1709087 667 665 0 True 544 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 587 411 0.00970142074762573 0.0489163168851403 0.00975051499198901 0.0498054474708171 0.00184161919254644 0.0100316862819338 424067 2131811 667 665 0 True 589 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 631 411 0.00951664245698163 0.0463381387779359 0.00961318379491875 0.048050659952697 0.00190570493957396 0.00882875463325054 415990 2019452 667 665 0 True 633 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 676 412 0.00940909723668722 0.0845506763016491 0.009399557488365 0.0817883573662928 0.00187349572627764 0.0137023449434696 411289 3684784 667 665 0 True 678 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 278 457 0.00950829231756289 0.0415395549987351 0.00952162966353857 0.0424353398947128 0.00156479242318963 0.00649513570743903 415625 1810326 667 665 0 True 277 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 322 457 0.00958920860009455 0.0562270634241819 0.00952162966353857 0.0567177843900206 0.00157351993543559 0.00866312994300611 419162 2450419 667 665 0 True 322 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 367 458 0.00960083016399788 0.034473159323119 0.00959792477302205 0.0349279011215381 0.00153282816175599 0.00412997050209869 419670 1502367 667 665 0 True 366 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 411 458 0.0098333300733474 0.0527797406081007 0.00978103303578241 0.0531624322880903 0.00181131258197944 0.010781048951548 429833 2300182 667 665 0 True 411 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 456 458 0.00989603618881793 0.0918216805460665 0.00990310521095598 0.0915083543144884 0.0021875964184223 0.0119507384146333 432574 4001660 667 665 0 True 455 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 499 456 0.00996226537681034 0.0575921607635477 0.00988784618905928 0.0585946440833143 0.00204266980037199 0.0128017798338981 435469 2509911 667 665 0 True 500 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 543 456 0.0102114884420916 0.0498121247270155 0.00999465934233616 0.0498817425803006 0.00235476105133313 0.0107089531051147 446363 2170851 667 665 0 True 544 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 589 453 0.00956020044452482 0.031224754493237 0.00949111161974517 0.0327763790341039 0.00199891416369043 0.00694252444126789 417894 1360799 667 665 0 False 589 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 632 455 0.00955400075197009 0.0375019260212789 0.00953688868543526 0.0383306630045014 0.00181476173685859 0.00515365760398397 417623 1634363 667 665 0 True 633 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 676 457 0.00957770142166271 0.0699232631819879 0.00962844281681544 0.0678416113527123 0.00191892367101665 0.0131758335033027 418659 3047310 667 665 0 True 678 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 279 502 0.00931896148515351 0.0522901210453463 0.00944533455405508 0.053330281528954 0.00161561507092783 0.0136353314457067 407349 2278844 667 665 0 True 277 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 323 502 0.00937542215388072 0.0554161095115908 0.009399557488365 0.05468833447776 0.00158724272203479 0.00799371711303078 409817 2415077 667 665 0 True 322 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 368 502 0.00954331714893297 0.0695805203097008 0.00952162966353857 0.0664072632944228 0.00163752416942988 0.0175344908018599 417156 3032373 667 665 0 True 366 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 412 502 0.00994574811472726 0.0880385904105652 0.00988784618905928 0.0846112764171817 0.00176711691846469 0.0203101780565171 434747 3836790 667 665 0 True 411 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 457 502 0.00995711803059331 0.095653943740101 0.00988784618905928 0.0921950102998398 0.00196929490078791 0.0304779863688703 435244 4168673 667 665 0 True 455 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 501 500 0.00975541069016876 0.0434211415469321 0.00971999694819562 0.0442511635004196 0.00179574943251889 0.00702444032534953 426427 1892327 667 665 0 True 500 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 544 496 0.0100152029730157 0.0355131591854436 0.0100404364080262 0.039658197909514 0.00206357463458501 0.0106608845968446 437783 1547691 667 665 0 False 544 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 589 500 0.00966170611192458 0.0979245550360222 0.00958266575112535 0.09399557488365 0.00193585228428283 0.0175748729490524 422331 4267628 667 665 0 True 589 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 633 499 0.00965994457566365 0.062105641765205 0.00976577401388571 0.0621805142290379 0.00183593151114993 0.0186947762128917 422254 2706612 667 665 0 True 633 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 677 500 0.00952663974718981 0.0729040729541868 0.00952162966353857 0.0710307469291218 0.00191911782810378 0.0131647333127928 416427 3177216 667 665 0 True 678 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 280 545 0.0091461707919215 0.0519194300697957 0.00915541313801785 0.0542458228427558 0.0014546126513034 0.0120024028067713 399796 2262689 667 665 0 True 277 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 324 546 0.00947038497231128 0.102715199534657 0.0093842984664683 0.0957961394674601 0.00146571271043277 0.0284250024374803 413968 4476408 667 665 0 True 322 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 368 546 0.00951922756863729 0.0371351358483184 0.00952162966353857 0.0371709773403525 0.00158925338607464 0.00850547846042278 416103 1618378 667 665 0 True 366 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 413 546 0.00988816646837945 0.0617790528048205 0.00993362325474937 0.0609597924773022 0.00183225791441661 0.0103794569608097 432230 2692379 667 665 0 True 411 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 457 545 0.0099180897077211 0.0550468411816908 0.00993362325474937 0.0555580987258717 0.00199276551873717 0.00669740944948536 433538 2398984 667 665 0 True 455 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 501 544 0.00996086987405816 0.0660349890519386 0.00984206912336919 0.0653238727397574 0.001931313954719 0.0150329593264072 435408 2877856 667 665 0 True 500 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 546 543 0.00978226839887449 0.0736802867778281 0.00985732814526589 0.0726787212939651 0.0018374737838927 0.0195637622731497 427601 3211044 667 665 0 True 544 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 590 543 0.00962830555424965 0.0560026984375565 0.00967421988250553 0.0570687418936446 0.00175087584467016 0.0126069084625752 420871 2440641 667 665 0 True 589 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 634 542 0.00948898404997547 0.0470606362553213 0.00950637064164187 0.0470283054856184 0.00185222219438265 0.00731344055259999 414781 2050939 667 665 0 True 634 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 678 543 0.00942762768306851 0.06337129158442 0.00932326237888151 0.0632181277180133 0.0017793209762901 0.0143853533119215 412099 2761770 667 665 0 True 678 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 281 589 0.00940747296299207 0.0447661841718051 0.00935378042267491 0.0460212100404364 0.0014191403878669 0.0103617447182247 411218 1950945 667 665 0 True 277 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 325 589 0.00932086028398024 0.0570795264655115 0.00921644922560464 0.057450217441062 0.00154703368019476 0.0139196367015489 407432 2487570 667 665 0 True 322 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 369 589 0.00955098097552277 0.0445164180765487 0.00958266575112535 0.0456549935149157 0.00134586285274592 0.00838628902066856 417491 1940060 667 665 0 True 366 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 413 587 0.00979453052141816 0.0502754023993378 0.00971999694819562 0.0501564049744411 0.00176912590292298 0.00727298041277302 428137 2191041 667 665 0 True 411 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 458 586 0.00976069529895158 0.0899632005167416 0.0098268101014725 0.0856794079499504 0.00203030281738536 0.021802291204445 426658 3920666 667 665 0 True 456 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 501 585 0.00946331595017323 0.0703203189938683 0.00944533455405508 0.0689402609292744 0.00200018541689706 0.0169029541734918 413659 3064614 667 665 0 True 500 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 546 585 0.00943304955441712 0.0540025963283122 0.0093842984664683 0.0536659800106813 0.00197173278625617 0.00781592329519852 412336 2353475 667 665 0 True 545 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 590 584 0.00940504799099649 0.0370462893328538 0.00949111161974517 0.0385137712672618 0.00176721872762375 0.00789134708623995 411112 1614506 667 665 0 True 589 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 634 584 0.00943380449852894 0.0472152916050713 0.00941481651026169 0.047348744945449 0.00160886703224727 0.00905590936481852 412369 2057679 667 665 0 True 634 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 678 585 0.00948669634054568 0.0535880786883666 0.00943007553215839 0.0520943007553216 0.00169712544572354 0.0090192965480274 414681 2335410 667 665 0 True 678 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 278 627 0.00908890942489387 0.00894499925712657 0.00904859998474098 0.0089723048752575 0.00145799847604614 0.00139213809440234 397293 389830 667 665 0 False 278 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 322 627 0.00891481473728688 0.00894896889740946 0.00886549172198062 0.0089417868314641 0.0013667865337013 0.00126004378717296 389683 390003 667 665 0 False 322 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 370 630 0.00914459227241495 0.0787063332398288 0.00910963607232776 0.0747234302281224 0.00133727434700889 0.0162893674217054 399727 3430083 667 665 0 True 367 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 414 630 0.00945917519610531 0.0796064549104508 0.00946059357595178 0.0756542305638209 0.00153781403700074 0.021855963906428 413478 3469311 667 665 0 True 411 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 456 627 0.00942586614680758 0.00916477506423417 0.00943007553215839 0.00923170824750134 0.00185044949666496 0.0019525950289341 412022 399408 667 665 0 False 456 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 500 627 0.00914907618289734 0.00920242928217775 0.00915541313801785 0.00914015411612116 0.00184095189564025 0.00191633393577738 399923 401049 667 665 0 False 500 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 545 627 0.00908030763743786 0.0090065631003579 0.00909437705043107 0.00909437705043107 0.0019039534346364 0.00192791699399632 396917 392513 667 665 0 False 545 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 589 626 0.00912896721700949 0.00928271697784172 0.00920119020370794 0.00920119020370794 0.00160545163760615 0.00161714996739705 399044 404548 667 665 0 False 589 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 634 626 0.00916527316566025 0.00905302854297566 0.00921644922560464 0.00915541313801785 0.00154182014594199 0.00140179370870755 400631 394538 667 665 0 False 634 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 678 626 0.00908737665957591 0.00916778097681833 0.00907911802853437 0.00923170824750134 0.00162085642904606 0.00140619396146256 397226 399539 667 665 0 False 678 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 277 677 0.00889360767087274 0.0394970488707463 0.00889600976577401 0.0399938963912413 0.00131471965728296 0.00814046391401367 388756 1721312 667 665 0 True 278 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 322 671 0.00871315315105093 0.00879126174328015 0.00872816052491035 0.00880445563439384 0.0013958644409154 0.00136360056058234 380868 383130 667 665 0 False 322 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 367 670 0.00873978208881368 0.00902900418819996 0.00875867856870375 0.00909437705043107 0.00129677839234567 0.00122072279637745 382032 393491 667 665 0 False 367 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 411 670 0.00899431263997207 0.00896335597519778 0.00901808194094758 0.0089417868314641 0.00145378606304428 0.00144571654867575 393158 390630 667 665 0 False 411 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 456 670 0.00921965201880634 0.00906645189306523 0.00920119020370794 0.00903334096284428 0.00153354101813343 0.00149492443124551 403008 395123 667 665 0 False 456 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 500 670 0.00903626923091441 0.00878380432656372 0.00903334096284428 0.00869764248111696 0.00167205090239924 0.00161196118029087 394992 382805 667 665 0 False 500 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 545 670 0.00889772554784636 0.0090088576901168 0.0089417868314641 0.00900282291905089 0.00174709265305571 0.00186090097087487 388936 392613 667 665 0 False 545 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 589 670 0.00891987057512672 0.00897414054706462 0.00888075074387732 0.00898756389715419 0.0013858571588364 0.00132482761120678 389904 391100 667 665 0 False 589 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 634 670 0.00929812045224813 0.00894830346637938 0.00935378042267491 0.00891126878767071 0.00141632328068018 0.00137656550520679 406438 389974 667 665 0 False 634 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 673 675 0.00914745190920219 0.0396927085394879 0.00915541313801785 0.0398718242160677 0.00150466242148633 0.00799191637461581 399852 1729839 667 665 0 True 678 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F3_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F3_2.csv new file mode 100755 index 0000000..fa9e4f7 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F3_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 277 280 0.00814884386600474 0.727641167464323 0.00785839627679866 0.720622568093385 0.00208068106158543 0.192837086868063 356201 31711166 667 665 12 True 277 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 321 280 0.00665762335129071 0.00643591124756272 0.00660715648126955 0.00642404821850919 0.00146528712238205 0.00151573622731468 291017 280482 667 665 0 False 321 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 365 280 0.00621209193983919 0.00606659702586748 0.00608834973678187 0.00619516289005875 0.00184976040707357 0.00131435811424989 271542 264387 667 665 0 True 366 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 410 281 0.00643514360924367 0.00632161773167182 0.00622568093385214 0.00636301213092241 0.00239385418799938 0.00144562026006102 281292 275501 667 665 0 True 410 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 454 281 0.00632322886393837 0.00636186483604296 0.00631723506523232 0.0063782711528191 0.00171474309925813 0.00175170859425832 276400 277255 667 665 0 True 455 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 497 280 0.00643852941919976 0.00636567385504273 0.0063935301747158 0.00636301213092241 0.00157751665171879 0.00153178745007176 281440 277421 667 665 0 True 499 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 542 279 0.00671490759541264 0.00652126998659386 0.00674448767833982 0.00656137941557946 0.00151364557339923 0.00157855713780782 293521 284202 667 665 0 True 544 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 586 279 0.00686907633388616 0.00694058331913556 0.00689707789730678 0.00695811398489357 0.00169862721500867 0.0018445847186772 300260 302476 667 665 0 True 588 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 633 279 0.014949883721449 0.00751124779217442 0.00814831769283589 0.00744640268558785 0.0289081552131323 0.0020273636584424 653487 327346 667 665 0 False 633 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 671 279 0.0105981799670089 0.726993863693337 0.00918593118181125 0.708934157320516 0.0104106346138178 0.177630874061507 463266 31682956 667 665 11 True 677 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 277 324 0.00672419569569759 0.0064620695708142 0.00672922865644312 0.00643930724040589 0.00150840306826943 0.00145414221156126 293927 281622 667 665 0 False 277 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 321 324 0.00625267590512366 0.00634387525233317 0.00630197604333562 0.00636301213092241 0.00125817499537538 0.00127125889376585 273316 276471 667 665 0 False 321 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 365 325 0.0063141466575021 0.00652877329510547 0.00634775310902571 0.00651560234988937 0.00134578122206398 0.00130676108822641 276003 284529 667 665 0 True 366 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 409 325 0.00628355998242582 0.00657225577103666 0.00627145799954223 0.00662241550316625 0.00146603063714244 0.00149439974037309 274666 286424 667 665 0 True 410 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 453 325 0.00644953330155705 0.0067614446966581 0.00656137941557946 0.00672922865644312 0.00169292934939388 0.00165817346287475 281921 294669 667 665 0 True 455 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 498 324 0.00670328603150931 0.00683051184840104 0.00675974670023652 0.00692759594110018 0.00157149700874594 0.00168660728629856 293013 297679 667 665 0 True 499 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 542 324 0.00657025572816704 0.0067248918817988 0.00663767452506294 0.00677500572213321 0.00152218107366668 0.0015350642042108 287198 293076 667 665 0 True 544 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 586 323 0.00699300155369786 0.00707091601744118 0.00698863202868696 0.00704966811627375 0.00188045310039722 0.00199076057710227 305677 308156 667 665 0 True 588 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 633 323 0.00727340609850717 0.00707224687950134 0.00717174029144732 0.00695811398489357 0.00292666012405339 0.00195564571038751 317934 308214 667 665 0 False 633 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 677 323 0.00727679190846326 0.00696079865491148 0.00714122224765393 0.00691233691920348 0.00307966232898903 0.0018582048176765 318082 303357 667 665 0 False 677 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 277 369 0.00592939968560009 0.00602976886023711 0.005981536583505 0.00599679560540169 0.00132283825620941 0.00141547536435119 259185 262782 667 665 0 True 277 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 322 369 0.00616423305856799 0.00605498640168744 0.00611886778057527 0.00610360875867857 0.00135900272480589 0.00128620611528951 269450 263881 667 665 0 True 321 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 366 369 0.00665140078164168 0.00658485306881303 0.00657663843747616 0.00660715648126955 0.00131652073491921 0.0013932189955551 290745 286973 667 665 0 True 366 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 410 370 0.00654179662286046 0.00674882445298414 0.00651560234988937 0.00674448767833982 0.00145885226703734 0.00143829898807958 285954 294119 667 665 0 True 410 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 454 369 0.00667043452409753 0.00684494481798454 0.00669871061264973 0.00691233691920348 0.00178174615076073 0.00163187670355697 291577 298308 667 665 0 True 455 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 499 368 0.00670914256764957 0.00674714940246015 0.00671396963454643 0.00672922865644312 0.00170839329795433 0.00171721948050432 293269 294046 667 665 0 True 499 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 544 366 0.00660109405128061 0.00673675491085232 0.00659189745937285 0.00685130083161669 0.00170844269112545 0.00175493628299268 288546 293593 667 665 0 False 544 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 586 367 0.00658565201262953 0.00690703641686042 0.00651560234988937 0.00691233691920348 0.00182340243336311 0.00211865183785943 287871 301014 667 665 0 True 588 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 631 367 0.0063838074096392 0.00665018003924896 0.00634775310902571 0.00657663843747616 0.00189888802242103 0.00212202293895986 279048 289820 667 665 0 True 633 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 674 368 0.00595843071826412 0.00613674263479711 0.00593575951781491 0.00610360875867857 0.00180825276966264 0.00189867860999516 260454 267444 667 665 0 True 678 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 277 411 0.00602266959905261 0.00627664377239735 0.005981536583505 0.00625619897764553 0.00138228444303005 0.0014508268291243 263262 273541 667 665 0 False 277 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 322 413 0.00629534168598923 0.00628233435499942 0.0063782711528191 0.00625619897764553 0.00127540348733976 0.00125830149571363 275181 273789 667 665 0 True 321 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 366 413 0.00663190949729987 0.00682027797807634 0.00665293354695964 0.00675974670023652 0.00131098865352573 0.00139021484607816 289893 297233 667 665 0 True 366 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 410 413 0.00685196426735133 0.00683588118843687 0.00677500572213321 0.0068055237659266 0.00178330990990423 0.0014508574457553 299512 297913 667 665 0 True 410 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 455 413 0.00688209340054166 0.00732008551936031 0.00683604180972 0.00730907148851759 0.00159358968773046 0.00211195980358676 300829 319015 667 665 0 True 455 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 499 411 0.00677127675576265 0.00695510807230941 0.00686655985351339 0.00692759594110018 0.00168712059888075 0.00168454538538744 295985 303109 667 665 0 True 500 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 543 411 0.00674158228736399 0.00672638336514208 0.00660715648126955 0.00675974670023652 0.00169162559950107 0.00147039196037698 294687 293141 667 665 0 True 544 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 587 411 0.00639979849855342 0.00668308445639161 0.00642404821850919 0.00666819256885634 0.00187102892178422 0.0020544198676164 279747 291254 667 665 0 True 589 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 631 411 0.00588108326244294 0.00587945028513146 0.00579842832074464 0.00590524147402152 0.00186130850909551 0.00186095715216816 257073 256231 667 665 0 True 633 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 676 412 0.00584683625227899 0.00570005925778052 0.00585946440833143 0.00564583810177768 0.00176851677915523 0.00180334805991628 255576 248413 667 665 0 True 678 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 278 457 0.00617514543254809 0.00619156038413727 0.00614938582436866 0.00617990386816205 0.00149407878064044 0.00153836597166833 269927 269833 667 665 0 True 277 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 322 457 0.00618136800219712 0.00612343401419548 0.00617990386816205 0.00611886778057527 0.00148820238480327 0.00146733494220064 270199 266864 667 665 0 True 322 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 367 458 0.00631819590319283 0.00648097699042754 0.00631723506523232 0.00653086137178607 0.00139621608055214 0.00140937183574685 276180 282446 667 665 0 True 366 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 411 458 0.00668994868553364 0.00667273585657896 0.00662241550316625 0.00663767452506294 0.00162801000060814 0.00151681598737635 292430 290803 667 665 0 True 411 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 456 458 0.00674773622573012 0.00676424409616396 0.00672922865644312 0.0068207827878233 0.00198922068266271 0.00197014070042012 294956 294791 667 665 0 True 455 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 499 456 0.0067371212539759 0.00687307648842867 0.00668345159075303 0.00685130083161669 0.00186523425995223 0.00181931089811378 294492 299534 667 665 0 True 500 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 543 456 0.00686822988139714 0.00615500756927797 0.00668345159075303 0.00628671702143893 0.00231319871679437 0.00181123109992475 300223 268240 667 665 0 True 544 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 589 453 0.00587957337421928 0.00585570128112683 0.00592050049591821 0.00588998245212482 0.00172570199940961 0.00190209603946932 257007 255196 667 665 0 False 589 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 632 455 0.00567580709530792 0.00571231236709306 0.00561532005798428 0.00569161516746777 0.00177792035628525 0.00178498287178854 248100 248947 667 665 0 True 633 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 676 457 0.00585337910124819 0.00577194875492692 0.00584420538643473 0.00569161516746777 0.00194971466124669 0.00188536996941889 255862 251546 667 665 0 True 678 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 279 502 0.00618537149369925 0.00649589182386041 0.00624093995574884 0.00643930724040589 0.00153785025702112 0.00156966032413074 270374 283096 667 665 0 True 277 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 323 502 0.00631034905984865 0.0061743739068431 0.00625619897764553 0.00616464484626535 0.00154337464197959 0.00153894120554348 275837 269084 667 665 0 True 322 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 368 502 0.00629710322225017 0.00624642402527261 0.00630197604333562 0.00631723506523232 0.00145640466115191 0.00156286179871813 275258 272224 667 665 0 True 366 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 412 502 0.00653260003095271 0.00663994616892426 0.0064087891966125 0.00666819256885634 0.00180635629330346 0.0016394036966152 285552 289374 667 665 0 True 411 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 457 502 0.00656455933168687 0.00673292294595495 0.00663767452506294 0.00672922865644312 0.00191911791346182 0.00173889656625654 286949 293426 667 665 0 True 455 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 501 500 0.00622769411815035 0.00615303422208531 0.00619516289005875 0.00622568093385214 0.00166833339205855 0.00171275564525782 272224 268154 667 665 0 True 500 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 544 496 0.00613568244488422 0.00590280920887708 0.00604257267109178 0.00587472343022812 0.00188064678073419 0.00159479820257852 268202 257249 667 665 0 False 544 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 589 500 0.0058510685147241 0.00584647703029604 0.00579842832074464 0.00587472343022812 0.00173519944579679 0.0017176111681459 255761 254794 667 665 0 True 589 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 633 499 0.00583340739792612 0.00565077146975931 0.00585946440833143 0.00564583810177768 0.00174003773714407 0.00176514629599555 254989 246265 667 665 0 True 633 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 677 500 0.00585983044184019 0.00597061433625263 0.00590524147402152 0.00602731364919509 0.00187372464426715 0.00183812659494736 256144 260204 667 665 0 True 678 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 280 545 0.00621758244247068 0.00642638870006327 0.00622568093385214 0.0063935301747158 0.00139401376231394 0.00133753532382201 271782 280067 667 665 0 True 277 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 324 546 0.00610383752962155 0.00630298566282954 0.00608834973678187 0.00625619897764553 0.00142001376303856 0.00139350996083477 266810 274689 667 665 0 True 322 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 368 546 0.00640602106820245 0.00639027185725816 0.00645456626230259 0.0064087891966125 0.00142663759432091 0.00135165902490945 280019 278493 667 665 0 True 366 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 413 546 0.0063924320741895 0.00611134152616607 0.0063935301747158 0.00604257267109178 0.00176132312443909 0.00158020439662907 279425 266337 667 665 0 True 411 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 457 545 0.00629808693730498 0.0061463799117845 0.00630197604333562 0.00614938582436866 0.00199078163145601 0.00204318462087062 275301 267864 667 665 0 True 455 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 501 544 0.00612964289198957 0.00607279241821652 0.00604257267109178 0.00605783169298848 0.0019438806446271 0.00197174507552786 267938 264657 667 665 0 True 500 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 546 543 0.00609178130092656 0.0062800856570357 0.00607309071488518 0.0063935301747158 0.00174200330834928 0.00192296483952703 266283 273691 667 665 0 True 544 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 590 543 0.0059978021975508 0.00604785022753726 0.0059510185397116 0.00610360875867857 0.00165594229015112 0.00148127592800788 262175 263570 667 665 0 True 589 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 634 542 0.00583098242593055 0.0059420466937543 0.00588998245212482 0.00604257267109178 0.00176417228142622 0.00182491711603311 254883 258959 667 665 0 True 634 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 678 543 0.0059967498512131 0.00601675853630414 0.0059662775616083 0.00601205462729839 0.0016529899485814 0.00171559122503096 262129 262215 667 665 0 True 678 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 281 589 0.0080416189250305 0.0136509963395557 0.00660715648126955 0.0072632944228275 0.0117877527948864 0.0469642111909854 351514 594921 667 665 0 True 277 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 325 589 0.00706492713817044 0.00651959493606986 0.00659189745937285 0.00650034332799268 0.00402277645906811 0.00151992345032555 308821 284129 667 665 0 True 322 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 369 589 0.00627601054130751 0.00635798697935041 0.00625619897764553 0.0063782711528191 0.00148316120005968 0.00131052934893082 274336 277086 667 665 0 True 366 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 413 587 0.00623741688322696 0.00602304571224353 0.00621042191195544 0.00599679560540169 0.00173954860826157 0.00155077813622214 272649 262489 667 665 0 True 411 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 458 586 0.00605044239153026 0.00624417532730889 0.00610360875867857 0.00624093995574884 0.00191434596165341 0.00187463020154074 264476 272126 667 665 0 True 456 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 501 585 0.0061794005720875 0.00618506669511958 0.00617990386816205 0.00622568093385214 0.00196297915500417 0.00208684463681549 270113 269550 667 665 0 True 500 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 546 585 0.00612051493136471 0.00624881039862187 0.00617990386816205 0.00619516289005875 0.00189631737483748 0.00170800136314912 267539 272328 667 665 0 True 545 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 590 584 0.00630453827789699 0.00609220464757683 0.00633249408712902 0.00608834973678187 0.00167643316295734 0.00157709613057032 275583 265503 667 665 0 True 589 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 634 584 0.00602953272734198 0.00578592280655863 0.005981536583505 0.00585946440833143 0.00156162335272425 0.00150691848339252 263562 252155 667 665 0 True 634 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 678 585 0.0059554109418168 0.00588660940517923 0.00593575951781491 0.00592050049591821 0.00166812124496993 0.00168553895721585 260322 256543 667 665 0 True 678 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 278 627 0.00665570167536968 0.00655298121706188 0.00656137941557946 0.00656137941557946 0.00139891140760884 0.00135598231577233 290933 285584 667 665 0 False 278 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 322 627 0.00638938942064788 0.00629660670329979 0.00643930724040589 0.00631723506523232 0.00140232079245407 0.00129878986130426 279292 274411 667 665 0 False 322 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 370 630 0.0061522454611559 0.00617056488784332 0.00621042191195544 0.00616464484626535 0.00124743719727718 0.00132141175549955 268926 268918 667 665 0 True 367 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 414 630 0.00589535856928482 0.00609631196324526 0.00599679560540169 0.00613412680247196 0.00154354823040513 0.00144058577931316 257697 265682 667 665 0 True 411 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 456 627 0.00599862577294552 0.00599305542409468 0.00604257267109178 0.00601205462729839 0.00177040212525958 0.00178181516253673 262211 261182 667 665 0 False 456 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 500 627 0.00603230085575203 0.00603107677639969 0.00602731364919509 0.00599679560540169 0.00173057180681057 0.00186489515274283 263683 262839 667 665 0 False 500 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 545 627 0.00589554158603921 0.00613102910629744 0.0059662775616083 0.00601205462729839 0.00173980063918753 0.00188683169908444 257705 267195 667 665 0 False 545 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 589 626 0.00601461686185976 0.00620172541676921 0.00604257267109178 0.00608834973678187 0.00150070122679411 0.00163754934224232 262910 270276 667 665 0 False 589 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 634 626 0.00602662733636615 0.00597139449677065 0.005981536583505 0.00593575951781491 0.00139420513275958 0.00138551421233115 263435 260238 667 665 0 False 634 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 678 626 0.00617663244367745 0.00632072284166585 0.00617990386816205 0.00631723506523232 0.00149855583609068 0.00146400624586169 269992 275462 667 665 0 False 678 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 277 677 0.00847360709665767 0.726381391794891 0.00825513084611276 0.709178301670863 0.002248965301723 0.189298923277535 370397 31656264 667 665 12 True 278 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 322 671 0.00675759625337251 0.00654306858930343 0.00668345159075303 0.00654612039368277 0.00158848115396419 0.00137497968574181 295387 285152 667 665 0 False 322 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 367 670 0.00602292124708989 0.00586146070142167 0.00608834973678187 0.00590524147402152 0.00131822172734591 0.0012175973432857 263273 255447 667 665 0 False 367 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 411 670 0.00583516893418706 0.00580187020538299 0.00582894636453803 0.00590524147402152 0.00134833086688245 0.00135900978636424 255066 252850 667 665 0 False 411 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 456 670 0.00581938373912151 0.00584537562721177 0.00585946440833143 0.00588998245212482 0.00157788967097699 0.00152739467423486 254376 254746 667 665 0 False 456 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 500 670 0.00586403982719101 0.00588580629876362 0.00578316929884794 0.00588998245212482 0.00164076651286262 0.00165079304508014 256328 256508 667 665 0 False 500 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 545 670 0.00589332250789231 0.00591747163743646 0.00590524147402152 0.0059662775616083 0.00173229211345156 0.0018111310643765 257608 257888 667 665 0 False 545 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 589 670 0.00589837834573215 0.00614913341949518 0.00582894636453803 0.00611886778057527 0.00136490471327141 0.00128618351258413 257829 267984 667 665 0 False 589 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 634 670 0.00751853416390912 0.0062176269237984 0.00672922865644312 0.00619516289005875 0.00428774205828644 0.00136653868675428 328649 270969 667 665 0 False 634 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 673 675 0.00773582080555053 0.735852265132963 0.00770580605783169 0.726802471961547 0.00173060494065724 0.184577427212917 338147 32069012 667 665 12 True 678 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F3_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F3_3.csv new file mode 100755 index 0000000..7c115d4 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F3_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 277 280 0.00110661080537781 0.0749889601550225 0.000961318379491875 0.072632944228275 0.000784118559322649 0.0224748034207708 48372 3268077 667 665 0 True 277 281 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 321 280 0.00096278251352694 0.000951268076347885 0.00080872816052491 0.000854505226215 0.000715592514692615 0.000685754004852837 42085 41457 667 665 0 False 321 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 365 280 0.000893602180370103 0.000977816479858378 0.000778210116731518 0.000885023270008392 0.00066238165714913 0.000673658440281614 39061 42614 667 665 0 True 366 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 410 281 0.000902203967826112 0.000822495699078321 0.000732433051041428 0.000625619897764553 0.000742357719683149 0.000705870669736011 39437 35845 667 665 0 True 410 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 454 281 0.000934986843954997 0.000883692407948229 0.000671396963454643 0.000595101853971161 0.000896655323903398 0.000888171729973906 40870 38512 667 665 0 True 455 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 497 280 0.000966580111180391 0.00101397921445867 0.000732433051041428 0.000762951094834821 0.000853243744635623 0.000867309126915501 42251 44190 667 665 0 True 499 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 542 279 0.00102011251183747 0.000938280698312501 0.000869764248111696 0.000732433051041428 0.000819705157130934 0.000819365534875682 44591 40891 667 665 0 True 544 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 586 279 0.000907854610117692 0.00094881286530586 0.000595101853971161 0.000625619897764553 0.000914671330783144 0.000993885906607001 39684 41350 667 665 0 True 588 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 633 279 0.00166840361005123 0.000977334616009009 0.000793469138628214 0.000625619897764553 0.00284459432847374 0.000978749711889472 72929 42593 667 665 0 False 633 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 671 279 0.00128242127505714 0.0745640250775715 0.000885023270008392 0.0719005111772335 0.00148964659819892 0.0205417165643622 56057 3249558 667 665 0 True 677 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 277 324 0.000938372653911085 0.00096143310897982 0.000778210116731518 0.000747692072938125 0.000716275842686812 0.000758083649595973 41018 41900 667 665 0 False 277 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 321 324 0.000915152403198721 0.000852325365944043 0.00080872816052491 0.000732433051041428 0.000641563931356168 0.00060919969229622 40003 37145 667 665 0 False 321 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 365 325 0.000891886398297761 0.00105436399421534 0.000778210116731518 0.000961318379491875 0.000687729877798154 0.000709013948008147 38986 45950 667 665 0 True 366 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 409 325 0.000926659581630563 0.00100603993389287 0.000656137941557946 0.000854505226215 0.000803315126198587 0.000778781264051459 40506 43844 667 665 0 True 410 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 453 325 0.000936450977990062 0.000996700953574139 0.000671396963454643 0.00080872816052491 0.000931908002883981 0.000857201298469093 40934 43437 667 665 0 True 455 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 498 324 0.00103052158974301 0.00096258040385927 0.00080872816052491 0.000747692072938125 0.000907331648942338 0.000859611911519825 45046 41950 667 665 0 True 499 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 542 324 0.000952968240073143 0.000866735389629946 0.000747692072938125 0.000671396963454643 0.000825840528399284 0.000758486019904181 41656 37773 667 665 0 True 544 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 586 323 0.000876833270249746 0.000960400543588314 0.000549324788281071 0.000534065766384375 0.000905529671474106 0.00109977742494461 38328 41855 667 665 0 True 588 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 633 323 0.000952442066904291 0.000979606259870321 0.000549324788281071 0.000564583810177768 0.0010264806285464 0.0010396553180927 41633 42692 667 665 0 False 633 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 677 323 0.000991516143965097 0.00106319816478711 0.000579842832074464 0.000671396963454643 0.00102622611922553 0.00106974660252228 43341 46335 667 665 0 False 677 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 277 369 0.000980855418022277 0.000900764155754458 0.000823987182421607 0.000778210116731518 0.000766596446678821 0.000683424056745828 42875 39256 667 665 0 True 277 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 322 369 0.00095006284909731 0.000838030071746085 0.000839246204318303 0.000671396963454643 0.000696740903473149 0.000694985252234938 41529 36522 667 665 0 True 321 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 366 369 0.00094951379883416 0.00093481586777656 0.000823987182421607 0.000823987182421607 0.000712306548917933 0.000705026991719933 41505 40740 667 665 0 True 366 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 410 370 0.000928352486608607 0.0009280468279878 0.000701915007248035 0.000747692072938125 0.000810916401636545 0.000770542913581142 40580 40445 667 665 0 True 410 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 454 369 0.000990944216607649 0.000943420579372441 0.000701915007248035 0.000610360875867857 0.000901733569417159 0.000896081972256517 43316 41115 667 665 0 True 455 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 499 368 0.0009947418142611 0.000937913563951077 0.000671396963454643 0.000610360875867857 0.000920553845825886 0.000923007579406472 43482 40875 667 665 0 True 499 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 544 366 0.000931806927847589 0.000977357561906598 0.000625619897764553 0.000762951094834821 0.000909103004044703 0.000882690447392829 40731 42594 667 665 0 False 544 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 586 367 0.000922587458845537 0.000956660362281304 0.000488288700694286 0.000534065766384375 0.00103566909488839 0.00109087159420278 40328 41692 667 665 0 True 588 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 631 367 0.000922564581751239 0.000891080986971893 0.000503547722590982 0.000457770656900893 0.000998653370533423 0.000979707582170478 40327 38834 667 665 0 True 633 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 674 368 0.000873699108330934 0.00091730814791614 0.000503547722590982 0.000473029678797589 0.000934428966763652 0.00101474735560112 38191 39977 667 665 0 True 678 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 277 411 0.000958916284590596 0.00095255304661287 0.000823987182421607 0.000793469138628214 0.000747038499356076 0.00082578786274688 41916 41513 667 665 0 False 277 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 322 413 0.000982777093943301 0.00101335967522377 0.000900282291905089 0.000885023270008392 0.000752478582565341 0.000746747399123554 42959 44163 667 665 0 True 321 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 366 413 0.000892481202749506 0.00105505237114301 0.000778210116731518 0.000961318379491875 0.000715176966060446 0.000734999791660445 39012 45980 667 665 0 True 366 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 410 413 0.000903759610238369 0.000887226076176938 0.000656137941557946 0.000671396963454643 0.000819576059403291 0.000802247282569075 39505 38666 667 665 0 True 410 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 455 413 0.000989708853515563 0.000937202241125817 0.000732433051041428 0.000701915007248035 0.000844529372901407 0.000828666743893479 43262 40844 667 665 0 True 455 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 499 411 0.000979459915270106 0.00112051701696448 0.000717174029144732 0.000854505226215 0.000889915739512679 0.000983581486324557 42814 48833 667 665 0 True 500 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 543 411 0.00104143396372311 0.00106696129199171 0.00080872816052491 0.000915541313801785 0.000880540864455941 0.000848469026342704 45523 46499 667 665 0 True 544 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 587 411 0.000942810810204877 0.000902462152176046 0.000579842832074464 0.000473029678797589 0.000997115915072611 0.00100215123201993 41212 39330 667 665 0 True 589 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 631 411 0.000841442405370901 0.00089885964625457 0.000503547722590982 0.000442511635004196 0.000898720094979053 0.000979237692599022 36781 39173 667 665 0 True 633 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 676 412 0.00103852857274727 0.000968615174925182 0.000732433051041428 0.000610360875867857 0.000986460271639845 0.000955772225241311 45396 42213 667 665 0 True 678 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 278 457 0.000911400559733866 0.0008962897057246 0.000747692072938125 0.000732433051041428 0.000840918908390878 0.000794225214670448 39839 39061 667 665 0 True 277 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 322 457 0.000901220252771303 0.000928482800041991 0.000732433051041428 0.000793469138628214 0.000792557155844194 0.000815181954170599 39394 40464 667 665 0 True 322 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 367 458 0.00086406785163152 0.000950900941986461 0.000732433051041428 0.000854505226215 0.00075300056696359 0.00075914544585889 37770 41441 667 665 0 True 366 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 411 458 0.000910691369810631 0.000922792217439915 0.000625619897764553 0.000671396963454643 0.000890302902390584 0.000865616617741108 39808 40216 667 665 0 True 411 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 456 458 0.000913917040106635 0.00082905822578878 0.000564583810177768 0.000335698481727321 0.000959318810440656 0.00100194894244358 39949 36131 667 665 0 True 455 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 499 456 0.000992476981925608 0.0010416978587462 0.000762951094834821 0.00064087891966125 0.000950817786053512 0.00106637051670459 43383 45398 667 665 0 True 500 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 543 456 0.000912155503845697 0.000983415278870098 0.000610360875867857 0.000671396963454643 0.000903534302855921 0.000949814746334414 39872 42858 667 665 0 True 544 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 589 453 0.000846406734833545 0.000921713760253231 0.0004272526131075 0.000503547722590982 0.000965430569565551 0.00100057056926356 36998 40169 667 665 0 False 589 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 632 455 0.000884542851028137 0.000923985404114544 0.000488288700694286 0.000473029678797589 0.000976854807315337 0.000979782122680374 38665 40268 667 665 0 True 633 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 676 457 0.000933248184788357 0.000939932802938911 0.000564583810177768 0.000503547722590982 0.000958334795072278 0.00105086545873715 40794 40963 667 665 0 True 678 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 279 502 0.000897811565720916 0.000974948242659751 0.000762951094834821 0.000869764248111696 0.000776683370188655 0.000828101524760531 39245 42489 667 665 0 True 277 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 323 502 0.000897811565720916 0.000896243813929422 0.000732433051041428 0.000793469138628214 0.000810555295626125 0.000772339564017765 39245 39059 667 665 0 True 322 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 368 502 0.000919613436586811 0.000993626203297211 0.000747692072938125 0.000839246204318303 0.000778132397511208 0.000813232462982171 40198 43303 667 665 0 True 366 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 412 502 0.000909158604492672 0.000933943923668177 0.000671396963454643 0.000656137941557946 0.000865634015339183 0.000871665828664434 39741 40702 667 665 0 True 411 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 457 502 0.000884062432047881 0.000928138611578156 0.000473029678797589 0.000518806744487678 0.0009820343125723 0.000952101070249538 38644 40449 667 665 0 True 455 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 501 500 0.000939333491871597 0.000981166580906374 0.000656137941557946 0.000625619897764553 0.000928878440320047 0.00100932253293664 41060 42760 667 665 0 True 500 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 544 496 0.00090494921914186 0.000956935713052372 0.000610360875867857 0.000732433051041428 0.000875579790707215 0.000893514481907169 39557 41704 667 665 0 False 544 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 589 500 0.000957246256706849 0.000850558531829689 0.000625619897764553 0.0004272526131075 0.00096687588303843 0.000947743551601096 41843 37068 667 665 0 True 589 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 633 499 0.000862946874010923 0.000930479093132236 0.000488288700694286 0.000534065766384375 0.00094456246536443 0.000948623917129839 37721 40551 667 665 0 True 633 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 677 500 0.000967289301103625 0.000946839518113205 0.00064087891966125 0.000534065766384375 0.000966540484659123 0.000991468384289291 42282 41264 667 665 0 True 678 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 280 545 0.000887471119098267 0.00103189996047569 0.000701915007248035 0.000915541313801785 0.000757381200172502 0.000783144212150884 38793 44971 667 665 0 True 277 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 324 546 0.000798547853562347 0.000896588002393257 0.000625619897764553 0.000778210116731518 0.000741842326100282 0.000706621102798103 34906 39074 667 665 0 True 322 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 368 546 0.000873424583199359 0.000995714279977811 0.000686655985351339 0.000839246204318303 0.000733712483495509 0.000736135205744958 38179 43394 667 665 0 True 366 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 413 546 0.000860727795864027 0.000902255639097744 0.000671396963454643 0.000625619897764553 0.000856896434012801 0.000846319999981116 37624 39321 667 665 0 True 411 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 457 545 0.000917874777420171 0.000906294117073411 0.000564583810177768 0.000442511635004196 0.000979088223675849 0.00105198785352748 40122 39497 667 665 0 True 455 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 501 544 0.000932333101016441 0.000903930689621743 0.000656137941557946 0.000457770656900893 0.000994202834858882 0.00106976026650054 40754 39394 667 665 0 True 500 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 546 543 0.000903622347672582 0.000910584999922558 0.000549324788281071 0.000442511635004196 0.000921156064314195 0.00101013949239727 39499 39684 667 665 0 True 544 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 590 543 0.000864113605820116 0.000911388106338173 0.000564583810177768 0.000701915007248035 0.000829893202977299 0.000804855912722788 37772 39719 667 665 0 True 589 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 634 542 0.000810741344823125 0.000932360656734535 0.000488288700694286 0.000549324788281071 0.000885804373291571 0.000968741680025321 35439 40633 667 665 0 True 634 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 678 543 0.00100469335028068 0.000858153623931653 0.000747692072938125 0.000534065766384375 0.000914826978248418 0.000856664122092848 43917 37399 667 665 0 True 678 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 281 589 0.00116421532881991 0.00158638757571429 0.000961318379491875 0.000839246204318303 0.00135292344790461 0.0048189602179823 50890 69136 667 665 0 True 277 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 325 589 0.00103159681317501 0.000946518275546959 0.000854505226215 0.00080872816052491 0.000863552871481395 0.000767017149129143 45093 41250 667 665 0 True 322 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 369 589 0.000907465699514628 0.00102825156275904 0.000778210116731518 0.000915541313801785 0.000709029579479644 0.000734346934077471 39667 44812 667 665 0 True 366 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 413 587 0.000869993019054675 0.000893421468525973 0.000595101853971161 0.000625619897764553 0.000857295729905365 0.000820661082339124 38029 38936 667 665 0 True 411 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 458 586 0.000977767010292062 0.000925109753096405 0.000610360875867857 0.000518806744487678 0.00103988658808499 0.000972688487396431 42740 40317 667 665 0 True 456 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 501 585 0.000937915112025127 0.000977564074984899 0.000488288700694286 0.000488288700694286 0.00104618058053048 0.00114758350162071 40998 42603 667 665 0 True 500 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 546 585 0.000921077570621876 0.000994888227664607 0.000488288700694286 0.000701915007248035 0.000975890524917807 0.000946815973585691 40262 43358 667 665 0 True 545 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 590 584 0.000875506398780468 0.000890186096965921 0.000534065766384375 0.000564583810177768 0.000876985018419013 0.000864489187238343 38270 38795 667 665 0 True 589 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 634 584 0.000937205922101892 0.000895073573152382 0.000686655985351339 0.000671396963454643 0.000854734060225818 0.000762832114011336 40967 39008 667 665 0 True 634 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 678 585 0.000948918994382415 0.000956775091769249 0.000701915007248035 0.000595101853971161 0.000832432066527586 0.000893920533239709 41479 41697 667 665 0 True 678 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 278 627 0.000944046173296963 0.000903976581416921 0.000839246204318303 0.000732433051041428 0.000695953179336538 0.000711868308040488 41266 39396 667 665 0 False 278 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 322 627 0.000952876731695951 0.000904527282959057 0.000839246204318303 0.000793469138628214 0.000692113579496578 0.000716794719523036 41652 39420 667 665 0 False 322 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 370 630 0.000987970194348923 0.000919510954084685 0.000823987182421607 0.000762951094834821 0.000768235744152077 0.000697547182379359 43186 40073 667 665 0 True 367 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 414 630 0.000884153940425072 0.00082554750345766 0.000656137941557946 0.000579842832074464 0.000802215816486515 0.000741926354452353 38648 35978 667 665 0 True 411 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 456 627 0.000873676231236636 0.000876372666617333 0.000503547722590982 0.000534065766384375 0.00094507534488502 0.000938142330088003 38190 38193 667 665 0 False 456 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 500 627 0.000907763101740501 0.00096120365000393 0.000564583810177768 0.000610360875867857 0.000949606532660925 0.000998828625481789 39680 41890 667 665 0 False 500 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 545 627 0.000906985280534372 0.00100881638750114 0.000610360875867857 0.000595101853971161 0.000901641733520126 0.00103261858637479 39646 43965 667 665 0 False 545 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 589 626 0.000889461426302184 0.000970382009039536 0.000656137941557946 0.000778210116731518 0.000769086670539346 0.000773947914362282 38880 42290 667 665 0 False 589 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 634 626 0.000902364107486197 0.000876120261743854 0.000701915007248035 0.000717174029144732 0.000757306241421831 0.000728686542731725 39444 38182 667 665 0 False 634 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 678 626 0.00094386315654258 0.000954572285600704 0.000732433051041428 0.000778210116731518 0.00080678930827504 0.000736485183043629 41258 41601 667 665 0 False 678 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 277 677 0.00101928893644274 0.0748399494960794 0.000854505226215 0.0717021438925765 0.000736026681474298 0.0222087560853203 44555 3261583 667 665 0 True 278 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 322 671 0.000952625083658674 0.000992433016622582 0.000747692072938125 0.000854505226215 0.000777901104313832 0.000700529649191948 41641 43251 667 665 0 False 322 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 367 670 0.00100098726100443 0.000967812068509566 0.000823987182421607 0.000869764248111696 0.000734434949200737 0.000695385099534514 43755 42178 667 665 0 False 367 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 411 670 0.00087363047704804 0.000845946406414296 0.000747692072938125 0.000671396963454643 0.000675106887792374 0.000676702521252342 38188 36867 667 665 0 False 411 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 456 670 0.000856358270853129 0.00086219210190732 0.00064087891966125 0.000671396963454643 0.000799045886211131 0.000792738558057296 37433 37575 667 665 0 False 456 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 500 670 0.000903690978955475 0.0010036765064412 0.000625619897764553 0.000732433051041428 0.000857425179019207 0.000901581223429736 39502 43741 667 665 0 False 500 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 545 670 0.000935535894218146 0.000871462244533283 0.000625619897764553 0.000518806744487678 0.000885091259426806 0.000907925592541615 40894 37979 667 665 0 False 545 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 589 670 0.000904468800161604 0.000899938103441254 0.000778210116731518 0.00080872816052491 0.000682638655520203 0.000630177272621944 39536 39220 667 665 0 False 589 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 634 670 0.000997395557199656 0.000887662048231129 0.00080872816052491 0.000762951094834821 0.000817493407098471 0.000675145224479881 43598 38685 667 665 0 False 634 670 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 673 675 0.00103219161762676 0.0759769187216152 0.000823987182421607 0.0735027084763867 0.000806731458037149 0.0216750096056505 45119 3311133 667 665 0 True 678 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F4_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F4_1.csv new file mode 100755 index 0000000..99b17c8 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F4_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 251 251 0.00962004692320812 0.0409339209777706 0.00959792477302205 0.0411535820553902 0.0016109739768562 0.00803152227714393 420510 1783932 667 665 0 True 251 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 296 251 0.0093266939430262 0.00939297201575695 0.00927748531319142 0.00933852140077821 0.00146322974598007 0.00152434786173159 407687 409353 667 665 0 False 296 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 339 251 0.00937791575715919 0.0578270579171665 0.00935378042267491 0.0584725719081407 0.00131351176777184 0.00669119492469815 409926 2520148 667 665 0 True 340 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 384 251 0.0093288443898902 0.0762475885295753 0.00926222629129473 0.0750133516441596 0.00121360406040776 0.00924941661484591 407781 3322929 667 665 0 True 385 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 427 250 0.00950154357474501 0.063815432378153 0.00952162966353857 0.0624246585793851 0.00162683659789335 0.0118013667680724 415330 2781126 667 665 0 True 430 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 472 250 0.00928379939121764 0.057037007717279 0.00933852140077821 0.0603036545357443 0.00168202152432979 0.0140393124063431 405812 2485717 667 665 0 True 474 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 516 249 0.00940285178994389 0.0714781230944149 0.0093690394445716 0.0713206683451591 0.001492890904911 0.0192963022404575 411016 3115072 667 665 0 True 519 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 560 249 0.00934753497593158 0.0600537966568975 0.0093690394445716 0.0597695887693599 0.00153339107542881 0.0146015880510338 408598 2617191 667 665 0 True 563 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 608 250 0.00944677581099585 0.00922002878562853 0.00944533455405508 0.00935378042267491 0.00204056441075269 0.00194317809923397 412936 401816 667 665 0 False 608 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 647 250 0.00941600611916518 0.040645582828667 0.00943007553215839 0.0407263294422828 0.00181957397406925 0.00770788772847592 411591 1771366 667 665 0 True 653 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 251 295 0.00950319072553446 0.00948512274047444 0.00947585259784848 0.00946059357595178 0.0015122129032001 0.00157693594233569 415402 413369 667 665 0 False 251 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 296 295 0.0095930519519366 0.00951589318914131 0.00959792477302205 0.00953688868543526 0.00133642614263074 0.00136605899810107 419330 414710 667 665 0 False 296 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 340 295 0.00969215552443508 0.110533256923494 0.00975051499198901 0.108873121232929 0.00145155387511894 0.0262763977583935 423662 4817125 667 665 0 True 341 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 384 295 0.00974550490833777 0.0458544163108618 0.00967421988250553 0.0460212100404364 0.00129392774808475 0.00500799484387157 425994 1998371 667 665 0 True 385 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 428 295 0.00969780616672666 0.0795683188286578 0.00968947890440223 0.0746471351186389 0.00164782262291558 0.0229000913103037 423909 3467649 667 665 0 True 430 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 473 294 0.00966081390524696 0.038252463385518 0.00976577401388571 0.0394140535591669 0.00175493254926599 0.00633383408641852 422292 1667072 667 665 0 True 474 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 516 294 0.00968636761957771 0.0395944542060117 0.00971999694819562 0.0415960936903944 0.0017155424799717 0.00700687188476258 423409 1725557 667 665 0 True 519 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 560 293 0.00960572586217763 0.0489774906481126 0.00965896086060884 0.0497138933394369 0.00187942572241409 0.0128513367957072 419884 2134477 667 665 0 True 564 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 608 294 0.00931486648527419 0.00931399223625555 0.00935378042267491 0.00924696726939803 0.00200070990863655 0.00198344960240854 407170 405911 667 665 0 False 608 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 653 293 0.00935311698694027 0.00929015144866056 0.00935378042267491 0.00924696726939803 0.00176291421280047 0.0019873804216414 408842 404872 667 665 0 False 653 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 251 339 0.00948902980416407 0.0515600743676541 0.00947585259784848 0.0521858548867018 0.00166216638261799 0.0117338092986408 414783 2247028 667 665 0 True 251 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 296 339 0.0096137099680876 0.0627321336070779 0.00955214770733196 0.0645761806668193 0.0014469676957188 0.0179907853382657 420233 2733915 667 665 0 True 296 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 340 340 0.00937471296395748 0.0398426829261297 0.00932326237888151 0.0400549324788281 0.00127192241490386 0.00769529451971765 409786 1736375 667 665 0 True 341 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 383 340 0.00929898978183145 0.0339104570765435 0.00932326237888151 0.0345159075303273 0.00134005332200707 0.00602155706050015 406476 1477844 667 665 0 True 385 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 428 340 0.00949856955248629 0.0651415675834126 0.00952162966353857 0.0635538261997406 0.00175942123951033 0.011173066365589 415200 2838920 667 665 0 True 430 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 474 337 0.00962576619678259 0.032152457132761 0.00968947890440223 0.0323949034866865 0.0018866915027202 0.00657917484801406 420760 1401229 667 665 0 False 474 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 516 337 0.00949728843520561 0.0273537815699698 0.00950637064164187 0.0275120164797436 0.00163074883503871 0.00320636411680145 415144 1192099 667 665 0 True 519 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 560 337 0.00936213056209364 0.0511945232731635 0.00941481651026169 0.0503395132372015 0.00179619958395072 0.012150976799442 409236 2231097 667 665 0 True 564 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 604 338 0.00954899066831885 0.0576782078795065 0.00953688868543526 0.0572365911345083 0.00207226020860365 0.0148851735604953 417404 2513661 667 665 0 True 608 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 648 337 0.00929997349688626 0.0617669144249959 0.0093842984664683 0.0620584420538643 0.0020178666143394 0.0168174061450632 406519 2691850 667 665 0 True 653 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 252 383 0.00934039732251064 0.0442042620857477 0.00932326237888151 0.0473029678797589 0.00155930567074986 0.00959130466670192 408286 1926456 667 665 0 True 252 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 296 383 0.00959071848831821 0.0337258343845423 0.00959792477302205 0.0325780117494469 0.00141804925274805 0.00644328275098972 419228 1469798 667 665 0 True 296 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 340 383 0.00966769991063063 0.0800351990069016 0.00964370183871214 0.0777752346074617 0.00146123764099587 0.0176728693424008 422593 3487996 667 665 0 True 341 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 384 384 0.00955310854529247 0.0646505253750077 0.00950637064164187 0.0646219577325094 0.00145398496757239 0.0147663376456507 417584 2817520 667 665 0 True 385 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 429 383 0.00981560032526653 0.0426938483769506 0.00985732814526589 0.043579766536965 0.00160474868151375 0.00713565983713217 429058 1860631 667 665 0 True 430 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 473 382 0.00973445527179189 0.0529537164036206 0.00971999694819562 0.0535896849011978 0.00167114245677673 0.00991742769831577 425511 2307764 667 665 0 True 475 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 517 381 0.00968680228436937 0.0400320095271367 0.00961318379491875 0.0409552147707332 0.00176855342408667 0.00609275241290373 423428 1744626 667 665 0 True 519 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 561 381 0.00963992711815299 0.0500777005457108 0.00961318379491875 0.0508125429159991 0.0018775945163589 0.00718411674566354 421379 2182425 667 665 0 True 564 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 605 382 0.00962725320791195 0.040934678192391 0.00968947890440223 0.0418249790188449 0.00205489221883555 0.00626187591602614 420825 1783965 667 665 0 True 608 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 649 382 0.00969396281488462 0.0913398625884923 0.00961318379491875 0.0884260318913558 0.00202974517771876 0.016047000757433 423741 3980662 667 665 0 True 653 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 252 427 0.00965843468743998 0.0450740951715521 0.00968947890440223 0.0454566262302586 0.00169472530328264 0.00814524508791892 422188 1964364 667 665 0 True 252 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 296 427 0.00997109593520932 0.0538877291649816 0.00996414129854276 0.0538643472953384 0.00166174701747168 0.00776737269043142 435855 2348469 667 665 0 True 296 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 340 428 0.00975316873492757 0.0332165272416564 0.00970473792629892 0.0339055466544594 0.00163131483794774 0.00326974258168186 426329 1447602 667 665 0 True 341 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 385 428 0.00983360459847897 0.052527473410007 0.00975051499198901 0.0512245365072099 0.00155846535274543 0.0102850140982444 429845 2289188 667 665 0 True 386 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 429 428 0.0100796019934642 0.100211733270003 0.0101472495613031 0.0993667505912871 0.00180578885870828 0.0155267035406164 440598 4367305 667 665 0 True 430 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 473 426 0.00997779892383861 0.0597239034872602 0.00999465934233616 0.0591439688715953 0.0017360085502912 0.0138997278868666 436148 2602814 667 665 0 True 475 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 517 425 0.00999134216366296 0.0506238588001246 0.00996414129854276 0.0505226214999619 0.00175445054379021 0.00965571601222768 436740 2206227 667 665 0 True 519 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 561 425 0.00992987141128452 0.0336730588200875 0.00996414129854276 0.0340733958953231 0.00189315082494726 0.00463921988912372 434053 1467498 667 665 0 True 564 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 605 426 0.00987121454150471 0.0383747650196675 0.00985732814526589 0.0391088731212329 0.00200487627859928 0.00465879685630493 431489 1672402 667 665 0 True 609 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 649 426 0.00966504616769208 0.0841886818212847 0.00967421988250553 0.0832227054245823 0.00196018774226448 0.0185844899225038 422477 3669008 667 665 0 True 653 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 253 471 0.00964715627995112 0.0496212378049725 0.00961318379491875 0.0510872053101396 0.00161852804011034 0.011394960541493 421695 2162532 667 665 0 True 252 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 298 471 0.00942499681722426 0.0547072877891685 0.00944533455405508 0.0536202029449912 0.00162764383659466 0.00763407100107292 411984 2384186 667 665 0 True 296 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 342 471 0.00995084970675569 0.0670570681682462 0.00991836423285267 0.0648203250171664 0.00167652079575082 0.0144027177048986 434970 2922399 667 665 0 True 341 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 386 472 0.00979448476722957 0.0838117725074875 0.0098268101014725 0.0798504615854124 0.00158532370162764 0.0169848250070821 428135 3652582 667 665 0 True 386 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 430 471 0.0100776345633546 0.0936917711995714 0.0100709544518196 0.0891279468986038 0.00190197742739731 0.0257272831747102 440512 4083160 667 665 0 True 430 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 474 471 0.0100435248157565 0.0430950573962946 0.0101472495613031 0.0436865796902419 0.0020470686658702 0.00603323410595526 439021 1878116 667 665 0 True 475 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 518 469 0.00990745185887258 0.0382469563700967 0.00996414129854276 0.0393835355153735 0.00184889917058558 0.00550280635248523 433073 1666832 667 665 0 True 520 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 563 470 0.0105114529025256 0.0998055679367795 0.0104982070649271 0.0981002517738613 0.00258745443074406 0.0146592139103529 459475 4349604 667 665 0 True 564 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 607 471 0.0102069359003263 0.0606441028182725 0.00996414129854276 0.0623483634699016 0.00289019714557653 0.0150388504731743 446164 2642917 667 665 0 True 609 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 651 471 0.00984717071539762 0.0715532250172238 0.00984206912336919 0.0710765239948119 0.00197935850131286 0.00954359784458502 430438 3118345 667 665 0 True 653 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 254 515 0.00929942444662311 0.0464765254862953 0.00927748531319142 0.0484779125658045 0.00157483303772592 0.00891319206288566 406495 2025483 667 665 0 True 252 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 298 515 0.0097420047129102 0.0969791381635595 0.00978103303578241 0.0947585259784848 0.00162316557538562 0.0198603042835975 425841 4226426 667 665 0 True 297 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 342 516 0.00980878295116575 0.0556300800066084 0.00973525597009232 0.0569161516746777 0.00168007756784227 0.0110407453712282 428760 2424402 667 665 0 True 341 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 387 515 0.00982735915173564 0.0576755920471814 0.00978103303578241 0.0569161516746777 0.00167351874870974 0.00763492590605816 429572 2513547 667 665 0 True 386 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 431 515 0.0101902127443946 0.0571909287983061 0.01025406271458 0.0559395742732891 0.00198845388094461 0.00913416170118686 445433 2492425 667 665 0 True 430 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 476 513 0.0101278040311499 0.0629890358764845 0.0102235446707866 0.061722743572137 0.00184909352742606 0.0126574136369164 442705 2745111 667 665 0 True 475 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 519 512 0.0100459040335634 0.0711705333372341 0.0100556954299229 0.0704051270313573 0.0018724910693913 0.0157276562187787 439125 3101667 667 665 0 True 520 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 564 512 0.00986727968128547 0.0550571668356058 0.00993362325474937 0.0552529182879377 0.00197063628604635 0.0115606737278767 431317 2399434 667 665 0 True 564 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 608 513 0.00995668336580165 0.0468312461171239 0.00991836423285267 0.0464179446097505 0.00187514235046729 0.00654320371918554 435225 2040942 667 665 0 True 609 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 652 512 0.00962823692296676 0.0611992329186436 0.00964370183871214 0.0612344548714427 0.00198807469622825 0.0118598730257725 420868 2667110 667 665 0 True 653 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 255 557 0.00935538181927576 0.0436090913940837 0.0093690394445716 0.043778133821622 0.00145919311423855 0.00742069996845791 408941 1900518 667 665 0 True 252 555 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 298 556 0.0094256144987703 0.0550325229415952 0.009399557488365 0.0559700923170825 0.0015747465672075 0.0113256920308041 412011 2398360 667 665 0 True 297 555 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 343 557 0.00967609580423796 0.0447297919782289 0.00958266575112535 0.0446784161135271 0.00158323357403939 0.00716346245556721 422960 1949359 667 665 0 True 341 555 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 387 557 0.01044190653586 0.049944866744568 0.00996414129854276 0.0480964370183871 0.00407634511119756 0.00781636975330229 456435 2176636 667 665 0 True 386 555 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 431 556 0.0101925233309187 0.0854589667118127 0.0101625085831998 0.0806286717021439 0.00254743488548218 0.017109453909021 445534 3724368 667 665 0 True 431 555 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 476 555 0.010038651994671 0.0610041927891369 0.0100099183642329 0.0600442511635004 0.00199998532368544 0.00956265738888954 438808 2658610 667 665 0 True 475 555 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 520 554 0.00979546848228438 0.0538594139273567 0.0098115510795758 0.053528648813611 0.00189417082684241 0.0061871031706957 428178 2347235 667 665 0 True 520 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 563 553 0.00964111672705648 0.0369741015390387 0.00965896086060884 0.0380407415884642 0.00199705636407565 0.00648180560577756 421431 1611360 667 665 0 True 564 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 608 554 0.00975632577394068 0.0459031304514433 0.00978103303578241 0.045990691996643 0.00167646503012799 0.00583298291842523 426467 2000494 667 665 0 True 609 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 652 554 0.00973491281367785 0.0516676217896538 0.00973525597009232 0.0507515068284123 0.00197654938569863 0.00623237556978379 425531 2251715 667 665 0 True 654 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 252 599 0.00911373107220709 0.00900984436371313 0.00915541313801785 0.0089723048752575 0.00131962108083657 0.00130476243084221 398378 392656 667 665 0 False 252 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 297 599 0.00924106497906917 0.00916186093524037 0.00921644922560464 0.00920119020370794 0.00138052754060575 0.00149440069164997 403944 399281 667 665 0 False 297 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 343 599 0.0093473290820829 0.0691265127800045 0.00929274433508812 0.0669260700389105 0.00151936303298333 0.0110064139786974 408589 3012587 667 665 0 True 342 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 387 599 0.00961814812438139 0.0733162501125783 0.00968947890440223 0.0693522545204852 0.00139333926658747 0.0169541056130961 420427 3195179 667 665 0 True 386 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 431 598 0.00933058304905684 0.00955584199684379 0.00935378042267491 0.00958266575112535 0.00181155917903199 0.00188382595768744 407857 416451 667 665 0 False 431 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 475 598 0.00957786156132279 0.00945380159026543 0.00958266575112535 0.00944533455405508 0.00205268940696417 0.00198412785095193 418666 412004 667 665 0 False 475 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 520 598 0.00940587156639121 0.00928533281016687 0.00947585259784848 0.00929274433508812 0.00203854140835544 0.00208273779422959 411148 404662 667 665 0 False 520 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 565 598 0.00953295382521603 0.00949099689025723 0.00947585259784848 0.00950637064164187 0.00179290576036454 0.0018366016864282 416703 413625 667 665 0 False 565 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 609 598 0.00957969172886663 0.00970661948990122 0.00950637064164187 0.00964370183871214 0.00156367048689616 0.00161145478013803 418746 423022 667 665 0 False 609 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 654 597 0.00976490468430239 0.00974526038144113 0.00973525597009232 0.00985732814526589 0.00172662449377256 0.00162660664791316 426842 424706 667 665 0 False 654 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 252 648 0.00921525961670115 0.0391934287538485 0.00926222629129473 0.0400549324788281 0.00138176471005148 0.00831425294375453 402816 1708080 667 665 0 True 252 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 297 642 0.00902066705260325 0.0090617250381619 0.00900282291905089 0.00907911802853437 0.00130161197706973 0.0012307039917471 394310 394917 667 665 0 False 297 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 342 642 0.00898719786364543 0.00893703703066318 0.00901808194094758 0.00892652780956741 0.00126581185195183 0.00128412707611632 392847 389483 667 665 0 False 342 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 386 642 0.00924138525838935 0.00898845878716016 0.00915541313801785 0.0089723048752575 0.00146196937380519 0.001243325393803 403958 391724 667 665 0 False 386 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 431 642 0.00920221967295135 0.00930013291411178 0.00917067215991455 0.00927748531319142 0.00167103851079569 0.0015622958998056 402246 405307 667 665 0 False 431 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 475 641 0.00931816078685308 0.00922367718334518 0.00935378042267491 0.00924696726939803 0.00180351064760308 0.00174154352774275 407314 401975 667 665 0 False 475 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 520 641 0.00932221003254381 0.00926972959980634 0.00935378042267491 0.00929274433508812 0.00179278262487127 0.001708006090361 407491 403982 667 665 0 False 520 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 565 641 0.00973793259012517 0.00964627177924211 0.00965896086060884 0.00961318379491875 0.0020269337191393 0.00186658427610011 425663 420392 667 665 0 False 565 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 609 641 0.00951389720566588 0.009644826187694 0.00950637064164187 0.00967421988250553 0.00140921949875475 0.00144434004957921 415870 420329 667 665 0 False 609 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 649 647 0.00970185541241739 0.0404286064210653 0.00968947890440223 0.0410772869459068 0.00150586553039552 0.00824682235307938 424086 1761910 667 665 0 True 654 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F4_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F4_2.csv new file mode 100755 index 0000000..900e8a4 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F4_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 251 251 0.00810933512415227 0.684400610131417 0.00794995040817884 0.659754329747463 0.00222150630452208 0.17912015058848 354474 29826709 667 665 6 True 251 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 296 251 0.00639478841490218 0.00665412673363427 0.00619516289005875 0.00660715648126955 0.0016025251123283 0.0014220441217355 279528 289992 667 665 0 False 296 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 339 251 0.00575528212089881 0.00591106973200913 0.00576791027695125 0.00593575951781491 0.00129924159055038 0.00122428449399901 251574 257609 667 665 0 True 340 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 384 251 0.00590791809405437 0.0059892693509925 0.00593575951781491 0.005981536583505 0.00130457783631369 0.00122472644405932 258246 261017 667 665 0 True 385 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 427 250 0.00606062269849282 0.00609663320581151 0.005981536583505 0.00607309071488518 0.00156358219339854 0.00161639472799848 264921 265696 667 665 0 True 430 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 472 250 0.00617155372874332 0.00615854123750668 0.00613412680247196 0.00616464484626535 0.00157543308622211 0.00149412318202723 269770 268394 667 665 0 True 474 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 516 249 0.006464197519002 0.00632916693197861 0.0063935301747158 0.00630197604333562 0.00159753866214287 0.00152506275656382 282562 275830 667 665 0 True 519 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 560 249 0.00678125116887654 0.00683730383408739 0.0068207827878233 0.0068055237659266 0.00161165231180535 0.00143572908446875 296421 297975 667 665 0 True 563 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 608 250 0.0103649479906419 0.00745243745665377 0.00791943236438544 0.00741588464179446 0.0127014820093038 0.00195435774625627 453071 324783 667 665 0 False 608 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 647 250 0.00927323017365202 0.712195044718686 0.00921644922560464 0.689723048752575 0.00240925833995297 0.173810365150743 405350 31038012 667 665 9 True 653 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 251 295 0.00640588380563666 0.00646232197568767 0.00643930724040589 0.00643930724040589 0.00157021352928981 0.00160014168940036 280013 281633 667 665 0 False 251 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 296 295 0.00610884761327279 0.00620452481627507 0.00614938582436866 0.00611886778057527 0.00128838194016026 0.00137461871423275 267029 270398 667 665 0 False 296 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 340 295 0.00627523272010138 0.00611303952258765 0.00625619897764553 0.00616464484626535 0.00128507130478457 0.00127978064298614 274302 266411 667 665 0 True 341 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 384 295 0.0061652396507171 0.00604339872340499 0.00614938582436866 0.00608834973678187 0.00128607529010663 0.00128214240556497 269494 263376 667 665 0 True 385 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 428 295 0.00624656772094612 0.00606788199613247 0.00619516289005875 0.00610360875867857 0.00165598446908598 0.00150235323628094 273049 264443 667 665 0 True 430 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 473 294 0.00666215301596169 0.00628850680145087 0.00662241550316625 0.00633249408712902 0.00164375040567567 0.00175475478011725 291215 274058 667 665 0 True 474 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 516 294 0.0066435996924861 0.00648182598863834 0.00665293354695964 0.00642404821850919 0.00156412090492774 0.00147393983389927 290404 282483 667 665 0 True 519 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 560 293 0.00672849658942559 0.00682271024322078 0.00671396963454643 0.00695811398489357 0.00167675872571595 0.00160405248150148 294115 297339 667 665 0 True 564 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 608 294 0.00732661821984407 0.00703647422516006 0.00738536659800107 0.00712596322575723 0.00201126422287789 0.00190937324511043 320260 306655 667 665 0 False 608 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 653 293 0.0079481888719179 0.00728548310579608 0.0076752880140383 0.0072632944228275 0.00272963869415068 0.00196989513214678 347430 317507 667 665 0 False 653 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 251 339 0.00563959265503435 0.00598309690454105 0.00566109712367437 0.00601205462729839 0.00141850004574756 0.00142369000797097 246517 260748 667 665 0 True 251 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 296 339 0.00605769443042269 0.00585907432807241 0.00605783169298848 0.00579842832074464 0.00130756271097524 0.0013174810245225 264793 255343 667 665 0 True 296 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 340 340 0.00612408375807519 0.00602667116406259 0.00605783169298848 0.00601205462729839 0.00131177728892612 0.00125238304523115 267695 262647 667 665 0 True 341 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 383 340 0.00629488414410327 0.00625117382607354 0.00622568093385214 0.00621042191195544 0.00127677045117528 0.00123045544179278 275161 272431 667 665 0 True 385 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 428 340 0.00638778802404703 0.0066576145100678 0.00633249408712902 0.00662241550316625 0.0016009518158872 0.00155808600378455 279222 290144 667 665 0 True 430 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 474 337 0.00670031200925058 0.00683718910459945 0.00663767452506294 0.00691233691920348 0.00177514715837907 0.00156545899396696 292883 297970 667 665 0 False 474 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 516 337 0.00664838100519436 0.00667576471506071 0.00677500572213321 0.00669871061264973 0.00158802320764568 0.00174291417368328 290613 290935 667 665 0 True 519 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 560 337 0.00666883312749668 0.00694469063480399 0.00657663843747616 0.00692759594110018 0.00175452827409789 0.00150553699978381 291507 302655 667 665 0 True 564 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 604 338 0.00695056454377526 0.00705866290812864 0.00700389105058366 0.00708018616006714 0.00204937640125892 0.00220042943094004 303822 307622 667 665 0 True 608 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 648 337 0.00683395999413889 0.00720124871574679 0.0068207827878233 0.00703440909437705 0.0018972681483518 0.00256183960821863 298725 313836 667 665 0 True 653 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 252 383 0.00575992617104128 0.00590345169400957 0.00578316929884794 0.00593575951781491 0.00141100829720879 0.00150546286566957 251777 257277 667 665 0 True 252 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 296 383 0.00594401814885645 0.00597935672323404 0.005981536583505 0.00592050049591821 0.00129534610931008 0.00130628606450961 259824 260585 667 665 0 True 296 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 340 383 0.00613078674670447 0.00643703559654458 0.00608834973678187 0.00642404821850919 0.00133169740648737 0.00134722823499149 267988 280531 667 665 0 True 341 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 384 384 0.00640620408495683 0.00672344629025069 0.0064087891966125 0.00669871061264973 0.0013253830897079 0.00135925945799629 280027 293013 667 665 0 True 385 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 429 383 0.00669925966291288 0.00676745652182642 0.00671396963454643 0.00677500572213321 0.00156176308483771 0.00158032094150312 292837 294931 667 665 0 True 430 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 473 382 0.00685809532862317 0.00675068307068885 0.00679026474402991 0.0068055237659266 0.00161454580277659 0.00177423320836182 299780 294200 667 665 0 True 475 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 517 381 0.00672813055591682 0.00678638688733736 0.00669871061264973 0.00683604180972 0.0017351418557606 0.00175984141211566 294099 295756 667 665 0 True 519 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 561 381 0.00689010038354592 0.00693633832808159 0.00688181887541009 0.00694285496299687 0.00177967561981347 0.0015390998949461 301179 302291 667 665 0 True 564 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 605 382 0.00653971480727935 0.00675233517531526 0.00656137941557946 0.00671396963454643 0.00211620392347559 0.00203649700093687 285863 294272 667 665 0 True 608 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 649 382 0.00623782867092432 0.00606774432074694 0.00628671702143893 0.00608834973678187 0.00183470204532525 0.00176587034222955 272667 264437 667 665 0 True 653 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 252 427 0.00611641993148539 0.00611069904103357 0.00614938582436866 0.00614938582436866 0.00152201360046249 0.00148713074866573 267360 266309 667 665 0 True 252 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 296 427 0.00639927232538457 0.00618091348765597 0.00642404821850919 0.00631723506523232 0.00152422672895132 0.00141131549708094 279724 269369 667 665 0 True 296 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 340 428 0.00653973768437365 0.0065247348171298 0.00656137941557946 0.00657663843747616 0.00138534500609804 0.00129552165434393 285864 284353 667 665 0 True 341 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 385 428 0.00656659539307938 0.00676197245230265 0.00656137941557946 0.00674448767833982 0.00135897274158562 0.00136616213720247 287038 294692 667 665 0 True 386 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 429 428 0.00674819376761608 0.00693567289705151 0.00674448767833982 0.00689707789730678 0.00165766278898111 0.00162782253830392 294976 302262 667 665 0 True 430 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 473 426 0.00684667965856852 0.00727694723189296 0.00692759594110018 0.0072480354009308 0.00173422565299657 0.0016611812660825 299281 317135 667 665 0 True 475 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 517 425 0.00689993753409402 0.00698906800074115 0.00695811398489357 0.00698863202868696 0.00172737700477318 0.00160676570172675 301609 304589 667 665 0 True 519 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 561 425 0.00680108560963281 0.00706075098480924 0.00686655985351339 0.00715648126955062 0.00177410096106398 0.00169722460602676 297288 307713 667 665 0 True 564 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 605 426 0.00611248507126615 0.00624718123989305 0.00611886778057527 0.00624093995574884 0.00193635819915541 0.00177184774153249 267188 272257 667 665 0 True 609 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 649 426 0.00602186890075219 0.0062360065877672 0.0059510185397116 0.00616464484626535 0.00188525023045305 0.0019376408739232 263227 271770 667 665 0 True 653 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 253 471 0.00626134632386256 0.0062151028750636 0.00624093995574884 0.00613412680247196 0.00155138463294673 0.00138003389114761 273695 270859 667 665 0 True 252 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 298 471 0.0061108836746653 0.00627997092754775 0.00613412680247196 0.00633249408712902 0.00154428850735928 0.0014505418870253 267118 273686 667 665 0 True 296 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 342 471 0.00634210246673413 0.006368450308651 0.0063935301747158 0.00646982528419928 0.00150495205724715 0.00142578178770883 277225 277542 667 665 0 True 341 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 386 472 0.00652985477963696 0.00652434473687079 0.00653086137178607 0.00651560234988937 0.00144466661229077 0.00155011428929887 285432 284336 667 665 0 True 386 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 430 471 0.00663330500005205 0.00657831348800016 0.00663767452506294 0.00659189745937285 0.00187470254844602 0.00207771182899571 289954 286688 667 665 0 True 430 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 474 471 0.00657663843747616 0.00685189742495401 0.00659189745937285 0.00697337300679027 0.00189316542172459 0.0019234277729486 287477 298611 667 665 0 True 475 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 518 469 0.0064903231606902 0.0063814147407888 0.00654612039368277 0.00636301213092241 0.00174560443405842 0.00168516171087787 283704 278107 667 665 0 True 520 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 563 470 0.0062923905408248 0.00607240233795751 0.00628671702143893 0.00611886778057527 0.00205309699442563 0.00185577501991577 275052 264640 667 665 0 True 564 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 607 471 0.00611429236171569 0.0059497794612418 0.00610360875867857 0.0059510185397116 0.0019089339370124 0.00167891910794351 267267 259296 667 665 0 True 609 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 651 471 0.0060478572798746 0.00635186042469415 0.00604257267109178 0.00617990386816205 0.0018502934559572 0.00234916846367106 264363 276819 667 665 0 True 653 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 254 515 0.00626253593276605 0.00625757573150087 0.00619516289005875 0.00624093995574884 0.00148245874840589 0.00139762547351879 273747 272710 667 665 0 True 252 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 298 515 0.00617741026488358 0.00630897454210027 0.00619516289005875 0.00628671702143893 0.00158305422746616 0.00151352373712372 270026 274950 667 665 0 True 297 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 342 516 0.00649929098165497 0.00633605070125531 0.0064087891966125 0.00628671702143893 0.0015852494040087 0.00155015744881137 284096 276130 667 665 0 True 341 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 387 515 0.00636914319219424 0.00645486455897124 0.00633249408712902 0.00643930724040589 0.00145404486340751 0.00155932184340822 278407 281308 667 665 0 True 386 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 431 515 0.00631332308210738 0.00653070075050294 0.0063782711528191 0.00656137941557946 0.00192066933541387 0.00188535469534236 275967 284613 667 665 0 True 430 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 476 513 0.00629275657433357 0.00629630840663113 0.0063782711528191 0.00622568093385214 0.00176234817442832 0.00161596038552834 275068 274398 667 665 0 True 475 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 519 512 0.0061424083106078 0.00631046602544356 0.00616464484626535 0.00627145799954223 0.00169519068811982 0.00167500624097383 268496 275015 667 665 0 True 520 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 564 512 0.00600409339848272 0.00610831266768432 0.00610360875867857 0.00611886778057527 0.00181743999259851 0.00168904374968038 262450 266205 667 665 0 True 564 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 608 513 0.00605410272661792 0.0058785324492279 0.00602731364919509 0.00585946440833143 0.00174248146619008 0.00176336424266475 264636 256191 667 665 0 True 609 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 652 512 0.00629948244005715 0.00601854831631608 0.00619516289005875 0.00602731364919509 0.00178102379776024 0.00186077260727746 275362 262293 667 665 0 True 653 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 255 557 0.00644493500560317 0.00648116055760826 0.00646982528419928 0.00653086137178607 0.00136795556358891 0.00135932211837696 281720 282454 667 665 0 True 252 555 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 298 556 0.00634590006438758 0.00632292564783439 0.00631723506523232 0.00630197604333562 0.00149192116187818 0.00136578722013907 277391 275558 667 665 0 True 297 555 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 343 557 0.00653795327101842 0.00683321946431655 0.00646982528419928 0.00683604180972 0.00143934650263514 0.00141927299254039 285786 297797 667 665 0 True 341 555 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 387 557 0.00651347478011967 0.00654522550367679 0.0063935301747158 0.00648508430609598 0.00176427150290328 0.00144822141715831 284716 285246 667 665 0 True 386 555 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 431 556 0.00635177947762214 0.00618736128487848 0.00634775310902571 0.00613412680247196 0.00190516987741354 0.00190458300551463 277648 269650 667 665 0 True 431 555 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 476 555 0.006506588774736 0.00632499077861741 0.00648508430609598 0.00628671702143893 0.00189458720963002 0.00190849782926276 284415 275648 667 665 0 True 475 555 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 520 554 0.00624558400589131 0.00642409411030437 0.00624093995574884 0.00645456626230259 0.00183382270388269 0.00200078288498025 273006 279967 667 665 0 True 520 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 563 553 0.00631442118263368 0.00607770284030057 0.0063782711528191 0.00605783169298848 0.001742068840137 0.00170623894740029 276015 264871 667 665 0 True 564 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 608 554 0.00643317617913405 0.00635463687830242 0.00634775310902571 0.00642404821850919 0.00152015359354001 0.00154834354207062 281206 276940 667 665 0 True 609 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 652 554 0.00679525195058685 0.00667434206941019 0.00685130083161669 0.00677500572213321 0.00182640942717916 0.00175001176384474 297033 290873 667 665 0 True 654 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 252 599 0.00688451837253724 0.00662691289909369 0.00683604180972 0.00668345159075303 0.00136817728285642 0.00132035653962736 300935 288806 667 665 0 False 252 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 297 599 0.0065587485497352 0.0065113573588354 0.00657663843747616 0.00648508430609598 0.00139791840684742 0.00138120378588259 286695 283770 667 665 0 False 297 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 343 599 0.00626340526234937 0.00650493250751048 0.00628671702143893 0.00659189745937285 0.00128789249941599 0.00152659979769745 273785 283490 667 665 0 True 342 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 387 599 0.00605375957020345 0.00619603483416713 0.00608834973678187 0.00617990386816205 0.00136660129195195 0.00124791547586145 264621 270028 667 665 0 True 386 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 431 598 0.00603394800654148 0.00611492108618995 0.00613412680247196 0.00614938582436866 0.00171761751946517 0.0018373885372194 263755 266493 667 665 0 False 431 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 475 598 0.00617953783465328 0.00603786876208603 0.00616464484626535 0.00601205462729839 0.00192033492730727 0.00194497051180802 270119 263135 667 665 0 False 475 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 520 598 0.00634059257851047 0.00644497487711038 0.00631723506523232 0.00646982528419928 0.00198009905135303 0.00197130308806572 277159 280877 667 665 0 False 520 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 565 598 0.00662214097803467 0.00632822615017746 0.00659189745937285 0.00627145799954223 0.00175295348617174 0.00172362493720652 289466 275789 667 665 0 False 565 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 609 598 0.00675629225899753 0.00665396611235115 0.00675974670023652 0.00656137941557946 0.00161657734449364 0.00145745566652868 295330 289985 667 665 0 False 609 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 654 597 0.00709247115970511 0.00693755446065381 0.00709544518196384 0.00695811398489357 0.00154454960063607 0.00160487358859164 310025 302344 667 665 0 False 654 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 252 648 0.00875666538440553 0.719930978740052 0.00799572747386892 0.718379491874571 0.00316301788761275 0.195827801092078 382770 31375150 667 665 9 True 252 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 297 642 0.00682398558102501 0.00671279939376939 0.00666819256885634 0.00663767452506294 0.00160514655941134 0.00132205218517653 298289 292549 667 665 0 False 297 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 342 642 0.00622293568253639 0.00611255765873829 0.00622568093385214 0.00602731364919509 0.00124139465879881 0.00129702310764377 272016 266390 667 665 0 False 342 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 386 642 0.00608425473690255 0.0059875943004685 0.00601205462729839 0.00601205462729839 0.00138662532313067 0.00121607024523351 265954 260944 667 665 0 False 386 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 431 642 0.00588625348575426 0.00569932498905767 0.005981536583505 0.00576791027695125 0.00157755171401926 0.00146333512517769 257299 248381 667 665 0 False 431 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 475 641 0.0058303876214788 0.00590682474095516 0.00582894636453803 0.00587472343022812 0.00170279732625654 0.00166086119866333 254857 257424 667 665 0 False 475 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 520 641 0.00630613967449784 0.00623697031546594 0.00627145799954223 0.00631723506523232 0.00185069576836506 0.00163286920123461 275653 271812 667 665 0 False 520 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 565 641 0.0068012228721986 0.00682103519269678 0.0068055237659266 0.0068055237659266 0.00174960806051957 0.00167611382222344 297294 297266 667 665 0 False 565 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 609 641 0.00753544033659526 0.00720150112062027 0.0072632944228275 0.00717174029144732 0.00217541626619771 0.00134119685040065 329388 313847 667 665 0 False 609 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 649 647 0.00889758828528057 0.74061900000631 0.00859082932784009 0.728236820019837 0.00254980983004566 0.194259022359745 388930 32276750 667 665 13 True 654 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F4_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F4_3.csv new file mode 100755 index 0000000..a3786fd --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F4_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 251 251 0.00103379301422761 0.0689306007063895 0.000869764248111696 0.0661783779659724 0.000825132187713748 0.0194555418137417 45189 3004049 667 665 0 True 251 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 296 251 0.00104566622616822 0.000932658953403192 0.000885023270008392 0.000793469138628214 0.000751589053569735 0.000682596875501751 45708 40646 667 665 0 False 296 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 339 251 0.000973992289732909 0.000927037208493883 0.000885023270008392 0.000823987182421607 0.000677076062954833 0.000636631203129993 42575 40401 667 665 0 True 340 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 384 251 0.000942467653790409 0.00108701600648451 0.000823987182421607 0.000991836423285267 0.000675613398123891 0.000651070666696212 41197 47373 667 665 0 True 385 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 427 250 0.00102480231616854 0.000928712259017881 0.000854505226215 0.000686655985351339 0.000844709531250688 0.000816883391581701 44796 40474 667 665 0 True 430 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 472 250 0.00104237192458932 0.00104663122672784 0.000854505226215 0.000869764248111696 0.000875750318197084 0.000830456905427544 45564 45613 667 665 0 True 474 251 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 516 249 0.00102155376877823 0.000934356949824779 0.00080872816052491 0.000701915007248035 0.000894119310707693 0.00087014978903806 44654 40720 667 665 0 True 519 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 560 249 0.00104335563964413 0.00103557130408993 0.000778210116731518 0.000915541313801785 0.000889510898996355 0.000767265366194741 45607 45131 667 665 0 True 563 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 608 250 0.00125320722563873 0.0010272878350603 0.000778210116731518 0.000564583810177768 0.00156780090183699 0.00108134198740696 54780 44770 667 665 0 False 608 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 647 250 0.00124229485165863 0.0720492464854055 0.000946059357595178 0.0686655985351339 0.0010923967889159 0.0197510523043986 54303 3139962 667 665 0 True 653 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 251 295 0.000912178380939995 0.000885367458472228 0.000717174029144732 0.000717174029144732 0.00076861970759329 0.000742376813131298 39873 38585 667 665 0 False 251 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 296 295 0.000915243911575913 0.000935251839830751 0.00080872816052491 0.000823987182421607 0.000638284402015806 0.000660966668442624 40007 40759 667 665 0 False 296 295 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 340 295 0.000922152794053877 0.000964163670792913 0.00080872816052491 0.00080872816052491 0.000697504716661403 0.000686774752784065 40309 42019 667 665 0 True 341 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 384 295 0.000998699551574636 0.000895371869821039 0.000885023270008392 0.000793469138628214 0.000720613425087434 0.000643232326161204 43655 39021 667 665 0 True 385 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 428 295 0.00101739013761602 0.00103586960075859 0.000778210116731518 0.00080872816052491 0.000904951342486734 0.00087840022023937 44472 45144 667 665 0 True 430 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 473 294 0.00106124552738508 0.000946747734522849 0.00080872816052491 0.000625619897764553 0.00093757098907065 0.000969024565841895 46389 41260 667 665 0 True 474 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 516 294 0.000940797625906662 0.000935779595475298 0.000747692072938125 0.000717174029144732 0.000806042265326811 0.000857233928535593 41124 40782 667 665 0 True 519 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 560 293 0.0010555720079992 0.000996609169983783 0.000869764248111696 0.000778210116731518 0.000926824379085384 0.000839022126770383 46141 43433 667 665 0 True 564 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 608 294 0.00115481284306348 0.000977426399599365 0.000839246204318303 0.000625619897764553 0.00111335125770366 0.00102031709160406 50479 42597 667 665 0 False 608 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 653 293 0.00107574960516995 0.00105502942524542 0.000717174029144732 0.000656137941557946 0.00103704859893363 0.00105566748772108 47023 45979 667 665 0 False 653 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 251 339 0.00082275181932952 0.000922172678205011 0.000625619897764553 0.000762951094834821 0.000726253912268769 0.000773543598220647 35964 40189 667 665 0 True 251 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 296 339 0.000910851509470717 0.000890782690303236 0.00080872816052491 0.000747692072938125 0.000666040552773588 0.000664372740299443 39815 38821 667 665 0 True 296 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 340 340 0.000937114413724701 0.00104858162802291 0.00080872816052491 0.000915541313801785 0.000686792419202058 0.000750279875854605 40963 45698 667 665 0 True 341 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 383 340 0.000990852708230458 0.00100161137565819 0.000869764248111696 0.000885023270008392 0.000729481254797489 0.000706218413419705 43312 43651 667 665 0 True 385 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 428 340 0.000970240446268054 0.00102524565017488 0.000762951094834821 0.000793469138628214 0.000839574938689185 0.000907980806897496 42411 44681 667 665 0 True 430 338 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 474 337 0.00100222262409651 0.0010703343389373 0.000762951094834821 0.000900282291905089 0.000891375487648133 0.000863615788557295 43809 46646 667 665 0 False 474 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 516 337 0.000972482401509248 0.000978344235502925 0.000701915007248035 0.000762951094834821 0.000893559233759255 0.000894852843436356 42509 42637 667 665 0 True 519 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 560 337 0.00100592871337277 0.00102432781427132 0.000701915007248035 0.000839246204318303 0.00094579496114852 0.000834183646484447 43971 44641 667 665 0 True 564 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 604 338 0.000998036115839997 0.000969464173135976 0.000534065766384375 0.000473029678797589 0.00112578522963889 0.00114289964311974 43626 42250 667 665 0 True 608 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 648 337 0.0010545196616615 0.00110149486786318 0.000762951094834821 0.000778210116731518 0.00100648385663606 0.00105188135990801 46095 48004 667 665 0 True 653 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 252 383 0.000834693662553022 0.000782615729068609 0.000671396963454643 0.000625619897764553 0.000744842559958695 0.000713605992149311 36486 34107 667 665 0 True 252 382 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 296 383 0.000925790252047243 0.000969280605955264 0.000793469138628214 0.000839246204318303 0.000709955287763354 0.000725783436545691 40468 42242 667 665 0 True 296 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 340 383 0.000892481202749506 0.00103472230587914 0.000732433051041428 0.000885023270008392 0.000725803161514493 0.00078325784414926 39012 45094 667 665 0 True 341 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 384 384 0.000898497878549853 0.000949822484799777 0.000732433051041428 0.00080872816052491 0.000746470623945261 0.000718937366293445 39275 41394 667 665 0 True 385 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 429 383 0.00101453050082878 0.00104289104542083 0.000762951094834821 0.000778210116731518 0.00085069887350308 0.000908546006710553 44347 45450 667 665 0 True 430 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 473 382 0.00100894848982009 0.00105769114936575 0.000701915007248035 0.000762951094834821 0.000966071991179275 0.000979636190340301 44103 46095 667 665 0 True 475 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 517 381 0.00103907762301042 0.00113719868451169 0.000778210116731518 0.000839246204318303 0.000962148288943894 0.00100866215960404 45420 49560 667 665 0 True 519 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 561 381 0.00101796206497346 0.00102244625066902 0.000747692072938125 0.000762951094834821 0.0009507759142471 0.000915075006297532 44497 44559 667 665 0 True 564 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 605 382 0.000935993436104104 0.00101083562648897 0.000457770656900893 0.000534065766384375 0.00107785768922419 0.00112286300603627 40914 44053 667 665 0 True 608 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 649 382 0.000899161314284492 0.000924673781042214 0.000457770656900893 0.000564583810177768 0.000995771291651058 0.000941119718422609 39304 40298 667 665 0 True 653 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 252 427 0.000919018632135065 0.000924627889247036 0.000762951094834821 0.000747692072938125 0.000782118199338288 0.000862937659850076 40172 40296 667 665 0 True 252 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 296 427 0.000883193102464561 0.000888327479261211 0.000762951094834821 0.000762951094834821 0.000741620727899847 0.000734210830217869 38606 38714 667 665 0 True 296 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 340 428 0.000944778240314496 0.000979330909099253 0.000839246204318303 0.000854505226215 0.000730671612551966 0.000697068248510828 41298 42680 667 665 0 True 341 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 385 428 0.00102640371276939 0.0010143234029225 0.000915541313801785 0.000885023270008392 0.000798897961645723 0.00079501378917305 44866 44205 667 665 0 True 386 425 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 429 428 0.00102022689730896 0.00102719605146994 0.000747692072938125 0.000686655985351339 0.000922136291739647 0.00093154052640763 44596 44766 667 665 0 True 430 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 473 426 0.000977217960028912 0.00108033875028611 0.000686655985351339 0.000854505226215 0.000907236788102806 0.000907386816689698 42716 47082 667 665 0 True 475 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 517 425 0.00102555726028037 0.00104936178854093 0.000732433051041428 0.000778210116731518 0.00095539267194082 0.000951696836980814 44829 45732 667 665 0 True 519 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 561 425 0.000986872093822624 0.00111113214485057 0.000686655985351339 0.000839246204318303 0.000952531070099826 0.00095667427270405 43138 48424 667 665 0 True 564 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 605 426 0.000968959328987372 0.000977885317551145 0.000610360875867857 0.000625619897764553 0.00101952193551983 0.00096391524572006 42355 42617 667 665 0 True 609 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 649 426 0.00098300586488628 0.00096003340922689 0.00064087891966125 0.000534065766384375 0.00100619497066572 0.00102929316564449 42969 41839 667 665 0 True 653 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 253 471 0.000910439721773354 0.000898790808561803 0.000762951094834821 0.000747692072938125 0.000766136359432317 0.000742333889428644 39797 39170 667 665 0 True 252 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 298 471 0.000877176426664214 0.000894981789562026 0.000732433051041428 0.000778210116731518 0.000769985087558274 0.000787487889120639 38343 39004 667 665 0 True 296 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 342 471 0.00095397483222225 0.00103391919946352 0.000823987182421607 0.000900282291905089 0.000769297007326156 0.000813442792864359 41700 45059 667 665 0 True 341 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 386 472 0.00095571349138889 0.000939680398065431 0.000793469138628214 0.000717174029144732 0.000854241896327261 0.000824348242733874 41776 40952 667 665 0 True 386 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 430 471 0.00102105047270368 0.00107634616410562 0.000701915007248035 0.000732433051041428 0.00101452977320001 0.00109895408891494 44632 46908 667 665 0 True 430 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 474 471 0.000959213686816468 0.00107928323899701 0.000671396963454643 0.000747692072938125 0.000965506352393018 0.00106949345710113 41929 47036 667 665 0 True 475 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 518 469 0.000957269133801147 0.000989748346604667 0.000579842832074464 0.000701915007248035 0.000982157772227803 0.000944240543483889 41844 43134 667 665 0 True 520 468 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 563 470 0.00101153360147576 0.00100879344160355 0.000656137941557946 0.000671396963454643 0.00105666965607513 0.00102530727244509 44216 43964 667 665 0 True 564 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 607 471 0.000965596396125581 0.00095138280583583 0.000579842832074464 0.000595101853971161 0.00100917763389721 0.000946929987267689 42208 41462 667 665 0 True 609 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 651 471 0.000931784050753291 0.000971873492382823 0.000503547722590982 0.000579842832074464 0.000983681747856485 0.000971957179952482 40730 42355 667 665 0 True 653 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 254 515 0.000935810419349721 0.000905468064760207 0.00080872816052491 0.000747692072938125 0.000761850620862966 0.000763627055503986 40906 39461 667 665 0 True 252 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 298 515 0.000876261342892298 0.000914623477898225 0.000686655985351339 0.000793469138628214 0.000822742634472209 0.000793349015259817 38303 39860 667 665 0 True 297 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 342 516 0.000988862401026541 0.00099387860817069 0.000869764248111696 0.000854505226215 0.000835738608808053 0.000850840177228774 43225 43314 667 665 0 True 341 512 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 387 515 0.000931440894338823 0.000928758150813059 0.000747692072938125 0.000686655985351339 0.000824956944684526 0.00080870047100287 40715 40476 667 665 0 True 386 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 431 515 0.000945944972123689 0.000954526393805525 0.000595101853971161 0.000473029678797589 0.00098290901619859 0.00105033163643121 41349 41599 667 665 0 True 430 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 476 513 0.00092766617377967 0.000997205763321097 0.000518806744487678 0.000701915007248035 0.00099665387793334 0.000929232800306423 40550 43459 667 665 0 True 475 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 519 512 0.000887997292267119 0.000932108251861056 0.000549324788281071 0.000625619897764553 0.000918264720481269 0.000871684172928902 38816 40622 667 665 0 True 520 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 564 512 0.000841396651182305 0.000905972874507165 0.000503547722590982 0.000610360875867857 0.000896125690409347 0.000867486504502155 36779 39483 667 665 0 True 564 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 608 513 0.000935467262935252 0.000937018673945105 0.000610360875867857 0.000595101853971161 0.000953233937267151 0.00095243507214448 40891 40836 667 665 0 True 609 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 652 512 0.000889850336905248 0.000973135516750218 0.000473029678797589 0.000518806744487678 0.000997846373560171 0.00105599503489399 38897 42410 667 665 0 True 653 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 255 557 0.000936588240555849 0.00095909262742574 0.000793469138628214 0.00080872816052491 0.000704237921789441 0.000722587830999919 40940 41798 667 665 0 True 252 555 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 298 556 0.00092766617377967 0.000973663272394766 0.000762951094834821 0.000869764248111696 0.000770699763709986 0.00074898663351602 40550 42433 667 665 0 True 297 555 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 343 557 0.000996114439918974 0.00102051879527154 0.000885023270008392 0.000885023270008392 0.000745412928941487 0.000756194906519459 43542 44475 667 665 0 True 341 555 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 387 557 0.00100160494255047 0.00103811829872232 0.000854505226215 0.000900282291905089 0.000805321935218196 0.000763810914496078 43782 45242 667 665 0 True 386 555 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 431 556 0.00100645488654162 0.00102047290347636 0.000701915007248035 0.000656137941557946 0.000976806650254711 0.00107188574957577 43994 44473 667 665 0 True 431 555 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 476 555 0.000922473073374048 0.000943259958089318 0.000457770656900893 0.000549324788281071 0.00105600571676975 0.00101539437046427 40323 41108 667 665 0 True 475 555 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 520 554 0.000971704580303119 0.000975177701635641 0.000610360875867857 0.000473029678797589 0.00102077985338499 0.00109708709348789 42475 42499 667 665 0 True 520 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 563 553 0.000911972487091314 0.000955329500221141 0.000610360875867857 0.00064087891966125 0.000905957411201492 0.000921856532840928 39864 41634 667 665 0 True 564 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 608 554 0.000984996172090197 0.000973869785473067 0.000778210116731518 0.000671396963454643 0.000846014235931979 0.000870771284230745 43056 42442 667 665 0 True 609 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 652 554 0.000961181116926087 0.000993763878682745 0.000625619897764553 0.000656137941557946 0.00100540492483677 0.00101772542154862 42015 43309 667 665 0 True 654 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 252 599 0.000996297456673357 0.00100319464259183 0.000885023270008392 0.000930800335698482 0.000705829995242107 0.000645285374865019 43550 43720 667 665 0 False 252 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 297 599 0.000990052009930032 0.000969946036985345 0.000869764248111696 0.000885023270008392 0.000782341670538373 0.000799085875616745 43277 42271 667 665 0 False 297 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 343 599 0.000931898436224781 0.000955490121504264 0.000793469138628214 0.00080872816052491 0.00074769943692813 0.000845780784454552 40735 41641 667 665 0 True 342 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 387 599 0.000906802263779989 0.0010552818301189 0.000762951094834821 0.000991836423285267 0.000741883054966424 0.000696956749605167 39638 45990 667 665 0 True 386 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 431 598 0.00101345527739678 0.0010471360364748 0.000686655985351339 0.000610360875867857 0.000976692875976971 0.00108640633065492 44300 45635 667 665 0 False 431 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 475 598 0.000958390111421744 0.00095324142354054 0.000534065766384375 0.000564583810177768 0.00105399793261408 0.00100293078937779 41893 41543 667 665 0 False 475 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 520 598 0.000906550615742712 0.000937179295228228 0.000457770656900893 0.000442511635004196 0.00107091848448653 0.00109772462424165 39627 40843 667 665 0 False 520 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 565 598 0.00101764178565329 0.00100372239823638 0.000686655985351339 0.00064087891966125 0.000986314956366831 0.00103243139559653 44483 43743 667 665 0 False 565 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 609 598 0.00117752979770129 0.00101413983574179 0.000976577401388571 0.00080872816052491 0.000886505067936156 0.000816512278338776 51472 44197 667 665 0 False 609 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 654 597 0.00110704547016947 0.000993672095092389 0.000885023270008392 0.000747692072938125 0.000893180619916944 0.00085337652107376 48391 43305 667 665 0 False 654 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 252 648 0.00104248631006081 0.0732752687394843 0.000885023270008392 0.07177843900206 0.000778928390786312 0.0219056475540124 45569 3193393 667 665 0 True 252 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 297 642 0.00096006013930549 0.000907372574260095 0.00080872816052491 0.000778210116731518 0.000740788545338315 0.000659464248012987 41966 39544 667 665 0 False 297 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 342 642 0.000951298212189396 0.000900121670621966 0.000839246204318303 0.000793469138628214 0.000682144385726846 0.000663281105176191 41583 39228 667 665 0 False 342 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 386 642 0.000929679358077885 0.00087690042226188 0.000793469138628214 0.000762951094834821 0.000676616929892469 0.000625468927691577 40638 38216 667 665 0 False 386 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 431 642 0.00102342969051066 0.000962465674371325 0.000732433051041428 0.000701915007248035 0.000932941323645808 0.000868975123009187 44736 41945 667 665 0 False 431 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 475 641 0.00103413617064208 0.000879447416894261 0.000717174029144732 0.000579842832074464 0.00100375076455592 0.000859653406319664 45204 38327 667 665 0 False 475 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 520 641 0.000910005056981695 0.000915403638416251 0.000518806744487678 0.000579842832074464 0.000962245942759911 0.000915172947688285 39778 39894 667 665 0 False 520 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 565 641 0.00102617494182641 0.00102639294505433 0.000793469138628214 0.000793469138628214 0.000908949414268215 0.00083967964877091 44856 44731 667 665 0 False 565 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 609 641 0.00105133974555409 0.00104392361081234 0.000915541313801785 0.000915541313801785 0.000758551560076486 0.000778975116480026 45956 45495 667 665 0 False 609 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 649 647 0.00110096016308623 0.076103557130409 0.000915541313801785 0.0730754558632792 0.000837069789226823 0.0234875942945147 48125 3316652 667 665 0 True 654 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F5_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F5_1.csv new file mode 100755 index 0000000..9a22e30 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F5_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 263 280 0.00938434422065689 0.0406835582891768 0.00943007553215839 0.0410772869459068 0.00147231296947476 0.00863476288702872 410207 1773021 667 665 0 True 264 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 308 280 0.00932795218321258 0.00914201273382587 0.00941481651026169 0.00917067215991455 0.00131355610910678 0.00127228677554854 407742 398416 667 665 0 False 308 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 351 281 0.00966408532973156 0.0575506516348092 0.00965896086060884 0.0583504997329671 0.00135137412130157 0.00799453962416456 422435 2508102 667 665 0 True 353 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 396 282 0.00962725320791195 0.075350105637176 0.00962844281681544 0.0739299610894942 0.00132554243810055 0.00840192057795482 420825 3283816 667 665 0 True 398 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 440 281 0.00955034041688243 0.0636687392548664 0.00946059357595178 0.0618905928130007 0.00171373291347224 0.0112517198901971 417463 2774733 667 665 0 True 442 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 484 281 0.00961881156011603 0.0578567269627491 0.00961318379491875 0.0606088349736782 0.00180394791991438 0.0152235186166527 420456 2521441 667 665 0 True 487 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 528 279 0.00966186625158467 0.0732391748425768 0.00971999694819562 0.073838406958114 0.00157326805705033 0.0184202293036992 422338 3191820 667 665 0 True 532 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 572 279 0.00957921130988637 0.0622762904055745 0.00962844281681544 0.0624399176012818 0.00180748834496691 0.0157920915146535 418725 2714049 667 665 0 True 576 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 621 279 0.00941019533721352 0.00926140023898152 0.00941481651026169 0.00932326237888151 0.00204214259859859 0.00184853964394819 411337 403619 667 665 0 False 621 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 660 278 0.00922967218610882 0.0403583001908525 0.00921644922560464 0.0411383230334936 0.00185784627260315 0.00917677489523034 403446 1758846 667 665 0 True 666 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 264 324 0.00933797235051506 0.00957020612873452 0.00935378042267491 0.00959792477302205 0.00146582295009617 0.0013056187773646 408180 417077 667 665 0 False 264 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 308 323 0.00954112094788038 0.00935903503322279 0.00958266575112535 0.0093842984664683 0.00133937695227401 0.00129977784247777 417060 407874 667 665 0 False 308 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 351 325 0.00971244750707732 0.0958263592145849 0.00973525597009232 0.0935072861829557 0.00142643665186966 0.0186935768764317 424549 4176187 667 665 0 True 353 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 395 325 0.00969810356895254 0.04765509562416 0.00968947890440223 0.0477912565804532 0.00142324350076538 0.00649922564519485 423922 2076846 667 665 0 True 398 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 440 325 0.00977860806378683 0.0690612317013637 0.00973525597009232 0.0672770275425345 0.00172425572315647 0.00983495196165956 427441 3009742 667 665 0 True 442 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 484 324 0.00991365155142731 0.0400254240545286 0.00987258716716258 0.0406958113984894 0.00169368520703862 0.00765502577161539 433344 1744339 667 665 0 True 487 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 532 323 0.00985188339682299 0.0366672460505808 0.00985732814526589 0.0397039749752041 0.00163992006451128 0.00872621207042178 430644 1597987 667 665 0 False 532 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 573 324 0.00965921250864611 0.0469762412439889 0.00971999694819562 0.0482948043030442 0.00186411740248452 0.00708941278375059 422222 2047261 667 665 0 True 576 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 621 323 0.0093864489133323 0.00927645274779992 0.00935378042267491 0.0093690394445716 0.00186052914800997 0.00212809608434597 410299 404275 667 665 0 False 621 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 666 323 0.00927984165390411 0.00954666363780819 0.00921644922560464 0.00967421988250553 0.00194093120203048 0.00184634260751584 405639 416051 667 665 0 False 666 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 264 370 0.00970057429513671 0.052604135653852 0.00975051499198901 0.0522316319523919 0.00164030522697231 0.00998257022961813 424030 2292529 667 665 0 True 264 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 308 370 0.00971249326126591 0.06240852761338 0.00967421988250553 0.0638284885938811 0.00141345669928679 0.0168340079783188 424551 2719812 667 665 0 True 308 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 353 367 0.00975694345548672 0.0325157595292879 0.00978103303578241 0.0360112916762036 0.00150499509430986 0.0145691976127631 426494 1417062 667 665 0 False 353 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 396 369 0.00991118082524313 0.0342644663845469 0.00993362325474937 0.0347905699244678 0.00144768644127343 0.00484338208208844 433236 1493272 667 665 0 True 398 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 441 369 0.00993323434414631 0.0698238386077347 0.00994888227664607 0.0680247196154726 0.00168473234679476 0.00991545788616856 434200 3042977 667 665 0 True 442 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 484 368 0.0101820456217302 0.032315258276155 0.0101472495613031 0.032669565880827 0.00169726422111288 0.00576242049737909 445076 1408324 667 665 0 True 487 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 529 368 0.0112020895022848 0.0277359225484173 0.010406652933547 0.0279697871366445 0.00553917329821715 0.00297015047155515 489664 1208753 667 665 0 True 532 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 572 367 0.0100853212670387 0.048643765513578 0.0100404364080262 0.0491798275730526 0.00194098188617768 0.00832367785217028 440848 2119933 667 665 0 True 577 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 617 368 0.00994863062860879 0.0557490774315051 0.0100099183642329 0.0560616464484627 0.00208170058734933 0.0098305767126798 434873 2429588 667 665 0 True 621 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 660 366 0.0099561571926328 0.0642622578419039 0.0100404364080262 0.0646219577325094 0.00199068603910321 0.0182984629514386 435202 2800599 667 665 0 True 666 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 265 413 0.00976790158365541 0.0467153693342994 0.00973525597009232 0.0472419317921721 0.00159569496599442 0.0113271618443831 426973 2035892 667 665 0 True 264 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 308 413 0.00985092255886248 0.0320905261551682 0.00988784618905928 0.0322728313115129 0.00141621214947811 0.00347027570430502 430602 1398530 667 665 0 True 309 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 352 413 0.0101555768236276 0.0792037314618659 0.0101625085831998 0.0761120012207217 0.00146183644334182 0.0156804647872981 443919 3451760 667 665 0 True 353 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 397 413 0.0102621840830557 0.0683839835340239 0.0102998397802701 0.0702372777904936 0.00157979997352638 0.0126991357421761 448579 2980227 667 665 0 True 398 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 440 412 0.0101820456217302 0.042934963868816 0.0102082856488899 0.0439917601281758 0.00155641042910728 0.0081688985575975 445076 1871139 667 665 0 True 443 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 484 411 0.0105520368678101 0.0532409302037424 0.0104829480430304 0.053482871747921 0.00173371303403647 0.0115983834718294 461249 2320281 667 665 0 True 487 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 529 411 0.0103419565108725 0.0411236835508318 0.0104219119554437 0.0421759365224689 0.00177539501457979 0.00494792277035894 452066 1792202 667 665 0 True 532 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 573 411 0.0103125136905111 0.0522654542054381 0.0103150988021668 0.0519569695582513 0.00189417836432085 0.00591711047597088 450779 2277769 667 665 0 True 577 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 617 411 0.0103526629910039 0.042947859463261 0.0103761348897536 0.0436865796902419 0.00186443263070593 0.00706492010333534 452534 1871701 667 665 0 True 621 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 661 410 0.0106165731508245 0.0844534086417692 0.0106507972838941 0.0828412298771649 0.00188377347871415 0.0142731118360442 464070 3680545 667 665 0 True 666 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 265 458 0.0099484704889487 0.0412428186511139 0.00994888227664607 0.0413824673838407 0.00161543988502211 0.00591884211681111 434866 1797394 667 665 0 True 264 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 308 457 0.0100083627218206 0.0527371530221755 0.00987258716716258 0.0530861371786069 0.0017330920448849 0.00738482770242594 437484 2298326 667 665 0 True 309 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 352 457 0.0101110351210296 0.0340971678452253 0.0100556954299229 0.0346532387273976 0.00149855813097041 0.00382151403050665 441972 1485981 667 665 0 True 353 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 396 456 0.010460414105147 0.0539119141410404 0.010406652933547 0.0529030289158465 0.00171426272325654 0.011236032897464 457244 2349523 667 665 0 True 398 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 441 457 0.0105447619518234 0.0942009177211741 0.0105592431525139 0.093141069657435 0.00207041723683944 0.0130563227072941 460931 4105349 667 665 0 True 443 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 485 455 0.010466476535136 0.0615539764953698 0.0104982070649271 0.0615854123750668 0.00189738996587552 0.0141645765267346 457509 2682570 667 665 0 True 487 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 529 455 0.0104843206686883 0.051416869020801 0.0104982070649271 0.0509040970473793 0.00175684302496493 0.00720601967781125 458289 2240787 667 665 0 True 532 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 573 454 0.0104781438532279 0.0322288669717324 0.0105287251087205 0.0324559395742733 0.00186363392380493 0.00424539808748323 458019 1404559 667 665 0 True 577 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 618 455 0.0104685354736228 0.040345657001281 0.0105134660868238 0.0402532997634852 0.00177648174012589 0.00521059188475965 457599 1758295 667 665 0 True 621 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 661 454 0.0105351993264068 0.0742435397259457 0.0105897611963073 0.0733958953231098 0.00198711452891801 0.0132326486472321 460513 3235591 667 665 0 True 666 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 266 501 0.00982081630276645 0.0503227856778591 0.0098115510795758 0.050919356069276 0.0015917991537519 0.0105045388209047 429286 2193106 667 665 0 True 264 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 310 501 0.00995251973463943 0.0526488113164578 0.00993362325474937 0.0525825894560159 0.0017329079388309 0.00575500057505452 435043 2294476 667 665 0 True 309 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 354 501 0.0102608572115865 0.0684777863633678 0.0102693217364767 0.0655222400244144 0.00162804856149436 0.0160379596810268 448521 2984315 667 665 0 True 353 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 398 501 0.0105351535722182 0.0864266640508344 0.0105592431525139 0.0824597543297475 0.0017252441697509 0.0176614774426591 460511 3766541 667 665 0 True 398 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 442 499 0.0104999228469995 0.0934547630233744 0.0105897611963073 0.0887006942854963 0.0020101520292543 0.0254474205015555 458971 4072831 667 665 0 True 443 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 486 499 0.0105769957776891 0.0419860133281246 0.0105134660868238 0.0427100022888533 0.00190264896207807 0.00496116499941635 462340 1829783 667 665 0 True 487 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 530 499 0.0106194099105174 0.0413982312154844 0.010605020218204 0.042572671091783 0.00185578623170115 0.00560014219870865 464194 1804167 667 665 0 True 532 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 575 498 0.0107045813325885 0.127805827225422 0.0107118333714809 0.125520714122225 0.0019219677909725 0.0275822773832583 467917 5569877 667 665 0 True 577 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 619 499 0.01037478514119 0.0636675460681918 0.0103456168459602 0.0636453803311208 0.00189021063190919 0.0167158364550607 453501 2774681 667 665 0 True 622 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 663 499 0.0104418379045771 0.0735364848376377 0.0104219119554437 0.0706034943160143 0.00209173540108091 0.0113802960142714 456432 3204777 667 665 0 True 666 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 266 545 0.00986526649698726 0.051067196487442 0.00984206912336919 0.053177691309987 0.0015101926617909 0.0101224894993492 431229 2225548 667 665 0 True 264 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 310 545 0.0102053116266312 0.099366589970004 0.0102388036926833 0.0942549782558938 0.00154480045023586 0.0204835971234785 446093 4330473 667 665 0 True 309 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 354 544 0.0101573154827942 0.0581335233253654 0.0101319905394064 0.0597390707255665 0.00145090865345829 0.0107573471736465 443995 2533504 667 665 0 True 354 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 398 544 0.0104598193006953 0.0607103017328168 0.0104371709773404 0.0588235294117647 0.00180469000545891 0.00974523540223224 457218 2645802 667 665 0 True 398 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 443 543 0.0108795682268731 0.0587437924176429 0.0108949416342412 0.057801174944686 0.00196643138295244 0.00856392008821887 475566 2560100 667 665 0 True 443 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 487 542 0.0106812466964046 0.0653955098320303 0.0106813153276875 0.0648355840390631 0.00205339479195211 0.0117155417013905 466897 2849987 667 665 0 True 488 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 531 541 0.0106046541846952 0.0738978597787671 0.0106507972838941 0.0723887998779278 0.00206233637478549 0.014619729078141 463549 3220526 667 665 0 True 532 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 575 541 0.0105742734034676 0.0579562662664902 0.0104829480430304 0.0580910963607233 0.00173536749910977 0.0113163545741929 462221 2525779 667 665 0 True 577 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 619 540 0.0103557742758284 0.0514152857538674 0.0103608758678569 0.0493629358358129 0.00176329423089502 0.00806794380333307 452670 2240718 667 665 0 True 622 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 663 539 0.0101110122439353 0.0633594973930592 0.0100404364080262 0.0635233081559472 0.00191610462826216 0.0119490358186496 441971 2761256 667 665 0 True 666 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 267 586 0.00953922214905365 0.0457196550543215 0.00955214770733196 0.0459601739528496 0.00133617476355528 0.00859644441743205 416977 1992498 667 665 0 True 264 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 311 585 0.00956710932700278 0.0570815915962945 0.00952162966353857 0.0565346761272602 0.001461796013421 0.0121264090110191 418196 2487660 667 665 0 True 309 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 355 585 0.00998255735945257 0.0461877054733423 0.00997940032043946 0.0466773479819944 0.00152335721521264 0.00782002278599534 436356 2012896 667 665 0 True 354 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 399 584 0.0103729778507405 0.0507969855974337 0.0102388036926833 0.0503700312809949 0.00167820636321221 0.00521827627165909 453422 2213772 667 665 0 True 398 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 443 584 0.0107278473374894 0.0888154008275438 0.0107423514152743 0.0856946669718471 0.00207073529364947 0.0195479569711856 468934 3870644 667 665 0 True 443 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 487 582 0.01050902793053 0.0635279891190554 0.0105592431525139 0.0613870450904097 0.00212632908594466 0.00945717178708816 459369 2768599 667 665 0 True 488 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 531 581 0.010291306624097 0.0562478982991927 0.0102693217364767 0.0557564660105287 0.00204930602405722 0.00697066938002774 449852 2451327 667 665 0 True 532 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 575 581 0.00995409825414599 0.0377561436206676 0.00991836423285267 0.0391088731212329 0.00177341160523768 0.00658277746126699 435112 1645442 667 665 0 True 577 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 619 581 0.00982546035290892 0.0487306845736451 0.00987258716716258 0.0476539253833829 0.00157865514531881 0.00718435898819679 429489 2123721 667 665 0 True 622 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 664 580 0.00986741694385126 0.0523610927065891 0.00985732814526589 0.0517280842298009 0.0017043319560999 0.00774302341895825 431323 2281937 667 665 0 True 666 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 264 628 0.0091853592544538 0.00925396576816268 0.00921644922560464 0.00917067215991455 0.0013632370622731 0.00144057085351057 401509 403295 667 665 0 False 264 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 309 628 0.00921393274523187 0.00930843932903901 0.00921644922560464 0.00935378042267491 0.00140531324057829 0.0012764713556831 402758 405669 667 665 0 False 309 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 355 626 0.00974733507588161 0.0746405037542357 0.00967421988250553 0.0707255664911879 0.00146465948268318 0.0128191470236381 426074 3252891 667 665 0 True 354 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 399 626 0.0103537153373416 0.0782282095717664 0.0101777676050965 0.0723735408560311 0.00197524993031526 0.0206271448215054 452580 3409246 667 665 0 True 398 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 443 628 0.00973367745058576 0.00991980982440078 0.00970473792629892 0.00984206912336919 0.00189782052931238 0.00186023122217419 425477 432313 667 665 0 False 443 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 488 627 0.0101839901747455 0.00981226240240106 0.010101472495613 0.0097962920576791 0.00205819854929272 0.001862461653922 445161 427626 667 665 0 False 488 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 532 627 0.00980198845415928 0.00957998108110744 0.0098268101014725 0.00965896086060884 0.00195753229466437 0.00190588616755161 428463 417503 667 665 0 False 532 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 577 627 0.00973241921039938 0.00961261014747902 0.00973525597009232 0.00952162966353857 0.00161768539384152 0.00160626569279241 425422 418925 667 665 0 False 577 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 622 627 0.00945331865996505 0.00948106131660119 0.009399557488365 0.00943007553215839 0.001409145142021 0.00141945963984207 413222 413192 667 665 0 False 622 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 667 627 0.0095104427644269 0.00931936157629138 0.00944533455405508 0.0093690394445716 0.00151461065734691 0.00142882510556915 415719 406145 667 665 0 False 667 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 266 678 0.0094777513966752 0.0395901862690601 0.00933852140077821 0.0395208667124437 0.0017855952828333 0.00729903479775891 414290 1725371 667 665 0 True 265 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 309 671 0.00925934377741319 0.00902540168227848 0.00926222629129473 0.00900282291905089 0.00142419242282447 0.00128146414953361 404743 393334 667 665 0 False 309 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 354 671 0.00943263776671975 0.00921493479636376 0.00943007553215839 0.00930800335698482 0.0014446035557604 0.00130292458886221 412318 401594 667 665 0 False 354 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 399 671 0.00940443030945045 0.0092384772872901 0.009399557488365 0.00915541313801785 0.00141813402444183 0.00140510644016484 411085 402620 667 665 0 False 399 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 443 671 0.00956612561194797 0.00965492238263317 0.00964370183871214 0.00967421988250553 0.00147554643186769 0.00153600229301621 418153 420769 667 665 0 False 443 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 488 671 0.00951241019453652 0.00973479705214054 0.00958266575112535 0.00973525597009232 0.00169673894620486 0.00168025450030381 415805 424250 667 665 0 False 488 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 533 671 0.00938477888544855 0.00957454290337884 0.00941481651026169 0.00959792477302205 0.00181439075537929 0.00182654974884053 410226 417266 667 665 0 False 533 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 577 671 0.00935105804845346 0.00937801129052891 0.00933852140077821 0.00929274433508812 0.00146201128165937 0.00138858310895872 408752 408701 667 665 0 False 577 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 622 671 0.00930985640162295 0.00940577582661162 0.0093690394445716 0.0093690394445716 0.00136093653503286 0.00141485073893081 406951 409911 667 665 0 False 622 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 663 675 0.00939868815878168 0.0403933615223685 0.0093690394445716 0.0410467689021134 0.00148433851633354 0.00806821324468708 410834 1760374 667 665 0 True 667 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F5_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F5_2.csv new file mode 100755 index 0000000..ae83ebe --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F5_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 263 280 0.00808979808562187 0.72050127607873 0.00772106507972839 0.725978484779126 0.00256384899932509 0.192301037331715 353620 31400004 667 665 11 True 264 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 308 280 0.00660523480534853 0.00640936284405222 0.00648508430609598 0.0064087891966125 0.00140134159370739 0.00117850322126381 288727 279325 667 665 0 False 308 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 351 281 0.00606041680464414 0.00617485577069247 0.00608834973678187 0.00617990386816205 0.0012216619036619 0.00133860618727104 264912 269105 667 665 0 True 353 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 396 282 0.00619848006873194 0.00655036538473673 0.00621042191195544 0.00622568093385214 0.00132168262429092 0.00243240441014128 270947 285470 667 665 0 True 398 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 440 281 0.00628026568084692 0.00622563504205696 0.00624093995574884 0.00630197604333562 0.0015651793559867 0.00161252604533307 274522 271318 667 665 0 True 442 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 484 281 0.00645911880406787 0.0064869199779031 0.00648508430609598 0.00653086137178607 0.00159488835034862 0.00167131003411856 282340 282705 667 665 0 True 487 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 528 279 0.00660040773845167 0.006725717934112 0.00659189745937285 0.00683604180972 0.00150732622138446 0.00155608700969233 288516 293112 667 665 0 True 532 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 572 279 0.00686827563558573 0.00686355394092923 0.0068055237659266 0.00689707789730678 0.00176761364099226 0.00171015748469235 300225 299119 667 665 0 True 576 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 621 279 0.00914484392045223 0.0075706088292372 0.00772106507972839 0.0076600289921416 0.00801812273535568 0.00188854892549235 399738 329933 667 665 0 False 621 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 660 278 0.008843941499152 0.726172607072729 0.00869764248111696 0.733806363012131 0.00219395031930211 0.204111649499944 386585 31647165 667 665 13 True 666 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 264 324 0.00647602497675401 0.00649086667228841 0.00648508430609598 0.00651560234988937 0.00154339949083575 0.00132928943711888 283079 282877 667 665 0 False 264 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 308 323 0.00608683984855821 0.00631572063599144 0.00613412680247196 0.00633249408712902 0.00129236101894424 0.00117374290578622 266067 275244 667 665 0 False 308 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 351 325 0.0061728577231183 0.00641133619124488 0.00617990386816205 0.00642404821850919 0.00132330573732326 0.00135329008724513 269827 279411 667 665 0 True 353 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 395 325 0.00642844062061439 0.00657422911822931 0.00634775310902571 0.00656137941557946 0.00133114952581791 0.00132362933602369 280999 286510 667 665 0 True 398 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 440 325 0.00653070123212598 0.00659302180835472 0.00653086137178607 0.00656137941557946 0.00159597352716334 0.00176122295507877 285469 287329 667 665 0 True 442 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 484 324 0.00676228605770358 0.00679632246099341 0.00674448767833982 0.00679026474402991 0.00165569430402317 0.0015695579117397 295592 296189 667 665 0 True 487 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 532 323 0.00710843937152504 0.00710744588640289 0.00715648126955062 0.00711070420386053 0.00157483881623822 0.00159040634304444 310723 309748 667 665 0 False 532 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 573 324 0.00708638585262187 0.00703202272102779 0.00709544518196384 0.00704966811627375 0.00185774083820398 0.00164647367161669 309759 306461 667 665 0 True 576 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 621 323 0.0073067837790878 0.00716485652217061 0.00737010757610437 0.00720225833524071 0.00193431518062735 0.00191024415652872 319393 312250 667 665 0 False 621 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 666 323 0.00731742162793632 0.00723665423572665 0.0072327763790341 0.0072480354009308 0.00194513342716291 0.00184288411121638 319858 315379 667 665 0 False 666 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 264 370 0.00650146430561327 0.00656642751304905 0.00653086137178607 0.00660715648126955 0.00154638175618651 0.00149528079422142 284191 286170 667 665 0 True 264 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 308 370 0.00646659961390328 0.00665777513135092 0.00648508430609598 0.00663767452506294 0.00132382470835319 0.00135144612665941 282667 290151 667 665 0 True 308 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 353 367 0.00675828256620145 0.00693762329834658 0.00679026474402991 0.00692759594110018 0.00131796975068814 0.00146294238246104 295417 302347 667 665 0 False 353 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 396 369 0.00701384258660324 0.00734840075698516 0.00700389105058366 0.00743114366369116 0.00138606838465468 0.00135561375722897 306588 320249 667 665 0 True 398 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 441 369 0.0072034250670499 0.00742859666905878 0.00720225833524071 0.00750743877317464 0.00176341980538413 0.00168297677109609 314875 323744 667 665 0 True 442 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 484 368 0.00728768140534905 0.00745691190668362 0.0072480354009308 0.00741588464179446 0.00170469495083674 0.00182749176083295 318558 324978 667 665 0 True 487 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 529 368 0.0263927683743768 0.00801557567528342 0.0081177996490425 0.00793469138628214 0.1014630228012 0.00199719062430345 1146758 349325 663 665 0 True 532 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 572 367 0.00759798631240571 0.00775346468712408 0.00752269779507134 0.00776684214541848 0.00182521221043019 0.00192510803635366 332122 337902 667 665 0 True 577 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 617 368 0.00732465078973445 0.0078004349394888 0.00743114366369116 0.00784313725490196 0.00198745045550064 0.00219578810819328 320174 339949 667 665 0 True 621 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 660 366 0.00701738853621942 0.00686415053426654 0.00704966811627375 0.00686655985351339 0.00191441229291728 0.00199405450590861 306743 299145 667 665 0 True 666 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 265 413 0.00651304011532801 0.00655642310170023 0.00651560234988937 0.00665293354695964 0.00154673023799056 0.00142901001962871 284697 285734 667 665 0 True 264 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 308 413 0.00666247329528186 0.0066404739245688 0.00668345159075303 0.00663767452506294 0.00139726214050786 0.00133254435660504 291229 289397 667 665 0 True 309 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 352 413 0.00678948692282378 0.00692927099162417 0.00677500572213321 0.00697337300679027 0.00131819624352556 0.00126602377403003 296781 301983 667 665 0 True 353 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 397 413 0.00714531724753325 0.00717538868916397 0.00715648126955062 0.00712596322575723 0.00149143578160441 0.00154310856318653 312335 312709 667 665 0 True 398 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 440 412 0.00710546534926631 0.00714606383204521 0.00715648126955062 0.0072480354009308 0.00164495758643026 0.00150841566347107 310593 311431 667 665 0 True 443 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 484 411 0.00740472061977709 0.00754364739957011 0.00744640268558785 0.00756847486076143 0.00172792229228365 0.00157199517667527 323674 328758 667 665 0 True 487 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 529 411 0.00744541897053304 0.00756799299691206 0.00755321583886473 0.00759899290455482 0.00166398954710905 0.00168674913824659 325453 329819 667 665 0 True 532 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 573 411 0.00730175081834226 0.00734401809054566 0.00737010757610437 0.00749217975127794 0.00179272651185116 0.00182479507657088 319173 320058 667 665 0 True 577 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 617 411 0.00714815400722619 0.00703525809258784 0.0072480354009308 0.00709544518196384 0.0019864801106269 0.001795008836073 312459 306602 667 665 0 True 621 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 661 410 0.00713017261110804 0.00689840875936695 0.00715648126955062 0.00700389105058366 0.00185776191632222 0.00184717168166155 311673 300638 667 665 0 True 666 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 265 458 0.00643555539694103 0.00659251699860776 0.00643930724040589 0.00663767452506294 0.00155326511873125 0.0015668240345591 281310 287307 667 665 0 True 264 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 308 457 0.00643406838581167 0.00656674875561529 0.00645456626230259 0.00656137941557946 0.00148591883298307 0.00148479359850818 281245 286184 667 665 0 True 309 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 352 457 0.00660395368806785 0.00676412936667602 0.00660715648126955 0.0068055237659266 0.00141824228388956 0.0013966335109235 288671 294786 667 665 0 True 353 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 396 456 0.00684457496589311 0.00695887119951401 0.00694285496299687 0.00698863202868696 0.00148033352798512 0.00151008429266317 299189 303273 667 665 0 True 398 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 441 457 0.00700704808959677 0.00713690841890719 0.00704966811627375 0.00714122224765393 0.00177557843681943 0.00199736759429674 306291 311032 667 665 0 True 443 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 485 455 0.00711033817035177 0.00710216832995742 0.00720225833524071 0.00718699931334401 0.00188108075670755 0.00190765829005643 310806 309518 667 665 0 True 487 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 529 455 0.00686406625023492 0.00699696138951177 0.00689707789730678 0.00704966811627375 0.00178473297446491 0.00173572970583906 300041 304933 667 665 0 True 532 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 573 454 0.00679623566564166 0.00673526342750903 0.00675974670023652 0.00663767452506294 0.00185375086067126 0.00199427192158473 297076 293528 667 665 0 True 577 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 618 455 0.00646431190447349 0.00653212339615346 0.00648508430609598 0.00657663843747616 0.00176642271984538 0.00172569452129041 282567 284675 667 665 0 True 621 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 661 454 0.00662358223497544 0.00666791721808527 0.00666819256885634 0.00677500572213321 0.00184092299123349 0.0019195779489299 289529 290593 667 665 0 True 666 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 266 501 0.00663195525148847 0.006713602500185 0.00663767452506294 0.00675974670023652 0.00147417328447747 0.00151817828224907 289895 292584 667 665 0 True 264 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 310 501 0.00679367343108029 0.00655903893402538 0.00694285496299687 0.00654612039368277 0.00163928886538874 0.00147015209014559 296964 285848 667 665 0 True 309 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 354 501 0.00667235620001855 0.00676972816568774 0.00660715648126955 0.00674448767833982 0.0014894924655228 0.00151277973370484 291661 295030 667 665 0 True 353 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 398 501 0.00672851946651989 0.00679859410485472 0.00671396963454643 0.00685130083161669 0.00161077076202142 0.00155965144683106 294116 296288 667 665 0 True 398 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 442 499 0.00690977468464211 0.00688230073925946 0.00688181887541009 0.00679026474402991 0.00182682054447726 0.00201076071613803 302039 299936 667 665 0 True 443 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 486 499 0.00685324538463201 0.00686119051347756 0.0068207827878233 0.00685130083161669 0.00179504819855677 0.0017934643527057 299568 299016 667 665 0 True 487 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 530 499 0.00692805348298613 0.00682053038294982 0.00704966811627375 0.00679026474402991 0.00168003002260062 0.00167660757749863 302838 297244 667 665 0 True 532 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 575 498 0.00664062567022737 0.00661160798540182 0.00671396963454643 0.00668345159075303 0.00168907444447782 0.00190764759887975 290274 288139 667 665 0 True 577 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 619 499 0.00654616614787136 0.00654036097338792 0.00650034332799268 0.00653086137178607 0.00178680396878945 0.00171257321368467 286145 285034 667 665 0 True 622 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 663 499 0.00671783586348277 0.00650713531367902 0.00675974670023652 0.00645456626230259 0.00189657396644841 0.00195368322610373 293649 283586 667 665 0 True 666 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 266 545 0.00680540938045511 0.00695854995694776 0.00683604180972 0.00698863202868696 0.0014358419531613 0.00148729261015658 297477 303259 667 665 0 True 264 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 310 545 0.0069164319190828 0.00699588293232509 0.00692759594110018 0.00701915007248035 0.00144059874211261 0.00140704820917644 302330 304886 667 665 0 True 309 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 354 544 0.00693480222580401 0.00723016054670896 0.00698863202868696 0.00720225833524071 0.0013660703550563 0.00138506839189551 303133 315096 667 665 0 True 354 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 398 544 0.00671980329359239 0.00709110840731951 0.00675974670023652 0.00711070420386053 0.00156121541172137 0.00152891468371856 293735 309036 667 665 0 True 398 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 443 543 0.00692583440483924 0.00675818637920046 0.00698863202868696 0.00671396963454643 0.00196276599628737 0.00208317105059589 302741 294527 667 665 0 True 443 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 487 542 0.00680296153136524 0.0068928558521504 0.00679026474402991 0.00692759594110018 0.00181280749477026 0.00207950072922548 297370 300396 667 665 0 True 488 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 531 541 0.00666297659135642 0.00699882000721648 0.00666819256885634 0.00686655985351339 0.00175870974555635 0.00196116081394455 291251 305014 667 665 0 True 532 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 575 541 0.00686745206019101 0.0066768431722474 0.00688181887541009 0.00666819256885634 0.00162413007993643 0.00170299246427763 300189 290982 667 665 0 True 577 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 619 540 0.00655561438781639 0.00707823575877207 0.00663767452506294 0.00691233691920348 0.00169070808235797 0.00233841119736329 286558 308475 667 665 0 True 622 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 663 539 0.00681044234120065 0.00681357777598035 0.0068055237659266 0.00695811398489357 0.00182760101723279 0.00178517658320221 297697 296941 667 665 0 True 666 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 267 586 0.00726134986981218 0.0069277565623833 0.0072632944228275 0.00694285496299687 0.00129159728130588 0.00133072476263257 317407 301917 667 665 0 True 264 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 311 585 0.00696081348202072 0.00710193887098153 0.00700389105058366 0.00717174029144732 0.00136146020507619 0.00151076873518561 304270 309508 667 665 0 True 309 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 355 585 0.00709427845015464 0.00694792600636404 0.00714122224765393 0.00683604180972 0.00137501615926714 0.00162365429367531 310104 302796 667 665 0 True 354 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 399 584 0.00675189985689234 0.00671305179864287 0.0068207827878233 0.00671396963454643 0.00139877734482882 0.00136754011450564 295138 292560 667 665 0 True 398 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 443 584 0.00673666371208994 0.00672952695311178 0.00672922865644312 0.00675974670023652 0.00185671061186556 0.00200191014195019 294472 293278 667 665 0 True 443 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 487 582 0.00678971569376676 0.00685139261520705 0.00672922865644312 0.00692759594110018 0.00204595767091273 0.00199296921351078 296791 298589 667 665 0 True 488 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 531 581 0.00667244770839575 0.00679719440510179 0.00663767452506294 0.00674448767833982 0.0018516523814239 0.00196292778903226 291665 296227 667 665 0 True 532 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 575 581 0.00658606380032689 0.00681956665525108 0.00674448767833982 0.0068055237659266 0.00162181345001851 0.00177125383179882 287889 297202 667 665 0 True 577 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 619 581 0.00645701411139246 0.00665669667416424 0.00650034332799268 0.00665293354695964 0.0015336499609706 0.00148993904633882 282248 290104 667 665 0 True 622 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 664 580 0.00646181830119502 0.00647590594706037 0.00650034332799268 0.00657663843747616 0.0016093691589088 0.00164073106243323 282458 282225 667 665 0 True 666 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 264 628 0.00734892338678452 0.00730377098617452 0.00733958953231098 0.00732433051041428 0.00143171824101943 0.00138075720592505 321235 318304 667 665 0 False 264 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 309 628 0.00687307982538829 0.00688363160131962 0.00686655985351339 0.00686655985351339 0.00138704999216308 0.00140575435707744 300435 299994 667 665 0 False 309 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 355 626 0.00656195134293691 0.00695760917514661 0.00645456626230259 0.00691233691920348 0.00135248820550312 0.00170436941464186 286835 303218 667 665 0 True 354 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 399 626 0.00651589975211524 0.00648714943687899 0.00650034332799268 0.00653086137178607 0.00148680452112218 0.00127230007938134 284822 282715 667 665 0 True 398 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 443 628 0.006358756991383 0.00643391495447247 0.0063782711528191 0.0063935301747158 0.00176656403389036 0.0018288662379222 277953 280395 667 665 0 False 443 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 488 627 0.0065946655877829 0.00641349310561825 0.00660715648126955 0.00645456626230259 0.00187950209511039 0.00183515785462591 288265 279505 667 665 0 False 488 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 532 627 0.00646783497699537 0.00635447625701929 0.00650034332799268 0.00643930724040589 0.00183830513773415 0.00181019437929677 282721 276933 667 665 0 False 532 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 577 627 0.00649073494838756 0.00644520433608627 0.00645456626230259 0.00648508430609598 0.00157596725130053 0.00144427802460221 283722 280887 667 665 0 False 577 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 622 627 0.00648629679209377 0.00637574710408431 0.00650034332799268 0.0063935301747158 0.00142479876529314 0.00129274090464361 283528 277860 667 665 0 False 622 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 667 627 0.0064555042231688 0.00641920663411791 0.00646982528419928 0.00646982528419928 0.00149459379950306 0.00140767244016587 282182 279754 667 665 0 False 667 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 266 678 0.00936203905371645 0.72486150143039 0.00885023270008392 0.711116197451743 0.00252590501270695 0.177257820370922 409232 31590026 667 665 11 True 265 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 309 671 0.00731835958880253 0.00693842640476219 0.00706492713817044 0.00694285496299687 0.00192740732987371 0.00131017077442377 319899 302382 667 665 0 False 309 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 354 671 0.0067577563930326 0.00639155682752315 0.00657663843747616 0.00628671702143893 0.00236154099897257 0.0012824660816026 295394 278549 667 665 0 False 354 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 399 671 0.0062794192283579 0.00607843710902342 0.00630197604333562 0.00604257267109178 0.001381513882501 0.00131188806180557 274485 264903 667 665 0 False 399 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 443 671 0.00631371199271044 0.00615537470363939 0.00634775310902571 0.00613412680247196 0.00147816080590635 0.0015057779372849 275984 268256 667 665 0 False 443 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 488 671 0.00623343626881913 0.00618931168617355 0.00624093995574884 0.00608834973678187 0.00161464308947535 0.00154979741144935 272475 269735 667 665 0 False 488 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 533 671 0.00617702135428052 0.00618472250665574 0.00624093995574884 0.00622568093385214 0.00178454881475513 0.00179508575997297 270009 269535 667 665 0 False 533 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 577 671 0.00627596478711891 0.0061720793170842 0.00627145799954223 0.00625619897764553 0.00144834320978813 0.00134195120140475 274334 268984 667 665 0 False 577 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 622 671 0.00732254609705905 0.00668124878458449 0.00701915007248035 0.00666819256885634 0.00265166122787756 0.00145063096806801 320082 291174 667 665 0 False 622 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 663 675 0.00804665188577604 0.746224384490638 0.00794995040817884 0.746242465857939 0.00180708275180802 0.186675157701734 351734 32521037 667 665 14 True 667 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F5_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F5_3.csv new file mode 100755 index 0000000..e1f28cb --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F5_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 263 280 0.00107064801314152 0.0732944974016639 0.000900282291905089 0.0727702754253452 0.000791821566147154 0.0216497322691162 46800 3194231 667 665 0 True 264 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 308 280 0.000880493605337409 0.000970978602376851 0.000762951094834821 0.000854505226215 0.000645778554135047 0.000654952615030023 38488 42316 667 665 0 False 308 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 351 281 0.000832703355349105 0.000872127675563365 0.000701915007248035 0.000701915007248035 0.000649029984779064 0.000710569877554022 36399 38008 667 665 0 True 353 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 396 282 0.00086363318683986 0.000857258733925682 0.000732433051041428 0.000686655985351339 0.000677513761925452 0.000739772510606372 37751 37360 667 665 0 True 398 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 440 281 0.000824856512004927 0.000961914972829189 0.000503547722590982 0.000732433051041428 0.000857254599695812 0.0008775303729793 36056 41921 667 665 0 True 442 280 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 484 281 0.000921763883450813 0.000957761765365577 0.00064087891966125 0.000625619897764553 0.000907066365782107 0.000932815863813716 40292 41740 667 665 0 True 487 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 528 279 0.000944663854843007 0.000938877291649816 0.000747692072938125 0.000686655985351339 0.000846039499382596 0.000891363236961584 41293 40917 667 665 0 True 532 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 572 279 0.000946082234689476 0.000962947538220695 0.00064087891966125 0.000610360875867857 0.000921764276924033 0.000931999599623733 41355 41966 667 665 0 True 576 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 621 279 0.00112710868186872 0.000896932190857092 0.000610360875867857 0.000534065766384375 0.00130645964106325 0.000953712676150589 49268 39089 667 665 0 False 621 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 660 278 0.00105463404713299 0.0746946790184433 0.000732433051041428 0.0733958953231098 0.00102055636998986 0.0235547562489812 46100 3255252 667 665 0 True 666 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 264 324 0.000905658409065094 0.000957532306389687 0.000717174029144732 0.000793469138628214 0.000749227744165327 0.00076767983034475 39588 41730 667 665 0 False 264 324 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 308 323 0.000836272182059577 0.000936720377276448 0.000717174029144732 0.000869764248111696 0.000634964223027905 0.000651825121292606 36555 40823 667 665 0 False 308 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 351 325 0.000787978635996719 0.000905949928609576 0.00064087891966125 0.000793469138628214 0.00065147322474426 0.000679692096671452 34444 39482 667 665 0 True 353 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 395 325 0.000787223691884888 0.000896725677778791 0.000656137941557946 0.000778210116731518 0.00063094884149186 0.00065233494331631 34411 39080 667 665 0 True 398 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 440 325 0.000931852682036185 0.000955398337913908 0.000671396963454643 0.000686655985351339 0.000847295246837245 0.000923308424221487 40733 41637 667 665 0 True 442 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 484 324 0.000966145446388731 0.000899938103441254 0.000717174029144732 0.000686655985351339 0.000851060232848046 0.00083441651871994 42232 39220 667 665 0 True 487 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 532 323 0.000955072932748549 0.000949891322492544 0.000778210116731518 0.000717174029144732 0.000839445473920896 0.000878532894286483 41748 41397 667 665 0 False 532 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 573 324 0.000945304413483348 0.000980271690900403 0.000625619897764553 0.000686655985351339 0.0009887771498094 0.000933714233496495 41321 42721 667 665 0 True 576 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 621 323 0.000893899582595976 0.000947344327860163 0.000473029678797589 0.000473029678797589 0.0010114303885191 0.0010876833205462 39074 41286 667 665 0 False 621 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 666 323 0.00097984882587317 0.00100418131618816 0.000534065766384375 0.00064087891966125 0.00105423386919175 0.00100307898692168 42831 43763 667 665 0 False 666 323 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 264 370 0.00100089575262723 0.000897207541628161 0.000854505226215 0.000732433051041428 0.000807162346452702 0.000777870803071122 43751 39101 667 665 0 True 264 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 308 370 0.000962691005149748 0.000931052740571961 0.000869764248111696 0.00080872816052491 0.000740992121397569 0.0007463018085712 42081 40576 667 665 0 True 308 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 353 367 0.000844553690195415 0.000804965033320312 0.000732433051041428 0.000625619897764553 0.0006646773252416 0.00069111153218255 36917 35081 667 665 0 False 353 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 396 369 0.000902409861674793 0.000919786304855754 0.000732433051041428 0.000747692072938125 0.000730577186429743 0.00070507083872336 39446 40085 667 665 0 True 398 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 441 369 0.000947363351970158 0.000963222888991763 0.000656137941557946 0.000625619897764553 0.000903680132801024 0.000946166797621663 41411 41978 667 665 0 True 442 367 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 484 368 0.000889095392793418 0.000950602645317804 0.000549324788281071 0.000595101853971161 0.000865075753583126 0.000939667883973588 38864 41428 667 665 0 True 487 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 529 368 0.00362746070315723 0.000967605555431265 0.000793469138628214 0.000625619897764553 0.0148154204354315 0.000958685849584747 158563 42169 667 665 0 True 532 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 572 367 0.00101402720475423 0.000989564779423955 0.000686655985351339 0.000625619897764553 0.00102943590127976 0.00102626410655893 44325 43126 667 665 0 True 577 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 617 368 0.000997555696859741 0.000997733518965645 0.000518806744487678 0.000625619897764553 0.00110347720477411 0.00105439625929905 43605 43482 667 665 0 True 621 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 660 366 0.000875849555194936 0.000958335412805302 0.000457770656900893 0.000503547722590982 0.000972142744970581 0.00105878783849296 38285 41765 667 665 0 True 666 366 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 265 413 0.000886853437552224 0.00104185848002932 0.000656137941557946 0.000854505226215 0.000814101406632162 0.000875024795786644 38766 45405 667 665 0 True 264 411 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 308 413 0.00090396550408705 0.000970037820575701 0.000747692072938125 0.000854505226215 0.000734793722641186 0.000745261912760139 39514 42275 667 665 0 True 309 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 352 413 0.000977858518669253 0.000905468064760207 0.000854505226215 0.000793469138628214 0.000737699985147018 0.000714581875847877 42744 39461 667 665 0 True 353 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 397 413 0.000928238101137117 0.000982015579117168 0.000747692072938125 0.000793469138628214 0.000760478465091235 0.000822232190656516 40575 42797 667 665 0 True 398 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 440 412 0.00091364251497506 0.00103807240692714 0.000656137941557946 0.000823987182421607 0.000852247762135201 0.000863163875607906 39937 45240 667 665 0 True 443 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 484 411 0.00099355220535761 0.000929538311331086 0.000732433051041428 0.00064087891966125 0.000862051690671053 0.000897273188342691 43430 40510 667 665 0 True 487 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 529 411 0.000997578573954039 0.000939060858830528 0.000762951094834821 0.000686655985351339 0.000899301056023197 0.000881885416852598 43606 40925 667 665 0 True 532 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 573 411 0.000927094246422223 0.000893054334164548 0.00064087891966125 0.000503547722590982 0.000949605791383994 0.000955869638704336 40525 38920 667 665 0 True 577 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 617 411 0.000965893798351454 0.00102983482969268 0.000549324788281071 0.000610360875867857 0.00100844533412923 0.00105347843851177 42221 44881 667 665 0 True 621 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 661 410 0.000908266397815054 0.000956637416383715 0.000518806744487678 0.000503547722590982 0.000941942187369821 0.0010310663145667 39702 41691 667 665 0 True 666 410 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 265 458 0.000952739469130164 0.000942342122185757 0.000778210116731518 0.000778210116731518 0.000834452692829023 0.000825268720300846 41646 41068 667 665 0 True 264 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 308 457 0.000901998073977431 0.000936812160866804 0.000762951094834821 0.000793469138628214 0.000771957396117249 0.000832163957354364 39428 40827 667 665 0 True 309 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 352 457 0.000890124862036823 0.000886813050020336 0.000747692072938125 0.000778210116731518 0.000770159573466885 0.000765042466355053 38909 38648 667 665 0 True 353 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 396 456 0.000878915085830854 0.000915265963030717 0.000671396963454643 0.000747692072938125 0.000784330816349413 0.000803257361179374 38419 39888 667 665 0 True 398 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 441 457 0.000856724304361896 0.000963727698738721 0.000473029678797589 0.000457770656900893 0.000948842743622004 0.00109868916087704 37449 42000 667 665 0 True 443 454 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 485 455 0.000928215224042819 0.000903242312694072 0.000534065766384375 0.000473029678797589 0.000984277687987816 0.00103547292175969 40574 39364 667 665 0 True 487 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 529 455 0.000884702990688222 0.00095466406919106 0.000579842832074464 0.000625619897764553 0.000923440575507547 0.000956846006696294 38672 41605 667 665 0 True 532 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 573 454 0.000879098102585238 0.000984792032725439 0.000518806744487678 0.000442511635004196 0.000942798628289955 0.00108951920954443 38427 42918 667 665 0 True 577 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 618 455 0.00100661502620171 0.000886881887713103 0.000656137941557946 0.000473029678797589 0.000992419677323843 0.000951669857426805 44001 38651 667 665 0 True 621 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 661 454 0.000900716956696749 0.000791266332459668 0.000503547722590982 0.000305180437933928 0.000938845579928791 0.000915433871239331 39372 34484 667 665 0 True 666 453 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 266 501 0.00094951379883416 0.000952805451486349 0.000793469138628214 0.00080872816052491 0.000798118225886097 0.000794326503626046 41505 41524 667 665 0 True 264 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 310 501 0.000921329218659153 0.000902026180121854 0.00080872816052491 0.000823987182421607 0.000809968191745552 0.000760628029480023 40273 39311 667 665 0 True 309 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 354 501 0.000920825922584599 0.000870475570936955 0.000732433051041428 0.000762951094834821 0.000839538563943175 0.000755355724961908 40251 37936 667 665 0 True 353 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 398 501 0.000888157431927204 0.000941791420643621 0.000671396963454643 0.000717174029144732 0.000818199468499843 0.00086567246272194 38823 41044 667 665 0 True 398 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 442 499 0.000826663802454461 0.000908336301958834 0.0004272526131075 0.000503547722590982 0.000939353724454535 0.000994864671827329 36135 39586 667 665 0 True 443 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 486 499 0.000936771257310232 0.000925339212072296 0.000579842832074464 0.000564583810177768 0.000948503471996608 0.000910452460429501 40948 40327 667 665 0 True 487 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 530 499 0.000913253604371996 0.000975866078563311 0.000579842832074464 0.000701915007248035 0.000924517182360272 0.000859256477716027 39920 42529 667 665 0 True 532 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 575 498 0.000970011675325075 0.000877634690984729 0.000610360875867857 0.000488288700694286 0.000968368540949284 0.000945659956232685 42401 38248 667 665 0 True 577 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 619 499 0.000864227991291605 0.000949570079926298 0.000442511635004196 0.000610360875867857 0.000947801614803419 0.000933955653051189 37777 41383 667 665 0 True 622 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 663 499 0.000942261759941727 0.000869098817081615 0.000534065766384375 0.000411993591210803 0.000977375394198303 0.00100411706766442 41188 37876 667 665 0 True 666 497 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 266 545 0.000939104720928618 0.000917399931506496 0.000778210116731518 0.000686655985351339 0.000756234889666648 0.000810236017754899 41050 39981 667 665 0 True 264 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 310 545 0.000916044609876339 0.00101918793321138 0.000793469138628214 0.000900282291905089 0.000745135803984897 0.00078876793005795 40042 44417 667 665 0 True 309 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 354 544 0.000989502959666882 0.000880365252797822 0.000869764248111696 0.000717174029144732 0.000768191717038345 0.000745695932359215 43253 38367 667 665 0 True 354 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 398 544 0.000919887961718386 0.000903609447055496 0.000732433051041428 0.000717174029144732 0.000822843355056441 0.000770251371654935 40210 39380 667 665 0 True 398 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 443 543 0.00096886782061018 0.000970817981093728 0.000549324788281071 0.000534065766384375 0.00102502890897046 0.00108114717105731 42351 42309 667 665 0 True 443 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 487 542 0.00094788952513901 0.000907808546314287 0.000595101853971161 0.000366216525520714 0.000981411876822524 0.00107445379295374 41434 39563 667 665 0 True 488 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 531 541 0.000970354831739543 0.000956362065612647 0.000610360875867857 0.000534065766384375 0.000987682055413731 0.00105048690011362 42416 41679 667 665 0 True 532 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 575 541 0.00085059324309006 0.000941057151920772 0.000549324788281071 0.000686655985351339 0.000858925649622517 0.000878203133569851 37181 41012 667 665 0 True 577 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 619 540 0.000887745644229842 0.000950877996088872 0.000534065766384375 0.000625619897764553 0.000938836527977895 0.000918650878319127 38805 41440 667 665 0 True 622 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 663 539 0.000857616511039514 0.000925178590789172 0.000518806744487678 0.000473029678797589 0.00091398134355893 0.00105815274553801 37488 40320 667 665 0 True 666 540 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 267 586 0.000909272989964162 0.000949661863516654 0.000793469138628214 0.00080872816052491 0.000680675912532804 0.000665551060323607 39746 41387 667 665 0 True 264 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 311 585 0.000872646761993231 0.000930754443903304 0.000762951094834821 0.000839246204318303 0.000721903532705185 0.000718406920205978 38145 40563 667 665 0 True 309 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 355 585 0.000958573128176127 0.000919832196650932 0.00080872816052491 0.000762951094834821 0.000769600040610921 0.000715743956364504 41901 40087 667 665 0 True 354 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 399 584 0.000905795671630882 0.0009579223866487 0.000732433051041428 0.000823987182421607 0.000747197699374386 0.000717092508393595 39594 41747 667 665 0 True 398 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 443 584 0.000945807709557901 0.000936077892143956 0.000473029678797589 0.000503547722590982 0.000999148410603092 0.00105608327510564 41343 40795 667 665 0 True 443 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 487 582 0.000969714273099202 0.00087878198586418 0.000564583810177768 0.000366216525520714 0.00105920106715044 0.00105282125478514 42388 38298 667 665 0 True 488 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 531 581 0.000921283464470557 0.000909024678886504 0.000488288700694286 0.000518806744487678 0.00103244089380391 0.000983198993561569 40271 39616 667 665 0 True 532 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 575 581 0.000904331537595816 0.000933576789306753 0.000579842832074464 0.000610360875867857 0.000877913468206112 0.000960988700308666 39530 40686 667 665 0 True 577 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 619 581 0.0009719104741518 0.00091519712533795 0.000717174029144732 0.000656137941557946 0.000845028045218934 0.000789642211570507 42484 39885 667 665 0 True 622 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 664 580 0.000923296648768772 0.000875294209430649 0.000656137941557946 0.000625619897764553 0.000854822322474776 0.000828027580077608 40359 38146 667 665 0 True 666 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 264 628 0.000932172961356356 0.00102157430656063 0.000793469138628214 0.000900282291905089 0.000716811214397136 0.000755726623734013 40747 44521 667 665 0 False 264 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 309 628 0.000828860003507059 0.000999890433339012 0.000747692072938125 0.000869764248111696 0.000642235125982184 0.000702563611409789 36231 43576 667 665 0 False 309 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 355 626 0.000855786343495682 0.000893031388266959 0.000717174029144732 0.000717174029144732 0.000692663236129697 0.000745049759187269 37408 38919 667 665 0 True 354 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 399 626 0.000911011649130802 0.000932406548529713 0.000701915007248035 0.000823987182421607 0.000710079707614673 0.000669310502951823 39822 40635 667 665 0 True 398 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 443 628 0.000885435057705755 0.000870269057858654 0.000564583810177768 0.000564583810177768 0.000913580842921971 0.000904666780000025 38704 37927 667 665 0 False 443 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 488 627 0.000944137681674155 0.000811389884645236 0.000595101853971161 0.000396734569314107 0.000975270642021086 0.000913791884995924 41270 35361 667 665 0 False 488 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 532 627 0.00102354407598215 0.00094087358474006 0.000564583810177768 0.000518806744487678 0.00106813348484115 0.000965881104772062 44741 41004 667 665 0 False 532 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 577 627 0.000896233046214361 0.000925660454638542 0.000686655985351339 0.00064087891966125 0.000780518855276634 0.000849752152334996 39176 40341 667 665 0 False 577 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 622 627 0.000907625839174713 0.000937867672155899 0.000732433051041428 0.000747692072938125 0.00076226917066032 0.000695815662430022 39674 40873 667 665 0 False 622 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 667 627 0.000959602597419532 0.000889199423369594 0.000762951094834821 0.000686655985351339 0.000772750154556226 0.000746226592375601 41946 38752 667 665 0 False 667 627 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 266 678 0.00110153209044368 0.0741741513316365 0.000946059357595178 0.0711528191042954 0.000767315502646701 0.0209703018366405 48150 3232567 667 665 0 True 265 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 309 671 0.00095800120081868 0.000897161649832983 0.000793469138628214 0.000717174029144732 0.000747426950036405 0.000700628405503334 41876 39099 667 665 0 False 309 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 354 671 0.000969668518910607 0.000883600624357873 0.000823987182421607 0.000717174029144732 0.000700957809155185 0.000661159147226497 42386 38508 667 665 0 False 354 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 399 671 0.000897697180249427 0.000903173475001305 0.000762951094834821 0.000762951094834821 0.00070156725294552 0.000697235436629605 39240 39361 667 665 0 False 399 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 443 671 0.000852126008408019 0.000852417149534399 0.000656137941557946 0.000656137941557946 0.000735643056795846 0.000744312217457043 37248 37149 667 665 0 False 443 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 488 671 0.000940957765566747 0.000835460131216115 0.000656137941557946 0.000595101853971161 0.000892168455627162 0.000781892333898363 41131 36410 667 665 0 False 488 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 533 671 0.000881500197486517 0.000925109753096405 0.000503547722590982 0.000610360875867857 0.000903233532675625 0.000899664195858771 38532 40317 667 665 0 False 533 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 577 671 0.000795322183266344 0.000928413962349224 0.000610360875867857 0.000732433051041428 0.000716145809575398 0.000746175810154147 34765 40461 667 665 0 False 577 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 622 671 0.000997098154973783 0.000946426491956602 0.000823987182421607 0.000762951094834821 0.000758036062446998 0.000781254753854624 43585 41246 667 665 0 False 622 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 663 675 0.00102509971839441 0.0772738667451416 0.000869764248111696 0.0745098039215686 0.000791435400651016 0.023036185622012 44809 3367655 667 665 0 True 667 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F6_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F6_1.csv new file mode 100755 index 0000000..9b9684d --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F6_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 276 262 0.00968838080387593 0.0403408613086849 0.00971999694819562 0.0409704737926299 0.00148465605470365 0.0091468239487149 423497 1758086 667 665 0 True 276 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 321 262 0.00994231655058257 0.00981253775317213 0.00985732814526589 0.0098268101014725 0.00175565926782723 0.00123429653311254 434597 427638 667 665 0 False 321 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 364 262 0.0100137617160749 0.0582165415828424 0.0100404364080262 0.059662775616083 0.00134313933767674 0.00892927507970302 437720 2537122 667 665 0 True 366 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 409 262 0.00982170850944407 0.088081591022647 0.00985732814526589 0.0823987182421607 0.00148538264114526 0.0219988736232028 429325 3838664 667 665 0 True 410 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 453 262 0.00958893407496298 0.0661920996127306 0.00962844281681544 0.0644235904478523 0.00161080303992187 0.0134639662219101 419150 2884703 667 665 0 True 455 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 500 261 0.00961055292907449 0.0537642802359527 0.00965896086060884 0.0588387884336614 0.00172736079706153 0.0187433743831005 420095 2343089 667 665 0 False 500 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 541 260 0.00951780918879082 0.0704722667277028 0.00959792477302205 0.0708323796444648 0.00172060120717056 0.0235119786830459 416041 3071236 667 665 0 True 544 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 585 260 0.00962963242571893 0.0626558155516968 0.00952162966353857 0.0632486457618067 0.00272575663463085 0.0191232175663262 420929 2730589 667 665 0 True 589 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 634 261 0.00938269706986745 0.00937456940589055 0.00932326237888151 0.0093842984664683 0.00189690712812513 0.00180120439428703 410135 408551 667 665 0 False 634 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 674 261 0.0094169440800314 0.0404518735612205 0.00941481651026169 0.0411841000991836 0.00183013813509065 0.00829881777676137 411632 1762924 667 665 0 True 678 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 276 306 0.00961874292883314 0.00940485799070806 0.00958266575112535 0.00946059357595178 0.00143513034754576 0.00141100009958939 420453 409871 667 665 0 False 276 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 321 306 0.00977686940462019 0.00968980014696847 0.00973525597009232 0.00968947890440223 0.00137260162336934 0.00118363181938962 427365 422289 667 665 0 False 321 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 365 306 0.00989484657991444 0.103193896850159 0.00988784618905928 0.103273060196841 0.00129440686762379 0.0242732737664456 432522 4497270 667 665 0 True 366 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 408 306 0.00968554404418299 0.0508876907306031 0.00968947890440223 0.0514229037918669 0.00149836938693675 0.00945846596037917 423373 2217725 667 665 0 True 410 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 453 306 0.00968687091565227 0.0686846206842352 0.00971999694819562 0.0665751125352865 0.00177379505677559 0.0142721642148696 423431 2993329 667 665 0 True 455 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 500 305 0.0096082652196447 0.0386194371256592 0.00958266575112535 0.0406042572671092 0.001696962998503 0.0109913376891395 419995 1683065 667 665 0 False 500 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 544 305 0.00958870530402 0.0364045843608793 0.00965896086060884 0.0399938963912413 0.00166667320056677 0.00931932035598516 419140 1586540 667 665 0 False 544 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 585 304 0.00947036209521698 0.046541026404418 0.0093842984664683 0.0489356832227054 0.00183926916298642 0.0108916813360134 413967 2028294 667 665 0 True 589 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 634 305 0.00922285481200805 0.00919432938032883 0.00923170824750134 0.00924696726939803 0.001859282496456 0.00191517950020678 403148 400696 667 665 0 False 634 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 679 304 0.00907156858741607 0.00927337799752299 0.00917067215991455 0.00917067215991455 0.00185289571751304 0.00192171750303683 396535 404141 667 665 0 False 679 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 276 350 0.00971487247907289 0.0514899287587245 0.00971999694819562 0.0515144579232471 0.00151147919516842 0.0142913654149617 424655 2243971 667 665 0 True 277 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 321 350 0.0100336419110198 0.0610897121494512 0.0100251773861295 0.0653696498054475 0.00146197104666282 0.0174127122375883 438589 2662337 667 665 0 True 321 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 364 351 0.0101487136953382 0.0359617055915137 0.0101472495613031 0.0377355611505302 0.00137215617316194 0.00727155378251772 443619 1567239 667 665 0 True 366 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 408 350 0.00999388152113003 0.032334188641666 0.00996414129854276 0.0333104448004883 0.00167779953336901 0.00513844126923704 436851 1409149 667 665 0 True 411 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 452 350 0.0101260882490776 0.0640614582921024 0.0100862134737163 0.0649118791485466 0.00187454500150764 0.0144110621821086 442630 2791848 667 665 0 True 455 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 500 348 0.0099810932254175 0.0299506605837092 0.00991836423285267 0.0315098802166781 0.00178877977260946 0.00597084869367399 436292 1305273 667 665 0 False 500 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 542 348 0.00993392065697524 0.0264560921644923 0.00994888227664607 0.0269474326695659 0.0016945737496995 0.00329256334225974 434230 1152977 667 665 0 True 545 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 585 348 0.00994430685778649 0.0459478978976395 0.00988784618905928 0.0475623712520027 0.00207396448733984 0.00888195659482508 434684 2002445 667 665 0 True 589 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 629 348 0.00981388454319418 0.0568303569635923 0.0098115510795758 0.0577859159227894 0.00206959277566833 0.0150235695232987 428983 2476711 667 665 0 True 634 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 673 349 0.00966758552515914 0.0610231690464431 0.00973525597009232 0.060364690623331 0.00199355453580863 0.018351250610511 422588 2659437 667 665 0 True 679 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 276 394 0.010423627737516 0.0433931704977711 0.010406652933547 0.0477149614709697 0.00165301028242268 0.0114656160420027 455636 1891108 667 665 0 True 277 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 321 393 0.0105677991857813 0.0327363613887087 0.0105745021744106 0.0328679331654841 0.00151429000682516 0.00575413966274819 461938 1426676 667 665 0 True 321 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 364 394 0.0106326786252102 0.0829782398316689 0.0106507972838941 0.0822613870450904 0.00151955381008006 0.0211525952069548 464774 3616256 667 665 0 True 366 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 408 394 0.0106807662774243 0.0621978842735128 0.0107270923933776 0.0638437476157778 0.00154461338738921 0.0175088066771104 466876 2710632 667 665 0 True 411 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 455 392 0.0107058853269634 0.0419834204416971 0.0108186465247578 0.0440527962157626 0.00174841768143209 0.00923777982552886 467974 1829670 667 665 0 False 455 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 497 392 0.0106066444918992 0.0521474664000353 0.0106660563057908 0.0527046616311894 0.00186002518326824 0.0141542478542939 463636 2272627 667 665 0 True 500 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 542 392 0.0105806103585882 0.040500082892055 0.0105745021744106 0.0415655756466011 0.00174496696272174 0.00610618249084379 462498 1765025 667 665 0 True 545 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 585 392 0.0104547177086668 0.0482656171213109 0.0104219119554437 0.0490424963759823 0.0019610310732808 0.00888916937532966 456995 2103453 667 665 0 True 589 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 629 393 0.0103314101704012 0.0425229014399124 0.0102845807583734 0.0437018387121385 0.00192988790878823 0.00878822985328748 451605 1853181 667 665 0 True 634 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 674 392 0.00998662948223759 0.0851173481885074 0.00996414129854276 0.0813458457312886 0.00181264911306283 0.0183131362258255 436534 3709480 667 665 0 True 679 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 277 438 0.0102993593612898 0.0436144148423244 0.01025406271458 0.0448615243762875 0.00164530918236347 0.00807089295624351 450204 1900750 667 665 0 True 277 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 321 438 0.0106954991261522 0.0488727655715163 0.0105439841306172 0.0491493095292592 0.00179452573085964 0.00765208279926243 467520 2129913 667 665 0 True 322 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 365 438 0.0106426530383241 0.034027343478862 0.0104982070649271 0.0352941176470588 0.00192656741887979 0.00531114748834604 465210 1482938 667 665 0 True 366 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 409 438 0.0107022249918758 0.050941797157118 0.0106507972838941 0.0527199206530861 0.00189415474494613 0.0110552857594891 467814 2220083 667 665 0 True 411 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 454 438 0.0114917363931904 0.0921791776305034 0.0110017547875181 0.0913710231174182 0.00556069973443878 0.0138067865266001 502325 4017240 667 665 0 True 456 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 498 436 0.0111158199796874 0.0568342348202849 0.0108644235904479 0.0579842832074464 0.00293972367766739 0.014546562229343 485893 2476880 667 665 0 True 500 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 542 435 0.0105849341294105 0.0506934995993073 0.0105897611963073 0.050965133134966 0.0017760774213058 0.0106948145195865 462687 2209262 667 665 0 True 545 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 586 435 0.0103754485769246 0.0319693029782054 0.0104219119554437 0.0329900053406577 0.00198180208318993 0.00516086938476227 453530 1393247 667 665 0 True 590 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 630 436 0.0102147369894819 0.0385098475187741 0.0102235446707866 0.0392156862745098 0.00198827923652608 0.00672635970434754 446505 1678289 667 665 0 True 634 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 674 436 0.0101455109021365 0.0682819890192407 0.0100404364080262 0.0681620508125429 0.00194840984711021 0.0102575307145865 443479 2975782 667 665 0 True 679 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 278 481 0.0100655783346596 0.0502232693200155 0.0100862134737163 0.0516060120546273 0.00151581852986777 0.0136232838350054 439985 2188769 667 665 0 True 277 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 324 481 0.0103146641373751 0.0553810022882796 0.0103150988021668 0.0562142366674296 0.00159723852757811 0.00816550595317156 450873 2413547 667 665 0 True 322 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 367 482 0.01041779407847 0.0684437346513457 0.0104371709773404 0.066498817425803 0.00165513052366451 0.0173897093547447 455381 2982831 667 665 0 True 366 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 412 482 0.0103302663156863 0.0872744231831582 0.0103456168459602 0.0824597543297475 0.00176961635656046 0.0222571286554554 451555 3803487 667 665 0 True 411 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 456 481 0.0118764833650925 0.0965601001817889 0.010955977721828 0.0908979934386206 0.007001481797841 0.0331646991658299 519143 4208164 667 665 0 True 456 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 499 480 0.010538745276023 0.040641062486842 0.0104371709773404 0.0421759365224689 0.00185736756940071 0.00592940582844806 460668 1771169 667 665 0 True 500 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 545 479 0.0111739049221098 0.0391082765278956 0.0104676890211337 0.0421454184786755 0.00505215878193867 0.00952318042589852 488432 1704369 667 665 0 False 545 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 588 480 0.0101858432193837 0.100107214706485 0.0102082856488899 0.0949416342412451 0.00189947730434686 0.0204687019943392 445242 4362750 667 665 0 True 590 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 631 480 0.0101473639467746 0.0653891079266029 0.0101625085831998 0.0658426794842451 0.00188992077285035 0.0212126672871614 443560 2849708 667 665 0 True 634 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 675 480 0.0100657384743197 0.07238935057947 0.010101472495613 0.0711070420386053 0.00197921437536775 0.0132747245527306 439992 3154784 667 665 0 True 679 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 279 526 0.00987366239059459 0.0488395399118074 0.00996414129854276 0.051468680857557 0.00154815013712566 0.0104757079132114 431596 2128465 667 665 0 True 277 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 324 525 0.0102449805081437 0.105307168126313 0.01025406271458 0.0986800946059358 0.00150347274911288 0.0318845184877922 447827 4589368 667 665 0 True 322 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 367 525 0.0100462929441665 0.0580003912275539 0.0101472495613031 0.0589761196307317 0.00159661676239877 0.0149711989352083 439142 2527702 667 665 0 True 366 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 412 524 0.0102337707319378 0.0570990763702573 0.0102693217364767 0.0576943617914092 0.00177920753667583 0.00747568604223697 447337 2488422 667 665 0 True 411 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 456 524 0.0102886528811584 0.0543195021199141 0.01025406271458 0.0556191348134585 0.0020122404100608 0.00830569190139277 449736 2367286 667 665 0 True 456 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 500 522 0.0103199945003465 0.060348054847579 0.0103150988021668 0.0612954909590295 0.0018312760565957 0.0124710678032568 451106 2630015 667 665 0 True 501 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 545 522 0.0102080797550412 0.0745573707672707 0.0101777676050965 0.0707255664911879 0.00197811374347925 0.0208429770527497 446214 3249268 667 665 0 True 545 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 589 521 0.0100727617422692 0.0551061333810608 0.0100404364080262 0.0557106889448386 0.00183996234950878 0.0132640075176175 440299 2401568 667 665 0 True 590 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 632 521 0.00994103543330189 0.0484747230860397 0.00988784618905928 0.0471351186388952 0.00201786733433303 0.00925759499426727 434541 2112566 667 665 0 True 635 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 677 521 0.00982159412397258 0.0609648405747718 0.00975051499198901 0.0621957732509346 0.00186963457882633 0.0152113047803179 429320 2656895 667 665 0 True 679 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 280 566 0.00958875105820859 0.0424830214699027 0.00964370183871214 0.0437170977340352 0.00143709650747113 0.00986305153204773 419142 1851443 667 665 0 True 277 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 324 566 0.00999141079494585 0.053932313043997 0.00990310521095598 0.0536659800106813 0.00180329320470827 0.0124128565464445 436743 2350412 667 665 0 True 322 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 368 566 0.00997880551598771 0.0435429613172322 0.0100251773861295 0.04443427176318 0.00143831527502369 0.00873693947663619 436192 1897636 667 665 0 True 367 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 412 565 0.0101783624095483 0.0498251121050509 0.0102235446707866 0.0493476768139162 0.00174784460831675 0.00841848349784913 444915 2171417 667 665 0 True 411 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 456 564 0.0103277498353135 0.0855357666310432 0.010452429999237 0.0816052491035325 0.00207700243270822 0.0225839637463716 451445 3727715 667 665 0 True 456 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 501 563 0.0100324751792106 0.0610300528157198 0.00996414129854276 0.0608987563897154 0.00200801365241194 0.0128304942638989 438538 2659737 667 665 0 True 501 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 545 562 0.00997052400785188 0.0547806458237606 0.00996414129854276 0.0551461051346609 0.0019095333071646 0.0107608180617177 435830 2387383 667 665 0 True 545 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 590 566 0.00975765264540996 0.033906074410104 0.00978103303578241 0.0379797055008774 0.00183286655867745 0.0109698203447631 426525 1477653 667 665 0 False 590 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 633 563 0.0096854296587115 0.0468717915181637 0.00973525597009232 0.046646829938201 0.00165711173636449 0.00835146696794153 423368 2042709 667 665 0 True 635 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 677 562 0.00983639560398331 0.0515658567338465 0.00985732814526589 0.050919356069276 0.00163084270786558 0.00726321470797649 429967 2247280 667 665 0 True 679 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 277 610 0.00926407933593286 0.00929253782200982 0.00923170824750134 0.00927748531319142 0.00137694882796742 0.00134739515453253 404950 404976 667 665 0 False 277 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 322 610 0.00943142528072196 0.00958819571244431 0.00941481651026169 0.00961318379491875 0.00149003391489776 0.00143037507110476 412265 417861 667 665 0 False 322 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 368 608 0.00983008152595709 0.0707574612888366 0.00985732814526589 0.0681467917906462 0.00136524192051741 0.0140294154327324 429691 3083665 667 665 0 True 367 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 412 608 0.0100070358503513 0.0757757749833499 0.00997940032043946 0.0723735408560311 0.00173230361545357 0.0199709331596517 437426 3302367 667 665 0 True 411 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 456 610 0.00975904814816213 0.00983582783922498 0.00975051499198901 0.00987258716716258 0.00192807132209826 0.00192610254011998 426586 428653 667 665 0 False 456 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 501 609 0.00979720714145102 0.00964500975487471 0.00962844281681544 0.00968947890440223 0.0023467798626706 0.00217824924994781 428254 420337 667 665 0 False 501 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 545 609 0.00950460910538093 0.00950561342702143 0.00953688868543526 0.00956740672922866 0.00193383788332458 0.00197902379877067 415464 414262 667 665 0 False 545 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 590 609 0.00961917759362479 0.0094511628120427 0.00953688868543526 0.009399557488365 0.00180091440316858 0.00170595745595736 420472 411889 667 665 0 False 590 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 635 609 0.00970142074762573 0.00961297728184044 0.00961318379491875 0.00964370183871214 0.00169734287964792 0.00160346558273412 424067 418941 667 665 0 False 635 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 679 609 0.00965319583284576 0.00961361976697294 0.00953688868543526 0.00956740672922866 0.00188553404043803 0.0016771581435531 421959 418969 667 665 0 False 679 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 279 659 0.00916120104287522 0.0391471468784114 0.00918593118181125 0.0392767223620966 0.00133493017115642 0.00827606474890694 400453 1706063 667 665 0 True 278 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 322 653 0.00920359229860922 0.0095320012092488 0.00926222629129473 0.00952162966353857 0.00132667548290869 0.00133956964817222 402306 415412 667 665 0 False 322 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 367 653 0.00922745310796193 0.00941153524690646 0.00924696726939803 0.00933852140077821 0.00131332702797522 0.00131823764588083 403349 410162 667 665 0 False 367 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 412 653 0.00952734893711304 0.00942911180445965 0.00955214770733196 0.00946059357595178 0.00143561842744419 0.00139166528490756 416458 410928 667 665 0 False 412 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 456 653 0.00933136087026297 0.00946300289519863 0.00935378042267491 0.0093842984664683 0.00163293994207316 0.00173378701720811 407891 412405 667 665 0 False 456 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 501 653 0.00966506904478637 0.00929935275359376 0.00970473792629892 0.00921644922560464 0.0019256739379141 0.00169962596367186 422478 405273 667 665 0 False 501 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 546 653 0.00931923601028508 0.00925988580974065 0.0093690394445716 0.00923170824750134 0.00167290083017861 0.00173000123004029 407361 403553 667 665 0 False 546 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 590 653 0.0093309948367542 0.00926741206414985 0.009399557488365 0.00924696726939803 0.00152109646256961 0.00126384678400339 407875 403881 667 665 0 False 590 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 635 652 0.00928675053638207 0.00939053975061251 0.00929274433508812 0.00943007553215839 0.00143079369950672 0.00133819462117748 405941 409247 667 665 0 False 635 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 675 658 0.00948445438530449 0.0397277928169015 0.00947585259784848 0.0402990768291753 0.00150465889591293 0.00890568351824794 414583 1731368 667 665 0 True 680 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F6_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F6_2.csv new file mode 100755 index 0000000..6f1b687 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F6_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 276 262 0.00795491473764148 0.747729176454526 0.00781261921110857 0.774334325169757 0.00199667863689594 0.207283181122449 347724 32586617 667 665 15 True 276 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 321 262 0.00664373695505189 0.00647895775143971 0.00656137941557946 0.00648508430609598 0.00143542843776335 0.00126699064858879 290410 282358 667 665 0 False 321 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 364 262 0.00626402294389541 0.00626276150435599 0.00628671702143893 0.00630197604333562 0.00125584838602904 0.00128065910651432 273812 272936 667 665 0 True 366 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 409 262 0.00625009079346799 0.00644538790326698 0.00625619897764553 0.00650034332799268 0.00139133801322769 0.00136563645803066 273203 280895 667 665 0 True 410 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 453 262 0.0063370466288943 0.0062529177142903 0.00636301213092241 0.00627145799954223 0.00151531334729963 0.00161578129610562 277004 272507 667 665 0 True 455 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 500 261 0.00640412226937573 0.00642244200567796 0.0064087891966125 0.00642404821850919 0.00158152892056971 0.00158136107752648 279936 279895 667 665 0 False 500 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 541 260 0.006690360473231 0.00665692613314013 0.00672922865644312 0.00657663843747616 0.00149084376718263 0.00141485072776679 292448 290114 667 665 0 True 544 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 585 260 0.00706096940085691 0.00701990728710079 0.00691233691920348 0.00711070420386053 0.00248992597236344 0.00188189063490906 308648 305933 667 665 0 True 589 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 634 261 0.0090571102638198 0.0076466744797448 0.00785839627679866 0.0076752880140383 0.00709070423970636 0.00182768737252507 395903 333248 667 665 0 False 634 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 674 261 0.00894489811628862 0.762919200037172 0.00871290150301366 0.771252002746624 0.00226146910397539 0.183586421142373 390998 33248610 667 665 15 True 678 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 276 306 0.00649503584211556 0.00601549651193674 0.00648508430609598 0.00601205462729839 0.00138483855652806 0.00136944040574919 283910 262160 667 665 0 False 276 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 321 306 0.00605460602269248 0.00597098147061405 0.00607309071488518 0.00590524147402152 0.00126446583668905 0.00118005183342228 264658 260220 667 665 0 False 321 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 365 306 0.00628186707744777 0.00615145095515167 0.00630197604333562 0.00621042191195544 0.00133992532708783 0.00131114007920568 274592 268085 667 665 0 True 366 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 408 306 0.00641171746468263 0.00615787580647659 0.00643930724040589 0.00607309071488518 0.00149692585513136 0.00153754869383445 280268 268365 667 665 0 True 410 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 453 306 0.00638362439288481 0.00641243759432915 0.00634775310902571 0.00642404821850919 0.00170674594866235 0.00171666247401892 279040 279459 667 665 0 True 455 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 500 305 0.00644230413975891 0.00653742389849653 0.00648508430609598 0.00659189745937285 0.00163955923886967 0.00162572956299295 281605 284906 667 665 0 False 500 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 544 305 0.00668841592021568 0.00674324859987001 0.00671396963454643 0.0068055237659266 0.0015103854205047 0.00148531134578455 292363 293876 667 665 0 False 544 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 585 304 0.00696872895664779 0.00697770978143459 0.00697337300679027 0.00697337300679027 0.00180487420308107 0.00198176718203089 304616 304094 667 665 0 True 589 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 634 305 0.0073371874374097 0.00728539132220572 0.00737010757610437 0.00735484855420768 0.00193220141830994 0.00194773603920371 320722 317503 667 665 0 False 634 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 679 304 0.00734283807970128 0.00707640008696495 0.00730907148851759 0.00711070420386053 0.00189743752235435 0.00190004878534154 320969 308395 667 665 0 False 679 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 276 350 0.00616796202493855 0.00612884924602649 0.00616464484626535 0.00613412680247196 0.00157507389046192 0.00139293010552184 269613 267100 667 665 0 True 277 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 321 350 0.00647195285396899 0.00640325923529354 0.00633249408712902 0.00630197604333562 0.00163752346757644 0.00142999046480711 282901 279059 667 665 0 True 321 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 364 351 0.00671346633847187 0.00649497398795685 0.00660715648126955 0.00645456626230259 0.00150644994715009 0.00135500166899746 293458 283056 667 665 0 True 366 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 408 350 0.00707869914893778 0.00653625365771949 0.00709544518196384 0.00653086137178607 0.00159085320361804 0.00136873376593481 309423 284855 667 665 0 True 411 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 452 350 0.00711301479038462 0.00734842370288275 0.00692759594110018 0.00689707789730678 0.00187752010262629 0.0031604125171958 310923 320250 667 665 0 True 455 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 500 348 0.0070327848206819 0.00708881381756061 0.00700389105058366 0.00700389105058366 0.0017403454022019 0.00187614808674568 307416 308936 667 665 0 False 500 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 542 348 0.00714273213587759 0.00706384868098376 0.00720225833524071 0.00700389105058366 0.00155416896484318 0.00162489508202715 312222 307848 667 665 0 True 545 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 585 348 0.00734890050969022 0.00749585109489219 0.0072632944228275 0.00737010757610437 0.00201994999415931 0.00215380135277961 321234 326675 667 665 0 True 589 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 629 348 0.00719848361468156 0.00751716783375238 0.00717174029144732 0.00750743877317464 0.00199434412823747 0.0022671623663321 314659 327604 667 665 0 True 634 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 673 349 0.00680607281618975 0.0064077336853234 0.00686655985351339 0.00634775310902571 0.00190188207496002 0.00198590764936973 297506 279254 667 665 0 True 679 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 276 394 0.00683945049677038 0.0071636403895984 0.0068207827878233 0.00709544518196384 0.00157110663678583 0.00143535044595951 298965 312197 667 665 0 True 277 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 321 393 0.00728569109814514 0.0760482575172195 0.00732433051041428 0.0775463492790112 0.00137038796854597 0.0219464767430748 318471 3314242 667 665 0 True 321 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 364 394 0.00736958140293552 0.00814622961615529 0.00743114366369116 0.00813305867093919 0.00141588819357003 0.00141882520157074 322138 355019 667 665 0 True 366 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 408 394 0.00785503334393687 0.00833252735868052 0.00782787823300526 0.00831616693369955 0.00152276945630119 0.00155462092514401 343358 363138 667 665 0 True 411 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 455 392 0.00802379766857244 0.00843764251553581 0.00804150453955901 0.00843823910887312 0.00172302909322292 0.00167178286224508 350735 367719 667 665 0 False 455 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 497 392 0.00771742762173502 0.00813337991350544 0.00779736018921187 0.0081025406271458 0.00184352619669833 0.00167658866617713 337343 354459 667 665 0 True 500 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 542 392 0.00790504267207207 0.00804024251519162 0.00794995040817884 0.00813305867093919 0.00163565623181455 0.0017273537970268 345544 350400 667 665 0 True 545 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 585 392 0.00760192117262495 0.00816986389067198 0.00770580605783169 0.0081025406271458 0.00198951492315405 0.00195972948777189 332294 356049 667 665 0 True 589 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 629 393 0.00702102599421278 0.00728068741319997 0.00711070420386053 0.00735484855420768 0.00200838455744061 0.00192614100931057 306902 317298 667 665 0 True 634 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 674 392 0.00663033097779332 0.00696440116083296 0.00657663843747616 0.00688181887541009 0.00180453292639014 0.00223495726087247 289824 303514 667 665 0 True 679 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 277 438 0.00689154164048669 0.00691336948459498 0.00688181887541009 0.00695811398489357 0.00159368392345529 0.0016262962033999 301242 301290 667 665 0 True 277 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 321 438 0.00722328238490048 0.00704248605032839 0.0072480354009308 0.00704966811627375 0.00173412198228732 0.00137364384023254 315743 306917 667 665 0 True 322 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 365 438 0.0072643696462595 0.0072467733765634 0.00730907148851759 0.0072480354009308 0.00139373597023714 0.00133848759296751 317539 315820 667 665 0 True 366 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 409 438 0.00771701583403766 0.00744241009940737 0.0076600289921416 0.00747692072938125 0.00165146176500144 0.00159450742751427 337325 324346 667 665 0 True 411 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 454 438 0.00780941641790686 0.00762060794008367 0.007690547035935 0.0076600289921416 0.0027329299299257 0.00173162314432422 341364 332112 667 665 0 True 456 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 498 436 0.00799870149612765 0.00792874839880658 0.00791943236438544 0.00785839627679866 0.00227326856024784 0.00197921723214528 349638 345541 667 665 0 True 500 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 542 435 0.0075916264801909 0.00731315585828843 0.007690547035935 0.00730907148851759 0.00182561757513206 0.00170670286817288 331844 318713 667 665 0 True 545 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 586 435 0.00686070331737313 0.00690646276942069 0.00689707789730678 0.00691233691920348 0.00192579988794691 0.00198178292080111 299894 300989 667 665 0 True 590 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 630 436 0.0065805275435068 0.00646613099468745 0.00663767452506294 0.00653086137178607 0.00190024538615511 0.00176003717146881 287647 281799 667 665 0 True 634 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 674 436 0.00640883495080109 0.00648469422583697 0.00642404821850919 0.00656137941557946 0.00179178123304039 0.00184350969525225 280142 282608 667 665 0 True 679 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 278 481 0.00685729463032274 0.00698335447224149 0.00688181887541009 0.00697337300679027 0.00152555316945543 0.00165997329004887 299745 304340 667 665 0 True 277 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 324 481 0.00679346753723161 0.00667737092789194 0.0068055237659266 0.00672922865644312 0.00143756314226111 0.00149682078194435 296955 291005 667 665 0 True 322 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 367 482 0.00700702521250247 0.00707580349362764 0.00698863202868696 0.00703440909437705 0.00158546145223257 0.00159714156825202 306290 308369 667 665 0 True 366 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 412 482 0.00709537655068094 0.00723706726188325 0.00706492713817044 0.0072480354009308 0.00172943539938263 0.00179325727901224 310152 315397 667 665 0 True 411 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 456 481 0.00809618079493099 0.00742816069700459 0.007690547035935 0.00749217975127794 0.0034800016546738 0.00186101946513517 353899 323725 667 665 0 True 456 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 499 480 0.00705483833958507 0.00707029647820627 0.00701915007248035 0.00704966811627375 0.00184846312483598 0.0018017777467063 308380 308129 667 665 0 True 500 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 545 479 0.00708402951190919 0.0067079578093781 0.00665293354695964 0.00659189745937285 0.00353500477628506 0.00180089851054468 309656 292338 667 665 0 False 545 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 588 480 0.00630478992593426 0.00663099726886454 0.00628671702143893 0.00671396963454643 0.00186271084682707 0.00180877833751603 275594 288984 667 665 0 True 590 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 631 480 0.00625748009492621 0.00648409763249965 0.00627145799954223 0.00654612039368277 0.00177144615342052 0.00182692012074365 273526 282582 667 665 0 True 634 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 675 480 0.00623979610103394 0.0064664522372537 0.00628671702143893 0.00648508430609598 0.00185539929922841 0.00172289557491604 272753 281813 667 665 0 True 679 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 279 526 0.00666938217775983 0.0066699364570731 0.00657663843747616 0.00662241550316625 0.00156927831905365 0.00151183846752203 291531 290681 667 665 0 True 277 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 324 525 0.00673190527647598 0.00668365810383133 0.00669871061264973 0.00668345159075303 0.00145907706214038 0.00156885123320908 294264 291279 667 665 0 True 322 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 367 525 0.00653882260060174 0.00667358485478976 0.00648508430609598 0.00663767452506294 0.0014299265037507 0.0016454430557045 285824 290840 667 665 0 True 366 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 412 524 0.00669978583608173 0.00672915981875036 0.00668345159075303 0.00668345159075303 0.00166223811250972 0.00170368166575524 292860 293262 667 665 0 True 411 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 456 524 0.00659953840886835 0.00639412676805312 0.00668345159075303 0.00642404821850919 0.00189170363024487 0.00192299356949799 288478 278661 667 665 0 True 456 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 500 522 0.00627264760844572 0.00662939105603331 0.00624093995574884 0.00663767452506294 0.00178743976975263 0.00175327223796876 274189 288914 667 665 0 True 501 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 545 522 0.00640700478325726 0.00658189304802404 0.00653086137178607 0.00660715648126955 0.00170241370104017 0.00168432805922328 280062 286844 667 665 0 True 545 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 589 521 0.00650125841176459 0.00650364753724549 0.00651560234988937 0.00653086137178607 0.00176078644036401 0.00173744327766367 284182 283434 667 665 0 True 590 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 632 521 0.00627562163070445 0.00635539409292285 0.00630197604333562 0.00630197604333562 0.00187165466412337 0.0019157753701402 274319 276973 667 665 0 True 635 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 677 521 0.00635084151675593 0.00636530672068131 0.0064087891966125 0.0063935301747158 0.00181326886670414 0.00184585915013466 277607 277405 667 665 0 True 679 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 280 566 0.00672325773483137 0.00684664281440612 0.00666819256885634 0.00679026474402991 0.00131573412964074 0.00137444618099524 293886 298382 667 665 0 True 277 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 324 566 0.00654095017037144 0.00668533315435533 0.00660715648126955 0.00671396963454643 0.00145400634338776 0.00142398962604497 285917 291352 667 665 0 True 322 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 368 566 0.00671483896412975 0.00673246402800317 0.00663767452506294 0.00672922865644312 0.00135852182710146 0.00127017699836439 293518 293406 667 665 0 True 367 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 412 565 0.0063630807622053 0.00644307036761049 0.00633249408712902 0.0063935301747158 0.0016140443575713 0.0015298352741504 278142 280794 667 665 0 True 411 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 456 564 0.00644937316189696 0.00636055691988038 0.00646982528419928 0.0063782711528191 0.00199660584831143 0.00182974839050038 281914 277198 667 665 0 True 456 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 501 563 0.00618903182878691 0.00622021981022595 0.00613412680247196 0.00617990386816205 0.00196725751059843 0.00208591055690194 270534 271082 667 665 0 True 501 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 545 562 0.00635514241048393 0.00654423883008047 0.00633249408712902 0.00663767452506294 0.00189719933411129 0.00174524971391535 277795 285203 667 665 0 True 545 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 590 566 0.00647730609403469 0.00641858709488301 0.00642404821850919 0.0063782711528191 0.00172993164074445 0.00144914033633784 283135 279727 667 665 0 False 590 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 633 563 0.00625798339100077 0.00622187191485236 0.00622568093385214 0.00619516289005875 0.00171151232288382 0.00162699711529784 273548 271154 667 665 0 True 635 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 677 562 0.00628843280351127 0.00631753336190098 0.00619516289005875 0.00633249408712902 0.00157425776158713 0.00164590333778888 274879 275323 667 665 0 True 679 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 277 610 0.00680888669878839 0.00669490159364995 0.0068207827878233 0.00674448767833982 0.00142971167732498 0.00154247601435011 297629 291769 667 665 0 False 277 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 322 610 0.00657377880068892 0.00667018886194658 0.00654612039368277 0.00671396963454643 0.0014546954761281 0.00152828138681073 287352 290692 667 665 0 False 322 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 368 608 0.00642436849782936 0.0064355211673037 0.00636301213092241 0.0063935301747158 0.00135772732323762 0.00135502239249072 280821 280465 667 665 0 True 367 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 412 608 0.00651619715434112 0.00638561384004759 0.00633249408712902 0.0063782711528191 0.00208639082838987 0.0014451347906687 284835 278290 667 665 0 True 411 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 456 610 0.00627276199391721 0.00620080758086565 0.00630197604333562 0.00617990386816205 0.00192912292467541 0.00193872021227962 274194 270236 667 665 0 False 456 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 501 609 0.00652431852281687 0.00644442417556824 0.00648508430609598 0.00643930724040589 0.00200035256966803 0.00197125255276256 285190 280853 667 665 0 False 501 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 545 609 0.00658521734783787 0.00634006623333339 0.00656137941557946 0.00643930724040589 0.00190686386369262 0.0019838772522685 287852 276305 667 665 0 False 545 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 590 609 0.00648101218331095 0.0064179675556481 0.00642404821850919 0.0064087891966125 0.00166244231204095 0.00159400811183798 283297 279700 667 665 0 False 590 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 635 609 0.00639311838701844 0.00624731891527858 0.00643930724040589 0.00625619897764553 0.0015281335358176 0.00151053663750852 279455 272263 667 665 0 False 635 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 679 609 0.00651265120472494 0.00646250554286839 0.00648508430609598 0.00643930724040589 0.00161539024131185 0.00163052425251549 284680 281641 667 665 0 False 679 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 279 659 0.00846630930357664 0.754649934518145 0.00827038986800946 0.763805600061036 0.00182669352836012 0.193289660003754 370078 32888229 667 665 16 True 278 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 322 653 0.00691512792470782 0.00686697287966999 0.00674448767833982 0.00686655985351339 0.00167107044325917 0.00137093009849958 302273 299268 667 665 0 False 322 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 367 653 0.00627797797141713 0.00605342608065139 0.00630197604333562 0.00608834973678187 0.00130199964031346 0.00127669243457378 274422 263813 667 665 0 False 367 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 412 653 0.0060565734528021 0.00619598894237195 0.00599679560540169 0.00617990386816205 0.00141423614056912 0.0014526179635393 264744 270026 667 665 0 False 412 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 456 653 0.0061510787293467 0.00609814763505238 0.00604257267109178 0.00605783169298848 0.0016314714659218 0.00162409169811918 268875 265762 667 665 0 False 456 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 501 653 0.00642205791130528 0.0062078060796303 0.00642404821850919 0.00614938582436866 0.00178083724077881 0.0016304255227174 280720 270541 667 665 0 False 501 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 546 653 0.00639613816346576 0.00625337663224208 0.00646982528419928 0.00621042191195544 0.00163345830699379 0.00160520576853197 279587 272527 667 665 0 False 546 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 590 653 0.00627097758056197 0.00617717330634896 0.00634775310902571 0.00622568093385214 0.00141166176781955 0.00125371406571204 274116 269206 667 665 0 False 590 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 635 652 0.00715956967728084 0.00683425202970805 0.00691233691920348 0.00672922865644312 0.00202446748428674 0.00126579557247578 312958 297842 667 665 0 False 635 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 675 658 0.00846081880094514 0.764422064545663 0.00805676356145571 0.779644464789807 0.00242226051085901 0.206503788646715 369838 33314106 667 665 17 True 680 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F6_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F6_3.csv new file mode 100755 index 0000000..f81e307 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F6_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 276 262 0.00098778717759454 0.0784082430842499 0.000823987182421607 0.0782940413519493 0.000786939463929834 0.0257022660205059 43178 3417092 667 665 0 True 276 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 321 262 0.000982822848131896 0.00086756144194315 0.000869764248111696 0.000778210116731518 0.000692894511074394 0.00064350960560989 42961 37809 667 665 0 False 321 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 364 262 0.000956742960632295 0.000935183002137984 0.000854505226215 0.000839246204318303 0.000669044829313607 0.000642206260465863 41821 40756 667 665 0 True 366 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 409 262 0.000915015140632934 0.000879998118436398 0.000778210116731518 0.000717174029144732 0.000706045153626578 0.000728511923522805 39997 38351 667 665 0 True 410 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 453 262 0.00092158086669643 0.000934884705469327 0.000686655985351339 0.000717174029144732 0.00085416598721133 0.00085572915966772 40284 40743 667 665 0 True 455 262 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 500 261 0.000877794108210257 0.000904802633730125 0.000671396963454643 0.000747692072938125 0.000830736727540742 0.000778703890909003 38370 39432 667 665 0 False 500 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 541 260 0.000952968240073143 0.000952851343281527 0.00080872816052491 0.000793469138628214 0.000756543137013141 0.000772826484514231 41656 41526 667 665 0 True 544 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 585 260 0.00103450220415084 0.000993970391761046 0.000762951094834821 0.000671396963454643 0.00091328480941041 0.00100804724911228 45220 43318 667 665 0 True 589 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 634 261 0.0011197880116934 0.000914141614048855 0.000793469138628214 0.000549324788281071 0.00108155609133703 0.000917837499446477 48948 39839 667 665 0 False 634 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 674 261 0.00109716256543278 0.0797009461167223 0.000762951094834821 0.0774395361257343 0.00101707700832752 0.0232301156386841 47959 3473429 667 665 0 True 678 261 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 276 306 0.000883055839898773 0.000840347607402576 0.000717174029144732 0.000671396963454643 0.000733007829729932 0.000701511476269564 38600 36623 667 665 0 False 276 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 321 306 0.000843135310348945 0.000849273561564704 0.000732433051041428 0.000717174029144732 0.00064225460928113 0.000623287613171529 36855 37012 667 665 0 False 321 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 365 306 0.0009610438543603 0.000951726994299665 0.000854505226215 0.000839246204318303 0.000711757693219639 0.000719428522290998 42009 41477 667 665 0 True 366 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 408 306 0.000942307514130323 0.000848309833865965 0.000778210116731518 0.000671396963454643 0.00075997531306244 0.000744140928165405 41190 36970 667 665 0 True 410 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 453 306 0.00091059986143344 0.000932383602632124 0.00064087891966125 0.000625619897764553 0.000909873902508257 0.000941243606632973 39804 40634 667 665 0 True 455 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 500 305 0.000883536258879029 0.000920107547422 0.000656137941557946 0.000686655985351339 0.000837624453635324 0.000829230095171379 38621 40099 667 665 0 False 500 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 544 305 0.00102425326590539 0.00096143310897982 0.000823987182421607 0.000854505226215 0.000831549512103422 0.000754430737413695 44772 41900 667 665 0 False 544 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 585 304 0.00102141650621245 0.000989863076092612 0.000762951094834821 0.000564583810177768 0.000977327139088057 0.00112644880533551 44648 43139 667 665 0 True 589 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 634 305 0.000925904637518732 0.000986329407863903 0.000473029678797589 0.000579842832074464 0.0010128487775224 0.00103376754370654 40473 42985 667 665 0 False 634 305 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 679 304 0.000943611508505303 0.000937156349330639 0.000503547722590982 0.000579842832074464 0.00101166462975289 0.000947817825060735 41247 40842 667 665 0 False 679 304 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 276 350 0.000888363325775885 0.000804024251519162 0.000671396963454643 0.000625619897764553 0.000753891982087271 0.000719729847717688 38832 35040 667 665 0 True 277 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 321 350 0.000934140391465975 0.00090842808554919 0.000778210116731518 0.000747692072938125 0.000724774471628299 0.000689214146499501 40833 39590 667 665 0 True 321 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 364 351 0.000950863547397736 0.000957394631004153 0.000869764248111696 0.00080872816052491 0.000721650995240673 0.00070393906681751 41564 41724 667 665 0 True 366 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 408 350 0.000918012039985958 0.000897643513682352 0.000732433051041428 0.000701915007248035 0.000777416530211409 0.000753267302567757 40128 39120 667 665 0 True 411 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 452 350 0.000946928687178498 0.000991193938152775 0.000656137941557946 0.000671396963454643 0.000915341085891579 0.000944384827517021 41392 43197 667 665 0 True 455 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 500 348 0.00100062122749566 0.00104302872080636 0.000732433051041428 0.000823987182421607 0.000929250139245384 0.000909191628323056 43739 45456 667 665 0 False 500 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 542 348 0.000973877904261419 0.000958794330757083 0.000762951094834821 0.000717174029144732 0.000861459978311973 0.000925385681085005 42570 41785 667 665 0 True 545 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 585 348 0.000995977177353186 0.000997045142037974 0.000717174029144732 0.000518806744487678 0.00103059167417157 0.00108569150975238 43536 43452 667 665 0 True 589 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 629 348 0.000923731313560432 0.00101338262112135 0.000579842832074464 0.000625619897764553 0.00100376858604704 0.00109233198336497 40378 44164 667 665 0 True 634 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 673 349 0.000981290082813938 0.000931396929035796 0.00064087891966125 0.000579842832074464 0.000985154459555492 0.00097024585527557 42894 40591 667 665 0 True 679 348 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 276 394 0.000917691760665787 0.000860769456256801 0.000717174029144732 0.000686655985351339 0.000761141831318437 0.000724119351238599 40114 37513 667 665 0 True 277 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 321 393 0.000889873213999546 0.00737717491256179 0.000732433051041428 0.00733958953231098 0.000688737091959487 0.00254993626142846 38898 321503 667 665 0 True 321 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 364 394 0.00095962547451383 0.00100349293926049 0.000854505226215 0.000915541313801785 0.00068336365088878 0.00073367297632876 41947 43733 667 665 0 True 366 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 408 394 0.00100229125537941 0.000957578198184865 0.000793469138628214 0.000701915007248035 0.00083135285827487 0.000807572256731703 43812 41732 667 665 0 True 411 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 455 392 0.000993186171848843 0.00100358472285084 0.000732433051041428 0.000747692072938125 0.000916461231674862 0.000898427363328661 43414 43737 667 665 0 False 455 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 497 392 0.00108480893451192 0.00105273483548652 0.00080872816052491 0.000793469138628214 0.000993171764349604 0.000950623085822925 47419 45879 667 665 0 True 500 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 542 392 0.00101274608747354 0.00113006251036151 0.000762951094834821 0.000976577401388571 0.000928584720953466 0.000890057979016876 44269 49249 667 665 0 True 545 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 585 392 0.000943817402353984 0.00105597020704657 0.000610360875867857 0.000686655985351339 0.000993986405488623 0.00111685381750425 41256 46020 667 665 0 True 589 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 629 393 0.000970881004908395 0.00101771939576568 0.000595101853971161 0.000686655985351339 0.000999725633222435 0.00101783262563222 42439 44353 667 665 0 True 634 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 674 392 0.000912132626751399 0.00100844925313972 0.000518806744487678 0.000549324788281071 0.000925439291667831 0.00107022571303775 39871 43949 667 665 0 True 679 391 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 277 438 0.000956285418746337 0.000927679693626375 0.000732433051041428 0.000747692072938125 0.000831443877013976 0.000825505351779189 41801 40429 667 665 0 True 277 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 321 438 0.000992774384151481 0.00103066088200588 0.000869764248111696 0.000930800335698482 0.000806261329402814 0.000773803714082958 43396 44917 667 665 0 True 322 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 365 438 0.000940042681794832 0.00112154958235598 0.000839246204318303 0.00105287251087205 0.000737393759039725 0.00079205499577046 41091 48878 667 665 0 True 366 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 409 438 0.000996228825390463 0.000911663457109241 0.000793469138628214 0.000656137941557946 0.000852437808389432 0.000837313404963879 43547 39731 667 665 0 True 411 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 454 438 0.000958801899119106 0.000962052648214723 0.000656137941557946 0.000701915007248035 0.000961978839295494 0.000942848971876089 41911 41927 667 665 0 True 456 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 498 436 0.000975845334371038 0.000993098447652663 0.000732433051041428 0.000671396963454643 0.000911699905121479 0.000984915347843047 42656 43280 667 665 0 True 500 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 542 435 0.000995931423164591 0.00103756759718018 0.000701915007248035 0.000762951094834821 0.000977213992572723 0.000937006820512564 43534 45218 667 665 0 True 545 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 586 435 0.000995977177353186 0.000963383510274886 0.000656137941557946 0.000579842832074464 0.00101641801963557 0.00104539030715523 43536 41985 667 665 0 True 590 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 630 436 0.0008697184939231 0.00100174905104372 0.000473029678797589 0.000579842832074464 0.000971730800411826 0.00100407062495612 38017 43657 667 665 0 True 634 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 674 436 0.000905086481707647 0.000967123691581896 0.000503547722590982 0.000579842832074464 0.000961915700600248 0.00101565142596625 39563 42148 667 665 0 True 679 435 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 278 481 0.000853773159197467 0.00098056998756906 0.000701915007248035 0.000778210116731518 0.000727297359880514 0.00085359355669073 37320 42734 667 665 0 True 277 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 324 481 0.000917485866817106 0.0010137038636876 0.000778210116731518 0.000839246204318303 0.000795212079669848 0.000827422600694944 40105 44178 667 665 0 True 322 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 367 482 0.000991218741739224 0.000907074277591438 0.000869764248111696 0.000747692072938125 0.000794369612786289 0.000754023909270014 43328 39531 667 665 0 True 366 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 412 482 0.000942490530884706 0.000987017784791574 0.00064087891966125 0.000717174029144732 0.000939469112160734 0.000921486735051133 41198 43015 667 665 0 True 411 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 456 481 0.00102466505360275 0.000989381212243243 0.000686655985351339 0.000534065766384375 0.00107699941863378 0.00111069228115964 44790 43118 667 665 0 True 456 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 499 480 0.000982662708471811 0.00100560396183868 0.00064087891966125 0.00064087891966125 0.000949900799245864 0.00102548600648168 42954 43825 667 665 0 True 500 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 545 479 0.00101640642256121 0.000986788325815684 0.000656137941557946 0.000671396963454643 0.00103422393431027 0.000919333914420242 44429 43005 667 665 0 False 545 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 588 480 0.00091494650935004 0.000999592136670355 0.000534065766384375 0.00064087891966125 0.000976668724356895 0.00104395488349158 39994 43563 667 665 0 True 590 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 631 480 0.000975891088559634 0.00103265717509613 0.000595101853971161 0.000732433051041428 0.00104501318521387 0.000927926314912737 42658 45004 667 665 0 True 634 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 675 480 0.000988176088197604 0.000883371165381983 0.000610360875867857 0.000488288700694286 0.00103901941373131 0.000942947328431376 43195 38498 667 665 0 True 679 478 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 279 526 0.000913070587617613 0.000934425787517547 0.000793469138628214 0.000793469138628214 0.000781245842803709 0.000800487445867246 39912 40723 667 665 0 True 277 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 324 525 0.000953883323845059 0.000962213269497846 0.00080872816052491 0.00080872816052491 0.000817443481291086 0.000820005523978664 41696 41934 667 665 0 True 322 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 367 525 0.00103301519302148 0.000954319880727224 0.000900282291905089 0.000778210116731518 0.000811558549107483 0.000831313681329562 45155 41590 667 665 0 True 366 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 412 524 0.000919155894700853 0.000812583071319865 0.000595101853971161 0.000488288700694286 0.000927088264487323 0.000875199644077431 40178 35413 667 665 0 True 411 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 456 524 0.000945899217935093 0.000874927075069225 0.000595101853971161 0.000488288700694286 0.000987485145084805 0.000953600132111712 41347 38130 667 665 0 True 456 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 500 522 0.00098463013858143 0.000945026792203672 0.000686655985351339 0.000595101853971161 0.00095736873069051 0.000949045006662264 43040 41185 667 665 0 True 501 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 545 522 0.000952830977507355 0.00104805387237836 0.00064087891966125 0.000732433051041428 0.0009189783685466 0.000982602492884891 41650 45675 667 665 0 True 545 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 589 521 0.000895226454065254 0.000908382193754012 0.000595101853971161 0.000579842832074464 0.00088853459938807 0.000923507057086298 39132 39588 667 665 0 True 590 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 632 521 0.000905246621367732 0.000937294024716174 0.000473029678797589 0.000549324788281071 0.00100803477073968 0.00100237291324195 39570 40848 667 665 0 True 635 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 677 521 0.000865920896269649 0.000973892731370656 0.000488288700694286 0.000625619897764553 0.000939502956518156 0.000974659969508856 37851 42443 667 665 0 True 679 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 280 566 0.000958939161684893 0.000899410347796706 0.000854505226215 0.000732433051041428 0.000694500918374883 0.000718556975031754 41917 39197 667 665 0 True 277 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 324 566 0.000999157093460594 0.000941148935511128 0.000869764248111696 0.000778210116731518 0.000788507438563486 0.000741679990433252 43675 41016 667 665 0 True 322 567 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 368 566 0.00103862008112446 0.00102616348607844 0.000915541313801785 0.000915541313801785 0.000759962318704157 0.000678200515929895 45400 44721 667 665 0 True 367 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 412 565 0.000916959693648255 0.000937798834463132 0.00064087891966125 0.000686655985351339 0.000889351099850575 0.00084356770423638 40082 40870 667 665 0 True 411 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 456 564 0.000869146566565653 0.000931213361855084 0.000488288700694286 0.000518806744487678 0.00100507362947429 0.00103116039042451 37992 40583 667 665 0 True 456 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 501 563 0.000911560699393951 0.000917445823301674 0.000473029678797589 0.000457770656900893 0.00105328912455646 0.00111586037660128 39846 39983 667 665 0 True 501 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 545 562 0.000899527347793258 0.00097240124802737 0.000503547722590982 0.000610360875867857 0.000993365962138462 0.000994473318290769 39320 42378 667 665 0 True 545 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 590 566 0.00098430985926126 0.000884908540520447 0.000717174029144732 0.000656137941557946 0.000890415054087166 0.000787851104416337 43026 38565 667 665 0 False 590 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 633 563 0.000890628158111377 0.000911043917874338 0.000610360875867857 0.000671396963454643 0.000857761664073715 0.000842461073310646 38931 39704 667 665 0 True 635 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 677 562 0.000851599835239167 0.000882728680249491 0.000610360875867857 0.000549324788281071 0.000820129891705999 0.000874500341593547 37225 38470 667 665 0 True 679 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 277 610 0.000941300921981216 0.00094578400682411 0.000823987182421607 0.000762951094834821 0.000679585161907341 0.000785708966320289 41146 41218 667 665 0 False 277 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 322 610 0.000890719666488568 0.000919419170494329 0.000747692072938125 0.000793469138628214 0.00076624333642061 0.000713672591497642 38935 40069 667 665 0 False 322 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 368 608 0.000949879832342927 0.000940667071661759 0.000793469138628214 0.000854505226215 0.000769744897987899 0.000733256717281853 41521 40995 667 665 0 True 367 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 412 608 0.000989754607704159 0.000821509025481993 0.00080872816052491 0.000549324788281071 0.000846174651195721 0.000782599628696348 43264 35802 667 665 0 True 411 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 456 610 0.000821470702048838 0.000921438409482163 0.000411993591210803 0.000473029678797589 0.000911918776790588 0.00102813124542004 35908 40157 667 665 0 False 456 610 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 501 609 0.000885778214120223 0.000902691611151936 0.0004272526131075 0.000381475547417411 0.00102030514663115 0.00106914762175111 38719 39340 667 665 0 False 501 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 545 609 0.000992156702605438 0.00097146046622622 0.000595101853971161 0.000595101853971161 0.00103897843887027 0.00103872378337948 43369 42337 667 665 0 False 545 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 590 609 0.000922267179525367 0.00094110304371595 0.000686655985351339 0.000656137941557946 0.00083511345381085 0.000887207524498357 40314 41014 667 665 0 False 590 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 635 609 0.000968204384875541 0.000885895214116775 0.000762951094834821 0.000701915007248035 0.000735170604718525 0.000785009924615328 42322 38608 667 665 0 False 635 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 679 609 0.00094082050300096 0.000887134292586582 0.000717174029144732 0.000610360875867857 0.000795253388773049 0.000833482905371907 41125 38662 667 665 0 False 679 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 279 659 0.000976920557803039 0.078939027587279 0.000854505226215 0.0772106507972839 0.000716134963647241 0.0244742973687077 42703 3440224 667 665 0 True 278 654 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 322 653 0.000906619247025606 0.000926371777463802 0.00080872816052491 0.000839246204318303 0.000668803192721652 0.000661434141431716 39630 40372 667 665 0 False 322 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 367 653 0.00101050413223235 0.000904435499368701 0.000930800335698482 0.000793469138628214 0.000717933612519762 0.000621845591308927 44171 39416 667 665 0 False 367 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 412 653 0.000920368380698641 0.000887684994128718 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.000778859208289779 0.000692476089928254 40231 38686 667 665 0 False 412 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 456 653 0.000977950027046445 0.000913843317380198 0.000701915007248035 0.000732433051041428 0.000924598282751704 0.000818896112182551 42748 39826 667 665 0 False 456 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 501 653 0.00101356966286827 0.000989771292502256 0.000732433051041428 0.000671396963454643 0.000929940721330233 0.00095423272757753 44305 43135 667 665 0 False 501 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 546 653 0.000945052765446071 0.000994268688429703 0.000701915007248035 0.000671396963454643 0.000866640147780327 0.000947485204062971 41310 43331 667 665 0 False 546 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 590 653 0.000905910057102371 0.000946357654263835 0.000762951094834821 0.000823987182421607 0.000705363283820311 0.000680525969227444 39599 41243 667 665 0 False 590 653 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 635 652 0.000991927931662459 0.00098873872711075 0.000839246204318303 0.000885023270008392 0.000721812564459493 0.000689432585588508 43359 43090 667 665 0 False 635 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 675 658 0.00104594075129979 0.0807339933720775 0.000869764248111696 0.0787975890745403 0.000837087648116243 0.0264407009401449 45720 3518450 667 665 0 True 680 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F7_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F7_1.csv new file mode 100755 index 0000000..6a30ef5 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F7_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 270 275 0.00969789767510385 0.0403256481785833 0.00976577401388571 0.0411841000991836 0.00141559881208675 0.00923840398305755 423913 1757423 667 665 0 True 270 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 315 276 0.00948582701096236 0.00946534337675271 0.00944533455405508 0.00949111161974517 0.00133031511042784 0.00135268195548591 414643 412507 667 665 0 False 315 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 359 275 0.00948944159186143 0.0577209560867148 0.00947585259784848 0.0578164339665827 0.00140324416534379 0.0106904426664301 414801 2515524 667 665 0 True 359 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 403 275 0.00969094303843729 0.0739505435596315 0.00962844281681544 0.0733501182574197 0.00141690429674207 0.00976436917685135 423609 3222822 667 665 0 True 404 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 447 275 0.00945951835251978 0.0612921638038791 0.00944533455405508 0.0606393530174716 0.00174105093157303 0.0116835746791132 413493 2671160 667 665 0 True 448 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 493 275 0.00955926248365861 0.0559589865026494 0.00962844281681544 0.0592813000686656 0.0016913142961703 0.0161101025589538 417853 2438736 667 665 0 False 493 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 536 274 0.00954020586410846 0.0709305421943506 0.00962844281681544 0.0705119401846342 0.00157365704376664 0.0232393107603342 417020 3091208 667 665 0 True 538 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 581 274 0.00954503293100531 0.0589918146246826 0.00956740672922866 0.0590524147402152 0.00182450279093689 0.0169851359051413 417231 2570909 667 665 0 True 582 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 627 275 0.009596231868044 0.00945632563900022 0.00970473792629892 0.00941481651026169 0.0021568719851427 0.00178622953022255 419469 412114 667 665 0 False 627 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 666 274 0.00950554706624715 0.0409877061617192 0.00953688868543526 0.0413824673838407 0.00191290899876149 0.00815885608379891 415505 1786276 667 665 0 True 671 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 270 319 0.00948335628477819 0.00949416342412451 0.00946059357595178 0.00946059357595178 0.00150566922910753 0.00152654894335119 414535 413763 667 665 0 False 270 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 315 319 0.00942353268318919 0.00961173820337064 0.00933852140077821 0.00962844281681544 0.00131569545932533 0.00125333046733128 411920 418887 667 665 0 False 315 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 360 320 0.00972754638931393 0.127120249697258 0.00978103303578241 0.119600213626307 0.00138713826445642 0.0577503562323528 425209 5539999 667 665 0 True 359 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 404 319 0.00981129943153852 0.0461301342162915 0.00984206912336919 0.0472266727702754 0.00149649966729204 0.00744085775909963 428870 2010387 667 665 0 True 404 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 448 320 0.0095332054732533 0.0686953593643068 0.00956740672922866 0.0674753948271916 0.00168102155604737 0.0136062249439109 416714 2993797 667 665 0 True 449 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 493 318 0.00945910656482242 0.0372233398786506 0.00949111161974517 0.0393377584496834 0.0017049183833641 0.00736945318841241 413475 1622222 667 665 0 False 493 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 536 318 0.00960410158848248 0.0408666665519372 0.00967421988250553 0.0421606775005722 0.00149953439652412 0.0108739038637305 419813 1781001 667 665 0 True 538 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 580 318 0.00963471114065306 0.0476512177674674 0.00962844281681544 0.0499275196459907 0.00187060068945589 0.0114418165336998 421151 2076677 667 665 0 True 582 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 627 318 0.00976611717030018 0.00955588788863897 0.00956740672922866 0.00971999694819562 0.00260764049920504 0.0019432550045531 426895 416453 667 665 0 False 627 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 672 318 0.0094821209216861 0.00942075949773725 0.00943007553215839 0.00943007553215839 0.00194419515691611 0.00189294459894733 414481 410564 667 665 0 False 672 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 271 364 0.0100539567707563 0.0509604521718579 0.0100099183642329 0.0518806744487678 0.00158768835213703 0.013539870076927 439477 2220896 667 665 0 True 270 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 315 363 0.0101063910708871 0.0625798646306772 0.0100099183642329 0.0650034332799268 0.00146761564766171 0.0239492229377437 441769 2727279 667 665 0 False 315 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 359 364 0.00995146738830173 0.037530447771982 0.0100404364080262 0.0386968795300221 0.00145109487576557 0.00848659307016925 434997 1635606 667 665 0 True 359 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 404 364 0.00982594077188918 0.0329555176565814 0.00984206912336919 0.0338139925230793 0.00151762359901747 0.00579137547418995 429510 1436227 667 665 0 True 404 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 448 364 0.0101158850650207 0.0637501512995122 0.010101472495613 0.0633859769588769 0.00189534154369234 0.0128841743859894 442184 2778281 667 665 0 True 449 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 493 362 0.0101567206783424 0.0293827955101762 0.010101472495613 0.0302281223773556 0.00195777631987189 0.00518572709003391 443969 1280525 667 665 0 True 493 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 536 363 0.0100634050107013 0.027306535966834 0.0101167315175097 0.0279545281147478 0.00177087590974255 0.00368860528162593 439890 1190040 667 665 0 True 538 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 580 362 0.00998555425880559 0.0479390969986192 0.00991836423285267 0.049057755397879 0.00198622222547129 0.0117189572684271 436487 2089223 667 665 0 True 582 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 624 364 0.00989656236198678 0.056322082386098 0.00988784618905928 0.0572060730907149 0.00209173788435831 0.0162713198038242 432597 2454560 667 665 0 True 627 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 668 362 0.00976559099713133 0.0635139462297309 0.00971999694819562 0.0628061341268025 0.00200988851291562 0.0214296778366009 426872 2767987 667 665 0 True 672 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 272 407 0.0100895077752952 0.0423230656178097 0.010101472495613 0.0451514457923247 0.00162495137372959 0.0124639550863966 441031 1844472 667 665 0 True 270 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 316 407 0.0103248444443377 0.0312830829649083 0.0103456168459602 0.0316929884794385 0.00139029461968751 0.00573369316734653 451318 1363341 667 665 0 True 315 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 359 408 0.0106116774526447 0.0792475810721585 0.0105897611963073 0.0786755168993667 0.00156157385487329 0.0222360925013156 463856 3453671 667 665 0 True 360 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 404 408 0.0105790318390816 0.0626214884889036 0.0105134660868238 0.0628061341268025 0.00159568547051905 0.0177399149905838 462429 2729093 667 665 0 True 404 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 448 407 0.0106539314458129 0.0417748192867153 0.0105897611963073 0.0438086518654154 0.00169244856949872 0.00880174452189125 465703 1820579 667 665 0 True 449 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 492 406 0.0106162071173157 0.0492375365054889 0.0107270923933776 0.0509040970473793 0.00173007125440194 0.0117849274160251 464054 2145810 667 665 0 True 493 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 536 406 0.0104149801958714 0.0407621479884192 0.0105134660868238 0.0424658579385061 0.0016846207422264 0.00662688344332088 455258 1776446 667 665 0 True 538 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 581 406 0.0105223652765057 0.05090171067403 0.010605020218204 0.0513771267261769 0.0020489259329313 0.00929061198203757 459952 2218336 667 665 0 True 583 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 625 406 0.010384462152078 0.0472615505346107 0.0103913939116503 0.0487373159380484 0.00183079753349149 0.00881110828064708 453924 2059695 667 665 0 True 627 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 669 406 0.0103894722357292 0.0819699282539147 0.0103761348897536 0.0782024872205692 0.00186611711491608 0.0180836945802235 454143 3572313 667 665 0 True 672 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 272 451 0.0101492169914127 0.0400465342803105 0.0101167315175097 0.0423437857633326 0.00166117190213354 0.00831232847409806 443641 1745259 667 665 0 True 271 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 316 451 0.0104699767305635 0.0499718281742351 0.0105134660868238 0.0509956511787594 0.00161156737520438 0.00764937724576138 457662 2177811 667 665 0 True 315 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 361 452 0.0103506726838 0.0332051690223499 0.0103456168459602 0.0341649500267033 0.00146993435434252 0.00413406015233539 452447 1447107 667 665 0 True 360 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 404 452 0.0106438655243218 0.0517820300350327 0.0106202792401007 0.0532539864194705 0.00174594426095266 0.0121755934399757 465263 2256701 667 665 0 True 404 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 449 452 0.0108575375850642 0.0906687180299111 0.0109102006561379 0.0903944457160296 0.00200932251219276 0.0170201378438041 474603 3951413 667 665 0 True 449 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 493 450 0.010783873341425 0.0589899101151827 0.010757610437171 0.0587014572365911 0.00199625460218127 0.0163163526524454 471383 2570826 667 665 0 True 494 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 537 450 0.0104368049438316 0.0509992766305785 0.0104829480430304 0.051621271076524 0.00185528936012669 0.0106793213800765 456212 2222588 667 665 0 True 538 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 582 450 0.0102556869882751 0.032106335878607 0.0104219119554437 0.0326085297932403 0.00194831668948826 0.00457897689812678 448295 1399219 667 665 0 True 583 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 626 450 0.0102280972125519 0.0379024696095928 0.01025406271458 0.0384832532234684 0.00188857587167209 0.00589623594581491 447089 1651819 667 665 0 True 627 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 669 451 0.0100725787255148 0.0721214342792206 0.00996414129854276 0.0705271992065309 0.00201818863308646 0.0149265135149348 440291 3143108 667 665 0 True 672 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 273 496 0.00988606177570404 0.0499095988999737 0.00985732814526589 0.0513923857480735 0.00166545076418766 0.0142621393151689 432138 2175099 667 665 0 True 271 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 317 495 0.0101731464320483 0.0507811758739949 0.0101167315175097 0.0518196383611811 0.00162251319157291 0.00897322139493743 444687 2213083 667 665 0 True 315 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 362 496 0.0105040407239731 0.0693867651504591 0.010406652933547 0.0679331654840925 0.00197093990204834 0.0173852199167332 459151 3023929 667 665 0 True 360 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 407 496 0.0106063013354847 0.0845259406240481 0.0105592431525139 0.0812237735561151 0.00179713938747518 0.019823372215337 463621 3683706 667 665 0 True 405 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 451 495 0.0107248504381364 0.09443831597763 0.0107118333714809 0.0901197833218891 0.00199266687692461 0.0316637016435072 468803 4115695 667 665 0 True 449 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 494 495 0.0102938917357526 0.0413770062602145 0.0103456168459602 0.0426184481574731 0.0018596206232133 0.00634277898329625 449965 1803242 667 665 0 True 494 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 538 492 0.010044256882774 0.0370110673800546 0.010101472495613 0.0397497520408942 0.0018393036619028 0.00790799463778321 439053 1612971 667 665 0 False 538 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 583 494 0.0102014225206005 0.0944625009536889 0.0102235446707866 0.0890058747234302 0.00197985618510874 0.0230247301508019 445923 4116749 667 665 0 True 583 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 626 494 0.0103543787730763 0.059261566596739 0.0103761348897536 0.0613565270466163 0.00186070760136092 0.0163042095726416 452609 2582665 667 665 0 True 628 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 671 495 0.0102000270178484 0.074457969138915 0.010101472495613 0.0742351415274281 0.0019245891824681 0.0147321412725051 445862 3244936 667 665 0 True 672 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 274 540 0.0099072459650239 0.0487053752486045 0.00987258716716258 0.051468680857557 0.0016058339941854 0.0113042863705454 433064 2122618 667 665 0 True 271 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 318 539 0.0099974732249348 0.097665954770194 0.00993362325474937 0.0912947280079347 0.00149205512838869 0.0306031894305615 437008 4256358 667 665 0 True 315 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 362 540 0.0101131855678936 0.0561152021734354 0.0101472495613031 0.0585183489738308 0.00148749090676013 0.0133413387225569 442066 2445544 667 665 0 True 360 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 406 539 0.0104631364793685 0.0588607476576541 0.010452429999237 0.0595559624628061 0.00182914654772017 0.00947295344794443 457363 2565197 667 665 0 True 405 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 451 539 0.0103572384098635 0.0553737972764367 0.0103761348897536 0.0554970626382849 0.00222419568445342 0.00857154643841713 452734 2413233 667 665 0 True 449 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 495 537 0.0100436849554165 0.0600485420463496 0.0101319905394064 0.0602273594262608 0.00189759720639919 0.0145084518117325 439028 2616962 667 665 0 True 494 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 539 538 0.01009847559626 0.0728977857782474 0.0101472495613031 0.0701304646372168 0.00190898068117075 0.0192152782137063 441423 3176942 667 665 0 True 538 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 584 537 0.00976641457252605 0.0563467721719038 0.00973525597009232 0.0563363088426032 0.00170398141079981 0.0147980893277551 426908 2455636 667 665 0 True 583 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 628 538 0.00977979767269032 0.0476772384153334 0.0098268101014725 0.0468604562447547 0.00192608806875946 0.00792977643551829 427493 2077811 667 665 0 True 628 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 672 537 0.0101902127443946 0.0630535826864024 0.0102388036926833 0.063080796520943 0.00188344338154743 0.0151159176255958 445433 2747924 667 665 0 True 672 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 275 582 0.00947628726264014 0.0420302300727786 0.00941481651026169 0.04272526131075 0.0013956170418297 0.0089759198168242 414226 1831710 667 665 0 True 271 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 319 582 0.00994611414823602 0.0521074028628449 0.00990310521095598 0.0534523537041276 0.0016280876168338 0.0107814312259559 434763 2270881 667 665 0 True 316 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 363 582 0.0102091321013789 0.0438838226259171 0.0102082856488899 0.0445410849164569 0.00172427878178931 0.0085920119258828 446260 1912491 667 665 0 True 360 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 407 582 0.0102360813184618 0.0499316728534543 0.0101930266269932 0.0494239719233997 0.00161550538681674 0.00828637997258949 447438 2176061 667 665 0 True 405 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 452 582 0.0101724143650308 0.0863232009986055 0.01025406271458 0.0800335698481727 0.00202732991361833 0.023067098258694 444655 3762032 667 665 0 True 449 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 496 580 0.00982083917986074 0.0612587316310919 0.0097962920576791 0.0607309071488518 0.002056856513345 0.0132586420306302 429287 2669703 667 665 0 True 494 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 540 579 0.00981978683352304 0.0534740834691444 0.0098115510795758 0.0540474555580987 0.0020195962968285 0.00896482936735683 429241 2330442 667 665 0 True 539 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 583 579 0.00970423463022437 0.0364169063078846 0.00971999694819562 0.0381780727855345 0.00172804070589527 0.00782889397670008 424190 1587077 667 665 0 False 583 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 628 580 0.00968913574798776 0.0460279102425324 0.00967421988250553 0.0467231250476844 0.00160365920435149 0.00726366568816837 423530 2005932 667 665 0 True 628 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 673 580 0.00961430477253934 0.0509425314258409 0.00958266575112535 0.0499885557335775 0.00174352973387417 0.00852085063317373 420259 2220115 667 665 0 True 672 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 271 623 0.0091864116007915 0.00938592762519712 0.00915541313801785 0.00935378042267491 0.0013997739567336 0.00151740777208858 401555 409046 667 665 0 False 271 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 316 623 0.0095180608368281 0.00954134018956753 0.00950637064164187 0.00953688868543526 0.00146789032458924 0.00134218460174333 416052 415819 667 665 0 False 316 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 362 626 0.00978252004691177 0.0685700288716756 0.00970473792629892 0.0679484245059892 0.00151760506289995 0.0143168548492354 427612 2988335 667 665 0 True 360 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 407 625 0.00991518431674527 0.0766213542554028 0.00988784618905928 0.0729076066224155 0.00154323223935485 0.0237383010017174 433411 3339218 667 665 0 True 405 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 450 623 0.00998926034808185 0.00983387743792991 0.010101472495613 0.00987258716716258 0.00190776509826234 0.00215504785019923 436649 428568 667 665 0 False 450 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 494 622 0.00960641217500657 0.00976210267027147 0.00975051499198901 0.00976577401388571 0.00197571719013481 0.00197150131774913 419914 425440 667 665 0 False 494 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 539 622 0.00964646996712218 0.00934703432878374 0.00965896086060884 0.00944533455405508 0.00187098653275932 0.00200519408587122 421665 407351 667 665 0 False 539 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 583 622 0.00967774295502741 0.00949051502640786 0.00953688868543526 0.00944533455405508 0.00169787001354427 0.00154955088541028 423032 413604 667 665 0 False 583 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 628 622 0.00971667976952243 0.00949744468747974 0.00953688868543526 0.00944533455405508 0.00231347338982954 0.00142229271993198 424734 413906 667 665 0 False 628 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 673 622 0.0097951939571528 0.00953229950591746 0.00962844281681544 0.00958266575112535 0.00282421863725207 0.00147827396516866 428166 415425 667 665 0 False 673 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 271 672 0.00929789168130515 0.0391198871520757 0.00924696726939803 0.040009155413138 0.00131538788053675 0.00922995286231309 406428 1704875 667 665 0 True 271 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 316 666 0.00928377651412335 0.00930245044976828 0.00923170824750134 0.0093690394445716 0.00153014977235456 0.00136167060871061 405811 405408 667 665 0 False 316 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 361 666 0.00948937296057853 0.00941481651026169 0.00949111161974517 0.00933852140077821 0.00143217714855087 0.00132728973051281 414798 410305 667 665 0 False 361 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 405 666 0.00940982930370475 0.00923755945138654 0.00946059357595178 0.00927748531319142 0.00132129130923863 0.00139921494440611 411321 402580 667 665 0 False 405 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 450 666 0.00942515695688434 0.00939852492297349 0.00949111161974517 0.00944533455405508 0.00157382941939838 0.00155655362382247 411991 409595 667 665 0 False 450 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 494 666 0.00941829382859497 0.00940387131711173 0.0093842984664683 0.00949111161974517 0.00177222102913633 0.00163222416800508 411691 409828 667 665 0 False 494 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 539 666 0.00931946478122806 0.00922631596156792 0.00926222629129473 0.00933852140077821 0.00182024558189126 0.00179628358051118 407371 402090 667 665 0 False 539 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 583 666 0.00933966525549311 0.00930210626130444 0.00935378042267491 0.00924696726939803 0.00152096628038596 0.00122919518630058 408254 405393 667 665 0 False 583 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 628 665 0.00975010320429165 0.0093999705145216 0.00950637064164187 0.009399557488365 0.00275998215255547 0.0014324774206683 426195 409658 667 665 0 False 628 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 668 670 0.00943785374421967 0.039954498285081 0.00944533455405508 0.0396734569314107 0.00140572264959528 0.00827466215818763 412546 1741248 667 665 0 True 673 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F7_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F7_2.csv new file mode 100755 index 0000000..c2d834b --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F7_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 270 275 0.00828862291216488 0.75206852103938 0.00813305867093919 0.783871213855192 0.00201219115563814 0.208227457472314 362311 32775729 667 665 15 True 270 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 315 276 0.00673076142176108 0.00648304212121056 0.00665293354695964 0.00642404821850919 0.00144126875219913 0.00128685495448228 294214 282536 667 665 0 False 315 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 359 275 0.00600564904089498 0.00621108734298553 0.0059510185397116 0.00619516289005875 0.00124301866693749 0.0012433877718671 262518 270684 667 665 0 True 359 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 403 275 0.00609262775341558 0.0060452573411097 0.00607309071488518 0.00601205462729839 0.00135581217457279 0.00133861419072967 266320 263457 667 665 0 True 404 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 447 275 0.00620143121389637 0.00614399353843524 0.00622568093385214 0.00605783169298848 0.00165119132874907 0.00165596882389493 271076 267760 667 665 0 True 448 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 493 275 0.00651482452868324 0.00642615924108738 0.00654612039368277 0.00643930724040589 0.00155901621864121 0.00155416081527124 284775 280057 667 665 0 False 493 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 536 274 0.00642004472700706 0.00645128499894736 0.00642404821850919 0.00648508430609598 0.00144552391924336 0.00157760452953349 280632 281152 667 665 0 True 538 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 581 274 0.00698863202868696 0.00694464474300881 0.00691233691920348 0.00695811398489357 0.00176318668513879 0.00186551173977844 305486 302653 667 665 0 True 582 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 627 275 0.0096289003587014 0.00754786944472649 0.00791943236438544 0.00756847486076143 0.00858223682327331 0.00190436157963552 420897 328942 667 665 0 False 627 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 666 274 0.00900197646656187 0.768627244467314 0.00898756389715419 0.768093385214008 0.00187768345501752 0.174955248392774 393493 33497371 667 665 15 True 671 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 270 319 0.00650436969658911 0.00650451948135388 0.00648508430609598 0.00653086137178607 0.00148680226864556 0.00138261563646199 284318 283472 667 665 0 False 270 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 315 319 0.00626681394939976 0.00615126738797096 0.00622568093385214 0.00616464484626535 0.00132384343352073 0.00118397848688475 273934 268077 667 665 0 False 315 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 360 320 0.00608324814475344 0.00614048281610412 0.00608834973678187 0.00614938582436866 0.00130476619632008 0.00127851722638141 265910 267607 667 665 0 True 359 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 404 319 0.00639940958795036 0.00627997092754775 0.0063935301747158 0.00628671702143893 0.0014606439566982 0.00133721744873517 279730 273686 667 665 0 True 404 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 448 320 0.00657064463877011 0.00655729504580862 0.00656137941557946 0.00657663843747616 0.00160926902579698 0.0016805094297305 287215 285772 667 665 0 True 449 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 493 318 0.00647515564717069 0.00653880065235187 0.00650034332799268 0.00651560234988937 0.00153973884653542 0.00154905562052818 283041 284966 667 665 0 False 493 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 536 318 0.00679321588919434 0.00652914042946689 0.00689707789730678 0.00654612039368277 0.00149682284916343 0.00157517267758971 296944 284545 667 665 0 True 538 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 580 318 0.00695799959942208 0.00685878119423071 0.00695811398489357 0.0068207827878233 0.00166669262200662 0.0018461839785157 304147 298911 667 665 0 True 582 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 627 318 0.00768899139352274 0.00731203150930657 0.00714122224765393 0.00738536659800107 0.00555424824265514 0.00196720309856005 336100 318664 667 665 0 False 627 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 672 318 0.00711926023712795 0.00689072188367462 0.00709544518196384 0.00685130083161669 0.00195846706513174 0.0018374399976098 311196 300303 667 665 0 False 672 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 271 364 0.0062499992850908 0.00654903452267657 0.00622568093385214 0.00654612039368277 0.00136254150910103 0.00167454699583537 273199 285412 667 665 0 True 270 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 315 363 0.00656272916414304 0.0069630702987728 0.00653086137178607 0.00695811398489357 0.00142201487630674 0.00135364958757109 286869 303456 667 665 0 False 315 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 359 364 0.0069426033149596 0.00693365365806368 0.00694285496299687 0.00685130083161669 0.00143506690262839 0.0015475338335135 303474 302174 667 665 0 True 359 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 404 364 0.00688133845642983 0.00726214712794805 0.00688181887541009 0.00715648126955062 0.00146153325720525 0.00167889352181343 300796 316490 667 665 0 True 404 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 448 364 0.00744125533937083 0.00774899023709422 0.00740062561989776 0.00772106507972839 0.00177484925307814 0.00178161243382234 325271 337707 667 665 0 True 449 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 493 362 0.00715707607400237 0.00737233332817051 0.00712596322575723 0.00747692072938125 0.00177446016091005 0.00187816863155368 312849 321292 667 665 0 True 493 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 536 363 0.00693189683482818 0.00681949781755832 0.00691233691920348 0.00683604180972 0.00174821445573205 0.00177004152397816 303006 297199 667 665 0 True 538 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 580 362 0.0070991055170515 0.00686226897066424 0.00701915007248035 0.00692759594110018 0.00194386046102284 0.00190034345130645 310315 299063 667 665 0 True 582 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 624 364 0.00692787046623175 0.00737816158615812 0.00691233691920348 0.00743114366369116 0.00200705791916414 0.00214163006731984 302830 321546 667 665 0 True 627 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 668 362 0.00644207536881593 0.00615457159722378 0.0063782711528191 0.00608834973678187 0.00181497907626995 0.00188279889830252 281595 268221 667 665 0 True 672 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 272 407 0.00651137008744426 0.00690783952327603 0.00651560234988937 0.00688181887541009 0.00147812411146624 0.0014512757636885 284624 301049 667 665 0 True 270 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 316 407 0.00702265026790793 0.00729144903916922 0.00703440909437705 0.00730907148851759 0.00152223354433618 0.00131789454399867 306973 317767 667 665 0 True 315 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 359 408 0.00763758656263537 0.00762411866241479 0.00755321583886473 0.00761425192645151 0.00138693433844144 0.00140323778002454 333853 332265 667 665 0 True 360 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 404 408 0.0077230782640266 0.0079097033038077 0.00773632410162509 0.00793469138628214 0.00149850459275658 0.00151609591756287 337590 344711 667 665 0 True 404 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 448 407 0.00785642884668904 0.00811224674182595 0.00787365529869535 0.00820935378042268 0.00159704077388936 0.00164645030043333 343419 353538 667 665 0 True 449 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 492 406 0.00767213097502519 0.00797663648707486 0.00773632410162509 0.00790417334248875 0.00168947899484814 0.00193158496477866 335363 347628 667 665 0 True 493 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 536 406 0.00750089592420544 0.00786087443373827 0.00759899290455482 0.00787365529869535 0.00162625725590353 0.00170685981233807 327878 342583 667 665 0 True 538 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 581 406 0.00735940109597296 0.00763118599887221 0.00744640268558785 0.00764476997024491 0.00185130277626871 0.00189914349502532 321693 332573 667 665 0 True 583 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 625 406 0.00669912240034709 0.0069434286104366 0.00666819256885634 0.00698863202868696 0.0018421273140161 0.00186320882841161 292831 302600 667 665 0 True 627 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 669 406 0.00673561136575223 0.00682961695839507 0.00677500572213321 0.00686655985351339 0.00183267059089448 0.00197240193546627 294426 297640 667 665 0 True 672 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 272 451 0.00666826120013923 0.00654527139547197 0.00660715648126955 0.00653086137178607 0.00151209089297539 0.00156299977850157 291482 285248 667 665 0 True 271 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 316 451 0.00701880691606589 0.00693461738576241 0.00703440909437705 0.00694285496299687 0.00147342438057591 0.00149562730508851 306805 302216 667 665 0 True 315 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 361 452 0.00720120598890301 0.00694799484405681 0.00720225833524071 0.00695811398489357 0.00144778369188833 0.00144784008060881 314778 302799 667 665 0 True 360 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 404 452 0.00737694782729944 0.00719326354338582 0.00737010757610437 0.00721751735713741 0.00158613374168529 0.00163839432562248 322460 313488 667 665 0 True 404 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 449 452 0.00743551318870206 0.00759555101991647 0.00744640268558785 0.00762951094834821 0.00188814798402506 0.00200243576838671 325020 331020 667 665 0 True 449 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 493 450 0.00743510140100469 0.0074183169069389 0.00750743877317464 0.00740062561989776 0.00190712928746049 0.00201054223901968 325002 323296 667 665 0 True 494 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 537 450 0.00697030747615435 0.00698154174633195 0.00697337300679027 0.00694285496299687 0.00171132917642774 0.00163921266152209 304685 304261 667 665 0 True 538 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 582 450 0.00656149380105095 0.00647211987395818 0.00663767452506294 0.00646982528419928 0.00180554480235262 0.00186717691520012 286815 282060 667 665 0 True 583 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 626 450 0.00640890358208399 0.00631397674777468 0.00656137941557946 0.00631723506523232 0.00176547240564398 0.00181941799176283 280145 275168 667 665 0 True 627 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 669 451 0.00637804238187612 0.00636124529680805 0.0063935301747158 0.00631723506523232 0.00181590981090319 0.00190553631960967 278796 277228 667 665 0 True 672 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 273 496 0.00661143449790326 0.00681857998165475 0.00660715648126955 0.00679026474402991 0.00148436894057457 0.00155022264094186 288998 297159 667 665 0 True 271 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 317 495 0.00677246636466614 0.00687401727022982 0.00672922865644312 0.00689707789730678 0.0015870322605869 0.00153160828064706 296037 299575 667 665 0 True 315 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 362 496 0.00714492833693018 0.00694886678816519 0.00694285496299687 0.00694285496299687 0.00255446930066406 0.00158453671367408 312318 302837 667 665 0 True 360 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 407 496 0.00713987249909035 0.0072682966285019 0.00714122224765393 0.00721751735713741 0.0017585239233698 0.00167813655673893 312097 316758 667 665 0 True 405 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 451 495 0.00716233780569088 0.00759311875477203 0.00718699931334401 0.00762951094834821 0.00186304996607793 0.00184447359581911 313079 330914 667 665 0 True 449 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 494 495 0.00686141250729636 0.00697110136292895 0.0068055237659266 0.00697337300679027 0.00182392364930513 0.00178885445783082 299925 303806 667 665 0 True 494 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 538 492 0.00630883917162499 0.0063941497139507 0.00628671702143893 0.00634775310902571 0.00168212064890511 0.00159494713579558 275771 278662 667 665 0 False 538 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 583 494 0.00627511833462989 0.00630569327874504 0.00627145799954223 0.00619516289005875 0.00175680100136693 0.00182129514476283 274297 274807 667 665 0 True 583 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 626 494 0.00641297570486901 0.00645608069154346 0.00642404821850919 0.00642404821850919 0.00170256439813478 0.00188934628607628 280323 281361 667 665 0 True 628 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 671 495 0.00631940838919062 0.00628194427474041 0.00631723506523232 0.00628671702143893 0.00189857632953738 0.00182746880571789 276233 273772 667 665 0 True 672 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 274 540 0.00644804629042769 0.00663092843117177 0.00642404821850919 0.00657663843747616 0.00158743129261702 0.00139671070841348 281856 288981 667 665 0 True 271 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 318 539 0.00686989990928088 0.00687039181841076 0.0068055237659266 0.00686655985351339 0.00149437721961688 0.0013984244607672 300296 299417 667 665 0 True 315 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 362 540 0.00682446600000526 0.00694200596478608 0.00686655985351339 0.00697337300679027 0.0013530303821811 0.0014367717996834 298310 302538 667 665 0 True 360 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 406 539 0.00665423754133462 0.00692144644054632 0.00668345159075303 0.00691233691920348 0.00169521772551248 0.00160793279464518 290869 301642 667 665 0 True 405 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 451 539 0.0067251336565638 0.00703085248025075 0.0068207827878233 0.00711070420386053 0.00197955147682494 0.00202775861867022 293968 306410 667 665 0 True 449 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 495 537 0.00640391637552705 0.00633951553179125 0.0063782711528191 0.0063782711528191 0.00189893331722667 0.00202921838650529 279927 276281 667 665 0 True 494 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 539 538 0.00589295647438355 0.00603864892260406 0.00592050049591821 0.00611886778057527 0.00185243841232941 0.00190245122629369 257592 263169 667 665 0 True 538 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 584 537 0.00606046255883274 0.00627416561545773 0.00608834973678187 0.00625619897764553 0.00165246203316721 0.00152617786680012 264914 273433 667 665 0 True 583 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 628 538 0.00617166811421481 0.00625367492891074 0.00622568093385214 0.00622568093385214 0.00180349992967967 0.00189830342642006 269775 272540 667 665 0 True 628 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 672 537 0.00628294230087977 0.00651110495396193 0.00636301213092241 0.00648508430609598 0.0018399521556701 0.00180344900655981 274639 283759 667 665 0 True 672 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 275 582 0.00638383028673349 0.00671761803226308 0.0063935301747158 0.00663767452506294 0.0013485982046875 0.00138047192792724 279049 292759 667 665 0 True 271 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 319 582 0.00679985024654073 0.00681559701496818 0.00685130083161669 0.00683604180972 0.00140690582598576 0.00142365043037456 297234 297029 667 665 0 True 316 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 363 582 0.00670852488610353 0.00660112171020364 0.00669871061264973 0.00663767452506294 0.00148778799128872 0.00138861688192998 293242 287682 667 665 0 True 360 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 407 582 0.0065359629638145 0.00664219486688798 0.00650034332799268 0.00666819256885634 0.00153340236489241 0.00145072226152275 285699 289472 667 665 0 True 405 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 452 582 0.00646687413903485 0.00650096286722758 0.0064087891966125 0.00646982528419928 0.00193980346266462 0.00194847683369072 282679 283317 667 665 0 True 449 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 496 580 0.00622931839184551 0.00633655551100227 0.00624093995574884 0.0064087891966125 0.00201605339435009 0.00199664235111254 272295 276152 667 665 0 True 494 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 540 579 0.00632984034419046 0.00600797025752754 0.00634775310902571 0.00604257267109178 0.00188965356231235 0.00179225868621434 276689 261832 667 665 0 True 539 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 583 579 0.00624103146412603 0.00644187718093586 0.00622568093385214 0.00642404821850919 0.0015671596366007 0.00161802414715546 272807 280742 667 665 0 False 583 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 628 580 0.00627406598829219 0.00631133796955194 0.00627145799954223 0.00627145799954223 0.00157345483819632 0.0014486136266086 274251 275053 667 665 0 True 628 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 673 580 0.00606437454195768 0.00609069021833595 0.00605783169298848 0.00614938582436866 0.00152280370055331 0.00175597903872992 265085 265437 667 665 0 True 672 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 271 623 0.0068719130935791 0.00671805400431727 0.00677500572213321 0.00669871061264973 0.0019109219409991 0.00133311976141281 300384 292778 667 665 0 False 271 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 316 623 0.00661285287774973 0.00663349837170174 0.00659189745937285 0.00660715648126955 0.00142661740681095 0.00133375806723405 289060 289093 667 665 0 False 316 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 362 626 0.00644969344121713 0.00614894985231447 0.00648508430609598 0.00611886778057527 0.00135703260445268 0.00139919683219762 281928 267976 667 665 0 True 360 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 407 625 0.0063380760981377 0.00628745129016177 0.00631723506523232 0.00627145799954223 0.00143470853903803 0.00133336138309171 277049 274012 667 665 0 True 405 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 450 623 0.00634299467341175 0.00649779633336029 0.00634775310902571 0.00646982528419928 0.00170690232873891 0.00192152323926994 277264 283179 667 665 0 False 450 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 494 622 0.00633521646135047 0.00635016242827256 0.00630197604333562 0.00633249408712902 0.0019127173509652 0.00191736001261946 276924 276745 667 665 0 False 494 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 539 622 0.00618322104683525 0.00631537644752761 0.00616464484626535 0.00631723506523232 0.00187183418427402 0.00185220555204284 270280 275229 667 665 0 False 539 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 583 622 0.006425031933564 0.00628192132884282 0.00643930724040589 0.00611886778057527 0.00153427445471023 0.00153164956014973 280850 273771 667 665 0 False 583 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 628 622 0.00637870581761076 0.00628976882581826 0.00630197604333562 0.00630197604333562 0.00210800387305597 0.00130244441164145 278825 274113 667 665 0 False 628 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 673 622 0.00657210877280517 0.00638694470210775 0.00654612039368277 0.00636301213092241 0.00235208003776788 0.00150138966434618 287279 278348 667 665 0 False 673 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 271 672 0.00872367661442796 0.748879660813742 0.00822461280231937 0.763622491798276 0.00269940144530495 0.214757345727575 381328 32636756 667 665 16 True 271 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 316 666 0.00689632295319495 0.00654616628547794 0.00686655985351339 0.00656137941557946 0.0015011261701609 0.00121577376580642 301451 285287 667 665 0 False 316 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 361 666 0.00632547081917956 0.0061509690913023 0.00634775310902571 0.00610360875867857 0.00129869289771143 0.00126137606145868 276498 268064 667 665 0 False 361 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 405 666 0.00615130750028968 0.00579638613585922 0.00617990386816205 0.00576791027695125 0.00134592695825207 0.00135843473662593 268885 252611 667 665 0 False 405 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 450 666 0.0060228297387127 0.00598869570355277 0.00605783169298848 0.00592050049591821 0.00149856702477486 0.00151984018913794 263269 260992 667 665 0 False 450 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 494 666 0.00631394076365342 0.00626349577307884 0.00633249408712902 0.00622568093385214 0.00161732800044679 0.00163298776885218 275994 272968 667 665 0 False 494 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 539 666 0.00628321682601135 0.00605083319422383 0.00625619897764553 0.00605783169298848 0.00167564427969573 0.00172932540029832 274651 263700 667 665 0 False 539 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 583 666 0.00616809928750434 0.00611313130617801 0.00608834973678187 0.00619516289005875 0.00137586278911223 0.00129479068543382 269619 266415 667 665 0 False 583 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 628 665 0.00745305992002854 0.00669586532134869 0.00695811398489357 0.00665293354695964 0.0031106381062873 0.00138579932200608 325787 291811 667 665 0 False 628 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 668 670 0.00811143981682768 0.769568003322566 0.00807202258335241 0.768276493476768 0.00181322771182467 0.1815280158524 354566 33538370 667 665 17 True 673 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F7_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F7_3.csv new file mode 100755 index 0000000..26d8e10 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F7_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 270 275 0.0010631900804004 0.0779223866487 0.000946059357595178 0.0780193789578088 0.000810602137898912 0.0253222855029179 46474 3395918 667 665 0 True 270 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 315 276 0.00085743349428513 0.000842756926649423 0.000732433051041428 0.000747692072938125 0.000650430135397045 0.000617943798796407 37480 36728 667 665 0 False 315 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 359 275 0.000908357906192246 0.000945898736312055 0.000778210116731518 0.000823987182421607 0.000652879489021704 0.000679108630265598 39706 41223 667 665 0 True 359 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 403 275 0.000919155894700853 0.000893123171857316 0.000778210116731518 0.000732433051041428 0.000730120857778714 0.000687168919631197 40178 38923 667 665 0 True 404 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 447 275 0.0010284397741619 0.000960607056666615 0.000732433051041428 0.000625619897764553 0.000930234033922024 0.00095119152744281 44955 41864 667 665 0 True 448 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 493 275 0.00102164527715543 0.00107031139303971 0.00080872816052491 0.000823987182421607 0.0009108056245575 0.000925032151138003 44658 46645 667 665 0 False 493 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 536 274 0.00104664994122303 0.00099784824845359 0.000839246204318303 0.000793469138628214 0.000852739635282491 0.000879046407468031 45751 43487 667 665 0 True 538 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 581 274 0.000983554915149429 0.00104835216904702 0.00064087891966125 0.000671396963454643 0.000974769784230731 0.00103442969337027 42993 45688 667 665 0 True 582 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 627 275 0.00113440647494975 0.00101602139934409 0.00064087891966125 0.000656137941557946 0.0012713018074061 0.00101677614393238 49587 44279 667 665 0 False 627 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 666 274 0.00114346580429172 0.0798031241986862 0.00080872816052491 0.0772411688410773 0.00102551862099805 0.0228441859372571 49983 3477882 667 665 0 True 671 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 270 319 0.000806829361698185 0.000876074369948676 0.00064087891966125 0.000671396963454643 0.000684668819842218 0.000721348839851802 35268 38180 667 665 0 False 270 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 315 319 0.000881820476806687 0.000868571061437067 0.000717174029144732 0.000732433051041428 0.000668975062124172 0.000637411245558994 38546 37853 667 665 0 False 315 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 360 320 0.000916525028856595 0.000890989203381537 0.000793469138628214 0.000717174029144732 0.000685635729477066 0.000718495702308184 40063 38830 667 665 0 True 359 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 404 319 0.000942010111904451 0.000841953820233807 0.000762951094834821 0.000701915007248035 0.000787170542779948 0.000695874462042118 41177 36693 667 665 0 True 404 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 448 320 0.000961158239831789 0.000876648017388401 0.000656137941557946 0.000595101853971161 0.000933576311959365 0.000873385715450923 42014 38205 667 665 0 True 449 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 493 318 0.000977538239349083 0.0009579223866487 0.000717174029144732 0.000793469138628214 0.000904382756992996 0.000832310004465451 42730 41747 667 665 0 False 493 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 536 318 0.000990120641212925 0.000997045142037974 0.000823987182421607 0.00080872816052491 0.000759133092695489 0.000864379145609279 43280 43452 667 665 0 True 538 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 580 318 0.000990029132835734 0.00105730106910673 0.000762951094834821 0.000793469138628214 0.000946053387979097 0.00101369354634346 43276 46078 667 665 0 True 582 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 627 318 0.00104525443847085 0.00100877049570596 0.000701915007248035 0.000549324788281071 0.0011565362008802 0.00107547015072773 45690 43963 667 665 0 False 627 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 672 318 0.000995313741618547 0.00101661799268141 0.000610360875867857 0.000625619897764553 0.00104382844058636 0.00100338528483764 43507 44305 667 665 0 False 672 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 271 364 0.000871297013429655 0.00088275162614708 0.000701915007248035 0.000747692072938125 0.000753748478814426 0.000712045902667314 38086 38471 667 665 0 True 270 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 315 363 0.000913939917200933 0.000895807841875231 0.000778210116731518 0.000793469138628214 0.000650941194185626 0.000683703081788887 39950 39040 667 665 0 False 315 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 359 364 0.00101629203708972 0.000868754628617779 0.000869764248111696 0.000686655985351339 0.000734172436611769 0.000739955829545981 44424 37861 667 665 0 True 359 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 404 364 0.000991401758493607 0.00100652179774224 0.000778210116731518 0.000854505226215 0.000814688654657972 0.000741232070335336 43336 43865 667 665 0 True 404 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 448 364 0.00109711681124418 0.000945279197077152 0.000793469138628214 0.000625619897764553 0.000955997488011031 0.000897783411168238 47957 41196 667 665 0 True 449 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 493 362 0.00104221178492923 0.0010322900407347 0.000732433051041428 0.000656137941557946 0.000963101761179213 0.000988626226703601 45557 44988 667 665 0 True 493 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 536 363 0.000953814692562165 0.000983507062460454 0.000701915007248035 0.000656137941557946 0.000867527384262364 0.000910784288942551 41693 42862 667 665 0 True 538 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 580 362 0.00104012996934813 0.000970886818786495 0.000732433051041428 0.000503547722590982 0.00104083145418197 0.00107667674255336 45466 42312 667 665 0 True 582 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 624 364 0.00102507684130011 0.000996930412550029 0.000595101853971161 0.000564583810177768 0.00110897671856165 0.00109087654622796 44808 43447 667 665 0 True 627 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 668 362 0.000976028351125421 0.000980156961412458 0.000518806744487678 0.000488288700694286 0.00105405021095801 0.00106894177364276 42664 42716 667 665 0 True 672 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 272 407 0.000840618829976177 0.00087153108222605 0.000701915007248035 0.000686655985351339 0.000775505831792144 0.000765467342199809 36745 37982 667 665 0 True 270 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 316 407 0.000854001930140446 0.000986581812737382 0.000701915007248035 0.000915541313801785 0.00070223453607152 0.000706897568464576 37330 42996 667 665 0 True 315 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 359 408 0.00099007488702433 0.000933071979559794 0.000839246204318303 0.00080872816052491 0.000747101963750571 0.000692986201272927 43278 40664 667 665 0 True 360 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 404 408 0.00102525985805449 0.00106053644066678 0.000854505226215 0.000900282291905089 0.000847748319228669 0.000840769107423116 44816 46219 667 665 0 True 404 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 448 407 0.000971818965774609 0.00100643001415188 0.000747692072938125 0.000747692072938125 0.00086485795003569 0.000893785136136802 42480 43861 667 665 0 True 449 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 492 406 0.00104836572329537 0.00104348763875814 0.00080872816052491 0.000747692072938125 0.000892040964021155 0.000959856460958434 45826 45476 667 665 0 True 493 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 536 406 0.000981038434776661 0.0010231116816991 0.000762951094834821 0.000839246204318303 0.000903829201585103 0.000872949578256376 42883 44588 667 665 0 True 538 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 581 406 0.00100970343393192 0.00103887551334275 0.000717174029144732 0.000656137941557946 0.000980181848097879 0.00107373406929654 44136 45275 667 665 0 True 583 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 625 406 0.000947088826838584 0.000949363566847997 0.000610360875867857 0.000564583810177768 0.000980418554451985 0.000986340980567601 41399 41374 667 665 0 True 627 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 669 406 0.000982502568811726 0.00103472230587914 0.000656137941557946 0.000579842832074464 0.000958610971737189 0.00107902772562696 42947 45094 667 665 0 True 672 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 272 451 0.000876696007683958 0.000880296415105055 0.000747692072938125 0.000747692072938125 0.000751662229759812 0.000775301165963261 38322 38364 667 665 0 True 271 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 316 451 0.000870542069317824 0.000809645996428471 0.000747692072938125 0.00064087891966125 0.000752740500576429 0.000757033249638992 38053 35285 667 665 0 True 315 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 361 452 0.00104221178492923 0.000956614470486126 0.000961318379491875 0.000839246204318303 0.000810435542360566 0.000740175048545289 45557 41690 667 665 0 True 360 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 404 452 0.000957749552781403 0.000976967481647584 0.000747692072938125 0.000762951094834821 0.000859010658492305 0.000859045581800187 41865 42577 667 665 0 True 404 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 449 452 0.0010262435731093 0.000965219182082008 0.000671396963454643 0.000518806744487678 0.00100607909778639 0.00106109420587776 44859 42065 667 665 0 True 449 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 493 450 0.00102727304235271 0.00104927000495058 0.000732433051041428 0.000671396963454643 0.00099445796405167 0.00107509160999696 44904 45728 667 665 0 True 494 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 537 450 0.00103367862875612 0.00101170757059736 0.000778210116731518 0.000778210116731518 0.0009343180075166 0.000929482693478761 45184 44091 667 665 0 True 538 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 582 450 0.0010381854163328 0.000909322975555162 0.000701915007248035 0.000457770656900893 0.00102895370762086 0.00102027035576182 45381 39629 667 665 0 True 583 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 626 450 0.000897697180249427 0.00096492088541335 0.000549324788281071 0.000579842832074464 0.000892622102846788 0.00102161598183292 39240 42052 667 665 0 True 627 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 669 451 0.00104600938258268 0.000950946833781639 0.000671396963454643 0.000442511635004196 0.00102779159802739 0.00107750003175919 45723 41443 667 665 0 True 672 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 273 496 0.000890422264262696 0.000909300029657573 0.000762951094834821 0.000747692072938125 0.000753987930765236 0.000787727499548993 38922 39628 667 665 0 True 271 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 317 495 0.00101796206497346 0.000890231988761099 0.000915541313801785 0.000732433051041428 0.000806756109897193 0.000790940954695034 44497 38797 667 665 0 True 315 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 362 496 0.000922473073374048 0.000938418373698035 0.00080872816052491 0.00080872816052491 0.000787124715022191 0.000815364603695584 40323 40897 667 665 0 True 360 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 407 496 0.000938304022628191 0.000924100133602489 0.000656137941557946 0.000625619897764553 0.000923926018597336 0.000928048172856407 41015 40273 667 665 0 True 405 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 451 495 0.000966122569294433 0.00101436929471768 0.000595101853971161 0.00064087891966125 0.00100261019211924 0.00106073535736899 42231 44207 667 665 0 True 449 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 494 495 0.000981335837002533 0.00105154164881189 0.00064087891966125 0.000701915007248035 0.000946058460301941 0.00101600509756753 42896 45827 667 665 0 True 494 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 538 492 0.000913619637880762 0.000971621087509343 0.00064087891966125 0.000732433051041428 0.000858153569528081 0.000877315059202931 39936 42344 667 665 0 False 538 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 583 494 0.000945098519634667 0.000969464173135976 0.000595101853971161 0.000534065766384375 0.000984299587750695 0.00105730909550921 41312 42250 667 665 0 True 583 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 626 494 0.000938738687419851 0.00096911998467214 0.000549324788281071 0.00064087891966125 0.000971989862783983 0.000939757142549004 41034 42235 667 665 0 True 628 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 671 495 0.00103422767901927 0.00103495176485503 0.000701915007248035 0.000595101853971161 0.00100903590352779 0.00107901598542729 45208 45104 667 665 0 True 672 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 274 540 0.000982433937528832 0.000819260327518269 0.000839246204318303 0.00064087891966125 0.000767568304337082 0.000675310398255295 42944 35704 667 665 0 True 271 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 318 539 0.000890353632979802 0.000925224482584351 0.00080872816052491 0.000747692072938125 0.000706647445147101 0.000789818566044649 38919 40322 667 665 0 True 315 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 362 540 0.000959076424250681 0.000878300122014811 0.000823987182421607 0.000747692072938125 0.000800242992618294 0.000758047378818736 41923 38277 667 665 0 True 360 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 406 539 0.000976577401388571 0.00102827450865663 0.000732433051041428 0.000823987182421607 0.00089824839213436 0.000864746542995129 42688 44813 667 665 0 True 405 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 451 539 0.000969027960270265 0.00102152841476546 0.00064087891966125 0.000503547722590982 0.000986448439887587 0.0011523909932492 42358 44519 667 665 0 True 449 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 495 537 0.000937251676290488 0.00101781117935603 0.000610360875867857 0.000625619897764553 0.000971516092736452 0.00110707396379808 40969 44357 667 665 0 True 494 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 539 538 0.000944480838088623 0.000942410959878524 0.000625619897764553 0.000534065766384375 0.000929394557174032 0.000999287734424808 41285 41071 667 665 0 True 538 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 584 537 0.000937045782441807 0.000964760264130227 0.000656137941557946 0.000762951094834821 0.00086292161580326 0.000859685981286325 40960 42045 667 665 0 True 583 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 628 538 0.00092288486107141 0.000919281495108795 0.000610360875867857 0.000564583810177768 0.000945995247115394 0.000956761751556422 40341 40063 667 665 0 True 628 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 672 537 0.0010241388804339 0.00096726136696743 0.000701915007248035 0.000549324788281071 0.00100472190157427 0.00103503395200208 44767 42154 667 665 0 True 672 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 275 582 0.000878732069076471 0.000872953727876569 0.000762951094834821 0.000747692072938125 0.000697628281960231 0.000687817326651091 38411 38044 667 665 0 True 271 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 319 582 0.000890307878791206 0.000942686310649593 0.000762951094834821 0.000823987182421607 0.000746832520279048 0.000757427874612286 38917 41083 667 665 0 True 316 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 363 582 0.000875849555194936 0.000950235510956379 0.000778210116731518 0.000839246204318303 0.000684882733821099 0.000717622844594169 38285 41412 667 665 0 True 360 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 407 582 0.000894906174745083 0.000954365772522402 0.000701915007248035 0.000717174029144732 0.000803243491658332 0.000838002437197041 39118 41592 667 665 0 True 405 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 452 582 0.000964498295599282 0.000971208061352741 0.000564583810177768 0.000579842832074464 0.00100937607192728 0.000999318335698498 42160 42326 667 665 0 True 449 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 496 580 0.000885686705743031 0.000991813477387678 0.000473029678797589 0.000579842832074464 0.00100149748414741 0.00113311779272432 38715 43224 667 665 0 True 494 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 540 579 0.000955850753954678 0.000975131809840463 0.000549324788281071 0.000610360875867857 0.0009976915784897 0.000972109767942723 41782 42497 667 665 0 True 539 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 583 579 0.000939996927606236 0.000927977990295033 0.000717174029144732 0.000656137941557946 0.000858748952727827 0.000870468693672979 41089 40442 667 665 0 False 583 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 628 580 0.000935650279689636 0.00094227328449299 0.000717174029144732 0.000747692072938125 0.00082388308881495 0.000740105095873638 40899 41065 667 665 0 True 628 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 673 580 0.000899733241641939 0.00103047731482517 0.00064087891966125 0.000732433051041428 0.00084786614430524 0.000934063944727682 39329 44909 667 665 0 True 672 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 271 623 0.000879418381905408 0.00090516976809155 0.000747692072938125 0.000732433051041428 0.000706697189020219 0.000744422339025594 38441 39448 667 665 0 False 271 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 316 623 0.000902592878429176 0.000896679785983613 0.000778210116731518 0.00080872816052491 0.00073179548112129 0.000639817047280845 39454 39078 667 665 0 False 316 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 362 626 0.000853613019537382 0.00090094772293517 0.000747692072938125 0.00080872816052491 0.000669425786938673 0.000678223534021487 37313 39264 667 665 0 True 360 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 407 625 0.000906207459328244 0.000885734592833652 0.000686655985351339 0.000732433051041428 0.000792273884415633 0.000714773031512527 39612 38601 667 665 0 True 405 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 450 623 0.000963125669941408 0.000943237012191729 0.000579842832074464 0.000610360875867857 0.000996352750993231 0.00100216674806529 42100 41107 667 665 0 False 450 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 494 622 0.00094864446925084 0.00098476908682785 0.000534065766384375 0.000518806744487678 0.0010168393327614 0.00104652134269306 41467 42917 667 665 0 False 494 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 539 622 0.000955484720445911 0.000974627000093504 0.000610360875867857 0.000503547722590982 0.000970418611085961 0.00109364331628013 41766 42475 667 665 0 False 539 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 583 622 0.000940042681794832 0.00100551217824832 0.000656137941557946 0.00080872816052491 0.000850507764873742 0.00088994726050219 41091 43821 667 665 0 False 583 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 628 622 0.00102400161786811 0.000890759744405647 0.000854505226215 0.000732433051041428 0.000779123146015805 0.000696451580107564 44761 38820 667 665 0 False 628 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 673 622 0.000956171033274848 0.000940254045505157 0.000778210116731518 0.000717174029144732 0.000792214548105878 0.000818288525412893 41796 40977 667 665 0 False 673 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 271 672 0.000973374608186866 0.0780657985086314 0.000839246204318303 0.0769512474250401 0.0006967332701792 0.0266660298724667 42548 3402168 667 665 0 True 271 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 316 666 0.000902936034843645 0.00101214354265155 0.00080872816052491 0.000885023270008392 0.000658385312191056 0.000693800933770287 39469 44110 667 665 0 False 316 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 361 666 0.00088113416397775 0.000871554028123639 0.000717174029144732 0.000747692072938125 0.000670096563751886 0.000640442485170311 38516 37983 667 665 0 False 361 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 405 666 0.000910874386565015 0.000947596732733642 0.000762951094834821 0.000793469138628214 0.000739570625204926 0.000707024382726984 39816 41297 667 665 0 False 405 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 450 666 0.000960883714700215 0.000942961661420661 0.000762951094834821 0.000747692072938125 0.000808638688605878 0.000800529245595686 42002 41095 667 665 0 False 450 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 494 666 0.00106074223131053 0.000886262348478199 0.000762951094834821 0.000610360875867857 0.000936957086497395 0.00081886700504451 46367 38624 667 665 0 False 494 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 539 666 0.00099995779176102 0.000950189619161201 0.000717174029144732 0.000595101853971161 0.000936553780669977 0.000957744245182422 43710 41410 667 665 0 False 539 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 583 666 0.000962530865489663 0.000976187321129558 0.00080872816052491 0.000839246204318303 0.000774032082703687 0.000688141671368904 42074 42543 667 665 0 False 583 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 628 665 0.00104623815352566 0.000977219886521063 0.000869764248111696 0.000778210116731518 0.000796465640104345 0.000744647138437763 45733 42588 667 665 0 False 628 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 668 670 0.00111768331901799 0.0805978324157843 0.000930800335698482 0.0768902113374533 0.000836941433973822 0.0241642127028506 48856 3512516 667 665 0 True 673 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F8_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F8_1.csv new file mode 100755 index 0000000..aa6013d --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F8_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 241 247 0.00951085455212426 0.0400308622322572 0.00952162966353857 0.0407721065079728 0.00166482157959643 0.00826709804854871 415737 1744576 667 665 0 True 242 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 286 246 0.00961938348747348 0.00960226154766637 0.00961318379491875 0.00965896086060884 0.00143448347620956 0.00141365455150077 420481 418474 667 665 0 False 286 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 329 247 0.00978968057742701 0.0564202219900862 0.00985732814526589 0.0567635614557107 0.00124703923111147 0.00690888473201366 427925 2458837 667 665 0 True 331 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 373 246 0.00966861499440255 0.0721112921924863 0.00975051499198901 0.0713206683451591 0.00141171847750766 0.0114269995022957 422633 3142666 667 665 0 True 376 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 418 247 0.00969862974212139 0.0614892231723736 0.00967421988250553 0.0606393530174716 0.00174098079817137 0.00880467013099806 423945 2679748 667 665 0 True 420 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 461 246 0.00973754367952211 0.0544111480348847 0.00973525597009232 0.0579995422293431 0.00186138154539441 0.0141821651539766 425646 2371280 667 665 0 True 465 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 506 245 0.00952771497062181 0.0726970780120363 0.00949111161974517 0.0741741054398413 0.00172241309398682 0.0165138367679395 416474 3168195 667 665 0 True 510 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 550 245 0.00956102401991954 0.0603857320114202 0.00949111161974517 0.060517280842298 0.00157493146727459 0.0147310876561402 417930 2631657 667 665 0 True 554 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 599 246 0.00942108483409932 0.00923033149364599 0.00952162966353857 0.00914015411612116 0.00189466755851079 0.00211783345507537 411813 402265 667 665 0 False 599 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 638 245 0.00930507508891469 0.0398304757086123 0.00932326237888151 0.0402990768291753 0.00175683933250532 0.0080232430783728 406742 1735843 667 665 0 True 644 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 242 290 0.00948603290481104 0.0095710780728429 0.00946059357595178 0.00961318379491875 0.00159817056689537 0.00150275706644701 414652 417115 667 665 0 False 242 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 286 290 0.00961329818039024 0.0095497613339827 0.00959792477302205 0.00953688868543526 0.00141964092661272 0.0014106619593544 420215 416186 667 665 0 False 286 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 330 291 0.00985815172066061 0.113042184311775 0.00984206912336919 0.115114061188678 0.00137234037450119 0.0331742166238557 430918 4926466 667 665 0 True 331 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 374 291 0.00958191080701352 0.0474453471742988 0.00958266575112535 0.0472571908140688 0.00141341133781995 0.00733540422417814 418843 2067705 667 665 0 True 376 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 418 291 0.00946464282164251 0.0683662693010852 0.00946059357595178 0.0668039978637369 0.00163636358762956 0.0116244689141188 413717 2979455 667 665 0 True 420 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 463 290 0.00930717978159009 0.037899945560858 0.00933852140077821 0.0385748073548486 0.00174919151723402 0.00642122099188776 406834 1651709 667 665 0 True 465 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 506 290 0.0094506420399322 0.0406186213989999 0.00933852140077821 0.0407263294422828 0.00173008202972493 0.0108860504352563 413105 1770191 667 665 0 True 510 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 551 290 0.00934366874699524 0.0438546354441838 0.0093842984664683 0.0450904097047379 0.00168824601387509 0.00667457529645728 408429 1911219 667 665 0 True 554 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 599 289 0.00940868544898986 0.00934859464981979 0.0093690394445716 0.00926222629129473 0.00195384477541273 0.00189300758536186 411271 407419 667 665 0 False 599 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 644 289 0.00926302698959515 0.00913239840273607 0.00930800335698482 0.00909437705043107 0.0019157887754884 0.00206671737263811 404904 397997 667 665 0 False 644 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 242 336 0.0096202070628682 0.0506219083988295 0.00962844281681544 0.0497901884489204 0.00159433888558756 0.0107398466994642 420517 2206142 667 665 0 True 242 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 285 336 0.00961384723065339 0.0575234607461662 0.00964370183871214 0.0614023041123064 0.00139017658177805 0.0166425732632128 420239 2506917 667 665 0 True 286 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 330 335 0.00978647778422531 0.0379536848530114 0.00973525597009232 0.0386968795300221 0.00139351772152819 0.00767421461911091 427785 1654051 667 665 0 True 331 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 375 335 0.00979981513020098 0.0318763491470723 0.00978103303578241 0.0323949034866865 0.0013818468768476 0.0037872766717237 428368 1389196 667 665 0 True 376 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 418 335 0.00981077325836967 0.0614329368855877 0.00984206912336919 0.0604257267109178 0.00161473600447881 0.00889534505697862 428847 2677295 667 665 0 True 420 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 463 334 0.00986718817290828 0.0294060397044339 0.00988784618905928 0.0299839780270085 0.00179213991729277 0.00434024823979821 431313 1281538 667 665 0 True 465 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 507 334 0.00957939432664075 0.0258195270735777 0.00950637064164187 0.0260929274433509 0.00165437729264749 0.0027779594985075 418733 1125235 667 665 0 True 510 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 551 333 0.00948299025126942 0.0467377874762438 0.00952162966353857 0.0477912565804532 0.00162600015450635 0.00948079398850511 414519 2036869 667 665 0 True 554 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 595 334 0.00964008725781307 0.0550688462974787 0.00971999694819562 0.0556343938353552 0.00206271472908354 0.0102970679227023 421386 2399943 667 665 0 True 599 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 639 332 0.00958410700806612 0.0597064875509901 0.00946059357595178 0.0601358052948806 0.00240617864376763 0.015718336979666 418939 2602055 667 665 0 True 644 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 242 381 0.010041031212478 0.0426022712996728 0.0100404364080262 0.0449683375295644 0.00153352558143909 0.00920054473911111 438912 1856640 667 665 0 True 242 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 286 380 0.0102426470445253 0.0306610655730652 0.0103150988021668 0.0310826276035706 0.00151079898800698 0.00359330308937011 447725 1336233 667 665 0 True 286 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 331 379 0.0105618740183582 0.0773660174698591 0.0105592431525139 0.0752574959945067 0.00141991190244148 0.0129728656488125 461679 3371671 667 665 0 True 331 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 375 380 0.0103840503643806 0.0609398066005022 0.0103456168459602 0.059464408331426 0.00145561845772984 0.0143685947311946 453906 2655804 667 665 0 True 376 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 419 379 0.0103924691350823 0.041441071206283 0.0103303578240635 0.0421606775005722 0.00172068139519347 0.00639009772183674 454274 1806034 667 665 0 True 420 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 463 378 0.0105017530145433 0.052121744048838 0.0105134660868238 0.0526894026092927 0.00183181063986936 0.010849160792619 459051 2271506 667 665 0 True 465 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 507 378 0.0103604869572538 0.0396255688431424 0.010406652933547 0.0407263294422828 0.00184103803844025 0.00541750423123189 452876 1726913 667 665 0 True 510 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 551 377 0.0105060539082713 0.0501199898349674 0.0102693217364767 0.0503089951934081 0.00193832099731841 0.00701043419081865 459239 2184268 667 665 0 True 554 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 596 377 0.0103624086331748 0.0401658988395686 0.0102845807583734 0.0406500343327993 0.00209635061342011 0.00579854714713237 452960 1750461 667 665 0 True 599 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 639 377 0.0100574340890896 0.0855794785659502 0.0100556954299229 0.0840772106507973 0.00210242052234318 0.0175630771040191 439629 3729620 667 665 0 True 644 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 243 423 0.0103585652813328 0.0408940868995561 0.0103303578240635 0.0414892805371176 0.00168854648953941 0.00592971320195595 452792 1782196 667 665 0 True 242 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 287 424 0.0104371709773404 0.0489698726101131 0.010452429999237 0.0489204242008087 0.00152105920155445 0.00570148977807719 456228 2134145 667 665 0 True 287 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 330 423 0.0103894264815406 0.0327244754137576 0.0104371709773404 0.0333714808880751 0.00144233462092592 0.00356926695698033 454141 1426158 667 665 0 True 331 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 375 423 0.0105514649404526 0.0501521599833872 0.0104676890211337 0.0498054474708171 0.00142560532427098 0.00978032337922817 461224 2185670 667 665 0 True 376 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 419 424 0.0105251334049158 0.0926733863727756 0.0105134660868238 0.0923628595407034 0.00165631505255498 0.0144561409507384 460073 4038778 667 665 0 True 421 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 464 422 0.0103531434099842 0.056623797993496 0.0102845807583734 0.0567330434119173 0.00177079587442154 0.0124790343113097 452555 2467709 667 665 0 True 465 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 507 421 0.0103998584365405 0.0480990299048147 0.0103608758678569 0.0487525749599451 0.00188434545304942 0.00904239179843282 454597 2096193 667 665 0 True 510 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 551 421 0.0101932325208419 0.0318863765043187 0.0101625085831998 0.0323949034866865 0.0016033949444127 0.00461729899381182 445565 1389633 667 665 0 True 555 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 596 422 0.0102004845597343 0.0384901828845403 0.0102082856488899 0.0387273975738155 0.00203790847768488 0.00410105606198925 445882 1677432 667 665 0 True 599 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 640 421 0.0102165442799314 0.0724195244347995 0.0101472495613031 0.0726024261844816 0.00191927666520285 0.011824748146954 446584 3156099 667 665 0 True 644 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 244 468 0.00975980309227396 0.0485774518695457 0.00985732814526589 0.0493629358358129 0.00157045539509127 0.0100769250799675 426619 2117043 667 665 0 True 242 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 288 467 0.0101759831917413 0.0515713866951655 0.0101167315175097 0.0516060120546273 0.00165533693324972 0.00497943263329923 444811 2247521 667 665 0 True 287 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 332 467 0.0103958091908498 0.0640341526739715 0.0104982070649271 0.0614633401998932 0.00158793324591914 0.0123919850068876 454420 2790658 667 665 0 True 331 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 376 467 0.0105275126227227 0.0850295112925367 0.0105287251087205 0.0833600366216525 0.00156412116826123 0.0156986113678272 460177 3705652 667 665 0 True 376 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 420 467 0.0104632051106514 0.0890052092924001 0.0104371709773404 0.0855268177309834 0.00179205926540981 0.0231430486995825 457366 3878916 667 665 0 True 421 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 464 466 0.0102730049486587 0.0403114676138733 0.0101777676050965 0.0409094377050431 0.00201241402415227 0.00492211547059008 449052 1756805 667 665 0 True 465 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 508 465 0.0101536322706122 0.0360973387921624 0.0101777676050965 0.0371099412527657 0.00188079371300983 0.00533317866579688 443834 1573150 667 665 0 True 510 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 553 466 0.0102049455931224 0.0958287914797293 0.0102235446707866 0.0944228274967575 0.00174973445511728 0.0142241028427818 446077 4176293 667 665 0 True 555 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 597 465 0.0101614791139564 0.0592071389276579 0.0101777676050965 0.0616769665064469 0.00189560186432995 0.0129113328106175 444177 2580293 667 665 0 True 599 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 642 466 0.0100910634177075 0.0720037218245889 0.010101472495613 0.0706034943160143 0.00182408225912799 0.00991319885944591 441099 3137978 667 665 0 True 644 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 244 512 0.00988505518355494 0.0461740297183793 0.00984206912336919 0.0487678339818418 0.0014916748199669 0.00915206861860172 432094 2012300 667 665 0 True 242 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 288 511 0.0104047770118145 0.0912825666822125 0.0102845807583734 0.0873731593804837 0.00204115049136795 0.0191070909770855 454812 3978165 667 665 0 True 287 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 332 512 0.0102992907300069 0.0527548672551142 0.0102998397802701 0.0549324788281071 0.00165350041781093 0.0101545650436758 450201 2299098 667 665 0 True 331 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 376 511 0.0105053447183481 0.0543931584511749 0.0104676890211337 0.0541084916456855 0.00158622365336648 0.00572257268913431 459208 2370496 667 665 0 True 376 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 421 510 0.0104040906989856 0.0525805013793353 0.010452429999237 0.0524299992370489 0.00181393326148895 0.00553219238761213 454782 2291499 667 665 0 True 421 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 465 509 0.0100424267152302 0.0607469004394713 0.0100709544518196 0.0594796673533226 0.00187146248504868 0.0110665678128539 438973 2647397 667 665 0 True 465 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 509 508 0.00986247549148291 0.0703766511724493 0.00990310521095598 0.0680857557030594 0.00176800131968156 0.0159820469797318 431107 3067069 667 665 0 True 510 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 553 508 0.00992104085288553 0.0541011030666619 0.00997940032043946 0.0551308461127642 0.00181024932913383 0.0105212496758372 433667 2357768 667 665 0 True 555 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 598 508 0.010014539537281 0.0466150728159378 0.0100556954299229 0.0460975051499199 0.00181803536040528 0.00597494916982772 437754 2031521 667 665 0 True 599 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 641 506 0.00983561778277718 0.0602935812867027 0.00984206912336919 0.0606240939955749 0.00184440854152301 0.0123893383493244 429933 2627641 667 665 0 True 644 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 245 554 0.0095875385722108 0.0412083768588328 0.00955214770733196 0.0423285267414359 0.00134267732412239 0.00687558228879323 419089 1795893 667 665 0 True 242 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 288 553 0.00989617345138371 0.0493301461481582 0.0098268101014725 0.0499427786678874 0.00151402246606873 0.0102935017244503 432580 2149846 667 665 0 True 287 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 333 553 0.0100807000939905 0.0425620012494041 0.0100709544518196 0.0424048218509194 0.00135946788255116 0.00604434289203281 440646 1854885 667 665 0 True 332 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 377 553 0.0102344341676724 0.0481829659981953 0.010101472495613 0.0476539253833829 0.00153305240816672 0.0068483747805989 447366 2099851 667 665 0 True 376 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 421 552 0.0102173221011376 0.0844128173489342 0.0101930266269932 0.0801556420233463 0.00182596158562778 0.0162248201190175 446618 3678776 667 665 0 True 421 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 465 551 0.00989672250164686 0.0594762943063771 0.0100099183642329 0.0587472343022812 0.00203654157313903 0.00977228909414308 432604 2592023 667 665 0 True 466 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 509 550 0.0097343408863204 0.0520409056516319 0.00976577401388571 0.0522621499961852 0.00199350022510473 0.0076557027944483 425506 2267983 667 665 0 True 510 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 553 550 0.00967721678185856 0.0353034795732751 0.00964370183871214 0.0365758754863813 0.00183641963213914 0.00626581173506951 423009 1538553 667 665 0 True 555 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 598 550 0.00975660029907225 0.0432121962034865 0.0098268101014725 0.0433508812085145 0.00165925209149795 0.00525269586309144 426479 1883221 667 665 0 True 600 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 642 550 0.0094734505029472 0.0526648734447701 0.00946059357595178 0.0510109102006561 0.00191463768995293 0.0084045990430111 414102 2295176 667 665 0 True 644 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 242 594 0.00923079316372942 0.00928512629708857 0.00926222629129473 0.00930800335698482 0.00128538086280499 0.001274608590252 403495 404653 667 665 0 False 242 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 287 594 0.0095310092722007 0.00981359326446122 0.00952162966353857 0.00950637064164187 0.00136661859499943 0.00270887638095715 416618 427684 667 665 0 False 287 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 333 596 0.0101073747859419 0.0675239024546948 0.0101319905394064 0.0651865415426871 0.00156957461986956 0.0105400551124704 441812 2942744 667 665 0 True 332 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 377 595 0.00982127384465241 0.0723427474614667 0.00985732814526589 0.0708171206225681 0.00141232159853397 0.015018368855264 429306 3152753 667 665 0 True 376 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 421 594 0.00989468644025435 0.00970141077114852 0.00988784618905928 0.00964370183871214 0.0017831187723992 0.00183739805285094 432515 422795 667 665 0 False 421 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 466 594 0.0095973985998532 0.00959872787943766 0.00955214770733196 0.00967421988250553 0.00186777831962783 0.00192338937897171 419520 418320 667 665 0 False 466 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 510 594 0.00942268623070017 0.00924855053633167 0.00953688868543526 0.00926222629129473 0.00201188058933851 0.00212850505291098 411883 403059 667 665 0 False 510 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 555 594 0.00945581226324352 0.0094645173244395 0.00952162966353857 0.00953688868543526 0.0018999239546351 0.00180421288566236 413331 412471 667 665 0 False 555 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 600 594 0.00949799762512884 0.00938452792544419 0.00958266575112535 0.00946059357595178 0.00169818195438307 0.00161713070001646 415175 408985 667 665 0 False 600 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 644 593 0.00944668430261866 0.00921417758174333 0.009399557488365 0.00923170824750134 0.00176314310653546 0.00158338411034704 412932 401561 667 665 0 False 644 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 244 644 0.00920443875109824 0.0382623989591741 0.00917067215991455 0.0384985122453651 0.00132747399915206 0.00698919778221969 402343 1667505 667 665 0 True 242 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 287 638 0.00937709218176446 0.00918287937743191 0.00943007553215839 0.00923170824750134 0.00139484115328962 0.00131564199809064 409890 400197 667 665 0 False 287 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 332 638 0.00948829773714653 0.00929044974532922 0.00946059357595178 0.00930800335698482 0.00146885870940371 0.00141101898382133 414751 404885 667 665 0 False 332 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 376 638 0.00938594561725775 0.00958564871781192 0.0093842984664683 0.00964370183871214 0.00131081841838885 0.00131006675991775 410277 417750 667 665 0 False 376 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 421 637 0.00951847262452546 0.00940634947405134 0.00949111161974517 0.00941481651026169 0.00165118688971966 0.00152341170295823 416070 409936 667 665 0 False 421 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 466 637 0.00922708707445316 0.00938250868645636 0.00915541313801785 0.00941481651026169 0.00175291495630745 0.00188214118445642 403333 408897 667 665 0 False 466 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 510 637 0.00938811894121605 0.00919270022160001 0.009399557488365 0.00927748531319142 0.00193130137870209 0.00175189426265187 410372 400625 667 665 0 False 510 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 555 637 0.00922360975611988 0.00899036329666005 0.00923170824750134 0.00900282291905089 0.00182354609387356 0.00165493496482276 403181 391807 667 665 0 False 555 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 600 637 0.00947383941355026 0.00927287318777603 0.00944533455405508 0.00926222629129473 0.00141715785370668 0.0013709942954483 414119 404119 667 665 0 False 600 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 641 642 0.00938667768427528 0.0398733845371038 0.00935378042267491 0.0399328603036545 0.00144592023721468 0.00744293298052643 410309 1737713 667 665 0 True 644 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F8_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F8_2.csv new file mode 100755 index 0000000..174030b --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F8_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 241 247 0.00797106596621579 0.684603497757899 0.00782787823300526 0.685526817730983 0.00230284847340818 0.189279834207216 348430 29835551 667 665 6 True 242 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 286 246 0.00667862452385618 0.00621349666223237 0.00660715648126955 0.00625619897764553 0.00150153061740653 0.00137405483424322 291935 270789 667 665 0 False 286 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 329 247 0.00626642503879669 0.00610195665405216 0.00624093995574884 0.00610360875867857 0.00131315707844441 0.00117590075426624 273917 265928 667 665 0 True 331 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 373 246 0.00600288091248493 0.00578236619243233 0.0059510185397116 0.00576791027695125 0.00125588414258995 0.00112729615835822 262397 252000 667 665 0 True 376 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 418 247 0.00614750990263623 0.00586790849864418 0.00604257267109178 0.00588998245212482 0.00157771885552453 0.00137102444442172 268719 255728 667 665 0 True 420 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 461 246 0.00651265120472494 0.00605289832500684 0.00643930724040589 0.00604257267109178 0.00168016722153708 0.00137658137360958 284680 263790 667 665 0 True 465 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 506 245 0.00659500874419737 0.00662232371957589 0.00665293354695964 0.00657663843747616 0.00167304300168358 0.00151941835667949 288280 288606 667 665 0 True 510 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 550 245 0.00686962538414931 0.00682335272835327 0.00688181887541009 0.0068055237659266 0.00161457524249656 0.00127423616772128 300284 297367 667 665 0 True 554 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 599 246 0.0085156551959772 0.00729277990122938 0.0076600289921416 0.00730907148851759 0.00540467972467445 0.00198999108246782 372235 317825 667 665 0 False 599 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 638 245 0.00890202644157436 0.705904679299531 0.0089570458533608 0.696101319905394 0.00195360686782611 0.186719876079813 389124 30763873 667 665 9 True 644 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 242 290 0.00637236886249025 0.00610039633301611 0.00643930724040589 0.00613412680247196 0.0015989549709176 0.00145367433469331 278548 265860 667 665 0 False 242 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 286 290 0.0059239320600629 0.00605386205270558 0.00588998245212482 0.00602731364919509 0.0012676453596628 0.00130145900292715 258946 263832 667 665 0 False 286 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 330 291 0.00597776186294584 0.0059721287654935 0.00602731364919509 0.00604257267109178 0.00125094684834804 0.00128460995773129 261299 260270 667 665 0 True 331 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 374 291 0.00591693166920774 0.00590163896810004 0.0059662775616083 0.00587472343022812 0.0012559744191882 0.00118322948111832 258640 257198 667 665 0 True 376 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 418 291 0.00590299951878032 0.00606338460020502 0.00587472343022812 0.00614938582436866 0.00142615383026211 0.00148221750949248 258031 264247 667 665 0 True 420 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 463 290 0.00622735096173589 0.00630250379898017 0.00622568093385214 0.00624093995574884 0.0016114917767634 0.00181335391216502 272209 274668 667 665 0 True 465 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 506 290 0.00627736028987109 0.00656658813433217 0.00630197604333562 0.00659189745937285 0.00167354993991127 0.00161114987091175 274395 286177 667 665 0 True 510 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 551 290 0.00668109525004035 0.0066511437669477 0.00669871061264973 0.00656137941557946 0.00151979586763609 0.00154524696419633 292043 289862 667 665 0 True 554 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 599 289 0.00700565258684459 0.00711449027696272 0.00695811398489357 0.00714122224765393 0.00184719670609587 0.00180933713724695 306230 310055 667 665 0 False 599 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 644 289 0.00741551860828569 0.00732735936889603 0.00738536659800107 0.0072632944228275 0.00189856862069141 0.001918611531646 324146 319332 667 665 0 False 644 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 242 336 0.00588231862553502 0.00577711158188444 0.00585946440833143 0.00576791027695125 0.00154711471613804 0.00140948019428748 257127 251771 667 665 0 True 242 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 285 336 0.00602008448739695 0.00601948909811723 0.00613412680247196 0.00601205462729839 0.00133579352390839 0.00131963928652492 263149 262334 667 665 0 True 286 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 330 335 0.00612490733346991 0.00609858360710657 0.00607309071488518 0.00607309071488518 0.00133805122878807 0.00116752431319747 267731 265781 667 665 0 True 331 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 375 335 0.00661454578272777 0.00615372259901298 0.00665293354695964 0.00616464484626535 0.00146290338433368 0.00128075647220181 289134 268184 667 665 0 True 376 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 418 335 0.00673316351666236 0.00647842999579516 0.00668345159075303 0.00653086137178607 0.00171873330322453 0.00157851125418027 294319 282335 667 665 0 True 420 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 463 334 0.00678125116887654 0.00675896653971849 0.00671396963454643 0.00669871061264973 0.0017596143384478 0.00144203900121809 296421 294561 667 665 0 True 465 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 507 334 0.00686301390389722 0.00653402790565335 0.00685130083161669 0.00651560234988937 0.00168481506174608 0.00162194180023286 299995 284758 667 665 0 True 510 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 551 333 0.00679161449259348 0.00686626155684473 0.00679026474402991 0.0068207827878233 0.00171406614325186 0.00138737675602895 296874 299237 667 665 0 True 554 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 595 334 0.00711932886841084 0.00707559698054934 0.00714122224765393 0.00704966811627375 0.00207628762483723 0.00205381937980122 311199 308360 667 665 0 True 599 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 639 332 0.00678779401784574 0.00686722528454347 0.00686655985351339 0.00683604180972 0.00186270861622376 0.00186176784312462 296707 299279 667 665 0 True 644 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 242 381 0.00643317617913405 0.00655807520632664 0.00636301213092241 0.00657663843747616 0.0016381354143116 0.00159037586702346 281206 285806 667 665 0 True 242 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 286 380 0.0067284279581427 0.00641376845638931 0.00669871061264973 0.00654612039368277 0.0015198108053403 0.00145044124835689 294112 279517 667 665 0 True 286 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 331 379 0.00710702099167857 0.00699519455539742 0.00711070420386053 0.00703440909437705 0.00147478668306436 0.00148480083064556 310661 304856 667 665 0 True 331 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 375 380 0.0072730629420927 0.00735817570935808 0.00730907148851759 0.00735484855420768 0.00150404531440439 0.00141206753934263 317919 320675 667 665 0 True 376 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 419 379 0.00747106419324099 0.00745078535202736 0.00752269779507134 0.00750743877317464 0.00167918853334158 0.00157930853256512 326574 324711 667 665 0 True 420 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 463 378 0.00764534189760236 0.00770532419398232 0.00773632410162509 0.00781261921110857 0.00185436288346524 0.00179923910032686 334192 335804 667 665 0 True 465 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 507 378 0.00748307466774738 0.00784997513238349 0.00759899290455482 0.00787365529869535 0.00170083896170495 0.00187210344249859 327099 342108 667 665 0 True 510 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 551 377 0.00786905700274148 0.00761452727722258 0.00787365529869535 0.00753795681696803 0.00180436383708786 0.0017255781917434 343971 331847 667 665 0 True 554 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 596 377 0.00758233837990595 0.00742882612803467 0.00758373388265812 0.00755321583886473 0.00208403274929327 0.00207921401820261 331438 323754 667 665 0 True 599 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 639 377 0.00697778828598976 0.00662666049422022 0.00697337300679027 0.00672922865644312 0.00186954505710633 0.00171551262164587 305012 288795 667 665 0 True 644 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 243 423 0.00684434619495013 0.00686610093556161 0.00679026474402991 0.0068055237659266 0.00153622481473078 0.00154093087189552 299179 299230 667 665 0 True 242 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 287 424 0.00698826599517819 0.00679134320121659 0.00701915007248035 0.00675974670023652 0.00152272899617064 0.0014159215184177 305470 295972 667 665 0 True 287 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 330 423 0.00719216953665534 0.00712773005987158 0.00721751735713741 0.00715648126955062 0.00133664011090253 0.00135659304791854 314383 310632 667 665 0 True 331 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 375 423 0.00724062322237828 0.00732061327500486 0.00729381246662089 0.00733958953231098 0.00140562529221371 0.00132032475793788 316501 319038 667 665 0 True 376 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 419 424 0.00728010908713645 0.00777847571549611 0.00729381246662089 0.00755321583886473 0.00162492518147361 0.00220467427627069 318227 338992 667 665 0 True 421 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 464 422 0.00738975900010626 0.00767930354611638 0.00735484855420768 0.00764476997024491 0.00168299946038187 0.00146098584866626 323020 334670 667 665 0 True 465 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 507 421 0.00736859768788071 0.0075798101341704 0.00737010757610437 0.00762951094834821 0.00178206448156739 0.00162374394252167 322095 330334 667 665 0 True 510 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 551 421 0.00711150490216096 0.00731483090881243 0.00721751735713741 0.00740062561989776 0.0016320949953648 0.0015586725053185 310857 318786 667 665 0 True 555 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 596 422 0.00685509842927014 0.00661493514055223 0.00685130083161669 0.00666819256885634 0.00186799720797045 0.00188271009791757 299649 288284 667 665 0 True 599 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 640 421 0.00658018438709233 0.00641014300457025 0.00657663843747616 0.00636301213092241 0.00184365020939963 0.00185462689257347 287632 279359 667 665 0 True 644 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 244 468 0.0065870017611931 0.006658440562381 0.00660715648126955 0.00669871061264973 0.00147755527414954 0.00137694121687963 287930 290180 667 665 0 True 242 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 288 467 0.00659429955427413 0.00669829758649313 0.00660715648126955 0.00672922865644312 0.00144798689439146 0.00152406696455089 288249 291917 667 665 0 True 287 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 332 467 0.00671358072394336 0.00675859940535706 0.0068055237659266 0.0068207827878233 0.00133878269807872 0.00148148649549201 293463 294545 667 665 0 True 331 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 376 467 0.00701148624589056 0.00706451411201384 0.00697337300679027 0.00714122224765393 0.00152176873370024 0.00146264003449845 306485 307877 667 665 0 True 376 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 420 467 0.00701258434641686 0.00720271725319249 0.00704966811627375 0.00727855344472419 0.0017996307922325 0.00176430405383784 306533 313900 667 665 0 True 421 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 464 466 0.00704122646847782 0.00738180998387477 0.00706492713817044 0.00741588464179446 0.00197685509467945 0.00196732064467531 307785 321705 667 665 0 True 465 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 508 465 0.00687026594278965 0.00706719878203176 0.00686655985351339 0.00709544518196384 0.00178191042836648 0.00189868043605168 300312 307994 667 665 0 True 510 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 553 466 0.0063978996997267 0.00645335012973037 0.00642404821850919 0.00645456626230259 0.00188115671945361 0.00179412225460472 279664 281242 667 665 0 True 555 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 597 465 0.00624622456453165 0.00608112177904133 0.00633249408712902 0.00613412680247196 0.0018130358429327 0.00180546947150462 273034 265020 667 665 0 True 599 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 642 466 0.00611205040647449 0.00599693328078723 0.00605783169298848 0.00602731364919509 0.00170634573251175 0.00174765149430343 267169 261351 667 665 0 True 644 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 244 512 0.00653944028214778 0.00661996029212422 0.00648508430609598 0.00659189745937285 0.00147008234445294 0.00141042491058063 285851 288503 667 665 0 True 242 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 288 511 0.00673030387987512 0.00661511870773294 0.00674448767833982 0.00662241550316625 0.00160822623744321 0.00156034308015624 294194 288292 667 665 0 True 287 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 332 512 0.00675199136526953 0.0068880601595543 0.0068055237659266 0.0068055237659266 0.00146307281101162 0.00148899936994684 295142 300187 667 665 0 True 331 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 376 511 0.00684871571996103 0.00686793660736873 0.00685130083161669 0.00683604180972 0.00159598347149266 0.00141529215806782 299370 299310 667 665 0 True 376 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 421 510 0.00675274630938136 0.00697534635398292 0.00675974670023652 0.00700389105058366 0.00194414166561097 0.00181300639039389 295175 303991 667 665 0 True 421 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 465 509 0.00648691447363981 0.00628462894475833 0.00648508430609598 0.00631723506523232 0.00198605471747991 0.00167821771827606 283555 273889 667 665 0 True 465 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 509 508 0.00600944663854843 0.00605599602118136 0.00599679560540169 0.00604257267109178 0.0017839529072114 0.00167865410433704 262684 263925 667 665 0 True 510 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 553 508 0.00619948666088105 0.00652349573865999 0.00610360875867857 0.00656137941557946 0.00178315856033156 0.00158034573575823 270991 284299 667 665 0 True 555 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 598 508 0.00611898216604675 0.00609700034017293 0.00616464484626535 0.00599679560540169 0.00183367876363199 0.00170203122764617 267472 265712 667 665 0 True 599 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 641 506 0.00623393956489368 0.00605230173166953 0.00621042191195544 0.00607309071488518 0.00183748138191185 0.00180110583703396 272497 263764 667 665 0 True 644 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 245 554 0.00628527576449816 0.00658129645468673 0.00628671702143893 0.00659189745937285 0.00140443078881704 0.00134025927650719 274741 286818 667 665 0 True 242 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 288 553 0.00651100405393549 0.00645525463923026 0.00650034332799268 0.0064087891966125 0.00133441745666827 0.00137103444144851 284608 281325 667 665 0 True 287 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 333 553 0.00674441904705692 0.00691470034665515 0.00677500572213321 0.00691233691920348 0.00145924961112571 0.00141628860656469 294811 301348 667 665 0 True 332 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 377 553 0.00648446662454994 0.00688943691340964 0.00645456626230259 0.00688181887541009 0.00144615948497762 0.00133351758939776 283448 300247 667 665 0 True 376 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 421 552 0.00623650179945504 0.0062019548757451 0.00619516289005875 0.00622568093385214 0.00184807010056053 0.00173866622593462 272609 270286 667 665 0 True 421 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 465 551 0.00625553554191089 0.00610422829791347 0.00633249408712902 0.00621042191195544 0.00195460532778549 0.00190246768654435 273441 266027 667 665 0 True 466 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 509 550 0.00620250643732837 0.00632590861452097 0.00624093995574884 0.00631723506523232 0.00186493460236805 0.0018882421739179 271123 275688 667 665 0 True 510 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 553 550 0.00616443895241667 0.00613304834528528 0.00621042191195544 0.00616464484626535 0.00185043889817006 0.00193857253761876 269459 267283 667 665 0 True 555 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 598 550 0.00625555841900519 0.00632886863530995 0.00628671702143893 0.00627145799954223 0.00177230843073071 0.00158340602390107 273442 275817 667 665 0 True 600 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 642 550 0.00605044239153026 0.00622903103490014 0.00604257267109178 0.0063935301747158 0.00175385921696874 0.00173865129349554 264476 271466 667 665 0 True 644 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 242 594 0.00688149859608992 0.00670111993189658 0.00691233691920348 0.00668345159075303 0.0013706665726814 0.00126464318359187 300803 292040 667 665 0 False 242 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 287 594 0.00675622362771464 0.00662789957269002 0.00677500572213321 0.00669871061264973 0.00140482636168708 0.00146411910676076 295327 288849 667 665 0 False 287 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 333 596 0.00652239684689585 0.00662682111550334 0.00656137941557946 0.00656137941557946 0.00140787799349087 0.00151474394001945 285106 288802 667 665 0 True 332 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 377 595 0.00640286402918934 0.0063628285637417 0.0063935301747158 0.00633249408712902 0.00140666768945107 0.00125229289139184 279881 277297 667 665 0 True 376 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 421 594 0.00612792710991723 0.00592961001726105 0.00613412680247196 0.0059662775616083 0.00165511992220737 0.00168343809804945 267863 258417 667 665 0 False 421 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 466 594 0.00618006400782214 0.00614424594330872 0.00611886778057527 0.00614938582436866 0.00184728597926965 0.00186614467152344 270142 267771 667 665 0 False 466 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 510 594 0.00619658126990522 0.00625222933736263 0.00622568093385214 0.00621042191195544 0.00196700995059337 0.00209327156755461 270864 272477 667 665 0 False 510 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 555 594 0.00616354674573906 0.00625025599016998 0.00624093995574884 0.00611886778057527 0.00178412118612994 0.00179484880137724 269420 272391 667 665 0 False 555 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 600 594 0.00649304553491165 0.00618694825872188 0.00653086137178607 0.00619516289005875 0.00155824153415119 0.00154269195056439 283823 269632 667 665 0 False 600 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 644 593 0.00626388568132963 0.00622233083280414 0.00614938582436866 0.00630197604333562 0.00164403912102577 0.00146432102913528 273806 271174 667 665 0 False 644 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 244 644 0.00848785952640526 0.704221069955732 0.00823987182421607 0.675745784695201 0.00206442574927841 0.173549628834414 371020 30690500 667 665 9 True 242 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 287 638 0.00701597015637295 0.00670954107631175 0.0068055237659266 0.00677500572213321 0.00196199858530952 0.00134615169208273 306681 292407 667 665 0 False 287 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 332 638 0.00627971663058377 0.00631273766930487 0.00627145799954223 0.00630197604333562 0.00126598254654646 0.00128901825973816 274498 275114 667 665 0 False 332 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 376 638 0.00628458945166922 0.00616436949549429 0.00625619897764553 0.00616464484626535 0.00126476407386321 0.00128901928538435 274711 268648 667 665 0 False 376 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 421 637 0.00600301817505072 0.00589372263343183 0.00601205462729839 0.00587472343022812 0.00151170601024253 0.00138366957650633 262403 256853 667 665 0 False 421 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 466 637 0.00606279602245112 0.00604369702007364 0.00601205462729839 0.00602731364919509 0.00176197781848821 0.00168462750426331 265016 263389 667 665 0 False 466 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 510 637 0.00617027261146264 0.00623671791059246 0.00621042191195544 0.00627145799954223 0.00183379682020394 0.0017095648633044 269714 271801 667 665 0 False 510 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 555 637 0.00634663213140511 0.00609879012018487 0.00627145799954223 0.00617990386816205 0.00174587968400714 0.00161045736539415 277423 265790 667 665 0 False 555 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 600 637 0.0069784517217244 0.00642104230592503 0.00679026474402991 0.0064087891966125 0.00190075118728854 0.00137267560924438 305041 279834 667 665 0 False 600 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 641 642 0.00789417605228057 0.741281929933554 0.00790417334248875 0.71279468986038 0.00161028211261383 0.173042901755943 345069 32305641 667 665 13 True 644 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F8_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F8_3.csv new file mode 100755 index 0000000..40dedaf --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F8_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 241 247 0.00103960379617927 0.0690654537465201 0.000762951094834821 0.0679789425497826 0.000891670070092319 0.0205591141232572 45443 3009926 667 665 0 True 242 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 286 246 0.000972871312112312 0.00101769644986809 0.000869764248111696 0.000839246204318303 0.00070116181088163 0.000771871941592549 42526 44352 667 665 0 False 286 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 329 247 0.000948530083779351 0.000931626388011686 0.000869764248111696 0.000823987182421607 0.000637881140356263 0.000606782889879829 41462 40601 667 665 0 True 331 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 373 246 0.000933065168033973 0.00083791534225814 0.000793469138628214 0.000747692072938125 0.000678383440752549 0.00056627986104349 40786 36517 667 665 0 True 376 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 418 247 0.000946173743066668 0.000893995115965698 0.000778210116731518 0.000701915007248035 0.000799311854107881 0.000732273154164672 41359 38961 667 665 0 True 420 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 461 246 0.000980100473910447 0.000957738819467988 0.000823987182421607 0.000839246204318303 0.000861729675688084 0.000732092943634887 42842 41739 667 665 0 True 465 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 506 245 0.000870839471543697 0.000942709256547182 0.000671396963454643 0.000747692072938125 0.000813297724472062 0.000832108242026263 38066 41084 667 665 0 True 510 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 550 245 0.000977149328746018 0.000925821075921665 0.000793469138628214 0.000793469138628214 0.000807314385710487 0.00072829112341003 42713 40348 667 665 0 True 554 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 599 246 0.00101340952320818 0.00090585814501922 0.000564583810177768 0.000457770656900893 0.00110022883456862 0.000997610315287451 44298 39478 667 665 0 False 599 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 638 245 0.00101679533316427 0.0710603241911141 0.00064087891966125 0.069565880827039 0.00099840808955456 0.0205963592975427 44446 3096864 667 665 0 True 644 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 242 290 0.000978361814743807 0.000933026087764616 0.000747692072938125 0.000747692072938125 0.000834127312178457 0.00077574602197637 42766 40662 667 665 0 False 242 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 286 290 0.000974609971278952 0.000971070385967207 0.000854505226215 0.00080872816052491 0.000712326665131455 0.000738226299551556 42602 42320 667 665 0 False 286 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 330 291 0.000922107039865281 0.000812032369777729 0.000793469138628214 0.000671396963454643 0.000665493548537525 0.000620320969056179 40307 35389 667 665 0 True 331 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 374 291 0.000896827850666107 0.000803771846645683 0.000762951094834821 0.000671396963454643 0.000685115853764972 0.000612047890436083 39202 35029 667 665 0 True 376 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 418 291 0.000882804191861497 0.000898584295483502 0.000686655985351339 0.000701915007248035 0.00073267057531729 0.000773094989751728 38589 39161 667 665 0 True 420 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 463 290 0.000873104303879189 0.000843078169215669 0.000625619897764553 0.000473029678797589 0.000861494607345019 0.000909291906375167 38165 36742 667 665 0 True 465 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 506 290 0.000894059722256061 0.000844156626402353 0.000610360875867857 0.000625619897764553 0.000872421173201173 0.000811220257336138 39081 36789 667 665 0 True 510 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 551 290 0.000818450925601516 0.000947803245811943 0.000564583810177768 0.000732433051041428 0.000825995419484259 0.00081573748154871 35776 41306 667 665 0 True 554 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 599 289 0.000989640222232669 0.000872380080436844 0.000595101853971161 0.000457770656900893 0.0010662877115222 0.000969228658249445 43259 38019 667 665 0 False 599 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 644 289 0.00104495703624498 0.000811137479771757 0.000671396963454643 0.000381475547417411 0.00102402270974816 0.000917008755741558 45677 35350 667 665 0 False 644 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 242 336 0.000949147765325394 0.000908496923241957 0.000762951094834821 0.000732433051041428 0.000802114386165849 0.000779835389920127 41489 39593 667 665 0 True 242 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 285 336 0.000935307123275167 0.000941929096029155 0.00080872816052491 0.00080872816052491 0.000703083455972387 0.000702686084206944 40884 41050 667 665 0 True 286 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 330 335 0.000922221425336771 0.000947826191709533 0.000778210116731518 0.000869764248111696 0.000670785806541819 0.00066948558320509 40312 41307 667 665 0 True 331 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 375 335 0.000973260222715376 0.000934494625210314 0.000869764248111696 0.00080872816052491 0.000699895804918623 0.000669700479671207 42543 40726 667 665 0 True 376 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 418 335 0.000909913548604503 0.000925453941560241 0.000686655985351339 0.000686655985351339 0.000831542501399177 0.000815565355949466 39774 40332 667 665 0 True 420 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 463 334 0.00088962156596227 0.0009698313074974 0.000656137941557946 0.000762951094834821 0.000827770677134189 0.000816659937591063 38887 42266 667 665 0 True 465 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 507 334 0.000991218741739224 0.000928758150813059 0.000762951094834821 0.000686655985351339 0.000897407772752956 0.000847491276491962 43328 40476 667 665 0 True 510 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 551 333 0.00091842382768332 0.000935366569318696 0.000717174029144732 0.000717174029144732 0.000839890092665044 0.000810929367211991 40146 40764 667 665 0 True 554 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 595 334 0.000907397068231735 0.000864876771925235 0.000503547722590982 0.000244144350347143 0.0010601190067199 0.0011173087963691 39664 37692 667 665 0 True 599 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 639 332 0.000925538604009966 0.000938510157288392 0.000457770656900893 0.000488288700694286 0.0010202780016807 0.00100324189365316 40457 40901 667 665 0 True 644 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 242 381 0.000991241618833522 0.00100688893210366 0.000854505226215 0.000854505226215 0.000818870761849828 0.000826375804228754 43329 43881 667 665 0 True 242 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 286 380 0.000920574274547322 0.000925063861301227 0.000778210116731518 0.00080872816052491 0.00071376317829923 0.000722067515952986 40240 40315 667 665 0 True 286 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 331 379 0.000897925951192406 0.0009460134658 0.000762951094834821 0.000839246204318303 0.000713537107321602 0.000745860008721406 39250 41228 667 665 0 True 331 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 375 380 0.00100583720499558 0.00098616878658078 0.000900282291905089 0.000885023270008392 0.000679913144982909 0.000722863587291111 43967 42978 667 665 0 True 376 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 419 379 0.000892824359163975 0.00104897170828192 0.00064087891966125 0.00080872816052491 0.000817707355313283 0.0009060295011531 39027 45715 667 665 0 True 420 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 463 378 0.000873996510556807 0.000981097743213607 0.000564583810177768 0.00064087891966125 0.000875274758330027 0.000922525153728257 38204 42757 667 665 0 True 465 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 507 378 0.000899847627113429 0.000967307258762608 0.000579842832074464 0.000595101853971161 0.000909076002058977 0.000987882122076176 39334 42156 667 665 0 True 510 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 551 377 0.000970766619436905 0.0010134973506093 0.000656137941557946 0.00080872816052491 0.000936706069178749 0.000877914714885911 42434 44169 667 665 0 True 554 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 596 377 0.0010273416736356 0.000862926370630169 0.000686655985351339 0.000350957503624018 0.00111134682611085 0.00104999493080048 44907 37607 667 665 0 True 599 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 639 377 0.000955347457880124 0.000904160148597633 0.000549324788281071 0.000564583810177768 0.00102262415408307 0.000950260610817115 41760 39404 667 665 0 True 644 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 243 423 0.0010251912267716 0.00101930266269932 0.00080872816052491 0.000823987182421607 0.000871194285099688 0.000865168846311077 44813 44422 667 665 0 True 242 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 287 424 0.000951435474755184 0.00100115245770641 0.000762951094834821 0.000869764248111696 0.000794773425708255 0.000807340068636211 41589 43631 667 665 0 True 287 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 330 423 0.000979734440401681 0.00100037229718838 0.000839246204318303 0.000885023270008392 0.000711067702689045 0.000737918545808096 42826 43597 667 665 0 True 331 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 375 423 0.00101665807059848 0.0010366956530718 0.000854505226215 0.000946059357595178 0.00076206707959774 0.000750085058234206 44440 45180 667 665 0 True 376 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 419 424 0.000959945753834001 0.00100333231797736 0.000701915007248035 0.000732433051041428 0.00088401227494603 0.000882908445766601 41961 43726 667 665 0 True 421 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 464 422 0.000962599496772557 0.000948101542480601 0.000656137941557946 0.000717174029144732 0.000899288780558604 0.000831184785463369 42077 41319 667 665 0 True 465 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 507 421 0.000954295111542421 0.0010112027608504 0.000610360875867857 0.000778210116731518 0.000961664868197848 0.000908389986677872 41714 44069 667 665 0 True 510 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 551 421 0.000942696424733387 0.000960216976407602 0.000656137941557946 0.000732433051041428 0.000917716363164142 0.000866255210009767 41207 41847 667 665 0 True 555 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 596 422 0.000992888769622971 0.00086944300554545 0.000534065766384375 0.0004272526131075 0.00106291373098862 0.00101142771772694 43401 37891 667 665 0 True 599 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 640 421 0.000939722402474661 0.000923182297698928 0.000579842832074464 0.000534065766384375 0.000972078474668649 0.000976512550117487 41077 40233 667 665 0 True 644 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 244 468 0.000985751116202027 0.00110089827452587 0.000823987182421607 0.000991836423285267 0.000811641881949599 0.000790833386674966 43089 47978 667 665 0 True 242 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 288 467 0.0010056084340526 0.000928138611578156 0.00080872816052491 0.000747692072938125 0.000847725227994831 0.000838463335136334 43957 40449 667 665 0 True 287 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 332 467 0.000904491677255902 0.000966389422859047 0.000793469138628214 0.000854505226215 0.000766076850039729 0.000832795845956922 39537 42116 667 665 0 True 331 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 376 467 0.000948964748571011 0.00103256539150577 0.000823987182421607 0.000900282291905089 0.000763339636231236 0.000863243340373168 41481 45000 667 665 0 True 376 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 420 467 0.000941598324207088 0.000993213177140608 0.000686655985351339 0.00064087891966125 0.000943622019641577 0.000997451028917477 41159 43285 667 665 0 True 421 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 464 466 0.000948850363099521 0.000931396929035796 0.000518806744487678 0.000473029678797589 0.00104883852794344 0.0010316135021237 41476 40591 667 665 0 True 465 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 508 465 0.000933888743428698 0.000863867152431319 0.000534065766384375 0.000488288700694286 0.00101958166961175 0.000901814605760555 40822 37648 667 665 0 True 510 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 553 466 0.000870473438034931 0.000830549709132066 0.000473029678797589 0.000457770656900893 0.000968817249681676 0.000899739593682752 38050 36196 667 665 0 True 555 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 597 465 0.000959831368362511 0.000864716150642112 0.00064087891966125 0.000488288700694286 0.000993404493577686 0.000870637810217916 41956 37685 667 665 0 True 599 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 642 466 0.00096179879847213 0.000853174364154837 0.000534065766384375 0.000411993591210803 0.00101702066245111 0.000925560305146707 42042 37182 667 665 0 True 644 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 244 512 0.000936725503121637 0.000983575900153221 0.000747692072938125 0.00080872816052491 0.000758299827886157 0.000772168113160092 40946 42865 667 665 0 True 242 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 288 511 0.000929564972606395 0.000976577401388571 0.000778210116731518 0.000793469138628214 0.000789633150424264 0.000827094740912644 40633 42560 667 665 0 True 287 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 332 512 0.00106154292961096 0.000939221480113651 0.000915541313801785 0.00080872816052491 0.000882004190779911 0.000764747584812464 46402 40932 667 665 0 True 331 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 376 511 0.000949307904985479 0.00101723753191631 0.000778210116731518 0.000869764248111696 0.000807525737715684 0.000814046077787468 41496 44332 667 665 0 True 376 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 421 510 0.000964246647562005 0.00100209323950756 0.000595101853971161 0.000579842832074464 0.0010172652082122 0.0010220985258398 42149 43672 667 665 0 True 421 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 465 509 0.000866927488418757 0.000925637508740953 0.000473029678797589 0.000579842832074464 0.000947135988154479 0.000891100646226229 37895 40340 667 665 0 True 465 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 509 508 0.000849701036412442 0.000866138796292631 0.000442511635004196 0.000534065766384375 0.000937744610336353 0.000856470262041834 37142 37747 667 665 0 True 510 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 553 508 0.000817581596018196 0.000913177886350117 0.000457770656900893 0.000671396963454643 0.000879895474772796 0.000857806142482133 35738 39797 667 665 0 True 555 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 598 508 0.000872097711730081 0.00087130162325016 0.000534065766384375 0.000488288700694286 0.000918794452890616 0.000922601363218728 38121 37972 667 665 0 True 599 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 641 506 0.000910828632376419 0.000856547411100422 0.000473029678797589 0.0004272526131075 0.00100955595204952 0.00100453146937261 39814 37329 667 665 0 True 644 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 245 554 0.000923868576126219 0.000985847544014534 0.000823987182421607 0.000823987182421607 0.000672931447177337 0.000728300828155179 40384 42964 667 665 0 True 242 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 288 553 0.000954615390862591 0.000971437520328631 0.00080872816052491 0.000869764248111696 0.000757628310894865 0.000716277491848408 41728 42336 667 665 0 True 287 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 333 553 0.000958161340478765 0.000907280790669739 0.00080872816052491 0.000762951094834821 0.000752043902335539 0.000728837281919972 41883 39540 667 665 0 True 332 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 377 553 0.0010033893559057 0.000873573267111473 0.000869764248111696 0.000701915007248035 0.000776797104949222 0.000718367580452866 43860 38071 667 665 0 True 376 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 421 552 0.000879029471302344 0.000809324753862225 0.000518806744487678 0.000442511635004196 0.000981933306412022 0.000906991327899331 38424 35271 667 665 0 True 421 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 465 551 0.000879258242245323 0.000850489694136922 0.000335698481727321 0.000442511635004196 0.00105868643615168 0.000975222464788512 38434 37065 667 665 0 True 466 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 509 550 0.000948484329590755 0.000861159536515815 0.000488288700694286 0.000396734569314107 0.00110220869114832 0.00101875461917325 41460 37530 667 665 0 True 510 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 553 550 0.00092201553148809 0.000908772274013025 0.000534065766384375 0.000488288700694286 0.000936259439442937 0.000997954545979691 40303 39605 667 665 0 True 555 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 598 550 0.000895432347913935 0.000846772458727501 0.000579842832074464 0.000595101853971161 0.00084966621806979 0.000785564221865585 39141 36903 667 665 0 True 600 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 642 550 0.000952098910489823 0.000963980103612201 0.000656137941557946 0.00064087891966125 0.000971461247696307 0.0009782162573498 41618 42011 667 665 0 True 644 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 242 594 0.000993186171848843 0.00102005987731976 0.000885023270008392 0.000915541313801785 0.000722658354593987 0.000685689017668542 43414 44455 667 665 0 False 242 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 287 594 0.000958664636553319 0.000971506358021398 0.000839246204318303 0.000839246204318303 0.000712862811980678 0.000760194800781997 41905 42339 667 665 0 False 287 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 333 596 0.000906642124119904 0.000993098447652663 0.000762951094834821 0.000885023270008392 0.000743544280164101 0.000798879702310455 39631 43280 667 665 0 True 332 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 377 595 0.000933980251805889 0.000912466563524857 0.00080872816052491 0.000839246204318303 0.000715261737051352 0.000660700584343421 40826 39766 667 665 0 True 376 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 421 594 0.000913322235654889 0.00081666744109071 0.000671396963454643 0.000518806744487678 0.000903719294866688 0.000838357305119619 39923 35591 667 665 0 False 421 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 466 594 0.000891405979317505 0.000886767158225158 0.000411993591210803 0.000488288700694286 0.00104266783227634 0.000984823068383351 38965 38646 667 665 0 False 466 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 510 594 0.0008773365663243 0.000901957342429087 0.000335698481727321 0.000473029678797589 0.00107908913543684 0.00110464298032316 38350 39308 667 665 0 False 510 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 555 594 0.00091929315726664 0.00101514945523571 0.000488288700694286 0.000625619897764553 0.000993644999431515 0.00101624230272661 40184 44241 667 665 0 False 555 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 600 594 0.000956857346103785 0.000865794607828796 0.000701915007248035 0.000625619897764553 0.000831205904205355 0.000790294044473057 41826 37732 667 665 0 False 600 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 644 593 0.000953929078033654 0.000902852232435059 0.000732433051041428 0.000686655985351339 0.000845051793558026 0.000803428506840147 41698 39347 667 665 0 False 644 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 244 644 0.00113003694993886 0.0710044509304848 0.000991836423285267 0.0675211718928817 0.000765236715572792 0.0197032345126418 49396 3094429 667 665 0 True 242 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 287 638 0.0010578368403347 0.00103729224640911 0.000930800335698482 0.000930800335698482 0.00075484301256793 0.000738497144689679 46240 45206 667 665 0 False 287 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 332 638 0.000913917040106635 0.00096400304950979 0.000778210116731518 0.000869764248111696 0.000678286470724526 0.000668359779076774 39949 42012 667 665 0 False 332 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 376 638 0.000847664975019929 0.000839337987908659 0.000686655985351339 0.000717174029144732 0.000659303826443227 0.000645662760831817 37053 36579 667 665 0 False 376 638 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 421 637 0.000869787125205994 0.000891172770562249 0.000686655985351339 0.000671396963454643 0.000764739131916493 0.000765356163007828 38020 38838 667 665 0 False 421 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 466 637 0.000930983352452865 0.000843973059221641 0.00064087891966125 0.000503547722590982 0.000944497981207957 0.000890786512444047 40695 36781 667 665 0 False 466 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 510 637 0.000948118296081989 0.000868158035280465 0.000549324788281071 0.000503547722590982 0.00102247445484825 0.000887960738024153 41444 37835 667 665 0 False 510 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 555 637 0.000852446287728189 0.000885619863345707 0.000534065766384375 0.000579842832074464 0.000878697998751988 0.000886094547845806 37262 38596 667 665 0 False 555 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 600 637 0.000891291593846016 0.000871944108382653 0.000701915007248035 0.000778210116731518 0.000725153762137407 0.000661094856342101 38960 38000 667 665 0 False 600 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 641 642 0.00096712916144354 0.0758257282024012 0.000793469138628214 0.0713206683451591 0.000727222194745416 0.0209390867457144 42275 3304544 667 665 0 True 644 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F9_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F9_1.csv new file mode 100755 index 0000000..68e9c18 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F9_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 255 277 0.00932822670834416 0.0395708658232902 0.0093690394445716 0.0397650110627909 0.00151140940252975 0.00790312465179588 407754 1724529 667 665 0 True 255 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 299 276 0.0091809897294429 0.00916550933295702 0.00924696726939803 0.00918593118181125 0.00139006512527066 0.00129876063977596 401318 399440 667 665 0 False 299 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 343 279 0.00935469550644682 0.0558582769581312 0.00932326237888151 0.056092164492256 0.00131682766000598 0.0070763171004833 408911 2434347 667 665 0 True 344 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 388 278 0.00932632790951743 0.0734508507478355 0.00935378042267491 0.072480354009308 0.00141785363731125 0.00785393892824158 407671 3201045 667 665 0 True 388 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 432 279 0.00945158000079841 0.0627971622808452 0.00949111161974517 0.0598001068131533 0.00170849393034052 0.0104772759677335 413146 2736749 667 665 0 True 433 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 476 278 0.00932422321684202 0.0535696072408074 0.00924696726939803 0.0568245975432975 0.00175311812401939 0.0127040399089832 407579 2334605 667 665 0 True 478 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 520 275 0.00943899759893457 0.0744040003877857 0.00952162966353857 0.0763256275272755 0.00159794555617851 0.0248651755045086 412596 3242584 667 665 0 True 522 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 564 276 0.00926096805110834 0.0608216581738163 0.00927748531319142 0.0592202639810788 0.00163053237786645 0.0141685104487001 404814 2650655 667 665 0 True 567 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 612 275 0.00910936154719619 0.00914428437768718 0.00914015411612116 0.00917067215991455 0.00196571343149922 0.00191729617580007 398187 398515 667 665 0 False 612 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 652 276 0.00925447095632774 0.0400080540100537 0.00917067215991455 0.0401312275883116 0.00186534918197107 0.00766061008033597 404530 1743582 667 665 0 True 656 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 255 320 0.00941916315817829 0.00937769004796266 0.00941481651026169 0.009399557488365 0.00151367018040441 0.00150127214008069 411729 408687 667 665 0 False 255 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 299 320 0.00935581648406742 0.00933124755124249 0.009399557488365 0.00930800335698482 0.00134070204915543 0.00133584313241106 408960 406663 667 665 0 False 299 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 342 322 0.00965582669869002 0.0967821246868602 0.00958266575112535 0.0932326237888151 0.00148550959093491 0.0263255124560944 422074 4217840 667 665 0 True 344 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 386 322 0.00963706748136575 0.0445592580673474 0.00955214770733196 0.0445105668726635 0.0015276112853805 0.00546227425889498 421254 1941927 667 665 0 True 389 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 431 322 0.0094951608654359 0.0725058010097342 0.00950637064164187 0.0718699931334401 0.00160801180466174 0.0142017317807201 415051 3159859 667 665 0 True 433 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 475 320 0.00941973508553574 0.0364328307608114 0.00944533455405508 0.0377813382162203 0.0016160938799772 0.00556518183980358 411754 1587771 667 665 0 True 478 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 520 321 0.00948081692731112 0.0377495581480595 0.00949111161974517 0.0395361257343404 0.00166873173872132 0.00676189978712603 414424 1645155 667 665 0 True 522 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 563 320 0.00931495799365138 0.0446923672192612 0.00926222629129473 0.0459449149309529 0.00181490467957219 0.0069936701466903 407174 1947728 667 665 0 True 567 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 612 319 0.00899708076838212 0.0090483475798675 0.00900282291905089 0.00903334096284428 0.00198393138890541 0.00215094411639946 393279 394334 667 665 0 False 612 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 656 319 0.00907543481635241 0.00892510516391689 0.00904859998474098 0.0089570458533608 0.00196714303860083 0.00179843715813981 396704 388963 667 665 0 False 656 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 255 366 0.0095038541612691 0.0493005000484732 0.00958266575112535 0.0479896238651102 0.0016213831619681 0.00952679394729811 415431 2148554 667 665 0 True 255 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 299 367 0.00959501938204622 0.0580480039650511 0.00958266575112535 0.0596169985503929 0.00147405328450667 0.0142256470603703 419416 2529777 667 665 0 True 299 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 344 363 0.00987643051900463 0.0302277322970966 0.00988784618905928 0.0336156252384222 0.00148730652074136 0.0128493736392859 431717 1317348 667 665 0 False 344 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 387 366 0.00957115857269351 0.0318183648638649 0.00959792477302205 0.0322270542458228 0.00141155163998486 0.00390650781445127 418373 1386669 667 665 0 True 389 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 431 366 0.00982918931927948 0.0627971393349476 0.00990310521095598 0.061173418783856 0.00166339255166119 0.00925583836099019 429652 2736748 667 665 0 True 433 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 475 364 0.00999447632558177 0.0304102439665196 0.00997940032043946 0.0309910734721904 0.0018418813642662 0.00446017726024532 436877 1325302 667 665 0 True 478 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 520 364 0.00974397214301982 0.0264904192272854 0.00988784618905928 0.0266727702754253 0.00180862288010121 0.00324153600087301 425927 1154473 667 665 0 True 523 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 563 364 0.00960856262187057 0.0455796850790285 0.00959792477302205 0.0460822461280232 0.00182899455270896 0.00789390117410453 420008 1986398 667 665 0 True 567 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 608 364 0.00971743471363426 0.0541730843473986 0.00973525597009232 0.0545815213244831 0.00203814746440345 0.0101402761647752 424767 2360905 667 665 0 True 612 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 652 364 0.00921891995178881 0.0620910940661335 0.00924696726939803 0.060517280842298 0.00210277856751004 0.0167487583309222 402976 2705978 667 665 0 True 657 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 255 410 0.00957626016472194 0.0416740867962995 0.00961318379491875 0.0436102845807584 0.00158900493935402 0.00883219406800777 418596 1816189 667 665 0 True 255 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 298 410 0.0101029137525538 0.0328807140304412 0.0101319905394064 0.0314183260852979 0.00154972854589004 0.00702303085842544 441617 1432967 667 665 0 True 300 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 343 410 0.0104020317604988 0.0753591463208261 0.010452429999237 0.0725719081406882 0.001456235652928 0.013956159803666 454692 3284210 667 665 0 True 344 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 387 410 0.0102986959255552 0.0590104696394224 0.0102998397802701 0.0586709391927977 0.00149745731712222 0.0113596355397993 450175 2571722 667 665 0 True 389 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 431 409 0.0104356610891167 0.0411971333690142 0.0105134660868238 0.0424048218509194 0.00171881005696123 0.00668041619783622 456162 1795403 667 665 0 True 433 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 476 409 0.0105651911970314 0.0508794531533687 0.0105745021744106 0.0510261692225528 0.00172201528026916 0.00863259121425712 461824 2217366 667 665 0 True 478 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 520 408 0.0106125696593223 0.0410378888397464 0.0106202792401007 0.0408789196612497 0.00176858621448649 0.00529058111844793 463895 1788463 667 665 0 True 523 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 564 408 0.0102515004800186 0.0526124879605744 0.0103303578240635 0.0518348973830777 0.00178806902855337 0.0072308033897294 448112 2292893 667 665 0 True 567 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 608 408 0.00987073412252445 0.0405983142796336 0.00985732814526589 0.041214618142977 0.00201720296949079 0.0052096397273989 431468 1769306 667 665 0 True 612 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 652 408 0.00968682516146367 0.081412824806351 0.00976577401388571 0.078965438315404 0.0019710091804913 0.0124543889258884 423429 3548034 667 665 0 True 657 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 254 454 0.00981189423599027 0.0400232441942577 0.0097962920576791 0.0404058899824521 0.00155622045680787 0.0060144448086216 428896 1744244 667 665 0 True 255 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 299 454 0.00983513736379693 0.0482093996722179 0.00990310521095598 0.0472724498359655 0.00154606522954414 0.00783572155443999 429912 2101003 667 665 0 True 300 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 343 454 0.0101801696999978 0.032951295611425 0.0102082856488899 0.0333104448004883 0.00151073622970764 0.00375272107685346 444994 1436043 667 665 0 True 344 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 387 453 0.010419784385674 0.0480132581396269 0.010406652933547 0.0482185091935607 0.00155090268464248 0.00670666084715028 455468 2092455 667 665 0 True 389 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 432 454 0.0105993695759124 0.0879236314636442 0.0106507972838941 0.0869459067673762 0.001959676890477 0.01255446210525 463318 3831780 667 665 0 True 434 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 476 452 0.010433533519347 0.0579186579403418 0.0104829480430304 0.058304722667277 0.00193832374221395 0.0119927466764246 456069 2524140 667 665 0 True 478 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 520 451 0.0104481748596976 0.0484899591620388 0.0104982070649271 0.0484931715877012 0.00172213381316154 0.00666880319388293 456709 2113230 667 665 0 True 523 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 564 452 0.0102572426306874 0.0315186684954547 0.0102693217364767 0.0315709163042649 0.00184414120980487 0.00362353817991456 448363 1373608 667 665 0 True 568 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 608 452 0.00968876971447899 0.0379016665031771 0.00975051499198901 0.0380712596322576 0.00191616049049987 0.00383041489999044 423514 1651784 667 665 0 True 612 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 652 452 0.00966085965943556 0.0691096934370717 0.00973525597009232 0.0679789425497826 0.00190362730084437 0.0118424042135617 422294 3011854 667 665 0 True 657 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 256 498 0.00955230784699205 0.0487645527184865 0.00952162966353857 0.0488899061570153 0.00146408079337958 0.00983059352665765 417549 2125197 667 665 0 True 255 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 300 498 0.00994567948344436 0.0498066406574918 0.00993362325474937 0.0493018997482261 0.00153556537379814 0.00452433240609499 434744 2170612 667 665 0 True 300 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 345 498 0.0100671797312605 0.0642504407046456 0.0100556954299229 0.0609140154116121 0.0015485303111579 0.0136673408165364 440055 2800084 667 665 0 True 344 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 389 498 0.0103258510364868 0.0805716511466352 0.0103303578240635 0.0773327229724575 0.00170757807447344 0.0135543026934415 451362 3511375 667 665 0 True 389 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 433 498 0.0104773660320218 0.0895827345888181 0.0104219119554437 0.0866407263294423 0.00191334716357414 0.0237320725362222 457985 3904085 667 665 0 True 434 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 478 496 0.0101514589466539 0.042510923681371 0.0102388036926833 0.0427100022888533 0.00189176327889344 0.00587068513041233 443739 1852659 667 665 0 True 478 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 521 496 0.0101220390033868 0.0373349487245236 0.010101472495613 0.0380407415884642 0.00181430157418158 0.00436871728497408 442453 1627086 667 665 0 True 523 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 566 496 0.00984426532442179 0.0932488694843082 0.00988784618905928 0.0912184328984512 0.0018840263662851 0.0122716962654291 430311 4063858 667 665 0 True 568 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 609 496 0.00964420513478669 0.0569010532740641 0.00956740672922866 0.0594186312657359 0.00181327056066521 0.0109593466862924 421566 2479792 667 665 0 True 612 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 654 496 0.00969421446292189 0.0696451130114139 0.00976577401388571 0.0679942015716793 0.00189875239888644 0.00989256029434114 423752 3035188 667 665 0 True 657 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 257 542 0.00933714877512034 0.046164048252928 0.00935378042267491 0.0478675516899367 0.00149119370414977 0.0079061645870164 408144 2011865 667 665 0 True 255 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 301 541 0.00985588688832512 0.124958837927963 0.00990310521095598 0.118394750896468 0.00156067080797254 0.0397924003925538 430819 5445803 667 665 0 True 300 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 344 541 0.0102046024367079 0.0546270918770949 0.0102693217364767 0.0557869840543221 0.00151515490346741 0.0101335628140433 446062 2380691 667 665 0 True 345 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 389 541 0.0103724288004773 0.0563339913069467 0.0103913939116503 0.0556038757915618 0.00157948667859685 0.00672411078086865 453398 2455079 667 665 0 True 389 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 433 540 0.0104663621496645 0.0537240560774791 0.010406652933547 0.0533913176165408 0.00195458846992946 0.00566270567395834 457504 2341336 667 665 0 True 434 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 477 539 0.0102103217102824 0.0611058890072515 0.0101625085831998 0.0599679560540169 0.0021235269337949 0.00956642625541248 446312 2663042 667 665 0 True 478 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 522 538 0.00999266903513224 0.0718291723816293 0.00999465934233616 0.069413290608072 0.00190245066156149 0.0147952323933634 436798 3130371 667 665 0 True 523 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 566 539 0.00977831066156096 0.0573146530781061 0.00970473792629892 0.0564736400396735 0.00175924535287695 0.0161371358895388 427428 2497817 667 665 0 True 568 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 610 537 0.00979825948778872 0.0478483459736547 0.0097962920576791 0.0464026855878538 0.00175950677538528 0.00666370307396169 428300 2085268 667 665 0 True 612 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 654 537 0.00961958938132216 0.0588881221134778 0.00959792477302205 0.059311818112459 0.00199862828372875 0.00926940171961108 420490 2566390 667 665 0 True 657 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 257 582 0.00929381955852012 0.0420154299688337 0.00932326237888151 0.0429541466392004 0.00135794610190928 0.00700770865281094 406250 1831065 667 665 0 True 255 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 301 582 0.00959675804121286 0.0532923060684442 0.00970473792629892 0.0527199206530861 0.00155050953465859 0.0101748809865319 419492 2322520 667 665 0 True 300 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 345 582 0.00982337853732781 0.0440501574375398 0.0098268101014725 0.0437628747997253 0.00145296555267049 0.00607862948254378 429398 1919740 667 665 0 True 345 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 389 582 0.00996983769502294 0.0487740293741908 0.00988784618905928 0.0483863584344244 0.00154334352803923 0.00569123858932903 435800 2125610 667 665 0 True 389 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 433 581 0.0102125407884293 0.0883562534167876 0.0102388036926833 0.0862439917601282 0.00195921427926503 0.0151931588788598 446409 3850634 667 665 0 True 434 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 477 579 0.010098018054374 0.0603504182750307 0.0101777676050965 0.0599069199664302 0.00197927564259132 0.00896764674581772 441403 2630118 667 665 0 True 479 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 522 579 0.00989971940099989 0.052659963022686 0.00985732814526589 0.0524605172808423 0.00200460642838533 0.00611727053414851 432735 2294962 667 665 0 True 523 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 566 579 0.00939049815902303 0.0366119234914937 0.00944533455405508 0.0376440070191501 0.00182831955342165 0.0065178082395856 410476 1595576 667 665 0 True 568 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 610 578 0.00949689952460254 0.0464215930074672 0.00950637064164187 0.0467231250476844 0.00160950349333524 0.00598604354906981 415127 2023089 667 665 0 True 613 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 654 578 0.00961672974453492 0.050402798022752 0.00961318379491875 0.0494239719233997 0.00166882948814394 0.0061415369212921 420365 2196593 667 665 0 True 657 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 256 624 0.00897299118808643 0.00900158384058108 0.00904859998474098 0.00904859998474098 0.0014592926299709 0.00142721852876495 392226 392296 667 665 0 False 256 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 300 624 0.00935437522712665 0.00896590296983016 0.00932326237888151 0.00898756389715419 0.00143067974520537 0.00141581299054021 408897 390741 667 665 0 False 300 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 345 624 0.00969059988202282 0.0694016340920968 0.00968947890440223 0.0684061951628901 0.00144158468941376 0.00960691220027228 423594 3024577 667 665 0 True 345 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 389 623 0.00956143580761691 0.07313883243242 0.00949111161974517 0.0688334477759976 0.00137250987773578 0.0160246884669063 417948 3187447 667 665 0 True 389 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 434 624 0.00968611597154044 0.00952062004404465 0.00970473792629892 0.00961318379491875 0.00179223751217199 0.0018069947824683 423398 414916 667 665 0 False 434 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 479 624 0.00954757228847238 0.00964234803075439 0.00962844281681544 0.00956740672922866 0.00193426943346573 0.00179344034994796 417342 420221 667 665 0 False 479 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 523 623 0.0093038854800112 0.00929370806278686 0.00930800335698482 0.00912489509422446 0.00192670488873108 0.00209227353730892 406690 405027 667 665 0 False 523 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 568 623 0.00912297341830344 0.00917856554868517 0.00917067215991455 0.00920119020370794 0.00171853869547304 0.00178172309896478 398782 400009 667 665 0 False 568 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 613 623 0.00931074860830057 0.00934155025925996 0.00921644922560464 0.00929274433508812 0.00147295209568019 0.00144016668660141 406990 407112 667 665 0 False 613 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 657 623 0.00926067064888247 0.00911523487133948 0.00923170824750134 0.00907911802853437 0.00151301798480191 0.00145748743934664 404801 397249 667 665 0 False 657 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 256 674 0.0090766015481616 0.037333250728102 0.00900282291905089 0.0384985122453651 0.00131974922671491 0.00923396302677622 396755 1627012 667 665 0 True 256 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 300 668 0.00900527076814076 0.00905637864402365 0.00901808194094758 0.00906385900663768 0.00127486389341495 0.00127957833682892 393637 394684 667 665 0 False 300 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 345 667 0.00925584358198562 0.00894977200382508 0.00921644922560464 0.0089417868314641 0.00135106481961021 0.00123229670001022 404590 390038 667 665 0 False 345 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 390 667 0.00922756749343342 0.00907333566234194 0.00924696726939803 0.00898756389715419 0.00135107122552616 0.00127749599801731 403354 395423 667 665 0 False 390 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 434 667 0.00934716894242281 0.0093744776223002 0.00941481651026169 0.0093842984664683 0.00151177190181712 0.00147148068427992 408582 408547 667 665 0 False 434 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 479 667 0.00931180095463827 0.0108767455374532 0.00930800335698482 0.00956740672922866 0.00162058515679099 0.00778738254129232 407036 474017 667 665 0 False 479 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 524 667 0.00914228168589086 0.00915754710649363 0.00926222629129473 0.00923170824750134 0.00176751879161318 0.0016822377975429 399626 399093 667 665 0 False 524 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 568 667 0.00923996687854288 0.00909547845351534 0.00929274433508812 0.00910963607232776 0.00157863876365796 0.00159499176822068 403896 396388 667 665 0 False 568 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 613 667 0.00917890791386179 0.0092430664668079 0.00914015411612116 0.00924696726939803 0.00130083262431177 0.00142088995358673 401227 402820 667 665 0 False 613 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 654 673 0.00906621534735036 0.0397987185863491 0.00909437705043107 0.0398565651941711 0.00140743711333607 0.00780228066522299 396301 1734459 667 665 0 True 657 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F9_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F9_2.csv new file mode 100755 index 0000000..f60c3b8 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F9_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 255 277 0.00775661608426732 0.72156587394327 0.00756847486076143 0.717753871976806 0.00201332773950501 0.182668647764959 339056 31446400 667 665 11 True 255 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 299 276 0.0065261486903607 0.00604179251057376 0.00646982528419928 0.005981536583505 0.00140686471030403 0.00121357934813298 285270 263306 667 665 0 False 299 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 343 279 0.00592095803780417 0.00605709742426563 0.00593575951781491 0.00599679560540169 0.0012272516256061 0.00135903198098007 258816 263973 667 665 0 True 344 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 388 278 0.00606583867599274 0.00606703299792168 0.00601205462729839 0.00607309071488518 0.00125707385071607 0.00129101954156298 265149 264406 667 665 0 True 388 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 432 279 0.00619509425877585 0.00663971670994837 0.00617990386816205 0.00631723506523232 0.00149389884664804 0.0034623866664436 270799 289364 667 665 0 True 433 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 476 278 0.00639222618034082 0.00639612306114336 0.0063782711528191 0.0063935301747158 0.00161925075982911 0.00162699079224959 279416 278748 667 665 0 True 478 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 520 275 0.00663856673174056 0.00660458654073958 0.00660715648126955 0.00662241550316625 0.00155033139563074 0.0016580684490506 290184 287833 667 665 0 True 522 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 564 276 0.00678870910161765 0.00677592355803677 0.0068055237659266 0.00679026474402991 0.00157685606378345 0.00152597327371455 296747 295300 667 665 0 True 567 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 612 275 0.00826249727047669 0.00734908913391283 0.00778210116731518 0.00743114366369116 0.00409701669750217 0.00193483571212884 361169 320279 667 665 0 False 612 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 652 276 0.00884256887349413 0.738200708913506 0.00874341954680705 0.725154497596704 0.00208377170650821 0.173895011976224 386525 32171359 667 665 12 True 656 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 255 320 0.00638426495152515 0.00600663939546738 0.00636301213092241 0.00599679560540169 0.001560257630715 0.0013686670359419 279068 261774 667 665 0 False 255 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 299 320 0.00608247032354731 0.00602240322711104 0.005981536583505 0.00605783169298848 0.00129147238384797 0.00125096653235401 265876 262461 667 665 0 False 299 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 342 322 0.006238034564773 0.0061355035563273 0.00608834973678187 0.00608834973678187 0.00207769916008687 0.00129930775227649 272676 267390 667 665 0 True 344 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 386 322 0.00660125419094069 0.00636452656016328 0.0063935301747158 0.0063935301747158 0.00258891525206184 0.00125783801521207 288553 277371 667 665 0 True 389 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 431 322 0.00649009438974722 0.00662179596393134 0.00648508430609598 0.00668345159075303 0.0015903144569916 0.00165118407946925 283694 288583 667 665 0 True 433 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 475 320 0.00674284052755037 0.00663058424270794 0.00679026474402991 0.00668345159075303 0.00165792995740598 0.00159481382495046 294742 288966 667 665 0 True 478 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 520 321 0.00666343413324237 0.0067349192390452 0.00675974670023652 0.00668345159075303 0.00157615636001058 0.00159507946141409 291271 293513 667 665 0 True 522 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 563 320 0.00680723954799895 0.00699092661844586 0.00694285496299687 0.00700389105058366 0.00170122805988869 0.00141673994420121 297557 304670 667 665 0 True 567 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 612 319 0.00722710285964823 0.00703943424594904 0.00727855344472419 0.00711070420386053 0.00198408897159437 0.00197471013039787 315910 306784 667 665 0 False 612 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 656 319 0.00737978458699238 0.00714349389151524 0.00738536659800107 0.00714122224765393 0.00211119388877391 0.00186825496253392 322584 311319 667 665 0 False 656 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 255 366 0.00605172350881094 0.00607556887182479 0.00599679560540169 0.00599679560540169 0.00148377354747416 0.00152850736090242 264532 264778 667 665 0 True 255 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 299 367 0.00625903573733847 0.00654341277776726 0.00630197604333562 0.00660715648126955 0.00133308558326354 0.00154359519668854 273594 285167 667 665 0 True 299 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 344 363 0.00646875006076728 0.00634334749668862 0.00648508430609598 0.00631723506523232 0.0013827622255398 0.00133753927798112 282761 276448 667 665 0 False 344 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 387 366 0.00673252295802202 0.0068353993245875 0.00666819256885634 0.00679026474402991 0.00132534872521326 0.00139274061095573 294291 297892 667 665 0 True 389 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 431 366 0.00707638856241369 0.00696701699315811 0.00711070420386053 0.00695811398489357 0.00160303892103938 0.00164010356996633 309322 303628 667 665 0 True 433 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 475 364 0.00709462160656911 0.00699790217131292 0.00714122224765393 0.00703440909437705 0.00180648873535853 0.00174343181959885 310119 304974 667 665 0 True 478 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 520 364 0.00690590845570577 0.0068684184712181 0.00688181887541009 0.00691233691920348 0.00168818000239131 0.00175306314802886 301870 299331 667 665 0 True 523 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 563 364 0.006959989906626 0.00685639482088145 0.00714122224765393 0.00689707789730678 0.0018538388987336 0.00178357896886656 304234 298807 667 665 0 True 567 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 608 364 0.00688881926626524 0.00709693666530712 0.00697337300679027 0.00706492713817044 0.00200245747395707 0.00206964789792809 301123 309290 667 665 0 True 612 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 652 364 0.00655078732091954 0.0064002074309142 0.00653086137178607 0.0064087891966125 0.00183758548636391 0.00183590902283244 286347 278926 667 665 0 True 657 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 255 410 0.00638884037038473 0.00621062842503374 0.00642404821850919 0.00619516289005875 0.00151467559226195 0.00149394030151694 279268 270664 667 665 0 True 255 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 298 410 0.00692855677906069 0.00708766652268116 0.00697337300679027 0.00701915007248035 0.00149460417849655 0.00147177923387359 302860 308886 667 665 0 True 300 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 343 410 0.00720150339112888 0.00739174555753081 0.0072327763790341 0.00741588464179446 0.00136534253505646 0.00137690109052806 314791 322138 667 665 0 True 344 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 387 410 0.00735658721337432 0.00742306670773982 0.00738536659800107 0.00738536659800107 0.00151285488911551 0.00153513404292646 321570 323503 667 665 0 True 389 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 431 409 0.00745157290889918 0.00741473734691501 0.00743114366369116 0.00746166170748455 0.00160900005969666 0.001632910182801 325722 323140 667 665 0 True 433 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 476 409 0.00771285220287544 0.00770566838244616 0.00782787823300526 0.00775158312352178 0.00174824707947814 0.00166382008205634 337143 335819 667 665 0 True 478 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 520 408 0.00794132574362853 0.00727249572776069 0.00802624551766232 0.0072632944228275 0.00176658851512761 0.00173796840088369 347130 316941 667 665 0 True 523 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 564 408 0.00724661702108433 0.00736678042095396 0.00733958953231098 0.00733958953231098 0.00179972551985514 0.00163337339126307 316763 321050 667 665 0 True 567 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 608 408 0.00683913021745021 0.00682158589423892 0.00683604180972 0.00691233691920348 0.00193355459908185 0.00196635848526747 298951 297290 667 665 0 True 612 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 652 408 0.00635495939372955 0.00626758014284969 0.00645456626230259 0.00622568093385214 0.00187978913808505 0.00190115540364567 277787 273146 667 665 0 True 657 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 254 454 0.0064315519054389 0.0066655537906336 0.00648508430609598 0.00671396963454643 0.00157544543277961 0.00159648035791915 281135 290490 667 665 0 True 255 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 299 454 0.00657306961076569 0.00664100168021335 0.00654612039368277 0.00666819256885634 0.00149657579111881 0.0014901986758148 287321 289420 667 665 0 True 300 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 343 454 0.0069523032029419 0.00684485303439418 0.00703440909437705 0.00691233691920348 0.00152267279027106 0.00153663550399373 303898 298304 667 665 0 True 344 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 387 453 0.00729969187985545 0.00716570552038141 0.00729381246662089 0.00712596322575723 0.0015556350343765 0.00143725131397779 319083 312287 667 665 0 True 389 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 432 454 0.00738763143033656 0.00743570989731137 0.00735484855420768 0.00743114366369116 0.00186106019714193 0.00189431834140548 322927 324054 667 665 0 True 434 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 476 452 0.00759498941305269 0.00740796830712625 0.00762951094834821 0.00738536659800107 0.00181987890468682 0.00191541070274866 331991 322845 667 665 0 True 478 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 520 451 0.00711841378463892 0.00734642740979251 0.00701915007248035 0.0072632944228275 0.00172960168794402 0.00179276401623176 311159 320163 667 665 0 True 523 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 564 452 0.0066708005576063 0.00657067250410301 0.00672922865644312 0.00654612039368277 0.00181495921443761 0.00185357736474454 291593 286355 667 665 0 True 568 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 608 452 0.00622840330807359 0.00611882188878009 0.00619516289005875 0.00614938582436866 0.00178113831555141 0.00184550089807708 272255 266663 667 665 0 True 612 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 652 452 0.00606782898319666 0.00603649200823069 0.00602731364919509 0.00602731364919509 0.00182741888357365 0.00206386340961162 265236 263075 667 665 0 True 657 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 256 498 0.00647575045162244 0.0065441699923877 0.00650034332799268 0.00646982528419928 0.00146739451136626 0.00143695908957031 283067 285200 667 665 0 True 255 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 300 498 0.00672314334935988 0.0068320721694371 0.00674448767833982 0.00691233691920348 0.0016313120660446 0.00150556463009344 293881 297747 667 665 0 True 300 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 345 498 0.00667361444020494 0.00674845731862272 0.00659189745937285 0.00672922865644312 0.00157725269336598 0.00150074807956203 291716 294103 667 665 0 True 344 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 389 498 0.00715824280581156 0.00684561024901462 0.00712596322575723 0.00688181887541009 0.00150920412675647 0.00160174033885781 312900 298337 667 665 0 True 389 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 433 498 0.00704571037896021 0.00710563316049336 0.00703440909437705 0.00717174029144732 0.00186813898864529 0.00200209314862094 307981 309669 667 665 0 True 434 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 478 496 0.00694111630383023 0.00700584145187872 0.00700389105058366 0.00688181887541009 0.00188765512343533 0.00215021321458018 303409 305320 667 665 0 True 478 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 521 496 0.00643569265950682 0.00622269796716557 0.00633249408712902 0.00628671702143893 0.00173060446646996 0.00166010681527286 281316 271190 667 665 0 True 523 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 566 496 0.00608057152472059 0.00638754129544507 0.00611886778057527 0.0063782711528191 0.00184866095929734 0.00182249588825544 265793 278374 667 665 0 True 568 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 609 496 0.00606856105021419 0.00617104675169269 0.00604257267109178 0.00624093995574884 0.00178104653723372 0.00181848328035618 265268 268939 667 665 0 True 612 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 654 496 0.0060586552683832 0.00631159037442542 0.00613412680247196 0.00630197604333562 0.0018007127027324 0.00186371472528786 264835 275064 667 665 0 True 657 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 257 542 0.0062924591721077 0.00656846969793447 0.00628671702143893 0.00654612039368277 0.00136198129786622 0.00151154525391351 275055 286259 667 665 0 True 255 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 301 541 0.00645166087132675 0.00670564027372161 0.00646982528419928 0.00669871061264973 0.00145007271303734 0.00142363661553137 282014 292237 667 665 0 True 300 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 344 541 0.00675743611371243 0.00668888976848163 0.0068055237659266 0.00668345159075303 0.00137627361128685 0.00142985418447968 295380 291507 667 665 0 True 345 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 389 541 0.00684352261955541 0.00686793660736873 0.00688181887541009 0.00691233691920348 0.00151912658613919 0.00145484926376419 299143 299310 667 665 0 True 389 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 433 540 0.00655749030954882 0.00668629688205407 0.00643930724040589 0.00669871061264973 0.00195833626470072 0.00208271751686318 286640 291394 667 665 0 True 434 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 477 539 0.00672085563993009 0.00698273493300658 0.0068207827878233 0.00704966811627375 0.00194751650140387 0.00200426612500115 293781 304313 667 665 0 True 478 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 522 538 0.00646369422292745 0.00647634191911456 0.00643930724040589 0.00648508430609598 0.00189397254142807 0.00182538209238742 282540 282244 667 665 0 True 523 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 566 539 0.00610569057425968 0.00818436569794823 0.00610360875867857 0.00643930724040589 0.0016535647490118 0.0104784181162497 266891 356681 667 665 0 True 568 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 610 537 0.00609397750197915 0.00623194516389394 0.00608834973678187 0.00625619897764553 0.00171638641778359 0.00154842475170125 266379 271593 667 665 0 True 612 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 654 537 0.00630865615487061 0.00614855977205545 0.00645456626230259 0.00611886778057527 0.00179922365815001 0.00187935922977798 275763 267959 667 665 0 True 657 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 257 582 0.00651999475199457 0.00652943872613555 0.00656137941557946 0.00648508430609598 0.00133331335392891 0.00117243183985812 285001 284558 667 665 0 True 255 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 301 582 0.00669651441159713 0.00673106432825024 0.00662241550316625 0.00671396963454643 0.00150086834845394 0.00138363305255447 292717 293345 667 665 0 True 300 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 345 582 0.00671474745575255 0.00677287175365743 0.00672922865644312 0.00674448767833982 0.00138758658505346 0.00144553062473776 293514 295167 667 665 0 True 345 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 389 582 0.00657686720841914 0.00656709294407913 0.00656137941557946 0.00653086137178607 0.00137649225238577 0.00129030153770727 287487 286199 667 665 0 True 389 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 433 581 0.0065740304487262 0.006579047756723 0.00651560234988937 0.00659189745937285 0.00180055455234526 0.00195570590556919 287363 286720 667 665 0 True 434 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 477 579 0.0064533766533991 0.00652936988844278 0.0064087891966125 0.00659189745937285 0.00199571784228349 0.00178356589053067 282089 284555 667 665 0 True 479 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 522 579 0.0063076038085329 0.0061971362372514 0.00624093995574884 0.00617990386816205 0.00202924592358901 0.00188966106405716 275717 270076 667 665 0 True 523 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 566 579 0.00630046615511196 0.00643019771906305 0.00627145799954223 0.00634775310902571 0.00173163035704696 0.00175450027123086 275405 280233 667 665 0 True 568 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 610 578 0.00622970730244857 0.0063590654365371 0.00616464484626535 0.0063782711528191 0.00150131059075581 0.00152661214414196 272312 277133 667 665 0 True 613 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 654 578 0.00627566738489304 0.00615755456391035 0.00630197604333562 0.00617990386816205 0.00166619074305904 0.0015221923096724 274321 268351 667 665 0 True 657 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 256 624 0.00651406958457141 0.00681300412854062 0.00648508430609598 0.00679026474402991 0.0012845771008851 0.00135461278972446 284742 296916 667 665 0 False 256 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 300 624 0.00656810528130304 0.00638474189593921 0.00654612039368277 0.00634775310902571 0.00139482690978587 0.00131880381846004 287104 278252 667 665 0 False 300 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 345 624 0.00646952788197341 0.00643361665780381 0.00650034332799268 0.00642404821850919 0.00138634431515924 0.001405140251401 282795 280382 667 665 0 True 345 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 389 623 0.00639149411332329 0.00634750070415223 0.00636301213092241 0.00631723506523232 0.00133908207359652 0.00126215040583806 279384 276629 667 665 0 True 389 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 434 624 0.00630193028914703 0.0060826591541798 0.00624093995574884 0.00605783169298848 0.00160511930709144 0.00178736837453925 275469 265087 667 665 0 False 434 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 479 624 0.00647904475320133 0.00632487604912946 0.00648508430609598 0.00627145799954223 0.00190843075434456 0.00190280613956587 283211 275643 667 665 0 False 479 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 523 623 0.00620451962162659 0.00636264499656098 0.00628671702143893 0.0063782711528191 0.00190380567573595 0.00184353410540085 271211 277289 667 665 0 False 523 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 568 623 0.00632752975766637 0.00639297947317366 0.00631723506523232 0.00633249408712902 0.00166224343761799 0.00168442648501336 276588 278611 667 665 0 False 568 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 613 623 0.00631570229991436 0.00635826233012148 0.00633249408712902 0.0063935301747158 0.00142496211037216 0.00129524849298727 276071 277098 667 665 0 False 613 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 657 623 0.00639128821947461 0.00615700386236821 0.00633249408712902 0.00616464484626535 0.0015413492680642 0.00148244548320835 279375 268327 667 665 0 False 657 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 256 674 0.0086080786569407 0.700784049847668 0.00793469138628214 0.706218051422904 0.0030217691222171 0.22424524289183 376275 30540712 667 665 12 True 256 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 300 668 0.00698096820209717 0.00666238725676632 0.00671396963454643 0.00665293354695964 0.00182339549194579 0.00127034370999648 305151 290352 667 665 0 False 300 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 345 667 0.00617002096342536 0.00608968059884204 0.00614938582436866 0.00611886778057527 0.00134407134347844 0.00133613103127656 269703 265393 667 665 0 False 345 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 390 667 0.00602669596764904 0.00611916607724392 0.00607309071488518 0.00616464484626535 0.00135144091167153 0.00128191254350185 263438 266678 667 665 0 False 390 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 434 667 0.00611452113265866 0.00611994623776195 0.00621042191195544 0.00608834973678187 0.00151090875870512 0.00149211355089438 267277 266712 667 665 0 False 434 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 479 667 0.00616581157807455 0.00667532874300652 0.00608834973678187 0.00633249408712902 0.00169413927658223 0.00291262879097161 269519 290916 667 665 0 False 479 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 524 667 0.00618072744355678 0.00618171659407158 0.00616464484626535 0.00614938582436866 0.0016900161873037 0.00166484204406408 270171 269404 667 665 0 False 524 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 568 667 0.00614924856180287 0.00623485929288775 0.00610360875867857 0.00624093995574884 0.00150751720389705 0.00138855591359521 268795 271720 667 665 0 False 568 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 613 667 0.00693647225368776 0.00660667461742018 0.00666819256885634 0.00659189745937285 0.00194106763385229 0.00143427388947511 303206 287924 667 665 0 False 613 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 654 673 0.00771928066637315 0.748888540876109 0.00764476997024491 0.735790035858702 0.00177028228446571 0.176037598035902 337424 32637143 667 665 14 True 657 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F9_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F9_3.csv new file mode 100755 index 0000000..44275d4 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_F9_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 255 277 0.000922678967222729 0.0739058908429233 0.000717174029144732 0.0719920653086137 0.000779809210317584 0.0215116558464164 40332 3220876 667 665 0 True 255 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 299 276 0.000847459081171248 0.00078422194189984 0.000686655985351339 0.000671396963454643 0.000686079437552853 0.000616588963759615 37044 34177 667 665 0 False 299 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 343 279 0.000899275699755982 0.000872058837870598 0.000762951094834821 0.000732433051041428 0.000676359357279428 0.000679106061685522 39309 38005 667 665 0 True 344 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 388 278 0.000886601789514947 0.000991400451231076 0.000747692072938125 0.000900282291905089 0.000700456285749087 0.000693009997045629 38755 43206 667 665 0 True 388 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 432 279 0.000849540896752356 0.000886216456683021 0.000610360875867857 0.000610360875867857 0.000825121021845628 0.000865544634653754 37135 38622 667 665 0 True 433 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 476 278 0.000828127936489526 0.000867423766557616 0.000595101853971161 0.000549324788281071 0.000850486131292399 0.000917786180174682 36199 37803 667 665 0 True 478 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 520 275 0.00091798916289166 0.000949271783257641 0.000717174029144732 0.000701915007248035 0.000808280602822158 0.000882561971239994 40127 41370 667 665 0 True 522 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 564 276 0.000936611117650147 0.000975590727792243 0.000686655985351339 0.000717174029144732 0.000875710085239868 0.00088434733819547 40941 42517 667 665 0 True 567 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 612 275 0.0010947147163429 0.0009221956241026 0.000671396963454643 0.000625619897764553 0.00115296101813089 0.000919804208892845 47852 40190 667 665 0 False 612 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 652 276 0.00115840454686825 0.0762299890261245 0.000869764248111696 0.073990997177081 0.00107251222251066 0.0214530320292474 50636 3322162 667 665 0 True 656 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 255 320 0.000827739025886462 0.000833693297101761 0.000686655985351339 0.000686655985351339 0.000697113711611119 0.000680116093328856 36182 36333 667 665 0 False 255 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 299 320 0.000839795254581453 0.00072655890125864 0.000686655985351339 0.000610360875867857 0.00068738871286309 0.000591958332709823 36709 31664 667 665 0 False 299 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 342 322 0.000875986817760724 0.00076694368101531 0.000747692072938125 0.000625619897764553 0.000663179837330979 0.000634891152895292 38291 33424 667 665 0 True 344 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 386 322 0.000900167906433599 0.00102446548965685 0.000747692072938125 0.000915541313801785 0.000693195644083106 0.000752959567454619 39348 44647 667 665 0 True 389 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 431 322 0.000965138854239623 0.00096120365000393 0.000701915007248035 0.00064087891966125 0.000880256174136757 0.000943058857511706 42188 41890 667 665 0 True 433 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 475 320 0.000911697961959739 0.000938510157288392 0.000701915007248035 0.000732433051041428 0.000875087289568937 0.000859920962566609 39852 40901 667 665 0 True 478 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 520 321 0.00102720441106981 0.000884770865134913 0.000793469138628214 0.000701915007248035 0.000919951806565709 0.000853173083621965 44901 38559 667 665 0 True 522 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 563 320 0.000906024442573861 0.00083511594275228 0.000671396963454643 0.000656137941557946 0.000895176993230143 0.000690317129654221 39604 36395 667 665 0 True 567 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 612 319 0.000959808491268213 0.000974374595220025 0.000457770656900893 0.000503547722590982 0.00109878769934063 0.00109063712145224 41955 42464 667 665 0 False 612 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 656 319 0.00108078256591549 0.000932108251861056 0.000701915007248035 0.000564583810177768 0.00108731436471403 0.000939072086694307 47243 40622 667 665 0 False 656 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 255 366 0.000813669612893256 0.000879929280743631 0.000610360875867857 0.000686655985351339 0.000744360714943678 0.000775804026598942 35567 38348 667 665 0 True 255 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 299 367 0.000816872406094961 0.000826970149108179 0.000656137941557946 0.000671396963454643 0.000683795727078354 0.000669992819338747 35707 36040 667 665 0 True 299 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 344 363 0.000885572320271542 0.000828920550403245 0.000732433051041428 0.000686655985351339 0.000718037031729869 0.000688282831586329 38710 36125 667 665 0 False 344 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 387 366 0.000905772794536584 0.000858337191112365 0.000732433051041428 0.000686655985351339 0.000744556153727995 0.000668147224451484 39593 37407 667 665 0 True 389 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 431 366 0.000941392430358407 0.00101326789163341 0.000686655985351339 0.000671396963454643 0.000834485623484021 0.000966128840426526 41150 44159 667 665 0 True 433 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 475 364 0.000969210977024649 0.000888235695670855 0.000686655985351339 0.000579842832074464 0.000919781402108801 0.000889175150788257 42366 38710 667 665 0 True 478 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 520 364 0.000887105085589501 0.000899479185489473 0.000595101853971161 0.000610360875867857 0.00089031073776208 0.000871397942715935 38777 39200 667 665 0 True 523 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 563 364 0.000889690197245163 0.000944407252968769 0.000579842832074464 0.000595101853971161 0.000945898024753363 0.000957604021593647 38890 41158 667 665 0 True 567 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 608 364 0.000887036454306607 0.000924283700783201 0.000457770656900893 0.000473029678797589 0.00101327520524018 0.00110281476107854 38774 40281 667 665 0 True 612 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 652 364 0.000968936451893074 0.000936307351119846 0.000595101853971161 0.000549324788281071 0.00102124069335995 0.00102014900524378 42354 40805 667 665 0 True 657 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 255 410 0.000823346623781266 0.000835253618137814 0.000701915007248035 0.00064087891966125 0.000708965731386903 0.000793489982094617 35990 36401 667 665 0 True 255 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 298 410 0.000854482349120702 0.00091285664378387 0.000747692072938125 0.000747692072938125 0.000685013478650536 0.000732855615295407 37351 39783 667 665 0 True 300 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 343 410 0.000953425781959101 0.000952071182763501 0.000854505226215 0.000823987182421607 0.000695845370075893 0.000701709156337259 41676 41492 667 665 0 True 344 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 387 410 0.000953585921619186 0.000927427288752896 0.000778210116731518 0.00080872816052491 0.000745816066647247 0.000735082931814487 41683 40418 667 665 0 True 389 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 431 409 0.00103921488557621 0.000966205855678335 0.000823987182421607 0.000732433051041428 0.000889680046910529 0.000840309756125736 45426 42108 667 665 0 True 433 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 476 409 0.000900442431565174 0.000948009758890245 0.000595101853971161 0.000671396963454643 0.000893316981755665 0.000839079545345918 39360 41315 667 665 0 True 478 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 520 408 0.00106444832058679 0.000907464357850451 0.00080872816052491 0.000656137941557946 0.000959371335065229 0.000877581182721581 46529 39548 667 665 0 True 523 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 564 408 0.000964017876619026 0.000927840314909499 0.000625619897764553 0.000717174029144732 0.000988337822294877 0.000820637064692217 42139 40436 667 665 0 True 567 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 608 408 0.000974243937770186 0.000946587113239726 0.000503547722590982 0.000549324788281071 0.00105242472115833 0.00102248138161013 42586 41253 667 665 0 True 612 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 652 408 0.000945670446992114 0.000926715965927637 0.000579842832074464 0.00064087891966125 0.00102037959238468 0.000919168825467954 41337 40387 667 665 0 True 657 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 254 454 0.000865989527552543 0.000862536290371156 0.000717174029144732 0.000717174029144732 0.000779434017019839 0.000777507652852136 37854 37590 667 665 0 True 255 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 299 454 0.000876398605458086 0.00083605672455343 0.000701915007248035 0.000701915007248035 0.000802706094688838 0.000739826843082512 38309 36436 667 665 0 True 300 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 343 454 0.00098289147941479 0.000923618269753119 0.000823987182421607 0.000762951094834821 0.000776812639954977 0.000786424737021576 42964 40252 667 665 0 True 344 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 387 453 0.000900694079602451 0.000913545020711541 0.000747692072938125 0.000762951094834821 0.000778146981070351 0.000738636500428857 39371 39813 667 665 0 True 389 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 432 454 0.000973031451772397 0.000978596640376405 0.000671396963454643 0.000656137941557946 0.000953075973696409 0.00101674909539319 42533 42648 667 665 0 True 434 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 476 452 0.000842837908123073 0.000878391905605167 0.000488288700694286 0.000442511635004196 0.000921624341463637 0.00100355580069805 36842 38281 667 665 0 True 478 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 520 451 0.000906642124119904 0.00100851809083248 0.000610360875867857 0.000762951094834821 0.000906813688403556 0.000928846231762561 39631 43952 667 665 0 True 523 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 564 452 0.000908335029097948 0.000887547318743184 0.000534065766384375 0.000442511635004196 0.000965511581622387 0.00100610198963107 39705 38680 667 665 0 True 568 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 608 452 0.00090581854872518 0.000882338599990478 0.000534065766384375 0.000473029678797589 0.000905557879610106 0.000967809713421333 39595 38453 667 665 0 True 612 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 652 452 0.00091581583893336 0.000938923183444994 0.000534065766384375 0.000473029678797589 0.000956694580872434 0.00101627155677088 40032 40919 667 665 0 True 657 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 256 498 0.000838880170809537 0.00084491384102279 0.000686655985351339 0.000671396963454643 0.000757766830476643 0.000760033050764657 36669 36822 667 665 0 True 255 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 300 498 0.000829889472750464 0.000811183371566935 0.000625619897764553 0.000671396963454643 0.00079539863212349 0.000730075337865399 36276 35352 667 665 0 True 300 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 345 498 0.000844416427629628 0.000952346533534569 0.000686655985351339 0.000778210116731518 0.000759815849778189 0.000867880262395234 36911 41504 667 665 0 True 344 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 389 498 0.000962851144809834 0.000935894324963244 0.000717174029144732 0.000732433051041428 0.000863069462233406 0.000832940951675056 42088 40787 667 665 0 True 389 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 433 498 0.000957749552781403 0.000932108251861056 0.000518806744487678 0.000503547722590982 0.0010266447393711 0.00100798891572652 41865 40622 667 665 0 True 434 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 478 496 0.000879647152848387 0.000868318656563588 0.000503547722590982 0.000488288700694286 0.000916614422069347 0.000937739496077925 38451 37842 667 665 0 True 478 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 521 496 0.000912590168637357 0.000932291819041768 0.000595101853971161 0.000625619897764553 0.000911295019753573 0.000870068056425833 39891 40630 667 665 0 True 523 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 566 496 0.000864250868385903 0.000890392610044223 0.000534065766384375 0.000549324788281071 0.00093728476733472 0.000948384336163017 37778 38804 667 665 0 True 568 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 609 496 0.000875346259120383 0.00086033348420261 0.000549324788281071 0.000503547722590982 0.000882057044890641 0.000901039185137986 38263 37494 667 665 0 True 612 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 654 496 0.000929725112266481 0.00100314875079665 0.000595101853971161 0.000656137941557946 0.00094931846909869 0.00103577475601628 40640 43718 667 665 0 True 657 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 257 542 0.000849083354866398 0.000777636469291792 0.000671396963454643 0.000518806744487678 0.000711789327691916 0.00075723729481688 37115 33890 667 665 0 True 255 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 301 541 0.000861665756730241 0.000821784376253061 0.000717174029144732 0.000701915007248035 0.000697079770663268 0.000661980513434474 37665 35814 667 665 0 True 300 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 344 541 0.00093418614565457 0.000889727179014141 0.000793469138628214 0.000762951094834821 0.000765548522065903 0.000726157184094575 40835 38775 667 665 0 True 345 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 389 541 0.000961501396246258 0.000905995820404754 0.000762951094834821 0.000686655985351339 0.000841883513023922 0.000811522033909014 42029 39484 667 665 0 True 389 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 433 540 0.000910988772036504 0.000927771477216731 0.000595101853971161 0.000503547722590982 0.000921817414138116 0.00101520817975535 39821 40433 667 665 0 True 434 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 477 539 0.00091222413512859 0.00088997958388762 0.000488288700694286 0.000473029678797589 0.00100065077679204 0.00106837044505779 39875 38786 667 665 0 True 478 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 522 538 0.0009447324861259 0.00078773266423096 0.000549324788281071 0.000350957503624018 0.00100385606527091 0.000942476717741226 41296 34330 667 665 0 True 523 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 566 539 0.000835425729570555 0.00101425456522974 0.000473029678797589 0.000625619897764553 0.000892301233023683 0.00135635500187775 36518 44202 667 665 0 True 568 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 610 537 0.000889598688867972 0.000921392517686985 0.000610360875867857 0.00064087891966125 0.000855321064921789 0.000860118616965095 38886 40155 667 665 0 True 612 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 654 537 0.000940591732057981 0.000894201629043999 0.000518806744487678 0.000366216525520714 0.000990562646629818 0.00105710805108267 41115 38970 667 665 0 True 657 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 257 582 0.000840710338353368 0.00079776002147736 0.000747692072938125 0.000701915007248035 0.000648109737684604 0.000602849325798654 36749 34767 667 665 0 True 255 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 301 582 0.000903324945446709 0.000749229448076589 0.00080872816052491 0.000579842832074464 0.000711749526101869 0.000703006146840046 39486 32652 667 665 0 True 300 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 345 582 0.000941895726432961 0.000893467360321151 0.000793469138628214 0.000762951094834821 0.000724759612051135 0.000711455608917514 41172 38938 667 665 0 True 345 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 389 582 0.00089961885617045 0.000929790716204565 0.000762951094834821 0.000778210116731518 0.000706716140050415 0.000713976956751701 39324 40521 667 665 0 True 389 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 433 581 0.000917165587496936 0.000824124857807141 0.000595101853971161 0.000350957503624018 0.000927113279235438 0.00098807763709328 40091 35916 667 665 0 True 434 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 477 579 0.000886006985063202 0.000876762746876346 0.000396734569314107 0.000457770656900893 0.00106294023419804 0.000978361806821297 38729 38210 667 665 0 True 479 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 522 579 0.000927734805062564 0.000844845003330023 0.000488288700694286 0.000457770656900893 0.00103250285692467 0.000964601225773228 40553 36819 667 665 0 True 523 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 566 579 0.000873218689350678 0.000981304256291908 0.000549324788281071 0.000686655985351339 0.00091236596008034 0.000949758293541505 38170 42766 667 665 0 True 568 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 610 578 0.000897468409306448 0.00085356444441385 0.000610360875867857 0.000610360875867857 0.000800051625417218 0.000768438485062481 39230 37199 667 665 0 True 613 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 654 578 0.000988519244612073 0.00091333850763324 0.00064087891966125 0.000717174029144732 0.000899087717969803 0.000813355005853518 43210 39804 667 665 0 True 657 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 256 624 0.000913939917200933 0.000847942699504541 0.000778210116731518 0.000671396963454643 0.00070065978588744 0.00070370773517465 39950 36954 667 665 0 False 256 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 300 624 0.000832017042520168 0.00081457936441011 0.000732433051041428 0.000671396963454643 0.000659536573878141 0.000650539328292152 36369 35500 667 665 0 False 300 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 345 624 0.000839749500392857 0.000923205243596517 0.000701915007248035 0.000793469138628214 0.000714415752439659 0.000744413278020409 36707 40234 667 665 0 True 345 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 389 623 0.00092723150898801 0.00096866106672036 0.000762951094834821 0.000823987182421607 0.000725294813137333 0.000688072329976119 40531 42215 667 665 0 True 389 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 434 624 0.000834053103912681 0.000901475478579718 0.000564583810177768 0.000579842832074464 0.000835990248117227 0.000936894327654052 36458 39287 667 665 0 False 434 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 479 624 0.00089309888429555 0.000898997321640104 0.000488288700694286 0.000503547722590982 0.000980401146079323 0.00098080022708308 39039 39179 667 665 0 False 479 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 523 623 0.000896759219383213 0.00081060972412721 0.000503547722590982 0.000335698481727321 0.000982941597524827 0.00095463113777168 39199 35327 667 665 0 False 523 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 568 623 0.000911331928450973 0.000826648906541933 0.000671396963454643 0.000473029678797589 0.00085501189379881 0.000867122416907319 39836 36026 667 665 0 False 568 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 613 623 0.00087276114746472 0.000987017784791574 0.000686655985351339 0.000854505226215 0.000737913835666656 0.000717393369176301 38150 43015 667 665 0 False 613 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 657 623 0.000944137681674155 0.000840049310733919 0.000747692072938125 0.00064087891966125 0.000762883700808835 0.000763070210975138 41270 36610 667 665 0 False 657 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 256 674 0.00105323854438082 0.0717976676642396 0.000885023270008392 0.0710917830167086 0.000793498969840626 0.025414999549756 46039 3128998 667 665 0 True 256 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 300 668 0.000890033353659632 0.00085893378444968 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.000732343227786263 0.000661215482620994 38905 37433 667 665 0 False 300 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 345 667 0.000863793326499945 0.000860723564461623 0.000762951094834821 0.000701915007248035 0.000657558473167392 0.000638649443296814 37758 37511 667 665 0 False 345 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 390 667 0.000906642124119904 0.000918317767410056 0.000732433051041428 0.00080872816052491 0.000721525275459415 0.000671505682603783 39631 40021 667 665 0 False 390 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 434 667 0.000878411789756301 0.000870337895551421 0.000671396963454643 0.000656137941557946 0.000787856671400897 0.000788391126112561 38397 37930 667 665 0 False 434 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 479 667 0.000895569610479722 0.000926257047975856 0.000595101853971161 0.000701915007248035 0.000841302909213921 0.000841389544340076 39147 40367 667 665 0 False 479 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 524 667 0.00085395617595185 0.000997962977941535 0.000518806744487678 0.000656137941557946 0.000877250195822222 0.000924810388951001 37328 43492 667 665 0 False 524 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 568 667 0.000960243156059873 0.000869282384262327 0.000793469138628214 0.000656137941557946 0.000797152093775196 0.0007448562335678 41974 37884 667 665 0 False 568 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 613 667 0.000974472708713165 0.000869718356316518 0.000823987182421607 0.000717174029144732 0.000732960299909186 0.000669218260115393 42596 37903 667 665 0 False 613 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 654 673 0.00119386404302998 0.0773475460223 0.00102235446707866 0.0740062561989776 0.000862527176104629 0.0217980241224568 52186 3370866 667 665 0 True 657 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G10_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G10_1.csv new file mode 100755 index 0000000..6bc7ba4 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G10_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 274 259 0.00956022332161912 0.0371518634076608 0.00955214770733196 0.0377508201724269 0.00151841860571732 0.0080448592214276 417895 1619107 667 665 0 True 274 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 318 259 0.0095342806966853 0.00918689490950998 0.00953688868543526 0.00924696726939803 0.00134216706723769 0.00140283442647447 416761 400372 667 665 0 False 318 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 361 259 0.00937372924890267 0.050477670486585 0.00935378042267491 0.0527656977187762 0.00135240714964185 0.00933022513667021 409743 2199856 667 665 0 True 363 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 406 260 0.00941664667780552 0.0708343529916574 0.00946059357595178 0.0704051270313573 0.00161159525241582 0.00927562226037848 411619 3087016 667 665 0 True 408 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 451 259 0.00924067606846611 0.0598557276689091 0.00926222629129473 0.0591134508278019 0.00155390796280133 0.0110525650848531 403927 2608559 667 665 0 True 452 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 497 259 0.00929709098300472 0.0499269001067558 0.00930800335698482 0.0543526359960327 0.00166415271599167 0.0162045728056689 406393 2175853 667 665 0 False 497 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 540 258 0.00926963846984725 0.0653778414908868 0.00932326237888151 0.0652628366521706 0.0015429920600264 0.018885408198557 405193 2849217 667 665 0 True 542 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 583 257 0.00943172268294784 0.0541759296386996 0.00952162966353857 0.0558785381857023 0.00183695854461125 0.0156738578732261 412278 2361029 667 665 0 True 586 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 631 258 0.00937523913712633 0.0093761526728242 0.0093690394445716 0.00949111161974517 0.0021269864342801 0.00178711859186703 409809 408620 667 665 0 False 631 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 670 258 0.00940877695736705 0.0389690408213255 0.00935378042267491 0.0390325780117494 0.00177325505425369 0.0077364918296529 411275 1698301 667 665 0 True 676 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 274 303 0.00935256793667712 0.00948528336175756 0.00943007553215839 0.00943007553215839 0.00152328197554328 0.00143589009487302 408818 413376 667 665 0 False 274 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 319 303 0.00959616323676111 0.00958601585217335 0.00955214770733196 0.00956740672922866 0.00127396055575254 0.00123596504367542 419466 417766 667 665 0 False 319 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 363 303 0.00975852197499328 0.0858778440723002 0.00975051499198901 0.0819256885633631 0.0013027194727142 0.0213705894897344 426563 3742623 667 665 0 True 363 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 408 304 0.00955166728835171 0.0449242814061934 0.00953688868543526 0.0455481803616388 0.00149847150703867 0.00711217767370197 417521 1957835 667 665 0 True 408 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 452 303 0.0094842942456444 0.0602166207461891 0.00949111161974517 0.0581673914702068 0.00176652774616822 0.0115251236960924 414576 2624287 667 665 0 True 452 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 496 302 0.00940516237646798 0.0391208508797744 0.00941481651026169 0.0391241321431296 0.00173558183495851 0.0101989526789885 411117 1704917 667 665 0 True 497 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 542 302 0.00924879743694186 0.0328604069110749 0.00932326237888151 0.035233081559472 0.00151157961420897 0.0072579071823347 404282 1432082 667 665 0 False 542 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 585 301 0.00945329578287075 0.042219143647629 0.00944533455405508 0.0435950255588617 0.00192205243593542 0.00797848389262198 413221 1839943 667 665 0 True 586 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 631 302 0.00929988198850906 0.00944157142685048 0.00935378042267491 0.00943007553215839 0.0019790930257628 0.00201722542058166 406515 411471 667 665 0 False 631 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 676 302 0.00905681286159392 0.00924657718913902 0.00901808194094758 0.00927748531319142 0.00188316344329106 0.00197381076886972 395890 402973 667 665 0 False 676 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 274 347 0.00964100234158499 0.0400700308794417 0.00961318379491875 0.0412298771648737 0.00147831768802574 0.0098322235736552 421426 1746283 667 665 0 True 274 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 318 346 0.00954905929960174 0.0516218906157589 0.00958266575112535 0.0543068589303426 0.00133886601806575 0.0171585669209022 417407 2249722 667 665 0 True 319 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 363 348 0.00967582127910638 0.0326457939309248 0.00964370183871214 0.0335393301289387 0.00146615888025275 0.0065770983248257 422948 1422729 667 665 0 True 363 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 407 347 0.00966326175433684 0.0289492098293342 0.00967421988250553 0.0294193942168307 0.00157317066850882 0.00413056717456859 422399 1261629 667 665 0 True 408 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 452 347 0.00983163716836935 0.0564192812082851 0.00987258716716258 0.0554055085069047 0.0018016261414432 0.0105885144673458 429759 2458796 667 665 0 True 453 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 497 345 0.00955686038875733 0.0264423475718364 0.00953688868543526 0.0272983901731899 0.00167015048762261 0.00442163536408758 417748 1152378 667 665 0 True 497 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 540 345 0.00940342371730134 0.0242575768787958 0.00943007553215839 0.0247959105821317 0.00153507239097115 0.0032694440720213 411041 1057164 667 665 0 True 542 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 584 344 0.00945828298942769 0.0426035333240402 0.0093842984664683 0.0429388876173037 0.00191264835676806 0.00989260930176317 413439 1856695 667 665 0 True 587 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 629 345 0.00940093011402287 0.0500819684826624 0.00949111161974517 0.0508888380254826 0.00197701840588173 0.0117010462810405 410932 2182611 667 665 0 True 631 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 672 345 0.00930589866430941 0.0533630253248135 0.00932326237888151 0.0538185702296483 0.00193375712025172 0.0147376124021719 406778 2325602 667 665 0 True 676 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 275 390 0.00973491281367785 0.0382674241107461 0.00973525597009232 0.0414435034714275 0.00147559722010711 0.0103907134498597 425531 1667724 667 665 0 True 274 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 320 390 0.00960238580641014 0.0266535416132457 0.00965896086060884 0.0274509803921569 0.00143855904913248 0.00371467686910983 419738 1161582 667 665 0 True 319 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 364 391 0.00996340923152523 0.0712569934793496 0.00993362325474937 0.0693064774547952 0.00160645261217414 0.0172058253431655 435519 3105435 667 665 0 True 364 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 407 390 0.0100895535294838 0.0535570328889287 0.0100556954299229 0.0548714427405203 0.00166194243313297 0.0131569080011765 441033 2334057 667 665 0 True 408 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 452 391 0.0101638812088577 0.0373081479161396 0.0101167315175097 0.0388799877927825 0.00176293924791383 0.00697001159987837 444282 1625918 667 665 0 True 453 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 496 389 0.00996459884042872 0.0443907892872488 0.00994888227664607 0.0456702525368124 0.00176000215317032 0.0103455017259952 435571 1934585 667 665 0 True 497 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 541 388 0.00948472891043606 0.0369214177581743 0.00950637064164187 0.0380254825665675 0.00170027443280018 0.0058610454376648 414595 1609064 667 665 0 True 542 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 584 388 0.00962787088945799 0.042834690296352 0.00956740672922866 0.0444190127412833 0.00192593459269624 0.00817920411395562 420852 1866769 667 665 0 True 587 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 628 389 0.00971361423888651 0.0382632709032825 0.00975051499198901 0.0393377584496834 0.00201525615238882 0.00686124764930432 424600 1667543 667 665 0 True 631 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 673 388 0.00958282589078544 0.0780458585236265 0.00955214770733196 0.0753337911039902 0.00184568981390581 0.0154473257310605 418883 3401299 667 665 0 True 676 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 276 434 0.00978210825921441 0.0395129044859803 0.0098115510795758 0.0409094377050431 0.00162322806709554 0.00789914725591991 427594 1722003 667 665 0 True 274 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 320 434 0.00970858127814097 0.0432894550406687 0.00976577401388571 0.0435950255588617 0.00151046114354284 0.00620039620344261 424380 1886588 667 665 0 True 319 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 364 434 0.00995194780728199 0.0304485177236981 0.00997940032043946 0.0312046997787442 0.00138394514107446 0.00360649170186857 435018 1326970 667 665 0 True 364 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 408 434 0.0100933740042316 0.0467903565276203 0.0100404364080262 0.0462806134126802 0.00156614113937153 0.0107105746133179 441200 2039160 667 665 0 True 408 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 453 434 0.0103400577120458 0.0847997310740803 0.0103303578240635 0.0840466926070039 0.00180588306623931 0.0117499653572014 451983 3695638 667 665 0 True 453 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 496 432 0.0101520766282 0.0499705202580725 0.0100709544518196 0.0518348973830777 0.00183367812487064 0.011841672007021 443766 2177754 667 665 0 True 498 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 541 432 0.00990324247352177 0.0473188234949929 0.00993362325474937 0.0474860761425193 0.00185385415369596 0.00817522564831083 432889 2062191 667 665 0 True 542 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 587 432 0.00983621258722893 0.0305998918100929 0.0098268101014725 0.0310978866254673 0.00198392357644791 0.00447866746723479 429959 1333567 667 665 0 False 587 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 629 433 0.00987290744648276 0.0389706929259519 0.00990310521095598 0.0388494697489891 0.00191800380408668 0.00756536336213375 431563 1698373 667 665 0 True 631 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 673 433 0.00985801445809483 0.0715554507692899 0.00999465934233616 0.07177843900206 0.00190178548294333 0.0112575762839333 430912 3118442 667 665 0 True 676 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 277 478 0.00942895455453779 0.0469849147932775 0.00944533455405508 0.0477454795147631 0.00160996673922673 0.0106568290277145 412157 2047639 667 665 0 True 275 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 321 477 0.00979835099616591 0.0469987511695237 0.0098115510795758 0.0476539253833829 0.00146719007938489 0.00644473348987913 428304 2048242 667 665 0 True 319 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 365 478 0.00986176630155968 0.0604749915530414 0.00985732814526589 0.0581521324483101 0.00159462151281074 0.0148833070577967 431076 2635547 667 665 0 True 364 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 409 478 0.0100971258476964 0.0777362495274579 0.010101472495613 0.0750743877317464 0.00186116556919735 0.0166937165335099 441364 3387806 667 665 0 True 408 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 453 478 0.0101473868238689 0.0864186788784734 0.010101472495613 0.0832837415121691 0.00190299869643082 0.025714589800797 443561 3766193 667 665 0 True 453 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 498 478 0.00976934284059618 0.0380975097390994 0.00975051499198901 0.0391241321431296 0.00193457327844113 0.00528511445950496 427036 1660319 667 665 0 True 498 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 542 475 0.00964708764866823 0.0354379195872492 0.00956740672922866 0.0368200198367285 0.00174637585609461 0.00584545839213418 421692 1544412 667 665 0 True 542 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 586 476 0.00990955655154798 0.0910444571029313 0.0100251773861295 0.0881971465629053 0.00195066880161632 0.0159696426053432 433165 3967788 667 665 0 True 587 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 631 477 0.00977195082934614 0.0563024177518642 0.0097962920576791 0.059662775616083 0.00187475230209123 0.0131904657401433 427150 2453703 667 665 0 True 632 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 674 477 0.00977403264492725 0.0698931811102487 0.00976577401388571 0.0686503395132372 0.00189640862210791 0.0113596360560871 427241 3045999 667 665 0 True 676 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 277 522 0.00946937838016217 0.0418821143038415 0.00941481651026169 0.0444495307850767 0.00147250416839203 0.00978094024122588 413924 1825255 667 665 0 True 275 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 321 521 0.00965127415692474 0.0948664864266411 0.00965896086060884 0.095399404898146 0.00156422627761374 0.0234599627091856 421875 4134355 667 665 0 True 319 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 366 523 0.00982086205695504 0.0504659221870194 0.00985732814526589 0.0530403601129168 0.00164583976225118 0.00971152943483576 429288 2199344 667 665 0 True 364 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 410 521 0.00992728629962885 0.0514470887679258 0.00991836423285267 0.0520637827115282 0.00186450323364563 0.00459488694414944 433940 2242104 667 665 0 True 409 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 454 521 0.0101800553145263 0.0502449302473396 0.0101625085831998 0.0508125429159991 0.00196425057972125 0.00611787412531929 444989 2189713 667 665 0 True 453 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 498 519 0.00977748708616623 0.0578715959043867 0.00970473792629892 0.0573739223315785 0.00185872315117339 0.0110231687008906 427392 2522089 667 665 0 True 498 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 542 518 0.00976112996374324 0.0689214223473539 0.00964370183871214 0.0653238727397574 0.00179014388722892 0.0170591397829346 426677 3003649 667 665 0 True 543 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 586 518 0.0097887426165608 0.0516267092542526 0.0097962920576791 0.0527199206530861 0.0018297393191734 0.0117722742777235 427884 2249932 667 665 0 True 587 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 630 518 0.00976714663954358 0.0435583350686168 0.00984206912336919 0.0431525139238575 0.00192191332566037 0.00720732439287516 426940 1898306 667 665 0 True 632 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 675 517 0.00970798647368923 0.0561056566800384 0.00975051499198901 0.0578316929884794 0.0018912639306455 0.0105426863802867 424354 2445128 667 665 0 True 676 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 277 563 0.00917346316541889 0.0376128923820194 0.00915541313801785 0.0382391088731212 0.00138338009137423 0.00758090445308348 400989 1639199 667 665 0 True 275 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 321 562 0.00949888983180646 0.0489291895336877 0.00958266575112535 0.0495765621423667 0.00141163980233363 0.0100238777252719 415214 2132372 667 665 0 True 319 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 365 563 0.00965319583284576 0.0395084988736433 0.00964370183871214 0.040009155413138 0.00143531329189788 0.0065115757161532 421959 1721811 667 665 0 True 364 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 410 563 0.00994915680177764 0.0445276845122649 0.00994888227664607 0.0446784161135271 0.00166109486989321 0.00564155648335636 434896 1940551 667 665 0 True 409 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 454 562 0.0100529730557015 0.0781233238738871 0.0100099183642329 0.0756542305638209 0.00204288647094684 0.0142209659722197 439434 3404675 667 665 0 True 453 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 497 559 0.00980702141490482 0.0562783933970885 0.00978103303578241 0.0566109712367437 0.0020583627332095 0.0103292533316266 428683 2452656 667 665 0 True 498 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 542 560 0.00957744977362543 0.0533435213118629 0.00961318379491875 0.0520637827115282 0.00189608337419171 0.00909492897405156 418648 2324752 667 665 0 True 543 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 587 563 0.00958042379588416 0.0319697618961572 0.00949111161974517 0.0355840390630961 0.00191214728495938 0.0108350148960864 418778 1393267 667 665 0 False 587 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 630 560 0.00946722793329817 0.0440338887961492 0.00956740672922866 0.0438544289311055 0.00182576703663327 0.00643310889159071 413830 1919031 667 665 0 True 632 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 674 559 0.00948568974839657 0.0470502876555087 0.00944533455405508 0.0465400167849241 0.00188671336420436 0.00562551443038935 414637 2050488 667 665 0 True 677 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 275 607 0.0089961656846102 0.00888983731932257 0.0089723048752575 0.00885023270008392 0.00134317836849749 0.00137126037355523 393239 387426 667 665 0 False 275 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 320 607 0.00927286414014325 0.009159704020867 0.00918593118181125 0.00918593118181125 0.00174316624679687 0.00145753331565766 405334 399187 667 665 0 False 320 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 363 604 0.00976604853901729 0.0650720415137179 0.00967421988250553 0.0648203250171664 0.00149832443822241 0.0108736296679936 426892 2835890 667 665 0 True 364 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 409 604 0.00979857976710889 0.0686085550337276 0.00970473792629892 0.067200732433051 0.00151067205358297 0.0154433140325145 428314 2990014 667 665 0 True 409 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 454 607 0.00963388756525834 0.00944916651895245 0.00959792477302205 0.00943007553215839 0.00196176220598725 0.00197042083982228 421115 411802 667 665 0 False 454 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 498 606 0.00994023473500146 0.00925974813435511 0.00935378042267491 0.00926222629129473 0.00429513683969193 0.00201310192267697 434506 403547 667 665 0 False 498 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 543 606 0.00928270129069134 0.00903591090337425 0.00926222629129473 0.00904859998474098 0.00196769821462082 0.00206598816282792 405764 393792 667 665 0 False 543 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 587 606 0.00917252520455268 0.00919010733517245 0.00924696726939803 0.00914015411612116 0.00163281755582507 0.00171506728985784 400948 400512 667 665 0 False 587 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 632 606 0.00932788355192969 0.00928028471269728 0.00929274433508812 0.00929274433508812 0.00154688929988678 0.00156040497630004 407739 404442 667 665 0 False 632 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 677 606 0.00936194754533926 0.00930809514057517 0.0093690394445716 0.00929274433508812 0.00151518782453298 0.00170588715878736 409228 405654 667 665 0 False 677 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 276 656 0.00900215948331625 0.0356644644341456 0.00901808194094758 0.0361943999389639 0.0013072094322326 0.0076866516497639 393501 1554285 667 665 0 True 275 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 320 650 0.00891444870377812 0.00879156003994881 0.00891126878767071 0.00874341954680705 0.00122382680452897 0.00129901378295846 389667 383143 667 665 0 False 320 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 364 650 0.00894638512741798 0.00879034390737659 0.0089417868314641 0.00880445563439384 0.00131615319982703 0.00122751894115766 391063 383090 667 665 0 False 364 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 409 650 0.0090527636159032 0.00892037830901355 0.00904859998474098 0.00901808194094758 0.00141195279168476 0.00153347573261005 395713 388757 667 665 0 False 409 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 454 650 0.00924994129165676 0.00902927953897103 0.00926222629129473 0.00903334096284428 0.00176206778826485 0.0016494365053622 404332 393503 667 665 0 False 454 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 498 650 0.00911810059721799 0.00899162532102745 0.00917067215991455 0.00888075074387732 0.00172272465462384 0.00174387532716162 398569 391862 667 665 0 False 498 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 543 650 0.00899360345004884 0.00912124669650781 0.00903334096284428 0.00912489509422446 0.00177456034283059 0.00162173321348685 393127 397511 667 665 0 False 543 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 588 650 0.00923877726963938 0.00895312210487308 0.00918593118181125 0.0089570458533608 0.00175295588241106 0.0012003491853239 403844 390184 667 665 0 False 588 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 632 649 0.00922704132026456 0.00918329240358851 0.00923170824750134 0.00921644922560464 0.00134749935275506 0.00132514692627199 403331 400215 667 665 0 False 632 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 673 655 0.0093027645023906 0.0374191601686753 0.00924696726939803 0.0377355611505302 0.00138896881828486 0.00740180817163485 406641 1630756 667 665 0 True 677 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G10_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G10_2.csv new file mode 100755 index 0000000..3f98ca8 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G10_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 274 259 0.00808389579529301 0.695205305550441 0.00793469138628214 0.699000534065766 0.00186992200802456 0.195999379912597 353362 30297586 667 665 8 True 274 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 318 259 0.00677921510748402 0.0063283408796654 0.00666819256885634 0.00634775310902571 0.00155019387177957 0.00127882611676091 296332 275794 667 665 0 False 318 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 361 259 0.00615675224873258 0.00622921460208085 0.00611886778057527 0.00616464484626535 0.00138081758610209 0.00128195700746649 269123 271474 667 665 0 True 363 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 406 260 0.00616931177350212 0.00622494666512929 0.00611886778057527 0.00617990386816205 0.00140508490965909 0.00132194033484047 269672 271288 667 665 0 True 408 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 451 259 0.00612895657916064 0.00634121352821284 0.00614938582436866 0.00634775310902571 0.00151247758542668 0.00162673501067166 267908 276355 667 665 0 True 452 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 497 259 0.00651917117659984 0.00680001675050524 0.00651560234988937 0.00686655985351339 0.00156601580092055 0.00149430546160187 284965 296350 667 665 0 False 497 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 540 258 0.00673428449428296 0.00661683965005212 0.00675974670023652 0.00656137941557946 0.00153113160015703 0.00147855796530874 294368 288367 667 665 0 True 542 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 583 257 0.00715428506849802 0.00728784653324775 0.00712596322575723 0.00735484855420768 0.0017933123040033 0.00180087222175019 312727 317610 667 665 0 True 586 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 631 258 0.00976424124856775 0.00780309666360913 0.00820935378042268 0.00782787823300526 0.00823188478507009 0.00191446559020168 426813 340065 667 665 0 False 631 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 670 258 0.00913557869726158 0.716224826199167 0.00918593118181125 0.701930266269932 0.00190694146950391 0.171971206529769 399333 31213633 667 665 9 True 676 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 274 303 0.00655591179004226 0.00642471364953928 0.00653086137178607 0.00646982528419928 0.00140863460630292 0.0015147429194864 286571 279994 667 665 0 False 274 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 319 303 0.00616103026536629 0.00631363255931084 0.00619516289005875 0.00631723506523232 0.00131691818245309 0.00117397324592924 269310 275153 667 665 0 False 319 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 363 303 0.00629040023362089 0.00662411349958783 0.00634775310902571 0.00666819256885634 0.00127588487129129 0.00134690508773691 274965 288684 667 665 0 True 363 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 408 304 0.00651150735001005 0.00649114202305948 0.00645456626230259 0.00650034332799268 0.00141329051022548 0.00144786603443017 284630 282889 667 665 0 True 408 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 452 303 0.00641247240879446 0.00643272176779784 0.0064087891966125 0.00643930724040589 0.00168378366581608 0.0018366154291707 280301 280343 667 665 0 True 452 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 496 302 0.00659951553177405 0.00669070249439116 0.00656137941557946 0.00677500572213321 0.00164199734377722 0.00170109544078332 288477 291586 667 665 0 True 497 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 542 302 0.00668418365777057 0.00688709643185556 0.00671396963454643 0.00697337300679027 0.00156361889429109 0.00151023396279009 292178 300145 667 665 0 False 542 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 585 301 0.00711205395242411 0.00706664808048962 0.00715648126955062 0.00711070420386053 0.00188416417616295 0.00195407677195568 310881 307970 667 665 0 True 586 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 631 302 0.0076220530156071 0.00743320879447417 0.00761425192645151 0.00747692072938125 0.00193278200751774 0.002014917016219 333174 323945 667 665 0 False 631 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 676 302 0.00765538494199913 0.00740785357763831 0.0076600289921416 0.00747692072938125 0.00184137406113595 0.00185624787839512 334631 322840 667 665 0 False 676 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 274 347 0.00618770495731763 0.00622944406105674 0.00610360875867857 0.00619516289005875 0.00136515758079772 0.00140584525738357 270476 271484 667 665 0 True 274 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 318 346 0.0063489198408349 0.0065750781164401 0.0063935301747158 0.00659189745937285 0.00125152532215872 0.0012971888153688 277523 286547 667 665 0 True 319 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 363 348 0.00664380558633478 0.00688558200261468 0.00660715648126955 0.00683604180972 0.00136921241745183 0.00140133911687457 290413 300079 667 665 0 True 363 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 407 347 0.00672529379622388 0.00705343124347835 0.00665293354695964 0.00701915007248035 0.00145824701268184 0.00142083882273167 293975 307394 667 665 0 True 408 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 452 347 0.00691476189119906 0.0073474829210816 0.00698863202868696 0.00732433051041428 0.00162350949131285 0.00182883197770302 302257 320209 667 665 0 True 453 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 497 345 0.00670243957902029 0.00688131406566313 0.00679026474402991 0.00686655985351339 0.00157449330249634 0.00164916619338271 292976 299893 667 665 0 True 497 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 540 345 0.00683183242436918 0.00680329801386047 0.00675974670023652 0.00675974670023652 0.00154969658114909 0.00163928351370019 298632 296493 667 665 0 True 542 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 584 344 0.00693770761677985 0.00710285670688509 0.00698863202868696 0.00706492713817044 0.0018725303806679 0.00195048552844744 303260 309548 667 665 0 True 587 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 629 345 0.00702871269789687 0.00736836368788761 0.00717174029144732 0.00733958953231098 0.00200290286687377 0.0019168238719061 307238 321119 667 665 0 True 631 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 672 345 0.00664947910572066 0.00666803194757321 0.00672922865644312 0.00668345159075303 0.00179068294810673 0.0019021655614165 290661 290598 667 665 0 True 676 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 275 390 0.00635967207515492 0.00628988355530621 0.00631723506523232 0.00627145799954223 0.00132708925830263 0.00147049988311081 277993 274118 667 665 0 True 274 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 320 390 0.0065511762315226 0.0605465598076216 0.00654612039368277 0.0642404821850919 0.00138468383365463 0.0133414980685216 286364 2638666 667 665 0 True 319 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 364 391 0.0072828772155465 0.00690710525455318 0.0072632944228275 0.00683604180972 0.00154988535910665 0.00133794251327617 318348 301017 667 665 0 True 364 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 407 390 0.00730088148875894 0.00738956569725986 0.00735484855420768 0.00740062561989776 0.00163260446545908 0.00143120085164491 319135 322043 667 665 0 True 408 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 452 391 0.00727708931068913 0.00722784301105246 0.00727855344472419 0.00712596322575723 0.00168514248606993 0.00169109635815404 318095 314995 667 665 0 True 453 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 496 389 0.00709084688600996 0.00695822871438151 0.00709544518196384 0.00694285496299687 0.00175817914445608 0.00174103793926967 309954 303245 667 665 0 True 497 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 541 388 0.00687923376375442 0.00694251077453304 0.00691233691920348 0.00700389105058366 0.0017019109413206 0.00150531491911961 300704 302560 667 665 0 True 542 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 584 388 0.00682208678219828 0.00703115077691941 0.00689707789730678 0.00706492713817044 0.00180681798968155 0.00195799520062656 298206 306423 667 665 0 True 587 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 628 389 0.00690975180754782 0.00682915804044329 0.00694285496299687 0.00650034332799268 0.00198563225718759 0.0027633780772506 302038 297620 667 665 0 True 631 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 673 388 0.00647680279796014 0.0068393689648704 0.00645456626230259 0.00679026474402991 0.00184363341003725 0.0019589607519918 283113 298065 667 665 0 True 676 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 276 434 0.00654744726515204 0.00641821996052158 0.00660715648126955 0.0063782711528191 0.00146967680473138 0.0015310813510273 286201 279711 667 665 0 True 274 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 320 434 0.00646367134583315 0.00662934516423813 0.00653086137178607 0.00662241550316625 0.00145501999087428 0.00138418769283104 282539 288912 667 665 0 True 319 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 364 434 0.00677152840379993 0.00691525104819728 0.00671396963454643 0.00689707789730678 0.00147761811952962 0.00136446187142144 295996 301372 667 665 0 True 364 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 408 434 0.00719029361492291 0.00745259807793689 0.0072632944228275 0.00747692072938125 0.00166610669324798 0.00157463153275861 314301 324790 667 665 0 True 408 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 453 434 0.00718846344737908 0.00730191236846981 0.0072327763790341 0.00727855344472419 0.00168058372135681 0.00172423075198358 314221 318223 667 665 0 True 453 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 496 432 0.00704509269741417 0.00730744232978877 0.00712596322575723 0.00743114366369116 0.00182102262713172 0.00187265779510112 307954 318464 667 665 0 True 498 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 541 432 0.00703093177604377 0.00772248772537891 0.00701915007248035 0.00762951094834821 0.001726913937693 0.00192018948012661 307335 336552 667 665 0 True 542 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 587 432 0.00678507164362429 0.00674439589474946 0.00674448767833982 0.00665293354695964 0.00192372926061261 0.0019775621181916 296588 293926 667 665 0 False 587 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 629 433 0.00628131802718462 0.00657597300644608 0.00630197604333562 0.00653086137178607 0.00187038000941823 0.00171303310585118 274568 286586 667 665 0 True 631 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 673 433 0.00605986775438099 0.00617602601146951 0.00608834973678187 0.00616464484626535 0.00182201793544734 0.00169631148291601 264888 269156 667 665 0 True 676 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 277 478 0.00639121958819171 0.00638834440186068 0.0063782711528191 0.00633249408712902 0.00149974796966167 0.0016125902284488 279372 278409 667 665 0 True 275 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 321 477 0.00628388026174599 0.00638770191672819 0.00627145799954223 0.00633249408712902 0.00154707186770035 0.00150404071528687 274680 278381 667 665 0 True 319 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 365 478 0.00661781720721237 0.00656367400533836 0.00662241550316625 0.00668345159075303 0.00158671547707936 0.00150900291602053 289277 286050 667 665 0 True 364 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 409 478 0.00690384951721896 0.00684719351594826 0.00695811398489357 0.00688181887541009 0.00176105119202814 0.00165067857418029 301780 298406 667 665 0 True 408 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 453 478 0.00690698367913777 0.00718208889125997 0.00685130083161669 0.00718699931334401 0.00186052606667905 0.00208923114703726 301917 313001 667 665 0 True 453 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 498 478 0.00678660440894224 0.006718627651757 0.00679026474402991 0.00674448767833982 0.00181666146565304 0.00193987119559397 296655 292803 667 665 0 True 498 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 542 475 0.00649993154029531 0.00646369872954301 0.00654612039368277 0.00648508430609598 0.00183934487696184 0.00174639386677892 284124 281693 667 665 0 True 542 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 586 476 0.00635308347199712 0.00635961613807923 0.00643930724040589 0.00645456626230259 0.00191852006757476 0.00186235049968148 277705 277157 667 665 0 True 587 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 631 477 0.00626315361431209 0.00618614515230626 0.00625619897764553 0.00617990386816205 0.00182783820677853 0.00171285108530138 273774 269597 667 665 0 True 632 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 674 477 0.00615233696953309 0.00620399706063052 0.00627145799954223 0.00621042191195544 0.00187975495119955 0.00183338075688581 268930 270375 667 665 0 True 676 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 277 522 0.00635932891874045 0.00623130267876145 0.00634775310902571 0.00624093995574884 0.00146649949029268 0.00147887010619392 277978 271565 667 665 0 True 275 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 321 521 0.00629671431164711 0.00633689969946611 0.0063782711528191 0.00633249408712902 0.00144026524176372 0.00153204421237477 275241 276167 667 665 0 True 319 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 366 523 0.00647524715554788 0.00647693851245188 0.00643930724040589 0.00650034332799268 0.00140198804401816 0.00156082203834574 283045 282270 667 665 0 True 364 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 410 521 0.00665698279265037 0.00700148173133681 0.00665293354695964 0.00695811398489357 0.00178915639771214 0.00168880291850312 290989 305130 667 665 0 True 409 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 454 521 0.00653019793605143 0.00667883946533764 0.00656137941557946 0.00677500572213321 0.00184492052380472 0.00189512429896784 285447 291069 667 665 0 True 453 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 498 519 0.00637200282898148 0.00665378254517043 0.0063935301747158 0.00672922865644312 0.00171880335206593 0.00176405413807762 278532 289977 667 665 0 True 498 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 542 518 0.00635045260615286 0.00664827552974907 0.00642404821850919 0.00668345159075303 0.00175183609153296 0.00159220786032147 277590 289737 667 665 0 True 543 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 586 518 0.00624947311192195 0.00611719273005127 0.00619516289005875 0.00602731364919509 0.00178241850522888 0.00161645060860114 273176 266592 667 665 0 True 587 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 630 518 0.00627889305518905 0.00617363963812025 0.00621042191195544 0.00621042191195544 0.00186025781183212 0.00179520914863645 274462 269052 667 665 0 True 632 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 675 517 0.00614265995864508 0.00638455832875849 0.00622568093385214 0.0063935301747158 0.00180851025952645 0.00187590039391525 268507 278244 667 665 0 True 676 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 277 563 0.00634040956175609 0.00647792518604821 0.00627145799954223 0.00650034332799268 0.00133072118891926 0.00130318122119029 277151 282313 667 665 0 True 275 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 321 562 0.00634663213140511 0.00641980322745523 0.00628671702143893 0.00642404821850919 0.00151845369015914 0.00144243924010152 277423 279780 667 665 0 True 319 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 365 563 0.00638609511906898 0.00637276413739774 0.0063935301747158 0.00633249408712902 0.00134746269984856 0.00133621205992266 279148 277730 667 665 0 True 364 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 410 563 0.00635942042711764 0.00631262293981693 0.0063935301747158 0.00628671702143893 0.00172728509987763 0.0015442103683923 277982 275109 667 665 0 True 409 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 454 562 0.00631982017688798 0.00649552468949898 0.00633249408712902 0.00648508430609598 0.00200428604582747 0.00189901726643623 276251 283080 667 665 0 True 453 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 497 559 0.00634077559526485 0.00654869033421274 0.00627145799954223 0.00656137941557946 0.00193032927425117 0.00203342429899185 277167 285397 667 665 0 True 498 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 542 560 0.00641176321887122 0.00646202367901902 0.00643930724040589 0.00651560234988937 0.00181965289073192 0.00176196082499083 280270 281620 667 665 0 True 543 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 587 563 0.00640421377775292 0.00651317008474494 0.0064087891966125 0.00648508430609598 0.00163792078069167 0.00144703753171177 279940 283849 667 665 0 False 587 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 630 560 0.00610303683132112 0.00630275620385365 0.00608834973678187 0.00628671702143893 0.00177812306158764 0.00167278422040594 266775 274679 667 665 0 True 632 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 674 559 0.00628397177012318 0.0062096876432326 0.00630197604333562 0.00617990386816205 0.0016664908555293 0.00170310483923513 274684 270623 667 665 0 True 677 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 275 607 0.00660370204003057 0.00660894626128149 0.00662241550316625 0.00663767452506294 0.00134505617970839 0.00131515282002975 288660 288023 667 665 0 False 275 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 320 607 0.00622103688370967 0.00647494221936163 0.00611886778057527 0.00648508430609598 0.00161078567841413 0.00142241983497245 271933 282183 667 665 0 False 320 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 363 604 0.00626033973171345 0.00623155508363493 0.00621042191195544 0.00630197604333562 0.00134831466014698 0.00133825332044134 273651 271576 667 665 0 True 364 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 409 604 0.00624732266505795 0.00625266530941682 0.00621042191195544 0.00628671702143893 0.00146711565922046 0.00147845472979307 273082 272496 667 665 0 True 409 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 454 607 0.00634388688008937 0.00630064518127546 0.00648508430609598 0.00627145799954223 0.00194952095082817 0.00184374123721872 277303 274587 667 665 0 False 454 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 498 606 0.00677020153233065 0.00640883508840768 0.00656137941557946 0.00651560234988937 0.00271969663414862 0.00207173677218035 295938 279302 667 665 0 False 498 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 543 606 0.00630337154608779 0.00613928962942949 0.00636301213092241 0.00621042191195544 0.00190712794141184 0.00192210026661001 275532 267555 667 665 0 False 543 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 587 606 0.00652150464021823 0.00631792344215999 0.00653086137178607 0.00625619897764553 0.00156096683021681 0.00170181432673906 285067 275340 667 665 0 False 587 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 632 606 0.00634528238284154 0.0062869694263124 0.00631723506523232 0.00633249408712902 0.00149583514328809 0.00144311574259933 277364 273991 667 665 0 False 632 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 677 606 0.00645031112276318 0.00648405174070447 0.0064087891966125 0.00656137941557946 0.00148155379673409 0.00171958692042757 281955 282580 667 665 0 False 677 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 276 656 0.00806129322612669 0.701520498430787 0.00784313725490196 0.698695353627832 0.00203924914744698 0.194028655552143 352374 30572807 667 665 8 True 275 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 320 650 0.00658830575556808 0.00646704883059101 0.00650034332799268 0.00650034332799268 0.00156380815423611 0.00128921147405448 287987 281839 667 665 0 False 320 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 364 650 0.00585482035818895 0.00592313927414095 0.00579842832074464 0.00592050049591821 0.00121020751527405 0.00122148519733274 255925 258135 667 665 0 False 364 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 409 650 0.00597700691883401 0.0058687116050598 0.005981536583505 0.00581368734264134 0.00137506567958541 0.00139413491385612 261266 255763 667 665 0 False 409 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 454 650 0.00619287518062896 0.00594452485069391 0.00617990386816205 0.00599679560540169 0.00161355809393106 0.00159495203797943 270702 259067 667 665 0 False 454 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 498 650 0.0061847538121532 0.00621503403737084 0.00627145799954223 0.00619516289005875 0.00173999286109956 0.00174250712602719 270347 270856 667 665 0 False 498 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 543 650 0.00614449012618891 0.00612843621986989 0.00616464484626535 0.00614938582436866 0.00164931269703244 0.00173078340105264 268587 267082 667 665 0 False 543 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 588 650 0.00648837860767488 0.00614681588383869 0.0063782711528191 0.00614938582436866 0.00181097255616689 0.00123750476415885 283619 267883 667 665 0 False 588 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 632 649 0.0070382753233134 0.00676247726204961 0.00688181887541009 0.00675974670023652 0.00181469912516843 0.00130872483074794 307656 294714 667 665 0 False 632 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 673 655 0.00821541621041162 0.728851173481885 0.00807202258335241 0.715632867933166 0.0018153091553172 0.18336566706895 359111 31763899 667 665 11 True 677 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G10_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G10_3.csv new file mode 100755 index 0000000..fbdcc01 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G10_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 274 259 0.00104125094696872 0.0705542983115835 0.000900282291905089 0.0691844052796216 0.000785269569699805 0.0217321197350234 45515 3074811 667 665 0 True 274 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 318 259 0.000894105476444657 0.000950717374805749 0.000747692072938125 0.000854505226215 0.000649471770564908 0.000648597179695007 39083 41433 667 665 0 False 318 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 361 259 0.000968707680950095 0.000944476090661536 0.000854505226215 0.000823987182421607 0.00069193746200885 0.000692938094391908 42344 41161 667 665 0 True 363 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 406 260 0.000909982179887397 0.000914623477898225 0.000778210116731518 0.000762951094834821 0.00071881576479686 0.00068678819045174 39777 39860 667 665 0 True 408 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 451 259 0.000818450925601516 0.000873894509677719 0.000610360875867857 0.00064087891966125 0.00077898692176697 0.000848649792667866 35776 38085 667 665 0 True 452 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 497 259 0.00092331952586307 0.000984952654008562 0.000717174029144732 0.000778210116731518 0.000814318836761376 0.00084129416383471 40360 42925 667 665 0 False 497 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 540 258 0.000916616537233786 0.000965219182082008 0.000701915007248035 0.000778210116731518 0.000814349058451866 0.000809872381967991 40067 42065 667 665 0 True 542 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 583 257 0.00100304619949124 0.00101083562648897 0.000701915007248035 0.000701915007248035 0.000962003182902535 0.000939461806690699 43845 44053 667 665 0 True 586 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 631 258 0.0011838667528218 0.0010983283339959 0.000823987182421607 0.000762951094834821 0.00119645327241556 0.00100283059487521 51749 47866 667 665 0 False 631 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 670 258 0.00119381828884139 0.0735538089903174 0.000915541313801785 0.070618753337911 0.00101362932976849 0.0203325706742942 52184 3205532 667 665 0 True 676 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 274 303 0.00096223346326379 0.000933760356487465 0.000778210116731518 0.000778210116731518 0.000728536343936946 0.000732855988166683 42061 40694 667 665 0 False 274 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 319 303 0.000833984472629787 0.000925362157969885 0.000732433051041428 0.00080872816052491 0.000605234521647485 0.000658929677071863 36455 40328 667 665 0 False 319 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 363 303 0.000927323017365202 0.00101836188089817 0.00080872816052491 0.000900282291905089 0.000703438500470425 0.000725399459047077 40535 44381 667 665 0 True 363 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 408 304 0.000960677820851534 0.00088366946205064 0.000778210116731518 0.000717174029144732 0.000782740907036303 0.000751875433841028 41993 38511 667 665 0 True 408 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 452 303 0.000959762737079618 0.000896840407266736 0.000656137941557946 0.000595101853971161 0.000909428175582976 0.000908054849694575 41953 39085 667 665 0 True 452 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 496 302 0.000888797990567545 0.000896106138543888 0.000656137941557946 0.000656137941557946 0.000852875759579749 0.000872020323473618 38851 39053 667 665 0 True 497 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 542 302 0.000964200893373409 0.000865656932443262 0.000778210116731518 0.000732433051041428 0.000813735089484976 0.000741235555882289 42147 37726 667 665 0 False 542 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 585 301 0.00100306907658553 0.000953562666106787 0.000701915007248035 0.000534065766384375 0.000984140727780908 0.0010579517882738 43846 41557 667 665 0 True 586 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 631 302 0.00107824320844842 0.00107235357792513 0.000732433051041428 0.000686655985351339 0.00108160371733905 0.00110082077236111 47132 46734 667 665 0 False 631 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 676 302 0.00104246343296651 0.000983071090406263 0.000671396963454643 0.000625619897764553 0.00100486082325086 0.00099439486803253 45568 42843 667 665 0 False 676 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 274 347 0.000928741397211671 0.000932452440324891 0.000778210116731518 0.000762951094834821 0.000735164595620812 0.000723565809170946 40597 40637 667 665 0 True 274 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 318 346 0.000944823994503092 0.000962052648214723 0.000793469138628214 0.000839246204318303 0.000718319069643895 0.00068024080188599 41300 41927 667 665 0 True 319 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 363 348 0.000978247429272317 0.00102327230298222 0.000839246204318303 0.000869764248111696 0.000692868753213661 0.000730522606661959 42761 44595 667 665 0 True 363 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 407 347 0.00102290351734181 0.000926693020030048 0.000839246204318303 0.000762951094834821 0.000813313057773197 0.000754219508453139 44713 40386 667 665 0 True 408 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 452 347 0.00095527882659723 0.000956935713052372 0.000717174029144732 0.000701915007248035 0.000872562093445156 0.00084708486741586 41757 41704 667 665 0 True 453 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 497 345 0.000849655282223846 0.000958725493064316 0.000564583810177768 0.000717174029144732 0.000829521085913436 0.000882226135965376 37140 41782 667 665 0 True 497 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 540 345 0.000937823603647936 0.000888992910291292 0.000762951094834821 0.000656137941557946 0.000824848795327472 0.000840659523311907 40994 38743 667 665 0 True 542 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 584 344 0.000940523100775087 0.00101207470495878 0.000534065766384375 0.000564583810177768 0.00103940278498813 0.00109076425136023 41112 44107 667 665 0 True 587 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 629 345 0.00104301248322966 0.000994383417917648 0.000595101853971161 0.000610360875867857 0.00113171253395219 0.00105430672878831 45592 43336 667 665 0 True 631 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 672 345 0.00100478485865788 0.000912696022500747 0.000656137941557946 0.000457770656900893 0.000987022788583141 0.00100468652657769 43921 39776 667 665 0 True 676 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 275 390 0.000854367963649212 0.000954273988932046 0.000686655985351339 0.00080872816052491 0.000731171805640007 0.000767216122024736 37346 41588 667 665 0 True 274 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 320 390 0.000923273771674474 0.00567789352070953 0.000778210116731518 0.00575265125505455 0.000692424166861347 0.00181161744148567 40358 247447 667 665 0 True 319 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 364 391 0.00102315516537909 0.000996425602803071 0.000869764248111696 0.000869764248111696 0.000743519639240717 0.00075421417710963 44724 43425 667 665 0 True 364 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 407 390 0.000964795697825155 0.00100351588515808 0.000762951094834821 0.000793469138628214 0.000816723753603178 0.000788251073606609 42173 43734 667 665 0 True 408 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 452 391 0.000923113632014389 0.00098151076937021 0.00064087891966125 0.000732433051041428 0.000856174999501253 0.000887869816708998 40351 42775 667 665 0 True 453 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 496 389 0.000947866648044712 0.000912030591470666 0.000610360875867857 0.000625619897764553 0.000918474727893133 0.000901575822092124 41433 39747 667 665 0 True 497 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 541 388 0.000944686731937304 0.000910837404796037 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.000845575432612618 0.000827310145185844 41294 39695 667 665 0 True 542 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 584 388 0.000834144612289872 0.000973938623165834 0.000473029678797589 0.000549324788281071 0.000952531810748582 0.00106608264820937 36462 42445 667 665 0 True 587 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 628 389 0.000964109384996218 0.000940506450378636 0.000564583810177768 0.000473029678797589 0.00102531373848473 0.00105053691012754 42143 40988 667 665 0 True 631 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 673 388 0.000914969386444338 0.000968798742105894 0.000564583810177768 0.000579842832074464 0.000917787389054827 0.000998803600645829 39995 42221 667 665 0 True 676 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 276 434 0.000939562262814576 0.000886422969761323 0.000778210116731518 0.000747692072938125 0.000777390612696244 0.000789037339054467 41070 38631 667 665 0 True 274 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 320 434 0.000989365697101095 0.00102350176195811 0.000885023270008392 0.000930800335698482 0.000747468290435584 0.000765307725446569 43247 44605 667 665 0 True 319 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 364 434 0.000973923658450015 0.00100112951180882 0.000854505226215 0.000854505226215 0.000721495688377239 0.000738633354751406 42572 43630 667 665 0 True 364 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 408 434 0.000945556061520624 0.000950556753522626 0.000686655985351339 0.000747692072938125 0.000834864047725847 0.000837740694384233 41332 41426 667 665 0 True 408 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 453 434 0.000938006620402319 0.000920956545632793 0.000656137941557946 0.000656137941557946 0.000890214210159473 0.000899814938963201 41002 40136 667 665 0 True 453 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 496 432 0.00096799849102686 0.000995599550489866 0.000671396963454643 0.000701915007248035 0.00091740012918178 0.000966411724514811 42313 43389 667 665 0 True 498 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 541 432 0.00100586008208988 0.000981877903731634 0.000747692072938125 0.000747692072938125 0.000955024116840729 0.000870360185998603 43968 42791 667 665 0 True 542 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 587 432 0.000961958938132216 0.000963314672582119 0.000579842832074464 0.000488288700694286 0.0010197205197456 0.0010464892690083 42049 41982 667 665 0 False 587 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 629 433 0.000924554888955156 0.00103635146460796 0.000534065766384375 0.000717174029144732 0.000977953572486582 0.000930832581861401 40414 45165 667 665 0 True 631 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 673 433 0.000894677403802104 0.000935183002137984 0.000549324788281071 0.000488288700694286 0.000919439850679764 0.000994036989735495 39108 40756 667 665 0 True 676 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 277 478 0.000944595223560113 0.000991606964309377 0.000839246204318303 0.000839246204318303 0.000763843205246245 0.000825663894437866 41290 43215 667 665 0 True 275 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 321 477 0.000943748771071091 0.000939909857041322 0.00080872816052491 0.000793469138628214 0.00084421262360235 0.00080719604339651 41253 40962 667 665 0 True 319 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 365 478 0.0010207988246664 0.000914072776356088 0.000854505226215 0.000762951094834821 0.000842865059410008 0.00074700545069468 44621 39836 667 665 0 True 364 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 409 478 0.000957612290215615 0.000923572377957941 0.000717174029144732 0.000686655985351339 0.000904566333861672 0.000870122208845996 41859 40250 667 665 0 True 408 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 453 478 0.000910325336301865 0.000958886114347439 0.000442511635004196 0.000488288700694286 0.0010654109331159 0.00106567696030657 39792 41789 667 665 0 True 453 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 498 478 0.000946791424612711 0.000929607149023853 0.000549324788281071 0.000534065766384375 0.00100253821893398 0.000978008308647112 41386 40513 667 665 0 True 498 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 542 475 0.000902043828166027 0.000824285479090264 0.000564583810177768 0.000503547722590982 0.000913024063024915 0.000873088220982938 39430 35923 667 665 0 True 542 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 586 476 0.000999660389535148 0.000962029702317134 0.000656137941557946 0.000518806744487678 0.00101720467437202 0.00104876024966977 43697 41926 667 665 0 True 587 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 631 477 0.000952533575281483 0.000981579607062977 0.000610360875867857 0.000595101853971161 0.000985980537113514 0.000978165209961976 41637 42778 667 665 0 True 632 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 674 477 0.000922724721411325 0.00104369415183645 0.000579842832074464 0.000656137941557946 0.000955296492534038 0.0010410193129826 40334 45485 667 665 0 True 676 475 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 277 522 0.000949536675928458 0.000968867579798661 0.000762951094834821 0.00080872816052491 0.000793138091098175 0.000821646825824232 41506 42224 667 665 0 True 275 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 321 521 0.000904377291784412 0.00100695776979643 0.000762951094834821 0.000854505226215 0.000775013309016789 0.000851316752392834 39532 43884 667 665 0 True 319 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 366 523 0.00101857974651951 0.000970267279551591 0.000854505226215 0.000793469138628214 0.000819891787735335 0.00087649562158047 44524 42285 667 665 0 True 364 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 410 521 0.000962370725829578 0.000894408142122301 0.000686655985351339 0.000595101853971161 0.000880479342701687 0.000855532554067034 42067 38979 667 665 0 True 409 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 454 521 0.000980374999042022 0.000890645014917702 0.00064087891966125 0.000457770656900893 0.00101893933959738 0.000961465829601569 42854 38815 667 665 0 True 453 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 498 519 0.000947935279327606 0.000917812957663098 0.000595101853971161 0.000549324788281071 0.000923380886131429 0.000934546381915243 41436 39999 667 665 0 True 498 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 542 518 0.000902478492957687 0.000867217253479315 0.000549324788281071 0.000595101853971161 0.000930163531383226 0.000843528139580635 39449 37794 667 665 0 True 543 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 586 518 0.000945441676049135 0.00086010402522672 0.000610360875867857 0.000534065766384375 0.000951578025245289 0.000906910930012974 41327 37484 667 665 0 True 587 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 630 518 0.000953013994261738 0.000941011260125594 0.00064087891966125 0.000503547722590982 0.000994057667940965 0.00103510314359657 41658 41010 667 665 0 True 632 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 675 517 0.000987261004425688 0.000974443432912792 0.000656137941557946 0.000625619897764553 0.00100959496405711 0.000992617510730345 43155 42467 667 665 0 True 676 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 277 563 0.000930365670906822 0.000932200035451412 0.00080872816052491 0.000823987182421607 0.000723444983015089 0.000686454134916363 40668 40626 667 665 0 True 275 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 321 562 0.000927620419591074 0.000981946741424401 0.000732433051041428 0.000869764248111696 0.000746483052500086 0.000760068615114004 40548 42794 667 665 0 True 319 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 365 563 0.00103477672928242 0.000954136313546512 0.000885023270008392 0.000839246204318303 0.000761963296756881 0.000690263465332354 45232 41582 667 665 0 True 364 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 410 563 0.00101375267962265 0.000943902443221811 0.000717174029144732 0.000747692072938125 0.000921740994148887 0.000803479401107182 44313 41136 667 665 0 True 409 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 454 562 0.000949285027891181 0.000957647035877632 0.000549324788281071 0.000549324788281071 0.00102514953813341 0.00103249667645425 41495 41735 667 665 0 True 453 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 497 559 0.000903690978955475 0.000818916139054434 0.000457770656900893 0.000244144350347143 0.00104633734901246 0.00105401229754334 39502 35689 667 665 0 True 498 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 542 560 0.000890307878791206 0.000892343011339289 0.000442511635004196 0.000518806744487678 0.00096412670727891 0.000918797659979959 38917 38889 667 665 0 True 543 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 587 563 0.000943954664919772 0.00095092388788405 0.000656137941557946 0.000701915007248035 0.000867337960982397 0.000807878589448543 41262 41442 667 665 0 False 587 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 630 560 0.000985682484919134 0.000945508656053042 0.000717174029144732 0.000671396963454643 0.000912678825042967 0.000863484216401715 43086 41206 667 665 0 True 632 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 674 559 0.00093647385508436 0.000950671483010571 0.000671396963454643 0.000625619897764553 0.000887498382422572 0.000945772536032539 40935 41431 667 665 0 True 677 562 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 275 607 0.000979299775610021 0.000975774294972955 0.00080872816052491 0.000854505226215 0.000785156798266671 0.000706129180040172 42807 42525 667 665 0 False 275 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 320 607 0.000986872093822624 0.000993442636116499 0.000823987182421607 0.000869764248111696 0.000776983072079018 0.000741933335328483 43138 43295 667 665 0 False 320 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 363 604 0.000978887987912658 0.00102611759428326 0.000900282291905089 0.000900282291905089 0.00071357639408097 0.000762117141918107 42789 44719 667 665 0 True 364 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 409 604 0.000943245474996537 0.000856501519305244 0.000686655985351339 0.000656137941557946 0.000825206459345049 0.00076246899102335 41231 37327 667 665 0 True 409 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 454 607 0.000849357879997973 0.000976898643954817 0.000457770656900893 0.000564583810177768 0.00093477473406207 0.00103352099880479 37127 42574 667 665 0 False 454 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 498 606 0.00101334089192529 0.000913545020711541 0.000564583810177768 0.000488288700694286 0.00111746676917058 0.00104450903761743 44295 39813 667 665 0 False 498 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 543 606 0.000961981815226513 0.000901567262170074 0.000564583810177768 0.000488288700694286 0.00104178048402655 0.000999202991193028 42050 39291 667 665 0 False 543 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 587 606 0.000882483912541326 0.000925798130024076 0.000625619897764553 0.000656137941557946 0.000857542996427522 0.00088637101461864 38575 40347 667 665 0 False 587 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 632 606 0.00100089575262723 0.000984057764002591 0.000823987182421607 0.000793469138628214 0.000800578657357059 0.000759933751478639 43751 42886 667 665 0 False 632 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 677 606 0.000900007766773514 0.000999798649748656 0.000717174029144732 0.000717174029144732 0.000768735779817651 0.000922363702472607 39341 43572 667 665 0 False 677 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 276 656 0.00112058870999382 0.0711961639048411 0.00103761348897536 0.0703440909437705 0.000743935265917279 0.0209462520846444 48983 3102784 667 665 0 True 275 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 320 650 0.00105042466178218 0.000959230302811274 0.000900282291905089 0.000885023270008392 0.000742077034016032 0.000627807001550648 45916 41804 667 665 0 False 320 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 364 650 0.000895066314405169 0.00091262718480798 0.000762951094834821 0.00080872816052491 0.000669001008486019 0.000631230960354816 39125 39773 667 665 0 False 364 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 409 650 0.000922839106882814 0.000884702027442146 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.000750651701794812 0.000701823144135503 40339 38556 667 665 0 False 409 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 454 650 0.000928581257551586 0.000905651631940919 0.000686655985351339 0.00064087891966125 0.000865827682399681 0.000850929999937674 40590 39469 667 665 0 False 454 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 498 650 0.000885137655479882 0.000956798037666838 0.000549324788281071 0.000671396963454643 0.000891341020739556 0.000919906811151311 38691 41698 667 665 0 False 498 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 543 650 0.000888340448681587 0.000835024159161924 0.000579842832074464 0.000473029678797589 0.00085292677635279 0.000879708209926265 38831 36391 667 665 0 False 543 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 588 650 0.000913688269163656 0.000817447601608737 0.000747692072938125 0.000701915007248035 0.000720703545465254 0.000664592097709671 39939 35625 667 665 0 False 588 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 632 649 0.000974106675204398 0.00102382300452436 0.00080872816052491 0.000900282291905089 0.000722055429995608 0.000746899513806553 42580 44619 667 665 0 False 632 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 673 655 0.00102374996983083 0.0745013368853583 0.000869764248111696 0.0718242160677501 0.000756377506740206 0.0211958030955961 44750 3246826 667 665 0 True 677 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G11_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G11_1.csv new file mode 100755 index 0000000..eff7116 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G11_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 267 274 0.00903471358850215 0.0350000659694556 0.00906385900663768 0.035538261997406 0.00152265483119485 0.00835089158007415 394924 1525330 667 665 0 True 268 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 312 273 0.00906115950951052 0.00904593826062065 0.00909437705043107 0.00904859998474098 0.00125341278440426 0.00134063367978801 396080 394229 667 665 0 False 312 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 355 273 0.00918128713166877 0.0475887590342301 0.00917067215991455 0.0496528572518502 0.00131625886133427 0.00965244427994079 401331 2073955 667 665 0 True 357 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 400 274 0.00906001565479563 0.0674537338998675 0.00906385900663768 0.0658274204623484 0.00140594898332009 0.0136215456295735 396030 2939686 667 665 0 True 401 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 445 274 0.00902720990157244 0.0558790888872444 0.0089570458533608 0.0559395742732891 0.00172239996077584 0.0110975617449744 394596 2435254 667 665 0 True 446 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 490 273 0.00932708285362926 0.0493342305179291 0.00920119020370794 0.053482871747921 0.00191749590179112 0.0145820180435003 407704 2150024 667 665 0 False 490 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 533 272 0.00921185092965076 0.0629771957933286 0.00924696726939803 0.0628976882581826 0.0015525440673782 0.0204268511174566 402667 2744595 667 665 0 True 535 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 577 272 0.00905509707952158 0.0509178645859327 0.00906385900663768 0.0516670481422141 0.00174738140184777 0.0143972837690656 395815 2219040 667 665 0 True 579 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 624 273 0.0092657722409109 0.00896695848111925 0.00923170824750134 0.00904859998474098 0.00211326933099554 0.0018276788209471 405024 390787 667 665 0 False 624 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 669 273 0.0104060810061895 0.0309491742631929 0.00943007553215839 0.0347142748149844 0.00433895978731913 0.0152336428444601 454869 1348789 667 665 0 False 669 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 268 317 0.0090494235601357 0.00910442735357506 0.00906385900663768 0.00920119020370794 0.00144180753119717 0.00146893305605147 395567 396778 667 665 0 False 268 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 312 317 0.00895608501540029 0.00899619155464766 0.00903334096284428 0.00898756389715419 0.00137208309317674 0.0012570823125286 391487 392061 667 665 0 False 312 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 357 318 0.00932314799341002 0.0911882590431217 0.00935378042267491 0.0925612268253605 0.00136373846737862 0.0235018923100395 407532 3974055 667 665 0 True 357 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 401 319 0.00929562684896965 0.0390527933475254 0.00932326237888151 0.0400396734569314 0.00150505975800224 0.00597823807461439 406329 1701951 667 665 0 True 401 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 445 318 0.00929818908353102 0.0562874340807386 0.00926222629129473 0.056092164492256 0.00167037021816439 0.0111944349786648 406441 2453050 667 665 0 True 446 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 489 317 0.0092657722409109 0.0338228037477534 0.00930800335698482 0.0354009308003357 0.00168273023786841 0.006378769362951 405024 1474024 667 665 0 True 490 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 532 316 0.00918490171256784 0.0360335033050697 0.00921644922560464 0.0371862363622492 0.00154695532184846 0.0106290593224388 401489 1570368 667 665 0 True 535 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 577 316 0.00912299629539774 0.0400712929038091 0.00910963607232776 0.0422980086976425 0.00183173342930653 0.00973630215573276 398783 1746338 667 665 0 True 580 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 624 316 0.00893439753000588 0.00887207719458867 0.0089417868314641 0.00886549172198062 0.00199914033469803 0.00210236037033765 390539 386652 667 665 0 False 624 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 669 316 0.00898008308731878 0.00882005884475437 0.00898756389715419 0.00886549172198062 0.00190744011610673 0.00186657841657524 392536 384385 667 665 0 False 669 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 269 363 0.00908213780498169 0.0389589446263863 0.00907911802853437 0.0388342107270924 0.00147660693575974 0.00792803812043766 396997 1697861 667 665 0 True 268 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 312 362 0.0092059486393219 0.0470432432649488 0.00935378042267491 0.0512550545510033 0.00140941275331759 0.0146745592677109 402409 2050181 667 665 0 True 312 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 357 363 0.00935680019912223 0.0295344678932396 0.00933852140077821 0.031113145647364 0.00174322682888649 0.0059295654389622 409003 1287135 667 665 0 True 357 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 402 363 0.00928670478219348 0.0283464440455683 0.00921644922560464 0.0289311055161364 0.00159753584735936 0.00424916511857836 405939 1235360 667 665 0 True 401 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 446 362 0.00938283433243323 0.0544117216823244 0.0093842984664683 0.0540474555580987 0.00175059090495232 0.00997128866863047 410141 2371305 667 665 0 True 446 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 490 360 0.0093918707846809 0.0249191071062871 0.009399557488365 0.0257114518959335 0.0017001102230198 0.00436462665308959 410536 1085994 667 665 0 False 490 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 533 360 0.0093212491945833 0.0236997850543043 0.00927748531319142 0.0245212481879911 0.00170797826017315 0.00409128332978546 407449 1032855 667 665 0 True 535 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 578 361 0.00917410372405923 0.0411687722395942 0.00909437705043107 0.0419165331502251 0.00195300844348356 0.00922623951133435 401017 1794167 667 665 0 True 580 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 622 361 0.00904008970566216 0.0489130815135802 0.00907911802853437 0.0495155260547799 0.00205568578753589 0.0115844047963451 395159 2131670 667 665 0 True 624 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 666 360 0.00899568526562994 0.0530091307462981 0.00901808194094758 0.0544747081712062 0.00182960570224859 0.0158759327565078 393218 2310179 667 665 0 True 669 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 269 407 0.00919906263393824 0.0354818609811322 0.00924696726939803 0.037445639734493 0.00160038626528766 0.00831243622313912 402108 1546327 667 665 0 True 268 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 313 406 0.0092375419065473 0.0273116299560988 0.00921644922560464 0.0271610589761196 0.0014436635286063 0.00464775128278346 403790 1190262 667 665 0 True 312 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 357 408 0.00932177536775215 0.0666456941162703 0.00929274433508812 0.0677500572213321 0.00139075713462576 0.0171112494434242 407472 2904471 667 665 0 True 357 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 401 406 0.00944327561556827 0.0502458021914479 0.00946059357595178 0.0514229037918669 0.00150755146411007 0.0132501177211463 412783 2189751 667 665 0 True 401 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 446 406 0.00945528609007467 0.0361569522340986 0.00943007553215839 0.0374914168001831 0.00173294663628365 0.00718579179612094 413308 1575748 667 665 0 True 446 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 490 405 0.00952361997074249 0.0456203681554539 0.00953688868543526 0.0461738002594034 0.00166646899091122 0.0116183251021271 416295 1988171 667 665 0 True 491 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 534 404 0.00953027720518317 0.0351417568870677 0.00956740672922866 0.0365300984206912 0.00165541252273126 0.00609515944681394 416586 1531505 667 665 0 True 535 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 578 405 0.0093125787758444 0.0447886711514423 0.00932326237888151 0.0457618066681926 0.00181092485898896 0.00839417647242748 407070 1951925 667 665 0 True 580 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 622 405 0.00923093042629521 0.0419740814613783 0.00926222629129473 0.0433813992523079 0.00176557792009163 0.00815617380494387 403501 1829263 667 665 0 True 624 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 666 405 0.00930683662517563 0.0893135103724062 0.0093842984664683 0.0892042420080873 0.00190731716677162 0.0254241362468141 406819 3892352 667 665 0 True 669 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 270 451 0.00913628788718481 0.0368986324818684 0.00914015411612116 0.0372625314717327 0.00156943538516155 0.00683377049688654 399364 1608071 667 665 0 True 268 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 313 450 0.00932623640114024 0.0417495787993674 0.00941481651026169 0.0419165331502251 0.00149226548445947 0.00734599731598089 407667 1819479 667 665 0 True 312 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 357 450 0.00951618491509567 0.0279543674934647 0.00956740672922866 0.0287785152971695 0.00146808550329372 0.00393980037429261 415970 1218273 667 665 0 True 357 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 402 450 0.00965205197813087 0.0443940934965016 0.00961318379491875 0.0452429999237049 0.00182232082872005 0.00780089362873686 421909 1934729 667 665 0 True 402 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 446 450 0.00949543539056748 0.0809761873211296 0.00952162966353857 0.0802929732204166 0.00190371924159565 0.0145141523189087 415063 3529005 667 665 0 True 446 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 490 449 0.00961519697921696 0.052100473201773 0.00961318379491875 0.0524147402151522 0.00189246777913099 0.0146968564183238 420298 2270579 667 665 0 True 491 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 534 449 0.00953515002626862 0.045305802845406 0.00946059357595178 0.0460669871061265 0.00171700927081539 0.00915467654668456 416799 1974462 667 665 0 True 535 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 579 448 0.00928011617903568 0.0295166618767105 0.00930800335698482 0.0296177615014878 0.00188527449577618 0.00404777850506465 405651 1286359 667 665 0 True 580 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 622 448 0.00920873964482625 0.0363198681069807 0.00924696726939803 0.0372930495155261 0.00187588667462678 0.00647762838196002 402531 1582848 667 665 0 True 624 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 667 448 0.00942783357691719 0.0680096900525518 0.00944533455405508 0.0673228046082246 0.00179407319764637 0.00985350523990164 412108 2963915 667 665 0 True 669 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 271 495 0.00933408324448442 0.0425656725930184 0.00935378042267491 0.0442969405661097 0.00153067119703042 0.00998287635382718 408010 1855045 667 665 0 True 268 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 314 495 0.00939662922029487 0.0440793446192731 0.00946059357595178 0.0446173800259403 0.00156196695341264 0.00562759354924671 410744 1921012 667 665 0 True 313 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 358 494 0.00956978594703564 0.0554235898742049 0.00958266575112535 0.0550240329594873 0.00156180026075854 0.0127935868499177 418313 2415403 667 665 0 True 357 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 404 495 0.00979835099616591 0.0735649377506481 0.00984206912336919 0.0710460059510185 0.00175751283446252 0.0155942140105281 428304 3206017 667 665 0 True 402 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 447 494 0.00977062395787686 0.0842339770231254 0.00976577401388571 0.0800030518043793 0.00182179083751657 0.0272391980325779 427092 3670982 667 665 0 True 446 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 491 492 0.00944684444227875 0.0353030206553234 0.00947585259784848 0.0366521705958648 0.00180657582676684 0.00535159282949907 412939 1538533 667 665 0 True 491 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 535 490 0.00965088524632168 0.0339427419544512 0.00965896086060884 0.0370489051651789 0.00176342288158675 0.00866247862054216 421858 1479251 667 665 0 False 535 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 580 493 0.00953784952339578 0.10709414873875 0.00956740672922866 0.103410391393912 0.00204374405756725 0.0265914076711404 416917 4667246 667 665 0 True 580 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 623 492 0.00921377260557178 0.0607574096605671 0.00926222629129473 0.0606240939955749 0.00174385456129619 0.0198870701487575 402751 2647855 667 665 0 True 624 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 667 492 0.00947825469274976 0.065317080754071 0.00943007553215839 0.0641641870756084 0.00200390010636404 0.0122004267153801 414312 2846569 667 665 0 True 669 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 270 538 0.00918732668456342 0.0382924810309133 0.00918593118181125 0.0413977264057374 0.00147565526835685 0.00919492801417544 401595 1668816 667 665 0 True 268 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 314 538 0.00930981064743435 0.0868049271725893 0.00930800335698482 0.0834821087968261 0.00157771616991432 0.021993513180293 406949 3783026 667 665 0 True 313 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 359 538 0.00969588449080564 0.0498233682168341 0.00962844281681544 0.0511024643320363 0.00171513670801621 0.0112061457787689 423825 2171341 667 665 0 True 357 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 403 537 0.00974470421003735 0.0494337468757726 0.00973525597009232 0.0502937361715114 0.00168941946894294 0.00563131249567202 425959 2154361 667 665 0 True 402 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 447 536 0.00972066038393026 0.0476832731863993 0.00970473792629892 0.0481727321278706 0.00192842011786307 0.0054064301029058 424908 2078074 667 665 0 True 446 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 492 535 0.00953114653476649 0.0557460485730233 0.00947585259784848 0.0561226825360494 0.00177083548054463 0.0117411086413314 416624 2429456 667 665 0 True 491 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 535 534 0.00972832421052005 0.0676433587975432 0.00961318379491875 0.0661936369878691 0.00223200457685545 0.0171296330772794 425243 2947950 667 665 0 True 535 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 578 534 0.00951188402136766 0.0514947473972182 0.00943007553215839 0.0522468909742886 0.00210751360031798 0.0115768633335768 415782 2244181 667 665 0 True 580 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 623 535 0.00915628246760117 0.0457496912342656 0.00926222629129473 0.0437628747997253 0.00187808413306047 0.00916557270153592 400238 1993807 667 665 0 True 625 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 668 534 0.00938402394133673 0.055702795556068 0.00926222629129473 0.056900892652781 0.00186842856833765 0.011953860061688 410193 2427571 667 665 0 True 669 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 270 581 0.00901634328178095 0.0361621150610562 0.00903334096284428 0.0370641641870756 0.00133866180738698 0.00793692812138798 394121 1575973 667 665 0 True 268 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 314 580 0.00914962523316049 0.0453779906392211 0.00906385900663768 0.0460364690623331 0.00145532351511377 0.00950850211257452 399947 1977608 667 665 0 True 313 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 359 579 0.00933881880300408 0.0381703859098421 0.00929274433508812 0.0386816205081254 0.00137500900583807 0.00647761852220908 408217 1663495 667 665 0 True 357 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 403 579 0.00950694256899932 0.0439645462936352 0.00959792477302205 0.0435339894712749 0.00160876124279193 0.00539360317921187 415566 1916009 667 665 0 True 402 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 446 578 0.00971139516073961 0.0810087475498084 0.00964370183871214 0.0766613260090028 0.00209834886846985 0.0185060103183521 424503 3530424 667 665 0 True 446 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 490 577 0.00975891088559634 0.0565129234163459 0.00965896086060884 0.0564736400396735 0.00237193963998327 0.0114921629629176 426580 2462877 667 665 0 True 491 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 534 577 0.00949854667539199 0.0506829903782115 0.0093690394445716 0.0501258869306477 0.00205269236250214 0.00864288828866576 415199 2208804 667 665 0 True 536 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 580 576 0.00911633906095705 0.033612229245579 0.00910963607232776 0.0356298161287861 0.00169185149301749 0.00788364325975468 398492 1464847 667 665 0 False 580 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 623 575 0.00913251316662566 0.0422942914622331 0.00920119020370794 0.0431525139238575 0.00157445201755294 0.00735953470195049 399199 1843218 667 665 0 True 625 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 667 575 0.00918513048351082 0.0469607986549115 0.00924696726939803 0.046646829938201 0.00170517537623458 0.00883505740485503 401499 2046588 667 665 0 True 669 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 268 621 0.00877533309335261 0.00855331278528204 0.00878919661249714 0.00860608834973678 0.00133528502787373 0.00136003981063196 383586 372760 667 665 0 False 268 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 313 620 0.00896736342288915 0.00883306916868734 0.00903334096284428 0.00883497367818723 0.00147250548700975 0.00142518444462292 391980 384952 667 665 0 False 313 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 358 622 0.00913756900446549 0.0619931150834284 0.00910963607232776 0.0609750514991989 0.00140549207799162 0.00914497277565821 399420 2701708 667 665 0 True 357 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 402 621 0.00939239695784976 0.0686787465344524 0.00946059357595178 0.0664072632944228 0.00145516628495307 0.0191422800795643 410559 2993073 667 665 0 True 402 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 447 620 0.0092309533033895 0.00934597881749464 0.00927748531319142 0.00933852140077821 0.00188604777887015 0.00207063289597913 403502 407305 667 665 0 False 447 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 491 620 0.00920825922584599 0.00917138348273981 0.00918593118181125 0.00921644922560464 0.00211244612164158 0.00188186386094998 402510 399696 667 665 0 False 491 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 536 620 0.00917543059552851 0.00973085035775523 0.00914015411612116 0.00930800335698482 0.00191719148368297 0.00427190902893128 401075 424078 667 665 0 False 536 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 580 620 0.0090951319945429 0.00892705556521195 0.00912489509422446 0.0089417868314641 0.00155388681746808 0.00169701664769356 397565 389048 667 665 0 False 580 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 625 620 0.00909314168733898 0.00894733973868065 0.00904859998474098 0.0089723048752575 0.00154639194022889 0.00149976110137039 397478 389932 667 665 0 False 625 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 669 620 0.00919698081835713 0.0106696358658147 0.00900282291905089 0.00923170824750134 0.00184728393034377 0.0101367973492537 402017 464991 667 665 0 False 669 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 269 670 0.00855241868651392 0.0344257072069049 0.00854505226215 0.0343938353551537 0.00135950442544755 0.00695868322531072 373842 1500299 667 665 0 True 268 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 313 664 0.00877942809323194 0.0086992257480506 0.00872816052491035 0.00872816052491035 0.00146429568927283 0.00132323717633579 383765 379119 667 665 0 False 313 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 358 664 0.00884147077296783 0.00881813138935689 0.00885023270008392 0.00874341954680705 0.0014041034035254 0.00127956050338763 386477 384301 667 665 0 False 358 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 402 664 0.00879480150060012 0.00880521284901427 0.00878919661249714 0.00880445563439384 0.00140824791654825 0.00141542262361772 384437 383738 667 665 0 False 402 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 447 663 0.00895194426133237 0.00881289972470659 0.00892652780956741 0.00881971465629053 0.00153031046564353 0.00154804000681476 391306 384073 667 665 0 False 447 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 491 663 0.00868615817977942 0.00886048951630622 0.00866712443732357 0.00886549172198062 0.00157688673719021 0.00160204295710258 379688 386147 667 665 0 False 491 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 536 663 0.00878269951771654 0.0089125537579357 0.00881971465629053 0.0089570458533608 0.00177198402509251 0.00176639113207471 383908 388416 667 665 0 False 536 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 580 663 0.00887686163784668 0.00886294472734824 0.00886549172198062 0.00888075074387732 0.00147324526006584 0.00127316536651372 388024 386254 667 665 0 False 580 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 625 663 0.00903185395171492 0.00874564529887318 0.00906385900663768 0.00872816052491035 0.00143265350321091 0.00137596588494576 394799 381142 667 665 0 False 625 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 665 667 0.00905006411877604 0.0375862063031233 0.00900282291905089 0.0377508201724269 0.00137285052052969 0.00821636317168083 395595 1638036 667 665 0 True 669 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G11_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G11_2.csv new file mode 100755 index 0000000..d4244ef --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G11_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 267 274 0.00795043082715909 0.67471516970499 0.00756847486076143 0.675120164797437 0.00233573920269963 0.21826615199753 347528 29404610 667 665 7 True 268 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 312 273 0.00637586905791783 0.00637721564153001 0.00633249408712902 0.0064087891966125 0.00141739111470649 0.0012275860520145 278701 277924 667 665 0 False 312 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 355 273 0.00589677694913129 0.00606414181482546 0.00588998245212482 0.00604257267109178 0.00126069510009136 0.0012374849786299 257759 264280 667 665 0 True 357 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 400 274 0.0059597118355448 0.00590198315656387 0.0059510185397116 0.00585946440833143 0.00131859569290589 0.00131078724787256 260510 257213 667 665 0 True 401 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 445 274 0.00601820856566452 0.00596111473465077 0.0059662775616083 0.00599679560540169 0.0016371664085736 0.00167851231639812 263067 259790 667 665 0 True 446 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 490 273 0.00622803727456482 0.00625303244377825 0.00622568093385214 0.00628671702143893 0.00173509905832357 0.00163710950545068 272239 272512 667 665 0 False 490 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 533 272 0.00666590485942655 0.00653981027184578 0.00663767452506294 0.00645456626230259 0.00149281047658038 0.00182376828619097 291379 285010 667 665 0 True 535 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 577 272 0.00697474563244814 0.00682417878066648 0.00697337300679027 0.00689707789730678 0.0016426872698611 0.00175196770195667 304879 297403 667 665 0 True 579 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 624 273 0.0121021887774355 0.00748440109199527 0.00796520943007553 0.00750743877317464 0.0198579258155976 0.00194034936517862 529009 326176 667 665 0 False 624 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 669 273 0.0410199340705019 0.539065769252612 0.00915541313801785 0.633005264362554 0.0963596379284443 0.362482395900922 1793057 23492904 667 665 11 False 669 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 268 317 0.00642054802308162 0.00613559533991766 0.0064087891966125 0.00613412680247196 0.00147366545442826 0.00149243196285414 280654 267394 667 665 0 False 268 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 312 317 0.00608951646859106 0.00599461574513074 0.00601205462729839 0.00599679560540169 0.00126222103215864 0.00123160145754419 266184 261250 667 665 0 False 312 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 357 318 0.00610164132856895 0.00621377201300344 0.00608834973678187 0.00621042191195544 0.00132075965795874 0.00132809721701953 266714 270801 667 665 0 True 357 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 401 319 0.00602514032523679 0.00617432801504792 0.00602731364919509 0.00611886778057527 0.00143854927935908 0.00133774418347396 263370 269082 667 665 0 True 401 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 445 318 0.00635054411453005 0.00623173865081564 0.00636301213092241 0.00627145799954223 0.00168835545319098 0.00167450752410492 277594 271584 667 665 0 True 446 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 489 317 0.00641164883339973 0.00641493869716635 0.00645456626230259 0.00646982528419928 0.00166296183804181 0.0016621296169039 280265 279568 667 665 0 True 490 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 532 316 0.00659834879996486 0.00664579737280946 0.00662241550316625 0.00663767452506294 0.00156998808065538 0.00151943766484803 288426 289629 667 665 0 True 535 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 577 316 0.00684240164193481 0.006899969080403 0.00689707789730678 0.00683604180972 0.00174985496141318 0.00179861080129627 299094 300706 667 665 0 True 580 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 624 316 0.00728436422667586 0.00724769121246696 0.00735484855420768 0.00729381246662089 0.00187309200411119 0.00188820745460688 318413 315860 667 665 0 False 624 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 669 316 0.00716350453750008 0.00712899208423898 0.00721751735713741 0.00720225833524071 0.0020236468904335 0.00184519502246716 313130 310687 667 665 0 False 669 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 269 363 0.00590368583160926 0.00582447191450818 0.00588998245212482 0.00576791027695125 0.00139667475610857 0.00140327144755726 258061 253835 667 665 0 True 268 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 312 362 0.0059749708574415 0.00602758899996616 0.00601205462729839 0.00602731364919509 0.00125885332821559 0.00129800245623458 261177 262687 667 665 0 True 312 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 357 363 0.00641899238066936 0.0062667081987413 0.0063935301747158 0.00619516289005875 0.00133831656082411 0.00126857214350152 280586 273108 667 665 0 True 357 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 402 363 0.00659626698438375 0.00655405967424857 0.00657663843747616 0.00656137941557946 0.00145175440816405 0.00141805349954154 288335 285631 667 665 0 True 401 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 446 362 0.00669136706538011 0.0066304465673224 0.00669871061264973 0.00668345159075303 0.00160355448159648 0.00177312985912886 292492 288960 667 665 0 True 446 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 490 360 0.00649558489237871 0.0065861609849756 0.0064087891966125 0.00662241550316625 0.00171417503080214 0.00171139229929318 283934 287030 667 665 0 False 490 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 533 360 0.00678772538656284 0.00666153825855552 0.00685130083161669 0.00665293354695964 0.00160431318012303 0.00164363331036106 296704 290315 667 665 0 True 535 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 578 361 0.00680200069340473 0.00679173328147561 0.00688181887541009 0.00685130083161669 0.00188169795561507 0.00199385567947047 297328 295989 667 665 0 True 580 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 622 361 0.00681435432432559 0.00680710703286025 0.00677500572213321 0.00688181887541009 0.00191470625548777 0.00194511200496794 297868 296659 667 665 0 True 624 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 666 360 0.00618649247131985 0.00635585301087463 0.00628671702143893 0.0063935301747158 0.00179624062753414 0.00189049567176493 270423 276993 667 665 0 True 669 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 269 407 0.00596728415375741 0.00590246502041324 0.00599679560540169 0.00588998245212482 0.00147687845173939 0.00139580431506009 260841 257234 667 665 0 True 268 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 313 406 0.00615679800292118 0.00631528466393725 0.00610360875867857 0.00631723506523232 0.00137147862402134 0.00135680828994418 269125 275225 667 665 0 True 312 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 357 408 0.00651194201480171 0.00642147827797922 0.00653086137178607 0.00643930724040589 0.00133248142277515 0.00131613301457004 284649 279853 667 665 0 True 357 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 401 406 0.00648300249051487 0.00666302974189881 0.00651560234988937 0.00665293354695964 0.00142414124157236 0.00148255939370574 283384 290380 667 665 0 True 401 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 446 406 0.00663742287702567 0.00675444619789345 0.00663767452506294 0.00679026474402991 0.00155193421123705 0.00158233633103691 290134 294364 667 665 0 True 446 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 490 405 0.00661255547552385 0.00654726768856222 0.00660715648126955 0.00654612039368277 0.00173303115713133 0.00161560012783455 289047 285335 667 665 0 True 491 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 534 404 0.00689350907059631 0.0068218382991124 0.00691233691920348 0.00692759594110018 0.00147887537898331 0.00157999085132531 301328 297301 667 665 0 True 535 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 578 405 0.00662369662044693 0.00661252582130538 0.00663767452506294 0.00662241550316625 0.00182899097157479 0.00186451286674671 289534 288179 667 665 0 True 580 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 622 405 0.00610264792071806 0.00615404384157923 0.00614938582436866 0.00613412680247196 0.0017593959116052 0.00182740137204923 266758 268198 667 665 0 True 624 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 666 405 0.00581634108557989 0.00589369968753424 0.00587472343022812 0.00588998245212482 0.00179460160784815 0.0017638724779401 254243 256852 667 665 0 True 669 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 270 451 0.00614405546139725 0.00602671705585777 0.00621042191195544 0.00605783169298848 0.00147732919087755 0.00151544513292035 268568 262649 667 665 0 True 268 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 313 450 0.00619539166100173 0.00626039807690432 0.00613412680247196 0.00627145799954223 0.00138671857899089 0.00150294544546315 270812 272833 667 665 0 True 312 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 357 450 0.00626210126797439 0.00639908308193234 0.00634775310902571 0.0064087891966125 0.00138470254315291 0.001398620600624 273728 278877 667 665 0 True 357 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 402 450 0.00656350698534917 0.00651599243014839 0.00659189745937285 0.00646982528419928 0.0016388661444033 0.00151151712647775 286903 283972 667 665 0 True 402 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 446 450 0.00654692109198319 0.00655906187992297 0.00668345159075303 0.00654612039368277 0.001828044618501 0.0019769818046491 286178 285849 667 665 0 True 446 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 490 449 0.00638026146002302 0.00651018711805836 0.0064087891966125 0.00646982528419928 0.00175274336838884 0.00178748656564973 278893 283719 667 665 0 True 491 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 534 449 0.00642482603971532 0.00627205459287954 0.00642404821850919 0.00625619897764553 0.0016497030371407 0.00161654807777324 280841 273341 667 665 0 True 535 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 579 448 0.00597760172328576 0.00599858538541364 0.00604257267109178 0.00614938582436866 0.00181630729053535 0.00186809627372268 261292 261423 667 665 0 True 580 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 622 448 0.00581940661621581 0.0058687116050598 0.00576791027695125 0.00578316929884794 0.00180429088637175 0.00175946899817594 254377 255763 667 665 0 True 624 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 667 448 0.00580929494053614 0.00601870893759921 0.00582894636453803 0.00599679560540169 0.00180058578683882 0.00169909544418174 253935 262300 667 665 0 True 669 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 271 495 0.00607652227902986 0.006259411403308 0.00604257267109178 0.00624093995574884 0.00147676300304317 0.00154081215883791 265616 272790 667 665 0 True 268 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 314 495 0.00617315512534417 0.00627483104648782 0.00611886778057527 0.00627145799954223 0.00142779003811783 0.00157919328494568 269840 273462 667 665 0 True 313 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 358 494 0.00639186014683205 0.006319988572943 0.00634775310902571 0.00630197604333562 0.00144002143229933 0.00141746305986494 279400 275430 667 665 0 True 357 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 404 495 0.0065109811768412 0.0062642070959041 0.00659189745937285 0.00633249408712902 0.00161006814802203 0.00156074917037305 284607 272999 667 665 0 True 402 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 447 494 0.00635068137709584 0.00668964698310207 0.00636301213092241 0.00668345159075303 0.00178259818868456 0.00189378233638035 277600 291540 667 665 0 True 446 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 491 492 0.00626278758080333 0.00615581067569358 0.00621042191195544 0.00619516289005875 0.00177829282983951 0.00182725642719367 273758 268275 667 665 0 True 491 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 535 490 0.00593777270211312 0.00587922082615557 0.00601205462729839 0.00588998245212482 0.00167348967634401 0.0016184057245788 259551 256221 667 665 0 False 535 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 580 493 0.00613353199802022 0.00588656351338406 0.00605783169298848 0.00593575951781491 0.00212890119456058 0.00182804911616897 268108 256541 667 665 0 True 580 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 623 492 0.00568445463695252 0.0056541445167049 0.00569161516746777 0.00566109712367437 0.00169216383228963 0.00167041342153807 248478 246412 667 665 0 True 624 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 667 492 0.00600347571693668 0.00579716629637724 0.0059510185397116 0.00579842832074464 0.00205147534795116 0.00173808476631915 262423 252645 667 665 0 True 669 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 270 538 0.00597165367876831 0.0060617554414762 0.00607309071488518 0.00611886778057527 0.00147141459401989 0.00146345437204488 261032 264176 667 665 0 True 268 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 314 538 0.00614048663468678 0.00635560060600116 0.00619516289005875 0.0063935301747158 0.00148501664642204 0.00142329191853085 268412 276982 667 665 0 True 313 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 359 538 0.00640053056557096 0.00636388407503079 0.00631723506523232 0.0063935301747158 0.00147629646823373 0.001443131392925 279779 277343 667 665 0 True 357 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 403 537 0.00622346185570524 0.00624137592780303 0.00619516289005875 0.00622568093385214 0.00163339124187259 0.00149272760815325 272039 272004 667 665 0 True 402 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 447 536 0.00605941021249503 0.00606756075356622 0.00608834973678187 0.00610360875867857 0.00184916687579713 0.00205573073109216 264868 264429 667 665 0 True 446 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 492 535 0.0061021446246435 0.00614869744744099 0.00605783169298848 0.00616464484626535 0.0018555042436117 0.00197581868310082 266736 267965 667 665 0 True 491 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 535 534 0.00616558280713157 0.0059740103290958 0.00610360875867857 0.00590524147402152 0.00173802824368276 0.00178557120657032 269509 260352 667 665 0 True 535 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 578 534 0.00584937560974605 0.0059882138397034 0.00578316929884794 0.00602731364919509 0.00169430414413622 0.00159821579088323 255687 260971 667 665 0 True 580 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 623 535 0.00589798943512908 0.00583167692635113 0.00593575951781491 0.00576791027695125 0.00175284421077435 0.00171419386606952 257812 254149 667 665 0 True 625 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 668 534 0.00596604879066532 0.00589571892652207 0.00601205462729839 0.00584420538643473 0.00168198915412276 0.00184357592626085 260787 256940 667 665 0 True 669 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 270 581 0.00630167864110975 0.00623435448314079 0.00622568093385214 0.00621042191195544 0.00128581492783766 0.00124150182263538 275458 271698 667 665 0 True 268 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 314 580 0.00628866157445425 0.00626702944130755 0.00634775310902571 0.00622568093385214 0.00146611429836691 0.00142255949087581 274889 273122 667 665 0 True 313 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 359 579 0.0061390911319346 0.00624041220010429 0.00608834973678187 0.00624093995574884 0.00131122157061427 0.00128532971873968 268351 271962 667 665 0 True 357 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 403 579 0.00593999178026002 0.00593647084064017 0.0059662775616083 0.0059662775616083 0.00145548261572254 0.00142005250547879 259648 258716 667 665 0 True 402 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 446 578 0.00612870493112336 0.00609817058094997 0.00616464484626535 0.00616464484626535 0.00190804451425039 0.00202695672680244 267897 265763 667 665 0 True 446 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 490 577 0.00627495819496981 0.00619697561596828 0.00621042191195544 0.00619516289005875 0.00205111216875388 0.00197715588650446 274290 270069 667 665 0 True 491 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 534 577 0.00614169912068457 0.00614823852948921 0.00616464484626535 0.00619516289005875 0.0018331355291884 0.00180840378976619 268465 267945 667 665 0 True 536 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 580 576 0.00604829194466626 0.00614780255743502 0.00601205462729839 0.00614938582436866 0.00163652381753723 0.00170296497234827 264382 267926 667 665 0 False 580 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 623 575 0.00614222529385342 0.00590230439913012 0.00614938582436866 0.00590524147402152 0.00148620773451067 0.00159425783612055 268488 257227 667 665 0 True 625 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 667 575 0.00594916549507347 0.00600732777239505 0.00605783169298848 0.00599679560540169 0.00164160382539412 0.00172826688812914 260049 261804 667 665 0 True 669 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 268 621 0.0064467880502413 0.00633290711328562 0.00642404821850919 0.0063782711528191 0.00142425841545943 0.00135552454995706 281801 275993 667 665 0 False 268 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 313 620 0.00624263286072688 0.00605932317633177 0.00616464484626535 0.00613412680247196 0.00137597454441625 0.00134957980197255 272877 264070 667 665 0 False 313 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 358 622 0.00598320661138874 0.00611836297082831 0.0059510185397116 0.00611886778057527 0.00126343426625407 0.0013786555248139 261537 266643 667 665 0 True 357 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 402 621 0.00583892077765192 0.00568833390411254 0.00584420538643473 0.00564583810177768 0.00139574892024709 0.00136856751885576 255230 247902 667 665 0 True 402 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 447 620 0.00587433451962506 0.00587575599561963 0.00593575951781491 0.00588998245212482 0.00167400484589376 0.00188663446552309 256778 256070 667 665 0 False 447 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 491 620 0.00598661529843913 0.00585395739291006 0.00593575951781491 0.00585946440833143 0.00185859667079085 0.00186608208277453 261686 255120 667 665 0 False 491 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 536 620 0.00597465057812133 0.00638237846848754 0.00590524147402152 0.00613412680247196 0.00188255768552624 0.00331543237918224 261163 278149 667 665 0 False 536 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 580 620 0.00592910228337422 0.0058908543962332 0.00585946440833143 0.00588998245212482 0.00151777197773759 0.0016723535671458 259172 256728 667 665 0 False 580 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 625 620 0.00589039423982218 0.00598986594432981 0.00587472343022812 0.00607309071488518 0.00139088097933241 0.0013337862429251 257480 261043 667 665 0 False 625 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 669 620 0.00638062749353179 0.00671266171838385 0.00625619897764553 0.00636301213092241 0.00161353495446479 0.0031985045519222 278909 292543 667 665 0 False 669 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 269 670 0.00767668351679047 0.693886627761897 0.00752269779507134 0.674753948271916 0.0016683109019006 0.183587401466743 335562 30240117 667 665 8 True 268 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 313 664 0.00660667606228929 0.00622356991127395 0.00660715648126955 0.00617990386816205 0.0014768882893727 0.00137079751012387 288790 271228 667 665 0 False 313 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 358 664 0.00586172924066692 0.0060116186552442 0.00584420538643473 0.00602731364919509 0.00125918283001975 0.00118001721478683 256227 261991 667 665 0 False 358 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 402 664 0.00572227047382695 0.00580994716133433 0.00564583810177768 0.00578316929884794 0.00134644150182279 0.00140932118326146 250131 253202 667 665 0 False 402 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 447 663 0.00572595368600891 0.00558629349753418 0.00573739223315786 0.00563057907988098 0.00152572021296993 0.0016355155200637 250292 243455 667 665 0 False 447 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 491 663 0.0055336488313408 0.00574735075271149 0.00549324788281071 0.00581368734264134 0.00164126791943903 0.00154131271041737 241886 250474 667 665 0 False 491 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 536 663 0.00574915105962697 0.00573319313389906 0.00578316929884794 0.00578316929884794 0.00160084293697888 0.00169408190610277 251306 249857 667 665 0 False 536 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 580 663 0.00580920343215895 0.00567656265864937 0.00575265125505455 0.00567635614557107 0.00139865902110602 0.0012252350235293 253931 247389 667 665 0 False 580 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 625 663 0.00730479347188388 0.00626184366845243 0.00645456626230259 0.00624093995574884 0.00432797284016413 0.00140816421352469 319306 272896 667 665 0 False 625 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 665 667 0.00788475068942983 0.732334934383338 0.00790417334248875 0.723262378881514 0.00166857253090917 0.195164656073062 344657 31915724 667 665 13 True 669 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G11_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G11_3.csv new file mode 100755 index 0000000..a1a6eb5 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G11_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 267 274 0.00104131957825162 0.0677066894748889 0.000854505226215 0.0673380636301213 0.00082219248003838 0.0232183285843877 45518 2950710 667 665 0 True 268 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 312 273 0.000920963185150387 0.0010308444491866 0.000823987182421607 0.000900282291905089 0.000698996783493379 0.000685922634294908 40257 44925 667 665 0 False 312 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 355 273 0.000964040753713324 0.000850030776185141 0.000823987182421607 0.000686655985351339 0.000724750805055214 0.000665531038986396 42140 37045 667 665 0 True 357 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 400 274 0.0009545238824854 0.000961708459750888 0.00080872816052491 0.00080872816052491 0.000687481035716036 0.000709363473041037 41724 41912 667 665 0 True 401 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 445 274 0.000935146983615082 0.0010009688905257 0.000701915007248035 0.000732433051041428 0.000824695194823169 0.000931269442002747 40877 43623 667 665 0 True 446 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 490 273 0.000952830977507355 0.000933737410589876 0.000762951094834821 0.000732433051041428 0.000868920927048058 0.000841862622971001 41650 40693 667 665 0 False 490 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 533 272 0.000965115977145325 0.000935618974192175 0.000778210116731518 0.000701915007248035 0.000825360080742847 0.000856400603232153 42187 40775 667 665 0 True 535 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 577 272 0.000978247429272317 0.0010059710962001 0.000717174029144732 0.000701915007248035 0.000933380373447551 0.000943361475440848 42761 43841 667 665 0 True 579 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 624 273 0.00141581761190817 0.000946678896830082 0.000823987182421607 0.000625619897764553 0.00204133590718311 0.000945299599522977 61888 41257 667 665 0 False 624 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 669 273 0.00425481926008843 0.0552129006425425 0.00112916762035554 0.0631113145647364 0.00958217420584358 0.03822951655154 185986 2406221 667 665 0 False 669 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 268 317 0.000882735560578603 0.000912994319169404 0.000717174029144732 0.000732433051041428 0.000716381169095629 0.000721374854562402 38586 39789 667 665 0 False 268 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 312 317 0.000897491286400746 0.000951726994299665 0.00080872816052491 0.000854505226215 0.000640222142651018 0.00065074113924777 39231 41477 667 665 0 False 312 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 357 318 0.000888820867661843 0.000924673781042214 0.000732433051041428 0.00080872816052491 0.000678309949908879 0.000687662521165128 38852 40298 667 665 0 True 357 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 401 319 0.000890696789394271 0.000849938992594785 0.000717174029144732 0.00064087891966125 0.000741725542287339 0.000714457962394632 38934 37041 667 665 0 True 401 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 445 318 0.000909478883812843 0.00098102890552084 0.000656137941557946 0.000686655985351339 0.000861472254551847 0.000921793262026201 39755 42754 667 665 0 True 446 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 489 317 0.00100329784752851 0.000978321289605336 0.000762951094834821 0.000762951094834821 0.000902423153095622 0.000837342521680204 43856 42636 667 665 0 True 490 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 532 316 0.000976577401388571 0.00085333498543796 0.000778210116731518 0.000671396963454643 0.000879943386952301 0.000791112601171915 42688 37189 667 665 0 True 535 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 577 316 0.000933042290939675 0.00109752522758028 0.000610360875867857 0.000823987182421607 0.00095300319707755 0.000995373385098313 40785 47831 667 665 0 True 580 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 624 316 0.00106787988473147 0.0010302019640541 0.000671396963454643 0.000671396963454643 0.00112255203523591 0.00106436506157003 46679 44897 667 665 0 False 624 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 669 316 0.00107339326445727 0.000995806063568167 0.000701915007248035 0.000625619897764553 0.00105598478073099 0.00100230853960583 46920 43398 667 665 0 False 669 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 269 363 0.000951412597660886 0.000909942514790065 0.000823987182421607 0.000762951094834821 0.000743770484214303 0.000744298557755416 41588 39656 667 665 0 True 268 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 312 362 0.00092462352023805 0.000920933599735204 0.000823987182421607 0.00080872816052491 0.000684367947467116 0.000670461776552882 40417 40135 667 665 0 True 312 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 357 363 0.000961158239831789 0.000899823373953309 0.00080872816052491 0.000778210116731518 0.000731876384336692 0.000718670882628533 42014 39215 667 665 0 True 357 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 402 363 0.000889667320150865 0.000884334893080722 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.000742777472326626 0.000694737810951193 38889 38540 667 665 0 True 401 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 446 362 0.00085189723746504 0.00094252568936647 0.000564583810177768 0.000656137941557946 0.000822171646335662 0.000909049916938351 37238 41076 667 665 0 True 446 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 490 360 0.00100162781964477 0.000959620383070287 0.000762951094834821 0.000671396963454643 0.000916182669895426 0.000885308418912549 43783 41821 667 665 0 False 490 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 533 360 0.00102699851722113 0.000946770680420438 0.000793469138628214 0.000625619897764553 0.000922973884407066 0.000916700410091072 44892 41261 667 665 0 True 535 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 578 361 0.000924097347069198 0.00103676449076456 0.000595101853971161 0.000686655985351339 0.000959819540424025 0.00110096863896312 40394 45183 667 665 0 True 580 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 622 361 0.000948461452496457 0.000872609539412734 0.000518806744487678 0.000457770656900893 0.00104525430828821 0.0009565867781461 41459 38029 667 665 0 True 624 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 666 360 0.000904285783407221 0.000852899013383768 0.000579842832074464 0.0004272526131075 0.000939615792687701 0.000943609603881228 39528 37170 667 665 0 True 669 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 269 407 0.000905978688385265 0.000961341325389464 0.000732433051041428 0.00080872816052491 0.000768305687062041 0.000761382966538447 39602 41896 667 665 0 True 268 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 313 406 0.000975479300862272 0.000943145228601373 0.000869764248111696 0.000823987182421607 0.000724220010507072 0.000703741505125254 42640 41103 667 665 0 True 312 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 357 408 0.000943497123033814 0.000894958843664437 0.000839246204318303 0.000762951094834821 0.000689881753509955 0.000680979689952169 41242 39003 667 665 0 True 357 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 401 406 0.000907580084986118 0.000981212472701552 0.000686655985351339 0.000762951094834821 0.000778369664696016 0.000805484909117877 39672 42762 667 665 0 True 401 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 446 406 0.000942421899601813 0.00103644324819832 0.000717174029144732 0.000839246204318303 0.000811982268126472 0.000897101210219604 41195 45169 667 665 0 True 446 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 490 405 0.000920185363944258 0.000879906334846042 0.00064087891966125 0.000579842832074464 0.000851413516645563 0.00084913256265726 40223 38347 667 665 0 True 491 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 534 404 0.00104049600285689 0.000948468676842025 0.000869764248111696 0.000747692072938125 0.000864899333462996 0.00084855430558066 45482 41335 667 665 0 True 535 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 578 405 0.000975296284107889 0.00100046408077874 0.00064087891966125 0.000717174029144732 0.000988279926319128 0.000988323788439009 42632 43601 667 665 0 True 580 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 622 405 0.00100034670236408 0.000926509452849335 0.000671396963454643 0.000503547722590982 0.00100913819189576 0.00100077005077782 43727 40378 667 665 0 True 624 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 666 405 0.000890536649734185 0.000906454738356534 0.000503547722590982 0.000503547722590982 0.000936234271053317 0.000961826184950096 38927 39504 667 665 0 True 669 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 270 451 0.000912109749657101 0.000881466655882095 0.000732433051041428 0.000671396963454643 0.000797374648470746 0.00081730382848874 39870 38415 667 665 0 True 268 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 313 450 0.000912475783165867 0.000996632115881372 0.00080872816052491 0.000839246204318303 0.000734552093417181 0.000828777726961048 39886 43434 667 665 0 True 312 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 357 450 0.000934986843954997 0.00087575312738243 0.000823987182421607 0.000732433051041428 0.00074656599677996 0.000723279855617627 40870 38166 667 665 0 True 357 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 402 450 0.000981839133077087 0.00088623940258061 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.000883566750976613 0.000771564271970358 42918 38623 667 665 0 True 402 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 446 450 0.000974770110939037 0.00100810506467588 0.000579842832074464 0.000686655985351339 0.000997766851261774 0.00104179456233536 42609 43934 667 665 0 True 446 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 490 449 0.000946288128538157 0.000928804042608237 0.000579842832074464 0.000518806744487678 0.000966329717482981 0.00101900137048839 41364 40478 667 665 0 True 491 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 534 449 0.000935375754558061 0.000937477591896886 0.000671396963454643 0.000686655985351339 0.000909924923811067 0.000903656533281099 40887 40856 667 665 0 True 535 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 579 448 0.000913139218900506 0.000955237716630785 0.000503547722590982 0.000595101853971161 0.000958932837539456 0.00101642000968506 39915 41630 667 665 0 True 580 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 622 448 0.000915495559613189 0.000967100745684307 0.000518806744487678 0.000625619897764553 0.000946623367031066 0.000959346927121702 40018 42147 667 665 0 True 624 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 667 448 0.000934849581389209 0.000844707327944489 0.000503547722590982 0.000396734569314107 0.000994697043450336 0.000979926210231255 40864 36813 667 665 0 True 669 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 271 495 0.000952213295961312 0.000902209747302566 0.000793469138628214 0.000732433051041428 0.000757787766942839 0.000800729493847767 41623 39319 667 665 0 True 268 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 314 495 0.00103534865663987 0.00098079944654495 0.000946059357595178 0.000900282291905089 0.00084593528580199 0.000788915673277895 45257 42744 667 665 0 True 313 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 358 494 0.000886624666609245 0.000919029090235316 0.000747692072938125 0.000732433051041428 0.000768714634312177 0.000838883217079162 38756 40052 667 665 0 True 357 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 404 495 0.000993231926037439 0.000979904556538979 0.000717174029144732 0.000732433051041428 0.000922178573486953 0.000857564948006814 43416 42705 667 665 0 True 402 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 447 494 0.000902890280655049 0.00096492088541335 0.000503547722590982 0.000518806744487678 0.000979493543711515 0.00106622071407894 39467 42052 667 665 0 True 446 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 491 492 0.000903507962201092 0.000853656228004206 0.000579842832074464 0.000411993591210803 0.000907112953039848 0.000964923947080503 39494 37203 667 665 0 True 491 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 535 490 0.000821333439483051 0.000875523668406539 0.000518806744487678 0.000610360875867857 0.000841818809885395 0.000824456645328522 35902 38156 667 665 0 False 535 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 580 493 0.00101141921600427 0.000962993430015873 0.000671396963454643 0.000579842832074464 0.000987558056351292 0.00100122871542519 44211 41968 667 665 0 True 580 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 623 492 0.000986506060313858 0.000979927502436568 0.000671396963454643 0.000656137941557946 0.000951646201060165 0.000938828180469303 43122 42706 667 665 0 True 624 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 667 492 0.000999591758252254 0.000834450511722199 0.000701915007248035 0.000411993591210803 0.000979998808623242 0.000971120989244979 43694 36366 667 665 0 True 669 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 270 538 0.000867751063813481 0.00090959832632623 0.000686655985351339 0.000732433051041428 0.000765336281834645 0.000800380203058255 37931 39641 667 665 0 True 268 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 314 538 0.000992179579699736 0.00101886669064513 0.000900282291905089 0.000885023270008392 0.000796099310579442 0.000808179060001697 43370 44403 667 665 0 True 313 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 359 538 0.000886807683363628 0.00088366946205064 0.000762951094834821 0.000778210116731518 0.000732962578400628 0.000710575474853949 38764 38511 667 665 0 True 357 534 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 403 537 0.000929747989360779 0.000924880294120515 0.000656137941557946 0.000686655985351339 0.000849572993999938 0.000837579282443747 40641 40307 667 665 0 True 402 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 447 536 0.000958779022024808 0.000827153716288891 0.000503547722590982 0.000335698481727321 0.00102737060263779 0.000977855684282087 41910 36048 667 665 0 True 446 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 492 535 0.000950017094908714 0.000845235083589037 0.000518806744487678 0.000366216525520714 0.0010534650148938 0.00101549521676985 41527 36836 667 665 0 True 491 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 535 534 0.000941918603527259 0.000897138703935394 0.000534065766384375 0.000457770656900893 0.000999168860362911 0.000991053443070436 41173 39098 667 665 0 True 535 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 578 534 0.000924920922463923 0.000972653652900849 0.00064087891966125 0.000656137941557946 0.000909699306145807 0.000952777348370621 40430 42389 667 665 0 True 580 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 623 535 0.000934552179163337 0.000864739096539701 0.000625619897764553 0.000503547722590982 0.000901310529554247 0.000914325306476948 40851 37686 667 665 0 True 625 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 668 534 0.000902592878429176 0.000871462244533283 0.000579842832074464 0.000442511635004196 0.000957186667957378 0.000970033421086767 39454 37979 667 665 0 True 669 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 270 581 0.000862191929899093 0.000978780207557117 0.000762951094834821 0.000885023270008392 0.000675618228026532 0.000654746676583509 37688 42656 667 665 0 True 268 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 314 580 0.000935375754558061 0.00101129454444075 0.000778210116731518 0.000900282291905089 0.000749414049496937 0.000807158011576565 40887 44073 667 665 0 True 313 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 359 579 0.000855328801609724 0.000897758243170297 0.000732433051041428 0.000762951094834821 0.000688234991539691 0.000697246403521738 37388 39125 667 665 0 True 357 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 403 579 0.000889987599471036 0.000898285998814844 0.000747692072938125 0.000717174029144732 0.000773834886966829 0.000765709166957077 38903 39148 667 665 0 True 402 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 446 578 0.000931784050753291 0.000850466748239333 0.000503547722590982 0.0004272526131075 0.000973529675413968 0.000972138291406637 40730 37064 667 665 0 True 446 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 490 577 0.000968227261969839 0.000891425175435728 0.000473029678797589 0.0004272526131075 0.00111189645839266 0.00104555007742584 42323 38849 667 665 0 True 491 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 534 577 0.000962736759338344 0.00100044113488115 0.000564583810177768 0.000595101853971161 0.00105466554906648 0.00103660329908455 42083 43600 667 665 0 True 536 577 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 580 576 0.000952259050149908 0.00101246478521779 0.000671396963454643 0.000717174029144732 0.000892540567339166 0.00095294171630314 41625 44124 667 665 0 False 580 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 623 575 0.000909707654755822 0.000923021676415805 0.000671396963454643 0.000701915007248035 0.000806064530089059 0.000822132039992514 39765 40226 667 665 0 True 625 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 667 575 0.000878869331642259 0.000889956637990031 0.000610360875867857 0.000595101853971161 0.000833500087163597 0.000844211710913579 38417 38785 667 665 0 True 669 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 268 621 0.000825565701928162 0.000891264554152605 0.000671396963454643 0.000732433051041428 0.000689591415995075 0.000702585790851657 36087 38842 667 665 0 False 268 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 313 620 0.000957635167309913 0.00095721106382344 0.00080872816052491 0.000869764248111696 0.000755090787590342 0.000695809490868755 41860 41716 667 665 0 False 313 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 358 622 0.000891977906674953 0.000932980195969438 0.000778210116731518 0.000793469138628214 0.000687242010459314 0.000721998514388434 38990 40660 667 665 0 True 357 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 402 621 0.000894540141236317 0.000875890802767964 0.000701915007248035 0.000686655985351339 0.000765207225699804 0.000751669117821082 39102 38172 667 665 0 True 402 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 447 620 0.00083341254527234 0.000934379895722368 0.000473029678797589 0.000534065766384375 0.000910792200906559 0.000975435068121781 36430 40721 667 665 0 False 447 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 491 620 0.00090712254310016 0.000931901738782755 0.000549324788281071 0.000488288700694286 0.000952617658366942 0.00101004151531725 39652 40613 667 665 0 False 491 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 536 620 0.000967174915632136 0.000996632115881372 0.000549324788281071 0.000503547722590982 0.00103700163986323 0.00111973236896489 42277 43434 667 665 0 False 536 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 580 620 0.000949468044645565 0.000978091830629446 0.000701915007248035 0.000701915007248035 0.000836208183513138 0.000878621443382482 41503 42626 667 665 0 False 580 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 625 620 0.00095191589373544 0.000878529580990701 0.000778210116731518 0.000701915007248035 0.000748714014539543 0.000722954475226099 41610 38287 667 665 0 False 625 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 669 620 0.000960128770588384 0.00101618202062721 0.000717174029144732 0.000747692072938125 0.000830566453467079 0.000856320569264966 41969 44286 667 665 0 False 669 620 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 269 670 0.00104321837707834 0.0699912289306466 0.000869764248111696 0.0675364309147784 0.000797685142746085 0.0203159624816125 45601 3050272 667 665 0 True 268 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 313 664 0.00100663790329601 0.000997664681272878 0.000900282291905089 0.000869764248111696 0.000735031046570065 0.000688366125422037 44002 43479 667 665 0 False 313 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 358 664 0.000896187292025766 0.000877588799189551 0.000793469138628214 0.000762951094834821 0.00066646834732762 0.000637850044670471 39174 38246 667 665 0 False 358 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 402 664 0.000968799189327286 0.000927886206704677 0.000823987182421607 0.000732433051041428 0.000748906767254321 0.000752044218670298 42348 40438 667 665 0 False 402 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 447 663 0.000890490895545589 0.000873986293268075 0.000671396963454643 0.000686655985351339 0.000812113008004293 0.000779512913075567 38925 38089 667 665 0 False 447 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 491 663 0.000886006985063202 0.000849525966438183 0.000595101853971161 0.000625619897764553 0.000833093259160224 0.000785631068460968 38729 37023 667 665 0 False 491 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 536 663 0.00102416175752819 0.000952438317124925 0.000671396963454643 0.000610360875867857 0.000956662444871821 0.000929820817307878 44768 41508 667 665 0 False 536 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 580 663 0.000929496341323502 0.000880319361002644 0.000732433051041428 0.000747692072938125 0.000752799362318963 0.000690389282397173 40630 38365 667 665 0 False 580 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 625 663 0.00101832809848223 0.000974397541117614 0.000823987182421607 0.000823987182421607 0.000788129954070782 0.000746501316410161 44513 42465 667 665 0 False 625 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 665 667 0.00106392214741794 0.0753468014279232 0.000915541313801785 0.0723430228122377 0.000796352844667692 0.0233329171184797 46506 3283672 667 665 0 True 669 663 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G12_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G12_1.csv new file mode 100755 index 0000000..e553d97 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G12_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 240 245 0.00911377682639568 0.0348876081253718 0.00909437705043107 0.0350652323186084 0.00167981812048593 0.00644549028753979 398380 1520429 667 665 0 True 240 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 285 245 0.00908595827972944 0.00912987435400128 0.00915541313801785 0.00912489509422446 0.00147277108621463 0.00153709182401966 397164 397887 667 665 0 False 285 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 328 245 0.00909659612857796 0.0461366508512068 0.00910963607232776 0.0461890592813001 0.00132332250385261 0.00505272294423349 397629 2010671 667 665 0 True 329 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 372 244 0.00930555550789494 0.0652263756209017 0.00930800335698482 0.0636301213092241 0.00127585637514485 0.00801114805786913 406763 2842616 667 665 0 True 374 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 418 245 0.00917080942248034 0.0557435245242885 0.00906385900663768 0.0545510032806897 0.00148793637307691 0.00812038771618369 400873 2429346 667 665 0 True 418 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 460 244 0.00904734174455459 0.0494962285549075 0.0089723048752575 0.0525062943465324 0.00167442080314289 0.0111960997753029 395476 2157084 667 665 0 True 463 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 505 243 0.00902137624252648 0.0623236966299934 0.00901808194094758 0.0629892423895628 0.00164534722076505 0.0145014960955066 394341 2716115 667 665 0 True 508 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 549 243 0.00899113272386466 0.0522222929720731 0.00898756389715419 0.0521400778210117 0.0015239829114871 0.0126348576816145 393019 2275888 667 665 0 True 552 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 597 244 0.00901309473439064 0.00879832907973757 0.0089417868314641 0.00883497367818723 0.002297509223149 0.0020327807863059 393979 383438 667 665 0 False 597 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 636 243 0.00902579152172598 0.0377085308831704 0.00909437705043107 0.0378271152819104 0.00208737638749746 0.00701588688761617 394534 1643367 667 665 0 True 642 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 240 288 0.00896100359067434 0.00894713322560234 0.00892652780956741 0.0089723048752575 0.00162524278265242 0.00155174477388605 391702 389923 667 665 0 False 240 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 285 288 0.00911606453582547 0.00902409376611591 0.00918593118181125 0.00904859998474098 0.00139294564548454 0.00138772019257406 398480 393277 667 665 0 False 285 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 329 288 0.00925426506247906 0.0730052184707592 0.00926222629129473 0.0709086747539483 0.00134480332455738 0.0113087996689045 404521 3181624 667 665 0 True 329 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 373 289 0.00920803045490301 0.0379539372578849 0.00923170824750134 0.0380102235446708 0.00138327325664708 0.00468603067769171 402500 1654062 667 665 0 True 374 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 417 288 0.00929688508915604 0.0586765838836046 0.00932326237888151 0.0578927290760662 0.00159949823933353 0.00695713652663491 406384 2557171 667 665 0 True 419 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 462 287 0.00906401914629776 0.033420172082759 0.00903334096284428 0.0341496910048066 0.00182849615881224 0.00580087210983627 396205 1456477 667 665 0 True 463 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 506 286 0.00906040456539869 0.0349966699766124 0.00909437705043107 0.035736629282063 0.00165850220350294 0.00761148212458706 396047 1525182 667 665 0 True 508 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 549 287 0.00890637308949096 0.0386951815336005 0.00889600976577401 0.0402380407415885 0.0015264448911522 0.00600873883923513 389314 1686366 667 665 0 True 552 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 597 287 0.0089396135075058 0.00890672549994809 0.00883497367818723 0.00892652780956741 0.00189830676404336 0.00193178253397037 390767 388162 667 665 0 False 597 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 642 287 0.00917467565141668 0.00878644310478646 0.00915541313801785 0.00880445563439384 0.00204206159413995 0.00194718947103744 401042 382920 667 665 0 False 642 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 240 333 0.00883776468369157 0.0350869850295228 0.00888075074387732 0.0352025635156786 0.00154583901123336 0.00507905712811272 386315 1529118 667 665 0 True 240 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 285 333 0.00908257246977335 0.0447769916895695 0.00917067215991455 0.0454718852521553 0.00136115706373286 0.0128281111931751 397016 1951416 667 665 0 True 285 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 328 334 0.00926330151472673 0.0307319225048201 0.00935378042267491 0.0307469291218433 0.00139279490598102 0.00573242115823527 404916 1339321 667 665 0 True 329 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 371 333 0.00932166098228066 0.0269305903807355 0.00935378042267491 0.027542534523537 0.00132439857045563 0.00443915366365998 407467 1173656 667 665 0 True 374 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 417 333 0.00948635318413121 0.0506450378635993 0.00946059357595178 0.0499580376897841 0.00158898985538719 0.00638761330045183 414666 2207150 667 665 0 True 419 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 461 331 0.0090407531413968 0.0246756281869701 0.00903334096284428 0.0254673075455863 0.00176352882848769 0.00395272404851604 395188 1075383 667 665 0 True 463 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 508 331 0.00927657022941951 0.0229516340634144 0.00927748531319142 0.0234988937209125 0.00173580171866551 0.00344565589205412 405496 1000250 667 665 0 False 508 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 550 331 0.00913830107148303 0.0383161841431227 0.00909437705043107 0.0386968795300221 0.00161425761259835 0.0051291869396691 399452 1669849 667 665 0 True 553 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 594 333 0.00903361548797586 0.0456942768915881 0.00904859998474098 0.045838101777676 0.00208381484666964 0.00832027785542774 394876 1991392 667 665 0 True 597 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 638 331 0.00881802175131249 0.0513869934621401 0.00878919661249714 0.0522163729304952 0.00204853997214524 0.0124262928424927 385452 2239485 667 665 0 True 642 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 241 377 0.00921427590164634 0.0321445637439903 0.00923170824750134 0.0338750286106661 0.0016386965258435 0.00689190608446389 402773 1400885 667 665 0 True 240 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 284 377 0.0092832045867659 0.0249140360629199 0.00927748531319142 0.0248874647135119 0.00148412760199721 0.00367709837915967 405786 1085773 667 665 0 True 285 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 328 377 0.00940610033733419 0.0590177893807533 0.00946059357595178 0.0588540474555581 0.00147613374675041 0.0104807322407896 411158 2572041 667 665 0 True 330 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 372 378 0.00926842598384946 0.0461905737105409 0.00932326237888151 0.0468604562447547 0.00144024175605549 0.00952940458679616 405140 2013021 667 665 0 True 374 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 416 376 0.00936174165149057 0.0339224577809826 0.0093690394445716 0.0343480582894636 0.00160800837516862 0.0062198467422784 409219 1478367 667 665 0 True 419 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 462 376 0.00944204025247619 0.0445367481418125 0.00943007553215839 0.0440375371938659 0.00169348697453826 0.00937738230559097 412729 1940946 667 665 0 True 464 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 506 376 0.00956774988564312 0.0344884183450157 0.00941481651026169 0.0347295338368811 0.00302848592902794 0.00430287141802312 418224 1503032 667 665 0 True 508 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 549 375 0.00917099243923472 0.042161526498783 0.00924696726939803 0.0424353398947128 0.00180191457329991 0.00645014063338286 400881 1837432 667 665 0 True 553 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 594 376 0.00906278378320567 0.0345155174500683 0.00907911802853437 0.0351720454718853 0.00244109229251842 0.00504226285136434 396151 1504213 667 665 0 True 597 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 637 376 0.00966721949165038 0.0786702393429213 0.00920119020370794 0.0763408865491722 0.00506195342522532 0.0159643795629664 422572 3428510 667 665 0 True 642 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 241 421 0.00912077721725084 0.034218230400905 0.00915541313801785 0.0346379797055009 0.00148475866962758 0.00470591285081634 398686 1491257 667 665 0 True 241 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 285 420 0.00918686914267746 0.0376452460976199 0.00924696726939803 0.037445639734493 0.00151765794558618 0.00535886480185315 401575 1640609 667 665 0 True 285 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 330 421 0.00916875048399353 0.0271492418388613 0.00920119020370794 0.0275272755016403 0.0013184408007029 0.00255686148469016 400783 1183185 667 665 0 True 330 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 373 421 0.00945549198392335 0.041330357250416 0.00943007553215839 0.0405737392233158 0.00141035501921883 0.00758214704359494 413317 1801209 667 665 0 True 374 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 418 421 0.00957827334902016 0.0730714403312011 0.00965896086060884 0.0725261310749981 0.00165170046725726 0.00944493849635937 418684 3184510 667 665 0 True 419 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 462 420 0.00957680921498509 0.0473413563664253 0.00959792477302205 0.0474708171206226 0.001737835544566 0.00960026524434778 418620 2063173 667 665 0 True 464 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 506 420 0.0093038626029169 0.0422409881421338 0.0093842984664683 0.042069123369192 0.00157718154691296 0.00513848158197229 406689 1840895 667 665 0 True 508 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 549 419 0.00918254537185516 0.0289228449930044 0.00915541313801785 0.0292668039978637 0.00165305595927846 0.00390332357554669 401386 1260480 667 665 0 True 553 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 594 420 0.00919936003616411 0.0336137207289223 0.00921644922560464 0.0339055466544594 0.00195359177831604 0.00399693829010957 402121 1464912 667 665 0 True 598 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 637 422 0.0136754694293961 0.0639215801003998 0.00949111161974517 0.0631723506523232 0.0178581349720153 0.00993951348003877 597780 2785752 667 665 0 True 642 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 243 465 0.00919860509205228 0.0402654610892073 0.00935378042267491 0.0412298771648737 0.0015503360268889 0.0090688580489397 402088 1754800 667 665 0 True 241 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 287 464 0.00911611029001407 0.0397799029503261 0.00914015411612116 0.0399176012817578 0.0015840118121937 0.0053444607269712 398482 1733639 667 665 0 True 285 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 330 465 0.00930255860854192 0.051908301309465 0.00949111161974517 0.0507209887846189 0.00158317284611973 0.00979548974271538 406632 2262204 667 665 0 True 330 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 374 465 0.00961782784506122 0.0658005049244764 0.00962844281681544 0.0645304036011292 0.00152265146277036 0.00960154036791526 420413 2867637 667 665 0 True 375 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 419 465 0.00976492756139669 0.0756017532960348 0.0097962920576791 0.0725413900968948 0.00183962967006618 0.0189691573418706 426843 3294783 667 665 0 True 419 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 463 463 0.00964358745324065 0.0373426814920111 0.00964370183871214 0.0370489051651789 0.00198068116701635 0.00633075025068417 421539 1627423 667 665 0 True 464 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 508 461 0.00978510515856743 0.0302567359116491 0.00955214770733196 0.0322880903334096 0.00338543332020241 0.00721612178274755 427725 1318612 667 665 0 False 508 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 552 464 0.00992714903706307 0.0858416813376999 0.00946059357595178 0.0846265354390784 0.00567227354296977 0.0120833738615505 433934 3741047 667 665 0 True 553 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 598 461 0.0140408166253335 0.0655496144802381 0.00993362325474937 0.0576333257038224 0.0194128597476461 0.0523375042778683 613750 2856703 667 665 0 False 598 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 640 464 0.0150970520690673 0.066347626906589 0.00964370183871214 0.063782711528191 0.0185602059389792 0.0106528692712112 659920 2891481 667 665 0 True 642 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 242 510 0.00921416151617485 0.0338601137772332 0.00912489509422446 0.0355687800411994 0.00145654990780608 0.00585491555036141 402768 1475650 667 665 0 True 241 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 287 508 0.0090755034476353 0.0756542305638209 0.00912489509422446 0.0732280460822461 0.00155783870401697 0.0166325881859949 396707 3297070 667 665 0 True 285 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 330 510 0.00916891062365361 0.0426181039690093 0.00917067215991455 0.044083314259556 0.00154983475629125 0.00700997885746418 400790 1857330 667 665 0 True 330 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 375 509 0.00967726253604715 0.0460524623529527 0.00973525597009232 0.0460517280842298 0.00198498313756129 0.00466568263616928 423011 2007002 667 665 0 True 375 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 420 508 0.0096778573404989 0.0451919453015693 0.00955214770733196 0.0454718852521553 0.00187664486856665 0.00506243327206346 423037 1969500 667 665 0 True 419 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 463 508 0.00964244359852575 0.0520171337017297 0.00956740672922866 0.0514076447699702 0.00189624431380238 0.00849491598170515 421489 2266947 667 665 0 True 464 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 506 508 0.00927583816240198 0.0608609415504887 0.00921644922560464 0.0588845654993515 0.00178536551335208 0.0119093321677231 405464 2652367 667 665 0 True 509 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 550 507 0.00908627855904961 0.0495318635338633 0.00907911802853437 0.0494850080109865 0.00169946509822959 0.00932071459821015 397178 2158637 667 665 0 True 553 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 595 506 0.00914049727253562 0.0442226876415117 0.00912489509422446 0.0421911955443656 0.00181568707456114 0.00804369642502919 399548 1927259 667 665 0 True 598 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 640 505 0.00908012462068348 0.0553563354483714 0.00901808194094758 0.0555733577477684 0.00186555319054199 0.0110259757027509 396909 2412472 667 665 0 True 643 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 243 551 0.00909993618434546 0.0312253740324719 0.00918593118181125 0.0317692835889219 0.00138771515956486 0.00474762953483772 397775 1360826 667 665 0 True 241 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 286 549 0.0091832088075898 0.0400449510133769 0.00917067215991455 0.0398260471503777 0.00145013349119189 0.00736809569811211 401415 1745190 667 665 0 True 286 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 331 552 0.00919160470119712 0.0335412346384386 0.00923170824750134 0.0345769436179141 0.00142500492183347 0.00482435342923893 401782 1461753 667 665 0 True 330 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 374 549 0.00947608136879146 0.0388515348797721 0.00952162966353857 0.0386053253986419 0.0014521082604867 0.00418959377474205 414217 1693180 667 665 0 True 375 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 419 550 0.00949921011112663 0.0733547762746303 0.00955214770733196 0.0693217364766918 0.00186111363685197 0.0130142755240722 415228 3196858 667 665 0 True 420 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 463 549 0.00948299025126942 0.0536205700793526 0.00952162966353857 0.0526131074998093 0.00197655109832993 0.00870662328924412 414519 2336826 667 665 0 True 464 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 506 549 0.00931953341251096 0.0462379569890623 0.00933852140077821 0.0460822461280232 0.00188436883320666 0.00563091042339622 407374 2015086 667 665 0 True 509 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 551 547 0.00897164143952286 0.032445177948304 0.00898756389715419 0.0335088120851453 0.00176598709154817 0.00591811938707344 392167 1413986 667 665 0 True 553 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 596 547 0.00902597453848036 0.0398286859286004 0.00904859998474098 0.040360112916762 0.00173845580687833 0.00527233165574052 394542 1735765 667 665 0 True 598 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 638 549 0.00919377802515542 0.0453091988382492 0.00929274433508812 0.0445868619821469 0.00187810576646915 0.00560238333814995 401877 1974610 667 665 0 True 643 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 241 593 0.00881921136021598 0.00873470010572322 0.00883497367818723 0.00878919661249714 0.00137607646184351 0.00127092267072365 385504 380665 667 665 0 False 241 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 286 592 0.00870873787185144 0.00868346191640695 0.00875867856870375 0.00872816052491035 0.00141600408188136 0.00147799988184433 380675 378432 667 665 0 False 286 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 328 594 0.00927670749198529 0.051671017782497 0.00927748531319142 0.0513923857480735 0.00149148087265449 0.007288218146604 405502 2251863 667 665 0 True 330 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 373 593 0.00943616083924163 0.0565782503867818 0.009399557488365 0.0563668268863966 0.00135836611284843 0.0125576084862771 412472 2465724 667 665 0 True 375 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 420 592 0.00925527165462817 0.00948801392357066 0.00927748531319142 0.00950637064164187 0.00177405155951947 0.00175504834310918 404565 413495 667 665 0 False 420 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 464 592 0.00926291260412366 0.00903692052286817 0.00924696726939803 0.00903334096284428 0.00198905842805495 0.00190928646855242 404899 393836 667 665 0 False 464 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 509 592 0.00887958401206813 0.00901188654859855 0.00904859998474098 0.00901808194094758 0.00210892064521235 0.00214114973651616 388143 392745 667 665 0 False 509 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 554 591 0.00874200116696058 0.00878327657091917 0.00878919661249714 0.00886549172198062 0.00191194469037651 0.00181797759424353 382129 382782 667 665 0 False 554 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 598 591 0.00870413957589756 0.00894929013997571 0.00874341954680705 0.0089570458533608 0.00168286653683191 0.00169274308242409 380474 390017 667 665 0 False 598 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 643 591 0.00871230669856191 0.00886016827373997 0.00868238345922026 0.00889600976577401 0.0017106058943185 0.00151245134202331 380831 386133 667 665 0 False 643 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 242 641 0.00859494720481371 0.0314577241914583 0.00856031128404669 0.0313115129320211 0.00133629036674509 0.00645624149639833 375701 1370952 667 665 0 True 241 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 286 636 0.00860457846151312 0.00867306742479912 0.00859082932784009 0.00871290150301366 0.00140672290953238 0.00138427511951818 376122 377979 667 665 0 False 286 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 331 636 0.00878617683604982 0.00878036244192537 0.00883497367818723 0.00880445563439384 0.00136018384339959 0.00124035641781613 384060 382655 667 665 0 False 331 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 375 635 0.0088015959976066 0.00893182831191047 0.00886549172198062 0.00891126878767071 0.00133103503202357 0.00134553040391361 384734 389256 667 665 0 False 375 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 420 635 0.00894668252964385 0.00917932276330561 0.00898756389715419 0.00924696726939803 0.00167709792180824 0.00153044620019234 391076 400042 667 665 0 False 420 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 464 635 0.00886112219696972 0.00886411496812528 0.0089417868314641 0.00891126878767071 0.00181340734056235 0.00180557213403253 387336 386305 667 665 0 False 464 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 509 635 0.0089331621669138 0.00864807934232468 0.00878919661249714 0.00874341954680705 0.00267598204703456 0.00179956480434786 390485 376890 667 665 0 False 509 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 554 635 0.00868192591733431 0.00872520050412137 0.00869764248111696 0.00883497367818723 0.00177710026499614 0.0017114107082002 379503 380251 667 665 0 False 554 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 598 635 0.00864161647718142 0.00873885331318684 0.00860608834973678 0.00880445563439384 0.00133371470415699 0.00134695937576464 377741 380846 667 665 0 False 598 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 639 641 0.00879624275754089 0.0374325605728673 0.00880445563439384 0.0372167544060426 0.00134455817445329 0.00710351992250022 384500 1631340 667 665 0 True 643 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G12_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G12_2.csv new file mode 100755 index 0000000..fcfad50 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G12_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 240 245 0.00751151089595966 0.666019707084144 0.00743114366369116 0.658655680170901 0.00194904641135906 0.16175549683152 328342 29025655 667 665 2 True 240 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 285 245 0.00623727962066117 0.00619096379079996 0.00617990386816205 0.00621042191195544 0.00149741271745258 0.00133931241136376 272643 269807 667 665 0 False 285 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 328 245 0.00594550515998581 0.00608511436522182 0.0059662775616083 0.00611886778057527 0.00122758957054522 0.00111207898422909 259889 265194 667 665 0 True 329 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 372 244 0.00594539077451432 0.00626287623384394 0.00593575951781491 0.00621042191195544 0.00118173830040408 0.00118169443641978 259884 272941 667 665 0 True 374 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 418 245 0.00586028798372615 0.00598603397943244 0.00581368734264134 0.00599679560540169 0.00138968461741368 0.00139485996773846 256164 260876 667 665 0 True 418 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 460 244 0.00612145289223093 0.00631971322217193 0.00613412680247196 0.00631723506523232 0.00155799771313186 0.00136843271237563 267580 275418 667 665 0 True 463 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 505 243 0.00632245104273224 0.0065508472485861 0.00633249408712902 0.00651560234988937 0.00160837257011202 0.0015509994068748 276366 285491 667 665 0 True 508 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 549 243 0.00654733287968055 0.00664834436744184 0.00653086137178607 0.00662241550316625 0.00145935244854629 0.00132795984376874 286196 289740 667 665 0 True 552 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 597 244 0.00914909905999163 0.00702846610690149 0.00764476997024491 0.00704966811627375 0.00837312242049295 0.00202595871250824 399924 306306 667 665 0 False 597 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 636 243 0.00886004697353772 0.721094221018327 0.00875867856870375 0.699565117875944 0.0019655039842744 0.16607585879127 387289 31425845 667 665 8 True 642 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 240 288 0.00610580495973117 0.00585948735422901 0.00602731364919509 0.00587472343022812 0.00164803284686326 0.00145716748131723 266896 255361 667 665 0 False 240 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 285 288 0.00593816161271619 0.00587451691714982 0.00592050049591821 0.00584420538643473 0.00130855340421869 0.00132419191984171 259568 256016 667 665 0 False 285 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 329 288 0.00592013446240945 0.00592463075748423 0.00599679560540169 0.00587472343022812 0.00133142758829915 0.00124029052731383 258780 258200 667 665 0 True 329 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 373 289 0.00605616166510473 0.00615386027439852 0.00605783169298848 0.00616464484626535 0.00136429177784002 0.00123673447513889 264726 268190 667 665 0 True 374 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 417 288 0.00609518998797694 0.00616939464706628 0.00608834973678187 0.00611886778057527 0.00136897384508886 0.00146021295208291 266432 268867 667 665 0 True 419 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 462 287 0.00614709811493887 0.00612481076805082 0.00617990386816205 0.00610360875867857 0.00166586154728027 0.00177518372619818 268701 266924 667 665 0 True 463 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 506 286 0.0062543688101017 0.0063937366877941 0.00634775310902571 0.0064087891966125 0.00161863281228538 0.00156133446918001 273390 278644 667 665 0 True 508 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 549 287 0.00645591601086616 0.00643841235039992 0.00656137941557946 0.00648508430609598 0.00145804138284197 0.00148351082355399 282200 280591 667 665 0 True 552 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 597 287 0.00694996973932352 0.00672356101973863 0.00697337300679027 0.00675974670023652 0.00200987705740181 0.00197473800115636 303796 293018 667 665 0 False 597 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 642 287 0.00755536628572873 0.00706327503354403 0.00747692072938125 0.00711070420386053 0.00199187323910525 0.00202094185485299 330259 307823 667 665 0 False 642 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 240 333 0.00561833983443161 0.00565687507851799 0.00558480201419089 0.00566109712367437 0.00135517057337572 0.00140326237394967 245588 246531 667 665 0 True 240 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 285 333 0.0057586221766663 0.00576680887386698 0.00570687418936446 0.00576791027695125 0.0013188211456703 0.00134558449932532 251720 251322 667 665 0 True 285 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 328 334 0.00595948306460183 0.0059794485068244 0.0059510185397116 0.005981536583505 0.00132112459038795 0.00121459539106596 260500 260589 667 665 0 True 329 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 371 333 0.00619292093481755 0.0062882314506798 0.00613412680247196 0.00631723506523232 0.00128910939085045 0.0013177768981494 270704 274046 667 665 0 True 374 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 417 333 0.00644182372077866 0.00655245346141733 0.00646982528419928 0.00646982528419928 0.0014653268909468 0.00148592079818022 281584 285561 667 665 0 True 419 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 461 331 0.0064827279653833 0.00646461656544658 0.00643930724040589 0.00646982528419928 0.00162583408918518 0.0015611145338973 283372 281733 667 665 0 True 463 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 508 331 0.00646323668104149 0.00654150826826737 0.00646982528419928 0.00645456626230259 0.00156033890662692 0.00153919265560811 282520 285084 667 665 0 False 508 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 550 331 0.00650436969658911 0.00656684053920565 0.00645456626230259 0.00654612039368277 0.00156617807670337 0.00133636395687433 284318 286188 667 665 0 True 553 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 594 333 0.00680604993909546 0.00678592796938558 0.0068055237659266 0.00675974670023652 0.00184805032675167 0.00204950783836477 297505 295736 667 665 0 True 597 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 638 331 0.00662957603368149 0.00676493247309163 0.00657663843747616 0.00683604180972 0.00185831736194351 0.0017393088049678 289791 294821 667 665 0 True 642 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 241 377 0.00557754997529846 0.00570815915962945 0.00556954299229419 0.00567635614557107 0.00150847398741563 0.00146217624768652 243805 248766 667 665 0 True 240 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 284 377 0.00579312083486753 0.00566033990905393 0.00578316929884794 0.00563057907988098 0.00130840144799173 0.00136371090860211 253228 246682 667 665 0 True 285 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 328 377 0.00591016004929556 0.0061455309135737 0.00593575951781491 0.00614938582436866 0.00127932097749898 0.00128616292398407 258344 267827 667 665 0 True 330 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 372 378 0.00646069732357442 0.00660063984635427 0.00648508430609598 0.00660715648126955 0.00134742923794155 0.00134272074742077 282409 287661 667 665 0 True 374 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 416 376 0.00663524955306737 0.0066812258386869 0.00662241550316625 0.00669871061264973 0.00159317796324259 0.00148434185466939 290039 291173 667 665 0 True 419 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 462 376 0.0066544434351833 0.00649853060208314 0.00668345159075303 0.00657663843747616 0.00166788818286279 0.00174460276775495 290878 283211 667 665 0 True 464 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 506 376 0.00656707581205964 0.00647657137809045 0.00659189745937285 0.00651560234988937 0.00170551219623483 0.00176533418438925 287059 282254 667 665 0 True 508 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 549 375 0.00661086257054581 0.00658395817880705 0.00662241550316625 0.00662241550316625 0.00167718131502363 0.00163266891179221 288973 286934 667 665 0 True 553 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 594 376 0.00666375441256254 0.00673705320752098 0.00663767452506294 0.00671396963454643 0.00193878351271465 0.00205270076137698 291285 293606 667 665 0 True 597 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 637 376 0.00647263916679792 0.00623492813058051 0.00625619897764553 0.00634775310902571 0.00338499989937151 0.00176230443421766 282931 271723 667 665 0 True 642 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 241 421 0.00583880639218043 0.00596976533804183 0.00584420538643473 0.00604257267109178 0.00147312391723973 0.00151460624874365 255225 260167 667 665 0 True 241 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 285 420 0.00572620533404618 0.00590583806735883 0.00578316929884794 0.00588998245212482 0.00138148179961776 0.00144699420483357 250303 257381 667 665 0 True 285 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 330 421 0.00616560568422587 0.00617680617198753 0.00611886778057527 0.00617990386816205 0.00135288759959091 0.00127311244292697 269510 269190 667 665 0 True 330 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 373 421 0.00661514058717952 0.0066442370517734 0.00666819256885634 0.00669871061264973 0.00128986776636015 0.00126337542958624 289160 289561 667 665 0 True 374 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 418 421 0.00663511229050158 0.00665371370747767 0.00671396963454643 0.00662241550316625 0.00149733783330847 0.00154546893614649 290033 289974 667 665 0 True 419 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 462 420 0.00655453916438439 0.0066208322362326 0.00659189745937285 0.00666819256885634 0.00164652452304962 0.00152790426427983 286511 288541 667 665 0 True 464 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 506 420 0.0063402265450017 0.00647228049524131 0.00643930724040589 0.00653086137178607 0.00172578939424093 0.00167239669101407 277143 282067 667 665 0 True 508 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 549 419 0.0063097771324912 0.00658967170730672 0.0063782711528191 0.00657663843747616 0.00172676993617351 0.00148906639736841 275812 287183 667 665 0 True 553 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 594 420 0.00598306934882296 0.00592318516593613 0.00602731364919509 0.00581368734264134 0.00182914183783849 0.00182408321974876 261531 258137 667 665 0 True 598 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 637 422 0.0087266048824981 0.00589606311498591 0.00599679560540169 0.00599679560540169 0.0114485772576093 0.00188693411064085 381456 256955 667 665 0 True 642 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 243 465 0.00599032138771539 0.00598449660429398 0.005981536583505 0.00608834973678187 0.00136407835436953 0.00142008411705812 261848 260809 667 665 0 True 241 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 287 464 0.00593754393117014 0.00598516203532406 0.0059662775616083 0.0059662775616083 0.00148409332931122 0.00153594861444539 259541 260838 667 665 0 True 285 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 330 465 0.00607867272589386 0.00614144654380286 0.00605783169298848 0.00611886778057527 0.0016247610082322 0.00156442374311614 265710 267649 667 665 0 True 330 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 374 465 0.00625166931297455 0.00668030800278334 0.00621042191195544 0.00648508430609598 0.00148886504699419 0.00244921086648625 273272 291133 667 665 0 True 375 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 419 465 0.00642777718487975 0.00667831170969309 0.0063782711528191 0.00666819256885634 0.00173809398917915 0.00175516095253516 280970 291046 667 665 0 True 419 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 463 463 0.00656927201311224 0.00641645312640723 0.00666819256885634 0.00642404821850919 0.0019189295059427 0.00196526890251527 287155 279634 667 665 0 True 464 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 508 461 0.00668205608800086 0.0064863004386682 0.00625619897764553 0.00646982528419928 0.00418394894563437 0.00175163249173129 292085 282678 667 665 0 False 508 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 552 464 0.00663890988815503 0.00587947323102905 0.00584420538643473 0.00590524147402152 0.00724280575212909 0.00177934276822996 290199 256232 667 665 0 True 553 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 598 461 0.00805740412009605 0.0139264159483167 0.0059662775616083 0.00619516289005875 0.00978376016600289 0.024140990653765 352204 606924 667 665 0 False 598 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 640 464 0.00996137317013272 0.00571017839861728 0.00631723506523232 0.00569161516746777 0.0119210253343975 0.00183791414967525 435430 248854 667 665 0 True 642 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 242 510 0.00587753731282676 0.00594583276685649 0.00585946440833143 0.0059510185397116 0.00139085598203907 0.00138854126271698 256918 259124 667 665 0 True 241 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 287 508 0.00599011549386671 0.00588105649796269 0.00604257267109178 0.00584420538643473 0.0014432628849374 0.00144189029929638 261839 256301 667 665 0 True 285 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 330 510 0.00612021752913884 0.00611668792030431 0.00611886778057527 0.00616464484626535 0.00139395061385661 0.00154523728637107 267526 266570 667 665 0 True 330 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 375 509 0.00646337394360728 0.0062383011775261 0.0064087891966125 0.00619516289005875 0.00146407195317921 0.00145233099030568 282526 271870 667 665 0 True 375 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 420 508 0.00638410481186507 0.00646606215699468 0.00645456626230259 0.0064087891966125 0.00180797310601865 0.00175161158111975 279061 281796 667 665 0 True 419 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 463 508 0.00630691749570397 0.00635257174751941 0.0063935301747158 0.00636301213092241 0.00191051636747418 0.00160641888364782 275687 276850 667 665 0 True 464 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 506 508 0.00602365331410742 0.00595351964254881 0.005981536583505 0.00599679560540169 0.00174546556810857 0.00174646096252186 263305 259459 667 665 0 True 509 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 550 507 0.0058315314761937 0.00568486907357659 0.00587472343022812 0.00575265125505455 0.00164442797331819 0.00161418105208596 254907 247751 667 665 0 True 553 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 595 506 0.00574118983081131 0.00563413569400728 0.00576791027695125 0.00561532005798428 0.00182996442428365 0.00179738346278185 250958 245540 667 665 0 True 598 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 640 505 0.00581977264972458 0.00568188610689002 0.00585946440833143 0.00561532005798428 0.00184935734839868 0.00190615613402955 254393 247621 667 665 0 True 643 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 243 551 0.00607226713949045 0.00610269092277501 0.00610360875867857 0.00613412680247196 0.00134702706335462 0.00135926681072483 265430 265960 667 665 0 True 241 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 286 549 0.00614524507030074 0.00604287096776044 0.00613412680247196 0.00604257267109178 0.00140692196525317 0.00142868471073629 268620 263353 667 665 0 True 286 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 331 552 0.00611340015503807 0.00619530056544428 0.00611886778057527 0.00625619897764553 0.0013198451732119 0.00138320071673786 267228 269996 667 665 0 True 330 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 374 549 0.00641757400082289 0.00626946170645199 0.00645456626230259 0.00619516289005875 0.0013088511458539 0.00136861451150059 280524 273228 667 665 0 True 375 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 419 550 0.00626793492702035 0.00622363874896672 0.00636301213092241 0.00619516289005875 0.00174986077777699 0.00171894186575298 273983 271231 667 665 0 True 420 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 463 549 0.00615560839401769 0.0062748539923854 0.00619516289005875 0.00631723506523232 0.00192174299004639 0.00186200754625125 269073 273463 667 665 0 True 464 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 506 549 0.00598199412539095 0.00618554855896895 0.00605783169298848 0.00608834973678187 0.00187170083048108 0.00198763121227814 261484 269571 667 665 0 True 509 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 551 547 0.00588346248024992 0.00594418066223008 0.00592050049591821 0.00601205462729839 0.00172140221243253 0.00191240246191993 257177 259052 667 665 0 True 553 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 596 547 0.00588341672606132 0.00587917493436039 0.00592050049591821 0.00587472343022812 0.00157707659017179 0.00146798454877007 257175 256219 667 665 0 True 598 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 638 549 0.00580041862794856 0.00586308986015049 0.00585946440833143 0.0059510185397116 0.00179214373063703 0.00179020215579021 253547 255518 667 665 0 True 643 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 241 593 0.00654493078477927 0.00648696586969828 0.00654612039368277 0.00654612039368277 0.00131851579762758 0.00124256526360718 286091 282707 667 665 0 False 241 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 286 592 0.0062066014372077 0.00615151979284444 0.00624093995574884 0.00616464484626535 0.00134950266824933 0.00149630614553427 271302 268088 667 665 0 False 286 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 328 594 0.00615398412032254 0.00608580274214949 0.00613412680247196 0.00608834973678187 0.00141218023933932 0.00150627637923483 269002 265224 667 665 0 True 330 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 373 593 0.00628074609982718 0.00605416034937424 0.00628671702143893 0.00604257267109178 0.00132342959596656 0.00126792791429671 274543 263845 667 665 0 True 375 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 420 592 0.0061783253486555 0.00600214199953994 0.00624093995574884 0.00601205462729839 0.00172794682790058 0.00158644677971168 270066 261578 667 665 0 False 420 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 464 592 0.00611337727794377 0.00622792963181586 0.00599679560540169 0.00624093995574884 0.00190627681546127 0.00180933012213486 267227 271418 667 665 0 False 464 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 509 592 0.00614819621546517 0.00618660407025804 0.00621042191195544 0.00616464484626535 0.00190586440681995 0.00193515250758167 268749 269617 667 665 0 False 509 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 554 591 0.00607331948582816 0.00592956412546587 0.00602731364919509 0.00592050049591821 0.0018172067442337 0.00169096807763559 265476 258415 667 665 0 False 554 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 598 591 0.00614041800340388 0.00612604984652063 0.00610360875867857 0.00614938582436866 0.00156502845163998 0.00155319858839699 268409 266978 667 665 0 False 598 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 643 591 0.0061619453491382 0.00613515936786347 0.00613412680247196 0.00613412680247196 0.00156558637209061 0.00139363393483522 269350 267375 667 665 0 False 643 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 242 641 0.00805310322636805 0.658468694051448 0.00790417334248875 0.635416189822232 0.0019177396919112 0.17373992397041 352016 28696576 667 665 2 True 241 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 286 636 0.00647225025619486 0.0062800856570357 0.0064087891966125 0.00624093995574884 0.00153220361720073 0.00131914798262183 282914 273691 667 665 0 False 286 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 331 636 0.00600393325882264 0.00598936113458285 0.00604257267109178 0.00588998245212482 0.00126429975036865 0.00130527822316602 262443 261021 667 665 0 False 331 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 375 635 0.0059282558308852 0.00605016776319375 0.00590524147402152 0.00607309071488518 0.00131144602075526 0.00121838681671682 259135 263671 667 665 0 False 375 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 420 635 0.00587792622342983 0.00595608958307878 0.00579842832074464 0.00585946440833143 0.00147496425383708 0.00152732595569124 256935 259571 667 665 0 False 420 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 464 635 0.006065243871541 0.00604243499570625 0.00593575951781491 0.00605783169298848 0.00172456397806866 0.00166991144031878 265123 263334 667 665 0 False 464 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 509 635 0.00663481488827571 0.00599339961255852 0.00619516289005875 0.00608834973678187 0.00328810821319476 0.00171410004491825 290020 261197 667 665 0 False 509 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 554 635 0.00574878502611821 0.00579253122506426 0.00567635614557107 0.00584420538643473 0.00166055767660915 0.00170377483253427 251290 252443 667 665 0 False 554 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 598 635 0.00671712667355953 0.00637485221407834 0.00659189745937285 0.0063935301747158 0.00185479988844834 0.00138952614828878 293618 277821 667 665 0 False 598 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 639 641 0.00825714403041098 0.747439002633615 0.00798046845197223 0.720271610589761 0.002060279348219 0.167228955994035 360935 32573971 667 665 11 True 643 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G12_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G12_3.csv new file mode 100755 index 0000000..8fb38dd --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G12_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 240 245 0.00105694463365708 0.066758656770101 0.00080872816052491 0.0660868238345922 0.000863416065915363 0.0169774108167141 46201 2909394 667 665 0 True 240 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 285 245 0.00100277167435966 0.000895188302640327 0.000793469138628214 0.000732433051041428 0.000787035144856309 0.000721588243132266 43833 39013 667 665 0 False 285 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 328 245 0.000931967067507674 0.00088275162614708 0.000793469138628214 0.000793469138628214 0.000663632371989087 0.000629117836444542 40738 38471 667 665 0 True 329 245 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 372 244 0.0009360391902927 0.000864509637563811 0.000854505226215 0.000747692072938125 0.00062528317288413 0.000611915814902238 40916 37676 667 665 0 True 374 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 418 245 0.000931646788187504 0.000942709256547182 0.000732433051041428 0.000762951094834821 0.000795069569564173 0.000763616223518736 40724 41084 667 665 0 True 418 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 460 244 0.000886167124723287 0.000870980380683914 0.000717174029144732 0.000717174029144732 0.000826647698431292 0.000766525214753524 38736 37958 667 665 0 True 463 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 505 243 0.000926568073253371 0.00103052320662035 0.000762951094834821 0.000823987182421607 0.000802499885440411 0.000855073648698093 40502 44911 667 665 0 True 508 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 549 243 0.00101665807059848 0.000971322790840686 0.000793469138628214 0.000823987182421607 0.000876632177300098 0.000766076839338377 44440 42331 667 665 0 True 552 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 597 244 0.00121829677974014 0.00100349293926049 0.000778210116731518 0.000518806744487678 0.00131665024147201 0.0010996619060473 53254 43733 667 665 0 False 597 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 636 243 0.00104607801386558 0.0730136396151743 0.000701915007248035 0.070618753337911 0.000985821881127882 0.0185776039916655 45726 3181991 667 665 0 True 642 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 240 288 0.000893259023955635 0.000904160148597633 0.000671396963454643 0.000701915007248035 0.000775747762713134 0.000797480279910377 39046 39404 667 665 0 False 240 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 285 288 0.000877565337267279 0.000842642197161478 0.000717174029144732 0.000717174029144732 0.000688254419748016 0.000667312965305927 38360 36723 667 665 0 False 285 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 329 288 0.000921809637639409 0.000917790011765509 0.00080872816052491 0.00080872816052491 0.000664789742678863 0.000675568386867472 40294 39998 667 665 0 True 329 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 373 289 0.000871708801127017 0.000913040210964582 0.000701915007248035 0.000793469138628214 0.000668728602869762 0.000687786576409664 38104 39791 667 665 0 True 374 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 417 288 0.000860979443901304 0.000953975692263389 0.000686655985351339 0.000778210116731518 0.000710309670756423 0.000800099719610509 37635 41575 667 665 0 True 419 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 462 287 0.000856106622815852 0.000934081599053711 0.000595101853971161 0.000625619897764553 0.000832834354261689 0.000981156963544539 37422 40708 667 665 0 True 463 288 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 506 286 0.000942010111904451 0.000855285386733026 0.000717174029144732 0.000671396963454643 0.000845744972072566 0.000780698526521188 41177 37274 667 665 0 True 508 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 549 287 0.000933019413845378 0.000948376893251669 0.000701915007248035 0.000732433051041428 0.000850562268524163 0.000791434861459271 40784 41331 667 665 0 True 552 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 597 287 0.000870450560940633 0.000967857960304745 0.000457770656900893 0.000595101853971161 0.000979153512305932 0.00103204578859414 38049 42180 667 665 0 False 597 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 642 287 0.000971864719963205 0.0010187290152596 0.000564583810177768 0.000671396963454643 0.00102179696380561 0.0010387211272951 42482 44397 667 665 0 False 642 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 240 333 0.000930411425095418 0.00103885256744516 0.000762951094834821 0.000885023270008392 0.000798739448689595 0.000786132604439313 40670 45274 667 665 0 True 240 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 285 333 0.000968135753592648 0.000865198014491482 0.000823987182421607 0.000701915007248035 0.000739206914621648 0.000686199069647758 42319 37706 667 665 0 True 285 332 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 328 334 0.000963468826355877 0.000855216549040259 0.000854505226215 0.000747692072938125 0.000674732568513516 0.000665648278026153 42115 37271 667 665 0 True 329 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 371 333 0.000924829414086731 0.00093061676851777 0.00080872816052491 0.00080872816052491 0.000680326427666519 0.000685280634063993 40426 40557 667 665 0 True 374 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 417 333 0.000911148911696589 0.000977472291394543 0.000701915007248035 0.000762951094834821 0.00080570483321267 0.000786921675747978 39828 42599 667 665 0 True 419 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 461 331 0.000975547932145166 0.000916482095602935 0.000686655985351339 0.000701915007248035 0.000943040662234512 0.00083476384617886 42643 39941 667 665 0 True 463 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 508 331 0.000995817037693101 0.000917124580735427 0.000793469138628214 0.000686655985351339 0.000868526320117841 0.000888976532693331 43529 39969 667 665 0 False 508 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 550 331 0.000936817011498828 0.000934311058029601 0.000686655985351339 0.000778210116731518 0.000870750674490443 0.000754393338332178 40950 40718 667 665 0 True 553 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 594 333 0.000960243156059873 0.000899502131387062 0.000488288700694286 0.000442511635004196 0.00107269291254332 0.00108538457023884 41974 39201 667 665 0 True 597 331 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 638 331 0.00100295469111404 0.000974581108298326 0.000579842832074464 0.000610360875867857 0.00104155933042336 0.000973843661876246 43841 42473 667 665 0 True 642 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 241 377 0.000912315643505782 0.000883738299743408 0.000717174029144732 0.000732433051041428 0.000796908031369138 0.00078874172232653 39879 38514 667 665 0 True 240 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 284 377 0.000912178380939995 0.00088718018438176 0.000717174029144732 0.000717174029144732 0.000774037452664776 0.000712158610068286 39873 38664 667 665 0 True 285 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 328 377 0.000868734778868291 0.000854597009805356 0.000717174029144732 0.000732433051041428 0.000705557428072084 0.000689009001179964 37974 37244 667 665 0 True 330 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 372 378 0.000961272625303279 0.000934494625210314 0.000839246204318303 0.000778210116731518 0.000701429943219604 0.000718423009922457 42019 40726 667 665 0 True 374 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 416 376 0.00102143938330674 0.000941676691155676 0.00080872816052491 0.000747692072938125 0.000880115463035865 0.00074930664370709 44649 41039 667 665 0 True 419 375 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 462 376 0.000859789834997814 0.000915862556368032 0.000534065766384375 0.000610360875867857 0.000904318997643474 0.000860071087156972 37583 39914 667 665 0 True 464 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 506 376 0.000915907347310552 0.000864119557304798 0.00064087891966125 0.000518806744487678 0.000856235111138525 0.000918994088080375 40036 37659 667 665 0 True 508 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 549 375 0.000945327290577646 0.000912076483265844 0.000701915007248035 0.000701915007248035 0.000901788877020588 0.000841562569405368 41322 39749 667 665 0 True 553 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 594 376 0.000872234974295869 0.00100881638750114 0.000442511635004196 0.000564583810177768 0.0010113427571728 0.00111972099113072 38127 43965 667 665 0 True 597 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 637 376 0.000984675892770026 0.000910424378639434 0.000564583810177768 0.000549324788281071 0.00105900743506501 0.000955728682825537 43042 39677 667 665 0 True 642 374 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 241 421 0.00109894697878802 0.000892870766983836 0.000946059357595178 0.000732433051041428 0.000867425582724714 0.000816951446395207 48037 38912 667 665 0 True 241 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 285 420 0.000885549443177244 0.000944246631685646 0.000762951094834821 0.000823987182421607 0.000731589975489596 0.000786612138217378 38709 41151 667 665 0 True 285 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 330 421 0.000853590142443084 0.000962167377702668 0.000747692072938125 0.000869764248111696 0.00066906610934996 0.000694025904793655 37312 41932 667 665 0 True 330 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 373 421 0.000935101229426486 0.000994268688429703 0.000778210116731518 0.000885023270008392 0.000745033606275913 0.000690545796772869 40875 43331 667 665 0 True 374 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 418 421 0.000874865840140127 0.00100390596541709 0.000671396963454643 0.000778210116731518 0.000807503836655567 0.00084160942219266 38242 43751 667 665 0 True 419 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 462 420 0.000941392430358407 0.000985319788369987 0.00064087891966125 0.000732433051041428 0.000894371182777168 0.000857891786074734 41150 42941 667 665 0 True 464 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 506 420 0.00102441340556547 0.000866850119117891 0.000793469138628214 0.00064087891966125 0.000940618493398449 0.000866638340235052 44779 37778 667 665 0 True 508 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 549 419 0.000933385447354144 0.000977403453701776 0.000686655985351339 0.000762951094834821 0.000894423921651581 0.000860188393357528 40800 42596 667 665 0 True 553 418 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 594 420 0.000942787933110579 0.000887547318743184 0.000457770656900893 0.000473029678797589 0.00106920463892815 0.00100830490721875 41211 38680 667 665 0 True 598 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 637 422 0.00125876635955311 0.000907349628362506 0.000793469138628214 0.000457770656900893 0.00143966403371382 0.00099196179657649 55023 39543 667 665 0 True 642 417 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 243 465 0.000957040362858168 0.00103079855739142 0.00080872816052491 0.000900282291905089 0.000774956466128456 0.000790536873089614 41834 44923 667 665 0 True 241 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 287 464 0.000964887206202346 0.000942846931932716 0.000854505226215 0.000839246204318303 0.000835608874094934 0.00081632899424094 42177 41090 667 665 0 True 285 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 330 465 0.000987901563066029 0.00088555102565294 0.000869764248111696 0.000747692072938125 0.000831813727059472 0.000775752646253729 43183 38593 667 665 0 True 330 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 374 465 0.00103942077942489 0.000988440430442093 0.000915541313801785 0.000869764248111696 0.00079932335759177 0.000815991057744125 45435 43077 667 665 0 True 375 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 419 465 0.000932699134525207 0.00087901144484007 0.000610360875867857 0.000534065766384375 0.000984486704060971 0.000938900311009267 40770 38308 667 665 0 True 419 462 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 463 463 0.000895203576970956 0.000809577158735704 0.000442511635004196 0.000335698481727321 0.00102060117765588 0.000956793203927245 39131 35282 667 665 0 True 464 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 508 461 0.00102532848933739 0.000899593914977418 0.000717174029144732 0.000579842832074464 0.00102866471986851 0.000949438701789863 44819 39205 667 665 0 False 508 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 552 464 0.00104072477379987 0.000796635672495498 0.000625619897764553 0.0004272526131075 0.00126374109175592 0.000914104032954241 45492 34718 667 665 0 True 553 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 598 461 0.00111823236928114 0.00151938555475436 0.00064087891966125 0.000625619897764553 0.00136362026388802 0.00238648229168649 48880 66216 667 665 0 False 598 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 640 464 0.00121141077435647 0.000890805636200825 0.000717174029144732 0.000473029678797589 0.00141398881385062 0.000956031293002866 52953 38822 667 665 0 True 642 461 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 242 510 0.000993963993054972 0.000938326590107679 0.000854505226215 0.000793469138628214 0.000759132969978741 0.000726589662777495 43448 40893 667 665 0 True 241 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 287 508 0.00096767821170669 0.000978298343707747 0.000823987182421607 0.000839246204318303 0.00082351682473829 0.000792536753802546 42299 42635 667 665 0 True 285 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 330 510 0.000955416089163018 0.000916069069446333 0.00080872816052491 0.000732433051041428 0.000840942636477719 0.000810993860790077 41763 39923 667 665 0 True 330 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 375 509 0.000992065194228246 0.000927151937981828 0.000823987182421607 0.000747692072938125 0.000842303017207064 0.000814997096923525 43365 40406 667 665 0 True 375 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 420 508 0.000878251650096215 0.000903563555260318 0.000549324788281071 0.000564583810177768 0.00094370648218664 0.000915260996238265 38390 39378 667 665 0 True 419 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 463 508 0.000973122960149589 0.000921667868458053 0.00064087891966125 0.000671396963454643 0.00101223984560754 0.000843974508116489 42537 40167 667 665 0 True 464 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 506 508 0.000886624666609245 0.000906340008868589 0.000595101853971161 0.000595101853971161 0.000888421224169961 0.000884396228064801 38756 39499 667 665 0 True 509 505 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 550 507 0.000916319135007914 0.000861411941389294 0.000549324788281071 0.000595101853971161 0.000908514772958182 0.00087163409163157 40054 37541 667 665 0 True 553 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 595 506 0.0009175544981 0.000889933692092442 0.000564583810177768 0.000518806744487678 0.000958938283265633 0.000917234519435325 40108 38784 667 665 0 True 598 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 640 505 0.000910645615622036 0.00094695424760115 0.000579842832074464 0.000534065766384375 0.000924408117241376 0.00101450245362349 39806 41269 667 665 0 True 643 504 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 243 551 0.000887585504569757 0.000919855142548521 0.000778210116731518 0.000762951094834821 0.000706553477164817 0.000720385574464766 38798 40088 667 665 0 True 241 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 286 549 0.000914809246784253 0.00104915527546263 0.00080872816052491 0.000915541313801785 0.000740143621418066 0.000800305046383784 39988 45723 667 665 0 True 286 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 331 552 0.000936588240555849 0.000942296230390579 0.000793469138628214 0.000778210116731518 0.000762190975773071 0.000738478144231152 40940 41066 667 665 0 True 330 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 374 549 0.000955667737200294 0.000890071367477976 0.000793469138628214 0.000778210116731518 0.000761780612915217 0.000642749889989492 41774 38790 667 665 0 True 375 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 419 550 0.000934597933351932 0.000971506358021398 0.000671396963454643 0.00064087891966125 0.000945028346282949 0.000937273501372395 40853 42339 667 665 0 True 420 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 463 549 0.000854299332366319 0.000869787194009285 0.000411993591210803 0.000366216525520714 0.000990133235692108 0.00102644810713904 37343 37906 667 665 0 True 464 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 506 549 0.000884131063330775 0.000988899348393873 0.000442511635004196 0.000701915007248035 0.0010146468561672 0.00108858944342515 38647 43097 667 665 0 True 509 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 551 547 0.000863312907519689 0.000910470270434612 0.000442511635004196 0.000518806744487678 0.000945425370989864 0.000982296333621803 37737 39679 667 665 0 True 553 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 596 547 0.000913413744032081 0.000909047624784093 0.00064087891966125 0.000686655985351339 0.000873491455948406 0.000785651652769484 39927 39617 667 665 0 True 598 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 638 549 0.000880402096960217 0.000938028293439022 0.000518806744487678 0.000579842832074464 0.00090707478334113 0.000996709244796775 38484 40880 667 665 0 True 643 548 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 241 593 0.000951755754075354 0.000916000231753566 0.000839246204318303 0.000778210116731518 0.000695665623262057 0.000658710416307039 41603 39920 667 665 0 False 241 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 286 592 0.00093212720716776 0.000874628778400568 0.000778210116731518 0.000747692072938125 0.000744335602532103 0.000736439635988186 40745 38117 667 665 0 False 286 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 328 594 0.000910622738527738 0.000883233489996449 0.000793469138628214 0.000747692072938125 0.000754850248903317 0.000750232375922927 39805 38492 667 665 0 True 330 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 373 593 0.000876673130589661 0.000923732999241064 0.000732433051041428 0.000793469138628214 0.000672597785153404 0.000684567881751571 38321 40257 667 665 0 True 375 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 420 592 0.000943908910731176 0.000970863872888906 0.000701915007248035 0.000610360875867857 0.000906931981212788 0.000922364050108898 41260 42311 667 665 0 False 420 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 464 592 0.000896393185874447 0.000886767158225158 0.000473029678797589 0.000488288700694286 0.00100469684953185 0.000921263218724751 39183 38646 667 665 0 False 464 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 509 592 0.000831902657048679 0.000857166950335326 0.000244144350347143 0.000305180437933928 0.00105028812574203 0.00107841096289125 36364 37356 667 665 0 False 509 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 554 591 0.000893625057464401 0.000935343623421107 0.000457770656900893 0.000579842832074464 0.000994671075425174 0.000965912615052345 39062 40763 667 665 0 False 554 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 598 591 0.000932470363582228 0.000939336209601596 0.000671396963454643 0.000671396963454643 0.00086688177618931 0.000828184494285038 40760 40937 667 665 0 False 598 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 643 591 0.000927506034119585 0.000973020787262273 0.00064087891966125 0.000762951094834821 0.000841740657544377 0.000818365567795317 40543 42405 667 665 0 False 643 591 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 242 641 0.0010969795486784 0.0657569306649549 0.000976577401388571 0.0642557412069886 0.00073426355501304 0.0178156820809607 47951 2865738 667 665 0 True 241 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 286 636 0.000981175697342448 0.00100895406288667 0.000854505226215 0.000900282291905089 0.000692413002268058 0.000692528513082842 42889 43971 667 665 0 False 286 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 331 636 0.00094734047487586 0.0009023474226881 0.000839246204318303 0.000839246204318303 0.000734400055706239 0.000654751403357241 41410 39325 667 665 0 False 331 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 375 635 0.000877267935041406 0.000863316450889182 0.00080872816052491 0.000747692072938125 0.00063437351053275 0.000651199129764671 38347 37624 667 665 0 False 375 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 420 635 0.000925836006235838 0.000932452440324891 0.000717174029144732 0.000732433051041428 0.000824848098018496 0.000781218583648337 40470 40637 667 665 0 False 420 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 464 635 0.000876490113835277 0.000889681287218963 0.000579842832074464 0.000488288700694286 0.000898393417499698 0.000984675818621348 38313 38773 667 665 0 False 464 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 509 635 0.000982388183340236 0.000879791605358097 0.000656137941557946 0.000488288700694286 0.00100153016726563 0.000946252125792375 42942 38342 667 665 0 False 509 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 554 635 0.000844233410875244 0.000882453329478423 0.000488288700694286 0.000549324788281071 0.000897436721376393 0.000886364813121123 36903 38458 667 665 0 False 554 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 598 635 0.000971956228340396 0.00106803974917839 0.00080872816052491 0.000885023270008392 0.00077478127652815 0.000773498462850959 42486 46546 667 665 0 False 598 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 639 641 0.00116723510526723 0.0758432359222616 0.00102235446707866 0.0728007934691386 0.000826674403341394 0.0195008533256048 51022 3305307 667 665 0 True 643 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G1_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G1_1.csv new file mode 100755 index 0000000..1e879d2 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G1_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 261 284 0.00859343731659004 0.037791296735774 0.0085145342183566 0.0373693446250095 0.00160132811680655 0.00790678875889185 375635 1646974 667 665 0 True 261 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 305 284 0.0085558731277529 0.0084351414126986 0.00859082932784009 0.00843823910887312 0.00126239531955334 0.00118329364202773 373993 367610 667 665 0 False 305 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 349 285 0.008637361337642 0.0537283240144307 0.00862134737163348 0.0547493705653468 0.0013273032696488 0.00642251101683935 377555 2341522 667 665 0 True 350 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 394 286 0.00886487404043458 0.070956425166831 0.00885023270008392 0.069916838330663 0.00136469406172975 0.00674182119297569 387500 3092336 667 665 0 True 394 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 437 285 0.00883957197414111 0.0634663564381313 0.00883497367818723 0.0641641870756084 0.00171312199758998 0.00962220251697825 386394 2765913 667 665 0 True 439 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 480 285 0.00890586979341641 0.0549680449693701 0.0089570458533608 0.0577859159227894 0.00187576736595127 0.0144121714348687 389292 2395550 667 665 0 True 484 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 526 284 0.00879457272965714 0.069095329305181 0.00877393759060044 0.0690318150606546 0.00163306650106853 0.0176460854879614 384427 3011228 667 665 0 True 528 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 570 283 0.00886551459907492 0.05736010890123 0.00886549172198062 0.0571755550469215 0.00190248216173678 0.01422300841285 387528 2499798 667 665 0 True 573 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 618 283 0.00876794379189439 0.00859844736583964 0.00880445563439384 0.00859082932784009 0.0018866634352656 0.00193126819235312 383263 374727 667 665 0 False 618 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 657 284 0.00858446949562527 0.0371870394686648 0.00862134737163348 0.0371557183184558 0.00174566560159953 0.00738892764343516 375243 1620640 667 665 0 True 662 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 261 328 0.00861743538850854 0.00846728861522082 0.00865186541542687 0.00843823910887312 0.00138507849224862 0.001533088882531 376684 369011 667 665 0 False 261 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 305 328 0.00851581533563728 0.0084456047419992 0.00843823910887312 0.00843823910887312 0.00125966359102145 0.00122195361903499 372242 368066 667 665 0 False 305 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 350 329 0.0088766099898094 0.0872774979334351 0.00883497367818723 0.0852368963149462 0.00137506576331924 0.0147584803240735 388013 3803621 667 665 0 True 350 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 395 329 0.00890653322915105 0.0433784392315189 0.00898756389715419 0.0430914778362707 0.00142918542916307 0.00565552468118175 389321 1890466 667 665 0 True 395 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 438 329 0.00895443786461084 0.0840309517212578 0.00903334096284428 0.0820172426947433 0.00163655562332543 0.0175479124965465 391415 3662134 667 665 0 True 439 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 483 328 0.00894139792086104 0.035963977235375 0.0089723048752575 0.0371099412527657 0.00162096442762884 0.00577320999110216 390845 1567338 667 665 0 True 484 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 529 327 0.00897932814320695 0.0347314383463809 0.00901808194094758 0.0375829709315633 0.00159640881828673 0.009385440685536 392503 1513623 667 665 0 False 529 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 571 327 0.00875023692090782 0.0415650937827517 0.00885023270008392 0.0431067368581674 0.00180631740286254 0.00690994763411771 382489 1811439 667 665 0 True 573 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 618 326 0.0086820174257115 0.00879100933840667 0.00868238345922026 0.00875867856870375 0.00190767078078637 0.00206710897200044 379507 383119 667 665 0 False 618 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 662 326 0.00850508597841157 0.00851189544013387 0.00849927519645991 0.00862134737163348 0.00185828290593292 0.00182876219833579 371773 370955 667 665 0 False 662 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 261 373 0.00877501281403244 0.0478913924775317 0.00874341954680705 0.0480048828870069 0.00156485446942138 0.0102801573029731 383572 2087144 667 665 0 True 261 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 306 372 0.00882145331545717 0.054745561546347 0.00874341954680705 0.0580453192950332 0.00135188530594797 0.0132269727497327 385602 2385854 667 665 0 True 306 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 350 371 0.00912091447981663 0.0253158646214988 0.00901808194094758 0.0288242923628595 0.00153923284876524 0.0122061940621895 398692 1103285 667 665 0 False 350 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 394 373 0.00877396046769474 0.0320255892649913 0.00878919661249714 0.0315709163042649 0.00146313440232093 0.005828777859744 383526 1395700 667 665 0 True 395 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 437 372 0.00899033202556424 0.0600167619781888 0.00898756389715419 0.0582436865796902 0.00166688719507835 0.0086456625547341 392984 2615577 667 665 0 True 439 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 484 370 0.00893556426181508 0.0277343851732788 0.00891126878767071 0.0287327382314794 0.00169336310190215 0.00546308224307683 390590 1208686 667 665 0 False 484 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 527 373 0.00896754643964353 0.0254494097454669 0.00898756389715419 0.0255741206988632 0.00169258926046981 0.00285139529054808 391988 1109105 667 665 0 True 529 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 569 371 0.00888468560409656 0.0444804618550267 0.00883497367818723 0.0443121995880064 0.00196716553180006 0.00851651374040679 388366 1938493 667 665 0 True 573 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 615 372 0.00905287800137469 0.0495526754629765 0.00906385900663768 0.0496833752956435 0.00207041743122776 0.00861100947660608 395718 2159544 667 665 0 True 618 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 658 371 0.00900177057271319 0.0567666591518852 0.00900282291905089 0.05639734493019 0.00194889079327478 0.0145241778029508 393484 2473935 667 665 0 True 663 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 261 416 0.00877155837279346 0.0440638102466053 0.00874341954680705 0.0464789806973373 0.0018284399207316 0.0121139561015085 383421 1920335 667 665 0 True 261 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 305 416 0.00889873213999546 0.0313102509076537 0.00886549172198062 0.0307316700999466 0.00146535546732866 0.00513722281197568 388980 1364525 667 665 0 True 306 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 349 417 0.00908465428535446 0.0771125570850908 0.00907911802853437 0.0744487678339818 0.00150766334092158 0.0165786627783868 397107 3360625 667 665 0 True 350 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 393 417 0.00909284428511311 0.0585592844551296 0.00910963607232776 0.0576791027695125 0.00149954645113806 0.0133746766997806 397465 2552059 667 665 0 True 395 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 439 417 0.00917215917104391 0.0399013096944696 0.00914015411612116 0.040665293354696 0.00165163261647764 0.00657942992302451 400932 1738930 667 665 0 True 440 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 483 415 0.00926979860950733 0.049218216059719 0.00926222629129473 0.0499732967116808 0.00162785986188344 0.00822912601152147 405200 2144968 667 665 0 True 484 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 526 415 0.00925447095632774 0.0386095474437983 0.00933852140077821 0.0388494697489891 0.0016293456942487 0.00526611912188962 404530 1682634 667 665 0 True 529 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 570 415 0.00894478373081713 0.0506654826583511 0.0089570458533608 0.0501411459525444 0.00182757901078903 0.0078369183184841 390993 2208041 667 665 0 True 574 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 614 415 0.00900154180177021 0.0397906186845002 0.00903334096284428 0.0405432211795224 0.00190638171016692 0.00661449409077149 393474 1734106 667 665 0 True 618 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 659 415 0.0089690105736786 0.0913406886408055 0.0089570458533608 0.0900129701686122 0.00187778904617424 0.0183013368731064 392052 3980698 667 665 0 True 663 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 262 461 0.0086091538803727 0.0473615487563037 0.00862134737163348 0.0446784161135271 0.00162245792475767 0.0155730120534339 376322 2064053 667 665 0 True 261 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 306 460 0.00883142772857105 0.0589632469821842 0.00871290150301366 0.0582894636453803 0.00158831832968193 0.010037360449648 386038 2569664 667 665 0 True 306 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 350 461 0.00897216761269171 0.0326009805929335 0.0089723048752575 0.0329900053406577 0.00143863086951905 0.00344320682103018 392190 1420776 667 665 0 True 351 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 394 461 0.00932655668046041 0.0512714608677794 0.00930800335698482 0.049912260624094 0.00151865224866696 0.00961351417812631 407681 2234450 667 665 0 True 395 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 438 461 0.00935638841142487 0.0888344918143378 0.00944533455405508 0.0883497367818723 0.00190026906946136 0.0117392692000098 408985 3871476 667 665 0 True 440 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 482 459 0.00917911380771047 0.0546534567134247 0.00921644922560464 0.0551155870908675 0.00186013228859304 0.0115609052240571 401236 2381840 667 665 0 True 484 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 526 458 0.00920759579011135 0.0486632924724262 0.00923170824750134 0.0492408636606394 0.00186963480248809 0.00763588257235551 402481 2120784 667 665 0 True 529 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 571 459 0.00913246741243706 0.0308117053907371 0.00907911802853437 0.0308384832532235 0.00193091973806816 0.0039418084296387 399197 1342798 667 665 0 True 574 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 615 459 0.00897383764057546 0.0360685187447906 0.00898756389715419 0.0366826886396582 0.00178908286317925 0.00428116450096965 392263 1571894 667 665 0 True 618 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 659 459 0.00910027934075992 0.0727033651879757 0.00907911802853437 0.0703288319218738 0.00190017737160869 0.0133111687431992 397790 3168469 667 665 0 True 663 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 262 504 0.00856969089270883 0.047774070103159 0.00856031128404669 0.0504463263904784 0.00155499918363268 0.011881702254232 374597 2082031 667 665 0 True 261 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 307 504 0.0088472129236366 0.0525939935671176 0.00888075074387732 0.0514839398794537 0.00159211719426061 0.00648650999552474 386728 2292087 667 665 0 True 306 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 351 504 0.00902409861674793 0.0660334746226977 0.00907911802853437 0.0634622720683604 0.00156229141000405 0.0126558251646894 394460 2877790 667 665 0 True 351 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 395 505 0.0093897432149112 0.0845493913313841 0.00944533455405508 0.0793316548409247 0.00170424056809641 0.0161303600647753 410443 3684728 667 665 0 True 395 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 439 504 0.00936762106472513 0.0961244493701638 0.00933852140077821 0.0897535667963684 0.0018869388406062 0.0275973476207919 409476 4189178 667 665 0 True 440 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 484 503 0.00935554195893584 0.039040976210267 0.00929274433508812 0.0395513847562371 0.00170082393780444 0.00396484515090077 408948 1701436 667 665 0 True 485 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 528 503 0.0091015833351349 0.0378905377428465 0.00915541313801785 0.0387121385519188 0.0018209386823408 0.00516984906967179 397847 1651299 667 665 0 True 529 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 574 500 0.0208797638260293 0.104229766450918 0.0097962920576791 0.0944686045624475 0.0487098787966836 0.0549979925840829 912693 4542414 667 665 0 False 574 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 616 503 0.009258177045604 0.0614918160588012 0.00921644922560464 0.0618295567254139 0.00237184831550737 0.0159371043521964 404692 2679861 667 665 0 True 619 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 660 503 0.00901282020925907 0.0718492041502245 0.00910963607232776 0.0703746089875639 0.00195792926918521 0.00898603520923608 393967 3131244 667 665 0 True 663 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 263 549 0.00852119145279729 0.0461638417398497 0.00849927519645991 0.0485694666971847 0.00146712990508965 0.00834728087330285 372477 2011856 667 665 0 True 262 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 307 548 0.00880013186357153 0.118379744279444 0.00885023270008392 0.112321660181582 0.0014346256529102 0.0400323624609231 384670 5159081 667 665 0 True 306 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 352 548 0.00915525299835777 0.0541708815412301 0.00921644922560464 0.0561989776455329 0.00137549054753619 0.00965736283057971 400193 2360809 667 665 0 True 351 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 396 548 0.0095919080972217 0.0572279634770148 0.00971999694819562 0.056748302433814 0.00167240451511034 0.0058505873438702 419280 2494039 667 665 0 True 396 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 440 547 0.00951179251299047 0.0548711673897493 0.00946059357595178 0.0545662623025864 0.00206052708012344 0.00539739920983798 415778 2391328 667 665 0 True 440 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 484 545 0.00930884980947384 0.0620752155050019 0.00926222629129473 0.0610055695429923 0.00194118242704427 0.0104843005354435 406907 2705286 667 665 0 True 485 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 529 545 0.00923012972799478 0.0751248228146471 0.0093842984664683 0.0727702754253452 0.00198391021408013 0.0149200124219125 403466 3273998 667 665 0 True 529 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 573 545 0.00924147676676654 0.0547888604550975 0.00915541313801785 0.0545052262149996 0.00217898675390154 0.0105654843347488 403962 2387741 667 665 0 True 574 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 617 545 0.00900277716486229 0.048480344830949 0.00898756389715419 0.0470740825513085 0.00181474681283735 0.00759333055582036 393528 2112811 667 665 0 True 619 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 661 544 0.00885652390101585 0.0588571910435278 0.00880445563439384 0.0588540474555581 0.00185087544861363 0.00988822699821544 387135 2565042 667 665 0 True 663 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 264 589 0.0084776563423484 0.0425993801165766 0.00848401617456321 0.0430304417486839 0.00139941352376858 0.00678260984316363 370574 1856514 667 665 0 True 262 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 308 588 0.00856726592071325 0.0525119619832369 0.00869764248111696 0.0527199206530861 0.00151153169836379 0.00928545538643322 374491 2288512 667 665 0 True 306 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 352 588 0.00886942658219986 0.0477404084713959 0.00898756389715419 0.0474708171206226 0.00149610689278733 0.00794829735115252 387699 2080564 667 665 0 True 351 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 396 588 0.00914882453486006 0.0508690816076584 0.00918593118181125 0.0498054474708171 0.00156494904626962 0.00611937483619541 399912 2216914 667 665 0 True 396 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 441 586 0.00917780981333549 0.0937514075874052 0.00920119020370794 0.0902876325627527 0.00194533251422675 0.0194374471221573 401179 4085759 667 665 0 True 440 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 485 586 0.00914589626678993 0.0633485292540117 0.00914015411612116 0.0613412680247196 0.00195292356473177 0.00995984421562936 399784 2760778 667 665 0 True 485 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 530 585 0.00894514976432589 0.0556650495545341 0.0089570458533608 0.05468833447776 0.00202665626174628 0.00739043599505774 391009 2425926 667 665 0 True 530 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 574 585 0.0089276716642823 0.035570363308133 0.00906385900663768 0.0365300984206912 0.00168087142250073 0.00616763350200212 390245 1550184 667 665 0 True 574 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 618 585 0.00882344362266109 0.0451639283606131 0.00880445563439384 0.0454261081864652 0.00155938864014417 0.00546841243400178 385689 1968279 667 665 0 True 619 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 662 584 0.00866451644857361 0.052510952363743 0.00868238345922026 0.052124818799115 0.00158379269558471 0.00749999387245892 378742 2288468 667 665 0 True 664 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 262 632 0.00810196869978835 0.00804274361802882 0.0081177996490425 0.00813305867093919 0.0014030905492935 0.00140410653708535 354152 350509 667 665 0 False 262 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 307 632 0.00835608746324938 0.00813422891171623 0.00834668497749294 0.00816357671473259 0.00126758525392052 0.00129009465551207 365260 354496 667 665 0 False 307 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 352 630 0.00883280035422893 0.0751721602013732 0.00869764248111696 0.0734111543450065 0.00156624359433943 0.0129659737282844 386098 3276061 667 665 0 True 351 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 396 629 0.00892391982081745 0.080096923471416 0.00889600976577401 0.079514763103685 0.00145612558239121 0.0164983810670251 390081 3490686 667 665 0 True 396 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 441 631 0.00860537915981355 0.00851625516067578 0.00863660639353018 0.00854505226215 0.00172403021587932 0.00180762784185966 376157 371145 667 665 0 False 441 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 485 631 0.00853786885454046 0.00859257321605685 0.00863660639353018 0.00863660639353018 0.00194601447985801 0.00178320137100681 373206 374471 667 665 0 False 485 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 530 631 0.00852059664834555 0.0085897508706534 0.00857557030594339 0.00859082932784009 0.00191869911161393 0.00179125380791416 372451 374348 667 665 0 False 530 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 574 631 0.00852318176000121 0.00842899191214475 0.00842298008697642 0.00846875715266651 0.00163821782367014 0.00156290455163414 372564 367342 667 665 0 False 574 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 619 631 0.00854955904972668 0.00858071018700333 0.00859082932784009 0.00863660639353018 0.00146124260906817 0.00142174599678997 373717 373954 667 665 0 False 619 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 664 630 0.00867590924153396 0.00865847383393251 0.00865186541542687 0.00868238345922026 0.0015081933237114 0.00154575787977722 379240 377343 667 665 0 False 664 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 264 682 0.00795365649745509 0.0367905573042242 0.00793469138628214 0.0370183871213855 0.00143290128377082 0.00707023238412567 347669 1603361 667 665 0 True 262 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 307 675 0.00827567447679227 0.00804334021136613 0.00827038986800946 0.00799572747386892 0.0012791838965416 0.00130980532279719 361745 350535 667 665 0 False 307 675 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 351 675 0.00828363570560794 0.00810364203023007 0.00819409475852598 0.00802624551766232 0.00138886099733827 0.00132827444513339 362093 353163 667 665 0 False 351 675 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 396 675 0.00827832821973083 0.00845023981331218 0.00830090791180285 0.00843823910887312 0.00140527729860179 0.00144192626520688 361861 368268 667 665 0 False 396 675 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 441 675 0.00838978542315018 0.0084441362045535 0.00834668497749294 0.0085145342183566 0.00167889171999796 0.00154177411754024 366733 368002 667 665 0 False 441 675 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 485 675 0.00838326545127528 0.00832658437120496 0.00833142595559625 0.00837720302128634 0.00166134303338912 0.00159822218692381 366448 362879 667 665 0 False 485 675 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 530 675 0.00830083928051996 0.0083762392935876 0.00836194399938964 0.00840772106507973 0.00171829914756194 0.0017750917345432 362845 365043 667 665 0 False 530 675 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 575 674 0.0084406412037744 0.0085774289236481 0.0085297932402533 0.00856031128404669 0.00140478039406194 0.00137462144673496 368956 373811 667 665 0 False 575 674 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 619 674 0.00853354508371816 0.00858204104906349 0.00859082932784009 0.00862134737163348 0.00139810149931459 0.0013775730948813 373017 374012 667 665 0 False 619 674 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 660 680 0.00856742606037334 0.0381065963145447 0.00860608834973678 0.0384985122453651 0.00146316052626305 0.00792329108088933 374498 1660715 667 665 0 True 664 674 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G1_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G1_2.csv new file mode 100755 index 0000000..313d358 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G1_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 261 284 0.00781291661333444 0.676908338596549 0.00752269779507134 0.661783779659724 0.00209572761318644 0.185375859498867 341517 29500190 667 665 6 True 261 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 305 284 0.00619447657722981 0.00591692093589432 0.00608834973678187 0.00588998245212482 0.00137301995811707 0.0012265143819803 270772 257864 667 665 0 False 305 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 349 285 0.00588629923994286 0.00587860128692067 0.00587472343022812 0.00590524147402152 0.00124912440627266 0.0012780820515292 257301 256194 667 665 0 True 350 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 394 286 0.00583157723038229 0.00577543653136044 0.00579842832074464 0.00576791027695125 0.00124923688924879 0.00130612962800654 254909 251698 667 665 0 True 394 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 437 285 0.00603506898416207 0.00608910695140231 0.00601205462729839 0.00610360875867857 0.00162685917692275 0.00159511127318448 263804 265368 667 665 0 True 439 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 480 285 0.00637955227009979 0.00622815909079175 0.00633249408712902 0.00621042191195544 0.00170740046394654 0.00176769346256821 278862 271428 667 665 0 True 484 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 526 284 0.00637840841538489 0.00636948287404251 0.00646982528419928 0.0063935301747158 0.0015715663035357 0.00151166535314035 278812 277587 667 665 0 True 528 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 570 283 0.00671939150589503 0.00681605593291996 0.00671396963454643 0.00686655985351339 0.00174794344788389 0.00169893353298916 293717 297049 667 665 0 True 573 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 618 283 0.0092027229690259 0.0073512460482862 0.00759899290455482 0.00735484855420768 0.00838557425683858 0.00192932731707625 402268 320373 667 665 0 False 618 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 657 284 0.00863946603031741 0.693124755124249 0.00856031128404669 0.671625848783093 0.00199219540035665 0.168186606610794 377647 30206914 667 665 7 True 662 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 261 328 0.00621607255424702 0.00601581775450299 0.00622568093385214 0.00599679560540169 0.00157896068470386 0.00149581602304534 271716 262174 667 665 0 False 261 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 305 328 0.00562115371703025 0.00582653704529119 0.00572213321126116 0.00572213321126116 0.00130438342782016 0.00123931213899313 245711 253925 667 665 0 False 305 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 350 329 0.00589739463067734 0.00618240497099925 0.0059662775616083 0.00613412680247196 0.0012530085370662 0.00167519885385751 257786 269434 667 665 0 True 350 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 395 329 0.00610086350736282 0.00620227611831134 0.00613412680247196 0.00617990386816205 0.00137745846407451 0.00124988770395247 266680 270300 667 665 0 True 395 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 438 329 0.00631291129441002 0.00632170951526218 0.0063935301747158 0.00628671702143893 0.00161042483152714 0.00162289615515039 275949 275505 667 665 0 True 439 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 483 328 0.00658537748749795 0.00635353547521814 0.00654612039368277 0.00634775310902571 0.00154421332602842 0.00150877847456133 287859 276892 667 665 0 True 484 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 529 327 0.00649480707117259 0.0064685403139343 0.00656137941557946 0.00642404821850919 0.0014692878379696 0.00152503083248339 283900 281904 667 665 0 False 529 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 571 327 0.00674048418683769 0.00670910510425755 0.00675974670023652 0.00663767452506294 0.00175910618209539 0.00152735539736973 294639 292388 667 665 0 True 573 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 618 326 0.00697504303467401 0.00701538694527576 0.00698863202868696 0.00706492713817044 0.00199800766561016 0.0020278439745205 304892 305736 667 665 0 False 618 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 662 326 0.00707707487524263 0.00701495097322156 0.00709544518196384 0.00700389105058366 0.00210058125418838 0.00174167448991868 309352 305717 667 665 0 False 662 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 261 373 0.0056368474037186 0.00579094795813062 0.00563057907988098 0.00581368734264134 0.00137700590380845 0.00146073002365173 246397 252374 667 665 0 True 261 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 306 372 0.00572485558548261 0.00575868602612046 0.00573739223315786 0.00581368734264134 0.00132156538846744 0.00139032511802452 250244 250968 667 665 0 True 306 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 350 371 0.00613495037786669 0.00621223463786498 0.00611886778057527 0.00622568093385214 0.00130358119013393 0.00138604623902022 268170 270734 667 665 0 False 350 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 394 373 0.0064424185252304 0.00659029124654162 0.00651560234988937 0.00656137941557946 0.00130798743700639 0.00127832592422795 281610 287210 667 665 0 True 395 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 437 372 0.00647327972543826 0.00664033624918327 0.00653086137178607 0.00668345159075303 0.0017136425890766 0.00162035808055341 282959 289391 667 665 0 True 439 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 484 370 0.00670571100350489 0.00672066983664242 0.00668345159075303 0.00674448767833982 0.00163739231414075 0.00172300970910046 293119 292892 667 665 0 False 484 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 527 373 0.00667665709374656 0.00647200514447024 0.00663767452506294 0.00653086137178607 0.00158413850557787 0.00166620090994267 291849 282055 667 665 0 True 529 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 569 371 0.00678587234192471 0.00691844052796216 0.00692759594110018 0.00695811398489357 0.00176071418840873 0.00216152996048047 296623 301511 667 665 0 True 573 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 615 372 0.00647430919468167 0.00669384608236086 0.0063782711528191 0.00677500572213321 0.00199369308238774 0.00186906160809613 283004 291723 667 665 0 True 618 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 658 371 0.0063065285851009 0.00612240144880397 0.00631723506523232 0.00614938582436866 0.00187265644732916 0.0018173417712827 275670 266819 667 665 0 True 663 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 261 416 0.00569522974836683 0.00596781493674677 0.00566109712367437 0.00604257267109178 0.0014240196565828 0.00145606624074734 248949 260082 667 665 0 True 261 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 305 416 0.00580245468934107 0.00582098413807464 0.00581368734264134 0.00578316929884794 0.0013906370118764 0.00140605922602357 253636 253683 667 665 0 True 306 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 349 417 0.00617352115885294 0.00616792610962058 0.00616464484626535 0.00625619897764553 0.00121048051208879 0.00127174412107297 269856 268803 667 665 0 True 350 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 393 417 0.00635374690773176 0.00638322746669833 0.0063935301747158 0.00633249408712902 0.00141532187162225 0.00148641394225049 277734 278186 667 665 0 True 395 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 439 417 0.00658981564379175 0.00641842647359988 0.00663767452506294 0.00643930724040589 0.00161769420210543 0.00156152214074853 288053 279720 667 665 0 True 440 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 483 415 0.00670035776343918 0.00666943164732614 0.00674448767833982 0.00671396963454643 0.0015342758198451 0.00159093197343365 292885 290659 667 665 0 True 484 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 526 415 0.00645518394384863 0.00675208277044178 0.00648508430609598 0.00668345159075303 0.00159144810529848 0.00156169876492342 282168 294261 667 665 0 True 529 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 570 415 0.00643690514550461 0.00642875212751494 0.00642404821850919 0.00653086137178607 0.0017689799163691 0.00169806254324487 281369 280170 667 665 0 True 574 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 614 415 0.00611163861877713 0.00597284008831876 0.00611886778057527 0.005981536583505 0.00191678222942786 0.00176201893223434 267151 260301 667 665 0 True 618 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 659 415 0.00590798672533726 0.00588470489567934 0.00579842832074464 0.00579842832074464 0.00190489435931972 0.00196332227325666 258249 256460 667 665 0 True 663 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 262 461 0.00589162960291427 0.00589567303472689 0.0059662775616083 0.00590524147402152 0.00149325999629359 0.00144463432825623 257534 256938 667 665 0 True 261 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 306 460 0.00596206817625749 0.00587066200635487 0.00590524147402152 0.00582894636453803 0.00137767675074358 0.00140460595610233 260613 255848 667 665 0 True 306 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 350 461 0.00596010074614787 0.00602111825684605 0.005981536583505 0.005981536583505 0.00138794483666093 0.00141209543329131 260527 262405 667 665 0 True 351 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 394 461 0.00615412138288832 0.00638357165516217 0.00614938582436866 0.00633249408712902 0.00149466973817364 0.00141690252718402 269008 278201 667 665 0 True 395 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 438 461 0.00654474776802489 0.00647423089653637 0.00656137941557946 0.0063782711528191 0.00175664630243084 0.00206894366636296 286083 282152 667 665 0 True 440 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 482 459 0.00650894511544868 0.0064647771867297 0.00642404821850919 0.00646982528419928 0.00186226567994347 0.00194944383144347 284518 281740 667 665 0 True 484 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 526 458 0.00622293568253639 0.00620636048808219 0.00630197604333562 0.00625619897764553 0.00165302124726276 0.00178854964421502 272016 270478 667 665 0 True 529 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 571 459 0.00588888435159852 0.00587098324892111 0.00590524147402152 0.00587472343022812 0.00185757863489974 0.00192028582990003 257414 255862 667 665 0 True 574 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 615 459 0.00583654155984493 0.00564361234971154 0.00585946440833143 0.00558480201419089 0.00163630713118985 0.00176260561251594 255126 245953 667 665 0 True 618 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 659 459 0.00582270091779471 0.00593892605168219 0.00585946440833143 0.0059510185397116 0.00176947010730318 0.00185678684580756 254521 258823 667 665 0 True 663 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 262 504 0.00584836901759695 0.00581570658162917 0.00590524147402152 0.00572213321126116 0.00132213166471558 0.00138721846181692 255643 253453 667 665 0 True 261 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 307 504 0.00599908331483148 0.00604913519780224 0.00608834973678187 0.00602731364919509 0.0015491556151075 0.00145214557205616 262231 263626 667 665 0 True 306 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 351 504 0.00601107091224358 0.00595533236845834 0.0059510185397116 0.0059510185397116 0.00147349279704536 0.00140342676362846 262755 259538 667 665 0 True 351 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 395 505 0.00621062780580412 0.0062884379637581 0.00624093995574884 0.00627145799954223 0.00155081319412403 0.00157941654088107 271478 274055 667 665 0 True 395 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 439 504 0.00629108654644982 0.00648728711226452 0.00631723506523232 0.00646982528419928 0.00184408747578018 0.00189809760607208 274995 282721 667 665 0 True 440 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 484 503 0.0063000772445089 0.00598956764766115 0.00630197604333562 0.00604257267109178 0.00174692741498653 0.00163260155193423 275388 261030 667 665 0 True 485 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 528 503 0.00579636938225783 0.00562954651448947 0.00579842832074464 0.00567635614557107 0.00165295361027628 0.00158026507737468 253370 245340 667 665 0 True 529 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 574 500 0.00864477351619452 0.0106566943795745 0.00622568093385214 0.00631723506523232 0.0115060357055389 0.0145429854469286 377879 464427 667 665 0 False 574 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 616 503 0.00593489018823159 0.00589507644138958 0.00582894636453803 0.00585946440833143 0.00180185162294952 0.00168272121389228 259425 256912 667 665 0 True 619 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 660 503 0.00593855052331925 0.00586038224423499 0.00584420538643473 0.0059662775616083 0.00185538701652132 0.001912445407091 259585 255400 667 665 0 True 663 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 263 549 0.00599830549362535 0.00585489817471121 0.00601205462729839 0.00578316929884794 0.00136336783099518 0.00140221432326113 262197 255161 667 665 0 True 262 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 307 548 0.00586371954787083 0.00604771255215172 0.00585946440833143 0.00608834973678187 0.00136098282870452 0.00139156353735381 256314 263564 667 665 0 True 306 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 352 548 0.00594221085840691 0.00622421239640644 0.0059510185397116 0.00624093995574884 0.00130686129897754 0.00129542598329398 259745 271256 667 665 0 True 351 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 396 548 0.00617461925937924 0.00616163893368119 0.00613412680247196 0.00611886778057527 0.00153863155615267 0.00138388846256756 269904 268529 667 665 0 True 396 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 440 547 0.00590462379247547 0.00606772137484935 0.00592050049591821 0.00610360875867857 0.00189079986217407 0.00205530352427001 258102 264436 667 665 0 True 440 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 484 545 0.00605659632989639 0.00631966733037675 0.00605783169298848 0.00634775310902571 0.00187263295950877 0.00201859109695414 264745 275416 667 665 0 True 485 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 529 545 0.00585424843083151 0.00605835944863303 0.00576791027695125 0.00604257267109178 0.00182177008985374 0.00194171595879275 255900 264028 667 665 0 True 529 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 573 545 0.00603472582774761 0.00598431303711327 0.00593575951781491 0.00599679560540169 0.00173124659962794 0.00163609646737391 263789 260801 667 665 0 True 574 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 617 545 0.00609342845171601 0.00590251091220842 0.00613412680247196 0.00601205462729839 0.00163613553279926 0.00171888061664357 266355 257236 667 665 0 True 619 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 661 544 0.00582071061059079 0.00591540650665345 0.00576791027695125 0.005981536583505 0.00185371478248817 0.00189189385874682 254434 257798 667 665 0 True 663 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 264 589 0.0060000212756977 0.00621285417709988 0.0059510185397116 0.00624093995574884 0.00120450907182605 0.00117011135367089 262272 270761 667 665 0 True 262 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 308 588 0.00593392935027108 0.0060277037294541 0.0059510185397116 0.00602731364919509 0.00135375004571953 0.00137312310857008 259383 262692 667 665 0 True 306 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 352 588 0.005939145327771 0.00626973705722305 0.00588998245212482 0.00613412680247196 0.00132053712811939 0.00210079990634734 259611 273240 667 665 0 True 351 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 396 588 0.00600189719743013 0.00609374202271529 0.005981536583505 0.00604257267109178 0.00147201994082393 0.00121690992993593 262354 265570 667 665 0 True 396 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 441 586 0.00590821549628024 0.00599307836999227 0.0059510185397116 0.005981536583505 0.00181077185846677 0.00186726519472372 258259 261183 667 665 0 True 440 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 485 586 0.00605211241941401 0.00625642843662142 0.00607309071488518 0.00630197604333562 0.00191673232877272 0.00184671470543394 264549 272660 667 665 0 True 485 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 530 585 0.00587046829068871 0.0061064769958772 0.00585946440833143 0.00616464484626535 0.00187570200934088 0.00194317216205449 256609 266125 667 665 0 True 530 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 574 585 0.00619170844881977 0.00612476487625564 0.00624093995574884 0.00614938582436866 0.00163375280124613 0.00179949841937148 270651 266922 667 665 0 True 574 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 618 585 0.00605993638566389 0.00604307748083874 0.00605783169298848 0.00602731364919509 0.00142369833413082 0.0014585355215596 264891 263362 667 665 0 True 619 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 662 584 0.006006495493384 0.00594808146482021 0.00593575951781491 0.005981536583505 0.00154984403155476 0.0014792955702853 262555 259222 667 665 0 True 664 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 262 632 0.00627312802742598 0.00616177660906673 0.00625619897764553 0.00617990386816205 0.00133567313967479 0.00139099389497909 274210 268535 667 665 0 False 262 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 307 632 0.00603559515733093 0.00595530942256075 0.00608834973678187 0.00602731364919509 0.00134851990882006 0.00128664425298247 263827 259537 667 665 0 False 307 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 352 630 0.00581284089015231 0.00570139011984069 0.00575265125505455 0.00564583810177768 0.00131250422819363 0.00124873998774874 254090 248471 667 665 0 True 351 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 396 629 0.00575873656213779 0.00577031959619809 0.00578316929884794 0.00575265125505455 0.00136042147973222 0.00137086968397458 251725 251475 667 665 0 True 396 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 441 631 0.00565267835297275 0.00560152957353328 0.00569161516746777 0.00567635614557107 0.00167105135833158 0.00172759452414629 247089 244119 667 665 0 False 441 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 485 631 0.00587355669841893 0.00580398122796118 0.00590524147402152 0.00578316929884794 0.00186542369937381 0.00174799304669417 256744 252942 667 665 0 False 485 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 530 631 0.00592212476961336 0.00591120740739466 0.00599679560540169 0.00592050049591821 0.0019830166442875 0.00170555507124097 258867 257615 667 665 0 False 530 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 574 631 0.00608974523953404 0.00589319487778728 0.00610360875867857 0.00590524147402152 0.00166356564033557 0.00150186875351033 266194 256830 667 665 0 False 574 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 619 631 0.00619690154922539 0.00620640637987737 0.00625619897764553 0.00619516289005875 0.00134623996109018 0.00132726057393979 270878 270480 667 665 0 False 619 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 664 630 0.00626466350253575 0.00607348079514419 0.00622568093385214 0.00605783169298848 0.00145556332717502 0.00136725063775114 273840 264687 667 665 0 False 664 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 264 682 0.00763200455162668 0.683309188512595 0.00735484855420768 0.669260700389105 0.002023352365009 0.174536853662349 333609 29779144 667 665 7 True 262 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 307 675 0.0064293785814806 0.00594633757660345 0.00627145799954223 0.00593575951781491 0.00180091096468283 0.00129166460952933 281040 259146 667 665 0 False 307 675 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 351 675 0.00568196103367405 0.00559044670499779 0.00573739223315786 0.00564583810177768 0.00123775008243192 0.0013494000452826 248369 243636 667 665 0 False 351 675 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 396 675 0.00563298117478226 0.00586359466989745 0.00569161516746777 0.00582894636453803 0.00135468422750464 0.00134347291185817 246228 255540 667 665 0 False 396 675 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 441 675 0.00568337941352052 0.00555231062320484 0.00567635614557107 0.0055390249485008 0.00145974168924937 0.00143724789021489 248431 241974 667 665 0 False 441 675 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 485 675 0.00562481405211791 0.00572396888306828 0.00560006103608759 0.00567635614557107 0.00160516919607247 0.00142609336484338 245871 249455 667 665 0 False 485 675 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 530 675 0.00589801231222338 0.00579581248841949 0.00592050049591821 0.00578316929884794 0.00170658603735011 0.00166618126493554 257813 252586 667 665 0 False 530 675 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 575 674 0.00610230476430359 0.00586696771684303 0.00613412680247196 0.0059510185397116 0.0015226089244273 0.00136775780124562 266743 255687 667 665 0 False 575 674 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 619 674 0.00684098326208834 0.00635702325165168 0.00668345159075303 0.00645456626230259 0.00185341160404854 0.00140883658152118 299032 277044 667 665 0 False 619 674 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 660 680 0.00772701312424584 0.698755861959775 0.00772106507972839 0.69205767910277 0.0018193756597643 0.178339629765405 337762 30452322 667 665 9 True 664 674 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G1_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G1_3.csv new file mode 100755 index 0000000..52dce66 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G1_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 261 284 0.00111082019072862 0.0678771086562825 0.000961318379491875 0.0660410467689021 0.000801328460854362 0.019869864409208 48556 2958137 667 665 0 True 261 285 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 305 284 0.000910142319547482 0.000835850211475129 0.000778210116731518 0.000732433051041428 0.000699185460272584 0.00063500601360227 39784 36427 667 665 0 False 305 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 349 285 0.000927803436345457 0.000915311854825895 0.000778210116731518 0.000762951094834821 0.000688806184897412 0.000715262786451172 40556 39890 667 665 0 True 350 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 394 286 0.000900831342168238 0.000930524984927414 0.000747692072938125 0.00080872816052491 0.000690855107788246 0.000697732825355929 39377 40553 667 665 0 True 394 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 437 285 0.000960700697945831 0.000951038617371995 0.000717174029144732 0.000701915007248035 0.000853585134385237 0.000854630638770477 41994 41447 667 665 0 True 439 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 480 285 0.00094354287722241 0.000911824078392365 0.000717174029144732 0.000610360875867857 0.000844237464865407 0.000908697463136184 41244 39738 667 665 0 True 484 284 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 526 284 0.000952853854601653 0.000889933692092442 0.00080872816052491 0.000701915007248035 0.000745000746959846 0.000802625802411467 41651 38784 667 665 0 True 528 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 570 283 0.000999408741497871 0.000948766973510682 0.000793469138628214 0.00064087891966125 0.000917557756716926 0.000934727097745567 43686 41348 667 665 0 True 573 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 618 283 0.00116746387621021 0.00105119746034805 0.000686655985351339 0.00080872816052491 0.00132424068227934 0.00098821140489513 51032 45812 667 665 0 False 618 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 657 284 0.0009697371501935 0.0701295926931084 0.000534065766384375 0.0677500572213321 0.00102742741904309 0.0184607087168323 42389 3056302 667 665 0 True 662 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 261 328 0.000958573128176127 0.000826029367307029 0.000762951094834821 0.000686655985351339 0.000786493609533799 0.000672675784729474 41901 35999 667 665 0 False 261 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 305 328 0.000871640169844123 0.000925522779253008 0.000762951094834821 0.000793469138628214 0.000649351688925486 0.000658647439611171 38101 40335 667 665 0 False 305 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 350 329 0.000951641368603865 0.000948560460432381 0.000854505226215 0.000839246204318303 0.000631771972227946 0.00067633385758292 41598 41339 667 665 0 True 350 328 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 395 329 0.000933682849580017 0.000930180796463578 0.000717174029144732 0.000793469138628214 0.000731580907335307 0.000684107551500013 40813 40538 667 665 0 True 395 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 438 329 0.000873538968670849 0.000927473180548074 0.000610360875867857 0.000610360875867857 0.000810414813913243 0.000905178308778653 38184 40420 667 665 0 True 439 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 483 328 0.000908014749777778 0.000922310353590545 0.000671396963454643 0.000747692072938125 0.000825522905558389 0.000833944629936963 39691 40195 667 665 0 True 484 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 529 327 0.000912521537354463 0.000951726994299665 0.000732433051041428 0.000762951094834821 0.000781652654666848 0.000818855383761186 39888 41477 667 665 0 False 529 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 571 327 0.000985019049184495 0.000954159259444101 0.000732433051041428 0.000701915007248035 0.000952377953878019 0.000848446026107212 43057 41583 667 665 0 True 573 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 618 326 0.00098344052967794 0.000944544928354303 0.000625619897764553 0.000503547722590982 0.00102923847713436 0.00105170469013999 42988 41164 667 665 0 False 618 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 662 326 0.000988198965291902 0.000976439726003037 0.000595101853971161 0.000625619897764553 0.00101840173880659 0.000956190489461805 43196 42554 667 665 0 False 662 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 261 373 0.000921626620885026 0.000929744824409387 0.000717174029144732 0.000762951094834821 0.000802845246032546 0.000751571995557242 40286 40519 667 665 0 True 261 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 306 372 0.000985659607824835 0.000982864577327962 0.000823987182421607 0.000885023270008392 0.000769497135681201 0.000729088964835525 43085 42834 667 665 0 True 306 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 350 371 0.000942902318582069 0.000906362954766178 0.00080872816052491 0.000778210116731518 0.000731624148887873 0.000708294258916434 41216 39500 667 665 0 False 350 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 394 373 0.000912910447957527 0.000922035002819477 0.000717174029144732 0.000762951094834821 0.00075939345847933 0.000728631511062285 39905 40183 667 665 0 True 395 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 437 372 0.000966145446388731 0.000852876067486179 0.000717174029144732 0.000564583810177768 0.000835850874864616 0.000869428533056004 42232 37169 667 665 0 True 439 371 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 484 370 0.000889186901170609 0.00100746257954339 0.000579842832074464 0.000610360875867857 0.000860162944441414 0.00100517791797686 38868 43906 667 665 0 False 484 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 527 373 0.000874568437914254 0.000887317859767294 0.000579842832074464 0.000595101853971161 0.000880261467451429 0.000872148553496383 38229 38670 667 665 0 True 529 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 569 371 0.000817444333452409 0.000953287315335719 0.000457770656900893 0.00064087891966125 0.000899831299976159 0.000970398636398422 35732 41545 667 665 0 True 573 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 615 372 0.000901563409185771 0.00095512298714284 0.000473029678797589 0.000473029678797589 0.00103789694091567 0.0010698995875764 39409 41625 667 665 0 True 618 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 658 371 0.00100860533340563 0.00102825156275904 0.000686655985351339 0.000686655985351339 0.0010486500948442 0.00104408156493781 44088 44812 667 665 0 True 663 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 261 416 0.000891337348034612 0.00093061676851777 0.000747692072938125 0.000778210116731518 0.000766524773336542 0.000814782460701458 38962 40557 667 665 0 True 261 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 305 416 0.000946608407858328 0.000887707940026307 0.000823987182421607 0.000778210116731518 0.000738776645115462 0.000708768909087292 41378 38687 667 665 0 True 306 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 349 417 0.000925790252047243 0.000938762562161871 0.000823987182421607 0.000823987182421607 0.00070151183048864 0.000688458933718415 40468 40912 667 665 0 True 350 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 393 417 0.00090831215200365 0.000977816479858378 0.000747692072938125 0.000839246204318303 0.000737684604105115 0.000762643010352865 39704 42614 667 665 0 True 395 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 439 417 0.000923571173900347 0.000921989111024299 0.00064087891966125 0.000686655985351339 0.000858263163956128 0.000826748018394108 40371 40181 667 665 0 True 440 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 483 415 0.00090625321351684 0.000864096611407209 0.000610360875867857 0.000625619897764553 0.000871928031391944 0.00078721762547509 39614 37658 667 665 0 True 484 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 526 415 0.000986940725105518 0.000888166857978088 0.000747692072938125 0.000671396963454643 0.000907046788553712 0.000841484777632406 43141 38707 667 665 0 True 529 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 570 415 0.000898589386927045 0.000924237808988023 0.00064087891966125 0.00064087891966125 0.000908406705239327 0.000872890944065208 39279 40279 667 665 0 True 574 414 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 614 415 0.000951961647924035 0.000934448733415136 0.000518806744487678 0.000564583810177768 0.000998249294314023 0.000949332549947722 41612 40724 667 665 0 True 618 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 659 415 0.00093462081044623 0.000887914453104609 0.000595101853971161 0.000442511635004196 0.000951555882261411 0.00097656021445812 40854 38696 667 665 0 True 663 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 262 461 0.000934231899843166 0.00080592876101905 0.000778210116731518 0.000656137941557946 0.00078376896952336 0.000713279892533686 40837 35123 667 665 0 True 261 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 306 460 0.000891039945808739 0.000904320769880756 0.000778210116731518 0.000793469138628214 0.000756969835974713 0.000780316583111694 38949 39411 667 665 0 True 306 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 350 461 0.000892847236258273 0.00105190878317331 0.000732433051041428 0.000930800335698482 0.000762501803209463 0.000811605209497215 39028 45843 667 665 0 True 351 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 394 461 0.000999797652100935 0.000889314152857539 0.000793469138628214 0.000717174029144732 0.000871812634040425 0.000810266543509575 43703 38757 667 665 0 True 395 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 438 461 0.000947409106158754 0.000939611560372664 0.000579842832074464 0.000473029678797589 0.000976568425860647 0.00109118468786771 41413 40949 667 665 0 True 440 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 482 459 0.000936839888593126 0.000920405844090657 0.000595101853971161 0.000518806744487678 0.000987826675794603 0.00101439368148042 40951 40112 667 665 0 True 484 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 526 458 0.000863107013671008 0.00101000957417577 0.000549324788281071 0.000762951094834821 0.000895129708754586 0.000905615948503914 37728 44017 667 665 0 True 529 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 571 459 0.000921878268922302 0.000876189099436621 0.000625619897764553 0.0004272526131075 0.000928123422441795 0.00101958369493193 40297 38185 667 665 0 True 574 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 615 459 0.000946425391103945 0.0009439253891194 0.000579842832074464 0.000518806744487678 0.000932864227219867 0.000971241526028247 41370 41137 667 665 0 True 618 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 659 459 0.000913734023352251 0.000965242127979597 0.000473029678797589 0.000549324788281071 0.001010215699375 0.00106914117146879 39941 42066 667 665 0 True 663 457 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 262 504 0.00100226837828511 0.000928781096710648 0.000823987182421607 0.000778210116731518 0.000843566188133581 0.000791379713029204 43811 40477 667 665 0 True 261 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 307 504 0.000874110896028296 0.000949593025823887 0.000701915007248035 0.00080872816052491 0.000796507268580699 0.000780792271218621 38209 41384 667 665 0 True 306 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 351 504 0.000911560699393951 0.000919189711518439 0.000732433051041428 0.000778210116731518 0.00080423123137052 0.000821700677191208 39846 40059 667 665 0 True 351 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 395 505 0.000919659190775407 0.000977013373442762 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.000802371059689485 0.00084373440617368 40200 42579 667 665 0 True 395 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 439 504 0.000920917430961791 0.000883417057177161 0.000549324788281071 0.000457770656900893 0.0010059048211947 0.000960054729057462 40255 38500 667 665 0 True 440 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 484 503 0.000895295085348148 0.000816415036217231 0.000564583810177768 0.000503547722590982 0.000936985432108758 0.000804944327718899 39135 35580 667 665 0 True 485 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 528 503 0.000880493605337409 0.000886858941815514 0.000579842832074464 0.000610360875867857 0.000906899739272282 0.00083193537523363 38488 38650 667 665 0 True 529 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 574 500 0.00111992527425919 0.00125676975684806 0.000671396963454643 0.000793469138628214 0.00143350735837721 0.00160239141625982 48954 54771 667 665 0 False 574 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 616 503 0.000943725893976793 0.000939336209601596 0.000579842832074464 0.000610360875867857 0.000950480615259306 0.000911707422066068 41252 40937 667 665 0 True 619 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 660 503 0.00091842382768332 0.000946311762468657 0.000473029678797589 0.000488288700694286 0.000992091768810326 0.00106210348751094 40146 41241 667 665 0 True 663 500 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 263 549 0.000947592122913137 0.000923801836933832 0.000793469138628214 0.000778210116731518 0.000769092275095124 0.000737245704866518 41421 40260 667 665 0 True 262 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 307 548 0.000886418772760564 0.000925063861301227 0.000762951094834821 0.000762951094834821 0.000728628771952912 0.000734839377105374 38747 40315 667 665 0 True 306 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 352 548 0.000927551788308181 0.000979468584484787 0.000793469138628214 0.000885023270008392 0.000762269457652174 0.000744828449646142 40545 42686 667 665 0 True 351 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 396 548 0.000881545951675112 0.000940483504481047 0.00064087891966125 0.000747692072938125 0.000826598101399751 0.000765242291207881 38534 40987 667 665 0 True 396 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 440 547 0.000888569219624566 0.000786310018580441 0.000457770656900893 0.000305180437933928 0.00098688012023586 0.000949598916975192 38841 34268 667 665 0 True 440 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 484 545 0.000810283802937167 0.000895234194435505 0.000366216525520714 0.000488288700694286 0.000940447616467207 0.00103682412283882 35419 39015 667 665 0 True 485 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 529 545 0.000882849946050092 0.000917331093813729 0.000518806744487678 0.000442511635004196 0.000975730844573857 0.0010393944604769 38591 39978 667 665 0 True 529 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 573 545 0.000873516091576551 0.000877542907394373 0.000549324788281071 0.000610360875867857 0.000878502086095252 0.000816267155926007 38183 38244 667 665 0 True 574 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 617 545 0.000876627376401065 0.00101588372395856 0.000579842832074464 0.000732433051041428 0.000863840999429992 0.000919287677015115 38319 44273 667 665 0 True 619 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 661 544 0.000934712318823422 0.00096680244901565 0.000549324788281071 0.000595101853971161 0.000985438385630188 0.000986368364408366 40858 42134 667 665 0 True 663 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 264 589 0.00101297485841652 0.000943833605529044 0.000900282291905089 0.000823987182421607 0.000733179506759186 0.00067780346558087 44279 41133 667 665 0 True 262 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 308 588 0.000942055866093046 0.00099458993099595 0.00080872816052491 0.000854505226215 0.000746514161891462 0.000787862966501609 41179 43345 667 665 0 True 306 589 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 352 588 0.000891657627354782 0.00096655004414217 0.000762951094834821 0.000762951094834821 0.000696319624457609 0.000805904528733772 38976 42123 667 665 0 True 351 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 396 588 0.00089483754346219 0.000964668480539871 0.000732433051041428 0.000823987182421607 0.000725718606466938 0.000697476392135225 39115 42041 667 665 0 True 396 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 441 586 0.00092375419065473 0.000893169063652494 0.000534065766384375 0.000442511635004196 0.000956282902049212 0.00103517557406087 40379 38925 667 665 0 True 440 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 485 586 0.000951755754075354 0.000848080374890075 0.000610360875867857 0.000366216525520714 0.000986216147284381 0.00100881424374191 41603 36960 667 665 0 True 485 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 530 585 0.000872166343012975 0.000908955841193737 0.000488288700694286 0.000411993591210803 0.000983703437965247 0.00105145292154876 38124 39613 667 665 0 True 530 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 574 585 0.000907763101740501 0.000905307443477084 0.000579842832074464 0.000610360875867857 0.000865368299859112 0.000922246956626257 39680 39454 667 665 0 True 574 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 618 585 0.000898543632738449 0.00091682628406677 0.000656137941557946 0.000671396963454643 0.000791355326013278 0.000814585919800446 39277 39956 667 665 0 True 619 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 662 584 0.000924920922463923 0.000928872880301004 0.000671396963454643 0.000656137941557946 0.000859080646293001 0.000879435193106332 40430 40481 667 665 0 True 664 587 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 262 632 0.000924829414086731 0.0009002593460075 0.000778210116731518 0.000747692072938125 0.000721331419522393 0.000762637818670349 40426 39234 667 665 0 False 262 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 307 632 0.000964109384996218 0.000899983995236432 0.000854505226215 0.000793469138628214 0.000714724109236203 0.000660978147887568 42143 39222 667 665 0 False 307 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 352 630 0.000901380392431388 0.000976692130876516 0.000762951094834821 0.000885023270008392 0.000697859652847681 0.000706534617930143 39401 42565 667 665 0 True 351 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 396 629 0.000864479639328882 0.000944453144763947 0.000701915007248035 0.00080872816052491 0.000686362078503549 0.00068602535451189 37788 41160 667 665 0 True 396 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 441 631 0.000919567682398215 0.000873733888394596 0.00064087891966125 0.000549324788281071 0.000919468050430952 0.000919382048517876 40196 38078 667 665 0 False 441 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 485 631 0.000930685950226992 0.000930249634156345 0.000625619897764553 0.000595101853971161 0.000942297259648889 0.00096359318377739 40682 40541 667 665 0 False 485 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 530 631 0.00089081117486576 0.000844615544354133 0.000488288700694286 0.000442511635004196 0.000974509667119298 0.000932508174372659 38939 36809 667 665 0 False 530 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 574 631 0.000835494360853448 0.000861802021648307 0.000610360875867857 0.00064087891966125 0.000797370579054649 0.000757371344168478 36521 37558 667 665 0 False 574 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 619 631 0.000945670446992114 0.00100016578411008 0.000747692072938125 0.000839246204318303 0.000728190063644113 0.000731921573588234 41337 43588 667 665 0 False 619 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 664 630 0.000940271452737811 0.000932658953403192 0.000732433051041428 0.000747692072938125 0.000779682286001645 0.000758304890013946 41101 40646 667 665 0 False 664 630 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 264 682 0.000943085335336452 0.0691977368461208 0.00080872816052491 0.0674601358052949 0.000712312392296032 0.0192258220287173 41224 3015691 667 665 0 True 262 676 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 307 675 0.000988633630083562 0.000952713667895993 0.000839246204318303 0.000793469138628214 0.000747824565024219 0.000700817618294458 43215 41520 667 665 0 False 307 675 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 351 675 0.000849975561544016 0.000985273896574809 0.000747692072938125 0.000839246204318303 0.000649011658845957 0.000675177866009455 37154 42939 667 665 0 False 351 675 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 396 675 0.000834236120667064 0.000882361545888067 0.000656137941557946 0.000747692072938125 0.000679314393425614 0.000700308393690496 36466 38454 667 665 0 False 396 675 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 441 675 0.000933637095391421 0.000920750032554492 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.000770801235670194 0.000801331410149692 40811 40127 667 665 0 False 441 675 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 485 675 0.000890605281017079 0.000860608834973678 0.000595101853971161 0.000549324788281071 0.000882675795066504 0.000836823082185446 38930 37506 667 665 0 False 485 675 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 530 675 0.000870473438034931 0.000896014354953532 0.000518806744487678 0.000518806744487678 0.000867651482638127 0.000928632805576327 38050 39049 667 665 0 False 530 675 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 575 674 0.00087493447142302 0.000932177089553823 0.00064087891966125 0.000762951094834821 0.000775843094256672 0.000714950098284466 38245 40625 667 665 0 False 575 674 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 619 674 0.000937732095270744 0.000864670258846934 0.000778210116731518 0.000686655985351339 0.000735606890162113 0.000729939148741552 40990 37683 667 665 0 False 619 674 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 660 680 0.00100828505408545 0.0713836777799385 0.000839246204318303 0.0689860379949645 0.000797978498816285 0.0204979959919502 44074 3110956 667 665 0 True 664 674 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G2_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G2_1.csv new file mode 100755 index 0000000..92a1b01 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G2_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 283 266 0.00903574305774556 0.0382163694886105 0.00907911802853437 0.0387121385519188 0.0014073283960657 0.00813339047963971 394969 1665499 667 665 0 True 283 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 328 266 0.00901039523726349 0.00901009676858661 0.00900282291905089 0.00903334096284428 0.00128933049343164 0.00129055280626646 393861 392667 667 665 0 False 328 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 371 265 0.00909979892177967 0.0543648891053452 0.00915541313801785 0.0558327611200122 0.00133109183900155 0.00925355503743766 397769 2369264 667 665 0 True 372 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 416 266 0.00930404561967128 0.0836994982305845 0.00932326237888151 0.0803540093080034 0.00155436623409613 0.017988822462272 406697 3647689 667 665 0 True 417 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 460 266 0.00922072724223835 0.0671876991632205 0.00926222629129473 0.0678416113527123 0.00174367900557281 0.0134385127849211 403055 2928092 667 665 0 True 461 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 506 265 0.00922427319185452 0.0537713705183077 0.00918593118181125 0.0584267948424506 0.00163807556740748 0.0167146732079413 403210 2343398 667 665 0 False 506 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 548 264 0.00927821738020896 0.0678712115606021 0.00933852140077821 0.0680857557030594 0.00158640920737534 0.022872456639116 405568 2957880 667 665 0 True 551 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 593 265 0.00902322928716461 0.0594140191403205 0.00900282291905089 0.0595864805065995 0.00179130298394488 0.0163835579386821 394422 2589309 667 665 0 True 595 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 640 265 0.00908653020708689 0.00899458534181643 0.00912489509422446 0.0089570458533608 0.00193483951426213 0.00176092451085343 397189 391991 667 665 0 False 640 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 680 265 0.00900227386878774 0.0385996118701423 0.00904859998474098 0.0386358434424353 0.00184595554742767 0.00763316507403567 393506 1682201 667 665 0 True 685 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 283 310 0.00892085429018153 0.00893981348427145 0.0089723048752575 0.00891126878767071 0.00148534684214728 0.00145304005439696 389947 389604 667 665 0 False 283 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 328 309 0.0090950862403543 0.00898079485736543 0.00910963607232776 0.00900282291905089 0.00138584349596582 0.00129275855422654 397563 391390 667 665 0 False 328 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 373 310 0.00927503746410155 0.0884441362045535 0.0093690394445716 0.0865796902418555 0.00123823885981454 0.0185937635233249 405429 3854464 667 665 0 True 372 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 417 310 0.00926746514588895 0.04810554653973 0.00926222629129473 0.0489204242008087 0.00153773777947764 0.00747437850036441 405098 2096477 667 665 0 True 417 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 461 310 0.00925797115175532 0.0683452967506888 0.00929274433508812 0.0658121614404517 0.00174589495299856 0.0156438378415897 404683 2978541 667 665 0 True 462 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 506 309 0.0093310405909428 0.0368473254548594 0.00930800335698482 0.0379186694132906 0.00166243141280204 0.00751080338316397 407877 1605835 667 665 0 False 506 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 549 308 0.00931630774221495 0.035262727659157 0.00935378042267491 0.0376134889753567 0.00150931090756371 0.00707697750326847 407233 1536777 667 665 0 True 551 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 594 308 0.00919251978496904 0.0424871517314688 0.00921644922560464 0.0445258258945602 0.00195913049216968 0.0102399949974031 401822 1851623 667 665 0 True 596 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 640 308 0.00881406401399895 0.00890498161173132 0.00881971465629053 0.0089417868314641 0.00197763938700912 0.00189920397596644 385279 388086 667 665 0 False 640 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 685 308 0.00889253244744073 0.00882990263482005 0.00883497367818723 0.00892652780956741 0.00187773108610384 0.00191204276654093 388709 384814 667 665 0 False 685 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 284 354 0.00901334638242792 0.0463186347649853 0.00900282291905089 0.0472114137483787 0.00146781674895791 0.0120202403003972 393990 2018602 667 665 0 True 283 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 329 353 0.00923893740929947 0.0600686655985351 0.00924696726939803 0.0611276417181659 0.00138646486493809 0.021226020143556 403851 2617839 667 665 0 True 328 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 372 354 0.00913091177002481 0.0329728188633635 0.00921644922560464 0.0348210879682612 0.0015026678533788 0.00687593957847872 399129 1436981 667 665 0 True 373 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 417 352 0.00911119171474002 0.0296416022890827 0.00903334096284428 0.0310368505378805 0.00155571795765294 0.00550003228999688 398267 1291804 667 665 0 False 417 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 461 353 0.00937867070127102 0.0592683126906302 0.00947585259784848 0.0593728542000458 0.00167856408222451 0.0118370862397318 409959 2582959 667 665 0 True 462 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 507 352 0.00941303209690646 0.0267971370403578 0.0093842984664683 0.027847714961471 0.00177160808839633 0.00471856877410324 411461 1167840 667 665 0 False 507 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 551 352 0.00934071760183081 0.0249145408726669 0.00929274433508812 0.0253757534142061 0.00161266447682141 0.00363225899418569 408300 1085795 667 665 0 False 551 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 593 352 0.00914594202097852 0.0427256284451114 0.00917067215991455 0.0438696879530022 0.00203029206478554 0.00903695076336374 399786 1862016 667 665 0 True 596 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 638 353 0.00902757593508121 0.0502317822480211 0.00903334096284428 0.0509803921568627 0.00194915944904438 0.011173678871387 394612 2189140 667 665 0 True 640 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 681 352 0.00904116492909416 0.0533625893527593 0.00906385900663768 0.054032196536202 0.00191699460013171 0.0155848835988888 395206 2325583 667 665 0 True 685 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 285 397 0.00903928900736173 0.0446244244165002 0.00901808194094758 0.046997787441825 0.00147566558584417 0.0130104782716683 395124 1944767 667 665 0 True 283 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 329 397 0.00924705877777522 0.0296871269498994 0.00929274433508812 0.0299992370489052 0.00136300016718517 0.00424953059571853 404206 1293788 667 665 0 True 328 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 373 397 0.00920530808068156 0.0782354604754046 0.00924696726939803 0.0769207293812467 0.00142256951847424 0.0209142800460115 402381 3409562 667 665 0 True 373 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 417 397 0.00938823332668754 0.0591349511338428 0.0093842984664683 0.0598611429007401 0.00165894360941585 0.014984112315086 410377 2577147 667 665 0 True 417 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 461 397 0.00959996083441456 0.0389573613594526 0.00958266575112535 0.0403143358510719 0.00164851433726241 0.0085287362817617 419632 1697792 667 665 0 True 462 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 506 396 0.00928434844148079 0.0470296134017809 0.00941481651026169 0.0478675516899367 0.00184945051242382 0.0106141658954006 405836 2049587 667 665 0 True 507 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 550 395 0.00924657835879497 0.038346656295121 0.00930800335698482 0.0393835355153735 0.00168957291378382 0.00657426892548901 404185 1671177 667 665 0 True 551 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 594 395 0.00915003702085785 0.0451607847726434 0.00912489509422446 0.045990691996643 0.00191213127460493 0.0090608945203634 399965 1968142 667 665 0 True 596 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 638 396 0.00895965384211076 0.0396425488073583 0.00898756389715419 0.0413061722743572 0.00182524065166759 0.00723136919790074 391643 1727653 667 665 0 True 641 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 682 395 0.00909648174310647 0.0810312574753432 0.00900282291905089 0.0785229266803998 0.00180827851219505 0.0181559865373467 397624 3531405 667 665 0 True 685 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 285 441 0.00921539687926694 0.0447417008990776 0.00914015411612116 0.0462195773250935 0.00162549091848018 0.0092636003454267 402822 1949878 667 665 0 True 284 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 329 440 0.00933801810470366 0.04953874730314 0.00935378042267491 0.0500038147554742 0.00151181848625721 0.00942449780547575 408182 2158937 667 665 0 True 328 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 373 441 0.00934618522736801 0.0327795685138688 0.00932326237888151 0.0340886549172198 0.00145297594122609 0.00508906893837425 408539 1428559 667 665 0 True 373 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 418 441 0.00954558198126846 0.0508643318068575 0.00949111161974517 0.0508125429159991 0.00171219144311218 0.0108793957651468 417255 2216707 667 665 0 True 418 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 462 441 0.00950632488745327 0.090099797445089 0.00950637064164187 0.090928511482414 0.00189967704341555 0.0162672595187091 415539 3926619 667 665 0 True 462 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 506 439 0.00956777276273742 0.0544218178772635 0.00962844281681544 0.0558785381857023 0.00175183514419571 0.0136499891690493 418225 2371745 667 665 0 True 507 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 551 439 0.00939322053324448 0.0490412114057173 0.009399557488365 0.0489814602883955 0.00177702724558843 0.00825285083478366 410595 2137254 667 665 0 True 552 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 595 439 0.00905104783383085 0.0300881982938578 0.00910963607232776 0.0306858930342565 0.00194134524581935 0.00420240438390421 395638 1311267 667 665 0 True 596 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 639 440 0.00913155232866515 0.0372008528990134 0.00912489509422446 0.0377050431067369 0.0019153872154622 0.00534498746548748 399157 1621242 667 665 0 True 641 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 682 439 0.00916552481369752 0.072153627373538 0.00932326237888151 0.0713664454108492 0.00188176554255692 0.0134122122641563 400642 3144511 667 665 0 True 685 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 286 485 0.00920292886287458 0.0492917576614918 0.00917067215991455 0.0510414282444495 0.00157697629794628 0.0141364843605383 402277 2148173 667 665 0 True 284 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 331 484 0.00940225698549215 0.0519525639459142 0.00930800335698482 0.0529640650034333 0.00168092654719945 0.00837209576326465 410990 2264133 667 665 0 True 328 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 375 485 0.00961920047071909 0.0670905691787262 0.00964370183871214 0.0657358663309682 0.001553653829264 0.0173377700451839 420473 2923859 667 665 0 True 373 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 419 485 0.00963791393385477 0.0834785751285974 0.00965896086060884 0.0807660028992142 0.0018284860507459 0.017832294477932 421291 3638061 667 665 0 True 418 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 464 484 0.00968597870897465 0.0922848434889008 0.00965896086060884 0.0884870679789426 0.00203973325001819 0.0305195311477544 423392 4021845 667 665 0 True 462 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 508 483 0.00943572617444997 0.0405455387151789 0.00943007553215839 0.042069123369192 0.00171971684734901 0.00723162656408074 412453 1767006 667 665 0 True 507 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 552 482 0.00936970288030624 0.0358181790020944 0.00935378042267491 0.0381170366979477 0.00180651981568299 0.00776672951453623 409567 1560984 667 665 0 False 552 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 596 483 0.00914466090369784 0.0999763313066369 0.00904859998474098 0.0991836423285267 0.00193479749426909 0.0216846744541791 399730 4357046 667 665 0 True 596 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 641 482 0.00921869118084583 0.0560662815197756 0.00924696726939803 0.059311818112459 0.00185186742551292 0.0170082042764596 402966 2443412 667 665 0 False 641 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 684 484 0.00920944883474948 0.072370420213959 0.00917067215991455 0.0718394750896467 0.00188393051892928 0.0124911600154079 402562 3153959 667 665 0 True 686 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 287 529 0.00892176937395344 0.046595018101445 0.00885023270008392 0.0497901884489204 0.00145922690295613 0.0107130078786033 389987 2030647 667 665 0 True 284 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 331 528 0.00917481291398247 0.118488806130685 0.00909437705043107 0.116578927290761 0.00150563018337816 0.0410903565919449 401048 5163834 667 665 0 True 329 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 376 529 0.00953258779170726 0.0556499511539205 0.00952162966353857 0.0576791027695125 0.00154613157069408 0.0129309607983939 416687 2425268 667 665 0 True 373 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 420 528 0.00945434812920846 0.0581847156228865 0.00953688868543526 0.0581521324483101 0.00177341605380477 0.0103514483308508 413267 2535735 667 665 0 True 418 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 465 528 0.00959257153295634 0.0533045821236543 0.00958266575112535 0.0542763408865492 0.00203102514630662 0.00712892323820048 419309 2323055 667 665 0 True 463 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 508 525 0.00953270217717875 0.0626020074218506 0.00952162966353857 0.0624246585793851 0.00187224212026962 0.0136300309278936 416692 2728244 667 665 0 True 507 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 552 525 0.00923248606870746 0.0719107679934558 0.00929274433508812 0.0712291142137789 0.00177284049438304 0.019576435991595 403569 3133927 667 665 0 True 552 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 597 526 0.00917957134959643 0.0531412302787181 0.00923170824750134 0.0542000457770657 0.00171645504365401 0.0130164959525376 401256 2315936 667 665 0 False 597 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 640 525 0.00926787693358631 0.0456356730691457 0.00929274433508812 0.0455786984054322 0.00195632584745284 0.00726822659557664 405116 1988838 667 665 0 True 641 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 684 525 0.00915873031669105 0.0602771520240289 0.00910963607232776 0.0594033722438392 0.00164265591159874 0.0138667034255141 400345 2626925 667 665 0 True 686 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 288 569 0.00859920234435312 0.0413052314925561 0.00859082932784009 0.0423285267414359 0.00139999250378502 0.00961319804453241 375887 1800114 667 665 0 True 284 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 332 569 0.00896567051791111 0.053807808603679 0.00889600976577401 0.0544289311055161 0.00145190271430053 0.0108381969083761 391906 2344986 667 665 0 True 329 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 376 569 0.00913386291518923 0.0434985151136023 0.00907911802853437 0.0442359044785229 0.00146036211541099 0.00824083740411114 399258 1895699 667 665 0 True 374 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 420 568 0.00919471598602164 0.0504626409236642 0.00914015411612116 0.049210345616846 0.00180153339364243 0.00772987646474336 401918 2199201 667 665 0 True 418 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 464 568 0.00938834771215903 0.0854498571904699 0.0093690394445716 0.0817578393224994 0.0020109841606034 0.0206661437728974 410382 3723971 667 665 0 True 463 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 508 566 0.00928190059239092 0.060989392685192 0.00923170824750134 0.0614785992217899 0.0021046182019356 0.0138486116397343 405729 2657965 667 665 0 True 507 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 553 566 0.00911288461971807 0.0545863170170792 0.00918593118181125 0.0539101243610285 0.00185108668691728 0.0119059201173372 398341 2378914 667 665 0 True 552 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 597 566 0.00894789501564164 0.0350681235017046 0.00889600976577401 0.0365758754863813 0.00160697292384306 0.00767779822064558 391129 1528296 667 665 0 True 597 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 641 566 0.00923392732564823 0.0442512093922148 0.00917067215991455 0.0445716029602502 0.00186564130284636 0.00656136175239031 403632 1928502 667 665 0 True 641 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 685 566 0.00895761778071825 0.0489150319148753 0.00904859998474098 0.0486610208285649 0.00161862759946212 0.00676795735394774 391554 2131755 667 665 0 True 686 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 284 614 0.00848923215206313 0.00848140034223806 0.00845349813076982 0.00857557030594339 0.00136149237535547 0.00145662331492281 371080 369626 667 665 0 False 284 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 329 614 0.00851501463733686 0.00861288033542313 0.00848401617456321 0.00866712443732357 0.00141857671086723 0.00141522061793446 372207 375356 667 665 0 False 329 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 375 611 0.00895116644012624 0.072540036288937 0.0089570458533608 0.0719157701991302 0.00146065996906812 0.0149200040527054 391272 3161351 667 665 0 True 374 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 420 610 0.00900799314236221 0.07698474843552 0.00883497367818723 0.0740215152208743 0.00166711883845266 0.0200959146921548 393756 3355055 667 665 0 True 418 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 463 613 0.00888287831364702 0.00879798489127373 0.0089723048752575 0.00871290150301366 0.00198020393659157 0.00191807900128065 388287 383423 667 665 0 False 463 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 508 613 0.00874607328974561 0.00877981174038323 0.00869764248111696 0.00871290150301366 0.00199632382217258 0.00209832636879577 382307 382631 667 665 0 False 508 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 552 613 0.00880324314839605 0.00882818169250088 0.00862134737163348 0.00885023270008392 0.00248186407267098 0.00196060216632075 384806 384739 667 665 0 False 552 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 597 612 0.00867167697908885 0.00861076931284494 0.00863660639353018 0.00854505226215 0.00146610542437836 0.00153573716410935 379055 375264 667 665 0 False 597 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 642 612 0.00864980647694006 0.00872453507309129 0.00866712443732357 0.00877393759060044 0.00153650705975905 0.0015739572082096 378099 380222 667 665 0 False 642 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 686 612 0.00877508144531534 0.00885296326189702 0.00883497367818723 0.00889600976577401 0.00160292563309286 0.00152523543185652 383575 385819 667 665 0 False 686 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 285 662 0.00865927759397939 0.0371651490823649 0.00862134737163348 0.0376592660410468 0.00132131401221861 0.00897737536359975 378513 1619686 667 665 0 True 285 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 329 657 0.00852043650868546 0.0085304127794882 0.00856031128404669 0.00857557030594339 0.00130986281829491 0.00122854103678714 372444 371762 667 665 0 False 329 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 374 657 0.0085428103069088 0.00850677850497152 0.0085297932402533 0.0085145342183566 0.0012496029570221 0.00120322927456387 373422 370732 667 665 0 False 374 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 419 657 0.00858067189797182 0.00864514226743329 0.00868238345922026 0.00868238345922026 0.00151845335031708 0.00136940560003003 375077 376762 667 665 0 False 419 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 463 656 0.00845862259989255 0.00854842530909558 0.00848401617456321 0.00857557030594339 0.00166342098655236 0.0015466997938276 369742 372547 667 665 0 False 463 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 508 656 0.00862349781849748 0.00835719419858871 0.00860608834973678 0.00839246204318303 0.00183865973906657 0.00171473228443879 376949 364213 667 665 0 False 508 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 552 656 0.00842593123214085 0.00846749512829912 0.00846875715266651 0.00846875715266651 0.00161819556257265 0.0018107051884469 368313 369020 667 665 0 False 552 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 597 656 0.00844617746059449 0.00851320335629644 0.00845349813076982 0.0085297932402533 0.00138752547738723 0.00128726163495185 369198 371012 667 665 0 False 597 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 642 656 0.00861928843314667 0.00857988413469012 0.00860608834973678 0.00849927519645991 0.00139476201916319 0.00131663807219899 376765 373918 667 665 0 False 642 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 683 661 0.0086417537397472 0.0381032921052918 0.00860608834973678 0.0382848859388113 0.00144421516785172 0.00763436258814518 377747 1660571 667 665 0 True 686 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G2_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G2_2.csv new file mode 100755 index 0000000..2980f36 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G2_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 283 266 0.00737157171013944 0.727655233299546 0.00720225833524071 0.734187838559548 0.00177526329639905 0.193440023396263 322225 31711779 667 665 12 True 283 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 328 266 0.00634290316503456 0.00593952264501951 0.0063782711528191 0.00587472343022812 0.00133327563704954 0.00121957327912458 277260 258849 667 665 0 False 328 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 371 265 0.00581945237040441 0.00587582483331239 0.00585946440833143 0.00587472343022812 0.00124774375409442 0.00128684807709406 254379 256073 667 665 0 True 372 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 416 266 0.00593349468547942 0.00610656877946755 0.0059662775616083 0.00611886778057527 0.00138706296360295 0.00130684648134881 259364 266129 667 665 0 True 417 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 460 266 0.00604442571572991 0.00609654142222115 0.00602731364919509 0.00614938582436866 0.00157124943631302 0.00162139900536975 264213 265692 667 665 0 True 461 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 506 265 0.00628257626737101 0.00629862594228763 0.00628671702143893 0.00636301213092241 0.00157672730649749 0.00147956496608968 274623 274499 667 665 0 False 506 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 548 264 0.00657272645435122 0.00647721386322295 0.00659189745937285 0.00648508430609598 0.0015309265537041 0.00141357440043967 287306 282282 667 665 0 True 551 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 593 265 0.00676141672812026 0.00705857112453829 0.00685130083161669 0.00717174029144732 0.00187363106098423 0.00181078109982827 295554 307618 667 665 0 True 595 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 640 265 0.00874984801030476 0.00767104302298433 0.00782787823300526 0.00772106507972839 0.00575827274244217 0.00175874536569048 382472 334310 667 665 0 False 640 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 680 265 0.00883817647138893 0.728510266281405 0.00888075074387732 0.716914625772488 0.00193471123200035 0.177010647339758 386333 31749042 667 665 11 True 685 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 283 310 0.00623828621281028 0.00596999479701772 0.00625619897764553 0.00592050049591821 0.00141754544757315 0.00139404446800798 272687 260177 667 665 0 False 283 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 328 309 0.00607023107809794 0.00596331754081932 0.00608834973678187 0.00587472343022812 0.0012603396285953 0.00118192734931752 265341 259886 667 665 0 False 328 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 373 310 0.00603012753179373 0.00626172893896449 0.00601205462729839 0.00628671702143893 0.00131930298969409 0.00124159524249544 263588 272891 667 665 0 True 372 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 417 310 0.00617784492967524 0.00661798694493157 0.00619516289005875 0.00643930724040589 0.00143462521623619 0.00236272776845003 270045 288417 667 665 0 True 417 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 461 310 0.00640075933651394 0.00643671435397833 0.00643930724040589 0.00645456626230259 0.0016818003267523 0.00171899224883016 279789 280517 667 665 0 True 462 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 506 309 0.00645497804999995 0.00645211105126056 0.00642404821850919 0.00650034332799268 0.00162805807748825 0.00153936752332133 282159 281188 667 665 0 False 506 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 549 308 0.00654472489093059 0.00643770102757466 0.00657663843747616 0.00653086137178607 0.00156620681360234 0.00139729500533353 286082 280560 667 665 0 True 551 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 594 308 0.00663831508370328 0.00679377546636103 0.00657663843747616 0.0068055237659266 0.00195327265419996 0.00196204776567833 290173 296078 667 665 0 True 596 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 640 308 0.00717983878282877 0.00710003436148164 0.00727855344472419 0.00703440909437705 0.00189314736240852 0.00190256963751544 313844 309425 667 665 0 False 640 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 685 308 0.00708581392526442 0.00696084454670666 0.00695811398489357 0.00695811398489357 0.0019857107886233 0.00190981456805466 309734 303359 667 665 0 False 685 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 284 354 0.00578884281823382 0.00571150926067744 0.00581368734264134 0.00575265125505455 0.00127761061970529 0.00138242119249616 253041 248912 667 665 0 True 283 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 329 353 0.00588938764767307 0.00590810971122014 0.00590524147402152 0.00585946440833143 0.00128864589710021 0.00130953438706714 257436 257480 667 665 0 True 328 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 372 354 0.00641139718536246 0.00620844856476279 0.0063935301747158 0.00616464484626535 0.00130164451636937 0.0013645391252479 280254 270569 667 665 0 True 373 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 417 352 0.00651690634426435 0.00646934342034991 0.00654612039368277 0.00650034332799268 0.00154348964651527 0.00145657786938325 284866 281939 667 665 0 False 417 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 461 353 0.00651667757332137 0.00653157269461133 0.00659189745937285 0.00656137941557946 0.00170917667995051 0.00155371696869522 284856 284651 667 665 0 True 462 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 507 352 0.0066185721513242 0.00656397230200702 0.00660715648126955 0.00656137941557946 0.00167154749656979 0.00158512780587664 289310 286063 667 665 0 False 507 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 551 352 0.00666251904947046 0.00651642840220258 0.00662241550316625 0.00653086137178607 0.00161071530642579 0.00170481481294962 291231 283991 667 665 0 False 551 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 593 352 0.00683546988236255 0.00666906451296472 0.00689707789730678 0.00669871061264973 0.00190931188984985 0.00208627301040295 298791 290643 667 665 0 True 596 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 638 353 0.00646325955813579 0.00647319833114487 0.00648508430609598 0.00643930724040589 0.00190116412673815 0.00190217656684374 282521 282107 667 665 0 True 640 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 681 352 0.00613646026609035 0.00603903900286307 0.00613412680247196 0.00610360875867857 0.00177587281918272 0.00183960672399448 268236 263186 667 665 0 True 685 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 285 397 0.00576013206488996 0.00583849185793506 0.00584420538643473 0.00585946440833143 0.00140512702981472 0.00138485291030575 251786 254446 667 665 0 True 283 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 329 397 0.00611678596499416 0.0693546179479369 0.00614938582436866 0.0718699931334401 0.00138007084558062 0.0152233435204766 267376 3022528 667 665 0 True 328 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 373 397 0.00654710410873757 0.00651294062576905 0.00660715648126955 0.00656137941557946 0.00142456077737625 0.00140726741208749 286186 283839 667 665 0 True 373 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 417 397 0.00661882379936148 0.00646714061418137 0.00662241550316625 0.00645456626230259 0.00144767388613865 0.00147781944351342 289321 281843 667 665 0 True 417 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 461 397 0.00666073463611522 0.00681438088239597 0.00660715648126955 0.00686655985351339 0.00168483761302821 0.00153523077593177 291153 296976 667 665 0 True 462 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 506 396 0.00674048418683769 0.00660963463820916 0.00677500572213321 0.00663767452506294 0.00170467332294717 0.00169310856088043 294639 288053 667 665 0 True 507 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 550 395 0.00676130234264877 0.0066644982793445 0.00671396963454643 0.00674448767833982 0.00156096357229463 0.00145245814483451 295549 290444 667 665 0 True 551 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 594 395 0.00640149140353147 0.00654205896980951 0.0064087891966125 0.00660715648126955 0.00191736639063496 0.00205410252832881 279821 285108 667 665 0 True 596 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 638 396 0.00587364820679612 0.005746708267579 0.00576791027695125 0.00579842832074464 0.0017502313180971 0.0017757477344866 256748 250446 667 665 0 True 641 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 682 395 0.0057075376250991 0.00575561127584353 0.00570687418936446 0.00567635614557107 0.00169521027218093 0.00173089349386131 249487 250834 667 665 0 True 685 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 285 441 0.00598055286845019 0.00602864451125525 0.005981536583505 0.00601205462729839 0.00135828468529498 0.00142683200739166 261421 262733 667 665 0 True 284 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 329 440 0.00620719624165944 0.00599645141693786 0.00617990386816205 0.00599679560540169 0.00136928263879045 0.00143671790832796 271328 261330 667 665 0 True 328 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 373 441 0.00622195196748158 0.0063072535997811 0.00622568093385214 0.00634775310902571 0.00144456174720724 0.00135486171135452 271973 274875 667 665 0 True 373 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 418 441 0.00636811372295084 0.00662181890982893 0.0064087891966125 0.00659189745937285 0.00168836979790212 0.00171699163528873 278362 288584 667 665 0 True 418 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 462 441 0.0065533266783866 0.00649323009974008 0.00659189745937285 0.00650034332799268 0.00177841007612696 0.00180049063901255 286458 282980 667 665 0 True 462 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 506 439 0.00646888732333307 0.00645502518025437 0.00651560234988937 0.00645456626230259 0.00173596731026833 0.00187309301011948 282767 281315 667 665 0 True 507 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 551 439 0.00638733048216107 0.00625030188196516 0.00636301213092241 0.00616464484626535 0.00168597327853848 0.00168704816322863 279202 272393 667 665 0 True 552 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 595 439 0.00568825223460597 0.00580579395387072 0.00566109712367437 0.00582894636453803 0.0018808520200194 0.0018964560746636 248644 253021 667 665 0 True 596 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 639 440 0.00571428636791698 0.00571166988196057 0.00578316929884794 0.00573739223315786 0.00186264359488801 0.00185304337242871 249782 248919 667 665 0 True 641 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 682 439 0.00569863843541722 0.00558764730549193 0.00566109712367437 0.00561532005798428 0.00170068740331393 0.00179974426372026 249098 243514 667 665 0 True 685 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 286 485 0.00600416202976562 0.00583323724738718 0.00601205462729839 0.00581368734264134 0.0015574232000465 0.00151375497437394 262453 254217 667 665 0 True 284 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 331 484 0.00606613607821862 0.00617253823503598 0.00608834973678187 0.00616464484626535 0.00153575846034678 0.00147549689773849 265162 269004 667 665 0 True 328 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 375 485 0.00613890811518022 0.00642374992184054 0.00608834973678187 0.00636301213092241 0.00142320396211483 0.00157037299581512 268343 279952 667 665 0 True 373 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 419 485 0.00633782445010042 0.00657301298565709 0.00631723506523232 0.00656137941557946 0.00177770284123456 0.00171579332736546 277038 286457 667 665 0 True 418 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 464 484 0.0064653413737169 0.00665766040186298 0.00645456626230259 0.00659189745937285 0.00189574572349058 0.00196340285608567 282612 290146 667 665 0 True 462 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 508 483 0.00620895777792038 0.00627095318979527 0.00613412680247196 0.00631723506523232 0.00183024740974276 0.00185138289048919 271405 273293 667 665 0 True 507 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 552 482 0.00605902130189197 0.00590859157506951 0.00607309071488518 0.00599679560540169 0.00184438650832853 0.00170991083618353 264851 257501 667 665 0 False 552 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 596 483 0.00584464005122639 0.0056704361039931 0.00593575951781491 0.00570687418936446 0.00177014183817738 0.00178776446346205 255480 247122 667 665 0 True 596 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 641 482 0.00572734918876108 0.00569785645161198 0.00576791027695125 0.00569161516746777 0.00180179371726933 0.00170976470877529 250353 248317 667 665 0 False 641 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 684 484 0.00591816703229983 0.00594489198505534 0.00590524147402152 0.00593575951781491 0.00185315923668377 0.00174717459512287 258694 259083 667 665 0 True 686 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 287 529 0.00580298086250992 0.00574677710527176 0.00587472343022812 0.00576791027695125 0.00149167177103457 0.0014413112800674 253659 250449 667 665 0 True 284 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 331 528 0.00598890300786892 0.00596742485648775 0.00601205462729839 0.0059662775616083 0.00142717061050552 0.00152601304193254 261786 260065 667 665 0 True 329 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 376 529 0.00607535554722067 0.00619392381158894 0.00602731364919509 0.00627145799954223 0.00140287510639182 0.00143221294191177 265565 269936 667 665 0 True 373 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 420 528 0.0061260511881848 0.00624197252114034 0.00604257267109178 0.00622568093385214 0.00168252165483098 0.00175526143205703 267781 272030 667 665 0 True 418 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 465 528 0.00614396395302006 0.00603708860156801 0.00627145799954223 0.00610360875867857 0.00190921980696028 0.00183441889550607 268564 263101 667 665 0 True 463 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 508 525 0.00629575347368659 0.00633852885819493 0.00633249408712902 0.00628671702143893 0.0018157397928129 0.00185380238582817 275199 276238 667 665 0 True 507 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 552 525 0.00617951495755899 0.00597492816499936 0.00619516289005875 0.0059662775616083 0.00165826052828979 0.00165280623882678 270118 260392 667 665 0 True 552 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 597 526 0.00616384414796493 0.00624807612989902 0.00622568093385214 0.00621042191195544 0.00169036204003834 0.00165743972513494 269433 272296 667 665 0 False 597 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 640 525 0.00580147097428626 0.00586742663479482 0.00587472343022812 0.005981536583505 0.00189289236364881 0.00181923999904995 253593 255707 667 665 0 True 641 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 684 525 0.00594335471312181 0.00581453634085213 0.00593575951781491 0.00575265125505455 0.00174316443667245 0.00175352403538746 259795 253402 667 665 0 True 686 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 288 569 0.0058064581808432 0.0061411482471342 0.00584420538643473 0.00616464484626535 0.00136995768792476 0.00138498000557855 253811 267636 667 665 0 True 284 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 332 569 0.00604259554818608 0.00600377115826875 0.00602731364919509 0.00604257267109178 0.0013271756595316 0.00130029721958221 264133 261649 667 665 0 True 329 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 376 569 0.00591782387588536 0.00597635081064988 0.0059510185397116 0.00599679560540169 0.00127629990131982 0.00124448599487924 258679 260454 667 665 0 True 374 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 420 568 0.00588936477057878 0.00603057196665273 0.00587472343022812 0.00607309071488518 0.001732794604289 0.001671207514581 257435 262817 667 665 0 True 418 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 464 568 0.00595005770175109 0.00607664732901147 0.00607309071488518 0.00614938582436866 0.00186417213302458 0.00170807278072467 260088 264825 667 665 0 True 463 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 508 566 0.00604172621860276 0.00620018804163074 0.005981536583505 0.00614938582436866 0.00191981162699581 0.00196372370568049 264095 270209 667 665 0 True 507 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 553 566 0.00618770495731763 0.00608729422549278 0.00624093995574884 0.00610360875867857 0.00174950626787601 0.00176132865695752 270476 265289 667 665 0 True 552 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 597 566 0.00611422373043279 0.00626328926000054 0.00601205462729839 0.00633249408712902 0.00164067238579438 0.00143368289039112 267264 272959 667 665 0 True 597 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 641 566 0.00599752767241923 0.0060799285923667 0.00604257267109178 0.00608834973678187 0.00161586627906836 0.00153313942516249 262163 264968 667 665 0 True 641 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 685 566 0.00593790996467891 0.00607552298002961 0.00588998245212482 0.00613412680247196 0.00156590336487465 0.00160471282850155 259557 264776 667 665 0 True 686 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 284 614 0.00607247303333913 0.00617194164169866 0.00604257267109178 0.00624093995574884 0.00137679933816456 0.00142175281675822 265439 268978 667 665 0 False 284 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 329 614 0.00605586426287886 0.00606164071198826 0.0059662775616083 0.00608834973678187 0.00146413920599441 0.0014640391665156 264713 264171 667 665 0 False 329 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 375 611 0.00579867996878192 0.00613079964732155 0.00575265125505455 0.00608834973678187 0.00131831680325227 0.00148723480581846 253471 267185 667 665 0 True 374 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 420 610 0.0056162580188505 0.00614305275663409 0.0055390249485008 0.00611886778057527 0.00164507664467038 0.00180792368081939 245497 267719 667 665 0 True 418 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 463 613 0.00570353413359697 0.00556885461536652 0.00579842832074464 0.00563057907988098 0.00183415549724825 0.00200026330711626 249312 242695 667 665 0 False 463 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 508 613 0.00586333063726777 0.00580682651926222 0.00573739223315786 0.00582894636453803 0.00204131246528829 0.0019864745533342 256297 253066 667 665 0 False 508 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 552 613 0.0060489325033066 0.00591006011251521 0.0059510185397116 0.0059510185397116 0.00277688995692255 0.00185915096594053 264410 257565 667 665 0 False 552 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 597 612 0.00600315543761651 0.00594294158376027 0.0059662775616083 0.00599679560540169 0.00151678245102279 0.00146019270393297 262409 258998 667 665 0 False 597 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 642 612 0.00600370448787966 0.0059656580223734 0.0059510185397116 0.0059662775616083 0.00138662334687766 0.0014397492034807 262433 259988 667 665 0 False 642 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 686 612 0.00619198297395134 0.00596100000516283 0.00622568093385214 0.00602731364919509 0.00148026415275284 0.0014790994715308 270663 259785 667 665 0 False 686 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 285 662 0.00843357218163635 0.70260886824523 0.00781261921110857 0.711589227130541 0.00334545375865652 0.224596442579755 368647 30620239 667 665 12 True 285 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 329 657 0.0067555830690743 0.00652813080997298 0.00660715648126955 0.00651560234988937 0.00178351803820855 0.00132538742404269 295299 284501 667 665 0 False 329 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 374 657 0.00579925189613936 0.00592144127771936 0.00582894636453803 0.00588998245212482 0.00121619715029281 0.00117760778344947 253496 258061 667 665 0 False 374 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 419 657 0.00571561323938626 0.00567215704631228 0.00578316929884794 0.00573739223315786 0.00141778643958187 0.00138438596575392 249840 247197 667 665 0 False 419 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 463 656 0.00554499587011255 0.00561795883620702 0.0055542839703975 0.00566109712367437 0.00159405895104208 0.00148796464717495 242382 244835 667 665 0 False 463 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 508 656 0.00570765201057059 0.00555735872067443 0.00566109712367437 0.00564583810177768 0.00171928490895449 0.00157668196444594 249492 242194 667 665 0 False 508 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 552 656 0.0056129408401773 0.0058603592983374 0.00558480201419089 0.00581368734264134 0.00151974541417751 0.00167887834688739 245352 255399 667 665 0 False 552 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 597 656 0.00582649851544816 0.00574847510169335 0.00588998245212482 0.00572213321126116 0.00129155615438793 0.0012099140305309 254687 250523 667 665 0 False 597 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 642 656 0.00665288779277104 0.0061712303188734 0.00648508430609598 0.00619516289005875 0.00185790516484531 0.0012432646244257 290810 268947 667 665 0 False 642 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 683 661 0.0077166040463403 0.73451293603659 0.00756847486076143 0.722514686808576 0.00187504603893603 0.182658375107675 337307 32010643 667 665 13 True 686 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G2_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G2_3.csv new file mode 100755 index 0000000..d587165 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G2_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 283 266 0.00111873566535569 0.0753397111455682 0.000976577401388571 0.0742046234836347 0.000790274487865872 0.0228762722291514 48902 3283363 667 665 0 True 283 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 328 266 0.000976325753351294 0.000985228004779631 0.000869764248111696 0.000885023270008392 0.000721268492070995 0.000679201516711231 42677 42937 667 665 0 False 328 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 371 265 0.000865760756609564 0.000979009666533007 0.000732433051041428 0.000854505226215 0.000663437713110249 0.000692641241736168 37844 42666 667 665 0 True 372 266 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 416 266 0.000849220617432186 0.000931213361855084 0.00064087891966125 0.000778210116731518 0.000743053241262292 0.000729621925927483 37121 40583 667 665 0 True 417 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 460 266 0.000925241201784093 0.000931878792885166 0.000717174029144732 0.000686655985351339 0.000851276001480878 0.000855661097611419 40444 40612 667 665 0 True 461 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 506 265 0.000960746452134427 0.000892939604676603 0.000747692072938125 0.00064087891966125 0.000862556809965642 0.000804231906686821 41996 38915 667 665 0 False 506 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 548 264 0.000931029106641461 0.000924260754885612 0.000732433051041428 0.000762951094834821 0.000794160836261661 0.000762813144738997 40697 40280 667 665 0 True 551 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 593 265 0.0010371101929008 0.000996356765110304 0.000762951094834821 0.000656137941557946 0.000950050973635763 0.00100554064094829 45334 43422 667 665 0 True 595 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 640 265 0.0011926515570322 0.00105105978496252 0.000885023270008392 0.000732433051041428 0.00107206793661225 0.000967411531349957 52133 45806 667 665 0 False 640 265 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 680 265 0.00117560812178026 0.0752673397845724 0.000900282291905089 0.0725413900968948 0.00100770873530726 0.0216146352217115 51388 3280209 667 665 0 True 685 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 283 310 0.000938281145533894 0.000889245315164772 0.000793469138628214 0.000747692072938125 0.000738267466134882 0.000717287794845608 41014 38754 667 665 0 False 283 310 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 328 309 0.00101473639467746 0.000962052648214723 0.000930800335698482 0.000869764248111696 0.000711259948453431 0.000648649926613617 44356 41927 667 665 0 False 328 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 373 310 0.000897628548966533 0.000864119557304798 0.000778210116731518 0.000778210116731518 0.000672326955939369 0.000609974975540693 39237 37659 667 665 0 True 372 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 417 310 0.00090321055997522 0.000962993430015873 0.000671396963454643 0.000686655985351339 0.000793216446463646 0.000856039786544635 39481 41968 667 665 0 True 417 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 461 310 0.00102363558435934 0.000923388810777229 0.000747692072938125 0.000671396963454643 0.000959203425651757 0.00087131375176341 44745 40242 667 665 0 True 462 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 506 309 0.000934483547880443 0.000910584999922558 0.000701915007248035 0.000717174029144732 0.000868635542132027 0.000818955557742024 40848 39684 667 665 0 False 506 309 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 549 308 0.00091810354836315 0.000968408661846881 0.000686655985351339 0.000839246204318303 0.00085376123200741 0.00073494357568505 40132 42204 667 665 0 True 551 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 594 308 0.000991333127210714 0.000966618881834937 0.000701915007248035 0.000503547722590982 0.000984952622504147 0.00110923697510478 43333 42126 667 665 0 True 596 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 640 308 0.00105882055538951 0.00104938473443852 0.00080872816052491 0.000686655985351339 0.0010305586090779 0.00105048813609599 46283 45733 667 665 0 False 640 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 685 308 0.00102654097533518 0.000980088123719691 0.000656137941557946 0.000534065766384375 0.000985689444764405 0.00106067658586693 44872 42713 667 665 0 False 685 308 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 284 354 0.000886098493440394 0.000917193418428195 0.000747692072938125 0.000747692072938125 0.000729998716655058 0.000767028745137694 38733 39972 667 665 0 True 283 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 329 353 0.000969897289853586 0.000916688608681236 0.00080872816052491 0.000793469138628214 0.000729525742817803 0.000709232580485615 42396 39950 667 665 0 True 328 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 372 354 0.000922976369448601 0.000874720561990924 0.000793469138628214 0.000762951094834821 0.000682627878295934 0.000645939771337403 40345 38121 667 665 0 True 373 353 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 417 352 0.000929267570380523 0.00102678302531334 0.000732433051041428 0.000762951094834821 0.000787369242925146 0.000863082660646166 40620 44748 667 665 0 False 417 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 461 353 0.00094745486034735 0.000871875270689886 0.000701915007248035 0.000579842832074464 0.000874394452899793 0.000825525516482076 41415 37997 667 665 0 True 462 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 507 352 0.000926110531367413 0.000939221480113651 0.000656137941557946 0.000686655985351339 0.000888791937547247 0.000876746288249863 40482 40932 667 665 0 False 507 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 551 352 0.000909089973209779 0.00100351588515808 0.000656137941557946 0.000747692072938125 0.000872839547913158 0.000934351005961871 39738 43734 667 665 0 False 551 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 593 352 0.000926751090007754 0.000915724880982497 0.000488288700694286 0.000274662394140536 0.00102804544335622 0.00115768793776352 40510 39908 667 665 0 True 596 352 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 638 353 0.000937617709799255 0.000875959640460731 0.000549324788281071 0.000442511635004196 0.00101783836397977 0.00100963998595983 40985 38175 667 665 0 True 640 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 681 352 0.000886006985063202 0.000857350517516038 0.000534065766384375 0.000442511635004196 0.00092337678597607 0.00089496685201337 38729 37364 667 665 0 True 685 351 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 285 397 0.000939127598022916 0.00092102538332556 0.000778210116731518 0.000762951094834821 0.000779986302810873 0.000763912175879728 41051 40139 667 665 0 True 283 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 329 397 0.000963789105676047 0.00675362014558025 0.000823987182421607 0.00691233691920348 0.000696957167671062 0.00190830092987692 42129 294328 667 665 0 True 328 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 373 397 0.000958412988516042 0.000976416780105448 0.000793469138628214 0.00080872816052491 0.00071829068605773 0.000795795822884085 41894 42553 667 665 0 True 373 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 417 397 0.000901220252771303 0.000923641215650708 0.000701915007248035 0.000671396963454643 0.000780653117396245 0.000823482136745162 39394 40253 667 665 0 True 417 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 461 397 0.000982342429151641 0.00095512298714284 0.00064087891966125 0.000701915007248035 0.000953737191356706 0.000852561295508808 42940 41625 667 665 0 True 462 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 506 396 0.000899916258396323 0.000921920273331532 0.000595101853971161 0.00064087891966125 0.000923229219275162 0.00090562813431374 39337 40178 667 665 0 True 507 396 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 550 395 0.000910645615622036 0.000975269485225997 0.000656137941557946 0.00080872816052491 0.000871669056492972 0.000838660903671734 39806 42503 667 665 0 True 551 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 594 395 0.000947592122913137 0.000966664773630116 0.000503547722590982 0.000534065766384375 0.00100454562752833 0.00107450188093734 41421 42128 667 665 0 True 596 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 638 396 0.000881820476806687 0.00099481938997184 0.000473029678797589 0.000610360875867857 0.000963651846097322 0.00102159004634278 38546 43355 667 665 0 True 641 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 682 395 0.000994993462298377 0.000911411052235762 0.000625619897764553 0.000503547722590982 0.000978116362042688 0.000995182693660896 43493 39720 667 665 0 True 685 395 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 285 441 0.000959236563910766 0.00101856839397647 0.000823987182421607 0.000885023270008392 0.000803673269547458 0.000856829038618563 41930 44390 667 665 0 True 284 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 329 440 0.000924532011860858 0.000863890098328908 0.00080872816052491 0.000732433051041428 0.000721531881955912 0.000698149122850009 40413 37649 667 665 0 True 328 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 373 441 0.000997830221991316 0.000848172158480431 0.000900282291905089 0.000701915007248035 0.000772555095465799 0.000664122675898933 43617 36964 667 665 0 True 373 440 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 418 441 0.00092450913476656 0.000972240626744247 0.000717174029144732 0.000610360875867857 0.000866921763843934 0.000943178830682416 40412 42371 667 665 0 True 418 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 462 441 0.000975410669579378 0.000959735112558232 0.00064087891966125 0.000610360875867857 0.000996369122700379 0.00100840526318888 42637 41826 667 665 0 True 462 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 506 439 0.000957406396366934 0.000888189803875677 0.000686655985351339 0.000549324788281071 0.000933179917208063 0.000933061777314652 41850 38708 667 665 0 True 507 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 551 439 0.000879098102585238 0.000885482187960173 0.000579842832074464 0.000579842832074464 0.000921404323507639 0.000881703219548074 38427 38590 667 665 0 True 552 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 595 439 0.00100460184190349 0.000825570449355249 0.000625619897764553 0.000335698481727321 0.000982449737321209 0.000995245063986806 43913 35979 667 665 0 True 596 439 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 639 440 0.00096550488774839 0.000913430291223596 0.000656137941557946 0.000503547722590982 0.000946885670057001 0.000996110730846724 42204 39808 667 665 0 True 641 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 682 439 0.000939036089645724 0.00101664093857899 0.000625619897764553 0.000656137941557946 0.000941663327894577 0.00096919457539143 41047 44306 667 665 0 True 685 438 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 286 485 0.000936817011498828 0.000966159963883157 0.000823987182421607 0.00080872816052491 0.000792010107979342 0.000833186017464862 40950 42106 667 665 0 True 284 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 331 484 0.000900945727639728 0.00100975716930229 0.000793469138628214 0.000854505226215 0.000769972194837192 0.000864442385002138 39382 44006 667 665 0 True 328 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 375 485 0.000943931787825474 0.00089908910523046 0.000793469138628214 0.000747692072938125 0.000829891205116558 0.000760656711346705 41261 39183 667 665 0 True 373 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 419 485 0.000949742569777139 0.000935389515216285 0.000686655985351339 0.000579842832074464 0.000948834878628777 0.0009436829250353 41515 40765 667 665 0 True 418 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 464 484 0.00100073561296715 0.00101313021624788 0.000686655985351339 0.00064087891966125 0.00102699330804687 0.00103754346559755 43744 44153 667 665 0 True 462 483 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 508 483 0.000937686341082148 0.000840875363047123 0.000625619897764553 0.000503547722590982 0.000941972719833146 0.00091557256167047 40988 36646 667 665 0 True 507 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 552 482 0.000978178797989424 0.000869947815292408 0.000656137941557946 0.000564583810177768 0.000994014685419274 0.000895321821832529 42758 37913 667 665 0 False 552 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 596 483 0.000879143856773833 0.000846382378468488 0.000457770656900893 0.000473029678797589 0.000965450791911345 0.000894291478003549 38429 36886 667 665 0 True 596 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 641 482 0.000841854193068263 0.000881489601779684 0.0004272526131075 0.000503547722590982 0.000905655464186291 0.000885238131633125 36799 38416 667 665 0 False 641 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 684 484 0.000984149719601174 0.000896220868031833 0.000579842832074464 0.000534065766384375 0.00105766112629255 0.000954936609958064 43019 39058 667 665 0 True 686 482 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 287 529 0.000957429273461232 0.00097474172958145 0.000793469138628214 0.00080872816052491 0.000786698697562748 0.000811047862490403 41851 42480 667 665 0 True 284 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 331 528 0.00101398145056563 0.000956568578690948 0.000900282291905089 0.000869764248111696 0.000795377338084163 0.000743490903007833 44323 41688 667 665 0 True 329 527 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 376 529 0.000898040336663895 0.000946151141185534 0.000717174029144732 0.000747692072938125 0.000755112391539293 0.000835404817230665 39255 41234 667 665 0 True 373 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 420 528 0.000879098102585238 0.000957188117925851 0.000549324788281071 0.000625619897764553 0.000935093471890565 0.000980914097934502 38427 41715 667 665 0 True 418 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 465 528 0.000910554107244844 0.000944246631685646 0.000518806744487678 0.000549324788281071 0.000976552513228029 0.00101821730982693 39802 41151 667 665 0 True 463 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 508 525 0.00104763365627784 0.000963658861045954 0.000732433051041428 0.000625619897764553 0.00104534613008908 0.000969234419731146 45794 41997 667 665 0 True 507 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 552 525 0.000913184973089102 0.000917170472530606 0.000595101853971161 0.000579842832074464 0.000876212574436322 0.000935771664922677 39917 39971 667 665 0 True 552 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 597 526 0.000933774357957208 0.00089791886445342 0.000610360875867857 0.000595101853971161 0.000915366032299352 0.000876823876555897 40817 39132 667 665 0 False 597 526 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 640 525 0.000812594389461255 0.000873894509677719 0.000411993591210803 0.000381475547417411 0.000957351218067994 0.00105286091784166 35520 38085 667 665 0 True 641 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 684 525 0.000913734023352251 0.000917629390482386 0.000579842832074464 0.000564583810177768 0.000921676533916468 0.000940671445617115 39941 39991 667 665 0 True 686 525 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 288 569 0.000928283855325713 0.000936353242915024 0.000793469138628214 0.00080872816052491 0.000710120174711981 0.000710415849293551 40577 40807 667 665 0 True 284 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 332 569 0.000927963576005543 0.000917881795355865 0.000778210116731518 0.000762951094834821 0.000730298306659231 0.000747531751702592 40563 40002 667 665 0 True 329 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 376 569 0.000885686705743031 0.000892893712881425 0.000762951094834821 0.000793469138628214 0.000671010473462334 0.000670806390307681 38715 38913 667 665 0 True 374 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 420 568 0.000873996510556807 0.000892572470315179 0.000549324788281071 0.000610360875867857 0.000933472873009912 0.00088439445395735 38204 38899 667 665 0 True 418 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 464 568 0.000900007766773514 0.000951313968143063 0.000488288700694286 0.000595101853971161 0.00100858616831244 0.000922202776183826 39341 41459 667 665 0 True 463 570 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 508 566 0.00086450251642318 0.000893467360321151 0.000366216525520714 0.000442511635004196 0.000979915093817026 0.00105675673005711 37789 38938 667 665 0 True 507 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 553 566 0.000944069050391261 0.000893031388266959 0.000579842832074464 0.000473029678797589 0.000967997557030229 0.000935708507867579 41267 38919 667 665 0 True 552 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 597 566 0.000947820893856116 0.000964622588744693 0.000656137941557946 0.000762951094834821 0.000890914259178369 0.000789432043914665 41431 42039 667 665 0 True 597 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 641 566 0.000841716930502476 0.000950166673263612 0.000534065766384375 0.000747692072938125 0.00082945920044771 0.000814714757869269 36793 41409 667 665 0 True 641 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 685 566 0.000905841425819478 0.000984218385285714 0.000625619897764553 0.000656137941557946 0.000807999535848856 0.000952331708480767 39596 42893 667 665 0 True 686 569 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 284 614 0.000924783659898135 0.000939863965246143 0.000747692072938125 0.000732433051041428 0.000728612453105447 0.000783474227753496 40424 40960 667 665 0 False 284 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 329 614 0.000969439747967628 0.0010024144820738 0.00080872816052491 0.000915541313801785 0.000757708424388857 0.000759957072191206 42376 43686 667 665 0 False 329 614 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 375 611 0.000790197714143615 0.000810494994639265 0.000656137941557946 0.000717174029144732 0.000660061957011381 0.000604368418232213 34541 35322 667 665 0 True 374 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 420 610 0.000882964331521582 0.000952897235076705 0.000625619897764553 0.000686655985351339 0.000846178626304278 0.000865469092173241 38596 41528 667 665 0 True 418 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 463 613 0.000923616928088943 0.000843468249474682 0.000503547722590982 0.000442511635004196 0.00102304177466348 0.000939967424486311 40373 36759 667 665 0 False 463 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 508 613 0.000875300504931787 0.000846864242317857 0.000457770656900893 0.000320439459830625 0.00103363098442828 0.00101756798984776 38261 36907 667 665 0 False 508 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 552 613 0.000978133043800828 0.000964530805154337 0.000579842832074464 0.000610360875867857 0.000984586052413214 0.00101565793809256 42756 42035 667 665 0 False 552 613 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 597 612 0.000948186927364882 0.000926899533108349 0.000732433051041428 0.000625619897764553 0.000833308566380042 0.00084370205467408 41447 40395 667 665 0 False 597 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 642 612 0.000908884079361098 0.000897414054706462 0.000701915007248035 0.000732433051041428 0.000807727216841326 0.000748883024217642 39729 39110 667 665 0 False 642 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 686 612 0.000856632795984704 0.000918134200229344 0.000625619897764553 0.000656137941557946 0.000757100501572658 0.000831533652124739 37445 40013 667 665 0 False 686 612 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 285 662 0.00110073139214325 0.0726686021531283 0.000915541313801785 0.0717174029144732 0.00078362694834436 0.0255635723681598 48115 3166954 667 665 0 True 285 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 329 657 0.00103555455048855 0.00100434193747128 0.000946059357595178 0.000885023270008392 0.000696110024993039 0.000685396207942109 45266 43770 667 665 0 False 329 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 374 657 0.000886761929175033 0.000987063676586752 0.000762951094834821 0.000885023270008392 0.000642643837677345 0.000688205365055649 38762 43017 667 665 0 False 374 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 419 657 0.000879441258999706 0.000874904129171636 0.000701915007248035 0.000701915007248035 0.000742035379152234 0.000726627809599871 38442 38129 667 665 0 False 419 657 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 463 656 0.000902386984580495 0.000825914637819084 0.000686655985351339 0.000610360875867857 0.000862505663173169 0.00076169707815995 39445 35994 667 665 0 False 463 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 508 656 0.000905406761027818 0.000895876679567998 0.000579842832074464 0.000564583810177768 0.000884694010058018 0.000873327164198112 39577 39043 667 665 0 False 508 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 552 656 0.000928993045248948 0.000867056632196192 0.000625619897764553 0.000503547722590982 0.000896180009098256 0.000916908453987673 40608 37787 667 665 0 False 552 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 597 656 0.000927917821816947 0.000934769975981382 0.000762951094834821 0.000839246204318303 0.000703727466796751 0.000647930947567378 40561 40738 667 665 0 False 597 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 642 656 0.00100640913235303 0.000964117778997735 0.000885023270008392 0.000823987182421607 0.000736706382200016 0.000670988406875954 43992 42017 667 665 0 False 642 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 683 661 0.00105742505263733 0.0762792997600433 0.000915541313801785 0.0723582818341344 0.000794558929928048 0.0226997316138721 46222 3324311 667 665 0 True 686 656 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G3_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G3_1.csv new file mode 100755 index 0000000..3bd653f --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G3_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 280 278 0.009337583439912 0.0378256696903623 0.00927748531319142 0.0386968795300221 0.00143892087038439 0.00888842115912418 408163 1648472 667 665 0 True 279 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 323 278 0.00915971403174586 0.00933485005716397 0.00914015411612116 0.00941481651026169 0.00124915638638934 0.00130994072844947 400388 406820 667 665 0 False 323 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 366 279 0.0095049751388897 0.0549594861495694 0.0093842984664683 0.0545662623025864 0.00162694164822963 0.0102901425418148 415480 2395177 667 665 0 True 368 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 412 279 0.00960675533142104 0.0757257299807082 0.00965896086060884 0.0738994430457008 0.00168497683421652 0.011672432702093 419929 3300186 667 665 0 True 412 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 456 279 0.00924593780015463 0.06177249027811 0.00924696726939803 0.0607919432364385 0.00171414843745089 0.011879096461251 404157 2692093 667 665 0 True 457 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 501 278 0.00923433911334559 0.0543882021372956 0.00927748531319142 0.0585030899519341 0.00166143668743398 0.0163921085583411 403650 2370280 667 665 0 False 501 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 545 278 0.00938121005873808 0.0688592389648876 0.0093842984664683 0.0679484245059892 0.00156953964312515 0.0224919597852095 410070 3000939 667 665 0 True 546 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 589 277 0.0094245621524326 0.0559543514313364 0.00941481651026169 0.0558022430762188 0.00177098897549431 0.0166677421614299 411965 2438534 667 665 0 True 590 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 635 277 0.00946738807295826 0.00903682873927781 0.0093842984664683 0.00909437705043107 0.00222146450553757 0.00182822202812576 413837 393832 667 665 0 False 635 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 673 278 0.00928004754775279 0.0384470216511753 0.00935378042267491 0.0382696269169146 0.0018032352675374 0.00763941063141485 405648 1675551 667 665 0 True 679 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 279 322 0.00935892776889193 0.00936123783939134 0.00933852140077821 0.0093842984664683 0.00135029836421244 0.00143011539427448 409096 407970 667 665 0 False 279 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 323 322 0.00945894642516233 0.00936504685839112 0.00946059357595178 0.0093842984664683 0.00138796011873501 0.0013098967545502 413468 408136 667 665 0 False 323 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 368 324 0.00943835704029423 0.0880331751787342 0.00946059357595178 0.0860456244754711 0.00136419691331795 0.0197885507548426 412568 3836554 667 665 0 True 368 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 412 323 0.00955011164593945 0.0439291407736554 0.00946059357595178 0.044785229266804 0.00165659186877455 0.00728702663326253 417453 1914466 667 665 0 True 412 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 456 323 0.00948017636867078 0.0714645391230422 0.00952162966353857 0.0675364309147784 0.00180575712267149 0.0195732509040257 414396 3114480 667 665 0 True 457 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 500 322 0.00944634114620419 0.0395928938849757 0.00941481651026169 0.0398413061722744 0.00169903707646742 0.0105736708078194 412917 1725489 667 665 0 True 501 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 544 322 0.00932813519996697 0.0382643723063667 0.00933852140077821 0.03930724040589 0.00153329132780049 0.00950612245331513 407750 1667591 667 665 0 True 546 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 588 322 0.00934856444517499 0.042699355392372 0.00933852140077821 0.0436865796902419 0.0018519419261188 0.00938316687160859 408643 1860871 667 665 0 True 590 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 635 321 0.00905189428631988 0.00916447676756551 0.00907911802853437 0.00935378042267491 0.00190720934614546 0.00195337747069354 395675 399395 667 665 0 False 635 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 679 321 0.00912105174238241 0.00908501512421475 0.00917067215991455 0.00914015411612116 0.00187293846988998 0.0019937692654494 398698 395932 667 665 0 False 679 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 280 367 0.00953670566868088 0.0491828793774319 0.00958266575112535 0.0499732967116808 0.00152617393437716 0.0124107073319104 416867 2143428 667 665 0 True 279 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 325 368 0.00954960834986489 0.0565213904525562 0.00955214770733196 0.0597543297474632 0.00135114571855514 0.0146064183930198 417431 2463246 667 665 0 True 323 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 368 368 0.00937025193056939 0.035620110014106 0.00935378042267491 0.036087586785687 0.00142051577466406 0.00780605213021004 409591 1552352 667 665 0 True 368 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 413 368 0.00948983050246449 0.0300165153097897 0.00949111161974517 0.0306706340123598 0.00162575337828573 0.00458159655402115 414818 1308143 667 665 0 True 412 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 457 368 0.00968714544078384 0.062623760132765 0.00968947890440223 0.0622720683604181 0.00178043424880023 0.0120839371232065 423443 2729192 667 665 0 True 457 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 501 366 0.0094299611466869 0.0273978835851359 0.00941481651026169 0.0279240100709545 0.00173012900747352 0.00434615076511751 412201 1194021 667 665 0 True 501 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 546 364 0.00944675293390155 0.0244796243297647 0.0093690394445716 0.0255130846112764 0.00165421944221329 0.0045396123674207 412935 1066841 667 665 0 False 546 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 589 365 0.00949959902172969 0.0452814572480641 0.00946059357595178 0.04614328221561 0.00201133274755169 0.0114096711641763 415245 1973401 667 665 0 True 590 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 633 365 0.00940438455526185 0.0511673094386229 0.00932326237888151 0.0532387273975738 0.00199632823095616 0.0130552944951683 411083 2229911 667 665 0 True 635 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 677 366 0.00919782727084615 0.0579524343015928 0.0093690394445716 0.0590218966964218 0.00191390790709824 0.016698700658055 402054 2525612 667 665 0 True 680 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 281 411 0.00939340354999886 0.0426326516680807 0.00943007553215839 0.04443427176318 0.00154485737726255 0.0104515817675049 410603 1857964 667 665 0 True 279 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 325 412 0.00960476502421712 0.0306312817979946 0.00961318379491875 0.0307469291218433 0.00146672713510952 0.0043415821494168 419842 1334935 667 665 0 True 323 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 369 412 0.00951925044573159 0.0784556263627712 0.00950637064164187 0.0779125658045319 0.00139321341429748 0.0193379774880323 416104 3419157 667 665 0 True 368 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 413 411 0.00966289572082807 0.0602769225650531 0.00971999694819562 0.0609750514991989 0.00158185291516024 0.0154159233201256 422383 2626915 667 665 0 True 412 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 457 408 0.0119819696469001 0.0386058072624913 0.0100099183642329 0.0424963759822995 0.0128529332590026 0.011658766747852 523754 1682471 667 665 0 False 457 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 502 411 0.00971617647344787 0.0490461677195965 0.00984206912336919 0.050263218127718 0.0018161623269197 0.00979097298235344 424712 2137470 667 665 0 True 502 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 546 411 0.00946006740278293 0.0383261426626764 0.00958266575112535 0.0397192339971008 0.001715170671588 0.00528348762684903 413517 1670283 667 665 0 True 546 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 589 409 0.00958875105820859 0.0474458290381481 0.00958266575112535 0.0487525749599451 0.0019651671147527 0.00998349202033464 419142 2067726 667 665 0 True 591 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 634 409 0.00956052072384499 0.0465270982445815 0.00959792477302205 0.0475623712520027 0.00181163401038333 0.0107091858060744 417908 2027687 667 665 0 True 635 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 678 410 0.00934931938928682 0.0925703822384985 0.009399557488365 0.0885328450446326 0.00188804293977279 0.0274140130176167 408676 4034289 667 665 0 True 680 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 281 455 0.0094744799721906 0.0418057733025629 0.00950637064164187 0.0432135500114443 0.00160955614944695 0.00776947593551592 414147 1821928 667 665 0 True 279 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 325 456 0.00947228377113801 0.0520704599677266 0.00953688868543526 0.0520332646677348 0.00158435695201879 0.00724375612047379 414051 2269271 667 665 0 True 324 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 369 456 0.00967094845802093 0.0334191395173675 0.00967421988250553 0.0345464255741207 0.00147214015631212 0.00445743559268217 422735 1456432 667 665 0 True 368 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 413 456 0.00963359016303247 0.0543357478154071 0.00967421988250553 0.0532387273975738 0.00174211600806315 0.0140880463714366 421102 2367994 667 665 0 True 413 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 458 456 0.00985497180455321 0.094282605116591 0.0098115510795758 0.0934157320515755 0.00192800312599853 0.014461472582689 430779 4108909 667 665 0 True 457 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 501 454 0.0097680159691269 0.0573867261424332 0.00978103303578241 0.0586251621271077 0.00178410739743671 0.0167952788977375 426978 2500958 667 665 0 True 502 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 546 454 0.00991744914908076 0.0485863548778102 0.00975051499198901 0.0491035324635691 0.00227858050022822 0.0100037525784006 433510 2117431 667 665 0 True 546 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 590 454 0.00947246678789239 0.0316812631257705 0.0093690394445716 0.0318913557640955 0.00191047517455024 0.0051035325466796 414059 1380694 667 665 0 True 591 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 634 454 0.00941698983421999 0.0375904742400749 0.00944533455405508 0.0385290302891585 0.00181642931217826 0.00674648368138415 411634 1638222 667 665 0 True 635 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 678 455 0.00918217933834639 0.067637897673917 0.00921644922560464 0.0674906538490883 0.00184463686645648 0.0105945664675598 401370 2947712 667 665 0 True 680 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 282 500 0.00933490681987914 0.0498763961861624 0.009399557488365 0.0514991989013504 0.00151940321659356 0.0130170326488299 408046 2173652 667 665 0 True 279 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 326 501 0.00967149750828408 0.0519911818915565 0.00968947890440223 0.0527504386968795 0.00154168353272876 0.00705036892516814 422759 2265816 667 665 0 True 324 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 370 501 0.00961245172790121 0.0673072931814544 0.00959792477302205 0.0648203250171664 0.00156462677848622 0.0185660461589468 420178 2933304 667 665 0 True 368 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 415 501 0.0101182642828277 0.086583292747777 0.0101472495613031 0.0828107118333715 0.0018170949799846 0.0214988393219948 442288 3773367 667 665 0 True 413 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 459 500 0.00978098728159381 0.0925124667929838 0.0098115510795758 0.0885328450446326 0.00196121966403463 0.0296391879242832 427545 4031765 667 665 0 True 457 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 504 499 0.00975895663978494 0.0431179115102932 0.0097962920576791 0.0441748683909361 0.00172541172187196 0.0078570462147972 426582 1879112 667 665 0 True 502 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 546 494 0.00967611868133226 0.0361413031319429 0.00958266575112535 0.0400854505226215 0.00185611884965702 0.0122155767996452 422961 1575066 667 665 0 False 546 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 591 499 0.00965626136348168 0.0990116169343019 0.00968947890440223 0.0966811627374685 0.00192733889032721 0.0173347792701405 422093 4315003 667 665 0 True 591 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 635 497 0.00935778391417704 0.0618693908036284 0.00930800335698482 0.061371786068513 0.00184057879115722 0.0218778286768839 409046 2696316 667 665 0 True 635 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 679 499 0.00924424489517658 0.0699004320138869 0.00926222629129473 0.0687876707103075 0.00175175624811572 0.0124584980530326 404083 3046315 667 665 0 True 680 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 282 543 0.00906392763792057 0.0481684412450215 0.00914015411612116 0.0505226214999619 0.00153569248899969 0.0119112005911587 396201 2099218 667 665 0 True 279 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 327 545 0.00946237798930702 0.105686027841405 0.00944533455405508 0.105271992065309 0.00140467333894387 0.0260625186280395 413618 4605879 667 665 0 True 324 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 371 545 0.00945649857607246 0.0561111178036646 0.00941481651026169 0.0586251621271077 0.00152444776727967 0.0125538283076514 413361 2445366 667 665 0 True 368 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 415 544 0.00970094032864547 0.0609698657263438 0.00959792477302205 0.0599069199664302 0.00184233794693071 0.0112920640320838 424046 2657114 667 665 0 True 413 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 459 543 0.00984918389969584 0.0546133702303367 0.0097962920576791 0.0549477378500038 0.00201840954860732 0.00787545814493765 430526 2380093 667 665 0 True 457 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 504 542 0.00952593055726657 0.0623497402237569 0.00952162966353857 0.0625314717326619 0.00187580500567592 0.0138181146764751 416396 2717250 667 665 0 True 502 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 548 542 0.0093342662612388 0.0755488171102969 0.0093690394445716 0.0713511863889525 0.00182933590347382 0.022546327714748 408018 3292476 667 665 0 True 546 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 592 541 0.00939450165052516 0.0545416184085758 0.00943007553215839 0.0556801709010452 0.0016518161803288 0.0134563997963797 410651 2376966 667 665 0 True 591 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 636 541 0.00920539958905875 0.0452106920998996 0.00927748531319142 0.0449988555733577 0.00176931523320251 0.00713387261229503 402385 1970317 667 665 0 True 636 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 680 541 0.00928297581582292 0.0632984613054724 0.00920119020370794 0.0617990386816205 0.00181437587388208 0.0177107217909002 405776 2758596 667 665 0 True 680 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 283 587 0.00904217152124327 0.0434670792339053 0.00903334096284428 0.043930724040589 0.00143951295169768 0.010241438070298 395250 1894329 667 665 0 True 279 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 327 586 0.00918499322094503 0.0535812867026803 0.00917067215991455 0.0539406424048219 0.00148393097468097 0.0126702846464483 401493 2335114 667 665 0 True 324 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 372 587 0.00936714064574488 0.0438917848523804 0.00941481651026169 0.0451819638361181 0.00149480121162727 0.00815426144432665 409455 1912838 667 665 0 True 368 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 416 586 0.00950458622828664 0.0519715631491179 0.00947585259784848 0.0502937361715114 0.00184620058872797 0.0090174178586354 415463 2264961 667 665 0 True 413 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 460 585 0.00960542845995176 0.0850326319346088 0.00968947890440223 0.0816968032349126 0.00194716779778807 0.0215427822670057 419871 3705788 667 665 0 True 458 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 504 583 0.00932504679223675 0.0635707602721613 0.00932326237888151 0.0614023041123064 0.00193475708476232 0.0154541024718464 407615 2770463 667 665 0 True 502 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 548 582 0.009117871826275 0.0553803827490447 0.00909437705043107 0.055039291981384 0.00191764467810175 0.010231367050451 398559 2413520 667 665 0 True 547 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 591 581 0.00899998615935795 0.0347234990658151 0.00904859998474098 0.0374914168001831 0.00164504019582874 0.00894102012733611 393406 1513277 667 665 0 False 591 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 637 583 0.00920549109743595 0.0467707607310792 0.00927748531319142 0.0470435645075151 0.0016339801499066 0.00986072733727514 402389 2038306 667 665 0 True 636 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 681 583 0.00904603775017961 0.0516856343192612 0.0089570458533608 0.0509346150911727 0.0016216790993501 0.00986103149615283 395419 2252500 667 665 0 True 680 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 280 625 0.00872948739637963 0.00883238079175967 0.00874341954680705 0.00881971465629053 0.00139242934160868 0.00142882329920789 381582 384922 667 665 0 False 280 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 324 625 0.00905230607401724 0.00910229338509928 0.00909437705043107 0.00901808194094758 0.00134431837281572 0.00170200270954473 395693 396685 667 665 0 False 324 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 372 628 0.00910748562546376 0.0725601139493274 0.00917067215991455 0.0695506218051423 0.00143008399507448 0.0138789560712781 398105 3162226 667 665 0 True 369 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 416 628 0.00953027720518317 0.0829793641806508 0.00949111161974517 0.0778057526512551 0.0016131230530892 0.0284529455590259 416586 3616305 667 665 0 True 413 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 458 625 0.00935682307621653 0.00907289969028775 0.009399557488365 0.00912489509422446 0.00192864137831013 0.00182081928280729 409004 395404 667 665 0 False 458 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 502 625 0.00900142741629872 0.00920981786120141 0.00900282291905089 0.00912489509422446 0.00191343096643577 0.00238402419269074 393469 401371 667 665 0 False 502 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 547 625 0.00891305320102595 0.0088014038300145 0.00886549172198062 0.00880445563439384 0.00178317651525483 0.00191749787740979 389606 383572 667 665 0 False 547 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 591 624 0.00891993920640961 0.00885252728984283 0.00901808194094758 0.00886549172198062 0.00156519461926195 0.00146128323153912 389907 385800 667 665 0 False 591 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 636 624 0.00902345805810759 0.00890250345479171 0.00901808194094758 0.0089417868314641 0.00158737884256486 0.00144650891919699 394432 387978 667 665 0 False 636 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 680 624 0.00890291864825198 0.0088774465346245 0.00891126878767071 0.00891126878767071 0.00149678544228059 0.00144914516823763 389163 386886 667 665 0 False 680 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 279 675 0.00874897868072144 0.0369819490360142 0.00878919661249714 0.0377660791943236 0.00134092144021028 0.00884505937866458 382434 1611702 667 665 0 True 280 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 324 669 0.00858222754038408 0.00859216018990025 0.00862134737163348 0.00860608834973678 0.00131151061296556 0.00128008100102691 375145 374453 667 665 0 False 324 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 369 668 0.00882936879008424 0.00866421030832976 0.00885023270008392 0.00872816052491035 0.0013165895060667 0.00120476917876531 385948 377593 667 665 0 False 369 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 413 668 0.00879537342795757 0.00867189718402208 0.00878919661249714 0.00874341954680705 0.00134439809642942 0.00149456828344583 384462 377928 667 665 0 False 413 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 458 668 0.00864884563897955 0.00877887095858208 0.00871290150301366 0.00878919661249714 0.00151372160771208 0.00142144440119884 378057 382590 667 665 0 False 458 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 502 668 0.00871420549738864 0.00857552441414821 0.00868238345922026 0.00863660639353018 0.00174029271718561 0.00169714949217608 380914 373728 667 665 0 False 502 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 547 668 0.00854951329553809 0.00856825056461249 0.00862134737163348 0.00856031128404669 0.00165017798828024 0.00183769287976308 373715 373411 667 665 0 False 547 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 591 668 0.00867099066625991 0.00865294387261355 0.00874341954680705 0.00868238345922026 0.00140102005593689 0.00127424421063132 379025 377102 667 665 0 False 591 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 636 668 0.00893778333996197 0.00995562837053724 0.00889600976577401 0.00930800335698482 0.00140137567893556 0.00454091904994191 390687 433874 667 665 0 False 636 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 675 674 0.00878727493657612 0.0378169961410737 0.00880445563439384 0.0379797055008774 0.00156798130050009 0.00816381439533131 384108 1648094 667 665 0 True 680 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G3_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G3_2.csv new file mode 100755 index 0000000..08abf3a --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G3_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 280 278 0.0077328925374804 0.682688593766403 0.00762951094834821 0.689387350270848 0.00168583862527616 0.212787694121743 338019 29752098 667 665 8 True 279 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 323 278 0.00656382726466934 0.00648542849455981 0.00653086137178607 0.00648508430609598 0.00151947527148324 0.00125039032170867 286917 282640 667 665 0 False 323 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 366 279 0.00628321682601135 0.00638189660463817 0.00630197604333562 0.00631723506523232 0.00131646420718709 0.0014417575887316 274651 278128 667 665 0 True 368 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 412 279 0.00636266897450794 0.00623954025599591 0.00634775310902571 0.00624093995574884 0.00135630206463336 0.00141769462298092 278124 271924 667 665 0 True 412 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 456 279 0.00654346665074421 0.00641156565022077 0.00643930724040589 0.0063935301747158 0.00250667582098048 0.00178036948708869 286027 279421 667 665 0 True 457 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 501 278 0.0067816172023853 0.00673744328777999 0.00685130083161669 0.00672922865644312 0.00162744518913777 0.00155843493718514 296437 293623 667 665 0 False 501 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 545 278 0.00702809501635083 0.00703732322337086 0.00704966811627375 0.00711070420386053 0.00159366285104861 0.00147775172068311 307211 306692 667 665 0 True 546 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 589 277 0.00731147358341887 0.00753052234614919 0.00735484855420768 0.00755321583886473 0.00170293584472959 0.00193932956252316 319598 328186 667 665 0 True 590 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 635 277 0.0134480939891693 0.00788347614286345 0.00834668497749294 0.00796520943007553 0.022510894291695 0.00196441607029239 587841 343568 667 665 0 False 635 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 673 278 0.00944119379998717 0.696366849832294 0.00943007553215839 0.677485313191424 0.00216807810075121 0.177271287440684 412692 30348207 667 665 8 True 679 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 279 322 0.00672716971795631 0.00636978117071117 0.00660715648126955 0.00642404821850919 0.00147810334857471 0.00141926163028517 294057 277600 667 665 0 False 279 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 323 322 0.0063196371601336 0.00624077933446571 0.00634775310902571 0.00624093995574884 0.00123269134037346 0.00118127380807406 276243 271978 667 665 0 False 323 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 368 324 0.0065022192497251 0.00652315155019616 0.00651560234988937 0.00654612039368277 0.00141043069141803 0.00127918179062841 284224 284284 667 665 0 True 368 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 412 323 0.00661276136937254 0.00661438443901009 0.00654612039368277 0.00665293354695964 0.00148322914552496 0.00146304313395623 289056 288260 667 665 0 True 412 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 456 323 0.00759924455259209 0.0069601332238814 0.00671396963454643 0.00700389105058366 0.0112161238718976 0.0015429058565017 332177 303328 667 665 0 True 457 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 500 322 0.00689238809297571 0.00684535784414114 0.00697337300679027 0.00688181887541009 0.00158582394684697 0.00156301671209307 301279 298326 667 665 0 True 501 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 544 322 0.00710278872923346 0.00699822341387917 0.00715648126955062 0.00709544518196384 0.00153985797035773 0.00137223758773722 310476 304988 667 665 0 True 546 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 588 322 0.00721772325098609 0.00730553782028888 0.00720225833524071 0.00729381246662089 0.00195749902144138 0.00209472629991917 315500 318381 667 665 0 True 590 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 635 321 0.00741732589873523 0.00731627650036054 0.00744640268558785 0.00740062561989776 0.00201599798104808 0.00197312230657633 324225 318849 667 665 0 False 635 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 679 321 0.00747968885779129 0.00739702311397629 0.00744640268558785 0.00740062561989776 0.00190771885434176 0.00197819355926616 326951 322368 667 665 0 False 679 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 280 367 0.00606876694406287 0.0061977787223839 0.00599679560540169 0.00619516289005875 0.00138349890812923 0.00138141935911493 265277 270104 667 665 0 True 279 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 325 368 0.00628651112759024 0.00643451154780979 0.00633249408712902 0.00648508430609598 0.00139330600458386 0.00124531767591494 274795 280421 667 665 0 True 323 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 368 368 0.00662712818459161 0.00667583355275348 0.00669871061264973 0.00668345159075303 0.00133584580012203 0.00133615478690128 289684 290938 667 665 0 True 368 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 413 368 0.00671737832159681 0.00686185594450764 0.00674448767833982 0.00683604180972 0.00162133061268038 0.00149240755950442 293629 299045 667 665 0 True 412 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 457 368 0.00692482781269013 0.00711240220028212 0.00695811398489357 0.00714122224765393 0.00167102253869755 0.00177673684445917 302697 309964 667 665 0 True 457 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 501 366 0.00685841560794334 0.00714301202766587 0.00691233691920348 0.00718699931334401 0.00172653474104501 0.00168390110087723 299794 311298 667 665 0 True 501 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 546 364 0.00703193836819288 0.00687410905382018 0.00706492713817044 0.00697337300679027 0.00161875251345005 0.00164940894594359 307379 299579 667 665 0 False 546 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 589 365 0.00712058710859722 0.00725489622430992 0.00718699931334401 0.00720225833524071 0.00191869260633744 0.00207636708957775 311254 316174 667 665 0 True 590 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 633 365 0.0067261631258072 0.00677218337672976 0.00671396963454643 0.00679026474402991 0.00180717102831433 0.00198895521773082 294013 295137 667 665 0 True 635 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 677 366 0.00636481942137194 0.00641057897662444 0.00630197604333562 0.00642404821850919 0.00180730339589568 0.00187446693046827 278218 279378 667 665 0 True 680 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 281 411 0.00625562705028809 0.00624334927499568 0.00628671702143893 0.00627145799954223 0.00138688473925744 0.00141200245380534 273445 272090 667 665 0 True 279 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 325 412 0.0062369364642467 0.00638689881031258 0.00621042191195544 0.00633249408712902 0.00131592676181077 0.00128920990171278 272628 278346 667 665 0 True 323 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 369 412 0.00668512161863678 0.00667564998557277 0.00659189745937285 0.00669871061264973 0.00132333940186618 0.00137016198674076 292219 290930 667 665 0 True 368 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 413 411 0.00677274088979772 0.00680293087949904 0.00683604180972 0.00688181887541009 0.00149487636393231 0.00153293242715429 296049 296477 667 665 0 True 412 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 457 408 0.00827942632025713 0.00701605237630584 0.00721751735713741 0.00708018616006714 0.00828552249782983 0.00158694573399207 361909 305765 667 665 0 False 457 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 502 411 0.00705046881457417 0.0070280301348473 0.00708018616006714 0.00697337300679027 0.00164923584645849 0.00172927383824711 308189 306287 667 665 0 True 502 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 546 411 0.00690259127703258 0.00717509039249531 0.00686655985351339 0.00711070420386053 0.00164614380783299 0.00149511180781208 301725 312696 667 665 0 True 546 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 589 409 0.00667853301547898 0.00656450005765157 0.00653086137178607 0.00659189745937285 0.00187969196290077 0.00195127952622948 291931 286086 667 665 0 True 591 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 634 409 0.00610065761351414 0.00623345959313482 0.00621042191195544 0.00622568093385214 0.00181503956443136 0.00181687487779143 266671 271659 667 665 0 True 635 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 678 410 0.00599846563328544 0.00612829854448435 0.00602731364919509 0.00605783169298848 0.00169806620287239 0.00173606897960819 262204 267076 667 665 0 True 680 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 281 455 0.00607075725126679 0.0062842618103969 0.00613412680247196 0.00625619897764553 0.00146380937131375 0.00150024216460066 265364 273873 667 665 0 True 279 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 325 456 0.00620161423065075 0.00628171481576452 0.00619516289005875 0.00627145799954223 0.00145092321283934 0.00147032881600019 271084 273762 667 665 0 True 324 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 369 456 0.00644653640220403 0.00638634810877044 0.00643930724040589 0.0063782711528191 0.00140380667604218 0.00145245593395315 281790 278322 667 665 0 True 368 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 413 456 0.00655611768389094 0.00680444530873992 0.00663767452506294 0.0068207827878233 0.00158846202794899 0.00165157078766938 286580 296543 667 665 0 True 413 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 458 456 0.00680813175467656 0.00676523076976029 0.00675974670023652 0.00674448767833982 0.00192095932829462 0.0019342781637288 297596 294834 667 665 0 True 457 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 501 454 0.00656892885669777 0.00691057008508912 0.00660715648126955 0.00700389105058366 0.00172849491262853 0.00175762125165922 287140 301168 667 665 0 True 502 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 546 454 0.00641823743655753 0.00653701087233993 0.0064087891966125 0.00651560234988937 0.00175519928479592 0.00175569264939063 280553 284888 667 665 0 True 546 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 590 454 0.00608677121727532 0.00597267946703564 0.00607309071488518 0.00599679560540169 0.00188928609522088 0.00183308814288959 266064 260294 667 665 0 True 591 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 634 454 0.0057825287402076 0.00588204317155902 0.00575265125505455 0.00593575951781491 0.0017933594730049 0.00183002183513104 252765 256344 667 665 0 True 635 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 678 455 0.00599494256076356 0.00602940172587569 0.00602731364919509 0.00604257267109178 0.00177013776633301 0.00191808978336718 262050 262766 667 665 0 True 680 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 282 500 0.00638506564982558 0.00655215516474868 0.00643930724040589 0.00653086137178607 0.00151834579199604 0.00175924154896591 279103 285548 667 665 0 True 279 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 326 501 0.00619038157735049 0.00636613277299451 0.00621042191195544 0.00634775310902571 0.00150806492721192 0.00149427158022402 270593 277441 667 665 0 True 324 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 370 501 0.00633306601448646 0.00627154978313259 0.00630197604333562 0.00633249408712902 0.00148711526612158 0.00152367802629241 276830 273319 667 665 0 True 368 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 415 501 0.00650215061844221 0.00671913246150395 0.00660715648126955 0.00672922865644312 0.00175206588231252 0.00161538259531043 284221 292825 667 665 0 True 413 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 459 500 0.00656730458300262 0.00663292472426202 0.00660715648126955 0.00665293354695964 0.0018738694724427 0.00168762781820819 287069 289068 667 665 0 True 457 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 504 499 0.00643015640268673 0.00621955437919587 0.00643930724040589 0.00619516289005875 0.00171156364296862 0.00163008031409981 281074 271053 667 665 0 True 502 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 546 494 0.00623105705101215 0.0060498465206275 0.00621042191195544 0.00608834973678187 0.00164382310822768 0.00154262892389606 272371 263657 667 665 0 False 546 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 591 499 0.00591910499316604 0.00615578772979599 0.00593575951781491 0.00621042191195544 0.00174235727886237 0.0018711111457051 258735 268274 667 665 0 True 591 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 635 497 0.00585255552585346 0.00604094351236296 0.0059662775616083 0.00607309071488518 0.00181610197960974 0.00185038616733531 255826 263269 667 665 0 True 635 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 679 499 0.00607132917862424 0.00613047840475531 0.00607309071488518 0.00619516289005875 0.00173162457556032 0.00169449504342183 265389 267171 667 665 0 True 680 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 282 543 0.00652855078526198 0.00644557147044769 0.00657663843747616 0.00645456626230259 0.00141960462517019 0.00132814163607604 285375 280903 667 665 0 True 279 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 327 545 0.00621513459338081 0.00627538174802995 0.00621042191195544 0.00625619897764553 0.00132702143553917 0.0013920131531634 271675 273486 667 665 0 True 324 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 371 545 0.00638572908556022 0.00646344632466954 0.0064087891966125 0.0064087891966125 0.00145784611015834 0.00150730778575003 279132 281682 667 665 0 True 368 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 415 544 0.00644383690507687 0.00639497576626391 0.00654612039368277 0.0063935301747158 0.00177820543189389 0.00166160933279528 281672 278698 667 665 0 True 413 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 459 543 0.00630906794256797 0.00629835059151656 0.00628671702143893 0.0063782711528191 0.00195173590057109 0.00194951650248783 275781 274487 667 665 0 True 457 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 504 542 0.00610953392610172 0.00648708059918622 0.00604257267109178 0.0064087891966125 0.00189930567083766 0.00189500414693888 267059 282712 667 665 0 True 502 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 548 542 0.00607288482103649 0.00624043514600188 0.00608834973678187 0.00628671702143893 0.00174568247371386 0.00173736049616653 265457 271963 667 665 0 True 546 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 592 541 0.00612053780845901 0.00614121708482697 0.00599679560540169 0.00613412680247196 0.00154910694188814 0.00143491493202259 267540 267639 667 665 0 True 591 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 636 541 0.00617999537653924 0.00608325574751711 0.00622568093385214 0.00611886778057527 0.00175909416540127 0.00189000001944921 270139 265113 667 665 0 True 636 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 680 541 0.0060837056866394 0.00606937347947576 0.00616464484626535 0.00604257267109178 0.00175389749453169 0.00166764467847455 265930 264508 667 665 0 True 680 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 283 587 0.00642082254821319 0.0062654691202715 0.0064087891966125 0.00624093995574884 0.00139315420712531 0.00134012466885688 280666 273054 667 665 0 True 279 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 327 586 0.00613007755678123 0.00625321601095896 0.00601205462729839 0.00619516289005875 0.00146848693523322 0.00138149287640252 267957 272520 667 665 0 True 324 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 372 587 0.0062989791439826 0.00628010860293329 0.00628671702143893 0.00633249408712902 0.00129097268169546 0.00131167104891444 275340 273692 667 665 0 True 368 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 416 586 0.00607455484892024 0.0062067505683412 0.00616464484626535 0.00625619897764553 0.00160218192339194 0.00168851668993192 265530 270495 667 665 0 True 413 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 460 585 0.00617242305832664 0.00622960468233986 0.00624093995574884 0.00621042191195544 0.00189253826840723 0.00188404814349077 269808 271491 667 665 0 True 458 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 504 583 0.00628559604381833 0.00630447714617282 0.00631723506523232 0.00622568093385214 0.00190031893313298 0.00208086562244434 274755 274754 667 665 0 True 502 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 548 582 0.00604881811783511 0.00631900189934667 0.00608834973678187 0.00636301213092241 0.00188876048279375 0.00166874233958585 264405 275387 667 665 0 True 547 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 591 581 0.00617091317010298 0.00637161684251829 0.00617990386816205 0.00634775310902571 0.00170788659720529 0.00150540014869551 269742 277680 667 665 0 False 591 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 637 583 0.00599940359415165 0.00592793496673705 0.00604257267109178 0.005981536583505 0.0015542569024382 0.00141013249122688 262245 258344 667 665 0 True 636 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 681 583 0.00597110462850516 0.00603665262951382 0.00593575951781491 0.00605783169298848 0.0015836249264096 0.00160555752432383 261008 263082 667 665 0 True 680 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 280 625 0.0063555084439927 0.00636275972604893 0.00636301213092241 0.00636301213092241 0.00130872735753964 0.00132439760828595 277811 277294 667 665 0 False 280 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 324 625 0.00623320749787615 0.00630798786850395 0.00622568093385214 0.00625619897764553 0.00129764162140821 0.00140389620386155 272465 274907 667 665 0 False 324 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 372 628 0.00594907398669628 0.00603603309027891 0.0059662775616083 0.00608834973678187 0.00128404027129316 0.00131549115449884 260045 263055 667 665 0 True 369 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 416 628 0.00591892197641166 0.00617926138302956 0.00590524147402152 0.00608834973678187 0.00148367799589892 0.00199332009695534 258727 269297 667 665 0 True 413 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 458 625 0.00588499524556788 0.00598165131299294 0.00588998245212482 0.0059510185397116 0.00188402790106765 0.00182862681781383 257244 260685 667 665 0 False 458 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 502 625 0.00595076689167433 0.00599548768923912 0.00599679560540169 0.00604257267109178 0.00190101734944251 0.00194053647410927 260119 261288 667 665 0 False 502 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 547 625 0.00613227375783383 0.00603821295054987 0.00610360875867857 0.00605783169298848 0.00166986796112611 0.00181727736119915 268053 263150 667 665 0 False 547 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 591 624 0.00606236135765946 0.00612664643985794 0.00604257267109178 0.00608834973678187 0.00150522013824405 0.00145977787831605 264997 267004 667 665 0 False 591 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 636 624 0.00599821398524816 0.00605691385708492 0.00601205462729839 0.00607309071488518 0.0013944576922261 0.0013123505344011 262193 263965 667 665 0 False 636 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 680 624 0.0061706615220657 0.00624741069886894 0.00617990386816205 0.00625619897764553 0.00147141733351024 0.00142734275578529 269731 272267 667 665 0 False 680 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 279 675 0.00811155420229917 0.685211242801442 0.00770580605783169 0.680567635614557 0.00237813264366825 0.207305104842278 354571 29862037 667 665 8 True 280 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 324 669 0.00636248595775356 0.00613141918655646 0.00624093995574884 0.00617990386816205 0.00157820159731653 0.0013150279806801 278116 267212 667 665 0 False 324 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 369 668 0.0058597618105573 0.00575292660582562 0.00590524147402152 0.00572213321126116 0.00131393219642171 0.00118829380988611 256141 250717 667 665 0 False 369 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 413 668 0.00567329061493515 0.00557840010876356 0.00567635614557107 0.00556954299229419 0.00139716504988882 0.00135145673524051 247990 243111 667 665 0 False 413 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 458 668 0.0057901239355145 0.00566770554218001 0.00581368734264134 0.00566109712367437 0.00146913022065306 0.00143454202005112 253097 247003 667 665 0 False 458 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 502 668 0.00583423097332085 0.00574358762550689 0.00578316929884794 0.00575265125505455 0.00168129054446276 0.00162069412084936 255025 250310 667 665 0 False 502 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 547 668 0.0058989273959953 0.00588507203004077 0.00585946440833143 0.00587472343022812 0.00160934328735693 0.00167667234762941 257853 256476 667 665 0 False 547 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 591 668 0.00602218918007236 0.00587928966384834 0.00602731364919509 0.00588998245212482 0.00132222597736754 0.00124749028148241 263241 256224 667 665 0 False 591 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 636 668 0.00750670670615711 0.0127145054212551 0.00671396963454643 0.00732433051041428 0.00446877656728173 0.022240787140283 328132 554108 667 665 0 False 636 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 675 674 0.00782433228338909 0.701454322462141 0.00764476997024491 0.69066910811017 0.00206698317477109 0.190606170460578 342016 30569923 667 665 9 True 680 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G3_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G3_3.csv new file mode 100755 index 0000000..afba299 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G3_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 280 278 0.00109077985612367 0.0685072488958721 0.000961318379491875 0.068863965819791 0.000729616752905128 0.0223093641936031 47680 2985599 667 665 0 True 279 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 323 278 0.00091853821315481 0.00100255215745934 0.000793469138628214 0.000900282291905089 0.000658352291320467 0.000663468507385278 40151 43692 667 665 0 False 323 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 366 279 0.00094136955326411 0.000923962458216955 0.000823987182421607 0.000793469138628214 0.00065567837504482 0.000713230519037267 41149 40267 667 665 0 True 368 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 412 279 0.000996320333767655 0.000938234806517323 0.000839246204318303 0.000793469138628214 0.000757456916382216 0.000753810252979747 43551 40889 667 665 0 True 412 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 456 279 0.000935741788066827 0.000993717986887567 0.000701915007248035 0.000732433051041428 0.000873442702108727 0.000947676750512935 40903 43307 667 665 0 True 457 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 501 278 0.000995153601958462 0.00106937061123856 0.000732433051041428 0.000823987182421607 0.000901924934865719 0.00094188948739098 43500 46604 667 665 0 False 501 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 545 278 0.00097811016670653 0.00101384153907314 0.000793469138628214 0.00080872816052491 0.00083458615284884 0.000836598456001445 42755 44184 667 665 0 True 546 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 589 277 0.00105717340460006 0.000992616583803294 0.000747692072938125 0.000579842832074464 0.000990485756911011 0.00102989593198574 46211 43259 667 665 0 True 590 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 635 277 0.00163205190721188 0.00102861869712046 0.000915541313801785 0.000656137941557946 0.00250631231746182 0.00101285420658973 71340 44828 667 665 0 False 635 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 673 278 0.00119594585861109 0.0700471251371735 0.000869764248111696 0.0681773098344396 0.00108589150889536 0.019117177770256 52277 3052708 667 665 0 True 679 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 279 322 0.000976211367879805 0.0009838283050267 0.000854505226215 0.00080872816052491 0.000713208887703673 0.000758576501651847 42672 42876 667 665 0 False 279 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 323 322 0.000965230362616815 0.000931970576475522 0.000854505226215 0.000839246204318303 0.000678239048472397 0.00063312854105845 42192 40616 667 665 0 False 323 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 368 324 0.000974312569053079 0.000971965275973179 0.00080872816052491 0.000885023270008392 0.000713157662097507 0.000670809564425404 42589 42359 667 665 0 True 368 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 412 323 0.000890971314525845 0.000964783210027816 0.000701915007248035 0.000732433051041428 0.000788382179479596 0.000781682881229651 38946 42046 667 665 0 True 412 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 456 323 0.00106083373968772 0.000954755852781416 0.000732433051041428 0.000686655985351339 0.00146146495697323 0.000882672346780374 46371 41609 667 665 0 True 457 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 500 322 0.00102825675740752 0.000968706958515538 0.000854505226215 0.000747692072938125 0.000876855177145569 0.000891770955067195 44947 42217 667 665 0 True 501 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 544 322 0.00106035332070747 0.00104158312925826 0.000900282291905089 0.000885023270008392 0.000844393093117281 0.000801483118320621 46350 45393 667 665 0 True 546 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 588 322 0.000919201648889449 0.0010314639884215 0.000595101853971161 0.000701915007248035 0.000920961935794351 0.00110382284992342 40180 44952 667 665 0 True 590 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 635 321 0.00100830793117975 0.000986008165297657 0.000610360875867857 0.000579842832074464 0.00105454515371719 0.00101101694469738 44075 42971 667 665 0 False 635 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 679 321 0.000988404859140583 0.00104318934208949 0.000610360875867857 0.000549324788281071 0.000983173800379334 0.00110828573855887 43205 45463 667 665 0 False 679 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 280 367 0.000937594832704957 0.000856317952124532 0.00080872816052491 0.000671396963454643 0.000710180364755746 0.000725665157276909 40984 37319 667 665 0 True 279 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 325 368 0.000927917821816947 0.000954365772522402 0.00080872816052491 0.000823987182421607 0.000691246359528369 0.000717704015698101 40561 41592 667 665 0 True 323 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 368 368 0.00092810083857133 0.000989817184297434 0.000762951094834821 0.000854505226215 0.000694228269639561 0.000740139699921684 40569 43137 667 665 0 True 368 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 413 368 0.000985819747484921 0.000952277695841802 0.000793469138628214 0.000732433051041428 0.000798295888543345 0.000809890976486174 43092 41501 667 665 0 True 412 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 457 368 0.000988130334009008 0.000941561961667731 0.000686655985351339 0.000610360875867857 0.000932002978990668 0.000926839804537679 43193 41034 667 665 0 True 457 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 501 366 0.000937411815950574 0.00103362090279487 0.00064087891966125 0.000747692072938125 0.000903803283556917 0.000956488238805883 40976 45046 667 665 0 True 501 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 546 364 0.000956468435500721 0.00101783412525362 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.0008729338971049 0.00091989881816454 41809 44358 667 665 0 False 546 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 589 365 0.0010404502486683 0.000955949039456045 0.000610360875867857 0.000473029678797589 0.00108386377316524 0.00107163089460206 45480 41661 667 665 0 True 590 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 633 365 0.00100634050107013 0.000985159167086863 0.000610360875867857 0.00064087891966125 0.00109180026628776 0.00100909421537422 43989 42934 667 665 0 True 635 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 677 366 0.000980672401267894 0.000975705457280188 0.000625619897764553 0.000534065766384375 0.00100282483180646 0.00106037252287949 42867 42522 667 665 0 True 680 364 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 281 411 0.00095973985998532 0.000975131809840463 0.000823987182421607 0.000854505226215 0.000789102083846184 0.000751650772547519 41952 42497 667 665 0 True 279 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 325 412 0.000894334247387636 0.000841104822023014 0.000778210116731518 0.000747692072938125 0.000701239472364416 0.000631374159464312 39093 36656 667 665 0 True 323 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 369 412 0.000930228408341034 0.000943764767836276 0.000854505226215 0.000823987182421607 0.000695097362844523 0.00072053042510599 40662 41130 667 665 0 True 368 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 413 411 0.000993849607583482 0.000992547746110527 0.000717174029144732 0.000793469138628214 0.000822894795107003 0.00082237845475713 43443 43256 667 665 0 True 412 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 457 408 0.00113319398895196 0.00113788706143936 0.000839246204318303 0.000915541313801785 0.00115653089003563 0.000925975182434711 49534 49590 667 665 0 False 457 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 502 411 0.000996686367276421 0.000941286610896663 0.000732433051041428 0.000686655985351339 0.000919193718736541 0.000943345432541376 43567 41022 667 665 0 True 502 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 546 411 0.00102210281904138 0.00102517681248211 0.000823987182421607 0.000854505226215 0.000866731522251891 0.000832627803240843 44678 44678 667 665 0 True 546 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 589 409 0.000991172987550629 0.00098945004993601 0.000610360875867857 0.000549324788281071 0.00101969397410978 0.00107060939463484 43326 43121 667 665 0 True 591 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 634 409 0.000928032207288436 0.00089300844236937 0.000488288700694286 0.000473029678797589 0.00100931745328724 0.00099064514916554 40566 38918 667 665 0 True 635 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 678 410 0.00103775075154114 0.000933920977770588 0.000656137941557946 0.000534065766384375 0.00104359073528186 0.00097443861457037 45362 40701 667 665 0 True 680 407 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 281 455 0.000996571981804932 0.000971208061352741 0.000854505226215 0.000885023270008392 0.000837064170262742 0.000778702321582406 43562 42326 667 665 0 True 279 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 325 456 0.000962759636432642 0.000925270374379529 0.000854505226215 0.000762951094834821 0.000784233101726132 0.000815288466651195 42084 40324 667 665 0 True 324 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 369 456 0.000931349385961631 0.00100287340002558 0.000823987182421607 0.000900282291905089 0.000736911642075947 0.000755614223842899 40711 43706 667 665 0 True 368 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 413 456 0.00101164798694724 0.00100980306109747 0.000717174029144732 0.000762951094834821 0.0009727877548944 0.000917785170499934 44221 44008 667 665 0 True 413 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 458 456 0.000931944190413376 0.000957325793311386 0.000579842832074464 0.000503547722590982 0.000994071856219314 0.00104469353107678 40737 41721 667 665 0 True 457 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 501 454 0.000984241227978366 0.00100496147670619 0.000671396963454643 0.000579842832074464 0.000984526429826777 0.00109027876461502 43023 43797 667 665 0 True 502 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 546 454 0.000930136899963843 0.000998330112302959 0.000625619897764553 0.000701915007248035 0.000947576099532902 0.000975061897587491 40658 43508 667 665 0 True 546 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 590 454 0.000916913939459659 0.000926922479005938 0.000518806744487678 0.000595101853971161 0.000979395546948193 0.000965590128756027 40080 40396 667 665 0 True 591 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 634 454 0.000822248523254967 0.000873229078647638 0.000488288700694286 0.000473029678797589 0.000871231627512719 0.000931101162870175 35942 38056 667 665 0 True 635 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 678 455 0.000994467289129525 0.000893123171857316 0.000625619897764553 0.000488288700694286 0.00103480812260087 0.000980995895482589 43470 38923 667 665 0 True 680 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 282 500 0.000965138854239623 0.00109259185959864 0.000778210116731518 0.000900282291905089 0.000813392468682445 0.000900589907665551 42188 47616 667 665 0 True 279 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 326 501 0.000907191174383053 0.000973433813418876 0.000778210116731518 0.000854505226215 0.000794749500582482 0.000812700120790361 39655 42423 667 665 0 True 324 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 370 501 0.00094788952513901 0.000909162354272039 0.000747692072938125 0.00080872816052491 0.000808785870208987 0.000786500889372436 41434 39622 667 665 0 True 368 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 415 501 0.00101688684154146 0.000991836423285267 0.000793469138628214 0.000701915007248035 0.000952418730421651 0.000901121759267929 44450 43225 667 665 0 True 413 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 459 500 0.000944457960994325 0.00100622350107358 0.000549324788281071 0.000686655985351339 0.00100804901253645 0.000936486121705683 41284 43852 667 665 0 True 457 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 504 499 0.000996457596333442 0.000930341417746701 0.000625619897764553 0.000610360875867857 0.000982676694854871 0.000908845577130558 43557 40545 667 665 0 True 502 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 546 494 0.000950543268077566 0.00096095124513045 0.000717174029144732 0.000732433051041428 0.000887271521382996 0.00088988977349317 41550 41879 667 665 0 False 546 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 591 499 0.000910256705018971 0.00101957801347039 0.000503547722590982 0.000579842832074464 0.000980851248913095 0.00100930018098253 39789 44434 667 665 0 True 591 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 635 497 0.000869535477168717 0.00090142958678454 0.0004272526131075 0.000442511635004196 0.000954355018209561 0.00096910831606832 38009 39285 667 665 0 True 635 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 679 499 0.000936954274064616 0.000926188210283089 0.00064087891966125 0.000549324788281071 0.000941064224438707 0.000993362959327229 40956 40364 667 665 0 True 680 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 282 543 0.000944640977748709 0.000954870582269361 0.000793469138628214 0.000823987182421607 0.000743009840028747 0.000753177389581307 41292 41614 667 665 0 True 279 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 327 545 0.000965779412879964 0.000967628501328854 0.000854505226215 0.000793469138628214 0.000792127492644018 0.000761993024818327 42216 42170 667 665 0 True 324 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 371 545 0.000942010111904451 0.00102524565017488 0.000793469138628214 0.000915541313801785 0.000796289015703632 0.00081057409182774 41177 44681 667 665 0 True 368 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 415 544 0.000946654162046924 0.00100562690773627 0.000671396963454643 0.000762951094834821 0.000953698062621625 0.000900509552176603 41380 43826 667 665 0 True 413 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 459 543 0.000956285418746337 0.000966687719527705 0.000518806744487678 0.000671396963454643 0.00103950877988106 0.00102792348475323 41801 42129 667 665 0 True 457 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 504 542 0.000897491286400746 0.000991882315080445 0.000473029678797589 0.000534065766384375 0.000990730083283547 0.0011059270483892 39231 43227 667 665 0 True 502 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 548 542 0.000940179944360619 0.000956935713052372 0.000579842832074464 0.00064087891966125 0.000936860845108922 0.000984411783890177 41097 41704 667 665 0 True 546 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 592 541 0.000804610283551289 0.000983897142719467 0.000503547722590982 0.000762951094834821 0.000834127007871977 0.000847963959306964 35171 42879 667 665 0 True 591 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 636 541 0.000962713882244046 0.000915633097392141 0.000686655985351339 0.000488288700694286 0.000907618904056895 0.0010229428388021 42082 39904 667 665 0 True 636 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 680 541 0.000886761929175033 0.000865381581672194 0.000610360875867857 0.000579842832074464 0.00090675964078582 0.000869874369644457 38762 37714 667 665 0 True 680 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 283 587 0.00094386315654258 0.000985732814526589 0.000854505226215 0.000869764248111696 0.00069329615725242 0.000734717290708726 41258 42959 667 665 0 True 279 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 327 586 0.000830118243693443 0.000939611560372664 0.000686655985351339 0.000793469138628214 0.000699224357311823 0.000771879478370166 36286 40949 667 665 0 True 324 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 372 587 0.00097321446852678 0.000893306739038028 0.000869764248111696 0.000839246204318303 0.000725018276686236 0.000637580709048609 42541 38931 667 665 0 True 368 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 416 586 0.00100224550119081 0.000993763878682745 0.000732433051041428 0.000717174029144732 0.000959678839373086 0.000886283880194487 43810 43309 667 665 0 True 413 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 460 585 0.00095713187123536 0.000964278400280858 0.000610360875867857 0.000549324788281071 0.00104278207462231 0.000996248984055841 41838 42024 667 665 0 True 458 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 504 583 0.000879921677979962 0.000904389607573523 0.000335698481727321 0.000473029678797589 0.00104019412044617 0.00108206952279784 38463 39414 667 665 0 True 502 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 548 582 0.00103335834943595 0.00102515386658452 0.00064087891966125 0.000671396963454643 0.00102984863535108 0.000964099300374694 45170 44677 667 665 0 True 547 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 591 581 0.000904285783407221 0.000929354744150374 0.000595101853971161 0.000671396963454643 0.000856581880488619 0.000801661561958671 39528 40502 667 665 0 False 591 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 637 583 0.000961158239831789 0.000996310873315126 0.000717174029144732 0.000793469138628214 0.000853084220007805 0.000796682519267697 42014 43420 667 665 0 True 636 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 681 583 0.00100402991454605 0.00090211796371221 0.000778210116731518 0.000518806744487678 0.000906252433313687 0.000933007929844907 43888 39315 667 665 0 True 680 581 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 280 625 0.000940225698549215 0.000958518979986014 0.000762951094834821 0.000823987182421607 0.000762286342607094 0.000760805301763153 41099 41773 667 665 0 False 280 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 324 625 0.000907305559854543 0.000867240199376904 0.000778210116731518 0.000762951094834821 0.000715722711944572 0.000641862054118119 39660 37795 667 665 0 False 324 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 372 628 0.000959419580665149 0.000877313448418483 0.000778210116731518 0.000762951094834821 0.000736111475846836 0.000660633605243589 41938 38234 667 665 0 True 369 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 416 628 0.000960105893494086 0.000966894232606006 0.000762951094834821 0.000793469138628214 0.000826749576503713 0.000766889963188739 41968 42138 667 665 0 True 413 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 458 625 0.0008903765100741 0.000860172862919487 0.000579842832074464 0.000473029678797589 0.00093814396162764 0.000939041352792773 38920 37487 667 665 0 False 458 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 502 625 0.000961135362737491 0.000972011167768357 0.000549324788281071 0.000579842832074464 0.0010190104625228 0.00101679783806624 42013 42361 667 665 0 False 502 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 547 625 0.000995679775127314 0.000994658768688716 0.00064087891966125 0.000610360875867857 0.000993849445127294 0.00102195698906187 43523 43348 667 665 0 False 547 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 591 624 0.00100309195367983 0.000956430903305414 0.000823987182421607 0.000686655985351339 0.000844568443954987 0.000834993311111291 43847 41682 667 665 0 False 591 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 636 624 0.00098300586488628 0.000921094221018327 0.000839246204318303 0.00080872816052491 0.000738829442206759 0.000692038124345776 42969 40142 667 665 0 False 636 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 680 624 0.000941026396849641 0.00094718370657704 0.000747692072938125 0.000778210116731518 0.000791351818214496 0.000766443587246506 41134 41279 667 665 0 False 680 624 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 279 675 0.00114170426803078 0.068840515112455 0.000946059357595178 0.0676737621118486 0.000832366266523559 0.0222896034277153 49906 3000123 667 665 0 True 280 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 324 669 0.000911514945205356 0.000934884705469327 0.000778210116731518 0.000839246204318303 0.000707395937124665 0.000664807407013911 39844 40743 667 665 0 False 324 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 369 668 0.000907740224646203 0.000930869173391249 0.000747692072938125 0.00080872816052491 0.000692662068759944 0.000637029654811537 39679 40568 667 665 0 False 369 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 413 668 0.00101478214886606 0.000944131902197701 0.000839246204318303 0.000732433051041428 0.000801826026790735 0.000754621093852196 44358 41146 667 665 0 False 413 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 458 668 0.000900030643867812 0.000932590115710425 0.000686655985351339 0.000778210116731518 0.000799708273645515 0.000779462551316399 39342 40643 667 665 0 False 458 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 502 668 0.000988107456914711 0.000964048941304968 0.000686655985351339 0.000671396963454643 0.00092077079362208 0.000916938361574503 43192 42014 667 665 0 False 502 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 547 668 0.000905521146499307 0.000985250950677219 0.000610360875867857 0.00064087891966125 0.00085581034368218 0.000940473516157779 39582 42938 667 665 0 False 547 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 591 668 0.000904697571104583 0.000913200832247706 0.000762951094834821 0.000793469138628214 0.000681531753899701 0.000650829668919368 39546 39798 667 665 0 False 591 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 636 668 0.00102784496971016 0.00145582541843278 0.000823987182421607 0.00102235446707866 0.000839205158308943 0.00229408314750473 44929 63446 667 665 0 False 636 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 675 674 0.00103152818189212 0.070762968304258 0.000869764248111696 0.0687571526665141 0.000734002244605775 0.0209791303281825 45090 3083905 667 665 0 True 680 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G4_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G4_1.csv new file mode 100755 index 0000000..557200b --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G4_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 255 250 0.0100708400663481 0.0397411243834007 0.0100099183642329 0.0400549324788281 0.00168910450564665 0.0077250008717001 440215 1731949 667 665 0 True 255 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 299 250 0.00996629174540677 0.00985299137062156 0.00991836423285267 0.0098268101014725 0.00148845720675519 0.00145955133139732 435645 429401 667 665 0 False 299 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 343 250 0.0100607512677628 0.0546711480004658 0.0100251773861295 0.0555886167696651 0.00145908559112926 0.00621002568481979 439774 2382611 667 665 0 True 344 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 388 250 0.00986711954162539 0.0796214385815764 0.00985732814526589 0.077103837644007 0.00141272185216985 0.0150842409033455 431310 3469964 667 665 0 True 388 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 431 249 0.00988054839597825 0.0659145001436987 0.00987258716716258 0.0664377813382162 0.00161723578321207 0.012011028070602 431897 2872605 667 665 0 True 433 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 475 249 0.00969668518910606 0.05646824775374 0.00964370183871214 0.059159227893492 0.00159157206866395 0.0142015618680734 423860 2460930 667 665 0 True 478 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 519 249 0.0097973901582054 0.0752307181320204 0.00984206912336919 0.077103837644007 0.00164765495966909 0.0159081500503252 428262 3278613 667 665 0 True 522 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 564 247 0.00977066971206546 0.0678428733770797 0.0097962920576791 0.0666056305790799 0.00168286262296751 0.0219113163723225 427094 2956645 667 665 0 True 567 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 611 249 0.00955020315431664 0.00966295344678932 0.00956740672922866 0.00968947890440223 0.00211019821054683 0.00203268886456491 417457 421119 667 665 0 False 611 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 650 249 0.0095570891597003 0.0391072439625041 0.00955214770733196 0.0392767223620966 0.00172117333192219 0.00726122348737179 417758 1704324 667 665 0 True 656 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 255 294 0.00958628033202442 0.00960797507616604 0.00959792477302205 0.00965896086060884 0.0015681639758888 0.00149376365188716 419034 418723 667 665 0 False 255 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 299 294 0.0101196826626742 0.00985592844551296 0.0100556954299229 0.00993362325474937 0.00140712170656332 0.00133826011699461 442350 429529 667 665 0 False 299 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 344 295 0.0102673085521785 0.0887297896836392 0.0102845807583734 0.0851606012054627 0.00149842422159928 0.0163244878444962 448803 3866913 667 665 0 True 344 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 388 294 0.0101763949794386 0.0445628605732688 0.0101777676050965 0.0449530785076677 0.00145002646534869 0.00639084202925661 444829 1942084 667 665 0 True 389 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 432 294 0.00994604551695313 0.068070037763211 0.0100862134737163 0.0666208896009766 0.00185493007442002 0.0106292959426122 434760 2966545 667 665 0 True 433 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 476 293 0.00982200591166994 0.0385961699855039 0.00975051499198901 0.0391393911650263 0.00181281661167292 0.00715583823202926 429338 1682051 667 665 0 True 478 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 520 293 0.00982406485015675 0.0366859469571158 0.0098268101014725 0.0384069581139849 0.00162900733195722 0.00604407989178708 429428 1598802 667 665 0 True 522 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 564 292 0.00967733116733005 0.044539845837987 0.00973525597009232 0.0462500953688869 0.00175809792087365 0.00741597344129719 423014 1941081 667 665 0 True 567 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 612 292 0.00943254625834256 0.00950419078137092 0.009399557488365 0.00952162966353857 0.00204908202128366 0.00186998145599874 412314 414200 667 665 0 False 612 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 656 292 0.00931189246301546 0.00953218477642952 0.00929274433508812 0.00952162966353857 0.00192590329077764 0.00194179418042014 407040 415420 667 665 0 False 656 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 255 338 0.00975204775730697 0.0494810383707036 0.00973525597009232 0.050614175631342 0.00167404902295403 0.00882852552910145 426280 2156422 667 665 0 True 255 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 299 339 0.00994037199756725 0.0564626719006259 0.0100099183642329 0.0580910963607233 0.00146840046341261 0.0154392548571313 434512 2460687 667 665 0 True 300 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 343 338 0.0103213213718158 0.0383975961877686 0.0102845807583734 0.0384832532234684 0.00139786570424897 0.00883411910385419 451164 1673397 667 665 0 True 344 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 387 338 0.010662922143872 0.0311963245261242 0.0106813153276875 0.0319829098954757 0.00141864321486038 0.00472638188062239 466096 1359560 667 665 0 True 389 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 432 338 0.010485830556912 0.0635315457331817 0.0104219119554437 0.0618600747692073 0.00165838615977821 0.0101743547369987 458355 2768754 667 665 0 True 433 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 478 336 0.0103004117076275 0.0289911549301269 0.0101319905394064 0.0297398336766613 0.00223718479385659 0.00433152780624533 450250 1263457 667 665 0 False 478 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 520 336 0.0100475054301643 0.0262881740859358 0.0101167315175097 0.0264591439688716 0.001721368815404 0.00308551775442096 439195 1145659 667 665 0 True 523 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 564 335 0.0100602250945939 0.0449210001428382 0.0100709544518196 0.0461738002594034 0.00186384158010739 0.00768489031803832 439751 1957692 667 665 0 True 567 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 608 337 0.00983522887217412 0.0549290139975712 0.00990310521095598 0.0557259479667353 0.00223256704077023 0.0125812221906984 429916 2393849 667 665 0 True 612 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 652 337 0.00989429752965129 0.0578619127356042 0.00990310521095598 0.0585641260395209 0.00197956592032643 0.0138619835268029 432498 2521667 667 665 0 True 656 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 255 381 0.0103088304783292 0.0419995743535997 0.01025406271458 0.044785229266804 0.00200091285024647 0.0110105230394 450618 1830374 667 665 0 True 255 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 300 382 0.01014946863945 0.0306089554396405 0.0100862134737163 0.0306706340123598 0.00146556498472524 0.00330987735298402 443652 1333962 667 665 0 True 300 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 344 382 0.0103106148916844 0.0773930018454238 0.0102388036926833 0.0755016403448539 0.00156592361232755 0.0167101423774445 450696 3372847 667 665 0 True 344 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 388 382 0.0106751842664157 0.0645645700426392 0.0107118333714809 0.0637521934843976 0.00147513792540534 0.0159837299370307 466632 2813774 667 665 0 True 389 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 433 382 0.0110934690585584 0.0427475647232065 0.0110170138094148 0.0428931105516136 0.00191382458153184 0.0074489165126721 484916 1862972 667 665 0 True 434 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 476 381 0.0114006626807905 0.0489136322151224 0.0112916762035554 0.0501564049744411 0.00252229732020307 0.00943577323481705 498344 2131694 667 665 0 True 478 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 521 380 0.0107161571423032 0.0399520660199365 0.0106813153276875 0.0401007095445182 0.00206321263013531 0.00563016499731355 468423 1741142 667 665 0 True 523 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 564 380 0.0103230371538882 0.049053900487084 0.0103150988021668 0.0496223392080568 0.00198855922482067 0.00807025470022264 451239 2137807 667 665 0 True 567 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 609 381 0.0103068859253138 0.040079897615405 0.0102082856488899 0.0404211490043488 0.00218934144886041 0.0070644841379646 450533 1746713 667 665 0 True 612 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 653 381 0.0101767152587588 0.0854474019794279 0.0101625085831998 0.082581826504921 0.00212693177603715 0.0153578748767197 444843 3723864 667 665 0 True 657 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 256 426 0.009903951663445 0.0489818503686545 0.00987258716716258 0.0495155260547799 0.0016112666855697 0.00792972832575479 432920 2134667 667 665 0 True 255 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 300 425 0.010080814479462 0.0561682989804564 0.0100862134737163 0.0564583810177768 0.00161934586866151 0.00988870642673731 440651 2447858 667 665 0 True 300 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 344 426 0.010163446544066 0.0347048669969729 0.0101625085831998 0.0351720454718853 0.0014143921331364 0.00424290111769273 444263 1512465 667 665 0 True 345 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 388 426 0.0102883097247439 0.0523038885838997 0.0103303578240635 0.0504463263904784 0.00159964001393187 0.0117991594916654 449721 2279444 667 665 0 True 389 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 432 426 0.0107397891807129 0.101904337405657 0.010757610437171 0.100938429846647 0.00200214589080182 0.0185910664918847 469456 4441070 667 665 0 True 434 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 476 425 0.0113978030440033 0.0572656635867536 0.0109864957656214 0.0586861982146944 0.0034530760878544 0.0121701933934297 498219 2495682 667 665 0 True 478 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 521 424 0.0110240599544586 0.0494726172262884 0.0108644235904479 0.0498817425803006 0.00235218708291382 0.0082610852692446 481882 2156055 667 665 0 True 523 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 565 423 0.0106192040166687 0.0334472023501188 0.0106660563057908 0.0334630350194553 0.00194252032455951 0.00513301940514742 464185 1457655 667 665 0 True 568 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 609 425 0.0104370108376803 0.0385066580390092 0.0104676890211337 0.0388799877927825 0.00205979526289383 0.00499295294364014 456221 1678150 667 665 0 True 612 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 653 425 0.0101811305379583 0.073575217512768 0.0101625085831998 0.0715800717174029 0.00190355889354955 0.0116781357816046 445036 3206465 667 665 0 True 657 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 257 470 0.0097735293488527 0.0504917133759094 0.00971999694819562 0.0516517891203174 0.00159465294067676 0.0125031187553034 427219 2200468 667 665 0 True 256 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 301 470 0.00994581674601015 0.0543855174672777 0.00994888227664607 0.0540932326237888 0.00158607785199529 0.0074699203360265 434750 2370163 667 665 0 True 300 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 345 470 0.0101257450926631 0.0726538020491834 0.0101167315175097 0.073182269016556 0.00152077336337582 0.0167423022493349 442615 3166309 667 665 0 True 345 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 389 470 0.0102855873505225 0.0918216805460665 0.0101777676050965 0.0886091401541161 0.00165581896422103 0.0187293755096748 449602 4001660 667 665 0 True 389 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 434 469 0.0106432707198701 0.0928469261962414 0.010605020218204 0.0894483863584344 0.0020880595962941 0.0254741205216115 465237 4046341 667 665 0 True 434 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 478 469 0.0103914396658389 0.041902077234744 0.0103608758678569 0.0426031891355764 0.00189369436417587 0.00552859890459858 454229 1826125 667 665 0 True 478 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 522 468 0.0103154877127698 0.0376420107260598 0.0103608758678569 0.0383916990920882 0.0018642709290596 0.00467883266173989 450909 1640468 667 665 0 True 523 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 566 468 0.0102697106470798 0.0983755337072367 0.0103608758678569 0.0985732814526589 0.00200087997485487 0.0159599988575599 448908 4287282 667 665 0 True 568 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 610 469 0.0100017054873799 0.0639297029481463 0.0100099183642329 0.0633554589150835 0.00186769249160337 0.0183868931388045 437193 2786106 667 665 0 True 612 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 655 469 0.0102185345871354 0.0705077869771706 0.010101472495613 0.0693369954985885 0.00213587600677687 0.00956821643877126 446671 3072784 667 665 0 True 657 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 258 513 0.00947514340792524 0.0476978438313683 0.00955214770733196 0.0487373159380484 0.00155447171990316 0.0108989507265049 414176 2078709 667 665 0 True 256 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 302 514 0.00985625292183389 0.0957813852553104 0.00984206912336919 0.0925154497596704 0.00162394296502603 0.0207971640598376 430835 4174227 667 665 0 True 300 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 346 515 0.0100573654578067 0.0546252103134926 0.0100099183642329 0.0553597314412146 0.00171225561345926 0.0120002408539574 439626 2380609 667 665 0 True 345 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 390 514 0.0104272880726037 0.057253525206929 0.0104676890211337 0.0562905317769131 0.00173461061535107 0.00855967360129582 455796 2495153 667 665 0 True 389 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 434 513 0.0106005134306273 0.0540152624637813 0.0106355382619974 0.0538796063172351 0.00196840777869119 0.00627536534483721 463368 2354027 667 665 0 True 434 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 478 512 0.0103858347777359 0.0671681492584746 0.0104829480430304 0.0666819256885634 0.00194881338065799 0.0140011065264661 453984 2927240 667 665 0 True 479 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 523 511 0.0105563606386324 0.0735949050928993 0.0104982070649271 0.0715037766079194 0.00175461634911146 0.0173545486405392 461438 3207323 667 665 0 True 523 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 566 510 0.0101161824672466 0.0541501843416048 0.0101319905394064 0.0550240329594873 0.00188816081752788 0.01064605800608 442197 2359907 667 665 0 True 568 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 611 511 0.0100410540895723 0.0469701605811278 0.0101319905394064 0.0463569085221637 0.00202920658404065 0.00654610015222251 438913 2046996 667 665 0 True 612 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 655 510 0.0099007488702433 0.0609073381554137 0.0098268101014725 0.0602883955138476 0.00196414093257078 0.0122462587058613 432780 2654389 667 665 0 True 657 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 258 555 0.00935741788066827 0.040533583902535 0.00932326237888151 0.0422827496757458 0.00140872328891585 0.0074296615439463 409030 1766485 667 665 0 True 256 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 302 555 0.00952288790372495 0.0526631754483485 0.00953688868543526 0.0530251010910201 0.00149207362834731 0.0104672479959568 416263 2295102 667 665 0 True 300 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 347 556 0.00969224703281227 0.0448653104493897 0.00965896086060884 0.0451209277485313 0.00150347046730441 0.00881299418929183 423666 1955265 667 665 0 True 345 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 391 555 0.0101023647022907 0.0498975523037394 0.0100099183642329 0.0490882734416724 0.00170340154019163 0.00674692477588999 441593 2174574 667 665 0 True 390 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 435 554 0.0099604352092665 0.0865827191003372 0.00987258716716258 0.0828564888990616 0.00200226684175098 0.0178512907550589 435389 3773342 667 665 0 True 434 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 479 553 0.01013594827672 0.0634483439085239 0.0101319905394064 0.0630045014114595 0.00202848601835105 0.0100225820672239 443061 2765128 667 665 0 True 479 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 523 552 0.0101836012641425 0.0537875473761079 0.0102235446707866 0.0536507209887846 0.00183467723836053 0.00623999950344099 445144 2344103 667 665 0 True 523 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 568 552 0.00986965889909245 0.0372524352767935 0.00987258716716258 0.038452735179675 0.00184180778287152 0.00702544965740787 431421 1623490 667 665 0 True 568 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 612 553 0.00974621409826101 0.0485966116940325 0.00976577401388571 0.0471351186388952 0.00183637873788213 0.0114409856756726 426025 2117878 667 665 0 True 613 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 656 552 0.00967447153054281 0.0509173368302881 0.00964370183871214 0.0496681162737469 0.00188688783395908 0.00729184899250297 422889 2219017 667 665 0 True 657 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 256 598 0.00881843353900985 0.00905036681885533 0.00881971465629053 0.00906385900663768 0.00130107406591969 0.00134576709431215 385470 394422 667 665 0 False 256 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 301 597 0.00911338791579262 0.00911716232673696 0.00910963607232776 0.00914015411612116 0.00150647687356049 0.00152395837707884 398363 397333 667 665 0 False 301 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 346 598 0.00962437069403042 0.0778233751006034 0.00949111161974517 0.0744640268558785 0.00175432449404622 0.0217470014445417 420699 3391603 667 665 0 True 345 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 390 597 0.00983779110673549 0.0865069976382935 0.00976577401388571 0.0826123445487144 0.00145959973809989 0.0236600792579365 430028 3770042 667 665 0 True 390 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 434 597 0.00953270217717875 0.0112800655793753 0.00949111161974517 0.00988784618905928 0.00179764721244511 0.0142644410271411 416692 491594 667 665 0 False 434 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 479 597 0.00953249628333007 0.0096859911279687 0.0093690394445716 0.00965896086060884 0.00204607297250978 0.00193807593006671 416683 422123 667 665 0 False 479 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 524 597 0.00939701813089793 0.00948702724997433 0.009399557488365 0.009399557488365 0.00197875102745172 0.0022101387783284 410761 413452 667 665 0 False 524 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 568 596 0.00948500343556764 0.00943897854042293 0.009399557488365 0.00943007553215839 0.0018429215818001 0.00191646584759715 414607 411358 667 665 0 False 568 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 613 596 0.00935631978014197 0.00919561435059381 0.00932326237888151 0.00917067215991455 0.00163393907911116 0.00142111191679092 408982 400752 667 665 0 False 613 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 657 596 0.00932086028398024 0.00914919479977123 0.00935378042267491 0.00924696726939803 0.00159836564874792 0.00166426811036679 407432 398729 667 665 0 False 657 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 256 646 0.00915886757925683 0.037984638868859 0.00912489509422446 0.038651102464332 0.00137423853829379 0.00869484906369358 400351 1655400 667 665 0 True 256 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 301 641 0.0090483483367037 0.00904150970238597 0.00912489509422446 0.00907911802853437 0.0014459099807551 0.00130818987728366 395520 394036 667 665 0 False 301 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 345 641 0.00905914632521231 0.00893513252116329 0.00912489509422446 0.00892652780956741 0.00135472261008006 0.00125751759361048 395992 389400 667 665 0 False 345 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 390 641 0.00925858883330136 0.00911498246646601 0.00927748531319142 0.00906385900663768 0.00134410002839877 0.00134498573492667 404710 397238 667 665 0 False 390 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 435 640 0.00929926430696302 0.00926759563133056 0.00930800335698482 0.00915541313801785 0.00160117668000964 0.00181218686278125 406488 403889 667 665 0 False 435 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 479 640 0.00927304715689763 0.00927810485242633 0.00927748531319142 0.00930800335698482 0.00180052867554677 0.00174793054736787 405342 404347 667 665 0 False 479 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 524 640 0.0091821107070635 0.00904761331114465 0.00924696726939803 0.00907911802853437 0.001758896227123 0.00183330647658111 401367 394302 667 665 0 False 524 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 568 640 0.00915934799823709 0.00920887707940026 0.00921644922560464 0.00920119020370794 0.00162996356569449 0.00155523246959148 400372 401330 667 665 0 False 568 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 613 640 0.0092527551742554 0.00939214596344374 0.00914015411612116 0.0093690394445716 0.00139866658716723 0.00142078393754766 404455 409317 667 665 0 False 613 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 653 645 0.00917561361228289 0.0391168353476963 0.00917067215991455 0.0386968795300221 0.00133646128353393 0.00742762341294629 401083 1704742 667 665 0 True 658 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G4_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G4_2.csv new file mode 100755 index 0000000..6de5406 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G4_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 255 250 0.00881783873455811 0.68210349632378 0.00860608834973678 0.663752193484398 0.00212189021582014 0.176858162949304 385444 29726599 667 665 6 True 255 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 299 250 0.00742583617781405 0.00730803892312608 0.00732433051041428 0.00737010757610437 0.00178041198565094 0.00133465894736076 324597 318490 667 665 0 False 299 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 343 250 0.00691286309237233 0.00704094867518992 0.00674448767833982 0.00709544518196384 0.00146084209513895 0.00144836552049207 302174 306850 667 665 0 True 344 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 388 250 0.00651063802042673 0.00707385309233257 0.00650034332799268 0.00709544518196384 0.00144077313211988 0.00137329099411984 284592 308284 667 665 0 True 388 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 431 249 0.00647257053551503 0.00710060800892137 0.00648508430609598 0.00715648126955062 0.00166211511958078 0.00160163359106957 282928 309450 667 665 0 True 433 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 475 249 0.00672890837712295 0.00700260608031867 0.00666819256885634 0.00701915007248035 0.00156757007784107 0.00154496874010954 294133 305179 667 665 0 True 478 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 519 249 0.00693464208614393 0.00716095571958048 0.00697337300679027 0.00714122224765393 0.00158425628654314 0.00153784125138624 303126 312080 667 665 0 True 522 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 564 247 0.00716837735858553 0.00735489444600285 0.00711070420386053 0.00729381246662089 0.00156778706264918 0.00158828048525964 313343 320532 667 665 0 True 567 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 611 249 0.00979924320284353 0.0079101163299643 0.00816357671473259 0.00799572747386892 0.00936138609258378 0.00197807498555993 428343 344729 667 665 0 False 611 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 650 249 0.0090787977492142 0.704657363252489 0.00914015411612116 0.686655985351339 0.00205163423333369 0.169094107151389 396851 30709514 667 665 6 True 656 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 255 294 0.00680650748098141 0.00661548584209436 0.00675974670023652 0.00663767452506294 0.00166708604765065 0.00148548662827852 297525 288308 667 665 0 False 255 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 299 294 0.00707691473558254 0.00668218956638564 0.00695811398489357 0.00677500572213321 0.00153011472145569 0.00132965813581981 309345 291215 667 665 0 False 299 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 344 295 0.00722570735689605 0.00679680432484278 0.00717174029144732 0.00679026474402991 0.00146173907001624 0.00140299633917351 315849 296210 667 665 0 True 344 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 388 294 0.00693118764490495 0.00686972638738067 0.00692759594110018 0.00686655985351339 0.00144519146274807 0.00135747664761398 302975 299388 667 665 0 True 389 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 432 294 0.0070078259108029 0.00691153381278786 0.00703440909437705 0.00697337300679027 0.00166219820624205 0.00166009738458772 306325 301210 667 665 0 True 433 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 476 293 0.0069707650180403 0.00715668778262892 0.00709544518196384 0.00711070420386053 0.00167801946370546 0.00192043021705034 304705 311894 667 665 0 True 478 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 520 293 0.0070186696535001 0.00727256456545346 0.00711070420386053 0.00732433051041428 0.00170177643214862 0.00159163243740979 306799 316944 667 665 0 True 522 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 564 292 0.00712070149406871 0.00728256897680227 0.00708018616006714 0.00727855344472419 0.00177614743355859 0.00167134654579494 311259 317380 667 665 0 True 567 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 612 292 0.00743160120557711 0.00760732226537963 0.00747692072938125 0.00762951094834821 0.00191727234948707 0.00194938380914032 324849 331533 667 665 0 False 612 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 656 292 0.00773346446483785 0.00766186466394873 0.0076752880140383 0.00761425192645151 0.00204564271878996 0.00197356629513699 338044 333910 667 665 0 False 656 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 255 338 0.00608544434580604 0.00609624312555249 0.00608834973678187 0.00608834973678187 0.0014957955056602 0.00148892145296491 266006 265679 667 665 0 True 255 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 299 339 0.00651361204268546 0.00631930019601533 0.00651560234988937 0.00633249408712902 0.00135254415981437 0.00128555710548017 284722 275400 667 665 0 True 300 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 343 338 0.00717919822418843 0.00654657931163455 0.00704966811627375 0.00650034332799268 0.00142450667495093 0.00138304395005155 313816 285305 667 665 0 True 344 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 387 338 0.00791378172209386 0.00752434989969775 0.00790417334248875 0.00740062561989776 0.00148086060872098 0.00158922087818587 345926 327917 667 665 0 True 389 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 432 338 0.00765554508165922 0.00775066528761822 0.00770580605783169 0.00779736018921187 0.00174799713077003 0.0018034850554153 334638 337780 667 665 0 True 433 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 478 336 0.0079764649604701 0.00770541597757268 0.00781261921110857 0.0076752880140383 0.0022867089315688 0.00170476865502071 348666 335808 667 665 0 False 478 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 520 336 0.00735992726914181 0.0074007632952833 0.00730907148851759 0.00743114366369116 0.00165514535964582 0.00166018583682239 321716 322531 667 665 0 True 523 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 564 335 0.00748126737729785 0.00738057090540496 0.00749217975127794 0.00737010757610437 0.00177789804576054 0.00150967708158997 327020 321651 667 665 0 True 567 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 608 337 0.00743581059092793 0.00753722254824518 0.00733958953231098 0.00746166170748455 0.00214942307232722 0.00220979688813578 325033 328478 667 665 0 True 612 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 652 337 0.00710166775161286 0.00707708846389262 0.00712596322575723 0.00712596322575723 0.0019873307838676 0.00181014715368179 310427 308425 667 665 0 True 656 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 255 381 0.00657457949898935 0.00672938927772625 0.00653086137178607 0.00662241550316625 0.00162119691736188 0.00193258637248779 287387 293272 667 665 0 True 255 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 300 382 0.00667102932854928 0.00695946779285132 0.00668345159075303 0.00685130083161669 0.00149692859653188 0.00155360205906488 291603 303299 667 665 0 True 300 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 344 382 0.00690362074627598 0.00739608233217514 0.00689707789730678 0.00729381246662089 0.00151066631821167 0.00184291194430355 301770 322327 667 665 0 True 344 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 388 382 0.00757501770973062 0.00816789054347932 0.00755321583886473 0.00804150453955901 0.00160125692356422 0.00163738959919164 331118 355963 667 665 0 True 389 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 433 382 0.00824270858390901 0.00819882161342932 0.00820935378042268 0.00825513084611276 0.00177305832552051 0.00202447794887494 360304 357311 667 665 0 True 434 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 476 381 0.00874076580386849 0.00781112772776528 0.00856031128404669 0.00790417334248875 0.00240783027440537 0.00190475327477288 382075 340415 667 665 0 True 478 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 521 380 0.00813356196701375 0.00742852783136601 0.00804150453955901 0.00737010757610437 0.0019624265507066 0.0016873757122329 355533 323741 667 665 0 True 523 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 564 380 0.00794763982165475 0.00778281249014043 0.00798046845197223 0.00761425192645151 0.00208903695226395 0.00182827874419922 347406 339181 667 665 0 True 567 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 609 381 0.00746106690303281 0.00736808833711654 0.00744640268558785 0.00743114366369116 0.00217140725085522 0.00203439978900582 326137 321107 667 665 0 True 612 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 653 381 0.00673455901941453 0.00681366955957071 0.00683604180972 0.00666819256885634 0.00197029563972288 0.00198308671193004 294380 296945 667 665 0 True 657 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 256 426 0.00648629679209377 0.00651202278986549 0.00651560234988937 0.00656137941557946 0.00153817543939085 0.00160754355900523 283528 283799 667 665 0 True 255 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 300 425 0.0066892394956104 0.00670288676601093 0.00669871061264973 0.00672922865644312 0.00143955980399698 0.00136255952116812 292399 292117 667 665 0 True 300 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 344 426 0.00694642378970734 0.00678420702706641 0.00697337300679027 0.00683604180972 0.00130947837297084 0.0013622183562 303641 295661 667 665 0 True 345 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 388 426 0.00701935596632904 0.00707568876413969 0.00706492713817044 0.00709544518196384 0.00149843406307592 0.00149300855634755 306829 308364 667 665 0 True 389 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 432 426 0.00755749385549843 0.00740246129170489 0.00756847486076143 0.00744640268558785 0.00171168238687309 0.00161390255415669 330352 322605 667 665 0 True 434 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 476 425 0.00820178146221007 0.00756441343688817 0.00802624551766232 0.00755321583886473 0.0026521731428623 0.00163537970627274 358515 329663 667 665 0 True 478 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 521 424 0.0081851269375612 0.00788118155310455 0.0081177996490425 0.00787365529869535 0.00213500540447919 0.00172379193245225 357787 343468 667 665 0 True 523 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 565 423 0.00771909764961877 0.00736120456783983 0.00776684214541848 0.00732433051041428 0.00198273650469843 0.00174477696207366 337416 320807 667 665 0 True 568 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 609 425 0.00698721364884049 0.00687052949379629 0.00697337300679027 0.00679026474402991 0.00216285366403411 0.00172658880000989 305424 299423 667 665 0 True 612 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 653 425 0.00656224874516278 0.00630498195591978 0.00654612039368277 0.00634775310902571 0.00192908127826985 0.00195952295004587 286848 274776 667 665 0 True 657 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 257 470 0.00649341156842041 0.00662057983135913 0.00656137941557946 0.00657663843747616 0.00150222106488201 0.00145041713097719 283839 288530 667 665 0 True 256 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 301 470 0.00651175899804733 0.00665883064264002 0.00650034332799268 0.00660715648126955 0.00160473559211387 0.001529631810141 284641 290197 667 665 0 True 300 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 345 470 0.00657002695722407 0.00665564116287514 0.00656137941557946 0.00666819256885634 0.00149271351937132 0.00148172929202164 287188 290058 667 665 0 True 345 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 389 470 0.00684990532886452 0.00697867350913333 0.00688181887541009 0.00703440909437705 0.00152569118207466 0.0015637504685784 299422 304136 667 665 0 True 389 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 434 469 0.00725055188130357 0.00752327144251106 0.00735484855420768 0.00752269779507134 0.00183815418589735 0.00220696187729462 316935 327870 667 665 0 True 434 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 478 469 0.00740648215603803 0.00781973243936116 0.00744640268558785 0.00784313725490196 0.00184787668315378 0.00207731042253602 323751 340790 667 665 0 True 478 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 522 468 0.00728848210364948 0.00739617411576549 0.00729381246662089 0.00732433051041428 0.00181447129726289 0.00200323269822869 318593 322331 667 665 0 True 523 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 566 468 0.00653463609234522 0.00668737533924076 0.00662241550316625 0.00660715648126955 0.00190538594911204 0.0019113148636562 285641 291441 667 665 0 True 568 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 610 469 0.00632869648947556 0.00637063016892196 0.00633249408712902 0.00633249408712902 0.00181200677917122 0.00172871618378033 276639 277637 667 665 0 True 612 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 655 469 0.00630144987016677 0.00621604365686475 0.00631723506523232 0.00616464484626535 0.0018990273650666 0.00180445503241364 275448 270900 667 665 0 True 657 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 258 513 0.00626502953604452 0.006290732553517 0.00631723506523232 0.00625619897764553 0.00142615150694752 0.00152694689690812 273856 274155 667 665 0 True 256 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 302 514 0.00650361475247727 0.00659478864246907 0.00650034332799268 0.00669871061264973 0.00146651712923992 0.00150148049381666 284285 287406 667 665 0 True 300 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 346 515 0.00659693042011839 0.00668418585947588 0.00653086137178607 0.00665293354695964 0.00149079321013931 0.00144703382437171 288364 291302 667 665 0 True 345 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 390 514 0.00679047063787859 0.00675017826094189 0.00675974670023652 0.00671396963454643 0.00159776957019578 0.00149711573569412 296824 294178 667 665 0 True 389 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 434 513 0.00705145252962898 0.00693356187447332 0.00698863202868696 0.00695811398489357 0.00198437424677789 0.00196626118920458 308232 302170 667 665 0 True 434 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 478 512 0.0069860011628427 0.00675882886433295 0.00715648126955062 0.00677500572213321 0.00193114321491133 0.00168726107829742 305371 294555 667 665 0 True 479 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 523 511 0.00675487387915106 0.00670251963164951 0.00671396963454643 0.00671396963454643 0.00174336791002825 0.00158791941439057 295268 292101 667 665 0 True 523 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 566 510 0.00648677721107402 0.00636147475578394 0.00646982528419928 0.00642404821850919 0.00181368851256634 0.00172896913612837 283549 277238 667 665 0 True 568 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 611 511 0.00640423665484722 0.00621395558018415 0.0063935301747158 0.00613412680247196 0.001865890773911 0.00179684412077026 279941 270809 667 665 0 True 612 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 655 510 0.006189191968447 0.00630688646541967 0.00617990386816205 0.00628671702143893 0.00190299768050911 0.00196562918767959 270541 274859 667 665 0 True 657 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 258 555 0.00663202388277136 0.00662280558342526 0.00663767452506294 0.00659189745937285 0.00131810054348444 0.00136843554033747 289898 288627 667 665 0 True 256 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 302 555 0.00647428631758737 0.00664951460821888 0.00645456626230259 0.00669871061264973 0.00132337936269194 0.00137456292311758 283003 289791 667 665 0 True 300 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 347 556 0.00662486335225612 0.00670720059475767 0.00675974670023652 0.00665293354695964 0.00133953724940149 0.00137791969787032 289585 292305 667 665 0 True 345 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 391 555 0.00663753726249716 0.00659552291119192 0.00666819256885634 0.00668345159075303 0.00146807062643061 0.00138854016156289 290139 287438 667 665 0 True 390 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 435 554 0.0065783770966428 0.00676842024952516 0.00660715648126955 0.00671396963454643 0.00184237874612742 0.00203269874007148 287553 294973 667 665 0 True 434 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 479 553 0.00658661285059004 0.00676741063003125 0.00663767452506294 0.00686655985351339 0.00198272841354208 0.00199439194209388 287913 294929 667 665 0 True 479 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 523 552 0.00666498977565463 0.00672716352566011 0.00666819256885634 0.00672922865644312 0.00204177827687127 0.00186941519856254 291339 293175 667 665 0 True 523 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 568 552 0.00647993695987895 0.00655116849115235 0.00648508430609598 0.00656137941557946 0.00171782066109284 0.00174170188806993 283250 285505 667 665 0 True 568 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 612 553 0.00630758093143861 0.00655823582760977 0.00636301213092241 0.00651560234988937 0.001614778672463 0.00153054405715285 275716 285813 667 665 0 True 613 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 656 552 0.00621909233069435 0.00632992414659905 0.00619516289005875 0.0063935301747158 0.00175812446534939 0.00173976650707979 271848 275863 667 665 0 True 657 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 256 598 0.00658018438709233 0.00669832053239072 0.00656137941557946 0.00663767452506294 0.00133984148314775 0.00125365553654494 287632 291918 667 665 0 False 256 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 301 597 0.00662561829636795 0.00656534905586236 0.00666819256885634 0.00660715648126955 0.00136309014167109 0.0015024630575654 289618 286123 667 665 0 False 301 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 346 598 0.00639149411332329 0.00655589534605569 0.0063935301747158 0.00663767452506294 0.00135950321511746 0.00150822218597459 279384 285711 667 665 0 True 345 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 390 597 0.00624842076558425 0.00634353106386933 0.00628671702143893 0.00634775310902571 0.00140423387222521 0.00116851087463438 273130 276456 667 665 0 True 390 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 434 597 0.00625997369820469 0.00699930187106585 0.00627145799954223 0.00627145799954223 0.00178648453405408 0.00757862757508168 273635 305035 667 665 0 False 434 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 479 597 0.00623876663179054 0.00653001237357527 0.00619516289005875 0.00651560234988937 0.00184204430713237 0.00196026324684588 272708 284583 667 665 0 False 479 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 524 597 0.00663984784902124 0.00655435797091722 0.00662241550316625 0.00671396963454643 0.00190602096030338 0.00206627930405009 290240 285644 667 665 0 False 524 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 568 596 0.00663698821223401 0.00636560501734997 0.00657663843747616 0.0063782711528191 0.00170028288678034 0.00175399289121976 290115 277418 667 665 0 False 568 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 613 596 0.00637360422558233 0.00622919165618326 0.00634775310902571 0.00621042191195544 0.00149625434361643 0.00152062903680804 278602 271473 667 665 0 False 613 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 657 596 0.00623558671568313 0.00632393526732831 0.00624093995574884 0.00631723506523232 0.00159924767736041 0.00158733578538533 272569 275602 667 665 0 False 657 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 256 646 0.00885787364957942 0.682204550056763 0.00801098649576562 0.682413977264057 0.00346064068933809 0.210642788035735 387194 29731003 667 665 8 True 256 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 301 641 0.00697552345365427 0.00674776894169505 0.00697337300679027 0.00675974670023652 0.00161148958262727 0.00129372538119752 304913 294073 667 665 0 False 301 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 345 641 0.00617464213647353 0.00609128681167327 0.00621042191195544 0.00607309071488518 0.00125944372874573 0.00130874672271276 269905 265463 667 665 0 False 345 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 390 641 0.00607885574264825 0.00613766047070067 0.00607309071488518 0.00616464484626535 0.00126474044184477 0.00127394475990189 265718 267484 667 665 0 False 390 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 435 640 0.0059488909699419 0.00592802675032741 0.0059662775616083 0.005981536583505 0.00151261913036177 0.00158745847031869 260037 258348 667 665 0 False 435 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 479 640 0.00609832414989576 0.00626060458998262 0.00613412680247196 0.00621042191195544 0.00171677724572135 0.00177143190688513 266569 272842 667 665 0 False 479 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 524 640 0.00622218073842456 0.00629708856714916 0.00616464484626535 0.00628671702143893 0.00174951656751414 0.00174583952597398 271983 274432 667 665 0 False 524 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 568 640 0.0060129925881646 0.00615626959364536 0.00592050049591821 0.00613412680247196 0.0016120645785837 0.00141098693592721 262839 268295 667 665 0 False 568 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 613 640 0.00711084146642632 0.00662672933191298 0.00671396963454643 0.00657663843747616 0.00255092495815994 0.00135567478676274 310828 288798 667 665 0 False 613 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 653 645 0.0083536396141595 0.739580537519124 0.00793469138628214 0.72632944228275 0.00239628217835761 0.183161193115263 365153 32231493 667 665 12 True 658 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G4_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G4_3.csv new file mode 100755 index 0000000..b8866e0 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G4_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 255 250 0.0010251912267716 0.0685108743476912 0.000778210116731518 0.0662241550316625 0.000862301581590126 0.0194810593229012 44813 2985757 667 665 0 True 255 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 299 250 0.00101386706509414 0.000962327998985791 0.000915541313801785 0.000869764248111696 0.000741203153748604 0.000651049862009661 44318 41939 667 665 0 False 299 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 343 250 0.00104353865639851 0.00103279485048166 0.000930800335698482 0.000930800335698482 0.000725049530370111 0.000679340795052643 45615 45010 667 665 0 True 344 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 388 250 0.000941323799075514 0.000912558347115213 0.000823987182421607 0.000793469138628214 0.000651506208683926 0.000634452603614589 41147 39770 667 665 0 True 388 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 431 249 0.00094342849175092 0.000945761060926521 0.000701915007248035 0.000732433051041428 0.000838305256139262 0.000816815709474612 41239 41217 667 665 0 True 433 250 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 475 249 0.000910737123999227 0.00106505678249182 0.000717174029144732 0.000946059357595178 0.000809778720163262 0.000834698521621866 39810 46416 667 665 0 True 478 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 519 249 0.00102667823790096 0.00103054615251794 0.000869764248111696 0.000854505226215 0.000814849532099248 0.000854295685500544 44878 44912 667 665 0 True 522 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 564 247 0.00101983798670589 0.00102024344450047 0.00080872816052491 0.000869764248111696 0.000898897134789415 0.00076814836934124 44579 44463 667 665 0 True 567 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 611 249 0.00117004898786587 0.00110133424658006 0.000671396963454643 0.000701915007248035 0.00135356655542948 0.00112769477581853 51145 47997 667 665 0 False 611 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 650 249 0.00110187524685815 0.0704644651225225 0.00080872816052491 0.0678873884184024 0.000985846746036307 0.0181963392161627 48165 3070896 667 665 0 True 656 249 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 255 294 0.00102638083567509 0.000941493123974964 0.000854505226215 0.000778210116731518 0.000800637229328182 0.000770712181235732 44865 41031 667 665 0 False 255 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 299 294 0.000971109775851374 0.000970703251605783 0.000900282291905089 0.000854505226215 0.000656759680851109 0.00068295438277843 42449 42304 667 665 0 False 299 294 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 344 295 0.00108194929772468 0.00105039435393244 0.000991836423285267 0.000930800335698482 0.000699051780955604 0.000751916108500911 47294 45777 667 665 0 True 344 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 388 294 0.000926819721290648 0.000969234714160085 0.000762951094834821 0.000839246204318303 0.000707496364329259 0.000719774653407027 40513 42240 667 665 0 True 389 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 432 294 0.00100741572450213 0.000990643236610638 0.000747692072938125 0.000793469138628214 0.000905488008726462 0.000860350763524965 44036 43173 667 665 0 True 433 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 476 293 0.00101926605934844 0.00101583783216338 0.00080872816052491 0.000656137941557946 0.000903968557526124 0.00101940727289652 44554 44271 667 665 0 True 478 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 520 293 0.00103580619852582 0.00101817831371746 0.000839246204318303 0.000869764248111696 0.000893793734785555 0.000816804016462181 45277 44373 667 665 0 True 522 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 564 292 0.000966168323483028 0.00106241800426908 0.000717174029144732 0.000854505226215 0.000918512919005426 0.000907820692542972 42233 46301 667 665 0 True 567 293 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 612 292 0.00102763907586147 0.00105418042703463 0.000564583810177768 0.000671396963454643 0.00108806158943944 0.00108644663146675 44920 45942 667 665 0 False 612 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 656 292 0.00103306094721008 0.00101765055807291 0.000701915007248035 0.000579842832074464 0.000988034111579943 0.0010431143262485 45157 44350 667 665 0 False 656 292 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 255 338 0.000863610309745562 0.000935389515216285 0.000732433051041428 0.000717174029144732 0.000688568772674534 0.000773575382667958 37750 40765 667 665 0 True 255 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 299 339 0.000900694079602451 0.000885046215905981 0.000778210116731518 0.000732433051041428 0.00066532410012941 0.000695978088141972 39371 38571 667 665 0 True 300 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 343 338 0.000971269915511459 0.00100193261822444 0.000915541313801785 0.000869764248111696 0.00068001706373033 0.0007195856093199 42456 43665 667 665 0 True 344 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 387 338 0.000974792988033335 0.00106131660118481 0.000854505226215 0.000885023270008392 0.000670961866143876 0.000795821655407101 42610 46253 667 665 0 True 389 337 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 432 338 0.000876398605458086 0.00101338262112135 0.000625619897764553 0.000732433051041428 0.000778307655194491 0.000929940803761807 38309 44164 667 665 0 True 433 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 478 336 0.00104543745522524 0.00107412041203948 0.000823987182421607 0.000854505226215 0.000886623740451239 0.000911537403046392 45698 46811 667 665 0 False 478 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 520 336 0.00105243784608039 0.00114002102991514 0.000869764248111696 0.000900282291905089 0.000866337866925194 0.00096417791391991 46004 49683 667 665 0 True 523 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 564 335 0.000949490921739862 0.00101377270138037 0.000686655985351339 0.00080872816052491 0.000933971711380956 0.000879591301172465 41504 44181 667 665 0 True 567 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 608 337 0.000973351731092568 0.000955513067401853 0.000503547722590982 0.000518806744487678 0.00111634066065744 0.00112266493551758 42547 41642 667 665 0 True 612 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 652 337 0.00103365575166182 0.000988096241978258 0.000656137941557946 0.000656137941557946 0.00106953006281325 0.000978529982124479 45183 43062 667 665 0 True 656 336 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 255 381 0.00099485619973259 0.000965471586955487 0.000854505226215 0.00080872816052491 0.000777012156784957 0.000789005462119206 43487 42076 667 665 0 True 255 381 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 300 382 0.00099659485889923 0.0010316705014998 0.000885023270008392 0.000900282291905089 0.000745717866413878 0.000720267282324802 43563 44961 667 665 0 True 300 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 344 382 0.000971635949020226 0.000963727698738721 0.000839246204318303 0.000823987182421607 0.000735058271103859 0.00074026932320436 42472 42000 667 665 0 True 344 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 388 382 0.000960906591794512 0.000959895733841356 0.000778210116731518 0.000823987182421607 0.000763903449067741 0.000745134903298622 42003 41833 667 665 0 True 389 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 433 382 0.00107966158829489 0.000985801652219356 0.000823987182421607 0.000732433051041428 0.000958604551248203 0.000928950032755434 47194 42962 667 665 0 True 434 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 476 381 0.00109190083374426 0.00100018873000767 0.000793469138628214 0.000671396963454643 0.000975666634151325 0.000955156736723307 47729 43589 667 665 0 True 478 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 521 380 0.00105568639347069 0.00100252921156175 0.000854505226215 0.000686655985351339 0.000918414043351097 0.000965563186237047 46146 43691 667 665 0 True 523 380 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 564 380 0.000976142736596911 0.00106542391685325 0.000701915007248035 0.000854505226215 0.000976766201161219 0.000879193029793863 42669 46432 667 665 0 True 567 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 609 381 0.000984286982166962 0.000980432312183526 0.000503547722590982 0.000457770656900893 0.00112542917781968 0.00111989780918176 43025 42728 667 665 0 True 612 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 653 381 0.000881294303637835 0.000963108159503818 0.000473029678797589 0.000610360875867857 0.000970408476762356 0.000961226200150297 38523 41973 667 665 0 True 657 379 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 256 426 0.00100110164647592 0.000976210267027147 0.000885023270008392 0.00080872816052491 0.000798326014028926 0.000833447269573966 43760 42544 667 665 0 True 255 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 300 425 0.000997166786256677 0.000945302142974741 0.000900282291905089 0.000793469138628214 0.000754793344350186 0.000760551623672235 43588 41197 667 665 0 True 300 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 344 426 0.000933088045128271 0.000976210267027147 0.000778210116731518 0.000854505226215 0.000719786024628864 0.000706260680556419 40787 42544 667 665 0 True 345 424 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 388 426 0.000893716565841593 0.000921231896403862 0.000686655985351339 0.000747692072938125 0.000805588878626741 0.000757079017510093 39066 40148 667 665 0 True 389 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 432 426 0.000940957765566747 0.000956614470486126 0.000671396963454643 0.000671396963454643 0.000867411436459366 0.000874516925573999 41131 41690 667 665 0 True 434 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 476 425 0.00105067630981945 0.000988302755056559 0.000793469138628214 0.000793469138628214 0.000973578790700309 0.000835893439818591 45927 43071 667 665 0 True 478 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 521 424 0.00108341343175974 0.00106521740377494 0.000854505226215 0.000839246204318303 0.000978650760285472 0.000907076592145836 47358 46423 667 665 0 True 523 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 565 423 0.00106014742685878 0.00105275778138411 0.000839246204318303 0.000717174029144732 0.000993041734340951 0.000983782537396469 46341 45880 667 665 0 True 568 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 609 425 0.00104946382382167 0.000965953450804856 0.000671396963454643 0.000686655985351339 0.00107837736495085 0.000940596272549472 45874 42097 667 665 0 True 612 423 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 653 425 0.000905887180008073 0.000949638917619065 0.000442511635004196 0.000488288700694286 0.00101097689942924 0.00100134698090306 39598 41386 667 665 0 True 657 422 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 257 470 0.000972413770226354 0.00100893111698909 0.000839246204318303 0.000869764248111696 0.000779455101358031 0.000829636805604485 42506 43970 667 665 0 True 256 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 301 470 0.000967060530160646 0.0010063841223567 0.000839246204318303 0.000854505226215 0.000786006145450627 0.000815272124489717 42272 43859 667 665 0 True 300 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 345 470 0.000958046955007275 0.00101709985653078 0.000793469138628214 0.000885023270008392 0.000808189148028852 0.000851098784795604 41878 44326 667 665 0 True 345 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 389 470 0.000902547124240581 0.00088600994360472 0.000762951094834821 0.000701915007248035 0.000761392557896178 0.000791751239020317 39452 38613 667 665 0 True 389 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 434 469 0.000936130698669891 0.0010101472495613 0.00064087891966125 0.000579842832074464 0.00097603671015167 0.00110451704552959 40920 44023 667 665 0 True 434 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 478 469 0.00104658130994013 0.00100000516282696 0.000610360875867857 0.000579842832074464 0.00110816993885561 0.00107508370998924 45748 43581 667 665 0 True 478 467 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 522 468 0.00106113114191359 0.00103463052228878 0.000717174029144732 0.000762951094834821 0.00101386642087232 0.00093035515151066 46384 45090 667 665 0 True 523 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 566 468 0.000969050837364563 0.00095581136407051 0.000610360875867857 0.000503547722590982 0.00101406319147529 0.00105230509272974 42359 41655 667 665 0 True 568 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 610 469 0.000848374164943164 0.000940552342173814 0.000518806744487678 0.000610360875867857 0.000875150441445247 0.000915706773852317 37084 40990 667 665 0 True 612 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 655 469 0.000927894944722649 0.000938487211390803 0.000457770656900893 0.000595101853971161 0.00103108150542662 0.000941104174953504 40560 40900 667 665 0 True 657 466 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 258 513 0.000938464162288277 0.000956820983564427 0.000732433051041428 0.000793469138628214 0.000817032586751126 0.000791126131410802 41022 41699 667 665 0 True 256 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 302 514 0.000927711927968266 0.00102100065912091 0.000762951094834821 0.000885023270008392 0.000784660890048217 0.000849983526267763 40552 44496 667 665 0 True 300 511 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 346 515 0.000921123324810472 0.000912925481476637 0.000747692072938125 0.000839246204318303 0.000796155452492201 0.000756586537247053 40264 39786 667 665 0 True 345 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 390 514 0.000936222207047083 0.000916918067657126 0.000717174029144732 0.000732433051041428 0.000870838765386058 0.000766488171556246 40924 39960 667 665 0 True 389 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 434 513 0.000896690588100319 0.000875363047123416 0.000473029678797589 0.0004272526131075 0.000986878539883476 0.00098214998842057 39196 38149 667 665 0 True 434 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 478 512 0.000995153601958462 0.000957279901516208 0.000671396963454643 0.00064087891966125 0.000990996034121333 0.000878611474796195 43500 41719 667 665 0 True 479 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 523 511 0.00104024435481961 0.00100085416103775 0.000762951094834821 0.000701915007248035 0.000962533034444988 0.000912092694301155 45471 43618 667 665 0 True 523 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 566 510 0.000973626256224142 0.000956362065612647 0.000656137941557946 0.000732433051041428 0.000954824963993435 0.000875884734455101 42559 41679 667 665 0 True 568 510 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 611 511 0.000949879832342927 0.000930892119288838 0.000610360875867857 0.000610360875867857 0.000954370625341715 0.000925504133638974 41521 40569 667 665 0 True 612 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 655 510 0.000932836397090994 0.000896473272905312 0.000473029678797589 0.000442511635004196 0.00103022972910024 0.00101991854005169 40776 39069 667 665 0 True 657 509 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 258 555 0.000926453687781882 0.000994222796634525 0.000762951094834821 0.000839246204318303 0.000762203992560833 0.000752714111097079 40497 43329 667 665 0 True 256 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 302 555 0.00100906287529158 0.00101170757059736 0.000900282291905089 0.000854505226215 0.000734156554653884 0.000770365656033712 44108 44091 667 665 0 True 300 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 347 556 0.00100192522187064 0.000940322883197924 0.000869764248111696 0.000793469138628214 0.000783883238530555 0.000738482994563525 43796 40980 667 665 0 True 345 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 391 555 0.000974175306487292 0.00093644502650538 0.00080872816052491 0.000793469138628214 0.000777460524322656 0.000740141744400271 42583 40811 667 665 0 True 390 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 435 554 0.000946173743066668 0.00104523152697491 0.000564583810177768 0.000686655985351339 0.000994874768424386 0.00105346947530401 41359 45552 667 665 0 True 434 554 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 479 553 0.000887288102343884 0.000914118668151266 0.000457770656900893 0.000473029678797589 0.00102866092641663 0.00107050939494348 38785 39838 667 665 0 True 479 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 523 552 0.000973283099809674 0.000943856551426633 0.000564583810177768 0.000595101853971161 0.0010284512859246 0.00102773314214707 42544 41134 667 665 0 True 523 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 568 552 0.000986597568691049 0.000995255362026031 0.000732433051041428 0.000701915007248035 0.000929469771307374 0.000921113141386263 43126 43374 667 665 0 True 568 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 612 553 0.000926613827441967 0.00093855604908357 0.000671396963454643 0.000656137941557946 0.000821463616158781 0.000887095510073866 40504 40903 667 665 0 True 613 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 656 552 0.000876512990929575 0.000848470455149088 0.000549324788281071 0.000518806744487678 0.00093678865911532 0.000912151088007768 38314 36977 667 665 0 True 657 553 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 256 598 0.000956559943877912 0.000963980103612201 0.000823987182421607 0.000885023270008392 0.000717810930954952 0.000653738312833863 41813 42011 667 665 0 False 256 598 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 301 597 0.00101855686942521 0.000961570784365354 0.000854505226215 0.000823987182421607 0.000754300884699973 0.000792500587612449 44523 41906 667 665 0 False 301 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 346 598 0.000914740615501359 0.000975108863942874 0.000793469138628214 0.000869764248111696 0.000721989350776253 0.000821893863317941 39985 42496 667 665 0 True 345 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 390 597 0.000891772012826272 0.000859736890865296 0.000732433051041428 0.000701915007248035 0.000729368383623883 0.000670452343452477 38981 37468 667 665 0 True 390 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 434 597 0.000966648742463284 0.00103749875948741 0.000656137941557946 0.000518806744487678 0.000935453868961102 0.00127426444556687 42254 45215 667 665 0 False 434 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 479 597 0.000914603352935572 0.00105959565886563 0.000503547722590982 0.000671396963454643 0.00104063768613214 0.00105249847681083 39979 46178 667 665 0 False 479 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 524 597 0.00101128195343848 0.00103733813820429 0.000701915007248035 0.000686655985351339 0.0010596969101698 0.0011210296775109 44205 45208 667 665 0 False 524 597 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 568 596 0.000929450587134906 0.000928482800041991 0.000579842832074464 0.000610360875867857 0.000961997694682334 0.000939824482459544 40628 40464 667 665 0 False 568 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 613 596 0.000931303631773035 0.000974627000093504 0.000732433051041428 0.000762951094834821 0.000766074123499646 0.000809787985496023 40709 42475 667 665 0 False 613 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 657 596 0.00089124583965742 0.000876487396105278 0.000686655985351339 0.000610360875867857 0.000764662002718793 0.000820148806475871 38958 38198 667 665 0 False 657 596 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 256 646 0.00106463133734117 0.0686152093440284 0.000900282291905089 0.0683604180972 0.000794091394459517 0.0225604078480012 46537 2990304 667 665 0 True 256 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 301 641 0.00102681550046675 0.000982795739635195 0.000915541313801785 0.000885023270008392 0.000709365227928823 0.000685578100314283 44884 42831 667 665 0 False 301 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 345 641 0.000990555306004585 0.000880342306900233 0.000854505226215 0.000747692072938125 0.000719382478378035 0.000646235549056945 43299 38366 667 665 0 False 345 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 390 641 0.00098332614420645 0.000909621272223819 0.000885023270008392 0.000762951094834821 0.000697014768624548 0.000682615538587206 42983 39642 667 665 0 False 390 641 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 435 640 0.000889141146982014 0.000918960252542549 0.00064087891966125 0.000656137941557946 0.000835776359377879 0.000899359046326714 38866 40049 667 665 0 False 435 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 479 640 0.000941872849338663 0.000944017172709756 0.000656137941557946 0.000625619897764553 0.000899721006102973 0.000913474440604441 41171 41141 667 665 0 False 479 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 524 640 0.000949536675928458 0.000940529396276225 0.000595101853971161 0.000488288700694286 0.000948118520194024 0.000967626861868385 41506 40989 667 665 0 False 524 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 568 640 0.000955804999766082 0.00090305874551336 0.000747692072938125 0.000656137941557946 0.000838292503284086 0.000793571722985539 41780 39356 667 665 0 False 568 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 613 640 0.000986528937408156 0.00100181788873649 0.000823987182421607 0.000869764248111696 0.000737313751546915 0.000733366175674518 43123 43660 667 665 0 False 613 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 653 645 0.00105291826506065 0.0751858359563363 0.000900282291905089 0.0726176852063783 0.000782077723538793 0.0214803845803386 46025 3276657 667 665 0 True 658 640 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G5_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G5_1.csv new file mode 100755 index 0000000..dc580d6 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G5_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 266 279 0.0103494144436136 0.0386167065638461 0.0102845807583734 0.0396887159533074 0.00155100741834263 0.00910239345601716 452392 1682946 667 665 0 True 268 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 312 279 0.00979132772821646 0.0095746346869692 0.0098268101014725 0.00958266575112535 0.00139670191589777 0.00139980169295078 427997 417270 667 665 0 False 312 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 355 280 0.0101265000367749 0.0541647090947786 0.0101777676050965 0.054383154039826 0.00150488132198876 0.00825161807607513 442648 2360540 667 665 0 True 357 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 400 280 0.0101614104826735 0.0735031444484408 0.0101319905394064 0.0729381246662089 0.00157003341344661 0.0078573968293377 444174 3203324 667 665 0 True 402 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 443 279 0.0100074247609544 0.0623586202861239 0.00999465934233616 0.061875333791104 0.00179036227350259 0.0115101021397485 437443 2717637 667 665 0 True 446 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 487 280 0.00980416177811758 0.0541339845379069 0.0098115510795758 0.0563820859082933 0.00174342433556595 0.0142692041999692 428558 2359201 667 665 0 True 491 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 532 278 0.00997493928705137 0.0725305825791304 0.0100099183642329 0.0735942626077668 0.00165459394370921 0.0189325674428734 436023 3160939 667 665 0 True 535 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 577 278 0.00985922694409261 0.0598405604306027 0.00978103303578241 0.0588998245212482 0.00171058831214675 0.0139831480040314 430965 2607898 667 665 0 True 580 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 625 278 0.0103161511485045 0.00956444670843967 0.0101930266269932 0.00952162966353857 0.00226380403732493 0.0019379948771561 450938 416826 667 665 0 False 625 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 663 277 0.0100792359599555 0.0392375766608097 0.0100404364080262 0.0394293125810636 0.00190725882119364 0.00858714526088834 440582 1710004 667 665 0 True 669 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 268 322 0.00996759573978175 0.0100399086523817 0.00997940032043946 0.0100404364080262 0.00147083829167853 0.00149393459772654 435702 437547 667 665 0 False 268 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 313 322 0.00975376353937931 0.0100970439373784 0.00970473792629892 0.0101167315175097 0.00131259529481591 0.00132820148563624 426355 440037 667 665 0 False 313 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 355 324 0.0101922716828814 0.110401134445177 0.0100556954299229 0.105683985656519 0.00161974644155205 0.0395982777561555 445523 4811367 667 665 0 True 357 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 400 324 0.00998308353262142 0.0456554294869699 0.00993362325474937 0.0452735179674983 0.00153247391187862 0.00717182598305249 436379 1989699 667 665 0 True 402 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 444 323 0.00999754185621769 0.0681282515053943 0.0100556954299229 0.0644998855573358 0.0018897625862026 0.0157504145718075 437011 2969082 667 665 0 True 446 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 488 323 0.00982987563210841 0.0375348763302167 0.0097962920576791 0.0386358434424353 0.00177278859056755 0.00565166179525293 429682 1635799 667 665 0 True 491 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 533 322 0.00977110437685712 0.0363960255410786 0.00978103303578241 0.0378423743038071 0.00158596477906417 0.00610810426037703 427113 1586167 667 665 0 True 535 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 576 322 0.00971080035628787 0.0428988699719085 0.00971999694819562 0.0443427176317998 0.0019086204474939 0.00688132618904349 424477 1869566 667 665 0 True 580 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 625 321 0.00961496820827398 0.00947573786836053 0.00953688868543526 0.00952162966353857 0.00206818527653052 0.00199153766763388 420288 412960 667 665 0 False 625 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 669 321 0.00973498144496074 0.00962789211527331 0.00968947890440223 0.00964370183871214 0.00188796119706969 0.00200857601977531 425534 419591 667 665 0 False 669 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 268 368 0.010451812317691 0.0489036507496712 0.0103761348897536 0.0488441290913252 0.00179650687946806 0.00883251979974637 456868 2131259 667 665 0 True 268 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 312 368 0.0104025808107619 0.0552281367185416 0.0103608758678569 0.0581368734264134 0.00158830904580508 0.0125180867132343 454716 2406885 667 665 0 True 313 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 357 365 0.010434379971836 0.0272815937761547 0.0102845807583734 0.0305180437933928 0.00174319476929369 0.0122105739869458 456106 1188953 667 665 0 False 357 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 402 365 0.0103741903367382 0.0317420238625862 0.010406652933547 0.0330510414282445 0.00170301903694501 0.00580959191471672 453475 1383342 667 665 0 False 402 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 444 368 0.0106652784845847 0.0618214338776674 0.0106965743495842 0.0614175631342031 0.00178515668515271 0.0102079890037695 466199 2694226 667 665 0 True 446 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 491 365 0.0103238149750943 0.0290654537465201 0.0102998397802701 0.0301365682459754 0.00184510628598271 0.00628844871329345 451273 1266695 667 665 0 False 491 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 532 365 0.0100066698168426 0.0266857347075631 0.0100556954299229 0.0269626916914626 0.00174677245253627 0.00406437834044976 437410 1162985 667 665 0 True 536 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 576 365 0.00989784347926746 0.044472568466256 0.0097962920576791 0.0453192950331884 0.00197087925519033 0.00803864805576282 432653 1938149 667 665 0 True 580 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 620 365 0.00974861619316229 0.0509473959561297 0.00965896086060884 0.051468680857557 0.00205189275445846 0.0106672058277377 426130 2220327 667 665 0 True 625 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 665 365 0.0098202214983147 0.057265640640856 0.0097962920576791 0.0575875486381323 0.00193445960730379 0.0139130711650146 429260 2495681 667 665 0 True 669 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 268 412 0.0105567724263298 0.0440234484127462 0.0105592431525139 0.0458838788433661 0.00161676970199305 0.0099602668365607 461456 1918576 667 665 0 True 268 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 312 412 0.010430696759654 0.0330509266987565 0.010452429999237 0.0321507591363394 0.00147076116879755 0.00599885401768076 455945 1440385 667 665 0 True 313 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 356 411 0.0107384623092436 0.0751631195177231 0.0105592431525139 0.0740825513084611 0.00186457088697786 0.0140753453580011 469398 3275667 667 665 0 True 357 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 401 411 0.0104817813112212 0.0598929000230033 0.0104676890211337 0.0591744869153887 0.00159550408956438 0.012718747611305 458178 2610179 667 665 0 True 402 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 445 411 0.0108010540392427 0.0409228151633375 0.0107423514152743 0.0422064545662623 0.001669781960693 0.00661324644341863 472134 1783448 667 665 0 True 447 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 488 409 0.0109266264098438 0.0492940522512507 0.0109254596780346 0.0502021820401312 0.00178399014303623 0.0107277578545916 477623 2148273 667 665 0 True 491 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 532 409 0.0107331090691779 0.039951148184033 0.0107118333714809 0.0410009918364233 0.00178319632841655 0.00609076049948318 469164 1741102 667 665 0 True 536 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 577 409 0.0109246361026399 0.0511626973132075 0.0108644235904479 0.0505683985656519 0.00220146186425768 0.00794455691275271 477536 2229710 667 665 0 True 580 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 621 409 0.0104722873170876 0.0413216837011274 0.0104676890211337 0.0420386053253986 0.00193571505390472 0.00662453244776114 457763 1800831 667 665 0 True 625 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 665 409 0.0106023893523598 0.0830859937667469 0.0104829480430304 0.0801556420233463 0.00208297249871635 0.0125373339336938 463450 3620952 667 665 0 True 669 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 268 455 0.0103089677408949 0.045392285933419 0.0103303578240635 0.0462348363469902 0.00186299493175971 0.00734624049087086 450624 1978231 667 665 0 True 268 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 312 455 0.0107925437601639 0.0522481529986559 0.0105134660868238 0.0526131074998093 0.00192881899116769 0.00698702128281495 471762 2277015 667 665 0 True 313 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 356 455 0.0105840419227328 0.0333801773832613 0.0105287251087205 0.034027618829633 0.00162257165427537 0.00365976026121519 462648 1454734 667 665 0 True 357 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 401 455 0.0107267034827745 0.0519670198613953 0.0106965743495842 0.0515144579232471 0.00179443205228821 0.00999164040633784 468884 2264763 667 665 0 True 402 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 445 455 0.0108822219698116 0.0852923565494189 0.0107728694590677 0.0847333485923552 0.00227531519154897 0.00915585614000681 475682 3717107 667 665 0 True 447 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 489 453 0.010575142733051 0.0577432594991714 0.0106660563057908 0.0572365911345083 0.00185224790026202 0.0137211409078237 462259 2516496 667 665 0 True 491 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 533 452 0.0106035103299804 0.0471900281718258 0.010605020218204 0.0474860761425193 0.00172278470576234 0.00753364351455078 463499 2056578 667 665 0 True 536 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 577 452 0.0103959464534155 0.0316555178286756 0.0104829480430304 0.0322728313115129 0.00190143752069522 0.00464782565856687 454426 1379572 667 665 0 True 580 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 622 453 0.0104499135188643 0.0390976296314143 0.0104371709773404 0.0396124208438239 0.00190248224068876 0.00480689440765053 456785 1703905 667 665 0 True 625 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 665 452 0.0103494144436136 0.0706252929187239 0.0103761348897536 0.0699778744182498 0.00201693796740404 0.00861396976611254 452392 3077905 667 665 0 True 670 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 269 499 0.0100832623285519 0.0500162284860698 0.0101319905394064 0.0510872053101396 0.00163004734562768 0.0117510627794089 440758 2179746 667 665 0 True 268 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 314 499 0.0101281700646587 0.0543404976162081 0.0101777676050965 0.053833829251545 0.00165400196116958 0.00820933053991604 442721 2368201 667 665 0 True 313 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 358 498 0.0103655199179993 0.0691655437518034 0.0103456168459602 0.0661936369878691 0.00168017793875389 0.0168292328515214 453096 3014288 667 665 0 True 358 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 402 499 0.0108020606313918 0.0800068837692767 0.0108186465247578 0.0771953917753872 0.00179727570782352 0.0153340090121081 472178 3486762 667 665 0 True 402 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 446 498 0.0105094625953217 0.0910142603017041 0.0105287251087205 0.0880598153658351 0.00191233526569789 0.0246974714509789 459388 3966472 667 665 0 True 447 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 490 497 0.010227799810326 0.0426433444563572 0.0102235446707866 0.0429999237048905 0.00181288460923076 0.0066586279221161 447076 1858430 667 665 0 True 491 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 535 498 0.0103068401711252 0.0377281266797114 0.0102693217364767 0.0386053253986419 0.00185330005910022 0.00450607286350333 450531 1644221 667 665 0 True 536 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 579 497 0.0106329073961531 0.0983888423278384 0.0105745021744106 0.0981612878614481 0.0019726571348345 0.012832315650564 464784 4287862 667 665 0 True 580 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 622 496 0.0103167917071448 0.0611007950179867 0.0103456168459602 0.061875333791104 0.00187526122334323 0.0166358720800609 450966 2662820 667 665 0 True 625 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 666 496 0.0103629805605323 0.0724567197347913 0.0103150988021668 0.0713359273670558 0.00200768113650224 0.0122172082985759 452985 3157720 667 665 0 True 670 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 269 543 0.0100014538393426 0.0475919255680974 0.00996414129854276 0.0499580376897841 0.00158625519977547 0.00975341002471858 437182 2074093 667 665 0 True 268 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 314 542 0.0102388265697776 0.102475047770491 0.010101472495613 0.100526436255436 0.00177793487206154 0.0200854510560148 447558 4465942 667 665 0 True 313 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 358 543 0.0105798782915706 0.0549219466611138 0.0104676890211337 0.0568245975432975 0.00172122141423184 0.0118110582147591 462466 2393541 667 665 0 True 358 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 403 542 0.0107311873932569 0.0557747309450096 0.0105897611963073 0.0559395742732891 0.00197482209980913 0.00699328266668096 469080 2430706 667 665 0 True 402 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 447 541 0.0107684999340568 0.0565161128961107 0.010605020218204 0.0561074235141527 0.00219065477415519 0.00918658879109063 470711 2463016 667 665 0 True 447 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 490 539 0.0102756358145029 0.061113507045251 0.0101930266269932 0.0605935759517815 0.00201889321213303 0.0113083604194333 449167 2663374 667 665 0 True 491 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 534 538 0.010112682271819 0.0710457306002475 0.0101167315175097 0.0691233691920348 0.00197716243117004 0.016053366006862 442044 3096228 667 665 0 True 536 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 578 538 0.0102150115146135 0.0564166883218575 0.0102082856488899 0.0564431219958801 0.00180466658339687 0.0121211937374732 446517 2458683 667 665 0 True 581 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 623 538 0.0102794562892507 0.0462218260230572 0.0103456168459602 0.0457312886243992 0.00200173485970919 0.00616001699920746 449334 2014383 667 665 0 True 625 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 666 537 0.0101050184452292 0.0602607686531504 0.00999465934233616 0.0602273594262608 0.00194208298764115 0.0114351765756491 441709 2626211 667 665 0 True 670 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 270 583 0.00966930130723148 0.0438563104947078 0.00961318379491875 0.0440375371938659 0.00141321057084598 0.00718036895571924 422663 1911292 667 665 0 True 269 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 314 583 0.00985202065938878 0.0529783602976312 0.0098268101014725 0.0532997634851606 0.0016504924487617 0.0103292080985462 430650 2308838 667 665 0 True 313 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 358 582 0.0101671983875309 0.0445792898359426 0.0101777676050965 0.0450446326390478 0.00158303358815768 0.00698253974846823 444427 1942800 667 665 0 True 358 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 403 582 0.0104510802506735 0.0511997090460186 0.010452429999237 0.0497138933394369 0.00174963068302815 0.0093750702474919 456836 2231323 667 665 0 True 402 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 446 581 0.0106276456644646 0.0882505875583901 0.010605020218204 0.0838025482566567 0.0021027126637782 0.0182667740129237 464554 3846029 667 665 0 True 447 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 490 579 0.010167129756248 0.0614126756580166 0.0100709544518196 0.059662775616083 0.00210041992984416 0.0114097373073819 444424 2676412 667 665 0 True 491 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 535 579 0.00993840456745763 0.055496833179309 0.0098115510795758 0.0544747081712062 0.0020783437871349 0.00876370671127628 434426 2418595 667 665 0 True 536 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 579 578 0.00999559730320237 0.0377831279962323 0.00997940032043946 0.0383611810482948 0.00177243405575602 0.00771045167544694 436926 1646618 667 665 0 True 581 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 623 578 0.0101213526905579 0.0455410441874886 0.0102235446707866 0.0456702525368124 0.00172415729442351 0.00720109941473751 442423 1984714 667 665 0 True 625 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 667 578 0.0100122975820398 0.0511337166445526 0.0100251773861295 0.050415808346685 0.00173402001911322 0.00661457262660343 437656 2228447 667 665 0 True 670 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 269 626 0.00937732095270744 0.00927874733755882 0.00943007553215839 0.00930800335698482 0.00148789127907845 0.00142931192365349 409900 404375 667 665 0 False 269 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 313 626 0.00955038617107102 0.00960588699948544 0.00955214770733196 0.00956740672922866 0.00143763714205245 0.00132192384358399 417465 418632 667 665 0 False 313 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 359 624 0.0100868311552624 0.0702043504274534 0.0100099183642329 0.0683909361409934 0.00165108249697974 0.0119235049985276 440914 3059560 667 665 0 True 358 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 402 623 0.0102234302853151 0.0743485860451082 0.0100709544518196 0.0716868848706798 0.00161063632695357 0.0172529926238041 446885 3240169 667 665 0 True 402 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 447 626 0.00976991476795363 0.00968105775998706 0.00970473792629892 0.00967421988250553 0.00188787818475459 0.0018856194579931 427061 421908 667 665 0 False 447 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 492 625 0.00954995150627936 0.00951520481221364 0.00950637064164187 0.00961318379491875 0.00193988535344665 0.00197325542294003 417446 414680 667 665 0 False 492 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 536 625 0.00945908368772812 0.0094613966823674 0.00955214770733196 0.00943007553215839 0.00183567074001338 0.00190810050219768 413474 412335 667 665 0 False 536 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 581 625 0.00929448299425476 0.00944964838280182 0.00929274433508812 0.00941481651026169 0.00170057898627238 0.00160983122540026 406279 411823 667 665 0 False 581 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 625 625 0.00960984373915125 0.00950669188420812 0.00956740672922866 0.00949111161974517 0.00150797193208695 0.0014826884337741 420064 414309 667 665 0 False 625 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 670 625 0.00971247038417161 0.00959278489196211 0.00968947890440223 0.00953688868543526 0.00157327026490515 0.00143236755206473 424550 418061 667 665 0 False 670 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 270 676 0.0094168983258428 0.038855504520055 0.00943007553215839 0.0385748073548486 0.00128879482391242 0.00771382272822292 411630 1693353 667 665 0 True 269 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 313 669 0.00919931428197552 0.00919855142548521 0.00918593118181125 0.00923170824750134 0.0013247608435886 0.00133710971080208 402119 400880 667 665 0 False 313 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 358 669 0.00919528791337909 0.0091137433879962 0.00924696726939803 0.00918593118181125 0.00133324809119109 0.00134405312079 401943 397184 667 665 0 False 358 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 402 669 0.00960686971689253 0.00933136228073044 0.00952162966353857 0.00930800335698482 0.0017505867107991 0.00136936797777716 419934 406668 667 665 0 False 402 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 447 669 0.00932596187600867 0.00949737584978698 0.00932326237888151 0.00956740672922866 0.00155923080735976 0.00158578735771122 407655 413903 667 665 0 False 447 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 492 669 0.00906955540311785 0.00935722230731326 0.00904859998474098 0.00926222629129473 0.00163279285008964 0.00163414006531592 396447 407795 667 665 0 False 492 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 536 669 0.00945132835276113 0.00933131638893526 0.00946059357595178 0.00926222629129473 0.00179330947197931 0.00179515598168123 413135 406666 667 665 0 False 536 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 581 669 0.00929320187697408 0.0101042030574261 0.00927748531319142 0.00955214770733196 0.0013565682621121 0.00417207441801757 406223 440349 667 665 0 False 581 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 625 669 0.00932804369158977 0.00914524810538592 0.00929274433508812 0.00914015411612116 0.00144730459992135 0.00142259676677526 407746 398557 667 665 0 False 625 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 666 673 0.00942188553239974 0.0387558275409283 0.009399557488365 0.0392462043183032 0.00146568633203616 0.00786105068104223 411848 1689009 667 665 0 True 670 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G5_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G5_2.csv new file mode 100755 index 0000000..abdb985 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G5_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 266 279 0.0108347977533321 0.689242515765266 0.00874341954680705 0.714213778896773 0.00744533649727723 0.218410186887099 473609 30037723 667 665 8 True 268 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 312 279 0.00705600507139426 0.0065188836132446 0.00691233691920348 0.00650034332799268 0.00165832614298645 0.00127015593060731 308431 284098 667 665 0 False 312 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 355 280 0.00650201335587642 0.00640853679173902 0.00650034332799268 0.0063935301747158 0.001344430592842 0.00136340244780818 284215 279289 667 665 0 True 357 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 400 280 0.0065283677685076 0.00650495545340807 0.00651560234988937 0.00650034332799268 0.00143272788151232 0.0013979493146995 285367 283491 667 665 0 True 402 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 443 279 0.00690794451709828 0.00660986409718505 0.00694285496299687 0.00659189745937285 0.00165120710947332 0.00170585750881845 301959 288063 667 665 0 True 446 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 487 280 0.00692613180706511 0.00660628453716117 0.00695811398489357 0.00660715648126955 0.00174402244110091 0.00169284129109085 302754 287907 667 665 0 True 491 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 532 278 0.00710571699730359 0.0068226643514256 0.00704966811627375 0.0068055237659266 0.0014965533094042 0.0015497405540463 310604 297337 667 665 0 True 535 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 577 278 0.00733034718621463 0.00730012258845787 0.00729381246662089 0.00738536659800107 0.00173236216417608 0.00174718316012285 320423 318145 667 665 0 True 580 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 625 278 0.011317527320112 0.00807959472955678 0.00871290150301366 0.00813305867093919 0.0125508806495269 0.00190216071247592 494710 352115 667 665 0 False 625 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 663 277 0.00947550944143401 0.703040801821445 0.00933852140077821 0.702784771496147 0.00217408902583899 0.199838604054162 414192 30639063 667 665 10 True 669 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 268 322 0.00676949234240742 0.00676665341541081 0.00669871061264973 0.0068207827878233 0.00154159184351203 0.0013950066193396 295907 294896 667 665 0 False 268 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 313 322 0.00645898154150208 0.00646037157439261 0.00651560234988937 0.00648508430609598 0.00131931580091023 0.00122117409589865 282334 281548 667 665 0 False 313 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 355 324 0.00637927774496821 0.00669659959007154 0.0064087891966125 0.00675974670023652 0.00130752094946907 0.00137532530686502 278850 291843 667 665 0 True 357 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 400 324 0.00694864286785424 0.00685607357831521 0.00692759594110018 0.00686655985351339 0.00145995299415059 0.00132954075232492 303738 298793 667 665 0 True 402 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 444 323 0.00695738191787604 0.00694560847070755 0.00703440909437705 0.00686655985351339 0.00169732282591588 0.00170114509644659 304120 302695 667 665 0 True 446 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 488 323 0.0068610235966933 0.00718321324024183 0.00694285496299687 0.00717174029144732 0.00163759340566566 0.00165314798632215 299908 313050 667 665 0 True 491 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 533 322 0.00697225202916967 0.00729158671455475 0.00692759594110018 0.00729381246662089 0.00157324393610944 0.00161431236729861 304770 317773 667 665 0 True 535 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 576 322 0.0073307132197234 0.00756338087149666 0.00738536659800107 0.00762951094834821 0.00180053999046065 0.00178262229662533 320439 329618 667 665 0 True 580 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 625 321 0.0077035641025905 0.00743263514703444 0.00776684214541848 0.00755321583886473 0.00209874473213268 0.00197246642059494 336737 323920 667 665 0 False 625 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 669 321 0.00759897002746052 0.00749658536361503 0.00758373388265812 0.00747692072938125 0.00210160010526862 0.00193055577605784 332165 326707 667 665 0 False 669 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 268 368 0.00682554122343726 0.00668457593973489 0.00666819256885634 0.00665293354695964 0.00172192633436534 0.00170900854602166 298357 291319 667 665 0 True 268 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 312 368 0.00698961574374177 0.00725498800790027 0.00685130083161669 0.00683604180972 0.00171588449491677 0.0040397038786079 305529 316178 667 665 0 True 313 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 357 365 0.007150212945713 0.00686795955326632 0.00700389105058366 0.00691233691920348 0.0016853541398296 0.00139580010348113 312549 299311 667 665 0 False 357 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 402 365 0.00763060904887451 0.00728128400653729 0.00758373388265812 0.00727855344472419 0.00171590629534777 0.00144243489165263 333548 317324 667 665 0 False 402 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 444 368 0.00797628194371571 0.00735698252268345 0.00796520943007553 0.00747692072938125 0.00192809072908856 0.00171347803803527 348658 320623 667 665 0 True 446 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 491 365 0.00725862749559073 0.00740604085172877 0.0072632944228275 0.00738536659800107 0.0017182372470393 0.00181096213615737 317288 322761 667 665 0 False 491 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 532 365 0.00720401987150165 0.00745190970100922 0.0072480354009308 0.00750743877317464 0.00171846807577412 0.00163658479549429 314901 324760 667 665 0 True 536 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 576 365 0.00746033483601527 0.007554317241949 0.00752269779507134 0.00755321583886473 0.00182490195397748 0.00197904796371215 326105 329223 667 665 0 True 580 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 620 365 0.00710617453918955 0.00719422727108456 0.00717174029144732 0.00720225833524071 0.00196959547301267 0.00202005682781528 310624 313530 667 665 0 True 625 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 665 365 0.00673810496903071 0.00670226722677603 0.0068055237659266 0.00675974670023652 0.00184822750753148 0.00200547247318145 294535 292090 667 665 0 True 669 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 268 412 0.00670687773531408 0.00668611331487336 0.00672922865644312 0.00669871061264973 0.00150009034639785 0.00160295507380604 293170 291386 667 665 0 True 268 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 312 412 0.00674910885138799 0.00677018708363952 0.00685130083161669 0.00677500572213321 0.00138528711550563 0.00135373905996905 295016 295050 667 665 0 True 313 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 356 411 0.00733245187889004 0.00727215153929686 0.00721751735713741 0.00727855344472419 0.00189668512369615 0.00142533126527213 320515 316926 667 665 0 True 357 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 401 411 0.00743780089813184 0.00746969277164071 0.00752269779507134 0.00746166170748455 0.00159760713926574 0.00152724138880614 325120 325535 667 665 0 True 402 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 445 411 0.00794466579939602 0.00762983219091446 0.00794995040817884 0.0076752880140383 0.00181904276968279 0.00148681172515895 347276 332514 667 665 0 True 447 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 488 409 0.00817355112784647 0.00786941030764138 0.00814831769283589 0.00790417334248875 0.00182596578378086 0.00173739599162114 357281 342955 667 665 0 True 491 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 532 409 0.00798001091008627 0.00771390595968062 0.00798046845197223 0.00764476997024491 0.00184556143248319 0.00172512441516741 348821 336178 667 665 0 True 536 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 577 409 0.00767194795827081 0.00753882876107642 0.00761425192645151 0.00753795681696803 0.00217767175619954 0.00192573122085712 335355 328548 667 665 0 True 580 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 621 409 0.00724789813836501 0.0068525399100865 0.00715648126955062 0.00688181887541009 0.00216506722278425 0.00196258606608157 316819 298639 667 665 0 True 625 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 665 409 0.00670221080807731 0.00696479124109197 0.00665293354695964 0.00689707789730678 0.00213613592263312 0.00206235215592558 292966 303531 667 665 0 True 669 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 268 455 0.00680238960400779 0.00667229988452477 0.00689707789730678 0.00665293354695964 0.00154475030593551 0.00155697362815473 297345 290784 667 665 0 True 268 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 312 455 0.0067870619508282 0.00694783422277369 0.00679026474402991 0.00692759594110018 0.00157270590331638 0.00149322053734771 296675 302792 667 665 0 True 313 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 356 455 0.00700578984941038 0.00707392193002534 0.00691233691920348 0.00704966811627375 0.00152597570020027 0.00142491814331811 306236 308287 667 665 0 True 357 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 401 455 0.00742203858016059 0.0076479135582146 0.00746166170748455 0.0076752880140383 0.00177074479587702 0.00177968553972074 324431 333302 667 665 0 True 402 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 445 455 0.00753667569968735 0.00770429162859082 0.00756847486076143 0.00781261921110857 0.00179425002829055 0.00202234706658673 329442 335759 667 665 0 True 447 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 489 453 0.00737770277141127 0.00812493582319268 0.00740062561989776 0.00813305867093919 0.00183846759336009 0.00205234418625396 322493 354091 667 665 0 True 491 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 533 452 0.00711813925950735 0.00735120015649102 0.00711070420386053 0.00732433051041428 0.00173380267295596 0.0018485815913858 311147 320371 667 665 0 True 536 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 577 452 0.00690380376303036 0.00707786862441065 0.00685130083161669 0.00708018616006714 0.00192738772782552 0.00214031717282118 301778 308459 667 665 0 True 580 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 622 453 0.00658359307414272 0.00689824813808382 0.00659189745937285 0.00698863202868696 0.00178815690381774 0.00177455610195178 287781 300631 667 665 0 True 625 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 665 452 0.00647664265830006 0.00747820569964623 0.00643930724040589 0.00709544518196384 0.00194758189722411 0.0038136162368582 283106 325906 667 665 0 True 670 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 269 499 0.00678305845932607 0.00652466597943703 0.00672922865644312 0.00654612039368277 0.00146552989225332 0.00156030969466463 296500 284350 667 665 0 True 268 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 314 499 0.0065848741914234 0.00665945018187492 0.00656137941557946 0.00662241550316625 0.00155281062865094 0.00152879667519996 287837 290224 667 665 0 True 313 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 358 498 0.00694495965567228 0.00665981731623634 0.00689707789730678 0.00672922865644312 0.00144935713364847 0.00154930544025322 303577 290240 667 665 0 True 358 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 402 499 0.00690284292506985 0.00677121964903102 0.00694285496299687 0.00679026474402991 0.00160972467761501 0.00166610767246743 301736 295095 667 665 0 True 402 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 446 498 0.00720859529036123 0.00720303849575874 0.00730907148851759 0.00718699931334401 0.00183055427771151 0.00188681728682387 315101 313914 667 665 0 True 447 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 490 497 0.00681350787183657 0.00686171826912211 0.00685130083161669 0.00685130083161669 0.00176249324872937 0.00179023458216869 297831 299039 667 665 0 True 491 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 535 498 0.00651271983600784 0.00642391054312366 0.00656137941557946 0.00643930724040589 0.00166215731127321 0.00153680042706758 284683 279959 667 665 0 True 536 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 579 497 0.00658976988960315 0.0064012629422033 0.00660715648126955 0.0064087891966125 0.00184980522904892 0.00180396691187911 288051 278972 667 665 0 True 580 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 622 496 0.00634960615366384 0.00615028071437463 0.00634775310902571 0.00619516289005875 0.00177852616998715 0.0018380918722812 277553 268034 667 665 0 True 625 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 666 496 0.00641659028576808 0.00624952172144713 0.00643930724040589 0.00619516289005875 0.00180004053151707 0.00188804788446005 280481 272359 667 665 0 True 670 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 269 543 0.00656815103549164 0.00645486455897124 0.00654612039368277 0.00648508430609598 0.00144280912266498 0.00141290580187014 287106 281308 667 665 0 True 268 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 314 542 0.00653555117611714 0.00667264407298861 0.00659189745937285 0.00665293354695964 0.00129981977470048 0.00159789631701934 285681 290799 667 665 0 True 313 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 358 543 0.00682318488272458 0.00677785101343425 0.00674448767833982 0.00686655985351339 0.00153609153926731 0.00143682978987139 298254 295384 667 665 0 True 358 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 403 542 0.00668102661875746 0.00684861616159878 0.00659189745937285 0.00686655985351339 0.00164154173034744 0.0015605352037621 292040 298468 667 665 0 True 402 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 447 541 0.00669774977468922 0.00663407201914147 0.00679026474402991 0.00668345159075303 0.00187290470369966 0.00207643785879563 292771 289118 667 665 0 True 447 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 490 539 0.00633889967353243 0.00664685288409855 0.00633249408712902 0.00663767452506294 0.00189960413253613 0.00187700635461576 277085 289675 667 665 0 True 491 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 534 538 0.00631018892018857 0.00662351690625052 0.00625619897764553 0.00659189745937285 0.00182649629624572 0.0018033674929909 275830 288658 667 665 0 True 536 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 578 538 0.00643681363712742 0.00661270938848609 0.00651560234988937 0.00659189745937285 0.00176771106106943 0.00161820296558197 281365 288187 667 665 0 True 581 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 623 538 0.0064957450320388 0.00623667201879728 0.00653086137178607 0.00628671702143893 0.00170084593127272 0.00172403684976992 283941 271799 667 665 0 True 625 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 666 537 0.00642960735242358 0.00642875212751494 0.00643930724040589 0.00642404821850919 0.00177462889288851 0.001993117118533 281050 280170 667 665 0 True 670 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 270 583 0.00649279388687437 0.00664802312487559 0.00650034332799268 0.00662241550316625 0.00143455864980224 0.00122189818518766 283812 289726 667 665 0 True 269 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 314 583 0.00648318550726925 0.00676564379591689 0.00648508430609598 0.00675974670023652 0.00138867955043337 0.00140070510605324 283392 294852 667 665 0 True 313 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 358 582 0.00656103625916499 0.00654336688597208 0.00654612039368277 0.00648508430609598 0.00152821361780454 0.0013819451705417 286795 285165 667 665 0 True 358 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 403 582 0.00638870310781894 0.00666004677521223 0.0063782711528191 0.00660715648126955 0.00151702133801854 0.00141576025792145 279262 290250 667 665 0 True 402 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 446 581 0.00648517581447317 0.00655704264093514 0.00654612039368277 0.00651560234988937 0.00186783436629798 0.00191753794675807 283479 285761 667 665 0 True 447 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 490 579 0.00653914287992191 0.00657214104154871 0.00657663843747616 0.00669871061264973 0.00200883082441405 0.00203740665368784 285838 286419 667 665 0 True 491 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 535 579 0.00633821336070349 0.00656856148152482 0.00636301213092241 0.00662241550316625 0.00177485192760653 0.00184168598113939 277055 286263 667 665 0 True 536 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 579 578 0.00665130927326449 0.00670736121604079 0.00666819256885634 0.00677500572213321 0.00169185759540451 0.00170933261444594 290741 292312 667 665 0 True 581 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 623 578 0.00641036771611905 0.00655483983476659 0.0063935301747158 0.00662241550316625 0.00157748274983441 0.00148610050547713 280209 285665 667 665 0 True 625 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 667 578 0.00639083067758865 0.00627168745851812 0.00645456626230259 0.00630197604333562 0.00162903376603519 0.00164689064872706 279355 273325 667 665 0 True 670 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 269 626 0.00668688315489772 0.00673976082343648 0.00669871061264973 0.00674448767833982 0.00149347108186925 0.00144814374428844 292296 293724 667 665 0 False 269 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 313 626 0.00641739098406851 0.00643586535576754 0.00643930724040589 0.00646982528419928 0.00134480586935867 0.00126745543352551 280516 280480 667 665 0 False 313 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 359 624 0.00628420054106616 0.0061894034697639 0.00630197604333562 0.00610360875867857 0.00140656313848847 0.0012770540764729 274694 269739 667 665 0 True 358 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 402 623 0.00638248053816992 0.00627905309164419 0.0063782711528191 0.00630197604333562 0.0013157209132209 0.00132644535152003 278990 273646 667 665 0 True 402 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 447 626 0.00641071087253352 0.00635213577546521 0.00650034332799268 0.00631723506523232 0.00177413734728625 0.00183932233070799 280224 276831 667 665 0 False 447 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 492 625 0.00625299618444383 0.00626152242588618 0.00610360875867857 0.00627145799954223 0.00190842006347741 0.00190135807067657 273330 272882 667 665 0 False 492 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 536 625 0.00648238480896883 0.00626785549362075 0.00650034332799268 0.00631723506523232 0.0018340941248822 0.00189489238950909 283357 273158 667 665 0 False 536 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 581 625 0.00647156394336592 0.00638311273721039 0.00657663843747616 0.00642404821850919 0.00150785332276587 0.0015580195564269 282884 278181 667 665 0 False 581 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 625 625 0.00647341698800405 0.006230155383882 0.0063782711528191 0.00624093995574884 0.00144552041272115 0.00125277592265254 282965 271515 667 665 0 False 625 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 670 625 0.00646584466979145 0.00653021888665358 0.00642404821850919 0.00656137941557946 0.00148976269329624 0.00138269320533546 282634 284592 667 665 0 False 670 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 270 676 0.00890554951409624 0.715806912566378 0.00842298008697642 0.700190737773709 0.00302384796346906 0.17999080272891 389278 31195420 667 665 10 True 269 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 313 669 0.00688481577476311 0.00662594917139496 0.00674448767833982 0.00659189745937285 0.00175036390517046 0.00128342011186386 300948 288764 667 665 0 False 313 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 358 669 0.00608667970889813 0.00607315955257794 0.00610360875867857 0.00611886778057527 0.00131440398982329 0.00123665112004938 266060 264673 667 665 0 False 358 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 402 669 0.00618486819762469 0.00605794642247642 0.00625619897764553 0.00610360875867857 0.00149328993911225 0.00125303402033438 270352 264010 667 665 0 False 402 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 447 669 0.00623501478832568 0.00629529878713722 0.00627145799954223 0.00631723506523232 0.00156390038654522 0.00156532025315425 272544 274354 667 665 0 False 447 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 492 669 0.00626104892163669 0.00610468721586525 0.00628671702143893 0.00614938582436866 0.00170242618237576 0.00157236132211105 273682 266047 667 665 0 False 492 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 536 669 0.00623952157590237 0.00612279152906299 0.00619516289005875 0.00611886778057527 0.00166874887496822 0.00169852159739342 272741 266836 667 665 0 False 536 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 581 669 0.00626175811155992 0.00661576119286543 0.00631723506523232 0.00636301213092241 0.00146074606179411 0.00211949440372246 273713 288320 667 665 0 False 581 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 625 669 0.00717048205126093 0.00669031241413215 0.0068207827878233 0.00672922865644312 0.00277767404443158 0.00136319412819779 313435 291569 667 665 0 False 625 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 666 673 0.00838241899878625 0.733315114290648 0.00819409475852598 0.735896849011978 0.00213518038294838 0.18381735213695 366411 31958441 667 665 11 True 670 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G5_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G5_3.csv new file mode 100755 index 0000000..da36fdc --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G5_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 266 279 0.00129159498987059 0.0695183369272345 0.00108339055466545 0.0702067597467002 0.00105521824621324 0.0234369689117358 56458 3029663 667 665 0 True 268 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 312 279 0.000962828267715536 0.000870682084015257 0.000839246204318303 0.000793469138628214 0.000684226835896405 0.000622213679159755 42087 37945 667 665 0 False 312 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 355 280 0.000857616511039514 0.000870475570936955 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.000619197322136541 0.000684437499037262 37488 37936 667 665 0 True 357 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 400 280 0.000872097711730081 0.000879653929972562 0.000686655985351339 0.000717174029144732 0.000713001032236635 0.000671179375051464 38121 38336 667 665 0 True 402 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 443 279 0.000964749943636559 0.000914852936874115 0.000717174029144732 0.00064087891966125 0.000917733416289126 0.000868010066055178 42171 39870 667 665 0 True 446 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 487 280 0.000956514189689316 0.00103316198484309 0.000717174029144732 0.000762951094834821 0.000889617899395447 0.000932340274683959 41811 45026 667 665 0 True 491 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 532 278 0.000996549104710634 0.000932613061608014 0.00080872816052491 0.000762951094834821 0.00082088624138059 0.000818654042025464 43561 40644 667 665 0 True 535 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 577 278 0.000985728239107729 0.00104679184801096 0.000671396963454643 0.000717174029144732 0.000946944161920706 0.000993830781611484 43088 45620 667 665 0 True 580 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 625 278 0.00139680674654662 0.00104874224930603 0.000869764248111696 0.000671396963454643 0.00172469120117631 0.00100965019923279 61057 45705 667 665 0 False 625 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 663 277 0.00121880007581469 0.0713098837732922 0.000961318379491875 0.0696116578927291 0.0010429940617675 0.0226771968883349 53276 3107740 667 665 0 True 669 278 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 268 322 0.000904972096236157 0.000953815070980266 0.000732433051041428 0.000823987182421607 0.000748082047640139 0.000726680729528787 39558 41568 667 665 0 False 268 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 313 322 0.000895958521082787 0.000932429494427302 0.000747692072938125 0.00080872816052491 0.000683557139675749 0.000692702484660344 39164 40636 667 665 0 False 313 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 355 324 0.000918217933834639 0.000932337710836946 0.000778210116731518 0.00080872816052491 0.000671985914260659 0.000700186511879164 40137 40632 667 665 0 True 357 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 400 324 0.00096941687087333 0.000950097835570845 0.000823987182421607 0.000762951094834821 0.000757469293878671 0.000742018461676289 42375 41406 667 665 0 True 402 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 444 323 0.000908792570983906 0.000899341510103939 0.000625619897764553 0.00064087891966125 0.000869047042014758 0.000869449685936487 39725 39194 667 665 0 True 446 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 488 323 0.000998791059951828 0.00094135544858943 0.00080872816052491 0.00080872816052491 0.000861356300381095 0.000824562287325224 43659 41025 667 665 0 True 491 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 533 322 0.000955370334974422 0.000916436203807757 0.00080872816052491 0.000732433051041428 0.000800689350203405 0.000826145670324782 41761 39939 667 665 0 True 535 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 576 322 0.000953791815467867 0.000978619586273994 0.000717174029144732 0.000701915007248035 0.000933593099489935 0.000964116999425608 41692 42649 667 665 0 True 580 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 625 321 0.00101672670188138 0.00108355117594857 0.000610360875867857 0.000701915007248035 0.00107672931845135 0.00111824164875564 44443 47222 667 665 0 False 625 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 669 321 0.000992293965171225 0.0011217102036391 0.000625619897764553 0.000717174029144732 0.000989492870326557 0.00112041052678478 43375 48885 667 665 0 False 669 321 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 268 368 0.000929015922343246 0.000920750032554492 0.000762951094834821 0.000717174029144732 0.000769532105355101 0.000807698947704608 40609 40127 667 665 0 True 268 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 312 368 0.000942101620281642 0.000858773163166557 0.000762951094834821 0.000671396963454643 0.000745802354718701 0.000791662292994618 41181 37426 667 665 0 True 313 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 357 365 0.00098257120009462 0.00100174905104372 0.000869764248111696 0.000869764248111696 0.000732677291325692 0.00077438276914854 42950 43657 667 665 0 False 357 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 402 365 0.00103434206449076 0.00101592961575374 0.000869764248111696 0.000869764248111696 0.000787726076741919 0.000766892679892782 45213 44275 667 665 0 False 402 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 444 368 0.00104388181281298 0.000909185300169628 0.000762951094834821 0.000579842832074464 0.000915041206376126 0.000909115638926099 45630 39623 667 665 0 True 446 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 491 365 0.0010154227075064 0.000927220775674595 0.000717174029144732 0.000564583810177768 0.00095022991255614 0.000939071954375004 44386 40409 667 665 0 False 491 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 532 365 0.00104850298586116 0.00101895847423549 0.00080872816052491 0.000732433051041428 0.00096195424426048 0.000979208880718568 45832 44407 667 665 0 True 536 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 576 365 0.00104646692446864 0.000962144431805079 0.000701915007248035 0.000503547722590982 0.00104155473474246 0.0010410288400901 45743 41931 667 665 0 True 580 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 620 365 0.00102230871289006 0.00106115597990169 0.000656137941557946 0.000701915007248035 0.00108549561786592 0.00109598254831594 44687 46246 667 665 0 True 625 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 665 365 0.000974175306487292 0.000998674300766794 0.000610360875867857 0.000518806744487678 0.00102750140071943 0.00108450616247959 42583 43523 667 665 0 True 669 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 268 412 0.000914260196521103 0.000874055130960842 0.000732433051041428 0.000671396963454643 0.000763795546851675 0.000781945699822806 39964 38092 667 665 0 True 268 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 312 412 0.000939219106400107 0.000835987886860663 0.000823987182421607 0.000747692072938125 0.000725893648408541 0.00065377524374869 41055 36433 667 665 0 True 313 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 356 411 0.000923273771674474 0.000975338322918764 0.00080872816052491 0.000885023270008392 0.000721522998568752 0.000679604610581581 40358 42506 667 665 0 True 357 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 401 411 0.000940248575643513 0.000993672095092389 0.000762951094834821 0.000793469138628214 0.000757410107524316 0.000808860494695037 41100 43305 667 665 0 True 402 409 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 445 411 0.00103454795833944 0.000979537422177554 0.000823987182421607 0.000717174029144732 0.000877372339763026 0.000880696486197879 45222 42689 667 665 0 True 447 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 488 409 0.00105719628169436 0.000920727086656903 0.000823987182421607 0.000610360875867857 0.000914228646950167 0.000858739153197829 46212 40126 667 665 0 True 491 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 532 409 0.00103216874053246 0.000926968370801116 0.000793469138628214 0.000671396963454643 0.000894141937807999 0.000904193279318504 45118 40398 667 665 0 True 536 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 577 409 0.00101151072438146 0.00097474172958145 0.000778210116731518 0.00064087891966125 0.000934843454535734 0.0010232184048163 44215 42480 667 665 0 True 580 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 621 409 0.00109965616871125 0.0010437859354268 0.000839246204318303 0.000656137941557946 0.00103069552295002 0.00107124831365557 48068 45489 667 665 0 True 625 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 665 409 0.00111532697830531 0.00109346380370702 0.00080872816052491 0.000671396963454643 0.00101744137007053 0.0010923650125555 48753 47654 667 665 0 True 669 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 268 455 0.000996388965050549 0.000946633005034904 0.000823987182421607 0.000778210116731518 0.00086196848324669 0.000786161653074438 43554 41255 667 665 0 True 268 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 312 455 0.000929999637398055 0.000929882499794921 0.00080872816052491 0.000762951094834821 0.000790081632893105 0.000788675201470431 40652 40525 667 665 0 True 313 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 356 455 0.00110285896191296 0.000990574398917871 0.000991836423285267 0.000854505226215 0.00081689424978564 0.000778992909511089 48208 43170 667 665 0 True 357 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 401 455 0.000928489749174394 0.00100335526387495 0.000732433051041428 0.00080872816052491 0.000844873964869673 0.000853330704936634 40586 43727 667 665 0 True 402 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 445 455 0.000998287763877274 0.000977518183189721 0.000732433051041428 0.000671396963454643 0.000982019990345657 0.00105168055702617 43637 42601 667 665 0 True 447 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 489 453 0.000960632066662938 0.000978390127298103 0.00064087891966125 0.000564583810177768 0.000978100873227405 0.00104797073359452 41991 42639 667 665 0 True 491 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 533 452 0.000984492876015643 0.00100601698799528 0.000686655985351339 0.000717174029144732 0.000933673449088964 0.000966467177317318 43034 43843 667 665 0 True 536 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 577 452 0.000964269524656303 0.00100883933339873 0.000625619897764553 0.000579842832074464 0.000927705856085949 0.00114124901414617 42150 43966 667 665 0 True 580 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 622 453 0.000978041535423636 0.000973525597009232 0.000610360875867857 0.000625619897764553 0.000979958405839963 0.000987940926403415 42752 42427 667 665 0 True 625 452 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 665 452 0.000975021758976314 0.00115245770640839 0.000610360875867857 0.000701915007248035 0.00101246471345736 0.00120096606583546 42620 50225 667 665 0 True 670 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 269 499 0.000880859638846176 0.000893880386477753 0.000701915007248035 0.000701915007248035 0.000781999684974211 0.000778460444527077 38504 38956 667 665 0 True 268 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 314 499 0.000869558354263015 0.000859530377786994 0.000778210116731518 0.000732433051041428 0.000781566680756802 0.000737651118473304 38010 37459 667 665 0 True 313 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 358 498 0.00104756502499494 0.000932039414168289 0.000854505226215 0.000839246204318303 0.000898302274265894 0.000766767003890319 45791 40619 667 665 0 True 358 496 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 402 499 0.00100229125537941 0.000986145840683191 0.000778210116731518 0.000732433051041428 0.000851393152715572 0.000889191883260728 43812 42977 667 665 0 True 402 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 446 498 0.00100640913235303 0.000951222184552707 0.00064087891966125 0.000503547722590982 0.00100555086286845 0.00105553881882464 43992 41455 667 665 0 True 447 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 490 497 0.00101947195319713 0.000981327202189498 0.000656137941557946 0.000625619897764553 0.00103304621861727 0.000982898716485104 44563 42767 667 665 0 True 491 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 535 498 0.000931235000490142 0.000965288019774775 0.000625619897764553 0.000686655985351339 0.000913512242239759 0.000913855531757187 40706 42068 667 665 0 True 536 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 579 497 0.000968776312232989 0.00098476908682785 0.000595101853971161 0.000610360875867857 0.000948321607955146 0.00103466908940511 42347 42917 667 665 0 True 580 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 622 496 0.0009740837981101 0.00096655004414217 0.000579842832074464 0.000610360875867857 0.000990572835761785 0.000992445684241204 42579 42123 667 665 0 True 625 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 666 496 0.00101439323826299 0.000984929708110973 0.000656137941557946 0.000518806744487678 0.00101140073010202 0.00107003774353979 44341 42924 667 665 0 True 670 495 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 269 543 0.000968844943515882 0.000901223073706239 0.000823987182421607 0.000732433051041428 0.000772628209700379 0.000736912559297177 42350 39276 667 665 0 True 268 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 314 542 0.000828722740941271 0.000904160148597633 0.00064087891966125 0.000778210116731518 0.00076405908783543 0.000750982731096105 36225 39404 667 665 0 True 313 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 358 543 0.000899092683001598 0.000955283608425963 0.000793469138628214 0.000793469138628214 0.000711517371495039 0.000781512266112516 39301 41632 667 665 0 True 358 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 403 542 0.000942055866093046 0.00100750847133857 0.000732433051041428 0.000793469138628214 0.000874802700024654 0.000896247707362586 41179 43908 667 665 0 True 402 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 447 541 0.000869032181094163 0.00091310904865735 0.000457770656900893 0.000442511635004196 0.000945926968322598 0.00108107767694697 37987 39794 667 665 0 True 447 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 490 539 0.000940500223680789 0.000984516681954371 0.000534065766384375 0.000549324788281071 0.00103233470806834 0.00110214644398981 41111 42906 667 665 0 True 491 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 534 538 0.000962324971640982 0.000941080097818361 0.000579842832074464 0.000564583810177768 0.000989555611337514 0.000992472560119106 42065 41013 667 665 0 True 536 539 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 578 538 0.000923594050994645 0.000995691334080222 0.000595101853971161 0.000701915007248035 0.000901177395383147 0.0009103922227593 40372 43393 667 665 0 True 581 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 623 538 0.000978704971158275 0.000984333114773659 0.000671396963454643 0.00064087891966125 0.000972434298899886 0.000978816041038648 42781 42898 667 665 0 True 625 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 666 537 0.000924440503483667 0.000962718079244805 0.000625619897764553 0.000534065766384375 0.000922233594744723 0.00103459329471182 40409 41956 667 665 0 True 670 538 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 270 583 0.000942421899601813 0.000885229783086694 0.000839246204318303 0.000793469138628214 0.000728040128479275 0.000647604171343794 41195 38579 667 665 0 True 269 583 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 314 583 0.000885343549328563 0.000960308759997958 0.000732433051041428 0.000823987182421607 0.000720781170792865 0.000791625387163516 38700 41851 667 665 0 True 313 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 358 582 0.000883787906916306 0.00100236859027863 0.000732433051041428 0.000885023270008392 0.000726993273515392 0.000742728929984145 38632 43684 667 665 0 True 358 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 403 582 0.000925286955972689 0.000950281402751557 0.000732433051041428 0.000793469138628214 0.000801298891078249 0.000756695428490037 40446 41414 667 665 0 True 402 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 446 581 0.000910691369810631 0.000944430198866358 0.000579842832074464 0.000488288700694286 0.000949308711549359 0.00105369963825055 39808 41159 667 665 0 True 447 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 490 579 0.00098126720571964 0.000990666182508227 0.000518806744487678 0.000534065766384375 0.00107693820398182 0.00109385826967489 42893 43174 667 665 0 True 491 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 535 579 0.00100405279164034 0.000909667164018997 0.000625619897764553 0.00064087891966125 0.0010507164546744 0.000914061532013737 43889 39644 667 665 0 True 536 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 579 578 0.000998905445423317 0.000970336117244358 0.000717174029144732 0.000625619897764553 0.000911631630209723 0.000946997591609331 43664 42288 667 665 0 True 581 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 623 578 0.000951618491509567 0.000990918587381707 0.000701915007248035 0.000747692072938125 0.000842956874650865 0.000852593167575867 41597 43185 667 665 0 True 625 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 667 578 0.00102205706485279 0.000968798742105894 0.000732433051041428 0.000671396963454643 0.000906226560911585 0.000877876475092234 44676 42221 667 665 0 True 670 582 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 269 626 0.000895249331159552 0.000993786824580334 0.000717174029144732 0.000839246204318303 0.000728350368415491 0.000768391931547547 39133 43310 667 665 0 False 269 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 313 626 0.000904811956576072 0.000883279381791627 0.000762951094834821 0.000762951094834821 0.000721327149652639 0.000673044260940583 39551 38494 667 665 0 False 313 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 359 624 0.000922473073374048 0.000990666182508227 0.000793469138628214 0.000854505226215 0.000723954086675809 0.000716455533118486 40323 43174 667 665 0 True 358 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 402 623 0.000881157041072048 0.0010070266074892 0.000717174029144732 0.000915541313801785 0.000718015893954805 0.000743428836838869 38517 43887 667 665 0 True 402 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 447 626 0.000977835641574955 0.000880755333056835 0.000671396963454643 0.000488288700694286 0.000954033191715148 0.000931366847213722 42743 38384 667 665 0 False 447 626 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 492 625 0.000860521902015346 0.000929836607999743 0.000442511635004196 0.000518806744487678 0.000922062709498711 0.000999735135222416 37615 40523 667 665 0 False 492 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 536 625 0.000965550641936985 0.00101964685116316 0.000595101853971161 0.00064087891966125 0.00100051614629509 0.00103834194464008 42206 44437 667 665 0 False 536 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 581 625 0.000984218350884068 0.00097845896499087 0.000762951094834821 0.000732433051041428 0.000826131608442219 0.000865872630824798 43022 42642 667 665 0 False 581 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 625 625 0.00102574027703475 0.00103089034098177 0.000839246204318303 0.000854505226215 0.00077403577447142 0.0007787783609818 44837 44927 667 665 0 False 625 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 670 625 0.000965436256465496 0.000964484913359159 0.000793469138628214 0.000747692072938125 0.000775571733570713 0.000799404787321443 42201 42033 667 665 0 False 670 625 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 270 676 0.00108364220270272 0.0728762166345137 0.000961318379491875 0.0700083924620432 0.000814417026807606 0.0210308484790707 47368 3176002 667 665 0 True 269 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 313 669 0.000981038434776661 0.000939565668577486 0.000869764248111696 0.000839246204318303 0.000715089913262164 0.000682250406584574 42883 40947 667 665 0 False 313 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 358 669 0.000951847262452546 0.000966687719527705 0.000839246204318303 0.000839246204318303 0.000683824581178138 0.000653936420806064 41607 42129 667 665 0 False 358 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 402 669 0.00088646452694916 0.000891241608255016 0.000717174029144732 0.000732433051041428 0.000703760912379034 0.000673845769351795 38749 38841 667 665 0 False 402 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 447 669 0.000941117905226833 0.000850168451570675 0.000732433051041428 0.000656137941557946 0.000803847312428705 0.000794183952953402 41138 37051 667 665 0 False 447 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 492 669 0.000863335784613987 0.000951199238655118 0.000549324788281071 0.000686655985351339 0.000876642644679284 0.000893643082051405 37738 41454 667 665 0 False 492 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 536 669 0.000943794525259687 0.000988256863261381 0.000595101853971161 0.00064087891966125 0.000885611234116339 0.000950143314530401 41255 43069 667 665 0 False 536 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 581 669 0.00104941806963307 0.000886124673092665 0.000885023270008392 0.000732433051041428 0.000778757587350571 0.000653258459402574 45872 38618 667 665 0 False 581 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 625 669 0.00113243904484013 0.0010078526598024 0.000991836423285267 0.000869764248111696 0.000798258072080929 0.000768942916715629 49501 43923 667 665 0 False 625 669 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 666 673 0.00118242549588104 0.0748944918946485 0.000991836423285267 0.0736552986953536 0.000863465023430797 0.0213574200598384 51686 3263960 667 665 0 True 670 668 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G6_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G6_1.csv new file mode 100755 index 0000000..fe59c97 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G6_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 280 259 0.0096550031232953 0.0383793541991853 0.00964370183871214 0.0390783550774395 0.00148298660895987 0.00934206183553457 422038 1672602 667 665 0 True 280 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 325 260 0.00963121094522549 0.00945313615923535 0.00959792477302205 0.00943007553215839 0.00130616852334691 0.00130986624129595 420998 411975 667 665 0 False 325 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 368 259 0.00965326446412866 0.0561324345425248 0.00961318379491875 0.0566720073243305 0.00132516896770205 0.0118995159022991 421962 2446295 667 665 0 True 369 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 412 260 0.0097886739852779 0.0849247403241452 0.00975051499198901 0.0828107118333715 0.00155763883074805 0.0182377644275824 427881 3701086 667 665 0 True 414 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 456 259 0.009837676721264 0.0630786625524672 0.00991836423285267 0.0626993209735256 0.00172452391075606 0.0144381449065816 430023 2749017 667 665 0 True 458 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 503 259 0.00989585317206355 0.0525401165995786 0.00996414129854276 0.0568856336308843 0.00177145512393494 0.0168516250999957 432566 2289739 667 665 0 False 503 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 544 258 0.00991660269659174 0.0679714162953734 0.00991836423285267 0.0674296177615015 0.00147140366979788 0.0215855815312135 433473 2962247 667 665 0 True 548 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 589 258 0.010067911798278 0.0560545332202101 0.0100251773861295 0.0566414892805371 0.0020003955958001 0.0158540811769016 440087 2442900 667 665 0 True 592 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 637 259 0.00988864688735971 0.00985535479807323 0.00996414129854276 0.00993362325474937 0.00197523358674426 0.00186244579873623 432251 429504 667 665 0 False 637 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 677 259 0.00994323163435449 0.0395539088049719 0.00999465934233616 0.0393987945372702 0.00186956133697726 0.00869639513731048 434637 1723790 667 665 0 True 682 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 280 303 0.00945803134139042 0.00963704752841132 0.00946059357595178 0.00962844281681544 0.00152789179381388 0.00149081978918414 413428 419990 667 665 0 False 280 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 325 303 0.00964530323531299 0.00953610852491724 0.00958266575112535 0.00959792477302205 0.00149731468983456 0.00132634741976774 421614 415591 667 665 0 False 325 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 368 304 0.00992927660683277 0.0889568163943849 0.0100404364080262 0.0874036774242771 0.00156037897817069 0.0208137812509493 434027 3876807 667 665 0 True 369 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 412 304 0.00986313892721755 0.0483610032175885 0.00984206912336919 0.0486457618066682 0.00146018206746207 0.0102310081455527 431136 2107610 667 665 0 True 414 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 456 303 0.00992975702581303 0.0648941419697103 0.00988784618905928 0.0654612039368277 0.00179369418149692 0.0141625004720839 434048 2828137 667 665 0 True 459 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 500 302 0.00993229638328009 0.0364610083230507 0.00996414129854276 0.0381933318074311 0.00164606502912754 0.00831710666742363 434159 1588999 667 665 0 True 503 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 548 302 0.0101110579981238 0.0342195383170676 0.010101472495613 0.0376592660410468 0.00164903503244034 0.00992168328278778 441973 1491314 667 665 0 False 548 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 588 302 0.00991381169108739 0.0429677306105731 0.0100404364080262 0.0449988555733577 0.00189701376641519 0.0096532593151339 433351 1872567 667 665 0 True 592 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 637 302 0.00979896867771196 0.00961612086981014 0.00968947890440223 0.00964370183871214 0.0020041641787175 0.00200835080757274 428331 419078 667 665 0 False 637 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 682 302 0.00947203212310073 0.00934035707258533 0.00950637064164187 0.00929274433508812 0.00193878203747445 0.0019973461663346 414040 407060 667 665 0 False 682 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 279 347 0.0097745816951904 0.0446525331410467 0.00970473792629892 0.0471198596169986 0.00167471497379341 0.0136221082677563 427265 1945992 667 665 0 True 280 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 325 347 0.00987487487659237 0.0578760015167238 0.00985732814526589 0.0585336079957275 0.00155656814339019 0.0185379587840422 431649 2522281 667 665 0 False 325 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 368 348 0.00995318317037407 0.0355805512866625 0.00993362325474937 0.0362096589608606 0.00145004023665669 0.0083525003922318 435072 1550628 667 665 0 True 370 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 412 347 0.0099821684488495 0.0299186051647774 0.00997940032043946 0.0308537422751202 0.00157810215196199 0.0048990950923116 436339 1303876 667 665 0 True 414 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 456 348 0.0101090905680142 0.0603130394078582 0.0100556954299229 0.060166323338674 0.00175237777580164 0.0129996785520394 441887 2628489 667 665 0 True 459 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 503 346 0.00999255464966075 0.0276546940709522 0.00991836423285267 0.0288853284504463 0.00174175811685223 0.0053398857527243 436793 1205213 667 665 0 False 503 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 548 346 0.00985202065938878 0.0252792429689467 0.0098268101014725 0.0258945601586938 0.00173014679731932 0.00431593428877675 430650 1101689 667 665 0 False 548 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 588 346 0.00997162210837818 0.044005596504422 0.0100556954299229 0.0452277409018082 0.00209536728967677 0.00998630023334233 435878 1917798 667 665 0 True 593 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 632 346 0.00978775890150599 0.0514371531942697 0.0097962920576791 0.052628366521706 0.00206453639516358 0.0127656426124183 427841 2241671 667 665 0 True 637 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 677 346 0.00972063750683596 0.0555854272899002 0.00976577401388571 0.0563820859082933 0.00192810123298358 0.0167892867647016 424907 2422456 667 665 0 True 682 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 281 391 0.00980363560494873 0.0421708654791017 0.0098115510795758 0.0449530785076677 0.00145067198089331 0.0112177008647749 428535 1837839 667 665 0 True 280 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 324 391 0.00987796328432259 0.0294557864104069 0.0098268101014725 0.0308384832532235 0.00142476071746248 0.0057865919002472 431784 1283706 667 665 0 True 325 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 368 392 0.0100706112954052 0.0762798963533806 0.010101472495613 0.0761730373083085 0.00147105209724136 0.0213312022735301 440205 3324337 667 665 0 True 370 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 412 391 0.010077199898563 0.0570549743550912 0.0100251773861295 0.058609903105211 0.00161654824070594 0.0155212612721788 440493 2486500 667 665 0 True 414 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 457 391 0.0103350476283945 0.039145104693526 0.010406652933547 0.0403753719386587 0.00173765839164115 0.00821788410848764 451764 1705974 667 665 0 True 459 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 501 390 0.0102598048652488 0.051480796291484 0.01025406271458 0.0516975661860075 0.0018311673229131 0.0136905367593607 448475 2243573 667 665 0 True 503 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 546 389 0.0100524240054383 0.03806543137427 0.00997940032043946 0.0397192339971008 0.00166914650478078 0.00741248666612918 439410 1658921 667 665 0 True 548 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 589 389 0.010011542637928 0.0450431411557046 0.0100404364080262 0.0461738002594034 0.00194763016397361 0.00947761194602481 437623 1963015 667 665 0 True 593 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 632 389 0.00991282797603258 0.0382423901364765 0.0100251773861295 0.040161745632105 0.00201202456421071 0.00815366873781398 433308 1666633 667 665 0 True 637 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 679 389 0.00986645610589075 0.0799844885732298 0.00991836423285267 0.0766918440527962 0.00188551770445725 0.0182416576320763 431281 3485786 667 665 0 True 682 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 281 435 0.0106149717542236 0.0446287841370421 0.0105287251087205 0.0466926070038911 0.00168907829406253 0.00985331555375586 464000 1944957 667 665 0 True 281 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 325 435 0.0110088009325619 0.0484416580476139 0.0109254596780346 0.0493324177920195 0.00188901297841046 0.00697206288422713 481215 2111125 667 665 0 True 325 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 369 435 0.0108557989258975 0.0327325064779137 0.0107270923933776 0.0337071793698024 0.00156852848807399 0.00439239377755509 474527 1426508 667 665 0 True 370 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 414 435 0.0109026512150196 0.0526002348512618 0.0110017547875181 0.0518196383611811 0.00164793144130912 0.0128259867509035 476575 2292359 667 665 0 True 414 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 458 434 0.0112786133827113 0.0904385477311957 0.0110170138094148 0.0899671931029221 0.00268144873134676 0.0160696911235408 493009 3941382 667 665 0 True 459 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 501 433 0.0109535298727382 0.0556304241950723 0.0108033875028611 0.0570077058060578 0.00189617632493366 0.0147244917954425 478799 2424417 667 665 0 True 504 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 546 433 0.0107566267221162 0.0488774924264197 0.0107423514152743 0.0495765621423667 0.00178273710261209 0.0104149276434512 470192 2130119 667 665 0 True 548 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 589 433 0.0105615308619437 0.0313583914007954 0.0105592431525139 0.0324406805523766 0.001838236713613 0.0057389849375175 461664 1366623 667 665 0 True 593 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 637 432 0.0105216560865825 0.0381245858982545 0.0104829480430304 0.0399176012817578 0.00201290727133826 0.00904650782055918 459921 1661499 667 665 0 False 637 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 679 433 0.0102918099201715 0.0766288116721192 0.0103456168459602 0.0749065384908827 0.00201233545653317 0.0117592997745169 449874 3339543 667 665 0 True 682 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 283 479 0.0104591558649606 0.0522482447822463 0.010452429999237 0.0530098420691234 0.00181046875737254 0.0138975920245232 457189 2277019 667 665 0 True 281 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 326 479 0.0108199962733213 0.0530757197411014 0.0107881284809644 0.0536964980544747 0.00163191838212544 0.00857324388167871 472962 2313081 667 665 0 True 325 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 371 479 0.0109582196770692 0.0656239591884265 0.0109254596780346 0.0636301213092241 0.00165041951042995 0.0168960569094972 479004 2859943 667 665 0 True 370 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 416 479 0.0114338573446168 0.084602602867893 0.0110017547875181 0.0801556420233463 0.00410806417779984 0.0227350606944623 499795 3687047 667 665 0 True 415 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 460 478 0.0112201624067801 0.0922294291462233 0.011108567940795 0.0868848706797894 0.00254306474071906 0.0330144777880658 490454 4019430 667 665 0 True 459 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 502 477 0.0112300910657054 0.0421941096733594 0.011108567940795 0.0434424353398947 0.0021871147160865 0.00853793366653274 490888 1838852 667 665 0 True 504 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 547 477 0.0109716485314221 0.0387773049010716 0.0109712367437247 0.0400701915007248 0.00189981334336173 0.00587471795534023 479591 1689945 667 665 0 True 548 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 592 477 0.010843010630185 0.114474696698257 0.0109712367437247 0.108995193408103 0.00200450171114122 0.0352106478009372 473968 4988896 667 665 0 True 593 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 634 477 0.0106359958038834 0.0612881023800059 0.0106202792401007 0.0624246585793851 0.00187742487704496 0.0186657969579123 464919 2670983 667 665 0 True 638 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 680 477 0.0105184075391922 0.0729355547256789 0.0105439841306172 0.0712291142137789 0.00200403211006764 0.0149718581333377 459779 3178588 667 665 0 True 682 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 283 523 0.010012846632303 0.0479988710618386 0.0100404364080262 0.0498054474708171 0.0014481357500816 0.0119862232382558 437680 2091828 667 665 0 True 281 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 328 522 0.010167976208737 0.100055402869729 0.0101930266269932 0.0970016021972992 0.00168733868806334 0.0264624872926322 444461 4360492 667 665 0 True 325 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 371 522 0.0104615350827676 0.0561356928599824 0.0104982070649271 0.0572671091783017 0.0015924835994403 0.0123286083616986 457293 2446437 667 665 0 True 370 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 416 521 0.0106154750502982 0.0569118378459309 0.0106202792401007 0.0568093385214008 0.00183754048964547 0.00870752612161399 464022 2480262 667 665 0 True 415 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 460 521 0.0108362161331785 0.0550732060180206 0.0109254596780346 0.0557869840543221 0.00203696074642305 0.00813384921257603 473671 2400133 667 665 0 True 459 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 504 519 0.0105524486555074 0.0639224749904058 0.0105745021744106 0.0625619897764553 0.00180361055012983 0.0156507906995452 461267 2785791 667 665 0 True 504 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 548 519 0.0104535509768576 0.0725002710484153 0.010452429999237 0.0708628976882582 0.0017736739111513 0.0208321004763509 456944 3159618 667 665 0 True 548 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 592 518 0.0103307696117608 0.0548904648896216 0.0104371709773404 0.0560311284046693 0.001892590174975 0.0140582492202674 451577 2392169 667 665 0 True 593 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 636 518 0.0104050744140404 0.0477120014501807 0.0103456168459602 0.0459296559090562 0.002053452666383 0.0101720120096348 454825 2079326 667 665 0 True 638 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 680 518 0.0103595718734819 0.0595187442169167 0.0102845807583734 0.0594033722438392 0.00213162444795222 0.0145876742546387 452836 2593873 667 665 0 True 682 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 284 563 0.00979146499078225 0.0411757248465636 0.0098268101014725 0.0422980086976425 0.00146848410901793 0.00876915786860254 428003 1794470 667 665 0 True 281 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 327 563 0.00997018085143741 0.0523501475134391 0.00994888227664607 0.0532845044632639 0.00151388759658926 0.0136455317245764 435815 2281460 667 665 0 True 326 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 372 563 0.0102630076584505 0.0440432736682631 0.0102998397802701 0.0450293736171511 0.00149184308365204 0.00851821730780473 448615 1919440 667 665 0 True 370 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 416 562 0.0105746165598821 0.0506210135088236 0.010605020218204 0.0495002670328832 0.00190186205242395 0.00830104289627807 462236 2206103 667 665 0 True 415 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 460 561 0.0106625332332689 0.087189959334133 0.0107423514152743 0.0822613870450904 0.0022138573264593 0.0200996937724917 466079 3799806 667 665 0 True 459 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 504 560 0.0104886901936992 0.0618156285655774 0.0105439841306172 0.0610818646524758 0.00204583835339218 0.0121127867869337 458480 2693973 667 665 0 True 504 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 548 560 0.0102881038308953 0.0553316686084633 0.0103303578240635 0.0544289311055161 0.00195175848311022 0.0097033432455647 449712 2411397 667 665 0 True 549 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 593 563 0.0101365888353603 0.033903114389315 0.0100404364080262 0.0377660791943236 0.0018748716279063 0.0103110367329828 443089 1477524 667 665 0 False 593 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 637 559 0.0101440467681014 0.0439972671435972 0.0100862134737163 0.0450904097047379 0.00164804411887822 0.00704581963934227 443415 1917435 667 665 0 True 638 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 681 559 0.00999246314128356 0.0493046303100392 0.00991836423285267 0.0485236896314946 0.00183757642257026 0.00796114538045859 436789 2148734 667 665 0 True 682 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 281 607 0.00923401883402542 0.00930607590158734 0.00917067215991455 0.00923170824750134 0.00138076868635879 0.00157492490834398 403636 405566 667 665 0 False 281 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 326 607 0.0095484873722443 0.00941972693234574 0.00953688868543526 0.00932326237888151 0.00146781114350275 0.0014565068110081 417382 410519 667 665 0 False 326 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 372 604 0.0100789614348239 0.0704864472924128 0.0100099183642329 0.0684519722285802 0.00142966720719767 0.0106067107153811 440570 3071854 667 665 0 True 370 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 416 604 0.0102216458719599 0.0769261216671801 0.0101625085831998 0.0734264133669032 0.00187653061293579 0.0197650552087928 446807 3352500 667 665 0 True 415 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 460 607 0.00980759334226226 0.00995035081409176 0.00993362325474937 0.0100099183642329 0.00213172810766863 0.00206466301666611 428708 433644 667 665 0 False 460 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 504 607 0.00992092646741404 0.00983773234872487 0.00990310521095598 0.0098268101014725 0.00208060749069674 0.0021357297759941 433662 428736 667 665 0 False 504 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 549 606 0.00960217991256146 0.00965834132137393 0.00956740672922866 0.00970473792629892 0.0018746734837913 0.00199767408168024 419729 420918 667 665 0 False 549 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 593 606 0.00952478670255168 0.00965551897597048 0.00953688868543526 0.00964370183871214 0.00156195309838733 0.00167497217135529 416346 420795 667 665 0 False 593 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 638 606 0.00988965347950881 0.0095537309742656 0.00988784618905928 0.00955214770733196 0.0015185390060344 0.00154723726244146 432295 416359 667 665 0 False 638 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 683 606 0.009735461863941 0.00949570079926298 0.00967421988250553 0.00953688868543526 0.00168567592584408 0.00169195313505972 425555 413830 667 665 0 False 683 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 282 656 0.00928347911189747 0.0375257897547715 0.00927748531319142 0.0379034103913939 0.00133032771724397 0.00857131167311261 405798 1635403 667 665 0 True 281 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 326 651 0.00929164623456182 0.00926197388642125 0.00929274433508812 0.00927748531319142 0.00130004837487087 0.00126874384170837 406155 403644 667 665 0 False 326 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 370 650 0.00939090994672039 0.00953337796310414 0.00935378042267491 0.00958266575112535 0.00128408208482047 0.00117357768589472 410494 415472 667 665 0 False 370 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 415 650 0.00981836845367657 0.00943512362962797 0.00970473792629892 0.00944533455405508 0.00173934916874634 0.00145223408449446 429179 411190 667 665 0 False 415 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 460 650 0.00943128801815618 0.00966793270656614 0.00941481651026169 0.00961318379491875 0.00168305671230744 0.00164338038660779 412259 421336 667 665 0 False 460 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 504 650 0.00973232770202219 0.00952259339123731 0.00973525597009232 0.00952162966353857 0.00177415899240393 0.00174999149156195 425418 415002 667 665 0 False 504 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 549 650 0.00959078711960111 0.0094603411710783 0.00958266575112535 0.00949111161974517 0.00170057249109371 0.00179008092562422 419231 412289 667 665 0 False 549 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 594 650 0.00944833145340811 0.00947252544269807 0.00947585259784848 0.00946059357595178 0.00140780987015058 0.00126219431413071 413004 412820 667 665 0 False 594 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 638 650 0.00966687633523591 0.00959524010300413 0.00968947890440223 0.00967421988250553 0.00140781275199837 0.00141444233760422 422557 418168 667 665 0 False 638 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 678 653 0.00977343784047551 0.0382148091675745 0.0098268101014725 0.0392614633401999 0.00151072170425506 0.00910757508162162 427215 1665431 667 665 0 True 683 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G6_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G6_2.csv new file mode 100755 index 0000000..42ea9b2 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G6_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 280 259 0.00835469196049721 0.704641255232382 0.00816357671473259 0.727138170443275 0.00201737213668535 0.220707665142493 365199 30708812 667 665 11 True 280 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 325 260 0.00690757848358952 0.00671660841276916 0.00688181887541009 0.0068055237659266 0.00137718381619953 0.00126844276620847 301943 292715 667 665 0 False 325 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 368 259 0.0063935759289044 0.0064229927072201 0.00646982528419928 0.0064087891966125 0.00132604508495954 0.0012568917036161 279475 279919 667 665 0 True 369 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 412 260 0.00651141584163286 0.00636200251142849 0.00642404821850919 0.00622568093385214 0.00143631836880252 0.00144315168307731 284626 277261 667 665 0 True 414 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 456 259 0.00644626187707245 0.00657941489108443 0.00634775310902571 0.00657663843747616 0.00162657492067191 0.00164565296156714 281778 286736 667 665 0 True 458 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 503 259 0.00671053807040174 0.00682186124500998 0.00671396963454643 0.00688181887541009 0.00160658231351036 0.00141355825004333 293330 297302 667 665 0 False 503 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 544 258 0.00687243926674795 0.00709016762551836 0.00691233691920348 0.00712596322575723 0.00149814715106184 0.00151614358243611 300407 308995 667 665 0 True 548 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 589 258 0.0073110846728158 0.00744690749533481 0.0072480354009308 0.00752269779507134 0.00179900869470068 0.00197809969070947 319581 324542 667 665 0 True 592 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 637 259 0.00908122272120978 0.00801653940298216 0.00840772106507973 0.00813305867093919 0.00525647599555252 0.00176452437635897 396957 349367 667 665 0 False 637 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 677 259 0.00937443843882591 0.71520416972851 0.00941481651026169 0.714030670634012 0.00207662054073708 0.193461921526539 409774 31169152 667 665 12 True 682 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 280 303 0.00670889091961229 0.00649614422873389 0.00668345159075303 0.00646982528419928 0.00170177599851955 0.00143177931326387 293258 283107 667 665 0 False 280 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 325 303 0.00654849961148975 0.0065638116807239 0.00651560234988937 0.00653086137178607 0.00145251134193561 0.00130050670544176 286247 286056 667 665 0 False 325 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 368 304 0.00641910676614085 0.00653182509948481 0.0063935301747158 0.00650034332799268 0.00137014340294842 0.00127702379190271 280591 284662 667 665 0 True 369 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 412 304 0.00645806645773016 0.00669850409957143 0.00656137941557946 0.00660715648126955 0.00144630817050519 0.00147304557321405 282294 291926 667 665 0 True 414 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 456 303 0.0067697439904447 0.00697410727551311 0.00685130083161669 0.00695811398489357 0.00169879580883818 0.00183589555843618 295918 303937 667 665 0 True 459 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 500 302 0.00683361683772442 0.00679574881355368 0.00694285496299687 0.00677500572213321 0.00158149399575372 0.00160259280524269 298710 296164 667 665 0 True 503 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 548 302 0.00726155576366086 0.00698468533430165 0.00721751735713741 0.00703440909437705 0.00162346349701749 0.0014748904137122 317416 304398 667 665 0 False 548 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 588 302 0.00730966629296933 0.00716602676294765 0.00733958953231098 0.0072480354009308 0.00184190553632566 0.00202169133867716 319519 312301 667 665 0 True 592 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 637 302 0.00767110150578179 0.00747416722167057 0.00776684214541848 0.00740062561989776 0.00198566046786149 0.00197072514254493 335318 325730 667 665 0 False 637 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 682 302 0.00759519530690137 0.00746269427287606 0.00761425192645151 0.0076752880140383 0.00194487618609678 0.00192148802416237 332000 325230 667 665 0 False 682 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 279 347 0.00645172950260965 0.00632737715196666 0.00643930724040589 0.00625619897764553 0.0012956715215662 0.00146439829193957 282017 275752 667 665 0 True 280 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 325 347 0.0065403324888254 0.00655438091681481 0.00651560234988937 0.00656137941557946 0.00130089532844224 0.00125151359306952 285890 285645 667 665 0 False 325 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 368 348 0.00671872807016039 0.00698810427304241 0.00671396963454643 0.00697337300679027 0.00135966112214164 0.001331170833794 293688 304547 667 665 0 True 370 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 412 347 0.00691043812037675 0.00702084806890194 0.00692759594110018 0.00701915007248035 0.00145688200353719 0.00143906274211274 302068 305974 667 665 0 True 414 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 456 348 0.00724185858547037 0.00718525542512725 0.00733958953231098 0.00715648126955062 0.00175437008131931 0.00163664789935897 316555 313139 667 665 0 True 459 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 503 346 0.00694761339861083 0.00696715466854364 0.00692759594110018 0.00703440909437705 0.00164497506833293 0.00163235198128897 303693 303634 667 665 0 False 503 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 548 346 0.00703438621728275 0.00711710610928787 0.00706492713817044 0.00712596322575723 0.00160387733989485 0.00169611021248824 307486 310169 667 665 0 False 548 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 588 346 0.00728340338871535 0.00747366241192361 0.0072632944228275 0.00755321583886473 0.00198321724246773 0.00212130881244853 318371 325708 667 665 0 True 593 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 632 346 0.00725094079190663 0.0073441328200336 0.00729381246662089 0.00729381246662089 0.00197356629322336 0.00192075309316679 316952 320063 667 665 0 True 637 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 677 346 0.00670150161815407 0.00680238017795691 0.0068055237659266 0.0068055237659266 0.00177610271995147 0.00187717678403034 292935 296453 667 665 0 True 682 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 281 391 0.00636401872307151 0.00633219579046036 0.0064087891966125 0.0063782711528191 0.00139887473097249 0.00142776171298991 278183 275962 667 665 0 True 280 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 324 391 0.00685955946265823 0.0670110386976826 0.00688181887541009 0.072281986724651 0.00136981107704539 0.0205685797001082 299844 2920393 667 665 0 True 325 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 368 392 0.0069392632591921 0.00726678219926103 0.00692759594110018 0.00708018616006714 0.00136414938286136 0.00235499534067057 303328 316692 667 665 0 True 370 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 412 391 0.00695925783960846 0.00697270757576018 0.00700389105058366 0.00698863202868696 0.00153598561064114 0.00152773924932728 304202 303876 667 665 0 True 414 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 457 391 0.00727061509300282 0.00730161407180116 0.00738536659800107 0.00738536659800107 0.00171255196423435 0.00155596666706333 317812 318210 667 665 0 True 459 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 501 390 0.00735180590066606 0.00712357685240797 0.00740062561989776 0.00704966811627375 0.00185791122295477 0.00165249358115051 321361 310451 667 665 0 True 503 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 546 389 0.00701777744682248 0.00726664452387549 0.00700389105058366 0.00732433051041428 0.00162794647949644 0.00154133919623606 306760 316686 667 665 0 True 548 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 589 389 0.00685754627836002 0.00723146846287153 0.00677500572213321 0.00718699931334401 0.00193222009827112 0.00199039203815659 299756 315153 667 665 0 True 593 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 632 389 0.00656650388470219 0.00669506221493308 0.00648508430609598 0.00679026474402991 0.00183400273109429 0.00183037872092318 287034 291776 667 665 0 True 637 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 679 389 0.00634432154488103 0.00634906102518829 0.00643930724040589 0.0063782711528191 0.00182049157550316 0.0018934062187457 277322 276697 667 665 0 True 682 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 281 435 0.00763662572467486 0.00721301996120996 0.00770580605783169 0.00720225833524071 0.00172365279508032 0.0015808634426992 333811 314349 667 665 0 True 281 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 325 435 0.00788902870606354 0.00745243745665377 0.00775158312352178 0.00746166170748455 0.00202570389676636 0.00141523753286065 344844 324783 667 665 0 True 325 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 369 435 0.00769320077887355 0.00751409308347546 0.00764476997024491 0.00747692072938125 0.00152724629339683 0.00134774028747645 336284 327470 667 665 0 True 370 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 414 435 0.00767197083536511 0.00777124775775557 0.00770580605783169 0.00775158312352178 0.00170269547964322 0.00177998571603874 335356 338677 667 665 0 True 414 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 458 434 0.00807989230379088 0.00828227584296057 0.00799572747386892 0.00836194399938964 0.0021636907059404 0.0017066643147574 353187 360948 667 665 0 True 459 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 501 433 0.00782451530014347 0.00800566304752497 0.00782787823300526 0.00793469138628214 0.0019587672303058 0.00207998726824583 342024 348893 667 665 0 True 504 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 546 433 0.00747950584103691 0.00780890197569915 0.00747692072938125 0.00778210116731518 0.00182917767681179 0.00169228758720361 326943 340318 667 665 0 True 548 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 589 433 0.00709320322672264 0.00718550783000073 0.00709544518196384 0.00718699931334401 0.00194329792761706 0.00205115006624943 310057 313150 667 665 0 True 593 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 637 432 0.00664179240203656 0.00699519455539742 0.00654612039368277 0.00695811398489357 0.00178363087943901 0.00190632781084097 290325 304856 667 665 0 False 637 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 679 433 0.00652207656757568 0.00697022941882057 0.00654612039368277 0.00683604180972 0.00192418931675287 0.0019502177403047 285092 303768 667 665 0 True 682 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 283 479 0.00722897878138065 0.00692504894646779 0.00714122224765393 0.00683604180972 0.00189915479319466 0.00158264185112675 315992 301799 667 665 0 True 281 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 326 479 0.00748790173464424 0.00699358834256619 0.00752269779507134 0.00703440909437705 0.00173192738717782 0.00154401009927432 327310 304786 667 665 0 True 325 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 371 479 0.00765751251176883 0.00720030793394564 0.007690547035935 0.00721751735713741 0.0017421216946492 0.00144713952004508 334724 313795 667 665 0 True 370 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 416 479 0.00875170105494289 0.00727933360524222 0.00782787823300526 0.00730907148851759 0.00768455361467041 0.00169219258976167 382553 317239 667 665 0 True 415 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 460 478 0.00786791314802658 0.00756498708432789 0.00788891432059205 0.00756847486076143 0.00224561441611228 0.00192747855302701 343921 329688 667 665 0 True 459 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 502 477 0.00759540120075005 0.00727667188112189 0.00750743877317464 0.00738536659800107 0.00218304241730036 0.00190080175327287 332009 317123 667 665 0 True 504 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 547 477 0.00706764951239189 0.00707584938542282 0.00708018616006714 0.00691233691920348 0.00198167341642322 0.00228221852104398 308940 308371 667 665 0 True 548 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 592 477 0.00678260091744011 0.00665743094288709 0.00675974670023652 0.00669871061264973 0.00216302881582479 0.0017414064527941 296480 290136 667 665 0 True 593 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 634 477 0.00687461259070625 0.00668923395694546 0.00688181887541009 0.00668345159075303 0.00201758824051936 0.0018128815930858 300502 291522 667 665 0 True 638 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 680 477 0.00700476038016698 0.00665616891851969 0.00691233691920348 0.00663767452506294 0.00214119896556656 0.00186696670733794 306191 290081 667 665 0 True 682 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 283 523 0.00654950620363885 0.00674093106421352 0.00656137941557946 0.00668345159075303 0.00158994828762324 0.00155592714161883 286291 293775 667 665 0 True 281 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 328 522 0.00684777775909482 0.00710154879072251 0.00685130083161669 0.00708018616006714 0.00154697591067541 0.00152266448458274 299329 309491 667 665 0 True 325 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 371 522 0.00695056454377526 0.00715418667979172 0.00698863202868696 0.00712596322575723 0.00149744641652473 0.00167019206306922 303822 311785 667 665 0 True 370 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 416 521 0.00680312167102532 0.00711022234001116 0.00688181887541009 0.00703440909437705 0.00175650340328535 0.00198908513730313 297377 309869 667 665 0 True 415 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 460 521 0.00677662999582836 0.00685325123291176 0.0068207827878233 0.00683604180972 0.00198785191204998 0.00185727487044457 296219 298670 667 665 0 True 459 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 504 519 0.00658890056001983 0.00674237665576163 0.00657663843747616 0.0068055237659266 0.00170773348163295 0.00168852247201062 288013 293838 667 665 0 True 504 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 548 519 0.00654328363398983 0.00658590858010212 0.00651560234988937 0.00653086137178607 0.0017504903094729 0.00171959512681724 286019 287019 667 665 0 True 548 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 592 518 0.00649160427797088 0.00647055955292213 0.0064087891966125 0.00657663843747616 0.001763478214032 0.00170116445530309 283760 281992 667 665 0 True 593 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 636 518 0.00635086439385022 0.00658150296776503 0.0063782711528191 0.00654612039368277 0.00192151566056747 0.00191522866452156 277608 286827 667 665 0 True 638 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 680 518 0.00666922203809974 0.00647012358086794 0.00665293354695964 0.00651560234988937 0.00194835221178643 0.00197716926823957 291524 281973 667 665 0 True 682 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 284 563 0.00691576848334816 0.00693374544165403 0.00686655985351339 0.00698863202868696 0.00136759123755503 0.00133609788854854 302301 302178 667 665 0 True 281 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 327 563 0.00684125778721992 0.00698450176712094 0.00695811398489357 0.00698863202868696 0.00144734060400832 0.00142205733669684 299044 304390 667 665 0 True 326 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 372 563 0.0068849530373289 0.00695159734997829 0.00686655985351339 0.00701915007248035 0.00139740685669293 0.00124161597686744 300954 302956 667 665 0 True 370 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 416 562 0.00666874161911949 0.00660841850563695 0.00663767452506294 0.00666819256885634 0.00175682877164073 0.00161044462143346 291503 288000 667 665 0 True 415 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 460 561 0.00664860977613734 0.00685201215444195 0.00672922865644312 0.0068055237659266 0.00200802295398213 0.00196048870050399 290623 298616 667 665 0 True 459 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 504 560 0.00652587416522913 0.00681362366777553 0.00657663843747616 0.00677500572213321 0.00208658019925758 0.00208019755323755 285258 296943 667 665 0 True 504 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 548 560 0.00638842858268737 0.00681495452983569 0.00648508430609598 0.00683604180972 0.00186294622494629 0.00175145120382602 279250 297001 667 665 0 True 549 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 593 563 0.00660818595051296 0.00673764980085829 0.00656137941557946 0.00674448767833982 0.00162464189279444 0.00150638097611031 288856 293632 667 665 0 False 593 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 637 559 0.00648288810504338 0.00651195395217272 0.00654612039368277 0.00654612039368277 0.0016629770158027 0.00158717885816976 283379 283796 667 665 0 True 638 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 681 559 0.00669722360152037 0.00645144562023048 0.00672922865644312 0.0064087891966125 0.00167521473352972 0.00170551420184872 292748 281159 667 665 0 True 682 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 281 607 0.00702857543533109 0.00673542404879216 0.00697337300679027 0.00675974670023652 0.00140632233925725 0.00154268140858505 307232 293535 667 665 0 False 281 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 326 607 0.0067620572867606 0.00669178095157785 0.00679026474402991 0.00663767452506294 0.0014823468631627 0.00139778031893068 295582 291633 667 665 0 False 326 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 372 604 0.00661278424646683 0.00642244200567796 0.00665293354695964 0.00642404821850919 0.00125244434637139 0.00129289105586138 289057 279895 667 665 0 True 370 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 416 604 0.00632995472966195 0.00646447889006104 0.00628671702143893 0.00648508430609598 0.00157269546138324 0.00157656319354317 276694 281727 667 665 0 True 415 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 460 607 0.00630478992593426 0.00635089669699541 0.00630197604333562 0.00642404821850919 0.00180318020336975 0.00190768424908585 275594 276777 667 665 0 False 460 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 504 607 0.00654289472338676 0.00655706558683273 0.00660715648126955 0.00657663843747616 0.00191344061482586 0.00197636850283574 286002 285762 667 665 0 False 504 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 549 606 0.0065077326294509 0.00651560234988937 0.00657663843747616 0.00656137941557946 0.00190308295114044 0.00186575863941358 284465 283955 667 665 0 False 549 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 593 606 0.00622035057088073 0.00644105112862265 0.00628671702143893 0.00645456626230259 0.00156470186870127 0.00162337584693854 271903 280706 667 665 0 False 593 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 638 606 0.0066262131008197 0.00639894540654681 0.00659189745937285 0.00643930724040589 0.00145644057862688 0.0014398297386573 289644 278871 667 665 0 False 638 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 683 606 0.00692164789658272 0.00655279764988117 0.00694285496299687 0.00659189745937285 0.00157819235639782 0.00162668214817225 302558 285576 667 665 0 False 683 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 282 656 0.00848882036436577 0.7112403347577 0.00807202258335241 0.718287937743191 0.00242057533125569 0.207705592526877 371062 30996405 667 665 12 True 281 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 326 651 0.00711056694129475 0.00665988615392911 0.00703440909437705 0.00662241550316625 0.00150268070550576 0.0012801939611574 310816 290243 667 665 0 False 326 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 370 650 0.00625052545825965 0.00632836382556299 0.00621042191195544 0.00633249408712902 0.00128382570269053 0.00115857002908556 273222 275795 667 665 0 False 370 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 415 650 0.00621241221915936 0.00608109883314374 0.00614938582436866 0.00608834973678187 0.00161930891466172 0.00139151237057302 271556 265019 667 665 0 False 415 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 460 650 0.00612266537822872 0.00615108382079024 0.00617990386816205 0.00602731364919509 0.00170936283433339 0.00165810082389397 267633 268069 667 665 0 False 460 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 504 650 0.00617553434315115 0.00627122854056634 0.00622568093385214 0.00628671702143893 0.00180214554087638 0.00162465977959437 269944 273305 667 665 0 False 504 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 549 650 0.00634940025981516 0.00613786698377897 0.00636301213092241 0.00607309071488518 0.00167783801987454 0.00172492463256987 277544 267493 667 665 0 False 549 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 594 650 0.00634834791347746 0.00631441271982887 0.00636301213092241 0.0063782711528191 0.0013174522551186 0.00129806941457669 277498 275187 667 665 0 False 594 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 638 650 0.00732236308030466 0.0067767037185548 0.00700389105058366 0.00679026474402991 0.00210449676525407 0.00128412833035838 320074 295334 667 665 0 False 638 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 678 653 0.00851066798942026 0.732122455371663 0.0085297932402533 0.750164034485389 0.00165924496582741 0.21940625412634 372017 31906464 667 665 14 True 683 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G6_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G6_3.csv new file mode 100755 index 0000000..35c2b9f --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G6_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 280 259 0.000994261395280844 0.0724440535993222 0.000839246204318303 0.0735332265201801 0.000757440037086664 0.0248843709295948 43461 3157168 667 665 0 True 280 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 325 260 0.000964727066542261 0.00102760907762655 0.000869764248111696 0.000946059357595178 0.000674411458283462 0.000697148559276443 42170 44784 667 665 0 False 325 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 368 259 0.000971132652945672 0.000883761245640997 0.000885023270008392 0.000793469138628214 0.000650318396848357 0.000645176278530471 42450 38515 667 665 0 True 369 260 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 412 260 0.000914809246784253 0.000917675282277564 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.000751801334143862 0.0007430239304677 39988 39993 667 665 0 True 414 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 456 259 0.00100654639491881 0.000985296842472397 0.000778210116731518 0.000762951094834821 0.000924285341596821 0.000886094522889556 43998 42940 667 665 0 True 458 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 503 259 0.000991081479173437 0.000926509452849335 0.000793469138628214 0.000717174029144732 0.000872638874472838 0.000816049272904941 43322 40378 667 665 0 False 503 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 544 258 0.000895615364668318 0.000978137722424624 0.000671396963454643 0.000823987182421607 0.00079498233694657 0.000798164680269766 39149 42628 667 665 0 True 548 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 589 258 0.00102471080779134 0.00105775998705851 0.000671396963454643 0.000686655985351339 0.00101184150081397 0.00109599464770007 44792 46098 667 665 0 True 592 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 637 259 0.00117812460215303 0.000961685513853299 0.000823987182421607 0.000595101853971161 0.00110768825254298 0.000975125642338191 51498 41911 667 665 0 False 637 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 677 259 0.00119818781385229 0.0741438856927166 0.000900282291905089 0.0719005111772335 0.00101235425958699 0.0231994612634112 52375 3231248 667 665 0 True 682 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 280 303 0.000918583967343405 0.000944935008613316 0.00080872816052491 0.000778210116731518 0.00073660824997331 0.000778423436981839 40153 41181 667 665 0 False 280 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 325 303 0.000988176088197604 0.000882958139225381 0.000915541313801785 0.000747692072938125 0.00069294195678182 0.000615901206395181 43195 38480 667 665 0 False 325 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 368 304 0.000910531230150546 0.00086524390628666 0.000793469138628214 0.000793469138628214 0.000659046487576756 0.000602833128820584 39801 37708 667 665 0 True 369 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 412 304 0.00101366117124546 0.0010118223000853 0.000839246204318303 0.000823987182421607 0.000832386342068049 0.000810976155691902 44309 44096 667 665 0 True 414 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 456 303 0.000898795280775726 0.00104539214825803 0.000625619897764553 0.000778210116731518 0.00093031635288923 0.00101178153095634 39288 45559 667 665 0 True 459 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 500 302 0.00101132770762707 0.000958404250498069 0.00080872816052491 0.000686655985351339 0.000894809409428496 0.000908079638676258 44207 41768 667 665 0 True 503 303 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 548 302 0.000921237710281961 0.000966274693371102 0.000717174029144732 0.00080872816052491 0.000837458023517683 0.000782516717450124 40269 42111 667 665 0 False 548 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 588 302 0.000910119442453184 0.000950648537112982 0.000625619897764553 0.000503547722590982 0.000931128768190282 0.00105924628627545 39783 41430 667 665 0 True 592 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 637 302 0.000998287763877274 0.000996035522544058 0.000610360875867857 0.000518806744487678 0.00101696856326738 0.00108817916131848 43637 43408 667 665 0 False 637 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 682 302 0.00105740217554304 0.00107093093227461 0.000717174029144732 0.000671396963454643 0.00101430077660859 0.00109310364441766 46221 46672 667 665 0 False 682 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 279 347 0.000952762346224462 0.000889910746194853 0.00080872816052491 0.000701915007248035 0.000762012623322076 0.000737400907039513 41647 38783 667 665 0 True 280 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 325 347 0.000963400195072983 0.00095209412866109 0.000869764248111696 0.000854505226215 0.000674137812149737 0.000697639281749414 42112 41493 667 665 0 False 325 347 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 368 348 0.00099920284764919 0.000991951152773213 0.000900282291905089 0.000885023270008392 0.000662401784377467 0.000708425136807232 43677 43230 667 665 0 True 370 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 412 347 0.000985385082693261 0.000994980011254963 0.000793469138628214 0.000793469138628214 0.000810911868368939 0.000766029907234179 43073 43362 667 665 0 True 414 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 456 348 0.000975136144447804 0.00100716428287473 0.000717174029144732 0.000747692072938125 0.000852250297117306 0.000865081545846266 42625 43893 667 665 0 True 459 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 503 346 0.000922633213034133 0.00101799474653675 0.000686655985351339 0.000762951094834821 0.000888436011423199 0.0008873156256992 40330 44365 667 665 0 False 503 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 548 346 0.000944549469371517 0.000980547041671471 0.000671396963454643 0.000732433051041428 0.000919431205929808 0.000867341691166246 41288 42733 667 665 0 False 548 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 588 346 0.00100062122749566 0.000982245038093058 0.000686655985351339 0.000503547722590982 0.00105150329290672 0.00113436087070058 43739 42807 667 665 0 True 593 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 632 346 0.00101967784704581 0.0010047320177303 0.00064087891966125 0.000579842832074464 0.00108051606500477 0.00105767753232277 44572 43787 667 665 0 True 637 346 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 677 346 0.000942055866093046 0.00102035817398842 0.000610360875867857 0.000671396963454643 0.00093060268764533 0.00102037485694583 41179 44468 667 665 0 True 682 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 281 391 0.000867407907399013 0.000981327202189498 0.000701915007248035 0.000839246204318303 0.00072836897809217 0.000768938637174279 37916 42767 667 665 0 True 280 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 324 391 0.000931440894338823 0.00660557321433591 0.000823987182421607 0.00688181887541009 0.000709443181320144 0.00242994360273983 40715 287876 667 665 0 True 325 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 368 392 0.00103772787444685 0.000939382101396774 0.000915541313801785 0.000823987182421607 0.000781281688662778 0.000726498928132187 45361 40939 667 665 0 True 370 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 412 391 0.000973580502035547 0.00102850396763252 0.000762951094834821 0.000869764248111696 0.000801890137513436 0.000827338117148067 42557 44823 667 665 0 True 414 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 457 391 0.001021919802287 0.000976738022671694 0.000762951094834821 0.000701915007248035 0.000916560770800066 0.000849729567900652 44670 42567 667 665 0 True 459 390 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 501 390 0.00100217686990792 0.000944430198866358 0.000671396963454643 0.000610360875867857 0.000979972269534105 0.000931360351739401 43807 41159 667 665 0 True 503 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 546 389 0.000987444021180071 0.000983002252713496 0.000762951094834821 0.000762951094834821 0.000903881483570098 0.000849507274154685 43163 42840 667 665 0 True 548 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 589 389 0.000978155920895126 0.00097682980626205 0.000595101853971161 0.000518806744487678 0.00104259711492507 0.00107249101373858 42757 42571 667 665 0 True 593 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 632 389 0.000969668518910607 0.000969142930569729 0.000579842832074464 0.000625619897764553 0.00101561221881179 0.000989669930917737 42386 42236 667 665 0 True 637 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 679 389 0.00097376351878993 0.00100005105462214 0.000671396963454643 0.000686655985351339 0.000968091073870571 0.00100404375800462 42565 43583 667 665 0 True 682 389 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 281 435 0.000983509160960833 0.000998651354869205 0.000854505226215 0.000854505226215 0.000805528611015895 0.000827334384680314 42991 43522 667 665 0 True 281 434 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 325 435 0.0010686805830319 0.00100792149749517 0.000915541313801785 0.000930800335698482 0.000809822097485603 0.000707866200052845 46714 43926 667 665 0 True 325 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 369 435 0.00101119044506129 0.000962557457961681 0.000885023270008392 0.000869764248111696 0.000779793745076638 0.000708719309735863 44201 41949 667 665 0 True 370 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 414 435 0.00110077714633185 0.00100544334055555 0.00080872816052491 0.000762951094834821 0.000951027988025472 0.000877301562490246 48117 43818 667 665 0 True 414 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 458 434 0.00112166393342583 0.00108100418131619 0.000869764248111696 0.000823987182421607 0.00100441433856078 0.000940773648045203 49030 47111 667 665 0 True 459 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 501 433 0.00101029823838367 0.00104630998416159 0.000793469138628214 0.000732433051041428 0.000929035178303618 0.000976380727801955 44162 45599 667 665 0 True 504 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 546 433 0.00100867396468852 0.0010421108849028 0.000747692072938125 0.000885023270008392 0.00096712196710501 0.000873562804850212 44091 45416 667 665 0 True 548 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 589 433 0.000909456006718545 0.000957256955618619 0.000534065766384375 0.000579842832074464 0.000961400609876489 0.00100833756263144 39754 41718 667 665 0 True 593 433 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 637 432 0.00105838589059785 0.00101689334345247 0.000656137941557946 0.000656137941557946 0.001040754993534 0.00100372210631781 46264 44317 667 665 0 False 637 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 679 433 0.000933156676411165 0.0010289628855843 0.000564583810177768 0.000656137941557946 0.000953664407025356 0.00100312201189308 40790 44843 667 665 0 True 682 432 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 283 479 0.0010284626512562 0.000879126174328015 0.000854505226215 0.000732433051041428 0.000878853767970131 0.000780699741140319 44956 38313 667 665 0 True 281 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 326 479 0.00098213653530296 0.000981533715267799 0.000823987182421607 0.000823987182421607 0.000845709565711565 0.000827614813169245 42931 42776 667 665 0 True 325 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 371 479 0.000986780585445433 0.000971804654690055 0.000839246204318303 0.000823987182421607 0.000820063692382764 0.000803763958115387 43134 42352 667 665 0 True 370 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 416 479 0.00113026572088183 0.000934861759571738 0.000793469138628214 0.000656137941557946 0.0013390504545931 0.000926185589612751 49406 40742 667 665 0 True 415 477 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 460 478 0.00103923776267051 0.00105505237114301 0.000671396963454643 0.000686655985351339 0.00111226061128751 0.00104423074283439 45427 45980 667 665 0 True 459 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 502 477 0.000972230753471971 0.00105785177064887 0.00064087891966125 0.000671396963454643 0.000977395607687364 0.00103377479277391 42498 46102 667 665 0 True 504 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 547 477 0.0010089027356315 0.000934356949824779 0.000671396963454643 0.000610360875867857 0.000996808815247666 0.00092483595795398 44101 40720 667 665 0 True 548 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 592 477 0.000978476200215296 0.00102299695221115 0.000610360875867857 0.000656137941557946 0.00101462070031408 0.00100234291737535 42771 44583 667 665 0 True 593 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 634 477 0.00102773058423867 0.00101852250218129 0.000671396963454643 0.000686655985351339 0.00105761185897585 0.000964035279294795 44924 44388 667 665 0 True 638 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 680 477 0.00105248360026899 0.000991377505333487 0.000701915007248035 0.000671396963454643 0.00105191381703058 0.000993886796591939 46006 43205 667 665 0 True 682 476 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 283 523 0.000900099275150706 0.000902049126019443 0.000747692072938125 0.000747692072938125 0.000790153811567462 0.000780566172294805 39345 39312 667 665 0 True 281 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 328 522 0.000943886033636878 0.000913613858404308 0.00080872816052491 0.000732433051041428 0.000769476894616371 0.000833652626238252 41259 39816 667 665 0 True 325 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 371 522 0.000923182263297282 0.000932888412379082 0.000747692072938125 0.000732433051041428 0.000797752039205804 0.000857106557671688 40354 40656 667 665 0 True 370 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 416 521 0.000955050055654251 0.00102838923814457 0.000671396963454643 0.000717174029144732 0.000914958800114244 0.000984957034968037 41747 44818 667 665 0 True 415 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 460 521 0.00098680346253973 0.000935527190601819 0.000625619897764553 0.000610360875867857 0.00104608939131325 0.000970026999984507 43135 40771 667 665 0 True 459 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 504 519 0.000899984889679216 0.001080568209262 0.000534065766384375 0.000747692072938125 0.000924004232932693 0.00102376402586733 39340 47092 667 665 0 True 504 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 548 519 0.000961661535906343 0.000910791513000859 0.000671396963454643 0.00064087891966125 0.000930997519616037 0.000857415335199954 42036 39693 667 665 0 True 548 520 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 592 518 0.000984836032430111 0.000872953727876569 0.000656137941557946 0.000595101853971161 0.000942096200281823 0.000863948133977232 43049 38044 667 665 0 True 593 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 636 518 0.000959899999645405 0.00096632058516628 0.00064087891966125 0.000473029678797589 0.000998306648297788 0.0010762849752628 41959 42113 667 665 0 True 638 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 680 518 0.00101146497019286 0.00102297400631356 0.000701915007248035 0.00064087891966125 0.00101216526498043 0.00103087859063562 44213 44582 667 665 0 True 682 519 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 284 563 0.000935238491992273 0.00088275162614708 0.000793469138628214 0.00080872816052491 0.000733133225919211 0.000678011458542249 40881 38471 667 665 0 True 281 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 327 563 0.000945578938614922 0.00103538773690922 0.000823987182421607 0.000900282291905089 0.000736562720325203 0.000764189363748901 41333 45123 667 665 0 True 326 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 372 563 0.000960677820851534 0.000938326590107679 0.000839246204318303 0.000823987182421607 0.000729275598664555 0.000671115352899291 41993 40893 667 665 0 True 370 564 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 416 562 0.00096092946888881 0.000917170472530606 0.000717174029144732 0.000656137941557946 0.000890094666335468 0.000861997694497736 42004 39971 667 665 0 True 415 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 460 561 0.00102219432741858 0.000995576604592277 0.000518806744487678 0.000625619897764553 0.00112600784928791 0.00100412984927053 44682 43388 667 665 0 True 459 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 504 560 0.000939104720928618 0.00098662770453256 0.000473029678797589 0.000518806744487678 0.00107426970443895 0.00115617286909376 41050 42998 667 665 0 True 504 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 548 560 0.000873081426784891 0.000973594434701999 0.000457770656900893 0.000610360875867857 0.000966996279282856 0.000991887182983318 38164 42430 667 665 0 True 549 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 593 563 0.0010045789648092 0.00102455727324721 0.000732433051041428 0.000778210116731518 0.00090109984642621 0.000828823104484693 43912 44651 667 665 0 False 593 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 637 559 0.000958458742704638 0.000943764767836276 0.000671396963454643 0.00064087891966125 0.000902658871916683 0.000900955631006774 41896 41130 667 665 0 True 638 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 681 559 0.00108984189525745 0.00101565426498267 0.000885023270008392 0.000701915007248035 0.000917139175830547 0.000927211370755982 47639 44263 667 665 0 True 682 563 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 281 607 0.000897148129986277 0.000924627889247036 0.000778210116731518 0.000778210116731518 0.000702648397104704 0.000753854388037921 39216 40296 667 665 0 False 281 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 326 607 0.000985430836881857 0.00104491028440866 0.000869764248111696 0.000946059357595178 0.000765480872659544 0.000741260381850307 43075 45538 667 665 0 False 326 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 372 604 0.000898497878549853 0.000976760968569283 0.000778210116731518 0.000869764248111696 0.000708725913998711 0.000722725201411256 39275 42568 667 665 0 True 370 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 416 604 0.000925904637518732 0.000961731405648477 0.000656137941557946 0.000671396963454643 0.000915264714702128 0.000870548586346776 40473 41913 667 665 0 True 415 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 460 607 0.000972642541169333 0.000882889301532614 0.000518806744487678 0.0004272526131075 0.00107904334436418 0.000971153199667457 42516 38477 667 665 0 False 460 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 504 607 0.000883833661104902 0.000942112663209867 0.000442511635004196 0.000518806744487678 0.00102427313831047 0.00104011015615644 38634 41058 667 665 0 False 504 607 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 549 606 0.000800652546237753 0.000998559571278849 0.000350957503624018 0.000610360875867857 0.000948080010786464 0.00105263685736091 34998 43518 667 665 0 False 549 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 593 606 0.000957543658932722 0.000952071182763501 0.000671396963454643 0.00064087891966125 0.000910987011484955 0.000848354233667572 41856 41492 667 665 0 False 593 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 638 606 0.000992545613208502 0.00100319464259183 0.000747692072938125 0.00080872816052491 0.000808753316136281 0.000826943290384284 43386 43720 667 665 0 False 638 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 683 606 0.00106792563892007 0.00104068823925228 0.000823987182421607 0.000732433051041428 0.00088352846442593 0.000914391192858611 46681 45354 667 665 0 False 683 606 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 282 656 0.00104605513677128 0.0730509037528589 0.000900282291905089 0.0720073243305104 0.000756611792375389 0.0234422956634093 45725 3183615 667 665 0 True 281 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 326 651 0.00101041262385516 0.000959161465118507 0.000930800335698482 0.000869764248111696 0.000715061473957357 0.000636594672089616 44167 41801 667 665 0 False 326 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 370 650 0.000898360615984066 0.00087550072250895 0.000793469138628214 0.000778210116731518 0.000640460301321975 0.000631296206677689 39269 38155 667 665 0 False 370 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 415 650 0.000993895361772078 0.000912971373271815 0.00080872816052491 0.000717174029144732 0.000784304052975493 0.000743379889860249 43445 39788 667 665 0 False 415 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 460 650 0.000945739078275008 0.00093527478572834 0.000671396963454643 0.000732433051041428 0.000909254782386808 0.00082576989653589 41340 40760 667 665 0 False 460 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 504 650 0.00092983949773797 0.000937431700101708 0.000595101853971161 0.000671396963454643 0.000929073267103794 0.000881895003350636 40645 40854 667 665 0 False 504 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 549 650 0.000934483547880443 0.000969234714160085 0.000656137941557946 0.000701915007248035 0.000882209279736778 0.00089356383006643 40848 42240 667 665 0 False 549 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 594 650 0.000879875923791366 0.000962718079244805 0.000701915007248035 0.000793469138628214 0.000694680667459546 0.000700194301418572 38461 41956 667 665 0 False 594 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 638 650 0.000944366452617134 0.000928758150813059 0.00080872816052491 0.000778210116731518 0.000699569615719217 0.000681082006899463 41280 40476 667 665 0 False 638 650 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 678 653 0.00114458678191232 0.0760299007991482 0.00103761348897536 0.075745784695201 0.000773116058523941 0.025414014881854 50032 3313442 667 665 0 True 683 649 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G7_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G7_1.csv new file mode 100755 index 0000000..539b409 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G7_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 274 277 0.00950376265289191 0.037377582202244 0.00956740672922866 0.0384069581139849 0.00145805655407096 0.00953863443666989 415427 1628944 667 665 0 True 275 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 320 276 0.00934618522736801 0.0104902907302589 0.00946059357595178 0.00976577401388571 0.00137290352162673 0.00521857468714734 408539 457175 667 665 0 False 320 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 362 276 0.00978684381773407 0.0509507460571777 0.0098115510795758 0.0539101243610285 0.00139812941336322 0.0106840036229602 427801 2220473 667 665 0 True 364 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 407 276 0.00979729864982821 0.0684271447673888 0.0098115510795758 0.0694285496299687 0.00162848895241976 0.0109888907935567 428258 2982108 667 665 0 True 409 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 451 276 0.00973532460137521 0.059191948743454 0.0098115510795758 0.0593575951781491 0.00185022044076889 0.015135916960618 425549 2579631 667 665 0 True 454 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 498 276 0.00961670686744062 0.0522713054093233 0.00962844281681544 0.0556038757915618 0.0015964834636532 0.0162209426930295 420364 2278024 667 665 0 False 498 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 540 275 0.00969512954669381 0.0663505410355828 0.00970473792629892 0.0667887388418402 0.00158750455283107 0.0217030643410526 423792 2891608 667 665 0 True 543 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 587 275 0.00979226568908267 0.0533490512731818 0.00971999694819562 0.0550240329594873 0.00194825094305428 0.0174140989562882 428038 2324993 667 665 0 False 587 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 632 275 0.00938397818714813 0.00923528780752522 0.00935378042267491 0.00935378042267491 0.00199608825806218 0.00184089623860008 410191 402481 667 665 0 False 632 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 670 273 0.00933689712708306 0.0375245277304041 0.00941481651026169 0.0386358434424353 0.0017650749764792 0.00895574704481565 408133 1635348 667 665 0 True 676 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 275 320 0.00933497545116204 0.00936279816042739 0.0093842984664683 0.009399557488365 0.00149250340703736 0.00149513110448719 408049 408038 667 665 0 False 275 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 320 319 0.00932278195990126 0.00950967485089469 0.00929274433508812 0.00949111161974517 0.00133815125366266 0.00127780022984914 407516 414439 667 665 0 False 320 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 364 320 0.00986361934619781 0.0874032643981205 0.0098268101014725 0.0850995651178759 0.00140092455347345 0.0230574875969478 431157 3809102 667 665 0 True 365 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 408 321 0.00987277018391697 0.0506348728309673 0.00988784618905928 0.0504005493247883 0.00154456149333879 0.0139769207231021 431557 2206707 667 665 0 True 409 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 452 319 0.00990653677510066 0.0695502087789857 0.00993362325474937 0.0679331654840925 0.00180908072839312 0.0181805908012122 433033 3031052 667 665 0 True 454 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 498 319 0.00992714903706307 0.0394495049709419 0.00994888227664607 0.0397039749752041 0.00174743892095462 0.0113834822370215 433934 1719240 667 665 0 False 498 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 543 319 0.00998694976155776 0.0334735212946534 0.00997940032043946 0.0357061112382696 0.00166906665288855 0.00748520487596728 436548 1458802 667 665 0 False 543 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 585 319 0.00978423582898411 0.0423026667148531 0.00978103303578241 0.0440985732814527 0.00195801341426719 0.00894861789091872 427687 1843583 667 665 0 True 587 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 632 319 0.0097234971436232 0.00955609440171727 0.00958266575112535 0.00953688868543526 0.00261464390238042 0.00198870058544177 425032 416462 667 665 0 False 632 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 676 319 0.0093386129091554 0.00937651980718562 0.0093690394445716 0.00941481651026169 0.00187793116778575 0.00190215849864449 408208 408636 667 665 0 False 676 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 275 365 0.00978782753278888 0.0458398686117904 0.00984206912336919 0.0476539253833829 0.00158092193829771 0.012549690998512 427844 1997737 667 665 0 True 275 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 320 363 0.00966438273195744 0.0537251115887682 0.00956740672922866 0.0563210498207065 0.00150799748231032 0.0190517547010516 422448 2341382 667 665 0 False 320 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 364 365 0.00970704851282301 0.0336965783651163 0.00968947890440223 0.0345922026398108 0.00158603346187702 0.00761380384820969 424313 1468523 667 665 0 True 365 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 409 363 0.00970695700444582 0.0299470121859926 0.00970473792629892 0.0307927061875334 0.00155648088950082 0.00550209756046588 424309 1305114 667 665 0 False 409 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 453 364 0.0101850882752718 0.0603575085573857 0.0102082856488899 0.0604715037766079 0.00172382963916796 0.0120598600300955 445209 2630427 667 665 0 True 454 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 498 362 0.0100420835588157 0.0269424304638915 0.0100556954299229 0.0281376363775082 0.00172064838110989 0.00517405085624163 438958 1174172 667 665 0 False 498 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 543 362 0.0101393798408646 0.0245400867699117 0.0101777676050965 0.0257267109178302 0.00164943135016744 0.00468023391982266 443211 1069476 667 665 0 False 543 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 585 363 0.00989075158003512 0.0430618776283809 0.00978103303578241 0.0438696879530022 0.00201731559370892 0.00872755828652351 432343 1876670 667 665 0 True 587 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 629 362 0.00966115706166143 0.051045925640377 0.00971999694819562 0.0518806744487678 0.00200594920919398 0.0143121212491727 422307 2224621 667 665 0 True 632 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 677 362 0.00985268409512341 0.0524541383213126 0.0098268101014725 0.0560616464484627 0.00209584491329397 0.0205147176256266 430679 2285992 667 665 0 False 677 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 276 406 0.00977993493525611 0.0380975556308946 0.0097962920576791 0.0428473334859236 0.0016509178552853 0.0126878234035016 427499 1660321 667 665 0 False 276 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 321 408 0.00969405432326181 0.0326351470344435 0.00968947890440223 0.0313267719539178 0.00144208254343798 0.00855211611634751 423745 1422265 667 665 0 True 320 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 364 408 0.00996107576790685 0.0755682522855548 0.00991836423285267 0.0757152666514076 0.0015288337132754 0.0214191407766118 435417 3293323 667 665 0 True 365 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 409 408 0.00994563372925577 0.0584692676988879 0.00993362325474937 0.0587167162584878 0.00149525898999056 0.0159581108513073 434742 2548136 667 665 0 True 409 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 453 408 0.0101101429143519 0.0391089419589257 0.0102082856488899 0.0406805523765927 0.00164220895847222 0.00886568579212064 441933 1704398 667 665 0 True 454 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 497 406 0.0100201901795726 0.0481973530759836 0.0100099183642329 0.0491493095292592 0.00169640595292738 0.0128639325322765 438001 2100478 667 665 0 True 498 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 541 406 0.0098821955467677 0.0377037581364719 0.00987258716716258 0.0397650110627909 0.00161155985065831 0.00738402967185597 431969 1643159 667 665 0 True 543 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 585 406 0.0101520995052943 0.0451932761636295 0.010101472495613 0.0458228427557794 0.00196701193653546 0.0091307967184269 443767 1969558 667 665 0 True 588 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 629 406 0.0101404321872023 0.0436440379961118 0.0100404364080262 0.0454261081864652 0.00209386522625796 0.00951944685221117 443257 1902041 667 665 0 True 632 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 673 406 0.00988709124494745 0.0840922861055133 0.0098268101014725 0.0856183718623636 0.00185253797481532 0.0210589376236065 432183 3664807 667 665 0 True 677 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 276 453 0.00984971007286469 0.0404194968997224 0.0098268101014725 0.0419928282597086 0.00169780589657324 0.00949988503837657 430549 1761513 667 665 0 True 276 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 321 452 0.00977709817556317 0.0520771831157202 0.00976577401388571 0.051621271076524 0.00159993006154137 0.0117643806790418 427375 2269564 667 665 0 True 320 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 366 452 0.00999898311315846 0.0329565043301777 0.00999465934233616 0.0336614023041123 0.00147804496518807 0.00457084858557267 437074 1436270 667 665 0 True 365 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 409 452 0.0101154275231347 0.0485775207072385 0.0100709544518196 0.0498817425803006 0.00185320630322045 0.0112936319507955 442164 2117046 667 665 0 True 409 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 454 452 0.0102660731890864 0.0889352243047536 0.0102388036926833 0.0887922484168765 0.00193907681298008 0.0143253915807059 448749 3875866 667 665 0 True 454 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 498 451 0.00999365275018705 0.055542334894228 0.0100709544518196 0.0560311284046693 0.00188961599376182 0.0159836735552789 436841 2420578 667 665 0 True 499 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 542 450 0.00992255074110919 0.0479941442069353 0.00990310521095598 0.0479743648432136 0.00184018650695639 0.0113059507949299 433733 2091622 667 665 0 True 543 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 588 449 0.0100273507100878 0.0305811679576602 0.00994888227664607 0.0316929884794385 0.00199599327357099 0.00600276696020721 438314 1332751 667 665 0 False 588 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 630 450 0.00970025401581654 0.0380019859674363 0.00965896086060884 0.0387273975738155 0.00181232112863279 0.0076364663781956 424016 1656156 667 665 0 True 632 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 674 450 0.0096745401618257 0.0832557245712129 0.00962844281681544 0.0784313725490196 0.00195991416405111 0.0288839952068679 422892 3628349 667 665 0 True 677 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 279 497 0.0101761204543071 0.0498557678242298 0.0101319905394064 0.0509040970473793 0.00153183164780183 0.0131705944063466 444817 2172753 667 665 0 True 276 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 322 496 0.0106040822573378 0.0504435040450749 0.0105897611963073 0.0513618677042802 0.00164998404449272 0.00767794196331016 463524 2198367 667 665 0 True 320 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 366 496 0.0106549609150563 0.0654547561396051 0.0105897611963073 0.0638742656595712 0.00165164695406835 0.017627188314404 465748 2852569 667 665 0 True 365 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 411 496 0.0106786387076546 0.0826040381337872 0.0105745021744106 0.0792248416876478 0.00198598511901171 0.0215776777833943 466783 3599948 667 665 0 True 409 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 455 495 0.0108283006585515 0.0912436963316967 0.0107423514152743 0.0886854352635996 0.0021098172690553 0.0320756928868058 473325 3976471 667 665 0 True 454 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 498 495 0.0106166417821073 0.0409639801036122 0.0106507972838941 0.0426031891355764 0.00198169660961571 0.00654641514195526 464073 1785242 667 665 0 True 499 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 543 493 0.0104558158091931 0.0400998605463074 0.0104676890211337 0.0418402380407416 0.00194080278875241 0.00973404862706002 457043 1747583 667 665 0 False 543 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 587 494 0.0107641761632345 0.0989270383557888 0.0106660563057908 0.0966964217593652 0.00239238522615232 0.0239701367417209 470522 4311317 667 665 0 True 588 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 631 494 0.0100751180829819 0.058746913059715 0.0100709544518196 0.0601815823605707 0.00194405123221723 0.0174904420463389 440402 2560236 667 665 0 True 632 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 676 494 0.0103951915093037 0.0707041120769422 0.010406652933547 0.071274891279469 0.00206078320949874 0.0157811917028175 454393 3081340 667 665 0 True 677 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 278 541 0.00973859602585981 0.0448831394118163 0.00975051499198901 0.0480659189745937 0.00154982686516525 0.010904280815595 425692 1956042 667 665 0 True 276 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 323 540 0.0102246885255015 0.094573490260327 0.0102693217364767 0.0905317769130999 0.00152052899457246 0.0264673404546361 446940 4121586 667 665 0 True 320 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 367 540 0.0102296299778698 0.0566637009094033 0.0102235446707866 0.0567940794995041 0.00157107088665629 0.0148199251433759 447156 2469448 667 665 0 True 365 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 411 540 0.0104293470110905 0.0539785031358437 0.0104676890211337 0.0547341115434501 0.00177078029317148 0.00825939960951591 455886 2352425 667 665 0 True 410 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 456 539 0.0104907948863746 0.0550817877837189 0.0105592431525139 0.0554055085069047 0.00209546307481694 0.00898353692980544 458572 2400507 667 665 0 True 454 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 500 537 0.0103929266769682 0.0600592577805236 0.0104219119554437 0.0596780346379797 0.00206388919360927 0.0148407802805237 454294 2617429 667 665 0 True 499 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 544 538 0.0102801426020796 0.0696004144029105 0.0103150988021668 0.0673990997177081 0.00192532090806377 0.0186119896853338 449364 3033240 667 665 0 True 543 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 588 537 0.0106046313076009 0.0570561445958682 0.0105897611963073 0.055893797207599 0.0019095700763191 0.0162178861181497 463548 2486551 667 665 0 True 588 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 632 537 0.00999543716354229 0.0460132019221778 0.00999465934233616 0.0453040360112917 0.00182048428892965 0.00771772563514672 436919 2005291 667 665 0 True 632 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 677 537 0.0102569452284615 0.0565541113025181 0.0101930266269932 0.0579995422293431 0.00197432949975801 0.0130246938297751 448350 2464672 667 665 0 True 677 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 280 583 0.0102450491394266 0.0420735060356315 0.00964370183871214 0.0426184481574731 0.00545600965716841 0.0100340244370714 447830 1833596 667 665 0 True 276 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 324 583 0.00999513976131641 0.050791776878681 0.00993362325474937 0.0511482413977264 0.00152457775619733 0.0118417261218484 436906 2213545 667 665 0 True 321 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 368 581 0.0100688268820499 0.0419671059085113 0.0100862134737163 0.0429999237048905 0.0013735310691426 0.00973700799632192 440127 1828959 667 665 0 True 365 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 412 582 0.0102582492228365 0.0506667446827185 0.0102082856488899 0.0490730144197757 0.00175013529103155 0.0105429721919929 448407 2208096 667 665 0 True 410 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 456 581 0.0102191065144928 0.0852123212586284 0.0102235446707866 0.0805828946364538 0.002076668203263 0.0245065375335236 446696 3713619 667 665 0 True 454 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 500 580 0.0101118815735186 0.0622224134380355 0.0100404364080262 0.0607461661707485 0.00216428353867869 0.0134448199426903 442009 2711701 667 665 0 True 499 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 544 579 0.0103789258952579 0.0518757410807862 0.0104219119554437 0.0522774090180819 0.00199326487054837 0.00921552331761164 453682 2260785 667 665 0 True 543 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 588 579 0.00998807073917836 0.035574998379446 0.0100556954299229 0.0367132066834516 0.00188254938565291 0.00822465889752711 436597 1550386 667 665 0 False 588 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 633 579 0.00988285898250234 0.0437103516401441 0.00990310521095598 0.0442969405661097 0.00176042549757693 0.00808298066060623 431998 1904931 667 665 0 True 633 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 677 579 0.00997175937094396 0.0481552702998054 0.0100404364080262 0.0479133287556268 0.00172337559344048 0.00851910675236375 435884 2098644 667 665 0 True 677 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 276 623 0.00945517170460318 0.00924760975453052 0.00947585259784848 0.00920119020370794 0.00154290226094872 0.00141163744677351 413303 403018 667 665 0 False 276 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 321 623 0.00955770684124635 0.00957848959776415 0.00958266575112535 0.00964370183871214 0.00141758295769029 0.00142886206435415 417785 417438 667 665 0 False 321 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 368 625 0.00977625172307415 0.0690962471410846 0.00976577401388571 0.0673685816739147 0.00135449263022117 0.0139665182287986 427338 3011268 667 665 0 True 365 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 412 625 0.00996640613087826 0.0743361034768198 0.00991836423285267 0.0706492713817044 0.00163579926733088 0.0238339996212732 435650 3239625 667 665 0 True 410 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 454 623 0.00967213806692442 0.00991510591539503 0.00984206912336919 0.00985732814526589 0.00181697013445006 0.00195435601667387 422787 432108 667 665 0 False 454 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 499 623 0.00964395348674942 0.00972883111876739 0.00959792477302205 0.00973525597009232 0.00207915482555998 0.00193579944312599 421555 423990 667 665 0 False 499 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 543 623 0.00996690942695281 0.00949152464590178 0.00987258716716258 0.00950637064164187 0.00200073712562295 0.0019548307040119 435672 413648 667 665 0 False 543 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 588 623 0.00962258628067518 0.0096563220823861 0.00958266575112535 0.00964370183871214 0.00157675895062666 0.00151239671303776 420621 420830 667 665 0 False 588 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 633 622 0.00970398298218709 0.00941860258336388 0.00975051499198901 0.0093842984664683 0.0014965867368747 0.00143217828127398 424179 410470 667 665 0 False 633 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 677 622 0.00959165644918443 0.00962082477881589 0.00965896086060884 0.00964370183871214 0.0016547476812752 0.00145858797040741 419269 419283 667 665 0 False 677 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 276 672 0.00935485564610691 0.0375686756373653 0.0093690394445716 0.0383154039826047 0.0013907873827961 0.00839485340235611 408918 1637272 667 665 0 True 276 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 321 667 0.00919341199164666 0.00930020175180455 0.00920119020370794 0.00929274433508812 0.00130815028226961 0.00129470930803075 401861 405310 667 665 0 False 321 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 365 666 0.00932108905492321 0.00931663101447829 0.00930800335698482 0.00930800335698482 0.00135158601397733 0.0012816482139566 407442 406026 667 665 0 False 365 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 410 666 0.00939175639920941 0.0093253734014597 0.009399557488365 0.00932326237888151 0.00144582039000662 0.00136749885177975 410531 406407 667 665 0 False 410 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 454 666 0.00924598355434322 0.0093968269265519 0.00921644922560464 0.00935378042267491 0.00143356104408642 0.00154606323618304 404159 409521 667 665 0 False 454 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 499 666 0.00939427287958218 0.00939070037189564 0.00943007553215839 0.00935378042267491 0.00177161952864091 0.00169699908354616 410641 409254 667 665 0 False 499 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 544 666 0.00937912824315697 0.00950391543059985 0.00950637064164187 0.00953688868543526 0.00174086763775202 0.00184581332364543 409979 414188 667 665 0 False 544 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 588 666 0.00958609731527004 0.0093778277233482 0.00959792477302205 0.0093842984664683 0.0014268136635645 0.00126093971096434 419026 408693 667 665 0 False 588 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 633 666 0.00940239424805794 0.00952966072769472 0.00935378042267491 0.00958266575112535 0.00138226723612859 0.00134813826305049 410996 415310 667 665 0 False 633 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 673 669 0.00957841061158594 0.0381480824973856 0.00961318379491875 0.0387731746395056 0.00153023150130875 0.0086597574953232 418690 1662523 667 665 0 True 677 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G7_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G7_2.csv new file mode 100755 index 0000000..b71862d --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G7_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 274 277 0.00846756754376302 0.69303680349879 0.00788891432059205 0.729762722209506 0.002988084161231 0.233742056801734 370133 30203081 667 665 10 True 275 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 320 276 0.00666123793218978 0.00693844935065978 0.00657663843747616 0.00668345159075303 0.00144084933495702 0.00217558499747188 291175 302383 667 665 0 False 320 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 362 276 0.00643953601134887 0.00628460599886074 0.0063935301747158 0.00633249408712902 0.00120844477007628 0.00123912182532191 281484 273888 667 665 0 True 364 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 407 276 0.00645429173717101 0.00666000088341706 0.00645456626230259 0.00669871061264973 0.00139003897436804 0.00138371946370709 282129 290248 667 665 0 True 409 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 451 276 0.00650057209893566 0.00651865415426871 0.00648508430609598 0.00650034332799268 0.0016062815212112 0.00180948288025489 284152 284088 667 665 0 True 454 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 498 276 0.00676619804082852 0.00683985082871977 0.00677500572213321 0.00683604180972 0.00166398918477958 0.0015676158716897 295763 298086 667 665 0 False 498 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 540 275 0.00712852546031859 0.00708853846678954 0.00711070420386053 0.00709544518196384 0.00153447977617776 0.00155995335119802 311601 308924 667 665 0 True 543 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 587 275 0.00711573716460607 0.00739280106881991 0.00700389105058366 0.00737010757610437 0.00166771947842012 0.00197675868326781 311042 322184 667 665 0 False 587 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 632 275 0.0105803358334566 0.00808386266650834 0.0080872816052491 0.00816357671473259 0.0124174774489119 0.00191369836943689 462486 352301 667 665 0 False 632 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 670 273 0.00919103277383968 0.700851464894784 0.00909437705043107 0.724193179217212 0.00215122348362166 0.216217592520567 401757 30543650 667 665 10 True 676 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 275 320 0.00664369120086329 0.00653106788486437 0.00659189745937285 0.00654612039368277 0.00162851533995723 0.00139674315360916 290408 284629 667 665 0 False 275 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 320 319 0.00647266204389222 0.00640413117940193 0.0063935301747158 0.0064087891966125 0.00127361646324824 0.00121248233004763 282932 279097 667 665 0 False 320 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 364 320 0.00664556712259572 0.0068074053295289 0.00674448767833982 0.0068055237659266 0.00133851149293125 0.00119410985148241 290490 296672 667 665 0 True 365 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 408 321 0.00683537837398536 0.00681483980034775 0.00679026474402991 0.00674448767833982 0.00147356594187567 0.00140033440993573 298787 296996 667 665 0 True 409 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 452 319 0.0070947359920406 0.00711042885308946 0.00709544518196384 0.00700389105058366 0.00176212572404669 0.00202675679442097 310124 309878 667 665 0 True 454 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 498 319 0.00708338895326885 0.00687947839385601 0.00703440909437705 0.00697337300679027 0.00171348998479905 0.00160798313406003 309628 299813 667 665 0 False 498 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 543 319 0.00709075537763277 0.00679623067740305 0.00708018616006714 0.0068055237659266 0.00158086289738797 0.00142216481384616 309950 296185 667 665 0 False 543 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 585 319 0.00713815671701801 0.00742442051569758 0.00712596322575723 0.00737010757610437 0.00188081475872631 0.00206743113674133 312022 323562 667 665 0 True 587 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 632 319 0.00763250784770123 0.00736352210349632 0.00762951094834821 0.00743114366369116 0.00210905605562147 0.00191865180166239 333631 320908 667 665 0 False 632 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 676 319 0.00728125294185135 0.0073148997465052 0.00720225833524071 0.00727855344472419 0.0018730748443204 0.00198950638133483 318277 318789 667 665 0 False 676 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 275 365 0.00627802372560573 0.00655424324142928 0.00625619897764553 0.00660715648126955 0.00145461147657431 0.001440520351778 274424 285639 667 665 0 True 275 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 320 363 0.00659107388397813 0.00632889158120754 0.00653086137178607 0.00631723506523232 0.00131435658874752 0.00135888763084312 288108 275818 667 665 0 False 320 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 364 365 0.00683553851364544 0.0071389735496902 0.0068207827878233 0.00712596322575723 0.0013183968288862 0.00140697750124592 298794 311122 667 665 0 True 365 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 409 363 0.00713843124214958 0.00707940599954911 0.00721751735713741 0.00714122224765393 0.0015206503721594 0.00143288515350195 312034 308526 667 665 0 False 409 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 453 364 0.00720925872609587 0.00724353800500335 0.00714122224765393 0.0072327763790341 0.00157799736059448 0.00179109024821019 315130 315679 667 665 0 True 454 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 498 362 0.00712349249957306 0.00696609915725455 0.00712596322575723 0.00688181887541009 0.00178673837503007 0.00192762483537658 311381 303588 667 665 0 False 498 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 543 362 0.0072002222738482 0.00731958070961336 0.00721751735713741 0.00727855344472419 0.00159769028653327 0.00165550281722038 314735 318993 667 665 0 False 543 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 585 363 0.00729706101401119 0.00750101392184971 0.0072632944228275 0.00747692072938125 0.00198788671076557 0.00234579085703597 318968 326900 667 665 0 True 587 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 629 362 0.00676393320849303 0.00712536663241991 0.00668345159075303 0.00701915007248035 0.00198550645977766 0.00259291797330583 295664 310529 667 665 0 True 632 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 677 362 0.00640128550968279 0.00640826144096795 0.0064087891966125 0.00643930724040589 0.00184110763764153 0.00188556837008903 279812 279277 667 665 0 False 677 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 276 406 0.00640160578900296 0.00664857382641773 0.0064087891966125 0.00663767452506294 0.00145139077902642 0.00145641793318459 279826 289750 667 665 0 False 276 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 321 408 0.00641242665460586 0.00669848115367384 0.0064087891966125 0.00672922865644312 0.001293053620148 0.00128739530231087 280299 291925 667 665 0 True 320 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 364 408 0.00699098836939964 0.00707339417438079 0.00691233691920348 0.00706492713817044 0.00135946443817353 0.00143485573755506 305589 308264 667 665 0 True 365 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 409 408 0.00705284803238115 0.00733082419943197 0.00709544518196384 0.00740062561989776 0.00139812701128711 0.0015017244431324 308293 319483 667 665 0 True 409 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 453 408 0.00723462942367223 0.00731666658061955 0.00733958953231098 0.00737010757610437 0.00160190882172009 0.00163046608713424 316239 318866 667 665 0 True 454 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 497 406 0.00715849445384884 0.00723706726188325 0.00732433051041428 0.00729381246662089 0.00172453966502597 0.00174752872595507 312911 315397 667 665 0 True 498 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 541 406 0.0069643365545426 0.00715531102877358 0.00700389105058366 0.00718699931334401 0.00156728026166288 0.00161250162801726 304424 311834 667 665 0 True 543 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 585 406 0.00684555868094792 0.00695497039692387 0.00685130083161669 0.00692759594110018 0.00189230989030676 0.00197624572100424 299232 303103 667 665 0 True 588 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 629 406 0.00661049653703704 0.00628545499707153 0.00656137941557946 0.00621042191195544 0.00186990304857932 0.00185951560724958 288957 273925 667 665 0 True 632 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 673 406 0.00614924856180287 0.00605457337553084 0.00619516289005875 0.00607309071488518 0.00176934331878633 0.00171194027090579 268795 263863 667 665 0 True 677 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 276 453 0.00633688648923421 0.00641418148254592 0.00633249408712902 0.00651560234988937 0.00147327938724492 0.00150951456765872 276997 279535 667 665 0 True 276 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 321 452 0.00652244260108444 0.00654428472187564 0.00656137941557946 0.00653086137178607 0.00143171343003684 0.00158157491853625 285108 285205 667 665 0 True 320 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 366 452 0.00673499368420619 0.00657934605339166 0.00675974670023652 0.00662241550316625 0.00141970336146277 0.00138039128048945 294399 286733 667 665 0 True 365 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 409 452 0.00683762032922655 0.00677466153366938 0.00683604180972 0.00685130083161669 0.00168617586229648 0.00154906519122487 298885 295245 667 665 0 True 409 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 454 452 0.00700297596681174 0.00703541871387097 0.00700389105058366 0.00709544518196384 0.00183699421085597 0.00192548222911807 306113 306609 667 665 0 True 454 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 498 451 0.00700279295005736 0.00709349478066877 0.00708018616006714 0.00711070420386053 0.00179472071882342 0.00190032905424479 306105 309140 667 665 0 True 499 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 542 450 0.00658562913553523 0.00702250017352835 0.00668345159075303 0.00704966811627375 0.00170890928388915 0.00181231421105438 287870 306046 667 665 0 True 543 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 588 449 0.00633670347247983 0.00674774599579746 0.00628671702143893 0.00669871061264973 0.00184546778740001 0.00211822764471652 276989 294072 667 665 0 False 588 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 630 450 0.00606094297781299 0.0061898394418181 0.00601205462729839 0.00624093995574884 0.00177280052240668 0.00184554804978832 264935 269758 667 665 0 True 632 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 674 450 0.00588684829020601 0.006066344620994 0.00587472343022812 0.00607309071488518 0.00175405926474312 0.00183640732302811 257325 264376 667 665 0 True 677 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 279 497 0.00735171439228886 0.00777191318878565 0.00733958953231098 0.00749217975127794 0.00175944903565299 0.00233053928813362 321357 338706 667 665 0 True 276 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 322 496 0.00740229564778151 0.0078881800518692 0.00740062561989776 0.00790417334248875 0.00178112550193232 0.00171853437263861 323568 343773 667 665 0 True 320 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 366 496 0.00732428475622569 0.0080822793995747 0.00733958953231098 0.00790417334248875 0.0016533727776105 0.00191827870394 320158 352232 667 665 0 True 365 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 411 496 0.00730184232671945 0.00840914371073025 0.00718699931334401 0.00845349813076982 0.0018533012527807 0.00201590347506234 319177 366477 667 665 0 True 409 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 455 495 0.00728761277406616 0.00884266055387955 0.0072480354009308 0.00878919661249714 0.00209042253528238 0.00223642494375476 318555 385370 667 665 0 True 454 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 498 495 0.00709409543340026 0.00845542558616729 0.00717174029144732 0.00820935378042268 0.00189047858204923 0.00250634169265541 310096 368494 667 665 0 True 499 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 543 493 0.00712793065586685 0.00835882335731753 0.00715648126955062 0.00781261921110857 0.00185115468299746 0.00334989644795334 311575 364284 667 665 0 False 543 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 587 494 0.00713856850471537 0.00769385124518781 0.00692759594110018 0.0076600289921416 0.00250457516401455 0.00248012790360452 312040 335304 667 665 0 True 588 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 631 494 0.00647961668055878 0.00764807417949773 0.00650034332799268 0.00738536659800107 0.00185886629070947 0.00273737588730962 283236 333309 667 665 0 True 632 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 676 494 0.0068805606352237 0.00738619265031427 0.00685130083161669 0.00717174029144732 0.00209299808741038 0.00250434563162081 300762 321896 667 665 0 True 677 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 278 541 0.00670381220467816 0.0068646553440135 0.00666819256885634 0.0068055237659266 0.00142697906476128 0.00146976673019728 293036 299167 667 665 0 True 276 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 323 540 0.00686562189264718 0.00680843789492041 0.00689707789730678 0.00686655985351339 0.00140725174890133 0.00140298160116292 300109 296717 667 665 0 True 320 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 367 540 0.00679419960424915 0.00713436142427481 0.00675974670023652 0.00715648126955062 0.00147983295773646 0.00148345699323557 296987 310921 667 665 0 True 365 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 411 540 0.0067272612263335 0.00702332622584156 0.00671396963454643 0.00708018616006714 0.00172883620485749 0.00170819221373742 294061 306082 667 665 0 True 410 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 456 539 0.00659695329721269 0.0067716785669828 0.00659189745937285 0.00677500572213321 0.00197443236338224 0.00198366908551007 288365 295115 667 665 0 True 454 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 500 537 0.00698362194503572 0.00684896035006261 0.00697337300679027 0.00679026474402991 0.0018639129248104 0.00207034965989 305267 298483 667 665 0 True 499 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 544 538 0.00676553460509388 0.00679015001454196 0.00685130083161669 0.00686655985351339 0.00172087688863412 0.00186239109907612 295734 295920 667 665 0 True 543 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 588 537 0.00687337722761416 0.00701793393990814 0.00691233691920348 0.00701915007248035 0.00177995484860274 0.00159717605562473 300448 305847 667 665 0 True 588 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 632 537 0.00665140078164168 0.00658471539342749 0.00660715648126955 0.00653086137178607 0.0017840192170963 0.00187517648918349 290745 286967 667 665 0 True 632 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 677 537 0.00667764080880137 0.00648533671096946 0.00659189745937285 0.00650034332799268 0.00181612177880185 0.0017999092248019 291892 282636 667 665 0 True 677 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 280 583 0.00808039559986544 0.0069728911429409 0.00683604180972 0.00691233691920348 0.00895486946218557 0.00139564443588981 353209 303884 667 665 0 True 276 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 324 583 0.00679822597284558 0.00673329008031638 0.00689707789730678 0.00675974670023652 0.00142324013093446 0.00139865689393826 297163 293442 667 665 0 True 321 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 368 581 0.0066805690768715 0.00693429614319617 0.00662241550316625 0.00692759594110018 0.0013444673572159 0.00126288185548109 292020 302202 667 665 0 True 365 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 412 582 0.00650285980836544 0.00683673018664767 0.00654612039368277 0.00692759594110018 0.0016055776757779 0.00156392598799323 284252 297950 667 665 0 True 410 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 456 581 0.00668015728917414 0.00661167682309459 0.00665293354695964 0.00668345159075303 0.00187701033305792 0.00183227949989392 292002 288142 667 665 0 True 454 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 500 580 0.0068023209727249 0.00686605504376643 0.00679026474402991 0.00694285496299687 0.00191775343455724 0.00217752733969187 297342 299228 667 665 0 True 499 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 544 579 0.00683951912805328 0.00698385928198845 0.00688181887541009 0.00691233691920348 0.00195187320795181 0.00173529071600706 298968 304362 667 665 0 True 543 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 588 579 0.0069479794321196 0.00707435790207953 0.00700389105058366 0.00708018616006714 0.00173159541123387 0.00159478699247494 303709 308306 667 665 0 False 588 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 633 579 0.0066403053909072 0.00663948725097248 0.00662241550316625 0.00666819256885634 0.0015570789512919 0.00146345372444983 290260 289354 667 665 0 True 633 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 677 579 0.00629710322225017 0.00647817759092168 0.00634775310902571 0.00651560234988937 0.00149095284441077 0.00175040034094277 275258 282324 667 665 0 True 677 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 276 623 0.00710711250005576 0.0069020571570836 0.00714122224765393 0.00695811398489357 0.00158319389980447 0.00141425986046778 310665 300797 667 665 0 False 276 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 321 623 0.00675739035952383 0.00673377194416575 0.00683604180972 0.00672922865644312 0.00142077209926855 0.00125620710323912 295378 293463 667 665 0 False 321 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 368 625 0.00648492416643589 0.00662783073499726 0.00651560234988937 0.00665293354695964 0.00135914443216738 0.00132755511394595 283468 288846 667 665 0 True 365 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 412 625 0.00622371350374252 0.00639986324245037 0.00624093995574884 0.00653086137178607 0.00145492550887551 0.00147980602919843 272050 278911 667 665 0 True 410 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 454 623 0.00625896710605558 0.00654182951083362 0.00627145799954223 0.00659189745937285 0.00180102895312687 0.00194625961678728 273591 285098 667 665 0 False 454 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 499 623 0.00653093000306896 0.00663138734912355 0.00646982528419928 0.00666819256885634 0.00181663046751381 0.00181808575193304 285479 289001 667 665 0 False 499 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 543 623 0.0066664310325954 0.0065117933308896 0.00657663843747616 0.00653086137178607 0.0017842653395762 0.00184701488099021 291402 283789 667 665 0 False 543 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 588 623 0.00665032555820968 0.00670134939087247 0.00671396963454643 0.00669871061264973 0.00167943556546312 0.00135770769971929 290698 292050 667 665 0 False 588 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 633 622 0.00662134027973425 0.00647530935372306 0.00656137941557946 0.00648508430609598 0.00148441563506593 0.00125768346770788 289431 282199 667 665 0 False 633 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 677 622 0.00655046704159937 0.0066657603037119 0.00653086137178607 0.00669871061264973 0.0015620246617055 0.00146069154193558 286333 290499 667 665 0 False 677 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 276 672 0.0087232648267306 0.719174360712952 0.00839246204318303 0.731746395056077 0.00227996010222977 0.208294834985321 381310 31342176 667 665 13 True 276 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 321 667 0.00690929426566186 0.00675885181023054 0.00686655985351339 0.00671396963454643 0.001483530069085 0.00131886385782525 302018 294556 667 665 0 False 321 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 365 666 0.00627340255255755 0.00615948201930783 0.00628671702143893 0.00613412680247196 0.00128468387981125 0.00112564253856346 274222 268435 667 665 0 False 365 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 410 666 0.00625386551402715 0.00608300334264363 0.00625619897764553 0.00605783169298848 0.00128357288680708 0.00133471186090214 273368 265102 667 665 0 False 410 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 454 666 0.00619207448232853 0.00599172456203452 0.00622568093385214 0.00599679560540169 0.00145599530063452 0.00154148293795727 270667 261124 667 665 0 False 454 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 499 666 0.00620955258237212 0.00613479223350204 0.00625619897764553 0.00613412680247196 0.00163571300060305 0.00161746819825072 271431 267359 667 665 0 False 499 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 544 666 0.00619470534817279 0.00628169186986693 0.00616464484626535 0.00631723506523232 0.00163374239390622 0.00177589055711788 270782 273761 667 665 0 False 544 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 588 666 0.00624709389411497 0.0062997273453719 0.00627145799954223 0.00628671702143893 0.00127884021008009 0.00123773511041762 273072 274547 667 665 0 False 588 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 633 666 0.0081145511016522 0.00670871502399854 0.00704966811627375 0.00672922865644312 0.0056056985793704 0.00137057615230939 354702 292371 667 665 0 False 633 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 673 669 0.00828876017473067 0.727480041371453 0.00813305867093919 0.738811322194247 0.00167775334384266 0.209714365003845 362317 31704144 667 665 14 True 677 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G7_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G7_3.csv new file mode 100755 index 0000000..fc86899 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G7_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 274 277 0.00107769415818527 0.0708288230303385 0.000869764248111696 0.0725413900968948 0.000824342981043138 0.02602654852149 47108 3086775 667 665 0 True 275 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 320 276 0.0010828415044023 0.000965127398491651 0.000930800335698482 0.000854505226215 0.0007547011949579 0.000713869422721482 47333 42061 667 665 0 False 320 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 362 276 0.000906939526345776 0.000941791420643621 0.000732433051041428 0.000823987182421607 0.000694043432539336 0.00066372043177961 39644 41044 667 665 0 True 364 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 407 276 0.000849449388375165 0.00099130866764072 0.000686655985351339 0.000839246204318303 0.000694445121129813 0.00074343336237707 37131 43202 667 665 0 True 409 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 451 276 0.00101276896456784 0.00100698071569402 0.000823987182421607 0.000701915007248035 0.000843554919453631 0.000930205425987073 44270 43885 667 665 0 True 454 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 498 276 0.00102093608723219 0.000905926982711987 0.000793469138628214 0.00064087891966125 0.000921225448466399 0.000854274301609475 44627 39481 667 665 0 False 498 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 540 275 0.00108270424183651 0.000959276194606452 0.000946059357595178 0.000732433051041428 0.000853061248055814 0.000835501441633373 47327 41806 667 665 0 True 543 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 587 275 0.000912818939580336 0.000977954155243912 0.000595101853971161 0.000579842832074464 0.000908969496352537 0.00102461327052967 39901 42620 667 665 0 False 587 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 632 275 0.00124924948832519 0.000977632912677666 0.000762951094834821 0.000625619897764553 0.00149874116905189 0.00100853042198437 54607 42606 667 665 0 False 632 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 670 273 0.00111152938065186 0.071309057720979 0.000839246204318303 0.0723125047684443 0.0010366999853352 0.0244748211681426 48587 3107704 667 665 0 True 676 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 275 320 0.00095875614493051 0.00100360766874843 0.000778210116731518 0.000854505226215 0.000742285246479219 0.000752992113789932 41909 43738 667 665 0 False 275 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 320 319 0.000911949609997016 0.000983920088617057 0.000778210116731518 0.000885023270008392 0.000657989715156788 0.000659182951111441 39863 42880 667 665 0 False 320 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 364 320 0.000977309468406104 0.000864624367051756 0.000839246204318303 0.000732433051041428 0.000742073889229824 0.000660882209412347 42720 37681 667 665 0 True 365 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 408 321 0.000964978714579538 0.000911388106338173 0.00080872816052491 0.000701915007248035 0.000772482464148006 0.000742012873789628 42181 39719 667 665 0 True 409 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 452 319 0.00100000354594962 0.00101363502599483 0.000762951094834821 0.000778210116731518 0.000908821657685642 0.000898712017554106 43712 44175 667 665 0 True 454 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 498 319 0.000943245474996537 0.000975498944201887 0.000701915007248035 0.00080872816052491 0.000875505374780325 0.000823726594414529 41231 42513 667 665 0 False 498 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 543 319 0.000968456032912818 0.00105023373264932 0.000762951094834821 0.000854505226215 0.000793865002120775 0.000850286928583075 42333 45770 667 665 0 False 543 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 585 319 0.000988770892649349 0.00102219384579554 0.000701915007248035 0.000671396963454643 0.00100176363374656 0.00110628520792653 43221 44548 667 665 0 True 587 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 632 319 0.000982182289491555 0.000922952838723038 0.000579842832074464 0.000473029678797589 0.00105278829451545 0.000996303481664731 42933 40223 667 665 0 False 632 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 676 319 0.00103914625429332 0.00101854544807888 0.000656137941557946 0.000656137941557946 0.00104371655421311 0.00104432816576273 45423 44389 667 665 0 False 676 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 275 365 0.000907923241400586 0.000972034113665946 0.000762951094834821 0.00080872816052491 0.000757409986601372 0.000775824596786488 39687 42362 667 665 0 True 275 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 320 363 0.00102807374065313 0.000984103655797769 0.000885023270008392 0.000854505226215 0.000727761304151895 0.000738326091582888 44939 42888 667 665 0 False 320 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 364 365 0.000973786395884228 0.00098805035018308 0.000854505226215 0.000885023270008392 0.000728519114255274 0.000679934887865492 42566 43060 667 665 0 True 365 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 409 363 0.000982388183340236 0.000933576789306753 0.000823987182421607 0.000732433051041428 0.000774606993213279 0.000791986636477042 42942 40686 667 665 0 False 409 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 453 364 0.00101144209309856 0.000962396836678558 0.000762951094834821 0.000656137941557946 0.00089397615440886 0.000877319416828152 44212 41942 667 665 0 True 454 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 498 362 0.000926133408461711 0.000974099244448957 0.000625619897764553 0.000610360875867857 0.000861843330342791 0.00093293063636764 40483 42452 667 665 0 False 498 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 543 362 0.000968044245215456 0.00103986218693908 0.000701915007248035 0.000778210116731518 0.000899650315406487 0.000966498673393047 42315 45318 667 665 0 False 543 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 585 363 0.00100142192579609 0.000977495237292132 0.000686655985351339 0.000579842832074464 0.00103292381714102 0.00107911784326456 43774 42600 667 665 0 True 587 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 629 362 0.000954615390862591 0.000926922479005938 0.000610360875867857 0.000503547722590982 0.00101958382910454 0.000988611881251862 41728 40396 667 665 0 True 632 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 677 362 0.000937800726553638 0.000947206652474629 0.000595101853971161 0.000503547722590982 0.000987483145944491 0.0010152851628428 40993 41280 667 665 0 False 677 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 276 406 0.000946173743066668 0.00103995397052944 0.000793469138628214 0.000900282291905089 0.000793215902131338 0.000802923524509719 41359 45322 667 665 0 False 276 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 321 408 0.000949353659174075 0.00099458993099595 0.000823987182421607 0.000885023270008392 0.000728414463058411 0.000712971243408827 41498 43345 667 665 0 True 320 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 364 408 0.000935009721049294 0.000971299844943097 0.00080872816052491 0.00080872816052491 0.000737207202421229 0.000746218677262602 40871 42330 667 665 0 True 365 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 409 408 0.000957955446630084 0.000914577586103047 0.000778210116731518 0.000701915007248035 0.00078233759316856 0.000782232428892456 41874 39858 667 665 0 True 409 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 453 408 0.00102219432741858 0.0010786866456597 0.000793469138628214 0.000823987182421607 0.00087038089361566 0.000924790324144161 44682 47010 667 665 0 True 454 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 497 406 0.00102722728816411 0.000969624794419099 0.000762951094834821 0.00064087891966125 0.00092571824417483 0.000888377093030121 44902 42257 667 665 0 True 498 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 541 406 0.000953746061279271 0.000995691334080222 0.000701915007248035 0.000839246204318303 0.000878602426715337 0.000824456071209254 41690 43393 667 665 0 True 543 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 585 406 0.000959533966136639 0.00098805035018308 0.000625619897764553 0.000534065766384375 0.000991866669609016 0.00109723591047632 41943 43060 667 665 0 True 588 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 629 406 0.000943268352090835 0.000891103932869482 0.000610360875867857 0.000473029678797589 0.000952258239764565 0.000946220964054006 41232 38835 667 665 0 True 632 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 673 406 0.000970400585928139 0.000942732202444771 0.000656137941557946 0.000473029678797589 0.000921150884410505 0.00101216855342292 42418 41085 667 665 0 True 677 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 276 453 0.000953036871356036 0.000942686310649593 0.000839246204318303 0.000778210116731518 0.000802964290009958 0.000845719828978034 41659 41083 667 665 0 True 276 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 321 452 0.00104193725979766 0.000918776685361837 0.000946059357595178 0.000778210116731518 0.000804744304478898 0.000798477842690474 45545 40041 667 665 0 True 320 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 366 452 0.000914671984218465 0.000944521982456714 0.000793469138628214 0.00080872816052491 0.000729178185400089 0.000769371931130446 39982 41163 667 665 0 True 365 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 409 452 0.000973283099809674 0.000920451735885835 0.000732433051041428 0.000686655985351339 0.000868734151124549 0.000878112346567143 42544 40114 667 665 0 True 409 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 454 452 0.000979162513044233 0.00110154075965836 0.000564583810177768 0.000762951094834821 0.00102712649602057 0.00111322490363846 42801 48006 667 665 0 True 454 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 498 451 0.000960426172814257 0.000913246724042884 0.000610360875867857 0.000503547722590982 0.000958777428651061 0.00100304656186963 41982 39800 667 665 0 True 499 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 542 450 0.0010197236012344 0.000875523668406539 0.000732433051041428 0.000579842832074464 0.000964058667060909 0.000871049730051732 44574 38156 667 665 0 True 543 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 588 449 0.00106906949363496 0.000964255454383269 0.000686655985351339 0.000488288700694286 0.00106905152778575 0.00103115561116366 46731 42023 667 665 0 False 588 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 630 450 0.000950222988757395 0.00103300136355996 0.000595101853971161 0.00064087891966125 0.000948881270611762 0.00103084468388084 41536 45019 667 665 0 True 632 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 674 450 0.00093516986070938 0.000886078781297487 0.000579842832074464 0.000488288700694286 0.000995895191944012 0.000975175048753899 40878 38616 667 665 0 True 677 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 279 497 0.0010611082648193 0.00106216559939561 0.000961318379491875 0.000915541313801785 0.000858850974696065 0.000873853766730851 46383 46290 667 665 0 True 276 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 322 496 0.00103894036044463 0.00110073765324274 0.000915541313801785 0.000976577401388571 0.000847138288460012 0.000808835424913057 45414 47971 667 665 0 True 320 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 366 496 0.00101043550094946 0.00111783234694656 0.000869764248111696 0.000946059357595178 0.000806470761977783 0.000861997615092823 44168 48716 667 665 0 True 365 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 411 496 0.000938830195797043 0.00100964243981434 0.000671396963454643 0.000717174029144732 0.000914566285844072 0.000905541274280145 41038 44001 667 665 0 True 409 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 455 495 0.000960083016399788 0.00109566660987557 0.000564583810177768 0.000732433051041428 0.0010087488000684 0.00107630320108079 41967 47750 667 665 0 True 454 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 498 495 0.00108670773333864 0.00101895847423549 0.000839246204318303 0.000732433051041428 0.000969104726035033 0.000956792494052229 47502 44407 667 665 0 True 499 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 543 493 0.000990326535061606 0.0011455280453365 0.000717174029144732 0.000869764248111696 0.000937562109583121 0.000987935634285203 43289 49923 667 665 0 False 543 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 587 494 0.00100464759609209 0.00104351058465573 0.000701915007248035 0.000686655985351339 0.000965913470523264 0.00103570582178532 43915 45477 667 665 0 True 588 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 631 494 0.000969142345741755 0.00108527211826775 0.000656137941557946 0.000717174029144732 0.000939997550909275 0.00107988075432391 42363 47297 667 665 0 True 632 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 676 494 0.000992271088076928 0.00097263070700326 0.000701915007248035 0.000549324788281071 0.000969670988722577 0.00101318093080142 43374 42388 667 665 0 True 677 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 278 541 0.00104360728768141 0.00110787382739293 0.000885023270008392 0.000976577401388571 0.000867886718402137 0.000829498919035241 45618 48282 667 665 0 True 276 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 323 540 0.000979551423647298 0.0009896795089119 0.000885023270008392 0.000823987182421607 0.00077739276500448 0.000777726238157428 42818 43131 667 665 0 True 320 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 367 540 0.00100531103182673 0.000974191028039313 0.000885023270008392 0.000869764248111696 0.000809863853670406 0.000767561619571374 43944 42456 667 665 0 True 365 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 411 540 0.000907465699514628 0.00096680244901565 0.000686655985351339 0.000717174029144732 0.000855426794620083 0.000907427081895453 39667 42134 667 665 0 True 410 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 456 539 0.000892412571466613 0.00106634175275681 0.000457770656900893 0.000732433051041428 0.00100887630557814 0.00113432747225646 39009 46472 667 665 0 True 454 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 500 537 0.000993094663471652 0.000866918956810658 0.000686655985351339 0.000457770656900893 0.000984560417849209 0.00102042105293341 43410 37781 667 665 0 True 499 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 544 538 0.000882483912541326 0.000950969779679228 0.000564583810177768 0.000473029678797589 0.000897565031399943 0.00102542736197561 38575 41444 667 665 0 True 543 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 588 537 0.000922312933713962 0.000981877903731634 0.00064087891966125 0.000717174029144732 0.000878579759800316 0.000896681873413138 40316 42791 667 665 0 True 588 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 632 537 0.000941575447112791 0.000917193418428195 0.00064087891966125 0.000518806744487678 0.000945341114061289 0.000977692187513545 41158 39972 667 665 0 True 632 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 677 537 0.000938784441608447 0.000840118148426686 0.000656137941557946 0.000488288700694286 0.000931139940429137 0.000891210452249096 41036 36613 667 665 0 True 677 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 280 583 0.00111887292792148 0.000990161372761269 0.000900282291905089 0.000915541313801785 0.00116117990049096 0.000711993955951149 48908 43152 667 665 0 True 276 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 324 583 0.00102976664563118 0.000948652244022737 0.000976577401388571 0.000793469138628214 0.000768144958672895 0.00077280644837725 45013 41343 667 665 0 True 321 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 368 581 0.000960837960511619 0.000994429309712826 0.000854505226215 0.000900282291905089 0.000702445540127093 0.000703670616735654 42000 43338 667 665 0 True 365 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 412 582 0.000930022514492353 0.00096352118566042 0.000671396963454643 0.000717174029144732 0.00086455782583655 0.000829847322564362 40653 41991 667 665 0 True 410 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 456 581 0.000931532402716014 0.00102194144092206 0.000457770656900893 0.000686655985351339 0.0010618362362302 0.000994625989202328 40719 44537 667 665 0 True 454 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 500 580 0.000968890697704478 0.000933347330330863 0.000503547722590982 0.000488288700694286 0.00110043456396099 0.00110197432579494 42352 40676 667 665 0 True 499 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 544 579 0.000983371898395046 0.0009002593460075 0.00064087891966125 0.000579842832074464 0.00101568052837784 0.000886345429597552 42985 39234 667 665 0 True 543 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 588 579 0.000997601451048337 0.000941860258336388 0.000701915007248035 0.000701915007248035 0.000927907662404781 0.000844479831989945 43607 41047 667 665 0 False 588 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 633 579 0.000928947291060352 0.000901383694989362 0.000671396963454643 0.000656137941557946 0.000863156194263084 0.000792902025645869 40606 39283 667 665 0 True 633 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 677 579 0.000986711954162539 0.000953929800468211 0.000717174029144732 0.000549324788281071 0.000887494642511228 0.000939950847529807 43131 41573 667 665 0 True 677 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 276 623 0.00105440527619001 0.000944957954510905 0.000900282291905089 0.000762951094834821 0.000805575610446076 0.000760995556727102 46090 41182 667 665 0 False 276 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 321 623 0.000887127962683799 0.00106900347687713 0.000778210116731518 0.000930800335698482 0.000703172943393848 0.000767335351449933 38778 46588 667 665 0 False 321 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 368 625 0.000957383519272637 0.000913636804301897 0.000823987182421607 0.00080872816052491 0.000721711401296566 0.000677188932614399 41849 39817 667 665 0 True 365 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 412 625 0.000965962429634347 0.000861641400365184 0.000747692072938125 0.00064087891966125 0.00083266428035021 0.000773236232859257 42224 37551 667 665 0 True 410 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 454 623 0.000917874777420171 0.000947917975299889 0.000549324788281071 0.000564583810177768 0.000968503874326677 0.000960946827052881 40122 41311 667 665 0 False 454 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 499 623 0.000952533575281483 0.000834152215053541 0.000534065766384375 0.0004272526131075 0.00104315461891922 0.000957269350877263 41637 36353 667 665 0 False 499 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 543 623 0.00100169645092766 0.000976738022671694 0.00064087891966125 0.000595101853971161 0.00100502996879902 0.00102088554669412 43786 42567 667 665 0 False 543 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 588 623 0.000935192737803678 0.000960584110769026 0.000717174029144732 0.000732433051041428 0.000835647143461144 0.000815163227150875 40879 41863 667 665 0 False 588 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 633 622 0.000872532376521741 0.000897597621887174 0.000732433051041428 0.000747692072938125 0.000732875934330466 0.000696524573689753 38140 39118 667 665 0 False 633 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 677 622 0.000958298603044552 0.000982176200400291 0.000747692072938125 0.000747692072938125 0.000806948452873009 0.000804880433987321 41889 42804 667 665 0 False 677 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 276 672 0.00110061700667176 0.0733104218545907 0.000961318379491875 0.0735790035858701 0.000791152290530724 0.0237068685014431 48110 3194925 667 665 0 True 276 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 321 667 0.00103145955060922 0.000986994838893985 0.000900282291905089 0.000839246204318303 0.000680660288611949 0.000712380638082147 45087 43014 667 665 0 False 321 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 365 666 0.00091407717976672 0.00102343292426534 0.000793469138628214 0.000915541313801785 0.000688494585707643 0.000678664768301675 39956 44602 667 665 0 False 365 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 410 666 0.000912887570863229 0.000884885594622858 0.000762951094834821 0.000717174029144732 0.000686130838111696 0.000703452679903946 39904 38564 667 665 0 False 410 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 454 666 0.00097060647977682 0.000927174883879417 0.000732433051041428 0.000762951094834821 0.000864251028255466 0.000794515677202941 42427 40407 667 665 0 False 454 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 499 666 0.000903759610238369 0.000990321994044392 0.000579842832074464 0.000717174029144732 0.00089191896760618 0.00090370414898364 39505 43159 667 665 0 False 499 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 544 666 0.000950886424492034 0.000899066159332871 0.000610360875867857 0.000610360875867857 0.000921323589546385 0.000881558933699915 41565 39182 667 665 0 False 544 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 588 666 0.000946997318461392 0.000922470974873668 0.000778210116731518 0.000793469138628214 0.000739161016130168 0.000671916396134989 41395 40202 667 665 0 False 588 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 633 666 0.00104726762276907 0.000925844021819254 0.000793469138628214 0.000762951094834821 0.000917064235016767 0.000728261712702369 45778 40349 667 665 0 False 633 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 673 669 0.00100119315485311 0.0748823994066191 0.00080872816052491 0.0726024261844816 0.000807286309744138 0.025360971859799 43764 3263433 667 665 0 True 677 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G8_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G8_1.csv new file mode 100755 index 0000000..d5d6398 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G8_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 244 247 0.00965628424057598 0.0386150774051173 0.00967421988250553 0.0394750896467536 0.00178540366448521 0.00869943423798571 422094 1682875 667 665 0 True 245 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 290 246 0.00959751298532469 0.00973064384467692 0.00955214770733196 0.00975051499198901 0.00149742156388631 0.00143271042753492 419525 424069 667 665 0 False 290 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 333 246 0.00987615599387306 0.0535652016284704 0.00984206912336919 0.0537270160982681 0.00134630843750076 0.00695778294688166 431705 2334413 667 665 0 True 334 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 376 246 0.0100200986711954 0.0745396794802295 0.00997940032043946 0.0753795681696803 0.00145479800375505 0.0126394549306899 437997 3248497 667 665 0 True 379 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 420 246 0.00965786276008253 0.0590347922908668 0.00970473792629892 0.0591897459372854 0.00164318190497998 0.0102771119661957 422163 2572782 667 665 0 True 424 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 464 246 0.00966326175433684 0.0528065184705871 0.00970473792629892 0.0559700923170825 0.00167644334710636 0.014033607097054 422399 2301349 667 665 0 True 468 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 509 245 0.00955544200891086 0.0668917429761173 0.00965896086060884 0.066849774929427 0.0016616070493426 0.0181581476530821 417686 2915194 667 665 0 True 513 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 553 244 0.00944721047578751 0.0565374755267661 0.00946059357595178 0.0570840009155413 0.00154484443018511 0.0154868313599671 412955 2463947 667 665 0 True 557 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 602 246 0.00948857226227811 0.00927060154391472 0.0093842984664683 0.00944533455405508 0.00203563617937058 0.0020655284570418 414763 404020 667 665 0 False 602 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 641 244 0.00934570480838775 0.038423479160249 0.009399557488365 0.039154650186923 0.0018585151614936 0.00878510986747899 408518 1674525 667 665 0 True 647 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 245 290 0.00981402180575997 0.00964689131847701 0.00976577401388571 0.00975051499198901 0.00157650884261242 0.00160409903510775 428989 420419 667 665 0 False 245 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 290 290 0.0100213340342875 0.00993901554068279 0.0100556954299229 0.00990310521095598 0.00140357457411283 0.00146948385082863 438051 433150 667 665 0 False 290 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 333 290 0.0100972859873565 0.0860533801888562 0.0100862134737163 0.0850537880521859 0.00152695792167371 0.0192421022210383 441371 3750273 667 665 0 True 334 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 377 290 0.00984442546408187 0.042804264036149 0.00978103303578241 0.0429694056610971 0.00140622647003659 0.0061757392309634 430318 1865443 667 665 0 True 379 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 421 290 0.0100202130566669 0.0625933797643571 0.00999465934233616 0.0613870450904097 0.00157914029037721 0.00950586800691205 438002 2727868 667 665 0 True 424 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 466 289 0.00958049242716705 0.0356210507959071 0.00962844281681544 0.036743724727245 0.0018056558244665 0.00632214414982433 418781 1552393 667 665 0 True 468 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 513 289 0.0097669407456949 0.0351410455642425 0.00965896086060884 0.0380254825665675 0.00175188869468452 0.00897979799816343 426931 1531474 667 665 0 False 513 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 553 289 0.00973472979692347 0.0421400032468445 0.00971999694819562 0.0436102845807584 0.00163832099964609 0.00741255452572095 425523 1836494 667 665 0 True 557 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 602 289 0.0100020257667001 0.00949735290388939 0.00941481651026169 0.00950637064164187 0.00469774203913597 0.00201788967102122 437207 413902 667 665 0 False 602 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 647 289 0.00935579360697312 0.00935364274728937 0.009399557488365 0.00935378042267491 0.00193066659021249 0.00199725462068028 408959 407639 667 665 0 False 647 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 245 336 0.00989905596526525 0.045151262225144 0.00984206912336919 0.0454566262302586 0.00166309538701021 0.00895498480302672 432706 1967727 667 665 0 True 245 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 289 336 0.0102027493920698 0.0560390676852351 0.0102235446707866 0.0571755550469215 0.00142657680604564 0.0165659254980727 445981 2442226 667 665 0 True 290 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 333 335 0.00994130995843346 0.0346942889381843 0.00990310521095598 0.0352941176470588 0.00130412959407225 0.00664306776343611 434553 1512004 667 665 0 True 335 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 377 335 0.00999438481720458 0.0296734970867315 0.010101472495613 0.0306706340123598 0.00141820329146842 0.004596263727898 436873 1293194 667 665 0 True 379 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 422 335 0.009924609679596 0.0596159200932062 0.00991836423285267 0.0589456015869383 0.00160283078907149 0.00849610338843738 433823 2598108 667 665 0 True 424 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 466 334 0.00979700124760234 0.0273094042040326 0.00978103303578241 0.0279240100709545 0.00171370988701679 0.00343152929656771 428245 1190165 667 665 0 True 468 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 510 332 0.00962270066614667 0.024544928354303 0.00952162966353857 0.0249485008010987 0.00172587190241458 0.0033010740270925 420626 1069687 667 665 0 True 513 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 554 333 0.0098898136191689 0.0424965824953778 0.00988784618905928 0.0432593270771344 0.00168291153209039 0.00680495814349192 432302 1852034 667 665 0 True 558 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 597 333 0.0109312018287034 0.0489413508594099 0.0100556954299229 0.050064850843061 0.00604744562281323 0.012080658140816 477823 2132902 667 665 0 True 602 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 641 332 0.00945434812920846 0.0556972426488515 0.00946059357595178 0.0569771877622644 0.00200172426452214 0.015974401361787 413267 2427329 667 665 0 True 647 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 246 379 0.00967307602779064 0.0394573065761222 0.00968947890440223 0.0406805523765927 0.00159379541732344 0.00824496860973263 422828 1719580 667 665 0 True 245 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 290 380 0.00990996833924535 0.0297915766757246 0.00999465934233616 0.0296330205233845 0.00152739751229048 0.0041991814669925 433183 1298340 667 665 0 True 290 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 334 378 0.00988949333984873 0.0704483800483126 0.00988784618905928 0.0696116578927291 0.00144805388407439 0.0140006057181529 432288 3070195 667 665 0 True 335 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 377 378 0.00995451004184335 0.0575225888020578 0.00994888227664607 0.0580148012512398 0.00139653230967052 0.0138673576847923 435130 2506879 667 665 0 True 379 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 422 378 0.00974134127717556 0.0384312578195317 0.00970473792629892 0.0388647287708858 0.00163591104464632 0.00737460230836926 425812 1674864 667 665 0 True 424 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 466 377 0.00991868451217284 0.0476547284897985 0.00993362325474937 0.0487830930037385 0.00172134547942115 0.0108096754604126 433564 2076830 667 665 0 True 468 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 510 377 0.0101213526905579 0.0365770916189535 0.0101472495613031 0.0379339284351873 0.00178943136391571 0.00540519046816719 442423 1594058 667 665 0 True 513 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 554 376 0.00993257090841167 0.0460697865056324 0.00996414129854276 0.0466620889600977 0.00179034897983922 0.00755143870454553 434171 2007757 667 665 0 True 558 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 598 376 0.0098669822790596 0.0375387082951141 0.00984206912336919 0.0383306630045014 0.00207438885164765 0.00718384734780594 431304 1635966 667 665 0 True 602 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 642 376 0.00959854245456809 0.0764563732517377 0.00953688868543526 0.0763714045929656 0.00196711533472448 0.016039153307645 419570 3332028 667 665 0 True 647 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 246 423 0.00984238940268936 0.0425265498376291 0.00978103303578241 0.0427710383764401 0.00166421730463371 0.00673086244696627 430229 1853340 667 665 0 True 245 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 290 423 0.00988114320043 0.0489301532613865 0.00984206912336919 0.0491493095292592 0.0015892597362002 0.00556096192926669 431923 2132414 667 665 0 True 290 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 334 423 0.00990699431698662 0.0311045409357681 0.00984206912336919 0.0317235065232319 0.00143511310178727 0.0032570484025532 433053 1355560 667 665 0 True 335 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 378 423 0.00995416688542888 0.045139536871476 0.00990310521095598 0.0458686198214694 0.00149069808744919 0.00759282108368748 435115 1967216 667 665 0 True 379 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 422 423 0.0101045837804375 0.0828495592379897 0.010101472495613 0.0827496757457847 0.00172383488331057 0.0106310674458392 441690 3610648 667 665 0 True 424 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 467 420 0.0101334775505358 0.0516232903155118 0.0101777676050965 0.0529488059815366 0.00174417223445047 0.011844975558939 442953 2249783 667 665 0 True 469 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 510 420 0.0101239149251193 0.0459641665390301 0.010101472495613 0.0459143968871595 0.00174171210692588 0.00913248101787332 442535 2003154 667 665 0 True 513 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 555 421 0.00995606568425561 0.0310051163615149 0.00993362325474937 0.0310978866254673 0.00174478031131665 0.00380633056916289 435198 1351227 667 665 0 True 558 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 599 421 0.00980873719697716 0.0368026727381512 0.00973525597009232 0.0369573510337987 0.00183633685118938 0.00476021108645708 428758 1603889 667 665 0 True 602 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 643 420 0.00981930641454279 0.0691106801106681 0.00985732814526589 0.0687266346227207 0.00182561682489981 0.0119248079737649 429220 3011897 667 665 0 True 647 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 247 468 0.00989624208266661 0.0508684161766283 0.00997940032043946 0.0516365300984207 0.00162851938797102 0.0123261146686929 432583 2216885 667 665 0 True 246 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 291 467 0.00980974378912627 0.0508101106508546 0.00973525597009232 0.0508125429159991 0.00154403681193538 0.00610443375432946 428802 2214344 667 665 0 True 290 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 335 466 0.0100118400401539 0.0613255500848711 0.00999465934233616 0.0598458838788434 0.00152898901036159 0.0126412962068708 437636 2672615 667 665 0 True 335 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 379 466 0.0101831437222565 0.0755381013761228 0.0101625085831998 0.0737468528267338 0.00156922006540148 0.0134148865673425 445124 3292009 667 665 0 True 379 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 423 466 0.0104404195247307 0.0869811746119705 0.010452429999237 0.0845807583733883 0.00182638850015994 0.025105383429919 456370 3790707 667 665 0 True 424 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 467 465 0.0101122018528387 0.0378817724099675 0.0101319905394064 0.0385442893110552 0.00197536525114736 0.00519191741049928 442023 1650917 667 665 0 True 469 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 511 465 0.0101964581911379 0.0359227664033051 0.0101625085831998 0.0366521705958648 0.00181633944617716 0.00477820349120328 445706 1565542 667 665 0 True 513 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 556 465 0.0103888774312775 0.0941117729090407 0.010406652933547 0.0927443350881209 0.00220544766044011 0.0154644208331339 454117 4101464 667 665 0 True 558 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 600 464 0.0100637252900215 0.0598799814826606 0.0100404364080262 0.0607461661707485 0.00193470885717932 0.0159534952295156 439904 2609616 667 665 0 True 602 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 644 465 0.00985712225141721 0.0717696966150786 0.00985732814526589 0.0698558022430762 0.00197824715196326 0.011066938236693 430873 3127779 667 665 0 True 647 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 248 512 0.0101097997579375 0.0440569723691238 0.0102082856488899 0.0464179446097505 0.00146995734001338 0.0087360452614429 441918 1920037 667 665 0 True 246 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 292 510 0.010245232156181 0.0893223215970804 0.01025406271458 0.0851911192492561 0.00160238113522102 0.0206960480346119 447838 3892736 667 665 0 True 290 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 335 511 0.0104674602501908 0.0518349432748729 0.0103761348897536 0.0530708781567102 0.0017209477649939 0.0106951120132018 457552 2259007 667 665 0 True 335 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 380 510 0.0105755773978426 0.0523430113392889 0.0106507972838941 0.0526588845654994 0.00173513553279289 0.00515502301772096 462278 2281149 667 665 0 True 379 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 424 509 0.0106161613631271 0.0510006533844338 0.0106507972838941 0.0515907530327306 0.00202430433574323 0.00594541912256532 464052 2222648 667 665 0 True 424 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 468 507 0.010505184578688 0.0582912304794947 0.0105134660868238 0.0585946440833143 0.0022440398481047 0.0121111137833183 459201 2540377 667 665 0 True 469 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 512 507 0.0103466920693922 0.0687784464594767 0.0103303578240635 0.0684672312504769 0.00190129744300666 0.0157780916622954 452273 2997418 667 665 0 True 513 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 556 507 0.0105907449113621 0.054898151765314 0.0105745021744106 0.0552224002441443 0.00181285072826963 0.0121916970065261 462941 2392504 667 665 0 True 558 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 600 506 0.0102779921552156 0.044759713428685 0.0103150988021668 0.0448767833981842 0.00189640936116892 0.00606069611843735 449270 1950663 667 665 0 True 603 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 644 505 0.0102946009256759 0.057340283645713 0.0103303578240635 0.0578927290760662 0.00203270302319524 0.0122387933754783 449996 2498934 667 665 0 True 647 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 248 553 0.00998845964978143 0.0383317644075857 0.00999465934233616 0.0396429388876173 0.00141625583111299 0.0068312554159516 436614 1670528 667 665 0 True 246 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 292 552 0.0102202274921134 0.0488025970166891 0.0102082856488899 0.0495918211642634 0.00141808313051573 0.0101659655136423 446745 2126855 667 665 0 True 290 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 336 552 0.0101949025487256 0.0401404977309376 0.01025406271458 0.0403906309605554 0.00152704103472108 0.00624991963541665 445638 1749354 667 665 0 True 335 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 380 551 0.0105222508910342 0.047565652515358 0.0104982070649271 0.0462500953688869 0.00149620223652286 0.00717772321493145 459947 2072948 667 665 0 True 380 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 424 550 0.0106891164168431 0.0822808451662459 0.0106965743495842 0.0783398184176394 0.00190852560821201 0.0177841614696298 467241 3585863 667 665 0 True 424 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 468 549 0.0104784183783595 0.0572144024515397 0.0105592431525139 0.057953765163653 0.00203224279940143 0.00955366584363003 458031 2493448 667 665 0 True 469 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 513 549 0.0104171535198297 0.0515079412883318 0.0104982070649271 0.0513618677042802 0.00198554253186526 0.00713579271181014 455353 2244756 667 665 0 True 513 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 556 548 0.0103554997506969 0.035045544738477 0.0104219119554437 0.0363317311360342 0.00185125625558487 0.00667563255020124 452658 1527312 667 665 0 True 558 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 601 548 0.0101973275207212 0.0439931598279287 0.0101777676050965 0.0439154650186923 0.00171019873013066 0.00638951804974745 445744 1917256 667 665 0 True 603 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 645 548 0.00998068143772014 0.0491644308757703 0.00994888227664607 0.0495002670328832 0.00194329125395233 0.00754100089871318 436274 2142624 667 665 0 True 647 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 246 594 0.00965159443624491 0.00947722935170382 0.00965896086060884 0.00944533455405508 0.00128123408539234 0.00116428994562338 421889 413025 667 665 0 False 246 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 290 594 0.00963153122454566 0.00976104715898237 0.00962844281681544 0.00978103303578241 0.0013998738737666 0.0014742360872701 421012 425394 667 665 0 False 290 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 336 594 0.0101255620759087 0.0652841763369284 0.0101625085831998 0.0634164950026703 0.0015395285550876 0.00974070994456838 442607 2845135 667 665 0 True 335 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 380 594 0.010147775734472 0.0721695059346696 0.0101167315175097 0.0707103074692912 0.00149191449847459 0.0181010142480939 443578 3145203 667 665 0 True 380 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 424 594 0.0098506251566366 0.00997042847448215 0.00990310521095598 0.00993362325474937 0.00178224888153871 0.00180569648099573 430589 434519 667 665 0 False 424 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 469 594 0.00982692448694398 0.00999947798082985 0.00990310521095598 0.00993362325474937 0.00195321458279442 0.00189682912989444 429553 435785 667 665 0 False 469 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 513 593 0.00982779381652731 0.00966394012038565 0.00999465934233616 0.00959792477302205 0.00211064581134821 0.00235285632493043 429591 421162 667 665 0 False 513 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 558 593 0.00990685705442083 0.00960572637820232 0.00993362325474937 0.00964370183871214 0.00190836510181076 0.00189384850459405 433047 418625 667 665 0 False 558 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 603 593 0.00990434057404806 0.0097004011516546 0.00988784618905928 0.00975051499198901 0.00163654443687652 0.0015353194150931 432937 422751 667 665 0 False 603 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 647 593 0.00947212363147792 0.00952849048691768 0.00949111161974517 0.00953688868543526 0.00160868454688569 0.0014949156205537 414044 415259 667 665 0 False 647 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 247 644 0.009423441174812 0.0374041535516521 0.00941481651026169 0.0370031280994888 0.001339622212143 0.00733360163124401 411916 1630102 667 665 0 True 246 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 291 637 0.00956779563983172 0.00940173734863595 0.00952162966353857 0.00943007553215839 0.00135143557248251 0.00129742043412502 418226 409735 667 665 0 False 291 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 335 637 0.00951453776430622 0.00926380955822837 0.00953688868543526 0.00921644922560464 0.00153797924758535 0.00135321471404314 415898 403724 667 665 0 False 335 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 380 637 0.00952373435621397 0.00954514920856731 0.00959792477302205 0.00955214770733196 0.00134069894888315 0.00132888672084306 416300 415985 667 665 0 False 380 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 424 637 0.00946391075462498 0.0106579334580443 0.00947585259784848 0.00993362325474937 0.00155662650370464 0.00522231258278499 413685 464481 667 665 0 False 424 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 469 637 0.00987851233458574 0.00955597967222933 0.00990310521095598 0.00962844281681544 0.00186192190079035 0.00173683218194115 431808 416457 667 665 0 False 469 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 514 637 0.00944538030824368 0.00946045590056625 0.00944533455405508 0.00949111161974517 0.00185226007211557 0.00186338733197583 412875 412294 667 665 0 False 514 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 558 637 0.0094158688565994 0.00946504508008405 0.00943007553215839 0.00943007553215839 0.0017577178976894 0.00169742874658429 411585 412494 667 665 0 False 558 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 603 637 0.0094864218154141 0.0094239948692973 0.00950637064164187 0.00943007553215839 0.00148422752738972 0.00127257738884067 414669 410705 667 665 0 False 603 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 644 641 0.00945418798954837 0.0385456431190129 0.00944533455405508 0.0385137712672618 0.00145126213102924 0.0072428266163895 413260 1679849 667 665 0 True 647 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G8_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G8_2.csv new file mode 100755 index 0000000..781aefe --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G8_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 244 247 0.00856790647935359 0.662180330661857 0.00791943236438544 0.665537499046311 0.00330950997016615 0.203171453302404 374519 28858332 667 665 5 True 245 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 290 246 0.00665611346306705 0.00660483894561306 0.00663767452506294 0.00662241550316625 0.00140783128906814 0.00135166808889526 290951 287844 667 665 0 False 290 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 333 246 0.00646824676469273 0.00643354782011105 0.00656137941557946 0.0064087891966125 0.00125349030919266 0.00121686048485168 282739 280379 667 665 0 True 334 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 376 246 0.00626072864231652 0.00627604717906003 0.00624093995574884 0.00636301213092241 0.0012535228029419 0.00125061308260205 273668 273515 667 665 0 True 379 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 420 246 0.00628218735676794 0.00629938315690806 0.00630197604333562 0.00631723506523232 0.0014724065287553 0.00149444609010683 274606 274532 667 665 0 True 424 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 464 246 0.00670195916004003 0.00662934516423813 0.00679026474402991 0.00659189745937285 0.00157144188970495 0.00143106558393396 292955 288912 667 665 0 True 468 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 509 245 0.00665254463635658 0.00668241902536153 0.00659189745937285 0.00669871061264973 0.00157942279585489 0.00157138549311449 290795 291225 667 665 0 True 513 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 553 244 0.00688936831652839 0.00723211094800402 0.00695811398489357 0.0072327763790341 0.00152254869543191 0.00139884761655946 301147 315181 667 665 0 True 557 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 602 246 0.00935179011547099 0.00747246922524898 0.00796520943007553 0.00747692072938125 0.00730645502332791 0.00198490936901043 408784 325656 667 665 0 False 602 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 641 244 0.00962000116901952 0.672988903937573 0.00935378042267491 0.681422140840772 0.0025219710517927 0.207204540750491 420508 29329378 667 665 6 True 647 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 245 290 0.00679612128017017 0.00645270764459788 0.00671396963454643 0.00651560234988937 0.0018333936378938 0.0015491710220304 297071 281214 667 665 0 False 245 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 290 290 0.00661514058717952 0.00643843529629751 0.00663767452506294 0.0064087891966125 0.00135725322184084 0.00140977088530351 289160 280592 667 665 0 False 290 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 333 290 0.00650610835575575 0.00645089491868834 0.00653086137178607 0.00650034332799268 0.00127592162258259 0.00134645161944402 284394 281135 667 665 0 True 334 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 377 290 0.0062956848424037 0.00678459710732542 0.00633249408712902 0.00677500572213321 0.00125998865911988 0.00124364618202453 275196 295678 667 665 0 True 379 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 421 290 0.00668255938407541 0.00644153299247202 0.00672922865644312 0.0063935301747158 0.00150749992629773 0.00150868754317988 292107 280727 667 665 0 True 424 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 466 289 0.00665561016699249 0.00671993556791957 0.00660715648126955 0.00675974670023652 0.00171517314136231 0.00192879046556207 290929 292860 667 665 0 True 468 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 513 289 0.00695857152677953 0.00682628980324466 0.00703440909437705 0.00691233691920348 0.00154874346315999 0.00159829966477707 304172 297495 667 665 0 False 513 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 553 289 0.00699160605094569 0.00713293877862429 0.00700389105058366 0.00718699931334401 0.00160852802871941 0.00152883060661695 305616 310859 667 665 0 True 557 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 602 289 0.00750384706936987 0.00722268018409494 0.00727855344472419 0.00729381246662089 0.00296025190153492 0.00199826859327429 328007 314770 667 665 0 False 602 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 647 289 0.00765177036110006 0.00742001490336048 0.00762951094834821 0.00744640268558785 0.00189080592782094 0.00194833840725648 334473 323370 667 665 0 False 647 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 245 336 0.00615084995840372 0.00597428567986687 0.00613412680247196 0.0059510185397116 0.00136285134242307 0.00133174169202235 268865 260364 667 665 0 True 245 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 289 336 0.00635148207539627 0.00634717946158599 0.00633249408712902 0.00636301213092241 0.00136035928491751 0.00135585572075972 277635 276615 667 665 0 True 290 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 333 335 0.00649231346789411 0.00632990120070146 0.00651560234988937 0.0063782711528191 0.00126257569912974 0.0012834819651836 283791 275862 667 665 0 True 335 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 377 335 0.00666661404934978 0.00677431734520554 0.00669871061264973 0.00675974670023652 0.00130024992199192 0.00130480851264781 291410 295230 667 665 0 True 379 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 422 335 0.00702825515601092 0.00699581409463232 0.00700389105058366 0.00698863202868696 0.00158708130904465 0.00165102607147933 307218 304883 667 665 0 True 424 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 466 334 0.00716030174429837 0.00701501981091433 0.00718699931334401 0.00698863202868696 0.00168273046677854 0.00152769038016951 312990 305720 667 665 0 True 468 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 510 332 0.0069370670581395 0.00695889414541159 0.00695811398489357 0.00688181887541009 0.00164376968086037 0.00176928483557481 303232 303274 667 665 0 True 513 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 554 333 0.00720109160343152 0.0070925998906628 0.0072327763790341 0.00708018616006714 0.00158048736449642 0.00151832256253632 314773 309101 667 665 0 True 558 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 597 333 0.00809258909112621 0.00767544863532142 0.00749217975127794 0.00759899290455482 0.00491594088723642 0.00232136653121559 353742 334502 667 665 0 True 602 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 641 332 0.00724112651845284 0.00744674687405169 0.00721751735713741 0.00750743877317464 0.00191891465349276 0.00182542831382361 316523 324535 667 665 0 True 647 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 246 379 0.0059640813605557 0.00621400147197933 0.00593575951781491 0.00617990386816205 0.00147651689761831 0.00153199128628051 260701 270811 667 665 0 True 245 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 290 380 0.00617859987378707 0.00641030362585337 0.00617990386816205 0.00642404821850919 0.00138933491875753 0.00134403496761348 270078 279366 667 665 0 True 290 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 334 378 0.00640702766035156 0.00665678845775459 0.00633249408712902 0.00660715648126955 0.00139241494563923 0.0014299527450215 280063 290108 667 665 0 True 335 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 377 378 0.00692139624854545 0.0069730976560192 0.00694285496299687 0.00700389105058366 0.00128055307919961 0.00137474684182956 302547 303893 667 665 0 True 379 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 422 378 0.00718967593337687 0.00719874761290959 0.0072632944228275 0.0072327763790341 0.00159559022270117 0.00149897856203597 314274 313727 667 665 0 True 424 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 466 377 0.0075209591359047 0.00738291138695904 0.00753795681696803 0.00740062561989776 0.0016777199563767 0.00172788350191348 328755 321753 667 665 0 True 468 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 510 377 0.00742002539586238 0.0072561811945749 0.00744640268558785 0.00729381246662089 0.00175980662512085 0.00178201071568858 324343 316230 667 665 0 True 513 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 554 376 0.00725222190918732 0.00717118958990518 0.0072632944228275 0.00720225833524071 0.00180726429677158 0.0015522625000045 317008 312526 667 665 0 True 558 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 598 376 0.00704134085394931 0.00698874675817491 0.00703440909437705 0.00714122224765393 0.00195805555481296 0.00198036932511494 307790 304575 667 665 0 True 602 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 642 376 0.0063663064325013 0.00662592622549737 0.00631723506523232 0.00662241550316625 0.00193598666670749 0.00189230058955806 278283 288763 667 665 0 True 647 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 246 423 0.00632384654548441 0.00614865155564581 0.00631723506523232 0.00617990386816205 0.00155574406633196 0.00149490015029586 276427 267963 667 665 0 True 245 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 290 423 0.00640711916872875 0.00625204577018192 0.0064087891966125 0.00625619897764553 0.00145541537787148 0.00143414100975416 280067 272469 667 665 0 True 290 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 334 423 0.00671522787473281 0.0067482966973396 0.00674448767833982 0.00679026474402991 0.0013650215115312 0.00133092519232472 293535 294096 667 665 0 True 335 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 378 423 0.00699856068761225 0.00697273052165777 0.00695811398489357 0.00701915007248035 0.00135326146214529 0.00144784978689062 305920 303877 667 665 0 True 379 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 422 423 0.00726189892007533 0.00726634622720684 0.00730907148851759 0.0072480354009308 0.00164106938397451 0.00155653612842692 317431 316673 667 665 0 True 424 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 467 420 0.00722554721723597 0.00745922944234011 0.0072632944228275 0.00744640268558785 0.00161326895618752 0.00161880903341044 315842 325079 667 665 0 True 469 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 510 420 0.0070697770821616 0.00743091420471527 0.00715648126955062 0.00740062561989776 0.00167606366396462 0.00168817910887308 309033 323845 667 665 0 True 513 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 555 421 0.00692800772879754 0.00698358393121738 0.00689707789730678 0.00701915007248035 0.00177989019242068 0.00163013115721629 302836 304350 667 665 0 True 558 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 599 421 0.00645182101098684 0.00641851825719024 0.0063782711528191 0.00650034332799268 0.00185968949149883 0.00190415622664136 282021 279724 667 665 0 True 602 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 643 420 0.00599537722555522 0.00614309864842927 0.0059510185397116 0.00605783169298848 0.00190984405366462 0.00195584023530714 262069 267721 667 665 0 True 647 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 247 468 0.00640473995092177 0.00620787491732306 0.00653086137178607 0.00617990386816205 0.0015693664151401 0.00151961749936633 279963 270544 667 665 0 True 246 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 291 467 0.00635495939372955 0.00632753777324979 0.00634775310902571 0.00633249408712902 0.0015038949779335 0.00156946361954424 277787 275759 667 665 0 True 290 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 335 466 0.00657034723654424 0.00641833469000953 0.00663767452506294 0.00645456626230259 0.00156787178399006 0.0015071045165301 287202 279716 667 665 0 True 335 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 379 466 0.00707389495913522 0.00669267584158382 0.00711070420386053 0.00672922865644312 0.00154050993966565 0.00152601955186972 309213 291672 667 665 0 True 379 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 423 466 0.00723906757996602 0.0071542325715869 0.00730907148851759 0.00708018616006714 0.00184477746223704 0.00194727696765216 316433 311787 667 665 0 True 424 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 467 465 0.00729630606989936 0.0070238539814861 0.00733958953231098 0.00704966811627375 0.00207039118055021 0.00198424127661443 318935 306105 667 665 0 True 469 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 511 465 0.00692473630431294 0.00662135999187715 0.00688181887541009 0.00660715648126955 0.00190820027258864 0.00187184311772281 302693 288564 667 665 0 True 513 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 556 465 0.00660779703990989 0.00645018359586308 0.00650034332799268 0.00645456626230259 0.00200446690818136 0.00191773193059928 288839 281104 667 665 0 True 558 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 600 464 0.00621625557100141 0.00649040775433663 0.00625619897764553 0.00646982528419928 0.00193732705853956 0.00195576325198723 271724 282857 667 665 0 True 602 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 644 465 0.00623007333595734 0.0060914244870588 0.00622568093385214 0.00607309071488518 0.00178366251709516 0.00180650273794857 272328 265469 667 665 0 True 647 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 248 512 0.00680410538608013 0.00748823305689263 0.00679026474402991 0.00741588464179446 0.00151607160431903 0.00172784618900331 297420 326343 667 665 0 True 246 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 292 510 0.00694868862204284 0.00750899909421069 0.00692759594110018 0.00753795681696803 0.00172152188319253 0.00162179993198527 303740 327248 667 665 0 True 290 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 335 511 0.00701384258660324 0.00803813149261343 0.00697337300679027 0.00796520943007553 0.00158540007052736 0.00183875919658315 306588 350308 667 665 0 True 335 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 380 510 0.00743112078659686 0.0075599619327559 0.00743114366369116 0.00756847486076143 0.00158351126155463 0.00153765365656844 324828 329469 667 665 0 True 379 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 424 509 0.00729683224306821 0.00825914637819084 0.00729381246662089 0.00817883573662928 0.00188727658554542 0.00198508589418606 318958 359940 667 665 0 True 424 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 468 507 0.00726400361275073 0.0075430278603352 0.0072327763790341 0.00759899290455482 0.00197943725521126 0.00188630665597781 317523 328731 667 665 0 True 469 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 512 507 0.0070904122212183 0.00735656949652685 0.00711070420386053 0.00732433051041428 0.00184790593477499 0.00191045455282161 309935 320605 667 665 0 True 513 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 556 507 0.00708158166281931 0.00760516535100626 0.00706492713817044 0.00756847486076143 0.00189926018044613 0.00192306541581964 309549 331439 667 665 0 True 558 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 600 506 0.0068946758024055 0.00753339058334782 0.00701915007248035 0.00743114366369116 0.00205115033954461 0.00205163042921218 301379 328311 667 665 0 True 603 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 644 505 0.00683517248013668 0.00714594910255726 0.00674448767833982 0.00712596322575723 0.00206135035621638 0.0023245177415363 298778 311426 667 665 0 True 647 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 248 553 0.00681707669854704 0.00670612213757098 0.00679026474402991 0.00675974670023652 0.00131048581357419 0.00143266471076918 297987 292258 667 665 0 True 246 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 292 552 0.00698664172148304 0.00695641598847198 0.00689707789730678 0.00691233691920348 0.00150132036729637 0.0013844607158969 305399 303166 667 665 0 True 290 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 336 552 0.00696012716919178 0.00695164324177347 0.00700389105058366 0.00694285496299687 0.00139186457956265 0.00143758373658344 304240 302958 667 665 0 True 335 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 380 551 0.0069892725873273 0.00722430934282376 0.00701915007248035 0.00718699931334401 0.00151169074006458 0.00147673343546916 305514 314841 667 665 0 True 380 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 424 550 0.00690696080204347 0.0069480177899544 0.00698863202868696 0.00704966811627375 0.0017911863569011 0.00181970693874803 301916 302800 667 665 0 True 424 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 468 549 0.0069349394883698 0.00698553433251244 0.00695811398489357 0.00701915007248035 0.00191013595716009 0.00200421335956087 303139 304435 667 665 0 True 469 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 513 549 0.00707318576921198 0.00687027708892281 0.00709544518196384 0.00683604180972 0.00193210377929175 0.0020436893457227 309182 299412 667 665 0 True 513 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 556 548 0.00696950677785392 0.00701148614268562 0.00689707789730678 0.00709544518196384 0.00180887983641589 0.00183977819455377 304650 305566 667 665 0 True 558 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 601 548 0.00671730969031392 0.00681279761546232 0.00671396963454643 0.0068055237659266 0.00161483196356324 0.00162424810575776 293626 296907 667 665 0 True 603 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 645 548 0.00655364695770677 0.00668563145102399 0.00654612039368277 0.00674448767833982 0.00189176341528323 0.00181369768955637 286472 291365 667 665 0 True 647 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 246 594 0.00711084146642632 0.00701196800653499 0.00704966811627375 0.00701915007248035 0.00133954664538896 0.00123245463603195 310828 305587 667 665 0 False 246 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 290 594 0.00697266381686703 0.00695524574769494 0.00689707789730678 0.00697337300679027 0.00150400468740778 0.00136225489388184 304788 303115 667 665 0 False 290 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 336 594 0.0068033504419683 0.006704837167306 0.0068055237659266 0.00672922865644312 0.00155506647235796 0.00148631971238064 297387 292202 667 665 0 True 335 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 380 594 0.00651404670747712 0.00678897977376492 0.00653086137178607 0.00675974670023652 0.00131885849297724 0.00130425758043345 284741 295869 667 665 0 True 380 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 424 594 0.00649350307679761 0.00660706469767919 0.00654612039368277 0.00654612039368277 0.0016428961892317 0.00180189475773873 283843 287941 667 665 0 False 424 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 469 594 0.0066163988273659 0.00662076339853984 0.00674448767833982 0.00660715648126955 0.00192884542742544 0.00191384222521353 289215 288538 667 665 0 False 469 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 513 593 0.00685917055205517 0.00675949429536304 0.00688181887541009 0.00669871061264973 0.0020649519789051 0.00229151734512283 299827 294584 667 665 0 False 513 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 558 593 0.00683098597188016 0.00654928692755005 0.00691233691920348 0.00646982528419928 0.00175625111888565 0.00182273705564392 298595 285423 667 665 0 False 558 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 603 593 0.00675091614183753 0.00662103874931091 0.00675974670023652 0.00657663843747616 0.00148483662938681 0.00156170126921205 295095 288550 667 665 0 False 603 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 647 593 0.00668473270803371 0.00668049156996405 0.00674448767833982 0.00668345159075303 0.00160272407185861 0.00157946303124193 292202 291141 667 665 0 False 647 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 247 644 0.00879136993645544 0.68992153076672 0.00842298008697642 0.669001297016861 0.00249247649973156 0.177832249330786 384287 30067315 667 665 7 True 246 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 291 637 0.00702365686005704 0.00673237224441282 0.00695811398489357 0.00675974670023652 0.00153894890539174 0.00138685602326215 307017 293402 667 665 0 False 291 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 335 637 0.00642134872138204 0.00632735420606908 0.00636301213092241 0.0063782711528191 0.00140116692279995 0.00130792663793812 280689 275751 667 665 0 False 335 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 380 637 0.00635132193573618 0.00629151271403503 0.00634775310902571 0.00633249408712902 0.00124927913116942 0.00121952328923744 277628 274189 667 665 0 False 380 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 424 637 0.00618985540418164 0.00659488042605943 0.00625619897764553 0.00628671702143893 0.00162153660313915 0.00217343816795353 270570 287410 667 665 0 False 424 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 469 637 0.0064468338044299 0.00650942990343793 0.0063935301747158 0.00656137941557946 0.00178151584195019 0.00172566669782722 281803 283686 667 665 0 False 469 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 514 637 0.00647492687622771 0.00636877155121725 0.00662241550316625 0.00628671702143893 0.00175276216846368 0.00180531708307138 283031 277556 667 665 0 False 514 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 558 637 0.00649535612143573 0.00631133796955194 0.00648508430609598 0.00634775310902571 0.00169983608750829 0.00162445307298233 283924 275053 667 665 0 False 558 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 603 637 0.00715918076667777 0.00676970521979015 0.00669871061264973 0.00672922865644312 0.00255268836515948 0.00145088035137471 312941 295029 667 665 0 False 603 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 644 641 0.00832680478254807 0.729052386057843 0.00830090791180285 0.711253528648814 0.00179441923793258 0.178643869382906 363980 31772668 667 665 11 True 647 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G8_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G8_3.csv new file mode 100755 index 0000000..8fbe900 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G8_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 244 247 0.00105767670067461 0.0664350737223007 0.000778210116731518 0.0662546730754559 0.00094799011132547 0.0214635407158706 46233 2895292 667 665 0 True 245 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 290 246 0.000861048075184198 0.000856730978281134 0.000717174029144732 0.000701915007248035 0.000650525641446575 0.000666050362600132 37638 37337 667 665 0 False 290 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 333 246 0.000847802237585716 0.000925889913614432 0.000732433051041428 0.000823987182421607 0.000616143773871913 0.000627896949368021 37059 40351 667 665 0 True 334 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 376 246 0.000837050003265705 0.000958358358702891 0.000717174029144732 0.000869764248111696 0.000615993586732202 0.000633930156099285 36589 41766 667 665 0 True 379 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 420 246 0.000872463745238848 0.000923755945138653 0.000686655985351339 0.000732433051041428 0.00074702743709036 0.000770216798386848 38137 40258 667 665 0 True 424 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 464 246 0.00085146257267338 0.000917216364325784 0.000625619897764553 0.000732433051041428 0.000840549079183106 0.000796156535603695 37219 39973 667 665 0 True 468 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 509 245 0.000949742569777139 0.000918753739464248 0.000747692072938125 0.000732433051041428 0.00085403532771631 0.000792903348401279 41515 40040 667 665 0 True 513 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 553 244 0.00088852346543597 0.000944453144763947 0.000717174029144732 0.000823987182421607 0.00076335268896622 0.000715010343486734 38839 41160 667 665 0 True 557 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 602 246 0.00110381979987347 0.000950097835570845 0.000656137941557946 0.000503547722590982 0.00121721357335544 0.00105088305423218 48250 41406 667 665 0 False 602 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 641 244 0.00111393147555314 0.0669902726603646 0.000793469138628214 0.0671396963454643 0.00101833967778362 0.0216046691094805 48692 2919488 667 665 0 True 647 246 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 245 290 0.000995084970675569 0.000831651112216339 0.000793469138628214 0.000656137941557946 0.000847412027553806 0.000758744586194539 43497 36244 667 665 0 False 245 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 290 290 0.000864891427026244 0.000844661436149311 0.000762951094834821 0.000686655985351339 0.000631355282586374 0.000671315669201067 37806 36811 667 665 0 False 290 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 333 290 0.000884405588462349 0.000936261459324668 0.000778210116731518 0.000762951094834821 0.000654881399609609 0.000745484561253091 38659 40803 667 665 0 True 334 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 377 290 0.000861620002541645 0.000973502651111643 0.000717174029144732 0.000900282291905089 0.000662205038470325 0.000633587908043612 37663 42426 667 665 0 True 379 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 421 290 0.000883833661104902 0.000922470974873668 0.000686655985351339 0.000686655985351339 0.000763948786554495 0.000805453656970583 38634 40202 667 665 0 True 424 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 466 289 0.000886739052080735 0.000865106230901126 0.00064087891966125 0.000473029678797589 0.000855466456329709 0.000934013615666113 38761 37702 667 665 0 True 468 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 513 289 0.000952647960752972 0.000904435499368701 0.000747692072938125 0.000701915007248035 0.000863759483393533 0.000837728888058825 41642 39416 667 665 0 False 513 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 553 289 0.000887059331400905 0.000922562758464024 0.000656137941557946 0.000732433051041428 0.000835177137384108 0.00077215634203922 38775 40206 667 665 0 True 557 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 602 289 0.00102198843356989 0.00106590578070261 0.000610360875867857 0.000610360875867857 0.0010767731412643 0.00110968133766647 44673 46453 667 665 0 False 602 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 647 289 0.00106051346036755 0.000941447232179786 0.000701915007248035 0.000442511635004196 0.000998770997294754 0.00105323746141923 46357 41029 667 665 0 False 647 289 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 245 336 0.000839246204318303 0.000971047440069618 0.00064087891966125 0.000793469138628214 0.000773933582407674 0.000783598742063412 36685 42319 667 665 0 True 245 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 289 336 0.000905246621367732 0.000834289890439076 0.000732433051041428 0.000686655985351339 0.000726635162460196 0.000680438265360729 39570 36359 667 665 0 True 290 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 333 335 0.000825405562268076 0.000832500110427132 0.000686655985351339 0.000717174029144732 0.000638350981781961 0.000626649662758858 36080 36281 667 665 0 True 335 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 377 335 0.000876146957420809 0.000921140112813505 0.000762951094834821 0.00080872816052491 0.00065946829430913 0.000628862946097969 38298 40144 667 665 0 True 379 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 422 335 0.000800103495974604 0.000891952931080276 0.000579842832074464 0.000610360875867857 0.000788023280400391 0.00085454104792909 34974 38872 667 665 0 True 424 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 466 334 0.000905338129744924 0.00088298108512297 0.000656137941557946 0.000656137941557946 0.000879275823396873 0.000803905988283178 39574 38481 667 665 0 True 468 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 510 332 0.000945487430237731 0.000887111346688993 0.000717174029144732 0.000625619897764553 0.000854230669837259 0.000849341661256581 41329 38661 667 665 0 True 513 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 554 333 0.00091407717976672 0.000982038525014757 0.000686655985351339 0.000793469138628214 0.000834545075497878 0.000793317509354219 39956 42798 667 665 0 True 558 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 597 333 0.000988931032309435 0.000962855754630339 0.000534065766384375 0.000488288700694286 0.00114127560853509 0.00115088729488828 43228 41962 667 665 0 True 602 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 641 332 0.00101345527739678 0.000997136925628331 0.000610360875867857 0.000595101853971161 0.00107523545311683 0.00103917175547805 44300 43456 667 665 0 True 647 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 246 379 0.000869421091697228 0.000934425787517547 0.000762951094834821 0.000778210116731518 0.000719451226702404 0.000784388956781834 38004 40723 667 665 0 True 245 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 290 380 0.000924760782803837 0.000916963959452304 0.000823987182421607 0.00080872816052491 0.0007093528064144 0.000675313517677888 40423 39962 667 665 0 True 290 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 334 378 0.000888500588341673 0.000954824690474183 0.000747692072938125 0.000762951094834821 0.000718496848107465 0.000774134774751991 38838 41612 667 665 0 True 335 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 377 378 0.000886807683363628 0.000881994411526642 0.000762951094834821 0.000762951094834821 0.000697715658401916 0.000672726977115574 38764 38438 667 665 0 True 379 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 422 378 0.000897308269646362 0.000938051239336611 0.000656137941557946 0.000686655985351339 0.000827350593194078 0.000870340289350311 39223 40881 667 665 0 True 424 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 466 377 0.000885549443177244 0.000903357042182017 0.000564583810177768 0.000564583810177768 0.000884196588295382 0.000938094505845334 38709 39369 667 665 0 True 468 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 510 377 0.000936062067386998 0.000908336301958834 0.00064087891966125 0.000610360875867857 0.000905348630000928 0.000907622037726363 40917 39586 667 665 0 True 513 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 554 376 0.000902821649372155 0.000947550840938464 0.000625619897764553 0.000732433051041428 0.000907195943917284 0.000845200122701753 39464 41295 667 665 0 True 558 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 598 376 0.00097277980373512 0.00100771498441687 0.000534065766384375 0.000549324788281071 0.00109197375746941 0.00110135829966278 42522 43917 667 665 0 True 602 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 642 376 0.000928283855325713 0.000944040118607345 0.000518806744487678 0.000625619897764553 0.000988121062738761 0.000939596583416802 40577 41142 667 665 0 True 647 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 246 423 0.000928260978231415 0.000849870154902018 0.000823987182421607 0.000656137941557946 0.000792845168612219 0.000797364931403328 40576 37038 667 665 0 True 245 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 290 423 0.000934254776937464 0.000891287500050194 0.000823987182421607 0.000717174029144732 0.000766901991782717 0.000762534955315693 40838 38843 667 665 0 True 290 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 334 423 0.000909341621247056 0.00086873168272019 0.000778210116731518 0.000701915007248035 0.000698576184636947 0.000700366434966314 39749 37860 667 665 0 True 335 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 378 423 0.00093983678794615 0.00089908910523046 0.000793469138628214 0.000793469138628214 0.000744845712026789 0.000710221144914748 41082 39183 667 665 0 True 379 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 422 423 0.000911972487091314 0.000940070478324445 0.000625619897764553 0.000656137941557946 0.000877659642961703 0.000834847329154121 39864 40969 667 665 0 True 424 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 467 420 0.000933682849580017 0.000928666367222703 0.000610360875867857 0.000762951094834821 0.000892062757355195 0.000796600369213868 40813 40472 667 665 0 True 469 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 510 420 0.000943725893976793 0.000879080282532837 0.00064087891966125 0.000579842832074464 0.000906740211044753 0.000868285018058074 41252 38311 667 665 0 True 513 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 555 421 0.000823346623781266 0.00100436488336887 0.000503547722590982 0.000717174029144732 0.000892564802381185 0.000873227558607219 35990 43771 667 665 0 True 558 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 599 421 0.000895478102102531 0.000914187505844033 0.000503547722590982 0.000534065766384375 0.000999063693717802 0.000942379704367119 39143 39841 667 665 0 True 602 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 643 420 0.000862626594690753 0.000990482615327515 0.000473029678797589 0.000686655985351339 0.000939085670608369 0.000969257432722638 37707 43166 667 665 0 True 647 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 247 468 0.000888111677738608 0.00096469142643746 0.000747692072938125 0.000793469138628214 0.00075181833098595 0.000778223052995363 38821 42042 667 665 0 True 246 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 291 467 0.000943039581147856 0.000785208615496168 0.000793469138628214 0.00064087891966125 0.00078528174541176 0.00071450492470313 41222 34220 667 665 0 True 290 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 335 466 0.000946951564272796 0.000924008350012133 0.000823987182421607 0.000793469138628214 0.000812338936726669 0.000799628762889088 41393 40269 667 665 0 True 335 464 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 379 466 0.000927528911213883 0.000894339304429533 0.000778210116731518 0.000747692072938125 0.000790081009560917 0.000772414068288287 40544 38976 667 665 0 True 379 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 423 466 0.000920093855567067 0.000849525966438183 0.000579842832074464 0.000534065766384375 0.000986455676049416 0.000897182211936203 40219 37023 667 665 0 True 424 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 467 465 0.000956765837726593 0.000984792032725439 0.000534065766384375 0.000549324788281071 0.00105500796575874 0.00109328230736681 41822 42918 667 665 0 True 469 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 511 465 0.0008740651418397 0.000908519869139546 0.000503547722590982 0.000564583810177768 0.00093118091970791 0.000900468599924454 38207 39594 667 665 0 True 513 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 556 465 0.000853452879877296 0.00089186114748992 0.000488288700694286 0.000488288700694286 0.000948000595719868 0.000979462612276114 37306 38868 667 665 0 True 558 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 600 464 0.000844736706949798 0.000850168451570675 0.000457770656900893 0.000473029678797589 0.00094735096590738 0.00091744103847012 36925 37051 667 665 0 True 602 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 644 465 0.000945304413483348 0.000896909244959503 0.000488288700694286 0.000503547722590982 0.00104070894799244 0.000969316807454562 41321 39088 667 665 0 True 647 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 248 512 0.000930548687661205 0.00101342851291653 0.000778210116731518 0.000900282291905089 0.000782724850470845 0.000792602336106053 40676 44166 667 665 0 True 246 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 292 510 0.000894563018330615 0.000899525077284651 0.000747692072938125 0.000778210116731518 0.000761310942294953 0.000784393175521683 39103 39202 667 665 0 True 290 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 335 511 0.000944160558768453 0.000993236123038197 0.000869764248111696 0.000854505226215 0.000782954911195185 0.000824350710681012 41271 43286 667 665 0 True 335 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 380 510 0.000868986426905568 0.0010126712982961 0.000717174029144732 0.000869764248111696 0.000779583160966862 0.000831627209368603 37985 44133 667 665 0 True 379 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 424 509 0.000839703746204261 0.000953539720209198 0.000488288700694286 0.000595101853971161 0.000924596168016446 0.000978573122808515 36705 41556 667 665 0 True 424 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 468 507 0.000856449779230321 0.00100090005283293 0.0004272526131075 0.000732433051041428 0.000998576548240954 0.000903173766189893 37437 43620 667 665 0 True 469 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 512 507 0.000883765029822008 0.000974466378810381 0.000564583810177768 0.000656137941557946 0.000882386596052258 0.000922563985486037 38631 42468 667 665 0 True 513 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 556 507 0.000926179162650307 0.000941332502691841 0.000625619897764553 0.000717174029144732 0.000937133340206115 0.000846941849886034 40485 41024 667 665 0 True 558 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 600 506 0.00098245681462313 0.00100475496362788 0.000610360875867857 0.000671396963454643 0.00100396473189383 0.000993949669891973 42945 43788 667 665 0 True 603 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 644 505 0.000932333101016441 0.000963727698738721 0.000518806744487678 0.000549324788281071 0.00102076058104243 0.00103326971782388 40754 42000 667 665 0 True 647 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 248 553 0.000973740641695632 0.000877497015599195 0.000885023270008392 0.000686655985351339 0.000705490380732631 0.000721705738043875 42564 38242 667 665 0 True 246 551 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 292 552 0.000935009721049294 0.000951313968143063 0.00080872816052491 0.00080872816052491 0.000742716379534059 0.000769477479676247 40871 41459 667 665 0 True 290 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 336 552 0.00089776581153232 0.000930547930825003 0.000701915007248035 0.000793469138628214 0.000777410546060576 0.000730006522709474 39243 40554 667 665 0 True 335 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 380 551 0.000925767374952945 0.00088087006254478 0.000793469138628214 0.000717174029144732 0.000754516686920227 0.000713715195471505 40467 38389 667 665 0 True 380 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 424 550 0.000892801482069677 0.000834152215053541 0.000610360875867857 0.000442511635004196 0.000946725268550459 0.000934703279095879 39026 36353 667 665 0 True 424 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 468 549 0.000861505617070156 0.0008843807848759 0.000350957503624018 0.000473029678797589 0.00103167564058275 0.00101486651572486 37658 38542 667 665 0 True 469 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 513 549 0.000887265225249586 0.000861847913443485 0.0004272526131075 0.000320439459830625 0.000976588411142507 0.00103236246609247 38784 37560 667 665 0 True 513 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 556 548 0.000932859274185292 0.000899961049338843 0.000610360875867857 0.000534065766384375 0.000912277771516931 0.000952392269983586 40777 39221 667 665 0 True 558 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 601 548 0.000921443604130642 0.000885642809243296 0.000686655985351339 0.000686655985351339 0.000837613521777343 0.000770992534427773 40278 38597 667 665 0 True 603 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 645 548 0.00093908184383432 0.000950809158396105 0.000656137941557946 0.000579842832074464 0.000939546771212075 0.0010105821514802 41049 41437 667 665 0 True 647 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 246 594 0.000999385864403573 0.00095558190509462 0.000915541313801785 0.000854505226215 0.000692128677949015 0.000683836267764748 43685 41645 667 665 0 False 246 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 290 594 0.000967861228461073 0.000917285202018551 0.000869764248111696 0.000701915007248035 0.000735291249690019 0.000803780156949285 42307 39976 667 665 0 False 290 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 336 594 0.000930319916718226 0.000858796109064146 0.000778210116731518 0.000686655985351339 0.000764113815385237 0.000774432741265461 40666 37427 667 665 0 True 335 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 380 594 0.000881385812015027 0.000965471586955487 0.000793469138628214 0.000854505226215 0.000656056030449292 0.000730144383059612 38527 42076 667 665 0 True 380 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 424 594 0.000923982961597709 0.000835666644294417 0.00064087891966125 0.000473029678797589 0.000932447503045605 0.000892429796352478 40389 36419 667 665 0 False 424 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 469 594 0.000836729723945535 0.000937248132920996 0.000320439459830625 0.000518806744487678 0.00100554655959367 0.00100263585092876 36575 40846 667 665 0 False 469 594 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 513 593 0.000912613045731655 0.000829930169897162 0.000442511635004196 0.000320439459830625 0.00105477364424547 0.00104808574471254 39892 36169 667 665 0 False 513 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 558 593 0.000932516117770824 0.000959069681528151 0.000549324788281071 0.000625619897764553 0.000979885503795746 0.000898221522561252 40762 41797 667 665 0 False 558 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 603 593 0.000966236954765922 0.000879837497153275 0.000701915007248035 0.000625619897764553 0.000852678764099323 0.00079365647726486 42236 38344 667 665 0 False 603 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 647 593 0.000880470728243111 0.000953149639950184 0.00064087891966125 0.000732433051041428 0.000801044369802105 0.000819723387719508 38487 41539 667 665 0 False 647 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 247 644 0.00109842080561916 0.0691416570724132 0.000946059357595178 0.0664072632944228 0.000763319750229889 0.0194003594983275 48014 3013247 667 665 0 True 246 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 291 637 0.000976531647199975 0.000952621884305637 0.000885023270008392 0.000839246204318303 0.000694688429533662 0.000700914401243769 42686 41516 667 665 0 False 291 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 335 637 0.000925172570501199 0.00089885964625457 0.000823987182421607 0.00080872816052491 0.000701678555371093 0.000635704551735942 40441 39173 667 665 0 False 335 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 380 637 0.000917920531608766 0.000893146117754905 0.000762951094834821 0.000747692072938125 0.000722747231553114 0.000668917763590426 40124 38924 667 665 0 False 380 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 424 637 0.000873035672596295 0.000895371869821039 0.000610360875867857 0.000625619897764553 0.000846714857905922 0.00083529314830474 38162 39021 667 665 0 False 424 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 469 637 0.000781458664121819 0.000886904833610692 0.000473029678797589 0.000534065766384375 0.000808851335473729 0.000947978923467759 34159 38652 667 665 0 False 469 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 514 637 0.000839314835601197 0.000854895306474013 0.000488288700694286 0.0004272526131075 0.000933277513935568 0.000958964739355555 36688 37257 667 665 0 False 514 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 558 637 0.000899801872924833 0.000952644830203226 0.000595101853971161 0.000671396963454643 0.000906336258865624 0.000867935941102665 39332 41517 667 665 0 False 558 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 603 637 0.000949147765325394 0.000967605555431265 0.000747692072938125 0.000839246204318303 0.000784155340400793 0.000706256092016214 41489 42169 667 665 0 False 603 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 644 641 0.00105632695211104 0.0742087996369959 0.000915541313801785 0.0710765239948119 0.000766551419405606 0.0210090525834041 46174 3234077 667 665 0 True 647 637 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G9_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G9_1.csv new file mode 100755 index 0000000..3520459 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G9_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 258 275 0.00984243515687796 0.0384052601175633 0.00985732814526589 0.0389868009460594 0.00156799623843746 0.00819162962155409 430231 1673731 667 665 0 True 259 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 303 275 0.0093712813998128 0.00982609877864724 0.00943007553215839 0.0098268101014725 0.00139776712452391 0.0013894087133514 409636 428229 667 665 0 False 303 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 347 276 0.00961428189544505 0.0530178042955868 0.00967421988250553 0.0525368123903258 0.00139272734056767 0.00697371951974139 420258 2310557 667 665 0 True 348 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 391 276 0.00955738656192618 0.0738694986493471 0.00956740672922866 0.0719310292210269 0.00141524186910791 0.0119371215109698 417771 3219290 667 665 0 True 392 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 435 276 0.00968364524535626 0.0615843568637777 0.00970473792629892 0.0606851300831617 0.00165420670408494 0.00924582309983882 423290 2683894 667 665 0 True 437 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 479 276 0.00950284756912 0.0524913795130995 0.00961318379491875 0.0550850690470741 0.00174309691819955 0.0129586434992123 415387 2287615 667 665 0 True 482 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 523 274 0.00941511391248757 0.0670435759804639 0.00944533455405508 0.0661326009002823 0.00169067380319156 0.0170503233199767 411552 2921811 667 665 0 True 526 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 567 274 0.00935407782490078 0.0562287155288083 0.00927748531319142 0.0554207675288014 0.00179992960791888 0.0132595876548777 408884 2450491 667 665 0 True 571 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 616 274 0.00938981184619409 0.00959923268918462 0.009399557488365 0.00973525597009232 0.00201980769763911 0.00191370628241017 410446 418342 667 665 0 False 616 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 654 274 0.00921516810832396 0.03857517448921 0.00923170824750134 0.0384985122453651 0.00183829750838645 0.00749303563145602 402812 1681136 667 665 0 True 660 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 259 319 0.00982223468261292 0.00983293665612876 0.0098268101014725 0.00985732814526589 0.00145827578450577 0.00144290209554313 429348 428527 667 665 0 False 259 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 303 319 0.00959746723113609 0.00956619059665644 0.00962844281681544 0.00961318379491875 0.00125523598492702 0.00123769935627388 419523 416902 667 665 0 False 303 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 346 320 0.00968348510569618 0.082653853677453 0.00964370183871214 0.0807049668116274 0.00129978608202453 0.016246092188785 423283 3602119 667 665 0 True 348 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 391 320 0.00963052463239655 0.0412128972006579 0.00961318379491875 0.0410009918364233 0.00142293009073992 0.00476958248096225 420968 1796090 667 665 0 True 393 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 435 320 0.0096832792118475 0.0620146153894693 0.00970473792629892 0.060669871061265 0.00167819153681171 0.00865308549137179 423274 2702645 667 665 0 True 437 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 480 319 0.00952076033395525 0.0362075020464872 0.00949111161974517 0.0369573510337987 0.00158542545008498 0.00626588932457957 416170 1577951 667 665 0 True 482 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 527 318 0.0098495956873932 0.0339702311397629 0.00984206912336919 0.0368963149462119 0.00169744028351077 0.00895870570007254 430544 1480449 667 665 0 False 527 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 568 318 0.0093766575169728 0.0414135820209714 0.00930800335698482 0.0421759365224689 0.00189405699428488 0.00706393107682376 409871 1804836 667 665 0 True 571 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 616 317 0.00992424364608723 0.00963966336073647 0.00962844281681544 0.0097962920576791 0.00369922168176968 0.00208692437697508 433807 420104 667 665 0 False 616 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 660 317 0.00938191924866132 0.00953145050770667 0.00932326237888151 0.00958266575112535 0.00205301350892311 0.00184534935540302 410101 415388 667 665 0 False 660 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 257 363 0.00970537848493926 0.0423016570953591 0.00970473792629892 0.0429846646829938 0.00152861583966083 0.0091019631455115 424240 1843539 667 665 0 True 259 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 302 363 0.00991959959594476 0.0488819668764495 0.0100099183642329 0.0487220569161517 0.00144530300295473 0.0129359673355348 433604 2130314 667 665 0 True 304 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 348 362 0.00980253750442243 0.0295005768025006 0.00987258716716258 0.0314183260852979 0.00133768538112284 0.00942032938255948 428487 1285658 667 665 0 False 348 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 391 364 0.00972949094232925 0.0295521591802808 0.00973525597009232 0.0301213092240787 0.00150525997690892 0.00359600554672498 425294 1287906 667 665 0 True 393 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 437 362 0.0113632128774249 0.0242925234808238 0.00990310521095598 0.0228427557793545 0.0073673202622095 0.0116407309357006 496707 1058687 667 665 0 False 437 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 482 361 0.00975472437733983 0.0272485057918314 0.00968947890440223 0.0284275577935454 0.00173087178043449 0.00584793346940393 426397 1187511 667 665 0 False 482 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 523 363 0.0095593082378472 0.0259142936306204 0.00953688868543526 0.026138704509041 0.00188290412471088 0.00296279117375158 417855 1129365 667 665 0 True 527 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 567 362 0.00959726133728741 0.0441109411202531 0.00953688868543526 0.0433203631647211 0.00192210231746157 0.00730766746536011 419514 1922389 667 665 0 True 571 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 612 362 0.0100507997317432 0.0456859934225585 0.00997940032043946 0.0471656366826886 0.00248305290875333 0.00788078042994378 439339 1991031 667 665 0 True 616 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 656 363 0.00979178527010242 0.0564553062674998 0.00990310521095598 0.0567330434119173 0.00206270053390521 0.0140054237617276 428017 2460366 667 665 0 True 661 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 259 408 0.00969734862484071 0.0405191738788491 0.00968947890440223 0.0420233463035019 0.00154929955113045 0.00872696578052716 423889 1765857 667 665 0 True 259 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 301 407 0.00974662588595837 0.0276944134196787 0.00971999694819562 0.0281834134431983 0.00149318617445025 0.00327691280307195 426043 1206944 667 665 0 True 304 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 346 408 0.0101292910422793 0.0715610725141992 0.010101472495613 0.0689707789730678 0.00138200736716732 0.0128053274199309 442770 3118687 667 665 0 True 348 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 390 407 0.00997400132618516 0.0552983970569592 0.0100709544518196 0.0553444724193179 0.00145263014586283 0.0116683821953165 435982 2409947 667 665 0 True 393 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 435 407 0.0110260045074739 0.04245782687435 0.00999465934233616 0.0375066758220798 0.00502895182810453 0.0130809219328478 481967 1850345 667 665 0 True 438 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 479 406 0.0100552150109427 0.0465603239042904 0.0101167315175097 0.0466926070038911 0.00163903869966857 0.00988797864439364 439532 2029135 667 665 0 True 482 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 523 406 0.0100243538107348 0.0377788141674855 0.0101167315175097 0.0381170366979477 0.00177210172717831 0.00461501599348433 438183 1646430 667 665 0 True 527 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 566 405 0.0100244681962063 0.0469990265202948 0.0101319905394064 0.0474402990768292 0.00182818519691627 0.00647439238484012 438188 2048254 667 665 0 True 572 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 611 407 0.00999072448211692 0.0402335203997634 0.0100251773861295 0.0408331425955596 0.0019571352615512 0.00690382147219287 436713 1753408 667 665 0 True 616 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 655 407 0.00972125518838201 0.0802789991687849 0.0098115510795758 0.0786297398336767 0.00197004110245642 0.0122717894646886 424934 3498621 667 665 0 True 661 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 258 452 0.00981340412421393 0.0407448008898419 0.00985732814526589 0.0413977264057374 0.00168406922758667 0.00580717692511342 428962 1775690 667 665 0 True 259 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 303 451 0.00997105018102073 0.0506627062047428 0.0100404364080262 0.0501869230182345 0.00164187982848242 0.00582125989743906 435853 2207920 667 665 0 True 304 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 345 451 0.0100117942859653 0.0313104803666296 0.00994888227664607 0.0321812771801328 0.00167091817462796 0.00425114812165291 437634 1364535 667 665 0 True 349 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 390 452 0.0101323336958209 0.0535189426989309 0.0100404364080262 0.0499580376897841 0.00168735930399114 0.014443374011594 442903 2332397 667 665 0 True 393 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 435 452 0.0104095583245228 0.0803528390672263 0.0103761348897536 0.0796520943007553 0.00210152932925694 0.00933920148733322 455021 3501839 667 665 0 True 438 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 479 450 0.0100242394252633 0.0515787064364964 0.0100404364080262 0.052323186083772 0.00184816746190421 0.00940473688980215 438178 2247840 667 665 0 True 482 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 523 450 0.00989134638448686 0.0463525029098266 0.00985732814526589 0.0455634393835355 0.00189119380288754 0.00596966588945327 432369 2020078 667 665 0 True 527 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 567 449 0.00995332043293986 0.0302885618716051 0.00990310521095598 0.0308079652094301 0.00181124689595955 0.00463065219116607 435078 1319999 667 665 0 True 572 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 611 450 0.010082964926326 0.0367024680033799 0.0101167315175097 0.0370794232089723 0.00194669848989097 0.00401705843401425 440745 1599522 667 665 0 True 616 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 656 450 0.00971537577514745 0.0726809470460312 0.00978103303578241 0.0714122224765393 0.0019817828987434 0.0113071187578721 424677 3167492 667 665 0 True 661 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 260 495 0.0102051286098768 0.0468712867084167 0.0101930266269932 0.0478065156023499 0.00168332037763959 0.00987235171154284 446085 2042687 667 665 0 True 259 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 304 495 0.0101755942811382 0.0486326138073497 0.0101625085831998 0.0484473945220111 0.00164239726466544 0.00482556306874332 444794 2119447 667 665 0 True 304 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 347 495 0.0104280430167155 0.0626902573439779 0.0104371709773404 0.0614480811779965 0.00172367308051659 0.0109951083572574 455829 2732090 667 665 0 True 349 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 392 496 0.0107982859108326 0.0769899342083751 0.0108033875028611 0.0744487678339818 0.00175411813038054 0.0143449341735888 472013 3355281 667 665 0 True 393 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 436 495 0.0108360559935185 0.0863079878685039 0.0107423514152743 0.0827649347676814 0.00204093232664026 0.0227074676465651 473664 3761369 667 665 0 True 438 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 480 494 0.010546958152876 0.0414247566730973 0.0105745021744106 0.0417334248874647 0.00212589539064579 0.00617097021761126 461027 1805323 667 665 0 True 483 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 524 494 0.010762529012445 0.0378484320207706 0.0107118333714809 0.038300144960708 0.00195435098868689 0.00434606340419332 470450 1649464 667 665 0 True 527 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 569 494 0.0105718713085664 0.0917098881330128 0.010605020218204 0.0895399404898146 0.0019320710368215 0.0124864645373396 462116 3996788 667 665 0 True 572 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 612 494 0.0100444170224341 0.059256151364908 0.0100251773861295 0.0604257267109178 0.00196758489713244 0.0140483781026892 439060 2582429 667 665 0 True 617 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 656 495 0.0100554437818857 0.071535120704026 0.0100099183642329 0.0701762417029068 0.00202065826216005 0.0107563819161017 439542 3117556 667 665 0 True 661 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 260 540 0.0102123348945806 0.0436430972143107 0.0102235446707866 0.0448615243762875 0.00163965725628864 0.00715903627122272 446400 1902000 667 665 0 True 260 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 304 538 0.0108035705196154 0.0917854030819782 0.0107881284809644 0.0891432059205005 0.00164101816991067 0.0180518986004614 472244 4000079 667 665 0 True 304 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 347 539 0.0108188752957007 0.0522707547077811 0.0108186465247578 0.054184786755169 0.00167796821776133 0.00983774478443485 472913 2278000 667 665 0 True 349 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 392 540 0.0111332523255424 0.0541076197015771 0.0110475318532082 0.0538185702296483 0.00192492125117503 0.00803659625144886 486655 2358052 667 665 0 True 394 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 437 538 0.0109158512984295 0.0532939122812754 0.0108644235904479 0.0527656977187762 0.00215798162182241 0.00563566698393492 477152 2322590 667 665 0 True 438 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 480 536 0.010837245602422 0.0607615399221331 0.0108949416342412 0.0590524147402152 0.00201121449930942 0.0110667196855755 473716 2648035 667 665 0 True 483 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 525 536 0.0108217578095823 0.068669109257465 0.0106965743495842 0.0666819256885634 0.00231306148072463 0.0134701655258455 473039 2992653 667 665 0 True 527 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 568 536 0.0105327743544113 0.055256589631552 0.0104371709773404 0.0552834363317311 0.00178625979304273 0.0111954364948763 460407 2408125 667 665 0 True 572 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 613 536 0.0102049227160281 0.0455655504061137 0.01025406271458 0.0449225604638743 0.00197540778482134 0.00616865042322058 446076 1985782 667 665 0 True 617 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 657 535 0.0101211467967092 0.0569516260323503 0.0101167315175097 0.0573128862439918 0.00195479243382566 0.0101648776232896 442414 2481996 667 665 0 True 661 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 260 580 0.00982486554845717 0.0401237701715952 0.00978103303578241 0.0407721065079728 0.00140496447978892 0.00612026369225721 429463 1748625 667 665 0 True 260 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 304 579 0.00991735764070357 0.0504832004479039 0.00985732814526589 0.0502174410620279 0.00192181201694019 0.00914205238783041 433506 2200097 667 665 0 True 304 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 348 579 0.0102020402021466 0.0421484702830549 0.0101625085831998 0.0424658579385061 0.00163917403458177 0.00561828566813658 445950 1836863 667 665 0 True 349 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 392 579 0.0103538754770017 0.0485322025595002 0.0103150988021668 0.0470588235294118 0.00157289866629336 0.00654387754328477 452587 2115071 667 665 0 True 394 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 436 578 0.0102817668757747 0.0812578941058299 0.0101930266269932 0.0764629587243458 0.00195156386772714 0.0152022700053104 449435 3541282 667 665 0 True 438 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 480 577 0.0100654868262824 0.0587504467279437 0.0101777676050965 0.056595712214847 0.00210955073175461 0.00972153955964335 439981 2560390 667 665 0 True 483 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 525 576 0.00999907462153565 0.0518138559949886 0.00999465934233616 0.0515602349889372 0.00214806098084589 0.00666226631032316 437078 2258088 667 665 0 True 528 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 569 576 0.00976460728207652 0.0356718989049644 0.0097962920576791 0.0368963149462119 0.00169623395035931 0.00659592504048078 426829 1554609 667 665 0 True 572 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 612 576 0.00975664605326085 0.047180689191507 0.00975051499198901 0.0464789806973373 0.00161857845447237 0.0075832707002196 426481 2056171 667 665 0 True 617 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 657 575 0.00966570960342671 0.0521296144917111 0.00971999694819562 0.050965133134966 0.00161442102006748 0.00792734833090177 422506 2271849 667 665 0 True 662 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 260 623 0.00941429033709284 0.00924228630628987 0.0093842984664683 0.00926222629129473 0.0014476811396353 0.00141298691683059 411516 402786 667 665 0 False 260 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 305 623 0.00956383790251819 0.00941100749126192 0.00949111161974517 0.009399557488365 0.00155698729305635 0.00138323344837342 418053 410139 667 665 0 False 305 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 347 621 0.00992378610420127 0.0678677237841686 0.00988784618905928 0.065995269703212 0.00154045002156081 0.0111432627153864 433787 2957728 667 665 0 True 349 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 391 620 0.0102210281904138 0.0711820062860287 0.0101167315175097 0.0684061951628901 0.00146368911021078 0.0180696343499665 446780 3102167 667 665 0 True 394 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 439 622 0.00962869446485272 0.00971868903203305 0.00959792477302205 0.00973525597009232 0.00193115131731623 0.00202922864604469 420888 423548 667 665 0 False 439 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 483 622 0.00961105622514904 0.0095251174399721 0.00965896086060884 0.00959792477302205 0.00201843566738015 0.00192173539830103 420117 415112 667 665 0 False 483 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 528 622 0.0096485060285147 0.009290908663281 0.00953688868543526 0.00932326237888151 0.0019821702979929 0.00196983625662736 421754 404905 667 665 0 False 528 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 572 622 0.00956017756743052 0.00937360567819182 0.00958266575112535 0.00933852140077821 0.0016531690527436 0.00178578956155273 417893 408509 667 665 0 False 572 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 617 622 0.00932616776985735 0.00962036586086411 0.00930800335698482 0.00968947890440223 0.00149390957589524 0.00134878478434049 407664 419263 667 665 0 False 617 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 662 621 0.00936391497544887 0.0094451050950792 0.00932326237888151 0.00950637064164187 0.00149191245893043 0.00157542398118982 409314 411625 667 665 0 False 662 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 261 672 0.00918817313705244 0.0369402792859925 0.00918593118181125 0.0372167544060426 0.0012806259584697 0.00802066147553549 401632 1609886 667 665 0 True 260 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 305 666 0.00944750787801339 0.00922594882720649 0.00933852140077821 0.00929274433508812 0.00182407162363256 0.00126390981765623 412968 402074 667 665 0 False 305 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 349 666 0.00915404051235998 0.00917195713017954 0.00915541313801785 0.00912489509422446 0.00132336388021006 0.00137151352817628 400140 399721 667 665 0 False 349 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 394 666 0.00938445860612839 0.00934999434957272 0.00935378042267491 0.00932326237888151 0.00130615006608704 0.00128973730377268 410212 407480 667 665 0 False 394 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 439 666 0.0095082465633743 0.00945588966694603 0.00949111161974517 0.009399557488365 0.00158288075586903 0.0016293186910392 415623 412095 667 665 0 False 439 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 483 666 0.00931621623383776 0.00925261196020493 0.00924696726939803 0.00929274433508812 0.0017060244025826 0.00154328281456307 407229 403236 667 665 0 False 483 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 528 666 0.00931566718357461 0.00920949661863517 0.00924696726939803 0.00924696726939803 0.00180025830972219 0.00164174733635486 407205 401357 667 665 0 False 528 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 573 665 0.00942474516918698 0.00931052740571961 0.009399557488365 0.00933852140077821 0.00149475951827517 0.00151706697010748 411973 405760 667 665 0 False 573 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 617 665 0.0092842569331036 0.00966006226369311 0.0093690394445716 0.00967421988250553 0.00138190550842799 0.0015691428605527 405832 420993 667 665 0 False 617 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 657 671 0.00954484991425093 0.0383649212296018 0.00956740672922866 0.0386205844205386 0.00149063385650514 0.00819361595822878 417223 1671973 667 665 0 True 662 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G9_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G9_2.csv new file mode 100755 index 0000000..ce4ab10 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G9_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 258 275 0.00871221519018472 0.7038140326784 0.00843823910887312 0.717326619363699 0.00254420347875825 0.199473938358267 380827 30672761 667 665 8 True 259 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 303 275 0.00706623113254542 0.00701983844940803 0.00695811398489357 0.00698863202868696 0.0015684243534306 0.00128716748028768 308878 305930 667 665 0 False 303 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 347 276 0.00639163137588908 0.0065132389224377 0.00645456626230259 0.00645456626230259 0.00132606807675441 0.00136467718720734 279390 283852 667 665 0 True 348 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 391 276 0.00639144835913469 0.0066411164097013 0.00642404821850919 0.00654612039368277 0.00135643459770799 0.00159355432411156 279382 289425 667 665 0 True 392 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 435 276 0.00654644067300294 0.006579047756723 0.00659189745937285 0.00657663843747616 0.00162688245822281 0.00161729465490649 286157 286720 667 665 0 True 437 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 479 276 0.0067512135440634 0.00678918628684322 0.00669871061264973 0.00675974670023652 0.00169638369395543 0.00173907975327452 295108 295878 667 665 0 True 482 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 523 274 0.00694310661103415 0.00717635241686271 0.00700389105058366 0.00718699931334401 0.00167944245619757 0.00171276129386438 303496 312751 667 665 0 True 526 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 567 274 0.00710905705307108 0.0070639634104717 0.00706492713817044 0.00708018616006714 0.00166873192972092 0.00150210289434865 310750 307853 667 665 0 True 571 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 616 274 0.0111475505094786 0.00801022928114518 0.00807202258335241 0.0080872816052491 0.014806558042635 0.0019027353974701 487280 349092 667 665 0 False 616 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 654 274 0.00903247163326096 0.714465013529475 0.00900282291905089 0.692774853131914 0.00190626840938096 0.174730290428038 394826 31136939 667 665 10 True 660 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 259 319 0.00714710166088848 0.00697672310783826 0.00712596322575723 0.00695811398489357 0.00160709390054293 0.00145734731540398 312413 304051 667 665 0 False 259 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 303 319 0.00661221231910939 0.00635062134622434 0.00654612039368277 0.0064087891966125 0.00139001235308196 0.00121085811826949 289032 276765 667 665 0 False 303 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 346 320 0.00627854989877458 0.00649107318536671 0.00622568093385214 0.00650034332799268 0.00120356488723184 0.00133577638210583 274447 282886 667 665 0 True 348 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 391 320 0.00652900832714794 0.00659114024475242 0.00650034332799268 0.00657663843747616 0.00123689525974025 0.00128650749422275 285395 287247 667 665 0 True 393 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 435 320 0.00673314063956806 0.00680242606975209 0.00668345159075303 0.00692759594110018 0.00162739321346992 0.00170863647471455 294318 296455 667 665 0 True 437 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 480 319 0.00675270055519276 0.00686685815018205 0.00674448767833982 0.00677500572213321 0.00176815163513723 0.00152729858254977 295173 299263 667 665 0 True 482 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 527 318 0.00692022951673625 0.00693073952906987 0.00689707789730678 0.00703440909437705 0.00152361351328729 0.00161931071266034 302496 302047 667 665 0 False 527 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 568 318 0.00703809230655901 0.00696729234392918 0.00698863202868696 0.00698863202868696 0.00167407715991823 0.00152303738959839 307648 303640 667 665 0 True 571 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 616 317 0.00766451290262399 0.00749738847003065 0.00756847486076143 0.00743114366369116 0.00265528098118914 0.00191310876927384 335030 326742 667 665 0 False 616 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 660 317 0.00777182935197542 0.00790373737043455 0.00775158312352178 0.00799572747386892 0.00203341785369419 0.00197057341934874 339721 344451 667 665 0 False 660 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 257 363 0.00632817031630671 0.0061344709909358 0.00636301213092241 0.00611886778057527 0.00139481577708124 0.00140201869667478 276616 267345 667 665 0 True 259 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 302 363 0.00645815796610736 0.00645279942818823 0.0063935301747158 0.00642404821850919 0.00141477951364988 0.00131707986973299 282298 281218 667 665 0 True 304 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 348 362 0.00658642983383566 0.00667532874300652 0.00656137941557946 0.00668345159075303 0.00129371841411857 0.00136218884372992 287905 290916 667 665 0 False 348 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 391 364 0.00706410356277572 0.00703172442435914 0.00700389105058366 0.00704966811627375 0.00135634445336649 0.00137909648480232 308785 306448 667 665 0 True 393 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 437 362 0.00721179808356293 0.00713654128454577 0.0072327763790341 0.00708018616006714 0.00160025781408479 0.00172029488964444 315241 311016 667 665 0 False 437 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 482 361 0.00703013107774334 0.00727740614984474 0.00711070420386053 0.00737010757610437 0.00165618211436874 0.00167028254760104 307300 317155 667 665 0 False 482 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 523 363 0.00721943903305843 0.00722203769896244 0.0072632944228275 0.00720225833524071 0.00166091093875835 0.00170305901182444 315575 314742 667 665 0 True 527 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 567 362 0.00732339254954807 0.00712236071983575 0.00733958953231098 0.00714122224765393 0.00184783216928579 0.00186727301375697 320119 310398 667 665 0 True 571 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 612 362 0.00699956727976136 0.00692422289415459 0.00700389105058366 0.00704966811627375 0.0020457353668232 0.00203900478750015 305964 301763 667 665 0 True 616 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 656 363 0.00681934153088253 0.00689280996035522 0.0068207827878233 0.00692759594110018 0.00191216019633196 0.00196709559289429 298086 300394 667 665 0 True 661 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 259 408 0.00630028313835758 0.00631085610570257 0.00628671702143893 0.00633249408712902 0.00151274187225976 0.0015558406047823 275397 275032 667 665 0 True 259 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 301 407 0.00647371439022993 0.00620000447445003 0.00643930724040589 0.00625619897764553 0.00144109997429153 0.00139630755536304 282978 270201 667 665 0 True 304 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 346 408 0.00687472697617774 0.00697215687421805 0.00692759594110018 0.00701915007248035 0.00138180714904421 0.00132711888291669 300507 303852 667 665 0 True 348 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 390 407 0.0071349768009106 0.00696986228445914 0.00714122224765393 0.00697337300679027 0.00148876141581087 0.00138761409613855 311883 303752 667 665 0 True 393 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 435 407 0.00718542079383746 0.0070579056935082 0.00718699931334401 0.00697337300679027 0.0016194505636883 0.00151716706152031 314088 307589 667 665 0 True 438 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 479 406 0.00733599782850621 0.00721600292789653 0.00730907148851759 0.00720225833524071 0.00174419318711939 0.00149363214264207 320670 314479 667 665 0 True 482 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 523 406 0.00723778646268534 0.00735611057857507 0.0072327763790341 0.00740062561989776 0.00153564567418203 0.00165179642150864 316377 320585 667 665 0 True 527 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 566 405 0.00688078940616668 0.00727745204163992 0.00688181887541009 0.00732433051041428 0.00175566328978333 0.00170886483558994 300772 317157 667 665 0 True 572 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 611 407 0.00657160547673062 0.00670965580579969 0.00662241550316625 0.00671396963454643 0.00192676504093004 0.00197682445813964 287257 292412 667 665 0 True 616 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 655 407 0.00613524778009256 0.00597228938677662 0.00616464484626535 0.00602731364919509 0.00181573424829813 0.00182153968506571 268183 260277 667 665 0 True 661 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 258 452 0.00628092911658156 0.00639942727039618 0.00633249408712902 0.0063935301747158 0.00156852260389883 0.00152523106711706 274551 278892 667 665 0 True 259 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 303 451 0.00661838913456982 0.00647721386322295 0.00659189745937285 0.00650034332799268 0.00152418126886962 0.00158262455197449 289302 282282 667 665 0 True 304 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 345 451 0.00670275985834046 0.00668005559790986 0.00659189745937285 0.00669871061264973 0.00139953099652699 0.00146020461920363 292990 291122 667 665 0 True 349 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 390 452 0.00701388834079184 0.00697284525114572 0.00694285496299687 0.00703440909437705 0.00149427334097491 0.00143018101139591 306590 303882 667 665 0 True 393 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 435 452 0.00717935836384852 0.00705276581244826 0.0072480354009308 0.00701915007248035 0.00182143594498417 0.00195778721245886 313823 307365 667 665 0 True 438 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 479 450 0.00715469685619539 0.00694046858964761 0.00718699931334401 0.00700389105058366 0.0017546560075537 0.00187019305190763 312745 302471 667 665 0 True 482 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 523 450 0.00717835177169941 0.00723511686058818 0.00712596322575723 0.00733958953231098 0.00175274318206519 0.0017588224898911 313779 315312 667 665 0 True 527 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 567 449 0.00646614207201732 0.0067438910850025 0.00643930724040589 0.00677500572213321 0.0017357432494794 0.00200813022479956 282647 293904 667 665 0 True 572 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 611 450 0.006320666629377 0.00606519732611455 0.00630197604333562 0.00610360875867857 0.00188778410018002 0.00176169451243717 276288 264326 667 665 0 True 616 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 656 450 0.00583821158772868 0.0060941321029743 0.00593575951781491 0.00608834973678187 0.00188483634240568 0.00205655294335038 255199 265587 667 665 0 True 661 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 260 495 0.00697890926361036 0.00652877329510547 0.00688181887541009 0.00653086137178607 0.00180158331486775 0.0015229669436176 305061 284529 667 665 0 True 259 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 304 495 0.00714522573915606 0.0064720969280606 0.00709544518196384 0.00646982528419928 0.00179677862098861 0.00151502380082353 312331 282059 667 665 0 True 304 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 347 495 0.00728315174067807 0.00666936280963338 0.00709544518196384 0.00669871061264973 0.00196296396397156 0.00163463074750802 318360 290656 667 665 0 True 349 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 392 496 0.00762896189808506 0.00706770359177871 0.00755321583886473 0.00708018616006714 0.00199301892367418 0.00164069004484245 333476 308016 667 665 0 True 393 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 436 495 0.0078133512781261 0.00724133519883481 0.00784313725490196 0.00720225833524071 0.00224927896552427 0.0019810206267397 341536 315583 667 665 0 True 438 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 480 494 0.0076296024567254 0.00722430934282376 0.00758373388265812 0.00714122224765393 0.00213409632095614 0.0018098694338317 333504 314841 667 665 0 True 483 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 524 494 0.00734162559370349 0.00668395640049999 0.00733958953231098 0.00671396963454643 0.00198671906735297 0.00157601409234335 320916 291292 667 665 0 True 527 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 569 494 0.00690199647258083 0.00660467832432994 0.00697337300679027 0.00659189745937285 0.00202365396298181 0.00190673986849336 301699 287837 667 665 0 True 572 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 612 494 0.00656984394046968 0.00644040864349016 0.00654612039368277 0.00646982528419928 0.00193278996224695 0.00177277623681812 287180 280678 667 665 0 True 617 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 656 495 0.00648879039537224 0.00676869560029623 0.00642404821850919 0.0068055237659266 0.00185399035674248 0.00205386229121535 283637 294985 667 665 0 True 661 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 260 540 0.00721859258056941 0.00686398991298342 0.00717174029144732 0.00686655985351339 0.00172722483735555 0.00155673909668088 315538 299138 667 665 0 True 260 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 304 538 0.0076046206697521 0.00692314443696791 0.00755321583886473 0.00694285496299687 0.00177837877116288 0.00141205266445764 332412 301716 667 665 0 True 304 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 347 539 0.00764868195336985 0.00704567553009326 0.00759899290455482 0.00700389105058366 0.00174717922683853 0.00144902576483578 334338 307056 667 665 0 True 349 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 392 540 0.00747273422112473 0.00701263343756507 0.00746166170748455 0.00704966811627375 0.00182352892934895 0.001550935804598 326647 305616 667 665 0 True 394 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 437 538 0.00756627865970883 0.00689255755548175 0.00761425192645151 0.00688181887541009 0.00209264845194322 0.00191596382476761 330736 300383 667 665 0 True 438 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 480 536 0.00757220382713198 0.00694698522456289 0.00749217975127794 0.00704966811627375 0.00216724932760257 0.0019461310617382 330995 302755 667 665 0 True 483 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 525 536 0.00722140646316805 0.00690634803993275 0.0072632944228275 0.00695811398489357 0.00220827725324466 0.00182815282337229 315661 300984 667 665 0 True 527 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 568 536 0.00677562340367925 0.00683815283229819 0.00677500572213321 0.00671396963454643 0.00178535472812505 0.00214833172905591 296175 298012 667 665 0 True 572 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 613 536 0.00699199496154875 0.00653675846746645 0.00701915007248035 0.00654612039368277 0.00176461264017221 0.00161551749467282 305633 284877 667 665 0 True 617 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 657 535 0.00669811580819798 0.00653097610127401 0.00669871061264973 0.00653086137178607 0.00181787811245841 0.00201816243526005 292787 284625 667 665 0 True 661 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 260 580 0.00683075720093718 0.00678328919116285 0.00677500572213321 0.0068207827878233 0.00128625035350688 0.00126392322091084 298585 295621 667 665 0 True 260 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 304 579 0.00662795175998634 0.00684370573951473 0.00659189745937285 0.00689707789730678 0.0013921679925538 0.00146884852398486 289720 298254 667 665 0 True 304 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 348 579 0.00676603790116844 0.00667112964374773 0.00675974670023652 0.00671396963454643 0.00142108293878507 0.00136866820194055 295756 290733 667 665 0 True 349 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 392 579 0.00650134992014178 0.00660825788435382 0.00654612039368277 0.00660715648126955 0.00141510949581034 0.00137635995101547 284186 287993 667 665 0 True 394 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 436 578 0.0066370339664226 0.00646319391979606 0.00666819256885634 0.00643930724040589 0.00187004126311787 0.00204240357570381 290117 281671 667 665 0 True 438 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 480 577 0.00665204134028202 0.00667677433455463 0.00668345159075303 0.00677500572213321 0.00202592564766604 0.00187097133126225 290773 290979 667 665 0 True 483 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 525 576 0.00671730969031392 0.00665873885904966 0.00674448767833982 0.00672922865644312 0.00209815787807937 0.00187896000283334 293626 290193 667 665 0 True 528 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 569 576 0.00647954804927589 0.00647179863139194 0.00648508430609598 0.0063782711528191 0.00174536082614664 0.00187018660628227 283233 282046 667 665 0 True 572 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 612 576 0.00655577452747648 0.00667709557712087 0.00657663843747616 0.00671396963454643 0.0015198636147226 0.00158482691116083 286565 290993 667 665 0 True 617 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 657 575 0.00644408855311415 0.00671410730993196 0.00645456626230259 0.00659189745937285 0.00160458242303551 0.00252874215399961 281683 292606 667 665 0 True 662 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 260 623 0.00712676392405766 0.00697419905910347 0.00709544518196384 0.00695811398489357 0.00131081055368044 0.00138405301505418 311524 303941 667 665 0 False 260 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 305 623 0.00677118524738546 0.00681679020164281 0.00677500572213321 0.00675974670023652 0.00136767992503609 0.00128903241693289 295981 297081 667 665 0 False 305 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 347 621 0.00640192606832313 0.00656780426690439 0.00646982528419928 0.00656137941557946 0.0014178989367569 0.0014367222271721 279840 286230 667 665 0 True 349 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 391 620 0.00652132162346385 0.00658563322933105 0.00653086137178607 0.00654612039368277 0.00127549550083824 0.00131013148130225 285059 287007 667 665 0 True 394 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 439 622 0.00632425833318177 0.00634628457158001 0.00631723506523232 0.00633249408712902 0.00172860850636823 0.00186770422772141 276445 276576 667 665 0 False 439 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 483 622 0.00645310212826752 0.00636353988656696 0.00648508430609598 0.00643930724040589 0.00189126283149047 0.00190012306011425 282077 277328 667 665 0 False 483 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 528 622 0.00659450544812281 0.00642533318877418 0.00653086137178607 0.00634775310902571 0.00190767653572929 0.00188859595003698 288258 280021 667 665 0 False 528 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 572 622 0.00665890446857139 0.00638483367952956 0.00659189745937285 0.00633249408712902 0.0017860347298428 0.001735809196689 291073 278256 667 665 0 False 572 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 617 622 0.00651523631638061 0.00660456359484199 0.00654612039368277 0.00657663843747616 0.00140465628297677 0.00137133079491442 284793 287832 667 665 0 False 617 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 662 621 0.00665247600507368 0.0067716785669828 0.00674448767833982 0.00679026474402991 0.00152386469938107 0.00148063935197992 290792 295115 667 665 0 False 662 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 261 672 0.00846944346549545 0.702283862551779 0.00833142595559625 0.697398336766613 0.00176344727673713 0.19955264208899 370215 30606075 667 665 10 True 260 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 305 666 0.00682345940785615 0.00656587681150691 0.00675974670023652 0.00657663843747616 0.00145257487090487 0.00128306730355358 298266 286146 667 665 0 False 305 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 349 666 0.00632478450635062 0.00633797815665279 0.00633249408712902 0.0063935301747158 0.0012768821083362 0.00130598712640978 276468 276214 667 665 0 False 349 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 394 666 0.0061989833648065 0.00617178102041554 0.00619516289005875 0.00622568093385214 0.00132502870544817 0.00127564203773725 270969 268971 667 665 0 False 394 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 439 666 0.00648238480896883 0.00632790490761121 0.0064087891966125 0.00625619897764553 0.00171368438008975 0.00172926129154915 283357 275775 667 665 0 False 439 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 483 666 0.00642363643081183 0.00629768516048648 0.00645456626230259 0.00630197604333562 0.00163102118637803 0.00157333977421796 280789 274458 667 665 0 False 483 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 528 666 0.00653939452795918 0.00639889951475163 0.00650034332799268 0.0063782711528191 0.00179333101322663 0.0016242416141419 285849 278869 667 665 0 False 528 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 573 665 0.00652935148356241 0.006330428956346 0.00651560234988937 0.00630197604333562 0.00152915475925046 0.00138181436304855 285410 275885 667 665 0 False 573 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 617 665 0.00742180980921762 0.00685804692550786 0.00697337300679027 0.00689707789730678 0.00289400725922444 0.00143457603708537 324421 298879 667 665 0 False 617 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 657 671 0.00857733184220433 0.730890122995748 0.00842298008697642 0.720973525597009 0.00208293537239832 0.189991331755599 374931 31852758 667 665 13 True 662 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G9_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G9_3.csv new file mode 100755 index 0000000..8a45e60 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_G9_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 258 275 0.00102665536080666 0.0718370428245023 0.000854505226215 0.0722667277027543 0.000840690795575879 0.0221252090353033 44877 3130714 667 665 0 True 259 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 303 275 0.00103116214838335 0.00104364826004127 0.000946059357595178 0.000961318379491875 0.00069162363982426 0.000688724625475498 45074 45483 667 665 0 False 303 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 347 276 0.000990692568570372 0.000979606259870321 0.000885023270008392 0.000839246204318303 0.000706470731175074 0.000714596233269042 43305 42692 667 665 0 True 348 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 391 276 0.00095539321206872 0.00093644502650538 0.00080872816052491 0.00080872816052491 0.000732622341396296 0.00070394303844337 41762 40811 667 665 0 True 392 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 435 276 0.000945556061520624 0.000939611560372664 0.000701915007248035 0.000717174029144732 0.000884169557301715 0.000830112273504185 41332 40949 667 665 0 True 437 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 479 276 0.00108114859942425 0.000982749847840017 0.00080872816052491 0.000656137941557946 0.000989107232368901 0.000976513614454546 47259 42829 667 665 0 True 482 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 523 274 0.000941049273943939 0.000980386420388348 0.000701915007248035 0.000793469138628214 0.000872015349761321 0.000875439447811984 41135 42726 667 665 0 True 526 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 567 274 0.000963445949261579 0.000966182909780746 0.000656137941557946 0.000732433051041428 0.000922175660932653 0.000882177441556178 42114 42107 667 665 0 True 571 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 616 274 0.00129781755951962 0.00103240477022265 0.000762951094834821 0.000747692072938125 0.00157682618801927 0.000957324510472001 56730 44993 667 665 0 False 616 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 654 274 0.00121292066258013 0.0734199196778855 0.000930800335698482 0.0705119401846342 0.00105888126867515 0.0202271517087841 53019 3199697 667 665 0 True 660 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 259 319 0.000998081870028593 0.00102315757349428 0.000823987182421607 0.000885023270008392 0.000824315712997036 0.00074629203595295 43628 44590 667 665 0 False 259 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 303 319 0.00092288486107141 0.000867745009123863 0.000762951094834821 0.000762951094834821 0.000692474528118572 0.000618337057302083 40341 37817 667 665 0 False 303 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 346 320 0.000944595223560113 0.00093644502650538 0.00080872816052491 0.000778210116731518 0.000676586608114541 0.000695995192617456 41290 40811 667 665 0 True 348 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 391 320 0.000914397459086891 0.000924719672837392 0.000778210116731518 0.000762951094834821 0.0006909094534769 0.000701469765128072 39970 40300 667 665 0 True 393 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 435 320 0.00099126449592782 0.000869144708876793 0.000732433051041428 0.000579842832074464 0.00088941739798561 0.00084018914810451 43330 37878 667 665 0 True 437 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 480 319 0.00096930248540184 0.000933783302385054 0.000762951094834821 0.000762951094834821 0.000863115189913545 0.000833476460074368 42370 40695 667 665 0 True 482 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 527 318 0.000821813858463307 0.000967284312865019 0.00064087891966125 0.000762951094834821 0.000748666858281226 0.000858283835196804 35923 42155 667 665 0 False 527 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 568 318 0.000990052009930032 0.00100714133697714 0.000762951094834821 0.000793469138628214 0.000918634196954153 0.000858310279391897 43277 43892 667 665 0 True 571 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 616 317 0.00108641033111277 0.00103029374764446 0.000625619897764553 0.000534065766384375 0.00116751299691389 0.00113815885943497 47489 44901 667 665 0 False 616 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 660 317 0.00104637541609145 0.00105186289137814 0.000717174029144732 0.000717174029144732 0.00101310477740068 0.00101246491470579 45739 45841 667 665 0 False 660 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 257 363 0.000993758099206291 0.00102747140224101 0.000839246204318303 0.000885023270008392 0.000772679421175876 0.000813632634022292 43439 44778 667 665 0 True 259 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 302 363 0.000903462208012496 0.000912604238910391 0.00080872816052491 0.000778210116731518 0.000666984350170859 0.000720337093672826 39492 39772 667 665 0 True 304 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 348 362 0.000935238491992273 0.000991216884050364 0.000823987182421607 0.000885023270008392 0.000709989331910162 0.000723137359939468 40881 43198 667 665 0 False 348 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 391 364 0.000890673912299973 0.000987040730689163 0.000732433051041428 0.000854505226215 0.000712490968030072 0.000746072472468706 38933 43016 667 665 0 True 393 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 437 362 0.000943359860468027 0.000904825579627714 0.000671396963454643 0.000579842832074464 0.000857804825457551 0.000926692994462638 41236 39433 667 665 0 False 437 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 482 361 0.000948918994382415 0.000978986720635418 0.000610360875867857 0.000656137941557946 0.000916094310018137 0.000894033991104827 41479 42665 667 665 0 False 482 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 523 363 0.000925035307935412 0.000990299048146803 0.00064087891966125 0.000671396963454643 0.000877794323446901 0.000934706718009007 40435 43158 667 665 0 True 527 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 567 362 0.000955118686937145 0.000970404954937125 0.000671396963454643 0.000671396963454643 0.000918639139804836 0.000937385308408011 41750 42291 667 665 0 True 571 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 612 362 0.000969531256344819 0.00100165726745337 0.000457770656900893 0.000534065766384375 0.00109891354891894 0.00109636193250156 42380 43653 667 665 0 True 616 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 656 363 0.0011111175929545 0.000982979306815907 0.000717174029144732 0.000518806744487678 0.00110785426655186 0.00106593859515761 48569 42839 667 665 0 True 661 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 259 408 0.00104735913114626 0.000916092015343922 0.000915541313801785 0.000747692072938125 0.000848728828891555 0.0007916519343952 45782 39924 667 665 0 True 259 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 301 407 0.000929816620643672 0.000882889301532614 0.000823987182421607 0.000778210116731518 0.000708619847830151 0.000690890721166664 40644 38477 667 665 0 True 304 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 346 408 0.000935696033878231 0.000963154051298996 0.000839246204318303 0.000854505226215 0.000707005436750442 0.000706444770117163 40901 41975 667 665 0 True 348 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 390 407 0.00099442153494093 0.000969005255184195 0.000839246204318303 0.000839246204318303 0.000787941754420197 0.00079414360270183 43468 42230 667 665 0 True 393 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 435 407 0.00103967242746217 0.000867836792714219 0.000778210116731518 0.000610360875867857 0.00090692064637189 0.000836334615561443 45446 37821 667 665 0 True 438 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 479 406 0.000988427736234881 0.00108924175855065 0.000671396963454643 0.000793469138628214 0.00092078075468921 0.000948658890556224 43206 47470 667 665 0 True 482 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 523 406 0.000945739078275008 0.00101482821266946 0.000732433051041428 0.000762951094834821 0.000852042738914466 0.000915383015404628 41340 44227 667 665 0 True 527 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 566 405 0.00094571620118071 0.00104523152697491 0.000701915007248035 0.00080872816052491 0.000905181654332612 0.000925521209418916 41339 45552 667 665 0 True 572 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 611 407 0.00101146497019286 0.00105876960655243 0.000732433051041428 0.000656137941557946 0.00100198440303411 0.00108944792970462 44213 46142 667 665 0 True 616 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 655 407 0.000952762346224462 0.00103157871790945 0.000625619897764553 0.000671396963454643 0.000985868539808963 0.000993602036500344 41647 44957 667 665 0 True 661 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 258 452 0.00102175966262691 0.000967330204660197 0.000839246204318303 0.00080872816052491 0.000870393739728724 0.000814859135446431 44663 42157 667 665 0 True 259 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 303 451 0.000906276090611138 0.000917376985608907 0.000778210116731518 0.000762951094834821 0.000803656438153371 0.000797063585998499 39615 39980 667 665 0 True 304 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 345 451 0.000934414916597549 0.000982635118352072 0.000823987182421607 0.000854505226215 0.00077003721292354 0.000779858719074376 40845 42824 667 665 0 True 349 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 390 452 0.00096637421733171 0.000976485617798215 0.00080872816052491 0.000793469138628214 0.000807919455590477 0.000800668402468335 42242 42556 667 665 0 True 393 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 435 452 0.00100757586416222 0.000940988314228005 0.000686655985351339 0.000473029678797589 0.00100881328710895 0.00106513544057221 44043 41009 667 665 0 True 438 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 479 450 0.00100313770786843 0.00102297400631356 0.000671396963454643 0.000518806744487678 0.00101291198307604 0.00112504438948791 43849 44582 667 665 0 True 482 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 523 450 0.000926407933593286 0.00100039524308597 0.000610360875867857 0.000732433051041428 0.00093603827836194 0.000905762667314345 40495 43598 667 665 0 True 527 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 567 449 0.000907465699514628 0.000968752850310716 0.000518806744487678 0.000564583810177768 0.00101587047431521 0.00104431434901622 39667 42219 667 665 0 True 572 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 611 450 0.00098897678649803 0.000853748011594562 0.00064087891966125 0.000473029678797589 0.00101170461058126 0.000930177270629374 43230 37207 667 665 0 True 616 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 656 450 0.00100682092005039 0.000975108863942874 0.000656137941557946 0.000564583810177768 0.00100700493518899 0.00106781152733556 44010 42496 667 665 0 True 661 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 260 495 0.000957177625423955 0.00100243742797139 0.00080872816052491 0.000839246204318303 0.000792132757112381 0.000777152544177372 41840 43687 667 665 0 True 259 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 304 495 0.000928009330194138 0.000864945609618002 0.000778210116731518 0.000686655985351339 0.000841875589366731 0.000798267901202615 40565 37695 667 665 0 True 304 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 347 495 0.000932676257430909 0.000962373890780969 0.000778210116731518 0.00080872816052491 0.000801326335608 0.000848808524395372 40769 41941 667 665 0 True 349 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 392 496 0.000982182289491555 0.000980845338340128 0.000793469138628214 0.000793469138628214 0.00080713598934281 0.000832983845241754 42933 42746 667 665 0 True 393 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 436 495 0.00103431918739646 0.000950235510956379 0.000701915007248035 0.000488288700694286 0.001016069884999 0.00103823220083503 45212 41412 667 665 0 True 438 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 480 494 0.00105504583483035 0.00104362531414368 0.000717174029144732 0.000762951094834821 0.0010062651963691 0.00097875497298445 46118 45482 667 665 0 True 483 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 524 494 0.00095745215055553 0.0010469295233965 0.00064087891966125 0.00080872816052491 0.000932375119062021 0.000929544823502414 41852 45626 667 665 0 True 527 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 569 494 0.00102562589156326 0.000982795739635195 0.000610360875867857 0.00064087891966125 0.00103178335753367 0.000968087907132376 44832 42831 667 665 0 True 572 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 612 494 0.000972299384754865 0.00100477790952547 0.000625619897764553 0.00064087891966125 0.000983134797705715 0.000967287752702333 42501 43789 667 665 0 True 617 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 656 495 0.000955301703691528 0.000987935620695135 0.000518806744487678 0.000534065766384375 0.00102367473235472 0.00105482368834414 41758 43055 667 665 0 True 661 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 260 540 0.00106568368367887 0.000981441931677442 0.000930800335698482 0.000778210116731518 0.000809851990668569 0.000810985271551237 46583 42772 667 665 0 True 260 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 304 538 0.00103525714826267 0.000966917178503595 0.000915541313801785 0.000839246204318303 0.000828246373656128 0.000783094295043369 45253 42139 667 665 0 True 304 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 347 539 0.00103550879629995 0.00100610877158564 0.000869764248111696 0.000839246204318303 0.000835619275383944 0.000803425256375702 45264 43847 667 665 0 True 349 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 392 540 0.00102356695307645 0.000970152550063646 0.000854505226215 0.000793469138628214 0.000835424888859782 0.000822482023926633 44742 42280 667 665 0 True 394 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 437 538 0.000989914747364244 0.000939611560372664 0.00064087891966125 0.000473029678797589 0.000987406751054326 0.00104986584051231 43271 40949 667 665 0 True 438 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 480 536 0.00100087287553294 0.000995415983309154 0.000610360875867857 0.000534065766384375 0.00105813568904007 0.00106499175526572 43750 43381 667 665 0 True 483 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 525 536 0.00100679804295609 0.000962672187449627 0.000656137941557946 0.000595101853971161 0.00100937757868701 0.000975732297815628 44009 41954 667 665 0 True 527 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 568 536 0.000992065194228246 0.00103339144381898 0.000686655985351339 0.000671396963454643 0.000905543163888835 0.000993582320676942 43365 45036 667 665 0 True 572 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 613 536 0.00102180541681551 0.00100140486257989 0.000732433051041428 0.000671396963454643 0.000987811767860061 0.000932505893863407 44665 43642 667 665 0 True 617 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 657 535 0.00113349139117784 0.000982176200400291 0.000747692072938125 0.000473029678797589 0.00111355166569594 0.00113305900012578 49547 42804 667 665 0 True 661 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 260 580 0.00106273253851445 0.000933393222126041 0.000946059357595178 0.000854505226215 0.000728405737614643 0.000643336466045855 46454 40678 667 665 0 True 260 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 304 579 0.000872989918407699 0.000945669277336165 0.000778210116731518 0.000854505226215 0.000686288886114912 0.000730176230897202 38160 41213 667 665 0 True 304 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 348 579 0.000973740641695632 0.000923985404114544 0.000823987182421607 0.000747692072938125 0.000717523901899539 0.000761192871349308 42564 40268 667 665 0 True 349 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 392 579 0.000998928322517615 0.000920359952295479 0.000839246204318303 0.000793469138628214 0.000764112806488525 0.000667579093024472 43665 40110 667 665 0 True 394 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 436 578 0.000937571955610659 0.000922838109235093 0.000595101853971161 0.000473029678797589 0.000952409435453238 0.00102405053158845 40983 40218 667 665 0 True 438 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 480 577 0.000941209413604024 0.000981786120141278 0.000579842832074464 0.000625619897764553 0.00101532025123985 0.00103358228281249 41142 42787 667 665 0 True 483 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 525 576 0.000970995390379884 0.000991584018411788 0.000488288700694286 0.00064087891966125 0.00107387795585712 0.0010386055628001 42444 43214 667 665 0 True 528 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 569 576 0.000998836814140423 0.000967353150557786 0.000717174029144732 0.000610360875867857 0.00093135945950473 0.000969971917339187 43661 42158 667 665 0 True 572 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 612 576 0.00102908033280224 0.000996173197929592 0.000823987182421607 0.000762951094834821 0.00083576779419842 0.000858269340477881 44983 43414 667 665 0 True 617 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 657 575 0.00101748164599321 0.00100583342081457 0.000656137941557946 0.000762951094834821 0.000960447199108811 0.000870145278120854 44476 43835 667 665 0 True 662 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 260 623 0.000935284246180869 0.000952484208920103 0.000823987182421607 0.000839246204318303 0.000688869311532107 0.000700045946145064 40883 41510 667 665 0 False 260 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 305 623 0.000980603769985001 0.000936605647788503 0.000839246204318303 0.000793469138628214 0.000797862041883042 0.000730542054032739 42864 40818 667 665 0 False 305 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 347 621 0.000928672765928778 0.000880755333056835 0.000762951094834821 0.000762951094834821 0.000755176747128321 0.000731359537864379 40594 38384 667 665 0 True 349 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 391 620 0.000970537848493927 0.00091193880788031 0.000854505226215 0.00080872816052491 0.000718512430847987 0.000640452621707254 42424 39743 667 665 0 True 394 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 439 622 0.000910851509470717 0.000863821260636141 0.000564583810177768 0.000518806744487678 0.000939479605300922 0.000906455957559822 39815 37646 667 665 0 False 439 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 483 622 0.000939630894097469 0.000935917270860833 0.000564583810177768 0.000549324788281071 0.000993929337717854 0.00101954284833014 41073 40788 667 665 0 False 483 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 528 622 0.000960311787342767 0.000881260142803794 0.00064087891966125 0.000411993591210803 0.000978149489851347 0.00102221447979437 41977 38406 667 665 0 False 528 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 572 622 0.000974838742221931 0.000990620290713049 0.000671396963454643 0.000701915007248035 0.000902528490454285 0.000955601652577994 42612 43172 667 665 0 False 572 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 617 622 0.00102825675740752 0.000963980103612201 0.000793469138628214 0.00080872816052491 0.000841397471930863 0.000716749347035558 44947 42011 667 665 0 False 617 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 662 621 0.00106703343224245 0.00104447431235447 0.000869764248111696 0.000869764248111696 0.000792451014728241 0.000815364670852627 46642 45519 667 665 0 False 662 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 261 672 0.00117377795423643 0.0723302878390758 0.00102235446707866 0.070267795834287 0.000799236326668136 0.0226984184164643 51308 3152210 667 665 0 True 260 667 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 305 666 0.000926636704536265 0.000925844021819254 0.000854505226215 0.000839246204318303 0.000642419729509434 0.00068201821399342 40505 40349 667 665 0 False 305 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 349 666 0.00091190385580842 0.000950028997878078 0.000823987182421607 0.00080872816052491 0.000649189096897263 0.000683183135957818 39861 41403 667 665 0 False 349 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 394 666 0.000934437793691847 0.000829838386306806 0.000762951094834821 0.000671396963454643 0.000720421090550318 0.000640834451712976 40846 36165 667 665 0 False 394 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 439 666 0.000980237736476234 0.000948399839149258 0.000747692072938125 0.000762951094834821 0.000860253700108134 0.000827264976167566 42848 41332 667 665 0 False 439 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 483 666 0.000933637095391421 0.0010653091873653 0.000671396963454643 0.000854505226215 0.000861605404702223 0.0008490670041486 40811 46427 667 665 0 False 483 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 528 666 0.000890856929054356 0.000931557550318919 0.000549324788281071 0.000671396963454643 0.000895980525792124 0.000889325329713475 38941 40598 667 665 0 False 528 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 573 665 0.00098517918884458 0.000935022380854861 0.000793469138628214 0.000747692072938125 0.000827209526393179 0.000747682727980725 43064 40749 667 665 0 False 573 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 617 665 0.00102050142244053 0.000993970391761046 0.000839246204318303 0.000823987182421607 0.000750562113403773 0.00075214785941973 44608 43318 667 665 0 False 617 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 657 671 0.00120269460142897 0.075821942129299 0.00105287251087205 0.0727244983596552 0.000830878064739737 0.0228536872207247 52572 3304379 667 665 0 True 662 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H10_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H10_1.csv new file mode 100755 index 0000000..1e6dc6c --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H10_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 278 254 0.00898928115042231 0.0345611109485777 0.0089570458533608 0.0363012130922408 0.00144944879013928 0.0090770812274814 366428 1506200 622 665 0 True 277 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 321 255 0.00925992026547754 0.00924168971295256 0.00923170824750134 0.00926222629129473 0.00123610309449764 0.00131157724151192 377460 402760 622 665 0 False 321 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 365 256 0.0094369690774204 0.0507210346764141 0.0093690394445716 0.0522621499961852 0.00152033500880573 0.00804992930393919 384677 2210462 622 665 0 True 366 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 410 256 0.00923801302021428 0.0713114899861235 0.00927748531319142 0.0711985961699855 0.00141467995302469 0.0110157419453001 376567 3107810 622 665 0 True 410 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 455 256 0.0091311998669374 0.0591687045491963 0.00917067215991455 0.057450217441062 0.0016612048469049 0.00992403399987945 372213 2578618 622 665 0 True 454 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 498 255 0.00869614601755474 0.0499019120242813 0.00877393759060044 0.0534370946822309 0.00169141760901316 0.0150234880105659 354479 2174764 622 665 0 False 498 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 542 254 0.008867356168386 0.0642497752736155 0.00886549172198062 0.0649576562142367 0.00157865316020685 0.0205348946503479 361458 2800055 622 665 0 True 543 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 587 254 0.009043104774283 0.0552157918256387 0.00907911802853437 0.05468833447776 0.00174730474755271 0.014172509470374 368622 2406347 622 665 0 True 587 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 631 254 0.00916591291514291 0.00895305326718031 0.00917067215991455 0.00898756389715419 0.00185137822222888 0.00184703572462425 373628 390181 622 665 0 False 631 254 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 674 255 0.00891519393799784 0.0366786501616825 0.00892652780956741 0.0370336461432822 0.00178125071809078 0.00834412434311339 363408 1598484 622 665 0 True 676 254 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 277 299 0.00915372041693928 0.00919999701703331 0.00921644922560464 0.00924696726939803 0.00130839510658678 0.00153655548703014 373131 400943 622 665 0 False 277 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 321 299 0.00941091589212411 0.00934620827647053 0.009399557488365 0.0093842984664683 0.00135351550752183 0.00127397690264061 383615 407315 622 665 0 False 321 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 367 300 0.00946748712121379 0.0915336406936315 0.00943007553215839 0.0911879148546578 0.00147064736391201 0.0207032204821095 385921 3989107 622 665 0 True 366 298 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 408 299 0.00952437726876756 0.0450813919669854 0.00946059357595178 0.0466620889600977 0.00158324966042417 0.00812071542704134 388240 1964682 622 665 0 True 410 298 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 454 300 0.00926551360469369 0.0635430645737713 0.00920119020370794 0.0637521934843976 0.0020937138002544 0.0126000338438581 377688 2769256 622 665 0 True 454 298 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 499 298 0.0089157827105469 0.0369651755848766 0.00888075074387732 0.0374303807125963 0.00180399826633474 0.00893889996225261 363432 1610971 622 665 0 True 499 298 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 543 298 0.0091063487589288 0.0332894263582968 0.00909437705043107 0.0352941176470588 0.00158155484292664 0.00682937108826037 371200 1450779 622 665 0 False 543 298 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 588 298 0.00922432405844843 0.0413553453328905 0.009399557488365 0.0428778515297169 0.00187157477419747 0.00737208560005744 376009 1802298 622 665 0 True 587 298 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 631 298 0.00896953273783896 0.00892196157594719 0.00892652780956741 0.00885023270008392 0.00211687300669912 0.00197309282418815 365623 388826 622 665 0 False 631 298 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 676 297 0.00878505067246411 0.00891868031259196 0.00883497367818723 0.00904859998474098 0.00181692671223916 0.00198889499986702 358103 388683 622 665 0 False 676 297 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 277 337 0.00959164453249865 0.0401445591548108 0.00955214770733196 0.0421301594567788 0.00161683255509841 0.0104895466424293 390982 1749531 622 665 0 True 277 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 319 338 0.00974028506894895 0.04840134210555 0.00975051499198901 0.0522621499961852 0.00154460588773355 0.0157988138632014 397041 2109368 622 665 0 True 322 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 367 338 0.00946996487235779 0.0323563773246345 0.00935378042267491 0.0333867399099718 0.00185208555349943 0.00539728659533879 386022 1410116 622 665 0 True 366 341 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 411 338 0.00934904571009281 0.0292469099046541 0.0093690394445716 0.0297703517204547 0.0015627478733475 0.00418981744125572 381093 1274603 622 665 0 True 410 341 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 453 337 0.00964326025930034 0.0568397647816038 0.00949111161974517 0.0575112535286488 0.00231958205984391 0.0110228958910929 393086 2477121 622 665 0 True 454 341 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 499 341 0.00932532308280325 0.0250632073431461 0.00930800335698482 0.0271152819104295 0.00179686147299213 0.00675299913053836 380126 1092274 622 665 0 False 499 341 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 543 341 0.00923558433344937 0.0221265684238061 0.00917067215991455 0.0241550316624704 0.00191155382979222 0.00629817591309675 376468 964293 622 665 0 False 543 341 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 587 335 0.00920261307070152 0.0425094092521301 0.00910963607232776 0.0433813992523079 0.00235924591138378 0.00887370542850502 375124 1852593 622 665 0 True 587 341 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 632 335 0.00896585290940729 0.048196045159821 0.0089570458533608 0.0485847257190814 0.001919945660499 0.011020115387015 365473 2100421 622 665 0 True 632 341 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 676 336 0.00883443397001725 0.0508758277015496 0.00880445563439384 0.0517586022735943 0.00198496783876508 0.0125793642084839 360116 2217208 622 665 0 True 676 341 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 278 381 0.00916890584226734 0.0354811037665117 0.00912489509422446 0.0378118562600137 0.00143486048929105 0.00807621476105302 373750 1546294 622 665 0 True 277 385 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 323 382 0.00904482202755112 0.0269447709454456 0.00904859998474098 0.0270695048447395 0.00145441231484441 0.00350376620217693 368692 1174274 622 665 0 True 322 385 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 366 382 0.00922891157789326 0.0680650355575365 0.00926222629129473 0.068207827878233 0.00153387726117579 0.0160782579976978 376196 2966327 622 665 0 True 366 385 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 411 381 0.00914449631367054 0.0528291431256099 0.00909437705043107 0.054337376974136 0.0014937389122246 0.0108546069550544 372755 2302335 622 665 0 True 410 384 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 456 380 0.00925835020534669 0.037579804397696 0.00921644922560464 0.0381780727855345 0.00171994811601284 0.00655223506291065 377396 1637757 622 665 0 True 455 384 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 499 379 0.00921004632413352 0.0450126231119112 0.00917067215991455 0.0468604562447547 0.00174165068659187 0.00999173132600806 375427 1961685 622 665 0 True 499 384 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 543 379 0.00906025277477463 0.035571258198139 0.00901808194094758 0.0366979476615549 0.00187083707691032 0.0065363020670567 369321 1550223 622 665 0 True 543 384 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 588 378 0.00911915456187104 0.0422122139865571 0.00907911802853437 0.0427557793545434 0.00192307672732571 0.00685717693986386 371722 1839641 622 665 0 True 587 384 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 632 379 0.00901975012983661 0.036079326262555 0.00910963607232776 0.036942092011902 0.00203197244547876 0.00541581680361325 367670 1572365 622 665 0 True 632 384 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 675 379 0.0090155551254245 0.0702681629686484 0.00906385900663768 0.0702525368123903 0.00182845251770806 0.0149853873315332 367499 3062341 622 665 0 True 676 384 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 278 425 0.00891144051299752 0.0350411850179351 0.00889600976577401 0.0367284657053483 0.00146221613520689 0.00743583255708916 363255 1527122 622 665 0 True 278 428 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 323 425 0.0092282737409651 0.0381186888025741 0.00927748531319142 0.0386663614862287 0.0014093777917312 0.00481551027729572 376170 1661242 622 665 0 True 322 428 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 366 425 0.00957655723592877 0.0283959383466678 0.0093842984664683 0.0293888761730373 0.00284041854162611 0.00404245686063288 390367 1237517 622 665 0 True 366 428 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 410 424 0.0091430979788665 0.0441893013605196 0.00915541313801785 0.0452277409018082 0.0015460999167803 0.00969443490933348 372698 1925804 622 665 0 True 410 428 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 456 424 0.0092894815538787 0.0812684033269257 0.00941481651026169 0.0813611047531853 0.00171712324066212 0.0118155208733008 378665 3541740 622 665 0 True 455 427 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 499 423 0.00935304445698857 0.0477860708075981 0.0093842984664683 0.0498664835584039 0.00174726824353944 0.0112256060918364 381256 2082554 622 665 0 True 499 427 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 543 423 0.00934242201891579 0.0435153574024326 0.00933852140077821 0.0443732356755932 0.00168757045657771 0.00788256994735475 380823 1896433 622 665 0 True 543 427 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 588 422 0.00909579991742465 0.027734431065074 0.00914015411612116 0.028351262684062 0.001937986431154 0.00456279108625962 370770 1208688 622 665 0 True 588 427 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 632 423 0.00898462003440885 0.0338144514410311 0.00910963607232776 0.034378576333257 0.00188925863746943 0.00430818974271957 366238 1473660 622 665 0 True 632 427 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 676 423 0.00900306824094634 0.0587095341925425 0.00906385900663768 0.0581216144045167 0.00190135468505845 0.00799671083949788 366990 2558607 622 665 0 True 676 427 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 280 469 0.0088888954308061 0.0462212523756175 0.00891126878767071 0.0473792629892424 0.00164234059326091 0.010545551906023 362336 2014358 622 665 0 True 278 471 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 324 469 0.00928614517610064 0.0440766370033576 0.0093690394445716 0.0446784161135271 0.00157401316125105 0.00473185928100381 378529 1920894 622 665 0 True 322 471 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 368 469 0.00921240141432979 0.0549821108045922 0.00917067215991455 0.0539253833829252 0.00164942467278581 0.0116530281983805 375523 2396163 622 665 0 True 366 471 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 412 469 0.00957444746762793 0.0735558282293052 0.00947585259784848 0.0713664454108492 0.00191139233366434 0.0164226122069875 390281 3205620 622 665 0 True 411 471 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 456 468 0.0094121179694118 0.0784914678548053 0.00941481651026169 0.0761577782864118 0.00199172274849861 0.0241096116386363 383664 3420719 622 665 0 True 455 471 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 501 467 0.00924996019652246 0.0356325237447017 0.00926222629129473 0.0365300984206912 0.00201018482086226 0.00500147526715864 377054 1552893 622 665 0 True 499 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 543 470 0.00954886039393299 0.0315893418600289 0.00964370183871214 0.0353093766689555 0.0020264327123666 0.00951131249208994 389238 1376688 622 665 0 False 543 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 589 467 0.00942379529163499 0.0931739970204752 0.00949111161974517 0.0901808194094759 0.00194574762125267 0.0160837844142939 384140 4060595 622 665 0 True 588 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 632 466 0.00923082508867773 0.0574522366800499 0.00923170824750134 0.0584267948424506 0.00186338904514651 0.0167730702882575 376274 2503813 622 665 0 True 632 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 677 467 0.0091529599190634 0.0749097738624428 0.00914015411612116 0.0715648126955062 0.00184571383527925 0.0131767094395962 373100 3264626 622 665 0 True 676 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 280 513 0.00900377967444313 0.0414149587748267 0.00898756389715419 0.0437170977340352 0.00154273320915613 0.00828852642863035 367019 1804896 622 665 0 True 278 514 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 324 513 0.0094811515507901 0.0864168890984614 0.00949111161974517 0.0797741664759289 0.00163055060327848 0.0232355794707851 386478 3766115 622 665 0 True 322 514 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 368 512 0.00952928370667646 0.0455064876657196 0.00949111161974517 0.0481422140840772 0.0017641782185653 0.00839288115737022 388440 1983208 622 665 0 True 366 514 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 412 512 0.00968579907597055 0.0483223852719462 0.00968947890440223 0.0487220569161517 0.00207856030223216 0.00560286830892411 394820 2105927 622 665 0 True 411 514 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 457 511 0.00944575160127734 0.0458216266232071 0.00944533455405508 0.0461738002594034 0.00177289279151263 0.0050983342595908 385035 1996942 622 665 0 True 455 514 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 500 509 0.0093401159930986 0.0536351636702193 0.0093690394445716 0.0534676127260243 0.0017375370433349 0.0108174472154746 380729 2337462 622 665 0 True 499 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 545 508 0.00933265820747707 0.061728273533456 0.00930800335698482 0.0612802319371328 0.00172544175417286 0.0139386977106027 380425 2690166 622 665 0 True 544 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 588 509 0.00917579938752936 0.0492196387053695 0.00906385900663768 0.0502327000839246 0.00182771092387535 0.0103359416132964 374031 2145030 622 665 0 True 588 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 633 508 0.0089913173221545 0.041437331024976 0.00915541313801785 0.0415503166247044 0.00185018811849611 0.00492840964317759 366511 1805871 622 665 0 True 632 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 678 508 0.00909889097330726 0.0571503604513688 0.00910963607232776 0.0579385061417563 0.0019622845055096 0.0116213482755595 370896 2490657 622 665 0 True 676 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 281 554 0.00888286051217815 0.0355559532844471 0.0089723048752575 0.0358129243915465 0.00142286804339076 0.00603811404930262 362090 1549556 622 665 0 True 278 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 324 552 0.00922030077936313 0.0458472112990189 0.00918593118181125 0.0465552758068208 0.00159258824043485 0.00959385524502454 375845 1998057 622 665 0 True 322 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 368 554 0.00954773191321395 0.0363119976641076 0.00946059357595178 0.0372930495155261 0.00200080741174879 0.00565733085166984 389192 1582505 622 665 0 True 367 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 413 552 0.00939060323918124 0.045745423297314 0.0093690394445716 0.0437628747997253 0.00183463173653178 0.00773770952033072 382787 1993621 622 665 0 True 411 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 457 552 0.00963791224197963 0.0724975175407046 0.00964370183871214 0.07006942854963 0.00198445172811223 0.0126632266173959 392868 3159498 622 665 0 True 455 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 501 550 0.00925572526106543 0.0514878406820439 0.00933852140077821 0.050919356069276 0.001954266302406 0.00715054623087959 377289 2243880 622 665 0 True 499 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 546 550 0.00918031331040555 0.0480023817841697 0.00927748531319142 0.04785229266804 0.00189809441007595 0.00581346450822486 374215 2091981 622 665 0 True 544 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 588 556 0.00978446754231864 0.0283186336176904 0.009399557488365 0.0323643854428931 0.00278490114331424 0.0114910937448274 398842 1234148 622 665 0 False 588 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 632 556 0.0103052613941594 0.0345867644620822 0.00944533455405508 0.0392309452964065 0.00423029042311438 0.0129653035546296 420071 1507318 622 665 0 False 632 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 676 556 0.0112717070012661 0.0356018221337275 0.00932326237888151 0.0422674906538491 0.00693059153653715 0.0158207461153192 459466 1551555 622 665 0 False 676 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 278 600 0.0086506142737601 0.00866519698192609 0.00869764248111696 0.00866712443732357 0.0013237564797743 0.00148972234344718 352623 377636 622 665 0 False 278 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 322 600 0.00889380186871501 0.00885328450446326 0.00898756389715419 0.00888075074387732 0.00152620255400733 0.00144234418957651 362536 385833 622 665 0 False 322 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 368 595 0.00916039317249539 0.0601760065074566 0.00915541313801785 0.0591744869153887 0.00142951788188741 0.00802643419102158 373403 2622517 622 665 0 True 367 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 413 594 0.00922802841906966 0.0634571092414029 0.00921644922560464 0.0619058518348974 0.00163657629735597 0.0133199374215509 376160 2765510 622 665 0 True 411 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 455 600 0.00908338662951512 0.00913974108996455 0.00909437705043107 0.00910963607232776 0.00201513973966969 0.00198862787105649 370264 398317 622 665 0 False 455 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 500 600 0.00879334255253016 0.00871941813792894 0.00883497367818723 0.00874341954680705 0.00196141227368631 0.00211859878446944 358441 379999 622 665 0 False 500 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 544 600 0.00866057434271518 0.0088500720788008 0.00866712443732357 0.00886549172198062 0.00189025576407883 0.00192346617683466 353029 385693 622 665 0 False 544 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 588 599 0.00868937513324045 0.00870124498703844 0.00872816052491035 0.00872816052491035 0.00168451011845269 0.00173212071577117 354203 379207 622 665 0 False 588 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 632 599 0.00864212613617769 0.00846852769369062 0.00871290150301366 0.0085145342183566 0.00150967564654647 0.00149189743807222 352277 369065 622 665 0 False 632 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 677 599 0.00869295683291395 0.00861125117669431 0.00866712443732357 0.00869764248111696 0.00163529312553769 0.00179230171497192 354349 375285 622 665 0 False 677 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 278 646 0.00874180042229711 0.0336430455860411 0.00883497367818723 0.0343480582894636 0.00134687331517148 0.00825772791731325 356340 1466190 622 665 0 True 278 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 323 643 0.00858933286427787 0.00852169333840438 0.00857557030594339 0.00856031128404669 0.00125880619289164 0.00117785054577952 350125 371382 622 665 0 False 323 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 367 643 0.0086985992365092 0.00865115409260161 0.00866712443732357 0.00871290150301366 0.00122741000186655 0.00124380640795799 354579 377024 622 665 0 False 367 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 411 643 0.00872325408700145 0.0087874068324852 0.00872816052491035 0.00881971465629053 0.00139386869427701 0.00144917126617657 355584 382962 622 665 0 False 411 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 455 643 0.00884736243390722 0.00877508488547989 0.00891126878767071 0.00877393759060044 0.00167183488411409 0.00170048591798829 360643 382425 622 665 0 False 455 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 500 643 0.00865088412784509 0.00852235876943446 0.00869764248111696 0.00848401617456321 0.00169692829016185 0.00178022308134719 352634 371411 622 665 0 False 500 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 544 643 0.00854897741247712 0.00870750921708024 0.0085297932402533 0.00860608834973678 0.00172890426248739 0.00180484027391229 348480 379480 622 665 0 False 544 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 588 643 0.00859158982571597 0.00861581741031453 0.0085297932402533 0.00860608834973678 0.00151762409586058 0.00136383443769019 350217 375484 622 665 0 False 588 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 632 642 0.00864428496885761 0.00872779339054893 0.00869764248111696 0.00872816052491035 0.00139988431899729 0.00140204828403902 352365 380364 622 665 0 False 632 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 675 645 0.00877224486952187 0.0360736586258505 0.00877393759060044 0.0365453574425879 0.00140405576523949 0.00764482621133422 357581 1572118 622 665 0 True 677 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H10_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H10_2.csv new file mode 100755 index 0000000..1d64e2a --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H10_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 278 254 0.00730107399472607 0.644999842246954 0.00703440909437705 0.673929961089494 0.00215320537571136 0.234447979722347 297612 28109593 622 665 5 True 277 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 321 255 0.00593548966372992 0.00586171310629515 0.00585946440833143 0.00585946440833143 0.00136075662735044 0.00116312841022005 241947 255458 622 665 0 False 321 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 365 256 0.00545524752120624 0.00551222414011683 0.00541695277332723 0.00547798886091402 0.00124752775099703 0.0011818447788512 222371 240227 622 665 0 True 366 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 410 256 0.00536124017087161 0.0055454956916209 0.00534065766384375 0.0055390249485008 0.00131387453565236 0.00127810675673404 218539 241677 622 665 0 True 410 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 455 256 0.00521478299929077 0.00536745847222772 0.00523384451056687 0.00538643472953384 0.00157769057561634 0.00158385175912692 212569 233918 622 665 0 True 454 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 498 255 0.00534571129488992 0.00531316847853211 0.00541695277332723 0.00531013962005036 0.00155480144261375 0.00138191824459993 217906 231552 622 665 0 False 498 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 542 254 0.0054941801060134 0.00556591754047513 0.00547798886091402 0.00552376592660411 0.00152311249808358 0.00141766190558338 223958 242567 622 665 0 True 543 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 587 254 0.00574575770979254 0.00570710364834035 0.00581368734264134 0.00570687418936446 0.00168601252612115 0.00178689624439283 234213 248720 622 665 0 True 587 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 631 254 0.00636801669758949 0.0062376816382912 0.00628671702143893 0.00621042191195544 0.00215329125255083 0.00167891994871317 259578 271843 622 665 0 False 631 254 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 674 255 0.00787382702402216 0.670213414057001 0.00770580605783169 0.665262836652171 0.00222439155998728 0.19747391622599 320959 29208420 622 665 7 True 676 254 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 277 299 0.0055686107690915 0.00564501204946447 0.00566109712367437 0.00566109712367437 0.00144196513155314 0.00138278426571619 226992 246014 622 665 0 False 277 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 321 299 0.00555970558428684 0.00540853162891206 0.0055390249485008 0.00544747081712062 0.00126161584506831 0.00116902874231215 226629 235708 622 665 0 False 321 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 367 300 0.00539565883280258 0.00559129570320858 0.00544747081712062 0.00556954299229419 0.00122983558536567 0.00122301541504827 219942 243673 622 665 0 True 366 298 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 408 299 0.00531033587756671 0.0053520388290479 0.00529488059815366 0.00531013962005036 0.00141688363264746 0.00142181956821074 216464 233246 622 665 0 True 410 298 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 454 300 0.00547004043150159 0.00542915999084459 0.00550850690470741 0.00537117570763714 0.00164594708026054 0.00171743199032862 222974 236607 622 665 0 True 454 298 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 499 298 0.00535029881433475 0.00551988806991156 0.00540169375143053 0.00556954299229419 0.00157675929420586 0.00164115147614052 218093 240561 622 665 0 True 499 298 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 543 298 0.00548510319588193 0.00546594226467978 0.0055542839703975 0.00549324788281071 0.0014805902508867 0.00143685898874122 223588 238210 622 665 0 False 543 298 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 588 298 0.00578623582254101 0.00571125685580396 0.00569161516746777 0.00572213321126116 0.00181611115374083 0.00197309412773609 235863 248901 622 665 0 True 587 298 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 631 298 0.00591939654738871 0.00584432011592267 0.005981536583505 0.00588998245212482 0.00181727205006688 0.00188689231961754 241291 254700 622 665 0 False 631 298 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 676 297 0.00613169811570705 0.00617531468864425 0.00610360875867857 0.00619516289005875 0.00197376249039482 0.00183672816176073 249945 269125 622 665 0 False 676 297 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 277 337 0.00522199546301687 0.00540233623656303 0.00523384451056687 0.00535591668574044 0.00132992055239023 0.00134004579732901 212863 235438 622 665 0 True 277 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 319 338 0.00559250512170787 0.00532826687914568 0.00561532005798428 0.00527962157625696 0.00116670635916607 0.00119688947165801 227966 232210 622 665 0 True 322 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 367 338 0.00533020695109778 0.00543826951218743 0.00535591668574044 0.00540169375143053 0.00128759754274558 0.00126577072473369 217274 237004 622 665 0 True 366 341 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 411 338 0.00537338360469615 0.00527817598470885 0.00537117570763714 0.00529488059815366 0.0014565633387971 0.00132965083912917 219034 230027 622 665 0 True 410 341 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 453 337 0.00541813031842537 0.00561660502824927 0.00538643472953384 0.00558480201419089 0.00161511438150833 0.00164515207624684 220858 244776 622 665 0 True 454 341 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 499 341 0.00549224206303939 0.00546406070107748 0.00550850690470741 0.00540169375143053 0.00160433791452134 0.00157203074958478 223879 238128 622 665 0 False 499 341 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 543 341 0.00569033949361145 0.00558087826570317 0.00564583810177768 0.0055542839703975 0.00168644626307152 0.00148200927661808 231954 243219 622 665 0 False 543 341 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 587 335 0.00573937934051096 0.00566763670448724 0.00572213321126116 0.00579842832074464 0.00182925615907723 0.00199249576745056 233953 247000 622 665 0 True 587 341 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 632 335 0.00566244639409932 0.00569418510799773 0.00575265125505455 0.00572213321126116 0.00187589253045198 0.00179738485216593 230817 248157 622 665 0 True 632 341 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 676 336 0.00536072499489117 0.00554928176472309 0.00529488059815366 0.00552376592660411 0.0017861373907478 0.0018373730086987 218518 241842 622 665 0 True 676 341 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 278 381 0.00521716262167659 0.00534476497951218 0.00526436255436027 0.00535591668574044 0.00135414900609243 0.0014066787526931 212666 232929 622 665 0 True 277 385 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 323 382 0.00546395644849455 0.0608960028820047 0.00556954299229419 0.0613412680247196 0.00132742013180072 0.0118243825671493 222726 2653895 622 665 0 True 322 385 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 366 382 0.00547072733280884 0.00582038754473733 0.00549324788281071 0.00581368734264134 0.00143095222030061 0.00139816213245238 223002 253657 622 665 0 True 366 385 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 411 381 0.00571089746844976 0.00564113419277193 0.00573739223315786 0.00564583810177768 0.00144395815799917 0.00144627619536696 232792 245845 622 665 0 True 410 384 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 456 380 0.00555960745552866 0.00583188343942943 0.00560006103608759 0.00585946440833143 0.001611578896006 0.00159957630316156 226625 254158 622 665 0 True 455 384 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 499 379 0.00562231173200447 0.00570398300626824 0.00560006103608759 0.00567635614557107 0.00163933574714312 0.00176335446994869 229181 248584 622 665 0 True 499 384 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 543 379 0.0057051324039068 0.00567906376148657 0.00561532005798428 0.00566109712367437 0.00172002679601774 0.00155719559610902 232557 247498 622 665 0 True 543 384 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 588 378 0.00533607014439892 0.00568032578585397 0.00532539864194705 0.00567635614557107 0.00185368112081545 0.00192172453365219 217513 247553 622 665 0 True 587 384 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 632 379 0.00527567189374029 0.00522739671334436 0.00521858548867018 0.00527962157625696 0.00192033454612279 0.00182419491624626 215051 227814 622 665 0 True 632 384 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 675 379 0.00515482632804395 0.00532388421270618 0.0051117723353933 0.00531013962005036 0.00184981700173644 0.00188445345657494 210125 232019 622 665 0 True 676 384 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 278 425 0.00545649866287301 0.00528634472425054 0.00538643472953384 0.00529488059815366 0.00162270743796449 0.00141428359186825 222422 230383 622 665 0 True 278 428 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 323 425 0.00557776127579161 0.00552016342068263 0.0055542839703975 0.00552376592660411 0.0013741875689611 0.00132549866651979 227365 240573 622 665 0 True 322 428 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 366 425 0.00565045015341205 0.00577231588928834 0.00552376592660411 0.00576791027695125 0.00166608019284056 0.00125443116090315 230328 251562 622 665 0 True 366 428 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 410 424 0.00586284985048857 0.00572520796153809 0.00581368734264134 0.00572213321126116 0.00148741993828831 0.0015905863427956 238986 249509 622 665 0 True 410 428 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 456 424 0.00581680293071349 0.00591678326050879 0.00585946440833143 0.00592050049591821 0.00166357669720855 0.00154943807810597 237109 257858 622 665 0 True 455 427 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 499 423 0.00576702711812764 0.00581247121006912 0.00582894636453803 0.00582894636453803 0.00162500594682168 0.00162543208704913 235080 253312 622 665 0 True 499 427 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 543 423 0.00554653179850143 0.00576068231921071 0.00547798886091402 0.00578316929884794 0.00166385551697388 0.00148873540051107 226092 251055 622 665 0 True 543 427 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 588 422 0.00508206385385488 0.00519235832772593 0.0051117723353933 0.00515754940108339 0.00175329353835921 0.00196330675470477 207159 226287 622 665 0 True 588 427 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 632 423 0.0050328768138181 0.00507905148543136 0.00502021820401312 0.00497444113832303 0.00171618201559446 0.0016914643035053 205154 221349 622 665 0 True 632 427 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 676 423 0.00525037920631988 0.00501491770167006 0.00527962157625696 0.00502021820401312 0.00177049944492224 0.0017742776475985 214020 218554 622 665 0 True 676 427 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 280 469 0.00529757913900356 0.0053265459368265 0.00531013962005036 0.00537117570763714 0.00141608033010875 0.00142942506739994 215944 232135 622 665 0 True 278 471 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 324 469 0.00554177255372979 0.00547434046319736 0.00564583810177768 0.00546272983901732 0.00143155491081237 0.00149211065351943 225898 238576 622 665 0 True 322 471 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 368 469 0.00559834378281947 0.00581788644190013 0.00560006103608759 0.00584420538643473 0.0015684720459636 0.0014404242290112 228204 253548 622 665 0 True 366 471 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 412 469 0.00570591743397223 0.00586100178346989 0.00569161516746777 0.00579842832074464 0.00170033696405076 0.00156901228879825 232589 255427 622 665 0 True 411 471 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 456 468 0.00584874384150047 0.00603311896128511 0.00587472343022812 0.00601205462729839 0.00187413344113409 0.00192052610267138 238411 262928 622 665 0 True 455 471 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 501 467 0.00553112558346746 0.00583610548458581 0.00560006103608759 0.00579842832074464 0.00177883550901735 0.0018803299546626 225464 254342 622 665 0 True 499 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 543 470 0.00513740847346733 0.00518841163334062 0.00515754940108339 0.00524910353246357 0.00170874203745724 0.00174007998205428 209415 226115 622 665 0 False 543 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 589 467 0.00501896706234635 0.00523561134468123 0.00502021820401312 0.00517280842298009 0.00184894618712125 0.00183844608344417 204587 228172 622 665 0 True 588 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 632 466 0.00517118929847015 0.00508499447290692 0.00524910353246357 0.00502021820401312 0.00171348227374727 0.00165593257186674 210792 221608 622 665 0 True 632 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 677 467 0.00507531750173013 0.00537408983663095 0.00509651331349661 0.00538643472953384 0.00180563600478916 0.00183266356242535 206884 234207 622 665 0 True 676 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 280 513 0.00539354906450175 0.00551809828989962 0.00543221179522393 0.0055390249485008 0.0015194509120134 0.00135799265095221 219856 240483 622 665 0 True 278 514 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 324 513 0.00544045461091089 0.00559338377988918 0.00546272983901732 0.00563057907988098 0.00150564750036375 0.00154905490675128 221768 243764 622 665 0 True 322 514 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 368 512 0.00552857423575483 0.00563732517377215 0.0055390249485008 0.00564583810177768 0.00163113789915965 0.00144922383557813 225360 245679 622 665 0 True 366 514 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 412 512 0.00558943859801481 0.00592834799289366 0.00556954299229419 0.00593575951781491 0.00168802237861941 0.00165176840547752 227841 258362 622 665 0 True 411 514 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 457 511 0.0057347182244975 0.00541438283279726 0.00567635614557107 0.00544747081712062 0.0018715210261778 0.0017217614848931 233763 235963 622 665 0 True 455 514 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 500 509 0.00527275256318449 0.00527631736700414 0.00527962157625696 0.00532539864194705 0.00160289268897047 0.00168766166166724 214932 229946 622 665 0 True 499 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 545 508 0.00533067306269912 0.00540963303199633 0.00529488059815366 0.00538643472953384 0.00166979716438992 0.00145361260694916 217293 235756 622 665 0 True 544 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 588 509 0.00519523084422379 0.00546422132236061 0.00521858548867018 0.00547798886091402 0.0016701132565268 0.00167465194562718 211772 238135 622 665 0 True 588 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 633 508 0.00523904533475031 0.00519990752803272 0.00523384451056687 0.00526436255436027 0.00175813241330475 0.00182360550993398 213558 226616 622 665 0 True 632 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 678 508 0.00530562569717416 0.00524093479292188 0.00540169375143053 0.00531013962005036 0.00172772392042347 0.00180291999713239 216272 228404 622 665 0 True 676 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 281 554 0.00542509746025601 0.00554448607212699 0.00546272983901732 0.00549324788281071 0.00136076047668345 0.00132165350581372 221142 241633 622 665 0 True 278 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 324 552 0.00584315050228431 0.00555625731759015 0.00558480201419089 0.00560006103608759 0.00331677064370505 0.00133695543723173 238183 242146 622 665 0 True 322 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 368 554 0.00708141276954437 0.00557722986798651 0.00579842832074464 0.00558480201419089 0.00852674350584761 0.00134156579112253 288658 243060 622 665 0 True 367 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 413 552 0.00551463995209354 0.00544161961323542 0.00552376592660411 0.00546272983901732 0.00162930358284457 0.00151084899676755 224792 237150 622 665 0 True 411 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 457 552 0.00535397864276643 0.00549423455640704 0.00547798886091402 0.00561532005798428 0.00191850457961422 0.00194801732722939 218243 239443 622 665 0 True 455 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 501 550 0.00532419656465937 0.00550742844752072 0.00543221179522393 0.00550850690470741 0.00182466881410909 0.00196158657997683 217029 240018 622 665 0 True 499 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 546 550 0.00553613015013455 0.00555963036453574 0.00550850690470741 0.00546272983901732 0.00178503040425139 0.00184652827577979 225668 242293 622 665 0 True 544 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 588 556 0.00540932326237888 0.00533581607945247 0.00547798886091402 0.00532539864194705 0.00151463163146596 0.00146753186027845 220499 232539 622 665 0 False 588 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 632 556 0.00548662419163369 0.00538186849591362 0.0055390249485008 0.00538643472953384 0.00160792930675019 0.0016100013634162 223650 234546 622 665 0 False 632 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 676 556 0.00527937625436152 0.00532193381141111 0.00526436255436027 0.00541695277332723 0.00157935194465023 0.00160611011948718 215202 231934 622 665 0 False 676 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 278 600 0.005901929628433 0.00578124184345047 0.00590524147402152 0.00582894636453803 0.00130096280684024 0.00135708970316383 240579 251951 622 665 0 False 278 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 322 600 0.00563187928592684 0.00563828890147089 0.00570687418936446 0.00563057907988098 0.00143872825858283 0.00135987080446753 229571 245721 622 665 0 False 322 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 368 595 0.00546128243983419 0.0055689005071617 0.00552376592660411 0.00563057907988098 0.00131854818013913 0.00127096949892091 222617 242697 622 665 0 True 367 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 413 594 0.00545267164130406 0.00533375094866945 0.00544747081712062 0.00540169375143053 0.00149651291936328 0.00147648712972633 222266 232449 622 665 0 True 411 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 455 600 0.00540924966581025 0.00548842924431702 0.00544747081712062 0.00550850690470741 0.00176785753749731 0.00183623206474592 220496 239190 622 665 0 False 455 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 500 600 0.00551647986630938 0.00539777000294281 0.00558480201419089 0.00541695277332723 0.00189143972287266 0.00201812010888053 224867 235239 622 665 0 False 500 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 544 600 0.00548068740176391 0.00543317552292266 0.00549324788281071 0.00540169375143053 0.00187025495110655 0.00182839956255665 223408 236782 622 665 0 False 544 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 588 599 0.00541997023264121 0.00536784855248673 0.00541695277332723 0.00541695277332723 0.00172854717109938 0.00166329657974749 220933 233935 622 665 0 False 588 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 632 599 0.0052702748120405 0.00530027288408708 0.00527962157625696 0.00537117570763714 0.0013934905013679 0.00135406959737387 214831 230990 622 665 0 False 632 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 677 599 0.00553642453640908 0.00560676123818358 0.0055390249485008 0.00575265125505455 0.00156464539648994 0.0016948663978404 225680 244347 622 665 0 False 677 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 278 646 0.00793746352370067 0.673390663658459 0.00735484855420768 0.686274509803922 0.0030425124336945 0.221828918498652 323553 29346887 622 665 7 True 278 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 323 643 0.00594871251389442 0.00565586545902408 0.00588998245212482 0.00563057907988098 0.0014887200463368 0.00127875384647792 242486 246487 622 665 0 False 323 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 367 643 0.00548601088689508 0.005360184622692 0.00560006103608759 0.00532539864194705 0.00137400375255264 0.00119541601301844 223625 233601 622 665 0 False 367 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 411 643 0.00525808231383687 0.00542055527924871 0.00526436255436027 0.00541695277332723 0.00147401165109615 0.00143818854353346 214334 236232 622 665 0 False 411 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 455 643 0.00525724821939235 0.00533246597840447 0.00526436255436027 0.00534065766384375 0.0016738137090309 0.00155645007941972 214300 232393 622 665 0 False 455 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 500 643 0.00526939165321689 0.00525936034868586 0.00532539864194705 0.00527962157625696 0.00169842989194791 0.00167606867074705 214795 229207 622 665 0 False 500 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 544 643 0.00537779939881416 0.00536695366248076 0.00535591668574044 0.00540169375143053 0.00164646389778782 0.0016182452822867 219214 233896 622 665 0 False 544 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 588 643 0.00533207139750316 0.00544451079633164 0.00535591668574044 0.00541695277332723 0.00140381095587693 0.00126568009971658 217350 237276 622 665 0 False 588 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 632 642 0.00574720510897567 0.00566935764680642 0.00576791027695125 0.00567635614557107 0.00145584121867698 0.00133172108898706 234272 247075 622 665 0 False 632 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 675 645 0.0075114375200704 0.720689225925881 0.00729381246662089 0.715938048371099 0.00209654653975938 0.194115563492399 306187 31408195 622 665 10 True 677 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H10_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H10_3.csv new file mode 100755 index 0000000..7176e2c --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H10_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 278 254 0.000931364576058006 0.0648615587951339 0.000778210116731518 0.0671702143892576 0.000737734322839098 0.0243786913215989 37965 2826717 622 665 0 True 277 256 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 321 255 0.000921478103671561 0.000871370460942927 0.00080872816052491 0.000747692072938125 0.000636085936321192 0.000635424808531805 37562 37975 622 665 0 False 321 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 365 256 0.000903201622460888 0.000830251412463409 0.000762951094834821 0.000717174029144732 0.0006555912259239 0.000605772498586775 36817 36183 622 665 0 True 366 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 410 256 0.000849672384874728 0.000886583591044446 0.000686655985351339 0.000717174029144732 0.000716114344599115 0.000707070633930165 34635 38638 622 665 0 True 410 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 455 256 0.000888899355956428 0.000796062025055773 0.000701915007248035 0.000579842832074464 0.000803326896969667 0.000738582976466387 36234 34693 622 665 0 True 454 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 498 255 0.000870083166575775 0.000858107732136475 0.000686655985351339 0.000656137941557946 0.000820401480724109 0.000761671920816724 35467 37397 622 665 0 False 498 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 542 254 0.000881711424419881 0.000935940216758422 0.000717174029144732 0.000762951094834821 0.000754158556380366 0.000792200484347445 35941 40789 622 665 0 True 543 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 587 254 0.000867041175072253 0.000832041192475352 0.000549324788281071 0.000442511635004196 0.000938532694971651 0.000940277780941084 35343 36261 622 665 0 True 587 255 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 631 254 0.000935240662006041 0.000908955841193737 0.000595101853971161 0.000503547722590982 0.000945864332223083 0.000932836182134911 38123 39613 622 665 0 False 631 254 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 674 255 0.00101786507639201 0.0676163973678761 0.000717174029144732 0.0661020828564889 0.000948931428754827 0.0212139911663454 41491 2946775 622 665 0 True 676 254 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 277 299 0.000920962927691126 0.000948009758890245 0.00080872816052491 0.000778210116731518 0.000694438327822415 0.000807761503231429 37541 41315 622 665 0 False 277 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 321 299 0.000897412025728379 0.000888969964393703 0.000762951094834821 0.000793469138628214 0.000661362180472783 0.000634042139150789 36581 38742 622 665 0 False 321 299 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 367 300 0.000807280761341783 0.000849089994383992 0.000671396963454643 0.000762951094834821 0.000657128580447838 0.000628921898149587 32907 37004 622 665 0 True 366 298 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 408 299 0.000760522408069913 0.000840049310733919 0.000549324788281071 0.00064087891966125 0.000699176791759142 0.000718511493991604 31001 36610 622 665 0 True 410 298 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 454 300 0.000782601378659988 0.000766966626912899 0.000549324788281071 0.000411993591210803 0.000814674446515879 0.000870742712107513 31901 33425 622 665 0 True 454 298 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 499 298 0.000899497261839664 0.00087598258635832 0.000686655985351339 0.000595101853971161 0.000842756856473272 0.000865180615330749 36666 38176 622 665 0 True 499 298 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 543 298 0.000850874462162409 0.000814808823386 0.000625619897764553 0.000564583810177768 0.000775812076561543 0.000807869267780189 34684 35510 622 665 0 False 543 298 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 588 298 0.000910291425239256 0.00100358472285084 0.000579842832074464 0.000503547722590982 0.000919187789111696 0.00110572152761717 37106 43737 622 665 0 True 587 298 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 631 298 0.000774334030783482 0.000899456239591884 0.000381475547417411 0.000457770656900893 0.000907591872492339 0.000990586858828651 31564 39199 622 665 0 False 631 298 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 676 297 0.000851782153175557 0.000946197032980712 0.000442511635004196 0.000579842832074464 0.000935192333830457 0.00098292318527636 34721 41236 622 665 0 False 676 297 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 277 337 0.000856173415104027 0.000748655800636863 0.000717174029144732 0.000518806744487678 0.000705601306034231 0.000711966013677375 34900 32627 622 665 0 True 277 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 319 338 0.00081706910497005 0.000845785785131173 0.000701915007248035 0.000747692072938125 0.000623388319529748 0.000614567523332195 33306 36860 622 665 0 True 322 342 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 367 338 0.00080330654663557 0.000820820648554322 0.000671396963454643 0.000701915007248035 0.000620486712871785 0.000630554612605482 32745 35772 622 665 0 True 366 341 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 411 338 0.000798547301863931 0.000868112143485287 0.000564583810177768 0.000656137941557946 0.00075858860200788 0.000753911053691955 32551 37833 622 665 0 True 410 341 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 453 337 0.000889242806610051 0.000862077372419375 0.000579842832074464 0.000625619897764553 0.000894966906912406 0.000809281538943042 36248 37570 622 665 0 True 454 341 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 499 341 0.000835615440265713 0.000832798407095789 0.000564583810177768 0.000579842832074464 0.000858360957005232 0.000839283180119777 34062 36294 622 665 0 False 499 341 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 543 341 0.00086333681445103 0.000792367735543941 0.000625619897764553 0.000579842832074464 0.000802014027685798 0.00077590165039924 35192 34532 622 665 0 False 543 341 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 587 335 0.000874400831935612 0.000950235510956379 0.000473029678797589 0.000564583810177768 0.000983044668897671 0.00104814488363722 35643 41412 622 665 0 True 587 341 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 632 335 0.000826538530134238 0.000825249206789003 0.000366216525520714 0.000442511635004196 0.00096163658544012 0.000919310155126511 33692 35965 622 665 0 True 632 341 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 676 336 0.000860343887326597 0.000821554917277171 0.000488288700694286 0.000396734569314107 0.00093746150878487 0.000947857625351513 35070 35804 622 665 0 True 676 341 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 278 381 0.000787066237157092 0.000827061932698535 0.000595101853971161 0.000686655985351339 0.000714526839033944 0.000722734186826406 32083 36044 622 665 0 True 277 385 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 323 382 0.000739081274407995 0.0057607052651083 0.000549324788281071 0.00578316929884794 0.000685735391406703 0.00179505572696712 30127 251056 622 665 0 True 322 385 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 366 382 0.000795799696634944 0.000881856736141108 0.000656137941557946 0.000717174029144732 0.000668503314274188 0.000718973844484066 32439 38432 622 665 0 True 366 385 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 411 381 0.000766606391076956 0.000787434367562302 0.000534065766384375 0.000549324788281071 0.000726367215479984 0.000709169077392174 31249 34317 622 665 0 True 410 384 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 456 380 0.000828402976539622 0.000961754351546066 0.000534065766384375 0.000717174029144732 0.000842345345153285 0.000868892966014658 33768 41914 622 665 0 True 455 384 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 499 379 0.000808580967387643 0.000793354409140269 0.000518806744487678 0.0004272526131075 0.000837638908976497 0.000867020494705811 32960 34575 622 665 0 True 499 384 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 543 379 0.000842705243044082 0.000827796201421384 0.000579842832074464 0.000564583810177768 0.000848419071527572 0.000826164709861659 34351 36076 622 665 0 True 543 384 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 588 378 0.000803159353498302 0.0008386266650834 0.000457770656900893 0.000274662394140536 0.000903518084705257 0.00102261521288525 32739 36548 622 665 0 True 587 384 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 632 379 0.00081809945693092 0.000801752607657849 0.0004272526131075 0.0004272526131075 0.000948878613191997 0.000894414694915429 33348 34941 622 665 0 True 632 384 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 675 379 0.000839614187161471 0.000814648202102877 0.000488288700694286 0.000350957503624018 0.000915224106348978 0.000962776869612727 34225 35503 622 665 0 True 676 384 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 278 425 0.000896357141577964 0.000823665939855361 0.000747692072938125 0.000625619897764553 0.000766072769382893 0.000767010828327993 36538 35896 622 665 0 True 278 428 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 323 425 0.000861349707097923 0.000919120873825672 0.000717174029144732 0.00080872816052491 0.000711393985756947 0.000704495022316728 35111 40056 622 665 0 True 322 428 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 366 425 0.000800362683890226 0.000800972447139823 0.000671396963454643 0.000686655985351339 0.000676825084491762 0.000660657447377779 32625 34907 622 665 0 True 366 428 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 410 424 0.00086983784468033 0.000930593822620181 0.000656137941557946 0.000671396963454643 0.000794180485736047 0.000840204353282261 35457 40556 622 665 0 True 410 428 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 456 424 0.000852984230463239 0.000857029274949791 0.000564583810177768 0.000579842832074464 0.000872901683631307 0.000845910104661518 34770 37350 622 665 0 True 455 427 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 499 423 0.000780295352842802 0.000829379468355026 0.000473029678797589 0.000534065766384375 0.000845574262610554 0.000879340943148469 31807 36145 622 665 0 True 499 427 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 543 423 0.000826587594513327 0.000900672372164102 0.000534065766384375 0.000671396963454643 0.000849639240804602 0.000782803190955153 33694 39252 622 665 0 True 543 427 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 588 422 0.000790819662157405 0.000892847821086247 0.000396734569314107 0.000366216525520714 0.000931915931568907 0.00101521824054768 32236 38911 622 665 0 True 588 427 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 632 423 0.000829114410036413 0.000894362250327122 0.000396734569314107 0.000503547722590982 0.000929467962525865 0.000933621584787266 33797 38977 622 665 0 True 632 427 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 676 423 0.000896528866904776 0.000820430568295309 0.000503547722590982 0.000411993591210803 0.000938374770255468 0.000887724956671822 36545 35755 622 665 0 True 676 427 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 280 469 0.000869739715922152 0.000862742803449457 0.000717174029144732 0.000717174029144732 0.000758231467966517 0.000777563357205404 35453 37599 622 665 0 True 278 471 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 324 469 0.000850555543698331 0.000863729477045785 0.000701915007248035 0.000701915007248035 0.000782902142216995 0.000779162011225414 34671 37642 622 665 0 True 322 471 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 368 469 0.000895473982754361 0.000824354316783031 0.000686655985351339 0.000656137941557946 0.000822015032414921 0.000762315140089796 36502 35926 622 665 0 True 366 471 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 412 469 0.000907641948768447 0.000782845188044499 0.000610360875867857 0.000473029678797589 0.000936892794124346 0.000864260275993919 36998 34117 622 665 0 True 411 471 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 456 468 0.000886397072622886 0.000924008350012133 0.000488288700694286 0.000473029678797589 0.000968634031991082 0.00104505171021039 36132 40269 622 665 0 True 455 471 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 501 467 0.000864293569843266 0.000851132179269414 0.000503547722590982 0.000457770656900893 0.000947608967980751 0.000923212592026048 35231 37093 622 665 0 True 499 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 543 470 0.000866771320987264 0.000844110734607175 0.000518806744487678 0.000457770656900893 0.00090928097998182 0.000959160758368572 35332 36787 622 665 0 False 543 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 589 467 0.000784195970980382 0.000827107824493713 0.000396734569314107 0.000381475547417411 0.000925306260856835 0.000983428211216729 31966 36046 622 665 0 True 588 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 632 466 0.000835321053991179 0.000867745009123863 0.000473029678797589 0.000457770656900893 0.000892268012844372 0.000930703535631825 34050 37817 622 665 0 True 632 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 677 467 0.000876240746151451 0.000916482095602935 0.000518806744487678 0.000473029678797589 0.000910555050253708 0.0010102324910454 35718 39941 622 665 0 True 676 470 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 280 513 0.000819448727355869 0.000862696911654279 0.00064087891966125 0.000717174029144732 0.000759564016113756 0.000772012167218402 33403 37597 622 665 0 True 278 514 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 324 513 0.000914707219357271 0.000883164652303682 0.00080872816052491 0.000732433051041428 0.000806132874345482 0.000805893516282609 37286 38489 622 665 0 True 322 514 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 368 512 0.000865593775889126 0.000826671852439522 0.000686655985351339 0.000686655985351339 0.000811271698254635 0.000731531012224522 35284 36027 622 665 0 True 366 514 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 412 512 0.000880828265596278 0.000786929557815344 0.000610360875867857 0.000442511635004196 0.000894987308069543 0.000828271359208572 35905 34295 622 665 0 True 411 514 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 457 511 0.00084280337180226 0.000864624367051756 0.000457770656900893 0.000503547722590982 0.000957929533744969 0.000908418456799079 34355 37681 622 665 0 True 455 514 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 500 509 0.000841331440429588 0.000887937399002198 0.000457770656900893 0.000534065766384375 0.000898280356715181 0.000895004773992015 34295 38697 622 665 0 True 499 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 545 508 0.000857645346476699 0.000865679878340851 0.000534065766384375 0.00064087891966125 0.000866126664825662 0.000808802916295066 34960 37727 622 665 0 True 544 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 588 509 0.000878473175400004 0.000825409828072126 0.000534065766384375 0.000457770656900893 0.000944524928045266 0.000877566927539693 35809 35972 622 665 0 True 588 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 633 508 0.000784686614771273 0.000832844298890967 0.000442511635004196 0.000411993591210803 0.00090388256165073 0.000947929071038081 31986 36296 622 665 0 True 632 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 678 508 0.000811917345165699 0.000883348219484394 0.000503547722590982 0.000473029678797589 0.000861664661177872 0.000984691456037944 33096 38497 622 665 0 True 676 513 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 281 554 0.000816578461179159 0.000844638490251722 0.000656137941557946 0.000671396963454643 0.000676865269055806 0.000690407577740117 33286 36810 622 665 0 True 278 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 324 552 0.000884238239942967 0.000925637508740953 0.000747692072938125 0.000793469138628214 0.000742970578135198 0.00071637923891503 36044 40340 622 665 0 True 322 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 368 554 0.000988622706454934 0.00082951714374056 0.000762951094834821 0.000747692072938125 0.00105138306629633 0.000651497845532239 40299 36151 622 665 0 True 367 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 413 552 0.000862085672784259 0.000839521555089371 0.000656137941557946 0.000564583810177768 0.000837533781664381 0.000825814832370276 35141 36587 622 665 0 True 411 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 457 552 0.000820307353989928 0.000818709625976133 0.000381475547417411 0.000320439459830625 0.000979253077710313 0.00097200196439453 33438 35680 622 665 0 True 455 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 501 550 0.000830709002356807 0.000838167747131619 0.0004272526131075 0.000244144350347143 0.000968250268166801 0.00110488078728178 33862 36528 622 665 0 True 499 557 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 546 550 0.000850187560855163 0.000891058041074304 0.000503547722590982 0.000457770656900893 0.000904223389545637 0.000982921945754612 34656 38833 622 665 0 True 544 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 588 556 0.000884115578995245 0.000813569744916193 0.000625619897764553 0.000625619897764553 0.00085016972818162 0.000698833505618943 36039 35456 622 665 0 False 588 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 632 556 0.000793518203007303 0.000826924257313001 0.000503547722590982 0.000518806744487678 0.00082253031646163 0.000862295366307896 32346 36038 622 665 0 False 632 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 676 556 0.000835173860853912 0.000817768844174983 0.000610360875867857 0.000457770656900893 0.000818807260608177 0.000838853437681509 34044 35639 622 665 0 False 676 556 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 278 600 0.000885857364452906 0.000871645811713995 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.000725089772026801 0.000723422000807753 36110 37987 622 665 0 False 278 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 322 600 0.000883183355792553 0.00088812096618291 0.000717174029144732 0.00080872816052491 0.000791361751067165 0.000726735508275998 36001 38705 622 665 0 False 322 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 368 595 0.000809930237812592 0.000799825152260372 0.000656137941557946 0.000686655985351339 0.000659721022830516 0.000656652853050971 33015 34857 622 665 0 True 367 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 413 594 0.000832965963794904 0.000817034575452135 0.000595101853971161 0.000579842832074464 0.000803653199070916 0.000752188578146193 33954 35607 622 665 0 True 411 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 455 600 0.000782257928006365 0.000851958231582619 0.000350957503624018 0.0004272526131075 0.000950597853179641 0.000958331039257246 31887 37129 622 665 0 False 455 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 500 600 0.000734199368688634 0.00079613086274854 0.000274662394140536 0.000259403372243839 0.000895392860614766 0.000987870284681266 29928 34696 622 665 0 False 500 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 544 600 0.000832769706278548 0.000904642012447002 0.000396734569314107 0.0004272526131075 0.000970261008209464 0.0010219291456245 33946 39425 622 665 0 False 544 600 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 588 599 0.00085082539778332 0.000795213026844979 0.000610360875867857 0.000457770656900893 0.000815345108200593 0.000868472343246129 34682 34656 622 665 0 False 588 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 632 599 0.000796903645164448 0.000736884555173698 0.000564583810177768 0.000503547722590982 0.000755923247408835 0.000679401537407885 32484 32114 622 665 0 False 632 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 677 599 0.000912303064781908 0.000885344512574639 0.000671396963454643 0.000564583810177768 0.000802027644260674 0.0008687275838435 37188 38584 622 665 0 False 677 599 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 278 646 0.00102588710237307 0.0682062675571969 0.00080872816052491 0.0690165560387579 0.000781148111822276 0.0235693716027534 41818 2972482 622 665 0 True 278 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 323 643 0.000890567544845456 0.000838259530721976 0.000747692072938125 0.000732433051041428 0.000711313480272487 0.000642960398164823 36302 36532 622 665 0 False 323 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 367 643 0.000850212093044707 0.000784795589339565 0.000701915007248035 0.000610360875867857 0.00065828748066504 0.000613085681642155 34657 34202 622 665 0 False 367 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 411 643 0.000914658154978182 0.000742070328028815 0.000732433051041428 0.000564583810177768 0.000765206664184722 0.000648086220078036 37284 32340 622 665 0 False 411 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 455 643 0.000801785550883809 0.000840760633559178 0.000518806744487678 0.000579842832074464 0.000815503582344398 0.000820782856742907 32683 36641 622 665 0 False 455 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 500 643 0.00078169368764684 0.000814395797229398 0.000457770656900893 0.000488288700694286 0.000816666233146168 0.000845938964695923 31864 35492 622 665 0 False 500 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 544 643 0.000827568882095108 0.000761184260720467 0.000457770656900893 0.000396734569314107 0.000898841583994204 0.000856549081528665 33734 33173 622 665 0 False 544 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 588 643 0.000829335199742314 0.000895876679567998 0.000656137941557946 0.000747692072938125 0.00069622920119013 0.000680100811368175 33806 39043 622 665 0 False 588 643 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 632 642 0.00080097598862884 0.000916803338169181 0.000686655985351339 0.000762951094834821 0.000658413054628231 0.000713441086105505 32650 39955 622 665 0 False 632 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 675 645 0.000924421966416904 0.0737214058263076 0.000793469138628214 0.0720988784618906 0.000719231603569627 0.022034739403337 37682 3212836 622 665 0 True 677 642 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H11_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H11_1.csv new file mode 100755 index 0000000..6a25da9 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H11_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 270 272 0.00871674920110851 0.0339268863392172 0.00865186541542687 0.0348973830777447 0.00148567681021847 0.00772339830226795 330755 1478560 579 665 0 True 271 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 315 271 0.00861792133908327 0.00883428530125956 0.00856031128404669 0.00880445563439384 0.00122425776642258 0.00128091930859585 327005 385005 579 665 0 False 315 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 359 272 0.00886340974835396 0.0478698692255932 0.0089723048752575 0.0498664835584039 0.00130023693444195 0.00858081379334518 336320 2086206 579 665 0 True 359 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 403 271 0.00884654312656832 0.0662827818000024 0.00875867856870375 0.0658274204623484 0.00147567207472498 0.0112601434641944 335680 2888655 579 665 0 True 404 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 449 272 0.00879425659903283 0.0561708000832936 0.00877393759060044 0.0545510032806897 0.00171462621729424 0.0116163538106908 333696 2447967 579 665 0 True 448 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 490 270 0.00909398173898297 0.0497560908451031 0.00917067215991455 0.0527656977187762 0.0017345309857187 0.0144349938361308 345069 2168409 579 665 0 True 492 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 537 270 0.00871943731895559 0.0647332682817137 0.00866712443732357 0.0646524757763027 0.00154377623860195 0.0207234392907208 330857 2821126 579 665 0 True 536 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 581 270 0.00879604867759756 0.0512695793041771 0.00874341954680705 0.0522011139085985 0.0017503710003246 0.0142067936981809 333764 2234368 579 665 0 True 580 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 625 271 0.00854660715384586 0.00865090168772813 0.0085297932402533 0.00871290150301366 0.00204218554453724 0.0019274536746222 324299 377013 579 665 0 False 625 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 665 268 0.00880284803450489 0.0360791885871695 0.00883497367818723 0.0366063935301747 0.00186408823734291 0.00819861504062651 334022 1572359 579 665 0 True 669 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 271 314 0.00865934997884425 0.00890906598150217 0.00868238345922026 0.00885023270008392 0.00140095371191573 0.0015954173167111 328577 388264 579 665 0 False 271 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 315 314 0.00890934493862329 0.00878692496863583 0.0089417868314641 0.00877393759060044 0.00123768818507589 0.00124882089925818 338063 382941 579 665 0 False 315 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 361 317 0.00932610862130784 0.0828727575404522 0.00929274433508812 0.0816205081254292 0.00149425423821148 0.0187954206137263 353877 3611659 579 665 0 True 359 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 403 315 0.00920205988889376 0.0410668695084014 0.00915541313801785 0.0416876478217746 0.00170291686565736 0.00854419244535171 349170 1789726 579 665 0 True 404 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 449 316 0.0093345682862972 0.0584595615842077 0.00924696726939803 0.0569924467841611 0.00202664236268251 0.0122758106030465 354198 2547713 579 665 0 True 448 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 493 315 0.00901874079336109 0.0346871527640341 0.0089570458533608 0.035736629282063 0.00175236756557504 0.00736889908956466 342214 1511693 579 665 0 True 492 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 536 313 0.00892676499643627 0.0338320509444818 0.00886549172198062 0.0356145571068894 0.00161175239398504 0.00747361353200281 338724 1474427 579 665 0 True 536 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 581 313 0.00873517071459001 0.0407425292459806 0.00865186541542687 0.042374303807126 0.00190213796533517 0.00879107627153739 331454 1775591 579 665 0 True 580 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 625 314 0.00882079517424868 0.00855847561223957 0.00883497367818723 0.00866712443732357 0.00201025350300977 0.00202676738361276 334703 372985 579 665 0 False 625 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 669 314 0.00873614581616199 0.00855546969965541 0.00889600976577401 0.00848401617456321 0.00193308209248777 0.00196321862136713 331491 372854 579 665 0 False 669 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 272 354 0.00864617293057422 0.0354612555650972 0.00862134737163348 0.0368963149462119 0.00147295771623038 0.00744226002336475 328077 1545429 579 665 0 True 271 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 316 354 0.00903012576306639 0.0472570760845809 0.00907911802853437 0.0499275196459907 0.00134297544249782 0.0122443552781893 342646 2059500 579 665 0 True 315 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 360 354 0.00921555318632228 0.0301464808737339 0.00914015411612116 0.031616693369955 0.00205660760607653 0.00599295424664621 349682 1313807 579 665 0 True 359 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 404 353 0.00909387632259681 0.0280129024782143 0.00910963607232776 0.0288090333409628 0.00152835409927509 0.00469135652600025 345065 1220824 579 665 0 True 404 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 449 354 0.00923784875199517 0.0536948000580531 0.00926222629129473 0.0537727931639582 0.00189158063644327 0.00903837052369121 350528 2340061 579 665 0 True 448 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 492 357 0.00922393378902202 0.0241135684255271 0.00918593118181125 0.0263065537499046 0.0017651962727551 0.00637301066350841 350000 1050888 579 665 0 False 492 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 536 357 0.0090738735633229 0.0219464431277324 0.00904859998474098 0.0236667429617761 0.00174721207878307 0.00559376184530861 344306 956443 579 665 0 False 536 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 581 352 0.00901531476081088 0.0406304844280534 0.00901808194094758 0.0416418707560845 0.00201508912105189 0.00869897646970855 342084 1770708 579 665 0 True 581 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 625 352 0.00878674568151891 0.0466057567815166 0.0089417868314641 0.0481116960402838 0.00202804939856705 0.0126832948900998 333411 2031115 579 665 0 True 625 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 669 352 0.00891574898408252 0.051409893467934 0.0089723048752575 0.0518348973830777 0.00183940414087056 0.0151989994674418 338306 2240483 579 665 0 True 669 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 272 398 0.00857477968304719 0.0313726178573006 0.0085145342183566 0.0333867399099718 0.00152011895125307 0.00728131715473818 325368 1367243 579 665 0 True 271 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 317 399 0.00884894134935346 0.0276350294367184 0.00886549172198062 0.0266117341878386 0.0013415107757295 0.00565284962586707 335771 1204356 579 665 0 True 315 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 360 398 0.00907727324177657 0.0637634369742163 0.00909437705043107 0.0639963378347448 0.00133536330487098 0.0142655374940247 344435 2778860 579 665 0 True 360 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 405 397 0.00901542017719704 0.0500262787892138 0.0089723048752575 0.0514534218356603 0.00149913750030453 0.0110828599964351 342088 2180184 579 665 0 True 404 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 449 398 0.00911675167839358 0.0349333163533691 0.00910963607232776 0.0367284657053483 0.00161680828985015 0.0071870918087488 345933 1522421 579 665 0 True 448 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 493 397 0.00905785027262654 0.0448464489215715 0.00910963607232776 0.0450446326390478 0.00179552974315379 0.0103947020235269 343698 1954443 579 665 0 True 492 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 537 396 0.00921049319978659 0.0340224560026755 0.00909437705043107 0.0355077439536126 0.00175476904561591 0.0059094701835693 349490 1482725 579 665 0 True 536 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 581 396 0.00889094977923832 0.0422775868487883 0.00900282291905089 0.0432593270771344 0.00184071697304028 0.00830024652209438 337365 1842490 579 665 0 True 581 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 625 396 0.00888101428484272 0.0381641905174931 0.00888075074387732 0.0396276798657206 0.00182281709762547 0.00771789536906467 336988 1663225 579 665 0 True 625 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 669 396 0.00871738169942547 0.0676868183275768 0.00877393759060044 0.0669565880827039 0.00190405391771336 0.0149069395218479 330779 2949844 579 665 0 True 669 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 273 442 0.00872671104960065 0.0345465861954038 0.00874341954680705 0.0352635996032654 0.00169939637538017 0.00672172990917693 331133 1505567 579 665 0 True 271 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 317 442 0.00899565460479199 0.0365629798919363 0.00903334096284428 0.0370489051651789 0.00155686072649881 0.00437721783589203 341338 1593443 579 665 0 True 315 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 360 441 0.00905785027262654 0.0272108515738878 0.00900282291905089 0.0281681544213016 0.00141929577596746 0.00417887774357192 343698 1185870 579 665 0 True 360 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 405 442 0.00892700218330513 0.0399236131069262 0.00900282291905089 0.0409857328145266 0.00154926070059052 0.00668293038359707 338733 1739902 579 665 0 True 404 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 448 441 0.00934579513142327 0.0737671370002025 0.00923170824750134 0.0739604791332876 0.00196016029762503 0.0135478902927792 354624 3214829 579 665 0 True 448 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 493 440 0.00958680334428214 0.0479241133274936 0.00956740672922866 0.0488899061570153 0.00178216750312854 0.0124631150782601 363769 2088570 579 665 0 True 492 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 537 439 0.00921742432717662 0.0409945440392008 0.00918593118181125 0.0416876478217746 0.00177296904988398 0.00815091799049244 349753 1786574 579 665 0 True 537 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 581 439 0.00900972769234439 0.0277004481907447 0.00900282291905089 0.0282444495307851 0.00190708554727548 0.00474534737618479 341872 1207207 579 665 0 True 581 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 625 438 0.00888193667822162 0.0321342610359729 0.00888075074387732 0.0332188906691081 0.0018778973403275 0.00569310813488171 337023 1400436 579 665 0 True 625 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 669 439 0.0090168432984102 0.061738599187371 0.0089417868314641 0.0613412680247196 0.00196697242089874 0.00964836441049811 342142 2690616 579 665 0 True 669 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 274 486 0.00872043877462412 0.0413197332998323 0.00874341954680705 0.0427405203326467 0.0014808220839976 0.00953990848892134 330895 1800746 579 665 0 True 271 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 317 486 0.0089297430093453 0.0416189478043931 0.00889600976577401 0.0422064545662623 0.0015968537285732 0.00494062572632872 338837 1813786 579 665 0 True 315 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 362 486 0.00943339614832244 0.0529712929611738 0.009399557488365 0.0521400778210117 0.0015443159836334 0.0119009536864739 357948 2308530 579 665 0 True 360 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 406 486 0.0096296023970632 0.0701812668544788 0.00971999694819562 0.0696421759365225 0.00192259855105237 0.0157366413527196 365393 3058554 579 665 0 True 404 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 449 484 0.00976319131242478 0.07757633956716 0.00967421988250553 0.0762035553521019 0.003102674400929 0.0245080774838713 370462 3380837 579 665 0 True 448 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 494 484 0.00938846241372163 0.0347790281379806 0.00932326237888151 0.0358739604791333 0.00187285773352203 0.00529085274007992 356243 1515697 579 665 0 True 492 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 537 484 0.0106687444236379 0.0345419511240908 0.00950637064164187 0.0356603341725795 0.00796582282155804 0.00639034200350368 404823 1505365 579 665 0 True 537 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 583 484 0.00899958136517646 0.085307867976189 0.00906385900663768 0.0816052491035325 0.00186819187822897 0.0154672659909565 341487 3717783 579 665 0 True 581 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 625 484 0.0090411154213236 0.0565832296465586 0.0089723048752575 0.0567788204776074 0.0018804592213364 0.0184970524472264 343063 2465941 579 665 0 True 625 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 671 484 0.00919101752244348 0.0719903902580897 0.00912489509422446 0.0694590676737621 0.00189134054256793 0.0149120267661181 348751 3137397 579 665 0 True 669 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 274 530 0.0087798936164185 0.038369992272969 0.00889600976577401 0.0407110704203861 0.00144515177108368 0.00774531699909229 333151 1672194 579 665 0 True 271 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 318 529 0.00905168341403616 0.0814034628801346 0.00900282291905089 0.0774700541695277 0.00148483262455807 0.019547484368364 343464 3547626 579 665 0 True 316 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 362 530 0.00923948270598065 0.0438812756312847 0.00927748531319142 0.0463721675440604 0.00143357975645516 0.00838982334042474 350590 1912380 579 665 0 True 360 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 406 530 0.00952004841774616 0.0468422601479666 0.00962844281681544 0.0472419317921721 0.00170868332235572 0.00603199443183754 361236 2041422 579 665 0 True 404 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 450 528 0.00987683017670554 0.0456824138625346 0.00953688868543526 0.0461890592813001 0.00424237959890517 0.00569093267353713 374774 1990875 579 665 0 True 448 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 494 526 0.00940725288455469 0.0538553525034835 0.0093842984664683 0.0532234683756771 0.00183178030056819 0.0116995467037712 356956 2347058 579 665 0 True 492 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 539 527 0.0092518164231614 0.0613578808545741 0.00929274433508812 0.0605630579079881 0.00198355420162052 0.0145150564824327 351058 2674024 579 665 0 True 537 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 581 525 0.00890157048014397 0.0478196177098732 0.00891126878767071 0.049256122682536 0.00174509856804958 0.00999596226407557 337768 2084016 579 665 0 True 581 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 625 525 0.00909118820474972 0.040177486517851 0.00914015411612116 0.0404821850919356 0.00179798581050525 0.00632135606622409 344963 1750966 579 665 0 True 625 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 671 525 0.00915870740008536 0.0575556997322787 0.00920119020370794 0.0563363088426032 0.00190180265689742 0.0154761471129284 347525 2508322 579 665 0 True 669 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 274 573 0.00857188073242778 0.0331318798254506 0.00859082932784009 0.0339513237201495 0.00145023460857626 0.00654523699849585 325258 1443913 579 665 0 True 271 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 317 571 0.00877030072527791 0.0450686799397211 0.00881971465629053 0.0437476157778286 0.00147313675994307 0.0120623401771862 332787 1964128 579 665 0 True 316 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 362 571 0.00911237689836793 0.0352790651382404 0.00910963607232776 0.0364232852674144 0.00134858791097563 0.00605767175965288 345767 1537489 579 665 0 True 360 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 406 569 0.00931527708762987 0.0407978976968629 0.00935378042267491 0.0407721065079728 0.00158722085356668 0.00460107903074326 353466 1778004 579 665 0 True 404 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 450 570 0.00933720369595121 0.0733223766672346 0.00935378042267491 0.0716411078049897 0.00210049838231772 0.0170076483237025 354298 3195446 579 665 0 True 448 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 494 568 0.00923505521776192 0.0533538699116755 0.00929274433508812 0.0528114747844663 0.00192214905675352 0.0111226375501395 350422 2325203 579 665 0 True 493 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 537 567 0.00898827545776077 0.0448960120603638 0.00912489509422446 0.0453345540550851 0.00201024086465612 0.00650958535497049 341058 1956603 579 665 0 True 537 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 581 572 0.00889461299865739 0.0288693351598268 0.00877393759060044 0.0321507591363394 0.0017185021760538 0.00975661180131228 337504 1258148 579 665 0 False 581 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 626 566 0.00905181518451887 0.0402004553613377 0.00903334096284428 0.0405889982452125 0.00167181877779592 0.00893423450730855 343469 1751967 579 665 0 True 625 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 670 566 0.00918622107687319 0.0432563211645502 0.00917067215991455 0.0430609597924773 0.00177935694635216 0.00607581309074169 348569 1885144 579 665 0 True 669 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 272 616 0.00828757273895358 0.00848709092484014 0.00830090791180285 0.00849927519645991 0.00133742158813425 0.00142374336845369 314470 369874 579 665 0 False 272 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 316 616 0.0086826733542822 0.00862476631037424 0.00866712443732357 0.00857557030594339 0.00133361963020659 0.00143999282368625 329462 375874 579 665 0 False 316 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 361 613 0.00912803123171273 0.0566558304665303 0.00917067215991455 0.0554970626382849 0.00150992125803993 0.0101651403641658 346361 2469105 579 665 0 True 360 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 405 612 0.00916313488830409 0.0615466108622437 0.00909437705043107 0.061371786068513 0.0015499078344445 0.0153676476920799 347693 2682249 579 665 0 True 404 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 448 615 0.00895965490891827 0.0088718018438176 0.0089723048752575 0.00900282291905089 0.0020161020604608 0.00185483223694152 339972 386640 579 665 0 False 448 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 493 615 0.00876112949968197 0.00861058574566423 0.00862134737163348 0.00863660639353018 0.00202307936840192 0.00194632418328628 332439 375256 579 665 0 False 493 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 537 615 0.00864996792047599 0.00873715531676525 0.00860608834973678 0.00885023270008392 0.00197869449855235 0.00193611023055939 328221 380772 579 665 0 False 537 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 581 615 0.00860463887442708 0.00837784550641883 0.00859082932784009 0.00837720302128634 0.00169582036139584 0.0016763145587021 326501 365113 579 665 0 False 581 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 625 615 0.00852818564036436 0.00858874125115948 0.00856031128404669 0.0085297932402533 0.00150926275015815 0.00145967406160155 323600 374304 579 665 0 False 625 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 670 615 0.00872204637451306 0.00877246905315475 0.00872816052491035 0.00885023270008392 0.00159170741596453 0.00161056217132812 330956 382311 579 665 0 False 670 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 272 663 0.00823122768055093 0.0329370232631246 0.00825513084611276 0.0335088120851453 0.0012613695746738 0.00683981853537525 312332 1435421 579 665 0 True 272 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 316 659 0.00848153888948844 0.00841350343127216 0.00849927519645991 0.00842298008697642 0.00130266754197453 0.0011942078719483 321830 366667 579 665 0 False 316 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 360 659 0.00855269495014661 0.00863165007965095 0.00854505226215 0.00863660639353018 0.0013050605742536 0.00119006747220482 324530 376174 579 665 0 False 360 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 404 658 0.00858819391818608 0.00866641311449831 0.00854505226215 0.00868238345922026 0.00133558631285176 0.00133793724356862 325877 377689 579 665 0 False 404 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 448 658 0.00846029748767715 0.00847658170374437 0.00842298008697642 0.0085297932402533 0.00155575413793069 0.00161728942880477 321024 369416 579 665 0 False 448 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 493 658 0.00841159511727112 0.00842091495619341 0.00833142595559625 0.00836194399938964 0.00165761248254296 0.00163565051074857 319176 366990 579 665 0 False 493 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 537 658 0.00835662047188855 0.00850542469701376 0.00834668497749294 0.0085145342183566 0.00169077941995259 0.00172879231077242 317090 370673 579 665 0 False 537 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 581 658 0.00845410427499024 0.00836896544405188 0.00845349813076982 0.00836194399938964 0.00145237758913172 0.00122944148488935 320789 364726 579 665 0 False 581 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 625 658 0.00857114281772466 0.00848302950096688 0.00857557030594339 0.0085145342183566 0.00142242927773455 0.00146413502344332 325230 369697 579 665 0 False 625 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 667 659 0.00887252826575682 0.035700673060541 0.00872816052491035 0.0354009308003357 0.00165423619219494 0.00746284840721 336666 1555863 579 665 0 True 670 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H11_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H11_2.csv new file mode 100755 index 0000000..c0106b1 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H11_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 270 272 0.00729278465685583 0.659486551122599 0.00698863202868696 0.677821011673152 0.00225433534662259 0.20281845388635 276723 28740935 579 665 5 True 271 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 315 271 0.00563598166967169 0.00548381711890163 0.00561532005798428 0.00550850690470741 0.00146409097922612 0.00127266674783328 213856 238989 579 665 0 False 315 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 359 272 0.00509472123493188 0.00536422310066767 0.00512703135729 0.00540169375143053 0.00118436173891635 0.0012501610049966 193318 233777 579 665 0 True 359 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 403 271 0.00517193873779427 0.00529432989661152 0.00518806744487678 0.00527962157625696 0.00131578289854599 0.00120049620431433 196248 230731 579 665 0 True 404 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 449 272 0.00523366003189109 0.0051009189258337 0.00529488059815366 0.00508125429159991 0.00164406553024149 0.00154742945691385 198590 222302 579 665 0 True 448 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 490 270 0.00541840224863693 0.00532666066631445 0.00540169375143053 0.00532539864194705 0.00166059549542161 0.00160755086055217 205600 232140 579 665 0 True 492 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 537 270 0.00551380407811196 0.00542353824593528 0.0055390249485008 0.00543221179522393 0.00148753438930647 0.00159259661368281 209220 236362 579 665 0 True 536 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 581 270 0.00569343360012903 0.00573294072902559 0.00575265125505455 0.00581368734264134 0.00165630691055959 0.00183509485429307 216036 249846 579 665 0 True 580 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 625 271 0.00660876408115849 0.00626856681644601 0.00636301213092241 0.00624093995574884 0.00239390506581433 0.00175468945921115 250768 273189 579 665 0 False 625 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 665 268 0.00772248820094155 0.67641695219968 0.00755321583886473 0.668894483863584 0.00236933956946913 0.198284542587438 293028 29478775 579 665 7 True 669 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 271 314 0.00576970235551597 0.00559579309913603 0.00569161516746777 0.00561532005798428 0.0014517361779082 0.001391737820606 218930 243869 579 665 0 False 271 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 315 314 0.0053130649247663 0.005253210848132 0.00527962157625696 0.00526436255436027 0.00125574846242742 0.00115519327680089 201603 228939 579 665 0 False 315 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 361 317 0.00525582382708129 0.00536213502398707 0.00524910353246357 0.00546272983901732 0.00132373685911503 0.00131441565284559 199431 233686 579 665 0 True 359 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 403 315 0.00541102310160572 0.00545109626893969 0.00541695277332723 0.00544747081712062 0.00133753159819208 0.00135954148422755 205320 237563 579 665 0 True 404 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 449 316 0.0055123809568988 0.00565871075032511 0.00547798886091402 0.00569161516746777 0.00163678071851502 0.00159622336842278 209166 246611 579 665 0 True 448 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 493 315 0.00534682452243412 0.00558156664263084 0.00526436255436027 0.00564583810177768 0.00151601496758858 0.00159017091935126 202884 243249 579 665 0 True 492 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 536 313 0.00549577787607856 0.00554579398828956 0.00549324788281071 0.00556954299229419 0.00142765787200102 0.00145087738036728 208536 241690 579 665 0 True 536 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 581 313 0.00568125800752752 0.00558546744522097 0.00573739223315786 0.00556954299229419 0.00171645108181012 0.00171311445232866 215574 243419 579 665 0 True 580 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 625 314 0.0057644578903045 0.00593933907783879 0.00585946440833143 0.00602731364919509 0.00203282680373649 0.00196210519132763 218731 258841 579 665 0 False 625 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 669 314 0.00580161716642599 0.00571114212631602 0.00575265125505455 0.00576791027695125 0.00192729680243178 0.00178786905085832 220141 248896 579 665 0 False 669 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 272 354 0.0053476678535234 0.00524676305090949 0.00532539864194705 0.00526436255436027 0.00147632454771759 0.00142588342869892 202916 228658 579 665 0 True 271 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 316 354 0.00526565390509073 0.00529930915638834 0.00523384451056687 0.00537117570763714 0.00130516227153918 0.00120616542271301 199804 230948 579 665 0 True 315 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 360 354 0.00529132279512075 0.00561206174052664 0.00532539864194705 0.00564583810177768 0.00127303973477517 0.0012282688012244 200778 244578 579 665 0 True 359 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 404 353 0.00550515993444682 0.0056838135622875 0.00541695277332723 0.00569161516746777 0.00147434966404205 0.00134563467041995 208892 247705 579 665 0 True 404 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 449 354 0.00566818637564365 0.00579335727737747 0.00578316929884794 0.00582894636453803 0.00160083295954266 0.00172015873632899 215078 252479 579 665 0 True 448 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 492 357 0.00558569805347325 0.00578381178398044 0.00558480201419089 0.00581368734264134 0.00163488417504318 0.00168617887543383 211948 252063 579 665 0 False 492 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 536 357 0.00565432412086358 0.0055505208431929 0.00561532005798428 0.0055390249485008 0.00154053744900686 0.00159939047545381 214552 241896 579 665 0 False 536 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 581 352 0.0056070448716707 0.00586136891783131 0.00558480201419089 0.00584420538643473 0.00182805618207962 0.00181707455927518 212758 255443 579 665 0 True 581 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 625 352 0.00549351142377611 0.00551160460088193 0.00546272983901732 0.00552376592660411 0.00190830905611645 0.00192961073526448 208450 240200 579 665 0 True 625 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 669 352 0.00533072216944814 0.00534880345748785 0.00532539864194705 0.00526436255436027 0.00183977154981001 0.00189399042344534 202273 233105 579 665 0 True 669 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 272 398 0.00524873457511201 0.00522615763487455 0.00526436255436027 0.00527962157625696 0.00143442090329583 0.00132936657558938 199162 227760 579 665 0 True 271 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 317 399 0.00531894188829474 0.00563604020350717 0.00532539864194705 0.00561532005798428 0.00137963081061048 0.00133133950357501 201826 245623 579 665 0 True 315 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 360 398 0.00546373129468584 0.0055129125170445 0.00541695277332723 0.0055542839703975 0.00130469734647429 0.0012888938939862 207320 240257 579 665 0 True 360 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 405 397 0.0057491988684078 0.00589119858469704 0.00575265125505455 0.00590524147402152 0.00150198838842371 0.00146985131297974 218152 256743 579 665 0 True 404 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 449 398 0.00572047290317913 0.00588358054669748 0.00575265125505455 0.00585946440833143 0.00153761382655111 0.00159619399831203 217062 256411 579 665 0 True 448 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 493 397 0.0056294722078263 0.00573872309521802 0.00561532005798428 0.00573739223315786 0.00159256490559668 0.00172412671055054 213609 250098 579 665 0 True 492 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 537 396 0.00549063882725325 0.00564503499536206 0.00541695277332723 0.00561532005798428 0.00155094238648863 0.00150288796254882 208341 246015 579 665 0 True 536 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 581 396 0.00561416047773652 0.00560100181788874 0.00566109712367437 0.00563057907988098 0.00170323369004018 0.00176003264084401 213028 244096 579 665 0 True 581 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 625 396 0.00517083186573958 0.00514912825666822 0.00514229037918669 0.00514229037918669 0.00182416316452061 0.00185634130792426 196206 224403 579 665 0 True 625 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 669 396 0.00513794195325758 0.00513561312298829 0.00514229037918669 0.0051117723353933 0.00175050938503511 0.00182230405899229 194958 223814 579 665 0 True 669 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 273 442 0.00531533137706875 0.00528781326169624 0.00527962157625696 0.00527962157625696 0.00146196894960662 0.00146075796731691 201689 230447 579 665 0 True 271 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 317 442 0.00523719148082746 0.00521154109811035 0.00517280842298009 0.00518806744487678 0.00137023844652387 0.00145754062525967 198724 227123 579 665 0 True 315 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 360 441 0.00535823584623597 0.0054105279220023 0.00547798886091402 0.00537117570763714 0.00141125578291983 0.00132648967783892 203317 235795 579 665 0 True 360 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 405 442 0.00548283801467739 0.00573493702211583 0.00552376592660411 0.00573739223315786 0.00157143955895375 0.00145626166906276 208045 249933 579 665 0 True 404 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 448 441 0.00571628260182926 0.00566105123187919 0.00575265125505455 0.00567635614557107 0.00172893900734432 0.00168142754240377 216903 246713 579 665 0 True 448 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 493 440 0.00582744418103525 0.00584498554695276 0.00576791027695125 0.00579842832074464 0.00175881854694826 0.00170199532906094 221121 254729 579 665 0 True 492 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 537 439 0.00570745397948834 0.00565292838413268 0.00569161516746777 0.00570687418936446 0.00165572051152311 0.0016860676344849 216568 246359 579 665 0 True 537 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 581 439 0.00540775519363475 0.00520527686806855 0.00540169375143053 0.00520332646677348 0.00167301050580999 0.0018259211436618 205196 226850 579 665 0 True 581 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 625 438 0.00513079999309523 0.00528907528606364 0.00515754940108339 0.00527962157625696 0.00186489479287303 0.00180422605450402 194687 230502 579 665 0 True 625 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 669 439 0.00538137474299815 0.00517911854481707 0.00537117570763714 0.00518806744487678 0.00206418199291267 0.00182730444299206 204195 225710 579 665 0 True 669 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 274 486 0.00548750268976498 0.00556357705892105 0.0055542839703975 0.00558480201419089 0.0015176404686626 0.00147163603183658 208222 242465 579 665 0 True 271 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 317 486 0.00524607281136146 0.00531959332985703 0.00523384451056687 0.00541695277332723 0.00148414060027546 0.0014547433862941 199061 231832 579 665 0 True 315 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 362 486 0.00538967628340827 0.00535603141522839 0.00538643472953384 0.00540169375143053 0.00134255355460686 0.00143952947209043 204510 233420 579 665 0 True 360 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 406 486 0.00550911304892783 0.00552856161920021 0.00564583810177768 0.0055390249485008 0.00166042382936453 0.0015887097834293 209042 240939 579 665 0 True 404 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 449 484 0.00565724942557952 0.00588757313287797 0.00556954299229419 0.00588998245212482 0.00203355523399568 0.00193248794741778 214663 256585 579 665 0 True 448 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 494 484 0.00564388789863371 0.0057980841322808 0.00564583810177768 0.00575265125505455 0.00179336675620579 0.00180012395521069 214156 252685 579 665 0 True 492 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 537 484 0.00583745873772047 0.00568659001589577 0.00561532005798428 0.00578316929884794 0.00254169406971805 0.00159952349670042 221501 247826 579 665 0 True 537 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 583 484 0.00533449080525337 0.0053108738887732 0.00531013962005036 0.00529488059815366 0.00180521537195641 0.00187882729496556 202416 231452 579 665 0 True 581 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 625 484 0.00523626908744856 0.0054337262244648 0.00514229037918669 0.00546272983901732 0.00179848849111933 0.00165091131375988 198689 236806 579 665 0 True 625 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 671 484 0.00529559215876024 0.0053902666944312 0.00523384451056687 0.00541695277332723 0.00171528365465456 0.00186299581042425 200940 234912 579 665 0 True 669 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 274 530 0.00559863791487442 0.00549421161050945 0.00556954299229419 0.00549324788281071 0.00138569802517438 0.001426972168673 212439 239442 579 665 0 True 271 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 318 529 0.00534914368292965 0.00547252773728783 0.00540169375143053 0.00534065766384375 0.00141710484716728 0.00159555849850095 202972 238497 579 665 0 True 316 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 362 530 0.00541104945570226 0.00547736932167911 0.00535591668574044 0.00544747081712062 0.00142332859503221 0.00142693076930075 205321 238708 579 665 0 True 360 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 406 530 0.00552474102817609 0.00549212353382885 0.00543221179522393 0.00549324788281071 0.00155994493135145 0.00158094241635481 209635 239351 579 665 0 True 404 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 450 528 0.00576113727414045 0.00575226117479554 0.00558480201419089 0.00566109712367437 0.00200818146983192 0.00194241605114525 218605 250688 579 665 0 True 448 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 494 526 0.00583224062660554 0.00598013688375207 0.00576791027695125 0.00602731364919509 0.00188218605605635 0.00177563132662782 221303 260619 579 665 0 True 492 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 539 527 0.00573509942675887 0.00583316840969441 0.00573739223315786 0.00590524147402152 0.00176003432893298 0.00169636442957515 217617 254214 579 665 0 True 537 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 581 525 0.00562238295585702 0.00554680360778348 0.00564583810177768 0.00556954299229419 0.00161486557175478 0.00173607837821596 213340 241734 579 665 0 True 581 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 625 525 0.00539760886646682 0.00537312610893221 0.00549324788281071 0.00531013962005036 0.00180278249026393 0.00178295069478307 204811 234165 579 665 0 True 625 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 671 525 0.00547880583790676 0.0055413195382597 0.00549324788281071 0.00561532005798428 0.00191861264234834 0.00178952849252373 207892 241495 579 665 0 True 669 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 274 573 0.00563050001759136 0.00566456195421031 0.00560006103608759 0.00563057907988098 0.00137027393384198 0.00124171382596329 213648 246866 579 665 0 True 271 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 317 571 0.00541721631429263 0.00540586990479173 0.00543221179522393 0.00537117570763714 0.00137955159768829 0.00132801947474335 205555 235592 579 665 0 True 316 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 362 571 0.00550313066901324 0.00552491322148356 0.00547798886091402 0.00552376592660411 0.00138528865259573 0.00123213080715418 208815 240780 579 665 0 True 360 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 406 569 0.00544188374865413 0.00549659798385871 0.00544747081712062 0.00552376592660411 0.00148053985442925 0.00138926536682777 206491 239546 579 665 0 True 404 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 450 570 0.0057051875271859 0.00575141217658474 0.00564583810177768 0.00569161516746777 0.00187078842345482 0.00198950590894228 216482 250651 579 665 0 True 448 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 494 568 0.00579726874049688 0.0057680020605416 0.00572213321126116 0.00576791027695125 0.00193020105091051 0.00191019515416576 219976 251374 579 665 0 True 493 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 537 567 0.00565324360290543 0.00575581778892183 0.00569161516746777 0.00569161516746777 0.00186058042620794 0.00179475664862168 214511 250843 579 665 0 True 537 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 581 572 0.00552634862806503 0.00580320106744316 0.00544747081712062 0.00578316929884794 0.00157540106367444 0.00158589576540215 209696 252908 579 665 0 False 581 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 626 566 0.00552687570999583 0.00568062408252263 0.00552376592660411 0.00570687418936446 0.00154786132565457 0.00154909449707951 209716 247566 579 665 0 True 625 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 670 566 0.00571074824155585 0.00566628289652949 0.00570687418936446 0.00564583810177768 0.00165089630792861 0.00170035402840755 216693 246941 579 665 0 True 669 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 272 616 0.00592039507953205 0.00567697568480597 0.00590524147402152 0.00564583810177768 0.00137938778674094 0.00133772608440815 224648 247407 579 665 0 False 272 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 316 616 0.00535322856789336 0.00545391861434314 0.00538643472953384 0.00541695277332723 0.00144060724149183 0.00129758542525011 203127 237686 579 665 0 False 316 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 361 613 0.00540612123964926 0.00549464758256364 0.00543221179522393 0.00560006103608759 0.00139888294888875 0.00145699163264137 205134 239461 579 665 0 True 360 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 405 612 0.00553388589967549 0.00545061440509032 0.00560006103608759 0.00543221179522393 0.00138898077112303 0.00135674282490228 209982 237542 579 665 0 True 404 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 448 615 0.0054109440393161 0.00567826065507096 0.00540169375143053 0.00570687418936446 0.00181510628020427 0.00193746930527831 205317 247463 579 665 0 False 448 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 493 615 0.00543442553933329 0.00551204057293612 0.00546272983901732 0.00549324788281071 0.00188629077801015 0.00194094278112268 206208 240219 579 665 0 False 493 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 537 615 0.00559191762025671 0.00574305986986234 0.00567635614557107 0.00579842832074464 0.0018272628000057 0.00195876555397273 212184 250287 579 665 0 False 537 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 581 615 0.00567319365398626 0.00549730930668397 0.00573739223315786 0.00546272983901732 0.00153128279185366 0.00160081020801667 215268 239577 579 665 0 False 581 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 625 615 0.00559726750185434 0.00555591312912632 0.00561532005798428 0.00552376592660411 0.00143912653443116 0.00133197744859723 212387 242131 579 665 0 False 625 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 670 615 0.00590613751330388 0.00589684327550393 0.0059662775616083 0.00581368734264134 0.00154409950210867 0.00164725147026293 224107 256989 579 665 0 False 670 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 272 663 0.00777192848605071 0.669829299731361 0.00744640268558785 0.66678873884184 0.00223626685490607 0.188588228719552 294904 29191680 579 665 4 True 272 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 316 659 0.00595452363455143 0.00567727398147463 0.00592050049591821 0.00560006103608759 0.00142156493367628 0.00124987483261638 225943 247420 579 665 0 False 316 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 360 659 0.00548636946361376 0.00541078032687578 0.00550850690470741 0.00547798886091402 0.00122246635644038 0.00117011271257747 208179 235806 579 665 0 False 360 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 404 658 0.00534026235239565 0.00531640385009216 0.00535591668574044 0.00529488059815366 0.00128900771140127 0.00124010217035282 202635 231693 579 665 0 False 404 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 448 658 0.0051515670211688 0.00539694395062961 0.00515754940108339 0.00540169375143053 0.00155612359286785 0.00153418139029171 195475 235203 579 665 0 False 448 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 493 658 0.00531156274126352 0.00529267779198511 0.00532539864194705 0.00531013962005036 0.00153742561786652 0.00159880702243874 201546 230659 579 665 0 False 493 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 537 658 0.00553725922403262 0.00556965772178214 0.00558480201419089 0.00550850690470741 0.00168937077742682 0.00169606552101108 210110 242730 579 665 0 False 537 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 581 658 0.00551082606520293 0.00560260803071997 0.00558480201419089 0.00563057907988098 0.00137347134886576 0.00122453892470156 209107 244166 579 665 0 False 581 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 625 658 0.00616280005950755 0.00589184106982953 0.00616464484626535 0.00585946440833143 0.00146064715092199 0.00135204072350675 233846 256771 579 665 0 False 625 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 667 659 0.00761253891017641 0.710892038978196 0.00740062561989776 0.696482795452811 0.00209901259961425 0.18578070415505 288856 30981226 579 665 10 True 670 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H11_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H11_3.csv new file mode 100755 index 0000000..bbaf238 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H11_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 270 272 0.00103771890536152 0.066265664160401 0.000869764248111696 0.0676890211337453 0.000800533524426733 0.0211265734671201 39376 2887909 579 665 0 True 271 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 315 271 0.000889029092682482 0.000859117351630392 0.000762951094834821 0.000732433051041428 0.000631438657872894 0.000675022079875706 33734 37441 579 665 0 False 315 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 359 272 0.000761317140849337 0.000756480351714718 0.000656137941557946 0.000625619897764553 0.000605994645906277 0.000616874425318652 28888 32968 579 665 0 True 359 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 403 271 0.000829758729563881 0.000836699209685922 0.000686655985351339 0.000701915007248035 0.00065735803327124 0.00065782615454569 31485 36464 579 665 0 True 404 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 449 272 0.000781530732895565 0.000856937491359435 0.000564583810177768 0.000564583810177768 0.00077129049046946 0.000860501565118754 29655 37346 579 665 0 True 448 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 490 270 0.000914856107291744 0.000866230579882987 0.000671396963454643 0.000625619897764553 0.000881571611721101 0.000858131656660883 34714 37751 579 665 0 True 492 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 537 270 0.000933303974869788 0.000854069254160808 0.000732433051041428 0.000656137941557946 0.000825615479947943 0.000796298454785388 35414 37221 579 665 0 True 536 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 581 270 0.000928612945685657 0.00091168640300683 0.000671396963454643 0.000564583810177768 0.000889009008530979 0.000945524337048965 35236 39732 579 665 0 True 580 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 625 271 0.000971201165694398 0.000876716855081168 0.000595101853971161 0.000549324788281071 0.000984819888192366 0.000905877305727968 36852 38208 579 665 0 False 625 271 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 665 268 0.000999057445737245 0.0680589319487779 0.000732433051041428 0.0666819256885634 0.000930137647469457 0.0214992797102557 37909 2966061 579 665 0 True 669 270 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 271 314 0.000864045409162502 0.000887157238484171 0.000701915007248035 0.000732433051041428 0.000710770178140984 0.000744642712195293 32786 38663 579 665 0 False 271 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 315 314 0.000845070459653657 0.000753428547335379 0.000762951094834821 0.000686655985351339 0.000621645690375551 0.00055758440962917 32066 32835 579 665 0 False 315 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 361 317 0.000732512113331048 0.000807672649235816 0.000595101853971161 0.000671396963454643 0.000629977568066076 0.000628982179834605 27795 35199 579 665 0 True 359 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 403 315 0.000801823387231414 0.000840209932017042 0.000686655985351339 0.000625619897764553 0.000618092116275344 0.000685808592460932 30425 36617 579 665 0 True 404 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 449 316 0.000910507681362633 0.000813959825175206 0.000625619897764553 0.000549324788281071 0.000874338984226683 0.000830920779112412 34549 35473 579 665 0 True 448 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 493 315 0.000872821323310343 0.000864050719612031 0.000686655985351339 0.000671396963454643 0.000843146593719445 0.000821281874427293 33119 37656 579 665 0 True 492 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 536 313 0.000865573946761826 0.000907533195543218 0.000656137941557946 0.000778210116731518 0.000791451838237856 0.000744961874403184 32844 39551 579 665 0 True 536 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 581 313 0.000929798880029959 0.000895463653411395 0.000686655985351339 0.000518806744487678 0.000927162953122074 0.000988444281917109 35281 39025 579 665 0 True 580 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 625 314 0.000870818411973299 0.000901934396531498 0.000366216525520714 0.000411993591210803 0.00101737048784453 0.0010309818883771 33043 39307 579 665 0 False 625 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 669 314 0.000893377518611592 0.000895761950080053 0.000457770656900893 0.000457770656900893 0.000990478956526193 0.000938784301398242 33899 39038 579 665 0 False 669 314 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 272 354 0.000854083560670359 0.00084702486360098 0.000671396963454643 0.000701915007248035 0.000731001821561368 0.000714476275173384 32408 36914 579 665 0 True 271 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 316 354 0.000846862538218381 0.00081363858260896 0.000717174029144732 0.000717174029144732 0.000694485874234962 0.000626553304835521 32134 35459 579 665 0 True 315 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 360 354 0.000782927500012189 0.0007531761424619 0.00064087891966125 0.00064087891966125 0.000650461556092397 0.000598861958084146 29708 32824 579 665 0 True 359 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 404 353 0.000793442784531674 0.000891815255694742 0.000595101853971161 0.000701915007248035 0.00072762604657468 0.000732493818487528 30107 38866 579 665 0 True 404 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 449 354 0.000898411151050744 0.000823642993957772 0.000610360875867857 0.000488288700694286 0.000900579573672562 0.000845300370605512 34090 35895 579 665 0 True 448 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 492 357 0.000930510440636541 0.000880319361002644 0.000610360875867857 0.000610360875867857 0.000917672371462532 0.000814692192239628 35308 38365 579 665 0 False 492 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 536 357 0.000841539010717289 0.000816139685446163 0.000625619897764553 0.000518806744487678 0.00078188093730024 0.000850057741910059 31932 35568 579 665 0 False 536 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 581 352 0.000851553567402513 0.000818709625976133 0.000503547722590982 0.000350957503624018 0.000939027783813735 0.000989288176351286 32312 35680 579 665 0 True 581 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 625 352 0.000877802247556415 0.000949088216076928 0.000411993591210803 0.000534065766384375 0.00103829040084855 0.0010204359650877 33308 41362 579 665 0 True 625 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 669 352 0.000855032308145801 0.000842045603824163 0.000457770656900893 0.000396734569314107 0.000929136014244268 0.000990721441070433 32444 36697 579 665 0 True 669 357 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 272 398 0.000892718666198091 0.00090305874551336 0.000717174029144732 0.000762951094834821 0.000796104919061101 0.000778585255505446 33874 39356 579 665 0 True 271 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 317 399 0.000846071915322179 0.000904664958344591 0.000732433051041428 0.00080872816052491 0.00069391423675801 0.000681296615822785 32104 39426 579 665 0 True 315 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 360 398 0.000790517479815727 0.000821325458301281 0.000671396963454643 0.000717174029144732 0.000656542730552881 0.000667408111908523 29996 35794 579 665 0 True 360 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 405 397 0.000812127838978578 0.000878667256376235 0.000625619897764553 0.00064087891966125 0.000709702486072002 0.000814858027313189 30816 38293 579 665 0 True 404 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 449 398 0.000821747084215701 0.000882545113068779 0.00064087891966125 0.000625619897764553 0.000769550221005436 0.000840377188187021 31181 38462 579 665 0 True 448 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 493 397 0.000854241685249599 0.000844982678715557 0.000564583810177768 0.000488288700694286 0.000843795249078724 0.000904131117529784 32414 36825 579 665 0 True 492 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 537 396 0.000871002890649079 0.000805791085633516 0.000701915007248035 0.000579842832074464 0.000813766531532557 0.000779403819176954 33050 35117 579 665 0 True 536 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 581 396 0.000941763639859148 0.000917858849458276 0.000610360875867857 0.000503547722590982 0.000955912325415762 0.00100881069576471 35735 40001 579 665 0 True 581 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 625 396 0.000895116888983237 0.000838007125848496 0.000473029678797589 0.0004272526131075 0.00100387502673698 0.000952590020058929 33965 36521 579 665 0 True 625 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 669 396 0.000857694071896347 0.000878942607147303 0.000442511635004196 0.0004272526131075 0.000906810677369095 0.000967084979268242 32545 38305 579 665 0 True 669 400 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 273 442 0.000895116888983237 0.000796475051212375 0.000717174029144732 0.00064087891966125 0.000792667886578192 0.000725793388824351 33965 34711 579 665 0 True 271 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 317 442 0.000873717362592706 0.000788948796803178 0.000717174029144732 0.000656137941557946 0.000761404423299526 0.000712522319589541 33153 34383 579 665 0 True 315 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 360 441 0.000768696287880555 0.00087855252688829 0.000671396963454643 0.000762951094834821 0.000639044030828985 0.000683412805639241 29168 38288 579 665 0 True 360 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 405 442 0.000905342278440781 0.000873160240954871 0.000625619897764553 0.000610360875867857 0.000863608276833508 0.000804784419012715 34353 38053 579 665 0 True 404 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 448 441 0.000894247203797414 0.000881856736141108 0.000534065766384375 0.000488288700694286 0.000926368654551571 0.000941762670746084 33932 38432 579 665 0 True 448 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 493 440 0.000910059661721452 0.000894132791351232 0.000564583810177768 0.000595101853971161 0.00095270134956249 0.000924891063947991 34532 38967 579 665 0 True 492 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 537 439 0.000833263824403709 0.000912810751988692 0.000579842832074464 0.00064087891966125 0.000820014241994163 0.000856913141180365 31618 39781 579 665 0 True 537 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 581 439 0.00080870180642837 0.000914692315590992 0.000457770656900893 0.000457770656900893 0.000883550076322303 0.00103697467786085 30686 39863 579 665 0 True 581 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 625 438 0.000878619224549157 0.000890117259273154 0.000488288700694286 0.000595101853971161 0.000976206111851068 0.000891300034460628 33339 38792 579 665 0 True 625 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 669 439 0.000878856411418018 0.000814510526717343 0.000473029678797589 0.000366216525520714 0.000995020650218296 0.000930498511583664 33348 35497 579 665 0 True 669 443 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 274 486 0.000883257545540208 0.000927863260807088 0.000747692072938125 0.000778210116731518 0.000737253507333127 0.000800768840922348 33515 40437 579 665 0 True 271 487 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 317 486 0.00087962068021768 0.000835161834547458 0.000732433051041428 0.000701915007248035 0.000788413933801381 0.000701457525196064 33377 36397 579 665 0 True 315 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 362 486 0.000805407544360862 0.000817103413144902 0.000701915007248035 0.00064087891966125 0.000726660880243572 0.000739526430078696 30561 35610 579 665 0 True 360 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 406 486 0.000865890195920307 0.000882246816400121 0.000610360875867857 0.000610360875867857 0.000868088149029845 0.000870732666624493 32856 38449 579 665 0 True 404 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 449 484 0.000911245596065755 0.000883302327689216 0.000473029678797589 0.000442511635004196 0.0010079833290484 0.00106320788462193 34577 38495 579 665 0 True 448 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 494 484 0.000844780564591716 0.000905261551681906 0.000503547722590982 0.000549324788281071 0.000890856436169411 0.000940959429281313 32055 39452 579 665 0 True 492 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 537 484 0.000883626502891769 0.000868938195798491 0.000579842832074464 0.000610360875867857 0.000882592207272369 0.000827878383039156 33529 37869 579 665 0 True 537 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 583 484 0.000897567819961462 0.000875592506099306 0.000534065766384375 0.0004272526131075 0.000959551381832628 0.000985413719612802 34058 38159 579 665 0 True 581 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 625 484 0.000844227128564375 0.000906064658097521 0.0004272526131075 0.000579842832074464 0.000902436797957137 0.000887220678836294 32034 39487 579 665 0 True 625 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 671 484 0.000842303279516951 0.000827589688343083 0.000442511635004196 0.0004272526131075 0.000941459749520039 0.000906828589245295 31961 36067 579 665 0 True 669 486 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 274 530 0.000818373759858573 0.000870544408629723 0.000686655985351339 0.000717174029144732 0.000713263421465085 0.000741757673620948 31053 37939 579 665 0 True 271 530 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 318 529 0.000802350469162215 0.000867171361684137 0.000671396963454643 0.000717174029144732 0.000705877235008109 0.000780126394031065 30445 37792 579 665 0 True 316 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 362 530 0.000745214787863359 0.000838557827390633 0.000579842832074464 0.000671396963454643 0.000713755476183257 0.000745787865599401 28277 36545 579 665 0 True 360 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 406 530 0.000772728464651184 0.000817103413144902 0.000457770656900893 0.000579842832074464 0.000771391814011381 0.000789266113868068 29321 35610 579 665 0 True 404 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 450 528 0.000791255394518849 0.000883164652303682 0.000442511635004196 0.000518806744487678 0.000905480219004111 0.000998469986092265 30024 38489 579 665 0 True 448 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 494 526 0.000890109610640625 0.000887294913869705 0.00064087891966125 0.000473029678797589 0.000905556793078683 0.000941066973756579 33775 38669 579 665 0 True 492 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 539 527 0.000983851132033628 0.000873022565569336 0.000686655985351339 0.000473029678797589 0.000947784071300141 0.000917338065143288 37332 38047 579 665 0 True 537 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 581 525 0.000878329329487217 0.000840118148426686 0.000595101853971161 0.000549324788281071 0.000892720763693539 0.000838864971470711 33328 36613 579 665 0 True 581 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 625 525 0.000944952485540495 0.000896679785983613 0.000595101853971161 0.000488288700694286 0.000958035234044408 0.000979426055222245 35856 39078 579 665 0 True 625 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 671 525 0.000865020510734485 0.000814212230048685 0.000488288700694286 0.000366216525520714 0.000928107684055675 0.000973664144363359 32823 35484 579 665 0 True 669 529 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 274 573 0.00085458428850462 0.00088321054409886 0.000717174029144732 0.000701915007248035 0.000687157696637222 0.000716930032478939 32427 38491 579 665 0 True 271 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 317 571 0.000799504226735888 0.000776466228514752 0.000625619897764553 0.00064087891966125 0.000714449173942138 0.000672509781454555 30337 33839 579 665 0 True 316 573 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 362 571 0.000796789754792262 0.000852944905178946 0.000656137941557946 0.000762951094834821 0.000675028374586879 0.000644366778622218 30234 37172 579 665 0 True 360 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 406 569 0.00078358635242569 0.000869465951443039 0.000549324788281071 0.00064087891966125 0.000745798937729363 0.000783727659784945 29733 37892 579 665 0 True 404 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 450 570 0.000796447151537241 0.000889543611833429 0.000320439459830625 0.000503547722590982 0.000902365416983368 0.000977444056366525 30221 38767 579 665 0 True 448 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 494 568 0.000907134357005505 0.000892113552363399 0.000457770656900893 0.000289921416037232 0.0010554200941205 0.00111438319761127 34421 38879 579 665 0 True 493 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 537 567 0.000923210355894944 0.000908244518368478 0.000534065766384375 0.000488288700694286 0.000998607346532285 0.00097612087457547 35031 39582 579 665 0 True 537 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 581 572 0.000886051079773455 0.000927955044397444 0.000549324788281071 0.000701915007248035 0.000889018795197503 0.000834344387611412 33621 40441 579 665 0 False 581 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 626 566 0.000873559238013465 0.000831788787601873 0.000595101853971161 0.000579842832074464 0.000810382099889506 0.000783940601934468 33147 36250 579 665 0 True 625 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 670 566 0.000977868752119034 0.00088718018438176 0.000656137941557946 0.000534065766384375 0.000947178501017379 0.000887235321308994 37105 38664 579 665 0 True 669 572 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 272 616 0.000883283899636748 0.000925109753096405 0.000747692072938125 0.000747692072938125 0.00073310984007027 0.000735084124394835 33516 40317 579 665 0 False 272 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 316 616 0.00084209244674463 0.000818824355464078 0.000732433051041428 0.000656137941557946 0.000736328548697449 0.00068244547399669 31953 35685 579 665 0 False 316 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 361 613 0.000762845678448661 0.000798723749176099 0.00064087891966125 0.000701915007248035 0.000623832004823316 0.000675951954589809 28946 34809 579 665 0 True 360 616 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 405 612 0.000745214787863359 0.00084119660561337 0.000503547722590982 0.000671396963454643 0.000687027108630355 0.000669978068761813 28277 36660 579 665 0 True 404 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 448 615 0.00080435338049926 0.000821876159843417 0.000442511635004196 0.000442511635004196 0.000905760988355906 0.000919903505789263 30521 35818 579 665 0 False 448 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 493 615 0.000869342582567055 0.000833922756077651 0.000411993591210803 0.000289921416037232 0.00100818447005915 0.00100365517000766 32987 36343 579 665 0 False 493 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 537 615 0.000828151129674937 0.000872265350948899 0.000381475547417411 0.000473029678797589 0.000933789509164503 0.00101660320864163 31424 38014 579 665 0 False 537 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 581 615 0.0008714772643868 0.000923251135391695 0.000595101853971161 0.000656137941557946 0.000846168596759325 0.000905386165873837 33068 40236 579 665 0 False 581 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 625 615 0.000878250267197596 0.000862742803449457 0.000671396963454643 0.000701915007248035 0.000772099342785227 0.000710012890214013 33325 37599 579 665 0 False 625 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 670 615 0.000891190128598767 0.000902806340639881 0.000686655985351339 0.000656137941557946 0.000768418279050602 0.000796961541620952 33816 39345 579 665 0 False 670 615 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 272 663 0.000941394682507587 0.0670308639531995 0.000762951094834821 0.0668955519951171 0.000710361914510939 0.0194428211184807 35721 2921257 579 665 0 True 272 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 316 659 0.000777129598773375 0.00081177996490425 0.000656137941557946 0.000701915007248035 0.000610184968786688 0.000597162651688934 29488 35378 579 665 0 False 316 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 360 659 0.000786959676782818 0.000821486079584404 0.000656137941557946 0.000701915007248035 0.000638853868629639 0.000611413510086314 29861 35801 579 665 0 False 360 659 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 404 658 0.000802429531451835 0.000868616953232245 0.00064087891966125 0.000686655985351339 0.000675257623501603 0.0006969351019216 30448 37855 579 665 0 False 404 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 448 658 0.000789516024147205 0.000821715538560294 0.000549324788281071 0.000610360875867857 0.000749435901445449 0.000788022918135393 29958 35811 579 665 0 False 448 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 493 658 0.000848232951238465 0.000850833882600757 0.000503547722590982 0.000564583810177768 0.000877207523370157 0.000831443897810804 32186 37080 579 665 0 False 493 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 537 658 0.000809492429324572 0.00095698160484755 0.000457770656900893 0.000610360875867857 0.000856579868777346 0.000949450988944345 30716 41706 579 665 0 False 537 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 581 658 0.000948352163994164 0.00101313021624788 0.000793469138628214 0.000900282291905089 0.00075919851128308 0.000707899570808529 35985 44153 579 665 0 False 581 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 625 658 0.000849550656065468 0.000878736094069002 0.000701915007248035 0.000701915007248035 0.000682277776301884 0.000737459860065161 32236 38296 579 665 0 False 625 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 667 659 0.0010542165697956 0.0722117263862334 0.000900282291905089 0.0695963988708324 0.000775845379703129 0.021161342157896 40002 3147043 579 665 0 True 670 658 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H12_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H12_1.csv new file mode 100755 index 0000000..f4f7e6a --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H12_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 242 243 0.00892625795548242 0.0324065141108665 0.0089417868314641 0.0332341496910048 0.00173259474975747 0.0073441967288869 363859 1412301 622 665 0 True 243 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 287 244 0.00880921487916547 0.0086181578918686 0.00888075074387732 0.00868238345922026 0.00146935442927751 0.00141540414297236 359088 375586 622 665 0 False 287 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 330 243 0.00881201154877355 0.0446379854419753 0.00888075074387732 0.0455176623178454 0.00136031374602016 0.00634275619990994 359202 1945358 622 665 0 True 332 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 373 243 0.008961289922152 0.0650063474089206 0.0089570458533608 0.0645456626230259 0.0014405149403391 0.0122107731080797 365287 2833027 622 665 0 True 376 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 419 244 0.00888774241789751 0.0534506327618084 0.0089417868314641 0.052674143587396 0.00155448319941927 0.00824078520178815 362289 2329420 622 665 0 True 420 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 462 243 0.00860258024663191 0.0491734715594204 0.00869764248111696 0.0518196383611811 0.00172984923979301 0.0122873149947374 350665 2143018 622 665 0 True 465 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 506 242 0.00895920468604072 0.0598761495177633 0.00891126878767071 0.0607003891050584 0.0016593538509038 0.0163518152485478 365202 2609449 622 665 0 True 509 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 550 242 0.00900912769176383 0.051932646906807 0.0089723048752575 0.0527809567406729 0.00153407098588 0.0150056035413246 367237 2263265 622 665 0 True 553 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 597 243 0.0088572734384832 0.0087982602420448 0.00880445563439384 0.00875867856870375 0.00190772592246253 0.00201626228967335 361047 383435 622 665 0 False 597 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 637 241 0.00876243199370406 0.0355237601901297 0.00881971465629053 0.0364385442893111 0.00181571427594477 0.00774771322990808 357181 1548153 622 665 0 True 642 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 243 287 0.00880923941135502 0.00868323245743106 0.00872816052491035 0.00868238345922026 0.00164915442523332 0.00158635425641826 359089 378422 622 665 0 False 243 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 288 287 0.00886566344730743 0.0086950495946894 0.00883497367818723 0.00866712443732357 0.00142597181525504 0.00140861428717366 361389 378937 622 665 0 False 288 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 330 287 0.00896523960466867 0.0781087073371229 0.00891126878767071 0.0800793469138628 0.00150469922493068 0.0180163990693586 365448 3404038 622 665 0 True 332 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 374 288 0.00884110672557336 0.0371864887671227 0.00886549172198062 0.0381475547417411 0.00139329678963823 0.00549614017897339 360388 1620616 622 665 0 True 376 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 419 287 0.00899168530499767 0.0628615484694799 0.00903334096284428 0.0635080491340505 0.00172768698457633 0.0104521439878892 366526 2739555 622 665 0 True 420 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 464 287 0.00893381386986213 0.0351709899605962 0.00883497367818723 0.0349736781872282 0.00176890343453984 0.00758214370416166 364167 1532779 622 665 0 True 465 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 507 285 0.00890864384338945 0.035241181461321 0.0089570458533608 0.0357824063477531 0.00168621883484965 0.00800804364907458 363141 1535838 622 665 0 True 509 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 551 286 0.00891686212688686 0.0404670178536293 0.00886549172198062 0.0419623102159152 0.00165838948844029 0.0070556284004421 363476 1763584 622 665 0 True 553 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 597 286 0.00870882915954927 0.00870762394656818 0.00881971465629053 0.00874341954680705 0.00197672237204185 0.00185064831747323 354996 379485 622 665 0 False 597 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 642 286 0.00883109759223919 0.00887733180513655 0.00880445563439384 0.00892652780956741 0.00199341141920244 0.00189414885753433 359980 386881 622 665 0 False 642 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 243 327 0.00889865924224482 0.0328156165189811 0.00900282291905089 0.0334172579537652 0.00141598340392833 0.00491170672007824 362734 1430130 622 665 0 True 243 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 287 326 0.00897782461790501 0.0419886750522449 0.00901808194094758 0.0443427176317998 0.00132119180090918 0.00918152363035413 365961 1829899 622 665 0 True 288 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 331 328 0.00879532965988327 0.0289785576323505 0.00874341954680705 0.0297245746547646 0.00131969494182152 0.00471362159052106 358522 1262908 622 665 0 True 332 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 376 330 0.00891099893358572 0.0254389005243711 0.00892652780956741 0.0274204623483635 0.00136632635406507 0.0059585924931879 363237 1108647 622 665 0 False 376 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 420 326 0.00903150104862844 0.0527454135453075 0.0089723048752575 0.0522011139085985 0.00179050719094052 0.00659701264567677 368149 2298686 622 665 0 True 420 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 465 329 0.00916632996236517 0.0251635038615077 0.00920119020370794 0.0265659571221485 0.0016893660537836 0.00600897234833768 373645 1096645 622 665 0 False 465 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 508 324 0.00933265820747707 0.0238259186533512 0.00933852140077821 0.0239719233997101 0.0018505295895077 0.00289990759527006 380425 1038352 622 665 0 True 509 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 552 324 0.00908260159944969 0.0412375869864636 0.00901808194094758 0.0414587624933242 0.00188091982501732 0.00691111250356196 370232 1797166 622 665 0 True 553 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 595 324 0.00900988818963971 0.0452404758749701 0.00914015411612116 0.0462958724345769 0.0020429814906875 0.0115892031053684 367268 1971615 622 665 0 True 597 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 640 323 0.00899009071267728 0.0496774552540656 0.00904859998474098 0.0507209887846189 0.00194185300760023 0.0127910017254118 366461 2164982 622 665 0 True 642 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 244 370 0.00876157336707 0.0288627267413211 0.00878919661249714 0.0301213092240787 0.00155969587610512 0.00531398997045668 357146 1257860 622 665 0 True 243 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 287 371 0.00878279371102602 0.0232388937553313 0.00877393759060044 0.0233463035019455 0.00140317942482879 0.0028753105174775 358011 1012769 622 665 0 True 288 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 330 369 0.00910215375451668 0.0581529355547257 0.00903334096284428 0.0589761196307317 0.00141624116258343 0.0116358150971778 371029 2534350 622 665 0 True 332 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 375 371 0.00901376427558775 0.046650570119508 0.00901808194094758 0.0469367513542382 0.0013706930063299 0.010196789043438 367426 2033068 622 665 0 True 376 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 419 369 0.0090982531363791 0.0335863462730986 0.00906385900663768 0.0345006485084306 0.0015880943914082 0.0053946982293708 370870 1463719 622 665 0 True 420 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 464 368 0.00952194858200265 0.0422691657043731 0.00926222629129473 0.0433203631647211 0.00279537590952152 0.00944084194638763 388141 1842123 622 665 0 True 465 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 509 369 0.00914211669128472 0.034210635308803 0.00921644922560464 0.034531166552224 0.00176520153857156 0.00422830930454826 372658 1490926 622 665 0 True 509 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 552 368 0.00926465497805964 0.0425595230924645 0.00930800335698482 0.0426031891355764 0.0017832383398557 0.00691229326290445 377653 1854777 622 665 0 True 553 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 596 368 0.00941523355748395 0.0342014340038698 0.00915541313801785 0.0350652323186084 0.00286714302618188 0.00615339467897043 383791 1490525 622 665 0 True 598 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 639 367 0.00908083528180249 0.0668160215140736 0.00912489509422446 0.066346227206836 0.00203644687432895 0.013874365645045 370160 2911894 622 665 0 True 642 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 243 414 0.0089287847710055 0.0296327910644086 0.00892652780956741 0.0301976043335622 0.00174443451392345 0.00535355178335532 363962 1291420 622 665 0 True 243 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 287 414 0.00905829019961107 0.0323498606897193 0.00914015411612116 0.0325322346837568 0.00146048081773343 0.00414204269828314 369241 1409832 622 665 0 True 288 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 333 414 0.00882474375514716 0.026482066920563 0.00880445563439384 0.0267643244068055 0.00135682046508352 0.00333942544994244 359721 1154109 622 665 0 True 332 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 376 414 0.00905696546137566 0.041508853387761 0.00907911802853437 0.0404516670481422 0.00151107279826932 0.00907531955004219 369187 1808988 622 665 0 True 376 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 420 414 0.00944128674278024 0.0720871531082226 0.00947585259784848 0.0720988784618906 0.00162138817510347 0.00880969495304226 384853 3141614 622 665 0 True 421 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 465 413 0.00930059463574237 0.0466398773312315 0.0093690394445716 0.0464637216754406 0.00172060457025517 0.00951517359067979 379118 2032602 622 665 0 True 465 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 508 412 0.00952719847056517 0.0402047232982892 0.00943007553215839 0.040665293354696 0.00212715008491633 0.00710816738317197 388355 1752153 622 665 0 True 509 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 552 412 0.00922106127723901 0.0274629122589032 0.00927748531319142 0.0275730525673304 0.00166933220306445 0.00333172939846529 375876 1196855 622 665 0 True 553 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 596 412 0.00916336156743028 0.0314842496490712 0.00921644922560464 0.0320897230487526 0.00197456533207446 0.00432078703567516 373524 1372108 622 665 0 True 598 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 640 414 0.00906903529863157 0.0557548368517999 0.00909437705043107 0.0547035934996567 0.00192442360710944 0.00770115259736538 369679 2429839 622 665 0 True 642 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 245 458 0.00893261179257445 0.0390732840340724 0.00900282291905089 0.0400244144350347 0.00163345700027955 0.00866122447616386 364118 1702844 622 665 0 True 244 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 290 458 0.00901690439584945 0.0384041357685814 0.00904859998474098 0.0386053253986419 0.00154950535021874 0.00404725906149291 367554 1673682 622 665 0 True 288 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 332 457 0.00905198542689812 0.0470840640167597 0.00915541313801785 0.0461127641718166 0.00157665966143296 0.00874639803071257 368984 2051960 622 665 0 True 332 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 376 458 0.00940164272447628 0.0634124335787971 0.00944533455405508 0.0619363698786908 0.00155489745668614 0.0102626024401951 383237 2763563 622 665 0 True 376 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 420 457 0.0093629799937541 0.0724663799576763 0.00930800335698482 0.0708476386663615 0.00195420757428603 0.0197837375747592 381661 3158141 622 665 0 True 421 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 465 456 0.009163484228378 0.0339377626946744 0.00906385900663768 0.0339360646982528 0.0020577173046008 0.00448200776475187 373529 1479034 622 665 0 True 465 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 509 459 0.00923516728622711 0.0290212140559685 0.00921644922560464 0.0305333028152895 0.00193554496681999 0.00575420947921512 376451 1264767 622 665 0 False 509 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 553 456 0.00945117321516668 0.0808535873903114 0.0093690394445716 0.0789959563591974 0.0019034616110684 0.0118738565145892 385256 3523662 622 665 0 True 553 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 597 455 0.00911061735990955 0.050962287843665 0.00920119020370794 0.0532997634851606 0.00194564861534039 0.0118206192750506 371374 2220976 622 665 0 True 598 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 642 456 0.00912568012428988 0.0651807821223923 0.00917067215991455 0.0629892423895628 0.00198270928570819 0.00993164095546172 371988 2840629 622 665 0 True 642 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 245 504 0.0088534709491038 0.0369331201659447 0.00883497367818723 0.0389410238803693 0.00156314364426668 0.0068822305690684 360892 1609574 622 665 0 True 244 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 289 501 0.00891369747443562 0.0763626622059842 0.00892652780956741 0.072480354009308 0.00149312613586242 0.016371125686004 363347 3327944 622 665 0 True 288 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 332 502 0.00908260159944969 0.0404745670539361 0.00907911802853437 0.0423285267414359 0.00163579290386176 0.00698280966822896 370232 1763913 622 665 0 True 332 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 376 501 0.00946248255454671 0.0429225501382204 0.009399557488365 0.043076218814374 0.00178269983762322 0.00497215079623775 385717 1870598 622 665 0 True 376 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 422 501 0.00923421053083488 0.0408147399856932 0.00930800335698482 0.0411535820553902 0.00194177602494833 0.00409931786098808 376412 1778738 622 665 0 True 421 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 465 500 0.00933057297136578 0.0477106705881206 0.00930800335698482 0.0477607385366598 0.0021469290763768 0.00840986482594393 380340 2079268 622 665 0 True 465 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 509 500 0.00939366976287431 0.0561608645096376 0.0093842984664683 0.0551613641565576 0.00213014116963112 0.0111691810297812 382912 2447534 622 665 0 True 509 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 553 499 0.00922577145763156 0.0440023840787595 0.00929274433508812 0.0455786984054322 0.00185142354884533 0.00827610376470184 376068 1917658 622 665 0 True 553 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 597 498 0.00927768157070778 0.0392945054327281 0.00932326237888151 0.0393682764934768 0.00194925315264911 0.00457297971376018 378184 1712485 622 665 0 True 598 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 642 497 0.00899745036954064 0.0535854399101439 0.00904859998474098 0.0544441901274128 0.00184443099135068 0.00936124800719071 366761 2335295 622 665 0 True 642 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 246 544 0.00874020582997672 0.0300943936862068 0.00877393759060044 0.0304722667277028 0.00138980425366517 0.00486099033030059 356275 1311537 622 665 0 True 244 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 288 543 0.00900495721954126 0.0371522075961247 0.0089570458533608 0.0375371938658732 0.00145241198925338 0.00590466568768099 367067 1619122 622 665 0 True 288 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 333 544 0.00909474503327424 0.0313167216507738 0.00904859998474098 0.0317235065232319 0.00146313333955322 0.00402389185682583 370727 1364807 622 665 0 True 332 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 377 543 0.00921198436710753 0.037105122614272 0.00929274433508812 0.0372014953841459 0.00156780467493841 0.00404627606752357 375506 1617070 622 665 0 True 376 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 422 543 0.00932215843035201 0.0678159578392078 0.0093842984664683 0.0658579385061418 0.0019397963586419 0.0117917292115296 379997 2955472 622 665 0 True 421 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 466 541 0.00918234948213774 0.0473314437386669 0.00923170824750134 0.0472877088578622 0.00200007516569765 0.00639210359365891 374298 2062741 622 665 0 True 465 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 509 541 0.00905949227689875 0.0430217452534977 0.00904859998474098 0.0428778515297169 0.00188883459185911 0.00544680823808731 369290 1874921 622 665 0 True 509 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 554 545 0.00944526095748645 0.0266966799007131 0.00927748531319142 0.0303807125963226 0.00211753943836271 0.00973576363074328 385015 1163462 622 665 0 False 554 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 597 538 0.00909658494749008 0.0387886860662758 0.00906385900663768 0.0385137712672618 0.00169000479924324 0.00536048136048836 370802 1690441 622 665 0 True 598 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 641 540 0.00894517227362125 0.041558990173993 0.00898756389715419 0.0409552147707332 0.00184755968480881 0.00567368809300682 364630 1811173 622 665 0 True 642 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 244 588 0.00847928146198112 0.00883426235536197 0.00845349813076982 0.00860608834973678 0.00131874742254625 0.00219478095588545 345639 385004 622 665 0 False 244 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 288 588 0.00861599935431277 0.00858038894443708 0.00862134737163348 0.00860608834973678 0.00144223845583867 0.0014117940536346 351212 373940 622 665 0 False 288 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 332 585 0.00894946540679154 0.050454724588996 0.0089417868314641 0.0496681162737469 0.00147328602297085 0.00651150706233782 364805 2198856 622 665 0 True 332 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 377 585 0.00897456183669559 0.0536818815177105 0.00900282291905089 0.0523537041275654 0.0014390412166042 0.0102385286429273 365828 2339498 622 665 0 True 377 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 421 588 0.00923705626482204 0.00911950280829104 0.00915541313801785 0.00921644922560464 0.0018686603574035 0.00177132708642276 376528 397435 622 665 0 False 421 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 465 588 0.00903748690287731 0.00889598681987643 0.00900282291905089 0.00889600976577401 0.00201068187554414 0.00179734977421004 368393 387694 622 665 0 False 465 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 509 588 0.00898928115042231 0.00880918248929717 0.00886549172198062 0.00883497367818723 0.00222759607044563 0.00211410933110885 366428 383911 622 665 0 False 509 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 554 588 0.00867934146771674 0.00873201543570531 0.00871290150301366 0.00880445563439384 0.00184841530810224 0.00170107338802035 353794 380548 622 665 0 False 554 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 598 588 0.0087510490577554 0.00882581826504921 0.00880445563439384 0.00888075074387732 0.00162732880668122 0.00157282886993398 356717 384636 622 665 0 False 598 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 642 588 0.00874611808765695 0.00862969967835588 0.00874341954680705 0.00862134737163348 0.00154501917599619 0.00149094886474716 356516 376089 622 665 0 False 642 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 244 635 0.00844378338371018 0.029903047846212 0.00845349813076982 0.0299534599832151 0.00129932456932727 0.00533514730221451 344192 1303198 622 665 0 True 244 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 288 631 0.0084737617193336 0.00846503991725709 0.00848401617456321 0.00845349813076982 0.00134483817330963 0.001333963383825 345414 368913 622 665 0 False 288 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 332 631 0.00840698509939339 0.00872999619671747 0.00836194399938964 0.00874341954680705 0.00139801217024696 0.00131755195499053 342692 380460 622 665 0 False 332 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 377 631 0.00856821064908003 0.00843596746501181 0.00859082932784009 0.00839246204318303 0.00128878214943216 0.00135523764504205 349264 367646 622 665 0 False 377 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 421 631 0.00899708238669747 0.00860510167614045 0.0089723048752575 0.00868238345922026 0.0016297734114905 0.00155593404413558 366746 375017 622 665 0 False 421 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 465 631 0.00870765161445113 0.00887707940026307 0.00865186541542687 0.00889600976577401 0.00188940857615786 0.00187389868966273 354948 386870 622 665 0 False 465 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 509 631 0.00856188134417754 0.00858325718163571 0.00860608834973678 0.00866712443732357 0.0017905700625774 0.00191579949381779 349006 374065 622 665 0 False 509 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 554 631 0.00864678725219115 0.00861811200007343 0.00868238345922026 0.00862134737163348 0.00173843196102929 0.00183065129945539 352467 375584 622 665 0 False 554 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 598 631 0.00867855643765132 0.00862497282345254 0.00871290150301366 0.00859082932784009 0.00140707210270684 0.00148252014077097 353762 375883 622 665 0 False 598 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 641 632 0.00874003410464991 0.0352559586193683 0.00869764248111696 0.0348058289463645 0.00136494655381227 0.00644814514013914 356268 1536482 622 665 0 True 642 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H12_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H12_2.csv new file mode 100755 index 0000000..fae9b81 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H12_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 242 243 0.00766684894083498 0.618181181954658 0.00708018616006714 0.627237354085603 0.00334281129443801 0.192684246180864 312522 26940815 622 665 0 True 243 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 287 244 0.00591218408366262 0.00558778498087746 0.00590524147402152 0.00556954299229419 0.00150235061090834 0.00140978737114166 240997 243520 622 665 0 False 287 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 330 243 0.00517467286938547 0.0053405429343558 0.00523384451056687 0.00531013962005036 0.00116527019136928 0.00114705200124632 210934 232745 622 665 0 True 332 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 373 243 0.00524343659667878 0.00517826954660627 0.00523384451056687 0.00517280842298009 0.00121181430625467 0.00116465710912996 213737 225673 622 665 0 True 376 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 419 244 0.005264215361223 0.00534506327618084 0.00527962157625696 0.00534065766384375 0.00138765004832902 0.00141396996980955 214584 232942 622 665 0 True 420 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 462 243 0.0053473549515894 0.00533134162942261 0.00541695277332723 0.00529488059815366 0.00152249026258139 0.00141891645378932 217973 232344 622 665 0 True 465 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 506 242 0.00560945686468314 0.00555185170525306 0.00564583810177768 0.00550850690470741 0.00161089025662232 0.00142652157373727 228657 241954 622 665 0 True 509 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 550 242 0.00558411511288364 0.00571983862150226 0.00549324788281071 0.00575265125505455 0.00145274184062392 0.00121391811478282 227624 249275 622 665 0 True 553 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 597 243 0.0063841098139307 0.00594087645297726 0.00621042191195544 0.00601205462729839 0.00230929827216199 0.00191844512981356 260234 258908 622 665 0 False 597 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 637 241 0.00781794269623973 0.66865887538714 0.00761425192645151 0.676646066987106 0.00234352526796945 0.196291735574645 318681 29140672 622 665 0 True 642 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 243 287 0.0056201774315141 0.00550240329594873 0.00564583810177768 0.00550850690470741 0.00160741846723046 0.00147493885189695 229094 239799 622 665 0 False 243 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 288 287 0.00524316674259379 0.00526899762567325 0.00527962157625696 0.00524910353246357 0.00128381103524346 0.00123827035899425 213726 229627 622 665 0 False 288 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 330 287 0.00526674217674608 0.00547142633420356 0.00527962157625696 0.00547798886091402 0.00118945301784207 0.00116735457966152 214687 238449 622 665 0 True 332 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 374 288 0.0052422345193911 0.00535086858827086 0.00527962157625696 0.00534065766384375 0.00122586115259564 0.0011537072218167 213688 233195 622 665 0 True 376 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 419 287 0.00529080825468927 0.0052195721622665 0.00531013962005036 0.00520332646677348 0.00148870167831625 0.00143648119968934 215668 227473 622 665 0 True 420 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 464 287 0.00539507006025351 0.00543329025241061 0.00550850690470741 0.00540169375143053 0.00162970046477091 0.00191983273590193 219918 236787 622 665 0 True 465 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 507 285 0.00540299395747639 0.0053357472417597 0.00535591668574044 0.00527962157625696 0.0015347145239767 0.00145106982354439 220241 232536 622 665 0 True 509 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 551 286 0.00566642060880553 0.00560889520665936 0.00563057907988098 0.00561532005798428 0.00145441713078779 0.00132585577336726 230979 244440 622 665 0 True 553 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 597 286 0.00572078394083621 0.00581169104955109 0.00573739223315786 0.00578316929884794 0.00191928579231155 0.00190669149624328 233195 253278 622 665 0 False 597 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 642 286 0.00617435959332499 0.00597256473754769 0.00617990386816205 0.00599679560540169 0.00171757284725027 0.00194717928975211 251684 260289 622 665 0 False 642 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 243 327 0.0052563405283792 0.00521716284301966 0.00523384451056687 0.00517280842298009 0.00144212002911744 0.00138389947151457 214263 227368 622 665 0 True 243 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 287 326 0.00538192080665764 0.00537071678968536 0.00537117570763714 0.00538643472953384 0.00129430908217215 0.00128761306992735 219382 234060 622 665 0 True 288 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 331 328 0.0052841600313227 0.00546770909879414 0.00532539864194705 0.00527962157625696 0.00123104266106312 0.0015841373093137 215397 238287 622 665 0 True 332 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 376 330 0.00548907741058814 0.00556206262968017 0.0055390249485008 0.0055542839703975 0.00127975800636478 0.001248373337949 223750 242399 622 665 0 False 376 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 420 326 0.00547833231156764 0.00565618670159032 0.00543221179522393 0.00567635614557107 0.00149543842672711 0.00148998153080778 223312 246501 622 665 0 True 420 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 465 329 0.0055607850006268 0.0057341568615978 0.00564583810177768 0.00572213321126116 0.00159020713880098 0.00151921292190883 226673 249899 622 665 0 False 465 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 508 324 0.00564061274540469 0.00551683626553222 0.00566109712367437 0.0055542839703975 0.00160583002647676 0.00151789380518716 229927 240428 622 665 0 True 509 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 552 324 0.00557498913837308 0.00562975302756777 0.00564583810177768 0.00563057907988098 0.00161711477437702 0.00141367644202093 227252 245349 622 665 0 True 553 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 595 324 0.00575262672286501 0.0058037288230877 0.00578316929884794 0.00581368734264134 0.00188089548656975 0.00212029555391336 234493 252931 622 665 0 True 597 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 640 323 0.00555541245111655 0.00552073706812235 0.00564583810177768 0.00547798886091402 0.00182303644247327 0.0018297610213418 226454 240598 622 665 0 True 642 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 244 370 0.00513414569225791 0.00513581963606659 0.00521858548867018 0.00508125429159991 0.00142277947018971 0.0014086909196783 209282 223823 622 665 0 True 243 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 287 371 0.00543292322872072 0.00527292137416097 0.00543221179522393 0.00526436255436027 0.00136041228083391 0.00126994607129748 221461 229798 622 665 0 True 288 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 330 369 0.00565734369867406 0.00567968330072148 0.00558480201419089 0.00566109712367437 0.00134870535014586 0.0012796715316501 230609 247525 622 665 0 True 332 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 375 371 0.00567483514981931 0.0056863146651247 0.00575265125505455 0.00564583810177768 0.00132458096292207 0.00132414615990719 231322 247814 622 665 0 True 376 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 419 369 0.00558620034899493 0.00566979361886061 0.00556954299229419 0.00575265125505455 0.00154917162269756 0.00148781026280372 227709 247094 622 665 0 True 420 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 464 368 0.00602042010393307 0.00590650349838891 0.00592050049591821 0.00588998245212482 0.00200404544418482 0.00172284964041197 245409 257410 622 665 0 True 465 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 509 369 0.00563622148347622 0.00564274040560316 0.00573739223315786 0.00560006103608759 0.00161317011639786 0.00166550585632962 229748 245915 622 665 0 True 509 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 552 368 0.00555367066565888 0.00623139446235181 0.0055390249485008 0.00611886778057527 0.00174967845126889 0.00226036238897114 226383 271569 622 665 0 True 553 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 596 368 0.00592503895098395 0.00579124625479928 0.00587472343022812 0.00576791027695125 0.00220088167820296 0.00206379251892045 241521 252387 622 665 0 True 598 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 639 367 0.00537326094374843 0.00547792002322125 0.00546272983901732 0.00547798886091402 0.00180016676332427 0.00177390466260525 219029 238732 622 665 0 True 642 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 243 414 0.00523894720599213 0.00517113337245609 0.00526436255436027 0.00517280842298009 0.00145636331023905 0.00147598172816969 213554 225362 622 665 0 True 243 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 287 414 0.00543954691989774 0.00546745669392066 0.00537117570763714 0.0055390249485008 0.00136734713542613 0.0013984594034107 221731 238276 622 665 0 True 288 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 333 414 0.00563705557792073 0.00564980774206058 0.00561532005798428 0.00566109712367437 0.0013311837694681 0.00126599183194857 229782 246223 622 665 0 True 332 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 376 414 0.00557528352464761 0.00592024809104473 0.00556954299229419 0.00592050049591821 0.00139922480429611 0.00138395419498443 227264 258009 622 665 0 True 376 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 420 414 0.00558894795422392 0.00573046257208597 0.00558480201419089 0.00572213321126116 0.00156274667180685 0.00149961388891667 227821 249738 622 665 0 True 421 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 465 413 0.00569968625782792 0.00584016690845906 0.00573739223315786 0.00587472343022812 0.00170017100600973 0.0015056489796956 232335 254519 622 665 0 True 465 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 508 412 0.00570856691044303 0.00573617610058564 0.00563057907988098 0.00572213321126116 0.00179463563591395 0.00168241311914746 232697 249987 622 665 0 True 509 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 552 412 0.00557000910389554 0.00569429983748568 0.00546272983901732 0.00567635614557107 0.00168379863247088 0.00149193458482374 227049 248162 622 665 0 True 553 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 596 412 0.00541962678198758 0.00541938503847167 0.00543221179522393 0.00546272983901732 0.00187128299004937 0.00197291675191029 220919 236181 622 665 0 True 598 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 640 414 0.00517933398539893 0.00536523272016159 0.00514229037918669 0.00524910353246357 0.00175763012249203 0.00183157113092079 211124 233821 622 665 0 True 642 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 245 458 0.00555354800471116 0.00536250215834849 0.0055390249485008 0.00537117570763714 0.00146334975859743 0.00148124575314359 226378 233702 622 665 0 True 244 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 290 458 0.00553752848493858 0.00570900815784024 0.0055390249485008 0.00570687418936446 0.00148665411867445 0.00151874348598162 225725 248803 622 665 0 True 288 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 332 457 0.00574693525489068 0.00566843981090286 0.00569161516746777 0.00575265125505455 0.0013750833768922 0.00150006434276378 234261 247035 622 665 0 True 332 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 376 458 0.00551537591777988 0.00579666148663029 0.00552376592660411 0.00578316929884794 0.00138446588612904 0.00137232189149308 224822 252623 622 665 0 True 376 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 420 457 0.00569244926191228 0.00572736487591145 0.00578316929884794 0.00573739223315786 0.00171876876160725 0.00176636204762102 232040 249603 622 665 0 True 421 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 465 456 0.0054599086372197 0.00574390886807313 0.00552376592660411 0.00575265125505455 0.00182351000560148 0.00184399414893743 222561 250324 622 665 0 True 465 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 509 459 0.005480736466143 0.00567142277758943 0.0055542839703975 0.00567635614557107 0.0017570483384192 0.00168839040100145 223410 247165 622 665 0 False 509 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 553 456 0.00543471407855747 0.00558932235601593 0.00535591668574044 0.00564583810177768 0.00169566863817842 0.00169201198669945 221534 243587 622 665 0 True 553 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 597 455 0.00533111464211093 0.00541927030898372 0.00537117570763714 0.00534065766384375 0.00174195997247018 0.00180719285458319 217311 236176 622 665 0 True 598 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 642 456 0.00525023201318262 0.00547135749651079 0.00517280842298009 0.00543221179522393 0.00178425000906506 0.00199351353237838 214014 238446 622 665 0 True 642 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 245 504 0.00534845890011891 0.00536367239912553 0.00540169375143053 0.00537117570763714 0.00141548580350051 0.00130720038802998 218018 233753 622 665 0 True 244 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 289 501 0.005533627866801 0.00548246331094387 0.00547798886091402 0.00543221179522393 0.00141724900900892 0.00137964951380738 225566 238930 622 665 0 True 288 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 332 502 0.0057569198560353 0.00560435191893673 0.00566109712367437 0.0055542839703975 0.00142440747822615 0.00147379215895475 234668 244242 622 665 0 True 332 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 376 501 0.00568258732171538 0.00560487967458128 0.00572213321126116 0.00558480201419089 0.00150141245544516 0.00145150390983798 231638 244265 622 665 0 True 376 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 422 501 0.00547008949588068 0.00557787235311901 0.00552376592660411 0.00563057907988098 0.00178506413473994 0.00174653110106741 222976 243088 622 665 0 True 421 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 465 500 0.00567073827416537 0.00571926497406253 0.00560006103608759 0.00576791027695125 0.00181969193156732 0.00165912125123911 231155 249250 622 665 0 True 465 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 509 500 0.00550806532529561 0.00532207148679664 0.00544747081712062 0.00535591668574044 0.00175701762143151 0.00161145689801496 224524 231940 622 665 0 True 509 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 553 499 0.00559120491566201 0.00554526623264501 0.00556954299229419 0.00546272983901732 0.00169661656388103 0.00158415438953746 227913 241667 622 665 0 True 553 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 597 498 0.00528585275240127 0.00543650267807307 0.00527962157625696 0.00544747081712062 0.00176922179946956 0.00178998973633844 215466 236927 622 665 0 True 598 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 642 497 0.00532915206694736 0.00556548156842094 0.00538643472953384 0.0055390249485008 0.00179933769822622 0.00191783286944574 217231 242548 622 665 0 True 642 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 246 544 0.00557214340438591 0.00548501030557625 0.00558480201419089 0.00552376592660411 0.00138392501016615 0.00142149042622645 227136 239041 622 665 0 True 244 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 288 543 0.0056820476135454 0.00554253567083192 0.00572213321126116 0.00550850690470741 0.00143923149844593 0.00140967327235907 231616 241548 622 665 0 True 288 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 333 544 0.00585907189329871 0.00580411890334672 0.00587472343022812 0.00582894636453803 0.0013791254596677 0.00133282861276755 238832 252948 622 665 0 True 332 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 377 543 0.00570086380292605 0.00563473228734459 0.00569161516746777 0.00567635614557107 0.0013408034621139 0.0013972259822781 232383 245566 622 665 0 True 376 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 422 543 0.00556674632268612 0.00592933466648998 0.00563057907988098 0.00582894636453803 0.00171490980175378 0.00209570855362527 226916 258405 622 665 0 True 421 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 466 541 0.00569173782841549 0.00587782112640264 0.00558480201419089 0.0059510185397116 0.00187534296717907 0.00193962449758966 232011 256160 622 665 0 True 465 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 509 541 0.00572272198381023 0.00570003631188293 0.00567635614557107 0.00572213321126116 0.00184614589596722 0.00185073950769119 233274 248412 622 665 0 True 509 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 554 545 0.00573979638773322 0.00573523531878449 0.00576791027695125 0.00566109712367437 0.00173170499282039 0.00203781892573656 233970 249946 622 665 0 False 554 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 597 538 0.00568317609426445 0.00551376151525529 0.00566109712367437 0.00558480201419089 0.0016690416221207 0.00150601202343966 231662 240294 622 665 0 True 598 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 641 540 0.00540851370012391 0.00550898876855678 0.00544747081712062 0.00544747081712062 0.00176142741891802 0.00180295504235044 220466 240086 622 665 0 True 642 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 244 588 0.00590543773153787 0.00606012628274738 0.00585946440833143 0.00593575951781491 0.00130037427673237 0.00161727782701348 240722 264105 622 665 0 False 244 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 288 588 0.0060288101127573 0.00578342170372142 0.0059510185397116 0.00581368734264134 0.00141354382169409 0.00134942752565715 245751 252046 622 665 0 False 288 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 332 585 0.00584508854525833 0.00593036723188149 0.00581368734264134 0.00599679560540169 0.00138887719556171 0.00136705925092046 238262 258450 622 665 0 True 332 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 377 585 0.00556350807366624 0.00549356912537696 0.00563057907988098 0.00550850690470741 0.00130695741055417 0.00127707072455841 226784 239414 622 665 0 True 377 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 421 588 0.00559142570536791 0.00556256743942713 0.00558480201419089 0.0055542839703975 0.00170935001400997 0.00169152794292487 227922 242421 622 665 0 False 421 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 465 588 0.00556014716369864 0.00576566157898752 0.0055390249485008 0.00578316929884794 0.00198275712839188 0.00167653268182521 226647 251272 622 665 0 False 465 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 509 588 0.00597250873775261 0.00582974947095365 0.00602731364919509 0.00573739223315786 0.00197520781202439 0.00204540568217611 243456 254065 622 665 0 False 509 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 554 588 0.00568999604295783 0.00584078644769397 0.00566109712367437 0.00584420538643473 0.00172780553917809 0.00172533751012854 231940 254546 622 665 0 False 554 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 598 588 0.00574357434492308 0.00575540476276523 0.00576791027695125 0.00576791027695125 0.00156607615519311 0.00152872700813621 234124 250825 622 665 0 False 598 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 642 588 0.0058701359107833 0.00569560775364825 0.00593575951781491 0.00570687418936446 0.00159689199004249 0.00143081693612728 239283 248219 622 665 0 False 642 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 244 635 0.00750049616353354 0.628820735748733 0.00704966811627375 0.603952086671244 0.00252114392334299 0.155032095296843 305741 27404495 622 665 0 True 244 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 288 631 0.00618468764512323 0.00629796051125754 0.00616464484626535 0.00616464484626535 0.00156466644184274 0.00165920433807369 252105 274470 622 665 0 False 288 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 332 631 0.00576923501518665 0.00571818651687585 0.00569161516746777 0.00582894636453803 0.00129214011870243 0.00127000034693741 235170 249203 622 665 0 False 332 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 377 631 0.00541219352855559 0.00544175728862096 0.00543221179522393 0.00547798886091402 0.00128727875988672 0.00124647838402374 220616 237156 622 665 0 False 377 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 421 631 0.00545402091172901 0.0052195721622665 0.00549324788281071 0.00518806744487678 0.00153678832507512 0.00142482836558275 222321 227473 622 665 0 False 421 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 465 631 0.00549560297300699 0.0057093064545089 0.0055390249485008 0.00566109712367437 0.00177818175100504 0.00177818343286882 224016 248816 622 665 0 False 465 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 509 631 0.00549705037219011 0.00545538715178883 0.00558480201419089 0.00538643472953384 0.0018545698182784 0.00179831311847047 224075 237750 622 665 0 False 509 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 554 631 0.00552477174637543 0.00555210411012654 0.00558480201419089 0.00556954299229419 0.0016849200575013 0.00169129965726315 225205 241965 622 665 0 False 554 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 598 631 0.00607814434593135 0.00593135390547782 0.005981536583505 0.00593575951781491 0.00153604513923396 0.00129751314885445 247762 258493 622 665 0 False 598 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 641 632 0.0072697954530568 0.713596557197526 0.00730907148851759 0.677256427862974 0.00159900892541428 0.170919691906574 296337 31099091 622 665 9 True 642 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H12_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H12_3.csv new file mode 100755 index 0000000..69c4756 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H12_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 242 243 0.00116886070303858 0.0619271915196552 0.000900282291905089 0.0627756160830091 0.000968839250979773 0.0197624664743127 47646 2698835 622 665 0 True 243 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 287 244 0.000935952095502833 0.00102889404789153 0.000762951094834821 0.000900282291905089 0.000722339314687311 0.00071406516592856 38152 44840 622 665 0 False 287 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 330 243 0.00094542152066702 0.000898308944712433 0.00080872816052491 0.000793469138628214 0.000681094342308476 0.000604297965211946 38538 39149 622 665 0 True 332 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 373 243 0.000906415339291221 0.000817654114687038 0.00080872816052491 0.000732433051041428 0.000636652314134966 0.000589121298942081 36948 35634 622 665 0 True 376 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 419 244 0.000835590908076169 0.000834817646083623 0.000671396963454643 0.000610360875867857 0.000735856822826278 0.000762422005334074 34061 36382 622 665 0 True 420 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 462 243 0.000886495201381064 0.000828002714499685 0.000686655985351339 0.000656137941557946 0.000825739872419817 0.000696380422181922 36136 36085 622 665 0 True 465 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 506 242 0.000915418652854063 0.000939634506270253 0.000701915007248035 0.000778210116731518 0.000843078517288179 0.000797964414551438 37315 40950 622 665 0 True 509 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 550 242 0.000971180319688775 0.00089186114748992 0.000747692072938125 0.000762951094834821 0.000849156719866279 0.000675978971757249 39588 38868 622 665 0 True 553 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 597 243 0.000937178704980059 0.000983231711689386 0.000610360875867857 0.000473029678797589 0.00097339439831067 0.00111368140050373 38202 42850 622 665 0 False 597 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 637 241 0.00105431991005518 0.0673497889837893 0.000717174029144732 0.0676585030899519 0.000993149611921191 0.0202267393438323 42977 2935156 622 665 0 True 642 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 243 287 0.000901852352035939 0.000977564074984899 0.000701915007248035 0.000778210116731518 0.000752021588947158 0.000822818283817548 36762 42603 622 665 0 False 243 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 288 287 0.000855903561019038 0.000919327386903973 0.000701915007248035 0.000778210116731518 0.000678436970899842 0.000695528960736643 34889 40065 622 665 0 False 288 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 330 287 0.000876363407099174 0.000942112663209867 0.000732433051041428 0.000823987182421607 0.000667962219507174 0.000698363252568702 35723 41058 622 665 0 True 332 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 374 288 0.000870696471314388 0.000848631076432211 0.000717174029144732 0.000671396963454643 0.000682063926602514 0.000661132464178409 35492 36984 622 665 0 True 376 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 419 287 0.000853769260528664 0.000870269057858654 0.00064087891966125 0.000671396963454643 0.000778500733571193 0.000753525733907464 34802 37927 622 665 0 True 420 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 464 287 0.00088019042866812 0.000942456851673702 0.000595101853971161 0.000610360875867857 0.000916681882942438 0.00101734494267322 35879 41073 622 665 0 True 465 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 507 285 0.0008838702570998 0.000878437797400345 0.00064087891966125 0.000686655985351339 0.000831469025411311 0.000816356574967873 36029 38283 622 665 0 True 509 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 551 286 0.000956240216256157 0.000991239829947953 0.000732433051041428 0.000823987182421607 0.000842278727360912 0.000796856792991123 38979 43199 622 665 0 True 553 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 597 286 0.000838951818043769 0.00090748730374804 0.000457770656900893 0.000534065766384375 0.000951380887727509 0.000972729562377496 34198 39549 622 665 0 False 597 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 642 286 0.000966592800243948 0.000813156718759591 0.000595101853971161 0.000366216525520714 0.000977273002174508 0.000939515089239527 39401 35438 622 665 0 False 642 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 243 327 0.0009035941374936 0.000816277360831697 0.000701915007248035 0.000625619897764553 0.000772469019143404 0.000713119508646983 36833 35574 622 665 0 True 243 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 287 326 0.000791310305948295 0.000890117259273154 0.000671396963454643 0.000778210116731518 0.000628903842715305 0.000676135748312835 32256 38792 622 665 0 True 288 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 331 328 0.000913357948932322 0.000846244703082953 0.000762951094834821 0.000732433051041428 0.000674920427203911 0.000621032962811837 37231 36880 622 665 0 True 332 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 376 330 0.000857841603993055 0.000890989203381537 0.000717174029144732 0.000793469138628214 0.00068831624219582 0.000673732949904737 34968 38830 622 665 0 False 376 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 420 326 0.000882447390106217 0.000887616156435951 0.00064087891966125 0.000595101853971161 0.000821454948332826 0.000822425338358353 35971 38683 622 665 0 True 420 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 465 329 0.000904207442232213 0.000906133495790288 0.000656137941557946 0.000686655985351339 0.000872005161957377 0.000831370981880607 36858 39490 622 665 0 False 465 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 508 324 0.000871285243863457 0.000961754351546066 0.000656137941557946 0.000823987182421607 0.000826597049407119 0.000852141902256817 35516 41914 622 665 0 True 509 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 552 324 0.000885587510367917 0.00094110304371595 0.000625619897764553 0.000823987182421607 0.000866010934302286 0.000723960474151238 36099 41014 622 665 0 True 553 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 595 324 0.000917258567069902 0.000904642012447002 0.000488288700694286 0.000289921416037232 0.000997868496426072 0.00111615263369209 37390 39425 622 665 0 True 597 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 640 323 0.000921895150893818 0.000874674670195746 0.000473029678797589 0.000442511635004196 0.00102019246094809 0.000947360667070206 37579 38119 622 665 0 True 642 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 244 370 0.000920398687331602 0.000886767158225158 0.000762951094834821 0.000717174029144732 0.000770252987945219 0.000789938939004307 37518 38646 622 665 0 True 243 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 287 371 0.000891033656446802 0.000927610855933608 0.000793469138628214 0.00080872816052491 0.000687543067861014 0.00071187124063988 36321 40426 622 665 0 True 288 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 330 369 0.000951824422138142 0.000878621364581057 0.000793469138628214 0.000762951094834821 0.000734150899866201 0.000655835558576834 38799 38291 622 665 0 True 332 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 375 371 0.000964458499753574 0.000873252024545227 0.000839246204318303 0.000686655985351339 0.000709533481042586 0.000726106422400119 39314 38057 622 665 0 True 376 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 419 369 0.000885440317230649 0.000827589688343083 0.000671396963454643 0.000534065766384375 0.000805940232683527 0.000767079350777141 36093 36067 622 665 0 True 420 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 464 368 0.00099011917001715 0.000968225094666169 0.000671396963454643 0.000564583810177768 0.000940722823874183 0.000988763223376826 40360 42196 622 665 0 True 465 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 509 369 0.00090489434353946 0.000982176200400291 0.000564583810177768 0.000610360875867857 0.000897591617306054 0.000945801083321134 36886 42804 622 665 0 True 509 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 552 368 0.000923416146645579 0.000906248225278233 0.000625619897764553 0.000625619897764553 0.000907251015504027 0.000870270791489156 37641 39495 622 665 0 True 553 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 596 368 0.000884213707753423 0.000923021676415805 0.0004272526131075 0.000442511635004196 0.00103724927522028 0.00110891392672598 36043 40226 622 665 0 True 598 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 639 367 0.000925942962168665 0.00089980042805572 0.000549324788281071 0.000488288700694286 0.000994755792258635 0.000989923951672628 37744 39214 622 665 0 True 642 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 243 414 0.000886249879485619 0.000938372481902857 0.000717174029144732 0.000793469138628214 0.000815634334819301 0.000772781629526561 36126 40895 622 665 0 True 243 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 287 414 0.000901827819846394 0.000875294209430649 0.000762951094834821 0.000732433051041428 0.000743355981491302 0.000742362427726033 36761 38146 622 665 0 True 288 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 333 414 0.00089449269517258 0.000877267556623305 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.000718090648860571 0.000669827037803189 36462 38232 622 665 0 True 332 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 376 414 0.000856958445169452 0.000929607149023853 0.000701915007248035 0.000717174029144732 0.000736997638823949 0.000779526128622937 34932 40513 622 665 0 True 376 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 420 414 0.000877001244027332 0.000870452625039366 0.000671396963454643 0.000595101853971161 0.000801229381093269 0.000792584930307024 35749 37935 622 665 0 True 421 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 465 413 0.000907470223441636 0.000879034390737659 0.000686655985351339 0.00064087891966125 0.000836100406622709 0.000820866273521778 36991 38309 622 665 0 True 465 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 508 412 0.000905409519519895 0.000934288112132012 0.000656137941557946 0.000671396963454643 0.000869900837204207 0.000900539765839675 36907 40717 622 665 0 True 509 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 552 412 0.000918264386841228 0.000870314949653832 0.000656137941557946 0.000671396963454643 0.000881956761327653 0.000779445545154283 37431 37929 622 665 0 True 553 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 596 412 0.00102125051854916 0.000833234379149981 0.000701915007248035 0.000289921416037232 0.0010345434597637 0.000992023816367115 41629 36313 622 665 0 True 598 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 640 414 0.000812972229316114 0.000880250523309877 0.000442511635004196 0.000534065766384375 0.000912254413714637 0.000909971260356604 33139 38362 622 665 0 True 642 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 245 458 0.000887819939616469 0.000866597714244412 0.000656137941557946 0.000732433051041428 0.000798062963599846 0.000689754939503393 36190 37767 622 665 0 True 244 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 290 458 0.000876878583079609 0.000981051851418429 0.000701915007248035 0.000854505226215 0.000811905270221918 0.000822503673611268 35744 42755 622 665 0 True 288 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 332 457 0.000837676144187453 0.000917491715096852 0.000686655985351339 0.000747692072938125 0.000776283497813976 0.000779507308929592 34146 39985 622 665 0 True 332 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 376 458 0.000836866581932484 0.00090305874551336 0.000671396963454643 0.000747692072938125 0.000736047708003109 0.000762503744344994 34113 39356 622 665 0 True 376 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 420 457 0.000871530565758902 0.000904389607573523 0.000610360875867857 0.000564583810177768 0.000867252671475297 0.000924126580004815 35526 39414 622 665 0 True 421 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 465 456 0.000882226600400316 0.000949157053769695 0.000442511635004196 0.000518806744487678 0.000994235620321811 0.00104715285671089 35962 41365 622 665 0 True 465 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 509 459 0.000945053537823853 0.000856639194690778 0.000564583810177768 0.000457770656900893 0.000954131286867157 0.000937071836951132 38523 37333 622 665 0 False 509 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 553 456 0.000874400831935612 0.000848378671558732 0.000534065766384375 0.000442511635004196 0.00094343027963379 0.00096666462166691 35643 36973 622 665 0 True 553 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 597 455 0.000926924249750446 0.000891815255694742 0.000503547722590982 0.000457770656900893 0.000997767156088876 0.000984354181361983 37784 38866 622 665 0 True 598 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 642 456 0.00089400205138169 0.000981051851418429 0.000457770656900893 0.000579842832074464 0.000986741140796004 0.00105663006689629 36442 42755 622 665 0 True 642 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 245 504 0.00102792327410527 0.000970840926991317 0.000900282291905089 0.000839246204318303 0.000768382850184971 0.000763829878979321 41901 42310 622 665 0 True 244 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 289 501 0.00102394905939905 0.000929928391590099 0.000900282291905089 0.000762951094834821 0.000809824008657474 0.000794277531896268 41739 40527 622 665 0 True 288 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 332 502 0.000966421074917136 0.000795098297357034 0.00080872816052491 0.000610360875867857 0.000810419678199739 0.000749522792025654 39394 34651 622 665 0 True 332 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 376 501 0.000938577039784097 0.000773827450292015 0.000778210116731518 0.000595101853971161 0.00082302656025173 0.000731092391070633 38259 33724 622 665 0 True 376 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 422 501 0.000888923888145972 0.000924788510530159 0.000579842832074464 0.000625619897764553 0.000956101130610272 0.00091996202468115 36235 40303 622 665 0 True 421 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 465 500 0.000908991219193396 0.00092827628696369 0.000473029678797589 0.000564583810177768 0.00100914261772373 0.000970422452443755 37053 40455 622 665 0 True 465 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 509 500 0.00091892675595893 0.00103066088200588 0.000579842832074464 0.000686655985351339 0.000953851332895435 0.000967235859092994 37458 44917 622 665 0 True 509 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 553 499 0.000833579268533517 0.000902026180121854 0.000564583810177768 0.000671396963454643 0.000839548834735805 0.000856975574337887 33979 39311 622 665 0 True 553 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 597 498 0.00102456236413767 0.00091939622459674 0.000656137941557946 0.000518806744487678 0.0010040397069748 0.000957488356261549 41764 40068 622 665 0 True 598 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 642 497 0.000906587064618033 0.000891333391845372 0.000518806744487678 0.000442511635004196 0.00098654274504922 0.00100309618348458 36955 38845 622 665 0 True 642 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 246 544 0.000967942070668897 0.000815933172367862 0.000839246204318303 0.00064087891966125 0.000759314311843688 0.000706131306586314 39456 35559 622 665 0 True 244 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 288 543 0.000928224455796306 0.000905376281169851 0.000747692072938125 0.000778210116731518 0.000768687546960848 0.000731570132801137 37837 39457 622 665 0 True 288 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 333 544 0.000886495201381064 0.000912351834036912 0.000747692072938125 0.000793469138628214 0.000725197681280913 0.000714516889546833 36136 39761 622 665 0 True 332 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 377 543 0.000859239938797094 0.000921713760253231 0.000671396963454643 0.000778210116731518 0.000767109526419915 0.000718944825245678 35025 40169 622 665 0 True 376 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 422 543 0.000896013690924341 0.0010032634802846 0.000579842832074464 0.000671396963454643 0.000943311585211447 0.00101916893939809 36524 43723 622 665 0 True 421 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 466 541 0.000914118446808203 0.000950006051980489 0.000488288700694286 0.000518806744487678 0.00103237247771372 0.00104871550535948 37262 41402 622 665 0 True 465 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 509 541 0.00086539751837277 0.000963176997196585 0.000488288700694286 0.000503547722590982 0.000961090760236087 0.00105514604543291 35276 41976 622 665 0 True 509 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 554 545 0.00091399578586048 0.000846152919492597 0.000518806744487678 0.000457770656900893 0.000937851490386163 0.000942278452823629 37257 36876 622 665 0 False 554 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 597 538 0.000884041982426611 0.00087318318685246 0.000595101853971161 0.00064087891966125 0.000863681683825805 0.000803290887313019 36036 38054 622 665 0 True 598 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 641 540 0.000873345947785197 0.000944131902197701 0.000503547722590982 0.000503547722590982 0.000934621069979266 0.00105607315292152 35600 41146 622 665 0 True 642 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 244 588 0.000915933828834498 0.000885849322321597 0.00080872816052491 0.000793469138628214 0.000668252711253383 0.000631103178063754 37336 38606 622 665 0 False 244 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 288 588 0.000953369950079448 0.000933668572897109 0.000869764248111696 0.000747692072938125 0.000728708289312813 0.000769885839248792 38862 40690 622 665 0 False 288 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 332 585 0.000920349622952513 0.000907441411952862 0.000793469138628214 0.000793469138628214 0.000777800715421246 0.00073431306660782 37516 39547 622 665 0 True 332 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 377 585 0.000873664866249276 0.000858176569829242 0.000717174029144732 0.000762951094834821 0.000710887730893739 0.000621882686497265 35613 37400 622 665 0 True 377 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 421 588 0.000825311920657011 0.000823528264469826 0.000534065766384375 0.000503547722590982 0.000863132774148912 0.000854920486726846 33642 35890 622 665 0 False 421 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 465 588 0.00086929813651035 0.000936100838041545 0.000396734569314107 0.000503547722590982 0.000976311041240348 0.000969952744420778 35435 40796 622 665 0 False 465 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 509 588 0.00090229393144774 0.00086430312448551 0.000335698481727321 0.000259403372243839 0.00105064148474672 0.00110915207165748 36780 37667 622 665 0 False 509 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 554 588 0.000898810360532417 0.000882430383580834 0.000534065766384375 0.000564583810177768 0.000955602169922975 0.00089648486500456 36638 38457 622 665 0 False 554 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 598 588 0.000932910103999311 0.000873619158906651 0.000625619897764553 0.000610360875867857 0.000873163300317151 0.000799536654491492 38028 38073 622 665 0 False 598 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 642 588 0.000894517227362125 0.000893673873399452 0.000686655985351339 0.000671396963454643 0.00078075494981256 0.000784534642876154 36463 38947 622 665 0 False 642 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 244 635 0.00112327989486485 0.06308710664278 0.00100709544518196 0.0608224612802319 0.000741461318866834 0.0157617908864596 45788 2749385 622 665 0 True 244 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 288 631 0.00106236646822579 0.000991056262767241 0.000946059357595178 0.000869764248111696 0.000721284755702934 0.000720775611006006 43305 43191 622 665 0 False 288 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 332 631 0.000898908489290595 0.000860608834973678 0.000793469138628214 0.000732433051041428 0.0006887225632018 0.00067925830441207 36642 37506 622 665 0 False 332 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 377 631 0.000929009485861731 0.000834634078902911 0.00080872816052491 0.000701915007248035 0.000672549108362535 0.000673630537496351 37869 36374 622 665 0 False 377 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 421 631 0.000957638551060195 0.000838190693029208 0.000762951094834821 0.000656137941557946 0.000842903306611457 0.000729898118613332 39036 36529 622 665 0 False 421 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 465 631 0.000963084697139081 0.000844867949227612 0.000656137941557946 0.000457770656900893 0.000965546853054401 0.000940519232659289 39258 36820 622 665 0 False 465 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 509 631 0.00091556584599133 0.000899983995236432 0.000488288700694286 0.000518806744487678 0.000999607030880127 0.000928462512911345 37321 39222 622 665 0 False 509 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 554 631 0.00094156996690853 0.000899616860875007 0.000625619897764553 0.000549324788281071 0.000927917795887265 0.000919634076838851 38381 39206 622 665 0 False 554 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 598 631 0.000880705604648556 0.000962190323600257 0.000671396963454643 0.00080872816052491 0.00075658200700045 0.000742770800188576 35900 41933 622 665 0 False 598 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 641 632 0.00093636914272509 0.0727092393377585 0.000823987182421607 0.0686655985351339 0.000742921654368402 0.0197511287480957 38169 3168725 622 665 0 True 642 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H1_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H1_1.csv new file mode 100755 index 0000000..84f955a --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H1_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 262 284 0.00849027188289707 0.0375799191271839 0.00856031128404669 0.0369726100556954 0.00151880402917834 0.00787213664076107 346087 1637762 622 665 0 True 263 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 307 283 0.00844361165838337 0.0084815380176236 0.00846875715266651 0.00845349813076982 0.00135493182986443 0.00132816213725739 344185 369632 622 665 0 False 307 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 351 284 0.00873213473961657 0.0556529341206071 0.00877393759060044 0.0572671091783017 0.00139483331171205 0.00862547829339648 355946 2425398 622 665 0 True 351 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 394 284 0.00961237423266378 0.0813269153657777 0.00889600976577401 0.0767986572060731 0.00662617061208012 0.0185898129178096 391827 3544290 622 665 0 True 395 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 438 283 0.0086447756126485 0.064026419906484 0.00868238345922026 0.0629129472800793 0.00173653565452806 0.0127267324072536 352385 2790321 622 665 0 True 440 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 482 283 0.00850506479319242 0.0556605062668115 0.00849927519645991 0.0601815823605707 0.0017168932211918 0.0155212974320399 346690 2425728 622 665 0 True 484 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 526 281 0.00842793558926442 0.0701294091259277 0.00854505226215 0.0718394750896467 0.00165641119483206 0.0224039308998387 343546 3056294 622 665 0 True 528 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 571 281 0.00839125996589535 0.0618996564425483 0.00842298008697642 0.0643778133821622 0.00177836657062368 0.015160398393289 342051 2697635 622 665 0 True 573 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 617 282 0.00815342038826115 0.00810972269309116 0.00817883573662928 0.00813305867093919 0.00189731008744717 0.00187526200474925 332356 353428 622 665 0 False 617 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 658 282 0.00807849908139216 0.0350391428330497 0.00814831769283589 0.0348058289463645 0.00197780739284749 0.00751994592471279 329302 1527033 622 665 0 True 661 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 263 327 0.00849849016639448 0.00854491458676446 0.00856031128404669 0.0085145342183566 0.00143107454128935 0.00152321997469453 346422 372394 622 665 0 False 263 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 307 326 0.00850180201198299 0.00852586949176558 0.00854505226215 0.00854505226215 0.00135713005175006 0.00123124939937232 346557 371564 622 665 0 False 307 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 351 327 0.00876961992524061 0.124173950555033 0.00874341954680705 0.117479209582666 0.00136422931241254 0.0482063712247616 357474 5411597 622 665 0 True 351 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 394 327 0.00945882725830458 0.0457694017602945 0.00914015411612116 0.0456702525368124 0.00428352044043002 0.00863192075896963 385568 1994666 622 665 0 True 396 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 439 326 0.00893013404143045 0.104793914289041 0.0089570458533608 0.105806057831693 0.00175147983573145 0.0282434100551704 364017 4567000 622 665 0 True 440 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 483 327 0.00882349261348039 0.0360158349639262 0.00874341954680705 0.0365148393987945 0.00171262904803479 0.00701508809796948 359670 1569598 622 665 0 True 484 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 527 326 0.00856217573045208 0.0368195609187767 0.0085145342183566 0.0374303807125963 0.00195280314758944 0.00824848358075324 349018 1604625 622 665 0 True 529 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 571 325 0.00845852722962645 0.0420690545314993 0.00849927519645991 0.0435034714274815 0.00182609881954756 0.00789439200543345 344793 1833402 622 665 0 True 573 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 617 326 0.0083771294247177 0.00837222376150952 0.00822461280231937 0.00837720302128634 0.00218713250857461 0.00201342155083706 341475 364868 622 665 0 False 617 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 661 326 0.00832831036752409 0.00820393854859167 0.00827038986800946 0.00830090791180285 0.00206568230603468 0.00178658764452535 339485 357534 622 665 0 False 661 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 263 366 0.00870061087605185 0.0417664669799929 0.00865186541542687 0.0422827496757458 0.00149610059723021 0.00727114894827594 354661 1820215 622 665 0 True 263 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 307 366 0.00879797913635408 0.0539549147531222 0.00875867856870375 0.0572671091783017 0.00139437111381642 0.0145123999802325 358630 2351397 622 665 0 True 307 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 351 369 0.00857054120708676 0.0284943074096319 0.00856031128404669 0.0309910734721904 0.00138720237029936 0.00905623265660531 349359 1241804 622 665 0 False 351 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 395 366 0.0087839957883137 0.0306301574490128 0.00874341954680705 0.030106050202182 0.00146541257513203 0.00612665886817137 358060 1334886 622 665 0 True 396 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 439 365 0.00922280306269667 0.0650807150630066 0.00915541313801785 0.0625925078202487 0.00189121289978725 0.011957625469352 375947 2836268 622 665 0 True 440 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 484 369 0.00871621334860217 0.0270647320980409 0.00872816052491035 0.0280155642023346 0.00170951785385198 0.00777432588868305 355297 1179502 622 665 0 False 484 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 527 365 0.00864357353536082 0.0243274471369543 0.00874341954680705 0.024429694056611 0.00163196640380912 0.0037175598753224 352336 1060209 622 665 0 True 529 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 571 363 0.00873895468830995 0.0430537318347368 0.00868238345922026 0.044281681544213 0.00198856727801557 0.00908121937484813 356224 1876315 622 665 0 True 573 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 615 363 0.00833147501997534 0.0493155066654964 0.00840772106507973 0.0508125429159991 0.00200343491335185 0.0113223259876471 339614 2149208 622 665 0 True 617 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 660 362 0.00811414435280036 0.0522120591017484 0.00822461280231937 0.0527962157625696 0.00194215654030178 0.0141676074156532 330755 2275442 622 665 0 True 662 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 264 410 0.00862588582669922 0.0376334748521567 0.00856031128404669 0.0385290302891585 0.00173694725549438 0.00874358964085818 351615 1640096 622 665 0 True 263 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 307 410 0.00918465550795493 0.0259295985443123 0.00888075074387732 0.0261997405966278 0.0024524191929557 0.00315589575468384 374392 1130032 622 665 0 True 307 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 351 409 0.00884792667426674 0.0807847038057492 0.00875867856870375 0.08032349126421 0.00138561614023041 0.0206388407300006 360666 3520660 622 665 0 True 351 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 395 409 0.00893234193848946 0.0600749757203721 0.00903334096284428 0.0587014572365911 0.00158596337714601 0.0139019712505013 364107 2618114 622 665 0 True 396 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 440 408 0.00924890531237205 0.0392764011195303 0.00920119020370794 0.0404364080262455 0.00158366657619301 0.00693847178806332 377011 1711696 622 665 0 True 440 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 484 407 0.00893454983554847 0.0477517437448049 0.0089570458533608 0.0469825284199283 0.00172218874549831 0.0118086560424278 364197 2081058 622 665 0 True 484 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 528 406 0.00878453549648368 0.0374658780161665 0.00878919661249714 0.0381475547417411 0.00166599804556449 0.0075756724297826 358082 1632792 622 665 0 True 529 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 572 407 0.0085237337894358 0.0503446531182614 0.00863660639353018 0.0504921034561685 0.00175289761939185 0.00900561893927586 347451 2194059 622 665 0 True 573 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 617 407 0.00854691670855538 0.0367500807408771 0.00863660639353018 0.0371099412527657 0.001910641916684 0.00689590150544383 348396 1601597 622 665 0 True 617 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 659 406 0.0083565223855003 0.0816815442130159 0.00836194399938964 0.0791332875562676 0.0018900145507043 0.0197971854660475 340635 3559745 622 665 0 True 662 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 263 453 0.00869543458405795 0.0427923780611979 0.00869764248111696 0.0437933928435187 0.00163409074175464 0.00685498146875673 354450 1864925 622 665 0 True 263 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 306 453 0.00880232133390346 0.0537245149954309 0.00875867856870375 0.0532234683756771 0.00163236025605214 0.0108304693081639 358807 2341356 622 665 0 True 307 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 351 453 0.00877563031167902 0.0309074586213761 0.00885023270008392 0.0314793621728847 0.00142749232752211 0.0039768628256486 357719 1346971 622 665 0 True 352 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 395 453 0.00903765862820412 0.0464125064320219 0.00898756389715419 0.0468146791790646 0.00159068000212125 0.00786540300309381 368400 2022693 622 665 0 True 396 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 439 453 0.00940728512807152 0.0956040593587425 0.0093842984664683 0.0970016021972992 0.00212354940538532 0.0154319147122612 383467 4166499 622 665 0 True 440 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 483 451 0.00903177090271343 0.0580071143755475 0.00910963607232776 0.0570077058060578 0.00185155633860619 0.0160253842707681 368160 2527995 622 665 0 True 485 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 528 451 0.00874047568406171 0.0465555282116943 0.00868238345922026 0.0462958724345769 0.00172403204379399 0.00778651013827716 356286 2028926 622 665 0 True 529 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 573 455 0.00917783555926155 0.0253154286494446 0.00912489509422446 0.0268711375600824 0.00232269007330342 0.00644276775779222 374114 1103266 622 665 0 False 573 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 617 450 0.00858420563666306 0.0336301040998009 0.00868238345922026 0.0340428778515297 0.00179825549707246 0.0046749776376213 349916 1465626 622 665 0 True 617 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 659 450 0.00849692010626363 0.062517956598982 0.00859082932784009 0.0640421149004349 0.00182300180023817 0.0116874162882265 346358 2724581 622 665 0 True 662 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 263 497 0.00856094912097485 0.0530653940871864 0.00863660639353018 0.0551461051346609 0.00150839133172878 0.0131780874728686 348968 2312631 622 665 0 True 263 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 308 497 0.00871398091935362 0.0522990469995084 0.00869764248111696 0.0523079270618753 0.00157553689851211 0.00670571926432254 355206 2279233 622 665 0 True 307 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 352 497 0.00950323052138017 0.067578995554806 0.00920119020370794 0.0666819256885634 0.00252371645322482 0.0154794963157154 387378 2945145 622 665 0 True 352 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 396 496 0.0103569507175297 0.0867624313702544 0.00955214770733196 0.0850537880521859 0.00351500124654121 0.0175436053840914 422178 3781174 622 665 0 True 396 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 440 496 0.00925859552724214 0.0968660148884457 0.00930800335698482 0.0928206301976043 0.00202933396064998 0.0269405103005983 377406 4221496 622 665 0 True 440 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 486 495 0.00902806654209221 0.0393979455390594 0.00903334096284428 0.0395208667124437 0.0017488905972496 0.00619507763193671 368009 1716993 622 665 0 True 485 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 529 494 0.00874182495448666 0.0387101652047262 0.00880445563439384 0.0388342107270924 0.001625459266615 0.00867253569498365 356341 1687019 622 665 0 True 529 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 572 494 0.00871231273046459 0.130868737419195 0.00877393759060044 0.126863508049134 0.00179414390123543 0.0385266062675855 355138 5703361 622 665 0 True 573 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 617 495 0.00877800993406483 0.0626069637357298 0.00889600976577401 0.0625619897764553 0.00181144042231583 0.0189998877068523 357816 2728460 622 665 0 True 618 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 661 494 0.00860076486460562 0.0783084284297376 0.00869764248111696 0.0767986572060731 0.00177628399319348 0.0141983932659577 350591 3412742 622 665 0 True 662 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 264 541 0.0085484131721176 0.0485007896257008 0.00862134737163348 0.0490424963759823 0.00139196022764231 0.0107428899173791 348457 2113702 622 665 0 True 263 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 308 540 0.00881183982344674 0.106392027218424 0.00886549172198062 0.102647440299077 0.00149209689156718 0.023783896543999 359195 4636647 622 665 0 True 307 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 353 541 0.00893771448799971 0.0526028047917918 0.0089723048752575 0.0538490882734417 0.00164171536806139 0.0122777335593674 364326 2292471 622 665 0 True 352 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 397 540 0.00921848539733684 0.0576341747020332 0.00920119020370794 0.0577096208133059 0.00168796387196864 0.0096268313043224 375771 2511742 622 665 0 True 396 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 441 539 0.00926195643720974 0.0531787697671737 0.00912489509422446 0.0536507209887846 0.00202029821280596 0.00633723836966939 377543 2317572 622 665 0 True 440 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 486 537 0.0089097723241085 0.0603627631679336 0.00886549172198062 0.0596932936598764 0.00181322515006219 0.0117015889282833 363187 2630656 622 665 0 True 485 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 529 536 0.00863091492555584 0.0705984232726472 0.0085297932402533 0.0704356450751507 0.00187452643504575 0.0153548034164186 351820 3076734 622 665 0 True 529 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 574 536 0.00922263133736986 0.0512379139655043 0.00880445563439384 0.051621271076524 0.00420632818304038 0.010741061639695 375940 2232988 622 665 0 True 573 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 618 535 0.00892839225597279 0.0459977134413053 0.00869764248111696 0.0438086518654154 0.00265814883864602 0.0099861892459588 363946 2004616 622 665 0 True 618 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 662 535 0.0084784473675366 0.0600893398522628 0.00857557030594339 0.0623178454261082 0.00192446647214482 0.0101284315144024 345605 2618740 622 665 0 True 662 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 265 581 0.00832541556915784 0.0438216621893484 0.00840772106507973 0.0435187304493782 0.00137911391137061 0.010461571977468 339367 1909782 622 665 0 True 263 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 309 580 0.00852245811557949 0.0555619077448715 0.00848401617456321 0.055542839703975 0.00163451864017009 0.0130252419505755 347399 2421431 622 665 0 True 308 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 353 580 0.00873161956363613 0.0446406701119932 0.00869764248111696 0.0433813992523079 0.00158410901442212 0.00946591918527777 355925 1945475 622 665 0 True 352 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 397 580 0.00885722437410411 0.0512619153743824 0.00881971465629053 0.0502327000839246 0.00151878824957047 0.00876258163097299 361045 2234034 622 665 0 True 396 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 441 585 0.0127914270791705 0.0704673792515163 0.00958266575112535 0.0779278248264286 0.0114900626946706 0.0386997249464222 521414 3071023 622 665 0 False 441 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 485 585 0.0119596386604738 0.0479381791627157 0.00929274433508812 0.0579232471198596 0.00988532000654658 0.0244570352847801 487508 2089183 622 665 0 False 485 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 529 585 0.012572943399087 0.0531693848950598 0.00915541313801785 0.0552224002441443 0.0119956538497023 0.0349716311016759 512508 2317163 622 665 0 False 529 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 573 585 0.00971759279362026 0.0255261408270046 0.00871290150301366 0.0276035706111238 0.00444690947029751 0.0132964030996606 396116 1112449 622 665 0 False 573 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 618 585 0.0112413852149891 0.0316915428878904 0.00898756389715419 0.0370794232089723 0.00743718769958734 0.016616124744732 458230 1381142 622 665 0 False 618 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 662 584 0.0120380926026372 0.0435601248486288 0.00885023270008392 0.0461280231937133 0.0104780882512949 0.0313393484930853 490706 1898384 622 665 0 False 662 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 263 629 0.00819708768565041 0.00820942261811544 0.00802624551766232 0.00816357671473259 0.00172727498666102 0.00142041532931958 334136 357773 622 665 0 False 263 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 308 628 0.00846107857733908 0.0110998714456088 0.00823987182421607 0.00868238345922026 0.00236277497946335 0.00752556748624928 344897 483741 622 665 0 False 308 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 352 628 0.0122664136907281 0.0547892046435613 0.00885023270008392 0.06323338673991 0.0108002857445582 0.0280239766108521 500013 2387756 622 665 0 False 352 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 396 628 0.0129924683724879 0.0580950430551086 0.00918593118181125 0.0638437476157778 0.0125120954364383 0.0355616106821813 529609 2531827 622 665 0 False 396 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 441 628 0.00855241191901335 0.00843500373731307 0.0085297932402533 0.00849927519645991 0.00177718784657496 0.00176098892297469 348620 367604 622 665 0 False 441 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 485 628 0.0084152524472699 0.00832890190686146 0.00849927519645991 0.00836194399938964 0.00192888188400459 0.00181304336582117 343029 362980 622 665 0 False 485 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 529 628 0.00818720121326397 0.00816034134317254 0.00817883573662928 0.00813305867093919 0.00191115294470093 0.00181296991169398 333733 355634 622 665 0 False 529 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 574 628 0.00802938563792402 0.00811630816569921 0.00802624551766232 0.00813305867093919 0.00173101432085071 0.00163031236650828 327300 353715 622 665 0 False 574 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 618 628 0.00785295013071977 0.00821621460380179 0.00787365529869535 0.00825513084611276 0.00144796827708889 0.00133010704346536 320108 358069 622 665 0 False 618 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 662 628 0.00813516843924002 0.008239596473445 0.00802624551766232 0.00827038986800946 0.00145536305528157 0.00151336395335101 331612 359088 622 665 0 False 662 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 265 675 0.00811696555459798 0.0350418963407603 0.0081025406271458 0.0343175402456703 0.00131202000190562 0.00766786374462046 330870 1527153 622 665 0 True 263 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 308 672 0.0080917955281253 0.00784568424953434 0.0080872816052491 0.00784313725490196 0.00119795072842922 0.0012630688025284 329844 341921 622 665 0 False 308 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 352 671 0.00813273975247511 0.00816676619449746 0.0081177996490425 0.00816357671473259 0.0012961730731434 0.00135987514474378 331513 355914 622 665 0 False 352 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 396 671 0.0080534517158672 0.0081744071783946 0.00807202258335241 0.00820935378042268 0.00139277307755041 0.00128172109619468 328281 356247 622 665 0 False 396 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 441 671 0.00811115142567593 0.00803326696232456 0.0081025406271458 0.00798046845197223 0.00150762950793966 0.00153459197611937 330633 350096 622 665 0 False 441 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 485 671 0.00811004747714643 0.00808065024084588 0.00816357671473259 0.0081025406271458 0.00165802299008924 0.00158089989513084 330588 352161 622 665 0 False 485 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 529 671 0.00794963148971476 0.00805855334146765 0.00804150453955901 0.00805676356145571 0.00182790302287129 0.00200829532274033 324049 351198 622 665 0 False 529 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 574 671 0.00813583080835772 0.00798579190021288 0.00817883573662928 0.00802624551766232 0.00154347284773332 0.00136125799095559 331639 348027 622 665 0 False 574 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 618 671 0.0080328446766498 0.00817548563558129 0.00804150453955901 0.00819409475852598 0.00124417712951155 0.00151639753229544 327441 356294 622 665 0 False 618 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 661 672 0.00811662210394436 0.0271915540740154 0.00814831769283589 0.0280155642023346 0.0014261071838396 0.00490046515989783 330856 1185029 622 665 0 True 662 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H1_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H1_2.csv new file mode 100755 index 0000000..fda2e93 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H1_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 262 284 0.00708676078686507 0.678947838811953 0.00672922865644312 0.663935301747158 0.00246793472539716 0.186735283878976 288876 29589073 622 665 8 True 263 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 307 283 0.00540951951989524 0.00522285342562173 0.00540169375143053 0.00520332646677348 0.00141890376631795 0.00127205129935033 220507 227616 622 665 0 False 307 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 351 284 0.00498503904420627 0.00505465999629424 0.00498970016021973 0.00503547722590982 0.00122859206006949 0.0013177832189727 203204 220286 622 665 0 True 351 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 394 284 0.00570891036109666 0.00513692103915086 0.00535591668574044 0.00515754940108339 0.00437214492729056 0.00126328655618357 232711 223871 622 665 0 True 395 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 438 283 0.00516186706644323 0.00533627499740425 0.0051117723353933 0.00526436255436027 0.00160950247576081 0.00167253448128172 210412 232559 622 665 0 True 440 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 482 283 0.00521880627837608 0.00513861903557245 0.00514229037918669 0.0051117723353933 0.00165661621095929 0.00175686842535435 212733 223945 622 665 0 True 484 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 526 281 0.00512403843016557 0.00527177407928152 0.00523384451056687 0.00526436255436027 0.00139025946163016 0.00152978223962484 208870 229748 622 665 0 True 528 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 571 281 0.00534620193868081 0.00543111039213965 0.00527962157625696 0.00538643472953384 0.00159118561222462 0.00162429732365405 217926 236692 622 665 0 True 573 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 617 282 0.00633823461948243 0.00595200521330793 0.00621042191195544 0.005981536583505 0.00221040065632201 0.00179987103878263 258364 259393 622 665 0 False 617 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 658 282 0.00717026836007465 0.644992132425364 0.00714122224765393 0.623163195239185 0.002010711954585 0.182209535166869 292280 28109257 622 665 3 True 661 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 263 327 0.00541437689342505 0.00535653622497535 0.00541695277332723 0.00538643472953384 0.00148449366123931 0.00134431139740051 220705 233442 622 665 0 False 263 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 307 326 0.00503869094274015 0.00500778152751988 0.00506599526970321 0.00502021820401312 0.00125592794127376 0.00118137625844706 205391 218243 622 665 0 False 307 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 351 327 0.00508069005124038 0.00523499180544632 0.00509651331349661 0.00524910353246357 0.00125851103341832 0.0012630970452645 207103 228145 622 665 0 True 351 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 394 327 0.00547808698967219 0.00531913441190525 0.00521858548867018 0.00531013962005036 0.00276108168636214 0.00126872564266828 223302 231812 622 665 0 True 396 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 439 326 0.00555109478575671 0.00567110153502318 0.00556954299229419 0.00564583810177768 0.00162319071867581 0.00164254553190844 226278 247151 622 665 0 True 440 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 483 327 0.00540377898754182 0.00548032934246809 0.00544747081712062 0.0055542839703975 0.00150083056002155 0.00153335178793569 220273 238837 622 665 0 True 484 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 527 326 0.00539472660959989 0.0052421509254941 0.00537117570763714 0.00520332646677348 0.00179819362158537 0.00154969028988515 219904 228457 622 665 0 True 529 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 571 325 0.00550529318787707 0.00540788914377957 0.0055390249485008 0.00541695277332723 0.00178507043684184 0.00156942530727649 224411 235680 622 665 0 True 573 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 617 326 0.00562267971484764 0.005672730693752 0.00567635614557107 0.00560006103608759 0.00185533818019824 0.00199757965778116 229196 247222 622 665 0 False 617 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 661 326 0.00558281490683778 0.00549242183049751 0.00560006103608759 0.00552376592660411 0.00199619347869162 0.00174570748495332 227571 239364 622 665 0 False 661 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 263 366 0.00495334345531474 0.00508281461263596 0.00498970016021973 0.00506599526970321 0.00148239487883474 0.00140816944102694 201912 221513 622 665 0 True 263 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 307 366 0.0050660443340823 0.00504633063546942 0.00508125429159991 0.00505073624780652 0.00135596141530212 0.00123960651151593 206506 219923 622 665 0 True 307 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 351 369 0.00534649632495534 0.0051815508099615 0.00527962157625696 0.0051117723353933 0.0013411817702949 0.00131325454929802 217938 225816 622 665 0 False 351 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 395 366 0.00539470207741034 0.00541768704205008 0.00531013962005036 0.00540169375143053 0.0013191886486858 0.00126908125560241 219903 236107 622 665 0 True 396 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 439 365 0.00567517860047293 0.00557192936564345 0.00569161516746777 0.00560006103608759 0.00161364706597546 0.00161731060103734 231336 242829 622 665 0 True 440 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 484 369 0.00543535191548563 0.00576726779181876 0.00550850690470741 0.00579842832074464 0.00156135176767262 0.00171546417709973 221560 251342 622 665 0 False 484 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 527 365 0.00535415036809324 0.0054493982725181 0.00532539864194705 0.00543221179522393 0.00163989615761143 0.00165123618817724 218250 237489 622 665 0 True 529 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 571 363 0.00563649133756121 0.00550995249625552 0.00564583810177768 0.00546272983901732 0.00178125016956135 0.00186217959210213 229759 240128 622 665 0 True 573 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 615 363 0.00543922800143366 0.00558934530191352 0.00537117570763714 0.0055542839703975 0.00186961174363044 0.00185236111319483 221718 243588 622 665 0 True 617 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 660 362 0.00504950963832929 0.00506911591177532 0.0051117723353933 0.00506599526970321 0.00183058639485719 0.00183780968977182 205832 220916 622 665 0 True 662 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 264 410 0.00524586528344369 0.00508533866137075 0.00520332646677348 0.00514229037918669 0.00147032303698077 0.00139801319438488 213836 221623 622 665 0 True 263 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 307 410 0.00535316908051146 0.00516333176727582 0.00527962157625696 0.0051117723353933 0.0018717998234087 0.0012722451333382 218210 225022 622 665 0 True 307 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 351 409 0.00536872248868269 0.00554639058162688 0.00535591668574044 0.00550850690470741 0.00129905776560348 0.0012906293337158 218844 241716 622 665 0 True 351 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 395 409 0.00543265337463573 0.005496414416678 0.00543221179522393 0.00546272983901732 0.00136257882898514 0.00142524693332576 221450 239538 622 665 0 True 396 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 440 408 0.00563928800716929 0.00560813799203892 0.00561532005798428 0.00564583810177768 0.00155333169150985 0.00154860142743379 229873 244407 622 665 0 True 440 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 484 407 0.0054428832976758 0.00570939823809925 0.00547798886091402 0.00572213321126116 0.00156428634603461 0.00158702959538644 221867 248820 622 665 0 True 484 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 528 406 0.00547031028558658 0.00542553453902552 0.00544747081712062 0.00531013962005036 0.00157305287375898 0.00212024212446297 222985 236449 622 665 0 True 529 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 572 407 0.00531168514799166 0.00541112451533962 0.00527962157625696 0.00540169375143053 0.0017262149538171 0.00167049475186037 216519 235821 622 665 0 True 573 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 617 407 0.0050938638370258 0.005201399011376 0.00503547722590982 0.00526436255436027 0.00178781522818338 0.00176375901600517 207640 226681 622 665 0 True 617 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 659 406 0.00493030772933243 0.00494704373660175 0.00495918211642634 0.00497444113832303 0.00175230906015874 0.00173423949624032 200973 215596 622 665 0 True 662 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 263 453 0.0050400402131651 0.00524137076497607 0.00509651331349661 0.00524910353246357 0.00143809351086057 0.00149272804940535 205446 228423 622 665 0 True 263 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 306 453 0.00517383877494096 0.00528375183782299 0.00521858548867018 0.00531013962005036 0.001433609183396 0.0014397017046706 210900 230270 622 665 0 True 307 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 351 453 0.00527891014276017 0.00522441374665779 0.00526436255436027 0.00520332646677348 0.00142271933111286 0.00140392515986042 215183 227684 622 665 0 True 352 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 395 453 0.00534477907168723 0.00544609406326528 0.00541695277332723 0.00540169375143053 0.00157399864917518 0.00143904264749502 217868 237345 622 665 0 True 396 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 439 453 0.0054941801060134 0.00557316844411326 0.0055542839703975 0.00560006103608759 0.0017883254656276 0.0019041327636965 223958 242883 622 665 0 True 440 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 483 451 0.00548223292970522 0.00543987572501866 0.0055390249485008 0.00538643472953384 0.00179577827926189 0.00181042437695389 223471 237074 622 665 0 True 485 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 528 451 0.00527952344749878 0.005325513371435 0.00527962157625696 0.00541695277332723 0.00166693587411301 0.0016605317827484 215208 232090 622 665 0 True 529 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 573 455 0.00542288956319701 0.00518600231409377 0.00509651331349661 0.0051117723353933 0.00293317477222885 0.00182263586461985 221052 226010 622 665 0 False 573 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 617 450 0.0050286327450269 0.00505365037680032 0.00505073624780652 0.00498970016021973 0.00169501446171157 0.00178155946428945 204981 220242 622 665 0 True 617 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 659 450 0.00493906572099982 0.00486244221219104 0.00494392309452964 0.00482185091935607 0.00178648659235651 0.0019113165275079 201330 211909 622 665 0 True 662 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 263 497 0.00526791972184422 0.00526640473924569 0.00521858548867018 0.00529488059815366 0.00146011027861571 0.00142177807805628 214735 229514 622 665 0 True 263 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 308 497 0.00511959810385801 0.00515348797721013 0.00515754940108339 0.00517280842298009 0.00144724559869044 0.00143996465146899 208689 224593 622 665 0 True 307 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 352 497 0.00545083172708822 0.00540116599578599 0.00543221179522393 0.00535591668574044 0.00164050907724541 0.00144172622959897 222191 235387 622 665 0 True 352 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 396 496 0.00568506507285938 0.00549090740125663 0.00549324788281071 0.00546272983901732 0.00184789041930285 0.0015503159420736 231739 239298 622 665 0 True 396 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 440 496 0.00550666699049157 0.00536390185810142 0.00546272983901732 0.00532539864194705 0.00171284302851756 0.00184479289984227 224467 233763 622 665 0 True 440 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 486 495 0.00538837277250786 0.0054316381477842 0.00537117570763714 0.00543221179522393 0.00178232429523975 0.00171193744663434 219645 236715 622 665 0 True 485 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 529 494 0.00505429341529047 0.00554478436879564 0.00503547722590982 0.00550850690470741 0.00163582466854916 0.00146589881276066 206027 241646 622 665 0 True 529 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 572 494 0.00513726128033007 0.00538184555001603 0.00518806744487678 0.00534065766384375 0.00177645722938148 0.00177433754764446 209409 234545 622 665 0 True 573 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 617 495 0.00535581855698227 0.00510188265353244 0.00534065766384375 0.00509651331349661 0.00173998357060454 0.00169687009655324 218318 222344 622 665 0 True 618 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 661 494 0.00519233604585753 0.00516156493316147 0.00512703135729 0.00512703135729 0.00174415798627339 0.001817979620681 211654 224945 622 665 0 True 662 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 264 541 0.00520860088752555 0.00526830924874558 0.00523384451056687 0.00518806744487678 0.00137561044202498 0.00142010797580796 212317 229597 622 665 0 True 263 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 308 540 0.00521696636416024 0.00543260187548294 0.00524910353246357 0.00534065766384375 0.00133128121065454 0.00139005960599803 212658 236757 622 665 0 True 307 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 353 541 0.00516844169324116 0.0052697318943961 0.0051117723353933 0.00526436255436027 0.00135789762375006 0.00129029419677383 210680 229659 622 665 0 True 352 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 397 540 0.00531399117380885 0.00539196469085279 0.00532539864194705 0.00537117570763714 0.00150220946721129 0.0014124560687281 216613 234986 622 665 0 True 396 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 441 539 0.00529115170534289 0.00542528213415204 0.00534065766384375 0.00546272983901732 0.00173981671000545 0.00189693629562446 215682 236438 622 665 0 True 440 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 486 537 0.00555205154114895 0.00579388503302202 0.00552376592660411 0.00573739223315786 0.00175102169929704 0.0018485497769299 226317 252502 622 665 0 True 485 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 529 536 0.0052792045290347 0.00542351530003769 0.00527962157625696 0.00537117570763714 0.00181324347408015 0.00182926125144926 215195 236361 622 665 0 True 529 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 574 536 0.0055596319877182 0.00540075296962938 0.00537117570763714 0.00537117570763714 0.00232362743755916 0.00164237438737573 226626 235369 622 665 0 True 573 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 618 535 0.00546015395911514 0.00542110598079084 0.00547798886091402 0.00541695277332723 0.0018262701690598 0.00174636438838378 222571 236256 622 665 0 True 618 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 662 535 0.0052644361509289 0.00524517978397585 0.00532539864194705 0.00535591668574044 0.00176068740284582 0.00180131687985911 214593 228589 622 665 0 True 662 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 265 581 0.00535228592168785 0.0054218173036161 0.00532539864194705 0.00537117570763714 0.00130798411626964 0.00119329128259679 218174 236287 622 665 0 True 263 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 309 580 0.00522592061334399 0.00545166991637941 0.00521858548867018 0.00541695277332723 0.00151216578354781 0.00132117813060842 213023 237588 622 665 0 True 308 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 353 580 0.00538574782822659 0.0053340721912357 0.00535591668574044 0.00535591668574044 0.0014281951247659 0.00132736215822215 219538 232463 622 665 0 True 352 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 397 580 0.00521679463883343 0.00548289928299806 0.00520332646677348 0.00544747081712062 0.0014267787525868 0.00127358230289214 212651 238949 622 665 0 True 396 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 441 585 0.00542889994963542 0.00545476761255393 0.00544747081712062 0.00547798886091402 0.00176923676073804 0.00191942692909991 221297 237723 622 665 0 False 441 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 485 585 0.00536045514080618 0.00581944676293618 0.00541695277332723 0.00576791027695125 0.00181571392659073 0.00193869720946653 218507 253616 622 665 0 False 485 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 529 585 0.00530155335370977 0.00536787149838432 0.00531013962005036 0.00537117570763714 0.00187456014243256 0.0019106799888735 216106 233936 622 665 0 False 529 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 573 585 0.0054637111265991 0.00545033905431925 0.00547798886091402 0.00540169375143053 0.00171411640958849 0.00179665189796048 222716 237530 622 665 0 False 573 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 618 585 0.00521858548867018 0.00539774705704522 0.00515754940108339 0.00544747081712062 0.00133210131773421 0.00146089148946555 212724 235238 622 665 0 False 618 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 662 584 0.00517626746170587 0.00523090743567548 0.00518806744487678 0.00521858548867018 0.00152246590369874 0.00158831458459157 210999 227967 622 665 0 False 662 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 263 629 0.00765031424508197 0.00602637286739394 0.00579842832074464 0.00556954299229419 0.00818856003276617 0.00363848301669062 311848 262634 622 665 0 False 263 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 308 628 0.00790235796046245 0.023360851201017 0.00578316929884794 0.00621042191195544 0.0102731823190562 0.0375949461420147 322122 1018084 622 665 0 False 308 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 352 628 0.00527424902674671 0.00525444992660181 0.00529488059815366 0.00527962157625696 0.001356073204152 0.00132110322489915 214993 228993 622 665 0 False 352 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 396 628 0.00513659891121236 0.00519437756671376 0.00520332646677348 0.00523384451056687 0.00124667198080382 0.00117273895691924 209382 226375 622 665 0 False 396 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 441 628 0.0052742980911258 0.00512698546549482 0.00527962157625696 0.00506599526970321 0.00160910530835943 0.0017783376898849 214995 223438 622 665 0 False 441 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 485 628 0.00538373618868394 0.00535626087420428 0.00537117570763714 0.00541695277332723 0.00174549642497356 0.00180970193244421 219456 233430 622 665 0 False 485 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 529 628 0.00531553670175015 0.00518774620231054 0.00526436255436027 0.00514229037918669 0.00176456549192327 0.00178743166552991 216676 226086 622 665 0 False 529 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 574 628 0.00532319074488804 0.00531803300882098 0.00541695277332723 0.00535591668574044 0.00152941422131179 0.00156856589440324 216988 231764 622 665 0 False 574 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 618 628 0.00551407571173402 0.00536839925402887 0.00546272983901732 0.00535591668574044 0.00134932009971128 0.00125651587993321 224769 233959 622 665 0 False 618 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 662 628 0.00547482420846277 0.00537796769332349 0.00549324788281071 0.00541695277332723 0.00148952276348814 0.00141611247755157 223169 234376 622 665 0 False 662 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 265 675 0.00739066555094269 0.636567018369912 0.00689707789730678 0.602151522087434 0.00391350542698258 0.169772427737527 301264 27742084 622 665 1 True 263 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 308 672 0.00572394859328745 0.00557367325386022 0.00563057907988098 0.00552376592660411 0.00157501651963141 0.00129693807046868 233324 242905 622 665 0 False 308 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 352 671 0.00513311534029704 0.00538494324619055 0.00506599526970321 0.00531013962005036 0.00128813772516232 0.00127615452959549 209240 234680 622 665 0 False 352 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 396 671 0.00523541457069772 0.00515970631545676 0.00524910353246357 0.00518806744487678 0.00127103438488605 0.00129927758765991 213410 224864 622 665 0 False 396 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 441 671 0.00521291855288539 0.00520470322062882 0.00524910353246357 0.00523384451056687 0.00152086344806295 0.0014660189888694 212493 226825 622 665 0 False 441 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 485 671 0.00540039354538467 0.00515718226672197 0.00550850690470741 0.00521858548867018 0.00153110621991273 0.00154164738515102 220135 224754 622 665 0 False 485 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 529 671 0.00525484406481699 0.00533703221202468 0.00520332646677348 0.00537117570763714 0.00167347901314869 0.00173834944842636 214202 232592 622 665 0 False 529 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 574 671 0.0051772242170981 0.00523611615442819 0.00524910353246357 0.00517280842298009 0.001433355976638 0.00137210349831746 211038 228194 622 665 0 False 574 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 618 671 0.00569264551942864 0.00564714601794025 0.00572213321126116 0.00567635614557107 0.00134097440785778 0.00131810402126906 232048 246107 622 665 0 False 618 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 661 672 0.00647237663191191 0.470562558834716 0.00648508430609598 0.493232623788815 0.00167840237430534 0.10727782509041 263832 20507481 622 665 0 True 662 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H1_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H1_3.csv new file mode 100755 index 0000000..c953b3e --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H1_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 262 284 0.000994216045671087 0.0683158112722869 0.00080872816052491 0.0656290531776913 0.000791716423716957 0.0206954484806253 40527 2977256 622 665 0 True 263 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 307 283 0.00100856737655464 0.00085239420363681 0.000900282291905089 0.000778210116731518 0.000714822446424979 0.000594688175745922 41112 37148 622 665 0 False 307 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 351 284 0.000908476043212961 0.0009658616672145 0.000793469138628214 0.000854505226215 0.000660917616756362 0.000729915442422006 37032 42093 622 665 0 True 351 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 394 284 0.000860074033241607 0.000963819482329077 0.000671396963454643 0.000839246204318303 0.000748446721790962 0.000681883001217526 35059 42004 622 665 0 True 395 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 438 283 0.00090126357948687 0.000833601513511405 0.000656137941557946 0.000595101853971161 0.000865056698897179 0.000790007124922946 36738 36329 622 665 0 True 440 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 482 283 0.000791187645000573 0.000907808546314287 0.000549324788281071 0.000671396963454643 0.00080542416824745 0.000890430335981061 32251 39563 622 665 0 True 484 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 526 281 0.000868905621477638 0.000808338080265897 0.000656137941557946 0.000595101853971161 0.000790989170354901 0.000780045775376556 35419 35228 622 665 0 True 528 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 571 281 0.000866869449745442 0.000868226872973232 0.000610360875867857 0.000564583810177768 0.000873088166012753 0.000885841476722741 35336 37838 622 665 0 True 573 283 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 617 282 0.000914461897461826 0.000865588094750495 0.000564583810177768 0.000518806744487678 0.000951023378968363 0.000904688630849369 37276 37723 622 665 0 False 617 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 658 282 0.00106805793620012 0.0642136125390152 0.000701915007248035 0.0620584420538643 0.000989350458820877 0.0188878081699186 43537 2798479 622 665 0 True 661 282 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 263 327 0.000926752524423635 0.0009121682668562 0.000762951094834821 0.000747692072938125 0.000746524939235077 0.000739762135725665 37777 39753 622 665 0 False 263 327 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 307 326 0.000930873932267115 0.000990918587381707 0.000869764248111696 0.000885023270008392 0.000642503282648116 0.00069359257373135 37945 43185 622 665 0 False 307 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 351 327 0.000947506756778305 0.000872793106593446 0.000854505226215 0.000717174029144732 0.0006831370674534 0.000655391187554696 38623 38037 622 665 0 True 351 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 394 327 0.000948120061516919 0.000946770680420438 0.000778210116731518 0.000823987182421607 0.000804370207198497 0.000669190415309892 38648 41261 622 665 0 True 396 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 439 326 0.000880828265596278 0.000901314857296595 0.000671396963454643 0.000579842832074464 0.000796811683040706 0.000905293681300835 35905 39280 622 665 0 True 440 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 483 327 0.000918215322462139 0.000877588799189551 0.000686655985351339 0.000686655985351339 0.000856564740272728 0.000824789927843818 37429 38246 622 665 0 True 484 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 527 326 0.000931708026711629 0.000847346106167226 0.000717174029144732 0.000625619897764553 0.000843841837169724 0.000838552245827205 37979 36928 622 665 0 True 529 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 571 325 0.000913112627036877 0.000908129788880533 0.000671396963454643 0.000732433051041428 0.000899789276692838 0.0008065312704972 37221 39577 622 665 0 True 573 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 617 326 0.000934185777855627 0.000916849229964359 0.000518806744487678 0.000411993591210803 0.00103227942898739 0.0011274161899585 38080 39957 622 665 0 False 617 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 661 326 0.000936050224261011 0.000957899440751111 0.000564583810177768 0.000610360875867857 0.0010001258145056 0.000954449885016159 38156 41746 622 665 0 False 661 326 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 263 366 0.00087942993079224 0.000956798037666838 0.000732433051041428 0.00080872816052491 0.000753024187644098 0.000805134477032992 35848 41698 622 665 0 True 263 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 307 366 0.00091036502180789 0.000881856736141108 0.000762951094834821 0.000747692072938125 0.000725164957060191 0.000707946649861885 37109 38432 622 665 0 True 307 370 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 351 369 0.000899325536512852 0.000906385900663767 0.000762951094834821 0.000762951094834821 0.000716649933076012 0.000738835559707821 36659 39501 622 665 0 False 351 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 395 366 0.000844937672292634 0.000892434794929645 0.000686655985351339 0.000717174029144732 0.000661200982368547 0.000676543743658014 34442 38893 622 665 0 True 396 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 439 365 0.000905139665434905 0.000881283088701383 0.000671396963454643 0.000579842832074464 0.00079733509220886 0.000869471547409397 36896 38407 622 665 0 True 440 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 484 369 0.000939509262986789 0.000917950633048632 0.00064087891966125 0.000579842832074464 0.000891390239000025 0.000927780387273744 38297 40005 622 665 0 False 484 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 527 365 0.000881024523112634 0.000865611040648084 0.00064087891966125 0.000579842832074464 0.000817835323593883 0.000875479276507036 35913 37724 622 665 0 True 529 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 571 363 0.000903054429323621 0.000864555529358989 0.000625619897764553 0.000488288700694286 0.000915259655468313 0.00095547683719141 36811 37678 622 665 0 True 573 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 615 363 0.000862772574091505 0.000960469381281081 0.000473029678797589 0.000488288700694286 0.00101728578371787 0.00107013593342468 35169 41858 622 665 0 True 617 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 660 362 0.000926948781939991 0.000969234714160085 0.000549324788281071 0.000518806744487678 0.000982904869712133 0.00101826758203061 37785 42240 622 665 0 True 662 369 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 264 410 0.000887255699256944 0.000847575565143116 0.000732433051041428 0.000656137941557946 0.000768736830806654 0.000749776740309566 36167 36938 622 665 0 True 263 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 307 410 0.000930824867888026 0.000941493123974964 0.000793469138628214 0.000823987182421607 0.000710997946286391 0.000698240893983809 37943 41031 622 665 0 True 307 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 351 409 0.000923121760371045 0.000921782597945998 0.000778210116731518 0.000793469138628214 0.000722123801315237 0.000698276820912735 37629 40172 622 665 0 True 351 413 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 395 409 0.000854431629646366 0.000948399839149258 0.000732433051041428 0.000762951094834821 0.000707316632987004 0.000817755125388992 34829 41332 622 665 0 True 396 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 440 408 0.000932591185535232 0.000894201629043999 0.000717174029144732 0.000671396963454643 0.00079309362057519 0.000790785091477686 38015 38970 622 665 0 True 440 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 484 407 0.000913039030468243 0.000876992205852236 0.000686655985351339 0.000656137941557946 0.000850066794103856 0.000801613682677233 37218 38220 622 665 0 True 484 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 528 406 0.00101106965988818 0.000862536290371156 0.000854505226215 0.000610360875867857 0.000870031007047176 0.00086755154017562 41214 37590 622 665 0 True 529 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 572 407 0.000873419544353831 0.000824514938066154 0.000610360875867857 0.000457770656900893 0.000894587638157972 0.000875558553221544 35603 35933 622 665 0 True 573 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 617 407 0.000912523854487808 0.000814762931590822 0.000488288700694286 0.000411993591210803 0.000991800695630793 0.000926765901325523 37197 35508 622 665 0 True 617 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 659 406 0.000892284798113573 0.000876716855081168 0.000488288700694286 0.000442511635004196 0.000946507782494449 0.000971003016925729 36372 38208 622 665 0 True 662 412 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 263 453 0.000802325259053789 0.000909575380428641 0.000671396963454643 0.000747692072938125 0.00074214410715374 0.000800043338269793 32705 39640 622 665 0 True 263 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 306 453 0.000913750463965035 0.000883141706406093 0.00080872816052491 0.000701915007248035 0.000754287285637286 0.000825850044574113 37247 38488 622 665 0 True 307 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 351 453 0.000917773743050337 0.00091379742558502 0.000793469138628214 0.000778210116731518 0.000742815715480153 0.000765960094842706 37411 39824 622 665 0 True 352 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 395 453 0.000885293124093382 0.000930249634156345 0.000701915007248035 0.000793469138628214 0.000794635637272362 0.00079942050478015 36087 40541 622 665 0 True 396 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 439 453 0.000880558411511288 0.00088064060356889 0.000549324788281071 0.000411993591210803 0.000930755441911592 0.00101987692835184 35894 38379 622 665 0 True 440 456 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 483 451 0.000925108867724151 0.000849686587721306 0.000564583810177768 0.000457770656900893 0.000976459614138929 0.000936636007971557 37710 37030 622 665 0 True 485 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 528 451 0.000885808300073817 0.000851728772606729 0.000549324788281071 0.000564583810177768 0.000935855992442291 0.000873756124143513 36108 37119 622 665 0 True 529 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 573 455 0.000974614826225009 0.00089394922417052 0.000595101853971161 0.000473029678797589 0.00101943824739221 0.000996283333101209 39728 38959 622 665 0 False 573 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 617 450 0.000873836591576088 0.000928115665680567 0.000473029678797589 0.000534065766384375 0.000912020245042009 0.000945485242661562 35620 40448 622 665 0 True 617 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 659 450 0.000949837314785035 0.000953700341492321 0.000534065766384375 0.000457770656900893 0.00102298293349112 0.00109837454983688 38718 41563 622 665 0 True 662 455 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 263 497 0.000964875546975831 0.000854826468781246 0.000778210116731518 0.000717174029144732 0.000796723640926581 0.000752744803988892 39331 37254 622 665 0 True 263 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 308 497 0.00101617235531344 0.000967857960304745 0.000915541313801785 0.000839246204318303 0.000785833531177746 0.000789127292864847 41422 42180 622 665 0 True 307 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 352 497 0.000937546687823227 0.000901681991658019 0.000823987182421607 0.000793469138628214 0.000782817050108734 0.00080320497006578 38217 39296 622 665 0 True 352 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 396 496 0.00100260605449532 0.00101003252007336 0.000762951094834821 0.00080872816052491 0.000878160035989664 0.000867992058441806 40869 44018 622 665 0 True 396 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 440 496 0.000955087203347564 0.000940162261914801 0.000671396963454643 0.000488288700694286 0.000935257794098642 0.00105731773684588 38932 40973 622 665 0 True 440 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 486 495 0.000966519203675314 0.00087153108222605 0.000671396963454643 0.000488288700694286 0.000903428503558331 0.000918511066582887 39398 37982 622 665 0 True 485 499 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 529 494 0.000940343357431303 0.000881696114857985 0.000686655985351339 0.000595101853971161 0.000871653266752415 0.000838394768204396 38331 38425 622 665 0 True 529 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 572 494 0.000881049055302179 0.000907166061181794 0.000503547722590982 0.000518806744487678 0.000920835957130328 0.000978721682902404 35914 39535 622 665 0 True 573 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 617 495 0.000880214960857665 0.000939909857041322 0.000503547722590982 0.000625619897764553 0.000934510620850783 0.00090918041163733 35880 40962 622 665 0 True 618 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 661 494 0.000930432352855314 0.000941539015770142 0.000564583810177768 0.000518806744487678 0.000966609515186872 0.00102762215830351 37927 41033 622 665 0 True 662 498 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 264 541 0.000949984507922303 0.000921094221018327 0.000793469138628214 0.000747692072938125 0.000768342580793867 0.000759349250047236 38724 40142 622 665 0 True 263 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 308 540 0.000931830687659352 0.000909093516579271 0.00080872816052491 0.000778210116731518 0.00074126938721845 0.000732074496168733 37984 39619 622 665 0 True 307 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 353 541 0.000935363322953764 0.000826442393463632 0.000793469138628214 0.000732433051041428 0.00075091894778385 0.000663237516047253 38128 36017 622 665 0 True 352 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 397 540 0.00104570911152505 0.000908519869139546 0.000869764248111696 0.000717174029144732 0.000851489216892206 0.000817335598310479 42626 39594 622 665 0 True 396 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 441 539 0.000883281484550731 0.000856455627510066 0.000442511635004196 0.000289921416037232 0.00097285808020468 0.00105444315583871 36005 37325 622 665 0 True 440 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 486 537 0.000930015305633057 0.000951910561480378 0.000518806744487678 0.000488288700694286 0.000998926614961332 0.0010610138011757 37910 41485 622 665 0 True 485 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 529 536 0.000852886101705061 0.000948652244022737 0.000534065766384375 0.000564583810177768 0.000907776040386197 0.000980944530609511 34766 41343 622 665 0 True 529 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 574 536 0.000867163836019976 0.000898423674200379 0.000549324788281071 0.000610360875867857 0.000867144814133995 0.00086596305210823 35348 39154 622 665 0 True 573 542 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 618 535 0.000908328850075694 0.000872586593515145 0.000579842832074464 0.000579842832074464 0.000917111873973383 0.000884227371856201 37026 38028 622 665 0 True 618 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 662 535 0.000957589486681106 0.00101198292136842 0.00064087891966125 0.00064087891966125 0.000953035373105875 0.0010515144643289 39034 44103 622 665 0 True 662 541 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 265 581 0.000859632453829806 0.000881007737930314 0.000762951094834821 0.000762951094834821 0.000644537433568446 0.000644545496817412 35041 38395 622 665 0 True 263 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 309 580 0.000814076177845618 0.000939818073450965 0.000701915007248035 0.000854505226215 0.000698010889861138 0.000745669101181382 33184 40958 622 665 0 True 308 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 353 580 0.000882888969518019 0.000839842797655618 0.000732433051041428 0.000701915007248035 0.000726506740749741 0.000674622237136463 35989 36601 622 665 0 True 352 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 397 580 0.000852174668208269 0.000871875270689886 0.000701915007248035 0.000717174029144732 0.000708304953008036 0.000712224133863336 34737 37997 622 665 0 True 396 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 441 585 0.00102429251005268 0.000861343103696527 0.000701915007248035 0.000396734569314107 0.000989430665649358 0.00101412684257066 41753 37538 622 665 0 False 441 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 485 585 0.000896528866904776 0.000907280790669739 0.000488288700694286 0.000457770656900893 0.000980391868576403 0.0010556158124595 36545 39540 622 665 0 False 485 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 529 585 0.000898982085859229 0.000867584387840739 0.000503547722590982 0.000396734569314107 0.000996322929035889 0.000982785228267465 36645 37810 622 665 0 False 529 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 573 585 0.000815572641407834 0.000940919476535238 0.000518806744487678 0.000503547722590982 0.000848530431167959 0.00101348171684591 33245 41006 622 665 0 False 573 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 618 585 0.000948095529327374 0.000885688701038474 0.000732433051041428 0.000671396963454643 0.00078989493960672 0.000745087798977758 38647 38599 622 665 0 False 618 585 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 662 584 0.000890150497623199 0.000949570079926298 0.000625619897764553 0.000671396963454643 0.000828702220217024 0.000836819358047517 36285 41383 622 665 0 False 662 584 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 263 629 0.00106337228799711 0.000966871286708417 0.000793469138628214 0.000793469138628214 0.00102234888177247 0.000800981875694123 43346 42137 622 665 0 False 263 629 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 308 628 0.00119491388833487 0.00262069685543683 0.000915541313801785 0.00131227588311589 0.00111864579524584 0.00356185405425827 48708 114212 622 665 0 False 308 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 352 628 0.00089167149337496 0.000923503540265174 0.000732433051041428 0.00080872816052491 0.000761265079344701 0.000715135521807399 36347 40247 622 665 0 False 352 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 396 628 0.00089140163928997 0.000857350517516038 0.000701915007248035 0.000762951094834821 0.000739145911340059 0.000658004544188124 36336 37364 622 665 0 False 396 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 441 628 0.000906660661186666 0.000967284312865019 0.000671396963454643 0.000595101853971161 0.000895427487194285 0.000983937945372056 36958 42155 622 665 0 False 441 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 485 628 0.0009134560776905 0.000899777482158131 0.000518806744487678 0.000457770656900893 0.00098141539015189 0.000973281482506907 37235 39213 622 665 0 False 485 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 529 628 0.000943213623608013 0.000856570356998011 0.000534065766384375 0.0004272526131075 0.000998518067817866 0.000996413070327572 38448 37330 622 665 0 False 529 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 574 628 0.000881220780628991 0.000831697004011517 0.000656137941557946 0.000564583810177768 0.000839308731105283 0.000822963378522415 35921 36246 622 665 0 False 574 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 618 628 0.00099141937606301 0.000889428882345484 0.000823987182421607 0.000701915007248035 0.00078811355261037 0.00073878318403789 40413 38762 622 665 0 False 618 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 662 628 0.000898368781120616 0.000928230395168512 0.000686655985351339 0.000747692072938125 0.000754710936185686 0.000763390872343772 36620 40453 622 665 0 False 662 628 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 265 675 0.0010360924932236 0.0635049743837736 0.000869764248111696 0.060318913557641 0.000782180892122452 0.0172654531111236 42234 2767596 622 665 0 True 263 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 308 672 0.00100069254371084 0.000990964479176885 0.000869764248111696 0.000885023270008392 0.000699355655204449 0.000688071264814327 40791 43187 622 665 0 False 308 672 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 352 671 0.000943017366091657 0.000905972874507165 0.00080872816052491 0.000747692072938125 0.000712191110981949 0.000715158919258034 38440 39483 622 665 0 False 352 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 396 671 0.000942453125732132 0.000926555344644513 0.00080872816052491 0.000793469138628214 0.000703644597921696 0.000699374272099618 38417 40380 622 665 0 False 396 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 441 671 0.000920079768867523 0.00088672126642998 0.000732433051041428 0.000686655985351339 0.000754497069338754 0.000813258061465876 37505 38644 622 665 0 False 441 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 485 671 0.000914314704324559 0.000951428697631008 0.000671396963454643 0.000701915007248035 0.000832126194815736 0.000833909262002753 37270 41464 622 665 0 False 485 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 529 671 0.000952584920014023 0.000912351834036912 0.000610360875867857 0.000518806744487678 0.000970281127229974 0.000929048205363071 38830 39761 622 665 0 False 529 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 574 671 0.000933302619032024 0.000874215752243965 0.000732433051041428 0.000701915007248035 0.000787886180227219 0.000705347850069896 38044 38099 622 665 0 False 574 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 618 671 0.000956436473772513 0.000899639806772596 0.000823987182421607 0.000732433051041428 0.000695876871822157 0.000678239817782022 38987 39207 622 665 0 False 618 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 661 672 0.000991762826716634 0.0464637446213382 0.000839246204318303 0.0484931715877012 0.000827026970813394 0.0107919795886487 40427 2024926 622 665 0 True 662 671 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H2_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H2_1.csv new file mode 100755 index 0000000..9d19821 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H2_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 285 264 0.00866864543307533 0.0378293639798742 0.00866712443732357 0.0380560006103609 0.00128559136796288 0.00816905608375359 353358 1648633 622 665 0 True 285 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 330 264 0.00874395925497703 0.00874933958838502 0.00872816052491035 0.00872816052491035 0.0012781651499794 0.00131778253814717 356428 381303 622 665 0 False 330 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 374 265 0.00893113986120178 0.0563875470319195 0.00891126878767071 0.0567177843900206 0.00130939320508621 0.0113164954708238 364058 2457413 622 665 0 True 374 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 417 264 0.0093165896233254 0.0738728028585999 0.00932326237888151 0.0737926298924239 0.00178215522432317 0.0125392561255585 379770 3219434 622 665 0 True 418 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 462 263 0.00902009358049024 0.0636330583841155 0.00904859998474098 0.0635538261997406 0.00176217250685709 0.0143129034295936 367684 2773178 622 665 0 True 463 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 505 264 0.00884822106054127 0.0546237876678421 0.00885023270008392 0.0585793850614176 0.00171507897256461 0.0148530209607088 360678 2380547 622 665 0 True 507 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 549 263 0.00892858851348915 0.0709857729698474 0.00892652780956741 0.0718394750896467 0.00153220482071941 0.0221279868967557 363954 3093615 622 665 0 True 551 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 594 262 0.008973408823787 0.0577701061993505 0.00891126878767071 0.0582131685358969 0.0019826618386042 0.0184073677162767 365781 2517666 622 665 0 True 596 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 640 263 0.00889102973129647 0.00875493838739674 0.00891126878767071 0.00875867856870375 0.00168803426239023 0.0018225893011056 362423 381547 622 665 0 False 640 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 681 263 0.00891605256463189 0.0365354218689319 0.00891126878767071 0.0366674296177615 0.00177696651494078 0.00807177364605656 363443 1592242 622 665 0 True 684 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 286 307 0.00872197841314513 0.00869548556674359 0.00872816052491035 0.00868238345922026 0.00143478564365425 0.00149987511570295 355532 378956 622 665 0 False 286 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 330 307 0.00878031595988202 0.00887106757509475 0.00883497367818723 0.00886549172198062 0.00131905880716503 0.00133117846151338 357910 386608 622 665 0 False 330 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 374 308 0.00932269813852199 0.153566934043738 0.00933852140077821 0.145830472266728 0.00148666055611889 0.0551481453197418 380019 6692566 622 665 0 True 374 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 418 309 0.0091217795061523 0.0483322520079095 0.00909437705043107 0.0489509422446021 0.00168401344927929 0.00773026106367794 371829 2106357 622 665 0 True 418 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 462 308 0.00924520095175083 0.0676317711192607 0.00914015411612116 0.0669260700389105 0.00221336857569844 0.0167582544516234 376860 2947445 622 665 0 True 463 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 507 307 0.00886308756740526 0.0377176633504108 0.00888075074387732 0.0391851682307164 0.00166891319404024 0.0101354880639665 361284 1643765 622 665 0 True 507 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 549 307 0.00897571484960418 0.0352568764552718 0.0089570458533608 0.0371709773403525 0.00160031725671414 0.00732986215707751 365875 1536522 622 665 0 True 551 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 595 307 0.00899050775989954 0.0432731175615854 0.00904859998474098 0.0448920424200809 0.0019520832234528 0.00845137126394597 366478 1885876 622 665 0 True 596 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 640 306 0.00866788493519945 0.00870147444601433 0.00866712443732357 0.00878919661249714 0.00187598844426971 0.00195973287861242 353327 379217 622 665 0 False 640 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 684 306 0.00867840924451405 0.00868307183614793 0.00868238345922026 0.00878919661249714 0.00183573270852439 0.00201829043977583 353756 378415 622 665 0 False 684 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 286 347 0.00881789927426424 0.0447182731376393 0.00881971465629053 0.0457618066681926 0.00145289469348556 0.0110544391331459 359442 1948857 622 665 0 True 286 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 330 347 0.0088572734384832 0.0587378035383721 0.00883497367818723 0.0592355230029755 0.00134833049172874 0.0189711811603352 361047 2559839 622 665 0 True 330 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 374 346 0.00946402808248801 0.03522225109581 0.00924696726939803 0.0361333638513771 0.00247482942967349 0.00820192992054839 385780 1535013 622 665 0 True 374 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 418 347 0.00917027964488184 0.0295229949444451 0.00917067215991455 0.0298008697642481 0.00177898178821342 0.0052483936466597 373806 1286635 622 665 0 True 419 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 462 346 0.00936320078346001 0.0625940451953872 0.00924696726939803 0.0632791638056001 0.0021186381857511 0.0126137587296767 381670 2727897 622 665 0 True 463 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 507 350 0.00923977933786149 0.0278796327050173 0.00923170824750134 0.0291447318226902 0.00167375379258873 0.00865795296941285 376639 1215016 622 665 0 False 507 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 552 350 0.00924723712348302 0.0234869618541662 0.00923170824750134 0.0252231631952392 0.00179167767620471 0.00666325102650726 376943 1023580 622 665 0 False 552 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 595 345 0.00911589178066162 0.0445119665724164 0.00904859998474098 0.045792324711986 0.00221092004141221 0.00909625682980503 371589 1939866 622 665 0 True 596 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 639 345 0.00895699678898171 0.0495735562297825 0.00901808194094758 0.0514839398794537 0.00188439350577006 0.0121362297181581 365112 2160454 622 665 0 True 640 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 683 343 0.00893908829061421 0.0520468486391075 0.00898756389715419 0.0542305638208591 0.00183404745153469 0.0151417531755684 364382 2268242 622 665 0 True 684 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 285 391 0.00889179022917235 0.0373691840037264 0.00892652780956741 0.0403906309605554 0.00151142730510691 0.00923621322814557 362454 1628578 622 665 0 True 286 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 330 391 0.00876601369337756 0.0276529042909402 0.00878919661249714 0.0279850461585412 0.00140378218504307 0.00402379976787116 357327 1205135 622 665 0 True 330 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 374 391 0.00912280985811318 0.075567127936573 0.00910963607232776 0.0762035553521019 0.00146477862486945 0.0175567351629683 371871 3293274 622 665 0 True 374 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 419 390 0.00900858798359385 0.0591692552507384 0.00903334096284428 0.0603036545357443 0.00166962874315524 0.0141800134154928 367215 2578642 622 665 0 True 419 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 463 390 0.0092594541538762 0.0386047517512022 0.00915541313801785 0.0403143358510719 0.00175061212862361 0.00851740386481198 377441 1682425 622 665 0 True 463 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 507 388 0.00910907183196824 0.047032343963594 0.00915541313801785 0.0482948043030442 0.00179269752806485 0.0115103483966978 371311 2049706 622 665 0 True 507 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 551 388 0.00927000299538034 0.0368917028207966 0.00926222629129473 0.0379797055008774 0.00175168491364816 0.00691283323296819 377871 1607769 622 665 0 True 552 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 595 388 0.00924358182724089 0.0437516083640091 0.00929274433508812 0.0451209277485313 0.00202113226114203 0.0087710660396474 376794 1906729 622 665 0 True 596 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 640 388 0.00903059335761529 0.0368746999106831 0.00914015411612116 0.0383306630045014 0.00196642360339481 0.00641338649609954 368112 1607028 622 665 0 True 640 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 684 387 0.00881549511968887 0.0693059038073554 0.00881971465629053 0.0693827725642786 0.00185294122276538 0.0140162711864228 359344 3020405 622 665 0 True 685 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 286 435 0.00902129565777792 0.0423057644110276 0.00891126878767071 0.0437018387121385 0.00174730539870199 0.00928778476117308 367733 1843718 622 665 0 True 286 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 330 433 0.00919078855534106 0.0460467947162482 0.00915541313801785 0.0467231250476844 0.00156477423009857 0.00835310816461217 374642 2006755 622 665 0 True 330 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 375 434 0.00921544340583331 0.0307215050673147 0.00930800335698482 0.0318455786984054 0.00139583807684768 0.00461987119380338 375647 1338867 622 665 0 True 374 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 420 434 0.00933984613901362 0.0518768654297681 0.0093690394445716 0.0505378805218586 0.00174997723563571 0.013669019288849 380718 2260834 622 665 0 True 419 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 464 433 0.00957957469524274 0.0907589412992311 0.00961318379491875 0.0878461890592813 0.00184988957676443 0.016937007633125 390490 3955345 622 665 0 True 463 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 507 432 0.00963737253380965 0.0532957250071849 0.00968947890440223 0.0559090562294957 0.00171278019800331 0.013098290680314 392846 2322669 622 665 0 True 507 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 552 432 0.00984776059134352 0.0475741195515683 0.0093842984664683 0.047547112230106 0.00410315011430696 0.0102975620511751 401422 2073317 622 665 0 True 552 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 596 436 0.00952472071942118 0.0303739665024314 0.0093690394445716 0.029404135194934 0.00225618105582637 0.0103593518477622 388254 1323721 622 665 0 False 596 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 640 431 0.00905539540124481 0.0344427101170183 0.00906385900663768 0.0351567864499886 0.00195890351491662 0.00512245289009501 369123 1501040 622 665 0 True 640 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 684 431 0.0090500473839241 0.0639269494404356 0.00912489509422446 0.0643015182726787 0.00183412815846035 0.00965837794758375 368905 2785986 622 665 0 True 685 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 288 479 0.00898616556235015 0.0542998145397827 0.00891126878767071 0.0554055085069047 0.00167137388180252 0.0140728521471835 366301 2366428 622 665 0 True 286 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 333 479 0.00920597398066913 0.0521406055766562 0.00921644922560464 0.0530251010910201 0.00167298457824119 0.00751115910241231 375261 2272328 622 665 0 True 330 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 376 478 0.0093542710664658 0.062912075335971 0.00933852140077821 0.0618448157473106 0.00155591451845521 0.0147194228565097 381306 2741757 622 665 0 True 375 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 421 478 0.00953902298592564 0.0813778093666301 0.00953688868543526 0.0794995040817884 0.00186410015383073 0.0182750145389268 388837 3546508 622 665 0 True 419 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 465 477 0.00947131414278274 0.0893153919360085 0.00946059357595178 0.0890211337453269 0.00198490699564154 0.0262850937454245 386077 3892434 622 665 0 True 463 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 509 475 0.00937644816581405 0.0399919230440487 0.00933852140077821 0.0404211490043488 0.00179573788949902 0.00769971826194962 382210 1742879 622 665 0 True 508 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 552 479 0.00941660736009844 0.032660410467689 0.00941481651026169 0.0351415274280919 0.00192878338714275 0.00787751450213677 383847 1423366 622 665 0 False 552 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 597 475 0.00935044404489685 0.0984865000679772 0.0093690394445716 0.0953688868543526 0.00190404003493569 0.0213107167067311 381150 4292118 622 665 0 True 596 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 641 475 0.00903029897134076 0.0611566912245136 0.00907911802853437 0.0632181277180133 0.00188721158017017 0.0167581902446982 368100 2665256 622 665 0 True 640 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 685 476 0.00908426978833872 0.0801053216699336 0.00912489509422446 0.0792706187533379 0.00197735206865671 0.0142069421191636 370300 3491052 622 665 0 True 685 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 288 522 0.00881537245874115 0.0462404122001043 0.00883497367818723 0.0497749294270237 0.00166059561873989 0.0101191391175311 359339 2015193 622 665 0 True 286 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 332 522 0.00933731932349053 0.102556390977444 0.00929274433508812 0.0984512092774853 0.00160154614559177 0.0259585060052392 380615 4469487 622 665 0 True 330 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 376 521 0.00922101221285992 0.0563638898115052 0.00920119020370794 0.0569771877622644 0.00156560716744795 0.0140787072740248 375874 2456382 622 665 0 True 375 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 421 522 0.00990955717680619 0.0543172993137456 0.00976577401388571 0.0550850690470741 0.00289394397454707 0.00783948536608037 403941 2367190 622 665 0 True 419 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 465 520 0.00952724753494426 0.0512300205767337 0.00944533455405508 0.0521858548867018 0.00204000695823691 0.00592207855837194 388357 2232644 622 665 0 True 463 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 509 518 0.00935792636270793 0.0590999815859172 0.0093842984664683 0.0600595101853971 0.00181775084212939 0.0126498423846157 381455 2575623 622 665 0 True 508 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 553 518 0.00908552093000549 0.0687652755142606 0.00915541313801785 0.0689555199511711 0.001814724218508 0.0166188475538899 370351 2996844 622 665 0 True 552 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 598 517 0.00922927956073643 0.0506617424770441 0.00924696726939803 0.0526894026092927 0.00174906252494172 0.0111281290036103 376211 2207878 622 665 0 True 596 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 642 517 0.00905436504928394 0.0466408640048278 0.00920119020370794 0.0456244754711223 0.00205523400189439 0.00941065772342593 369081 2032645 622 665 0 True 641 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 686 516 0.00910274252706575 0.0579055328869209 0.00918593118181125 0.060669871061265 0.00181629831914423 0.0115986510195499 371053 2523568 622 665 0 True 685 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 289 563 0.00866288036853236 0.0407226122068733 0.00865186541542687 0.0422827496757458 0.00135299415194303 0.00786602192155902 353123 1774723 622 665 0 True 286 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 333 562 0.00898594477264426 0.0514517697310339 0.00906385900663768 0.0527351796749828 0.00142947627776194 0.0110070890234781 366292 2242308 622 665 0 True 330 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 377 562 0.00923494649652121 0.0391963658287399 0.00927748531319142 0.0402532997634852 0.00140930043205632 0.00615584727659008 376442 1708208 622 665 0 True 375 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 422 562 0.00927424706417155 0.0463590883824347 0.00923170824750134 0.0465857938506142 0.00214287634391922 0.00674759814001832 378044 2020365 622 665 0 True 419 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 466 561 0.00934227482577852 0.0812520887937399 0.00933852140077821 0.080170901045243 0.00210231299501984 0.0178497771352049 380817 3541029 622 665 0 True 463 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 510 559 0.00909898910206544 0.0584569686977802 0.00906385900663768 0.0588235294117647 0.0020018209438503 0.010060208207217 370900 2547600 622 665 0 True 508 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 554 559 0.00907229807984099 0.0489643885405893 0.00914015411612116 0.0495307850766766 0.00183304249279869 0.00644466737916812 369812 2133906 622 665 0 True 552 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 596 565 0.00982023547467456 0.027995945459896 0.00946059357595178 0.031815060654612 0.00273053347567839 0.0119836590523162 400300 1220085 622 665 0 False 596 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 641 565 0.0105834073592153 0.0336734718462441 0.00927748531319142 0.0394598306248569 0.00522756999116707 0.0141451812563707 431409 1467516 622 665 0 False 641 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 685 565 0.0107837126868464 0.0374675071748954 0.00927748531319142 0.0434424353398947 0.00586522331789099 0.0165353368660416 439574 1632863 622 665 0 False 685 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 286 609 0.0086143066332342 0.00855150005937251 0.00845349813076982 0.0085145342183566 0.00180976006856975 0.00142379910139419 351143 372681 622 665 0 False 286 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 331 609 0.00851355293077482 0.00847961056222612 0.00860608834973678 0.00848401617456321 0.00148279286249561 0.0014063092949935 347036 369548 622 665 0 False 331 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 378 604 0.00902544159781094 0.0699396694987641 0.00904859998474098 0.0679636835278859 0.00140806786079009 0.0128816786474927 367902 3048025 622 665 0 True 375 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 422 603 0.00897169157051888 0.0749480476196213 0.00900282291905089 0.0753643091477836 0.00192368940750159 0.0180194607355464 365711 3266294 622 665 0 True 419 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 463 609 0.00872058007834109 0.00894169504787375 0.00872816052491035 0.00891126878767071 0.00186501068898469 0.00196851938861977 355475 389686 622 665 0 False 463 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 508 609 0.00860800186052125 0.00872570531386833 0.00862134737163348 0.00877393759060044 0.00196948688381673 0.00190951406886364 350886 380273 622 665 0 False 508 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 552 609 0.00866506373340183 0.00852642019330772 0.00868238345922026 0.0085297932402533 0.00186290511129779 0.00190545054764766 353212 371588 622 665 0 False 552 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 596 608 0.0085396551804502 0.00869920280215301 0.00854505226215 0.00872816052491035 0.00161545017059854 0.00151174857557853 348100 379118 622 665 0 False 596 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 641 608 0.00851899907685371 0.00878598418683468 0.00849927519645991 0.00872816052491035 0.00138283326389705 0.00152146218405121 347258 382900 622 665 0 False 641 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 685 608 0.00861025882195935 0.00868756923207538 0.00863660639353018 0.00880445563439384 0.00151023071507399 0.00165334464240789 350978 378611 622 665 0 False 685 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 288 657 0.00849390264694965 0.0349772577472521 0.00846875715266651 0.0353551537346456 0.00133316900350767 0.00828833182411043 346235 1524336 622 665 0 True 286 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 331 652 0.0082413192233992 0.0083252535091448 0.00828564888990616 0.00834668497749294 0.0013341765813336 0.00124667982998205 335939 362821 622 665 0 False 331 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 375 652 0.00839896307341233 0.00841338870178422 0.00840772106507973 0.00845349813076982 0.00134427397707982 0.00124648645862277 342365 366662 622 665 0 False 375 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 419 652 0.00861106838421432 0.00860014536226123 0.00860608834973678 0.00856031128404669 0.00150911752945789 0.00144517090390215 351011 374801 622 665 0 False 419 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 464 652 0.00841436928844629 0.00830522174054959 0.00836194399938964 0.00828564888990616 0.00175435729105273 0.00152350554184849 342993 361948 622 665 0 False 464 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 508 652 0.00849912800332264 0.00861632222006148 0.00849927519645991 0.00854505226215 0.00166559894176432 0.00167853985155016 346448 375506 622 665 0 False 508 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 552 652 0.00856180774760891 0.00844390674557761 0.00863660639353018 0.00854505226215 0.0015943235647821 0.00168276338684925 349003 367992 622 665 0 False 552 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 597 652 0.00858155616019225 0.00860081079329131 0.00863660639353018 0.00862134737163348 0.00130583840518329 0.00124047389093905 349808 374830 622 665 0 False 597 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 641 651 0.00859757567996483 0.00865069517464983 0.00854505226215 0.00871290150301366 0.0013169934749196 0.00123258295573534 350461 377004 622 665 0 False 641 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 685 654 0.00892169496822713 0.0366870024684049 0.00880445563439384 0.0367589837491417 0.00214391013361393 0.00721708714150821 363673 1598848 622 665 0 True 685 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H2_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H2_2.csv new file mode 100755 index 0000000..6884ac4 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H2_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 285 264 0.00733571344636294 0.684988919999702 0.00700389105058366 0.684473945220111 0.00234055656122793 0.197971081999833 299024 29852348 622 665 8 True 285 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 330 264 0.0057306949454122 0.0054335197113865 0.00566109712367437 0.00532539864194705 0.00129771817368171 0.00123878536418673 233599 236797 622 665 0 False 330 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 374 265 0.00524142495713613 0.00528616115706983 0.00527962157625696 0.00524910353246357 0.00122310173627106 0.00110958730824882 213655 230375 622 665 0 True 374 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 417 264 0.00523386904275642 0.00523067797669959 0.00518806744487678 0.00526436255436027 0.00148891681787215 0.00129556780961595 213347 227957 622 665 0 True 418 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 462 263 0.00532898034162055 0.00543921029398858 0.00535591668574044 0.00549324788281071 0.00154674174263088 0.00153898550803132 217224 237045 622 665 0 True 463 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 505 264 0.0054139598462028 0.0056503813895003 0.00546272983901732 0.00570687418936446 0.00151314190650322 0.00148849305030695 220688 246248 622 665 0 True 507 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 549 263 0.00560734709638231 0.00550919528163508 0.00563057907988098 0.00549324788281071 0.00147359136011343 0.00135491316247904 228571 240095 622 665 0 True 551 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 594 262 0.00567274991370802 0.00579902491408195 0.00566109712367437 0.00585946440833143 0.00177439167956779 0.00178324708753943 231237 252726 622 665 0 True 596 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 640 263 0.00661873567473457 0.00607676205849942 0.00648508430609598 0.00604257267109178 0.00245745938882926 0.00172060871314978 269798 264830 622 665 0 False 640 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 681 263 0.00737790881237953 0.644586793144454 0.00729381246662089 0.626123445487144 0.00193382896577136 0.184616330902149 300744 28091592 622 665 2 True 684 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 286 307 0.00559508100161005 0.00536036818987271 0.00561532005798428 0.00538643472953384 0.0013607491918067 0.00132469163341482 228071 233609 622 665 0 False 286 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 330 307 0.00538668005142928 0.00528588580629876 0.00538643472953384 0.00531013962005036 0.0012630613957649 0.00117528940895791 219576 230363 622 665 0 False 330 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 374 308 0.00534948925207978 0.00536904173916136 0.00532539864194705 0.00535591668574044 0.0012623884203674 0.00121894128490113 218060 233987 622 665 0 True 374 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 418 309 0.00550909567725648 0.00536649474452898 0.00546272983901732 0.00535591668574044 0.00146505865101101 0.00144419095934216 224566 233876 622 665 0 True 418 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 462 308 0.00555283657121437 0.00547282603395649 0.00546272983901732 0.00546272983901732 0.00168430688201048 0.00168548872464224 226349 238510 622 665 0 True 463 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 507 307 0.00558666646059627 0.00554974068267487 0.00560006103608759 0.0055390249485008 0.00155710418419503 0.00154307340038883 227728 241862 622 665 0 True 507 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 549 307 0.00555816005634553 0.00553668446694672 0.0055542839703975 0.00547798886091402 0.0014853725223696 0.00141691335022526 226566 241293 622 665 0 True 551 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 595 307 0.00553995717170349 0.00555712926169854 0.00550850690470741 0.00558480201419089 0.00182034855583532 0.00203877316001875 225824 242184 622 665 0 True 596 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 640 306 0.00574833358969471 0.00572307399306231 0.00584420538643473 0.00587472343022812 0.00181834312768725 0.00178370564070728 234318 249416 622 665 0 False 640 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 684 306 0.00586289891486766 0.00579214114480525 0.00584420538643473 0.00587472343022812 0.00181114827500356 0.00184902930371828 238988 252426 622 665 0 False 684 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 286 347 0.00518811650925587 0.0052327431074826 0.00515754940108339 0.00523384451056687 0.00132175755018575 0.00142482619275546 211482 228047 622 665 0 True 286 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 330 347 0.00521669651007525 0.0053340721912357 0.00523384451056687 0.00538643472953384 0.00121686094452458 0.0012316170519265 212647 232463 622 665 0 True 330 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 374 346 0.00551380585764903 0.00551348616448423 0.00552376592660411 0.00552376592660411 0.00120950825398497 0.00122906849589456 224758 240282 622 665 0 True 374 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 418 347 0.00558951219458344 0.005650174876422 0.00558480201419089 0.00566109712367437 0.001523949985758 0.00141156929363211 227844 246239 622 665 0 True 419 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 462 346 0.00560550718216647 0.00572002218868297 0.00556954299229419 0.00570687418936446 0.0015573080413383 0.00163072150723646 228496 249283 622 665 0 True 463 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 507 350 0.00566229920096205 0.00555380210654813 0.00564583810177768 0.00566109712367437 0.00164004172667659 0.00167835830921093 230811 242039 622 665 0 False 507 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 552 350 0.00563771794703844 0.0056591696682769 0.00558480201419089 0.00569161516746777 0.00153079866861732 0.00149483772172001 229809 246631 622 665 0 False 552 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 595 345 0.00567851497825099 0.00584750959568755 0.00576791027695125 0.00582894636453803 0.00185503049189658 0.00203159635946391 231472 254839 622 665 0 True 596 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 639 345 0.00540628127087536 0.00556899229075206 0.00537117570763714 0.00556954299229419 0.00184590050192198 0.00180067280875672 220375 242701 622 665 0 True 640 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 683 343 0.00516140095484188 0.00540648944402664 0.00518806744487678 0.00543221179522393 0.00169849203706691 0.00186073297453282 210393 235619 622 665 0 True 684 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 285 391 0.00521458674177442 0.0052319170551694 0.00518806744487678 0.00526436255436027 0.00131042300581701 0.00126083932375761 212561 228011 622 665 0 True 286 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 330 391 0.00558229973085735 0.0615461978360871 0.00561532005798428 0.062928206301976 0.00127989485341196 0.0137373552362316 227550 2682231 622 665 0 True 330 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 374 391 0.00553193514572243 0.00555958447274056 0.0055390249485008 0.00556954299229419 0.00128801793328649 0.00127231919687956 225497 242291 622 665 0 True 374 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 419 390 0.00568837691844789 0.00583036901018855 0.00575265125505455 0.00585946440833143 0.00146604317262919 0.00145325899582993 231874 254092 622 665 0 True 419 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 463 390 0.00584710018480098 0.00597387265371027 0.00587472343022812 0.00592050049591821 0.00166038629786722 0.00162590327563035 238344 260346 622 665 0 True 463 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 507 388 0.00551809899081932 0.0057026062524129 0.00552376592660411 0.00560006103608759 0.00166616826941113 0.00167846528802907 224933 248524 622 665 0 True 507 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 551 388 0.00562672752612249 0.00560992777205086 0.00567635614557107 0.00564583810177768 0.00169549578446273 0.00144507736111062 229361 244485 622 665 0 True 552 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 595 388 0.0055148362096099 0.00541263894458049 0.00552376592660411 0.00538643472953384 0.00186643637978414 0.00194292577370182 224800 235887 622 665 0 True 596 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 640 388 0.00524795051955498 0.00505486650937254 0.00517280842298009 0.00509651331349661 0.00183699509626829 0.00184573531156887 213921 220295 622 665 0 True 640 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 684 387 0.00502581154322928 0.00508887232959946 0.00494392309452964 0.00524910353246357 0.00168520886672245 0.00179651126159978 204866 221777 622 665 0 True 685 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 286 435 0.00548034395111029 0.00544088534451258 0.0055390249485008 0.0055390249485008 0.00141070634317955 0.00146455356675171 223394 237118 622 665 0 True 286 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 330 433 0.00543253071368801 0.00548622643814847 0.00552376592660411 0.00547798886091402 0.00134043714877698 0.00132986203138305 221445 239094 622 665 0 True 330 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 375 434 0.00579631855244381 0.00557759700234794 0.00573739223315786 0.00552376592660411 0.00144010783613441 0.00124729860986932 236274 243076 622 665 0 True 374 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 420 434 0.00565383559556919 0.00579230176608837 0.00563057907988098 0.00579842832074464 0.00161296708091661 0.00159574139014058 230466 252433 622 665 0 True 419 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 464 433 0.00585745276878877 0.00590891281763576 0.00572213321126116 0.00602731364919509 0.00175968958243315 0.00160721464974309 238766 257515 622 665 0 True 463 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 507 432 0.00582757256192354 0.00631969027627434 0.00582894636453803 0.00592050049591821 0.00172002723810968 0.00296681931169474 237548 275417 622 665 0 True 507 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 552 432 0.00584393553234974 0.00563000543244125 0.00567635614557107 0.00561532005798428 0.00218961915019913 0.00166058165958652 238215 245360 622 665 0 True 552 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 596 436 0.00529421822903596 0.00529999753331601 0.00527962157625696 0.00518806744487678 0.00178992712974051 0.00200520196074825 215807 230978 622 665 0 False 596 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 640 431 0.00520114310190402 0.00512680189831411 0.00529488059815366 0.00514229037918669 0.00175395410735547 0.00170182329730607 212013 223430 622 665 0 True 640 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 684 431 0.00527841949896928 0.00536518682836641 0.00531013962005036 0.00531013962005036 0.00171043919912366 0.00179346073146874 215163 233819 622 665 0 True 685 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 288 479 0.00563560817873761 0.00565145984668698 0.00569161516746777 0.00561532005798428 0.00147156791959617 0.00155343628894876 229723 246295 622 665 0 True 286 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 333 479 0.00543380638754432 0.00535192409955996 0.00540169375143053 0.00540169375143053 0.00148338484773994 0.00143618285830619 221497 233241 622 665 0 True 330 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 376 478 0.00554991724065857 0.00563468639554941 0.00547798886091402 0.00567635614557107 0.00147609193168735 0.00136201009708981 226230 245564 622 665 0 True 375 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 421 478 0.00566956072906724 0.00573966387701917 0.00570687418936446 0.00575265125505455 0.00174946766363775 0.00178196599330244 231107 250139 622 665 0 True 419 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 465 477 0.00561635040994515 0.00585122683109697 0.00561532005798428 0.00592050049591821 0.00190463671564201 0.00193519461106539 228938 255001 622 665 0 True 463 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 509 475 0.00563663853069848 0.00553592725232628 0.00561532005798428 0.00566109712367437 0.00179021582702678 0.0016149335079632 229765 241260 622 665 0 True 508 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 552 479 0.00553718503428496 0.00555579839963837 0.0055390249485008 0.00552376592660411 0.00170686121543531 0.00181234951765245 225711 242126 622 665 0 False 552 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 597 475 0.00534279196433412 0.00531851487267035 0.00532539864194705 0.00524910353246357 0.00188836818401415 0.00176162302264398 217787 231785 622 665 0 True 596 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 641 475 0.00524947151530674 0.00524710723937333 0.00523384451056687 0.00529488059815366 0.00181285615026992 0.00170629921266216 213983 228673 622 665 0 True 640 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 685 476 0.00550764827807335 0.00544462552581958 0.00546272983901732 0.00556954299229419 0.00174289744487148 0.00176945389051052 224507 237281 622 665 0 True 685 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 288 522 0.00536810918394407 0.00540247391194856 0.00541695277332723 0.00537117570763714 0.00139296525985932 0.00139642167089809 218819 235444 622 665 0 True 286 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 332 522 0.00557815379082432 0.00546754847751101 0.0055542839703975 0.00541695277332723 0.00136509403020178 0.00144373755447627 227381 238280 622 665 0 True 330 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 376 521 0.00551135263869457 0.00562185963879715 0.0055542839703975 0.00556954299229419 0.00141138776584658 0.00146158988219098 224658 245005 622 665 0 True 375 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 421 522 0.00562120778347497 0.00570694302705723 0.00552376592660411 0.00561532005798428 0.00205512555210709 0.00172072586853827 229136 248713 622 665 0 True 419 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 465 520 0.00562898448756058 0.00560533859253306 0.00566109712367437 0.00561532005798428 0.00189559495865954 0.00167188396115808 229453 244285 622 665 0 True 463 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 509 518 0.00549729569408556 0.00589324076958246 0.00549324788281071 0.00593575951781491 0.00169876903397237 0.00173547983979463 224085 256832 622 665 0 True 508 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 553 518 0.00559628307889773 0.00567897197789622 0.00561532005798428 0.00566109712367437 0.0016924719440312 0.00176722337306319 228120 247494 622 665 0 True 552 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 598 517 0.0054574308860757 0.00552151722864038 0.00546272983901732 0.00546272983901732 0.00178983397445267 0.001682086431469 222460 240632 622 665 0 True 596 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 642 517 0.00531551216956061 0.00522051294406765 0.00520332646677348 0.00532539864194705 0.00186915311886945 0.00184362904369419 216675 227514 622 665 0 True 641 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 686 516 0.00540574156270538 0.0055760137354143 0.00537117570763714 0.0055542839703975 0.00172255975668255 0.00193888774871579 220353 243007 622 665 0 True 685 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 289 563 0.00551849150585203 0.00546943004111331 0.00552376592660411 0.00549324788281071 0.00125608251467706 0.00136847100479128 224949 238362 622 665 0 True 286 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 333 562 0.00556885609098695 0.00550701542136412 0.00549324788281071 0.00549324788281071 0.00137387810322369 0.00130442714617016 227002 240000 622 665 0 True 330 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 377 562 0.00552715136876125 0.00558163548032361 0.00552376592660411 0.00566109712367437 0.00136847297310283 0.00120849074245 225302 243252 622 665 0 True 375 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 422 562 0.0057194592026008 0.00551022784702658 0.00575265125505455 0.00556954299229419 0.00183985130065545 0.00167092746885281 233141 240140 622 665 0 True 419 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 466 561 0.0056887694334806 0.00579514705738941 0.00575265125505455 0.00582894636453803 0.00185271311732439 0.00171379619186197 231890 252557 622 665 0 True 463 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 510 559 0.00564853664262757 0.00576295396307202 0.00558480201419089 0.00584420538643473 0.00199653362989549 0.00196465287129979 230250 251154 622 665 0 True 508 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 554 559 0.00552025782349924 0.00579101679582339 0.00552376592660411 0.00575265125505455 0.00170329058893037 0.00177239062377784 225021 252377 622 665 0 True 552 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 596 565 0.00555084946386126 0.0056372333901818 0.00556954299229419 0.00573739223315786 0.00145248488226301 0.00143401573559053 226268 245675 622 665 0 False 596 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 641 565 0.005543269017292 0.00537872490794393 0.00558480201419089 0.00544747081712062 0.00171178394061791 0.00152812863858499 225959 234409 622 665 0 False 641 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 685 565 0.0053783145747946 0.00542062411694147 0.00532539864194705 0.00534065766384375 0.00157858796660947 0.00164692165153563 219235 236235 622 665 0 False 685 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 286 609 0.00579779048381648 0.00573713982828438 0.00561532005798428 0.00570687418936446 0.00151667384373563 0.00140942276322525 236334 250029 622 665 0 False 286 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 331 609 0.00562770881370427 0.00565669151133728 0.00567635614557107 0.00567635614557107 0.00144350729283756 0.00144322488782656 229401 246523 622 665 0 False 331 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 378 604 0.00554214053657296 0.00545414807331903 0.0055390249485008 0.00546272983901732 0.00119896734561914 0.00127797241284168 225913 237696 622 665 0 True 375 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 422 603 0.0054908191960458 0.00551385329884565 0.00550850690470741 0.00549324788281071 0.00172130887625047 0.00167916994376512 223821 240298 622 665 0 True 419 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 463 609 0.00548961711875812 0.0055087363636833 0.00547798886091402 0.00560006103608759 0.00199222358517471 0.00188854835591817 223772 240075 622 665 0 False 463 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 508 609 0.00552614554898992 0.00567465814914948 0.00549324788281071 0.00572213321126116 0.00190790990077054 0.0019482786073609 225261 247306 622 665 0 False 508 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 552 609 0.00549567656957562 0.00547732342988393 0.00537117570763714 0.00550850690470741 0.0018768719835578 0.00187361972827705 224019 238706 622 665 0 False 552 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 596 608 0.00554793013330547 0.0055246149248149 0.00550850690470741 0.00550850690470741 0.00159594377346804 0.00148815215672126 226149 240767 622 665 0 False 596 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 641 608 0.00551218673313909 0.00547367503216728 0.00550850690470741 0.00550850690470741 0.00145092319330548 0.0014050848500548 224692 238547 622 665 0 False 641 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 685 608 0.0057943314450907 0.00554983246626523 0.00585946440833143 0.00558480201419089 0.00149838209868107 0.00158720559700937 236193 241866 622 665 0 False 685 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 288 657 0.00761393300798744 0.664461749475543 0.00704966811627375 0.657221332112612 0.00265076195427633 0.204346375921998 310365 28957758 622 665 7 True 286 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 331 652 0.00588762736192854 0.00580698714054534 0.00576791027695125 0.00581368734264134 0.00142839646543797 0.00116824576773478 239996 253073 622 665 0 False 331 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 375 652 0.00528094631449237 0.00533703221202468 0.00532539864194705 0.00531013962005036 0.00119484967218793 0.00117193872179568 215266 232592 622 665 0 False 375 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 419 652 0.00520629486170837 0.0052922877117261 0.00523384451056687 0.00538643472953384 0.00146896611518576 0.00144866536432451 212223 230642 622 665 0 False 419 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 464 652 0.00536830544146043 0.00526807978976969 0.00541695277332723 0.00526436255436027 0.00159057230988052 0.00148674117368617 218827 229587 622 665 0 False 464 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 508 652 0.00537132290077441 0.00540128072527393 0.00538643472953384 0.00543221179522393 0.00168037519534663 0.00167894266281979 218950 235392 622 665 0 False 508 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 552 652 0.0054778171355872 0.00541463523767074 0.00563057907988098 0.00537117570763714 0.00152133764002631 0.00174375081735615 223291 235974 622 665 0 False 552 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 597 652 0.00542208000094204 0.0052952018407199 0.00549324788281071 0.00527962157625696 0.00133921229756529 0.00126494039963204 221019 230769 622 665 0 False 597 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 641 651 0.00579133851796627 0.0056355583396578 0.00579842832074464 0.00558480201419089 0.00145509355065829 0.00128573526574041 236071 245602 622 665 0 False 641 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 685 654 0.00741583557741537 0.690016251431967 0.00720225833524071 0.674570840009155 0.00209475132327818 0.179226330270565 302290 30071443 622 665 6 True 685 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H2_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H2_3.csv new file mode 100755 index 0000000..de55ada --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H2_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 285 264 0.00104774528325725 0.0695485107825641 0.000915541313801785 0.0690012970168612 0.000758075881631721 0.0214985223055987 42709 3030978 622 665 0 True 285 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 330 264 0.000996595668056906 0.00090048880498339 0.000869764248111696 0.000747692072938125 0.000700237211341917 0.000693365696598875 40624 39244 622 665 0 False 330 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 374 265 0.000889512660695041 0.000994222796634525 0.000793469138628214 0.000854505226215 0.000633935246745688 0.000669233888135272 36259 43329 622 665 0 True 374 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 417 264 0.000949837314785035 0.000952369479432158 0.000793469138628214 0.000823987182421607 0.000757461123549615 0.000733645617169608 38718 41505 622 665 0 True 418 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 462 263 0.000932345863639787 0.000975407160611531 0.000686655985351339 0.000732433051041428 0.000878503430949222 0.000863444063071034 38005 42509 622 665 0 True 463 264 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 505 264 0.000894664420499392 0.00093738580830653 0.000701915007248035 0.000701915007248035 0.000801885440355833 0.000815343752457561 36469 40852 622 665 0 True 507 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 549 263 0.000893511407590799 0.00091379742558502 0.000686655985351339 0.000747692072938125 0.000823291703575276 0.00075543678304294 36422 39824 622 665 0 True 551 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 594 262 0.000884483561838413 0.00101941739218727 0.000549324788281071 0.000686655985351339 0.000927710025849472 0.00102137492074853 36054 44427 622 665 0 True 596 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 640 263 0.000993848062827919 0.000937798834463132 0.000656137941557946 0.000564583810177768 0.000940715475666028 0.000947120401322151 40512 40870 622 665 0 False 640 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 681 263 0.00113657634159798 0.0650227307797991 0.000823987182421607 0.0629892423895628 0.00102566413546164 0.0192939675689698 46330 2833741 622 665 0 True 684 263 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 286 307 0.000866648660039541 0.000933324384433274 0.000717174029144732 0.000762951094834821 0.000672739057484807 0.000717146885223644 35327 40675 622 665 0 False 286 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 330 307 0.000938110928182751 0.000861411941389294 0.000778210116731518 0.000762951094834821 0.000696008087726183 0.000616197015422674 38240 37541 622 665 0 False 330 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 374 308 0.000975007341257721 0.00086664360603959 0.000778210116731518 0.000778210116731518 0.000756996320203095 0.000622753260182082 39744 37769 622 665 0 True 374 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 418 309 0.000910512214945157 0.000946197032980712 0.000686655985351339 0.000701915007248035 0.000799665607495923 0.000816348599400821 37115 41236 622 665 0 True 418 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 462 308 0.000978171993708965 0.000930570876722592 0.000701915007248035 0.00064087891966125 0.000934806989773814 0.000908087562913395 39873 40555 622 665 0 True 463 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 507 307 0.00087812972474638 0.000888947018496114 0.000701915007248035 0.000686655985351339 0.000797639514650551 0.000785837127814231 35795 38741 622 665 0 True 507 307 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 549 307 0.00088956172507413 0.000852141798763331 0.000717174029144732 0.000717174029144732 0.000787070626222184 0.000696467424079696 36261 37137 622 665 0 True 551 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 595 307 0.000876976711837787 0.000951336914040652 0.000503547722590982 0.000457770656900893 0.000980463204161812 0.00114633467828102 35748 41460 622 665 0 True 596 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 640 306 0.000935853966744655 0.000978183614219802 0.000549324788281071 0.000549324788281071 0.000977887418476246 0.00102995480769754 38148 42630 622 665 0 False 640 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 684 306 0.00100945053537824 0.000950487915829858 0.00064087891966125 0.000473029678797589 0.000971975047412854 0.00103039568731855 41148 41423 622 665 0 False 684 306 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 286 347 0.00102380186626179 0.000903540609362729 0.000900282291905089 0.000793469138628214 0.000752310737578873 0.000696202596131992 41733 39377 622 665 0 True 286 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 330 347 0.000897289364780656 0.000906844818615548 0.000747692072938125 0.000778210116731518 0.000716538016506079 0.000697002106706525 36576 39521 622 665 0 True 330 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 374 346 0.000882054875073505 0.000914439910717512 0.000732433051041428 0.000793469138628214 0.000690466833667449 0.000692844785710457 35955 39852 622 665 0 True 374 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 418 347 0.000857081106117175 0.000912673076603158 0.000671396963454643 0.000701915007248035 0.000776124798424948 0.000792126440618483 34937 39775 622 665 0 True 419 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 462 346 0.000904698086023104 0.000937959455746255 0.00064087891966125 0.000686655985351339 0.00089572145470766 0.000810507026172443 36878 40877 622 665 0 True 463 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 507 350 0.000911910549749195 0.000965976396702445 0.000610360875867857 0.000671396963454643 0.000897906350245008 0.00088108304201838 37172 42098 622 665 0 False 507 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 552 350 0.00105952073423862 0.000934907651366916 0.000793469138628214 0.00064087891966125 0.000983073867137301 0.000870706093577242 43189 40744 622 665 0 False 552 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 595 345 0.000944194911189794 0.000925729292331309 0.000518806744487678 0.000488288700694286 0.00104625588803415 0.00109387338835864 38488 40344 622 665 0 True 596 350 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 639 345 0.000953688868543526 0.00100888522519391 0.000518806744487678 0.000671396963454643 0.00103055914270979 0.000982826451278425 38875 43968 622 665 0 True 640 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 683 343 0.000911542566906027 0.000893375576730795 0.000534065766384375 0.000473029678797589 0.000949506632459479 0.000959602417549837 37157 38934 622 665 0 True 684 349 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 285 391 0.000916105554161309 0.000929836607999743 0.000839246204318303 0.00080872816052491 0.000711143020778616 0.000711047264192999 37343 40523 622 665 0 True 286 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 330 391 0.000861153449581567 0.00594881573354306 0.000717174029144732 0.00608834973678187 0.000694807600453972 0.00185530964985328 35103 259254 622 665 0 True 330 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 374 391 0.00095219240498131 0.000914646423795814 0.000793469138628214 0.000793469138628214 0.00073466858950721 0.00071281760626008 38814 39861 622 665 0 True 374 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 419 390 0.000966519203675314 0.000947527895040875 0.000717174029144732 0.000701915007248035 0.000878408217057503 0.000810963992180378 39398 41294 622 665 0 True 419 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 463 390 0.000894517227362125 0.000970863872888906 0.000610360875867857 0.000701915007248035 0.000882535299503143 0.000890169112581127 36463 42311 622 665 0 True 463 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 507 388 0.000944023185862982 0.000820224055217008 0.000625619897764553 0.000503547722590982 0.000950468817607891 0.000849798507129851 38481 35746 622 665 0 True 507 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 551 388 0.000945495117235654 0.000961869081034011 0.00064087891966125 0.000778210116731518 0.000885949541516433 0.000818712103203257 38541 41919 622 665 0 True 552 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 595 388 0.000930530481613492 0.000908909949398559 0.000473029678797589 0.000457770656900893 0.00104792186751534 0.00104841062200114 37931 39611 622 665 0 True 596 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 640 388 0.000928494309881296 0.000934724084186204 0.000442511635004196 0.000579842832074464 0.00103055810643263 0.00092629467315183 37848 40736 622 665 0 True 640 393 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 684 387 0.000890027836675476 0.000928391016451635 0.000564583810177768 0.000518806744487678 0.000922339111615569 0.0010452936088155 36280 40460 622 665 0 True 685 392 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 286 435 0.000922263133736986 0.000942571581161648 0.000762951094834821 0.000778210116731518 0.000803267582999661 0.00079465333492846 37594 41078 622 665 0 True 286 437 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 330 433 0.000845869895495326 0.000893742711092219 0.000656137941557946 0.000747692072938125 0.000712496825631033 0.000722701693393261 34480 38950 622 665 0 True 330 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 375 434 0.000962839375243635 0.000838947907649646 0.000823987182421607 0.000732433051041428 0.000760625780708941 0.000690687154767255 39248 36562 622 665 0 True 374 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 420 434 0.000979423135375736 0.000972102951358713 0.000747692072938125 0.000747692072938125 0.000892689026333733 0.000870537788653524 39924 42365 622 665 0 True 419 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 464 433 0.000984795684885988 0.000954778798679005 0.000686655985351339 0.000656137941557946 0.000973058468559026 0.000917576810675904 40143 41610 622 665 0 True 463 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 507 432 0.000918705966253029 0.000969188822364907 0.000625619897764553 0.000732433051041428 0.000921842443597835 0.000944130321201392 37449 42238 622 665 0 True 507 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 552 432 0.000863533071967386 0.00096632058516628 0.000564583810177768 0.000747692072938125 0.000919606731997884 0.000880627021207485 35200 42113 622 665 0 True 552 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 596 436 0.000891769622133138 0.00094975364710701 0.000488288700694286 0.000534065766384375 0.000962292440163424 0.00102098347585303 36351 41391 622 665 0 False 596 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 640 431 0.000957344164785661 0.000950740320703338 0.000610360875867857 0.000518806744487678 0.00103652625286888 0.000998471789528541 39024 41434 622 665 0 True 640 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 684 431 0.000888923888145972 0.000897276379320928 0.000579842832074464 0.000518806744487678 0.000918089188889366 0.000889577625766912 36235 39104 622 665 0 True 685 436 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 288 479 0.000926482670338645 0.000995438929206743 0.000778210116731518 0.000885023270008392 0.000804516216792339 0.000844204337788846 37766 43382 622 665 0 True 286 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 333 479 0.000854210839940465 0.000918684901771481 0.000747692072938125 0.00080872816052491 0.000756653639269577 0.000778135826053476 34820 40037 622 665 0 True 330 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 376 478 0.00092986811249579 0.000912282996344145 0.000793469138628214 0.000732433051041428 0.00079586159038141 0.000791596767831559 37904 39758 622 665 0 True 375 480 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 421 478 0.000933400747790202 0.000924421376168735 0.000656137941557946 0.000610360875867857 0.000979495044421725 0.000916564470149389 38048 40287 622 665 0 True 419 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 465 477 0.000914609090599093 0.000985686922731411 0.000503547722590982 0.000671396963454643 0.00100645027954495 0.000998081520660367 37282 42957 622 665 0 True 463 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 509 475 0.000941103855307183 0.00090771676272393 0.00064087891966125 0.000534065766384375 0.00094495167404374 0.000910811062154717 38362 39559 622 665 0 True 508 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 552 479 0.000883919321478889 0.000892962550574192 0.000549324788281071 0.000549324788281071 0.000952518896568601 0.000922919661187181 36031 38916 622 665 0 False 552 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 597 475 0.000915246927527251 0.000913407345326007 0.000503547722590982 0.000503547722590982 0.000985265652044264 0.000924078305029045 37308 39807 622 665 0 True 596 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 641 475 0.000961146654165063 0.000944797333227782 0.000656137941557946 0.000595101853971161 0.00099926992364718 0.000927072145223678 39179 41175 622 665 0 True 640 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 685 476 0.000926850653181813 0.000916711554578825 0.000549324788281071 0.000549324788281071 0.000991023759051926 0.000969599703042958 37781 39951 622 665 0 True 685 479 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 288 522 0.000801025053007929 0.000907946221699821 0.000610360875867857 0.000686655985351339 0.00075446072850042 0.000827478662055879 32652 39569 622 665 0 True 286 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 332 522 0.000922287665926531 0.000920681194861725 0.000839246204318303 0.000793469138628214 0.000747219157144886 0.000768957757295797 37595 40124 622 665 0 True 330 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 376 521 0.000957982001713819 0.000982933415020729 0.000762951094834821 0.000793469138628214 0.000846470895657091 0.000835303309867859 39050 42837 622 665 0 True 375 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 421 522 0.000927120507266802 0.00100610877158564 0.000595101853971161 0.00064087891966125 0.000999382470061211 0.00100490385149615 37792 43847 622 665 0 True 419 523 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 465 520 0.000941643563477163 0.001049637139312 0.000701915007248035 0.000686655985351339 0.000947303727870604 0.000983767258568076 38384 45744 622 665 0 True 463 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 509 518 0.000940294293052214 0.000860677672666445 0.000610360875867857 0.000549324788281071 0.000930462094757143 0.000871991011555026 38329 37509 622 665 0 True 508 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 553 518 0.000966911718708027 0.000991170992255186 0.000625619897764553 0.000686655985351339 0.000939747860231962 0.000916721833394223 39414 43196 622 665 0 True 552 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 598 517 0.000891524300237692 0.000870337895551421 0.000595101853971161 0.000579842832074464 0.000900140097525203 0.000865643762446442 36341 37930 622 665 0 True 596 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 642 517 0.00098935867214127 0.000959826896148588 0.000625619897764553 0.000518806744487678 0.00101957316391456 0.00101611669634568 40329 41830 622 665 0 True 641 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 686 516 0.000837234564775652 0.000818686680078544 0.000457770656900893 0.000473029678797589 0.000912641348111691 0.000915889023044267 34128 35679 622 665 0 True 685 522 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 289 563 0.000912401193540086 0.000936513864198147 0.000793469138628214 0.000839246204318303 0.000704875468216602 0.000710906521850627 37192 40814 622 665 0 True 286 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 333 562 0.000972922105146436 0.000926853641313171 0.000854505226215 0.000762951094834821 0.000787084735294901 0.000750831997633527 39659 40393 622 665 0 True 330 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 377 562 0.000897976266087903 0.000908359247856423 0.000747692072938125 0.000762951094834821 0.000729901809024915 0.00070095752977722 36604 39587 622 665 0 True 375 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 422 562 0.000894713484878481 0.00102093182142814 0.000625619897764553 0.000701915007248035 0.00089008403613236 0.000994300438370594 36471 44493 622 665 0 True 419 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 466 561 0.000965905898936701 0.000923916566421777 0.000549324788281071 0.00064087891966125 0.00105444012046365 0.000927393530679886 39373 40265 622 665 0 True 463 566 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 510 559 0.00100655573701198 0.000896679785983613 0.000534065766384375 0.000457770656900893 0.00113305379725021 0.0010623545122463 41030 39078 622 665 0 True 508 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 554 559 0.000961882619851399 0.00100060175616427 0.000610360875867857 0.00064087891966125 0.000986924645052445 0.00100222235230363 39209 43607 622 665 0 True 552 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 596 565 0.000941643563477163 0.000890484393634579 0.00064087891966125 0.000671396963454643 0.000866825731414833 0.000785468077185157 38384 38808 622 665 0 False 596 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 641 565 0.000973829796159584 0.00100239153617622 0.000671396963454643 0.000823987182421607 0.000899684970442023 0.000851455314358406 39696 43685 622 665 0 False 641 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 685 565 0.000896160884061608 0.00092056646537378 0.00064087891966125 0.000595101853971161 0.000847045240878523 0.000867546109646443 36530 40119 622 665 0 False 685 565 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 286 609 0.000912474790108719 0.000936995728047516 0.000793469138628214 0.000778210116731518 0.000704791081746152 0.000801585419304713 37195 40835 622 665 0 False 286 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 331 609 0.000951505503674063 0.000914829990976526 0.00080872816052491 0.000823987182421607 0.000772128529728594 0.000752421427037496 38786 39869 622 665 0 False 331 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 378 604 0.000942526722300766 0.000886813050020336 0.000823987182421607 0.000778210116731518 0.000720977566540112 0.0006519666324742 38420 38648 622 665 0 True 375 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 422 603 0.000983348285702861 0.000900534696778568 0.000823987182421607 0.000625619897764553 0.000884137453753826 0.000854484086644854 40084 39246 622 665 0 True 419 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 463 609 0.00091583570007632 0.000963911265919434 0.000610360875867857 0.000503547722590982 0.000943405321198359 0.00104667865302722 37332 42008 622 665 0 False 463 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 508 609 0.000960361624099638 0.000943168174498962 0.000488288700694286 0.000488288700694286 0.00104788752916802 0.00107283167732543 39147 41104 622 665 0 False 508 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 552 609 0.00095690258537386 0.000910493216332201 0.000534065766384375 0.000503547722590982 0.00104527494678694 0.000978642717783163 39006 39680 622 665 0 False 552 609 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 596 608 0.000932983700567945 0.000963658861045954 0.000656137941557946 0.000701915007248035 0.000866424960265666 0.000840604619106167 38031 41997 622 665 0 False 596 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 641 608 0.000950941263314539 0.000959253248708863 0.000747692072938125 0.000732433051041428 0.000799968397909674 0.000852275709130376 38763 41805 622 665 0 False 641 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 685 608 0.000872585449909317 0.000922608650259203 0.00064087891966125 0.000671396963454643 0.000780698257928321 0.000826376751013102 35569 40208 622 665 0 False 685 608 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 288 657 0.00109769282116991 0.0677361290614956 0.000946059357595178 0.0658426794842451 0.000789053454723516 0.0223851936674806 44745 2951993 622 665 0 True 286 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 331 652 0.000894296437656224 0.000933485005716397 0.000732433051041428 0.00080872816052491 0.00068642596653178 0.000665002787506046 36454 40682 622 665 0 False 331 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 375 652 0.000907053176219379 0.000834542295312555 0.000793469138628214 0.000701915007248035 0.00066446245794599 0.000657355293990873 36974 36370 622 665 0 False 375 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 419 652 0.000919417399749821 0.000804460223573353 0.000762951094834821 0.000625619897764553 0.000743699152161674 0.000660875700472829 37478 35059 622 665 0 False 419 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 464 652 0.000975988628839502 0.000943489417065208 0.000762951094834821 0.000701915007248035 0.000874803511955022 0.000846066824439471 39784 41118 622 665 0 False 464 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 508 652 0.000935240662006041 0.000969991928780523 0.000610360875867857 0.000625619897764553 0.000923246816584047 0.000981350162036612 38123 42273 622 665 0 False 508 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 552 652 0.000890886463309535 0.000965104452594062 0.000656137941557946 0.000610360875867857 0.000806735628246087 0.000916376557413139 36315 42060 622 665 0 False 552 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 597 652 0.000991836423285267 0.000871967054280242 0.000823987182421607 0.000762951094834821 0.00073396471138772 0.000624841811398529 40430 38001 622 665 0 False 597 652 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 641 651 0.00100346468112937 0.000926348831566213 0.000839246204318303 0.000762951094834821 0.000775228502279797 0.000711943405404845 40904 40371 622 665 0 False 641 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 685 654 0.00102129958292825 0.0697647299755454 0.000854505226215 0.0676279850461585 0.000806272608598105 0.0194186567696069 41631 3040401 622 665 0 True 685 651 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H3_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H3_1.csv new file mode 100755 index 0000000..02bfcbb --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H3_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 285 280 0.00880329605414607 0.0377310637546028 0.00869764248111696 0.0381628137636378 0.00134756761047877 0.00829382553758344 334039 1644349 579 665 0 True 285 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 329 279 0.00882398401993002 0.00891386167409827 0.00891126878767071 0.0089570458533608 0.00130989429544327 0.00131641506503436 334824 388473 579 665 0 False 329 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 373 279 0.00933185381435358 0.0540990608817764 0.00918593118181125 0.0559548332951858 0.00228126023702625 0.011830548380547 354095 2357679 579 665 0 True 373 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 417 280 0.0091253167597691 0.0726901483509644 0.00901808194094758 0.07348744945449 0.00151659711789593 0.012630898976147 346258 3167893 579 665 0 True 417 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 461 279 0.00908109458577488 0.0710052540369004 0.00912489509422446 0.0704051270313573 0.00181327191944633 0.0210345064265091 344580 3094464 579 665 0 True 461 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 504 277 0.00888309625846938 0.0561646276368422 0.00888075074387732 0.0582131685358969 0.00167039671045692 0.017555151044655 337067 2447698 579 665 0 True 505 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 548 277 0.0088053516736762 0.0693722403972853 0.00889600976577401 0.0698252841992828 0.00155355119401712 0.0241757266731801 334117 3023296 579 665 0 True 549 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 592 278 0.00871930554847289 0.0559040999156165 0.00877393759060044 0.0567025253681239 0.00181907045261429 0.0176404383656983 330852 2436344 579 665 0 True 593 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 637 279 0.00858036675151368 0.00858722682191861 0.0085297932402533 0.00866712443732357 0.00191117440793892 0.00191750294759644 325580 374238 579 665 0 False 637 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 676 276 0.00831031632426766 0.0367840865611041 0.00822461280231937 0.0369573510337987 0.00189116727170654 0.00774834260845006 315333 1603079 579 665 0 True 681 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 285 322 0.00879944835605122 0.00868424207692498 0.00881971465629053 0.00865186541542687 0.00144648931832862 0.00138728216309616 333893 378466 579 665 0 False 285 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 329 322 0.00886812713163463 0.00899910568364147 0.00891126878767071 0.0089417868314641 0.00129972690963424 0.00124129020259996 336499 392188 579 665 0 False 329 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 373 324 0.0090921633063217 0.0889083087668817 0.00914015411612116 0.0876478217746242 0.0015911533656687 0.0224366603407288 345000 3874693 579 665 0 True 373 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 417 323 0.00917892099213159 0.0450500708167764 0.00927748531319142 0.045639734493019 0.00166141865414921 0.010095564288137 348292 1963317 579 665 0 True 417 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 461 324 0.00959842550085631 0.064563858719814 0.00935378042267491 0.0627145799954223 0.00254094951797923 0.0163956840333059 364210 2813743 579 665 0 True 461 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 505 322 0.00902817555992243 0.034832492079363 0.00898756389715419 0.0365758754863813 0.00164728238196113 0.00783036437191631 342572 1518027 579 665 0 False 505 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 548 321 0.00895614981407844 0.0351456347437603 0.00891126878767071 0.0371252002746624 0.00152708845398021 0.00836958477553297 339839 1531674 579 665 0 True 549 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 593 322 0.0089091604599475 0.0421005821947866 0.00892652780956741 0.0437170977340352 0.0019935620949076 0.0105804688328035 338056 1834776 579 665 0 True 593 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 637 322 0.00876761260743083 0.00858532231241872 0.00888075074387732 0.00868238345922026 0.00192465518860978 0.001912442824687 332685 374155 579 665 0 False 637 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 682 322 0.00871606399459846 0.00841747307155506 0.00866712443732357 0.00842298008697642 0.00197217234796574 0.00202218621531136 330729 366840 579 665 0 False 682 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 286 363 0.00906280484277607 0.0474250859467277 0.00904859998474098 0.0475776302738994 0.00140033392049241 0.0123598425233038 343886 2066822 579 665 0 True 285 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 330 362 0.00908539030351091 0.0612640091875374 0.00909437705043107 0.0602578774700542 0.00141467582145794 0.0240573330687269 344743 2669933 579 665 0 True 329 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 374 361 0.00923945635188411 0.0359717788405553 0.00912489509422446 0.0363012130922408 0.00191024035462942 0.00900776369984062 350589 1567678 579 665 0 True 373 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 417 361 0.00941642411015063 0.0282752199794519 0.00941481651026169 0.0288853284504463 0.0017629654538786 0.00510193228773685 357304 1232256 579 665 0 True 417 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 462 361 0.00962891719055316 0.0618984173640785 0.00949111161974517 0.06152437628748 0.00192762975661317 0.014040076396 365367 2697581 579 665 0 True 461 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 505 365 0.00957436421071523 0.0243896305194205 0.00953688868543526 0.02734416723888 0.00188530791080501 0.00761565960682294 363297 1062919 579 665 0 False 505 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 549 365 0.00936490185141481 0.0225792909832374 0.00935378042267491 0.0246433203631647 0.00191438742519675 0.00672350970305985 355349 984023 579 665 0 False 549 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 594 360 0.00911369460319493 0.0417660998456315 0.00912489509422446 0.0424811169604028 0.00206805684175486 0.00840474843602156 345817 1820199 579 665 0 True 593 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 638 360 0.00878856411418018 0.0504966926356863 0.00869764248111696 0.0507515068284123 0.00196740680026348 0.0143261884792596 333480 2200685 579 665 0 True 638 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 681 359 0.00871042421793889 0.0564064085597376 0.00875867856870375 0.0593881132219425 0.00185831157620225 0.0177770107991398 330515 2458235 579 665 0 True 682 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 286 405 0.00910452337759899 0.036906755329615 0.00917067215991455 0.0391393911650263 0.00148873849973196 0.00832959087353932 345469 1608425 579 665 0 True 285 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 330 406 0.00934864137384959 0.0264228894506809 0.00929274433508812 0.0269626916914626 0.0014236650504833 0.00309657058762214 354732 1151530 579 665 0 True 329 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 373 405 0.00944362153777998 0.0761568604505083 0.00941481651026169 0.0753337911039902 0.00144339064905031 0.0235049131160651 358336 3318975 579 665 0 True 373 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 418 406 0.00940841246480246 0.0582235171357095 0.00933852140077821 0.0595559624628061 0.00160589640894388 0.0170272584842304 357000 2537426 579 665 0 True 417 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 462 405 0.00939739645244871 0.0403851927828268 0.00941481651026169 0.0407415884641794 0.00175766616239468 0.0110377167675987 356582 1760018 579 665 0 True 461 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 506 404 0.00961418525058727 0.0478310677127701 0.00953688868543526 0.0484779125658045 0.00169210890519555 0.0116993087433473 364808 2084515 579 665 0 True 505 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 549 403 0.00926472993046603 0.0364353318636486 0.00927748531319142 0.0383154039826047 0.00162059257703788 0.00750818449008327 351548 1587880 579 665 0 True 549 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 594 403 0.00910017495166988 0.0446841984797196 0.00914015411612116 0.0464179446097505 0.00195114843218599 0.00964074253486126 345304 1947372 579 665 0 True 593 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 638 403 0.00885892955194214 0.0401728055547429 0.00881971465629053 0.042221713588159 0.00187036931829694 0.00873640008266027 336150 1750762 579 665 0 True 638 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 682 402 0.0114780260201901 0.0728357859629619 0.00906385900663768 0.0725719081406882 0.016501562656693 0.0183462071538178 435531 3174240 579 665 0 True 682 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 285 450 0.00917141007461767 0.0411348811488552 0.00914015411612116 0.042221713588159 0.00156587930649539 0.0103041996856556 348007 1792690 579 665 0 True 285 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 329 449 0.00942675491599434 0.0457118993409365 0.0093690394445716 0.0461280231937133 0.00157005694778471 0.00755979191913972 357696 1992160 579 665 0 True 329 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 374 449 0.00938097785030425 0.032097685275216 0.00932326237888151 0.0329442282749676 0.00150790859550358 0.00488661486355391 355959 1398842 579 665 0 True 373 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 418 447 0.0096113126540644 0.0512594142715452 0.00961318379491875 0.0502937361715114 0.00171279493342512 0.0143826735496013 364699 2233925 579 665 0 True 417 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 462 450 0.0097532031098361 0.0861584953457115 0.00976577401388571 0.0830090791180285 0.00188082650988303 0.0196981796249344 370083 3754854 579 665 0 True 461 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 506 448 0.00933177475206395 0.0569629613057592 0.00924696726939803 0.0561074235141527 0.00180032635512997 0.0187465123363602 354092 2482490 579 665 0 True 505 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 550 446 0.00940862329757478 0.0441185821041503 0.00943007553215839 0.045792324711986 0.00173575132331525 0.00945132875176598 357008 1922722 579 665 0 True 549 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 594 451 0.00938711835479808 0.0272222556849895 0.00947585259784848 0.0289768825818265 0.00196360478597943 0.00760922502184474 356192 1186367 579 665 0 False 594 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 639 447 0.00905537298755177 0.0343200872403026 0.00903334096284428 0.0352483405813687 0.00183346403026051 0.00583376974915911 343604 1495696 579 665 0 True 638 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 682 447 0.00916271322275945 0.0710535092595301 0.00923170824750134 0.070923933775845 0.00202767602944653 0.0128221983754791 347677 3096567 579 665 0 True 682 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 286 493 0.00930781887830904 0.0545226192053721 0.00935378042267491 0.0545510032806897 0.00155586914348732 0.0181557650592041 353183 2376138 579 665 0 True 285 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 330 493 0.00931677927113266 0.0502025262285951 0.00935378042267491 0.0512245365072099 0.00163022365463124 0.00887758070032348 353523 2187865 579 665 0 True 329 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 375 493 0.00945959212028326 0.064301059354727 0.00955214770733196 0.0625925078202487 0.00163685833293476 0.0205975688836363 358942 2802290 579 665 0 True 373 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 419 493 0.0095082944906893 0.0788446281645978 0.00953688868543526 0.0784466315709163 0.00179421565410551 0.0212373797612112 360790 3436110 579 665 0 True 417 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 463 492 0.00964807661873779 0.0885056771018873 0.00976577401388571 0.086503395132372 0.00192383219480858 0.0315295289515521 366094 3857146 579 665 0 True 461 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 507 492 0.00937238641483219 0.0415501330575236 0.00952162966353857 0.0413824673838407 0.00193113340549276 0.00973269284752501 355633 1810787 579 665 0 True 505 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 551 491 0.00934951105903542 0.035277022953355 0.00941481651026169 0.0362859540703441 0.00179788101823926 0.00601565449397762 354765 1537400 579 665 0 True 550 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 595 491 0.00927084408086333 0.0884713270931965 0.00915541313801785 0.084443427176318 0.00201050456412584 0.0239065382614715 351780 3855649 579 665 0 True 594 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 639 491 0.00907540210092222 0.0590706108370032 0.00915541313801785 0.0611123826962692 0.00187029522050108 0.0190725957248307 344364 2574343 579 665 0 True 638 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 683 490 0.00897177779332669 0.0725286551237329 0.0089417868314641 0.0720225833524071 0.00187021766865278 0.0194090100543479 340432 3160855 579 665 0 True 682 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 287 538 0.00901650069515518 0.0481605478562508 0.00901808194094758 0.0516823071641108 0.00146176260952673 0.012813981897707 342129 2098874 579 665 0 True 285 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 330 535 0.00934028712524639 0.0987161655569457 0.00933852140077821 0.0930952925917449 0.00149726502829333 0.0317918337942642 354415 4302127 579 665 0 True 329 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 374 536 0.00955673332012993 0.054099863988192 0.00953688868543526 0.0554512855725948 0.00145578804608626 0.0152741766921082 362628 2357714 579 665 0 True 373 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 419 536 0.00962048387966034 0.0553846047942011 0.00949111161974517 0.0563820859082933 0.00179168351513086 0.0105268001876119 365047 2413704 579 665 0 True 417 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 463 536 0.00955789290037769 0.0505217954476486 0.00953688868543526 0.0520790417334249 0.002011535554141 0.00844970039540846 362672 2201779 579 665 0 True 461 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 508 534 0.0095448739766869 0.0587341092488603 0.00959792477302205 0.058808270389868 0.00193799034570752 0.0154873023797541 362178 2559678 579 665 0 True 505 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 552 535 0.00920232342985916 0.0696039480711392 0.00926222629129473 0.0680094605935759 0.00175288060032508 0.0198062000470364 349180 3033394 579 665 0 True 550 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 596 533 0.00920034687261866 0.0514202879595418 0.00912489509422446 0.0527504386968795 0.00174889990204293 0.0133161815197087 349105 2240936 579 665 0 True 594 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 640 533 0.00897504570129766 0.0449084028450618 0.0089417868314641 0.0438086518654154 0.00180332465902991 0.0109692415064237 340556 1957143 579 665 0 True 638 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 684 532 0.00890265099810211 0.0610849164568551 0.0089417868314641 0.0590524147402152 0.00189133604081046 0.0195258104991221 337809 2662128 579 665 0 True 682 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 287 580 0.00889058082188676 0.0409169639594523 0.00885023270008392 0.0425574120698863 0.00151255565164816 0.0106345770458494 337351 1783193 579 665 0 True 285 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 332 579 0.00923993072562183 0.0562284172321396 0.00924696726939803 0.0585030899519341 0.00141994923348518 0.0146005984977037 350607 2450478 579 665 0 True 329 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 376 578 0.00925374027220883 0.0393316777868223 0.00924696726939803 0.0404211490043488 0.00135123141460538 0.00719590003512551 351131 1714105 579 665 0 True 373 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 420 578 0.00934571606913365 0.0469666269128991 0.00935378042267491 0.0457770656900893 0.00177620159283359 0.00896032397249442 354621 2046842 579 665 0 True 417 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 464 576 0.00948020102377759 0.0849282969382715 0.00947585259784848 0.0806591897459373 0.00204015147788833 0.0247522589453717 359724 3701241 579 665 0 True 461 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 507 575 0.00923571407017543 0.0569846681248785 0.00920119020370794 0.0565194171053635 0.00203952931005363 0.0130680485455362 350447 2483436 579 665 0 True 506 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 553 575 0.0090493378994441 0.0476850629664112 0.00901808194094758 0.0482642862592508 0.00185691158304927 0.00818876810272761 343375 2078152 579 665 0 True 550 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 594 579 0.00904638624063161 0.0311063307157801 0.00904859998474098 0.034882124055848 0.00189976019271002 0.0109086569034583 343263 1355638 579 665 0 False 594 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 640 575 0.00892552635389888 0.0424713649539275 0.00901808194094758 0.0416571297779812 0.00174108032686821 0.00989601147545762 338677 1850935 579 665 0 True 638 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 685 574 0.00862524777792141 0.0464941479356436 0.00862134737163348 0.0460669871061265 0.00174699175201108 0.0100037913681302 327283 2026251 579 665 0 True 682 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 285 623 0.00861755238173171 0.00852653492279566 0.00866712443732357 0.00849927519645991 0.00139126622350332 0.00137286186137007 326991 371593 579 665 0 False 285 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 329 623 0.00869450634362869 0.00872515461232619 0.00872816052491035 0.00871290150301366 0.00145978777908595 0.00138133175320684 329911 380249 579 665 0 False 329 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 375 620 0.00896297552508231 0.0751573371515307 0.00891126878767071 0.0705424582284276 0.00141364434338735 0.0232515894390303 340098 3275415 579 665 0 True 373 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 420 619 0.00916598113073042 0.0892006165562682 0.00920119020370794 0.0833142595559625 0.00160555258761747 0.034427202053224 347801 3887432 579 665 0 True 417 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 461 622 0.00906870816040105 0.00890101197144842 0.00901808194094758 0.00889600976577401 0.00189726092781516 0.0019107787321255 344110 387913 579 665 0 False 461 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 506 622 0.00873419561301803 0.00866542644090198 0.00880445563439384 0.00865186541542687 0.00198994599026736 0.00193430447050378 331417 377646 579 665 0 False 506 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 550 622 0.00858479423973241 0.00846921607061829 0.00859082932784009 0.0085297932402533 0.00187420220046128 0.00196587661431025 325748 369095 579 665 0 False 550 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 594 622 0.00867650649569183 0.0083664184494195 0.00863660639353018 0.00849927519645991 0.00161160695838617 0.00156903522554445 329228 364615 579 665 0 False 594 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 638 622 0.00844991397364037 0.00858669906627406 0.00837720302128634 0.00857557030594339 0.00151541279130581 0.00160553085074259 320630 374215 579 665 0 False 638 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 682 622 0.00851060745797213 0.00860154506201416 0.00860608834973678 0.00865186541542687 0.00140669719893162 0.00146451195706092 322933 374862 579 665 0 False 682 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 283 670 0.00861786863089019 0.0354853258116681 0.00868238345922026 0.0364690623331045 0.0013408266959003 0.00801430135267546 327003 1546478 579 665 0 True 285 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 329 666 0.00859528317015536 0.00842286535748848 0.00854505226215 0.00843823910887312 0.00130752656565292 0.0012723973771208 326146 367075 579 665 0 False 329 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 373 666 0.00853382541702393 0.00842194752158492 0.00854505226215 0.00843823910887312 0.00131538482908154 0.00122872171962933 323814 367035 579 665 0 False 373 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 417 665 0.00861404728689188 0.00847112058011818 0.00863660639353018 0.00843823910887312 0.00139235062702626 0.00137565772101545 326858 369178 579 665 0 False 417 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 462 665 0.00858363465948465 0.008538352060054 0.00860608834973678 0.0085297932402533 0.00161487856172709 0.00151208676968639 325704 372108 579 665 0 False 462 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 506 665 0.00861984518813069 0.00825095469275156 0.00862134737163348 0.00836194399938964 0.0016875206868974 0.00167717377291681 327078 359583 579 665 0 False 506 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 550 665 0.00848496492203865 0.00833174719816249 0.00849927519645991 0.00840772106507973 0.0019427244719209 0.00173542436056322 321960 363104 579 665 0 False 550 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 594 665 0.00827552891683477 0.00829436833098998 0.00831616693369955 0.00833142595559625 0.00129654989518078 0.00130512782609218 314013 361475 579 665 0 False 594 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 638 665 0.00837190584788178 0.00885943400501712 0.00840772106507973 0.00863660639353018 0.00145333959406765 0.00251617573434045 317670 386101 579 665 0 False 638 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 679 666 0.00854167893779287 0.0367590984786296 0.00857557030594339 0.0364232852674144 0.00145629843556271 0.00768609139475011 324112 1601990 579 665 0 True 682 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H3_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H3_2.csv new file mode 100755 index 0000000..2d10887 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H3_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 285 280 0.00698544318300561 0.682533456552803 0.00683604180972 0.691004806591897 0.00172250526271847 0.200000246159067 265061 29745337 579 665 7 True 285 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 329 279 0.00555012002314417 0.00557190641974586 0.00561532005798428 0.00563057907988098 0.00153447571723263 0.00123019137060089 210598 242828 579 665 0 False 329 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 373 279 0.0054622554652796 0.00527774001265466 0.00523384451056687 0.00526436255436027 0.00242587023755307 0.00119881052571019 207264 230008 579 665 0 True 373 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 417 280 0.0052791208484227 0.0054138780230503 0.00527962157625696 0.00541695277332723 0.00133029457850741 0.0014074616182024 200315 235941 579 665 0 True 417 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 461 279 0.00544578415494206 0.00542379065080876 0.00540169375143053 0.00541695277332723 0.00164727374912972 0.00166471447022984 206639 236373 579 665 0 True 461 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 504 277 0.00542775795290866 0.00535063912929497 0.00540169375143053 0.00534065766384375 0.00150717010737306 0.00160515191327677 205955 233185 579 665 0 True 505 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 548 277 0.00557107152989352 0.00567961446302871 0.0055542839703975 0.00563057907988098 0.00157835049016576 0.00148066327045786 211393 247522 579 665 0 True 549 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 592 278 0.00575407437626771 0.00563913789968168 0.00582894636453803 0.00567635614557107 0.00173308604688614 0.00186742037653147 218337 245758 579 665 0 True 593 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 637 279 0.00704676916565434 0.00621542411762985 0.00619516289005875 0.00617990386816205 0.00517428870898473 0.00189234025368324 267388 270873 579 665 0 False 637 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 676 276 0.00741989046446855 0.672521977867534 0.00732433051041428 0.670405127031357 0.0020967415186183 0.181889702050559 281546 29309029 579 665 4 True 681 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 285 322 0.00568550101707047 0.00552601462456783 0.00558480201419089 0.00550850690470741 0.0013972560382755 0.00130839489666533 215735 240828 579 665 0 False 285 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 329 322 0.00543331866727861 0.00541229475611666 0.00544747081712062 0.00540169375143053 0.00130017457155793 0.00116260533113078 206166 235872 579 665 0 False 329 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 373 324 0.00543858948658662 0.00555088797755432 0.00540169375143053 0.0055542839703975 0.0013141510245123 0.00118310121517026 206366 241912 579 665 0 True 373 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 417 323 0.00553583610281945 0.00556830391382439 0.00558480201419089 0.00546272983901732 0.00147377002129906 0.0014881117673214 210056 242671 579 665 0 True 417 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 461 324 0.00564114707259354 0.00569728280417225 0.00564583810177768 0.00575265125505455 0.00164889592442879 0.00150999547450165 214052 248292 579 665 0 True 461 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 505 322 0.00554055348610013 0.00552612935405577 0.00560006103608759 0.00550850690470741 0.00155935029753386 0.00152703839703733 210235 240833 579 665 0 False 505 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 548 321 0.00569891525220936 0.00547030198522169 0.00579842832074464 0.00546272983901732 0.00156520012505938 0.00135173266272781 216244 238400 579 665 0 True 549 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 593 322 0.00562699492275153 0.00592935761238757 0.00563057907988098 0.0059662775616083 0.00191019333935356 0.00200365655060277 213515 258406 579 665 0 True 593 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 637 322 0.00588191809858356 0.00572777790206806 0.00585946440833143 0.00564583810177768 0.00180820249355526 0.00184675273339565 223188 249621 579 665 0 False 637 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 682 322 0.00563519104677549 0.00570811326783427 0.00563057907988098 0.00569161516746777 0.00174764950029785 0.00188837701920312 213826 248764 579 665 0 False 682 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 286 363 0.0052279411929419 0.00529084212017799 0.00521858548867018 0.00534065766384375 0.00133506691583372 0.00133247548708271 198373 230579 579 665 0 True 285 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 330 362 0.00520812291234377 0.00554673477009071 0.00521858548867018 0.0055390249485008 0.00137954940615875 0.00133818330311376 197621 241731 579 665 0 True 329 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 374 361 0.00573035568938166 0.00563819711788053 0.00575265125505455 0.00569161516746777 0.00132273445651829 0.00129069175531817 217437 245717 579 665 0 True 373 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 417 361 0.00587872925290221 0.00574225676344673 0.00578316929884794 0.00572213321126116 0.00151237822707355 0.00138275645863575 223067 250252 579 665 0 True 417 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 462 361 0.00594703907113406 0.00578156308601671 0.0059662775616083 0.00575265125505455 0.0016878438195862 0.00165811675260312 225659 251965 579 665 0 True 461 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 505 365 0.00584963433032198 0.00569943971854562 0.00587472343022812 0.00570687418936446 0.00165332224409961 0.00185351123091277 221963 248386 579 665 0 False 505 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 549 365 0.00577410348963816 0.00563482407093495 0.00576791027695125 0.00564583810177768 0.00164554575591488 0.00155204463661273 219097 245570 579 665 0 False 549 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 594 360 0.0055469838856559 0.0056274125460137 0.0055542839703975 0.00572213321126116 0.00185131386180764 0.00199767087937967 210479 245247 579 665 0 True 593 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 638 360 0.00554877596422062 0.00539474114446106 0.00567635614557107 0.00544747081712062 0.00173710217610175 0.00188864115353983 210547 235107 579 665 0 True 638 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 681 359 0.00519502492636336 0.00534664654311448 0.00532539864194705 0.00526436255436027 0.00176624515386747 0.00178790651287027 197124 233011 579 665 0 True 682 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 286 405 0.00556975382506651 0.00554680360778348 0.0055390249485008 0.00552376592660411 0.0014295168263849 0.00128427289005257 211343 241734 579 665 0 True 285 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 330 406 0.00573283297445642 0.00563714160659144 0.00578316929884794 0.00569161516746777 0.00135417221319019 0.00126292998696795 217531 245671 579 665 0 True 329 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 373 405 0.00576653986393116 0.00579214114480525 0.00576791027695125 0.00579842832074464 0.00128273810823189 0.00130205491797494 218810 252426 579 665 0 True 373 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 418 406 0.00584599746499945 0.00590072113219648 0.00587472343022812 0.0059662775616083 0.00153684680145137 0.00147200622418405 221825 257158 579 665 0 True 417 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 462 405 0.00601598138768286 0.006055904237591 0.0059510185397116 0.00607309071488518 0.00159149993204089 0.00156328541891084 228275 263921 579 665 0 True 461 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 506 404 0.00598438282593132 0.00588922523750438 0.00601205462729839 0.00581368734264134 0.00158858807999658 0.00160169463547714 227076 256657 579 665 0 True 505 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 549 403 0.00581495233927526 0.00595402445229577 0.00581368734264134 0.0059662775616083 0.00154311396379067 0.00142910818891539 220647 259481 579 665 0 True 549 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 594 403 0.00565018652770679 0.00562566865779693 0.00566109712367437 0.00572213321126116 0.00177553014639555 0.00209887975234334 214395 245171 579 665 0 True 593 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 638 403 0.00535973802973875 0.00543152341829626 0.00540169375143053 0.00544747081712062 0.00171388849163158 0.00178742333463254 203374 236710 579 665 0 True 638 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 682 402 0.0072750747039809 0.00545095859355415 0.00532539864194705 0.00549324788281071 0.0135231480041537 0.00180786381863411 276051 237557 579 665 0 True 682 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 285 450 0.00551952291706115 0.00569377208184113 0.00547798886091402 0.00575265125505455 0.0014949584170583 0.00146070132286127 209437 248139 579 665 0 True 285 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 329 449 0.00550139129864159 0.00573755285444098 0.00546272983901732 0.00572213321126116 0.00134611852729418 0.00152810947158408 208749 250047 579 665 0 True 329 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 374 449 0.00562103889693348 0.0056708491301497 0.00566109712367437 0.00570687418936446 0.00144324269718865 0.00133665403687518 213289 247140 579 665 0 True 373 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 418 447 0.00581402994589636 0.00600544620879275 0.00592050049591821 0.00601205462729839 0.00159379916770385 0.00178503119734409 220612 261722 579 665 0 True 417 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 462 450 0.00575699968098366 0.0059566632305185 0.00572213321126116 0.0059662775616083 0.00185638800506631 0.00175682253696826 218448 259596 579 665 0 True 461 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 506 448 0.00565282193736079 0.00596944409547558 0.00564583810177768 0.00587472343022812 0.00165731915668858 0.00180283298666897 214495 260153 579 665 0 True 505 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 550 446 0.00574218867872815 0.00563328669579648 0.00579842832074464 0.00567635614557107 0.00169435839088938 0.00169868176344227 217886 245503 579 665 0 True 549 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 594 451 0.00528739603473628 0.00539506238702731 0.00529488059815366 0.00541695277332723 0.00178241392116737 0.00187857466636277 200629 235121 579 665 0 False 594 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 639 447 0.00507648420012616 0.0053167250926584 0.00506599526970321 0.00526436255436027 0.0017937434195143 0.00171940479659344 192626 231707 579 665 0 True 638 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 682 447 0.00519141441513737 0.00539751759806933 0.00524910353246357 0.00538643472953384 0.0018322103612091 0.00179812192967592 196987 235228 579 665 0 True 682 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 286 493 0.00550239275431011 0.00560403067637049 0.00550850690470741 0.00560006103608759 0.00145556639722066 0.0014370662795173 208787 244228 579 665 0 True 285 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 330 493 0.0056388806202911 0.0054786542919441 0.00567635614557107 0.00547798886091402 0.00155583460075051 0.00146256632914826 213966 238764 579 665 0 True 329 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 375 493 0.00547274439570254 0.00576690065745733 0.00543221179522393 0.00581368734264134 0.00155964457342758 0.0014559939600846 207662 251326 579 665 0 True 373 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 419 493 0.00564483664610915 0.00578349054141419 0.00563057907988098 0.00573739223315786 0.00168436956534786 0.00173011368852436 214192 252049 579 665 0 True 417 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 463 492 0.00563015741433634 0.00591033546328628 0.00560006103608759 0.0059662775616083 0.00190075690831013 0.00170158462699049 213635 257577 579 665 0 True 461 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 507 492 0.00553870869934232 0.00552750610791111 0.0055542839703975 0.00550850690470741 0.00164248182121684 0.00162192341691663 210165 240893 579 665 0 True 505 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 551 491 0.00558843887951342 0.00558535271573303 0.00558480201419089 0.00560006103608759 0.00168036527285397 0.00167420994850797 212052 243414 579 665 0 True 550 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 595 491 0.00561943129704453 0.00535733933139096 0.00564583810177768 0.00535591668574044 0.0017313517574655 0.00179414659452512 213228 233477 579 665 0 True 594 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 639 491 0.00506212121751182 0.00528687247989509 0.00508125429159991 0.00526436255436027 0.00176725963575721 0.00186254308047881 192081 230406 579 665 0 True 638 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 683 490 0.00525998777433461 0.00544361590632567 0.00526436255436027 0.00546272983901732 0.00172830199750216 0.00173070976801209 199589 237237 579 665 0 True 682 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 287 538 0.00574956782575936 0.00582497672425513 0.00570687418936446 0.00588998245212482 0.00170483261676788 0.00133779728669169 218166 253857 579 665 0 True 285 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 330 535 0.00569398703615637 0.0056286516244835 0.00575265125505455 0.00563057907988098 0.00133898755409327 0.0013351886911197 216057 245301 579 665 0 True 329 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 374 536 0.00564288644296519 0.00571281717684002 0.00563057907988098 0.00575265125505455 0.00144671847505492 0.00152161884753249 214118 248969 579 665 0 True 373 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 419 536 0.00559555448557924 0.00558197966878744 0.00561532005798428 0.00564583810177768 0.0016248497102761 0.00175500292194616 212322 243267 579 665 0 True 417 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 463 536 0.00571902342786943 0.00590599868864195 0.00567635614557107 0.00593575951781491 0.00187015516531299 0.00186591189312808 217007 257388 579 665 0 True 461 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 508 534 0.00560498925214058 0.00566453900831273 0.00566109712367437 0.00570687418936446 0.00181115621022901 0.00187063169018434 212680 246865 579 665 0 True 505 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 552 535 0.00570863991383265 0.00578424775603463 0.00576791027695125 0.00575265125505455 0.00166931179835637 0.00182054785124671 216613 252082 579 665 0 True 550 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 596 533 0.00558506555515629 0.00554574809649438 0.00564583810177768 0.00558480201419089 0.00158051487488851 0.00156883974238963 211924 241688 579 665 0 True 594 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 640 533 0.00530760962678251 0.005365209774264 0.00524910353246357 0.00531013962005036 0.00177506783425103 0.00192022413638578 201396 233820 579 665 0 True 638 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 684 532 0.00541415923909398 0.00562270863700795 0.00547798886091402 0.00569161516746777 0.00168192219567096 0.00157082591351784 205439 245042 579 665 0 True 682 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 287 580 0.00560367154731358 0.00577952090113129 0.00563057907988098 0.00573739223315786 0.00132852472056869 0.00129384482658347 212630 251876 579 665 0 True 285 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 332 579 0.00553644224703987 0.00585774346601225 0.00556954299229419 0.00584420538643473 0.00141933589510772 0.00140233555848917 210079 255285 579 665 0 True 329 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 376 578 0.00553828703379768 0.00543799416141636 0.00552376592660411 0.00541695277332723 0.00132472349708998 0.00125153421066113 210149 236992 579 665 0 True 373 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 420 578 0.00554695753155936 0.00557438457668548 0.00560006103608759 0.00560006103608759 0.00160091014018751 0.00171163533740059 210478 242936 579 665 0 True 417 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 464 576 0.00564109436440046 0.00573713982828438 0.00561532005798428 0.00573739223315786 0.00193871539027178 0.00178843716788168 214050 250029 579 665 0 True 461 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 507 575 0.00577025579154331 0.00595397856050059 0.00582894636453803 0.00590524147402152 0.00196129887603499 0.00213181660200831 218951 259479 579 665 0 True 506 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 553 575 0.00578082378425588 0.00574133892754317 0.00584420538643473 0.00572213321126116 0.00171623541775332 0.00174254864550332 219352 250212 579 665 0 True 550 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 594 579 0.0056041459210513 0.00563507647580843 0.00567635614557107 0.00561532005798428 0.00153971895537844 0.0015180579616088 212648 245581 579 665 0 False 594 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 640 575 0.00549598870885088 0.00550676301649064 0.00546272983901732 0.00550850690470741 0.00143701481740545 0.00145247228221573 208544 239989 579 665 0 True 638 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 685 574 0.00520108636856757 0.00545456109947563 0.00521858548867018 0.00550850690470741 0.00153156893557373 0.00161891547866518 197354 237714 579 665 0 True 682 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 285 623 0.00591965716482893 0.00586003805577115 0.00592050049591821 0.00582894636453803 0.00138721457566332 0.00149749883138338 224620 255385 579 665 0 False 285 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 329 623 0.00567532833580601 0.00571228942119547 0.00567635614557107 0.00575265125505455 0.00132366845585075 0.00129357246097538 215349 248946 579 665 0 False 329 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 375 620 0.00523379180237379 0.00542837983032656 0.00529488059815366 0.00544747081712062 0.00131726906428242 0.00119492342032105 198595 236573 579 665 0 True 373 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 420 619 0.00527553669129325 0.00554359118212102 0.00526436255436027 0.00563057907988098 0.00155909101034289 0.00153922714117812 200179 241594 579 665 0 True 417 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 461 622 0.00547595959548043 0.00551883255862247 0.0055390249485008 0.00546272983901732 0.00182761870252394 0.0017918633489063 207784 240515 579 665 0 False 461 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 506 622 0.00539531606006784 0.00541745758307419 0.00531013962005036 0.00537117570763714 0.00177094562854056 0.00191520369709408 204724 236097 579 665 0 False 506 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 550 622 0.00553428121112359 0.0054535744258793 0.00558480201419089 0.00549324788281071 0.00176114441873962 0.00182996880091586 209997 237671 579 665 0 False 550 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 594 622 0.0053633221868682 0.00546415248466784 0.00531013962005036 0.00550850690470741 0.00151236314109838 0.00141323578082467 203510 238132 579 665 0 False 594 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 638 622 0.00540427645289146 0.00548117834067889 0.00540169375143053 0.00541695277332723 0.0014233399065669 0.00143702314809665 205064 238874 579 665 0 False 638 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 682 622 0.00582051305364521 0.00567702157660115 0.00579842832074464 0.00572213321126116 0.00147933566847927 0.00140942138662918 220858 247409 579 665 0 False 682 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 283 670 0.00780437037889153 0.666465041064552 0.00706492713817044 0.667246509498741 0.00310795943967574 0.207785671587627 296135 29045063 579 665 5 True 285 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 329 666 0.00594564230401743 0.00567929322046246 0.00592050049591821 0.00569161516746777 0.00131936744369211 0.00123838044935738 225606 247508 579 665 0 False 329 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 373 666 0.00534890649606079 0.00533666507766326 0.00532539864194705 0.00532539864194705 0.00129611536125107 0.00115955620464973 202963 232576 579 665 0 False 373 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 417 665 0.00529287768681661 0.00533168581788644 0.00529488059815366 0.00527962157625696 0.00140679144374242 0.00136318649229694 200837 232359 579 665 0 False 417 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 462 665 0.00539842584345957 0.00525151285171042 0.00547798886091402 0.00532539864194705 0.00150413037391348 0.00140959635036739 204842 228865 579 665 0 False 462 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 506 665 0.00533022144161388 0.00534896407877097 0.00529488059815366 0.00535591668574044 0.00162965961513603 0.00162872968034723 202254 233112 579 665 0 False 506 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 550 665 0.0052708983703022 0.00527186586287187 0.00529488059815366 0.00531013962005036 0.00163315970311933 0.00167393272762672 200003 229752 579 665 0 False 550 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 594 665 0.00543342408366477 0.00540047761885832 0.00546272983901732 0.00535591668574044 0.0013142776270933 0.00112916836081628 206170 235357 579 665 0 False 594 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 638 665 0.00595544602793033 0.00577167340415585 0.00582894636453803 0.00576791027695125 0.00187638078617503 0.0014174990256313 225978 251534 579 665 0 False 638 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 679 666 0.00719943844691092 0.693558317859194 0.00715648126955062 0.681177996490425 0.001952658049946 0.184087175202179 273181 30225809 579 665 8 True 682 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H3_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H3_3.csv new file mode 100755 index 0000000..89a3093 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H3_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 285 280 0.000978474896339456 0.0690238298882936 0.000823987182421607 0.0689555199511711 0.000746955421404388 0.0219102540886128 37128 3008112 579 665 0 True 285 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 329 279 0.000907687793032847 0.000925201536686762 0.000778210116731518 0.000793469138628214 0.000665792077778216 0.000694919678927151 34442 40321 579 665 0 False 329 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 373 279 0.000956943599466224 0.000888717559520224 0.000839246204318303 0.000778210116731518 0.000695790871928416 0.000634813816109415 36311 38731 579 665 0 True 373 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 417 280 0.000926372847479751 0.000913177886350117 0.000732433051041428 0.000701915007248035 0.00076436164677427 0.000771299725590276 35151 39797 579 665 0 True 417 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 461 279 0.000896012928265599 0.000826786581927467 0.00064087891966125 0.000534065766384375 0.000867820119057916 0.000885727906868076 33999 36032 579 665 0 True 461 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 504 277 0.000916463707180687 0.000832729569403022 0.000686655985351339 0.000579842832074464 0.000858507531334862 0.000810651534830072 34775 36291 579 665 0 True 505 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 548 277 0.000887078889538517 0.000901337803194184 0.000656137941557946 0.000686655985351339 0.000816918732808914 0.000774699985684187 33660 39281 579 665 0 True 549 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 592 278 0.00087139820209718 0.000880594711773712 0.000518806744487678 0.000473029678797589 0.000891842105682399 0.000995619867045361 33065 38377 579 665 0 True 593 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 637 279 0.000962846917091198 0.000926257047975856 0.000595101853971161 0.000503547722590982 0.00102764213393255 0.000964789335863395 36535 40367 579 665 0 False 637 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 676 276 0.00103890483970582 0.0674189938109178 0.000732433051041428 0.0663614862287327 0.000964745801125938 0.0193194463728151 39421 2938172 579 665 0 True 681 279 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 285 322 0.000986460187591095 0.000988876402496284 0.000869764248111696 0.000823987182421607 0.000750634479585726 0.000780078409234923 37431 43096 579 665 0 False 285 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 329 322 0.000861910727342757 0.000838879069956879 0.000762951094834821 0.000701915007248035 0.000638626903654756 0.000621561150681029 32705 36559 579 665 0 False 329 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 373 324 0.000864467074707143 0.000893903332375342 0.000701915007248035 0.00080872816052491 0.00070201274629703 0.000650471661467127 32802 38957 579 665 0 True 373 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 417 323 0.000909374455211411 0.000922448028976079 0.000686655985351339 0.000701915007248035 0.000791222166803772 0.000802586458468134 34506 40201 579 665 0 True 417 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 461 324 0.000885550351939194 0.000939542722679897 0.000579842832074464 0.000732433051041428 0.000885092630625888 0.000833906124034755 33602 40946 579 665 0 True 461 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 505 322 0.000827096965813334 0.000908106842982944 0.000610360875867857 0.000686655985351339 0.000801767313194826 0.000840754926341923 31384 39576 579 665 0 False 505 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 548 321 0.000929008257133757 0.000903793014236209 0.000717174029144732 0.000747692072938125 0.000811080451146831 0.000738433158607587 35251 39388 579 665 0 True 549 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 593 322 0.000871688097159121 0.000918501334590768 0.000488288700694286 0.000503547722590982 0.000937925993796288 0.0010646784901347 33076 40029 579 665 0 True 593 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 637 322 0.000828730919798818 0.00088506916180357 0.000396734569314107 0.000473029678797589 0.000957955286333606 0.000955099410045428 31446 38572 579 665 0 False 637 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 682 322 0.00100604128132036 0.000991951152773213 0.000656137941557946 0.000534065766384375 0.000994713813862575 0.00103430213366647 38174 43230 579 665 0 False 682 322 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 286 363 0.0010061994058996 0.000909644218121408 0.000915541313801785 0.000762951094834821 0.000750426554995208 0.000711871174813696 38180 39643 579 665 0 True 285 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 330 362 0.000868393835091613 0.000938418373698035 0.000762951094834821 0.000793469138628214 0.000668570926776968 0.000741319025112252 32951 40897 579 665 0 True 329 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 374 361 0.000903471137586436 0.000910699729410503 0.000778210116731518 0.000762951094834821 0.000685829935659835 0.000703028509287389 34282 39689 579 665 0 True 373 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 417 361 0.000866944359781909 0.000899823373953309 0.00064087891966125 0.000717174029144732 0.000796031289456733 0.000757184891009973 32896 39215 579 665 0 True 417 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 462 361 0.000917017143208029 0.000915610151494552 0.000564583810177768 0.000625619897764553 0.000926828721309838 0.00085726390717815 34796 39903 579 665 0 True 461 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 505 365 0.000867945815450432 0.000936307351119846 0.000534065766384375 0.000625619897764553 0.000918600914320649 0.000932303091435247 32934 40805 579 665 0 False 505 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 549 365 0.000859486150461071 0.000794754108893199 0.000564583810177768 0.000549324788281071 0.000849876796124915 0.000814573884523515 32613 34636 579 665 0 False 549 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 594 360 0.00089635553152062 0.000880457036388178 0.0004272526131075 0.000289921416037232 0.00106118661040813 0.00104778091729837 34012 38371 579 665 0 True 593 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 638 360 0.000902575098304074 0.00090585814501922 0.000503547722590982 0.000473029678797589 0.000977973978531832 0.00100414922901276 34248 39478 579 665 0 True 638 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 681 359 0.000940314164549445 0.000873481483521117 0.000671396963454643 0.000442511635004196 0.000944144605724717 0.000978812880816621 35680 38067 579 665 0 True 682 365 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 286 405 0.000874982359226629 0.00100461728824235 0.000732433051041428 0.000869764248111696 0.000741183132102277 0.000781920634391997 33201 43782 579 665 0 True 285 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 330 406 0.000886551807607716 0.000919074982030494 0.000762951094834821 0.000793469138628214 0.000674502615684414 0.000642671747321602 33640 40054 579 665 0 True 329 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 373 405 0.000966641906992967 0.000944177793992879 0.000839246204318303 0.000823987182421607 0.000732122096399901 0.000731256580378775 36679 41148 579 665 0 True 373 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 418 406 0.000933014079807847 0.000851201016962181 0.000747692072938125 0.000579842832074464 0.000803758523405599 0.000825517785759562 35403 37096 579 665 0 True 417 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 462 405 0.000902311557338674 0.000901911450633909 0.000625619897764553 0.000717174029144732 0.000857985997992505 0.000776742990229144 34238 39306 579 665 0 True 461 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 506 404 0.000878988181900718 0.000904274878085578 0.000564583810177768 0.000625619897764553 0.000873527385048122 0.000878191957551935 33353 39409 579 665 0 True 505 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 549 403 0.000904525301448039 0.000962098540009901 0.000625619897764553 0.000747692072938125 0.000878233819161298 0.000829748612010904 34322 41929 579 665 0 True 549 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 594 403 0.000885339519166873 0.000894018061863287 0.000488288700694286 0.0004272526131075 0.000933395997582076 0.00106135425588919 33594 38962 579 665 0 True 593 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 638 403 0.000886077433869995 0.000853770957492151 0.000534065766384375 0.000473029678797589 0.000922847655334052 0.000939003544480898 33622 37208 579 665 0 True 638 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 682 402 0.00104544065564776 0.000913154940452528 0.000549324788281071 0.000518806744487678 0.00158491363130943 0.000944305652894651 39669 39796 579 665 0 True 682 408 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 285 450 0.000977684273443253 0.00100542039465797 0.000839246204318303 0.000869764248111696 0.00080726641315689 0.000833726037923692 37098 43817 579 665 0 True 285 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 329 449 0.000982006345275824 0.000938143022926967 0.000839246204318303 0.000823987182421607 0.000830478083794264 0.000814279551786117 37262 40885 579 665 0 True 329 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 374 449 0.000928533883396036 0.000977173994725885 0.000778210116731518 0.000885023270008392 0.000752860113848111 0.000723592127642759 35233 42586 579 665 0 True 373 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 418 447 0.000944109154451213 0.00100122129539918 0.000701915007248035 0.000686655985351339 0.000928553971697845 0.000971855885018874 35824 43634 579 665 0 True 417 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 462 450 0.000903128534331416 0.000975636619587421 0.000595101853971161 0.00064087891966125 0.000956666892251776 0.00100647405800101 34269 42519 579 665 0 True 461 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 506 448 0.00100722721566466 0.000905445118862618 0.000701915007248035 0.000595101853971161 0.00100806547896371 0.000955445571281854 38219 39460 579 665 0 True 505 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 550 446 0.000849682426548168 0.000903357042182017 0.000579842832074464 0.000610360875867857 0.000863703922455841 0.00090102053569922 32241 39369 579 665 0 True 549 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 594 451 0.000792652161635472 0.000885573971550529 0.000396734569314107 0.0004272526131075 0.000884662722563299 0.000989282634378764 30077 38594 579 665 0 False 594 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 639 447 0.000901125622994371 0.000874078076858431 0.000579842832074464 0.000381475547417411 0.000912042762342262 0.0010034569630391 34193 38093 579 665 0 True 638 451 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 682 447 0.000902601452400614 0.00087504180455717 0.000534065766384375 0.000442511635004196 0.000958562648957785 0.000984576503331733 34249 38135 579 665 0 True 682 450 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 286 493 0.000921128382268279 0.00103274895868649 0.000732433051041428 0.000885023270008392 0.00084428516415759 0.000873495903928548 34952 45008 579 665 0 True 285 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 330 493 0.000915673084284486 0.000857235788028093 0.000823987182421607 0.000717174029144732 0.000793869659549241 0.000762216404743997 34745 37359 579 665 0 True 329 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 375 493 0.000958735678030948 0.000952943126871883 0.000839246204318303 0.000823987182421607 0.000824716822163019 0.000831364968595718 36379 41530 579 665 0 True 373 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 419 493 0.000927690552306754 0.001009940736483 0.000579842832074464 0.000732433051041428 0.000945259459874824 0.000965361807858677 35201 44014 579 665 0 True 417 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 463 492 0.000914065484395542 0.000903953635519332 0.000549324788281071 0.000595101853971161 0.000978291093181958 0.000903118934218762 34684 39395 579 665 0 True 461 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 507 492 0.000958287658389767 0.000912374779934501 0.000610360875867857 0.000564583810177768 0.000960662473943641 0.000926183977982082 36362 39762 579 665 0 True 505 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 551 491 0.000871002890649079 0.00081177996490425 0.000564583810177768 0.000549324788281071 0.00089405912487679 0.000832909952193529 33050 35378 579 665 0 True 550 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 595 491 0.000888422948462061 0.000906317062971 0.000518806744487678 0.000503547722590982 0.000968234928093384 0.000965780649420126 33711 39498 579 665 0 True 594 494 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 639 491 0.000902285203242134 0.000868662845027423 0.000534065766384375 0.000579842832074464 0.000935405882221807 0.000883258738945496 34237 37857 579 665 0 True 638 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 683 490 0.000891690856433028 0.000869007033491258 0.000549324788281071 0.000503547722590982 0.000938755830708247 0.000937144950472907 33835 37872 579 665 0 True 682 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 287 538 0.000903602908069137 0.000955398337913908 0.000732433051041428 0.000823987182421607 0.000757921593871743 0.000782440215016031 34287 41637 579 665 0 True 285 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 330 535 0.000904024573613778 0.000980202853207636 0.000762951094834821 0.000869764248111696 0.000763639989417868 0.000771237852717092 34303 42718 579 665 0 True 329 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 374 536 0.000872979447889584 0.000912535401217624 0.000671396963454643 0.000747692072938125 0.000769382400723999 0.000801416538844466 33125 39769 579 665 0 True 373 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 419 536 0.000890610338474886 0.000922057948717066 0.000595101853971161 0.000610360875867857 0.000922829601703947 0.000938048543199592 33794 40184 579 665 0 True 417 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 463 536 0.000885550351939194 0.000883715353845818 0.000457770656900893 0.000442511635004196 0.00103745250511396 0.00101855948644243 33602 38513 579 665 0 True 461 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 508 534 0.000919283595510474 0.000847919753606952 0.000457770656900893 0.000350957503624018 0.00102163718232941 0.000991005457852658 34882 36953 579 665 0 True 505 537 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 552 535 0.000801770679038334 0.000914348127127156 0.000473029678797589 0.000503547722590982 0.000846328246096433 0.000990752243159012 30423 39848 579 665 0 True 550 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 596 533 0.000909690704369891 0.000876097315846265 0.000610360875867857 0.000595101853971161 0.000874650048048128 0.000850972336956033 34518 38181 579 665 0 True 594 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 640 533 0.00098859486941084 0.00087550072250895 0.000610360875867857 0.000396734569314107 0.00101551569110503 0.00101573748043392 37512 38155 579 665 0 True 638 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 684 532 0.000961265671298794 0.000926211156180678 0.000717174029144732 0.000625619897764553 0.000914888376332239 0.00087844935358634 36475 40365 579 665 0 True 682 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 287 580 0.000919942447923976 0.000936169675734312 0.000778210116731518 0.000823987182421607 0.00073797903631436 0.000727404418960537 34907 40799 579 665 0 True 285 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 332 579 0.00095944723863753 0.000856111439046231 0.000778210116731518 0.000686655985351339 0.000787282799608048 0.00071793904538663 36406 37310 579 665 0 True 329 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 376 578 0.00084644087267374 0.000969968982882934 0.000686655985351339 0.000854505226215 0.000700077060973889 0.000658245119545246 32118 42272 579 665 0 True 373 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 420 578 0.000913881005719761 0.00099059734481546 0.000625619897764553 0.000671396963454643 0.000936004147731382 0.000916513247916817 34677 43171 579 665 0 True 417 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 464 576 0.000823749995552746 0.000913177886350117 0.000381475547417411 0.000564583810177768 0.000993266593979219 0.00092195764917835 31257 39797 579 665 0 True 461 580 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 507 575 0.000941368328411047 0.000874835291478869 0.000335698481727321 0.000274662394140536 0.00113984279132824 0.0011108164418017 35720 38126 579 665 0 True 506 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 553 575 0.000868973625215494 0.000833349108637926 0.000503547722590982 0.000442511635004196 0.000952154816313746 0.000918578077097486 32973 36318 579 665 0 True 550 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 594 579 0.000880701198175822 0.000875018858659581 0.000625619897764553 0.00064087891966125 0.000829738547111069 0.00078745129246223 33418 38134 579 665 0 False 594 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 640 575 0.000877723185266795 0.000902737502947114 0.000564583810177768 0.000732433051041428 0.000870157963211095 0.000782030630140426 33305 39342 579 665 0 True 638 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 685 574 0.000956759120790444 0.000879378579201494 0.000732433051041428 0.000595101853971161 0.000861088464834785 0.000852864042550963 36304 38324 579 665 0 True 682 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 285 623 0.000856587199841665 0.000964897939515761 0.000671396963454643 0.000823987182421607 0.00070660304834389 0.000744740369071497 32503 42051 579 665 0 False 285 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 329 623 0.000923763791922285 0.000868777574515368 0.000778210116731518 0.000762951094834821 0.000740697267495956 0.000676018791407895 35052 37862 579 665 0 False 329 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 375 620 0.000909611642080271 0.000900832993447225 0.000762951094834821 0.000854505226215 0.00071397709489281 0.000618872150415537 34515 39259 579 665 0 True 373 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 420 619 0.000820403025292158 0.000885642809243296 0.000625619897764553 0.000656137941557946 0.000766366335542141 0.000805578200775556 31130 38597 579 665 0 True 417 623 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 461 622 0.000877749539363335 0.000849984884389963 0.000488288700694286 0.0004272526131075 0.000972739959988409 0.000955628374572857 33306 37043 579 665 0 False 461 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 506 622 0.000837137876595098 0.000839751014065262 0.000366216525520714 0.000396734569314107 0.000986578823176732 0.00098027102891149 31765 36597 579 665 0 False 506 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 550 622 0.000889977840157924 0.000868777574515368 0.000579842832074464 0.0004272526131075 0.000896436644259651 0.000990692920649914 33770 37862 579 665 0 False 550 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 594 622 0.000914961523677904 0.000897505838296818 0.000701915007248035 0.000732433051041428 0.00078662024593727 0.000752560883226061 34718 39114 579 665 0 False 594 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 638 622 0.000883231191443668 0.000856547411100422 0.000686655985351339 0.000717174029144732 0.000747032126232859 0.000731721642948866 33514 37329 579 665 0 False 638 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 682 622 0.00090903185195639 0.000925981697204788 0.000671396963454643 0.000732433051041428 0.000794553383423966 0.00079432819254967 34493 40355 579 665 0 False 682 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 283 670 0.00108507721684401 0.0673134656279059 0.000885023270008392 0.0674296177615015 0.00077837440574465 0.0217557167777835 41173 2933573 579 665 0 True 285 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 329 666 0.000916015687539506 0.000974191028039313 0.000778210116731518 0.000869764248111696 0.0006983715894713 0.000709758520652554 34758 42456 579 665 0 False 329 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 373 666 0.000932618768359746 0.000885757538731241 0.00080872816052491 0.000793469138628214 0.000694614996998227 0.000638945943248975 35388 38602 579 665 0 False 373 666 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 417 665 0.000844411607240156 0.000858360137009954 0.000656137941557946 0.000686655985351339 0.000749258943925827 0.000712906223285146 32041 37408 579 665 0 False 417 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 462 665 0.000866865297492289 0.000904206040392811 0.00064087891966125 0.000717174029144732 0.000795884237577885 0.000781800746215522 32893 39406 579 665 0 False 462 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 506 665 0.000878382037680297 0.000929262960560018 0.000549324788281071 0.000579842832074464 0.000868376388554035 0.000944990335185396 33330 40498 579 665 0 False 506 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 550 665 0.000851764400174833 0.000951681102504487 0.000564583810177768 0.000595101853971161 0.000842142151695223 0.000966632916935607 32320 41475 579 665 0 False 550 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 594 665 0.000870739349683678 0.000896427381110134 0.000701915007248035 0.000762951094834821 0.000685623192642244 0.000673611126793148 33040 39067 579 665 0 False 594 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 638 665 0.000894642515245515 0.000912948427374226 0.000717174029144732 0.000778210116731518 0.000686815820452001 0.000698096047770892 33947 39787 579 665 0 False 638 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 679 666 0.00106478456250816 0.0701541906953238 0.000885023270008392 0.0676585030899519 0.000784986723248378 0.0204175384517151 40403 3057374 579 665 0 True 682 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H4_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H4_1.csv new file mode 100755 index 0000000..46ed1d0 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H4_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 258 249 0.00892188948857636 0.0380225684375737 0.0089570458533608 0.0387731746395056 0.00157951955329508 0.00799546886298082 338539 1657053 579 665 0 True 259 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 303 248 0.00888831436958431 0.00880805814031531 0.00888075074387732 0.00885023270008392 0.00139341195968656 0.00140207104898908 337265 383862 579 665 0 False 303 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 345 248 0.00928731539120087 0.0511470482110518 0.00923170824750134 0.0536354619668879 0.00159473346466519 0.00898436478915084 352405 2229028 579 665 0 True 347 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 390 248 0.00920501154770625 0.0708154226261465 0.00915541313801785 0.070618753337911 0.0015978001315288 0.00960433385494661 349282 3086191 579 665 0 True 391 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 434 248 0.00928149113586551 0.0641945674440163 0.00924696726939803 0.0642557412069886 0.00170594617067434 0.0146197230441822 352184 2797649 579 665 0 True 436 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 478 248 0.00916300311782139 0.054998425337778 0.00914015411612116 0.057099259937438 0.00153221421603361 0.0158519585407031 347688 2396874 579 665 0 True 480 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 522 247 0.00930070327224322 0.0663825046709243 0.00921644922560464 0.0678721293965057 0.00167814767125175 0.0202143995306802 352913 2893001 579 665 0 True 524 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 566 246 0.00904264395892292 0.059431412130693 0.00910963607232776 0.060669871061265 0.00179591957740671 0.0168000129144912 343121 2590067 579 665 0 True 568 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 613 247 0.0088842294846206 0.00900977552602036 0.00891126878767071 0.00906385900663768 0.00184251251317087 0.00199415094704327 337110 392653 579 665 0 False 613 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 653 246 0.0089720413342921 0.0373282714683252 0.0089417868314641 0.0379339284351873 0.00178732791861236 0.00797544283247228 340442 1626795 579 665 0 True 657 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 259 291 0.00880516719500042 0.00882235343451327 0.00885023270008392 0.00888075074387732 0.00158301804516488 0.00153812005067556 334110 384485 579 665 0 False 259 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 303 291 0.00889545632974667 0.00893770246169326 0.00889600976577401 0.00891126878767071 0.00129387773704439 0.00130033051802201 337536 389512 579 665 0 False 303 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 346 293 0.00938925303661783 0.0908099500295715 0.00927748531319142 0.0892652780956741 0.00166148753390416 0.0221128234426844 356273 3957568 579 665 0 True 347 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 391 293 0.0093754171359343 0.0455668583222763 0.00933852140077821 0.0450141145952544 0.0014290873366676 0.00822119985222219 355748 1985839 579 665 0 True 391 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 434 292 0.0094336333351913 0.0780259185386217 0.009399557488365 0.0762798504615854 0.00184821690449019 0.0192207415512777 357957 3400430 579 665 0 True 436 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 479 290 0.00924169645009002 0.0363169769238844 0.00915541313801785 0.038101777676051 0.00177545845399843 0.00822190274485938 350674 1582722 579 665 0 True 480 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 523 291 0.00919489157463487 0.0376473341743005 0.00921644922560464 0.0399328603036545 0.00167215237843545 0.00732602294252151 348898 1640700 579 665 0 True 524 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 567 291 0.00918904096520297 0.0458531542864944 0.00926222629129473 0.0465857938506142 0.00177949470722005 0.0102447535326683 348676 1998316 579 665 0 True 568 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 613 290 0.00895620252227152 0.00904993084680114 0.00904859998474098 0.00915541313801785 0.00203433590888189 0.00190407984975989 339841 394403 579 665 0 False 613 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 657 290 0.00870143747101873 0.00885734592833652 0.00875867856870375 0.00886549172198062 0.00189033729463195 0.00188181827053667 330174 386010 579 665 0 False 657 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 259 331 0.00922770242482725 0.0434075116837642 0.00921644922560464 0.043579766536965 0.00155739452583761 0.00806074939405636 350143 1891733 579 665 0 True 259 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 304 331 0.00908004042191327 0.0604583328313918 0.00910963607232776 0.0592507820248722 0.00141658004569022 0.0208434681670469 344540 2634821 579 665 0 True 303 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 347 331 0.00941671400521258 0.0382789658972334 0.00926222629129473 0.0360112916762036 0.002015638751858 0.0133557656412735 357315 1668227 579 665 0 True 347 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 391 331 0.0093099008519357 0.0310548860133855 0.00927748531319142 0.0309758144502937 0.00155106074269903 0.00532521244106503 353262 1353396 579 665 0 True 392 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 435 331 0.00957149161419237 0.0648004768157519 0.00949111161974517 0.0629892423895628 0.00176817116890322 0.014206921082101 363188 2824055 579 665 0 True 436 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 480 334 0.00957275661082629 0.0260115612905002 0.00958266575112535 0.0284275577935454 0.00180884572163352 0.00712806378149222 363236 1133604 579 665 0 False 480 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 524 334 0.00968634276691396 0.0217528715356714 0.00956740672922866 0.023071641107805 0.00205004149184999 0.00506319553077883 367546 948007 579 665 0 False 524 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 567 329 0.00934165753826648 0.048089071385261 0.00932326237888151 0.0466010528725109 0.00207681619409967 0.0156594183467129 354467 2095759 579 665 0 True 568 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 612 329 0.00927737989680526 0.0496705714847889 0.00935378042267491 0.0503547722590982 0.00203809930066878 0.0120168759731904 352028 2164682 579 665 0 True 613 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 655 328 0.00890802723379628 0.0525183868345618 0.00886549172198062 0.0542153047989624 0.00189247582949281 0.0140586721867215 338013 2288792 579 665 0 True 657 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 260 375 0.00894639879835861 0.0371097806314826 0.00892652780956741 0.0382696269169146 0.00154492929935803 0.007897881334987 339469 1617273 579 665 0 True 259 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 304 376 0.00919560313524145 0.0309268020130436 0.00915541313801785 0.0294499122606241 0.00139495304128605 0.00711167877401549 348925 1347814 579 665 0 True 303 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 347 375 0.00949050547552475 0.0739882895611654 0.00941481651026169 0.0726939803158618 0.00150646773818921 0.0177120552486353 360115 3224467 579 665 0 True 347 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 391 375 0.00942346065392683 0.0588251815163911 0.00935378042267491 0.0597390707255665 0.00155102303758118 0.0167544426577958 357571 2563647 579 665 0 True 392 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 436 375 0.00953085359732759 0.0386990134984979 0.00947585259784848 0.0402380407415885 0.00164824184067254 0.0069642896786406 361646 1686533 579 665 0 True 436 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 480 373 0.00963157895430371 0.0527426829834944 0.00964370183871214 0.0528725108720531 0.00173011827346657 0.015384863477604 365468 2298567 579 665 0 True 480 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 524 373 0.00935934113704486 0.0363343928601545 0.00933852140077821 0.0375829709315633 0.00167072201852312 0.00559873654370461 355138 1583481 579 665 0 True 524 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 568 373 0.00948196674824577 0.046233895565189 0.00955214770733196 0.0468909742885481 0.00192565455330203 0.0082933525413607 359791 2014909 579 665 0 True 569 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 612 373 0.00913691256224673 0.0373612676690582 0.00917067215991455 0.038300144960708 0.00204383482093613 0.00731743914128542 346698 1628233 579 665 0 True 613 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 656 373 0.00901072914801291 0.0819787624244865 0.0089570458533608 0.079819943541619 0.00192135403273447 0.0191327748606009 341910 3572698 579 665 0 True 657 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 259 419 0.00926043421273 0.0390231243019428 0.00921644922560464 0.0398718242160677 0.00177682564673716 0.0087774119041911 351385 1700658 579 665 0 True 259 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 303 419 0.00946251742499921 0.0508532718842196 0.009399557488365 0.0510261692225528 0.00175660761891651 0.0102312572207028 359053 2216225 579 665 0 True 303 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 347 419 0.00955438780553787 0.0305682953091128 0.00943007553215839 0.0315709163042649 0.0013507729598519 0.00447432000121601 362539 1332190 579 665 0 True 347 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 392 419 0.00942775637166286 0.0489544529669332 0.00941481651026169 0.0476844434271763 0.00158216259954719 0.0117215231159372 357734 2133473 579 665 0 True 392 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 436 418 0.00964504589763568 0.0908129559421557 0.00956740672922866 0.0911116197451743 0.00181545499936321 0.0130122959306899 365979 3957699 579 665 0 True 436 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 480 417 0.00987364133102419 0.0561051289243938 0.00987258716716258 0.0548714427405203 0.00171280866157377 0.0166611459577815 374653 2445105 579 665 0 True 480 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 524 417 0.00960095549412416 0.0467092198337455 0.00959792477302205 0.0477607385366598 0.0018434691226773 0.00966713532607075 364306 2035624 579 665 0 True 524 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 569 420 0.00986433833494555 0.0290888356161633 0.00991836423285267 0.030258640421149 0.00215356074138939 0.00572017885221389 374300 1267714 579 665 0 False 569 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 613 417 0.00925047236423786 0.0348422899776335 0.00927748531319142 0.0352635996032654 0.0020065391034718 0.00469290589719419 351007 1518454 579 665 0 True 613 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 656 417 0.00928792153542129 0.0646089015167812 0.00932326237888151 0.0634012359807736 0.00189815640797012 0.0111205120478244 352428 2815706 579 665 0 True 657 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 260 463 0.00917665453982914 0.0539307297770634 0.00912489509422446 0.0549935149156939 0.00153799952177194 0.013798182609913 348206 2350343 579 665 0 True 259 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 305 464 0.00946707668370064 0.0519038498053327 0.009399557488365 0.0514991989013504 0.00165449380573441 0.00741505514405261 359226 2262010 579 665 0 True 303 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 349 463 0.00969646273998534 0.0671190450376341 0.00965896086060884 0.0653391317616541 0.00173019813245969 0.0157971263890131 367930 2925100 579 665 0 True 348 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 392 463 0.0097209720497676 0.0836780667622363 0.00976577401388571 0.0825055313954376 0.0016920479610442 0.0186866552628763 368860 3646755 579 665 0 True 392 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 437 462 0.00967303394816123 0.0879209238477287 0.00961318379491875 0.0847791256580453 0.00193321887392684 0.0274065980275084 367041 3831662 579 665 0 True 436 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 481 461 0.00953994576063391 0.0396397494078524 0.00959792477302205 0.0401312275883116 0.00191843713982075 0.00674100917857909 361991 1727531 579 665 0 True 480 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 525 461 0.00963595373432936 0.0359591127050861 0.00965896086060884 0.0366979476615549 0.00178221311524358 0.0051630658878357 365634 1567126 579 665 0 True 525 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 569 461 0.00966583927980579 0.125644461347922 0.00962844281681544 0.121675440604257 0.0019956190031552 0.0312662222057554 366768 5475683 579 665 0 True 569 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 613 460 0.00953174963660995 0.0549042553740726 0.00956740672922866 0.0565346761272602 0.0018274913608894 0.0136181497103153 361680 2392770 579 665 0 True 613 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 658 461 0.00925619120318705 0.072544281279991 0.00917067215991455 0.070618753337911 0.00197949867195614 0.0122074079112691 351224 3161536 579 665 0 True 657 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 261 507 0.00903842730347651 0.0480894155737249 0.00912489509422446 0.0505836575875486 0.00154733600940163 0.00999047986627175 342961 2095774 579 665 0 True 259 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 306 508 0.00921911098935518 0.0907186712489624 0.00915541313801785 0.087006942854963 0.00164971859318911 0.0221913521891282 349817 3953590 579 665 0 True 303 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 349 507 0.00957096453226156 0.0491121601210626 0.009399557488365 0.0512703135729 0.00155389148321125 0.00963913542082273 363168 2140346 579 665 0 True 348 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 394 507 0.00963049843634557 0.0517682395505817 0.00962844281681544 0.0520943007553216 0.00166545078964209 0.00685462395454654 365427 2256100 579 665 0 True 392 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 438 505 0.00954073638353011 0.0499869724666438 0.00955214770733196 0.0504005493247883 0.00187655200915074 0.00697805563223819 362021 2178471 579 665 0 True 436 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 482 504 0.00972263235784963 0.0550941556225193 0.00975051499198901 0.0553444724193179 0.00174882936698319 0.0125300044102627 368923 2401046 579 665 0 True 480 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 526 504 0.00951907331617418 0.0673084863681291 0.00953688868543526 0.0680247196154726 0.00178041996224491 0.0158725990033696 361199 2933356 579 665 0 True 525 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 570 503 0.00951514655578971 0.0501669600873321 0.00950637064164187 0.0511024643320363 0.00185504461446994 0.0111561842432722 361050 2186315 579 665 0 True 569 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 615 502 0.00932479091648084 0.0432254818781906 0.00930800335698482 0.0431219958800641 0.00186325961277512 0.00816768952181711 353827 1883800 579 665 0 True 613 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 658 502 0.00912681894327188 0.0586143316634456 0.00909437705043107 0.0603799496452277 0.00189289576728895 0.0123158289629536 346315 2554458 579 665 0 True 657 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 262 549 0.00899647158178473 0.0374601185958717 0.0089723048752575 0.0387884336614023 0.00146970598216917 0.00734056238490512 341369 1632541 579 665 0 True 259 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 306 548 0.00896384521026814 0.04971662390125 0.00901808194094758 0.0500190737773709 0.00151254293362946 0.01035169020467 340131 2166689 579 665 0 True 304 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 350 547 0.00947709124038586 0.0387013769259496 0.00941481651026169 0.039658197909514 0.00142593735516092 0.00659907503954782 359606 1686636 579 665 0 True 348 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 394 547 0.0094165295265368 0.0461320846175865 0.00944533455405508 0.0448615243762875 0.00159477645775434 0.0081396687705103 357308 2010472 579 665 0 True 392 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 439 547 0.00942704481105628 0.0813804022530577 0.00949111161974517 0.0772716868848707 0.0018643489906552 0.0190378476233182 357707 3546621 579 665 0 True 436 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 482 545 0.00955644342506799 0.0567916472343596 0.00958266575112535 0.0566262302586404 0.00196498502155012 0.0102253526665485 362617 2475024 579 665 0 True 481 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 527 545 0.00929972817067124 0.0483582267639802 0.00933852140077821 0.0487373159380484 0.00198423124303953 0.00570866956870097 352876 2107489 579 665 0 True 525 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 571 543 0.0092100451801454 0.0329501024247504 0.00917067215991455 0.034378576333257 0.00183778768281249 0.00641604117231081 349473 1435991 579 665 0 True 569 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 615 544 0.00910049120082836 0.0424604656525727 0.00900282291905089 0.0427862973983368 0.00163323397319922 0.0065055317151561 345316 1850460 579 665 0 True 613 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 660 544 0.00897978943867487 0.0461722399383673 0.00891126878767071 0.045990691996643 0.00192535210552519 0.00720140624937182 340736 2012222 579 665 0 True 657 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 259 593 0.00844482763300814 0.00839672998013459 0.00848401617456321 0.00831616693369955 0.00129173856579988 0.00124456516076739 320437 365936 579 665 0 False 259 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 304 593 0.00862002966680647 0.00857440006516635 0.00865186541542687 0.00865186541542687 0.0013746190509882 0.00145635318727315 327085 373679 579 665 0 False 304 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 351 590 0.00922311681202927 0.0613998259553668 0.00917067215991455 0.0596932936598764 0.00153680499155859 0.0100379635690163 349969 2675852 579 665 0 True 348 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 394 590 0.00932826965722413 0.0695242569688125 0.00932326237888151 0.0670634012359808 0.00155809200057132 0.0191129444060431 353959 3029921 579 665 0 True 392 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 436 592 0.00912133729119155 0.00897214425397437 0.00910963607232776 0.0089723048752575 0.00186630428438159 0.00200031881943504 346107 391013 579 665 0 False 436 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 481 592 0.00900279656495435 0.00893999705145216 0.00901808194094758 0.0089723048752575 0.00200402580076448 0.00197902481507163 341609 389612 579 665 0 False 481 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 525 592 0.00885086519840089 0.00893104815139244 0.00889600976577401 0.0089570458533608 0.00195804939994514 0.00193096652703937 335844 389222 579 665 0 False 525 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 569 592 0.00887798356374061 0.00873479188931358 0.00891126878767071 0.00875867856870375 0.00180700512393385 0.00183982340813393 336873 380669 579 665 0 False 569 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 613 592 0.00873145478697786 0.00887533551204631 0.00869764248111696 0.0089417868314641 0.00146480241352824 0.00151241258674505 331313 386794 579 665 0 False 613 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 658 592 0.00871935825666597 0.00873472305162081 0.00871290150301366 0.00885023270008392 0.00164695884943569 0.00159512506188385 330854 380666 579 665 0 False 658 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 260 640 0.00841929051346081 0.0361689988303329 0.00843823910887312 0.0365758754863813 0.00129803483805563 0.00720942046243087 319468 1576273 579 665 0 True 259 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 304 636 0.00847444963751917 0.00840912076483266 0.00848401617456321 0.00836194399938964 0.00134895793106161 0.00138671471527249 321561 366476 579 665 0 False 304 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 348 636 0.00847658431933891 0.00857747481544328 0.00843823910887312 0.0085297932402533 0.00133617872406608 0.00125324492526061 321642 373813 579 665 0 False 348 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 392 635 0.00883919033363364 0.00869319097698469 0.00886549172198062 0.00872816052491035 0.00127834668594368 0.00132465859399726 335401 378856 579 665 0 False 392 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 436 635 0.00875899481786223 0.00865312743979427 0.00874341954680705 0.00871290150301366 0.00168072572046816 0.00172536519394877 332358 377110 579 665 0 False 436 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 481 635 0.00881046436840497 0.00871620571226648 0.00872816052491035 0.00871290150301366 0.00176763829763294 0.00188606675423372 334311 379859 579 665 0 False 481 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 525 635 0.00871901565341095 0.00854707150113783 0.00865186541542687 0.00869764248111696 0.001939576323171 0.00188654579069913 330841 372488 579 665 0 False 525 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 569 635 0.00876205189306088 0.00852467630509095 0.00878919661249714 0.0085145342183566 0.00170255771799397 0.00158343540676076 332474 371512 579 665 0 False 569 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 613 635 0.00884427667426587 0.00872485631565753 0.00877393759060044 0.00874341954680705 0.00134535827536577 0.00141229805038801 335594 380236 579 665 0 False 613 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 657 637 0.00864388012417523 0.0364961843840547 0.00863660639353018 0.0367284657053483 0.00142812739921364 0.00680253167985341 327990 1590532 579 665 0 True 658 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H4_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H4_2.csv new file mode 100755 index 0000000..8ec66e4 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H4_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 258 249 0.00763673197080019 0.671178197267029 0.00700389105058366 0.67838559548333 0.00346091891453428 0.188335794728398 289774 29250466 579 665 4 True 259 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 303 248 0.00586491970631522 0.00571465284864714 0.00572213321126116 0.00566109712367437 0.00147594031705612 0.00122010724740025 222543 249049 579 665 0 False 303 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 345 248 0.00547082054665512 0.00539698984242478 0.00540169375143053 0.00544747081712062 0.0012798749968485 0.00122364525900683 207589 235205 579 665 0 True 347 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 390 248 0.00537800141864102 0.00531700044342947 0.00540169375143053 0.00535591668574044 0.0012325973104203 0.0011524712794722 204067 231719 579 665 0 True 391 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 434 248 0.00529219248030657 0.0053564214954874 0.00526436255436027 0.00546272983901732 0.00149044832600278 0.00148801855078752 200811 233437 579 665 0 True 436 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 478 248 0.00541010070822681 0.00550807093265322 0.00541695277332723 0.0055390249485008 0.00151930007425711 0.00147555460811326 205285 240046 579 665 0 True 480 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 522 247 0.00551675573692445 0.00552264157762224 0.00556954299229419 0.0055390249485008 0.00155565213157498 0.00155495341071145 209332 240681 579 665 0 True 524 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 566 246 0.00575296750421303 0.00597846183322807 0.00576791027695125 0.00601205462729839 0.00160613337451441 0.00137905720612887 218295 260546 579 665 0 True 568 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 613 247 0.00662541987017181 0.00617423623145756 0.00650034332799268 0.00625619897764553 0.00274003861742687 0.0019692132341281 251400 269078 579 665 0 False 613 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 653 246 0.00811540142625735 0.677112878327657 0.00784313725490196 0.668894483863584 0.0025858960443065 0.194503330512611 307937 29509104 579 665 6 True 657 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 259 291 0.00559668771173046 0.00545036200021684 0.00556954299229419 0.00544747081712062 0.00164877085950019 0.00144836325646889 212365 237531 579 665 0 False 259 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 303 291 0.00548976914206742 0.00544384536530156 0.00546272983901732 0.00544747081712062 0.00127333101057402 0.00116680848722187 208308 237247 579 665 0 False 303 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 346 293 0.00535486252187884 0.00543909556450063 0.00535591668574044 0.00544747081712062 0.00116654780965962 0.00132438410463762 203189 237040 579 665 0 True 347 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 391 293 0.00549944109549763 0.00577933733395058 0.00544747081712062 0.00561532005798428 0.00127547954075606 0.00195021543199875 208675 251868 579 665 0 True 391 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 434 292 0.00557787088680085 0.00543960037424759 0.00560006103608759 0.00541695277332723 0.001592252341891 0.0015612502834859 211651 237062 579 665 0 True 436 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 479 290 0.00552848330988478 0.00562151545033332 0.00552376592660411 0.00560006103608759 0.00171146828246915 0.00181759009887132 209777 244990 579 665 0 True 480 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 523 291 0.00572653434538335 0.00571926497406253 0.00575265125505455 0.00572213321126116 0.00151924708123925 0.0014952595191436 217292 249250 579 665 0 True 524 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 567 291 0.0059404241929025 0.00615994093725961 0.00610360875867857 0.00617990386816205 0.00166950663248578 0.00165311513037293 225408 268455 579 665 0 True 568 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 613 290 0.00595982080795599 0.00598300512095069 0.0059510185397116 0.00599679560540169 0.00190436448889691 0.001806450488059 226144 260744 579 665 0 False 613 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 657 290 0.00633644720161002 0.00606918991229504 0.0063782711528191 0.00599679560540169 0.0019738870646004 0.00188436920279243 240435 264500 579 665 0 False 657 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 259 331 0.00521376268900334 0.0053075467336228 0.00521858548867018 0.00534065766384375 0.0012886505366077 0.00149677123748584 197835 231307 579 665 0 True 259 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 304 331 0.00531846751455701 0.00556428838174631 0.00534065766384375 0.0055542839703975 0.00120282017659321 0.00132206662583282 201808 242496 579 665 0 True 303 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 347 331 0.00562288368369128 0.00552821743073637 0.00560006103608759 0.00560006103608759 0.00118180746745839 0.00126552564868626 213359 240924 579 665 0 True 347 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 391 331 0.00572571736839061 0.00570632348782233 0.00579842832074464 0.00572213321126116 0.0012377493088045 0.0011854489893283 217261 248686 579 665 0 True 392 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 435 331 0.00573246401710486 0.0057732337251919 0.00564583810177768 0.00579842832074464 0.00156066966363021 0.0015505544964288 217517 251602 579 665 0 True 436 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 480 334 0.00570977313998387 0.00590494317735286 0.00569161516746777 0.00584420538643473 0.00156443566885619 0.00162479909026266 216656 257342 579 665 0 False 480 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 524 334 0.00574756491442232 0.00569228059849785 0.00576791027695125 0.00563057907988098 0.00156514054148069 0.0014417604149276 218090 248074 579 665 0 False 524 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 567 329 0.00596756891233876 0.00607315955257794 0.00624093995574884 0.00614938582436866 0.00173401114530578 0.00148585829955709 226438 264673 579 665 0 True 568 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 612 329 0.00588655641957461 0.00594532795710953 0.00592050049591821 0.00601205462729839 0.00196759338874701 0.00196234608976576 223364 259102 579 665 0 True 613 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 655 328 0.00565917327462695 0.00572929233130893 0.00570687418936446 0.00578316929884794 0.00192992134901192 0.0016574720525387 214736 249687 579 665 0 True 657 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 260 375 0.00547390397595031 0.00553629438668771 0.00546272983901732 0.0055390249485008 0.00150677407765142 0.00138691875035755 207706 241276 579 665 0 True 259 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 304 376 0.00556543175323394 0.00570295044087674 0.00550850690470741 0.00569161516746777 0.00132284725730753 0.00137383848176559 211179 248539 579 665 0 True 303 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 347 375 0.00582876188586225 0.00597327606037295 0.00588998245212482 0.005981536583505 0.00124628585009801 0.00133920789834718 221171 260320 579 665 0 True 347 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 391 375 0.00600625672605958 0.00621519465865396 0.005981536583505 0.00619516289005875 0.00137318962479291 0.00138862948340473 227906 270863 579 665 0 True 392 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 436 375 0.00600143392639274 0.00615578772979599 0.00593575951781491 0.00614938582436866 0.00152873111747279 0.0017017914173144 227723 268274 579 665 0 True 436 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 480 373 0.00584433715691743 0.00607488049489712 0.00584420538643473 0.00605783169298848 0.00172964153450315 0.00177529917758236 221762 264748 579 665 0 True 480 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 524 373 0.00583440166252183 0.00597522646166802 0.00592050049591821 0.00599679560540169 0.00158594753477356 0.00158550254703056 221385 260405 579 665 0 True 524 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 568 373 0.00580659809067206 0.0060450508280314 0.00575265125505455 0.00605783169298848 0.00182385062037342 0.00164289831480233 220330 263448 579 665 0 True 569 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 612 373 0.00576896444081285 0.00581928614165306 0.00561532005798428 0.00582894636453803 0.00198060521308347 0.00194184959610816 218902 253609 579 665 0 True 613 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 656 373 0.00528001688770506 0.00556495381277639 0.00527962157625696 0.00550850690470741 0.00184850159748925 0.00176513839742778 200349 242525 579 665 0 True 657 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 259 419 0.00540975810497179 0.00550364237441854 0.00540169375143053 0.00552376592660411 0.00143334685313699 0.0015089743127193 205272 239853 579 665 0 True 259 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 303 419 0.00549546162692008 0.00575746989354824 0.00550850690470741 0.00582894636453803 0.00132546840975536 0.0014177435572819 208524 250915 579 665 0 True 303 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 347 419 0.00572094727691686 0.0059040253414493 0.00566109712367437 0.00587472343022812 0.00129364605565775 0.00130248720492982 217080 257302 579 665 0 True 347 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 392 419 0.00590550501498692 0.00603142096486352 0.00587472343022812 0.00601205462729839 0.00148949016532575 0.00144551958251861 224083 262854 579 665 0 True 392 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 436 418 0.00596393204701623 0.00619029835976988 0.0059510185397116 0.00625619897764553 0.00148555853813087 0.00160266286005087 226300 269778 579 665 0 True 436 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 480 417 0.00591393832587974 0.00605693680298251 0.0059662775616083 0.00607309071488518 0.00157339247866426 0.00153071675630159 224403 263966 579 665 0 True 480 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 524 417 0.00597381483321876 0.00588564567748049 0.00592050049591821 0.00592050049591821 0.00170725732687479 0.00159912750625048 226675 256501 579 665 0 True 524 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 569 420 0.00579982508786126 0.00561437927618313 0.00578316929884794 0.0055390249485008 0.00183796657090803 0.00172781062108137 220073 244679 579 665 0 False 569 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 613 417 0.00527817210094726 0.00546977422957715 0.00532539864194705 0.00544747081712062 0.00182523671721466 0.00175418985250918 200279 238377 579 665 0 True 613 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 656 417 0.00527930532709848 0.00522792446898891 0.00526436255436027 0.00529488059815366 0.00167477280901383 0.00182382382839328 200322 227837 579 665 0 True 657 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 260 463 0.00542069505503592 0.00556988718075803 0.00538643472953384 0.00563057907988098 0.00144461258267044 0.00141855867259949 205687 242740 579 665 0 True 259 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 305 464 0.00554221379418215 0.00558154369673325 0.00560006103608759 0.00556954299229419 0.00147277782925256 0.0014285838513719 210298 243248 579 665 0 True 303 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 349 463 0.00565954223197851 0.00581758814523147 0.00570687418936446 0.00581368734264134 0.0015593380217493 0.00149830321583612 214750 253535 579 665 0 True 348 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 392 463 0.00585071484828012 0.00594610811762756 0.00582894636453803 0.00599679560540169 0.00142517125562205 0.00144722843287983 222004 259136 579 665 0 True 392 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 437 462 0.00588218163954896 0.00583431570457386 0.00592050049591821 0.00585946440833143 0.00183030113621777 0.00191464148750828 223198 254264 579 665 0 True 436 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 481 461 0.00590574220185578 0.00603529882155606 0.00584420538643473 0.00599679560540169 0.00169305413525925 0.0020236699159001 224092 263023 579 665 0 True 480 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 525 461 0.00565411328809126 0.00565106976642797 0.00561532005798428 0.00567635614557107 0.00165458473500403 0.00161398016008289 214544 246278 579 665 0 True 525 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 569 461 0.00530568577773508 0.00545690158102971 0.00532539864194705 0.00544747081712062 0.00169136870607709 0.00184454454572284 201323 237816 579 665 0 True 569 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 613 460 0.00535950084286989 0.00512882113730194 0.00535591668574044 0.00508125429159991 0.00164625631142503 0.00178309588235626 203365 223518 579 665 0 True 613 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 658 461 0.0051363079992721 0.00537886258332946 0.00503547722590982 0.00538643472953384 0.00177462781486051 0.00184672630789135 194896 234415 579 665 0 True 657 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 261 507 0.00534382015542855 0.00548792443457006 0.00538643472953384 0.00544747081712062 0.00148657057823733 0.00143753607758708 202770 239168 579 665 0 True 259 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 306 508 0.00579226146215427 0.00552186141710422 0.00575265125505455 0.00549324788281071 0.00148751360111517 0.00153511818706161 219786 240647 579 665 0 True 303 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 349 507 0.00556627508432323 0.00574232560113949 0.00556954299229419 0.00576791027695125 0.00131456171039733 0.00152852717841871 211211 250255 579 665 0 True 348 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 394 507 0.00584995057948046 0.00570418951934655 0.00585946440833143 0.00570687418936446 0.00156975613856702 0.00152156342446022 221975 248593 579 665 0 True 392 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 438 505 0.00571997217534487 0.00572082529509858 0.00575265125505455 0.00567635614557107 0.00178526517288848 0.00195824914990775 217043 249318 579 665 0 True 436 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 482 504 0.00566497117586576 0.00587731631665568 0.00567635614557107 0.00584420538643473 0.0017276298081217 0.00169413968834655 214956 256138 579 665 0 True 480 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 526 504 0.00547743542488667 0.00572899403464027 0.00556954299229419 0.00576791027695125 0.00162533444326203 0.00156465095827542 207840 249674 579 665 0 True 525 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 570 503 0.00544101406346831 0.00558218618186574 0.00544747081712062 0.00556954299229419 0.00173251982990125 0.00173446462037982 206458 243276 579 665 0 True 569 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 615 502 0.00539684459766716 0.00547186230625775 0.00546272983901732 0.00543221179522393 0.00180507503569638 0.00175007596688328 204782 238468 579 665 0 True 613 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 658 502 0.00536817134063157 0.00539088623366611 0.00546272983901732 0.00521858548867018 0.00176944501396884 0.00225119501958563 203694 234939 579 665 0 True 657 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 262 549 0.00563389969604503 0.00575880075560841 0.00566109712367437 0.00572213321126116 0.00135734262086074 0.00140202310851272 213777 250973 579 665 0 True 259 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 306 548 0.00574574648176105 0.00575402800890989 0.00576791027695125 0.00575265125505455 0.00137100572629804 0.00133023681561096 218021 250765 579 665 0 True 304 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 350 547 0.0058164281686815 0.00591391502331016 0.00579842832074464 0.00590524147402152 0.00131174307278084 0.00132661650573086 220703 257733 579 665 0 True 348 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 394 547 0.00565817181895843 0.00584900107903083 0.00567635614557107 0.00585946440833143 0.00152492964024768 0.00142825804470027 214698 254904 579 665 0 True 392 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 439 547 0.00566549825779656 0.00574007690317577 0.00570687418936446 0.00570687418936446 0.00176517942972876 0.00185937381455319 214976 250157 579 665 0 True 436 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 482 545 0.00563455854845853 0.00581283834443054 0.00561532005798428 0.00575265125505455 0.00188435890914252 0.00196633300308634 213802 253328 579 665 0 True 481 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 527 545 0.00555172762303311 0.00590248796631083 0.00550850690470741 0.00599679560540169 0.00181654850313189 0.00194954055839341 210659 257235 579 665 0 True 525 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 571 543 0.00563613979425093 0.00567073440066176 0.00558480201419089 0.00575265125505455 0.00157782834174882 0.00167623684843707 213862 247135 579 665 0 True 569 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 615 544 0.00562438586719406 0.00553457344436853 0.00563057907988098 0.00550850690470741 0.00154504610411539 0.00158560966156956 213416 241201 579 665 0 True 613 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 660 544 0.00533572944779076 0.00553989689260918 0.00535591668574044 0.00558480201419089 0.00170096842675662 0.00181591951592401 202463 241433 579 665 0 True 657 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 259 593 0.00602220095446631 0.00580095236947943 0.00607309071488518 0.00585946440833143 0.00129048101002508 0.00131250396212799 228511 252810 579 665 0 False 259 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 304 593 0.00584217612100115 0.00583108033301381 0.00588998245212482 0.00588998245212482 0.00135527786385217 0.00133948982378556 221680 254123 579 665 0 False 304 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 351 590 0.00555736739969268 0.00577619374598088 0.0055390249485008 0.00576791027695125 0.00132192300348356 0.00144298620205579 210873 251731 579 665 0 True 348 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 394 590 0.00561326443845416 0.00561412687130965 0.00567635614557107 0.00566109712367437 0.00131919482160758 0.00127744850354871 212994 244668 579 665 0 True 392 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 436 592 0.00565574724207674 0.00561593959721919 0.00575265125505455 0.00560006103608759 0.00164741715325026 0.00204206569940557 214606 244747 579 665 0 False 436 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 481 592 0.00557531453943647 0.00566754492089689 0.00558480201419089 0.00563057907988098 0.00199355999898832 0.00182717749459327 211554 246996 579 665 0 False 481 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 525 592 0.00545682652139234 0.00559599961221433 0.00543221179522393 0.0055542839703975 0.00198067689465179 0.00193249315346323 207058 243878 579 665 0 False 525 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 569 592 0.00578751772477705 0.00570701186475 0.00582894636453803 0.00573739223315786 0.00170863956996088 0.00185674334093026 219606 248716 579 665 0 False 569 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 613 592 0.00575367906481961 0.00551045730600248 0.00578316929884794 0.00546272983901732 0.00145049083442081 0.00142255766323424 218322 240150 579 665 0 False 613 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 658 592 0.00560140509501113 0.00557546303387216 0.00563057907988098 0.00560006103608759 0.00154755402142049 0.00153213440704405 212544 242983 579 665 0 False 658 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 260 640 0.00812217442906815 0.686071094421795 0.0072480354009308 0.672068360418097 0.00361403097628082 0.185689736728694 308194 29899510 579 665 6 True 259 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 304 636 0.00611886778057527 0.00600149951440744 0.00614938582436866 0.00599679560540169 0.00151553909251886 0.00136620992824033 232179 261550 579 665 0 False 304 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 348 636 0.00554840700686906 0.00552383476429687 0.00552376592660411 0.00552376592660411 0.0012519840954231 0.00120700898676338 210533 240733 579 665 0 False 348 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 392 635 0.0054863958177103 0.0055024721336415 0.00547798886091402 0.00544747081712062 0.00125046681077966 0.00123697865707553 208180 239802 579 665 0 False 392 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 436 635 0.00541118122618496 0.00531130986082739 0.00546272983901732 0.00531013962005036 0.00154522185114634 0.0016330978822374 205326 231471 579 665 0 False 436 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 481 635 0.0055204716645366 0.0054157595866526 0.00556954299229419 0.00552376592660411 0.00174129702210589 0.00159368963897569 209473 236023 579 665 0 False 481 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 525 635 0.00540791331821399 0.00537163462558892 0.00543221179522393 0.00535591668574044 0.00173202077367106 0.0017467703035856 205202 234100 579 665 0 False 525 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 569 635 0.00557584162136727 0.00548985188996754 0.00558480201419089 0.00550850690470741 0.00166182046638687 0.0014740024720996 211574 239252 579 665 0 False 569 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 613 635 0.00597942825578179 0.00567651676685419 0.00604257267109178 0.00569161516746777 0.00139482137304388 0.0013525158149286 226888 247387 579 665 0 False 613 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 657 637 0.00767096594220573 0.705709685061819 0.0072480354009308 0.697199969481956 0.00240350968328855 0.182805472297944 291073 30755375 579 665 7 True 658 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H4_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H4_3.csv new file mode 100755 index 0000000..1754889 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H4_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 258 249 0.00100482899287952 0.0680723094070723 0.00080872816052491 0.0681162737468528 0.000846337178813343 0.0199493137627303 38128 2966644 579 665 0 True 259 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 303 248 0.000911061117389975 0.000934632300595848 0.000778210116731518 0.000854505226215 0.000660981806302711 0.000637078041262511 34570 40732 579 665 0 False 303 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 345 248 0.00093003606689882 0.000918983198440138 0.000854505226215 0.000793469138628214 0.000661331984890557 0.000634471250556087 35290 40050 579 665 0 True 347 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 390 248 0.000884891499525692 0.000988348646851737 0.000762951094834821 0.000839246204318303 0.000681528821243508 0.000735145981923237 33577 43073 579 665 0 True 391 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 434 248 0.000902522390110994 0.000943351741679674 0.000686655985351339 0.000732433051041428 0.000772815056389216 0.000802452147102108 34246 41112 579 665 0 True 436 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 478 248 0.000860830209384615 0.000934379895722368 0.00064087891966125 0.000747692072938125 0.000798546461274476 0.000796887202915002 32664 40721 579 665 0 True 480 248 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 522 247 0.000948562996766484 0.000903494717567551 0.000747692072938125 0.000717174029144732 0.000796278835450087 0.00079368412278332 35993 39375 579 665 0 True 524 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 566 246 0.000972518870521401 0.000967376096455375 0.000778210116731518 0.000778210116731518 0.000840887666714011 0.000758730499322617 36902 42159 579 665 0 True 568 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 613 247 0.00100556690758264 0.000974994134454929 0.000625619897764553 0.000625619897764553 0.0010366492154066 0.00099790818105122 38156 42491 579 665 0 False 613 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 653 246 0.00108323243008621 0.0690417506343106 0.000778210116731518 0.0676127260242618 0.000937602260454444 0.0210279118229407 41103 3008893 579 665 0 True 657 247 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 259 291 0.000932987725711307 0.00098662770453256 0.000701915007248035 0.00080872816052491 0.00081201031802426 0.000808927400058128 35402 42998 579 665 0 False 259 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 303 291 0.000876168293570931 0.000906982494001082 0.000762951094834821 0.000778210116731518 0.000651539899907514 0.000639549898407386 33246 39527 579 665 0 False 303 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 346 293 0.000935016991144892 0.000871599919918817 0.000854505226215 0.000671396963454643 0.000681602228372656 0.000759518093880997 35479 37985 579 665 0 True 347 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 391 293 0.000872478720055323 0.000917675282277564 0.000717174029144732 0.000823987182421607 0.000687505138926619 0.000677560930151464 33106 39993 579 665 0 True 391 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 434 292 0.000918809221772753 0.000918960252542549 0.000686655985351339 0.000671396963454643 0.000846523469100962 0.000847864367878744 34864 40049 579 665 0 True 436 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 479 290 0.000844991397364037 0.000909093516579271 0.000534065766384375 0.000595101853971161 0.000872550296520421 0.000917674377189891 32063 39619 579 665 0 True 480 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 523 291 0.000876589959115572 0.000856868653666668 0.000701915007248035 0.000656137941557946 0.000756526095343234 0.000791482061295996 33262 37343 579 665 0 True 524 291 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 567 291 0.000920996611785578 0.000940804747047293 0.000625619897764553 0.000686655985351339 0.000935301187645183 0.00086586135950072 34947 41001 579 665 0 True 568 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 613 290 0.000903892803131077 0.000885023270008392 0.000473029678797589 0.000564583810177768 0.000980028340532645 0.000895935607441296 34298 38570 579 665 0 False 613 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 657 290 0.000975444175237348 0.00092873520491547 0.00064087891966125 0.000473029678797589 0.000965703822859911 0.00100915322730321 37013 40475 579 665 0 False 657 290 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 259 331 0.000872452365958783 0.000878368959707578 0.000671396963454643 0.000732433051041428 0.000751995583074817 0.000697112747159342 33105 38280 579 665 0 True 259 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 304 331 0.000854373455732299 0.000904160148597633 0.000717174029144732 0.000793469138628214 0.000651863837147122 0.000654765368771944 32419 39404 579 665 0 True 303 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 347 331 0.000896329177424079 0.000840737687661589 0.000762951094834821 0.000717174029144732 0.00067014911728513 0.000665072344418102 34011 36640 579 665 0 True 347 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 391 331 0.000902733222883315 0.000999270894104109 0.000762951094834821 0.000854505226215 0.000675088982456432 0.000707544144887317 34254 43549 579 665 0 True 392 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 435 331 0.000879409847445359 0.000918983198440138 0.000625619897764553 0.000595101853971161 0.000785985429703778 0.000924024532343762 33369 40050 579 665 0 True 436 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 480 334 0.000955520478253061 0.000885826376424008 0.000732433051041428 0.00064087891966125 0.000841487958216838 0.000799355248037417 36257 38605 579 665 0 False 480 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 524 334 0.000959130989479049 0.00095535244611873 0.000717174029144732 0.000717174029144732 0.000853138214504562 0.000900826867837879 36394 41635 579 665 0 False 524 334 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 567 329 0.000916753602242628 0.00093621556752949 0.000579842832074464 0.000686655985351339 0.000967692372058413 0.000836412241733881 34786 40801 579 665 0 True 568 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 612 329 0.000912247051734277 0.000951566373016542 0.000488288700694286 0.000503547722590982 0.00106652800265203 0.00110304216648133 34615 41470 579 665 0 True 613 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 655 328 0.000892797728487711 0.000958564871781192 0.000488288700694286 0.000610360875867857 0.000961866994248363 0.000921199183001957 33877 41775 579 665 0 True 657 333 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 260 375 0.000919626198765495 0.000945646331438576 0.000732433051041428 0.000778210116731518 0.000797408295541204 0.000792523272891672 34895 41212 579 665 0 True 259 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 304 376 0.000820323963002538 0.000844500814866188 0.000671396963454643 0.000701915007248035 0.000665452847494192 0.000695777618226878 31127 36804 579 665 0 True 303 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 347 375 0.000933330328966328 0.000919189711518439 0.00080872816052491 0.000762951094834821 0.000695732401906781 0.000718328202629674 35415 40059 579 665 0 True 347 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 391 375 0.000865916550016847 0.000898676079073858 0.000732433051041428 0.000762951094834821 0.000704012519586812 0.000662374039465455 32857 39165 579 665 0 True 392 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 436 375 0.00103969546260202 0.000978367181400514 0.000793469138628214 0.000717174029144732 0.000870584357210659 0.000915267614595412 39451 42638 579 665 0 True 436 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 480 373 0.000958551199355168 0.000930754443903304 0.00064087891966125 0.000579842832074464 0.000872909714750701 0.000933124560545965 36372 40563 579 665 0 True 480 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 524 373 0.000978685729111776 0.000870773867605613 0.000717174029144732 0.000564583810177768 0.000873611746259155 0.000907930089724718 37136 37949 579 665 0 True 524 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 568 373 0.000952937776792135 0.000999454461284821 0.000701915007248035 0.000732433051041428 0.000951523814322494 0.00097458737162818 36159 43557 579 665 0 True 569 377 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 612 373 0.000910560389555713 0.000860356430100199 0.000381475547417411 0.000442511635004196 0.00105215083078238 0.00102676430506842 34551 37495 579 665 0 True 613 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 656 373 0.000921444631426759 0.00101384153907314 0.000488288700694286 0.000625619897764553 0.00103337448217444 0.0010306710670488 34964 44184 579 665 0 True 657 376 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 259 419 0.000877960372135656 0.000956545632793359 0.000732433051041428 0.00080872816052491 0.000780059669186502 0.000830423216863871 33314 41687 579 665 0 True 259 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 303 419 0.000854268039346139 0.000900970668832759 0.000762951094834821 0.000747692072938125 0.000671170178130868 0.000730983311040165 32415 39265 579 665 0 True 303 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 347 419 0.000887922220627799 0.000907051331693849 0.000732433051041428 0.000747692072938125 0.000684405787880749 0.000715927798293856 33692 39530 579 665 0 True 347 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 392 419 0.000948773829538805 0.000901934396531498 0.000793469138628214 0.000793469138628214 0.000774953396959471 0.000750642340570087 36001 39307 579 665 0 True 392 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 436 418 0.000954624438970699 0.000933966869565766 0.000686655985351339 0.000701915007248035 0.000875192797191337 0.000835819511080487 36223 40703 579 665 0 True 436 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 480 417 0.000982665197689325 0.000906844818615548 0.000717174029144732 0.000686655985351339 0.000896606619620283 0.000812536007637824 37287 39521 579 665 0 True 480 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 524 417 0.00091770234971807 0.000940919476535238 0.00064087891966125 0.000732433051041428 0.000849277331823433 0.00085906840244015 34822 41006 579 665 0 True 524 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 569 420 0.000902153432759433 0.000824882072427578 0.000579842832074464 0.000473029678797589 0.000931146178386373 0.000868377877783272 34232 35949 579 665 0 False 569 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 613 417 0.000906053839047363 0.000861870859341074 0.000457770656900893 0.000518806744487678 0.000974907876488887 0.000872941293432404 34380 37561 579 665 0 True 613 420 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 656 417 0.000877565060687555 0.000880457036388178 0.000442511635004196 0.000503547722590982 0.000938236119119194 0.000962915698525397 33299 38371 579 665 0 True 657 419 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 260 463 0.000890821171247206 0.000925224482584351 0.000732433051041428 0.000747692072938125 0.000800323126825567 0.000784101381236793 33802 40322 579 665 0 True 259 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 305 464 0.000857535947317107 0.000893444414423562 0.000686655985351339 0.000747692072938125 0.000784419165269085 0.000776755846200954 32539 38937 579 665 0 True 303 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 349 463 0.000896302823327539 0.000901154236013472 0.000732433051041428 0.000747692072938125 0.000754698110757126 0.000761689824270375 34010 39273 579 665 0 True 348 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 392 463 0.000923684729632665 0.000887684994128718 0.000732433051041428 0.000717174029144732 0.000796323952892864 0.000799533634493919 35049 38686 579 665 0 True 392 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 437 462 0.000901099268897831 0.000896243813929422 0.000564583810177768 0.000442511635004196 0.000920713921526454 0.00104111516778289 34192 39059 579 665 0 True 436 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 481 461 0.000911772677996556 0.000939978694734089 0.000564583810177768 0.000488288700694286 0.000971470228836108 0.00105182252817869 34597 40965 579 665 0 True 480 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 525 461 0.000910639451845334 0.000920612357168958 0.000579842832074464 0.000625619897764553 0.00089356760993214 0.0008798826134335 34554 40121 579 665 0 True 525 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 569 461 0.000942264367693409 0.000877474069701606 0.000595101853971161 0.000457770656900893 0.000975218434713582 0.00100800178822272 35754 38241 579 665 0 True 569 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 613 460 0.000904604363737659 0.000893536198013918 0.000473029678797589 0.000534065766384375 0.000981157123961037 0.000939900546882962 34325 38941 579 665 0 True 613 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 658 461 0.000897356987189142 0.000922172678205011 0.000503547722590982 0.000442511635004196 0.00093361353616691 0.00103657118873791 34050 40189 579 665 0 True 657 463 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 261 507 0.000891374607274548 0.000919327386903973 0.000762951094834821 0.000762951094834821 0.000743523412608712 0.000789730754415564 33823 40065 579 665 0 True 259 507 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 306 508 0.000880200470341561 0.000912076483265844 0.000717174029144732 0.000778210116731518 0.000781646688983286 0.000785339663051959 33399 39749 579 665 0 True 303 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 349 507 0.00084211880084117 0.000953333207130897 0.000686655985351339 0.000793469138628214 0.000751958268962417 0.000806917496520165 31954 41547 579 665 0 True 348 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 394 507 0.000936466466454595 0.000965930504907267 0.000717174029144732 0.000747692072938125 0.00084850108508607 0.000850435801916621 35534 42096 579 665 0 True 392 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 438 505 0.000926978991700173 0.000964943831310939 0.000518806744487678 0.000564583810177768 0.000979202424256148 0.00103959110312582 35174 42053 579 665 0 True 436 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 482 504 0.000968750234716172 0.000981304256291908 0.000595101853971161 0.00064087891966125 0.000995048783277293 0.000935002585592413 36759 42766 579 665 0 True 480 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 526 504 0.000973704804865704 0.000871508136328461 0.000671396963454643 0.000610360875867857 0.000918353474805998 0.000840082335630674 36947 37981 579 665 0 True 525 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 570 503 0.000843252026992393 0.000880548819978534 0.000579842832074464 0.000564583810177768 0.000871743430559811 0.000887101354504764 31997 38375 579 665 0 True 569 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 615 502 0.00093427907644177 0.000910263757356311 0.000579842832074464 0.000579842832074464 0.000961521432410965 0.000967997102647063 35451 39670 579 665 0 True 613 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 658 502 0.000921260152750979 0.000972217680846658 0.000534065766384375 0.000518806744487678 0.0009691447836481 0.00106142201149617 34957 42370 579 665 0 True 657 506 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 262 549 0.000866891651588829 0.000973984514961012 0.000717174029144732 0.00080872816052491 0.000720231171364113 0.000737140428173049 32894 42447 579 665 0 True 259 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 306 548 0.000832525909700587 0.000865771661931207 0.000732433051041428 0.000747692072938125 0.000699179936767871 0.000684960349929483 31590 37731 579 665 0 True 304 550 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 350 547 0.000863412910845541 0.000895601328796929 0.000732433051041428 0.000762951094834821 0.000723666352946633 0.000717554346764827 32762 39031 579 665 0 True 348 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 394 547 0.00094703445916716 0.000921369571789396 0.000762951094834821 0.000762951094834821 0.000800188511029953 0.000748783310160653 35935 40154 579 665 0 True 392 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 439 547 0.000904709780123819 0.000901590208067663 0.000534065766384375 0.000473029678797589 0.000946783234672904 0.00106308003179257 34329 39292 579 665 0 True 436 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 482 545 0.000883731919277929 0.000920772978452081 0.000457770656900893 0.000488288700694286 0.000954093603340863 0.00105453308767679 33533 40128 579 665 0 True 481 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 527 545 0.000974785322823847 0.000880893008442369 0.000564583810177768 0.000473029678797589 0.00104143979507069 0.000960562375145909 36988 38390 579 665 0 True 525 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 571 543 0.000866707172913049 0.000930410255439469 0.000595101853971161 0.000717174029144732 0.000851070114861057 0.000869122646538478 32887 40548 579 665 0 True 569 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 615 544 0.000884865145429152 0.000918593118181125 0.000625619897764553 0.00064087891966125 0.000845538242377327 0.000855400957941498 33576 40033 579 665 0 True 613 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 660 544 0.000882308798064766 0.000901154236013472 0.000503547722590982 0.000534065766384375 0.000904815325850991 0.000966655209705674 33479 39273 579 665 0 True 657 549 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 259 593 0.000961186609009174 0.00092990544569251 0.000823987182421607 0.00080872816052491 0.000713953830621905 0.000662371946517908 36472 40526 579 665 0 False 259 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 304 593 0.000866127382789167 0.000903127583206127 0.000717174029144732 0.000762951094834821 0.000732987130925985 0.000754467845028783 32865 39359 579 665 0 False 304 593 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 351 590 0.00095517787499804 0.000824101911909552 0.000793469138628214 0.000686655985351339 0.000739376626421858 0.000722738053711401 36244 35915 579 665 0 True 348 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 394 590 0.000895380429948637 0.000917147526633017 0.000747692072938125 0.000793469138628214 0.000698861099343881 0.000699415597817681 33975 39970 579 665 0 True 392 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 436 592 0.000985089774571011 0.000936972782149927 0.000625619897764553 0.000579842832074464 0.000983631869924888 0.00100938676544509 37379 40834 579 665 0 False 436 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 481 592 0.000865758425437606 0.000902576881663991 0.000442511635004196 0.000473029678797589 0.000990671515907581 0.000996386564950298 32851 39335 579 665 0 False 481 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 525 592 0.000904156344096478 0.000889727179014141 0.000518806744487678 0.000366216525520714 0.00101770057352752 0.00105098306724335 34308 38775 579 665 0 False 525 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 569 592 0.00093825854501932 0.000857029274949791 0.000610360875867857 0.000488288700694286 0.000945539928149652 0.000892480484668754 35602 37350 579 665 0 False 569 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 613 592 0.000846757121832221 0.000817126359042491 0.000579842832074464 0.000595101853971161 0.000768551530013205 0.000722771867675609 32130 35611 579 665 0 False 613 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 658 592 0.000880648489982742 0.000950832104293694 0.00064087891966125 0.000701915007248035 0.000806818318264662 0.000816538364648722 33416 41438 579 665 0 False 658 592 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 260 640 0.00113043261698946 0.0701034114239593 0.000946059357595178 0.0682383459220264 0.000770920595358746 0.0204038188171626 42894 3055161 579 665 0 True 259 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 304 636 0.00085901177672335 0.000888717559520224 0.000762951094834821 0.000762951094834821 0.000648255923905241 0.000658670714951876 32595 38731 579 665 0 False 304 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 348 636 0.00100920377290517 0.000933898031872999 0.000900282291905089 0.000793469138628214 0.000717199807041752 0.000700754680269879 38294 40700 579 665 0 False 348 636 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 392 635 0.000901705413118252 0.000962465674371325 0.000762951094834821 0.000839246204318303 0.000706858176717227 0.000690466982784734 34215 41945 579 665 0 False 392 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 436 635 0.000844016295792055 0.000910814458898448 0.000595101853971161 0.000625619897764553 0.000842048337757538 0.000872245144031313 32026 39694 579 665 0 False 436 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 481 635 0.000857535947317107 0.00092079592434967 0.000518806744487678 0.000656137941557946 0.000910424457609307 0.000897857093933248 32539 40129 579 665 0 False 481 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 525 635 0.000857193344062086 0.000838833178161701 0.000473029678797589 0.000457770656900893 0.000967213458958211 0.000897534413151837 32526 36557 579 665 0 False 525 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 569 635 0.000916727248146088 0.000874146914551198 0.000625619897764553 0.00064087891966125 0.000921216975485891 0.000785369851874181 34785 38096 579 665 0 False 569 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 613 635 0.00089229700065345 0.000879493308689439 0.000762951094834821 0.000701915007248035 0.000665139986167085 0.000727453514419912 33858 38329 579 665 0 False 613 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 657 637 0.00100108671117083 0.0725670206645017 0.000839246204318303 0.0710612649729152 0.000749944166348154 0.0202921942986657 37986 3162527 579 665 0 True 658 635 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H5_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H5_1.csv new file mode 100755 index 0000000..8293d6a --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H5_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 271 276 0.00904705445679967 0.0376510284638123 0.0089723048752575 0.0386816205081254 0.00149802011178456 0.00827143009833615 368783 1640861 622 665 0 True 271 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 315 277 0.00901400959748319 0.00908799809090132 0.00900282291905089 0.00907911802853437 0.00126129672306845 0.00122943758176891 367436 396062 622 665 0 False 315 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 360 278 0.00920320184325059 0.0519060985032965 0.00915541313801785 0.0525368123903258 0.00138499590394757 0.00693671002749158 375148 2262108 622 665 0 True 360 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 404 278 0.00925437599064048 0.0769860104598874 0.00921644922560464 0.0733653772793164 0.00145810560251335 0.0153885620083109 377234 3355110 622 665 0 True 404 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 447 278 0.00941339364326811 0.0651362670810696 0.00941481651026169 0.0646982528419928 0.00167618821251777 0.0121468254289727 383716 2838689 622 665 0 True 448 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 491 277 0.00918426299292222 0.054219962816173 0.00921644922560464 0.0562294956893263 0.00174370606391469 0.0141723983438422 374376 2362948 622 665 0 True 493 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 536 277 0.00921674361187917 0.0731119398404457 0.00920119020370794 0.0733501182574197 0.00162254958190315 0.0190506667117658 375700 3186275 622 665 0 True 537 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 580 276 0.00923651655665206 0.0577182025790042 0.00924696726939803 0.0581673914702068 0.00195592404155575 0.0135869322516976 376506 2515404 622 665 0 True 581 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 626 276 0.00892692032460012 0.00887877739668466 0.00892652780956741 0.00892652780956741 0.00192041663684413 0.00178240475382631 363886 386944 622 665 0 False 626 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 668 276 0.00904462577003476 0.0378697028678356 0.0089417868314641 0.0375371938658732 0.00179421679296338 0.00783930993519027 368684 1650391 622 665 0 True 670 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 271 320 0.00904754510059056 0.0089131732971706 0.00904859998474098 0.00892652780956741 0.00150953261942296 0.00138994324079361 368803 388443 622 665 0 False 271 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 316 320 0.00914049756677478 0.00901998645044747 0.00914015411612116 0.00903334096284428 0.00133112467776844 0.00120909225040789 372592 393098 622 665 0 False 316 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 359 322 0.00994218498890041 0.134321773763775 0.00958266575112535 0.133562218661784 0.00250973666816793 0.0351797606992254 405271 5853847 622 665 0 True 360 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 403 322 0.00947690748199889 0.0439062178219639 0.00946059357595178 0.0437018387121385 0.00164298929227193 0.00660454770595749 386305 1913467 622 665 0 True 404 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 448 322 0.00963374176975706 0.0656220776248242 0.00943007553215839 0.0646219577325094 0.00239706834617136 0.00985347701147924 392698 2859861 622 665 0 True 449 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 491 321 0.00953747745798433 0.0369335331921013 0.00952162966353857 0.0378576333257038 0.00165009651772824 0.00644797788242527 388774 1609592 622 665 0 True 493 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 536 320 0.00945097695765033 0.0362887764157475 0.00952162966353857 0.0379644464789807 0.00172289631374774 0.00682713033598017 385248 1581493 622 665 0 True 537 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 580 321 0.0094130011282354 0.0420555164519217 0.009399557488365 0.0430914778362707 0.00209107050016821 0.00668209728422149 383700 1832812 622 665 0 True 581 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 626 319 0.00909074628637848 0.00901553494631521 0.00912489509422446 0.00904859998474098 0.00209476854932018 0.00208357115387886 370564 392904 622 665 0 False 626 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 670 319 0.00899823539960606 0.00882866355635025 0.00906385900663768 0.00885023270008392 0.00191804578115129 0.00196756324442963 366793 384760 622 665 0 False 670 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 271 360 0.00935508062872077 0.0426839816409873 0.00921644922560464 0.0430914778362707 0.00148866229865251 0.00886584015375385 381339 1860201 622 665 0 True 271 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 315 361 0.00945715906941555 0.052745780679669 0.00944533455405508 0.0558480201419089 0.00147617478405567 0.0125803620602516 385500 2298702 622 665 0 True 316 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 360 363 0.0104103082297891 0.0258946519422842 0.00994888227664607 0.0258640421149004 0.00274155208765019 0.0142947489579327 424353 1128509 622 665 0 False 360 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 404 363 0.00955874686631944 0.0299452912436734 0.00952162966353857 0.0314488441290913 0.00162828949941117 0.00676909424942328 389641 1305039 622 665 0 False 404 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 448 360 0.00972519777237906 0.0623034812942175 0.00971999694819562 0.0617074845502403 0.00199796567932142 0.00910508130129819 396426 2715234 622 665 0 True 449 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 491 359 0.00970140154852087 0.0298105758789283 0.00965896086060884 0.0298008697642481 0.00184387119311134 0.00504228754981942 395456 1299168 622 665 0 True 493 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 537 362 0.00962292307416792 0.0243432568603931 0.00961318379491875 0.0252231631952392 0.00178715747463279 0.00444200625054862 392257 1060898 622 665 0 False 537 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 579 358 0.00971104269901187 0.0434680429616041 0.00956740672922866 0.0437933928435187 0.00232287281896984 0.00898945009615261 395849 1894371 622 665 0 True 582 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 624 358 0.00915693413376961 0.048674971934299 0.00923170824750134 0.0495918211642634 0.00201679239343802 0.00888681609062962 373262 2121293 622 665 0 True 626 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 668 358 0.00909705105909142 0.0554946762649356 0.00907911802853437 0.05468833447776 0.00199185781652926 0.0144058283885311 370821 2418501 622 665 0 True 670 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 271 404 0.00945519649425199 0.038680083132987 0.009399557488365 0.0404821850919356 0.00150850961392812 0.00992941137105004 385420 1685708 622 665 0 True 272 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 316 404 0.00938243402006292 0.0284040382485167 0.0093842984664683 0.0281223773556115 0.00142529145258265 0.00353535212715241 382454 1237870 622 665 0 True 316 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 359 404 0.00992199499690526 0.0707781125966668 0.00978103303578241 0.070420386053254 0.00164346253221136 0.0148743591067032 404448 3084565 622 665 0 True 360 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 404 404 0.00985445787908918 0.0564734564724927 0.0097962920576791 0.0563820859082933 0.0017672719098408 0.0116337214371108 401695 2461157 622 665 0 True 404 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 448 403 0.00974999981600858 0.0400733809804897 0.00976577401388571 0.0405432211795224 0.00166354308141377 0.00752520143553461 397437 1746429 622 665 0 True 449 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 491 402 0.00967610886110046 0.0476124850923372 0.0097962920576791 0.0496223392080568 0.00181585529811715 0.00940707669895054 394425 2074989 622 665 0 True 493 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 536 402 0.0096532693926345 0.0368958789741578 0.00965896086060884 0.0377050431067369 0.0016647147263459 0.0048912729296923 393494 1607951 622 665 0 True 537 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 580 402 0.00946022559310861 0.0477522256086543 0.00946059357595178 0.0474708171206226 0.00176538421532503 0.00722407794562765 385625 2081079 622 665 0 True 582 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 625 401 0.00935032138394913 0.0382153598691166 0.00946059357595178 0.0389257648584726 0.00198211737116075 0.00676633417211498 381145 1665455 622 665 0 True 626 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 668 402 0.00934531681728205 0.0736443305563061 0.0093690394445716 0.0715037766079194 0.00192753342186502 0.0122963536139771 380941 3209477 622 665 0 True 670 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 272 447 0.00957403042040568 0.0416809705655762 0.00958266575112535 0.0423590447852293 0.00176649138516809 0.00587895136403958 390264 1816489 622 665 0 True 272 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 316 447 0.00970571921388071 0.0465513750042307 0.00962844281681544 0.0466926070038911 0.00174586363443136 0.00475568095433 395632 2028745 622 665 0 True 316 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 360 448 0.00950158686468069 0.0311483676001631 0.00947585259784848 0.0314030670634012 0.00167296981040309 0.00338419899440131 387311 1357470 622 665 0 True 360 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 404 447 0.00972316160064686 0.0458979446785882 0.00970473792629892 0.0456855115587091 0.00167696695579229 0.00709851258119644 396343 2000268 622 665 0 True 405 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 448 447 0.0100298139699535 0.0796250640333955 0.00996414129854276 0.0797741664759289 0.00202646785076675 0.00942465984530214 408843 3470122 622 665 0 True 449 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 492 445 0.00969009220914084 0.0524588651762159 0.00961318379491875 0.0531624322880903 0.00195659260806513 0.0127713477912738 394995 2286198 622 665 0 True 493 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 536 445 0.00942902064800797 0.0456395738717359 0.00946059357595178 0.0456549935149157 0.00179686578240326 0.00718317534206556 384353 1989008 622 665 0 True 538 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 580 446 0.00943559527480591 0.0291286467484803 0.00952162966353857 0.0292362859540703 0.00189000317524704 0.00394524646463418 384621 1269449 622 665 0 True 582 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 625 445 0.00925518555289545 0.0349367811839051 0.00927748531319142 0.0353398947127489 0.00176403955636006 0.00409677140104466 377267 1522572 622 665 0 True 626 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 669 446 0.0096315584048876 0.0657532363754431 0.00959792477302205 0.0652780956740673 0.00206096309284397 0.00789612052984323 392609 2865577 622 665 0 True 670 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 273 491 0.00915408839978245 0.0541726254294468 0.00904859998474098 0.0538643472953384 0.00161883940443997 0.0138564006031119 373146 2360885 622 665 0 True 272 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 317 492 0.00968121155652572 0.0506391866597141 0.00964370183871214 0.0504310673685817 0.00171175764718354 0.00682818942851398 394633 2206895 622 665 0 True 316 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 361 491 0.00957287740749709 0.0627973458480259 0.00956740672922866 0.0614175631342031 0.00167957270949535 0.0134339430041193 390217 2736757 622 665 0 True 360 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 405 491 0.00984491485735636 0.0751951290448598 0.00990310521095598 0.0733806363012131 0.0017392143231112 0.0136768859585796 401306 3277062 622 665 0 True 405 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 449 490 0.00974916572156406 0.0842620169099792 0.00973525597009232 0.0812237735561151 0.00189129434669312 0.0229994723021156 397403 3672204 622 665 0 True 449 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 493 490 0.0095080388305309 0.0414381111854941 0.00950637064164187 0.0411535820553902 0.00194953876144018 0.00719704262235075 387574 1805905 622 665 0 True 493 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 537 489 0.0094614276703963 0.03399205268837 0.009399557488365 0.0349126420996414 0.00186095610134757 0.00454545020360011 385674 1481400 622 665 0 True 538 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 582 489 0.00936695420846032 0.0893918247208775 0.009399557488365 0.0872663462272068 0.00191207011344547 0.0124261120857263 381823 3895765 622 665 0 True 582 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 625 489 0.00922812654782783 0.056667739387379 0.00920119020370794 0.0575112535286488 0.00190912203483774 0.013625154135009 376164 2469624 622 665 0 True 626 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 670 490 0.00966222364181826 0.0704875716413946 0.00965896086060884 0.0686961165789273 0.00214928071008231 0.0107280069751579 393859 3071903 622 665 0 True 671 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 273 535 0.00923990199880921 0.0471279824647451 0.00923170824750134 0.0485847257190814 0.00138962421694446 0.00936436152825776 376644 2053874 622 665 0 True 272 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 317 535 0.00952310159491124 0.0917001361265374 0.0093690394445716 0.0865186541542687 0.00177526507201071 0.0201993402671869 388188 3996363 622 665 0 True 316 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 361 535 0.00985340299493876 0.0503679890961095 0.0097962920576791 0.0521858548867018 0.00172666922813172 0.00931531719842223 401652 2195076 622 665 0 True 361 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 405 534 0.00979813197189494 0.0528146642642312 0.00976577401388571 0.0521705958648051 0.0020150058592091 0.00686776659832656 399399 2301704 622 665 0 True 405 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 450 534 0.0100373208199541 0.0498743769471745 0.00990310521095598 0.050766765850309 0.00234786165004968 0.00612318538049712 409149 2173564 622 665 0 True 449 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 494 531 0.00963884446518232 0.0585027228175727 0.00964370183871214 0.0576791027695125 0.00183776292239117 0.0123478432463467 392906 2549594 622 665 0 True 493 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 538 530 0.00937828808002989 0.0667981466598517 0.00952162966353857 0.0665598535133898 0.00191078550101885 0.0143740246322349 382285 2911115 622 665 0 True 538 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 582 531 0.00945745345569008 0.050456284910032 0.00941481651026169 0.0514076447699702 0.00172564247619739 0.00935742099528377 385512 2198924 622 665 0 True 582 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 626 530 0.00932755551205181 0.0419487950822352 0.00933852140077821 0.0417639429312581 0.00188601775055383 0.00473625975175476 380217 1828161 622 665 0 True 626 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 670 530 0.00926126953590249 0.0584178229964933 0.00909437705043107 0.057953765163653 0.00208963190414219 0.012641252108336 377515 2545894 622 665 0 True 671 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 273 575 0.00889959146544752 0.0393493690738634 0.00888075074387732 0.0395513847562371 0.00138613149982807 0.00726537783769151 362772 1714876 622 665 0 True 272 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 317 575 0.00938017705862482 0.0486065472676886 0.0093690394445716 0.0495460440985733 0.00155239880902256 0.00869909131333604 382362 2118311 622 665 0 True 316 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 361 574 0.00939489637235153 0.0401680786998396 0.00933852140077821 0.0405889982452125 0.00144311993533871 0.0060595037514337 382962 1750556 622 665 0 True 361 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 406 574 0.00945848380765095 0.0462050525719196 0.00950637064164187 0.045792324711986 0.00171775397491105 0.00586846932464488 385554 2013652 622 665 0 True 405 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 450 573 0.00964416795031348 0.0822151051696534 0.00961318379491875 0.0801403830014496 0.00204952753153822 0.0146078242831914 393123 3582998 622 665 0 True 449 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 493 571 0.00953048578396414 0.0563484013306326 0.00952162966353857 0.055741206988632 0.00201296013961421 0.0100174795285457 388489 2455707 622 665 0 True 494 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 538 578 0.0112262979184192 0.0426736330411747 0.00991836423285267 0.0479743648432136 0.00551772501540987 0.018020299301739 457615 1859750 622 665 0 False 538 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 582 578 0.010292357462459 0.0283344662870268 0.00946059357595178 0.0317845426108186 0.00359694854742413 0.0122744834646911 419545 1234838 622 665 0 False 582 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 627 578 0.0114622485174585 0.0338385905252947 0.00956740672922866 0.0394293125810636 0.00628195314906134 0.014671818525976 467233 1474712 622 665 0 False 627 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 671 578 0.0121181902015 0.0362980465583735 0.00970473792629892 0.0428168154421302 0.00757972681975596 0.0167077406469788 493971 1581897 622 665 0 False 671 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 272 622 0.00878161616592788 0.00865709708007717 0.00874341954680705 0.00878919661249714 0.00144236042741373 0.0014631032061159 357963 377283 622 665 0 False 272 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 316 622 0.00878090473243109 0.00869518727007493 0.00877393759060044 0.00865186541542687 0.00145488458995149 0.00133185184042379 357934 378943 622 665 0 False 316 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 361 616 0.00948929623771888 0.0653015693273009 0.0093690394445716 0.0646219577325094 0.00156709041922793 0.00803606635763721 386810 2845893 622 665 0 True 361 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 406 616 0.00938002986548755 0.0708546371651261 0.00927748531319142 0.0684977492942702 0.00175654861356416 0.0167716630561767 382356 3087900 622 665 0 True 405 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 449 621 0.00935768104081249 0.00895823904003543 0.00947585259784848 0.00906385900663768 0.00190007340797859 0.00193427317045047 381445 390407 622 665 0 False 449 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 494 621 0.00903552432771374 0.00890475215275543 0.00901808194094758 0.00886549172198062 0.00201172187234095 0.00193821100954169 368313 388076 622 665 0 False 494 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 538 621 0.00876407565040354 0.00892535756879037 0.00877393759060044 0.00900282291905089 0.00192423771211065 0.00193917455559928 357248 388974 622 665 0 False 538 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 582 621 0.00882106392671548 0.00871909689536269 0.00885023270008392 0.00880445563439384 0.0016309210007903 0.00158038786644252 359571 379985 622 665 0 False 582 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 627 621 0.00891980598963221 0.00884780043493949 0.0089417868314641 0.00888075074387732 0.00140727061087303 0.00147204100647144 363596 385594 622 665 0 False 627 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 671 621 0.00883364893995182 0.00891741828822457 0.00888075074387732 0.0089570458533608 0.00160898712654816 0.00159513856065883 360084 388628 622 665 0 False 671 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 272 667 0.00888536279551169 0.035378191415825 0.00881971465629053 0.0362859540703441 0.00129558558175506 0.00859433715733646 362192 1541809 622 665 0 True 272 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 317 665 0.00871667946020351 0.00856926018410641 0.00871290150301366 0.0085297932402533 0.00128744484961077 0.00126489632900485 355316 373455 622 665 0 False 317 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 361 665 0.00865372986183226 0.00866689497834768 0.00863660639353018 0.00868238345922026 0.00129932180781228 0.00116617776415886 352750 377710 622 665 0 False 361 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 405 665 0.00860177068437694 0.00855962290711902 0.00860608834973678 0.00857557030594339 0.00143954497437442 0.00131967862091764 350632 373035 622 665 0 False 405 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 450 665 0.0088341886481218 0.00879204190379818 0.00885023270008392 0.00889600976577401 0.00154730440442961 0.00147233945710907 360106 383164 622 665 0 False 450 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 494 664 0.00875401745269029 0.00862751981808492 0.00871290150301366 0.0085297932402533 0.00170264167769451 0.00168243865550769 356838 375994 622 665 0 False 494 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 538 664 0.00875860497213511 0.00873795842318086 0.00877393759060044 0.00877393759060044 0.0017799210118601 0.00183135344766688 357025 380807 622 665 0 False 538 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 582 664 0.00875973345285416 0.00885271085702354 0.00874341954680705 0.00875867856870375 0.00147405042880588 0.00154587738126892 357071 385808 622 665 0 False 582 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 627 664 0.00877761741903212 0.00926468150233675 0.00880445563439384 0.0089723048752575 0.00143938681373913 0.00258566276546361 357800 403762 622 665 0 False 627 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 669 666 0.00874636340955239 0.0362166115678301 0.00874341954680705 0.0362859540703441 0.00145455733857058 0.00782976104491481 356526 1578348 622 665 0 True 671 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H5_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H5_2.csv new file mode 100755 index 0000000..51aa330 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H5_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 271 276 0.0080733963859669 0.698399856358681 0.00718699931334401 0.72323186083772 0.00358233017593109 0.206643155038345 329094 30436807 622 665 7 True 271 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 315 277 0.00587047936143692 0.00555756523375273 0.00575265125505455 0.00558480201419089 0.00157852583927269 0.0011561581415572 239297 242203 622 665 0 False 315 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 360 278 0.00537377611972886 0.00541470407536351 0.00540169375143053 0.00541695277332723 0.00130843209789936 0.00123547990737903 219050 235977 622 665 0 True 360 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 404 278 0.00544013569244681 0.00549847954746101 0.00544747081712062 0.00552376592660411 0.00126980122471447 0.00129186632554208 221755 239628 622 665 0 True 404 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 447 278 0.00553264657921922 0.0054401969675849 0.00549324788281071 0.00541695277332723 0.0016137504132974 0.0017238270377884 225526 237088 622 665 0 True 448 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 491 277 0.00546312235405003 0.00555940090555985 0.00552376592660411 0.00560006103608759 0.00157301457163157 0.00156266655510338 222692 242283 622 665 0 True 493 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 536 277 0.00567044388789084 0.00560855101819552 0.00567635614557107 0.00560006103608759 0.00139878352843508 0.00144847058755889 231143 244425 622 665 0 True 537 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 580 276 0.00574848078283198 0.00569994452829258 0.00567635614557107 0.00570687418936446 0.00176740328886244 0.00174140912889176 234324 248408 622 665 0 True 581 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 626 276 0.00673317833895979 0.00619394675748653 0.00627145799954223 0.00631723506523232 0.00307718881501019 0.00188344552959423 274463 269937 622 665 0 False 626 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 668 276 0.00792858287108555 0.703488981093154 0.007690547035935 0.698558022430762 0.00243622662726134 0.183121941898443 323191 30658595 622 665 8 True 670 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 271 320 0.00598119313285137 0.00575113682581368 0.0059662775616083 0.00570687418936446 0.00152812952016361 0.00136799601032166 243810 250639 622 665 0 False 271 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 316 320 0.00558301116435414 0.00543420808831417 0.00556954299229419 0.00543221179522393 0.00119563063023999 0.00118464304999329 227579 236827 622 665 0 False 316 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 359 322 0.00562054541435727 0.00549386742204562 0.00560006103608759 0.00552376592660411 0.00127357301004688 0.00117872748632661 229109 239427 622 665 0 True 360 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 403 322 0.00564870836795439 0.00544760849250616 0.00566109712367437 0.00537117570763714 0.00136005910864118 0.00126324474399137 230257 237411 622 665 0 True 404 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 448 322 0.00565611708919683 0.00566155604162615 0.00564583810177768 0.00569161516746777 0.00165073042641528 0.00166887444767355 230559 246735 622 665 0 True 449 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 491 321 0.00564743269409807 0.00564792617845828 0.00569161516746777 0.00561532005798428 0.00154901484439406 0.00154120977742553 230205 246141 622 665 0 True 493 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 536 320 0.00555965651990775 0.00552310049557402 0.00556954299229419 0.00550850690470741 0.00147489125898742 0.00145914951423522 226627 240701 622 665 0 True 537 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 580 321 0.00593929215310932 0.00567089502194488 0.0059662775616083 0.00569161516746777 0.00184225207109247 0.00177245963644338 242102 247142 622 665 0 True 581 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 626 319 0.0058979063493477 0.00608275093777015 0.00587472343022812 0.00613412680247196 0.0018674702224377 0.0019373635682391 240415 265091 622 665 0 False 626 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 670 319 0.00611661081913717 0.00593068847444774 0.00601205462729839 0.00592050049591821 0.00195542275116312 0.00186213470334311 249330 258464 622 665 0 False 670 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 271 360 0.00541349373460145 0.00568305634766706 0.00541695277332723 0.00566109712367437 0.00137111581537791 0.00144080327286729 220669 247672 622 665 0 True 271 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 315 361 0.0054547323452258 0.00567020664501721 0.00543221179522393 0.00572213321126116 0.00126603012720145 0.00129397485128961 222350 247112 622 665 0 True 316 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 360 363 0.00590499615212607 0.00566642057191502 0.00592050049591821 0.00573739223315786 0.0013079430546069 0.00128676080647739 240704 246947 622 665 0 False 360 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 404 363 0.0059653944027847 0.00583541710765814 0.00604257267109178 0.00590524147402152 0.00147202909912872 0.00132630282629143 243166 254312 622 665 0 False 404 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 448 360 0.0059427511918351 0.00594319398863375 0.00593575951781491 0.0059510185397116 0.00158436720403489 0.00171157131818287 242243 259009 622 665 0 True 449 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 491 359 0.00593161357778188 0.00608605514702297 0.00588998245212482 0.00605783169298848 0.00162357767888821 0.00164054065208353 241789 265235 622 665 0 True 493 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 537 362 0.00574529159819119 0.00569156927567259 0.00576791027695125 0.00563057907988098 0.0015636930661943 0.00164292469160502 234194 248043 622 665 0 False 537 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 579 358 0.0057822616078348 0.00597529529936078 0.00572213321126116 0.00602731364919509 0.00186136365917453 0.00186370117502755 235701 260408 622 665 0 True 582 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 624 358 0.00561968678772321 0.00581667030932791 0.00560006103608759 0.00579842832074464 0.00194849186382094 0.00194795121564618 229074 253495 622 665 0 True 626 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 668 358 0.0055912539800411 0.00535793592472828 0.00558480201419089 0.00540169375143053 0.00181995348981116 0.00185256593338957 227915 233503 622 665 0 True 670 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 271 404 0.00540814571728074 0.00570375354729236 0.00535591668574044 0.00575265125505455 0.00147720262947477 0.00143518609380974 220451 248574 622 665 0 True 272 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 316 404 0.00570292450684779 0.00569833831546135 0.00567635614557107 0.00572213321126116 0.00128467142365434 0.00138026151398154 232467 248338 622 665 0 True 316 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 359 404 0.00585870391045555 0.00596623166981312 0.00587472343022812 0.0059510185397116 0.00120679317047844 0.00134135460339939 238817 260013 622 665 0 True 360 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 404 404 0.00601701012958638 0.00613619193325497 0.00605783169298848 0.00613412680247196 0.00160353414280213 0.00141425313020065 245270 267420 622 665 0 True 404 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 448 403 0.00597876444608647 0.00605523880656092 0.00593575951781491 0.00604257267109178 0.0016005811528025 0.00157912536012824 243711 263892 622 665 0 True 449 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 491 402 0.00588200949052285 0.00603929140773655 0.00588998245212482 0.00607309071488518 0.00173819412031538 0.00181014083397771 239767 263197 622 665 0 True 493 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 536 402 0.00570810079884169 0.00591916963385805 0.00567635614557107 0.005981536583505 0.00158947721267468 0.00155954841093809 232678 257962 622 665 0 True 537 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 580 402 0.00570819892759987 0.00576777260156571 0.00575265125505455 0.00578316929884794 0.00170022674631551 0.00188768217495059 232682 251364 622 665 0 True 582 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 625 401 0.00546876475764527 0.00544180318041614 0.00550850690470741 0.00540169375143053 0.00176175710722402 0.00187366677540649 222922 237158 622 665 0 True 626 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 668 402 0.00525899000485001 0.00519770472186417 0.00531013962005036 0.00531013962005036 0.00174345308129658 0.00185097883727789 214371 226520 622 665 0 True 670 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 272 447 0.0055751117993208 0.00554331583134995 0.0055542839703975 0.00550850690470741 0.00141174627840056 0.00154380742058595 227257 241582 622 665 0 True 272 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 316 447 0.00569804260112843 0.00554994719575317 0.00569161516746777 0.00556954299229419 0.00140130087270568 0.00145460168191055 232268 241871 622 665 0 True 316 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 360 448 0.00566350127824974 0.00563328669579648 0.00569161516746777 0.00569161516746777 0.00138723409407029 0.00139340643487052 230860 245503 622 665 0 True 360 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 404 447 0.00573533152923611 0.00585329196187998 0.00575265125505455 0.00592050049591821 0.00154211629332386 0.00152166648542166 233788 255091 622 665 0 True 405 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 448 447 0.00559898161974763 0.00579165928095588 0.00564583810177768 0.00584420538643473 0.001817045154262 0.0018478133111631 228230 252405 622 665 0 True 449 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 492 445 0.00582185656175966 0.00597644259424024 0.00592050049591821 0.0059662775616083 0.00172653522913351 0.00187417094162207 237315 260458 622 665 0 True 493 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 536 445 0.00554503533493921 0.0056255309824114 0.00560006103608759 0.00563057907988098 0.00172480763274745 0.00166679400154688 226031 245165 622 665 0 True 538 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 580 446 0.00539955945094016 0.00533154814250091 0.00540169375143053 0.00527962157625696 0.00179004769260388 0.00176180898146037 220101 232353 622 665 0 True 582 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 625 445 0.00536148549276705 0.0054633952700474 0.00543221179522393 0.00550850690470741 0.00175281830826567 0.00173848149952414 218549 238099 622 665 0 True 626 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 669 446 0.00528720202282622 0.00516746202884185 0.00527962157625696 0.00512703135729 0.00188840412952918 0.00181539378804777 215521 225202 622 665 0 True 670 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 273 491 0.0053646501452183 0.00555414629501196 0.00538643472953384 0.0055542839703975 0.00145177723167192 0.0014122064581249 218678 242054 622 665 0 True 272 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 317 492 0.00560440323363697 0.00537532891510075 0.00567635614557107 0.00540169375143053 0.0014196759244089 0.00144151997307834 228451 234261 622 665 0 True 316 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 361 491 0.00561210634115395 0.00571008661502692 0.00561532005798428 0.00567635614557107 0.00138550747998964 0.00152076404384981 228765 248850 622 665 0 True 360 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 405 491 0.00576283211371553 0.00572201848177321 0.00584420538643473 0.00570687418936446 0.00156536634277831 0.00152828154080845 234909 249370 622 665 0 True 405 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 449 490 0.00567257818838121 0.00579751048484108 0.00566109712367437 0.00582894636453803 0.00182304088527843 0.0019919325529437 231230 252660 622 665 0 True 449 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 493 490 0.00581248526535365 0.00733447259714863 0.00560006103608759 0.00592050049591821 0.00237392769223802 0.00801565821246566 236933 319642 622 665 0 True 493 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 537 489 0.00592383687369627 0.00619741158802247 0.00558480201419089 0.00575265125505455 0.00356786331382007 0.0029071115001147 241472 270088 622 665 0 True 538 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 582 489 0.00550210400323629 0.00549506060872024 0.00552376592660411 0.00550850690470741 0.0017801997043732 0.00179917889768382 224281 239479 622 665 0 True 582 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 625 489 0.00532709136302562 0.00521108218015857 0.00534065766384375 0.00521858548867018 0.0017394606381813 0.00164445289055961 217147 227103 622 665 0 True 626 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 670 490 0.00527157501808636 0.00542466259491714 0.00534065766384375 0.00532539864194705 0.00174033346454393 0.00179893685087628 214884 236411 622 665 0 True 671 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 273 535 0.00544810865404878 0.00565935323545761 0.00550850690470741 0.00575265125505455 0.0014094755871954 0.00148145566173425 222080 246639 622 665 0 True 272 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 317 535 0.00553647360078817 0.00569728280417225 0.00549324788281071 0.00567635614557107 0.00137998685099632 0.0014286859987506 225682 248292 622 665 0 True 316 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 361 535 0.00553129730879427 0.00555485761783722 0.0055390249485008 0.00552376592660411 0.00140963951883601 0.00143974289955505 225471 242085 622 665 0 True 361 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 405 534 0.00583630602140139 0.00579734986355796 0.0059662775616083 0.00581368734264134 0.00155688715355218 0.00152564192407441 237904 252653 622 665 0 True 405 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 450 534 0.0056304809511228 0.00570770024167767 0.00576791027695125 0.00570687418936446 0.00182750458466967 0.00184053622298398 229514 248746 622 665 0 True 449 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 494 531 0.0056206190109259 0.0059129971874066 0.00556954299229419 0.005981536583505 0.00183545772445985 0.00191992542880855 229112 257693 622 665 0 True 493 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 538 530 0.00559893255536854 0.00563711866069385 0.00561532005798428 0.00573739223315786 0.00179505914766598 0.00179021862345466 228228 245670 622 665 0 True 538 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 582 531 0.0056423790630519 0.00560152957353328 0.00564583810177768 0.00552376592660411 0.00170093595264582 0.00155525403704795 229999 244119 622 665 0 True 582 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 626 530 0.00543287416434163 0.00552163195812833 0.00532539864194705 0.00550850690470741 0.00177769672189679 0.00180880643779814 221459 240637 622 665 0 True 626 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 670 530 0.00549339507594798 0.00531495825854405 0.00552376592660411 0.00527962157625696 0.00175960541971864 0.00183534786134016 223926 231630 622 665 0 True 671 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 273 575 0.00562515746599164 0.00578846980119101 0.00563057907988098 0.00584420538643473 0.00127401182856616 0.00133862234399744 229297 252266 622 665 0 True 272 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 317 575 0.00573062134884357 0.00570435014062967 0.00567635614557107 0.00564583810177768 0.00141091547306584 0.00132712535047129 233596 248600 622 665 0 True 316 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 361 574 0.00557359080356904 0.00577798352599283 0.00556954299229419 0.00581368734264134 0.00128774623899616 0.00122541480301515 227195 251809 622 665 0 True 361 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 406 574 0.00550153976287676 0.00567862778943238 0.0055542839703975 0.00572213321126116 0.00152591621318288 0.00143958459826726 224258 247479 622 665 0 True 405 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 450 573 0.00553664532611498 0.0057412700898504 0.00556954299229419 0.00567635614557107 0.00181907747999361 0.00181550745034755 225689 250209 622 665 0 True 449 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 493 571 0.00559777954245995 0.00580873102876211 0.0055542839703975 0.00578316929884794 0.00190966718822527 0.00208130362347342 228181 253149 622 665 0 True 494 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 538 578 0.00554655633069097 0.00578626699502246 0.0055542839703975 0.00578316929884794 0.00179490262051042 0.00173565312535234 226093 252170 622 665 0 False 538 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 582 578 0.0055767063916412 0.00574191257498289 0.00549324788281071 0.00575265125505455 0.00159662662534503 0.00161405877742831 227322 250237 622 665 0 False 582 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 627 578 0.00559140117317837 0.00564062938302497 0.00556954299229419 0.00570687418936446 0.00150890244405892 0.00145219795474932 227921 245823 622 665 0 False 627 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 671 578 0.00536241771596974 0.00534644003003618 0.00534065766384375 0.00535591668574044 0.00161911649476948 0.00173408911112717 218587 233002 622 665 0 False 671 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 272 622 0.00599237981128368 0.00579985096639516 0.00599679560540169 0.00585946440833143 0.00141662760376589 0.00129408067674892 244266 252762 622 665 0 False 272 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 316 622 0.00567041935570129 0.00572796146924877 0.00561532005798428 0.00575265125505455 0.00135916441487237 0.00116800945448466 231142 249629 622 665 0 False 316 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 361 616 0.00554864156680226 0.00557443046848065 0.00552376592660411 0.00552376592660411 0.00129531941475495 0.00129402799091953 226178 242938 622 665 0 True 361 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 406 616 0.00547541298101184 0.00555914850068637 0.00552376592660411 0.0055542839703975 0.00144952899792379 0.0013502051314856 223193 242272 622 665 0 True 405 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 449 621 0.00548777720454228 0.00547661210705867 0.0055390249485008 0.00547798886091402 0.00182696651361524 0.00184961977390369 223697 238675 622 665 0 False 449 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 494 621 0.00549432729915067 0.00537319494662497 0.00544747081712062 0.0055390249485008 0.00183895738173988 0.00187270387674242 223964 234168 622 665 0 False 494 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 538 621 0.00545205833656545 0.00549643736257559 0.00543221179522393 0.00550850690470741 0.00182372133740518 0.00198190910673487 222241 239539 622 665 0 False 538 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 582 621 0.00549719756532738 0.00534623351695788 0.0055542839703975 0.00534065766384375 0.00156051500881366 0.00162460852542359 224081 232993 622 665 0 False 582 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 627 621 0.00563082440177642 0.00559007957063637 0.00566109712367437 0.00558480201419089 0.00142386370457495 0.00128332900512948 229528 243620 622 665 0 False 627 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 671 621 0.00589353961960878 0.00574214203395878 0.0059510185397116 0.00581368734264134 0.001454887532109 0.00143549593928683 240237 250247 622 665 0 False 671 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 272 667 0.00859696237522622 0.666292877994942 0.00747692072938125 0.671854734111543 0.00423684663595442 0.219199428903724 350436 29037560 622 665 8 True 272 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 317 665 0.00617350096669093 0.00580131950384086 0.00610360875867857 0.00575265125505455 0.00149937350115944 0.00127946996624146 251649 252826 622 665 0 False 317 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 361 665 0.00561846017824598 0.00534070355563893 0.00558480201419089 0.00535591668574044 0.00123691289660442 0.00123341709686025 229024 232752 622 665 0 False 361 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 405 665 0.00539156195714864 0.00546741080212548 0.00541695277332723 0.00549324788281071 0.00132760748070955 0.00130109084008236 219775 238274 622 665 0 False 405 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 450 665 0.00539637026629937 0.0051567004028726 0.00527962157625696 0.00520332646677348 0.00142060148325994 0.00149167553386093 219971 224733 622 665 0 False 450 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 494 664 0.00517111570190151 0.00531220475083337 0.00517280842298009 0.00523384451056687 0.00164269573161706 0.00166267783688382 210789 231510 622 665 0 False 494 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 538 664 0.00539767047234523 0.00538682480979285 0.00537117570763714 0.00543221179522393 0.0016234745766239 0.00162105186120842 220024 234762 622 665 0 False 538 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 582 664 0.00556964112105237 0.00564168489431406 0.00558480201419089 0.00552376592660411 0.00136279701278764 0.00146875883254142 227034 245869 622 665 0 False 582 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 627 664 0.00607574019135599 0.00565926145186725 0.00602731364919509 0.00564583810177768 0.00154036568329771 0.00139641717198642 247664 246635 622 665 0 False 627 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 669 666 0.0077086763240084 0.695817869232477 0.00733958953231098 0.693522545204852 0.00247666037095967 0.194406525191649 314227 30324282 622 665 9 True 671 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H5_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H5_3.csv new file mode 100755 index 0000000..480ea79 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H5_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 271 276 0.00104045922296252 0.0704227494807056 0.000885023270008392 0.071976806286717 0.000799379754679038 0.0220738956506475 42412 3069078 622 665 0 True 271 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 315 277 0.000853671131770486 0.000786539477556331 0.000732433051041428 0.000686655985351339 0.000673381178221426 0.000581674659639018 34798 34278 622 665 0 False 315 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 360 278 0.000874327235366978 0.000898079485736543 0.000778210116731518 0.000778210116731518 0.000657812090093383 0.000656995755191348 35640 39139 622 665 0 True 360 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 404 278 0.000831297774905876 0.000848263942070787 0.00064087891966125 0.000686655985351339 0.000692427116206682 0.000669499353731809 33886 36968 622 665 0 True 404 277 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 447 278 0.00084746448781572 0.000965999342600034 0.000610360875867857 0.000686655985351339 0.000826445496333762 0.000918688940806817 34545 42099 622 665 0 True 448 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 491 277 0.00093425937442426 0.000936651539583681 0.000686655985351339 0.000701915007248035 0.000870070424158736 0.00081676651389526 38083 40820 622 665 0 True 493 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 536 277 0.000926286412822289 0.000999798649748656 0.000701915007248035 0.000793469138628214 0.000778582236186955 0.000848844641097386 37758 43572 622 665 0 True 537 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 580 276 0.000979619392892092 0.000911135701464694 0.000671396963454643 0.000595101853971161 0.000969965303025811 0.000924910857309741 39932 39708 622 665 0 True 581 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 626 276 0.00104892282835538 0.000944108956300112 0.000701915007248035 0.000625619897764553 0.00102097668353128 0.000936599457356358 42757 41145 622 665 0 False 626 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 668 276 0.00108074107819464 0.0712370534943447 0.000793469138628214 0.0701152056153201 0.000968608194820415 0.0205321102855545 44054 3104566 622 665 0 True 670 276 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 271 320 0.000957859340766096 0.000921782597945998 0.000778210116731518 0.000717174029144732 0.000708436681017879 0.000763615489889227 39045 40172 622 665 0 False 271 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 316 320 0.000852886101705061 0.000860930077539924 0.000732433051041428 0.000778210116731518 0.000642231143331838 0.000580226778604108 34766 37520 622 665 0 False 316 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 359 322 0.000798669962811654 0.000948950540691394 0.00064087891966125 0.000869764248111696 0.000655587659969401 0.000693155910630013 32556 41356 622 665 0 True 360 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 403 322 0.00080070613454385 0.000774997691069055 0.000579842832074464 0.000610360875867857 0.000716379447658568 0.000647837057663181 32639 33775 622 665 0 True 404 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 448 322 0.000876461535857352 0.000843169952806025 0.000625619897764553 0.000579842832074464 0.000851284822938744 0.000810828236699058 35727 36746 622 665 0 True 449 320 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 491 321 0.000816480332420981 0.000913751533789842 0.000579842832074464 0.000686655985351339 0.000809002934497768 0.000828236693668388 33282 39822 622 665 0 True 493 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 536 320 0.000978221058088054 0.00103476819767432 0.000823987182421607 0.000854505226215 0.000836135955541428 0.000875718231680068 39875 45096 622 665 0 True 537 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 580 321 0.000993651805311563 0.000912030591470666 0.000732433051041428 0.000518806744487678 0.000946918622018919 0.00101499915680469 40504 39747 622 665 0 True 581 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 626 319 0.000909727184879732 0.000848218050275609 0.000503547722590982 0.000457770656900893 0.00100664348613853 0.000939919374370218 37083 36966 622 665 0 False 626 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 670 319 0.000911763356611928 0.000944866170920549 0.000549324788281071 0.000564583810177768 0.000995749302002493 0.000969826606036302 37166 41178 622 665 0 False 670 319 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 271 360 0.000843956384710853 0.00090539922706744 0.000701915007248035 0.000762951094834821 0.000690042543875706 0.000727637968073232 34402 39458 622 665 0 True 271 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 315 361 0.00088203034288396 0.000857189896232915 0.000747692072938125 0.000747692072938125 0.000705451551506875 0.000648710907355481 35954 37357 622 665 0 True 316 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 360 363 0.000884336368701146 0.000870567354527312 0.000732433051041428 0.000717174029144732 0.000718094892962106 0.000685885631138665 36048 37940 622 665 0 False 360 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 404 363 0.000864121844516455 0.000827910930909329 0.000701915007248035 0.00064087891966125 0.000714461210559372 0.000686625397424344 35224 36081 622 665 0 False 404 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 448 360 0.000835639972455258 0.00094649532964937 0.000549324788281071 0.000625619897764553 0.0008295089260657 0.000892337406867775 34063 41249 622 665 0 True 449 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 491 359 0.000887648214289657 0.000961685513853299 0.00064087891966125 0.000625619897764553 0.000856616896007819 0.000919189254135484 36183 41911 622 665 0 True 493 363 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 537 362 0.000962078877367755 0.000988692835315572 0.000732433051041428 0.000717174029144732 0.000833166843205714 0.000912928019098139 39217 43088 622 665 0 False 537 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 579 358 0.000947310499261949 0.000959895733841356 0.000701915007248035 0.000457770656900893 0.00096476827201611 0.00110061737215965 38615 41833 622 665 0 True 582 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 624 358 0.000992376131455247 0.000897299325218517 0.000595101853971161 0.000488288700694286 0.00104940442214542 0.000999508380872236 40452 39105 622 665 0 True 626 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 668 358 0.000907372094683457 0.000911388106338173 0.000518806744487678 0.000457770656900893 0.000963309795134405 0.001000542145412 36987 39719 622 665 0 True 670 362 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 271 404 0.000909800781448366 0.000905261551681906 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.000798795496930857 0.000772574532602852 37086 39452 622 665 0 True 272 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 316 404 0.000923808661678291 0.000893054334164548 0.000793469138628214 0.000793469138628214 0.000724584760817922 0.000664870455141538 37657 38920 622 665 0 True 316 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 359 404 0.000956730860047048 0.000927427288752896 0.000823987182421607 0.000793469138628214 0.000737363469395981 0.000723836813993492 38999 40418 622 665 0 True 360 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 404 404 0.000968285521322521 0.000856409735714888 0.000778210116731518 0.00064087891966125 0.000786573066538204 0.000744692703872456 39470 37323 622 665 0 True 404 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 448 403 0.000993676337501107 0.000908244518368478 0.000747692072938125 0.00064087891966125 0.000876020686042415 0.00084264635138156 40505 39582 622 665 0 True 449 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 491 402 0.00100876363407099 0.000908244518368478 0.000762951094834821 0.000610360875867857 0.00088403689979109 0.000878759012105812 41120 39582 622 665 0 True 493 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 536 402 0.000970763272466518 0.000894109845453643 0.000778210116731518 0.000717174029144732 0.000876384414032635 0.000840258381324399 39571 38966 622 665 0 True 537 406 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 580 402 0.00102230540269957 0.000966228801575924 0.000732433051041428 0.000579842832074464 0.000999549544972006 0.00105707091031759 41672 42109 622 665 0 True 582 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 625 401 0.000924716352691439 0.000877887095858208 0.000549324788281071 0.000457770656900893 0.000998074987279196 0.000998844153079134 37694 38259 622 665 0 True 626 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 668 402 0.000871211647294823 0.000931924684680344 0.000503547722590982 0.000534065766384375 0.0009206342196364 0.000976321626807495 35513 40614 622 665 0 True 670 405 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 272 447 0.000879601656119052 0.000985411571960343 0.000701915007248035 0.00080872816052491 0.000772585017982627 0.000859329933555504 35855 42945 622 665 0 True 272 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 316 447 0.000819571388303592 0.000914439910717512 0.000701915007248035 0.000762951094834821 0.000708099184324151 0.000814627021322138 33408 39852 622 665 0 True 316 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 360 448 0.000895056935532104 0.00088600994360472 0.000762951094834821 0.000793469138628214 0.000731397382272384 0.000676114084231035 36485 38613 622 665 0 True 360 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 404 447 0.000838559303011056 0.000802463930483109 0.000625619897764553 0.000656137941557946 0.00077191275197918 0.000743234287011322 34182 34972 622 665 0 True 405 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 448 447 0.000900355888473722 0.00091730814791614 0.000595101853971161 0.000549324788281071 0.000915091648044231 0.000974829454260701 36701 39977 622 665 0 True 449 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 492 445 0.000990462620670774 0.000933003141867027 0.000732433051041428 0.000503547722590982 0.000917548903772957 0.00100690110620373 40374 40661 622 665 0 True 493 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 536 445 0.000998779032926369 0.00106971479970239 0.000732433051041428 0.000793469138628214 0.000909389281399909 0.000983788744018229 40713 46619 622 665 0 True 538 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 580 446 0.000877222033733233 0.000885436296164995 0.000473029678797589 0.0004272526131075 0.000927063019200554 0.00103935246338665 35758 38588 622 665 0 True 582 449 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 625 445 0.000858651166248025 0.000842343900492821 0.000518806744487678 0.000457770656900893 0.000898590701359971 0.000928929793804171 35001 36710 622 665 0 True 626 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 669 446 0.000906881450892567 0.000893169063652494 0.000503547722590982 0.000457770656900893 0.000985570103310218 0.00100046651187998 36967 38925 622 665 0 True 670 448 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 273 491 0.000912916369520521 0.000880250523309877 0.000762951094834821 0.000671396963454643 0.000767074751668267 0.000834850763782732 37213 38362 622 665 0 True 272 493 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 317 492 0.000830610873598629 0.000852761337998234 0.000717174029144732 0.000717174029144732 0.000737175104303213 0.000758797898820219 33858 37164 622 665 0 True 316 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 361 491 0.000950254362007293 0.00084539570487216 0.000793469138628214 0.000686655985351339 0.000833996396938007 0.000812859772934396 38735 36843 622 665 0 True 360 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 405 491 0.000857252831443987 0.000872173567358543 0.000610360875867857 0.00064087891966125 0.000846473453778165 0.000840415509742202 34944 38010 622 665 0 True 405 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 449 490 0.000816823783074605 0.000919946926138877 0.000411993591210803 0.000488288700694286 0.000897383016302477 0.00103518285904399 33296 40092 622 665 0 True 449 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 493 490 0.000915075202200439 0.00110555629173644 0.000579842832074464 0.000656137941557946 0.000900353893865001 0.00124009226459462 37301 48181 622 665 0 True 493 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 537 489 0.00101614782312389 0.00101081268059138 0.000747692072938125 0.000778210116731518 0.000928033757224119 0.000879494740973487 41421 44052 622 665 0 True 538 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 582 489 0.00090852510759205 0.00090539922706744 0.000595101853971161 0.000442511635004196 0.00092570146955974 0.00100738261378928 37034 39458 622 665 0 True 582 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 625 489 0.000842239131442736 0.000860815348051979 0.000518806744487678 0.000534065766384375 0.000876257838433065 0.000847634662839285 34332 37515 622 665 0 True 626 492 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 670 490 0.000855363852849058 0.000947046031191506 0.000503547722590982 0.000534065766384375 0.000889378654873732 0.00103072885028783 34867 41273 622 665 0 True 671 491 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 273 535 0.000866599595660452 0.000804230764597463 0.000701915007248035 0.000625619897764553 0.000733582158872502 0.000724918014555949 35325 35049 622 665 0 True 272 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 317 535 0.000801000520818384 0.000880479982285767 0.000686655985351339 0.000732433051041428 0.00065181214230002 0.00074437677826076 32651 38372 622 665 0 True 316 536 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 361 535 0.000861619561182913 0.000875776073280019 0.000732433051041428 0.000717174029144732 0.000745090838583046 0.000734393920050605 35122 38167 622 665 0 True 361 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 405 534 0.000934627357267428 0.000845671055643228 0.000671396963454643 0.000595101853971161 0.000866777139482067 0.000832036740411305 38098 36855 622 665 0 True 405 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 450 534 0.000864563423928256 0.000895670166489696 0.000488288700694286 0.000396734569314107 0.000946622588044529 0.0010525740466311 35242 39034 622 665 0 True 449 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 494 531 0.00089503240334256 0.000921667868458053 0.000564583810177768 0.000549324788281071 0.00095086975539752 0.000999491778423783 36484 40167 622 665 0 True 493 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 538 530 0.000942232336026232 0.000892044714670632 0.000625619897764553 0.000503547722590982 0.000961179524006959 0.000910569818174007 38408 38876 622 665 0 True 538 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 582 531 0.000931977880796619 0.000929790716204565 0.000625619897764553 0.00064087891966125 0.00085942211503081 0.000917608525721986 37990 40521 622 665 0 True 582 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 626 530 0.000859190874418004 0.000982336821683414 0.000473029678797589 0.000625619897764553 0.000934822635259669 0.00101038355455514 35023 42811 622 665 0 True 626 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 670 530 0.000887451956773301 0.000887134292586582 0.000534065766384375 0.000473029678797589 0.000916764906477766 0.000966580128603939 36175 38662 622 665 0 True 671 535 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 273 575 0.00089216213716585 0.000999569190772766 0.000762951094834821 0.000885023270008392 0.000701746156653995 0.000707671330609974 36367 43562 622 665 0 True 272 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 317 575 0.000889684386021853 0.000875087696352348 0.000747692072938125 0.000747692072938125 0.000754967261269367 0.000706760087414071 36266 38137 622 665 0 True 316 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 361 574 0.000850506479319242 0.000870911542991147 0.000671396963454643 0.000732433051041428 0.000701153639015777 0.000697897515543041 34669 37955 622 665 0 True 361 579 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 406 574 0.000793101155785046 0.000926899533108349 0.000595101853971161 0.000717174029144732 0.0007113699864623 0.000782995492212802 32329 40395 622 665 0 True 405 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 450 573 0.000881637827851248 0.00092547688745783 0.000457770656900893 0.000503547722590982 0.000968320258578155 0.00101244554384624 35938 40333 622 665 0 True 449 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 493 571 0.000894100180139868 0.000917652336379975 0.000473029678797589 0.000473029678797589 0.00101959322922281 0.001083595476437 36446 39992 622 665 0 True 494 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 538 578 0.000946795323281514 0.000924444322066324 0.000610360875867857 0.000518806744487678 0.00100530608209813 0.000965507009130523 38594 40288 622 665 0 False 538 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 582 578 0.000899325536512852 0.000888235695670855 0.00064087891966125 0.000579842832074464 0.000861303944974823 0.000871024861027188 36659 38710 622 665 0 False 582 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 627 578 0.000919098481285742 0.000904481391163879 0.000701915007248035 0.000686655985351339 0.000803293189985356 0.000786607470197575 37465 39418 622 665 0 False 627 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 671 578 0.000907175837167101 0.000904550228856646 0.00064087891966125 0.000579842832074464 0.000842340932948043 0.000900605610760192 36979 39421 622 665 0 False 671 578 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 272 622 0.000892014944028583 0.000941194827306306 0.000747692072938125 0.00080872816052491 0.00071289118187695 0.000769309619186338 36361 41018 622 665 0 False 272 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 316 622 0.000853131423600506 0.00085567546699204 0.000732433051041428 0.000717174029144732 0.00071828832328129 0.00066968873383615 34776 37291 622 665 0 False 316 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 361 616 0.00081760881314003 0.000883004031020559 0.000671396963454643 0.000747692072938125 0.000684859328240814 0.000747813197537964 33328 38482 622 665 0 True 361 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 406 616 0.000783558134052225 0.000902852232435059 0.000579842832074464 0.000778210116731518 0.000721193247614673 0.000713639495860841 31940 39347 622 665 0 True 405 622 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 449 621 0.000901925948604572 0.000755860812479815 0.000534065766384375 0.000350957503624018 0.000971282836930483 0.000915861624481503 36765 32941 622 665 0 False 449 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 494 621 0.000928715099587197 0.000936926890354749 0.000518806744487678 0.000473029678797589 0.00101242034984904 0.00104872089491991 37857 40832 622 665 0 False 494 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 538 621 0.000958619838641976 0.000940231099607568 0.000549324788281071 0.000503547722590982 0.00102962938989432 0.00104063945088261 39076 40976 622 665 0 False 538 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 582 621 0.000921110120828393 0.000901131290115882 0.000747692072938125 0.000625619897764553 0.000826412335762995 0.000832830191495073 37547 39272 622 665 0 False 582 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 627 621 0.000853474874254129 0.000907372574260095 0.000686655985351339 0.000717174029144732 0.000695216465579919 0.000735961428116286 34790 39544 622 665 0 False 627 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 671 621 0.000906292678343498 0.000872448918129611 0.000686655985351339 0.000717174029144732 0.000754999126596337 0.000728715563471303 36943 38022 622 665 0 False 671 621 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 272 667 0.00118517460908569 0.0672412319422957 0.00100709544518196 0.0671091783016709 0.000886061775668648 0.0234014733090004 48311 2930425 622 665 0 True 272 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 317 665 0.00104774528325725 0.000887684994128718 0.000930800335698482 0.000778210116731518 0.000734609801324479 0.000665727754867713 42709 38686 622 665 0 False 317 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 361 665 0.000846458668044394 0.0009142563435368 0.000701915007248035 0.000793469138628214 0.000665342280933806 0.000685045917706068 34504 39844 622 665 0 False 361 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 405 665 0.000884802480302492 0.000829310630662259 0.000701915007248035 0.000671396963454643 0.000713566781818516 0.000663008699561143 36067 36142 622 665 0 False 405 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 450 665 0.000892947167231275 0.000922792217439915 0.000671396963454643 0.000747692072938125 0.000780205073605267 0.00084436729864039 36399 40216 622 665 0 False 450 665 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 494 664 0.000969217744525213 0.000822335077795197 0.000686655985351339 0.000564583810177768 0.000871724035490607 0.000783723518080006 39508 35838 622 665 0 False 494 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 538 664 0.000924740884880983 0.000977908263448734 0.00064087891966125 0.000595101853971161 0.000902933045773823 0.000974102731298114 37695 42618 622 665 0 False 538 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 582 664 0.0008970931072643 0.000979996340129335 0.000732433051041428 0.000839246204318303 0.000756173864150809 0.000701481798438605 36568 42709 622 665 0 False 582 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 627 664 0.000941373709392173 0.000988463376339682 0.000823987182421607 0.000793469138628214 0.000674064654446157 0.000753984498434247 38373 43078 622 665 0 False 627 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 669 666 0.00100451956527979 0.0705641650475468 0.00080872816052491 0.0692759594110018 0.000788061953868962 0.0218985877477232 40947 3075241 622 665 0 True 671 664 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H6_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H6_1.csv new file mode 100755 index 0000000..f5250fd --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H6_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 283 259 0.00916284639144984 0.037116067807422 0.00914015411612116 0.0376440070191501 0.00152854954101069 0.00793111670894173 373503 1617547 622 665 0 True 283 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 328 258 0.00909646228654235 0.00895950106440283 0.00906385900663768 0.00891126878767071 0.00124621877987209 0.0012499017516924 370797 390462 622 665 0 False 328 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 371 259 0.00910485229536658 0.0516211563470361 0.00909437705043107 0.0537727931639582 0.00123687086054921 0.00903886851520511 371139 2249690 622 665 0 True 372 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 415 259 0.00919697066710628 0.0877122538550542 0.00920119020370794 0.0874036774242771 0.00152124727453919 0.0190641517177058 374894 3822568 622 665 0 True 416 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 459 259 0.00919341349962233 0.0614075128310591 0.00923170824750134 0.0614023041123064 0.00176759579515091 0.0142123790574252 374749 2676187 622 665 0 True 460 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 505 258 0.00915462810795243 0.05193471203759 0.00910963607232776 0.0545510032806897 0.00177893199797638 0.0173473497996696 373168 2263355 622 665 0 False 505 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 547 257 0.00918065676105917 0.0665839237599607 0.00918593118181125 0.0659189745937285 0.00161631965118471 0.0214108445353372 374229 2901779 622 665 0 True 549 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 591 257 0.00906452137575538 0.0557175038764226 0.00907911802853437 0.0548409246967269 0.00196787459680453 0.0172195432008972 369495 2428212 622 665 0 True 593 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 638 258 0.00887059441740588 0.00889839613912327 0.00889600976577401 0.00892652780956741 0.00183350321786479 0.00182173409887279 361590 387799 622 665 0 False 638 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 680 258 0.0091292127595843 0.0370234581647527 0.00910963607232776 0.0373693446250095 0.00180391553564904 0.00839618707862127 372132 1613511 622 665 0 True 682 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 283 302 0.00899364788016124 0.00905702112915615 0.00901808194094758 0.00907911802853437 0.0013677492224574 0.00138404573047249 366606 394712 622 665 0 False 283 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 328 302 0.00904725071431603 0.00884314241772892 0.00907911802853437 0.00888075074387732 0.00140758403808219 0.0012527305893815 368791 385391 622 665 0 False 328 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 370 303 0.00933891391581092 0.0832724062387601 0.00932326237888151 0.0824902723735409 0.00142665663677742 0.0220696803683818 380680 3629076 622 665 0 True 372 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 414 303 0.00952970075389872 0.046853182395219 0.00959792477302205 0.0479896238651102 0.00161377333854566 0.0100876628992185 388457 2041898 622 665 0 True 416 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 459 303 0.00942391795258271 0.0642302712606648 0.00929274433508812 0.0628976882581826 0.00201067318400082 0.0154565391202724 384145 2799205 622 665 0 True 461 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 505 301 0.00929073269554547 0.0370332331171256 0.00924696726939803 0.0376440070191501 0.00166284478631358 0.0100327528957742 378716 1613937 622 665 0 False 505 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 549 301 0.00921274486498341 0.0330042088512653 0.00923170824750134 0.035538261997406 0.00161918056372072 0.00775144505886007 375537 1438349 622 665 0 False 549 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 591 301 0.0091856858599158 0.0428182151418831 0.00909437705043107 0.0440070191500725 0.00193265850278132 0.00896333133999997 374434 1866051 622 665 0 True 593 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 638 301 0.00903805114323683 0.0087585638392158 0.00903334096284428 0.00881971465629053 0.00197982480059925 0.00186234823428569 368416 381705 622 665 0 False 638 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 682 301 0.00903118213016436 0.00895215837717434 0.00892652780956741 0.0089723048752575 0.00191508172766712 0.0019029441891396 368136 390142 622 665 0 False 682 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 282 341 0.00922751324308922 0.0424485337858264 0.00926222629129473 0.0440375371938659 0.00148801785949099 0.010385391148704 376139 1849940 622 665 0 True 284 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 327 341 0.00918789375697481 0.0544481368217981 0.00920119020370794 0.0551766231784543 0.00137546389892867 0.0174412940199731 374524 2372892 622 665 0 True 328 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 370 341 0.00954552401615494 0.0333669834921476 0.00955214770733196 0.0347447928587778 0.00154538840681555 0.0078025374455384 389102 1454159 622 665 0 True 372 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 414 341 0.00940522442414978 0.0288564395653818 0.009399557488365 0.0296940566109712 0.0017231086035833 0.00471629911749787 383383 1257586 622 665 0 True 416 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 459 341 0.00934963448264188 0.0590720793744489 0.00930800335698482 0.0586861982146944 0.00188347582007614 0.0127750780250205 381117 2574407 622 665 0 True 461 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 505 344 0.00949385922497416 0.0254299286784138 0.00949111161974517 0.0278629739833677 0.00187220915377557 0.00724616532414648 386996 1108256 622 665 0 False 505 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 547 340 0.00928531108165613 0.0255708623814056 0.00926222629129473 0.025833524071107 0.00154917665122575 0.00440193453850331 378495 1114398 622 665 0 True 549 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 591 339 0.00930569733116763 0.042440686288851 0.00923170824750134 0.0431372549019608 0.00223151292987131 0.00962334966894162 379326 1849598 622 665 0 True 593 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 635 339 0.00918441018605949 0.0471203644267455 0.00918593118181125 0.0493324177920195 0.00206803721811788 0.0113597534999997 374382 2053542 622 665 0 True 638 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 679 339 0.0089593028147989 0.049968317451904 0.00901808194094758 0.0511329823758297 0.00194822051234294 0.0139182574542426 365206 2177658 622 665 0 True 682 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 284 388 0.00913303978115324 0.0368271101190835 0.00915541313801785 0.0400396734569314 0.00144556768768478 0.0112138714087025 372288 1604954 622 665 0 False 284 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 327 385 0.00910509761726203 0.0276551300430063 0.00914015411612116 0.0282444495307851 0.00145764632075347 0.00525913779143522 371149 1205232 622 665 0 True 328 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 371 385 0.0093977421063387 0.0721052803673179 0.00943007553215839 0.0711985961699855 0.0014124979419396 0.02028518460773 383078 3142404 622 665 0 True 372 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 415 384 0.0095156438092897 0.0556754669920395 0.00952162966353857 0.056244754711223 0.001717740264659 0.0148635934876408 387884 2426380 622 665 0 True 417 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 459 384 0.00938186977970339 0.0376874894950813 0.009399557488365 0.038452735179675 0.00166868828262215 0.00733698043873583 382431 1642450 622 665 0 True 461 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 503 383 0.00956328532138518 0.0462148045783949 0.00965896086060884 0.0469672693980316 0.00172953527081007 0.0111849377093648 389826 2014077 622 665 0 True 505 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 547 382 0.00929178757969588 0.0353071509168894 0.00912489509422446 0.0372014953841459 0.00177468682837007 0.00666169728773671 378759 1538713 622 665 0 True 549 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 592 383 0.0093838568870565 0.0424184517140872 0.0093842984664683 0.0430457007705806 0.00199707831183391 0.00808548226096786 382512 1848629 622 665 0 True 594 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 635 382 0.00911405186644578 0.0359646656123027 0.00912489509422446 0.0373083085374228 0.00198803834966933 0.00739104207955591 371514 1567368 622 665 0 True 638 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 680 383 0.00897463543326422 0.071927449661003 0.0089723048752575 0.0731059739070726 0.0019049548210694 0.0164295592971633 365831 3134654 622 665 0 True 682 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 283 428 0.00935721492921114 0.0397840332118922 0.00943007553215839 0.0419317921721218 0.0016118078140798 0.0091757849696826 381426 1733819 622 665 0 True 284 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 328 429 0.00920867252151902 0.0420449613390308 0.00915541313801785 0.0428320744640269 0.00145178434795696 0.00553180956758774 375371 1832352 622 665 0 True 328 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 372 431 0.00951623258183877 0.0284181270296363 0.00953688868543526 0.0307316700999466 0.00142219018153206 0.00636473982655201 387908 1238484 622 665 0 False 372 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 415 428 0.00969546475865109 0.044859987001149 0.00970473792629892 0.0462806134126802 0.00164171543477987 0.0101817725662222 395214 1955033 622 665 0 True 417 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 460 428 0.00972245016715007 0.0811985560146647 0.00964370183871214 0.0800640878919661 0.00173506090514221 0.0146915744520455 396314 3538696 622 665 0 True 461 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 504 427 0.00970230923953402 0.0529607378482829 0.00975051499198901 0.0537270160982681 0.00182159488216641 0.0158474253400242 395493 2308070 622 665 0 True 505 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 549 427 0.0095064442382105 0.0462934172235349 0.00952162966353857 0.0469214923323415 0.0017824870611903 0.00908314760597186 387509 2017503 622 665 0 True 549 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 592 426 0.00945985761026545 0.0286692928246457 0.00944533455405508 0.0295109483482109 0.00190243590543183 0.00522314082481986 385610 1249430 622 665 0 True 594 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 636 426 0.00921323550877431 0.0332331400715109 0.00920119020370794 0.0342412451361868 0.00196075872275894 0.00578764069103115 375557 1448326 622 665 0 True 638 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 680 427 0.009267059132635 0.0619509405236598 0.00924696726939803 0.0624704356450752 0.00177705738532644 0.00908846588017878 377751 2699870 622 665 0 True 682 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 284 474 0.0090124150051628 0.0486214391552238 0.00900282291905089 0.0512245365072099 0.00162044546903013 0.0160890885534917 367371 2118960 622 665 0 False 284 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 330 472 0.00923467664243622 0.0485519130855291 0.00921644922560464 0.0484931715877012 0.00158368223530692 0.00676506484412313 376431 2115930 622 665 0 True 328 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 372 472 0.00961860540880809 0.0580579395387071 0.00956740672922866 0.0574196993972686 0.00163225541166805 0.0151129019520249 392081 2530210 622 665 0 True 372 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 418 472 0.00960327279034276 0.0811999327685201 0.00959792477302205 0.0782330052643626 0.00191246712633833 0.0185514575869328 391456 3538756 622 665 0 True 417 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 460 471 0.00983556809313989 0.0831011610050533 0.00997940032043946 0.079667353322652 0.00212284158211717 0.0290985644407208 400925 3621613 622 665 0 True 461 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 505 471 0.00981064338856265 0.0368865629397366 0.00976577401388571 0.0379797055008774 0.00190573148578378 0.00568372154567262 399909 1607545 622 665 0 True 505 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 550 473 0.00958143914164813 0.0318387178750263 0.00965896086060884 0.034531166552224 0.00196685379415432 0.00788754311885496 390566 1387556 622 665 0 False 550 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 593 470 0.00953612818755938 0.101058115648471 0.00952162966353857 0.0903486686503395 0.00203683187699585 0.0350279037168452 388719 4404191 622 665 0 True 594 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 637 469 0.00916677154177697 0.0615554909246107 0.00914015411612116 0.0612954909590295 0.00198470975457857 0.0216819300243944 373663 2682636 622 665 0 True 638 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 682 471 0.00942975661369431 0.078404273443967 0.00944533455405508 0.0749675745784695 0.00182909942715516 0.0160765265320685 384383 3416919 622 665 0 True 682 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 284 516 0.00903078961513165 0.0463944709565169 0.00907911802853437 0.0499275196459907 0.0016426443741387 0.0115044234915032 368120 2021907 622 665 0 True 284 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 329 517 0.00961536715978821 0.0905392802216115 0.00950637064164187 0.0850537880521859 0.00174672631213603 0.024203876297565 391949 3945772 622 665 0 True 328 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 374 516 0.0095082596202368 0.0512010169621811 0.00950637064164187 0.0530861371786069 0.00164511291148601 0.0105571942881748 387583 2231380 622 665 0 True 373 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 419 515 0.00986569362190057 0.0535141011145396 0.00985732814526589 0.0532082093537804 0.00191130787146316 0.00818164795688684 402153 2332186 622 665 0 True 417 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 462 514 0.0098171689509815 0.0512208881094932 0.00978103303578241 0.0515754940108339 0.00235871352740506 0.0079749191869844 400175 2232246 622 665 0 True 461 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 507 513 0.00979531077009732 0.0572835154950778 0.0097962920576791 0.0569924467841611 0.00180712636300043 0.0120373536855627 399284 2496460 622 665 0 True 505 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 551 512 0.00933165238770574 0.0657147561051863 0.00930800335698482 0.0641641870756084 0.00179341233841344 0.0187157005748838 380384 2863900 622 665 0 True 550 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 594 512 0.00944035451957755 0.0506674789514413 0.0093842984664683 0.0511787594415198 0.00180867610849006 0.011544631907188 384815 2208128 622 665 0 True 594 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 638 511 0.00921411866759791 0.0445500338165166 0.00921644922560464 0.0443884946974899 0.00205136084531429 0.00864639374498243 375593 1941525 622 665 0 True 638 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 683 511 0.00931661415551495 0.058602193283621 0.00932326237888151 0.0593270771343557 0.00186162388912492 0.0129509214338991 379771 2553929 622 665 0 True 683 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 286 556 0.008920517423129 0.0381519603540781 0.0089723048752575 0.0388342107270924 0.00142042218270407 0.00883395967219826 363625 1662692 622 665 0 True 284 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 329 556 0.00920418313083237 0.0485218998514827 0.00920119020370794 0.0491798275730526 0.00147654770891432 0.0107711058745621 375188 2114622 622 665 0 True 328 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 374 556 0.00938883692153404 0.0405565527460216 0.00943007553215839 0.0415808346684977 0.00147259329060006 0.00654360084477232 382715 1767486 622 665 0 True 373 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 418 555 0.00962383076518107 0.0438324238153176 0.00950637064164187 0.0435492484931716 0.00197509683673667 0.00517872700840893 392294 1910251 622 665 0 True 417 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 462 555 0.00983863461683296 0.0776183993974407 0.0097962920576791 0.0758678568703746 0.00206233336266591 0.0164225824815929 401050 3382670 622 665 0 True 461 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 506 553 0.00982712901993658 0.0554027320532964 0.00967421988250553 0.0549935149156939 0.00296600407624572 0.00971588707032003 400581 2414494 622 665 0 True 506 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 551 553 0.00943385348934824 0.0490880210367989 0.00943007553215839 0.049057755397879 0.00184622262109417 0.00732806497882909 384550 2139294 622 665 0 True 550 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 594 559 0.00997289929021016 0.0285388912886473 0.00962844281681544 0.032318608377203 0.00274063620095116 0.0118992415383627 406523 1243747 622 665 0 False 594 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 638 559 0.0104632241626366 0.034500235482274 0.00962844281681544 0.0391699092088197 0.00404850204652656 0.0136257171489356 426510 1503547 622 665 0 False 638 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 683 553 0.00938390595143559 0.0487570494099749 0.009399557488365 0.0485847257190814 0.00178931402368061 0.00851639883755599 382514 2124870 622 665 0 True 683 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 284 603 0.00860974364597892 0.00869039157747883 0.00866712443732357 0.00871290150301366 0.00141565952696451 0.00141088136769886 350957 378734 622 665 0 False 284 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 329 603 0.00887346468358259 0.0087999352925688 0.00892652780956741 0.00871290150301366 0.00152781562738303 0.00148758781367726 361707 383508 622 665 0 False 329 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 374 597 0.00919785382592989 0.0614546207588094 0.00920119020370794 0.0598306248569467 0.00141235576163589 0.00952340164373638 374930 2678240 622 665 0 True 373 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 419 597 0.00946380729278212 0.0714325295959055 0.00941481651026169 0.0679789425497826 0.00172740949372679 0.0187980340413208 385771 3113085 622 665 0 True 417 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 461 603 0.00909319950533293 0.00923737588420582 0.00906385900663768 0.00923170824750134 0.00196335486184183 0.00204632523255793 370664 402572 622 665 0 False 461 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 506 603 0.00889338482149275 0.00909150881323244 0.0089723048752575 0.00906385900663768 0.00205370769556757 0.00205319581595109 362519 396215 622 665 0 False 506 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 550 603 0.0087961146899487 0.00896181860005931 0.00869764248111696 0.00886549172198062 0.00195065265581238 0.00211283955977273 358554 390563 622 665 0 False 550 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 594 603 0.00874202121200301 0.0089894225148589 0.00872816052491035 0.0089570458533608 0.00168532141144697 0.00166309908822448 356349 391766 622 665 0 False 594 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 639 602 0.00888739896724388 0.00870273647038172 0.00888075074387732 0.00871290150301366 0.00145981307397285 0.00161086172225494 362275 379272 622 665 0 False 639 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 683 602 0.00887299857198125 0.00902241871559191 0.00885023270008392 0.00900282291905089 0.00165564909125615 0.00170437270278577 361688 393204 622 665 0 False 683 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 285 650 0.00867357640317378 0.034897589590823 0.00874341954680705 0.0349889372091249 0.00129139369758662 0.00800799776783183 353559 1520864 622 665 0 True 284 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 329 646 0.00857510419434204 0.00848766457227986 0.00857557030594339 0.00848401617456321 0.00133968315730646 0.00133204757473064 349545 369899 622 665 0 False 329 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 373 646 0.00869197554533217 0.00877143648776324 0.00866712443732357 0.00875867856870375 0.00126391753025008 0.00125995562276469 354309 382266 622 665 0 False 373 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 417 646 0.00892770535466554 0.00902049126019443 0.00892652780956741 0.00901808194094758 0.0014535233632901 0.00154194496921046 363918 393120 622 665 0 False 417 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 462 646 0.00883482648504996 0.00891207189408633 0.00886549172198062 0.00892652780956741 0.00178191647754858 0.00165177678305122 360132 388395 622 665 0 False 462 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 506 646 0.00867978304712854 0.00885993881476408 0.00871290150301366 0.00888075074387732 0.00164692390874468 0.00179851831288695 353812 386123 622 665 0 False 506 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 550 646 0.008657998462813 0.00882297297374817 0.00865186541542687 0.00889600976577401 0.00161271970881631 0.00188115095707232 352924 384512 622 665 0 False 550 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 594 646 0.00879927934239994 0.00882632307479617 0.00875867856870375 0.00881971465629053 0.00145063570150897 0.00120739651595724 358683 384658 622 665 0 False 594 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 639 646 0.00865682091771487 0.00859869977071312 0.00868238345922026 0.00856031128404669 0.00131760117131082 0.0013764888632336 352876 374738 622 665 0 False 639 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 682 648 0.00889753076152577 0.0359188885466126 0.00892652780956741 0.0361181048294804 0.00139595734825901 0.00745671168049575 362688 1565373 622 665 0 True 683 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H6_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H6_2.csv new file mode 100755 index 0000000..f305d08 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H6_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 283 259 0.00754892270569444 0.711257704802175 0.0072632944228275 0.719890135042344 0.00225765998768538 0.196419387940246 307715 30997162 622 665 10 True 283 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 328 258 0.0059624750722289 0.00554281102160299 0.00588998245212482 0.00556954299229419 0.00129804397440958 0.00124466841597866 243047 241560 622 665 0 False 328 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 371 259 0.0052821238595905 0.0054957719315455 0.00526436255436027 0.00549324788281071 0.00126945183953017 0.00118790392575967 215314 239510 622 665 0 True 372 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 415 259 0.0054498259073169 0.00547619908090207 0.00547798886091402 0.00552376592660411 0.00132173562796048 0.00129955972334703 222150 238657 622 665 0 True 416 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 459 259 0.00545186207904909 0.00559772055453351 0.00544747081712062 0.00566109712367437 0.00160899412653683 0.00158162251258379 222233 243953 622 665 0 True 460 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 505 258 0.00556318915520216 0.00573530415647725 0.00561532005798428 0.00576791027695125 0.00171831079030843 0.00137091465128777 226771 249949 622 665 0 False 505 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 547 257 0.00569465715897129 0.00568670474538372 0.00572213321126116 0.00573739223315786 0.00152700810231013 0.00134937852646714 232130 247831 622 665 0 True 549 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 591 257 0.00558146563641283 0.00580788203055132 0.00549324788281071 0.00582894636453803 0.00167196287305947 0.00178912909291113 227516 253112 622 665 0 True 593 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 638 258 0.00688032241184787 0.00594785200584432 0.00651560234988937 0.00599679560540169 0.00336390841232494 0.00174502976776874 280461 259212 622 665 0 False 638 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 680 258 0.00791143487059393 0.704748986221562 0.0076752880140383 0.717479209582666 0.00255928002172631 0.203352175605058 322492 30713507 622 665 10 True 682 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 283 302 0.0057298117865886 0.00577238472698111 0.00572213321126116 0.00582894636453803 0.00142957715927001 0.00134958436455813 233563 251565 622 665 0 False 283 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 328 302 0.00547865123003172 0.00535004253595766 0.00543221179522393 0.00541695277332723 0.00124658405313211 0.00120471929308009 223325 233159 622 665 0 False 328 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 370 303 0.00540480933950269 0.00555540831937936 0.00543221179522393 0.00556954299229419 0.00123678629803275 0.00121936050029623 220315 242109 622 665 0 True 372 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 414 303 0.00547936266352851 0.00563916084557927 0.00541695277332723 0.00570687418936446 0.00144573291328582 0.00151390730629281 223354 245759 622 665 0 True 416 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 459 303 0.00567770541599602 0.00579083322864268 0.00578316929884794 0.00592050049591821 0.00169112357875714 0.0017754385500063 231439 252369 622 665 0 True 461 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 505 301 0.00576118845701605 0.00559604550400951 0.00575265125505455 0.00556954299229419 0.00157771678466946 0.00160599765313622 234842 243880 622 665 0 False 505 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 549 301 0.00567203848021123 0.0056457922099825 0.00567635614557107 0.00564583810177768 0.00158440758029824 0.00145445011439718 231208 246048 622 665 0 False 549 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 591 301 0.00563236992971773 0.0058511579934042 0.00572213321126116 0.00584420538643473 0.00179439502402074 0.00197210961995456 229591 254998 622 665 0 True 593 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 638 301 0.00577293937580788 0.00567631025377589 0.00584420538643473 0.00572213321126116 0.00186342435326092 0.0018260657086658 235321 247378 622 665 0 False 638 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 682 301 0.00610171978008364 0.0062719398633916 0.00616464484626535 0.00628671702143893 0.00193103562912717 0.00188476342834806 248723 273336 622 665 0 False 682 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 282 341 0.00552114098232284 0.0055663994043245 0.00552376592660411 0.00564583810177768 0.00136766320962524 0.00132148473526 225057 242588 622 665 0 True 284 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 327 341 0.00541538271319638 0.00552624408354372 0.00541695277332723 0.0055390249485008 0.00121847827828433 0.00120004978934887 220746 240838 622 665 0 True 328 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 370 341 0.00550521959130844 0.00571770465302648 0.00544747081712062 0.00572213321126116 0.00128036709268938 0.00128743761144473 224408 249182 622 665 0 True 372 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 414 341 0.00559176915602154 0.00591584247870764 0.00552376592660411 0.00587472343022812 0.00148633144299523 0.00144761715423388 227936 257817 622 665 0 True 416 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 459 341 0.00596684180196783 0.00606432538200617 0.00604257267109178 0.00601205462729839 0.00168372990506295 0.00152309683434043 243225 264288 622 665 0 True 461 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 505 344 0.00591100653856448 0.0058292217153091 0.00588998245212482 0.00578316929884794 0.0015904041713122 0.00166188627314384 240949 254042 622 665 0 False 505 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 547 340 0.00563904268527384 0.00573282599953764 0.00569161516746777 0.00570687418936446 0.00157272017604838 0.00144202287752258 229863 249841 622 665 0 True 549 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 591 339 0.00569173782841549 0.00588091882257716 0.00578316929884794 0.00581368734264134 0.00197312150960157 0.00203475670688716 232011 256295 622 665 0 True 593 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 635 339 0.00564578903739859 0.00577713452778203 0.00558480201419089 0.00587472343022812 0.00190397099999031 0.00182689777087363 230138 251772 622 665 0 True 638 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 679 339 0.00534659445371352 0.00547743815937188 0.00535591668574044 0.00550850690470741 0.00168026468703798 0.0018559612753532 217942 238711 622 665 0 True 682 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 284 388 0.00544673485143429 0.00550573045109914 0.00547798886091402 0.00544747081712062 0.00133551161387546 0.00139880021490506 222024 239944 622 665 0 False 284 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 327 385 0.00562302316550127 0.0655071186779033 0.00560006103608759 0.0678110933089189 0.00127980947890567 0.0198819367093015 229210 2854851 622 665 0 True 328 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 371 385 0.00595825553562724 0.00592536502620708 0.00599679560540169 0.005981536583505 0.00130480755568562 0.00133816998303949 242875 258232 622 665 0 True 372 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 415 384 0.00581660667319714 0.00609296186219726 0.00587472343022812 0.00608834973678187 0.00146419722144951 0.00151874144023623 237101 265536 622 665 0 True 417 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 459 384 0.00600702552844176 0.00595285421151873 0.00617990386816205 0.00602731364919509 0.00174948475930341 0.0016583652451661 244863 259430 622 665 0 True 461 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 503 383 0.00592312544019948 0.0059008817534796 0.00592050049591821 0.00585946440833143 0.00169637904341403 0.00161505124394406 241443 257165 622 665 0 True 505 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 547 382 0.00581466863022312 0.00598093999016768 0.00579842832074464 0.00601205462729839 0.00165595157771433 0.00152160030753897 237022 260654 622 665 0 True 549 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 592 383 0.00548049114424756 0.00574434484012733 0.00547798886091402 0.00581368734264134 0.00197069677790682 0.00199444273876385 223400 250343 622 665 0 True 594 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 635 382 0.00519388157379884 0.00534350295514479 0.00521858548867018 0.00531013962005036 0.00179588602732454 0.00179119117902334 211717 232874 622 665 0 True 638 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 680 383 0.00498771305286662 0.00529494943584643 0.00502021820401312 0.00527962157625696 0.001784080256733 0.00173087417670201 203313 230758 622 665 0 True 682 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 283 428 0.00554761121484139 0.00574216497985637 0.0055542839703975 0.00576791027695125 0.00154291500056014 0.00152739992973435 226136 250248 622 665 0 True 284 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 328 429 0.00561600695929153 0.00558097004929352 0.00564583810177768 0.00558480201419089 0.00136326647033601 0.00129115430585436 228924 243223 622 665 0 True 328 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 372 431 0.00588529680392181 0.00571589192711695 0.00582894636453803 0.00563057907988098 0.00130425420690248 0.00127469188906883 239901 249103 622 665 0 False 372 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 415 428 0.00571941013822172 0.00579891018459401 0.00563057907988098 0.00576791027695125 0.00160845098848632 0.00150105255162957 233139 252721 622 665 0 True 417 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 460 428 0.00592734497680114 0.00607171396102984 0.00590524147402152 0.00602731364919509 0.00164209931972905 0.00155823017328283 241615 264610 622 665 0 True 461 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 504 427 0.00579879630358781 0.00597885191348708 0.00593575951781491 0.00602731364919509 0.00174412936744976 0.00166378667135096 236375 260563 622 665 0 True 505 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 549 427 0.00573751489410558 0.00566653530140297 0.00575265125505455 0.00572213321126116 0.0016726425455145 0.00157989353294189 233877 246952 622 665 0 True 549 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 592 426 0.00531377038410294 0.00540212972348472 0.00527962157625696 0.00541695277332723 0.00184954334358908 0.00182434732725107 216604 235429 622 665 0 True 594 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 636 426 0.00504789051381935 0.00498855286534028 0.00498970016021973 0.00505073624780652 0.00185028209570892 0.00177036896387078 205766 217405 622 665 0 True 638 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 680 427 0.00509300521039174 0.00535848662627041 0.0051117723353933 0.00531013962005036 0.00178523554145629 0.00197225095554154 207605 233527 622 665 0 True 682 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 284 474 0.0055060782179425 0.00571052258708112 0.00550850690470741 0.00567635614557107 0.00146842982627851 0.00155278547400157 224443 248869 622 665 0 False 284 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 330 472 0.0054863543375487 0.00547913615579347 0.00544747081712062 0.00544747081712062 0.00144807934687738 0.00150108962790968 223639 238785 622 665 0 True 328 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 372 472 0.00565987051419715 0.00568344642792608 0.00572213321126116 0.00564583810177768 0.00141688126591095 0.00146018212235553 230712 247689 622 665 0 True 372 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 418 472 0.00582188109394921 0.00584124536564575 0.00582894636453803 0.00585946440833143 0.00173273516351821 0.00161152518580181 237316 254566 622 665 0 True 417 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 460 471 0.00599242887566277 0.00588883515724537 0.00599679560540169 0.00582894636453803 0.00195179423565955 0.00191634714794666 244268 256640 622 665 0 True 461 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 505 471 0.00580784868152974 0.00591577364101487 0.00579842832074464 0.00590524147402152 0.00185120851728169 0.00174343901168405 236744 257814 622 665 0 True 505 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 550 473 0.00529036667527747 0.00558301223417895 0.00521858548867018 0.00556954299229419 0.00173975783223723 0.00170681779981561 215650 243312 622 665 0 False 550 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 593 470 0.00519390610598838 0.00522106364560979 0.0051117723353933 0.00517280842298009 0.00180956028374111 0.00175523056345029 211718 227538 622 665 0 True 594 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 637 469 0.00517266122984282 0.00503738173540971 0.00517280842298009 0.00503547722590982 0.00177925303893061 0.00175372985646801 210852 219533 622 665 0 True 638 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 682 471 0.00530832423802406 0.00526252688255314 0.00527962157625696 0.00529488059815366 0.00173640894849654 0.0017599649920981 216382 229345 622 665 0 True 682 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 284 516 0.00553706237333724 0.00575184814863894 0.00550850690470741 0.00558480201419089 0.00151466032631451 0.00240164552886371 225706 250670 622 665 0 True 284 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 329 517 0.00549216846647075 0.00540164785963536 0.00546272983901732 0.00537117570763714 0.00138680528945018 0.00147131642842987 223876 235408 622 665 0 True 328 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 374 516 0.0055491076784036 0.00578156308601671 0.00549324788281071 0.00573739223315786 0.00150744333649638 0.00135805779986674 226197 251965 622 665 0 True 373 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 419 515 0.00573709784688332 0.00574354173371171 0.00569161516746777 0.00569161516746777 0.00170296107834467 0.00165856830022741 233860 250308 622 665 0 True 417 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 462 514 0.0058550976785925 0.0057134826078701 0.00579842832074464 0.00566109712367437 0.00193179631324134 0.00174227091262611 238670 248998 622 665 0 True 461 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 507 513 0.00564632874556857 0.00580583984566589 0.00560006103608759 0.00575265125505455 0.00166366358484955 0.00161245831160359 230160 253023 622 665 0 True 505 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 551 512 0.00566987964753131 0.00575189404043411 0.00570687418936446 0.00585946440833143 0.0016703209114788 0.00160993502327653 231120 250672 622 665 0 True 550 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 594 512 0.00544496853378708 0.00546371651261365 0.00546272983901732 0.0055390249485008 0.00170179142366938 0.0017365157699565 221952 238113 622 665 0 True 594 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 638 511 0.00522069525697101 0.00521454701069451 0.00515754940108339 0.0051117723353933 0.0017527711052183 0.00188830301935588 212810 227254 622 665 0 True 638 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 683 511 0.00540905340829389 0.00541713634050794 0.00544747081712062 0.00546272983901732 0.00171192415660011 0.00171260956843508 220488 236083 622 665 0 True 683 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 286 556 0.00550929193477283 0.00571134863939432 0.00550850690470741 0.00569161516746777 0.00139771248361002 0.00133632138044009 224574 248905 622 665 0 True 284 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 329 556 0.00547563377071774 0.00558537566163062 0.00546272983901732 0.0055542839703975 0.00134292260089872 0.0013963732529187 223202 243415 622 665 0 True 328 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 374 556 0.00563644227318212 0.00560770201998473 0.00564583810177768 0.00561532005798428 0.00133401773278254 0.00128329978439007 229757 244388 622 665 0 True 373 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 418 555 0.00568322515864354 0.00552700129816416 0.00564583810177768 0.0055390249485008 0.00166840074638706 0.00159152448167836 231664 240871 622 665 0 True 417 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 462 555 0.00578454310146244 0.00571205996221958 0.00575265125505455 0.00578316929884794 0.0019609316405218 0.00183859492450361 235794 248936 622 665 0 True 461 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 506 553 0.00587747103545711 0.00591570480332211 0.00582894636453803 0.00599679560540169 0.00227177171514899 0.00202377453958062 239582 257811 622 665 0 True 506 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 551 553 0.00575458929802857 0.005724542530508 0.00582894636453803 0.00569161516746777 0.00166489230454941 0.00185817203203102 234573 249480 622 665 0 True 550 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 594 559 0.00548721296418276 0.00553985100081401 0.00552376592660411 0.00556954299229419 0.00156910349263183 0.0015371280262197 223674 241431 622 665 0 False 594 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 638 559 0.00535937572446622 0.0056090099361473 0.00537117570763714 0.00543221179522393 0.00167799600855841 0.00215594693189714 218463 244445 622 665 0 False 638 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 683 553 0.00521583788344119 0.00549210058793126 0.00527962157625696 0.0055390249485008 0.00163245255600292 0.00158864398824544 212612 239350 622 665 0 True 683 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 284 603 0.00604963794168061 0.00599608428257643 0.00602731364919509 0.005981536583505 0.00144948733872591 0.0014553854841025 246600 261314 622 665 0 False 284 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 329 603 0.00556208520667266 0.00551704277861052 0.00552376592660411 0.00547798886091402 0.00132363354824925 0.00139277418255626 226726 240437 622 665 0 False 329 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 374 597 0.00560236706190477 0.0056451726707476 0.00561532005798428 0.00561532005798428 0.00131528842889057 0.00132189097357213 228368 246021 622 665 0 True 373 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 419 597 0.00571698145145681 0.00575921378176501 0.00575265125505455 0.00572213321126116 0.00163125297073962 0.00158374016927731 233040 250991 622 665 0 True 417 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 461 603 0.00564431710602592 0.00558957476088941 0.00560006103608759 0.00556954299229419 0.00188588933506417 0.00181905667185053 230078 243598 622 665 0 False 461 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 506 603 0.00570500974295908 0.00579379324943166 0.00567635614557107 0.00579842832074464 0.00189490706996801 0.00197309630147042 232552 252498 622 665 0 False 506 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 550 603 0.00560486934523831 0.00571373501274358 0.00566109712367437 0.00560006103608759 0.00184575442965379 0.00190299936715371 228470 249009 622 665 0 False 550 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 594 603 0.00550666699049157 0.00544120658707882 0.00550850690470741 0.00552376592660411 0.00157267736955477 0.00155887698414947 224467 237132 622 665 0 False 594 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 639 602 0.00545662132382073 0.00555618847989739 0.00549324788281071 0.00550850690470741 0.00147352405763506 0.00142043574602025 222427 242143 622 665 0 False 639 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 683 602 0.00560158203183935 0.00589039547828142 0.00566109712367437 0.00592050049591821 0.00156007530499488 0.00172390885227047 228336 256708 622 665 0 False 683 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 285 650 0.00811998301391196 0.703437811741531 0.00741588464179446 0.703166247043565 0.00322889064852003 0.205911044416888 330993 30656365 622 665 11 True 284 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 329 646 0.00596276945850343 0.00590533325761187 0.00584420538643473 0.00592050049591821 0.00154943913374024 0.00128891038465042 243059 257359 622 665 0 False 329 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 373 646 0.00538572329603705 0.00541149164970104 0.00529488059815366 0.00538643472953384 0.00123074731269589 0.00126311292608109 219537 235837 622 665 0 False 373 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 417 646 0.00548174228591433 0.00533017138864557 0.00547798886091402 0.00541695277332723 0.00138688525020015 0.00137581957261067 223451 232293 622 665 0 False 417 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 462 646 0.00547242005388741 0.00555660150605399 0.00550850690470741 0.0055390249485008 0.00166785658564185 0.00148638259187709 223071 242161 622 665 0 False 462 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 506 646 0.00545169035372228 0.00555201232653618 0.00540169375143053 0.00556954299229419 0.00166135622681427 0.00161764813106545 222226 241961 622 665 0 False 506 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 550 646 0.00542625047316461 0.00567390093452904 0.00537117570763714 0.00570687418936446 0.00155428375300322 0.00165989390946354 221189 247273 622 665 0 False 550 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 594 646 0.00536555783623144 0.00538402541028699 0.00534065766384375 0.00535591668574044 0.00136531637256301 0.00128768934521161 218715 234640 622 665 0 False 594 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 639 646 0.00578297304133159 0.00563310312861577 0.00579842832074464 0.00561532005798428 0.00149399266064493 0.00134752545764752 235730 245495 622 665 0 False 639 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 682 648 0.00741885303672935 0.728909869087918 0.00708018616006714 0.72632944228275 0.00229196540439927 0.191658297060377 302413 31766457 622 665 12 True 683 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H6_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H6_3.csv new file mode 100755 index 0000000..c74e3dc --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H6_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 283 259 0.00104882469959721 0.0715126337243888 0.000854505226215 0.070267795834287 0.000796401739111605 0.0221646943994178 42753 3116576 622 665 0 True 283 259 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 328 258 0.000961367443870964 0.000950189619161201 0.000839246204318303 0.000869764248111696 0.000682181452591502 0.000692446134339108 39188 41410 622 665 0 False 328 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 371 259 0.000848715629482491 0.000941837312438799 0.000747692072938125 0.000823987182421607 0.000630590494841915 0.000658804941591211 34596 41046 622 665 0 True 372 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 415 259 0.000917675614292159 0.000908955841193737 0.000747692072938125 0.000732433051041428 0.000766584206666485 0.000718569962700744 37407 39613 622 665 0 True 416 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 459 259 0.00091453549403046 0.000908680490422669 0.000717174029144732 0.000732433051041428 0.000857590339908852 0.000798385633827376 37279 39601 622 665 0 True 460 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 505 258 0.000924053983573737 0.00100427309977851 0.000701915007248035 0.000839246204318303 0.000869655227200757 0.000811201075387737 37667 43767 622 665 0 False 505 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 547 257 0.00088153969909307 0.000794616433507665 0.000701915007248035 0.00064087891966125 0.000802515143335018 0.000674074791534647 35934 34630 622 665 0 True 549 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 591 257 0.000905041536676727 0.000847942699504541 0.000625619897764553 0.0004272526131075 0.000927838790045722 0.000965994525197684 36892 36954 622 665 0 True 593 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 638 258 0.000961588233576864 0.000917399931506496 0.000595101853971161 0.000595101853971161 0.000960804780736068 0.00089847945431268 39197 39981 622 665 0 False 638 258 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 680 258 0.00115715884862584 0.071384434994559 0.000885023270008392 0.0718242160677501 0.00100427064298229 0.0225866872052861 47169 3110989 622 665 0 True 682 257 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 283 302 0.000874130977850622 0.000923021676415805 0.000701915007248035 0.000778210116731518 0.000695427477077869 0.000725537421933312 35632 40226 622 665 0 False 283 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 328 302 0.000891720557754049 0.000861205428310993 0.000793469138628214 0.000717174029144732 0.000632617072405338 0.000637329902213396 36349 37532 622 665 0 False 328 302 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 370 303 0.000910463150566068 0.00089931856420635 0.000747692072938125 0.000762951094834821 0.000693655086229825 0.000674727681237897 37113 39193 622 665 0 True 372 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 414 303 0.00090256378553273 0.000900511750880979 0.000732433051041428 0.000656137941557946 0.000781070578908768 0.000781698812899827 36791 39245 622 665 0 True 416 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 459 303 0.000907838206284804 0.000950992725576817 0.00064087891966125 0.000625619897764553 0.000869791251506726 0.000924690685394312 37006 41445 622 665 0 True 461 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 505 301 0.00090256378553273 0.000859025568040036 0.000701915007248035 0.000656137941557946 0.000831658013295638 0.000813265568837717 36791 37437 622 665 0 False 505 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 549 301 0.000924103047952826 0.000828782875017711 0.000717174029144732 0.00064087891966125 0.000843798002735493 0.000713646408157357 37669 36119 622 665 0 False 549 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 591 301 0.000917700146481704 0.000865220960389071 0.000518806744487678 0.000411993591210803 0.000970458060626238 0.000997523769556764 37408 37707 622 665 0 True 593 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 638 301 0.000991051393219842 0.00103277190458407 0.000595101853971161 0.000671396963454643 0.00103056656247051 0.0010527722510037 40398 45009 622 665 0 False 638 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 682 301 0.000963771598446327 0.00105688804295013 0.000579842832074464 0.000671396963454643 0.000978128199573999 0.00108214558145678 39286 46060 622 665 0 False 682 301 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 282 341 0.000853499406443674 0.000808934673603211 0.000701915007248035 0.000610360875867857 0.000692084569891882 0.000709938838292388 34791 35254 622 665 0 True 284 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 327 341 0.000876486068046897 0.000886078781297487 0.000762951094834821 0.000778210116731518 0.000676300907917458 0.000628172825814595 35728 38616 622 665 0 True 328 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 370 341 0.000927243168214525 0.000933140817252561 0.00080872816052491 0.000839246204318303 0.000696900313034368 0.000636079007624977 37797 40667 622 665 0 True 372 345 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 414 341 0.000950965795504084 0.000911755240699598 0.000762951094834821 0.000701915007248035 0.000782299540531027 0.0007744055337174 38764 39735 622 665 0 True 416 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 459 341 0.00101597609779708 0.000901223073706239 0.000717174029144732 0.000717174029144732 0.000911053048423026 0.000789802666169016 41414 39276 622 665 0 True 461 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 505 344 0.000836523131278861 0.000868135089382876 0.000549324788281071 0.000610360875867857 0.000850566880323218 0.00082273342922316 34099 37834 622 665 0 False 505 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 547 340 0.000922385794684709 0.00089137928364055 0.000717174029144732 0.000686655985351339 0.000813005320707483 0.00076391871047898 37599 38847 622 665 0 True 549 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 591 339 0.000914829880304994 0.000854895306474013 0.000503547722590982 0.000488288700694286 0.00104500125790076 0.00101258412555764 37291 37257 622 665 0 True 593 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 635 339 0.000888359647786448 0.000955100041245251 0.000488288700694286 0.000534065766384375 0.000968698047844452 0.00102307094353151 36212 41624 622 665 0 True 638 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 679 339 0.000961784491093221 0.000867056632196192 0.00064087891966125 0.000473029678797589 0.000977181400196196 0.000979417319601907 39205 37787 622 665 0 True 682 344 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 284 388 0.000980502551715695 0.000875179479942704 0.00080872816052491 0.000778210116731518 0.000765522357985914 0.000675203080875259 39968 38141 622 665 0 False 284 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 327 385 0.000875210394190581 0.00636732595966914 0.000717174029144732 0.00646982528419928 0.000724215372102137 0.00229050883278291 35676 277493 622 665 0 True 328 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 371 385 0.000934063116907904 0.000910516162229791 0.000762951094834821 0.000762951094834821 0.000735075349331019 0.000730328776377315 38075 39681 622 665 0 True 372 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 415 384 0.000927046910698169 0.000962511566166503 0.000686655985351339 0.000701915007248035 0.00082208678208814 0.000810266439540973 37789 41947 622 665 0 True 417 388 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 459 384 0.000914216575566381 0.000970404954937125 0.000579842832074464 0.000686655985351339 0.00089605392995825 0.000877476746748909 37266 42291 622 665 0 True 461 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 503 383 0.000951603632432241 0.000914164559946444 0.000610360875867857 0.000549324788281071 0.000956830170976386 0.000960361019967216 38790 39840 622 665 0 True 505 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 547 382 0.000837111903827929 0.000871990000177831 0.000549324788281071 0.000671396963454643 0.000854585572190153 0.000793053985315936 34123 38002 622 665 0 True 549 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 592 383 0.000936835254326436 0.000829172955276725 0.000473029678797589 0.000350957503624018 0.00106676153149725 0.000990584233128893 38188 36136 622 665 0 True 594 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 635 382 0.000837381757912919 0.000899639806772596 0.000396734569314107 0.000595101853971161 0.0010036850328139 0.00092069362447287 34134 39207 622 665 0 True 638 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 680 383 0.000900135098767822 0.000925660454638542 0.000534065766384375 0.000488288700694286 0.000917925180481959 0.00102876122125742 36692 40341 622 665 0 True 682 387 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 283 428 0.000945666842562466 0.000866482984756467 0.00080872816052491 0.000717174029144732 0.00077228676178134 0.000755911457055249 38548 37762 622 665 0 True 284 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 328 429 0.000973805263970039 0.000927863260807088 0.000854505226215 0.000778210116731518 0.000748400785187978 0.000728238039259966 39695 40437 622 665 0 True 328 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 372 431 0.000988401916749033 0.000928345124656457 0.000854505226215 0.000823987182421607 0.000752254778581995 0.000702365745288267 40290 40458 622 665 0 False 372 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 415 428 0.000857718943045333 0.000959689220763054 0.000656137941557946 0.000686655985351339 0.000799362672272862 0.000858798317696678 34963 41824 622 665 0 True 417 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 460 428 0.000901312643865959 0.00100512209798931 0.000595101853971161 0.000732433051041428 0.000900429299232924 0.000924232671369101 36740 43804 622 665 0 True 461 431 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 504 427 0.000859043681280737 0.000960171084612424 0.000549324788281071 0.000671396963454643 0.000874150470437969 0.000936006389838726 35017 41845 622 665 0 True 505 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 549 427 0.000867163836019976 0.000868708736822601 0.000610360875867857 0.000671396963454643 0.000873591443286684 0.000785853120652963 35348 37859 622 665 0 True 549 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 592 426 0.000871285243863457 0.00087036084144901 0.000442511635004196 0.000411993591210803 0.000973231808536424 0.000989564999699439 35516 37931 622 665 0 True 594 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 636 426 0.000832867835036726 0.00090259982756158 0.000442511635004196 0.000549324788281071 0.000935601354248768 0.000931993633947439 33950 39336 622 665 0 True 638 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 680 427 0.000969708388316103 0.000911525781723707 0.000625619897764553 0.000549324788281071 0.000959945924798937 0.000924174720855245 39528 39725 622 665 0 True 682 430 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 284 474 0.000920913863312037 0.000996264981519948 0.00080872816052491 0.000900282291905089 0.00078814047321502 0.000864578309308498 37539 43418 622 665 0 False 284 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 330 472 0.000880214960857665 0.000926670074132459 0.000686655985351339 0.000732433051041428 0.000783377009643788 0.000816890406083002 35880 40385 622 665 0 True 328 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 372 472 0.000951996147464954 0.000922723379747148 0.00080872816052491 0.000778210116731518 0.000804636171622817 0.000758100441832206 38806 40213 622 665 0 True 372 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 418 472 0.000944293039947972 0.000845831676926351 0.000595101853971161 0.000579842832074464 0.00100552037421861 0.000888452012215584 38492 36862 622 665 0 True 417 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 460 471 0.000918264386841228 0.000942869877830305 0.000503547722590982 0.000503547722590982 0.00101273122187912 0.0010627802476856 37431 41091 622 665 0 True 461 474 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 505 471 0.00102537192639264 0.00091565604328973 0.000747692072938125 0.000518806744487678 0.00102290586733302 0.000968563102107023 41797 39905 622 665 0 True 505 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 550 473 0.000813094890263836 0.000892159444158577 0.000457770656900893 0.000579842832074464 0.000897312963020131 0.000903468574600401 33144 38881 622 665 0 False 550 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 593 470 0.000862649913143783 0.000932727791095959 0.000457770656900893 0.000564583810177768 0.000976457567897487 0.000931032472116046 35164 40649 622 665 0 True 594 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 637 469 0.00094802193275874 0.000880686495364068 0.000564583810177768 0.000503547722590982 0.000997702219761454 0.000906882130985947 38644 38381 622 665 0 True 638 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 682 471 0.000952216937170855 0.000931236307752673 0.000610360875867857 0.000518806744487678 0.000990518681158911 0.00101462871804952 38815 40584 622 665 0 True 682 473 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 284 516 0.000861864883078358 0.000896932190857092 0.000701915007248035 0.000747692072938125 0.000766350870730877 0.000798500390466327 35132 39089 622 665 0 True 284 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 329 517 0.000927046910698169 0.000917698228175153 0.000778210116731518 0.000793469138628214 0.000782308554061739 0.000777817623284357 37789 39994 622 665 0 True 328 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 374 516 0.000876952179648243 0.000901062452423115 0.000701915007248035 0.000793469138628214 0.000754754771573747 0.000726970743254737 35747 39269 622 665 0 True 373 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 419 515 0.00092439743422736 0.000947734408119176 0.00064087891966125 0.000564583810177768 0.00093925719018169 0.000950428785498513 37681 41303 622 665 0 True 417 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 462 514 0.000799822975720247 0.000932727791095959 0.000381475547417411 0.000595101853971161 0.000934684635386698 0.000895990198530923 32603 40649 622 665 0 True 461 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 507 513 0.000867016642882709 0.000930662660312948 0.000503547722590982 0.000625619897764553 0.000891649192608877 0.00086451046523819 35342 40559 622 665 0 True 505 517 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 551 512 0.000887304763636034 0.000903747122441031 0.000579842832074464 0.00064087891966125 0.000905338583636942 0.000887908703566069 36169 39386 622 665 0 True 550 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 594 512 0.000845649105789425 0.000929354744150374 0.000488288700694286 0.000625619897764553 0.000934355034952478 0.000931510265241648 34471 40502 622 665 0 True 594 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 638 511 0.000904207442232213 0.000883508840767517 0.000518806744487678 0.000473029678797589 0.00100197468380211 0.00100154417815837 36858 38504 622 665 0 True 638 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 683 511 0.000936074756450555 0.000956178498431935 0.000671396963454643 0.000610360875867857 0.000951881033102465 0.00095871496519892 38157 41671 622 665 0 True 683 516 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 286 556 0.000872708110857039 0.000880319361002644 0.000701915007248035 0.000732433051041428 0.000734092421931006 0.000688320046264619 35574 38365 622 665 0 True 284 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 329 556 0.000903814927199501 0.000899203834718405 0.000747692072938125 0.000778210116731518 0.000720318910115991 0.00073532037830595 36842 39188 622 665 0 True 328 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 374 556 0.000901827819846394 0.000897253433423339 0.000762951094834821 0.000823987182421607 0.000709574356881225 0.00065474391110752 36761 39103 622 665 0 True 373 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 418 555 0.000941054790928094 0.000946839518113205 0.000701915007248035 0.000625619897764553 0.000932659525652207 0.000917854447674137 38360 41264 622 665 0 True 417 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 462 555 0.000866648660039541 0.000924834402325337 0.000442511635004196 0.000457770656900893 0.00103498721774886 0.00100449752974452 35327 40305 622 665 0 True 461 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 506 553 0.000926507202528189 0.000900442913188212 0.000473029678797589 0.000473029678797589 0.0010593560253493 0.00102843756838644 37767 39242 622 665 0 True 506 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 551 553 0.000966421074917136 0.000877428177906428 0.000625619897764553 0.000457770656900893 0.000981852990120541 0.000936714611696533 39394 38239 622 665 0 True 550 560 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 594 559 0.000862551784385605 0.000854482280317411 0.000564583810177768 0.00064087891966125 0.000850034154289835 0.00073393470662483 35160 37239 622 665 0 False 594 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 638 559 0.000870475681608487 0.00101909614962102 0.000579842832074464 0.000732433051041428 0.000897665112664146 0.000925714396488238 35483 44413 622 665 0 False 638 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 683 553 0.000910733004651058 0.000947872083504711 0.000686655985351339 0.000625619897764553 0.000792633716969116 0.000896789024537797 37124 41309 622 665 0 True 683 559 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 284 603 0.000854824144679079 0.000957050442540317 0.000732433051041428 0.000778210116731518 0.000680597261400042 0.000829791169964454 34845 41709 622 665 0 False 284 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 329 603 0.000959478465276035 0.000909322975555162 0.000854505226215 0.000762951094834821 0.000745687749191673 0.000785280777095271 39111 39629 622 665 0 False 329 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 374 597 0.000956657263478414 0.000910653837615325 0.000839246204318303 0.000823987182421607 0.000721300778614494 0.000640998766881223 38996 39687 622 665 0 True 373 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 419 597 0.00086929813651035 0.000860998915232692 0.000564583810177768 0.000579842832074464 0.000868220453108501 0.000823359450649026 35435 37523 622 665 0 True 417 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 461 603 0.000912891837330976 0.000985962273502479 0.000503547722590982 0.000473029678797589 0.000989671689532594 0.00111632636591457 37212 42969 622 665 0 False 461 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 506 603 0.000902710978669997 0.000827910930909329 0.000488288700694286 0.000305180437933928 0.00103983654563165 0.00101298281218541 36797 36081 622 665 0 False 506 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 550 603 0.000956534602530692 0.000907647925031163 0.000473029678797589 0.000488288700694286 0.00103741791049131 0.00100767206542123 38991 39556 622 665 0 False 550 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 594 603 0.000936540868051901 0.000861343103696527 0.000701915007248035 0.000564583810177768 0.000876657584333479 0.000834042517512277 38176 37538 622 665 0 False 594 603 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 639 602 0.000923735065109658 0.000936261459324668 0.000701915007248035 0.000717174029144732 0.000782094462627232 0.00079866631315161 37654 40803 622 665 0 False 639 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 683 602 0.000948365383412364 0.000909139408374449 0.000701915007248035 0.000625619897764553 0.000837558877774744 0.000812240983104973 38658 39621 622 665 0 False 683 602 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 285 650 0.00111999258146588 0.0716137562950636 0.000961318379491875 0.0698405432211795 0.000833076903982028 0.0232355619770067 45654 3120983 622 665 0 True 284 647 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 329 646 0.000894590823930758 0.00102306578990392 0.00080872816052491 0.000900282291905089 0.000683220370681551 0.000708656549687969 36466 44586 622 665 0 False 329 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 373 646 0.00088696131298241 0.000933507951613986 0.000732433051041428 0.000747692072938125 0.000646195818386102 0.000712216216413856 36155 40683 622 665 0 False 373 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 417 646 0.000882275664779405 0.000874215752243965 0.000656137941557946 0.000625619897764553 0.000776213191710998 0.000742788612705023 35964 38099 622 665 0 False 417 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 462 646 0.000955675975896633 0.000962190323600257 0.000717174029144732 0.000686655985351339 0.000879742176264755 0.000875301307435518 38956 41933 622 665 0 False 462 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 506 646 0.000895105999911193 0.000855078873654725 0.000595101853971161 0.000503547722590982 0.000872969352953174 0.0009035461775586 36487 37265 622 665 0 False 506 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 550 646 0.000887574617721023 0.000861297211901349 0.000610360875867857 0.000549324788281071 0.000856876872388868 0.000854762559843954 36180 37536 622 665 0 False 550 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 594 646 0.000837479886671097 0.000884357838978311 0.00064087891966125 0.000747692072938125 0.000669829999490281 0.000641411298863281 34138 38541 622 665 0 False 594 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 639 646 0.000946329211680168 0.000964186616690502 0.00080872816052491 0.000839246204318303 0.000706390875495395 0.000708023339621417 38575 42020 622 665 0 False 639 646 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 682 648 0.00100258152230577 0.074244021589795 0.000900282291905089 0.0726176852063783 0.000725394671773927 0.0223431289987275 40868 3235612 622 665 0 True 683 645 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H7_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H7_1.csv new file mode 100755 index 0000000..6bb4d67 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H7_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 278 274 0.00907838011383125 0.0365326913071188 0.00907911802853437 0.0369878690775921 0.00140702162669091 0.00854364457515476 344477 1592123 579 665 0 True 278 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 322 273 0.00902058558011889 0.00899983995236432 0.00900282291905089 0.00900282291905089 0.00134582861786646 0.00128771411101364 342284 392220 579 665 0 False 322 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 367 274 0.00936582424479371 0.0519603196592993 0.00943007553215839 0.052628366521706 0.00125254240687795 0.00974124020384612 355384 2264471 579 665 0 True 367 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 412 274 0.00931203553375545 0.073818306351826 0.00933852140077821 0.0748760204470893 0.00144282118620385 0.0130405156888679 353343 3217059 579 665 0 True 411 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 456 274 0.00939531447882205 0.0598982464171415 0.0093842984664683 0.0599374380102235 0.00183684381914743 0.0136475077198704 356503 2610412 579 665 0 True 455 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 499 272 0.00926246347816359 0.0525257983594831 0.00926222629129473 0.055237659266041 0.00169781575251749 0.0151198759491973 351462 2289115 579 665 0 True 499 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 544 272 0.00924615029240529 0.0659142247929276 0.00920119020370794 0.0667277027542535 0.00156847593071095 0.0211214336736977 350843 2872593 579 665 0 True 544 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 588 272 0.00922857211001307 0.0545042165955057 0.00917067215991455 0.0542458228427558 0.00178478623660728 0.0161011094885804 350176 2375336 579 665 0 True 588 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 632 273 0.00905719142021304 0.00901645278221876 0.00903334096284428 0.00907911802853437 0.00192738472042065 0.0019024389313821 343673 392944 579 665 0 False 632 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 674 272 0.00907743136635581 0.036580808854363 0.00910963607232776 0.0367742427710384 0.00179618166932264 0.00832856503318356 344441 1594220 579 665 0 True 676 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 278 317 0.0089000155884481 0.00880463920157455 0.00892652780956741 0.00872816052491035 0.00141542918753439 0.00144196368675233 337709 383713 579 665 0 False 278 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 323 316 0.00924562321047449 0.0090092707162734 0.00917067215991455 0.00904859998474098 0.00137565877550839 0.00123484078035774 350823 392631 579 665 0 False 323 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 367 318 0.00920408915432735 0.0918717943864009 0.00915541313801785 0.0929121843289845 0.00145464003462644 0.0235121278773366 349247 4003844 579 665 0 True 367 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 411 318 0.00943919404956125 0.0448207495162718 0.0093690394445716 0.0447089341573205 0.00150465881547722 0.0102310021850504 358168 1953323 579 665 0 True 411 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 455 318 0.00956121351654174 0.0625319765424089 0.00941481651026169 0.0621499961852445 0.00186590584313541 0.0154590753328001 362798 2725192 579 665 0 True 455 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 499 316 0.00938161034862121 0.035612629651492 0.00944533455405508 0.0366826886396582 0.00170871159332604 0.00816743685445049 355983 1552026 579 665 0 True 500 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 544 316 0.00937207016567371 0.0365042154482108 0.0093842984664683 0.0372167544060426 0.00154058929447031 0.00833776507229173 355621 1590882 579 665 0 False 544 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 588 316 0.0091928096010082 0.0424303147431408 0.00935378042267491 0.0438239108873121 0.0019707455316868 0.00968992801708633 348819 1849146 579 665 0 True 588 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 632 316 0.00925355579353305 0.00900011530313538 0.00926222629129473 0.00903334096284428 0.00209293194645219 0.00195803019423391 351124 392232 579 665 0 False 632 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 676 315 0.00906327921651379 0.00907046742514331 0.00907911802853437 0.00907911802853437 0.00184938904022376 0.0017846467040378 343904 395298 579 665 0 False 676 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 279 356 0.00914695347302849 0.0428300322791414 0.00926222629129473 0.0427100022888533 0.00153725246113974 0.00993086658157581 347079 1866566 579 665 0 True 278 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 323 356 0.00937454745074848 0.055200922884001 0.009399557488365 0.0556191348134585 0.0014086367871857 0.0187625545158978 355715 2405699 579 665 0 True 323 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 367 356 0.00945065808155618 0.0323366897445032 0.0093842984664683 0.0336614023041123 0.0015864607308497 0.00650490242159651 358603 1409258 579 665 0 True 367 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 411 356 0.00936139675657499 0.0293028978947713 0.00941481651026169 0.0299687190051118 0.00153980817622046 0.00540958093493405 355216 1277043 579 665 0 True 411 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 456 356 0.00960517214957057 0.0582380189429858 0.00958266575112535 0.0575265125505455 0.00187447424437999 0.0107493541381865 364466 2538058 579 665 0 True 455 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 500 359 0.00951504113940355 0.0250959052472105 0.00944533455405508 0.0271152819104295 0.00186321837523401 0.00640295766250647 361046 1093699 579 665 0 False 500 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 543 354 0.00971214342742668 0.0248084160963177 0.00959792477302205 0.0255588616769665 0.00179876318703613 0.00410443127414891 368525 1081170 579 665 0 True 544 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 588 354 0.00933419932894564 0.0418937478739192 0.00933852140077821 0.0424505989166094 0.00221207580134977 0.00879160496877023 354184 1825762 579 665 0 True 588 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 632 354 0.00917815672333193 0.0485242862248319 0.00920119020370794 0.0495002670328832 0.00204534553210949 0.0117621765318279 348263 2114726 579 665 0 True 632 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 676 355 0.00943033907312379 0.0531773241756256 0.0093690394445716 0.0535439078355077 0.00188728504732087 0.0159622753616066 357832 2317509 579 665 0 True 677 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 279 403 0.00931677927113266 0.0338814305160934 0.00920119020370794 0.0372167544060426 0.00178842281430955 0.0113243916441487 353523 1476579 579 665 0 False 279 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 323 400 0.00929609130534871 0.0301039391796038 0.00927748531319142 0.0298466468299382 0.00136775364525619 0.00755486517382412 352738 1311953 579 665 0 True 323 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 367 399 0.00973654732082278 0.0700787675299487 0.00968947890440223 0.0709697108415351 0.00149752306003093 0.0193792320907746 369451 3054087 579 665 0 True 367 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 412 400 0.00943568895472142 0.0549040947527895 0.0093690394445716 0.0555123216601816 0.00166780107878089 0.0136114447318151 358035 2392763 579 665 0 True 411 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 456 399 0.00964596829101458 0.0369736655669845 0.00973525597009232 0.0384222171358816 0.00159789155733607 0.0082025868739169 366014 1611341 579 665 0 True 456 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 500 399 0.00954569095367964 0.0480524726786066 0.00953688868543526 0.0479133287556268 0.0018326789164678 0.0123707140615582 362209 2094164 579 665 0 True 500 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 545 398 0.00944254101982184 0.0360928413962349 0.00943007553215839 0.0375829709315633 0.00165111612072371 0.00623196589744008 358295 1572954 579 665 0 True 544 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 588 398 0.00946338711018503 0.0446569616992814 0.00947585259784848 0.0458991378652628 0.0019051833495114 0.00896196921713231 359086 1946185 579 665 0 True 588 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 632 398 0.00947187312927093 0.0408132485023499 0.00944533455405508 0.0423437857633326 0.00189738026573749 0.00829893227619953 359408 1778673 579 665 0 True 632 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 677 399 0.00941186485144921 0.0700661013944796 0.00930800335698482 0.0692759594110018 0.00187452315184835 0.0145726718260058 357131 3053535 579 665 0 True 677 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 279 443 0.0091495888826825 0.0371073713122357 0.00914015411612116 0.0383459220263981 0.00174368362556268 0.00886994270389885 347179 1617168 579 665 0 True 279 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 325 444 0.00947145146372629 0.0464446536345441 0.0093842984664683 0.045487144274052 0.00161182873677647 0.00763024101889226 359392 2024094 579 665 0 True 323 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 367 446 0.00977881929167304 0.028654423883008 0.00970473792629892 0.0308842603189136 0.00177632311441018 0.00671730884955817 371055 1248782 579 665 0 False 367 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 412 444 0.00989873043093033 0.0453312727917298 0.00984206912336919 0.0457007705806058 0.00168341130973647 0.00988514142996893 375605 1975572 579 665 0 True 411 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 456 443 0.00986444375133171 0.0803018532827835 0.00985732814526589 0.0789959563591974 0.00193129592415938 0.0154004339525221 374304 3499617 579 665 0 True 456 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 501 442 0.0096538745199766 0.0496474649659167 0.00962844281681544 0.0511329823758297 0.00180363943189785 0.0121292588887644 366314 2163675 579 665 0 True 500 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 545 442 0.0094519230781901 0.0444615314895157 0.00946059357595178 0.0446021210040436 0.00176897979270071 0.008821621454304 358651 1937668 579 665 0 True 544 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 588 441 0.00937293985085953 0.0283676919467357 0.00946059357595178 0.02905317769131 0.00198770277152048 0.00539975833595777 355654 1236286 579 665 0 True 588 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 633 441 0.00925455724920157 0.0327415471615638 0.00924696726939803 0.0337529564354925 0.00188065146856237 0.00568220368525557 351162 1426902 579 665 0 True 633 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 677 443 0.00943060261408919 0.0633391443818978 0.00947585259784848 0.063584344243534 0.00188057497643839 0.00885276451304665 357842 2760369 579 665 0 True 677 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 282 488 0.00903597637249829 0.0494910198361548 0.00901808194094758 0.0503852903028916 0.00159766749475867 0.0133761981824533 342868 2156857 579 665 0 True 279 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 325 488 0.00951042917250904 0.0477184492474032 0.00949111161974517 0.0482490272373541 0.00167805739463972 0.0075604674857404 360871 2079607 579 665 0 True 323 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 369 488 0.00968963702898147 0.0591017713659291 0.00962844281681544 0.0577096208133059 0.00156673570863929 0.0151641672760312 367671 2575701 579 665 0 True 367 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 414 488 0.00966333564063449 0.0757455552362252 0.00968947890440223 0.0732890821698329 0.0017995287046939 0.0185165506270444 366673 3301050 579 665 0 True 412 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 458 486 0.00974108022542767 0.0838513541808286 0.00976577401388571 0.0814831769283589 0.00202197214508558 0.0285534778063398 369623 3654307 579 665 0 True 456 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 501 486 0.0097539937327323 0.0380100858692853 0.0097962920576791 0.0390783550774395 0.00184415327915516 0.00655748284414468 370113 1656509 579 665 0 True 500 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 545 485 0.00947859342388864 0.0331999832494948 0.00943007553215839 0.0346684977492943 0.00180926357349216 0.00591230310546008 359663 1446881 579 665 0 True 544 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 590 486 0.00953918149183425 0.0916955928388148 0.00953688868543526 0.0907301441977569 0.00182877276348134 0.0198418597162726 361962 3996165 579 665 0 True 588 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 633 486 0.00922253702190539 0.0571929021454988 0.00917067215991455 0.0580453192950332 0.00179980873701034 0.0170787776929566 349947 2492511 579 665 0 True 633 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 678 486 0.00945213391096242 0.0729277531204987 0.00955214770733196 0.0710307469291218 0.0018935518179225 0.0140856680170171 358659 3178248 579 665 0 True 677 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 282 532 0.0089723048752575 0.0446604953675101 0.00898756389715419 0.0464332036316472 0.00156329072295307 0.0104062887496278 340452 1946339 579 665 0 True 279 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 326 532 0.0093344365158145 0.0883226606227173 0.0093842984664683 0.0836957351033799 0.00159205507712886 0.0244255613326642 354193 3849170 579 665 0 True 323 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 370 531 0.0094853400726029 0.0505023373264932 0.00949111161974517 0.0518196383611811 0.00159306015275802 0.0118122825056916 359919 2200931 579 665 0 True 367 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 415 531 0.00976419276809331 0.0521669015752932 0.0097962920576791 0.0532082093537804 0.00179857551328276 0.00757648785129248 370500 2273474 579 665 0 True 412 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 459 531 0.00999898141416873 0.0487244891812961 0.00987258716716258 0.049912260624094 0.00197139739559635 0.00776636315428019 379409 2123451 579 665 0 True 456 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 503 529 0.00958943875393615 0.0556862974557015 0.00964370183871214 0.0565651941710536 0.00191366578260965 0.0126783446258756 363869 2426852 579 665 0 True 500 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 547 530 0.00958485314113818 0.065574579616815 0.00956740672922866 0.0647440299076829 0.00180083515102966 0.0164789769507782 363695 2857791 579 665 0 True 544 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 591 528 0.00945389963543061 0.0494053169086598 0.00952162966353857 0.0507057297627222 0.00171921368702948 0.0118136377812117 358726 2153122 579 665 0 True 589 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 635 528 0.00938761908263235 0.0427133064981061 0.00930800335698482 0.0426947432669566 0.00193528783211289 0.00750814201376418 356211 1861479 579 665 0 True 633 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 679 529 0.00924401561058554 0.0539882780882167 0.00924696726939803 0.0551461051346609 0.00184749839915131 0.0108712123132245 350762 2352851 579 665 0 True 677 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 283 574 0.00871996440088639 0.0380282819660733 0.00865186541542687 0.0393530174715801 0.00138987750517294 0.0082947844473486 330877 1657302 579 665 0 True 279 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 326 574 0.00911611918007662 0.0474642087021169 0.00904859998474098 0.0484321355001144 0.00145360551340259 0.0121074813538679 345909 2068527 579 665 0 True 323 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 371 574 0.00951203677239799 0.0390312700955869 0.00958266575112535 0.0398413061722744 0.00148106490126225 0.00798189608371025 360932 1701013 579 665 0 True 368 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 415 573 0.00981550419405681 0.0471393406840516 0.00988784618905928 0.0445410849164569 0.00181385441179197 0.0101956919372615 372447 2054369 579 665 0 True 412 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 459 573 0.00993789261838886 0.0796547560248757 0.0100404364080262 0.0773327229724575 0.00202367983953047 0.0205794796783146 377091 3471416 579 665 0 True 456 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 503 571 0.00942272273922371 0.0533515753219166 0.0093690394445716 0.0538185702296483 0.00209111259092848 0.0110612980248418 357543 2325103 579 665 0 True 500 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 547 571 0.00956456048680233 0.0483961563326949 0.00955214770733196 0.0482795452811475 0.00183644199991152 0.00845460825870615 362925 2109142 579 665 0 True 544 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 589 574 0.00943895686269239 0.0310081452199967 0.00944533455405508 0.0338139925230793 0.00168257363200947 0.0105333761063694 358159 1351359 579 665 0 False 589 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 635 571 0.00925621755728359 0.0413374704786686 0.00930800335698482 0.0408484016174563 0.00162432614515838 0.0087380011796626 351225 1801519 579 665 0 True 633 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 680 572 0.00932091686428945 0.0432624936110016 0.00923170824750134 0.0435492484931716 0.00173578001650541 0.00903416177167486 353680 1885413 579 665 0 True 677 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 279 618 0.00856402721165884 0.00854181689058994 0.00854505226215 0.00862134737163348 0.00133991654996259 0.00136341686563789 324960 372259 579 665 0 False 279 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 323 618 0.00879873679544464 0.00897957872479322 0.00878919661249714 0.00898756389715419 0.00142055513558272 0.00129207690529098 333866 391337 579 665 0 False 323 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 371 617 0.00942153680487941 0.0621876045113929 0.00947585259784848 0.0610513466086824 0.00144843977484598 0.0130365261132914 357498 2710184 579 665 0 True 368 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 416 616 0.00954221221293636 0.0664630447714617 0.00946059357595178 0.0650949874113069 0.00160294012759239 0.0188570646641222 362077 2896511 579 665 0 True 412 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 456 618 0.00930739721276439 0.00909628155993096 0.00941481651026169 0.00904859998474098 0.00199343996491278 0.00187520122583989 353167 396423 579 665 0 False 456 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 500 617 0.00901939964577459 0.00894314063942185 0.00907911802853437 0.0089570458533608 0.00189769561830034 0.00199453602797054 342239 389749 579 665 0 False 500 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 545 617 0.00907595553694956 0.00895936338901729 0.00912489509422446 0.0089723048752575 0.00181105324194834 0.00197903762494181 344385 390456 579 665 0 False 545 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 589 617 0.00893240477309584 0.00884656135646968 0.00889600976577401 0.00881971465629053 0.0017989516956048 0.00157667025085488 338938 385540 579 665 0 False 589 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 633 617 0.0090164479869621 0.00880434090490589 0.00904859998474098 0.00880445563439384 0.00149672321661757 0.00145716387273822 342127 383700 579 665 0 False 633 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 677 617 0.0089839533859282 0.00900679255933379 0.0089417868314641 0.00907911802853437 0.00157577895341405 0.00158646450546684 340894 392523 579 665 0 False 677 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 279 664 0.00877881309846035 0.0348896962020524 0.00875867856870375 0.0350194552529183 0.00139375551649929 0.00768919889729312 333110 1520520 579 665 0 True 279 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 324 661 0.00868689000972861 0.00884970494443938 0.00869764248111696 0.00886549172198062 0.00124571162233116 0.00122573434655099 329622 385677 579 665 0 False 324 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 368 661 0.00879056702551722 0.00867187423812449 0.00883497367818723 0.00866712443732357 0.00131957822451488 0.00128075774084429 333556 377927 579 665 0 False 368 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 412 661 0.00876982635154019 0.00898129966711239 0.00874341954680705 0.00901808194094758 0.00142231346219871 0.00139735543034996 332769 391412 579 665 0 False 412 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 456 661 0.00895641335504384 0.00890319183171938 0.0089417868314641 0.0089570458533608 0.00157096420651204 0.00146393909066873 339849 388008 579 665 0 False 456 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 501 660 0.00888668041559883 0.00884215574413259 0.00891126878767071 0.00891126878767071 0.00167853739744333 0.00171285772185023 337203 385348 579 665 0 False 501 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 545 660 0.00892802999307019 0.00880521284901427 0.0089570458533608 0.00881971465629053 0.0017059562234486 0.00181450039501974 338772 383738 579 665 0 False 545 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 589 660 0.00883138952105778 0.0087428917911625 0.00888075074387732 0.00875867856870375 0.00147298237402396 0.00129055067867131 335105 381022 579 665 0 False 589 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 633 660 0.00893704309408689 0.00893453592782597 0.00904859998474098 0.00888075074387732 0.00139250940523842 0.00138493862642814 339114 389374 579 665 0 False 633 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 675 663 0.00928130665718973 0.035341340304297 0.00933852140077821 0.0358281834134432 0.00142105738318583 0.00864540828908605 352177 1540203 579 665 0 True 677 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H7_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H7_2.csv new file mode 100755 index 0000000..4553593 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H7_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 278 274 0.00720449843344662 0.693461555009061 0.00689707789730678 0.705607690547036 0.00200198615977073 0.208431729163674 273373 30221592 579 665 10 True 278 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 322 273 0.00597078411211665 0.00568411185895616 0.00592050049591821 0.00566109712367437 0.00141916377484213 0.00128147401693157 226560 247718 579 665 0 False 322 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 367 274 0.00561144600579289 0.00563677447223001 0.00561532005798428 0.00564583810177768 0.00124557396225535 0.00129325115264434 212925 245655 579 665 0 True 367 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 412 274 0.00550776899000429 0.00556626172893896 0.00546272983901732 0.00556954299229419 0.00138953672930361 0.00132273518416063 208991 242582 579 665 0 True 411 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 456 274 0.00555270272460509 0.00558259920802234 0.00550850690470741 0.00556954299229419 0.00167764572335612 0.00165514699814101 210696 243294 579 665 0 True 455 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 499 272 0.00545292611510442 0.00568108300047441 0.00540169375143053 0.00569161516746777 0.00156823640214756 0.00145262954948979 206910 247586 579 665 0 True 499 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 544 272 0.00552977466061524 0.00553842835516349 0.0055390249485008 0.00564583810177768 0.00148052543715258 0.00137404565889979 209826 241369 579 665 0 True 544 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 588 272 0.00574411252777557 0.00586127713424096 0.00579842832074464 0.00592050049591821 0.00178594511920366 0.00184704038248297 217959 255439 579 665 0 True 588 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 632 273 0.00644945356757381 0.00642749010314755 0.00630197604333562 0.00634775310902571 0.00205701026945019 0.00186926801135727 244723 280115 579 665 0 False 632 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 674 272 0.00782208033176645 0.691393900177314 0.0076752880140383 0.698466468299382 0.00245836451444778 0.205870350493205 296807 30131482 579 665 9 True 676 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 278 317 0.00582762865971103 0.00556821213023403 0.00587472343022812 0.00556954299229419 0.00148272817956714 0.00128693628481971 221128 242667 579 665 0 False 278 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 323 316 0.00552392405118335 0.00549003545714825 0.00552376592660411 0.0055542839703975 0.0012085447109166 0.0011895499419012 209604 239260 579 665 0 False 323 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 367 318 0.00551217012412648 0.00555015370883147 0.0055542839703975 0.00558480201419089 0.0012376810100912 0.00126330091546818 209158 241880 579 665 0 True 367 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 411 318 0.00587925633483301 0.00585363615034382 0.00581368734264134 0.00578316929884794 0.0016119005978053 0.00143808081739059 223087 255106 579 665 0 True 411 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 455 318 0.00581065662153923 0.00592788907494188 0.00578316929884794 0.00592050049591821 0.00154058120256508 0.00160865797569347 220484 258342 579 665 0 True 455 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 499 316 0.00577710785664373 0.00579604194739538 0.00578316929884794 0.00576791027695125 0.00164153193818282 0.00154517727418728 219211 252596 579 665 0 True 500 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 544 316 0.00573915795762604 0.00562500322676685 0.00576791027695125 0.00567635614557107 0.00140768805851183 0.00145415087970435 217771 245142 579 665 0 False 544 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 588 316 0.00573905254123988 0.00599828708874498 0.00579842832074464 0.005981536583505 0.0018246898396104 0.00191383311827601 217767 261410 579 665 0 True 588 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 632 316 0.00589923274001038 0.0059792419937461 0.00585946440833143 0.00590524147402152 0.00192975864907907 0.00181221075321246 223845 260580 579 665 0 False 632 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 676 315 0.00613668314983635 0.0060462899065012 0.00611886778057527 0.00602731364919509 0.0018684501534239 0.00186726238206311 232855 263502 579 665 0 False 676 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 279 356 0.00553754911909456 0.00549928265387662 0.00547798886091402 0.00546272983901732 0.00146487277071995 0.00142393910862583 210121 239663 579 665 0 True 278 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 323 356 0.0054976490169329 0.00560180492430435 0.00550850690470741 0.00566109712367437 0.00130057379165619 0.00129257859212296 208607 244131 579 665 0 True 323 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 367 356 0.00572258123090234 0.00578119595165529 0.00572213321126116 0.00576791027695125 0.00126481444866054 0.00134005181430293 217142 251949 579 665 0 True 367 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 411 356 0.00594342855990807 0.00611583892209351 0.00593575951781491 0.00613412680247196 0.00147762939881865 0.00137728603344347 225522 266533 579 665 0 True 411 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 456 356 0.00600428016881907 0.00599736925284142 0.00593575951781491 0.005981536583505 0.00150193876749171 0.00161051741071597 227831 261370 579 665 0 True 455 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 500 359 0.00592284601051028 0.00603213228768878 0.00602731364919509 0.00610360875867857 0.00172742980662483 0.00161064737183761 224741 262885 579 665 0 False 500 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 543 354 0.0058141880704756 0.00568723250102826 0.00585946440833143 0.00567635614557107 0.00159831771871025 0.00166542960022962 220618 247854 579 665 0 True 544 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 588 354 0.00580169622871561 0.00580879986645488 0.00588998245212482 0.00578316929884794 0.00194739963214062 0.00201030535521049 220144 253152 579 665 0 True 588 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 632 354 0.00566093899909513 0.00581859776472539 0.00558480201419089 0.00581368734264134 0.00188729912215116 0.00190265753647961 214803 253579 579 665 0 True 632 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 676 355 0.00546249265214846 0.00554519739495225 0.0055390249485008 0.00550850690470741 0.00176066128087416 0.00180381201819179 207273 241664 579 665 0 True 677 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 279 403 0.00566689502491319 0.00538996839776255 0.00566109712367437 0.00532539864194705 0.00152200714390649 0.0014503075261229 215029 234899 579 665 0 False 279 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 323 400 0.00545993630478407 0.00553161342357955 0.00549324788281071 0.00546272983901732 0.00127991275899372 0.00131855206802675 207176 241072 579 665 0 True 323 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 367 399 0.00596393204701623 0.00607839121722824 0.0059510185397116 0.00607309071488518 0.00125974851862998 0.00126097280150568 226300 264901 579 665 0 True 367 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 412 400 0.00600749536859696 0.00614488842844121 0.00599679560540169 0.00616464484626535 0.00148385649541257 0.00146277033937563 227953 267799 579 665 0 True 411 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 456 399 0.00610092064083148 0.00624722713168823 0.00605783169298848 0.00631723506523232 0.00158202450388836 0.00157627798113701 231498 272259 579 665 0 True 456 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 500 399 0.0059755542035904 0.00600959941625637 0.00604257267109178 0.00607309071488518 0.00165872253306344 0.00165344105823291 226741 261903 579 665 0 True 500 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 545 398 0.00570149795367029 0.00564884401436184 0.00572213321126116 0.00564583810177768 0.00151208624700118 0.00148388491817249 216342 246181 579 665 0 True 544 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 588 398 0.00568655518093207 0.00542645237492908 0.00569161516746777 0.00546272983901732 0.0017505089660527 0.00189023642458808 215775 236489 579 665 0 True 588 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 632 398 0.00537209810101604 0.00530550454873737 0.00531013962005036 0.00543221179522393 0.00181168682413524 0.00182328724489194 203843 231218 579 665 0 True 632 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 677 399 0.0052883974904048 0.00538563162311822 0.00531013962005036 0.00541695277332723 0.00171139260047594 0.00181642397147094 200667 234710 579 665 0 True 677 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 279 443 0.00548642217180684 0.00561924380647201 0.00552376592660411 0.00563057907988098 0.00143023781910144 0.00148307062609383 208181 244891 579 665 0 True 279 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 325 444 0.00563629791883017 0.00552500500507391 0.00567635614557107 0.00544747081712062 0.00145311883355691 0.00140819387852931 213868 240784 579 665 0 True 323 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 367 446 0.00573892077075718 0.00567071145476417 0.00576791027695125 0.00572213321126116 0.00147888286148307 0.0013088111477202 217762 247134 579 665 0 False 367 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 412 444 0.00581276494926243 0.00589154277316087 0.00588998245212482 0.0059510185397116 0.00149775103328361 0.00161148923531715 220564 256758 579 665 0 True 411 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 456 443 0.00587714800710981 0.00598814500201063 0.00593575951781491 0.00599679560540169 0.00181646887649134 0.00186296839072481 223007 260968 579 665 0 True 456 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 501 442 0.00580712517260286 0.00590374999067823 0.00585946440833143 0.00588998245212482 0.00170457649668857 0.00179534993245261 220350 257290 579 665 0 True 500 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 545 442 0.0055363895388468 0.00562511795625479 0.00552376592660411 0.00561532005798428 0.00167198527488779 0.00159922598085414 210077 245147 579 665 0 True 544 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 588 441 0.00547785709043132 0.00540261158733409 0.00543221179522393 0.00534065766384375 0.00189027398097467 0.00188468013267763 207856 235450 579 665 0 True 588 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 633 441 0.00521995590169026 0.00516725551576354 0.00520332646677348 0.00527962157625696 0.00175109317690415 0.00174315338502698 198070 225193 579 665 0 True 633 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 677 443 0.00525735236468061 0.00521505182044147 0.00521858548867018 0.00518806744487678 0.00193128152588027 0.00180967404041793 199489 227276 579 665 0 True 677 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 282 488 0.00561192037953061 0.00568537388332355 0.00563057907988098 0.00576791027695125 0.0014755837933918 0.00152841713821556 212943 247773 579 665 0 True 279 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 325 488 0.00565793463208957 0.00556621583714379 0.00556954299229419 0.00552376592660411 0.00154218113372712 0.00139621218126284 214689 242580 579 665 0 True 323 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 369 488 0.00557320621171326 0.00566284101189114 0.00552376592660411 0.00560006103608759 0.00145286005182957 0.00146128519054051 211474 246791 579 665 0 True 367 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 414 488 0.00574983136672476 0.00577415156109546 0.00581368734264134 0.00576791027695125 0.0017472726812746 0.00166384647084638 218176 251642 579 665 0 True 412 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 458 486 0.00592719443643939 0.00600278448467243 0.0059510185397116 0.00610360875867857 0.00184903559644618 0.00178067975211111 224906 261606 579 665 0 True 456 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 501 486 0.00596074320133489 0.00557670211234197 0.00587472343022812 0.0055542839703975 0.00173207580227531 0.00167304221348087 226179 243037 579 665 0 True 500 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 545 485 0.00551159033400259 0.00537691218203439 0.00556954299229419 0.00538643472953384 0.00163684259131335 0.00166903982754386 209136 234330 579 665 0 True 544 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 590 486 0.0053455595258002 0.00550398656288237 0.00527962157625696 0.0055390249485008 0.00178262300253141 0.00176597198398605 202836 239868 579 665 0 True 588 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 633 486 0.00527016045559908 0.00539949094526199 0.00521858548867018 0.00546272983901732 0.00175901711247414 0.00168154749679071 199975 235314 579 665 0 True 633 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 678 486 0.00543782521778696 0.00566726957012582 0.00544747081712062 0.00569161516746777 0.00166504233014745 0.00176000595494306 206337 246984 579 665 0 True 677 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 282 532 0.00550476462299872 0.00570060995932266 0.00549324788281071 0.00575265125505455 0.00140955482270817 0.00140866364231107 208877 248437 579 665 0 True 279 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 326 532 0.00553522995859903 0.00563815122608536 0.00550850690470741 0.00566109712367437 0.00150696151115813 0.00144038820475989 210033 245715 579 665 0 True 323 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 370 531 0.0057978748847173 0.00566967888937267 0.00576791027695125 0.00567635614557107 0.00136235122731314 0.00145623520647506 219999 247089 579 665 0 True 367 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 415 531 0.00573878900027448 0.00571440044377366 0.00572213321126116 0.00582894636453803 0.00177433027532154 0.00171212745500137 217757 249038 579 665 0 True 412 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 459 531 0.00581698160470884 0.00567736576506499 0.00581368734264134 0.00575265125505455 0.00183640260110672 0.00190876904416075 220724 247424 579 665 0 True 456 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 503 529 0.00568149519439638 0.00592580099826128 0.00572213321126116 0.00588998245212482 0.00177904487110676 0.00183052445603132 215583 258251 579 665 0 True 500 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 547 530 0.00560962757313163 0.0057966385407327 0.00558480201419089 0.00573739223315786 0.00162589415357722 0.00175185815931714 212856 252622 579 665 0 True 544 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 591 528 0.00553504547992325 0.00561008839333399 0.0055390249485008 0.00547798886091402 0.00160320905482016 0.00166975605460318 210026 244492 579 665 0 True 589 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 635 528 0.00555668219318264 0.00542936650392289 0.0055390249485008 0.00535591668574044 0.00180646523434294 0.00187442546512496 210847 236616 579 665 0 True 633 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 679 529 0.0055208669759847 0.00559526534349148 0.00547798886091402 0.00558480201419089 0.00169612663181881 0.00173129208269051 209488 243846 579 665 0 True 677 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 283 574 0.0057470905406846 0.00558597225496793 0.00576791027695125 0.00556954299229419 0.00125953315198772 0.00131944491540942 218072 243441 579 665 0 True 279 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 326 574 0.0055367848502949 0.0056541445167049 0.00563057907988098 0.00566109712367437 0.00146072547373473 0.00131395398845446 210092 246412 579 665 0 True 323 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 371 574 0.00565548370111134 0.00550543215443048 0.00561532005798428 0.00560006103608759 0.00137213704793799 0.00119626613608095 214596 239931 579 665 0 True 368 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 415 573 0.005772680368425 0.00572061878202028 0.00578316929884794 0.00572213321126116 0.00165289698790532 0.00158256740211446 219043 249309 579 665 0 True 412 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 459 573 0.00589686087132177 0.00594558036198301 0.00582894636453803 0.005981536583505 0.00190833345003675 0.00171542108159783 223755 259113 579 665 0 True 456 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 503 571 0.00584346747173161 0.00585007953621752 0.00590524147402152 0.00588998245212482 0.00199640748795688 0.00202275353846848 221729 254951 579 665 0 True 500 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 547 571 0.00562038004451998 0.00585682563010869 0.00561532005798428 0.00585946440833143 0.00179376986395403 0.00165633278821399 213264 255245 579 665 0 True 544 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 589 574 0.00571873353280749 0.00578711599323326 0.00573739223315786 0.00585946440833143 0.00172262532117688 0.00143176279087106 216996 252207 579 665 0 False 589 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 635 571 0.00548792435530962 0.0055714016099989 0.00558480201419089 0.0055390249485008 0.00158193496172622 0.00147253542705343 208238 242806 579 665 0 True 633 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 680 572 0.00548196832949156 0.00550426191365344 0.0055390249485008 0.00544747081712062 0.00154509217220228 0.00169069216394051 208012 239880 579 665 0 True 677 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 279 618 0.00589622837300481 0.00591680620640638 0.00592050049591821 0.00587472343022812 0.00134253994368014 0.00134939265322775 223731 257859 579 665 0 False 279 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 323 618 0.00552065614321238 0.00561364500746029 0.00547798886091402 0.00564583810177768 0.0013253291660492 0.00131174494991404 209480 244647 579 665 0 False 323 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 371 617 0.0055732325658098 0.00573723161187473 0.0055542839703975 0.00575265125505455 0.00135726226578267 0.00122493379477129 211475 250033 579 665 0 True 368 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 416 616 0.00553056528351144 0.00565168930566287 0.00558480201419089 0.00564583810177768 0.00151776567981267 0.00150304731447398 209856 246305 579 665 0 True 412 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 456 618 0.00561987931668571 0.00584663765157917 0.00564583810177768 0.00585946440833143 0.00181324065163301 0.00175221989958252 213245 254801 579 665 0 False 456 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 500 617 0.00572611267983871 0.00556396713918006 0.00581368734264134 0.00566109712367437 0.00192349533643483 0.00196613616756744 217276 242482 579 665 0 False 500 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 545 617 0.00566223034982559 0.00560148368173811 0.00570687418936446 0.00558480201419089 0.00173032922486979 0.00184653613129762 214852 244117 579 665 0 False 545 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 589 617 0.0056711116803596 0.0056489128520546 0.00572213321126116 0.00567635614557107 0.00154482107748615 0.00156478191078092 215189 246184 579 665 0 False 589 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 633 617 0.00561956306752723 0.00559336083399159 0.00560006103608759 0.00560006103608759 0.00143630760912852 0.00136112432695745 213233 243763 579 665 0 False 633 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 677 617 0.00590094575628549 0.00573408802390504 0.00584420538643473 0.00578316929884794 0.00157268398635215 0.00150239627000905 223910 249896 579 665 0 False 677 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 279 664 0.00792739130154054 0.688164792847305 0.00730907148851759 0.680292973220417 0.00292272010723418 0.203607891864103 300803 29990755 579 665 9 True 279 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 324 661 0.00626244489852553 0.00582288864757453 0.00619516289005875 0.00584420538643473 0.00135260106754608 0.00122018429700203 237627 253766 579 665 0 False 324 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 368 661 0.00566729033636129 0.00553824478798277 0.00564583810177768 0.00549324788281071 0.00135158770812748 0.00115971710287138 215044 241361 579 665 0 False 368 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 412 661 0.00566025379258509 0.00556841864331233 0.00569161516746777 0.00556954299229419 0.00136907211330876 0.00138928445061255 214777 242676 579 665 0 False 412 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 456 661 0.00561948400523761 0.00553461933616371 0.00563057907988098 0.0055390249485008 0.00142826599500832 0.00152461283873629 213230 241203 579 665 0 False 456 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 501 660 0.00570705866804024 0.00563287366963988 0.00563057907988098 0.00561532005798428 0.00163481270742566 0.00163574481799031 216553 245485 579 665 0 False 501 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 545 660 0.00562757471287541 0.00560081825070802 0.00569161516746777 0.00567635614557107 0.00159641085467223 0.00170511580023098 213537 244088 579 665 0 False 545 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 589 660 0.00567061095252534 0.00555474288834928 0.00566109712367437 0.00556954299229419 0.00134275378431133 0.00120346280244701 215170 242080 579 665 0 False 589 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 633 660 0.0060225172036248 0.00589197874521506 0.00610360875867857 0.0059510185397116 0.00157106887203822 0.00138480535887514 228523 256777 579 665 0 False 633 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 675 663 0.00828050984108084 0.697105776572353 0.00744640268558785 0.694254978255894 0.00348018768416939 0.217505684454651 314202 30380410 579 665 11 True 677 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H7_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H7_3.csv new file mode 100755 index 0000000..5c27d4a --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H7_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 278 274 0.00102114217863782 0.0702948490475445 0.000839246204318303 0.0694743266956588 0.000759386108070163 0.0233438647859054 38747 3063504 579 665 0 True 278 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 322 273 0.00100121848165353 0.000903815960133798 0.000900282291905089 0.00080872816052491 0.000721499350349131 0.000633535777005151 37991 39389 579 665 0 False 322 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 367 274 0.000944715298671635 0.000852279474148865 0.000823987182421607 0.000732433051041428 0.000696681541682058 0.000641591717584091 35847 37143 579 665 0 True 367 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 412 274 0.000815843766590727 0.000931029794674372 0.000610360875867857 0.000717174029144732 0.000727807050028168 0.000742380866356665 30957 40575 579 665 0 True 411 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 456 274 0.000896223761037919 0.000838328368414743 0.000656137941557946 0.000534065766384375 0.000871779628936694 0.000893883038245843 34007 36535 579 665 0 True 455 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 499 272 0.000822484998918823 0.000899364456001528 0.000610360875867857 0.000701915007248035 0.00079950594113592 0.000784834119816914 31209 39195 579 665 0 True 499 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 544 272 0.000860382189743434 0.000852531879022344 0.000671396963454643 0.000671396963454643 0.000763893228754475 0.000746255843979983 32647 37154 579 665 0 True 544 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 588 272 0.000904657071930739 0.0009838283050267 0.000549324788281071 0.000610360875867857 0.000933716623595327 0.00105064187524927 34327 42876 579 665 0 True 588 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 632 273 0.0010572472908977 0.000935114164445217 0.000717174029144732 0.000518806744487678 0.00103189096327296 0.000996934581377887 40117 40753 579 665 0 False 632 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 674 272 0.00110199654682273 0.0695479141892268 0.000778210116731518 0.0693522545204852 0.00100031019493507 0.0223543358877423 41815 3030952 579 665 0 True 676 272 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 278 317 0.000894695223438596 0.000884059542309654 0.000747692072938125 0.000747692072938125 0.000713897339501664 0.000694468811678591 33949 38528 579 665 0 False 278 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 323 316 0.00089648730200332 0.000904963255013248 0.000793469138628214 0.000793469138628214 0.00065112659867499 0.000669048049674689 34017 39439 579 665 0 False 323 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 367 318 0.000903313013007196 0.0008227481039518 0.000762951094834821 0.000732433051041428 0.000725440033543741 0.000634303866545073 34276 35856 579 665 0 True 367 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 411 318 0.00084198703035847 0.000921094221018327 0.000686655985351339 0.000671396963454643 0.000715397221618397 0.000779143799706178 31949 40142 579 665 0 True 411 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 455 318 0.000933014079807847 0.000942227392697812 0.000671396963454643 0.000701915007248035 0.000870514972753473 0.000874196420658067 35403 41063 579 665 0 True 455 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 499 316 0.00080443244278888 0.000880319361002644 0.000549324788281071 0.000671396963454643 0.000824460715429186 0.000818068790408215 30524 38365 579 665 0 True 500 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 544 316 0.000890478567992185 0.000953172585847773 0.00064087891966125 0.00080872816052491 0.000835221626394028 0.000730214812613092 33789 41540 579 665 0 False 544 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 588 316 0.00091343298607858 0.000875408938918594 0.000564583810177768 0.000457770656900893 0.000974280028689145 0.00105520276484409 34660 38151 579 665 0 True 588 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 632 316 0.000931749083173924 0.00100941298083845 0.000579842832074464 0.000625619897764553 0.000971817899022454 0.00106147840894775 35355 43991 579 665 0 False 632 316 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 676 315 0.000983060509137426 0.000907234898874561 0.000534065766384375 0.000442511635004196 0.000989281342444396 0.00103189685695049 37302 39538 579 665 0 False 676 315 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 279 356 0.000908662894604829 0.000841976766131396 0.000762951094834821 0.000671396963454643 0.000719382228126909 0.000715761393243777 34479 36694 579 665 0 True 278 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 323 356 0.000877433290204854 0.000948858757101038 0.00080872816052491 0.000823987182421607 0.000639012825813298 0.000737616168546186 33294 41352 579 665 0 True 323 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 367 356 0.00095109299003433 0.000871141001967037 0.000793469138628214 0.000717174029144732 0.000755731756043434 0.000696176672370112 36089 37965 579 665 0 True 367 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 411 356 0.000886999827248897 0.000954296934829635 0.000717174029144732 0.000762951094834821 0.00075545907453012 0.000780540404201999 33657 41589 579 665 0 True 411 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 456 356 0.000922050775647181 0.000902806340639881 0.000595101853971161 0.000549324788281071 0.000877858586451955 0.00090094530176103 34987 39345 579 665 0 True 455 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 500 359 0.000832631326086747 0.000801683769965082 0.000518806744487678 0.000503547722590982 0.000864073766721069 0.000812504609382835 31594 34938 579 665 0 False 500 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 543 354 0.00080456421327158 0.000836332075324498 0.000549324788281071 0.000564583810177768 0.000778495278925918 0.000815379739720157 30529 36448 579 665 0 True 544 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 588 354 0.000869395290760135 0.000905536902452974 0.000549324788281071 0.000289921416037232 0.000929495684534941 0.00113058691530022 32989 39464 579 665 0 True 588 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 632 354 0.000945769462533237 0.000916069069446333 0.000549324788281071 0.000473029678797589 0.00101952432685432 0.000982515993288657 35887 39923 579 665 0 True 632 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 676 355 0.00098427279757827 0.000859668053172529 0.000549324788281071 0.000442511635004196 0.00102538144246215 0.000968727914078121 37348 37465 579 665 0 True 677 359 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 279 403 0.000999452757185346 0.000829104117583958 0.000839246204318303 0.000625619897764553 0.000807654823996049 0.000774188516956328 37924 36133 579 665 0 False 279 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 323 400 0.000921444631426759 0.000985434517857932 0.000778210116731518 0.000885023270008392 0.000724120950020766 0.00068453120840262 34964 42946 579 665 0 True 323 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 367 399 0.00091738610055959 0.000909758947609353 0.000762951094834821 0.000823987182421607 0.000728799122840541 0.000673992785978897 34810 39648 579 665 0 True 367 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 412 400 0.000903049472041795 0.000848493401046677 0.000686655985351339 0.000656137941557946 0.000782716784369177 0.000731667495125541 34266 36978 579 665 0 True 411 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 456 399 0.000953807461977957 0.000880066956129165 0.000671396963454643 0.000610360875867857 0.000888869588200175 0.000824939278168525 36192 38354 579 665 0 True 456 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 500 399 0.000839430682994084 0.000822197402409663 0.000549324788281071 0.000564583810177768 0.000854528501123425 0.000846529306301899 31852 35832 579 665 0 True 500 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 545 398 0.000894985118500536 0.000777292280827957 0.000686655985351339 0.000549324788281071 0.000799359518035217 0.000751289808435656 33960 33875 579 665 0 True 544 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 588 398 0.000839878702635265 0.000906730089127603 0.000488288700694286 0.000442511635004196 0.000895617593552935 0.00104876404002619 31869 39516 579 665 0 True 588 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 632 398 0.000935016991144892 0.000921254842301451 0.000473029678797589 0.000564583810177768 0.00101669801702461 0.000985227300696186 35479 40149 579 665 0 True 632 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 677 399 0.000827096965813334 0.000895463653411395 0.000457770656900893 0.000488288700694286 0.000885389868541229 0.000950092511105748 31384 39025 579 665 0 True 677 402 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 279 443 0.000855295849111202 0.000848172158480431 0.000701915007248035 0.00064087891966125 0.00078685723368957 0.000817225123013745 32454 36964 579 665 0 True 279 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 325 444 0.000865284051699885 0.000881466655882095 0.000778210116731518 0.000747692072938125 0.000688137562250058 0.000734762864990202 32833 38415 579 665 0 True 323 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 367 446 0.000882783171802487 0.000872380080436844 0.000762951094834821 0.000701915007248035 0.000734739389797912 0.000713260463177021 33497 38019 579 665 0 False 367 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 412 444 0.000845281292425978 0.000895968463158354 0.000656137941557946 0.000579842832074464 0.000835074627424773 0.000901009237743985 32074 39047 579 665 0 True 411 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 456 443 0.000894220849700874 0.000923434702572407 0.000564583810177768 0.000564583810177768 0.000965161665318141 0.000934895829739645 33931 40244 579 665 0 True 456 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 501 442 0.000944030092161593 0.000908060951187766 0.000595101853971161 0.000564583810177768 0.000959439076694378 0.000942975173411666 35821 39574 579 665 0 True 500 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 545 442 0.000908531124122129 0.000872058837870598 0.000610360875867857 0.000579842832074464 0.000929977118182912 0.000854460759679418 34474 38005 579 665 0 True 544 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 588 441 0.000873453821627305 0.000852738392100645 0.000457770656900893 0.000411993591210803 0.000962238899094998 0.000977732632791517 33143 37163 579 665 0 True 588 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 633 441 0.000964454516980142 0.000915174179440361 0.000610360875867857 0.000534065766384375 0.000967601815864586 0.000967609846792693 36596 39884 579 665 0 True 633 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 677 443 0.000868841854732794 0.000922172678205011 0.000457770656900893 0.000473029678797589 0.000965033379405985 0.000980016351032163 32968 40189 579 665 0 True 677 445 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 282 488 0.000984088318902489 0.000879791605358097 0.000839246204318303 0.000747692072938125 0.000783449787695474 0.000788605550397133 37341 38342 579 665 0 True 279 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 325 488 0.000927769614596375 0.00101666388447658 0.000747692072938125 0.000900282291905089 0.000803313200242871 0.000839377301260275 35204 44307 579 665 0 True 323 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 369 488 0.000855322203207742 0.00090959832632623 0.000656137941557946 0.000747692072938125 0.00075505442595627 0.000793143885863572 32455 39641 579 665 0 True 367 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 414 488 0.000885313165070333 0.000928804042608237 0.000625619897764553 0.000610360875867857 0.000865261250326049 0.000909579222874314 33593 40478 579 665 0 True 412 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 458 486 0.000857008865386306 0.000916757446374003 0.000518806744487678 0.000518806744487678 0.000930098968841203 0.00102605025754544 32519 39953 579 665 0 True 456 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 501 486 0.000915066940064064 0.000924421376168735 0.000549324788281071 0.000610360875867857 0.000941424441338901 0.000948884476555599 34722 40287 579 665 0 True 500 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 545 485 0.000784561453997673 0.000802808118946944 0.000473029678797589 0.000503547722590982 0.000850100430681705 0.000830126960499818 29770 34987 579 665 0 True 544 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 590 486 0.000892613249811931 0.000930180796463578 0.000579842832074464 0.000595101853971161 0.000941557130087029 0.00092569514927077 33870 40538 579 665 0 True 588 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 633 486 0.000918835575869293 0.000928620475427525 0.000549324788281071 0.000579842832074464 0.000961847201295492 0.000934284680413074 34865 40470 579 665 0 True 633 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 678 486 0.00096777513314419 0.000935779595475298 0.000610360875867857 0.000488288700694286 0.000972646296963558 0.00100319162897011 36722 40782 579 665 0 True 677 488 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 282 532 0.000941658223472988 0.000885344512574639 0.00080872816052491 0.000717174029144732 0.000792435798857088 0.0007654347787731 35731 38584 579 665 0 True 279 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 326 532 0.000898490213340365 0.000907234898874561 0.000762951094834821 0.000793469138628214 0.00072154474664883 0.000750062966473742 34093 39538 579 665 0 True 323 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 370 531 0.00095093486545509 0.000829081171686369 0.000839246204318303 0.00064087891966125 0.000747537398586688 0.000781267811892538 36083 36132 579 665 0 True 367 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 415 531 0.000869869664497856 0.000879608038177384 0.000579842832074464 0.000579842832074464 0.000853459828561091 0.000895728898396423 33007 38334 579 665 0 True 412 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 459 531 0.000922419732998742 0.000839269150215892 0.000549324788281071 0.0004272526131075 0.000989261396616914 0.000956771257539885 35001 36576 579 665 0 True 456 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 503 529 0.000818452822148193 0.00091168640300683 0.000488288700694286 0.000518806744487678 0.000874452083997295 0.000973370026839634 31056 39732 579 665 0 True 500 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 547 530 0.000961529212264195 0.000830274358360998 0.000671396963454643 0.000442511635004196 0.00095571727127058 0.000930546411055528 36485 36184 579 665 0 True 544 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 591 528 0.000876194647667471 0.00092359532385553 0.000625619897764553 0.000656137941557946 0.000842986899605614 0.000894896205461039 33247 40251 579 665 0 True 589 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 635 528 0.0010156078183644 0.00076671422203942 0.000686655985351339 0.000305180437933928 0.00096848836145326 0.000940336207738095 38537 33414 579 665 0 True 633 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 679 529 0.000937599692605818 0.000866138796292631 0.000579842832074464 0.000564583810177768 0.000991515264111714 0.000901124179967956 35577 37747 579 665 0 True 677 531 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 283 574 0.000860197711067653 0.000927587910036019 0.000717174029144732 0.000823987182421607 0.000658743179366169 0.000712317349113969 32640 40425 579 665 0 True 279 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 326 574 0.000920232342985916 0.000954251043034457 0.000732433051041428 0.00080872816052491 0.000784332295696177 0.000767747622381615 34918 41587 579 665 0 True 323 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 371 574 0.000857509593220567 0.000892067660568221 0.000686655985351339 0.000732433051041428 0.000683194450343898 0.000677884154223263 32538 38877 579 665 0 True 368 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 415 573 0.000813366481515961 0.000970817981093728 0.000564583810177768 0.000610360875867857 0.000809492441336467 0.000950357549341393 30863 42309 579 665 0 True 412 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 459 573 0.000817266887803891 0.000856753924178723 0.000457770656900893 0.000503547722590982 0.000909395708710178 0.000884577207618089 31011 37338 579 665 0 True 456 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 503 571 0.000819138028658235 0.000877772366370263 0.000381475547417411 0.000473029678797589 0.000973201438620833 0.00106069540848985 31082 38254 579 665 0 True 500 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 547 571 0.000908636540508289 0.000856203222636587 0.000518806744487678 0.000518806744487678 0.00098295719907004 0.000919367152346859 34478 37314 579 665 0 True 544 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 589 574 0.000904683426027279 0.000928092719782978 0.000610360875867857 0.00064087891966125 0.000876258212818686 0.000844613413959287 34328 40447 579 665 0 False 589 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 635 571 0.000979845309359539 0.000905238605784317 0.000686655985351339 0.000717174029144732 0.000889433283142079 0.000797039307795301 37180 39451 579 665 0 True 633 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 680 572 0.000921971713357561 0.000897987702146187 0.000701915007248035 0.000564583810177768 0.000804123515427046 0.000895512849769554 34984 39135 579 665 0 True 677 574 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 279 618 0.000924528060721947 0.00101065205930826 0.000762951094834821 0.000885023270008392 0.000715880718638541 0.00078577070279543 35081 44045 579 665 0 False 279 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 323 618 0.000881228280106623 0.000944820279125371 0.000747692072938125 0.00080872816052491 0.000719470221023538 0.000745721893429117 33438 41176 579 665 0 False 323 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 371 617 0.000897831360926863 0.000896588002393257 0.000793469138628214 0.000778210116731518 0.000676403562048923 0.000697097801549701 34068 39074 579 665 0 True 368 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 416 616 0.000912457884506598 0.000863729477045785 0.000732433051041428 0.000625619897764553 0.000795446111048443 0.000786707691997533 34623 37642 579 665 0 True 412 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 456 618 0.000882229735775146 0.00090539922706744 0.000457770656900893 0.0004272526131075 0.00100584496439512 0.00100066050360947 33476 39458 579 665 0 False 456 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 500 617 0.000858168445634068 0.000901246019603828 0.000473029678797589 0.0004272526131075 0.000961614635542649 0.00105983804979389 32563 39277 579 665 0 False 500 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 545 617 0.000856877094903605 0.000900557642676157 0.000518806744487678 0.000411993591210803 0.000917006310213739 0.00106710401023268 32514 39247 579 665 0 False 545 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 589 617 0.000895011472597076 0.000940254045505157 0.00064087891966125 0.000717174029144732 0.000826949357441137 0.000829659672990749 33961 40977 579 665 0 False 589 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 633 617 0.000993233190401891 0.000868571061437067 0.000823987182421607 0.000671396963454643 0.000758170810763963 0.000754060983839157 37688 37853 579 665 0 False 633 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 677 617 0.00104214639358025 0.000844363139480654 0.000869764248111696 0.000595101853971161 0.000861240135663713 0.000790871607684898 39544 36798 579 665 0 False 677 617 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 279 664 0.00110070519609227 0.0696332958741555 0.000976577401388571 0.0677500572213321 0.000757790240671005 0.0225265220201247 41766 3034673 579 665 0 True 279 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 324 661 0.000927954093272155 0.00093667448548127 0.000793469138628214 0.000823987182421607 0.000685150645188594 0.000679908982714975 35211 40821 579 665 0 False 324 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 368 661 0.00085055211173399 0.000801752607657849 0.000747692072938125 0.000701915007248035 0.000616604882448728 0.000574869729363487 32274 34941 579 665 0 False 368 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 412 661 0.000781109067350925 0.000839636284577316 0.00064087891966125 0.000701915007248035 0.000630245649880619 0.000683823096241292 29639 36592 579 665 0 False 412 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 456 661 0.000938074066343539 0.000908382193754012 0.000747692072938125 0.000686655985351339 0.000827926593766331 0.000804772358189869 35595 39588 579 665 0 False 456 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 501 660 0.000845439417005218 0.000842320954595232 0.000534065766384375 0.000564583810177768 0.000844434530740604 0.000798312488264157 32080 36709 579 665 0 False 501 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 545 660 0.000858142091537528 0.000897092812140215 0.000564583810177768 0.000610360875867857 0.000823038159000247 0.000890852103652737 32562 39096 579 665 0 False 545 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 589 660 0.000919942447923976 0.000953792125082677 0.000701915007248035 0.000839246204318303 0.000734642045423105 0.000672988310184214 34907 41567 579 665 0 False 589 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 633 660 0.000914539858133263 0.000864440799871044 0.000778210116731518 0.000732433051041428 0.000713900474122991 0.000622332814574224 34702 37673 579 665 0 False 633 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 675 663 0.00117789634485811 0.0709940793847746 0.00103761348897536 0.0689250019073777 0.000841072074790496 0.024803165543074 44695 3093977 579 665 0 True 677 660 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H8_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H8_1.csv new file mode 100755 index 0000000..6b94b58 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H8_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 247 244 0.00947192744752135 0.0361845332030006 0.00941481651026169 0.037247272449836 0.00167195062380848 0.0086317686424819 386102 1576950 622 665 0 True 248 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 293 243 0.00908944608033262 0.00914832285566285 0.00912489509422446 0.00907911802853437 0.00146484821987604 0.00130575283046253 370511 398691 622 665 0 False 293 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 336 243 0.00943547261385819 0.0513531712090939 0.0093842984664683 0.0526588845654994 0.00149720870161899 0.00793454680371353 384616 2238011 622 665 0 True 337 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 380 243 0.00943029632186429 0.0698627548500457 0.0093842984664683 0.0695201037613489 0.00142009830499917 0.00912319093247156 384405 3044673 622 665 0 True 381 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 423 243 0.00949106255536609 0.0573835137167708 0.00943007553215839 0.057801174944686 0.00183139293285095 0.0118222490626849 386882 2500818 622 665 0 True 426 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 468 243 0.0092506961622088 0.0537593698138686 0.00921644922560464 0.0557869840543221 0.00164954922122176 0.0148779864965762 377084 2342875 622 665 0 True 470 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 513 242 0.00920690620387182 0.0660439608978959 0.00917067215991455 0.0663309681849393 0.00171054671660978 0.0182025223837514 375299 2878247 622 665 0 True 514 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 556 242 0.00927652855779919 0.0563031749664847 0.0093690394445716 0.0556954299229419 0.00158967721536794 0.0149469084163831 378137 2453736 622 665 0 True 558 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 603 243 0.00927172024864846 0.00900438324008694 0.00930800335698482 0.00914015411612116 0.00190212377347972 0.0020003606636257 377941 392418 622 665 0 False 603 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 644 242 0.0091693228894896 0.037167374834431 0.00917067215991455 0.0376440070191501 0.00186948155897042 0.00799215236791879 373767 1619783 622 665 0 True 647 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 249 287 0.00906766149601708 0.00897079044601662 0.00907911802853437 0.00906385900663768 0.00153240071267688 0.00156156796184244 369623 390954 622 665 0 False 249 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 293 287 0.00917636362788888 0.00908166502316675 0.00918593118181125 0.00904859998474098 0.00140490148445405 0.00128574619700372 374054 395786 622 665 0 False 293 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 337 287 0.00946201644294536 0.0983371911123655 0.00952162966353857 0.096757457846952 0.00137524845642726 0.0290839345335921 385698 4285611 622 665 0 True 337 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 380 287 0.00944521189310736 0.0419002186170393 0.00941481651026169 0.0423285267414359 0.00142904857492317 0.00622322458635723 385013 1826044 622 665 0 True 381 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 424 287 0.00949111161974517 0.065218596961619 0.00943007553215839 0.0650949874113069 0.00183252516543357 0.0123824453179566 386884 2842277 622 665 0 True 426 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 469 286 0.00940713793493425 0.0358681092752481 0.0093842984664683 0.0370336461432822 0.00181146871227883 0.00757387551812808 383461 1563160 622 665 0 True 470 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 514 286 0.00920967834129035 0.0333278607367584 0.00917067215991455 0.0350957503624018 0.00166537525791507 0.00602209412274075 375412 1452454 622 665 0 False 514 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 556 285 0.00921200889929708 0.0436957580492775 0.00920119020370794 0.0445410849164569 0.00175597131209847 0.0110368168716085 375507 1904295 622 665 0 True 558 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 603 286 0.00894051115760779 0.00907512544235388 0.00900282291905089 0.00921644922560464 0.00198480248255143 0.00194198464246558 364440 395501 622 665 0 False 603 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 647 286 0.00904626942673425 0.00898850467895534 0.00906385900663768 0.00891126878767071 0.00190854006058168 0.00203087856549275 368751 391726 622 665 0 False 647 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 248 326 0.00917528421154892 0.0414926535840632 0.00915541313801785 0.0415503166247044 0.00163462512043939 0.00868521525321819 374010 1808282 622 665 0 True 249 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 293 326 0.00937252301548693 0.0538026228308239 0.0093690394445716 0.0538033112077516 0.00142151822675651 0.016420990056742 382050 2344760 622 665 0 True 293 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 337 326 0.00938500989996509 0.0344913324740095 0.00935378042267491 0.0344090943770504 0.00154707277602913 0.00664064978625091 382559 1503159 622 665 0 True 337 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 381 326 0.00936813175355846 0.0298395336016856 0.00935378042267491 0.0303654535744259 0.00139727887325175 0.0044451896063221 381871 1300430 622 665 0 True 381 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 425 325 0.00965093883462777 0.0577635207267425 0.00947585259784848 0.0572365911345083 0.00213385291554065 0.00872488537750003 393399 2517379 622 665 0 True 426 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 469 325 0.00947833034899248 0.0273276232467183 0.00946059357595178 0.0279850461585412 0.00178995502523347 0.00425902142150859 386363 1190959 622 665 0 True 470 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 514 329 0.00953313526043495 0.0258410044337211 0.00952162966353857 0.0251468680857557 0.00176432524447503 0.0136053297693421 388597 1126171 622 665 0 False 514 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 557 323 0.00948475778265314 0.0418412247143379 0.0093690394445716 0.0436408026245518 0.00202901743125479 0.00840534475068965 386625 1823473 622 665 0 True 559 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 600 324 0.00920494362870825 0.0470769966803023 0.00932326237888151 0.0486762798504616 0.00214000019905237 0.0119422825185816 375219 2051652 622 665 0 True 603 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 645 323 0.00910848305941917 0.0518938453939839 0.00921644922560464 0.0528572518501564 0.00194996718060219 0.0147211829317069 371287 2261574 622 665 0 True 647 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 249 370 0.00919245674423009 0.0350010755889495 0.00920119020370794 0.0361486228732738 0.00154817218774762 0.00844450186932688 374710 1525374 622 665 0 True 249 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 293 371 0.00918499895860855 0.0268196469658926 0.00909437705043107 0.0272068360418097 0.00153062611607923 0.00318945925992419 374406 1168821 622 665 0 True 293 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 337 369 0.0096515030749873 0.0686609864097185 0.00962844281681544 0.0679789425497826 0.00161810553250091 0.0158522111670297 393422 2992299 622 665 0 True 337 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 381 369 0.00946002933559226 0.0523864938152201 0.00947585259784848 0.0522621499961852 0.00147306707032109 0.0116729688611628 385617 2283044 622 665 0 True 382 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 424 369 0.00942853000421708 0.0374424273088306 0.00950637064164187 0.0384069581139849 0.00164261816784627 0.00802333209283494 384333 1631770 622 665 0 True 426 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 469 368 0.0097543665457475 0.045703661763702 0.00975051499198901 0.0472266727702754 0.00193993256004615 0.0104821658013276 397615 1991801 622 665 0 True 470 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 513 368 0.0094977353109222 0.0354794746077829 0.00949111161974517 0.0368200198367285 0.00174706579985367 0.00614822004398873 387154 1546223 622 665 0 True 514 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 557 368 0.00948885465830708 0.0450833882600757 0.00956740672922866 0.0448004882887007 0.00188284601229561 0.00853698697193418 386792 1964769 622 665 0 True 559 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 601 367 0.00937105108411426 0.0354543259040253 0.00935378042267491 0.036942092011902 0.00213980898334117 0.00725929794724648 381990 1545127 622 665 0 True 603 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 645 368 0.00927981587119815 0.0742566188875714 0.00932326237888151 0.0747844663157092 0.00190581139960165 0.014176490806099 378271 3236161 622 665 0 True 647 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 249 413 0.00919380601465504 0.0350123420246657 0.00915541313801785 0.0358434424353399 0.001654249171728 0.00598279360238469 374765 1525865 622 665 0 True 249 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 293 414 0.00956142087497979 0.043137966224786 0.00956740672922866 0.0431219958800641 0.00162615370054803 0.0062612111397535 389750 1879986 622 665 0 True 293 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 337 414 0.00955111735537109 0.0291396378334254 0.00947585259784848 0.0298008697642481 0.00142842214535772 0.00373993801739989 389330 1269928 622 665 0 True 337 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 381 413 0.00959552061844668 0.0442559591930157 0.00959792477302205 0.0442359044785229 0.00156245841842401 0.00895224821750375 391140 1928709 622 665 0 True 382 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 425 414 0.00997383151341285 0.0816851237730398 0.0098268101014725 0.0810711833371481 0.00191173557873462 0.0128478640518993 406561 3559901 622 665 0 True 426 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 470 412 0.00962498377808966 0.0528298085566399 0.00965896086060884 0.0520790417334249 0.00170865656490926 0.0144288504767469 392341 2302364 622 665 0 True 470 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 513 412 0.00958870066975331 0.0437971100789282 0.00947585259784848 0.0445868619821469 0.0018050474280889 0.00847674607188826 390862 1908712 622 665 0 True 515 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 557 411 0.00952354317432304 0.0285760177509464 0.00962844281681544 0.029404135194934 0.00181827786859807 0.00459585237072127 388206 1245365 622 665 0 True 559 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 602 412 0.0092753755448906 0.0338456349158545 0.00923170824750134 0.034378576333257 0.00192313474752141 0.00480494688277839 378090 1475019 622 665 0 True 603 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 645 412 0.00931627070486132 0.0590525524156007 0.00930800335698482 0.0592507820248722 0.00188636750472887 0.00926693386053007 379757 2573556 622 665 0 True 647 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 250 459 0.00938476457806964 0.0504969450405597 0.00946059357595178 0.0506599526970321 0.00156388159050211 0.0132230510832913 382549 2200696 622 665 0 True 249 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 295 458 0.00939658909343011 0.0467341390785272 0.00944533455405508 0.0468299382009613 0.00156722254268503 0.0055148349562796 383031 2036710 622 665 0 True 293 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 338 456 0.00939766850977007 0.0563923886163107 0.00946059357595178 0.0550545510032807 0.00151933076525945 0.0119484177394412 383075 2457624 622 665 0 True 338 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 383 457 0.00960030439540787 0.0799181978750952 0.00962844281681544 0.076600289921416 0.00155690838031384 0.0192498738561089 391335 3482897 622 665 0 True 382 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 427 457 0.00974605013349191 0.0825711337166446 0.00976577401388571 0.0780346379797055 0.00187883108049796 0.0252504443598752 397276 3598514 622 665 0 True 426 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 470 456 0.00978527710457361 0.0360567474993274 0.00978103303578241 0.0372320134279393 0.00190198469688162 0.00544284743262558 398875 1571381 622 665 0 True 470 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 515 456 0.00973861688005992 0.0341132758653328 0.0098115510795758 0.0349736781872282 0.00171092845320218 0.00515049467584808 396973 1486683 622 665 0 True 515 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 559 456 0.00961526903103003 0.0909161436436135 0.00956740672922866 0.0889448386358434 0.00185566723320594 0.0165501874836278 391945 3962196 622 665 0 True 559 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 603 455 0.0093851816252919 0.0508772044554049 0.0093842984664683 0.0531471732661936 0.00188804375600279 0.0120111975619187 382566 2217268 622 665 0 True 603 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 647 456 0.00936891678362388 0.0664495525836794 0.00943007553215839 0.0648050659952697 0.00187960996649002 0.0111555716226007 381903 2895923 622 665 0 True 647 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 250 502 0.00895174690041918 0.04467401050119 0.00900282291905089 0.0469062333104448 0.00158730303257574 0.0100996431149888 364898 1946928 622 665 0 True 249 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 295 502 0.00943961855389121 0.0853361832138139 0.00935378042267491 0.0816510261692226 0.0016524938702763 0.0191746116038194 384785 3719017 622 665 0 True 293 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 338 502 0.00946410167905665 0.0471842228597357 0.00943007553215839 0.048706797894255 0.00161908204880823 0.00998723918436331 385783 2056325 622 665 0 True 338 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 383 501 0.00965270515227498 0.0487194181379289 0.00959792477302205 0.0491340505073625 0.00160382499598481 0.00617957774772365 393471 2123230 622 665 0 True 382 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 428 500 0.00966644317841992 0.0475380027087632 0.00973525597009232 0.0475318532082094 0.00188032564801846 0.00659713400206372 394031 2071743 622 665 0 True 426 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 472 499 0.0098113302898699 0.0523719231702511 0.00973525597009232 0.0527809567406729 0.00184812321267426 0.00981702703655861 399937 2282409 622 665 0 True 470 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 515 498 0.00954243296027233 0.0637560025033974 0.00959792477302205 0.0622873273823148 0.00173562844311424 0.0149053703149184 388976 2778536 622 665 0 True 515 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 559 497 0.00953168786125182 0.0471485649348824 0.00955214770733196 0.0487373159380484 0.0018614940682158 0.0107200728399545 388538 2054771 622 665 0 True 559 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 603 497 0.00934276546956941 0.0407500325544922 0.0093842984664683 0.0410925459678035 0.00181294723543603 0.00651975394867849 380837 1775918 622 665 0 True 603 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 648 497 0.00940453752284254 0.057090999414306 0.00927748531319142 0.0576333257038224 0.00247044514030136 0.0123072995997959 383355 2488070 622 665 0 True 648 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 251 543 0.00900046782885462 0.0360880457036388 0.00900282291905089 0.0368352788586252 0.0014415849596466 0.00688824150300166 366884 1572745 622 665 0 True 249 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 295 543 0.00917638816007843 0.0438652364488699 0.00918593118181125 0.0447699702449073 0.00148707993713795 0.00805476470418962 374055 1911681 622 665 0 True 293 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 339 543 0.00956738219703911 0.0373125764743743 0.00952162966353857 0.0377660791943236 0.00153504871149611 0.00528169332942642 389993 1626111 622 665 0 True 338 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 383 543 0.00967672216583907 0.0428334282719846 0.00964370183871214 0.0424658579385061 0.00159112131395917 0.00662380474120921 394450 1866714 622 665 0 True 382 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 428 542 0.00976256029705538 0.0745620058385836 0.00991836423285267 0.0715800717174029 0.00188011898732396 0.0155633311096893 397949 3249470 622 665 0 True 426 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 472 540 0.00957192065210485 0.0523079270618753 0.00956740672922866 0.0522468909742886 0.00197859834233946 0.00834664195906768 390178 2279620 622 665 0 True 471 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 516 540 0.00943969215045984 0.0455735585243723 0.00947585259784848 0.0460975051499199 0.00199378292977816 0.00584186628045547 384788 1986131 622 665 0 True 515 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 559 545 0.00945249795340209 0.0281341027092795 0.00935378042267491 0.0318608377203021 0.00224235206185012 0.0103517932755018 385310 1226106 622 665 0 False 559 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 604 538 0.00931921456760667 0.0408038406843385 0.0093690394445716 0.0413366903181506 0.00183346777306363 0.00641747867480307 379877 1778263 622 665 0 True 603 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 648 539 0.00926759884080498 0.0445121271936995 0.00933852140077821 0.0443884946974899 0.00191120248338271 0.00678266700098592 377773 1939873 622 665 0 True 648 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 249 588 0.00862654819581692 0.00869537083725565 0.00859082932784009 0.00869764248111696 0.00130650952302836 0.00119736047104456 351642 378951 622 665 0 False 249 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 294 588 0.00866037808519882 0.00844252999172227 0.00865186541542687 0.00842298008697642 0.00140533865566708 0.00147240955329914 353021 367932 622 665 0 False 294 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 339 585 0.00921595858181375 0.0580897425527655 0.00923170824750134 0.0571602960250248 0.00169116001549923 0.00834285437292315 375668 2531596 622 665 0 True 338 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 383 584 0.00917655988540524 0.0631874490529368 0.00915541313801785 0.0613870450904097 0.0014184686578583 0.0153063488864521 374062 2753758 622 665 0 True 382 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 426 588 0.00912268719716545 0.00928044533398041 0.00926222629129473 0.00929274433508812 0.00185627973441244 0.00191940467820093 371866 404449 622 665 0 False 426 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 471 588 0.00932559293688824 0.00912845170835076 0.0093690394445716 0.00907911802853437 0.00198367308154679 0.00179946331766043 380137 397825 622 665 0 False 471 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 515 588 0.00912445351481266 0.00870402144064671 0.00910963607232776 0.00880445563439384 0.00197275214279904 0.00205226487475754 371938 379328 622 665 0 False 515 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 559 588 0.00893948080564692 0.00884509281902398 0.0089570458533608 0.00892652780956741 0.00180924425342094 0.00176499564202383 364398 385476 622 665 0 False 559 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 603 588 0.00884466389305732 0.0089188179879775 0.00885023270008392 0.00900282291905089 0.00159525837308995 0.00169535680313795 360533 388689 622 665 0 False 603 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 648 588 0.00875916921249464 0.00873424118777144 0.00880445563439384 0.00878919661249714 0.00160535619240209 0.00160148476876971 357048 380645 622 665 0 False 648 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 250 635 0.00860778107081536 0.0344088419721769 0.00862134737163348 0.0348668650339513 0.00134760523380521 0.00693153107638935 350877 1499564 622 665 0 True 249 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 294 631 0.00878777374550356 0.00857036158719068 0.00878919661249714 0.0085297932402533 0.0013462883660083 0.00134443896313738 358214 373503 622 665 0 False 294 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 338 631 0.00859360146525862 0.00875034920787893 0.00863660639353018 0.00865186541542687 0.00137083313692651 0.00134018819323967 350299 381347 622 665 0 False 338 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 382 631 0.00886715991086965 0.00881689231088708 0.00883497367818723 0.00878919661249714 0.0013671159587014 0.00139702956973623 361450 384247 622 665 0 False 382 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 426 631 0.00908336209732557 0.00901581029708627 0.00909437705043107 0.00885023270008392 0.00165512258858266 0.00181116977318457 370263 392916 622 665 0 False 426 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 471 631 0.00900868611235203 0.00889022739958158 0.00906385900663768 0.0089570458533608 0.00182950075941045 0.00192905948766869 367219 387443 622 665 0 False 471 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 515 631 0.0087799725092284 0.0088795346113051 0.00880445563439384 0.00892652780956741 0.00185360800884112 0.00182542928382436 357896 386977 622 665 0 False 515 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 559 631 0.00871447156314451 0.00855856739582993 0.00869764248111696 0.0085145342183566 0.00169331879263742 0.00173876903400758 355226 372989 622 665 0 False 559 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 604 631 0.00880195335106029 0.00889660635911133 0.00885023270008392 0.00889600976577401 0.00139882737013252 0.00132898392350497 358792 387721 622 665 0 False 604 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 647 632 0.0089371011832611 0.0361773052452601 0.00892652780956741 0.0366369115739681 0.00146121063367921 0.00709201059275485 364301 1576635 622 665 0 True 648 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H8_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H8_2.csv new file mode 100755 index 0000000..0c9c344 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H8_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 247 244 0.00870694018095434 0.621964616278623 0.0072480354009308 0.62743572137026 0.00551495082247017 0.212514707136407 354919 27105700 622 665 2 True 248 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 293 243 0.00600219268710149 0.00573803471829035 0.00593575951781491 0.00575265125505455 0.00160066016760022 0.00134142257706492 244666 250068 622 665 0 False 293 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 336 243 0.00537142102953259 0.00535199293725272 0.00540169375143053 0.00532539864194705 0.0013046845814585 0.00120428552841318 218954 233244 622 665 0 True 337 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 380 243 0.00531801445289415 0.00536119424218592 0.00535591668574044 0.00535591668574044 0.00129418178683697 0.00115683512608283 216777 233645 622 665 0 True 381 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 423 243 0.00535574496041363 0.00538716899825669 0.00532539864194705 0.00541695277332723 0.00152784499655827 0.0015178688475721 218315 234777 622 665 0 True 426 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 468 243 0.00535954744979303 0.00553925440747669 0.00531013962005036 0.00552376592660411 0.00163552687722468 0.00142584481410003 218470 241405 622 665 0 True 470 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 513 242 0.00534068219603329 0.00529550013738856 0.00535591668574044 0.00527962157625696 0.00154997597115394 0.00158018087464178 217701 230782 622 665 0 True 514 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 556 242 0.0056239799208935 0.00566947237629436 0.00564583810177768 0.00567635614557107 0.00148919984312916 0.00120856596752005 229249 247080 622 665 0 True 558 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 603 243 0.00674792218487605 0.00605647788503073 0.00643930724040589 0.00605783169298848 0.00295049733616002 0.00193369545089864 275064 263946 622 665 0 False 603 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 644 242 0.007935991592328 0.656639447095652 0.00784313725490196 0.648386358434424 0.00235716516297995 0.194133063073015 323493 28616856 622 665 4 True 647 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 249 287 0.005923689680559 0.00581194345442457 0.00588998245212482 0.00584420538643473 0.0016334734671835 0.00152873902880886 241466 253289 622 665 0 False 249 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 293 287 0.00557081866615051 0.00550359648262336 0.00561532005798428 0.00544747081712062 0.00129879432122029 0.00127418423322433 227082 239851 622 665 0 False 293 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 337 287 0.0053745120854152 0.0054596321428428 0.00544747081712062 0.00549324788281071 0.00122277096321468 0.00128702914484684 219080 237935 622 665 0 True 337 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 380 287 0.00548505413150284 0.0055166756442491 0.00549324788281071 0.00547798886091402 0.00124218255692413 0.00118827371983542 223586 240421 622 665 0 True 381 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 424 287 0.0055488868886977 0.00534143782436177 0.00569161516746777 0.00540169375143053 0.00154827711536216 0.00153776935392327 226188 232784 622 665 0 True 426 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 469 286 0.00546025208787332 0.00575473933173515 0.00546272983901732 0.00573739223315786 0.00175745721337798 0.00176922074482713 222575 250796 622 665 0 True 470 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 514 286 0.00547762087807085 0.00544737903353027 0.00549324788281071 0.00538643472953384 0.00158100628011334 0.0015416390228396 223283 237401 622 665 0 False 514 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 556 285 0.00552045408101559 0.00565396094952419 0.0055390249485008 0.00564583810177768 0.00163982882077028 0.00155328445958008 225029 246404 622 665 0 True 558 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 603 286 0.00584469603022562 0.0057736467513485 0.00592050049591821 0.00578316929884794 0.00190245034847802 0.00191580075252693 238246 251620 622 665 0 False 603 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 647 286 0.00624511042797141 0.00619119324977585 0.00621042191195544 0.00621042191195544 0.00191713128458279 0.00190790569446165 254568 269817 622 665 0 False 647 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 248 326 0.00545792152986659 0.00541190467585765 0.00540169375143053 0.00549324788281071 0.00140772100556641 0.00143617295365961 222480 235855 622 665 0 True 249 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 293 326 0.00543596522022424 0.00542716369775434 0.00546272983901732 0.00546272983901732 0.00136958802777995 0.00132976277261975 221585 236520 622 665 0 True 293 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 337 326 0.00551071480176642 0.00528776736990106 0.00552376592660411 0.00524910353246357 0.00127968947624052 0.00126569248085931 224632 230445 622 665 0 True 337 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 381 326 0.00556058874311044 0.00563425042349522 0.00560006103608759 0.00566109712367437 0.00124803376050595 0.00118259214702771 226665 245545 622 665 0 True 381 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 425 325 0.00570756109067171 0.00575760756893378 0.00581368734264134 0.00572213321126116 0.00148422652705857 0.00157782285700192 232656 250921 622 665 0 True 426 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 469 325 0.00578461669803107 0.00578046168293244 0.00575265125505455 0.00570687418936446 0.00158443371128734 0.00147639254444889 235797 251917 622 665 0 True 470 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 514 329 0.00545581176156576 0.00751113306268647 0.00546272983901732 0.00567635614557107 0.00139748720015803 0.0107815920320094 222394 327341 622 665 0 False 514 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 557 323 0.00566997777628949 0.00561963388673102 0.00556954299229419 0.00563057907988098 0.00161175170570994 0.00132414458570708 231124 244908 622 665 0 True 559 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 600 324 0.00569909748527885 0.0058860587036371 0.00567635614557107 0.00588998245212482 0.00198816822476972 0.00214971674325961 232311 256519 622 665 0 True 603 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 645 323 0.00568006050619229 0.00584730308260925 0.00566109712367437 0.00582894636453803 0.00189479897083478 0.00174826100036785 231535 254830 622 665 0 True 647 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 249 370 0.00536980190502265 0.00542087652181495 0.00540169375143053 0.00535591668574044 0.00152730661938485 0.00148184247127127 218888 236246 622 665 0 True 249 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 293 371 0.00534411670256953 0.0054358143011454 0.00531013962005036 0.00543221179522393 0.00128089732295716 0.00128137698106802 217841 236897 622 665 0 True 293 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 337 369 0.00565707384458907 0.00545017843303613 0.00556954299229419 0.00541695277332723 0.00130438427589727 0.00135423418576399 230598 237523 622 665 0 True 337 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 381 369 0.00579185369394671 0.00578089765498663 0.00581368734264134 0.00579842832074464 0.00129085308156168 0.00131086184897686 236092 251936 622 665 0 True 382 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 424 369 0.00585090267418039 0.00603555122642954 0.00593575951781491 0.0059662775616083 0.00144224956253315 0.00155936073885655 238499 263034 622 665 0 True 426 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 469 368 0.0059241312599708 0.00607384792950561 0.00607309071488518 0.00611886778057527 0.00162192135617096 0.00162881700206451 241484 264703 622 665 0 True 470 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 513 368 0.0056988521633834 0.00570430424883449 0.00560006103608759 0.00566109712367437 0.00161922503768648 0.00169981237430415 232301 248598 622 665 0 True 514 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 557 368 0.00565307509769331 0.00583557772894126 0.00561532005798428 0.00585946440833143 0.00162859987819674 0.00153103383241351 230435 254319 622 665 0 True 559 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 601 367 0.00567358400815254 0.00585538003856058 0.00567635614557107 0.00584420538643473 0.00190698463899896 0.00199615605844336 231271 255182 622 665 0 True 603 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 645 368 0.00535643186172088 0.00563041845859786 0.00534065766384375 0.00578316929884794 0.00179515712561728 0.00182245749946135 218343 245378 622 665 0 True 647 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 249 413 0.00530991883034445 0.00551945209785737 0.00534065766384375 0.00549324788281071 0.00152506699205361 0.00148490150103496 216447 240542 622 665 0 True 249 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 293 414 0.00529853589439579 0.00570643821731027 0.00527962157625696 0.00570687418936446 0.00135785051656558 0.00139989932362442 215983 248691 622 665 0 True 293 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 337 414 0.00576055062008789 0.00578390356757079 0.00573739223315786 0.00582894636453803 0.00129038477217065 0.00121559123290898 234816 252067 622 665 0 True 337 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 381 413 0.00581008111077829 0.00586130008013855 0.00573739223315786 0.00592050049591821 0.00147985578393866 0.00141671886474437 236835 255440 622 665 0 True 382 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 425 414 0.00582445697385138 0.00596430421441565 0.00582894636453803 0.005981536583505 0.00156707321578623 0.00151098637602675 237421 259929 622 665 0 True 426 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 470 412 0.00589341695866105 0.00589626962806421 0.00592050049591821 0.0059510185397116 0.00163420545073876 0.00145711775462231 240232 256964 622 665 0 True 470 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 513 412 0.00590188056405391 0.00574501027115741 0.0059662775616083 0.00572213321126116 0.00159670140364362 0.00163925546914191 240577 250372 622 665 0 True 515 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 557 411 0.0057389622932887 0.00564872928487389 0.00573739223315786 0.00563057907988098 0.0015637349724984 0.00147878811393562 233936 246176 622 665 0 True 559 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 602 412 0.00542119684211843 0.00546504737467381 0.00534065766384375 0.00550850690470741 0.00186702452688336 0.0018068179219267 220983 238171 622 665 0 True 603 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 645 412 0.00520550983164294 0.00529492648994884 0.00520332646677348 0.00529488059815366 0.00186708080446405 0.00182427588651173 212191 230757 622 665 0 True 647 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 250 459 0.00551417384049219 0.00547909026399829 0.0055390249485008 0.00550850690470741 0.00142941633623018 0.00136744345207506 224773 238783 622 665 0 True 249 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 295 458 0.00540689457561397 0.00553399979692881 0.00540169375143053 0.00558480201419089 0.00152548382693316 0.00149622294354916 220400 241176 622 665 0 True 293 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 338 456 0.00552950645895752 0.00560428308124397 0.00549324788281071 0.00558480201419089 0.0014737880660746 0.00136895260861825 225398 244239 622 665 0 True 338 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 383 457 0.00570687418936446 0.00561740813466488 0.00569161516746777 0.00563057907988098 0.00143157166793178 0.00136095695343417 232628 244811 622 665 0 True 382 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 427 457 0.00561993210961865 0.00576336698922862 0.00561532005798428 0.00579842832074464 0.00185987469299219 0.00181874445269311 229084 251172 622 665 0 True 426 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 470 456 0.00576643834557858 0.00574540035141642 0.00579842832074464 0.00578316929884794 0.00179486995391535 0.00193622062430421 235056 250389 622 665 0 True 470 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 515 456 0.00556775214245744 0.00564010162738042 0.0055542839703975 0.00560006103608759 0.00170415762628044 0.00174137124468939 226957 245800 622 665 0 True 515 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 559 456 0.00542495026711875 0.0053071107615686 0.00552376592660411 0.00524910353246357 0.00170444785145832 0.00184704608677607 221136 231288 622 665 0 True 559 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 603 455 0.00509099357084909 0.00529738170099086 0.00514229037918669 0.00534065766384375 0.00173614165170631 0.00177006959790579 207523 230864 622 665 0 True 603 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 647 456 0.00520560796040112 0.00523368388928375 0.00518806744487678 0.00521858548867018 0.001768537917681 0.00181489762086549 212195 228088 622 665 0 True 647 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 250 502 0.00554400498297834 0.00549005840304584 0.00556954299229419 0.0055390249485008 0.00148951453314945 0.00140493496656734 225989 239261 622 665 0 True 249 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 295 502 0.00548991150503266 0.00544196380169926 0.00552376592660411 0.00547798886091402 0.00152815286248627 0.00141878137793623 223784 237165 622 665 0 True 293 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 338 502 0.00548100632022799 0.00541018373353847 0.00549324788281071 0.00537117570763714 0.0014167645775431 0.00156351281734318 223421 235780 622 665 0 True 338 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 383 501 0.00560879449556544 0.00558312696366689 0.00556954299229419 0.0055542839703975 0.00147989751912827 0.00161767461558748 228630 243317 622 665 0 True 382 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 428 500 0.00570142804328558 0.00564730663922337 0.00566109712367437 0.00567635614557107 0.00177900358538148 0.00174085541439623 232406 246114 622 665 0 True 426 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 472 499 0.00570611369148858 0.00575772229842172 0.00564583810177768 0.00575265125505455 0.00176571272582693 0.0016221119192878 232597 250926 622 665 0 True 470 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 515 498 0.00561632587775561 0.00538877521108792 0.00558480201419089 0.00534065766384375 0.00161873060162261 0.00164424210524267 228937 234847 622 665 0 True 515 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 559 497 0.0055713093099414 0.00557741343516723 0.0055542839703975 0.00556954299229419 0.00179133174273341 0.00172477959828126 227102 243068 622 665 0 True 559 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 603 497 0.00544126417316586 0.00555414629501196 0.00549324788281071 0.00549324788281071 0.00177265582428652 0.00180089201395787 221801 242054 622 665 0 True 603 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 648 497 0.00551716676761663 0.00558372355700421 0.00549324788281071 0.00558480201419089 0.00207094337318797 0.00181008332967783 224895 243343 622 665 0 True 648 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 251 543 0.00552921207268299 0.00563521415119396 0.00563057907988098 0.00567635614557107 0.00132740163006129 0.00143669451011827 225386 245587 622 665 0 True 249 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 295 543 0.00555555964425381 0.00561871605082746 0.00549324788281071 0.00563057907988098 0.00145830946698699 0.00140972409744339 226460 244868 622 665 0 True 293 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 339 543 0.00563948426468564 0.00551564307885759 0.00567635614557107 0.00549324788281071 0.00147613809782277 0.0013645032884961 229881 240376 622 665 0 True 338 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 383 543 0.00566892289213908 0.00562862867858591 0.00567635614557107 0.00567635614557107 0.00141230714280536 0.00141217524176645 231081 245300 622 665 0 True 382 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 428 542 0.00568381393119261 0.00558929941011834 0.00570687418936446 0.00556954299229419 0.00180767148579503 0.00178857571407157 231688 243586 622 665 0 True 426 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 472 540 0.00567596363053836 0.00604151715980269 0.00567635614557107 0.00614938582436866 0.00176466979892223 0.00197299623115735 231368 263294 622 665 0 True 471 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 516 540 0.00564402271975138 0.00561685743312275 0.00558480201419089 0.00558480201419089 0.00187626775550505 0.00185983603369288 230066 244787 622 665 0 True 515 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 559 545 0.00554164989278207 0.00575233001248831 0.00560006103608759 0.00570687418936446 0.00167058608593301 0.00177719574274719 225893 250691 622 665 0 False 559 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 604 538 0.00565037655684341 0.00566850864859562 0.00563057907988098 0.00570687418936446 0.00159157539576151 0.00153961569088284 230325 247038 622 665 0 True 603 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 648 539 0.00541572616385 0.00545150929509629 0.00543221179522393 0.00544747081712062 0.00187216857946579 0.00190356733691849 220760 237581 622 665 0 True 648 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 249 588 0.00598126672942001 0.00599069199664302 0.00601205462729839 0.0059662775616083 0.00133038361764665 0.00119651790872522 243813 261079 622 665 0 False 249 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 294 588 0.00562160029850768 0.00584250739001314 0.0055542839703975 0.00584420538643473 0.00131709085351969 0.00130031482126413 229152 254621 622 665 0 False 294 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 339 585 0.00552145990078692 0.005648499825898 0.00546272983901732 0.00569161516746777 0.00140445595165498 0.00148467522864272 225070 246166 622 665 0 True 338 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 383 584 0.00549187408019622 0.00561538889567705 0.00546272983901732 0.00560006103608759 0.00130397787206493 0.00126103669528922 223864 244723 622 665 0 True 382 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 426 588 0.00562483854752756 0.00551419748730948 0.00556954299229419 0.0055542839703975 0.00178358831809328 0.00178264975745217 229284 240313 622 665 0 False 426 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 471 588 0.00574261758953084 0.00586781671505383 0.00575265125505455 0.00592050049591821 0.00186549300361532 0.00172454965121867 234085 255724 622 665 0 False 471 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 515 588 0.00568459896125803 0.00562709130344745 0.00575265125505455 0.00566109712367437 0.00199244940002701 0.00200875870799995 231720 245233 622 665 0 False 515 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 559 588 0.00573395772662162 0.00587089146533076 0.00587472343022812 0.00592050049591821 0.001746454143867 0.0017152741709292 233732 255858 622 665 0 False 559 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 603 588 0.00568523679818619 0.0057368874234109 0.00564583810177768 0.00572213321126116 0.00157065801749619 0.00153041943296797 231746 250018 622 665 0 False 603 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 648 588 0.00585087814199084 0.00568392829177544 0.00579842832074464 0.00563057907988098 0.00168004736981827 0.00142428838334644 238498 247710 622 665 0 False 648 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 250 635 0.00808598139920324 0.656755691012838 0.00735484855420768 0.642221713588159 0.00331896837935821 0.18691504122936 329607 28621922 622 665 3 True 249 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 294 631 0.00637773144464913 0.00604482136905551 0.00628671702143893 0.0059662775616083 0.00184948327572996 0.00139465303077905 259974 263438 622 665 0 False 294 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 338 631 0.00549871856107914 0.00558464139290777 0.00550850690470741 0.0055542839703975 0.00141200490323808 0.00136972299496376 224143 243383 622 665 0 False 338 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 382 631 0.00574985458544648 0.00559762877094315 0.00573739223315786 0.00564583810177768 0.00134332894349927 0.001270080790765 234380 243949 622 665 0 False 382 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 426 631 0.00555097212480899 0.00554873106318096 0.00558480201419089 0.00552376592660411 0.00154728497086618 0.00162904598073575 226273 241818 622 665 0 False 426 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 471 631 0.00554491267399149 0.00549402804332874 0.00552376592660411 0.00541695277332723 0.00181533675124318 0.00179987337725678 226026 239434 622 665 0 False 471 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 515 631 0.00551554764310669 0.005613828574641 0.00558480201419089 0.0055542839703975 0.0018280404163454 0.0017740903532113 224829 244655 622 665 0 False 515 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 559 631 0.00577173729852019 0.00557798708260695 0.00585946440833143 0.00563057907988098 0.00175270732870678 0.00168194704588659 235272 243093 622 665 0 False 559 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 604 631 0.00602226001814891 0.00589799057038339 0.00593575951781491 0.00587472343022812 0.00151289594357693 0.0013292527367786 245484 257039 622 665 0 False 604 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 647 632 0.00729430311041178 0.694314821156806 0.00718699931334401 0.677470054169528 0.00165036422027799 0.189130205777876 297336 30258778 622 665 7 True 648 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H8_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H8_3.csv new file mode 100755 index 0000000..58bf2c4 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H8_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 247 244 0.00110519967117053 0.0626354166487402 0.00080872816052491 0.0631570916304265 0.00099758527768957 0.0217768468984174 45051 2729700 622 665 0 True 248 244 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 293 243 0.000934480164130161 0.00094135544858943 0.000778210116731518 0.000778210116731518 0.000709824163384262 0.000700995023214601 38092 41025 622 665 0 False 293 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 336 243 0.000889414531936863 0.000878024771243742 0.000778210116731518 0.00080872816052491 0.000638561545131602 0.000620939366677781 36255 38265 622 665 0 True 337 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 380 243 0.000902710978669997 0.000905926982711987 0.00080872816052491 0.000793469138628214 0.000633896887926832 0.000642223940335216 36797 39481 622 665 0 True 381 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 423 243 0.000853106891410962 0.000903035799615771 0.000656137941557946 0.000671396963454643 0.000752336704256314 0.000780805726074702 34775 39355 622 665 0 True 426 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 468 243 0.00086230646249016 0.00096072178615456 0.000671396963454643 0.00080872816052491 0.000820368785609867 0.000748155526218499 35150 41869 622 665 0 True 470 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 513 242 0.000992081745180713 0.000888327479261211 0.000778210116731518 0.000686655985351339 0.000882437233376204 0.00081400663512918 40440 38714 622 665 0 True 514 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 556 242 0.000928616970829019 0.000929790716204565 0.000732433051041428 0.000778210116731518 0.000789203286361275 0.000720605286111868 37853 40521 622 665 0 True 558 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 603 243 0.000907862738474348 0.000851591097221194 0.000488288700694286 0.000442511635004196 0.000959289703590063 0.000982128647248243 37007 37113 622 665 0 False 603 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 644 242 0.000997871341913221 0.0666281863964099 0.000656137941557946 0.0663767452506294 0.000959068268016042 0.0202683659138892 40676 2903708 622 665 0 True 647 243 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 249 287 0.000888236986838726 0.000964416075666392 0.000671396963454643 0.000778210116731518 0.000746605711797547 0.000768361277811714 36207 42030 622 665 0 False 249 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 293 287 0.000952315065929033 0.000901291911399006 0.00080872816052491 0.000762951094834821 0.000707908989395836 0.00069514149074152 38819 39279 622 665 0 False 293 287 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 337 287 0.000843195886834972 0.000930524984927414 0.000747692072938125 0.000778210116731518 0.000629652714471587 0.000694093716104833 34371 40553 622 665 0 True 337 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 380 287 0.000882226600400316 0.000812628963115043 0.000732433051041428 0.000671396963454643 0.000637412582040922 0.00064328387438468 35962 35415 622 665 0 True 381 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 424 287 0.000931732558901174 0.000918799631259426 0.000701915007248035 0.000686655985351339 0.000848614649788616 0.000786143307679913 37980 40042 622 665 0 True 426 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 469 286 0.000863655732915109 0.00095558190509462 0.000595101853971161 0.000579842832074464 0.000858180506480854 0.000993298061671914 35205 41645 622 665 0 True 470 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 514 286 0.000830193826376372 0.000918271875614878 0.000625619897764553 0.000686655985351339 0.000786784285546954 0.000856253820922747 33841 40019 622 665 0 False 514 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 556 285 0.00099635034616146 0.00093855604908357 0.00080872816052491 0.000732433051041428 0.000898036994004505 0.000779090831836735 40614 40903 622 665 0 True 558 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 603 286 0.000912376661350541 0.000864853826027646 0.000595101853971161 0.000457770656900893 0.000988846584589967 0.000921363893870859 37191 37691 622 665 0 False 603 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 647 286 0.000893560471969888 0.000918386605102823 0.000534065766384375 0.000442511635004196 0.000928596122478869 0.00103185171714302 36424 40024 622 665 0 False 647 286 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 248 326 0.000844839543534456 0.000935435407011463 0.000671396963454643 0.000747692072938125 0.000730236791144157 0.000788221586963244 34438 40767 622 665 0 True 249 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 293 326 0.000895400386185728 0.000873825671984952 0.000778210116731518 0.000762951094834821 0.000686850943005647 0.000651179135312367 36499 38082 622 665 0 True 293 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 337 326 0.000893118892558087 0.000899915157543665 0.000747692072938125 0.00080872816052491 0.000688984481463105 0.000664828278529025 36406 39219 622 665 0 True 337 330 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 381 326 0.000930922996646204 0.00089046144773699 0.000839246204318303 0.000747692072938125 0.000662718636898341 0.000669112184647514 37947 38807 622 665 0 True 381 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 425 325 0.000893315150074443 0.000959230302811274 0.000671396963454643 0.000671396963454643 0.000788740226200179 0.0008709553204629 36414 41804 622 665 0 True 426 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 469 325 0.000850113964286529 0.000913315561735651 0.000595101853971161 0.000701915007248035 0.000840709163533451 0.000819389179191615 34653 39803 622 665 0 True 470 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 514 329 0.000916105554161309 0.00104334996337261 0.000717174029144732 0.000686655985351339 0.000813093787780096 0.00128066854103415 37343 45470 622 665 0 False 514 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 557 323 0.000906488935859854 0.000898263052917255 0.000671396963454643 0.00080872816052491 0.000839620368748727 0.000661626101445494 36951 39147 622 665 0 True 559 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 600 324 0.000930922996646204 0.000910103136073188 0.000473029678797589 0.000350957503624018 0.00104973606699245 0.00112067868030282 37947 39663 622 665 0 True 603 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 645 323 0.000891548832427237 0.000879034390737659 0.000473029678797589 0.000518806744487678 0.000980190412659303 0.000898404518619741 36342 38309 622 665 0 True 647 329 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 249 370 0.000957270568217027 0.000887249022074527 0.000823987182421607 0.000747692072938125 0.000788569090556441 0.000748359512628588 39021 38667 622 665 0 True 249 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 293 371 0.00090283363961772 0.00085379390338974 0.000778210116731518 0.000671396963454643 0.000733132041026388 0.000684669197232124 36802 37209 622 665 0 True 293 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 337 369 0.00097586596789178 0.000934976489059683 0.000885023270008392 0.000839246204318303 0.00070867827956212 0.000742418676244938 39779 40747 622 665 0 True 337 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 381 369 0.000926556266907278 0.000922356245385723 0.000778210116731518 0.00080872816052491 0.000696761630936185 0.000669969764444907 37769 40197 622 665 0 True 382 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 424 369 0.00097716617393764 0.000918432496898001 0.000732433051041428 0.000656137941557946 0.000842065586122095 0.000875404164299193 39832 40026 622 665 0 True 426 373 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 469 368 0.000953419014458537 0.000980409366285937 0.00064087891966125 0.000717174029144732 0.000935922979471674 0.000916623541111109 38864 42727 622 665 0 True 470 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 513 368 0.000964728353838564 0.000970382009039536 0.000686655985351339 0.000747692072938125 0.000934117919213013 0.000881349518893666 39325 42290 622 665 0 True 514 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 557 368 0.000905335922951262 0.00101326789163341 0.000564583810177768 0.000747692072938125 0.000956725295169846 0.000963077991733465 36904 44159 622 665 0 True 559 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 601 367 0.000897951733898359 0.000966251747473513 0.0004272526131075 0.000534065766384375 0.00104289045348692 0.00108916600835227 36603 42110 622 665 0 True 603 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 645 368 0.000910414086186979 0.00094858340632997 0.000473029678797589 0.000518806744487678 0.000994610112154973 0.00103789787866186 37111 41340 622 665 0 True 647 372 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 249 413 0.000872585449909317 0.00092242508307849 0.000701915007248035 0.000747692072938125 0.000787962780533089 0.000797230556644273 35569 40200 622 665 0 True 249 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 293 414 0.000893167956937176 0.000855377170323382 0.000762951094834821 0.000686655985351339 0.000770889331579729 0.000731086569155479 36408 37278 622 665 0 True 293 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 337 414 0.000880533879321744 0.000936169675734312 0.000793469138628214 0.000823987182421607 0.000648934186737801 0.000666016930636404 35893 40799 622 665 0 True 337 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 381 413 0.000859853243535707 0.00089768940547753 0.000671396963454643 0.000732433051041428 0.00076334193843487 0.000703926326049531 35050 39122 622 665 0 True 382 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 425 414 0.000875553844844205 0.00087715282713536 0.000610360875867857 0.000656137941557946 0.000857524460785999 0.000765277951280928 35690 38227 622 665 0 True 426 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 470 412 0.000947997400569196 0.000966527098244581 0.000656137941557946 0.000762951094834821 0.000906046567336584 0.000793699339249132 38643 42122 622 665 0 True 470 416 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 513 412 0.000890910995499079 0.000974512270605559 0.000686655985351339 0.000701915007248035 0.000847681997469095 0.000940312054105325 36316 42470 622 665 0 True 515 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 557 411 0.000954596559556674 0.000938395427800446 0.000732433051041428 0.000732433051041428 0.000887550980255152 0.000809118849212435 38912 40896 622 665 0 True 559 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 602 412 0.000875480248275571 0.000891998822875454 0.000518806744487678 0.000457770656900893 0.000933540633266698 0.000945128300550651 35687 38874 622 665 0 True 603 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 645 412 0.000816112349577813 0.000921576084867697 0.000411993591210803 0.000534065766384375 0.000920957403177862 0.000969122179837151 33267 40163 622 665 0 True 647 415 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 250 459 0.00091036502180789 0.000886858941815514 0.000732433051041428 0.000717174029144732 0.000815311040339543 0.000779114688772952 37109 38650 622 665 0 True 249 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 295 458 0.000889610789453219 0.000890071367477976 0.000747692072938125 0.000778210116731518 0.000786502260407608 0.000786623177632626 36263 38790 622 665 0 True 293 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 338 456 0.000886323476054252 0.000955031203552484 0.000793469138628214 0.000793469138628214 0.000737565926790804 0.000792361911336495 36129 41621 622 665 0 True 338 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 383 457 0.000892014944028583 0.000865656932443262 0.000732433051041428 0.000701915007248035 0.000765323694960241 0.000742581983509043 36361 37726 622 665 0 True 382 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 427 457 0.000860638273601132 0.000929400635945552 0.000610360875867857 0.000564583810177768 0.000884358434330036 0.00102411403417802 35082 40504 622 665 0 True 426 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 470 456 0.000932542121156143 0.000835414239420937 0.000610360875867857 0.000396734569314107 0.000968665708985125 0.000976322285272517 38013 36408 622 665 0 True 470 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 515 456 0.000903299751219066 0.000956316173817469 0.000595101853971161 0.000625619897764553 0.000955436936944752 0.000969303809052414 36821 41677 622 665 0 True 515 459 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 559 456 0.000978613573120767 0.000912512455320035 0.00064087891966125 0.000503547722590982 0.00101732396262936 0.000948657521348049 39891 39768 622 665 0 True 559 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 603 455 0.000830144761997283 0.000881719060755574 0.000411993591210803 0.000488288700694286 0.000929176116710091 0.000944164945808823 33839 38426 622 665 0 True 603 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 647 456 0.00089839331331016 0.000863270559094004 0.000503547722590982 0.000381475547417411 0.000972804319506003 0.00101930660701824 36621 37622 622 665 0 True 647 458 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 250 502 0.000853671131770486 0.000902324476790511 0.000686655985351339 0.000701915007248035 0.000750355365782649 0.000774792240816058 34798 39324 622 665 0 True 249 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 295 502 0.000890493948276822 0.00084142606458926 0.000793469138628214 0.000701915007248035 0.000767270528571611 0.000721325577488698 36299 36670 622 665 0 True 293 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 338 502 0.000893339682263987 0.000925798130024076 0.000732433051041428 0.000778210116731518 0.000789811602139471 0.000791405856022328 36415 40347 622 665 0 True 338 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 383 501 0.000831763886507222 0.000853839795184918 0.00064087891966125 0.00064087891966125 0.000799558402978515 0.000811863233396101 33905 37211 622 665 0 True 382 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 428 500 0.000850383818371519 0.000960538218973848 0.000518806744487678 0.000610360875867857 0.000929043343734617 0.000976773185857302 34664 41861 622 665 0 True 426 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 472 499 0.000894320969845769 0.000959964571534123 0.000534065766384375 0.000625619897764553 0.000918636962497643 0.000906472883347434 36455 41836 622 665 0 True 470 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 515 498 0.000886936780792866 0.00097100154827444 0.000579842832074464 0.000671396963454643 0.000887613171341891 0.000902688629463522 36154 42317 622 665 0 True 515 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 559 497 0.00101065261266592 0.000902875178332648 0.000686655985351339 0.000610360875867857 0.000974877296981329 0.000880118205101513 41197 39348 622 665 0 True 559 502 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 603 497 0.000951063924262262 0.000861411941389294 0.000595101853971161 0.000488288700694286 0.000989595630409397 0.000931057173548671 38768 37541 622 665 0 True 603 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 648 497 0.000903643201872689 0.000864096611407209 0.000503547722590982 0.000381475547417411 0.000951838194562347 0.000994111504470417 36835 37658 622 665 0 True 648 501 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 251 543 0.000883404145498454 0.000790371442453697 0.000747692072938125 0.000595101853971161 0.000689479829777016 0.000705955720442652 36010 34445 622 665 0 True 249 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 295 543 0.000901975012983661 0.000846497107956433 0.000762951094834821 0.000686655985351339 0.000772520783732498 0.00070927394942838 36767 36891 622 665 0 True 293 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 339 543 0.000839246204318303 0.000896381489314956 0.000686655985351339 0.000778210116731518 0.000728542029860944 0.000721239441090397 34210 39065 622 665 0 True 338 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 383 543 0.000860540144842954 0.000893696819297041 0.00064087891966125 0.000732433051041428 0.000778520004189873 0.000746436988032491 35078 38948 622 665 0 True 382 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 428 542 0.000918804095011208 0.000961524892570176 0.000671396963454643 0.000549324788281071 0.000959159568459113 0.000988632923235772 37453 41904 622 665 0 True 426 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 472 540 0.000892284798113573 0.000868226872973232 0.000473029678797589 0.000442511635004196 0.000988151852845492 0.000987563385484663 36372 37838 622 665 0 True 471 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 516 540 0.000812187199250689 0.000955513067401853 0.0004272526131075 0.000488288700694286 0.000945917107085033 0.00107928738560291 33107 41642 622 665 0 True 515 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 559 545 0.000806814649740437 0.000843124061010847 0.000442511635004196 0.0004272526131075 0.000879938583001246 0.000932605865723283 32888 36744 622 665 0 False 559 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 604 538 0.000922459391253342 0.0008425963053663 0.000671396963454643 0.000564583810177768 0.000851054145510157 0.000804318959303438 37602 36721 622 665 0 True 603 545 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 648 539 0.000859755114777529 0.000876831584569113 0.000457770656900893 0.000411993591210803 0.000920625064701152 0.00101860060404877 35046 38213 622 665 0 True 648 544 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 249 588 0.000912548386677353 0.000895463653411395 0.000778210116731518 0.000762951094834821 0.000675967274535793 0.000635930183165424 37198 39025 622 665 0 False 249 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 294 588 0.000919319270991643 0.000960813569744916 0.000747692072938125 0.000839246204318303 0.000740237142651761 0.000769501397913473 37474 41873 622 665 0 False 294 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 339 585 0.000963501744361338 0.000939863965246143 0.000823987182421607 0.000793469138628214 0.000815575193135273 0.000768118536662894 39275 40960 622 665 0 True 338 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 383 584 0.000910512214945157 0.000942663364752004 0.000778210116731518 0.000823987182421607 0.000693948955941006 0.000676943921449373 37115 41082 622 665 0 True 382 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 426 588 0.00090960452393201 0.000869465951443039 0.000686655985351339 0.000473029678797589 0.000870318809899182 0.000930862352606572 37078 37892 622 665 0 False 426 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 471 588 0.000906047356448053 0.000886400023863734 0.000473029678797589 0.000534065766384375 0.00101911368375561 0.000908537169094418 36933 38630 622 665 0 False 471 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 515 588 0.000925746704652309 0.00094087358474006 0.000488288700694286 0.000503547722590982 0.00106010418596933 0.00109631732664623 37736 41004 622 665 0 False 515 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 559 588 0.000899374600891941 0.000972906057774328 0.000457770656900893 0.000595101853971161 0.000967235556415196 0.00099922510532229 36661 42400 622 665 0 False 559 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 603 588 0.000913701399585946 0.000882705734351902 0.000671396963454643 0.000686655985351339 0.000841404037413545 0.000772677282570488 37245 38469 622 665 0 False 603 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 648 588 0.000908647768539773 0.000898767862664214 0.000671396963454643 0.000717174029144732 0.000828503730888781 0.000770896149418115 37039 39169 622 665 0 False 648 588 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 250 635 0.000985556182761868 0.066428694762771 0.000854505226215 0.064438849469749 0.000737543633869437 0.0198004366381127 40174 2895014 622 665 0 True 249 632 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 294 631 0.000983814397304207 0.000899364456001528 0.000839246204318303 0.000717174029144732 0.000726476921539921 0.000726449752214168 40103 39195 622 665 0 False 294 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 338 631 0.000951358310536796 0.000860471159588144 0.000839246204318303 0.000732433051041428 0.000715037849621005 0.000650340460754743 38780 37500 622 665 0 False 338 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 382 631 0.000879233673275884 0.000868249818870821 0.000747692072938125 0.000747692072938125 0.000659775298820176 0.00065651895952029 35840 37839 622 665 0 False 382 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 426 631 0.000861545964614279 0.000887684994128718 0.00064087891966125 0.000610360875867857 0.000825617998163975 0.000827463750527161 35119 38686 622 665 0 False 426 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 471 631 0.000913284352363689 0.000967857960304745 0.000564583810177768 0.00064087891966125 0.000959452198080159 0.000993251679753602 37228 42180 622 665 0 False 471 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 515 631 0.000956804456615681 0.000883462948972339 0.000610360875867857 0.000503547722590982 0.000980386180179222 0.000913757261891217 39002 38502 622 665 0 False 515 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 559 631 0.000928248987985851 0.000925270374379529 0.000625619897764553 0.000610360875867857 0.000937792812868856 0.000846893784482524 37838 40324 622 665 0 False 559 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 604 631 0.00099872996854728 0.000957761765365577 0.000839246204318303 0.00080872816052491 0.00074629896212303 0.000695606181627879 40711 41740 622 665 0 False 604 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 647 632 0.00106943173881461 0.0705930539326113 0.000900282291905089 0.0690318150606546 0.000785680743998297 0.0208783746897758 43593 3076500 622 665 0 True 648 631 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H9_1.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H9_1.csv new file mode 100755 index 0000000..2c1ed6d --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H9_1.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 261 275 0.0093613440483819 0.0374728076772384 0.00943007553215839 0.0371709773403525 0.00156518756900524 0.00686352124494754 355214 1633094 579 665 0 True 261 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 305 274 0.00888549448125453 0.00885993881476408 0.0089723048752575 0.00889600976577401 0.00132365230368964 0.00128729930503265 337158 386123 579 665 0 False 305 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 348 275 0.00931725364487038 0.0509743803316944 0.00924696726939803 0.0520027466239414 0.00142693548955424 0.00690641463885503 353541 2221503 579 665 0 True 349 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 393 275 0.00941444755291013 0.0684758818538679 0.00933852140077821 0.0676432440680552 0.00146795747836974 0.00638506246727858 357229 2984232 579 665 0 True 393 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 437 275 0.00928892299108981 0.0616311206030641 0.00932326237888151 0.0609597924773022 0.00166589612440603 0.0104176522185786 352466 2685932 579 665 0 True 438 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 480 275 0.00915480699379743 0.0522770418837205 0.00918593118181125 0.0549019607843137 0.00170642015079702 0.0125947529196703 347377 2278274 579 665 0 True 482 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 524 273 0.00908944883437808 0.0671137215893935 0.00912489509422446 0.0670939192797742 0.00166670917320315 0.0175706433029346 344897 2924868 579 665 0 True 526 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 567 272 0.00948694767249184 0.0557977227343938 0.00943007553215839 0.0549782558937972 0.00177142333374674 0.014980923820879 359980 2431708 579 665 0 True 570 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 615 274 0.00923292053594218 0.0104639258939291 0.00932326237888151 0.009399557488365 0.0019900393428552 0.00626235422438195 350341 456026 579 665 0 False 615 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 656 272 0.00911374731138801 0.0381763747891129 0.00909437705043107 0.0383306630045014 0.00186208923480116 0.00804356968307357 345819 1663756 579 665 0 True 659 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 261 318 0.00914566212229803 0.0090709033971975 0.00906385900663768 0.00915541313801785 0.00160482961248452 0.00144714231899425 347030 395317 579 665 0 False 261 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 305 317 0.00921244340293055 0.00913769890507913 0.00924696726939803 0.00923170824750134 0.00128272694240371 0.00132580872380662 349564 398228 579 665 0 False 305 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 349 318 0.00959054562599083 0.0926867867769676 0.00941481651026169 0.0917067215991455 0.00171028821834274 0.0236447173018995 363911 4039362 579 665 0 True 349 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 392 319 0.00954339814728066 0.0423782734474089 0.00944533455405508 0.0427405203326467 0.00167945066119382 0.00591234595194289 362122 1846878 579 665 0 True 394 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 436 318 0.00957887076122358 0.0665548513077154 0.00947585259784848 0.0647592889295796 0.00207990770816804 0.0151043015286544 363468 2900512 579 665 0 True 438 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 481 317 0.00940124415054356 0.0358381648788944 0.00947585259784848 0.0366216525520714 0.00175331702239078 0.00632611372274059 356728 1561855 579 665 0 True 482 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 525 318 0.00925205361003026 0.0350736534630235 0.00921644922560464 0.0366521705958648 0.00159868228293962 0.00624364343651376 351067 1528537 579 665 0 True 526 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 569 317 0.00957410066974983 0.0407648326584371 0.00944533455405508 0.0420080872816053 0.00208106478107984 0.00616268708813906 363287 1776563 579 665 0 True 570 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 615 317 0.00924093218129036 0.0091881110420822 0.00915541313801785 0.00915541313801785 0.00221859533460275 0.00203747755823879 350645 400425 579 665 0 False 615 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 659 317 0.00933591234522074 0.00917948338458873 0.00929274433508812 0.00918593118181125 0.00221445876793331 0.00189479282254115 354249 400049 579 665 0 False 659 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 260 356 0.00932257717237147 0.0403998781572838 0.00929274433508812 0.0406042572671092 0.00153746431192963 0.00827823306967194 353743 1760658 579 665 0 True 261 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 305 357 0.00933251266676708 0.0493475850303259 0.0093690394445716 0.0518196383611811 0.00138208594986358 0.0108396508390925 354120 2150606 579 665 0 True 305 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 349 360 0.00989406575584274 0.0248973314494751 0.00946059357595178 0.0265812161440452 0.00269369028271382 0.0122032321963154 375428 1085045 579 665 0 False 349 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 392 356 0.00969092837971193 0.0304375036928554 0.00952162966353857 0.0303807125963226 0.00175067360810152 0.00583285059095838 367720 1326490 579 665 0 True 394 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 437 357 0.00964517766811838 0.0588853456598695 0.00949111161974517 0.0586709391927977 0.00194631367082061 0.00847443188583242 365984 2566269 579 665 0 True 438 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 482 360 0.00952545100753688 0.026254718967251 0.00949111161974517 0.0279850461585412 0.00174577230676132 0.00580799862001855 361441 1144201 579 665 0 False 482 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 526 360 0.00944404320332462 0.0243185211827922 0.00946059357595178 0.0255588616769665 0.00185308728531592 0.0049980388580224 358352 1059820 579 665 0 False 526 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 568 354 0.00977420732477853 0.0423958500049621 0.00950637064164187 0.0428168154421302 0.0023358340727132 0.00842412362756044 370880 1847644 579 665 0 True 571 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 612 354 0.00938993824312787 0.0472752951272666 0.00935378042267491 0.0485694666971847 0.00219376476142475 0.0096572837773103 356299 2060294 579 665 0 True 615 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 657 354 0.00915022138099946 0.0535527190601819 0.00923170824750134 0.0524910353246357 0.00200718288134426 0.0148287561984328 347203 2333869 579 665 0 True 659 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 261 402 0.00931414386147865 0.035015783909304 0.00924696726939803 0.0368352788586252 0.00167563501763847 0.00764387252008672 353423 1526015 579 665 0 True 261 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 305 404 0.00957312556817785 0.0277433111274409 0.00943007553215839 0.0281376363775082 0.00171731296449119 0.00733410292121126 363250 1209075 579 665 0 False 305 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 348 400 0.00957338910914325 0.0644937360567819 0.00949111161974517 0.065293354695964 0.00162285264424634 0.011417725761906 363260 2810687 579 665 0 True 349 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 392 400 0.00962680886282996 0.0528039255841595 0.00962844281681544 0.0528877698939498 0.00153309274518946 0.011546142443329 365287 2301236 579 665 0 True 394 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 437 400 0.00951245843794262 0.0381202950154053 0.00953688868543526 0.0385748073548486 0.00179951579172691 0.00692356391340895 360948 1661312 579 665 0 True 438 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 481 399 0.00956693235549094 0.0469074953348122 0.00955214770733196 0.0479133287556268 0.00173681438518245 0.00912842083782551 363015 2044265 579 665 0 True 482 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 525 399 0.00945221297325204 0.0359695989802843 0.00950637064164187 0.0364538033112078 0.00167420791521815 0.00469371011939095 358662 1567583 579 665 0 True 526 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 569 398 0.00933156391929163 0.0466832909694699 0.00933852140077821 0.0461890592813001 0.00169316852801676 0.00792514125160519 354084 2034494 579 665 0 True 571 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 612 398 0.00946104159559296 0.0360919235603314 0.00947585259784848 0.0367589837491417 0.00204751710976679 0.00617106695686286 358997 1572914 579 665 0 True 615 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 657 398 0.00926367576660443 0.0714508863139768 0.00926222629129473 0.0716868848706798 0.00189203325112 0.0116419611968588 351508 3113885 579 665 0 True 659 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 261 445 0.00937707744401632 0.0388686525193735 0.009399557488365 0.0385290302891585 0.00173377707036734 0.00806544093453748 355811 1693926 579 665 0 True 261 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 304 444 0.00951306458216305 0.0419719474929025 0.00944533455405508 0.0419470511940185 0.00177315729011421 0.00479606560449188 360971 1829170 579 665 0 True 305 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 349 445 0.00941165401867688 0.0290734159729835 0.0093842984664683 0.0296177615014878 0.00157704175375445 0.0031450972503096 357123 1267042 579 665 0 True 350 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 393 444 0.00962008856821224 0.0429658031551756 0.00961318379491875 0.0437476157778286 0.00160964677955654 0.00623574952610558 365032 1872483 579 665 0 True 394 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 436 444 0.00974758968727307 0.0888763451315402 0.00961318379491875 0.0853284504463264 0.00212229563817855 0.0206223045909241 369870 3873300 579 665 0 True 438 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 481 442 0.00961060109345782 0.0494722959837222 0.00958266575112535 0.0499732967116808 0.00175688387013573 0.0109818829980695 364672 2156041 579 665 0 True 482 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 524 442 0.00952057549967696 0.0416755323878476 0.00949111161974517 0.0422064545662623 0.00177222001341148 0.00691095429758477 361256 1816252 579 665 0 True 527 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 571 446 0.0095965807140985 0.0271374935392957 0.00955214770733196 0.0282902265964752 0.00191959280506856 0.00530328251051967 364140 1182673 579 665 0 False 571 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 613 442 0.00932252446417839 0.0341815628565577 0.0093690394445716 0.0344090943770504 0.00188057233947483 0.00439969880738915 353741 1489659 579 665 0 True 615 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 657 443 0.00944006373474707 0.063201170699695 0.00955214770733196 0.0625619897764553 0.0019395116213757 0.00831050808183698 358201 2754356 579 665 0 True 659 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 261 488 0.00926478263865911 0.0491722324809506 0.00920119020370794 0.0486610208285649 0.00146597622516422 0.0124871236622065 351550 2142964 579 665 0 True 261 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 305 488 0.00929053059097876 0.0473007191817952 0.00918593118181125 0.0469062333104448 0.00159510853093293 0.0050918214505946 352527 2061402 579 665 0 True 305 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 349 488 0.00952521382066802 0.0564612492549754 0.00950637064164187 0.0550850690470741 0.0015601093177196 0.0119840344875864 361432 2460625 579 665 0 True 350 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 393 488 0.00985846137141711 0.0701025853716461 0.0098115510795758 0.0682688639658198 0.00153392591989284 0.0124827676044332 374077 3055125 579 665 0 True 394 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 437 488 0.00988297068119937 0.0802214508576316 0.00994888227664607 0.0765087357900359 0.00196196293507005 0.0219343096034655 375007 3496113 579 665 0 True 438 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 483 487 0.00951575270001013 0.037753665463728 0.00956740672922866 0.038300144960708 0.00174972988087748 0.00557115041524389 361073 1645334 579 665 0 True 482 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 527 487 0.00946214846764764 0.0318404617632431 0.00950637064164187 0.0322575722896162 0.00183078600885642 0.0034913158889755 359039 1387632 579 665 0 True 527 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 570 486 0.00944567715731011 0.0839379061065344 0.00949111161974517 0.0808117799649043 0.00185593073494868 0.0131823131370447 358414 3658079 579 665 0 True 571 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 614 486 0.00930025525260204 0.0549308496693783 0.00921644922560464 0.055191882200351 0.00189930554904683 0.0145715224440283 352896 2393929 579 665 0 True 615 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 659 487 0.00977926731131422 0.0696792335611287 0.00971999694819562 0.0688944838635843 0.00234567143367143 0.0116976237370437 371072 3036675 579 665 0 True 659 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 262 533 0.00929448370545977 0.0416485021204878 0.00914015411612116 0.0434576943617914 0.00157189896110206 0.00869773674808005 352677 1815074 579 665 0 True 261 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 305 532 0.00955789290037769 0.0869638275133932 0.00941481651026169 0.0824597543297475 0.00167764933546622 0.0189774011826805 362672 3789951 579 665 0 True 306 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 350 533 0.00984958004088311 0.0474973425782355 0.00968947890440223 0.0493629358358129 0.00175651500556177 0.00918323701595265 373740 2069971 579 665 0 True 350 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 394 532 0.00993212107124659 0.047972666846792 0.00985732814526589 0.0480201419089036 0.00185205995218724 0.00568821978484102 376872 2090686 579 665 0 True 394 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 438 531 0.0102536146949388 0.0484106810858687 0.0100404364080262 0.0481116960402838 0.00228989794218805 0.00679564364251887 389071 2109775 579 665 0 True 438 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 482 528 0.00969920356602551 0.0529216380387912 0.00968947890440223 0.0533455405508507 0.00195325196402274 0.0098937329621217 368034 2306366 579 665 0 True 483 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 526 528 0.00973159275067325 0.0631494506465294 0.00971999694819562 0.0617685206378271 0.00181097735611912 0.012815835209378 369263 2752102 579 665 0 True 527 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 569 527 0.00941083704168414 0.0491633753644812 0.00941481651026169 0.0498054474708171 0.0017560367869837 0.00962799714214748 357092 2142578 579 665 0 True 571 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 615 527 0.00960258944810964 0.0408106556159224 0.00965896086060884 0.0410925459678035 0.00183343002966302 0.00563812058034411 364368 1778560 579 665 0 True 615 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 658 526 0.00943054990589611 0.0557418035819693 0.00943007553215839 0.0559548332951858 0.00204662573288893 0.0104316360760698 357840 2429271 579 665 0 True 660 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 262 572 0.00875064056925903 0.0355120807282569 0.00871290150301366 0.0364232852674144 0.00144771880479797 0.00595318186475373 332041 1547644 579 665 0 True 261 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 305 572 0.00916152728841515 0.046451973375875 0.00915541313801785 0.0467536430914778 0.00153609446705082 0.00923906819324623 347632 2024413 579 665 0 True 306 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 350 572 0.00945450577965103 0.037921996568441 0.0093690394445716 0.0381322957198444 0.00149996929610225 0.00649211479992567 358749 1652670 579 665 0 True 350 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 393 571 0.00951335447722499 0.0407686187315393 0.0093690394445716 0.0410315098802167 0.0016270082919231 0.00449228858116516 360982 1776728 579 665 0 True 394 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 437 570 0.00976084579783272 0.075274843093084 0.00968947890440223 0.0720225833524071 0.00200996667124855 0.0147109821480782 370373 3280536 579 665 0 True 438 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 481 569 0.00960836099525191 0.0539170999138955 0.00959792477302205 0.053482871747921 0.00212065725611042 0.00852746184069044 364587 2349749 579 665 0 True 483 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 527 575 0.0112847187220688 0.0379871399716962 0.0100404364080262 0.0437628747997253 0.00545701978041136 0.0152057201810824 428196 1655509 579 665 0 False 527 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 571 575 0.0103706795917698 0.0285149816633596 0.00965896086060884 0.0325017166399634 0.00357147907017755 0.0123977805766385 393513 1242705 579 665 0 False 571 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 615 575 0.011478263207059 0.0324496523983339 0.00976577401388571 0.0367132066834516 0.00610415182349122 0.0137585240008178 435540 1414181 579 665 0 False 615 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 660 575 0.0128358154280307 0.0342148573539594 0.00988784618905928 0.0399328603036545 0.00901685498613811 0.0164277022483121 487052 1491110 579 665 0 False 660 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 262 619 0.00855712243836534 0.00848536998252096 0.00866712443732357 0.00848401617456321 0.00143605357205974 0.00136635215109493 324698 369799 579 665 0 False 262 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 306 619 0.00882827973766605 0.00874117084884333 0.00871290150301366 0.00871290150301366 0.00141794593795203 0.00137039187633114 334987 380947 579 665 0 False 306 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 349 613 0.00922625294951754 0.0590102860722417 0.00917067215991455 0.0574044403753719 0.00161645940567325 0.00807186881365199 350088 2571714 579 665 0 True 350 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 394 619 0.0123289997974688 0.0516960517567666 0.00964370183871214 0.0557717250324254 0.00836777451275505 0.0274169000150362 467821 2252954 579 665 0 False 394 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 439 619 0.00887727200313403 0.00898744916766625 0.00883497367818723 0.00903334096284428 0.00179164664111746 0.00186606009049842 336846 391680 579 665 0 False 439 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 483 619 0.00894950858175034 0.00896721088599273 0.0089570458533608 0.00907911802853437 0.0018550636094476 0.0020332507904754 339587 390798 579 665 0 False 483 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 527 618 0.00870710360177484 0.00877797606857611 0.00868238345922026 0.00878919661249714 0.00200291194214862 0.00203644157947069 330389 382551 579 665 0 False 527 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 571 618 0.00871456181109568 0.00876108788795059 0.00872816052491035 0.00878919661249714 0.00164103596952331 0.00177907452811875 330672 381815 579 665 0 False 571 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 615 618 0.00875127306757599 0.0087372471003556 0.00872816052491035 0.00878919661249714 0.00146237635515757 0.00137350447156651 332065 380776 579 665 0 False 615 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 660 618 0.00883521086505609 0.00885289442420425 0.00889600976577401 0.00880445563439384 0.0015065612678459 0.00155859427473809 335250 385816 579 665 0 False 660 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 262 665 0.00857704613534963 0.0352169276475694 0.00859082932784009 0.0352483405813687 0.00142191907917555 0.00683094491423735 325454 1534781 579 665 0 True 262 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 306 662 0.00844084816443059 0.00860156800791174 0.00848401617456321 0.00860608834973678 0.00129450506523616 0.00122155764855619 320286 374863 579 665 0 False 306 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 350 662 0.00847658431933891 0.00856691970255233 0.00845349813076982 0.00849927519645991 0.00141881096674982 0.00132051445017067 321642 373353 579 665 0 False 350 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 394 662 0.00861607655232547 0.00856379906048022 0.00868238345922026 0.00848401617456321 0.00144090211143615 0.00121677545587888 326935 373217 579 665 0 False 394 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 439 662 0.00863552587557203 0.00876276293847459 0.00868238345922026 0.00883497367818723 0.00152103342180419 0.00148738935080542 327673 381888 579 665 0 False 439 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 483 662 0.00883550076011803 0.00862114085855518 0.00886549172198062 0.00871290150301366 0.00167988875176739 0.00155369728677118 335261 375716 579 665 0 False 483 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 527 661 0.00847228860160288 0.00855624986017344 0.00856031128404669 0.00859082932784009 0.00179594277533697 0.00167319228783879 321479 372888 579 665 0 False 527 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 571 661 0.00867840399064271 0.00856652962229332 0.00869764248111696 0.00859082932784009 0.00145629400591947 0.00143184630698349 329300 373336 579 665 0 False 571 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 616 661 0.00872465543007053 0.00909375751119616 0.00875867856870375 0.0089570458533608 0.00137085480773681 0.00232463264476213 331055 396313 579 665 0 False 616 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 658 663 0.00890391599473603 0.0367554041891178 0.00885023270008392 0.0370183871213855 0.0014553165561517 0.00720215093121999 337857 1601829 579 665 0 True 660 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H9_2.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H9_2.csv new file mode 100755 index 0000000..8f35d7b --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H9_2.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 261 275 0.00793885533353547 0.73358328299577 0.00741588464179446 0.718699931334401 0.00279587728765992 0.165010364627199 301238 31970128 579 665 11 True 261 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 305 274 0.00594572136630705 0.00577148983697513 0.00581368734264134 0.00579842832074464 0.00148121396584004 0.00120515167179004 225609 251526 579 665 0 False 305 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 348 275 0.0055306706998976 0.00553237063819999 0.00552376592660411 0.0055390249485008 0.00123633608703343 0.00133778832787307 209860 241105 579 665 0 True 349 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 393 275 0.00541286788836352 0.00544230799016309 0.00544747081712062 0.00538643472953384 0.00128680873779715 0.00127209325998343 205390 237180 579 665 0 True 393 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 437 275 0.00572289748006082 0.0056169492167131 0.00570687418936446 0.0055542839703975 0.0015388539638743 0.00161586398159672 217154 244791 579 665 0 True 438 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 480 275 0.00565753932064146 0.00572908581823063 0.00566109712367437 0.00564583810177768 0.00154994478026708 0.00169188474966067 214674 249678 579 665 0 True 482 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 524 273 0.0055304071589322 0.00561307136002056 0.0055542839703975 0.00561532005798428 0.00154602426155779 0.00160297645704623 209850 244622 579 665 0 True 526 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 567 272 0.00596253527989961 0.00586357172399986 0.00593575951781491 0.00585946440833143 0.00164963763715321 0.00165450851491123 226247 255539 579 665 0 True 570 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 615 274 0.00680106992361133 0.00680036093896908 0.00665293354695964 0.00651560234988937 0.00235219727447624 0.0029236476653606 258065 296365 579 665 0 False 615 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 656 272 0.00827631953973097 0.738965793976817 0.0081025406271458 0.740169375143053 0.0024010985029156 0.187840671848822 314043 32204702 579 665 13 True 659 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 261 318 0.00574316378030013 0.00564381886278984 0.00572213321126116 0.00561532005798428 0.00162933200655956 0.00144671704440257 217923 245962 579 665 0 False 261 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 305 317 0.00559932312138446 0.0054458416583918 0.00563057907988098 0.00544747081712062 0.00124849348826542 0.00119794182984154 212465 237334 579 665 0 False 305 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 349 318 0.00542430556626191 0.00567394682632422 0.00540169375143053 0.00570687418936446 0.00122666898282062 0.00141605884513496 205824 247275 579 665 0 True 349 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 392 319 0.00570463409115856 0.00576625817232484 0.00569161516746777 0.00581368734264134 0.00129340714365519 0.00132809118751146 216461 251298 579 665 0 True 394 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 436 318 0.0058128703656486 0.00576137069613838 0.00588998245212482 0.00573739223315786 0.00155195188220754 0.0016683218927066 220568 251085 579 665 0 True 438 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 481 317 0.00584858016646038 0.00592729248160456 0.00576791027695125 0.00593575951781491 0.00157069686261818 0.00149146653337983 221923 258316 579 665 0 True 482 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 525 318 0.00563471667303777 0.00557686273362509 0.00566109712367437 0.0055542839703975 0.00154521902259834 0.00154699625487981 213808 243044 579 665 0 True 526 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 569 317 0.00602314970194176 0.00593289128061628 0.005981536583505 0.00584420538643473 0.00172304577673036 0.00147954882181666 228547 258560 579 665 0 True 570 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 615 317 0.00615246925366385 0.00590482844786491 0.00608834973678187 0.00588998245212482 0.00194624246725284 0.00191726734342824 233454 257337 579 665 0 False 615 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 659 317 0.00623914787718411 0.00624656170065815 0.00633249408712902 0.00631723506523232 0.00188993112470955 0.00182339382952537 236743 272230 579 665 0 False 659 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 260 356 0.00542043151407052 0.00549214647972644 0.00547798886091402 0.00546272983901732 0.00138711828223217 0.00151210306553199 205677 239352 579 665 0 True 261 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 305 357 0.00542939190689414 0.00542170257412816 0.00543221179522393 0.00540169375143053 0.00129614195525179 0.00136468815783959 206017 236282 579 665 0 True 305 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 349 360 0.00588945537019402 0.00564595283126562 0.00588998245212482 0.00573739223315786 0.00133868107742371 0.00136485240082881 223474 246055 579 665 0 False 349 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 392 356 0.00601445285008354 0.00591478696741855 0.00593575951781491 0.00587472343022812 0.00138832823824136 0.00127706579777017 228217 257771 579 665 0 True 394 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 437 357 0.00596767432872492 0.00609422388656466 0.005981536583505 0.00605783169298848 0.00167540856002548 0.00173405165058425 226442 265591 579 665 0 True 438 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 482 360 0.006082841730605 0.00601407386628622 0.00610360875867857 0.00599679560540169 0.00166361759933819 0.00172359958338743 230812 262098 579 665 0 False 482 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 526 360 0.00580362007776303 0.00595730571565099 0.00584420538643473 0.00588998245212482 0.00168175594269904 0.00177774329730023 220217 259624 579 665 0 False 526 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 568 354 0.00589093119960026 0.00585634376625932 0.00584420538643473 0.00582894636453803 0.00173389830590403 0.00173184176478848 223530 255224 579 665 0 True 571 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 612 354 0.00596662016486332 0.00581205818391252 0.00582894636453803 0.00584420538643473 0.00209766868539175 0.00197963373533119 226402 253294 579 665 0 True 615 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 657 354 0.00553183028014536 0.00555091092345191 0.00566109712367437 0.0055390249485008 0.00183515401264255 0.00183685536877335 209904 241913 579 665 0 True 659 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 261 402 0.00539152107016607 0.00544921470533739 0.00541695277332723 0.00546272983901732 0.00152278430144351 0.00147446752861534 204580 237481 579 665 0 True 261 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 305 404 0.00579455426855325 0.00560912466563525 0.00576791027695125 0.00563057907988098 0.00133003538333869 0.00133744501150319 219873 244450 579 665 0 False 305 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 348 400 0.00593043599031381 0.00571894373149628 0.00587472343022812 0.00575265125505455 0.00136913310432781 0.00131782930572807 225029 249236 579 665 0 True 349 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 392 400 0.00597737263625167 0.00606258149378941 0.00588998245212482 0.00602731364919509 0.00142750474461395 0.00146987272656783 226810 264212 579 665 0 True 394 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 437 400 0.00616298453818333 0.00589916081116043 0.00621042191195544 0.00592050049591821 0.00159106242091885 0.00158604549673396 233853 257090 579 665 0 True 438 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 481 399 0.00602141033157011 0.00605315072988032 0.00608834973678187 0.00607309071488518 0.00164986240110308 0.00155605771574953 228481 263801 579 665 0 True 482 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 525 399 0.00585316577925835 0.00589709568037741 0.00587472343022812 0.00587472343022812 0.00152621950551518 0.00167124813886187 222097 257000 579 665 0 True 526 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 569 398 0.00583606197060385 0.0058714192209753 0.00581368734264134 0.00590524147402152 0.00168760274438057 0.00170297535286767 221448 255881 579 665 0 True 571 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 612 398 0.00554806440361404 0.00545758995795738 0.00549324788281071 0.00543221179522393 0.001993955694989 0.0018287341910628 210520 237846 579 665 0 True 615 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 657 398 0.00531981157348056 0.00535447109419234 0.00532539864194705 0.00535591668574044 0.00181766937848384 0.00172427922443531 201859 233352 579 665 0 True 659 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 261 445 0.00565635338629716 0.0054995350587501 0.00564583810177768 0.00550850690470741 0.00146886509932514 0.00150323877227284 214629 239674 579 665 0 True 261 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 304 444 0.00568268112874068 0.00558714249574497 0.00564583810177768 0.00552376592660411 0.00143992826979325 0.00149349182669826 215628 243492 579 665 0 True 305 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 349 445 0.00580098466810903 0.00569012368412448 0.00576791027695125 0.00570687418936446 0.00129757571889099 0.00135462628976468 220117 247980 579 665 0 True 350 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 393 444 0.00581534765072336 0.00592272624798435 0.00585946440833143 0.0059510185397116 0.00149154983803863 0.00148757889440682 220662 258117 579 665 0 True 394 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 436 444 0.00584554944535827 0.00593167514804406 0.00593575951781491 0.00588998245212482 0.00170890838699864 0.00178498167716459 221808 258507 579 665 0 True 438 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 481 442 0.00585306036287219 0.00594516733582641 0.005981536583505 0.00593575951781491 0.00169768360017154 0.00182949955766314 222093 259095 579 665 0 True 482 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 524 442 0.00562272555911204 0.00591139097457537 0.00578316929884794 0.00588998245212482 0.00161697698153568 0.00172179736247391 213353 257623 579 665 0 True 527 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 571 446 0.00542043151407052 0.00545931090027656 0.00546272983901732 0.00541695277332723 0.0018181141819309 0.0019062149081238 205677 237921 579 665 0 False 571 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 613 442 0.00535686543321589 0.00510477383662865 0.00529488059815366 0.0051117723353933 0.00168786361153136 0.00171281964264946 203265 222470 579 665 0 True 615 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 657 443 0.00516469136124575 0.00529426105891876 0.00527962157625696 0.00537117570763714 0.00189353664627162 0.00183507162444928 195973 230728 579 665 0 True 659 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 261 488 0.00566157149741209 0.00559664209734682 0.00572213321126116 0.00550850690470741 0.00146123866927769 0.00143853806140159 214827 243906 579 665 0 True 261 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 305 488 0.00556935851361841 0.00571612138609284 0.0055542839703975 0.00572213321126116 0.00141797888433787 0.00146244004737387 211328 249113 579 665 0 True 305 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 349 488 0.00566476034309344 0.00588199727976384 0.00566109712367437 0.00587472343022812 0.00149173039687039 0.00153795896405756 214948 256342 579 665 0 True 350 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 393 488 0.00570120805860835 0.00589301131060657 0.00564583810177768 0.00587472343022812 0.00152389811567823 0.00149612780591073 216331 256822 579 665 0 True 394 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 437 488 0.00570076003896717 0.00603754751951979 0.00570687418936446 0.00607309071488518 0.00186294047218052 0.0019025765412976 216314 263121 579 665 0 True 438 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 483 487 0.00586813490609311 0.00587972563590253 0.00585946440833143 0.00588998245212482 0.00156791802379163 0.00192258709097608 222665 256243 579 665 0 True 482 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 527 487 0.00545774891477125 0.00536819274095057 0.00546272983901732 0.00538643472953384 0.00161120519568321 0.00156363513392485 207093 233950 579 665 0 True 527 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 570 486 0.00544499353204586 0.00546630939904121 0.00540169375143053 0.00550850690470741 0.00173571044523357 0.00201685063279687 206609 238226 579 665 0 True 571 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 614 486 0.00518190058628641 0.00533705515792227 0.00526436255436027 0.00538643472953384 0.00169889033218383 0.00165004116702868 196626 232593 579 665 0 True 615 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 659 487 0.00518095183881097 0.00533320024712732 0.00515754940108339 0.00531013962005036 0.00181620438173188 0.00168623383323149 196590 232425 579 665 0 True 659 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 262 533 0.00544768164989294 0.00565818299468057 0.00549324788281071 0.00560006103608759 0.00149437426676332 0.0014998039184495 206711 246588 579 665 0 True 261 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 305 532 0.00558627784359713 0.00558225501955851 0.00550850690470741 0.0055542839703975 0.00140685698288791 0.00145786647272624 211970 243279 579 665 0 True 306 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 350 533 0.00558559263708709 0.00592889869443579 0.0055542839703975 0.00588998245212482 0.00134314763100271 0.00143860656885856 211944 258386 579 665 0 True 350 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 394 532 0.00574152982631464 0.00648529081917428 0.00578316929884794 0.00633249408712902 0.0015495792853787 0.00188185282066575 217861 282634 579 665 0 True 394 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 438 531 0.00580981329044995 0.00607919432364385 0.00579842832074464 0.00608834973678187 0.0017293421354339 0.00202374394140682 220452 264936 579 665 0 True 438 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 482 528 0.00572455778814284 0.00615622370185019 0.00576791027695125 0.00617990386816205 0.00170545829727592 0.00184228158915378 217217 268293 579 665 0 True 483 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 526 528 0.00571675697556699 0.00595026132509117 0.00572213321126116 0.0059662775616083 0.00174266113384427 0.00175836944441655 216921 259317 579 665 0 True 527 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 569 527 0.00547930656574102 0.00542060117104388 0.00540169375143053 0.00535591668574044 0.00168044694612368 0.00167587589110125 207911 236234 579 665 0 True 571 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 615 527 0.00537481257295967 0.0054615137064451 0.00540169375143053 0.00540169375143053 0.00174181230277863 0.001702058124949 203946 238017 579 665 0 True 615 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 658 526 0.00539428825030278 0.0054886816491905 0.00547798886091402 0.00547798886091402 0.00187442106485525 0.00189899677903702 204685 239201 579 665 0 True 660 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 262 572 0.00552213197261862 0.00564166194841647 0.00549324788281071 0.00561532005798428 0.00128079074362488 0.0012600913735663 209536 245868 579 665 0 True 261 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 305 572 0.00575386354349539 0.0056407670584105 0.00567635614557107 0.00556954299229419 0.00136180800509979 0.00136303654265508 218329 245829 579 665 0 True 306 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 350 572 0.00581621733590918 0.00572190375228527 0.00582894636453803 0.00572213321126116 0.00141785624611824 0.00130649329648356 220695 249365 579 665 0 True 350 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 393 571 0.0056986780653405 0.00583264065404986 0.00578316929884794 0.00587472343022812 0.00139955010937677 0.00135304887432785 216235 254191 579 665 0 True 394 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 437 570 0.00570950959901847 0.00580226028564201 0.00567635614557107 0.00582894636453803 0.00172733917807853 0.00194970782045402 216646 252867 579 665 0 True 438 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 481 569 0.00567385250639976 0.00592899047802615 0.00573739223315786 0.00599679560540169 0.0019645085651293 0.00186886431263284 215293 258390 579 665 0 True 483 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 527 575 0.00580074748124017 0.00586405358784923 0.00582894636453803 0.00575265125505455 0.00191658908736518 0.00186165425960564 220108 255560 579 665 0 False 527 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 571 575 0.00584647183873718 0.00612281447496058 0.00590524147402152 0.00584420538643473 0.00161061205512858 0.00287830530885063 221843 266837 579 665 0 False 571 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 615 575 0.00586597387017682 0.00557945562005265 0.00579842832074464 0.0055542839703975 0.00151151667736278 0.00154628421313976 222583 243157 579 665 0 False 615 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 660 575 0.00548376040805629 0.0058091670008163 0.00552376592660411 0.0055542839703975 0.00162389827790805 0.00282785453173926 208080 253168 579 665 0 False 660 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 262 619 0.00582799761706259 0.00568170253970931 0.00584420538643473 0.00561532005798428 0.0013652694200116 0.00137963752793441 221142 247613 579 665 0 False 262 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 306 619 0.00564989663264485 0.00566598459986083 0.00560006103608759 0.00558480201419089 0.00129890090207398 0.00135430343741031 214384 246928 579 665 0 False 306 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 349 613 0.00559576531835156 0.0055910432983351 0.00560006103608759 0.00549324788281071 0.0013480247765502 0.00150692782381875 212330 243662 579 665 0 True 350 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 394 619 0.00535507335465116 0.00537477821355862 0.00537117570763714 0.00538643472953384 0.0012942006173143 0.00128607395291331 203197 234237 579 665 0 False 394 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 439 619 0.00551182752087146 0.00538762791620847 0.00541695277332723 0.00532539864194705 0.00160940656732182 0.00185845234610039 209145 234797 579 665 0 False 439 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 483 619 0.00548244270322929 0.00556139719865009 0.0055390249485008 0.00570687418936446 0.00183474346917515 0.00187624103044098 208030 242370 579 665 0 False 483 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 527 618 0.00565529922243556 0.00536192851090877 0.00564583810177768 0.00529488059815366 0.00183760336380626 0.00188790500322843 214589 233677 579 665 0 False 527 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 571 618 0.00562852346035085 0.00543462111447077 0.00556954299229419 0.00537117570763714 0.00161711138027954 0.00170652294797031 213573 236845 579 665 0 False 571 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 615 618 0.00564083082343506 0.00557126393461337 0.00566109712367437 0.00560006103608759 0.00138215307858278 0.0013219300159303 214040 242800 579 665 0 False 615 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 660 618 0.00580095831401249 0.00552137955325485 0.00572213321126116 0.00552376592660411 0.00163672376750475 0.00151944114216351 220116 240626 579 665 0 False 660 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 262 665 0.00838423956506253 0.719810145643349 0.00735484855420768 0.71648737315938 0.00404319946555136 0.180334274802763 318138 31369884 579 665 9 True 262 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 306 662 0.00600327871315055 0.00584925348390431 0.00585946440833143 0.00582894636453803 0.00171211124394231 0.00125571815442689 227793 254915 579 665 0 False 306 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 350 662 0.00547904302477562 0.00547236711600471 0.00547798886091402 0.00550850690470741 0.00121274088260602 0.00123852426405363 207901 238490 579 665 0 False 350 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 394 662 0.00528407541857223 0.00524265573524106 0.00523384451056687 0.00520332646677348 0.0013094206618288 0.00129389993291101 200503 228479 579 665 0 False 394 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 439 662 0.00533409549380527 0.00545056851329514 0.00540169375143053 0.00550850690470741 0.00147901633104852 0.00156071795971876 202401 237540 579 665 0 False 439 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 483 662 0.00547184835642018 0.00543918734809099 0.00543221179522393 0.0055542839703975 0.00157436536396981 0.00144027988203756 207628 237044 579 665 0 False 483 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 527 661 0.005361213859145 0.00531537128470065 0.00534065766384375 0.00537117570763714 0.0017313807040834 0.00165539106572722 203430 231648 579 665 0 False 527 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 571 661 0.00547229637606136 0.00534501738438566 0.0055542839703975 0.00538643472953384 0.00146784265834024 0.00135293988698904 207645 232940 579 665 0 False 571 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 616 661 0.00589630743529443 0.00583211289840532 0.00581368734264134 0.00567635614557107 0.00151901091297155 0.00152765165615297 223734 254168 579 665 0 False 616 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 658 663 0.00787586904280472 0.74520021729765 0.00746166170748455 0.740764476997025 0.00250644176676984 0.181419788699152 298848 32476403 579 665 14 True 660 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H9_3.csv b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H9_3.csv new file mode 100755 index 0000000..4fe1a79 --- /dev/null +++ b/example_data/mtp_wo_parameters/160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_H9_3.csv @@ -0,0 +1,101 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour +1 261 275 0.00101542333968862 0.0749954538440402 0.000823987182421607 0.07177843900206 0.000832292627828574 0.0200387610101159 38530 3268360 579 665 0 True 261 275 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +2 305 274 0.000952384340764793 0.000889841908502086 0.00080872816052491 0.000823987182421607 0.000683800149162146 0.000639712448044812 36138 38780 579 665 0 False 305 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +3 348 275 0.00099307506582265 0.000861824967545896 0.000839246204318303 0.000778210116731518 0.000705082151220797 0.000694798620517285 37682 37559 579 665 0 True 349 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +4 393 275 0.000873743716689246 0.00086407366550962 0.000717174029144732 0.000732433051041428 0.00067523120356669 0.000646676992472614 33154 37657 579 665 0 True 393 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +5 437 275 0.000878250267197596 0.000944751441432604 0.000625619897764553 0.000686655985351339 0.000804906220275948 0.000847985045966102 33325 41173 579 665 0 True 438 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +6 480 275 0.000916700894049548 0.000978826099352295 0.000686655985351339 0.000686655985351339 0.000850770467334076 0.000914253441029335 34784 42658 579 665 0 True 482 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +7 524 273 0.000960422340209512 0.000950602645317804 0.000747692072938125 0.00080872816052491 0.000825349637337963 0.00081340771738732 36443 41428 579 665 0 True 526 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +8 567 272 0.00102301331949216 0.00103903613462588 0.000823987182421607 0.000793469138628214 0.000876899806250253 0.000889775783044956 38818 45282 579 665 0 True 570 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +9 615 274 0.000984167381192109 0.000980248745002814 0.00064087891966125 0.000625619897764553 0.000989678665045974 0.00101328701580557 37344 42720 579 665 0 False 615 274 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +10 656 272 0.00115083068771147 0.0759908009896566 0.000823987182421607 0.0744029907682918 0.00107942536139723 0.0225691657882207 43668 3311738 579 665 0 True 659 273 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +11 261 318 0.000935175115724132 0.000953103748155006 0.000778210116731518 0.000762951094834821 0.000784125934582448 0.000800949382916964 35485 41537 579 665 0 False 261 318 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +12 305 317 0.000847047016894162 0.000797851805067716 0.000732433051041428 0.000671396963454643 0.000625910906910257 0.000578599443953019 32141 34771 579 665 0 False 305 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +13 349 318 0.00093406824366945 0.000831949408884996 0.000869764248111696 0.000701915007248035 0.000651348051156307 0.000649066365445372 35443 36257 579 665 0 True 349 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +14 392 319 0.000845992853032559 0.000883348219484394 0.000686655985351339 0.000793469138628214 0.00068198591578962 0.000632392570088279 32101 38497 579 665 0 True 394 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +15 436 318 0.000938126774536619 0.000910309649151489 0.00064087891966125 0.000610360875867857 0.000878968497691587 0.000872672474091689 35597 39672 579 665 0 True 438 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +16 481 317 0.000988304974348899 0.00098034052859317 0.000778210116731518 0.00080872816052491 0.000857603976157004 0.000842370741327356 37501 42724 579 665 0 True 482 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +17 525 318 0.000964190976014741 0.000958014170239056 0.000778210116731518 0.000778210116731518 0.000808691234146255 0.000863255832779006 36586 41751 579 665 0 True 526 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +18 569 317 0.000940076977680584 0.000961111866413573 0.000717174029144732 0.000732433051041428 0.000903046791712526 0.000837717842064723 35671 41886 579 665 0 True 570 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +19 615 317 0.000986671020363415 0.00086804330579252 0.000488288700694286 0.000473029678797589 0.00113540125843387 0.00101896029592327 37439 37830 579 665 0 False 615 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +20 659 317 0.000930694919312322 0.00103307020125273 0.000534065766384375 0.000671396963454643 0.00100086378033921 0.00104909897111364 35315 45022 579 665 0 False 659 317 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +21 260 356 0.000912932258244319 0.000846956025908213 0.000747692072938125 0.000656137941557946 0.000768759583716096 0.000780117514879557 34641 36911 579 665 0 True 261 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +22 305 357 0.000931564604498144 0.000846956025908213 0.00080872816052491 0.000717174029144732 0.000712259406394489 0.000639321686950088 35348 36911 579 665 0 True 305 361 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +23 349 360 0.000899860626360448 0.000911342214542995 0.000732433051041428 0.000747692072938125 0.000719627089217331 0.000734409620804332 34145 39717 579 665 0 False 349 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +24 392 356 0.000953201317757535 0.000940896530637649 0.000793469138628214 0.000778210116731518 0.000717110428533228 0.000755663753063333 36169 41005 579 665 0 True 394 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +25 437 357 0.000949643514724627 0.000935641920089764 0.00064087891966125 0.000595101853971161 0.00088314378468619 0.000919933341760438 36034 40776 579 665 0 True 438 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +26 482 360 0.000952937776792135 0.000882797517942258 0.000656137941557946 0.000579842832074464 0.00086751623915741 0.000858491964587752 36159 38473 579 665 0 False 482 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +27 526 360 0.00109432750472957 0.000990253156351625 0.000839246204318303 0.000762951094834821 0.00096428148230606 0.000928064029167046 41524 43156 579 665 0 False 526 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +28 568 354 0.000947192583746401 0.000918891414849782 0.000610360875867857 0.000549324788281071 0.000985394593170279 0.00100151979315393 35941 40046 579 665 0 True 571 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +29 612 354 0.000953702045591796 0.000868479277846711 0.000473029678797589 0.000381475547417411 0.00113418489748501 0.00102390680872397 36188 37849 579 665 0 True 615 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +30 657 354 0.000930853043891562 0.000903081691410949 0.000656137941557946 0.000442511635004196 0.000989706548546603 0.00103113460206679 35321 39357 579 665 0 True 659 360 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +31 261 402 0.000781741565667886 0.000874238698141554 0.000656137941557946 0.000717174029144732 0.000697721629504778 0.000761656264973054 29663 38100 579 665 0 True 261 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +32 305 404 0.000963242228539299 0.000899203834718405 0.000823987182421607 0.000778210116731518 0.000734519683024266 0.000710373892389017 36550 39188 579 665 0 False 305 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +33 348 400 0.000835635693092315 0.000872150621460954 0.000732433051041428 0.000778210116731518 0.000681252510633328 0.000662227892433445 31708 38009 579 665 0 True 349 404 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +34 392 400 0.000835161319354593 0.000860081079329131 0.000701915007248035 0.000671396963454643 0.000669013528803399 0.00073913703992741 31690 37483 579 665 0 True 394 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +35 437 400 0.000916121103925667 0.000969051146979373 0.000656137941557946 0.000762951094834821 0.00081717261958264 0.000796031460252984 34762 42232 579 665 0 True 438 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +36 481 399 0.000978606666822156 0.0009518646696852 0.000717174029144732 0.000686655985351339 0.000851210438272992 0.000881777346162268 37133 41483 579 665 0 True 482 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +37 525 399 0.000925397745907769 0.000944063064504934 0.000701915007248035 0.00064087891966125 0.000896136811240335 0.000974701496727967 35114 41143 579 665 0 True 526 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +38 569 398 0.000923131293605323 0.000914646423795814 0.000701915007248035 0.000610360875867857 0.000891301165667925 0.000910159735408846 35028 39861 579 665 0 True 571 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +39 612 398 0.000978606666822156 0.000899502131387062 0.000595101853971161 0.000442511635004196 0.00104900199294683 0.00103775322373616 37133 39201 579 665 0 True 615 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +40 657 398 0.000921998067454101 0.000934999434957272 0.000595101853971161 0.000625619897764553 0.000954979257717895 0.000931765000569432 34985 40748 579 665 0 True 659 403 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +41 261 445 0.000863913638679802 0.000922057948717066 0.000701915007248035 0.000747692072938125 0.000787266604071727 0.000847143677397885 32781 40184 579 665 0 True 261 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +42 304 444 0.00102794153554515 0.000886078781297487 0.000930800335698482 0.000747692072938125 0.000824794095417595 0.000742519270546244 39005 38616 579 665 0 True 305 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +43 349 445 0.00087577298212283 0.000878483689195523 0.000717174029144732 0.000732433051041428 0.00074952418569702 0.00070712109425768 33231 38285 579 665 0 True 350 447 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +44 393 444 0.000849893259320489 0.000891700526206796 0.000656137941557946 0.000717174029144732 0.000763839792687498 0.000767096633150985 32249 38861 579 665 0 True 394 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +45 436 444 0.000862200622404698 0.000934655246493437 0.000595101853971161 0.000549324788281071 0.00088362602224712 0.00095899157352497 32716 40733 579 665 0 True 438 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +46 481 442 0.000939418125267082 0.000914692315590992 0.00064087891966125 0.000595101853971161 0.000961450417257464 0.000939453215069641 35646 39863 579 665 0 True 482 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +47 524 442 0.00100179827177741 0.000922838109235093 0.000671396963454643 0.000656137941557946 0.000962201928088592 0.000895033955190463 38013 40218 579 665 0 True 527 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +48 571 446 0.000886209204352695 0.000970037820575701 0.000549324788281071 0.000579842832074464 0.000942733213773576 0.0010312376939344 33627 42275 579 665 0 False 571 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +49 613 442 0.00101834864440457 0.000989266482755298 0.000610360875867857 0.00064087891966125 0.00103464403528888 0.000944737775391817 38641 43113 579 665 0 True 615 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +50 657 443 0.000860909271674235 0.000938234806517323 0.000442511635004196 0.000503547722590982 0.000931821108584623 0.00105329960724931 32667 40889 579 665 0 True 659 446 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +51 261 488 0.000943213115168851 0.000891356337742961 0.00080872816052491 0.000701915007248035 0.000769917320375863 0.000733980133664361 35790 38846 579 665 0 True 261 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +52 305 488 0.000917280684173429 0.000805401005374503 0.000762951094834821 0.000686655985351339 0.000830837244588209 0.000695576612145067 34806 35100 579 665 0 True 305 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +53 349 488 0.000877854955749495 0.000944177793992879 0.000701915007248035 0.00080872816052491 0.000801640475001816 0.000806650161856644 33310 41148 579 665 0 True 350 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +54 393 488 0.00091764964152499 0.000880594711773712 0.000717174029144732 0.000671396963454643 0.000808679415528196 0.000800088991832353 34820 38377 579 665 0 True 394 490 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +55 437 488 0.000959816195989091 0.000908405139651601 0.000610360875867857 0.000457770656900893 0.000971911336026529 0.00103825165348695 36420 39589 579 665 0 True 438 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +56 483 487 0.000929719817740339 0.00094532508887233 0.000595101853971161 0.000549324788281071 0.000916572955924437 0.000984585750929609 35278 41198 579 665 0 True 482 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +57 527 487 0.00106810517867221 0.000973617380599588 0.000823987182421607 0.000717174029144732 0.000977462538725446 0.000891212445557157 40529 42431 579 665 0 True 527 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +58 570 486 0.0010035639962456 0.000886767158225158 0.000686655985351339 0.000457770656900893 0.000990979339653697 0.000963562330403082 38080 38646 579 665 0 True 571 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +59 614 486 0.000891980751494969 0.000794983567869089 0.000473029678797589 0.000473029678797589 0.000983205943997428 0.00083359131699173 33846 34646 579 665 0 True 615 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +60 659 487 0.000922235254322961 0.00102825156275904 0.000518806744487678 0.000671396963454643 0.00097041551629631 0.000997730949541073 34994 44812 579 665 0 True 659 489 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +61 262 533 0.000843120256509692 0.000946770680420438 0.000671396963454643 0.000747692072938125 0.000707214427155293 0.00080035776744709 31992 41261 579 665 0 True 261 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +62 305 532 0.000902522390110994 0.000890231988761099 0.000778210116731518 0.000793469138628214 0.000758442958720096 0.000725671887547988 34246 38797 579 665 0 True 306 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +63 350 533 0.000876458188632872 0.000875844910972786 0.000717174029144732 0.000701915007248035 0.000782281142677202 0.000763835696718564 33257 38170 579 665 0 True 350 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +64 394 532 0.000840959220593407 0.000962465674371325 0.000610360875867857 0.000717174029144732 0.000784888501518514 0.000872226288205684 31910 41945 579 665 0 True 394 533 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +65 438 531 0.000940656767804465 0.000866896010913069 0.000579842832074464 0.000320439459830625 0.000941607456300747 0.00104436319106412 35693 37780 579 665 0 True 438 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +66 482 528 0.000886947119055817 0.000910332595049078 0.000488288700694286 0.000549324788281071 0.000994458796882215 0.000969943495188221 33655 39673 579 665 0 True 483 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +67 526 528 0.00101392115618584 0.000940047532426856 0.000656137941557946 0.000625619897764553 0.00100123198811495 0.00094184843984204 38473 40968 579 665 0 True 527 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +68 569 527 0.000890504922088726 0.0010241442470906 0.000579842832074464 0.000732433051041428 0.000885445125376555 0.000936101887018774 33790 44633 579 665 0 True 571 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +69 615 527 0.000884496188077591 0.000897781189067886 0.000564583810177768 0.000564583810177768 0.00091520684319343 0.00092174838866323 33562 39126 579 665 0 True 615 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +70 658 526 0.000898648337919605 0.000892136498260988 0.000488288700694286 0.000457770656900893 0.0010033869368785 0.00100231438987197 34099 38880 579 665 0 True 660 532 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +71 262 572 0.000912194343541197 0.000847667348733473 0.000762951094834821 0.000747692072938125 0.000720830211970263 0.000592899520680265 34613 36942 579 665 0 True 261 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +72 305 572 0.000921312860944059 0.000891172770562249 0.00080872816052491 0.000778210116731518 0.000759080974748995 0.000678872215069057 34959 38838 579 665 0 True 306 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +73 350 572 0.000899491669008887 0.000845258029486626 0.000793469138628214 0.000701915007248035 0.000729134227692032 0.000659049818459424 34131 36837 579 665 0 True 350 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +74 393 571 0.000944741652768175 0.000903173475001305 0.000823987182421607 0.000778210116731518 0.000721069095917472 0.000686951955848672 35848 39361 579 665 0 True 394 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +75 437 570 0.000971148457501318 0.000925017969506049 0.00064087891966125 0.000381475547417411 0.000959885344418831 0.00107514478698368 36850 40313 579 665 0 True 438 576 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +76 481 569 0.000898015839602643 0.00104041288848122 0.000488288700694286 0.000595101853971161 0.00100925799782023 0.00109535119077192 34075 45342 579 665 0 True 483 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +77 527 575 0.000952700589923274 0.00103791178564401 0.000564583810177768 0.000656137941557946 0.00102593301441032 0.00107992498793375 36150 45233 579 665 0 False 527 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +78 571 575 0.000880358594920801 0.000953356153028486 0.000564583810177768 0.000610360875867857 0.000878277926898801 0.000954798012710851 33405 41548 579 665 0 False 571 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +79 615 575 0.000930879397988102 0.000962924592323106 0.000656137941557946 0.000686655985351339 0.000817245896293728 0.000867880167148528 35322 41965 579 665 0 False 615 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +80 660 575 0.000943634780713492 0.000973755055985122 0.000656137941557946 0.000717174029144732 0.000871907012804675 0.00086194383857393 35806 42437 579 665 0 False 660 575 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +81 262 619 0.000869158103891275 0.000881879682038697 0.000701915007248035 0.000701915007248035 0.000686441337613873 0.000693542389320727 32980 38433 579 665 0 False 262 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +82 306 619 0.000882045257099365 0.00082577696243355 0.000732433051041428 0.000686655985351339 0.000755807034446817 0.000666717121737837 33469 35988 579 665 0 False 306 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +83 349 613 0.000786933322686278 0.000864876771925235 0.000656137941557946 0.000671396963454643 0.000654908190418772 0.000775612394285852 29860 37692 579 665 0 True 350 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +84 394 619 0.000849603364258548 0.000790646793224765 0.000701915007248035 0.000671396963454643 0.000653351744992799 0.000639536886691084 32238 34457 579 665 0 False 394 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +85 439 619 0.000898279380568044 0.00084539570487216 0.000595101853971161 0.000457770656900893 0.000894938218465136 0.000943406496128502 34085 36843 579 665 0 False 439 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +86 483 619 0.000934753450179491 0.000967146637479485 0.000518806744487678 0.000534065766384375 0.000979562205759263 0.0010532651755532 35469 42149 579 665 0 False 483 619 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +87 527 618 0.000868999979312034 0.000962419782576147 0.000457770656900893 0.000625619897764553 0.000982480900692788 0.0010496994556588 32974 41943 579 665 0 False 527 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +88 571 618 0.000929350860388778 0.000890438501839401 0.000610360875867857 0.000579842832074464 0.000867935750358177 0.000911107804563208 35264 38806 579 665 0 False 571 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +89 615 618 0.000938943751529361 0.000919648629470219 0.000732433051041428 0.000717174029144732 0.000754670528349515 0.000726323276280559 35628 40079 579 665 0 False 615 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +90 660 618 0.000945769462533237 0.000947252544269807 0.000701915007248035 0.000732433051041428 0.000795639064528591 0.000830199931784476 35887 41282 579 665 0 False 660 618 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +91 262 665 0.00110436841551134 0.0733623943126298 0.000900282291905089 0.0718242160677501 0.000851620624486732 0.0206305139615674 41905 3197190 579 665 0 True 262 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +92 306 662 0.000917122559594189 0.000860953023437513 0.00080872816052491 0.000747692072938125 0.000692227705423984 0.000611532934595095 34800 37521 579 665 0 False 306 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +93 350 662 0.000924106395177306 0.000864394908075866 0.00080872816052491 0.000762951094834821 0.000681277299377295 0.000647119231520936 35065 37671 579 665 0 False 350 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +94 394 662 0.000912984966437399 0.000850397910546566 0.000778210116731518 0.000701915007248035 0.000725455718506171 0.000647767953549175 34643 37061 579 665 0 False 394 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +95 439 662 0.00101447459221318 0.000912948427374226 0.000793469138628214 0.000732433051041428 0.000820859896568953 0.000762035416713155 38494 39787 579 665 0 False 439 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +96 483 662 0.000982823322268566 0.000950074889673256 0.000686655985351339 0.000701915007248035 0.000924082365776125 0.000819313135313772 37293 41405 579 665 0 False 483 662 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +97 527 661 0.00103481995474211 0.000914852936874115 0.000747692072938125 0.000579842832074464 0.000955248145156477 0.000885595278029251 39266 39870 579 665 0 False 527 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +98 571 661 0.000913828297526681 0.000910562054024969 0.000686655985351339 0.000732433051041428 0.000829443376794213 0.00074219321250568 34675 39683 579 665 0 False 571 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +99 616 661 0.000961529212264195 0.000981235418599141 0.000793469138628214 0.000778210116731518 0.0007084603777355 0.000798857038696498 36485 42763 579 665 0 False 616 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} +100 658 663 0.00120875699190653 0.0773125305825791 0.00105287251087205 0.0743572137026017 0.000863699465099322 0.022980371371915 45866 3369340 579 665 0 True 660 661 29 {X=0,Y=0,Width=0,Height=0} diff --git a/example_data/no_array.csv b/example_data/no_array.csv new file mode 100644 index 0000000..61920b8 --- /dev/null +++ b/example_data/no_array.csv @@ -0,0 +1,2 @@ + ID Pos.X Pos.Y Bkg.Mean Spot.Mean Bkg.Median Spot.Median Bkg.StdDev Spot.StdDev Bkg.Sum Spot.Sum Bkg.Area Spot.Area Spot.Sat. (%) Found Pos.Nom.X Pos.Nom.Y Dia. Rect. Contour + 0 \ No newline at end of file diff --git a/pyproject.toml b/pyproject.toml index 49e6406..68ec6c8 100644 --- a/pyproject.toml +++ b/pyproject.toml @@ -1,5 +1,3 @@ - - [build-system] requires = ["flit"] build-backend = "flit.buildapi" @@ -24,8 +22,9 @@ classifiers = [ ] requires = [ - + "pandas >=1.0.0" ] + requires-python = ">=3.7" [tool.flit.metadata.requires-extra] diff --git a/sensovation_data_parser/__init__.py b/sensovation_data_parser/__init__.py index 0e648fe..58e6a00 100644 --- a/sensovation_data_parser/__init__.py +++ b/sensovation_data_parser/__init__.py @@ -4,3 +4,26 @@ Parsing the numerical output from Sensovation image analysis. """ __version__ = "0.0.1" + + +from pathlib import Path + +import pandas + + +def _guess_decimal_separator(file_handle): + file_handle.seek(0) + headers = next(file_handle) # noqa: F841 + data = next(file_handle) + separator = "," if data.count(",") > data.count(".") else "." + file_handle.seek(0) + return separator + + +def _parse_csv(data_file): + data_path = Path(data_file) + with data_path.open("r") as handle: + decimal_sep = _guess_decimal_separator(handle) + df = pandas.read_csv(handle, sep="\t", decimal=decimal_sep) + # print(df) + return df diff --git a/tests/test_sensovation_data_parser.py b/tests/test_sensovation_data_parser.py index 0acc5a4..682e45a 100644 --- a/tests/test_sensovation_data_parser.py +++ b/tests/test_sensovation_data_parser.py @@ -1,5 +1,92 @@ """ Stub file for testing the project """ +from pathlib import Path -def test_dummy(): - assert True +import numpy +import pytest + +EXAMPLE_DIR_WO_PARAMS = "mtp_wo_parameters" +EXAMPLE_DIR_WITH_PARAMS = "mtp_with_parameters" + + +@pytest.fixture +def example_dir(request): + root_dir = Path(request.config.rootdir) + yield root_dir / "example_data" + + +@pytest.fixture +def example_file(example_dir): + data_dir = example_dir / EXAMPLE_DIR_WO_PARAMS + yield data_dir / "160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A1_1.csv" + + +@pytest.mark.parametrize( + "sub_dir,file_name", + [ + ( + EXAMPLE_DIR_WO_PARAMS, + "160218_SG2-013-001_Regen1_Cy3-100_1_A1_1.csv", + ), + ( + EXAMPLE_DIR_WITH_PARAMS, + "160210_SG2-010-001_Regen_cy3100_1_A1_1.csv", + ), + ], +) +def test_parse_csv(example_dir, sub_dir, file_name): + from sensovation_data_parser import _parse_csv + + result = _parse_csv(example_dir / sub_dir / file_name) + + columns = { + " ID ": numpy.int64, + "Pos.X": numpy.int64, + "Pos.Y": numpy.int64, + "Bkg.Mean": float, + "Spot.Mean": float, + "Bkg.Median": float, + "Spot.Median": float, + "Bkg.StdDev": float, + "Spot.StdDev": float, + "Bkg.Sum": numpy.int64, + "Spot.Sum": numpy.int64, + "Bkg.Area": numpy.int64, + "Spot.Area": numpy.int64, + "Spot.Sat. (%)": numpy.int64, + "Found": numpy.bool_, + "Pos.Nom.X": numpy.int64, + "Pos.Nom.Y": numpy.int64, + "Dia.": numpy.int64, + "Rect.": str, + "Contour": object, # ignore the type of contour + } + + assert set(result.columns) == set(columns.keys()) + assert len(result[" ID "].unique()) == 100 + assert len(result) == 100 + for column, value_type in columns.items(): + assert isinstance(result[column][0], value_type) + + +@pytest.mark.parametrize( + "input,expected", [("", "."), ("..,", "."), (".,,", ","), ("..,,", "."),] +) +def test_guess_decimal_separator_returns_correct_separator(input, expected): + from sensovation_data_parser import _guess_decimal_separator + from io import StringIO + + handle = StringIO(f"header\n{input}\n") + result = _guess_decimal_separator(handle) + + assert result == expected + + +def test_guess_decimal_separator_rewinds_handle(): + from sensovation_data_parser import _guess_decimal_separator + from io import StringIO + + handle = StringIO(f"header\n{input}\n") + _guess_decimal_separator(handle) + + assert next(handle) == "header\n"